diff test-data/samtools_phase_out_2_log.txt @ 1:8bfe0d1616d2 draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-devteam/tree/master/tool_collections/samtools/samtools_phase commit a1517c9d22029095120643bbe2c8fa53754dd2b7
author devteam
date Wed, 11 Nov 2015 12:53:49 -0500
parents cba1944e3ed0
children
line wrap: on
line diff
--- a/test-data/samtools_phase_out_2_log.txt	Thu Mar 27 15:26:17 2014 -0400
+++ b/test-data/samtools_phase_out_2_log.txt	Wed Nov 11 12:53:49 2015 -0500
@@ -21,45 +21,45 @@
 M1	chrI	1412	1421	G	A	3	7	0	9	0
 M1	chrI	1412	1471	T	C	4	5	0	6	0
 M1	chrI	1412	1542	C	T	5	3	0	2	0
-EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	TGG	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1340
-EV	0	chrI	1	40	4M	*	0	0	CAAC	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:4	YO:i:0	YS:i:1374
-EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	TGG	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1346
 EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	TGG	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1366
+EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	CAA	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1343
 EV	0	chrI	1	40	4M	*	0	0	TGGT	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:4	YO:i:0	YS:i:1409
-EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	CAA	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1359
 EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	CAA	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1353
-EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	CAA	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1343
-EV	0	chrI	1	40	4M	*	0	0	CAAC	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:4	YO:i:0	YS:i:1379
+EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	TGG	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1358
+EV	0	chrI	1	40	4M	*	0	0	CAAC	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:4	YO:i:0	YS:i:1374
 EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	CAA	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1350
+EV	0	chrI	1	40	4M	*	0	0	CAAC	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:4	YO:i:0	YS:i:1379
 EV	0	chrI	1	40	4M	*	0	0	CAAC	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:4	YO:i:0	YS:i:1389
-EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	CAA	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1348
-EV	0	chrI	1	40	4M	*	0	0	TGGT	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:4	YO:i:0	YS:i:1407
-EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	TGG	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1358
 EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	TGG	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1341
+EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	TGG	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1340
+EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	CAA	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1359
 EV	0	chrI	1	40	4M	*	0	0	CAAC	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:4	YO:i:0	YS:i:1392
+EV	0	chrI	1	40	4M	*	0	0	TGGT	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:4	YO:i:0	YS:i:1407
+EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	TGG	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1346
+EV	0	chrI	1	40	3M	*	0	0	CAA	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:3	YO:i:0	YS:i:1348
+EV	0	chrI	4	40	2M	*	0	0	TC	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:1444
 EV	0	chrI	4	40	2M	*	0	0	CT	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:1462
+EV	0	chrI	4	40	2M	*	0	0	CT	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:1457
 EV	0	chrI	4	40	2M	*	0	0	TC	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:1468
-EV	0	chrI	4	40	2M	*	0	0	TC	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:1444
-EV	0	chrI	4	40	2M	*	0	0	CT	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:1457
 EV	0	chrI	4	40	2M	*	0	0	TC	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:1461
 //
 PS	chrI	3611	3731
 M1	chrI	3611	3611	T	A	6	5	0	4	0
 M1	chrI	3611	3659	C	T	7	9	0	6	0
 M1	chrI	3611	3731	T	A	8	4	0	1	1
-EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	AT	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3578
+EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	TC	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3569
 EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	TC	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3569
-EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	AT	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3590
+EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	AT	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3576
 EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	TC	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3571
-EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	AT	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3576
-EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	TC	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3559
-EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	TC	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3569
 EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	AT	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3568
+EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	AT	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3578
+EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	AT	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3590
+EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	TC	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3559
 EV	0	chrI	6	40	2M	*	0	0	TC	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3609
-EV	0	chrI	7	40	2M	*	0	0	CT	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3651
-EV	0	chrI	7	40	2M	*	0	0	CT	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3647
 EV	0	chrI	7	40	2M	*	0	0	TA	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3644
-EV	0	chrI	7	40	2M	*	0	0	CT	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3644
+EV	0	chrI	7	40	2M	*	0	0	CT	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3651
+EV	0	chrI	7	40	2M	*	0	0	CT	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3637
+EV	0	chrI	7	40	2M	*	0	0	CT	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3647
 EV	0	chrI	7	40	2M	*	0	0	TT	*	YP:i:1	YF:i:0	YI:i:1	YO:i:1	YS:i:3657
-EV	0	chrI	7	40	2M	*	0	0	CT	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3637
+EV	0	chrI	7	40	2M	*	0	0	CT	*	YP:i:0	YF:i:0	YI:i:2	YO:i:0	YS:i:3644
 //