test-data/
 | 
 | 
drwxr-xr-x | 
  tool-data/
 | 
 | 
drwxr-xr-x | 
  picard_AddCommentsToBam.xml
 | 
2279 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_AddOrReplaceReadGroups.xml
 | 
3679 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_BedToIntervalList.xml
 | 
3925 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CleanSam.xml
 | 
1545 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectAlignmentSummaryMetrics.xml
 | 
5614 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectBaseDistributionByCycle.xml
 | 
4736 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectGcBiasMetrics.xml
 | 
4923 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectHsMetrics.xml
 | 
4731 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectInsertSizeMetrics.xml
 | 
6674 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectRnaSeqMetrics.xml
 | 
14034 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectSequencingArtifactsMetrics.xml
 | 
8547 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectWgsMetrics.xml
 | 
4254 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_DownsampleSam.xml
 | 
2837 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_EstimateLibraryComplexity.xml
 | 
8502 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_FastqToSam.xml
 | 
10783 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_FilterSamReads.xml
 | 
5255 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_FixMateInformation.xml
 | 
2932 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MarkDuplicates.xml
 | 
8882 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MarkDuplicatesWithMateCigar.xml
 | 
8957 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MeanQualityByCycle.xml
 | 
4484 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MergeBamAlignment.xml
 | 
18713 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MergeSamFiles.xml
 | 
3290 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_NormalizeFasta.xml
 | 
2578 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_QualityScoreDistribution.xml
 | 
4872 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_ReorderSam.xml
 | 
5449 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_ReplaceSamHeader.xml
 | 
2256 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_RevertOriginalBaseQualitiesAndAddMateCigar.xml
 | 
3089 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_RevertSam.xml
 | 
8291 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_SamToFastq.xml
 | 
12478 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_SortSam.xml
 | 
3053 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_ValidateSamFile.xml
 | 
14091 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_macros.xml
 | 
6854 | 
-rw-r--r-- | 
  read_group_macros.xml
 | 
11264 | 
-rw-r--r-- | 
  tool_data_table_conf.xml.sample
 | 
385 | 
-rw-r--r-- | 
  tool_data_table_conf.xml.test
 | 
273 | 
-rw-r--r-- |