view test-data/EGF089.vcf @ 0:924c527fb379 draft

"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e1f3ca871f13569401f41a5af9d0e281bf372540"
author artbio
date Sun, 13 Sep 2020 18:40:29 +0000
parents
children
line wrap: on
line source

##fileformat=VCFv4.2
##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
##reference=hg38
##source=varscan.py
##contig=<ID=chr1,length=248956422>
##contig=<ID=chr10,length=133797422>
##contig=<ID=chr11,length=135086622>
##contig=<ID=chr12,length=133275309>
##contig=<ID=chr13,length=114364328>
##contig=<ID=chr14,length=107043718>
##contig=<ID=chr15,length=101991189>
##contig=<ID=chr16,length=90338345>
##contig=<ID=chr17,length=83257441>
##contig=<ID=chr18,length=80373285>
##contig=<ID=chr19,length=58617616>
##contig=<ID=chr2,length=242193529>
##contig=<ID=chr20,length=64444167>
##contig=<ID=chr21,length=46709983>
##contig=<ID=chr22,length=50818468>
##contig=<ID=chr3,length=198295559>
##contig=<ID=chr4,length=190214555>
##contig=<ID=chr5,length=181538259>
##contig=<ID=chr6,length=170805979>
##contig=<ID=chr7,length=159345973>
##contig=<ID=chr8,length=145138636>
##contig=<ID=chr9,length=138394717>
##contig=<ID=chrM,length=16569>
##contig=<ID=chrX,length=156040895>
##contig=<ID=chrY,length=57227415>
##filter="SOMATIC"
##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases">
##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation">
##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)">
##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value">
##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls">
##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls">
##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand">
##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position">
##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads">
##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05">
##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90">
##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100">
##FILTER=<ID=VarMapQual,Description="Average mapping quality of variant reads < 15">
##FILTER=<ID=VarBaseQual,Description="Average base quality of variant reads < 15">
##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01">
##FILTER=<ID=RefAvgRL,Description="Average clipped length of ref-supporting reads < 90">
##FILTER=<ID=RefReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
##FILTER=<ID=RefDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
##FILTER=<ID=RefMapQual,Description="Average mapping quality of reference reads < 15">
##FILTER=<ID=RefBaseQual,Description="Average base quality of ref-supporting reads < 15">
##FILTER=<ID=RefMMQS,Description="Average mismatch quality sum for ref-supporting reads > 100">
##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50">
##FILTER=<ID=MinMMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) < 50">
##FILTER=<ID=MapQualDiff,Description="Mapping quality difference (ref - var) > 50">
##FILTER=<ID=MaxBAQdiff,Description="Average base quality difference (ref - var) > 50">
##FILTER=<ID=ReadLenDiff,Description="Average supporting read length difference (ref - var) > 0.25">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype code">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele">
##FORMAT=<ID=ADF,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the forward strand">
##FORMAT=<ID=ADR,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the reverse strand">
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	TUMOR
chr1	109575	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.035881;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,10:10,5:17,5
chr1	109580	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0062666;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:13,7:22,4
chr1	136733	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.072331;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:13,4:13,1
chr1	183800	.	C	G	0	PASS	DP=506;GPV=1;SPV=0.0068358;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:288:251,37:120,16:131,21
chr1	188062	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.041617;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:21,6:5,2
chr1	464057	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.019428;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:7,5:12,6
chr1	608256	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,3:2,1
chr1	857687	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028205;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
chr1	1030397	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.33518;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,2:12,2
chr1	1134829	.	GA	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.016677;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:42,17:21,10:21,7
chr1	2432621	.	G	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=8.6397e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:25,8:20,7
chr1	2671789	.	A	T	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.044752;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:91,12:71,10:20,2
chr1	3066327	.	C	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=7.263e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:47,17:26,7:21,10
chr1	3868678	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.025178;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,7:16,2:4,5
chr1	4644163	.	A	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0011965;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:8,3:24,5
chr1	6516868	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020689;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:5,4:10,1
chr1	6516870	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027709;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:5,4:14,1
chr1	7219542	.	T	TAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:6,3:3,1
chr1	7310714	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,2:13,2
chr1	8276928	.	C	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
chr1	8366917	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:3,2:3,2:0,0
chr1	8501943	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,2:4,1:3,1
chr1	10014390	.	C	CT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.014256;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:15,3:17,4
chr1	11718315	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.021848;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:4,4:1,1
chr1	11997879	.	C	CTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,4:7,1
chr1	13242734	.	TTACAAAGAACCTTCTTAAGGGTGGGGGAGAC	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.0045646;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:29,4:30,3
chr1	15904478	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:3,2:5,5
chr1	15904479	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:3,2:9,5
chr1	16112755	.	T	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00022955;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:20,8:24,6
chr1	16512652	.	C	A	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.031459;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:115,19:78,16:37,3
chr1	16516845	.	T	G	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.02177;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:85,19:26,7:59,12
chr1	16535787	.	G	A	0	PASS	DP=509;GPV=1;SPV=0.030136;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:293:262,31:136,23:126,8
chr1	16550749	.	C	A	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.019915;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:92,20:51,8:41,12
chr1	16594434	.	T	C	0	PASS	DP=474;GPV=1;SPV=0.00152;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:259:226,33:111,16:115,17
chr1	16595518	.	C	T	0	PASS	DP=358;GPV=1;SPV=0.049846;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:194:164,30:84,14:80,16
chr1	16606649	.	A	G	0	PASS	DP=488;GPV=1;SPV=0.01332;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:265:227,38:123,21:104,17
chr1	16611797	.	G	A	0	PASS	DP=458;GPV=1;SPV=0.022882;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:201,32:99,15:102,17
chr1	16623756	.	AG	A	0	PASS	DP=541;GPV=1;SPV=0.026576;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:272:241,31:141,22:100,9
chr1	16626425	.	G	A	0	PASS	DP=463;GPV=1;SPV=0.046149;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:247:216,31:98,18:118,13
chr1	16628965	.	G	A	0	PASS	DP=423;GPV=1;SPV=0.028487;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:247:215,32:107,17:108,15
chr1	16652640	.	G	A	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.0084969;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:71,19:40,16:31,3
chr1	16735009	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.059933;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:23,4:0,0
chr1	16874574	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0048994;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:34,16:20,11:14,5
chr1	17367486	.	G	GTCTTTTGTGTGGGAGTCGACTTTCCCAC	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.023323;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:12,6:18,3
chr1	17658621	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=8.648e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:15,7:16,5
chr1	17683340	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0055436;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,9:7,1
chr1	18286956	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00073529;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:22,5:19,7
chr1	18296624	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00039485;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:19,5:16,5
chr1	18611271	.	G	GAGGAAGGA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.064666;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:21,3:4,1
chr1	20011131	.	C	CA	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.042596;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:24,5:26,1
chr1	20647466	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,8:14,6:2,2
chr1	23487144	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023812;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:9,4:7,3
chr1	23703868	.	AATAT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.085668;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,2:11,2
chr1	24189141	.	T	TTCTC	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.040489;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:9,4:11,4
chr1	25875571	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=4.2157e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:21,10:21,6
chr1	26158356	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=2.4863e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:45,16:25,12:20,4
chr1	26435430	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:3,3:5,3
chr1	26803792	.	A	AC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,1:12,3
chr1	27277036	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.068062;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:23,3:19,2
chr1	28303493	.	CT	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.068498;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:18,3:12,1
chr1	29365423	.	T	TCTCTCC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,4:7,2:9,2
chr1	29554795	.	A	ATGTGCTGTGGTGTGGCATGGTGTGTGTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0054024;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,7:11,4:5,3
chr1	29723904	.	TACC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00072598;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:5,5:1,5
chr1	31154909	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.001715;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:19,5:16,6
chr1	33404286	.	T	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00013825;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:24,4:8,7
chr1	35116835	.	A	ATTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:2,4:4,2
chr1	35238703	.	T	TAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
chr1	35705018	.	AAGAAAGAGAGAGAGAGAG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.28542;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,6:23,4:8,2
chr1	36449835	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
chr1	37414047	.	CTT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,7:5,5:5,2
chr1	37980841	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.012681;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:6,9:5,4
chr1	39138072	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.029963;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,10:9,9:6,1
chr1	39505985	.	C	CAA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.022251;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,8:15,4:4,4
chr1	40558252	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.083965;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,2:19,2
chr1	40670574	.	T	TTATATATATATATATA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,2:2,3
chr1	43875897	.	CTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.031499;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,11:6,2:13,9
chr1	44046539	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0063642;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:16,9:9,6:7,3
chr1	44415506	.	C	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0058868;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:19,6:18,4
chr1	45520723	.	CA	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.034818;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,8:10,7:11,1
chr1	45727494	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16375;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:0,0:29,4
chr1	45762019	.	A	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=2.2816e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:21,4:11,8
chr1	46101980	.	C	CTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.034857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:10,10:12,2
chr1	46272025	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,3:7,1
chr1	47588411	.	T	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.011956;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:19,14:13,8:6,6
chr1	47653083	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,3:5,1
chr1	48827995	.	T	TACAC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,7:11,4:5,3
chr1	50692241	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.011329;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,9:9,7:6,2
chr1	54704793	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.007971;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,5:2,1
chr1	54780507	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0014835;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:14,8:5,5:9,3
chr1	56647364	.	T	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=2.1555e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:18,9:25,7
chr1	57555025	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028921;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,3:6,3
chr1	57735609	.	GTT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0095308;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:10,3:2,3
chr1	58473549	.	T	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.011682;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:28,15:12,8:16,7
chr1	59955307	.	C	CATAT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.18741;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:20,2:16,2
chr1	61347165	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,6:4,3:9,3
chr1	62838780	.	C	CA	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0011955;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,9:21,8:11,1
chr1	65375282	.	A	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00037424;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:15,5:26,7
chr1	66187579	.	A	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.045403;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,10:28,9:24,1
chr1	67259965	.	G	GA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:9,7:5,1
chr1	67482066	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.29549;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,3:10,1
chr1	68737235	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023889;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:14,5:15,1
chr1	70237513	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=2.9469e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:47,15:27,8:20,7
chr1	72895693	.	G	GTT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:5,5:3,2:2,3
chr1	73747985	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0079864;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:9,7:2,3:7,4
chr1	74224724	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0013656;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:18,5:20,6
chr1	74722610	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.039635;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:17,5:14,3
chr1	75886415	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0088091;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,4:8,1
chr1	75886416	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0082105;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,4:8,1
chr1	77367763	.	A	ATGTAAT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,2:0,1:4,1
chr1	77475382	.	ATATATG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,3:6,1
chr1	78838429	.	ATTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.030781;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,9:11,5:10,4
chr1	78840128	.	T	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0015624;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:49,14:25,5:24,9
chr1	79559217	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0022144;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:14,1:21,9
chr1	80455065	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.084679;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,5:15,4:4,1
chr1	84245172	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.011783;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:6,4:3,1
chr1	85409396	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=4.1341e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:24,9:19,7
chr1	85914304	.	A	ATG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,10:3,7:5,3
chr1	88623526	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:3,3:3,1:0,2
chr1	90311030	.	T	TTTCCTTCCTTCC	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0042046;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,9:11,5:20,4
chr1	90499440	.	A	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.010217;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,8:20,5:26,3
chr1	92412374	.	C	CTTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,4:12,1:15,3
chr1	93053223	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:4,2:15,2
chr1	93126159	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:1,2:0,1:1,1
chr1	94591266	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,4:16,3:10,1
chr1	94881184	.	C	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.00080381;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:49,11:27,4:22,7
chr1	97529514	.	T	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.9106e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:38,18:18,9:20,9
chr1	99708626	.	ATAT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,4:2,3:1,1
chr1	100028321	.	GTT	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.022644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:28,2:14,4
chr1	101750012	.	T	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.1832e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:32,18:18,8:14,10
chr1	102118219	.	GCAA	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.013188;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:37,6:18,3
chr1	103195970	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02905;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:4,1:15,5
chr1	103196013	.	TTC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0071858;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:2,1:9,7
chr1	103320217	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.015638;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:14,2:17,5
chr1	105071539	.	A	ACTCTCTCTCTCTCTCT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,6:6,5:8,1
chr1	105075289	.	T	TATAC	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018761;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:15,2:5,4
chr1	105176574	.	C	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=7.3001e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:17,6:25,8
chr1	106711994	.	T	TGA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.056165;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,5:13,2:20,3
chr1	108227490	.	A	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
chr1	108241901	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:0,0:17,4
chr1	108489196	.	G	GT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.027875;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,2:16,2
chr1	108489197	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.033417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,5:15,3:18,2
chr1	108523875	.	TATATATATG	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.12939;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,4:16,2:13,2
chr1	109469827	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0065559;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:8,6:1,1
chr1	113423259	.	T	TG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00387;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:10,9:0,1
chr1	114024625	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:5,8:2,2
chr1	114784814	.	C	CTTTTTTTT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.046785;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:14,8:8,1
chr1	116830698	.	T	TTCTC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,9:2,8:6,1
chr1	117137454	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.022846;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:21,2:15,3
chr1	118312815	.	GC	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,3:5,3
chr1	120061685	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.039481;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:7,10:22,2
chr1	120118304	.	T	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.0081296;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:30,11:15,2
chr1	120120057	.	T	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.024659;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:26,6:26,1
chr1	120122567	.	T	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.036338;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:56,13:27,10:29,3
chr1	120124322	.	G	C	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.012563;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:52,12:26,8:26,4
chr1	120147514	.	CT	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.042357;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:57,13:29,2:28,11
chr1	120199379	.	C	CCTCT	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0027718;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:30,18:13,6:17,12
chr1	120511371	.	G	A	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.045519;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:75,21:30,9:45,12
chr1	120865334	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,3:9,1
chr1	120920945	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.083411;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:24,4:15,1
chr1	121006911	.	C	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.014857;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:60,20:21,17:39,3
chr1	121017426	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0489;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:50,12:29,10:21,2
chr1	121035524	.	C	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.0051375;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:58,10:32,5:26,5
chr1	121070056	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.096448;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,2:14,2
chr1	121123014	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.028548;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:15,7:9,4
chr1	121123034	.	G	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0030354;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:18,9:11,5
chr1	121295036	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14592;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:21,3:8,2
chr1	121312943	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.025682;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:21,3:14,2
chr1	121375318	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,7:6,4:6,3
chr1	121398942	.	G	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0053111;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:12,10:27,6
chr1	121655844	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.057792;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
chr1	121662952	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.02099;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:18,2:28,5
chr1	121769292	.	T	C	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.0098206;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:74,9:29,7:45,2
chr1	121918780	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031046;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:19,1:2,4
chr1	121938737	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.039155;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:18,4:24,1
chr1	121951935	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.045061;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:17,2:8,3
chr1	121952283	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.010627;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:15,7:10,7
chr1	122122886	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:16,3:1,1
chr1	122164394	.	T	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.015096;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:24,4:20,2
chr1	122164557	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:3,1:12,6
chr1	122290901	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.060567;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:27,1:4,3
chr1	123692217	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.057784;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:36,4:0,0
chr1	123845299	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19246;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:6,1:19,3
chr1	124786953	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.031149;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:22,3:9,2
chr1	124788615	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,5:0,1
chr1	124804266	.	T	A	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.010263;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:64,12:45,9:19,3
chr1	124819244	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.036822;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:17,3:15,3
chr1	124832181	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0079695;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,6:4,2
chr1	124833991	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.039036;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:19,3:12,2
chr1	124866881	.	T	A	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.023164;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:114,17:76,11:38,6
chr1	125135958	.	C	G	0	PASS	DP=211;GPV=1;SPV=0.00014152;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:86,29:34,5:52,24
chr1	125135961	.	A	T	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.00031663;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:93,28:34,5:59,23
chr1	125170319	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.082408;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:1,3:30,1
chr1	125178301	.	A	C	0	PASS	DP=13569;GPV=1;SPV=9.8163e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:6911:6057,728:633,39:5424,689
chr1	125182272	.	G	A	0	PASS	DP=12697;GPV=1;SPV=0.0060736;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:6772:6000,739:5014,473:986,266
chr1	143185845	.	C	T	0	PASS	DP=548;GPV=1;SPV=0.00057945;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:359:289,68:177,52:112,16
chr1	143187209	.	A	C	0	PASS	DP=1386;GPV=1;SPV=0.0018903;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:813:721,90:227,40:494,50
chr1	143194773	.	A	T	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.031672;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:77,14:31,3:46,11
chr1	143201663	.	G	A	0	PASS	DP=638;GPV=1;SPV=0.01979;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:396:346,47:107,19:239,28
chr1	143210881	.	C	T	0	PASS	DP=1180;GPV=1;SPV=0.0011506;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:732:648,79:617,41:31,38
chr1	143214275	.	A	G	0	PASS	DP=8966;GPV=1;SPV=0.0034751;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:5453:4819,619:4117,404:702,215
chr1	143214277	.	C	G	0	PASS	DP=9389;GPV=1;SPV=0.0017894;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:5732:5012,625:4106,424:906,201
chr1	143237848	.	T	A	0	PASS	DP=3596;GPV=1;SPV=0.036833;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2154:1930,219:1400,145:530,74
chr1	143245469	.	A	G	0	PASS	DP=1075;GPV=1;SPV=0.022884;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:641:554,79:532,74:22,5
chr1	143324676	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
chr1	143505908	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.3167;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:22,4:6,1
chr1	143743001	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.014985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,12:21,9:11,3
chr1	143769128	.	T	C	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.025318;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:75,18:44,9:31,9
chr1	143791240	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.21414;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:17,4:5,1
chr1	143816122	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=1.1349e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,22:5,10:8,12
chr1	143876753	.	C	CTA	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0094722;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,8:19,5:7,3
chr1	143908474	.	G	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.041053;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:97,18:45,2:52,16
chr1	144103951	.	G	A	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.037815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:86,16:46,13:40,3
chr1	144484369	.	C	CA	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.048523;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,7:32,6:14,1
chr1	144592574	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.058582;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:16,5:12,1
chr1	144592578	.	G	GA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.086254;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,7:14,6:6,1
chr1	144827138	.	A	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.041942;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:73,15:27,2:46,13
chr1	144827697	.	A	AATG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053126;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:4,1:19,6
chr1	144827768	.	TTAAA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.26796;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:2,1:34,3
chr1	144988999	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:5,8:9,4
chr1	145136580	.	A	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.019561;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:63,12:37,10:26,2
chr1	145162688	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.02761;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:16,5:7,6
chr1	145411387	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,17:6,11:11,6
chr1	145445127	.	C	CT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.035929;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:10,9:13,3
chr1	146333614	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0097372;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:11,6:9,6
chr1	146397990	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.7941e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:29,18:13,8:16,10
chr1	146443480	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0037023;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:8,1:15,8
chr1	146717129	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:7,6:4,1
chr1	147090778	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.18565;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:26,2:11,3
chr1	148239596	.	CT	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.023047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:48,18:28,12:20,6
chr1	148471265	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.045222;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,11:18,5:15,6
chr1	148474192	.	GTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.37843;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:19,3:4,1
chr1	149058110	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021975;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,5:11,3
chr1	149157370	.	T	C	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.02174;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:73,18:49,5:24,13
chr1	149176407	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.029779;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:17,7:11,7
chr1	149398307	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00019831;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:26,34:12,13:14,21
chr1	149424393	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0010994;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:11,5:12,12
chr1	149475128	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.017006;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,5:9,5
chr1	149528005	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023166;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,1:5,4
chr1	149569833	.	C	T	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.040363;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:86,18:38,12:48,6
chr1	149583520	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.15137;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,4:27,1:7,3
chr1	149602017	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.016573;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:18,1:12,6
chr1	149609586	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0040088;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:18,9:10,2
chr1	149634139	.	GCCCCCACCGA	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.024131;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,6:15,4
chr1	149644757	.	AC	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.016341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,6:15,4:10,2
chr1	149685676	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11425;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,4:10,1
chr1	149771820	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13128;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,2:14,3
chr1	149789393	.	A	AAATAATAATAATAATAAT	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.00012454;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:53,17:26,13:27,4
chr1	150020956	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=1.3844e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:52,21:24,11:28,10
chr1	150724165	.	C	CTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.045954;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,10:8,8:9,2
chr1	150775822	.	ATTT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,6:13,3:4,3
chr1	151999734	.	G	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.00016247;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:67,22:30,10:37,12
chr1	153558554	.	G	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.018547;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:74,9:44,6:30,3
chr1	154113157	.	TA	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.02492;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:70,9:29,3:41,6
chr1	154593135	.	C	CAAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.040919;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,16:12,14:7,2
chr1	154714319	.	G	GGTGTGTGTGGGGT	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.074687;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,6:22,4:30,2
chr1	155065700	.	CTTTATTTATTTA	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0036289;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:15,5:24,10
chr1	155584670	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.20137;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:27,3:3,1
chr1	156617351	.	C	CTT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.010745;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,16:15,13:7,3
chr1	156756793	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.052073;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,6:19,5:9,1
chr1	156787448	.	TTG	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.008238;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:8,8:6,7:2,1
chr1	156979361	.	C	CTT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.010186;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,14:16,12:13,2
chr1	157035934	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.1019;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,3:15,1
chr1	157274173	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:5,2:7,2
chr1	158084688	.	T	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0029786;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:63,11:25,3:38,8
chr1	160569542	.	G	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.092902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:25,5:8,3:17,2
chr1	160973841	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1532;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:6,5:7,1
chr1	161097738	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.012533;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:16,9:6,7:10,2
chr1	161443332	.	G	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.011182;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:88,10:30,2:58,8
chr1	161513933	.	G	A	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.024873;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:81,15:43,4:38,11
chr1	161629853	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.32052;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:32,2:2,2
chr1	161981444	.	C	A	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.0009232;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:73,14:23,2:50,12
chr1	162403503	.	AAAAAAAAAATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.20823;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:16,1:19,3
chr1	164776899	.	TTGTGTG	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01792;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,13:16,9:7,4
chr1	164793872	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.11976;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,4:10,1
chr1	165117026	.	C	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=1.6016e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:58,22:30,13:28,9
chr1	165591334	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,1:14,3
chr1	165695487	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0083313;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,7:5,2
chr1	167111513	.	TACAC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,4:2,1:5,3
chr1	168153906	.	CAA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0093016;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,15:12,12:9,3
chr1	168466949	.	C	T	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.003938;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:76,13:43,9:33,4
chr1	169997884	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.031247;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,12:13,10:9,2
chr1	170166140	.	C	CT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:5,6:1,2:4,4
chr1	170331019	.	A	AT	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.0030735;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:65,14:33,4:32,10
chr1	171694664	.	G	GAA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.11157;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,5:19,3:18,2
chr1	174795790	.	G	T	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.00059571;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:81,20:46,13:35,7
chr1	174973979	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,5:16,4:4,1
chr1	175085874	.	C	CAA	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.013604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:33,20:26,17:7,3
chr1	175122455	.	TTGCTAACAAAGGACTGAAGAAGAGCCAGTGAGTTAGGAAAATCAAGGGAGTA	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.022351;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:19,10:20,6
chr1	179410300	.	G	A	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=5.0817e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:52,24:30,16:22,8
chr1	181727163	.	G	A	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=2.1332e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:56,36:31,18:25,18
chr1	182141378	.	CTTTCTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:7,2:7,2
chr1	183364655	.	A	ATTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0089603;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,15:17,2:19,13
chr1	183441072	.	G	A	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.0010762;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:64,13:37,5:27,8
chr1	184811511	.	T	TGTTTTTTTTTG	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.054778;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:45,9:14,7:31,2
chr1	185858586	.	ATTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.2649;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:14,2:14,2
chr1	186163946	.	A	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.01109;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:79,10:37,7:42,3
chr1	189139638	.	C	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0037905;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:69,8:43,3:26,5
chr1	190277113	.	A	ATATATATATATATATATT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:1,1:3,4
chr1	190280208	.	A	C	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.00043432;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:55,14:31,6:24,8
chr1	190408019	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,10:6,9:3,1
chr1	191089426	.	TATATATTTGTGTGTATACATGTGTATGTATACGCAC	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.16867;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:16,2:19,2
chr1	191581492	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.064856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,9:7,7:8,2
chr1	191806131	.	GAAT	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.12939;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:29,4:11,3:18,1
chr1	192048740	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.01311;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,8:26,6:3,2
chr1	192550559	.	G	A	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=9.5454e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:68,20:30,4:38,16
chr1	192606029	.	A	AAGAG	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.14384;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:29,2:7,2
chr1	193177358	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.01273;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,16:24,15:3,1
chr1	193564348	.	TTATA	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.024837;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:71,13:36,8:35,5
chr1	193988983	.	A	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.0017076;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:69,14:39,6:30,8
chr1	194673631	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01018;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,11:11,8:7,3
chr1	194834203	.	T	A	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.01342;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:25,8:11,3:14,5
chr1	195543282	.	GGTGT	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10026;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:26,4:7,1
chr1	196235161	.	T	C	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.0015681;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:62,19:29,8:33,11
chr1	198404753	.	A	C	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=3.3498e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:60,30:30,14:30,16
chr1	198977744	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.28876;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,4:12,2:13,2
chr1	199200439	.	C	CT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00036531;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:14,11:9,9
chr1	200073268	.	T	TTATA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,9:5,5:5,4
chr1	200736164	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.26519;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,3:11,1:5,2
chr1	200919962	.	C	CT	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.15872;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:33,5:13,2:20,3
chr1	201765404	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.023939;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:5,5:28,2
chr1	201901513	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0011846;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:5,17:1,12:4,5
chr1	202065074	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.043306;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,13:13,11:11,2
chr1	202721205	.	C	CTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:12,10:6,9:6,1
chr1	203315362	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.021e-10;SS=2;SSC=99;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:25,32:23,23:2,9
chr1	203315363	.	G	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=2.3122e-10;SS=2;SSC=96;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:27,32:23,23:4,9
chr1	203918573	.	A	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.023333;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:23,6:9,1:14,5
chr1	204099424	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.011427;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,9:13,8:4,1
chr1	205314328	.	T	G	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=4.0037e-17;SS=2;SSC=163;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:36,56:17,18:19,38
chr1	205898579	.	T	TTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,2:6,3
chr1	205956552	.	C	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0001101;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:78,19:38,10:40,9
chr1	206118843	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.066379;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,8:9,4:9,4
chr1	206322898	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053126;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:6,2:17,5
chr1	206345228	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0072004;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:4,4:9,5
chr1	207118198	.	A	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.018568;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:57,14:27,3:30,11
chr1	211214809	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.050308;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:20,4:23,2
chr1	211440639	.	CA	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00017113;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:30,27:15,17:15,10
chr1	211535137	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0024246;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:26,16:10,3:16,13
chr1	212116319	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0043177;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,10:11,8:10,2
chr1	212806847	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.018872;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:14,9:22,4
chr1	212865485	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.011608;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,8:15,7:2,1
chr1	212896856	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.018479;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:6,17:4,9:2,8
chr1	213355745	.	C	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.0061895;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:64,10:44,7:20,3
chr1	213714274	.	T	A	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.012157;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:61,7:35,3:26,4
chr1	213728937	.	G	GTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.012914;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,11:9,7:2,4
chr1	215732544	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0048547;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:4,8:3,4
chr1	216880304	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.019316;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:12,9:6,1
chr1	216912226	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,2:7,2:0,0
chr1	217958962	.	C	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=7.2352e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:81,27:41,12:40,15
chr1	218230928	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.012102;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:9,5:2,2
chr1	218991845	.	G	A	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=1.7265e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:65,29:24,12:41,17
chr1	219165731	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0038232;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:15,14:8,5:7,9
chr1	219927678	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,8:6,3:3,5
chr1	221297986	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,9:5,6:4,3
chr1	221524306	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,4:4,3:2,1
chr1	223065455	.	CTTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.097821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:8,3:11,4
chr1	223268044	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:6,3:10,3
chr1	223656676	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.016951;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:14,5:5,2
chr1	224011834	.	GGACAT	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,4:16,2:7,2
chr1	224342475	.	ATCTC	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.018933;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,11:9,7:10,4
chr1	226844839	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
chr1	228817691	.	A	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00021864;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:29,9:19,4
chr1	229069432	.	T	TA	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.017657;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:12,2:20,9
chr1	229116825	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.076651;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,5:3,3:9,2
chr1	229550525	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0052123;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:15,9:3,3
chr1	229870926	.	A	ACACAC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:4,1:1,1
chr1	231169368	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:8,4:5,1
chr1	232368199	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15645;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,2:15,3
chr1	233120164	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.030612;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,7:20,6:4,1
chr1	233729406	.	TGGC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.01817;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,2:13,5
chr1	234108657	.	TTA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.069262;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:22,3:15,4
chr1	235080879	.	G	GA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0047012;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,11:9,9:3,2
chr1	235926950	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.032608;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,10:14,9:3,1
chr1	237594886	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024462;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:5,2:5,2
chr1	237827936	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14184;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,5:9,1
chr1	237884033	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0024202;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,15:6,6:9,9
chr1	240248861	.	T	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00027224;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:47,16:29,3:18,13
chr1	240277525	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:5,4:3,1
chr1	240364499	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00013601;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:26,8:14,5
chr1	241571864	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.028117;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:7,8:12,2
chr1	242512288	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0010162;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:17,3:13,5
chr1	243079412	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00081679;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:24,6:16,4
chr1	245006970	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.034441;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,4:9,1:12,3
chr1	245781338	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00022306;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:25,4:11,7
chr1	246267930	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=3.0204e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:50,20:33,9:17,11
chr1	246273153	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:6,3:12,1
chr1	246408663	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,4:2,2
chr1	247852884	.	GACACACACAC	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.018096;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:20,4:14,4
chr1	247958619	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00015449;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:17,9:26,4
chr1	248475596	.	TTAAA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033483;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
chr1	248938433	.	T	C	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.022333;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,7:21,3:32,4
chr1	248945547	.	GGAGGGT	G	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.028385;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:65,10:25,3:40,7
chr1	248945740	.	TA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,1:1,3
chr10	51939	.	T	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0093264;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:51,8:24,6:27,2
chr10	260402	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013043;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:6,3:2,3
chr10	685159	.	AAAATATATATATATATATATATATATACATAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:4,1:10,6
chr10	794158	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.022194;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:15,8:6,2
chr10	1542823	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.031109;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:12,3:1,4
chr10	2205050	.	CA	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=3.8981e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:37,16:15,9:22,7
chr10	2583951	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.02706;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:18,2:14,3
chr10	4117550	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,3:1,2
chr10	4169431	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:15,8:4,2
chr10	4929666	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.008578;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:21,7:21,3
chr10	5370687	.	A	ATG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0046642;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,8:6,5:0,3
chr10	8613475	.	CTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.025795;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,8:7,6:6,2
chr10	9058088	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,5:6,4:3,1
chr10	9133448	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.048301;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:15,8:15,3
chr10	9321021	.	C	CTT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.1519;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:11,2:21,3
chr10	9776111	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.040415;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,8:16,7:4,1
chr10	10127847	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:20,4:14,2:6,2
chr10	10383234	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.05154;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:23,5:11,3:12,2
chr10	10621243	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0087248;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,10:8,8:5,2
chr10	10652124	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.004796;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:8,3:13,10
chr10	11197070	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,2:5,1:0,1
chr10	11645046	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010514;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,11:16,9:6,2
chr10	11662229	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.12928;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,2:12,2
chr10	12131682	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:5,1:6,5
chr10	12256163	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03895;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:13,8:3,1
chr10	12330744	.	CTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016858;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:8,3:1,2
chr10	12385739	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,13:5,9:2,4
chr10	14191806	.	TC	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.024274;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:17,3:19,2
chr10	14374865	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.022357;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:15,2:3,6
chr10	14628112	.	G	GTTTTTTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,4:6,1:8,3
chr10	15379603	.	G	GTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,5:5,4:4,1
chr10	15390270	.	A	AT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.02262;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,8:13,6:14,2
chr10	15930344	.	G	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0023029;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:51,8:27,2:24,6
chr10	17520917	.	GA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11029;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,2:4,2:0,0
chr10	18426955	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0070913;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,10:2,4:4,6
chr10	18563165	.	AATGGAATGGAATGGAGAATGGT	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.027747;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:13,3:19,7
chr10	19023687	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0047508;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:24,6:13,3
chr10	19885779	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.032911;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:27,4:17,1
chr10	20682249	.	T	TA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,9:8,8:5,1
chr10	21664944	.	C	CTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,9:5,6:5,3
chr10	22298888	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0029478;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:16,6:16,2
chr10	23051201	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.032391;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:16,5:20,4
chr10	25200869	.	T	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.14184;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,6:11,3:9,3
chr10	25211071	.	G	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.00067164;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:21,7:23,4
chr10	25713463	.	T	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.014855;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,10:9,8:9,2
chr10	25753378	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:10,4:3,2
chr10	25908233	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,4:10,1:11,3
chr10	27404164	.	A	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.005129;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:20,4:17,3
chr10	27446902	.	CTTTTCT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0084291;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,6:5,1:4,5
chr10	27656879	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0048547;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,10:2,2:5,8
chr10	27948779	.	A	ATT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,4:14,3:5,1
chr10	28465570	.	C	CA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.010573;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,10:10,7:10,3
chr10	28521937	.	G	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.00011299;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:25,6:19,6
chr10	29481168	.	T	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.11468;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:13,3:32,2
chr10	29507556	.	CAT	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.033939;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:15,2:11,3
chr10	30073685	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.036876;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:10,4:16,7
chr10	31312481	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0064153;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:23,4:26,4
chr10	31889619	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,2:3,2
chr10	31920449	.	C	CAAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.20433;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,6:17,5:6,1
chr10	31922180	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,9:3,6:4,3
chr10	33897211	.	G	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.079813;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:32,5:19,3:13,2
chr10	34371514	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,4:5,1
chr10	35262257	.	C	CAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,7:3,6:5,1
chr10	36383345	.	A	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00022873;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:29,6:15,7
chr10	38071302	.	C	CAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016961;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:9,7:7,2
chr10	38215937	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:12,5:1,1
chr10	38600954	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,1:4,6
chr10	38651226	.	A	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.026174;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:27,6:18,3
chr10	38953450	.	T	C	0	PASS	DP=414;GPV=1;SPV=0.023922;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:238:210,28:107,18:103,10
chr10	39720018	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0032962;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:28,6:5,2
chr10	39986132	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:33,4:0,0
chr10	39998840	.	G	A	0	PASS	DP=513;GPV=1;SPV=0.001616;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:277:243,34:143,25:100,9
chr10	40278008	.	T	TA	0	PASS	DP=415;GPV=1;SPV=0.0062425;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:236:195,39:157,31:38,8
chr10	40421309	.	C	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.03755;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:66,9:33,5:33,4
chr10	40477143	.	A	T	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.00059398;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:67,29:50,22:17,7
chr10	40701121	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.32006;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:24,3:17,1:7,2
chr10	40792873	.	A	G	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.014753;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:87,21:42,4:45,17
chr10	41066625	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:8,1:15,3
chr10	41072437	.	G	A	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.041395;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:93,20:53,10:40,10
chr10	41413507	.	C	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.020165;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:19,1:40,6
chr10	41550741	.	A	G	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.0090706;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:96,18:34,8:62,10
chr10	41559853	.	T	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.034486;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:110,26:87,10:23,16
chr10	41584224	.	A	T	0	PASS	DP=330;GPV=1;SPV=0.041571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:169,23:112,19:57,4
chr10	41587208	.	G	T	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.041845;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:79,11:13,6:66,5
chr10	41592961	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.012992;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:0,9:17,1
chr10	41874905	.	G	GGAATGGAATGCAACA	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0073197;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:33,10:22,3:11,7
chr10	41882526	.	C	T	0	PASS	DP=484;GPV=1;SPV=0.0071833;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:254:215,39:112,24:103,15
chr10	41899853	.	C	CGAATGGAATG	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.024355;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:37,11:18,4:19,7
chr10	41912099	.	T	A	0	PASS	DP=410;GPV=1;SPV=0.02222;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:235:205,30:108,20:97,10
chr10	42073671	.	T	A	0	PASS	DP=3712;GPV=1;SPV=0.016542;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2025:1788,237:832,129:956,108
chr10	42079479	.	C	T	0	PASS	DP=4454;GPV=1;SPV=0.022841;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2370:2099,271:1599,238:500,33
chr10	42085585	.	G	C	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.038256;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:90,11:18,3:72,8
chr10	42085807	.	G	A	0	PASS	DP=473;GPV=1;SPV=0.0037187;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:278:249,29:133,13:116,16
chr10	42130126	.	T	C	0	PASS	DP=692;GPV=1;SPV=0.024327;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:380:325,55:159,30:166,25
chr10	42130137	.	G	C	0	PASS	DP=728;GPV=1;SPV=0.034664;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:398:345,53:170,16:175,37
chr10	42766332	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.20063;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:26,4:8,1
chr10	42831180	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.0058807;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:31,5:19,3
chr10	42891280	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00010642;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:15,5:12,7
chr10	44382770	.	A	C	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=4.5383e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:46,21:21,15:25,6
chr10	45741650	.	C	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.014179;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:29,6:28,1
chr10	45836673	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033449;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:12,7:4,4
chr10	46323835	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0080848;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:24,6:20,2
chr10	46484868	.	A	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.014737;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:51,10:29,8:22,2
chr10	46525521	.	CAT	C	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.016073;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:69,18:31,8:38,10
chr10	47520838	.	TA	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.021295;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,10:13,6:11,4
chr10	48051799	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.017584;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:11,10:16,2
chr10	48140522	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10903;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,3:17,1
chr10	50028240	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,3:2,1
chr10	50748900	.	T	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.038215;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,9:18,4:23,5
chr10	51091344	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00062159;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:20,5:23,11
chr10	51285968	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.04872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:20,4:18,1
chr10	52036899	.	G	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.041079;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:50,11:34,6:16,5
chr10	52380498	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0010177;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:27,5:11,5
chr10	53164463	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=2.6315e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:20,8:19,8
chr10	53729877	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.013778;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:13,7:19,4
chr10	55582628	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02037;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:5,2:4,3
chr10	56175687	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,3:5,2:1,1
chr10	56684222	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.8184e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:14,7:13,6
chr10	57620739	.	C	CATATATATATATATAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.022727;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,3:6,2
chr10	57811028	.	T	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=1.2729e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:38,18:19,5:19,13
chr10	61120281	.	G	GTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:6,2:7,2
chr10	61680578	.	T	TATA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0088769;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,7:6,2
chr10	62977815	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018244;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:6,5:0,1
chr10	64460856	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,7:2,1
chr10	65470642	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0026067;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:22,6:14,5
chr10	66380758	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0019257;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:22,4:13,5
chr10	66421834	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.046847;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,4:2,2
chr10	66976334	.	T	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=3.5233e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:13,6:17,8
chr10	68821532	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.050822;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:13,2:27,3
chr10	70045898	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.016941;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:14,1:23,8
chr10	70311222	.	A	AT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.02977;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:14,8:10,5
chr10	71590884	.	AAAC	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.035289;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,6:8,4:11,2
chr10	72319091	.	C	CT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.043948;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,5:14,3:13,2
chr10	73724908	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,3:4,1
chr10	74018177	.	G	GATATATATATAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.014286;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,4:0,4:0,0
chr10	74602105	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:13,7:1,1
chr10	75109823	.	G	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0075351;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:30,5:19,3
chr10	78459622	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0017333;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:26,8:11,1
chr10	80032868	.	T	TAAA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:5,4:2,2:3,2
chr10	80383621	.	G	GTATACGTATATATATATATATA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:13,3:15,1
chr10	84047174	.	C	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0039955;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:26,5:22,8
chr10	84437150	.	C	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:4,6:1,5:3,1
chr10	84922885	.	T	TGTAAGAGGTTG	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.025097;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:16,3:23,3
chr10	86600343	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0036889;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:17,3:20,5
chr10	86625377	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011299;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:9,7:2,2
chr10	87219963	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,2:7,2
chr10	87351605	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.018263;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:19,5:23,5
chr10	87985763	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
chr10	88613770	.	G	GTATA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0024902;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,8:1,6:2,2
chr10	90289883	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:24,2:8,2
chr10	92582076	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.048675;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:28,1:16,4
chr10	93644896	.	ATATAG	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,1:16,3
chr10	93693480	.	GTGTATA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.020192;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:12,3:7,7
chr10	93693509	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.010436;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:8,2:9,8
chr10	93693514	.	TATATATATATATACACC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035132;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:8,1:12,7
chr10	96025192	.	AAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:10,2:9,2
chr10	96794402	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.017686;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:15,2:17,5
chr10	97166543	.	GA	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.016354;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:13,2:6,3
chr10	97449861	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,3:6,1
chr10	99321534	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:26,4:21,3
chr10	99321537	.	AAGAACC	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.073758;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:48,6:26,5:22,1
chr10	99922502	.	GTT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19804;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,4:9,1
chr10	99929440	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00011756;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:16,6:14,4
chr10	102663393	.	A	AAAT	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,4:21,3:9,1
chr10	103728043	.	C	A	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=4.2495e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:50,16:28,8:22,8
chr10	103776395	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.022854;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:8,5:8,3
chr10	104293563	.	A	AT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0061419;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,6:18,4:7,2
chr10	104306020	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00048357;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:14,15:11,12:3,3
chr10	104534704	.	TTCTTTC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.020689;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,5:2,3:13,2
chr10	105512880	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.407e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:14,11:10,3
chr10	106125874	.	A	AAG	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.012602;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,10:13,6:17,4
chr10	108123939	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=6.9523e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:39,17:18,5:21,12
chr10	109500156	.	GTGTGGGCTGAATTCTGAGCACTACACATCA	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.03317;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:38,16:22,9:16,7
chr10	111375645	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.020244;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,7:5,3:10,4
chr10	113073503	.	CA	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.043711;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:16,5:7,3
chr10	113156115	.	C	CT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00077751;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,10:7,9:6,1
chr10	113348938	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00080682;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:13,5:24,6
chr10	114083902	.	AATATTATATATAAAT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:1,3:7,3
chr10	118600042	.	G	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.00026184;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:53,13:26,8:27,5
chr10	119636647	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.020593;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:25,4:25,4
chr10	119717299	.	A	AT	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00018434;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:23,6:10,5
chr10	121080935	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.00036241;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:18,6:27,6
chr10	121421866	.	G	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=2.2741e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:22,4:17,10
chr10	121455813	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:1,3:3,2
chr10	121650820	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.006961;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:19,3:8,5
chr10	123068657	.	CACAT	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0091599;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:21,5:18,2
chr10	123211730	.	G	GTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.013574;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:13,6:5,3
chr10	125826996	.	T	TAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0082486;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,10:10,6:8,4
chr10	125864929	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0045249;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,5:1,1
chr10	125894099	.	AAT	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.028118;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:100,16:33,4:67,12
chr10	127755343	.	C	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=7.5652e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:16,8:19,7
chr10	130347228	.	G	GT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0092633;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:7,3:3,6
chr10	131350780	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0010195;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:21,4:14,6
chr10	131746881	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0052114;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,6:6,2:12,4
chr10	132816830	.	G	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=2.593e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:34,21:19,9:15,12
chr10	133011316	.	T	TTA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.023176;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,2:3,3
chr10	133430349	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.015108;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:24,3:21,3
chr10	133625834	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0086278;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:23,3:21,11
chr10	133657822	.	A	T	0	PASS	DP=389;GPV=1;SPV=0.02169;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:211:175,36:91,22:84,14
chr11	123174	.	AAAAC	A	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.035374;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:68,10:39,6:29,4
chr11	349700	.	C	CAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,1:8,3
chr11	897146	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020382;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:20,5:3,2
chr11	1096112	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.01598;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:21,5:11,2
chr11	2917012	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.029749;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:20,8:13,3
chr11	3754941	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:11,3:10,3
chr11	4046059	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.30935;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,5:10,3:6,2
chr11	4174497	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00096207;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:7,8:12,9
chr11	4233598	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,1:9,3
chr11	4244066	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.040748;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:11,5:15,2
chr11	4297902	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.031471;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,1:15,3
chr11	4308516	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.065183;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:17,1:21,6
chr11	4353566	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.036854;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:14,3:8,4
chr11	4819566	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
chr11	5692793	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.026055;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,8:10,7:9,1
chr11	8854016	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:9,1:5,3
chr11	9719093	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0079779;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,12:17,9:7,3
chr11	10108515	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.19203;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:14,3:9,1
chr11	12155973	.	G	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=2.1165e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:42,19:16,11:26,8
chr11	12306140	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00010265;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,13:18,6:21,7
chr11	12330900	.	A	AGAGT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,4:18,3:8,1
chr11	12837681	.	T	TTTCTCCTTTCTCCC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:12,2:16,6
chr11	15283720	.	C	CT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0012048;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:15,8:11,2
chr11	18274075	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=3.3037e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:34,19:22,10:12,9
chr11	18598411	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,3:5,1
chr11	22334110	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,10:7,7:6,3
chr11	22339167	.	TATATATATATG	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,2:14,2
chr11	23228372	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.039737;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,5:6,2:2,3
chr11	25219930	.	CAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015942;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,4:2,1
chr11	25650319	.	C	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.012311;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:21,8:16,2
chr11	25650327	.	GTATA	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.013578;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,9:17,7:15,2
chr11	25849885	.	T	TA	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00014302;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,14:23,5:14,9
chr11	25857940	.	C	CTTATTATTATTATTATTA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0093999;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:14,4:15,5
chr11	29143731	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,9:4,1
chr11	29504566	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,7:1,2:2,5
chr11	30888060	.	AAG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,5:12,4:5,1
chr11	30888104	.	AAG	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023578;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,9:14,7:10,2
chr11	32855211	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=5e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:17,11:25,5
chr11	33310270	.	G	GTCTATCTTATCTATCTA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.071484;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,3:17,1
chr11	34237276	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:20,4:1,0
chr11	35887994	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.022257;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:19,5:20,2
chr11	36793927	.	TATATATATA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010836;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,5:2,2:2,3
chr11	37315818	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=2.1193e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:33,19:15,10:18,9
chr11	38943261	.	T	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=4.7395e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:24,10:17,3
chr11	39326384	.	T	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=2.3519e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:36,17:17,10:19,7
chr11	40906706	.	C	CTG	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.027169;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,3:16,2
chr11	41303775	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019062;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,1:9,4
chr11	43888382	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,2:2,4
chr11	45337328	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.045915;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,9:9,1
chr11	47545867	.	CTGCGTG	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,4:8,1:11,3
chr11	47862750	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.011497;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:17,3:25,4
chr11	52225432	.	C	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:1,0:21,4
chr11	52599572	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1041;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:25,4:7,1
chr11	52599777	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.092724;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:6,4:44,2
chr11	52737767	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:21,4:0,0
chr11	53072080	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:3,3:16,2
chr11	53300818	.	C	A	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.01649;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:115,13:43,4:72,9
chr11	53535337	.	T	A	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.01123;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:98,22:45,10:53,12
chr11	53616452	.	G	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr11	54256182	.	G	A	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.0093624;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:94,23:37,10:57,13
chr11	54351934	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,3:1,1
chr11	54353579	.	C	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.044477;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,1:8,3
chr11	54362637	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,1:10,3
chr11	54382746	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.060731;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,1:20,3
chr11	54393362	.	C	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.012341;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:89,19:1,1:88,18
chr11	54421961	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.04394;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,4:4,1
chr11	54530924	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr11	54536160	.	T	G	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.029289;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:68,17:35,14:33,3
chr11	55317589	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0058707;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:26,2:14,6
chr11	55568525	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.7247e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:14,8:10,6
chr11	55608897	.	C	CTATATATA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,7:5,4:3,3
chr11	55993111	.	A	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.038888;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:22,8:15,2:7,6
chr11	56498551	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0003709;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:14,5:16,4
chr11	56974177	.	A	AATAT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:6,4:1,1
chr11	58320076	.	GT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.035323;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:10,4:5,4
chr11	58697156	.	G	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.048805;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,10:35,8:22,2
chr11	59905247	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,10:3,9:2,1
chr11	61376652	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00062737;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:17,6:18,4
chr11	61657599	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,8:8,4:6,4
chr11	62098145	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.016315;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,11:14,6:8,5
chr11	62184483	.	A	G	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=4.0571e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:19,7:25,9
chr11	63145562	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0035559;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:2,4:6,6
chr11	63177835	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.012629;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:13,4:8,4
chr11	64170679	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:3,3:6,4
chr11	64582112	.	T	TCACCAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.25362;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,3:7,1:10,2
chr11	66270245	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:13,5:7,3:6,2
chr11	67670248	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:17,3:6,1
chr11	68511463	.	A	AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.010126;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,7:9,6:13,1
chr11	69715028	.	AAGAGAGAGAG	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0092391;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,14:11,10:8,4
chr11	70678532	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:4,4:2,1
chr11	71931566	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00024808;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:41,15:21,7:20,8
chr11	72907599	.	G	GTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.029887;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,12:10,8:9,4
chr11	73735920	.	T	TAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014318;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,6:4,3
chr11	73762590	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0048917;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:15,4:11,2
chr11	74353860	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0028145;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:1,4:3,2
chr11	76076802	.	G	GTATTTATTTATT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.032545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,10:10,5:20,5
chr11	77920226	.	TACATAC	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0078411;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,8:18,7:22,1
chr11	78535632	.	C	CT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.060679;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:23,3:10,1
chr11	78942108	.	TA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.006277;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:14,5:15,2
chr11	79124893	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.20154;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,9:17,4:9,5
chr11	80326049	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0037001;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:18,7:21,1
chr11	85598630	.	A	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00022326;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:30,3:10,9
chr11	85753760	.	CT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:23,3:9,1
chr11	86939405	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,2:6,2
chr11	87189098	.	CG	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.068696;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:9,2:20,2
chr11	88080857	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.25926;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,4:15,4:0,0
chr11	89060285	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:23,4:12,2:11,2
chr11	89157084	.	T	TATAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:7,3:3,1
chr11	89422795	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0023788;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,9:7,8:4,1
chr11	89757187	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,8:7,7:2,1
chr11	89861631	.	C	T	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.018449;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:51,10:25,6:26,4
chr11	90552211	.	GT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0032719;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:9,9:6,4
chr11	91670125	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,2:2,1:2,1
chr11	92010898	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0011397;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:11,2:28,8
chr11	92293064	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.031089;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:15,4:9,1
chr11	92712942	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.013703;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:22,1:19,6
chr11	93591583	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015718;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:2,1:3,6
chr11	95337512	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.051974;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:26,2:7,3
chr11	96232615	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00032416;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:12,8:28,5
chr11	96932088	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,10:5,7:4,3
chr11	97579453	.	ACACACACACACACC	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0073017;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:14,9:10,5
chr11	97899853	.	GACATATTAAAATAAATTCTTCAGAGAGAACCA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0048961;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:17,6:8,4
chr11	98135976	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.059972;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,6:17,2:18,4
chr11	98316306	.	TA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,2:1,1:3,1
chr11	98697052	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,3:4,1:2,2
chr11	98859045	.	C	CTATATATATA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1226;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,6:7,5:4,1
chr11	99727378	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.013425;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:13,11:16,4
chr11	101046292	.	ATTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,2:6,2
chr11	101622377	.	G	GAAAGAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:13,4:6,3:7,1
chr11	101629982	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.033473;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,2:11,4
chr11	102149977	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:5,2:3,2
chr11	103125366	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0001763;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,14:7,12:3,2
chr11	103487799	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,9:5,5:11,4
chr11	103526491	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,6:7,1
chr11	105365792	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=8.9306e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:22,6:17,7
chr11	106000360	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.010101;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:1,4:0,2:1,2
chr11	106855905	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0014228;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,18:7,12:9,6
chr11	107512304	.	T	G	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.046944;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:52,13:23,10:29,3
chr11	107540628	.	A	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.038009;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:33,5:26,4
chr11	108856170	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=1.5282e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:19,10:16,4
chr11	111276453	.	A	AAATATAT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:8,9:7,7:1,2
chr11	112102806	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=5.656e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:10,8:22,9
chr11	112255078	.	TG	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:4,4:3,2:1,2
chr11	112677726	.	C	CTTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.035511;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:14,8:4,1
chr11	113210775	.	A	AACAC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.016244;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,10:14,7:3,3
chr11	116818311	.	AT	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.057736;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,6:20,1:16,5
chr11	118504565	.	A	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=3.0753e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:42,19:21,13:21,6
chr11	118609315	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.027862;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:9,1:11,4
chr11	118802450	.	T	TATATATATATATA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,6:6,4:4,2
chr11	118831563	.	A	ATTTATTTTTATT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.021689;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,11:8,3:21,8
chr11	119818978	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.022061;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,8:8,5:13,3
chr11	121120793	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=5.6929e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:25,9:14,3
chr11	121147059	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.7558e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:10,7:8,5
chr11	121765653	.	TTCTC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.010021;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:3,1:8,4
chr11	121765659	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:2,1:6,4
chr11	122558020	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,5:10,2
chr11	123368271	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.098694;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:11,2:20,3
chr11	123403451	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.029506;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:22,5:13,4
chr11	123614151	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=6.0843e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:13,7:20,4
chr11	123709175	.	CT	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:15,2:20,2
chr11	123750349	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00017791;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:19,4:23,10
chr11	124337155	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.007251;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:5,6:7,3
chr11	125623068	.	CAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0050719;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:13,7:3,1
chr11	126417787	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.047777;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:16,2:26,4
chr11	126923098	.	TCTTCTC	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:3,2:23,2
chr11	126956487	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0012263;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:19,5:15,4
chr11	127617757	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1671;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:9,4:9,1
chr11	127992652	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,1:6,3
chr11	128985860	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.06037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,2:14,2
chr11	129043381	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
chr11	130091047	.	A	C	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.0011005;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:45,20:20,10:25,10
chr11	131680469	.	C	CTG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0083484;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:10,5:7,7
chr11	132069996	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02791;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,2:14,4
chr11	132217352	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.094058;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:18,2:18,2
chr11	132599386	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.049096;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,4:9,1:9,3
chr11	134896512	.	C	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00036516;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:23,6:21,6
chr12	43841	.	T	C	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.016532;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:91,11:66,9:25,2
chr12	422048	.	AC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.14184;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:15,1:7,2
chr12	1501253	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.064526;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,1:11,3
chr12	1604830	.	A	AGT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,2:3,2
chr12	1933007	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.026239;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:24,8:17,2
chr12	3072183	.	C	CTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,8:2,2:7,6
chr12	5133551	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0003312;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:20,8:19,5
chr12	5658624	.	A	G	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.031023;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:47,16:25,13:22,3
chr12	5932324	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.025884;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:38,15:19,9:19,6
chr12	5998499	.	ATAT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,6:2,4:0,2
chr12	6400481	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0078411;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:18,4:22,4
chr12	7197123	.	A	AT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.071698;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:10,3:13,2
chr12	7197197	.	T	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0031015;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:16,6:16,9
chr12	7197198	.	A	AT	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.036143;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:17,4:21,6
chr12	7300180	.	AG	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.05062;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:14,3:7,1
chr12	7421606	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,7:4,3:2,4
chr12	7874783	.	A	ACG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.057887;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,5:12,2:15,3
chr12	8983395	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.025395;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:7,2:6,5
chr12	9284446	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.045574;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:14,4:11,5
chr12	9440307	.	A	G	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.021699;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:61,10:20,1:41,9
chr12	9445081	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.029989;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:34,4:27,4
chr12	9775802	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0040214;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:12,12:6,2
chr12	10229652	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.047343;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:6,4:0,0
chr12	10860794	.	GGGAAA	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,4:1,1
chr12	11301199	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21758;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,1:14,3
chr12	12433348	.	A	AAT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.015123;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,12:8,9:4,3
chr12	14586637	.	CAT	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.095143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:19,2:16,2
chr12	14684586	.	TTCCTTCC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0011312;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,7:0,3:2,4
chr12	16157109	.	CTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021442;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:12,3:8,3
chr12	16523882	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.00035725;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:22,7:25,5
chr12	17001438	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.2854e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:12,3:21,13
chr12	17429190	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0037716;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:21,5:23,4
chr12	17437782	.	A	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:10,4:4,3:6,1
chr12	17535764	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0075589;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:17,3:19,5
chr12	18650700	.	GTGTGTATATATCTATATATATATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,6:2,3
chr12	20195673	.	A	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00062967;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:49,15:25,6:24,9
chr12	20386122	.	AAT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020906;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:13,2:10,6
chr12	21579349	.	CTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018977;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,12:7,9:6,3
chr12	22651683	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.12521;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:26,8:17,6:9,2
chr12	22655358	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0019815;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,17:13,10:12,7
chr12	23184603	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:6,3:3,1
chr12	24965737	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00021938;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:17,9:17,3
chr12	26182586	.	T	TC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:3,1:7,3
chr12	29076043	.	GAA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,4:3,1
chr12	29588287	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0013642;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:26,2:20,8
chr12	30698745	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,3:0,1:2,2
chr12	31256208	.	CTTTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,2:0,0:4,2
chr12	31600148	.	TAA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:5,3:6,3
chr12	32118087	.	A	AT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10903;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,2:18,2
chr12	34396603	.	G	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.00018046;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:24,4:22,8
chr12	34809155	.	C	T	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.048332;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,15:26,7:32,8
chr12	34897693	.	C	A	0	PASS	DP=412;GPV=1;SPV=0.044198;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:247:213,34:190,29:23,5
chr12	34900136	.	G	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.028877;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:16,9:36,7
chr12	34907389	.	C	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,1:5,3
chr12	35119500	.	G	C	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.047506;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:63,18:38,14:25,4
chr12	35131522	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.3107;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:0,0:27,4
chr12	35346166	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr12	35410170	.	C	A	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.019872;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:64,17:19,5:45,12
chr12	35536409	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.029251;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:14,4:18,5
chr12	35732599	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.33518;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:23,4:0,0
chr12	36077545	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0048798;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:1,1:20,10
chr12	36081326	.	G	A	0	PASS	DP=494;GPV=1;SPV=0.037777;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:289:249,40:112,13:137,27
chr12	36345295	.	G	A	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.026669;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:141,20:48,9:93,11
chr12	36354434	.	A	T	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.021426;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:111,23:56,15:55,8
chr12	36440145	.	G	C	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.028831;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:141,19:72,10:69,9
chr12	36512617	.	G	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.018096;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:61,11:57,3:4,8
chr12	36687647	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,1:18,3
chr12	36941561	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr12	37065138	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr12	37109804	.	AC	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:24,1:9,3
chr12	37109806	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10242;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:25,1:9,3
chr12	37235869	.	C	T	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.024763;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:76,12:21,3:55,9
chr12	37239433	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.040852;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:20,4:13,3
chr12	37239914	.	T	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:25,3:16,2
chr12	37570739	.	T	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0060738;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:19,4:19,3
chr12	39534883	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.022431;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,8:16,5:6,3
chr12	39653558	.	T	TTC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.030984;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,5:11,3:7,2
chr12	41270326	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:20,4:11,2:9,2
chr12	41713007	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
chr12	41744307	.	T	TTTTTC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.027873;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,10:12,4:9,6
chr12	41950085	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
chr12	42485239	.	GTTTTTT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:12,4:5,1
chr12	45376368	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.024372;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:12,4:19,10
chr12	46874014	.	TTC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.014083;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:8,5:11,3
chr12	48055293	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00012694;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:18,8:16,6
chr12	48271915	.	C	CTTT	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.046436;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,6:24,5:7,1
chr12	48879131	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0070569;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:19,4:14,3
chr12	49313495	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0074524;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,13:8,9:4,4
chr12	49385862	.	TG	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.030617;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:21,5:20,2
chr12	49548096	.	G	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.029376;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:29,10:12,3:17,7
chr12	51721081	.	T	TTATATA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,4:11,1:11,3
chr12	52374729	.	A	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00024819;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:20,4:15,7
chr12	52423554	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=4.8427e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:43,17:23,9:20,8
chr12	52943056	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=2.468e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:18,7:18,7
chr12	55098653	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.034248;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,3:10,2
chr12	55928676	.	CAAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,7:6,1
chr12	56690308	.	T	TAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,6:7,5:6,1
chr12	57970676	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:7,2:17,2
chr12	60537210	.	A	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00030968;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:17,5:15,6
chr12	61400232	.	ATTTAAGAATATTTAAATAAAGAATTAGTATATTC	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0062315;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:20,5:18,7
chr12	61461169	.	GA	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0051771;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:22,3:23,5
chr12	63011208	.	A	C	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.00026049;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:50,14:32,8:18,6
chr12	63839163	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.032183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:9,5:14,3
chr12	66390272	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0024615;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:15,7:27,3
chr12	67184674	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,4:5,4
chr12	69200826	.	TGAGG	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,3:3,1
chr12	69299620	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,3:3,3
chr12	69357532	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:11,2:12,2
chr12	69840286	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.00010162;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:49,15:25,9:24,6
chr12	69960686	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0082862;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,6:7,6
chr12	70596519	.	T	TA	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.025619;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:26,1:24,5
chr12	71901930	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00015233;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:23,10:17,5
chr12	72551787	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=8.2952e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:15,8:17,5
chr12	75429935	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.016397;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,4:11,5
chr12	75669850	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,4:1,1:2,3
chr12	76019229	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0094835;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,9:7,6:6,3
chr12	78274684	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:9,5:7,1
chr12	79179243	.	G	GAT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.023972;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,1:10,8
chr12	79632300	.	TATATATACATAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015215;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:11,7:2,1
chr12	79632312	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13725;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,2:4,1:1,1
chr12	80431621	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0017568;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,13:11,9:1,4
chr12	80552643	.	AATTATATAT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:3,1:1,3
chr12	82227812	.	A	AATGTTTATT	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.020631;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:19,5:27,2
chr12	82227814	.	A	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.023704;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:21,5:26,2
chr12	82227815	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.037567;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:20,4:26,2
chr12	84155582	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00068089;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:53,13:24,9:29,4
chr12	85993908	.	C	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.016475;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:66,9:38,7:28,2
chr12	86595999	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00082226;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:18,8:22,5
chr12	86612739	.	CA	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00042315;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:12,5:8,4
chr12	87202646	.	A	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00049606;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:22,4:10,5
chr12	87747203	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.010857;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:11,2:13,11
chr12	88522481	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=3.2868e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,16:12,8:24,8
chr12	90093214	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
chr12	90866407	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.24135;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:20,3:8,1
chr12	93401164	.	A	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.037663;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:52,8:16,1:36,7
chr12	93614404	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.012068;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:2,1:13,5
chr12	96220382	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0062647;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,12:20,9:8,3
chr12	96291628	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,8:5,7:4,1
chr12	96909176	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0082862;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,12:12,9:6,3
chr12	101437951	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0048847;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:28,3:13,6
chr12	101810432	.	T	TAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:10,3:2,1
chr12	102829664	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0032271;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,5:9,5
chr12	102831578	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.044568;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:28,1:23,5
chr12	103039964	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0098054;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:25,4:17,3
chr12	103224524	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.030671;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:22,1:22,7
chr12	103259056	.	T	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=6.1657e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:49,19:18,10:31,9
chr12	103831770	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0047817;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,6:7,3
chr12	104323684	.	A	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.022711;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:19,3:10,7
chr12	105036516	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:4,1:1,1
chr12	105598715	.	A	ATGTGTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02761;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,11:15,8:8,3
chr12	106109555	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.021089;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,11:13,9:2,2
chr12	106115736	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=9.0588e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:20,7:21,6
chr12	107069643	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0070569;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:22,3:11,4
chr12	112655563	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:4,4:6,1
chr12	113432209	.	CTTCTTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:3,1:14,4
chr12	113642131	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,10:3,1:6,9
chr12	113941612	.	A	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.031957;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:32,10:20,4:12,6
chr12	114207721	.	A	ATT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.045384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,10:15,6:11,4
chr12	114912242	.	C	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.0073381;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:49,12:28,4:21,8
chr12	115083989	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00025208;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:27,9:19,5
chr12	115909594	.	A	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=1.0227e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:41,22:22,10:19,12
chr12	116385440	.	C	CTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:7,5:6,1
chr12	117285531	.	GA	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.076397;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:26,3:7,1
chr12	117321992	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
chr12	118003891	.	C	CA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.019651;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,6:17,5:12,1
chr12	118709094	.	T	TTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0046784;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,10:1,4:5,6
chr12	118757668	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:5,2:6,5
chr12	119075452	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,3:11,1
chr12	119377254	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0087645;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:13,10:3,1
chr12	120441974	.	ATTAT	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
chr12	122156931	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00047755;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:14,7:16,7
chr12	122696119	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
chr12	125390634	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00089506;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:27,6:12,6
chr12	126225669	.	CT	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0086452;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,9:11,4:15,5
chr12	126697301	.	G	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0023465;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:28,5:14,4
chr12	127103899	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:6,4:4,1
chr12	127341272	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,5:10,4:6,1
chr12	127480647	.	C	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,4:4,2
chr12	127747591	.	T	TTTCC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,7:7,3:9,4
chr12	128016648	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,2:4,1:2,1
chr12	128701903	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.054119;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:21,2:11,2
chr12	129043525	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0012547;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:19,4:17,5
chr12	130533037	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.018505;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:14,4:8,2
chr12	131539486	.	ATGGTGATGG	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.031797;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:13,6:12,2
chr12	132165171	.	TATA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0054438;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,2:7,6
chr12	132463893	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,4:8,1:8,3
chr12	132758936	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.037005;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:11,4:7,4
chr13	18318089	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=252;GPV=1;SPV=0.049683;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:84,11:40,8:44,3
chr13	21393699	.	CAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
chr13	21853434	.	T	TA	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.010252;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:26,2:18,8
chr13	22379938	.	C	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=5.5065e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:22,3:21,11
chr13	22701443	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:8,3:5,2
chr13	23059875	.	TTC	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.010151;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:4,1:15,4
chr13	23101730	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11553;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:19,2:4,3
chr13	23318367	.	G	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00018163;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:19,6:21,9
chr13	24406427	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.12939;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,2:15,2
chr13	24584653	.	T	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00014015;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:41,17:22,7:19,10
chr13	24587447	.	T	C	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.049596;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:85,19:24,10:61,9
chr13	24764890	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:40:1,6:1,4:0,2
chr13	24961756	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.030258;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:11,9:15,1
chr13	25399397	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:2,5:2,1
chr13	25888068	.	A	ACCCC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:1,0:10,4
chr13	25953522	.	T	TA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064424;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,5:21,4:13,1
chr13	26982961	.	A	AAAG	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,4:20,1:7,3
chr13	27466530	.	T	C	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.00043273;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:46,13:26,6:20,7
chr13	28059974	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:4,3:2,1:2,2
chr13	28099048	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00091067;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:24,5:16,5
chr13	29566785	.	T	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.00076988;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:26,7:20,2
chr13	31999431	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.047124;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,1:15,3
chr13	33178023	.	G	GA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0085139;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:2,5:3,1
chr13	34013843	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0084455;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:16,4:22,3
chr13	34136234	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0033188;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:15,5:29,5
chr13	34362913	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:3,5:6,1
chr13	35809161	.	A	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0005101;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:22,6:23,7
chr13	38207779	.	GAGAGA	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:20,2:12,2
chr13	38988367	.	T	TAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10735;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:14,2:13,1
chr13	39566731	.	T	TAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:11,3:3,1
chr13	42836567	.	ATATATATAT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.011905;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,6:0,1:0,5
chr13	43100205	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:9,2:2,3
chr13	45019034	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.060034;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,2:16,2
chr13	46625631	.	G	GT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029113;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,6:11,4
chr13	47144838	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=8.3622e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:19,8:25,7
chr13	48174576	.	A	AT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0081878;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,8:10,7:16,1
chr13	49378723	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,3:9,1
chr13	49775153	.	ACT	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.017354;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:9,8:15,6
chr13	51604796	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00039728;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:23,9:16,6
chr13	52078073	.	C	CA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:19,2:15,2
chr13	54177183	.	T	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=1.9766e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:14,9:25,5
chr13	54874289	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.019164;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:55,8:31,4:24,4
chr13	55556250	.	C	CTT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.026086;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,14:7,4:15,10
chr13	55614797	.	A	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0254;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:24,3:17,4
chr13	56654601	.	C	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=5.6815e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:39,17:22,6:17,11
chr13	56804533	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0011362;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:26,8:14,2
chr13	57884182	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0096294;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:25,2:21,5
chr13	58781479	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.020516;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:24,11:18,2:6,9
chr13	58866893	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,1:17,3
chr13	59749444	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.01483;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:23,3:6,3
chr13	63260054	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.010704;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:10,7:6,2:4,5
chr13	63429909	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.04872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:25,2:13,3
chr13	63864907	.	C	CTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1852;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,5:7,2:15,3
chr13	64509325	.	C	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00023731;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:19,6:14,4
chr13	67019188	.	C	CTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046683;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,5:9,3:7,2
chr13	67174318	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.041983;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:12,4:17,2
chr13	68412521	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=1.9489e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:44,17:27,9:17,8
chr13	70292136	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,9:8,8:6,1
chr13	70382679	.	G	GATATATAT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022595;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:4,2:5,4
chr13	71118149	.	G	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.052643;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:12,2:2,4
chr13	71700588	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,3:1,1:3,2
chr13	72949960	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00025924;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:45,14:28,9:17,5
chr13	74429226	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:7,2:18,2
chr13	75771542	.	T	TTTTAA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.05421;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:18,2:22,3
chr13	75771545	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.061918;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,5:13,2:23,3
chr13	75940903	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:5,5:3,1
chr13	76835153	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:26,4:9,2:17,2
chr13	76835645	.	G	GAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.18687;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:31,3:3,1
chr13	76964894	.	G	GTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.092279;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:13,4:7,1
chr13	77748398	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:9,5:1,2
chr13	78078379	.	T	TAC	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=7.4607e-06;SS=2;SSC=51;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:11,8:14,7
chr13	79116653	.	TAC	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.049204;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:19,4:18,7
chr13	80627712	.	TTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,4:6,1
chr13	80848572	.	A	ATTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0094722;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,8:4,2:22,6
chr13	81849772	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0078067;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,10:9,7:7,3
chr13	82981586	.	TAGATA	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.019438;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:14,4:12,5
chr13	83763729	.	G	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00099218;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:27,6:18,6
chr13	84580274	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00025429;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:15,5:22,7
chr13	85395893	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.091614;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,3:12,1
chr13	87074528	.	T	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0064982;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,6:15,4
chr13	89441315	.	T	TAGATAGATAGAC	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.044315;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,7:14,2:15,5
chr13	89463802	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.034805;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:12,4:15,4
chr13	91073961	.	C	CTG	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.020856;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:21,9:15,5
chr13	91093399	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020447;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:10,8:5,4
chr13	91432209	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:13,10:8,5:5,5
chr13	93649934	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=3.0999e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:41,19:17,9:24,10
chr13	95126885	.	A	ATATATT	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.013635;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,11:24,5:12,6
chr13	96348818	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00037553;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:14,5:25,6
chr13	96589619	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00069515;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:25,9:17,6
chr13	96754757	.	T	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.017808;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:18,2:17,3
chr13	96943450	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0219;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
chr13	97105084	.	TA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,3:1,2
chr13	98391600	.	T	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0012787;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:17,4:22,6
chr13	100232351	.	C	CGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.12943;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:21,3:11,1
chr13	100232357	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.029506;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:16,5:19,4
chr13	101332397	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:11,5:1,3
chr13	102974309	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.021263;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,6:17,1:24,5
chr13	103047630	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.003331;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:12,5:19,6
chr13	105065149	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.028679;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:14,4:13,5
chr13	105467729	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0027647;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,15:12,12:6,3
chr13	106216651	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.045253;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:19,7:4,1
chr13	106867015	.	CAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.077519;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,2:11,2
chr13	107565384	.	C	CAAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.01458;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:12,10:5,7:7,3
chr13	107668673	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0059563;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:20,3:15,4
chr13	108046191	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=2.9162e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:17,9:16,4
chr13	108543460	.	C	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0050209;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:22,5:13,2
chr13	108761545	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.7586e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,19:17,13:13,6
chr13	109336084	.	G	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00019321;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:20,6:17,6
chr13	110219664	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.034636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,5:11,1:9,4
chr13	110506255	.	CCA	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.056634;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:21,2:16,3
chr13	111281181	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:6,3:4,3
chr13	111859149	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,4:6,1:10,3
chr13	112383157	.	G	GA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:15,2:4,2
chr13	112863429	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:7,2:12,2
chr13	112961104	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.021818;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:34,12:11,6:23,6
chr13	113055459	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,4:3,2
chr14	18270100	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.040969;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:16,2:19,6
chr14	18379672	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.021229;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:22,8:0,1
chr14	18520206	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr14	18938656	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:0,0:19,4
chr14	18952842	.	C	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.047824;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:23,9:21,1
chr14	18999953	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,2:7,2
chr14	19013983	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:6,4:1,2
chr14	19014505	.	G	C	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.036063;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:51,7:37,5:14,2
chr14	19014583	.	A	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.04103;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:25,5:12,7
chr14	19212342	.	G	C	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.036428;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:77,19:33,13:44,6
chr14	19237864	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.20218;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,3:13,1
chr14	19276115	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
chr14	19289034	.	T	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.012161;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:54,19:17,5:37,14
chr14	19291750	.	C	T	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.0064441;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:72,22:41,16:31,6
chr14	19293378	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:7,3:1,3
chr14	19318253	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.030482;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:19,4:23,11
chr14	19335869	.	T	TG	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023594;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:2,4:23,7
chr14	19351441	.	C	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.0042191;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:67,17:29,10:38,7
chr14	19377333	.	T	TA	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.01768;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:118,14:69,2:49,12
chr14	19377338	.	C	T	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.012506;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:111,15:63,2:48,13
chr14	19449258	.	G	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.064826;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:0,0:23,4
chr14	19488364	.	G	A	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.03486;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:141,25:74,16:67,9
chr14	19506468	.	C	CTTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:11,3:9,1
chr14	19507331	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0067016;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:6,6:31,2
chr14	19642736	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.04729;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:12,3:24,8
chr14	19645109	.	TA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.24396;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:13,3:20,1
chr14	19685723	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:25,4:0,0
chr14	19686710	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:16,2:2,2
chr14	19891409	.	T	TTTC	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.049892;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,5:27,3:9,2
chr14	19900360	.	C	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=1.3363e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:85,22:39,9:46,13
chr14	20179034	.	CGT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,3:14,1
chr14	23002451	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.016015;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,13:18,10:2,3
chr14	23234622	.	T	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.00010394;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:42,13:22,7:20,6
chr14	25124162	.	C	CAA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0096904;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,9:18,8:4,1
chr14	25745394	.	A	AG	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0029353;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:17,3:22,6
chr14	26345632	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00018429;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:15,6:20,4
chr14	26732225	.	T	TTTC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010741;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,7:4,2:13,5
chr14	27841292	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:6,2:4,1:2,1
chr14	27873697	.	G	GT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.04422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,7:9,6:5,1
chr14	30724072	.	T	TA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.039561;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:13,3:8,7
chr14	33517594	.	T	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0007833;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:23,4:21,8
chr14	34159596	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0036508;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,6:1,2:0,4
chr14	34709787	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.028662;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,10:15,8:4,2
chr14	34735162	.	C	CACAG	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.047026;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:19,1:16,3
chr14	36468370	.	A	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0010064;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:21,6:19,5
chr14	37186587	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,8:6,7:3,1
chr14	37348983	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013587;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,8:12,6:2,2
chr14	37351986	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0069797;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,16:2,4:10,12
chr14	38100237	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:13,1:8,3
chr14	38603160	.	A	AAGAGAG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16749;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,3:11,2:3,1
chr14	40192069	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00067686;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:21,4:20,10
chr14	45045543	.	GTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027862;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,2:10,3
chr14	45045559	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.027541;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,2:9,3
chr14	45306696	.	C	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=4.8407e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:48,20:28,14:20,6
chr14	46149252	.	G	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.023395;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:54,8:24,3:30,5
chr14	50016709	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,7:2,1
chr14	52197581	.	A	C	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.00026888;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:51,13:27,9:24,4
chr14	52402875	.	T	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00054005;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:25,6:15,5
chr14	52697647	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,1:10,3
chr14	54131908	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0018745;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:16,6:14,2
chr14	54267301	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0012111;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:20,9:27,3
chr14	55445592	.	GAAAAA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034759;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:11,3:1,1
chr14	56596794	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,4:17,3:18,1
chr14	56669459	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,1:11,3
chr14	56875540	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.013266;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:10,4:6,1
chr14	56922104	.	CACATAT	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.046164;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:15,3:11,5
chr14	57880034	.	GAGGAAGGAAGGAAGGA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.032;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,7:11,6:6,1
chr14	60741658	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0089005;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,8:11,5:12,3
chr14	60898142	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.044529;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,8:6,1:15,7
chr14	61002392	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=4.8132e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:38,19:14,9:24,10
chr14	63003516	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11664;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:7,1:18,4
chr14	63126362	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.4158e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:16,8:10,5
chr14	63959287	.	CTTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.24868;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,4:12,1
chr14	64253610	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.005945;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:5,4:15,1
chr14	64380668	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,6:3,3
chr14	64869619	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.024141;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:19,3:9,5
chr14	66921444	.	G	GT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00091899;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,11:16,8:12,3
chr14	67466994	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,7:5,6:0,1
chr14	67643852	.	TAA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,7:8,4:6,3
chr14	69397452	.	G	GAAA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.022951;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:18,7:7,5
chr14	69842784	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.093588;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,4:18,3:8,1
chr14	70654587	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,7:4,2
chr14	73440263	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.041596;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,1:16,3
chr14	73689026	.	GTT	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.026706;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,9:13,5:4,4
chr14	73772839	.	TG	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034091;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,11:10,6:13,5
chr14	74092315	.	GT	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:18,4:11,2:7,2
chr14	74320563	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,3:7,2
chr14	74340528	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.00016256;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:19,6:18,4
chr14	76503172	.	TC	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:20,2:8,2
chr14	77513016	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,4:3,2:12,2
chr14	77905633	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0001383;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:16,11:15,2
chr14	79790615	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.14936;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:18,4:5,1
chr14	80184516	.	TA	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0012479;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:19,5:10,8
chr14	81303059	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.033219;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,11:20,8:13,3
chr14	81966199	.	CA	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0084152;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,9:19,7:9,2
chr14	82862874	.	ATTTTTTT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.046549;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,6:12,4:3,2
chr14	83590209	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.030468;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:16,8:14,2
chr14	85917277	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.040784;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:13,3:16,6
chr14	86279901	.	C	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.2862e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:17,8:14,5
chr14	86287051	.	AGGAAG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:6,5:8,2
chr14	89613116	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.011012;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,7:6,5:2,2
chr14	91108526	.	T	TGTGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:1,2:3,3
chr14	92448345	.	T	TACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.089356;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,7:12,6:6,1
chr14	92911791	.	G	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.02785;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:57,8:37,2:20,6
chr14	94088499	.	C	CTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.024419;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,7:8,3
chr14	94815455	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=1.056e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:43,20:29,8:14,12
chr14	96340130	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,4:5,3:10,1
chr14	96340131	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,4:4,3:9,1
chr14	96621139	.	TC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0057212;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:20,2:12,6
chr14	97376058	.	G	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0021438;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:18,6:20,3
chr14	98401101	.	G	GAGAAAGAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:3,3:2,1
chr14	99903784	.	C	CTT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.01976;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:15,10:9,3
chr14	99959377	.	CCT	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.01339;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,8:16,2:16,6
chr14	99959385	.	C	CT	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.023261;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,6:23,2:16,4
chr14	101089548	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.040631;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:32,6:21,1:11,5
chr14	101607561	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.21337;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:2,0:21,4
chr14	103908165	.	C	CAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.021719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,13:13,9:4,4
chr14	104225631	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.047547;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,7:13,3:19,4
chr14	105594814	.	T	C	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.029663;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:59,17:43,13:16,4
chr14	105665211	.	GTT	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:6,6:0,1
chr14	105759956	.	CT	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.0052291;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:18,3:21,7
chr15	17063205	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0068563;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:16,3:17,6
chr15	19872473	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:5,5:4,1
chr15	20001506	.	TAGAG	T	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.036939;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:71,12:52,7:19,5
chr15	20053156	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:22,5:4,1
chr15	20104346	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
chr15	20332701	.	TAC	T	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.009197;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:58,17:26,15:32,2
chr15	20332717	.	C	G	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.032853;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:80,16:35,14:45,2
chr15	20427539	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.059617;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:13,4:21,1
chr15	20457729	.	A	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.048603;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:53,6:25,2:28,4
chr15	20537493	.	C	A	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.0067746;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:58,13:37,7:21,6
chr15	20573432	.	G	GT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.26796;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:0,0:36,4
chr15	20640595	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.023456;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:20,2:26,8
chr15	20651177	.	G	T	0	PASS	DP=317;GPV=1;SPV=0.0032421;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:134,36:63,17:71,19
chr15	20737194	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:3,6:6,2
chr15	20957725	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.067259;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:10,3:15,2
chr15	21053699	.	G	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.0058709;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:57,13:43,8:14,5
chr15	21135521	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
chr15	21253620	.	A	G	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.033925;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:112,15:71,2:41,13
chr15	21346492	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.0065235;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:69,17:18,3:51,14
chr15	21549180	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
chr15	21554146	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,1:11,4
chr15	21554908	.	TGAAG	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:16,3:7,1
chr15	22440026	.	C	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0068284;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:49,7:21,3:28,4
chr15	23041097	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.20486;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:12,2:9,1
chr15	23195795	.	A	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.028972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:66,16:46,6:20,10
chr15	23363256	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.024221;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:17,5:11,1
chr15	24262448	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.015035;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,5:4,2
chr15	24353047	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.014016;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:15,1:24,5
chr15	24395903	.	C	CATATATATACAT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:7,3:3,1
chr15	25170183	.	T	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00011182;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:13,6:30,8
chr15	25786617	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:8,3:5,3
chr15	25845332	.	G	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.042088;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:20,3:19,5
chr15	25854517	.	G	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00020622;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:23,9:18,4
chr15	26142377	.	T	TTC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.049645;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,4:3,2:16,2
chr15	27257538	.	T	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00038112;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,12:14,8:10,4
chr15	28151020	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00012153;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:40,17:19,7:21,10
chr15	28378480	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
chr15	28453922	.	G	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.0010594;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:43,19:23,7:20,12
chr15	29534106	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0055231;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,3:2,3
chr15	30344256	.	T	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.027562;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:47,11:26,4:21,7
chr15	31921025	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=7.9372e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:20,5:21,8
chr15	32234382	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:22,4:0,0
chr15	32306060	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033079;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:16,6:14,2
chr15	32329566	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0086319;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:17,3:8,11
chr15	32813042	.	T	C	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0097526;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:29,3:30,6
chr15	33419056	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.033251;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:20,2:16,3
chr15	34062554	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0063215;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,7:10,1:5,6
chr15	34310771	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:4,2:3,1:1,1
chr15	35074963	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00081325;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:22,6:17,4
chr15	35733612	.	T	C	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=7.5848e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:24,8:17,4
chr15	35971475	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.036822;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:8,4:24,2
chr15	36991779	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,3:6,4
chr15	38681355	.	C	CTCT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0065499;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,12:8,3:15,9
chr15	38846873	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,3:4,1
chr15	38903984	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,11:7,9:5,2
chr15	38965037	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:4,3:3,1:1,2
chr15	38989442	.	CCTATGCTATGCTATGCTATGCTATGCTATGCTATGCTATG	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.027296;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,6:9,1
chr15	43697631	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00089389;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:28,7:16,5
chr15	43964997	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0017697;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:21,5:24,4
chr15	44824992	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0001703;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:24,5:14,7
chr15	44875797	.	C	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=1.4002e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:44,27:22,16:22,11
chr15	45798088	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0033421;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:9,10:6,4
chr15	46169548	.	A	ATT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036581;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,11:17,9:5,2
chr15	46954340	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0049996;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:27,4:18,5
chr15	47384814	.	GTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,3:4,1
chr15	47657719	.	CTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,3:6,1
chr15	50393532	.	A	ATATATATGTG	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:3,2:1,1:2,1
chr15	50585050	.	A	ATT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.025116;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,11:9,9:8,2
chr15	50629859	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0048312;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:5,5:5,4
chr15	50644797	.	C	CA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.069354;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,5:16,4:8,1
chr15	51194251	.	CTT	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.049052;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:8,3:20,5
chr15	51353714	.	TA	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.15343;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:24,3:12,1
chr15	53495192	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,1:3,3
chr15	54249209	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0059483;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:20,6:18,5
chr15	54687307	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:33:0,5:0,3:0,2
chr15	55210213	.	A	ATG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0019705;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,12:12,9:8,3
chr15	60065017	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:5,7:4,1
chr15	63466031	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,3:10,5
chr15	64277781	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.038165;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:19,3:21,7
chr15	64715925	.	TAC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.089726;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:25,4:10,3
chr15	66551345	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0036895;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,10:7,9:4,1
chr15	66616079	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.00015443;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:19,8:33,8
chr15	67353366	.	T	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.007321;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,8:27,5:11,3
chr15	68269598	.	CAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01391;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:5,6:6,1
chr15	69534230	.	A	ATTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01494;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,8:5,4:7,4
chr15	72163112	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00072854;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:21,6:18,4
chr15	72725059	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043517;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:18,2:15,4
chr15	73238271	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,7:5,4:4,3
chr15	73661242	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012052;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,9:8,2
chr15	73898880	.	A	AAAAAAAAAAT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,5:3,4:0,1
chr15	74939066	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,7:3,6:3,1
chr15	75432685	.	C	CA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.017254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,12:13,10:9,2
chr15	75503490	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.050822;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:16,3:24,2
chr15	75503628	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10359;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,2:16,2
chr15	75830581	.	C	CA	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=6.1657e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:49,19:23,9:26,10
chr15	77408156	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.021295;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:24,10:10,6:14,4
chr15	77992856	.	C	CCCACT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:0,0:5,2
chr15	80089259	.	G	GTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02247;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,8:8,7:9,1
chr15	81258773	.	C	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00081654;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:16,4:21,8
chr15	82337538	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0096214;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:17,2:17,9
chr15	82341038	.	G	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.024526;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:11,7:32,6
chr15	82524026	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033483;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,2:2,2
chr15	83340285	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.065677;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:18,3:26,2
chr15	83384284	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.1625;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:10,1:19,4
chr15	83450759	.	C	CTT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.2381;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,3:0,1:3,2
chr15	84520959	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,1:14,3
chr15	84700593	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:18,4:0,0
chr15	84777696	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0011108;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:13,8:7,3
chr15	84796237	.	AAAATATATATATATATATATATATATATTTTATATATATAT	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:2,5:0,1
chr15	84885731	.	C	CAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0082261;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,6:10,5:7,1
chr15	85245352	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020407;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:1,2:11,4
chr15	85270641	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
chr15	86104945	.	C	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=6.3166e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:18,11:15,3
chr15	87417776	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.03701;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:38,13:19,8:19,5
chr15	88540969	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.12341;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:20,1:11,3
chr15	88552759	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,2:10,2
chr15	88966789	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.038586;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:22,2:17,6
chr15	90129213	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.014644;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:13,4:13,8
chr15	90173939	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.017079;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:13,7:15,5
chr15	90328484	.	C	CTTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0085654;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:16,8:6,3
chr15	90331980	.	AGG	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033614;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,2:15,3
chr15	90331984	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.024272;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:17,2:18,4
chr15	90331991	.	AAG	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.064197;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,4:21,1:12,3
chr15	90392748	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,3:4,2
chr15	91196879	.	G	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=5.473e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:42,13:29,6:13,7
chr15	93131667	.	T	TA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11618;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,1:20,3
chr15	94162147	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.064462;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,3:17,1
chr15	94868218	.	C	CT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.026312;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,9:12,2
chr15	95581318	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0012733;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:18,7:17,4
chr15	95948056	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0002546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:18,8:13,4
chr15	96357729	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.071891;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:6,2:30,3
chr15	96470894	.	C	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.006601;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:54,9:29,5:25,4
chr15	96707509	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0027396;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:48,9:23,4:25,5
chr15	100377498	.	AT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.033697;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:18,5:15,2
chr15	101920402	.	G	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.0086553;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:44,17:24,6:20,11
chr15	101928520	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.034006;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:21,4:25,7
chr16	579814	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.041011;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,1:4,3
chr16	1011197	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:2,1:4,1
chr16	1466923	.	CAA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.011302;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,9:13,8:7,1
chr16	1593399	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0016018;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:16,8:27,4
chr16	2343751	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.1436;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:16,2:19,3
chr16	2441937	.	T	TTATA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:4,5:1,1
chr16	3657602	.	T	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=6.3106e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:33,9:19,7
chr16	4621368	.	A	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.049419;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:28,4:13,2
chr16	5183258	.	C	T	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=8.6019e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,15:28,8:30,7
chr16	5827911	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.018191;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:4,1:21,5
chr16	5895759	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=9.8817e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:12,10:20,3
chr16	6170796	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00014469;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:14,6:11,6
chr16	6442611	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00025381;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:24,10:19,2
chr16	6487690	.	AAAAAAAAAAAATATATAT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,2:4,1:0,1
chr16	6694859	.	A	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=3.4067e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:41,15:14,5:27,10
chr16	6955677	.	TTAGGTATGTATG	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.11312;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,5:12,1:18,4
chr16	7165410	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,2:11,2
chr16	7810991	.	T	TATGTGTGTGG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047515;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:13,6:7,4
chr16	8382337	.	G	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0073566;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:19,4:17,2
chr16	8660816	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:8,5:0,2
chr16	8999575	.	CTTAT	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0060651;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:17,9:18,8
chr16	9292581	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.049919;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:14,3:29,3
chr16	9437492	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00071257;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:18,5:18,5
chr16	9597697	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,6:4,1
chr16	9970635	.	T	TA	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0051091;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:48,12:24,7:24,5
chr16	10268417	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,3:10,1
chr16	10568780	.	C	CTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017079;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:6,5:2,1
chr16	12243985	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00014785;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:46,15:30,8:16,7
chr16	13216133	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00026114;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:19,8:16,5
chr16	13746557	.	CT	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00025924;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:45,14:24,9:21,5
chr16	14785942	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.04208;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:18,2:22,3
chr16	15308471	.	G	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.036166;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:13,5:12,1
chr16	16470372	.	T	TCTTCCTTCCTTC	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.013337;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:46,14:11,2:35,12
chr16	16701811	.	C	CT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.034293;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:19,1:16,5
chr16	16717740	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.057792;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
chr16	16959714	.	TTTTTTTTAATTTAAAAAAAC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.018681;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:7,5:15,4
chr16	17603381	.	AT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014137;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,3:5,3
chr16	18151399	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.041183;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,8:11,6:9,2
chr16	18238291	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.030078;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:25,8:12,4
chr16	18246717	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:1,1:7,4
chr16	21026700	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011322;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,9:9,8:8,1
chr16	21155621	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0029033;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,10:5,8:5,2
chr16	21177619	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.008557;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:12,11:2,1
chr16	21613168	.	CTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00028986;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,14:2,11:3,3
chr16	22173903	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:7,1:16,3
chr16	22627936	.	CAA	C	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.043079;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:45,12:29,6:16,6
chr16	23207170	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=3.4959e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:38,17:23,13:15,4
chr16	23374573	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.043779;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,5:4,2
chr16	23902732	.	C	CCCTCCCTCCCTCCCTCCCTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:0,0:10,4
chr16	24432837	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.029998;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:20,3:9,5
chr16	24579241	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.015771;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:13,9:5,2
chr16	24588697	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,4:13,1:3,3
chr16	24627697	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02835;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,6:9,3
chr16	25059861	.	C	CT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.01597;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:9,5:8,6
chr16	26177870	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.038233;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:6,5:6,2
chr16	26766064	.	AGAT	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.023442;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:23,3:11,3
chr16	26770730	.	T	TTAGA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.01641;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:19,3:3,3
chr16	26958789	.	ATATATTTT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:13,11:8,4:5,7
chr16	27265161	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:2,2:2,3
chr16	28464022	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.10662;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:29,2:7,3
chr16	28662310	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048554;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:7,2:14,4
chr16	28810791	.	T	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.025834;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:57,15:16,10:41,5
chr16	29504437	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.041011;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,3:9,1
chr16	29504509	.	AAT	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.025941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,7:15,1:17,6
chr16	30499712	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,5:7,1
chr16	30499730	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,2:8,2
chr16	31104840	.	G	A	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.019899;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:79,15:38,11:41,4
chr16	31220456	.	G	GT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:3,3:6,1
chr16	31989663	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.028667;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:13,1:17,5
chr16	32083617	.	C	A	0	PASS	DP=233;GPV=1;SPV=0.040993;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:110,19:43,3:67,16
chr16	32143910	.	A	G	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.0078097;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:92,19:48,17:44,2
chr16	32288934	.	A	C	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.013189;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:68,8:36,6:32,2
chr16	32300620	.	T	TTAAAA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.048123;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,6:20,5:10,1
chr16	32383739	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.04495;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:54,8:29,3:25,5
chr16	32441647	.	C	A	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.020195;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:88,19:45,4:43,15
chr16	32441648	.	CTT	C	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.045156;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:87,16:42,3:45,13
chr16	32545620	.	T	TAA	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.023547;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:64,22:31,18:33,4
chr16	32802161	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
chr16	32812264	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.018772;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:31,5:23,1
chr16	32862141	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.069027;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:16,3:15,2
chr16	32982841	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:14,4:1,1
chr16	33018909	.	G	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.039534;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:20,10:23,4
chr16	33057658	.	T	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.039144;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:15,1:36,5
chr16	33777396	.	TTG	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.03143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:14,9:28,3
chr16	34258608	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0016161;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:24,7:15,3
chr16	35857796	.	A	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=4.8866e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:11,5:25,8
chr16	35905106	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00014322;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,3:12,8
chr16	37737580	.	G	A	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.020107;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:60,14:11,4:49,10
chr16	46386931	.	T	C	0	PASS	DP=13529;GPV=1;SPV=0.014552;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7486:6666,807:4068,379:2598,428
chr16	46391132	.	T	C	0	PASS	DP=15299;GPV=1;SPV=0.0021004;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7644:6746,838:2104,221:4642,617
chr16	46446274	.	T	G	0	PASS	DP=469;GPV=1;SPV=0.037765;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:261:225,36:106,15:119,21
chr16	47074889	.	C	CA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.003791;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,9:14,8:8,1
chr16	48482430	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.044124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:14,5:6,3
chr16	51719029	.	CAA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.004738;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,10:7,9:9,1
chr16	52992519	.	AAG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.038102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,5:17,3:5,2
chr16	53742793	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00022082;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:21,4:15,8
chr16	55078551	.	G	GA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:42:1,3:0,0:1,3
chr16	56277776	.	TACACACACACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0019985;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:4,7:2,1
chr16	56596519	.	AG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.11061;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:11,2:24,3
chr16	56825205	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
chr16	56930231	.	G	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.038859;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:23,5:18,2
chr16	57006413	.	C	CTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:6,4:5,2
chr16	57327670	.	CAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,5:3,1
chr16	57414410	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.023692;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,11:9,8:2,3
chr16	58675346	.	G	GA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.020195;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,10:13,9:5,1
chr16	60011342	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.020403;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,19:15,15:6,4
chr16	60527880	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.042807;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:13,4:14,2
chr16	61167057	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00020665;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:17,11:19,3
chr16	61466756	.	G	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=7.3327e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:10,6:13,7
chr16	61634118	.	GT	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.044109;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:28,5:16,4
chr16	61812854	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0013605;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:20,5:16,7
chr16	62057788	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0014811;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:22,5:23,7
chr16	62126380	.	G	GTA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.074336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,5:14,1:8,4
chr16	62946969	.	T	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00013409;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:21,7:23,8
chr16	63084008	.	G	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0037159;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:19,6:17,4
chr16	63084012	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.049892;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:18,4:18,1
chr16	63509414	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0042232;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:22,3:18,7
chr16	64257783	.	A	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00057799;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:27,6:14,7
chr16	64560021	.	TTC	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.060214;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,2:12,2
chr16	65012026	.	A	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=1.8341e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:20,9:24,7
chr16	65463338	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=5.3308e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:35,16:15,7:20,9
chr16	65893148	.	AT	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.042684;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:12,4:17,4
chr16	66861190	.	AAAG	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0051799;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:18,11:11,3
chr16	68010049	.	TTTCC	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.017879;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:6,6:20,7
chr16	68753212	.	C	CAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.043206;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,7:11,5:6,2
chr16	68928298	.	A	ATTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.047286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:6,3:10,3
chr16	68980437	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,11:5,6:4,5
chr16	70039712	.	C	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.0007532;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:57,12:30,6:27,6
chr16	70052158	.	C	CGG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020186;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:16,9:4,1
chr16	70825625	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020691;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:12,1:11,5
chr16	70941764	.	T	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.032479;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:19,4:24,5
chr16	71134600	.	G	C	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.016085;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:33,1:24,6
chr16	71148368	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.004694;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:29,7:20,1
chr16	71163030	.	T	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.030587;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:30,1:28,6
chr16	72545153	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=4.6265e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:32,20:19,12:13,8
chr16	74082162	.	GTT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.028182;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:19,3:7,6
chr16	74494403	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:3,5:2,2
chr16	75873770	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=8.0875e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:31,22:11,8:20,14
chr16	76098933	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,5:8,4:8,1
chr16	76937902	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.060034;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,2:11,2
chr16	77469657	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0019982;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:23,3:16,5
chr16	78002391	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,5:11,1:12,4
chr16	79289867	.	T	TTTTTTTTTTTTTC	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.041497;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,8:9,3:6,5
chr16	80010206	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:7,4:5,3:2,1
chr16	80142912	.	C	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.0055347;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:29,5:14,1
chr16	83659785	.	CT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0041408;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,12:5,7:3,5
chr16	84697711	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:2,6:5,1
chr16	85855426	.	CATAT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.046683;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,5:12,4:4,1
chr16	86791022	.	C	A	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.00039387;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:56,13:28,8:28,5
chr16	87174641	.	TTTGTTTTTTTTTTG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:4,2:4,2
chr16	87193365	.	TAC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.025641;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,8:1,7:2,1
chr16	87928756	.	CTTTGTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.006865;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:3,3:3,3
chr16	88371972	.	C	CCAT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.17398;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,4:13,2:21,2
chr16	88545320	.	G	GT	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.00024453;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:49,13:25,7:24,6
chr16	88862588	.	C	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.039374;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:13,6:14,2
chr16	88988070	.	C	CTT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.032244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:2,4:27,5
chr16	89215991	.	G	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=8.7205e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:43,19:22,11:21,8
chr16	89411921	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.024173;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:6,4:20,1
chr16	89536520	.	C	CAGGTGAGGCAGGTG	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.053676;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,6:16,4:14,2
chr16	89634091	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,4:0,3:3,1
chr16	89688077	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018492;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,4:1,1
chr16	89812652	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.037909;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,5:16,2
chr17	244209	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.046149;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,7:18,4:6,3
chr17	314822	.	T	C	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.038495;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:91,18:50,8:41,10
chr17	402995	.	C	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:4,1:11,4
chr17	415383	.	TTG	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.16171;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:8,3:19,1
chr17	672169	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,1:5,3
chr17	942611	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
chr17	1256435	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:13,4:5,3
chr17	2356376	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
chr17	2730521	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.011346;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:10,9:6,1
chr17	2772859	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.021388;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:11,3:13,4
chr17	3320546	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.046548;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,4:11,1
chr17	3635245	.	G	GGAAGGAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:16,3:0,1
chr17	3641384	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.2381;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,3:2,2:1,1
chr17	6941618	.	T	TCTCACTCTCA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:5,1:12,3
chr17	7073723	.	CA	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.020195;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,10:13,8:5,2
chr17	7274080	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031608;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:10,5:5,2
chr17	7277976	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.011316;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,9:8,8:4,1
chr17	7378264	.	AGAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:3,4:10,1
chr17	8363861	.	ATT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,4:3,1:14,3
chr17	10881914	.	GACAA	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.038125;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:18,3:17,2
chr17	11509020	.	C	CCAGCTGATTATAAAAT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.03973;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,5:10,2
chr17	11707959	.	CCACACACACACACACA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,4:16,3:7,1
chr17	12452680	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0019875;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:10,1:12,7
chr17	12630428	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0094429;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:16,2:18,4
chr17	13082355	.	ATG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,3:13,1
chr17	13687794	.	T	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0014365;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:19,4:20,6
chr17	14186097	.	G	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.039231;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:51,11:27,9:24,2
chr17	14346247	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,4:1,3:2,1
chr17	16161240	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.082705;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,5:17,4:11,1
chr17	18395786	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020274;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:1,2:16,7
chr17	18926236	.	A	ATTAT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.009672;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:9,1:11,6
chr17	19700763	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0071869;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:10,7:4,2
chr17	20099511	.	C	CA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.015677;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,8:12,7:3,1
chr17	20309815	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:5,2:7,6
chr17	20554552	.	C	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.016944;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:48,14:26,12:22,2
chr17	21347012	.	T	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.019345;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:24,6:15,1
chr17	21429100	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.041253;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:20,3:23,2
chr17	21618605	.	C	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.0017091;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:65,12:31,7:34,5
chr17	21638255	.	C	CT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.052808;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:15,1:22,4
chr17	21745153	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0079024;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:9,8:8,6
chr17	21906166	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.13808;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:35,4:19,2:16,2
chr17	23165463	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
chr17	26522412	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,2:3,2
chr17	26578810	.	C	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.04645;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:16,4:17,4
chr17	26601793	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:1,1:17,3
chr17	26630320	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.10922;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:14,1:6,2
chr17	26742711	.	A	G	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.0036329;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:80,26:33,18:47,8
chr17	26743898	.	G	T	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.0407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:128,27:69,17:59,10
chr17	26955510	.	ATAT	A	0	PASS	DP=159;GPV=1;SPV=0.0079553;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:72,18:37,15:35,3
chr17	28488776	.	C	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00010626;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:47,15:34,7:13,8
chr17	28894616	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:6,4:8,3
chr17	29691498	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.013018;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:40,8:21,4:19,4
chr17	30466795	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=2.3687e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:13,8:19,7
chr17	30846409	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0054479;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,5:9,6
chr17	32072443	.	A	AC	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.020415;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:15,7:14,2
chr17	32653607	.	CAA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00076786;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,18:11,13:3,5
chr17	33436853	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,4:1,2:4,2
chr17	35561745	.	AAAAAAAAG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,6:4,4
chr17	37260301	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:3,2:1,1
chr17	38202136	.	G	GATATATATATATAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11425;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,5:16,3:5,2
chr17	38944848	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,8:8,7:4,1
chr17	39170524	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023193;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:8,5:4,3
chr17	39355855	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,6:13,5:4,1
chr17	39498513	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.2992e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:15,9:18,8
chr17	40679936	.	T	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=2.607e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:14,7:12,9
chr17	41094456	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0002133;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:38,13:27,3:11,10
chr17	41151528	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00017414;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:22,8:21,6
chr17	41330198	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.13725;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,2:3,1:2,1
chr17	41633660	.	GGT	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.039014;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,9:19,6:16,3
chr17	42048377	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:5,2:3,1:2,1
chr17	42356541	.	T	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0010854;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:21,4:22,7
chr17	44181155	.	G	GGGT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.050247;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:21,2:8,2
chr17	44640699	.	TA	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.30655;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:27,3:15,2:12,1
chr17	44954088	.	C	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.00046201;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:55,12:32,8:23,4
chr17	44985119	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.023036;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:15,2:11,8
chr17	45603026	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.033857;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:33,6:6,6
chr17	45791854	.	A	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.020048;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:16,5:15,3
chr17	46125081	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,2:6,2:0,0
chr17	46213288	.	T	TTTG	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.026147;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:65,19:40,12:25,7
chr17	46228676	.	T	TTTG	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.0079248;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:40,16:27,11:13,5
chr17	46232324	.	G	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.015123;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:52,12:27,10:25,2
chr17	46256885	.	T	TG	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.029088;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:63,16:30,13:33,3
chr17	46688553	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031197;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:5,4:13,4
chr17	47000064	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.078605;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:17,3:8,3
chr17	47724490	.	A	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0002844;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:18,5:21,8
chr17	48224071	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:6,1:1,1
chr17	48541816	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.013977;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:2,1:22,7
chr17	49395490	.	T	TTTC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.03973;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:6,2:13,5
chr17	49504773	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0029007;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,1:3,5
chr17	51854780	.	C	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.00094598;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:28,5:25,6
chr17	52712033	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0234;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:21,11:18,4
chr17	52783194	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.031171;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:20,2:20,4
chr17	53021068	.	G	GT	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00098386;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:49,14:33,7:16,7
chr17	53627705	.	ACAACT	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.064931;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:27,3:14,2
chr17	53855532	.	C	CA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0040897;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:16,5:13,3
chr17	53909895	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00047197;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:18,5:11,6
chr17	54139013	.	ATT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022502;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,4:9,3
chr17	55506816	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:3,2:3,1
chr17	59219059	.	ATTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.27897;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:5,1:10,2
chr17	59673100	.	T	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:50:1,3:0,2:1,1
chr17	63742930	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.051469;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,5:9,2
chr17	64082704	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=1.4092e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:20,6:10,7
chr17	65147587	.	C	CTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.057853;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,7:12,5:10,2
chr17	65460125	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=8.9175e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:22,9:12,5
chr17	65838091	.	T	TA	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0054114;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:15,3:31,6
chr17	65870065	.	G	GA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.038888;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,8:20,6:2,2
chr17	66482098	.	CA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0030632;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,11:4,9:3,2
chr17	66746154	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.082922;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,3:6,3
chr17	67089668	.	T	TATATATAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,4:6,2:7,2
chr17	67309496	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.6e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:31,17:14,6:17,11
chr17	67767795	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.057887;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,2:13,3
chr17	67894880	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.7841e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:19,8:14,9
chr17	69197027	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.098288;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:23,4:13,1
chr17	71295236	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:8,6:3,1
chr17	72147114	.	A	AAGG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.068336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,5:16,4:5,1
chr17	72504634	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,6:8,2
chr17	72754041	.	TATATACACATAC	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0054956;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:10,3:5,7
chr17	73026187	.	G	GAGAGAAGAGAAGAGA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,9:4,8:9,1
chr17	73224840	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.059053;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:48,6:30,3:18,3
chr17	73855711	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=5.5727e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:41,19:19,8:22,11
chr17	74423357	.	TTG	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0065856;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,7:5,3:14,4
chr17	74423362	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0051054;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:21,7:7,3:14,4
chr17	74791357	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.038854;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:21,1:15,8
chr17	75269548	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.075059;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:14,4:3,2
chr17	75560802	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:10,2:2,4
chr17	76031286	.	A	ATTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,2:3,1:1,1
chr17	76297870	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0024201;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:11,8:2,2
chr17	77638792	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:20,2:0,2
chr17	77665949	.	T	TCATG	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.045096;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:32,2:12,4
chr17	77905259	.	T	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00010709;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:47,14:28,4:19,10
chr17	78635453	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.019428;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,11:16,8:3,3
chr17	79283954	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0040253;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:36,19:21,7:15,12
chr17	79656702	.	AAGGAAG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,2:3,1:3,1
chr17	80148544	.	CT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,6:10,5:8,1
chr17	80915773	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.019011;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,5:8,3
chr17	81048476	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0010149;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:22,5:21,5
chr17	81339604	.	A	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:4,6:3,2:1,4
chr17	82746093	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.011327;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,9:12,8:4,1
chr17	82856751	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.094974;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:9,1:10,2
chr17	83032028	.	AC	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.039321;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:54,8:24,5:30,3
chr18	147641	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.021189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:7,8:7,2
chr18	696206	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.040316;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,4:2,2:3,2
chr18	731966	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,8:8,7:4,1
chr18	2986548	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.039801;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:12,6:20,1
chr18	3926773	.	GAGCACCTAT	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00040227;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:23,10:19,5
chr18	3927940	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00037832;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:14,6:29,4
chr18	4306464	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.17449;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:21,5:8,4:13,1
chr18	4510780	.	T	TGTG	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,4:13,2:15,2
chr18	4510905	.	G	GA	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0034365;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:85,11:41,2:44,9
chr18	4524842	.	G	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=6.0755e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:51,18:28,12:23,6
chr18	6432242	.	T	TGCGCGC	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.027616;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,8:21,5:16,3
chr18	8472568	.	G	GAAGAAAGAAAGA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.033806;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:10,6:9,3
chr18	9641349	.	T	TAGAA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.034112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,6:11,4:16,2
chr18	11644947	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04287;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:6,6:9,3
chr18	12022528	.	A	AAATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:4,1:0,3
chr18	12874140	.	C	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.00020345;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:48,12:28,9:20,3
chr18	14451784	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048762;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:19,5:16,2
chr18	15152436	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:22,4:8,2:14,2
chr18	15406802	.	A	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.031533;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:92,11:57,6:35,5
chr18	15471993	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.021795;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:5,1:37,9
chr18	15484444	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
chr18	15494057	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.064403;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:8,1:21,3
chr18	15517248	.	G	T	0	PASS	DP=358;GPV=1;SPV=0.022723;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:194:169,25:102,13:67,12
chr18	15520846	.	T	C	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.0080062;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:93,26:25,7:68,19
chr18	15528080	.	T	C	0	PASS	DP=271;GPV=1;SPV=0.028874;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:115,21:34,14:81,7
chr18	15534382	.	G	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0042842;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:5,6:28,9
chr18	15540233	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.023885;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:26,12:3,1
chr18	15555357	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:2,1:14,5
chr18	15573280	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr18	15580200	.	G	C	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.02679;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:93,17:26,3:67,14
chr18	15582785	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:16,3:4,1
chr18	15588637	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.049445;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:2,1:29,4
chr18	15684083	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
chr18	15713707	.	G	C	0	PASS	DP=386;GPV=1;SPV=0.012311;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:191,35:94,24:97,11
chr18	15727235	.	G	C	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.022784;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:57,19:49,17:8,2
chr18	15727935	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,0:16,4
chr18	16442072	.	T	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0061782;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:50,16:2,2:48,14
chr18	16913119	.	A	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
chr18	16959666	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.048633;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:20,1:2,8
chr18	17065706	.	G	T	0	PASS	DP=473;GPV=1;SPV=0.022877;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:207,35:30,9:177,26
chr18	17300370	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0007759;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:22,12:4,1
chr18	17638914	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
chr18	17676479	.	C	A	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.046569;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:68,14:51,11:17,3
chr18	17732441	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:0,0:22,4
chr18	18040886	.	G	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.01615;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,8:33,6:20,2
chr18	18231134	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.019616;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:43,11:5,2
chr18	19053810	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.013809;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:13,2:21,4
chr18	19869150	.	T	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.049403;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:49,9:11,3:38,6
chr18	20445267	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,3:3,2
chr18	20582385	.	T	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.027025;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:26,7:14,4
chr18	20786158	.	C	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
chr18	20923340	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
chr18	21640623	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:3,5:7,1
chr18	21899266	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.045915;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:10,7:11,3
chr18	22079428	.	G	GT	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0006601;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:24,6:22,6
chr18	25960005	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.044045;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:17,2:25,3
chr18	27501014	.	C	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.017025;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:23,5:25,2
chr18	27702207	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=1.3702e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:11,7:17,11
chr18	28772839	.	T	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:14,4:6,2:8,2
chr18	28873679	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0013442;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:16,6:27,7
chr18	29311057	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.062626;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,7:16,6:11,1
chr18	30454417	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.011449;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:28,4:24,3
chr18	31308385	.	AT	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00020572;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:16,5:21,10
chr18	33610413	.	C	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.018132;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:19,3:13,2
chr18	35214060	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.37564;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:8,2:4,2
chr18	35445026	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.022451;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,6:6,3:11,3
chr18	36133897	.	GTTTTTT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.090553;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,7:11,2:12,5
chr18	37382878	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=5.077e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:15,8:18,7
chr18	37727602	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0061213;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:25,3:20,6
chr18	38567748	.	G	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00015275;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:23,5:19,9
chr18	39706587	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:6,5:4,3:2,2
chr18	39863531	.	GCACGCACACACACACA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,7:7,2
chr18	40192263	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0095308;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:9,1:3,5
chr18	40241814	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00012515;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:15,4:20,11
chr18	42054126	.	GTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,6:7,3:4,3
chr18	42278307	.	C	CAAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.010276;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,8:18,4:10,4
chr18	42922557	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00046557;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:19,9:19,5
chr18	43745787	.	A	AATCT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0054715;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:17,15:7,7:10,8
chr18	45346968	.	AAAATAAAAATAAAAAT	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.040632;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,12:16,3:17,9
chr18	45615840	.	A	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.022208;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,8:30,4:23,4
chr18	45830583	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:12,3:3,2
chr18	46330410	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=1.8341e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:24,8:20,8
chr18	47982777	.	A	AGAGAGG	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:5,2:0,0
chr18	48281933	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0084605;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,16:13,5:18,11
chr18	51977546	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0019724;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:30,7:19,3
chr18	53598647	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=8.1726e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:17,8:20,7
chr18	54771591	.	A	AGT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.011272;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,9:5,5:5,4
chr18	54980069	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0098204;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:13,3:12,3
chr18	55711294	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:8,5:5,1
chr18	56158489	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00013409;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:18,8:26,7
chr18	56736924	.	A	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00018926;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:45,18:15,8:30,10
chr18	56738798	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,2:7,2
chr18	56900082	.	GTATA	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:2,2:2,1:0,1
chr18	59882954	.	ATT	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.049546;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:25,3:17,7
chr18	61010065	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.5622e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:16,7:15,7
chr18	62189275	.	G	GT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.031485;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,11:11,5:15,6
chr18	63174820	.	CA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.049356;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:14,7:7,2
chr18	65891839	.	A	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0013864;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:20,7:23,4
chr18	67394999	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
chr18	72173274	.	T	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=5.8144e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:36,20:18,11:18,9
chr18	72528962	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,5:3,2
chr18	72690942	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=3.0143e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:46,21:16,7:30,14
chr18	73899710	.	C	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=3.4355e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:16,7:19,8
chr18	74737392	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00045086;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:21,5:15,5
chr18	76028583	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=1.076e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:36,18:14,10:22,8
chr18	76458795	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0044583;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:5,8:11,2
chr18	77708903	.	G	A	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=3.6562e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:47,25:23,10:24,15
chr18	77958179	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.020648;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:21,1:11,4
chr18	78042031	.	GTT	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0007185;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:24,12:14,7:10,5
chr18	78513404	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12395;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:12,4:14,1
chr18	78840321	.	TGA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:11,6:3,2
chr18	79618653	.	A	C	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.035863;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:70,13:31,9:39,4
chr19	106852	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.052666;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:0,1:21,6
chr19	160592	.	G	T	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.028659;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:91,12:41,6:50,6
chr19	190040	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,1:4,3
chr19	350618	.	CAT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.012598;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:4,3:11,4
chr19	481425	.	AGAAGGATGATGGG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:12,2:4,2
chr19	492581	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:4,2:6,3
chr19	714358	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:5,3:10,2
chr19	1035181	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.044401;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:26,4:15,1
chr19	1877185	.	C	T	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.022449;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:21,6:25,6
chr19	2725749	.	C	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=7.7806e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:48,15:32,11:16,4
chr19	2864729	.	GAAAGAAAAAGAAAA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01828;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:3,1:7,7
chr19	3528158	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.00073223;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:14,5:25,4
chr19	3972314	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:2,5:5,4
chr19	4068661	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.046571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:52,6:29,4:23,2
chr19	4232769	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.049454;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,10:18,6:15,4
chr19	4334836	.	C	CTGTCCA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,2:2,3
chr19	4952393	.	C	CTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11785;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,7:8,5:5,2
chr19	5463442	.	TTCC	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.031089;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,1:11,4
chr19	5516651	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:13,10:8,6:5,4
chr19	6162566	.	C	CAAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.037576;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,9:18,8:9,1
chr19	6287882	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=4.2775e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,19:18,10:14,9
chr19	6455720	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:2,2:2,1:0,1
chr19	6614552	.	G	GTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021122;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,7:9,6:3,1
chr19	6994039	.	T	TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAC	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0037845;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,11:13,6:11,5
chr19	8063855	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075102;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:10,3:15,1
chr19	8423985	.	C	CA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.035556;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:33,14:20,11:13,3
chr19	8541425	.	GT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.028446;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:15,8:7,2
chr19	8785481	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:20,4:0,0
chr19	8853515	.	A	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.049592;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:23,6:14,1
chr19	8959981	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.015072;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:20,4:22,2
chr19	9428062	.	A	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00032403;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:21,7:15,4
chr19	9970015	.	T	TG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0021563;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,11:3,4:6,7
chr19	10196339	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=4.7992e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:30,4:13,10
chr19	10307347	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,4:1,3:3,1
chr19	11159637	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:54:0,3:0,2:0,1
chr19	11974110	.	TTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.016686;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:8,4:25,8
chr19	13291633	.	T	TA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00011777;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,21:16,14:6,7
chr19	16341517	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=9.1667e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,16:14,7:22,9
chr19	18072946	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.019247;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:12,8:7,1
chr19	18159144	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016908;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:2,4:7,2
chr19	18201263	.	A	AAAAGAAAG	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.023995;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,8:15,6:14,2
chr19	19744153	.	CTT	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10771;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:9,2:29,3
chr19	20890454	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.046474;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:9,2:18,2
chr19	21709169	.	C	CAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0097243;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,12:14,8:8,4
chr19	22655736	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.01458;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,3:3,6
chr19	23417434	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,4:1,1
chr19	24346300	.	T	C	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.017291;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:86,11:46,6:40,5
chr19	25408284	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.13636;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:2,1:13,2
chr19	26019887	.	T	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
chr19	27414078	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0013497;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:20,6:20,6
chr19	27437536	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=2.1314e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:18,5:17,13
chr19	28819963	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.022285;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:26,2:18,4
chr19	29548626	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0007833;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:23,7:21,5
chr19	29782829	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.041455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:13,4:1,0
chr19	29874253	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:1,2:0,0
chr19	29900314	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:3,1:3,4
chr19	32019290	.	GAGAGAGAGAA	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.046683;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:7,4:9,1
chr19	32667832	.	C	CAAA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.006922;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,15:18,11:15,4
chr19	33961138	.	C	CTTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0040779;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:11,4:11,6
chr19	34451536	.	GT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049275;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
chr19	36428649	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.03385;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:22,4:5,1
chr19	36975136	.	A	ATTTC	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.027342;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:11,4:20,7
chr19	37184356	.	AAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.032887;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,7:12,3:12,4
chr19	37283037	.	G	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.013084;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:20,3:21,9
chr19	37551835	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.010281;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:17,5:18,1
chr19	38422132	.	G	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=8.3659e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:58,18:30,8:28,10
chr19	43765527	.	G	GAC	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00034173;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:15,3:20,9
chr19	44338836	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.00035589;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:51,15:30,10:21,5
chr19	45372147	.	T	TGTGTGTGTGTGTGCGC	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00033727;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,15:6,5:13,10
chr19	45903858	.	C	CAA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.019414;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,12:18,10:6,2
chr19	46157787	.	A	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00027053;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:17,6:11,3
chr19	47051770	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:8,1:18,3
chr19	47747779	.	CTTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0084717;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,5:3,3
chr19	47895696	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,6:6,4:5,2
chr19	48153637	.	A	AACAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:8,3:2,3
chr19	48331200	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,2:8,3
chr19	48829635	.	C	CTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:12,4:7,1
chr19	48958345	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:14,2:2,3
chr19	49182467	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,4:13,2:6,2
chr19	49544708	.	CAG	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.047358;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:10,2:14,7
chr19	50346024	.	AT	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.101;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:12,3:23,1
chr19	50618106	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.015393;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:26,3:13,4
chr19	50738867	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,4:6,1:16,3
chr19	51393559	.	T	TTTTA	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.038138;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:20,8:22,6
chr19	52997685	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=8.2016e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:10,9:13,12
chr19	53470160	.	T	TCCTTCCTTCCTTCCTTCC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.028482;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,9:13,2:10,7
chr19	53470177	.	C	CT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0069242;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:14,5:8,10
chr19	53821031	.	CTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.1039;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,3:10,2:4,1
chr19	53921585	.	GT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.19536;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:6,2:10,1
chr19	53923820	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,3:4,5
chr19	53954418	.	A	ATCTT	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.027602;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:36,14:14,4:22,10
chr19	54413375	.	GGTGT	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00073139;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,13:12,9:6,4
chr19	54492716	.	C	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.0087887;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:61,15:23,8:38,7
chr19	54636053	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.014985;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:19,2:13,10
chr19	54862802	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,7:4,5:1,2
chr19	55319433	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
chr19	55864705	.	T	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0015871;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:14,4:26,4
chr19	55990079	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,3:2,1
chr19	56696976	.	T	TATATGTGTATAC	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.02769;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,8:11,6:6,2
chr19	57165803	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.02761;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,11:16,9:7,2
chr19	57281556	.	A	AT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.049356;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:15,4:6,5
chr19	57457933	.	A	AGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:4,3:9,1
chr19	58232766	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.014077;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:11,6:3,3:8,3
chr19	58390426	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:3,3:2,1
chr2	913213	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.24396;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:17,2:16,2
chr2	923366	.	A	ATT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,2:11,2
chr2	1281225	.	GTTTATGTGGTGTGGT	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043132;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,1:13,3
chr2	1547975	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:1,2:0,0:1,2
chr2	1719834	.	TTGTG	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:6,2:13,8
chr2	3180664	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040535;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:6,4:8,4
chr2	3669728	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00016747;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:21,2:18,9
chr2	4405526	.	C	CAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.044964;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,12:17,10:3,2
chr2	4522520	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.7203e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:8,5:21,8
chr2	5333727	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0023465;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:22,5:20,4
chr2	5600394	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.035066;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,6:14,5:4,1
chr2	6134131	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0042725;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:22,9:22,2
chr2	6862573	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00044152;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:19,10:24,4
chr2	9118194	.	TTCTC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0053523;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,4:7,4
chr2	10554207	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0082048;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:20,7:14,3
chr2	10554273	.	G	GA	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.014217;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:16,9:20,3
chr2	10690415	.	C	CAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0064663;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,7:13,6:4,1
chr2	10727051	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020274;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:0,1:17,8
chr2	12199778	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034767;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,6:5,3
chr2	13280936	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0013781;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:22,4:25,8
chr2	13484441	.	ATGTGTGTGTG	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.038795;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,8:9,6:11,2
chr2	14757402	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00053467;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:16,5:24,5
chr2	15846446	.	G	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=5.5211e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:22,9:22,5
chr2	16092284	.	GT	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.042122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,8:12,6:4,2
chr2	16299765	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,4:11,3:10,1
chr2	17707999	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:17,5:10,2:7,3
chr2	17921915	.	G	GTA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,4:2,4
chr2	18029352	.	ATTT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,4:6,2
chr2	18296634	.	A	AGT	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.015651;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:69,22:31,18:38,4
chr2	18530290	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,3:5,2
chr2	19263268	.	G	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=1.2759e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:46,19:25,9:21,10
chr2	22738315	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0036201;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:45,10:25,6:20,4
chr2	23581828	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.052666;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,7:15,6:6,1
chr2	23918202	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.014414;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:17,10:3,1
chr2	24621432	.	ATTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,4:4,3
chr2	25901727	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,4:6,1
chr2	26668091	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00061273;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:19,6:20,5
chr2	27539702	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10694;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:6,1:11,2
chr2	28258632	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,2:11,2
chr2	28443199	.	AT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00094846;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,15:9,9:4,6
chr2	28939057	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:5,3:14,2
chr2	30193879	.	AT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0041629;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,6:4,2
chr2	30886989	.	T	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.003441;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:19,7:26,1
chr2	31243452	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,4:8,2:2,2
chr2	31245545	.	ATATATATATT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0055032;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,7:12,4:5,3
chr2	31881495	.	TA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:7,5:7,3
chr2	32030629	.	C	CAA	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.015555;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,14:21,12:9,2
chr2	32343478	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028534;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:6,6:7,2
chr2	32446738	.	G	GT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,3:8,1
chr2	33654935	.	GA	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0057212;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:19,3:13,5
chr2	34123925	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0012005;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:25,9:14,4
chr2	34314362	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,3:10,2
chr2	35214857	.	A	AT	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.046149;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,7:14,4:10,3
chr2	35541650	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.022366;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,9:5,2:9,7
chr2	35610856	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0001474;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:22,7:22,7
chr2	37519556	.	AATATATATGT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,2:5,2
chr2	37519805	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.044512;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:14,4:12,2
chr2	39978827	.	CTA	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.05702;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:32,2:9,3
chr2	41452723	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,2:5,2
chr2	42121772	.	G	GA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013378;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:12,6:6,3
chr2	42403477	.	G	GTTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
chr2	42451204	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.032622;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,8:12,7:4,1
chr2	42525516	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.091638;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:5,1:28,3
chr2	42628772	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.026638;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:19,5:6,4
chr2	44588374	.	G	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:1,1:8,6
chr2	44666612	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.22913;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:15,3:5,1
chr2	45064398	.	G	GT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0028422;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:17,6:14,8
chr2	45716732	.	AAAGT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14853;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,6:16,5:2,1
chr2	45868214	.	CTT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0013974;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,12:8,8:2,4
chr2	46299246	.	G	GCGAAT	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.00018801;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:58,16:28,11:30,5
chr2	46299254	.	C	G	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.00012803;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:57,16:27,10:30,6
chr2	47259984	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00010638;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:34,15:17,11:17,4
chr2	49358589	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0014915;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:19,1:18,7
chr2	51939045	.	G	GT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.01049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,7:1,4:1,3
chr2	53439035	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00029953;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:19,5:12,7
chr2	54930953	.	C	CTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.092279;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:13,4:7,1
chr2	55425116	.	A	AAG	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=7.7172e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:12,4:15,6
chr2	57376462	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:9,5:3,3:6,2
chr2	57912417	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00010821;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:42,17:20,10:22,7
chr2	60166802	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00071811;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:20,5:17,5
chr2	61054725	.	ATG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.031169;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,6:10,4
chr2	61623897	.	TAATAAAATAAAATAA	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.016656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:12,4:11,7
chr2	61676192	.	GT	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.03601;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:15,4:8,4
chr2	61715319	.	C	CTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.024419;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:9,6:8,4
chr2	62629617	.	CTCTCCCTCTCCCCACGG	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,4:16,3:8,1
chr2	63455439	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.052103;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:21,2:17,3
chr2	65220216	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0065088;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,11:4,9:5,2
chr2	65699924	.	G	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00019326;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:45,14:27,9:18,5
chr2	67945849	.	C	CTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034996;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:7,4:7,2
chr2	69662992	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0090729;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,7:4,1
chr2	70219738	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.017733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:16,10:1,1
chr2	70396496	.	C	CA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.013912;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,10:13,9:8,1
chr2	71161823	.	G	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=8.8589e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:40,22:20,11:20,11
chr2	75186371	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.043206;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:11,6:6,1
chr2	76300327	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.048573;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,3:12,3
chr2	77509384	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00017939;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:45,16:19,9:26,7
chr2	78858407	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0015983;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:18,5:22,5
chr2	79187261	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.057027;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:14,3:12,3
chr2	79283033	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.035066;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,3:6,3
chr2	79395157	.	C	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=4.2848e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:32,7:14,7
chr2	79851737	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,1:7,3
chr2	79982253	.	TACAC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.031354;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:4,2:11,7
chr2	80375562	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:8,4:3,1
chr2	80932071	.	C	CATAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.017571;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,9:9,4:5,5
chr2	86902578	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00064447;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:27,23:10,10:17,13
chr2	87116473	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.015567;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:12,3:7,7
chr2	87178306	.	T	TG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.028693;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,10:9,4:16,6
chr2	87201007	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
chr2	87247722	.	A	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.012017;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:15,8:26,5
chr2	87345906	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:4,2:21,2
chr2	87388545	.	C	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0030596;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:24,9:11,9
chr2	87398126	.	CGCCA	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.079421;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:20,4:21,1
chr2	87420984	.	C	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,2:4,2
chr2	87706027	.	T	C	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.043168;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:52,14:30,9:22,5
chr2	89534524	.	G	GTGAT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.16149;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:10,3:1,0:9,3
chr2	89597075	.	A	G	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=2.2566e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:45,23:28,10:17,13
chr2	89767663	.	GT	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.040655;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:49,6:29,4:20,2
chr2	89837671	.	T	A	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.021811;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:49,14:25,7:24,7
chr2	90247912	.	G	A	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.0064228;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:58,19:32,12:26,7
chr2	90249171	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.048023;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:50,13:35,6:15,7
chr2	90311614	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0018363;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:32,18:23,11:9,7
chr2	90323215	.	C	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.038293;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:49,7:15,3:34,4
chr2	90324502	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:6,2:1,5
chr2	90326314	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
chr2	90350028	.	A	T	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.0092286;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:72,19:42,11:30,8
chr2	90401619	.	G	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.019783;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:79,18:45,15:34,3
chr2	91472627	.	C	T	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.0025124;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:113,22:54,12:59,10
chr2	91476732	.	T	C	0	PASS	DP=270;GPV=1;SPV=0.0036469;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:121,24:51,5:70,19
chr2	91546596	.	A	G	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.00060653;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:71,21:36,7:35,14
chr2	91601565	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.027931;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,10:13,5:20,5
chr2	91711048	.	G	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.0012651;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:12,7:33,6
chr2	91711082	.	C	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.048471;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:55,12:12,8:43,4
chr2	91895156	.	G	GCT	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.023718;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:104,14:49,10:55,4
chr2	91911069	.	A	C	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.0052731;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:84,10:35,8:49,2
chr2	91932523	.	T	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.018291;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:30,3:27,4
chr2	92198813	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.20884;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:30,4:3,0
chr2	92204805	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:2,0:19,4
chr2	92208558	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.20116;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:0,0:32,4
chr2	92218555	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.079426;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:34,4:2,0
chr2	92295228	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
chr2	92332611	.	G	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.023569;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:54,10:28,2:26,8
chr2	92366760	.	T	G	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.023461;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:132,23:2,9:130,14
chr2	92386741	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,3:10,1
chr2	92392766	.	C	T	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.0050942;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:88,25:40,15:48,10
chr2	92418824	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:20,4:0,0
chr2	92485165	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.12943;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:3,0:29,4
chr2	92491173	.	T	G	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.026545;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:68,9:42,6:26,3
chr2	92511077	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.022365;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:9,6:19,1
chr2	92564394	.	T	A	0	PASS	DP=244;GPV=1;SPV=0.029233;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:113,20:61,5:52,15
chr2	92674209	.	T	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.044237;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:76,10:62,5:14,5
chr2	92684703	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:2,0:32,4
chr2	92746667	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.026152;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:12,5:28,2
chr2	92746668	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.049115;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,6:11,5:30,1
chr2	92763497	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011977;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:19,11:4,1
chr2	92828797	.	T	A	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.0079688;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:153,18:1,1:152,17
chr2	92856348	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,1:5,8
chr2	92909528	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.022996;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:14,1:10,8
chr2	92956450	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10169;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:0,1:35,4
chr2	92992587	.	T	A	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.01794;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:75,19:35,13:40,6
chr2	93070152	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011208;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,7:5,1
chr2	93077499	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023024;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,5:5,3
chr2	93100041	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.16867;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:35,4:0,0
chr2	93114949	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:11,3:25,1
chr2	93164279	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:17,1:9,3
chr2	93215666	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.043236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,2:16,5
chr2	93233897	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080194;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:8,1:23,5
chr2	93249883	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
chr2	93432710	.	C	T	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.031747;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:66,12:26,7:40,5
chr2	93459900	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:0,3:25,1
chr2	93551914	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:0,5:6,4
chr2	93575342	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.023393;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:30,7:9,1
chr2	93596222	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.025703;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:41,6:6,1
chr2	93672880	.	C	G	0	PASS	DP=339;GPV=1;SPV=0.017673;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:189,23:62,12:127,11
chr2	93683512	.	A	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
chr2	93690772	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.25968;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,1:7,3
chr2	93864295	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0066847;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,5:11,5
chr2	93958145	.	A	G	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.0012808;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:119,21:98,18:21,3
chr2	94073421	.	GAA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.23474;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:18,2:9,1
chr2	94084064	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.29538;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:20,3:14,1
chr2	94084147	.	G	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
chr2	94084897	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14592;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:11,3:18,2
chr2	94286187	.	A	G	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.011597;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:100,27:56,12:44,15
chr2	94287837	.	G	T	0	PASS	DP=388;GPV=1;SPV=0.0017827;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:198,28:75,3:123,25
chr2	94851909	.	G	GTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,4:16,3:3,1
chr2	95484068	.	T	TA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.012518;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:12,9:11,3
chr2	95936776	.	C	A	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.030583;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:102,20:70,16:32,4
chr2	95987605	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0047325;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:5,3:6,4
chr2	96009000	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=6.3244e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:15,6:22,8
chr2	96023181	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:21,4:29,2
chr2	96462406	.	C	T	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.015623;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:65,10:35,8:30,2
chr2	97060632	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0034588;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:25,5:18,4
chr2	100014783	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,4:4,2
chr2	102487178	.	G	GGT	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0025178;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:20,3:25,5
chr2	102818770	.	C	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.043302;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:26,3:20,3
chr2	103496471	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=3.4306e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:22,7:14,8
chr2	103705085	.	TATATATAA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.02121;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,7:5,2
chr2	105522330	.	AAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,4:3,2:7,2
chr2	106287921	.	AAAC	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.077531;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:10,1:20,4
chr2	106394211	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.015335;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:13,5:12,8
chr2	106464556	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0044711;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:14,5:29,1
chr2	107904796	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.003233;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:14,11:25,3
chr2	109606672	.	CTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036089;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:6,3:1,2
chr2	110175315	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00037706;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,4:17,6
chr2	111551691	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0021846;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:2,2:6,9
chr2	111812295	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.064595;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,3:8,2
chr2	113236228	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
chr2	113394909	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0097821;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:0,1:9,6
chr2	113561824	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,3:16,1
chr2	113594232	.	AG	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.046454;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:30,2:28,5
chr2	114026437	.	G	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.000332;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:51,14:22,3:29,11
chr2	116900074	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:12,4:9,1:3,3
chr2	116900753	.	TC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011003;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,5:11,6
chr2	117042252	.	T	TTA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.042657;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:19,7:10,3
chr2	117736666	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00015203;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:18,6:10,6
chr2	118030701	.	T	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=1.0575e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:46,19:25,12:21,7
chr2	118200387	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,4:9,3:15,1
chr2	118200397	.	TATATACAC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:21,5:7,3:14,2
chr2	118563884	.	AAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,7:8,5:4,2
chr2	119529550	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,13:7,11:1,2
chr2	121235579	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0026133;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:7,5:9,6
chr2	123358800	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,4:2,1
chr2	124237077	.	C	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00019654;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:46,13:22,5:24,8
chr2	125013436	.	T	TA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,4:2,1
chr2	125032097	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0029706;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:21,2:12,6
chr2	125894961	.	CAT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:5,1:4,5
chr2	128606445	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0068293;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:17,8:20,1
chr2	129435058	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017739;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,8:9,1
chr2	130226771	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.029035;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:20,1:20,9
chr2	130637244	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0082085;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:33,18:20,6:13,12
chr2	130680549	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,3:9,1
chr2	131275700	.	C	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr2	132012048	.	TA	T	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.023941;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:100,18:36,6:64,12
chr2	132052015	.	A	C	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.034853;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:90,13:47,3:43,10
chr2	132723140	.	A	AT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020153;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,7:14,5:7,2
chr2	133302829	.	C	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=1.6041e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:45,19:24,8:21,11
chr2	133960430	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037959;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,2:2,2
chr2	134465189	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.077652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:18,3:27,2
chr2	137781367	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=4.3552e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:34,16:19,9:15,7
chr2	137911418	.	ATTTTTTTT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0079921;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,11:9,8:4,3
chr2	138984952	.	TCTTC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.07563;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:7,2:17,2
chr2	139200479	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00022098;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:17,3:11,7
chr2	139975755	.	C	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0012829;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:48,16:27,13:21,3
chr2	140743990	.	AAGT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00059538;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,10:1,4:0,6
chr2	141645469	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:9,5:1,1
chr2	141962869	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0010228;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:20,5:19,6
chr2	142353850	.	C	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019548;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,2:5,5
chr2	143090910	.	C	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0011295;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:15,3:27,7
chr2	145080448	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.15966;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:17,3:8,1:9,2
chr2	146135294	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0047012;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:7,9:5,2
chr2	148411512	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,4:10,1
chr2	149675021	.	A	ATCTATCTATCTATCTATCTATC	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.04668;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:28,8:8,6:20,2
chr2	149988264	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0083921;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:21,5:21,2
chr2	150184369	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.03053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:18,8:4,3
chr2	150304967	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00048032;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:22,9:15,4
chr2	150653021	.	C	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=2.3536e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:41,24:17,8:24,16
chr2	153069708	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=8.0829e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:21,7:22,6
chr2	153345635	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.009702;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,9:1,6:15,3
chr2	153414478	.	A	AT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.010719;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:21,6:8,1
chr2	154118282	.	C	CTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.032462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,16:10,7:10,9
chr2	154417282	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.023489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,7:12,5:4,2
chr2	154620996	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11785;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:3,2:10,4
chr2	155613561	.	T	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:5,8:3,5:2,3
chr2	156462454	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.044826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,4:5,1:13,3
chr2	156617063	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,4:10,3:13,1
chr2	156773425	.	T	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0066107;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:19,6:27,3
chr2	162285325	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.032385;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:28,5:23,1
chr2	164259174	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0013605;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:15,5:21,7
chr2	164584147	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:4,3:5,1
chr2	165520782	.	AT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.32712;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,4:9,3:1,1
chr2	165766678	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.038035;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:17,6:6,1
chr2	165927223	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:5,2:5,2
chr2	167683806	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.1162e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:12,6:14,10
chr2	169079881	.	GAA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,3:6,2
chr2	169284256	.	C	CTCT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,4:5,1
chr2	169466445	.	TATAAAC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.13115;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:17,1:6,4
chr2	169591920	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0095308;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,6:10,2:2,4
chr2	169969548	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0011242;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,12:10,9:3,3
chr2	170230336	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.040008;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,9:8,4:8,5
chr2	171496400	.	A	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,4:16,1:8,3
chr2	171508528	.	C	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=4.7992e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:24,7:19,7
chr2	172744982	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=7.0728e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:17,9:25,7
chr2	172857881	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,4:6,3:7,1
chr2	172911758	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
chr2	173844256	.	C	CGTGTGT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0032844;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:13,14:9,8:4,6
chr2	174110302	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0023112;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,15:5,12:4,3
chr2	174540463	.	C	CAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,8:4,7:6,1
chr2	177853678	.	ATATGTG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,4:1,2:7,2
chr2	177855903	.	AACAC	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0023233;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:12,13:8,10:4,3
chr2	179027646	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:4,3:9,1
chr2	181301902	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0089356;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:20,5:23,4
chr2	181418864	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,1:4,4
chr2	183242462	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0090729;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,8:4,3:8,5
chr2	183265413	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:6,5:8,1
chr2	183283860	.	TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.085684;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:16,3:26,3
chr2	186406821	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.045381;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:20,2:24,4
chr2	187243808	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.034248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,5:15,3:8,2
chr2	189835906	.	C	CAAA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.015597;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,10:19,9:4,1
chr2	191524061	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:8,2:4,2
chr2	194519854	.	A	AT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.024221;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:16,4:12,2
chr2	194623176	.	TTG	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.011999;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,7:25,4:21,3
chr2	196613582	.	T	TA	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00015878;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:40,14:22,9:18,5
chr2	196626026	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0039984;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,8:5,2
chr2	197240374	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0078195;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,13:12,11:6,2
chr2	197695447	.	T	TA	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.036723;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:25,2:26,4
chr2	197853604	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00037553;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:19,4:20,7
chr2	198253112	.	G	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0064775;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:21,6:27,2
chr2	199290797	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=3.1445e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:39,17:26,9:13,8
chr2	199701299	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,7:6,6:4,1
chr2	203271080	.	ATATTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:4,4:3,2
chr2	203512621	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.019226;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,7:8,2
chr2	204362490	.	A	AGATAGATAGATAGATG	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0049095;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,13:11,10:8,3
chr2	206180734	.	C	CATTATTATT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0095299;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,13:5,7:11,6
chr2	207820890	.	CTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:4,4:4,1
chr2	208173120	.	CAA	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0031524;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,11:7,9:3,2
chr2	209510211	.	G	GT	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0066158;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:24,6:18,3
chr2	211317921	.	CG	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.044904;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,8:15,5:7,3
chr2	212949823	.	GTTT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,6:4,3
chr2	214595549	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.03415;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:11,6:15,5
chr2	214608659	.	T	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.041404;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:18,4:16,2
chr2	215246625	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,4:7,3:16,1
chr2	216187470	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,2:4,1:2,1
chr2	217150072	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00022563;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:25,8:5,3
chr2	217229439	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,4:9,2:5,2
chr2	217293693	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=2.52e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:20,6:17,8
chr2	217809576	.	GATAGGTGC	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.02182;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,8:9,3:15,5
chr2	218321623	.	CT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0062802;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:17,7:5,3
chr2	218588588	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:4,1:3,5
chr2	219159526	.	C	CAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,4:12,2:5,2
chr2	220791974	.	AT	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:4,1:1,1
chr2	220833442	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.010567;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,15:15,13:8,2
chr2	221405710	.	T	TTTTGTTTTTTTTTTTTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013894;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:3,1:4,3
chr2	221868009	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=8.0829e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:19,7:24,6
chr2	222323434	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,9:1,4:3,5
chr2	222816602	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.18154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:4,1:11,2
chr2	223321343	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.8214e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:24,8:13,7
chr2	223547202	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:26,4:13,2:13,2
chr2	223626106	.	G	GGAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.022123;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,6:22,5:5,1
chr2	223626112	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.023915;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:18,9:11,6:7,3
chr2	227045783	.	CAT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.052629;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,1:12,4
chr2	227377124	.	T	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:1,2:0,1:1,1
chr2	227427984	.	C	CTCTTTTCTTTCTTT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.038786;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,5:8,2:24,3
chr2	228055142	.	C	CAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,2:3,2:0,0
chr2	228139910	.	T	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.21504;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,3:2,2:8,1
chr2	228393427	.	T	TATAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:10,2:10,2
chr2	228403532	.	A	G	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0020126;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:63,12:36,6:27,6
chr2	230222840	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10034;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:15,2:7,2
chr2	230782817	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,1:12,3
chr2	231852022	.	TC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,5:2,3:4,2
chr2	232886127	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.05558;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:29,5:12,2:17,3
chr2	233253340	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0070941;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:5,5:3,5
chr2	233258016	.	AATATCTAT	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0024809;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:13,3:14,12
chr2	234561655	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.9917e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:17,9:16,5
chr2	234747587	.	AT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0030816;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,14:5,8:4,6
chr2	235090896	.	CTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.033381;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,12:13,4:22,8
chr2	236024021	.	G	GT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.069135;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,2:16,2
chr2	238162785	.	G	A	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.0029955;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:72,10:28,7:44,3
chr2	239094421	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.883e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:18,8:9,9
chr2	241848563	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:1,2:7,5
chr2	242178601	.	T	G	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.017245;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:89,16:49,9:40,7
chr20	227692	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.052186;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
chr20	508437	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=6.7435e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:13,9:15,3
chr20	1948736	.	AAAAAAG	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.034215;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,6:16,3:15,3
chr20	4103854	.	C	CAA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.018271;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,9:15,8:6,1
chr20	4768812	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.12821;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:3,2:2,1:1,1
chr20	5763290	.	C	CA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0049095;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,13:17,11:2,2
chr20	6530251	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=8.189e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:48,16:24,8:24,8
chr20	6606159	.	CTT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.044481;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:3,1:23,4
chr20	7810723	.	CT	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.045061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:13,4:12,1
chr20	8031760	.	GATGTATGTGTGTATGTATGATGT	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.046772;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,5:13,4:16,1
chr20	8123251	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.072687;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:21,3:23,3
chr20	9189274	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:14,3:6,1
chr20	9191345	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,2:5,2
chr20	10118020	.	A	AAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:6,6:1,2
chr20	10336200	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00038475;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:16,4:7,7
chr20	12341282	.	T	TG	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.045641;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:20,3:21,5
chr20	13960126	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.8386e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:37,17:22,11:15,6
chr20	14008889	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00041767;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:20,6:23,6
chr20	15294120	.	T	TAAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.011404;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,15:10,11:12,4
chr20	18118892	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.44608;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,4:3,2:8,2
chr20	18464667	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,3:5,1
chr20	20411129	.	C	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=6.1367e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:55,17:28,9:27,8
chr20	20937991	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00030699;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:28,9:14,7
chr20	21463989	.	C	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00089328;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:20,6:19,2
chr20	21944595	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00011575;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:23,6:20,10
chr20	22082620	.	G	GTATATATGA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.12945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,3:18,1
chr20	25027351	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.00017575;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:18,5:24,7
chr20	26514233	.	G	T	0	PASS	DP=257;GPV=1;SPV=0.019443;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:124,15:105,6:19,9
chr20	26534544	.	T	A	0	PASS	DP=248;GPV=1;SPV=0.0069962;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:122,16:122,13:0,3
chr20	27540217	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
chr20	28518449	.	T	A	0	PASS	DP=1270;GPV=1;SPV=0.039135;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:738:660,78:195,25:465,53
chr20	28521867	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064294;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:23,2:8,2
chr20	28547142	.	T	G	0	PASS	DP=547;GPV=1;SPV=0.027317;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:305:273,31:215,23:58,8
chr20	28614307	.	TTC	T	0	PASS	DP=395;GPV=1;SPV=0.043453;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:198,25:112,13:86,12
chr20	28623285	.	C	T	0	PASS	DP=318;GPV=1;SPV=0.012606;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:149,36:105,20:44,16
chr20	28640875	.	C	T	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.026665;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:99,11:54,9:45,2
chr20	28645448	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:10,5:5,3
chr20	28861781	.	AC	A	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.031078;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:70,13:42,8:28,5
chr20	28890149	.	C	CA	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.012413;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:96,17:29,4:67,13
chr20	29073075	.	TA	T	0	PASS	DP=407;GPV=1;SPV=0.03738;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:207:178,29:72,4:106,25
chr20	29073097	.	C	T	0	PASS	DP=384;GPV=1;SPV=0.048485;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:206:175,31:61,8:114,23
chr20	29119431	.	T	C	0	PASS	DP=311;GPV=1;SPV=0.028171;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:140,19:63,6:77,13
chr20	29248974	.	C	CA	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.026235;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:256:229,27:131,17:98,10
chr20	29321156	.	CA	C	0	PASS	DP=296;GPV=1;SPV=0.0019801;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:132,39:69,11:63,28
chr20	29503185	.	A	G	0	PASS	DP=436;GPV=1;SPV=0.014857;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:248:212,36:109,11:103,25
chr20	29504586	.	AT	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.0088583;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:61,19:25,6:36,13
chr20	29662251	.	T	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.042124;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:20,6:18,1
chr20	29738863	.	A	G	0	PASS	DP=301;GPV=1;SPV=0.043134;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:143,24:63,6:80,18
chr20	29821788	.	T	C	0	PASS	DP=255;GPV=1;SPV=0.0047543;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:118,20:48,15:70,5
chr20	29880455	.	G	A	0	PASS	DP=928;GPV=1;SPV=0.0029875;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:501:450,51:251,31:199,20
chr20	29880516	.	G	A	0	PASS	DP=828;GPV=1;SPV=0.01893;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:438:387,51:204,35:183,16
chr20	29897157	.	G	T	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.046093;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:144,25:68,14:76,11
chr20	30154381	.	C	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0012895;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:49,12:21,7:28,5
chr20	30727455	.	CACACACACACGT	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.024635;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,8:17,6:12,2
chr20	30727526	.	C	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.017892;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:54,11:33,8:21,3
chr20	31054776	.	T	A	0	PASS	DP=671;GPV=1;SPV=0.033557;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:343:300,43:145,20:155,23
chr20	31060810	.	G	C	0	PASS	DP=1686;GPV=1;SPV=0.011049;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:995:882,100:445,75:437,25
chr20	31069228	.	T	A	0	PASS	DP=1178;GPV=1;SPV=0.001115;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:699:588,111:204,27:384,84
chr20	31072178	.	T	TGGAAA	0	PASS	DP=1113;GPV=1;SPV=0.040867;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:663:553,70:251,41:302,29
chr20	31171448	.	G	GAAT	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.045288;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:15,5:26,1
chr20	34650694	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.077531;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:12,2:18,3
chr20	35578117	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:1,4:4,2
chr20	35926362	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.042577;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,4:15,1
chr20	36317223	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0045492;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,9:5,3:17,6
chr20	37073705	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,10:4,4:4,6
chr20	37480592	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,5:0,3:3,2
chr20	37519404	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011194;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:22,6:3,1
chr20	38468121	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.00055593;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:49,12:28,5:21,7
chr20	38662745	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.041365;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,3:8,1
chr20	39636426	.	G	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.018013;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:49,6:28,4:21,2
chr20	39700651	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00075349;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:26,10:14,2
chr20	40094345	.	CTTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:9,3:10,1
chr20	41555257	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027859;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,5:7,1
chr20	41848464	.	AT	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0069091;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:18,6:17,4
chr20	42363270	.	TTATATATATATATA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:16,3:7,1
chr20	42423178	.	T	TAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:11,6:7,4
chr20	42655416	.	G	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0011693;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:26,5:18,7
chr20	45942278	.	C	CT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.055772;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:20,4:18,1
chr20	46568401	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.011308;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,7:8,2
chr20	47039835	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0012546;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,13:3,11:2,2
chr20	48515196	.	C	G	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.0065333;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:55,7:15,4:40,3
chr20	54481002	.	C	CT	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.037368;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:49,11:29,4:20,7
chr20	55587924	.	G	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00018355;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:48,18:25,4:23,14
chr20	56114844	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00029833;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:20,4:13,6
chr20	57350881	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr20	58736472	.	C	CAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.14971;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,7:17,5:8,2
chr20	59491334	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0041352;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,8:13,5:6,3
chr20	60018702	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
chr20	61126462	.	T	TA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.03212;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:13,7:19,5
chr20	61329895	.	G	GTCCATCTGT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0053893;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,14:2,3:18,11
chr20	61329897	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011956;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:2,3:17,11
chr20	62226743	.	G	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=9.3901e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:23,5:24,8
chr20	63221510	.	CGGACTGCAGGGATTGCAG	C	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.008266;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:61,10:30,8:31,2
chr20	63626400	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045056;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:21,5:14,1
chr20	64131416	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.26796;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,1:19,3
chr21	5377310	.	G	GA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.019526;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:16,8:17,1
chr21	5377321	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0090348;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:13,10:16,2
chr21	7234619	.	C	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.019047;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:61,17:35,11:26,6
chr21	7284211	.	G	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.034032;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:62,8:33,3:29,5
chr21	7311054	.	C	G	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.0082281;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:56,15:17,4:39,11
chr21	7947593	.	C	T	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.012346;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:139,27:61,10:78,17
chr21	7956671	.	T	G	0	PASS	DP=261;GPV=1;SPV=0.04126;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:111,15:52,5:59,10
chr21	8032662	.	G	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.037103;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:75,11:38,6:37,5
chr21	8043442	.	T	C	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.024791;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:102,25:39,10:63,15
chr21	8530938	.	G	T	0	PASS	DP=310;GPV=1;SPV=0.049839;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:146,27:68,10:78,17
chr21	8545244	.	C	T	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.026785;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:88,16:43,6:45,10
chr21	8549900	.	ACGCGGCTTTTTGCGCCCACCGC	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,2:14,2
chr21	8671742	.	A	C	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.0027686;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:65,24:40,13:25,11
chr21	8702759	.	C	CAT	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.011216;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:101,25:58,9:43,16
chr21	8763455	.	G	T	0	PASS	DP=366;GPV=1;SPV=0.0029205;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:190:157,33:86,17:71,16
chr21	8763673	.	G	T	0	PASS	DP=363;GPV=1;SPV=0.043572;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:201:177,24:90,14:87,10
chr21	8771691	.	T	A	0	PASS	DP=325;GPV=1;SPV=0.049824;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:172:149,23:74,17:75,6
chr21	8778000	.	G	A	0	PASS	DP=450;GPV=1;SPV=0.032269;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:247:216,31:112,15:104,16
chr21	8779650	.	T	A	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.016695;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:207:176,31:91,20:85,11
chr21	8797707	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.022054;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:4,1:26,7
chr21	8806422	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.028409;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,1:16,3
chr21	8806745	.	G	C	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.04515;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:96,13:61,8:35,5
chr21	8815758	.	C	T	0	PASS	DP=587;GPV=1;SPV=0.034858;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:321:276,44:96,18:180,26
chr21	8816612	.	A	G	0	PASS	DP=292;GPV=1;SPV=0.043024;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:132,28:114,21:18,7
chr21	8819382	.	C	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.046688;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:24,3:17,3
chr21	8823242	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,3:12,2
chr21	8825121	.	C	T	0	PASS	DP=440;GPV=1;SPV=0.047395;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:202,25:102,11:100,14
chr21	8839785	.	C	T	0	PASS	DP=357;GPV=1;SPV=0.029043;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:188:168,20:114,9:54,11
chr21	8878700	.	T	C	0	PASS	DP=841;GPV=1;SPV=0.047098;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:463:412,51:229,31:183,20
chr21	8987900	.	A	G	0	PASS	DP=2146;GPV=1;SPV=0.0050428;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1153:1002,143:844,72:158,71
chr21	8993706	.	C	T	0	PASS	DP=447;GPV=1;SPV=0.04647;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:245:220,25:108,13:112,12
chr21	9008657	.	T	C	0	PASS	DP=404;GPV=1;SPV=0.018758;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:232:207,25:85,7:122,18
chr21	9013374	.	A	G	0	PASS	DP=350;GPV=1;SPV=0.0048849;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:148,35:82,23:66,12
chr21	9013554	.	C	CT	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=0.043271;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:141,28:78,11:63,17
chr21	9013741	.	G	A	0	PASS	DP=367;GPV=1;SPV=0.046477;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:185,33:96,16:89,17
chr21	9015952	.	A	G	0	PASS	DP=522;GPV=1;SPV=0.046044;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:282:243,39:125,20:118,19
chr21	9020764	.	G	A	0	PASS	DP=500;GPV=1;SPV=0.012366;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:289:251,38:135,19:116,19
chr21	9024027	.	C	A	0	PASS	DP=529;GPV=1;SPV=0.021783;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:281:249,32:132,16:117,16
chr21	9024957	.	A	C	0	PASS	DP=476;GPV=1;SPV=0.038402;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:251:220,31:97,16:123,15
chr21	9032118	.	G	A	0	PASS	DP=544;GPV=1;SPV=0.029411;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:286:257,29:143,20:114,9
chr21	9033231	.	G	A	0	PASS	DP=511;GPV=1;SPV=0.0026081;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:262:229,33:118,14:111,19
chr21	9041943	.	G	A	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.042496;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:149,18:81,9:68,9
chr21	9056372	.	A	T	0	PASS	DP=428;GPV=1;SPV=0.036967;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:203,30:131,22:72,8
chr21	9059642	.	A	T	0	PASS	DP=388;GPV=1;SPV=0.036616;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:222:194,28:121,19:73,9
chr21	9070128	.	G	A	0	PASS	DP=575;GPV=1;SPV=0.039435;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:285:256,29:133,23:123,6
chr21	9102690	.	T	G	0	PASS	DP=495;GPV=1;SPV=0.038667;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:272:231,41:151,14:80,27
chr21	9106027	.	C	T	0	PASS	DP=294;GPV=1;SPV=0.037169;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:135,21:72,12:63,9
chr21	9110896	.	T	C	0	PASS	DP=780;GPV=1;SPV=0.011975;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:451:383,68:172,26:211,42
chr21	9120170	.	T	C	0	PASS	DP=497;GPV=1;SPV=0.040604;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:278:245,33:123,17:122,16
chr21	9123976	.	C	A	0	PASS	DP=852;GPV=1;SPV=0.022951;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:474:417,57:223,31:194,26
chr21	9131132	.	C	T	0	PASS	DP=874;GPV=1;SPV=0.04638;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:456:396,60:206,28:190,32
chr21	9150722	.	A	C	0	PASS	DP=750;GPV=1;SPV=0.032696;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:402:348,54:179,29:169,25
chr21	9155364	.	C	T	0	PASS	DP=467;GPV=1;SPV=0.030253;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:262:231,31:168,23:63,8
chr21	9166199	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=272;GPV=1;SPV=0.037934;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:85,21:38,18:47,3
chr21	9169532	.	T	A	0	PASS	DP=733;GPV=1;SPV=0.02235;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:418:371,47:179,16:192,31
chr21	9172451	.	A	T	0	PASS	DP=524;GPV=1;SPV=0.038483;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:297:258,39:143,17:115,22
chr21	9177169	.	C	T	0	PASS	DP=605;GPV=1;SPV=0.0073745;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:339:298,41:176,19:122,22
chr21	9192936	.	G	GA	0	PASS	DP=457;GPV=1;SPV=0.038651;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:256:215,41:104,12:111,29
chr21	9255491	.	G	A	0	PASS	DP=952;GPV=1;SPV=0.0017834;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:530:470,54:204,18:266,36
chr21	9264019	.	T	A	0	PASS	DP=415;GPV=1;SPV=0.021377;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:189,32:99,24:90,8
chr21	9265282	.	AG	A	0	PASS	DP=325;GPV=1;SPV=0.0071758;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:156,29:104,19:52,10
chr21	9286058	.	T	G	0	PASS	DP=270;GPV=1;SPV=0.040609;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:133,20:105,12:28,8
chr21	9292979	.	GT	G	0	PASS	DP=374;GPV=1;SPV=0.021292;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:176,36:44,4:132,32
chr21	9321336	.	GT	G	0	PASS	DP=571;GPV=1;SPV=0.01829;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:308:264,44:132,23:132,21
chr21	9334566	.	A	G	0	PASS	DP=487;GPV=1;SPV=0.0040494;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:260:211,48:106,20:105,28
chr21	9348069	.	T	G	0	PASS	DP=669;GPV=1;SPV=0.00026859;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:363:295,68:130,28:165,40
chr21	9362795	.	C	T	0	PASS	DP=473;GPV=1;SPV=0.00051641;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:264:225,39:123,11:102,28
chr21	9368395	.	C	T	0	PASS	DP=1221;GPV=1;SPV=0.0091982;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:635:565,70:290,46:275,24
chr21	9374811	.	G	T	0	PASS	DP=861;GPV=1;SPV=0.040834;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:462:402,60:179,37:223,23
chr21	9568119	.	GATA	G	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.021101;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:81,19:45,7:36,12
chr21	9579930	.	G	C	0	PASS	DP=297;GPV=1;SPV=0.00087408;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:122,35:57,19:65,16
chr21	9604525	.	C	CAA	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.0084205;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:66,15:43,10:23,5
chr21	9619052	.	C	T	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.011468;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:78,22:54,17:24,5
chr21	9689135	.	C	T	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.026206;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:122,26:65,10:57,16
chr21	9721868	.	C	T	0	PASS	DP=212;GPV=1;SPV=0.033766;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:96,21:57,11:39,10
chr21	9820722	.	G	T	0	PASS	DP=588;GPV=1;SPV=0.021097;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:313:272,41:139,27:133,14
chr21	9820972	.	G	A	0	PASS	DP=797;GPV=1;SPV=0.0025079;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:426:371,55:144,25:227,30
chr21	9858418	.	A	C	0	PASS	DP=211;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:104,26:49,17:55,9
chr21	9880504	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.0052311;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:45,16:23,8:22,8
chr21	9942462	.	C	A	0	PASS	DP=308;GPV=1;SPV=0.030683;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:145,25:67,11:78,14
chr21	10024042	.	G	T	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.047615;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:74,20:43,14:31,6
chr21	10087051	.	A	G	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.00063389;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:102,29:53,17:49,12
chr21	10325231	.	TATATA	T	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.046502;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:69,9:43,8:26,1
chr21	10333904	.	C	T	0	PASS	DP=480;GPV=1;SPV=0.0018907;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:264:233,31:84,13:149,18
chr21	10366189	.	T	C	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.040644;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:119,22:54,11:65,11
chr21	10423803	.	T	A	0	PASS	DP=544;GPV=1;SPV=0.010678;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:235,43:134,22:101,21
chr21	10467542	.	A	G	0	PASS	DP=502;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:239,30:120,16:119,14
chr21	10469473	.	G	A	0	PASS	DP=532;GPV=1;SPV=0.024453;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:291:247,44:120,20:127,24
chr21	10472512	.	GAAC	G	0	PASS	DP=520;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:220,49:120,27:100,22
chr21	10480244	.	T	C	0	PASS	DP=509;GPV=1;SPV=0.0024418;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:282:237,45:123,28:114,17
chr21	10480245	.	G	A	0	PASS	DP=518;GPV=1;SPV=0.0042244;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:287:242,45:129,28:113,17
chr21	10485910	.	C	T	0	PASS	DP=277;GPV=1;SPV=0.011841;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:162:137,25:70,13:67,12
chr21	10679026	.	ATTCCG	A	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.016439;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:89,20:48,12:41,8
chr21	10785034	.	A	G	0	PASS	DP=270;GPV=1;SPV=0.0013993;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:139,30:56,10:83,20
chr21	10798374	.	G	A	0	PASS	DP=581;GPV=1;SPV=0.015273;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:361:315,46:170,26:145,20
chr21	13137513	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.046561;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:9,7:34,1
chr21	13144811	.	C	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.047696;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:30,2:24,4
chr21	13379484	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.013587;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,5:9,3
chr21	13641624	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.032295;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:18,1:13,8
chr21	13907540	.	G	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.03431;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:60,9:35,6:25,3
chr21	16854693	.	TTTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022726;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,2:8,6
chr21	17483379	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,4:7,1:8,3
chr21	17973417	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.020011;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,6:5,2
chr21	18982554	.	A	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0067604;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:26,3:18,5
chr21	19463992	.	C	CATACATATATATATAT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05384;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,5:12,4:9,1
chr21	19628116	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.068138;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,4:21,3:11,1
chr21	22232667	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.052643;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,4:8,2
chr21	23590599	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015395;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:13,6:4,1
chr21	23697931	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.025013;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:21,9:9,1:12,8
chr21	24846151	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,2:5,2:0,0
chr21	24948990	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0052229;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:13,4:16,4
chr21	25615142	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:11,5:4,2:7,3
chr21	27298891	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015718;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:4,5:1,2
chr21	27347967	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,4:15,2:15,2
chr21	27354565	.	T	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0037211;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:26,4:19,5
chr21	27416163	.	TG	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:7,4:4,1
chr21	27814389	.	CACACACACACACACACACACATACACACACACACATATAT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.018505;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:9,3:13,3
chr21	28617212	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0040373;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:20,5:27,3
chr21	28877054	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
chr21	31944841	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0030877;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:19,5:20,3
chr21	31947865	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=2.1435e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:39,17:17,3:22,14
chr21	32258875	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0097766;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:19,2:20,6
chr21	33443898	.	T	TG	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.41384;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:34,4:17,2:17,2
chr21	33577660	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,3:5,3
chr21	34886880	.	T	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=2.4883e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:37,16:20,10:17,6
chr21	35224837	.	TAAAAA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00060756;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,13:3,11:7,2
chr21	36401545	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.059432;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,2:10,2
chr21	36679792	.	G	GA	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.03324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,7:26,3:10,4
chr21	37715702	.	G	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=3.2932e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:44,17:21,7:23,10
chr21	38080849	.	G	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.00015222;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:17,5:27,6
chr21	38247073	.	GATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGC	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:15,2:18,2
chr21	38823821	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00014004;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:10,5:23,7
chr21	40856359	.	A	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:22,4:9,1:13,3
chr21	42726623	.	TA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,4:3,2:3,2
chr21	43285797	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11553;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:5,1:18,4
chr21	43285798	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.23453;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:5,1:20,3
chr21	45798200	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.064069;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:24,2:12,2
chr21	46011608	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.034481;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,2:8,4
chr21	46135606	.	C	CCCCCTCACAAATGT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.045809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,5:8,5
chr21	46290029	.	T	TCG	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.0010541;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:63,17:37,6:26,11
chr22	10689007	.	G	C	0	PASS	DP=320;GPV=1;SPV=0.0079376;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:133,27:55,10:78,17
chr22	10700391	.	G	C	0	PASS	DP=523;GPV=1;SPV=0.033443;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:298:268,30:126,16:142,14
chr22	10714537	.	G	A	0	PASS	DP=513;GPV=1;SPV=0.036131;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:283:252,31:148,18:104,13
chr22	10733494	.	C	T	0	PASS	DP=981;GPV=1;SPV=0.043216;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:518:460,58:232,33:228,25
chr22	10736687	.	T	C	0	PASS	DP=893;GPV=1;SPV=0.013435;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:485:424,61:222,32:202,29
chr22	10747965	.	T	TAA	0	PASS	DP=527;GPV=1;SPV=0.0026073;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:240,38:123,4:117,34
chr22	10750862	.	C	A	0	PASS	DP=456;GPV=1;SPV=0.039077;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:265:238,27:134,14:104,13
chr22	10751852	.	G	T	0	PASS	DP=304;GPV=1;SPV=0.035037;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:144,27:57,20:87,7
chr22	10769175	.	C	T	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.023598;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:110,26:42,11:68,15
chr22	10770017	.	C	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.023772;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:15,2:38,9
chr22	10859372	.	G	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
chr22	11037850	.	CATGGTCTATCCACCAGAAGCTCCACT	C	0	PASS	DP=409;GPV=1;SPV=0.016737;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:192,25:116,11:76,14
chr22	11045266	.	A	G	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.049948;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:105,12:62,3:43,9
chr22	11450271	.	C	G	0	PASS	DP=403;GPV=1;SPV=0.048218;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:189,28:69,18:120,10
chr22	11461986	.	C	T	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.04756;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:132,26:86,14:46,12
chr22	11581793	.	T	A	0	PASS	DP=242;GPV=1;SPV=0.0010021;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:108,33:54,17:54,16
chr22	11681871	.	AT	A	0	PASS	DP=318;GPV=1;SPV=0.035282;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:129,24:61,8:68,16
chr22	11723034	.	C	T	0	PASS	DP=327;GPV=1;SPV=0.045514;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:199:170,29:63,9:107,20
chr22	11786618	.	A	G	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.043844;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:58,9:24,3:34,6
chr22	11792346	.	CTA	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00031414;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:15,9:5,4
chr22	11794198	.	G	A	0	PASS	DP=362;GPV=1;SPV=0.0037187;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:176,21:79,10:97,11
chr22	11863677	.	C	T	0	PASS	DP=398;GPV=1;SPV=0.0072569;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:213:187,26:103,15:84,11
chr22	11879766	.	T	A	0	PASS	DP=976;GPV=1;SPV=0.036518;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:541:469,72:283,42:186,30
chr22	11903218	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,4:5,3:2,1
chr22	11909680	.	A	T	0	PASS	DP=352;GPV=1;SPV=0.0010556;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:164,36:101,15:63,21
chr22	11929057	.	C	T	0	PASS	DP=969;GPV=1;SPV=0.022939;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:522:467,55:249,31:218,24
chr22	11930912	.	A	C	0	PASS	DP=951;GPV=1;SPV=0.044041;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:513:454,59:233,29:221,30
chr22	11932496	.	T	C	0	PASS	DP=676;GPV=1;SPV=0.044802;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:360:319,41:130,17:189,24
chr22	11932569	.	G	A	0	PASS	DP=625;GPV=1;SPV=0.031177;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:317:277,40:124,23:153,17
chr22	11936610	.	G	A	0	PASS	DP=405;GPV=1;SPV=0.027745;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:229:199,30:77,7:122,23
chr22	11937738	.	C	T	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.0085398;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:94,26:37,4:57,22
chr22	11942202	.	C	T	0	PASS	DP=445;GPV=1;SPV=0.039894;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:239:210,29:82,20:128,9
chr22	11946259	.	T	C	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.0058279;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:66,10:33,4:33,6
chr22	11946261	.	C	T	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.0040059;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:69,11:31,5:38,6
chr22	11976519	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.019883;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:28,9:21,1
chr22	11976540	.	C	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.008073;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:51,13:33,11:18,2
chr22	12033461	.	A	C	0	PASS	DP=614;GPV=1;SPV=0.029847;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:334:300,34:150,21:150,13
chr22	12050597	.	A	T	0	PASS	DP=544;GPV=1;SPV=0.016893;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:322:285,37:127,19:158,18
chr22	12055207	.	T	G	0	PASS	DP=357;GPV=1;SPV=0.036506;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:165,26:80,15:85,11
chr22	12061675	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
chr22	12088780	.	CTT	C	0	PASS	DP=319;GPV=1;SPV=0.022509;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:153,18:83,10:70,8
chr22	12142166	.	A	T	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.025642;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:91,13:37,6:54,7
chr22	12152516	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.045548;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:49,12:28,7:21,5
chr22	12166049	.	G	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.021333;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:32,6:11,4
chr22	12185462	.	G	T	0	PASS	DP=462;GPV=1;SPV=0.038331;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:250:216,34:112,17:104,17
chr22	12195493	.	A	C	0	PASS	DP=335;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:187:168,19:73,15:95,4
chr22	12203053	.	A	C	0	PASS	DP=440;GPV=1;SPV=0.011802;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:259:214,45:139,13:75,32
chr22	12208373	.	T	C	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.02796;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:115,27:40,9:75,18
chr22	12220167	.	T	C	0	PASS	DP=442;GPV=1;SPV=0.047508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:207,26:121,14:86,12
chr22	12308408	.	G	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.04336;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:18,1:29,8
chr22	12309863	.	G	T	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.02033;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:103,13:61,11:42,2
chr22	12318474	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0012208;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:7,6:9,9
chr22	12367917	.	C	T	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.00052148;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:74,27:30,11:44,16
chr22	12414131	.	T	G	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.0080936;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:106,29:44,15:62,14
chr22	12414141	.	T	C	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.0039034;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:108,32:44,15:64,17
chr22	12621815	.	A	G	0	PASS	DP=432;GPV=1;SPV=0.012537;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:217,25:105,18:112,7
chr22	12622715	.	CAT	C	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.01243;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:125,15:58,6:67,9
chr22	12704191	.	A	C	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.018695;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:114,28:48,14:66,14
chr22	12717397	.	T	A	0	PASS	DP=417;GPV=1;SPV=0.029457;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:230:199,30:91,4:108,26
chr22	12721141	.	G	A	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.0064155;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:101,28:36,18:65,10
chr22	12721329	.	C	T	0	PASS	DP=344;GPV=1;SPV=0.020704;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:163,33:104,17:59,16
chr22	12725414	.	T	A	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.030986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:83,20:49,13:34,7
chr22	12783586	.	A	G	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.041242;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:76,15:34,5:42,10
chr22	12807090	.	G	T	0	PASS	DP=311;GPV=1;SPV=0.006667;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:172:149,22:75,10:74,12
chr22	12811984	.	A	C	0	PASS	DP=238;GPV=1;SPV=0.039103;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:117,16:54,10:63,6
chr22	12874391	.	C	T	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.018876;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:116,14:1,1:115,13
chr22	12899067	.	A	AAG	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.0096207;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:80,22:9,2:71,20
chr22	12899086	.	C	T	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.016357;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:79,23:10,2:69,21
chr22	15246055	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.010276;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:18,3:10,5
chr22	15328198	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.044843;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:26,6:20,5
chr22	15362633	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0054483;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:30,4:11,5
chr22	15375380	.	A	G	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.015007;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:32,8:27,1
chr22	15493116	.	TTTTATTTA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01404;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,1:8,5
chr22	15522715	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.037221;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:21,8:13,3
chr22	15541395	.	T	C	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.030268;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:98,19:51,9:47,10
chr22	15561011	.	A	G	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.037527;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:23,2:29,13
chr22	15646529	.	GA	G	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.0033681;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:67,18:43,10:24,8
chr22	15724758	.	C	T	0	PASS	DP=327;GPV=1;SPV=0.047029;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:175:147,28:85,15:62,13
chr22	15781692	.	C	T	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.0032617;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:69,11:38,7:31,4
chr22	15792412	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,1:10,3
chr22	15811856	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.031652;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:14,1:9,8
chr22	15813627	.	A	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.038366;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:72,10:49,8:23,2
chr22	15851023	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
chr22	15890034	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.014047;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:2,3:4,1
chr22	15941887	.	C	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.019626;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:65,18:59,17:6,1
chr22	15941905	.	C	G	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.014796;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:69,19:64,18:5,1
chr22	15948114	.	T	C	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.0090593;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:97,27:52,14:45,13
chr22	16071022	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,2:2,5
chr22	16149178	.	G	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=2.8187e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:43,17:20,8:23,9
chr22	16255232	.	C	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00049344;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:41,21:25,15:16,6
chr22	16358075	.	C	CTGGAATGGAATGGAATGGAA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023399;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,7:11,3
chr22	16451280	.	C	T	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.036095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:148,18:101,14:47,4
chr22	16545715	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.048152;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:21,4:12,1
chr22	16558256	.	G	GGCCAGCCAA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.012849;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,14:14,4:15,10
chr22	16772010	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012694;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,14:5,12:2,2
chr22	17710067	.	T	TAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.03177;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:12,5:7,4
chr22	18172991	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.018829;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:18,7:23,7
chr22	18357235	.	C	A	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.043095;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:79,14:34,8:45,6
chr22	18501462	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,6:9,2
chr22	18551852	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.01699;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:10,2:16,9
chr22	18775887	.	G	A	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.01;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:37,1:21,7
chr22	18856566	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.015096;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:20,1:24,5
chr22	18864091	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.014772;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:13,5:23,4
chr22	20201442	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,3:0,0:2,3
chr22	21023436	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.0078472;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:21,4:23,2
chr22	21123786	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.048804;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,3:15,1
chr22	21129361	.	G	C	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.038397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:108,26:66,14:42,12
chr22	21160939	.	C	CA	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0069435;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,13:22,10:5,3
chr22	21183055	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:23,4:2,0
chr22	21194980	.	T	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.0095288;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:49,9:29,8:20,1
chr22	21199929	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.040092;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:19,2:23,6
chr22	21256321	.	A	G	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.020495;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:32,6:20,5
chr22	21276374	.	G	A	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.0032688;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:79,19:30,7:49,12
chr22	21281758	.	C	CAA	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.038365;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:68,16:41,11:27,5
chr22	21282567	.	G	A	0	PASS	DP=159;GPV=1;SPV=0.037464;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:76,12:37,2:39,10
chr22	22906108	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0089808;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:13,4:20,4
chr22	23916807	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.017646;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:17,3:1,2
chr22	23937746	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,2:7,3
chr22	23937765	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,1:10,3
chr22	23951323	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.047026;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:26,1:9,3
chr22	25085783	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:24,3:1,1
chr22	26294892	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.025639;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:11,3:12,5
chr22	26773211	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.031743;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:23,9:13,2
chr22	27506065	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,6:5,1
chr22	27769552	.	A	ATTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.28173;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:3,3:8,1
chr22	29159129	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:15,2:9,5
chr22	31913686	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,4:4,1
chr22	32213647	.	TATAC	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0342;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,7:6,4:12,3
chr22	32409823	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:17,4:6,2:11,2
chr22	34423171	.	C	CT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.015231;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,9:5,4:10,5
chr22	34440931	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00013624;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:22,10:17,3
chr22	34729243	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00041682;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:16,5:19,6
chr22	35002572	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:12,8:1,2
chr22	36074155	.	ATATATG	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:19,1:13,3
chr22	37152929	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:4,4:6,1
chr22	37325753	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:2,5:3,1
chr22	38550946	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10359;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:18,2:11,2
chr22	39057005	.	G	GTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:4,4:4,2
chr22	39110577	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.019973;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:12,2:19,5
chr22	40075154	.	A	ATT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:11,3:8,1
chr22	40164779	.	GTT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00098508;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:1,9:0,6:1,3
chr22	40586903	.	GTGC	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.018872;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:20,3:16,3
chr22	41039446	.	TA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.031685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:11,4:19,2
chr22	41187130	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,8:4,7:7,1
chr22	41649139	.	A	AAAAAAAATATATATATATATAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.041455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,1:7,3
chr22	41649160	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0054797;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:10,5:12,4
chr22	42982888	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045968;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:5,3:11,3
chr22	43281460	.	C	CTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,4:8,2:6,2
chr22	43281461	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:7,4:6,2
chr22	43344508	.	G	GCA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.029194;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,9:18,8:4,1
chr22	45321847	.	C	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0059888;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,10:29,4:18,6
chr22	45670438	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047956;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,1:4,4
chr22	46628577	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042462;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:20,4:4,2
chr22	47425042	.	A	ATCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.015968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,8:1,3:11,5
chr22	47822489	.	T	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.00016147;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:28,2:18,10
chr22	48414872	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.013151;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:14,6:19,6
chr22	48493497	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=4.2021e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:33,18:22,7:11,11
chr22	48661949	.	T	TG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.115;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:20,4:14,1
chr22	48736261	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0032318;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:8,8:3,3
chr22	48926645	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:0,1:6,4
chr22	48942477	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.038776;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:20,2:24,3
chr22	49071003	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,4:2,1:4,3
chr22	49981606	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,4:18,2:6,2
chr22	50397790	.	T	TCC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027557;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:11,4:1,0
chr3	539552	.	C	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=2.9334e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:26,11:20,3
chr3	594638	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=8.3492e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:35,21:19,9:16,12
chr3	760398	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.047242;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:12,2:13,6
chr3	2798074	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.089726;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:18,2:19,4
chr3	4456773	.	C	CGTGTAT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.026963;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,7:10,3:16,4
chr3	4457038	.	GTATATATATATACGTGTGTGTATATATATATATATACGTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.12945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,3:17,1
chr3	7928613	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.011853;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:15,4:8,10
chr3	7928614	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.015065;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:11,4:9,8
chr3	9556782	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.040958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:17,7:13,5
chr3	12095535	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,3:9,1
chr3	13682097	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0223;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:12,8:19,2
chr3	15446818	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.062192;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,6:9,5:8,1
chr3	17943713	.	C	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=2.4942e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:22,7:18,8
chr3	18853399	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=4.4921e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:19,10:20,6
chr3	21143522	.	T	TATATAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
chr3	22541399	.	C	CATATACACACATATGTGTACAT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.039984;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,10:14,6:12,4
chr3	23328661	.	TC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.055024;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:28,4:12,2
chr3	23921570	.	GT	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00098502;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:12,13:8,2
chr3	23921574	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0022239;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:8,13:14,3
chr3	25849097	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.3678e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:20,11:15,7
chr3	27902453	.	AT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:11,2:6,3
chr3	27916234	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.048274;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,5:16,2
chr3	28865466	.	CCT	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10299;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:14,1:23,4
chr3	30172443	.	TGA	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,4:10,2:18,2
chr3	30509594	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.002901;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:15,2:25,8
chr3	32938730	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.012825;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,10:15,2:7,8
chr3	33113157	.	G	GA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0091169;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:18,4:3,2
chr3	34543707	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00010498;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:18,11:17,3
chr3	34705068	.	A	ATAT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022424;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:9,8:11,1
chr3	34705070	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.014937;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:9,8:10,2
chr3	36398591	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,4:5,1
chr3	37004861	.	A	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00029634;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:18,4:21,7
chr3	38161250	.	ATATATTTCATG	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.029223;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:54,11:26,7:28,4
chr3	38949519	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=5.5261e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:23,5:17,10
chr3	39169713	.	AGAAG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,5:5,4:2,1
chr3	41123103	.	C	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=7.7811e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:20,6:19,7
chr3	42272301	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=2.6976e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:40,18:18,9:22,9
chr3	43016925	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016558;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:18,3:17,4
chr3	43580142	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.036288;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:15,2:5,2
chr3	44405951	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.014318;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,9:10,7:3,2
chr3	46161710	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.090728;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:11,2:10,4
chr3	49790111	.	TTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,6:4,3:12,3
chr3	50016829	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.089909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,4:13,3:16,1
chr3	50946094	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:5,4:4,2
chr3	50975454	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.024549;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:12,10:15,2
chr3	51016122	.	G	GAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
chr3	51760324	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0046387;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:18,4:11,3
chr3	54547672	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0033618;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,10:6,3:1,7
chr3	54918336	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020817;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:11,6:6,1
chr3	55003739	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0037149;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:19,4:23,4
chr3	55368311	.	CCACA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:13,8:3,2
chr3	55651038	.	T	TG	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0041072;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,11:9,2:9,9
chr3	57959637	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.019611;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:23,3:20,3
chr3	58386290	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:3,4:3,2
chr3	59082428	.	TATA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:3,2:6,4
chr3	60058130	.	GT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,1:4,3
chr3	60206152	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.049205;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:17,5:20,2
chr3	60418374	.	GTGTATATA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.014569;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,6:1,5:0,1
chr3	60418426	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.013387;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:1,1:7,6
chr3	60859723	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:9,3:4,1
chr3	60860722	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.020146;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,3:10,6
chr3	62005690	.	CTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,6:5,2
chr3	62750353	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,8:5,7:4,1
chr3	62847576	.	A	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:0,1:4,7
chr3	62855091	.	A	ATTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:6,1:5,3
chr3	64475229	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=3.9759e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:17,9:18,8
chr3	65929402	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0012029;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:25,7:19,4
chr3	66095020	.	T	TC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.25926;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,4:9,2:6,2
chr3	67265479	.	T	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.018065;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:22,1:23,7
chr3	67838857	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=3.0224e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:16,12:14,6
chr3	67911386	.	T	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0044491;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:23,4:23,5
chr3	68076855	.	C	T	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.04767;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:32,1:18,7
chr3	68444771	.	A	AATAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0056039;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,9:7,3:5,6
chr3	68760215	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00061221;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:18,3:17,10
chr3	68760216	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0016391;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:22,3:17,9
chr3	69263817	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:2,2:3,2
chr3	69477359	.	A	AT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0027151;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:9,3:12,12
chr3	69560415	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,2:3,2
chr3	70154530	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00083722;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:12,5:22,6
chr3	72045562	.	CTATAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.035372;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:3,5:5,1
chr3	72857229	.	C	CA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:25,3:11,1
chr3	73600335	.	A	ACTCT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,5:2,1:9,4
chr3	73734013	.	C	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=3.9089e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:42,23:18,16:24,7
chr3	74210363	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.0504e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:32,16:21,6:11,10
chr3	75155073	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0010228;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:22,7:17,4
chr3	75697563	.	TG	T	0	PASS	DP=346;GPV=1;SPV=0.032276;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:150,27:71,15:79,12
chr3	75880014	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=2.017e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:34,15:20,7:14,8
chr3	76273403	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00045564;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:20,5:16,7
chr3	76682685	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=2.8766e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:49,19:18,6:31,13
chr3	76760920	.	C	CT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.01062;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:15,4:15,3
chr3	78673605	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:4,1:4,3
chr3	79023696	.	GTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:13,1:2,4
chr3	79024828	.	C	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=2.6242e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:46,17:24,7:22,10
chr3	84324433	.	G	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00023502;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:18,6:21,5
chr3	85568473	.	C	CTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,4:0,3:5,1
chr3	86405125	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018485;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:7,6:3,5
chr3	86596078	.	G	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.0011685;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:63,19:32,15:31,4
chr3	86843970	.	T	TAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:3,8:8,1
chr3	86859807	.	A	AAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.24893;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,4:11,3:13,1
chr3	86859822	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.13783;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,5:12,4:20,1
chr3	87794982	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,4:3,1
chr3	90798808	.	C	G	0	PASS	DP=281;GPV=1;SPV=0.0046815;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:137,19:4,1:133,18
chr3	90805489	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:1,3:6,1
chr3	90831428	.	A	G	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.045123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:64,11:53,10:11,1
chr3	90851104	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:1,0:20,4
chr3	90886829	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:27,3:1,1
chr3	90903284	.	A	C	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0022767;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:64,8:19,7:45,1
chr3	90903489	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:18,1:11,3
chr3	90905544	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.017926;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:9,4:25,3
chr3	90939262	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0027092;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:11,6:3,2
chr3	90948816	.	T	A	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.049765;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:90,14:39,12:51,2
chr3	90954559	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.13255;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:0,1:31,3
chr3	90984477	.	T	A	0	PASS	DP=363;GPV=1;SPV=0.0024643;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:187,22:117,16:70,6
chr3	90997507	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:0,3:17,1
chr3	91002253	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.15567;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,4:28,1:5,3
chr3	91014694	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.053889;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:1,0:30,4
chr3	91018076	.	G	A	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.0016556;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:141,19:107,17:34,2
chr3	91018090	.	C	A	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.0016843;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:133,19:97,17:36,2
chr3	91018462	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.10571;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:1,0:35,4
chr3	91027672	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0074891;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,1:1,4
chr3	91048782	.	C	T	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.0011912;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:88,22:76,20:12,2
chr3	91069464	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.059099;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,1:0,3
chr3	91090520	.	G	C	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.031628;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:73,11:50,6:23,5
chr3	91090645	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.051203;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:7,3:13,3
chr3	91149523	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:0,3:32,1
chr3	91152348	.	T	G	0	PASS	DP=481;GPV=1;SPV=0.005532;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:244:218,26:55,4:163,22
chr3	91177444	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:30,4:0,0
chr3	91283350	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045135;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:26,4:6,1
chr3	91932493	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
chr3	92156121	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.05384;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:3,2:18,3
chr3	95131785	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,4:6,3:6,1
chr3	96994759	.	A	AGAGAGC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,10:9,5:8,5
chr3	99263623	.	C	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,3:1,1:0,2
chr3	100135438	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.016961;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:11,5:5,4
chr3	100956214	.	AACACACACACAC	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.019569;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,7:12,6:8,1
chr3	101616345	.	CCTTTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,7:7,2
chr3	102517213	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.022089;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,15:16,13:12,2
chr3	103099702	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063158;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:2,1:4,2
chr3	103235162	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026014;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:3,2:12,2
chr3	103490639	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,4:9,1
chr3	103750097	.	C	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.00017007;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:57,18:32,10:25,8
chr3	104465360	.	T	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00082723;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:20,5:26,6
chr3	105266608	.	T	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:21,4:9,2:12,2
chr3	105529504	.	A	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=2.1899e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:38,17:16,7:22,10
chr3	106707337	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10396;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,5:11,2:14,3
chr3	108795945	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0053746;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,10:4,9:6,1
chr3	109321582	.	GT	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.019606;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:13,8:10,4
chr3	109527907	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:19,4:8,2:11,2
chr3	109906974	.	GATAT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,3:3,1
chr3	109930083	.	C	CCCTTCCCTCCTTCCCTCCTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.27439;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,3:7,2:17,1
chr3	110172450	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00070127;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:21,7:16,5
chr3	110648326	.	C	CT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0097737;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,4:10,1
chr3	112012215	.	G	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,13:1,1:9,12
chr3	112562096	.	C	A	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.0003713;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:56,11:28,5:28,6
chr3	115537067	.	TATAG	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:4,2:6,3
chr3	115776408	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0034116;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:32,6:10,2
chr3	116421443	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=9.7046e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:18,6:25,10
chr3	116664364	.	TAAC	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0083333;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:31:0,7:0,5:0,2
chr3	117131025	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0097133;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:44,7:20,4:24,3
chr3	118133343	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.023519;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:25,4:12,3
chr3	119623721	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.047696;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:5,3:10,3
chr3	119845421	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=2.5707e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:20,6:18,8
chr3	120169863	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0049041;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:26,4:20,5
chr3	122430515	.	A	AGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:11,3:6,1
chr3	123724139	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
chr3	124144641	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.013761;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:18,4:15,2
chr3	124853407	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.7206e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:17,6:18,9
chr3	131181745	.	C	CAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0084599;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,8:5,7:8,1
chr3	132355509	.	AT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041513;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,5:5,2
chr3	134701428	.	A	ATG	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.099673;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:19,1:17,3
chr3	134860174	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.064086;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:16,3:22,2
chr3	135738067	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.17024;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,5:11,2:19,3
chr3	136227187	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.017643;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:16,5:14,9
chr3	136447596	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,9:14,5:2,4
chr3	136702123	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.037023;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,8:11,3:13,5
chr3	138397587	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.00048225;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:20,5:20,5
chr3	138890387	.	CTCTCGCTCGCTT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.039259;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:2,2:14,2
chr3	139860290	.	T	G	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=5.7843e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:19,9:24,7
chr3	139955112	.	C	CTATATATATATATA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:4,3:2,1
chr3	140518474	.	G	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=8.0627e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:17,6:20,8
chr3	141636481	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0095308;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:12,6:8,3:4,3
chr3	142920596	.	G	GTGTTTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.019247;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:10,6:9,3
chr3	143920646	.	T	TAC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.01326;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:16,4:9,2
chr3	143920676	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017377;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:13,7:6,2
chr3	143976584	.	G	GAGAGAGAGAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.030474;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,9:9,4:8,5
chr3	144568320	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0094148;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:7,9:4,1
chr3	145631060	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.42424;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:6,2:0,1:6,1
chr3	147818553	.	GA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:14,3:3,1
chr3	147936619	.	G	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=1.9997e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:49,15:17,10:32,5
chr3	149417090	.	G	A	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=4.8957e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:47,14:18,7:29,7
chr3	151525002	.	CTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0098105;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
chr3	152644923	.	T	TATAGAG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:2,6:2,2:0,4
chr3	153206221	.	C	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,4:17,1:11,3
chr3	153350196	.	C	CTCTCTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0034381;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,11:9,4:9,7
chr3	153711346	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0035757;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:18,2:15,8
chr3	154646137	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:6,3:6,1
chr3	155140410	.	CTT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.033476;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:6,2:7,6
chr3	155237763	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0026248;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,10:3,8:2,2
chr3	155928019	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:3,3:1,1
chr3	157963976	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:17,4:6,1:11,3
chr3	159691416	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0071396;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,4:2,3
chr3	160674106	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.045175;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:18,3:21,2
chr3	160771543	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,3:4,1
chr3	160976605	.	G	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=7.3373e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:18,9:16,4
chr3	161369286	.	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.051138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,4:7,1
chr3	161605235	.	T	TTTTATATATATATATATATATA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,4:3,2:3,2
chr3	162603638	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:3,5:6,1
chr3	163040250	.	TATATAG	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.029248;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:17,6:14,3
chr3	163784956	.	GT	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.7096e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:16,17:13,12:3,5
chr3	164011343	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.09921;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:21,1:22,4
chr3	164765099	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,3:7,1
chr3	165488881	.	GT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:6,2:4,2
chr3	165983125	.	C	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0045735;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:50,9:33,3:17,6
chr3	166880502	.	AATATATATT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:9,3:10,1
chr3	168568422	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGGTGT	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=9.1446e-07;SS=2;SSC=60;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:16,20:13,9:3,11
chr3	170285078	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0014958;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,19:8,17:5,2
chr3	171562565	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:5,2:15,3
chr3	171586739	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.035373;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:25,6:15,5
chr3	171710872	.	C	CT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.036439;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,18:18,16:6,2
chr3	172623989	.	A	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=3.4682e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:40,31:23,13:17,18
chr3	173978835	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,4:4,2:8,2
chr3	175174789	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.15567;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:33,4:19,3:14,1
chr3	175656897	.	T	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=2.561e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:40,35:21,17:19,18
chr3	177805499	.	T	TAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0041408;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:8,12:2,9:6,3
chr3	180244709	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,2:10,2
chr3	180592693	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.27607;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,2:6,2
chr3	181702070	.	CCA	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.069705;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:22,2:12,3
chr3	181957214	.	A	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.038206;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:27,6:15,1:12,5
chr3	181976434	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.075059;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,6:11,5:6,1
chr3	182665652	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0026749;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:36,2:17,9
chr3	183167172	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.028809;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,7:4,4:17,3
chr3	183234707	.	T	TTTTTTTA	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.013385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:32,15:20,4:12,11
chr3	183609768	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:16,1:8,3
chr3	184617634	.	GAGA	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.098102;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:21,1:20,5
chr3	185091968	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:5,3:4,1
chr3	185454379	.	GATATATGAGAT	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.029627;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,13:16,2:11,11
chr3	185454601	.	TGA	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00065651;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:14,4:12,9
chr3	185454626	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0082759;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:13,5:14,8
chr3	185455148	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.11141;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,4:19,2:10,2
chr3	185455151	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10033;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,4:19,2:12,2
chr3	185638985	.	CAA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.17119;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,8:13,6:7,2
chr3	186786051	.	T	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.2601e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:33,25:10,14:23,11
chr3	187856602	.	G	GT	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=2.4148e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:42,17:25,14:17,3
chr3	188142523	.	GAAGA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00082127;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,9:8,1
chr3	188524881	.	TTCCTTCCTTCCGTCCG	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0084177;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:2,5:15,5
chr3	188638313	.	AG	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.014646;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:15,5:7,3
chr3	188770347	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.020196;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:7,2:7,3
chr3	189966137	.	AAG	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:26,6:12,1
chr3	191632973	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.0011102;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:27,9:22,1
chr3	191875373	.	CTT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.026352;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,10:9,5:11,5
chr3	193596361	.	CTTAA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.15731;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:25,3:8,1:17,2
chr3	195290848	.	A	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.03708;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:51,17:33,15:18,2
chr3	195482567	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.069135;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:19,2:8,2
chr3	195487256	.	C	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.038826;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:46,15:33,13:13,2
chr3	195487534	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10169;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:17,4:18,1
chr3	195489437	.	T	A	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.011845;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:82,22:34,3:48,19
chr3	195622600	.	C	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.013931;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:42,8:7,2
chr3	195698193	.	C	T	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.02706;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:65,15:33,9:32,6
chr3	195719427	.	CTTT	C	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=0.0099771;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:5,7:1,4:4,3
chr3	195816817	.	T	TGCCCA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,4:8,1:16,3
chr3	195978090	.	C	T	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.0068093;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:135,21:71,11:64,10
chr3	196037653	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,7:9,6:6,1
chr3	196052292	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10722;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,4:10,2
chr3	196346919	.	C	CTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,4:13,3:5,1
chr3	196910335	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:6,3:1,1
chr3	196949037	.	T	TC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,1:4,3
chr3	197459525	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:2,1:4,1
chr3	197624815	.	C	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.010631;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:62,11:29,3:33,8
chr4	15464	.	G	C	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.018837;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:89,21:62,9:27,12
chr4	20957	.	T	C	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.033085;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:100,19:72,14:28,5
chr4	24734	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
chr4	34973	.	A	T	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.032843;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:103,18:52,11:51,7
chr4	450958	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:3,4:2,3:1,1
chr4	1906654	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,3:3,2
chr4	3198215	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.024875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:13,5:2,5
chr4	3788247	.	C	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=3.9178e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:40,25:25,12:15,13
chr4	4082660	.	T	TCACACACACACACACACACACACA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.029276;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:9,4:14,2
chr4	4606615	.	ATTT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,1:9,6
chr4	7115598	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,4:18,3:9,1
chr4	7566015	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021554;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,3:9,2
chr4	8263816	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.051471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:4,3:2,2:2,1
chr4	8630136	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:19,4:1,0
chr4	8652924	.	C	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=5.454e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:54,17:31,9:23,8
chr4	8692329	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.027874;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:24,4:17,1
chr4	9090052	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.025971;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,6:4,1
chr4	9140304	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0062652;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:3,4:4,3
chr4	9981256	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,1:6,7
chr4	11565730	.	AC	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:0,1:5,1
chr4	12428449	.	C	CTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0076326;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,11:7,7:6,4
chr4	14834044	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.018064;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:16,6:19,8
chr4	15664550	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,1:11,4
chr4	16816407	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045366;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:12,9:6,2
chr4	17035717	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00041767;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:26,5:17,7
chr4	17154514	.	G	GTTCTTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0051634;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,15:10,11:8,4
chr4	17392769	.	GA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17641;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:20,3:7,1
chr4	17696172	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0005289;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:11,5:28,8
chr4	18160746	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022726;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,6:7,2
chr4	18207818	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0011693;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:21,5:23,7
chr4	18277327	.	C	CAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,10:7,8:1,2
chr4	19259011	.	C	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.9322e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:19,11:9,5
chr4	20211807	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.044785;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:18,6:18,2
chr4	20716612	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.9388e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:13,5:11,8
chr4	22084117	.	G	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0010978;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:22,6:24,6
chr4	22815365	.	ATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,5:1,3:2,2
chr4	23603769	.	TTG	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.091638;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:13,2:20,2
chr4	24726335	.	C	CTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0029195;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,11:11,10:2,1
chr4	25444486	.	G	GTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.017473;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,2:2,2
chr4	26316502	.	TATATATTC	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.041596;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:19,3:9,1
chr4	27501814	.	G	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00047924;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:20,6:13,4
chr4	27781760	.	T	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=4.7366e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:18,8:21,7
chr4	27837405	.	G	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00074812;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:19,8:27,4
chr4	28397577	.	G	GT	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.047026;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:22,1:13,3
chr4	28725976	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.022472;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,5:16,1:18,4
chr4	28933105	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,6:7,5:5,1
chr4	29036293	.	T	TAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.030558;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:13,10:8,4
chr4	29055438	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0030877;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:16,5:23,3
chr4	29514900	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00011761;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:18,5:21,9
chr4	31368449	.	C	CCTCTCTCTCT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21504;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,3:3,2:7,1
chr4	32154568	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,9:9,8:2,1
chr4	32793744	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.048633;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,9:14,8:8,1
chr4	32856257	.	CTTT	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.037745;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,5:20,3:17,2
chr4	32862019	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.034373;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,4:13,2:11,2
chr4	35953472	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:7,2:4,1:3,1
chr4	36713372	.	C	CTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.026985;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:12,8:6,1
chr4	37348581	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:1,6:5,2
chr4	37774975	.	G	C	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.011371;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:53,7:30,4:23,3
chr4	37777168	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.079011;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,2:17,2
chr4	39297302	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,3:12,1
chr4	39793488	.	TCCTTTC	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.036334;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:19,2:20,5
chr4	39793511	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0028438;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:20,5:16,7
chr4	40045853	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026993;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,9:10,8:5,1
chr4	40405377	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=7.4138e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:18,6:24,9
chr4	43384910	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:10,3:4,3
chr4	44282396	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0007003;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:25,4:13,7
chr4	46348939	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.011661;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:32,6:10,3
chr4	47195456	.	T	TAGA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:36:0,2:0,1:0,1
chr4	48092553	.	TGGACACATTTTTCCAAAAGTGTGACTTACAAGAGCAATGTGTAAAGGGAGAAAGAGTTAGGGCAGCA	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.064593;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,2:14,2
chr4	49102880	.	A	ATTCCT	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.021398;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,6:24,2:26,4
chr4	49117668	.	ACCATT	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.048559;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,6:27,2:21,4
chr4	49161694	.	C	T	0	PASS	DP=278;GPV=1;SPV=0.018289;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:146:122,24:53,13:69,11
chr4	49173848	.	G	A	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.0098093;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:71,9:41,1:30,8
chr4	49235503	.	T	C	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.049851;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:77,18:43,13:34,5
chr4	49237120	.	G	C	0	PASS	DP=212;GPV=1;SPV=0.024925;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:83,20:33,8:50,12
chr4	49237791	.	CACTTAAA	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.037423;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:48,9:27,2:21,7
chr4	49246131	.	C	A	0	PASS	DP=402;GPV=1;SPV=0.0056713;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:229:201,28:145,19:56,9
chr4	49249561	.	C	T	0	PASS	DP=366;GPV=1;SPV=0.032859;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:168,32:94,23:74,9
chr4	49252795	.	C	T	0	PASS	DP=577;GPV=1;SPV=0.04704;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:292:260,32:152,21:108,11
chr4	49256477	.	T	A	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.0033633;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:178,37:91,25:87,12
chr4	49257937	.	T	A	0	PASS	DP=413;GPV=1;SPV=0.023553;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:192,29:86,15:106,14
chr4	49264667	.	GTGTT	G	0	PASS	DP=614;GPV=1;SPV=0.0099073;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:342:243,46:159,17:84,29
chr4	49266327	.	AT	A	0	PASS	DP=712;GPV=1;SPV=0.0051943;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:406:349,54:165,15:184,39
chr4	49292267	.	G	A	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.0096171;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:124,19:69,6:55,13
chr4	49498308	.	T	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.045686;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:19,1:27,5
chr4	49519369	.	C	T	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.028218;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:94,13:54,8:40,5
chr4	49519466	.	TA	T	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.035166;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:65,17:42,9:23,8
chr4	49554189	.	C	CA	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.0068684;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:118,16:58,7:60,9
chr4	49556231	.	G	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.029547;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:49,11:30,8:19,3
chr4	49558512	.	T	C	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.012898;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:53,20:26,9:27,11
chr4	49579191	.	C	T	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.034495;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:108,22:27,7:81,15
chr4	49591746	.	G	A	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.0043003;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:172:140,32:94,21:46,11
chr4	49591755	.	G	C	0	PASS	DP=317;GPV=1;SPV=0.009297;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:146,36:100,23:46,13
chr4	49610504	.	A	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.014844;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:17,2:32,6
chr4	49636085	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0002515;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,9:11,1
chr4	49647349	.	G	A	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.044924;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:77,9:48,8:29,1
chr4	49788517	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,4:7,1
chr4	49893276	.	C	A	0	PASS	DP=645;GPV=1;SPV=0.011987;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:362:311,51:144,24:167,27
chr4	50045157	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.022376;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:30,3:4,7
chr4	50531544	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr4	50752559	.	T	C	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.045908;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,10:57,3:0,7
chr4	51099347	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
chr4	51567766	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.016282;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:22,4:6,2
chr4	51717602	.	G	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
chr4	52424285	.	G	GAAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.036581;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,11:14,9:8,2
chr4	54622537	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,4:10,2:25,2
chr4	55117039	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0077737;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:21,3:21,4
chr4	55344846	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,7:5,6:4,1
chr4	55542385	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:26:0,6:0,1:0,5
chr4	55761622	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.026414;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,6:19,3:16,3
chr4	56619681	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.01722;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:27,4:23,4
chr4	56651878	.	G	GTGTGTT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.17898;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,5:11,3:25,2
chr4	56901844	.	GT	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0063671;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,12:11,9:7,3
chr4	57103659	.	TC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.022451;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,5:8,1
chr4	57429325	.	T	TC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:5,3:6,1
chr4	58216382	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0057881;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:18,4:25,5
chr4	58877410	.	CTATA	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.05753;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:26,5:20,4
chr4	59158894	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=3.3036e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:22,4:13,10
chr4	60170060	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:7,8:6,1
chr4	60338297	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,1:3,3
chr4	61930175	.	CA	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=5.5762e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,16:23,12:8,4
chr4	62079954	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.042605;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:17,8:4,1
chr4	63417628	.	T	TACAC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,7:9,5:5,2
chr4	63422490	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00095274;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:19,4:16,7
chr4	63509573	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=8.9306e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:18,7:21,6
chr4	63535392	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.038888;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:10,3:12,5
chr4	63535460	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.037131;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:10,5:7,2
chr4	64653798	.	A	AAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAAAG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041838;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,2:12,3
chr4	65334585	.	C	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.00025319;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:50,12:26,5:24,7
chr4	66317249	.	A	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00034554;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:18,8:23,6
chr4	66681806	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=2.344e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:51,20:21,13:30,7
chr4	67342257	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,8:5,7:3,1
chr4	67540341	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0037102;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:21,6:20,2
chr4	68714842	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,4:10,2:10,2
chr4	68977991	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.050238;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:17,3:24,2
chr4	69335373	.	GTA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.062133;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:15,3:13,2
chr4	69472099	.	TACAAAA	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0063865;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:30,17:16,7:14,10
chr4	73349484	.	TA	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.028888;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,4:20,2:14,2
chr4	74561269	.	A	AAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,5:4,3
chr4	75665626	.	AAC	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.023939;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:18,3:15,4
chr4	76167671	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
chr4	76889847	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,7:6,1
chr4	76917675	.	G	A	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.044051;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,9:47,8:10,1
chr4	76918224	.	C	T	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.0047068;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:81,22:57,14:24,8
chr4	80750416	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0017641;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:14,5:18,3
chr4	82248742	.	CGT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.033476;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,8:7,6:6,2
chr4	84242410	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0030266;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:25,5:21,6
chr4	86799825	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:5,1:2,3
chr4	87113590	.	T	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0007893;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:15,5:24,6
chr4	87746818	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.034759;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:12,4:14,6
chr4	88098645	.	G	GAGATAGAT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.018938;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,11:13,6:9,5
chr4	88887530	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,4:3,2
chr4	90865779	.	C	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0019678;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:21,5:17,3
chr4	92149762	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0001398;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:17,6:12,8
chr4	93244513	.	C	CTATTATA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020413;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:10,4:9,3
chr4	93612825	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037023;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:16,7:8,1
chr4	96513383	.	G	A	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=1.6916e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:45,21:32,9:13,12
chr4	100104827	.	A	ATATGTATATATG	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.094058;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,4:18,2:18,2
chr4	100226787	.	GTT	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027005;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:8,9:5,1
chr4	101470541	.	CAT	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.041296;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:18,3:14,1
chr4	101470555	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.045506;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,3:15,1
chr4	102798279	.	A	AATATATATATATAT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.017962;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,11:12,8:10,3
chr4	102926038	.	A	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.042888;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:56,10:38,5:18,5
chr4	103732723	.	C	CCGTATATATGCA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0072137;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,13:19,7:6,6
chr4	104220900	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,4:6,3:12,1
chr4	105284064	.	ACGTG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,5:9,3:11,2
chr4	105914373	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00034907;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:3,6:7,6
chr4	107719187	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0024737;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,16:17,13:6,3
chr4	109753059	.	TATA	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0136;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,6:14,2:16,4
chr4	109753065	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.036679;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:13,2:17,4
chr4	113804741	.	A	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=7.1737e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:13,8:22,10
chr4	115118961	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.016274;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:14,8:23,7
chr4	117192020	.	ATG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,10:9,9:4,1
chr4	118501329	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.017739;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,8:5,1
chr4	118810137	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.016929;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,9:4,2:9,7
chr4	118876667	.	CTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012898;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,11:0,2:14,9
chr4	119418794	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.014047;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
chr4	119479109	.	T	TGATTACCTCTGTAAAATCA	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.023273;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,10:6,5:22,5
chr4	119531060	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00432;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:26,4:17,6
chr4	119576953	.	A	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.15365;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:26,4:13,1:13,3
chr4	119734507	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00037553;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:27,6:12,5
chr4	121405687	.	A	ATAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,2:4,2
chr4	124026110	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.019772;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:11,6:10,3
chr4	125814698	.	G	GGA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0095885;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,16:11,12:12,4
chr4	128662542	.	C	CT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.047358;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,9:16,5:8,4
chr4	128807055	.	C	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=5.3794e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:42,20:21,7:21,13
chr4	129956700	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00010382;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:21,6:18,6
chr4	130350139	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.095042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:0,0:25,4
chr4	131278724	.	C	CT	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.024074;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:22,1:22,4
chr4	132783622	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00029292;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:22,7:16,4
chr4	132999967	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0042441;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:17,7:27,5
chr4	133456730	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0031698;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:9,3:23,6
chr4	135272246	.	GT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0012088;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,16:5,13:8,3
chr4	136925000	.	G	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00040855;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:22,5:20,5
chr4	139092416	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.036354;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:23,4:14,4
chr4	139092417	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.026881;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:24,4:12,3
chr4	139092418	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.006996;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:21,4:13,4
chr4	139989902	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.060769;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:11,3:22,2
chr4	140800462	.	A	ATATT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,4:17,2:5,2
chr4	141580080	.	TTC	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:24,4:9,3:15,1
chr4	143948795	.	C	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.00029442;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:60,14:27,8:33,6
chr4	144292744	.	C	A	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.024171;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:63,7:30,5:33,2
chr4	144562388	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=9.7059e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:41,16:16,6:25,10
chr4	146542376	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,4:5,2
chr4	148324367	.	T	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.052629;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:22,5:14,3:8,2
chr4	148492842	.	AGTATCCTCTATACATAGTATTTTATATATATC	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,2:1,2:0,0
chr4	149102144	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:11,3:6,2
chr4	150380982	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.018436;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,7:2,1
chr4	150647352	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:1,3:0,1
chr4	150780633	.	A	ATATATATACGTGTATATATATACATATATATACACG	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.055746;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,4:8,3:16,1
chr4	150970557	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,6:8,3:6,3
chr4	151008397	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0015215;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:14,4:19,5
chr4	151222669	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.12189;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,2:10,3
chr4	152701645	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00040756;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:23,7:18,7
chr4	153399890	.	ATT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,3:4,2
chr4	153566329	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.6594e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:13,8:18,4
chr4	154176775	.	C	CT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041383;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,3:13,2
chr4	154385557	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=3.8419e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:7,12:21,7
chr4	154433395	.	C	CCTTTTTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:0,0:5,4
chr4	154751761	.	A	AAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:3,2:3,2
chr4	157599693	.	C	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0021288;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:23,4:19,5
chr4	158255594	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:18,3:15,3
chr4	158492068	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0066451;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:19,14:10,6:9,8
chr4	160555509	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00024258;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:25,8:17,6
chr4	161887403	.	CT	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.067189;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,6:15,4:15,2
chr4	162657480	.	ATATAGTATAGAC	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0077271;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,6:7,5:16,1
chr4	164864400	.	A	AGAG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,6:4,1
chr4	164892111	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00013794;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:13,9:26,5
chr4	165235571	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.016048;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:48,6:23,3:25,3
chr4	166473672	.	A	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00048809;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:17,6:24,6
chr4	167327273	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0074763;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,8:8,7:2,1
chr4	169103086	.	ATT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.040008;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,9:8,7:8,2
chr4	172552837	.	T	TAAAAAAAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:1,3:2,1
chr4	176418256	.	C	CT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.001413;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:24,23:10,10:14,13
chr4	176809676	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0012733;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:20,5:15,6
chr4	177205827	.	CA	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.016636;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:10,3:23,5
chr4	177511398	.	AT	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0010149;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:23,7:20,3
chr4	177919881	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.02825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:13,6:7,4
chr4	178098024	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.043916;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:30,2:19,8
chr4	180436765	.	C	CAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036153;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:14,9:13,2
chr4	181411099	.	A	AG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0062613;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:10,5:15,3
chr4	181825425	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,7:4,3:6,4
chr4	181844536	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00013137;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:20,6:22,8
chr4	182049097	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.02185;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:48,9:23,3:25,6
chr4	184308769	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:5,5:3,2
chr4	184607094	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00075514;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:16,2:16,6
chr4	184928147	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034441;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,8:6,6:8,2
chr4	185443342	.	A	ATATATATTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.27198;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:7,1:1,3
chr4	186478194	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
chr4	186970880	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,4:5,5
chr4	186981764	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:12,2:16,2
chr4	187078357	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.047407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:10,9:15,1
chr4	187298453	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0011232;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:15,3:19,8
chr4	187639769	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,3:3,2
chr4	187943519	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0066158;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:17,4:25,5
chr4	188443382	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.084679;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:9,4:10,1
chr4	188698800	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=1.959e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:20,6:17,7
chr4	188974431	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14474;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:8,3:2,2:6,1
chr4	189205947	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,5:11,2:12,3
chr4	189447454	.	A	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0086439;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,6:18,4:15,2
chr4	189447455	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.032947;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,5:18,3:25,2
chr4	189685393	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.019428;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,11:13,9:6,2
chr4	189757141	.	G	GT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.015407;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,13:10,3:15,10
chr4	190050837	.	C	T	0	PASS	DP=293;GPV=1;SPV=0.049845;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:138,21:65,14:73,7
chr4	190116123	.	T	C	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:117,18:58,9:59,9
chr5	100875	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.16035;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:23,3:13,2:10,1
chr5	502907	.	C	T	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.025674;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:79,13:35,11:44,2
chr5	649065	.	TG	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.062133;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:18,3:10,2
chr5	649720	.	CCG	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,2:2,2
chr5	682627	.	C	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.020165;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:32,2:27,5
chr5	700911	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.027715;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:15,3:11,4
chr5	700916	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048244;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:16,3:11,3
chr5	714493	.	AT	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.031765;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:6,3:30,7
chr5	847849	.	T	G	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.041895;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:23,2:35,5
chr5	1238415	.	G	GA	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.035178;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,5:18,1:21,4
chr5	2580850	.	CCTTCCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.010837;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,5:2,1:6,4
chr5	2594305	.	TGCACAGAGATACACACAGACACACAGAGATACACAGGCACAGACAGAC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.071484;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:22,3:13,1
chr5	4040418	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:8,1:9,4
chr5	4506713	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.014858;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:20,2:27,5
chr5	4559105	.	A	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.01722;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:25,5:25,3
chr5	5816146	.	GAT	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,6:2,1:16,5
chr5	6260056	.	A	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00057272;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:17,5:20,5
chr5	6313801	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.011847;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:13,6:7,4
chr5	6995984	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=1.2479e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:37,17:15,10:22,7
chr5	7288807	.	TTCTTCTTC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016301;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:12,3:15,3
chr5	7776193	.	T	TA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0051328;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:16,16:7,14:9,2
chr5	8454942	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.03854;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:18,2:16,8
chr5	9021991	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=4.3022e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:41,16:16,7:25,9
chr5	9674709	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00043374;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:22,7:12,3
chr5	9766290	.	T	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=1.3389e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:21,6:14,11
chr5	9954291	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0032629;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:22,5:12,2
chr5	10285688	.	C	CTCTCTCTT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.03878;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,11:14,6:13,5
chr5	10352719	.	T	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.00039347;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:50,14:20,8:30,6
chr5	10864421	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,3:9,5
chr5	11228353	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036457;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,7:10,5:6,2
chr5	12099554	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0059953;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,8:16,3:12,5
chr5	13029343	.	A	AGGG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.083916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:5,3:0,2
chr5	13149494	.	CAGATAGAT	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.011623;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:18,8:17,9
chr5	15033020	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.083787;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:16,5:6,1
chr5	15265506	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.068062;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:20,1:22,4
chr5	15379417	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00076695;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:13,5:16,5
chr5	16142884	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:7,5:1,1
chr5	16232857	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0021309;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:26,7:14,5
chr5	17217075	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.060567;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:8,1:23,3
chr5	17343355	.	A	AAATAATAAT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0042467;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,13:8,8:8,5
chr5	17595177	.	G	A	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.040357;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:65,11:65,7:0,4
chr5	18369049	.	A	ATGG	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.024981;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,4:13,1:5,3
chr5	18780674	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,8:1,4:5,4
chr5	19382635	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.020403;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,10:13,4:8,6
chr5	20095323	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,2:4,1:1,1
chr5	21970839	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0082418;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:2,4:0,0
chr5	22466525	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.022062;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:15,3:17,2
chr5	25382046	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.011784;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:13,7:17,4
chr5	26121258	.	A	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0016467;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:24,3:22,8
chr5	26803072	.	A	G	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.00058548;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:54,13:30,8:24,5
chr5	27949409	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:3,3:5,1
chr5	29877631	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.06407;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,4:11,1
chr5	29947445	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.000239;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:18,7:19,7
chr5	30771958	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=5.3599e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:43,19:29,12:14,7
chr5	33178032	.	CCA	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00021757;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:8,3:10,16
chr5	33881564	.	C	CT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.023403;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:21,2:10,3
chr5	33911832	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00064041;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:18,8:23,4
chr5	34665043	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
chr5	35880888	.	A	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.00011099;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:52,17:34,9:18,8
chr5	39028201	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:7,3:20,1
chr5	39371299	.	G	A	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=1.7232e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:47,15:29,7:18,8
chr5	40294210	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=2.9026e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:38,15:21,9:17,6
chr5	40546086	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0065197;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:11,2:16,11
chr5	41426844	.	A	AT	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=1.7371e-06;SS=2;SSC=57;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,16:19,10:17,6
chr5	42917957	.	C	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00047993;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:20,4:23,7
chr5	43645657	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,1:6,8
chr5	44748860	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.035343;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,5:6,1:10,4
chr5	45807187	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:11,3:2,2
chr5	46663683	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.017166;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:7,2:12,5
chr5	46665462	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:1,1:34,12
chr5	46665464	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0093922;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:1,1:31,13
chr5	46756249	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.013393;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,4:2,4
chr5	46783409	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.011463;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:54,11:16,2:38,9
chr5	47112438	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.062847;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:7,3:22,3
chr5	47112440	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.071601;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:8,3:23,3
chr5	47116274	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.28678;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:4,2:29,2
chr5	47116995	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.10478;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:29,4:7,2
chr5	47297581	.	G	A	0	PASS	DP=260;GPV=1;SPV=0.039095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:127,20:78,9:49,11
chr5	50141951	.	C	A	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.025998;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:87,16:21,8:66,8
chr5	50145036	.	T	G	0	PASS	DP=460;GPV=1;SPV=0.020017;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:248:221,27:69,8:152,19
chr5	50628618	.	T	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0033793;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:31,5:14,4
chr5	50655431	.	C	CTT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.021615;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,7:3,1:11,6
chr5	51500712	.	C	CCTCT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:6,4:4,1
chr5	51567438	.	G	GTA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.044074;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,8:11,4:7,4
chr5	51609127	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020314;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:12,7:6,1
chr5	51879386	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:11,3:7,1
chr5	52103502	.	G	GATTTT	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00077065;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:12,8:16,11
chr5	54798863	.	A	AAGAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,5:2,3:4,2
chr5	58817454	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0095669;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:19,5:21,3
chr5	60668159	.	T	TTTTA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0098611;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,10:5,5:7,5
chr5	60874986	.	G	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=1.3278e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:44,18:28,10:16,8
chr5	61638540	.	T	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.2598e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:36,17:15,10:21,7
chr5	62238968	.	A	AT	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.028602;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:24,7:19,1
chr5	62238999	.	T	TG	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.039663;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:28,7:20,1
chr5	64463583	.	G	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.019795;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:20,5:23,7
chr5	65007626	.	CTTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0045748;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,12:6,7:2,5
chr5	66389037	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0040054;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:40,9:20,4:20,5
chr5	66522574	.	T	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0047446;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,8:15,6:31,2
chr5	67398893	.	A	ATTATTTATTTATTTATTTAT	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.031786;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,8:8,4:20,4
chr5	67508890	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:7,3:5,1
chr5	68217627	.	G	GGTGTGTGT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.028582;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:20,14:13,3
chr5	73682418	.	C	CT	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.011394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:20,13:15,5
chr5	76829263	.	CTT	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.20253;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:22,4:14,2:8,2
chr5	77443876	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,4:4,3
chr5	79567406	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.062905;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,9:11,1
chr5	80066094	.	CA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.048297;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,5:7,2
chr5	80338707	.	T	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0090267;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:18,7:30,1
chr5	80600615	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.030957;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:8,2:9,3
chr5	80612791	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,5:11,4:3,1
chr5	80617029	.	CTATATATATA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,4:17,2:5,2
chr5	80762778	.	T	TTTTTA	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.029694;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,11:16,7:21,4
chr5	82050839	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.038556;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,4:5,2
chr5	82472884	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.042665;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:37,9:3,1
chr5	82505422	.	C	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.027702;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:26,2:28,4
chr5	84238665	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0074891;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:1,4:4,1
chr5	84359577	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=8.5136e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:23,7:18,5
chr5	85392531	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.010345;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:25,4:16,4
chr5	85392541	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.015734;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:24,3:19,4
chr5	85392546	.	CA	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.043084;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:25,3:20,2
chr5	85420733	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.031527;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:17,4:23,4
chr5	85420734	.	TTA	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.022898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:17,4:25,4
chr5	86218528	.	A	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=3.9621e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:20,11:17,3
chr5	89121849	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.031077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,3:10,2
chr5	89480700	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=5.7039e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:13,8:11,4
chr5	91035846	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,2:3,2
chr5	91150009	.	CTTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015726;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
chr5	93142335	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.7484e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:37,19:22,10:15,9
chr5	93341444	.	C	CTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0092864;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,7:8,6:5,1
chr5	93351645	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00053646;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:25,8:19,3
chr5	96680383	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,2:1,1:6,1
chr5	97634997	.	G	GT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.015665;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,8:15,7:10,1
chr5	98071411	.	A	AAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.15021;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:6,3:2,2
chr5	98851539	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:15,4:1,0
chr5	99954797	.	C	CA	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00080682;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,11:14,6:23,5
chr5	101381937	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,4:13,3:15,1
chr5	102050841	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,1:5,5
chr5	102414907	.	GTAAA	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.029668;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:14,9:20,5
chr5	107827145	.	GA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:14,3:3,1
chr5	108558362	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:6,2:2,1:4,1
chr5	109780510	.	CTG	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0024346;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:31,20:18,14:13,6
chr5	109932957	.	T	TTG	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.049775;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,11:14,6:14,5
chr5	111098300	.	C	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00075282;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:18,9:26,2
chr5	111964873	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.026042;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,1:5,3
chr5	112035948	.	ATGTTTAGTTCTCACTTATAAGTGAGAGCATACAGTATTTGGTTTTC	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.018989;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:12,9:9,4
chr5	112377215	.	G	GA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0082887;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:15,9:9,1
chr5	113418689	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.024912;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:18,4:16,2
chr5	113424132	.	T	TACACACACACAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0037215;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:7,2:2,4
chr5	113942875	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:4,4:4,1
chr5	114385521	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.065336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:16,4:21,1
chr5	115547937	.	G	GTGTGTGTGTGTGTATA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.25926;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,2:4,2
chr5	118300419	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.00035702;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:54,18:31,9:23,9
chr5	119089293	.	T	TA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,1:2,4
chr5	119259999	.	TAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.025988;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:6,4:7,3
chr5	119503076	.	T	TTG	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.030283;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:21,4:6,8
chr5	120048971	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027654;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:6,5:11,2
chr5	121758050	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00033668;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:21,7:21,8
chr5	121946774	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:52:1,3:1,2:0,1
chr5	122768581	.	GAAGAAGAAGAAA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.040341;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:20,4:6,2
chr5	125385480	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0046299;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,11:3,4:4,7
chr5	126209194	.	C	CGACACTTATGACCTCACTTAATCTTAACTACT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.044908;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:10,4:22,2
chr5	126301689	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.020196;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:10,3:4,2
chr5	127674413	.	T	TC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0023514;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,10:12,5:8,5
chr5	128479998	.	A	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.14706;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,3:5,1:2,2
chr5	128818607	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02607;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,2:2,2
chr5	128818611	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01707;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:10,2:3,3
chr5	128862735	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00054719;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:38,13:19,7:19,6
chr5	133040733	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:17,4:3,6
chr5	133132133	.	A	AT	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.038534;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:16,2:21,6
chr5	133132135	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.04432;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:15,1:15,6
chr5	133625816	.	TC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11664;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:14,3:11,2
chr5	133625871	.	CCATAT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,2:4,2
chr5	133625903	.	CCAT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037203;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
chr5	134581621	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.012341;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:14,4:29,3
chr5	135465724	.	C	CA	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=2.2194e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:22,6:23,9
chr5	135886603	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,4:3,1:0,3
chr5	135886606	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,2:1,1:0,1
chr5	137160497	.	C	CTA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.020124;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:0,2:7,5
chr5	137916478	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.043214;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:20,5:14,4
chr5	138719109	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0072028;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:17,10:1,1
chr5	138947465	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0001115;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:21,9:24,6
chr5	139003676	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.4049e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:12,7:18,5
chr5	140286600	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,3:1,2:0,1
chr5	140467115	.	TTG	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.018474;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:27,4:25,3
chr5	142188590	.	A	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.024367;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:23,5:11,2
chr5	142683857	.	AATCCTTT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:11,4:3,4
chr5	144465779	.	C	CTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.028042;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,5:5,2
chr5	145502843	.	G	GT	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0034956;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:12,5:22,4
chr5	147260167	.	C	CTG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:2,1:3,1
chr5	147651165	.	T	TTTATCATTACTATAAGAAAA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.014541;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:14,7:11,5
chr5	148212537	.	T	TATATA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,2:8,3
chr5	151474176	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.071753;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,2:10,2
chr5	151474178	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.024248;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:9,2:8,3
chr5	152278458	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:3,2:4,2
chr5	153189298	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00097618;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:27,8:15,3
chr5	153217085	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0032114;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,4:8,4
chr5	153428652	.	AG	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.046412;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:21,8:12,2
chr5	154464170	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0014109;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:56,15:21,4:35,11
chr5	155032165	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:13,2:14,2
chr5	155033235	.	TA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13283;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:23,3:5,1
chr5	156660289	.	C	T	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.010351;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:51,17:31,10:20,7
chr5	157890366	.	AT	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.028779;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:35,6:17,2:18,4
chr5	158567730	.	C	CTTTCTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.097821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,7:6,4:13,3
chr5	160354597	.	AG	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:9,10:4,2:5,8
chr5	161809637	.	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.020223;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,11:3,2:13,9
chr5	162681843	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:5,3:3,2:2,1
chr5	162685313	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00035338;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:1,13:0,9:1,4
chr5	162688688	.	G	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0040464;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:22,4:21,4
chr5	162688689	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0040417;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:23,4:22,4
chr5	163626366	.	ACT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0072753;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:8,7:7,6
chr5	165884152	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0071318;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:22,3:15,4
chr5	167181504	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:7,3:17,1
chr5	168502386	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.052808;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:23,1:14,4
chr5	168539872	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.015377;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,11:14,6:12,5
chr5	168908214	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=7.9266e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:19,9:14,3
chr5	170264978	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.016233;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,6:3,3
chr5	170503711	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.016386;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:16,4:7,2
chr5	170731693	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.068336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:16,3:5,2
chr5	172052164	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0030721;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:18,6:27,3
chr5	172725544	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0039154;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:16,3:19,4
chr5	172857589	.	C	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,2:0,1:1,1
chr5	173289783	.	CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:0,0:11,4
chr5	173516978	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,4:10,2
chr5	174061909	.	CT	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.044481;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:17,7:5,3
chr5	175918325	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.039973;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:8,5:13,3
chr5	178018091	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.011798;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:27,2:21,5
chr5	178027845	.	T	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.006972;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:22,8:22,1
chr5	178027971	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.021516;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:30,1:29,8
chr5	179013776	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,1:9,3
chr5	179397489	.	GTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
chr5	179429980	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.027835;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:16,9:12,4
chr5	179594547	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0021594;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,14:1,2:7,12
chr5	180300049	.	G	A	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.018747;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:78,10:44,1:34,9
chr5	180530909	.	C	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.032217;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:58,12:24,2:34,10
chr5	181032233	.	AG	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,2:3,1:2,1
chr5	181032238	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:3,2:1,1:2,1
chr6	1111770	.	C	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.727e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:16,7:13,7
chr6	1512694	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0068176;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,4:8,6
chr6	2828420	.	G	GA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:5,3:1,3
chr6	2940604	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.02519;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:13,7:19,2
chr6	4867772	.	G	GT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.043808;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,5:14,4:21,1
chr6	5292829	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.022916;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:33,5:19,2
chr6	6332752	.	TA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,8:3,4:4,4
chr6	6817878	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:9,3:7,1
chr6	7117388	.	GTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0097821;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:5,5:4,2
chr6	7449715	.	A	ATT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.027568;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:13,3:8,3
chr6	7659339	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,10:5,6:3,4
chr6	7957018	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0066622;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,6:11,4:4,2
chr6	8041312	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.028628;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,7:11,4
chr6	8901169	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,11:5,8:1,3
chr6	9204743	.	T	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0014733;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:51,11:23,4:28,7
chr6	9494455	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10909;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,2:2,1:0,1
chr6	12337054	.	C	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00065809;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:48,14:33,9:15,5
chr6	13732406	.	C	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0071789;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:18,5:22,2
chr6	14448843	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.041422;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,6:11,3:17,3
chr6	14684389	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0011599;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:17,7:17,3
chr6	15277795	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.15091;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:21,5:6,1:15,4
chr6	16443208	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:8,4:0,1
chr6	18570841	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.048187;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:17,3:22,2
chr6	19941221	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.040102;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:19,2:10,4
chr6	20021488	.	A	AAAATAAAT	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.02282;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:17,7:19,8
chr6	20273024	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04287;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:11,5:4,4
chr6	20371541	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.017517;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:13,8:6,4
chr6	21156424	.	C	CAAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0020034;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:8,9:5,3
chr6	21965351	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,0:13,4
chr6	22162978	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.038803;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:15,3:6,7
chr6	22162980	.	AGT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011696;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:16,4:8,7
chr6	22163000	.	ATAGATAGT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.002513;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:13,4:11,6
chr6	23731309	.	ATT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:2,4:1,3:1,1
chr6	26137737	.	CATATATATATATATATATATAT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:7,4:0,3
chr6	26315902	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,4:10,2:6,2
chr6	26382666	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.011098;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,6:12,4:15,2
chr6	26522893	.	A	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0027576;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:24,4:23,4
chr6	26605221	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0048714;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:16,2:10,8
chr6	27100546	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,1:11,3
chr6	27217046	.	A	AAAAACAAAACAAAAC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.049992;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,6:14,4:15,2
chr6	27217081	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0026559;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,18:10,8:4,10
chr6	27235620	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,4:2,1:5,3
chr6	27748895	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00037553;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:21,5:18,6
chr6	29238947	.	TTATA	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:26,4:11,3:15,1
chr6	29932035	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01269;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:9,3:6,2
chr6	30467010	.	ATTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016525;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,1:12,5
chr6	31487417	.	CA	C	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.0038365;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:64,11:41,3:23,8
chr6	31487481	.	G	T	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.028495;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:69,19:45,6:24,13
chr6	32979047	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,4:8,2:10,2
chr6	32993949	.	TTTTTTTTTTTTTGG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,8:6,7:4,1
chr6	33361461	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00079781;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:22,6:16,5
chr6	34212002	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,10:3,8:5,2
chr6	34258748	.	A	ATATTTTTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:2,3:5,2
chr6	35543076	.	T	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.00017103;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:31,10:17,3
chr6	35652253	.	A	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.040434;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:51,7:33,6:18,1
chr6	35791058	.	AG	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.030144;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:62,19:19,9:43,10
chr6	36153472	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00026004;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:24,4:14,7
chr6	37262032	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,4:5,2:3,2
chr6	38228351	.	C	CCA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,4:5,1:3,3
chr6	38772971	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.021064;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:5,9:7,2
chr6	39058671	.	C	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.012167;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:48,15:25,6:23,9
chr6	41802025	.	G	GT	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0081641;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,6:19,2:15,4
chr6	41985304	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:7,8:1,1
chr6	42138850	.	A	AACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,9:4,5:6,4
chr6	42494445	.	T	TC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:6,3:4,3
chr6	43570311	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:9,4:0,2
chr6	44271370	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.084652;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:24,2:11,2
chr6	45100541	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031247;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:9,7:13,5
chr6	45399773	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.12269;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:13,3:9,2
chr6	45891633	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.020186;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:11,8:9,2
chr6	46877227	.	C	CTTTCTTTCTTTCTTTCT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.033698;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,7:8,2:17,5
chr6	48304249	.	T	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00047744;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:14,7:23,4
chr6	53157950	.	AAAG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.034034;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,3:14,2
chr6	54675034	.	A	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.018053;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:49,7:28,4:21,3
chr6	55962557	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048018;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:12,2:21,4
chr6	57539658	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,4:8,3:15,1
chr6	57913549	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=5.9634e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:40,21:21,10:19,11
chr6	58755015	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr6	59422846	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031141;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:6,5:10,2
chr6	63148838	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.040965;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:19,4:6,1
chr6	63458066	.	TTA	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.079949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,2:18,2
chr6	67659586	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.024816;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:24,3:16,3
chr6	68904069	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,3:0,1
chr6	69533355	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.027692;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:21,3:22,3
chr6	69921531	.	C	CAT	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0048013;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:20,8:18,6
chr6	72074925	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0018753;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:20,10:24,4
chr6	74438585	.	AT	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.046916;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,2:11,2
chr6	75137886	.	A	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00022955;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:24,10:20,4
chr6	75456565	.	C	CT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00056917;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:19,6:4,3
chr6	75536160	.	A	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,4:0,1:0,3
chr6	76272024	.	CTT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0056817;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:1,3:18,4
chr6	77270294	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0009357;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:12,5:11,7
chr6	77561686	.	G	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00032937;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:17,3:15,6
chr6	79373616	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=6.6836e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:18,10:18,5
chr6	80318686	.	T	TA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.027805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:10,8:15,5
chr6	80806606	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.057784;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,2:20,2
chr6	81559728	.	C	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0055147;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:18,3:18,4
chr6	81612427	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0054566;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:13,8:15,10
chr6	82422987	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00070597;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:14,6:23,5
chr6	85872303	.	TTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,9:4,2:14,7
chr6	86090284	.	CTT	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.039205;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:12,2:20,2
chr6	86167786	.	A	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.9917e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:16,3:17,11
chr6	86743844	.	TG	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,2:13,2
chr6	89845243	.	ATG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,10:5,9:2,1
chr6	90473373	.	C	CTG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.043685;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:10,6:9,2
chr6	90964127	.	TATATACTAC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:2,2:11,2
chr6	91841142	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.045802;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:7,2:15,4
chr6	93015866	.	TCCTCTGTAAAGAG	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0028658;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:22,5:19,3
chr6	94917868	.	C	CA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.027604;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,2:11,4
chr6	95121561	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0054024;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,3:7,4
chr6	95323596	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0014181;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:28,6:14,5
chr6	95601716	.	ATT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:7,2:6,2
chr6	96136242	.	T	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=4.1533e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:16,6:17,9
chr6	96411350	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00019202;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:14,3:22,9
chr6	96594227	.	TTATATATATATA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.20757;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,11:6,8:8,3
chr6	97091981	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,4:9,2:4,2
chr6	98623447	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00047803;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:17,4:15,9
chr6	100497438	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00069443;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:17,3:16,7
chr6	100659197	.	G	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00035126;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:45,17:25,6:20,11
chr6	102463894	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0083313;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:5,7:6,4
chr6	102757247	.	A	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0025743;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:18,6:25,3
chr6	103465401	.	C	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=7.238e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:16,5:17,8
chr6	103999545	.	C	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=8.6514e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:20,5:10,6
chr6	104020542	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.032802;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:13,5:17,3
chr6	105542764	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.049667;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:7,6:6,1
chr6	110270837	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018907;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,6:12,5:7,1
chr6	111058932	.	C	CTT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0015829;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,12:11,7:8,5
chr6	113582269	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.056492;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:16,2:18,4
chr6	114320954	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.5866e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:9,6:11,6
chr6	114913348	.	T	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:5,4:3,3:2,1
chr6	117069620	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0057488;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:8,7:8,10
chr6	117738740	.	TA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,6:6,1
chr6	118519466	.	GTGTGT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:5,5:1,1
chr6	118760105	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00073099;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:14,11:21,2
chr6	122228508	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0017182;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:49,11:22,8:27,3
chr6	122353620	.	A	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00029045;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:21,5:18,7
chr6	124139079	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,10:4,7:4,3
chr6	124658961	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.020406;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:14,2:17,3
chr6	124687519	.	TAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,6:8,1
chr6	128291921	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0034056;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:19,2:21,5
chr6	129055186	.	TTA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,4:17,1:17,3
chr6	130728750	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.010573;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:13,9:7,1
chr6	131499479	.	G	GT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,4:5,1:1,3
chr6	131559893	.	C	CT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0060843;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,13:13,6:11,7
chr6	133394282	.	GTGTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,7:5,6:1,1
chr6	133644593	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00076721;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:19,6:9,6
chr6	136369356	.	T	C	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.00015018;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:50,12:30,7:20,5
chr6	138853256	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00015449;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:14,7:29,6
chr6	139341552	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0013696;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,9:10,5:24,4
chr6	141441319	.	T	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.032222;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:14,3:16,8
chr6	142818711	.	G	GA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043486;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:15,3:5,2
chr6	142818723	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,3:6,1
chr6	142908854	.	C	CAAA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0010314;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:13,16:10,13:3,3
chr6	145301406	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0012682;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:20,5:17,4
chr6	148326414	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0098884;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:4,5:4,1
chr6	148482688	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.044564;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,9:16,5:11,4
chr6	149915078	.	C	CCTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10911;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:16,2:3,4
chr6	150833044	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,2:5,1:2,1
chr6	153349342	.	CA	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.01339;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:24,3:8,5
chr6	153496288	.	C	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00014589;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:22,10:14,2
chr6	154331405	.	A	AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAG	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.049488;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,6:27,2:8,4
chr6	154687498	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.058895;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,3:12,2
chr6	154812292	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:8,7:4,1
chr6	156003552	.	A	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0017721;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:19,4:22,6
chr6	157279320	.	A	AAG	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.018965;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:19,3:23,4
chr6	157522730	.	CTCCTCCCTCCCTCCCTTTCT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:1,2:8,3
chr6	158761301	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.099229;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,5:18,4:8,1
chr6	159010200	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.040224;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:6,1:21,4
chr6	159133753	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.04992;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,7:9,1:18,6
chr6	160872501	.	C	CTTTTCT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.019162;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,3:8,4
chr6	162021463	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,4:9,3:5,1
chr6	162418613	.	A	AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046347;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,6:14,4:9,2
chr6	162612597	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0073681;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:16,11:5,4
chr6	162658671	.	AAAG	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00483;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:36,21:13,7:23,14
chr6	164370462	.	TA	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00012362;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,11:6,3:12,8
chr6	164513819	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.045025;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
chr6	164848823	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00016948;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:16,4:13,5
chr6	165136817	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.075844;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:25,2:15,3
chr6	166164374	.	C	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=9.7731e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:18,9:18,3
chr6	167376005	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.020267;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:11,8:16,3
chr6	167941643	.	A	AG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,4:2,1
chr6	168001615	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00074754;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,12:7,3:9,9
chr6	168560884	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr6	168589727	.	G	GCC	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.047311;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:28,3:17,6
chr6	168589730	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.036692;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:24,5:15,8
chr6	168911467	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,4:10,2:5,2
chr6	170039884	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,5:15,2:4,3
chr6	170736435	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.21163;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:24,1:6,4
chr7	1190285	.	G	GAGTC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.064462;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,1:11,3
chr7	1408585	.	A	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0012326;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:19,6:14,2
chr7	2452593	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,0:11,4
chr7	2859404	.	C	CAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,10:1,7:7,3
chr7	2895183	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:9,5:3,1
chr7	3280111	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.012883;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:11,4:11,7
chr7	4083708	.	T	TGCTC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:0,1:15,7
chr7	4598967	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033483;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
chr7	6457972	.	CT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,2:10,2
chr7	6745558	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,4:5,3:10,1
chr7	6757889	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.047407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:13,4:15,1
chr7	9045935	.	A	ATT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:10,1:5,3
chr7	9143957	.	A	ATATATAAACATATATATATAAATATATG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047035;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:4,1:5,3
chr7	9203198	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:7,1:5,3
chr7	10723665	.	C	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.012866;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:19,11:10,7:9,4
chr7	11179957	.	TATATATAATGTATATATACATAATATATA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:3,1:20,4
chr7	13148829	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:5,1:14,4
chr7	13587394	.	G	GTT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0012561;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,17:11,8:9,9
chr7	14259379	.	TTCTC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.017938;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:13,4:15,2
chr7	14418390	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021894;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,4:11,7
chr7	15014868	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0088578;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,7:0,5:1,2
chr7	15406281	.	CAT	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.03714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:15,5:27,4
chr7	15735093	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.017694;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,6:9,5:3,1
chr7	16415707	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0029154;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:14,6:16,4
chr7	16990931	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.033577;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,11:16,9:14,2
chr7	17752194	.	G	GT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0013728;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:14,9:18,3
chr7	18706160	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.082337;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:7,4:9,2
chr7	19302139	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.041838;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,5:14,4:9,1
chr7	20661540	.	C	CTT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,6:13,4:13,2
chr7	20668664	.	C	A	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.035422;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:73,14:25,7:48,7
chr7	22114012	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.016586;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:7,3:18,4
chr7	23046402	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0037629;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:15,11:4,3
chr7	23637163	.	AG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
chr7	23690199	.	A	ATATATATAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.04287;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,9:4,4:11,5
chr7	24355915	.	CTA	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10169;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:17,2:18,3
chr7	24430732	.	ATATATATAAATG	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.064403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,3:15,1
chr7	25253506	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0021281;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:21,3:12,4
chr7	26083654	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=1.5421e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:41,22:23,12:18,10
chr7	26962990	.	TAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.051628;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:7,7:11,1
chr7	28057410	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=6.763e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:42,18:21,9:21,9
chr7	28725645	.	T	TTAAA	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.047268;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,12:25,7:12,5
chr7	29123628	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
chr7	29784970	.	A	C	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.00038558;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:59,15:26,9:33,6
chr7	29986717	.	AT	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.034293;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,12:24,4:13,8
chr7	30766197	.	A	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.13974;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:29,4:21,2:8,2
chr7	32374118	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:19,4:1,0
chr7	32954414	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036526;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:4,2:6,2
chr7	33695812	.	T	TTATATATATATATA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:2,5:4,2
chr7	34128086	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=3.0233e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:16,7:23,7
chr7	34953728	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.047669;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:29,8:12,5:17,3
chr7	36517204	.	TTC	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02403;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:3,4:12,4
chr7	37882605	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,5:11,3:4,2
chr7	39015837	.	A	ATT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,3:1,2:1,1
chr7	39015991	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:14,4:5,1
chr7	39015997	.	T	TTATATATATTATATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:14,3:6,1
chr7	43983807	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.03116;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:20,1:13,4
chr7	44032112	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.023029;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:23,3:9,3
chr7	45841359	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=4.0373e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:14,6:16,6
chr7	46010128	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.1599;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,8:7,3:12,5
chr7	46843617	.	TA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,10:3,9:7,1
chr7	48550265	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0040597;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:9,10:15,2
chr7	48913634	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.047959;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,7:16,1:15,6
chr7	48922573	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0031611;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:13,4:13,4
chr7	49014897	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=1.4291e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:41,18:28,9:13,9
chr7	49032613	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00054309;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:21,5:16,6
chr7	52476780	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.067259;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,5:11,3:14,2
chr7	52562752	.	C	CAAA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.045845;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,8:20,7:6,1
chr7	53458023	.	G	C	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.00010387;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:57,21:29,12:28,9
chr7	53700155	.	A	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=6.5776e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:14,9:16,9
chr7	53761057	.	G	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00048809;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:23,6:18,6
chr7	54397052	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.06127;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:17,4:15,2
chr7	54397100	.	T	TA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.026658;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:12,5:18,2
chr7	54397143	.	T	TA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0071548;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:11,6:21,7
chr7	54416638	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.062192;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,6:10,2:7,4
chr7	55323229	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.052719;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,5:14,2:13,3
chr7	56736408	.	A	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.028989;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:17,2:20,5
chr7	56736546	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:17,1:19,8
chr7	56802275	.	T	C	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.021192;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:65,16:38,6:27,10
chr7	56870984	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.043084;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:20,3:25,2
chr7	56972510	.	G	T	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.02467;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:54,16:31,11:23,5
chr7	57389185	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=5.8494e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:21,7:15,7
chr7	59452090	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.13255;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:0,0:31,4
chr7	60996788	.	GAGATGAAA	G	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.0069242;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:91,11:58,9:33,2
chr7	61247396	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=5.4574e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:13,8:14,5
chr7	61381733	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.011433;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:16,7:20,3
chr7	63759651	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.043658;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:0,1:27,3
chr7	64254999	.	C	CAAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0013639;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:8,10:3,9:5,1
chr7	65123873	.	T	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.035299;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:23,1:35,7
chr7	65622845	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.016132;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:24,13:12,9:12,4
chr7	66421225	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.010685;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,12:10,10:6,2
chr7	66562091	.	AG	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.048716;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:15,1:13,4
chr7	66598828	.	T	TCTGCTGCTGCTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0027565;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,13:6,9:4,4
chr7	67180423	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,3:14,1
chr7	67252893	.	C	CAAAT	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.1103e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:26,26:12,17:14,9
chr7	67409850	.	TTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.036036;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:1,0:12,4
chr7	67435937	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00015256;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:3,14:1,11:2,3
chr7	67548523	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0073893;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:22,3:22,5
chr7	67903888	.	T	TA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.036173;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:21,9:10,1
chr7	67989694	.	T	TAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12446;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,5:15,4:13,1
chr7	68600503	.	C	CT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.041607;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,9:10,5:12,4
chr7	70084077	.	C	CA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.4423e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:14,6:13,8
chr7	71290347	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=9.1458e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:50,18:30,11:20,7
chr7	72299689	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0095364;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:6,8:7,1
chr7	72593820	.	TAAA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020128;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
chr7	72756201	.	T	TTTTTATTTTA	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.037443;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:30,14:7,10:23,4
chr7	72876661	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:3,3:4,1
chr7	73211608	.	C	CTT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.035907;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:16,6:6,1
chr7	74016494	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
chr7	74671079	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
chr7	74861501	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,9:4,8:4,1
chr7	74955968	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,1:9,6
chr7	74960683	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.037117;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,10:10,7:11,3
chr7	76046341	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:3,4:4,5
chr7	76088684	.	CA	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.069135;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,4:15,3:12,1
chr7	76262840	.	GA	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.079534;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:28,4:10,1
chr7	76460515	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,3:14,1
chr7	76500368	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.031994;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:10,1:15,8
chr7	76622297	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.016746;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:25,1:21,8
chr7	76641285	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,2:15,2
chr7	76969216	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.010634;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:2,6:12,3
chr7	76970542	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.023497;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:51,9:25,3:26,6
chr7	78070630	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.054119;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:24,1:8,3
chr7	78430240	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.036419;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:6,3:6,2
chr7	79625141	.	T	TATATA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044663;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:13,3:20,2
chr7	79767092	.	G	A	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=4.326e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:49,16:24,9:25,7
chr7	80152558	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026716;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:14,6:3,2
chr7	80964594	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:4,5:2,3:2,2
chr7	81736894	.	G	GGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.018698;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,6:10,4
chr7	82322451	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.019737;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,8:8,7:2,1
chr7	82512544	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=1.8109e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:37,20:18,10:19,10
chr7	84736856	.	A	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.12591;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:27,4:19,1:8,3
chr7	84750620	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=8.6302e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,19:17,6:15,13
chr7	85481067	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0020696;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,6:11,4
chr7	85717463	.	CT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0096405;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,9:11,8:5,1
chr7	87350028	.	T	C	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=2.9752e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:23,6:20,10
chr7	87766872	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.017595;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:21,5:25,2
chr7	88604328	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00034961;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:18,8:12,3
chr7	91922242	.	AAAAAAAC	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0050167;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:7,4:10,7
chr7	93405435	.	T	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:13,4:20,2
chr7	96868173	.	A	ATTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:5,5:6,1
chr7	96898974	.	T	TTTATTATTATTATTATTATTA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0063671;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:7,6:11,6
chr7	97712859	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.9538e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:36,19:20,10:16,9
chr7	98420585	.	G	GTA	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.036437;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:14,5:19,2
chr7	99180901	.	A	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
chr7	100457801	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027751;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:5,3:4,2
chr7	100998245	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
chr7	101140194	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:4,2:12,2
chr7	101140236	.	GAA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,1:0,3
chr7	101146056	.	C	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0017227;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:48,12:28,7:20,5
chr7	101241637	.	C	CTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.027296;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:13,6:3,1
chr7	102547818	.	GAA	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
chr7	102554519	.	G	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.0040935;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:104,22:24,12:80,10
chr7	102570134	.	GA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.034481;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:4,2:10,4
chr7	102572592	.	T	C	0	PASS	DP=588;GPV=1;SPV=0.044139;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:304:264,40:139,20:125,20
chr7	102665519	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:5,1:19,3
chr7	102668693	.	G	A	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.037009;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:84,19:39,10:45,9
chr7	105071580	.	GTGTATATATATATA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:5,3:8,1
chr7	105455567	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
chr7	105727777	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.072836;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,7:7,4:9,3
chr7	107065336	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,3:3,2:3,1
chr7	107158258	.	TAGAA	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.01609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:25,2:18,4
chr7	107158264	.	G	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.011583;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:24,2:17,4
chr7	107909839	.	CT	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.035511;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,9:12,6:6,3
chr7	108549354	.	T	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.0010134;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:20,7:26,3
chr7	108891130	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1371;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:13,5:4,1
chr7	109038790	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,3:4,1
chr7	109751577	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:6,3:1,1
chr7	111537527	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0037321;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:10,8:5,1
chr7	116562964	.	A	AAAG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:20,3:7,1
chr7	116562978	.	GGA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:22,3:6,1
chr7	117529217	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:4,4:16,1
chr7	119646481	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00014726;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:15,4:11,8
chr7	119654833	.	G	GA	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0057229;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:19,7:20,2
chr7	120050531	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.028465;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:9,3:16,2
chr7	120167623	.	G	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=2.0285e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:28,7:18,7
chr7	120265704	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.039155;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:22,3:20,2
chr7	121380733	.	T	TTATATATATATATATATATATA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:17,2:9,2
chr7	121395252	.	G	GATAC	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.031169;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,5:21,3:14,2
chr7	123990564	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0018214;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:16,1:17,6
chr7	124784842	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:5,3:3,1
chr7	124991025	.	G	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.00024999;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:58,16:33,4:25,12
chr7	125143216	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,7:6,5:4,2
chr7	125289405	.	G	GATATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0055944;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:1,8:1,7:0,1
chr7	126763472	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:4,2:3,1:1,1
chr7	127029006	.	A	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00047793;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:23,5:15,6
chr7	127125765	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0015492;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,9:4,6:1,3
chr7	129114664	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=8.8849e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:18,4:14,8
chr7	129659073	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016464;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:17,3:3,3
chr7	129696084	.	A	AAAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.032005;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:8,2:1,3
chr7	129790556	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:10,5:3,1:7,4
chr7	129884416	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036457;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:8,6:8,1
chr7	130257636	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.019231;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,4:0,0:3,4
chr7	131189547	.	C	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.083225;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:25,5:11,2:14,3
chr7	131227477	.	C	CTT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.086167;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,2:21,2
chr7	131227493	.	TTC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.069705;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,5:12,3:22,2
chr7	132217179	.	A	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0002238;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:22,5:19,7
chr7	132615927	.	A	ATCTCTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.25076;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,4:8,1:21,3
chr7	133247882	.	AT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.034541;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:14,7:8,3
chr7	133737909	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.27368;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:2,5:9,2
chr7	135309610	.	C	CTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:5,5:7,3
chr7	135819017	.	T	C	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=4.4906e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:50,18:26,7:24,11
chr7	136191578	.	C	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.047407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:25,10:14,5:11,5
chr7	137792282	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0071224;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:29,6:18,3
chr7	138636470	.	A	AT	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0019055;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:18,5:18,5
chr7	138745963	.	AT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,2:13,2
chr7	139905057	.	T	TTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.025917;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,5:14,1:10,4
chr7	140266059	.	A	ATT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.024063;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:14,7:7,2
chr7	140961346	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047956;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,1:10,4
chr7	141432146	.	CTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,5:5,1
chr7	142378361	.	G	GTT	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.033108;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:17,2:22,3
chr7	142814163	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0053554;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:2,6:5,2
chr7	144318748	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0068026;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:0,3:4,3
chr7	145673910	.	C	CAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.022623;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:11,5:5,1
chr7	146901870	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0068445;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:4,6:14,4
chr7	147033176	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,4:3,1:3,3
chr7	147239929	.	G	C	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.00041262;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:31,10:17,3
chr7	148598765	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,8:4,3:0,5
chr7	149542686	.	C	CA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0042972;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,12:14,11:3,1
chr7	150007999	.	C	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.028806;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:55,9:29,1:26,8
chr7	150797514	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=6.6865e-10;SS=2;SSC=91;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:30,27:17,18:13,9
chr7	152238768	.	T	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.03511;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:47,14:23,7:24,7
chr7	152480647	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.012115;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:21,3:14,5
chr7	152511786	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:13,8:3,2
chr7	152874515	.	G	GC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.16482;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:2,2:25,3
chr7	152938560	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=8.7178e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:20,4:16,9
chr7	153762484	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0056915;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:18,4:22,3
chr7	153845294	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.001855;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:27,5:19,6
chr7	154776250	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.047725;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:41,11:32,4:9,7
chr7	155050527	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.038903;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,12:20,10:11,2
chr7	155111533	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:2,5:7,1
chr7	155539625	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=3.4257e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:21,7:16,8
chr7	156024264	.	C	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.00017676;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:56,16:27,9:29,7
chr7	156389357	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.010436;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:28,2:30,6
chr7	157498375	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037307;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:10,3:15,2
chr7	157982292	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,2:6,4
chr7	158089591	.	A	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.018729;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:27,4:14,5
chr7	158166518	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.039387;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:13,5:6,1
chr7	158320111	.	ACACACACACAGCCTCCCT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,1:0,3
chr8	283011	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.26049;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:18,1:3,2
chr8	403891	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,1:16,3
chr8	1017526	.	C	CTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.056718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,3:7,2
chr8	1104182	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=8.0217e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:20,10:13,6
chr8	1275848	.	T	TAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:7,3:18,1
chr8	1275920	.	AAT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031602;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,1:10,5
chr8	2120675	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:0,2:4,3
chr8	2516725	.	T	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=6.5335e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:33,21:17,8:16,13
chr8	3068584	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00020622;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:26,7:15,6
chr8	3390899	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=6.289e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:40,16:26,8:14,8
chr8	3906261	.	G	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0010064;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:14,7:26,4
chr8	4409642	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,8:2,7:2,1
chr8	5269651	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0049996;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:21,8:24,1
chr8	5624850	.	T	TAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,4:12,3:7,1
chr8	5655618	.	A	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0012714;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:20,3:20,7
chr8	6113421	.	TACTATATACAGTGTATATACACTATAGAC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.32127;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,2:12,2
chr8	6261270	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.014917;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:18,2:23,5
chr8	6768735	.	GAA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.029045;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,7:14,5:8,2
chr8	7207095	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0093016;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:8,10:13,5
chr8	7376048	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,3:11,1
chr8	7376049	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.098182;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:12,2:10,1
chr8	7482193	.	A	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.016522;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:56,18:31,5:25,13
chr8	7583423	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,4:0,0
chr8	7801383	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00038792;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:23,14:5,4
chr8	7818239	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:11,5:1,1
chr8	8057148	.	A	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
chr8	8067091	.	G	A	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.024755;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:92,14:54,4:38,10
chr8	8142268	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
chr8	8183755	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.077596;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:16,4:20,1
chr8	8313737	.	T	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.4277e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:13,9:20,5
chr8	8436016	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
chr8	8447410	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,5:9,1:6,4
chr8	8558379	.	C	A	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=4.326e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:49,16:13,5:36,11
chr8	8879564	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=8.3554e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:25,5:11,10
chr8	9973961	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.040392;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:16,5:12,2
chr8	10048938	.	GT	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00070234;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:23,9:20,3
chr8	11700075	.	T	C	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.00053331;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,11:24,8:24,3
chr8	12001900	.	C	CTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.019231;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,4:0,3:3,1
chr8	12209513	.	C	G	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.040163;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:60,15:28,9:32,6
chr8	12286375	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,3:5,1
chr8	12442343	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.040934;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:14,2:12,7
chr8	12522519	.	CTCT	C	0	PASS	DP=187;GPV=1;SPV=0.028869;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:89,20:35,10:54,10
chr8	12555537	.	C	A	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.049651;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:118,25:41,9:77,16
chr8	12556968	.	G	A	0	PASS	DP=279;GPV=1;SPV=0.036536;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:117,23:67,10:50,13
chr8	12559343	.	G	A	0	PASS	DP=281;GPV=1;SPV=0.010149;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:125,32:59,14:66,18
chr8	12566962	.	C	G	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.040469;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:131,24:64,8:67,16
chr8	12590428	.	G	A	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.044471;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:134,23:58,12:76,11
chr8	12591444	.	G	A	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.011397;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:94,26:40,11:54,15
chr8	12774582	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.042981;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,5:8,2
chr8	14948879	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.019247;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:19,9:14,4:5,5
chr8	15648068	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=7.0149e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:34,17:20,7:14,10
chr8	15782334	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=1.8338e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:51,19:26,9:25,10
chr8	16122843	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.014951;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:11,9:4,4
chr8	16707079	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,2:2,1:4,1
chr8	16947855	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.079663;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:24,4:11,1
chr8	18509669	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.8323e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:11,7:16,7
chr8	21813654	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.046916;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,2:16,2
chr8	22592057	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.12341;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:10,2:21,2
chr8	22860188	.	ATATG	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.020178;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:21,1:16,6
chr8	23374399	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.010763;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:26,4:18,5
chr8	23652544	.	CCTTCCTTCCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.017837;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:7,3:13,6
chr8	25903607	.	G	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.00089077;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:21,6:24,3
chr8	26731248	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.095044;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,5:23,4:4,1
chr8	28881475	.	GA	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.048964;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:28,2:16,4
chr8	30046474	.	TAAAAAAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:7,2:9,2
chr8	30089770	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.032967;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:1,2:0,0:1,2
chr8	30173970	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.016248;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:14,5:16,1
chr8	30692495	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:4,5:4,2
chr8	32389771	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0030396;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:14,2:17,5
chr8	32412421	.	TAC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.34673;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,3:13,1:11,2
chr8	35523578	.	CT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.023028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:24,9:5,3
chr8	38574646	.	T	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.019217;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:37,3:21,4
chr8	39749587	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.036723;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:31,4:20,2
chr8	40067256	.	TTC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.089038;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:5,1:14,2
chr8	40332741	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:14,4:6,1
chr8	40680701	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:15,4:5,3:10,1
chr8	42203992	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.01549;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,9:8,1:11,8
chr8	44933113	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:5,2:1,1
chr8	48746954	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00018197;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:18,9:21,4
chr8	49787630	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00012803;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:22,4:18,11
chr8	51349171	.	GT	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:32,4:16,3:16,1
chr8	54478540	.	C	CTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.010436;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,7:10,3
chr8	55750541	.	C	CTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0033813;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,7:6,1
chr8	56633257	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:5,5:4,1
chr8	61166136	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.027483;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:14,3:24,3
chr8	61262000	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.026618;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:21,3:25,7
chr8	61752495	.	CA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.021168;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:7,4:14,2
chr8	61752509	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,3:15,1
chr8	63017600	.	C	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00028775;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:23,6:19,6
chr8	63166003	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=3.2412e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:38,17:16,4:22,13
chr8	63819075	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00071194;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:15,8:21,3
chr8	64040802	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=7.4953e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:34,20:17,11:17,9
chr8	64549678	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,6:5,2
chr8	65596309	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016761;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,6:5,1:7,5
chr8	66851018	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0080832;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:53,9:22,4:31,5
chr8	67403755	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
chr8	67468972	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00017122;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:19,5:9,5
chr8	67475817	.	CCTTTCT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,6:2,2:12,4
chr8	68095500	.	AATAC	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.012987;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:14,3:17,5
chr8	68095521	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.016986;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:10,4:17,8
chr8	68268006	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:2,2:7,3
chr8	68525956	.	C	CTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:12,3:8,1
chr8	70643527	.	T	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=4.5526e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:17,9:18,5
chr8	72152181	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.014234;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:16,6:14,5
chr8	73090922	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00024465;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:24,6:15,7
chr8	74802578	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0015192;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:15,3:19,8
chr8	75287608	.	AAT	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.093588;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:26,4:10,3:16,1
chr8	75584552	.	C	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00019435;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:17,6:11,4
chr8	75644593	.	A	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=5.4584e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:11,8:23,4
chr8	76731856	.	C	CATTATT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0060061;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:12,8:13,3
chr8	77133292	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:8,4:4,1
chr8	77473407	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:7,2:3,1:4,1
chr8	77486236	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:10,3:13,2
chr8	79683371	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,6:3,1
chr8	80086101	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,6:4,1
chr8	81980963	.	TATATATA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:4,3:7,4
chr8	84151550	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.00027199;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:54,15:36,8:18,7
chr8	85180511	.	CATATATATATATATAT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0044521;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,10:3,7:2,3
chr8	85654505	.	G	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:18,3:5,1
chr8	85657690	.	A	G	0	PASS	DP=733;GPV=1;SPV=0.037764;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:378:331,47:95,18:236,29
chr8	85741876	.	C	G	0	PASS	DP=812;GPV=1;SPV=0.020207;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:452:399,53:195,28:204,25
chr8	86162635	.	T	TTA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:4,4:2,1
chr8	86162674	.	A	ATAATATATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,4:2,1
chr8	86162689	.	T	TTA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:11,3:3,1
chr8	86600776	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.039565;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,9:8,5:15,4
chr8	88749707	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0014381;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:20,3:8,5
chr8	88830408	.	ATATATGTACTATATATGCATGTATGCATC	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.024749;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:17,8:22,5
chr8	88867842	.	ATATATATAGT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,2:4,2
chr8	89753827	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.053564;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:26,3:24,4
chr8	89753830	.	ATATT	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.058382;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:29,3:23,4
chr8	90202884	.	CTTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:11,8:2,1
chr8	92631352	.	A	AGT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.036061;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,12:22,9:10,3
chr8	95553955	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.098694;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:19,4:12,1
chr8	95581559	.	G	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=6.5448e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:18,2:26,10
chr8	95625128	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0020227;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:18,5:25,6
chr8	98105121	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,2:2,1:5,1
chr8	98115388	.	CAAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031197;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:6,6:12,2
chr8	98421016	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0035237;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:25,6:21,4
chr8	98680981	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.008898;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:5,9:5,2
chr8	98858323	.	T	TATAGAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,5:2,1
chr8	101049459	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:0,2:19,3
chr8	101592100	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,5:1,1:2,4
chr8	102371275	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,5:8,4:5,1
chr8	103059898	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:5,3:1,2:4,1
chr8	103684539	.	TTTTTATTTTATTTTATTTTA	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.042981;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,7:6,4:12,3
chr8	104549400	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.010488;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:9,7:8,5
chr8	106161086	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0048593;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:18,5:18,4
chr8	106704393	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:3,3:6,2
chr8	106984409	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=4.5526e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:15,5:20,9
chr8	107033169	.	A	AAAAAAAAAAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.026469;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,7:7,4:7,3
chr8	108097991	.	AGAAGGAAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:13,3:6,1
chr8	108098147	.	AGAAGGAAGGAAGGAAG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,4:20,1:1,3
chr8	108614685	.	A	G	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=4.1184e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:18,5:23,9
chr8	109608824	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00011817;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:21,10:18,3
chr8	110152082	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,2:7,4
chr8	113537715	.	T	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.002391;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:18,4:14,4
chr8	116366082	.	GGGAAGGAAGGAAGGAA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.044074;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,6:8,2
chr8	116752665	.	GAAGAAAGAAAGA	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.039029;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,3:8,2
chr8	117920671	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00018514;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:17,5:14,7
chr8	120078337	.	CAA	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0049412;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,12:17,8:8,4
chr8	120920575	.	TTATA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.080441;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:16,1:7,4
chr8	121112767	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.8286e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:33,18:17,10:16,8
chr8	123702459	.	A	G	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=1.0881e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:15,7:18,6
chr8	125540475	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00083722;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:18,5:16,6
chr8	126196445	.	A	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=1.613e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:40,19:16,13:24,6
chr8	127817460	.	AAT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,3:11,1
chr8	129449402	.	G	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:6,2:0,0
chr8	132409076	.	T	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=9.7521e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:41,18:20,14:21,4
chr8	133578440	.	AAGAAAAAG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
chr8	134113457	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0034446;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:24,6:11,3
chr8	134190431	.	GGTTGT	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.048023;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:50,13:32,11:18,2
chr8	134214861	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.024674;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,5:4,4
chr8	135515365	.	TAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:8,4:7,1
chr8	135645992	.	ATTT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,4:11,2:6,2
chr8	135782500	.	C	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=6.0337e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:17,5:20,7
chr8	137237914	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.053645;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,3:14,1
chr8	137433570	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0011997;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:19,5:22,4
chr8	137569743	.	T	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00084558;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:22,8:19,4
chr8	140033660	.	T	TTTTTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:6,1:15,4
chr8	140902036	.	T	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.18462;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:6,3:3,1:3,2
chr8	141540940	.	C	CACAG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.10033;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,3:18,1
chr8	142760623	.	C	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:4,2:1,1
chr8	142887418	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.038264;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:17,6:7,1
chr8	143908400	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00031571;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:21,3:14,7
chr8	144188449	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:1,0:12,4
chr9	400004	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,3:5,1
chr9	528469	.	CT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,3:1,1
chr9	932654	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.001805;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:18,6:20,5
chr9	1551518	.	C	CT	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=1.467e-06;SS=2;SSC=58;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:17,5:14,10
chr9	4465756	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0096404;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:13,3:25,8
chr9	4857407	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0017262;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:14,5:17,3
chr9	5919543	.	A	AACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:8,4:2,2
chr9	6179458	.	T	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.01818;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:53,7:35,5:18,2
chr9	9034725	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0016349;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:16,4:22,6
chr9	9158600	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0040567;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:26,4:13,4
chr9	11399613	.	A	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0040654;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:19,6:17,2
chr9	12019965	.	G	A	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=5.0519e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:49,15:29,4:20,11
chr9	12038241	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=7.9911e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:19,3:9,10
chr9	12386854	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.25826;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:8,2:2,2
chr9	14768275	.	A	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:42:1,4:0,0:1,4
chr9	15345467	.	C	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.054832;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,5:13,2:12,3
chr9	15363370	.	CAT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.014079;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,7:5,1
chr9	15534643	.	T	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0002546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:21,3:10,9
chr9	16367422	.	A	ATT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:6,2:5,2
chr9	17608147	.	C	CTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:2,4:5,4
chr9	18283607	.	T	TAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,4:3,2
chr9	22361749	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0022864;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:15,3:21,5
chr9	22753409	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00071247;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:16,11:2,1
chr9	22830913	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.10313;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,4:18,3:7,1
chr9	22905412	.	AT	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.9917e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:21,11:12,3
chr9	23159451	.	C	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,2:6,4
chr9	23228610	.	G	GA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.017057;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,16:20,12:10,4
chr9	23289832	.	CAA	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.115;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:24,4:10,1
chr9	23627441	.	GTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0045822;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:5,9:5,3
chr9	24471382	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.6702e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:16,6:18,7
chr9	24609154	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0048907;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:11,9:17,2
chr9	25012710	.	A	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=5.8151e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:18,6:18,9
chr9	25460823	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.035008;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,10:21,9:12,1
chr9	25552600	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00018501;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:18,10:17,5
chr9	26003300	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=7.3924e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:22,7:16,7
chr9	26121984	.	C	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=1.5702e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:41,16:19,9:22,7
chr9	27875868	.	AAC	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0049255;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:13,5:12,4
chr9	27880014	.	G	A	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=7.2274e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:30,8:22,8
chr9	28848160	.	ATATAGT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:12,3:8,2:4,1
chr9	29024836	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=1.9604e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:18,6:15,8
chr9	29085281	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.33771;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:14,3:6,1
chr9	32165011	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00041078;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:17,7:15,4
chr9	32601670	.	T	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0001031;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:18,4:22,9
chr9	34416213	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,9:4,1
chr9	35333964	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.036676;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:17,4:12,2:5,2
chr9	36156385	.	TAA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.044451;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:12,8:4,3
chr9	36792753	.	CCA	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.028317;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:24,5:12,1
chr9	38460772	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.044477;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
chr9	38989371	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.051196;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:18,3:16,3
chr9	39054976	.	C	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.042295;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:60,10:32,7:28,3
chr9	39584585	.	A	AAAAAAAG	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.02264;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:68,8:36,4:32,4
chr9	39796987	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.054403;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:11,1:16,5
chr9	40040894	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.041933;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:16,4:5,2
chr9	40068507	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.039226;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:24,5:13,2
chr9	40200174	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:24,10:20,6
chr9	40516774	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.039259;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,3:9,1
chr9	40731686	.	A	AT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.025396;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,6:15,1:23,5
chr9	40804756	.	C	CCTTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.015839;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,11:8,3:14,8
chr9	40851579	.	A	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.012703;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:47,6:18,3:29,3
chr9	40960658	.	A	T	0	PASS	DP=240;GPV=1;SPV=0.037876;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:115,25:58,18:57,7
chr9	40973717	.	G	A	0	PASS	DP=316;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:155,18:76,13:79,5
chr9	40979805	.	TAA	T	0	PASS	DP=386;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:202,25:114,13:88,12
chr9	40995624	.	G	C	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0046679;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:76,9:57,8:19,1
chr9	41075176	.	TGTGTAC	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.029296;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,13:13,3:24,10
chr9	41112893	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.036359;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:10,8:15,1
chr9	41203255	.	G	A	0	PASS	DP=168;GPV=1;SPV=0.042316;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:70,9:29,3:41,6
chr9	41204487	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,3:8,2
chr9	41221222	.	G	A	0	PASS	DP=393;GPV=1;SPV=0.010139;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:203:172,31:104,19:68,12
chr9	41253107	.	G	C	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.0010047;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:99,16:47,7:52,9
chr9	41275062	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0041548;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:7,7:24,7
chr9	41275865	.	C	T	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.008596;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:144,22:59,6:85,16
chr9	41326243	.	A	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.018267;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:17,3:13,11
chr9	41338692	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0096193;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:20,10:12,3
chr9	41460901	.	G	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.041853;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:15,1:25,6
chr9	41460991	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0016204;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:4,2:20,10
chr9	41482510	.	T	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.033965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:53,9:20,3:33,6
chr9	41501442	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.026137;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:11,6:16,4
chr9	41717094	.	A	AT	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.022536;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:58,13:37,5:21,8
chr9	41920840	.	G	A	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.0053225;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:97,28:60,18:37,10
chr9	41932622	.	C	T	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.0060414;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:79,25:41,9:38,16
chr9	42187574	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.026125;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:18,2:9,6
chr9	42189883	.	T	C	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.021814;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:59,17:33,9:26,8
chr9	43005960	.	A	T	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.02464;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:76,16:50,5:26,11
chr9	43034421	.	G	A	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.04063;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:72,8:33,2:39,6
chr9	43040612	.	T	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.017696;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:29,11:15,3
chr9	43319585	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0013404;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:27,5:17,7
chr9	43435546	.	T	G	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.03335;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:70,13:62,11:8,2
chr9	43497226	.	T	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.019473;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:63,8:42,3:21,5
chr9	43555952	.	C	T	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.046991;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:122,23:93,19:29,4
chr9	43657784	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,1:6,4
chr9	43737971	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr9	44129620	.	G	A	0	PASS	DP=387;GPV=1;SPV=0.028788;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:191,26:132,23:59,3
chr9	44310318	.	A	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
chr9	44414745	.	T	C	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.019624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:90,14:23,3:67,11
chr9	44843023	.	A	G	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.016542;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:62,19:56,2:6,17
chr9	44895497	.	G	C	0	PASS	DP=467;GPV=1;SPV=0.010463;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:255:219,36:140,29:79,7
chr9	44934534	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,2:11,2
chr9	45123799	.	G	C	0	PASS	DP=455;GPV=1;SPV=0.006184;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:239:215,24:123,12:92,12
chr9	45374360	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.064347;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:29,4:1,0
chr9	45419343	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.025685;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:2,8:12,1
chr9	60610139	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:1,0:22,4
chr9	61161872	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0091926;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,9:9,2
chr9	61915782	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.017906;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:45,7:19,1:26,6
chr9	62099604	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0011775;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,10:0,2:1,8
chr9	62800114	.	C	T	0	PASS	DP=487;GPV=1;SPV=0.031305;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:240,39:124,15:116,24
chr9	62802278	.	C	T	0	PASS	DP=480;GPV=1;SPV=0.043145;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:254:215,39:100,14:115,25
chr9	62811764	.	T	C	0	PASS	DP=310;GPV=1;SPV=0.025293;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:139,25:62,13:77,12
chr9	62826395	.	G	C	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.02156;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:127,16:69,2:58,14
chr9	62835638	.	G	C	0	PASS	DP=296;GPV=1;SPV=0.01712;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:150,19:79,6:71,13
chr9	62840770	.	G	C	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.0035057;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:190:164,26:39,6:125,20
chr9	62841157	.	A	T	0	PASS	DP=258;GPV=1;SPV=0.033344;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:110,21:55,5:55,16
chr9	62885216	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0432;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:14,3:26,8
chr9	62904052	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.023646;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:19,8:9,1
chr9	62905632	.	TC	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064294;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:31,4:0,0
chr9	63345898	.	T	G	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.01398;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:43,15:16,7:27,8
chr9	63757194	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.00082552;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:51,13:32,9:19,4
chr9	63812339	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.032541;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:51,9:28,4:23,5
chr9	63819760	.	G	T	0	PASS	DP=567;GPV=1;SPV=0.014374;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:300:261,39:120,23:141,16
chr9	63861709	.	C	A	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.015469;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:112,28:35,7:77,21
chr9	63861710	.	A	G	0	PASS	DP=260;GPV=1;SPV=0.023576;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:112,27:39,7:73,20
chr9	63870056	.	A	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.020167;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:51,12:33,7:18,5
chr9	63870158	.	G	A	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.021202;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,10:31,3:26,7
chr9	63870195	.	CT	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.014363;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:51,6:29,1:22,5
chr9	64077123	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.03931;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,12:16,10:3,2
chr9	64107800	.	C	A	0	PASS	DP=400;GPV=1;SPV=0.046046;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:182,27:90,18:92,9
chr9	64375598	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.010536;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:8,4:11,9
chr9	64386168	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.031028;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:17,4:3,1
chr9	64469826	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,4:4,1:3,3
chr9	64492136	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.041089;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:10,7:17,2
chr9	64493849	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.041004;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:36,2:8,3
chr9	64682117	.	G	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:0,5:3,1
chr9	65256879	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015873;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:0,1:16,7
chr9	65269468	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.3426;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:16,2:3,1
chr9	65287393	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0019324;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,4:4,3
chr9	65653714	.	T	G	0	PASS	DP=247;GPV=1;SPV=0.017356;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:109,19:62,13:47,6
chr9	65936253	.	A	C	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.049277;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:65,13:30,7:35,6
chr9	65967821	.	G	T	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.03329;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:53,12:23,5:30,7
chr9	66031944	.	T	C	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.0014401;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:71,23:40,12:31,11
chr9	66042285	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:3,3:7,2
chr9	66171597	.	T	C	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.049508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:75,16:38,9:37,7
chr9	66171811	.	T	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.018795;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:26,9:26,7
chr9	66176323	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.027751;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,1:2,4
chr9	66220831	.	C	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.031662;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:79,16:42,9:37,7
chr9	66354771	.	AAAGG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.26573;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:1,0:22,4
chr9	66356240	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016558;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:11,1:6,5
chr9	66738566	.	G	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.024045;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:21,8:19,2
chr9	66886167	.	A	ATT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.038251;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,4:9,7
chr9	67126309	.	A	C	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.00032488;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:61,13:34,8:27,5
chr9	67505891	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,8:3,1
chr9	67616303	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.023721;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:6,2:18,3
chr9	67749642	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
chr9	67778907	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.028868;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:6,3:28,4
chr9	67810124	.	A	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.020503;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:73,9:35,7:38,2
chr9	67897767	.	G	GT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.064244;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:15,1:17,3
chr9	68235379	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.047588;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,10:16,6:19,4
chr9	68257015	.	GGTTTTTT	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,2:2,1:2,1
chr9	68263305	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
chr9	68293018	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.13808;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:34,4:1,0
chr9	68302441	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.02545;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,5:3,2
chr9	68331415	.	C	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.027329;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:60,7:28,5:32,2
chr9	68331508	.	A	G	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.03356;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:65,9:21,2:44,7
chr9	68356290	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.044109;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:26,7:18,2
chr9	70505606	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.011214;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:18,1:19,9
chr9	70505607	.	CT	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.11654;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:15,1:23,4
chr9	71928186	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:6,15:3,13:3,2
chr9	74549551	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,3:5,3:0,0
chr9	74847168	.	T	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00019647;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:21,6:19,6
chr9	76351610	.	GA	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.028362;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:18,2:6,3
chr9	77431748	.	G	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=3.6348e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:44,19:21,10:23,9
chr9	77951092	.	C	CTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.019062;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,5:6,4:6,1
chr9	79516885	.	C	CA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.064152;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:19,2:15,2
chr9	79516891	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.024282;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:15,6:9,3:6,3
chr9	79845036	.	C	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00017085;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:17,5:18,6
chr9	80682810	.	G	GTGTGTACATA	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0012204;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,17:15,7:10,10
chr9	80758140	.	CACAT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
chr9	81017974	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00035994;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:15,5:14,7
chr9	81082749	.	TTC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.020884;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:6,1:10,8
chr9	82276208	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.013935;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:15,6:15,6
chr9	83158653	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10931;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,4:17,2:13,2
chr9	83378261	.	G	GT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.014733;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,15:4,11:12,4
chr9	84773759	.	A	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00042036;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:21,4:16,7
chr9	84797611	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:0,0:6,2
chr9	84924229	.	TAGAAAGAA	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0010569;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:13,10:9,6
chr9	85219269	.	T	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0052387;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:18,3:25,5
chr9	85259866	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.021798;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,1:7,6
chr9	87183343	.	G	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00025363;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:20,6:25,6
chr9	88136022	.	C	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.020238;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:58,17:31,7:27,10
chr9	88178055	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.039403;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,10:6,2:17,8
chr9	88423726	.	AT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0034815;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,14:17,10:12,4
chr9	90352561	.	A	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=1.2761e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:33,21:18,12:15,9
chr9	91372933	.	T	TTTG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,4:3,1:9,3
chr9	92156756	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.03611;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:16,2:14,8
chr9	96165262	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.014087;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:23,3:18,3
chr9	96456759	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,3:2,1
chr9	97946938	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=2.6269e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:43,19:20,13:23,6
chr9	98246667	.	TC	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00032303;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:19,9:25,3
chr9	98729589	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0056752;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:19,5:25,3
chr9	100973502	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,2:0,0:0,2
chr9	102747129	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=7.4988e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:21,9:13,5
chr9	102910576	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0001091;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:14,8:18,6
chr9	103157090	.	AT	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.6127e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:14,7:17,8
chr9	103157095	.	A	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.0255e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:13,6:17,8
chr9	103168002	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.007985;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:50,9:22,7:28,2
chr9	103739609	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:2,1:11,3
chr9	109332155	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033265;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,6:8,3:5,3
chr9	109510558	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.059209;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,5:11,1:15,4
chr9	110245653	.	TA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,3:1,1:0,2
chr9	111153004	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0022504;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,13:10,10:2,3
chr9	111985797	.	G	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00032727;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:21,8:16,3
chr9	112161821	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:7,4:5,1:2,3
chr9	112290707	.	T	TACACACACAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011333;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,11:5,4:11,7
chr9	112477701	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:22,5:17,6
chr9	112775542	.	T	TTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021554;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:12,3:5,2
chr9	113248462	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.032107;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:3,4:3,1
chr9	114496542	.	A	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.020919;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,6:8,5:14,1
chr9	114949683	.	C	CTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.080194;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,5:5,2:21,3
chr9	114949709	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.020314;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:1,3:17,5
chr9	115298062	.	CAAA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,5:12,1:9,4
chr9	116141871	.	T	TGGAAGGAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:7,4:7,1
chr9	119043947	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,4:13,1:13,3
chr9	121002240	.	ATATGTATATATATG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.012978;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:12,3:10,5
chr9	122391368	.	T	TAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,2:7,2
chr9	123848228	.	TAA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,3:5,1
chr9	123946971	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,1:7,3
chr9	125126591	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.025527;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:16,4:6,1
chr9	125368651	.	TTA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024893;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:7,5:7,5
chr9	126043190	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00025457;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:17,5:15,7
chr9	126720734	.	T	TA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.013592;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:18,2:17,5
chr9	128830632	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0036482;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:5,2:1,7
chr9	129493970	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0091766;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:14,4:3,1
chr9	130334549	.	G	GTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:10,11:6,9:4,2
chr9	130955308	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:0,5:3,1
chr9	131462836	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040316;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:4,2:1,2
chr9	132313931	.	T	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.11505;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:31,4:22,2:9,2
chr9	132708087	.	AAGAAAG	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027472;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,9:10,3:10,6
chr9	132964743	.	CT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0036125;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,6:4,2:3,4
chr9	134679626	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr9	135125996	.	GT	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.043084;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:16,1:29,4
chr9	136452449	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:11,9:5,1
chr9	136802875	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,4:4,3:23,1
chr9	137323590	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.022631;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:24,10:3,2
chr9	137379006	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:4,1:12,3
chr9	138218119	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.046765;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:35,6:23,1
chrM	4201	.	G	A	0	PASS	DP=14053;GPV=1;SPV=0;SS=2;SSC=255;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7031:5235,1795:2022,765:3213,1030
chrX	3092212	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.029045;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:8,4:14,3
chrX	3309177	.	A	AAT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00068379;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:10,8:9,4
chrX	3659728	.	TG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10909;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,2:0,1:2,1
chrX	4121774	.	T	TCTC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
chrX	7992178	.	T	TTCTC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:0,4:3,1
chrX	9313051	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,4:0,4:0,0
chrX	9411434	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.068498;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:12,3:18,1
chrX	13675572	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,2:10,2
chrX	14545758	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=1.7034e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:6,7:6,5
chrX	18214152	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=4.9037e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:7,7:4,8
chrX	21331652	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00017618;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:6,8:6,7
chrX	22690043	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=2.9309e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:5,7:8,6
chrX	26425516	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00012264;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:6,3:5,8
chrX	27042819	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=9.7816e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:6,6:5,7
chrX	27096437	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:0,2:0,0:0,2
chrX	28945905	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.068336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,2:10,3
chrX	33412878	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.037062;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,4:14,2
chrX	34032854	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00010021;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,7:5,4
chrX	38518516	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.064151;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,5:7,1
chrX	44125010	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
chrX	44616563	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,2:3,2:0,0
chrX	45302124	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.19342;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:14,3:8,3
chrX	46037998	.	GATATATAT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:4,3:3,9
chrX	46917834	.	C	CCTCT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:2,3:0,2
chrX	48779797	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=4.5999e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,17:6,8:0,9
chrX	51692739	.	A	ACGCG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:7,3:1,5
chrX	53078022	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:1,4:1,3:0,1
chrX	53463626	.	T	TTCTTCTTTCTA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:8,1:12,3
chrX	55940070	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0033075;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,6:5,2
chrX	59031791	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0050575;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,5:2,1
chrX	61711362	.	G	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,0:11,4
chrX	72049295	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=4.8084e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:6,7:10,8
chrX	79631705	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0010246;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:6,5:9,5
chrX	80453521	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00053602;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:7,7:2,5
chrX	82060681	.	C	CTCT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13462;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:6,2:12,1
chrX	82593914	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.095675;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:18,2:12,4
chrX	83754213	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.063124;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:19,2:16,3
chrX	87257915	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.003412;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,3:9,5
chrX	87796085	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00013922;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:8,5:5,5
chrX	88491057	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01393;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,1:7,5
chrX	88811126	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=2.0919e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,15:3,9:6,6
chrX	90203941	.	C	CTCTTTCTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:2,2:4,4
chrX	91286984	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=7.3793e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:8,3:6,8
chrX	91807176	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:13,4:3,1
chrX	91893509	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=8.5672e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:7,5:6,6
chrX	93083071	.	ATTTTAT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.051203;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:13,1:7,5
chrX	93083081	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02299;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:14,1:10,5
chrX	97016615	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=1.3047e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:3,6:8,8
chrX	100214822	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,2:0,1:1,1
chrX	100501914	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.26154;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:10,1:4,2
chrX	107347815	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0071858;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,4:8,4
chrX	107623602	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:4,3:11,5
chrX	110091519	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=3.3228e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,12:3,7:3,5
chrX	110912416	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,2:5,1:1,1
chrX	111269239	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.001265;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:9,5:7,9
chrX	111766846	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0014461;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:8,5:2,3
chrX	116312761	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,3:12,1
chrX	117350431	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,2:9,4
chrX	117350432	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041126;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:6,2:9,3
chrX	118009278	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,3:10,1
chrX	123694621	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:0,2:0,1:0,1
chrX	123916752	.	AAGTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0098105;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,2:3,3
chrX	124536737	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=8.1543e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,17:4,8:3,9
chrX	126872642	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0023473;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:3,4:10,5
chrX	126945081	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,5:3,2:9,3
chrX	126945083	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,4:2,2:8,2
chrX	127531176	.	TGTA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0041657;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:4,3:6,8
chrX	127921041	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:1,4:1,1:0,3
chrX	128936893	.	GTA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12821;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,2:3,1:0,1
chrX	129599558	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=1.5459e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,14:2,5:7,9
chrX	130732698	.	T	TCA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,2:9,2
chrX	139415082	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=5.8711e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:4,5:9,9
chrX	147897926	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,1:7,3
chrX	152244389	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=8.2699e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:7,6:8,8
chrX	153679546	.	T	TTTTTC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:2,2:9,2
chrX	154888408	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,4:8,2:8,2
chrX	155051710	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0042541;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,5:7,4
chrY	3056481	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,2:14,2
chrY	3309359	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.091905;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,1:16,4
chrY	3773083	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:0,1:6,1
chrY	3795271	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.073354;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,2:14,2
chrY	3809249	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=4.3264e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:9,10:4,5
chrY	4571151	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=5.6034e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,20:9,10:6,10
chrY	4616746	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.070174;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,2:13,3
chrY	4631875	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.073845;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:14,1:12,5
chrY	5682239	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:4,1:1,1
chrY	6718333	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.023207;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,1:12,4
chrY	8465534	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
chrY	9196507	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0004971;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:5,4:4,4
chrY	9462573	.	G	C	0	PASS	DP=305;GPV=1;SPV=0.040288;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:133,17:52,5:81,12
chrY	9469163	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:1,0:10,4
chrY	10065090	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=5.941e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:4,6:10,8
chrY	10669371	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.23636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,3:8,2:3,1
chrY	11123549	.	CT	C	0	PASS	DP=258;GPV=1;SPV=0.0092257;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:96,25:54,13:42,12
chrY	11161812	.	T	A	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.028338;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:73,12:41,9:32,3
chrY	11193193	.	C	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.045127;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:77,14:35,5:42,9
chrY	11222315	.	T	C	0	PASS	DP=618;GPV=1;SPV=0.012111;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:324:285,39:156,20:129,19
chrY	11240134	.	T	C	0	PASS	DP=820;GPV=1;SPV=0.018731;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:432:380,52:202,25:178,27
chrY	11250509	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0094467;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:51,11:26,4:25,7
chrY	11259114	.	T	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.04336;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,9:28,7:19,2
chrY	11266802	.	G	C	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.011379;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:92,20:52,12:40,8
chrY	11280375	.	T	C	0	PASS	DP=499;GPV=1;SPV=0.017248;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:274:244,30:105,11:139,19
chrY	11299445	.	T	TTTCCA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.020935;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,9:11,4:14,5
chrY	11548439	.	T	TATGGAATGGAATGGA	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.014981;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:36,6:22,5:14,1
chrY	12093051	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:3,3:4,1
chrY	13654970	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00026317;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,5:3,3
chrY	15682277	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,1:9,3
chrY	20082265	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.033133;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:16,2:11,5
chrY	20087972	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:14,7:6,1
chrY	22241393	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:5,7:5,1
chrY	22241422	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:10,4:2,4
chrY	26671555	.	T	A	0	PASS	DP=1600;GPV=1;SPV=0.041367;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:888:797,89:312,39:485,50
chrY	56728619	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:0,0:22,4
chrY	56752448	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.083915;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,4:0,0:29,4
chrY	56828396	.	T	G	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.00081136;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:105,16:55,12:50,4
chrY	56834375	.	CTCTAT	C	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.01997;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:173,28:94,15:79,13
chrY	56854458	.	C	G	0	PASS	DP=422;GPV=1;SPV=0.046799;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:185,33:108,18:77,15
chrY	56871363	.	G	T	0	PASS	DP=934;GPV=1;SPV=0.037494;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:499:435,64:207,37:228,27
chrY	56878387	.	A	G	0	PASS	DP=839;GPV=1;SPV=0.048414;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:458:408,50:204,23:204,27
chrY	56879897	.	T	C	0	PASS	DP=317;GPV=1;SPV=0.028389;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:129,25:77,14:52,11
chrY	56883281	.	G	A	0	PASS	DP=251;GPV=1;SPV=0.035565;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:124,14:55,8:69,6