[up]
|
|
drwxr-xr-x |
alignmentSieve.bam
|
1649393 |
-rw-r--r-- |
alignmentSieve.bed
|
68349 |
-rw-r--r-- |
alignmentSieve.txt
|
102 |
-rw-r--r-- |
alignmentSieve2.bam
|
132804 |
-rw-r--r-- |
alignmentSieve3.bam
|
132870 |
-rw-r--r-- |
bamCompare_result1.bg
|
15 |
-rw-r--r-- |
bamCompare_result2.bw
|
620 |
-rw-r--r-- |
bamCoverage_result1.bw
|
658 |
-rw-r--r-- |
bamCoverage_result2.bw
|
673 |
-rw-r--r-- |
bamCoverage_result3.bg
|
159 |
-rw-r--r-- |
bamCoverage_result4.bg
|
11624 |
-rw-r--r-- |
bamCoverage_result4.bw
|
3333 |
-rw-r--r-- |
bamCoverage_result5.bw
|
2858 |
-rw-r--r-- |
bamCoverage_result6.bw
|
653 |
-rw-r--r-- |
bamPEFragmentSize_histogram_result1.png
|
16485 |
-rw-r--r-- |
bamPEFragmentSize_lengths1.txt
|
115 |
-rw-r--r-- |
bamPEFragmentSize_result1.txt
|
626 |
-rw-r--r-- |
bamPEFragmentSize_table1.txt
|
823 |
-rw-r--r-- |
bigwigCompare_result1.bw
|
762 |
-rw-r--r-- |
bigwigCompare_result2.bg
|
36 |
-rw-r--r-- |
bowtie2 test1.bam
|
26318 |
-rw-r--r-- |
computeGCBias_result1.png
|
55278 |
-rw-r--r-- |
computeGCBias_result1.tabular
|
22575 |
-rw-r--r-- |
computeMatrix1.bed
|
207 |
-rw-r--r-- |
computeMatrix2.bed
|
127 |
-rw-r--r-- |
computeMatrix2.bw
|
19429 |
-rw-r--r-- |
computeMatrixOperations.txt
|
50 |
-rw-r--r-- |
computeMatrixOperations_result2.mat.gz
|
497 |
-rw-r--r-- |
computeMatrix_result1.gz
|
483 |
-rw-r--r-- |
computeMatrix_result2.gz
|
383 |
-rw-r--r-- |
computeMatrix_result3.gz
|
388 |
-rw-r--r-- |
correctGCBias_result1.bam
|
493613 |
-rw-r--r-- |
estimateReadFiltering.txt
|
353 |
-rw-r--r-- |
heatmapper_result1.png
|
71326 |
-rw-r--r-- |
heatmapper_result2.png
|
56250 |
-rw-r--r-- |
heatmapper_result2.tabular
|
76 |
-rw-r--r-- |
multiBamSummary_regions.bed
|
31 |
-rw-r--r-- |
multiBamSummary_result1.npz
|
461 |
-rw-r--r-- |
multiBamSummary_result2.npz
|
378 |
-rw-r--r-- |
multiBamSummary_result2b.npz
|
386 |
-rw-r--r-- |
multiBigwigSummary_result1.npz
|
404 |
-rw-r--r-- |
multiBigwigSummary_result1.png
|
35851 |
-rw-r--r-- |
paired_chr2L.bam
|
512363 |
-rw-r--r-- |
paired_chr2L.cram
|
256394 |
-rw-r--r-- |
phiX.2bit
|
1391 |
-rw-r--r-- |
phiX.bam
|
58479 |
-rw-r--r-- |
phiX.bam.bai
|
96 |
-rw-r--r-- |
phiX.fasta
|
5473 |
-rw-r--r-- |
plotCorrelation_result1.png
|
27387 |
-rw-r--r-- |
plotCorrelation_result1.tabular
|
145 |
-rw-r--r-- |
plotCorrelation_result2.png
|
12275 |
-rw-r--r-- |
plotCoverage.metrics
|
247 |
-rw-r--r-- |
plotCoverage_result1.png
|
46173 |
-rw-r--r-- |
plotCoverage_result1.tabular
|
392583 |
-rw-r--r-- |
plotEnrichment_output.png
|
36918 |
-rw-r--r-- |
plotEnrichment_output.txt
|
197 |
-rw-r--r-- |
plotFingerprint_quality_metrics.tabular
|
512 |
-rw-r--r-- |
plotFingerprint_result1.png
|
22438 |
-rw-r--r-- |
plotFingerprint_result2.png
|
25159 |
-rw-r--r-- |
plotFingerprint_result2.tabular
|
65742 |
-rw-r--r-- |
plotPCA_result1.png
|
56228 |
-rw-r--r-- |
plotPCA_result2.png
|
56228 |
-rw-r--r-- |
plotPCA_result2.tabular
|
194 |
-rw-r--r-- |
profiler_result1.png
|
46658 |
-rw-r--r-- |
profiler_result2.png
|
33277 |
-rw-r--r-- |
profiler_result2.tabular
|
94 |
-rw-r--r-- |
sequence.2bit
|
2603 |
-rw-r--r-- |
test.bw
|
19429 |
-rw-r--r-- |