diff test-data/outFull_test03.tabular @ 1:2744d20c830a draft default tip

" master branch Updating with tag :CI_COMMIT_TAG - - Fxx"
author fgiacomoni
date Fri, 27 Nov 2020 11:21:58 +0000
parents de13e2c45971
children
line wrap: on
line diff
--- a/test-data/outFull_test03.tabular	Tue Jan 21 15:49:00 2020 -0500
+++ b/test-data/outFull_test03.tabular	Fri Nov 27 11:21:58 2020 +0000
@@ -1,10 +1,10 @@
 name	namecustom	mz	mzmin	mzmax	rt	rtmin	rtmax	npeaks	sample	blanc	NbPool	X.Pool0	X.PoolNon0	Mean_blanc	Mean_Other	fold_Other_VS_blanc	norm.b1	norm.b2	norm.b3	norm.b4	CV.samp	CV.pool	CV.ind	sample_mean	sample_sd	sample_CV	pool_mean	pool_sd	pool_CV	poolCV_over_sampleCV	_MESURED_MONOISOTOPIC_MASS_	_PPM_ERROR_	_COMPUTED_MONOISOTOPIC_MASS_	_ANNOTATION_NAME_	_ANNOTATION_TYPE_	_ANNOTATION_IN_NEG_MODE_	_ANNOTATION_IN_POS_MODE_	_ANNOTATION_FORMULA_
-M45T38	M44.9981T0.63	44.9981010714674	44.9976804761414	44.9984569216727	0.634833333333333	0.308666666666667	0.668483333333333	494	450	4	0	0	100	372.125	106302.726872247	285.664029216652	0	0	0	0	0.387595943667356	0.0582029852286417	1	106302.726872247	41202.5057364617	0.387595943667356	106302.726872247	6187.1360419097	0.0582029852286417	0.150164072095122	44.9981010714674	2.27787390043874	44.9982036	"Formic acid"	unknown	[M-H]-	NA	NA
-M45T427	M44.9981T7.12	44.9981024029652	44.9978232239459	44.9985756743207	7.11828333333333	6.87948333333333	7.25576666666667	433	421	1	0	0	100	39.5	5330.86343612335	134.958568003123	1	1	1	1	0.486770821402075	0.0755019920383209	1	5067.71589705261	2466.81622984065	0.486770821402075	5307.8799418585	400.755509110564	0.0755019920383209	0.15510788387202	44.9981024029652	2.24898372588555	44.9982036	"Formic acid"	unknown	[M-H]-	NA	NA
-M45T909	M44.9981T15.14	44.998112256197	44.9974528882205	44.9984883944837	15.1422833333333	14.6795666666667	15.45055	449	425	0	0	0	100	0	5702.70484581498	Inf	1	1	1	1	0.53981872056282	0.0676576374883456	1	5685.11872119033	3068.9335143207	0.53981872056282	5691.48339870913	385.072320560799	0.0676576374883456	0.125333996230818	44.998112256197	2.02897400406895	44.9982036	"Formic acid"	unknown	[M-H]-	NA	NA
+M45T38	M44.9981T0.63	44.9981010714674	44.9976804761414	44.9984569216727	0.634833333333333	0.308666666666667	0.668483333333333	494	450	4	0	0	100	372.125	106302.726872247	285.664029216652	0	0	0	0	0.387595943667356	0.0582029852286417	1	106302.726872247	41202.5057364617	0.387595943667356	106302.726872247	6187.1360419097	0.0582029852286417	0.150164072095122	44.9981010714674	2.3	44.9982036	"Formic acid"	unknown	[M-H]-	NA	NA
+M45T427	M44.9981T7.12	44.9981024029652	44.9978232239459	44.9985756743207	7.11828333333333	6.87948333333333	7.25576666666667	433	421	1	0	0	100	39.5	5330.86343612335	134.958568003123	1	1	1	1	0.486770821402075	0.0755019920383209	1	5067.71589705261	2466.81622984065	0.486770821402075	5307.8799418585	400.755509110564	0.0755019920383209	0.15510788387202	44.9981024029652	2.2	44.9982036	"Formic acid"	unknown	[M-H]-	NA	NA
+M45T909	M44.9981T15.14	44.998112256197	44.9974528882205	44.9984883944837	15.1422833333333	14.6795666666667	15.45055	449	425	0	0	0	100	0	5702.70484581498	Inf	1	1	1	1	0.53981872056282	0.0676576374883456	1	5685.11872119033	3068.9335143207	0.53981872056282	5691.48339870913	385.072320560799	0.0676576374883456	0.125333996230818	44.998112256197	2.0	44.9982036	"Formic acid"	unknown	[M-H]-	NA	NA
 M57T59	M57.0345T0.98	57.034452592233	57.0341895154699	57.0349020897492	0.97715	0.891466666666667	1.0799	356	353	0	2	4	96	0	11698.3942731278	Inf	1	0	0	0	0.870673331712721	0.280007916504815	1	12816.0067554922	11158.5553010572	0.870673331712721	11623.434773665	3254.65375360354	0.280007916504815	0.321599279897554	57.034452592233	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
-M59T39	M59.0137T0.65	59.0137157156687	59.0135105287772	59.0139254556355	0.651733333333333	0.582795008635214	0.702561675301881	405	404	0	0	0	100	0	104954.370044053	Inf	1	1	1	1	0.682371665277953	0.0561292163222426	1	113379.85923403	77367.2033545047	0.682371665277953	104631.322662158	5872.87414378662	0.0561292163222426	0.0822560771180019	59.0137157156687	2.33674491307088	59.0138536	"Acetic Acid"	Solvent	[M-H]-	NA	NA
-M59T47	M59.0137T0.79	59.0137129234658	59.0134415820214	59.0139307039268	0.787416666666667	0.737789375508069	0.805966666666667	404	404	0	1	2	98	0	86687.6563876652	Inf	1	1	0	0	0.699295472836914	0.203036202545209	1	94711.9005025219	66231.6032451938	0.699295472836914	86638.2036142797	17590.691857182	0.203036202545209	0.290343939624732	59.0137129234658	2.38419162309737	59.0138536	"Acetic Acid"	Solvent	[M-H]-	NA	NA
+M59T39	M59.0137T0.65	59.0137157156687	59.0135105287772	59.0139254556355	0.651733333333333	0.582795008635214	0.702561675301881	405	404	0	0	0	100	0	104954.370044053	Inf	1	1	1	1	0.682371665277953	0.0561292163222426	1	113379.85923403	77367.2033545047	0.682371665277953	104631.322662158	5872.87414378662	0.0561292163222426	0.0822560771180019	59.0137157156687	2.3	59.0138536	"Acetic Acid"	Solvent	[M-H]-	NA	NA
+M59T47	M59.0137T0.79	59.0137129234658	59.0134415820214	59.0139307039268	0.787416666666667	0.737789375508069	0.805966666666667	404	404	0	1	2	98	0	86687.6563876652	Inf	1	1	0	0	0.699295472836914	0.203036202545209	1	94711.9005025219	66231.6032451938	0.699295472836914	86638.2036142797	17590.691857182	0.203036202545209	0.290343939624732	59.0137129234658	2.4	59.0138536	"Acetic Acid"	Solvent	[M-H]-	NA	NA
 M62T62	M61.9882T1.03	61.9882231262141	61.9879375365369	61.9886153953783	1.02705	0.771633333333333	1.24938333333333	572	391	0	0	0	100	0	5964.59471365639	Inf	1	1	1	0	0.772869775235845	0.114595417144577	1	5731.41979586296	4429.64112941088	0.772869775235845	5952.9251522387	682.17794105124	0.114595417144577	0.148272607904233	61.9882231262141	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M71T38	M71.0137T0.64	71.0137007829942	71.0134767633343	71.0139365242841	0.635183333333333	0.565695008635214	0.702561675301881	389	388	0	0	0	100	0	144096.834801762	Inf	1	0	1	1	0.73936154758788	0.0415654336080057	1	135114.575760127	99898.5218356878	0.73936154758788	144256.931636383	5996.1019144267	0.0415654336080057	0.056218008285135	71.0137007829942	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M71T47	M71.0137T0.79	71.0136946160437	71.0134130011465	71.0138774244458	0.787325	0.737789375508069	0.8048	402	402	0	0	0	100	0	123655.279735683	Inf	1	1	1	1	0.614164506961179	0.104164502024361	1	135047.510129742	82941.3874751677	0.614164506961179	123151.266583372	12827.9903573262	0.104164502024361	0.16960358477854	71.0136946160437	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
@@ -13,10 +13,10 @@
 M74T38	M74.0246T0.63	74.0246025925501	74.0242920142509	74.0248185799775	0.633733333333333	0.548578341968547	0.668833333333333	285	284	0	3	6	94	0	6891.77753303965	Inf	0	0	0	0	1.57395772623963	0.298649782864237	1	6891.77753303965	10847.3664956525	1.57395772623963	6891.77753303965	2058.22786379092	0.298649782864237	0.189744475271102	74.0246025925501	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M75T40	M75.0086T0.67	75.0086106690331	75.0083544778621	75.008825042016	0.667366666666667	0.582795008635214	0.805983333333333	444	441	0	0	0	100	0	576383.577092511	Inf	0	1	0	0	0.730355780018836	0.0740754805598535	1	603608.187257069	440848.728429893	0.730355780018836	576072.10325935	42672.8178860619	0.0740754805598535	0.101423830120086	75.0086106690331	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M79T51	M78.9187T0.86	78.9187053591132	78.9183587905889	78.9189906456692	0.857283333333333	0.703283333333333	0.942933333333333	441	408	0	0	0	100	0	3257.0704845815	Inf	1	0	1	0	0.702762773040126	0.0782779674946176	1	3331.91859964959	2341.54835463372	0.702762773040126	3246.8984923715	254.160614644179	0.0782779674946176	0.111386047322897	78.9187053591132	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
-M79T44	M78.9589T0.74	78.9589162539509	78.958658059076	78.9592059649114	0.736333333333333	0.532558933231565	0.874333333333333	511	453	0	0	0	100	0	873586.887665198	Inf	0	0	0	0	0.415729927628134	0.0886754236366915	1	873586.887665198	363176.21358594	0.415729927628134	873586.887665198	77465.6873471703	0.0886754236366915	0.213300553420851	78.9589162539509	1.77687342552627	78.9590566	"Phosphoric acid"	unknown	[M-H3O]-	NA	NA
-M80T817	M79.9573T13.62	79.9572959941509	79.9565981559525	79.9575533991381	13.6200333333333	13.17385	13.7905166666667	475	449	0	0	0	100	0	14622.1101321586	Inf	1	1	0	0	0.685650554652289	0.054266799917554	1	15095.4756991319	10350.22128585	0.685650554652289	14627.5464051183	793.790134051292	0.054266799917554	0.0791464391727562	79.9572959941509	0.870464654095999	79.9573656	"Sulphuric acid"	unknown	[M-H2O]-	NA	NA
-M80T78	M79.9572T1.3	79.9572310694573	79.9569850046981	79.9574617009428	1.30048333333333	1.11356666666667	1.47308333333333	547	450	0	0	0	100	0	31620.9140969163	Inf	1	0	0	0	0.425702882921209	0.079479518961422	1	31081.9971266684	13231.6957837715	0.425702882921209	31612.6716158092	2512.55993310992	0.079479518961422	0.186701857445801	79.9572310694573	1.68214929658035	79.9573656	"Sulphuric acid"	unknown	[M-H2O]-	NA	NA
-M80T908	M79.9573T15.14	79.9572880455522	79.9564866802331	79.9575985885683	15.1415416666667	14.9874833333333	15.34665	422	414	0	0	0	100	0	34555.3898678414	Inf	1	0	1	0	0.794718073643283	0.0313134038483537	1	34111.6137676144	27109.1159822622	0.794718073643283	34517.571674313	1080.86266170226	0.0313134038483537	0.0394019022428941	79.9572880455522	0.970518159092524	79.9573656	"Sulphuric acid"	unknown	[M-H2O]-	NA	NA
+M79T44	M78.9589T0.74	78.9589162539509	78.958658059076	78.9592059649114	0.736333333333333	0.532558933231565	0.874333333333333	511	453	0	0	0	100	0	873586.887665198	Inf	0	0	0	0	0.415729927628134	0.0886754236366915	1	873586.887665198	363176.21358594	0.415729927628134	873586.887665198	77465.6873471703	0.0886754236366915	0.213300553420851	78.9589162539509	1.8	78.9590566	"Phosphoric acid"	unknown	[M-H3O]-	NA	NA
+M80T817	M79.9573T13.62	79.9572959941509	79.9565981559525	79.9575533991381	13.6200333333333	13.17385	13.7905166666667	475	449	0	0	0	100	0	14622.1101321586	Inf	1	1	0	0	0.685650554652289	0.054266799917554	1	15095.4756991319	10350.22128585	0.685650554652289	14627.5464051183	793.790134051292	0.054266799917554	0.0791464391727562	79.9572959941509	0.9	79.9573656	"Sulphuric acid"	unknown	[M-H2O]-	NA	NA
+M80T78	M79.9572T1.3	79.9572310694573	79.9569850046981	79.9574617009428	1.30048333333333	1.11356666666667	1.47308333333333	547	450	0	0	0	100	0	31620.9140969163	Inf	1	0	0	0	0.425702882921209	0.079479518961422	1	31081.9971266684	13231.6957837715	0.425702882921209	31612.6716158092	2512.55993310992	0.079479518961422	0.186701857445801	79.9572310694573	1.7	79.9573656	"Sulphuric acid"	unknown	[M-H2O]-	NA	NA
+M80T908	M79.9573T15.14	79.9572880455522	79.9564866802331	79.9575985885683	15.1415416666667	14.9874833333333	15.34665	422	414	0	0	0	100	0	34555.3898678414	Inf	1	0	1	0	0.794718073643283	0.0313134038483537	1	34111.6137676144	27109.1159822622	0.794718073643283	34517.571674313	1080.86266170226	0.0313134038483537	0.0394019022428941	79.9572880455522	1.0	79.9573656	"Sulphuric acid"	unknown	[M-H2O]-	NA	NA
 M81T51	M80.9167T0.86	80.9166655796872	80.9162012419823	80.9169779985661	0.857333333333333	0.703283333333333	1.12978333333333	455	418	0	0	0	100	0	3522.29074889868	Inf	0	0	0	0	0.808490445727329	0.0665747407877885	1	3522.29074889868	2847.73841755834	0.808490445727329	3522.29074889868	234.495593587155	0.0665747407877885	0.0823444991089498	80.9166655796872	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M81T818	M80.9651T13.64	80.9651104476057	80.964302355373	80.9655283333292	13.637225	13.2948166666667	13.7583333333333	572	448	0	0	0	100	0	10738.9603524229	Inf	1	1	0	0	0.691993662062837	0.0534216462952799	1	10987.5570262524	7603.31982372063	0.691993662062837	10716.3341308416	572.484211519858	0.0534216462952799	0.0771996178924959	80.9651104476057	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M81T909	M80.9651T15.14	80.9651013882625	80.9642228343245	80.9654565421367	15.1421166666667	14.8836333333333	15.6884333333333	483	436	0	0	0	100	0	12698.6960352423	Inf	0	0	0	0	0.904559214532039	0.0593796110208921	1	12698.6960352423	11486.7225112199	0.904559214532039	12698.6960352423	754.043631045233	0.0593796110208921	0.0656448025369034	80.9651013882625	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
@@ -36,7 +36,7 @@
 M93T378	M93.0345T6.3	93.0345431859462	93.0341562934277	93.035294749241	6.29758333333333	6.19486666666667	6.38321666666667	286	286	0	1	2	98	0	4137.83039647577	Inf	0	1	1	0	1.05539010829955	0.167895508809624	1	4027.04794124175	4250.1065628346	1.05539010829955	4123.44611871134	692.308084150111	0.167895508809624	0.159083837804903	93.0345431859462	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M94T683	M94.0379T11.38	94.0379172370326	94.0364722924149	94.0383281228632	11.3775	11.0349666666667	11.9261333333333	527	427	0	0	0	100	0	7089.88546255507	Inf	0	0	0	0	0.918981971186115	0.0926654379517354	1	7089.88546255507	6515.47691786264	0.918981971186115	7089.88546255507	656.987341415307	0.0926654379517354	0.100834881267729	94.0379172370326	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M95T54	M94.925T0.89	94.9249599715485	94.9243712018686	94.925194686606	0.891809943877103	0.65195	1.04474500863521	529	415	0	0	0	100	0	6770.58810572687	Inf	0	0	0	0	0.716637872757035	0.0760281793823528	1	6770.58810572687	4852.05985740219	0.716637872757035	6770.58810572687	514.755487026227	0.0760281793823528	0.10609009413619	94.9249599715485	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
-M95T55	M94.9807T0.91	94.9807499641041	94.9800432439608	94.9813271355568	0.908583333333333	0.616583333333333	1.26623333333333	662	450	0	0	0	100	0	17034.1497797357	Inf	0	0	0	0	0.642119491133346	0.0544717978732427	1	17034.1497797357	10937.9595884531	0.642119491133346	17034.1497797357	927.880763744303	0.0544717978732427	0.0848312481172305	94.9807499641041	0.953877496589996	94.9808406	Methanesulfonate	unknown	[M-H]-	NA	NA
+M95T55	M94.9807T0.91	94.9807499641041	94.9800432439608	94.9813271355568	0.908583333333333	0.616583333333333	1.26623333333333	662	450	0	0	0	100	0	17034.1497797357	Inf	0	0	0	0	0.642119491133346	0.0544717978732427	1	17034.1497797357	10937.9595884531	0.642119491133346	17034.1497797357	927.880763744303	0.0544717978732427	0.0848312481172305	94.9807499641041	1.0	94.9808406	Methanesulfonate	unknown	[M-H]-	NA	NA
 M95T655	M95.0138T10.91	95.0138235296212	95.0128347850341	95.0142620215904	10.91495	10.7609	11.1218333333333	444	369	0	3	6	94	0	2439.57709251101	Inf	0	0	0	1	0.955522769822528	0.286958315419122	1	2675.59919244564	2556.59595130058	0.955522769822528	2440.51561935224	700.326250883375	0.286958315419122	0.300315517831584	95.0138235296212	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M97T508	M96.9601T8.47	96.9600605566796	96.9594831481193	96.9605513043504	8.4704	8.35018333333333	8.70988333333333	375	370	0	0	0	100	0	4573.63656387665	Inf	0	0	0	0	0.67075675481543	0.069355071692201	1	4573.63656387665	3067.7976192911	0.67075675481543	4573.63656387665	317.204891781737	0.069355071692201	0.103398245629722	96.9600605566796	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M97T77_1	M96.96T1.29_1	96.9600063916444	96.9597618415465	96.9601897646398	1.28500833333333	1.11383333333333	1.45603333333333	528	448	0	0	0	100	0	2204833.89427313	Inf	1	0	0	1	0.339232951108649	0.0466971667095359	1	2126301.33171641	721311.475704407	0.339232951108649	2203460.71609906	102895.372397591	0.0466971667095359	0.137655161613648	96.9600063916444	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
@@ -145,7 +145,7 @@
 M125T785	M125.0972T13.09	125.097165060709	125.096157913249	125.097708815645	13.0883166666667	13.0202950086352	13.2754833333333	471	453	10	0	0	100	1298.5625	55848.4581497797	43.007909245631	0	0	0	0	0.589535999908679	0.0687207636913918	1	55848.4581497797	32924.6766186884	0.589535999908679	55848.4581497797	3837.94869503959	0.0687207636913918	0.116567544139861	125.097165060709	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M126T51	M125.9942T0.86	125.994159276515	125.992872343	125.995654872737	0.85735	0.703283333333333	1.11356666666667	518	411	0	0	0	100	0	4024.97136563877	Inf	1	1	1	1	0.601609025333883	0.0626602026761277	1	4231.48423765707	2545.69910793256	0.601609025333883	4024.21329439407	252.1580206387	0.0626602026761277	0.104154359455216	125.994159276515	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M126T50	M126.0196T0.84	126.019639568209	126.017387018667	126.020168174607	0.838916666666667	0.686516666666667	1.01021666666667	455	449	0	0	0	100	0	14206.1740088106	Inf	1	1	1	1	0.414622989782006	0.0527553681888734	1	13874.0532202279	5752.50142656555	0.414622989782006	14166.5144811416	747.359687405633	0.0527553681888734	0.127236958608133	126.019639568209	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
-M127T70	M126.9049T1.16	126.904905319881	126.904556344875	126.905293082861	1.16411666666667	1.07846666666667	1.3534	423	420	0	0	0	100	0	4332.82599118943	Inf	0	0	0	0	0.714242183125826	0.121905011843853	1	4332.82599118943	3094.68709505146	0.714242183125826	4332.82599118943	528.193203773302	0.121905011843853	0.170677418281773	126.904905319881	0.947953900574352	126.9050256	"Iodine anion (Iodide)"	unknown	[M]-	NA	NA
+M127T70	M126.9049T1.16	126.904905319881	126.904556344875	126.905293082861	1.16411666666667	1.07846666666667	1.3534	423	420	0	0	0	100	0	4332.82599118943	Inf	0	0	0	0	0.714242183125826	0.121905011843853	1	4332.82599118943	3094.68709505146	0.714242183125826	4332.82599118943	528.193203773302	0.121905011843853	0.170677418281773	126.904905319881	0.9	126.9050256	"Iodine anion (Iodide)"	unknown	[M]-	NA	NA
 M127T52	M126.9872T0.87	126.987197831375	126.986666125129	126.988479093235	0.87245	0.70155	1.11256666666667	583	445	0	0	0	100	0	6992.06167400881	Inf	1	1	0	1	0.504829411253171	0.0567739311109594	1	7308.45308005039	3689.52206557326	0.504829411253171	6978.54872094869	396.199644337615	0.0567739311109594	0.112461615439611	126.987197831375	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M127T424	M127.0401T7.07	127.040071736318	127.039489436963	127.041124030502	7.06564166666667	6.86226666666667	7.35843333333333	472	429	0	1	2	98	0	4901.89427312775	Inf	0	1	0	0	0.677666659794305	0.244792243310036	1	5054.55159429227	3425.30109566202	0.677666659794305	4899.76808476983	1199.42522116972	0.244792243310036	0.361228104956999	127.040071736318	0	0	NA	NA	NA	NA	NA
 M127T762	M127.0513T12.7	127.051317791524	127.050389095002	127.051882374202	12.69585	12.6269283419685	12.8141666666667	411	410	0	0	0	100	0	5671.10352422907	Inf	1	1	1	0	0.828658193235012	0.0624012489833143	1	5954.07405509452	4933.89224888209	0.828658193235012	5672.79511695302	353.989500524315	0.0624012489833143	0.0753039666930765	127.051317791524	0	0	NA	NA	NA	NA	NA