# HG changeset patch # User francesco_lapi # Date 1751537928 0 # Node ID 0bb8dd125b42a8a59af901a28299992d414a379b # Parent 3708b6751876bf6f1b0e09dac51ebc2f4641c984 Uploaded diff -r 3708b6751876 -r 0bb8dd125b42 COBRAxy/local/models/ENGRO2.xml --- a/COBRAxy/local/models/ENGRO2.xml Wed Jul 02 09:35:26 2025 +0000 +++ b/COBRAxy/local/models/ENGRO2.xml Thu Jul 03 10:18:48 2025 +0000 @@ -426,6 +426,17 @@

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pathways: ['Tryptophan metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8103,6 +12459,17 @@

pathways: ['Butanoate metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8120,6 +12487,17 @@

pathways: ['Tryptophan metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8146,6 +12524,17 @@

pathways: ['Cholesterol metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8167,6 +12556,17 @@

pathways: ['Aminoacids uptake/secretion']

+ + + + + + + + + + + @@ -8202,6 +12602,17 @@

pathways: ['Taurine and hypotaurine metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8220,6 +12631,17 @@

pathways: ['Methionine and cysteine metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8239,6 +12661,17 @@

pathways: ['Methionine and cysteine metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8260,6 +12693,17 @@

pathways: ['Methionine and cysteine metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8279,6 +12723,17 @@

pathways: ['Methionine and cysteine metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8295,6 +12750,17 @@

pathways: ['Methionine and cysteine metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8311,6 +12777,17 @@

pathways: ['Sodium-sulfite co-transport']

+ + + + + + + + + + + @@ -8324,6 +12801,17 @@

pathways: ['Sulfite transport']

+ + + + + + + + + + + @@ -8337,6 +12825,17 @@

pathways: ['Phenylanine metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8358,6 +12857,17 @@

pathways: ['Aminoacids uptake/secretion']

+ + + + + + + + + + + @@ -8391,6 +12901,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8412,6 +12933,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8430,6 +12962,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8448,6 +12991,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8464,6 +13018,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8483,6 +13048,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8504,6 +13080,17 @@

pathways: ['Aminoacids uptake/secretion']

+ + + + + + + + + + + @@ -8535,6 +13122,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8555,6 +13153,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8572,6 +13181,17 @@

pathways: ['PropionilCOA transport']

+ + + + + + + + + + + @@ -8586,6 +13206,17 @@

pathways: ['Aminoacids uptake/secretion']

+ + + + + + + + + + + @@ -8620,6 +13251,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8641,6 +13283,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8660,6 +13313,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8679,6 +13343,17 @@

pathways: ['Tryptophan metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8692,6 +13367,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8713,6 +13399,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8731,6 +13428,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8749,6 +13457,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8767,6 +13486,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8784,6 +13514,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8802,6 +13543,17 @@

pathways: ['Aminoacid synthesis/degradation']

+ + + + + + + + + + + @@ -8820,6 +13572,17 @@

pathways: ['Methionine and cysteine metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8835,6 +13598,17 @@

pathways: ['Methionine and cysteine metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8857,6 +13631,17 @@

pathways: ['Methionine and cysteine metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8873,6 +13658,17 @@

pathways: ['Methionine and cysteine metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8888,6 +13684,17 @@

pathways: ['Cholesterol metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8911,6 +13718,17 @@

pathways: ['Glycerophospholipid metabolism']

+ + + + + + + + + + + @@ -8930,6 +13748,17 @@

pathways: ['Pentose phosphate pathway']

+ + + + + + + + + + + @@ -8943,6 +13772,17 @@

pathways: ['Pentose phosphate pathway']

+ + + + + + + + + + + @@ -8958,6 +13798,17 @@

pathways: ['Pentose phosphate pathway']

+ + + + + + + + + + + @@ -8965,12 +13816,23 @@ - +

pathways: ['β-Alanine transport']

 + + + + + + + + + + + @@ -8978,22 +13840,44 @@ - +

pathways: ['β-Alanine exchange']

 + + + + + + + + + + + - +

pathways: ['N-A']

 + + + + + + + + + + + @@ -9010,12 +13894,23 @@ - +

pathways: ['Thymid transport']

 + + + + + + + + + + + @@ -9029,22 +13924,44 @@ - +

pathways: ['Thymidine exchange']

 + + + + + + + + + + + - +

pathways: ['Arginine and proline metabolism']

 + + + + + + + + + + + @@ -9052,22 +13969,44 @@ - +

pathways: ['Exchange reaction']

 + + + + + + + + + + + - +

pathways: ['Arginine and proline metabolism']

 + + + + + + + + + + + @@ -9075,22 +14014,44 @@ - +

pathways: ['4-Aminobutanoate exchange']

 + + + + + + + + + + + - +

pathways: ['Aminoacids uptake/secretion']

 + + + + + + + + + + + @@ -9110,22 +14071,44 @@ - +

pathways: ['Cholesterol exchange']

 + + + + + + + + + + + - - - -

pathways: ['Fatty acids/cholesterol synthesis']

- - + + + +

pathways: ['Fatty acids/cholesterol synthesis']

+ + + + + + + + + + + + + @@ -9133,22 +14116,44 @@ - +

pathways: ['D-Galactose exchange']

 + + + + + + + + + + + - +

pathways: ['Galactose pathway']

 + + + + + + + + + + + @@ -9165,12 +14170,23 @@ - +

pathways: ['Galactose pathway']

 + + + + + + + + + + + @@ -9186,12 +14202,23 @@ - +

pathways: ['Galactose pathway']

 + + + + + + + + + + + @@ -9204,12 +14231,23 @@ - +

pathways: ['Galactose pathway']

 + + + + + + + + + + + @@ -9223,12 +14261,23 @@ - +

pathways: ['Galactose pathway']

 + + + + + + + + + + + @@ -9239,12 +14288,23 @@ - +

pathways: ['Aminoacids uptake/secretion']

 + + + + + + + + + + + @@ -9260,12 +14320,23 @@ - +

pathways: ['Aminoacids uptake/secretion']

 + + + + + + + + + + + @@ -9281,12 +14352,23 @@ - +

pathways: ['Aminoacids uptake/secretion']

 + + + + + + + + + + + @@ -9302,12 +14384,23 @@ - +

pathways: ['Aminoacids uptake/secretion']

 + + + + + + + + + + + @@ -9323,12 +14416,23 @@ - - - -

pathways: ['Fatty acids/cholesterol synthesis']

- - + + + +

pathways: ['Fatty acids/cholesterol synthesis']

+ + + + + + + + + + + + + @@ -9341,12 +14445,23 @@ - - - -

pathways: ['Fatty acids/cholesterol synthesis']

- - + + + +

pathways: ['Fatty acids/cholesterol synthesis']

+ + + + + + + + + + + + + @@ -9359,12 +14474,23 @@ - - - -

pathways: ['Fatty acids/cholesterol synthesis']

- - + + + +

pathways: ['Fatty acids/cholesterol synthesis']

+ + + + + + + + + + + + + @@ -9442,6 +14568,7 @@ + @@ -9464,12 +14591,23 @@ - +

pathways: ['Transport reaction']

 + + + + + + + + + + + @@ -9479,12 +14617,23 @@ - +

pathways: ['Pyruvate decarboxylase']

 + + + + + + + + + + + @@ -9495,12 +14644,23 @@ - +

pathways: ['Krebs cycle']

 + + + + + + + + + + +