Mercurial > repos > bjoern-gruening > augustus
view test-data/human_augustus.fa @ 6:e664f2137b03 default tip
Merge multiple heads.
author | Dave Bouvier <dave@bx.psu.edu> |
---|---|
date | Mon, 27 Jan 2014 14:04:46 -0500 |
parents | a4fab0c1ae1a |
children |
line wrap: on
line source
>HS04636 gagctcacattaactatttacagggtaactgcttaggaccagtattatgaggagaattta cctttcccgcctctctttccaagaaacaaggagggggtgaaggtacggagaacagtattt cttctgttgaaagcaacttagctacaaagataaattacagctatgtacactgaaggtagc tatttcattccacaaaataagagttttttaaaaagctatgtatgtatgtgctgcatatag agcagatatacagcctattaagcgtcgtcactaaaacataaaacatgtcagcctttctta accttactcgccccagtctgtcccgacgtgacttcctcgaccctctaaagacgtacagac cagacacggcggcggcggcgggagaggggattccctgcgcccccggacctcagggccgct cagattcctggagaggaagccaagtgtccttctgccctcccccggtatcccatccaaggc gatcagtccagaactggctctcggaagcgctcgggcaaagactgcgaagaagaaaagaca tctggcggaaacctgtgcgcctggggcggtggaactcggggaggagagggagggatcaga caggagagtggggactaccccctctgctcccaaattggggcagcttcctgggtttccgat tttctcatttccgtgggtaaaaaaccctgcccccaccgggcttacgcaatttttttaagg ggagaggagggaaaaaatttgtgggggggtacgaaaaggcggaaagaaacagtcattcac atgggcttggttttcagtcttataaaaaggaaggttctctcggttagcgaccaattgtca tacgacttgcagtgagcgtcaggagcacgtccaggaactcctcagcagcgcctccttcag ctccacagccagacgccctcagacagcaaagcctacccccgcgccgcgccctgcccgccg ctcggatgctcgcccgcgccctgctgctgtgcgcggtcctggcgctcagccatacaggtg agtacctggcgccgcgcaccggggactccggttccacgcacccgggcagagtttccgctc tgacctcctgggtctatcccagtactccgacttctctccgaatagagaagctacgtgact tgggaaagagcttggaccgctagagtccgaaagaactccgtggatattccagctttccca caagcactgatcattatgagccagttacttaaccgatctgagacactctcacctcctaaa tagggatagatgatactaatttgcaggttgtcattatgataagacaggatctgatcaata tatgtgaattgtttatatttggaacctttttattgagtggaagaagttgttttaaatatt ctagtcagttctttcctgctcccaggaaagcccggattatgttttaagataagcaaaatg tcttaaaagtaagctgttttactttgaatttttccctaaatgttgattagtgtactagat ccattttaatttggaaagtgaagtgctacttatttgaacttcttaaaaatgctaatttta acatctaaagagttaactaagaaaagcttagtaacatgatgtaccaagttgaatatgctg ttatccttatttagaatagaaaattggtatttctacgttttatccattctaaggcaggtt aaaaaattgtatttccatgactacctatatatttcttgaatttattattgtaaagttgat tcatagtcaaacaattaaatgtttaaattaagattaagacactagagaatgatttatttg ctgtcctttaattgcagcaaatccttgctgttcccacccatgtcaaaaccgaggtgtatg tatgagtgtgggatttgaccagtataagtgcgattgtacccggacaggattctatggaga aaactgctcaacacgtaagtttgtcctttggttgcctcattaggagtggggctggataca gttatcattgtatagatttgtgtcttataatgagtcccattaatttctccctccctttct tcgtcttcttgcagcggaatttttgacaagaataaaattatttctgaaacccactccaaa cacagtgcactacatacttacccacttcaagggattttggaacgttgtgaataacattcc cttccttcgaaatgcaattatgagttatgtcttgacatgtaagtacaagtgtctttctaa ggtttttagccttctcaaagaaaaatatgctttataatactgtaagcctaatctaaaaac atatttccaagcttatcaaaaagactttaagatagcttttaagtttgccttccatcttaa tcgccaaaaatattgacatttagtcccatccagtttatacagtctgctcacaactctgta tacctcttctaacctttactgtttggtcagtttgtggaggtagcatggtccagctgttta ttgaatgcccatgggccacagaattgttctgaacatgtagcacccattaaaataaatttg gatttggatcagcaagaaaataactttccatgattctaaagtgggtgccatactcagcca ttcctttcataggcctcttggatagtgagcagatggctacctgaaaaatcaatattgcca gattataatgtgcagagtatatgtattttattaaagatgtatttcaagtggccattagac tataaagtgtagttgtttaaaaatagattttttttattttggagttacattcaacctcag gtgccactttccacattttacaataaaaataatggttgatttacttaacaaatgagaata aataaaacatttttttctttgaaaatttcagccagatcacatttgattgacagtccacca acttacaatgctgactatggctacaaaagctgggaagccttctctaacctctcctattat actagagcccttcctcctgtgcctgatgattgcccgactcccttgggtgtcaaaggtgag taagaagaatccattagagatgtattaactataagacgggctgcattgctgccaaaaaaa aaaattgaccttagactaccatttatttattaacaaaagcagtttttacttttagcatgg ttatctatgggtattttttaaagtatgagtctatataaactattatgtaaaagcaaatga gcgtcttggtataatgtcttaatattttcaaattatttctttagaaatgaaataattcta attaaaatagataaaatcattcagtaagaagttgttccaccatatcttagaactgttgtt tatattatgatcctattcacaattgtaattctcatataaatgaagaattcttggtagatt gacagtcaccatctcctttcttgaatacatagatggattcttaccttagctttctcattt ttcaggtaaaaagcagcttcctgattcaaatgagattgtggaaaaattgcttctaagaag aaagttcatccctgatccccagggctcaaacatgatgtttgcattctttgcccagcactt cacgcatcagtttttcaagacagatcataagcgagggccagctttcaccaacgggctggg ccatggggtaagatagagttaatatcttagagttagtaaaattataccaaatcatagtca agggctaacattaaaggagatatacagatagatagatccaaataacttatccactttttt taaaaagaagtcttatctataaaaaccttaaaggaattttccatttacttcactggtcta gtaaaattatacacacacacagacatgcacacacatatataaacattcacacacatacat atgtacaggtattgttatttgtaatttgacccttgtattttttagtttaaaatgttagta ctgcaaaatgttatgtcctcaaaaacacattgtaccatgattatgccgctttcaatattg taaagtgaggtttttgccgcattattattttttggatttcaatagcatagcttcaagtta ttcgtaagaattttttataaataatacatttttatacttttttataattaccatatcatc atagtgaagtatataatatatatgatataagctcaatatagtatattaattccgttaaac acaaagacatatcagtttgtagctttggtggataaacaaattaatttagcaattcatggc tatgaaaaatgtatattttatttaaaaattttaaagaaagctaaatgatcaaattattta atgatgaattatatgatagacactttatataagaaaaacttcaacagcaacaaattaaaa ttttttcatcattttctaggtggacttaaatcatatttacggtgaaactctggctagaca gcgtaaactgcgccttttcaaggatggaaaaatgaaatatcaggtatgcttcctttgact attaagacttagttattaccgcttatacccatattttaaaatccctaaaaatgtgttcct taactttttaactgatgtttatttatttatttatttttttagataattgatggagagatg tatcctcccacagtcaaagatactcaggcagagatgatctaccctcctcaagtccctgag catctacggtttgctgtggggcaggaggtctttggtctggtgcctggtctgatgatgtat gccacaatctggctgcgggaacacaacagagtatgcgatgtgcttaaacaggagcatcct gaatggggtgatgagcagttgttccagacaagcaggctaatactgataggtaaacaagaa aatgatttatataaaaccctcttccccagggaaaattagtgtgctatctttgttatgttt tgagtaaatgacaagatgtggtaaatgaaaactcacacattctatatacattaaatatgt aagcatgactgataaaatagctatcttttgatactgacaaggaagaaaacagaaatgaag gaatagcaaattttaaaaattgcattccagttgcttgaaagcttgtgatcagatgcaata aatgtttttattatttattttgtgcaaataggagagactattaagattgtgattgaagat tatgtgcaacacttgagtggctatcacttcaaactgaaatttgacccagaactacttttc aacaaacaattccagtaccaaaatcgtattgctgctgaatttaacaccctctatcactgg catccccttctgcctgacacctttcaaattcatgaccagaaatacaactatcaacagttt atctacaacaactctatattgctggaacatggaattacccagtttgttgaatcattcacc aggcaaattgctggcagggtaagcattattattgaaaaccaaaacaaaagactagtcagt aactttagaatttctgccacggaaattatttttcttaaacttactaaaagagtagttagt tatattgctagtaaaattattttattgatataagaagcctaactttgtttgaaaagtcta aacttttagtctagtctacagttgtcagacaaatagcaaattgtacccctaccttaaaaa tattttcaaaaagtatctataatcttataggaataaatattttaggcttgaatactagtg ttatttttgaaatgtaaaaaggcaaattagttctaggctggtgtcccattgaattttaag cagagctcctgttgaaatgtaggtaagcatctttccagcaaataaaaattgtctccgctg ggagtttcagttttacctgatttgtacctaaggcaagctgaatacaaacagtaaatatgc ctaaaattcttgttttacaactaattttactttccacaggttgctggtggtaggaatgtt ccacccgcagtacagaaagtatcacaggcttccattgaccagagcaggcagatgaaatac cagtcttttaatgagtaccgcaaacgctttatgctgaagccctatgaatcatttgaagaa cttacaggtaagaaacagtttctaaacttcttcgttttttgtttgtttgtttgtttttgt tgtttttggttttcttttcgagatggagccgccctctgtcacccaggctggagtgcagtg gcgccatctcggctcactgcaacctccgcctcctgggttcaagcaattctcctgcctcaa cttcctgagtagctgggactacaggctcacgtcgcacgcatggataattttttgtatttt cagtatagacggggtttcaccgtgttagccaggctggtctcaaactcctgacctagtgat ccgccggcttcggcctcccgaagtgctgggattacaggcgtgagccaccgcgcctggccc ctaaacttcttaaaagaatcaggggtcaaatggaaacagagaagttggcagcaaattgag caaaagaatcaaactgttttttattttgtgaagtttgacattggttgtatctctgtcttc atcgccttcacaggagaaaaggaaatgtctgcagagttggaagcactctatggtgacatc gatgctgtggagctgtatcctgcccttctggtagaaaagcctcggccagatgccatcttt ggtgaaaccatggtagaagttggagcaccattctccttgaaaggacttatgggtaatgtt atatgttctcctgcctactggaagccaagcacttttggtggagaagtgggttttcaaatc atcaacactgcctcaattcagtctctcatctgcaataacgtgaagggctgtccctttact tcattcagtgttccagatccagagctcattaaaacagtcaccatcaatgcaagttcttcc cgctccggactagatgatatcaatcccacagtactactaaaagaacgttcgactgaactg tagaagtctaatgatcatatttatttatttatatgaaccatgtctattaatttaattatt taataatatttatattaaactccttatgttacttaacatcttctgtaacagaagtcagta ctcctgttgcggagaaaggagtcatacttgtgaagacttttatgtcactactctaaagat tttgctgttgctgttaagtttggaaaacagtttttattctgttttataaaccagagagaa atgagttttgacgtctttttacttgaatttcaacttatattataagaacgaaagtaaaga tgtttgaatacttaaacactatcacaagatggcaaaatgctgaaagtttttacactgtcg atgtttccaatgcatcttccatgatgcattagaagtaactaatgtttgaaattttaaagt acttttggttatttttctgtcatcaaacaaaaacaggtatcagtgcattattaaatgaat atttaaattagacattaccagtaatttcatgtctactttttaaaatcagcaatgaaacaa taatttgaaatttctaaattcatagggtagaatcacctgtaaaagcttgtttgatttctt aaagttattaaacttgtacatataccaaaaagaagctgtcttggatttaaatctgtaaaa tcagatgaaattttactacaattgcttgttaaaatattttataagtgatgttcctttttc accaagagtataaacctttttagtgtgactgttaaaacttccttttaaatcaaaatgcca aatttattaaggtggtggagccactgcagtgttatctcaaaataagaatattttgttgag atattccagaatttgtttatatggctggtaacatgtaaaatctatatcagcaaaagggtc tacctttaaaataagcaataacaaagaagaaaaccaaattattgttcaaatttaggttta aacttttgaagcaaacttttttttatccttgtgcactgcaggcctggtactcagattttg ctatgaggttaatgaagtaccaagctgtgcttgaataacgatatgttttctcagattttc tgttgtacagtttaatttagcagtccatatcacattgcaaaagtagcaatgacctcataa aatacctcttcaaaatgcttaaattcatttcacacattaattttatctcagtcttgaagc caattcagtaggtgcattggaatcaagcctggctacctgcatgctgttccttttcttttc ttcttttagccattttgctaagagacacagtcttctcatcacttcgtttctcctattttg ttttactagttttaagatcagagttcactttctttggactctgcctatattttcttacct gaacttttgcaagttttcaggtaaacctcagctcaggactgctatttagctcctcttaag aagattaaaagagaaaaaaaaaggcccttttaaaaatagtatacacttattttaagtgaa aagcagagaattttatttatagctaattttagctatctgtaaccaagatggatgcaaaga ggctagtgcctcagagagaactgtacggggtttgtgactggaaaaagttacgttcccatt ctaattaatgccctttcttatttaaaaacaaaaccaaatgatatctaagtagttctcagc aataataataatgacgataatacttcttttccacatctcattgtcactgacatttaatgg tactgtatattacttaatttattgaagattattatttatgtcttattaggacactatggt tataaactgtgtttaagcctacaatcattgatttttttttgttatgtcacaatcagtata ttttctttggggttacctctctgaatattatgtaaacaatccaaagaaatgattgtatta agatttgtgaataaatttttagaaatctgattggcatattgagatatttaaggttgaatg tttgtccttaggataggcctatgtgctagcccacaaagaatattgtctcattagcctgaa tgtgccataagactgaccttttaaaatgttttgagggatctgtggatgcttcgttaattt gttcagccacaatttattgagaaaatattctgtgtcaagcactgtgggttttaatatttt taaatcaaacgctgattacagataatagtatttatataaataattgaaaaaaattttctt ttgggaagagggagaaaatgaaataaatatcattaaagataactcaggagaatcttcttt acaattttacgtttagaatgtttaaggttaagaaagaaatagtcaatatgcttgtataaa acactgttcactgttttttttaaaaaaaaaacttgatttgttattaacattgatctgctg acaaaacctgggaatttgggttgtgtatgcgaatgtttcagtgcctcagacaaatgtgta tttaacttatgtaaaagataagtctggaaataaatgtctgtttatttttgtactatttaa aaaaaaaaaaaaaaatcgatgtcgactcgagtc >HS08198 agcgggcggcggtcgtgggcggggttgcaggcgaggctcaacgaacgctggtctgaccgt cggcgctccctgttgccgggccctgagcaagtggcttcatgaaccccgtgacgttggcca tggagataagaccactgggtgatggtttaaggaagataacgtgtaaagggctaaggactg tcggtggaaatcaggggtgcaggagaaatggataaacagccagaggtcaactcggacttt gtacataggacatggtgccaggccctgccaggaagtgcagatcgaagctaggctcacgag gaggctggaggtggggggtggggaggcaacggatggacatggacttcctgggctgggctc tgtgacagcagagtagactctgtcctgggacttggtggtgctacccttggcctcccacag tcctgccaccctgctgccgccaccatgctgccccctgggactgcgaccctcttgactctg ctcctggcagctggctcgctgggccagaagcctcagaggccacgccggcccgcatccccc atcagcaccatccagcccaaggccaattttgatgcgcagcaggtagaagttggggggggt agagggaggcaggtagaagttgtgggaggggtagagggagacaggtagaagttgttgcgg gggagagggaagcaggtgaagttgtggggggtgtagagggaagcaggtgaggggccctcc cacagtgccctcgagttctcccatggtctgcccccagtttgcagggacctggctccttgt ggctgtgggctccgcttgccgtttcctgcaggagcagggccaccgggccgaggccaccac actgcatgtggctccccagggcacagccatggctgtcagtaccttccgaaagctgtgagt cccagagcagccctgcaccctaaccccaaccctcctctcagcccccggacttcagccctg ctctggcccctgaccccaccccggctgtggcctggactaggattcctggttggggtctcc cagcctgtggtgcctcctccccgcccccccagggatgggatctgctggcaggtgcgccag ctctatggagacacaggggtcctcggccgcttcctgcttcaaggtgaggcaggggctgca ggtcatgtgggtgggggatgacgcagccactgtggctctctgacatggctactgtggctc tgcccagcccgaggcgcccgaggggctgtgcacgtggttgtcgctgagaccgactaccag agtttcgctgtcctgtacctggagcgggcggggcagctgtcagtgaagctctacggtatg tgggggccagcctctgtgaccaggcaggcgctcaagctctgcacactcactgggccaccc cgaggggctgggtgagccatggggacacacttcctttctcccatcctgatcctcctgcta agcaggggcccagggagtagtgacagacaggcctggtgtgggagcagggaggagggcccc gaggggcaggggacacacagaccccgttcccagagccctccacgccgcctggtgccagga ccccaggaaccctgtctgccctgcagcccgctcgctccctgtgagcgactcggtcctgag tgggtttgagcagcgggtccaggaggcccacctgactgaggaccagatcttctacttccc caagtacggtgagtgtccccagcaggtccccagctcagccacccccactctctggctgat gtccagcctgacccctgccttggcgccccaggcttctgcgaggctgcagaccagttccac gtcctggacggtgagtgcacagcgggggcaagcatggcggcgtggtgaggggggccactc gcaccggctgagtctcgtctctgctgcagaagtgaggaggtgaggccggcacacagctcc agtgctgagaagtcagtgccccgagagacgaccccaccagtggggtgcccgctgcctgtc ctccgtgaaaccagcctcagatcagggccctgccacccagggcaggggatcttctgccgg ctgccccagaggacagtgggtggagtggtacctacttattaaatgtctcagacccctctc tgactcttctgtccactctggaccggcgccagtaccaccaaggccctctctgcccccacc ccgcctctttaaaagcccggcgctccctgttggctggagtccacgcagggtcactgggcc gatttcggctcttgggatttgggaggggagatcctctctggcatatgccatcttgtgccc tgctggacctgggggcgtccacgtcactccaaggctgctcttgcctgggccatgcctgca gccc