##fileformat=VCFv4.2
##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
##reference=hg38
##source=varscan.py
##contig=<ID=chr1,length=248956422>
##contig=<ID=chr10,length=133797422>
##contig=<ID=chr11,length=135086622>
##contig=<ID=chr12,length=133275309>
##contig=<ID=chr13,length=114364328>
##contig=<ID=chr14,length=107043718>
##contig=<ID=chr15,length=101991189>
##contig=<ID=chr16,length=90338345>
##contig=<ID=chr17,length=83257441>
##contig=<ID=chr18,length=80373285>
##contig=<ID=chr19,length=58617616>
##contig=<ID=chr2,length=242193529>
##contig=<ID=chr20,length=64444167>
##contig=<ID=chr21,length=46709983>
##contig=<ID=chr22,length=50818468>
##contig=<ID=chr3,length=198295559>
##contig=<ID=chr4,length=190214555>
##contig=<ID=chr5,length=181538259>
##contig=<ID=chr6,length=170805979>
##contig=<ID=chr7,length=159345973>
##contig=<ID=chr8,length=145138636>
##contig=<ID=chr9,length=138394717>
##contig=<ID=chrM,length=16569>
##contig=<ID=chrX,length=156040895>
##contig=<ID=chrY,length=57227415>
##filter="SOMATIC"
##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases">
##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation">
##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)">
##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value">
##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls">
##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls">
##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand">
##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position">
##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads">
##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05">
##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90">
##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100">
##FILTER=<ID=VarMapQual,Description="Average mapping quality of variant reads < 15">
##FILTER=<ID=VarBaseQual,Description="Average base quality of variant reads < 15">
##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01">
##FILTER=<ID=RefAvgRL,Description="Average clipped length of ref-supporting reads < 90">
##FILTER=<ID=RefReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
##FILTER=<ID=RefDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
##FILTER=<ID=RefMapQual,Description="Average mapping quality of reference reads < 15">
##FILTER=<ID=RefBaseQual,Description="Average base quality of ref-supporting reads < 15">
##FILTER=<ID=RefMMQS,Description="Average mismatch quality sum for ref-supporting reads > 100">
##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50">
##FILTER=<ID=MinMMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) < 50">
##FILTER=<ID=MapQualDiff,Description="Mapping quality difference (ref - var) > 50">
##FILTER=<ID=MaxBAQdiff,Description="Average base quality difference (ref - var) > 50">
##FILTER=<ID=ReadLenDiff,Description="Average supporting read length difference (ref - var) > 0.25">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype code">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele">
##FORMAT=<ID=ADF,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the forward strand">
##FORMAT=<ID=ADR,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the reverse strand">
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	TUMOR
chr1	38775	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr1	52058	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.041853;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:18,4:22,3
chr1	93819	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.076076;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:23,1:9,5
chr1	136733	.	G	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,2:6,2
chr1	136764	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.32759;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:9,2:9,1
chr1	181917	.	G	T	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.0094908;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:55,20:34,8:21,12
chr1	188252	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.067805;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:22,2:21,5
chr1	610844	.	G	A	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=9.8076e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:40,21:18,11:22,10
chr1	692574	.	T	C	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.024095;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:84,10:49,1:35,9
chr1	872970	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17641;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,1:10,3
chr1	2675066	.	G	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.014863;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:79,14:63,12:16,2
chr1	3287407	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.20253;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,2:13,2
chr1	3908420	.	GTCTCTCTCTC	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:6,4:3,1
chr1	4751034	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.0893e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:25,27:14,18:11,9
chr1	6421408	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00012338;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:14,6:12,6
chr1	6929498	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.5271e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:15,8:11,7
chr1	6963302	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:2,3:11,1
chr1	8366915	.	AC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.015626;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:15,2:7,5
chr1	8490999	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=1.6895e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:29,22:14,12:15,10
chr1	9131231	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:7,2:7,1:0,1
chr1	9845814	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00090577;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:6,10:2,2
chr1	10332501	.	ATT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,1:5,5
chr1	11041404	.	G	GTGGATGGA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:5,4:2,1
chr1	11771031	.	ATG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,5:3,3:5,2
chr1	12285929	.	CTTCCT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,3:8,2
chr1	12809352	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.041843;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,11:12,9:11,2
chr1	12867528	.	TTTCTTTC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:2,1:6,6
chr1	12877779	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
chr1	13048038	.	A	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,2:5,2
chr1	13308308	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10903;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:5,2:29,2
chr1	13320513	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=2.9276e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:22,12:6,10
chr1	13391530	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.9796e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:13,3:11,8
chr1	14497335	.	TAAA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,8:5,7:3,1
chr1	15448170	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.059571;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:7,6:10,3
chr1	16513214	.	C	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.022218;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:73,12:49,6:24,6
chr1	16533137	.	A	G	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.012934;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:60,10:30,4:30,6
chr1	16534573	.	C	T	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.021029;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:56,16:21,3:35,13
chr1	16572153	.	G	A	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.018439;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:88,17:53,8:35,9
chr1	16591685	.	C	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.018042;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:72,19:26,6:46,13
chr1	16674332	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.043448;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:26,3:13,7
chr1	16687956	.	C	CA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.012849;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:17,5:12,9
chr1	16728743	.	C	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.028883;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:82,14:41,6:41,8
chr1	16747651	.	G	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
chr1	16896032	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0005299;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:39,9:14,2
chr1	16969810	.	C	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=7.827e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:29,31:17,12:12,19
chr1	17352065	.	GGTGGGAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,1:10,3
chr1	18700080	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.054436;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:19,3:16,3
chr1	18795159	.	CATAAAATAAAATAAA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.032529;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,8:15,3:5,5
chr1	18940562	.	C	CGGAT	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0036346;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:14,7:13,10
chr1	19874142	.	C	CCACCACCACCATCACCACCACCACCAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,4:12,3:14,1
chr1	19965980	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,2:3,3
chr1	20475026	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=1.4245e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,19:12,9:18,10
chr1	20559688	.	GGTGTGT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:7,3:1,2
chr1	20580501	.	C	CAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,6:6,5:4,1
chr1	20655174	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075416;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:13,4:17,2
chr1	21435430	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=4.1499e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:15,10:11,7
chr1	21576218	.	T	TGATG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.010902;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,8:10,5:12,3
chr1	21576287	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.034034;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:18,4:7,1
chr1	22898118	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,13:10,10:7,3
chr1	23837636	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1371;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:12,3:5,3
chr1	26109124	.	G	GT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0058313;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:6,7:10,2
chr1	27204812	.	G	GTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:8,2:5,2
chr1	27680860	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,2:3,1:4,1
chr1	27899512	.	AG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,1:9,3
chr1	28847055	.	G	GTCCCCTTTCCTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.010106;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,8:5,4:6,4
chr1	29307749	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,2:8,3
chr1	29503981	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=3.8811e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:15,11:12,10
chr1	30465017	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
chr1	30468602	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00020157;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:15,9:14,4
chr1	31038986	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022357;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,8:10,3:8,5
chr1	31254369	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,2:1,1:4,1
chr1	31842010	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0098105;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:5,3:2,2
chr1	31986380	.	TAATAA	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16049;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:14,4:17,1
chr1	32648963	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,5:7,2
chr1	32699153	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0015083;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,6:1,4:1,2
chr1	32974597	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.059571;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,3:10,5
chr1	32990704	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0052761;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:8,9:3,1
chr1	33695543	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=3.2519e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:14,7:20,7
chr1	33975486	.	T	TACACACACACACACAC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.037106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,8:14,4:15,4
chr1	34254910	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0021249;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:12,6:4,7
chr1	34922969	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.8239e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:6,5:11,8
chr1	35050454	.	C	CTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:6,7:5,1
chr1	35800326	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.043948;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,5:16,4:11,1
chr1	37131785	.	CCTTCCTTCCTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,0:6,4
chr1	39579857	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,5:5,3:6,2
chr1	39764267	.	A	AT	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.017728;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:37,18:20,12:17,6
chr1	40291839	.	C	CTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0045803;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,4:5,3
chr1	40730964	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00013412;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:17,5:14,9
chr1	40934307	.	A	ATGTATTTATTTATTTG	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0018492;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,13:13,9:8,4
chr1	41018828	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,5:4,4
chr1	42545186	.	A	AAAAAAAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:6,2:4,3
chr1	42887127	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.0668e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:15,11:11,6
chr1	43281408	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016716;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:11,5:2,1
chr1	43686151	.	G	GT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,8:2,4:2,4
chr1	44597468	.	GCACACACACA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,12:3,7:2,5
chr1	45611456	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:4,5:2,1
chr1	46171705	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.1812e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:21,25:11,13:10,12
chr1	46235123	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.008898;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:8,4:2,7
chr1	46290916	.	G	GTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:3,2:4,2
chr1	49087734	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.8539e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:10,7:12,12
chr1	50219767	.	A	ATG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:2,4:2,1:0,3
chr1	51929784	.	TG	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.3557e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:8,11:15,5
chr1	53097955	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:17,3:5,1
chr1	53203775	.	CTT	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.079656;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,2:14,2
chr1	53284251	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12563;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:19,5:9,2
chr1	53378059	.	C	CAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.28876;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,4:16,3:9,1
chr1	53462097	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.2621e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:12,10:8,9
chr1	54561922	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020884;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:3,4:13,5
chr1	54562373	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0024657;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:6,3:5,8
chr1	54828365	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.5758e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:17,10:7,7
chr1	55792004	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,1:19,3
chr1	55799118	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,1:2,3
chr1	57606559	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,2:6,5
chr1	59557756	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=2.1926e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:15,13:9,7
chr1	61668090	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
chr1	63997844	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.059824;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,4:9,2:13,2
chr1	65519152	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
chr1	65563555	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:14,4:7,1
chr1	66631681	.	TTCTCTCTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,6:2,1
chr1	67164653	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.027873;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,4:9,6
chr1	67786949	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010783;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,4:13,6
chr1	68444324	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.5227e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:29,17:12,8:17,9
chr1	69526605	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,5:3,1
chr1	69916165	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.019285;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,2:5,2
chr1	70669231	.	GTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:6,2:1,2
chr1	71310903	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:4,7:2,1
chr1	71329711	.	G	GTTA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0071456;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:9,7:17,4
chr1	71358681	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=6.3166e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:15,8:18,6
chr1	72712614	.	CAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:5,4:0,0
chr1	72998125	.	T	TACAC	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0043853;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,12:13,4:14,8
chr1	73996641	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,5:9,1:4,4
chr1	74471845	.	G	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.774e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:30,24:13,10:17,14
chr1	74978805	.	TA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.6729e-07;SS=2;SSC=65;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:4,22:1,11:3,11
chr1	75378068	.	TG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,1:9,3
chr1	75710562	.	TAAA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:1,6:6,1
chr1	76872068	.	A	AAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.011976;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:12,12:8,7:4,5
chr1	80462558	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=5.8035e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:12,5:12,11
chr1	80943296	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,1:4,3
chr1	82381401	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0082862;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:9,7:9,5
chr1	83103986	.	ATGTACG	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.082408;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,2:17,2
chr1	83446760	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0092573;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:18,4:16,6
chr1	84601128	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.0081e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:29,23:15,13:14,10
chr1	86828934	.	CAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011272;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:4,7:6,2
chr1	88874069	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00096111;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:15,5:17,7
chr1	90643879	.	T	TTTCTTTC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.33319;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:6,1:20,3
chr1	91951039	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,4:10,1:10,3
chr1	91952819	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=2.7175e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,4:8,8
chr1	91958124	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=8.5186e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:23,25:10,10:13,15
chr1	92467452	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.8603e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:10,11:15,9
chr1	93396901	.	T	TA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:12,3:9,3
chr1	93777402	.	T	TTCCTCTTCC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.29549;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,4:8,2:12,2
chr1	96364934	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=3.5118e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:8,13:12,5
chr1	97525758	.	T	TAGAGAGAG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0054686;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:14,5:7,9
chr1	97656966	.	A	AT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.036548;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:6,6:8,1
chr1	100915256	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,1:15,3
chr1	101846998	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.5507e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:9,8:11,7
chr1	102648603	.	A	ACC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018839;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,2:6,6
chr1	103199869	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011401;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:4,6:2,1
chr1	104438856	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.1102e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:11,10:7,9
chr1	104883578	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.068498;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,1:14,3
chr1	104964690	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0034427;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:4,6:11,6
chr1	105395278	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,4:1,1
chr1	105522363	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:21,3:7,1
chr1	105939139	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=6.7637e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:29,21:6,7:23,14
chr1	106912405	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.0704e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,21:8,12:10,9
chr1	107049530	.	GT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0054674;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:7,7:4,3
chr1	107112163	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.01652;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,2:10,3
chr1	107209895	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:13,2:20,2
chr1	107968049	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,4:13,1:13,3
chr1	108229759	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
chr1	108458398	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
chr1	110213170	.	T	TAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,4:8,3:2,1
chr1	110374011	.	A	ATATATATATATATATATATCCTTAGTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.026055;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:11,3:8,5
chr1	111594590	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.055299;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:17,5:7,1
chr1	113129309	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,9:2,8:6,1
chr1	114689570	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.2913e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:27,29:11,18:16,11
chr1	115355591	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.030002;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:14,3:13,4
chr1	115414865	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.1015e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:29,21:19,14:10,7
chr1	116263076	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.3876e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:29,27:15,18:14,9
chr1	116934531	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.8872e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:2,4:15,8
chr1	117196403	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.6346e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:11,23:5,13:6,10
chr1	117504330	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.085385;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,1:18,3
chr1	118089354	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.37127;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:13,2:13,2
chr1	118324442	.	T	TTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:2,2:7,3
chr1	119843465	.	C	CTTTTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,7:1,5:4,2
chr1	120379034	.	C	CTT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0071208;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:11,9:16,7
chr1	120418603	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0037422;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:11,11:8,4
chr1	120508455	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,5:2,1
chr1	120560460	.	C	CAT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.055494;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,3:13,1
chr1	120563830	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12206;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,3:12,1
chr1	120704427	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.052515;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:17,3:9,1
chr1	121126844	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.016771;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:9,8:2,1
chr1	121202431	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.025405;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,6:10,4
chr1	121238011	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,1:8,3
chr1	121341391	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,3:6,1
chr1	121640231	.	C	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,3:2,2
chr1	121731784	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,6:6,1
chr1	121764804	.	T	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.0015366;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:90,12:29,10:61,2
chr1	121777230	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.094058;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:14,3:22,1
chr1	121793875	.	AG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,3:17,1
chr1	121793879	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.25496;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:9,3:18,1
chr1	121803036	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:13,3:15,5
chr1	121814437	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.21541;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:0,1:36,3
chr1	121841017	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.023578;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:15,5:9,4
chr1	121925466	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.16752;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:9,3:16,2
chr1	122043610	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.13105;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:9,4:12,1
chr1	122091755	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,1:6,1
chr1	122181447	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr1	122282736	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0050701;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,14:2,1:20,13
chr1	122293456	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,2:5,2
chr1	122345629	.	G	T	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.022505;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:60,13:9,4:51,9
chr1	122390092	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,1:8,3
chr1	124797823	.	A	T	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.040389;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:66,11:38,8:28,3
chr1	124829379	.	T	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.049793;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,6:8,2
chr1	124843346	.	GC	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:5,1:16,4
chr1	124856963	.	CT	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.083854;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:30,2:6,3
chr1	124858310	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.090728;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:3,3:18,3
chr1	124869470	.	C	T	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.0050296;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:110,20:90,16:20,4
chr1	124877015	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.038459;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:18,5:10,6
chr1	124893993	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.050238;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:18,3:23,2
chr1	124901802	.	AG	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.012137;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:59,10:36,6:23,4
chr1	124901833	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0071318;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:25,4:12,3
chr1	124926649	.	G	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:15,3:0,3
chr1	124929931	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,2:9,5
chr1	124929932	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.029984;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:3,2:5,4
chr1	125124300	.	G	A	0	PASS	DP=360;GPV=1;SPV=0.041751;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:181,31:100,12:81,19
chr1	125147758	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.15614;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,4:15,1:13,3
chr1	125183179	.	G	C	0	PASS	DP=1545;GPV=1;SPV=8.5196e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:919:812,102:91,3:721,99
chr1	143185074	.	G	C	0	PASS	DP=2826;GPV=1;SPV=0.0075839;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1512:1314,173:705,113:609,60
chr1	143212534	.	G	A	0	PASS	DP=14005;GPV=1;SPV=0.00031864;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7467:6550,830:2892,534:3658,296
chr1	143216012	.	A	C	0	PASS	DP=928;GPV=1;SPV=0.0030993;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:533:464,64:130,19:334,45
chr1	143230867	.	G	C	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.035681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:130,27:79,16:51,11
chr1	143239214	.	T	G	0	PASS	DP=497;GPV=1;SPV=0.00014353;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:277:220,57:159,37:61,20
chr1	143255660	.	C	G	0	PASS	DP=7301;GPV=1;SPV=0.0048443;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:4112:3187,422:1670,104:1517,318
chr1	143443500	.	C	T	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.046114;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:62,8:25,7:37,1
chr1	143758803	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:10,4:9,1
chr1	144103864	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.07667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:8,1:26,5
chr1	144480297	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.043024;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:6,7:14,2
chr1	145411387	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01726;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:2,5:9,5
chr1	145780618	.	T	TA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024928;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:11,6:4,3
chr1	146333876	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0062802;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:8,8:14,2
chr1	146333962	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.15847;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:10,1:14,4
chr1	146337736	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,0:16,4
chr1	146366233	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.037277;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:12,5:21,8
chr1	148815547	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:8,4:9,1
chr1	149046625	.	G	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.022117;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,4:8,4
chr1	149046626	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.025362;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:9,3:6,4
chr1	149054280	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.020191;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,2:9,8
chr1	149144781	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.014227;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:19,1:11,8
chr1	149176408	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.04667;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:18,4:18,5
chr1	149241005	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
chr1	149393069	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.03685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:8,4:5,2
chr1	150229296	.	T	TTA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,1:15,4
chr1	150423793	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:3,2:1,1:2,1
chr1	150501293	.	CAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,7:4,1
chr1	151497704	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:3,5:5,1
chr1	151600822	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.027999;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:7,6:7,2
chr1	151637339	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.1014e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:29,22:17,11:12,11
chr1	151932761	.	TATATATATATATATATATATATATATACAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0076326;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:10,8:3,3
chr1	152228065	.	AAT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:4,2:2,2
chr1	152645481	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.1644e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:20,23:9,9:11,14
chr1	153859914	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:8,6:7,1
chr1	154676330	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00012241;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:14,4:11,10
chr1	155876235	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,5:4,3:7,2
chr1	157178895	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17001;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,6:10,3:7,3
chr1	158123253	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.1971e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:36,18:16,6:20,12
chr1	159021939	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,2:4,6
chr1	159755212	.	TA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
chr1	160732207	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.2259e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:29,25:15,11:14,14
chr1	160984686	.	A	ATG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18941;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:25,3:18,1:7,2
chr1	161055905	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0050131;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,9:8,4:6,5
chr1	161661251	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.01652;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,5:17,4:6,1
chr1	161728460	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.014395;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:13,7:7,3
chr1	162416406	.	A	AAGAG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.047734;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:22,6:9,1
chr1	163656351	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.013096;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:5,7:9,4
chr1	164229777	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=7.7636e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:9,10:12,4
chr1	164435466	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.0563e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:31,24:13,10:18,14
chr1	166285268	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=6.9014e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,19:5,9:7,10
chr1	170585727	.	T	TAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0041408;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,5:5,3
chr1	171225139	.	TTATATATA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,9:5,3:2,6
chr1	171835883	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.054634;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,8:9,7:5,1
chr1	172304206	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,7:4,2
chr1	172747690	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.012087;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,5:8,3
chr1	172835631	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.2979e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:12,5:10,10
chr1	172901636	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.6277e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:24,23:15,6:9,17
chr1	173630818	.	TA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:9,6:0,1
chr1	175207798	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.5139e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:23,26:11,13:12,13
chr1	176042270	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,5:1,4:1,1
chr1	176275360	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,9:8,7:3,2
chr1	176300459	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.0582e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,20:11,7:8,13
chr1	176836611	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.9689e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:11,9:6,10
chr1	177075433	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.7744e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,20:7,12:11,8
chr1	177402840	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0037194;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:24,1:19,7
chr1	177594049	.	TA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,2:10,3
chr1	178030248	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.8231e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:13,7:11,11
chr1	178164504	.	T	TGTGC	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.019231;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,7:11,4:22,3
chr1	178590468	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022983;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,4:9,7
chr1	178650426	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.039412;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:8,5:1,1
chr1	178695591	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.034818;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:13,6:8,2
chr1	178695713	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,4:7,3:11,1
chr1	179013365	.	C	CAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010901;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:9,8:6,4
chr1	179295966	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:7,2:6,2
chr1	180559644	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.0858e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:9,12:15,10
chr1	180575130	.	TTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.020561;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:5,3:15,6
chr1	180588706	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:13,2:5,2
chr1	180711722	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.3202e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:11,9:6,8
chr1	181537106	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,4:8,2:3,2
chr1	182109765	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,9:4,6:3,3
chr1	183156625	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,5:2,1
chr1	183624519	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.039341;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:4,4:2,1:2,3
chr1	184024655	.	C	CTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.012912;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:13,8:5,3
chr1	185494559	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1599;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:7,4:12,2
chr1	186652267	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033264;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:2,3:11,3
chr1	187257763	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.047467;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:14,5:10,6
chr1	187303719	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0074752;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,9:4,2:2,7
chr1	187303763	.	CCTTCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:3,1:11,4
chr1	188985760	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.2273e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:20,24:7,6:13,18
chr1	190260557	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00051706;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:14,5:9,5
chr1	190706678	.	TC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:9,11:4,5:5,6
chr1	190959631	.	GTA	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,5:13,3:8,2
chr1	191433483	.	A	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:3,3:2,1
chr1	191703593	.	A	AT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,5:5,3:5,2
chr1	192223097	.	GTGTA	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.048788;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,8:10,5:14,3
chr1	192320520	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048018;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:19,4:14,2
chr1	193941137	.	GTATATATATATA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,2:3,1:1,1
chr1	194212699	.	A	AATATATAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:3,4:3,2
chr1	194623934	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=5.4453e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:25,23:14,14:11,9
chr1	194768659	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12206;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
chr1	195632162	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,5:4,1
chr1	195990677	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:2,2:5,6
chr1	196638281	.	AAAAAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,3:3,1
chr1	196714597	.	ATG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,7:6,2
chr1	197951046	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,8:2,6:2,2
chr1	198660503	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.08973;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:19,1:20,4
chr1	198660504	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.1268;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:15,1:21,3
chr1	198983869	.	C	CTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0018037;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:4,12:3,10:1,2
chr1	200164867	.	GT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.056741;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,5:3,2
chr1	200938862	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:5,3:3,1
chr1	201007285	.	CACAG	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.39535;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,2:14,2
chr1	201178375	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,5:5,1
chr1	201266373	.	T	TTTCC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:1,0:13,4
chr1	202971255	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.086046;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:12,4:6,4
chr1	203724118	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=6.4115e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:11,9:13,5
chr1	204660581	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.013387;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:8,7:4,4:4,3
chr1	206171646	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:3,5:0,2
chr1	206255661	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,3:14,1
chr1	207057302	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.017537;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:15,7:5,1
chr1	209084697	.	CTCACATGTTGTGAAGCTACCT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036961;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:9,6:14,4
chr1	209215742	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=9.9977e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:28,27:19,15:9,12
chr1	209827240	.	CT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.4893;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,4:9,3:9,1
chr1	212136772	.	T	TA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0036299;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,17:12,10:9,7
chr1	212210698	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.016188;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:6,4:10,7
chr1	212771611	.	C	CAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,4:7,1
chr1	212806856	.	ATATG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0055835;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,8:2,7:3,1
chr1	212886042	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:7,7:7,1
chr1	213319312	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,8:1,7:4,1
chr1	214741429	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.5451e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:13,24:8,10:5,14
chr1	214796417	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:3,2:14,3
chr1	215312157	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,5:1,3:1,2
chr1	215764977	.	T	TA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.1405e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,21:13,14:13,7
chr1	216084534	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00030969;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:30,16:13,9:17,7
chr1	218720878	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,2:5,1
chr1	219353072	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=3.1863e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:25,17:11,5:14,12
chr1	219598196	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.013119;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:19,3:23,6
chr1	219655529	.	ATGATAGAT	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:9,4:3,2:6,2
chr1	219747368	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,1:11,3
chr1	220214946	.	T	TTATATATATA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:4,3:1,3
chr1	220311319	.	CTTCTTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.18323;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:23,3:6,2:17,1
chr1	220965682	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.031574;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,7:9,4:20,3
chr1	221279608	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:2,2:17,2
chr1	221916527	.	GAC	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.032095;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,6:8,4:8,2
chr1	221920288	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,2:2,3
chr1	222308853	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:7,8:5,2
chr1	222480478	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0066111;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,4:11,5
chr1	222754232	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0021846;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,11:5,8:3,3
chr1	223692817	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.6283e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:8,5:13,12
chr1	223855748	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.059347;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:15,7:9,1
chr1	223963079	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0013797;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,9:1,7:2,2
chr1	224209064	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.013912;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,10:11,8:10,2
chr1	226243695	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0015608;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,5:2,1
chr1	226844827	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01473;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:5,8:6,6
chr1	226845216	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.026716;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,8:10,7:7,1
chr1	226960345	.	G	GTGGTGGTGCT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,3:14,1
chr1	226960383	.	G	GTGATGGTACT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
chr1	230038337	.	AGG	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.079426;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:26,3:10,1
chr1	230626692	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20263;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,5:11,2:10,3
chr1	230986668	.	ATTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,3:4,1
chr1	232314349	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.016158;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:12,6:14,1
chr1	233285686	.	C	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.045641;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:31,5:19,2:12,3
chr1	233400932	.	C	CA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.018721;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:12,11:13,2
chr1	234181071	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.537e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:15,7:7,12
chr1	234995695	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.032711;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,10:17,8:12,2
chr1	235353791	.	T	TGTTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.064595;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:7,4:12,1
chr1	235924946	.	T	TACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,7:5,4:5,3
chr1	235924960	.	CACACACAT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,7:1,3:3,4
chr1	235961336	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,7:7,1
chr1	236106068	.	G	GT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00032973;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:6,7:10,5
chr1	236279504	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.043812;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,10:15,8:9,2
chr1	237077437	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.031538;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,6:11,2
chr1	237133924	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:8,9:6,8:2,1
chr1	237536714	.	C	CAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.019247;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:14,7:5,2
chr1	237795838	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.026412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,2:13,3
chr1	237883979	.	CACAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.076601;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,7:7,5:5,2
chr1	239563916	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=5.9535e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:30,24:16,12:14,12
chr1	240708216	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=2.0574e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:20,25:8,19:12,6
chr1	240916109	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:8,6:5,3
chr1	241562906	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,2:5,1:2,1
chr1	241771945	.	CAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:2,8:2,1
chr1	243317319	.	A	AT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.039035;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,13:17,6:14,7
chr1	244479028	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:10,3:5,1
chr1	245281529	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.027239;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,8:11,1
chr1	246825912	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.030728;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:8,1:8,4
chr1	248170703	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.081098;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,1:19,3
chr1	248383360	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
chr1	248657457	.	T	TAC	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.034303;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:22,10:21,2
chr1	248753485	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,4:4,2
chr1	248753486	.	CAT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,4:4,2
chr10	53793	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0083305;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:11,6:9,3
chr10	1159831	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.042775;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,2:11,4
chr10	1499307	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=1.9296e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:3,14:2,10:1,4
chr10	1777971	.	CTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:1,5:2,1
chr10	2544339	.	G	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.7128e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,19:18,8:12,11
chr10	2562056	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.8465e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:12,6:12,8
chr10	3179629	.	T	TGTGTC	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:12,5:6,1
chr10	3318475	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,2:10,2
chr10	3440844	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.049115;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:22,5:19,1
chr10	3545930	.	G	GTTATTA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.039741;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,2:10,6
chr10	4513347	.	A	ATTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0023616;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:10,13:6,2
chr10	5249117	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.16149;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:10,3:6,1:4,2
chr10	5428038	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0027337;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:10,11:5,4:5,7
chr10	5428047	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,9:5,4:3,5
chr10	6115875	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:8,4:8,2:0,2
chr10	6161643	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.018989;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:13,7:8,6
chr10	6206367	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,3:5,1
chr10	6345669	.	C	CCATCCATCCATCCATG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:18,4:5,1
chr10	6410976	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046544;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:14,8:3,1
chr10	6819421	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0017612;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,5:4,4
chr10	6819425	.	CG	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0017841;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,5:4,4
chr10	6911780	.	CTT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,2:11,2
chr10	7113568	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,3:0,2
chr10	8084592	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.048243;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,7:12,5:8,2
chr10	10759296	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:3,6:3,1
chr10	10988298	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.0959e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,15:16,10:9,5
chr10	11426859	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,4:2,1
chr10	11736399	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:13,3:3,1
chr10	12007833	.	AG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041563;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,4:3,1:4,3
chr10	12267997	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00030073;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,13:2,5:4,8
chr10	12307313	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:15,3:5,2
chr10	12333229	.	A	AAAAAAAAAC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.030024;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,11:13,9:9,2
chr10	12564155	.	C	CTGTCTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,6:10,3:8,3
chr10	12644826	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.728e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:13,13:15,6
chr10	13072859	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01441;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,2:7,5
chr10	14039459	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,9:6,3:3,6
chr10	14280982	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0094549;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,4:4,3
chr10	14339933	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=2.3136e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,23:7,9:14,14
chr10	14517750	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,2:16,2
chr10	14690027	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:25,3:1,1
chr10	15052729	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.032;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:13,6:4,1
chr10	15287091	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037022;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,8:13,7:5,1
chr10	17404064	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:4,9:4,2
chr10	17507626	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.1396;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,5:12,3:12,2
chr10	18107602	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.6406e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:17,7:9,7
chr10	18137133	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,1:14,3
chr10	18787462	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0091605;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:8,3:8,3
chr10	19334119	.	G	GTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,7:3,3:6,4
chr10	19695519	.	CTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:10,13:6,8:4,5
chr10	19876601	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,4:5,1
chr10	20217596	.	CTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,8:2,7:2,1
chr10	20914969	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029113;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:11,6:7,4
chr10	21408723	.	C	CTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,9:8,7:1,2
chr10	21813165	.	TCTCTCTCTCC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:7,1:9,3
chr10	23136121	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.048713;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,10:10,9:3,1
chr10	24018556	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:7,2:0,1:7,1
chr10	24656407	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:6,3:17,1
chr10	24829333	.	CTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12909;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:8,1:23,5
chr10	25403110	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=7.0452e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,20:11,13:17,7
chr10	26240731	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0086905;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,7:7,5
chr10	26245250	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=2.174e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:11,5:5,7
chr10	28155598	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022459;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:10,4:3,1
chr10	28347052	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.034034;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:14,2:11,3
chr10	29037896	.	A	ATTAT	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.015407;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,13:9,6:16,7
chr10	30679362	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.084652;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:24,3:11,1
chr10	31670539	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.027747;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,7:15,3
chr10	32061248	.	C	CAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0048547;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,9:5,7:4,2
chr10	32619910	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,12:8,4:4,8
chr10	33870971	.	T	TAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.20486;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,3:17,2:4,1
chr10	34492615	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=5.8377e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:25,28:15,17:10,11
chr10	34851877	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,8:5,2:5,6
chr10	35497726	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022827;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,12:18,10:1,2
chr10	35514075	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:8,3:1,1
chr10	36768081	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.5203e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:10,7:18,8
chr10	38112798	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0082728;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,10:5,6:8,4
chr10	38633095	.	C	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=1.6658e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:49,18:24,9:25,9
chr10	38716636	.	A	AT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00099441;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:12,8:4,1
chr10	38812968	.	CCATTCCATTT	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026083;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:18,7:8,6
chr10	38891590	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:6,4:3,2
chr10	38911635	.	ACAGTGGAGTG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
chr10	38920914	.	C	G	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.0065695;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:121,30:68,13:53,17
chr10	38932039	.	A	AG	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.022433;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:46,8:32,7:14,1
chr10	38966310	.	C	CACAA	0	PASS	DP=363;GPV=1;SPV=0.038776;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:172,25:93,14:79,11
chr10	38969377	.	C	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00080513;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:24,9:15,7
chr10	38973239	.	CT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00045089;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:7,8:10,3
chr10	39691510	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.011374;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:3,6:2,4
chr10	39719987	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.046828;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:28,4:7,5
chr10	39845077	.	C	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.049919;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:36,5:7,1
chr10	40066085	.	C	T	0	PASS	DP=451;GPV=1;SPV=0.028977;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:208,33:47,5:161,28
chr10	40217971	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.040749;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:12,12:17,2
chr10	40387974	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:19,1:2,3
chr10	40408508	.	C	A	0	PASS	DP=249;GPV=1;SPV=0.0081709;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:110,17:82,15:28,2
chr10	40426686	.	A	G	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.0093405;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:66,8:18,4:48,4
chr10	40484098	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:10,3:17,1
chr10	40541808	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:18,2:6,2
chr10	40547140	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,0:16,4
chr10	40854565	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
chr10	40895085	.	A	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.046035;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:49,9:30,5:19,4
chr10	40963846	.	T	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.01835;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:4,5:31,5
chr10	41117922	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.062923;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:18,4:21,1
chr10	41222386	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.054928;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:0,0:21,4
chr10	41228173	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,3:4,1
chr10	41232714	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:10,2:23,2
chr10	41360989	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.01483;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:2,1:27,5
chr10	41425052	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.017441;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:24,9:3,2
chr10	41425419	.	T	G	0	PASS	DP=219;GPV=1;SPV=0.028155;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:89,19:77,16:12,3
chr10	41498689	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.090326;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:42,2:2,3
chr10	41506033	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr10	41509795	.	G	C	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.021029;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:27,1:25,6
chr10	41527683	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.035034;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:36,4:10,2
chr10	41550590	.	C	T	0	PASS	DP=219;GPV=1;SPV=0.0098271;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:98,13:40,4:58,9
chr10	41563298	.	G	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.010615;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:57,8:14,1:43,7
chr10	41571058	.	G	T	0	PASS	DP=329;GPV=1;SPV=0.038805;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:159,27:81,8:78,19
chr10	41574180	.	C	G	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.028312;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:75,16:39,12:36,4
chr10	41576085	.	G	A	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.00030758;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:83,29:39,22:44,7
chr10	41705085	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0093079;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:12,4:10,2
chr10	41893643	.	G	T	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.0083873;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:62,20:31,8:31,12
chr10	41895333	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.028327;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,12:19,5:16,7
chr10	41912745	.	G	C	0	PASS	DP=485;GPV=1;SPV=0.01458;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:289:259,30:136,15:123,15
chr10	42070501	.	G	T	0	PASS	DP=3887;GPV=1;SPV=0.038722;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2243:1978,262:1920,253:58,9
chr10	42072684	.	G	C	0	PASS	DP=572;GPV=1;SPV=0.044586;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:324:284,40:22,2:262,38
chr10	42077623	.	T	A	0	PASS	DP=873;GPV=1;SPV=0.017567;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:471:422,49:185,34:237,15
chr10	42077625	.	A	G	0	PASS	DP=807;GPV=1;SPV=0.036286;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:440:383,57:156,28:227,29
chr10	42078977	.	C	A	0	PASS	DP=900;GPV=1;SPV=0.022287;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:500:446,54:387,29:59,25
chr10	42130128	.	T	G	0	PASS	DP=468;GPV=1;SPV=0.0011696;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:261:210,51:113,25:97,26
chr10	42142848	.	A	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.03082;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:50,16:29,4:21,12
chr10	42146210	.	C	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.043589;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:17,4:22,7
chr10	42182059	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037023;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:23,7:1,1
chr10	43493708	.	AAATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,7:4,4:4,3
chr10	44202309	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:4,5:1,5
chr10	45784310	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:5,2:0,6
chr10	45794560	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,5:10,1:9,4
chr10	46726100	.	T	C	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=9.7584e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:70,29:29,13:41,16
chr10	47230850	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.4139e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,25:11,10:8,15
chr10	47526940	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:1,1:19,3
chr10	47542263	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
chr10	47623839	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.0822e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,18:9,11:6,7
chr10	47743405	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:1,5:2,1
chr10	49096622	.	C	CGT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.011404;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,15:11,9:11,6
chr10	49212799	.	A	AAG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036419;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:9,4:3,1
chr10	49968267	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.019572;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:40,9:21,6:19,3
chr10	50006736	.	C	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.032391;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:18,6:18,3
chr10	50012825	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0037422;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:13,3:6,12
chr10	50709797	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.038146;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,2:9,6
chr10	50748900	.	T	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.042021;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:19,2:20,5
chr10	52244815	.	A	AAT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048922;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,2:9,3
chr10	52244825	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034789;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,2:8,3
chr10	52244830	.	AC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:12,2:9,3
chr10	52244836	.	AT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.046386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,2:12,3
chr10	53469806	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0030753;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,21:8,8:17,13
chr10	53639326	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:0,0:6,2
chr10	54155194	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00016659;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,4:11,7
chr10	54655302	.	GAC	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,3:5,1
chr10	55330870	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.073064;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:8,3:19,4
chr10	55538966	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,2:1,1:4,1
chr10	55802444	.	G	GT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00015814;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:11,9:9,9
chr10	56247968	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.068e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,19:12,6:9,13
chr10	56373261	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.044964;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:12,10:8,2
chr10	56402550	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=6.0445e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:11,9:13,9
chr10	57173571	.	T	TAAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0027704;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,10:12,4:4,6
chr10	59067922	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00030171;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:21,10:15,3
chr10	59760440	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.2598e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:10,8:7,10
chr10	60724209	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:8,6:8,1
chr10	62311289	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:21,2:7,2
chr10	62556385	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=3.0481e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:34,22:19,11:15,11
chr10	62947004	.	GTCCCTC	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.025825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:3,4:13,5
chr10	63031081	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:6,4:3,2
chr10	63309494	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:9,7:5,1
chr10	63500746	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0082708;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,14:10,7:16,7
chr10	63828472	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,7:6,2
chr10	65221068	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=5.6124e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:12,13:5,7
chr10	66050424	.	AT	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00037324;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:8,6:15,4
chr10	66840364	.	TCTCTCTCTCACACA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:9,2:11,3
chr10	68018900	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.032284;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,5:2,2
chr10	68676257	.	TATATATATATA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:0,3:0,1:0,2
chr10	69434486	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=3.1322e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,23:11,13:10,10
chr10	69804809	.	CAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:10,7:1,2
chr10	70248467	.	G	GT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.010217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,7:3,5:2,2
chr10	70663953	.	T	TA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:9,6:2,1
chr10	70768302	.	CAA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0020704;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:4,6:3,2
chr10	71689203	.	TTGGTGGAGTCAGGGA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,6:11,3:7,3
chr10	71759838	.	CACACACACATAT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0070729;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,4:4,6
chr10	72805099	.	TTC	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.050167;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,5:4,1:26,4
chr10	73188768	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.011153;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,4:6,3:6,1
chr10	74052946	.	A	AT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0032284;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:14,4:7,5
chr10	74136202	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.5725e-12;SS=2;SSC=113;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:12,33:6,15:6,18
chr10	75048398	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.010569;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:6,7:6,5
chr10	75159063	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0729;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,6:11,5:13,1
chr10	77025240	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:4,4:2,2
chr10	78138404	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.068312;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:18,2:13,2
chr10	78276605	.	A	ATT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0057333;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,5:8,5
chr10	79063602	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=7.241e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:10,16:12,7
chr10	79212197	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=9.9383e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:23,24:14,13:9,11
chr10	79533787	.	A	AAACAACAACAAC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.046347;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:17,1:6,5
chr10	79755284	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0089009;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,5:4,1
chr10	79758480	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.39766;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:6,3:7,1
chr10	80232305	.	T	TA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,7:5,5:1,2
chr10	80930787	.	CCTAAATGTAAGAG	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00073638;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:17,6:10,8
chr10	81693944	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,1:7,3
chr10	81693976	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr10	82968662	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046139;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:18,3:1,3
chr10	83295063	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=6.9734e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:15,21:6,11:9,10
chr10	83989626	.	C	CAGAAAGAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,5:12,4:8,1
chr10	84600483	.	CTT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,8:5,7:4,1
chr10	85694558	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,3:3,2:0,1
chr10	85745182	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
chr10	86161139	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=4.8508e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:12,6:11,14
chr10	86850612	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00016135;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:10,5:10,7
chr10	87063069	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,4:6,2:9,2
chr10	87234735	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.014185;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:20,3:6,7
chr10	87964537	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.026092;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,7:10,3:11,4
chr10	88546974	.	A	AC	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.6102e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:8,10:13,5
chr10	90050470	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.029089;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,9:7,3:11,6
chr10	90070613	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0038279;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,9:2,6:4,3
chr10	91389230	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:8,7:3,1
chr10	91400009	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.5306e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:27,22:17,14:10,8
chr10	91573283	.	G	GAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.040021;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:14,4:3,1
chr10	91898698	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:6,6:4,1
chr10	92025810	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,8:5,7:2,1
chr10	92580171	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.4794e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:12,11:6,6
chr10	93141921	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23612;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,4:10,1
chr10	93369110	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:5,5:1,1
chr10	95365173	.	A	ATGTGTGTGTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:4,2:9,2
chr10	96142315	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0092066;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:15,6:10,9
chr10	96629930	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,4:4,3:0,1
chr10	96663627	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:6,6:3,1
chr10	96676655	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:1,3:1,2:0,1
chr10	99094551	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,7:1,4:4,3
chr10	99669740	.	G	GT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:8,1:3,5
chr10	100111300	.	AG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.044862;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:6,6:17,1
chr10	100368998	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=4.3898e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,20:15,13:15,7
chr10	100698242	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=6.3645e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:41,23:22,11:19,12
chr10	101075616	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.31501;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,5:18,3:6,2
chr10	101318994	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27607;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,4:10,1:6,3
chr10	101343299	.	A	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=6.3041e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:34,20:20,5:14,15
chr10	102638179	.	TA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.024526;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:22,5:16,3
chr10	103251002	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.20188;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,4:2,0:24,4
chr10	105242432	.	A	ATATT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014077;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:1,1:10,5
chr10	105242433	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014077;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:1,1:10,5
chr10	106342384	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,2:11,2
chr10	106764798	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.2829e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:22,31:13,19:9,12
chr10	107220138	.	A	ACTCTCTCTCT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,7:3,4:4,3
chr10	107333064	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
chr10	108073020	.	A	AACACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024928;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:14,6:1,4
chr10	108244394	.	C	CTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037712;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,9:12,5:12,4
chr10	108335624	.	CT	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.135e-05;SS=2;SSC=49;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:13,9:9,8
chr10	108335629	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.7627e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:12,9:10,8
chr10	109514597	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.5408e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:7,10:14,7
chr10	110360446	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,1:14,3
chr10	111631182	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00024281;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:18,7:13,7
chr10	111733716	.	TATAG	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0036085;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,5:6,2
chr10	111747465	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.2731e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:16,10:13,9
chr10	112207705	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=9.2378e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:19,13:11,4
chr10	113077858	.	CTTATTTATTTATTTATTTAT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.015787;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:16,4:12,4
chr10	115148744	.	G	GTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:4,5:7,1
chr10	115310134	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.1571e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:26,21:14,8:12,13
chr10	117305485	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,4:12,3:13,1
chr10	124961033	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.4168e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:23,26:13,14:10,12
chr10	125282185	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.1528e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:15,10:10,10
chr10	125570181	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=2.4766e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:36,19:21,11:15,8
chr10	125894933	.	GC	G	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.020645;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:70,21:34,11:36,10
chr10	126645504	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00011008;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:12,5:7,8
chr10	126659528	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=4.2071e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:33,19:16,16:17,3
chr10	127508738	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,1:11,3
chr10	128961543	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.8449e-09;SS=2;SSC=87;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:23,28:12,15:11,13
chr10	130129930	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,4:10,2:12,2
chr10	130786522	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.1154e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:10,2:9,11
chr10	131176620	.	AC	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.055387;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:69,8:37,2:32,6
chr10	131346980	.	CCTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:0,0:26,4
chr10	131540385	.	CTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,3:6,3
chr10	132622891	.	A	ACCGT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0065388;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:12,7:2,1
chr10	133011515	.	GTGTGTTAGTGTGTGA	G	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.01692;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:58,7:33,2:25,5
chr10	133042047	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,4:5,1
chr10	133181833	.	T	TACACACACACACACAC	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.04979;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,13:18,7:12,6
chr10	133431304	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
chr10	133658674	.	C	G	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.029612;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:69,14:51,9:18,5
chr11	128855	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:18,1:6,3
chr11	696767	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010948;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,11:7,6:5,5
chr11	2938092	.	GGTGTGAATATGCTTT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.23776;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,3:13,1
chr11	3206756	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048018;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:14,2:19,4
chr11	3556345	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.045597;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:19,2:19,3
chr11	4287898	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:3,2:8,3
chr11	4290799	.	C	T	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.0087657;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:114,27:61,18:53,9
chr11	5175771	.	TCCC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,2:16,2
chr11	5537895	.	T	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0033931;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:11,10:12,4
chr11	5693189	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:3,5:3,1
chr11	6496505	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:4,4:2,2
chr11	7694803	.	C	CTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.049827;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,9:10,7:9,2
chr11	8434077	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.2295e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,25:11,18:8,7
chr11	9229899	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:2,4:4,1
chr11	9419560	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.063176;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:7,4:16,3
chr11	9868366	.	A	AG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:9,1:4,3
chr11	10310651	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,4:10,1:8,3
chr11	10680344	.	GGAAA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
chr11	12010756	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,4:6,3:19,1
chr11	12289556	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,5:9,1:1,4
chr11	13002884	.	CTCTCTCTGTG	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.013277;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:11,4:15,5
chr11	14425512	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00042977;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,9:10,6:5,3
chr11	14779766	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=6.0898e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:9,5:9,9
chr11	15422225	.	A	AT	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.6e-06;SS=2;SSC=52;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:31,17:20,9:11,8
chr11	16389969	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:7,2:12,2
chr11	16480645	.	A	AC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014699;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:5,2:17,13
chr11	18512723	.	A	ATTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.023137;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:10,8:5,2
chr11	20275711	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00012961;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:9,6:11,6
chr11	21269378	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0068563;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:14,5:19,4
chr11	21501591	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.3315e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:13,8:11,8
chr11	21697973	.	A	AATTGT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,7:2,5:1,2
chr11	22269541	.	AAAGG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,1:3,3
chr11	24745610	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.6713e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:13,10:9,10
chr11	25651441	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014656;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,8:6,2:7,6
chr11	25651442	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,8:7,2:7,6
chr11	25680333	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.2783e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:22,25:9,14:13,11
chr11	25902175	.	CATATATACAT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15556;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,3:11,1:1,2
chr11	25902191	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.18154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:11,1:4,2
chr11	25902197	.	CAT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:10,1:4,3
chr11	26150425	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=5.242e-11;SS=2;SSC=102;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:12,27:5,20:7,7
chr11	26406676	.	AGT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,10:4,7:3,3
chr11	26418714	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=4.9538e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:38,24:19,13:19,11
chr11	29476007	.	T	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=3.5765e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:14,13:13,11
chr11	31294814	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,4:22,3:0,1
chr11	31294820	.	AAG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,4:17,3:1,1
chr11	32755665	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:3,2:14,2
chr11	33844928	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.051974;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,5:20,4:13,1
chr11	33854868	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.04269;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,8:7,5:10,3
chr11	34734637	.	AT	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.5134e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:7,4:15,12
chr11	35100537	.	C	CAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:12,4:8,1
chr11	36105240	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.13128;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:27,5:10,2:17,3
chr11	36146773	.	C	CTTTATTTTATTTTATTTTAT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.040883;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:11,2:14,4
chr11	36158525	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0625;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:2,1:2,2
chr11	37001487	.	CTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,8:4,6:2,2
chr11	37190545	.	AAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0060611;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:8,9:3,2
chr11	37362759	.	G	GA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.020833;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:12,7:3,1
chr11	37515803	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.091905;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:16,3:17,2
chr11	37743824	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.18154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:5,1:10,2
chr11	37743835	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,2:10,3
chr11	38560483	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,9:6,8:0,1
chr11	40544332	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00019397;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:13,10:12,5
chr11	40998503	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0012979;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:11,6:18,3
chr11	41834706	.	GTA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:4,3:4,5
chr11	42844486	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,5:4,3:3,2
chr11	43147196	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.6364e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:11,10:16,11
chr11	43788690	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:2,1:1,1
chr11	44348165	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=3.1322e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,21:6,10:10,11
chr11	45448674	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=4.122e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:18,10:12,7
chr11	46625279	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0092889;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,4:9,7
chr11	47809759	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0015312;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,10:1,1:4,9
chr11	48199359	.	C	CACACATATAT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.024218;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,8:11,6:10,2
chr11	49035339	.	ATTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:10,5:2,1
chr11	49743675	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:4,5:2,1
chr11	51411656	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.17398;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:3,0:31,4
chr11	51583228	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.064666;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:24,4:1,0
chr11	51612622	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0030535;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:8,1:14,7
chr11	51687436	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.031539;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:8,1:18,6
chr11	51770980	.	A	G	0	PASS	DP=349;GPV=1;SPV=0.020319;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:179:159,20:94,13:65,7
chr11	52556390	.	A	G	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.0015334;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:139,20:54,8:85,12
chr11	52673774	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.039259;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,2:13,2
chr11	52721947	.	G	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.012324;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:82,18:61,11:21,7
chr11	52780877	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.28552;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,3:11,1
chr11	53328021	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.036498;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:18,2:13,5
chr11	53345622	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
chr11	53411563	.	A	C	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.030597;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:59,10:51,9:8,1
chr11	53602042	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.055746;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:23,4:1,0
chr11	53704843	.	C	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.010491;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:9,5:27,9
chr11	53728797	.	A	T	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.02839;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:83,14:49,12:34,2
chr11	54385190	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,2:6,4
chr11	54406711	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:27,4:0,0
chr11	54421856	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.045374;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:13,9:22,2
chr11	54424282	.	C	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
chr11	54580932	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:2,2:1,1:1,1
chr11	55299524	.	G	GATATAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:8,5:0,0
chr11	55642650	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.5716e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:25,17:15,10:10,7
chr11	55815761	.	CTCTCTCTCTCTCTATATATATATA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:6,1:5,3
chr11	55900224	.	C	CAAAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:4,3:5,1
chr11	56049215	.	TGCAC	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026257;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,1:15,4
chr11	57633376	.	C	CAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,3:3,1
chr11	57790542	.	C	CTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,4:10,1
chr11	58697156	.	G	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.013898;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:19,4:17,2
chr11	58774870	.	C	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.1952e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:23,29:14,16:9,13
chr11	59645024	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.017806;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:3,4:12,6
chr11	61642075	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.05702;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,5:23,2:18,3
chr11	61853239	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,2:0,0:7,2
chr11	62043126	.	C	CTATT	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.015202;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:15,6:24,7
chr11	62090839	.	G	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=2.1747e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:40,27:18,12:22,15
chr11	62245854	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:8,1:3,3
chr11	62697384	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,6:8,1:6,5
chr11	63077873	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=7.8642e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:10,9:7,8
chr11	63802379	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.019162;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,3:7,4
chr11	64114356	.	GA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.053977;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:10,1:6,4
chr11	66009427	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0099771;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,12:3,9:2,3
chr11	66704429	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=5.6577e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,22:10,8:12,14
chr11	67583357	.	A	AAT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.073271;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,5:22,2:10,3
chr11	67839931	.	A	ATTTTTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020979;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,7:0,1:2,6
chr11	68639250	.	TC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019168;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:2,4:15,8
chr11	68855739	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.9862e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,21:11,11:17,10
chr11	68888058	.	CTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:2,5:4,1
chr11	69071114	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:0,2:0,1:0,1
chr11	69153941	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,7:6,3:1,4
chr11	70076964	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.05053;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:20,5:11,3
chr11	70194328	.	G	GTGGA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.27357;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,5:7,3:7,2
chr11	70196380	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:13,4:6,3:7,1
chr11	70579739	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=7.4607e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:12,8:13,7
chr11	70833124	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=2.1659e-11;SS=2;SSC=106;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:22,26:11,16:11,10
chr11	71146373	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.030755;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:16,8:19,5
chr11	71344357	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0076145;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:17,3:21,3
chr11	71460622	.	C	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=5.304e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:32,20:12,8:20,12
chr11	71642221	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.048187;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:19,1:20,4
chr11	71642222	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.035875;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:14,1:19,4
chr11	72297636	.	GGT	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.084115;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,6:13,3:11,3
chr11	72475951	.	A	ATTT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0041742;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,9:12,4:13,5
chr11	76110211	.	C	CATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.20161;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:15,2:13,2
chr11	76401773	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030583;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:8,6:3,1
chr11	77005992	.	T	TA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022269;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:1,12:0,5:1,7
chr11	77098510	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.32127;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:10,1:18,3
chr11	77578002	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:21,2:7,2
chr11	79681739	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.2077e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:11,12:14,9
chr11	79696275	.	C	CATAT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.072331;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,5:14,1:12,4
chr11	79791527	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.308e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:10,7:15,7
chr11	79831170	.	G	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.6566e-09;SS=2;SSC=87;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:25,26:13,16:12,10
chr11	80243161	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0014229;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:14,1:10,7
chr11	80406888	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00024094;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,6:16,3
chr11	80479358	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.030888;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,4:8,1
chr11	82424826	.	TA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.3095e-06;SS=2;SSC=54;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:12,13:11,9
chr11	82483317	.	C	CGTGTGT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,10:6,8:4,2
chr11	83850123	.	A	AGTGT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.025519;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:7,3:1,3
chr11	84058504	.	T	TAAAATAATAATAATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.19205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,7:6,4:9,3
chr11	85205140	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.15143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:24,4:21,1
chr11	88253114	.	C	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,4:1,3:3,1
chr11	89005694	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.5248e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:14,11:10,7
chr11	90611083	.	TA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:5,3:0,2
chr11	92765789	.	A	AG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037638;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:11,5:5,4
chr11	93549615	.	A	ATTTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00015682;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:4,1:7,6
chr11	93549627	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=9.3131e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:5,2:8,10
chr11	93912142	.	T	TC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:6,2:12,3
chr11	95704253	.	CTGGATCTGCCCAG	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=7.4864e-06;SS=2;SSC=51;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,20:13,13:6,7
chr11	96199196	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,6:13,5:3,1
chr11	96790885	.	G	GT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0030987;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:12,7:10,9
chr11	96914325	.	GTCTC	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0029007;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,6:5,4:5,2
chr11	96949996	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=6.569e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:39,18:22,11:17,7
chr11	98354556	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.060295;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,1:13,3
chr11	98406759	.	C	CTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,3:2,1
chr11	98425657	.	C	CAAAAAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:4,6:4,1
chr11	98832036	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.035811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:19,5:12,4
chr11	99193908	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.4655e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:2,17:1,10:1,7
chr11	99523668	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.26877;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,4:4,2:9,2
chr11	99747460	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:4,5:3,1
chr11	99819481	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.048301;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:27,10:3,1
chr11	100176610	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=4.3946e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:5,8:6,6
chr11	100502368	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=6.6438e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:10,4:10,9
chr11	101041779	.	G	GA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=4.6765e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,13:8,10:8,3
chr11	101144253	.	TA	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=5.0774e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:5,8:14,8
chr11	101785493	.	TTTC	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00086088;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:8,2:15,8
chr11	103025629	.	ATACG	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,4:10,3:11,1
chr11	103025635	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,4:8,3:13,1
chr11	103224749	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.2255e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,27:8,20:13,7
chr11	103233875	.	TGTGG	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,11:3,4:8,7
chr11	104119550	.	A	AATAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.00387;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:4,3:0,3
chr11	105472804	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:17,3:4,1
chr11	106335502	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.012658;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,6:17,4
chr11	106668985	.	GATATAT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:17,3:9,1
chr11	106671248	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:13,4:1,0
chr11	107231861	.	GAT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.075461;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:9,5:14,2
chr11	107231878	.	G	GAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:12,4:8,1
chr11	107231884	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.12376;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,5:9,1
chr11	108922243	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:11,4:3,1
chr11	111028911	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0060788;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,12:8,10:7,2
chr11	111898788	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.6305e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,16:7,8:4,8
chr11	112394177	.	A	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.6597e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:25,29:15,18:10,11
chr11	113485600	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0045179;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,13:6,11:3,2
chr11	115111632	.	G	GACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031923;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,4:6,4
chr11	115685919	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:2,3:14,1
chr11	115831750	.	ACCCT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:9,3:12,1
chr11	116630100	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.9186e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:8,8:9,11
chr11	117138905	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.14706;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:2,5:5,3
chr11	118432823	.	A	AT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.011333;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:9,7:7,4
chr11	118763838	.	TA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.040748;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:16,1:10,6
chr11	119330536	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065325;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:5,2:10,3
chr11	119448941	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.038233;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,5:3,2
chr11	120174924	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:4,4:2,3:2,1
chr11	120580196	.	GTTCT	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00089081;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,15:10,6:11,9
chr11	121919473	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016809;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,2:4,4
chr11	122761779	.	CTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,2:9,2
chr11	125584229	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:5,4:9,1
chr11	126296217	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,10:2,8:4,2
chr11	126302359	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,4:1,2
chr11	126725332	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=3.5005e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:9,12:14,9
chr11	127052937	.	GTAGTAATAATAA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02692;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:12,7:9,5
chr11	127306776	.	TC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,6:2,5:11,1
chr11	127306787	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:5,5:15,1
chr11	127497143	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:2,6:6,1
chr11	128565061	.	A	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.050822;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,5:20,2:20,3
chr11	129642545	.	A	ATG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,13:15,10:7,3
chr11	130057831	.	A	ATT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.01441;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,7:7,5:6,2
chr11	132213730	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024674;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:10,8:3,1
chr11	132716416	.	A	ATCTG	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:26,4:15,1:11,3
chr11	132818615	.	TA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.24135;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:9,3:19,1
chr11	132928109	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.6289e-11;SS=2;SSC=107;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:18,41:16,25:2,16
chr11	133498490	.	G	A	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=9.3652e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:56,20:23,9:33,11
chr11	134138202	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.35962;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
chr11	134773486	.	G	GAGAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.15576;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,5:22,3:15,2
chr11	134813424	.	G	GTA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.02026;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,8:15,3:22,5
chr11	134827657	.	ATATG	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.082972;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:28,5:23,1
chr11	135055865	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.087834;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:15,5:10,2
chr12	16088	.	AG	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.0090346;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,8:9,5:44,3
chr12	16321	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0043285;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:11,3:16,11
chr12	423473	.	TTTTGTGTTTTTTTTTGTTTTG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,4:0,0:3,4
chr12	2850653	.	TTTTTG	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0053439;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,8:10,5
chr12	4620474	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0024499;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,10:3,9:3,1
chr12	5375449	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.1217e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:15,14:9,8
chr12	5636605	.	TAC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.036735;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:16,6:5,3
chr12	5931794	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16375;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,3:15,1
chr12	7137793	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0012364;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,10:9,5:13,5
chr12	7197123	.	A	AT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.03797;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:14,3:14,4
chr12	7389960	.	T	TTA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00072464;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,9:6,3:0,6
chr12	7475097	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,8:7,7:1,1
chr12	7924946	.	T	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.033043;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:23,10:12,4
chr12	9513023	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:9,1:16,3
chr12	9607313	.	CTTCT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.27439;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:24,3:8,1:16,2
chr12	9953386	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:3,9:1,7:2,2
chr12	10239453	.	C	CCTTATT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.030593;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:2,2:17,6
chr12	10239466	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025768;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:4,1:16,7
chr12	10239469	.	C	CCTTATT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.036024;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,8:3,1:16,7
chr12	10603313	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.064856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,6:5,1
chr12	10610576	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.25826;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,4:6,2:4,2
chr12	10674873	.	CCGCG	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0013983;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,16:5,8:9,8
chr12	11168404	.	G	GGA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:23,2:0,2
chr12	12081456	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:9,7:4,1
chr12	13457272	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,4:0,0:7,4
chr12	14246866	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
chr12	14586568	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020486;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,3:7,3
chr12	17413201	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023193;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,8:8,6:4,2
chr12	17535950	.	C	CTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,2:9,2
chr12	18163528	.	A	ATATATAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
chr12	18521510	.	C	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=4.7205e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:34,23:11,15:23,8
chr12	19400856	.	A	AT	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.043302;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:25,2:21,4
chr12	19518218	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0070941;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,12:5,9:3,3
chr12	20711810	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.8087e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:16,13:10,7
chr12	21592165	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.062847;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:25,4:4,2
chr12	22955726	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=5.0013e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:22,21:15,13:7,8
chr12	23412257	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,5:13,3:6,2
chr12	23500259	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:7,1:1,5
chr12	23577193	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:3,1:10,3
chr12	23779814	.	T	TACAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0021316;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,10:7,5:0,5
chr12	24505872	.	TGC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21758;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:11,3:21,1
chr12	24948481	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.4368e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,24:18,17:7,7
chr12	25077330	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.070922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,3:8,1
chr12	25488234	.	C	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
chr12	27874093	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.005778;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,3:4,4
chr12	28508610	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=6.0159e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:13,11:15,8
chr12	30138549	.	G	GA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,10:4,9:1,1
chr12	30399886	.	G	GA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:15,8:1,2
chr12	30540173	.	TTTGTTTG	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.057946;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:12,1:12,6
chr12	31031571	.	ACT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:1,2:10,3
chr12	31613788	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.025551;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:18,12:20,2
chr12	31840469	.	G	GAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:5,4:2,1
chr12	32005190	.	ATATATG	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019067;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:9,4:9,2
chr12	32117709	.	T	TACAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0044074;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,4:8,5
chr12	32142467	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
chr12	32300631	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:12,3:4,1
chr12	32673869	.	AT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.12341;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,3:16,1
chr12	32959639	.	A	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=7.8387e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,27:11,9:10,18
chr12	34141907	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.02099;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,7:9,4
chr12	34779934	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:4,6:1,2
chr12	34880972	.	C	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
chr12	34885476	.	T	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.047933;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:33,9:8,4
chr12	35012841	.	C	T	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.025566;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:63,14:26,8:37,6
chr12	35058634	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.06044;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:29,4:0,0
chr12	35324342	.	C	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.046114;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:51,10:17,5:34,5
chr12	35332845	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.014996;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:12,5:18,7
chr12	35337682	.	C	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.018943;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:78,22:39,11:39,11
chr12	35473953	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16089;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
chr12	35473959	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,3:14,1
chr12	35473968	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,3:12,1
chr12	35500729	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.026864;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:18,4:10,2
chr12	35538803	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.04568;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:8,1:12,6
chr12	35541957	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.029881;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:8,4:35,5
chr12	35544547	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.2649;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:2,0:26,4
chr12	35689053	.	T	C	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.010005;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:120,15:95,8:25,7
chr12	35735880	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:3,8:5,3
chr12	35788169	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:18,4:2,0
chr12	35858401	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0079898;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:8,1:21,4
chr12	35974352	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.053889;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:29,4:2,0
chr12	36704968	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.033449;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,5:11,3
chr12	36704970	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035006;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:13,6:11,3
chr12	36806763	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.022644;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:14,1:28,5
chr12	36881419	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.025704;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:18,4:11,6
chr12	36939834	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,3:12,1
chr12	37007145	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr12	37058953	.	T	G	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.017715;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:101,19:51,14:50,5
chr12	37240035	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.037769;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:18,3:14,3
chr12	37814669	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.032805;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:6,4:5,6
chr12	39712017	.	TATGTATATATAC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,2:8,2
chr12	42514901	.	CT	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.029043;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:13,6:17,3
chr12	43421284	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.042577;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,4:15,1
chr12	43654565	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.1921e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:11,8:9,12
chr12	43958795	.	C	CT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.026443;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,7:16,4:8,3
chr12	44461624	.	AAG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:16,3:10,1
chr12	44587284	.	A	AAAAAAAAATATAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:6,2:4,2
chr12	44644623	.	T	TAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.38255;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:19,1:8,3
chr12	44953896	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.009553;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,3:5,4
chr12	44971251	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21886;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:8,4:6,1
chr12	45022298	.	G	GTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
chr12	45080147	.	TAC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,4:17,2:8,2
chr12	45711984	.	G	GCCTCCAAGGTGCTAGGATTACAGGTGT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.015407;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,13:7,6:18,7
chr12	48332596	.	A	ACC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.054417;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,7:9,1:22,6
chr12	49376709	.	AT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.031941;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:10,5:2,1
chr12	49606486	.	G	GACAC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.055299;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,6:15,2:9,4
chr12	49908462	.	CAAA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,6:1,1
chr12	51046344	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:7,1:4,4
chr12	51197147	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046819;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:17,1:12,8
chr12	51400785	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:2,4:4,3
chr12	52633627	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.020689;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,5:7,1:8,4
chr12	52633628	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.013669;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,5:7,1:7,4
chr12	53645358	.	TA	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,4:3,1
chr12	53763982	.	T	TTATTTTATTTTTATA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0031185;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:14,4:4,3
chr12	53763983	.	TGAGGGGG	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0016215;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:16,4:4,4
chr12	53763992	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0021337;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:15,4:4,4
chr12	55052474	.	TTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11117;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,8:4,4:17,4
chr12	55100164	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011216;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:12,5:10,9
chr12	56001118	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:3,2:7,2
chr12	56102806	.	T	TAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:4,4:2,2
chr12	56429497	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:9,3:4,3
chr12	57003174	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=8.3573e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:19,10:14,5
chr12	57423808	.	TA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,8:3,6:1,2
chr12	57722695	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.033061;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,3:3,1
chr12	58032649	.	CT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=3.4248e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:7,13:6,2
chr12	58452126	.	CTATCTAGATATATATGATA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.03159;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,8:7,1
chr12	61279630	.	C	CAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,5:1,3:1,2
chr12	62286937	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,10:9,8:1,2
chr12	63737080	.	A	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.02185;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:22,4:14,7
chr12	63763961	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,4:4,4:0,0
chr12	64203996	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.041043;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:21,4:17,5
chr12	64204010	.	CATTA	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.017109;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:17,6:17,5
chr12	64380125	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,5:5,6
chr12	64772237	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02948;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:9,6:4,1
chr12	64947767	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.2099e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:10,6:15,12
chr12	65422388	.	GTATATATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.02396;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,11:4,6:1,5
chr12	65661709	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.040809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:10,5:4,3
chr12	65793271	.	AT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0084717;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,6:4,2
chr12	66006908	.	G	GAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:22,2:6,2
chr12	66006919	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.046186;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:23,2:7,3
chr12	66173784	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,8:7,4:6,4
chr12	66730701	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:11,4:7,1
chr12	67756548	.	C	CGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.030517;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,10:21,8:12,2
chr12	67873271	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:5,2:2,2
chr12	68101180	.	AACACACACACAC	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,10:9,6:1,4
chr12	69522190	.	T	TTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.016175;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:13,5:9,5
chr12	70126484	.	C	CAAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:17,8:3,1
chr12	71055549	.	G	GT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0028686;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:4,8:1,2
chr12	71248746	.	CTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,8:3,4:1,4
chr12	72496234	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.5163e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:23,24:9,11:14,13
chr12	72955677	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,4:6,1:14,3
chr12	73557031	.	T	TAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.015231;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:10,6:5,3
chr12	74319765	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00010787;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:11,8:16,7
chr12	74494246	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=6.152e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:8,11:7,5
chr12	75490195	.	T	TCA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,11:5,2:1,9
chr12	76661923	.	GTGTGTGTATATATATA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,2:3,1:1,1
chr12	76855015	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:10,4:8,1:2,3
chr12	77279015	.	C	CTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.025527;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:11,4:10,3
chr12	77539752	.	A	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.8544e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:11,9:12,10
chr12	77976665	.	TC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,1:5,4
chr12	78651145	.	C	CCTCTCTCT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,5:11,4:6,1
chr12	79204778	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:4,2:2,3
chr12	79253483	.	G	GTCTCTC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030289;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:3,2:4,3
chr12	79568594	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,5:7,1
chr12	79841051	.	T	TA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.035086;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:16,4:6,2
chr12	81242708	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.014934;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,3:3,4
chr12	81412335	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0094835;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:11,8:2,1
chr12	81927189	.	TCATA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.042363;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:14,3:7,4
chr12	81927217	.	T	TCATA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.048707;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
chr12	83014769	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=6.3199e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,20:7,8:9,12
chr12	83895039	.	T	TA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.036677;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,5:15,4:13,1
chr12	84514468	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.2636e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:11,14:11,6
chr12	85221285	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=4.8137e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:19,22:11,12:8,10
chr12	85659476	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:3,4:4,1
chr12	86426352	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=6.7524e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:17,11:8,9
chr12	86502770	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036036;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,1:6,3
chr12	86566317	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.002293;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,5:9,4
chr12	87893158	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.06e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:23,7:9,10
chr12	88595703	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.059099;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:13,3:4,1
chr12	88665001	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:8,2:17,2
chr12	89887113	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,8:4,7:1,1
chr12	91308224	.	C	CA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00046907;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:15,9:9,3
chr12	91467146	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0011679;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:9,6:6,10
chr12	92516137	.	C	CTGTGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,4:5,1
chr12	92921866	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:10,8:0,1
chr12	92995012	.	T	TTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011272;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,14:8,11:2,3
chr12	93291515	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.020137;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:10,9:15,1
chr12	93514299	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.044908;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,6:16,3:16,3
chr12	94516083	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,5:7,2:6,3
chr12	94904262	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=4.3844e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:8,11:7,3
chr12	95053681	.	GT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.014414;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:14,5:6,6
chr12	95599688	.	TTA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,4:9,2:6,2
chr12	95702858	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.030583;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:2,3:9,4
chr12	96190492	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.00070028;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,5:1,4:0,1
chr12	96466181	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.3044e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:31,17:9,5:22,12
chr12	96978485	.	CTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,3:2,4
chr12	97988353	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,2:1,2
chr12	98334636	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=7.2341e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:12,7:6,10
chr12	99532748	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.2103e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,21:8,13:11,8
chr12	100012716	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.1661e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:8,8:14,5
chr12	100385116	.	C	CTG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0052219;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:9,9:12,5
chr12	100475124	.	C	CCTATCTATCTAT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0094816;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,14:16,6:10,8
chr12	100483066	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.4647e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:19,7:10,8
chr12	101040124	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.8133e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:25,28:14,13:11,15
chr12	101193291	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00031521;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:15,8:10,6
chr12	101259836	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=2.0246e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:8,13:9,7
chr12	101259878	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,5:11,4:4,1
chr12	102036362	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,10:9,8:4,2
chr12	102228465	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=9.3791e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:11,25:5,8:6,17
chr12	103404920	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.6819e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:37,22:15,12:22,10
chr12	103775010	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.013346;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,13:14,10:5,3
chr12	104161217	.	A	AT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0075114;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,4:11,7
chr12	104637392	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0010679;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,12:6,11:0,1
chr12	105619178	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0091688;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,8:2,7:1,1
chr12	105631649	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0066111;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:14,6:4,3
chr12	105865663	.	CA	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017221;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,4:6,1
chr12	106477891	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010876;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,6:7,4:3,2
chr12	107482985	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,2:3,1:4,1
chr12	107643752	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.055718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:9,3:6,2
chr12	108490233	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.005418;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:3,4:1,2
chr12	108757194	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,6:9,5:0,1
chr12	109349658	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.015123;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:6,9:6,3
chr12	109354618	.	T	TTAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.033228;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,6:13,4:15,2
chr12	109427316	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,6:5,3
chr12	109443214	.	GTA	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.115;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:15,4:19,1
chr12	109443262	.	GTA	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048762;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:18,5:17,2
chr12	110595211	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0089009;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:11,4:4,2
chr12	112713051	.	CCTTCTTCTTCTTCTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:0,3:5,1
chr12	112739417	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=6.4011e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:15,16:10,5
chr12	113491777	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.0232e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:24,23:13,9:11,14
chr12	114357023	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0082398;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:15,3:20,6
chr12	114576263	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:1,0:18,4
chr12	114781830	.	T	TAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0044074;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,9:12,7:5,2
chr12	115927160	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,5:2,1
chr12	117011127	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.025784;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,3:8,4
chr12	117088680	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.010905;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,7:10,4:6,3
chr12	117215869	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,4:8,1
chr12	117361858	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.18462;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,3:2,2:4,1
chr12	117893017	.	AT	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.5381e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:9,8:12,5
chr12	117995993	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.034767;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,7:4,2
chr12	118204255	.	G	GA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00054483;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,12:13,9:5,3
chr12	118646576	.	G	GT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.22807;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,6:10,4:1,2
chr12	119075497	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,2:17,2
chr12	120528211	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:4,2:3,1:1,1
chr12	120868474	.	TTG	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.05717;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:16,1:16,4
chr12	121644589	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0058024;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,8:11,2
chr12	124901888	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0065088;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:9,12:6,10:3,2
chr12	127042467	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=4.2186e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:21,24:12,12:9,12
chr12	127089069	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.037462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:13,4:16,6
chr12	127225612	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,3:5,2
chr12	127475365	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,8:2,5:2,3
chr12	127590198	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.2826e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:8,3:12,13
chr12	127697209	.	GGTGATAGTGGTGATGATGGCA	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.042786;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:22,3:13,4
chr12	127736409	.	C	CTTTCT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:3,3:3,2
chr12	128060616	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,2:3,1:4,1
chr12	128278750	.	A	ATG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.036024;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:14,5:5,3
chr12	128874102	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,5:4,3:11,2
chr12	129643513	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.0437e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:9,8:14,6
chr12	130155274	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.037408;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:12,4:10,7
chr12	130897372	.	G	GACACACACACACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,8:5,6:2,2
chr12	131259917	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.034956;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:14,3:4,2
chr12	131925532	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:3,2:2,4
chr12	132243194	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.21888;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:20,2:10,2
chr12	132321203	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0069983;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,7:7,4:11,3
chr12	132692569	.	T	TA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.039528;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:22,2:15,5
chr12	132742222	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.033476;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:13,8:9,5:4,3
chr13	18174876	.	T	C	0	PASS	DP=280;GPV=1;SPV=0.025123;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:144,16:72,6:72,10
chr13	18194860	.	C	T	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.027244;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:75,17:35,12:40,5
chr13	18320625	.	A	T	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.0020701;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:81,25:42,14:39,11
chr13	19311248	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,9:2,8:3,1
chr13	19779663	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:16,2:2,2
chr13	19970600	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.009224;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,7:3,2
chr13	20063841	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015942;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:2,2:6,3
chr13	20218615	.	C	CCT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.01905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,8:6,1:10,7
chr13	20394727	.	C	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=1.0869e-10;SS=2;SSC=99;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:33,28:18,16:15,12
chr13	20958455	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,10:2,7:2,3
chr13	21081796	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.067367;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:10,4:6,2
chr13	21136300	.	T	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=9.5177e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:14,6:11,10
chr13	21377451	.	G	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0017334;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:52,20:27,3:25,17
chr13	21946632	.	C	CTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.03366;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:11,8:13,5
chr13	22314271	.	TTTTTTG	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0090872;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,4:7,3
chr13	22562413	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=8.7616e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:11,9:10,7
chr13	22570106	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00040437;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:7,8:13,4
chr13	23065294	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.701e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:17,10:13,7
chr13	23204617	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,1:13,3
chr13	23387468	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.10662;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:15,2:21,3
chr13	23774784	.	CTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:7,3:1,1
chr13	23775127	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0096412;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:7,5:14,4
chr13	24163332	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.6678e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:23,25:14,9:9,16
chr13	24424673	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.013499;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,8:8,4
chr13	24472891	.	GTT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00037946;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,14:10,11:3,3
chr13	24586838	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.047734;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:25,6:17,1
chr13	25004051	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,3:8,1
chr13	25081463	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:9,2:2,3
chr13	25100046	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:8,5:2,4
chr13	26901899	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.04668;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:6,6:14,3
chr13	27751173	.	C	CGAGAGA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.055194;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:11,4:9,1
chr13	27990755	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10815;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:21,1:9,5
chr13	29286668	.	G	GTCTATCTATCTATCTATCTATCTA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.018147;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,10:16,4:12,6
chr13	30146490	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.01095;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:4,5:5,3
chr13	30688026	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,2:1,1:1,1
chr13	30764285	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=1.8308e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:34,26:12,18:22,8
chr13	30842612	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.24625;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,3:13,1
chr13	30966432	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,9:4,6:1,3
chr13	31685958	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,6:7,5:8,1
chr13	32523390	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.011404;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:9,8:13,7
chr13	32799312	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,7:2,6:2,1
chr13	33296436	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.031483;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:21,7:12,1
chr13	34713680	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0044505;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:8,5:5,1
chr13	35853771	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.9123e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:5,10:12,7
chr13	36010051	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00071247;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,6:7,6
chr13	39497293	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.3844e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,23:8,13:15,10
chr13	39576811	.	T	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.023921;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,5:6,2:10,3
chr13	40201734	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010062;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,5:2,2
chr13	40714439	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.031468;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:21,1:23,5
chr13	41758392	.	ACGCTAG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:3,1:1,1
chr13	42171828	.	C	CTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,8:4,7:0,1
chr13	45958652	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.34103;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,4:6,3:11,1
chr13	46515602	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,2:2,2
chr13	48080396	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0062663;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,8:7,2
chr13	48110844	.	GTATATATATATATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,10:1,5:2,5
chr13	48110884	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.00059227;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:3,13:0,6:3,7
chr13	50316876	.	G	GATAAATAAATAAATAAATAA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,11:10,5:18,6
chr13	50743178	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,7:7,4:13,3
chr13	51825636	.	T	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:6,3:4,2:2,1
chr13	53374580	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.5235e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:11,10:12,10
chr13	53824645	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=5.7991e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,23:10,14:8,9
chr13	54392755	.	T	TAA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0082887;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:9,4:15,6
chr13	54963344	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.064151;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,6:9,4:10,2
chr13	55338258	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.037194;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:11,5:5,2
chr13	55388469	.	AAG	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.14744;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,3:18,1
chr13	56933829	.	C	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,4:5,4
chr13	57959564	.	T	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.0555e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:10,7:16,7
chr13	58465615	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=9.0336e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:14,12:12,10
chr13	58857633	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0011442;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:16,4:13,5
chr13	59663665	.	G	GCACACACA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.024807;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:12,7:5,2
chr13	60776126	.	T	TTTTATTTATTTA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.015078;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:17,7:7,3
chr13	61260559	.	T	TAGAG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10927;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:8,3:7,4
chr13	61864731	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0030535;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:13,3:9,5
chr13	61864743	.	A	ATTTACTTAATGAGAAATTAACT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039588;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:15,3:14,2
chr13	63445366	.	ATATAGATGAG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,1:5,3
chr13	63534837	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,2:3,1:2,1
chr13	64354724	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:12,7:1,1
chr13	64633674	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,4:9,3:2,1
chr13	64922205	.	C	CAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:10,7:1,1
chr13	66873940	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.02396;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:2,1:3,5
chr13	67557953	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.2509e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:12,9:12,15
chr13	68070422	.	G	GAGAGAAGAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0054674;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,10:7,3:4,7
chr13	69542750	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,3:8,2
chr13	71291325	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,5:9,1
chr13	71590875	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:3,3:6,1
chr13	72945581	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=3.5309e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:10,10:10,8
chr13	72966941	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0010086;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:2,7:8,5
chr13	73934950	.	ATTAT	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0056474;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:14,7:8,3
chr13	74814335	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=2.9228e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:18,13:8,9
chr13	75142489	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020376;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,7:6,3:5,4
chr13	75157414	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=6.9612e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:8,15:12,5
chr13	76318655	.	C	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,4:5,2:5,2
chr13	76318660	.	A	ATG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,4:5,2:5,2
chr13	76457792	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,4:3,3:13,1
chr13	82047149	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0001126;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:5,11:9,8
chr13	82082276	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.8837e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,22:9,15:12,7
chr13	82084148	.	G	GGT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.015511;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,8:15,4:7,4
chr13	82392688	.	TAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010683;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:8,7:6,4
chr13	85510720	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=4.5153e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:9,10:20,9
chr13	87433344	.	CACTTGAAACTAACAATATTTTAAAAG	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.063556;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:10,4:10,4
chr13	87860077	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:7,2:4,1:3,1
chr13	89038023	.	G	GTA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.17207;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:13,5:10,1
chr13	90271648	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:1,7:0,1:1,6
chr13	90314350	.	CACAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19246;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:10,2:15,2
chr13	90314366	.	TAC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:5,3:16,3
chr13	90314394	.	C	CACT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12337;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,5:10,4:14,1
chr13	90314398	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.051469;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:8,5:9,2
chr13	90535531	.	GT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:12,12:6,8:6,4
chr13	93102644	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.069764;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,8:14,7:7,1
chr13	93719694	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.9137e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,19:7,7:8,12
chr13	93979319	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.031815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:2,4:14,3
chr13	95350698	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.04524;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:15,8:10,3
chr13	96242577	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21758;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,1:16,3
chr13	96866641	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,7:8,3:4,4
chr13	96943450	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:4,1:3,4
chr13	97745962	.	TAA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=9.1959e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:7,21:4,10:3,11
chr13	98372081	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013375;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:9,8:1,1
chr13	98488160	.	G	GACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0061246;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,8:3,7:3,1
chr13	100067016	.	G	GTATA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,3:11,1
chr13	100348890	.	TTTCC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.1043;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:11,2:14,4
chr13	100524374	.	C	CGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.01504;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:5,3:18,7
chr13	100609682	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.058759;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:13,4:20,2
chr13	100812765	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=6.3369e-11;SS=2;SSC=101;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:19,30:12,17:7,13
chr13	101256765	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,8:7,1
chr13	104361264	.	C	CT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.3655e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,12:9,9:5,3
chr13	104467288	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.1402e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:14,9:11,6
chr13	104934498	.	C	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=4.489e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,23:15,14:8,9
chr13	105286843	.	C	CTTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,3:7,8
chr13	106169412	.	T	TAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0007996;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,14:5,9:2,5
chr13	106281922	.	AAAT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:19,1:14,3
chr13	106395375	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.5832e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,22:14,11:11,11
chr13	109392632	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.23992;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:8,2:13,1
chr13	109670435	.	G	GT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:2,4:1,2:1,2
chr13	109765589	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:1,0:12,4
chr13	110481218	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:5,4:13,1
chr13	110516896	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045968;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:3,4:13,2
chr13	110603307	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00017215;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,10:4,8:4,2
chr13	111680082	.	AAG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:0,4:7,8
chr13	112279249	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:15,1:4,3
chr13	112292665	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.082314;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:23,4:19,4
chr13	112300579	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,1:9,3
chr13	112863264	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.028868;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:10,6:9,2
chr13	113512746	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,2:3,2
chr13	113600427	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:4,3:7,2
chr13	113640819	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00023524;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:18,10:12,8
chr13	114028232	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
chr14	16032010	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.026087;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
chr14	18254190	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048825;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,5:10,5
chr14	18403011	.	C	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,3:4,2
chr14	18631061	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:18,3:10,1
chr14	18679857	.	TA	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.027603;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:41,15:24,9:17,6
chr14	18951065	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0054626;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:5,3:12,9
chr14	18953821	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.016516;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:20,2:30,5
chr14	19115443	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:17,4:1,1
chr14	19271533	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
chr14	19339980	.	T	TC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.028508;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,6:12,3:13,3
chr14	19340017	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:16,3:2,1
chr14	19397645	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016895;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:10,1:14,4
chr14	19475796	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:3,2:11,2
chr14	19480483	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.047268;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:26,8:11,4
chr14	19489756	.	T	G	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.03269;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:71,21:28,9:43,12
chr14	19708740	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.14106;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:31,4:14,1
chr14	19833665	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=6.6042e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:12,6:13,14
chr14	20506338	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0070965;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,14:1,3:6,11
chr14	21460585	.	C	CAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,7:3,2
chr14	22782464	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.045689;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:22,3:21,4
chr14	23016888	.	AT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,3:14,1
chr14	23129127	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.0826e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,18:13,10:13,8
chr14	23779038	.	CTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.006993;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,8:1,1:1,7
chr14	24004269	.	T	TA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0048364;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:12,5:0,1
chr14	25125164	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.059881;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:13,5:2,1
chr14	26941188	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.5607e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:17,23:10,12:7,11
chr14	27112425	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.0511e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,19:9,12:3,7
chr14	28392771	.	C	CT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.3087e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:11,6:10,7
chr14	28562095	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,1:14,3
chr14	29466224	.	TAAATATATAATATATAA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,5:6,3
chr14	30434626	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:5,2:5,2
chr14	32056469	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.025586;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,12:1,3:10,9
chr14	33541098	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.038751;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:20,5:15,2
chr14	34371073	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:13,5:4,1
chr14	34784368	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,5:0,2:4,3
chr14	34890002	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,10:6,8:10,2
chr14	35259993	.	G	GT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:8,4:5,5
chr14	35977406	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.21888;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,1:16,3
chr14	37181064	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:9,8:10,3
chr14	37200892	.	GTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.049827;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,6:8,3
chr14	37433616	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.7351e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:12,21:5,14:7,7
chr14	38953429	.	A	AGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:4,5:2,1
chr14	38989050	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0023054;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,9:8,3:8,6
chr14	40464959	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=2.4234e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:14,12:9,10
chr14	41051835	.	C	CATTATTATTATTATTATTATT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,10:4,5:3,5
chr14	41494216	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=5.8335e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,23:9,14:12,9
chr14	42157721	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.070365;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,7:6,3:14,4
chr14	44684892	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0049228;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:16,5:3,3
chr14	45757259	.	G	GGCTTGCTTGCTTGCTTGCTT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0015921;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,12:8,4:12,8
chr14	46266489	.	CAAACA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,1:7,3
chr14	46275141	.	TAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,4:6,3:6,1
chr14	47361207	.	C	CTA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0018885;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:12,7:9,2
chr14	49799207	.	C	CAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.064856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:11,6:4,1
chr14	50239185	.	AAAG	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0023885;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,11:7,8:4,3
chr14	50585894	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.4733e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:10,16:17,5
chr14	51068346	.	CAAA	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.035023;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:27,4:23,2
chr14	51247352	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,7:4,5:2,2
chr14	51646318	.	CAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:9,4:3,1
chr14	52107305	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:2,2:5,2
chr14	52739632	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,5:4,1
chr14	52762858	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,4:5,1
chr14	52779724	.	T	TAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:1,5:4,1
chr14	54208438	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00064075;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:10,6:16,4
chr14	55099607	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,9:6,2:5,7
chr14	55990192	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.069424;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:13,3:9,4
chr14	56102549	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.004119;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:4,6:3,2
chr14	56546913	.	AT	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=9.0495e-07;SS=2;SSC=60;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:8,6:14,12
chr14	56883287	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:4,3:3,1
chr14	57381058	.	A	AGAAG	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.070174;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,5:10,4:17,1
chr14	57381064	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.028751;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,9:9,7:9,2
chr14	58743217	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.023494;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:18,4:15,4
chr14	58954563	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00014931;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:46,20:25,12:21,8
chr14	59289767	.	G	GATATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.018966;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:7,3:4,3
chr14	59575505	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00096036;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,12:9,6:0,6
chr14	59749420	.	C	CTA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,2:1,1:3,1
chr14	60784179	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,9:2,4:4,5
chr14	61106104	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:31:0,6:0,3:0,3
chr14	61607114	.	G	GGTGTGTGCGT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.047515;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,10:13,4:7,6
chr14	62799573	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:5,4:2,2
chr14	63074461	.	TATGTCA	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.7204e-08;SS=2;SSC=74;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:13,6:4,11
chr14	64716465	.	CA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.02087;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,6:3,3:3,3
chr14	65436630	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:5,2:1,1:4,1
chr14	67179340	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=3.0979e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:22,27:11,13:11,14
chr14	67323261	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.14256;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:20,3:11,1
chr14	67389775	.	C	CT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00060405;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:12,4:4,4
chr14	67655028	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,10:6,9:3,1
chr14	68388076	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.093861;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:21,1:10,3
chr14	68635709	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.2589e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:9,8:14,5
chr14	70659134	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:15,5:16,2
chr14	71708015	.	GT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016908;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,5:5,1
chr14	71845111	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0051416;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:7,2:8,8
chr14	71845125	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,1:6,5
chr14	71899692	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.637e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:10,13:9,3
chr14	73258618	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:14,1:4,3
chr14	73395037	.	T	TTG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.004257;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,7:4,5:0,2
chr14	73401563	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.042832;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,4:9,3
chr14	73834946	.	A	AGT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:2,3:3,3
chr14	73844185	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,4:10,2:8,2
chr14	74335740	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.034367;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:14,1:8,4
chr14	76678199	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=6.0264e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:13,14:9,9
chr14	77501593	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:5,5:5,1
chr14	77642878	.	ATAAATGTGTGT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,10:9,5:1,5
chr14	77648612	.	GAAAGGAAAGAAGA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.024217;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:10,7:8,3
chr14	77657742	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:4,4:4,1
chr14	78073537	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,3:8,4
chr14	79284343	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:6,3:0,2
chr14	79601040	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,11:1,9:7,2
chr14	79921819	.	T	TTC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:0,2:0,0:0,2
chr14	81807138	.	TCAC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:5,6:15,2
chr14	82885965	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.031249;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,8:14,7:2,1
chr14	83298937	.	G	GT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,4:8,3
chr14	83759808	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.9123e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:11,8:7,10
chr14	84790356	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:1,1:0,1
chr14	85109882	.	ATACG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,1:12,3
chr14	85109901	.	C	CG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.1672;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,4:17,1:16,3
chr14	85504440	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0099771;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,12:2,10:3,2
chr14	85598916	.	G	GTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:14,8:2,2
chr14	87349200	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.17135;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:8,4:8,1
chr14	88205542	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02564;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:8,4:3,4
chr14	88212109	.	A	AATATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:10,3:8,2
chr14	88990751	.	T	TC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.045802;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,2:12,4
chr14	89336250	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:4,4:15,1
chr14	90046237	.	CTT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:4,1:1,1
chr14	90144495	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,8:2,5:3,3
chr14	90515076	.	CT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.021743;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:16,4:3,2
chr14	90675064	.	C	CCGGTGGTT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.040958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,12:13,9:17,3
chr14	90675068	.	CCCCTA	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.017517;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,14:13,9:14,5
chr14	90675076	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0067999;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,13:12,9:11,4
chr14	90675077	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.012514;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:15,10:12,5
chr14	91044346	.	AGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAAAGAAGGAAAGAAAGAAAGAAG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,2:5,2
chr14	91586577	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.07056;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,1:13,3
chr14	91586581	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.083817;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,2:15,2
chr14	94598852	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=8.9063e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:13,13:14,11
chr14	94701786	.	G	GA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.04269;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:10,3:7,5
chr14	94740143	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.2394e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:29,23:19,14:10,9
chr14	95578854	.	CTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:4,6:2,1
chr14	95817827	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.9774e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:10,10:8,7
chr14	95845501	.	T	TCA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00068033;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,20:13,5:12,15
chr14	95943673	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.1682e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:10,11:13,8
chr14	98014407	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,3:5,2:1,1
chr14	98090703	.	CTTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0062751;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,8:4,2
chr14	98247482	.	A	AT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,4:5,1
chr14	98430947	.	C	CA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0045584;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,8:20,6:12,2
chr14	98656998	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0094013;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:13,3:4,3
chr14	98667025	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.057792;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
chr14	100100784	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.093821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,7:11,6:10,1
chr14	101724878	.	CTA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.044153;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:12,4:13,4
chr14	101765734	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,1:7,3
chr14	102198097	.	CTTTATTTA	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.026923;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:9,4:17,7
chr14	102202372	.	GT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.27668;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:8,1:5,2
chr14	102463416	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.048842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,5:21,1:5,4
chr14	102692768	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:2,4:4,4
chr14	103467674	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0729;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,6:16,5:8,1
chr14	103683237	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=9.577e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:31,18:13,12:18,6
chr14	105736712	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:1,6:16,4
chr14	105744265	.	T	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.015261;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:24,5:24,3
chr14	105763959	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.028667;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:22,5:8,1
chr14	105992368	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.04073;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:5,1:17,6
chr14	105992391	.	T	TCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.24625;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,4:9,2:10,2
chr14	106330206	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.04214;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:17,5:27,3
chr15	17074312	.	T	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.035564;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:51,8:27,3:24,5
chr15	17949032	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:15,2:3,2
chr15	19417458	.	G	A	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.042691;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:75,12:40,7:35,5
chr15	19904285	.	CT	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0080542;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:64,10:27,2:37,8
chr15	19925520	.	G	A	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.021921;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:95,15:54,5:41,10
chr15	20034110	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.077637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:19,1:23,4
chr15	20104979	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16049;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:13,4:18,1
chr15	20123651	.	TA	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.021168;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:8,2:13,4
chr15	20141272	.	G	T	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.0033445;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:64,20:45,12:19,8
chr15	20239156	.	T	C	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.012734;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:55,7:36,4:19,3
chr15	20251534	.	C	T	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.021476;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:83,21:36,10:47,11
chr15	20274409	.	T	C	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.018172;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:72,22:38,8:34,14
chr15	20309052	.	TGATGA	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.023365;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:39,1:19,6
chr15	20427360	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048554;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:13,5:8,1
chr15	20495787	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,4:3,4
chr15	20542554	.	C	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.001061;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:22,15:12,9:10,6
chr15	20585598	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.012777;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:21,4:16,4
chr15	20760843	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,2:7,2:0,0
chr15	20940008	.	A	AGCGAGGCAAG	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.026673;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:62,14:33,7:29,7
chr15	21112441	.	TGGCTA	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.059112;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:53,6:31,2:22,4
chr15	21275609	.	C	CA	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.029691;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:88,21:43,10:45,11
chr15	21355190	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.075302;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:15,3:16,2
chr15	21442268	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.015531;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:21,6:20,3
chr15	21495301	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,1:7,3
chr15	21640770	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,6:8,1
chr15	21642220	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.26383;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:5,2:15,3
chr15	21917714	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.021811;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:49,14:19,10:30,4
chr15	22421798	.	A	C	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.039392;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:62,17:26,9:36,8
chr15	22597673	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00014569;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:11,5:10,15
chr15	22821649	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:1,2:1,1:0,1
chr15	23041964	.	G	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.082337;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,1:7,5
chr15	23043520	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.26573;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:16,3:7,1
chr15	23047926	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
chr15	23149525	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.033582;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,6:5,1
chr15	23347821	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.057558;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:24,1:12,4
chr15	24262448	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0060315;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,6:4,3
chr15	24369770	.	AT	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.04773;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,2:14,2
chr15	25953441	.	CTT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.086687;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,10:3,6:3,4
chr15	25967006	.	TTTATATATA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,2:3,4
chr15	26355115	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=4.108e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:25,25:15,12:10,13
chr15	26361251	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:4,2:9,2
chr15	26665926	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.7527e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:8,8:11,9
chr15	26760768	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0027222;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:14,5:6,4
chr15	26946807	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=4.2987e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:12,7:10,8
chr15	27001888	.	G	GTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,5:2,4:4,1
chr15	27306943	.	TATATA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.058021;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:13,3:13,4
chr15	27307407	.	A	ATG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,4:11,3:13,1
chr15	27602343	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.2072e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:6,11:14,9
chr15	28472246	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.036691;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:24,4:20,1
chr15	28488117	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,4:9,1:10,3
chr15	28808374	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.011156;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:46,17:23,5:23,12
chr15	29975228	.	C	CAAGA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,12:9,9:5,3
chr15	30150979	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.028132;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:18,2:4,3
chr15	30326364	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.19804;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,5:11,3:7,2
chr15	30371006	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.036306;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:17,6:21,1
chr15	30596779	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.033698;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:14,1:11,6
chr15	30652848	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013375;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:4,2:6,7
chr15	31199330	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,1:12,3
chr15	32387887	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:3,2:19,10
chr15	32424950	.	A	T	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.01026;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:92,25:52,17:40,8
chr15	32457303	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.042279;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:12,4:29,5
chr15	32591731	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,3:10,1
chr15	32738083	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028205;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:7,3:1,1
chr15	33271983	.	ATT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:1,2:0,0:1,2
chr15	33572654	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13283;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:23,3:5,1
chr15	34181727	.	C	CAT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,4:11,3:12,1
chr15	34518917	.	G	GAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.03366;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,14:10,8:14,6
chr15	34709673	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:4,2:7,7
chr15	36521645	.	AGAAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0073297;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,7:8,4:1,3
chr15	36521672	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,2:0,2
chr15	37334425	.	T	TTATATA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0054438;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:8,7:3,1
chr15	37402739	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.043422;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,1:8,5
chr15	38112415	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:47:2,8:0,2:2,6
chr15	38369233	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,4:3,1:1,3
chr15	40073724	.	CTTT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.035178;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:10,6:15,5
chr15	40318685	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.04741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,8:7,7:6,1
chr15	40377313	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0019978;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,13:8,9:10,4
chr15	41615216	.	A	AT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.565e-06;SS=2;SSC=54;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,20:13,9:15,11
chr15	42785115	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019162;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,6:9,1
chr15	43261074	.	GTGT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,2:6,2
chr15	43608459	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.071818;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:13,4:9,2
chr15	44764928	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.7648e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:12,10:8,4
chr15	46106874	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.03936;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:16,2:25,3
chr15	46546000	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.3453e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:9,6:9,7
chr15	47083875	.	T	TTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045213;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:13,7:9,4
chr15	47133961	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0073228;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:10,9:4,2
chr15	48568052	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,4:15,3:3,1
chr15	50169282	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.12269;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:22,5:9,1:13,4
chr15	50615163	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17207;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:15,5:8,1
chr15	50772849	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:2,2:3,3
chr15	51079855	.	CAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0083426;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,5:2,3
chr15	52697957	.	ATTT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,3:7,1
chr15	53135920	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.016315;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:16,9:6,2
chr15	53703277	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00011889;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:17,8:10,12
chr15	54280745	.	TAC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:7,3:7,4
chr15	54475281	.	TTTATTATTATTATTA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0022329;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:8,20:5,9:3,11
chr15	55119378	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.074336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,4:10,1
chr15	55370885	.	GAA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030401;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:13,8:1,2
chr15	55428466	.	TCTCA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:5,4:4,7
chr15	58726567	.	C	CA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,4:1,3:0,1
chr15	60878343	.	CAAA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,10:8,9:3,1
chr15	61184986	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:2,4:4,1
chr15	61277734	.	T	TC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:9,8:6,2:3,6
chr15	63158567	.	ATT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0015492;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,14:0,11:5,3
chr15	64577230	.	AATAC	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029832;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,5:2,3
chr15	65221802	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0022391;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:2,5:9,8
chr15	65284337	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:10,3:4,3
chr15	65986793	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:6,2:4,2
chr15	66632730	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,9:5,6:5,3
chr15	67244127	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.5575e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:13,12:10,7
chr15	67875410	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,2:4,3
chr15	68368877	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,2:11,2
chr15	69808686	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,4:8,2:11,2
chr15	71416711	.	ATTTTG	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036162;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:13,6:11,4
chr15	72151953	.	TTTATTTA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.17271;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:15,1:17,3
chr15	72436772	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=8.075e-10;SS=2;SSC=90;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:18,31:12,17:6,14
chr15	72860754	.	TATCTATCTATCTATCTATCTATCC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0307;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,6:14,3:8,3
chr15	72948523	.	T	TAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:7,6:7,1
chr15	74076151	.	T	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.041086;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:14,3:26,10
chr15	74170093	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.049242;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:17,6:18,2
chr15	74894039	.	AGTGTGTGTGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.10909;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,2:2,2:0,0
chr15	75184978	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:3,9:6,1
chr15	76475634	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.1043e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,6:11,9
chr15	77378188	.	T	TTATATATATATA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.013807;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,8:10,5
chr15	77746207	.	CAAA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.006848;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,10:11,8:5,2
chr15	78920737	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=8.3675e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,5:3,3
chr15	78968262	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.030276;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:22,3:15,3
chr15	79273657	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:14,1:7,3
chr15	80637342	.	C	CAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:11,7:1,1
chr15	82108073	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,5:4,4:4,1
chr15	82367272	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0050719;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,1:9,7
chr15	82367273	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022726;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,1:8,7
chr15	82367274	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.011329;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:7,2:8,7
chr15	82520259	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21758;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,3:18,1
chr15	82526543	.	ATTTATAGTTTAAATTTATTTGTGTTTCTAATTTATAG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.012459;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,10:12,5:10,5
chr15	82902197	.	A	AT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00022489;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:14,15:8,11:6,4
chr15	84426018	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.026626;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:24,7:17,6
chr15	85293018	.	ATT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:11,3:9,5
chr15	85355163	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,7:1,4:10,3
chr15	85359195	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,8:6,7:6,1
chr15	85765636	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,4:3,1:4,3
chr15	85896830	.	G	GTCTC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,4:2,1:5,3
chr15	86160099	.	GT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0028624;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:6,5:4,7
chr15	86271043	.	A	ATTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,3:7,1
chr15	86391640	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,1:6,3
chr15	86724235	.	C	CAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,6:11,5:3,1
chr15	89424577	.	G	GAATTAGAAAGGTTGCTTCTGCCACCCAGTCACTTCCCAAAGT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,2:10,2
chr15	89424578	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,2:10,2
chr15	89541444	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00037187;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,5:10,6
chr15	91406849	.	CAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,8:5,7:0,1
chr15	93463490	.	C	CAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:6,3:3,1
chr15	94744908	.	AGGAG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
chr15	95100648	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00022188;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:10,7:12,3
chr15	95620717	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:8,5:3,3
chr15	97186929	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.0344e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:16,26:6,11:10,15
chr15	97466847	.	GAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,2:9,2
chr15	98367147	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,3:3,1:1,2
chr15	98489320	.	G	GTA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,1:4,3
chr15	98878663	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:8,4:0,1
chr15	99750660	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.012427;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:17,3:10,6
chr15	100356520	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=7.0704e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:20,22:10,14:10,8
chr15	100535801	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.031065;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,3:6,5
chr15	101661101	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.090326;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:22,4:22,1
chr15	101755793	.	G	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,1:4,3
chr15	101759784	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.028059;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:25,3:17,3
chr15	101944808	.	C	T	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.0027971;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:98,29:52,19:46,10
chr15	101951124	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.024579;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,4:9,2
chr16	825460	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.1717e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:13,6:16,10
chr16	858660	.	G	GC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14691;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,3:14,2
chr16	1092432	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.28111;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:7,3:20,1
chr16	1511927	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0012196;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:9,2:15,8
chr16	2524524	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.1033e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,22:11,10:10,12
chr16	2599069	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.0325e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:31,21:17,14:14,7
chr16	3146294	.	G	GC	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00017382;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:10,4:10,14
chr16	3944592	.	AAAGAAGAAGAAG	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0020704;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:7,6:0,2
chr16	4227064	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017118;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:12,3:8,7
chr16	4237956	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=4.0661e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:13,7:13,10
chr16	5202753	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:10,1:5,4
chr16	5488566	.	TG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:14,4:2,2
chr16	6806836	.	A	ATATATATATATAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17217;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:5,1:4,4
chr16	6861823	.	G	GTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:6,3:4,2
chr16	6864991	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.062457;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,1:9,4
chr16	7330510	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.013487;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,6:4,2:6,4
chr16	7508622	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00037122;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:16,8:12,5
chr16	8707353	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0087781;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,7:8,4:15,3
chr16	8773105	.	TACAC	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0051611;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:21,16:12,12:9,4
chr16	8990182	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0026611;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,9:15,7:7,2
chr16	9193261	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.076832;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,1:14,3
chr16	9193263	.	CTTTCTGTCTCTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040021;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:4,1:13,4
chr16	9965116	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=9.2748e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:14,6:13,8
chr16	10986012	.	ATTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:7,1:6,5
chr16	11486257	.	AGATGGATGGATGGAGG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.18237;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:8,5:13,1
chr16	11520664	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:8,5:7,1
chr16	11855946	.	GTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,9:7,6:4,3
chr16	11893093	.	G	GT	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=9.5714e-08;SS=2;SSC=70;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:14,11:8,8
chr16	12101301	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:1,3:3,1
chr16	12182189	.	G	GT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,10:5,9:3,1
chr16	12441089	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.065489;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:11,3:6,1
chr16	12619111	.	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0039295;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,8:2,7:2,1
chr16	12970351	.	GTGTATATA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:2,2:1,3
chr16	13107472	.	G	GAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0096894;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:6,5:1,1
chr16	14435896	.	T	TCACA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.027067;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,14:18,12:0,2
chr16	15263066	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.13506;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:23,2:19,4
chr16	16324387	.	C	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.041457;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:50,13:11,4:39,9
chr16	16468806	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064494;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:20,5:18,1
chr16	16473782	.	G	C	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.026432;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:42,13:14,4:28,9
chr16	16508138	.	GA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15645;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,1:15,4
chr16	16600714	.	TC	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:13,4:9,3:4,1
chr16	16607270	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0075808;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:10,3:14,9
chr16	16663176	.	T	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.024133;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:20,9:24,3
chr16	16936582	.	A	ATAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,3:0,0:0,3
chr16	18683772	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,2:1,2
chr16	19093031	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:14,6:2,2:12,4
chr16	19363464	.	CAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,9:4,8:0,1
chr16	20513554	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00016294;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:13,5:11,6
chr16	21244072	.	TA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:16,2:17,4
chr16	21921367	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
chr16	22042437	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.0279e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:9,9:13,8
chr16	22081064	.	T	TAA	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.036285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:19,7:18,4
chr16	22234877	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:6,7:1,1
chr16	22955353	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0014133;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:24,9:21,4
chr16	23875562	.	C	CAT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.040176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,9:19,7:10,2
chr16	23875617	.	CAT	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.031193;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:22,7:12,5
chr16	24396302	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0010413;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,4:7,7
chr16	24420042	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.2196e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:13,4:12,12
chr16	24440766	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0056638;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,5:3,3
chr16	24461423	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.00037161;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,7:3,3:1,4
chr16	24482261	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,6:2,3
chr16	24830828	.	ATT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
chr16	24888478	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,2:3,2:0,0
chr16	25182809	.	A	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:6,3:2,2:4,1
chr16	26663859	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,1:11,3
chr16	26737206	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,5:5,1:6,4
chr16	27077403	.	C	CCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTTCTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,4:4,1:15,3
chr16	28819391	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,7:4,1
chr16	29057728	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,1:13,3
chr16	29495118	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.1625;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,3:13,2
chr16	29677012	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029832;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,8:6,6:5,2
chr16	30219035	.	AACACACACACACACAC	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,6:18,4:0,2
chr16	30244853	.	A	AT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.024615;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,9:28,7:5,2
chr16	30327682	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0022268;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:13,8:12,13
chr16	31027172	.	ATT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,2:5,4
chr16	31660065	.	T	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=4.4711e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:24,33:14,18:10,15
chr16	32431415	.	C	CA	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.0046163;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:77,9:36,3:41,6
chr16	32432148	.	CTATTTT	C	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.043374;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:57,14:22,2:35,12
chr16	32742591	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.011783;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:3,2:6,3
chr16	32806184	.	C	A	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.037006;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:123,15:61,11:62,4
chr16	32828383	.	A	G	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.0064393;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:79,18:33,11:46,7
chr16	32840133	.	T	C	0	PASS	DP=508;GPV=1;SPV=0.033921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:283:248,35:118,22:130,13
chr16	32840428	.	A	G	0	PASS	DP=331;GPV=1;SPV=0.0037718;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:149,32:56,7:93,25
chr16	32924356	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,1:5,3
chr16	33066992	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.03297;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:11,2:13,4
chr16	33336271	.	G	C	0	PASS	DP=248;GPV=1;SPV=0.025434;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:133,22:74,15:59,7
chr16	33337167	.	T	C	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.026253;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:91,13:43,5:48,8
chr16	33573794	.	C	T	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=4.2437e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:48,26:24,15:24,11
chr16	33733280	.	AC	A	0	PASS	DP=349;GPV=1;SPV=0.015777;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:153,21:81,11:72,10
chr16	33737560	.	G	T	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.025573;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:137,20:45,8:92,12
chr16	33913297	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=7.4607e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:13,10:12,5
chr16	34641277	.	T	TA	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.031989;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,7:31,2:16,5
chr16	34641305	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.015177;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:52,6:30,2:22,4
chr16	34790316	.	A	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.046508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:48,14:26,10:22,4
chr16	34805509	.	G	A	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.0039048;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:83,13:61,9:22,4
chr16	36108857	.	A	G	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.046237;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:48,6:22,1:26,5
chr16	36121348	.	C	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.039594;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:73,12:30,4:43,8
chr16	36122861	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.0806e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:14,7:8,7
chr16	37816259	.	A	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,1:3,3
chr16	37852203	.	G	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.006543;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:17,7:30,1
chr16	37852518	.	C	G	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.028777;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:94,14:13,5:81,9
chr16	38280337	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0076646;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:3,4:30,8
chr16	47102417	.	A	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=1.0295e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:23,25:11,14:12,11
chr16	48737570	.	T	TACAC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0088657;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,11:9,5:9,6
chr16	48805638	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.026903;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,7:10,6:5,1
chr16	50116900	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:9,4:4,2
chr16	50761746	.	A	ATATCTATCTATCTATC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:9,7:10,3
chr16	51523034	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.9184e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:5,9:7,6
chr16	52660470	.	TAAAAAAA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,4:5,3
chr16	52804555	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=1.6121e-06;SS=2;SSC=57;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,13:2,6:2,7
chr16	52991588	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.052719;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:17,3:10,2
chr16	54702775	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.059571;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:13,6:4,2
chr16	57030466	.	GAAAA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,4:13,2:5,2
chr16	57899327	.	A	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=2.0528e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:25,27:15,18:10,9
chr16	57973361	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015475;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,6:7,3
chr16	58478403	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.020668;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,4:7,1:4,3
chr16	59284332	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.107e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:11,10:12,12
chr16	59666520	.	T	TAC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.01056;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:14,9:7,5
chr16	60238853	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=6.2662e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,4:7,7
chr16	62126371	.	ATATATTCAG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.044477;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,2:5,2
chr16	62471538	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.1631e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:14,9:10,9
chr16	63421692	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:38:0,2:0,0:0,2
chr16	64312021	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,4:6,1
chr16	65648766	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:3,3:2,2:1,1
chr16	65690848	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.055194;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,4:8,1
chr16	66861200	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.047776;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:22,6:4,5
chr16	66970863	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.6406e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:12,9:14,5
chr16	68532521	.	CTGTGTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0038666;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:12,7:10,7
chr16	68583454	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,8:0,7:3,1
chr16	68922027	.	TA	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.5648e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:15,7:14,7
chr16	69511409	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10559;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:12,1:20,3
chr16	69665646	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.098151;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:7,2:15,4
chr16	70090016	.	A	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.04939;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:18,4:18,4
chr16	70125552	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.050318;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,6:19,5:7,1
chr16	70187410	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.048775;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,5:15,1:17,4
chr16	70188113	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.022677;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:11,3:14,3
chr16	70532357	.	C	CAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,7:9,4:15,3
chr16	70902823	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,4:4,3:4,1
chr16	70937669	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,8:5,2
chr16	71031199	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.006391;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:3,4:5,1
chr16	71092724	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017327;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,2:7,7
chr16	71382155	.	A	AAGGAAGGAAGGAAGGAAG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.033431;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,6:10,5:5,1
chr16	72195980	.	AATGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.093861;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,1:16,3
chr16	72323845	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.029259;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,7:13,6:6,1
chr16	73155180	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:20,4:3,1
chr16	73346634	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=4.699e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:19,26:12,16:7,10
chr16	73534743	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.0995e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:7,9:8,7
chr16	73606180	.	TAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,2:5,2
chr16	74109717	.	ATTTAAT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075047;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:15,1:13,4
chr16	74138987	.	T	TACAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,8:4,6:1,2
chr16	74512160	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.028446;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:6,8:16,2
chr16	74882807	.	CAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:8,5:3,1
chr16	75438992	.	C	CTT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.037457;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,9:13,8:4,1
chr16	76056284	.	CT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00084999;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:10,7:12,4
chr16	76092653	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.4245e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:10,7:10,8
chr16	76518615	.	T	TG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,4:9,1:8,3
chr16	76974053	.	A	AT	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=8.9816e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,19:20,11:7,8
chr16	77910158	.	A	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.6041e-09;SS=2;SSC=87;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:20,26:15,11:5,15
chr16	78229508	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.005531;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:9,5:14,4
chr16	78991600	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:7,9:4,1
chr16	80723975	.	G	GAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.025116;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,9:10,5:7,4
chr16	81159638	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=1.1066e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:31,28:21,19:10,9
chr16	82901364	.	GTGTC	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.040194;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:15,7:13,6
chr16	83000574	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027005;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:8,5:5,5
chr16	83191464	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,3:8,1
chr16	83201744	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0017626;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:11,4:7,4
chr16	83334363	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.19386;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:19,3:16,1
chr16	83405655	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00046557;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:20,7:18,7
chr16	83443717	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATAT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,15:4,7:4,8
chr16	83460982	.	A	AACAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,8:7,6:1,2
chr16	83843818	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:21,2:14,2
chr16	85387996	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,5:1,4:5,1
chr16	85443982	.	C	CTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.043512;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:1,3:2,2
chr16	86040590	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
chr16	86108465	.	TTAC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06862;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:16,3:8,4
chr16	86421862	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:15,5:7,1
chr16	86470758	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,9:7,8:3,1
chr16	86720545	.	T	TCTCTCTCTCACACACACACACACACA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.031293;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,8:20,2:6,6
chr16	87814170	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,5:1,1
chr16	88590564	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,5:6,1
chr16	89634087	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0055698;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:9,4:5,7
chr17	118657	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.04316;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:21,2:14,12
chr17	218207	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.035018;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,5:17,5
chr17	232829	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,9:9,6:4,3
chr17	234083	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:1,4:8,1
chr17	242763	.	A	AC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15472;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:9,2:19,3
chr17	489078	.	T	TG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:9,3:1,3
chr17	643595	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0016056;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:19,12:0,6
chr17	724675	.	TA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,2:1,2:0,0
chr17	790918	.	C	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,2:3,1:2,1
chr17	994181	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:1,1:8,3
chr17	1121543	.	TC	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.033085;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:17,4:24,2
chr17	1164351	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.03797;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:23,2:5,5
chr17	1404055	.	GAGAGGGC	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.01571;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,16:12,9:14,7
chr17	1427030	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:7,3:5,3
chr17	1563700	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00066955;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,10:1,7:3,3
chr17	1961983	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0070131;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,10:8,8:3,2
chr17	1964788	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.00011908;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,8:0,6:1,2
chr17	2352775	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,4:12,2
chr17	2778007	.	T	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:6,6:2,1
chr17	2889889	.	A	ATATATATATTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,5:8,4:6,1
chr17	3240047	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.018621;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:15,5:6,6
chr17	3649451	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0056346;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:7,8:4,4
chr17	3966363	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,4:4,2
chr17	4564645	.	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:2,1:10,4
chr17	4715726	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.083573;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:16,5:13,2
chr17	4999797	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.0006e-10;SS=2;SSC=95;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:21,29:14,18:7,11
chr17	5098508	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,2:10,3
chr17	7005474	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,4:3,1
chr17	7664407	.	CT	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.041463;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:7,4:21,2
chr17	8020089	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.22175;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:8,3:9,2
chr17	8044105	.	G	GAGGAAGGA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:8,3:6,1
chr17	9113937	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.884e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:8,10:10,6
chr17	9887384	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=3.7963e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:32,22:18,16:14,6
chr17	10162066	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.18543;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,5:21,4:6,1
chr17	10846696	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,3:7,1
chr17	11200174	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.0799e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:12,10:13,4
chr17	11435295	.	A	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=9.1893e-11;SS=2;SSC=100;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:4,13:10,6
chr17	12743486	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,4:2,1
chr17	12807119	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.0952e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:6,7:11,11
chr17	13396594	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.22913;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,2:11,2
chr17	14522470	.	GA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,5:4,1
chr17	14950148	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0029865;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,14:13,9:5,5
chr17	15317992	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.022727;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:8,1:5,4
chr17	18608787	.	C	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.018744;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:47,18:24,7:23,11
chr17	18687312	.	T	TC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:4,2:9,4
chr17	18717186	.	A	ATG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,9:5,1:6,8
chr17	19587866	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.1063;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:24,2:19,3
chr17	19951263	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.025931;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,5:5,1
chr17	20144182	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022163;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,6:4,1
chr17	20780985	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.037131;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:17,7:11,2:6,5
chr17	21324903	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.038797;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:19,6:23,5
chr17	21356979	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00014725;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:8,4:12,11
chr17	21694470	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.050308;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:22,5:21,1
chr17	21754166	.	A	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.043039;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:17,5:19,7
chr17	21776339	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:4,2:2,1:2,1
chr17	21987969	.	GTAATGTAATA	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.013655;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,12:12,5:19,7
chr17	22855727	.	G	A	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.041915;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:133,15:56,4:77,11
chr17	22930425	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.068138;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:30,4:2,0
chr17	22945311	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.044156;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:15,1:4,4
chr17	23140593	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.10313;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:25,1:0,3
chr17	23145205	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:1,0:14,4
chr17	26578449	.	A	G	0	PASS	DP=302;GPV=1;SPV=0.046444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:131,23:74,12:57,11
chr17	26597652	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.028065;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:3,3:34,6
chr17	26750493	.	CA	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.035593;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:22,5:12,4
chr17	26950327	.	C	A	0	PASS	DP=344;GPV=1;SPV=0.010726;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:151,17:70,11:81,6
chr17	26950336	.	T	C	0	PASS	DP=349;GPV=1;SPV=0.03988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:147,23:72,11:75,12
chr17	26950372	.	G	A	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.0004366;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:142,25:73,16:69,9
chr17	26958530	.	C	A	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.029729;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:93,22:43,10:50,12
chr17	26970947	.	C	T	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.041873;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:101,17:41,4:60,13
chr17	27491304	.	GGTGTGTGTGTGT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,8:6,7:5,1
chr17	28503758	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,3:4,1
chr17	28553186	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:13,4:1,0
chr17	29602901	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=4.6208e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:10,12:10,6
chr17	31200443	.	C	CA	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.5306e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:27,22:15,13:12,9
chr17	31451458	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0039984;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:8,6:5,3
chr17	32603522	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0066111;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,9:16,6:2,3
chr17	32632586	.	T	TAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.023915;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,9:14,8:4,1
chr17	32893334	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:14,4:7,3:7,1
chr17	33233620	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=6.4811e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:16,24:7,11:9,13
chr17	33768011	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0041183;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:12,6:7,3
chr17	33857486	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.8997e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,27:11,16:10,11
chr17	34659136	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=1.1879e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:29,26:19,16:10,10
chr17	34912446	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:4,3:3,1
chr17	36163680	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.010382;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:31,3:6,10
chr17	36167665	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.016719;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:41,11:40,8:1,3
chr17	36176137	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,1:9,3
chr17	36208207	.	T	TTATATATA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034394;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,5:10,2
chr17	36254409	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,3:2,1
chr17	36337263	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.022245;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:18,6:2,1
chr17	36350885	.	C	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.005383;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:61,22:36,11:25,11
chr17	36448257	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.6735e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,12:8,4
chr17	36789051	.	CTG	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016895;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,2:11,3
chr17	36789063	.	C	CTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0088503;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:12,2:9,5
chr17	36854288	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,8:6,6:2,2
chr17	36877008	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.041497;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,5:8,3
chr17	37403368	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.00028635;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:5,9:0,1
chr17	37951297	.	TAA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0011038;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,10:4,2:7,8
chr17	38192668	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,0:11,4
chr17	39037193	.	A	AC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0019978;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:13,6:5,7
chr17	41301085	.	CA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.015698;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:11,18:8,16:3,2
chr17	41364916	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=2.876e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:29,30:13,20:16,10
chr17	41561112	.	T	TAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:5,6:2,1
chr17	43349954	.	ATCC	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.0124e-05;SS=2;SSC=49;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:14,9:15,7
chr17	43404625	.	TA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039921;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,3:5,4
chr17	44062221	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0061699;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,9:12,8:3,1
chr17	45586178	.	C	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.026276;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:67,11:24,3:43,8
chr17	45587450	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:2,3:7,1
chr17	45835683	.	T	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=3.9119e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:35,35:17,13:18,22
chr17	46096153	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.013354;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:5,3:15,6
chr17	46198422	.	TAAA	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.056363;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,8:19,7:9,1
chr17	46245801	.	AG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.26796;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:29,3:7,1
chr17	46298641	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,7:3,1
chr17	46693693	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.04952;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:1,2:16,6
chr17	46900162	.	CATATACATATAT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.29464;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,5:3,3:5,2
chr17	47340766	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,2:8,4
chr17	47653271	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030401;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,4:9,4
chr17	48069374	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=8.4582e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:10,11:12,12
chr17	48976580	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.010284;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:18,4:16,3
chr17	49163751	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00034194;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,9:9,2
chr17	49288055	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.083772;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,7:10,6:5,1
chr17	49347740	.	G	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,3:3,1:2,2
chr17	50093976	.	CAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046847;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:9,5:2,1
chr17	50645371	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:6,3:4,1
chr17	50864056	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:3,3:3,3
chr17	50913604	.	TTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1599;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:5,1:14,5
chr17	51026674	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0013501;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,6:6,3
chr17	52259764	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.079656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:6,3:21,1
chr17	53556009	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.4432e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,16:9,8:7,8
chr17	55515086	.	G	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,2:1,2
chr17	57062208	.	T	TG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.064064;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:9,2:22,4
chr17	57083097	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.033188;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:16,4:15,5
chr17	57129427	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:12,7:1,1
chr17	57767301	.	T	TTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:11,1:4,3
chr17	58629217	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=5.2697e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:16,7:10,10
chr17	60978906	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.030816;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:19,1:17,5
chr17	61113793	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
chr17	61670595	.	GAT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.034996;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,6:10,4:4,2
chr17	61940990	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,5:3,3
chr17	62094937	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,5:9,1:9,4
chr17	62820819	.	C	CGTGTGT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:13,13:8,10:5,3
chr17	63500193	.	C	CTTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:8,6:4,2
chr17	63890018	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0086905;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:9,6:9,6
chr17	64360582	.	C	CTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.030329;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:18,7:11,4
chr17	64909760	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.0018344;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:50,24:25,14:25,10
chr17	64932791	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.065677;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:18,4:26,1
chr17	65503063	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00088893;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:9,6:10,6
chr17	66554880	.	C	CTTTTTTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:2,3:2,1
chr17	67391149	.	G	GA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0073681;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,15:11,4:10,11
chr17	68381243	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.5193e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:23,26:11,14:12,12
chr17	68455361	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.001816;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,13:11,12:2,1
chr17	68622246	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.024999;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:3,4:10,2
chr17	69831580	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,2:5,2
chr17	70003024	.	C	CCTTCCTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.2416;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,4:5,2:16,2
chr17	71469205	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.036342;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,4:11,2
chr17	71610436	.	CTA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:1,3:2,4
chr17	71906247	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015516;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:5,2:9,3
chr17	72484836	.	GA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16126;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:9,4:4,1
chr17	72590124	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.038501;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:11,5:7,1
chr17	72809202	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.043736;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:17,2:11,9
chr17	73224263	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,9:3,5:5,4
chr17	73963872	.	T	TAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,3:2,3
chr17	75233385	.	TTCTTTC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.017005;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:7,3:15,14
chr17	75497344	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
chr17	75527167	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0032719;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:10,8:5,5
chr17	75532079	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,4:8,1:10,3
chr17	75630844	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00032421;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,12:12,8:6,4
chr17	76092335	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.6557e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:27,23:14,10:13,13
chr17	76096511	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,8:10,6:3,2
chr17	76600480	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.036e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:14,7:8,9
chr17	77025779	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.472e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:19,24:8,13:11,11
chr17	77485248	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.093318;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:22,4:8,1
chr17	78382636	.	G	GT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,5:3,1
chr17	79030319	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.048447;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,11:15,7:12,4
chr17	80024394	.	GAC	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.022253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:19,5:25,4
chr17	80634716	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,3:2,1
chr17	80750079	.	T	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=2.5245e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:32,27:11,15:21,12
chr17	81125044	.	GTGA	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:10,5:1,3:9,2
chr17	81140904	.	TGGGGCCGTG	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,4:14,3:7,1
chr17	81339604	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.029105;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:22,8:13,6:9,2
chr17	82969411	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:19,1:7,3
chr18	918966	.	C	CT	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.5169e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:17,7:12,8
chr18	1572078	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096176;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:16,3:12,3
chr18	3028219	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00022883;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,10:1,6:4,4
chr18	3422679	.	T	TG	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,4:5,1
chr18	4510860	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1182;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,6:9,5:11,1
chr18	4550743	.	TC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.067259;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,3:13,2
chr18	5541252	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.01776;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,9:18,8:2,1
chr18	6090593	.	TACACACAC	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0029068;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:13,8:10,10
chr18	6594714	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=7.6418e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,19:10,4:9,15
chr18	6841208	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,2:0,0:7,2
chr18	6937623	.	A	AAAATAAATAAAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.011208;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,7:6,3:7,4
chr18	6991389	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,6:2,1
chr18	7269333	.	TAGAG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,5:5,3
chr18	8264794	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.23569;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,5:7,3:8,2
chr18	8488955	.	TTGAATTCTATAAAATGTTCATACCC	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020157;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:11,6:12,6
chr18	9404353	.	A	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:4,3:3,1:1,2
chr18	9444134	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:0,5:0,1:0,4
chr18	9468342	.	CAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.26795;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,6:13,5:4,1
chr18	9912048	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.171e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:29,21:10,13:19,8
chr18	9913971	.	CG	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=1.5311e-09;SS=2;SSC=88;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:29,27:15,13:14,14
chr18	10150832	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10901;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,7:16,2:15,5
chr18	11685540	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.097821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:15,6:4,1
chr18	12461571	.	GTACATACA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.04952;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,3:7,5
chr18	12525276	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:11,8:3,1
chr18	12671637	.	ACTTT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,8:9,3
chr18	13505735	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0093359;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,5:11,6
chr18	14672212	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,1:4,6
chr18	14672475	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
chr18	15392253	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.018528;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:59,8:38,3:21,5
chr18	15410300	.	C	A	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.023883;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:106,20:37,9:69,11
chr18	15469770	.	A	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.024523;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:15,5:28,2
chr18	15479572	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,3:6,1
chr18	15483374	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027668;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,3:0,1
chr18	15520726	.	A	C	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.020742;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:77,10:43,5:34,5
chr18	15580219	.	G	A	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.022036;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:71,10:17,2:54,8
chr18	15584416	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10722;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:17,5:4,1
chr18	15609223	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.044122;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:24,2:10,6
chr18	15637983	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.20188;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:0,0:26,4
chr18	15646675	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,1:6,3
chr18	15649309	.	G	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.037368;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:39,1:2,5
chr18	15666055	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027357;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:5,4:12,1
chr18	15675677	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.033861;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:29,8:9,1
chr18	15703657	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
chr18	15727935	.	A	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,0:13,4
chr18	15737152	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
chr18	15737631	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
chr18	16053308	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.021659;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,4:9,6
chr18	16360743	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:1,1:11,7
chr18	16697190	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
chr18	18318482	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0048811;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:3,3:17,5
chr18	18419373	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:20,7:12,2
chr18	18730629	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
chr18	18892542	.	G	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,1:0,1
chr18	19397249	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:8,1:8,6
chr18	20724838	.	C	G	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.028926;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:106,21:48,8:58,13
chr18	20835814	.	C	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.0060998;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:67,16:40,12:27,4
chr18	22232784	.	CCATA	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.074196;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,5:23,2:18,3
chr18	22425547	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=2.2853e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:0,8:0,7:0,1
chr18	22605099	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=4.8216e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,17:0,7:10,10
chr18	23076959	.	A	ATT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:8,11:6,7:2,4
chr18	23218612	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:6,3:11,1
chr18	23371945	.	T	TG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,8:3,4:3,4
chr18	23455398	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.028534;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:2,1:11,7
chr18	24592034	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.005394;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:10,2:3,8
chr18	26117056	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.8289e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,22:10,15:11,7
chr18	26309245	.	ATTTTTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:6,2:4,2
chr18	26715724	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,5:4,4
chr18	27155106	.	AG	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,2:3,1:2,1
chr18	28947408	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.0855e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:20,24:6,13:14,11
chr18	29511579	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.024272;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:13,5:22,1
chr18	29511757	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0076703;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:12,3:8,4
chr18	30549168	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.5589e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:12,9:9,6
chr18	31121482	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:15,2:12,2
chr18	31459826	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.4255e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:10,6:7,8
chr18	31712287	.	ATTTTTTT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.038078;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:8,4:5,3
chr18	31934960	.	A	AAATAAATT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.1216e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,14:8,7:10,7
chr18	31989079	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,9:3,5:2,4
chr18	32482155	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,7:2,3:1,4
chr18	32874122	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.4103e-10;SS=2;SSC=90;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:14,26:4,10:10,16
chr18	33593258	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,4:8,1
chr18	33719224	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.016636;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:18,3:15,5
chr18	34400477	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.070897;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,2:9,3
chr18	35931434	.	G	GA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
chr18	37385061	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.8286e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:8,6:13,9
chr18	37515175	.	A	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=2.9231e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:28,30:11,13:17,17
chr18	39190202	.	ATCTC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:17,4:4,1
chr18	40103686	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:15,1:8,4
chr18	40957409	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.951e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:12,11:11,7
chr18	46574388	.	T	TACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.046254;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:13,3:9,3
chr18	47967316	.	CTTTCTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:4,5:9,1
chr18	48635327	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,4:4,1
chr18	50449675	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.022974;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:20,2:22,7
chr18	50521728	.	G	GTA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:6,3:4,1
chr18	51406764	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:1,10:1,6:0,4
chr18	52738745	.	G	GT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=2.0088e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:12,12:6,4
chr18	53762026	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,8:6,7:3,1
chr18	53810350	.	G	GTA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:7,4:2,2
chr18	55278562	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.050563;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:23,3:17,3
chr18	55387512	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.8608e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:23,25:8,13:15,12
chr18	56754289	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,3:14,1
chr18	57474702	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=6.3755e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:26,19:14,11:12,8
chr18	57627205	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,9:3,6:8,3
chr18	57761122	.	A	AAT	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,4:18,2:8,2
chr18	59390195	.	ATAT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:8,5:4,2:4,3
chr18	59491827	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.049892;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:19,4:17,1
chr18	59758967	.	T	TACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.04108;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:16,6:4,1
chr18	61136306	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=6.0159e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:11,10:17,9
chr18	61629966	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.1361e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:26,25:16,17:10,8
chr18	62640070	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:11,1:3,3
chr18	63963071	.	CTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0091926;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,11:1,3:14,8
chr18	64148466	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.007e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:18,10:9,14
chr18	65357014	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:4,5:4,1
chr18	65713628	.	AGG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.017739;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:10,5:4,4
chr18	66455795	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0066378;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:4,1:16,6
chr18	68007627	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.01632;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:13,3:13,3
chr18	68199591	.	CT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00029312;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,11:5,8:5,3
chr18	68761432	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=7.8076e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:29,18:13,7:16,11
chr18	70930266	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.025362;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,1:4,6
chr18	71592609	.	C	CAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,5:2,1
chr18	71650624	.	T	TCAACAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.030499;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:20,8:6,4
chr18	72185919	.	T	TA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00094142;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,13:13,8:8,5
chr18	72536935	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00070139;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:14,8:9,7
chr18	73293503	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,10:4,9:2,1
chr18	74569060	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.3533e-10;SS=2;SSC=96;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:17,25:8,9:9,16
chr18	75999618	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=9.5082e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:12,14:11,4
chr18	76611977	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.075;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:25,3:21,1:4,2
chr18	76641242	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.047546;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:16,4:16,4
chr18	76642774	.	T	TTTATTATTA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0059827;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,11:5,6:8,5
chr18	77624277	.	TAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:6,3:4,2
chr18	78321767	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.0069e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:20,23:11,10:9,13
chr18	78416496	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.011905;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:34:0,3:0,2:0,1
chr18	78599589	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.8873e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:24,26:8,11:16,15
chr18	78917262	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,1:11,3
chr18	78953544	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.015361;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:16,5:19,3
chr18	78953545	.	A	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.043461;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:15,6:22,3
chr18	78995311	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=3.1431e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:13,8:12,13
chr18	79482090	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:0,5:4,3
chr18	79828951	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0046784;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:4,6:2,5
chr18	79831580	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0065388;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,6:4,2
chr19	108091	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00060516;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:10,11:0,1
chr19	720442	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0050929;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:15,3:6,12
chr19	760364	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.065471;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,4:4,3
chr19	1280915	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=3.4904e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:17,8:15,7
chr19	1290639	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=3.4855e-12;SS=2;SSC=114;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:19,26:12,16:7,10
chr19	1538695	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,5:3,3:2,2
chr19	1727959	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0017573;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:31,19:14,13:17,6
chr19	2683486	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=8.8646e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:7,9:14,4
chr19	3169661	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,3:1,1
chr19	3299611	.	T	TTTC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.021189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,9:5,4:9,5
chr19	3354209	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
chr19	3385570	.	GTTGT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0097821;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,6:5,1
chr19	3719982	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0006045;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:6,2:15,7
chr19	4043725	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,2:0,0:7,2
chr19	5057705	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.0971e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:12,9:5,11
chr19	5162315	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.7433e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:13,10:14,9
chr19	6235148	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=9.3033e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:15,9:10,10
chr19	6814667	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016212;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:6,2:12,6
chr19	7060204	.	T	C	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.039151;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:94,19:44,9:50,10
chr19	7202996	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,8:2,7:4,1
chr19	7229324	.	G	GGATA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,6:6,4:1,2
chr19	7457353	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,6:4,1
chr19	8037374	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.03876;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,2:12,3
chr19	8331980	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:8,3:4,3
chr19	8767852	.	C	T	0	PASS	DP=503;GPV=1;SPV=0.026761;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:285:243,42:131,22:112,20
chr19	8777797	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.2538;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:1,0:21,4
chr19	8781025	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:16,4:0,0
chr19	8988006	.	ATT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:6,3:10,2
chr19	9938034	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,3:4,1
chr19	10190765	.	AAAAATAAAAT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.038795;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:9,4:11,4
chr19	12845411	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.015249;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:12,9:4,1
chr19	12981782	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.019439;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,2:7,4
chr19	13198576	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,5:2,2:2,3
chr19	13260331	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.33319;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,4:11,2:15,2
chr19	14314098	.	A	ACACACACAGTTTCACATTCACACCCCATACGCT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,3:5,4
chr19	14759502	.	TA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,3:12,1
chr19	14866670	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,10:11,9:1,1
chr19	15011734	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0087248;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,11:14,9:4,2
chr19	15595616	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.007e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:13,13:14,11
chr19	16341955	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0060117;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,14:8,12:9,2
chr19	16352764	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
chr19	16432591	.	TACAAATAC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,4:8,2:7,2
chr19	16474897	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0083443;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,13:11,9:8,4
chr19	16767167	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:6,7:2,2
chr19	16888396	.	G	GTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.071753;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,3:9,1
chr19	16901298	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=5.3362e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:32,34:20,17:12,17
chr19	17430632	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0069381;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:3,5:9,3
chr19	17430636	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,3:10,3
chr19	17584067	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.5999e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:15,10:7,6
chr19	17918501	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,3:10,1
chr19	18529091	.	C	CAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.013698;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:12,5:5,4
chr19	18936313	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0040291;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:11,4:6,3
chr19	18960837	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02037;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,5:3,3:6,2
chr19	19687492	.	AATATTTATCTATTACATTAATAT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.042521;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,2:10,2
chr19	19790844	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,2:1,1:2,1
chr19	20743548	.	A	AATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:2,3:2,2
chr19	20753022	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.6571e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:30,25:13,12:17,13
chr19	21011659	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00095261;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,9:1,6:1,3
chr19	22040397	.	G	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=3.3634e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:32,29:20,20:12,9
chr19	22107631	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.29579;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:11,2:5,1
chr19	22763927	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.046664;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,3:7,4
chr19	22881134	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.037585;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,9:6,4:11,5
chr19	23004422	.	T	TAAAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:8,3:7,2
chr19	26881424	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:3,1:6,3
chr19	27440028	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=2.6364e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:14,10:6,8
chr19	27605591	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=7.5907e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,20:15,9:15,11
chr19	29059312	.	TC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
chr19	29646926	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
chr19	29744609	.	AC	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.04115;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:17,4:17,1
chr19	30271299	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:7,3:6,2
chr19	31226977	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:10,3:2,3
chr19	31958446	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.086635;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,4:11,1
chr19	32019272	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,4:10,2:5,2
chr19	32190561	.	G	GTCTCTC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0089185;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,9:7,3:10,6
chr19	32515023	.	C	CT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.035232;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:21,10:8,4
chr19	33851187	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0024472;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:8,6:5,4
chr19	35374030	.	AGAAGGAAGGAAGGAAG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,6:8,3:4,3
chr19	35973022	.	AACACAC	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,10:11,5:7,5
chr19	36391473	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,5:9,3:4,2
chr19	37269045	.	T	TC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,4:10,1
chr19	37289000	.	G	C	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.016422;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:120,24:71,9:49,15
chr19	37857275	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:37:1,4:0,2:1,2
chr19	38138910	.	A	AAAAAAAAAAAAACAAAAAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,4:5,2:9,2
chr19	38920950	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,5:9,3:10,2
chr19	39512009	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,3:5,1
chr19	39775772	.	C	CAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,6:3,5:1,1
chr19	40163148	.	CGT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:1,3:5,3
chr19	40692926	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=5.174e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:16,8:9,5
chr19	40785791	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=6.3605e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:25,23:16,13:9,10
chr19	40834261	.	CCCAGCTACTCGGG	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0011495;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:14,7:13,6
chr19	40834276	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00035192;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:14,7:9,6
chr19	40834279	.	TGAG	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00057944;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:14,7:10,5
chr19	40845531	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.1529e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:11,10:13,10
chr19	43155799	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040508;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,7:5,1
chr19	43440230	.	TA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,4:8,1
chr19	44180086	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,6:9,1
chr19	44532564	.	GA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,7:4,5:0,2
chr19	45021573	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:4,3:11,2
chr19	45477031	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0016292;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,10:9,9:8,1
chr19	46406261	.	CTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.009224;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,10:6,5:4,5
chr19	46668014	.	CAAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0058774;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:8,9:4,2
chr19	47265987	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
chr19	47645942	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=6.6772e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:24,27:14,14:10,13
chr19	47731785	.	A	AT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=8.0727e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,14:11,10:8,4
chr19	47748446	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00041185;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:12,4:20,8
chr19	47774924	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.019715;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:10,5:9,4
chr19	47824990	.	A	ATT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,6:14,3:4,3
chr19	47987760	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=4.9568e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,20:8,9:5,11
chr19	48028497	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:3,6:3,3
chr19	49346182	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.062847;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:9,5:20,1
chr19	49410486	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:8,8:2,4
chr19	49885451	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,2:3,1:4,1
chr19	50078405	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,2:2,1:5,1
chr19	50182988	.	T	TTCCCTCCCTCCC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:0,0:8,4
chr19	50520630	.	G	GA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0061831;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,11:10,8:5,3
chr19	50816955	.	T	TAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.090923;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,3:8,3
chr19	50937767	.	CTCCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.036807;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:7,3:16,4
chr19	51189641	.	T	TATATATATATATATATAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,4:7,2:5,2
chr19	51714695	.	T	TAAAAAAA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,5:3,3:0,2
chr19	51795508	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,3:4,4
chr19	53916342	.	GGTACCAAGGCCCAGAATTGCATAGAGAGTTGCCCATAA	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.033591;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:16,5:15,5
chr19	53924195	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:3,7:5,6
chr19	54002284	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.025884;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:13,4:7,9
chr19	54012556	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=8.4872e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:9,9:4,7
chr19	54848277	.	G	C	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.00012294;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:68,18:27,8:41,10
chr19	54995148	.	T	TA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,7:4,3
chr19	55033047	.	CGTGTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.074501;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:3,4:11,3
chr19	55547071	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:21,2:5,2
chr19	55953792	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
chr19	55962955	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.9149e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:16,12:11,8
chr19	56216585	.	CTTCCTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
chr19	56710871	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.5354e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,20:15,12:13,8
chr19	57505106	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.040948;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:10,4:23,2
chr19	58119844	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.011327;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:6,4:10,5
chr2	837627	.	G	GTGTATATATATATA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.079204;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,6:13,4:14,2
chr2	914985	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.011343;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:5,8:9,2
chr2	1009653	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046139;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:13,2:6,4
chr2	1009654	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:13,2:4,2
chr2	1279081	.	CCT	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.13146;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:20,2:17,3
chr2	1279091	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.14299;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:20,2:17,3
chr2	1387475	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.046e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,20:12,8:16,12
chr2	1480776	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.048386;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:17,2:7,4
chr2	2034291	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.21569;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:1,2:18,1
chr2	2716686	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,3:12,1
chr2	3032681	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.7895e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:29,17:12,4:17,13
chr2	3075648	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.020447;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,12:11,10:4,2
chr2	3531025	.	G	GTAT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.025567;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,11:19,8:9,3
chr2	3550142	.	T	TAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.059881;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:8,2:7,4
chr2	4260644	.	TTA	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0087152;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:14,3:11,4
chr2	4260661	.	TTA	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.059705;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,4:11,1:10,3
chr2	4382243	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.2016e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:26,23:19,11:7,12
chr2	4612518	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.069923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,5:5,3
chr2	5774635	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.7562e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,21:9,12:5,9
chr2	5989357	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.9573e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:18,26:9,15:9,11
chr2	7240598	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,4:2,1:6,3
chr2	7937979	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.37283;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,4:8,2:11,2
chr2	7937980	.	TC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.30799;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,4:7,2:11,2
chr2	9183583	.	GA	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.24882;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:29,2:7,2
chr2	9193871	.	TTC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.013481;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:10,2:12,5
chr2	10297146	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:6,3:3,3
chr2	11463263	.	TTAC	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.2213e-05;SS=2;SSC=49;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:28,26:16,12:12,14
chr2	13288665	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:8,10:5,4
chr2	13891576	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
chr2	14159206	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.969e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,16:2,11:12,5
chr2	14686910	.	G	GAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0034481;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,5:4,2
chr2	14843581	.	CA	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.059869;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:28,3:14,2
chr2	14852201	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:6,3:19,1
chr2	15528880	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,2:2,1:4,1
chr2	17622506	.	AAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.35366;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:11,1:16,2
chr2	21808890	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.3942e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,23:9,9:3,14
chr2	21816173	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0030632;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:4,7:3,5
chr2	23120689	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0071577;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:18,10:13,8:5,2
chr2	23881360	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,5:10,4:2,1
chr2	25098831	.	A	ATT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.025988;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,1:7,6
chr2	26935691	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,9:4,6:1,3
chr2	26943540	.	G	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=7.2192e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,19:10,9:22,10
chr2	27866737	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.5018e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:11,4:9,11
chr2	28100462	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.021382;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,7:16,6:2,1
chr2	28837742	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:3,9:4,2
chr2	28880560	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011765;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:0,3:11,9
chr2	29540592	.	TAAA	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.12341;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,4:13,2:18,2
chr2	30304930	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013014;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,3:3,4
chr2	31190121	.	C	CTTTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,4:9,4
chr2	33064021	.	T	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=9.2047e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:26,21:14,11:12,10
chr2	34482612	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=5.6651e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:12,11:11,11
chr2	35126335	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.002136;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:5,5:16,6
chr2	35865373	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.012866;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:11,7:8,4
chr2	36165831	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.03159;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,6:6,3
chr2	36209313	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,2:11,2
chr2	36715554	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=6.2617e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:9,8:12,12
chr2	43189854	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,14:5,12:4,2
chr2	43272623	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036457;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,5:6,2
chr2	43617891	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0012136;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:7,11:4,2
chr2	43635551	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.03453;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:4,3:19,7
chr2	43971485	.	T	TAAAAAAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:3,3:5,1
chr2	44304813	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.20158;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,5:7,2:6,3
chr2	44974693	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:1,7:5,1
chr2	45689901	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,9:3,6:6,3
chr2	45744576	.	T	TCC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0013497;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,10:6,3:7,7
chr2	46203576	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.19804;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:14,3:4,2
chr2	46285615	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0023325;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,4:9,5
chr2	47393498	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00086667;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:18,8:10,6
chr2	48800016	.	A	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.3321e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:14,5:11,13
chr2	49779401	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.6188e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:10,13:9,5
chr2	49868843	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.6281e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:28,24:15,13:13,11
chr2	50093473	.	G	GA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:5,6:3,3
chr2	50516103	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.8015e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:10,9:15,12
chr2	51495069	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.22807;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:10,4:1,0
chr2	51716479	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,1:3,3
chr2	52782338	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00087744;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:12,2:11,7
chr2	54406048	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=9.7905e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:24,21:12,15:12,6
chr2	55597623	.	A	AAAACAAAC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.021526;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,13:12,8:14,5
chr2	55619937	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:8,4:4,2
chr2	56519661	.	C	CAT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.13128;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,5:13,3:14,2
chr2	56976616	.	AT	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.086e-06;SS=2;SSC=56;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:14,9:9,10
chr2	57330546	.	G	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,7:6,4
chr2	59081779	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.028868;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:15,1:19,6
chr2	59382419	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,4:6,1
chr2	60208082	.	TC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,1:15,3
chr2	60851863	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.095238;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:3,2:2,1:1,1
chr2	61515938	.	C	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,5:1,3:2,2
chr2	61515940	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,7:2,3:3,4
chr2	61799695	.	A	AAAAAAAAT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:3,1:2,3
chr2	62629632	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:8,3:2,1
chr2	63204336	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,4:5,2
chr2	63338569	.	AATATAT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:0,1:4,1
chr2	63686847	.	AGTGCTGAAAAAACTGTATATCCATATTCAGATCCACATTCT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.036677;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:12,3:16,2
chr2	63951206	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.035026;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,5:14,4
chr2	64025689	.	TTATATATATATATATATATATATA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0091605;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:5,4:11,2
chr2	64191486	.	CCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018961;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:3,5:14,3
chr2	64273188	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.048554;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,6:11,4:10,2
chr2	64376031	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.13783;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:19,1:13,4
chr2	64376137	.	T	TACC	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.13649;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,5:18,4:24,1
chr2	65119842	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,4:4,1:9,3
chr2	65600861	.	C	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,2:5,2
chr2	66775102	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022424;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:8,5:12,4
chr2	67582657	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.030178;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,15:12,6:6,9
chr2	68991108	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,3:11,1
chr2	68991113	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,3:13,1
chr2	68998749	.	AGAGATAGAGAGAGG	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0028455;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:10,7:5,3
chr2	69433085	.	GGTTGCAGTGAGCCGAGATC	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00053043;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,14:1,2:7,12
chr2	69662992	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.014049;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,4:2,1
chr2	69924748	.	CT	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=5.5219e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:20,9:7,9
chr2	69924750	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=4.2622e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:15,9:8,11
chr2	69941863	.	TAC	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.057534;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,2:20,2
chr2	70056604	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:3,8:1,5:2,3
chr2	70128634	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0057892;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:12,7:8,1
chr2	70197453	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:6,2:8,2
chr2	70338595	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:5,2:2,1:3,1
chr2	71441110	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:3,3:5,1
chr2	72542962	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.9601e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:9,10:12,5
chr2	73047219	.	TAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,3:10,1
chr2	73978483	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.5589e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:8,6:13,9
chr2	74474791	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=1.7519e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:32,26:17,9:15,17
chr2	76332700	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr2	77721081	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.9327e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:27,26:13,14:14,12
chr2	77866354	.	TA	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00022812;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:16,3:17,10
chr2	77955960	.	ATCT	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.8089e-06;SS=2;SSC=57;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:13,8:10,9
chr2	77955964	.	A	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.6545e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:13,9:11,7
chr2	80075621	.	T	TTATAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15021;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,5:3,1:5,4
chr2	80123447	.	G	GA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0087276;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:10,8:1,1
chr2	80192627	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00016426;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:13,7:8,5
chr2	80192628	.	GCGATTCTC	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00038475;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:15,6:8,5
chr2	80832317	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,7:7,6:2,1
chr2	80857039	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.6156e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:10,10:12,9
chr2	81034978	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=4.405e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:16,7:8,15
chr2	81962147	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,3:2,1
chr2	82952571	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.5282e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:5,9:19,13
chr2	83217571	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:5,8:3,3:2,5
chr2	84598187	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:8,1:15,3
chr2	85298191	.	C	CAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.010101;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,4:0,4:0,0
chr2	85329996	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.032284;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,7:7,6:5,1
chr2	85364804	.	C	CAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:1,3:3,1
chr2	86041192	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,5:6,1:8,4
chr2	86217684	.	T	TTTTTTTTTTC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,4:11,1:12,3
chr2	87345542	.	G	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.019537;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:15,4:7,7
chr2	87366406	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.069853;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:13,3:4,2
chr2	87386273	.	T	A	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.032113;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:99,24:43,14:56,10
chr2	87395392	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.011049;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:15,3:15,5
chr2	87405081	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0052983;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,13:19,9:23,4
chr2	87414607	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.13285;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:23,3:9,4
chr2	87415391	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10396;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:18,3:7,2
chr2	87419569	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,1:15,3
chr2	87515462	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.032693;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:17,4:16,2
chr2	87551150	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.013346;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:9,5:10,8
chr2	87650939	.	T	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
chr2	87737292	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.043188;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:6,3:17,7
chr2	87865551	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.030755;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:10,3:14,7
chr2	87960257	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0044438;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:8,7:13,8
chr2	88463345	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:13,3:0,1
chr2	88487414	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:13,7:5,2
chr2	88625332	.	TACAC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0059827;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,11:5,4:8,7
chr2	89760247	.	C	CTT	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.0026065;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:54,19:30,14:24,5
chr2	89878508	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,3:13,1
chr2	89878509	.	T	TTTAC	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.028145;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:15,3:16,3
chr2	90235961	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.065679;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:22,1:32,5
chr2	90358675	.	C	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.04667;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:17,2:19,7
chr2	90392157	.	T	C	0	PASS	DP=3014;GPV=1;SPV=0.034818;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1677:1439,182:1214,142:225,40
chr2	90397513	.	G	A	0	PASS	DP=3904;GPV=1;SPV=0.018625;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2205:1942,262:1601,221:341,41
chr2	90397514	.	G	A	0	PASS	DP=4009;GPV=1;SPV=0.034286;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2234:1969,263:1596,229:373,34
chr2	90397522	.	T	A	0	PASS	DP=4450;GPV=1;SPV=0.0060816;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2458:2156,300:1717,251:439,49
chr2	91472787	.	TAAA	T	0	PASS	DP=291;GPV=1;SPV=0.031471;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:132,24:72,15:60,9
chr2	91514668	.	G	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.023535;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:57,13:21,5:36,8
chr2	91518504	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.12575;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:19,2:26,4
chr2	91548974	.	A	AAC	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.0099619;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:57,17:23,9:34,8
chr2	91659987	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.032622;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:25,2:30,7
chr2	91675456	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0039629;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:16,5:16,9
chr2	91776604	.	ATG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:5,5:4,3
chr2	91872488	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.022683;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:14,10:18,2
chr2	91988869	.	GAA	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.046336;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,11:17,9:11,2
chr2	92111507	.	C	A	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=2.5363e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:123,19:76,12:47,7
chr2	92199111	.	G	T	0	PASS	DP=334;GPV=1;SPV=0.013223;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:172,20:97,9:75,11
chr2	92233793	.	G	C	0	PASS	DP=355;GPV=1;SPV=0.0015939;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:184:156,28:34,3:122,25
chr2	92272955	.	T	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.15322;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,3:15,2
chr2	92273398	.	A	G	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.017;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:89,10:52,9:37,1
chr2	92308713	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.060821;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:28,1:13,4
chr2	92396225	.	G	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.045403;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,10:6,2:46,8
chr2	92416782	.	C	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.0089064;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:51,9:29,8:22,1
chr2	92421752	.	T	C	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.046042;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:134,16:117,13:17,3
chr2	92426580	.	C	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,3:7,1
chr2	92443667	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.012509;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:16,4:19,5
chr2	92545721	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0080873;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:23,5:19,1
chr2	92551876	.	C	A	0	PASS	DP=464;GPV=1;SPV=0.0081141;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:263:215,48:189,43:26,5
chr2	92588273	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.088876;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:36,2:6,3
chr2	92619739	.	C	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0016152;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:56,14:52,13:4,1
chr2	92620212	.	T	C	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0070779;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:53,10:12,9:41,1
chr2	92622459	.	TC	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.18741;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:33,4:3,0
chr2	92750551	.	G	C	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.043608;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:124,24:70,12:54,12
chr2	92771321	.	C	G	0	PASS	DP=329;GPV=1;SPV=0.0041606;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:152,26:19,5:133,21
chr2	92822653	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20161;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:25,3:3,1
chr2	92866630	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:5,2:10,3
chr2	92930378	.	A	G	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.046865;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:115,15:77,2:38,13
chr2	92995470	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.011605;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:11,3:17,7
chr2	93032963	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:1,4:23,2
chr2	93039274	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0032719;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:6,11:9,2
chr2	93100868	.	A	T	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:91,20:26,5:65,15
chr2	93138680	.	C	A	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.01151;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:90,16:65,11:25,5
chr2	93312547	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.051138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:2,4:16,1
chr2	93641680	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:19,4:0,0
chr2	93753399	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.18072;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:0,0:35,4
chr2	93753410	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.18072;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:0,0:35,4
chr2	93775972	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:2,0:23,4
chr2	94087365	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.01322;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:6,4:31,3
chr2	94145947	.	T	G	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.034765;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:97,19:48,2:49,17
chr2	94271661	.	G	C	0	PASS	DP=295;GPV=1;SPV=0.020189;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:139,18:61,14:78,4
chr2	94287043	.	A	G	0	PASS	DP=315;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:162:144,18:81,6:63,12
chr2	94646732	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,3:8,1
chr2	95791873	.	G	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
chr2	96096278	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:6,6:5,1
chr2	97607287	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,1:6,5
chr2	97923628	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,6:0,4:3,2
chr2	98014637	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026716;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:9,11:8,8
chr2	99074351	.	C	CGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:3,6:3,1
chr2	99534592	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0071032;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,11:3,8:4,3
chr2	100304790	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.080441;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:10,4:13,1
chr2	101600527	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=4.8188e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:10,9:11,6
chr2	101608339	.	TC	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.014944;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:7,5:32,3
chr2	102958979	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0067079;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,10:3,6:0,4
chr2	103589519	.	A	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.0095e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:23,26:12,17:11,9
chr2	103666547	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.7941e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:8,11:15,8
chr2	104002968	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:2,4:2,2
chr2	104916714	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=6.0898e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:13,7:5,7
chr2	105110931	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.015393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:18,5:21,2
chr2	106458682	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.16358;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:17,3:5,1
chr2	107159048	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.03809;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,7:11,1:7,6
chr2	107171493	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,1:9,3
chr2	107629681	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,5:4,4:3,1
chr2	108313079	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.077419;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,2:2,1:5,1
chr2	108509733	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047632;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:13,3:7,4
chr2	110068906	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
chr2	111392237	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.068908;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,3:11,1
chr2	111572997	.	A	AAGGG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:11,4:0,0
chr2	111583445	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0076585;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:6,3:14,9
chr2	111596205	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:11,4:0,2
chr2	111755585	.	GAC	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.060731;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:22,3:12,1
chr2	112132043	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,5:3,4:6,1
chr2	112753526	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:10,6:4,1
chr2	113591192	.	G	C	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.043637;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:94,20:63,15:31,5
chr2	113620330	.	C	CAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,2:3,5
chr2	114371220	.	A	ATAAATATATATTTATATATATTTC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:0,2:0,2:0,0
chr2	114497241	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.021089;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:9,3:6,10
chr2	114697749	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0098611;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:6,7:6,3
chr2	115044355	.	CT	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.7081e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,9:11,6
chr2	115675665	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0040654;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:18,5:18,3
chr2	115827343	.	A	ATG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042462;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:8,5:16,1
chr2	116030269	.	AT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00052096;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,5:8,4
chr2	117508901	.	T	TATAG	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.049895;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:13,1:15,3
chr2	117607686	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.6483e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:10,14:7,4
chr2	118449070	.	C	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.0714e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,22:11,16:11,6
chr2	119876897	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.23776;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,3:8,1
chr2	121278029	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:4,3:3,2
chr2	121854393	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.031253;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,7:11,2:7,5
chr2	123610163	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0011832;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:15,7:0,5
chr2	123749949	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=7.7086e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,14:0,8:5,6
chr2	124149403	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:6,8:1,1
chr2	124320037	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=8.6457e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:30,24:19,14:11,10
chr2	124857550	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.8454e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:15,8:16,7
chr2	125354392	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.1663e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:19,14:7,8
chr2	125595779	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,4:11,2:8,2
chr2	125946992	.	A	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:2,1:8,3
chr2	126264772	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
chr2	126956722	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.2544e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:9,10:15,10
chr2	127788709	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044019;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:23,3:7,4
chr2	127952452	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,2:2,1:2,1
chr2	128766892	.	C	CTTCT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,4:2,1:14,3
chr2	128861947	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,2:14,2
chr2	130064088	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.084679;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,4:12,1
chr2	130090797	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12395;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:14,4:12,1
chr2	130248523	.	G	C	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.032646;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:45,14:22,5:23,9
chr2	130997863	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0020091;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:8,4:11,10
chr2	131112156	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,1:10,3
chr2	131253757	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0088303;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:9,3:5,7
chr2	131531493	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.047994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:11,6:22,2
chr2	132492612	.	ATC	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.20218;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,2:13,2
chr2	133128945	.	ATT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,5:5,3
chr2	133518344	.	A	AT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:4,3:3,1
chr2	134871678	.	G	GACAC	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0032857;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,12:13,8:9,4
chr2	135837613	.	T	TAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,5:5,4:1,1
chr2	136551498	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011208;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,2:5,6
chr2	136964873	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.8207e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:22,24:10,14:12,10
chr2	137200855	.	AGATGGGGACTCCTATGTTGCCCAGACTG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0072786;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,2:11,9
chr2	138858850	.	G	GGTGTGTGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.069102;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:11,3:7,3
chr2	139088395	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=4.6939e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:9,8:12,9
chr2	139966003	.	CATCT	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0068367;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,8:16,4:12,4
chr2	139982211	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.090639;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,3:17,1
chr2	139982216	.	TAC	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.081098;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:17,2:16,2
chr2	140228200	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:4,1:10,3
chr2	140228419	.	AATAT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.026299;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:12,4:5,2
chr2	141840257	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:7,4:1,1
chr2	142162559	.	GA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024305;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:13,7:3,1
chr2	142418880	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,6:8,3:5,3
chr2	144225024	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.3048e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:12,14:14,6
chr2	147731214	.	TA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.030049;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:8,4:12,4
chr2	148294509	.	T	TTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTTTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.094639;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:9,1:8,4
chr2	148667293	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.9466e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,8:8,8
chr2	149507574	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.2798e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:11,9:11,11
chr2	150648952	.	CACACACACAG	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.016864;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,12:11,9:13,3
chr2	151010114	.	TTTATTTTTA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:4,1:12,3
chr2	152383273	.	C	CTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,10:2,8:2,2
chr2	152811407	.	G	GT	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.5471e-07;SS=2;SSC=68;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:10,9:13,11
chr2	154007180	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=7.6126e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:13,10:8,10
chr2	155372561	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:9,3:3,1
chr2	158508389	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,6:5,1:6,5
chr2	158942780	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=7.3933e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:4,9:9,4
chr2	159643876	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01088;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:17,9:4,1
chr2	160120731	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,4:4,6
chr2	161661349	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=6.7963e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:22,25:14,12:8,13
chr2	162345125	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20321;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:15,1:3,2
chr2	162689143	.	C	CTATTATTATTAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.049216;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,6:9,2
chr2	163117432	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:5,3:6,2
chr2	163812960	.	T	TCGCG	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.101;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,1:18,3
chr2	164374846	.	A	ATT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:3,3:2,3
chr2	165398055	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.012505;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:18,8:11,3
chr2	166310918	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.057842;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,2:10,2
chr2	167680549	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021894;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:6,5:15,6
chr2	168520598	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:3,1:6,4
chr2	168739052	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.056741;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,7:7,3:5,4
chr2	168888924	.	CGTGTGT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016449;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,6:8,5
chr2	169361352	.	C	CTCTCTCTG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0071736;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:5,3:23,6
chr2	169463881	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0020358;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:17,4:8,6
chr2	169548420	.	T	TA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00094133;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:15,10:14,9
chr2	170959821	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,8:7,3
chr2	171973400	.	C	CAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0029985;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:8,13:6,9:2,4
chr2	171992121	.	G	GA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.040919;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,9:15,8:4,1
chr2	172107292	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,8:5,2:3,6
chr2	172622674	.	CATATATT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.22736;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,3:17,1
chr2	172622723	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0058029;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:12,8:8,6
chr2	173005520	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:16,3:5,2
chr2	173166910	.	G	GTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.018977;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,11:8,7:5,4
chr2	173657640	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00028276;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:7,6:10,8
chr2	176045337	.	CAA	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0033584;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:13,13:6,3
chr2	177351096	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,2:1,1:0,1
chr2	177495917	.	CAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0012916;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,10:2,8:1,2
chr2	177622392	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=8.1411e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:11,5:9,10
chr2	178747853	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=9.3895e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,22:12,13:13,9
chr2	180013868	.	G	GTT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0039979;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,14:13,7:13,7
chr2	181677112	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,1:2,3
chr2	181948670	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,1:14,3
chr2	182972246	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,3:2,2:3,1
chr2	183144629	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.1861e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,22:10,10:6,12
chr2	183283891	.	CTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTCTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,5:0,2:4,3
chr2	183644763	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.4703e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:9,9:9,6
chr2	184213659	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,2:5,1:0,1
chr2	184531464	.	GAT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.013487;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,4:7,2
chr2	186276309	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.2056e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:15,7:10,9
chr2	187053684	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00027216;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:13,6:10,13
chr2	187117005	.	AT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.02948;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,7:7,6:6,1
chr2	187261193	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:5,9:4,4
chr2	187358530	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:2,3:7,1
chr2	188931860	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=6.3838e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:9,5:13,12
chr2	189670190	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.019042;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:9,9:5,1
chr2	189714972	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,2:2,1:3,1
chr2	190823113	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,1:11,3
chr2	190972816	.	G	GGT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0042171;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,13:10,7:10,6
chr2	191017618	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.056479;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,6:21,1:26,5
chr2	192995417	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:4,2:2,1:2,1
chr2	194048674	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.072536;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:16,4:8,4
chr2	194491933	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,2:16,2
chr2	196991764	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:3,2:2,1:1,1
chr2	197034050	.	T	TAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,11:8,8:3,3
chr2	197145312	.	TA	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.027216;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:17,2:16,4
chr2	197608623	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011224;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,16:4,11:6,5
chr2	197922935	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:9,4:4,3
chr2	198732500	.	AT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00020368;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,12:13,6:8,6
chr2	198811945	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
chr2	199109602	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=9.3322e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:15,9:11,4
chr2	199355348	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00077002;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:32:1,11:1,4:0,7
chr2	199489596	.	CTT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10396;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,2:14,3
chr2	200803621	.	T	TACACACACACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0030624;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:7,4:12,6
chr2	201409279	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00051722;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:15,8:5,5
chr2	202405687	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,9:4,7:4,2
chr2	202803400	.	CAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,8:2,7:6,1
chr2	202836812	.	TATAG	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.21643;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:20,1:14,3
chr2	202836818	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.27503;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,5:17,2:14,3
chr2	202885308	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=6.4027e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:12,7:9,10
chr2	205017666	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.2813e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,22:12,13:13,9
chr2	205037381	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.036704;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,3:13,1
chr2	205127296	.	C	CAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018809;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,8:13,6:6,2
chr2	205188782	.	TC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.16171;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:18,1:9,3
chr2	205413674	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.1625e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:13,13:11,9
chr2	205567304	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,5:3,1
chr2	207009049	.	AGT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:13,14:7,8:6,6
chr2	207409313	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,2:7,1:0,1
chr2	207679413	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=4.1304e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:20,22:10,10:10,12
chr2	208100923	.	GTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,6:5,2
chr2	208103138	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014419;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:11,7:9,1
chr2	209164458	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.025393;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,7:8,1
chr2	210451039	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.9457e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:23,24:9,12:14,12
chr2	210497893	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,10:2,9:2,1
chr2	211856366	.	C	CTATTTATTTATT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033424;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,13:17,7:11,6
chr2	214511921	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,6:9,5:7,1
chr2	215015169	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.03569;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,4:7,3:9,1
chr2	217295628	.	T	TA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:4,4:2,2
chr2	218202779	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0062663;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:11,8:5,2
chr2	218408723	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:2,3:1,1:1,2
chr2	220020588	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.024817;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:10,5:12,2
chr2	220818415	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.058162;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,4:4,2:9,2
chr2	223426084	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,7:3,6:1,1
chr2	223579690	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.5018e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:8,7:12,8
chr2	223832135	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.01205;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:9,17:4,10:5,7
chr2	225053895	.	A	ATATATTTTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.026055;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,8:9,4:10,4
chr2	225204909	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:5,1:6,4
chr2	227599021	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.067259;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,3:14,2
chr2	227656632	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.024543;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:18,2:19,8
chr2	228461502	.	TTG	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00082127;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,4:11,6
chr2	229668522	.	GTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:1,4:6,2
chr2	231451014	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,6:2,1:2,5
chr2	231826069	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.19378;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:5,1:15,2
chr2	231828108	.	C	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
chr2	231830216	.	AG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.12376;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:16,1:7,5
chr2	231847018	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.32176;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,1:12,3
chr2	231940065	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00793;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:5,7:8,2
chr2	232694003	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,7:6,1
chr2	232734109	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:3,6:4,1
chr2	233218804	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=8.6672e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:17,22:9,11:8,11
chr2	233567231	.	T	G	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.043553;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:65,16:29,9:36,7
chr2	234408303	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,3:5,1
chr2	236344992	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.069887;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:21,2:23,3
chr2	238196072	.	T	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,1:2,4
chr2	240284281	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.2998e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:13,8:9,11
chr2	240850366	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.037048;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:28,5:15,1
chr2	240881091	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.9498e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:8,7:10,8
chr2	241338945	.	TTA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,3:1,2
chr2	241338962	.	A	AT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,3:3,3
chr2	241338967	.	AAATAT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,3:4,2
chr2	242181823	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.049592;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:20,6:17,1
chr2	242182971	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,2:8,2
chr20	833025	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03726;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:5,2:10,5
chr20	1559135	.	G	GTATATATATATA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.062277;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,5:16,2:8,3
chr20	3696133	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.10963;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:17,4:25,1
chr20	3746301	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:3,3:5,1
chr20	3818084	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.10288;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,8:8,6:6,2
chr20	3887307	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.050247;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,1:17,3
chr20	5479327	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.8644e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:12,7:8,6
chr20	5542922	.	AGT	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.063538;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:48,6:29,2:19,4
chr20	5542926	.	AT	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.045288;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:26,2:15,4
chr20	5701011	.	ACCTGGAATCATTCAACAGTGAAAACCTATGAACTTTATTTACT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.063391;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:6,1:18,5
chr20	5871836	.	GGAA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
chr20	6198774	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.5855e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:11,5:9,13
chr20	7224002	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14559;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:8,3:4,2
chr20	8704984	.	C	CTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.011868;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,10:1,9:3,1
chr20	9203777	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,6:4,4
chr20	10453318	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.036717;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:18,3:14,5
chr20	11100141	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=2.1422e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:36,21:23,13:13,8
chr20	12653895	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.423e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:25,27:14,12:11,15
chr20	12963109	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=5.0503e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:20,22:10,13:10,9
chr20	13951296	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:5,3:13,1
chr20	14210364	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.7288e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:15,9:9,6
chr20	16200995	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:5,2:5,5
chr20	16259183	.	TC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:5,4:0,1
chr20	16347575	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:19,4:9,1:10,3
chr20	16514585	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.057842;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,4:7,2:5,2
chr20	17335857	.	G	GGTGTGT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00093746;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:14,6:4,6
chr20	17347787	.	CGAAAGAAAGAAAGAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,4:8,3:7,1
chr20	17483028	.	A	ATTT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00016659;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,7:10,4
chr20	17851390	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0061141;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:24,7:12,1
chr20	17851402	.	CT	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.090639;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,4:23,3:11,1
chr20	18054782	.	AG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.07056;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,3:13,1
chr20	18184062	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=8.9729e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:25,23:12,13:13,10
chr20	18250697	.	TAA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.060214;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:17,3:9,1
chr20	18579211	.	GTTTTTT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.079329;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,6:8,4:2,2
chr20	19116484	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,5:4,1
chr20	19147598	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:13,5:2,1
chr20	19187357	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00031092;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:16,4:14,10
chr20	19322981	.	C	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.8934e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:26,24:18,16:8,8
chr20	19513736	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.045605;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:10,7:11,3
chr20	19696971	.	AAGGGAGGGAGGG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:8,5:1,2
chr20	21012812	.	C	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=5.4427e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:31,27:11,11:20,16
chr20	22836039	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.1617e-10;SS=2;SSC=96;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,20:3,5:10,15
chr20	23803669	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:1,1:4,1
chr20	26270392	.	C	CA	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.037417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:22,1:19,7
chr20	26441655	.	C	A	0	PASS	DP=708;GPV=1;SPV=0.013532;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:420:376,44:161,25:215,19
chr20	26542186	.	A	T	0	PASS	DP=1421;GPV=1;SPV=0.0048167;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:768:678,87:337,50:341,37
chr20	26603057	.	AG	A	0	PASS	DP=252;GPV=1;SPV=0.01924;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:117,23:29,5:88,18
chr20	27655384	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0028871;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,9:25,3:4,6
chr20	27765802	.	C	G	0	PASS	DP=551;GPV=1;SPV=0.021477;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:314:264,50:219,45:45,5
chr20	27962669	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.017734;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:6,4:7,6
chr20	28514774	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14022;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:2,3:20,2
chr20	28516630	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.083817;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:19,2:3,2
chr20	28624228	.	C	T	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.028401;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:189:162,27:97,18:65,9
chr20	28642942	.	A	AAT	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.040321;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:53,10:28,5:25,5
chr20	28777653	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,2:5,3
chr20	28839112	.	G	C	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.015773;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:145,17:139,15:6,2
chr20	28900911	.	C	A	0	PASS	DP=310;GPV=1;SPV=0.038337;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:151,26:68,14:83,12
chr20	28959558	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.048243;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:25,1:11,7
chr20	29030826	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=9.0569e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:11,8:13,11
chr20	29072931	.	G	C	0	PASS	DP=421;GPV=1;SPV=0.020403;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:228:201,27:85,14:116,13
chr20	29222612	.	G	A	0	PASS	DP=235;GPV=1;SPV=0.044307;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:110,23:56,14:54,9
chr20	29242240	.	CA	C	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.037913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:179:155,24:82,7:73,17
chr20	29242274	.	A	C	0	PASS	DP=316;GPV=1;SPV=0.0092047;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:154,24:85,8:69,16
chr20	29508233	.	G	A	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.027818;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:146:130,16:69,9:61,7
chr20	29882272	.	G	A	0	PASS	DP=622;GPV=1;SPV=0.023889;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:350:300,50:118,22:182,28
chr20	29974817	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:8,4:0,5
chr20	29988308	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037959;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:2,3:9,1
chr20	30105925	.	G	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.040005;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:21,2:11,8
chr20	30105984	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.029347;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:22,3:32,3
chr20	30114859	.	TC	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.028807;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:51,16:34,10:17,6
chr20	30258827	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,3:7,1
chr20	30258829	.	T	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:0,3:5,1
chr20	30356428	.	A	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.049484;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:73,12:30,2:43,10
chr20	30394669	.	A	G	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.027216;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:64,17:34,6:30,11
chr20	30507298	.	AAGAAAGAG	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.044305;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:11,5:13,4
chr20	30861112	.	C	T	0	PASS	DP=243;GPV=1;SPV=0.004446;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:104,27:57,20:47,7
chr20	31055552	.	G	T	0	PASS	DP=463;GPV=1;SPV=0.021878;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:240,29:135,13:105,16
chr20	31063384	.	G	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.095044;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:27,5:8,3:19,2
chr20	31075736	.	C	A	0	PASS	DP=907;GPV=1;SPV=0.043392;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:592:454,69:121,26:333,43
chr20	31096487	.	C	CAATGG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12446;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:13,3:15,2
chr20	31096524	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13133;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,3:13,2
chr20	31346990	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,9:4,7:6,2
chr20	31957819	.	TATATATATATATATATATTCTGTA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,1:4,3
chr20	32850549	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049275;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,5:4,1
chr20	33536358	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0054348;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:1,5:7,2
chr20	33557004	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
chr20	33910437	.	CTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:10,4:5,1
chr20	34375696	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,3:2,1
chr20	35090180	.	T	TAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0021067;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:10,6:9,8
chr20	35153833	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.17513;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,2:19,2
chr20	35186566	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015482;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:14,9:4,1
chr20	35214688	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0053306;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,14:13,11:13,3
chr20	36014118	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.3402e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,17:3,7:9,10
chr20	36763885	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.069923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,8:9,7:7,1
chr20	37126314	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
chr20	37908680	.	G	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=3.085e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:31,33:18,18:13,15
chr20	38379162	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,3:6,1
chr20	38640174	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.13137;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,5:13,3:18,2
chr20	38708430	.	A	AAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011329;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,9:9,5:5,4
chr20	39135065	.	C	CT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.012896;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,15:13,6:12,9
chr20	39203388	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.1055e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:17,10:8,10
chr20	40161346	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,6:7,4
chr20	41019977	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,12:5,7:2,5
chr20	41227191	.	T	TG	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.9762e-07;SS=2;SSC=60;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:6,8:12,7
chr20	41787546	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
chr20	41876054	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.009224;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,9:9,7:1,2
chr20	42850389	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.1303e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,21:15,9:13,12
chr20	43287842	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.9117e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:6,8:11,12
chr20	44680826	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1672;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:16,2:17,2
chr20	45697379	.	A	ATTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:11,4:15,2
chr20	45738910	.	CTATATATAGTTA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,3:6,4
chr20	47450571	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=3.2073e-10;SS=2;SSC=94;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:21,32:13,16:8,16
chr20	47490809	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,2:2,1:4,1
chr20	47593334	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:8,3:3,1
chr20	48412456	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00098758;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:3,1:8,6
chr20	48512118	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.27668;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:7,2:6,1
chr20	50667286	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:5,4:2,2
chr20	51241063	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0083603;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:11,10:6,4
chr20	51472629	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:6,4:6,1
chr20	51961764	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.011401;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:2,5:4,2
chr20	52077167	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.019351;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:12,8:7,4
chr20	52113592	.	C	CTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013278;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:7,7:3,3
chr20	52922077	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:2,3:2,1
chr20	53096927	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.023594;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:20,2:12,3
chr20	54564919	.	C	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.6327e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:21,26:13,12:8,14
chr20	56302246	.	C	CTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0058029;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,12:7,10:13,2
chr20	58122733	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030401;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,7:5,1
chr20	58466125	.	C	CAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.018356;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,7:10,6:3,1
chr20	58798661	.	C	CTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0017432;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,17:2,7:1,10
chr20	59443486	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.037674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,10:15,4:3,6
chr20	60647654	.	CTCTCTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.043024;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:13,6:7,3
chr20	61071639	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=2.8402e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:15,13:12,11
chr20	61383296	.	ATG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.030521;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:11,3:16,3
chr20	61383377	.	GGAT	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.008813;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:11,3:11,4
chr20	61383394	.	T	TATG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.019947;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,6:13,2:14,4
chr20	62325123	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.18255;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:20,3:19,2
chr20	62593036	.	TGTGTGCATGTGTGA	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.028542;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,9:15,2:11,7
chr20	63101758	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:15,2:3,2
chr20	63221532	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015574;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,11:11,7:9,4
chr20	63257805	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,7:16,4:0,3
chr20	63257807	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022502;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:17,4:0,3
chr20	63257808	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.030049;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,8:19,5:1,3
chr20	63257828	.	AGGACAGTGAT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.096448;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:23,2:6,2
chr20	63492639	.	ACAAT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.028934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:13,8:3,1
chr20	63609857	.	CT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.16867;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:26,2:9,2
chr20	63847301	.	G	GAGACACACACAGACACTGACACACAC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,7:4,6:7,1
chr21	5225998	.	A	G	0	PASS	DP=349;GPV=1;SPV=0.02483;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:188:162,26:68,14:94,12
chr21	5226679	.	T	C	0	PASS	DP=509;GPV=1;SPV=0.030746;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:274:238,36:116,13:122,23
chr21	5231730	.	C	G	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.010705;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:90,21:38,9:52,12
chr21	5251434	.	T	G	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.045679;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:103,21:36,8:67,13
chr21	6376086	.	G	A	0	PASS	DP=354;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:206:185,21:106,12:79,9
chr21	7254538	.	T	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.024408;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:26,5:17,3
chr21	7281326	.	T	C	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.0072587;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:86,25:55,15:31,10
chr21	7958662	.	T	C	0	PASS	DP=512;GPV=1;SPV=0.00091737;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:294:239,55:121,34:118,21
chr21	7958780	.	T	A	0	PASS	DP=487;GPV=1;SPV=0.022966;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:266:222,44:101,16:121,28
chr21	7966316	.	G	C	0	PASS	DP=274;GPV=1;SPV=0.0021228;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:117,28:57,15:60,13
chr21	7995998	.	A	T	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.0018624;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:63,19:37,7:26,12
chr21	8035866	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.12392;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:22,2:12,2
chr21	8039154	.	A	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.048393;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,12:24,8:12,4
chr21	8419850	.	A	ACTGT	0	PASS	DP=1226;GPV=1;SPV=0.011035;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:781:664,106:356,77:308,29
chr21	8440697	.	G	A	0	PASS	DP=3237;GPV=1;SPV=0.0067114;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2059:1834,224:1141,168:693,56
chr21	8536809	.	T	C	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.035525;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:129,18:65,8:64,10
chr21	8546996	.	C	T	0	PASS	DP=242;GPV=1;SPV=0.028437;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:124,16:72,7:52,9
chr21	8554722	.	AATG	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.042156;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:37,12:18,2:19,10
chr21	8625901	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0099066;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:6,2:37,6
chr21	8660444	.	G	A	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.048236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:57,16:28,3:29,13
chr21	8675401	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.036877;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:13,6:4,2
chr21	8682330	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.024897;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:10,8:14,1
chr21	8769953	.	C	T	0	PASS	DP=235;GPV=1;SPV=0.046124;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:110,14:49,8:61,6
chr21	8779016	.	C	A	0	PASS	DP=282;GPV=1;SPV=0.024803;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:137,21:63,16:74,5
chr21	8787009	.	TGTC	T	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.015842;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:133,31:64,20:69,11
chr21	8795779	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:25,4:0,0
chr21	8799600	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.020858;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:26,10:19,2
chr21	8816612	.	A	G	0	PASS	DP=204;GPV=1;SPV=0.012785;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:96,19:73,12:23,7
chr21	8818460	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0059499;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:7,1:17,5
chr21	8830956	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:18,4:2,0
chr21	8832637	.	G	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.028559;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:54,16:37,14:17,2
chr21	8834266	.	A	C	0	PASS	DP=523;GPV=1;SPV=0.026699;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:270:227,43:113,23:114,20
chr21	8846751	.	A	G	0	PASS	DP=646;GPV=1;SPV=0.010371;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:368:325,43:158,14:167,29
chr21	8853664	.	G	A	0	PASS	DP=583;GPV=1;SPV=0.0061804;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:305:267,38:128,13:139,25
chr21	8857552	.	A	G	0	PASS	DP=464;GPV=1;SPV=0.027757;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:248:221,27:79,7:142,20
chr21	8863068	.	C	T	0	PASS	DP=612;GPV=1;SPV=0.044801;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:340:297,43:161,20:136,23
chr21	8865457	.	A	T	0	PASS	DP=583;GPV=1;SPV=0.001813;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:318:280,38:175,27:105,11
chr21	8885938	.	G	C	0	PASS	DP=585;GPV=1;SPV=0.0065017;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:319:283,36:131,17:152,19
chr21	9006958	.	G	C	0	PASS	DP=378;GPV=1;SPV=0.046043;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:177,24:94,12:83,12
chr21	9010439	.	C	T	0	PASS	DP=356;GPV=1;SPV=0.027572;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:183,22:105,7:78,15
chr21	9015907	.	G	A	0	PASS	DP=373;GPV=1;SPV=0.019314;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:198:175,23:88,12:87,11
chr21	9018769	.	C	T	0	PASS	DP=362;GPV=1;SPV=0.0016674;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:159,37:81,23:78,14
chr21	9030012	.	T	C	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.029096;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:174:150,24:69,13:81,11
chr21	9030013	.	G	A	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.014282;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:145,23:68,13:77,10
chr21	9058265	.	T	G	0	PASS	DP=354;GPV=1;SPV=0.044755;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:182,30:86,18:96,12
chr21	9059947	.	G	A	0	PASS	DP=331;GPV=1;SPV=0.027458;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:161,22:72,11:89,11
chr21	9070503	.	G	A	0	PASS	DP=405;GPV=1;SPV=0.036246;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:197,26:94,12:103,14
chr21	9073841	.	C	T	0	PASS	DP=300;GPV=1;SPV=0.041439;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:150,20:59,5:91,15
chr21	9076389	.	A	G	0	PASS	DP=304;GPV=1;SPV=0.0013819;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:145,33:88,14:57,19
chr21	9091122	.	C	T	0	PASS	DP=405;GPV=1;SPV=0.010665;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:178,39:112,20:66,19
chr21	9101789	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.045802;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,3:12,3
chr21	9102555	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=256;GPV=1;SPV=0.0082606;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:124,15:70,10:54,5
chr21	9110288	.	A	T	0	PASS	DP=636;GPV=1;SPV=0.034218;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:346:308,38:180,18:128,20
chr21	9110896	.	T	C	0	PASS	DP=574;GPV=1;SPV=0.0023613;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:325:285,40:132,13:153,27
chr21	9123920	.	T	A	0	PASS	DP=521;GPV=1;SPV=0.016704;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:295:263,32:146,18:117,14
chr21	9126698	.	C	G	0	PASS	DP=553;GPV=1;SPV=0.029204;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:243,36:154,18:89,18
chr21	9126790	.	C	T	0	PASS	DP=604;GPV=1;SPV=0.007596;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:312:274,38:159,18:115,20
chr21	9141392	.	T	A	0	PASS	DP=580;GPV=1;SPV=0.026096;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:315:266,49:137,26:129,23
chr21	9151734	.	G	T	0	PASS	DP=452;GPV=1;SPV=0.043814;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:205,37:107,28:98,9
chr21	9151776	.	A	G	0	PASS	DP=435;GPV=1;SPV=0.031767;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:231:199,32:124,22:75,10
chr21	9174854	.	G	A	0	PASS	DP=391;GPV=1;SPV=0.0016586;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:210:182,28:97,12:85,16
chr21	9175241	.	A	C	0	PASS	DP=435;GPV=1;SPV=0.019887;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:191,35:124,19:67,16
chr21	9183135	.	C	T	0	PASS	DP=479;GPV=1;SPV=0.034094;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:268:225,43:110,24:115,19
chr21	9186837	.	G	C	0	PASS	DP=511;GPV=1;SPV=0.016891;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:280:233,47:104,19:129,28
chr21	9186947	.	A	C	0	PASS	DP=474;GPV=1;SPV=0.031342;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:268:240,28:123,18:117,10
chr21	9194375	.	G	A	0	PASS	DP=898;GPV=1;SPV=0.025909;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:483:433,50:246,39:187,11
chr21	9259601	.	G	A	0	PASS	DP=586;GPV=1;SPV=0.00027813;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:342:285,57:144,33:141,24
chr21	9266003	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,1:6,4
chr21	9274388	.	G	A	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.039332;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:67,16:64,13:3,3
chr21	9297708	.	G	A	0	PASS	DP=453;GPV=1;SPV=0.012951;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:250:224,26:103,10:121,16
chr21	9304507	.	G	A	0	PASS	DP=610;GPV=1;SPV=0.040493;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:355:319,36:153,12:166,24
chr21	9309334	.	C	T	0	PASS	DP=476;GPV=1;SPV=0.028189;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:244:219,25:129,18:90,7
chr21	9315263	.	T	C	0	PASS	DP=530;GPV=1;SPV=0.024312;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:298:266,32:133,15:133,17
chr21	9333403	.	A	T	0	PASS	DP=441;GPV=1;SPV=0.010601;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:259:231,28:116,14:115,14
chr21	9340796	.	T	C	0	PASS	DP=385;GPV=1;SPV=0.048947;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:213:191,22:136,12:55,10
chr21	9340825	.	T	C	0	PASS	DP=438;GPV=1;SPV=0.0060631;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:250:222,28:133,18:89,10
chr21	9343680	.	T	G	0	PASS	DP=416;GPV=1;SPV=0.046557;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:244:219,25:107,12:112,13
chr21	9346068	.	C	G	0	PASS	DP=615;GPV=1;SPV=0.049783;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:333:287,46:141,9:146,37
chr21	9350207	.	A	AT	0	PASS	DP=488;GPV=1;SPV=0.031053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:265:227,38:107,9:120,29
chr21	9354669	.	G	C	0	PASS	DP=399;GPV=1;SPV=0.0263;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:243:218,25:129,12:89,13
chr21	9355187	.	G	T	0	PASS	DP=560;GPV=1;SPV=0.023377;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:329:276,53:147,24:129,29
chr21	9362484	.	T	G	0	PASS	DP=384;GPV=1;SPV=0.040314;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:220:194,26:96,16:98,10
chr21	9527333	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.018462;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:54,15:43,11:11,4
chr21	9551000	.	ACT	A	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.022332;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:91,18:39,11:52,7
chr21	9551005	.	T	TGAGGTCAGGA	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.023467;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:90,19:37,12:53,7
chr21	9628624	.	A	G	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.00071048;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:78,30:41,13:37,17
chr21	9657307	.	C	CAA	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.014457;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:22,13:14,10:8,3
chr21	9664360	.	C	T	0	PASS	DP=299;GPV=1;SPV=0.037377;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:139,28:67,11:72,17
chr21	9675117	.	G	A	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.009354;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:106,19:51,11:55,8
chr21	9676168	.	C	T	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.044993;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:97,21:42,5:55,16
chr21	9680606	.	G	A	0	PASS	DP=219;GPV=1;SPV=0.048526;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:103,21:49,13:54,8
chr21	9687709	.	G	A	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.024684;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:103,19:62,8:41,11
chr21	9694189	.	G	A	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.043687;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:107,21:50,11:57,10
chr21	9705739	.	G	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,1:6,3
chr21	9817080	.	G	T	0	PASS	DP=3580;GPV=1;SPV=0.014742;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2013:1779,234:674,75:1105,159
chr21	9818669	.	G	A	0	PASS	DP=790;GPV=1;SPV=0.020873;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:445:386,49:298,37:88,12
chr21	9843165	.	A	G	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.0047134;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:84,24:47,15:37,9
chr21	9908583	.	C	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.018498;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:74,18:39,14:35,4
chr21	9909302	.	G	A	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.007021;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:87,24:55,11:32,13
chr21	9909505	.	G	T	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.04634;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:139,26:71,13:68,13
chr21	9909534	.	C	T	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.033658;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:114,21:53,12:61,9
chr21	9941161	.	T	C	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.01166;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:115,22:61,11:54,11
chr21	9951540	.	G	A	0	PASS	DP=242;GPV=1;SPV=0.010745;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:104,24:62,11:42,13
chr21	9956562	.	T	C	0	PASS	DP=204;GPV=1;SPV=0.036658;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:86,20:41,12:45,8
chr21	9967057	.	G	C	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=2.8573e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:87,16:40,9:47,7
chr21	10074081	.	T	A	0	PASS	DP=252;GPV=1;SPV=0.0070661;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:108,30:57,11:51,19
chr21	10163368	.	G	A	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.040113;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:105,25:53,14:52,11
chr21	10343994	.	C	T	0	PASS	DP=323;GPV=1;SPV=6.3894e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:174:152,22:67,6:85,16
chr21	10358499	.	C	T	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.027824;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:146,23:68,15:78,8
chr21	10359428	.	G	A	0	PASS	DP=317;GPV=1;SPV=0.00076568;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:156,27:76,17:80,10
chr21	10361076	.	G	C	0	PASS	DP=623;GPV=1;SPV=0.020065;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:340:259,48:130,24:129,24
chr21	10361114	.	C	G	0	PASS	DP=698;GPV=1;SPV=0.0029897;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:366:308,58:165,24:143,34
chr21	10403331	.	C	T	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.017765;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:133,22:47,3:86,19
chr21	10422921	.	G	A	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.036589;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:119,15:83,11:36,4
chr21	10460505	.	T	C	0	PASS	DP=399;GPV=1;SPV=0.021557;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:224:197,27:108,13:89,14
chr21	10469718	.	G	A	0	PASS	DP=389;GPV=1;SPV=0.015551;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:185,33:109,21:76,12
chr21	10473424	.	C	T	0	PASS	DP=362;GPV=1;SPV=0.0071959;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:172,25:61,13:111,12
chr21	10488409	.	A	G	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.018334;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:86,14:57,8:29,6
chr21	10488554	.	G	T	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.012581;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:98,18:61,11:37,7
chr21	10663986	.	C	T	0	PASS	DP=233;GPV=1;SPV=0.0045943;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:109,31:51,18:58,13
chr21	10716321	.	T	G	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.0050663;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:96,21:56,8:40,13
chr21	10746406	.	C	T	0	PASS	DP=475;GPV=1;SPV=0.025619;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:287:254,33:128,15:126,18
chr21	10756286	.	G	C	0	PASS	DP=414;GPV=1;SPV=0.015409;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:216:190,26:91,10:99,16
chr21	10798012	.	T	A	0	PASS	DP=606;GPV=1;SPV=0.041582;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:340:302,38:155,25:147,13
chr21	10808909	.	G	A	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.042499;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:147,26:67,12:80,14
chr21	12976028	.	G	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=7.0417e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:69,18:33,7:36,11
chr21	13027223	.	C	CA	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.035746;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:45,15:22,2:23,13
chr21	13100149	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.032357;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:24,5:10,4
chr21	13139744	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.074336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,4:12,1
chr21	13139745	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.062277;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:9,4:15,1
chr21	13225211	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.005596;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,7:16,6:2,1
chr21	13485001	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=4.6629e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:14,7:10,8
chr21	13490606	.	ATATATTT	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:1,1:1,1
chr21	13550568	.	A	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.045262;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:56,9:33,5:23,4
chr21	13612108	.	C	CAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.074732;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,2:14,3
chr21	13810187	.	AGGGG	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.083854;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,5:16,3:20,2
chr21	14061959	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.004133;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,13:3,6:7,7
chr21	15239757	.	CTATA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:10,12:6,9:4,3
chr21	16145996	.	ATGTGAGCCAGCAAAGTAATGTGAGGAGTTGCCTTGGGCCTGGGAGAATC	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.022393;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:19,6:7,3
chr21	16420345	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=6.9776e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,19:8,11:9,8
chr21	17057769	.	AGTAAAAGT	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00016727;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:12,6:18,8
chr21	17530114	.	A	AT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.026224;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:2,3:2,3
chr21	18070027	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr21	18174120	.	GGT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,3:4,3
chr21	19524779	.	C	CAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0021328;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,16:9,11:8,5
chr21	20144940	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21758;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:17,2:15,2
chr21	20349991	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=2.6597e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:22,26:6,19:16,7
chr21	22562732	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:3,2:2,2
chr21	25193617	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.6179e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,21:11,13:7,8
chr21	25621758	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:1,6:5,2
chr21	26226543	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=6.2936e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:6,6:9,8
chr21	27627381	.	T	A	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.028841;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:77,15:33,5:44,10
chr21	27879185	.	A	AT	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00074156;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:4,22:2,12:2,10
chr21	30490177	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.9336e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:8,8:13,10
chr21	30562390	.	T	TAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,2:2,1:1,1
chr21	31473429	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.19205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,4:4,1
chr21	31735263	.	GAAAAAAAAAAAAAAAA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:3,7:2,1
chr21	31770100	.	GTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0027123;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:2,4:2,5
chr21	32030655	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.22736;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,4:18,2:13,2
chr21	32255498	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016338;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:5,2:13,7
chr21	33876219	.	T	TTC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
chr21	34135346	.	G	GT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,11:5,8:5,3
chr21	35769468	.	AATATAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0086957;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,7:3,4:3,3
chr21	35793297	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,3:9,1
chr21	36115398	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,5:9,1
chr21	36436742	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0081568;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,16:15,12:7,4
chr21	37212564	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,6:3,2:5,4
chr21	38201730	.	GTCTA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:5,3:5,1
chr21	38358110	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.16972;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,4:20,1:8,3
chr21	39682186	.	TA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00057614;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:13,8:9,7
chr21	40353480	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.2902e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:21,30:11,17:10,13
chr21	40818102	.	CAAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,9:4,8:5,1
chr21	40875087	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.060214;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:18,2:8,2
chr21	41311236	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:10,3:6,1
chr21	41655939	.	C	CCACACACA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,10:7,7:2,3
chr21	41671014	.	C	CT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.05944;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:8,1:22,4
chr21	41726529	.	C	CTCT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.21337;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,4:12,2:11,2
chr21	41733013	.	T	TACACACACACACACAC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034981;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,10:11,5:8,5
chr21	41745315	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.1955e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:16,14:9,6
chr21	42008571	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,2:2,1:4,1
chr21	42212707	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,2:1,1:1,1
chr21	42311322	.	GGCAGGCAGCGCTCACAGGAGGCCCAA	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.013462;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:18,6:7,5
chr21	42362097	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.027692;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:17,2:26,4
chr21	42883098	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0031186;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,12:10,10:4,2
chr21	43337398	.	C	CCACCAT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0090365;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,11:7,8:8,3
chr21	44257696	.	ATAAAT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.026312;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:13,6:8,5
chr21	44345311	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=1.0398e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:31,22:16,10:15,12
chr21	44598534	.	A	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.8098e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:28,24:11,11:17,13
chr21	44789384	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:7,6:4,1
chr21	45610068	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.637e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:9,9:10,7
chr21	46321901	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:13,4:3,1
chr21	46446680	.	G	GTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.040363;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,8:13,4:9,4
chr22	10527469	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.025076;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:3,1:17,4
chr22	10531809	.	TGA	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.010226;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:75,13:49,8:26,5
chr22	10612761	.	T	C	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.015286;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:74,10:34,1:40,9
chr22	10641581	.	TGA	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.041309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:45,9:27,5:18,4
chr22	10650005	.	G	GAA	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.00037634;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:73,18:47,12:26,6
chr22	10690286	.	T	C	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.021635;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:92,16:32,2:60,14
chr22	10698681	.	A	G	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.010064;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:98,14:62,9:36,5
chr22	10733640	.	G	A	0	PASS	DP=622;GPV=1;SPV=0.035246;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:356:319,37:157,19:162,18
chr22	10737705	.	A	G	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.016527;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:219:191,28:91,13:100,15
chr22	10760350	.	G	A	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.0066425;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:96,15:64,12:32,3
chr22	10760366	.	T	TTA	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.0088568;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:100,12:73,10:27,2
chr22	10760379	.	T	A	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:105,14:79,11:26,3
chr22	10765864	.	A	G	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.0048919;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:111,28:43,11:68,17
chr22	10767229	.	C	T	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.038719;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:101,17:56,8:45,9
chr22	10771026	.	C	T	0	PASS	DP=328;GPV=1;SPV=0.024823;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:152,31:79,14:73,17
chr22	10951034	.	C	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.041605;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:80,11:33,4:47,7
chr22	11033002	.	G	A	0	PASS	DP=361;GPV=1;SPV=0.048903;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:203:182,21:80,8:102,13
chr22	11047586	.	T	TAC	0	PASS	DP=333;GPV=1;SPV=0.029758;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:162:88,12:41,8:47,4
chr22	11054290	.	G	A	0	PASS	DP=470;GPV=1;SPV=0.038644;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:254:226,28:123,17:103,11
chr22	11056829	.	G	T	0	PASS	DP=350;GPV=1;SPV=0.032197;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:199:171,28:108,15:63,13
chr22	11057590	.	C	A	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.016529;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:99,17:43,8:56,9
chr22	11059377	.	C	T	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.034641;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:140,20:54,12:86,8
chr22	11061247	.	C	T	0	PASS	DP=333;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:162,20:93,12:69,8
chr22	11062802	.	G	A	0	PASS	DP=352;GPV=1;SPV=0.035925;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:162,24:80,13:82,11
chr22	11064460	.	C	G	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.047192;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:123,19:41,10:82,9
chr22	11337982	.	T	TTTA	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.0075827;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:146,17:86,10:60,7
chr22	11358586	.	T	C	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.0025746;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:106,23:45,13:61,10
chr22	11359091	.	T	C	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.001598;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:63,26:41,11:22,15
chr22	11455564	.	G	C	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.011593;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:63,18:21,6:42,12
chr22	11681998	.	TA	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.014807;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:90,16:31,5:59,11
chr22	11703850	.	G	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.027799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:28,5:15,7
chr22	11705259	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0092558;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:6,2:36,7
chr22	11714754	.	G	T	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.020188;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:120,15:46,3:74,12
chr22	11791237	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.084652;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,2:17,2
chr22	11793951	.	C	T	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.015938;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:66,10:61,8:5,2
chr22	11797775	.	G	A	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.048875;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:123,19:59,15:64,4
chr22	11832943	.	A	G	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.030878;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:67,15:41,6:26,9
chr22	11833156	.	T	G	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.034567;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:95,21:37,15:58,6
chr22	11834671	.	T	G	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:105,13:20,5:85,8
chr22	11841442	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:13,4:0,0
chr22	11845146	.	G	A	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.00082342;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:63,12:35,6:28,6
chr22	11865156	.	G	A	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.048415;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:83,15:47,9:36,6
chr22	11871637	.	T	C	0	PASS	DP=606;GPV=1;SPV=0.026301;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:350:306,44:200,29:106,15
chr22	11884747	.	T	C	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.00064121;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:55,23:44,16:11,7
chr22	11885181	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.048436;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:16,3:34,4
chr22	11891373	.	G	A	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.015085;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:90,12:40,3:50,9
chr22	11895984	.	C	A	0	PASS	DP=521;GPV=1;SPV=0.010284;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:306:266,40:87,13:179,27
chr22	11906163	.	C	T	0	PASS	DP=260;GPV=1;SPV=0.045317;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:131,16:27,2:104,14
chr22	11909971	.	C	T	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.00094504;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:123,18:66,14:57,4
chr22	11923710	.	C	T	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.018527;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:75,12:57,10:18,2
chr22	11935953	.	C	T	0	PASS	DP=383;GPV=1;SPV=0.015369;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:215:187,28:119,24:68,4
chr22	12033044	.	A	G	0	PASS	DP=569;GPV=1;SPV=0.011073;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:308:271,37:126,8:145,29
chr22	12039706	.	T	C	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.025824;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:123,27:56,9:67,18
chr22	12043443	.	G	A	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.012671;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:80,19:46,11:34,8
chr22	12069675	.	T	C	0	PASS	DP=338;GPV=1;SPV=0.047797;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:198:177,21:118,7:59,14
chr22	12088827	.	A	T	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.037554;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:96,17:52,10:44,7
chr22	12118834	.	G	A	0	PASS	DP=440;GPV=1;SPV=0.044889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:229:198,31:115,15:83,16
chr22	12146047	.	C	A	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.0017936;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:64,26:38,23:26,3
chr22	12149864	.	AGAG	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.044501;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:92,15:50,12:42,3
chr22	12156454	.	G	A	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.042675;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:92,15:36,5:56,10
chr22	12195122	.	T	G	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.01993;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:98,24:66,14:32,10
chr22	12219625	.	A	T	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.035918;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:135,24:64,14:71,10
chr22	12220317	.	A	G	0	PASS	DP=348;GPV=1;SPV=0.028848;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:193:166,27:72,11:94,16
chr22	12297193	.	A	G	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.00066193;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:105,18:47,7:58,11
chr22	12351292	.	A	C	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.038942;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:60,10:42,6:18,4
chr22	12352794	.	G	A	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.049836;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:83,17:46,8:37,9
chr22	12361039	.	T	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,3:6,3:0,0
chr22	12387088	.	C	T	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.0074262;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:90,24:42,16:48,8
chr22	12427862	.	T	G	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.037363;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:73,17:35,10:38,7
chr22	12525510	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.018465;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:21,2:18,5
chr22	12575901	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:15,3:12,1
chr22	12605667	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,5:9,3:8,2
chr22	12695078	.	T	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.0035609;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:95,18:50,5:45,13
chr22	12696778	.	T	TG	0	PASS	DP=235;GPV=1;SPV=0.017206;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:124,16:61,4:63,12
chr22	12710410	.	C	T	0	PASS	DP=204;GPV=1;SPV=0.021079;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:100,19:44,7:56,12
chr22	12721426	.	CACATAAAA	C	0	PASS	DP=455;GPV=1;SPV=0.020099;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:249:223,26:98,10:125,16
chr22	12799629	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0094855;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:31,2:11,8
chr22	12803331	.	T	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0099003;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:22,7:15,4
chr22	12805364	.	T	A	0	PASS	DP=278;GPV=1;SPV=0.014734;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:123,19:67,9:56,10
chr22	12817911	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064294;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:0,0:31,4
chr22	12882421	.	G	C	0	PASS	DP=468;GPV=1;SPV=0.0005702;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:263:232,29:152,10:80,19
chr22	12882822	.	G	A	0	PASS	DP=573;GPV=1;SPV=0.035159;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:308:264,44:130,22:134,22
chr22	12904103	.	T	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.029313;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:14,4:22,8
chr22	13409654	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr22	13409657	.	C	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr22	15238702	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,9:6,5:5,4
chr22	15525972	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.032993;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:6,2:14,9
chr22	15535592	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.11088;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,1:19,3
chr22	15554048	.	G	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.042965;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:115,20:42,4:73,16
chr22	15567784	.	T	C	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.0096848;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:66,19:47,10:19,9
chr22	15571833	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01441;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:7,6:6,1
chr22	15575357	.	G	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
chr22	15628399	.	C	T	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.004149;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:91,23:56,17:35,6
chr22	15670174	.	C	T	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.04729;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:80,17:32,9:48,8
chr22	15713197	.	T	C	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.04126;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:58,11:33,4:25,7
chr22	15737153	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.31172;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:21,3:12,1
chr22	15741615	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:3,5:3,4
chr22	15745113	.	CT	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.029717;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,6:27,1:21,5
chr22	15747068	.	C	T	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.01536;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:59,18:30,10:29,8
chr22	15787990	.	A	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.012601;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:52,12:27,8:25,4
chr22	15790824	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0027222;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:9,3:11,6
chr22	15821211	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.021168;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:26,4:21,9
chr22	15829890	.	G	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.025801;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:50,17:25,3:25,14
chr22	15833829	.	ATTTTC	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,1:6,3
chr22	15880948	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,2:4,2
chr22	15917376	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,2:6,2
chr22	15940680	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.055772;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:16,4:22,1
chr22	15940780	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.038714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:16,3:24,7
chr22	16367520	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.057853;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,7:12,5:10,2
chr22	16523138	.	CAT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,7:2,3:0,4
chr22	16558307	.	C	CA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.1382;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,5:7,1:23,4
chr22	16622614	.	GACACAC	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.097821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:18,5:1,2
chr22	16887739	.	TATATATATATATAG	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,3:13,1
chr22	17756436	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.22398;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,4:6,1:7,3
chr22	17757402	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0059497;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,8:4,5:3,3
chr22	18226222	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,4:4,2
chr22	18517964	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.036364;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
chr22	18525675	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,3:5,1
chr22	18570148	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0021989;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,7:7,6:0,1
chr22	18652609	.	G	A	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.028852;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:25,2:36,6
chr22	18656144	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,5:4,1:6,4
chr22	18791976	.	C	T	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.035784;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:81,18:39,9:42,9
chr22	18846493	.	G	T	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.0098534;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:10,5:40,1
chr22	18911395	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.025848;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:18,4:20,10
chr22	19341452	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,2:2,1:3,1
chr22	19586736	.	AAAAAACAAAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0094582;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:17,10:13,8
chr22	20333103	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.02099;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:11,9:10,8
chr22	20357187	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.029113;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:6,6:12,4
chr22	20358112	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.095133;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:12,6:10,2
chr22	20360105	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.033698;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:16,4:9,3
chr22	20689430	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.072303;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:11,4:28,1
chr22	21164570	.	CAG	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,1:14,3
chr22	21164577	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:10,1:15,3
chr22	21209601	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
chr22	21216501	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:30,2:22,9
chr22	21247741	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:13,4:1,0
chr22	21274288	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.03902;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:25,4:12,2
chr22	21283959	.	C	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.048426;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,13:18,4:24,9
chr22	21333348	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.011133;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:23,9:21,7
chr22	21690957	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10638;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:13,3:7,4
chr22	21912604	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:5,2:3,2
chr22	22543000	.	A	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.9315e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:27,22:16,13:11,9
chr22	23597502	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027568;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,6:15,5:6,1
chr22	23980515	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.027219;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,5:5,2
chr22	23990220	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.02269;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:9,2:15,7
chr22	23990273	.	GA	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.011902;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:16,2:19,9
chr22	24257335	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.033817;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:17,6:24,1
chr22	24659196	.	C	G	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.048394;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:21,2:24,10
chr22	24675083	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.041933;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,5:10,1
chr22	25230922	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.7944e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:7,13:10,7
chr22	25491699	.	T	TTC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.059099;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,4:7,2:10,2
chr22	25491711	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,4:8,2:6,2
chr22	26047125	.	A	AT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00039513;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:13,4:13,7
chr22	26542240	.	T	TA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0032973;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:7,6:9,5
chr22	26634592	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.049619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:13,3:6,4
chr22	26679647	.	C	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00019573;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:21,9:9,2
chr22	26772544	.	ACTT	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.058975;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:22,3:21,2
chr22	27441102	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.2532e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:13,5:15,8
chr22	27501803	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=1.2145e-10;SS=2;SSC=99;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:21,28:13,11:8,17
chr22	28883207	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,8:7,6:7,2
chr22	28883208	.	G	GA	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.025745;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,6:8,5:11,1
chr22	28883210	.	G	GAA	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.029606;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:15,5:15,1
chr22	29280862	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022726;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:8,5:7,3
chr22	29437953	.	A	ATT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0018443;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:10,6:5,3
chr22	30313550	.	AT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:9,3:3,2
chr22	30497989	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.3065e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:10,8:12,8
chr22	31145349	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.0538e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:15,7:18,10
chr22	33203101	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.04108;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,6:16,5:19,1
chr22	33309850	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=5.7731e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,22:11,6:7,16
chr22	33661840	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.0577e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:10,7:9,7
chr22	34073523	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.11785;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,7:7,3:6,4
chr22	34155855	.	C	CTTTCTTTTCTTTTCT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.057946;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:6,1:18,6
chr22	34357060	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0065417;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,8:3,1
chr22	35498150	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.974e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:7,10:16,7
chr22	35977727	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:5,2:3,2
chr22	36347820	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,4:7,1:9,3
chr22	37138061	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.6194e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:22,21:15,15:7,6
chr22	37894264	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,4:8,4
chr22	38923747	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.090553;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:5,1:18,5
chr22	40982177	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,3:4,1
chr22	41063290	.	AAG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:17,1:13,3
chr22	41785906	.	T	TA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.010406;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,11:4,4:11,7
chr22	42407903	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:13,4:5,1
chr22	42839124	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.043976;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,9:4,7:14,2
chr22	42863309	.	CAAA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0047817;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:10,8:5,1
chr22	42896400	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.23178;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,2:10,2
chr22	43334660	.	TCAC	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.14256;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,2:15,2
chr22	43579419	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,2:9,2
chr22	43579420	.	G	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,4:9,2
chr22	43836404	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,5:3,3
chr22	44066804	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0075858;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,2:8,5
chr22	44763802	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.30409;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,5:8,2:4,3
chr22	44774518	.	A	ATT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.076179;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,6:11,4:8,2
chr22	45670438	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:3,2:4,4
chr22	46940716	.	A	AC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.11976;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:7,2:9,3
chr22	46940879	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,8:4,2
chr22	47414330	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:1,3:6,3
chr22	47467579	.	G	GT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00032526;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,15:12,9:6,6
chr22	48636614	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.078605;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:7,3:18,3
chr22	49091116	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.10738;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,2:17,2
chr22	49149156	.	G	GAGCTCTGCTGGGTGCTGGTGAGTCGGGAGCCCTGACTC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,9:1,3:4,6
chr22	50638443	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.035742;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:21,4:13,1
chr22	50748762	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.017734;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:10,8:3,1
chr3	996388	.	GT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,4:5,1
chr3	1210425	.	GA	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.011976;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,8:8,5:4,3
chr3	1997735	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,4:3,1
chr3	2394784	.	G	GTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,10:6,8:0,2
chr3	2920420	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00050514;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:6,11:7,4
chr3	3270834	.	AAAG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.015065;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:9,3:11,9
chr3	5353098	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0087495;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:3,6:4,2
chr3	5914126	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.0802e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:10,12:7,8
chr3	7385289	.	ATTT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0018037;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,9:3,7:1,2
chr3	7566111	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,4:4,1:5,3
chr3	7634478	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,3:8,1
chr3	8542002	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,3:5,1
chr3	9824737	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,4:3,2
chr3	10072523	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.3344e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:6,6:19,14
chr3	11103903	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0070433;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:1,4:4,6
chr3	11171123	.	C	CTTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.011263;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,13:9,7:11,6
chr3	11487352	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:3,2:5,4
chr3	11649895	.	ATTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGG	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.047106;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:11,4:11,3
chr3	12221298	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04308;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,3:1,2
chr3	13682077	.	CACGCATGTGTGTGTGAGT	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.032693;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,6:20,1:13,5
chr3	13682097	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.046535;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:28,1:15,5
chr3	13907950	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,1:8,3
chr3	14062633	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=4.6832e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:19,23:7,11:12,12
chr3	14965522	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,8:4,7:0,1
chr3	16095206	.	GTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01162;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,9:7,4:3,5
chr3	17263366	.	CAA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02776;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:15,8:3,2
chr3	17705338	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.033902;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,6:6,3
chr3	18798204	.	CTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:10,3:1,1
chr3	20756723	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.934e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:9,10:13,8
chr3	21512145	.	C	CAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:7,7:5,1
chr3	21600115	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.2818e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:14,6:9,5
chr3	21855465	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=7.0946e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:10,8:17,10
chr3	22164216	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,2:4,3
chr3	22181697	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024928;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:6,6:9,3
chr3	22329076	.	C	CAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.02761;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,11:18,9:5,2
chr3	23179213	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:4,5:2,1
chr3	24843900	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.043967;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:14,8:7,1
chr3	25210558	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,4:7,2
chr3	26152563	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:4,2:3,1:1,1
chr3	26512253	.	C	CCTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:6,3:5,1
chr3	27407111	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:2,2:1,1:1,1
chr3	27965073	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,4:4,1
chr3	29498188	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=9.067e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:13,4:12,11
chr3	29514650	.	C	CATATATATAT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.048897;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:9,5:10,2
chr3	30631621	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:4,4:6,1
chr3	34214669	.	C	CATATGTGTGTGT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,5:7,4:8,1
chr3	34417100	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=2.5198e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:6,10:7,2
chr3	35635040	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13974;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:18,2:11,2
chr3	36793773	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01472;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,8:8,3
chr3	37407353	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.01132;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:13,6:4,2
chr3	37518093	.	C	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.029072;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:10,4:15,3
chr3	39438589	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:8,4:2,1
chr3	39441101	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.00086785;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:7,9:2,2
chr3	39469386	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.030856;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,8:9,2:12,6
chr3	39674718	.	TAAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:10,10:4,2
chr3	40377077	.	AAAGGG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:8,4:0,0
chr3	42029324	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=2.679e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,25:11,13:8,12
chr3	43508943	.	T	TA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.6009e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:12,6:7,6
chr3	44033758	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018593;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,7:8,3:0,4
chr3	45427825	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.039341;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:4,13:0,8:4,5
chr3	47049323	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,2:3,1:4,1
chr3	48056114	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.011836;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:61,9:36,3:25,6
chr3	48074676	.	T	TTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01494;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,8:9,3:3,5
chr3	49202495	.	TTGTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.056741;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,7:7,2:5,5
chr3	49243757	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:6,3:8,1
chr3	50010900	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,9:5,8:5,1
chr3	51599746	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:3,2:2,1:1,1
chr3	52832750	.	GT	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.046922;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:11,4:10,3
chr3	53898962	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,3:8,3
chr3	54554870	.	CTTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.010266;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:9,8:4,3
chr3	55388459	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,6:7,1
chr3	55876778	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.8531e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:13,10:7,9
chr3	61172717	.	TCTAAAATTCACTGACACTGGAGCTTAAATCCACGTGCCTAGAATGCTC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037638;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,3:9,6
chr3	61748425	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.016027;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:21,2:26,5
chr3	62819407	.	C	CGT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0081996;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,10:14,6:5,4
chr3	63245680	.	TGAGA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:5,3:7,2
chr3	63314068	.	CATAT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:0,4:0,2:0,2
chr3	65023977	.	T	TA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.018634;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,2:2,3
chr3	65109719	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.036993;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:16,2:15,5
chr3	65957520	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,10:9,9:3,1
chr3	67197014	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.073242;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:21,3:25,3
chr3	67782428	.	T	TTTTTTTG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:0,4:8,2
chr3	68084950	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=8.7132e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:13,8:10,10
chr3	68127751	.	CGGT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
chr3	68193747	.	C	CA	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.513e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,6:12,7
chr3	68479229	.	C	CAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.014712;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:5,7:4,1
chr3	68900083	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,7:4,3:5,4
chr3	71343554	.	A	ATTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,11:4,8:1,3
chr3	72183638	.	CA	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.017354;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:17,7:7,7
chr3	72183640	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0256;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:17,7:13,5
chr3	75146049	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:7,2:11,3
chr3	75637216	.	A	G	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.025503;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:115,17:50,8:65,9
chr3	75645127	.	G	C	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.0146;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:66,21:34,12:32,9
chr3	76910745	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014569;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:1,6:0,2:1,4
chr3	76962638	.	C	CAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.029259;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:16,6:3,1
chr3	76977752	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.2353e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:14,11:13,5
chr3	77126782	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,4:2,1
chr3	77132923	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.6189e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:13,11:8,7
chr3	79226543	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0024454;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,6:6,5
chr3	79848847	.	TCC	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10606;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:1,1:2,3
chr3	81082161	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00020455;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:11,4:15,7
chr3	81990993	.	T	TG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:3,3:7,3
chr3	83025863	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=4.4433e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:8,9:14,11
chr3	86171357	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:10,6:3,1
chr3	88540939	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:38:0,2:0,2:0,0
chr3	89415467	.	A	AATATATATATATATAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,6:7,2:8,4
chr3	89540948	.	GT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.01458;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,5:6,4
chr3	90172561	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0015434;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:4,5:14,8
chr3	90789318	.	C	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0053729;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:49,13:10,9:39,4
chr3	90789415	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.25039;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:1,2:26,1
chr3	90793448	.	A	T	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.043644;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:33,6:26,3
chr3	90835792	.	C	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.0015408;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:88,22:80,21:8,1
chr3	90836180	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.07265;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:19,2:12,2
chr3	90888861	.	T	C	0	PASS	DP=598;GPV=1;SPV=0.028125;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:315:280,35:4,1:276,34
chr3	90900911	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.2364;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:12,1:9,4
chr3	90938510	.	A	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.017081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:48,10:35,4:13,6
chr3	90951588	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:12,6:1,0
chr3	90992803	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.034293;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:28,4:9,8
chr3	91000939	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.080441;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,1:15,4
chr3	91007033	.	G	C	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.041014;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:66,8:53,6:13,2
chr3	91074842	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.035048;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:4,1:19,5
chr3	91094421	.	C	G	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.035994;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:56,7:33,2:23,5
chr3	91094508	.	G	A	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.016038;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:62,9:21,7:41,2
chr3	91141286	.	C	G	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.037488;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:86,14:51,8:35,6
chr3	91146787	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:3,2:3,1
chr3	91165899	.	G	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,3:10,2
chr3	91165902	.	GA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:6,3:10,4
chr3	91195210	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
chr3	91226160	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr3	91283652	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.026247;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:3,10:26,3
chr3	91557056	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.036466;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:21,4:4,2
chr3	91740664	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,4:4,1
chr3	91764104	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:1,1:15,5
chr3	91876564	.	A	T	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.037726;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,15:11,2:47,13
chr3	91933099	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.034293;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:18,2:19,10
chr3	92303938	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
chr3	92777906	.	A	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.039121;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:74,9:38,7:36,2
chr3	93117036	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.019617;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:27,4:8,4
chr3	93342330	.	A	T	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.031855;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:76,10:58,9:18,1
chr3	93647998	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.01904;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:7,3:28,7
chr3	93925821	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0042621;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:6,6:8,5
chr3	94553985	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,3:13,1
chr3	94628188	.	T	TCTTC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0058824;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:0,13:0,2:0,11
chr3	95317090	.	T	TGAGAGAGA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0089185;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,10:11,8:7,2
chr3	96004721	.	AT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,8:15,5:5,3
chr3	96004740	.	T	TAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20188;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,4:14,2:12,2
chr3	96114203	.	TAA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015259;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:16,6:9,6
chr3	96580477	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:9,4:5,1
chr3	97451743	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00018662;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:13,6:10,5
chr3	98074420	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,5:3,3
chr3	99696976	.	AT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,4:15,2:3,2
chr3	101843020	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:15,3:3,2
chr3	103756573	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.9336e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:11,10:10,8
chr3	104653635	.	GTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.045954;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,10:7,5:10,5
chr3	106707369	.	T	TA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.031077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,2:12,3
chr3	107196510	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,4:0,1:5,3
chr3	108955590	.	TAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,4:5,1
chr3	109137637	.	G	GTGTGTATATATATATATATA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:1,1:3,3
chr3	109333349	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:8,6:1,2
chr3	109421529	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:16,1:1,3
chr3	109529342	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.24135;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:15,1:13,3
chr3	109552628	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.049781;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:15,9:5,1
chr3	111149459	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1182;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,6:16,4:4,2
chr3	113260686	.	AC	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:9,4:12,2
chr3	113504571	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,6:5,1
chr3	113843049	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,5:4,1
chr3	113849994	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.042976;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:7,5:18,11
chr3	114426337	.	CAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,8:4,5:1,3
chr3	116086758	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.5592e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:22,21:4,9:18,12
chr3	117163885	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,4:5,2:6,2
chr3	118133474	.	GAAAAAGAA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,4:21,2:4,2
chr3	118917790	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.059869;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:18,4:24,1
chr3	119837945	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:4,2:3,1:1,1
chr3	120201184	.	G	GTTTTTTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,3:4,2
chr3	120649139	.	CTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.035343;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:11,2:5,3
chr3	121395164	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=4.9772e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:12,9:9,9
chr3	122281880	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.16358;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:22,4:12,2:10,2
chr3	122346941	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1671;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,4:8,1
chr3	122773303	.	GTT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0023953;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,9:7,8:3,1
chr3	124347274	.	C	CTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.050669;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:9,2:6,5
chr3	125215920	.	GTT	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:4,3:3,1
chr3	125897872	.	C	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0095826;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:22,2:19,4
chr3	126086407	.	T	TG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:1,6:8,3
chr3	126086417	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:2,10:7,2
chr3	126333527	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.041993;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:17,6:10,2
chr3	126949585	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12446;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:14,2:14,3
chr3	128600310	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0096036;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:8,8:5,4
chr3	128639455	.	G	GA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:6,3:4,1
chr3	129094505	.	C	CT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:2,1:3,1
chr3	129400120	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.01971;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,8:9,7:1,1
chr3	130566811	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.1797e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,23:12,11:9,12
chr3	130680060	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043327;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:9,8:5,3
chr3	131653446	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.1423e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:12,10:10,9
chr3	131717874	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:6,2:11,3
chr3	131953239	.	TAA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.1287e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:11,17:8,12:3,5
chr3	132052774	.	A	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.02327;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:22,7:15,7
chr3	132812112	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,8:5,1
chr3	134090006	.	G	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=6.3104e-11;SS=2;SSC=101;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:27,33:14,15:13,18
chr3	134204596	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,3:12,1
chr3	134204597	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.06964;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,3:11,1
chr3	134249918	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.077483;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,5:9,4:18,1
chr3	134399017	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,1:15,4
chr3	135099322	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.10359;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,4:17,1:12,3
chr3	135599612	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:5,3:1,1
chr3	135814821	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.070897;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:11,4:9,1
chr3	136041250	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0019499;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:9,3:10,7
chr3	136061920	.	CTA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024928;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:12,6:3,3
chr3	136290671	.	G	GTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:4,2:6,2
chr3	136447596	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:10,5:1,2
chr3	138051047	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10954;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:19,4:14,1
chr3	138154119	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:10,2:11,2
chr3	138815162	.	A	AATAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,9:10,4:2,5
chr3	139257745	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.8092e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:6,7:15,5
chr3	140251584	.	G	GTTCCTTTCCT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0023885;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,11:5,4:6,7
chr3	140367515	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:7,4:4,3:3,1
chr3	141421278	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:10,4:2,2
chr3	141973093	.	G	GTA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.017005;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,12:14,7:8,5
chr3	142391750	.	ATAT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,4:9,2:7,2
chr3	143071596	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=4.8163e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:26,26:14,10:12,16
chr3	143748692	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0033344;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:7,7:1,3
chr3	144825127	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.034961;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:15,8:3,3
chr3	145425313	.	A	ATTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,1:5,3
chr3	146337911	.	G	GAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:12,14:9,11:3,3
chr3	146797543	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.0121e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,23:8,15:8,8
chr3	146952504	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:21,3:5,1
chr3	147156572	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01494;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,7:2,1
chr3	148892856	.	T	TAGTCCCGGCTACTTGGGAGGCTG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.022983;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,11:7,5:10,6
chr3	148964030	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.064935;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,2:4,1:0,1
chr3	149380455	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.035909;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:25,4:8,2
chr3	149625100	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:4,5:7,2
chr3	149696112	.	C	CAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016771;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,9:8,8:3,1
chr3	150028648	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.025979;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:17,3:13,3
chr3	150428595	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:4,3:3,1:1,2
chr3	151198345	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.077637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:19,3:23,2
chr3	151423014	.	A	AATAT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0018554;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,13:8,10:8,3
chr3	152880189	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.001166;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:10,5:20,8
chr3	153175616	.	G	GT	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.9143e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:11,10:13,6
chr3	154099718	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:9,9:4,1
chr3	155119742	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1672;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:22,2:11,2
chr3	155125444	.	CT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.021468;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:9,4:11,6
chr3	156982909	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.22668;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,6:5,4:13,2
chr3	158330838	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.4608e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:10,7:6,8
chr3	159553967	.	CGT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.014604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,9:6,6:8,3
chr3	160008042	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.056741;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:10,5:2,3
chr3	160018031	.	A	AAG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.19205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,5:8,3:7,2
chr3	161300205	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012432;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:14,8:6,4
chr3	161841078	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,5:9,2:12,3
chr3	161969282	.	AT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022687;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,11:10,8:10,3
chr3	163502251	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:5,9:1,7:4,2
chr3	163945200	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0012277;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:13,7:10,3
chr3	164574495	.	AT	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.6008e-06;SS=2;SSC=57;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:11,9:14,11
chr3	165422609	.	ATATATATACATGTATATATATACATGTATATATACTG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
chr3	165488881	.	G	GTT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:4,1:0,1
chr3	166231536	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0003763;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:8,7:17,5
chr3	166826852	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0003327;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:8,10:7,2
chr3	167726114	.	GTTT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038682;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,17:15,9:5,8
chr3	168037064	.	A	ATCTATGAATGCCCATTCATAGATGGGCATTTGT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.094604;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,7:23,4:23,3
chr3	168515447	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.5475e-10;SS=2;SSC=98;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:18,37:7,13:11,24
chr3	169663474	.	GTCTCTCTCTCTCTC	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0088119;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:14,12:7,8:7,4
chr3	170126525	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.23136;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:14,1:22,3
chr3	171145090	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.083322;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:25,2:18,5
chr3	171562723	.	CCTTCTTCTTCTTCTT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.3532;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,6:5,5:18,1
chr3	171599827	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0048942;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,6:5,1
chr3	171866586	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.21886;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,5:7,2:7,3
chr3	172229084	.	AAC	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0072008;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,17:17,12:4,5
chr3	172701449	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10315;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:11,4:16,2
chr3	174066516	.	G	GTC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20188;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,4:21,3:5,1
chr3	174234985	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:9,3:6,2
chr3	174816415	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,4:14,2:11,2
chr3	174989937	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00021276;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:15,11:20,3
chr3	175013099	.	T	TATGTA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,14:4,4:7,10
chr3	175013145	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0050131;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,1:6,8
chr3	175173321	.	T	TA	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.010542;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:17,11:17,8:0,3
chr3	176627669	.	AAG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.032319;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:15,7:8,3
chr3	176844403	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00081261;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:7,6:3,9
chr3	177248298	.	GC	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.25496;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:0,0:27,4
chr3	179120075	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.9119e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:30,31:21,15:9,16
chr3	179359596	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:7,5:7,3
chr3	179457921	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.075976;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:22,4:21,1
chr3	179836955	.	T	TG	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00032758;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:46,15:22,8:24,7
chr3	179836957	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=4.9433e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:43,19:20,10:23,9
chr3	180010225	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00047641;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:13,8:14,10
chr3	180062134	.	C	CTGTGTGTG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,11:8,7:7,4
chr3	180695723	.	T	TA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.098102;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:18,1:23,5
chr3	180695725	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.055212;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:18,1:21,6
chr3	181150490	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.075107;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:20,5:23,2
chr3	181787646	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.049356;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:12,2:9,7
chr3	181984974	.	TTCTTTCTC	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.019606;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:23,17:8,7:15,10
chr3	182099491	.	C	CAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0779;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:11,5:6,3
chr3	182263268	.	G	GAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.23571;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,4:21,3:11,1
chr3	182338370	.	A	AT	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=1.167e-05;SS=2;SSC=49;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:45,23:27,15:18,8
chr3	182495384	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00010432;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:56,28:23,15:33,13
chr3	183608422	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.15023;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:23,5:22,1
chr3	184067796	.	T	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.00038454;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:62,18:33,10:29,8
chr3	185256601	.	T	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=1.6584e-12;SS=2;SSC=117;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:24,35:11,17:13,18
chr3	185522636	.	G	GAGAGAAAGAA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.079204;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,6:22,5:5,1
chr3	185522654	.	G	GA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:15,7:12,5:3,2
chr3	186353690	.	ATATCTATATCTATAT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.032726;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:22,4:8,9
chr3	186353705	.	T	TCTA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:21,4:16,2:5,2
chr3	186597603	.	TTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0034102;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,20:5,4:19,16
chr3	186836730	.	GT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,6:5,1
chr3	186868037	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.026248;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,8:6,7:2,1
chr3	187402484	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.047306;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,11:17,8:7,3
chr3	187411083	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=7.827e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:29,36:17,22:12,14
chr3	187845993	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,2:0,0:5,2
chr3	190244160	.	C	CA	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.020615;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,11:21,7:18,4
chr3	190729296	.	A	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=1.6289e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:46,21:18,11:28,10
chr3	191661498	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0074524;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,12:6,8:6,4
chr3	192378026	.	T	TTTCTCTCTC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0069124;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,10:1,3:13,7
chr3	193706986	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0053523;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,8:7,5:5,3
chr3	194752055	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.013927;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,14:12,9:12,5
chr3	195487344	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.050324;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:32,6:11,1
chr3	195487359	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.12651;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:31,4:9,1
chr3	195489448	.	T	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.033858;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:62,8:29,1:33,7
chr3	195489724	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0172;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:12,6:19,9
chr3	195498073	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.036993;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:13,4:18,3
chr3	195505012	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.090326;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,5:18,1:26,4
chr3	195598434	.	C	CTGTGTG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.03159;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,9:7,3:10,6
chr3	195631851	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,2:5,2
chr3	195657804	.	G	C	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.026777;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:48,9:24,5:24,4
chr3	195677199	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0034858;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:11,7:10,11
chr3	195680645	.	A	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.02191;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:18,8:15,1
chr3	195682065	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.020173;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:50,11:31,4:19,7
chr3	195775470	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13206;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:0,3:20,4
chr3	195783015	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12909;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:17,4:14,2
chr3	195788323	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.057459;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:20,7:14,6
chr3	195872007	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.01451;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:26,5:15,7
chr3	195872008	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.012454;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,11:23,5:10,6
chr3	195913045	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:7,5:4,2:3,3
chr3	195969825	.	T	C	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.0048554;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:58,22:25,17:33,5
chr3	196006432	.	T	C	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.04515;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:58,13:35,3:23,10
chr3	196337050	.	TC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.39982;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:15,1:11,2
chr3	196531298	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:2,0:24,4
chr3	196768484	.	T	TTATG	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00031868;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:38,21:18,12:20,9
chr3	196973207	.	T	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.11021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:46,8:26,4:20,4
chr3	197384162	.	C	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.001321;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:72,19:27,12:45,7
chr3	197623199	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.12257;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:16,4:14,2
chr3	197897937	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.094543;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:20,4:21,3
chr4	36988	.	C	T	0	PASS	DP=346;GPV=1;SPV=0.035617;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:156,25:84,13:72,12
chr4	679239	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016027;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:17,5:9,4
chr4	1350766	.	T	TA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0020039;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,15:9,10:12,5
chr4	1590955	.	CAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
chr4	1687805	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,7:1,6:4,1
chr4	1951443	.	TACACACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.018839;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,8:9,6:6,2
chr4	1951462	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.015939;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:13,6:3,1
chr4	2728896	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0041535;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:6,7:3,1
chr4	3310033	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.19941;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:9,2:18,5
chr4	3673057	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.9248e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:13,7:16,9
chr4	4266332	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.2558e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:11,11:17,8
chr4	4581663	.	C	CA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,3:0,1
chr4	5053994	.	A	AATAAATAAATAAATAAATAAAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.013256;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:14,7:7,2
chr4	5358700	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.010572;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:6,6:5,3:1,3
chr4	5602291	.	T	TA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,3:7,2
chr4	6043111	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.0279e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:8,10:14,7
chr4	6353413	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr4	6570167	.	GAA	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0053947;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:18,6:4,3
chr4	6742478	.	AAACG	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.085385;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,1:18,3
chr4	6742485	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11618;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,1:17,3
chr4	6947661	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.031844;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,9:13,4:7,5
chr4	7175997	.	GTTT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.064151;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,2:7,4
chr4	7178846	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0050388;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,6:3,3
chr4	7373478	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.24265;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:4,4:4,2
chr4	7803190	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.4682e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,20:12,12:7,8
chr4	7900336	.	TAGCACATTTAGCATTTAGCACATTTAG	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.04524;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,2:11,9
chr4	8608649	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0065243;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:13,4:8,7
chr4	8632069	.	G	A	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.0064202;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:80,22:47,5:33,17
chr4	8657494	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=8.9472e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:11,7:12,13
chr4	8765599	.	C	CAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.039878;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,10:11,9:14,1
chr4	8829432	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.6364e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:16,11:11,10
chr4	9038283	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=6.1538e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:10,5:12,15
chr4	9272438	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:0,0:26,4
chr4	9416977	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:3,4:4,1
chr4	11662604	.	GA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00049102;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:5,8:16,5
chr4	12327953	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.011e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:14,11:12,11
chr4	12913820	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=9.0328e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:14,12:12,8
chr4	14731562	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,6:2,5:3,1
chr4	15471628	.	C	CA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.2848e-08;SS=2;SSC=78;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:3,20:3,17:0,3
chr4	16522285	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.032545;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:17,5:13,5
chr4	16919903	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTATATATA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,5:13,2:6,3
chr4	17696814	.	A	AAATG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0051175;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:9,2:15,10
chr4	17751306	.	CAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:11,6:5,2
chr4	17751823	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.30409;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,4:10,1:2,3
chr4	18534789	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,3:4,7
chr4	18764359	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:0,1:1,1
chr4	18883082	.	G	GTATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:4,5:2,1
chr4	19400971	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.041455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,1:13,3
chr4	19541224	.	G	GTA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0040779;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,10:11,7:11,3
chr4	25315712	.	GTT	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.032993;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,5:8,6
chr4	26279785	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:6,3:0,4
chr4	27253614	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.005919;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:18,3:11,6
chr4	27348730	.	A	ATCTCTC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.065471;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:1,3:12,5
chr4	31549953	.	A	ATTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0032809;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,6:3,2
chr4	31784181	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00025582;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,6:5,4
chr4	31967319	.	C	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.056718;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:8,2:11,3
chr4	32399582	.	TATATAC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,2:4,2
chr4	32829767	.	A	ATTTATATATTAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:1,2:5,2
chr4	33419054	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=9.4025e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:7,5:5,7
chr4	34198775	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00046785;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,13:13,6:9,7
chr4	34506607	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.6644e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,22:11,9:11,13
chr4	36226988	.	G	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=2.4234e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:14,9:9,13
chr4	36804353	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00025351;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:9,5:18,8
chr4	37604776	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:25,3:10,1
chr4	39187419	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,10:9,8:3,2
chr4	39208303	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,13:10,9:3,4
chr4	39693657	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:1,5:5,1
chr4	40295271	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.11287;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:49,6:27,2:22,4
chr4	40424981	.	A	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:1,2:1,2:0,0
chr4	40900454	.	G	GT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0045922;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,14:10,10:7,4
chr4	41625846	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00019536;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:12,6:5,4
chr4	41900589	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.1624e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:11,7:11,9
chr4	41963752	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.27368;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,3:5,1:6,2
chr4	42096568	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17677;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:10,3:4,2
chr4	43996437	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,2:7,2
chr4	44868702	.	C	CTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
chr4	45102348	.	G	GGAAAGAAAGAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.026299;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:15,3:2,3
chr4	46439449	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.035509;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:6,7:10,3
chr4	46853356	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0014413;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:20,7:9,8
chr4	48651289	.	C	CTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:6,2:3,3
chr4	48969828	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.7047e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:6,8:11,8
chr4	49077969	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.6435e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:9,13:15,7
chr4	49166427	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:17,2:15,2
chr4	49168066	.	C	A	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.043396;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:106,16:59,12:47,4
chr4	49186951	.	G	A	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.040226;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:69,12:35,4:34,8
chr4	49186952	.	G	A	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.017173;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:72,12:34,4:38,8
chr4	49191933	.	TTC	T	0	PASS	DP=292;GPV=1;SPV=0.048091;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:146,23:76,14:70,9
chr4	49200136	.	A	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.028346;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:25,10:7,2
chr4	49237985	.	T	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0067584;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:30,2:14,8
chr4	49240739	.	AC	A	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.041341;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:110,17:67,10:43,7
chr4	49261063	.	T	C	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.032451;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:185,27:71,14:114,13
chr4	49272511	.	T	A	0	PASS	DP=447;GPV=1;SPV=0.048344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:255:215,40:140,18:75,22
chr4	49493061	.	A	AT	0	PASS	DP=607;GPV=1;SPV=0.043452;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:316:278,38:110,20:168,18
chr4	49496659	.	A	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.042287;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:56,12:22,7:34,5
chr4	49509541	.	A	T	0	PASS	DP=518;GPV=1;SPV=0.0062804;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:226,43:160,30:66,13
chr4	49523914	.	G	C	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.027531;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:83,19:47,4:36,15
chr4	49529857	.	C	T	0	PASS	DP=302;GPV=1;SPV=0.0063826;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:163,19:65,5:98,14
chr4	49531294	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.041135;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:25,11:23,2
chr4	49535901	.	T	G	0	PASS	DP=397;GPV=1;SPV=2.2475e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:220:167,53:87,27:80,26
chr4	49555605	.	T	A	0	PASS	DP=262;GPV=1;SPV=0.006048;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:132,17:77,8:55,9
chr4	49563245	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.010338;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:10,5:10,2
chr4	49569166	.	T	C	0	PASS	DP=368;GPV=1;SPV=0.043105;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:200,23:108,13:92,10
chr4	49570692	.	C	G	0	PASS	DP=187;GPV=1;SPV=0.014016;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:81,14:26,2:55,12
chr4	49573600	.	C	T	0	PASS	DP=640;GPV=1;SPV=0.037546;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:376:325,51:174,32:151,19
chr4	49575935	.	G	A	0	PASS	DP=617;GPV=1;SPV=0.0064767;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:349:290,59:141,27:149,32
chr4	49579650	.	C	A	0	PASS	DP=374;GPV=1;SPV=0.022186;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:181,24:107,18:74,6
chr4	49579667	.	T	C	0	PASS	DP=423;GPV=1;SPV=0.021503;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:231:207,24:120,18:87,6
chr4	49616846	.	G	A	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.044458;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:67,11:43,8:24,3
chr4	49628414	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19313;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:9,3:20,1
chr4	49643728	.	G	C	0	PASS	DP=591;GPV=1;SPV=0.045671;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:343:296,47:178,25:118,22
chr4	49807936	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,4:7,2
chr4	49851921	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023879;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,5:5,1
chr4	50599090	.	T	G	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.029897;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:57,14:48,13:9,1
chr4	50660768	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.038371;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:18,1:32,6
chr4	50839265	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,3:14,1
chr4	50839266	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:7,4:14,1
chr4	51247605	.	T	A	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.00038175;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:96,14:54,6:42,8
chr4	51300765	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
chr4	51454069	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
chr4	52465363	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.017846;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:12,4:5,6
chr4	52820939	.	C	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.029435;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:10,3:30,2
chr4	53254030	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.7005e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:6,8:13,8
chr4	53857209	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0099003;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:18,8:10,1
chr4	54458417	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.01291;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,3:8,8
chr4	55510630	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.015123;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:12,12:7,6:5,6
chr4	55565973	.	GTT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0023112;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:7,6:2,2
chr4	56567442	.	GT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,5:4,4
chr4	59160279	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:21,4:10,2:11,2
chr4	59396458	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.6435e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:11,10:13,10
chr4	59594998	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,6:7,1
chr4	60337595	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0060382;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:10,8:2,3
chr4	60595364	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,5:11,5
chr4	62219080	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.037815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,3:12,2
chr4	62980196	.	GA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00010467;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:11,10:3,2
chr4	63096250	.	TGAGAGA	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:11,14:8,8:3,6
chr4	63306618	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.2971e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:5,9:15,9
chr4	64457238	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0001695;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:13,6:10,6
chr4	64746293	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,2:3,1:2,1
chr4	64888261	.	TAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:8,3:0,5
chr4	65620108	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,7:7,6:8,1
chr4	65640279	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0047357;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,12:11,4:12,8
chr4	67336359	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.022078;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,6:7,5:11,1
chr4	67584098	.	GAA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:11,4:2,3
chr4	67590745	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019045;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,4:5,3
chr4	68115356	.	CAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
chr4	68531882	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:6,5:2,3
chr4	68796080	.	GA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.020314;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:17,7:1,1
chr4	69223356	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=6.9241e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:11,13:12,8
chr4	69584226	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:1,8:1,7:0,1
chr4	69593977	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,4:14,2:9,2
chr4	70363897	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=3.2034e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:14,9:15,10
chr4	71011232	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:5,6:10,1
chr4	71443116	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,4:6,2:6,2
chr4	71812954	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.01548;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,11:1,8:3,3
chr4	71867311	.	ATGTGTGTGTGTGTGTGTG	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:3,5:6,2
chr4	73035627	.	C	CAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010538;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,10:1,8:6,2
chr4	73378217	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.7348e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:7,9:10,7
chr4	74782763	.	T	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.2489e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:28,23:15,9:13,14
chr4	75098906	.	C	CTT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00055962;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,25:7,13:12,12
chr4	75487692	.	CAT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,2:9,2
chr4	75599548	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,7:3,1
chr4	76552011	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.064336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:6,2:11,5
chr4	76720151	.	GT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,3:4,1
chr4	76756417	.	C	CT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.001437;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,11:11,5:14,6
chr4	77559921	.	C	CAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.014733;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,11:11,9:5,2
chr4	79009542	.	G	GTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:5,3:2,1
chr4	80390934	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.041156;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,7:13,3:11,4
chr4	80447132	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.039556;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:6,3:12,2
chr4	82375523	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0010246;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,10:10,9:5,1
chr4	82730585	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,8:4,7:4,1
chr4	83020773	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0079526;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,10:10,8:1,2
chr4	84894947	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0079921;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,11:8,7:5,4
chr4	85643234	.	GTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:12,1:3,3
chr4	87157514	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:1,3:1,2:0,1
chr4	87306905	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:11,4:6,1
chr4	89108575	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:12,1:16,3
chr4	89600378	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=1.0522e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,18:1,8:6,10
chr4	90870190	.	C	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.2773e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:22,25:10,17:12,8
chr4	92131666	.	T	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,6:2,1:11,5
chr4	97078479	.	CATATATAT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:5,4:1,1
chr4	99237399	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,4:2,2
chr4	99506397	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:2,1:20,4
chr4	100648830	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=8.5814e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:7,10:14,8
chr4	100702053	.	A	AC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,4:6,3:0,1
chr4	101124725	.	GAGAAAGAA	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,7:10,6:1,1
chr4	103329256	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.9835e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:38,21:19,11:19,10
chr4	104745124	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=8.5538e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:15,13:7,4
chr4	105756582	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.054281;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,6:6,1:13,5
chr4	105898328	.	GTCTC	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:10,4:7,1
chr4	106412538	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=3.4463e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:9,5:8,9
chr4	107447368	.	G	GT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.019168;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,4:9,5
chr4	107478346	.	T	TAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0033619;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,9:13,6:6,3
chr4	108694191	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=8.8825e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:15,9:10,9
chr4	108781537	.	A	ATTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:4,2:4,4
chr4	109569497	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,3:4,5
chr4	110884300	.	CAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.030702;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:1,1:2,3
chr4	111127550	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.8683e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:30,27:16,11:14,16
chr4	111253923	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:5,3:3,2
chr4	113567168	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,4:5,3
chr4	113605019	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=8.0013e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,22:9,9:9,13
chr4	114754988	.	G	GT	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=6.8419e-08;SS=2;SSC=71;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:13,8:10,12
chr4	114760198	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=7.4178e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,16:3,7:6,9
chr4	118238155	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,7:7,5:5,2
chr4	118627860	.	T	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.041297;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:30,9:14,6
chr4	118701183	.	G	GTT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.012614;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,10:13,5:8,5
chr4	118712619	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.013751;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:14,7:3,4
chr4	119260950	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,7:7,3:2,4
chr4	119505921	.	TCTC	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.883e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:13,6:14,11
chr4	120075462	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.6543e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:10,9:12,6
chr4	122444130	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.074501;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:12,6:2,2
chr4	124351183	.	C	CTTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:5,3:2,1
chr4	125828134	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0053999;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:19,10:4,7
chr4	127088245	.	T	TAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01828;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,6:4,2
chr4	127288170	.	G	GACACACACAC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.045253;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,8:10,4:13,4
chr4	127895565	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.017316;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:9,4:12,11
chr4	128166930	.	TTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.022587;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:5,5:8,2
chr4	128264482	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=1.662e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:29,25:12,11:17,14
chr4	128616674	.	C	CAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:5,4:1,1
chr4	130999757	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:0,4:3,2
chr4	131155329	.	C	CACACACACACACACACACACAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.092279;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,5:12,3:8,2
chr4	131980985	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00021002;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:9,5:14,9
chr4	133214730	.	CTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20158;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,6:9,3:4,3
chr4	134257697	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.026469;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:14,7:9,4:5,3
chr4	135352112	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013612;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:14,3:5,7
chr4	135539116	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0033813;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:12,6:3,2
chr4	136752910	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00019465;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:14,6:12,10
chr4	137904686	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=9.5082e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:11,7:12,11
chr4	138368321	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.4968e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:7,5:13,14
chr4	138582710	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.5042e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:9,11:14,7
chr4	139114561	.	T	TCCAGTCTCACACACACACACA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.011519;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,12:13,4:8,8
chr4	139579034	.	CTTTCTTT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,4:6,3:7,1
chr4	140083969	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,2:1,1:1,1
chr4	140083971	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,2:1,1:1,1
chr4	140835726	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.17513;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:25,1:11,3
chr4	140852408	.	TTTATTATTA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011004;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:7,1:8,9
chr4	141539521	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=3.777e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:4,10:6,5
chr4	143109062	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,3:7,5
chr4	143335243	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03733;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,6:4,4:1,2
chr4	144323307	.	A	AATTTGAGGATAATATCCTCAAATAT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.043916;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,11:13,4:9,7
chr4	144473366	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016244;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,10:13,6:4,4
chr4	144681421	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,9:2,6:4,3
chr4	146172129	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,4:6,2:11,2
chr4	146286200	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021517;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:16,6:13,3
chr4	147358353	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.24893;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,3:15,1
chr4	148457975	.	AT	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.4813e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,15:18,7:7,8
chr4	148807689	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,4:12,3:1,1
chr4	149331280	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,8:8,7:2,1
chr4	150674297	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.6188e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:13,12:9,8
chr4	154530741	.	TA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.059881;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:14,5:1,1
chr4	157202962	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:7,5:2,1
chr4	157248567	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:2,1:2,1
chr4	157248568	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:2,1:2,1
chr4	157274921	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048897;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:16,3:3,4
chr4	157486670	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.012653;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:26,3:15,5
chr4	157486679	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.047685;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:25,3:15,2
chr4	158529245	.	TTG	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016036;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:17,2:20,6
chr4	158964157	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,4:15,1:7,3
chr4	162223330	.	C	CA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.004173;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,13:21,10:4,3
chr4	164514816	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=8.0734e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:20,23:9,14:11,9
chr4	164873353	.	AG	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:4,1:0,1
chr4	166195617	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=9.0569e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:14,9:10,10
chr4	166665288	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.05062;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:14,2:7,2
chr4	166856811	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.053858;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:13,1:14,6
chr4	166856812	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.053838;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:19,1:19,5
chr4	168767542	.	A	AT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0087537;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:8,9:12,5
chr4	168971437	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,2:2,1:3,1
chr4	169428351	.	G	GATATATATATATATAT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.23453;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,4:12,3:13,1
chr4	169720526	.	T	TTCTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.064412;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,8:11,4:14,4
chr4	170478430	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017818;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:12,3:6,4
chr4	170478449	.	TAG	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.062683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,1:6,4
chr4	170478480	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,1:7,3
chr4	170581068	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.020124;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:4,5:3,3
chr4	170915196	.	A	AAG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,7:6,5:2,2
chr4	173399546	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.079081;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:14,3:21,4
chr4	174273323	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0041286;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,2:4,4
chr4	174909366	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11497;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:16,3:16,4
chr4	175680388	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0059953;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:16,4:12,4
chr4	178559825	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,4:2,1
chr4	180245137	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:7,3:14,4
chr4	180818931	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:2,3:5,1
chr4	181605480	.	GAGAAAGAAAGAAAGAA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,2:6,2
chr4	181953298	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:12,7:6,5:6,2
chr4	182030528	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.0729e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:19,10:11,7
chr4	182098963	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0023306;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:6,1:1,5
chr4	182220384	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.18182;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:3,2:2,1:1,1
chr4	182456905	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=9.9016e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:17,21:8,10:9,11
chr4	183045502	.	A	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=7.6151e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:36,20:18,9:18,11
chr4	183198789	.	T	TAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:4,8:3,4
chr4	183341967	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,2:4,4
chr4	185216513	.	GT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01327;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:11,7:6,3
chr4	185877871	.	AAAC	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.017166;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,4:10,3
chr4	186446583	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.2952e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:11,6:17,9
chr4	186475348	.	GAA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.073845;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:20,5:6,1
chr4	186478438	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.12939;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:18,2:11,2
chr4	186651039	.	TTTA	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.058259;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:17,4:14,1
chr4	187055034	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.064462;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,3:16,1
chr4	187630481	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.0618e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:13,9:9,9
chr4	188780081	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0050575;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:8,5:0,1
chr4	188936870	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.013649;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:10,3:11,5
chr4	188974270	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1371;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:9,1:5,2
chr4	189490834	.	C	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.20894;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:9,2:8,1
chr4	189743894	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,1:18,3
chr4	189836362	.	ACACCAT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.16556;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,4:12,3:19,1
chr4	189881455	.	A	C	0	PASS	DP=476;GPV=1;SPV=0.014385;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:299:254,45:98,23:156,22
chr4	190025179	.	CAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,1:4,5
chr4	190044812	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.031895;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:16,2:13,2
chr4	190054909	.	CCTGTA	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.027384;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:11,5:10,3
chr4	190095436	.	C	G	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0085394;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:96,13:47,6:49,7
chr4	190118950	.	G	A	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.0039489;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:74,11:32,5:42,6
chr5	59933	.	TGTA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0052836;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,9:7,3:6,6
chr5	328255	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:9,3:4,1
chr5	436256	.	GAGGGACCCACCACCCCT	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.03948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:17,1:24,5
chr5	608766	.	TGTGGGAGCGTGCGCTGGGATGGGGAGGGGTCACTGTGAGCACGGTGCGTC	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:8,1:18,5
chr5	629839	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,1:8,3
chr5	629945	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,2:7,8
chr5	710921	.	T	TGA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,1:9,4
chr5	1042652	.	GTGAGTTAGTGAA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.35726;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,4:9,2:9,2
chr5	2794836	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=8.3106e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:3,6:16,10
chr5	2798125	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.1412e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,23:9,10:12,13
chr5	2940178	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.2005e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:7,5:14,9
chr5	3324107	.	T	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.044728;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:53,10:16,6:37,4
chr5	3751219	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=8.063e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:10,8:8,8
chr5	4009290	.	TGATA	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10265;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:17,2:13,3
chr5	4583580	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.3648e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:32,22:13,14:19,8
chr5	5305111	.	CCACA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:6,3:7,1
chr5	5305356	.	C	CAG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.16972;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:18,3:10,1
chr5	5817171	.	TAGATAGATGATA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,4:12,3:8,1
chr5	7016947	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.028009;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,8:7,6:3,2
chr5	7112066	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.9746e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:31,18:17,8:14,10
chr5	7989144	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.3827e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:16,11:10,6
chr5	9704363	.	GA	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.4592e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:11,10:6,6
chr5	9796721	.	GA	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00086785;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:9,11:5,9:4,2
chr5	10758417	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0076062;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:13,7:10,7
chr5	12333595	.	A	ATATATG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0050975;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,9:10,4:5,5
chr5	12628150	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,5:4,4:2,1
chr5	13347332	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.027067;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:15,9:3,2
chr5	13379088	.	CAT	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.011905;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:35:0,6:0,2:0,4
chr5	13422513	.	T	TA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17217;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:7,3:2,2
chr5	14116340	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,2:4,2
chr5	14793007	.	A	AAAAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.25926;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
chr5	14975431	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,6:7,2
chr5	15188580	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.1848e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,20:10,10:8,10
chr5	15662852	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=8.4091e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:7,10:10,7
chr5	15664469	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:5,3:10,2
chr5	15942324	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018839;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,5:4,3
chr5	16299826	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.6639e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:11,7:13,11
chr5	16792110	.	TACAC	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.16556;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:21,3:10,1
chr5	17137530	.	C	CT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00013176;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:7,8:15,9
chr5	17583646	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
chr5	17849095	.	CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:0,1:2,4
chr5	17899698	.	TTATC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.057437;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:21,4:10,2
chr5	17899720	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.070174;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:20,4:7,1
chr5	18149172	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:38:0,2:0,0:0,2
chr5	18507863	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.7295e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:22,21:8,12:14,9
chr5	18976341	.	ATG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.065377;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:9,1:17,4
chr5	20056680	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,11:6,10:0,1
chr5	20271560	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.0865e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:8,8:12,8
chr5	20757924	.	C	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.025831;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:21,3:22,6
chr5	20881099	.	G	GTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0060573;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,2:1,5
chr5	21489456	.	TA	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.04801;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:55,9:33,5:22,4
chr5	22036158	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=3.5059e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:17,28:10,9:7,19
chr5	23521237	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.7585e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:10,6:13,10
chr5	23965892	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.9236e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:13,8:5,7
chr5	24563597	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,9:5,8:1,1
chr5	24651517	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=3.9467e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:11,12:14,8
chr5	25020096	.	ATCCCTTAAAAAATGT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03735;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
chr5	25235811	.	CAT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.095104;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,2:17,2
chr5	25576719	.	CCTTT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00019727;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,11:8,2:6,9
chr5	26606116	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.1801e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:15,13:9,4
chr5	26955604	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.15343;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,1:20,3
chr5	27968898	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00751;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:7,5:11,9
chr5	28251892	.	AAG	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:8,4:5,3:3,1
chr5	28972704	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00058098;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:32,18:11,9:21,9
chr5	29013269	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=2.6556e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:6,12:17,9
chr5	29429312	.	G	GAAAAAAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.013474;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,10:8,9:8,1
chr5	29862401	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.1225e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:13,10:11,12
chr5	30153936	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0005395;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:20,7:15,5
chr5	30707695	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:11,3:4,1
chr5	31777926	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.19365;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:20,2:13,2
chr5	32281899	.	C	CAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.022955;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:11,8:9,4
chr5	32499604	.	T	TTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.046405;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,8:19,3:11,5
chr5	32551720	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.6375e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,18:10,10:3,8
chr5	33097535	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=6.9536e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:18,9:9,11
chr5	34087880	.	G	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.033526;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:26,6:20,3
chr5	35014452	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,8:6,7:3,1
chr5	35433032	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=8.0199e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:9,10:8,5
chr5	35824242	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.5343e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:9,8:15,8
chr5	36322414	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0035678;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:10,7:8,9
chr5	36738638	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13122;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:15,1:10,4
chr5	38333916	.	GT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:5,3:3,2
chr5	39781530	.	C	CAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00083905;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:4,14:3,12:1,2
chr5	40023602	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,8:6,6:2,2
chr5	42310527	.	CT	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:4,1:0,1
chr5	42579128	.	TA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0432;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,1:11,3
chr5	42650578	.	C	CATAT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00030514;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:11,18:7,11:4,7
chr5	42739692	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0018511;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,9:1,4:0,5
chr5	42900260	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.9862e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:18,24:2,14:16,10
chr5	42902678	.	ATTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,6:5,1
chr5	43198209	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.20154;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,6:3,4:23,2
chr5	43560061	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.1439;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:13,2:15,2
chr5	44060310	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=5.8369e-10;SS=2;SSC=92;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,23:12,11:6,12
chr5	44451477	.	TTG	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
chr5	45890883	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:19,3:9,1
chr5	46582296	.	G	A	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.027768;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:126,16:36,4:90,12
chr5	46667716	.	G	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,3:8,1
chr5	46672473	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:0,0:18,4
chr5	46721513	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:4,3:28,1
chr5	46746519	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,7:2,1
chr5	47115870	.	C	A	0	PASS	DP=248;GPV=1;SPV=0.033326;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:110,19:39,14:71,5
chr5	47119711	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.017792;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:50,9:22,6:28,3
chr5	47143865	.	C	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.017331;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:48,15:37,11:11,4
chr5	47210350	.	T	A	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.008825;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:74,20:55,11:19,9
chr5	47210473	.	T	A	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.031909;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:92,21:42,4:50,17
chr5	49661142	.	C	T	0	PASS	DP=337;GPV=1;SPV=0.016263;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:159,37:77,19:82,18
chr5	50621975	.	A	AAAAGAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,10:12,9:4,1
chr5	50905586	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.6642e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:31,23:19,15:12,8
chr5	50913028	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.0101e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:6,8:10,7
chr5	51991814	.	T	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.0109e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:20,22:11,5:9,17
chr5	54092047	.	A	AACACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022251;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:9,6:10,2
chr5	54549504	.	A	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.9279e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:10,9:14,7
chr5	54925925	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:2,6:1,2
chr5	55372892	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,10:5,9:4,1
chr5	56173541	.	CCTCT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0069996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,7:1,4:5,3
chr5	57138557	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.094639;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,2:10,3
chr5	59806844	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=5.5655e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,24:10,8:15,16
chr5	61942589	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,3:0,3:0,0
chr5	62236304	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.041472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:15,3:18,2
chr5	62248035	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.022833;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:18,1:19,7
chr5	64937921	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.062192;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,4:6,2
chr5	65707395	.	T	TAC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.03548;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,8:17,4:9,4
chr5	67049035	.	A	ACACG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,3:13,1
chr5	67339629	.	C	CCTTTCTTCCTTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,7:5,3:9,4
chr5	68237131	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=1.5429e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:24,25:11,18:13,7
chr5	68240687	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.6883e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:7,8:14,10
chr5	69377612	.	TAC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:11,3:9,1
chr5	69515608	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13122;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,1:13,4
chr5	69610330	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.20823;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:22,3:13,1
chr5	69906805	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
chr5	70503142	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.15614;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:0,0:28,4
chr5	70678178	.	G	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.046569;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:74,13:34,9:40,4
chr5	70755720	.	C	CACAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
chr5	72130276	.	T	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=5.6452e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:28,25:12,14:16,11
chr5	72522028	.	TTATATA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,2:3,2
chr5	74111166	.	A	AAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,2:3,4
chr5	74702067	.	CTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,3:3,2
chr5	75200297	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:5,6:8,3
chr5	76503174	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,5:2,2:4,3
chr5	77945005	.	A	AG	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.051974;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:16,3:17,2
chr5	77948482	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.039653;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:8,5:6,1
chr5	78455041	.	AT	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.052957;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:44,7:18,2:26,5
chr5	78455090	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.044064;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:13,2:24,5
chr5	78749499	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:1,2:0,0:1,2
chr5	78753391	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.10395;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,1:15,3
chr5	78848273	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:2,1:3,7
chr5	79138859	.	T	TTATATATATA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0016175;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,11:9,7:13,4
chr5	79456145	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,9:3,6:0,3
chr5	79606106	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032529;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:18,6:2,2
chr5	79782528	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.032095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,2:7,4
chr5	79842655	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.467e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,19:11,11:21,8
chr5	80388623	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010143;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,14:4,11:4,3
chr5	80602612	.	G	GATATAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.013474;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:11,8:5,2
chr5	80654917	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.10395;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,3:19,1
chr5	81296613	.	C	CTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,4:5,1
chr5	82059664	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.042579;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:18,3:18,4
chr5	82592361	.	TCCTCC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:3,3:12,1
chr5	83550887	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,5:4,1
chr5	83854054	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:6,3:1,2
chr5	84160742	.	TTTCTTTCCTTTCC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:4,3:5,3
chr5	84340548	.	A	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,2:4,1:3,1
chr5	84800768	.	A	AGAAGGAAGGAAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:14,3:1,1
chr5	85167738	.	GGTTT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,5:0,1
chr5	86206231	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.024795;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
chr5	86348377	.	T	TA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.043401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:15,5:17,1
chr5	88079405	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.03619;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:14,3:20,4
chr5	88215877	.	T	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=7.5915e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:29,22:17,11:12,11
chr5	88702983	.	T	TAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018961;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:16,6:1,2
chr5	89568337	.	ATT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,5:3,2
chr5	90114719	.	AAT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0031357;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:13,8:10,9
chr5	90281470	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=8.5986e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:14,20:9,12:5,8
chr5	91014136	.	C	CCACACACACACACACA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,6:10,5:6,1
chr5	91179947	.	A	AG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:7,3:1,4
chr5	92113985	.	GTATATATA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:2,2:2,2
chr5	92346045	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,2:6,1:0,1
chr5	92717487	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,1:10,3
chr5	93040928	.	CTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.10283;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,7:11,4:6,3
chr5	93080862	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,4:3,2
chr5	93123893	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.6554e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:9,12:13,6
chr5	93793239	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,3:4,3
chr5	95134992	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:10,4:0,0
chr5	95326965	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
chr5	96579179	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.4707e-10;SS=2;SSC=98;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:16,26:8,12:8,14
chr5	96648728	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.019526;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:20,7:13,2
chr5	97614899	.	CAG	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056191;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,3:5,4
chr5	98103764	.	T	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=2.915e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:32,31:12,13:20,18
chr5	99470884	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.053387;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:16,3:13,1
chr5	99523793	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.020202;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:19,7:13,2
chr5	99535107	.	C	CTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.017445;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:2,5:8,1
chr5	100006299	.	TA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00018181;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:3,5:4,7
chr5	103754429	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,8:0,6:4,2
chr5	105144833	.	AT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,1:1,3
chr5	105331051	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.3543e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:9,9:8,10
chr5	105366838	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
chr5	106254272	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=7.0453e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:5,6:11,4
chr5	107013991	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029515;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:4,5:3,2
chr5	107097634	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016427;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,3:6,7
chr5	107435315	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,4:3,3:3,1
chr5	107766518	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,10:2,7:4,3
chr5	110102154	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00046953;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,16:20,6:11,10
chr5	111410285	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.9448e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:10,8:7,4
chr5	111413801	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.0268e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:11,9:9,10
chr5	113333838	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
chr5	113776664	.	G	GA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.014951;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:10,9:14,7
chr5	115725800	.	C	CT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.9869e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:15,10:6,6
chr5	117993358	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.01943;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:14,4:17,8
chr5	118087859	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00012866;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:15,8:9,8
chr5	118438416	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17119;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:7,1:13,5
chr5	119880334	.	C	CAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.086635;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:16,2:8,3
chr5	120737307	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,6:7,5:5,1
chr5	120829860	.	CTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:6,3:5,1
chr5	122329262	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.002076;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:11,3:7,5
chr5	123053488	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,2:0,0:4,2
chr5	124559310	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0080824;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:10,10:8,3
chr5	125130486	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,2:0,1:1,1
chr5	126163846	.	CAT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17217;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:2,1:7,4
chr5	126481221	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:7,2:10,2
chr5	126536120	.	CAA	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:24,2:9,2
chr5	126688340	.	G	GT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.31269;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:14,5:6,1
chr5	126973879	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0082825;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,4:5,4
chr5	127119095	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045968;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,6:12,4:4,2
chr5	131523279	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,7:5,1
chr5	131820074	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.025884;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:13,9:7,4
chr5	137076608	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:5,3:4,1:1,2
chr5	138756027	.	CTTAT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.011669;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:14,6:11,6
chr5	140052681	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.0101e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:6,9:10,6
chr5	140636480	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00046416;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,20:10,10:11,10
chr5	142075636	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,2:10,2
chr5	143254319	.	C	CAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:13,3:1,1
chr5	144590836	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=6.0795e-10;SS=2;SSC=92;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:21,26:11,11:10,15
chr5	146496869	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.051469;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:14,6:3,1
chr5	146509492	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00011224;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:4,5:9,4
chr5	146580713	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.12392;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,2:17,2
chr5	148588529	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,1:5,3
chr5	149354836	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,4:5,1
chr5	149784560	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:6,4:2,2
chr5	150463069	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
chr5	150493168	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:6,2:2,2
chr5	152277161	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=8.5814e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:10,7:11,11
chr5	152847763	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0019458;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:13,8:14,2
chr5	153163069	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.605e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:8,8:8,9
chr5	154003178	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015873;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,4:5,4
chr5	154064160	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,6:3,1
chr5	155443463	.	C	CTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.036581;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:10,3:12,8
chr5	156009081	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=1.6252e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:10,6:17,13
chr5	158226194	.	ATATATATATATATATATTTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:3,6:3,4
chr5	160092013	.	G	GATATATATATATATAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,8:3,4:1,4
chr5	160233880	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,4:6,2:11,2
chr5	162160353	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.9315e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:27,22:9,12:18,10
chr5	163131669	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,4:4,5
chr5	163143077	.	C	CTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,5:3,4:3,1
chr5	164790169	.	GTA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:7,13:3,7:4,6
chr5	166418120	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.9527e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:13,10:10,12
chr5	166892730	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.006192;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:3,4:1,1
chr5	167597162	.	TTTC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00057702;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:8,8:8,3
chr5	168777109	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.014656;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,8:6,2:7,6
chr5	170316063	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0055835;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,12:1,4:4,8
chr5	170860295	.	TAA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:12,2:2,3
chr5	171415713	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,10:4,7:5,3
chr5	172348653	.	TC	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.025658;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,6:9,5:9,1
chr5	172978676	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:20,1:4,3
chr5	173166560	.	GATATATATAT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,8:7,4:1,4
chr5	173302768	.	A	AGT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0016605;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:13,2:12,6
chr5	173622113	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0070885;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,4:3,3
chr5	174272340	.	T	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.8504e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:16,13:11,11
chr5	174426387	.	G	GCTCGCTCACTCA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.010954;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,12:15,9:11,3
chr5	174837994	.	A	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.9011e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:30,28:23,13:7,15
chr5	175313714	.	CCTCT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,3:3,2
chr5	175650718	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.074196;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:14,1:27,4
chr5	175650720	.	TC	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.073933;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:11,1:27,4
chr5	175958254	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0025282;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:13,2:15,6
chr5	176048461	.	A	AG	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.008914;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:22,9:14,3
chr5	177480969	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:6,3:5,7
chr5	177672070	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028928;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:19,6:12,1
chr5	177749020	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,3:8,1
chr5	177767877	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.26573;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,3:10,1
chr5	177885544	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011208;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,6:8,2
chr5	177920547	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:6,8:4,2
chr5	177988854	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.16401;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,3:8,1:13,2
chr5	178025459	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.03318;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:16,5:14,7
chr5	179004688	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.051469;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:12,5:5,2
chr5	179376012	.	A	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr5	179479049	.	CTTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,8:10,3:5,5
chr5	179642093	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0076491;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:11,9:17,5
chr5	179674561	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,3:5,1
chr5	180015736	.	GA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.37843;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,4:19,3:4,1
chr5	180174491	.	C	CGT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.046386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:18,2:5,3
chr5	180228444	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:1,5:5,5
chr6	1948483	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=7.8657e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,17:9,12:5,5
chr6	4247407	.	GT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:7,3:2,1
chr6	4923902	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,2:3,1:4,1
chr6	5493209	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0042621;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:10,7:4,4
chr6	5503405	.	CAGAGAG	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:5,4:2,1:3,3
chr6	6046596	.	A	AAT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,2:6,2
chr6	6722660	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:5,3:1,1
chr6	7000651	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:10,8:0,1
chr6	7117388	.	GTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,9:8,7:1,2
chr6	7286916	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.023277;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,9:9,6:4,3
chr6	7838974	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=8.258e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,20:4,3:14,17
chr6	8853685	.	CACACACACACACACAG	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,4:3,2:4,2
chr6	9146089	.	TATAG	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,1:11,3
chr6	9303915	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:1,2:0,0:1,2
chr6	10993857	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,8:6,7:6,1
chr6	10994483	.	A	AAGAAAAG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.003663;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,10:0,6:1,4
chr6	11501455	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.2608e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,20:10,10:6,10
chr6	11855203	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,6:4,3:1,3
chr6	12348035	.	CTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.062457;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:3,2:17,3
chr6	13458757	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,13:14,11:1,2
chr6	13507347	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,4:7,3:8,1
chr6	13793125	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0044521;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,10:3,9:2,1
chr6	13926792	.	T	TG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00018595;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,16:10,9:13,7
chr6	13926794	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00016529;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,17:11,10:12,7
chr6	14754524	.	ATTTTTTTT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,9:8,7:2,2
chr6	14998417	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.001935;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,3:2,4
chr6	15818956	.	A	AC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,6:0,2:2,4
chr6	16391161	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,5:5,1
chr6	18290629	.	C	CTTTATTTATTTATTTA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10026;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,1:16,4
chr6	18749571	.	G	GCGCGCA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:16,3:6,1
chr6	18769079	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,3:1,2:2,1
chr6	18939913	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.030216;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,1:5,3
chr6	19567413	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.6453e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:6,12:8,7
chr6	19894547	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.2173e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:13,9:14,12
chr6	21889339	.	C	CT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:0,5:2,1
chr6	23667897	.	C	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.002997;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:0,5:0,2:0,3
chr6	23797596	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,3:2,2:0,1
chr6	23971680	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.8775e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,16:10,9:6,7
chr6	25031699	.	TTATATATATATA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:3,2:4,2
chr6	27105858	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=3.3508e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:10,9:11,11
chr6	27777967	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,4:2,3
chr6	29462079	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.5219e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:10,9:11,9
chr6	31854578	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.032284;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,4:9,3
chr6	32027543	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
chr6	32135286	.	T	TAAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:13,3:4,1
chr6	32238597	.	T	TA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:11,3:3,6
chr6	33154868	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:6,2:3,2
chr6	33481609	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.22017;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:15,2:16,3
chr6	34192501	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,8:2,5:5,3
chr6	34416799	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.011976;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,8:7,7:5,1
chr6	34428911	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:10,1:6,4
chr6	38328564	.	CGT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037585;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,6:6,3
chr6	39149355	.	TCACACACA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,6:11,2
chr6	39149365	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,6:9,2
chr6	39152883	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:1,2:0,0:1,2
chr6	40113988	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,1:9,3
chr6	40113989	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,1:9,3
chr6	40491504	.	G	GTC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00058463;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:10,7:9,8
chr6	40583202	.	A	ATATATACACTATATACATATATAG	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0030487;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,10:12,6:5,4
chr6	41415989	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1672;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:17,2:16,2
chr6	41730964	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=8.0594e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:12,7:16,9
chr6	42636180	.	TTG	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.043779;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:5,4:10,3
chr6	42990699	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,4:6,2
chr6	43870747	.	T	TTTCCTTCC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:3,3:4,1
chr6	44182285	.	C	CCA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043302;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,13:22,7:5,6
chr6	44492865	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:12,3:5,2
chr6	45180518	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,4:15,3:7,1
chr6	45831858	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.002743;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,27:9,11:12,16
chr6	46263477	.	G	GTA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:7,7:2,5:5,2
chr6	47056841	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0059539;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:6,8:2,1
chr6	47582786	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075102;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,1:10,3
chr6	47775858	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=2.5416e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:32,24:19,11:13,13
chr6	48261664	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.065169;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:15,5:18,1
chr6	48993875	.	G	GATATATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,3:8,1
chr6	49073002	.	A	ACG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,6:9,3:2,3
chr6	49349888	.	CAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058443;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:17,3:1,2
chr6	50609954	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0010173;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,6:11,7
chr6	51975626	.	T	TAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.035782;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,4:5,2
chr6	52810109	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.3687e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:9,13:15,11
chr6	53707006	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.001804;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,15:9,6:5,9
chr6	54414560	.	GGTGTGT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015549;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:8,6:10,4
chr6	55539859	.	G	GAAGAAAGA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:9,3:2,1
chr6	55853195	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:7,1:3,3
chr6	56053862	.	A	AGT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.15275;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,5:15,3:4,2
chr6	56260876	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:13,3:3,1
chr6	59006644	.	G	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.00019944;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:55,15:26,7:29,8
chr6	59643763	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.2008;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:10,2:26,2
chr6	59707692	.	T	C	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.041603;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:64,10:11,1:53,9
chr6	61309829	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.4806e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:6,5:12,14
chr6	63505553	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.28142;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,3:7,1
chr6	63973297	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.8722e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,18:13,9:13,9
chr6	64085342	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:16,1:7,3
chr6	64094733	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=5.7856e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,22:14,10:11,12
chr6	64643112	.	T	TCC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01327;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,10:8,5:9,5
chr6	64758447	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.339e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:12,6:11,9
chr6	65268336	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=8.8931e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:14,11:10,9
chr6	66020600	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.0729e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:18,8:12,9
chr6	67213948	.	GATAT	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.038102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,5:9,4:13,1
chr6	67291667	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=5.5655e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,24:15,19:10,5
chr6	67368956	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0088608;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:11,8:1,1
chr6	67432489	.	CTATATATAGGT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:5,3:9,2
chr6	68139482	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0065845;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:12,7:13,2
chr6	68453959	.	GATATATATATATATAT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,6:2,2:1,4
chr6	68511146	.	G	GTATATATATATATATA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:7,4:0,0
chr6	68643438	.	C	CTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.32759;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:8,1:10,2
chr6	68903992	.	G	GA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:10,6:3,1
chr6	71386851	.	G	GTTTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:3,5:6,1
chr6	71788649	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=6.1955e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:15,10:13,6
chr6	72500207	.	AAG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.32898;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,3:23,2:4,1
chr6	73197580	.	TAC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,7:7,5:3,2
chr6	73777119	.	T	TG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02457;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:4,8:12,4
chr6	73839726	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.044913;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,3:5,3
chr6	74207299	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.016983;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,4:1,4:0,0
chr6	75620082	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.015238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,9:3,8:6,1
chr6	75965626	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:2,3:15,1
chr6	77485758	.	A	ATC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10931;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,1:15,3
chr6	77603242	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.19341;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,3:15,1
chr6	78679138	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,8:11,6:4,2
chr6	80625694	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0062662;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:6,8:3,1
chr6	81549622	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02948;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,7:9,6:4,1
chr6	81622692	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.3613e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:15,6:12,12
chr6	82560513	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.023055;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:9,1:20,6
chr6	82727946	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:4,3:5,1
chr6	85837908	.	G	GCTCTCC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.057027;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,6:20,2:6,4
chr6	87128528	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
chr6	87576511	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066077;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:13,2:9,3
chr6	87673155	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.36477;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,4:12,1:3,3
chr6	88817749	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,4:5,2
chr6	89226316	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0083603;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:14,2:3,12
chr6	90100726	.	CAG	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.039826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:16,3:16,4
chr6	90869070	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0022624;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:2,6:0,2:2,4
chr6	92362251	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.2304e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:33,22:13,8:20,14
chr6	93972375	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.8499e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:13,10:10,9
chr6	93972376	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.4089e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:13,10:8,8
chr6	94734298	.	T	TATA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:2,3:2,3
chr6	95206300	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.2103;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,2:15,2
chr6	95222683	.	C	CTTTATTTA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011012;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,7:1,4:7,3
chr6	95486213	.	CAT	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.033212;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:19,5:18,8
chr6	95986165	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00023962;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,14:8,13:1,1
chr6	97518133	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:1,5:0,1:1,4
chr6	97752884	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0042363;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:5,15:2,9:3,6
chr6	99194841	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.5862e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:19,26:8,12:11,14
chr6	99536268	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,1:6,3
chr6	99854166	.	T	TCTTTCTTTCTTG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18054;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,7:11,1:14,6
chr6	100278030	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=6.7064e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:6,8:10,7
chr6	101006187	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=7.6418e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,19:10,11:9,8
chr6	101464501	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:4,3:0,2
chr6	101478574	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.1349e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,23:7,6:9,17
chr6	101920016	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.1925e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:13,8:11,11
chr6	102592586	.	TAC	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,2:2,2
chr6	103119646	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.6846e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:29,21:17,11:12,10
chr6	104416698	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=9.9525e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,6:6,6
chr6	106471817	.	GAA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013986;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:0,3:0,2:0,1
chr6	106542608	.	CATTTTATTTT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.012393;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:2,4:10,3
chr6	106946765	.	AAT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0037028;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,1:8,4
chr6	107464075	.	T	TTA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=7.6853e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,10:2,6:0,4
chr6	108179492	.	CTG	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011625;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,12:2,6:2,6
chr6	108194201	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.1416e-12;SS=2;SSC=119;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:2,20:1,9:1,11
chr6	110963703	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00027326;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,9:3,7:0,2
chr6	111100952	.	TTCTCTCCC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:4,3:0,1
chr6	111523087	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.01202;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:9,2:6,4
chr6	111526908	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,2:13,2
chr6	111532656	.	G	GTTTTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.015851;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,4:5,1
chr6	112273188	.	G	GT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:2,3:1,2
chr6	112340122	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0098578;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,4:1,3:0,1
chr6	112815220	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=1.1468e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:4,12:1,6:3,6
chr6	113143734	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00012036;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:1,3:4,3
chr6	113647950	.	CTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:1,6:3,2
chr6	113855010	.	CTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:0,5:3,1
chr6	114744473	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:2,2:2,2:0,0
chr6	114872481	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035975;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,1:8,3
chr6	114957420	.	ATCTCTC	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.004156;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:1,5:3,4
chr6	115030939	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00074646;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:2,7:2,3:0,4
chr6	118540758	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:6,3:3,1:3,2
chr6	118567249	.	GTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:0,3:0,1:0,2
chr6	118638207	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00027194;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,4:3,3
chr6	118746433	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00090356;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,4:3,3
chr6	122703941	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030207;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,2:3,2
chr6	122799961	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:1,5:3,1
chr6	124716810	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0014706;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,3:0,1:0,2
chr6	125140009	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00019367;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:1,3:5,6
chr6	125946953	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0024264;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,6:3,2
chr6	127538842	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.000258;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:0,6:0,2:0,4
chr6	127543935	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0001754;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,7:1,5:0,2
chr6	128658432	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=6.0551e-13;SS=2;SSC=122;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:3,21:2,12:1,9
chr6	129256763	.	C	CAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:5,3:1,1
chr6	130154695	.	GAAAAAAAA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,4:0,3:1,1
chr6	131367234	.	TA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00027385;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,3:3,7
chr6	131669655	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0019985;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:2,7:4,1
chr6	131701894	.	A	AAAAG	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.018284;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:48,13:32,4:16,9
chr6	132717180	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.026298;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:8,2:6,4
chr6	137107283	.	TTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:0,4:3,3
chr6	137684774	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.42424;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,2:0,1:6,1
chr6	139152418	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:3,5:0,1
chr6	139391578	.	A	AATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00055741;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:2,3:2,3
chr6	139423756	.	A	ATT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0085588;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,3:3,3
chr6	140681966	.	TAC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0032151;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:2,7:2,5:0,2
chr6	141236493	.	TC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=3.2572e-11;SS=2;SSC=104;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:3,16:1,6:2,10
chr6	142862557	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033752;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:10,6:13,3
chr6	144030254	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00027871;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:2,6:2,1
chr6	144854279	.	TG	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.012218;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,4:7,1
chr6	145079334	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.017294;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,5:7,1
chr6	145390563	.	T	TTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=1.6227e-06;SS=2;SSC=57;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,11:0,6:1,5
chr6	147113553	.	G	GT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0063768;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:2,5:4,3
chr6	148310424	.	G	GA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=8.7675e-06;SS=2;SSC=50;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,12:0,8:3,4
chr6	148368774	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
chr6	148429385	.	TAAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.005418;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,10:4,8:0,2
chr6	148482688	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.028937;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,1:5,3
chr6	148510995	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013595;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,11:3,8:2,3
chr6	148537776	.	CTGTGTGTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0012276;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:3,6:4,3
chr6	149182971	.	C	CA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.6076e-11;SS=2;SSC=107;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:6,21:2,12:4,9
chr6	149253940	.	AAG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:5,1:5,3
chr6	149498307	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013155;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:4,4:2,2
chr6	149711255	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00035303;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:32:1,5:0,1:1,4
chr6	150494265	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.004329;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:33:0,2:0,1:0,1
chr6	150547198	.	T	TGAAATAAAAGCAAACAGGCAGACTC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=7.4322e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:1,4:2,4
chr6	150806223	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016601;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,3:1,1
chr6	151374930	.	T	TA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00041113;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:2,7:3,1
chr6	153229197	.	C	CTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=4.1725e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,13:6,8:2,5
chr6	154572176	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:1,1:0,1
chr6	154955391	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.020734;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:2,3:1,1
chr6	155112125	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,4:3,3
chr6	157010640	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:1,3:0,1:1,2
chr6	157062708	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040303;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,2:8,3
chr6	158260824	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.012255;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,3:2,1:0,2
chr6	158365881	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.006993;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,4:0,0:1,4
chr6	158438604	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00037527;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:30:2,6:1,4:1,2
chr6	158957669	.	C	CAA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,5:2,4:0,1
chr6	159010668	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=9.8367e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,11:1,8:0,3
chr6	160000728	.	GTT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:5,3:1,2
chr6	160399614	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.8199e-13;SS=2;SSC=125;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:5,23:2,10:3,13
chr6	160584170	.	TTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:2,2:7,6
chr6	161859610	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:6,5:2,1
chr6	163603806	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.018062;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
chr6	165128078	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,5:3,2:0,3
chr6	166005467	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.3223e-11;SS=2;SSC=108;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:4,16:3,7:1,9
chr6	166449922	.	C	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0017012;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,5:7,2
chr6	166449945	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0032306;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:0,5:5,2
chr6	167338868	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,0:9,4
chr6	167671652	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.008228;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,1:6,5
chr6	168309421	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.032849;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
chr6	168311597	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023923;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,3:1,1:1,2
chr6	168714925	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:1,2:0,0:1,2
chr6	169024831	.	T	TCGG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,2:0,0:2,2
chr6	169032514	.	GA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00084958;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:2,2:3,8
chr6	169186616	.	T	TGCCATGAGCTCAATAAACCCCACTACGCCCTC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00048033;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:2,2:1,4
chr6	169923874	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=2.8145e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,8:0,2:0,6
chr6	170394572	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014432;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:3,4:16,2
chr6	170398819	.	G	T	0	PASS	DP=255;GPV=1;SPV=0.004943;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:96,11:60,5:36,6
chr6	170453100	.	AGTGTAT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.018737;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:16,3:0,2
chr6	170453117	.	G	GT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.034379;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:14,2:4,4
chr6	170743352	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.076398;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:47,6:22,4:25,2
chr7	1258930	.	A	ATTTTTTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,6:2,3:0,3
chr7	1504780	.	C	CTAATAATAATAA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.035377;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:20,4:15,6
chr7	2515047	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022502;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:14,5:3,2
chr7	2519556	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.7206e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:17,8:8,10
chr7	3147626	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0025203;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:5,17:4,14:1,3
chr7	3485683	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:6,2:1,3
chr7	3655485	.	ATATATATATATATATATATG	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
chr7	5097841	.	C	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:5,1:7,4
chr7	5364459	.	GA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.029599;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,8:13,5:8,3
chr7	5886635	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018485;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:7,5:3,5
chr7	5942560	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0064122;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,9:8,2
chr7	6049645	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,5:3,1:3,4
chr7	6174539	.	G	GTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,8:4,3:4,5
chr7	6372792	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:9,5:4,2
chr7	6807540	.	A	G	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.045587;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:49,15:24,7:25,8
chr7	7649158	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,4:13,3:6,1
chr7	7673310	.	TAGCAGC	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.012896;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,15:17,7:8,8
chr7	8739171	.	TA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:8,2:5,3
chr7	9322189	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00025134;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,10:9,5
chr7	11248413	.	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0052504;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,15:9,10:17,5
chr7	12946653	.	ATTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087294;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:11,5:2,2
chr7	13213807	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030651;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:5,1:6,4
chr7	13778320	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:3,5:5,1
chr7	14265318	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:4,3:3,1
chr7	14340159	.	CTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:8,3:0,2
chr7	15356953	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:11,11:1,1
chr7	16342820	.	C	CATATATAG	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:4,2:1,2
chr7	16732383	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:6,2:15,2
chr7	17540920	.	A	ATT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,2:6,2
chr7	17751092	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=4.6765e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:13,9:3,4
chr7	18257118	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048962;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,5:4,2:7,3
chr7	18783838	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.5134e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:14,8:8,8
chr7	18980778	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15091;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:12,2:9,3
chr7	21179338	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.6188e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,10:7,8
chr7	22000749	.	A	AAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,4:4,1:0,3
chr7	22615614	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.07e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,19:11,11:8,8
chr7	23243947	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:9,3:6,1
chr7	23382894	.	C	CAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:6,4:3,1
chr7	23937962	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.5717e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,18:4,13:9,5
chr7	24503296	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.863e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:13,6:6,10
chr7	24599525	.	T	TTTTTTTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.098151;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,6:11,2:11,4
chr7	25018615	.	C	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.25735;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:8,2:11,1
chr7	26252693	.	GA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11245;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:30,4:9,1
chr7	27100382	.	C	CA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00020455;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:10,5:16,6
chr7	27288061	.	C	CAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0021594;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:8,11:2,9:6,2
chr7	27613171	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.014917;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,4:9,3
chr7	28608123	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:2,7:5,1
chr7	28974605	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.097821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,7:14,4:5,3
chr7	30393033	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.076981;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:14,3:7,4
chr7	31124226	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.091905;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,1:15,4
chr7	34309486	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.013646;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,8:17,2:11,6
chr7	34427902	.	GTA	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,6:2,3:1,3
chr7	35115753	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.048842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:15,2:11,3
chr7	35115757	.	A	AGAGAAAAG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,1:11,3
chr7	35579561	.	A	AT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0036289;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:13,2:16,6
chr7	36650136	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.012702;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:17,5:16,1
chr7	36757915	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:3,6:4,6
chr7	37449431	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.083916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:4,3:1,2
chr7	37847824	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
chr7	38855210	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.017857;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,3:0,0:2,3
chr7	38944891	.	C	CAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,4:2,3:1,1
chr7	39057163	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.2151e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:20,24:11,15:9,9
chr7	39820298	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.007794;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:9,8:3,3
chr7	39871439	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.7292e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:10,6:13,9
chr7	39939877	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029742;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,2:8,4
chr7	40089725	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,4:5,1:5,3
chr7	41260472	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.025589;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,9:13,4:14,5
chr7	41369105	.	CTTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,2:13,2
chr7	42114991	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.0851e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:18,24:8,8:10,16
chr7	42166650	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,2:6,4
chr7	43483547	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.2419;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:10,2:4,2
chr7	45283429	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:9,5:3,2:6,3
chr7	45283430	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0040786;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:8,6:3,4:5,2
chr7	46926730	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,4:5,4:0,0
chr7	47586408	.	TC	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,4:10,2:9,2
chr7	48001522	.	G	GT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:15,2:5,2
chr7	49059558	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:3,2:6,2
chr7	49588796	.	ATATT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:8,4:1,2
chr7	50843129	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0034446;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,6:6,5:4,1
chr7	51566510	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.537e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:6,12:16,7
chr7	52185078	.	G	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.5863e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:16,12:10,8
chr7	52299337	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:7,10:1,1
chr7	52652664	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.2103e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:11,9:9,6
chr7	53369483	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:1,2:0,1:1,1
chr7	54761973	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,2:5,1:0,1
chr7	56813424	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.031941;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:2,3:10,3
chr7	56815916	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.025226;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:28,6:9,3
chr7	56816060	.	T	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.030972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:49,14:19,3:30,11
chr7	56823993	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12337;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,3:13,2
chr7	56826427	.	C	G	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.020375;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:97,14:20,2:77,12
chr7	56881387	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.018549;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:14,4:26,2
chr7	57078312	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:0,1:11,4
chr7	57690906	.	G	GCTTT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.017404;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:19,5:11,3
chr7	58057572	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.4146e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:11,9:12,8
chr7	58093136	.	A	G	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.04915;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:102,19:45,11:57,8
chr7	59144468	.	G	C	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.034705;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:55,14:15,4:40,10
chr7	60997686	.	G	T	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.0472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:95,22:57,15:38,7
chr7	61383935	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.11838;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:19,1:25,4
chr7	61420012	.	G	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.031766;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:62,7:32,6:30,1
chr7	61450357	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.11088;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:2,0:31,4
chr7	61458212	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
chr7	61499553	.	T	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
chr7	61519323	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.038105;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:9,2:29,4
chr7	62208143	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.05493;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:22,3:14,1
chr7	62247650	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.4132e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:24,26:10,13:14,13
chr7	63108831	.	A	AAAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00043157;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,12:5,7:0,5
chr7	63125260	.	G	GTTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,10:2,5:3,5
chr7	63266483	.	C	CAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.042019;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:18,5:6,5
chr7	63420340	.	C	CAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:8,1:3,3
chr7	63493980	.	C	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,3:12,1
chr7	63499197	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00024591;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,11:13,6:0,5
chr7	63538726	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.046254;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,1:12,5
chr7	63635885	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.025864;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,3:11,3
chr7	63764777	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
chr7	64083704	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0005577;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:12,5:14,6
chr7	64238898	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.8395e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:10,15:14,9
chr7	64955977	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,6:7,5:4,1
chr7	65123739	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.088082;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:19,1:18,4
chr7	65536082	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,1:8,4
chr7	65553140	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.092902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:20,4:5,1
chr7	66109180	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.065325;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:12,2:3,3
chr7	66223987	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.3652e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,8:7,10
chr7	66296676	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:5,4:0,1
chr7	66687113	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
chr7	66874154	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.028921;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
chr7	66983916	.	A	ATT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,6:10,4:5,2
chr7	67853945	.	C	CAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0028986;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,8:4,7:1,1
chr7	67938498	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:9,4:3,1:6,3
chr7	68959639	.	GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,3:2,5
chr7	69434282	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=7.0303e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:26,27:13,13:13,14
chr7	70990521	.	TTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,1:15,3
chr7	70990543	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:5,1:9,5
chr7	71451878	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.9774e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:7,8:11,9
chr7	72046709	.	TA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,2:5,2
chr7	73040521	.	ATT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,9:2,3:5,6
chr7	73369923	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.048713;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,10:6,6:7,4
chr7	73588509	.	T	TA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
chr7	73609236	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.057585;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,7:9,6:9,1
chr7	73857461	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.028792;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:3,1:10,5
chr7	74311933	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:9,4:3,2:6,2
chr7	74792229	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0039384;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:34,16:17,10:17,6
chr7	74960681	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.12042;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,7:13,4:3,3
chr7	75616584	.	G	GGGAGGAGGA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.039954;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:14,6:16,3
chr7	75798478	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.1775e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:32,20:14,12:18,8
chr7	76005852	.	GGAGGAGA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,4:12,2:9,2
chr7	76445508	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:14,3:7,1
chr7	76493649	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.087068;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:16,4:16,1
chr7	76976851	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.026132;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:15,3:17,5
chr7	76997644	.	A	ATG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:21,2:2,3
chr7	77448829	.	T	TC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0788;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:12,4:7,3
chr7	78355331	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00069954;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:22,6:14,7
chr7	79157945	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.2488;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,4:3,1:9,3
chr7	79535993	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.022593;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:13,3:3,5
chr7	80667754	.	T	TTTTTTTTG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,6:8,3:8,3
chr7	80683350	.	A	ATATGTG	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.14744;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,4:18,1:17,3
chr7	80683365	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.17398;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:20,2:14,2
chr7	80683370	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.17881;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:18,1:13,3
chr7	81785356	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.044239;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:13,5:10,1
chr7	82710682	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.3499e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,21:15,8:4,13
chr7	83533600	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.029609;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:17,10:8,5:9,5
chr7	83533601	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.013002;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:16,11:7,5:9,6
chr7	84987123	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,2:7,4
chr7	85333008	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.051194;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,2:14,2
chr7	85445397	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:4,4:5,1
chr7	85460245	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00094923;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:2,2:4,8
chr7	86627732	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,6:2,3
chr7	87552711	.	G	GA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:1,8:3,1
chr7	88045888	.	TTG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,8:3,2:3,6
chr7	92998049	.	T	TTTCC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:1,3:13,2
chr7	93023328	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.023519;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:20,1:17,6
chr7	94482669	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:7,3:4,1
chr7	94541537	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:6,3:3,3
chr7	96991900	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12406;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,10:3,5:5,5
chr7	97398988	.	C	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.8752e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:10,11:15,9
chr7	97973032	.	T	TAG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.003663;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:1,4:1,2:0,2
chr7	98083223	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.043;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:20,2:9,3
chr7	98573677	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,2:7,2:0,0
chr7	98842400	.	TATACAC	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.23571;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,4:14,1:18,3
chr7	99146737	.	AAAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.039412;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,4:7,2
chr7	99181023	.	G	GTGTCTC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,7:0,5:2,2
chr7	99187790	.	CTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17641;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:18,3:9,1
chr7	99416717	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:8,5:5,1
chr7	100300585	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.012803;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:16,3:10,3
chr7	100505916	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00074257;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,8:3,1
chr7	100731172	.	A	ATTTCT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,4:11,1:14,3
chr7	100975659	.	G	GGAGCTTAGGGCTGGAGGGGCACAGAGA	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.020548;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:53,16:20,3:33,13
chr7	100977050	.	CAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00086221;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,8:1,7:3,1
chr7	101129670	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.34557;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:12,3:2,1
chr7	101530566	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,6:4,2
chr7	102041666	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.016617;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:8,8:3,3
chr7	102502679	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.22036;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:18,3:10,1
chr7	102525408	.	G	GACCT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0040831;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:0,1:6,7
chr7	102545789	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0070176;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,1:6,5
chr7	102566497	.	C	A	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.012066;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:47,15:19,6:28,9
chr7	102572315	.	G	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.0084663;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:88,23:54,13:34,10
chr7	102737971	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.014866;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:2,1:8,5
chr7	102775654	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.02254;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:11,1:11,6
chr7	102778232	.	C	CA	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.029475;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,7:11,1
chr7	104835764	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.04188;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:4,3:3,2:1,1
chr7	105170953	.	A	AAG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.017286;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:1,3:1,1
chr7	105258420	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,2:1,1:2,1
chr7	105961488	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.011868;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,7:2,6:2,1
chr7	106947079	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.021122;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:6,3:6,4
chr7	106974638	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.025641;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:0,1:3,3
chr7	109507335	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.2938e-11;SS=2;SSC=108;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:3,19:1,5:2,14
chr7	109848658	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037662;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:2,3:2,1:0,2
chr7	110136642	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:1,3:1,3:0,0
chr7	110669024	.	AGTATGTGTGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,5:4,2
chr7	110873429	.	C	CAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:6,4:0,0
chr7	111281166	.	GAA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,2:6,2
chr7	111702887	.	A	ATT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0064996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:4,5:0,4
chr7	113294142	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0010878;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:0,4:8,2
chr7	113615090	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.039216;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:2,2:1,1:1,1
chr7	113712765	.	CTA	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.018073;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,3:6,4
chr7	114929084	.	G	GATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.031805;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,3:2,2
chr7	115934090	.	A	ATGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,5:2,3:0,2
chr7	117883407	.	GAA	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:2,4:0,2
chr7	119513863	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.030854;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,3:5,2
chr7	119604986	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=5.0269e-15;SS=2;SSC=142;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:3,25:2,15:1,10
chr7	121413715	.	AT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.015738;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:1,3:0,2:1,1
chr7	121635818	.	AT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.6852e-10;SS=2;SSC=94;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:3,19:1,14:2,5
chr7	121824269	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
chr7	122023777	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.010953;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
chr7	122023787	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013479;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
chr7	122064553	.	T	TTTTG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.000258;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:0,6:0,1:0,5
chr7	123108357	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=4.9735e-11;SS=2;SSC=103;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:4,23:2,14:2,9
chr7	123623931	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.027634;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:1,2:1,2
chr7	123648340	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:17,3:15,4
chr7	124298019	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0002442;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,4:1,3:0,1
chr7	124454122	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:0,2:0,1:0,1
chr7	124537302	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0030303;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:23:0,7:0,4:0,3
chr7	125742595	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=4.9042e-14;SS=2;SSC=133;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:2,19:1,8:1,11
chr7	125758857	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=9.3817e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,6:1,4:0,2
chr7	126456519	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.022967;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,7:2,6:1,1
chr7	126869933	.	T	TA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0011576;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,8:2,7:1,1
chr7	126995904	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.4479e-13;SS=2;SSC=128;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:2,18:1,13:1,5
chr7	128258439	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:3,4:0,0
chr7	130581224	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063158;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:3,1:3,2
chr7	132493755	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0022942;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,5:3,3:3,2
chr7	132621264	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,2:2,1:2,1
chr7	133898745	.	CAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,5:4,1
chr7	133899745	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0024526;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:5,5:1,1
chr7	135236276	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.016295;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,3:10,1
chr7	135320002	.	C	CAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:4,4:2,1
chr7	135526213	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00052709;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,10:1,5:4,5
chr7	136094834	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:13,4:1,0
chr7	136275026	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:0,0:2,2
chr7	137811390	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0046977;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:6,2:0,6
chr7	137905393	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:1,2:1,1:0,1
chr7	137946786	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.00027737;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,3:1,3
chr7	138309420	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,2:9,2
chr7	138820771	.	AT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,3:5,4
chr7	138846533	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,3:2,2
chr7	138903792	.	AGTGTGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,3:3,4
chr7	139498140	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,2:0,2:0,0
chr7	140647891	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,4:4,2
chr7	140948253	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0054137;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,5:0,2:1,3
chr7	141343525	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,2:2,6
chr7	142447384	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:7,4:0,1
chr7	143750910	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0036482;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:3,3:3,6
chr7	144153330	.	TA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.036707;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:5,1:2,3
chr7	144156150	.	AAGAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0032938;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:3,2:0,2
chr7	144156170	.	AAAAAG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040085;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,3:4,2
chr7	144180904	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,4:2,3
chr7	144227383	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0050687;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:13,5:6,4
chr7	144327328	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.096448;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:16,2:13,2
chr7	144559994	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.009705;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:2,7:7,1
chr7	147081583	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:3,3:3,2
chr7	147193952	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,4:3,1:2,3
chr7	147949440	.	G	GTATATATATATATATATA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.029654;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:2,3:3,1
chr7	148259179	.	TA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,5:4,1
chr7	148429736	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.04741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:11,7:2,1
chr7	148942840	.	C	CTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,8:3,7:1,1
chr7	149526935	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.001677;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:1,5:0,1:1,4
chr7	150001441	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0076579;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:14,3:5,6
chr7	150359978	.	A	AC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:7,4:0,2
chr7	150496012	.	AATATAAATATAATTTATTTATATTATAAATAT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0070965;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,5:6,3
chr7	151703845	.	A	AACAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
chr7	152245691	.	G	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.047874;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:13,5:15,3
chr7	152247622	.	AT	A	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.0021227;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:54,22:35,16:19,6
chr7	152279938	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.035613;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:15,5:18,6
chr7	152403904	.	TGGAGACTCAGAAGGTTGGGAGGCTGGGA	T	0	PASS	DP=244;GPV=1;SPV=0.010049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:117,32:62,15:55,17
chr7	152789549	.	ATTT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0035252;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:13,3:8,5
chr7	153701292	.	GACGA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.013973;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,6:8,3
chr7	153857322	.	T	TTCTCTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:2,3:4,1
chr7	153988960	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.036156;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:16,7:11,2
chr7	154301810	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00024198;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,11:2,2:2,9
chr7	154778820	.	A	AACACC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,1:6,3
chr7	155482634	.	T	TTCAGAACACGCTCAGAACATGC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:4,3:2,2
chr7	155724990	.	TTG	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,15:3,9:6,6
chr7	156049334	.	A	AAAG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.001677;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,5:0,4:1,1
chr7	156594952	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.735e-11;SS=2;SSC=105;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:5,15:3,9:2,6
chr7	158087988	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.076651;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,2:5,3
chr7	158406094	.	A	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:2,1:0,5
chr7	158496193	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,3:1,1:0,2
chr7	158496194	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.040959;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,3:1,1:0,2
chr8	299656	.	C	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.039905;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:26,2:23,8
chr8	358395	.	ATTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:10,2:1,2
chr8	798487	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.085035;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:17,6:17,1
chr8	811362	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.096304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:13,1:21,3
chr8	1040226	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:5,8:2,3
chr8	1874778	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043517;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:7,1:26,5
chr8	2229155	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.9868e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:7,9:11,8
chr8	2444748	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.047227;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:14,8:17,3
chr8	2472888	.	C	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.015361;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:19,3:24,2
chr8	3021702	.	C	CATCCAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.038682;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:6,3:14,6
chr8	4524252	.	C	CA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.4703e-09;SS=2;SSC=81;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,19:9,16:6,3
chr8	5069234	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,4:13,1
chr8	5464267	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=5.0234e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:12,14:12,10
chr8	5560584	.	TAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049667;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:4,4:9,3
chr8	5715391	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00010362;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:16,7:16,10
chr8	5971516	.	C	CAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.061797;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:11,3:11,3
chr8	6486262	.	ATC	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,10:3,4:4,6
chr8	6527899	.	A	ATTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.049992;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:13,3:16,3
chr8	6567257	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.28552;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,2:13,2
chr8	6576046	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0047817;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,7:7,2
chr8	7158841	.	G	A	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.0056646;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:84,28:44,12:40,16
chr8	7394778	.	T	G	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.031998;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:68,13:39,8:29,5
chr8	7412099	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.003625;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:8,5:22,7
chr8	7413451	.	T	C	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.04944;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:52,13:26,6:26,7
chr8	7443791	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.021326;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:7,1:11,6
chr8	7482816	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.077619;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:21,1:18,4
chr8	7728128	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.032338;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:8,1:25,8
chr8	7788059	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0012781;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:7,5:0,8
chr8	7862559	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00063544;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:11,5:10,7
chr8	7870447	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.022141;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:30,7:11,5
chr8	7885678	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,3:11,1
chr8	7933590	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:12,4:1,1
chr8	8025448	.	A	G	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.036171;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:149,22:92,12:57,10
chr8	8058875	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.034141;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:21,3:7,5
chr8	8073671	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.017233;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:18,6:7,4
chr8	8188444	.	G	T	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.047567;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:65,15:22,6:43,9
chr8	9158542	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.0798e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:29,17:17,11:12,6
chr8	9857271	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.2098e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:17,26:10,20:7,6
chr8	9871654	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:4,4:5,1
chr8	10129761	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.7807e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:11,7:9,8
chr8	12156549	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.03609;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:11,4:14,5
chr8	12351193	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0063215;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:15,5:0,2
chr8	12408339	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.021611;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:26,5:17,8
chr8	12444059	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.002684;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:3,4:15,9
chr8	12457388	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.02455;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,4:9,3
chr8	12477051	.	G	A	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.038811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:108,23:43,11:65,12
chr8	12481078	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030499;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,5:6,1
chr8	12488765	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0057362;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:2,1:37,14
chr8	12523396	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.038682;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:5,3:15,6
chr8	12553640	.	G	A	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.019575;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:111,23:51,11:60,12
chr8	12554999	.	G	C	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.011245;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:112,27:54,12:58,15
chr8	12559174	.	T	G	0	PASS	DP=305;GPV=1;SPV=0.041368;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:156,21:90,14:66,7
chr8	12566578	.	A	T	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.034655;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:129,25:67,14:62,11
chr8	12575468	.	A	T	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.027986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:111,18:47,11:64,7
chr8	12575947	.	C	G	0	PASS	DP=252;GPV=1;SPV=0.014876;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:122,30:62,15:60,15
chr8	12578071	.	G	A	0	PASS	DP=291;GPV=1;SPV=0.0094149;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:118,30:60,11:58,19
chr8	12584053	.	G	A	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.0010457;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:114,33:58,16:56,17
chr8	12591386	.	C	T	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.020299;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:104,21:48,10:56,11
chr8	12592545	.	C	G	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.00095766;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:69,11:37,5:32,6
chr8	12597860	.	C	T	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.029283;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:95,23:50,11:45,12
chr8	12996992	.	TTTA	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:3,2:14,2
chr8	14207151	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018501;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,2:5,3
chr8	14479740	.	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.022269;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:1,12:1,9:0,3
chr8	14920883	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.99e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:17,22:8,12:9,10
chr8	15066315	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022413;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,5:3,3
chr8	15578761	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.025071;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:23,3:25,4
chr8	16226991	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=6.6057e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:14,8:10,9
chr8	16460723	.	C	CAGATAGAT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.007899;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:15,7:13,5
chr8	17199545	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040021;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,1:9,4
chr8	17547785	.	A	AGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0019317;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,11:5,7:1,4
chr8	17657799	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0037289;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,12:7,10:5,2
chr8	18727584	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.06964;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,3:14,1
chr8	19906397	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
chr8	20060686	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.015907;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:4,6:6,1
chr8	21024149	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0032306;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:3,6:2,5
chr8	23526447	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.012732;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,7:7,2:11,5
chr8	24336580	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,5:8,4:6,1
chr8	24453702	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=9.2103e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:27,23:18,12:9,11
chr8	26211161	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0077399;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:4,5:0,1
chr8	26397641	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015459;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:7,1:7,7
chr8	26459352	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,2:1,2:0,0
chr8	26867416	.	TTGTG	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.060625;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,3:14,1
chr8	28198597	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.010572;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:2,2:4,4
chr8	28452937	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.077337;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:19,2:12,2
chr8	28452938	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.038786;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:20,2:12,3
chr8	28684958	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.013798;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:18,4:9,6
chr8	28905295	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.3228e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:30,22:14,12:16,10
chr8	31689385	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=8.063e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:7,8:11,8
chr8	31702451	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0021265;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,14:2,7:1,7
chr8	31987320	.	A	ATG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0088769;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,9:7,3:5,6
chr8	32364957	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00022435;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,8:1,3:2,5
chr8	32685308	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=5.8399e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:18,27:10,17:8,10
chr8	33509979	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,7:2,1
chr8	33519252	.	CCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:2,3:12,2
chr8	33999608	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=8.3252e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:11,7:11,7
chr8	34006849	.	G	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.3912e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:15,7:13,7
chr8	34529226	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0023627;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,7:5,2
chr8	34683207	.	G	GT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0010489;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:14,6:8,5
chr8	35005401	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.5956e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,23:11,12:12,11
chr8	35021243	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=6.234e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:15,7:11,5
chr8	36201245	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=1.2833e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:12,8:16,14
chr8	36846788	.	G	GAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:6,7:1,1
chr8	37542086	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.23498;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,5:1,2:11,3
chr8	38581989	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.026864;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:11,3:17,3
chr8	39490853	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0050177;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,6:7,2
chr8	43106509	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037131;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:13,6:4,1
chr8	45507566	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.025658;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:12,4:6,2
chr8	45928734	.	G	C	0	PASS	DP=396;GPV=1;SPV=0.0078175;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:195,31:78,12:117,19
chr8	46302903	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.2903e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:19,23:10,9:9,14
chr8	47647651	.	AGAGG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.020348;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:14,3:13,4
chr8	48475489	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.5771e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:13,7:9,7
chr8	49316765	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.23136;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:22,3:14,1
chr8	49995314	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=9.6906e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:8,8:10,10
chr8	52849803	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.5103e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:19,28:11,17:8,11
chr8	54483873	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,9:1,3:4,6
chr8	54882775	.	C	CTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.030499;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:13,8:13,4
chr8	55041021	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,3:10,1
chr8	60406577	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
chr8	60462774	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:10,3:7,2
chr8	61523320	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.013095;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,5:7,1:1,4
chr8	62595382	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,6:2,5:2,1
chr8	63133416	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,6:6,3:10,3
chr8	64939647	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.3884e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:9,7:8,9
chr8	65268629	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:38:1,3:1,1:0,2
chr8	66521790	.	GGAGAGAGAGA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:6,5:3,1
chr8	69230820	.	GAT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,4:3,2:2,2
chr8	69646938	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:6,3:6,4
chr8	69904302	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,4:7,4
chr8	71041817	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.9669e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:19,22:8,12:11,10
chr8	71790725	.	A	AGAAAGAAAG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0026087;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,1:2,5
chr8	72732990	.	T	TA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.7941e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,18:18,9:11,9
chr8	73605866	.	CACACACACACAT	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016096;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:21,6:6,4
chr8	74188250	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.21337;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,1:12,3
chr8	75838937	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,7:3,1
chr8	76126828	.	CAG	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0010258;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:13,8:3,2
chr8	76444527	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.27668;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:2,1:11,2
chr8	78627039	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=2.9228e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:8,8:18,14
chr8	79201310	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.444e-11;SS=2;SSC=108;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:16,32:8,12:8,20
chr8	79233810	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00015011;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:8,5:18,9
chr8	80362139	.	A	AG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.007794;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:5,4:7,7
chr8	83012785	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:9,2:2,5
chr8	83094532	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00010136;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,4:8,7
chr8	83847711	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,2:11,2
chr8	84235767	.	C	CTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.03809;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,7:12,6:6,1
chr8	85805567	.	C	A	0	PASS	DP=274;GPV=1;SPV=0.025007;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:135,17:77,12:58,5
chr8	85811985	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.27738;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:0,0:24,4
chr8	86248962	.	TAG	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.084372;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:15,2:18,3
chr8	86991392	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.487e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:12,7:15,8
chr8	87297163	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,7:0,6:2,1
chr8	87428135	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.07563;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:17,1:7,3
chr8	88416538	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.3416e-10;SS=2;SSC=93;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:24,30:13,15:11,15
chr8	88956317	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0050026;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:16,2:17,9
chr8	89638936	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:11,4:6,1
chr8	90370514	.	AT	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=4.6848e-06;SS=2;SSC=53;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:7,4:15,9
chr8	91755145	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:7,5:4,2:3,3
chr8	91755147	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,4:3,2:4,2
chr8	92247825	.	CTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.04668;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,9:4,4:16,5
chr8	92439776	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0095875;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,9:14,8:6,1
chr8	93412693	.	T	TA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00014964;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:17,12:7,5
chr8	93644645	.	T	TTATA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0044739;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,3:2,3
chr8	94690276	.	A	ATT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.16556;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:19,3:12,1
chr8	94705156	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:8,3:3,2
chr8	94708595	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,3:4,3
chr8	95245992	.	C	CT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.014795;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,9:15,7:7,2
chr8	96309193	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:6,3:1,1
chr8	97732895	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1114;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,6:14,2:3,4
chr8	97900258	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=1.216e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:35,25:18,16:17,9
chr8	99438034	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:6,6:1,1
chr8	100925460	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.0869e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:11,11:17,6
chr8	100935082	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=6.5574e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:12,11:9,7
chr8	101656873	.	G	GACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.016341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,6:19,4:6,2
chr8	102762274	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=4.9905e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:12,14:10,9
chr8	102770856	.	G	GCTCAAGTGATTCTCCCGC	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.031137;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:13,4:23,7
chr8	102955075	.	CTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0049208;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,12:5,2:7,10
chr8	103533661	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.020376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:8,6:3,1
chr8	107282553	.	C	CAT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,3:3,2
chr8	107906379	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.20884;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:15,1:18,3
chr8	108008782	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.025371;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,8:8,1
chr8	108233836	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,12:6,11:0,1
chr8	110181574	.	G	GT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,3:0,1
chr8	110898449	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.2772e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:12,6:13,7
chr8	111912027	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:6,2:7,2
chr8	113954535	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.077418;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,5:12,3:12,2
chr8	115691028	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.064462;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:8,1:20,3
chr8	117284889	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=9.5575e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:10,6:9,12
chr8	117409285	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.4245e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:12,4:8,11
chr8	117968552	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,1:5,3
chr8	118132970	.	GTGTATATATATATA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:5,3:0,2
chr8	118165618	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,3:4,2:0,1
chr8	118257784	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.8879e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:9,6:8,5
chr8	119490725	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.6652e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:10,10:18,12
chr8	122065748	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0029872;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:8,6:12,2
chr8	123007749	.	ATTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,7:4,3:7,4
chr8	123936462	.	G	GTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.14559;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,5:7,4:5,1
chr8	124717411	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.049892;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:20,4:16,1
chr8	125316732	.	T	TTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:0,0:4,2
chr8	125376818	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:1,5:5,1
chr8	126443782	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0105;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:13,7:8,2
chr8	126983830	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.038251;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,2:12,9
chr8	129496996	.	GTA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.28142;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,2:9,2
chr8	129991943	.	C	CAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:11,3:2,1
chr8	130920144	.	T	TAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0036197;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:9,7:7,3
chr8	131396100	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=7.0926e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,18:6,11:10,7
chr8	133441437	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:0,1:9,5
chr8	133880995	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.2295e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:19,28:8,14:11,14
chr8	134215454	.	C	CTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.016716;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,3:6,3
chr8	135751485	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,3:11,1
chr8	136094179	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:5,1:4,3
chr8	138609088	.	T	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.6989e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:29,23:16,8:13,15
chr8	141252918	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031133;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:10,6:13,6
chr8	141789461	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=1.0504e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:37,26:10,9:27,17
chr8	141872048	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14022;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:11,2:11,3
chr8	142223287	.	TAC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,3:8,1
chr8	142223297	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,3:8,1
chr8	143119856	.	TAA	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.026101;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:20,2:22,4
chr9	13542	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:8,5:11,5
chr9	55850	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.032946;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:20,3:19,6
chr9	671559	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.04886;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:15,7:17,4
chr9	911470	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0088119;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,12:6,7:8,5
chr9	1837598	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=5.2009e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:16,6:10,10
chr9	2488782	.	ATATATATATATATTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,5:2,1
chr9	3505365	.	AT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02791;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:19,4:7,2
chr9	3505482	.	TA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.081913;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:29,3:5,2
chr9	4545189	.	G	GTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.049793;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,8:9,5:9,3
chr9	5113191	.	CTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.012653;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:3,4:7,1
chr9	6697718	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.008238;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,10:5,9:3,1
chr9	7424942	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:20,4:11,1:9,3
chr9	11665189	.	CT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00018113;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:5,6:5,5
chr9	12366212	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.3654e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:13,5:8,13
chr9	12477580	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016311;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,2:7,4
chr9	12541727	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.01961;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:14,2:14,3
chr9	13330806	.	C	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.9695e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:20,8:12,7
chr9	13691837	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=5.02e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:12,11:11,6
chr9	14886321	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.022446;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,2:10,9
chr9	14976300	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,7:3,1:3,6
chr9	15341116	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.048842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:8,1:18,4
chr9	17185771	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.018613;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,12:17,9:4,3
chr9	17366310	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:10,3:18,1
chr9	17599600	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.015e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:11,13:10,7
chr9	18267771	.	AAAAC	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.075844;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:19,3:21,2
chr9	18359827	.	G	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:0,0:5,2
chr9	18756076	.	AATATATAT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:9,2:3,3
chr9	19321788	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.6028e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:9,5:10,12
chr9	19382844	.	C	CT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:9,5:9,6
chr9	19540910	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20161;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:13,1:15,3
chr9	20573193	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.083854;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:21,3:15,2
chr9	21209735	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.016144;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:18,3:25,5
chr9	21355822	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.089571;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:23,4:18,2
chr9	22126574	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12152;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:16,5:2,1
chr9	23194075	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.6904e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:19,29:9,19:10,10
chr9	24804384	.	A	AATATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,7:6,3:0,4
chr9	24872725	.	GTGTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.038035;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:8,4:15,3
chr9	26123501	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0050173;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:8,9:5,3
chr9	26334676	.	G	GCACACACACA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,9:8,4:1,5
chr9	26434898	.	TA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=5.8963e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:7,6:8,7
chr9	27532584	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:4,2:3,1:1,1
chr9	28062576	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10359;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:20,2:9,2
chr9	32130820	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:10,4:2,1
chr9	32900610	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.19342;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:8,2:14,4
chr9	32900627	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,1:12,4
chr9	33554181	.	A	AAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,9:14,5:6,4
chr9	34142503	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:9,2:4,3
chr9	34593490	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=2.1109e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:18,9:10,10
chr9	35030338	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.03499;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:23,4:18,1
chr9	35897023	.	T	TTTATTATTA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.032315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,7:11,5:8,2
chr9	35950813	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:3,4:8,6
chr9	36061393	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0084717;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,8:7,4:1,4
chr9	37379213	.	TTA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010837;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,3:2,2
chr9	38239622	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,4:1,0:13,4
chr9	38419888	.	C	CCTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.012101;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:14,12:6,3:8,9
chr9	38816954	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.29549;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,3:11,1
chr9	38969560	.	C	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0051636;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:67,22:32,9:35,13
chr9	38988871	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.044421;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,8:37,7:4,1
chr9	39128880	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,6:6,1
chr9	39372028	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,4:2,4
chr9	39400748	.	T	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.041731;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:22,5:19,1
chr9	39405589	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,4:4,3
chr9	39509905	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06057;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:10,3:11,2
chr9	39532000	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,3:13,1
chr9	39595207	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.086635;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:17,3:7,2
chr9	39667342	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
chr9	39745305	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.018809;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:11,3:8,5
chr9	39820099	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:5,1:9,6
chr9	40145659	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.042105;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
chr9	40183672	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0013579;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:16,11:4,3
chr9	40285600	.	TA	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:28,4:0,0
chr9	40285614	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:22,4:0,0
chr9	40298133	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.077483;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:20,3:7,2
chr9	40299278	.	A	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00068097;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:20,7:25,8
chr9	40306702	.	G	A	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.020139;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:189:168,21:77,12:91,9
chr9	40335612	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:1,0:27,4
chr9	40579635	.	T	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.043937;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:51,14:17,10:34,4
chr9	40611077	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.020406;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:28,8:9,4
chr9	40661826	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:4,3:4,2
chr9	40697499	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00087959;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:16,6:19,8
chr9	40960658	.	A	T	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0098875;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:91,22:43,18:48,4
chr9	40998632	.	G	T	0	PASS	DP=356;GPV=1;SPV=0.03833;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:143,24:85,6:58,18
chr9	41108289	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.054568;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:22,4:8,1
chr9	41113935	.	G	A	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.016601;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:92,24:54,13:38,11
chr9	41118301	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.01951;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:14,7:15,5
chr9	41145993	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,2:10,2
chr9	41146643	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
chr9	41242173	.	T	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0084226;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:24,2:34,6
chr9	41242177	.	T	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.0073237;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:22,2:36,6
chr9	41362484	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10523;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,3:11,1
chr9	41630797	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:12,2:1,2
chr9	41688986	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.029805;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,3:11,7
chr9	41968416	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.072836;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,3:7,4
chr9	42042742	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
chr9	42089151	.	G	GAGA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0070885;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:7,3:1,4
chr9	42089154	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024846;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,3:3,4
chr9	42103937	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
chr9	42323965	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.056405;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,2:13,2
chr9	42956074	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:5,2:2,4
chr9	43039861	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.067362;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:16,1:16,4
chr9	43297666	.	T	C	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.027641;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:65,9:31,6:34,3
chr9	43497197	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.031187;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:23,2:17,3
chr9	43620679	.	G	A	0	PASS	DP=240;GPV=1;SPV=0.041516;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:120,14:78,10:42,4
chr9	43668116	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015732;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
chr9	43689780	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:15,1:1,4
chr9	43768939	.	T	A	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:14,3:41,6
chr9	43841173	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.043968;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:13,1:26,5
chr9	43916288	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
chr9	44023533	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.021109;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:24,8:22,3
chr9	44099639	.	T	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
chr9	44201242	.	C	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:5,2:1,1
chr9	44338865	.	C	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.29601;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:2,1:20,2
chr9	44440552	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:12,4:1,0
chr9	44453150	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.027179;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:24,5:5,3
chr9	44542024	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.088082;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:27,2:10,3
chr9	44688356	.	G	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.00097947;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:27,5:15,6
chr9	45123859	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13372;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:5,1:15,2
chr9	45174115	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,0:16,4
chr9	45294434	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,1:5,3
chr9	45374637	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.037223;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:9,5:22,7
chr9	45389007	.	C	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
chr9	60680938	.	A	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.042221;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:64,16:39,11:25,5
chr9	61224599	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.028374;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:19,2:22,7
chr9	61837378	.	AC	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.044803;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:27,6:21,1
chr9	61931359	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
chr9	61940002	.	G	GT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,8:10,4:5,4
chr9	62801828	.	C	T	0	PASS	DP=315;GPV=1;SPV=0.031186;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:148,29:68,12:80,17
chr9	62802684	.	G	A	0	PASS	DP=452;GPV=1;SPV=0.043558;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:264:230,34:112,16:118,18
chr9	62803933	.	C	G	0	PASS	DP=445;GPV=1;SPV=0.014385;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:236:200,36:99,23:101,13
chr9	62815266	.	A	T	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.0124;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:179:146,33:78,16:68,17
chr9	62815267	.	T	C	0	PASS	DP=362;GPV=1;SPV=0.014244;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:157,34:85,17:72,17
chr9	62819905	.	G	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.036683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:15,4:31,5
chr9	62824658	.	G	A	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.00626;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:152,28:77,15:75,13
chr9	62829944	.	C	A	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.012578;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:78,17:8,5:70,12
chr9	62829977	.	A	C	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.00014198;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:59,19:1,1:58,18
chr9	62832774	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.01087;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,1:4,4
chr9	62836383	.	A	G	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.047996;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:87,15:32,11:55,4
chr9	62899957	.	C	G	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.017492;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:64,16:34,10:30,6
chr9	62917536	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.025934;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:22,2:15,3
chr9	62917779	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:1,0:19,4
chr9	62921641	.	T	C	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.04637;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:63,14:30,8:33,6
chr9	63157556	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
chr9	63283693	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.1146;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:19,4:12,4
chr9	63757391	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0022355;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:15,14:17,3
chr9	63764445	.	G	A	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.019648;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:130,20:71,12:59,8
chr9	63767998	.	A	T	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.023725;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:74,11:59,7:15,4
chr9	63777282	.	C	A	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.014641;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:78,13:49,2:29,11
chr9	63809392	.	C	G	0	PASS	DP=416;GPV=1;SPV=0.028429;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:196,27:109,18:87,9
chr9	63841203	.	G	GTTAA	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.0017596;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:63,13:36,2:27,11
chr9	63872967	.	TG	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0070763;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:43,18:24,7:19,11
chr9	64329169	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.040505;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:20,5:11,3
chr9	64330435	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.049831;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:31,7:9,4
chr9	64365022	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:1,0:14,4
chr9	64399530	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:4,2:14,2
chr9	64435226	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.020146;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:6,1:13,8
chr9	64789412	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10033;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,4:0,0:31,4
chr9	64910453	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,6:2,1
chr9	64918204	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,1:10,3
chr9	65563407	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0045803;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:13,8:18,7
chr9	65702685	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:1,1:12,10
chr9	65742989	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.017241;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:12,7:13,2
chr9	65822249	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
chr9	65908897	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,2:10,2
chr9	66014140	.	G	T	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.029558;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:54,17:25,9:29,8
chr9	66031656	.	GTATAA	G	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.014734;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:85,17:40,9:45,8
chr9	66031662	.	G	C	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.0092019;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:83,18:38,10:45,8
chr9	66176323	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
chr9	66246819	.	A	G	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.018937;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:61,19:38,13:23,6
chr9	66343510	.	C	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.019321;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:6,9:28,3
chr9	66384998	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:2,1:3,7
chr9	66702087	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:8,3:12,1
chr9	66740151	.	AAC	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22398;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:11,2:2,2
chr9	66810630	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016944;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:15,5:16,8
chr9	66813660	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.0047712;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:55,15:38,11:17,4
chr9	66831566	.	G	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.038208;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:60,7:23,3:37,4
chr9	66843453	.	G	A	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=9.6213e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:77,28:35,10:42,18
chr9	67394112	.	G	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:0,2:7,4
chr9	67394154	.	TG	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:0,1:6,4
chr9	67428071	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.00761;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:2,7:0,4:2,3
chr9	67462701	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,3:2,1
chr9	67760386	.	T	A	0	PASS	DP=221;GPV=1;SPV=0.029858;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:105,21:56,11:49,10
chr9	67787556	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.024045;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:38,16:5,7:33,9
chr9	67889140	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1041;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:8,1:24,4
chr9	68272928	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:0,3:4,3
chr9	68303202	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011954;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:1,5:15,3
chr9	70570302	.	GTT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,6:3,1
chr9	71282430	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,4:13,2:4,2
chr9	72662352	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0074587;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,3:9,5
chr9	73430930	.	GTCTATTCTATTCTAT	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.015771;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,11:6,8:12,3
chr9	73951254	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0002546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:15,4:16,8
chr9	77054665	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,4:16,1:9,3
chr9	77136184	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:8,3:1,5
chr9	77761294	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00035596;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:2,4:3,6
chr9	77853774	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:4,5:3,1
chr9	77889410	.	CAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:5,7:6,3
chr9	78048583	.	AAC	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0072464;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:6,6:2,1
chr9	80147181	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.6753e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:13,7:10,11
chr9	80259058	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.9053e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:14,26:5,16:9,10
chr9	80545519	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01398;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:7,7:8,2
chr9	81583255	.	A	AGAGAAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,6:9,2:7,4
chr9	81739537	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0029219;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:11,5:14,5
chr9	82274114	.	TAG	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.7557e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:8,8:11,4
chr9	83612064	.	AGT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.6034e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,13:8,3
chr9	85132495	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=1.2378e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:27,26:16,19:11,7
chr9	85245751	.	CA	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.7762e-07;SS=2;SSC=65;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:13,21:7,9:6,12
chr9	85454708	.	ATG	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.07056;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,4:8,2:14,2
chr9	85795856	.	G	GT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:8,4:2,1
chr9	86031449	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,5:7,4:7,1
chr9	86462953	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.119;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:8,1:18,3
chr9	86808629	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0050488;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:12,7:10,3
chr9	86948027	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0085139;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,1:4,5
chr9	88873077	.	G	GGA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,7:5,5:2,2
chr9	89709437	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.04473;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:5,1:24,5
chr9	89709444	.	C	CTT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10395;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:12,1:21,3
chr9	89763019	.	A	AACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:10,3:5,2
chr9	90622276	.	T	TCATA	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0016804;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,15:9,5:12,10
chr9	91744213	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0069996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,10:2,6:4,4
chr9	92939400	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.5439e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:12,7:11,10
chr9	94529740	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:7,1:2,3
chr9	95683965	.	T	TA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00022877;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,11:9,7:15,4
chr9	97729466	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:4,3:7,1
chr9	100762761	.	T	TACAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029832;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,4:3,4
chr9	100879022	.	G	GAAAAA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:4,3:1,1
chr9	101495140	.	GATTTTATATATATTATAT	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:0,1:4,4
chr9	103169408	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.6294e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,18:5,7:6,11
chr9	103557358	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0088148;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:16,5:2,3
chr9	107096076	.	C	CGTGT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.010144;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,13:15,9:5,4
chr9	107256003	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,4:2,1
chr9	107561912	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,9:5,5:5,4
chr9	108416311	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00015298;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,23:8,14:8,9
chr9	109066452	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0019577;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:7,6:4,2
chr9	109657938	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:12,10:6,8:6,2
chr9	110422681	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.24135;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,3:14,1
chr9	111209287	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,4:9,2:12,2
chr9	111551400	.	GTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.035343;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:14,4:2,1
chr9	111580755	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010105;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:12,8:3,1
chr9	111642052	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.1172;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:12,1:28,4
chr9	112077499	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,2:3,2
chr9	113264864	.	C	CAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.03376;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,6:14,3:5,3
chr9	114528246	.	T	TA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031133;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:13,7:10,5
chr9	115953384	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.0078e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,18:8,6:8,12
chr9	117108438	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,5:5,3:4,2
chr9	117986268	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,10:8,6:2,4
chr9	119202281	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.2897e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:10,11:12,8
chr9	120033961	.	TTGTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00042941;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,17:11,12:7,5
chr9	120351269	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=6.2631e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:19,15:9,7
chr9	120495863	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,2:11,2
chr9	121826153	.	A	AAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,6:4,1
chr9	122833485	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,3:5,2
chr9	122859252	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:5,6:5,2
chr9	122860405	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,9:3,7:0,2
chr9	124093281	.	C	CTG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028506;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:17,7:9,7
chr9	124292992	.	C	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=2.5627e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:18,12:11,7
chr9	124670216	.	CA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.042069;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:12,6:10,4
chr9	125401768	.	A	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.034336;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:25,2:24,6
chr9	126850541	.	A	AT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:0,1:4,5
chr9	126894705	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0022883;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,12:3,10:2,2
chr9	128124186	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.3687e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:5,18:19,6
chr9	129454508	.	G	GTGGTGGAGA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:9,4:0,0
chr9	130140524	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=6.7374e-10;SS=2;SSC=91;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:22,26:10,13:12,13
chr9	130542924	.	C	CGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14804;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,5:9,2:16,3
chr9	131335733	.	CCTTTCT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.053977;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
chr9	131363925	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,7:3,6:1,1
chr9	131430510	.	TATAGATAG	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0096647;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:9,5:7,5
chr9	131435307	.	G	GA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0094835;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:12,8:1,1
chr9	131760905	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,7:8,4:3,3
chr9	132964743	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,7:3,4:6,3
chr9	133682710	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0017035;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:3,5:6,7
chr9	134089610	.	A	AAAAT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.049775;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,11:12,6:16,5
chr9	134847041	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.064403;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:17,1:12,3
chr9	134945705	.	G	GAGGGCAGAGGGCAGAGGGCAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.031259;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,6:10,2:16,4
chr9	135041240	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.3531e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,17:6,7:4,10
chr9	136174238	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,4:9,1:5,3
chr9	137001013	.	TGACCTCGGGGGCGGCGA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15645;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,5:21,3:5,2
chr9	137329978	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:0,1:4,1
chr9	137401152	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:5,4:3,4
chr9	137693588	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:1,1:18,3
chr9	137824174	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=9.9241e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:14,5:3,6
chr9	137861559	.	TTTTTC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:6,2:7,4
chr9	138029609	.	CTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,10:1,7:5,3
chr9	138203561	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,5:10,2:11,3
chrX	2932395	.	C	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016632;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,2:7,4
chrX	4067377	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=5.9538e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,9:0,2:0,7
chrX	4067401	.	TC	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0045249;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:0,1:3,5
chrX	5378042	.	GT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0028986;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:5,5:2,7
chrX	5847356	.	T	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=9.6148e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,10:1,3:0,7
chrX	7279309	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:5,2:6,3
chrX	8407352	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:8,5:1,1
chrX	9082385	.	AG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:10,2:2,2
chrX	9276951	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,2:7,2
chrX	9413118	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040535;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,7:9,1
chrX	9414048	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:15,7:5,2
chrX	10685877	.	T	TAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,9:3,5:2,4
chrX	11005587	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=9.592e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:2,6:4,5
chrX	16716483	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=3.1646e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:4,14:2,8:2,6
chrX	16964812	.	CG	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,3:16,1
chrX	19345572	.	TA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:1,4:5,2
chrX	20810590	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=1.0776e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,14:0,6:1,8
chrX	24882684	.	G	GGTGTGTGT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,5:1,2:0,3
chrX	26157137	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=5.9414e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:2,19:1,10:1,9
chrX	26320245	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.32086;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:17,1:14,3
chrX	26543486	.	C	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=6.8795e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:2,20:1,13:1,7
chrX	28969902	.	AAC	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037959;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,3:4,1
chrX	34715810	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
chrX	36133730	.	C	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=1.744e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,12:4,7:1,5
chrX	36618496	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=1.3684e-10;SS=2;SSC=98;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:0,16:0,9:0,7
chrX	40246808	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,11:2,9:2,2
chrX	40380891	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=3.1782e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:3,25:0,11:3,14
chrX	42053561	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.00067304;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,4:2,4
chrX	44165536	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=8.169e-12;SS=2;SSC=110;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:2,20:0,10:2,10
chrX	44797121	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
chrX	46893247	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=8.3047e-07;SS=2;SSC=60;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:3,14:1,8:2,6
chrX	49060427	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:2,5:6,7
chrX	52553396	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=1.7328e-12;SS=2;SSC=117;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:1,28:0,19:1,9
chrX	52792095	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=2.1862e-11;SS=2;SSC=106;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:1,20:0,13:1,7
chrX	53098050	.	C	CA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.043512;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:1,4:2,1
chrX	57865071	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=7.6201e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,10:0,9:0,1
chrX	71412123	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,2:1,2:0,0
chrX	73548458	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:6,5:3,4
chrX	73627137	.	C	CAA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,8:1,7:0,1
chrX	73729834	.	AGAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,3:7,1
chrX	75239816	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=1.0931e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:3,19:1,15:2,4
chrX	77956726	.	C	CCTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:4,4:10,1
chrX	79119133	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,3:2,2
chrX	79957198	.	AGAGAGAGATG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,5:3,4:0,1
chrX	83349506	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=2.4562e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:23:1,22:0,14:1,8
chrX	83520862	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=1.6595e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:2,20:1,7:1,13
chrX	83981200	.	AAG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
chrX	85257415	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=4.2733e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,15:0,5:1,10
chrX	89835746	.	A	ATTT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:0,1:5,1
chrX	92910966	.	C	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=8.3212e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:1,16:0,10:1,6
chrX	92953345	.	TTATATATATATA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.22704;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,7:4,4:5,3
chrX	93761563	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=5.0332e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:2,22:1,9:1,13
chrX	94633618	.	TCTA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:6,4:1,3
chrX	95970112	.	C	CTAAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,10:2,7:2,3
chrX	98286045	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=2.5916e-11;SS=2;SSC=105;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:3,22:1,11:2,11
chrX	100853261	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.22398;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,4:4,2:9,2
chrX	109217384	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
chrX	118044433	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,4:0,0:0,4
chrX	118585845	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=1.96e-11;SS=2;SSC=107;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:0,22:0,10:0,12
chrX	118929560	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,3:4,2
chrX	123434487	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=2.9781e-11;SS=2;SSC=105;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:0,18:0,10:0,8
chrX	125161039	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00026653;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,14:3,11:3,3
chrX	128814913	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,4:1,3:6,1
chrX	130510191	.	A	ATGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:4,12:3,6:1,6
chrX	133403133	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=2.1967e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:1,18:1,10:0,8
chrX	134621444	.	CA	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,5:1,1
chrX	137555032	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,1:3,3
chrX	137664250	.	T	TTC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:1,1:10,4
chrX	145503667	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=6.3565e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,11:2,6:2,5
chrX	145548273	.	CAAA	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
chrX	145727300	.	G	GA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=2.1794e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:3,10:2,8:1,2
chrX	147574832	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=1.9463e-12;SS=2;SSC=117;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:0,20:0,12:0,8
chrX	148486637	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=6.7878e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,17:1,8:0,9
chrX	151078786	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=2.1967e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:2,18:0,11:2,7
chrX	151457070	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00041408;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:5,15:4,12:1,3
chrX	151530151	.	G	GT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=2.2344e-08;SS=2;SSC=76;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:3,19:1,14:2,5
chrX	155077213	.	T	TA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=9.4736e-09;SS=2;SSC=80;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:5,20:2,6:3,14
chrY	3024501	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,3:4,1
chrY	3075729	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03726;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,3:5,4
chrY	3092641	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:5,2:13,2
chrY	3299174	.	G	GT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.033408;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,2:7,4
chrY	3489132	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.090128;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:17,3:12,3
chrY	4766472	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=2.5454e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:2,16:1,8:1,8
chrY	5416744	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=6.2541e-10;SS=2;SSC=92;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:1,20:0,8:1,12
chrY	5658242	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,1:13,4
chrY	5972856	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.01597;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,5:9,6
chrY	8767437	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=4.2409e-12;SS=2;SSC=113;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:31:1,30:0,11:1,19
chrY	9523481	.	A	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.01659;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:61,11:23,3:38,8
chrY	9533996	.	CAT	C	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.028931;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:49,12:33,10:16,2
chrY	10654088	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,5:3,4:4,1
chrY	10963506	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=1.9269e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,12:0,3:0,9
chrY	11097921	.	G	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.042491;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:63,15:31,11:32,4
chrY	11105770	.	A	G	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.043833;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:94,12:44,5:50,7
chrY	11142922	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.042579;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:15,1:21,6
chrY	11144433	.	C	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.004369;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:53,9:28,1:25,8
chrY	11175863	.	GC	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.042644;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:28,10:14,2
chrY	11193832	.	AGG	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.019378;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:20,6:17,2
chrY	11203339	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.035038;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:9,5:35,8
chrY	11220150	.	ATTT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.032993;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,11:9,5:11,6
chrY	11223744	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.037331;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:46,13:23,10:23,3
chrY	11236585	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0029706;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:22,7:11,1
chrY	11272437	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.048788;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:11,1:13,7
chrY	11284353	.	T	C	0	PASS	DP=444;GPV=1;SPV=0.038976;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:237:205,26:54,18:151,8
chrY	11303581	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,3:1,2:0,1
chrY	11347753	.	T	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.035943;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:29,6:23,5
chrY	11565379	.	T	A	0	PASS	DP=525;GPV=1;SPV=0.042965;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:290:246,44:102,12:144,32
chrY	11567195	.	T	A	0	PASS	DP=233;GPV=1;SPV=0.017981;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:116,14:66,8:50,6
chrY	11853987	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0015076;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,7:3,3
chrY	13193942	.	AAAT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0085545;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:4,8:6,7
chrY	15108020	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=7.4782e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,14:1,7:0,7
chrY	15163095	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,7:3,4:0,3
chrY	20122203	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:11,6:1,2
chrY	20126331	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.039018;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,8:5,2
chrY	20137261	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00020969;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:16,14:11,6
chrY	20349541	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.23142;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:18,4:22,2
chrY	26647432	.	T	A	0	PASS	DP=295;GPV=1;SPV=0.017142;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:156,21:95,18:61,3
chrY	26668102	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.085726;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:7,2:20,3
chrY	26670121	.	T	A	0	PASS	DP=1393;GPV=1;SPV=0.017933;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:791:697,94:407,45:290,49
chrY	26672403	.	G	T	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.047949;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:57,14:31,10:26,4
chrY	56677373	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.048559;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:48,6:1,1:47,5
chrY	56745054	.	A	G	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.046999;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:87,12:53,7:34,5
chrY	56767649	.	G	A	0	PASS	DP=601;GPV=1;SPV=0.0014573;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:345:282,63:33,3:249,60
chrY	56828396	.	T	G	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.042377;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:79,12:54,6:25,6
chrY	56835356	.	TATTCCACTCCACTCCACTCCAGTAC	T	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.0064908;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:105,28:59,18:46,10
chrY	56835388	.	C	T	0	PASS	DP=212;GPV=1;SPV=0.0035919;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:88,28:47,21:41,7
chrY	56852614	.	T	G	0	PASS	DP=323;GPV=1;SPV=0.0091544;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:141,25:80,13:61,12
chrY	56871315	.	AT	A	0	PASS	DP=575;GPV=1;SPV=0.027352;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:310:269,41:132,19:137,22
chrY	56878251	.	G	GCACACACACA	0	PASS	DP=300;GPV=1;SPV=0.048489;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:136,26:76,16:60,10
chrY	56879311	.	T	C	0	PASS	DP=491;GPV=1;SPV=0.033825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:267:234,32:124,17:110,15