comparison test-data/scaffold.fa @ 0:a2e034f1638e draft

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author drosofff
date Sun, 21 Jun 2015 14:40:10 -0400
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13 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGTTTGCTCA
14 TTTCTTGAGGATACTTTACCAGGTATGGTCGAGCACGTTACGCTCGTAGCACAAAATACA
15 TCCGCGTCAGCCAAGGTGTTATCTGACGAGTTGATCAAATCAATGCTTTGCATTGTTTTG
16 ATTTGCTTGTTGATTGAAACCAAGTTCTATAAGACCGCTTTCGCGGTACTTATAGTGGTT
17 GCTCTACGTGTTTTCGGGTACAGTGAGCAAATAATTGAGACAGCTATGGACATGTATCGC
18 GTAATTAGGGCTCCAAAGGCTCAAGGTAATATGGAAGATGTCGTTTTCCATCCGTGGTTG
19 AACACGTGTGGAAAGTTGATTTTCCTACTTATCGCTGTCCTGTGTCTCAAGAAATTACCA
20 GGAAAGAACGACGTAGACACTTTCATGCGCAGGCTCGACAGCTTACCCAAAGCTGTTAAG
21 GGTGCGACACAACTACATGAATGGGTGTCAAAATACTTCGATCTCTCTTTGGATCACGTC
22 AAGGCGATGATTGTTGGTAAATCTTGTGCCGAAATGAAGAAGGCTGAATCATCAAGCGCC
23 AAAGTTTTGGCTTGGGCCGCTAGAGTTCAAGATTTCGTCAGATTGGAACAACGAAGTAAA
24 ATCGATAGTGATATCGCTGTCGCCAACGAGGCTGAAGCCTTGTATCACACTGGATTGCAA
25 TTTGCAGGAGACACTCTGTTACCTCCAGAATTGCACAAGGTCGTGAACAGTGCGCTAAGA
26 CCAGCCCGCGATATATATGAGTACGTCACCCGCTCCCCAATAAAAGGAGGGAGTCGTAAG
27 ATGAGACCCTTGATGATTTGGCTAGCTGGCCAGTCAGGAATTGGGAAAACCTCTATGGTG
28 GATCCTCTATGTATCGATTTGCTTCGAGCAATGGGTTATGTGGGACCTGAACATCTCCAC
29 TCGTTGGTGTATGGCCGCCAAGTTGAGACGGAGTACTGGGATGGTTACAAAGCCCACAAG
30 ATAGTGATCTATGATGATGCTTTTCAGCTGAAAGATGATGCTGTGAACAGGAATTTGGAG
31 GTATTTGAGGTTATACGTTCTTGCAACACGTATCCTCAACACCTTCATATGGCTTGTCTC
32 TCGGATAAAAACACTTTTTCAGTAGCGGAAGTGTACATCTACACTACCAACGAAATGAAT
33 GTCAAACTTGAGTCGCTGACTCATGAACAAGCATTCTACAACCGCATGAGTGAAAACGCG
34 TTCACTGTGCGTCCAAAAGAGGCTTATCGTCTAGTCGAAGAAGGATCAACCGGCAATAAG
35 CAGTATCGTTTGGACAAAACGAAAACCAAAGGAGCTATCGATCTCGATGTGTACGAATTC
36 GTGCGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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62 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCACAGCTCAGATGAGT
63 TTTGAGGCACCGAAGGACGCAATTGAAGGACCGTGTCAAACCCCGGAAGGATTGTTCGCC
64 CCTATTGGCAAAGCGCCGATAGGCGTAGGGATGTCCACCAAGACGGCTATACGACCTTCA
65 CGCTTGTATGGAAGAATAACTAAACCGACAACTGCACCATCATACTTGGGTAAAGACGCG
66 CTTTATCGTGGATTGACCAAGTGTGGTGTTCGCACAGTTAATATTCAACCAGAATACATA
67 GACGCAGCGGCGAATGACGTCGCACGCTATGTGTTAAACCAGCATGTTGGTCACGTGGAT
68 AGGGAACGATACACACGTATATTGTCGTACGAGGAGGCTGTTAAGGGCGTGCCGTACGAT
69 GATTTCATGAAGTCAGTGACTCGAGTCACTTCCCCTGGTTACCCCTATTGCTTGGATACT
70 GGAAACATGCCAGGGAAAAGCAAATGGATGGGGCTCGAACAAGATTTCGATATGACAAGT
71 CCAGCTGCTTTGGCTTTGAGGAAAGATGTTGAAAGTTTGTTGGAAGATTGCAAAAATGGC
72 TTAGTCCGTGATGTGGTGTTTGTCGACACTCTCAAGGATGAAAGGCGCGAGCTGATAAAG
73 GTGGAAGCAAAGAAGACTCGAGTCTTTTCTGCTGGACCACAGCATTTTGTAATAGCTTTC
74 CGGCAATACTTTCTTCCATTCTCTGCCTGGGTCATGCATAACAGAATCGAAAACGAAGTA
75 GCCGTTGGAACAAACCCCTTCTCAATGGATTGGCACAACATTGCTGTGCGTATGCGTAGT
76 AAAGGGAGACACATTATTGCTGGAGATTTTAGCAATTTTGATGGATCCCTCAACGCCCAA
77 GTTCTCTGGACAATATTTTGGAAGATATTTGTCCCGTGGCTTAATGATATTGAACCACTT
78 GGTACACCCAAGAATGAGGAGAATCTGCGGGTCTGCACGAGTCTATGGACGCACTTGGTG
79 CACTCCGTGCACATTTGTGGAGATAACTTGTACATGTGGACACATTCTCAACCATCGGGC
80 AATCCCTTCACGGTGATAATCAATAGTTTGTATAACTCAGTTATCATGCGTGTCGTGTGG
81 CAATACATAATGGCGAAAGAAGAACCTAAGTTACGCACAATGAACCATTTCAATCAACAT
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83 ATCTTCAACCAACTTACCATCTCGGAAGCCATGCGTTGGATAGGACACGAATACACAGAT
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