--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/test.small.vcf	Mon Jan 27 09:29:09 2014 -0500
@@ -0,0 +1,1000 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##fileDate=20110215
+##source=freeBayes version 0.4.1
+##reference=/d2/data/references/build_37/human_reference_v37.fa
+##phasing=none
+##commandline="/share/software/freebayes/bin/freebayes --stdin --no-filters --min-alternate-count 2 --posterior-integration-depth 100 --pvar 0.01 --vcf /d1/data/1000G/20101123/filteringTests/AFR/mosaik/noFilters/Pipeline/none//freebayes/freebayes.20:0-1000000.baq.20110210.vcf --fasta-reference /d2/data/references/build_37/human_reference_v37.fa --region 20:0..1000000"
+##vcfPytools=merge freebayes.20:0-1000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:1000000-2000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:2000000-3000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:3000000-4000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:4000000-5000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:5000000-6000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:6000000-7000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:7000000-8000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:8000000-9000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:9000000-10000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:10000000-11000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:11000000-12000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:12000000-13000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:13000000-14000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:14000000-15000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:15000000-16000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:16000000-17000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:17000000-18000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:18000000-19000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:19000000-20000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:20000000-21000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:21000000-22000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:22000000-23000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:23000000-24000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:24000000-25000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:25000000-26000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:26000000-27000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:27000000-28000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:28000000-29000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:29000000-30000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:30000000-31000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:31000000-32000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:32000000-33000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:33000000-34000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:34000000-35000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:35000000-36000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:36000000-37000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:37000000-38000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:38000000-39000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:39000000-40000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:40000000-41000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:41000000-42000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:42000000-43000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:43000000-44000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:44000000-45000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:45000000-46000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:46000000-47000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:47000000-48000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:48000000-49000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:49000000-50000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:50000000-51000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:51000000-52000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:52000000-53000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:53000000-54000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:54000000-55000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:55000000-56000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:56000000-57000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:57000000-58000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:58000000-59000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:59000000-60000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:60000000-61000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:61000000-62000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:62000000-63000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:63000000-63025520.baq.20110210.vcf
+##vcfPytools=
+##INFO=<ID=AB,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance at heterozygous sites: a number between 0 and 1 representing the ratio of reads showing the reference allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous">
+##INFO=<ID=DEL,Number=1,Type=Integer,Description="Length of deletion allele, if present">
+##INFO=<ID=CpG,Number=0,Type=Flag,Description="CpG site (either CpG, TpG or CpA)">
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total read depth at the locus">
+##INFO=<ID=TV,Number=0,Type=Flag,Description="transversion SNP">
+##INFO=<ID=TS,Number=0,Type=Flag,Description="transition SNP">
+##INFO=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
+##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of samples with data">
+##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
+##INFO=<ID=ABA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the alternate allele">
+##INFO=<ID=AC,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alternate alleles in called genotypes">
+##INFO=<ID=REPEAT,Number=1,Type=String,Description="Description of the local repeat structures flanking the current position">
+##INFO=<ID=AF,Number=1,Type=Float,Description="Estimated allele frequency in the range (0,1]">
+##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
+##INFO=<ID=ABR,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the reference allele">
+##INFO=<ID=RUN,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length: the number of consecutive nucleotides in the reference genome matching the alternate allele prior to the current position">
+##INFO=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
+##INFO=<ID=INS,Number=1,Type=Integer,Description="Length of insertion allele, if present">
+##INFO=<ID=MNP,Number=0,Type=Integer,Description="Length of MNP allele, if present">
+##INFO=<ID=SNP,Number=0,Type=Flag,Description="SNP allele">
+##INFO=<ID=SB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the alternate allele: a number between 0 and 1 representing the ratio of forward strand sequence reads showing the alternate allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous">
+##INFO=<ID=SA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
+##FORMAT=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
+##FORMAT=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
+##FORMAT=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
+##FORMAT=<ID=SA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
+##FORMAT=<ID=GL,Number=1,Type=Float,Description="Genotype Likelihood">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth">
+#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO
+20	60479	.	C	T	75.2	PASS	NS=368;DP=2111;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2096;AA=9;SR=1153|943;SA=5|4;SB=0.55556;AB=0.47059;ABR=8;ABA=9;RUN=2;SNP;TS
+20	60571	.	C	A	99.0	PASS	NS=366;DP=2338;AC=6;AN=732;AF=0.0081967;RA=2293;AA=30;SR=1123|1170;SA=19|11;SB=0.63333;AB=0.51515;ABR=17;ABA=16;RUN=1;SNP;TV
+20	60828	.	T	G	8.94	PASS	NS=361;DP=2341;AC=3;AN=722;AF=0.0041551;RA=2267;AA=30;SR=1101|1166;SA=15|15;SB=0.5;AB=0.16667;ABR=1;ABA=4;RUN=3;SNP;TV
+20	61098	.	C	T	99.0	PASS	NS=366;DP=1780;AC=140;AN=732;AF=0.19126;RA=1457;AA=317;SR=600|857;SA=132|185;SB=0.4164;AB=0.56587;ABR=262;ABA=198;RUN=2;SNP;TS
+20	61270	.	A	C	1.01	PASS	NS=220;DP=449;AC=18;AN=440;AF=0.040909;RA=423;AA=23;SR=165|258;SA=6|17;SB=0.26087;AB=0.61111;ABR=11;ABA=7;RUN=1;SNP;TV
+20	61388	.	T	C	46.6	PASS	NS=314;DP=1036;AC=2;AN=628;AF=0.0031847;RA=1025;AA=6;SR=709|316;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
+20	61409	.	A	G	36.0	PASS	NS=340;DP=1212;AC=1;AN=680;AF=0.0014706;RA=1207;AA=4;SR=876|331;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	61517	.	C	T	13.8	PASS	NS=363;DP=2032;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2019;AA=7;SR=1200|819;SA=7|0;SB=1;AB=0.72727;ABR=8;ABA=3;RUN=4;SNP;TS
+20	61535	.	A	G	0.0666	PASS	NS=362;DP=2048;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2037;AA=4;SR=1150|887;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	61586	.	C	A	0.0941	PASS	NS=362;DP=1953;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1941;AA=6;SR=1062|879;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	61651	.	C	A	99.0	PASS	NS=369;DP=2217;AC=6;AN=738;AF=0.0081301;RA=2190;AA=22;SR=1230|960;SA=12|10;SB=0.54545;AB=0.41176;ABR=14;ABA=20;RUN=4;SNP;TV
+20	61724	.	A	C	99.0	PASS	NS=369;DP=2442;AC=6;AN=738;AF=0.0081301;RA=2409;AA=29;SR=1205|1204;SA=16|13;SB=0.55172;AB=0.48889;ABR=22;ABA=23;RUN=2;SNP;TV
+20	61795	.	G	T	99.0	PASS	NS=368;DP=2464;AC=324;AN=736;AF=0.44022;RA=1426;AA=1032;SR=740|686;SA=519|513;SB=0.50291;AB=0.49956;ABR=568;ABA=565;RUN=1;SNP;TV
+20	61807	.	G	T	16.2	PASS	NS=369;DP=2523;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2506;AA=7;SR=1311|1195;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
+20	61848	.	A	G	0.0723	PASS	NS=370;DP=2478;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2458;AA=9;SR=1313|1145;SA=2|7;SB=0.22222;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	61909	.	C	G	0.224	PASS	NS=366;DP=2253;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2240;AA=4;SR=1131|1109;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	61986	.	G	A	0.054	PASS	NS=364;DP=2106;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2072;AA=26;SR=906|1166;SA=0|26;SB=0;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	62100	.	T	C	82.3	PASS	NS=363;DP=2082;AC=3;AN=726;AF=0.0041322;RA=2069;AA=8;SR=1052|1017;SA=2|6;SB=0.25;AB=0.5;ABR=7;ABA=7;RUN=1;SNP;TS
+20	62255	.	T	C	99.0	PASS	NS=361;DP=2204;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2195;AA=6;SR=1247|948;SA=6|0;SB=1;AB=0.57143;ABR=8;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
+20	62348	.	A	G	99.0	PASS	NS=350;DP=1861;AC=2;AN=700;AF=0.0028571;RA=1845;AA=10;SR=949|896;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.23077;ABR=3;ABA=10;RUN=1;SNP;TS
+20	62420	.	A	G	46.8	PASS	NS=364;DP=1821;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1812;AA=3;SR=933|879;SA=0|3;SB=0;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	62471	.	G	A	43.6	PASS	NS=350;DP=1782;AC=2;AN=700;AF=0.0028571;RA=1772;AA=7;SR=891|881;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.69231;ABR=9;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	62530	.	A	G	1.17	PASS	NS=364;DP=2137;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2129;AA=4;SR=1034|1095;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	62545	.	C	G	99.0	PASS	NS=348;DP=2043;AC=5;AN=696;AF=0.0071839;RA=2018;AA=17;SR=907|1111;SA=9|8;SB=0.52941;AB=0.44828;ABR=13;ABA=16;RUN=1;SNP;TV
+20	62553	.	T	C	0.193	PASS	NS=345;DP=2009;AC=2;AN=690;AF=0.0028986;RA=1986;AA=5;SR=869|1117;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TS
+20	62673	.	G	T	0.556	PASS	NS=359;DP=2225;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2218;AA=5;SR=1217|1001;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	62727	.	C	T	8.51	PASS	NS=347;DP=1801;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1794;AA=2;SR=906|888;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	62731	.	C	A	99.0	PASS	NS=345;DP=1727;AC=22;AN=690;AF=0.031884;RA=1666;AA=55;SR=840|826;SA=26|29;SB=0.47273;AB=0.53061;ABR=52;ABA=46;RUN=2;SNP;TV
+20	62739	.	T	C	7.0	PASS	NS=342;DP=1646;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1623;AA=7;SR=812|811;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	62770	.	G	C	3.33	PASS	NS=324;DP=1429;AC=1;AN=648;AF=0.0015432;RA=1422;AA=3;SR=655|767;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	62783	.	A	G	17.3	PASS	NS=328;DP=1471;AC=1;AN=656;AF=0.0015244;RA=1455;AA=8;SR=665|790;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	62881	.	G	T	0.253	PASS	NS=345;DP=1772;AC=1;AN=690;AF=0.0014493;RA=1761;AA=7;SR=910|851;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	62946	.	T	A	83.9	PASS	NS=349;DP=1880;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=1868;AA=5;SR=787|1081;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.58333;ABR=7;ABA=5;RUN=2;SNP;TV
+20	62997	.	A	T	5.74	PASS	NS=364;DP=2195;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2190;AA=2;SR=1042|1148;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	63054	.	A	G	48.5	PASS	NS=364;DP=2097;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=2082;AA=8;SR=1090|992;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.52941;ABR=9;ABA=8;RUN=2;SNP;TS
+20	63055	.	A	G	0.234	PASS	NS=362;DP=2088;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2078;AA=4;SR=1096|982;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	63063	.	T	C	0.0841	PASS	NS=363;DP=2065;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2059;AA=2;SR=1083|976;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	63141	.	T	C	2.61	PASS	NS=360;DP=1900;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1891;AA=2;SR=1041|850;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	63197	.	T	A	0.305	PASS	NS=364;DP=2047;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2037;AA=5;SR=1067|970;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	63231	.	T	G	99.0	PASS	NS=360;DP=2025;AC=76;AN=720;AF=0.10556;RA=1828;AA=186;SR=914|914;SA=102|84;SB=0.54839;AB=0.52581;ABR=163;ABA=145;RUN=1;SNP;TV
+20	63244	.	A	C	99.0	PASS	NS=364;DP=1991;AC=84;AN=728;AF=0.11538;RA=1701;AA=284;SR=871|830;SA=132|152;SB=0.46479;AB=0.46951;ABR=154;ABA=174;RUN=2;SNP;TV
+20	63245	.	C	A	4.67	PASS	NS=364;DP=2000;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1990;AA=6;SR=1010|980;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	63351	.	A	G	30.7	PASS	NS=369;DP=2363;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2354;AA=5;SR=1414|940;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	63360	.	C	T	38.4	PASS	NS=367;DP=2348;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2334;AA=4;SR=1363|971;SA=0|4;SB=0;AB=0.63636;ABR=7;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	63426	.	G	T	99.0	PASS	NS=369;DP=2178;AC=5;AN=738;AF=0.0067751;RA=2146;AA=17;SR=1263|883;SA=8|9;SB=0.47059;AB=0.69231;ABR=27;ABA=12;RUN=1;SNP;TV
+20	63452	.	C	G	99.0	PASS	NS=369;DP=2242;AC=22;AN=738;AF=0.02981;RA=2169;AA=68;SR=1220|949;SA=40|28;SB=0.58824;AB=0.47321;ABR=53;ABA=59;RUN=1;SNP;TV
+20	63466	.	A	G	0.305	PASS	NS=369;DP=2343;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2334;AA=3;SR=1290|1044;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	63521	.	G	A	33.5	PASS	NS=370;DP=2387;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2376;AA=3;SR=1217|1159;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	63680	.	A	G	0.841	PASS	NS=371;DP=2758;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2741;AA=5;SR=1422|1319;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	63733	.	C	T	99.0	PASS	NS=366;DP=2571;AC=58;AN=732;AF=0.079235;RA=2363;AA=200;SR=1311|1052;SA=101|99;SB=0.505;AB=0.50291;ABR=173;ABA=171;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	63746	.	C	T	0.0651	PASS	NS=369;DP=2564;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2552;AA=3;SR=1391|1161;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	63799	.	C	T	99.0	PASS	NS=367;DP=2322;AC=331;AN=734;AF=0.45095;RA=1274;AA=1026;SR=610|664;SA=489|537;SB=0.47661;AB=0.53157;ABR=564;ABA=494;RUN=3;SNP;TS
+20	63808	.	G	C	99.0	PASS	NS=368;DP=2352;AC=61;AN=736;AF=0.08288;RA=2168;AA=171;SR=1043|1125;SA=80|91;SB=0.46784;AB=0.56869;ABR=178;ABA=134;RUN=1;SNP;TV
+20	63967	.	A	G	99.0	PASS	NS=370;DP=2363;AC=21;AN=740;AF=0.028378;RA=2276;AA=68;SR=911|1365;SA=26|42;SB=0.38235;AB=0.48837;ABR=63;ABA=66;RUN=1;SNP;TS
+20	63983	.	C	T	0.569	PASS	NS=371;DP=2349;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2334;AA=3;SR=892|1442;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	64016	.	G	A	32.3	PASS	NS=370;DP=2259;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2231;AA=15;SR=854|1377;SA=1|14;SB=0.066667;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=2;SNP;TS
+20	64062	.	G	A	62.0	PASS	NS=370;DP=2274;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2264;AA=6;SR=953|1311;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=3;SNP;TS
+20	64150	.	C	A	99.0	PASS	NS=368;DP=2268;AC=38;AN=736;AF=0.05163;RA=2160;AA=103;SR=881|1279;SA=41|62;SB=0.39806;AB=0.545;ABR=109;ABA=90;RUN=1;SNP;TV
+20	64175	.	A	G	97.6	PASS	NS=369;DP=2213;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2192;AA=10;SR=838|1354;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.22222;ABR=2;ABA=7;RUN=3;SNP;TS
+20	64186	.	C	G	99.0	PASS	NS=369;DP=2166;AC=4;AN=738;AF=0.0054201;RA=2111;AA=20;SR=858|1253;SA=9|11;SB=0.45;AB=0.5;ABR=12;ABA=12;RUN=1;SNP;TV
+20	64539	.	A	T	0.0711	PASS	NS=352;DP=1674;AC=1;AN=704;AF=0.0014205;RA=1667;AA=4;SR=856|811;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=5;SNP;TV
+20	64560	.	A	G	0.0799	PASS	NS=358;DP=1831;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1824;AA=4;SR=1057|767;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	64568	.	A	C	1.98	PASS	NS=355;DP=1856;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1842;AA=7;SR=1124|718;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	64587	.	A	G	1.36	PASS	NS=357;DP=1971;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1963;AA=3;SR=1234|729;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	64597	.	T	C	0.152	PASS	NS=359;DP=1981;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1974;AA=3;SR=1238|736;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	64618	.	G	A	0.794	PASS	NS=361;DP=2018;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2011;AA=3;SR=1263|748;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=4;SNP;TS
+20	64624	.	T	C	5.08	PASS	NS=364;DP=2000;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1994;AA=3;SR=1238|756;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	64625	.	A	G	99.0	PASS	NS=363;DP=1995;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1980;AA=7;SR=1229|751;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
+20	64647	.	T	C	0.188	PASS	NS=362;DP=1911;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1899;AA=5;SR=1157|742;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	64656	.	C	T	2.15	PASS	NS=368;DP=1875;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=1866;AA=3;SR=1113|753;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	64672	.	T	C	48.3	PASS	NS=365;DP=1877;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1869;AA=5;SR=1097|772;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.375;ABR=3;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
+20	64771	.	A	G	0.563	PASS	NS=365;DP=2023;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2017;AA=2;SR=1315|702;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	64898	.	G	A	49.7	PASS	NS=371;DP=2342;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2329;AA=7;SR=1249|1080;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
+20	64913	.	G	T	0.846	PASS	NS=370;DP=2344;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2333;AA=5;SR=1234|1099;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	65122	.	T	C	1.23	PASS	NS=368;DP=2280;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2265;AA=3;SR=976|1289;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	65173	.	C	G	12.2	PASS	NS=370;DP=2118;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2104;AA=4;SR=947|1157;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	65240	.	G	A	89.4	PASS	NS=364;DP=2106;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=2087;AA=8;SR=941|1146;SA=0|8;SB=0;AB=0.25;ABR=2;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
+20	65241	.	T	C	0.371	PASS	NS=364;DP=2101;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2087;AA=8;SR=934|1153;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	65288	.	G	T	99.0	PASS	NS=364;DP=2003;AC=21;AN=728;AF=0.028846;RA=1924;AA=76;SR=915|1009;SA=29|47;SB=0.38158;AB=0.4963;ABR=67;ABA=68;RUN=1;SNP;TV
+20	65317	.	A	C	0.0806	PASS	NS=365;DP=1967;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1957;AA=4;SR=954|1003;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	65335	.	T	G	99.0	PASS	NS=363;DP=1773;AC=12;AN=726;AF=0.016529;RA=1744;AA=22;SR=831|913;SA=11|11;SB=0.5;AB=0.46875;ABR=15;ABA=17;RUN=1;SNP;TV
+20	65338	.	A	T	0.813	PASS	NS=362;DP=1726;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1715;AA=3;SR=799|916;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	65562	.	A	G	6.8	PASS	NS=325;DP=1375;AC=2;AN=650;AF=0.0030769;RA=1343;AA=4;SR=759|584;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	65578	.	T	C	3.24	PASS	NS=327;DP=1379;AC=1;AN=654;AF=0.0015291;RA=1375;AA=3;SR=790|585;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	65632	.	C	T	40.9	PASS	NS=366;DP=1714;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1703;AA=5;SR=918|785;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.2;ABR=1;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	65850	.	G	A	0.111	PASS	NS=307;DP=1146;AC=1;AN=614;AF=0.0016287;RA=1128;AA=3;SR=696|432;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	65900	.	G	A	99.0	PASS	NS=325;DP=1412;AC=530;AN=650;AF=0.81538;RA=271;AA=1129;SR=145|126;SA=639|490;SB=0.56599;AB=0.47594;ABR=178;ABA=193;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	65986	.	G	A	8.36	PASS	NS=370;DP=2269;AC=3;AN=740;AF=0.0040541;RA=2255;AA=6;SR=1197|1058;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	66029	.	T	C	0.101	PASS	NS=339;DP=1544;AC=1;AN=678;AF=0.0014749;RA=1526;AA=7;SR=748|778;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	66060	.	C	T	6.42	PASS	NS=324;DP=1304;AC=1;AN=648;AF=0.0015432;RA=1297;AA=3;SR=613|684;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	66248	.	C	T	12.0	PASS	NS=288;DP=1080;AC=1;AN=576;AF=0.0017361;RA=1074;AA=2;SR=440|634;SA=2|0;SB=1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	66370	.	G	A	99.0	PASS	NS=262;DP=824;AC=404;AN=524;AF=0.77099;RA=185;AA=629;SR=79|106;SA=267|362;SB=0.42448;AB=0.55801;ABR=101;ABA=79;RUN=1;SNP;TS
+20	66388	.	C	T	0.809	PASS	NS=269;DP=809;AC=1;AN=538;AF=0.0018587;RA=798;AA=3;SR=351|447;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	66620	.	C	T	2.19	PASS	NS=338;DP=1326;AC=1;AN=676;AF=0.0014793;RA=1319;AA=3;SR=634|685;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=4;SNP;TS
+20	66705	.	C	T	4.94	PASS	NS=292;DP=835;AC=8;AN=584;AF=0.013699;RA=819;AA=10;SR=483|336;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.5;ABR=6;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
+20	66890	.	G	T	6.54	PASS	NS=313;DP=1102;AC=1;AN=626;AF=0.0015974;RA=1097;AA=4;SR=670|427;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	67080	.	A	G	0.371	PASS	NS=355;DP=1745;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1732;AA=4;SR=907|825;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	67421	.	A	C	0.0555	PASS	NS=363;DP=1999;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1990;AA=6;SR=945|1045;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
+20	67461	.	A	G	99.0	PASS	NS=357;DP=1894;AC=4;AN=714;AF=0.0056022;RA=1872;AA=14;SR=841|1031;SA=8|6;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=13;ABA=13;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	67563	.	A	G	3.64	PASS	NS=360;DP=1912;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1904;AA=4;SR=1033|871;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	67572	.	A	T	0.0602	PASS	NS=363;DP=1887;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1871;AA=6;SR=1028|843;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=2;SNP;TV
+20	67573	.	C	T	4.67	PASS	NS=364;DP=1888;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1878;AA=6;SR=1028|850;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	67641	.	C	T	99.0	PASS	NS=364;DP=1910;AC=23;AN=728;AF=0.031593;RA=1837;AA=67;SR=897|940;SA=35|32;SB=0.52239;AB=0.52679;ABR=59;ABA=53;RUN=1;SNP;TS
+20	67644	.	T	C	40.4	PASS	NS=365;DP=1899;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=1887;AA=9;SR=933|954;SA=4|5;SB=0.44444;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	67646	.	G	A	3.98	PASS	NS=365;DP=1897;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1877;AA=6;SR=923|954;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	67752	.	T	A	0.292	PASS	NS=367;DP=2181;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2163;AA=6;SR=1201|962;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.82353;ABR=14;ABA=3;RUN=2;SNP;TV
+20	67760	.	C	T	67.6	PASS	NS=367;DP=2169;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2152;AA=5;SR=1181|971;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	67765	.	C	T	99.0	PASS	NS=369;DP=2200;AC=3;AN=738;AF=0.004065;RA=2178;AA=11;SR=1201|977;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.42857;ABR=6;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	67831	.	C	T	0.781	PASS	NS=371;DP=2294;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2281;AA=5;SR=1237|1044;SA=2|3;SB=0.4;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=4;SNP;TS
+20	67949	.	G	T	10.4	PASS	NS=366;DP=2315;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2282;AA=12;SR=1321|961;SA=2|10;SB=0.16667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	67976	.	T	A	0.679	PASS	NS=369;DP=2408;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2397;AA=6;SR=1299|1098;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	68015	.	C	T	0.113	PASS	NS=369;DP=2466;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2453;AA=5;SR=1313|1140;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.875;ABR=14;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	68055	.	A	G	0.102	PASS	NS=370;DP=2540;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2522;AA=5;SR=1296|1226;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.86667;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	68075	.	T	C	0.0657	PASS	NS=370;DP=2582;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2562;AA=8;SR=1291|1271;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	68123	.	C	A	0.0592	PASS	NS=369;DP=2705;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2685;AA=13;SR=1300|1385;SA=11|2;SB=0.84615;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
+20	68182	.	A	T	99.0	PASS	NS=368;DP=2675;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2653;AA=10;SR=1458|1195;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.2;ABR=2;ABA=8;RUN=2;SNP;TV
+20	68190	.	T	C	0.109	PASS	NS=368;DP=2678;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2661;AA=5;SR=1481|1180;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	68205	.	A	G	31.9	PASS	NS=369;DP=2686;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2672;AA=6;SR=1492|1180;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	68264	.	T	C	99.0	PASS	NS=369;DP=2558;AC=98;AN=738;AF=0.13279;RA=2173;AA=376;SR=1055|1118;SA=202|174;SB=0.53723;AB=0.48951;ABR=280;ABA=292;RUN=1;SNP;TS
+20	68474	.	A	G	31.0	PASS	NS=370;DP=2532;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2507;AA=14;SR=1171|1336;SA=2|12;SB=0.14286;AB=0.58333;ABR=7;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
+20	68505	.	A	G	0.483	PASS	NS=369;DP=2490;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2477;AA=3;SR=1140|1337;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	68535	.	G	A	99.0	PASS	NS=369;DP=2573;AC=12;AN=738;AF=0.01626;RA=2503;AA=58;SR=1186|1317;SA=32|26;SB=0.55172;AB=0.50893;ABR=57;ABA=55;RUN=1;SNP;TS
+20	68618	.	G	A	99.0	PASS	NS=368;DP=2561;AC=21;AN=736;AF=0.028533;RA=2451;AA=93;SR=1224|1227;SA=48|45;SB=0.51613;AB=0.45517;ABR=66;ABA=78;RUN=1;SNP;TS
+20	68657	.	C	A	3.85	PASS	NS=370;DP=2602;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2585;AA=9;SR=1214|1371;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	68660	.	C	A	99.0	PASS	NS=370;DP=2608;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2591;AA=14;SR=1221|1370;SA=8|6;SB=0.57143;AB=0.44;ABR=11;ABA=14;RUN=2;SNP;TV
+20	68664	.	A	C	0.0666	PASS	NS=370;DP=2602;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2571;AA=12;SR=1212|1359;SA=6|6;SB=0.5;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
+20	68667	.	T	G	99.0	PASS	NS=370;DP=2607;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2584;AA=15;SR=1201|1383;SA=5|10;SB=0.33333;AB=0.41176;ABR=7;ABA=10;RUN=2;SNP;TV
+20	68749	.	T	C	99.0	PASS	NS=368;DP=2323;AC=426;AN=736;AF=0.5788;RA=983;AA=1334;SR=457|526;SA=640|694;SB=0.47976;AB=0.47215;ABR=568;ABA=632;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	68799	.	T	C	1.55	PASS	NS=367;DP=2269;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2213;AA=15;SR=1064|1149;SA=14|1;SB=0.93333;AB=0.66667;ABR=8;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	68815	.	C	T	0.275	PASS	NS=367;DP=2245;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2226;AA=3;SR=1051|1175;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	68826	.	A	T	2.17	PASS	NS=370;DP=2244;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2223;AA=5;SR=1043|1180;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	68926	.	T	C	0.43	PASS	NS=369;DP=2139;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2120;AA=4;SR=904|1216;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.61538;ABR=8;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	68975	.	C	G	1.62	PASS	NS=367;DP=2121;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2105;AA=4;SR=767|1338;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	68987	.	G	T	2.55	PASS	NS=369;DP=2074;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2059;AA=8;SR=732|1327;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	69049	.	T	A	0.201	PASS	NS=361;DP=2045;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2038;AA=5;SR=936|1102;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	69066	.	C	G	14.2	PASS	NS=360;DP=2078;AC=3;AN=720;AF=0.0041667;RA=2069;AA=8;SR=1074|995;SA=1|7;SB=0.125;AB=0.45455;ABR=5;ABA=6;RUN=2;SNP;TV
+20	69094	.	G	A	99.0	PASS	NS=362;DP=2092;AC=318;AN=724;AF=0.43923;RA=1227;AA=857;SR=691|536;SA=451|406;SB=0.52625;AB=0.49681;ABR=389;ABA=392;RUN=1;SNP;TS
+20	69130	.	C	A	11.5	PASS	NS=365;DP=2014;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2007;AA=3;SR=1082|925;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	69145	.	A	G	0.195	PASS	NS=367;DP=1999;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=1991;AA=5;SR=1033|958;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	69262	.	A	T	1.7	PASS	NS=365;DP=2053;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2047;AA=3;SR=1145|902;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	69305	.	T	C	0.123	PASS	NS=367;DP=1964;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=1956;AA=3;SR=1101|855;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	69355	.	C	T	4.52	PASS	NS=367;DP=2009;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2000;AA=3;SR=970|1030;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	69376	.	G	A	0.665	PASS	NS=367;DP=2085;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2077;AA=3;SR=1003|1074;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	69408	.	C	T	99.0	PASS	NS=366;DP=2154;AC=38;AN=732;AF=0.051913;RA=2013;AA=133;SR=894|1119;SA=60|73;SB=0.45113;AB=0.51685;ABR=138;ABA=128;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	69486	.	C	G	0.0652	PASS	NS=362;DP=1836;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1820;AA=2;SR=1092|728;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	69641	.	C	A	0.0576	PASS	NS=367;DP=2135;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2121;AA=8;SR=1038|1083;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.8125;ABR=13;ABA=3;RUN=3;SNP;TV
+20	69656	.	T	C	0.253	PASS	NS=366;DP=2096;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2090;AA=2;SR=1030|1060;SA=0|2;SB=0;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	69668	.	T	C	40.6	PASS	NS=365;DP=2114;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2104;AA=6;SR=1026|1078;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	69707	.	T	A	0.375	PASS	NS=366;DP=2148;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2143;AA=2;SR=1011|1132;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	69723	.	T	A	0.883	PASS	NS=363;DP=2037;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2026;AA=2;SR=945|1081;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	69752	.	A	C	1.31	PASS	NS=362;DP=1984;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1977;AA=2;SR=932|1045;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	69821	.	A	T	0.479	PASS	NS=364;DP=1967;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1960;AA=3;SR=958|1002;SA=3|0;SB=1;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=4;SNP;TV
+20	69835	.	A	G	0.671	PASS	NS=363;DP=1953;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1943;AA=5;SR=936|1007;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	69903	.	T	A	0.0459	PASS	NS=362;DP=1913;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1904;AA=5;SR=821|1083;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	69951	.	A	T	0.159	PASS	NS=354;DP=1819;AC=2;AN=708;AF=0.0028249;RA=1810;AA=8;SR=774|1036;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.78571;ABR=11;ABA=3;RUN=4;SNP;TV
+20	69966	.	T	C	0.661	PASS	NS=351;DP=1768;AC=2;AN=702;AF=0.002849;RA=1762;AA=4;SR=773|989;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	70470	.	A	G	4.57	PASS	NS=359;DP=1690;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1681;AA=2;SR=1065|616;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	70490	.	C	T	0.934	PASS	NS=358;DP=1682;AC=5;AN=716;AF=0.0069832;RA=1665;AA=12;SR=962|703;SA=11|1;SB=0.91667;AB=0.2;ABR=1;ABA=4;RUN=5;SNP;TS
+20	70604	.	A	T	0.698	PASS	NS=360;DP=1795;AC=2;AN=720;AF=0.0027778;RA=1776;AA=10;SR=1075|701;SA=9|1;SB=0.9;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=4;SNP;TV
+20	70611	.	G	A	0.143	PASS	NS=362;DP=1806;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1788;AA=5;SR=1077|711;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	70696	.	T	C	1.72	PASS	NS=365;DP=1849;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1839;AA=4;SR=983|856;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	70785	.	A	G	99.0	PASS	NS=368;DP=1990;AC=14;AN=736;AF=0.019022;RA=1938;AA=40;SR=1005|933;SA=20|20;SB=0.5;AB=0.51852;ABR=42;ABA=38;RUN=1;SNP;TS
+20	70804	.	C	T	4.03	PASS	NS=369;DP=2057;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2042;AA=5;SR=1069|973;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	70917	.	T	C	1.54	PASS	NS=369;DP=2193;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2182;AA=2;SR=1110|1072;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	70920	.	A	G	99.0	PASS	NS=368;DP=2172;AC=13;AN=736;AF=0.017663;RA=2121;AA=45;SR=1084|1037;SA=24|21;SB=0.53333;AB=0.38462;ABR=25;ABA=40;RUN=2;SNP;TS
+20	70980	.	G	A	99.0	PASS	NS=368;DP=2339;AC=39;AN=736;AF=0.052989;RA=2221;AA=106;SR=1223|998;SA=71|35;SB=0.66981;AB=0.57416;ABR=120;ABA=89;RUN=1;SNP;TS
+20	71013	.	A	C	0.0504	PASS	NS=371;DP=2390;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2371;AA=12;SR=1359|1012;SA=2|10;SB=0.16667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	71015	.	T	C	0.569	PASS	NS=371;DP=2398;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2390;AA=5;SR=1364|1026;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	71037	.	T	C	0.223	PASS	NS=369;DP=2289;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2279;AA=4;SR=1353|926;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	71079	.	C	T	99.0	PASS	NS=370;DP=2338;AC=60;AN=740;AF=0.081081;RA=2168;AA=166;SR=1421|747;SA=102|64;SB=0.61446;AB=0.53086;ABR=129;ABA=113;RUN=1;SNP;TS
+20	71093	.	G	A	99.0	PASS	NS=365;DP=2393;AC=93;AN=730;AF=0.1274;RA=2085;AA=299;SR=1382|703;SA=194|105;SB=0.64883;AB=0.5317;ABR=260;ABA=225;RUN=1;SNP;TS
+20	71281	.	G	A	66.6	PASS	NS=369;DP=2496;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2481;AA=11;SR=1273|1208;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.66667;ABR=12;ABA=6;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	71290	.	A	G	0.526	PASS	NS=368;DP=2466;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2448;AA=4;SR=1262|1186;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	71454	.	T	C	0.691	PASS	NS=370;DP=2518;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2498;AA=5;SR=1203|1295;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	71543	.	A	G	1.37	PASS	NS=369;DP=2378;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2369;AA=6;SR=1023|1346;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=3;SNP;TS;CpG
+20	71549	.	G	T	99.0	PASS	NS=370;DP=2354;AC=49;AN=740;AF=0.066216;RA=2139;AA=210;SR=769|1370;SA=208|2;SB=0.99048;AB=0.68065;ABR=211;ABA=99;RUN=4;SNP;TV
+20	71726	.	C	A	5.19	PASS	NS=363;DP=2309;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2301;AA=3;SR=1162|1139;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	71809	.	G	A	27.3	PASS	NS=354;DP=1947;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1937;AA=3;SR=923|1014;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	71850	.	T	C	0.131	PASS	NS=358;DP=2062;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=2055;AA=2;SR=1053|1002;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	71859	.	G	A	14.4	PASS	NS=355;DP=2030;AC=3;AN=710;AF=0.0042254;RA=2010;AA=7;SR=1055|955;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	71926	.	T	A	4.2	PASS	NS=336;DP=1791;AC=1;AN=672;AF=0.0014881;RA=1787;AA=2;SR=879|908;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	71929	.	T	A	0.237	PASS	NS=336;DP=1782;AC=1;AN=672;AF=0.0014881;RA=1773;AA=3;SR=875|898;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	72002	.	A	C	0.101	PASS	NS=340;DP=1976;AC=1;AN=680;AF=0.0014706;RA=1960;AA=10;SR=1100|860;SA=9|1;SB=0.9;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
+20	72036	.	G	A	99.0	PASS	NS=349;DP=2037;AC=6;AN=698;AF=0.008596;RA=2022;AA=11;SR=1106|916;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.60714;ABR=17;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	72206	.	T	G	1.43	PASS	NS=370;DP=2151;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2144;AA=4;SR=1129|1015;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	72287	.	A	G	0.0526	PASS	NS=369;DP=2216;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2210;AA=2;SR=1016|1194;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	72331	.	T	A	0.125	PASS	NS=367;DP=2265;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2246;AA=7;SR=1089|1157;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	72406	.	C	T	0.0949	PASS	NS=366;DP=2205;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2191;AA=2;SR=1075|1116;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	72570	.	C	A	2.37	PASS	NS=365;DP=1829;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1810;AA=13;SR=969|841;SA=6|7;SB=0.46154;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	72604	.	A	G	2.22	PASS	NS=363;DP=2084;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2079;AA=3;SR=1043|1036;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	72632	.	G	T	99.0	PASS	NS=367;DP=2170;AC=21;AN=734;AF=0.02861;RA=2099;AA=67;SR=1017|1082;SA=36|31;SB=0.53731;AB=0.54167;ABR=65;ABA=55;RUN=2;SNP;TV
+20	72665	.	G	A	99.0	PASS	NS=365;DP=2216;AC=3;AN=730;AF=0.0041096;RA=2198;AA=11;SR=1006|1192;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.5;ABR=10;ABA=10;RUN=2;SNP;TS
+20	72719	.	C	T	99.0	PASS	NS=360;DP=2045;AC=12;AN=720;AF=0.016667;RA=2005;AA=33;SR=968|1037;SA=19|14;SB=0.57576;AB=0.52174;ABR=36;ABA=32;RUN=3;SNP;TS
+20	72747	.	T	A	0.163	PASS	NS=368;DP=2073;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2062;AA=4;SR=1092|970;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	72771	.	A	T	1.48	PASS	NS=371;DP=2071;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2062;AA=3;SR=1149|913;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	72772	.	A	G	0.311	PASS	NS=371;DP=2065;AC=2;AN=742;AF=0.0026954;RA=2051;AA=5;SR=1145|906;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	72815	.	T	C	25.8	PASS	NS=367;DP=2079;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2062;AA=8;SR=1133|929;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	72820	.	C	A	3.07	PASS	NS=366;DP=2061;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2048;AA=5;SR=1097|951;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	72882	.	T	C	4.28	PASS	NS=369;DP=2031;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2013;AA=5;SR=914|1099;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	72887	.	A	G	2.42	PASS	NS=367;DP=2020;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2004;AA=6;SR=906|1098;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	72890	.	A	G	1.25	PASS	NS=366;DP=2018;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2006;AA=3;SR=910|1096;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	72892	.	G	A	99.0	PASS	NS=365;DP=2011;AC=36;AN=730;AF=0.049315;RA=1913;AA=88;SR=863|1050;SA=43|45;SB=0.48864;AB=0.56647;ABR=98;ABA=73;RUN=5;SNP;TS
+20	72894	.	T	C	77.5	PASS	NS=365;DP=2035;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2010;AA=11;SR=921|1089;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	73014	.	C	G	12.4	PASS	NS=368;DP=2017;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=1989;AA=3;SR=858|1131;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	73136	.	T	A	5.76	PASS	NS=282;DP=784;AC=3;AN=564;AF=0.0053191;RA=758;AA=7;SR=402|356;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	73268	.	G	T	0.0695	PASS	NS=346;DP=1716;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1710;AA=4;SR=1061|649;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	73369	.	C	T	5.68	PASS	NS=365;DP=1955;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1943;AA=6;SR=800|1143;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=4;SNP;TS
+20	73416	.	C	T	0.0527	PASS	NS=362;DP=1908;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1894;AA=3;SR=937|957;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	73431	.	C	G	1.76	PASS	NS=363;DP=1863;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1856;AA=3;SR=950|906;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	73719	.	C	A	99.0	PASS	NS=277;DP=997;AC=18;AN=554;AF=0.032491;RA=964;AA=30;SR=443|521;SA=18|12;SB=0.6;AB=0.40909;ABR=9;ABA=13;RUN=1;SNP;TV
+20	73767	.	A	G	3.17	PASS	NS=284;DP=893;AC=1;AN=568;AF=0.0017606;RA=883;AA=3;SR=402|481;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	73852	.	T	G	99.0	PASS	NS=335;DP=1416;AC=7;AN=670;AF=0.010448;RA=1377;AA=28;SR=855|522;SA=8|20;SB=0.28571;AB=0.375;ABR=9;ABA=15;RUN=2;SNP;TV
+20	73858	.	C	T	96.7	PASS	NS=341;DP=1497;AC=9;AN=682;AF=0.013196;RA=1483;AA=13;SR=916|567;SA=8|5;SB=0.61538;AB=0.64516;ABR=20;ABA=11;RUN=1;SNP;TS
+20	73888	.	G	A	0.0568	PASS	NS=351;DP=1692;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1679;AA=4;SR=945|734;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	73957	.	G	A	13.1	PASS	NS=368;DP=2167;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2158;AA=3;SR=1176|982;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	74009	.	C	T	3.44	PASS	NS=369;DP=2230;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2224;AA=2;SR=1283|941;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	74053	.	A	T	6.52	PASS	NS=366;DP=2231;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2219;AA=4;SR=1326|893;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	74073	.	T	A	0.0672	PASS	NS=365;DP=2246;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2237;AA=2;SR=1302|935;SA=2|0;SB=1;AB=0.4;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	74142	.	A	G	0.849	PASS	NS=370;DP=2293;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2273;AA=7;SR=1239|1034;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	74232	.	T	C	0.106	PASS	NS=366;DP=2368;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2348;AA=6;SR=1206|1142;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	74247	.	T	C	99.0	PASS	NS=365;DP=2372;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2353;AA=9;SR=1194|1159;SA=2|7;SB=0.22222;AB=0.3;ABR=3;ABA=7;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	74281	.	C	T	3.59	PASS	NS=366;DP=2430;AC=2;AN=732;AF=0.0027322;RA=2418;AA=5;SR=1176|1242;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=2;SNP;TS
+20	74297	.	A	T	0.214	PASS	NS=367;DP=2402;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2379;AA=5;SR=1148|1231;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	74347	.	G	A	99.0	PASS	NS=371;DP=2504;AC=76;AN=742;AF=0.10243;RA=2237;AA=253;SR=1152|1085;SA=127|126;SB=0.50198;AB=0.52459;ABR=224;ABA=203;RUN=1;SNP;TS
+20	74355	.	G	T	0.613	PASS	NS=368;DP=2548;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2530;AA=9;SR=1322|1208;SA=5|4;SB=0.55556;AB=0.8125;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	74545	.	T	A	1.96	PASS	NS=361;DP=2030;AC=3;AN=722;AF=0.0041551;RA=2012;AA=12;SR=933|1079;SA=4|8;SB=0.33333;AB=0.55;ABR=11;ABA=9;RUN=1;SNP;TV
+20	74595	.	G	C	0.696	PASS	NS=364;DP=2054;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2046;AA=4;SR=1037|1009;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	74617	.	A	G	4.15	PASS	NS=365;DP=2159;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2139;AA=6;SR=1030|1109;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	74651	.	T	G	55.6	PASS	NS=367;DP=2262;AC=3;AN=734;AF=0.0040872;RA=2241;AA=12;SR=985|1256;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.46154;ABR=6;ABA=7;RUN=1;SNP;TV
+20	74747	.	C	T	0.125	PASS	NS=355;DP=2085;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=2069;AA=10;SR=1059|1010;SA=9|1;SB=0.9;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=2;SNP;TS
+20	74776	.	T	C	0.0648	PASS	NS=357;DP=2083;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2066;AA=5;SR=1096|970;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	74801	.	T	C	0.234	PASS	NS=361;DP=1925;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1921;AA=2;SR=960|961;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	74873	.	T	A	0.0536	PASS	NS=337;DP=1479;AC=2;AN=674;AF=0.0029674;RA=1470;AA=4;SR=610|860;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=2;SNP;TV
+20	74885	.	C	A	0.412	PASS	NS=342;DP=1549;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1540;AA=4;SR=692|848;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=5;SNP;TV
+20	74995	.	T	A	0.177	PASS	NS=365;DP=2238;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2203;AA=16;SR=1233|970;SA=14|2;SB=0.875;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
+20	75003	.	T	A	0.703	PASS	NS=365;DP=2252;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2235;AA=3;SR=1241|994;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	75026	.	G	A	6.27	PASS	NS=361;DP=2078;AC=3;AN=722;AF=0.0041551;RA=2063;AA=9;SR=1109|954;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=6;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	75040	.	T	C	2.13	PASS	NS=367;DP=2087;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2076;AA=3;SR=1074|1002;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	75245	.	T	A	3.0	PASS	NS=363;DP=2162;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2150;AA=3;SR=1018|1132;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	75254	.	C	A	99.0	PASS	NS=362;DP=2018;AC=255;AN=724;AF=0.35221;RA=1339;AA=657;SR=615|724;SA=345|312;SB=0.52511;AB=0.52083;ABR=450;ABA=401;RUN=2;SNP;TV
+20	75280	.	A	G	0.0778	PASS	NS=350;DP=1862;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1823;AA=17;SR=786|1037;SA=0|17;SB=0;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TS
+20	75389	.	C	T	2.19	PASS	NS=361;DP=2144;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2136;AA=4;SR=1054|1082;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	75514	.	C	T	0.116	PASS	NS=369;DP=2263;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2248;AA=7;SR=1190|1058;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	75516	.	A	G	99.0	PASS	NS=369;DP=2296;AC=5;AN=738;AF=0.0067751;RA=2273;AA=14;SR=1217|1056;SA=3|11;SB=0.21429;AB=0.42105;ABR=8;ABA=11;RUN=1;SNP;TS
+20	75691	.	C	G	1.39	PASS	NS=370;DP=2164;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2149;AA=6;SR=933|1216;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	75729	.	C	G	99.0	PASS	NS=368;DP=2200;AC=13;AN=736;AF=0.017663;RA=2156;AA=37;SR=1063|1093;SA=19|18;SB=0.51351;AB=0.50667;ABR=38;ABA=36;RUN=1;SNP;TV
+20	75790	.	G	T	0.37	PASS	NS=366;DP=2147;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2139;AA=5;SR=1124|1015;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=4;SNP;TV
+20	75813	.	G	T	45.2	PASS	NS=367;DP=2170;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2155;AA=11;SR=1100|1055;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.22222;ABR=2;ABA=7;RUN=2;SNP;TV
+20	75880	.	G	A	4.19	PASS	NS=369;DP=2153;AC=3;AN=738;AF=0.004065;RA=2139;AA=7;SR=1037|1102;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=3;SNP;TS
+20	75999	.	T	C	99.0	PASS	NS=371;DP=2394;AC=21;AN=742;AF=0.028302;RA=2315;AA=63;SR=1290|1025;SA=41|22;SB=0.65079;AB=0.50794;ABR=64;ABA=61;RUN=1;SNP;TS
+20	76282	.	G	A	2.2	PASS	NS=370;DP=2122;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2113;AA=2;SR=1137|976;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	76316	.	T	G	0.0522	PASS	NS=353;DP=2029;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2019;AA=6;SR=1099|920;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
+20	76317	.	A	T	0.0577	PASS	NS=353;DP=2039;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2028;AA=4;SR=1106|922;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	76388	.	G	A	99.0	PASS	NS=371;DP=2615;AC=3;AN=742;AF=0.0040431;RA=2588;AA=14;SR=1183|1405;SA=7|7;SB=0.5;AB=0.54167;ABR=13;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	76407	.	C	T	0.047	PASS	NS=369;DP=2638;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2620;AA=7;SR=1141|1479;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=3;SNP;TS
+20	76477	.	G	T	0.0468	PASS	NS=369;DP=2510;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2495;AA=8;SR=1108|1387;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.83333;ABR=5;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
+20	76519	.	T	C	55.2	PASS	NS=367;DP=2405;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2395;AA=6;SR=1135|1260;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
+20	76526	.	G	A	97.7	PASS	NS=365;DP=2372;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2355;AA=6;SR=1100|1255;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.625;ABR=10;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
+20	76559	.	G	A	0.0519	PASS	NS=366;DP=2361;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2351;AA=3;SR=1069|1282;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	76614	.	T	C	0.355	PASS	NS=364;DP=2186;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2180;AA=2;SR=1061|1119;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	76631	.	T	A	0.135	PASS	NS=362;DP=2146;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2138;AA=4;SR=1088|1050;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	76668	.	T	C	0.299	PASS	NS=370;DP=2308;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2288;AA=7;SR=1196|1092;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	76669	.	T	A	3.27	PASS	NS=370;DP=2325;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2319;AA=3;SR=1215|1104;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	76689	.	T	C	14.1	PASS	NS=369;DP=2386;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2371;AA=7;SR=1247|1124;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	76796	.	T	C	18.7	PASS	NS=368;DP=2408;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2393;AA=9;SR=1269|1124;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.76667;ABR=23;ABA=7;RUN=1;SNP;TS
+20	76801	.	G	A	1.02	PASS	NS=364;DP=2385;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2372;AA=4;SR=1252|1120;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	76915	.	A	G	99.0	PASS	NS=366;DP=2285;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=2256;AA=11;SR=1262|994;SA=8|3;SB=0.72727;AB=0.5;ABR=10;ABA=9;RUN=1;SNP;TS
+20	76920	.	G	A	65.7	PASS	NS=367;DP=2288;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2276;AA=7;SR=1297|979;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.58824;ABR=10;ABA=7;RUN=2;SNP;TS
+20	76934	.	A	G	40.7	PASS	NS=368;DP=2253;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2238;AA=6;SR=1276|962;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	76962	.	T	C	99.0	PASS	NS=369;DP=2127;AC=599;AN=738;AF=0.81165;RA=436;AA=1670;SR=226|210;SA=898|772;SB=0.53772;AB=0.51024;ABR=299;ABA=281;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	77013	.	C	T	47.1	PASS	NS=370;DP=2371;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2361;AA=5;SR=1049|1312;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.57143;ABR=8;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	77025	.	A	G	99.0	PASS	NS=370;DP=2398;AC=4;AN=740;AF=0.0054054;RA=2351;AA=24;SR=1035|1316;SA=5|19;SB=0.20833;AB=0.57143;ABR=24;ABA=18;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	77115	.	A	G	0.997	PASS	NS=371;DP=2355;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2344;AA=4;SR=1291|1053;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	77225	.	T	C	0.928	PASS	NS=366;DP=2199;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2192;AA=3;SR=986|1206;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	77264	.	C	T	0.0587	PASS	NS=369;DP=2275;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2261;AA=5;SR=1054|1207;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TS
+20	77327	.	G	T	24.8	PASS	NS=367;DP=2294;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2282;AA=10;SR=1172|1110;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.6875;ABR=11;ABA=5;RUN=2;SNP;TV
+20	77393	.	G	A	32.7	PASS	NS=367;DP=2297;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2277;AA=11;SR=1261|1016;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=3;SNP;TS;CpG
+20	77484	.	A	T	0.241	PASS	NS=369;DP=2290;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2283;AA=5;SR=1203|1080;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	77499	.	G	T	0.058	PASS	NS=369;DP=2269;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2260;AA=4;SR=1216|1044;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	77655	.	T	C	0.0462	PASS	NS=371;DP=2542;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2533;AA=3;SR=1188|1345;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	77816	.	G	A	99.0	PASS	NS=369;DP=2224;AC=16;AN=738;AF=0.02168;RA=2161;AA=45;SR=1004|1157;SA=21|24;SB=0.46667;AB=0.53571;ABR=45;ABA=37;RUN=1;SNP;TS
+20	77870	.	A	G	0.0585	PASS	NS=368;DP=2214;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2176;AA=15;SR=836|1340;SA=3|12;SB=0.2;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	77871	.	C	T	28.8	PASS	NS=368;DP=2215;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2200;AA=11;SR=831|1369;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.75;ABR=9;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	77884	.	T	C	2.39	PASS	NS=369;DP=2325;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2308;AA=4;SR=832|1476;SA=3|1;SB=0.75;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	77890	.	T	C	13.2	PASS	NS=369;DP=2347;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2324;AA=5;SR=842|1482;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	78254	.	C	T	99.0	PASS	NS=345;DP=1534;AC=11;AN=690;AF=0.015942;RA=1494;AA=34;SR=751|743;SA=18|16;SB=0.52941;AB=0.58824;ABR=50;ABA=34;RUN=1;SNP;TS
+20	78255	.	C	A	0.0735	PASS	NS=347;DP=1551;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1538;AA=6;SR=774|764;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	78266	.	T	A	0.136	PASS	NS=354;DP=1640;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1632;AA=4;SR=840|792;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	78455	.	G	A	99.0	PASS	NS=342;DP=1209;AC=3;AN=684;AF=0.004386;RA=1190;AA=12;SR=657|533;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.45;ABR=9;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	78515	.	G	A	15.5	PASS	NS=201;DP=435;AC=1;AN=402;AF=0.0024876;RA=429;AA=2;SR=37|392;SA=0|2;SB=0;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	78691	.	T	G	0.408	PASS	NS=164;DP=352;AC=1;AN=328;AF=0.0030488;RA=346;AA=3;SR=10|336;SA=0|3;SB=0;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	79234	.	T	C	99.0	PASS	NS=185;DP=299;AC=221;AN=370;AF=0.5973;RA=126;AA=171;SR=83|43;SA=113|58;SB=0.66082;AB=0.57447;ABR=27;ABA=20;RUN=1;SNP;TS
+20	79509	.	A	G	6.23	PASS	NS=341;DP=1250;AC=1;AN=682;AF=0.0014663;RA=1242;AA=3;SR=618|624;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	79697	.	A	G	6.18	PASS	NS=129;DP=195;AC=1;AN=258;AF=0.003876;RA=191;AA=2;SR=53|138;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	79749	.	A	T	0.0964	PASS	NS=158;DP=301;AC=2;AN=316;AF=0.0063291;RA=290;AA=3;SR=117|173;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
+20	79969	.	T	G	6.07	PASS	NS=214;DP=647;AC=1;AN=428;AF=0.0023364;RA=643;AA=2;SR=615|28;SA=2|0;SB=1;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	80071	.	G	A	99.0	PASS	NS=299;DP=809;AC=271;AN=598;AF=0.45318;RA=473;AA=335;SR=453|20;SA=325|10;SB=0.97015;AB=0.53559;ABR=158;ABA=137;RUN=1;SNP;TS
+20	80079	.	G	A	27.1	PASS	NS=316;DP=898;AC=7;AN=632;AF=0.011076;RA=888;AA=8;SR=851|37;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.73333;ABR=22;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	80095	.	A	G	0.0807	PASS	NS=324;DP=1080;AC=3;AN=648;AF=0.0046296;RA=1063;AA=7;SR=935|128;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=2;SNP;TS
+20	80165	.	G	T	0.0494	PASS	NS=365;DP=2212;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2191;AA=14;SR=1178|1013;SA=1|13;SB=0.071429;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	80174	.	A	T	0.633	PASS	NS=369;DP=2363;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2353;AA=2;SR=1187|1166;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	80251	.	T	C	2.09	PASS	NS=369;DP=2247;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2212;AA=25;SR=1205|1007;SA=5|20;SB=0.2;AB=0.22222;ABR=2;ABA=7;RUN=3;SNP;TS
+20	80289	.	C	A	1.02	PASS	NS=367;DP=2183;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2177;AA=3;SR=1321|856;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	80359	.	T	C	0.834	PASS	NS=367;DP=2201;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2177;AA=7;SR=1148|1029;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	80448	.	A	G	0.782	PASS	NS=367;DP=2320;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2310;AA=4;SR=1056|1254;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	80481	.	G	C	99.0	PASS	NS=368;DP=2442;AC=48;AN=736;AF=0.065217;RA=2286;AA=149;SR=1092|1194;SA=62|87;SB=0.41611;AB=0.50794;ABR=128;ABA=122;RUN=1;SNP;TV
+20	80497	.	G	T	0.851	PASS	NS=366;DP=2581;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2572;AA=5;SR=1218|1354;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	80513	.	C	G	25.9	PASS	NS=369;DP=2672;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2659;AA=6;SR=1308|1351;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=2;SNP;TV
+20	80525	.	C	A	0.0588	PASS	NS=365;DP=2634;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2619;AA=5;SR=1324|1295;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	80655	.	A	G	99.0	PASS	NS=366;DP=2328;AC=646;AN=732;AF=0.88251;RA=331;AA=1993;SR=147|184;SA=829|1164;SB=0.41596;AB=0.56156;ABR=260;ABA=203;RUN=1;SNP;TS
+20	80725	.	T	A	8.94	PASS	NS=366;DP=2067;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2061;AA=2;SR=1019|1042;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	80728	.	C	G	99.0	PASS	NS=366;DP=2029;AC=17;AN=732;AF=0.023224;RA=1969;AA=56;SR=983|986;SA=27|29;SB=0.48214;AB=0.5045;ABR=56;ABA=55;RUN=1;SNP;TV
+20	80838	.	C	T	76.1	PASS	NS=365;DP=2253;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2239;AA=6;SR=953|1286;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	80856	.	C	G	0.0837	PASS	NS=363;DP=2218;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2206;AA=4;SR=931|1275;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	80865	.	A	C	0.0761	PASS	NS=363;DP=2195;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2187;AA=5;SR=937|1250;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	80887	.	G	A	58.7	PASS	NS=361;DP=2159;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2148;AA=6;SR=901|1247;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	81001	.	T	C	39.3	PASS	NS=364;DP=1961;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1955;AA=3;SR=979|976;SA=3|0;SB=1;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	81017	.	C	T	0.602	PASS	NS=358;DP=1953;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1946;AA=3;SR=966|980;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	81071	.	A	G	99.0	PASS	NS=363;DP=1794;AC=6;AN=726;AF=0.0082645;RA=1756;AA=20;SR=873|883;SA=8|12;SB=0.4;AB=0.38462;ABR=10;ABA=16;RUN=1;SNP;TS
+20	81282	.	A	T	3.99	PASS	NS=361;DP=1909;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1900;AA=4;SR=1029|871;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	81297	.	T	A	9.74	PASS	NS=360;DP=1948;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1931;AA=6;SR=1062|869;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	81298	.	G	A	99.0	PASS	NS=360;DP=1942;AC=5;AN=720;AF=0.0069444;RA=1923;AA=17;SR=1058|865;SA=11|6;SB=0.64706;AB=0.40909;ABR=9;ABA=13;RUN=1;SNP;TS
+20	81481	.	A	G	0.751	PASS	NS=354;DP=1746;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1737;AA=3;SR=786|951;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	81550	.	G	T	13.7	PASS	NS=351;DP=1755;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1750;AA=3;SR=809|941;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	81551	.	A	T	10.2	PASS	NS=350;DP=1763;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1754;AA=2;SR=809|945;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	81561	.	A	G	0.396	PASS	NS=348;DP=1704;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1696;AA=3;SR=816|880;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	81602	.	C	G	1.28	PASS	NS=348;DP=1658;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1645;AA=3;SR=860|785;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	81679	.	T	G	4.28	PASS	NS=350;DP=1612;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1602;AA=5;SR=664|938;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	81692	.	T	C	4.66	PASS	NS=347;DP=1557;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1550;AA=5;SR=624|926;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	81715	.	C	G	5.01	PASS	NS=344;DP=1520;AC=1;AN=688;AF=0.0014535;RA=1513;AA=2;SR=584|929;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	81966	.	G	A	15.2	PASS	NS=187;DP=338;AC=1;AN=374;AF=0.0026738;RA=329;AA=4;SR=172|157;SA=4|0;SB=1;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	82012	.	T	C	57.6	PASS	NS=161;DP=273;AC=49;AN=322;AF=0.15217;RA=222;AA=41;SR=75|147;SA=16|25;SB=0.39024;AB=0.6;ABR=15;ABA=10;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	82119	.	G	A	1.23	PASS	NS=223;DP=490;AC=1;AN=446;AF=0.0022422;RA=486;AA=2;SR=322|164;SA=1|1;SB=0.5;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	82168	.	G	A	0.0662	PASS	NS=223;DP=456;AC=1;AN=446;AF=0.0022422;RA=447;AA=3;SR=316|131;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	82204	.	T	C	60.6	PASS	NS=275;DP=670;AC=17;AN=550;AF=0.030909;RA=633;AA=23;SR=366|267;SA=16|7;SB=0.69565;AB=0.5;ABR=11;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	82215	.	G	A	99.0	PASS	NS=313;DP=849;AC=97;AN=626;AF=0.15495;RA=715;AA=126;SR=411|304;SA=85|41;SB=0.6746;AB=0.49645;ABR=70;ABA=71;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	82217	.	G	A	99.0	PASS	NS=314;DP=864;AC=493;AN=628;AF=0.78503;RA=182;AA=666;SR=108|74;SA=392|274;SB=0.58859;AB=0.46875;ABR=75;ABA=83;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	82223	.	C	T	99.0	PASS	NS=325;DP=994;AC=20;AN=650;AF=0.030769;RA=956;AA=34;SR=548|408;SA=18|16;SB=0.52941;AB=0.53488;ABR=23;ABA=19;RUN=1;SNP;TS
+20	82239	.	A	T	7.56	PASS	NS=344;DP=1299;AC=1;AN=688;AF=0.0014535;RA=1285;AA=2;SR=747|538;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	82258	.	A	G	14.1	PASS	NS=355;DP=1549;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=1536;AA=8;SR=883|653;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=3;SNP;TS
+20	82309	.	G	A	0.136	PASS	NS=356;DP=1542;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1528;AA=6;SR=935|593;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=5;SNP;TS
+20	82359	.	T	C	15.4	PASS	NS=365;DP=1749;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1734;AA=8;SR=1094|640;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=3;SNP;TS
+20	82415	.	A	C	23.9	PASS	NS=369;DP=1845;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=1831;AA=10;SR=1068|763;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
+20	82416	.	T	C	99.0	PASS	NS=369;DP=1849;AC=16;AN=738;AF=0.02168;RA=1813;AA=31;SR=1060|753;SA=14|17;SB=0.45161;AB=0.57627;ABR=34;ABA=25;RUN=1;SNP;TS
+20	82446	.	C	G	59.2	PASS	NS=359;DP=1707;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1700;AA=4;SR=909|791;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TV
+20	82460	.	C	T	9.05	PASS	NS=363;DP=1665;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1657;AA=3;SR=856|801;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=2;SNP;TS
+20	82571	.	T	C	12.6	PASS	NS=351;DP=1817;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1807;AA=4;SR=940|867;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	82701	.	T	C	99.0	PASS	NS=351;DP=1848;AC=103;AN=702;AF=0.14672;RA=1578;AA=267;SR=848|730;SA=159|108;SB=0.59551;AB=0.5063;ABR=241;ABA=235;RUN=1;SNP;TS
+20	82729	.	G	C	7.54	PASS	NS=348;DP=1793;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1782;AA=5;SR=948|834;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	82783	.	C	G	0.355	PASS	NS=364;DP=1952;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1940;AA=3;SR=954|986;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	82898	.	C	T	99.0	PASS	NS=367;DP=2131;AC=3;AN=734;AF=0.0040872;RA=2111;AA=11;SR=1035|1076;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.68966;ABR=20;ABA=9;RUN=3;SNP;TS
+20	82923	.	T	A	0.244	PASS	NS=368;DP=2124;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2113;AA=2;SR=1084|1029;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	82991	.	G	C	11.7	PASS	NS=367;DP=1988;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=1974;AA=3;SR=1070|904;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	83034	.	T	C	1.7	PASS	NS=367;DP=2054;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2021;AA=8;SR=1049|972;SA=6|2;SB=0.75;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	83129	.	A	G	0.056	PASS	NS=367;DP=2217;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2204;AA=6;SR=1098|1106;SA=0|6;SB=0;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS
+20	83154	.	C	G	0.0482	PASS	NS=368;DP=2149;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2137;AA=6;SR=1070|1067;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
+20	83196	.	A	T	99.0	PASS	NS=368;DP=1931;AC=14;AN=736;AF=0.019022;RA=1884;AA=39;SR=936|948;SA=18|21;SB=0.46154;AB=0.47619;ABR=30;ABA=33;RUN=3;SNP;TV
+20	83231	.	G	A	2.47	PASS	NS=339;DP=1326;AC=1;AN=678;AF=0.0014749;RA=1312;AA=5;SR=685|627;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	83481	.	G	T	0.0764	PASS	NS=363;DP=2028;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2017;AA=7;SR=858|1159;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	83485	.	A	C	2.92	PASS	NS=363;DP=2053;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2047;AA=4;SR=881|1166;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	83492	.	A	T	2.75	PASS	NS=361;DP=2031;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2016;AA=11;SR=866|1150;SA=9|2;SB=0.81818;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=6;SNP;TV
+20	83501	.	G	A	0.105	PASS	NS=362;DP=2022;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2015;AA=2;SR=889|1126;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	83570	.	T	G	99.0	PASS	NS=366;DP=2101;AC=53;AN=732;AF=0.072404;RA=1942;AA=152;SR=1026|916;SA=88|64;SB=0.57895;AB=0.47685;ABR=103;ABA=113;RUN=3;SNP;TV
+20	83611	.	C	A	99.0	PASS	NS=367;DP=2005;AC=13;AN=734;AF=0.017711;RA=1959;AA=41;SR=1062|897;SA=20|21;SB=0.4878;AB=0.51852;ABR=42;ABA=38;RUN=1;SNP;TV
+20	83613	.	T	C	0.232	PASS	NS=367;DP=2011;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2004;AA=4;SR=1083|921;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	83629	.	C	T	5.45	PASS	NS=363;DP=1970;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1962;AA=3;SR=1038|924;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	83666	.	G	T	0.202	PASS	NS=360;DP=1983;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1977;AA=3;SR=1132|845;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	83732	.	A	T	0.0538	PASS	NS=369;DP=2058;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2035;AA=9;SR=1048|987;SA=1|8;SB=0.11111;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	83765	.	A	G	1.78	PASS	NS=369;DP=2031;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2018;AA=3;SR=1058|960;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	83777	.	T	C	0.0484	PASS	NS=368;DP=2022;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2013;AA=6;SR=1109|904;SA=6|0;SB=1;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	83819	.	A	T	1.79	PASS	NS=366;DP=2143;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2133;AA=3;SR=1253|880;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	83929	.	G	A	99.0	PASS	NS=365;DP=2235;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2216;AA=10;SR=999|1217;SA=2|8;SB=0.2;AB=0.61538;ABR=16;ABA=10;RUN=1;SNP;TS
+20	83934	.	C	T	0.265	PASS	NS=365;DP=2214;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2192;AA=3;SR=983|1209;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	83966	.	C	T	0.338	PASS	NS=370;DP=2246;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2222;AA=6;SR=1045|1177;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	83971	.	C	T	22.1	PASS	NS=368;DP=2238;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2220;AA=11;SR=1057|1163;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.5;ABR=8;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	83996	.	C	G	99.0	PASS	NS=366;DP=2129;AC=25;AN=732;AF=0.034153;RA=2061;AA=56;SR=1024|1037;SA=22|34;SB=0.39286;AB=0.5283;ABR=56;ABA=50;RUN=1;SNP;TV
+20	84003	.	A	G	0.091	PASS	NS=365;DP=2098;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2068;AA=12;SR=1047|1021;SA=1|11;SB=0.083333;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	84079	.	G	A	45.3	PASS	NS=360;DP=1898;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1874;AA=10;SR=901|973;SA=7|3;SB=0.7;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=3;SNP;TS
+20	84201	.	G	A	99.0	PASS	NS=355;DP=1809;AC=4;AN=710;AF=0.0056338;RA=1784;AA=14;SR=830|954;SA=9|5;SB=0.64286;AB=0.5;ABR=11;ABA=11;RUN=2;SNP;TS
+20	84351	.	G	A	1.43	PASS	NS=363;DP=2151;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2138;AA=4;SR=1159|979;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	84358	.	T	C	0.98	PASS	NS=360;DP=2134;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2108;AA=13;SR=1150|958;SA=9|4;SB=0.69231;AB=0.8;ABR=12;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	84488	.	A	G	0.241	PASS	NS=365;DP=2176;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2139;AA=9;SR=1014|1125;SA=3|6;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=3;SNP;TS;CpG
+20	84499	.	G	A	27.9	PASS	NS=364;DP=2141;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2118;AA=11;SR=1047|1071;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=2;SNP;TS
+20	84504	.	G	A	35.0	PASS	NS=366;DP=2125;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=2098;AA=13;SR=1028|1070;SA=10|3;SB=0.76923;AB=0.36364;ABR=4;ABA=7;RUN=2;SNP;TS
+20	84666	.	G	A	99.0	PASS	NS=368;DP=2163;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2140;AA=15;SR=1118|1022;SA=6|9;SB=0.4;AB=0.28571;ABR=4;ABA=10;RUN=4;SNP;TS;CpG
+20	84727	.	G	A	88.5	PASS	NS=371;DP=2412;AC=2;AN=742;AF=0.0026954;RA=2393;AA=10;SR=1261|1132;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.5625;ABR=9;ABA=7;RUN=1;SNP;TS
+20	84892	.	C	T	99.0	PASS	NS=368;DP=2536;AC=8;AN=736;AF=0.01087;RA=2499;AA=25;SR=1170|1329;SA=12|13;SB=0.48;AB=0.55102;ABR=27;ABA=21;RUN=1;SNP;TS
+20	84906	.	T	C	99.0	PASS	NS=369;DP=2485;AC=7;AN=738;AF=0.0094851;RA=2422;AA=30;SR=1127|1295;SA=20|10;SB=0.66667;AB=0.58491;ABR=31;ABA=20;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	84934	.	C	T	0.156	PASS	NS=369;DP=2365;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2353;AA=4;SR=1081|1272;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	84937	.	T	A	0.102	PASS	NS=369;DP=2325;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2299;AA=11;SR=1060|1239;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TV
+20	84949	.	G	A	1.84	PASS	NS=369;DP=2295;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2281;AA=5;SR=1075|1206;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	85116	.	C	T	99.0	PASS	NS=367;DP=2259;AC=49;AN=734;AF=0.066757;RA=2119;AA=129;SR=989|1130;SA=54|75;SB=0.4186;AB=0.50679;ABR=112;ABA=106;RUN=1;SNP;TS
+20	85180	.	A	G	2.49	PASS	NS=366;DP=2123;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2111;AA=3;SR=882|1229;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	85182	.	C	T	6.7	PASS	NS=365;DP=2111;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2100;AA=2;SR=874|1226;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	85195	.	A	G	0.062	PASS	NS=354;DP=2020;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=2010;AA=5;SR=851|1159;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.875;ABR=14;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	85371	.	A	G	3.11	PASS	NS=349;DP=2019;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=2008;AA=2;SR=1054|954;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	85388	.	G	A	2.07	PASS	NS=364;DP=2082;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2071;AA=4;SR=1054|1017;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	85414	.	G	C	0.348	PASS	NS=369;DP=2163;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2147;AA=5;SR=1106|1041;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	85492	.	T	C	2.17	PASS	NS=369;DP=2347;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2323;AA=6;SR=1170|1153;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	85530	.	G	A	1.82	PASS	NS=366;DP=1908;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1900;AA=3;SR=984|916;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	85875	.	A	G	38.7	PASS	NS=357;DP=1986;AC=2;AN=714;AF=0.0028011;RA=1979;AA=6;SR=1078|901;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
+20	85937	.	G	C	99.0	PASS	NS=369;DP=2379;AC=3;AN=738;AF=0.004065;RA=2348;AA=15;SR=1362|986;SA=9|6;SB=0.6;AB=0.38095;ABR=8;ABA=13;RUN=1;SNP;TV
+20	86055	.	A	C	0.233	PASS	NS=369;DP=2109;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2095;AA=7;SR=1161|934;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	86103	.	G	T	10.5	PASS	NS=355;DP=2067;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=2052;AA=6;SR=1129|923;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
+20	86115	.	G	A	99.0	PASS	NS=356;DP=2026;AC=16;AN=712;AF=0.022472;RA=1969;AA=51;SR=1039|930;SA=28|23;SB=0.54902;AB=0.48837;ABR=42;ABA=44;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	86335	.	T	A	2.87	PASS	NS=357;DP=2032;AC=2;AN=714;AF=0.0028011;RA=2003;AA=17;SR=925|1078;SA=0|17;SB=0;AB=0.625;ABR=10;ABA=6;RUN=6;SNP;TV
+20	86458	.	C	T	0.0675	PASS	NS=362;DP=1974;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1959;AA=2;SR=1098|861;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	86620	.	T	A	4.96	PASS	NS=368;DP=2381;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2365;AA=3;SR=1199|1166;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	86691	.	C	T	0.306	PASS	NS=359;DP=2285;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2274;AA=4;SR=1261|1013;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	86719	.	A	G	0.0505	PASS	NS=362;DP=2130;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2108;AA=9;SR=1090|1018;SA=0|9;SB=0;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=1;SNP;TS
+20	86757	.	A	G	2.16	PASS	NS=364;DP=2159;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2147;AA=4;SR=1029|1118;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	86823	.	T	G	1.16	PASS	NS=360;DP=1894;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1867;AA=9;SR=870|997;SA=1|8;SB=0.11111;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	87003	.	A	C	43.6	PASS	NS=357;DP=2114;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2103;AA=10;SR=846|1257;SA=8|2;SB=0.8;AB=0.28571;ABR=2;ABA=5;RUN=1;SNP;TV
+20	87029	.	C	A	6.64	PASS	NS=353;DP=2097;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2090;AA=5;SR=842|1248;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	87067	.	A	T	0.0727	PASS	NS=349;DP=1846;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=1839;AA=4;SR=850|989;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	87112	.	G	A	99.0	PASS	NS=350;DP=1657;AC=181;AN=700;AF=0.25857;RA=1252;AA=400;SR=740|512;SA=233|167;SB=0.5825;AB=0.51139;ABR=247;ABA=236;RUN=4;SNP;TS;CpG
+20	87230	.	G	A	0.205	PASS	NS=347;DP=1809;AC=4;AN=694;AF=0.0057637;RA=1779;AA=26;SR=812|967;SA=1|25;SB=0.038462;AB=0.71429;ABR=15;ABA=6;RUN=8;SNP;TS
+20	87254	.	C	T	99.0	PASS	NS=333;DP=1705;AC=3;AN=666;AF=0.0045045;RA=1687;AA=11;SR=755|932;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TS
+20	87265	.	A	G	0.41	PASS	NS=335;DP=1686;AC=1;AN=670;AF=0.0014925;RA=1680;AA=3;SR=813|867;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	87313	.	A	G	1.57	PASS	NS=354;DP=1886;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1880;AA=2;SR=941|939;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	87314	.	A	T	0.279	PASS	NS=354;DP=1882;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1874;AA=3;SR=939|935;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	87362	.	A	G	99.0	PASS	NS=345;DP=1823;AC=26;AN=690;AF=0.037681;RA=1732;AA=89;SR=879|853;SA=46|43;SB=0.51685;AB=0.46809;ABR=66;ABA=75;RUN=1;SNP;TS
+20	87416	.	A	C	99.0	PASS	NS=357;DP=1755;AC=511;AN=714;AF=0.71569;RA=537;AA=1217;SR=259|278;SA=650|567;SB=0.5341;AB=0.48414;ABR=290;ABA=309;RUN=3;SNP;TV
+20	87471	.	T	C	0.608	PASS	NS=349;DP=1783;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=1768;AA=5;SR=935|833;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.86667;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	87555	.	T	A	0.0485	PASS	NS=355;DP=1728;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1715;AA=7;SR=840|875;SA=0|7;SB=0;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=5;SNP;TV
+20	87682	.	G	A	0.887	PASS	NS=355;DP=1823;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1803;AA=4;SR=925|878;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	87790	.	C	T	99.0	PASS	NS=345;DP=1766;AC=16;AN=690;AF=0.023188;RA=1705;AA=49;SR=867|838;SA=32|17;SB=0.65306;AB=0.5102;ABR=50;ABA=46;RUN=2;SNP;TS
+20	88003	.	A	G	1.57	PASS	NS=343;DP=1528;AC=1;AN=686;AF=0.0014577;RA=1524;AA=3;SR=698|826;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	88031	.	T	C	1.06	PASS	NS=347;DP=1727;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1710;AA=4;SR=899|811;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	88058	.	T	C	0.444	PASS	NS=367;DP=2138;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2122;AA=7;SR=1196|926;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	88072	.	C	T	99.0	PASS	NS=372;DP=2307;AC=6;AN=744;AF=0.0080645;RA=2286;AA=17;SR=1310|976;SA=6|11;SB=0.35294;AB=0.54545;ABR=18;ABA=15;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	88123	.	C	T	0.301	PASS	NS=357;DP=2104;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2091;AA=5;SR=1202|889;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	88155	.	T	C	99.0	PASS	NS=364;DP=2136;AC=17;AN=728;AF=0.023352;RA=2082;AA=41;SR=1144|938;SA=30|11;SB=0.73171;AB=0.60494;ABR=49;ABA=32;RUN=1;SNP;TS
+20	88162	.	G	A	47.4	PASS	NS=369;DP=2151;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2139;AA=7;SR=1175|964;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	88320	.	A	T	0.798	PASS	NS=350;DP=1709;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1700;AA=3;SR=1029|671;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	88565	.	A	G	0.361	PASS	NS=331;DP=1574;AC=1;AN=662;AF=0.0015106;RA=1565;AA=3;SR=773|792;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	88647	.	T	G	0.076	PASS	NS=363;DP=2151;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2140;AA=4;SR=1060|1080;SA=0|4;SB=0;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	88750	.	T	C	5.86	PASS	NS=360;DP=1753;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1747;AA=2;SR=887|860;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	88814	.	T	C	0.327	PASS	NS=335;DP=1461;AC=1;AN=670;AF=0.0014925;RA=1447;AA=4;SR=749|698;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	88827	.	C	A	99.0	PASS	NS=328;DP=1379;AC=133;AN=656;AF=0.20274;RA=1086;AA=290;SR=531|555;SA=135|155;SB=0.46552;AB=0.4788;ABR=192;ABA=209;RUN=6;SNP;TV
+20	88874	.	C	T	3.41	PASS	NS=346;DP=1464;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1450;AA=3;SR=694|756;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	88880	.	T	C	69.1	PASS	NS=352;DP=1515;AC=9;AN=704;AF=0.012784;RA=1470;AA=16;SR=727|743;SA=11|5;SB=0.6875;AB=0.6;ABR=21;ABA=13;RUN=1;SNP;TS
+20	88924	.	A	T	15.2	PASS	NS=357;DP=1741;AC=2;AN=714;AF=0.0028011;RA=1730;AA=6;SR=863|867;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=2;SNP;TV
+20	89032	.	C	T	87.2	PASS	NS=356;DP=1715;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1703;AA=6;SR=753|950;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.16667;ABR=1;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	89057	.	T	C	11.1	PASS	NS=346;DP=1555;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1546;AA=2;SR=644|902;SA=2|0;SB=1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	89061	.	C	T	3.13	PASS	NS=338;DP=1513;AC=1;AN=676;AF=0.0014793;RA=1503;AA=3;SR=618|885;SA=3|0;SB=1;AB=0.78571;ABR=11;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	89208	.	T	C	1.55	PASS	NS=348;DP=1527;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1515;AA=2;SR=795|720;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	89322	.	C	G	0.0545	PASS	NS=296;DP=1182;AC=1;AN=592;AF=0.0016892;RA=1176;AA=2;SR=694|482;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	89442	.	G	T	0.338	PASS	NS=345;DP=1852;AC=1;AN=690;AF=0.0014493;RA=1844;AA=6;SR=1099|745;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	89517	.	A	T	4.6	PASS	NS=360;DP=2035;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2030;AA=2;SR=1134|896;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	89661	.	G	A	47.0	PASS	NS=366;DP=2184;AC=2;AN=732;AF=0.0027322;RA=2175;AA=5;SR=1085|1090;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	89739	.	T	A	0.145	PASS	NS=359;DP=1950;AC=2;AN=718;AF=0.0027855;RA=1928;AA=8;SR=951|977;SA=8|0;SB=1;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
+20	89750	.	G	T	0.157	PASS	NS=361;DP=1896;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1882;AA=10;SR=971|911;SA=7|3;SB=0.7;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	89784	.	C	T	4.3	PASS	NS=350;DP=1854;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1848;AA=3;SR=1005|843;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	89860	.	C	A	2.95	PASS	NS=371;DP=2493;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2480;AA=9;SR=1216|1264;SA=3|6;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	89871	.	T	G	3.36	PASS	NS=364;DP=2415;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2403;AA=9;SR=1148|1255;SA=0|9;SB=0;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=3;SNP;TV
+20	90008	.	C	A	99.0	PASS	NS=346;DP=1902;AC=69;AN=692;AF=0.099711;RA=1671;AA=228;SR=919|752;SA=125|103;SB=0.54825;AB=0.48;ABR=168;ABA=182;RUN=4;SNP;TV
+20	90187	.	A	C	0.0959	PASS	NS=370;DP=2329;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2306;AA=14;SR=1020|1286;SA=7|7;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	90407	.	G	A	99.0	PASS	NS=368;DP=2398;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2378;AA=11;SR=1117|1261;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.35714;ABR=5;ABA=9;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	90509	.	G	A	0.677	PASS	NS=370;DP=2346;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2331;AA=2;SR=1216|1115;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	90541	.	C	T	99.0	PASS	NS=371;DP=2334;AC=4;AN=742;AF=0.0053908;RA=2300;AA=23;SR=1229|1071;SA=11|12;SB=0.47826;AB=0.41667;ABR=15;ABA=21;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	90542	.	G	A	0.692	PASS	NS=371;DP=2337;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2318;AA=16;SR=1245|1073;SA=2|14;SB=0.125;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=3;SNP;TS;CpG
+20	90570	.	G	A	23.7	PASS	NS=370;DP=2343;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2331;AA=6;SR=1221|1110;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=3;SNP;TS
+20	90628	.	G	T	6.52	PASS	NS=371;DP=2396;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2379;AA=6;SR=1154|1225;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	90688	.	T	C	0.367	PASS	NS=370;DP=2304;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2272;AA=15;SR=946|1326;SA=6|9;SB=0.4;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	90752	.	A	C	0.122	PASS	NS=370;DP=2411;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2399;AA=6;SR=1210|1189;SA=6|0;SB=1;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	90795	.	C	T	0.18	PASS	NS=368;DP=2454;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2443;AA=4;SR=1318|1125;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	90814	.	T	C	43.3	PASS	NS=368;DP=2403;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2388;AA=10;SR=1294|1094;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.6;ABR=12;ABA=8;RUN=1;SNP;TS
+20	90826	.	T	A	0.0721	PASS	NS=367;DP=2295;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2287;AA=5;SR=1231|1056;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=4;SNP;TV
+20	90984	.	A	G	99.0	PASS	NS=361;DP=2035;AC=150;AN=722;AF=0.20776;RA=1619;AA=410;SR=766|853;SA=181|229;SB=0.44146;AB=0.5;ABR=331;ABA=330;RUN=1;SNP;TS
+20	91053	.	G	A	1.89	PASS	NS=361;DP=2062;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2051;AA=4;SR=1080|971;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	91072	.	G	A	9.59	PASS	NS=361;DP=2180;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2166;AA=8;SR=1078|1088;SA=1|7;SB=0.125;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	91088	.	C	T	99.0	PASS	NS=363;DP=2177;AC=616;AN=726;AF=0.84848;RA=386;AA=1782;SR=187|199;SA=833|949;SB=0.46745;AB=0.49684;ABR=236;ABA=239;RUN=1;SNP;TS
+20	91217	.	T	C	0.0587	PASS	NS=369;DP=2369;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2361;AA=5;SR=1348|1013;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.8;ABR=12;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	91227	.	C	T	99.0	PASS	NS=369;DP=2355;AC=25;AN=738;AF=0.033875;RA=2274;AA=74;SR=1302|972;SA=44|30;SB=0.59459;AB=0.46018;ABR=52;ABA=61;RUN=3;SNP;TS
+20	91346	.	G	A	99.0	PASS	NS=369;DP=2207;AC=150;AN=738;AF=0.20325;RA=1744;AA=456;SR=974|770;SA=250|206;SB=0.54825;AB=0.49656;ABR=361;ABA=363;RUN=2;SNP;TS
+20	91474	.	C	A	0.361	PASS	NS=369;DP=2458;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2449;AA=4;SR=1260|1189;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=5;SNP;TV
+20	91497	.	A	G	0.291	PASS	NS=370;DP=2513;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2504;AA=3;SR=1280|1224;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	91508	.	G	A	99.0	PASS	NS=369;DP=2483;AC=621;AN=738;AF=0.84146;RA=424;AA=2039;SR=222|202;SA=1036|1003;SB=0.50809;AB=0.52604;ABR=303;ABA=270;RUN=1;SNP;TS
+20	91707	.	C	T	99.0	PASS	NS=369;DP=2273;AC=112;AN=738;AF=0.15176;RA=1930;AA=291;SR=948|982;SA=137|154;SB=0.47079;AB=0.53738;ABR=230;ABA=197;RUN=1;SNP;TS
+20	91716	.	C	T	99.0	PASS	NS=368;DP=2309;AC=6;AN=736;AF=0.0081522;RA=2285;AA=18;SR=1117|1168;SA=7|11;SB=0.38889;AB=0.60465;ABR=26;ABA=17;RUN=2;SNP;TS
+20	91718	.	C	T	61.6	PASS	NS=368;DP=2338;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2322;AA=10;SR=1129|1193;SA=8|2;SB=0.8;AB=0.5;ABR=9;ABA=9;RUN=2;SNP;TS
+20	91778	.	T	A	2.05	PASS	NS=366;DP=2459;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2444;AA=7;SR=1123|1321;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	91863	.	A	G	1.48	PASS	NS=364;DP=2501;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2488;AA=4;SR=1261|1227;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=4;SNP;TS
+20	91920	.	C	A	1.42	PASS	NS=368;DP=2547;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2530;AA=6;SR=1225|1305;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	91937	.	T	A	15.2	PASS	NS=368;DP=2523;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2492;AA=7;SR=1179|1313;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	91951	.	G	A	99.0	PASS	NS=364;DP=2528;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=2504;AA=12;SR=1185|1319;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.62069;ABR=18;ABA=11;RUN=1;SNP;TS
+20	91971	.	G	A	99.0	PASS	NS=367;DP=2448;AC=4;AN=734;AF=0.0054496;RA=2412;AA=26;SR=1136|1276;SA=9|17;SB=0.34615;AB=0.54545;ABR=24;ABA=20;RUN=1;SNP;TS
+20	91987	.	A	C	2.61	PASS	NS=366;DP=2461;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2447;AA=8;SR=1115|1332;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	91991	.	G	C	99.0	PASS	NS=367;DP=2461;AC=12;AN=734;AF=0.016349;RA=2421;AA=30;SR=1104|1317;SA=12|18;SB=0.4;AB=0.525;ABR=21;ABA=19;RUN=2;SNP;TV
+20	92037	.	G	T	18.0	PASS	NS=369;DP=2484;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2465;AA=11;SR=1128|1337;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	92080	.	T	C	99.0	PASS	NS=363;DP=2461;AC=10;AN=726;AF=0.013774;RA=2425;AA=32;SR=1182|1243;SA=15|17;SB=0.46875;AB=0.46341;ABR=19;ABA=22;RUN=1;SNP;TS
+20	92091	.	C	A	3.93	PASS	NS=363;DP=2512;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2502;AA=3;SR=1238|1264;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	92171	.	T	G	0.0778	PASS	NS=361;DP=2344;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2332;AA=6;SR=1179|1153;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	92207	.	T	C	1.8	PASS	NS=360;DP=2413;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2409;AA=2;SR=1146|1263;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	92366	.	A	G	99.0	PASS	NS=359;DP=2411;AC=131;AN=718;AF=0.18245;RA=1937;AA=464;SR=930|1007;SA=219|245;SB=0.47198;AB=0.50995;ABR=282;ABA=269;RUN=1;SNP;TS
+20	92383	.	T	C	0.775	PASS	NS=364;DP=2395;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2377;AA=6;SR=1138|1239;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	92421	.	A	C	8.1	PASS	NS=366;DP=2327;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2315;AA=6;SR=1224|1091;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	92441	.	T	C	2.12	PASS	NS=364;DP=2420;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2406;AA=6;SR=1351|1055;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	92492	.	G	A	0.0468	PASS	NS=366;DP=2377;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2366;AA=2;SR=1174|1192;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	92527	.	A	G	99.0	PASS	NS=371;DP=2105;AC=644;AN=742;AF=0.86792;RA=317;AA=1752;SR=144|173;SA=822|930;SB=0.46918;AB=0.51415;ABR=218;ABA=198;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	92712	.	T	C	0.198	PASS	NS=361;DP=2260;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2241;AA=10;SR=1190|1051;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	92774	.	T	C	0.403	PASS	NS=364;DP=2560;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2548;AA=3;SR=1242|1306;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	92816	.	T	C	0.817	PASS	NS=369;DP=2431;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2407;AA=12;SR=1073|1334;SA=2|10;SB=0.16667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	92865	.	T	C	10.2	PASS	NS=346;DP=2171;AC=2;AN=692;AF=0.0028902;RA=2155;AA=5;SR=1041|1114;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	92891	.	A	G	99.0	PASS	NS=353;DP=2023;AC=99;AN=706;AF=0.14023;RA=1744;AA=258;SR=877|867;SA=137|121;SB=0.53101;AB=0.47804;ABR=185;ABA=200;RUN=1;SNP;TS
+20	92972	.	G	A	9.84	PASS	NS=362;DP=2148;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2140;AA=6;SR=1068|1072;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	93066	.	C	T	0.0559	PASS	NS=356;DP=2150;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2137;AA=3;SR=1048|1089;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	93114	.	C	T	0.601	PASS	NS=356;DP=2138;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2132;AA=2;SR=970|1162;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	93169	.	C	T	99.0	PASS	NS=352;DP=2227;AC=25;AN=704;AF=0.035511;RA=2133;AA=88;SR=999|1134;SA=36|52;SB=0.40909;AB=0.44681;ABR=63;ABA=77;RUN=1;SNP;TS
+20	93175	.	C	A	0.159	PASS	NS=359;DP=2283;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2272;AA=5;SR=1057|1215;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	93327	.	T	C	99.0	PASS	NS=352;DP=1862;AC=25;AN=704;AF=0.035511;RA=1797;AA=60;SR=792|1005;SA=20|40;SB=0.33333;AB=0.53535;ABR=53;ABA=46;RUN=3;SNP;TS
+20	93343	.	T	C	1.43	PASS	NS=351;DP=1897;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1886;AA=3;SR=804|1082;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	93356	.	C	T	0.0835	PASS	NS=365;DP=1919;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1910;AA=2;SR=804|1106;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.78571;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	93389	.	A	G	10.9	PASS	NS=361;DP=1775;AC=2;AN=722;AF=0.0027701;RA=1758;AA=5;SR=744|1014;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	93406	.	T	C	99.0	PASS	NS=350;DP=1595;AC=7;AN=700;AF=0.01;RA=1573;AA=18;SR=651|922;SA=10|8;SB=0.55556;AB=0.55;ABR=22;ABA=18;RUN=1;SNP;TS
+20	93428	.	T	C	3.27	PASS	NS=334;DP=1422;AC=1;AN=668;AF=0.001497;RA=1415;AA=3;SR=565|850;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	93440	.	A	G	99.0	PASS	NS=327;DP=1360;AC=157;AN=654;AF=0.24006;RA=1041;AA=315;SR=395|646;SA=136|179;SB=0.43175;AB=0.50992;ABR=180;ABA=172;RUN=2;SNP;TS
+20	93499	.	T	C	99.0	PASS	NS=365;DP=1887;AC=82;AN=730;AF=0.11233;RA=1681;AA=203;SR=679|1002;SA=79|124;SB=0.38916;AB=0.48855;ABR=128;ABA=134;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	93684	.	A	G	60.8	PASS	NS=182;DP=336;AC=34;AN=364;AF=0.093407;RA=256;AA=30;SR=174|82;SA=19|11;SB=0.63333;AB=0.34783;ABR=8;ABA=14;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	93704	.	G	C	64.2	PASS	NS=230;DP=445;AC=12;AN=460;AF=0.026087;RA=428;AA=12;SR=245|183;SA=4|8;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	93718	.	T	C	99.0	PASS	NS=260;DP=565;AC=55;AN=520;AF=0.10577;RA=498;AA=64;SR=267|231;SA=37|27;SB=0.57812;AB=0.5;ABR=30;ABA=30;RUN=2;SNP;TS
+20	93739	.	A	G	99.0	PASS	NS=278;DP=706;AC=75;AN=556;AF=0.13489;RA=582;AA=91;SR=316|266;SA=55|36;SB=0.6044;AB=0.48235;ABR=41;ABA=44;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	93931	.	G	A	99.0	PASS	NS=325;DP=1064;AC=167;AN=650;AF=0.25692;RA=811;AA=248;SR=366|445;SA=126|122;SB=0.50806;AB=0.55128;ABR=129;ABA=105;RUN=1;SNP;TS
+20	94019	.	C	T	0.498	PASS	NS=360;DP=1907;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1900;AA=5;SR=1175|725;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	94036	.	G	A	99.0	PASS	NS=355;DP=1929;AC=25;AN=710;AF=0.035211;RA=1850;AA=68;SR=1138|712;SA=44|24;SB=0.64706;AB=0.48958;ABR=47;ABA=49;RUN=1;SNP;TS
+20	94087	.	T	C	25.9	PASS	NS=364;DP=1913;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1901;AA=7;SR=1020|881;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	94091	.	T	C	99.0	PASS	NS=363;DP=1926;AC=93;AN=726;AF=0.1281;RA=1686;AA=228;SR=919|767;SA=116|112;SB=0.50877;AB=0.4822;ABR=149;ABA=156;RUN=1;SNP;TS
+20	94179	.	G	A	9.12	PASS	NS=356;DP=1627;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1617;AA=3;SR=942|675;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	94256	.	A	C	0.101	PASS	NS=355;DP=1594;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1565;AA=4;SR=725|840;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	94307	.	C	A	8.46	PASS	NS=339;DP=1691;AC=1;AN=678;AF=0.0014749;RA=1675;AA=4;SR=703|972;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	94528	.	T	G	99.0	PASS	NS=349;DP=1836;AC=84;AN=698;AF=0.12034;RA=1656;AA=177;SR=898|758;SA=96|81;SB=0.54237;AB=0.52747;ABR=144;ABA=129;RUN=1;SNP;TV
+20	94588	.	G	A	0.244	PASS	NS=364;DP=2022;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=2006;AA=7;SR=1153|853;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.80952;ABR=17;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	94592	.	T	A	99.0	PASS	NS=365;DP=2021;AC=89;AN=730;AF=0.12192;RA=1806;AA=212;SR=1024|782;SA=123|89;SB=0.58019;AB=0.5216;ABR=169;ABA=155;RUN=3;SNP;TV
+20	94624	.	G	T	99.0	PASS	NS=361;DP=1991;AC=15;AN=722;AF=0.020776;RA=1949;AA=39;SR=1051|898;SA=25|14;SB=0.64103;AB=0.5;ABR=17;ABA=17;RUN=2;SNP;TV
+20	94704	.	G	A	99.0	PASS	NS=361;DP=2028;AC=2;AN=722;AF=0.0027701;RA=2015;AA=8;SR=958|1057;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.41667;ABR=5;ABA=7;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	94717	.	T	C	57.7	PASS	NS=365;DP=1994;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1985;AA=6;SR=926|1059;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	94760	.	A	G	99.0	PASS	NS=356;DP=2012;AC=22;AN=712;AF=0.030899;RA=1957;AA=50;SR=987|970;SA=19|31;SB=0.38;AB=0.55046;ABR=60;ABA=48;RUN=2;SNP;TS
+20	94794	.	T	C	0.713	PASS	NS=365;DP=2100;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2091;AA=2;SR=1072|1019;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	94952	.	G	T	99.0	PASS	NS=360;DP=2103;AC=157;AN=720;AF=0.21806;RA=1678;AA=422;SR=854|824;SA=209|213;SB=0.49526;AB=0.49323;ABR=255;ABA=262;RUN=3;SNP;TV
+20	94973	.	T	A	0.162	PASS	NS=363;DP=2064;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2059;AA=2;SR=1059|1000;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	95052	.	T	C	54.2	PASS	NS=361;DP=1889;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1877;AA=5;SR=937|940;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	95093	.	T	G	99.0	PASS	NS=364;DP=1944;AC=95;AN=728;AF=0.13049;RA=1730;AA=212;SR=840|890;SA=99|113;SB=0.46698;AB=0.46619;ABR=131;ABA=150;RUN=1;SNP;TV
+20	95104	.	A	G	4.49	PASS	NS=362;DP=1930;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1921;AA=3;SR=930|991;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	95186	.	T	C	6.33	PASS	NS=359;DP=1991;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1986;AA=3;SR=977|1009;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0;ABR=0;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	95249	.	C	G	1.12	PASS	NS=363;DP=1934;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1923;AA=4;SR=955|968;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	95360	.	C	G	0.0671	PASS	NS=365;DP=2104;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2088;AA=3;SR=1177|911;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.86667;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	95601	.	A	G	10.6	PASS	NS=368;DP=2205;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2172;AA=14;SR=1077|1095;SA=2|12;SB=0.14286;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	95603	.	T	C	0.0469	PASS	NS=347;DP=1778;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1758;AA=5;SR=858|900;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	95619	.	C	T	33.4	PASS	NS=368;DP=2234;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2205;AA=8;SR=1105|1100;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.57143;ABR=8;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
+20	95627	.	C	T	99.0	PASS	NS=368;DP=2216;AC=6;AN=736;AF=0.0081522;RA=2175;AA=22;SR=1082|1093;SA=10|12;SB=0.45455;AB=0.40541;ABR=15;ABA=21;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	95781	.	A	T	0.36	PASS	NS=363;DP=2225;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2185;AA=10;SR=1083|1102;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	95836	.	T	C	5.74	PASS	NS=365;DP=2341;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2320;AA=11;SR=1153|1167;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	95989	.	C	T	0.0518	PASS	NS=364;DP=2264;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2235;AA=5;SR=1159|1076;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	96026	.	C	T	83.3	PASS	NS=362;DP=2328;AC=2;AN=724;AF=0.0027624;RA=2304;AA=10;SR=1145|1159;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.57895;ABR=11;ABA=8;RUN=2;SNP;TS
+20	96038	.	G	C	0.823	PASS	NS=362;DP=2311;AC=2;AN=724;AF=0.0027624;RA=2279;AA=19;SR=1095|1184;SA=9|10;SB=0.47368;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TV
+20	96141	.	T	C	0.0737	PASS	NS=367;DP=2161;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2126;AA=13;SR=1101|1025;SA=13|0;SB=1;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	96166	.	C	T	1.2	PASS	NS=367;DP=2187;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2169;AA=7;SR=1101|1068;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	96213	.	C	A	0.0772	PASS	NS=359;DP=2247;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2231;AA=8;SR=994|1237;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	96325	.	C	T	0.047	PASS	NS=364;DP=2278;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2256;AA=8;SR=1018|1238;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TS
+20	96369	.	A	G	99.0	PASS	NS=366;DP=2148;AC=9;AN=732;AF=0.012295;RA=2087;AA=37;SR=1003|1084;SA=14|23;SB=0.37838;AB=0.5;ABR=21;ABA=20;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	96421	.	G	C	1.04	PASS	NS=363;DP=2132;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2103;AA=12;SR=943|1160;SA=6|6;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	96497	.	C	G	16.9	PASS	NS=362;DP=1926;AC=2;AN=724;AF=0.0027624;RA=1908;AA=6;SR=907|1001;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TV
+20	96579	.	G	A	24.7	PASS	NS=359;DP=1704;AC=5;AN=718;AF=0.0069638;RA=1670;AA=17;SR=848|822;SA=9|8;SB=0.52941;AB=0.52632;ABR=10;ABA=9;RUN=1;SNP;TS
+20	96646	.	G	A	0.141	PASS	NS=364;DP=1850;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1823;AA=6;SR=961|862;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=2;SNP;TS
+20	96670	.	C	T	2.72	PASS	NS=366;DP=1963;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1953;AA=4;SR=1050|903;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	96695	.	C	T	13.0	PASS	NS=364;DP=1927;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1894;AA=13;SR=1024|870;SA=12|1;SB=0.92308;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	96815	.	A	G	0.711	PASS	NS=371;DP=2127;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2098;AA=18;SR=1051|1047;SA=1|17;SB=0.055556;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	96857	.	T	A	0.885	PASS	NS=366;DP=2378;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2341;AA=12;SR=1217|1124;SA=11|1;SB=0.91667;AB=0.57143;ABR=4;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	96872	.	G	T	0.0924	PASS	NS=368;DP=2394;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2385;AA=5;SR=1289|1096;SA=0|5;SB=0;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
+20	96891	.	C	T	4.45	PASS	NS=365;DP=2401;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2387;AA=4;SR=1293|1094;SA=1|3;SB=0.25;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	96923	.	C	A	99.0	PASS	NS=363;DP=2448;AC=20;AN=726;AF=0.027548;RA=2358;AA=85;SR=1286|1072;SA=56|29;SB=0.65882;AB=0.45385;ABR=59;ABA=71;RUN=2;SNP;TV
+20	96931	.	A	G	99.0	PASS	NS=365;DP=2424;AC=256;AN=730;AF=0.35068;RA=1586;AA=831;SR=882|704;SA=463|368;SB=0.55716;AB=0.50916;ABR=389;ABA=373;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	97048	.	G	T	0.0453	PASS	NS=367;DP=2268;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2250;AA=9;SR=1094|1156;SA=2|7;SB=0.22222;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=2;SNP;TV
+20	97122	.	C	T	99.0	PASS	NS=366;DP=2087;AC=168;AN=732;AF=0.22951;RA=1606;AA=470;SR=818|788;SA=230|240;SB=0.48936;AB=0.49234;ABR=257;ABA=261;RUN=1;SNP;TS
+20	97227	.	A	C	87.6	PASS	NS=358;DP=1952;AC=2;AN=716;AF=0.0027933;RA=1912;AA=35;SR=1012|900;SA=33|2;SB=0.94286;AB=0.42857;ABR=6;ABA=8;RUN=2;SNP;TV
+20	97271	.	A	T	10.8	PASS	NS=367;DP=2260;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2241;AA=3;SR=1067|1174;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	97285	.	T	C	0.442	PASS	NS=363;DP=2215;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2169;AA=24;SR=1010|1159;SA=6|18;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	97371	.	G	A	99.0	PASS	NS=365;DP=2386;AC=16;AN=730;AF=0.021918;RA=2319;AA=54;SR=1350|969;SA=26|28;SB=0.48148;AB=0.48958;ABR=47;ABA=49;RUN=1;SNP;TS
+20	97394	.	A	G	99.0	PASS	NS=346;DP=2074;AC=185;AN=692;AF=0.26734;RA=1552;AA=509;SR=904|648;SA=280|229;SB=0.5501;AB=0.46933;ABR=176;ABA=199;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	97458	.	A	G	68.2	PASS	NS=365;DP=2315;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2304;AA=7;SR=1121|1183;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.45455;ABR=5;ABA=6;RUN=2;SNP;TS
+20	97465	.	G	C	2.86	PASS	NS=365;DP=2309;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2285;AA=9;SR=1111|1174;SA=1|8;SB=0.11111;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	97526	.	C	G	0.0531	PASS	NS=370;DP=2381;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2370;AA=2;SR=1223|1147;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	97564	.	T	G	0.0531	PASS	NS=369;DP=2445;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2425;AA=8;SR=1233|1192;SA=0|8;SB=0;AB=0.78571;ABR=11;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
+20	97804	.	G	C	12.2	PASS	NS=367;DP=2119;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2109;AA=4;SR=1004|1105;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.6;ABR=6;ABA=4;RUN=1;SNP;TV
+20	97915	.	A	T	0.991	PASS	NS=359;DP=1872;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1857;AA=5;SR=936|921;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	98008	.	T	C	99.0	PASS	NS=335;DP=1359;AC=19;AN=670;AF=0.028358;RA=1305;AA=48;SR=640|665;SA=24|24;SB=0.5;AB=0.48571;ABR=34;ABA=36;RUN=3;SNP;TS
+20	98061	.	G	T	0.0607	PASS	NS=331;DP=1432;AC=1;AN=662;AF=0.0015106;RA=1423;AA=5;SR=794|629;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.9;ABR=18;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	98439	.	T	C	99.0	PASS	NS=369;DP=2319;AC=29;AN=738;AF=0.039295;RA=2221;AA=84;SR=1227|994;SA=55|29;SB=0.65476;AB=0.56627;ABR=94;ABA=71;RUN=1;SNP;TS
+20	98447	.	T	G	99.0	PASS	NS=371;DP=2416;AC=29;AN=742;AF=0.039084;RA=2311;AA=89;SR=1239|1072;SA=49|40;SB=0.55056;AB=0.52941;ABR=81;ABA=72;RUN=2;SNP;TV
+20	98491	.	C	T	99.0	PASS	NS=370;DP=2385;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2364;AA=8;SR=1167|1197;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.55556;ABR=10;ABA=8;RUN=1;SNP;TS
+20	98688	.	T	C	99.0	PASS	NS=362;DP=2160;AC=28;AN=724;AF=0.038674;RA=2090;AA=64;SR=1092|998;SA=29|35;SB=0.45312;AB=0.54839;ABR=68;ABA=55;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	98741	.	C	T	99.0	PASS	NS=367;DP=2469;AC=26;AN=734;AF=0.035422;RA=2377;AA=81;SR=1083|1294;SA=40|41;SB=0.49383;AB=0.51538;ABR=67;ABA=63;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	98792	.	G	C	99.0	PASS	NS=371;DP=2401;AC=32;AN=742;AF=0.043127;RA=2291;AA=92;SR=1124|1167;SA=41|51;SB=0.44565;AB=0.52632;ABR=80;ABA=70;RUN=1;SNP;TV
+20	98796	.	G	T	0.637	PASS	NS=369;DP=2424;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2407;AA=13;SR=1185|1222;SA=10|3;SB=0.76923;AB=0.72727;ABR=8;ABA=3;RUN=4;SNP;TV
+20	98905	.	T	C	0.0446	PASS	NS=368;DP=2477;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2462;AA=9;SR=1319|1143;SA=3|6;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS
+20	98908	.	A	T	6.25	PASS	NS=370;DP=2483;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2471;AA=7;SR=1328|1143;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	98930	.	G	A	99.0	PASS	NS=370;DP=2431;AC=159;AN=740;AF=0.21486;RA=1920;AA=502;SR=1041|879;SA=269|233;SB=0.53586;AB=0.54773;ABR=350;ABA=287;RUN=1;SNP;TS
+20	98957	.	A	G	99.0	PASS	NS=370;DP=2423;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2404;AA=13;SR=1270|1134;SA=6|7;SB=0.46154;AB=0.41176;ABR=7;ABA=10;RUN=1;SNP;TS
+20	98991	.	T	C	4.43	PASS	NS=370;DP=2386;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2377;AA=3;SR=1217|1160;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	99132	.	G	T	0.374	PASS	NS=371;DP=2502;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2492;AA=6;SR=1292|1200;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	99200	.	C	G	47.2	PASS	NS=368;DP=2476;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2464;AA=5;SR=1140|1324;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TV
+20	99228	.	C	T	48.9	PASS	NS=368;DP=2404;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2382;AA=12;SR=1087|1295;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.5;ABR=9;ABA=9;RUN=4;SNP;TS
+20	99318	.	G	T	0.264	PASS	NS=368;DP=2147;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2135;AA=8;SR=914|1221;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	99500	.	C	A	99.0	PASS	NS=366;DP=2130;AC=35;AN=732;AF=0.047814;RA=2048;AA=75;SR=792|1256;SA=26|49;SB=0.34667;AB=0.512;ABR=64;ABA=60;RUN=1;SNP;TV
+20	99554	.	C	A	5.17	PASS	NS=365;DP=2104;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2095;AA=4;SR=846|1249;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	99563	.	T	C	0.153	PASS	NS=365;DP=2130;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2126;AA=3;SR=906|1220;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	99612	.	A	G	1.43	PASS	NS=370;DP=2190;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2185;AA=2;SR=1213|972;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	99627	.	G	T	1.72	PASS	NS=369;DP=2210;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2203;AA=6;SR=1239|964;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	99632	.	T	C	2.53	PASS	NS=369;DP=2206;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2197;AA=3;SR=1231|966;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	99653	.	C	A	0.0845	PASS	NS=366;DP=2296;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2287;AA=5;SR=1195|1092;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=4;SNP;TV
+20	99667	.	C	T	99.0	PASS	NS=367;DP=2225;AC=5;AN=734;AF=0.006812;RA=2197;AA=21;SR=1101|1096;SA=9|12;SB=0.42857;AB=0.54545;ABR=24;ABA=20;RUN=1;SNP;TS
+20	99704	.	T	C	0.0612	PASS	NS=370;DP=2145;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2141;AA=2;SR=997|1144;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	99734	.	C	T	0.0662	PASS	NS=366;DP=2113;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2101;AA=6;SR=956|1145;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	99801	.	G	A	99.0	PASS	NS=367;DP=1968;AC=88;AN=734;AF=0.11989;RA=1750;AA=214;SR=977|773;SA=103|111;SB=0.48131;AB=0.46021;ABR=133;ABA=154;RUN=1;SNP;TS
+20	99919	.	A	T	4.0	PASS	NS=359;DP=2099;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2092;AA=2;SR=1038|1054;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	100030	.	G	T	2.4	PASS	NS=361;DP=1980;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1969;AA=9;SR=986|983;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	100133	.	T	C	2.2	PASS	NS=359;DP=2041;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2033;AA=3;SR=936|1097;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	100134	.	A	G	72.1	PASS	NS=360;DP=2052;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2042;AA=5;SR=942|1100;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	100172	.	G	C	16.2	PASS	NS=356;DP=2127;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2120;AA=2;SR=996|1124;SA=2|0;SB=1;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	100184	.	A	G	68.0	PASS	NS=360;DP=2141;AC=3;AN=720;AF=0.0041667;RA=2125;AA=12;SR=1021|1104;SA=4|8;SB=0.33333;AB=0.58824;ABR=10;ABA=7;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	100190	.	A	T	99.0	PASS	NS=360;DP=2144;AC=20;AN=720;AF=0.027778;RA=2093;AA=43;SR=1027|1066;SA=23|20;SB=0.53488;AB=0.56044;ABR=51;ABA=40;RUN=1;SNP;TV
+20	100272	.	C	T	99.0	PASS	NS=352;DP=1860;AC=85;AN=704;AF=0.12074;RA=1684;AA=174;SR=855|829;SA=90|84;SB=0.51724;AB=0.48826;ABR=104;ABA=109;RUN=6;SNP;TS
+20	100275	.	C	G	27.0	PASS	NS=354;DP=1879;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1870;AA=5;SR=954|916;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
+20	100277	.	A	G	0.355	PASS	NS=351;DP=1863;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1857;AA=3;SR=938|919;SA=0|3;SB=0;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	100279	.	T	C	99.0	PASS	NS=349;DP=1846;AC=9;AN=698;AF=0.012894;RA=1829;AA=13;SR=926|903;SA=3|10;SB=0.23077;AB=0.52381;ABR=11;ABA=10;RUN=2;SNP;TS
+20	100308	.	A	G	5.47	PASS	NS=354;DP=1794;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1781;AA=3;SR=814|967;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	100339	.	C	A	99.0	PASS	NS=356;DP=1834;AC=18;AN=712;AF=0.025281;RA=1785;AA=45;SR=760|1025;SA=16|29;SB=0.35556;AB=0.50667;ABR=38;ABA=37;RUN=2;SNP;TV
+20	100495	.	G	A	99.0	PASS	NS=359;DP=2056;AC=85;AN=718;AF=0.11838;RA=1866;AA=181;SR=948|918;SA=93|88;SB=0.51381;AB=0.548;ABR=137;ABA=113;RUN=1;SNP;TS
+20	100505	.	T	C	99.0	PASS	NS=357;DP=2026;AC=83;AN=714;AF=0.11625;RA=1853;AA=167;SR=909|944;SA=83|84;SB=0.49701;AB=0.57025;ABR=138;ABA=104;RUN=1;SNP;TS
+20	100515	.	T	A	1.58	PASS	NS=357;DP=1978;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1971;AA=3;SR=933|1038;SA=0|3;SB=0;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=4;SNP;TV
+20	100537	.	C	A	8.5	PASS	NS=360;DP=1925;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1910;AA=6;SR=851|1059;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	100554	.	T	C	5.56	PASS	NS=361;DP=1910;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1902;AA=3;SR=827|1075;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	100564	.	T	C	0.454	PASS	NS=359;DP=1868;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1865;AA=2;SR=825|1040;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	100569	.	A	G	0.0539	PASS	NS=353;DP=1836;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1825;AA=3;SR=832|993;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	100592	.	T	C	6.17	PASS	NS=350;DP=1763;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1756;AA=3;SR=892|864;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	100645	.	C	T	99.0	PASS	NS=355;DP=1769;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=1753;AA=12;SR=929|824;SA=8|4;SB=0.66667;AB=0.42857;ABR=9;ABA=12;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	100678	.	C	T	99.0	PASS	NS=351;DP=1593;AC=77;AN=702;AF=0.10969;RA=1411;AA=177;SR=563|848;SA=177|0;SB=1;AB=0.69182;ABR=220;ABA=97;RUN=4;SNP;TS
+20	100699	.	C	T	99.0	PASS	NS=348;DP=1572;AC=178;AN=696;AF=0.25575;RA=1157;AA=387;SR=473|684;SA=178|209;SB=0.45995;AB=0.49265;ABR=201;ABA=204;RUN=2;SNP;TS
+20	100700	.	A	C	0.0548	PASS	NS=350;DP=1624;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1609;AA=7;SR=721|888;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=4;SNP;TV
+20	100764	.	C	T	20.8	PASS	NS=353;DP=1810;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1805;AA=3;SR=774|1031;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	100767	.	T	G	99.0	PASS	NS=355;DP=1827;AC=8;AN=710;AF=0.011268;RA=1795;AA=25;SR=765|1030;SA=6|19;SB=0.24;AB=0.45714;ABR=16;ABA=19;RUN=1;SNP;TV
+20	100816	.	A	G	1.13	PASS	NS=346;DP=1873;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1867;AA=2;SR=836|1031;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	100854	.	T	A	93.6	PASS	NS=346;DP=1891;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1877;AA=10;SR=914|963;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=4;ABA=8;RUN=2;SNP;TV
+20	100862	.	C	A	6.72	PASS	NS=347;DP=1913;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1902;AA=4;SR=956|946;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	100881	.	T	C	0.499	PASS	NS=353;DP=1949;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1943;AA=2;SR=1035|908;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	100904	.	T	C	4.63	PASS	NS=358;DP=1912;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1906;AA=2;SR=1075|831;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	101020	.	T	C	1.07	PASS	NS=357;DP=1819;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1807;AA=4;SR=962|845;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	101235	.	T	G	39.9	PASS	NS=365;DP=2094;AC=3;AN=730;AF=0.0041096;RA=2082;AA=8;SR=1042|1040;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.41667;ABR=5;ABA=7;RUN=2;SNP;TV
+20	101355	.	T	C	99.0	PASS	NS=362;DP=2122;AC=25;AN=724;AF=0.03453;RA=2066;AA=51;SR=947|1119;SA=17|34;SB=0.33333;AB=0.58036;ABR=65;ABA=47;RUN=1;SNP;TS
+20	101362	.	G	A	99.0	PASS	NS=362;DP=2073;AC=86;AN=724;AF=0.11878;RA=1825;AA=242;SR=817|1008;SA=107|135;SB=0.44215;AB=0.54505;ABR=242;ABA=202;RUN=3;SNP;TS
+20	101437	.	C	T	99.0	PASS	NS=364;DP=1982;AC=21;AN=728;AF=0.028846;RA=1917;AA=58;SR=1001|916;SA=24|34;SB=0.41379;AB=0.46667;ABR=42;ABA=48;RUN=1;SNP;TS
+20	101449	.	A	G	99.0	PASS	NS=362;DP=1984;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1971;AA=10;SR=1065|906;SA=5|5;SB=0.5;AB=0;ABR=0;ABA=10;RUN=1;SNP;TS
+20	101513	.	T	C	99.0	PASS	NS=364;DP=2010;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=1985;AA=11;SR=952|1033;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.47059;ABR=8;ABA=9;RUN=1;SNP;TS
+20	101515	.	G	A	25.8	PASS	NS=364;DP=1991;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1979;AA=5;SR=946|1033;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TS
+20	101521	.	A	T	3.47	PASS	NS=365;DP=1956;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1949;AA=3;SR=905|1044;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	101567	.	A	G	31.0	PASS	NS=359;DP=1818;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1808;AA=5;SR=875|933;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.375;ABR=3;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
+20	101590	.	C	A	0.0543	PASS	NS=355;DP=1773;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1756;AA=9;SR=848|908;SA=1|8;SB=0.11111;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	101905	.	G	C	99.0	PASS	NS=370;DP=2159;AC=13;AN=740;AF=0.017568;RA=2107;AA=46;SR=1075|1032;SA=30|16;SB=0.65217;AB=0.46988;ABR=39;ABA=44;RUN=1;SNP;TV
+20	101918	.	C	T	99.0	PASS	NS=368;DP=2159;AC=29;AN=736;AF=0.039402;RA=2069;AA=83;SR=1068|1001;SA=46|37;SB=0.55422;AB=0.59296;ABR=118;ABA=80;RUN=3;SNP;TS
+20	102181	.	T	C	99.0	PASS	NS=370;DP=2299;AC=310;AN=740;AF=0.41892;RA=1354;AA=940;SR=740|614;SA=508|432;SB=0.54043;AB=0.51446;ABR=427;ABA=401;RUN=2;SNP;TS
+20	102203	.	T	C	99.0	PASS	NS=369;DP=2327;AC=7;AN=738;AF=0.0094851;RA=2305;AA=15;SR=1223|1082;SA=11|4;SB=0.73333;AB=0.72727;ABR=24;ABA=9;RUN=2;SNP;TS
+20	102205	.	A	G	7.9	PASS	NS=368;DP=2331;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2314;AA=5;SR=1222|1092;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	102278	.	C	A	0.0803	PASS	NS=370;DP=2369;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2353;AA=11;SR=1241|1112;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TV
+20	102312	.	A	G	39.1	PASS	NS=369;DP=2482;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2466;AA=6;SR=1292|1174;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.63636;ABR=7;ABA=4;RUN=2;SNP;TS
+20	102387	.	C	A	0.0651	PASS	NS=372;DP=2764;AC=1;AN=744;AF=0.0013441;RA=2750;AA=8;SR=1316|1434;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	102441	.	T	C	99.0	PASS	NS=370;DP=2720;AC=18;AN=740;AF=0.024324;RA=2616;AA=92;SR=1328|1288;SA=36|56;SB=0.3913;AB=0.51075;ABR=95;ABA=91;RUN=1;SNP;TS
+20	102464	.	G	C	99.0	PASS	NS=368;DP=2753;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2720;AA=13;SR=1339|1381;SA=9|4;SB=0.69231;AB=0.56667;ABR=17;ABA=13;RUN=1;SNP;TV
+20	102485	.	A	G	0.539	PASS	NS=372;DP=2911;AC=1;AN=744;AF=0.0013441;RA=2902;AA=4;SR=1393|1509;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	102510	.	C	T	0.0965	PASS	NS=368;DP=2818;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2807;AA=3;SR=1294|1513;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	102511	.	G	A	0.0598	PASS	NS=369;DP=2815;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2803;AA=6;SR=1297|1506;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	102519	.	G	A	9.8	PASS	NS=369;DP=2741;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2734;AA=4;SR=1271|1463;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	102524	.	A	G	99.0	PASS	NS=370;DP=2710;AC=31;AN=740;AF=0.041892;RA=2605;AA=99;SR=1195|1410;SA=45|54;SB=0.45455;AB=0.54082;ABR=106;ABA=90;RUN=1;SNP;TS
+20	102631	.	G	A	2.6	PASS	NS=367;DP=2311;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2298;AA=4;SR=1160|1138;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	102760	.	A	G	0.319	PASS	NS=371;DP=2530;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2521;AA=5;SR=1100|1421;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	102799	.	G	A	99.0	PASS	NS=367;DP=2411;AC=188;AN=734;AF=0.25613;RA=1818;AA=585;SR=812|1006;SA=250|335;SB=0.42735;AB=0.49346;ABR=377;ABA=383;RUN=1;SNP;TS
+20	103002	.	G	A	59.3	PASS	NS=365;DP=2072;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2051;AA=6;SR=1068|983;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	103003	.	C	G	0.107	PASS	NS=365;DP=2089;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2079;AA=2;SR=1075|1004;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	103119	.	T	C	5.14	PASS	NS=362;DP=2079;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2070;AA=2;SR=950|1120;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	103308	.	A	T	99.0	PASS	NS=367;DP=1956;AC=21;AN=734;AF=0.02861;RA=1908;AA=46;SR=920|988;SA=23|23;SB=0.5;AB=0.56061;ABR=37;ABA=29;RUN=1;SNP;TV
+20	103351	.	C	A	99.0	PASS	NS=362;DP=2013;AC=23;AN=724;AF=0.031768;RA=1954;AA=58;SR=1062|892;SA=37|21;SB=0.63793;AB=0.49438;ABR=44;ABA=45;RUN=4;SNP;TV
+20	103487	.	A	G	99.0	PASS	NS=367;DP=2018;AC=26;AN=734;AF=0.035422;RA=1949;AA=62;SR=873|1076;SA=26|36;SB=0.41935;AB=0.52577;ABR=51;ABA=46;RUN=1;SNP;TS
+20	103517	.	A	T	99.0	PASS	NS=362;DP=1991;AC=307;AN=724;AF=0.42403;RA=1246;AA=741;SR=604|642;SA=340|401;SB=0.45884;AB=0.49821;ABR=278;ABA=279;RUN=1;SNP;TV
+20	103565	.	A	G	31.2	PASS	NS=360;DP=2009;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2002;AA=5;SR=1066|936;SA=3|2;SB=0.6;AB=0;ABR=0;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	103642	.	C	G	99.0	PASS	NS=361;DP=1999;AC=90;AN=722;AF=0.12465;RA=1791;AA=200;SR=906|885;SA=106|94;SB=0.53;AB=0.50545;ABR=139;ABA=134;RUN=1;SNP;TV
+20	103645	.	T	C	3.37	PASS	NS=362;DP=1984;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1980;AA=3;SR=1009|971;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	103659	.	T	G	0.587	PASS	NS=355;DP=1968;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1961;AA=6;SR=994|967;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	103694	.	C	T	9.34	PASS	NS=360;DP=2012;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2005;AA=2;SR=1039|966;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	103722	.	T	C	3.92	PASS	NS=365;DP=2168;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2161;AA=4;SR=1157|1004;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	103762	.	G	A	5.05	PASS	NS=367;DP=2133;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2122;AA=2;SR=1144|978;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	103813	.	G	A	99.0	PASS	NS=362;DP=1974;AC=23;AN=724;AF=0.031768;RA=1909;AA=59;SR=1009|900;SA=35|24;SB=0.59322;AB=0.58779;ABR=77;ABA=54;RUN=1;SNP;TS
+20	103826	.	T	C	1.89	PASS	NS=360;DP=1939;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1930;AA=2;SR=993|937;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	104114	.	G	C	99.0	PASS	NS=361;DP=2017;AC=4;AN=722;AF=0.0055402;RA=2002;AA=12;SR=921|1081;SA=3|9;SB=0.25;AB=0.5;ABR=11;ABA=11;RUN=1;SNP;TV
+20	104292	.	A	G	0.304	PASS	NS=360;DP=2180;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2177;AA=2;SR=1102|1075;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	104330	.	A	T	0.0694	PASS	NS=366;DP=2128;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2121;AA=3;SR=1033|1088;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	104367	.	T	G	0.273	PASS	NS=366;DP=2220;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2206;AA=8;SR=1142|1064;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	104402	.	T	G	0.435	PASS	NS=362;DP=2078;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2064;AA=10;SR=1163|901;SA=1|9;SB=0.1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	104520	.	A	G	99.0	PASS	NS=366;DP=2249;AC=90;AN=732;AF=0.12295;RA=1999;AA=247;SR=942|1057;SA=126|121;SB=0.51012;AB=0.52493;ABR=200;ABA=181;RUN=2;SNP;TS
+20	104532	.	C	T	9.69	PASS	NS=370;DP=2249;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2239;AA=3;SR=1069|1170;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	104534	.	T	C	99.0	PASS	NS=371;DP=2257;AC=27;AN=742;AF=0.036388;RA=2156;AA=93;SR=1027|1129;SA=49|44;SB=0.52688;AB=0.51852;ABR=84;ABA=78;RUN=1;SNP;TS
+20	104604	.	T	C	99.0	PASS	NS=364;DP=2148;AC=30;AN=728;AF=0.041209;RA=2078;AA=61;SR=1065|1013;SA=29|32;SB=0.47541;AB=0.52632;ABR=50;ABA=42;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	104610	.	C	A	0.102	PASS	NS=365;DP=2131;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2113;AA=14;SR=1080|1033;SA=4|10;SB=0.28571;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	104716	.	C	A	0.52	PASS	NS=368;DP=2299;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2289;AA=7;SR=1070|1219;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	104808	.	G	T	13.4	PASS	NS=361;DP=2053;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2046;AA=3;SR=998|1048;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	104899	.	C	T	99.0	PASS	NS=358;DP=1718;AC=155;AN=716;AF=0.21648;RA=1331;AA=378;SR=675|656;SA=191|187;SB=0.50529;AB=0.49703;ABR=251;ABA=251;RUN=2;SNP;TS
+20	104902	.	T	A	0.0554	PASS	NS=358;DP=1715;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1704;AA=4;SR=864|840;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	104959	.	G	C	4.15	PASS	NS=355;DP=1738;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1728;AA=3;SR=833|895;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
+20	105111	.	T	A	0.299	PASS	NS=353;DP=2057;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2048;AA=2;SR=1090|958;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	105131	.	T	C	0.314	PASS	NS=354;DP=1957;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1953;AA=2;SR=1047|906;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	105239	.	A	C	7.74	PASS	NS=353;DP=1694;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1682;AA=6;SR=893|789;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
+20	105359	.	G	T	85.9	PASS	NS=343;DP=1740;AC=3;AN=686;AF=0.0043732;RA=1730;AA=7;SR=780|950;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.5;ABR=7;ABA=7;RUN=1;SNP;TV
+20	105407	.	T	C	6.06	PASS	NS=347;DP=1867;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1860;AA=2;SR=843|1017;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	105450	.	A	G	1.12	PASS	NS=353;DP=1846;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1842;AA=2;SR=803|1039;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	105477	.	A	G	0.259	PASS	NS=350;DP=1929;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1925;AA=2;SR=871|1054;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	105540	.	A	G	2.1	PASS	NS=348;DP=1862;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1855;AA=4;SR=957|898;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	105930	.	G	T	11.5	PASS	NS=362;DP=2051;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2038;AA=2;SR=1081|957;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	106063	.	T	C	0.044	PASS	NS=362;DP=2061;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2041;AA=5;SR=905|1136;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	106098	.	A	G	99.0	PASS	NS=362;DP=1933;AC=14;AN=724;AF=0.019337;RA=1875;AA=55;SR=915|960;SA=20|35;SB=0.36364;AB=0.43023;ABR=37;ABA=49;RUN=1;SNP;TS
+20	106169	.	A	C	5.1	PASS	NS=363;DP=1990;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1985;AA=4;SR=1081|904;SA=4|0;SB=1;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	106204	.	A	G	14.8	PASS	NS=367;DP=1984;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=1967;AA=6;SR=965|1002;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	106371	.	C	A	27.8	PASS	NS=357;DP=1931;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1919;AA=9;SR=1070|849;SA=4|5;SB=0.44444;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=5;SNP;TV
+20	106411	.	C	A	99.0	PASS	NS=353;DP=1798;AC=6;AN=706;AF=0.0084986;RA=1782;AA=15;SR=908|874;SA=8|7;SB=0.53333;AB=0.5;ABR=13;ABA=13;RUN=3;SNP;TV
+20	106550	.	T	C	0.176	PASS	NS=348;DP=1664;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1657;AA=3;SR=738|919;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	106604	.	T	C	0.162	PASS	NS=359;DP=1894;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1887;AA=3;SR=817|1070;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	106609	.	A	G	22.0	PASS	NS=360;DP=1886;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1872;AA=5;SR=801|1071;SA=3|2;SB=0.6;AB=0;ABR=0;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	106613	.	A	G	99.0	PASS	NS=363;DP=1933;AC=17;AN=726;AF=0.023416;RA=1878;AA=52;SR=795|1083;SA=23|29;SB=0.44231;AB=0.45833;ABR=44;ABA=52;RUN=1;SNP;TS
+20	106635	.	G	A	99.0	PASS	NS=364;DP=1892;AC=261;AN=728;AF=0.35852;RA=1263;AA=626;SR=506|757;SA=246|380;SB=0.39297;AB=0.48309;ABR=300;ABA=321;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	107011	.	A	G	33.8	PASS	NS=303;DP=833;AC=1;AN=606;AF=0.0016502;RA=827;AA=4;SR=348|479;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	107071	.	G	A	0.0548	PASS	NS=297;DP=963;AC=1;AN=594;AF=0.0016835;RA=954;AA=4;SR=622|332;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	107118	.	C	T	0.0477	PASS	NS=310;DP=1008;AC=3;AN=620;AF=0.0048387;RA=1002;AA=3;SR=698|304;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0;ABR=0;ABA=1;RUN=1;SNP;TS
+20	107120	.	T	G	11.1	PASS	NS=306;DP=986;AC=1;AN=612;AF=0.001634;RA=974;AA=7;SR=677|297;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	107152	.	A	G	38.9	PASS	NS=307;DP=943;AC=5;AN=614;AF=0.0081433;RA=930;AA=9;SR=548|382;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=3;SNP;TS;CpG
+20	107160	.	C	G	99.0	PASS	NS=312;DP=969;AC=4;AN=624;AF=0.0064103;RA=951;AA=12;SR=546|405;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.4;ABR=6;ABA=9;RUN=2;SNP;TV
+20	107201	.	G	A	99.0	PASS	NS=317;DP=936;AC=24;AN=634;AF=0.037855;RA=883;AA=51;SR=486|397;SA=36|15;SB=0.70588;AB=0.40278;ABR=29;ABA=43;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	107273	.	C	A	0.855	PASS	NS=298;DP=985;AC=1;AN=596;AF=0.0016779;RA=978;AA=3;SR=689|289;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	107457	.	T	C	99.0	PASS	NS=350;DP=1623;AC=91;AN=700;AF=0.13;RA=1430;AA=185;SR=730|700;SA=101|84;SB=0.54595;AB=0.52964;ABR=134;ABA=117;RUN=1;SNP;TS
+20	107563	.	T	G	1.01	PASS	NS=353;DP=1642;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1604;AA=29;SR=596|1008;SA=25|4;SB=0.86207;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	107613	.	T	G	99.0	PASS	NS=350;DP=1383;AC=68;AN=700;AF=0.097143;RA=1287;AA=95;SR=532|755;SA=36|59;SB=0.37895;AB=0.58621;ABR=68;ABA=48;RUN=1;SNP;TV
+20	107682	.	T	C	1.66	PASS	NS=328;DP=1188;AC=1;AN=656;AF=0.0015244;RA=1174;AA=7;SR=513|661;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	107739	.	C	T	19.1	PASS	NS=309;DP=939;AC=1;AN=618;AF=0.0016181;RA=931;AA=4;SR=333|598;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	107955	.	C	T	0.385	PASS	NS=353;DP=1950;AC=2;AN=706;AF=0.0028329;RA=1935;AA=7;SR=1127|808;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TS
+20	107972	.	T	C	8.26	PASS	NS=356;DP=1989;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1981;AA=3;SR=1113|868;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	107980	.	T	C	3.5	PASS	NS=353;DP=2021;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2005;AA=6;SR=1111|894;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	107995	.	A	G	0.878	PASS	NS=353;DP=2018;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2007;AA=2;SR=1100|907;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	108012	.	A	C	0.159	PASS	NS=352;DP=1969;AC=1;AN=704;AF=0.0014205;RA=1957;AA=8;SR=1101|856;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	108015	.	T	C	6.58	PASS	NS=353;DP=1948;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1941;AA=3;SR=1097|844;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	108017	.	C	T	0.235	PASS	NS=355;DP=1935;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1924;AA=4;SR=1088|836;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=5;SNP;TS
+20	108135	.	G	A	0.105	PASS	NS=359;DP=1667;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1654;AA=4;SR=1019|635;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	108187	.	A	G	99.0	PASS	NS=357;DP=1712;AC=83;AN=714;AF=0.11625;RA=1508;AA=195;SR=874|634;SA=103|92;SB=0.52821;AB=0.54895;ABR=157;ABA=128;RUN=1;SNP;TS
+20	108192	.	G	A	99.0	PASS	NS=359;DP=1741;AC=3;AN=718;AF=0.0041783;RA=1721;AA=14;SR=975|746;SA=7|7;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=6;ABA=12;RUN=4;SNP;TS
+20	108286	.	T	G	99.0	PASS	NS=360;DP=1849;AC=159;AN=720;AF=0.22083;RA=1402;AA=404;SR=743|659;SA=205|199;SB=0.50743;AB=0.46593;ABR=253;ABA=274;RUN=1;SNP;TV
+20	108328	.	A	C	99.0	PASS	NS=362;DP=2007;AC=628;AN=724;AF=0.8674;RA=315;AA=1690;SR=139|176;SA=829|861;SB=0.49053;AB=0.52174;ABR=204;ABA=187;RUN=1;SNP;TV
+20	108333	.	G	A	3.94	PASS	NS=360;DP=2056;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2044;AA=5;SR=980|1064;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	108642	.	T	C	0.532	PASS	NS=216;DP=749;AC=1;AN=432;AF=0.0023148;RA=741;AA=3;SR=201|540;SA=0|3;SB=0;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	108711	.	A	C	99.0	PASS	NS=227;DP=741;AC=10;AN=454;AF=0.022026;RA=723;AA=15;SR=265|458;SA=7|8;SB=0.46667;AB=0.51724;ABR=15;ABA=14;RUN=1;SNP;TV
+20	108793	.	C	G	68.9	PASS	NS=193;DP=364;AC=8;AN=386;AF=0.020725;RA=352;AA=10;SR=228|124;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.57895;ABR=11;ABA=8;RUN=1;SNP;TV
+20	108889	.	G	C	99.0	PASS	NS=353;DP=1305;AC=22;AN=706;AF=0.031161;RA=1259;AA=38;SR=644|615;SA=22|16;SB=0.57895;AB=0.5;ABR=21;ABA=21;RUN=2;SNP;TV
+20	108949	.	T	G	99.0	PASS	NS=329;DP=1082;AC=61;AN=658;AF=0.092705;RA=988;AA=92;SR=653|335;SA=70|22;SB=0.76087;AB=0.53;ABR=53;ABA=47;RUN=1;SNP;TV
+20	108958	.	A	C	99.0	PASS	NS=324;DP=1013;AC=125;AN=648;AF=0.1929;RA=809;AA=201;SR=551|258;SA=141|60;SB=0.70149;AB=0.5503;ABR=93;ABA=75;RUN=2;SNP;TV
+20	109043	.	G	T	13.5	PASS	NS=342;DP=1318;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1299;AA=4;SR=862|437;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	109213	.	A	C	37.3	PASS	NS=366;DP=1810;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1803;AA=4;SR=998|805;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.2;ABR=1;ABA=4;RUN=1;SNP;TV
+20	109258	.	T	C	3.83	PASS	NS=370;DP=2046;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2039;AA=3;SR=1134|905;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	109272	.	C	G	99.0	PASS	NS=367;DP=2020;AC=90;AN=734;AF=0.12262;RA=1774;AA=241;SR=983|791;SA=127|114;SB=0.52697;AB=0.50142;ABR=177;ABA=175;RUN=2;SNP;TV
+20	109273	.	T	A	7.99	PASS	NS=367;DP=2018;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2012;AA=2;SR=1110|902;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	109288	.	G	C	99.0	PASS	NS=364;DP=1921;AC=90;AN=728;AF=0.12363;RA=1686;AA=221;SR=898|788;SA=120|101;SB=0.54299;AB=0.51133;ABR=158;ABA=148;RUN=1;SNP;TV
+20	109358	.	T	C	0.707	PASS	NS=358;DP=2101;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=2093;AA=5;SR=1099|994;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	109377	.	A	C	99.0	PASS	NS=361;DP=2239;AC=21;AN=722;AF=0.029086;RA=2161;AA=75;SR=1073|1088;SA=46|29;SB=0.61333;AB=0.49635;ABR=68;ABA=68;RUN=2;SNP;TV
+20	109385	.	A	G	1.51	PASS	NS=363;DP=2269;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2254;AA=8;SR=1091|1163;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	109422	.	T	A	99.0	PASS	NS=366;DP=2242;AC=24;AN=732;AF=0.032787;RA=2159;AA=76;SR=1039|1120;SA=30|46;SB=0.39474;AB=0.48387;ABR=60;ABA=64;RUN=1;SNP;TV
+20	109440	.	T	C	0.386	PASS	NS=362;DP=2222;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2218;AA=3;SR=1057|1161;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	109575	.	A	G	0.588	PASS	NS=364;DP=2020;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2008;AA=4;SR=931|1077;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	109582	.	T	G	23.2	PASS	NS=362;DP=1967;AC=3;AN=724;AF=0.0041436;RA=1957;AA=6;SR=907|1050;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.58333;ABR=7;ABA=5;RUN=1;SNP;TV
+20	109707	.	G	A	0.971	PASS	NS=323;DP=1467;AC=1;AN=646;AF=0.001548;RA=1455;AA=3;SR=669|786;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	109725	.	T	C	0.908	PASS	NS=336;DP=1492;AC=1;AN=672;AF=0.0014881;RA=1479;AA=7;SR=670|809;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	109736	.	T	C	0.074	PASS	NS=342;DP=1489;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1478;AA=5;SR=680|798;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	109783	.	T	C	99.0	PASS	NS=342;DP=1544;AC=26;AN=684;AF=0.038012;RA=1472;AA=66;SR=641|831;SA=28|38;SB=0.42424;AB=0.46364;ABR=51;ABA=57;RUN=2;SNP;TS
+20	109889	.	T	C	0.545	PASS	NS=365;DP=2083;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2077;AA=4;SR=1096|981;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	109901	.	A	G	99.0	PASS	NS=364;DP=2112;AC=28;AN=728;AF=0.038462;RA=2028;AA=78;SR=1064|964;SA=39|39;SB=0.5;AB=0.46479;ABR=66;ABA=74;RUN=1;SNP;TS
+20	109933	.	G	A	0.166	PASS	NS=357;DP=1915;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1908;AA=3;SR=1017|891;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	109947	.	T	A	4.68	PASS	NS=352;DP=1833;AC=2;AN=704;AF=0.0028409;RA=1822;AA=4;SR=950|872;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=2;SNP;TV
+20	109997	.	C	T	0.0475	PASS	NS=346;DP=1655;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1639;AA=11;SR=790|849;SA=10|1;SB=0.90909;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=8;SNP;TS
+20	110058	.	G	C	99.0	PASS	NS=338;DP=1651;AC=146;AN=676;AF=0.21598;RA=1306;AA=340;SR=717|589;SA=189|151;SB=0.55588;AB=0.4978;ABR=226;ABA=226;RUN=1;SNP;TV
+20	110082	.	A	G	99.0	PASS	NS=337;DP=1696;AC=5;AN=674;AF=0.0074184;RA=1677;AA=14;SR=1008|669;SA=5|9;SB=0.35714;AB=0.47826;ABR=11;ABA=12;RUN=1;SNP;TS
+20	110098	.	A	G	99.0	PASS	NS=347;DP=1831;AC=242;AN=694;AF=0.3487;RA=1250;AA=577;SR=767|483;SA=353|224;SB=0.61179;AB=0.51826;ABR=298;ABA=277;RUN=3;SNP;TS
+20	110124	.	T	C	0.105	PASS	NS=365;DP=2096;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2091;AA=3;SR=1273|818;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	110234	.	G	A	0.759	PASS	NS=350;DP=1744;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1727;AA=4;SR=739|988;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	110315	.	T	C	0.0966	PASS	NS=337;DP=1589;AC=1;AN=674;AF=0.0014837;RA=1583;AA=3;SR=729|854;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	110366	.	C	A	99.0	PASS	NS=340;DP=1634;AC=7;AN=680;AF=0.010294;RA=1602;AA=28;SR=724|878;SA=18|10;SB=0.64286;AB=0.39474;ABR=15;ABA=23;RUN=3;SNP;TV
+20	110404	.	G	A	26.7	PASS	NS=351;DP=1839;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1826;AA=5;SR=727|1099;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	110417	.	G	A	7.25	PASS	NS=363;DP=1934;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1923;AA=4;SR=782|1141;SA=0|4;SB=0;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	110427	.	A	G	0.108	PASS	NS=364;DP=2009;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2000;AA=3;SR=826|1174;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	110442	.	C	A	9.88	PASS	NS=367;DP=2074;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2060;AA=5;SR=845|1215;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	110520	.	A	G	8.32	PASS	NS=351;DP=1771;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1759;AA=3;SR=809|950;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	110536	.	T	C	55.6	PASS	NS=359;DP=1709;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1697;AA=6;SR=784|913;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	110564	.	T	C	1.51	PASS	NS=360;DP=1650;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1637;AA=5;SR=750|887;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	110702	.	C	T	99.0	PASS	NS=244;DP=491;AC=104;AN=488;AF=0.21311;RA=368;AA=102;SR=39|329;SA=6|96;SB=0.058824;AB=0.50617;ABR=41;ABA=38;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	110773	.	G	A	0.095	PASS	NS=223;DP=443;AC=18;AN=446;AF=0.040359;RA=425;AA=14;SR=61|364;SA=3|11;SB=0.21429;AB=0.57895;ABR=11;ABA=7;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	110875	.	C	T	99.0	PASS	NS=165;DP=461;AC=14;AN=330;AF=0.042424;RA=439;AA=21;SR=7|432;SA=0|21;SB=0;AB=0.52941;ABR=18;ABA=16;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	110970	.	G	A	99.0	PASS	NS=88;DP=160;AC=37;AN=176;AF=0.21023;RA=125;AA=32;SR=6|119;SA=0|32;SB=0;AB=0.54545;ABR=12;ABA=9;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	110976	.	G	A	67.8	PASS	NS=80;DP=137;AC=6;AN=160;AF=0.0375;RA=127;AA=8;SR=4|123;SA=0|8;SB=0;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	110979	.	A	G	99.0	PASS	NS=41;DP=61;AC=39;AN=82;AF=0.47561;RA=29;AA=30;SR=4|25;SA=0|30;SB=0;AB=0.375;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	111531	.	G	A	0.0614	PASS	NS=6;DP=8;AC=4;AN=12;AF=0.33333;RA=3;AA=4;SR=0|3;SA=0|4;SB=0;AB=0;ABR=0;ABA=0;RUN=7;SNP;TS
+20	116405	.	G	A	49.6	PASS	NS=55;DP=69;AC=26;AN=110;AF=0.23636;RA=52;AA=16;SR=49|3;SA=16|0;SB=1;AB=0;ABR=0;ABA=0;RUN=2;SNP;TS
+20	116545	.	G	A	95.2	PASS	NS=65;DP=84;AC=19;AN=130;AF=0.14615;RA=70;AA=13;SR=67|3;SA=13|0;SB=1;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	116652	.	A	T	0.615	PASS	NS=305;DP=848;AC=1;AN=610;AF=0.0016393;RA=842;AA=3;SR=602|240;SA=3|0;SB=1;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	116787	.	A	G	99.0	PASS	NS=293;DP=885;AC=195;AN=586;AF=0.33276;RA=619;AA=263;SR=450|169;SA=196|67;SB=0.74525;AB=0.52709;ABR=107;ABA=95;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	116986	.	G	T	0.068	PASS	NS=200;DP=396;AC=1;AN=400;AF=0.0025;RA=385;AA=4;SR=239|146;SA=0|4;SB=0;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
+20	117254	.	T	C	99.0	PASS	NS=360;DP=1886;AC=3;AN=720;AF=0.0041667;RA=1869;AA=10;SR=1183|686;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.6087;ABR=14;ABA=9;RUN=1;SNP;TS
+20	117290	.	T	G	99.0	PASS	NS=358;DP=1981;AC=49;AN=716;AF=0.068436;RA=1888;AA=79;SR=1178|710;SA=41|38;SB=0.51899;AB=0.7807;ABR=267;ABA=74;RUN=2;SNP;TV
+20	117305	.	T	C	3.02	PASS	NS=359;DP=2077;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2064;AA=3;SR=1224|840;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	117312	.	G	A	0.499	PASS	NS=364;DP=2121;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=2108;AA=8;SR=1235|873;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.7619;ABR=16;ABA=5;RUN=2;SNP;TS
+20	117329	.	T	C	6.59	PASS	NS=361;DP=2185;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2178;AA=2;SR=1178|1000;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	117475	.	T	C	1.49	PASS	NS=367;DP=2292;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2284;AA=4;SR=1049|1235;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	117575	.	A	G	0.598	PASS	NS=358;DP=2097;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=2089;AA=3;SR=957|1132;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TS;CpG
+20	117618	.	T	G	0.0451	PASS	NS=366;DP=2178;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2162;AA=10;SR=1020|1142;SA=8|2;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	117683	.	G	C	0.218	PASS	NS=359;DP=2011;AC=2;AN=718;AF=0.0027855;RA=1997;AA=5;SR=926|1071;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
+20	117685	.	T	A	0.339	PASS	NS=360;DP=2018;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2009;AA=2;SR=939|1070;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	117719	.	T	C	99.0	PASS	NS=363;DP=2041;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2030;AA=8;SR=948|1082;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.36364;ABR=4;ABA=7;RUN=2;SNP;TS
+20	117742	.	T	A	0.194	PASS	NS=361;DP=1998;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1990;AA=4;SR=956|1034;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
+20	117749	.	C	G	8.36	PASS	NS=360;DP=1983;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1974;AA=4;SR=956|1018;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	117769	.	A	G	3.93	PASS	NS=358;DP=1977;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1968;AA=4;SR=942|1026;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	117770	.	C	T	1.74	PASS	NS=359;DP=1977;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1969;AA=2;SR=938|1031;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	117892	.	C	T	99.0	PASS	NS=363;DP=2099;AC=4;AN=726;AF=0.0055096;RA=2082;AA=14;SR=1169|913;SA=6|8;SB=0.42857;AB=0.56667;ABR=17;ABA=13;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	117925	.	G	C	3.85	PASS	NS=367;DP=2130;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2121;AA=2;SR=1246|875;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	117968	.	G	A	69.7	PASS	NS=362;DP=2113;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2094;AA=9;SR=1143|951;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=3;ABA=6;RUN=2;SNP;TS
+20	117971	.	T	C	0.191	PASS	NS=361;DP=2106;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2096;AA=4;SR=1139|957;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	118008	.	G	A	99.0	PASS	NS=369;DP=2249;AC=98;AN=738;AF=0.13279;RA=1978;AA=264;SR=1025|953;SA=161|103;SB=0.60985;AB=0.51459;ABR=194;ABA=183;RUN=1;SNP;TS
+20	118034	.	A	G	43.1	PASS	NS=368;DP=2280;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2262;AA=8;SR=1177|1085;SA=2|6;SB=0.25;AB=0.63636;ABR=7;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	118087	.	A	G	99.0	PASS	NS=366;DP=2284;AC=95;AN=732;AF=0.12978;RA=1966;AA=308;SR=1170|796;SA=194|114;SB=0.62987;AB=0.51454;ABR=230;ABA=214;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	118150	.	A	G	99.0	PASS	NS=366;DP=2270;AC=96;AN=732;AF=0.13115;RA=1946;AA=312;SR=1208|738;SA=191|121;SB=0.61218;AB=0.50302;ABR=250;ABA=246;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	118166	.	C	T	75.1	PASS	NS=369;DP=2290;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2268;AA=8;SR=1313|955;SA=2|6;SB=0.25;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
+20	118169	.	T	C	0.287	PASS	NS=369;DP=2281;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2254;AA=14;SR=1275|979;SA=9|5;SB=0.64286;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	118222	.	A	G	99.0	PASS	NS=367;DP=2462;AC=20;AN=734;AF=0.027248;RA=2368;AA=84;SR=1080|1288;SA=41|43;SB=0.4881;AB=0.47134;ABR=74;ABA=82;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	118249	.	C	A	2.99	PASS	NS=369;DP=2568;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2555;AA=6;SR=1170|1385;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	118252	.	T	C	41.3	PASS	NS=369;DP=2588;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2562;AA=10;SR=1173|1389;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	118410	.	T	C	99.0	PASS	NS=366;DP=2417;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=2365;AA=26;SR=1156|1209;SA=17|9;SB=0.65385;AB=0.52174;ABR=12;ABA=11;RUN=1;SNP;TS
+20	118477	.	G	C	40.1	PASS	NS=368;DP=2524;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2501;AA=9;SR=1136|1365;SA=4|5;SB=0.44444;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TV
+20	118525	.	T	A	0.143	PASS	NS=369;DP=2559;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2528;AA=5;SR=1373|1155;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	118535	.	G	A	99.0	PASS	NS=370;DP=2547;AC=25;AN=740;AF=0.033784;RA=2432;AA=98;SR=1401|1031;SA=47|51;SB=0.47959;AB=0.51872;ABR=97;ABA=89;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	118618	.	C	T	1.78	PASS	NS=367;DP=2563;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2546;AA=3;SR=1375|1171;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	118657	.	C	T	0.168	PASS	NS=368;DP=2612;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2602;AA=3;SR=1428|1174;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	118780	.	T	C	0.605	PASS	NS=368;DP=2715;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2696;AA=6;SR=1421|1275;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	118803	.	C	T	2.66	PASS	NS=370;DP=2742;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2728;AA=4;SR=1422|1306;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	118878	.	C	A	4.89	PASS	NS=371;DP=2432;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2419;AA=6;SR=1178|1241;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	118954	.	G	A	0.29	PASS	NS=357;DP=2361;AC=3;AN=714;AF=0.0042017;RA=2337;AA=8;SR=1048|1289;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=2;SNP;TS
+20	118963	.	C	T	0.62	PASS	NS=359;DP=2420;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2411;AA=4;SR=1067|1344;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	118973	.	G	C	1.48	PASS	NS=365;DP=2459;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2422;AA=13;SR=1098|1324;SA=7|6;SB=0.53846;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TV
+20	119005	.	A	C	0.0651	PASS	NS=368;DP=2535;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2503;AA=21;SR=1147|1356;SA=19|2;SB=0.90476;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	119035	.	G	C	1.82	PASS	NS=366;DP=2461;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2443;AA=8;SR=1160|1283;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	119056	.	A	C	99.0	PASS	NS=368;DP=2408;AC=22;AN=736;AF=0.029891;RA=2343;AA=61;SR=1089|1254;SA=30|31;SB=0.4918;AB=0.57895;ABR=77;ABA=55;RUN=4;SNP;TV
+20	119085	.	G	T	11.6	PASS	NS=369;DP=2362;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2353;AA=3;SR=1098|1255;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	119295	.	C	T	5.3	PASS	NS=370;DP=2159;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2150;AA=7;SR=909|1241;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	119420	.	A	G	2.58	PASS	NS=365;DP=2001;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1996;AA=3;SR=955|1041;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	119421	.	A	G	72.7	PASS	NS=366;DP=2005;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=1990;AA=10;SR=951|1039;SA=5|5;SB=0.5;AB=0.52941;ABR=9;ABA=8;RUN=1;SNP;TS
+20	119496	.	C	A	0.46	PASS	NS=355;DP=1848;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1840;AA=5;SR=837|1003;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=5;SNP;TV
+20	119518	.	C	T	0.149	PASS	NS=356;DP=1941;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1932;AA=2;SR=900|1032;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	119534	.	A	G	99.0	PASS	NS=360;DP=2109;AC=39;AN=720;AF=0.054167;RA=1989;AA=114;SR=879|1110;SA=47|67;SB=0.41228;AB=0.47396;ABR=91;ABA=101;RUN=3;SNP;TS
+20	119596	.	A	G	99.0	PASS	NS=366;DP=2103;AC=39;AN=732;AF=0.053279;RA=2004;AA=97;SR=874|1130;SA=41|56;SB=0.42268;AB=0.54706;ABR=93;ABA=76;RUN=1;SNP;TS
+20	119599	.	A	T	4.27	PASS	NS=365;DP=2081;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2067;AA=5;SR=906|1161;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	119714	.	G	A	0.547	PASS	NS=314;DP=1079;AC=1;AN=628;AF=0.0015924;RA=1068;AA=6;SR=496|572;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	119730	.	A	G	99.0	PASS	NS=308;DP=1035;AC=49;AN=616;AF=0.079545;RA=956;AA=69;SR=376|580;SA=24|45;SB=0.34783;AB=0.52427;ABR=54;ABA=48;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	119734	.	T	C	4.93	PASS	NS=310;DP=1053;AC=1;AN=620;AF=0.0016129;RA=1034;AA=10;SR=379|655;SA=2|8;SB=0.2;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=3;SNP;TS
+20	119897	.	T	C	0.0526	PASS	NS=263;DP=770;AC=1;AN=526;AF=0.0019011;RA=760;AA=7;SR=349|411;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	119918	.	A	G	44.3	PASS	NS=294;DP=924;AC=3;AN=588;AF=0.005102;RA=911;AA=11;SR=340|571;SA=2|9;SB=0.18182;AB=0.52632;ABR=10;ABA=9;RUN=1;SNP;TS
+20	119945	.	T	C	0.0906	PASS	NS=335;DP=1320;AC=1;AN=670;AF=0.0014925;RA=1312;AA=3;SR=458|854;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	119983	.	T	C	18.0	PASS	NS=351;DP=1675;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1664;AA=4;SR=800|864;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	119986	.	T	A	99.0	PASS	NS=348;DP=1647;AC=34;AN=696;AF=0.048851;RA=1580;AA=64;SR=781|799;SA=29|35;SB=0.45312;AB=0.55046;ABR=60;ABA=49;RUN=3;SNP;TV
+20	119992	.	A	T	0.112	PASS	NS=348;DP=1643;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1632;AA=3;SR=839|793;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	120093	.	T	C	99.0	PASS	NS=336;DP=1402;AC=35;AN=672;AF=0.052083;RA=1335;AA=61;SR=744|591;SA=39|22;SB=0.63934;AB=0.53153;ABR=59;ABA=52;RUN=1;SNP;TS
+20	120127	.	T	C	99.0	PASS	NS=345;DP=1541;AC=39;AN=690;AF=0.056522;RA=1447;AA=87;SR=872|575;SA=51|36;SB=0.58621;AB=0.47436;ABR=74;ABA=82;RUN=1;SNP;TS
+20	120210	.	G	C	99.0	PASS	NS=366;DP=2009;AC=16;AN=732;AF=0.021858;RA=1951;AA=51;SR=1192|759;SA=31|20;SB=0.60784;AB=0.44595;ABR=33;ABA=40;RUN=1;SNP;TV
+20	120234	.	C	A	99.0	PASS	NS=363;DP=1980;AC=21;AN=726;AF=0.028926;RA=1914;AA=62;SR=1162|752;SA=31|31;SB=0.5;AB=0.53982;ABR=61;ABA=52;RUN=6;SNP;TV
+20	120289	.	T	C	1.51	PASS	NS=359;DP=2131;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2120;AA=4;SR=1226|894;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	120327	.	A	G	99.0	PASS	NS=365;DP=2183;AC=3;AN=730;AF=0.0041096;RA=2172;AA=9;SR=1158|1014;SA=4|5;SB=0.44444;AB=0.52941;ABR=9;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	120353	.	T	C	99.0	PASS	NS=361;DP=2069;AC=15;AN=722;AF=0.020776;RA=2029;AA=35;SR=1056|973;SA=16|19;SB=0.45714;AB=0.34043;ABR=16;ABA=31;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	120463	.	T	C	0.168	PASS	NS=357;DP=2200;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2187;AA=4;SR=1102|1085;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	120464	.	T	C	0.96	PASS	NS=357;DP=2188;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2158;AA=17;SR=1089|1069;SA=3|14;SB=0.17647;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	120471	.	A	G	99.0	PASS	NS=355;DP=2155;AC=292;AN=710;AF=0.41127;RA=1332;AA=818;SR=667|665;SA=419|399;SB=0.51222;AB=0.50122;ABR=411;ABA=408;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	120487	.	A	G	0.161	PASS	NS=361;DP=2223;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2217;AA=2;SR=1044|1173;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	120491	.	G	A	2.04	PASS	NS=361;DP=2213;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2201;AA=3;SR=1022|1179;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=4;SNP;TS
+20	120534	.	T	A	2.45	PASS	NS=366;DP=2334;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2317;AA=6;SR=1093|1224;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	120535	.	G	A	3.2	PASS	NS=366;DP=2332;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2321;AA=5;SR=1104|1217;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	120553	.	G	A	99.0	PASS	NS=363;DP=2295;AC=38;AN=726;AF=0.052342;RA=2196;AA=93;SR=1087|1109;SA=46|47;SB=0.49462;AB=0.5509;ABR=92;ABA=75;RUN=1;SNP;TS
+20	120746	.	A	G	0.107	PASS	NS=356;DP=2078;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2073;AA=3;SR=1040|1033;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	120761	.	A	G	4.72	PASS	NS=360;DP=2025;AC=2;AN=720;AF=0.0027778;RA=2013;AA=7;SR=1011|1002;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.72727;ABR=8;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	120863	.	T	C	7.31	PASS	NS=356;DP=2117;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2108;AA=2;SR=1114|994;SA=1|1;SB=0.5;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	120911	.	T	C	4.66	PASS	NS=364;DP=2171;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2152;AA=3;SR=1110|1042;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	121040	.	C	T	0.0497	PASS	NS=351;DP=2064;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=2047;AA=3;SR=1039|1008;SA=3|0;SB=1;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TS
+20	121125	.	A	G	2.32	PASS	NS=362;DP=2128;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2124;AA=3;SR=1089|1035;SA=3|0;SB=1;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	121188	.	G	A	99.0	PASS	NS=363;DP=1947;AC=35;AN=726;AF=0.048209;RA=1842;AA=103;SR=897|945;SA=51|52;SB=0.49515;AB=0.4069;ABR=59;ABA=86;RUN=2;SNP;TS
+20	121235	.	C	T	0.234	PASS	NS=360;DP=1946;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1935;AA=3;SR=820|1115;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	121288	.	G	A	43.3	PASS	NS=364;DP=2030;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2021;AA=5;SR=756|1265;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	121310	.	A	C	99.0	PASS	NS=358;DP=1910;AC=195;AN=716;AF=0.27235;RA=1431;AA=477;SR=602|829;SA=212|265;SB=0.44444;AB=0.52581;ABR=326;ABA=294;RUN=1;SNP;TV
+20	121478	.	C	A	99.0	PASS	NS=332;DP=1073;AC=248;AN=664;AF=0.37349;RA=685;AA=338;SR=373|312;SA=200|138;SB=0.59172;AB=0.49371;ABR=157;ABA=143;RUN=1;SNP;TV
+20	121493	.	C	T	99.0	PASS	NS=304;DP=848;AC=120;AN=608;AF=0.19737;RA=641;AA=202;SR=285|356;SA=94|108;SB=0.46535;AB=0.59302;ABR=204;ABA=137;RUN=18;SNP;TS
+20	121543	.	C	T	73.2	PASS	NS=355;DP=1309;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=1270;AA=6;SR=571|699;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=3;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
+20	121609	.	G	C	99.0	PASS	NS=362;DP=1963;AC=22;AN=724;AF=0.030387;RA=1886;AA=71;SR=987|899;SA=41|30;SB=0.57746;AB=0.496;ABR=62;ABA=63;RUN=1;SNP;TV
+20	121682	.	C	A	2.49	PASS	NS=361;DP=1952;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1941;AA=6;SR=1070|871;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	121727	.	T	C	0.137	PASS	NS=365;DP=2073;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2064;AA=4;SR=1229|835;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	121761	.	G	A	0.814	PASS	NS=363;DP=1992;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1983;AA=4;SR=1067|916;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	121787	.	A	G	5.77	PASS	NS=368;DP=1959;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=1946;AA=6;SR=952|994;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	121824	.	C	T	99.0	PASS	NS=366;DP=1902;AC=299;AN=732;AF=0.40847;RA=1098;AA=764;SR=470|628;SA=353|411;SB=0.46204;AB=0.48175;ABR=330;ABA=346;RUN=1;SNP;TS
+20	121975	.	C	T	0.0658	PASS	NS=368;DP=2209;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2200;AA=2;SR=1147|1053;SA=2|0;SB=1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	121976	.	G	A	99.0	PASS	NS=368;DP=2174;AC=320;AN=736;AF=0.43478;RA=1282;AA=888;SR=680|602;SA=467|421;SB=0.5259;AB=0.50249;ABR=404;ABA=399;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	121986	.	A	G	29.8	PASS	NS=366;DP=2153;AC=4;AN=732;AF=0.0054645;RA=2143;AA=7;SR=1159|984;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.69565;ABR=16;ABA=7;RUN=1;SNP;TS
+20	122072	.	T	C	0.195	PASS	NS=369;DP=2181;AC=4;AN=738;AF=0.0054201;RA=2151;AA=13;SR=1122|1029;SA=13|0;SB=1;AB=0.76;ABR=19;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
+20	122202	.	C	T	2.54	PASS	NS=365;DP=2275;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2262;AA=3;SR=1021|1241;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	122214	.	A	T	0.559	PASS	NS=368;DP=2327;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2321;AA=5;SR=1038|1283;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	122337	.	A	G	13.1	PASS	NS=370;DP=2216;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2208;AA=4;SR=1130|1078;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	122411	.	C	T	1.75	PASS	NS=366;DP=2162;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2155;AA=3;SR=1002|1153;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	122505	.	T	G	99.0	PASS	NS=358;DP=2049;AC=24;AN=716;AF=0.03352;RA=1985;AA=61;SR=948|1037;SA=23|38;SB=0.37705;AB=0.48936;ABR=46;ABA=48;RUN=1;SNP;TV
+20	122508	.	G	A	99.0	PASS	NS=358;DP=2024;AC=118;AN=716;AF=0.1648;RA=1718;AA=301;SR=831|887;SA=133|168;SB=0.44186;AB=0.51299;ABR=237;ABA=224;RUN=4;SNP;TS
+20	122511	.	T	C	99.0	PASS	NS=363;DP=2032;AC=20;AN=726;AF=0.027548;RA=1967;AA=59;SR=932|1035;SA=27|32;SB=0.45763;AB=0.39706;ABR=27;ABA=41;RUN=2;SNP;TS
+20	122548	.	C	T	99.0	PASS	NS=356;DP=1990;AC=37;AN=712;AF=0.051966;RA=1899;AA=86;SR=950|949;SA=49|37;SB=0.56977;AB=0.51471;ABR=70;ABA=66;RUN=6;SNP;TS
+20	122637	.	G	T	0.0819	PASS	NS=365;DP=2023;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2003;AA=14;SR=955|1048;SA=6|8;SB=0.42857;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=2;SNP;TV
+20	122706	.	G	A	13.0	PASS	NS=362;DP=2089;AC=3;AN=724;AF=0.0041436;RA=2063;AA=10;SR=944|1119;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.4375;ABR=7;ABA=9;RUN=5;SNP;TS
+20	122770	.	T	C	0.0898	PASS	NS=359;DP=2007;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2001;AA=3;SR=951|1050;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	122897	.	C	G	63.7	PASS	NS=367;DP=2167;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2145;AA=11;SR=1277|868;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.45455;ABR=5;ABA=6;RUN=2;SNP;TV
+20	122913	.	G	C	33.5	PASS	NS=368;DP=2131;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2115;AA=7;SR=1201|914;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
+20	122977	.	T	A	0.153	PASS	NS=368;DP=2071;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2056;AA=6;SR=1062|994;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=10;ABA=4;RUN=4;SNP;TV
+20	122995	.	C	G	0.222	PASS	NS=368;DP=2170;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2158;AA=3;SR=1124|1034;SA=3|0;SB=1;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	123021	.	C	T	0.0437	PASS	NS=368;DP=2290;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2281;AA=4;SR=1221|1060;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=3;SNP;TS
+20	123037	.	T	C	99.0	PASS	NS=367;DP=2305;AC=4;AN=734;AF=0.0054496;RA=2285;AA=13;SR=1267|1018;SA=10|3;SB=0.76923;AB=0.63333;ABR=19;ABA=11;RUN=2;SNP;TS
+20	123073	.	C	T	0.404	PASS	NS=371;DP=2357;AC=2;AN=742;AF=0.0026954;RA=2341;AA=7;SR=1293|1048;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	123251	.	T	C	71.0	PASS	NS=363;DP=2413;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2393;AA=10;SR=1226|1167;SA=7|3;SB=0.7;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
+20	123318	.	T	C	99.0	PASS	NS=367;DP=2371;AC=24;AN=734;AF=0.032698;RA=2289;AA=73;SR=1174|1115;SA=41|32;SB=0.56164;AB=0.5;ABR=56;ABA=56;RUN=1;SNP;TS
+20	123404	.	T	A	6.08	PASS	NS=365;DP=2328;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2304;AA=6;SR=1114|1190;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	123499	.	C	T	99.0	PASS	NS=367;DP=2330;AC=5;AN=734;AF=0.006812;RA=2298;AA=18;SR=1062|1236;SA=6|12;SB=0.33333;AB=0.38462;ABR=10;ABA=16;RUN=2;SNP;TS
+20	123500	.	A	G	0.191	PASS	NS=367;DP=2342;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2317;AA=13;SR=1062|1255;SA=3|10;SB=0.23077;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TS;CpG
+20	123513	.	A	G	1.47	PASS	NS=368;DP=2373;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2358;AA=5;SR=1071|1287;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
+20	123556	.	C	G	7.19	PASS	NS=371;DP=2383;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2370;AA=6;SR=1058|1312;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	123564	.	T	C	0.229	PASS	NS=372;DP=2373;AC=1;AN=744;AF=0.0013441;RA=2348;AA=10;SR=1045|1303;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.72727;ABR=8;ABA=2;RUN=5;SNP;TS
+20	123809	.	A	T	0.953	PASS	NS=356;DP=1910;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1896;AA=7;SR=843|1053;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=2;SNP;TV
+20	123979	.	C	A	0.314	PASS	NS=363;DP=2152;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2141;AA=3;SR=1118|1023;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	124059	.	C	T	37.8	PASS	NS=358;DP=1984;AC=3;AN=716;AF=0.0041899;RA=1971;AA=7;SR=971|1000;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	124060	.	G	A	34.6	PASS	NS=359;DP=1991;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1983;AA=3;SR=995|988;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=2;SNP;TS;CpG
+20	124137	.	C	A	0.0701	PASS	NS=357;DP=1933;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1922;AA=4;SR=990|932;SA=0|4;SB=0;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=2;SNP;TV
+20	124148	.	A	G	0.344	PASS	NS=358;DP=1957;AC=2;AN=716;AF=0.0027933;RA=1947;AA=6;SR=989|958;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.8;ABR=12;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	124229	.	T	C	0.672	PASS	NS=356;DP=1979;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1972;AA=4;SR=1025|947;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	124230	.	A	G	0.0816	PASS	NS=356;DP=1970;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1959;AA=4;SR=1026|933;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	124249	.	A	G	99.0	PASS	NS=359;DP=1969;AC=41;AN=718;AF=0.057103;RA=1864;AA=101;SR=974|890;SA=55|46;SB=0.54455;AB=0.51977;ABR=92;ABA=85;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	124302	.	A	C	99.0	PASS	NS=358;DP=2007;AC=319;AN=716;AF=0.44553;RA=1185;AA=819;SR=577|608;SA=392|427;SB=0.47863;AB=0.51934;ABR=376;ABA=348;RUN=2;SNP;TV
+20	124335	.	C	T	99.0	PASS	NS=361;DP=2035;AC=4;AN=722;AF=0.0055402;RA=2013;AA=15;SR=929|1084;SA=10|5;SB=0.66667;AB=0.3913;ABR=9;ABA=14;RUN=1;SNP;TS
+20	124412	.	C	T	99.0	PASS	NS=357;DP=2005;AC=307;AN=714;AF=0.42997;RA=1207;AA=795;SR=602|605;SA=400|395;SB=0.50314;AB=0.51286;ABR=379;ABA=360;RUN=1;SNP;TS
+20	124511	.	T	A	0.647	PASS	NS=365;DP=2141;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2133;AA=4;SR=1077|1056;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
+20	124607	.	A	G	2.28	PASS	NS=357;DP=1872;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1865;AA=2;SR=930|935;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	124737	.	A	C	99.0	PASS	NS=367;DP=2024;AC=4;AN=734;AF=0.0054496;RA=2003;AA=16;SR=1046|957;SA=11|5;SB=0.6875;AB=0.26316;ABR=5;ABA=14;RUN=1;SNP;TV
+20	124827	.	T	C	1.7	PASS	NS=367;DP=2059;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2048;AA=4;SR=987|1061;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	124848	.	A	G	36.5	PASS	NS=364;DP=2077;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2060;AA=6;SR=966|1094;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
+20	124878	.	G	A	0.22	PASS	NS=361;DP=2060;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2049;AA=4;SR=974|1075;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	124920	.	A	G	76.0	PASS	NS=361;DP=1956;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1949;AA=6;SR=984|965;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS;CpG
+20	124942	.	A	T	1.44	PASS	NS=362;DP=2015;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2007;AA=4;SR=1107|900;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	124998	.	T	C	99.0	PASS	NS=366;DP=2204;AC=29;AN=732;AF=0.039617;RA=2131;AA=66;SR=1132|999;SA=36|30;SB=0.54545;AB=0.54902;ABR=56;ABA=46;RUN=1;SNP;TS
+20	125096	.	C	G	4.18	PASS	NS=363;DP=2095;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2082;AA=2;SR=1071|1011;SA=2|0;SB=1;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	125109	.	A	T	0.0858	PASS	NS=365;DP=2091;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2080;AA=7;SR=1103|977;SA=7|0;SB=1;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=8;SNP;TV
+20	125121	.	C	T	99.0	PASS	NS=364;DP=2075;AC=208;AN=728;AF=0.28571;RA=1472;AA=599;SR=826|646;SA=335|264;SB=0.55927;AB=0.49868;ABR=377;ABA=378;RUN=1;SNP;TS
+20	125179	.	C	A	99.0	PASS	NS=368;DP=2155;AC=7;AN=736;AF=0.0095109;RA=2127;AA=26;SR=1123|1004;SA=16|10;SB=0.61538;AB=0.36842;ABR=14;ABA=24;RUN=2;SNP;TV
+20	125266	.	T	A	3.47	PASS	NS=364;DP=2138;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2123;AA=5;SR=907|1216;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
+20	125381	.	A	G	4.69	PASS	NS=362;DP=2102;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2094;AA=3;SR=919|1175;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
+20	125450	.	G	A	0.364	PASS	NS=359;DP=1881;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1868;AA=5;SR=862|1006;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
+20	125470	.	A	G	0.602	PASS	NS=360;DP=1870;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1855;AA=5;SR=909|946;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS