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comparison test-data/fasta_clipping_histogram-in2.fa @ 2:9db07fd39f85 draft

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planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tool_collections/fastx_toolkit/fasta_clipping_histogram commit bbb2e6b6769b03602a8ab97001f88fbec52080a1
author iuc
date Tue, 08 May 2018 12:53:35 -0400
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children
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equal deleted inserted replaced
1:f666895cbebd 2:9db07fd39f85
1 >Scaffold3648
2 AGGAATGATGACTACAATGATCAACTTAACCTATCTATTTAATTTAGTTCCCTAATGTCA
3 GGGACCTACCTGTTTTTGTTATGTTTGGGTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTTAATCTGAAGG
4 TATTGTGCATTATATGACCTGTAATACACAGTATAACTTTTCAAATACTTTTGTTTTACA
5 ACTTTTCTCTCTGGACTTATATTAAAGTCAATTTTAATGAACATGTAGTAAAAACTAATA
6 CATGTACATCTACAGTTTATTTATTTTTTTCTTCTTCTTTTTGTATTTCTTGTGTTACAT
7 TATTTCACTTCACGTTCATGTTACCAACCTTGCCCCCTTGCTTTCCATGCAAAAAAAGAA
8 AAAAAAGAAGCAATACTTACACTTACCCTTGAGATATCTTGATCTGAATGCTTTAACATT
9 CTATATGTACAATAAATTTTTGTATCTATAGCCTATTATTATATATGTTGCTATGTCAGG
10 CACATTGACAACATTCTCAGAAGGTTAGAAGATGGTATTGTTCTGAAATGCCTGGAATGC
11 CTTGTGAACTAAGATGATTACTCATGTCATTAAAGTCCCCTAACCCAGGTATTTCCTCCT
12 TCCCATGACGAAAACAGTCCATTTAAACTTCACCCCACTTTGGACCCGAAAGTGGGGTGC
13 ATTTTGGTGGTAAGCTCACCACAGAGCAAGAGAGAGTTAGAGTCCCTAATCTGCAGTGTA
14 AACAAACTTTGCCAGGACATCACCAGCCCAACCTTGATAAGTACTGCTTGGAACTCCTCC
15 ATGATGTTCTAGTCTTATTCGCAGTCTCATATAGGTTCGGATTTTGTCCATTCTCATAGC
16 TACCAGTATACATGGGAGATGCCAGTTTCATCTTCCTTGCTTCACTTTATAAGCATAGTT
17 ATATCANGAACTTCCTGGTTATAATTATGTTCCTTTCAAGTTTCATCATAATTGTCTAGT
18 TCGATATAGTACATGGACACAATTAAATATGATATTGTCT
19 >Scaffold9299
20 CAGCATCTACATAATATGATCGCTATTAAACTTAAATCTCCTTGACGGAGTCTTCGGTCA
21 TAACACAAACCCAGACCTACGTATATGACAAAGCTAATAGGAAAAGCATCCTTGTTTGTT
22 TCACTATGCTTTTTAATGGTTGACGTTAAaggtaaagaccagtattggaaacgccccaat
23 ttcaaaaaatgaaatggaagctctcattaccaatcatgtgaaagaatatgttttgactaa
24 tacatgatgataaaaaaattgccgggaaaccgcctactaattcatatatttagtaaattt
25 gtttctctcatggtctgtgagagatatagggtagtcccatatacatctttctgtgtatag
26 tgcttgtaactttacgaagaatgggccaaatttcttatcattttgatgattccagaacct
27 tgcagatgcgagatggtagatgatcaaccttttctgatcgattccataacgtttctttca
28 caatgcaatcgcatgaccataactggtctttacctTTAAGTTGTAGGTCTTAATTGATAA
29 CACTATATAGTTTTTTTCTTTTTACTGTTTTTATTAATGACCTCTGTAATTTGCCCTATT
30 GTGAAAATACTAAAATATGTTTATACGCCGATGATGCGGCAATATTTTGCCAAGGCAAAG
31 AAATTGCCCTTGTTGAGAAAACTCTTAAATGTGAGTTTAAAAAAATAGTTGATCACATTG
32 AAAAAGATGACTTAATGTTGAATATCAAGAAGTGTAAGATCATGTTATTTGGGACAAGAA
33 AACGAATCAAAAATCAAAGTGTACGCTTGATTTACAGAGATAATGTTATCGAAGTTGTAA
34 ATGAATTTAAATATCTTGGTGTATTATTTGATAATTATTTAAAGTGGGATATACATATAT
35 CGAAAACTGCCTCCAAAATATCTAGAACCATATCATGTATAAAACGAATTAAATATTATT
36 TGCCGAAAAGAATTTTAAAATTGTTATATGATAGTTTGATATTGTCACATATTGACTACG
37 GTATTGTTTTGTGGGGATGTTCAGCAAAGTGTCATTTGGAAAAGTTACAAAAGTTACAAA
38 ATCGTTATGCCCGTTTAATACTAAACGTAGATATTTTGACACCTCGTATTATATTATTAT
39 CCTCTCTAAGATGGCAATCAGTTGTTCAGAGAGTGCAATACCAA
40 >Scaffold9309
41 GAAGGAAGAAGAGGAAAATAATGATGAATTTGTAGAATTTCTATAACGTATGAAAACATA
42 AACAACATGAAAAAGTATGAACCGACAGAAGAATGAAAATTTCAATCATATAACATGTCA
43 TTCACTTCTCTTCTCTGACTGTCAAGTATTAGGTATTCCTTTTTATTTCCTCTTAAAATG
44 ATCATAGTTTCCTATTTCTTTTACACCATTGGGAAGGGAATTCCAATGTTTTATGGCATT
45 GTAATAAAACGAATTTCCAATACTACCTACTCTTTCTGGTAAGTTAAAGTTGAATCGGCT
46 ATTTCTTGTATTATAATCATGTACGTCAGTAACAAGATCGAAGTTGGATCGAATATAATG
47 ATTCGACCTAGTATGATATATTTTATGCACGTGATGCAATACGAGTTGTTTTGATCTTTG
48 GTCGACTTCAAGAAAACCAGCTTTAGAAAGTTCGCTGTAGCCAACATGAGTTCTTGCCTT
49 GGACTAGAACAGTTGATAAATCTCACCATTTTGTTCTTTAAGATGGGTAGAAGAATCCCT
50 GCAATCTAAATGGTCAATTACTGTGAAGTTATTTTTACTGGATGCACCCAATAttttttt
51 gataatttttttttctttgataatttttttctttttctttaataaattttttggataatt
52 tttttttggataaatagttcttttttgataattctaataatttttttatttatttttttt
53 ttttctataattttttttaaaaaatttattaatttttaattaaaaaaaaaataaGAGTTA
54 ACAGATTAAGGGAAACTGACAATTCAAAAAAAAAAAAAA
55 >Scaffold9310
56 GCGGGGGCTGGGGAGGAAGGGGTGGCGTTATTTCACTTCCGATCTAATACGCTTTCTTAA
57 GACACTGAAATATCAGTAGGTATTGGTATAGAGAATTACTTTTTATTTTTAATTAAAACA
58 TTATCGAAATGAAGATACAGAGAAAAACGATGAGATGTAAGAAGTGCGCGTATTTAtgtg
59 tgtgggtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgcgtgcgtgtgtgtggtggtgtgt
60 ACTAATTTTGATGTGTGTTGTGGCACAATTGCAATCATCAGTATCTTCATGAAAATGATA
61 ACCAGAAGCACAAAAAGGAGGgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtttagtgtgcgtgcgtgt
62 gagggtgtttaagtgtgtatgtCGGAAATGTGGCACAATTGCAATCATCTGTATCTTCAT
63 GAAAATGATAACCAGAAGAACAAAAAAAAAAAACATTGAGAGAACATGTTTTTTTGATGG
64 AAGACAAGAAGTTCTCGTAACGTAGGATCTCCGAGACATGATGGGGTCAACTTAAAAAGA
65 GAGCAGTGAGAGGCATTTATATCGAAGGTCAGGGAAAGGCAAACAAAGAAAGAAAAAAAA
66 AAGGCTCACAGGAGAACGAAAACACGGGCCAAAATAATAAACAGGAGCAAGTGAACGGGC
67 AGTTTGGTAGCTACTTCATTTACCGGCTTTTAAaggtactatgtcccatttgcaggtcaa
68 aaaaaatgaaaaagttaaattccaactgcatttgaaagataatactaatttacaacttcc
69 ctaaaaaaggtggggcttgaaaatgtcttcaagtgcggaaaataacgactattagttgtc
70 aaatcgactttagggCTATAGAGCCCAAAAGTAATAGTCTTGA
71 >Scaffold11911
72 TTCTTGGCACCCCCCCCCCCCCCACACTCCTGCACTGAAGAACTACTCAAGTTTAAACTT
73 TGCATTGCTTTTCTTTCTTTTTCAGTATTTTTTGCTTGGTACATGTTTCTCTTAATATCT
74 GTCGTATAGatttttaatatttttatttatatCTACGTCAATCTGGCTGttctttttctt
75 gtcttctttttttttctctctcttttttttcctcgtattttGTATTGATCCTTACCCTAG
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77 TTGtctctgttcccctctccccccctctctctctctctctctctctctctctctctctct
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80 TGATTCTAATCATATTCTAACTCTTATTTTACATTTTACTTCACTAACAACTGGTTTATT
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83 AACCCCCTTTTTCTGCTTGCATTTTTATCCCTTTGCCGTGGACTTCACTGGATATTTTGC
84 TTTGATGCCAATCCAACAATTTTGCATATATTA