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hicexplorer_hicplottads
directory /test-data/ @ 3:
6323d728dbab
draft
Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or
revset expression
.
name
size
permissions
[up]
drwxr-xr-x
find_TADs/
drwxr-xr-x
Li_et_al_2015.h5
14215139
-rw-r--r--
bedgraph_chrx_2e6_5e6.bg
262649
-rw-r--r--
bigwig_chrx_2e6_5e6.bw
109391
-rw-r--r--
diagnostic_plot.png
12182
-rw-r--r--
dm3_genes.bed.gz
98624
-rw-r--r--
dm3_genes.bed6.gz
33265
-rw-r--r--
domains.bed
33733
-rw-r--r--
hicBuildMatrix_result1.bam
5045696
-rw-r--r--
hicCorrectMatrix_result1.npz.h5
55572
-rw-r--r--
hicCorrelate_heatmap_result1.png
17439
-rw-r--r--
hicCorrelate_scatter_result1.png
9989
-rw-r--r--
hicFindTADs_TAD_score.tabular
821275
-rw-r--r--
hicFindTADs_find_boundaries.bed
0
-rw-r--r--
hicFindTADs_find_boundaries.gff
0
-rw-r--r--
hicFindTADs_find_domains.bed
0
-rw-r--r--
hicFindTADs_find_score.bedgraph
815904
-rw-r--r--
hicMergeMatrixBins_result1.npz.h5
160066
-rw-r--r--
hicPlotDistVsCounts_result1.png
26030
-rw-r--r--
hicPlotDistVsCounts_result2.png
208493
-rw-r--r--
hicPlotTADs_result1.svg
517449
-rw-r--r--
hicSumMatrices_result1.npz.h5
55571
-rw-r--r--
master_TADs_plot.png
452212
-rw-r--r--
master_matrix_plot.png
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-rw-r--r--
merged_matrix.npz.h5
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small_test_R1_unsorted.bam
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small_test_R2_unsorted.bam
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small_test_matrix.h5
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small_test_matrix_50kb_res.h5
125850
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small_test_matrix_result.bam
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-rw-r--r--
small_test_matrix_result_sorted.bam
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-rw-r--r--
tad_classification.bed
164265
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tad_score.gz
1309246
-rw-r--r--