[up]
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drwxr-xr-x |
find_TADs/
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drwxr-xr-x |
Li_chrX30-35_cool.png
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53981 |
-rw-r--r-- |
Li_et_al_2015.cool
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14371559 |
-rw-r--r-- |
Li_et_al_2015.h5
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covariance_small_50kb.cool
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covariance_small_50kb.h5
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diagnostic_plot.png
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dm3_genes.bed6.gz
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domains.bed
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hicBuildMatrix_result1.bam
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hicCorrectMatrix_result1.npz.h5
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55572 |
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hicCorrelate_heatmap_result1.png
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17439 |
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hicCorrelate_scatter_result1.png
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9989 |
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hicFindTADs_TAD_score.tabular
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hicFindTADs_find_boundaries.bed
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0 |
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0 |
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hicFindTADs_find_domains.bed
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0 |
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hicFindTADs_find_score.bedgraph
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hicPlotDistVsCounts_result1.png
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26030 |
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hicPlotDistVsCounts_result2.png
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248459 |
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hicPlotTADs_result1.svg
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hicSumMatrices_result1.npz.h5
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li_32-33mb_interactions.bedgraph
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li_32mb_interactions.bedgraph
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li_viewpoint_32-33Mb.png
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li_viewpoint_32Mb.png
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master_TADs_plot.png
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master_matrix_plot.png
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merged_matrix.npz.h5
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obs_exp_small_50kb.cool
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obs_exp_small_50kb.h5
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-rw-r--r-- |
pca2.bw
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pearson_small_50kb.cool
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-rw-r--r-- |
pearson_small_50kb.h5
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raw_qc_report
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791 |
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small_matrix_50kb_pearson_pca1_plot.png
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750752 |
-rw-r--r-- |
small_matrix_50kb_pearson_pca1_plot.svg
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small_test_R1_unsorted.bam
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small_test_R1_unsorted.sam
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-rw-r--r-- |
small_test_R2_unsorted.sam
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small_test_matrix_2.h5
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small_test_matrix_50kb_res.h5
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small_test_matrix_result.bam
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small_test_matrix_result_sorted.bam
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tad_classification.bed
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-rw-r--r-- |
tad_score.gz
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1309246 |
-rw-r--r-- |