--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/input_bcell_command_line.txt	Thu Nov 25 01:26:36 2021 +0000
@@ -0,0 +1,1153 @@
+input: 5C0N_A Chain A of Development of a therapeutic monoclonal antibody that targets secreted fatty acid-binding protein aP2 to treat type 2 diabetes.
+Position	Residue	Score	Assignment
+0	C	0.243	E
+1	D	0.294	E
+2	A	0.340	E
+3	F	0.402	E
+4	V	0.452	E
+5	G	0.469	E
+6	T	0.488	E
+7	W	0.502	E
+8	K	0.522	E
+9	L	0.533	E
+10	V	0.554	E
+11	S	0.562	E
+12	S	0.573	E
+13	E	0.582	E
+14	N	0.576	E
+15	F	0.554	E
+16	D	0.546	E
+17	D	0.545	E
+18	Y	0.535	E
+19	M	0.529	E
+20	K	0.527	E
+21	E	0.520	E
+22	V	0.526	E
+23	G	0.536	E
+24	V	0.547	E
+25	G	0.548	E
+26	F	0.544	E
+27	A	0.542	E
+28	T	0.517	E
+29	R	0.525	E
+30	K	0.521	E
+31	V	0.512	E
+32	A	0.510	E
+33	G	0.508	E
+34	M	0.497	E
+35	A	0.479	E
+36	K	0.472	E
+37	P	0.463	E
+38	N	0.452	E
+39	M	0.450	E
+40	I	0.453	E
+41	I	0.448	E
+42	S	0.458	E
+43	V	0.468	E
+44	N	0.468	E
+45	G	0.466	E
+46	D	0.467	E
+47	L	0.467	E
+48	V	0.460	E
+49	T	0.457	E
+50	I	0.454	E
+51	R	0.447	E
+52	S	0.448	E
+53	E	0.469	E
+54	S	0.486	E
+55	T	0.502	E
+56	F	0.508	E
+57	K	0.509	E
+58	N	0.501	E
+59	T	0.486	E
+60	E	0.477	E
+61	I	0.473	E
+62	S	0.458	E
+63	F	0.454	E
+64	K	0.464	E
+65	L	0.462	E
+66	G	0.468	E
+67	V	0.489	E
+68	E	0.519	E
+69	F	0.531	E
+70	D	0.538	E
+71	E	0.556	E
+72	I	0.569	E
+73	T	0.582	E
+74	A	0.589	E
+75	D	0.577	E
+76	D	0.557	E
+77	R	0.543	E
+78	K	0.523	E
+79	V	0.494	E
+80	K	0.475	E
+81	S	0.455	E
+82	I	0.432	E
+83	I	0.421	E
+84	T	0.427	E
+85	L	0.427	E
+86	D	0.426	E
+87	G	0.437	E
+88	G	0.461	E
+89	A	0.458	E
+90	L	0.473	E
+91	V	0.486	E
+92	Q	0.502	E
+93	V	0.515	E
+94	Q	0.529	E
+95	K	0.540	E
+96	W	0.547	E
+97	D	0.551	E
+98	G	0.560	E
+99	K	0.551	E
+100	S	0.547	E
+101	T	0.543	E
+102	T	0.530	E
+103	I	0.520	E
+104	K	0.515	E
+105	R	0.505	E
+106	K	0.505	E
+107	R	0.507	E
+108	D	0.499	E
+109	G	0.490	E
+110	D	0.468	E
+111	K	0.458	E
+112	L	0.438	E
+113	V	0.433	E
+114	V	0.433	E
+115	E	0.426	E
+116	C	0.415	E
+117	V	0.413	E
+118	M	0.415	E
+119	K	0.424	E
+120	G	0.426	E
+121	V	0.448	E
+122	T	0.442	E
+123	S	0.436	E
+124	T	0.439	E
+125	R	0.447	E
+126	V	0.453	E
+127	Y	0.401	E
+128	E	0.353	E
+129	R	0.308	E
+130	A	0.251	E
+input: 5BVP_A Chain A of The molecular mode of action and species specificity of canakinumab, a human monoclonal antibody neutralizing IL-1beta
+Position	Residue	Score	Assignment
+0	V	0.228	E
+1	R	0.273	E
+2	S	0.308	E
+3	L	0.333	E
+4	N	0.388	E
+5	C	0.399	E
+6	T	0.409	E
+7	L	0.419	E
+8	R	0.440	E
+9	D	0.451	E
+10	S	0.456	E
+11	Q	0.449	E
+12	Q	0.450	E
+13	K	0.430	E
+14	S	0.433	E
+15	L	0.430	E
+16	V	0.424	E
+17	M	0.415	E
+18	S	0.406	E
+19	G	0.390	E
+20	P	0.414	E
+21	Y	0.415	E
+22	E	0.427	E
+23	L	0.425	E
+24	K	0.425	E
+25	A	0.439	E
+26	L	0.456	E
+27	H	0.482	E
+28	L	0.523	E
+29	Q	0.540	E
+30	G	0.576	E
+31	Q	0.591	E
+32	D	0.609	E
+33	M	0.600	E
+34	E	0.582	E
+35	Q	0.542	E
+36	Q	0.512	E
+37	V	0.469	E
+38	V	0.456	E
+39	F	0.437	E
+40	S	0.421	E
+41	M	0.414	E
+42	S	0.436	E
+43	F	0.459	E
+44	V	0.502	E
+45	Q	0.525	E
+46	G	0.552	E
+47	E	0.559	E
+48	E	0.575	E
+49	S	0.584	E
+50	N	0.559	E
+51	D	0.524	E
+52	K	0.485	E
+53	I	0.448	E
+54	P	0.417	E
+55	V	0.394	E
+56	A	0.388	E
+57	L	0.385	E
+58	G	0.388	E
+59	L	0.405	E
+60	K	0.428	E
+61	E	0.439	E
+62	K	0.442	E
+63	N	0.440	E
+64	L	0.441	E
+65	Y	0.434	E
+66	L	0.429	E
+67	S	0.426	E
+68	C	0.427	E
+69	V	0.428	E
+70	L	0.435	E
+71	K	0.448	E
+72	D	0.460	E
+73	D	0.453	E
+74	K	0.454	E
+75	P	0.439	E
+76	T	0.448	E
+77	L	0.459	E
+78	Q	0.477	E
+79	L	0.490	E
+80	E	0.500	E
+81	S	0.521	E
+82	V	0.553	E
+83	D	0.562	E
+84	P	0.591	E
+85	K	0.591	E
+86	N	0.587	E
+87	Y	0.579	E
+88	P	0.559	E
+89	K	0.550	E
+90	K	0.534	E
+91	K	0.523	E
+92	M	0.513	E
+93	E	0.492	E
+94	K	0.475	E
+95	R	0.460	E
+96	F	0.446	E
+97	V	0.460	E
+98	F	0.471	E
+99	N	0.485	E
+100	K	0.499	E
+101	I	0.512	E
+102	E	0.538	E
+103	I	0.543	E
+104	N	0.559	E
+105	N	0.539	E
+106	K	0.536	E
+107	L	0.510	E
+108	E	0.490	E
+109	F	0.477	E
+110	E	0.469	E
+111	S	0.448	E
+112	A	0.447	E
+113	Q	0.418	E
+114	F	0.422	E
+115	P	0.394	E
+116	N	0.385	E
+117	W	0.376	E
+118	Y	0.370	E
+119	I	0.383	E
+120	S	0.391	E
+121	T	0.406	E
+122	S	0.433	E
+123	Q	0.448	E
+124	A	0.474	E
+125	E	0.481	E
+126	N	0.491	E
+127	M	0.475	E
+128	P	0.451	E
+129	V	0.453	E
+130	F	0.454	E
+131	L	0.456	E
+132	G	0.473	E
+133	G	0.488	E
+134	G	0.508	E
+135	G	0.516	E
+136	Q	0.540	E
+137	D	0.535	E
+138	I	0.521	E
+139	T	0.493	E
+140	D	0.485	E
+141	F	0.478	E
+142	T	0.468	E
+143	M	0.466	E
+144	Q	0.471	E
+145	F	0.414	E
+146	V	0.376	E
+147	S	0.328	E
+148	S	0.290	E
+input: 4XAK_A Chain A of Crystal structure of potent neutralizing antibody m336 in complex with MERS Co-V RBD
+Position	Residue	Score	Assignment
+0	V	0.269	E
+1	E	0.332	E
+2	C	0.394	E
+3	D	0.452	E
+4	F	0.519	E
+5	S	0.526	E
+6	P	0.542	E
+7	L	0.539	E
+8	L	0.532	E
+9	S	0.525	E
+10	G	0.525	E
+11	T	0.519	E
+12	P	0.523	E
+13	P	0.513	E
+14	Q	0.501	E
+15	V	0.501	E
+16	Y	0.503	E
+17	N	0.505	E
+18	F	0.505	E
+19	K	0.493	E
+20	R	0.489	E
+21	L	0.495	E
+22	V	0.501	E
+23	F	0.521	E
+24	T	0.531	E
+25	N	0.544	E
+26	C	0.542	E
+27	N	0.548	E
+28	Y	0.565	E
+29	N	0.561	E
+30	L	0.559	E
+31	T	0.560	E
+32	K	0.548	E
+33	L	0.552	E
+34	L	0.550	E
+35	S	0.556	E
+36	L	0.569	E
+37	F	0.566	E
+38	S	0.579	E
+39	V	0.580	E
+40	N	0.571	E
+41	D	0.576	E
+42	F	0.573	E
+43	T	0.564	E
+44	C	0.569	E
+45	S	0.551	E
+46	Q	0.542	E
+47	I	0.538	E
+48	S	0.518	E
+49	P	0.512	E
+50	A	0.513	E
+51	A	0.511	E
+52	I	0.522	E
+53	A	0.530	E
+54	S	0.545	E
+55	N	0.554	E
+56	C	0.562	E
+57	Y	0.570	E
+58	S	0.577	E
+59	S	0.567	E
+60	L	0.558	E
+61	I	0.547	E
+62	L	0.536	E
+63	D	0.531	E
+64	Y	0.519	E
+65	F	0.515	E
+66	S	0.525	E
+67	Y	0.536	E
+68	P	0.549	E
+69	L	0.562	E
+70	S	0.572	E
+71	M	0.582	E
+72	K	0.593	E
+73	S	0.610	E
+74	D	0.628	E
+75	L	0.625	E
+76	S	0.618	E
+77	V	0.608	E
+78	S	0.590	E
+79	S	0.582	E
+80	A	0.579	E
+81	G	0.568	E
+82	P	0.563	E
+83	I	0.549	E
+84	S	0.547	E
+85	Q	0.555	E
+86	F	0.569	E
+87	N	0.581	E
+88	Y	0.578	E
+89	K	0.582	E
+90	Q	0.582	E
+91	S	0.572	E
+92	F	0.568	E
+93	S	0.569	E
+94	N	0.561	E
+95	P	0.536	E
+96	T	0.525	E
+97	C	0.516	E
+98	L	0.507	E
+99	I	0.500	E
+100	L	0.505	E
+101	A	0.511	E
+102	T	0.520	E
+103	V	0.513	E
+104	P	0.523	E
+105	H	0.534	E
+106	N	0.538	E
+107	L	0.531	E
+108	T	0.539	E
+109	T	0.529	E
+110	I	0.518	E
+111	T	0.501	E
+112	K	0.510	E
+113	P	0.504	E
+114	L	0.499	E
+115	K	0.507	E
+116	Y	0.520	E
+117	S	0.525	E
+118	Y	0.532	E
+119	I	0.534	E
+120	N	0.547	E
+121	K	0.545	E
+122	C	0.558	E
+123	S	0.556	E
+124	R	0.560	E
+125	F	0.559	E
+126	L	0.557	E
+127	S	0.559	E
+128	D	0.556	E
+129	D	0.539	E
+130	R	0.532	E
+131	T	0.532	E
+132	E	0.530	E
+133	V	0.527	E
+134	P	0.533	E
+135	Q	0.527	E
+136	L	0.552	E
+137	V	0.570	E
+138	N	0.591	E
+139	A	0.607	E
+140	N	0.604	E
+141	Q	0.604	E
+142	Y	0.603	E
+143	S	0.588	E
+144	P	0.582	E
+145	C	0.549	E
+146	V	0.523	E
+147	S	0.512	E
+148	I	0.506	E
+149	V	0.505	E
+150	P	0.514	E
+151	S	0.512	E
+152	T	0.512	E
+153	V	0.512	E
+154	W	0.521	E
+155	E	0.522	E
+156	D	0.518	E
+157	G	0.505	E
+158	D	0.517	E
+159	Y	0.520	E
+160	Y	0.522	E
+161	R	0.528	E
+162	K	0.532	E
+163	Q	0.530	E
+164	L	0.545	E
+165	S	0.547	E
+166	P	0.558	E
+167	L	0.546	E
+168	E	0.539	E
+169	G	0.540	E
+170	G	0.540	E
+171	G	0.544	E
+172	W	0.562	E
+173	L	0.558	E
+174	V	0.580	E
+175	A	0.583	E
+176	S	0.589	E
+177	G	0.597	E
+178	S	0.610	E
+179	T	0.616	E
+180	V	0.628	E
+181	A	0.627	E
+182	M	0.626	E
+183	T	0.621	E
+184	E	0.627	E
+185	Q	0.623	E
+186	L	0.607	E
+187	Q	0.589	E
+188	M	0.571	E
+189	G	0.556	E
+190	F	0.545	E
+191	G	0.551	E
+192	I	0.549	E
+193	T	0.542	E
+194	V	0.548	E
+195	Q	0.558	E
+196	Y	0.572	E
+197	G	0.587	E
+198	T	0.587	E
+199	T	0.584	E
+200	N	0.574	E
+201	S	0.567	E
+202	V	0.564	E
+203	C	0.570	E
+204	P	0.564	E
+205	K	0.560	E
+206	L	0.495	E
+207	E	0.437	E
+208	F	0.378	E
+209	A	0.320	E
+input: 4WFF_A Chain A of Human TRAAK K+ channel in a K+ bound nonconductive conformation
+Position	Residue	Score	Assignment
+0	R	0.182	E
+1	S	0.223	E
+2	T	0.268	E
+3	T	0.291	E
+4	L	0.316	E
+5	L	0.313	E
+6	A	0.310	E
+7	L	0.295	E
+8	L	0.285	E
+9	A	0.279	E
+10	L	0.269	E
+11	V	0.252	E
+12	L	0.251	E
+13	L	0.266	E
+14	Y	0.276	E
+15	L	0.291	E
+16	V	0.313	E
+17	S	0.324	E
+18	G	0.309	E
+19	A	0.328	E
+20	L	0.351	E
+21	V	0.358	E
+22	F	0.366	E
+23	R	0.398	E
+24	A	0.426	E
+25	L	0.440	E
+26	E	0.464	E
+27	Q	0.507	E
+28	P	0.524	E
+29	H	0.533	E
+30	E	0.572	E
+31	Q	0.593	E
+32	Q	0.591	E
+33	A	0.574	E
+34	Q	0.574	E
+35	R	0.572	E
+36	E	0.572	E
+37	L	0.566	E
+38	G	0.575	E
+39	E	0.566	E
+40	V	0.537	E
+41	R	0.528	E
+42	E	0.548	E
+43	K	0.549	E
+44	F	0.545	E
+45	L	0.541	E
+46	R	0.542	E
+47	A	0.536	E
+48	H	0.541	E
+49	P	0.567	E
+50	C	0.572	E
+51	V	0.584	E
+52	S	0.577	E
+53	D	0.583	E
+54	Q	0.577	E
+55	E	0.550	E
+56	L	0.533	E
+57	G	0.526	E
+58	L	0.507	E
+59	L	0.471	E
+60	I	0.444	E
+61	K	0.443	E
+62	E	0.432	E
+63	V	0.416	E
+64	A	0.443	E
+65	D	0.455	E
+66	A	0.463	E
+67	L	0.473	E
+68	G	0.514	E
+69	G	0.532	E
+70	G	0.553	E
+71	A	0.588	E
+72	D	0.623	E
+73	P	0.631	E
+74	E	0.647	E
+75	T	0.651	E
+76	S	0.653	E
+77	H	0.645	E
+78	S	0.627	E
+79	A	0.610	E
+80	W	0.577	E
+81	D	0.544	E
+82	L	0.519	E
+83	G	0.493	E
+84	S	0.457	E
+85	A	0.424	E
+86	F	0.395	E
+87	F	0.380	E
+88	F	0.353	E
+89	S	0.339	E
+90	G	0.338	E
+91	T	0.348	E
+92	I	0.365	E
+93	I	0.394	E
+94	T	0.435	E
+95	T	0.477	E
+96	I	0.501	E
+97	G	0.534	E
+98	Y	0.562	E
+99	G	0.573	E
+100	N	0.595	E
+101	V	0.583	E
+102	A	0.581	E
+103	L	0.573	E
+104	R	0.549	E
+105	T	0.538	E
+106	D	0.520	E
+107	A	0.490	E
+108	G	0.467	E
+109	R	0.417	E
+110	L	0.389	E
+111	F	0.357	E
+112	C	0.321	E
+113	I	0.301	E
+114	F	0.277	E
+115	Y	0.263	E
+116	A	0.260	E
+117	L	0.270	E
+118	V	0.277	E
+119	G	0.286	E
+120	I	0.289	E
+121	P	0.310	E
+122	L	0.316	E
+123	F	0.322	E
+124	G	0.329	E
+125	I	0.339	E
+126	L	0.347	E
+127	L	0.366	E
+128	A	0.393	E
+129	G	0.430	E
+130	V	0.444	E
+131	G	0.458	E
+132	D	0.472	E
+133	R	0.484	E
+134	L	0.485	E
+135	G	0.504	E
+136	S	0.510	E
+137	S	0.500	E
+138	L	0.497	E
+139	R	0.493	E
+140	H	0.499	E
+141	G	0.505	E
+142	I	0.518	E
+143	G	0.529	E
+144	H	0.526	E
+145	I	0.528	E
+146	E	0.543	E
+147	A	0.550	E
+148	I	0.567	E
+149	F	0.585	E
+150	L	0.604	E
+151	K	0.606	E
+152	W	0.617	E
+153	H	0.628	E
+154	V	0.644	E
+155	P	0.648	E
+156	P	0.664	E
+157	E	0.648	E
+158	L	0.642	E
+159	V	0.638	E
+160	R	0.630	E
+161	V	0.627	E
+162	L	0.619	E
+163	S	0.607	E
+164	A	0.604	E
+165	M	0.569	E
+166	L	0.564	E
+167	F	0.532	E
+168	L	0.493	E
+169	L	0.466	E
+170	I	0.433	E
+171	G	0.401	E
+172	C	0.356	E
+173	L	0.305	E
+174	L	0.282	E
+175	F	0.261	E
+176	V	0.255	E
+177	L	0.261	E
+178	T	0.262	E
+179	P	0.263	E
+180	T	0.271	E
+181	F	0.304	E
+182	V	0.342	E
+183	F	0.379	E
+184	C	0.420	E
+185	Y	0.445	E
+186	M	0.481	E
+187	E	0.509	E
+188	D	0.532	E
+189	W	0.540	E
+190	S	0.528	E
+191	K	0.515	E
+192	L	0.470	E
+193	E	0.427	E
+194	A	0.393	E
+195	I	0.352	E
+196	Y	0.320	E
+197	F	0.288	E
+198	V	0.262	E
+199	V	0.253	E
+200	T	0.243	E
+201	L	0.258	E
+202	T	0.280	E
+203	T	0.318	E
+204	V	0.345	E
+205	G	0.372	E
+206	F	0.404	E
+207	G	0.431	E
+208	D	0.459	E
+209	Y	0.488	E
+210	V	0.513	E
+211	A	0.538	E
+212	G	0.559	E
+213	A	0.578	E
+214	D	0.591	E
+215	P	0.602	E
+216	R	0.624	E
+217	Q	0.639	E
+218	D	0.638	E
+219	S	0.631	E
+220	P	0.607	E
+221	A	0.579	E
+222	Y	0.545	E
+223	Q	0.519	E
+224	P	0.487	E
+225	L	0.446	E
+226	V	0.400	E
+227	W	0.365	E
+228	F	0.329	E
+229	W	0.304	E
+230	I	0.282	E
+231	L	0.281	E
+232	L	0.288	E
+233	G	0.281	E
+234	L	0.274	E
+235	A	0.285	E
+236	Y	0.293	E
+237	F	0.317	E
+238	A	0.339	E
+239	S	0.367	E
+240	V	0.360	E
+241	L	0.349	E
+242	T	0.374	E
+243	T	0.406	E
+244	I	0.403	E
+245	G	0.427	E
+246	N	0.435	E
+247	W	0.426	E
+248	L	0.372	E
+249	R	0.337	E
+250	V	0.296	E
+251	V	0.243	E
+input: 4WFF_B Chain B of Human TRAAK K+ channel in a K+ bound nonconductive conformation
+Position	Residue	Score	Assignment
+0	R	0.185	E
+1	S	0.226	E
+2	T	0.274	E
+3	T	0.297	E
+4	L	0.323	E
+5	L	0.319	E
+6	A	0.314	E
+7	L	0.300	E
+8	L	0.291	E
+9	A	0.286	E
+10	L	0.275	E
+11	V	0.255	E
+12	L	0.253	E
+13	L	0.269	E
+14	Y	0.281	E
+15	L	0.297	E
+16	V	0.318	E
+17	S	0.327	E
+18	G	0.314	E
+19	A	0.333	E
+20	L	0.360	E
+21	V	0.368	E
+22	F	0.375	E
+23	R	0.406	E
+24	A	0.438	E
+25	L	0.455	E
+26	E	0.484	E
+27	Q	0.526	E
+28	P	0.543	E
+29	H	0.551	E
+30	E	0.589	E
+31	Q	0.610	E
+32	Q	0.609	E
+33	A	0.586	E
+34	Q	0.581	E
+35	R	0.576	E
+36	E	0.577	E
+37	L	0.570	E
+38	G	0.581	E
+39	E	0.575	E
+40	V	0.548	E
+41	R	0.528	E
+42	E	0.551	E
+43	K	0.552	E
+44	F	0.546	E
+45	L	0.537	E
+46	R	0.538	E
+47	A	0.531	E
+48	H	0.534	E
+49	P	0.556	E
+50	C	0.569	E
+51	V	0.578	E
+52	S	0.573	E
+53	D	0.577	E
+54	Q	0.575	E
+55	E	0.546	E
+56	L	0.520	E
+57	G	0.509	E
+58	L	0.490	E
+59	L	0.456	E
+60	I	0.426	E
+61	K	0.424	E
+62	E	0.413	E
+63	V	0.393	E
+64	A	0.418	E
+65	D	0.436	E
+66	A	0.444	E
+67	L	0.442	E
+68	G	0.480	E
+69	G	0.503	E
+70	G	0.523	E
+71	A	0.552	E
+72	D	0.591	E
+73	P	0.618	E
+74	E	0.634	E
+75	T	0.649	E
+76	Q	0.682	E
+77	S	0.682	E
+78	S	0.684	E
+79	H	0.673	E
+80	S	0.651	E
+81	A	0.632	E
+82	W	0.607	E
+83	D	0.587	E
+84	L	0.553	E
+85	G	0.535	E
+86	S	0.516	E
+87	A	0.482	E
+88	F	0.458	E
+89	F	0.434	E
+90	F	0.403	E
+91	S	0.371	E
+92	G	0.349	E
+93	T	0.357	E
+94	I	0.350	E
+95	I	0.355	E
+96	T	0.375	E
+97	T	0.405	E
+98	I	0.441	E
+99	G	0.478	E
+100	Y	0.524	E
+101	G	0.569	E
+102	N	0.598	E
+103	V	0.602	E
+104	A	0.619	E
+105	L	0.623	E
+106	R	0.621	E
+107	T	0.616	E
+108	D	0.603	E
+109	A	0.576	E
+110	G	0.541	E
+111	R	0.497	E
+112	L	0.463	E
+113	F	0.425	E
+114	C	0.390	E
+115	I	0.347	E
+116	F	0.316	E
+117	Y	0.294	E
+118	A	0.282	E
+119	L	0.284	E
+120	V	0.287	E
+121	G	0.299	E
+122	I	0.300	E
+123	P	0.313	E
+124	L	0.324	E
+125	F	0.329	E
+126	G	0.338	E
+127	I	0.352	E
+128	L	0.362	E
+129	L	0.381	E
+130	A	0.403	E
+131	G	0.440	E
+132	V	0.464	E
+133	G	0.484	E
+134	D	0.501	E
+135	R	0.524	E
+136	L	0.538	E
+137	G	0.553	E
+138	S	0.555	E
+139	S	0.555	E
+140	L	0.549	E
+141	R	0.542	E
+142	H	0.547	E
+143	G	0.553	E
+144	I	0.563	E
+145	G	0.564	E
+146	H	0.573	E
+147	I	0.590	E
+148	E	0.593	E
+149	A	0.602	E
+150	I	0.616	E
+151	F	0.629	E
+152	L	0.644	E
+153	K	0.637	E
+154	W	0.641	E
+155	H	0.642	E
+156	V	0.640	E
+157	P	0.649	E
+158	P	0.665	E
+159	E	0.654	E
+160	L	0.645	E
+161	V	0.631	E
+162	R	0.619	E
+163	V	0.598	E
+164	L	0.577	E
+165	S	0.557	E
+166	A	0.548	E
+167	M	0.522	E
+168	L	0.533	E
+169	F	0.527	E
+170	L	0.529	E
+171	L	0.545	E
+172	I	0.559	E
+173	G	0.562	E
+174	C	0.549	E
+175	L	0.517	E
+176	L	0.485	E
+177	F	0.447	E
+178	V	0.429	E
+179	L	0.411	E
+180	T	0.391	E
+181	P	0.387	E
+182	T	0.387	E
+183	F	0.407	E
+184	V	0.438	E
+185	F	0.471	E
+186	C	0.503	E
+187	Y	0.524	E
+188	M	0.538	E
+189	E	0.543	E
+190	D	0.530	E
+191	W	0.526	E
+192	S	0.505	E
+193	K	0.479	E
+194	L	0.454	E
+195	E	0.413	E
+196	A	0.371	E
+197	I	0.335	E
+198	Y	0.302	E
+199	F	0.281	E
+200	V	0.254	E
+201	I	0.255	E
+202	V	0.260	E
+203	T	0.267	E
+204	L	0.287	E
+205	T	0.318	E
+206	T	0.355	E
+207	V	0.387	E
+208	G	0.421	E
+209	F	0.451	E
+210	G	0.461	E
+211	D	0.478	E
+212	Y	0.493	E
+213	V	0.513	E
+214	A	0.538	E
+215	G	0.558	E
+216	A	0.578	E
+217	D	0.592	E
+218	P	0.604	E
+219	R	0.626	E
+220	Q	0.640	E
+221	D	0.637	E
+222	S	0.628	E
+223	P	0.603	E
+224	A	0.572	E
+225	Y	0.538	E
+226	Q	0.511	E
+227	P	0.480	E
+228	L	0.441	E
+229	V	0.398	E
+230	W	0.368	E
+231	F	0.337	E
+232	W	0.312	E
+233	I	0.289	E
+234	L	0.289	E
+235	L	0.297	E
+236	G	0.288	E
+237	L	0.279	E
+238	A	0.286	E
+239	Y	0.290	E
+240	F	0.304	E
+241	A	0.325	E
+242	S	0.350	E
+243	V	0.349	E
+244	L	0.335	E
+245	T	0.357	E
+246	T	0.390	E
+247	I	0.397	E
+248	G	0.413	E
+249	N	0.374	E
+250	W	0.329	E
+251	L	0.278	E
+252	R	0.237	E
+input: 4Z5R_A Chain A of Rontalizumab Fab bound to Interferon-a2
+Position	Residue	Score	Assignment
+0	L	0.257	E
+1	G	0.312	E
+2	S	0.367	E
+3	R	0.427	E
+4	R	0.476	E
+5	T	0.462	E
+6	L	0.471	E
+7	M	0.472	E
+8	L	0.444	E
+9	L	0.458	E
+10	A	0.472	E
+11	Q	0.484	E
+12	M	0.492	E
+13	R	0.505	E
+14	K	0.544	E
+15	I	0.553	E
+16	S	0.552	E
+17	L	0.588	E
+18	F	0.578	E
+19	S	0.571	E
+20	C	0.572	E
+21	L	0.575	E
+22	K	0.579	E
+23	D	0.564	E
+24	R	0.569	E
+25	H	0.568	E
+26	D	0.555	E
+27	F	0.552	E
+28	G	0.550	E
+29	F	0.542	E
+30	P	0.533	E
+31	Q	0.542	E
+32	E	0.554	E
+33	E	0.562	E
+34	F	0.583	E
+35	G	0.602	E
+36	N	0.603	E
+37	Q	0.605	E
+38	F	0.608	E
+39	Q	0.600	E
+40	K	0.568	E
+41	A	0.552	E
+42	E	0.509	E
+43	T	0.464	E
+44	I	0.439	E
+45	P	0.414	E
+46	V	0.378	E
+47	L	0.349	E
+48	H	0.343	E
+49	E	0.352	E
+50	M	0.338	E
+51	I	0.355	E
+52	Q	0.391	E
+53	Q	0.377	E
+54	I	0.377	E
+55	F	0.409	E
+56	N	0.438	E
+57	L	0.461	E
+58	F	0.491	E
+59	S	0.535	E
+60	T	0.563	E
+61	K	0.575	E
+62	D	0.604	E
+63	S	0.621	E
+64	S	0.624	E
+65	A	0.626	E
+66	A	0.617	E
+67	W	0.593	E
+68	D	0.556	E
+69	E	0.530	E
+70	T	0.517	E
+71	L	0.479	E
+72	L	0.478	E
+73	D	0.467	E
+74	K	0.449	E
+75	F	0.417	E
+76	Y	0.426	E
+77	T	0.442	E
+78	E	0.443	E
+79	L	0.434	E
+80	Y	0.463	E
+81	Q	0.468	E
+82	Q	0.458	E
+83	L	0.484	E
+84	N	0.508	E
+85	D	0.476	E
+86	L	0.476	E
+87	E	0.482	E
+88	A	0.497	E
+89	C	0.502	E
+90	V	0.512	E
+91	I	0.535	E
+92	Q	0.528	E
+93	G	0.538	E
+94	M	0.560	E
+95	K	0.568	E
+96	E	0.570	E
+97	D	0.560	E
+98	S	0.531	E
+99	I	0.524	E
+100	L	0.525	E
+101	A	0.513	E
+102	V	0.486	E
+103	R	0.482	E
+104	K	0.480	E
+105	Y	0.455	E
+106	F	0.456	E
+107	Q	0.486	E
+108	R	0.476	E
+109	I	0.444	E
+110	T	0.444	E
+111	L	0.468	E
+112	Y	0.480	E
+113	L	0.472	E
+114	K	0.495	E
+115	E	0.491	E
+116	K	0.480	E
+117	K	0.481	E
+118	Y	0.485	E
+119	S	0.475	E
+120	P	0.463	E
+121	C	0.445	E
+122	A	0.414	E
+123	W	0.402	E
+124	E	0.394	E
+125	V	0.384	E
+126	V	0.362	E
+127	R	0.389	E
+128	A	0.398	E
+129	E	0.387	E
+130	I	0.370	E
+131	M	0.400	E
+132	R	0.411	E
+133	S	0.405	E
+134	F	0.423	E
+135	S	0.446	E
+136	L	0.429	E
+137	S	0.432	E
+138	T	0.446	E
+139	N	0.468	E
+140	L	0.447	E
+141	Q	0.392	E
+142	E	0.355	E
+143	S	0.294	E
+144	L	0.242	E
+