comparison test-data/samtools_stats_out1__gcc.tab @ 3:95a7ddf617e7 draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tool_collections/samtools/samtools_stats commit 70b38ebad0d0936f102e3e7cb70f1060347ea8c4
author iuc
date Thu, 27 Sep 2018 09:05:10 -0400
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
2:24c5d43cb545 3:95a7ddf617e7
1 # ACGT content per cycle. The columns are: cycle; A,C,G,T base counts as a percentage of all A/C/G/T bases [%]; and N and O counts as a percentage of all A/C/G/T bases [%]
2 1 21.94 30.10 34.18 13.78 2.04 0.00
3 2 30.00 16.00 11.00 43.00 0.00 0.00
4 3 33.00 25.00 9.00 33.00 0.00 0.00
5 4 17.00 29.00 13.00 41.00 0.00 0.00
6 5 37.00 22.00 12.00 29.00 0.00 0.00
7 6 36.00 26.00 17.00 21.00 0.00 0.00
8 7 29.50 13.50 31.50 25.50 0.00 0.00
9 8 50.50 14.50 19.50 15.50 0.00 0.00
10 9 17.00 33.00 18.00 32.00 0.00 0.00
11 10 37.00 14.00 21.00 28.00 0.00 0.00
12 11 20.50 14.50 29.50 35.50 0.00 0.00
13 12 30.00 24.00 22.00 24.00 0.00 0.00
14 13 27.00 15.00 21.00 37.00 0.00 0.00
15 14 24.24 22.22 26.26 27.27 1.01 0.00
16 15 25.50 20.50 24.50 29.50 0.00 0.00
17 16 31.00 15.00 20.00 34.00 0.00 0.00
18 17 28.00 25.00 14.00 33.00 0.00 0.00
19 18 30.50 28.50 19.50 21.50 0.00 0.00
20 19 29.00 26.00 21.00 24.00 0.00 0.00
21 20 22.50 23.50 17.50 36.50 0.00 0.00
22 21 35.50 17.50 19.50 27.50 0.00 0.00
23 22 37.50 28.50 15.50 18.50 0.00 0.00
24 23 31.31 19.19 13.13 36.36 1.01 0.00
25 24 37.00 12.00 22.00 29.00 0.00 0.00
26 25 35.50 22.50 17.50 24.50 0.00 0.00
27 26 33.50 18.50 15.50 32.50 0.00 0.00
28 27 34.50 14.50 25.50 25.50 0.00 0.00
29 28 31.00 14.00 24.00 31.00 0.00 0.00
30 29 30.00 27.00 24.00 19.00 0.00 0.00
31 30 31.00 20.00 14.00 35.00 0.00 0.00
32 31 33.50 29.50 13.50 23.50 0.00 0.00
33 32 42.50 20.50 19.50 17.50 0.00 0.00
34 33 25.50 23.50 14.50 36.50 0.00 0.00
35 34 39.50 16.50 20.50 23.50 0.00 0.00
36 35 32.50 23.50 21.50 22.50 0.00 0.00
37 36 42.00 25.00 16.00 17.00 0.00 0.00
38 37 38.00 17.00 19.00 26.00 0.00 0.00
39 38 24.00 26.00 25.00 25.00 0.00 0.00
40 39 22.50 41.50 18.50 17.50 0.00 0.00
41 40 32.00 16.00 21.00 31.00 0.00 0.00
42 41 33.00 28.00 19.00 20.00 0.00 0.00
43 42 30.50 25.50 19.50 24.50 0.00 0.00
44 43 35.00 29.00 15.00 21.00 0.00 0.00
45 44 20.00 27.00 22.00 31.00 0.00 0.00
46 45 40.50 21.50 21.50 16.50 0.00 0.00
47 46 26.50 20.50 22.50 30.50 0.00 0.00
48 47 38.50 29.50 16.50 15.50 0.00 0.00
49 48 27.50 24.50 17.50 30.50 0.00 0.00
50 49 28.50 32.50 10.50 28.50 0.00 0.00
51 50 46.50 20.50 9.50 23.50 0.00 0.00
52 51 34.50 28.50 13.50 23.50 0.00 0.00
53 52 41.50 23.50 20.50 14.50 0.00 0.00
54 53 20.00 28.00 26.00 26.00 0.00 0.00
55 54 31.50 18.50 24.50 25.50 0.00 0.00
56 55 30.50 22.50 16.50 30.50 0.00 0.00
57 56 33.50 22.50 13.50 30.50 0.00 0.00
58 57 23.00 24.00 23.00 30.00 0.00 0.00
59 58 25.00 37.00 19.00 19.00 0.00 0.00
60 59 34.00 23.00 24.00 19.00 0.00 0.00
61 60 29.00 28.00 17.00 26.00 0.00 0.00
62 61 25.50 23.50 24.50 26.50 0.00 0.00
63 62 31.50 22.50 16.50 29.50 0.00 0.00
64 63 27.50 28.50 25.50 18.50 0.00 0.00
65 64 33.50 21.50 25.50 19.50 0.00 0.00
66 65 35.50 19.50 18.50 26.50 0.00 0.00
67 66 34.00 25.00 15.00 26.00 0.00 0.00
68 67 37.00 23.00 19.00 21.00 0.00 0.00
69 68 36.50 29.50 13.50 20.50 0.00 0.00
70 69 38.50 19.50 20.50 21.50 0.00 0.00
71 70 38.50 16.50 18.50 26.50 0.00 0.00
72 71 25.50 38.50 21.50 14.50 0.00 0.00
73 72 29.00 29.00 25.00 17.00 0.00 0.00
74 73 32.50 20.50 21.50 25.50 0.00 0.00
75 74 28.50 32.50 12.50 26.50 0.00 0.00
76 75 41.50 12.50 18.50 27.50 0.00 0.00
77 76 24.50 29.50 23.50 22.50 0.00 0.00
78 77 36.00 21.00 18.00 25.00 0.00 0.00
79 78 27.00 34.00 22.00 17.00 0.00 0.00
80 79 21.50 26.50 25.50 26.50 0.00 0.00
81 80 34.00 19.00 28.00 19.00 0.00 0.00
82 81 17.00 26.00 26.00 31.00 0.00 0.00
83 82 31.00 30.00 23.00 16.00 0.00 0.00
84 83 31.50 26.50 12.50 29.50 0.00 0.00
85 84 19.00 41.00 21.00 19.00 0.00 0.00
86 85 37.50 24.50 16.50 21.50 0.00 0.00
87 86 15.00 48.00 15.00 22.00 0.00 0.00
88 87 41.00 16.00 18.00 25.00 0.00 0.00
89 88 23.50 27.50 27.50 21.50 0.00 0.00
90 89 26.50 27.50 26.50 19.50 0.00 0.00
91 90 18.50 23.50 24.50 33.50 0.00 0.00
92 91 27.00 32.00 22.00 19.00 0.00 0.00
93 92 23.50 17.50 27.50 31.50 0.00 0.00
94 93 25.50 37.50 15.50 21.50 0.00 0.00
95 94 27.00 17.00 24.00 32.00 0.00 0.00
96 95 26.77 37.88 14.65 20.71 1.01 0.00
97 96 29.50 25.50 16.50 28.50 0.00 0.00
98 97 29.00 31.00 21.00 19.00 0.00 0.00
99 98 18.18 33.33 22.22 26.26 1.01 0.00
100 99 24.50 33.50 24.50 17.50 0.00 0.00
101 100 24.50 16.50 24.50 34.50 0.00 0.00
102 101 25.00 40.00 19.00 16.00 0.00 0.00
103 102 17.50 17.50 32.50 32.50 0.00 0.00
104 103 31.00 26.00 16.00 27.00 0.00 0.00
105 104 26.50 29.50 20.50 23.50 0.00 0.00
106 105 34.00 33.00 21.00 12.00 0.00 0.00
107 106 23.00 31.00 26.00 20.00 0.00 0.00
108 107 17.68 35.86 23.74 22.73 1.01 0.00
109 108 24.75 30.81 23.74 20.71 1.01 0.00
110 109 17.00 31.00 22.00 30.00 0.00 0.00
111 110 16.16 35.35 24.24 24.24 1.01 0.00
112 111 24.24 32.32 23.23 20.20 1.01 0.00
113 112 37.37 28.28 16.16 18.18 1.01 0.00
114 113 19.70 22.73 32.83 24.75 1.01 0.00
115 114 17.00 31.00 35.00 17.00 0.00 0.00
116 115 29.50 24.50 23.50 22.50 0.00 0.00
117 116 22.00 30.00 34.00 14.00 0.00 0.00
118 117 27.00 23.00 19.00 31.00 0.00 0.00
119 118 25.50 14.50 34.50 25.50 0.00 0.00
120 119 22.50 34.50 20.50 22.50 0.00 0.00
121 120 17.50 24.50 26.50 31.50 0.00 0.00
122 121 27.78 33.84 22.73 15.66 1.01 0.00
123 122 17.00 23.00 25.00 35.00 0.00 0.00
124 123 23.50 46.50 11.50 18.50 0.00 0.00
125 124 9.00 32.00 34.00 25.00 0.00 0.00
126 125 24.00 27.00 19.00 30.00 0.00 0.00
127 126 26.00 17.00 28.00 29.00 0.00 0.00
128 127 26.50 16.50 21.50 35.50 0.00 0.00
129 128 18.00 34.00 31.00 17.00 0.00 0.00
130 129 25.50 25.50 27.50 21.50 0.00 0.00
131 130 25.00 20.00 22.00 33.00 0.00 0.00
132 131 17.50 39.50 24.50 18.50 0.00 0.00
133 132 21.00 28.00 23.00 28.00 0.00 0.00
134 133 13.50 31.50 35.50 19.50 0.00 0.00
135 134 24.50 19.50 30.50 25.50 0.00 0.00
136 135 16.50 23.50 30.50 29.50 0.00 0.00
137 136 28.00 32.00 15.00 25.00 0.00 0.00
138 137 22.50 21.50 30.50 25.50 0.00 0.00
139 138 14.50 34.50 24.50 26.50 0.00 0.00
140 139 20.50 29.50 24.50 25.50 0.00 0.00
141 140 17.00 23.00 30.00 30.00 0.00 0.00
142 141 20.50 23.50 25.50 30.50 0.00 0.00
143 142 18.00 29.00 38.00 15.00 0.00 0.00
144 143 22.00 24.00 27.00 27.00 0.00 0.00
145 144 21.50 30.50 26.50 21.50 0.00 0.00
146 145 22.00 21.00 29.00 28.00 0.00 0.00
147 146 25.00 16.00 39.00 20.00 0.00 0.00
148 147 26.50 22.50 30.50 20.50 0.00 0.00
149 148 12.50 28.50 36.50 22.50 0.00 0.00
150 149 26.50 23.50 23.50 26.50 0.00 0.00
151 150 14.00 29.00 24.00 33.00 0.00 0.00
152 151 19.50 30.50 32.50 17.50 0.00 0.00
153 152 18.50 17.50 29.50 34.50 0.00 0.00
154 153 22.50 22.50 31.50 23.50 0.00 0.00
155 154 22.00 21.00 29.00 28.00 0.00 0.00
156 155 21.00 26.00 19.00 34.00 0.00 0.00
157 156 14.50 23.50 35.50 26.50 0.00 0.00
158 157 22.00 31.00 23.00 24.00 0.00 0.00
159 158 22.50 29.50 24.50 23.50 0.00 0.00
160 159 17.50 12.50 46.50 23.50 0.00 0.00
161 160 24.50 26.50 26.50 22.50 0.00 0.00
162 161 13.00 23.00 45.00 19.00 0.00 0.00
163 162 31.50 16.50 22.50 29.50 0.00 0.00
164 163 19.50 21.50 35.50 23.50 0.00 0.00
165 164 29.00 18.00 21.00 32.00 0.00 0.00
166 165 14.50 17.50 35.50 32.50 0.00 0.00
167 166 17.50 37.50 28.50 16.50 0.00 0.00
168 167 16.50 21.50 31.50 30.50 0.00 0.00
169 168 14.00 25.00 30.00 31.00 0.00 0.00
170 169 18.50 20.50 23.50 37.50 0.00 0.00
171 170 19.00 23.00 28.00 30.00 0.00 0.00
172 171 20.00 28.00 33.00 19.00 0.00 0.00
173 172 19.00 20.00 32.00 29.00 0.00 0.00
174 173 24.50 16.50 33.50 25.50 0.00 0.00
175 174 17.50 23.50 33.50 25.50 0.00 0.00
176 175 33.50 17.50 35.50 13.50 0.00 0.00
177 176 16.50 32.50 28.50 22.50 0.00 0.00
178 177 19.00 22.00 27.00 32.00 0.00 0.00
179 178 16.00 26.00 30.00 28.00 0.00 0.00
180 179 18.00 18.00 22.00 42.00 0.00 0.00
181 180 21.00 22.00 34.00 23.00 0.00 0.00
182 181 20.50 19.50 35.50 24.50 0.00 0.00
183 182 32.50 18.50 22.50 26.50 0.00 0.00
184 183 24.50 13.50 28.50 33.50 0.00 0.00
185 184 15.00 29.00 30.00 26.00 0.00 0.00
186 185 15.00 32.00 33.00 20.00 0.00 0.00
187 186 22.50 23.50 34.50 19.50 0.00 0.00
188 187 19.00 14.00 40.00 27.00 0.00 0.00
189 188 27.50 21.50 27.50 23.50 0.00 0.00
190 189 17.00 22.00 34.00 27.00 0.00 0.00
191 190 23.00 30.00 23.00 24.00 0.00 0.00
192 191 25.00 22.00 28.00 25.00 0.00 0.00
193 192 34.50 24.50 13.50 27.50 0.00 0.00
194 193 18.50 25.50 25.50 30.50 0.00 0.00
195 194 18.50 33.50 24.50 23.50 0.00 0.00
196 195 16.00 26.00 23.00 35.00 0.00 0.00
197 196 21.50 25.50 24.50 28.50 0.00 0.00
198 197 20.00 21.00 23.00 36.00 0.00 0.00
199 198 17.00 21.00 37.00 25.00 0.00 0.00
200 199 20.50 18.50 25.50 35.50 0.00 0.00
201 200 21.00 29.00 21.00 29.00 0.00 0.00
202 201 27.00 21.00 23.00 29.00 0.00 0.00
203 202 21.50 24.50 19.50 34.50 0.00 0.00
204 203 21.50 24.50 26.50 27.50 0.00 0.00
205 204 27.00 29.00 24.00 20.00 0.00 0.00
206 205 19.50 21.50 22.50 36.50 0.00 0.00
207 206 26.50 24.50 21.50 27.50 0.00 0.00
208 207 22.50 21.50 19.50 36.50 0.00 0.00
209 208 14.00 35.00 29.00 22.00 0.00 0.00
210 209 16.00 23.00 12.00 49.00 0.00 0.00
211 210 18.50 19.50 40.50 21.50 0.00 0.00
212 211 26.00 20.00 22.00 32.00 0.00 0.00
213 212 21.00 31.00 18.00 30.00 0.00 0.00
214 213 24.00 15.00 31.00 30.00 0.00 0.00
215 214 17.50 24.50 25.50 32.50 0.00 0.00
216 215 26.00 24.00 23.00 27.00 0.00 0.00
217 216 21.50 17.50 25.50 35.50 0.00 0.00
218 217 26.00 29.00 17.00 28.00 0.00 0.00
219 218 20.00 27.00 21.00 32.00 0.00 0.00
220 219 17.00 21.00 21.00 41.00 0.00 0.00
221 220 25.50 23.50 23.50 27.50 0.00 0.00
222 221 21.50 23.50 20.50 34.50 0.00 0.00
223 222 21.50 21.50 18.50 38.50 0.00 0.00
224 223 20.00 27.00 28.00 25.00 0.00 0.00
225 224 22.50 22.50 24.50 30.50 0.00 0.00
226 225 14.50 35.50 30.50 19.50 0.00 0.00
227 226 20.00 23.00 26.00 31.00 0.00 0.00
228 227 20.50 24.50 23.50 31.50 0.00 0.00
229 228 33.00 19.00 26.00 22.00 0.00 0.00
230 229 22.50 24.50 18.50 34.50 0.00 0.00
231 230 21.00 32.00 16.00 31.00 0.00 0.00
232 231 23.00 28.00 30.00 19.00 0.00 0.00
233 232 23.50 21.50 12.50 42.50 0.00 0.00
234 233 21.00 27.00 25.00 27.00 0.00 0.00
235 234 16.50 27.50 22.50 33.50 0.00 0.00
236 235 20.00 15.00 28.00 37.00 0.00 0.00
237 236 28.00 23.00 21.00 28.00 0.00 0.00
238 237 20.50 19.50 22.50 37.50 0.00 0.00
239 238 21.50 29.50 24.50 24.50 0.00 0.00
240 239 20.00 8.00 17.00 55.00 0.00 0.00
241 240 28.00 24.00 16.00 32.00 0.00 0.00
242 241 22.50 22.50 16.50 38.50 0.00 0.00
243 242 29.00 25.00 13.00 33.00 0.00 0.00
244 243 22.50 15.50 23.50 38.50 0.00 0.00
245 244 20.50 23.50 16.50 39.50 0.00 0.00
246 245 28.00 23.00 19.00 30.00 0.00 0.00
247 246 21.00 29.00 25.00 25.00 0.00 0.00
248 247 32.00 14.00 13.00 41.00 0.00 0.00
249 248 18.00 18.00 25.00 39.00 0.00 0.00
250 249 25.00 23.00 21.00 31.00 0.00 0.00
251 250 27.50 22.50 17.50 32.50 0.00 0.00
252 251 13.50 20.50 36.50 29.50 0.00 0.00