Mercurial > repos > devteam > fasta_formatter

view test-data/fasta_formatter1.fasta @ 0:8f0ae92440b8

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded tool tarball.
author devteam
date Wed, 25 Sep 2013 10:55:39 -0400
parents
children
line wrap: on
line source

>Scaffold3648
AGGAATGATGACTACAATGATCAACTTAACCTATCTATTTAATTTAGTTC
CCTAATGTCAGGGACCTACCTGTTTTTGTTATGTTTGGGTTTTGTTGTTG
TTGTTTTTTTAATCTGAAGGTATTGTGCATTATATGACCTGTAATACACA
GTATAACTTTTCAAATACTTTTGTTTTACAACTTTTCTCTCTGGACTTAT
ATTAAAGTCAATTTTAATGAACATGTAGTAAAAACTAATACATGTACATC
TACAGTTTATTTATTTTTTTCTTCTTCTTTTTGTATTTCTTGTGTTACAT
TATTTCACTTCACGTTCATGTTACCAACCTTGCCCCCTTGCTTTCCATGC
AAAAAAAGAAAAAAAAGAAGCAATACTTACACTTACCCTTGAGATATCTT
GATCTGAATGCTTTAACATTCTATATGTACAATAAATTTTTGTATCTATA
GCCTATTATTATATATGTTGCTATGTCAGGCACATTGACAACATTCTCAG
AAGGTTAGAAGATGGTATTGTTCTGAAATGCCTGGAATGCCTTGTGAACT
AAGATGATTACTCATGTCATTAAAGTCCCCTAACCCAGGTATTTCCTCCT
TCCCATGACGAAAACAGTCCATTTAAACTTCACCCCACTTTGGACCCGAA
AGTGGGGTGCATTTTGGTGGTAAGCTCACCACAGAGCAAGAGAGAGTTAG
AGTCCCTAATCTGCAGTGTAAACAAACTTTGCCAGGACATCACCAGCCCA
ACCTTGATAAGTACTGCTTGGAACTCCTCCATGATGTTCTAGTCTTATTC
GCAGTCTCATATAGGTTCGGATTTTGTCCATTCTCATAGCTACCAGTATA
CATGGGAGATGCCAGTTTCATCTTCCTTGCTTCACTTTATAAGCATAGTT
ATATCANGAACTTCCTGGTTATAATTATGTTCCTTTCAAGTTTCATCATA
ATTGTCTAGTTCGATATAGTACATGGACACAATTAAATATGATATTGTCT
>Scaffold9299
CAGCATCTACATAATATGATCGCTATTAAACTTAAATCTCCTTGACGGAG
TCTTCGGTCATAACACAAACCCAGACCTACGTATATGACAAAGCTAATAG
GAAAAGCATCCTTGTTTGTTTCACTATGCTTTTTAATGGTTGACGTTAAa
ggtaaagaccagtattggaaacgccccaatttcaaaaaatgaaatggaag
ctctcattaccaatcatgtgaaagaatatgttttgactaatacatgatga
taaaaaaattgccgggaaaccgcctactaattcatatatttagtaaattt
gtttctctcatggtctgtgagagatatagggtagtcccatatacatcttt
ctgtgtatagtgcttgtaactttacgaagaatgggccaaatttcttatca
ttttgatgattccagaaccttgcagatgcgagatggtagatgatcaacct
tttctgatcgattccataacgtttctttcacaatgcaatcgcatgaccat
aactggtctttacctTTAAGTTGTAGGTCTTAATTGATAACACTATATAG
TTTTTTTCTTTTTACTGTTTTTATTAATGACCTCTGTAATTTGCCCTATT
GTGAAAATACTAAAATATGTTTATACGCCGATGATGCGGCAATATTTTGC
CAAGGCAAAGAAATTGCCCTTGTTGAGAAAACTCTTAAATGTGAGTTTAA
AAAAATAGTTGATCACATTGAAAAAGATGACTTAATGTTGAATATCAAGA
AGTGTAAGATCATGTTATTTGGGACAAGAAAACGAATCAAAAATCAAAGT
GTACGCTTGATTTACAGAGATAATGTTATCGAAGTTGTAAATGAATTTAA
ATATCTTGGTGTATTATTTGATAATTATTTAAAGTGGGATATACATATAT
CGAAAACTGCCTCCAAAATATCTAGAACCATATCATGTATAAAACGAATT
AAATATTATTTGCCGAAAAGAATTTTAAAATTGTTATATGATAGTTTGAT
ATTGTCACATATTGACTACGGTATTGTTTTGTGGGGATGTTCAGCAAAGT
GTCATTTGGAAAAGTTACAAAAGTTACAAAATCGTTATGCCCGTTTAATA
CTAAACGTAGATATTTTGACACCTCGTATTATATTATTATCCTCTCTAAG
ATGGCAATCAGTTGTTCAGAGAGTGCAATACCAA
>Scaffold9309
GAAGGAAGAAGAGGAAAATAATGATGAATTTGTAGAATTTCTATAACGTA
TGAAAACATAAACAACATGAAAAAGTATGAACCGACAGAAGAATGAAAAT
TTCAATCATATAACATGTCATTCACTTCTCTTCTCTGACTGTCAAGTATT
AGGTATTCCTTTTTATTTCCTCTTAAAATGATCATAGTTTCCTATTTCTT
TTACACCATTGGGAAGGGAATTCCAATGTTTTATGGCATTGTAATAAAAC
GAATTTCCAATACTACCTACTCTTTCTGGTAAGTTAAAGTTGAATCGGCT
ATTTCTTGTATTATAATCATGTACGTCAGTAACAAGATCGAAGTTGGATC
GAATATAATGATTCGACCTAGTATGATATATTTTATGCACGTGATGCAAT
ACGAGTTGTTTTGATCTTTGGTCGACTTCAAGAAAACCAGCTTTAGAAAG
TTCGCTGTAGCCAACATGAGTTCTTGCCTTGGACTAGAACAGTTGATAAA
TCTCACCATTTTGTTCTTTAAGATGGGTAGAAGAATCCCTGCAATCTAAA
TGGTCAATTACTGTGAAGTTATTTTTACTGGATGCACCCAATAttttttt
gataatttttttttctttgataatttttttctttttctttaataaatttt
ttggataatttttttttggataaatagttcttttttgataattctaataa
tttttttatttattttttttttttctataattttttttaaaaaatttatt
aatttttaattaaaaaaaaaataaGAGTTAACAGATTAAGGGAAACTGAC
AATTCAAAAAAAAAAAAAA
>Scaffold9310
GCGGGGGCTGGGGAGGAAGGGGTGGCGTTATTTCACTTCCGATCTAATAC
GCTTTCTTAAGACACTGAAATATCAGTAGGTATTGGTATAGAGAATTACT
TTTTATTTTTAATTAAAACATTATCGAAATGAAGATACAGAGAAAAACGA
TGAGATGTAAGAAGTGCGCGTATTTAtgtgtgtgggtgcgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgttgtgtgcgtgcgtgtgtgtggtggtgtgtACTAATTTTG
ATGTGTGTTGTGGCACAATTGCAATCATCAGTATCTTCATGAAAATGATA
ACCAGAAGCACAAAAAGGAGGgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtttagtgt
gcgtgcgtgtgagggtgtttaagtgtgtatgtCGGAAATGTGGCACAATT
GCAATCATCTGTATCTTCATGAAAATGATAACCAGAAGAACAAAAAAAAA
AAACATTGAGAGAACATGTTTTTTTGATGGAAGACAAGAAGTTCTCGTAA
CGTAGGATCTCCGAGACATGATGGGGTCAACTTAAAAAGAGAGCAGTGAG
AGGCATTTATATCGAAGGTCAGGGAAAGGCAAACAAAGAAAGAAAAAAAA
AAGGCTCACAGGAGAACGAAAACACGGGCCAAAATAATAAACAGGAGCAA
GTGAACGGGCAGTTTGGTAGCTACTTCATTTACCGGCTTTTAAaggtact
atgtcccatttgcaggtcaaaaaaaatgaaaaagttaaattccaactgca
tttgaaagataatactaatttacaacttccctaaaaaaggtggggcttga
aaatgtcttcaagtgcggaaaataacgactattagttgtcaaatcgactt
tagggCTATAGAGCCCAAAAGTAATAGTCTTGA
>Scaffold11911
TTCTTGGCACCCCCCCCCCCCCCACACTCCTGCACTGAAGAACTACTCAA
GTTTAAACTTTGCATTGCTTTTCTTTCTTTTTCAGTATTTTTTGCTTGGT
ACATGTTTCTCTTAATATCTGTCGTATAGatttttaatatttttatttat
atCTACGTCAATCTGGCTGttctttttcttgtcttctttttttttctctc
tcttttttttcctcgtattttGTATTGATCCTTACCCTAGTTTTTGAACT
TGAACAGCAATTTGCAGCACTCAAATTTCTTTAAAATTACCTTCTCTTAT
TTGtctctgttcccctctccccccctctctctctctctctctctctctct
ctctctctctttcATCTCCCATATCATAATTTGAAGTACCATCTATGGTG
TTTTCAGATTGATCTTTCTTGCTTTCCCCACCCTCCCCCTTTATGCAGTT
AATTTTCAGTCTATTTGTGTTTTCTGTGGTTGATTCTAATCATATTCTAA
CTCTTATTTTACATTTTACTTCACTAACAACTGGTTTATTATATTTGTTA
CTAATTTTGAATTAAACTATTTACCATTCTGAACGAACTGAAAGATTAAA
GATCAAACTATCTATGAATAGAATGGTATTTCTTCAATTTATTCAAATTT
CTCTCTCTTTAACCCCCTTTTTCTGCTTGCATTTTTATCCCTTTGCCGTG
GACTTCACTGGATATTTTGCTTTGATGCCAATCCAACAATTTTGCATATA
TTA