Mercurial > repos > devteam > samtools_stats
view test-data/samtools_stats_out1__gcc.tab @ 12:541082d03bef draft default tip
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tool_collections/samtools/samtools_stats commit 9c5a35ce695c3d134e41d8695487edd5f71ea33c
author | iuc |
---|---|
date | Sun, 08 Sep 2024 03:27:04 +0000 |
parents | 95a7ddf617e7 |
children |
line wrap: on
line source
# ACGT content per cycle. The columns are: cycle; A,C,G,T base counts as a percentage of all A/C/G/T bases [%]; and N and O counts as a percentage of all A/C/G/T bases [%] 1 21.94 30.10 34.18 13.78 2.04 0.00 2 30.00 16.00 11.00 43.00 0.00 0.00 3 33.00 25.00 9.00 33.00 0.00 0.00 4 17.00 29.00 13.00 41.00 0.00 0.00 5 37.00 22.00 12.00 29.00 0.00 0.00 6 36.00 26.00 17.00 21.00 0.00 0.00 7 29.50 13.50 31.50 25.50 0.00 0.00 8 50.50 14.50 19.50 15.50 0.00 0.00 9 17.00 33.00 18.00 32.00 0.00 0.00 10 37.00 14.00 21.00 28.00 0.00 0.00 11 20.50 14.50 29.50 35.50 0.00 0.00 12 30.00 24.00 22.00 24.00 0.00 0.00 13 27.00 15.00 21.00 37.00 0.00 0.00 14 24.24 22.22 26.26 27.27 1.01 0.00 15 25.50 20.50 24.50 29.50 0.00 0.00 16 31.00 15.00 20.00 34.00 0.00 0.00 17 28.00 25.00 14.00 33.00 0.00 0.00 18 30.50 28.50 19.50 21.50 0.00 0.00 19 29.00 26.00 21.00 24.00 0.00 0.00 20 22.50 23.50 17.50 36.50 0.00 0.00 21 35.50 17.50 19.50 27.50 0.00 0.00 22 37.50 28.50 15.50 18.50 0.00 0.00 23 31.31 19.19 13.13 36.36 1.01 0.00 24 37.00 12.00 22.00 29.00 0.00 0.00 25 35.50 22.50 17.50 24.50 0.00 0.00 26 33.50 18.50 15.50 32.50 0.00 0.00 27 34.50 14.50 25.50 25.50 0.00 0.00 28 31.00 14.00 24.00 31.00 0.00 0.00 29 30.00 27.00 24.00 19.00 0.00 0.00 30 31.00 20.00 14.00 35.00 0.00 0.00 31 33.50 29.50 13.50 23.50 0.00 0.00 32 42.50 20.50 19.50 17.50 0.00 0.00 33 25.50 23.50 14.50 36.50 0.00 0.00 34 39.50 16.50 20.50 23.50 0.00 0.00 35 32.50 23.50 21.50 22.50 0.00 0.00 36 42.00 25.00 16.00 17.00 0.00 0.00 37 38.00 17.00 19.00 26.00 0.00 0.00 38 24.00 26.00 25.00 25.00 0.00 0.00 39 22.50 41.50 18.50 17.50 0.00 0.00 40 32.00 16.00 21.00 31.00 0.00 0.00 41 33.00 28.00 19.00 20.00 0.00 0.00 42 30.50 25.50 19.50 24.50 0.00 0.00 43 35.00 29.00 15.00 21.00 0.00 0.00 44 20.00 27.00 22.00 31.00 0.00 0.00 45 40.50 21.50 21.50 16.50 0.00 0.00 46 26.50 20.50 22.50 30.50 0.00 0.00 47 38.50 29.50 16.50 15.50 0.00 0.00 48 27.50 24.50 17.50 30.50 0.00 0.00 49 28.50 32.50 10.50 28.50 0.00 0.00 50 46.50 20.50 9.50 23.50 0.00 0.00 51 34.50 28.50 13.50 23.50 0.00 0.00 52 41.50 23.50 20.50 14.50 0.00 0.00 53 20.00 28.00 26.00 26.00 0.00 0.00 54 31.50 18.50 24.50 25.50 0.00 0.00 55 30.50 22.50 16.50 30.50 0.00 0.00 56 33.50 22.50 13.50 30.50 0.00 0.00 57 23.00 24.00 23.00 30.00 0.00 0.00 58 25.00 37.00 19.00 19.00 0.00 0.00 59 34.00 23.00 24.00 19.00 0.00 0.00 60 29.00 28.00 17.00 26.00 0.00 0.00 61 25.50 23.50 24.50 26.50 0.00 0.00 62 31.50 22.50 16.50 29.50 0.00 0.00 63 27.50 28.50 25.50 18.50 0.00 0.00 64 33.50 21.50 25.50 19.50 0.00 0.00 65 35.50 19.50 18.50 26.50 0.00 0.00 66 34.00 25.00 15.00 26.00 0.00 0.00 67 37.00 23.00 19.00 21.00 0.00 0.00 68 36.50 29.50 13.50 20.50 0.00 0.00 69 38.50 19.50 20.50 21.50 0.00 0.00 70 38.50 16.50 18.50 26.50 0.00 0.00 71 25.50 38.50 21.50 14.50 0.00 0.00 72 29.00 29.00 25.00 17.00 0.00 0.00 73 32.50 20.50 21.50 25.50 0.00 0.00 74 28.50 32.50 12.50 26.50 0.00 0.00 75 41.50 12.50 18.50 27.50 0.00 0.00 76 24.50 29.50 23.50 22.50 0.00 0.00 77 36.00 21.00 18.00 25.00 0.00 0.00 78 27.00 34.00 22.00 17.00 0.00 0.00 79 21.50 26.50 25.50 26.50 0.00 0.00 80 34.00 19.00 28.00 19.00 0.00 0.00 81 17.00 26.00 26.00 31.00 0.00 0.00 82 31.00 30.00 23.00 16.00 0.00 0.00 83 31.50 26.50 12.50 29.50 0.00 0.00 84 19.00 41.00 21.00 19.00 0.00 0.00 85 37.50 24.50 16.50 21.50 0.00 0.00 86 15.00 48.00 15.00 22.00 0.00 0.00 87 41.00 16.00 18.00 25.00 0.00 0.00 88 23.50 27.50 27.50 21.50 0.00 0.00 89 26.50 27.50 26.50 19.50 0.00 0.00 90 18.50 23.50 24.50 33.50 0.00 0.00 91 27.00 32.00 22.00 19.00 0.00 0.00 92 23.50 17.50 27.50 31.50 0.00 0.00 93 25.50 37.50 15.50 21.50 0.00 0.00 94 27.00 17.00 24.00 32.00 0.00 0.00 95 26.77 37.88 14.65 20.71 1.01 0.00 96 29.50 25.50 16.50 28.50 0.00 0.00 97 29.00 31.00 21.00 19.00 0.00 0.00 98 18.18 33.33 22.22 26.26 1.01 0.00 99 24.50 33.50 24.50 17.50 0.00 0.00 100 24.50 16.50 24.50 34.50 0.00 0.00 101 25.00 40.00 19.00 16.00 0.00 0.00 102 17.50 17.50 32.50 32.50 0.00 0.00 103 31.00 26.00 16.00 27.00 0.00 0.00 104 26.50 29.50 20.50 23.50 0.00 0.00 105 34.00 33.00 21.00 12.00 0.00 0.00 106 23.00 31.00 26.00 20.00 0.00 0.00 107 17.68 35.86 23.74 22.73 1.01 0.00 108 24.75 30.81 23.74 20.71 1.01 0.00 109 17.00 31.00 22.00 30.00 0.00 0.00 110 16.16 35.35 24.24 24.24 1.01 0.00 111 24.24 32.32 23.23 20.20 1.01 0.00 112 37.37 28.28 16.16 18.18 1.01 0.00 113 19.70 22.73 32.83 24.75 1.01 0.00 114 17.00 31.00 35.00 17.00 0.00 0.00 115 29.50 24.50 23.50 22.50 0.00 0.00 116 22.00 30.00 34.00 14.00 0.00 0.00 117 27.00 23.00 19.00 31.00 0.00 0.00 118 25.50 14.50 34.50 25.50 0.00 0.00 119 22.50 34.50 20.50 22.50 0.00 0.00 120 17.50 24.50 26.50 31.50 0.00 0.00 121 27.78 33.84 22.73 15.66 1.01 0.00 122 17.00 23.00 25.00 35.00 0.00 0.00 123 23.50 46.50 11.50 18.50 0.00 0.00 124 9.00 32.00 34.00 25.00 0.00 0.00 125 24.00 27.00 19.00 30.00 0.00 0.00 126 26.00 17.00 28.00 29.00 0.00 0.00 127 26.50 16.50 21.50 35.50 0.00 0.00 128 18.00 34.00 31.00 17.00 0.00 0.00 129 25.50 25.50 27.50 21.50 0.00 0.00 130 25.00 20.00 22.00 33.00 0.00 0.00 131 17.50 39.50 24.50 18.50 0.00 0.00 132 21.00 28.00 23.00 28.00 0.00 0.00 133 13.50 31.50 35.50 19.50 0.00 0.00 134 24.50 19.50 30.50 25.50 0.00 0.00 135 16.50 23.50 30.50 29.50 0.00 0.00 136 28.00 32.00 15.00 25.00 0.00 0.00 137 22.50 21.50 30.50 25.50 0.00 0.00 138 14.50 34.50 24.50 26.50 0.00 0.00 139 20.50 29.50 24.50 25.50 0.00 0.00 140 17.00 23.00 30.00 30.00 0.00 0.00 141 20.50 23.50 25.50 30.50 0.00 0.00 142 18.00 29.00 38.00 15.00 0.00 0.00 143 22.00 24.00 27.00 27.00 0.00 0.00 144 21.50 30.50 26.50 21.50 0.00 0.00 145 22.00 21.00 29.00 28.00 0.00 0.00 146 25.00 16.00 39.00 20.00 0.00 0.00 147 26.50 22.50 30.50 20.50 0.00 0.00 148 12.50 28.50 36.50 22.50 0.00 0.00 149 26.50 23.50 23.50 26.50 0.00 0.00 150 14.00 29.00 24.00 33.00 0.00 0.00 151 19.50 30.50 32.50 17.50 0.00 0.00 152 18.50 17.50 29.50 34.50 0.00 0.00 153 22.50 22.50 31.50 23.50 0.00 0.00 154 22.00 21.00 29.00 28.00 0.00 0.00 155 21.00 26.00 19.00 34.00 0.00 0.00 156 14.50 23.50 35.50 26.50 0.00 0.00 157 22.00 31.00 23.00 24.00 0.00 0.00 158 22.50 29.50 24.50 23.50 0.00 0.00 159 17.50 12.50 46.50 23.50 0.00 0.00 160 24.50 26.50 26.50 22.50 0.00 0.00 161 13.00 23.00 45.00 19.00 0.00 0.00 162 31.50 16.50 22.50 29.50 0.00 0.00 163 19.50 21.50 35.50 23.50 0.00 0.00 164 29.00 18.00 21.00 32.00 0.00 0.00 165 14.50 17.50 35.50 32.50 0.00 0.00 166 17.50 37.50 28.50 16.50 0.00 0.00 167 16.50 21.50 31.50 30.50 0.00 0.00 168 14.00 25.00 30.00 31.00 0.00 0.00 169 18.50 20.50 23.50 37.50 0.00 0.00 170 19.00 23.00 28.00 30.00 0.00 0.00 171 20.00 28.00 33.00 19.00 0.00 0.00 172 19.00 20.00 32.00 29.00 0.00 0.00 173 24.50 16.50 33.50 25.50 0.00 0.00 174 17.50 23.50 33.50 25.50 0.00 0.00 175 33.50 17.50 35.50 13.50 0.00 0.00 176 16.50 32.50 28.50 22.50 0.00 0.00 177 19.00 22.00 27.00 32.00 0.00 0.00 178 16.00 26.00 30.00 28.00 0.00 0.00 179 18.00 18.00 22.00 42.00 0.00 0.00 180 21.00 22.00 34.00 23.00 0.00 0.00 181 20.50 19.50 35.50 24.50 0.00 0.00 182 32.50 18.50 22.50 26.50 0.00 0.00 183 24.50 13.50 28.50 33.50 0.00 0.00 184 15.00 29.00 30.00 26.00 0.00 0.00 185 15.00 32.00 33.00 20.00 0.00 0.00 186 22.50 23.50 34.50 19.50 0.00 0.00 187 19.00 14.00 40.00 27.00 0.00 0.00 188 27.50 21.50 27.50 23.50 0.00 0.00 189 17.00 22.00 34.00 27.00 0.00 0.00 190 23.00 30.00 23.00 24.00 0.00 0.00 191 25.00 22.00 28.00 25.00 0.00 0.00 192 34.50 24.50 13.50 27.50 0.00 0.00 193 18.50 25.50 25.50 30.50 0.00 0.00 194 18.50 33.50 24.50 23.50 0.00 0.00 195 16.00 26.00 23.00 35.00 0.00 0.00 196 21.50 25.50 24.50 28.50 0.00 0.00 197 20.00 21.00 23.00 36.00 0.00 0.00 198 17.00 21.00 37.00 25.00 0.00 0.00 199 20.50 18.50 25.50 35.50 0.00 0.00 200 21.00 29.00 21.00 29.00 0.00 0.00 201 27.00 21.00 23.00 29.00 0.00 0.00 202 21.50 24.50 19.50 34.50 0.00 0.00 203 21.50 24.50 26.50 27.50 0.00 0.00 204 27.00 29.00 24.00 20.00 0.00 0.00 205 19.50 21.50 22.50 36.50 0.00 0.00 206 26.50 24.50 21.50 27.50 0.00 0.00 207 22.50 21.50 19.50 36.50 0.00 0.00 208 14.00 35.00 29.00 22.00 0.00 0.00 209 16.00 23.00 12.00 49.00 0.00 0.00 210 18.50 19.50 40.50 21.50 0.00 0.00 211 26.00 20.00 22.00 32.00 0.00 0.00 212 21.00 31.00 18.00 30.00 0.00 0.00 213 24.00 15.00 31.00 30.00 0.00 0.00 214 17.50 24.50 25.50 32.50 0.00 0.00 215 26.00 24.00 23.00 27.00 0.00 0.00 216 21.50 17.50 25.50 35.50 0.00 0.00 217 26.00 29.00 17.00 28.00 0.00 0.00 218 20.00 27.00 21.00 32.00 0.00 0.00 219 17.00 21.00 21.00 41.00 0.00 0.00 220 25.50 23.50 23.50 27.50 0.00 0.00 221 21.50 23.50 20.50 34.50 0.00 0.00 222 21.50 21.50 18.50 38.50 0.00 0.00 223 20.00 27.00 28.00 25.00 0.00 0.00 224 22.50 22.50 24.50 30.50 0.00 0.00 225 14.50 35.50 30.50 19.50 0.00 0.00 226 20.00 23.00 26.00 31.00 0.00 0.00 227 20.50 24.50 23.50 31.50 0.00 0.00 228 33.00 19.00 26.00 22.00 0.00 0.00 229 22.50 24.50 18.50 34.50 0.00 0.00 230 21.00 32.00 16.00 31.00 0.00 0.00 231 23.00 28.00 30.00 19.00 0.00 0.00 232 23.50 21.50 12.50 42.50 0.00 0.00 233 21.00 27.00 25.00 27.00 0.00 0.00 234 16.50 27.50 22.50 33.50 0.00 0.00 235 20.00 15.00 28.00 37.00 0.00 0.00 236 28.00 23.00 21.00 28.00 0.00 0.00 237 20.50 19.50 22.50 37.50 0.00 0.00 238 21.50 29.50 24.50 24.50 0.00 0.00 239 20.00 8.00 17.00 55.00 0.00 0.00 240 28.00 24.00 16.00 32.00 0.00 0.00 241 22.50 22.50 16.50 38.50 0.00 0.00 242 29.00 25.00 13.00 33.00 0.00 0.00 243 22.50 15.50 23.50 38.50 0.00 0.00 244 20.50 23.50 16.50 39.50 0.00 0.00 245 28.00 23.00 19.00 30.00 0.00 0.00 246 21.00 29.00 25.00 25.00 0.00 0.00 247 32.00 14.00 13.00 41.00 0.00 0.00 248 18.00 18.00 25.00 39.00 0.00 0.00 249 25.00 23.00 21.00 31.00 0.00 0.00 250 27.50 22.50 17.50 32.50 0.00 0.00 251 13.50 20.50 36.50 29.50 0.00 0.00