changeset 6:a53ce9294c0a

fix logs output
author cmonjeau
date Thu, 10 Sep 2015 14:40:43 +0000
parents 8b2edb8a315e
children 9590778f5181
files commet.py commet.xml
diffstat 2 files changed, 2 insertions(+), 1 deletions(-) [+]
line wrap: on
line diff
--- a/commet.py	Thu Sep 10 14:37:19 2015 +0000
+++ b/commet.py	Thu Sep 10 14:40:43 2015 +0000
@@ -35,7 +35,7 @@
         parser.add_argument("-e", dest="minshannonindex")
         parser.add_argument("-m", dest="maxreads")
 
-        parser.add_argument("--output")
+        parser.add_argument("--output_logs")
         parser.add_argument("--output_vectors")
         parser.add_argument("--output_dendro")
         parser.add_argument("--output_matrix")
--- a/commet.xml	Thu Sep 10 14:37:19 2015 +0000
+++ b/commet.xml	Thu Sep 10 14:40:43 2015 +0000
@@ -20,6 +20,7 @@
 --output_vectors $output_vectors
 --output_dendro $output_dendro
 --output_matrix $output_matrix
+--output_logs $output_logs
 --output_heatmap1 $output_heatmap1
 --output_heatmap2 $output_heatmap2
 --output_heatmap3 $output_heatmap3