Mercurial > repos > chemteam > gmx_restraints
view test-data/lig.itp @ 8:14a7bf3e03df draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxycomputationalchemistry/galaxy-tools-compchem/tree/master/tools/gromacs commit 2f3d14b4f200100881e362b0f3b97f0e8a36d1f3"
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N11 - C12 - C17 [ dihedrals ] ; propers ; for gromacs 4.5 or higher, using funct 9 ; i j k l func phase kd pn 1 2 3 11 9 180.00 0.00000 2 ; C1- C2- C3- C4 1 2 3 20 9 180.00 0.00000 2 ; C1- C2- C3- O20 1 13 12 11 9 180.00 0.00000 2 ; C1- C6- C5- C4 2 1 13 12 9 180.00 0.00000 2 ; C2- C1- C6- C5 2 3 11 4 9 180.00 12.02900 2 ; C2- C3- C4- C7 2 3 11 12 9 180.00 12.02900 2 ; C2- C3- C4- C5 3 11 4 14 9 180.00 16.73600 2 ; C3- C4- C7- N8 3 11 4 16 9 180.00 16.73600 2 ; C3- C4- C7- N11 3 11 12 13 9 180.00 0.00000 2 ; C3- C4- C5- C6 4 11 3 20 9 180.00 12.02900 2 ; C7- C4- C3- O20 4 11 12 13 9 180.00 0.00000 2 ; C7- C4- C5- C6 4 14 15 5 9 180.00 16.73600 2 ; C7- N8- N9- C10 4 16 5 15 9 180.00 6.06680 2 ; C7- N11- C10- N9 4 16 5 18 9 180.00 6.06680 2 ; C7- N11- C10- S18 4 16 6 7 9 180.00 7.74040 2 ; C7- N11- C12- C13 4 16 6 17 9 180.00 7.74040 2 ; C7- N11- C12- C17 5 16 4 11 9 180.00 7.11280 2 ; C10- N11- C7- C4 5 16 4 14 9 180.00 7.11280 2 ; C10- N11- C7- N8 5 16 6 7 9 180.00 7.74040 2 ; C10- N11- C12- C13 5 16 6 17 9 180.00 7.74040 2 ; 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N9- N8- C7- N11 16 6 7 19 9 180.00 27.82360 2 ; N11- C12- C13- F19 17 6 7 19 9 180.00 27.82360 2 ; C17- C12- C13- F19 21 1 2 3 9 180.00 0.00000 2 ; O21- C1- C2- C3 21 1 13 12 9 180.00 0.00000 2 ; O21- C1- C6- C5 [ dihedrals ] ; impropers ; treated as propers in GROMACS to use correct AMBER analytical function ; i j k l func phase kd pn 3 4 11 12 4 180.00 4.60240 2 ; C3- C7- C4- C5 5 4 16 6 4 180.00 4.60240 2 ; C10- C7- N11- C12 6 8 7 19 4 180.00 4.60240 2 ; C12- C14- C13- F19 7 17 6 16 4 180.00 4.60240 2 ; C13- C17- C12- N11 11 2 3 20 4 180.00 43.93200 2 ; C4- C2- C3- O20 11 16 4 14 4 180.00 4.60240 2 ; C4- N11- C7- N8 18 16 5 15 4 180.00 4.60240 2 ; S18- N11- C10- N9 21 1 13 2 4 180.00 43.93200 2 ; O21- C1- C6- C2