Mercurial > repos > cpt > cpt_helical_wheel
view generateHelicalWheel.py @ 2:e9fb56f44c35 draft default tip
planemo upload commit f33bdf952d796c5d7a240b132af3c4cbd102decc
author | cpt |
---|---|
date | Fri, 05 Jan 2024 05:52:58 +0000 |
parents | 9b276485c94a |
children |
line wrap: on
line source
## import argparse from plotWheels.helical_wheel import helical_wheel if __name__ == "__main__": parser = argparse.ArgumentParser(description="Generate Helical Wheel") parser.add_argument("--sequence", dest="sequence", type=str) parser.add_argument("--seqRange", dest="seqRange", type=int, default=1) parser.add_argument("--t_size", dest="t_size", type=int, default=32) parser.add_argument("--rotation", dest="rotation", type=int, default=90) parser.add_argument( "--numbering", action="store_true", help="numbering for helical wheel" ) parser.add_argument( "--output", dest="output", type=argparse.FileType("wb"), default="_helicalwheel.png", ) # dest="output",default="_helicalwheel.png") #### circle colors parser.add_argument("--f_A", dest="f_A", default="#ffcc33") parser.add_argument("--f_C", dest="f_C", default="#b5b5b5") parser.add_argument("--f_D", dest="f_D", default="#db270f") parser.add_argument("--f_E", dest="f_E", default="#db270f") parser.add_argument("--f_F", dest="f_F", default="#ffcc33") parser.add_argument("--f_G", dest="f_G", default="#b5b5b5") parser.add_argument("--f_H", dest="f_H", default="#12d5fc") parser.add_argument("--f_I", dest="f_I", default="#ffcc33") parser.add_argument("--f_K", dest="f_K", default="#12d5fc") parser.add_argument("--f_L", dest="f_L", default="#ffcc33") parser.add_argument("--f_M", dest="f_M", default="#ffcc33") parser.add_argument("--f_N", dest="f_N", default="#b5b5b5") parser.add_argument("--f_P", dest="f_P", default="#ffcc33") parser.add_argument("--f_Q", dest="f_Q", default="#b5b5b5") parser.add_argument("--f_R", dest="f_R", default="#12d5fc") parser.add_argument("--f_S", dest="f_S", default="#b5b5b5") parser.add_argument("--f_T", dest="f_T", default="#b5b5b5") parser.add_argument("--f_V", dest="f_V", default="#ffcc33") parser.add_argument("--f_W", dest="f_W", default="#ffcc33") parser.add_argument("--f_Y", dest="f_Y", default="#b5b5b5") ### text colors parser.add_argument("--t_A", dest="t_A", default="k") parser.add_argument("--t_C", dest="t_C", default="k") parser.add_argument("--t_D", dest="t_D", default="w") parser.add_argument("--t_E", dest="t_E", default="w") parser.add_argument("--t_F", dest="t_F", default="k") parser.add_argument("--t_G", dest="t_G", default="k") parser.add_argument("--t_H", dest="t_H", default="k") parser.add_argument("--t_I", dest="t_I", default="k") parser.add_argument("--t_K", dest="t_K", default="k") parser.add_argument("--t_L", dest="t_L", default="k") parser.add_argument("--t_M", dest="t_M", default="k") parser.add_argument("--t_N", dest="t_N", default="k") parser.add_argument("--t_P", dest="t_P", default="k") parser.add_argument("--t_Q", dest="t_Q", default="k") parser.add_argument("--t_R", dest="t_R", default="k") parser.add_argument("--t_S", dest="t_S", default="k") parser.add_argument("--t_T", dest="t_T", default="k") parser.add_argument("--t_V", dest="t_V", default="k") parser.add_argument("--t_W", dest="t_W", default="k") parser.add_argument("--t_Y", dest="t_Y", default="k") args = parser.parse_args() # print(type(args.output)) f_colors = [ args.f_A, args.f_C, args.f_D, args.f_E, args.f_F, args.f_G, args.f_H, args.f_I, args.f_K, args.f_L, args.f_M, args.f_N, args.f_P, args.f_Q, args.f_R, args.f_S, args.f_T, args.f_V, args.f_W, args.f_Y, ] t_colors = [ args.t_A, args.t_C, args.t_D, args.t_E, args.t_F, args.t_G, args.t_H, args.t_I, args.t_K, args.t_L, args.t_M, args.t_N, args.t_P, args.t_Q, args.t_R, args.t_S, args.t_T, args.t_V, args.t_W, args.t_Y, ] colors = [f_colors, t_colors] tmp_file = "./tmp.png" helical_wheel( sequence=args.sequence, colorcoding=colors[0], text_color=colors[1], seqRange=args.seqRange, t_size=args.t_size, rot=args.rotation, numbering=args.numbering, filename=tmp_file, ) with open("tmp.png", "rb") as f: for line in f: args.output.write(line)