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comparison test-data/blastn_chimera_vs_three_human_max1.txt @ 15:c16c30e9ad5b draft
Uploaded v0.1.03 (internal changes); v0.1.02 (BLAST+ 2.2.30 etc)
author | peterjc |
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date | Sun, 05 Jul 2015 10:37:27 -0400 |
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1 BLASTN 2.2.30+ | |
2 | |
3 | |
4 Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb | |
5 Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J | |
6 Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. | |
7 | |
8 | |
9 | |
10 Database: Just 3 human mRNA sequences | |
11 3 sequences; 10,732 total letters | |
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15 Query= chimera chunks of AB011145 plus M10051 plus BC112106 | |
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17 Length=9973 | |
18 Score E | |
19 Sequences producing significant alignments: (Bits) Value | |
20 | |
21 ENA|AB011145|AB011145.1 Homo sapiens mRNA for KIAA0573 protein,... 8421 0.0 | |
22 | |
23 | |
24 > ENA|AB011145|AB011145.1 Homo sapiens mRNA for KIAA0573 protein, | |
25 partial cds. | |
26 Length=4796 | |
27 | |
28 Score = 8421 bits (4560), Expect = 0.0 | |
29 Identities = 4560/4560 (100%), Gaps = 0/4560 (0%) | |
30 Strand=Plus/Plus | |
31 | |
32 Query 1 GGACCCCAGCGTTACCATGCATCCTGCCGTCTTCCTATCCTTACCCGACCTCAGATGCTC 60 | |
33 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
34 Sbjct 121 GGACCCCAGCGTTACCATGCATCCTGCCGTCTTCCTATCCTTACCCGACCTCAGATGCTC 180 | |
35 | |
36 Query 61 CCTTCTGCTCCTGGTAACTTGGGTTTTTACTCCTGTAACAACTGAAATAACAAGTCTTGA 120 | |
37 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
38 Sbjct 181 CCTTCTGCTCCTGGTAACTTGGGTTTTTACTCCTGTAACAACTGAAATAACAAGTCTTGA 240 | |
39 | |
40 Query 121 TACAGAGAATATAGATGAAATTTTAAACAATGCTGATGTTGCTTTAGTAAATTTTTATGC 180 | |
41 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
42 Sbjct 241 TACAGAGAATATAGATGAAATTTTAAACAATGCTGATGTTGCTTTAGTAAATTTTTATGC 300 | |
43 | |
44 Query 181 TGACTGGTGTCGTTTCAGTCAGATGTTGCATCCAATTTTTGAGGAAGCTTCCGATGTCAT 240 | |
45 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
46 Sbjct 301 TGACTGGTGTCGTTTCAGTCAGATGTTGCATCCAATTTTTGAGGAAGCTTCCGATGTCAT 360 | |
47 | |
48 Query 241 TAAGGAAGAATTTCCAAATGAAAATCAAGTAGTGTTTGCCAGAGTTGATTGTGATCAGCA 300 | |
49 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
50 Sbjct 361 TAAGGAAGAATTTCCAAATGAAAATCAAGTAGTGTTTGCCAGAGTTGATTGTGATCAGCA 420 | |
51 | |
52 Query 301 CTCTGACATAGCCCAGAGATACAGGATAAGCAAATACCCAACCCTCAAATTGTTTCGTAA 360 | |
53 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
54 Sbjct 421 CTCTGACATAGCCCAGAGATACAGGATAAGCAAATACCCAACCCTCAAATTGTTTCGTAA 480 | |
55 | |
56 Query 361 TGGGATGATGATGAAGAGAGAATACAGGGGTCAGCGATCAGTGAAAGCATTGGCAGATTA 420 | |
57 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
58 Sbjct 481 TGGGATGATGATGAAGAGAGAATACAGGGGTCAGCGATCAGTGAAAGCATTGGCAGATTA 540 | |
59 | |
60 Query 421 CATCAGGCAACAAAAAAGTGACCCCATTCAAGAAATTCGGGACTTAGCAGAAATCACCAC 480 | |
61 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
62 Sbjct 541 CATCAGGCAACAAAAAAGTGACCCCATTCAAGAAATTCGGGACTTAGCAGAAATCACCAC 600 | |
63 | |
64 Query 481 TCTTGATCGCAGCAAAAGAAATATCATTGGATATTTTGAGCAAAAGGACTCGGACAACTA 540 | |
65 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
66 Sbjct 601 TCTTGATCGCAGCAAAAGAAATATCATTGGATATTTTGAGCAAAAGGACTCGGACAACTA 660 | |
67 | |
68 Query 541 TAGAGTTTTTGAACGAGTAGCGAATATTTTGCATGATGACTGTGCCTTTCTTTCTGCATT 600 | |
69 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
70 Sbjct 661 TAGAGTTTTTGAACGAGTAGCGAATATTTTGCATGATGACTGTGCCTTTCTTTCTGCATT 720 | |
71 | |
72 Query 601 TGGGGATGTTTCAAAACCGGAAAGATATAGTGGCGACAACATAATCTACAAACCACCAGG 660 | |
73 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
74 Sbjct 721 TGGGGATGTTTCAAAACCGGAAAGATATAGTGGCGACAACATAATCTACAAACCACCAGG 780 | |
75 | |
76 Query 661 GCATTCTGCTCCGGATATGGTGTACTTGGGAGCTATGACAAATTTTGATGTGACTTACAA 720 | |
77 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
78 Sbjct 781 GCATTCTGCTCCGGATATGGTGTACTTGGGAGCTATGACAAATTTTGATGTGACTTACAA 840 | |
79 | |
80 Query 721 TTGGATTCAAGATAAATGTGTTCCTCTTGTCCGAGAAATAACATTTGAAAATGGAGAGGA 780 | |
81 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
82 Sbjct 841 TTGGATTCAAGATAAATGTGTTCCTCTTGTCCGAGAAATAACATTTGAAAATGGAGAGGA 900 | |
83 | |
84 Query 781 ATTGACAGAAGAAGGACTGCCTTTTCTCATACTCTTTCACATGAAAGAAGATACAGAAAG 840 | |
85 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
86 Sbjct 901 ATTGACAGAAGAAGGACTGCCTTTTCTCATACTCTTTCACATGAAAGAAGATACAGAAAG 960 | |
87 | |
88 Query 841 TTTAGAAATATTCCAGAATGAAGTAGCTCGGCAATTAATAAGTGAAAAAGGTACAATAAA 900 | |
89 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
90 Sbjct 961 TTTAGAAATATTCCAGAATGAAGTAGCTCGGCAATTAATAAGTGAAAAAGGTACAATAAA 1020 | |
91 | |
92 Query 901 CTTTTTACATGCCGATTGTGACAAATTTAGACATCCTCTTCTGCACATACAGAAAACTCC 960 | |
93 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
94 Sbjct 1021 CTTTTTACATGCCGATTGTGACAAATTTAGACATCCTCTTCTGCACATACAGAAAACTCC 1080 | |
95 | |
96 Query 961 AGCAGATTGTCCTGTAATCGCTATTGACAGCTTTAGGCATATGTATGTGTTTGGAGACTT 1020 | |
97 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
98 Sbjct 1081 AGCAGATTGTCCTGTAATCGCTATTGACAGCTTTAGGCATATGTATGTGTTTGGAGACTT 1140 | |
99 | |
100 Query 1021 CAAAGATGTATTAATTCCTGGAAAACTCAAGCAATTCGTATTTGACTTACATTCTGGAAA 1080 | |
101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
102 Sbjct 1141 CAAAGATGTATTAATTCCTGGAAAACTCAAGCAATTCGTATTTGACTTACATTCTGGAAA 1200 | |
103 | |
104 Query 1081 ACTGCACAGAGAATTCCATCATGGACCTGACCCAACTGATACAGCCCCAGGAGAGCAAGC 1140 | |
105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
106 Sbjct 1201 ACTGCACAGAGAATTCCATCATGGACCTGACCCAACTGATACAGCCCCAGGAGAGCAAGC 1260 | |
107 | |
108 Query 1141 CCAAGATGTAGCAAGCAGTCCACCTGAGAGCTCCTTCCAGAAACTAGCACCCAGTGAATA 1200 | |
109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
110 Sbjct 1261 CCAAGATGTAGCAAGCAGTCCACCTGAGAGCTCCTTCCAGAAACTAGCACCCAGTGAATA 1320 | |
111 | |
112 Query 1201 TAGGTATACTCTATTGAGGGATCGAGATGAGCTTTAAAAACTTGAAAAACAGTTTGTAAG 1260 | |
113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
114 Sbjct 1321 TAGGTATACTCTATTGAGGGATCGAGATGAGCTTTAAAAACTTGAAAAACAGTTTGTAAG 1380 | |
115 | |
116 Query 1261 CCTTTCAACAGCAGCATCAACCTACGTGGTGGAAATAGTAAACCTATATTTTCATAATTC 1320 | |
117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
118 Sbjct 1381 CCTTTCAACAGCAGCATCAACCTACGTGGTGGAAATAGTAAACCTATATTTTCATAATTC 1440 | |
119 | |
120 Query 1321 TATGTGTatttttattttgaataaacagaaagaaattttgggtttttaatttttttCTCC 1380 | |
121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
122 Sbjct 1441 TATGTGTATTTTTATTTTGAATAAACAGAAAGAAATTTTGGGTTTTTAATTTTTTTCTCC 1500 | |
123 | |
124 Query 1381 CCGACTCAAAATGCATTGTCATTTAATATAGTAGCCTCTTaaaaaaaaaaaaaCCTGCTA 1440 | |
125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
126 Sbjct 1501 CCGACTCAAAATGCATTGTCATTTAATATAGTAGCCTCTTAAAAAAAAAAAAACCTGCTA 1560 | |
127 | |
128 Query 1441 GGATTTAAAAATAAAAATCAGAGGCCTATCTCCACTTTAAATCTGTCCTGTAAAAGTTTT 1500 | |
129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
130 Sbjct 1561 GGATTTAAAAATAAAAATCAGAGGCCTATCTCCACTTTAAATCTGTCCTGTAAAAGTTTT 1620 | |
131 | |
132 Query 1501 ATAAATCAAATGAAAGGTGACATTGCCAGAAACTTACCATTAACTTGCACTACTAGGGTA 1560 | |
133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
134 Sbjct 1621 ATAAATCAAATGAAAGGTGACATTGCCAGAAACTTACCATTAACTTGCACTACTAGGGTA 1680 | |
135 | |
136 Query 1561 GGGAGGACTTAGGATGTTTCCTGTGTCGTATGTGCTTTTCTTTCTTTCATATGATCAATT 1620 | |
137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
138 Sbjct 1681 GGGAGGACTTAGGATGTTTCCTGTGTCGTATGTGCTTTTCTTTCTTTCATATGATCAATT 1740 | |
139 | |
140 Query 1621 CTGTTGGTATTTTCAGTATCTCATTTCTCAAAGCTAAAGAGATATACATTCTGGATACTT 1680 | |
141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
142 Sbjct 1741 CTGTTGGTATTTTCAGTATCTCATTTCTCAAAGCTAAAGAGATATACATTCTGGATACTT 1800 | |
143 | |
144 Query 1681 GGGAGGGGAATAAATTAAAGTTTTCACACTGTGTACTGTGTTTTACTGATTGGTTGGATA 1740 | |
145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
146 Sbjct 1801 GGGAGGGGAATAAATTAAAGTTTTCACACTGTGTACTGTGTTTTACTGATTGGTTGGATA 1860 | |
147 | |
148 Query 1741 TTGCTTATGAAAATTCCATAGTGGTAtttttttGGATTCTTAATGTGTAACTTAAACATA 1800 | |
149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
150 Sbjct 1861 TTGCTTATGAAAATTCCATAGTGGTATTTTTTTGGATTCTTAATGTGTAACTTAAACATA 1920 | |
151 | |
152 Query 1801 CTTTGAAGTGGAGGAGAGTCATAAGACAGAACATTTGGCAGGAATTGTCCTTATGAAACA 1860 | |
153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
154 Sbjct 1921 CTTTGAAGTGGAGGAGAGTCATAAGACAGAACATTTGGCAGGAATTGTCCTTATGAAACA 1980 | |
155 | |
156 Query 1861 AGAAAAAGAAAATGAAAAGTATTATTAAGCTTCTGTGTTTGTCTAAAAATGTGGCATATG 1920 | |
157 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
158 Sbjct 1981 AGAAAAAGAAAATGAAAAGTATTATTAAGCTTCTGTGTTTGTCTAAAAATGTGGCATATG 2040 | |
159 | |
160 Query 1921 GATGGCATTTAAAACTTTGAATGAATTATACCTAAATCTGGGACAGGGAGGTGACAGTGG 1980 | |
161 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
162 Sbjct 2041 GATGGCATTTAAAACTTTGAATGAATTATACCTAAATCTGGGACAGGGAGGTGACAGTGG 2100 | |
163 | |
164 Query 1981 AACAGGCTACCAATCAGAACTAGATGACTTTTAAGGCTCCTCCTATTATGAGACTTCAAT 2040 | |
165 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
166 Sbjct 2101 AACAGGCTACCAATCAGAACTAGATGACTTTTAAGGCTCCTCCTATTATGAGACTTCAAT 2160 | |
167 | |
168 Query 2041 TTCCAAAGAGAAGAACTAGCAGAGAAATTGTATTTCAGTAATTTTAAGCTCCTTCTGTCT 2100 | |
169 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
170 Sbjct 2161 TTCCAAAGAGAAGAACTAGCAGAGAAATTGTATTTCAGTAATTTTAAGCTCCTTCTGTCT 2220 | |
171 | |
172 Query 2101 TGTAGAGTCTTGTTATAGTTGTATAAATCAAAAACACAGAATAAGGAACATATTTAACtt 2160 | |
173 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
174 Sbjct 2221 TGTAGAGTCTTGTTATAGTTGTATAAATCAAAAACACAGAATAAGGAACATATTTAACTT 2280 | |
175 | |
176 Query 2161 tttttCATTATAAAATGGTTAGAGGACCCTACCCCCTCTAGATTCCCTGATTTCCCCAGG 2220 | |
177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
178 Sbjct 2281 TTTTTCATTATAAAATGGTTAGAGGACCCTACCCCCTCTAGATTCCCTGATTTCCCCAGG 2340 | |
179 | |
180 Query 2221 CCTGCAGCATACAGTAAGATGGGTCCCTGTGCCAGGCCTCAATACTGCCAGGGAATAAAA 2280 | |
181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
182 Sbjct 2341 CCTGCAGCATACAGTAAGATGGGTCCCTGTGCCAGGCCTCAATACTGCCAGGGAATAAAA 2400 | |
183 | |
184 Query 2281 CCAGAGGGAGAGGACCCTCAGTGTCATATCAGGAAGCCCAGTGCCAGAGGACAGACAGGT 2340 | |
185 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
186 Sbjct 2401 CCAGAGGGAGAGGACCCTCAGTGTCATATCAGGAAGCCCAGTGCCAGAGGACAGACAGGT 2460 | |
187 | |
188 Query 2341 TCAAAACTGGCTTTTCCTCTGGGCCTGGGTTGGTGCTATAGGCCAAGGGTCATTTTATAC 2400 | |
189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
190 Sbjct 2461 TCAAAACTGGCTTTTCCTCTGGGCCTGGGTTGGTGCTATAGGCCAAGGGTCATTTTATAC 2520 | |
191 | |
192 Query 2401 TTGGGTATAAATCAATCCCAGTTTGGGAAAAGATTATTTTTAAGCTTAAAAGGCTGACAT 2460 | |
193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
194 Sbjct 2521 TTGGGTATAAATCAATCCCAGTTTGGGAAAAGATTATTTTTAAGCTTAAAAGGCTGACAT 2580 | |
195 | |
196 Query 2461 GTGCCATTATATGTAGTATGTAATATATGTAACATCTTCCAATTCTTTTAAAATAAAATT 2520 | |
197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
198 Sbjct 2581 GTGCCATTATATGTAGTATGTAATATATGTAACATCTTCCAATTCTTTTAAAATAAAATT 2640 | |
199 | |
200 Query 2521 AATATTTATAATGGATATTTAATGATTGTTATTTTTAAAAACCAGCTTATAATTCCTCGT 2580 | |
201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
202 Sbjct 2641 AATATTTATAATGGATATTTAATGATTGTTATTTTTAAAAACCAGCTTATAATTCCTCGT 2700 | |
203 | |
204 Query 2581 TATGCATGATTTATCCAAAGTTTCCATAGTTTTATTCAAAATAATAAATGTTAATAAGGT 2640 | |
205 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
206 Sbjct 2701 TATGCATGATTTATCCAAAGTTTCCATAGTTTTATTCAAAATAATAAATGTTAATAAGGT 2760 | |
207 | |
208 Query 2641 GATAAGGGGTATATTTAATGTATTGTATCAAATTGTGAATAAGAAAGTAGGATGGAGCTT 2700 | |
209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
210 Sbjct 2761 GATAAGGGGTATATTTAATGTATTGTATCAAATTGTGAATAAGAAAGTAGGATGGAGCTT 2820 | |
211 | |
212 Query 2701 TCTAGAGGTTGGGCCTTAGTTCTGTTATCCTCATTGCTTTTAACCAATAAGTTAAATGAA 2760 | |
213 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
214 Sbjct 2821 TCTAGAGGTTGGGCCTTAGTTCTGTTATCCTCATTGCTTTTAACCAATAAGTTAAATGAA 2880 | |
215 | |
216 Query 2761 GTTAGAGTTATGGTCTTCAGGTTAGATTATGGACCAGATCTGTGAGGGTCAGCATGGAAA 2820 | |
217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
218 Sbjct 2881 GTTAGAGTTATGGTCTTCAGGTTAGATTATGGACCAGATCTGTGAGGGTCAGCATGGAAA 2940 | |
219 | |
220 Query 2821 TTCACATTCAACAAGGTAGCACACAGGACCAAGAGCAGCACATGCAATCAACTGGAATAA 2880 | |
221 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
222 Sbjct 2941 TTCACATTCAACAAGGTAGCACACAGGACCAAGAGCAGCACATGCAATCAACTGGAATAA 3000 | |
223 | |
224 Query 2881 TATAGTAATCCTGTAACTGGGTTTGAAAAAATAATCAACAAAAGATACAATTCAAGGGTT 2940 | |
225 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
226 Sbjct 3001 TATAGTAATCCTGTAACTGGGTTTGAAAAAATAATCAACAAAAGATACAATTCAAGGGTT 3060 | |
227 | |
228 Query 2941 AGGTTGCAGAGAGCTGGCTTGAGAGTAGTTATTATGAAAAAGGCCTCAAGGAGTACGTGT 3000 | |
229 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
230 Sbjct 3061 AGGTTGCAGAGAGCTGGCTTGAGAGTAGTTATTATGAAAAAGGCCTCAAGGAGTACGTGT 3120 | |
231 | |
232 Query 3001 TCAGTATGCTCTAAGATGATAAAGTGGCTGTTAAAAAGGGAGTTGATTTGAGGAAGTATT 3060 | |
233 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
234 Sbjct 3121 TCAGTATGCTCTAAGATGATAAAGTGGCTGTTAAAAAGGGAGTTGATTTGAGGAAGTATT 3180 | |
235 | |
236 Query 3061 ACTTAGCATTCATGCATATTGGGCTTAGGCTCTAGCCCTGCCACTATCATTGTCTTCTCT 3120 | |
237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
238 Sbjct 3181 ACTTAGCATTCATGCATATTGGGCTTAGGCTCTAGCCCTGCCACTATCATTGTCTTCTCT 3240 | |
239 | |
240 Query 3121 GGACTGTGAAGTCACTGAGGACAAGGAAACTAAATTTAATGTCTGTATCACTAGTGCCTA 3180 | |
241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
242 Sbjct 3241 GGACTGTGAAGTCACTGAGGACAAGGAAACTAAATTTAATGTCTGTATCACTAGTGCCTA 3300 | |
243 | |
244 Query 3181 GAATTTCTGGACACTTAGTAGTCACCATCAGGCGTTTATTTAATGAATGAGAAGCAAAGT 3240 | |
245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
246 Sbjct 3301 GAATTTCTGGACACTTAGTAGTCACCATCAGGCGTTTATTTAATGAATGAGAAGCAAAGT 3360 | |
247 | |
248 Query 3241 GACCTTGGTTACTTTTTTACCCTGAGGGGCTCAGCACTCATTAGGACTTGGTGCCTAATT 3300 | |
249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
250 Sbjct 3361 GACCTTGGTTACTTTTTTACCCTGAGGGGCTCAGCACTCATTAGGACTTGGTGCCTAATT 3420 | |
251 | |
252 Query 3301 TTATAAAAAGTCACTAAGCTCAAGTGCTTGGATGAAAGGACAGCGTGGATAAAAAGGTTT 3360 | |
253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
254 Sbjct 3421 TTATAAAAAGTCACTAAGCTCAAGTGCTTGGATGAAAGGACAGCGTGGATAAAAAGGTTT 3480 | |
255 | |
256 Query 3361 TTAAAACATGGATGTTAAGGCTGTTTTGCTTGGAGAAGACTTGGGACTGGGACAGTCTTT 3420 | |
257 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
258 Sbjct 3481 TTAAAACATGGATGTTAAGGCTGTTTTGCTTGGAGAAGACTTGGGACTGGGACAGTCTTT 3540 | |
259 | |
260 Query 3421 AGATATTATTTGAAATGCTGGCACTGTCTATCTGGATCCCAGGGCTTGAACTAGGATTTG 3480 | |
261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
262 Sbjct 3541 AGATATTATTTGAAATGCTGGCACTGTCTATCTGGATCCCAGGGCTTGAACTAGGATTTG 3600 | |
263 | |
264 Query 3481 AGGAAGTCACAGGGAAGCAGATTTCAGTCTGACATTTATTCAGTGCAAGTTTTTTGGTGC 3540 | |
265 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
266 Sbjct 3601 AGGAAGTCACAGGGAAGCAGATTTCAGTCTGACATTTATTCAGTGCAAGTTTTTTGGTGC 3660 | |
267 | |
268 Query 3541 TGTAGTATATGATGAAAGATGTAAAGCTGAATAAAGCATTATTTCTGCCCTAGAGTTGTT 3600 | |
269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
270 Sbjct 3661 TGTAGTATATGATGAAAGATGTAAAGCTGAATAAAGCATTATTTCTGCCCTAGAGTTGTT 3720 | |
271 | |
272 Query 3601 CACAGCCTAGTCAGGCATATGGATATGTAAACAATGACTGTAACGTGTTATAGATGTAAA 3660 | |
273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
274 Sbjct 3721 CACAGCCTAGTCAGGCATATGGATATGTAAACAATGACTGTAACGTGTTATAGATGTAAA 3780 | |
275 | |
276 Query 3661 GACAAAATAAAGGTTAAAGAGGGCATAAAGGAGCACTCAATTGCAGAGATTTGAGGACAT 3720 | |
277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
278 Sbjct 3781 GACAAAATAAAGGTTAAAGAGGGCATAAAGGAGCACTCAATTGCAGAGATTTGAGGACAT 3840 | |
279 | |
280 Query 3721 TATTTTTATTTTGAGCTTTAAAAAGATGAATAGGTGTTCTCAGGAGGTAGGGATCTGGCT 3780 | |
281 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
282 Sbjct 3841 TATTTTTATTTTGAGCTTTAAAAAGATGAATAGGTGTTCTCAGGAGGTAGGGATCTGGCT 3900 | |
283 | |
284 Query 3781 GAGAGGGAATAATCTGAGCAAAGGTATGAAACAGCCTAATGCATTAGAGAAAAAAGTTCT 3840 | |
285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
286 Sbjct 3901 GAGAGGGAATAATCTGAGCAAAGGTATGAAACAGCCTAATGCATTAGAGAAAAAAGTTCT 3960 | |
287 | |
288 Query 3841 TTTAGTAAGGCATTTGGGGTTGGGGAAGCTAGAAAAAGAAATGGGAGCTGGTCACACAGG 3900 | |
289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
290 Sbjct 3961 TTTAGTAAGGCATTTGGGGTTGGGGAAGCTAGAAAAAGAAATGGGAGCTGGTCACACAGG 4020 | |
291 | |
292 Query 3901 GCCTTGTGTGCCAGACTAAGGGGTTTGTAGTATATATTGTAGGCAGAAGAGATCCATCAA 3960 | |
293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
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295 | |
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349 Posted date: Dec 26, 2014 5:54 AM | |
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356 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5 |