diff test-data/F.vcf @ 2:aea952be68cb draft

"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit cd8f633245d53cf47eaf860a4e0ae8d806c34419"
author artbio
date Wed, 16 Sep 2020 22:58:28 +0000
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/F.vcf	Wed Sep 16 22:58:28 2020 +0000
@@ -0,0 +1,4089 @@
+##fileformat=VCFv4.2
+##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
+##reference=hg38
+##source=varscan.py
+##contig=<ID=chr1,length=248956422>
+##contig=<ID=chr10,length=133797422>
+##contig=<ID=chr11,length=135086622>
+##contig=<ID=chr12,length=133275309>
+##contig=<ID=chr13,length=114364328>
+##contig=<ID=chr14,length=107043718>
+##contig=<ID=chr15,length=101991189>
+##contig=<ID=chr16,length=90338345>
+##contig=<ID=chr17,length=83257441>
+##contig=<ID=chr18,length=80373285>
+##contig=<ID=chr19,length=58617616>
+##contig=<ID=chr2,length=242193529>
+##contig=<ID=chr20,length=64444167>
+##contig=<ID=chr21,length=46709983>
+##contig=<ID=chr22,length=50818468>
+##contig=<ID=chr3,length=198295559>
+##contig=<ID=chr4,length=190214555>
+##contig=<ID=chr5,length=181538259>
+##contig=<ID=chr6,length=170805979>
+##contig=<ID=chr7,length=159345973>
+##contig=<ID=chr8,length=145138636>
+##contig=<ID=chr9,length=138394717>
+##contig=<ID=chrM,length=16569>
+##contig=<ID=chrX,length=156040895>
+##contig=<ID=chrY,length=57227415>
+##filter="SOMATIC"
+##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL">
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases">
+##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation">
+##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)">
+##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value">
+##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls">
+##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls">
+##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand">
+##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position">
+##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads">
+##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05">
+##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90">
+##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
+##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
+##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100">
+##FILTER=<ID=VarMapQual,Description="Average mapping quality of variant reads < 15">
+##FILTER=<ID=VarBaseQual,Description="Average base quality of variant reads < 15">
+##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01">
+##FILTER=<ID=RefAvgRL,Description="Average clipped length of ref-supporting reads < 90">
+##FILTER=<ID=RefReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
+##FILTER=<ID=RefDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
+##FILTER=<ID=RefMapQual,Description="Average mapping quality of reference reads < 15">
+##FILTER=<ID=RefBaseQual,Description="Average base quality of ref-supporting reads < 15">
+##FILTER=<ID=RefMMQS,Description="Average mismatch quality sum for ref-supporting reads > 100">
+##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50">
+##FILTER=<ID=MinMMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) < 50">
+##FILTER=<ID=MapQualDiff,Description="Mapping quality difference (ref - var) > 50">
+##FILTER=<ID=MaxBAQdiff,Description="Average base quality difference (ref - var) > 50">
+##FILTER=<ID=ReadLenDiff,Description="Average supporting read length difference (ref - var) > 0.25">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype code">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
+##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele">
+##FORMAT=<ID=ADF,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the forward strand">
+##FORMAT=<ID=ADR,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the reverse strand">
+#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	TUMOR
+chr1	167967	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr1	271578	.	A	AT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.012429;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,5:7,2:10,3
+chr1	636494	.	A	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.031633;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:24,9:23,4
+chr1	996625	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.083867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:19,2:3,3
+chr1	1644921	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.045371;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:16,5:13,5
+chr1	1864314	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:6,6:2,1
+chr1	1976870	.	C	CAG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00016042;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,16:2,6:7,10
+chr1	2142262	.	A	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
+chr1	2913844	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.1392e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:14,6:12,8
+chr1	3181193	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.024399;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:5,5:13,2
+chr1	4251782	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:9,3:5,1
+chr1	5606389	.	A	AATATATATATATAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,7:2,6:1,1
+chr1	5732600	.	A	AG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0043505;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,3:3,4
+chr1	7051663	.	C	CTGCCAGGACAGACTCATCCCTGTT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031156;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,1:9,3
+chr1	8167511	.	GCACA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:4,3:3,2
+chr1	8233826	.	A	ATATATTTT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:1,1:2,1
+chr1	8501213	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:3,2:14,2
+chr1	8647643	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.048962;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,5:8,4:3,1
+chr1	9647481	.	A	AATTATTATT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0046297;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:3,5:8,5
+chr1	9916882	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.059432;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,1:7,3
+chr1	10583224	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022127;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,1:7,3
+chr1	10616234	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.9275e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:7,10:12,8
+chr1	11045998	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00030325;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:10,6:18,7
+chr1	11771345	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.4859e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:13,9:5,6
+chr1	12381912	.	C	CTTTCT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.022593;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:1,4:15,4
+chr1	12871201	.	C	CT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.018007;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,3:9,7
+chr1	12881560	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.013032;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,3:11,3
+chr1	12947985	.	CTACAAAAA	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0010116;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:9,3:15,7
+chr1	13040570	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,3:7,1
+chr1	13168970	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.020006;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,1:1,3
+chr1	13198698	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.024875;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:11,4:4,6
+chr1	13199161	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.03148;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,6:7,3
+chr1	13217209	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:2,1:5,1
+chr1	13341194	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0036109;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:21,6:14,1
+chr1	13926652	.	T	TA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00036335;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,3:4,4
+chr1	14528362	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.057503;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,8:6,3:13,5
+chr1	15194917	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0074752;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,11:5,8:1,3
+chr1	15293726	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.024383;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,3:10,4
+chr1	16311503	.	A	AATAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.083772;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:9,3:6,4
+chr1	16631115	.	G	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.0019297;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:81,24:42,14:39,10
+chr1	16656105	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:11,6:2,1
+chr1	16690451	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0079357;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,12:8,3:17,9
+chr1	16732665	.	A	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.011554;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:60,10:37,8:23,2
+chr1	16733940	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
+chr1	16746403	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.018572;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:8,5:12,7
+chr1	16755063	.	G	A	0	PASS	DP=227;GPV=1;SPV=6.2457e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:98,13:53,5:45,8
+chr1	16849895	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.019869;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:17,8:17,6
+chr1	16860384	.	C	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0059855;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:19,3:20,9
+chr1	16896326	.	A	C	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.0087261;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:16,3:24,4
+chr1	17296935	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0067299;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,4:10,3
+chr1	17822187	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0017389;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:8,2:13,4
+chr1	18611271	.	GAGGA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:6,3:0,1
+chr1	21699192	.	AT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr1	21977914	.	GC	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0028915;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:5,2:7,9
+chr1	24266066	.	T	TTGGA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:7,4:5,4
+chr1	24407443	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0010171;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,10:6,8:6,2
+chr1	26214945	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.21465;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,5:5,3:6,2
+chr1	27824672	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,4:5,1
+chr1	28923111	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,3:3,1:2,2
+chr1	33493334	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=4.8916e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:8,4:9,9
+chr1	33510173	.	A	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chr1	33890232	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0081527;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:9,8:6,4
+chr1	34128594	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.001651;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:12,4:15,6
+chr1	34959242	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,3:5,1
+chr1	35207403	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0014564;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:6,8:2,2
+chr1	36806360	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.6735e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:9,6:11,10
+chr1	37427639	.	G	GAAGAAAGAAAGAAAGA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,4:2,4:0,0
+chr1	38514430	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:5,3:3,2
+chr1	39021177	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,3:0,0:5,3
+chr1	39021181	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,2:0,0:5,2
+chr1	39045665	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:3,1:7,6
+chr1	41260924	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06057;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,1:10,4
+chr1	42131047	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.035721;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:3,3:3,1
+chr1	43813905	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:1,2:0,0:1,2
+chr1	43882975	.	A	AT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.023174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:9,5:11,2
+chr1	44006586	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:12,3:4,1
+chr1	45539020	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064803;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,6:10,3:16,3
+chr1	46212281	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0093079;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,6:13,4:9,2
+chr1	46242260	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:11,7:1,0
+chr1	46700982	.	A	AGT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,3:6,3
+chr1	48192907	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010572;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,2:2,4
+chr1	51933945	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=8.4086e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:9,8:9,6
+chr1	52783985	.	C	CGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:12,6:8,3
+chr1	54985221	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:4,4:4,4:0,0
+chr1	55030784	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.079204;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:12,4:15,2
+chr1	55941187	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018827;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,3:11,4
+chr1	56227866	.	T	TACAC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017469;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,4:4,4
+chr1	57139968	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00037187;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:11,5:9,6
+chr1	59805102	.	A	ATG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0041795;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:12,9:4,2
+chr1	59860777	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022366;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,4:8,5
+chr1	60301295	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,3:2,2
+chr1	63283765	.	A	AAG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:5,3:5,3
+chr1	63817884	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.4829e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:8,7:12,6
+chr1	64268120	.	A	AAAAAAAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.012328;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:4,2:8,3
+chr1	64398280	.	AAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,4:2,2
+chr1	65038938	.	T	TTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.046888;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,4:8,3
+chr1	65518871	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,1:10,3
+chr1	65731219	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0045987;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:9,5:11,1
+chr1	65736482	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00020766;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:14,2:8,7
+chr1	68406582	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.040021;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,5:7,2:10,3
+chr1	71928161	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,8:3,5:2,3
+chr1	74111090	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0044219;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:7,3:8,3
+chr1	74448376	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0047587;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:11,4:3,2
+chr1	77533509	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:6,5:1,2
+chr1	77765735	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,3:2,3
+chr1	77793626	.	AT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.2759;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:13,2:13,1
+chr1	78005365	.	CT	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.028465;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:15,4:10,1
+chr1	79202929	.	AC	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.026676;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:5,1:9,4
+chr1	80497577	.	TA	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.8738e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:10,11:18,5
+chr1	81825657	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0096686;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:3,1:1,4
+chr1	82627810	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,2:1,1:3,1
+chr1	83241791	.	C	CATAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,3:3,1
+chr1	83248504	.	A	AT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0060587;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:18,12:11,2
+chr1	83390671	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.011442;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:12,6:21,1
+chr1	83716701	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.4826e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:12,9:10,9
+chr1	84418338	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,1:9,3
+chr1	86985509	.	CAT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016414;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:3,4:9,1
+chr1	88567358	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,7:5,6:2,1
+chr1	91040277	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:4,6:2,4
+chr1	95681557	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.7162e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:6,6:7,6
+chr1	96650554	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031354;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:6,1:9,8
+chr1	98112422	.	TAA	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:2,4:0,0
+chr1	99227734	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00036745;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:15,5:12,12
+chr1	99822926	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.017056;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,7:5,1:5,6
+chr1	100283934	.	AG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,3:5,2
+chr1	100394111	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14851;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,3:14,1
+chr1	101306166	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,8:4,1
+chr1	101529118	.	G	GAC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00010085;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:11,5:8,7
+chr1	102577728	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=7.6466e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:7,10:8,4
+chr1	102810163	.	C	CAA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
+chr1	103792409	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0010691;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:7,8:11,5
+chr1	104883863	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00044723;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:16,5:7,8
+chr1	105455897	.	AT	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=6.0123e-06;SS=2;SSC=52;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,8:6,3
+chr1	106599829	.	C	CTCTCTCTCTA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:3,1:3,3
+chr1	108164778	.	T	TTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.026993;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,4:7,5
+chr1	110808911	.	T	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0089783;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:1,5:2,1
+chr1	111632921	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11976;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,5:14,3:2,2
+chr1	112383177	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,8:6,7:3,1
+chr1	112918065	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00086701;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:7,5:10,10
+chr1	114716126	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00056474;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:6,5:16,6
+chr1	115766865	.	TGATA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0020828;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,10:3,6:6,4
+chr1	118287981	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:10,5:6,4:4,1
+chr1	118682202	.	ATG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,8:2,6:5,2
+chr1	121753005	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036872;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:6,3:21,2
+chr1	121773480	.	TC	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.038637;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:9,2:18,2
+chr1	122138561	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.013215;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,7:4,2
+chr1	122258262	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr1	124704670	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,4:8,1
+chr1	124798780	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.065489;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,4:0,0
+chr1	124872883	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.010192;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:1,1:26,4
+chr1	124906269	.	A	T	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.0092839;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:76,21:41,6:35,15
+chr1	124921389	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.14706;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,3:2,1:5,2
+chr1	124924096	.	G	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:8,3:6,2:2,1
+chr1	125094391	.	T	C	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.016143;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:83,17:45,7:38,10
+chr1	143217456	.	T	A	0	PASS	DP=14662;GPV=1;SPV=0.048859;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7342:6526,739:1761,246:4765,493
+chr1	143217457	.	C	A	0	PASS	DP=13749;GPV=1;SPV=0.0086744;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:6854:6080,740:1673,258:4407,482
+chr1	143241404	.	A	G	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.0089788;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:62,19:58,18:4,1
+chr1	143256117	.	A	T	0	PASS	DP=1640;GPV=1;SPV=0.03986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:847:755,92:200,20:555,72
+chr1	143334185	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr1	143388651	.	ATAT	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.0036516;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:28,9:10,5
+chr1	143509985	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0045966;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:4,1:26,7
+chr1	143729574	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,4:3,3
+chr1	143739631	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017469;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,1:4,7
+chr1	144104657	.	C	T	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.037546;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:74,13:34,5:40,8
+chr1	144105904	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.03525;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:14,8:15,1
+chr1	144517710	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:7,1:6,8
+chr1	144529624	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018956;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,6:7,1
+chr1	144549585	.	TA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
+chr1	145227356	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:1,2:0,0
+chr1	145257749	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,1:13,3
+chr1	145602319	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,12:3,4:5,8
+chr1	146129855	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=2.3666e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,2:4,7
+chr1	146626712	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.029248;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:20,3:11,6
+chr1	148067460	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0018071;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,5:3,3
+chr1	148106039	.	GA	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.093588;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,3:12,1
+chr1	148556832	.	C	CCCTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
+chr1	148869643	.	C	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,1:4,3
+chr1	148893065	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,6:0,5:0,1
+chr1	148906381	.	G	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.020124;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:1,2:6,5
+chr1	149801515	.	GAAGT	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023812;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,4:9,3
+chr1	150088434	.	A	AATATATAT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,5:4,2
+chr1	150241670	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034961;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:8,5:10,6
+chr1	150312297	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.020244;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:13,5:7,2
+chr1	150741885	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.19203;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,4:15,1:8,3
+chr1	153202842	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021442;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:8,5:12,1
+chr1	153877887	.	TA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.024795;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,2:2,2
+chr1	154304368	.	GT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014142;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:4,5:1,1
+chr1	157035978	.	AAT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,4:5,1
+chr1	158444953	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,5:7,2
+chr1	158984028	.	G	GT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0036613;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,10:3,7:4,3
+chr1	159126648	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,8:3,7:7,1
+chr1	160335883	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:1,4:2,2
+chr1	160948627	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010552;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,6:4,2
+chr1	161142085	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,3:2,2
+chr1	161543514	.	T	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.044015;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:16,6:30,3
+chr1	161594229	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
+chr1	161746600	.	C	CTCTCTCTCTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.015516;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:5,1:9,4
+chr1	162467966	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057228;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:5,4:1,1
+chr1	162693713	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00024212;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:5,5:8,4
+chr1	163328474	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00037903;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,6:11,7
+chr1	165020483	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.015907;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,3:4,4
+chr1	166896635	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.005305;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
+chr1	167558484	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0028678;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:6,7:3,4
+chr1	168009472	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,1:13,3
+chr1	168440410	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,4:5,4
+chr1	170282189	.	T	TA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018904;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,6:10,2
+chr1	170933516	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,2:2,2
+chr1	171045482	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00039944;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,16:3,6:8,10
+chr1	171681188	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020212;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,1:3,3
+chr1	171694664	.	G	GAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,4:13,2:6,2
+chr1	171906127	.	AT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00011732;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,6:3,3
+chr1	172872876	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr1	174136273	.	T	TTA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027859;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,6:9,3:6,3
+chr1	174607239	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0022162;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:16,5:9,4
+chr1	174946916	.	AAAT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,2:4,3
+chr1	175417011	.	AAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,1:9,5
+chr1	176042270	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,9:7,6:5,3
+chr1	176406395	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0010863;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:6,3:13,6
+chr1	178695925	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.030658;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,2:10,2
+chr1	182650202	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.9131e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,3:11,8
+chr1	183166550	.	C	CAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:10,4:2,1
+chr1	185077375	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.005596;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:4,1:14,6
+chr1	185454785	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00025863;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:9,7:15,7
+chr1	185655759	.	ATG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:19,2:14,2
+chr1	186628414	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.9826e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:17,7:9,13
+chr1	187637839	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.014488;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:10,3:10,3
+chr1	187827169	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.026923;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:1,11:1,2:0,9
+chr1	188473743	.	A	AG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,13:5,2:2,11
+chr1	188805737	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.5288e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:7,11:10,3
+chr1	188848105	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,2:6,3
+chr1	191806127	.	ATTTG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,2:1,1:2,1
+chr1	192627568	.	TAA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,8:2,5:2,3
+chr1	194088881	.	T	TTATCTATCTATC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.008542;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,6:9,3
+chr1	194698706	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00026263;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,6:9,2
+chr1	195004485	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00017262;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,5:11,5
+chr1	196806094	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0057417;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,6:5,1
+chr1	196904226	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00011139;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:10,4:12,8
+chr1	197365625	.	TC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,2:14,2
+chr1	199367532	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0028686;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:4,6:1,4
+chr1	200443192	.	A	ATT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00057632;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,11:5,5:1,6
+chr1	200942179	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.016908;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,5:2,1
+chr1	202847186	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,2:8,2
+chr1	202928823	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,6:7,5:5,1
+chr1	203330817	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024751;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,4:9,3
+chr1	204195269	.	CACAT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,4:6,2
+chr1	204195292	.	A	ACATATACG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018404;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:3,3:8,2
+chr1	205884539	.	CAT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,1:5,3
+chr1	207213830	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,3:0,1:1,2
+chr1	207729251	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,7:5,6:4,1
+chr1	208845734	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016895;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,1:13,4
+chr1	210798040	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048497;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
+chr1	212210694	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,1:3,3
+chr1	212224368	.	C	CAG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.048094;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:9,2:18,3
+chr1	213812952	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0056882;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:5,3:15,3
+chr1	214398606	.	CCTG	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,2:8,3
+chr1	216165808	.	G	GT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0041486;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:10,9:0,2
+chr1	218395611	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:2,2:3,4
+chr1	218482328	.	A	AT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:3,2:4,5
+chr1	218788920	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00076774;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:12,2:7,7
+chr1	222192151	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00057068;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:14,5:5,6
+chr1	222488201	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0043971;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:13,4:4,2
+chr1	222936762	.	TAA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:2,4:3,2
+chr1	224260699	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
+chr1	224711794	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:6,3:3,1
+chr1	226114622	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0053554;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,3:3,5
+chr1	226252318	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,1:14,3
+chr1	226732102	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:3,8:3,2
+chr1	226795555	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:0,3:1,1
+chr1	226886041	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0069488;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:4,5:12,1
+chr1	227726185	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013278;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:6,8:4,2
+chr1	228903868	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.6453e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:11,8:3,11
+chr1	232424065	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0058348;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:14,4:7,3
+chr1	232496560	.	C	CAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021659;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:8,8:8,2
+chr1	232849287	.	CTT	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,1:2,3
+chr1	234623890	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,2:4,2:0,0
+chr1	234786202	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.059099;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,2:10,2
+chr1	236464427	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,3:4,2
+chr1	238605947	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,4:5,1
+chr1	238739107	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0014624;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:12,6:7,5
+chr1	240729885	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:8,2:1,5
+chr1	241235918	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,3:2,3
+chr1	241327129	.	A	AG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr1	241428779	.	C	CTT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:2,1:3,1
+chr1	242091832	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,1:3,4
+chr1	242207816	.	T	TTA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,6:0,2:1,4
+chr1	242831901	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23569;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,5:10,3:5,2
+chr1	245443291	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,6:5,2
+chr1	245612107	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,2:10,2
+chr1	246232920	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.23453;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
+chr1	247428109	.	C	CTG	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0093304;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:21,5:11,7
+chr1	248658775	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.023086;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,1:14,3
+chr1	248942173	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.02714;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:21,7:4,1
+chr10	201585	.	T	TACACACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:5,4:0,3
+chr10	347891	.	G	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.012987;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,5:0,2:1,3
+chr10	348012	.	C	CCCCACACTCA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:23,2:3,2
+chr10	467539	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:33:0,2:0,1:0,1
+chr10	2430663	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,3:0,1
+chr10	2571322	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,3:2,2:3,1
+chr10	2967703	.	C	CGT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,7:6,5:3,2
+chr10	3323486	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:5,4:1,1
+chr10	5370005	.	G	GTA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.27607;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,4:4,1:12,3
+chr10	5398439	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,2:9,2
+chr10	5610441	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:2,2:0,0:2,2
+chr10	5692149	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,9:8,8:4,1
+chr10	5707654	.	T	TTC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01548;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:0,4:4,2
+chr10	5998631	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0022186;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,19:7,10:12,9
+chr10	6402371	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:8,5:0,1
+chr10	6517588	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:3,4:1,1
+chr10	6876594	.	T	TCTCA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.000999;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:0,10:0,6:0,4
+chr10	8216268	.	CTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.033794;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:1,2:7,3
+chr10	8696501	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,2:16,2
+chr10	10743101	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00016735;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,7:10,3
+chr10	10857649	.	G	GTA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,4:3,1
+chr10	12056441	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00071703;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:1,7:4,3
+chr10	12226655	.	GAT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.017674;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:5,2:5,3
+chr10	12574497	.	T	TTTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:4,3:9,1
+chr10	13789769	.	ATG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:6,3:3,1
+chr10	14417553	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.3691e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:13,7:6,6
+chr10	15600251	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.9244e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:8,8:10,10
+chr10	15728097	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=4.9403e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,2:7,8
+chr10	16324158	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
+chr10	16652392	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:11,4:1,1
+chr10	21770395	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,3:4,2
+chr10	24369179	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0088484;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:3,4:7,3
+chr10	24436757	.	CAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:5,3:1,1
+chr10	24456706	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.003276;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,5:3,2
+chr10	25983935	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0017823;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:8,3:15,5
+chr10	26721425	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.005667;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,2:4,6
+chr10	27572311	.	AT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0025759;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:6,5:6,3
+chr10	29329657	.	ATCTC	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,6:6,2:11,4
+chr10	29445342	.	GAGAGAA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr10	34724899	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0058421;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:19,4:14,8
+chr10	35196895	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.018501;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,1:4,5
+chr10	37327549	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=7.0959e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:16,10:9,5
+chr10	38621941	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.016232;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:17,2:14,4
+chr10	38745197	.	GATGAAATGAA	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028648;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:15,3:7,1
+chr10	38930473	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.018934;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:20,6:25,6
+chr10	38957246	.	C	T	0	PASS	DP=356;GPV=1;SPV=0.047562;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:176:158,18:95,3:63,15
+chr10	38966360	.	C	T	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.0056063;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:113,23:64,11:49,12
+chr10	38966727	.	T	C	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.033863;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:20,5:34,1
+chr10	39997897	.	G	T	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.0061832;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:123,16:52,4:71,12
+chr10	40000624	.	C	A	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.030441;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:103,20:55,16:48,4
+chr10	40608677	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:2,2:9,3
+chr10	40706691	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046847;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,3:7,3
+chr10	40864302	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr10	40920571	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.033517;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,6:11,1:18,5
+chr10	40975414	.	C	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.012197;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:23,2:13,5
+chr10	41135564	.	T	A	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.04186;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:64,12:57,11:7,1
+chr10	41150961	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.032688;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,4:10,3
+chr10	41202411	.	C	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0087417;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:9,1:27,6
+chr10	41232580	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:7,5:0,2
+chr10	41425591	.	A	T	0	PASS	DP=289;GPV=1;SPV=0.0047975;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:124,15:11,3:113,12
+chr10	41552857	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.023472;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,3:10,2
+chr10	41552862	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.044988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,2:11,2
+chr10	41562381	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0034912;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:7,10:12,2
+chr10	41562631	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.010634;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,2:8,7
+chr10	41564142	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:19,4:24,2
+chr10	41576755	.	C	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.032789;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:17,6:19,2
+chr10	41713561	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0042869;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:8,3:16,6
+chr10	41864307	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,5:6,3
+chr10	41912091	.	G	C	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.014084;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:66,17:29,11:37,6
+chr10	42073656	.	C	G	0	PASS	DP=654;GPV=1;SPV=0.012143;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:347:299,40:129,22:170,18
+chr10	42073671	.	T	A	0	PASS	DP=648;GPV=1;SPV=0.013281;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:334:287,47:131,26:156,21
+chr10	42080556	.	G	T	0	PASS	DP=821;GPV=1;SPV=0.04623;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:411:359,52:199,26:160,26
+chr10	42103837	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011867;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:15,5:9,3
+chr10	42130049	.	A	T	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.0077328;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:151,17:105,13:46,4
+chr10	42190895	.	GAT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.014047;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:3,3:3,1
+chr10	42227104	.	C	CTCA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.049555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,2:14,7
+chr10	42271021	.	C	G	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.0039034;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:58,16:26,7:32,9
+chr10	43330621	.	TA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,4:5,2
+chr10	43729991	.	AAG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.24625;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,4:12,2:7,2
+chr10	44338700	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=2.3557e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,16:5,6:5,10
+chr10	45507811	.	G	GA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03378;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:5,5:4,1
+chr10	45695659	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037203;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,2:4,2
+chr10	45775775	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0090384;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,3:6,7
+chr10	46391919	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.053635;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:20,3:11,2
+chr10	46411570	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.033847;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:12,6:19,4
+chr10	46455528	.	C	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,2:9,2
+chr10	46541273	.	GT	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.02442;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:8,1:26,8
+chr10	46541275	.	C	CAG	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:8,1:28,8
+chr10	47584258	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,3:11,1
+chr10	47606142	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017732;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:11,3:12,6
+chr10	47995404	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.016464;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:13,3:7,3
+chr10	48806215	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=4.3619e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:7,8:10,11
+chr10	51621007	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,6:1,2:1,4
+chr10	52866670	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:3,4:4,1
+chr10	53604670	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
+chr10	54105277	.	GATATAT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:3,3:3,6
+chr10	54146887	.	TGTGTATAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:9,1:8,2
+chr10	54221600	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.029984;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,5:3,1
+chr10	54503225	.	A	ATATGTG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.018374;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,10:13,7:6,3
+chr10	54873697	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030897;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,2:8,2
+chr10	55253253	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.074732;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:9,4:16,1
+chr10	55781207	.	GA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:5,3:3,2
+chr10	56390120	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,2:1,1:1,1
+chr10	56546403	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0011625;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,3:14,6
+chr10	57379700	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0004914;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:12,6:5,3
+chr10	57813753	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=6.8987e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:10,7:10,6
+chr10	58038377	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.017938;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:15,2:13,4
+chr10	58136758	.	G	GTA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.012821;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,5:1,2:2,3
+chr10	59162436	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.004102;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:14,3:12,5
+chr10	60822450	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.5971e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,3:11,10
+chr10	63556634	.	GTT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,4:1,2:0,2
+chr10	63652988	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,2:8,2
+chr10	63733760	.	TAGATCTATATCTAC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=3.7518e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,19:3,7:4,12
+chr10	64509039	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:1,2:5,1
+chr10	67057674	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.030658;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,2:9,2
+chr10	70248478	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:1,1:4,1
+chr10	71642393	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:4,1:5,3
+chr10	74302101	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,3:1,1:4,2
+chr10	75884245	.	T	TTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:1,2:5,4
+chr10	76535243	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0028662;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,5:10,3
+chr10	77324971	.	C	CTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,6:0,2:3,4
+chr10	78266694	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,10:2,9:5,1
+chr10	79787227	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016895;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:12,4:12,1
+chr10	80061163	.	C	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,2:4,1:3,1
+chr10	80158813	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00057068;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:9,7:10,4
+chr10	80990997	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,5:4,2:9,3
+chr10	82170653	.	G	GGT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,5:1,1
+chr10	84174493	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01205;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,4:3,3
+chr10	84319447	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,4:4,2:4,2
+chr10	84394385	.	A	ATGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,5:4,4:2,1
+chr10	88478570	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=3.9238e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,9:5,2
+chr10	90037498	.	G	GA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.013387;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:6,3:2,4
+chr10	90102009	.	C	CAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016238;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:11,6:3,1
+chr10	90604983	.	GAGAT	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:13,5:9,5
+chr10	91153473	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00034236;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,3:10,7
+chr10	91664097	.	G	GGGAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:12,3:11,2
+chr10	92675142	.	AC	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01921;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,3:4,4
+chr10	92983490	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:1,7:4,4
+chr10	93982563	.	C	CCTCT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.01018;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:7,5:11,6
+chr10	97282839	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0070941;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,8:4,2
+chr10	97819830	.	G	GT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:0,5:0,4:0,1
+chr10	100676628	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.043486;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,5:11,3:9,2
+chr10	102520212	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:9,3:6,2
+chr10	102894439	.	TAA	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.16089;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,4:10,1:10,3
+chr10	103639625	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,4:4,1:8,3
+chr10	104620423	.	T	TTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.066203;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,7:8,5:3,2
+chr10	104696666	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.20979;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,4:4,3:2,1
+chr10	105411722	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00018161;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,5:9,5
+chr10	106291175	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=7.0793e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:11,3:4,7
+chr10	106779547	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,6:8,2:4,4
+chr10	107171514	.	C	CTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,7:1,5:3,2
+chr10	108936941	.	CTG	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,2:12,2
+chr10	109850929	.	CAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,10:4,9:4,1
+chr10	112251080	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=7.2935e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:9,5:14,11
+chr10	113118664	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,3:1,2:5,1
+chr10	113658881	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:3,1:4,3
+chr10	116267948	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.10989;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:2,1:1,1
+chr10	116628774	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:5,1:1,1
+chr10	117146974	.	ATT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:3,5:6,1
+chr10	118438311	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,4:4,3:4,1
+chr10	118944739	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.046332;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,2:8,2
+chr10	119001107	.	ATG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.023193;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,5:6,3
+chr10	119567417	.	AT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
+chr10	119666547	.	T	TGTGCTCAGCGAGATGCATGAG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046549;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:9,3:6,3
+chr10	121167304	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=9.9495e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,5:6,3
+chr10	121955444	.	AT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,7:2,3:0,4
+chr10	123078525	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:5,3:2,1
+chr10	124580721	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,4:0,0:4,4
+chr10	124587024	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,2:3,3
+chr10	124949522	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:4,1:0,1
+chr10	125486448	.	T	TAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.003311;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:3,5:8,4
+chr10	126558020	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00161;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:10,3:12,4
+chr10	126651080	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=5.0681e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:8,6:7,6
+chr10	129343960	.	A	ATT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:10,5:0,3
+chr10	130705325	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.57e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,4:10,9
+chr10	133645068	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0040096;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,9:14,7:23,2
+chr10	133657809	.	A	G	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.029166;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:124,15:66,8:58,7
+chr11	179314	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.014318;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:17,2:10,10
+chr11	350146	.	A	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,4:2,1
+chr11	350151	.	C	CACA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr11	2178862	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00056474;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:14,6:8,5
+chr11	3257577	.	G	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,6:6,1
+chr11	4160122	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,4:9,3:6,1
+chr11	4228378	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.038913;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:12,1:17,5
+chr11	4276958	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,1:4,5
+chr11	4335202	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,4:8,1
+chr11	6385445	.	A	AAAGGAAGG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:3,2:5,2
+chr11	7282591	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00088456;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,5:11,6
+chr11	7407360	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:10,2:5,2
+chr11	7889212	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0030692;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:14,4:10,5
+chr11	8862322	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0032575;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:4,12:3,9:1,3
+chr11	9671357	.	TAAATA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0041408;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:2,1:6,7
+chr11	10901712	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:1,1:1,1
+chr11	14781161	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0028662;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,6:9,2
+chr11	15298915	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,3:0,0:5,3
+chr11	15298919	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,3:0,0:6,3
+chr11	15502822	.	G	GCA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,4:8,3:4,1
+chr11	16149796	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=6.7064e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:5,8:11,7
+chr11	17756520	.	AACACACAC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,9:3,5:1,4
+chr11	18377215	.	G	GTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,6:6,5:2,1
+chr11	19234145	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013278;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,12:9,10:1,2
+chr11	20289136	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,4:7,2:12,2
+chr11	20549262	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,2:10,2
+chr11	21251540	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0041203;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:15,5:7,3
+chr11	21697973	.	A	AATT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
+chr11	21697974	.	T	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,6:1,5:3,1
+chr11	22659898	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,2:1,2:0,0
+chr11	24926388	.	TAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:5,1:13,3
+chr11	25300473	.	C	CTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,8:3,7:2,1
+chr11	25475491	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=6.2951e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:4,4:8,6
+chr11	26447206	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,5:7,4:1,1
+chr11	26726156	.	TCTTCCTTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,8:4,3:2,5
+chr11	28433172	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,4:8,2:7,2
+chr11	29820724	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=6.6326e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,5:4,4
+chr11	30235108	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=9.1194e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:3,5:14,9
+chr11	30790121	.	GA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:14,2:3,2
+chr11	31148210	.	T	TAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:7,3:7,1
+chr11	31163795	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=7.0087e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:4,7:6,5
+chr11	32503846	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:2,1:3,1
+chr11	34424259	.	C	CAA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:3,3:1,1
+chr11	37194539	.	CTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:3,4:5,2
+chr11	37216846	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=9.263e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,3:8,9
+chr11	40578140	.	GGTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022967;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,4:1,3
+chr11	40834919	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:9,3:14,1
+chr11	40851076	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.316e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:6,5:9,7
+chr11	41083294	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00014258;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:11,7:4,6
+chr11	41304529	.	T	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chr11	41938396	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047696;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:9,3:6,3
+chr11	42125346	.	AC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:1,7:0,1:1,6
+chr11	43810371	.	AT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.012987;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:0,5:0,2:0,3
+chr11	45923985	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.004257;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:4,5:0,2
+chr11	45989490	.	T	TAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,9:3,6:4,3
+chr11	46816787	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,3:3,2:2,1
+chr11	49035339	.	ATTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,1:4,3
+chr11	49212688	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=9.3552e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,6:7,4
+chr11	49857032	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00029985;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:7,5:7,5
+chr11	51289722	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:6,2:22,2
+chr11	51622370	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020274;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:1,2:16,7
+chr11	51850532	.	C	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr11	52142061	.	A	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
+chr11	52304615	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.064197;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:2,0:31,4
+chr11	52482834	.	A	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.024396;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:74,10:30,3:44,7
+chr11	52556895	.	T	C	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.016892;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:53,14:9,7:44,7
+chr11	53372519	.	T	G	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.025298;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:172:150,22:81,3:69,19
+chr11	53604369	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0085098;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:14,5:20,2
+chr11	53628092	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.031193;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:14,10:20,2
+chr11	53698751	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.032518;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,0:16,4
+chr11	54372015	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036365;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:8,2:13,6
+chr11	54384523	.	C	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:14,3:5,1
+chr11	54533839	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024656;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,1:8,3
+chr11	55775691	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034379;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:10,4:8,2
+chr11	56166092	.	GA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0055032;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,5:5,2
+chr11	60451481	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.039341;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,3:2,1
+chr11	62899037	.	C	CAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:7,3:3,1
+chr11	64236716	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:2,3:4,2
+chr11	64733395	.	AACAC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:4,5:2,1
+chr11	66213902	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.4422e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:12,9:15,7
+chr11	68426423	.	C	CTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:13,3:4,1
+chr11	68954772	.	A	AAAG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:1,1:4,3
+chr11	69026145	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0012058;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:6,7:2,2
+chr11	70157979	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:9,4:3,1
+chr11	71133346	.	A	ATGGCTGGCTGGC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,2:3,2
+chr11	71658720	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:15,2:8,3
+chr11	74636665	.	C	CT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00052897;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:10,8:9,4
+chr11	74656744	.	G	GT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0033983;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,9:8,7:1,2
+chr11	76236832	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0034541;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,7:9,4
+chr11	76494720	.	TTCC	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.12281;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:1,1:4,1
+chr11	83008989	.	G	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0069488;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,3:9,3
+chr11	83467810	.	T	TACAC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:3,1:1,3
+chr11	83848124	.	CTT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:11,2:6,5
+chr11	86602116	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11792;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:24,3:12,1:12,2
+chr11	87419191	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00039192;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,17:8,11:6,6
+chr11	88052933	.	T	TG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,2:2,1:1,1
+chr11	88570571	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,4:4,2:2,2
+chr11	89749670	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011696;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:12,7:12,4
+chr11	89772506	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.019233;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:16,1:14,8
+chr11	89883593	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0143;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:2,3:15,3
+chr11	89960943	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024176;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr11	90971910	.	G	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,1:3,3
+chr11	92315479	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,3:0,1
+chr11	92950475	.	TCTCCCTCCCTCCCTTCCTTCCTTCCTTCTTTC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.23636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:11,3:1,0:10,3
+chr11	93243149	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:13,4:7,4
+chr11	93420517	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0051564;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:3,2:11,4
+chr11	94810793	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0010673;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,4:5,4
+chr11	95403130	.	AT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:2,4:2,1
+chr11	95654621	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,2:15,2
+chr11	98275560	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01707;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,1:7,4
+chr11	98977220	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.026047;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,2:2,4
+chr11	99080980	.	GT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,4:7,1
+chr11	99151211	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.061499;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:10,4:17,2
+chr11	99724327	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0035931;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,3:10,4
+chr11	100194603	.	GA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00078184;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:10,10:6,2
+chr11	101263877	.	GTATA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.012394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:15,3:2,3
+chr11	101263883	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.034629;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:13,2:2,2
+chr11	104194686	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:3,4:2,4
+chr11	105161856	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0089783;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,1:1,5
+chr11	107523052	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:5,2:1,1:4,1
+chr11	107572651	.	A	AT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0060836;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:17,4:8,3
+chr11	109323949	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00034172;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,14:5,9:3,5
+chr11	109757896	.	TTCTCTCTCTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028205;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,1:4,3
+chr11	111005139	.	A	ATG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:5,5:3,1
+chr11	111177973	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,5:4,4:5,1
+chr11	111768842	.	C	CGTGTGT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:5,2:0,4
+chr11	112108914	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.027541;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:15,3:3,2
+chr11	114468134	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:1,2:0,1:1,1
+chr11	115169206	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:5,3:3,2
+chr11	116818336	.	TA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,2:9,2
+chr11	117514578	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032696;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,1:5,6
+chr11	118419127	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.4113e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,4:8,8
+chr11	118852964	.	A	AT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.019318;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,5:13,3:14,2
+chr11	119022957	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:2,3:4,1
+chr11	119763937	.	TTTTTC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,2:5,2
+chr11	123102279	.	G	GTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030289;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:4,4:3,1
+chr11	123565202	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:10,8:1,1
+chr11	126863356	.	A	AGTGTGTGTTTGAGTGCGT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:13,2:13,2
+chr11	127364704	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.026693;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,2:13,3
+chr11	127553387	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.048514;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:11,6:3,1
+chr11	129585183	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0051722;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:7,4:6,2
+chr11	129585356	.	G	GT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.041497;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,8:5,7:10,1
+chr11	129688629	.	CAAA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.052323;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:15,3:6,6
+chr11	130037592	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.024807;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,2:7,7
+chr11	130596877	.	C	CGGATGGAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02564;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:5,6:6,2
+chr11	131137267	.	C	CACACATACACACAT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.04269;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,8:12,4:5,4
+chr11	131265696	.	A	ATCT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,2:3,3
+chr11	131325631	.	C	CTG	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00011829;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,12:8,8:9,4
+chr11	131578609	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.9881e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:6,8:14,7
+chr11	132161395	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.010538;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,10:3,4:4,6
+chr11	133437271	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0011582;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:5,5:14,3
+chr11	135047060	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02835;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,8:6,1
+chr12	544240	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11667;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:17,1:3,2
+chr12	1122125	.	G	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.26316;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:8,2:5,1:3,1
+chr12	1522170	.	A	AAAAAAAATAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,6:7,1
+chr12	1522184	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,5:6,1
+chr12	3496214	.	A	ATATT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:8,6:1,1
+chr12	3919773	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,3:2,1
+chr12	4512508	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.030096;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:15,3:14,8
+chr12	6820855	.	TGAGA	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,5:1,1:0,4
+chr12	8215041	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.01931;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:14,2:16,6
+chr12	8455116	.	G	GATTTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:9,5:3,1
+chr12	9216233	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00072423;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:11,3:12,7
+chr12	9284109	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.034629;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,3:10,1
+chr12	10239540	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013043;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:1,1:7,5
+chr12	10526141	.	CACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,6:2,4:0,2
+chr12	11160485	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,5:5,1:3,4
+chr12	11524456	.	CTTAG	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=6.1809e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:7,8:11,4
+chr12	12909937	.	T	TAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:4,4:7,1
+chr12	13698823	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00076774;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:12,5:7,4
+chr12	13880506	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0054908;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,2:7,4
+chr12	15143335	.	T	TA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0084034;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,4:5,2:3,2
+chr12	15166540	.	GGTA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.10731;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,2:18,2
+chr12	15610657	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.025398;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:12,5:13,1
+chr12	16235270	.	ATG	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.053645;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,2:14,2
+chr12	17722701	.	GA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,4:3,2:9,2
+chr12	18255252	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,4:10,1:9,3
+chr12	18516261	.	G	GTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=3.7614e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:4,6:3,7
+chr12	18524479	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.7124e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:6,6:8,9
+chr12	19439669	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.08867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,2:3,1:4,1
+chr12	21181585	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=7.8463e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,5:8,5
+chr12	21419847	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,2:7,9
+chr12	23379875	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,5:2,4:0,1
+chr12	23726118	.	CGAGA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.30409;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:8,3:4,1
+chr12	23907746	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.069923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,8:7,5:9,3
+chr12	28183993	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00019854;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:11,5:2,4
+chr12	29299213	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:6,5:3,1
+chr12	30362495	.	ATATATATATGTATATATATATATATATATATG	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,2:0,2:0,0
+chr12	31048468	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.077856;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:9,2:21,2
+chr12	31108896	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.012102;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,6:7,1
+chr12	32676648	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00010246;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,3:4,4
+chr12	32742129	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0066191;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:8,5:12,8
+chr12	33459924	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02299;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:12,2:12,4
+chr12	33962526	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00051786;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:16,3:8,6
+chr12	34349437	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,3:2,1
+chr12	34796338	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0054096;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,6:2,1
+chr12	34907117	.	G	T	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.0066075;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:179:156,23:75,19:81,4
+chr12	34916097	.	T	C	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.031211;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:62,7:28,1:34,6
+chr12	35037606	.	A	C	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.033931;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:18,2:28,4
+chr12	35208597	.	C	G	0	PASS	DP=422;GPV=1;SPV=0.022837;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:201:169,32:74,16:95,16
+chr12	35302590	.	T	C	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.024674;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:75,17:33,7:42,10
+chr12	36508012	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chr12	36854572	.	G	C	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.027728;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:103,14:94,12:9,2
+chr12	36965324	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,1:7,1
+chr12	37433992	.	G	GTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:7,5:1,1
+chr12	37948223	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.18371;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:16,1:11,2
+chr12	46415122	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,4:2,2
+chr12	46716673	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:1,1:0,1
+chr12	48078370	.	CAT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr12	50172552	.	A	ATT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:11,3:2,1
+chr12	51199139	.	GATGGAACCAAGTGGTCAAGGCCCCGCAGAGGCTA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,1:13,3
+chr12	53788018	.	G	GTA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0070433;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:3,8:2,2
+chr12	54026966	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,5:9,4:9,1
+chr12	54412066	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.025527;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,2:13,3
+chr12	56691319	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,4:3,1
+chr12	56876294	.	C	CTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:1,3:2,2
+chr12	57658719	.	CAA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,4:1,3:0,1
+chr12	58023731	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:3,7:1,1
+chr12	58261437	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00013297;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:12,6:9,6
+chr12	61299907	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13128;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:16,2:11,3
+chr12	61518665	.	A	AAAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:7,6:2,3
+chr12	62059139	.	A	ATGTGTGTGTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.023489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:7,6:9,1
+chr12	64288489	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0070131;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:10,7:1,3
+chr12	64328700	.	AAAAAAAATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,5:2,2
+chr12	66000736	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,4:2,2:8,2
+chr12	66815848	.	CTT	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043132;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,3:14,1
+chr12	67634086	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,5:2,2:0,3
+chr12	68683283	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,9:5,7:1,2
+chr12	69200310	.	ATAAGAAAGAGATAAGAGATAAGAGG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.042832;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,3:9,4
+chr12	69491505	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:7,5:3,2
+chr12	70103509	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0016986;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,5:9,3
+chr12	72373657	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.1266e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:9,7:8,5
+chr12	73319208	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:5,3:9,2
+chr12	75435052	.	G	GTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,4:2,2
+chr12	76122077	.	TATATA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:8,1:2,3
+chr12	76122145	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:14,1:3,3
+chr12	76122149	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,1:2,3
+chr12	77090322	.	TTCCTTCCTTCCC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,0:9,4
+chr12	79486998	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,2:1,3
+chr12	79563504	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=3.9623e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:9,9:6,3
+chr12	79890901	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:3,1:3,2
+chr12	80355229	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,3:5,2:0,1
+chr12	80504030	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.004138;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:5,3:9,3
+chr12	81922880	.	A	AT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.034479;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
+chr12	83409601	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.18462;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,3:4,2:2,1
+chr12	84275060	.	T	TATATATAAAATATATTTTATATATATATA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:5,3:6,1
+chr12	85464656	.	TACAC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:8,1:0,4
+chr12	85488282	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.002853;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:11,5:13,7
+chr12	86376844	.	CAGAG	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,6:6,5:3,1
+chr12	86502767	.	ATG	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.45333;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:15,2:4,1:11,1
+chr12	88745578	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:9,5:1,1
+chr12	89677954	.	TTATA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:6,7:4,2
+chr12	89862508	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,4:6,2:8,2
+chr12	90181091	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:2,2:2,1
+chr12	91180314	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0432;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,2:8,2
+chr12	92079801	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,2:1,1:3,1
+chr12	92537344	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.02229;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:9,2:10,3
+chr12	92632819	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.2072e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:8,9:12,11
+chr12	92998044	.	G	GAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030474;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,7:6,2
+chr12	94014289	.	C	CT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:0,1:2,3
+chr12	95055952	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.023452;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,3:0,1
+chr12	95347547	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.19298;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,3:4,1:5,2
+chr12	95424716	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,4:5,5
+chr12	95641273	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.045693;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,2:11,3
+chr12	96561704	.	TACACACAC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0093665;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:8,4:4,3
+chr12	96591717	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00022263;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:9,4:14,7
+chr12	96868430	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0094148;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:6,8:5,2
+chr12	97614646	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,1:7,3
+chr12	98037742	.	G	GGGAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.008898;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,11:8,6:2,5
+chr12	99151541	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.001665;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,6:7,4
+chr12	99322275	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.011127;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,1:8,4
+chr12	99693781	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.060413;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,3:11,2
+chr12	102337565	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00056917;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:16,4:7,5
+chr12	105088569	.	A	AAACAACAACAAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.026636;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,12:5,6:1,6
+chr12	106200353	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036526;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
+chr12	107124459	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:14,4:0,0
+chr12	107987959	.	T	TACACACACACACAC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0085139;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,10:3,6:2,4
+chr12	110311733	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:0,3:0,1:0,2
+chr12	113061450	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00065454;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,4:11,4
+chr12	114219607	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,4:3,4
+chr12	114556107	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.048e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:11,5:14,9
+chr12	114617380	.	G	GTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:10,3:1,2
+chr12	114698158	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,6:6,1:9,5
+chr12	114783555	.	TA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00070128;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,3:4,4
+chr12	115353202	.	TC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=6.5361e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,8:10,5
+chr12	115441818	.	CTCTATA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:1,2:8,2
+chr12	115627826	.	TAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.009628;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:7,6:3,4
+chr12	116356029	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:2,4:4,1
+chr12	116800812	.	T	TTAAAATAAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,4:5,3:10,1
+chr12	117135743	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.022967;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,7:1,5:2,2
+chr12	117283855	.	C	CAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:16,3:2,1
+chr12	117632218	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:2,2:6,2
+chr12	117734745	.	C	CATGGATGGATGGATGGATGG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.026469;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,4:4,3
+chr12	117833965	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0054096;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,4:5,3
+chr12	118345748	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00077493;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:8,4:6,7
+chr12	118701939	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016233;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,9:9,6:3,3
+chr12	118938845	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.0928e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,17:6,8:7,9
+chr12	119731475	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:6,6:3,2
+chr12	120201481	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0016572;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:3,3:0,4
+chr12	121530227	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:9,5:2,1
+chr12	122124584	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0019379;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:5,8:3,2
+chr12	122458532	.	A	ATTTAAT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.030143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,5:7,3
+chr12	123273990	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00041286;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:10,8:9,5
+chr12	123733313	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0014958;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:9,10:4,2
+chr12	125696500	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00083898;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:12,9:6,3:6,6
+chr12	125708010	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.8667e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:12,11:11,6
+chr12	126612632	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:3,2:6,2
+chr12	127036284	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0001362;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:8,5:8,6
+chr12	127136130	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=8.543e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,9:8,7
+chr12	127592713	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=6.605e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:6,7:7,8
+chr12	128462101	.	GT	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.10033;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,1:18,3
+chr12	129297613	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0076814;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:8,3:13,4
+chr12	129588746	.	TTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,3:1,2:2,1
+chr12	130532162	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:2,3:6,7
+chr12	131278535	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0044741;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,4:5,1
+chr12	132054452	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00018612;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,7:10,6
+chr12	132380926	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016594;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:8,3:8,3
+chr12	132692796	.	G	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0074932;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,4:3,3
+chr12	132895660	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,2:4,4
+chr12	132965438	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr13	18178573	.	A	G	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=0.027138;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:140,19:67,12:73,7
+chr13	18194779	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.01173;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:10,4:12,4
+chr13	18336400	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.01598;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:12,2:8,6
+chr13	18747015	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.023954;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:9,4:16,1
+chr13	19779877	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.015217;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:16,5:7,2
+chr13	20851711	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:3,4:3,1
+chr13	21884018	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,1:11,3
+chr13	22402137	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,8:0,4:6,4
+chr13	24421478	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.035001;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:30,8:15,1
+chr13	25159298	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.044826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:6,3:12,1
+chr13	25159308	.	A	AAT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025437;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:7,4:9,2
+chr13	25310519	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:4,4:3,2
+chr13	25740308	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:6,9:2,2
+chr13	26723699	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0093762;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:2,3:9,5
+chr13	26805525	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00058707;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:4,6:6,5
+chr13	26897028	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.4106e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,11:7,7
+chr13	28646352	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0031516;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,8:6,4:4,4
+chr13	28737290	.	A	AAGT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,1:6,3
+chr13	29168888	.	C	CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:2,4:4,2
+chr13	29181857	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00033748;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:4,5:13,8
+chr13	31038665	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,2:16,2
+chr13	34362939	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,3:6,1
+chr13	34368386	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0016883;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,3:5,3
+chr13	34802492	.	T	TA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.014855;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:12,2:18,4
+chr13	34992238	.	G	GTATA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,6:3,4:1,2
+chr13	36142687	.	AC	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:3,3:5,3
+chr13	37335480	.	A	ATTTACCCCAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.043236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:5,4:5,2
+chr13	37844797	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00043265;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,6:10,4
+chr13	42841090	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,1:8,3
+chr13	43434943	.	T	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0089783;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:0,5:3,1
+chr13	43879836	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:6,3:7,1
+chr13	44066175	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.011037;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:2,4:3,2
+chr13	47559950	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
+chr13	47702279	.	A	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,6:5,5:1,1
+chr13	48636013	.	T	TACATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.015417;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:5,1:4,3
+chr13	48641363	.	C	CAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010106;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:5,6:6,2
+chr13	51479845	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.12281;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:3,1:2,1
+chr13	51963736	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027836;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:9,4:1,0
+chr13	52223586	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.013095;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:5,1:3,4
+chr13	52281163	.	TGTGTGTGTGC	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.045903;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:22,5:30,10
+chr13	52333747	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.039673;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,6:16,1
+chr13	52504583	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019548;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:3,5:7,2
+chr13	54672674	.	GGT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:2,3:3,1
+chr13	56018887	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.011027;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:15,5:14,4
+chr13	56024786	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00094048;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,6:10,3
+chr13	56089113	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.011057;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,3:10,2
+chr13	56277723	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.022727;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,3:5,2
+chr13	56368797	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0041064;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:15,5:10,3
+chr13	58582543	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.054928;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,4:13,1:8,3
+chr13	59443228	.	T	TAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:2,4:4,3
+chr13	60014969	.	T	TTTTTGTTTTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011765;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,12:3,5:8,7
+chr13	60321660	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0059289;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,4:2,1
+chr13	60662347	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,3:2,4
+chr13	60859020	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=7.8995e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:18,8:10,4
+chr13	61015496	.	C	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010905;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,7:12,5:4,2
+chr13	64416401	.	CATCTATCT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.026352;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,5:10,5
+chr13	65280394	.	A	AGTGTGTGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00066757;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,13:9,5:4,8
+chr13	65288043	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,2:9,2
+chr13	65513553	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.013595;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:4,8:1,3
+chr13	66114842	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,2:5,3
+chr13	66687365	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0028364;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,4:10,3
+chr13	66756542	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014137;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,6:5,3:10,3
+chr13	66820549	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00070506;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:4,5:13,4
+chr13	69784882	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,3:3,3
+chr13	70753162	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017168;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,3:2,1
+chr13	71864164	.	AGCGC	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,2:3,3
+chr13	77377562	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:14,2:5,3
+chr13	79219049	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,2:0,1:5,1
+chr13	81088696	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.2865e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:12,24:6,10:6,14
+chr13	81658352	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.25826;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,4:5,2:5,2
+chr13	82684636	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.060625;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:13,2:19,2
+chr13	86756239	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.2416;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,4:6,3:15,1
+chr13	87090543	.	C	CT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0092175;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:9,4:7,9
+chr13	87331654	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.001382;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:12,6:11,1
+chr13	87837249	.	T	TTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:3,4:10,1
+chr13	88347891	.	A	AG	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:5,2:0,0
+chr13	89527562	.	C	CTTTTCTTTTCT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0018592;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,8:5,6:5,2
+chr13	90344571	.	C	CATATAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.04308;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,4:3,1
+chr13	92064310	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.8865e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:16,10:6,7
+chr13	93459617	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=8.3669e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:10,9:9,5
+chr13	93495622	.	TTTCTG	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.02253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,3:4,2
+chr13	94214796	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00046384;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:8,8:11,2
+chr13	94455381	.	T	TAG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035323;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,3:8,5
+chr13	94738966	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=5.0918e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:6,4:10,7
+chr13	96074548	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018018;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,5:7,2
+chr13	97852827	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0063975;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,5:9,2
+chr13	98064640	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:5,4:5,1
+chr13	98078917	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=2.3919e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,14:4,6:5,8
+chr13	98705202	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,7:1,1:1,6
+chr13	101092811	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0001513;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:6,4:11,8
+chr13	101693624	.	G	GTCTGTCTA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:3,5:8,2
+chr13	102728046	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0065417;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,8:4,4:5,4
+chr13	104498343	.	ATATATTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0027765;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:1,4:5,4
+chr13	106245764	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,2:6,2
+chr13	106763047	.	ACCCTCTCTCTCTCT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,4:6,2:4,2
+chr13	107176318	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010674;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:5,3:3,1
+chr13	109147175	.	GA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,4:5,1
+chr13	109765530	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,1:8,3
+chr13	110960659	.	GT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:15,4:8,1
+chr13	111622955	.	C	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,3:1,2
+chr13	112640591	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.010101;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,4:0,1:1,3
+chr13	112787108	.	C	CG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.031421;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,5:7,1
+chr13	113512592	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.016558;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,3:9,3
+chr13	113593081	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.016935;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,3:4,1:2,2
+chr13	113804730	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019346;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,5:8,3
+chr14	16085235	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:4,4:1,4
+chr14	18276446	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chr14	18288630	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.044297;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:14,4:4,1
+chr14	18293945	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:10,5:15,8
+chr14	18426424	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.03636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:7,2:13,6
+chr14	18529582	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013155;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,3:2,3
+chr14	18700193	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.022061;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:12,6:9,2
+chr14	18939956	.	CCTGA	C	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.00027128;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:60,21:28,7:32,14
+chr14	18969317	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,7:8,6:3,1
+chr14	18969319	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.009659;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:12,6:16,1
+chr14	18974856	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.57e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:7,4:8,12
+chr14	18979682	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13043;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr14	19108286	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0086983;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:16,4:12,1
+chr14	19232448	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.077327;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,3:8,2
+chr14	19298439	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,4:2,3:1,1
+chr14	19301996	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:13,4:7,1
+chr14	19372235	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016655;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:7,3:9,2
+chr14	19390940	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.033806;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,3:2,4
+chr14	19475066	.	T	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
+chr14	19667110	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040303;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,1:7,4
+chr14	19817651	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.5681e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,20:4,9:4,11
+chr14	21222040	.	CAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:5,3:1,1
+chr14	21696025	.	GTT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.050152;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,2:10,2
+chr14	22034527	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,3:4,2
+chr14	22637442	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:2,1:5,1
+chr14	23962302	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.026928;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:12,4:3,1
+chr14	24719632	.	ATG	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0089783;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,1:1,5
+chr14	25523801	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr14	26813631	.	GT	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:4,2:0,0
+chr14	29466327	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037605;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:5,3:12,3
+chr14	29826544	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:4,2:7,2
+chr14	30445162	.	GA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00058755;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,7:7,2
+chr14	31052934	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,5:4,3
+chr14	31933233	.	ATT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.006192;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,3:1,2
+chr14	32475678	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:5,3:3,1
+chr14	34702539	.	AT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,2:5,2
+chr14	34840768	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,2:0,1:6,1
+chr14	35007749	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,2:13,2
+chr14	36122153	.	A	ATT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,9:2,5:4,4
+chr14	37200850	.	ATG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.001204;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,7:0,6:5,1
+chr14	39187659	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.025265;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,4:5,5
+chr14	39300937	.	TATATAC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019016;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,2:5,4
+chr14	39300953	.	CAT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.047286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:10,2:6,4
+chr14	39300963	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.046549;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,6:10,2:5,4
+chr14	42051617	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:4,4:5,2
+chr14	42624923	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=7.799e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:8,8:9,8
+chr14	43213467	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=3.148e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:9,11:13,7
+chr14	43528639	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.537e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:12,6:10,13
+chr14	45692176	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037585;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:11,6:6,9
+chr14	45887569	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0076872;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:5,3:10,3
+chr14	48767763	.	A	AT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.043843;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:10,7:12,3
+chr14	49960412	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:2,3:3,2
+chr14	50224327	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,3:6,1
+chr14	50236734	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,3:3,1:3,2
+chr14	50479008	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,2:3,1:1,1
+chr14	50811544	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:5,2:1,2
+chr14	56444101	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:2,4:8,3
+chr14	56922072	.	C	CAT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,5:6,1
+chr14	57323176	.	CAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,7:2,5:2,2
+chr14	60667650	.	A	AATAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:6,1:2,3
+chr14	63439356	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.030658;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,3:13,1
+chr14	63846582	.	T	TTTCTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:6,2:7,3
+chr14	64492119	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,2:1,1:5,1
+chr14	64583073	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0027027;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,5:8,2
+chr14	64949722	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:4,7:4,2
+chr14	65247931	.	C	CACACAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.006031;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,12:5,7:5,5
+chr14	65266406	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,4:1,3:1,1
+chr14	66516183	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00016223;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,2:9,9
+chr14	67780754	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=8.1801e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,19:6,13:7,6
+chr14	67803228	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.076832;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
+chr14	69654792	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,2:1,1:0,1
+chr14	69745994	.	T	TACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.020719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:5,3:3,3
+chr14	70710663	.	CTTTCT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.058162;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:1,2:12,2
+chr14	70710706	.	TTC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:1,2:10,2
+chr14	71906790	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0081121;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:7,5:1,4
+chr14	71906791	.	G	GAAAAGCATATGCTGAAAAGCATAATACTTTTTA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0020704;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:6,5:1,3
+chr14	73536516	.	T	TA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014845;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
+chr14	74014389	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.14744;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:24,2:11,2
+chr14	74520801	.	AAATG	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0079392;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:11,6:8,6
+chr14	74868313	.	TTATA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:3,3:1,1
+chr14	75153777	.	C	CTTTTTTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045968;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:6,3:10,3
+chr14	75257469	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00012491;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:13,8:11,6
+chr14	79233666	.	C	CTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0036809;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,7:5,2
+chr14	79233730	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0041486;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:7,4:3,7
+chr14	79343870	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.537e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:13,9:10,5
+chr14	80195814	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00021796;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:8,9:2,1
+chr14	81572276	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.060215;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
+chr14	82823662	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00063642;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,3:7,6
+chr14	83327150	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0016044;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:7,5:15,4
+chr14	83577812	.	G	GAT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,4:3,4
+chr14	83936135	.	AAG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.029654;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:3,2:2,2
+chr14	84703045	.	GATATAT	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019067;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:10,2:8,4
+chr14	85440994	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:6,5:0,1
+chr14	85470210	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=1.7795e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:6,23:2,14:4,9
+chr14	87551018	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:2,2:1,1:1,1
+chr14	88484211	.	CTAT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.033935;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,4:7,5
+chr14	88716732	.	AAC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00049132;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,12:3,8:0,4
+chr14	90237501	.	A	AAGG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0043369;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,12:3,5:6,7
+chr14	90983813	.	C	CTCTCTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.035372;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:7,2:1,4
+chr14	91572426	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,4:3,5
+chr14	91661524	.	C	CAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0015312;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,9:4,6:1,3
+chr14	92808663	.	G	GT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00024986;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:6,7:3,5
+chr14	92808701	.	G	GA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0011741;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,11:8,5:3,6
+chr14	93357775	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014142;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:0,2:5,4
+chr14	94533813	.	TAA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,6:10,3:6,3
+chr14	95476466	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0024931;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,4:11,4
+chr14	97068412	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:3,2:9,2
+chr14	97154203	.	TTTCCTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:0,1:12,3
+chr14	97193720	.	A	AT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00067301;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:8,7:10,3
+chr14	99130508	.	GAA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:7,7:0,1
+chr14	99811184	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=9.8865e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:5,5:7,5
+chr14	99846281	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.010024;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:11,9:1,1
+chr14	101397815	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:8,4:1,4
+chr14	101397817	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037198;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,3:2,2
+chr14	101674930	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031763;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:12,2:6,2
+chr14	101942512	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0025217;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,5:5,2
+chr14	102202372	.	GT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,2:3,2
+chr14	104097956	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:2,2:3,7
+chr14	105598771	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.016371;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,8:6,1
+chr14	105927535	.	AGG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.077519;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,2:9,2
+chr14	106419214	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0065876;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:3,3:1,1
+chr14	106459602	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.054945;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,8:1,6:2,2
+chr15	17745729	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040316;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,3:4,1
+chr15	18358341	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,3:9,4
+chr15	18749305	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr15	19910197	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.3405e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:9,10:10,7
+chr15	20170452	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.036717;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:13,7:19,1
+chr15	20247398	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.036143;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:10,3:28,7
+chr15	20336424	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0036197;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:6,7:10,3
+chr15	20336442	.	G	GTTTTTTGTTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0073947;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:6,7:5,3
+chr15	20347933	.	G	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.020231;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:21,5:16,8
+chr15	20355877	.	C	CTTTCTTTCTTTTTTTT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,4:15,1:13,3
+chr15	20550951	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04308;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,4:4,1
+chr15	20582882	.	T	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.049331;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:17,9:23,3
+chr15	20670150	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
+chr15	21254323	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.014276;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,4:8,1
+chr15	22422812	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.024399;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,6:10,1
+chr15	22444687	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.016949;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:16,9:10,3
+chr15	22949262	.	TGCCTAAGCCTAAAGCGGGGACCAGGCGGGCCGGAAGGCGGGCACAATGC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:12,2:4,2
+chr15	23217430	.	ATTT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,5:10,3:6,2
+chr15	24080017	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.7719e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:6,3:10,10
+chr15	24334109	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.085094;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:19,1:22,4
+chr15	25132879	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,7:5,2
+chr15	26251855	.	A	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
+chr15	28422218	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:2,2:16,2
+chr15	28493416	.	T	C	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.032621;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:110,13:66,7:44,6
+chr15	29057406	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=7.6729e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:5,4:12,7
+chr15	30524903	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.020062;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:13,5:12,3
+chr15	30691517	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.025964;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
+chr15	31165579	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
+chr15	31567594	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00058845;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:19,10:8,3
+chr15	32044253	.	C	CTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,5:5,3:5,2
+chr15	32162135	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011004;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:13,6:2,4
+chr15	32181183	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
+chr15	32580639	.	C	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,3:4,3
+chr15	33343334	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.022e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:11,13:9,7
+chr15	33889981	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.4224e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:8,7:12,7
+chr15	34053319	.	A	AATAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:2,1:1,1
+chr15	34423155	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.1208;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:19,2:13,2
+chr15	34543009	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,2:4,4
+chr15	34949276	.	A	ATGAGCCACTACACTGGGCC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,5:5,1
+chr15	35482218	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.4893e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:12,5:10,10
+chr15	36178301	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00085567;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:9,7:13,3
+chr15	36278095	.	CATAT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,2:7,2
+chr15	36286610	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0090312;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,4:5,1
+chr15	36471641	.	C	CAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10134;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:11,5:5,1
+chr15	36722985	.	G	GTGTGTGTGTGTT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.10396;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,5:11,3:14,2
+chr15	40504337	.	G	GTGTATATA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.035289;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,6:9,1:10,5
+chr15	40951605	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,2:0,0:1,2
+chr15	41179528	.	A	AAAGGAAGGAAGGAAGG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:4,3:4,4
+chr15	42789854	.	T	TACACACACACAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00026695;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:8,7:4,5
+chr15	45934450	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00070687;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,5:6,3
+chr15	48314237	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
+chr15	48435768	.	GTA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,5:2,2:0,3
+chr15	50874129	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0074524;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:3,4:9,8
+chr15	51583106	.	CT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
+chr15	51747017	.	T	TA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,4:2,1
+chr15	51912441	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.08867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,2:5,1:2,1
+chr15	52462280	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.034205;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,4:2,1:3,3
+chr15	55518897	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,4:6,2:7,2
+chr15	55778195	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,2:9,3
+chr15	56312269	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:4,5:9,5
+chr15	57007764	.	TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.059289;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:0,0:4,2
+chr15	57223643	.	GTTT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.1532;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:9,4:4,2
+chr15	57336148	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:3,5:0,1
+chr15	59093361	.	T	TC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:3,1:3,4
+chr15	59359330	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0023112;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,4:3,4
+chr15	59719506	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
+chr15	60009125	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:35:0,2:0,1:0,1
+chr15	60132343	.	GGGA	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,2:3,1:0,1
+chr15	60993644	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0099161;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,10:3,9:4,1
+chr15	61451616	.	T	TTTTTTC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:2,1:3,4
+chr15	62096613	.	AT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00077001;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,5:4,3
+chr15	64718753	.	G	GGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034996;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:8,2:6,4
+chr15	66432959	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:6,5:2,1
+chr15	67055971	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:7,5:4,2
+chr15	68741633	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.026636;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:5,5:1,1
+chr15	69078387	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0072477;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:7,2:11,6
+chr15	72665570	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010436;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,3:8,7
+chr15	74073767	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.049123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chr15	76330727	.	T	TTA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,6:1,5:2,1
+chr15	76572915	.	T	TCACACA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,9:2,3:2,6
+chr15	77024962	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.4083e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:9,8:7,4
+chr15	77343482	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:2,3:9,3
+chr15	77509555	.	CGTGTGT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027772;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:4,4:1,1
+chr15	77883340	.	C	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,5:2,2
+chr15	78215763	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.069354;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:17,2:7,3
+chr15	78877117	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:4,1:1,1
+chr15	80339873	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0014199;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:12,4:14,6
+chr15	80382911	.	C	CAATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027154;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,4:10,1
+chr15	81179982	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,3:5,3
+chr15	82383908	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,4:6,2
+chr15	82427338	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.082831;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:6,1:17,3
+chr15	82523942	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
+chr15	82916807	.	A	AT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.011338;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,3:11,4
+chr15	83417902	.	T	TA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.01095;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,10:5,8:4,2
+chr15	83822769	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.1474e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:8,7:10,5
+chr15	84419727	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0219;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:10,7:4,3:6,4
+chr15	84425290	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.014936;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:10,5:7,2
+chr15	85151765	.	CAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:4,4:4,1
+chr15	85504515	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
+chr15	85841139	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,4:5,2
+chr15	86380935	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0010872;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,4:6,4
+chr15	86703427	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=8.1679e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,4:5,6
+chr15	86826036	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0076326;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,15:8,9:5,6
+chr15	87055660	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.3351e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:12,8:9,4
+chr15	89354401	.	CTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.043512;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,5:2,2:1,3
+chr15	89952550	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,4:5,1
+chr15	90175683	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0015067;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,7:4,2
+chr15	90407221	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0005505;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:16,3:10,7
+chr15	90651919	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:5,3:3,2
+chr15	90735236	.	AAT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,12:2,9:1,3
+chr15	91420126	.	CTG	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
+chr15	92587513	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.013891;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:9,6:5,1
+chr15	92767870	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.017924;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,2:8,5
+chr15	92999083	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015182;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,4:4,1
+chr15	93677756	.	A	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,2:8,2
+chr15	93940288	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:2,4:8,3
+chr15	94162144	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,4:7,2
+chr15	96447738	.	TATC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.013865;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:8,4:10,4
+chr15	96857600	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023277;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,8:4,1
+chr15	96865316	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.1208;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:15,2:17,2
+chr15	99085857	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,2:4,1:3,1
+chr15	100759176	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=1.3625e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:10,8:6,7
+chr15	101258008	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.039412;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,2:2,4
+chr15	101743927	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.04982;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:15,1:13,6
+chr16	1833555	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.064336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:11,4:6,3
+chr16	2542624	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.028132;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,4:12,1
+chr16	3329169	.	G	GACACAC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,6:1,5:1,1
+chr16	3889002	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00013223;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:6,2:13,8
+chr16	5801341	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020486;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,4:4,2
+chr16	6134683	.	A	ATTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,4:6,2
+chr16	6220657	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013378;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,5:7,4
+chr16	6367254	.	G	GTTTTGT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0019606;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:15,17:6,9:9,8
+chr16	6562757	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0043971;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,1:8,5
+chr16	8563144	.	AG	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.024978;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:13,5:6,3
+chr16	9019654	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,2:8,2
+chr16	9199895	.	GTCCT	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,5:2,2:0,3
+chr16	10612629	.	A	AG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:9,2:10,3
+chr16	11067187	.	TTG	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.13514;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:9,2:8,1
+chr16	11505470	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,2:3,5
+chr16	11712929	.	A	AACACACACACACAC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,2:4,2
+chr16	12105223	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10145;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr16	12380394	.	C	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr16	12817263	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,3:4,3
+chr16	14360253	.	C	CCA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00026837;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,11:3,8:2,3
+chr16	14978118	.	G	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.049005;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:28,7:14,1
+chr16	15164208	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:1,1:3,4
+chr16	15175445	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.039721;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:13,7:22,5
+chr16	15857202	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.022078;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,6:14,4:4,2
+chr16	15861496	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:5,3:4,2
+chr16	16139611	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:4,6:4,1
+chr16	16274259	.	T	TTGGA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.038169;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:5,3:10,4
+chr16	16462130	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0070044;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,7:5,2
+chr16	16464052	.	G	GTGTGTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015379;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:4,2:13,3
+chr16	16602352	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=8.1261e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:8,10:2,5
+chr16	16918059	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.3463e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:8,7:5,9
+chr16	17044323	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,3:6,1
+chr16	18121796	.	GGTTT	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.037048;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:22,5:21,1
+chr16	18130476	.	TAAAAAA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018634;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:2,2:5,3
+chr16	18144826	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,5:3,3
+chr16	19101995	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,5:3,3:0,2
+chr16	19162689	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02313;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,1:8,3
+chr16	20195336	.	A	AATTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01192;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:3,3:6,5
+chr16	20295279	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.00761;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,8:1,7:1,1
+chr16	20489820	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.028251;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,2:12,3
+chr16	20545378	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0022994;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:15,4:5,3
+chr16	20596673	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.085094;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:26,1:15,4
+chr16	21269193	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010026;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,4:6,4
+chr16	21307622	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0055997;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,9:2,4:5,5
+chr16	21354148	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.011503;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:12,1:9,6
+chr16	22469165	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022366;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,4:7,5
+chr16	22553505	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.023251;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:18,3:9,1
+chr16	22632007	.	CTATA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,9:5,6:6,3
+chr16	23875759	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.021895;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:9,6:14,2
+chr16	24479358	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13043;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
+chr16	24579241	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19016;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,5:20,3:5,2
+chr16	26887122	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:6,1:0,1
+chr16	28162560	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.085726;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:17,2:10,3
+chr16	29482918	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
+chr16	29648003	.	T	TTG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:2,2:3,2
+chr16	30032642	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,3:3,3
+chr16	30342200	.	A	AT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.02253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
+chr16	32125849	.	GT	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0053747;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:15,4:12,4
+chr16	32176170	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr16	32465038	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.021299;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:15,3:15,8
+chr16	32837836	.	G	C	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.021664;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:106,23:69,20:37,3
+chr16	32838865	.	A	G	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.024159;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:146,19:81,14:65,5
+chr16	32839745	.	G	A	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.0027228;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:80,15:47,9:33,6
+chr16	33049073	.	GA	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:21,1:5,3
+chr16	33506889	.	TAAAAAA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.038556;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,4:5,2
+chr16	33543309	.	C	G	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:53,12:21,8:32,4
+chr16	33912493	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.013578;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:17,1:15,8
+chr16	34585666	.	C	A	0	PASS	DP=7755;GPV=1;SPV=0.025427;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:3857:3455,402:2115,221:1340,181
+chr16	34811099	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0003763;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:13,4:12,8
+chr16	35340267	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.1874e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,6:7,5
+chr16	37852470	.	G	T	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.029413;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:99,17:30,5:69,12
+chr16	37878930	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
+chr16	46460582	.	A	G	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.023263;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:25,12:27,3
+chr16	48416181	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:0,2:0,2:0,0
+chr16	49058614	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.27198;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,2:4,2
+chr16	49702923	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064294;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:9,2:22,2
+chr16	50938942	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.0799e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:14,6:11,8
+chr16	51663775	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.9786e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:7,3:16,10
+chr16	52826730	.	AGT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:2,3:3,2
+chr16	53403333	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0021291;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,2:6,3
+chr16	53551675	.	CAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:2,7:5,1
+chr16	54680831	.	A	ATACATGTATGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:3,2:8,4
+chr16	55472560	.	TAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:5,3:2,1
+chr16	56300008	.	C	CGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:7,4:8,4
+chr16	57002644	.	TG	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,1:7,3
+chr16	58085568	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,2:7,2
+chr16	59312571	.	T	TTC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:2,1:8,4
+chr16	59312572	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,0:9,4
+chr16	59858527	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.7587e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,5:8,5
+chr16	60311989	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00078689;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,14:13,6:7,8
+chr16	61428604	.	CTTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,2:2,1:2,1
+chr16	62079731	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:8,6:1,2
+chr16	62486857	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,3:4,1:2,2
+chr16	62658786	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=1.1853e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:8,6:5,6
+chr16	63024573	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=6.6009e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,3:10,7
+chr16	64370054	.	G	GCACACACA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.021468;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,8:10,2
+chr16	64398295	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00016426;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:15,5:6,7
+chr16	69944708	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.04269;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,3:7,5
+chr16	70050982	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:3,1:16,2
+chr16	71022770	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.028482;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,4:10,5
+chr16	71832216	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.057792;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,2:0,1
+chr16	74423310	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.051458;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
+chr16	74495106	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.016783;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:3,5:0,1
+chr16	74502722	.	GT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0077399;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,9:2,4:2,5
+chr16	74821501	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00011781;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:10,3:6,6
+chr16	75180991	.	A	AAAG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0067977;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:3,1:6,5
+chr16	75732085	.	CAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:2,3:1,1
+chr16	75939212	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.001906;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:12,4:9,3
+chr16	78078648	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,3:7,5
+chr16	80672318	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,2:8,2
+chr16	81280320	.	CACAG	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:1,1:2,4
+chr16	81376465	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,6:4,5:0,1
+chr16	84013729	.	CT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016727;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:8,9:9,3
+chr16	84940732	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0056634;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:16,6:17,2
+chr16	86197778	.	G	GTGTGTGTGT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0023232;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,11:3,3:7,8
+chr16	87013968	.	TTCCCTCATTCAC	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,7:5,2
+chr16	87562669	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,8:4,6:6,2
+chr16	87564563	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:0,2:0,1:0,1
+chr16	88728472	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12479;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:3,1:16,2
+chr16	89426529	.	T	TCACA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0065388;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:8,6:6,2
+chr16	90207896	.	A	AG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,5:4,1
+chr17	243024	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
+chr17	515956	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,3:0,1
+chr17	579185	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,4:4,2
+chr17	605741	.	G	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0037594;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:3,10:3,9:0,1
+chr17	1417665	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:7,4:1,1
+chr17	2509676	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.7714e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:13,8:8,4
+chr17	2760947	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:4,2:13,2
+chr17	2872213	.	C	CA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
+chr17	2979460	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,3:4,1
+chr17	4215925	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0097246;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:12,4:14,4
+chr17	4747337	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0050388;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:9,3:1,6
+chr17	7676333	.	CCTCCAGGT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,4:1,3:2,1
+chr17	7714124	.	C	CGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,9:5,8:3,1
+chr17	8299542	.	T	TA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00756;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:5,2:9,5
+chr17	8401335	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,7:5,2:4,5
+chr17	9754279	.	CT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.055494;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,3:12,1
+chr17	9773741	.	T	TC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0018566;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,9:3,1:3,8
+chr17	10363315	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:5,7:3,1
+chr17	11543910	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,5:3,2
+chr17	12020110	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.001198;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:15,5:12,5
+chr17	12676253	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,3:6,4
+chr17	13235142	.	AGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,4:6,4
+chr17	13595847	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:5,3:4,1
+chr17	14694438	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:7,1:5,4
+chr17	14876514	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0039329;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,5:5,1:2,4
+chr17	15264253	.	GAT	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.15598;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:17,1:9,2
+chr17	15264255	.	T	TAG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.021691;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,5:6,4:5,1
+chr17	15810688	.	T	TAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:12,2:6,2
+chr17	15810734	.	CATGTGTGT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:2,2:4,3
+chr17	15826095	.	G	GT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:5,4:2,2
+chr17	16161240	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,2:3,1:2,1
+chr17	16812494	.	G	GCTGCTGGAGGAGTTCCCATCCCTGCAGGTGT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,2:4,5
+chr17	18436242	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.038781;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:7,5:12,3
+chr17	19638169	.	TACAC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,11:3,7:3,4
+chr17	20393023	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.038786;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:18,4:14,1
+chr17	20490397	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023562;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,3:4,2
+chr17	20579254	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.028543;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:16,5:11,5
+chr17	21569888	.	G	GTGTGTGTGTGTGTA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:0,10:0,6:0,4
+chr17	21665064	.	A	G	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.026358;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:21,7:20,5
+chr17	21987851	.	AAG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.041183;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:8,6:12,2
+chr17	22823512	.	G	A	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.020573;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:78,13:21,5:57,8
+chr17	22868198	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046053;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:12,3:5,1:7,2
+chr17	22912586	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,3:7,1
+chr17	22953324	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,3:7,1
+chr17	26738747	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.032184;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:19,8:8,1
+chr17	26750226	.	G	A	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.011419;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:11,1:50,7
+chr17	26750553	.	TA	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.014972;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:15,4:20,1
+chr17	26750627	.	G	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.044441;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:18,4:11,1
+chr17	26756863	.	G	A	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.01171;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:49,18:18,9:31,9
+chr17	26777173	.	C	A	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.045845;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:74,17:35,9:39,8
+chr17	26846954	.	C	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.048755;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,3:10,3
+chr17	26953277	.	A	G	0	PASS	DP=311;GPV=1;SPV=0.0092;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:130,18:49,6:81,12
+chr17	26958286	.	G	A	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.046035;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:131,16:61,4:70,12
+chr17	26958523	.	A	T	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.009667;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:56,9:28,3:28,6
+chr17	29424436	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:9,4:1,0
+chr17	29743907	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:4,2:4,2
+chr17	31537633	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0031736;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,5:10,2
+chr17	31675974	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023188;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,1:4,5
+chr17	31866887	.	C	CAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:2,4:2,1
+chr17	34754836	.	GCTTAC	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,1:17,3
+chr17	35530512	.	GA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:13,3:1,1
+chr17	35581299	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,2:1,1:1,1
+chr17	35871916	.	AT	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,2:3,3
+chr17	36270978	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:24,4:2,0
+chr17	36536524	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:5,8:2,1
+chr17	37439942	.	A	AT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,4:6,2:4,2
+chr17	39153334	.	G	GGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:4,3:5,3
+chr17	40728399	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0079051;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
+chr17	40815568	.	TA	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,2:15,2
+chr17	41225342	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.004375;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,18:7,11:9,7
+chr17	41226775	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.033503;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:4,3:21,3
+chr17	41733052	.	T	TTTTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03835;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,1:4,3
+chr17	41928852	.	T	TAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0074142;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,13:2,10:3,3
+chr17	42973190	.	T	TG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:5,3:2,5
+chr17	43177572	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,4:10,1:4,3
+chr17	45250258	.	TAC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0042363;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,7:4,5:1,2
+chr17	45757480	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:5,3:1,2
+chr17	47890931	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0057417;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:4,4:3,4
+chr17	48985838	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,4:7,2
+chr17	49553043	.	CCACA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.025565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:5,3:2,2
+chr17	51849183	.	GTA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,7:2,2:0,5
+chr17	53025193	.	T	TTC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0038647;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,13:2,5:5,8
+chr17	53334019	.	T	TAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:3,11:3,7:0,4
+chr17	53702004	.	AT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.039412;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,4:6,2
+chr17	54593370	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.4873e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:9,7:14,8
+chr17	55277235	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0012432;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,7:0,3:0,4
+chr17	55336527	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=1.7815e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:10,10:5,4
+chr17	55402087	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,5:2,3
+chr17	56303851	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:13,1:4,4
+chr17	57030254	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0041286;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:2,3:10,3
+chr17	57860372	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:2,2:1,3
+chr17	61311903	.	CAT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0017321;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:6,5:13,11
+chr17	63086771	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:6,2:3,3
+chr17	63629362	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00013375;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:10,7:11,7
+chr17	65286372	.	T	TAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:8,6:11,4
+chr17	65989245	.	AAAAAAAG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010569;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,12:6,6:6,6
+chr17	67579625	.	T	TC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:5,9:7,1
+chr17	67952084	.	C	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0017509;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:2,4:7,4
+chr17	68163538	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,4:3,3:2,1
+chr17	68172141	.	A	AG	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.046007;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:10,1:16,3
+chr17	70417232	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:9,3:3,1
+chr17	70494004	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.22036;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:17,2:11,2
+chr17	70602851	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:15,3:5,1
+chr17	71032587	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:3,3:4,1
+chr17	71338895	.	T	TC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
+chr17	71608515	.	A	ATC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,5:5,1
+chr17	72117696	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00020424;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:12,4:16,9
+chr17	73569199	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:6,3:3,1
+chr17	74176320	.	T	TAAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:6,5:6,2
+chr17	74285976	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,3:7,4
+chr17	74867306	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,4:5,1
+chr17	75358914	.	T	TATATAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,3:7,2
+chr17	75938864	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,3:4,4
+chr17	76238085	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.019243;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:12,4:5,2
+chr17	76935870	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033472;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:4,3:11,5
+chr17	77145095	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,6:6,1:5,5
+chr17	77413954	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.051458;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
+chr17	77718749	.	G	GTGTGTGTCTGTGTGTGCACATGCA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.095044;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:12,3:15,2
+chr17	77876975	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:14,3:5,1
+chr17	80024355	.	A	ACAC	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.044481;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:1,2:25,3
+chr17	80024394	.	GAC	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.04522;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:5,3:16,3
+chr17	81661858	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:7,5:2,1
+chr18	77738	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.055746;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,1:12,3
+chr18	105445	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:1,3:3,1
+chr18	1629634	.	ATATGTGAATG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.042059;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,3:6,4
+chr18	1632822	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.015123;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:9,8:3,4
+chr18	1748634	.	ATT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,1:6,3
+chr18	2826171	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.01057;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:8,2:8,4
+chr18	3378878	.	C	CAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0045767;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:3,5:2,1
+chr18	3382688	.	G	GA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:5,5:1,2
+chr18	3782035	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,2:2,1:2,1
+chr18	3827062	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00026567;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,5:9,5
+chr18	3992328	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0025527;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:9,5:11,3
+chr18	4080891	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,4:4,2:5,2
+chr18	7842889	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
+chr18	10208596	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0013375;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:10,4:9,3
+chr18	11133872	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0017532;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,5:11,6
+chr18	12521336	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.036744;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:15,4:6,3
+chr18	12792282	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,6:3,3
+chr18	13275039	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00048831;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,16:6,11:6,5
+chr18	13443709	.	T	TCTCCTCCTCCTCCTC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0062699;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,13:7,7:3,6
+chr18	14467281	.	C	CTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,9:3,8:2,1
+chr18	14716165	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,2:9,2
+chr18	15197059	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00028843;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:8,2:9,8
+chr18	15410300	.	C	A	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=0.022939;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:73,18:32,8:41,10
+chr18	15467183	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.033038;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:27,4:1,0
+chr18	15552815	.	G	T	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.045507;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:57,13:45,7:12,6
+chr18	15603964	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.060505;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:12,2:18,2
+chr18	15622831	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053885;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:4,2:14,2
+chr18	15651172	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:0,0:17,4
+chr18	15699753	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0079853;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:3,1:9,5
+chr18	16959351	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.021073;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:9,4:1,1
+chr18	17368130	.	T	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
+chr18	17377058	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0029264;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:13,5:5,3
+chr18	17837660	.	G	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr18	18293571	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.029181;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:58,14:17,6:41,8
+chr18	18629431	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.05062;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:18,3:3,1
+chr18	19039313	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.041455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,0:13,4
+chr18	19502295	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
+chr18	20557981	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,0:16,4
+chr18	20815525	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0011434;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:12,2:8,4
+chr18	20838526	.	TC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0048875;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:3,4:6,6
+chr18	20838540	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,2:8,5
+chr18	20956155	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.038561;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:12,3:11,1
+chr18	22232505	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0016259;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:13,1:15,9
+chr18	22232528	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.010404;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,1:8,7
+chr18	23414331	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.020274;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,9:13,7:4,2
+chr18	24729487	.	CT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.004662;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,7:0,4:0,3
+chr18	27137977	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0038981;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,4:6,3
+chr18	27567221	.	T	TAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:3,5:3,1
+chr18	28518417	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.01229;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:6,3:13,4
+chr18	30059360	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=2.9583e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,7:11,6
+chr18	30706535	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.3012e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:12,6:4,6
+chr18	31001091	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0091169;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:10,6:9,2
+chr18	32086355	.	G	GT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:6,4:2,5
+chr18	32567283	.	CA	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.02299;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,6:17,4:7,2
+chr18	33093675	.	AT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0028364;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:12,6:7,1
+chr18	33109832	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=5.4595e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:7,8:5,6
+chr18	33768234	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0086905;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:11,5:7,12
+chr18	34440623	.	AG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0015629;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:10,2:9,6
+chr18	34691046	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0018974;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:14,4:9,5
+chr18	35885155	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0045189;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,5:2,1
+chr18	36206244	.	C	CT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:1,4:2,1
+chr18	36463387	.	AAAAT	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.063808;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:42,5:17,3:25,2
+chr18	36720277	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:4,1:10,4
+chr18	36869541	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00090261;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:6,3:14,10
+chr18	36984904	.	CAA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,7:3,5:5,2
+chr18	37462794	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:8,4:3,1:5,3
+chr18	37857488	.	CTTTCTTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030957;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,3:11,2
+chr18	40601560	.	C	CTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.046888;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:2,2:15,5
+chr18	42825432	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00014918;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:10,6:6,4
+chr18	43425274	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.4904e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:6,5:14,8
+chr18	45209180	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0047407;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:8,8:1,1
+chr18	50852319	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.028977;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:3,1:9,3
+chr18	50913860	.	T	TATACACACACACACAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013177;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr18	51131287	.	TAC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.026055;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:5,5:14,3
+chr18	51384788	.	TATATATATATA	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,3:0,0:2,3
+chr18	51844934	.	GT	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031008;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,2:7,3
+chr18	53407528	.	G	GATATATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,5:4,4:3,1
+chr18	53499957	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0038679;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,3:11,7
+chr18	57390047	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0035421;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,4:11,4
+chr18	57527638	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.11998;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:21,3:8,1
+chr18	58646138	.	AG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.089104;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:13,1:13,4
+chr18	58920735	.	CGTGTGTGTGT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010876;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:10,5:0,1
+chr18	59237459	.	C	CA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,4:2,1
+chr18	59522993	.	C	CAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:2,4:0,1
+chr18	62850074	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:2,1:4,1
+chr18	63878575	.	G	GAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0083111;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,8:11,1
+chr18	64062944	.	C	CTA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016993;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
+chr18	64062989	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017591;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,4:5,3
+chr18	65420400	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0026788;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:13,4:10,4
+chr18	66760271	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.5142e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:11,9:10,7
+chr18	67402010	.	A	AG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:5,1:3,4
+chr18	68026237	.	T	TA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034789;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,4:12,1
+chr18	68504776	.	G	GAGGAAGGAAGGA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:4,4:0,2
+chr18	69214371	.	CTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.016783;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,6:1,3:2,3
+chr18	71156912	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.02564;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,1:8,7
+chr18	71205760	.	C	CTCCA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028921;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:3,4:7,2
+chr18	71210783	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:3,2:6,3
+chr18	71420401	.	G	GTATATATATATATATA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:11,3:2,3
+chr18	72625698	.	C	CTA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00030146;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:3,4:4,6
+chr18	73094559	.	AAAC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,3:10,2
+chr18	73983993	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.033472;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:11,6:4,2
+chr18	74174891	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00070165;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,9:7,6:6,3
+chr18	76126690	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=1.7815e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:6,8:9,6
+chr18	77796251	.	CT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.010905;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,7:7,4:9,3
+chr18	78012529	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00023235;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:9,6:9,5
+chr18	78109088	.	TTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049275;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,3:7,3
+chr18	79017137	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.015156;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
+chr18	79505741	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.33824;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:15,1:6,2
+chr18	79732475	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022281;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,3:1,1
+chr19	103817	.	TAC	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0030733;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:20,11:7,3
+chr19	319605	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:11,5:7,1
+chr19	785067	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0053746;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:4,6:6,4
+chr19	2155498	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0021594;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:6,8:2,3
+chr19	2990703	.	A	ACAT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0023444;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,10:7,7:4,3
+chr19	3313188	.	T	TGTTGGAGACCATGAAGGGAGGCC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,5:7,5
+chr19	3789721	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,3:3,1
+chr19	5433796	.	C	CAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:1,4:3,1
+chr19	5465489	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.9702e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:14,8:4,5
+chr19	7355068	.	TCACACACACACACACACACA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,3:3,5
+chr19	7692107	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,4:1,1
+chr19	8771295	.	G	T	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.046443;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:103,23:76,19:27,4
+chr19	8775174	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036961;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:0,2:23,8
+chr19	8987807	.	ATTGTT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:3,6:9,4
+chr19	9820707	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,3:0,0:2,3
+chr19	9908464	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,6:0,3:2,3
+chr19	10301799	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,1:13,3
+chr19	10724339	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.2849e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,13:8,6:4,7
+chr19	12308695	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,5:0,2:3,3
+chr19	13572639	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0015405;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:8,4:10,5
+chr19	13903673	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038355;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:16,8:9,3
+chr19	14318078	.	ATATATATAT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,2:3,3
+chr19	15650803	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:5,1:5,3
+chr19	16790642	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.045025;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
+chr19	17681069	.	C	CTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:0,3:2,1
+chr19	18159144	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:2,1:4,3
+chr19	18345725	.	C	CA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:8,3:1,1
+chr19	18621422	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,4:6,1:13,3
+chr19	18983363	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,5:3,3
+chr19	19318113	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.042892;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,3:1,1:3,2
+chr19	19440986	.	TTTCCTTCCC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0074534;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:3,3:4,3
+chr19	19691395	.	C	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0014993;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:2,2:5,6
+chr19	19984567	.	C	CA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,2:2,2
+chr19	20770110	.	AG	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.028958;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:10,1:22,7
+chr19	20770112	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.036531;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:11,1:19,6
+chr19	21565265	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
+chr19	22489382	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.9123e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:13,9:5,9
+chr19	22885732	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.1758e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:16,7:8,8
+chr19	23478513	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:2,2:0,0:2,2
+chr19	24355432	.	G	GAAAT	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.044976;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:50,15:26,2:24,13
+chr19	24372163	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.00041668;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:40,21:23,10:17,11
+chr19	24395330	.	C	T	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=2.0682e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:50,17:20,6:30,11
+chr19	24441180	.	C	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.038827;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:31,9:6,1
+chr19	25425602	.	T	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr19	25963563	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr19	26161162	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
+chr19	28819965	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.016072;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,1:9,3
+chr19	29901079	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
+chr19	30333181	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16375;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:11,3:18,1
+chr19	30881294	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,3:2,2
+chr19	32421647	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,7:3,4:4,3
+chr19	35624102	.	G	GTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,3:2,3
+chr19	36771535	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:2,4:6,2
+chr19	36956601	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.01246;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,7:5,5:5,2
+chr19	37229616	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:6,1:13,2
+chr19	37355397	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0001676;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,4:6,4
+chr19	37375315	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:4,1:10,6
+chr19	37537911	.	AT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024176;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:1,1:7,3
+chr19	39633991	.	T	TC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,4:6,4
+chr19	41645411	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,0:13,4
+chr19	43303650	.	ATGTGTGTGTGTGTGTG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:4,6:2,1
+chr19	44167314	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0022121;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:4,6:1,3
+chr19	44532565	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,7:3,2:5,5
+chr19	44587574	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:11,3:1,1
+chr19	45626380	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:3,4:3,1
+chr19	46200507	.	TTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,1:12,3
+chr19	46399136	.	TG	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,5:9,5
+chr19	46793102	.	T	TAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,2:6,2
+chr19	46941876	.	T	TAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:6,3:4,1
+chr19	47420910	.	T	TCTCACA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.015156;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,3:7,1
+chr19	47908463	.	T	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr19	47915101	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr19	47920306	.	A	C	0	PASS	DP=327;GPV=1;SPV=0.024939;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:137,20:71,14:66,6
+chr19	47939926	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
+chr19	48016456	.	TTTTCTTTCCTTC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:2,1:11,5
+chr19	48559006	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014432;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:7,3:12,3
+chr19	48655202	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.095238;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:3,2:0,0
+chr19	49321321	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:0,1:1,1
+chr19	51362170	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,5:16,3:2,2
+chr19	51608754	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,4:3,3:7,1
+chr19	51995567	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,1:5,3
+chr19	52865470	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11077;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,2:6,1:1,1
+chr19	52865924	.	TATG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,3:7,3
+chr19	52865936	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.03094;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,3:6,3
+chr19	53007064	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:9,4:5,3
+chr19	53125130	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.7463e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:7,9:9,3
+chr19	53127875	.	C	CAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,5:4,4:9,1
+chr19	53309270	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.016233;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:10,8:2,1
+chr19	53820691	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0016476;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,13:3,9:2,4
+chr19	54221926	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.048616;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,3:14,3
+chr19	54286038	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.031211;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,1:12,5
+chr19	54353176	.	AG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022451;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:6,4:11,2
+chr19	54779651	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0076246;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:3,4:8,2
+chr19	55335498	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0050719;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,4:8,4
+chr19	55734371	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.54545;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,2:2,1:5,1
+chr19	56745414	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.025744;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:13,2:18,6
+chr2	736402	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.072331;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:16,2:10,3
+chr2	802134	.	C	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0067841;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:3,4:5,7
+chr2	869219	.	C	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:9,3:3,2
+chr2	1235444	.	GC	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,3:7,2
+chr2	1262695	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0092864;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,4:5,3
+chr2	1342708	.	C	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
+chr2	1861649	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:2,1:7,4
+chr2	3199807	.	G	GGA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:5,1:11,3
+chr2	6151090	.	C	CTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011088;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,6:5,1
+chr2	6169093	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:2,1:5,5
+chr2	6677975	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,2:1,2:0,0
+chr2	6677977	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,2:1,2:0,0
+chr2	6896532	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0028986;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,8:3,6:2,2
+chr2	7480506	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00099636;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,19:10,7:6,12
+chr2	8995590	.	A	AT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00088132;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,8:8,1
+chr2	10554207	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:16,2:8,2
+chr2	12825828	.	TA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0023186;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:7,5:8,4
+chr2	12878380	.	GTATATATATATGTGTATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.027296;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,4:9,3
+chr2	14735748	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,2:2,2
+chr2	16006439	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.2354e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,4:6,4
+chr2	17447149	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.003465;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,2:8,5
+chr2	17503990	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:6,5:3,1
+chr2	21572766	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.021701;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,5:7,4
+chr2	22395978	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0044459;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:16,7:16,6
+chr2	23910651	.	T	TGAGGTCA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0089978;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:12,9:1,1
+chr2	24109152	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,7:10,5:0,2
+chr2	24116876	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.050152;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:10,3:10,1
+chr2	24773141	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,2:3,1:4,1
+chr2	27642960	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
+chr2	31618478	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0033467;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,5:9,3
+chr2	31737876	.	G	GACAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:9,3:5,1
+chr2	32461047	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,1:5,4
+chr2	33341729	.	A	AAAATATATATAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:6,3:8,4
+chr2	34243744	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0065359;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,10:2,9:1,1
+chr2	34787738	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:7,3:3,1
+chr2	35521833	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0056979;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,1:5,4
+chr2	35701204	.	TAA	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.053387;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,1:15,3
+chr2	35974670	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10733;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:9,2:1,4
+chr2	38482904	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,1:12,4
+chr2	38482905	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039873;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,1:13,3
+chr2	39207517	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.6127e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:9,14:10,2
+chr2	39619216	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023277;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,6:5,3
+chr2	40972280	.	T	TAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0088578;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,6:1,5:0,1
+chr2	41324684	.	T	TTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.056191;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:3,4:7,3
+chr2	42347307	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011229;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:5,5:4,4
+chr2	43636340	.	A	AGAT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040214;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:4,4:9,3
+chr2	44346784	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.3707e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:7,10:13,9
+chr2	44400928	.	GTGTA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,1:1,3
+chr2	46769584	.	G	GA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0041286;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
+chr2	47009888	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.11053;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,2:3,1:2,1
+chr2	47344111	.	TAA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0069071;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:6,3:4,7
+chr2	47950544	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0034325;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,1:2,5
+chr2	48288282	.	A	AGAGT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0058369;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,7:5,3
+chr2	48288283	.	CTTTTAT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0066039;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:7,7:7,5
+chr2	50951963	.	A	ATATTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,7:10,4:7,3
+chr2	51413347	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.002854;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:8,2:8,5
+chr2	51834653	.	ATCTATATATCTATATATATATATATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022366;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,4:5,5
+chr2	52111307	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.028335;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:5,5:5,2
+chr2	52305046	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.9001e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:5,7:6,6
+chr2	55726018	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.884e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:7,4:9,11
+chr2	56693547	.	T	TATATATATATATATATACAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011671;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,5:8,1
+chr2	56889637	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0099416;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,5:6,4:3,1
+chr2	57595116	.	T	TGC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:6,4:6,4
+chr2	60251438	.	T	TTAGA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0061654;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,6:10,5
+chr2	60560194	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.3518e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:5,6:6,8
+chr2	60625053	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.013909;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,5:9,1
+chr2	61596396	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,1:7,3
+chr2	65125864	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:0,1:1,3
+chr2	65234600	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0047587;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,3:8,3
+chr2	65444840	.	TTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016237;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:4,4:10,6
+chr2	65647998	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0033311;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:5,5:8,1
+chr2	66130391	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,5:4,2:3,3
+chr2	71245513	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,5:3,3
+chr2	71635766	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,2:2,1:2,1
+chr2	71635770	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,2:5,1:2,1
+chr2	74182834	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0015405;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:6,3:12,6
+chr2	74473763	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,7:6,2
+chr2	77603466	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,1:0,1
+chr2	78518329	.	CT	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.012115;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:22,3:13,5
+chr2	78543274	.	G	GTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0001029;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,13:5,10:1,3
+chr2	79046766	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00024707;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,3:8,8
+chr2	80881318	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=8.5672e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:3,4:10,7
+chr2	81963292	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:11,13:5,2
+chr2	82186972	.	GTA	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.032848;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,3:9,1
+chr2	82477666	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00064337;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:10,8:11,7
+chr2	83212156	.	A	AT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15761;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,2:17,2
+chr2	84141454	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0084701;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,3:12,3
+chr2	84480962	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024656;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
+chr2	85194385	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=4.8428e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:8,4:4,8
+chr2	86226632	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,3:6,2
+chr2	86716902	.	A	AAAAAAAAAACAAAC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,3:8,2
+chr2	87080887	.	GAACT	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.072031;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:16,3:17,1
+chr2	87140408	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.013126;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:7,5:16,4
+chr2	87175658	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11077;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
+chr2	87348767	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034192;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,3:9,4
+chr2	87361291	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.016609;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:19,5:19,4
+chr2	87364750	.	TGATGA	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.023935;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:28,2:20,6
+chr2	87368746	.	TA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.071412;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:14,1:19,4
+chr2	87417936	.	CA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.13725;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:2,1:3,1
+chr2	87425940	.	CAAGCCAGCCACCCAGCA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:9,1:6,3
+chr2	87472920	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.002173;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:3,9:2,5:1,4
+chr2	87597072	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.02064;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,3:3,2:0,1
+chr2	87656421	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,3:4,1
+chr2	87721053	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0055231;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
+chr2	87879624	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:0,2:8,7
+chr2	89315609	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.010747;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,4:4,3
+chr2	89538074	.	T	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.030096;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:59,19:24,10:35,9
+chr2	89552645	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,3:2,1
+chr2	89559108	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
+chr2	89593824	.	A	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.048552;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:25,6:8,3
+chr2	90022764	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016895;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,4:10,1
+chr2	90058484	.	C	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,1:4,3
+chr2	90133849	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013278;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:7,8:3,4
+chr2	90254023	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.04931;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:1,1:30,4
+chr2	90287226	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.042693;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:21,6:19,1
+chr2	90371425	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.037418;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,10:7,4:26,6
+chr2	90371859	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:13,2:3,2
+chr2	91427568	.	C	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.0079957;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:71,9:37,1:34,8
+chr2	91432684	.	G	C	0	PASS	DP=236;GPV=1;SPV=0.033118;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:115,14:58,5:57,9
+chr2	91451180	.	T	C	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.018932;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:93,18:46,10:47,8
+chr2	91472185	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.035165;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,10:24,7:12,3
+chr2	91473716	.	G	C	0	PASS	DP=271;GPV=1;SPV=0.017556;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:113,22:55,17:58,5
+chr2	91499851	.	TTGGCTGGC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01539;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,5:6,1
+chr2	91649254	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.026147;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:6,1:19,5
+chr2	91669627	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:2,3:11,1
+chr2	91727840	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
+chr2	91892509	.	C	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.026338;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:68,10:21,3:47,7
+chr2	92057127	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr2	92057166	.	T	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr2	92197366	.	G	T	0	PASS	DP=449;GPV=1;SPV=0.002724;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:198,29:117,17:81,12
+chr2	92358452	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.012894;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,1:11,6
+chr2	92376082	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018165;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:2,1:13,8
+chr2	92380957	.	T	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.027334;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:60,13:5,1:55,12
+chr2	92416953	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.049645;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:12,1:7,3
+chr2	92436292	.	T	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.022694;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:18,8:19,2
+chr2	92595112	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr2	92667798	.	T	G	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0087838;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:24,6:15,2
+chr2	92687005	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.043165;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:13,5:21,4
+chr2	92705371	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.021326;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,1:7,6
+chr2	92795746	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.028929;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,9:23,8:6,1
+chr2	93249851	.	T	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.033687;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:1,0:34,4
+chr2	93253263	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:10,2:17,2
+chr2	93263138	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0084925;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:33,7:2,0
+chr2	93455444	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
+chr2	93485871	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030104;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
+chr2	93580446	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.068312;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:28,2:3,2
+chr2	93674089	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr2	93824475	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,1:16,3
+chr2	93857398	.	C	A	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.02357;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:88,19:87,18:1,1
+chr2	93879854	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18803;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:10,2:2,1:8,1
+chr2	93883067	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.036878;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,4:14,5
+chr2	93946886	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr2	94219398	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.010246;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:16,7:9,7
+chr2	94739855	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.026412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:15,4:12,1
+chr2	95639887	.	G	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:3,4:14,3
+chr2	95885787	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0074736;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,2:6,4
+chr2	97166079	.	A	ATGG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.031714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:5,1:14,5
+chr2	97514685	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.035343;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:5,1:11,4
+chr2	97667268	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:7,2:3,2
+chr2	98635988	.	A	AAAAAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018694;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,2:2,4
+chr2	102260258	.	AG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.026903;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,4:6,3
+chr2	102958716	.	G	GT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00021623;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:16,8:6,3
+chr2	103359765	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.1901e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:8,8:11,6
+chr2	104375468	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0084306;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:3,6:6,3
+chr2	105996608	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.1294e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:12,8:12,5
+chr2	107095278	.	GA	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00019854;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:10,5:3,4
+chr2	107904832	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.019667;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:9,7:19,2
+chr2	108122467	.	AAAAAAAAAATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014907;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,4:2,1
+chr2	108292393	.	AACAC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0026559;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,12:12,6:2,6
+chr2	110049908	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0075507;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:39,18:19,11:20,7
+chr2	110226308	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00024036;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,3:6,5
+chr2	111506131	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0081354;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:14,5:9,4
+chr2	111593055	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.04437;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:18,3:17,5
+chr2	112338859	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,4:1,1:0,3
+chr2	112373873	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:2,2:8,2
+chr2	113077537	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037732;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:3,4:5,3
+chr2	113589594	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.020182;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:18,2:19,11
+chr2	114426588	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00024866;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,1:9,8
+chr2	114812583	.	G	GACAC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.065377;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,5:12,4:14,1
+chr2	116463887	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0018182;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:7,2:11,5
+chr2	117407919	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.12281;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:0,0:5,2
+chr2	119114640	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00051776;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,6:8,2
+chr2	119922218	.	TAA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.014934;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,6:4,1
+chr2	120142114	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,2:1,2:0,0
+chr2	120142116	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:0,2:0,2:0,0
+chr2	121151724	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:2,2:0,1:2,1
+chr2	121672921	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0015417;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,4:4,2
+chr2	121891029	.	C	CAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,3:2,2
+chr2	124655937	.	G	GAGAAAGAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021691;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:7,3:4,2
+chr2	125894961	.	CAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:1,2:3,2
+chr2	129549054	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.9426e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:16,5:11,11
+chr2	130074871	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0017104;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:11,4:7,7
+chr2	131534031	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.584e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:17,6:10,13
+chr2	131709276	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00057068;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:4,6:15,5
+chr2	132362152	.	CAT	C	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.043085;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:57,11:32,6:25,5
+chr2	132362164	.	G	GC	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.03724;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:56,11:30,6:26,5
+chr2	133482871	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=8.4874e-06;SS=2;SSC=50;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:9,11:10,6
+chr2	134145214	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00135;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:13,8:9,8
+chr2	134193675	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,6:2,5:1,1
+chr2	134516780	.	C	CATATATATATGCATATATATGAATAT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:7,2:9,3
+chr2	135699053	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.092902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:16,2:9,3
+chr2	139873820	.	ATAT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0071795;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,2:2,2
+chr2	140228179	.	AAT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,4:2,3:2,1
+chr2	141088021	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.1154e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:11,9:8,4
+chr2	142448453	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,6:4,4
+chr2	143680030	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:3,1:1,1
+chr2	144484185	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:3,6:4,2
+chr2	145541243	.	AT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,4:4,2:6,2
+chr2	145893425	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,5:7,1
+chr2	146979198	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,11:5,7:4,4
+chr2	147397397	.	AACATT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.025662;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:11,4:20,3
+chr2	147398202	.	CAAA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0031585;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:9,4:5,2
+chr2	149720221	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0004122;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:9,6:16,7
+chr2	150284846	.	CTT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr2	151285589	.	G	GA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:5,6:3,1
+chr2	153390112	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=6.0912e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:9,7:8,7
+chr2	154216802	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
+chr2	155721753	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,5:3,4:2,1
+chr2	155815260	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=2.7022e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:7,5:5,5
+chr2	156256911	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.023554;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:14,2:8,3
+chr2	156256938	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.037167;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,1:7,3
+chr2	158962657	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0033296;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,3:6,4
+chr2	159874193	.	TATTGTAA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038501;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,5:11,1
+chr2	159874209	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.02545;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,7:5,4:7,3
+chr2	160324880	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:10,4:3,1
+chr2	162820209	.	T	TTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.022136;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,7:1,3:5,4
+chr2	162908321	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053885;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
+chr2	163934847	.	TA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,5:4,1:4,4
+chr2	164142977	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,1:9,3
+chr2	166100056	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021726;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,5:6,4
+chr2	166414462	.	GATAT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,4:3,2
+chr2	167590345	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,11:4,7:1,4
+chr2	168897560	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.28347;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:9,1:12,2
+chr2	169327154	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
+chr2	169466284	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,1:1,3
+chr2	170149646	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0015602;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,3:1,3
+chr2	170681049	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.014907;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,13:5,5:2,8
+chr2	171048626	.	GAAACCC	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.022974;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,4:6,3
+chr2	171048633	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016311;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,4:5,2
+chr2	171496401	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.13598;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:19,3:11,1
+chr2	172117902	.	T	TATATATATATATACAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0056039;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,9:7,5:5,4
+chr2	172203335	.	C	CAAA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,3:2,2
+chr2	175787160	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0027568;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:7,4:12,5
+chr2	176542107	.	GA	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:3,3:3,1
+chr2	176656424	.	T	TTTCCTTCCTTCC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14559;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:11,3:1,2
+chr2	177019690	.	T	TATATATATATATATACACAC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028555;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,7:12,2:8,5
+chr2	179663713	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.021073;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
+chr2	184229750	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0060802;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,5:9,1
+chr2	184448586	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.01309;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:12,3:11,3
+chr2	186242677	.	C	CT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.0050505;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,7:1,6:0,1
+chr2	188800494	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,5:3,1
+chr2	189931387	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=4.6765e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:10,7:6,6
+chr2	190270282	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00042977;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,4:6,5
+chr2	192947802	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=5.1236e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:14,6:9,13
+chr2	194450607	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,3:6,3
+chr2	196922577	.	G	GACAC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:8,6:1,1
+chr2	197103228	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,2:3,1:2,1
+chr2	198158230	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.3187e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:6,7:10,6
+chr2	201561893	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.016233;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,5:6,4
+chr2	203216011	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.18182;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,2:2,1:1,1
+chr2	207423566	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,6:7,2:4,4
+chr2	207462764	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,3:4,1
+chr2	207818542	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,6:8,5
+chr2	208157628	.	GTT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:2,3:0,0:2,3
+chr2	208856067	.	C	CTGATGGTCCTTTAACTGCAGTGTACTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,4:6,4
+chr2	209081372	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.21538;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:8,1:5,2
+chr2	210330336	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0031353;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:3,7:3,3
+chr2	212145727	.	TAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:4,1:2,5
+chr2	212864383	.	TTA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.083654;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:7,2:19,1
+chr2	213030812	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.012393;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,7:8,4:4,3
+chr2	213322357	.	C	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:0,5:0,3:0,2
+chr2	213608771	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.863e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:11,10:8,6
+chr2	213800335	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:0,0:5,2
+chr2	214037864	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:4,4:1,1
+chr2	214977880	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0006592;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:5,4:7,5
+chr2	215786411	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.7296e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:10,5:4,7
+chr2	219933255	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:11,5:3,5
+chr2	220257285	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,2:0,2:0,0
+chr2	224305397	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,7:3,1
+chr2	224357093	.	CAAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:6,3:4,1
+chr2	224458590	.	GTT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,10:1,5:3,5
+chr2	225204941	.	C	CTTTCTTTCT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:7,3:4,3
+chr2	225655885	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,3:1,1
+chr2	225764030	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,7:2,1
+chr2	226318398	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0088417;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,2:1,2
+chr2	226354884	.	G	GT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.055746;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,2:16,2
+chr2	227656624	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.025922;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,1:9,3
+chr2	228501713	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,4:1,3:0,1
+chr2	228808589	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00014325;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,5:8,3
+chr2	230119123	.	A	AT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.18018;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,2:9,1:5,1
+chr2	231725370	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016206;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:1,3:0,2:1,1
+chr2	231801630	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:6,4:9,1
+chr2	235278477	.	C	CTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:0,3:2,2
+chr2	235831185	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,3:2,2:3,1
+chr2	237307233	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12281;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,2:3,1:2,1
+chr2	238086708	.	T	TAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.025058;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,5:0,2:1,3
+chr2	238110553	.	A	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:6,1:1,1
+chr2	240308866	.	GTGTCTC	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.077856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,4:12,3:18,1
+chr2	240411015	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,5:3,2
+chr2	240976465	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.034164;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:13,1:7,7
+chr2	241338719	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,1:3,6
+chr2	241648688	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.034034;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:13,3:12,2
+chr2	241774683	.	TC	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.039485;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,4:13,1
+chr2	241819955	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:2,2:3,1
+chr2	242006800	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,1:7,6
+chr2	242183243	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.017865;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:13,2:16,4
+chr20	149164	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.017268;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:15,1:13,7
+chr20	3635363	.	T	TAATAAATAAATA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.013238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:4,6:6,2
+chr20	4231083	.	T	TC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:6,1:11,3
+chr20	4747645	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0070897;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:7,3:9,10
+chr20	4985134	.	TC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,1:11,3
+chr20	5005000	.	A	AAAAT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.006682;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:5,5:13,4
+chr20	5250006	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0002157;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,4:5,5
+chr20	6425084	.	A	AAAAAAGAG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,8:7,1:7,7
+chr20	6690801	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,5:4,1
+chr20	7535830	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=9.0835e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,5:7,4
+chr20	7680055	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0011112;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
+chr20	7815911	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.1927e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:12,6:11,10
+chr20	8556656	.	GGT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0073495;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:4,6:6,1
+chr20	8633101	.	TACACACACAC	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00045491;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:14,7:2,7
+chr20	8896268	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,7:8,6:1,1
+chr20	9879554	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:5,4:1,2
+chr20	10082287	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:10,7:2,1
+chr20	10891617	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:3,3:3,1
+chr20	11374566	.	TTA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.049139;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,1:11,5
+chr20	11854879	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0018815;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:3,5:2,5
+chr20	11859724	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:9,6:4,1
+chr20	12342744	.	GA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,1:13,3
+chr20	12681880	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.03842;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,4:9,2
+chr20	13612491	.	A	AACAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0024835;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:9,5:3,5
+chr20	14071695	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=4.2509e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:15,5:4,6
+chr20	17479809	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,12:2,4:4,8
+chr20	17504905	.	G	GT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0028667;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,5:8,4
+chr20	20000330	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0028364;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:12,4:7,3
+chr20	20000533	.	AC	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0012459;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,3:16,6
+chr20	21353266	.	C	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:1,1:4,1
+chr20	22762349	.	TAGAGAC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,5:1,3:3,2
+chr20	22904023	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:7,4:7,4
+chr20	24913641	.	TG	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.019011;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:8,2:10,6
+chr20	25472324	.	GATATAT	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.039341;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,2:0,2
+chr20	25594374	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0056638;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,7:5,1
+chr20	25611226	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.026832;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:7,4:3,1
+chr20	26220241	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.058134;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:24,1:20,4
+chr20	26478052	.	C	A	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.047425;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:75,11:26,8:49,3
+chr20	26568343	.	GT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:13,4:0,0
+chr20	26568349	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.29565;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:14,3:0,0
+chr20	26697336	.	G	A	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.032344;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:89,19:39,10:50,9
+chr20	27291338	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr20	28299891	.	A	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.048496;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:15,3:17,6
+chr20	28546561	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:3,1:7,4
+chr20	28636613	.	C	G	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.012643;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:32,9:11,2
+chr20	28638505	.	GCCTTGGT	G	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.0032755;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:64,18:40,8:24,10
+chr20	28804568	.	A	G	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.03277;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:91,19:72,15:19,4
+chr20	29076856	.	TG	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.014499;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,4:12,7
+chr20	29105731	.	AAT	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.015946;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,5:10,3:15,2
+chr20	29312353	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023024;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:6,6:7,2
+chr20	29312389	.	AG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0005304;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:6,5:4,5
+chr20	29312393	.	AAAG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.018356;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:8,3:5,4
+chr20	29312487	.	AAGGG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.035323;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:14,5:1,3
+chr20	29513081	.	G	A	0	PASS	DP=314;GPV=1;SPV=0.016919;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:134,17:88,13:46,4
+chr20	29877931	.	G	A	0	PASS	DP=306;GPV=1;SPV=0.043172;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:130,19:55,12:75,7
+chr20	29880455	.	G	A	0	PASS	DP=461;GPV=1;SPV=0.028207;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:193,33:106,16:87,17
+chr20	30185432	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.027227;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:17,3:12,6
+chr20	30198474	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:5,3:3,1
+chr20	30217154	.	A	G	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.043773;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:58,10:32,6:26,4
+chr20	30217160	.	A	C	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.028517;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:30,7:22,4
+chr20	30296138	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.048995;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:13,2:16,4
+chr20	30358649	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.024141;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:16,9:18,4
+chr20	30401783	.	TTTCTA	T	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.026485;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:28,3:26,3
+chr20	30638478	.	T	C	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.03661;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:57,14:24,2:33,12
+chr20	30674344	.	TA	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.039831;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:77,16:37,8:40,8
+chr20	30756951	.	G	GT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.048775;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:14,1:18,4
+chr20	30815445	.	C	T	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.024294;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:113,20:50,7:63,13
+chr20	30820376	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.017537;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:17,2:21,3
+chr20	30839004	.	G	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.01741;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:54,15:32,5:22,10
+chr20	31056505	.	TTGGAA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:11,4:7,1
+chr20	31058549	.	T	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.037815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:42,13:24,7:18,6
+chr20	31059753	.	C	A	0	PASS	DP=204;GPV=1;SPV=0.033896;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:82,14:40,7:42,7
+chr20	31061380	.	GAATGGAATGT	G	0	PASS	DP=863;GPV=1;SPV=0.0043696;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:415:368,44:168,18:200,26
+chr20	31063668	.	A	AGGAAT	0	PASS	DP=219;GPV=1;SPV=0.0067066;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:80,13:52,7:28,6
+chr20	31064863	.	T	A	0	PASS	DP=257;GPV=1;SPV=0.019901;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:102,15:45,8:57,7
+chr20	31069987	.	T	G	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0013934;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:56,12:38,7:18,5
+chr20	31082413	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015968;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:9,2:3,9
+chr20	31186507	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.025853;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,3:13,4
+chr20	33329513	.	TC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=6.0153e-06;SS=2;SSC=52;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:11,9:7,7
+chr20	33329515	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.001032;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:31:0,16:0,8:0,8
+chr20	36406397	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.039259;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,3:2,1
+chr20	37480584	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,5:0,1:0,4
+chr20	37614567	.	ATATATTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,6:4,4
+chr20	38209339	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=4.435e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:10,5:14,10
+chr20	38379407	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:17,1:6,3
+chr20	39238316	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011004;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,12:8,7:7,5
+chr20	41000645	.	G	GAAAATAAAATAAAATAAAAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,12:4,7:3,5
+chr20	41918191	.	TTTCC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,6:0,4:0,2
+chr20	42516774	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00011008;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:12,5:7,8
+chr20	47184413	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:7,6:4,9
+chr20	47255746	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,1:1,4
+chr20	48160689	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.1812e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:20,25:8,12:12,13
+chr20	48280400	.	AT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0038123;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,7:7,4:4,3
+chr20	48514859	.	C	G	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.01884;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:25,7:19,7
+chr20	49132759	.	CCAAAA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.035929;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:8,7:15,5
+chr20	49722846	.	A	AATAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:9,3:4,1
+chr20	49972568	.	TA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0044123;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,3:3,6
+chr20	50162720	.	G	GACAC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.051458;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,2:10,2
+chr20	52881023	.	T	TTC	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.053561;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:20,2:16,3
+chr20	52913480	.	C	CCTCTCTCT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:6,4:3,1
+chr20	53179221	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0017056;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:7,3:10,4
+chr20	54311908	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.2211e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:6,4:12,7
+chr20	55408731	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00035994;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:16,3:13,9
+chr20	55734036	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.01291;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:8,6:10,5
+chr20	56705597	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00062884;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:18,9:16,2
+chr20	58386147	.	A	ATTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0082573;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,3:5,2
+chr20	60875644	.	T	TCTTTCTTTCTTTCTTTCTTC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053977;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,5:6,3:10,2
+chr20	61202206	.	T	TG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,3:10,1:7,2
+chr20	61214659	.	A	ATGTGTGTGTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.076601;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,7:5,5:7,2
+chr20	61340589	.	CT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0028186;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,6:6,2
+chr20	61868708	.	G	GTGTCCCCCCACACTGGGCGGA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.015604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,9:6,3:15,6
+chr20	62313988	.	AGT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:1,4:2,2
+chr21	5216824	.	A	T	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.033361;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:118,15:66,9:52,6
+chr21	5222177	.	T	A	0	PASS	DP=233;GPV=1;SPV=0.0064634;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:81,18:28,8:53,10
+chr21	5235224	.	T	G	0	PASS	DP=454;GPV=1;SPV=0.0030909;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:239:215,24:88,15:127,9
+chr21	5314304	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,2:4,3
+chr21	5367797	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.012914;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,4:3,4
+chr21	6373962	.	T	A	0	PASS	DP=285;GPV=1;SPV=0.019912;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:117,19:73,8:44,11
+chr21	6375346	.	T	C	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=0.039471;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:176:156,20:77,4:79,16
+chr21	7209105	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0026385;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:0,1:9,7
+chr21	7222022	.	A	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.021295;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:17,2:18,10
+chr21	7225469	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.021579;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:21,3:18,3
+chr21	7284211	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.019625;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:16,1:19,6
+chr21	7307621	.	G	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0019938;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:17,5:21,2
+chr21	7921289	.	T	C	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.028675;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:50,13:24,7:26,6
+chr21	7930121	.	A	G	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.046157;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:86,17:45,9:41,8
+chr21	8229974	.	C	CCT	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.017801;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:113,14:19,4:94,10
+chr21	8401672	.	A	G	0	PASS	DP=1680;GPV=1;SPV=0.00098206;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:675:599,76:379,45:220,31
+chr21	8434180	.	T	C	0	PASS	DP=11481;GPV=1;SPV=0.0010525;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:5295:4745,549:2821,341:1924,208
+chr21	8443332	.	CT	C	0	PASS	DP=4328;GPV=1;SPV=0.0030189;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1924:1731,193:144,4:1587,189
+chr21	8447275	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:0,0:6,2
+chr21	8465033	.	G	A	0	PASS	DP=1572;GPV=1;SPV=0.0013903;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:536:461,67:211,42:250,25
+chr21	8540814	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:20,4:0,0
+chr21	8554165	.	G	GATGAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,4:0,0
+chr21	8584900	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037765;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:6,3:14,3
+chr21	8600030	.	AATCATCATC	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,2:1,2:0,0
+chr21	8760950	.	TATA	T	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.038391;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:118,18:59,2:59,16
+chr21	8762801	.	C	T	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.035066;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:67,14:34,9:33,5
+chr21	8766588	.	G	T	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.0076057;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:86,20:35,9:51,11
+chr21	8786330	.	T	TTA	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.01398;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:135,17:65,12:70,5
+chr21	8793237	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.025634;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:15,9:21,2
+chr21	8800254	.	C	T	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.033041;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:70,14:37,10:33,4
+chr21	8806881	.	CGCGT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:5,3:11,5
+chr21	8839468	.	G	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.014375;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:8,5:18,5
+chr21	8839785	.	C	T	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.044078;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:68,10:52,6:16,4
+chr21	8840921	.	C	T	0	PASS	DP=319;GPV=1;SPV=0.017205;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:136,19:46,2:90,17
+chr21	8842183	.	AC	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.036589;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:17,8:21,4
+chr21	8845410	.	A	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.038644;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:10,4:24,4
+chr21	8848326	.	G	T	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.027845;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:102,15:51,4:51,11
+chr21	8851808	.	T	G	0	PASS	DP=369;GPV=1;SPV=0.002886;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:193:158,35:73,16:85,19
+chr21	8854791	.	G	A	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.0017759;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:11,8:33,7
+chr21	8858689	.	T	A	0	PASS	DP=338;GPV=1;SPV=0.024747;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:153,29:86,9:67,20
+chr21	8879134	.	T	G	0	PASS	DP=448;GPV=1;SPV=0.012621;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:220:196,24:111,11:85,13
+chr21	8880786	.	T	G	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.008366;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:106,15:41,3:65,12
+chr21	8999488	.	A	T	0	PASS	DP=318;GPV=1;SPV=0.031407;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:138,19:76,7:62,12
+chr21	9004659	.	A	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.0011357;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:53,16:29,8:24,8
+chr21	9016088	.	G	C	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.017335;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:134,21:73,16:61,5
+chr21	9016237	.	A	G	0	PASS	DP=369;GPV=1;SPV=0.0115;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:153,28:76,15:77,13
+chr21	9026251	.	G	A	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.016619;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:130,23:62,17:68,6
+chr21	9026268	.	T	C	0	PASS	DP=327;GPV=1;SPV=0.013028;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:137,22:65,17:72,5
+chr21	9032681	.	C	T	0	PASS	DP=332;GPV=1;SPV=0.04664;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:146,18:69,11:77,7
+chr21	9050202	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.04952;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:23,6:23,8
+chr21	9064459	.	G	A	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.036768;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:127,16:68,6:59,10
+chr21	9086619	.	C	T	0	PASS	DP=335;GPV=1;SPV=0.026265;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:132,22:73,11:59,11
+chr21	9102967	.	T	C	0	PASS	DP=332;GPV=1;SPV=0.0097214;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:144,17:73,14:71,3
+chr21	9108624	.	G	A	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.031242;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:84,11:46,5:38,6
+chr21	9118263	.	G	A	0	PASS	DP=367;GPV=1;SPV=0.012376;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:156,35:91,23:65,12
+chr21	9118901	.	G	A	0	PASS	DP=406;GPV=1;SPV=0.014637;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:202:170,32:97,18:73,14
+chr21	9121545	.	A	T	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.00068551;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:109,23:50,14:59,9
+chr21	9121963	.	C	T	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.033951;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:92,17:55,10:37,7
+chr21	9131132	.	C	T	0	PASS	DP=454;GPV=1;SPV=0.036715;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:222:196,26:98,9:98,17
+chr21	9132966	.	G	C	0	PASS	DP=412;GPV=1;SPV=0.024501;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:165,26:84,9:81,17
+chr21	9142219	.	T	A	0	PASS	DP=508;GPV=1;SPV=0.024478;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:251:217,34:112,16:105,18
+chr21	9165984	.	A	G	0	PASS	DP=377;GPV=1;SPV=0.0079952;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:190:111,23:56,13:55,10
+chr21	9167416	.	A	G	0	PASS	DP=357;GPV=1;SPV=0.044098;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:189:167,22:103,4:64,18
+chr21	9172802	.	A	G	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.013747;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:161,22:100,11:61,11
+chr21	9173280	.	T	A	0	PASS	DP=390;GPV=1;SPV=0.013109;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:199:168,31:72,11:96,20
+chr21	9174974	.	G	T	0	PASS	DP=258;GPV=1;SPV=0.031092;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:114,17:43,7:71,10
+chr21	9189404	.	C	T	0	PASS	DP=417;GPV=1;SPV=0.043995;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:203:179,24:85,13:94,11
+chr21	9248111	.	G	T	0	PASS	DP=432;GPV=1;SPV=0.033383;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:216:190,26:89,10:101,16
+chr21	9248375	.	CAGTGG	C	0	PASS	DP=350;GPV=1;SPV=0.0208;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:115,25:67,21:48,4
+chr21	9251567	.	T	C	0	PASS	DP=1009;GPV=1;SPV=0.00015531;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:529:455,74:218,39:237,35
+chr21	9254687	.	A	G	0	PASS	DP=489;GPV=1;SPV=0.0030471;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:234:201,33:105,19:96,14
+chr21	9262060	.	CTT	C	0	PASS	DP=248;GPV=1;SPV=0.026434;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:116,14:63,10:53,4
+chr21	9265351	.	G	GT	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.0053784;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:166,33:87,19:79,14
+chr21	9272355	.	A	G	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.022441;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:90,10:37,7:53,3
+chr21	9274547	.	A	C	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.047456;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:144,26:110,15:34,11
+chr21	9292728	.	C	A	0	PASS	DP=490;GPV=1;SPV=0.0051027;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:237:196,41:102,22:94,19
+chr21	9296111	.	T	C	0	PASS	DP=282;GPV=1;SPV=0.0071273;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:125,17:43,7:82,10
+chr21	9296276	.	G	C	0	PASS	DP=399;GPV=1;SPV=0.0094903;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:180,29:108,16:72,13
+chr21	9303023	.	C	T	0	PASS	DP=413;GPV=1;SPV=0.031045;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:207:182,25:96,9:86,16
+chr21	9310548	.	A	G	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.046618;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:141,19:70,9:71,10
+chr21	9324691	.	A	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.049403;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,9:23,3:26,6
+chr21	9330352	.	G	A	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.011472;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:112,13:57,7:55,6
+chr21	9331411	.	G	A	0	PASS	DP=363;GPV=1;SPV=0.040762;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:154,23:68,11:86,12
+chr21	9342123	.	C	T	0	PASS	DP=415;GPV=1;SPV=0.018889;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:206:180,26:86,9:94,17
+chr21	9345074	.	C	T	0	PASS	DP=428;GPV=1;SPV=0.00093647;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:201,32:111,23:90,9
+chr21	9348919	.	G	T	0	PASS	DP=335;GPV=1;SPV=0.0015484;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:187:161,26:80,18:81,8
+chr21	9361283	.	G	A	0	PASS	DP=650;GPV=1;SPV=0.013952;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:333:296,37:135,19:161,18
+chr21	9365190	.	T	C	0	PASS	DP=618;GPV=1;SPV=0.0045248;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:320:269,51:137,36:132,15
+chr21	9365624	.	G	T	0	PASS	DP=588;GPV=1;SPV=0.024203;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:298:261,37:92,17:169,20
+chr21	9556399	.	A	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.0091486;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:57,21:29,7:28,14
+chr21	9606113	.	G	A	0	PASS	DP=159;GPV=1;SPV=0.031226;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:68,19:24,6:44,13
+chr21	9628172	.	T	G	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.0069375;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:52,18:26,13:26,5
+chr21	9638268	.	G	A	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=8.9074e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:27,13:25,2
+chr21	9765488	.	A	AGTGTAGTGAATGATGGGACAGT	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.0041422;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:42,19:21,13:21,6
+chr21	9821495	.	G	C	0	PASS	DP=1275;GPV=1;SPV=0.046842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:607:499,67:285,26:214,41
+chr21	9850023	.	A	G	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.018431;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:27,3:34,5
+chr21	9881159	.	T	C	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.0019529;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:57,22:27,8:30,14
+chr21	9919461	.	C	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.039548;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:52,13:28,9:24,4
+chr21	9990371	.	A	C	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.020704;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:53,14:24,4:29,10
+chr21	10021470	.	C	G	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.0040553;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:48,18:16,6:32,12
+chr21	10080386	.	A	T	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.040884;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:65,17:41,7:24,10
+chr21	10086175	.	C	T	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0010453;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:54,24:30,14:24,10
+chr21	10097757	.	T	A	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.0084706;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:45,16:29,12:16,4
+chr21	10151268	.	T	C	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.049348;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:59,13:35,8:24,5
+chr21	10272847	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00045089;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,5:7,6
+chr21	10324728	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.039697;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,3:19,1
+chr21	10329291	.	C	T	0	PASS	DP=323;GPV=1;SPV=0.016545;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:125,23:53,8:72,15
+chr21	10342477	.	C	A	0	PASS	DP=372;GPV=1;SPV=0.046158;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:189:166,23:87,8:79,15
+chr21	10361114	.	C	G	0	PASS	DP=593;GPV=1;SPV=0.024432;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:293:254,39:133,18:121,21
+chr21	10365143	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.013531;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:23,4:19,3
+chr21	10392780	.	C	T	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.028575;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:73,14:22,4:51,10
+chr21	10406244	.	C	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.0021767;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:76,9:17,2:59,7
+chr21	10415521	.	G	T	0	PASS	DP=381;GPV=1;SPV=0.00088859;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:146,37:72,16:74,21
+chr21	10415652	.	G	A	0	PASS	DP=418;GPV=1;SPV=0.010425;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:195:163,32:102,22:61,10
+chr21	10417512	.	G	A	0	PASS	DP=629;GPV=1;SPV=0.018643;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:323:275,48:164,25:111,23
+chr21	10419095	.	G	A	0	PASS	DP=598;GPV=1;SPV=0.020884;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:296:260,36:116,20:144,16
+chr21	10420063	.	G	T	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.0094397;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:98,25:40,12:58,13
+chr21	10422931	.	G	GT	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.049712;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:105,13:71,9:34,4
+chr21	10425535	.	G	A	0	PASS	DP=585;GPV=1;SPV=0.025935;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:302:264,38:133,18:131,20
+chr21	10429776	.	A	G	0	PASS	DP=602;GPV=1;SPV=0.049364;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:300:263,37:128,21:135,16
+chr21	10430637	.	C	T	0	PASS	DP=471;GPV=1;SPV=0.005776;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:231:201,30:102,15:99,15
+chr21	10437112	.	A	G	0	PASS	DP=393;GPV=1;SPV=0.046443;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:173,27:68,8:105,19
+chr21	10445465	.	T	A	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.048543;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:61,9:29,7:32,2
+chr21	10449982	.	C	G	0	PASS	DP=302;GPV=1;SPV=0.018207;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:115,24:59,7:56,17
+chr21	10449987	.	TATTTC	T	0	PASS	DP=316;GPV=1;SPV=0.037054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:146:127,19:68,5:59,14
+chr21	10451024	.	A	C	0	PASS	DP=406;GPV=1;SPV=0.02949;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:161,25:73,8:88,17
+chr21	10461146	.	T	C	0	PASS	DP=344;GPV=1;SPV=0.020052;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:143,25:75,14:68,11
+chr21	10462629	.	C	T	0	PASS	DP=385;GPV=1;SPV=0.014232;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:193:158,35:74,16:84,19
+chr21	10464875	.	G	A	0	PASS	DP=412;GPV=1;SPV=0.015602;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:215:179,36:80,20:99,16
+chr21	10467788	.	C	G	0	PASS	DP=398;GPV=1;SPV=0.0066795;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:156,25:84,10:72,15
+chr21	10475546	.	C	T	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.025186;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:130,19:54,8:76,11
+chr21	10583185	.	C	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=1.6182e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:54,16:32,10:22,6
+chr21	10665385	.	A	G	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.021267;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:51,15:26,7:25,8
+chr21	10693311	.	C	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.040129;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:20,7:25,5
+chr21	10744491	.	C	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0060775;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,8:25,4:21,4
+chr21	10745524	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:25,3:0,1
+chr21	10806728	.	G	A	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.015258;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:161,19:79,9:82,10
+chr21	13282962	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:15,4:14,1
+chr21	13330523	.	TTATCTATC	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:0,2:3,4
+chr21	13352710	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00012397;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:11,7:3,3
+chr21	13432290	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.029835;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:12,5:14,2
+chr21	13524811	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.031128;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:14,1:14,4
+chr21	13530697	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.046744;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:14,5:15,4
+chr21	18194603	.	TA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=9.7744e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,4:9,5
+chr21	19227218	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.047782;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,2:9,2
+chr21	20508555	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,1:8,3
+chr21	21994806	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.16587;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,5:7,4:4,1
+chr21	23072541	.	CTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:3,3:1,1
+chr21	23219743	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.6336e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:13,2:5,10
+chr21	23685848	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038906;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:15,5:15,1
+chr21	24811016	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0025828;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,8:12,3
+chr21	25655350	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,3:5,3
+chr21	26062230	.	A	AAC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,4:3,1
+chr21	27240865	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00026636;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:12,7:11,4
+chr21	27257780	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00075779;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:11,5:12,4
+chr21	27940507	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0092633;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,6:3,3
+chr21	28413998	.	T	TC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03733;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,6:2,1:3,5
+chr21	28831522	.	AGAAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030571;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,3:2,2
+chr21	30571058	.	T	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.015937;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:14,3:15,5
+chr21	31941311	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:7,2:9,3
+chr21	32481509	.	G	GA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.004816;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,4:0,1
+chr21	33237082	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:5,3:9,4
+chr21	33337714	.	TATAC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015793;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,3:7,3
+chr21	34671143	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,3:2,2:2,1
+chr21	34787254	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00019352;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:7,5:7,3
+chr21	35526972	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
+chr21	35704576	.	GAGAA	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.012821;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:2,3:1,2
+chr21	35960240	.	CTCTCTA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,2:13,2
+chr21	36176106	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:6,2:8,5
+chr21	37004264	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,2:3,2
+chr21	37033999	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013362;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,3:4,3
+chr21	37389925	.	G	GT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.021798;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:7,5:6,2
+chr21	39177130	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=6.2544e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:15,6:9,8
+chr21	39245602	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:4,2:2,1:2,1
+chr21	39378669	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:1,2:0,1:1,1
+chr21	39715048	.	CT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:0,2:0,0:0,2
+chr21	39819608	.	TCTATC	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,2:5,2
+chr21	39953826	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.02087;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,3:3,3
+chr21	40898219	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0052114;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:11,3:7,3
+chr21	42840044	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021256;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,3:5,3
+chr21	44863127	.	G	GAC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.043229;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,6:16,5:14,1
+chr21	44972960	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.029276;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:11,4:12,2
+chr21	44973001	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0041395;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:11,5:12,2
+chr21	45902313	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0076628;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
+chr21	46294304	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.015045;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,2:2,4
+chr22	10547332	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.054545;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
+chr22	10550830	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,4:0,0
+chr22	10709382	.	CT	C	0	PASS	DP=366;GPV=1;SPV=0.023069;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:167,29:97,14:70,15
+chr22	10753801	.	A	G	0	PASS	DP=320;GPV=1;SPV=0.04636;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:140,23:64,12:76,11
+chr22	10754578	.	A	G	0	PASS	DP=386;GPV=1;SPV=0.04514;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:164,27:62,5:102,22
+chr22	10761243	.	C	CAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,8:6,4:4,4
+chr22	10765275	.	G	A	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.018029;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:60,16:18,9:42,7
+chr22	10780040	.	A	C	0	PASS	DP=296;GPV=1;SPV=0.011605;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:120,27:71,14:49,13
+chr22	11027060	.	A	G	0	PASS	DP=315;GPV=1;SPV=0.045494;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:135,19:86,9:49,10
+chr22	11338143	.	C	T	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.04179;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:103,22:55,13:48,9
+chr22	11348943	.	A	C	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.039295;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:70,12:29,7:41,5
+chr22	11477170	.	C	T	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.041719;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:66,15:33,9:33,6
+chr22	11696409	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00756;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:2,1:12,6
+chr22	11704981	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.03093;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,7:25,6:9,1
+chr22	11710948	.	A	G	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.019466;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:53,15:36,11:17,4
+chr22	11801203	.	C	G	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.045184;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,15:37,9:21,6
+chr22	11808059	.	T	C	0	PASS	DP=227;GPV=1;SPV=0.039916;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:96,19:56,10:40,9
+chr22	11854158	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.042122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,2:5,6
+chr22	11863430	.	G	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.026088;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:16,3:24,8
+chr22	11870867	.	T	C	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.0070634;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:53,17:34,15:19,2
+chr22	11871871	.	T	A	0	PASS	DP=685;GPV=1;SPV=0.032896;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:347:311,36:178,18:133,18
+chr22	11874817	.	T	C	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.025014;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:145,19:93,8:52,11
+chr22	11912157	.	G	T	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.034312;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:77,19:38,11:39,8
+chr22	11912224	.	C	T	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.042527;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:79,15:34,8:45,7
+chr22	11913684	.	G	A	0	PASS	DP=363;GPV=1;SPV=0.035839;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:140,28:45,9:95,19
+chr22	11914787	.	T	C	0	PASS	DP=411;GPV=1;SPV=0.046627;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:183,29:109,15:74,14
+chr22	11917800	.	A	G	0	PASS	DP=585;GPV=1;SPV=0.029142;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:297:258,39:118,20:140,19
+chr22	11940484	.	T	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.011798;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:26,2:22,5
+chr22	11942962	.	CA	C	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.0055173;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:47,12:33,10:14,2
+chr22	11972802	.	G	A	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.0050678;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:50,19:27,9:23,10
+chr22	11974475	.	C	A	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.037788;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:64,10:13,5:51,5
+chr22	12036085	.	C	A	0	PASS	DP=334;GPV=1;SPV=0.0045758;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:141,18:61,11:80,7
+chr22	12060744	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016594;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:2,2:14,4
+chr22	12112120	.	G	T	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.029151;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:58,16:28,6:30,10
+chr22	12119341	.	A	C	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.0067648;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:30,2:22,13
+chr22	12154648	.	C	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.015096;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:22,2:22,4
+chr22	12166049	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.028904;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:14,5:4,2
+chr22	12193191	.	G	T	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.0023926;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:74,20:50,8:24,12
+chr22	12193684	.	A	G	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.047103;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:108,16:53,7:55,9
+chr22	12199201	.	A	C	0	PASS	DP=333;GPV=1;SPV=0.015491;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:130,19:55,11:75,8
+chr22	12200388	.	G	A	0	PASS	DP=344;GPV=1;SPV=0.014258;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:172:152,20:76,9:76,11
+chr22	12209191	.	T	G	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.0033214;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:55,17:30,8:25,9
+chr22	12218039	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.012776;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:40,14:25,5:15,9
+chr22	12218817	.	TTATTTA	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.0064636;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:67,21:42,16:25,5
+chr22	12295505	.	A	G	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.033746;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:63,8:23,1:40,7
+chr22	12315376	.	A	AG	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0562;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,2:11,2
+chr22	12315438	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0096691;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:24,8:6,6
+chr22	12362977	.	A	G	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.04804;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:83,10:50,6:33,4
+chr22	12368037	.	G	A	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.038911;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:23,5:23,9
+chr22	12421244	.	TA	T	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.011472;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:70,10:39,4:31,6
+chr22	12559389	.	TG	T	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.047491;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:71,13:32,6:39,7
+chr22	12619844	.	C	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.014369;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:63,14:32,10:31,4
+chr22	12637781	.	TAAG	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.054264;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:19,4:0,0
+chr22	12703951	.	G	T	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.048991;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:83,18:50,12:33,6
+chr22	12709021	.	A	C	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.018392;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:94,11:55,6:39,5
+chr22	12720922	.	C	G	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.038263;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:75,14:31,9:44,5
+chr22	12721011	.	A	G	0	PASS	DP=279;GPV=1;SPV=0.044359;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:105,21:41,9:64,12
+chr22	12787768	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.044641;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,4:10,1
+chr22	12804136	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.048003;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:15,4:10,1
+chr22	12811984	.	A	C	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=0.019622;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:66,19:28,10:38,9
+chr22	12871086	.	C	G	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.043857;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:78,14:51,7:27,7
+chr22	12875723	.	T	A	0	PASS	DP=299;GPV=1;SPV=0.0087155;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:111,27:30,14:81,13
+chr22	12879835	.	G	A	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.01238;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:71,19:47,8:24,11
+chr22	12889651	.	G	A	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.047833;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:101,12:71,10:30,2
+chr22	12891489	.	C	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.04238;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:73,10:42,6:31,4
+chr22	13533510	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr22	15220225	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,3:6,1
+chr22	15480387	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0083426;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,7:2,1
+chr22	15562148	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,3:0,1
+chr22	15748494	.	C	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.042235;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:24,6:18,4
+chr22	15752140	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.044153;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,3:5,2
+chr22	15787648	.	TTG	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.033621;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:14,5:29,9
+chr22	15815076	.	C	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.049247;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,10:25,5:22,5
+chr22	15837952	.	T	TTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.026661;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,5:19,2:25,3
+chr22	15856012	.	T	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.011448;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:38,13:22,6:16,7
+chr22	15881643	.	G	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
+chr22	16164202	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0006592;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:10,6:2,3
+chr22	16416347	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.044716;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:11,3:13,4
+chr22	16431788	.	A	AT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0025099;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:11,11:13,6
+chr22	16434619	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.011955;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:18,5:14,3
+chr22	16450533	.	C	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.038122;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:52,12:25,8:27,4
+chr22	17178722	.	A	AGAGTGAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:5,3:3,4
+chr22	17343151	.	G	GT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0086626;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,3:7,2
+chr22	17605694	.	T	TC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:5,7:4,1
+chr22	17626325	.	A	AAAAG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,8:2,1:0,7
+chr22	18125513	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,4:2,1
+chr22	18188614	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048922;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:15,2:5,3
+chr22	18234348	.	A	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.051478;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:15,1:18,3
+chr22	18363031	.	G	GA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.012473;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:13,4:20,5
+chr22	18846304	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,2:3,4
+chr22	18982721	.	C	CAAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.025058;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,5:0,4:1,1
+chr22	20164469	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.035289;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:13,3:6,3
+chr22	20341553	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:1,2:4,1
+chr22	20343677	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0022919;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:44,17:21,10:23,7
+chr22	21135936	.	G	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.011147;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:53,6:30,3:23,3
+chr22	21166611	.	G	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
+chr22	21166864	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0017012;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,3:6,4
+chr22	21170330	.	G	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,1:4,5
+chr22	21313803	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:12,4:1,0
+chr22	21335516	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:12,6:11,3
+chr22	21789843	.	T	TATAACATAACATAACATAAC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.040169;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:8,1:9,3
+chr22	22517876	.	T	TAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.02002;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,7:5,2
+chr22	23331669	.	A	AATTATTATT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,7:0,4:5,3
+chr22	23855210	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.054545;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:2,2:4,1
+chr22	26451996	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,2:0,1:6,1
+chr22	29159124	.	G	GT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,3:6,1
+chr22	29402766	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.012187;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:10,2:3,6
+chr22	29535261	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,6:2,1
+chr22	30076606	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.4205e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:15,6:11,7
+chr22	30308332	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.044913;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:14,8:15,1
+chr22	32505862	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0023186;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,4:7,5
+chr22	32799358	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0038291;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:11,4:9,3
+chr22	33201344	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,5:7,3:6,2
+chr22	33282639	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00017455;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:11,6:15,5
+chr22	33403962	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0014018;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:8,3:12,8
+chr22	35694644	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027592;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,4:11,2
+chr22	39018818	.	CAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:10,5:3,1
+chr22	41132286	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,4:3,1
+chr22	41167560	.	TTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,4:6,2
+chr22	41194019	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:6,2:1,4
+chr22	42666228	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013014;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
+chr22	44284901	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.052629;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:8,3:14,2
+chr22	45182623	.	G	GT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0049438;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,6:3,5:0,1
+chr22	47493701	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.4873e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,7:9,4
+chr22	49072416	.	A	AAAAAGAAG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,4:3,3:2,1
+chr22	50021649	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0099771;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,6:2,1
+chr3	1119322	.	C	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:4,5:3,1
+chr3	1170236	.	C	CA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,6:3,1
+chr3	1210426	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.029963;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:12,5:3,5
+chr3	1348241	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:4,4:6,4
+chr3	2226518	.	AATT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=7.6384e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:8,9:6,4
+chr3	2520259	.	CTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:4,2:0,2
+chr3	3339466	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:2,4:2,1
+chr3	3762779	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,3:8,3
+chr3	5306469	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.02882;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,3:5,3
+chr3	8831343	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,5:3,4:0,1
+chr3	9972462	.	GAAA	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:4,5:1,1
+chr3	11294017	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,5:3,2
+chr3	12221298	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,6:4,1
+chr3	14738817	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,5:7,2:4,3
+chr3	16633137	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,6:1,4:2,2
+chr3	18846669	.	G	GT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.046332;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,2:4,2
+chr3	19293817	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0040349;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:12,6:13,5
+chr3	20018690	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,2:10,2
+chr3	20312112	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,2:2,1:5,1
+chr3	20356709	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00069576;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:8,2:12,8
+chr3	20595413	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.2171e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:14,8:10,5
+chr3	21148171	.	A	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,3:3,1:1,2
+chr3	21193894	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0054797;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:9,6:13,3
+chr3	22380646	.	G	GGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0068755;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:10,5:6,6
+chr3	22541727	.	ATATATGTG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:7,4:6,1
+chr3	22541750	.	CATATATATGTGTACAT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr3	22813731	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,4:1,3
+chr3	23196721	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:0,2:0,1:0,1
+chr3	23842245	.	GT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,1:7,3
+chr3	25785136	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,2:0,1:0,1
+chr3	27204305	.	T	TTTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11053;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:0,0:5,2
+chr3	27884071	.	GAT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13793;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:7,2:6,1
+chr3	28255241	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.011037;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:4,4:1,2
+chr3	28649287	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.017646;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,3:9,2
+chr3	29475379	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0033004;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:8,6:7,9
+chr3	30034589	.	AAAGGAAGGAAGGAAGG	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:1,3:3,1
+chr3	32249030	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:1,2:1,2
+chr3	32721647	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027191;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,4:2,2
+chr3	35253133	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0033254;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:9,4:9,2
+chr3	35305121	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.030376;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:18,2:9,5
+chr3	36104907	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.020196;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
+chr3	36183915	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016738;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:10,10:4,2
+chr3	36346943	.	AG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00077087;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,3:5,4
+chr3	36515975	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,4:2,3
+chr3	40846033	.	C	CAG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,5:8,2:6,3
+chr3	42349199	.	T	TTC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0070739;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:2,3:8,5
+chr3	42349200	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:2,4:10,6
+chr3	42743587	.	T	TTATATATATATATATATATATA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0084353;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:4,4:5,1
+chr3	44723874	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,5:1,2:2,3
+chr3	45415897	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,4:1,2:0,2
+chr3	45569952	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,2:7,2
+chr3	46372541	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.039302;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,3:15,2
+chr3	46441899	.	CAGAGAG	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:10,2:7,2
+chr3	46507138	.	C	CATT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.035511;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:8,3:10,6
+chr3	50281670	.	A	AT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,3:2,1
+chr3	52718472	.	CAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:3,4:1,1
+chr3	53221115	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:3,4:0,2
+chr3	54060178	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0070234;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:3,4:3,1
+chr3	54226312	.	C	CTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,4:2,1
+chr3	55222209	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.032887;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:7,4:17,3
+chr3	55675960	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0014155;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,3:6,4
+chr3	57054643	.	AT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,2:4,3
+chr3	57427113	.	ATATT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0052761;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:6,6:5,4
+chr3	57754987	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037959;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:7,3:4,1
+chr3	58003748	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015516;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,4:5,3
+chr3	60895665	.	CCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:0,2:7,4
+chr3	61900879	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=9.0511e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:11,8:6,7
+chr3	62926096	.	GAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:14,3:7,1
+chr3	63112336	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.0035e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:11,6:9,8
+chr3	64451256	.	C	CAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,6:2,3:1,3
+chr3	64670139	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,4:4,3:7,1
+chr3	65132927	.	GA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.28173;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,4:4,2:7,2
+chr3	65346987	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=7.1534e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:11,9:12,7
+chr3	67350128	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00056247;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:8,9:9,3
+chr3	68021185	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:7,3:4,1
+chr3	68545006	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0007761;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,5:4,2
+chr3	70336814	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:3,4:3,1
+chr3	73203639	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.03385;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:10,2:17,3
+chr3	74391557	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:5,5:2,1
+chr3	74711393	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0012182;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:13,3:3,6
+chr3	75446337	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.079329;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:8,5:2,1
+chr3	75646619	.	G	A	0	PASS	DP=236;GPV=1;SPV=0.020742;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:109,16:54,7:55,9
+chr3	75825024	.	G	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.042449;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:54,10:33,1:21,9
+chr3	76427003	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0039305;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,2:11,4
+chr3	77039673	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.0271e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,19:6,4:9,15
+chr3	77135567	.	AT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00070906;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,6:4,2
+chr3	77323048	.	ATATAATATAT	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.068138;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:19,3:13,1
+chr3	78251357	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0010255;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,3:10,7
+chr3	78310783	.	GA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:12,5:2,1
+chr3	78311905	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0034481;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,4:5,3
+chr3	78941630	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.000461;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:4,4:12,5
+chr3	79519628	.	C	CAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:3,3:4,1
+chr3	79675075	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.095104;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,2:17,2
+chr3	79675076	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.11141;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,2:15,2
+chr3	80594472	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.9796e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:11,5:6,10
+chr3	82214511	.	CGT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,2:16,2
+chr3	82915520	.	A	AAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,3:3,2
+chr3	83084765	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00081261;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:7,8:3,7
+chr3	83418140	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00011093;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:10,6:10,7
+chr3	83907471	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:1,2:2,4
+chr3	83919255	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,1:7,3
+chr3	84517268	.	TTATATATATATATATATATATATATATA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:2,2:2,3
+chr3	84949434	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.012068;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,4:9,2
+chr3	85269986	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00021136;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,7:8,2
+chr3	85515617	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.058162;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,2:4,2
+chr3	85651984	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.025795;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:8,7:5,1
+chr3	89136384	.	G	GA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:2,2:2,3
+chr3	89316505	.	A	AATAT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:2,4:0,1
+chr3	89411165	.	CT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0040439;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,3:7,2
+chr3	89778644	.	GTT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.07827;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:10,3:7,1:3,2
+chr3	90555751	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0059828;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,1:2,4
+chr3	90795678	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr3	90795679	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr3	90796078	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,2:0,2
+chr3	90798071	.	G	T	0	PASS	DP=777;GPV=1;SPV=0.014721;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:366:321,42:193,22:128,20
+chr3	90806513	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16089;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:17,2:3,2
+chr3	90806570	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
+chr3	90824580	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.071233;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:36,4:0,0
+chr3	90880190	.	C	T	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.03135;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:32,10:15,3
+chr3	90892203	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0059289;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,3:3,2
+chr3	90946611	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.046434;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:6,1:27,10
+chr3	90979496	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.042576;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:1,0:24,4
+chr3	91022659	.	C	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.047794;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:3,2:33,4
+chr3	91029637	.	A	G	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.038605;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:54,9:45,6:9,3
+chr3	91063281	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10145;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,1:0,1
+chr3	91091786	.	G	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.008448;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:6,4:44,2
+chr3	91141897	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0056194;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:1,1:8,6
+chr3	91177837	.	T	G	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.015911;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:94,13:89,12:5,1
+chr3	91205533	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.029092;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:0,0:32,4
+chr3	91218372	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.064197;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:6,1:27,3
+chr3	93591170	.	G	C	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.013747;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:104,13:100,12:4,1
+chr3	93591186	.	CT	C	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.028852;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:116,14:112,13:4,1
+chr3	94936374	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0011874;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:7,5:11,6
+chr3	95784347	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:5,4:0,1
+chr3	96171183	.	GA	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026257;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:14,3:12,2
+chr3	96518048	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00021015;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:12,7:14,6
+chr3	96983705	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01412;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:8,5:12,2
+chr3	97879569	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.6767e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:7,9:9,4
+chr3	98427377	.	TGTGAGA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.076651;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:9,3:3,2
+chr3	100854188	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.012535;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:10,1:8,5
+chr3	101431508	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
+chr3	101440054	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020048;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:12,4:7,4
+chr3	101930935	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,4:7,3:7,1
+chr3	103975233	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00013031;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,8:3,1
+chr3	106534734	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0013735;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:12,5:11,3
+chr3	106542761	.	TA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00026263;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,5:9,3
+chr3	106775348	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.057257;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,2:14,2
+chr3	106775349	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.029196;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:18,3:17,2
+chr3	108173766	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,8:7,4:1,4
+chr3	108958612	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=5.7534e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:11,8:6,8
+chr3	109529342	.	G	GT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0059828;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:2,2:6,4
+chr3	109529360	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0052475;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,2:7,4
+chr3	109963081	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.011174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,3:7,3
+chr3	110129439	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00017742;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:11,7:6,8
+chr3	112261530	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.4663e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:7,6:16,5
+chr3	113826339	.	TACAC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0011989;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,10:7,8:0,2
+chr3	113935487	.	AAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.033476;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,6:8,2
+chr3	115698281	.	AAATATAAT	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:3,1:1,1
+chr3	115698297	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
+chr3	115736864	.	C	CT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr3	115895057	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00029504;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,3:7,6
+chr3	116119672	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,6:9,5:5,1
+chr3	116350967	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00043396;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:6,6:7,5
+chr3	117315395	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.14505;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:21,4:10,1
+chr3	117979641	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.2822e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:14,7:6,7
+chr3	118392849	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.008555;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:13,3:10,3
+chr3	120118602	.	TAAAAA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.28173;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,4:5,3:6,1
+chr3	123183268	.	TTC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.032284;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,1:9,6
+chr3	123694091	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0029206;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,1:6,4
+chr3	124597073	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:1,3:0,1:1,2
+chr3	125030879	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.7719e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,13:7,4:9,9
+chr3	125214652	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00023483;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,15:5,9:4,6
+chr3	125712093	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00094346;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:14,4:9,4
+chr3	126891525	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00059303;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:14,3:10,6
+chr3	127244996	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:7,4:0,2
+chr3	130001138	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.046672;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:21,3:13,1
+chr3	130639103	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.4247e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,18:9,10:7,8
+chr3	130986903	.	GT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,5:8,2:7,3
+chr3	131615891	.	T	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,3:3,2:2,1
+chr3	131631897	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.21557;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:10,2:6,1
+chr3	133150342	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:7,6:4,1
+chr3	133449949	.	AAGAGAG	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,2:4,3
+chr3	134289297	.	A	ACAAAAAC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.030143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:5,3:10,5
+chr3	134582164	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00034194;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:5,3:10,8
+chr3	135541930	.	GTA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018356;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,7:7,5:6,2
+chr3	138050905	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,2:10,2
+chr3	147343399	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024176;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr3	147860263	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=4.2249e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,5:7,6
+chr3	148614914	.	TGAGA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:6,2:5,2
+chr3	148811068	.	A	ATCT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0041352;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:7,1:12,7
+chr3	148811069	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0004646;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:9,2:14,9
+chr3	150723292	.	TTCTTTCTTTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,5:1,3:15,2
+chr3	151174855	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00016103;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:11,8:10,8
+chr3	156590063	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00020424;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:15,10:13,3
+chr3	157005999	.	AT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.013286;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:13,4:6,3
+chr3	157071796	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:1,2:0,0:1,2
+chr3	157304038	.	T	TATATATATATATATATATATAC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.031941;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:7,2:5,4
+chr3	157674912	.	A	ATTCTTTCT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0030816;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,8:1,3:8,5
+chr3	159626255	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,2:2,1:3,1
+chr3	160137036	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,4:10,2:5,2
+chr3	167725256	.	CAAAAAAGAAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,5:3,1
+chr3	168886414	.	TAC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:4,3:4,2
+chr3	171813199	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00015824;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:9,5:10,7
+chr3	172712727	.	CCTCTCTCT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,6:5,5:4,1
+chr3	173233574	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,6:6,3:3,3
+chr3	174348015	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,5:5,1
+chr3	174368155	.	TAAA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0085139;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,5:0,1
+chr3	174703303	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0048875;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,5:4,5
+chr3	175016670	.	AT	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.5614e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:13,5:7,7
+chr3	175016675	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0002841;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,5:7,7
+chr3	175232234	.	G	GAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAAGA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:4,3:2,2
+chr3	175384300	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=7.9253e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:7,4:8,10
+chr3	177540989	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:4,1:14,3
+chr3	177687164	.	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:4,3:4,3
+chr3	178283385	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
+chr3	180444297	.	CT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0012555;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:13,5:7,5
+chr3	180755577	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.025784;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,5:7,2
+chr3	180864487	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,6:1,5:1,1
+chr3	181447069	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:4,6:5,2
+chr3	183657107	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.095104;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:21,2:9,2
+chr3	183725041	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0013736;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,5:0,3:0,2
+chr3	184617395	.	GAA	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,2:2,3
+chr3	184658008	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0054348;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:5,5:3,2
+chr3	186259095	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.015379;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,5:7,1:10,4
+chr3	187137817	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00022958;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:5,9:5,6
+chr3	187137821	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.005394;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:5,8:8,2
+chr3	187303546	.	CTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.019763;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,2:6,2
+chr3	187434294	.	C	CAT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:6,1:8,4
+chr3	187434387	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037117;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:10,4:11,6
+chr3	187597736	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:3,4:4,3
+chr3	191463020	.	C	CTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:0,0:4,2
+chr3	192656320	.	CAGAG	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.04724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,4:5,2:2,2
+chr3	192788183	.	G	GT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,3:1,2:2,1
+chr3	193264511	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0083293;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,11:10,6:5,5
+chr3	194011714	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.012914;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:7,6:4,2
+chr3	194866663	.	GTATATATATA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:7,4:1,2
+chr3	195728090	.	T	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.042229;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:25,9:27,7
+chr3	195746888	.	G	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.039792;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:48,10:24,7:24,3
+chr3	195983454	.	A	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.028926;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:6,1:39,5
+chr3	197623223	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.03191;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,6:8,3
+chr3	197827646	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.711e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:10,6:9,8
+chr4	16009	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.021504;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:19,4:10,4
+chr4	41218	.	T	C	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.015504;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:98,13:43,6:55,7
+chr4	45414	.	A	C	0	PASS	DP=304;GPV=1;SPV=0.028326;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:137,21:60,7:77,14
+chr4	49031	.	G	C	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.040434;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:84,13:43,7:41,6
+chr4	49132	.	G	C	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.046495;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:76,12:40,5:36,7
+chr4	59576	.	A	G	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.018653;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:116,18:64,7:52,11
+chr4	62314	.	G	C	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.0081263;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:97,17:40,12:57,5
+chr4	1283150	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,2:9,2
+chr4	1296586	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027154;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:7,1:9,4
+chr4	1860669	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
+chr4	3580444	.	T	TCATCCATCCATCCATC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:6,2:12,2
+chr4	4010099	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0032628;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,7:3,1
+chr4	5441527	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0079024;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:8,7:9,7
+chr4	8409607	.	T	TGC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,3:8,2
+chr4	8626671	.	G	GT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:16,3:1,1
+chr4	10610050	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
+chr4	10786561	.	G	GT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,3:2,1
+chr4	11305451	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,3:1,3
+chr4	14012406	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.08867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
+chr4	14471731	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,3:12,1
+chr4	14548401	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00017105;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:10,8:6,3
+chr4	15722592	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:10,7:2,3
+chr4	17404560	.	CAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:9,3:1,1
+chr4	17448183	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,7:2,5:1,2
+chr4	17925890	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,3:0,1:2,2
+chr4	18948670	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0015903;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:12,5:9,4
+chr4	19324347	.	AT	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00012761;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:14,7:9,7
+chr4	20211809	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.095143;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,3:18,1
+chr4	22181677	.	CATAG	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014502;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,4:5,3
+chr4	22872559	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:6,4:0,1
+chr4	24122385	.	A	ATG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0046348;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,6:3,2
+chr4	25046334	.	TACACACAC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.008413;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,7:4,1:0,6
+chr4	25453947	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.014049;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,1:5,4
+chr4	25679119	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.011461;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:15,3:6,3
+chr4	25808836	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,3:7,1
+chr4	26244317	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:4,2:10,2
+chr4	26590809	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024176;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,3:6,1
+chr4	27108120	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:4,7:5,3
+chr4	27792425	.	C	CAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,4:5,1
+chr4	27799164	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00059303;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:12,7:12,2
+chr4	29733016	.	GTT	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.040563;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:22,2:14,3
+chr4	29965622	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00061478;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:7,7:7,3
+chr4	32641732	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=1.8212e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,15:1,10:6,5
+chr4	32671096	.	AC	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0028593;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,4:3,5
+chr4	32717008	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0029614;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:1,6:6,3
+chr4	35152970	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.01548;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,6:3,1:1,5
+chr4	35233969	.	G	GTA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0010229;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:8,4:6,6
+chr4	35312910	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.0398e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:11,5:12,6
+chr4	35468056	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.022198;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:6,3:10,6
+chr4	38087862	.	AG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.011037;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:0,4:5,2
+chr4	38438950	.	G	GA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:8,6:9,7
+chr4	38718049	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.974e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:11,10:12,7
+chr4	39179952	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.8896e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:7,4:9,10
+chr4	39789185	.	G	GA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0070165;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:8,7:5,1
+chr4	40481486	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0067079;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:0,3:3,4
+chr4	41343610	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00014652;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:7,7:3,8
+chr4	42555146	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,2:8,2
+chr4	43503790	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=5.6363e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:4,6:9,6
+chr4	43758095	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0021846;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,10:3,5:5,5
+chr4	43846701	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00057502;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:3,15:3,7:0,8
+chr4	44121593	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=5.8313e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,5:6,7
+chr4	44349071	.	G	GCCA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00025277;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,3:4,7
+chr4	44987638	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027592;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:14,2:7,4
+chr4	46100707	.	G	GA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,7:1,6:0,1
+chr4	48393386	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,7:3,4:3,3
+chr4	48823432	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.001147;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:7,5:12,6
+chr4	48943952	.	TAA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:6,2:13,3
+chr4	49150033	.	G	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,2:6,3
+chr4	49158494	.	C	T	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.038593;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:77,14:40,7:37,7
+chr4	49159235	.	G	A	0	PASS	DP=187;GPV=1;SPV=0.024688;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:78,10:24,1:54,9
+chr4	49184579	.	A	C	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.029498;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:24,6:20,7
+chr4	49195425	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.013575;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:55,7:34,4:21,3
+chr4	49226686	.	C	T	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.017843;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:82,17:46,14:36,3
+chr4	49241359	.	G	A	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.013299;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:63,12:35,6:28,6
+chr4	49241573	.	G	C	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.045618;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:51,13:21,9:30,4
+chr4	49246982	.	C	T	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.0048956;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:60,12:25,10:35,2
+chr4	49252716	.	T	A	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.011007;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:75,17:36,8:39,9
+chr4	49261767	.	T	A	0	PASS	DP=323;GPV=1;SPV=0.028096;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:139,19:66,6:73,13
+chr4	49263781	.	A	C	0	PASS	DP=236;GPV=1;SPV=0.0034993;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:107,13:59,6:48,7
+chr4	49273073	.	A	C	0	PASS	DP=640;GPV=1;SPV=0.018305;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:295:254,41:130,20:124,21
+chr4	49490706	.	G	A	0	PASS	DP=483;GPV=1;SPV=0.022536;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:244:211,33:118,15:93,18
+chr4	49497096	.	G	GAT	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.038776;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:22,4:22,1
+chr4	49520640	.	TAGGGTTGGATTAGTGTGAGGGTG	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:21,4:1,0
+chr4	49543512	.	C	T	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.0083518;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:152,17:34,6:118,11
+chr4	49585249	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0048935;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:11,8:8,7
+chr4	49612408	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.031714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:14,10:18,2
+chr4	49714997	.	C	T	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.0051851;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:33,1:14,8
+chr4	50007021	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:23,4:0,0
+chr4	50273970	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.037745;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:17,2:20,3
+chr4	50413448	.	G	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr4	50463635	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.045508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:4,3:15,1
+chr4	50481840	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.030747;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:2,1:17,4
+chr4	50723811	.	C	T	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.031484;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:52,14:23,10:29,4
+chr4	51016099	.	C	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr4	51292859	.	A	T	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.0074367;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:50,16:26,6:24,10
+chr4	52528380	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,3:2,1:2,2
+chr4	52835837	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0062713;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:2,6:1,4:1,2
+chr4	54654426	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.068312;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:18,2:13,2
+chr4	55170346	.	TG	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.058895;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:11,3:11,2
+chr4	55375916	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.33939;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,3:5,3:0,0
+chr4	55604679	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:2,3:2,3
+chr4	55761557	.	T	TATATATATACAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:9,4:6,3
+chr4	56609050	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01473;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,4:6,5
+chr4	56721176	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,4:6,2:1,2
+chr4	56750279	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,5:2,3:6,2
+chr4	56898314	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,2:4,1:2,1
+chr4	57672617	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0034711;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:10,7:11,3
+chr4	59362900	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=2.7606e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:10,4:5,7
+chr4	59604543	.	CCTCTCT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,8:2,5:5,3
+chr4	61596005	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=4.8434e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:7,9:4,6
+chr4	63262848	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.002076;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:13,4:5,4
+chr4	63539399	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0027222;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:11,7:9,2
+chr4	64460069	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00012961;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:10,8:10,4
+chr4	64669447	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.014275;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,5:4,3
+chr4	65229314	.	G	GA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0054264;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:16,4:9,4
+chr4	66352614	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=9.6988e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:10,6:8,6
+chr4	66786246	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,2:0,2:0,0
+chr4	68764743	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=5.4752e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:8,5:12,8
+chr4	68870508	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,3:1,2
+chr4	70100946	.	G	GA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018436;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,8:7,5:4,3
+chr4	71577684	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.007849;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,5:4,5
+chr4	72532492	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,4:7,3:16,1
+chr4	73318657	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.043422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:1,2:16,4
+chr4	73785611	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,9:2,7:4,2
+chr4	73861691	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0041113;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:8,3:2,3
+chr4	76316900	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,6:3,5:1,1
+chr4	76424292	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0073297;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:5,6:4,1
+chr4	77103258	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:3,7:1,2
+chr4	77753902	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:5,3:4,1:1,2
+chr4	78040335	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00079368;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:12,7:11,7
+chr4	78081067	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.5057e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:4,9:14,9
+chr4	78968710	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12821;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,2:3,2:0,0
+chr4	81307689	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0024472;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:7,6:1,1
+chr4	81533599	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,4:3,1
+chr4	82702130	.	CTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,3:2,2
+chr4	82809422	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0060573;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:0,4:4,3
+chr4	82947233	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:4,4:1,3
+chr4	83182848	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016795;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,1:5,6
+chr4	83634132	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,3:7,1
+chr4	83893982	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,1:6,4
+chr4	84078144	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034789;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,4:12,1
+chr4	87542730	.	TCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:4,1:10,6
+chr4	87616352	.	CAGCAATGAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1039;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:11,2:3,1
+chr4	87774476	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.012656;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:19,4:14,3
+chr4	90083296	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:6,7:5,2
+chr4	90854409	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.001818;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,2:8,4
+chr4	90942828	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00011829;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:7,4:10,8
+chr4	91041659	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00013428;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,3:10,7
+chr4	92336954	.	G	GTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:4,3:3,1
+chr4	92588678	.	CAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.032107;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
+chr4	92911766	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00012227;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:7,6:4,6
+chr4	95047250	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00039828;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:7,3:12,6
+chr4	96629329	.	T	TATTA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=3.2748e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:4,4:9,7
+chr4	97072239	.	TAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,6:5,2
+chr4	97589537	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.2409e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:11,7:3,8
+chr4	97793370	.	T	TAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,4:3,3
+chr4	98437791	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:10,7:10,2
+chr4	99879799	.	C	CCTA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025971;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,3:6,4
+chr4	99879808	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.014276;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,1:7,4
+chr4	100378940	.	TTTTCC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,7:0,6:3,1
+chr4	100749881	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.4158e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:11,6:3,5
+chr4	100794963	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.043956;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,9:0,4:3,5
+chr4	101582055	.	G	GAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:6,5:7,2
+chr4	101748749	.	A	ATG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:8,4:12,6
+chr4	101748762	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024122;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,2:11,4
+chr4	104853700	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.3091e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:13,10:10,4
+chr4	105406114	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0028986;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:5,6:2,2
+chr4	108247355	.	CATATATATATATATATAT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:6,2:1,2
+chr4	111402103	.	TA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0021401;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:7,5:14,2
+chr4	112204072	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0011989;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:4,8:3,2
+chr4	114791514	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022078;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,3:11,3
+chr4	115463073	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.7718e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:14,20:9,13:5,7
+chr4	116204797	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,4:5,4
+chr4	118563314	.	G	GT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.023838;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
+chr4	119769356	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0012565;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:12,5:11,6
+chr4	120224633	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.00058257;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,12:3,7:4,5
+chr4	120489546	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0048426;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:14,3:7,5
+chr4	120644181	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,3:15,1
+chr4	123373069	.	T	TAAAGAAAG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:3,4:6,2
+chr4	125249246	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.8879e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:5,4:12,7
+chr4	128563468	.	GTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.036526;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,2:3,2
+chr4	128731300	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,2:2,2
+chr4	130360918	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=7.3464e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:5,4:14,7
+chr4	130720455	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:11,7:7,4:4,3
+chr4	131674287	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0053469;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:15,2:9,5
+chr4	131745978	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
+chr4	132042003	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=2.4323e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:5,10:9,5
+chr4	132205992	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00068948;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:15,6:9,7
+chr4	132438919	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0086626;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,3:7,2
+chr4	133731278	.	CAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:7,4:4,1
+chr4	134669019	.	C	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016117;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,3:5,1
+chr4	134774594	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.9466e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:11,9:9,7
+chr4	135597776	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0014466;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,5:10,2
+chr4	136057133	.	C	CGT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,9:10,3:4,6
+chr4	139572216	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,2:10,2
+chr4	140901671	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0016174;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:10,4:13,5
+chr4	141101739	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.2414e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:13,5:5,7
+chr4	141956697	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.028465;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:10,4:15,1
+chr4	142579879	.	G	GTAGGTAGATAGA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,5:9,3:7,2
+chr4	143880094	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026257;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,1:15,4
+chr4	144158703	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,1:7,3
+chr4	144473366	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,8:9,4:3,4
+chr4	145706808	.	A	AT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048875;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,6:7,2
+chr4	145864420	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:8,8:2,2
+chr4	149102144	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:11,4:2,1
+chr4	150148381	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.032805;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:4,8:7,2
+chr4	150228159	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00038673;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:2,3:12,4
+chr4	150818532	.	C	CTG	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023594;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:15,6:10,5
+chr4	151074116	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00012852;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,4:7,5
+chr4	151328963	.	CAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0037445;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,4:1,1
+chr4	151697953	.	GTATATATA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12821;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,2:0,1:3,1
+chr4	151811965	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:1,2:3,4
+chr4	155015980	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:8,4:5,1
+chr4	156851930	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0055469;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,7:5,1
+chr4	157277890	.	GTA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.050152;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:8,1:12,3
+chr4	160193329	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0012507;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:3,5:6,7
+chr4	163883259	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027778;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:0,2:0,0:0,2
+chr4	163883260	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:0,2:0,0:0,2
+chr4	164754450	.	ACT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043486;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,3:9,2
+chr4	164854493	.	AT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:7,3:11,2
+chr4	165254553	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.036638;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:13,2:14,5
+chr4	165289509	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0016314;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,5:3,3
+chr4	166666435	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.051138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,3:10,2
+chr4	167111783	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=3.2263e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:8,5:7,9
+chr4	168386575	.	G	GAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0060713;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:10,11:4,2
+chr4	169787292	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.040231;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:16,4:13,3
+chr4	169985113	.	TATCTATCAATC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.025825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,4:9,5
+chr4	175484848	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:3,1:1,1
+chr4	175706655	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.0101e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:8,8:8,7
+chr4	176056801	.	C	CAATA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.028555;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:5,2:13,6
+chr4	176204540	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022727;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:6,4:7,1
+chr4	176500213	.	T	TCACACA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.024154;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,2:3,3
+chr4	176570483	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,3:9,1
+chr4	176617441	.	T	TATTCCCATTTTAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,6:4,3:8,3
+chr4	176617455	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040085;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,5:4,2:6,3
+chr4	177002018	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:1,4:0,2:1,2
+chr4	177410391	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010741;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:14,4:3,3
+chr4	178835888	.	AT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012829;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:11,4:6,3
+chr4	179560034	.	T	TAAAAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00053043;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,14:5,9:3,5
+chr4	179974374	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:4,4:3,1
+chr4	180011122	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.702e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:12,8:6,7
+chr4	181253700	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.045508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:12,3:7,1
+chr4	181789218	.	A	ATTTATTTTAT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.044727;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:11,4:15,5
+chr4	182125139	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,2:4,3
+chr4	182223783	.	C	CAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,5:4,3:4,2
+chr4	183374863	.	AAT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.05832;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,3:9,3
+chr4	184005474	.	A	AAAAAAC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,4:9,6
+chr4	184814290	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.025944;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:6,6:3,1
+chr4	185453543	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,4:3,2
+chr4	186476636	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,3:14,1
+chr4	187427448	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:4,2:1,1:3,1
+chr4	187939899	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00057914;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,7:9,4
+chr4	187991036	.	T	TAAAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035323;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,3:4,5
+chr4	187996987	.	GGGAGCATGGAGCATGGAGCGTGGAGCGT	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,1:9,3
+chr4	188270847	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0015991;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,10:10,9:12,1
+chr4	188797423	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.513e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:9,9:14,4
+chr4	188801720	.	T	TTTTATTTATTTA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,9:7,7:7,2
+chr4	189686678	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.042825;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,3:2,1
+chr4	189691776	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.042478;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:14,1:16,5
+chr4	189787161	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.018404;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,5:4,4:7,1
+chr4	189808046	.	CACACACACACACACACATACAT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.13236;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:15,3:8,4
+chr4	190053653	.	T	A	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0093712;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:83,14:32,5:51,9
+chr5	710573	.	C	CTG	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.10169;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:18,3:17,2
+chr5	1076411	.	C	CATCCTGTGACCA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,9:6,3:7,6
+chr5	2580934	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:0,0:7,4
+chr5	2907358	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,2:6,2
+chr5	4107442	.	G	GA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:18,5:7,1
+chr5	4258666	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,2:5,2:0,0
+chr5	4326862	.	C	CCT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040404;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:5,1:8,3
+chr5	4479231	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00014249;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:6,6:10,7
+chr5	4825300	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=5.9839e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:7,4:5,7
+chr5	4912782	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:14,3:1,1
+chr5	5908876	.	CTATTTTATTTTATTTTATTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.038556;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,4:8,2
+chr5	5925042	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,3:6,1
+chr5	6751444	.	G	GCTTTTCAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,3:5,4
+chr5	7207044	.	T	TTCC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:2,3:7,2
+chr5	11081086	.	A	ACACACACACACACACACACT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,4:14,1:6,3
+chr5	11441368	.	ATTT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr5	12166540	.	A	AAAAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:8,3:3,2
+chr5	12348504	.	GT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,4:3,1
+chr5	13921475	.	TCA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027424;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:5,1:12,6
+chr5	13921481	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0026248;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,8:1,2:4,6
+chr5	15255713	.	G	GA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0013843;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:14,4:2,3
+chr5	15993627	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.6656e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:19,6:9,8
+chr5	16905836	.	C	CA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.15e-06;SS=2;SSC=53;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:8,5:6,6
+chr5	16912802	.	G	GCA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:7,5:2,1
+chr5	16948192	.	A	ATT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,10:2,3:2,7
+chr5	17048058	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:32:0,4:0,2:0,2
+chr5	17517981	.	A	G	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.0039287;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:65,20:25,10:40,10
+chr5	17520616	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.084652;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:3,0:32,4
+chr5	17520622	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.11412;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:3,0:32,4
+chr5	18898273	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.4825e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:10,6:8,7
+chr5	19142888	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.0255e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:15,8:15,6
+chr5	21880592	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:1,0:12,4
+chr5	22696370	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.04287;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,9:9,8:6,1
+chr5	22885764	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,2:10,2
+chr5	23093753	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.5256e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:10,11:6,4
+chr5	23715625	.	ATATAATATATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:6,1:0,3
+chr5	23818651	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=5.7558e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:11,9:13,6
+chr5	24362633	.	G	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,2:3,1:2,1
+chr5	24449752	.	GTATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:4,3:2,3
+chr5	25931554	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,3:2,3
+chr5	26298904	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.36264;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,4:3,1:5,3
+chr5	26933496	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.9242e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:14,12:10,5
+chr5	27327781	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,7:5,4:4,3
+chr5	27560009	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:9,5:0,1
+chr5	27656828	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.5302e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:17,6:5,6
+chr5	28127451	.	AG	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.1474e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:12,7:6,5
+chr5	28138339	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0016259;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:18,4:10,6
+chr5	28440136	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.3183e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:5,7:14,6
+chr5	29223416	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0011582;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:15,4:4,4
+chr5	30155111	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00043265;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,5:7,5
+chr5	30655965	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=8.6537e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:12,5:5,7
+chr5	31199444	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.03185;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:2,3:10,2
+chr5	33073496	.	GTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:2,4:7,2
+chr5	34401085	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,1:6,6
+chr5	34530037	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0015209;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:7,6:10,3
+chr5	35294767	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:1,5:8,5
+chr5	37105334	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,5:6,4:7,1
+chr5	38134496	.	AGAG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011437;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
+chr5	38272776	.	GTC	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10026;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:16,3:17,2
+chr5	39053890	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.028335;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,7:6,6:4,1
+chr5	39333595	.	C	CCCTTTCCATG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.025519;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:2,4:6,2
+chr5	39478507	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.20035;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:12,1:10,2
+chr5	42448845	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0021725;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,3:6,4
+chr5	43088211	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036676;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:13,2:4,2
+chr5	43681259	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:6,7:3,2
+chr5	44209224	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0024409;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:6,8:1,1
+chr5	44868214	.	AT	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.091905;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,1:16,4
+chr5	46627803	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.007849;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,6:6,4
+chr5	46693227	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,1:9,3
+chr5	46772267	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,2:3,2
+chr5	47048025	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.093168;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:8,3:6,1:2,2
+chr5	47183378	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045519;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,4:8,1
+chr5	50134813	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022618;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:5,2:15,3
+chr5	50140509	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:51,9:8,3:43,6
+chr5	50142018	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0083637;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:8,2:23,4
+chr5	50353017	.	A	AGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:9,5:6,1
+chr5	51703098	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=1.3217e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:5,4:2,6
+chr5	54275851	.	A	AT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031354;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:6,3:9,6
+chr5	54749468	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:5,6:2,2
+chr5	55249182	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:4,6:1,1
+chr5	61756494	.	G	GGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.041183;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:12,4:8,4
+chr5	64208956	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=7.064e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,5:11,8
+chr5	65559630	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.22807;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,4:8,1:3,3
+chr5	66113763	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:5,3:1,1
+chr5	67280831	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00024201;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:9,7:2,5
+chr5	67984149	.	T	TAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057971;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:7,7:1,1
+chr5	68648681	.	A	ACATGGGTATTTTCGCAGCTTCC	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0081402;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:9,5:8,5
+chr5	69092095	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.042367;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,8:16,5:13,3
+chr5	71442703	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,3:15,1
+chr5	72008798	.	GA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0018707;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,7:7,2
+chr5	73449741	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,4:2,1
+chr5	76182959	.	CAGAG	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,2:0,1:1,1
+chr5	77335532	.	G	GGTGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,2:3,6
+chr5	77466806	.	A	ATT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01322;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,6:4,2
+chr5	77694855	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=6.5361e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:11,4:7,9
+chr5	78904685	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,5:5,2
+chr5	79137077	.	T	TGAATATA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028936;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr5	79566669	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:15,2:7,2
+chr5	80224133	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,9:4,7:3,2
+chr5	80275747	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
+chr5	81296613	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,3:4,1
+chr5	82534451	.	GT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00019163;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:11,10:5,2
+chr5	82661949	.	AAGAG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.012445;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:9,7:3,3
+chr5	84374197	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=1.6358e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:5,7:0,3
+chr5	84934274	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:8,7:5,2
+chr5	85443188	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=4.3264e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:6,8:7,7
+chr5	85994895	.	AT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,2:10,3
+chr5	88132228	.	A	ATAAACTAATTATACAATTAGTTTAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.024679;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,5:6,1
+chr5	88464585	.	GA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=1.784e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,5:4,4
+chr5	88904619	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.018514;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:15,1:5,4
+chr5	92309593	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.0254e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:13,10:7,4
+chr5	94954147	.	C	CAA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,1:1,3
+chr5	95009056	.	AAGAGAG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,5:5,4:0,1
+chr5	95263507	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.015665;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:14,2:11,6
+chr5	98901749	.	T	TA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0050264;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:5,9:8,3
+chr5	99027283	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0002652;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:8,6:1,4
+chr5	99523029	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.025471;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:22,3:22,10
+chr5	101502647	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:1,2:0,0
+chr5	105295049	.	TA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0027511;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,12:12,9:4,3
+chr5	105678880	.	AT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00023971;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:5,3:6,7
+chr5	107194847	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0019836;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,11:8,8:1,3
+chr5	107649910	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00090534;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:6,8:6,4
+chr5	109353445	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1039;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:7,1:7,2
+chr5	110128036	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00010989;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:14,10:10,7
+chr5	110620577	.	ATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.2419;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:4,1:10,3
+chr5	117203277	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.057257;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,2:14,2
+chr5	117366735	.	TTATATA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.26374;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,3:4,2:3,1
+chr5	118438718	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,1:3,3
+chr5	118543049	.	GTGTATATGTATTAC	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:2,2:8,2
+chr5	118543768	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:4,6:2,4
+chr5	118577937	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,4:3,4
+chr5	120048898	.	ATCCTATG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022127;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
+chr5	120048914	.	CTA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.018737;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
+chr5	120048956	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
+chr5	120195278	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,2:3,7
+chr5	121343977	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,5:7,2:3,3
+chr5	121493096	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0092138;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,7:8,1:6,6
+chr5	122128378	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.022595;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,4:6,2
+chr5	124521954	.	A	AC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0067861;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:1,2:10,7
+chr5	125216989	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.014912;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:10,5:7,3:3,2
+chr5	126721755	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,5:5,2:7,3
+chr5	127930227	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,4:10,2:10,2
+chr5	128915495	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00022655;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:6,13:3,7:3,6
+chr5	129436180	.	C	CT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00051949;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:9,2:12,7
+chr5	129816655	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.029646;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,6:11,3
+chr5	130538347	.	G	GA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,5:5,1
+chr5	130540752	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,8:3,2:1,6
+chr5	130765983	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.152e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:11,6:7,10
+chr5	132328823	.	TTATATA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.040085;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:6,2:4,3
+chr5	136513473	.	GAA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.039737;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
+chr5	137518612	.	AAAGAAAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00035367;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:4,4:0,2
+chr5	138267188	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:6,6:5,1
+chr5	138433114	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:2,4:3,2
+chr5	138772864	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.009553;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,2:4,5
+chr5	139717201	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0016927;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,6:9,5
+chr5	139826200	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0031706;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,4:11,5
+chr5	140707351	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00059971;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,5:9,4
+chr5	141395556	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.049216;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,5:10,3
+chr5	141989692	.	CAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10526;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,10:4,9:3,1
+chr5	142306913	.	C	CAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:9,6:7,1
+chr5	142311564	.	TTTGTTGTTGTTGTTG	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00072806;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,11:3,7:2,4
+chr5	142392104	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:2,3:2,1
+chr5	142498760	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0017818;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,3:4,6
+chr5	144256615	.	TTG	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00014241;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,6:10,4
+chr5	146174144	.	TAA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0040793;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:0,6:0,5:0,1
+chr5	146239484	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,2:5,6
+chr5	148212480	.	TTA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0033988;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,2:6,5
+chr5	148233325	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048922;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:9,3:11,2
+chr5	148547566	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,2:10,2
+chr5	148560205	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.062683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:14,3:2,2
+chr5	148945971	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0089978;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:9,6:4,4
+chr5	149598777	.	GAT	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,2:1,1:1,1
+chr5	151764045	.	TATATATA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,4:0,3:1,1
+chr5	151971915	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00084999;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:13,8:8,2
+chr5	153098547	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00016168;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,5:10,5
+chr5	154525165	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=8.2514e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:7,11:11,8
+chr5	154525791	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00058707;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:0,5:9,6
+chr5	154574640	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.012894;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,1:11,5
+chr5	155528491	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0046429;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,2:6,4
+chr5	156298576	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,5:1,1
+chr5	156307555	.	G	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:2,2:1,2
+chr5	156981160	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,5:5,2:7,3
+chr5	157490891	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,8:8,7:1,1
+chr5	157607172	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:4,4:1,1
+chr5	158310000	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr5	159241128	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.059824;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:6,2:16,2
+chr5	159579503	.	G	GTGTATATA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,7:2,6:1,1
+chr5	160009597	.	C	CATAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.020191;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:9,5:7,5
+chr5	162316689	.	C	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.041563;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
+chr5	164834924	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.049123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,3:1,1:4,2
+chr5	165595663	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0079657;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,4:7,2
+chr5	166085665	.	TAGAAGAATCTAACTAGAG	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.01794;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,3:6,5
+chr5	167101939	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,6:6,1
+chr5	168374065	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:3,3:4,1
+chr5	168548035	.	T	TACACACACACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0024977;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,6:4,2
+chr5	169026345	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.5269e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:13,8:11,8
+chr5	170636716	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.8479e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,4:8,7
+chr5	173289783	.	CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,1:7,3
+chr5	174950954	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:10,4:1,0
+chr5	175929273	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.029194;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,7:11,2
+chr5	175955410	.	G	C	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.049555;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:28,6:16,7
+chr5	176072362	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.040785;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:12,8:23,3
+chr5	176076559	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0311;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:15,1:10,4
+chr5	176089142	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,1:16,3
+chr5	176104048	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.011566;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:11,2:21,5
+chr5	176231512	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.029148;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,1:4,7
+chr5	176873132	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:11,3:2,1
+chr5	177838191	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:20,1:16,3
+chr5	177890659	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0026931;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:3,5:11,6
+chr5	178002192	.	CCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,4:1,0:14,4
+chr5	178731336	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00044686;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,13:2,5:8,8
+chr5	178854098	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0005304;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:2,8:8,2
+chr5	179003538	.	AT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.051834;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,1:10,3
+chr5	179077809	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0086957;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,4:2,3
+chr5	180233038	.	A	AACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,5:5,3:2,2
+chr5	181169685	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.057399;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:20,2:13,2
+chr6	325357	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:2,2:11,3
+chr6	857841	.	TCGATCCAC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
+chr6	1521364	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.08111;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,2:11,2
+chr6	3298769	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.8219e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:7,12:11,6
+chr6	4756590	.	G	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.19341;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,2:17,2
+chr6	5304618	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00021682;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:9,8:4,8
+chr6	6796626	.	ATT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:9,2:3,2
+chr6	6855132	.	C	CAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0041602;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,8:6,5:4,3
+chr6	7418032	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00097732;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,4:10,4
+chr6	8567230	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.039341;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
+chr6	9159529	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,4:0,1:0,3
+chr6	11259935	.	A	AACACACACACACACAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.031608;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,4:6,3
+chr6	11776926	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0078236;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
+chr6	11931079	.	G	GGAGA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:7,2:9,2
+chr6	12001582	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,2:4,1:3,1
+chr6	13799827	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,5:2,1
+chr6	14947393	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,7:2,4:2,3
+chr6	15404519	.	GCACA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:2,5:3,1
+chr6	16933294	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00026567;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:11,5:8,5
+chr6	17587129	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.017571;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,2:5,7
+chr6	18492372	.	AAAC	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037638;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:12,6:4,3
+chr6	19618705	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00095695;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,3:4,4
+chr6	20472025	.	A	AACACACACAC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.20979;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:4,3:2,1
+chr6	20936241	.	A	AT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:7,5:0,1
+chr6	21909773	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,1:5,4
+chr6	21909776	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,1:6,3
+chr6	24327451	.	A	AAGTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0017164;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:6,5:11,6
+chr6	24624012	.	G	GTTTTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.11976;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
+chr6	24967909	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,5:2,3
+chr6	25853406	.	GT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:7,4:2,1
+chr6	26913994	.	G	GAGAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:5,1:11,5
+chr6	27265641	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.01269;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,2:5,3
+chr6	27561063	.	TC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,2:4,5
+chr6	27646781	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,1:7,3
+chr6	28063651	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,5:3,4:2,1
+chr6	30382634	.	A	AAATAATAATAATAATAAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.073845;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:13,3:13,3
+chr6	31168238	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.027999;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,2:5,6
+chr6	31428117	.	TATTC	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:0,1:4,1
+chr6	31722845	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,8:8,7:2,1
+chr6	32044978	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.018384;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:12,5:15,5
+chr6	36496043	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,3:5,4
+chr6	36549329	.	CTCT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,9:0,2:6,7
+chr6	36777773	.	CA	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:0,1:3,4
+chr6	37464892	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0019606;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:9,7:6,7
+chr6	39281122	.	G	GTT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.011209;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:23,2:7,7
+chr6	42640399	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0066302;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:11,7:4,5
+chr6	42974448	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021256;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,5:7,1
+chr6	43294524	.	T	TCAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:8,3:9,1
+chr6	43460695	.	A	ATT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0012227;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:15,9:8,4
+chr6	45958424	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,7:1,4:0,3
+chr6	46941470	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.028266;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:15,4:5,2
+chr6	49280081	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00056171;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:16,6:12,7
+chr6	49297543	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00036855;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:13,4:5,6
+chr6	52172643	.	AAAGAAAGG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0094161;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,3:5,4
+chr6	52880731	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.0412e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:9,6:7,8
+chr6	52945464	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0073133;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,3:10,3
+chr6	53323576	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.012217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,7:0,5:2,2
+chr6	53821879	.	GT	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:5,4:2,1
+chr6	54210730	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,5:6,3:5,2
+chr6	54520748	.	A	AACAC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.026985;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:11,5:7,4
+chr6	54552173	.	A	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:4,1:1,1
+chr6	56595997	.	ACTTT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:9,1:20,3
+chr6	56706326	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,4:6,1:8,3
+chr6	57252437	.	G	GCCT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.0995e-06;SS=2;SSC=59;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:8,7:6,8
+chr6	58194425	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00060405;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,5:10,3
+chr6	58924430	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:14,4:1,0
+chr6	60295723	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.5356e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:10,4:10,13
+chr6	60417585	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,2:4,2
+chr6	60944908	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.864e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:11,10:8,7
+chr6	61210112	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:3,3:4,3
+chr6	64697953	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.003938;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,7:7,2:14,5
+chr6	65293726	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.5502e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:11,10:8,7
+chr6	66148255	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.6321e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,9:9,6
+chr6	67293929	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.080441;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,5:8,3:15,2
+chr6	67293930	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.05384;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,5:9,3:12,2
+chr6	67293931	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,5:9,3:10,2
+chr6	67442154	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,2:8,7
+chr6	69219487	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:1,2:3,2
+chr6	69532257	.	CTCTG	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,5:9,3
+chr6	69888777	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:6,4:3,2
+chr6	70271703	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=7.3475e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:12,7:12,9
+chr6	70652449	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0033618;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:5,8:2,2
+chr6	70873403	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00013918;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:12,7:16,6
+chr6	71315288	.	T	TATATATATATATATATCCA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:6,4:3,5
+chr6	72895114	.	TA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:3,5:3,2
+chr6	73673929	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.00010562;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:2,2:1,6
+chr6	74031899	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.2589e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:10,7:13,6
+chr6	75944917	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:0,1:1,1
+chr6	76171460	.	T	TTTA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:1,2:0,2
+chr6	77706329	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00012791;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,5:8,6
+chr6	78087069	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.012665;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,3:8,3
+chr6	78117123	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.158e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:6,8:9,2
+chr6	79102143	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.013043;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,6:4,1:4,5
+chr6	81776487	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:6,7:0,1
+chr6	82919438	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.001632;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,3:5,8
+chr6	84249054	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0034481;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:5,2:8,5
+chr6	84402981	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,3:4,4
+chr6	84491047	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,8:1,5:1,3
+chr6	84995233	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017466;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:8,1:12,6
+chr6	85023514	.	T	TAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:6,2:4,2
+chr6	85654481	.	CAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:1,4:2,2
+chr6	87128727	.	ATCATATG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:1,3:9,7
+chr6	90323992	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,1:12,3
+chr6	91172037	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,6:1,5:0,1
+chr6	91436194	.	TTGTG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,8:2,5:2,3
+chr6	93168016	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.037288;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:12,7:6,2
+chr6	93556958	.	A	ATG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,2:2,2
+chr6	93699539	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,5:10,3
+chr6	94335781	.	G	GAGAT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,1:10,3
+chr6	96100250	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,2:5,1:2,1
+chr6	97976066	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00029607;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:13,7:6,4
+chr6	98359516	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1129;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,3:7,2:6,1
+chr6	99385976	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0063768;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,6:3,2
+chr6	100074033	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00050477;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:10,7:12,3
+chr6	102373125	.	AAT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0039611;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,13:8,4:12,9
+chr6	102726156	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00013031;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,3:3,6
+chr6	102763104	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.9968e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:13,10:8,4
+chr6	102790516	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0010576;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:5,2:13,7
+chr6	104394911	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00069928;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,5:12,6
+chr6	105886762	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,5:7,2:2,3
+chr6	106517435	.	C	CACACATATATAT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.019715;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:13,5:6,4
+chr6	107177131	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,9:5,7:2,2
+chr6	108022016	.	TA	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.101;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,1:17,3
+chr6	109655627	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=2.706e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,17:10,4:4,13
+chr6	110553287	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.02002;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:7,8:5,1
+chr6	111163146	.	ATT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015417;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,2:2,2
+chr6	113314517	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:11,3:6,1
+chr6	113611727	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,2:15,2
+chr6	113666600	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:5,2:0,0
+chr6	114459985	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,4:3,2
+chr6	117398476	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00023992;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:7,7:12,4
+chr6	117452883	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00091926;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:10,3:10,5
+chr6	117609264	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,5:6,3
+chr6	118070992	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:3,1:5,5
+chr6	118989801	.	C	CATTTATTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.03973;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:6,4:13,3
+chr6	122357957	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010883;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,13:0,8:3,5
+chr6	122799961	.	C	CTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:2,4:7,1
+chr6	123266483	.	A	AAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:2,1:3,3
+chr6	123799546	.	CATATATAT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:2,4:2,1
+chr6	126147120	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0081185;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,3:3,4
+chr6	126287669	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=1.2131e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:5,20:2,10:3,10
+chr6	127263211	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00015537;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,5:3,2
+chr6	129048489	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:4,1:9,5
+chr6	130861874	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,3:7,1
+chr6	132589742	.	CAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:1,4:1,1
+chr6	133394284	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,5:2,1:0,4
+chr6	134528947	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,2:1,1:1,1
+chr6	134754863	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:10,4:1,1
+chr6	134926822	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,7:8,1
+chr6	136381917	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.097397;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:15,2:9,4
+chr6	137377819	.	CAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,6:2,1
+chr6	143042681	.	TA	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0021;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:10,5:13,2
+chr6	145396551	.	CTCAGGTACATAAACTTTGCAATGTCTGCCT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.045916;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:9,3:9,3
+chr6	147790792	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,3:1,2:5,1
+chr6	147863838	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,2:2,2
+chr6	148568676	.	A	ATATC	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:1,4:3,1
+chr6	150886435	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:12,4:1,1
+chr6	151208830	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=7.799e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:10,9:7,7
+chr6	151740285	.	A	ATT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,1:5,4
+chr6	152697504	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:7,6:7,2
+chr6	154331411	.	GAGAA	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,2:5,2
+chr6	154426346	.	T	TTTTATTTA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.017962;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:10,7:12,4
+chr6	155502665	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.5695e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,5:6,5
+chr6	155828878	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,5:3,4:2,1
+chr6	156433103	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,2:0,0:4,2
+chr6	156880739	.	C	CA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:5,3:4,1
+chr6	157507369	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00023911;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,16:6,5:3,11
+chr6	158029042	.	C	CCCTGCAGAGGGTGGGCCCTGGGTCT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,1:7,3
+chr6	159269210	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.026061;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:3,3:12,6
+chr6	159269281	.	TATCTATCTATCC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.011795;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,3:9,4
+chr6	159408174	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
+chr6	160958101	.	C	CTATATATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
+chr6	161453741	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr6	162279405	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
+chr6	162667953	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.0465e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:12,15:11,7
+chr6	164719165	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00017983;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:15,23:11,14:4,9
+chr6	165202989	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.055233;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:20,2:14,3
+chr6	165306915	.	T	TTG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0077494;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,7:5,1
+chr6	165943346	.	G	GAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:7,6:4,1
+chr6	166304496	.	G	GGCTGAAATTACCAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,3:7,1
+chr6	166650231	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00037902;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:6,4:7,4
+chr6	167490297	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,5:2,4:5,1
+chr6	168364594	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0069124;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:3,9:11,1
+chr6	168572298	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:2,1:5,1
+chr6	168680341	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:0,3:0,1:0,2
+chr6	169514544	.	GA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.028551;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:14,2:5,4
+chr6	169895224	.	G	GA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=8.0768e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:12,5:7,5
+chr7	31456	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.012958;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:11,1:15,7
+chr7	1693824	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.5955e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:6,7:9,7
+chr7	1903563	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,4:5,4
+chr7	4448610	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018907;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:10,1:9,5
+chr7	4819072	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,2:3,4
+chr7	4973319	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15021;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:6,4:2,1
+chr7	5484639	.	A	AT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.016023;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:5,6:8,4
+chr7	5857708	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.029938;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:5,5:12,6
+chr7	6313076	.	ATT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047337;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:4,3:9,3
+chr7	6743832	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.027715;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:18,2:8,5
+chr7	7022753	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,1:3,3
+chr7	8410432	.	TATATATATA	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.0034965;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:0,3:2,3
+chr7	12538980	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0002515;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:9,4:9,6
+chr7	12608319	.	ATG	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02313;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,1:9,3
+chr7	12621637	.	GT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,9:3,8:1,1
+chr7	13476115	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0036508;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,9:0,8:1,1
+chr7	14211317	.	TA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.054264;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,1:9,3
+chr7	16219670	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,4:6,2
+chr7	16352879	.	GCACA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,5:2,3:0,2
+chr7	16551767	.	TAA	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0034707;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:13,3:8,4
+chr7	16556070	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00094545;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,5:8,3
+chr7	16556706	.	GT	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=9.1018e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:13,5:11,5
+chr7	18799038	.	AAGACACACACACACAC	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0031186;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,12:10,6:4,6
+chr7	18817299	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=8.0727e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:5,8:14,6
+chr7	21218988	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027772;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,5:4,2:1,3
+chr7	21570883	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027654;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,5:9,2
+chr7	21619979	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,2:15,2
+chr7	22491415	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00012013;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:11,6:10,5
+chr7	22592889	.	TAGGAAAGAATGTTGCCCTGTAG	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00031586;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:4,4:8,7
+chr7	23618563	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:7,4:10,3
+chr7	23630505	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,1:11,3
+chr7	24117614	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00097732;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,4:9,4
+chr7	24152155	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0076269;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:10,5:7,2
+chr7	24377884	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,2:8,2
+chr7	25084082	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:4,3:3,1
+chr7	26284380	.	GTATA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.031941;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:11,4:1,2
+chr7	26317659	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
+chr7	27309471	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.1295e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:8,8:12,6
+chr7	29541131	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
+chr7	30006116	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,8:3,6:2,2
+chr7	31192393	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,3:3,4
+chr7	33525617	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:17,2:13,2
+chr7	34400745	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:2,3:3,1
+chr7	34686960	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.029051;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:8,4:1,2
+chr7	35281894	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0027765;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,8:3,7:3,1
+chr7	36272519	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.063676;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:18,4:9,1
+chr7	38344493	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13372;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:16,1:4,2
+chr7	38408752	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.39286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,4:2,2:7,2
+chr7	39930838	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11029;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,2:2,1:2,1
+chr7	40064817	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00042089;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:7,7:4,4
+chr7	43028716	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.1295e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:13,4:7,10
+chr7	43945776	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,5:4,3
+chr7	44872252	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.1148e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,22:9,15:9,7
+chr7	45782740	.	AT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,5:6,2:2,3
+chr7	45817605	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.022724;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,1:4,3
+chr7	46142778	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01921;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,5:3,2
+chr7	48759056	.	A	AACACACACACACAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037959;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:10,3:1,1
+chr7	50539850	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00032942;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,7:11,4
+chr7	51896176	.	C	CTTAAGCAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0026395;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,8:8,2:14,6
+chr7	51896180	.	T	TGGATTAAGG	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.008813;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,7:9,1:13,6
+chr7	51896182	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0067299;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,7:8,2:14,5
+chr7	52353057	.	A	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.6121e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:14,14:12,8
+chr7	54254829	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0014755;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,6:6,3
+chr7	56166301	.	C	CAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0064996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:1,8:3,1
+chr7	56768611	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:6,5:3,1
+chr7	56986716	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,5:6,3
+chr7	57034955	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,2:9,2
+chr7	58069949	.	C	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.0235;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:60,10:41,9:19,1
+chr7	58074607	.	A	G	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.024322;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:85,15:58,7:27,8
+chr7	58767509	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,2:0,0:7,2
+chr7	58894373	.	A	G	0	PASS	DP=304;GPV=1;SPV=0.00010709;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:96,34:32,7:64,27
+chr7	60031408	.	A	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.015827;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:60,13:45,8:15,5
+chr7	60047386	.	C	G	0	PASS	DP=453;GPV=1;SPV=0.020488;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:235:210,25:146,14:64,11
+chr7	60914309	.	GATGATGATTCCTTTCGATATCATTTGATGATTCCATTCAATTCCATTCT	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.079011;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,3:16,1
+chr7	60966013	.	G	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.0069542;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:62,11:26,4:36,7
+chr7	61419712	.	CT	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.02424;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,2:12,2
+chr7	62273765	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.035271;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:14,3:18,3
+chr7	62331223	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0001759;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,3:12,10
+chr7	62431487	.	G	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.039578;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:21,10:24,2
+chr7	63757346	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
+chr7	63759423	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.056405;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:19,2:8,2
+chr7	63759567	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.119;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:0,0:26,4
+chr7	64089741	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.7368e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,8:11,7
+chr7	64096569	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0028734;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:10,4:3,3
+chr7	65099169	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045858;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:16,3:8,4
+chr7	65101107	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:4,8:3,1
+chr7	65784392	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0092406;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:16,9:10,1
+chr7	66324807	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,2:1,1:1,1
+chr7	67225790	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011304;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:5,4:11,4
+chr7	67712804	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.045385;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,2:7,5
+chr7	67730877	.	TAG	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:5,4:2,1
+chr7	67967899	.	A	ATTAT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,5:10,4:8,1
+chr7	68476999	.	A	ATG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027654;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:10,6:7,1
+chr7	69021853	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:12,1:11,3
+chr7	69073218	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:3,8:6,1
+chr7	69927186	.	T	TTATATA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.037194;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,4:5,3
+chr7	71447728	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=8.1411e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,15:10,8:10,7
+chr7	72588022	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030898;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:12,6:9,1
+chr7	72602750	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0061179;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:18,7:7,1
+chr7	72615348	.	G	GGA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.016937;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:17,3:7,5
+chr7	72713300	.	CA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
+chr7	73156587	.	GC	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,1:4,3
+chr7	73639000	.	GA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00026967;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:5,8:11,1
+chr7	74336891	.	T	TTTG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,5:6,4:2,1
+chr7	74410895	.	AGAGAGAAG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0059157;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,5:7,2
+chr7	74460418	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=9.5049e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:14,8:13,5
+chr7	75715458	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,5:9,1:4,4
+chr7	75723951	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018803;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,4:6,3:1,1
+chr7	76514912	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:0,3:0,1:0,2
+chr7	76757277	.	T	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0077399;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:1,5:3,1
+chr7	76882331	.	G	GAGAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18281;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,6:10,3:8,3
+chr7	76993485	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044663;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,1:15,4
+chr7	79653897	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.8158e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:12,5:7,9
+chr7	83387850	.	GT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,4:6,3:11,1
+chr7	83515293	.	GA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011976;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,5:2,3
+chr7	86187771	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,2:4,2
+chr7	87999987	.	TA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0041611;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,5:6,3
+chr7	88127476	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.2075e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:11,8:9,5
+chr7	88266099	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.010479;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:9,4:7,7
+chr7	88814447	.	A	AAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,8:4,5:2,3
+chr7	89176587	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,3:5,2:1,1
+chr7	90331378	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=7.9892e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,5:5,4
+chr7	91729131	.	G	GGAAGGGA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,2:2,2:0,0
+chr7	94339211	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.003791;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:9,5:13,4
+chr7	94376048	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,4:7,1
+chr7	95100844	.	AT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.011868;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:4,6:0,1
+chr7	95580039	.	TTATATATATATATATATATA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
+chr7	98889555	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015475;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,9:8,6:3,3
+chr7	98889557	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0088061;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:5,4:3,3
+chr7	101063702	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.083916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,5:3,2:2,3
+chr7	101825753	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0054096;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:7,5:2,2
+chr7	102488756	.	A	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.034205;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:22,6:24,4
+chr7	102490814	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.034752;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:17,4:18,4
+chr7	102502759	.	C	CA	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.0096458;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:50,10:28,6:22,4
+chr7	102592517	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.014313;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:35,9:7,1
+chr7	102605663	.	G	A	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.0092848;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:71,14:48,8:23,6
+chr7	105492052	.	CAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,7:5,6:4,1
+chr7	106628825	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:1,3:2,3
+chr7	107722685	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0045822;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,9:6,4:4,5
+chr7	108024743	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,3:8,2
+chr7	108749132	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0011981;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:14,6:17,6
+chr7	108884387	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,7:8,4:1,3
+chr7	110802341	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.018803;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,4:4,2:3,2
+chr7	110802349	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,4:2,3:4,1
+chr7	111217126	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,4:4,2:5,2
+chr7	111632668	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,5:4,1
+chr7	112445062	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,5:1,2
+chr7	113840324	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00028547;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:13,7:9,7
+chr7	114176298	.	T	TTC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,3:0,2:1,1
+chr7	116288619	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,5:6,1
+chr7	118804763	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=9.294e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:9,7:8,5
+chr7	118952191	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=7.2318e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:10,4:3,6
+chr7	119014250	.	G	GTA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:4,3:5,1
+chr7	119221565	.	A	AT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
+chr7	119839161	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00019536;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,7:8,3
+chr7	120768774	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:6,2:5,4
+chr7	122150366	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:1,3:1,2:0,1
+chr7	125349432	.	GTA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00057944;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:7,4:6,3
+chr7	126019610	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0015164;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,5:9,5
+chr7	127483685	.	AATAT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:8,3:3,1
+chr7	128512979	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0064613;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,4:4,3
+chr7	129033906	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:9,4:2,1
+chr7	130626708	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.237e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:11,3:8,11
+chr7	130940445	.	CAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:2,2:3,3
+chr7	131444745	.	TAGTAGTAGTAGTAGA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011679;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,3:3,5
+chr7	131868548	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0044739;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:3,5:2,1
+chr7	132711346	.	T	TGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,2:4,2
+chr7	133076058	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:6,9:3,1
+chr7	133397331	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.7738e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:5,7:7,4
+chr7	133649465	.	T	TTTTTTC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.027357;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:8,2:9,3
+chr7	133745729	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.019985;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,1:4,9
+chr7	134527015	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:0,1:4,3
+chr7	136880046	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
+chr7	137023785	.	T	TGATA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.024656;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,4:5,3:7,1
+chr7	137324435	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,2:8,2
+chr7	137640006	.	G	GT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0143;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,5:8,1
+chr7	137696766	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00022263;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:7,9:16,2
+chr7	138654500	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:5,3:3,3
+chr7	139110664	.	TA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,7:4,6:7,1
+chr7	143767673	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.036975;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:17,5:8,1
+chr7	144204888	.	C	T	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.044454;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:81,15:46,8:35,7
+chr7	144362416	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
+chr7	144530700	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0012555;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:12,5:8,5
+chr7	145746199	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016594;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,4:9,2
+chr7	146555527	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11618;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:22,2:12,2
+chr7	147198955	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:13,4:1,3
+chr7	148283259	.	G	GA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,3:1,2
+chr7	149906416	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,2:0,1:2,1
+chr7	149973119	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.049445;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:16,4:15,1
+chr7	150041507	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.049123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,3:4,1:1,2
+chr7	150158985	.	A	AGG	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.056165;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,4:15,1
+chr7	150366215	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.944e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:7,7:7,8
+chr7	150987805	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.27198;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:8,4:2,1:6,3
+chr7	151443970	.	A	AT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,2:6,2
+chr7	152379913	.	C	G	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.0019945;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:75,13:42,5:33,8
+chr7	152796880	.	T	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:2,1:5,1
+chr7	153694853	.	TAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:6,5:2,1
+chr7	156205191	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,1:7,3
+chr7	156886047	.	G	GA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,8:0,7:2,1
+chr7	157648793	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,2:5,3
+chr7	158152191	.	A	AAAAAAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,9:6,3:3,6
+chr7	158720933	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,3:8,1
+chr7	158720943	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:13,4:8,3
+chr7	159195589	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
+chr8	200941	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0041252;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:11,5:10,3
+chr8	933541	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr8	1690703	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:4,3:3,1
+chr8	2446587	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.033154;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:20,4:18,1
+chr8	3262190	.	T	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.023173;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
+chr8	3308731	.	A	AATTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,8:1,3:2,5
+chr8	3712438	.	CAGACAGAG	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.11312;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,5:13,4:17,1
+chr8	4933931	.	G	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011437;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:3,3:9,3
+chr8	5038381	.	AT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0013537;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,5:5,2
+chr8	6592821	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,2:2,1:2,1
+chr8	6874118	.	T	TAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023613;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,3:6,3
+chr8	7280617	.	T	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0063539;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:3,3:8,3
+chr8	7388774	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.013586;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,4:11,3
+chr8	7445427	.	A	G	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.042142;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:23,8:23,2
+chr8	7590600	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:11,2:19,2
+chr8	7741855	.	G	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.031602;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:83,19:28,9:55,10
+chr8	7765543	.	C	A	0	PASS	DP=357;GPV=1;SPV=0.03449;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:143,16:58,4:85,12
+chr8	7767717	.	T	C	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.047471;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:7,1:35,6
+chr8	7894605	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:18,4:1,0
+chr8	7905079	.	C	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0069996;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,7:0,1:6,6
+chr8	7949368	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:4,1:1,7
+chr8	8023753	.	T	G	0	PASS	DP=325;GPV=1;SPV=0.0016451;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:129,36:55,19:74,17
+chr8	8037828	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.058687;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:3,2:12,2
+chr8	8068506	.	G	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chr8	8074498	.	A	G	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.033059;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:22,1:27,7
+chr8	8161332	.	C	A	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.032509;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:63,9:36,7:27,2
+chr8	9398157	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=8.543e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:9,8:11,8
+chr8	10219867	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.075059;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,4:6,2
+chr8	10991891	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0010554;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:7,3:13,5
+chr8	11180735	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0054457;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:8,6:10,10
+chr8	12189987	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.030651;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,4:3,1
+chr8	12449811	.	A	ATG	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.03999;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:41,13:24,11:17,2
+chr8	12483538	.	C	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.011673;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:22,9:17,5
+chr8	12495803	.	C	T	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.046457;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:49,13:27,10:22,3
+chr8	12497170	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:1,3:5,1
+chr8	12501192	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.057585;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,5:7,2
+chr8	12509931	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10145;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr8	12516289	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,0:11,4
+chr8	12552262	.	A	G	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.033288;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:86,18:44,14:42,4
+chr8	12577813	.	T	C	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.0068415;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:82,25:37,10:45,15
+chr8	12577823	.	A	G	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.0026385;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:88,20:36,13:52,7
+chr8	12584810	.	G	A	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.012888;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:84,19:44,12:40,7
+chr8	12588896	.	T	C	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.03851;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:90,17:42,9:48,8
+chr8	12594078	.	A	C	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.010693;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:70,18:41,9:29,9
+chr8	12596034	.	TC	T	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.016696;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:77,18:39,9:38,9
+chr8	12884712	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:3,5:2,2
+chr8	13753701	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00017105;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:2,6:14,5
+chr8	13935838	.	A	AT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:3,4:4,4
+chr8	15558792	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0094436;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:8,10:11,3
+chr8	15923495	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,3:4,1:1,2
+chr8	16926818	.	A	ATGTAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00387;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,4:1,3:1,1
+chr8	18271057	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0013228;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:11,7:8,10
+chr8	18991373	.	T	TACAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,5:0,3:2,2
+chr8	19666793	.	AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
+chr8	20199604	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.012394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:14,3:3,3
+chr8	20516661	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,4:3,1:2,3
+chr8	20936544	.	C	CAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.014985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,4:0,0
+chr8	22106419	.	CAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
+chr8	22649850	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0094041;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,5:9,1:3,4
+chr8	22765825	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
+chr8	23876294	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0055944;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,6:0,3:1,3
+chr8	24758151	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.3892e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:5,6:8,10
+chr8	24924432	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:0,2:0,0:0,2
+chr8	26618315	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:5,2:11,8
+chr8	27021715	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:1,2:1,2:0,0
+chr8	32366679	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:2,3:3,1
+chr8	33433611	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0011632;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:2,8:7,3
+chr8	34993484	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=4.6796e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:3,4:11,8
+chr8	35551220	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0029872;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,1:11,5
+chr8	35864646	.	T	TAC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,4:0,1:0,3
+chr8	36225747	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,3:2,1
+chr8	37657098	.	TAC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,10:4,6:2,4
+chr8	38148813	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:30:0,2:0,2:0,0
+chr8	41504120	.	T	TAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0093361;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,12:13,9:4,3
+chr8	43972750	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
+chr8	44142988	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:0,2:10,4
+chr8	44211094	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10777;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:12,2:6,1
+chr8	45086951	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:1,6:6,1
+chr8	46208097	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=5.5231e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,7:11,4
+chr8	46279883	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0011018;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,3:7,4
+chr8	46673421	.	T	TA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=8.275e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:9,7:9,4
+chr8	47015050	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:5,5:2,2
+chr8	47648800	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.4255e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:10,7:7,7
+chr8	50961698	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:12,2:6,2
+chr8	52963543	.	T	TG	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0076838;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,12:11,9:13,3
+chr8	54239104	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00036687;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:10,7:9,4
+chr8	54547199	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.4566e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:11,8:5,3
+chr8	55755593	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:1,2:1,1:0,1
+chr8	55801582	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,2:5,2
+chr8	56285203	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,3:1,1
+chr8	57159303	.	T	TGACA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.15499;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,1:8,4
+chr8	57261742	.	T	TG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:4,6:1,1
+chr8	59389650	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01441;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,7:7,5:6,2
+chr8	60425281	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0003586;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:14,6:7,2
+chr8	62385634	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0048347;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:12,1:13,6
+chr8	62465619	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=3.4904e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:8,7:12,8
+chr8	62870770	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.00041135;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,9:0,3:0,6
+chr8	63080732	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0095174;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:15,3:6,5
+chr8	63285041	.	TTCC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.11761;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:4,2:23,3
+chr8	63937992	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:5,5:4,8
+chr8	64396808	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.018404;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:4,4:7,1
+chr8	65126348	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,4:7,2
+chr8	66867551	.	AAAT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.033718;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,3:11,6
+chr8	67218207	.	A	AAATAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,5:2,1:5,4
+chr8	69444882	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14256;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,2:18,2
+chr8	69931130	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.3365e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,18:5,11:6,7
+chr8	70378743	.	T	TAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,3:4,3
+chr8	71208737	.	GA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0062663;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:7,7:9,7
+chr8	72249868	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,4:1,2:4,2
+chr8	73106573	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.2714e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:8,3:13,7
+chr8	73256869	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,2:2,1:4,1
+chr8	73699451	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.3207e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,20:12,8:2,12
+chr8	74230754	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013657;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,6:5,5:6,1
+chr8	75916038	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:7,8:3,3:4,5
+chr8	76140882	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00025084;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:17,8:11,3
+chr8	77040107	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.076832;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:6,2:16,2
+chr8	77040108	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.059705;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,2:14,2
+chr8	78843814	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:12,1:7,4
+chr8	80127839	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,7:3,4:5,3
+chr8	80329468	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,4:5,1:6,3
+chr8	82396759	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.1081e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:10,9:9,7
+chr8	83820094	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00011224;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:5,5:8,4
+chr8	83945783	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,5:5,4:6,1
+chr8	83949234	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00070506;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,7:9,2
+chr8	83959734	.	G	GCA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.03809;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,7:16,6:2,1
+chr8	84903683	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0002546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:11,7:17,5
+chr8	85653042	.	C	G	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.0084042;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:127,31:62,12:65,19
+chr8	86362063	.	C	CAT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:3,2:1,7
+chr8	88456275	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.7463e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,9:8,3
+chr8	89751607	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.034681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,4:4,3
+chr8	90070865	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.14511;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,1:21,3
+chr8	90100331	.	AT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.002101;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:6,4:9,2
+chr8	90522683	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0011083;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:9,5:12,3
+chr8	92042938	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.5662e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:9,11:11,4
+chr8	92569374	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00024975;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:12,1:4,7
+chr8	92626183	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:6,3:6,3
+chr8	93281553	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=8.1991e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,22:8,12:8,10
+chr8	97123152	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,3:13,2:6,1
+chr8	97347890	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=5.2542e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,5:5,3
+chr8	97621742	.	TAAAAAA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,3:4,1
+chr8	100093513	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00017406;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:9,4:9,6
+chr8	100100291	.	AT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0053469;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:12,5:12,2
+chr8	100493756	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,4:9,2:6,2
+chr8	101124545	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,3:6,5
+chr8	102528666	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0066001;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,3:7,2
+chr8	103992278	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00014576;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,17:6,4:3,13
+chr8	107192192	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,1:9,3
+chr8	107551396	.	G	GTA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:7,3:8,6
+chr8	107551422	.	G	GTA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.069853;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:10,2:7,3
+chr8	108466442	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:8,7:4,1
+chr8	109269251	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0020965;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:10,7:12,8
+chr8	110395508	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:13,1:23,3
+chr8	110764485	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,3:2,1:1,2
+chr8	110953462	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0052889;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:11,4:7,6
+chr8	111806622	.	TC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.054945;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,3:2,1:1,2
+chr8	111833170	.	T	TTAGATAGATAGA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,5:4,4:4,1
+chr8	114796569	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=8.1682e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:7,5:9,8
+chr8	117558717	.	C	CTGTGTG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.015516;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
+chr8	117563233	.	CAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:6,4:3,2
+chr8	117748531	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.2591e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:8,7:12,6
+chr8	118637996	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=7.3076e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:6,8:11,1
+chr8	118840904	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=5.4752e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:7,6:13,7
+chr8	122223529	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0014372;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,4:8,4
+chr8	123545013	.	C	CAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,3:2,1
+chr8	123671946	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00092217;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,5:8,4
+chr8	124302600	.	AATAT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:4,2:6,3
+chr8	124302660	.	AATAT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.22984;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:8,1:9,2
+chr8	125911787	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.8653e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:7,7:11,4
+chr8	127408101	.	TATGG	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,2:4,4
+chr8	127408113	.	T	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,3:0,2:4,1
+chr8	128952445	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.261e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:13,5:5,9
+chr8	129184572	.	AC	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0069381;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,6:7,2
+chr8	129610157	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:2,7:2,6:0,1
+chr8	130758196	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.006237;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:11,3:3,4
+chr8	132154192	.	AGTTTTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:1,3:6,2
+chr8	132782895	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=1.3655e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:6,9:8,3
+chr8	133395213	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.021372;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,1:3,4
+chr8	133928343	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00017351;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:13,5:8,6
+chr8	135058547	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00041251;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:9,4:12,6
+chr8	135117214	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,2:1,1:2,1
+chr8	137335629	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
+chr8	137446909	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00012301;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,5:8,5
+chr8	137610924	.	A	ATT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0053956;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,8:7,3
+chr8	137863580	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=4.9323e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,7:5,1
+chr8	137905012	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0014004;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:13,3:11,6
+chr8	138281212	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00010966;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:9,9:13,7
+chr8	138314693	.	C	CAATAAATAAATAAATAAATA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:2,4:2,1
+chr8	138795528	.	G	GACACACACACAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:13,3:7,1
+chr8	139068153	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,8:5,7:5,1
+chr8	139223325	.	CT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00024036;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,5:2,3
+chr8	139390449	.	A	AT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:6,1:3,3
+chr8	140225168	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0027568;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:15,4:4,5
+chr8	140283294	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0045767;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:3,4:2,2
+chr8	140448153	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,3:11,1
+chr8	141345359	.	T	TA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015942;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,4:2,1
+chr8	142397036	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087302;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:10,3:3,1:7,2
+chr8	143287678	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.014981;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:16,1:20,5
+chr8	143670217	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=4.8725e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:6,7:15,5
+chr9	13621	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,3:6,1
+chr9	55054	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,1:2,6
+chr9	56883	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,1:13,3
+chr9	60874	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0054804;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:16,6:17,7
+chr9	704992	.	CAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:6,3:2,2
+chr9	4213079	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.3459e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:8,9:10,8
+chr9	4270925	.	GTGTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.010459;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,1:4,6
+chr9	5080727	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.0511e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,17:2,14:13,3
+chr9	5626226	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00080386;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:3,6:8,5
+chr9	6542885	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,6:2,1
+chr9	10511947	.	CGT	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,4:0,2:1,2
+chr9	10875971	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.364e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:11,10:6,6
+chr9	12799746	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00012301;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,7:8,3
+chr9	13925346	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00023686;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,4:10,5
+chr9	15664695	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,3:5,1:1,2
+chr9	16059502	.	TTTC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:6,2:9,3
+chr9	16779114	.	T	TAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016673;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:8,4:6,2
+chr9	17668652	.	A	ATTTAT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.01932;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:12,8:6,3
+chr9	18238768	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.0388e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:11,9:7,10
+chr9	18894345	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:9,4:4,1
+chr9	20545096	.	CAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.014049;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,4:5,1
+chr9	20974069	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00092488;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:5,4:4,8
+chr9	21565186	.	C	CAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037638;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,4:7,5
+chr9	23263748	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.4608e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:4,12:12,3
+chr9	25102456	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00072423;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:10,5:13,5
+chr9	25241546	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00042492;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,3:5,5
+chr9	25760556	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,1:13,3
+chr9	26233976	.	GT	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.3574e-07;SS=2;SSC=68;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:11,13:9,6
+chr9	27211204	.	A	AAT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.018628;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:13,2:8,4
+chr9	27380785	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0013149;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:2,3:10,4
+chr9	27635638	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
+chr9	27797636	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018907;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,1:8,5
+chr9	28297829	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00049368;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:7,3:13,6
+chr9	28498477	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0028764;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:21,3:8,6
+chr9	30467575	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:1,3:1,2:0,1
+chr9	32360274	.	A	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
+chr9	33157065	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.54545;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,2:1,1:6,1
+chr9	33437246	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0063848;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:6,4:11,9
+chr9	33579951	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,1:6,3
+chr9	35309222	.	AGTGT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,10:3,8:1,2
+chr9	36216327	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:5,3:2,1
+chr9	38564762	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0069576;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:15,4:5,5
+chr9	38825196	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr9	38973013	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.040748;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:17,1:9,6
+chr9	39038729	.	T	C	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.04207;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:60,14:37,3:23,11
+chr9	39477841	.	CAA	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.025745;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:14,2:5,4
+chr9	39790829	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.033111;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:1,8:33,3
+chr9	39806065	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.040794;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:18,4:6,4
+chr9	39811309	.	T	TA	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.03895;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:63,17:31,8:32,9
+chr9	39817917	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,1:16,3
+chr9	40141902	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10773;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:11,1:11,4
+chr9	40299040	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,3:2,5
+chr9	40887604	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.002391;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:20,7:12,1
+chr9	40984387	.	A	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.025831;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:51,7:26,5:25,2
+chr9	41055190	.	AAGG	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.014823;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:10,2:8,4
+chr9	41124566	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0045001;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:17,7:5,6
+chr9	41149757	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.034482;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:10,7:18,2
+chr9	41294007	.	G	A	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.015832;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:69,14:29,3:40,11
+chr9	41390057	.	AT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.02769;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,4:6,4
+chr9	41496485	.	GAAAGGA	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.034215;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,6:28,4:3,2
+chr9	41527965	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.033733;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:17,5:15,3
+chr9	41661484	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.071753;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,3:10,1
+chr9	41770012	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
+chr9	41830987	.	C	T	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.012325;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:80,16:38,6:42,10
+chr9	41940481	.	A	G	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.0032578;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:63,24:34,12:29,12
+chr9	42027461	.	T	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,5:0,1
+chr9	42286662	.	G	A	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.0019358;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:64,8:34,6:30,2
+chr9	42534142	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.014968;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:15,4:19,9
+chr9	42564238	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.014448;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr9	42990597	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.073271;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:16,2:16,3
+chr9	43008955	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.099673;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:15,1:21,3
+chr9	43398652	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:0,0:22,4
+chr9	43450256	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.03569;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,1:2,3
+chr9	43491159	.	G	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
+chr9	43569176	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033651;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:18,2:8,2
+chr9	44012425	.	G	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:4,2:7,2
+chr9	44081441	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.01244;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:19,8:6,1
+chr9	45015567	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.095042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,2:10,2
+chr9	45173488	.	C	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.04859;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:38,5:0,1
+chr9	60560821	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037194;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:0,1:16,6
+chr9	60655675	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,2:4,4
+chr9	61534271	.	A	ATG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.04269;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,1:6,7
+chr9	61698971	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:12,4:1,0
+chr9	61972395	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.010479;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,4:8,5
+chr9	62578345	.	C	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.033589;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:15,1:20,6
+chr9	62804228	.	G	C	0	PASS	DP=299;GPV=1;SPV=0.019582;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:132,16:52,4:80,12
+chr9	62804246	.	T	C	0	PASS	DP=310;GPV=1;SPV=0.010327;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:135,19:53,6:82,13
+chr9	62805547	.	C	T	0	PASS	DP=289;GPV=1;SPV=0.014771;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:115,22:63,12:52,10
+chr9	62816131	.	C	G	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.014587;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:91,21:55,13:36,8
+chr9	62832112	.	C	T	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.041377;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:63,14:41,9:22,5
+chr9	62832215	.	G	T	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.033849;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:120,20:68,9:52,11
+chr9	62832227	.	A	G	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.021249;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:114,20:62,10:52,10
+chr9	62834514	.	G	A	0	PASS	DP=350;GPV=1;SPV=0.027412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:176:156,20:79,7:77,13
+chr9	63271325	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0076269;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,3:8,4
+chr9	63367584	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,1:2,6
+chr9	63767558	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.049649;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:13,1:13,8
+chr9	63794610	.	A	G	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.028344;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:64,10:35,9:29,1
+chr9	63852085	.	A	G	0	PASS	DP=244;GPV=1;SPV=0.033866;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:95,18:44,6:51,12
+chr9	63875499	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0026263;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:18,8:16,2
+chr9	64054984	.	T	A	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.0023845;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:55,8:23,3:32,5
+chr9	64364444	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0031054;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:15,6:7,3
+chr9	64375257	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.067818;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,1:17,3
+chr9	64475776	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
+chr9	64543521	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,1:8,3
+chr9	64724833	.	AAAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:13,3:10,1
+chr9	65559995	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.035906;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:19,1:2,8
+chr9	66058425	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040008;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:5,2:11,7
+chr9	66058712	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,1:15,3
+chr9	66234321	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022983;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,4:7,7
+chr9	66246635	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.011389;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:12,2:12,9
+chr9	66343510	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.045253;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:5,6:18,2
+chr9	66374592	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.030284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:15,10:19,3
+chr9	66817730	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0088349;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:8,7:11,3
+chr9	66942755	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0082692;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,3:6,4
+chr9	66949045	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.064347;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,2:15,2
+chr9	66958756	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
+chr9	67103214	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0024876;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,13:6,2:6,11
+chr9	67165889	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:2,2:6,3
+chr9	67428816	.	G	GC	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.043261;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:22,3:6,2
+chr9	67563763	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,4:2,3
+chr9	67709320	.	A	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr9	67737196	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.010238;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:26,5:17,7
+chr9	68265354	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
+chr9	70008285	.	A	AGATAGATAGAT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.020584;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,9:14,5:9,4
+chr9	70792518	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.024248;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,3:10,2
+chr9	72205110	.	C	CAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,9:2,8:3,1
+chr9	72273869	.	C	CTCTGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:5,5:3,1
+chr9	77164452	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:7,6:4,1
+chr9	78715470	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,5:1,2:5,3
+chr9	79155809	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.6484e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,21:7,14:9,7
+chr9	79835821	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:3,3:5,2
+chr9	79891930	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.013673;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:14,4:14,3
+chr9	80561564	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.3459e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:10,10:8,7
+chr9	80678615	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0067079;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:3,10:2,8:1,2
+chr9	80914871	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00094384;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:12,4:11,9
+chr9	80949038	.	T	TAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:8,8:3,1
+chr9	81017936	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,4:6,1:10,3
+chr9	82212576	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=9.6434e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:7,8:2,3
+chr9	83350623	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011625;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:2,5:2,1
+chr9	85248479	.	ATG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,5:5,3
+chr9	85612007	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.1184e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:5,6:11,5
+chr9	85691522	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020538;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,2:6,2
+chr9	86037438	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.029984;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,3:3,3
+chr9	86216454	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,6:4,1
+chr9	87387357	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.010876;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:6,5:4,1
+chr9	88264218	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:6,2:1,2
+chr9	89182522	.	A	AAAAAT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.035241;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,4:7,3
+chr9	90541817	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0027337;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,11:5,4:5,7
+chr9	91562181	.	AAAGGAAGG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024328;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,4:2,2
+chr9	94308754	.	TCAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
+chr9	94452715	.	ATATATATATAATAGATATTATATATAAATATC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,4:8,1
+chr9	96284215	.	TAAAAA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00094923;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:3,6:3,5
+chr9	96371474	.	CAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:1,7:4,1
+chr9	96429027	.	T	TAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.015843;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,4:4,2
+chr9	96603155	.	G	GAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011229;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:7,6:2,3
+chr9	97743548	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,1:8,4
+chr9	99195776	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:5,4:2,1
+chr9	99500142	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.044512;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:15,5:11,1
+chr9	103728043	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=6.2544e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:14,2:10,12
+chr9	104045357	.	A	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,3:0,1:2,2
+chr9	104690644	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1599;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,4:7,2
+chr9	104696115	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,3:3,1:3,2
+chr9	107242263	.	A	AAG	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
+chr9	107641702	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00033576;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,5:9,5
+chr9	108095796	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:6,3:1,2
+chr9	108996155	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0067968;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:9,5:8,6
+chr9	109249721	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0013464;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,4:7,2
+chr9	109357854	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:7,4:4,1
+chr9	110313480	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00037187;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:14,6:6,5
+chr9	112320312	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,1:9,3
+chr9	112448507	.	TCTTTCTTTCTTTCCTC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.008898;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:3,5:7,6
+chr9	113000950	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0012203;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,3:7,5
+chr9	113050469	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:32:0,2:0,1:0,1
+chr9	113218379	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,5:3,4:3,1
+chr9	115355012	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00043396;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:4,9:9,2
+chr9	116389810	.	GT	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.002854;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,3:7,4
+chr9	116882828	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.040404;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,4:7,2:6,2
+chr9	117005080	.	A	ATTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,2:2,2
+chr9	117134295	.	TACACACACAC	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,2:3,1:0,1
+chr9	117187917	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.4083e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,6:8,6
+chr9	117362368	.	C	CA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=6.911e-06;SS=2;SSC=51;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:12,10:2,4
+chr9	118141002	.	A	ATT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.004773;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:10,6:4,6
+chr9	120004935	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00080119;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,3:4,4
+chr9	122606773	.	ACCTAT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.19341;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,2:18,2
+chr9	123395472	.	G	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:6,3:11,1
+chr9	126697837	.	C	CTGTTT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.020561;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:5,4:15,5
+chr9	128598272	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00068482;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:11,5:8,5
+chr9	129575015	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0053975;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:9,10:6,4
+chr9	129659598	.	TTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.049808;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:7,2:4,2
+chr9	130121181	.	T	TCAAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,2:7,3
+chr9	130123533	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.03148;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:7,3:9,6
+chr9	131317261	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:10,5:3,1
+chr9	132172722	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,6:12,2:2,4
+chr9	132361988	.	A	AT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,1:7,3
+chr9	135730990	.	T	TAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0065226;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:2,5:7,3
+chr9	136236902	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012829;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:3,2:14,5
+chrX	2857148	.	ATCTATCTATCTAGACCTAGATG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.029045;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,2:10,5
+chrX	3417799	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00013223;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:15,6:4,4
+chrX	5706845	.	CTA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.028248;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,1:7,3
+chrX	5740439	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.537e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:13,9:10,5
+chrX	6313965	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.316e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:6,10:9,2
+chrX	6352929	.	CACACACACACATATATATAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
+chrX	7716394	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0018791;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,4:7,4
+chrX	8960822	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=2.0941e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:11,7:7,7
+chrX	9405116	.	C	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.039026;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:23,6:12,3
+chrX	9413850	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.016724;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
+chrX	9976423	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:8,13:0,0
+chrX	10691809	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.077531;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:17,3:13,2
+chrX	11656387	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00011173;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:12,6:11,5
+chrX	13128799	.	G	GTA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,4:9,1
+chrX	14487387	.	TA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,3:2,2
+chrX	14604543	.	AGTGTGT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,5:1,1
+chrX	14933447	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,5:4,3
+chrX	15397163	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.1811e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,17:3,9:12,8
+chrX	15675424	.	TG	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.051974;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:15,3:18,2
+chrX	15742793	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.5776e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:10,8:8,6
+chrX	15975953	.	TTC	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0087495;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,3:3,5
+chrX	18155664	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.031941;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,4:5,2
+chrX	18550063	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0025995;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:14,5:20,5
+chrX	19634031	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.23867;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,3:12,2:4,1
+chrX	20141814	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.7627e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:8,9:14,8
+chrX	21235464	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0030624;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:11,5:8,5
+chrX	23065635	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=2.3891e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:3,6:4,6
+chrX	23350060	.	TAAAAAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.001482;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,11:5,6:2,5
+chrX	24741874	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=8.5672e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:9,4:4,7
+chrX	25466850	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.6055e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,7:9,3
+chrX	25998490	.	G	GCACACACACACACACACA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010459;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,7:6,6:6,1
+chrX	26792298	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,8:5,7:1,1
+chrX	26870981	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0022747;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:13,7:2,1
+chrX	29218352	.	AT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00024436;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,2:11,6
+chrX	31588872	.	GT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0009828;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,5:5,3
+chrX	31748518	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=5.2411e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:6,6:5,7
+chrX	32592107	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=4.2654e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:11,9:8,9
+chrX	32710937	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.3982e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,23:5,6:7,17
+chrX	33062862	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=6.5751e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:5,5:13,8
+chrX	33129325	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:1,4:3,2
+chrX	33908153	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=3.1587e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:9,9:5,4
+chrX	35405459	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0049024;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,2:8,3
+chrX	35678154	.	AT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.003791;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:10,4:12,5
+chrX	39563033	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0060979;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,1:5,4
+chrX	39733942	.	AGGAT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.030143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,4:6,4
+chrX	41648794	.	CT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.1718e-05;SS=2;SSC=49;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:7,5:11,12
+chrX	42022824	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,4:2,1
+chrX	43589283	.	TA	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
+chrX	44852267	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,2:6,2
+chrX	45220178	.	T	TA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.16358;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:17,3:5,1
+chrX	47856048	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:3,6:1,2
+chrX	48091469	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,3:8,5
+chrX	48096043	.	G	GAAA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.026017;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:10,8:12,1
+chrX	49341543	.	C	T	0	PASS	DP=331;GPV=1;SPV=0.018877;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:149,20:98,12:51,8
+chrX	50149916	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018761;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:9,1:11,5
+chrX	51225373	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0018697;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:19,8:10,2
+chrX	53010524	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,2:3,4
+chrX	53181137	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0046664;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:10,4:13,3
+chrX	53507860	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.18182;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,2:0,1:3,1
+chrX	53721402	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0014171;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:16,8:9,1
+chrX	55101106	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=5.9904e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:8,6:5,9
+chrX	55597620	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015939;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:7,6:9,1
+chrX	55614666	.	A	ATATATATATATCCTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030651;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:5,3:6,2
+chrX	57038082	.	GA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.022121;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:5,5:16,2
+chrX	57306724	.	GTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.025586;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:1,4:10,5
+chrX	63643360	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0037582;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:8,5:7,2
+chrX	65566646	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010777;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:12,3:5,3
+chrX	67184170	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.13094;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,7:7,6:7,1
+chrX	67415469	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,1:3,3
+chrX	67422657	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14184;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,2:9,4
+chrX	68650782	.	C	CAAACAAAACA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,6:9,4:6,2
+chrX	69898419	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0026031;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:12,4:8,3
+chrX	70338953	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.049645;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
+chrX	70577735	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=1.6121e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,11:2,8:2,3
+chrX	70632121	.	G	GAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.19805;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:12,5:4,1
+chrX	71364171	.	G	GA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.054928;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:14,3:7,1
+chrX	72057396	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0093175;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:18,3:15,3
+chrX	74070376	.	TAAATA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,4:5,3
+chrX	74388455	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.0663e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:4,4:12,7
+chrX	75728930	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0066036;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,5:11,3
+chrX	76106112	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.2339e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:8,6:4,5
+chrX	77073595	.	T	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=8.7225e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:20,25:14,14:6,11
+chrX	78965898	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:6,1:15,3
+chrX	82488047	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0006592;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,4:3,5
+chrX	84591550	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=5.8565e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:6,9:11,4
+chrX	85642275	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00010095;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:8,5:10,6
+chrX	86113285	.	GATTT	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0432;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,2:10,2
+chrX	86140667	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0011868;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:4,8:3,3
+chrX	87211070	.	TTCCTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:3,1:5,5
+chrX	87234171	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,6:6,5:8,1
+chrX	87912589	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00080253;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:11,5:9,3
+chrX	89202018	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00087495;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,9:2,7:2,2
+chrX	89202024	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0035042;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:3,9:1,7:2,2
+chrX	89597156	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:2,2:3,2
+chrX	89900161	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.12189;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,1:10,4
+chrX	89900371	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.21337;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,3:13,1
+chrX	89905042	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0055336;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:0,1:3,4
+chrX	90159408	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0076872;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:9,1:6,5
+chrX	90179343	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0045549;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,3:6,3
+chrX	90315318	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.7786e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:11,9:10,8
+chrX	90824432	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0056817;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,4:10,3
+chrX	91215008	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:13,3:4,1
+chrX	91710886	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00012397;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,3:8,7
+chrX	92578105	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.016596;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:6,6:10,4
+chrX	93344490	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.010126;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:13,5:9,2
+chrX	96082566	.	T	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chrX	96105973	.	CAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,3:4,2
+chrX	97129145	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.049139;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:7,3:12,3
+chrX	97129146	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:2,4:9,1
+chrX	101318824	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.064935;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:2,1:2,1
+chrX	103136865	.	AT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.040844;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:13,3:8,3
+chrX	104310937	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00021607;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,6:8,3
+chrX	104465952	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:4,6:6,6
+chrX	106356782	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.9388e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:8,8:16,5
+chrX	107235832	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.3992e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,6:9,5
+chrX	108656846	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.7952e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:10,10:7,3
+chrX	109064210	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:2,1:5,4
+chrX	109201859	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00034703;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:11,1:10,9
+chrX	109245103	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=1.4033e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,16:6,8:8,8
+chrX	112713503	.	C	CAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011437;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
+chrX	112740421	.	A	AAAG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:11,4:0,0
+chrX	112954507	.	TC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.026636;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:1,2:5,4
+chrX	113025085	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,2:2,3
+chrX	113339159	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,3:3,5
+chrX	114387168	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:7,2:6,2
+chrX	114387169	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,4:6,2:4,2
+chrX	114387198	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:8,1:8,3
+chrX	115895510	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0078247;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:3,8:4,4
+chrX	116771502	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00014241;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:7,7:13,3
+chrX	117424521	.	A	ATG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,1:9,3
+chrX	117582261	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00052875;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:10,5:14,5
+chrX	118072252	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.041988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,1:10,3
+chrX	119058281	.	CTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:3,3:3,1
+chrX	119615883	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00015402;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,8:7,1
+chrX	121762835	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.2826e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,7:8,9
+chrX	122588930	.	AT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0030632;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:1,3:6,8
+chrX	122846270	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:1,4:4,1
+chrX	122937514	.	A	AT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10077;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:25,3:14,1:11,2
+chrX	122945040	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=2.4323e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:5,6:9,9
+chrX	123874694	.	AT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0032406;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:8,9:4,2
+chrX	123937999	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022502;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,3:9,4
+chrX	123938000	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.019711;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:9,3:19,4
+chrX	124025140	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00061059;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,6:8,2
+chrX	124088615	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
+chrX	124550761	.	AT	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0026395;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:14,5:8,3
+chrX	124592434	.	GT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,4:4,2
+chrX	126737139	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=5.1896e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:5,6:8,9
+chrX	127815860	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0040433;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:9,7:14,5
+chrX	129924283	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.016858;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,5:7,1
+chrX	131499198	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0003269;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:13,4:4,8
+chrX	132811663	.	A	AACTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.027668;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,2:4,2
+chrX	132923062	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:10,4:8,2
+chrX	134161309	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.021448;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,1:9,3
+chrX	134452113	.	GGA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,8:4,7:4,1
+chrX	134503061	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0017056;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:11,6:6,1
+chrX	135760399	.	G	A	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.036255;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:75,11:56,5:19,6
+chrX	135975981	.	C	CA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11029;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:3,1:1,1
+chrX	138530197	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.218e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:12,8:8,11
+chrX	139667050	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00010405;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,5:6,4
+chrX	141171923	.	T	TA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0143;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,4:6,2
+chrX	141576665	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,1:4,4
+chrX	142607510	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014575;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:8,4:7,3
+chrX	143003764	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=1.2376e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:4,7:6,5
+chrX	143901303	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00080797;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:13,9:12,2
+chrX	144115647	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=9.3552e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,7:7,3
+chrX	144115648	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.7463e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:10,8:6,4
+chrX	144922972	.	ATATATATT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.001935;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,4:1,3
+chrX	145116759	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.020181;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,4:6,6
+chrX	145944797	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0013091;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:5,4:12,3
+chrX	146120230	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.3183e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:6,4:13,9
+chrX	146175122	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.481e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,5:10,5
+chrX	146340931	.	TCCTTTCC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024337;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:5,1:7,8
+chrX	146431808	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0009678;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:11,5:10,4
+chrX	147282283	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.023962;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,6:5,1
+chrX	147282284	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.026903;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,6:5,1
+chrX	148625000	.	C	CT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.023954;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:15,3:10,2
+chrX	151449467	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.091614;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,2:15,2
+chrX	151750280	.	GA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0010749;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,6:5,3
+chrX	152241307	.	CTCAGGGG	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0088512;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,5:9,2
+chrX	152265933	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.0663e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:10,7:6,4
+chrX	152698051	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020486;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,4:5,2
+chrX	153030841	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0045929;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:16,2:17,7
+chrX	153664066	.	A	AAAAAAAAAAC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:4,3:2,1
+chrX	153860467	.	T	TTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:5,2:13,2
+chrX	153870995	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0008665;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:8,5:13,6
+chrX	155018031	.	AT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.017896;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,3:5,1
+chrX	155077239	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.0279e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:14,9:8,8
+chrY	3749578	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,4:1,1
+chrY	11109189	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,3:11,1
+chrY	11136382	.	T	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.0018526;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:5,2:31,8
+chrY	11186458	.	A	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.016106;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:26,6:15,6
+chrY	11198115	.	A	T	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.010994;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:26,13:14,6:12,7
+chrY	11198341	.	G	A	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.0070645;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:158,22:78,7:80,15
+chrY	11200655	.	G	T	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.032837;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:77,14:44,7:33,7
+chrY	11226998	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
+chrY	11234720	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013362;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,3:4,3
+chrY	11240233	.	T	G	0	PASS	DP=295;GPV=1;SPV=0.006285;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:119,29:57,9:62,20
+chrY	11240847	.	G	A	0	PASS	DP=255;GPV=1;SPV=0.027677;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:103,18:63,5:40,13
+chrY	11251840	.	A	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.032756;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:20,8:14,2
+chrY	11261967	.	C	T	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.042588;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:126,19:69,11:57,8
+chrY	56837265	.	G	A	0	PASS	DP=337;GPV=1;SPV=0.0027187;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:135,16:72,8:63,8
+chrY	56866220	.	T	C	0	PASS	DP=255;GPV=1;SPV=0.029132;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:88,22:35,4:53,18