# HG changeset patch
# User francesco_lapi
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- Legend:
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- Up-regulated in dataset1= Down-regulated in dataset 2
- Down-regulated in dataset2= Flux-inversion: the flux is in the same direction of the arrow in dataset1, in the opposite direction in dataset2.
- Flux-inversion: same direction of the arrow in dataset1, opposite direction in dataset2.= Fold change under threshold
- Fold change under threshold= Not classified
- Not classified= Not significant
- Not significant= Flux-inversion: the flux is in the same direction of the arrow in dataset2, in the opposite direction in dataset1.
- Flux-inversion: same direction of the arrow in dataset2, opposite direction in dataset1.
-
-
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-
- Tickness is proportional to z-score
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- Tickness is proportional to z-score
- Palm
- Palm
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- Lys
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- Leu
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-
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- ₂
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- FormateTHF
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-
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- ATP
-
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-
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-
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- ⁺
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- 2 HNH
- NH₃
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- ₃5forthf
-
-
- 5forthf
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- 2 H
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- HNADP
- NADP
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-
-
- 5mTHF
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- OrnArg
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- ₃Ci
- CiGly
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- SAH
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- CreatinePATP
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- ADP
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- Creatinine
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- CreatinineH
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- ⁺Pi
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- Glutathione synthesis
- Glutathione synthesis
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- GSSGGSH
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- H
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- NAD⁺
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- ₂GSH
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- NADP⁺
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- H⁺
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- NADPH
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- ATP
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- GlyPi
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-
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- Biomass
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- 0.27 Palm0.20 Chol
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-
-
-
-
-
- Fatty acids / Cholesterol synthesis
- Fatty acids / Cholesterol synthesis
-
-
- ATP
-
- ATPHCO
- HCO⁻
- ⁻₃
-
-
- ₃H
- H⁺
-
- ⁺ADP
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- Pi
-
-
- CoA
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- ACP
-
-
-
-
- CO
- CO₂
-
- ₂
- ACP
- ACP
-
-
- MalCoA
- MalCoA
- CoA
- CoAMalACP
- MalACPACP
- ACP
-
-
- AcCoA
-
- AcCoAHO
- O₂
-
- ₂CoA
- CoAAcAcCoA
- AcAcCoA
-
-
-
- PalmCoA
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- ATP
-
- Palm
-
-
- PalmAcAcACP
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-
- 14 NADPH14 NADP
- 14 NADP⁺
-
-
- ⁺6 HO
- O₂
-
-
- ₂6 CO
- 6 CO₂
-
- ₂6 MalACP
- 6 MalACP7 ACP
- 7 ACP
-
- 14 H
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-
- ⁺
-
-
- HMGCoA
- HMGCoA3 ATP
- 3 ATPCoA
- CoA2 NADPH
-
- 2 NADPH2 NADP
- 2 NADP⁺
-
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-
- 3 ADPCO
- CO₂
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- ₂Pi
- Pi
-
-
-
- 2 PPi
- 2 PPifPP
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- 2 ippPPippPP
- ippPP
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-
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-
- 13 NADPH2
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-
-
- 10 O13 NADP
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-
- ⁺2 PPi
- 2 PPiformate
-
- formate2 CO
- 2 CO₂
-
- ₂Chol
- CholfPP
-
- fPP15 HO
- O₂
-
- ₂
-
-
- 16 H
- 16 H⁺
-
-
- ⁺AcCoA
-
- AcCoAHMGCoA
- HMGCoA
-
-
-
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- aCarn
- aCarnaCarn
- aCarn
-
-
-
-
-
- AcCoA
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- CoA
-
-
-
-
-
-
-
-
- Ammonia detox
- Ammonia detox
-
-
-
-
- 3
- 3NH
-
- NH
-
-
-
- Ci
-
-
- Ci3
- 3NH
-
-
- NHH
- H⁺
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-
- ⁺⁻
- ⁻₃
- ₃HCO
-
- HCO2 ADP
- 2 ADPPi
- Pi
-
- 2 ATP
-
- 2 ATPOrn
-
- OrnH
- H⁺
-
- ⁺
- Orn
-
- OrnH
- H⁺
-
- ⁺
- Ci
-
- CiCP
- CPPi
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- Orn
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- Glycolysis / Gluconeogenesis
- Glycolysis / Gluconeogenesis
- Amino acids uptake/secretion
-
-
- Amino acids uptake/secretionGlc
- GlcGlc
- GlcGal
- GalGal
- GalGal1p
- Gal1pudpg
- udpgG6P
- G6PF6P
- F6PF1,6BP
- F1,6BPGA3P
- GA3PATP
- ATPADP
-
- ADPNAD
- NAD⁺
-
- ⁺NADH
- NADH
-
-
-
-
-
-
- ATP
- ATPADP
- ADP
-
-
-
- ATP
- ATPADP
- ADP
-
-
-
- Pi
- Pi
-
-
-
-
- HO
- O₂
-
- ₂Pi
-
- PiHO
- O₂
-
- ₂Pi
- Pi
-
-
-
-
-
-
-
-
-
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- 1,3BPGA3PG
- 3PG2PG
- 2PGADP
- ADPATP
- ATP
-
-
-
-
- 2,3BPG
-
- 2,3BPGHO
- O₂
-
- ₂Pi
- Pi
-
-
-
-
-
-
-
- PEP
-
- PEP
- Pyr
-
- PyrADP
- ADPATP
- ATP
-
- Lact
-
-
- LactH
- H⁺
-
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-
- NADHNAD
- NAD⁺
-
- ⁺
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- HO
- O₂
-
- ₂
-
-
- G6P
- G6PG1P
- G1Pudpgal
- udpgal
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- Mitochondrial space
- Mitochondrial space
-
-
-
-
- Pi
- Pi
- H
- H⁺
-
- ⁺Pi
- Pi
-
- ATP
- ATPADP
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- ATPADP
- ADP
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- GTP
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- GDPGTP
- GTPGDP
- GDP
-
-
-
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- O₂
-
-
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-
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- O
- O₂
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- ₂
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-
- NADHNAD
- NAD⁺
-
-
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- 0.95 QH₂
-
-
- ₂4.75 H
- 4.75 H⁺
-
- ⁺0.95 Q
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- 0.95 Q3.8 H
- 3.8 H⁺
-
-
- ⁺FADH
- FADH₂
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-
- FADQH
- QH₂
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- ₂Q
- Q
- 2 Cytc-ox
- 2 Cytc-ox2 Cytc-red
- 2 Cytc-redQ
-
- Q2 H
- 2 H⁺
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-
- ⁺QH
- QH₂
-
- ₂
-
- 4 H
- 4 H⁺
-
- ⁺4 Cytc-red
- 4 Cytc-red4 Cytc-ox
-
- 4 Cytc-ox2 HO
- O₂
-
-
- ₂8 H
- 8 H⁺
-
-
- ⁺O
- O₂
-
- ₂
- GSH
- GSHGSH
- GSH
-
-
- Pi
- PiPi
-
- Pi
-
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- GlyGly
-
- GlyMal
- MalAKG
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- AKG
-
-
- ADP
- ADPPi
- PiATP
-
- ATPHO
- O₂
-
-
- ₂4 H
- 4 H⁺
-
- ⁺10-formylTHF
- 10-formylTHF5,10mTHF
-
- 5,10mTHFHO
- O₂
-
- ₂5,10meTHF
- 5,10meTHF
-
-
- NADPH
-
- NADPHNADP
- NADP⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
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- ⁺THF
-
- THFHO
- O₂
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-
- ₂CO
- CO₂
-
-
- ₂CO
- CO₂
-
- ₂
-
-
-
- NADH
- NADHNADPH
-
- NADPHNADP
- NADP⁺
-
-
- ⁺NAD
- NAD⁺
-
- ⁺
-
- H
- H⁺
-
- ⁺
-
- H
- H⁺
-
-
-
-
- ⁺HO
- O₂₂
-
-
- ₂2 HO
- O₂
-
- ₂2 GSH
-
- 2 GSHO
- O₂
- ₂⁻
-
-
- ⁻O
- O₂
- ₂⁻
-
-
- ⁻2 H
- 2 H⁺
-
-
- ⁺O
- O₂
-
- ₂
-
- GSSG
- GSSG
-
-
-
- NADH
-
- NADHH
- H⁺
-
-
- ⁺NAD
- NAD⁺
-
- ⁺NADPH
-
- NADPHH
- H⁺
-
-
- ⁺NADP
- NADP⁺
-
- ⁺
-
-
-
-
-
-
- CO
- CO₂
-
-
- ₂HCO
- HCO₃
- ₃⁻
-
- ⁻
-
- H
- H⁺
-
-
- ⁺HO
- O₂
-
- ₂
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- ADP
-
- ADP
-
- Ser
- SerSer
- Ser
-
-
- 0.05 O
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-
- 0.05 O
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-
- ⁻
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- DHAPDHAP
- DHAPFAD
- FAD
-
- FADH
- FADH₂
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- ₂
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- Gly3PGly3P
- Gly3P
-
-
-
- AcCoA
- AcCoAPyr
- Pyr
-
- NAD
- NAD⁺
-
-
- ⁺NADP
- NADP⁺
-
- ⁺NADH
-
- NADHCO
- CO₂
-
-
- ₂H
- H⁺
-
- ⁺
-
-
- Pi
- PiADP
-
- ADPH
- H⁺
-
- ⁺ATP
-
- ATPHCO
- HCO₃
- ₃⁻
-
-
- ⁻NAD
- NAD⁺
-
- ⁺CoA
-
- CoA2
- 2CO
-
-
- COH
- H⁺
-
- ⁺NADH
- NADH
-
-
-
- NADPH
-
- NADPHH
- H⁺
-
-
- ⁺CO
- CO₂
-
-
- ₂
-
-
- Pi
- Pi
- ATP
- ATP
-
-
- Formate
- Formate
-
- Formate
-
- FormateFormate
- Formate
-
-
-
-
-
-
-
-
- H
- H⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
- ⁺
- H
- H⁺
-
- ⁺Mal
-
- MalH
- H⁺
-
-
- ⁺OAA
- OAACit
- CitIso
- IsoAKG
-
- AKGNADP
- NADP⁺
-
- ⁺SuCoA
- SuCoASucc
- SuccFum
- FumMal
- Mal
- FAD
-
- FADFADH
- FADH₂
-
-
- ₂NAD
- NAD⁺
-
- ⁺
-
- HO
- O₂
-
- ₂
- HO
- O₂
-
- ₂
- HO
- O₂
-
- ₂
- HO
- O₂
- ₂₂
-
- ₂CoA
- CoA
-
-
-
- HO
- O₂
-
- ₂
-
-
-
-
-
- NADH
-
- NADHH
- H⁺
-
- ⁺
- 2H
- 2H⁺
-
- ⁺
-
-
- GDP
- GDPPi
- PiCoA
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- GTP
-
-
-
- CoA
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- CoANAD
- NAD⁺
-
- ⁺
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- NADH
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- NADHCO
- CO₂
-
-
- ₂H
- H⁺
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- NADPH⁺
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- CO₂
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- ₂H
- H⁺
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- ⁺
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- NAD⁺
-
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- ⁺NADH
- NADH⁺
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- H⁺
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- ₂
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- CO₂
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- NADH
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- NAD⁺
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- NH₃
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- NADP⁺
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- ⁺HO
- O₂
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- ₂
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- NADP
- NADP⁺
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- ⁺NADPH
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- DHF
-
-
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- NADP
- NADP⁺
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- NADPHH
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- O₂
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- NAD⁺
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- ⁺
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- Gln
- GlnGlu
- Glu
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- Gln
- Gln
-
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- NH
- NH₃
-
- ₃Glu
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- ₂
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-
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- +H
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- GluSA
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-
- GluSA
-
- GluSA
-
-
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-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
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-
-
- Val, 3mob, propCoAFum
- Fum
-
-
- Pi
- PiPi
- PiFum
-
- Fum
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- 2oxoadp2oxoadp
- 2oxoadp
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-
- AKG
-
-
-
- H
- H⁺
-
-
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- H⁺
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-
- Lys
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- 4mopH
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- ⁺H
- H⁺
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- ⁺
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- AC
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- H⁺
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- ⁺
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- 5,10meTHF5,10meTHF
- 5,10meTHF
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- Val
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- 3mobH
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- ⁺
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- Leu
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- H⁺
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- AcAcCoA
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-
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- ⁺
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- sulfite
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-
- 3sPyr
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- 3sPyr
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-
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-
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-
- Urea cycle
- Urea cycle
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-
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-
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-
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- HO
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-
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- Urea
-
-
-
-
-
-
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- 3
- 3NH
-
-
-
-
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-
-
-
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- Fatty acids β-oxidation
-
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- PalmCarn
- PalmCarnPalmCarn
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-
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-
-
-
-
-
- Carn
- CarnCarn
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- 7 NADH7 H
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-
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- CySS
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- 2 Cys
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- ₃
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- Pyr
-
-
-
-
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- AsnAMP
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- O₂
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- ₃
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-
- Asp
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-
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-
- ⁺NADPH
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- NAD⁺
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- NADP⁺
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-
- Lfmkynr
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- urcan
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- 5forthf
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- Lkynr
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-
- anthH
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- 2oxoadp
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-
-
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- 2obut
- 2obut
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-
- Thr
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- Tyr
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-
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-
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- 3mob
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- Val
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- Leu
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- 5,10meTHF
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- AKG
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-
-
-
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-
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- Nucleotide synthesis
-
-
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-
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- QH
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-
-
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-
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-
-
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-
-
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- Ery4P
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- NADH
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- Cit
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- ₂
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- 3PPyrNADH
-
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- NAD⁺
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- ⁺
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- AC
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-
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-
- ⁻
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- Putr
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- SAM
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- SAH
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- AMP
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- Hcys
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- AKG
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- 4abutn
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- NADH
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- Glu
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- Leu
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-
- Tickness is proportional to z-score
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- Palm
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- Chol
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-
-
- 10formylTHFH
- H⁺
-
-
- ⁺HO
- O₂
-
- ₂
-
-
-
-
-
- HO
- O₂
-
-
- ₂NADP
- NADP⁺
-
- ⁺NADPH
-
- NADPHCO
- CO₂
-
-
- ₂H
- H⁺
-
- ⁺Formate
- FormateTHF
- THFPi
- PiADP
- ADP
-
-
- ATP
- ATP
-
-
-
-
- 5,10mTHF
- 5,10mTHF5,10meTHF
-
- 5,10meTHF
-
-
- NADH
-
- NADHNAD
- NAD⁺
-
-
-
- ⁺
-
- 2 H
-
- 2 HNH
- NH₃
-
- ₃5forthf
-
-
- 5forthf
-
-
- NADPH
-
- NADPHNADP
- NADP⁺
-
-
-
- ⁺
- NADPH
-
- NADPH2
- 2 H
-
- HNADP
- NADP
- 5mTHF
-
-
- 5mTHF
-
-
-
- Orn
- OrnArg
-
- ArgO
- O₂
-
-
- ₂NH
- NH₃
-
- ₃Ci
- CiGly
- GlyGA
- GA
-
-
- Creatine
- CreatineSAM
- SAMSAH
-
- SAH
-
-
-
- CreatineP
- CreatinePATP
- ATPADP
- ADP
-
- Creatinine
-
- CreatinineH
- H⁺
-
- ⁺Pi
- Pi
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- Glutathione synthesis
- Glutathione synthesis
-
-
- GSSG
- GSSGGSSG
-
- GSSGGSH
- GSHGSH
- GSH
-
- H
- H⁺
-
- ⁺NADH
-
- NADHNAD
- NAD⁺
-
-
- ⁺HO
- O₂₂
-
- ₂GSH
- GSH
-
- 2 HO
- O₂
-
- ₂GSH
- GSH
-
-
-
- NADP
- NADP⁺
-
- ⁺GSH
- GSH
-
- H
- H⁺
-
- ⁺NADPH
- NADPH
-
-
-
-
-
-
-
-
- GC
- GCCys
-
- CysATP
- ATP
-
- Gly
- GlyPi
- PiADP
-
-
- ADPATP
- ATP
-
- Glu
- GluPi
- PiADP
-
-
-
- ADP
-
-
-
- Biomass
- Biomass
-
-
- 0.01 dTTP
- 0.01 dTTP0.01 dATP
- 0.01 dATP0.01 dGTP
- 0.01 dGTP0.05 UTP
- 0.05 UTP0.01 dCTP
- 0.01 dCTP0.04CTP
- 0.04CTP0.27 Palm
- 0.27 Palm0.20 Chol
-
- 0.20 Chol0.28 G6P
-
-
- 0.28 G6P20.65 H20
- 20.65 H2020.70 ATP
-
- 20.70 ATP0.04 GTP
- 0.04 GTP0.36 Arg
- 0.36 Arg0.05 Cys
- 0.05 Cys0.39 Glu
- 0.39 Glu0.35 Asp
- 0.35 Asp0.33 Gln
- 0.33 Gln0.28 Asn
- 0.28 Asn0.29 Ile
- 0.29 Ile0.12 His
- 0.12 His0.54 Gly
- 0.54 Gly0.59Lys
- 0.59Lys0.41 Pro
- 0.41 Pro0.26 Phe
- 0.26 Phe0.15 Met
- 0.15 Met0.55 Leu
- 0.55 Leu0.01 Trp
- 0.01 Trp0.31Thr
- 0.31Thr0.16 Tyr
- 0.16 Tyr0.35Val
- 0.35Val0.39 Ser
- 0.39 Ser0.51 Ala
- 0.51 AlaBiomass
- Biomass20.65 Pi
- 20.65 Pi20.65ADP
- 20.65ADP20.65 H
- 20.65 H
-
-
-
-
-
-
-
- Fatty acids / Cholesterol synthesis
- Fatty acids / Cholesterol synthesis
-
-
- ATP
-
- ATPHCO
- HCO⁻
- ⁻₃
-
-
- ₃H
- H⁺
-
- ⁺ADP
- ADPPi
- Pi
-
-
- CoA
- CoAAcACP
- AcACPACP
- ACP
-
-
-
-
- CO
- CO₂
-
- ₂
- ACP
- ACP
-
-
- MalCoA
- MalCoA
- CoA
- CoAMalACP
- MalACPACP
- ACP
-
-
- AcCoA
-
- AcCoAHO
- O₂
-
- ₂CoA
- CoAAcAcCoA
- AcAcCoA
-
-
-
- PalmCoA
- PalmCoACoA
- CoAAMP
- AMPPPi
- PPiATP
- ATP
-
- Palm
-
-
- PalmAcAcACP
- AcAcACP14 NADPH
-
- 14 NADPH14 NADP
- 14 NADP⁺
-
-
- ⁺6 HO
- O₂
-
-
- ₂6 CO
- 6 CO₂
-
- ₂6 MalACP
- 6 MalACP7 ACP
- 7 ACP
-
- 14 H
- 14 H⁺
-
- ⁺
-
-
- HMGCoA
- HMGCoA3 ATP
- 3 ATPCoA
- CoA2 NADPH
-
- 2 NADPH2 NADP
- 2 NADP⁺
-
- ⁺3 ADP
-
- 3 ADPCO
- CO₂
-
- ₂Pi
- Pi
-
-
-
- 2 PPi
- 2 PPifPP
- fPP2 ippPP
- 2 ippPPippPP
- ippPP
-
-
-
- 13 NADPH
-
- 13 NADPH2
- 210 O
-
-
- 10 O13 NADP
- 13 NADP⁺
-
- ⁺2 PPi
- 2 PPiformate
-
- formate2 CO
- 2 CO₂
-
- ₂Chol
- CholfPP
-
- fPP15 HO
- O₂
-
- ₂
-
-
- 16 H
- 16 H⁺
-
-
- ⁺AcCoA
-
- AcCoAHMGCoA
- HMGCoA
-
-
-
-
- aCarn
- aCarnaCarn
- aCarn
-
-
-
-
-
- AcCoA
- AcCoACoA
- CoA
-
-
-
-
-
-
-
-
- Ammonia detox
- Ammonia detox
-
-
-
-
- 3
- 3NH
-
- NH
-
-
-
- Ci
-
-
- Ci3
- 3NH
-
-
- NHH
- H⁺
-
-
- ⁺⁻
- ⁻₃
- ₃HCO
-
- HCO2 ADP
- 2 ADPPi
- Pi
-
- 2 ATP
-
- 2 ATPOrn
-
- OrnH
- H⁺
-
- ⁺
- Orn
-
- OrnH
- H⁺
-
- ⁺
- Ci
-
- CiCP
- CPPi
- PiOrn
- Orn
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- Glycolysis / Gluconeogenesis
- Glycolysis / Gluconeogenesis
- Amino acids uptake/secretion
-
-
- Amino acids uptake/secretionGlc
- GlcGlc
- GlcGal
- GalGal
- GalGal1p
- Gal1pudpg
- udpgG6P
- G6PF6P
- F6PF1,6BP
- F1,6BPGA3P
- GA3PATP
- ATPADP
-
- ADPNAD
- NAD⁺
-
- ⁺NADH
- NADH
-
-
-
-
-
-
- ATP
- ATPADP
- ADP
-
-
-
- ATP
- ATPADP
- ADP
-
-
-
- Pi
- Pi
-
-
-
-
- HO
- O₂
-
- ₂Pi
-
- PiHO
- O₂
-
- ₂Pi
- Pi
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- 1,3BPGA
- 1,3BPGA3PG
- 3PG2PG
- 2PGADP
- ADPATP
- ATP
-
-
-
-
- 2,3BPG
-
- 2,3BPGHO
- O₂
-
- ₂Pi
- Pi
-
-
-
-
-
-
-
- PEP
-
- PEP
- Pyr
-
- PyrADP
- ADPATP
- ATP
-
- Lact
-
-
- LactH
- H⁺
-
- ⁺NADH
-
- NADHNAD
- NAD⁺
-
- ⁺
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- HO
- O₂
-
- ₂
-
-
- G6P
- G6PG1P
- G1Pudpgal
- udpgal
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- Mitochondrial space
- Mitochondrial space
-
-
-
-
- Pi
- Pi
- H
- H⁺
-
- ⁺Pi
- Pi
-
- ATP
- ATPADP
- ADPATP
- ATPADP
- ADP
-
- GTP
- GTPGDP
- GDPGTP
- GTPGDP
- GDP
-
-
-
- HO
- O₂
-
-
- ₂HO
- O₂
-
-
- ₂
- O
- O₂
-
- ₂
- O
- O₂
-
- ₂
-
-
- NADH
-
- NADHNAD
- NAD⁺
-
-
- ⁺0.95 QH
- 0.95 QH₂
-
-
- ₂4.75 H
- 4.75 H⁺
-
- ⁺0.95 Q
-
- 0.95 Q3.8 H
- 3.8 H⁺
-
-
- ⁺FADH
- FADH₂
-
- ₂FAD
-
- FADQH
- QH₂
-
- ₂Q
- Q
- 2 Cytc-ox
- 2 Cytc-ox2 Cytc-red
- 2 Cytc-redQ
-
- Q2 H
- 2 H⁺
-
-
- ⁺QH
- QH₂
-
- ₂
-
- 4 H
- 4 H⁺
-
- ⁺4 Cytc-red
- 4 Cytc-red4 Cytc-ox
-
- 4 Cytc-ox2 HO
- O₂
-
-
- ₂8 H
- 8 H⁺
-
-
- ⁺O
- O₂
-
- ₂
- GSH
- GSHGSH
- GSH
-
-
- Pi
- PiPi
-
- Pi
-
- Gly
- GlyGly
-
- GlyMal
- MalAKG
- AKGAKG
- AKG
-
-
- ADP
- ADPPi
- PiATP
-
- ATPHO
- O₂
-
-
- ₂4 H
- 4 H⁺
-
- ⁺10-formylTHF
- 10-formylTHF5,10mTHF
-
- 5,10mTHFHO
- O₂
-
- ₂5,10meTHF
- 5,10meTHF
-
-
- NADPH
-
- NADPHNADP
- NADP⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
- ⁺THF
-
- THFHO
- O₂
-
-
- ₂CO
- CO₂
-
-
- ₂CO
- CO₂
-
- ₂
-
-
-
- NADH
- NADHNADPH
-
- NADPHNADP
- NADP⁺
-
-
- ⁺NAD
- NAD⁺
-
- ⁺
-
- H
- H⁺
-
- ⁺
-
- H
- H⁺
-
-
-
-
- ⁺HO
- O₂₂
-
-
- ₂2 HO
- O₂
-
- ₂2 GSH
-
- 2 GSHO
- O₂
- ₂⁻
-
-
- ⁻O
- O₂
- ₂⁻
-
-
- ⁻2 H
- 2 H⁺
-
-
- ⁺O
- O₂
-
- ₂
-
- GSSG
- GSSG
-
-
-
- NADH
-
- NADHH
- H⁺
-
-
- ⁺NAD
- NAD⁺
-
- ⁺NADPH
-
- NADPHH
- H⁺
-
-
- ⁺NADP
- NADP⁺
-
- ⁺
-
-
-
-
-
-
- CO
- CO₂
-
-
- ₂HCO
- HCO₃
- ₃⁻
-
- ⁻
-
- H
- H⁺
-
-
- ⁺HO
- O₂
-
- ₂
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- ADP
-
- ADP
-
- Ser
- SerSer
- Ser
-
-
- 0.05 O
- 0.05 O₂
-
- ₂
-
- 0.05 O
- 0.05 O₂
- ₂⁻
-
- ⁻
-
- DHAP
- DHAPDHAP
- DHAPFAD
- FAD
-
- FADH
- FADH₂
-
- ₂
- Gly3P
- Gly3PGly3P
- Gly3P
-
-
-
- AcCoA
- AcCoAPyr
- Pyr
-
- NAD
- NAD⁺
-
-
- ⁺NADP
- NADP⁺
-
- ⁺NADH
-
- NADHCO
- CO₂
-
-
- ₂H
- H⁺
-
- ⁺
-
-
- Pi
- PiADP
-
- ADPH
- H⁺
-
- ⁺ATP
-
- ATPHCO
- HCO₃
- ₃⁻
-
-
- ⁻NAD
- NAD⁺
-
- ⁺CoA
-
- CoA2
- 2CO
-
-
- COH
- H⁺
-
- ⁺NADH
- NADH
-
-
-
- NADPH
-
- NADPHH
- H⁺
-
-
- ⁺CO
- CO₂
-
-
- ₂
-
-
- Pi
- Pi
- ATP
- ATP
-
-
- Formate
- Formate
-
- Formate
-
- FormateFormate
- Formate
-
-
-
-
-
-
-
-
- H
- H⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
- ⁺
- H
- H⁺
-
- ⁺Mal
-
- MalH
- H⁺
-
-
- ⁺OAA
- OAACit
- CitIso
- IsoAKG
-
- AKGNADP
- NADP⁺
-
- ⁺SuCoA
- SuCoASucc
- SuccFum
- FumMal
- Mal
- FAD
-
- FADFADH
- FADH₂
-
-
- ₂NAD
- NAD⁺
-
- ⁺
-
- HO
- O₂
-
- ₂
- HO
- O₂
-
- ₂
- HO
- O₂
-
- ₂
- HO
- O₂
- ₂₂
-
- ₂CoA
- CoA
-
-
-
- HO
- O₂
-
- ₂
-
-
-
-
-
- NADH
-
- NADHH
- H⁺
-
- ⁺
- 2H
- 2H⁺
-
- ⁺
-
-
- GDP
- GDPPi
- PiCoA
- CoAGTP
- GTP
-
-
-
- CoA
-
- CoANAD
- NAD⁺
-
- ⁺
-
- NADH
-
- NADHCO
- CO₂
-
-
- ₂H
- H⁺
-
-
-
- ⁺NADPH
- NADPH⁺
-
-
- ⁺CO
- CO₂
-
-
- ₂H
- H⁺
-
- ⁺
-
-
-
- NAD
- NAD⁺
-
-
- ⁺NADH
- NADH⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
-
- ⁺CO
- CO₂
-
- ₂
- CO
- COCO
- CO₂
-
- ₂
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- NADH
-
- NADHH
- H⁺
-
-
- ⁺NH
- NH₃
-
-
- ₃NAD
- NAD⁺
-
-
- ⁺HO
- O₂
-
- ₂NADPH
-
- NADPHH
- H⁺
-
-
- ⁺NH
- NH₃
-
-
- ₃NADP
- NADP⁺
-
-
- ⁺HO
- O₂
-
-
- ₂
-
-
-
-
-
-
- NADP
- NADP⁺
-
- ⁺NADPH
-
- NADPHH
- H⁺
-
- ⁺DHF
- DHF
-
-
-
- NADP
- NADP⁺
-
- ⁺NADPH
-
- NADPHH
- H⁺
-
- ⁺Folate
- Folate
-
-
-
- 4 H
- 4 H⁺
-
-
- ⁺4 H
- 4 H⁺
-
-
- ⁺NADH
-
- NADHH
- H⁺
-
-
- ⁺HO
- O₂
-
-
- ₂NAD
- NAD⁺
-
- ⁺
-
-
- Gln
- GlnGlu
- Glu
-
- Gln
- Gln
-
-
- NH
- NH₃
-
- ₃Glu
-
- GluHO
- O₂
-
- ₂
-
-
- H
- H⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
-
- ⁺Folate
- Folate
-
-
- +
- +H
-
- HMal
-
- MalGluSA
- GluSA
-
-
- GluSA
-
- GluSA
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- Val, 3mob, propCoA
-
-
- Val, 3mob, propCoAFum
- Fum
-
-
- Pi
- PiPi
- PiFum
-
- Fum
- 2oxoadp
- 2oxoadp2oxoadp
- 2oxoadp
- AKG
- AKGAKG
-
- AKG
-
-
-
- H
- H⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
- ⁺Lys
- LysLys
-
- Lys
- 4mop
- 4mop4mop
-
- 4mopH
- H⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
- ⁺
-
-
-
- AC
- ACAC
- AC
- H
- H⁺
-
- ⁺
- H
- H⁺
-
- ⁺
-
-
-
-
- 5,10meTHF
- 5,10meTHF5,10meTHF
- 5,10meTHF
-
-
-
-
- Val
- ValVal
- Val
-
-
-
-
- propCoA
- propCoApropCoA
- propCoA
-
-
-
-
- 3mob
- 3mob3mob
-
- 3mobH
- H⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
- ⁺
-
-
-
- Leu
- LeuLeu
- Leu
-
-
-
-
-
-
- AKG
- AKGGlu
- Glu
-
-
- Asp
- AspGlu
-
- GluH
- H⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
- ⁺Glu
- Glu
-
-
-
- AcAcCoA
- AcAcCoA
-
- CoA
- CoA2 AcCoA
- 2 AcCoA
-
-
- NADH
-
- NADHNAD
- NAD⁺
-
-
- ⁺H
- H⁺
-
-
- ⁺
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- HMGCoA
- HMGCoALeu, 4mop
- Leu, 4mopLys, 2oxoadp
- Lys, 2oxoadp
- AcCoA
-
- AcCoAHO
- O₂
-
- ₂CoA
-
- CoAH
- H⁺
-
- ⁺
-
- HO
- O₂
-
- ₂
-
-
-
-
-
- asp
- asp3sala
- 3sala3sala
- 3salaH
- HH2O
- 2O
-
-
- sulfite
- sulfite
-
-
- 3sPyr
-
- 3sPyr
-
- Glu
- GluH+AKG
- H+AKG3sPyr
- 3sPyr
-
- Glu
- GluH+AKG
- +AKGH
- HH2O
- 2Osulfite
- sulfite
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- Urea cycle
- Urea cycle
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- Ci
- CiOrn
- OrnArgSuc
- ArgSucArg
- ArgFum
- Fum
-
- HO
- O₂
-
-
- ₂Urea
- Urea
-
-
-
-
-
-
-
- 3
- 3NH
-
-
-
-
- NH
-
-
-
- Fatty acids β-oxidation
- Fatty acids β-oxidation
-
-
- PalmCarn
- PalmCarnPalmCarn
- PalmCarn
-
-
- Carn
- CarnCarn
- CarnPalmCoA
- PalmCoAPalmCoA
- PalmCoA
-
-
-
-
-
- Carn
- CarnCarn
- CarnCoA
- CoACoA
- CoA8 AcCoA
- 8 AcCoA7 FAD
-
- 7 FAD7 NAD
- 7 NAD⁺
-
- ⁺7 CoA
-
- 7 CoA7 HO
- O₂
-
- ₂
-
- 7 FADH
- 7 FADH₂
-
- ₂7 NADH
-
- 7 NADH7 H
- 7 H⁺
-
- ⁺
- AcCoA
- AcCoACarn
- CarnCarn
- CarnCarn
- CarnCoA
- CoACoA
-
-
- CoA
-
-
-
- Amino acids synthesis / degradation
- Amino acids synthesis / degradation
-
-
-
- CySS
- CySS
- 2 GSH
- 2 GSHGSSG
- GSSG2 Cys
- 2 Cys
-
-
-
- H
- H⁺
-
- ⁺NADPH
- NADPHNADP
- NADPNADH
-
- NADHH
- H⁺
-
- ⁺NAD
- NAD
-
-
- HO
- O₂
-
-
- ₂NH
- NH₃
-
- ₃
-
- Pyr
- Pyr
-
-
-
-
- Asn
- AsnAMP
- AMPGlu
- GluPPi
- PPiATP
- ATPGln
-
- GlnHO
- O₂
-
- ₂
-
- HO
- O₂
-
-
- ₂NH
- NH₃
-
- ₃
-
-
- Asp
-
- Asp
- P5C
- P5CPro
- Pro
-
-
-
-
- H
- H⁺
-
- ⁺NADH
-
- NADHH
- H⁺
-
- ⁺NADPH
-
- NADPHNAD
- NAD⁺
-
-
- ⁺NADP
- NADP⁺
-
-
- ⁺GluSA
-
- GluSAHO
- O₂
-
- ₂
-
-
-
-
-
-
-
- NH
- NH₃
-
- ₃Gln
-
- GlnHO
- O₂
-
-
- ₂NH
- NH₃
-
- ₃ATP
- ATP
-
- ADP
- ADPPi
-
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-
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- O₂
-
- ₂Trp
- Trp
-
- Lfmkynr
-
- Lfmkynr
- formate
-
- formateH
- H⁺
-
- ⁺
-
-
- HO
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- urcan
-
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-
- His
-
-
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- ₂
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- 4izpforglu
- forglu
- H
- H⁺
-
- ⁺5forthf
- 5forthf
-
- H
-
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-
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- hpp
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- 4mlacac
-
- O
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- 4fumacac
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-
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- ₂H
- H⁺
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- AcAc
-
-
-
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- CoAATP
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- Lkynr
-
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-
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-
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-
- ₂
-
-
-
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-
-
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-
-
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- 2oxoadp
- 2oxoadp
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
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-
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- propCoANADH
- NADH
- CO
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-
- ₂CoA
- CoANAD
- NAD
-
- 2obut
- 2obut
- NH
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- ₃
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- Thr
-
- Thr
- Tyr
- Tyr
-
-
- AKG
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-
- Glu
- 3mob
- 3mob
- Val
- Val
- Glu
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- AKG
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- 4mop
- 4mop
- Leu
- Leu
- Glu
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- AKG
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- Cyst
- CystCys
-
-
- CysNH
- NH₃
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- ₃2-obut
-
- 2-obutHO
- O₂
-
- ₂
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-
-
-
-
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-
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- GlyTHF
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- 5,10meTHF
-
-
-
-
- HO
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- Ser
-
- SerNH
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-
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- 3PSer
- 3PSerGlu
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- AKG
-
-
-
-
- Ala
- AlaAKG
- AKGGlu
- Glu
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- Nucleotide synthesis
- Nucleotide synthesis
-
-
- ADP
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- dTTP
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-
-
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- Gly2 10fTHF
- 2 10fTHF2 THF
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- 2 Glu4 ATP
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-
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-
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-
- ₂Asp
- Asp2 ATP
-
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- QH₂
-
- ₂2 ADP
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- GlnGlu
-
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-
- QH
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-
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- ₂
-
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- ATP
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-
- ₃CDP
- CDP
- O
- O₂
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- ₂dCDP
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- ATPADP
- ADP
-
-
-
-
-
-
-
- UMP
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-
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-
-
-
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- 4 Pi
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- IMP
- IMP2 Pi
- 2 Pi
-
-
-
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- ADPATP
- ATP
-
-
- ADP
- ADPATP
- ATP
-
-
- ADP
- ADPATP
- ATP
-
-
-
-
- GTP
- GTPAsp
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-
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- NAD⁺
-
-
- ⁺O
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-
- ₂ATP
-
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-
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-
- NADHH
- H⁺
-
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-
- NADP
- NADP⁺
-
-
- ⁺NH
- NH₃
-
-
- ₃H
- H⁺
-
- ⁺NADPH
- NADPH
-
-
-
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-
-
-
-
-
-
-
- ADP
- ADPATP
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- GTP
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
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- Pentose Phosphate pathway
- Pentose Phosphate pathwayGalactose pathway
- Galactose pathway
-
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-
- 6PglNADP
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-
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-
- 6PDGNADP
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-
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-
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-
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- Ru5P
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-
-
-
-
-
- AMP
- AMPudpgal
- udpgaludpg
- udpgATP
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- R5P
-
-
-
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- Xil5P
-
-
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- F6PSed1,7BP
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-
-
-
-
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- Ery4P
-
-
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- GA3PF6P
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- Xil5P
-
-
-
-
-
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-
- ⁺
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- NADH
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-
- Gly3P
-
- GTP
-
- GTPCO
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-
- ₂GDP
- GDP
-
-
-
-
-
-
-
-
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-
-
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- Cit
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-
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-
-
- ₃
-
- NADPH
-
- NADPHH
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-
-
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- CO₂
-
-
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-
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- NAD⁺
-
- ⁺
-
-
-
-
-
-
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- O₂
-
-
- ₂
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- 3PPyrNADH
-
- NADHH
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-
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- NAD⁺
-
- ⁺
-
-
-
-
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-
- AC
-
- AC
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-
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-
-
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-
- ⁻
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-
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- Putr
-
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- ametam
- ametam5mta
-
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- spermidine
-
-
- ametam
- ametam5mta
-
- 5mtaspermine
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-
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-
- SAM5mdr1p
- 5mdr1p
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- 5mdru1p
- 5mdru1p
-
-
-
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- ₂HO
-
-
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- met
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- Gln2 H
- 2 H⁺
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-
-
-
-
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- ADP+PiPi
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- PPi
-
-
- SAM
- SAM
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- 5mTHF
-
-
- SAH
- SAH
-
- HO
- O₂
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-
-
-
-
- Pi
- Piadenine
-
- adenine
-
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- PRPPPPi
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- AMP
-
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- Hcys
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- 5mTHFTHF
-
- THF
-
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- 2 Hformate
-
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- 2kmb
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- AKG
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- ₂
- ₂CO
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-
- CO
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- ATPAMP
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- ⁺
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-
-
-
-
- ₂
- ₂HO
-
- OHis
- His
-
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- 4abutn
- 4abutn
-
- ₂
- ₂HO
-
-
- ONAD
- NAD⁺
-
- ⁺
-
-
- 4abut
-
- 4abut₂
- ₂CO
-
-
- COH
- H⁺
-
- ⁺NADH
- NADH
-
- Glu
-
- Glu
-
-
- ₂
- ₂HO
-
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- O₂
- ₂O
-
-
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- O
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- CySSAla
-
- Ala
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- LeuCySS
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- CySSLeu
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- Leu
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- CySS
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- Glu
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-
- Pi
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- O₂
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- H
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-
- anth
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-
- hcarn
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