| [up] |  | drwxr-xr-x | 
|  blastdb.loc | 370 | -rw-r--r-- | 
|  blastdb_d.loc | 348 | -rw-r--r-- | 
|  blastdb_p.loc | 421 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_arabidopsis.extended.tabular | 1453 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_arabidopsis.standard.tabular | 63 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_arabidopsis.xml | 4719 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_chimera_vs_rhodopsin_db.tabular | 510 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_chimera_vs_three_human_and_rhodopsin_db.tabular | 732 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_chimera_vs_three_human_db.tabular | 222 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_chimera_vs_three_human_max1.tabular | 74 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_chimera_vs_three_human_max1.txt | 19011 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_rhodopsin_vs_three_human.columns.tabular | 486 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_rhodopsin_vs_three_human.tabular | 677 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_rhodopsin_vs_three_human.xml | 23536 | -rw-r--r-- | 
|  blastn_rhodopsin_vs_three_human_converted.tabular | 665 | -rw-r--r-- | 
|  blastp_four_human_vs_rhodopsin.tabular | 316 | -rw-r--r-- | 
|  blastp_four_human_vs_rhodopsin.xml | 15644 | -rw-r--r-- | 
|  blastp_four_human_vs_rhodopsin_converted.tabular | 434 | -rw-r--r-- | 
|  blastp_four_human_vs_rhodopsin_converted_ext.tabular | 5068 | -rw-r--r-- | 
|  blastp_four_human_vs_rhodopsin_ext.tabular | 4796 | -rw-r--r-- | 
|  blastp_human_vs_pdb_seg_no.xml | 26729 | -rw-r--r-- | 
|  blastp_human_vs_pdb_seg_no_converted_ext.tabular | 11242 | -rw-r--r-- | 
|  blastp_human_vs_pdb_seg_no_converted_std.tabular | 670 | -rw-r--r-- | 
|  blastp_rhodopsin_vs_four_human.tabular | 518 | -rw-r--r-- | 
|  blastp_sample.xml | 23132 | -rw-r--r-- | 
|  blastp_sample_converted.tabular | 711 | -rw-r--r-- | 
|  blastx_rhodopsin_vs_four_human.tabular | 908 | -rw-r--r-- | 
|  blastx_rhodopsin_vs_four_human.xml | 19808 | -rw-r--r-- | 
|  blastx_rhodopsin_vs_four_human_all.tabular | 7746 | -rw-r--r-- | 
|  blastx_rhodopsin_vs_four_human_converted.tabular | 893 | -rw-r--r-- | 
|  blastx_rhodopsin_vs_four_human_converted_ext.tabular | 6103 | -rw-r--r-- | 
|  blastx_rhodopsin_vs_four_human_ext.tabular | 5518 | -rw-r--r-- | 
|  blastx_sample.xml | 73475 | -rw-r--r-- | 
|  blastx_sample_converted.tabular | 2866 | -rw-r--r-- | 
|  cd00003.smp | 495662 | -rw-r--r-- | 
|  cd00003_and_cd00008.aux | 89 | -rw-r--r-- | 
|  cd00003_and_cd00008.freq | 44372 | -rw-r--r-- | 
|  cd00003_and_cd00008.loo | 538448 | -rw-r--r-- | 
|  cd00003_and_cd00008.phr | 3190 | -rw-r--r-- | 
|  cd00003_and_cd00008.pin | 104 | -rw-r--r-- | 
|  cd00003_and_cd00008.psd | 34 | -rw-r--r-- | 
|  cd00003_and_cd00008.psi | 69 | -rw-r--r-- | 
|  cd00003_and_cd00008.psq | 397 | -rw-r--r-- | 
|  cd00003_and_cd00008.rps | 44372 | -rw-r--r-- | 
|  cd00008.smp | 327111 | -rw-r--r-- | 
|  chimera.fasta | 10194 | -rw-r--r-- | 
|  convert2blastmask_four_human_masked.maskinfo-asn1 | 3229 | -rw-r--r-- | 
|  convert2blastmask_four_human_masked.maskinfo-asn1-binary | 1291 | -rw-r--r-- | 
|  dustmasker_three_human.fasta | 11158 | -rw-r--r-- | 
|  dustmasker_three_human.maskinfo-asn1 | 1058 | -rw-r--r-- | 
|  dustmasker_three_human.maskinfo-asn1-binary | 442 | -rw-r--r-- | 
|  empty_file.dat | 0 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins.dbinfo.txt | 234 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins.fasta | 3668 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins.fasta.log.txt | 60 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins.fasta.phd | 51 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins.fasta.phi | 65 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins.fasta.phr | 571 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins.fasta.pin | 120 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins.fasta.pog | 48 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins.fasta.psd | 72 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins.fasta.psi | 70 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins.fasta.psq | 3302 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins_masked.fasta | 3681 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins_taxid.fasta.log.txt | 60 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins_taxid.fasta.phd | 51 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins_taxid.fasta.phi | 65 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins_taxid.fasta.phr | 575 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins_taxid.fasta.pin | 120 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins_taxid.fasta.pog | 48 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins_taxid.fasta.psd | 72 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins_taxid.fasta.psi | 70 | -rw-r--r-- | 
|  four_human_proteins_taxid.fasta.psq | 3302 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_bufo.fasta | 1643 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.dbinfo.txt | 218 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta | 10978 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta.log.txt | 63 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta.nhd | 78 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta.nhi | 65 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta.nhr | 785 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta.nin | 164 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta.nnd | 48 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta.nni | 52 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta.nog | 56 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta.nsd | 159 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta.nsi | 63 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.fasta.nsq | 2590 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_nucs.no_gi.fasta | 10870 | -rw-r--r-- | 
|  rhodopsin_proteins.fasta | 2454 | -rw-r--r-- | 
|  segmasker_four_human.fasta | 3681 | -rw-r--r-- | 
|  segmasker_four_human.maskinfo-asn1 | 1854 | -rw-r--r-- | 
|  segmasker_four_human.maskinfo-asn1-binary | 796 | -rw-r--r-- | 
|  tblastn_four_human_vs_rhodopsin.html | 13777 | -rw-r--r-- | 
|  tblastn_four_human_vs_rhodopsin.tabular | 907 | -rw-r--r-- | 
|  tblastn_four_human_vs_rhodopsin.xml | 18723 | -rw-r--r-- | 
|  tblastn_four_human_vs_rhodopsin_deflines.tabular | 571 | -rw-r--r-- | 
|  tblastn_four_human_vs_rhodopsin_ext.tabular | 5651 | -rw-r--r-- | 
|  tblastx_rhodopsin_vs_three_human.tabular | 11393 | -rw-r--r-- | 
|  three_human_mRNA.dbinfo.txt | 226 | -rw-r--r-- | 
|  three_human_mRNA.fasta | 11161 | -rw-r--r-- | 
|  three_human_mRNA.fasta.log.txt | 69 | -rw-r--r-- | 
|  three_human_mRNA.fasta.nhd | 39 | -rw-r--r-- | 
|  three_human_mRNA.fasta.nhi | 65 | -rw-r--r-- | 
|  three_human_mRNA.fasta.nhr | 435 | -rw-r--r-- | 
|  three_human_mRNA.fasta.nin | 128 | -rw-r--r-- | 
|  three_human_mRNA.fasta.nog | 44 | -rw-r--r-- | 
|  three_human_mRNA.fasta.nsd | 54 | -rw-r--r-- | 
|  three_human_mRNA.fasta.nsi | 70 | -rw-r--r-- | 
|  three_human_mRNA.fasta.nsq | 2686 | -rw-r--r-- | 
|  tool_data_table_conf.xml.test | 502 | -rw-r--r-- |