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comparison test-data/355_fraction_counts.tab @ 2:15e3e29f310e draft

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author artbio
date Tue, 19 Sep 2017 17:23:15 -0400
parents f6f0f1e5e940
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equal deleted inserted replaced
1:51b4590a972d 2:15e3e29f310e
1 LSU-rRNA_Dme rRNA rRNA 4126525 1 5S_DM RNA RNA 4146
2 FW3_DM LINE Jockey 376 2 ACCORD_I-int LTR Gypsy 2031
3 DMTOM1_LTR LTR Gypsy 458 3 ACCORD_LTR LTR Gypsy 344
4 R1_DM LINE R1 6019 4 ACCORD2_I-int LTR Gypsy 1200
5 TAHRE LINE Jockey 1417 5 ACCORD2_LTR LTR Gypsy 76
6 G4_DM LINE Jockey 1225 6 ALA_DM Unknown Unknown 0
7 ARS406_DM Unknown Unknown 230
8 Baggins1 LINE LOA 1832
9 BARI_DM DNA TcMar-Tc1 522
10 BARI1 DNA TcMar-Tc1 125
11 BATUMI_I-int LTR Pao 1842
12 BATUMI_LTR LTR Pao 169
13 BEL_I-int LTR Pao 15192
14 BEL_LTR LTR Pao 605
15 Bica_I-int LTR Gypsy 618
16 Bica_LTR LTR Gypsy 67
17 BLASTOPIA_I-int LTR Gypsy 12045
18 BLASTOPIA_LTR LTR Gypsy 919
19 BLOOD_I-int LTR Gypsy 13280
20 BLOOD_LTR LTR Gypsy 542
7 BS LINE Jockey 4135 21 BS LINE Jockey 4135
8 Stalker2_I-int LTR Gypsy 4814 22 BS2 LINE Jockey 2086
9 Stalker3_LTR LTR Gypsy 235 23 BS3_DM LINE Jockey 453
10 TABOR_I-int LTR Gypsy 3691 24 BS4_DM LINE Jockey 23
11 G7_DM LINE Jockey 418 25 BURDOCK_I-int LTR Gypsy 2232
12 BEL_I-int LTR Pao 15192 26 BURDOCK_LTR LTR Gypsy 193
13 Gypsy6_I-int LTR Gypsy 3763 27 Chimpo_I-int LTR Gypsy 370
14 ACCORD_I-int LTR Gypsy 2031 28 Chimpo_LTR LTR Gypsy 33
29 Chouto_I-int LTR Gypsy 518
30 Chouto_LTR LTR Gypsy 159
31 CIRCE LTR Gypsy 1570
32 Copia_I-int LTR Copia 87220
33 Copia_LTR LTR Copia 3075
34 Copia1-I_DM LTR Copia 1946
35 Copia1-LTR_DM LTR Copia 389
36 Copia2_I-int LTR Copia 1892
37 Copia2_LTR_DM LTR Copia 460
38 DIVER_I-int LTR Pao 11751
39 DIVER_LTR LTR Pao 328
40 DIVER2_I-int LTR Pao 2668
41 DIVER2_LTR LTR Pao 240
42 DM1731_I-int LTR Copia 6873
43 DM1731_LTR LTR Copia 321
44 DM176_I-int LTR Gypsy 2298
45 DM176_LTR LTR Gypsy 330
46 DM297_I-int LTR Gypsy 42705
47 DM297_LTR LTR Gypsy 2516
48 DM412 LTR Gypsy 23508
15 DM412B_LTR LTR Gypsy 3001 49 DM412B_LTR LTR Gypsy 3001
16 G2_DM LINE Jockey 764 50 DMCR1A LINE CR1 8072
17 SSU-rRNA_Hsa rRNA rRNA 301813 51 DMLTR5 LTR Gypsy 94
18 TART_B1 LINE Jockey 5089 52 DMRP1 Unknown Unknown 144
19 S2_DM DNA TcMar-Tc1 205 53 DMRPR Unknown Unknown 136
20 LOOPER1_DM DNA PiggyBac 31 54 DMRT1A LINE R1 1235
21 HOBO DNA hAT-hobo 2119
22 ARS406_DM Unknown Unknown 230
23 G6_DM LINE Jockey 786
24 DOC2_DM LINE Jockey 2052
25 Baggins1 LINE LOA 1832
26 NINJA_LTR LTR Pao 114
27 TRANSIB2 DNA CMC-Transib 1484
28 Gypsy5_LTR LTR Gypsy 326
29 MDG3_LTR LTR Gypsy 454
30 Gypsy12A_LTR LTR Gypsy 1077
31 Gypsy_LTR LTR Gypsy 1737
32 TIRANT_LTR LTR Gypsy 1596
33 I_DM LINE I 11149
34 DIVER2_I-int LTR Pao 2668
35 P-1_DY DNA P 4
36 Invader2_I-int LTR Gypsy 3157
37 DOC6_DM LINE Jockey 768
38 BURDOCK_LTR LTR Gypsy 193
39 SSU-rRNA_Dme rRNA rRNA 3822
40 MAX_LTR LTR Pao 343
41 STALKER4_LTR LTR Gypsy 803
42 XDMR_DM Unknown Unknown 1587
43 BARI_DM DNA TcMar-Tc1 522
44 Transib-N1_DM DNA CMC-Transib 130
45 Gypsy5_I-int LTR Gypsy 1036
46 XDMR Unknown Unknown 903
47 ACCORD2_LTR LTR Gypsy 76
48 POGON1 DNA TcMar-Pogo 256
49 BS4_DM LINE Jockey 23
50 ALA_DM Unknown Unknown 0
51 Gypsy1-I_DM LTR Gypsy 22753
52 ACCORD_LTR LTR Gypsy 344
53 BURDOCK_I-int LTR Gypsy 2232
54 ZAM_I-int LTR Gypsy 2892
55 Invader5_I-int LTR Gypsy 117
56 G3_DM LINE Jockey 250
57 ROOA_I-int LTR Pao 2579
58 Gypsy1-LTR_DM LTR Gypsy 576
59 DM1731_I-int LTR Copia 6873
60 ROO_I-int LTR Pao 22941
61 DM412 LTR Gypsy 23508
62 PROTOP DNA P 2059
63 TART-A LINE Jockey 1825
64 ROO_LTR LTR Pao 1453
65 DIVER_LTR LTR Pao 328
66 Gypsy3_I-int LTR Gypsy 2258
67 BATUMI_LTR LTR Pao 169
68 IDEFIX_LTR LTR Gypsy 1012
69 G5_DM LINE Jockey 1300
70 HETA LINE Jockey 10327
71 Gypsy11_I-int LTR Gypsy 168
72 R1-2_DM LINE R1 68
73 Gypsy11_LTR LTR Gypsy 48
74 HELENA_RT LINE Jockey 416
75 FTZ_DM Unknown Unknown 0
76 MICROPIA_I-int LTR Gypsy 3327
77 Invader4_I-int LTR Gypsy 1180
78 PLACW_DM DNA P 204
79 BLOOD_LTR LTR Gypsy 542
80 R2_DM LINE R2 15128
81 Copia1-I_DM LTR Copia 1946
82 Gypsy4_I-int LTR Gypsy 5348
83 Chouto_LTR LTR Gypsy 159
84 BATUMI_I-int LTR Pao 1842
85 DNAREP1_DM RC Helitron 36953
86 DMRT1B LINE R1 4115 55 DMRT1B LINE R1 4115
87 DMRT1C LINE R1 670 56 DMRT1C LINE R1 670
88 TLD2 LTR Gypsy 1 57 DMTOM1_LTR LTR Gypsy 458
89 DMRT1A LINE R1 1235 58 DNAREP1_DM RC Helitron 36953
90 DM1731_LTR LTR Copia 321 59 DOC LINE Jockey 21700
60 DOC2_DM LINE Jockey 2052
61 DOC3_DM LINE Jockey 5205
62 DOC4_DM LINE Jockey 658
63 DOC5_DM LINE Jockey 752
64 DOC6_DM LINE Jockey 768
65 FB4_DM DNA TcMar-Tc1 3348
66 FROGGER_I-int LTR Copia 546
67 FROGGER_LTR LTR Copia 57
68 FTZ_DM Unknown Unknown 0
69 FUSHI_DM Unknown Unknown 0
70 FW2_DM LINE Jockey 8864
71 FW3_DM LINE Jockey 376
72 G_DM LINE Jockey 4582
73 G2_DM LINE Jockey 764
74 G3_DM LINE Jockey 250
75 G4_DM LINE Jockey 1225
76 G5_DM LINE Jockey 1300
77 G5A_DM LINE Jockey 582
78 G6_DM LINE Jockey 786
79 G7_DM LINE Jockey 418
80 GTWIN_I-int LTR Gypsy 2930
81 GTWIN_LTR LTR Gypsy 938
82 Gypsy_I-int LTR Gypsy 11161
83 Gypsy_LTR LTR Gypsy 1737
84 Gypsy1-I_DM LTR Gypsy 22753
85 Gypsy1-LTR_DM LTR Gypsy 576
86 Gypsy10_I-int LTR Gypsy 927
87 Gypsy10_LTR LTR Gypsy 162
88 Gypsy11_I-int LTR Gypsy 168
89 Gypsy11_LTR LTR Gypsy 48
90 Gypsy12_I-int LTR Gypsy 2466
91 Gypsy12_LTR LTR Gypsy 2680
92 Gypsy12A_LTR LTR Gypsy 1077
93 Gypsy2_I-int LTR Gypsy 1552
94 Gypsy2_LTR LTR Gypsy 250
95 Gypsy2-I_DM LTR Gypsy 2658
96 Gypsy2-LTR_DM LTR Gypsy 385
97 Gypsy3_I-int LTR Gypsy 2258
98 Gypsy3_LTR LTR Gypsy 212
99 Gypsy4_I-int LTR Gypsy 5348
100 Gypsy4_LTR LTR Gypsy 218
101 Gypsy5_I-int LTR Gypsy 1036
102 Gypsy5_LTR LTR Gypsy 326
103 Gypsy6_I-int LTR Gypsy 3763
104 Gypsy6_LTR LTR Gypsy 760
105 Gypsy6A_LTR LTR Gypsy 219
106 Gypsy7_I-int LTR Gypsy 742
107 Gypsy7_LTR LTR Gypsy 39
108 Gypsy8_I-int LTR Gypsy 1247
109 Gypsy8_LTR LTR Gypsy 486
110 Gypsy9_I-int LTR Gypsy 188
111 Gypsy9_LTR LTR Gypsy 8
112 HELENA_RT LINE Jockey 416
113 Helitron1_DM RC Helitron 0
114 HETA LINE Jockey 10327
115 HMSBEAGLE_I-int LTR Gypsy 4079
116 HOBO DNA hAT-hobo 2119
117 I_DM LINE I 11149
118 IDEFIX_I-int LTR Gypsy 3286
119 IDEFIX_LTR LTR Gypsy 1012
120 Invader1_I-int LTR Gypsy 1768
121 Invader1_LTR LTR Gypsy 1903
122 Invader2_I-int LTR Gypsy 3157
123 Invader2_LTR LTR Gypsy 213
124 Invader3_I-int LTR Gypsy 2022
125 Invader3_LTR LTR Gypsy 227
126 Invader4_I-int LTR Gypsy 1180
127 Invader4_LTR LTR Gypsy 679
128 Invader5_I-int LTR Gypsy 117
129 Invader5_LTR LTR Gypsy 23
130 Invader6_I-int LTR Gypsy 3298
131 Invader6_LTR LTR Gypsy 146
132 IVK_DM LINE I 1769
133 Jockey2 LINE Jockey 760
134 LINEJ1_DM LINE Jockey 15939
135 LmeSINE1c SINE tRNA-Deu-L2 653
136 LOOPER1_DM DNA PiggyBac 31
91 LSU-rRNA_Cel rRNA rRNA 251671 137 LSU-rRNA_Cel rRNA rRNA 251671
92 Copia_LTR LTR Copia 3075 138 LSU-rRNA_Dme rRNA rRNA 4126525
93 Gypsy6_LTR LTR Gypsy 760 139 LSU-rRNA_Hsa rRNA rRNA 11
94 Gypsy12_I-int LTR Gypsy 2466 140 M4DM DNA CMC-Transib 918
95 BLASTOPIA_LTR LTR Gypsy 919 141 Mariner2_DM DNA TcMar-Tc1 926
96 Bica_LTR LTR Gypsy 67 142 MAX_I-int LTR Pao 3905
97 Gypsy8_LTR LTR Gypsy 486 143 MAX_LTR LTR Pao 343
144 MDG1_I-int LTR Gypsy 8043
145 MDG1_LTR LTR Gypsy 281
146 MDG3_I-int LTR Gypsy 3770
147 MDG3_LTR LTR Gypsy 454
148 MICROPIA_I-int LTR Gypsy 3327
149 MICROPIA_LTR LTR Gypsy 149
150 MINOS DNA TcMar-Tc1 93
151 MuDR-1_DEl DNA MULE-NOF 4
98 NINJA_I-int LTR Pao 1146 152 NINJA_I-int LTR Pao 1146
153 NINJA_LTR LTR Pao 114
154 NOF_FB DNA MULE-NOF 63
155 NOMAD_I-int LTR Gypsy 8154
156 NOMAD_LTR LTR Gypsy 277
157 NTS_DM Other Other 21753
158 P-1_DY DNA P 4
159 PLACW_DM DNA P 204
160 POGO DNA TcMar-Pogo 1032
161 POGON1 DNA TcMar-Pogo 256
162 PROTOP DNA P 2059
163 PROTOP_A DNA P 1988
99 PROTOP_B DNA P 4300 164 PROTOP_B DNA P 4300
100 PROTOP_A DNA P 1988 165 QUASIMODO_I-int LTR Gypsy 8000
101 Invader3_LTR LTR Gypsy 227
102 Chimpo_LTR LTR Gypsy 33
103 Invader2_LTR LTR Gypsy 213
104 BLASTOPIA_I-int LTR Gypsy 12045
105 FROGGER_LTR LTR Copia 57
106 NOMAD_I-int LTR Gypsy 8154
107 QUASIMODO_LTR LTR Gypsy 528 166 QUASIMODO_LTR LTR Gypsy 528
108 TABOR_LTR LTR Gypsy 88 167 QUASIMODO2-I_DM LTR Gypsy 1811
109 Stalker2_LTR LTR Gypsy 356 168 QUASIMODO2-LTR_DM LTR Gypsy 105
110 MICROPIA_LTR LTR Gypsy 149 169 R1_DM LINE R1 6019
111 Gypsy9_I-int LTR Gypsy 188 170 R1-2_DM LINE R1 68
112 STALKER4_I-int LTR Gypsy 3132 171 R2_DM LINE R2 15128
113 TRANSIB1 DNA CMC-Transib 289 172 ROO_I-int LTR Pao 22941
114 DOC LINE Jockey 21700 173 ROO_LTR LTR Pao 1453
115 TRANSIB3 DNA CMC-Transib 741 174 ROOA_I-int LTR Pao 2579
116 Copia_I-int LTR Copia 87220 175 ROOA_LTR LTR Pao 276
117 TRANSIB4 DNA CMC-Transib 153 176 ROVER-I_DM LTR Gypsy 3069
118 Gypsy10_LTR LTR Gypsy 162
119 Invader3_I-int LTR Gypsy 2022
120 Invader1_I-int LTR Gypsy 1768
121 BS3_DM LINE Jockey 453
122 Gypsy2-LTR_DM LTR Gypsy 385
123 LSU-rRNA_Hsa rRNA rRNA 11
124 NOMAD_LTR LTR Gypsy 277
125 Helitron1_DM RC Helitron 0
126 LINEJ1_DM LINE Jockey 15939
127 Invader4_LTR LTR Gypsy 679
128 MDG3_I-int LTR Gypsy 3770
129 LmeSINE1c SINE tRNA-Deu-L2 653
130 ROVER-LTR_DM LTR Gypsy 168 177 ROVER-LTR_DM LTR Gypsy 168
131 S_DM DNA TcMar-Tc1 2041 178 S_DM DNA TcMar-Tc1 2041
132 Invader6_I-int LTR Gypsy 3298 179 S2_DM DNA TcMar-Tc1 205
133 ROVER-I_DM LTR Gypsy 3069
134 QUASIMODO_I-int LTR Gypsy 8000
135 Chouto_I-int LTR Gypsy 518
136 NTS_DM Other Other 21753
137 Gypsy3_LTR LTR Gypsy 212
138 SSU-rRNA_Cel rRNA rRNA 1817 180 SSU-rRNA_Cel rRNA rRNA 1817
139 MINOS DNA TcMar-Tc1 93 181 SSU-rRNA_Dme rRNA rRNA 3822
140 DOC4_DM LINE Jockey 658 182 SSU-rRNA_Hsa rRNA rRNA 301813
183 Stalker2_I-int LTR Gypsy 4814
184 Stalker2_LTR LTR Gypsy 356
185 Stalker3_LTR LTR Gypsy 235
186 STALKER4_I-int LTR Gypsy 3132
187 STALKER4_LTR LTR Gypsy 803
188 TABOR_I-int LTR Gypsy 3691
189 TABOR_LTR LTR Gypsy 88
190 TAHRE LINE Jockey 1417
191 TART_B1 LINE Jockey 5089
192 TART-A LINE Jockey 1825
193 TC1_DM DNA TcMar-Tc1 1485
194 TC1-2_DM DNA TcMar-Tc1 2287
195 TIRANT_I-int LTR Gypsy 12728
196 TIRANT_LTR LTR Gypsy 1596
197 TLD2 LTR Gypsy 1
198 TOM_I-int LTR Gypsy 3390
199 Transib-N1_DM DNA CMC-Transib 130
200 TRANSIB1 DNA CMC-Transib 289
201 TRANSIB2 DNA CMC-Transib 1484
202 TRANSIB3 DNA CMC-Transib 741
203 TRANSIB4 DNA CMC-Transib 153
204 Transib5 DNA CMC-Transib 328
205 TRANSPAC_I-int LTR Gypsy 16760
206 TRANSPAC_LTR LTR Gypsy 979
207 XDMR Unknown Unknown 903
208 XDMR_DM Unknown Unknown 1587
209 ZAM_I-int LTR Gypsy 2892
141 ZAM_LTR LTR Gypsy 118 210 ZAM_LTR LTR Gypsy 118
142 QUASIMODO2-LTR_DM LTR Gypsy 105
143 Gypsy2-I_DM LTR Gypsy 2658
144 TRANSPAC_I-int LTR Gypsy 16760
145 Bica_I-int LTR Gypsy 618
146 BS2 LINE Jockey 2086
147 BLOOD_I-int LTR Gypsy 13280
148 DMCR1A LINE CR1 8072
149 QUASIMODO2-I_DM LTR Gypsy 1811
150 HMSBEAGLE_I-int LTR Gypsy 4079
151 DMLTR5 LTR Gypsy 94
152 Gypsy7_LTR LTR Gypsy 39
153 G5A_DM LINE Jockey 582
154 MDG1_I-int LTR Gypsy 8043
155 Gypsy2_I-int LTR Gypsy 1552
156 BARI1 DNA TcMar-Tc1 125
157 Invader5_LTR LTR Gypsy 23
158 DM176_LTR LTR Gypsy 330
159 DOC3_DM LINE Jockey 5205
160 Copia1-LTR_DM LTR Copia 389
161 TOM_I-int LTR Gypsy 3390
162 NOF_FB DNA MULE-NOF 63
163 Chimpo_I-int LTR Gypsy 370
164 DIVER_I-int LTR Pao 11751
165 TIRANT_I-int LTR Gypsy 12728
166 Gypsy2_LTR LTR Gypsy 250
167 FB4_DM DNA TcMar-Tc1 3348
168 GTWIN_LTR LTR Gypsy 938
169 Invader6_LTR LTR Gypsy 146
170 Gypsy8_I-int LTR Gypsy 1247
171 G_DM LINE Jockey 4582
172 TRANSPAC_LTR LTR Gypsy 979
173 FUSHI_DM Unknown Unknown 0
174 Transib5 DNA CMC-Transib 328
175 MuDR-1_DEl DNA MULE-NOF 4
176 Mariner2_DM DNA TcMar-Tc1 926
177 DOC5_DM LINE Jockey 752
178 TC1_DM DNA TcMar-Tc1 1485
179 Gypsy9_LTR LTR Gypsy 8
180 DMRP1 Unknown Unknown 144
181 Gypsy10_I-int LTR Gypsy 927
182 Gypsy4_LTR LTR Gypsy 218
183 DM297_LTR LTR Gypsy 2516
184 ACCORD2_I-int LTR Gypsy 1200
185 Invader1_LTR LTR Gypsy 1903
186 BEL_LTR LTR Pao 605
187 IVK_DM LINE I 1769
188 M4DM DNA CMC-Transib 918
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197 GTWIN_I-int LTR Gypsy 2930
198 CIRCE LTR Gypsy 1570
199 DIVER2_LTR LTR Pao 240
200 POGO DNA TcMar-Pogo 1032
201 Gypsy6A_LTR LTR Gypsy 219
202 MAX_I-int LTR Pao 3905
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206 DM297_I-int LTR Gypsy 42705
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208 Jockey2 LINE Jockey 760
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210 DMRPR Unknown Unknown 136