test-data/
|
|
drwxr-xr-x |
tool-data/
|
|
drwxr-xr-x |
picard_AddCommentsToBam.xml
|
2279 |
-rw-r--r-- |
picard_AddOrReplaceReadGroups.xml
|
3679 |
-rw-r--r-- |
picard_BedToIntervalList.xml
|
3925 |
-rw-r--r-- |
picard_CleanSam.xml
|
1545 |
-rw-r--r-- |
picard_CollectAlignmentSummaryMetrics.xml
|
5614 |
-rw-r--r-- |
picard_CollectBaseDistributionByCycle.xml
|
4736 |
-rw-r--r-- |
picard_CollectGcBiasMetrics.xml
|
4923 |
-rw-r--r-- |
picard_CollectHsMetrics.xml
|
4731 |
-rw-r--r-- |
picard_CollectInsertSizeMetrics.xml
|
6674 |
-rw-r--r-- |
picard_CollectRnaSeqMetrics.xml
|
14034 |
-rw-r--r-- |
picard_CollectSequencingArtifactsMetrics.xml
|
8547 |
-rw-r--r-- |
picard_CollectWgsMetrics.xml
|
4254 |
-rw-r--r-- |
picard_DownsampleSam.xml
|
2837 |
-rw-r--r-- |
picard_EstimateLibraryComplexity.xml
|
8502 |
-rw-r--r-- |
picard_FastqToSam.xml
|
10783 |
-rw-r--r-- |
picard_FilterSamReads.xml
|
5255 |
-rw-r--r-- |
picard_FixMateInformation.xml
|
2932 |
-rw-r--r-- |
picard_MarkDuplicates.xml
|
8882 |
-rw-r--r-- |
picard_MarkDuplicatesWithMateCigar.xml
|
8957 |
-rw-r--r-- |
picard_MeanQualityByCycle.xml
|
4484 |
-rw-r--r-- |
picard_MergeBamAlignment.xml
|
18713 |
-rw-r--r-- |
picard_MergeSamFiles.xml
|
3290 |
-rw-r--r-- |
picard_NormalizeFasta.xml
|
2578 |
-rw-r--r-- |
picard_QualityScoreDistribution.xml
|
4872 |
-rw-r--r-- |
picard_ReorderSam.xml
|
5449 |
-rw-r--r-- |
picard_ReplaceSamHeader.xml
|
2256 |
-rw-r--r-- |
picard_RevertOriginalBaseQualitiesAndAddMateCigar.xml
|
3089 |
-rw-r--r-- |
picard_RevertSam.xml
|
8291 |
-rw-r--r-- |
picard_SamToFastq.xml
|
12478 |
-rw-r--r-- |
picard_SortSam.xml
|
3053 |
-rw-r--r-- |
picard_ValidateSamFile.xml
|
14091 |
-rw-r--r-- |
picard_macros.xml
|
6854 |
-rw-r--r-- |
read_group_macros.xml
|
11264 |
-rw-r--r-- |
tool_data_table_conf.xml.sample
|
385 |
-rw-r--r-- |
tool_data_table_conf.xml.test
|
273 |
-rw-r--r-- |