Mercurial > repos > devteam > picard

diff test-data/random_phiX_1.fastqsanger @ 0:1cd7f3b42609

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded tool.
author devteam
date Tue, 23 Oct 2012 13:14:29 -0400
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/random_phiX_1.fastqsanger	Tue Oct 23 13:14:29 2012 -0400
@@ -0,0 +1,80 @@
+@random_phiX_region_0
+TTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCTTT
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_1
+GTTAGTGCTGAGGTTGACTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTA
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_2
+AATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTTTCCA
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_3
+GGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTC
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_4
+ACGCAAAAAGAGAGATGAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGAC
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_5
+AGCTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCA
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_6
+CACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGC
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_7
+AACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGTTGGCG
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_8
+CTCGTGCTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTT
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_9
+CAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGACTTAGTTCA
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_10
+TACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTC
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_11
+TATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGA
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_12
+AGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGGTGATA
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_13
+TTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCA
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_14
+CCGGGCAATAACGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGC
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_15
+AACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTT
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_16
+GCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACTGGACAATCA
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_17
+CATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAG
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_18
+TGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGA
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+@random_phiX_region_19
+GCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACT
++
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~