view test-data/output.fa @ 3:8be88084f89c draft

planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/fetch_fasta_from_ncbi commit ab45487db8cc69750f92a40d763d51ffac940e25
author artbio
date Wed, 08 Nov 2017 13:00:26 -0500
parents c877548ebde1
children
line wrap: on
line source

>NC_001834.1_Drosophila_C_virus_strain_EB,_complete_genome
TTTATATCGTGTGTACATATAAATATGTACACACGGCTTTTAGGTAGAATATTGTTTTCAATGTTGATTT
TAAAGGTAACTTTGGTTATTATGCTTTACGGTTTTCATTGTTGATGGTATTTGTGGCCTGCGGTCCCTAA
TTGTTGAATTATTTATTCTGATACGTTGTTTTCATTGTTGATGGTAAGGATTCTTATTTTGAAGTGGTTT
TTCAGAAGATAACTCTAAATATGAATTATGCCTTATTGTTTTCAATGTTGATGGCCTTCGTTTAAATACT
CTTTGTTAATGACGGTAATCAAAGATTACATCTCAAACTTAGATTAATATTTTTAAGTAGGGTATACTGA
GTTAGTCCTCTCTCTTTACTGATTTTGATATCTGGTAATTGACTTCGAAGAAAGATGCGTCTTTTGGATT
TGTAATGACTGGGCCTTAAGTTCATAGGTGTTATTACATGGAGGAACACATTACTTTGGTTGATGATGAT
GTTTTGATGATGACTTTCAATGTATGTGCTTATGTTAAGCCTGACATAAGAACTTACTAGTTTGCATAAT
GCAAAGGGTTAGTATATGATTTTTAGTATGTGGATTTTGACACTGCCTTTGATTAGGATGTGTGAATGAT
TTTGAAACATATTAAGATGTTTATACGAGCGTGTTGTTTACTATTTTCAGGATATGTGGAAGCGGTTGTG
TATGATCTATACGCACATTTAGTTCCCAGAGGGCGTTGTCGTCTCCCCCTAAGCAAGGGAGAAACACGTG
GCACATGATCTTGCGCTTAACGATAAAAATGGAATCTGATAAAAGTATGGCCTGTTTAAATAGAATTTTG
ATGAATAAGATGATGTTTGTGGAAGATAAGATCTCTACCCTTAAGATGGTTGCTGATTATTATCAAAAAG
AAGTAAAGTATGATTTTGATGCAGTTGAATCTCCCCGTGAGGCACCTGTATTTAGATGTACTTGTCGATT
CCTTGGTTATACCATTATGACTCAAGGCATCGGTAAGAAGAATCCGAAACAGGAAGCTGCACGTCAGATG
TTGCTCTTGTTATCAGGAGATGTTGAGACTAACCCTGGACCCGTTCAATCGCGCCCCGTGTATTATCGTT
ACAACGACCCTAGATATACACGGTTGGAAAAAGCTATTGAACGTCGAGACGATAAAATTAAAACATTAAT
TAAAGAGTTGCGTCGACAAATCAAAAATAGGAAAATTTATTCCCAAGGAATGTTTGATAAATTAACTAAA
CAAATTTCTGATGGGATAAAAGATGGTGTTGGCTCTGAACAGATGAATGGAAATTTGACTCGTATTTGTG
ATTTCCTAGAGAACACTCTTCCTGGGTTACAAGCAAATATTCAAGCCACTGTGATTGATACAACAGACAA
ATATGTTTCTTTAAAAGAGGATATTATGAAGATTGTTTTAGTGATATTGCTTGTTCGTCTTTTAATGGTT
TGGAAGAAGTATCGTGCTTCTCTGTGTGTTATTTTAATCTTTATTTTTAAATTTTATGGATTCGATCAAA
AGTTGATTGATTTAATTATGGATTTGAAGAATAAAATATTTTCACAGGGTGCATTGGAAGATACAGTTGA
GGAGGTTGTATATCATCCTTGGTTCCATACGTGTGGAAAAATCATCTTTGCGGTTATGGCTTTCTTAACA
ATTAAGAAAATTCCTGGTAAACAGGATTGGGATAGTTACATAACACGTTTAGATCGTATCCCAAAATCTA
TTGAGGGAGCTAAAAAGATCACTGATTACTGTTCAGAATATTTTAATATTGCTAATGATCAGATCAAGAT
GATGGTTCTTGGAAAGACTAAAGAAGAATTGCAACGTGCTAATGGACTATATGGAGAAATTCAAGCTTGG
GCTCAAGAGGTTCGCCAGTATTTGGAATTGGATCAACGGAATAAAATTGATCTAGATACTGAAACCGCAA
ATCGTGTTGAACAACTTTGGATAAAGGGCTTGAAATTCAAGAGTGAACCCCTTTTGAGTAAGGAAATGTC
AGCTTTAGTTCATACAACTCTTTTACCAGCTAAGCAATTGTACGAGTATGTATCGTGTTCTCCTGTTAAA
GGGGGAGGACCACGTATGCGTCCAATTTGTTTATGGTTGGTAGGTGAATCAGGAGTTGGTAAGACTGAAA
TGGTATATCCATTGTGCATTGATGTTCTTCGGGAAATGGGGATGATTAAGAAAGATGATTTTCATCATCA
AGTTTATGGTCGTCAAGTTGAAACTGAATTCTGGGATGGTTATAAAGGACAGAAAATTGTCATTTATGAT
GATGCATTTCAGAAGAAAGATGACAAAACAGCAGCTAACCCAGAAATTTTTGAGGTTATTCGCTCTTGCA
ACACTTTTCCTCAGCATTTACATATGGCAGCTCTTCATGATAAAAATACTTTTTCTGCTGCTGAATTACT
CTTATATACCACTAATGATTATAATGTTAAGCTGGAATCTATTACTTTTCCCGATGCTTTCTTTAATCGT
ATGGGCGATATGGCTTATAAAGTTAGTCCTAAGAAAGAGTATGGTATTGAAACCGAGAAAGGGAATTCAG
GTAAAACTTATTTAAAATTGGATAAGAGTAAATTGGACAAAACAAAAGCTATTGACCTTTCAGTGTATGA
ATTCCAAAAAATTGTACGTGACGAGAAAAGTGATGCAGGTTGGATTGATTCTGGATCACCCTTGGACTAT
GAAGATTTTGCTAAATTAGTGTGTTCAAAATGGAAAGAAGCGAAACAATCTTCAATGAATAAATTGAAAT
TTTTGGAAGAATATGCTATTCGTGCTCAGGTTGGATCAGAAGAAAATTCTGAATATGGTGATTGTATAGA
TTTTGTCGATGATATTGCCAAACGCTTACAAAAAGGTGAAACTCTTGAAGAAATAGAGTTTGATTATGCC
TCAGATCCAGAGATGTTTACTCAATACTATCATTTTAAATCTACAATTAAACCGGCATCGCGTTGGCAGA
AGTATAAGGATCGGATGGACATTTGTTTGAGCGACTGTAAGACTTATTTAGCAAAGAAATACGAAGAAAT
TAAGAAAATTCTTGCCGAACATCCTATCTTGACGATTTTAGGAATGATAGGGGTTGCCTTATCTGCTCTG
GCAATGTACTATTGGTTTTCTAAATCGTTGGATCCTGTAGAAGCCGAGGTTGCTCCTTCTGGTGACGCTA
AAACAGTGCGCTTACCAAGGAAACTCGTTGAGATTGGTGCTTCTGGAGATGTTAAAACACAGAAGATTGT
GAAACCCGTTGTAGAGACCGAATGGCATCGTAACAATAAAGGAGAGATTGAAATTTCTTGTGATGAATGT
GGTATGCATAGGATGTCTGCATTTAACAATATGACAGATGAAGAATTTGATAACTGTACATATGAAGATT
TGAATAAGGACCAGAAACGTGAACTTGCCCAGTGGTCTACTAAAGATTCTTGGTTAGGTCGATTCTTTTT
GAGTCGAGATCGCAAGAATAAGGTTGGAATTTGGGCCGAAGTGGGACAATCAGGTGATGTTAAAACAAAT
AAAGCTCAGATTAAACGTGTTGAAGCTGGAGCCGAAGAATTAGTTACTGTTGCTTTAACTCAAGGTTGTT
CTGATGATGCTGCACACAATTTGATGATTGACGTTTTCCAAAAAAATACATATAGAATGTCATACTTCCG
TGGAGACAAGCGTTATCAACTTGGAAATTGTACATTTGTTCGTGGTTGGTCTTTTATTATGCCATATCAT
TTTGTACAGGCTGTGTTTGCGCGAAGATTGCCACCTAACACGATTATTTCTTTGTCCCAACAGATGTCTG
AAGATTTAATGCAAATTCCATTATCACACTTCTTTTCTGCTGGTGTTGACAATTTTTATTTAACAGATAA
TTGTGTGCGCTTGCCATTTAAAAATGGAGATTTTCGCGATTGTGTTATGGTTAATTTACATTCACGAATG
TGCACGCCACATCGTGATTTGGTTCGGCATTTTATTTTAACTTCTGATCAAGGTAAATTGAAGGGATCTT
TTAGTGGTGCAATGGCAACTTTCCATGTTAACAATATGGGTTTATATCGTGTTTATAATTGGCTAAATGC
AGTTCGTCCTTGCGATAAAAAGATAGAAATTTTCCACCCTGAAGATGGTTTTGAGTATCCCGAAGAATCA
TATATTCAACGTGACTGTTATGAATATAATGCACCGACTCGTACTGGGGATTGTGGATCTATTATTGGAT
TGTATAATAAATATTTAGAAAGGAAAATCATCGGTATGCACATTGCTGGAAATGATGCAGAAGAGCATGG
TTATGCGTGCCCTTTGACACAAGAGTGTCTTGAGACTGCTTTTTCTGCTTTAGTAAATAAAAATAAGAAG
AATATTTCCTCACAATTTTATTATGAAATACCCAATATGGTTGATCCACTCGGTGATAGTAGTGTTCCTG
AAGGTAAGTTTTACGCTTTAGGAAAGTCATCTATTCGTGTGGGACAGGCAGTTAATTCGTCCATAATTCC
TTCTCGAATTTATGGGAAGTTGTCTGTTCCTACAATGAAACCAGCACTACTCAAGCCAACGATTCTGAAT
AACAAAGTACATAATCCTTTATTGTCGGGACTTAAGAAATGTGGTGTAGACACTGCGGTCTTGAGTGATG
ATGAAGTTTTGAGTGCTTCACAAGATGTTTGTCGTGTTATGTTGAACCAATATAATAAAAATTTGAATAA
AACAAAGTATCAACGCATTTTAACATATGAGGAAGCTATTCGTGGAACCCAAGATGATGAATTTATGTGT
GCTATTAATCGTACAACGTCACCAGGATTTCCTTATGCACAAATGAAAAGAAATGCTCCAGGTAAACAGC
AATGGATGGGTTTTGGTGAAGAATTTGATTTTACAAGTAATTATGCACTAGCTTTGCGGAAAGATGTTGA
ACAACTCATTGAAGATTGTGCTAGCGGAAAAATATCTAATGTCATTTTTGTAGATACATTGAAAGATGAG
CGACGCGATATAGCTAAAGTAAATGTAGGTAAAACGCGTGTATTTTCTGCAGGTCCTCAACATTTTGTAG
TTGCATTTCGCCAATATTTCCTACCTTTTGCTGCTTGGTTGATGCATAATCGCATTTCGAACGAAGTAGC
AGTTGGCACTAATGTTTATTCATCTGATTGGGAACGTATTGCAAAACGTCTTAAAACAAAAGGTAGTCAC
GTCATTGCGGGGGACTTTGGAAATTTCGATGGATCTTTAGTAGCACAAATTTTGTGGGCCATATTTTGGG
AAATTTTTGTTGTATGGCTTAAGCAATTTATTGATATAGAGAATTCAGAAGGAAAACGTATTTTATGTAT
CTGTCTTGGTTTGTGGTCACATTTAGTTCACTCTGTTCATATTTATGAAGATAATGTATATATGTGGACT
CATTCTCAACCTTCTGGCAATCCTTTCACTGTTATTATTAATTGCTTGTATAATTCGATTATTATGCGAC
TGTCATGGATTCGTGTGATGGAGAAATTTCAACCTAGACTTAAGTCCATGAAGTGGTTCAACGAATATGT
CGCCTTGATAACATATGGTGACGACAATGTTTTAAACATTGATGCAAAGGTTGTGGAATGGTTTAATCAG
ATTAACATTAGTGAGGTTATGACTGAAATGCGACATGAATATACGGACGAAGCTAAAACTGGTGATATTG
TTAAATCTCGTAAATTAGAAGATATTTTCTTTTTGAAGAGAAAATTTCGTTTTAGCCCAGAATTACAACG
CCATGTTGCTCCATTGAAGATCGAAGTTATTTATGAAATGTTGAATTGGTCTCGCCGCTCTATAGATCCA
GATGAAATCTTGATGTCGAACATTGAAACGGCTTTTCGTGAAGTAGTTTACCACGGAAAAGAAGAATACG
ATAAACTAAGGTCAGCGGTATTGGCGTTGAAGGTACCCCAGGAACTTCCTGAAAACCCTCAGATTTTGAC
GTACAACCAATATTTGCACGATATTGAATATCTTGCGGACCCTTTGTACGACTTTTAGTTAAGATGTGAT
CTTGCTTCCTTATACAATTTTGAGAGGTTAATAAGAAGGAAGTAGTGCTATCTTAATAATTAGGTTAACT
ATTTAGTTTTACTGTTCAGGATGCCTATTGGCAGCCCCATAATATCCAGGACACCCTCTCTGCTTCTTAT
ATGATTAGGTTGTCATTTAGAATAAGAAAATAACCTGCTAACTTTCAAACAAATAATAATAACATTGAAA
ATGAAGATCGGAAAATTACTTCCGAGCAAAAAGAGATTGTACACTTTTCTAGTGAAGGAGTTACCCCTAG
TACCACTGCGGTGCCTGATATCGTTAGTCTTTCAACAGATTATTTGTCTATGACTACTCGTGAAGATCGT
ATCCACACGATTAAAGATTTTCTTTCTCGTCCAATTATAATTCAAACTGGTCTTTGGTCTTCCGCTACAA
CTGCCGAAACTCAATTGTATACTGCTAATTTCCCTGAAGTGTTCATTTCTAATACTATGTATCAAGAAAA
GTTGCGTGGGTTCGTGGGTTTGCGAGCAACTTTAGTCATTAAAGTGCAAGTGAATTCCCAACCTTTCCAG
CAAGGACGATTGATGCTACAGTATTATCCGTATGCACAGTATATGCCTAACCGTGTTTCTTTGGTGAATT
CCACTCTCCAAGGACGCTCTGGTTGTCCTCGAACAGATTTGGATTTGAGCGTTGGTACGGAAGTTGAAAT
GCGAATTCCTTATGTGTCCCCTCATGTATATTACAATCTTATTACTGGACAAGGATCATTTGGCGCTATA
TATTTGGTTGTATATAGCCAACTAAGAGATCAAGTTACAGGAACAGGTTCTGTTGAATATACTGTTTGGG
CTCATTTGGAAGATGTAGATGTGCAATACCCGACCGGTGCAAACATTTTCACGGGTAGCTCTCCAAATTT
TGCCTCTTTGGGTCAGAAAATGAGTGATGGAAAATTCACTGAAAAAGACTTGAGAGATATTTGGACTTCA
AAAGCGTACAATAAACAACCAGACAAAATTTTCGCACAAGTGGCTTCTGAAATAACACAACTCAAAGAAT
CAGGAACAATTAGTTCTGGAATTGGACAAGTTTCTGAAGGTCTTTCTACCATGTCTAAAATCCCTATACT
CGGAAATATGTTTACAAAACCCGCCTGGATTTCAGCTCAAGTATCTAATATCTTCAAGATGCTTGGTTTT
TCAAAACCCACTGTTCAAGGTCTTCCTTGTGAATCGAAACTGCGTGGTCAAGTTCGAATGGCGAATTTTG
ATGGCGCTGATACATCACATAAATTGGCTTTGTCTGCCCAAAACGAAATTGAAACAAAATCTGGACTTTC
TGGAACTTCTCCTGATGAAATGGATTTATCACACGTCCTTTCCATACCAAATTTTTGGGATCGTTTTACT
TGGAACACAACCGATGCCACTAGTTCTATTTTATGGGATAATTATGTTACACCAATGAAAATTAAACCAT
ATTCCTCTACAATATTAGATAGATTTAGATGCACTCATATGGGTTTTGTAGCCAACACACACGGTTATTG
GTGTGGATCAATAGTTTATACTTTTAAATTTGTTAAGACTCAATTTCATTCTGGACGTTTACGCATTAGT
TTTATTCCATTTTATTATAATACGACTATATCTGCAGGAGTTCCCGATGTTTCTCGTACCCAAAAAGTAA
TCGTTGATCTGCGCACCTCTACAGAAGTCTCTTTCACTATTCCGTATGTGTCTTCACGACCTTGGATGTA
CTGTATTCGTCCTGAAGCTTCGTGGCTTGGAACCGATAATGCTTTGATGTACAACGCCGTTACGGGTATA
GTGAGAGTTGAGGTTCTTAACCAGTTGGTTGCCGCTAACAACGTGTTTCAATCTATAGACACTATTGTTG
AAGTTAGTGGTGGTCCTGATTTAACTTTTGCAGCACCAATGGCTCCCTCTTATGTTCCTTATTCTGGAGG
TTTTACTTTAGCAGATGATGCGGCAGCAAAGAAACAGCGTGAGGAGGAGTATGACAACAACATACCTCAA
ACTATTTCTAATCGTGGAAAACGTGAGGTTGAAGATGCTCGTATTGTTGCGCAAGTAATGGGTGAAGATT
TAGCTATTCAAAGAAACGATGCTCAACATGGTGTTCATCCAATGACTATAGACACTCATAAGATCGACTC
AAATTGGTCTCCGGAAGCGCATTGTATTGGTGAAAAGATTATGTCTATTCGCCAATTGATTAAGCGTTTT
GGCATGGCTTTGAACTCCTTGAATTTGATAAGTGATGCACCAAACACCTTGATAGCACCATTTTCAGTTC
AGCACCCAACTCCTGTTGTTGCCCCTGCTGAACCCATGTCCCTTTTTGAATATTATTATTTCATTTATGG
ATTTTGGAGAGGTGGCATGAGATTTAAACTTCAGGCAGTACGTACAAACTCAGCAGAAACATCAGTTAAA
ACCGACACAACTTGGACTGTAAATTTGTGGAATTCTGTACAAGATTCTTTTAATTCTCTAATTAATGTAT
TTAGTACTACTGATTACCCTATAAAATCCACAGGAGCACTTCCAGCCGGAACAAGCGGTTTTGGCAATTC
GATGACGTATATAGATCCTGAGGTTGAAGGTTTTATGGAATTTGAGATTCCATATTATAATATCTCCCAT
ATTTCTCCAGCTACAACCTATGTTCGTGGTACTGAATCTCCTATTACAATTAATAGTGTCTTGCGTGGAC
ATTTGCCACCACAAATTGTGGCTGTTGCACCACAGGGCACTATTGCCACTACAGATGTAGTGAACGCTCA
ATTTGCTCGTGCTCCTTCTGACGACTTTTCATTTATGTATCTCGTTGGTGTTCCACCACTTACCAACGTC
GCTCGTCCCTAACTCCCTTACTATTCTGGATCCTTTAAAATTTATTAGGATAGACAAAAATTAACTCTAT
ATTAGATAGTATTAGATTAAGTTTCTTTTTGGTTTTGGGTTTTATTCAGTAACTATCTGCCCTGCTTACA
CGGGTATTATTTTTAATTCTTGTCCCTTCTGGACTCTTTTATTTTGTATTTTCAAAATTTTTACTAATTT
TTAGTCAGAGTCCTTAGGGGCTACCAGGTTTTTCGCAATTTTCCTGCTTACTGACAGTAATTGCAATTTC
GAATTAAAATAATAGTTGTTTTCT