Mercurial > repos > chemteam > acpype_amber2gromacs
view test-data/base_GMX.itp @ 0:79c856227ff1 draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxycomputationalchemistry/galaxy-tools-compchem/ commit f6acbf6f5875904c5b0c69445da0bf44932611c6"
| author | chemteam |
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; base_GMX.itp created by acpype (v: 2019-03-22T14:36:00UTC) on Fri May 31 15:21:44 2019 [ atomtypes ] ;name bond_type mass charge ptype sigma epsilon Amb c3 c3 0.00000 0.00000 A 3.39967e-01 4.57730e-01 ; 1.91 0.1094 ca ca 0.00000 0.00000 A 3.39967e-01 3.59824e-01 ; 1.91 0.0860 oh oh 0.00000 0.00000 A 3.06647e-01 8.80314e-01 ; 1.72 0.2104 hc hc 0.00000 0.00000 A 2.64953e-01 6.56888e-02 ; 1.49 0.0157 ha ha 0.00000 0.00000 A 2.59964e-01 6.27600e-02 ; 1.46 0.0150 ho ho 0.00000 0.00000 A 0.00000e+00 0.00000e+00 ; 0.00 0.0000 [ moleculetype ] ;name nrexcl base 3 [ atoms ] ; nr type resi res atom cgnr charge mass ; qtot bond_type 1 c3 1 JZ4 C4 1 -0.093100 12.01000 ; qtot -0.093 2 ca 1 JZ4 C7 2 -0.162000 12.01000 ; qtot -0.255 3 ca 1 JZ4 C8 3 -0.095000 12.01000 ; qtot -0.350 4 ca 1 JZ4 C9 4 -0.211000 12.01000 ; qtot -0.561 5 ca 1 JZ4 C10 5 0.124100 12.01000 ; qtot -0.437 6 ca 1 JZ4 C11 6 -0.099000 12.01000 ; qtot -0.536 7 ca 1 JZ4 C12 7 -0.098300 12.01000 ; qtot -0.634 8 c3 1 JZ4 C13 8 -0.032100 12.01000 ; 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