roary_plots: Roary/t/data/example_annotation

comparison Roary/t/data/example_annotation_2.gff @ 0:c47a5f61bc9f draft

Uploaded

author	dereeper
date	Fri, 14 May 2021 20:27:06 +0000
parents
children

comparison

equal deleted inserted replaced

--1:000000000000
+:c47a5f61bc9f
+##gff-version 3
+##sequence-region abc|SC|contig000001 1 15000
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	172	1131	.	-	0	ID=abc_00001;gene=hly;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60,similar to AA sequence:UniProtKB:Q2G1X0,protein motif:TIGRFAMs:TIGR01002,protein motif:Pfam:PF07968.6;locus_tag=abc_00001;product=Alpha-toxin,beta-channel forming cytolysin,Leukocidin/Hemolysin toxin family protein;protein_id=gnl|SC|abc_00001
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	1804	1950	.	+	0	ID=abc_00002;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60;locus_tag=abc_00002;product=hypothetical protein;protein_id=gnl|SC|abc_00002
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	1934	2131	.	+	0	ID=abc_00003;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60;locus_tag=abc_00003;product=hypothetical protein;protein_id=gnl|SC|abc_00003
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	2621	3337	.	-	0	ID=abc_00004;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60,protein motif:CLUSTERS:PRK13350,protein motif:Pfam:PF02876.11;locus_tag=abc_00004;product=superantigen-like protein,Staphylococcal/Streptococcal toxin%2C beta-grasp domain;protein_id=gnl|SC|abc_00004
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	3445	4170	.	-	0	ID=abc_00005;gene=speH;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60,similar to AA sequence:UniProtKB:P0C0I6,protein motif:CLUSTERS:PRK13349,protein motif:Pfam:PF02876.11;locus_tag=abc_00005;note=SPE H;product=hypothetical protein,superantigen-like protein,Staphylococcal/Streptococcal toxin%2C beta-grasp domain;protein_id=gnl|SC|abc_00005
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	4265	4990	.	-	0	ID=abc_00006;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60,protein motif:CLUSTERS:PRK13043,protein motif:Pfam:PF02876.11;locus_tag=abc_00006;product=superantigen-like protein,Staphylococcal/Streptococcal toxin%2C beta-grasp domain;protein_id=gnl|SC|abc_00006
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	5428	6429	.	+	0	ID=abc_00007;eC_number=2.1.3.3;gene=argF;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60,similar to AA sequence:UniProtKB:P99073,protein motif:CLUSTERS:PRK04284,protein motif:Cdd:COG0078,protein motif:TIGRFAMs:TIGR00658,protein motif:Pfam:PF00185.1;locus_tag=abc_00007;product=Ornithine carbamoyltransferase,ornithine carbamoyltransferase,Ornithine carbamoyltransferase,ornithine carbamoyltransferase,Aspartate/ornithine carbamoyltransferase%2C Asp/Orn binding domain;protein_id=gnl|SC|abc_00007
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	6449	7384	.	+	0	ID=abc_00008;eC_number=2.7.2.2;gene=arcC1;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60,similar to AA sequence:UniProtKB:Q7A627,protein motif:CLUSTERS:PRK12353,protein motif:TIGRFAMs:TIGR00746,protein motif:Pfam:PF00696.22;locus_tag=abc_00008;product=Carbamate kinase 1,putative amino acid kinase,carbamate kinase,Amino acid kinase family protein;protein_id=gnl|SC|abc_00008
+abc|SC|contig000001	RNAmmer:1.2	rRNA	7556	9112	.	+	0	ID=abc_01705;inference=COORDINATES:profile:RNAmmer:1.2;locus_tag=abc_01705;product=16S ribosomal RNA
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	9419	9646	.	+	0	ID=abc_00010;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60;locus_tag=abc_00010;product=hypothetical protein;protein_id=gnl|SC|abc_00010
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	9952	10899	.	-	0	ID=abc_00011;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60,protein motif:Pfam:PF03595.11;locus_tag=abc_00011;product=C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein;protein_id=gnl|SC|abc_00011
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	11148	11336	.	+	0	ID=abc_00012;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60;locus_tag=abc_00012;product=hypothetical protein;protein_id=gnl|SC|abc_00012
+abc|SC|contig000001	Aragorn:1.2.34	tRNA	11803	11820	.	-	0	ID=abc_00013;inference=COORDINATES:profile:Aragorn:1.2.34;locus_tag=abc_00013;product=tRNA-Arg(tct)
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	12241	12375	.	+	0	ID=abc_00014;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60,similar to AA sequence:UniProtKB:P11699,protein motif:Pfam:PF05480.5;locus_tag=abc_00014;product=Gonococcal growth inhibitor III,Staphylococcus haemolytic protein;protein_id=gnl|SC|abc_00014
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	12432	12566	.	+	0	ID=abc_00015;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60,similar to AA sequence:UniProtKB:P11699,protein motif:Pfam:PF05480.5;locus_tag=abc_00015;product=Gonococcal growth inhibitor III,Staphylococcus haemolytic protein;protein_id=gnl|SC|abc_00015
+abc|SC|contig000001	Prodigal:2.60	CDS	12699	13385	.	+	0	ID=abc_00016;eC_number=3.-.-.-;gene=yfnB;inference=ab initio prediction:Prodigal:2.60,similar to AA sequence:UniProtKB:O06480,protein motif:CLUSTERS:PRK09449,protein motif:TIGRFAMs:TIGR02254,protein motif:Pfam:PF00702.1;locus_tag=abc_00016;product=Putative HAD-hydrolase yfnB,dUMP phosphatase,HAD hydrolase,haloacid dehalogenase-like hydrolase;protein_id=gnl|SC|abc_00016
+##FASTA
+>abc|SC|contig000001
+ACTGGCCGCCTAATAATAAAAACTCTAAAAGTTGTAATTTAAAATAGTTCTTTAAATTAT
+ATACCCACCACATTTGGTGGAGAACCAAAAATTAGCCGAAAAACATCATTTCTGAAGTTA
+TCGGCTAAAGTTATAAATTATATTTATTTGTACATGAACAAATAATTTACATTAATTTGT
+CATTTCTTCTTTTTCCCAATCGATTTTATATCTTTCTGAAGAACGATCTGTCCATTTATC
+TTTAGTATTGGTACCTTTCCAATTTGTTGAAGTCCAATGCAATTGGTAGTCATCACGAAC
+TCGTTCGTATATTACATCTATATTTGTTTGTTGTTTGGATGCTTTTCTATCCATAGTAAT
+AACTGTAGCGAAGTCTGGTGAAAACCCTGAAGATAATAGAGAACTTGCTTTGTTAGGATC
+AAGGAAGTTCTCTGCTGCTTTCATAGAACCATTTCTAGTTTTCATGAAAAGTTGATTGCC
+ATATACCGGGTTCCAAGAATCTCTATCATATGGTCCCCAATTTTGATTCACCATATTGTT
+AAATATCACTTTCCAGCCTACTTTTTTATCAGTTGGGCTCTCTAAAATTGTTTTGAAATC
+AGGTTGAACATATTTCAGTGTATGACCAATCGAAACATTTGCACCAATAAGGCCGCCAAT
+TTTTCCTGTATCATCACCAGTAACATTACCGTTGAATCCATAAGTTAAAGTACTCATATA
+CTCTTTTGTATCAATCGAATTTCTTGGATAGTAATCAGATATTTGAGCTACTTCATTATC
+AGGTAGTTGCAACTGTACCTTAAAGGCTGAAGGCCAGGCTAAACCACTTTTGTTAGCACC
+TTCTTCGCTATAAACTCTATATTGACCAGCAATGGTACCTTTCGTTCTAATAACTAGCAG
+TTTTTTATTGTGATTTTTATCATCGATAAAACTATAAAATACTTTTTTGTGCATGCCATT
+TTCTTTATCATAAGTGACTAAATCACCTGTTTTTACTGTAGTATTGCTTCCAATATCTGT
+AGTACCGGTTTTAATATTAATATCAGAATCTGCGGCATTAGCGACAGGATTCATTAATAT
+GGAACCTAGCAATAGTGTTGTTGTTACTGAGCTGACTATACGTGTTTTCATTTTCATCAT
+CCTTCTATTTTTTTTAACGATTTGAGGAAACAATAATCAATATGTCAATTTAGAATATTG
+CAGTTGAGACATATCAAATATTTATAATCGTTTATATTAGTATATTTAATGTAGCAACTG
+ATAAATTACTGAGTGATGATGAGTGATTATTTTAAGAATATGTTTTTAACTTTTATTTAA
+AATTTGAAAGGAAGCATTTCAATTTCGAGGGTTAGTCAAAGTTGAATAAATTCTTTATGA
+AACAAGGAAAAGACATAGCTAATTTTATTGATTAATTTCTTTAAAACTAATGATTTGTTT
+GATTTAAAAATGTAATCGATTACAATATAAAAATACAAATATCTTAGAATTAAATCAATT
+AATTAACTATTAAATAAAAATTAAATATATATTAACTACTGTAAATTAATAAATAGAAAT
+AGAGAAAAAGGGTATTAATTATGTTTGGAATTTCGTCGGGAATAATTTTTGCCATTACAT
+AGAAATATCTAATAGATAATGAAAAAGTATCGTATGTATTTTTAATATAGTGTAAAATAT
+CATATGTAAAATAAAATGTAGATTTTTAGTTAGAGGCATTATAAGAAAATTTTGAGTATA
+GGTTAGCTTTTAATTATGAATCTTATTGAAATTTGATTAATAAATATATGATAGGGGATT
+AAAATGAAACTATTTTATATCGTATTTCTTATTATTATATGGCTGAATATATTTTTAGGA
+AATGAAATTATCCATACACTGACTGTTTTAATAACAACATTGTATATTGTTAATTCAAGA
+AAGGGGATTAAAAATGACAGAGTTGAATAATATTATAAACTCTCTTCAATCTTTGTTTGA
+GTCTGAATCAGGCTATAAAATTTCGAAAAATTCAGGAGTTCCATATCAAACAGTACAAGA
+TTTAAGAAATGGGAAAACCAAACTAGAAGATGCTAGATTTAGAACGATTATTAAACTTTA
+TAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACATTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATA
+ATTGAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATAATAAATCAATGTCTTAGGCTCT
+ACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGACCATGTAACAAGCATTTTTGG
+GGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGGGATGGG
+CCCCAACACAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCA
+ACATAGAGAAATTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGAGTGACAACGAAA
+TAAATTTTATAAAATACCATTTCTGTCACATTCCTACTCCCAATTCCATTTAAATATATA
+GAAAATTTCACCTATTATATACATCATACACTTTAAAAATTATCATTTAAATAATCTGAT
+TTGGAATTAAAGTGCATGAAGTATAAGTCACCTTCATATACTAATCAAAGAGGACGTCAA
+CAGTTATTTTATTAGGATTTTTAACATAAACATTTGCTAGATCTGAATGTAATCTTTTGC
+TTAAATCAATAGTGTAGTTATTACCGCCACCGGTGATCTTAAGCTTACCTTTATTACGAT
+TTTCGGTATATAATATTTTATTTTTTATTAACGCTTCTCGTGCACGGAAATCGATTTCTT
+TCAATGTTAATACTGGTTTATTGCCTTGGTATATTTTATGCGCACCAATAATCGTTTGTA
+GTTTATCTTTGTATTGCACAAAAAGATTATAAGTTTTATCAGAAGGTTTTGCGGCTGGTG
+TAACGCCACCTGTAAATGTCTCTCTATAAGACCACCATAACTGATCAGTATCTTTGTCTT
+TTAGTCCAAACACATCTACGTAACGATCTTTTAACTGATTAATATTTCCCCAACTTTCAG
+CGCCCCATAAAGATATATGTGCTGACCATGAATATCTCTTAAGTTCAACATAAATGTTTC
+CATTATCATATTGATATAGCCATTTATTTGAAAATGAAAAATGAGGCTGTGTGTAATATT
+TAATTAATTCATTGATGTTAGTTTCATCTTGACCAATGCTATAAGCTTTAGCTTCAGAGT
+AAAAACTAAATACTGGTTTTTGATTTTGAGGTAATACAGTACCTAATAGTAATAATGTTG
+TCGTTAAAATTATATTTTTCGTGATGTTCTTACTCATTAGAACATCTCCTTTCAGAGGAA
+TCATGATACGAGGAATAAGAAATTTAAATGTGAGCGAAGTCAATATAGTATTTGCGATTA
+TTTTTATTAACTCCATTATTATTGTTAGTTTGATTTTTCGAGGATAACTTCAATTTTTGC
+ATTTTGAGGTTTTTTAACATATCTATTTGCATCAGTTGATGGCAACCTTTTACTTAAATC
+TATTGTGTAGTTATTGTCTGTACCTGTTATTTTAATTTGTCCTTTATTATAAGAATTATT
+ATATAATTTTTTACTTTTAATTAATGTTTGACGAATACGAAAATCTAATTCTTTTAAAGT
+TAAAACAGGCTTATTGCCTTCATAAACTGGAAATCCGCCAGTAAACGTTTCTGCTTTATC
+TTTATATGTTACATTCAGTTTATAGTGTTTATCGTTAGATGTTGCTGCAGGAGTAACACC
+ACCAGTAAACGTTTCTTGAGATAATGCAAAAGAATCAATGGTTTCTTGGTCTTTTATGCC
+AAAAATATCAACGCTTTTATTTCTTAATTGGTTGATATTGCCCCAACTTTCAGGTCCATA
+AACTTGAATATGACTATACCAAGAAAACTGTAACAACGTTGCATGAATCGTACCGTTATC
+TTTTTGCCATAACGTACTGTTAGAGAAGGTTAAATATTTTTGCGAGTAATATTTAGTTAA
+CTCATTAACGTTAGTTTCGTTTTGATTTATATAATAAGCTTTCGCTTCAGATGAAGAATT
+GATAGGTGTATTAGGAAATTGTGTAAATGCTGTACCTAATAGTAACAATGTTGTTGATAA
+AATAATTTTTTTCGTGATGTTATTGTTCATTCGAATTTCTCCTTTGAGTATTGTTGGAAT
+GTTTAATTATAAAAAGGGGTTAATTAGATAATTGAAATTATCCGCATTTACAAAAGGTAA
+TAGGTTAGTTAGATTTTTCGAGTATGACTTCAATTTGTGCATTTTTAGGATTTTTAACAT
+AACGGTTTGTGTCAGTTAATTTTAACTTTTTACTTAAATCAATCGTGTAATTATTTCCAT
+CAGCAGTTATCTTAATTTGACCTTTATTAAATTCTCCGTTATATAACTTTTTATTCTTTA
+TTAATGTTTGACGAATACGGAAATCTAATTCTTTTAAAGTTAATACTGGTTTATTTCCTT
+TGTAAAATTCATGTCCACCGATGATAGTTTGTTGTTTATCACTATATTTTAAAAATAGTC
+TATAAGGTTTATCAGATGAAGTAGCTGCTGGCGTAACACCACCAGTAAATGTTTCATCAT
+AAGTCCAGTAACCTTCAACTGTGTCCTCATCTTTAGTTCCAAATATATCAACGTATTTAT
+TTCTTAACTGATTAATGTTTCCCCAACTCTCGGATCCAAACACTTGAATATGACTATACC
+AAACCCACGTTTGCAATGTTGCATGAATGCTACCATTGGGCTTTTGCCATAGCCATTTTC
+CAGATAATGAAAAATGCGGCTGAGTGTAATATTTGATTAACTCATTGATATTAGTCTCGT
+TTTCACTGATATTATAGGCTTTTGCTTCAGATGAAAAACTGATTGGTGTTTTAGGAAGTT
+GTGTTGATGTGGTTCCTAAAAGTAACAATGCTGTTGATAAAACTAATTTATTCATGATGT
+TCTTTTTCATATGAAAATCTCCTTTGCGTGAATTACCCAAAGTATATAAGCTATTACACC
+GATTCGGAATTAAATAAAAGCTAAAACTATGTTAAATAAACTTAAACAGTTAGTAGTGTT
+ATTTAAGCAAAACTTATCATTTTTAAGTTTTGGACAGAAACAGTACTTAATAAAGTAGGC
+GGGAGTTATATATTAAAAACGACACGTTACAATTATTCTCTAATCAATTGCATTAAATTG
+TTTGATAATTGAATTTTCTAACTACTTGAAAAATAGTTATACTTTAAATGTAGTACTTAT
+TTTAATTATTTCCTACTACTTAAATTTAATATTAATAAAATGTTCATTTAATTATTGATA
+AAATATTACAAATTTTAATAGTAGGTTGTGTTTATTTTGTATGCGCTTACAATTTAGGTG
+TAACTAAAATAAAAGGAGTTGTTATTAATGAAAAATTTACGAAACAGAAGTTTTTTAACT
+TTATTAGACTTTTCACGACAAGAGGTAGAATTCTTATTAACACTCTCCGAGGATTTAAAA
+CGTGCTAAATATATTGGCACTGAAAAGCCTATGTTAAAAAATAAAAATATTGCACTGTTA
+TTTGAAAAAGATTCTACAAGAACGCGATGTGCATTTGAAGTTGCAGCGCATGATCAAGGT
+GCAAATGTAACTTATTTAGGCCCAACTGGATCACAAATGGGTAAAAAAGAAACAACTAAA
+GATACTGCACGTGTGCTTGGTGGAATGTATGATGGCATTGAATACCGTGGTTTTTCACAA
+AGAACAGTAGAAACTTTAGCTGAAAATTCAGGCGTACCAGTGTGGAATGGTTTAACTGAT
+GAAGATCATCCTACTCAAGTTCTTGCTGATTTCTTAACAGCAAAAGAAGTCTTAAAAAAA
+GATTATGCAGATATTAACTTTACATATGTTGGAGATGGTCGTAATAACGTTGCAAATGCA
+TTAATGCAAGGTGCTGCCATTATGGGTATGAACTTCCATTTAGTTTGTCCAAAAGAATTA
+AATCCAACAGATGAATTATTAAATCGCTGTAAAAATATTGCCGCTGAAAATGGTGGCAAC
+ATATTAATCACAGATGATATTGACCAAGGTGTAAAAGGTTCGGATGTAATTTACACTGAT
+GTTTGGGTATCAATGGGTGAACCTGATGAAGTATGGAAAGAACGACTTGAATTATTGAAA
+CCATATCAAGTAAATAAAGAAATGATGGATAAAACTGGTAATCCAAATGTTATTTTTGAG
+CATTGCTTACCATCTTTCCATAATGCTGATACGAAAATTGGTCAACAAATTTTTGAAAAA
+TATGGTATTCGAGAAATGGAAGTTACAGATGAAGTATTCGAAAGTAAAGCTTCAGTTGTA
+TTCCAAGAAGCTGAGAACAGAATGCATACAATCAAAGCAGTCATGGTTGCTACATTGGGT
+GAATTTTAAATGATATAAGGAAGTGAATATGATGGCGAAAATAGTAGTAGCATTAGGTGG
+TAATGCTTTAGGAAAATCACCTCAAGAACAACTCGAGCTTGTTAAAAATACTGCGAAATC
+ATTAGTAGGATTAATAACAAAAGGACATGAGATTGTTATTAGTCATGGTAATGGACCACA
+GGTTGGAAGCATTAATTTGGGACTTAACTATGCTGCAGAACATAACCAAGGTCCGGCATT
+TCCATTTGCTGAATGTGGCGCAATGAGTCAAGCTTACATCGGCTATCAATTACAAGAAAG
+CTTACAAAATGAATTGCATTCTATTGGAATGGATAAACAAGTGGTAACACTAGTGACACA
+AGTTGAAGTTGATGAAAATGATCCGGCATTTAACAATCCTTCAAAACCAATTGGGTTATT
+TTACAACAAAGAAGAAGCTGAACAAATTCAAAAAGAAAAAGGATTTATATTTGTTGAAGA
+TGCTGGAAGAGGATATAGACGCGTTGTTCCTTCACCACAACCCATCTCTATTATTGAATT
+AGAGAGTATTAAAACACTTATTAAAAATGATACACTCGTTATTGCTGCTGGTGGTGGAGG
+TATACCAGTAATTAGAGAGCAACATGATGGTTTTAAAGGTATTGATGCAGTTATAGACAA
+AGATAAAACAAGTGCGTTGTTGGGTGCTAATATTCAATGCGATCAATTGATTATTTTAAC
+AGCAATTGATTATGTATATATTAATTTTAACACTGAAAACCAACAGCCTTTGAAAACAAC
+AAATGTTGATGAATTAAAACGATATATAGACGAAAATCAATTTGCAAAAGGAAGTATGTT
+ACCAAAAATTGAAGCAGCCATATCATTTATTGAAAACAATCCAAAAGGAAGTGTGCTTAT
+AACATCATTAAATGAATTAGATGCTGCCTTAGAGGGTAAAGTAGGTACTGTGATTAAAAA
+GTAATTGAATTGAAACGCTTTTCAATTACTATATGTCAAATGCATGATTTTTATTATTTA
+TGTGCACCCCCTGAAAATAATGCCTCTATTTTGATGCGGGGTGCACTTTCTTAATTTATA
+TTTATAAAATCTTTAAGGTAGAAATGCTAGGTTAAATGTCGAAGGAGATGAAACCGTGGA
+AAATACAATTAATGAAAGTGAAAAGAAAAAACGATTTAAATTAAAAATGCCAGGTGCATT
+TATGATTTTATTCATTTTAACGGTTGTTGCAGTTATAGCAACATGGGTTATTCCTGCTGG
+TGCATATTCTAAACTTTCTTACGAACCTTCATCCCAAGAACTAAAGATAGTTAACCCTCA
+TAACCAAGTGAAAAAGGTTCCGGGTACGCAACAGGAACTAGACAAAATGGGGGTTAAAAT
+TAAGATTGAACAATTTAAATCAGGTGCAATTAATAAGCCAGTATCAATTCCGAATACTTA
+TGAAAGATTAAAGCAACATCCAGCTGGACCAGAACAAATAACAAGTAGCATGGTTGAAGG
+TACGATAGAAGCGGTCGATATCATGGTATTCATTCTTGTACTAGGGGGACTTATTGGCGT
+AGTTCAAGCCAGTGGTTCTTTTGAATCGGGATTGTTAGCTTTAACGAAGAAAACAAAAGG
+GCATGAATTTATGCTAATTGTGTTTGTATCAATACTAATGATTATCGGCGGGACGTTATG
+TGGTATTGAAGAAGAAGCTGTAGCATTCTATCCGATTTTAGTCCCTATATTTATAGCGTT
+AGGATACGATTCTATCGTTTCAGTTGGTGCCATATTCCTTGCCAGCTCTGTCGGTAGTAC
+ATTTTCAACTATTAACCCGTTCTCGGTTGTAATTGCCTCTAATGCCGCTGGTACAACTTT
+TACGGATGGCTTGTATTGGAGAATAGGTGCTTGTATTGTCGGTGCGATTTTTGTTATTAG
+TTATTTATATTGGTACTGTAAAAAAATTAAAAACGATCCTAAAGCGTCATATTCTTATGA
+AGACAAAGATGCTTTTGAACAGCAATGGTCTGTATTAAAAGATGACGATAGTGCCCATTT
+TACTTTGCGTAAGAAGATAATCCTTACATTATTTGTACTACCATTTCCAATTATGGTATG
+GGGAGTTATGACGCAAGGTTGGTGGTTCCCAGTTATGGCTTCAGCATTTTTAATATTTAC
+AATTATAATAATGTTTATTGCTGGGACAGGTAAATCTGGATTGGGAGAAAAAGGAACTGT
+AGATGCATTTGTCAATGGTGCATCAAGTTTAGTAGGTGTATCTTTAATTATTGGTTTAGC
+TCGAGGTATTAATTTAGTGTTGAATGAAGGTATGATTTCAGATACAATCTTACACTTTTC
+ATCATCTTTAGTTCAACATATGAGTGGACCATTATTTATCATCGTATTACTATTTATTTT
+CTTCTGTTTAGGTTTTATCGTGCCATCATCTTCTGGATTAGCGGTATTATCAATGCCTAT
+CTTTGCACCACTAGCTGATACAGTAGGTATACCAAGATTCGTCATCGTTACGACATATCA
+ATTTGGTCAATATGCGATGTTATTCTTAGCGCCGACTGGACTTGTTATGGCCACACTACA
+AATGTTAAACATGCGATATTCACATTGGTTCCGATTTGTATGGCCGGTAGTTGCTTTTGT
+ATTGATTTTCGGTGGCGGAGTACTAATTACGCAAGTACTAATTTATTCATAATTTGAAAT
+GCTATATTATAAAAATACTAATTGGGTTTTATGCATCTCGTAGGTTTGTAGAAATACTAA
+ACTAAGCGAGGTGCATTATTATTTTTGATTAAGAAAATAATGACGGTAATGATAACACTA
+GTAAGTAATTGATACAATGCTCTATTTAATAATGATATTTTTAAAATTTGTTTTTAATGT
+AATGTTAGATCTATGGTATATTATATTTATCGTGGTAAATATGTATTTGCTGTAAACAGT
+TTTTGTAACACATGACACATATGGTTGTGAAAATAGCATATATAAAGGATGGCTATAAAT
+GACACATTTGACAAAGGTTTTAGATACACTAACTGGAATATGCGTAGTATTATTATTTAG
+TAAATATTTTGTGGCGTATGCAAATATGGTGTTTGATTGGAATTTAAGATGGTATTTGCT
+AGAAAACATACCACATTTGCCAATTATATTATTTATTCTGATGTTTATTTTCGGAGTACC
+TTCTGAAATGATAAAAGATAGGCAAAGGAAAAATAACGGTGTTTAATTTATCGATATTTA
+GAGGTGATAAAATTTGTCAACTATTACAAAGACTAAAATAAAAATCTTTATTAATTATTT
+TATTGGTATATTAGCCTTGGCGTTTGCTGCTTATATATTATTTAAATAAAGGTTAGAGTG
+AAACGTGTTTATGAACTAGACGTTCTAGTATAGTTACTACAGCTTTAGTCAGAAGGTATC
+ATTGATAAGATCATATTAAATCAAAGAGGCATTGATATACACTAAAAAGAGGCAAGATTA
+CCTGCCTCTTTTTTAGTTATTAAATATGCGTGTTAATTCTTGGTAATAGTGTTACTGAGA
+CGCATTACGAAGAAATTTATCTTGATTTTCCTTTTTTAAAAAGAAGTGAAGATATCCTAT
+AAAGACTCTAAGTACTATTACAGTGGCTAATAACACTTCGATAAACAAAAGACCTTTCCA
+AATATCTGGAAACATAAGTACAGGCAAACTGTTCTTTAAAGCAGTTGCTGAGATTACTAA
+AGGGAATGTGAAAGCTGAAAATACGGGCGAAAAAGGTTCTTTTAGTAATTTAGGCAATTG
+TATAATGATATAAAAATAAAATATTTGAGCTAATATTAAAAATATAATTACGATAAAAGC
+ATTCGCCTTAGGAAAGGCTATAACATATGCTGCAGCGACTAAAGAAAATGGTGCACAAAT
+TGTCGATGTGTTCGGTTTGATTGACGTCTGCAATGGAAATGCTTTTAATCGCTTGAAAAC
+AATAGGTAAGACAATACAAGTAGCTACAAAGCCATATATTACTGTTAATTGACCTATGAA
+AAAACATCCGCTAACGGGTGCCGTCAATCCTGCGATAGCAATACCAATAAAAAGTACAGT
+CCACGAAGGATAAACATTTTCAAGTGAAAAATCTTTTAAATATTTTATTGAAAAAATAAT
+CATATGCGTCATAATTCCCACAAGGCATAAAATCCAAATAGGCGTTATTAAGCTATTGAT
+AAAAGTTATGTTACTAAAAAATGTATTTAAATAAGTAGTACCTAAAAAGCCAGACATGAA
+AAATGTTGTGAACACTGATGAAACTAGAGGACTGTTTAATTGTTCTTTCACATTATTAAA
+ATATTTGATCATAGTACATAAAAGGTGAATCCAAATCAAGAAAGCAAAGATTCCGCAAAC
+AGCGTTTAAAGTAAGAGATAAGTCTTTTAATAGATTACCCAGGCCTAATAATCCTAAGAC
+TAGTCCTGACGTTACTAGAGGTGCTTTTTGAAGTCTCATGATTTACAACCTTTCTTATGT
+GATTTTCTTCACTAATTATATCATGATAGCTATGGCCAATTAATAAGAAGAGTGTGTACT
+ATTACGTTATTAGAGTATGTATATTGGATTGATAGACACATAATTGACATTTAAATCTCA
+AAATTAATGATATTTGAGGTATGCTTTGCAACCTAAATATTGGAATATGTGGAAAAGTAA
+TTATTTAATTTAAATGATGATTGAAGATTTACAAGGGGGTGTACAAAATGAGAAATCAAA
+TTCAAAAACTATTAGACAGTGATTTGAGCAGTTTACATATATCGAAACAAACAGGAGTTC
+CACAAAGCACAATACACAGAATGAGAAAAAAAGAAAGATCATTAGACAATATGTCATTGA
+AAAACGCTGAACTACTTTATAAATTTGCCAATAGTATATTTAGCAATGAAAATTAAGAAG
+AATAATTAGTGAGTTAAATAATTAAAAAACCACGTCTCGATGGACGTGGTTATTTTTTTA
+AATGTATTTAATTATAGGATTTCGGGCCCCTGAAAAGTCCCTAAAATTTTGAATAGTATC
+AAAATCTATAGGAATAATATAATAATAAAAATCTCTACGCATGCAAATGGTGAGTGTTAA
+AAATCTTGGTGTAGTGTTGGTGTAGTTCAGGTGCAGTATAGATGAAATTTGAGCACAAAA
+TTACTTAATTAAAAATGTATAAACAAGTGTCAGACGCGTGTCAATTGTGTGTCAAAAAAT
+TCTATGACGAATAAGCATGCTTGTTTTAATTACTGTATTTTCGGGGCTTATGCGGGGGAC
+GTTTTGGTGACGCATCATACTATATTACTGAAATTCAAAACAAAAAGAGCCCCGTAATCA
+CGGAACTCTTTTGTTTGGTAATGCGTATAAAAATACCTATAAACGTCCTGGGAGGGATTC
+GAACCCCCGACCGATGGCTTAGAAGGCCATTGCTCTATCCAGCTGAGCTACCAGGACACG
+TTTAACAACACAAGAATTATTATATCTAAATGAACTTAAATTAGCAATACCTTGTAAATA
+AAAAATGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACT
+TAAATGCGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATT
+TCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTA
+ATTGCATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGTTAAGCGAATAACATTTCGGT
+GATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCA
+ATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTGCAGCAATTAATAATGATGGC
+GCAAAATTAGGCACAAGCATTGTGAGCATCGTTGAAAATGGCGTAGGTTTATTAGGTAAA
+TTATTCGGATTCTAATTTCAATATGTTATGTAAGTAATCAGTATTATTTCAAAGGTGAGG
+GAGAGATTTAAATGACTGGACTAGCAGAAGCAATCGCAAATACTGTGCAAGCTGCACAAC
+AACATGATAGTGTGAAATTAGGCACAAGTATCGTAGACATCGTTGCTAACGGTGTGGGTT
+TACTAGGTAAATTATTTGGATTCTAATATAATAACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGT
+GAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTT
+AAGATTTAGATACATAGACAATATAGGAGATGGGGAAATTGGGATATAAAAATATTTTGA
+TAGACTTTGATGATACAATTGTTGATTTTTATGATGCAGAAGAATGGGCGTTTCACTATA
+TGGCGAATGTTTTTAATCATAAAGCAACAAAGGATGATTTTTTAACATTTAAAAAAATCA
+ATCACCAACATTGGGAAGCTTTTCAACAAAATAAATTAACGAAGTCTGAAGTATTATCAG
+AACGATTTGTGAATTACTTCAAACATCATCAAATGGAAGTTGATGGGCATCGTGCAGATG
+TGTTATTTAGAAATGGATTAGCAGAAGCTAAAGTTAAATACTTTGATCAAACATTAGAAA
+CAATTGTCGAATTATCGAAAAGACATGATTTATATATTGTTACTAATGGTGTAACCGAAA
+CGCAAAAGAGAAGGTTAAATCAGACGCCGTTGCATAAATATATTAAAAAGATATTTATAT
+CTGAGGAAACAGGATATCAAAAACCTAATCCGGAATTTTTTAATTATGTTTTTAATGATA
+TTGGTGAGGATGAAAGACAGCACTCGATTATAGTTGGAGATTCTTTAACATCTGACATTC
+TAGGTGGAATCAATGCGGGTATAGCTACTTGCTGGTTTAATTTTAGAGGATTTGATCATA
+ATCCAGGAATTATACCTGATTATGAAATTAATTCATGGAAACAACTAAATGATATTGTAC
+GTTAAGACAAATAATTTGAAAATGATTTATATTAGCTTAAGAAAGTAATTGTAAAAACGA
+CACTACGAAAAGATGCATTTTCATGCTCGTAGTGTCGAATATTATTATCTTATGGTTTCC
+ACAATAAGACATCATGTCCCTCTATATTTTTAGCTTCCACATCTGTAAATCCATGATGTA
+AAAAGAAATCCTTAGAATCATTTCTGCCAATGGCTTTAATTGGCATATTGAAACTCTTTG
+CAAAATCAATCAATTCTGAAGCGTACCCTCTGTTTTGATATTTTGGTAATACTTCTAACT
+TCCATAATAATATATAATCTTCAAAATCTGGGAAGTAGATTTCTTCGACATCACCTTTTT
+TTAGTAATGCCATTCTAGCTCCTAATTGATCTCCGACAAATATGCCATAAAATGGTGAAT
+CTGAACTTGCATCAATCATTTGACCGTTTAACTCATTGACCATGTATAAGTCTTTGTTGC
+CAAACGCTCTAAAGTTTTCGAATAATTCGTCAGTTTTGTAATTAATTTCAAGACGTTTGA
+TTTCACTCATATTTATCTACCCCTTATTTGTTTACTACTATTATTATACATTAAACCACT
+TGTGTTTTTCATTGATTTGAAAATGTAAAACAATGAACATTATAAATTTTCCATGATTAA
+ATTGATTTTCAAGCCGTAAAATTGTCAATCACCGGTATAGACTTTATACTATAGTTTGTA
+ATCGCGTACTTAAGGAGAAAAAACATGGACTGTAAAGTAGTTAGTTTAAATGAAAAAGAT
+CAGTTTATACCAAAAATAAAGAGCAGTGACCCTGTAATAACAGGATTATTTCAATATGAT
+GCAGCTCAACAAACTAGTTTTGAAAAAAGGATGTCTAAAGAAAATAATGGAAGAGAAGCG
+GCATTAGCGAATGTTATTCGTGAATATATGAGTGATTTAAAGCTTTCAAATGAACAAGAA
+TTAAACATACAACATTTAGCTAATGGTTCAAAAGTTGTGATTGGTGGACAACAAGCAGGG
+CTTTTCGGGGGACCATTGTATACATTCCATAAAATATTTTCAATCATTACTTTATCTAAG
+GAATTAACGGATACACATAAGCAACAAGTAGTACCAGTTTTTTGGATTGCAGGAGAAGAT
+CATGATTTCGATGAAGTGAATCATACATTTGTTTATAACGAAAATCATGGGTCGCTGCAT
+AAGGTTAAATATCATACAATGGAGATGCCAGAGACGACAGTCTCTAGATATTATCCTGAT
+AAGGCTGAGTTGAAACAAACTTTAAAAACGATGTTCATTCATATGAAAGAAACTGTTCAT
+ACACAAGGTCTACTGGAGATTTGTGACAGAATTATTGACCAATATGACTCGTGGACTGAT
+ATGTTTAAAGCACTACTGCATGAAACATTTAAAGCATATGGCGTTCTATTTATAGATGCG
+CAGTTTGAGCCGTTAAGAAAAATGGAAGCGCCTATGTTTAAAAAGATTTTGAAAAAACAT
+CAGTTGCTTGATGATGCTTTTAGAGCAACACAACAACGTACTCAAAATCAAGGCTTGAAT
+GCGATGATACAAACAGATACAAATGTTCATTTATTCTTACATGATGAAAATATGCGCCAA
+TTAGTTTCGTATGATGGTAAGCATTTTAAATTAAATAAAACAGATAAGACATATATAAAG

Mercurial > repos > dereeper > roary_plots

comparison Roary/t/data/example_annotation_2.gff @ 0:c47a5f61bc9f draft