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AAGCCTAGTT-TCCCACTCAATATGTGGGTGTAATGTTCAATTATGCTAGGTGCTTAGCATATCTCAATCTCAGTATTCCCTAGCTCCTGAATTCATCAGGTCTATTTTTATCAAGGTGTACCCTATCAATCAATACATCTTAGAATGCATTCTCACTAGAGGGTTAGTTAGTCACAACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 3923 180 + 647215 AAGGCTAGTTATGCCACTCA--ATGCGGGTGGAATGTTGAATTTTGTTATGTTCTTAGCATATCCTAATATCAGTATTTTCTAATTCTTGAATACATCAGGTCTATTTTTATCAAGGTGTAAGCTATCAATCAATACATTGAACAATGCAATCTCTCTAAAGGGACATTTAGTCACAATTTG + +a +s mr.mrrefChr0 4112 63 + 130230 TACATCCTGCAACATAAAACTTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTATGTAGTGGCATAGTAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4322 60 + 636262 TACATCCTGCAACATAAAACTTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTATGTAGTGGCATA---GCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 4103 63 + 647215 TAAATCTAGCAACATAAAACCTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTTTGTAGTGGCATAGTAGTGG + +a +s mr.mrrefChr0 4175 17 + 130230 CACACCCTATTCTACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4382 17 + 636262 CACACCCTATTCTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 4174 17 + 647215 CACACCCTATTCTACAA + +a +s mr.mrrefChr0 4192 19 + 130230 TACTCTTATCCTCAAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4401 19 + 636262 TACTCTTATCCTCAAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 4191 19 + 647215 TACTCTTTCCCTCCAGGGA + +a +s mr.mrrefChr0 4211 136 + 130230 GTGTTTGGTAGGCTCAGAGGCATAGTTAGCAATAGTTGCTACTGCACTGCAAGGATCCCAAAGGCATGCACCATGATTTGCTCATCCCAATGAATAAGAATCATGAACCCACCCTAACTTTGTGGGCCCAGATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4421 135 + 636262 GTGTTTGGTGGGCTCGGAGGCACAGTTAGCAATAGTTGCTACTCCATTGCAAGGATCCCAAAGGCTTGCACCGTGATTTGCTCATCCCAATGAATAAGAATCATGAACCCACCTT-ACTTTGTAGGCCCAGATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 4210 136 + 647215 GTGTTTGGTAGACCCAGATGCATAGGTAGCAGTAGTTGCTACTGCACTGCGAGGATCCCAAAGGCATGCACCATGATTTGCTCATGCTGATGCCTAAGAAGCACAAACCCACCCTAACTTTGTGGGTCCAAATGCT + +a +s mr.mrrefChr0 4347 14 + 130230 TGACAACGGGAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4564 14 + 636262 TGACAACGGGAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 4346 14 + 647215 TGACAAAGGGAATT + +a +s mr.mrrefChr0 4361 37 + 130230 TTATTAATAGGCTAGGGGTGTTGTTCACAGTACCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4578 37 + 636262 TCATTAATAGGCTAGGGATGTTGTTCACAGTACCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 642057 18 - 647215 TTGCTATTCGTCCAGGGG------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 4398 23 + 130230 CATCGTACACCAAGGTATAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4616 23 + 636262 CATCGTACACCAAGGTATAACCA + +a +s mr.mrrefChr0 4421 255 + 130230 ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATAGTGAAGATTGCAAGACAAAGAATGTGCTGATCTAAATTTTTTGATTAGTGGATGCAGCTGGTTGCACCATCAACACAGACGGCAGCAGCATTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCACTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGTGGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4650 255 + 636262 ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATACTGAAGATTGCAAAACAAAGAATGTACTGATCTAAATTCTTTAATTAGTGGATGTGGCTGGTTGCACCATCAACACAGACAGCAGCATCACTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCGCTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGCAGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 642075 254 - 647215 ACCTTAGCTTGCACCCATGTATATCAAGCCCCCCTGTTAGTCACAGTGAAGATTGCAAGACAAAGAAAGTGCTGATCTAAATTTTTTGATTAGTGGATACAGCTGGTTGCTCCATCAGCACAGATGGCAGCAGCATTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATGCCACTGCAGACCTTATTGCAGCTTATTA-GGAAAGTGCTGTGGACAGTGGCAGCTTCCATGGGGTGATACCCGATGCCAGTGGCAACTG + +a +s mr.mrrefChr0 4676 108 + 130230 CTGTGCTGCAACTCTTGAAAGTATGAGAGATGAGCTACAGAGAGTACACAGTAGCCAGGGAGGTATTTTACCAATGTAGTAGGATCTTGCTAACATGGGATTGCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4905 108 + 636262 CTGTGCTGCAACTCTCGAAAGTATGAGAGATGAGCTACAGACAGTACACAGCAACCAGCGGGGTATTTTACCAGTATAGTAGGATCCTGCTAACATGGGATTGCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 642397 108 - 647215 CTATGGTGCAGCTCTTGAAAGTATAAGAGATGGGCTGCACAGGGTACGCAGTAGCCAGGTAGGTATTTTACCAATGTAGTAGGATCTTCCTAAGATGGGATTGTTAAG + +a +s mr.mrrefChr0 4784 151 + 130230 GATATGCTGTACTGAGAAGGGTGGAGGAACATATAGATTCAACTAGTGATCACAAGAAAAAAGCATTTATGGTGAATTGTTATAGGGCTATATTTGATGACAATATAGTATAAGCTGTTAAAATGGAAAAATGATGAGCAGCATAATATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5013 135 + 636262 GATATGCTGTACTGAGAA-----GAGGAACATATAGATTCAACCAGTGACCACAAAAAAAAAGAATTTATGGTGAATAGCTATAGGGCTATATTTGATGACAATATAGTATAAGCTGTTAAAATGGA-----------CATCATAATATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 642515 151 - 647215 GTTATACTGTACTGAGAAGGGTGGAGGAACATATAGATTCAACTAGGGATCACAAGAAAAAAACATTTATGGTGAATTGTTATAGGGCTATATTTGAGGACAATATAGTATAAGCTGTTGAAATGGAAAAATGATGAGCAGCGTAATATGC + +a +s mr.mrrefChr0 4935 32 + 130230 AGGCTTCTTTAATGTATATAACAACAGAGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5149 32 + 636262 AGGCTTCTTTAATGTATATAACAACAGAGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 642666 32 - 647215 AGGCTTCTTAAATGTATTTAACAACAGAGTAC + +a +s mr.mrrefChr0 4967 209 + 130230 CATGGTTAGACTTAGCACAGAATGGATAATTCAGACAGTATGGATAATTCAGAGAGCTACCTTGAACCTTGAAATATGAGTAGTGGGAAGGAAAGGTTCAAGAAAAGTACCTATTTCATGAATCTGTCTTATGATATGCTATGTTTTGCTTAACATCACCTTGAGGGGTGGGGCCCTGGCAGCTGTTAAAATCTGATAATTCTAGCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5182 209 + 636262 CATGGTTAGACTTGGCACAGAATGGATAATTCAGACAGTATGGATAATTCAGAGAGCTACCTTGAACCTTGAAATATGAGTAGTGGGAAGGAAAGGTTCAAGAAAAGTACCTAGCTCATGAATCTGTCTCATGATATGCTATGTTTTGCTTAACATCACCTTGAGGGGTGGGGCCCTGGCAGCTGTTAAAATCTGATAATTCTAGCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 642698 152 - 647215 CATGGTTAGATTTAGCACGGTATAGATAATTCAGACAGTATTGATAATTCAGAGAACTACCTTGTATCTTGAAATAGGATTAGTAGGAGAGAAAAT----AAAAAAGTACCTATTTCATGGATCTGTCTTGTGGTATGCTATGTTTTGCTTAACAT----------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 5176 100 + 130230 TGAGATGTTGAGACCATTTCTAGTGTAGATTTAACAGGAAATTTCAGTATTTTTTAAGAGTTGAGCAGGACTTCACACCACTGAACACTTATCATGAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5449 100 + 636262 TGAGATGTTGAGACCATTTCTAGTGTAGATTTAACAGGAAATTTCAGTATTTTTTAAGAGTTGAGCAGGACTTCACACCACTGAACACTTATCATGAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 5276 41 + 130230 TCATAAGAGCATGTAGAGTAAAATTCAGCACAGGACTAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5551 41 + 636262 TCATAAGAGCATGTAGAGTAAAATTCAGCACAGGACTAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 5317 204 + 130230 AGGCTATGCCTTTGTCACTAGAAATGCACACCACGTTTCTAATTTGAATCAACGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTATAATAAGTTGCAGCCTATGCTTTTATCACTAGAAACGCACACCACATATCTAATCTGAATCAATATTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGATAGGTCATGTCTCTACACTTAAATGTTCTGGTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5603 204 + 636262 AGGCTATGCCTTTGTCACTAGAAATGCACACCACGTTTCTAATTTGAATCAACGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTATAATAAGTTGCAGCCCATGCTTTTATCACTAGAAACGCACACCACGTATCTAATCTGAATCAATGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTAGATCATGTCTCTACACTTAAATGTTCTGATTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 5192 116 + 647215 ----------------------------------------------------------------------------------------TGAAGGCTACGCTTTTGTCACTAGAAACTCACACCACATATCTAATTTAACTCAACATTACAATAAGTGTTGAAAGTTAGATATGTCATGTCCCTACACTTAAGTGTTCTGGTTTC + +a +s mr.mrrefChr0 5521 169 + 130230 AACTCCAAAGAACCTGGCAACCCTCTACCTTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGCATTATATACTTAATGCATAAACAATTGAAGGGGATGCAAGTGCCACCACTAGAACATGCAAAGGTATAAAGGGAACTCACATAAGAGAGCAGTTGAGTTTATCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5807 169 + 636262 AACTCCAAAGAACCTGGCAACACTCTACCGTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGCACTATATACTTAAGGGATAAACAATTGAAGGGGAAGCAAGTACCACCACTAGAACATGTATAAGTACAACGGGAACTCACATAAAAGAACAGTTGAGTTTATCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 5309 169 + 647215 AACTCAAAAGAAACTGGTGACCCTCTACCTTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGAATTATATACTTAATGCATAAACAATTGAAGGGGCTGCAAGTGCCACCACTAGAACATGCAAAGATATAAAGGGAGCTCACACAAGAGAGCAGTTGAGCTTATCTA + +a +s mr.mrrefChr0 5690 128 + 130230 CTTGCATGTTACTAGAGAGTCCATGAGCTCTTTAGTTAGATGACTTGTGGGTGTCATAAGGTTAATGTGGACAAGTAAGCTAGGGGCTTTCATAAGGTAGGGGCTTTCAAACTGCTGGAAGTTCAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5976 128 + 636262 CTTGAATGTTATTAGAGAGTCCATGAGCTTTTTAGTTAGATGACTTGTGGGTGCCATAAGATTAATGTAGACAAGTAAGCTAGGGGCTTTCATAAGGTAGGGGCTTTCAAACTGCTGGAAGTTCAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 5479 111 + 647215 CTTGCATGTTACTAGAGAGTCCATAAGCTCTTTAGGTAGATGACTTGTGGGTGTCATAAGGTTAATGTGGACAAGTA----------------GAGGTAGGGGCTTTCACCCTG-TGGAATTTCAGGA + +a +s mr.mrrefChr0 5818 327 + 130230 TGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTCTCATACATTCCAGGCATTGGCATAGACATCCGAACTTCAGACAGCTCTTCAATTAAAATCCTCTCCTCCTAATTGTTGAGAGAGTGATGGCTAAGCAACATGGGCTTCATTTAGTCCAGTCCACTGCTCCCGGCATCCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAGTGCAGGCAGCAATTGCCTTACAATCTTCGAGAGGGTGACGGCTAAGCACCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAATGCAGGCATAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAACACTCACAATCTGATGTACTTATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6110 327 + 636262 TGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTCTCATACATTCCAGGCACTGGCATAGACATCCGAACTTCAGACAGCTCTTCAATTAAAATCCTCTCCTCCCAATTGTTGAGAGAGTGCTGGATAAGCAACATGGGCTTCATTTAGTCCAGTCCACTGCTCCCGGCATCCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAGTGCAGGCAGCAATTGCCTTACAATCTTCGAGAGAGTGATGGCTAAGCACCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAATGCAGGCACAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAATACTCACAATCTGATGTACTTATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 5590 327 + 647215 CGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTATCATACCGTACTGGCATCGGCATGGACCTCCGAACTGCAGCCAGTTCTTCAAGTAAAATCAACTTCTCCTAATTGTTGAGAGAATGATGACTAAGCAACATGGGCTTCAATTTGTCCAGTCCAATGCTCCCAGCATCCTGTAGATGCAGCAATACAGGCTTTAGTGCAGACAGCAAATGCCTTACAATCCTTGAGAGGGTGACGGCTAAGCACCTGTGGATGCAGCAGTACAGCCTGTAATGCAGGCATAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAACACTCACAATCTGATGTACTTATCA + +a +s mr.mrrefChr0 6145 52 + 130230 CAATTTATTAATGTATATGAGGGCTAACAACCGGTGGTCAGTAGATTCAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6437 52 + 636262 CAATTTATTAATGTATATAAGGGCTAACATCCAGCGGTCAGTAGATTCAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 5918 52 + 647215 AAATTTATTAATGTATATGAGGGCTATCAATGGGTGGTCAGCAGATTCAAAG + +a +s mr.mrrefChr0 6197 9 + 130230 TGCATTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6489 9 + 636262 TGCATTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 5975 9 + 647215 TGCATTTGT + +a +s mr.mrrefChr0 6206 90 + 130230 ATTTGTAGTAACTAAAATAACCAATAGACAATTAGTACACAGAAGGTGTTATTGAGCTATCAGCCCCACAAGCTTCACCTTAGTTAGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6498 89 + 636262 ATCTGTAA-AACTAAAATAACCAACAGACAATTAGTACACAAAAGGTGTTACTGAGCTATCAGTCCCACAAGCTTCACCTTAGTTGGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 5985 90 + 647215 ATTTGTAGTAACTAAAATAACTGATAGACAGTTAGTGCTCAGAAGGTGTTATTGGGCTATCAGCCCCATGAGCTTCACCTTAGTTAGGAA + +a +s mr.mrrefChr0 6296 12 + 130230 TAACGTGAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6592 12 + 636262 TAACGTGAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 6075 12 + 647215 TAACGCTAACCA + +a +s mr.mrrefChr0 6308 52 + 130230 CAGGTTCAGATAGCTTCCTGTGCCCATGTCTGCATGACTCCCAGAGCCTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6604 52 + 636262 CAGGTTCAGATAGGTTCCTGTGCCCATGTCTGCATGACTCCCAGCGCATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6088 52 + 647215 CAGGTTCAGATAGCTTCCCGTGCCCATAAATGCATGACTCCCAGAGCCTGTG + +a +s mr.mrrefChr0 6360 7 + 130230 CACCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6658 7 + 636262 CACCGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 6140 7 + 647215 CACCACT + +a +s mr.mrrefChr0 6367 184 + 130230 TATTAATGCACCAAAGCATTATGATCTTAAGTAGCACTAGCACTGAATTTCAATCTAGACCGTCTGGCCCAAAAGCAATCTGAGATGGAAAGGAATCACACAGAGAGAAGGGTAGTATTGATGAAGCCAGGCTACAGCTTGAAACCAACTAGCAAGTTTTAATTCAATAGCCATAAAGAACTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6674 182 + 636262 TATTAATGCACCAAAGCATTAGGATCTTAAGTAGCACTAGCACTGAATTTCAATCTAGACCGTTTGGCCCAAAAGCAATCTGATATGGAA--GAATCACACAGAGAGAAGGGTAGTATTGATGAAGCCAGGCTACAGCTTGAAATCAACTAGCAAGTTTTAATTCAATACCCATAAAGAACTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 6147 180 + 647215 TATTAATGCATCAGTGCATTATGATATTAAGTAGCATTAGCACTGAATGTCAATCTA----GTCTGGCCCAAAAGCAATCTGAGATGGAAAGGAATCACAAAGAGGGAAGGGTAGTATTGGTGGGGCCAGGCTATGGCTCGGAACCAACCAGCAAGTTTTAATCCAATAGCCATATAGAACTAA + +a +s mr.mrrefChr0 6551 178 + 130230 AACCAAGCGCAGTAATGTAACAGGCAGCATGGAGTGGCAAGTGACCAGAGCAGTGCAGTATTGGTCATTTATGTATTAGCAATTCTAAGCACAATTGGTGTCATACTATGTAAAACAGTTTTGGTGAAACCATCACAGATCAGCAATGTGTCTTTGAATGGAGCCCAATGATAAGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6856 178 + 636262 AACCAAGCACAGTAATGTAACAGGCAGCATGGAGTGGCAAGTGACCAAAGCAGTGCAGTATTGGTCATTTATGTGTTAGCAATTCTAGATGCAATTGGTGTCAAACTATGTAGAACAGTTTTGGTTAAACCATCACAGATCAGCAATGGGTTTTTGAATGGAGCCCAATGATAAGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 6375 174 + 647215 AACCAAGCGCAGTCATGTAATAGGCA----GGAGTGGCAAGTGACTAGCGCAGTTCAGTATTGGTCATTTATGCAGTAGCAATTCTAAGCACAACCAGTGTCATACTATGTAAAACAGTTTTGGTGAAACCATCACAGATCAGCAATGTGTCTTTGAATGGAACCCAATGAAAAGATT + +a +s mr.mrrefChr0 6729 63 + 130230 CAATGCCCTATTGCTAGAGGGAAATTGACCACCCAGCTACTACACATGATGATGGAGTACCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7034 63 + 636262 CAATGCCCTATTGCTAGAGGGAAATTGACCACCCAGCTACTACACATGATGATGGAGTACCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 6550 63 + 647215 CAATTCCCTATTGTTAGAGGGAGATTGACTACCCAGTGACTACTCATAATGACAGTGCATCAA + +a +s mr.mrrefChr0 6792 14 + 130230 TCCTGAGGATATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7098 14 + 636262 TCCTGAGGATATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 6613 14 + 647215 CCCTGAGGATATGA + +a +s mr.mrrefChr0 6806 73 + 130230 AATTTCCATTGGAGCTGAATCAGGGGATAGACTGCTGACATCCAACAAAGGTGATGAAGTTACACAAAATTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7112 73 + 636262 AATTTCCATTGGAGCTGAATCAGGGGATAGACTGCTGACATCCAACAAAGGTGATGAAGTTACACAAAATTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 6630 73 + 647215 AATTTCCATTTTAGGTGAATCAGGGGATACACTGCTGATATCAAACAAAAGTCGTGAAGTTGCACAAAATTAC + +a +s mr.mrrefChr0 6879 58 + 130230 ACTAAATCATAGTCATGGCTAAAAGGTATGGACAACTACATACAGTTTATTTAGGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7185 58 + 636262 ACTAAATCATAGTCATGGCTAAAAGGTATGGACAACTACATACAGTTTATTTAGGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6704 58 + 647215 ACTAAATCACTGTCATGGCTAGGAGGTGTAGACAAATACATACAGTTCAATTATATTG + +a +s mr.mrrefChr0 6937 31 + 130230 TACTCTGCTTTGCTATTTGCTGAGTGGCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7243 31 + 636262 TACTCTGCTTTGCTATTTGCTGAGTGGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 6764 31 + 647215 TATTCTACTTTGCTATTTGCAGGGTGACTTC + +a +s mr.mrrefChr0 6968 4 + 130230 TAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7281 4 + 636262 TAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 6795 4 + 647215 TAAT + +a +s mr.mrrefChr0 6972 57 + 130230 ATCAATCCATTTTTGGGATGTCATGACCCTTGTAGAAGGTGACCTGCCTTAGCTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7290 57 + 636262 ATCAATCCATTTTTGGGATGTCATGACCCTTGTAGAAGGTGACGTGCCTTAGCTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 6799 57 + 647215 CTTGATCCATTTTTGGGATGTCATCACCTTTGGAGGAGGTGACCCACCTTAGCTGCT + +a +s mr.mrrefChr0 7029 53 + 130230 GTATTTACCGATCAGCATTGCTGTCACCAAGTGCCGGGAAGTTGTCTTCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7347 53 + 636262 GTATTTACCGACCAGCATTGCTGTCACCAAGTGCCGAGAAATTGTCTTCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6857 53 + 647215 GTATTTACCAATCGACATTGCTGTTGCCAAGCACCGGGAAGTTGTCTTCTTGG + +a +s mr.mrrefChr0 7082 10 + 130230 ATGACTCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7409 10 + 636262 ATGACTCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6910 10 + 647215 ATGACTCTAA + +a +s mr.mrrefChr0 7092 13 + 130230 GTCCACATGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7420 13 + 636262 GTCCACATGCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6920 13 + 647215 GTCCATATGCATG + +a +s mr.mrrefChr0 7105 42 + 130230 ATACCACAAGCCTTTGGGAGCTGGTACTGACTCAAATGGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7467 42 + 636262 ATACCACAAGCCTTTGGGAGCTGGTACTGACTCAAATGGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 6933 42 + 647215 ATACCACAGGTCTTGGGAAGCTTGTACTGTCTCAGATGATCA + +a +s mr.mrrefChr0 7147 58 + 130230 AGTGATCATCAACAGAACGAGACAGCTGAGCAGTCATGAGCCTACTTTCTCTTGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7926 58 + 636262 AGTGATCATCAACAGAACGAGACAGCTGAGCAGTCATGAGCCTACTTTCTCTTGGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6975 58 + 647215 AGTGCTCATCAATAGAACAAGCCAGCTGAGCAGTCATGAGTCTATCTTCTCTTGGATG + +a +s mr.mrrefChr0 7205 61 + 130230 CTGGGATGGGACTAGCAATCATTCATACCTGAGAGAAGTAATAGAGTAAGCCTCTTATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7984 61 + 636262 CTGGGATGGGACTAGCAATCATTCATACCTGAGAGAAGTAATAGAGTAAGCCTCTTATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 7041 61 + 647215 CTGGGATGGGACTAGCAACCACTGGCACCTGAGAGAAGCACTAGAGTAAGCCTCGTACATA + +a +s mr.mrrefChr0 7266 9 + 130230 CCTATGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8048 9 + 636262 CCTATGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 7102 9 + 647215 CCTATGTTG 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ATCCAGGACAGAAAGATCAGATATTACTGACTTCTTAAAAATTTTTTTCACTTTTTGAGGTATATTGGGACAACCACACCATCAATGGATAGGAAAAACAATACATGGAAATGACAAGCCTTTCAATCCTGATATGCTGCAAAATTGATTCGCACCAGAGGTGATACACAAAGTCTCTACACCTGGACCACCTGGTCACAGGTTTCAGGAGTGCTTAATTTTTTGTGCAGAGTATTAAAAAGAAGGTGCACTTCAGTTTGCTTCTGACAGGGGTTAGGTTGTCAGGCATACTAACCTCGTTATCTAGTCCATCAGGGATAGAATGCAGGAAAAAATGCATTATTATGAGATTCAGGGCACCGCTGGCATACTGCTCGGACCCAACATCCCTCACCATCACCATTGGCTGAGAGTGGTCAAGTATCGAGTGATGCTGCACAACTTAAGGGGGGAAGGTTGTAGTCTTTGGAGCTATTGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8148 480 + 636262 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TATTGTCAGTGAGGAGTACCTCAAATGGTGCCAGACAGACTTTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8913 46 + 636262 TATTGTCAGTGAGGAGTACCTCAAATGGTGCCAGACAGACTTTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 7971 46 + 647215 TTCTGTCAGTGAGGAGTAGCCCAAATGGTGCCAGACAGAATTTGGC + +a +s mr.mrrefChr0 8166 76 + 130230 AATAGGTTATGAACACTCCTCCTACCAATCACAGTAGTGATACATGACTTCCCCCAGGATAGATCATGTGGGTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8960 76 + 636262 AATAGGTTATGAACACTCCTCCTACCAATCACAGTAGTGATACATGACTTCCCCCAGGATAGATCATGTGGGTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 8017 76 + 647215 GGTAGGTTATAAACCCTCCTCCTACCAATCATAGTAGTGCTACATAGCATCCCCCAGGATAGGTCATGTGGGTTAC + +a +s mr.mrrefChr0 8242 102 + 130230 TACATGGGGCCTGTTCACCCCACCCGCCAAACTAACAAGGCCAAGAAAGGAAGGAGCTTTAGCCTGAGTTTCTCTAACTCCAGGTGTAATTCCCTTAGGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9036 102 + 636262 TACATGGGGCCTGTTCACCCCACCCGCCAAACTAACAAGGCCAAGAAAGGAAGGAGCTTTAGCCTGAGTTTCTCTAACTCCAGGTGTAATTCCCTTAGGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 8132 102 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 8352 68 + 647215 CAAACACAGGTAAGCGAGTTACTAAATATGGTGTAAGGAGAAATTTTTTAAAAACTCTTATCAACCCA + +a +s mr.mrrefChr0 8495 91 + 130230 AAGGGGAATAACAGgcatccataaaatccacctctcatgcttgcctggtacattggtgcacttgagattaaggggtgacaataggaccatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9294 91 + 636262 AAGGGGAATAACAGgcatccataaaatccacctctcatgcttgcctggtacattggtgcacttgagattaaggggtgacaataggaccatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 8420 91 + 647215 AAAGGAAATAACTGGCATCCATACAATCCACCTCCCTTGCTTGCCTGGCATGTTGGTGCGCTCAAGATTAAGGGCTGACAATGAGACCATC + +a +s mr.mrrefChr0 8586 56 + 130230 atcagaagtggacaaagaaaaagggtgggaatttagttccaaccaacaagtcagac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9391 56 + 636262 atcagaagtggacaaagaaaaagggtgggaatttagttccaaccaacaagtcagac +s simRat_chr6.simRat.chr6 8511 56 + 647215 ACCAGAAGGGTATATAGAAAAGGGTTGGGAATTTAGTTCCAACGCACAAGTCAGAC + +a +s mr.mrrefChr0 8642 110 + 130230 aaggataaaagggggataataaagggcattcaagtgaagtccaaaggcactaacccatctcaaaggtcaaaccattctaagtgtttgcccgctttatatatgggcattat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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simRat_chr6.simRat.chr6 8854 13 + 647215 AGGTACctgctta + +a +s mr.mrrefChr0 8915 71 + 130230 ttttctctgctctacctatgcccactcaaaccaggcactcaagtgaggaccaaagactttgttggtattgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9754 71 + 636262 TTTTCTCTGCTCTACCTATGCCCACTCAAACCAGGCACTCAAGTGAGGACCAAAGACTTTGTTGGTATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 8867 71 + 647215 ttttctctgctctacttatgcccactcaaaccaagcattcaagtgaggaccaaagattgcgttggtattgt + +a +s mr.mrrefChr0 8986 4 + 130230 gccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9825 4 + 636262 GCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 8946 4 + 647215 gccc + +a +s mr.mrrefChr0 8990 17 + 130230 tgtgcaaggctatgttt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9829 17 + 636262 TGTGCAAGGCTATGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 8964 17 + 647215 tctgcaaggccgtgtct + +a +s mr.mrrefChr0 9007 41 + 130230 acaatacaagtaacagcaaaaaacggctgctgacaacatgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9846 41 + 636262 acaatacaagtaacagcaaaaaacggctgctgacaacatgt +s simRat_chr6.simRat.chr6 9203 41 + 647215 acaatataACTACCAGTAAAAATGGGCTGCTGACACCAGGT + +a +s 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Catagggaagcccacgcattgacaatcacttgagattcagtctggagaagctgggatggcttgggatgtataaacttataaatttcacaagactcatggtatgtaatggaatatattaacagaatcacatgattagatcattggataatggtggtgcacagattgaattaaacaaacaggatcacatcacaggttagccataatgaatgagttagaaagtgaccgataacagtgcctgaatgttgcctgcacaagcataaagctgctttccagtggttatggttggacacttgtgtaatccct +s simRat_chr6.simRat.chr6 9879 303 + 647215 CACAgggaagcttgtacatttacaattacttgagactcattctggagaagctgggatggcttgggatatatagacttgtaaatgtcacaagactcatgctatataatggagtatattaatggaattagatcaggagatcaatggataatggtgatggacaaattgaattaaacaaacaggatcacatcacagggtaaccacaatgaacaagttaagaattgacgcatgaccgcacctgaatgttggcagCATAAGCACAAAGCTGCTTTCCAGTGATTATGGTTGGACACTTGTGTAATCACT + +a +s mr.mrrefChr0 9916 47 + 130230 ttgagtgtcactagagggcaccaaggacgttccataatcatcGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10850 47 + 636262 ttgagtgtcactagagggcaccaaggacgttccataatcatcGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 10226 47 + 647215 TTGACTGGCACTAGAGGACAACGAGGATGTTGCATAACCATTACGTA + +a +s mr.mrrefChr0 9963 84 + 130230 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AGGCCTAGCTTAGTCTCCAAAAATGAATTCTCTTTTAGCCACAATTACCCTGTATGATGACTGAGGATGCTCATATCTCAATCAGACACTGGCTTCATTTCTCCATCAGAAAACAAGTCTTATAGGTCAACATACACTCATCAATAATT------------ + +a +s mr.mrrefChr0 12351 104 + 130230 AGCTCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTGGGCTCAAAGGCCAGGAGGCACCTTAGTCGTGACTGACTTTAGATACATGCTGTTAGAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13532 104 + 636262 AGCTCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTGGGCTCAAAGGCCAGGAGGCACCTTAGTCGTGACTGACTTTAGATACATGCTGTTAGAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 235663 104 - 647215 GGATCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTTGGCTGGAACGCTAGGGGAAACCCAAGTCATGACTGACTTTAGGTACATGCTGTTAGAAACT + +a +s mr.mrrefChr0 12455 19 + 130230 GTGTGAATTGTAATGAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13636 19 + 636262 GTGTGAATTGTAATGAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 235786 19 - 647215 GTGGGAATTGTAATGAAAG + +a +s mr.mrrefChr0 12474 50 + 130230 TAGGACTCATACTATCATTAGTAAAGACCTGTGATTAAAAGGCAGTTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13659 50 + 636262 TAGGACTCATACTATCATTAGTAAAGACCTGTGATTAAAAGGCAGTTACA +s 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AATATCTTAAGTGAGAGTAGTGAATCAAGCAGGGTGAGGAGCCTGCGTTGCTGAAATTACATGAATACCTTGACCTAGGAGATTGGTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 238972 90 - 647215 AATATCTTGAGTGTGAGTAGTGAATTAAGCAGGGTGAGGAACCTGTGTTGCTGAAACTACACTAGCACCTTCACCTGTGGGATTGGTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 15661 54 + 130230 CTAATTGATCAACTTAGACACATTTAGCAGAGTGTCCTATTCGTGGAAATGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17000 54 + 636262 CTAATTGATCAACTTAGACACATTTAGCAAAGTGTCCTATTCGTGGAAATGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 239064 54 - 647215 CTAATTGATCAACTTAAACACATTCAGCAGAGTGTCCTACTCATGGAAATAAGT + +a +s mr.mrrefChr0 15715 253 + 130230 GACTCAATTTGACCTACTCATGTAAATGGCTCGAAATAGCTTAAGGCTAGGATTTGTATTGTCCCAAGGCCTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGCATCAATCTACAACTGTGCCTGTGTTTAGATCACACTCTAGCACTAGAAGCAAAGTGCCATTTTCTAGAAATTTCTGGGATCAGAACTATTAAAAAGTGAAGATTTACATGCTAGCTACCACTAGGGGCCACCAGGACTGCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17055 253 + 636262 GGCTCAATTTGAGCTACTCATGTAAATGGCTCGAAATAGATTAAGGCCAAGATTTGTATTGTCCCAATAACTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGCATCAATCTACAACTGTGCCAGTGTTTAGATCACACTCTAGCACTAGAAGCAAAGTGCCATTTTCTTGAAATTTCTGGGACCAGAACTATTAAAAAGTGAAGATTTACATGGTAACTACCACTAGGGGCCACCAAGACTGCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 239118 253 - 647215 GACACAATTTGACCTACTCATGGAAATGGCTCGAAATAGCTTAAGGTTAGGATTTGTGTTGTCCCAAGGCCTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGAATCAGCCTACAGCTGTACCTGGGGTTAGATCACACTATAGCACTGGAAGCAAAGTGCCATTTTCTAGAAATTTTTGGGATCGGAACTATTAAAATGTGAAGATTTACAAGCTAGCTACCAGTGAGGACCACCAGGATTGCAGG + +a +s mr.mrrefChr0 15968 229 + 130230 CTCTTTCACCCTGGACTCATGCCCTAAATATTATAAATCTAAGCCATAAAATAACCTCTGAGGACAGCTTATAGCTGGATACCTGTTGTGGCATTATGTGGAGCAGGTGGAGGTTACAAGCATCCTCAATTCTCAGGCTCTGACACCATATCCCTCCCCCTACCCCTAGCTTAGACATTCTATTCAAACAGGCACTTGGTAAGCTTTGGTGAATCAACACAGATTGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17308 229 + 636262 CTCTTTCACCCTGGACGCATGCCCTAAATATTATAAATCAAAGCCATAAAATGACCCCTGAGGACAGCTTATAGCTGGACACCTGTTGTACCATTATGTGGAGCAGGTGGAGGTTACAAGCATATTCAATTCTCAGGCTCTGACACCATATCCCTCCCCCTACCCCTAGCTTAGACATTCTATTCAAACAGGCACTTGGTAAGCTCTGGTGAATCAACACAGATTGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 239379 228 - 647215 CTTTTTCACCTTGGACTTATGCCCTAAATA-TATAAATCTAAGCCATAAAATAATCTAAGAGTACAGCTTAGAGCTGGATACCTGTTGTGGCAACGTGTGGAGCAGGTGGAGGTTACAAGCATCCTCAATTCTCAGGCACTGATAACACATCCCTTCCCCTACCCCTAGCTTAGACATTCTACTCAAACAGGCACTTGGAAAGCTTTGGTAAATCAACACAGATTACTT + +a +s mr.mrrefChr0 16197 208 + 130230 AGATGACTAAGAGTTAAATGAAGGGGTTCCCACCTTGTTGTTGTATATGATAGTTGATATTGGGCTCTGATTCAGAACTCCTCATTCATAAGGTATGGGATCTTACTCACAGCAAGCACAACTTCTGGACTACTTATGAGGGTTGAGTACTGATGTGATAGAGAATCATGGTGAAAAGTAGCAAACCAGGCTTAACCTTAAATCCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17541 207 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 240088 82 - 647215 TTAAATAGAATACCATGATGATTGTATGCTGACTCAATTGCAATTGGGGTATGATTAAGGCCAGGTCAGGGTAAATTGCAAC + +a +s mr.mrrefChr0 16762 95 + 130230 ACTAAACACACACTATTTCCATGTGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGTCACCCTGTTGTCCGTAGTGCATGAATTGATACAGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18115 95 + 636262 ACTAAACACACAGCATTTCCATGCGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGTCATCCTGTTGTCCGTAGTGCATGAATTGATACAGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 240174 71 - 647215 ACTAACCACACACTATTTCTATGTGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGCCACCCTGTTGTCA------------------------ + +a +s mr.mrrefChr0 16857 165 + 130230 TTTGAGTAACCGAACCCCTATAATAGCAGTTATACAGCACAATATTGAATGTGCTGAATATGCTCTTTTACCCTAATGACATGAACCTCTGTTCATTCTTGAATTTGGTGGGACTATTAATCTTGATGTTGTGTGTTTATGTCATCCCATGGTAAATGACAAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18211 164 + 636262 TTTGAATAACCGAACCCCTATAATAGCAGTTATACAGCACAATATTGAATGTGGTTAATATGCTCTTTTACCCTAATGACTTGAACCTCTGTTCATTCTTGAA-TTGGTGGAACTATTAATCTAGATGTTGTGTGTTTATGTCATCCCAAGGTAAATGACAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 20703 23 + 636262 TTTTATGAGTATGTGCAATCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 12670 23 + 647215 TTTTGATAGGATATGCAATCCTG + +a +s mr.mrrefChr0 19075 70 + 130230 CCTGCATGTGGGCACACATTGACAAAATATTGTCAATCACCCCTCTTGTCAAACATCAGGCACTGGCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20772 70 + 636262 CCTGCATGTGGGCACACATTGACAAAATATTGTCAATCACCCCTCTTGTCAAACATCAGGCACTGGCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 12693 70 + 647215 CCTTCCTGGGCATCCGCATTGACAGTATATTGTCAATAACTCCTCTTTTCAAACATGAGGCGCAGGCTAG + +a +s mr.mrrefChr0 19145 7 + 130230 GATCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20842 7 + 636262 GATCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 12767 7 + 647215 GATCTTA + +a +s mr.mrrefChr0 19152 43 + 130230 AGCATTCTCTCTAGTCAGCAGTATAATTAGATTAGACTGACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20849 43 + 636262 AGCATTCTCTCTAGTCAGCAGTCTAATTAGATTAGACTAACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 12778 43 + 647215 AGCACTCCCTCTAGTCAGCAATATAATTAGATAGGACTGACAC + +a +s mr.mrrefChr0 19195 72 + 130230 ATTTGTAATCTTGTGCTTTATAACAAAGGTGTGTGACGTACATATAAATTGTGTAATGAGCTGCAGTGTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20893 72 + 636262 ATTTGTAATCTTGTGCTTTATAACAAAGGTGTGTGACATACATATAAATTGTGTAATGAGCTGCAGTATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 12821 72 + 647215 ATTTGTAATCTTGTGCCTAATAGCAAAGGTGTGTGACGTACATCTAGATTGTGTAATGACCTGTAGTGTCAA + +a +s mr.mrrefChr0 19267 190 + 130230 CCAATTGGGACCTTATAATGCTTCAGTTTAGAATCATCTTATAAACCATGTGAAATCAATAATGTCAGACACATTGGTCTATATATCTTAAAGTTATGTGCATGTGACCCCTCAAGTGTCTGCATTGCTGGATTAATATATATGTTAATCTTAGAATTTACACCTAAGAGGATCAGTGTACATCCCTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20967 189 + 636262 CCAATTGGGACCTCGTAACGCTTCAGTCTAGAATCAACTTATAAACTATGTGAAATCAATAATGTCAGACACATTGGTCTGTATATCTTAAAGTTATGTGTATGTGACCCCTAAAGTGTCTACATTGCTGCATTAACATATATGTTAATCTTAGAATCTACACATAAGAGGATCAGTGTACATCCC-TTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 12893 190 + 647215 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CTTACCAGAAGCAGACCAGTTGTATTAGTGTAGAATATATGTAGGTGCTACTTGTCACTGACAACCACTTTTACCATTAAGAGCAGCTTAAATCTTCCAGTTTTACATCTAGCTATGAATGTTCTCTCTTGGCATCGATAACCATTTGCAGTACTAGACACACAAAGGGCATCGCTTAGCATGTGCCAACCTTCAACTTCAATTTCTTACTCTTTGACGAGTATATAACTTAATATACCTTACACTTCCAACCCTGTAACAGATAGCCGATTTGCTTCCCTGCCAGGTTTCCCTTCCATAATGTCTAGTCCCTGCAGTATTGCATTTGTTGGGTAGCTAACTTAGCCCGCTATGCTGCTGCCAATTAACAG-----CAAACCTACCACATTGCCCCCTGGACTTTGCTCATGCCCTCGCATAGAGACAGTCCAAGTGGTTTCGGTTTCTTGAATTTACTAATCTCTACACTCT---TGTGCACTATACTAACAGGATGAAGGGGTCTCACATACCAGGGGTTCCCCTTTGAGGTGATGAAACACTATGACTTTATATTTCATGGCAAAATTTGAGACAGAGCTGGTTGTCCCTATGGGCAGTAACTGACTTTGTTCAATCTGTATTGTATGTGATCTGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 14992 615 + 647215 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CATTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAATTAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTAAATGAATAGTCATATTAGTTTACATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGTCTCCCAATCATCCTGCTGCAA-----TGGGATTAGATGTTGACAGATCATGTTGAAGAG-CCTCAAGGGCTCTGCAGCTCAGATAAAACTACTAAAGTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 19760 221 + 647215 CGTTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAAATAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTACATGAATAGACGTATCAGTTTAGATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGT------ATCACCCTACTGCAATGTGTTGGGATGAGATGTGGACAGATTACTTTGAAGAGCCCTCAAGGGCTTTGCATCCCAAAAAGAACAACTAAAGTAGT + +a +s mr.mrrefChr0 26351 26 + 130230 AACATAGGCCTATTATGAACATGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27881 26 + 636262 AACATAGGCCTATTATGAACATGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 19981 26 + 647215 ACCTTAGGCCTATTATGAACCTGTTA + +a +s mr.mrrefChr0 26377 37 + 130230 GTGTACATAGGATAATAGATAGTGCTCTAGCAGTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27907 37 + 636262 GTGTACATAGGATAATAGATAGTGCTCTAGCAGTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 20008 37 + 647215 GTGTATATGGAATAATAATTAGTTCTATAGTGGCAGT + +a +s mr.mrrefChr0 26414 59 + 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ATTTTATTGAAGAGCCCGCAAGGGCCTGGCAGCCCAAATAAAACAACTAAAGTAGTAAGCTTAGGGTCATTATGAATATGTTATGTGCA + +a +s mr.mrrefChr0 26590 71 + 130230 CACAGAATAATATTTAGTTTGCTAGCAGTGGTAAGACTATCACCAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28116 69 + 636262 CACAGAATAATATTTAGTTTGCTAGTAGT--TAAGACTATCACCAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 20251 71 + 647215 CATAGGATAATAATTAGCTCTCTAGCAGTGGTAAGACTATCATTAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGG + +a +s mr.mrrefChr0 26661 216 + 130230 CTACCAATGGCACACGTCCACACAACATTGTCCAGATTGAATACTAAAACTGGACCTTGGGGGGAGCTGATGGTTCTCCTCTTTTTCTCTCATCCTGCCTGTCACATCTGAAGAATTTTGTGACTACACTGCTTGAAGAGAGCATCTATTCACCAGAGGTTGCTCTGCTCTAGTAAACCAGATGGGGGTGACTAACTAGATAAATTATTGCACTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28188 213 + 636262 CTACCAACGGCATGCGTCCACACAACATCCTCCAGATTGAATACTAAAACTGGACCTTGGGCGGAGCTGATAGTTCTCCTCTTTTTCT---ATCCTGCCCGTCATATCTGAAGAATTTTGTGACTACACTGCTTGAGGAGAACACCTATTCGCCAGAGGTTGCTCTGCTCTAGTAGACCAGGTGGGGGTGACCAACTACATAAATTATTGCACTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 20322 214 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 34146 9 + 636262 AATAGTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26244 9 + 647215 AATAGTTTA + +a +s mr.mrrefChr0 32199 27 + 130230 GGATTTGCAATCCAGTTGAGTGCTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34155 27 + 636262 GGATTTGCAATCCAGTTGAGTGCTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26254 27 + 647215 GGATTTGCAACCCAGCTGAGTACTATT + +a +s mr.mrrefChr0 32226 61 + 130230 AAACTTGTCTTGTCTCATGAGTCCCCTTGCATAATTTTTCCATGACAGAGTAAATATCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34182 61 + 636262 AAACTTGTCTTGTCTCATGAGTCCCGTTGCAGAATTTTTCCATGACAGAGTAAATATCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 26284 61 + 647215 AAACTTGTTTTGTCTTATGAGTCCCCTTGCATAATTTTCCCATGACAAAGTAAATATCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 32287 246 + 130230 ATTTTGTTGTAGGGAACCTACTTAATTGGAAAGTCATTATGGATAGTTAGTGTTGCTGTGTGTGTGGCTTACACCCTCATCTACTAATTATGATAGGTGGAGATACAATAATATAGAATCCAAGCTTGAGAGGAAAGGTTTCAATAGGTCAAGAGCAATACCAAATTGTCATACACTGTGATGTGGATTATCTCTGCTTTCATCATGTACATTTATAAACTCACTTGTCCTTTTGCAGTGCCCGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34259 245 + 636262 ATTTTGTTGTAGGGAACCTACTTGATTGGAAAGTCAATATGGG-AGCAAGTGTGGCTGTGTGTGTGGTTTACATCCCCATCTACTAATTATGACAGGTGGAGATACAATAATATAGAATCCAAGCTTTAGAGGAAATGCTTCAATAGGTCAAGAGCAATACCAAATTGTGATACACTGTGGTGTGGATTATCTCTGCTTTCATCATGTACATTTATAAACTCACTTGTCCTTTCGCAGTGCCCGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 26345 243 + 647215 ATTTTGTTGCAGTGAACCTACTTAATTCAAAAGTCATTATGGATAGTTAGTGTTACTGCGTGCGTGGCTTACACCCTCATCTACTAATTATGATAGGTGGAAAT---ATAATATAGAATCTGAGCTTGAGAGGGAAGGTTTCAATAGGTCAAGAGCAATATCAGATTGTCATACACTGTGATGTGGAATATCTCTGCTTTCATCATGTACATTTAAAAGCTCACTTGTCCGTTTGCAGTGCCCGTG + +a +s mr.mrrefChr0 32533 96 + 130230 CTACTCCTATTAACTTACATTCCTTATTTCCCTCTAATTTTTCACTCATTGCCCCCATCTCAGTCAAAATACTGCTGGACCCCTCTCCAATTCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34510 96 + 636262 CTACTCCTATTAACTTACATTCCTTATTTCCCTCTAATTTTTCACTCAGTGCCCTCATCTCAGTCAAGATACTGCTGGACCCCTCTCCAATTCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26588 96 + 647215 CTACTCCTATTACAGTACATTCCTTGTTCTCCCCTAATTTTTCACTCATTGCCCCCATCTCAGTCAAAATACTGCTGGACCCCTCTCCAAGTCCCT + +a +s mr.mrrefChr0 32629 66 + 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GCACTTGTTGCCAATGGGAGGAAGTTACCATCAGATTAACAAGTTAATTCCCCAGGGCCAGAGGCTATAAATGGTAGTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26820 64 + 647215 GCATTTGGTGCCATTGGGAGGGAGGTATAATCAGGTTAACAAGTT-----------------GGCTATGAATGGTGGTAGA + +a +s mr.mrrefChr0 32847 189 + 130230 CTGAAGAGAAGTTCATATGTTGCACATCATCTGTACCTATGCTCAACTGCACCTTTCCTGGAATTCCATTTTGAAGTGAAGTGCTGGATTTTTTGAAATGCTGCTCACTAATCAAGATTAACAATTCAGAATAAGTTTCTACTTGTATAATAGGTTTCTCAGCTAGCTCAGTATTTCATTTCCATCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34851 185 + 636262 CTGAAGAGAAGTTCATGTGTTGCACATCATCTGTACCTATGCTCAAATGCACCTTTCCTGGAATTCCATTTTGAAGTGATGTGCTGGATTTTTTGAAATGCTG----CTAATAAAGATTAACAATTCAGAATAAGTTTCTACTCATATAATAGGTTTCTCAGCTAGCTCAGTATTTCATTTCCATCTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 26890 189 + 647215 ACAAAGAGAAGTTCATATGAAGCACATCATTTGAATCTATGTTCGACTGCATCTCTCCTGGGATCCCATTTTTAAGTGAAGTGTCGGATTTTTTGAAAACCTGCTCACTAATCAAGATGAACAACTCAGAATAAGTTTCTACTTGCATAATCGGTTTGTCAACTCGCTTAGTATCTCATTTCCATCTAG + +a +s mr.mrrefChr0 33036 237 + 130230 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ATGTTAGCAGCAACTTGGTGACTTATGAGGCTACTACTGGTGACTCTGGACATGCAATATCATACTTTGCACACATGTCTTTATTTGCAGTAACAACAAACAATCTTGACATATTTCTAATTGGCCAGATCAGCACATGAATTACTCACACCAATGGTGGTTTTGAAAAATGAATGCATCTCACATGCATTTGACATGA----------------------TGTACATCAGTGGTATCTACATACGGGGTGACGATGTTGTTAATGGTTATTCAAATAAAACTTTAAATCTACCACTGACATAAAGTGCTTCCTCATTTCACACTACCATATAGCCTGTTGACACGTACCCCCCCAGGTTCACTCATTCAATATGCTCCCTCAACCATCTAGCCCAATTTCCTGAGTTGGATTATACTTGAGGAAAGCCCTAGAAAATTTCCAACCTTCAATGACAAAATGGCATGATCCTTCTG-CAAAAAGTCTTAGTACACTCATAATAATTTCCCTAA--------GCAGTGCACTTATATGGGCTATGTGCACAGCCCAGTCACAGGATCGATAGAGGATCTCCTGGTAGTTATTGTGTATCTAGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29023 602 + 647215 AAGTTAGCAGCAATTTGGTGACTTATGAGGCTACTACTGGTGTCTCTAGACATGCAATGTCACACATTGCACACATGTCTTTATCTGCAGTAACAACAAACAATCTTTGTATATTTCTAATTGGCCAGATGAGCACATGAATTATTCAAAACAGTGGTGGTTTCCAACAATGAATGCACGTCACATACATTTGACATGAGATTGATTTCTATTAACATGCCTATACATCAGTGTCATCTACATATGCGGAGAGGATGTTGTTAA-GGTTATTCAGATGAAACTCCAAATCTGCAACTGACATAAAGTGCTTCGCCATTTCATACTACCATGTAGCCTGTTGATGTGTACCCCTCCAGGTTCAGTCATTCAATATGTTCCAATACTCATCTAGCCCAATTTCCTGAGTTGGATTATACTTGCGAAAAGCCCTAGAAAATTTCTGACCTTTAATGACAAAATGGCATGATCCTTCTGGCAAAAAGTCTCAGTACACTCACAATAATTTCCCTAGCCACCTCTGCAGTTCACTTCTAGGGGCTCTGTGCACAGCCAAGTCGCAGGATCCATGGAAGATCTCATGATAGCTATTGTCTATCTAGCAT + +a +s mr.mrrefChr0 35329 15 + 130230 TGAGCACCTTATTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37291 15 + 636262 TGAGCACCATATTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29625 15 + 647215 TGAGCACCTTGTTCT + +a +s mr.mrrefChr0 35344 63 + 130230 TTAGGAAAACCACAGCTCTGATAGGGGGTCAATTAGGAAAACGGCAGTTCCACTTGATTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37306 40 + 636262 -----------------------GGGGGTCAATTAGGAAAACGGCAGCTCCACTTGATTGGCA 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636262 TATCTATTAGAGGAGTTATTACATTACCATAACTAGAGAAGCCTTGTACGAAGTGGAAGGCACAGACTCCACACACC---TTGACAGACCAGAACTTTTACCTGGTTGGATGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTATATTGGAACAGGTATAACCCAGATCGCAGTTAGGCGCATGAATCTGTGAGAGCAGCAGGGCCTTTGCTATCCCTTCGCAATTCAGATGGAATAGTACCATACAGTACCATTAATTGAGCCATTGGATGAGGTGATCTCCTGTCAGATGCTCCCAAAGTAGGCAGGTAACAATGAAGGCTGATTGCAGCATATCTAATGGAATAGATAACACTTGATGCCGGTCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 31618 367 + 647215 TGTCTATTGGAGGAGTTACTGCATTACCATATCTAGAGAAGCCTTGTGTGAAGCGGAAGGCACAGACTCCACACACCCTATTGGTAGACCAAAGCTTTTATCTGGGTGATTGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTGTATTGAAACAGATAGAACCCAGATCACAGCTAGGCACATAAGTCAGTATGATTAGCAGGGCCTTTGCTGCCCCTTAACAATTCAAATGAAACCGTGCCATATAGTACCATTAATTAGGCCATCAAATGAGACGATCTCCTGTCTGATGCTCCCAAAGTAGGTGGGGAACAATGAAGGCTGATCACAGAATATCTGATGGCATGGGTAACAATTAAGCTCGATCATA + +a +s mr.mrrefChr0 37524 552 + 130230 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CAGGGAAGCTTCGGCTTCTTCCTTCTTCCTCAGCTGGCTAATGGAAGTAGGACTCCTAAGTAATGACTCTTAAGTGACTCCTAATTTACTACTTACCTCCTTTTATACCTGACCAGCTAATATTAGTGCTACTTGTTGATGGTTGAAGGCCCCATCCTTGACTCCCCTGCTTTAGTAGGTGGATAGGCTTCTACTTAACTAAGTCAATAGGCCCACCATTTGTACTTCATACAATGAATGAATACAAGCATATTTGATCTCCAAACACAGGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGGGAGAGGAATCATCTAGGGTCCATTTTCTTTTAAGTGATACATAAAATTTGGATAAGCATTAGCGTAGACTGGAGTTTAGATCTTGACAGGTGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTCATGAGATTTCGTTAGCGGTTTTTCAGGTTCAGTGTGTCCTGGCACCCTAAACCTTAAGAGAATGAGTTAAATTGGGATACTTCATAGCTGCAAATATTTCCAGGTATCTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 31985 520 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 41092 8 + 636262 CAGCTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 33326 8 + 647215 CAGCTTCA + +a +s mr.mrrefChr0 38880 3 + 130230 CAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41101 3 + 636262 CAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33334 3 + 647215 CAC + +a +s mr.mrrefChr0 38883 86 + 130230 CCATAGTAAACCTGTCTTGCCCAACCCACACCATCTGCCCCGGCTTCAATTTGTCAAGATGGTGCAAAGGCAGTCCTGGACACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41107 86 + 636262 CCATAGTAAACCTGTCTTGCCCAACCCACACCATCTGCCCCGGCTTCAATTTGTCAAGATGGTGCAAAGGCAGTCCTGGACACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 33337 86 + 647215 CCATAGTCAACTGGTCTTGCCTAAGCCACACCATCTGCTCTGTCTTCAACATGTCAAGATGGTGTAAAGGTAACCCTGAACACATG + +a +s mr.mrrefChr0 38969 365 + 130230 TCAGGAGCTGGATCCCTTATCTTTTTTAACTTATCAACGTGTCTTTGCCCTATCACTCCCACAGTTATGCGCCAGTCACTCTGAGTAGCACAGACAACTCTATTTCGACATTCAACATTCGAATTTGTATCTAGAACACAACACGTGGAATTGTTTTCAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAAGCAGCATATTTTGTCTTGAAAGGGCTGAGTGTGGAACCAACAGTGACTTGTTCCTCTACTCTAGTGTGGGGGTGTCACAGGACAGATTATACATATAGCAGGAATAGAAATTTAGACAGATGTTTGGCAGGATGTTATCTACAGATAATATTATCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41193 364 + 636262 TCAGGAGCTGGATCCCTTATCTTTTTTAACTTATCAACGTGTCTTTGCCCTATCACTCCCACAGTTATGCGCCAGTCACTCTGAGTAGCACAGACAACTCTATTTCGACATTCAACATTCGAATTTGTATCTAGAACACAACACGTGGAATTGTTTTCAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAAGCAGCATATTTTGTCTTGAAAGGGCTGAGTGTGGAACCAACAGTGTCTTGTTCCTCTACTCTAGCGTGGGGGTGTCACAGGACAGATTGTACATATAGCAGGAATAGAA-TTTAGACAGATGTTTGGCAGAATGTTATCTACAGATAACATTATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 33425 365 + 647215 TCTGGGGCTCAATCCCATCTCTTTTTTAACTTATCAGCGTGTCCTTGTCCCATCACCACCACAGTATTGTCACAGTTGCGCAGAGTAGCACAGACAACTCCATTTGGAAATCCAACAATCAAGCCTGTATTCAAAACACAACACTTTGAATTGTTTTGAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAGGCAGCATATTTTGTCTTGGAAGGGCTGAGTGTGGAGCCATCAGTGAGATGTTACTCTACTCTGGTGTGGGGGTGTCACAGGACAGAGTATACATATAGCAGGAATAGAAATTTACATAGATGTTTGGCAGGATGTTATCTACAGATTATATTATCTG + +a +s mr.mrrefChr0 39334 86 + 130230 TGCGGCAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTTTTCTCAAGCTAGATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCACCATATTAACAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41574 85 + 636262 TGCGGCAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTTTTCTCAAGC-AGATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCAGCATACTAACAATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 33790 86 + 647215 TGCAATAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTATTCTCAAGCTATATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCACCAGATCAACAATAA + +a +s mr.mrrefChr0 39420 40 + 130230 TGAACTTACATACTTAGGGTTCCTGAGTCTTTGAAGGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41659 40 + 636262 TGAACTTACATACTTAGGGCTCCTGAGTCTTTGAAGGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33946 40 + 647215 TGAACTTACATACGTGGAGTTCGTGAGTCTTTAAAGGAAT + +a +s mr.mrrefChr0 39460 39 + 130230 CTGGTAGAAAAGCCAAAATGGACCTACCACAGGGCCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41699 39 + 636262 CTGGTAGAAAAGCTAAAATGAACCTACCACAGGGCCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 612973 39 - 647215 CTGGTAGAAAAGCCAAAATGGACCTACCACAGGGCTACT + +a +s mr.mrrefChr0 39499 18 + 130230 TTACTATAGGAGTAAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41738 18 + 636262 TTACTATAGGAGTGGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 613017 18 - 647215 TTACTATAGGAACAAAGG + +a +s mr.mrrefChr0 39517 16 + 130230 CAGAAATAAGCTATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41756 16 + 636262 CAGAAATAAGCTATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 613038 16 - 647215 CTGAGATAAGCTATTA + +a +s mr.mrrefChr0 39533 57 + 130230 GGAAAGCAAATAGACAATAAACTGTGGAAACCACACATCTACAAGATGACTGCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41773 57 + 636262 GGAAAGCAAATAAACAAGAAACTGTGGAAACCACACATCTACAAGATGACTGCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 613054 57 - 647215 GGAAAGCAAATAGATAATAAACTGTGGAAACCCCCCATCTACAAGACAACTGCTAAG + +a +s mr.mrrefChr0 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GTAACAACCACCAACATGTGCGCCATGGTGAACATCAAAAGTCCTGTGGTCACTGTAAACTCTTGAAAACATAAGCTAAGGAAAGCT + +a +s mr.mrrefChr0 39763 49 + 130230 TTGCTCACACATGACTAGAGATATACCAACCATCCCAATAAGATAATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42009 49 + 636262 TTGCTCACACATGACTAAAGATCTACCAACCATCCCAATAGGAGAATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 34353 49 + 647215 TTGCTCACACATGACTAGAGACATACCAACCATCCCAATAAGATAATTG + +a +s mr.mrrefChr0 39812 268 + 130230 TGATTGTGCTAGTTGATGATAATGCAGTATCAGACAGAAAGAAGGATTAACTTCATTACATCACTTTGTAGTAAGGGTATTCCTGACCATGCTAGAGCGTTTTGGACCACCTCTGGTTAAAGGCTCATTATATAATCCATAACTGCTGTCAGGTCAGGTGTAAGTGGTTTAGACTCTACTGCATAGCTCATAGTTTTCAGCTGGTGCTTAATTGGGTGCCAATCAACTGTATCCAATGAACTGTAGTCTTGCACTTGGTGCTTCACGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42058 264 + 636262 CCAT----CTAGCTGATGATAATGCGGTATCAGACAAAAAGACGGATTAACTTCATTACATTGCTTTGTAGTAAGGGTAATCCTGACCATGCTAGAGCGTTTTGGACCACCTCTGGTTAAAGGCTCATTATATAATCCATAACTGCTGTCATGTCAGGTGTAAGTGGTTTAGACTCTACTGCATAGCTCATAGTTTTCAGCTGGTGCATAATTGGGTGCCAATCAACAGTATCCAATGAATTGTGGTCTTGCACTTGGTGCTTCACGA 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+a +s mr.mrrefChr0 41109 130 + 130230 TGTAAAGAATTTATTTTGTCATTTGCTTTTTTGACATTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGGACTATGTCCTGGGTTGGTTGCTCTAGCACAGGCTAATGTTCCTCAGTTATATTGGACTTAGATTCAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43347 130 + 636262 TGTAAAGAATTTTTTTTGTCACTTGCTTTTTTAACATTGGATGGATCAATCCATTTTAAGGAATATGTCCTGGGTTGGCTACTCTAGCATAGGCTAATGTTTCTCAGTTATATTGGACTTAGATTCAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 35678 130 + 647215 TGAGAAGAGTTTATTTTGTCATTTGCTATTCTGACGTTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGGACTATGTCCTGGGTTGGTTGCTCTAGCACAGGGTAATGTTCCTCAGTTATATTGGACTTAGAACACAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 35808 130 + 647215 TGTAAAGAATTTATTTTGTCATTTGCTCTTTTGACATTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGAACTATGTCATGGGTCGGTTGCTCTGGCACAGGTTAATGTTCCTCAGTTGTATTGGACTTAGATTCAAAG + +a +s mr.mrrefChr0 41239 171 + 130230 CCTGATAAATTGATCTATATTTGTTGGATTGATCACCTGCCATTTGTCATGTGAAACACAATCACAACTGTGGCTAGTTCCGATGTTTAGATATTTCCTTACTATAAGCGAGTGCATGTTTGGTGGGCACCCAGTCTTCTTGGCCCATATGTTAGATGAGAAGGACTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43477 165 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 44144 11 + 647215 TGATTTGTAAC + +a +s mr.mrrefChr0 49088 90 + 130230 GAACAAGGCCTCTCCTGTGCCACATCCCAAGAACTGTAGGGCTTAGCAAAATTGAAAAGGTTGTTAGGACAAACTAGTATAGGTAATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51299 90 + 636262 GAACAAGGCCTATCCTATGCCACATCCCAACAATTGTAGGGCTTAGCAAAATTGAAAAGGTTGTTAGGACAAACTAGTATAGGTAATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 44155 90 + 647215 AAACAAGGTCTCTCCTGTGCCACATCACAAGAACTGTGGAGCTTAGTAAAATTAAAGAGGGTGTTAGGACAAGCTAGTATGGGTAATACA + +a +s mr.mrrefChr0 49178 140 + 130230 TGAATGAGTATCAGAGGCTAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGTTTCGTGTGGCATTAATGGGATTAAACAGCTGAGTTCACAAATCCACTGGTTGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCTGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51392 140 + 636262 CGAATGACTATCAGAGGCTAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGTTGCGTGTGGCATTAATGGAATTAAACAGCTGAGTTCACAAATCCCTTGGTCGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCTGGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 44245 140 + 647215 TGAACCAGTATCAGAGGATAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGCTTTGTGTGGCACTAATGGGATTAAACAGCTGAGTTCACACATACACTAGTTGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCCAGATG + +a +s mr.mrrefChr0 49318 108 + 130230 TTGTGAGTACAGTATCCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGATACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTATGCCTGCTAATCTTCATTATTGGTTGATTCATATGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51532 108 + 636262 TTGTGAGTACAGTATCCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGATACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTATGCCTGCTGATTTTCATTATTGGTTGATTCATATGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 44400 108 + 647215 TTATGATTGCAGTACTCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGTTACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTACACCTGCTAATCTTCATTATTGGTTGCTTCATATGAT + +a +s mr.mrrefChr0 49426 42 + 130230 GATCTCCACAGGTGAGCTAGTTTTAATACTGACTGATCATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51640 42 + 636262 GAGCTCCACAGGTGAGCTAGTTTGAATACTGACTAATCATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 44519 42 + 647215 GATCTCCATAGGTGAGCTAATTTTAATCCTGACTGATCATCA + +a +s mr.mrrefChr0 49468 31 + 130230 CCTTTCCAGGTTTCACCCTGTTCCCTCCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51682 27 + 636262 CCTTTC----TTTCACCCTGTCCTTTTCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 44562 31 + 647215 CCTTTCCAGGTTTCACCCTGTTCCCTCCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 49499 198 + 130230 ATAGAGGAACCTGGGTGTGTAGGAGCTTGATGTCAATTCTGCAGAGTAGTACATTGCTGCTTCTGAATCCACTCAGAGTTTAATCTCACCATCTAGGAACCGTGCTCCTTGCTACTATTAATTTACACACCTCTTTAAAATTTCTGTTATCACCCTTGTGGTCCATAACAATAATATCACCCTTTTACTTATAACTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51742 197 + 636262 ATAAAGGAACCTGGGTGAGTAGGAGTTTGATGTCAATTCTGCAGAGTGGCACATTGCTGCTTCTGAATCCACTCAGA-TTTAATCTCACCATCTAGGAACCACACTCCTTGCTACTATTAATTTACACACCTCTTTAAAATTTCTGTTATCACCCTTGTGGTCCATATCAATAATATCACCCTTTTACTTATAACTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 44593 198 + 647215 TTAGAGGAACCTGGGTGTGTAGGATCTTGATGTCAATCCTACAGAGTAATAGATTGCTGCTTCTGAATCCACGCAGAGTTTAATCTCAGCATCTAAGAACCGTGCTCCTTGGTACTACTAATTTACACACCTCTTTAAAGTTTCTGTCATCACCCTTGTGGCCCATAACAATCATATCACCCTTTTACTTATTACTGA + +a +s mr.mrrefChr0 49697 227 + 130230 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 53444 41 + 636262 CTAAAGGTGGCCTtcactgggagggacctcctgtatgatag +s simRat_chr6.simRat.chr6 46572 41 + 647215 CTAAAGGTGGCCTTCACTGGAAGGGATCTCCTGTATGTTGG + +a +s mr.mrrefChr0 51168 24 + 130230 cttgaggtggcctagcccccactc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53527 24 + 636262 cttgaggtggcctagcccccactc +s simRat_chr6.simRat.chr6 46613 24 + 647215 CTAGaggtggcctaccccccactt + +a +s mr.mrrefChr0 51192 65 + 130230 agtccctttgtttgttaccaggtgcactagcgttttctttggaaagtttccagtAGCTCATAAGt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53551 65 + 636262 agtccctttgtttgttaccaggtgcactagcgttttctttggaaagtttccggtAGCTCATAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 46638 65 + 647215 ggtccctgactttgctaccaggggcactagcgttttctttggaaagtttccagtagctcataagt + +a +s mr.mrrefChr0 51257 10 + 130230 gaggcccagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53618 10 + 636262 GAGGCCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 46703 10 + 647215 gagacccagt + +a +s mr.mrrefChr0 51267 38 + 130230 AAGGGTGATCACACAAATTAGCTCTCTATCTGGTCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53628 38 + 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130230 TATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54573 5 + 636262 CATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54818 5 + 636262 TATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 47708 5 + 647215 TATTG + +a +s mr.mrrefChr0 52241 80 + 130230 CACAGCATCTTGTCATTGTCTAGATTATGCTTCCAAGGACCCATAGGCATAAAATATAACAACCAATAGGCAATGTGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54823 78 + 636262 CACAGCATCTTGTCATTGTCTAGAATATG--TCCAAGGACCCATAGGCATAAAATATAACAACCAATAGGCAATGTGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 47713 80 + 647215 CACACCACCTTGTCATTGTTGAGATTATGCTTCCAAGGACCCATAGGCATGAAATATAACAACCAATAGGCAATGTCAGA + +a +s mr.mrrefChr0 52321 55 + 130230 ACAGGACAGTAGTGAATCACCTGGCACTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54901 55 + 636262 ACAGGACAGTAGTGAGTCACCTGGCACTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 47824 55 + 647215 ACAGGACAGTAGTGAATCACCTGGTATTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG + +a +s mr.mrrefChr0 52376 23 + 130230 AAATTCGAGGACTATCATCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54956 23 + 636262 AAATTCGAGGACTATCATCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 48100 23 + 647215 AAATCTGAGGACTATCGTCATTA + +a +s mr.mrrefChr0 52399 224 + 130230 TTTACTTCCTACTGAGTATGTGCCAGGCCTACATATTTTTCCACTGAGTATGTACCAGGTGTGCAACTGTTCCTTCATTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCCTGAAATTTTTGCCTGCCTGTATCAGGCCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTCGGCATACCTATCTTTTGCATTCATTAGGTAGAATTGGCACAATGTCCACTGAAGCTCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54979 224 + 636262 TTTACTTCCTACTGAGTATGTGCCAGGCCTACATATTTTTCCACTGAGTATGTACCAGGTGTGCAACTGTTCCTTCATTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCCTGAAATTTTTGCCTGCCTGTATCAGGCCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTCGGCATACCTATCTTTTGCATTCATTAGGTAGAATTGGCACAATGTCCACTGAAGCTCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 48124 224 + 647215 TTTGCTTCACACTTAGTATGTGCCAGGTCTAAATCTGATTTCACTGAGTATGTGCTAGGCCTGCAACCATTTCTTCGTTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCTTGAAATTATTGCATTGATGTATCAGACCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTGGGCATACGTGTCTCTTGCATTCAGTAGGTATAATTAGAGTAATATGCACTGAGGCTCCATG + +a +s mr.mrrefChr0 52623 99 + 130230 TGACATCTAACACAGTATGCCCCTTGTGATTGGCTCACCAGAAGATTGAGTTTAAATGCAATTGTGTGTCTATATACATTGAGCGGCCAACGTTGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55203 99 + 636262 TGACATCTAACACAGTATGCCCCTTGTGATTGGCTCACCAGAAGATTGAGTTTAAATGCAATTGTGTGTCTATATACATTGAGCGGCCAACGTTGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48349 99 + 647215 TGACAACTAACACAGTATCTCCCGTGTGAATGGCCCACAAGAGGATTCAGTCGAAGAGCAATTGTGTGGCTGTATACAATGAATGGCCAACATTGAATG + +a +s mr.mrrefChr0 52722 111 + 130230 CCATGAGTGCCTATTGGATCTCTTAACTTGGCGCGGGCAGGTTGCACCCCATGTAAGCTGAAACTACACTATTGCAATTATGGCAGAGCCTGATAGACAACCTGCTGTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55302 109 + 636262 CCATGAGTGCCTATTGGATCTCTTAACTTGGCGCGGGCAGGTTGCACCCCATGTAAGCTGAAACTACACTATTGCAATCA-GGCAGAGCCTG-TAGATAACCTGCTGTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 48487 111 + 647215 ACATAGGTGCCTATTGGATCTCTTAACTCGGCACGGGCAGGTTGTGCCCCATGTAAACCGAAGGCACATTATTGCAATTATGGCAGGGCCTGATAAACAACCTGCTGTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 52833 50 + 130230 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACATTGACCTTGCAACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55411 50 + 636262 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACAATGAACTTGCAACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 48601 50 + 647215 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACATTGACCTTGCAACTA + +a +s mr.mrrefChr0 52883 110 + 130230 TAAACTTTTGAGAGCATTGGATAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAATGTTTTCATAAGCATAAATTATTGGTTTTTCTGGCTTTTCAAGATCATGGGTCTTAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55473 103 + 636262 TAAACTTTTGAGAGCACTGGATAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAACGTTTTCATAAGCATGAATTATTGATTTTTCGGGCTTTTCAAGATCATGGGT------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 48651 110 + 647215 TAAATTTTTAAGAGCATTGGACAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAATGCTTGCACAAGCATAAATTATTGGTTTTTCTGGCTTTTCAAGATCATGGATCTTAATT + +a +s mr.mrrefChr0 52993 266 + 130230 TCTAATTAACTACACCACTTGTTCTGAGGAATTAATACTAAGGGGGATGACATTTCCCTAGCTATCAGAGCATTGCCGGATGACATTGGTTGGCTTCCCGGACCTGCAGAAGAACAAACCACCCAAACATGTTGCACTGAAGATGATTCTGTTGTCCTCCCACATGACAGCTTATGGTAACAAAACACTCATTGGAAGGAGTGAAAGGGTGACTCACAGTCCGCAGAGAGGGAAGGGGACACAAACCCACTATAGAGATGTTCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55576 265 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 56131 3 + 636262 ATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 49290 3 + 647215 ATA + +a +s mr.mrrefChr0 53536 271 + 130230 ATCACTGTATAATTTTGATAAACTGGTTCCCACTAAATAAGTTTAAAATTGGAGTGATCTATGAGTCTGCATTTTGGTATGGATTTGTGCCACATCCACAACCAGGGCTCAAGATGTAAGCAGTGGTGGTGGTATAGGGTATCCCACTTAGTTTCAGTGATCAACATTTCTTTGTTAATATGAGTGTTGTATATATAGCATCAGTTGTACAGGTAGCATCAGAACTGGCATTGATGATAAAGGGTAACGGATCAGCAAAGCTGTCAGGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56134 267 + 636262 ATCACTGTGTAATTTCAATAAACTGGTTCCCACTAAATGAGTTAAAAATTGGAGTGATCTATGAGTCTGCATTTTGGTATGGACTTGTGCCACATCCACAACCAGGGCTCAAGATGTAAGCAGTGGTGGTGGTATAGGGTACCCCAATTAGTTTCAGGGATCAACATTTCTGTGTTAATATGAGT-TTGTTCATATATCATC---TGTACAGGTAGCATCAGAATCGGCATTGATGATAAAGGGTAACGGATCACCAAAGCTGTCAGGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 49294 266 + 647215 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CATGGGATCAACATAGTCTTTACAGCAACCCACTCAACTTTACTGTACAGGTGTATTAAGACTGTCTAGCTGTTCCGTCTCAAGTGCATGTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 49895 94 + 647215 CATAGGATCAACATAGTCTTTACACCAACCCACCCAACTCTACTGTACAGATGTATTAAGACTGACTAGTGGTTTCTTCTCAAGTCGTTGTGGT + +a +s mr.mrrefChr0 53967 133 + 130230 AATGTTAGATCAGTGTCCACTAAATGTATGTCTTAAGAATTGTTCATTGGAGAGAGTGCATAAAGCATCCTAGAATCTTAGCCCAATACATATATGAGATATTCAACTGGAGCCGTAATTACATGACTTGACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56562 133 + 636262 AATGTTAGATCAGTGTTCACTAAATGTATGTCTTAAGGATTGTTCATTGGAGAGAGTGCATAAAGCATCCTAGAACCTTAGCCCAATACATATACTAGATATTCAGCTGGAGCCATAATTACATGACTTGACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 49989 133 + 647215 AATGGAAGATCAATGTCCACTAAATGTATGTTTTAAGAATTGGTCACTGGGGAGGGTGCATAAAGCATCGTAGAATCTTAGCCCAATACATATATGAGATATTCAACTGGGGCTGCAACTACATGACTTTGCG + +a +s mr.mrrefChr0 54100 123 + 130230 AGAAATTCTTGGGGATCAATGGGTGTCATTGCCTGACTGACACTAGTTGATGGAGGTCTGCTGTCTAGGAAAGTTATGATATTTAAACTAGGTTGTAGCGGAAGACTTGCATATCCATTTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56794 120 + 636262 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AGAGTGGTGACACTGTCCCCATCCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAATTAAATGAAACACATTTTATGTCAGCGGACTCCAATTTAACTAAGGAGTATAAAAGTGACATTTCTCACACACTTGCCAATGCCCTGCTACAAATTTCCCTATGCAGGTACTCACACCAGTATACTTCTTCTTGCACCTGAAAACAGCTGGATGAATGTACACCCACCACAATAGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69576 243 + 636262 AGAGTGGTGACACTGTCTCCATCCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAATTAAATGAAACACATTTTATGTCAACGGACTCCAGTTTAACTATGGAGTATAAAAGTGACATTTCTCACAC-CTTGCCAATCCCCTGGTACAAAGTTCCCGATGCAGGTACTCACACCAGTATACTTCTTCTTGCACCTGAAAACAGCTGGATGCATGTACACCTACCACAATCGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 61349 229 + 647215 AGAGTGGT---TCTGTCCCCAACCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAT--AAATGCAACACGTCTTATGTCAGCTGACTCCAATTTAACTAAGGA----------GATGTTTTTCACACACTTGCCAATGCCCTGCTACAAATTTCCCTATGCAGGTACTCACACCAGTAGACTTCTTGTTGCGACTAAAAATGGCTAGATGAAACTATACCCACCACAATAGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG + +a +s mr.mrrefChr0 65898 143 + 130230 AGTTGTGTGCAACATTGACTTTAAAGGGATGAACACCTGTTGAAGTCAGCCTGAAAAAAAGTATAAAACAACATTCCTTTGCATGAAATTGCCTATAAAACCAGGAAAAGGCAGCCACATCCTACCCTTACTTAACTGCGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69821 137 + 636262 AGTTGTGTGCAACATTGACTTTAAAGGGATGAACACCCATTGAAGTCAGT------GAAAGTATAAAACAACATTCCTTTGCATGAAATTGCCTATAAAACCAGGAAAAGGCAGCCACATCCTACCCTTACCTAACTGCGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 61578 142 + 647215 AGCTGTGTGCAACATTGACTTTAAAGGGATGAACACCTGTTGAAGTCAGCCTGAAAAAAAGTATAAAACAACATTCCATT-CATGAAATTACCCATAAAACCGGAAAAAGGCAGCCACATCCTACCCTTACTTAACTGCATAC + +a +s mr.mrrefChr0 66041 236 + 130230 TGTTTTAATCTACCTAGCATGGTTATGAATGTTTTAGTCTGTGCAAGTGGAAAGCCCTTCCACTATTGCTTTCTTTAATGGGAACACTGTGAATTGAGCACAAGCCTGCCAGTCCACGGCACTATTGGTGCCTTGTCACTGGTCCAGCTTTTTTCTAAGTTCAAGAACTCTACGCCATCTTAACGCTAGACTCAATTCATGCACAATTGGGTGTAAATGAGTTAGACCATACCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69958 235 + 636262 TGTTCTAATCCACCTAACATGGTTATGAATGTTTTAGTCTGTGCAAGTGGAAAGCCCTTCCACCATTGCTTTCTTTAAT-GGAACACTGTGCATTGAGCATAAGCCTGCCAGTCCACGACACTATTGGTGCCTTGTCACTGGTCCAGCTTTTTTCTAAGTCCAAGAACTCTACGCCATCTTAACGCTAGATTCGATTCATGCATAGTTGGGTGTAAATGAGTTAGACCATACCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 61723 208 + 647215 TGTTTTAATCTACCTAGTATGGTTATGAA------------TGCAAGTGAAGAGCCCTTCCACTATTGCTTTTTTTAATGGGAACACTGTGAATTGAGGACAAGTCTGCCAGTACATGGTACTATTGGTGCCTTGTCACTGGTCCAGCTTTTTTCTAAGTTCAAGAACTCTGCGCCATCTTAACCCTAGACTCAATTCATGTGCAATTGGGTGTAAATGA---------------- + +a +s mr.mrrefChr0 66277 267 + 130230 CTGCTGTACTTCAGTTGGTGCAGGAGCATTGTTAACACCGGGATTCAATGTCTGGTGCTCTGCATCTAGGTTCTAGGACCAAGTGAGACACAAGTTTGCAGTTGAAATGTGCAGGAAAGAAAGAAGCACTCACTGTGTGTCATTGTATAGTTCCAAAAACATCAATTTGAACCTGGTCAAATACACAGAGTAGCCACTGTGTCAGGATATTCATCTGGGGTTGGAATGAACTTACTGCGGGTGTGAGTCAGGCCTGTATAATGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70196 266 + 636262 CTGCTGTACATCAGTTAGTGCA-GAGCATTGTTAACACCGGGATTCAATGTCTGGTGCTCAGCATCTAGATTCTAGGACCAAGTGAGTCACAAGTTTGCAGTTGAAATGTGCAGGAAAGAAAGAAGCACTCACTGTGTGTCATTGTACAGTTCCAAAAACATCAATTTGACTCTGGTCAAATACACAGAGTAGCCACTGTGTCAGGATACTCATCTGGGGTTGGAATGAACTTACTGCGGGTGTGAGTCAGGCCTGTATAATGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 61931 261 + 647215 ------TACTTCAGTTGGTGCAGGAGCATTGATAACATCAGCATTCAATGTCTGGTGCTCTGCATCTAGGTTCTAGGACTGAGTGAGACACAAGTTTGCAGTTGAAATGTGAAAGAAAGAAAGGCACACTCACTGTGTGTCATTATATAATTCCGAAAACATCAATTGGAACCTGGTCAAATACACAGAGTAGCCAAGGTGTTGGGATATTCATCAGGGCTTGGATTGAACTTACCGTGAGGGTTAGTAAGGCCTGTATGATGATGA + +a +s mr.mrrefChr0 66544 80 + 130230 CCTTTTCCAAGATGTGAAATTGGGGATTGAGAATGAGTGGCGTGCAAGGATTTTTACTTAGTCTACTGTCATTCAATCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70462 77 + 636262 CCTTTTCCAAGACGTGAAACTGGGGATTGAGAACGAGTGGCGTGCAAGGATTTTTACTTAATCTGCTGTCATTCAAT--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 62195 79 + 647215 TCTTTTCCAAGATGTGAAATTGGGGATTGAGAATGAGTGG-GTGCAAGGATTTTTACTTAGTCTACTGTCATCCAACCCT + +a +s mr.mrrefChr0 66624 175 + 130230 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296 + 636262 CATACATAGGTAGAAGGAACTATTCATGTCTAGGGAGGCTCATGATATCAACTTCCTTGATGTTTATTACCCAGCCCACAAAATCCTTACAAAACTTTGGTCCCATTGGGCAGAACACGCAACTATATCCAAAGTCTAATCTTCTAATGTGTGTTTCTTAGGGACAAGCCCAATTTGGTCTTCAGGCATTCATGGACTCTATAATGCACCCCTGGACACACATAAGGTACATAAGCTTTTAAGCTTTGCCTGCTCCTCCCTAACTATGGCAAGTTAAGTTTCACCATATCATGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 62451 290 + 647215 CATACATAGGTAGAAGGAATTATTCATCTCTGGGGAGGCTCATGATATCAGCTTCCTTGAAATTTATTACCTAGCCCACAAAATCCTTCCAAAACTTTGGTCCCATTGGGCAGAACACCCCACTTGATCTAAATTCTAATGTTCTAATGTATGTTTCTTATGGACAAGCCCCATCTGGCCTTCAAGCACTCGTGGACTCTATAATGCACCCCTGGACACATGGAAGGCACATAAGCTTATTAGCTTCTCCTGCTCCTCCCCAACTAT------TTAAGTATCACCATATCATGCTT + +a +s mr.mrrefChr0 67095 148 + 130230 AATAAGAGTGTAATGTTATTGATGGCATCTCATTTTTGGATGCCCAAGATGATCACAGGGTTCGGCATGACAAAAGTTATTCAATTTTTGCAGGTCTTTCAACTAGTATTGTTCAGCATCTAAAATCCTTTACAGTCTTATCTCCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71097 147 + 636262 AATAAGAGTGTAATGTTATTGATGGCATTTCATTTTTGGAAGCCCAAGATGATCACAGGGAACGGCATGCCAAAAGTTTTTTGATTTATGCAGGTCTTTCAACTAGTATG-TTCAGCATCTAAAATCCCTTACAGTCTTATCTCCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 62743 148 + 647215 AATAAGAGCGTACTGTTATTGATGGCACCTAATCTTTGGATGCCCAGGATGATCATAGGGTTCAACATGACAAAAGTTATTCAATTTTTGCAGGTCTTTCGACTAGTATTGTTCAGCATCTCAAATCCTTGACAGTCTTATCTCCACC + +a +s mr.mrrefChr0 67243 25 + 130230 TGAATCTCTTTGTTTGTTTTTAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71264 25 + 636262 TGAATCTCTTTGTTTGTTTTTAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 62891 25 + 647215 TGAATCTCTTTGTTTGTTTTTAATG + +a +s mr.mrrefChr0 67268 35 + 130230 TGCATATAGGTAGCTGCATTAACTGAGCTATAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71294 35 + 636262 TGCATATAGGTAGCTGCATTAACTGAACTATAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 62916 35 + 647215 TGTATTTAGGTAGCTTCATCAACTGAGCTATAGTC + +a +s mr.mrrefChr0 67303 298 + 130230 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mr.mrrefChr0 67601 174 + 130230 CTTGCCACATCCTTATACAATGTGTGGTTATGTGCACATGTGCCATGGTAATGACATCAATATAGTTGCCCAGTTTTGTTGCAGCCCAATAGGTACATAACTAGAGAATCACTTGGACGTGGAGGATCACCTGGGAATATAAGACTAAGGCACTCAGATTTATAGGATGGCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71626 174 + 636262 CCTGCCACATCCTTATACAATGTGTGGTTATGTGCACATGTGCCATGGTAATGACATCAATATAGCTGCCCAGTTTTGTGGCAGCCCAATAGGTACATAACTGGAGAATCACTTGGACGTGGAGGATCACCTGGGAATATAAGACTAAGGCACTCAGATTTATAGGATGGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 63267 174 + 647215 CTTGCCACATCCTTATACAATAAGTACTTATGTGCACATGAGCCATGGTAATGTCATCATCATAGTTGCCCAGTTTTGTTGCAGCCCATTAGGTACATAAGTAGAGAATCCCCTGGGAGTGGAGACTTACCTGGGAATCTAAGACTAAGGCACTCAAATTTATACGATGGCTTT + +a +s mr.mrrefChr0 67775 745 + 130230 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CCAGGGCTTCCTCTGCATATTTCATAGGAATGTGGAGTGAGTTGAATGAATTCTCCAAGCTGCATCCTGACTTACTTAAGAACTGGAAGCAAGTATAATATGTGTAGTCCTATCCAGGCATATATATGATGAACTAACTGAGATCTGATATTAACCTGAAGTTGTCTTTAACCAACCATCTGTGCAACAGACTTTATAAGTTCTATTTGATTATTCAATATGGGGATACTTTCTTGTTTCTTGGCATGTAAGGAACCCAATACCGCTGAGCAACTGGTCTTCCCTGACTGGTAATTTCATGATTGTATATTGGGCTGGGAAGACTATTCATTGCCCTATGTTTCTCTTAGGGGTTGCCTAACATCAAAATTCACCGATCTAAATACACCAGGTCTTTATCTACCTCAAATGAATTTATAAGCAAA--------CTCAGGTAACTTCAACCCCCCTGAGAGCATCCACTGAGTACAGG + +a +s mr.mrrefChr0 69565 33 + 130230 GGAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTACACCGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73572 33 + 636262 GGAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTGAACAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 65232 33 + 647215 GCAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTACCCCGC + +a +s mr.mrrefChr0 69598 266 + 130230 AAAAAGAAGAGATACACCATCTTTGCTTCTAAGGACTGACAGTGTCCCATGTTTTCAATTTCATTGAGTCTTCAATTTCATTGAGTTGAACTTATCTCCTAAGCCCTATTATGGAGATTATACTTTCAAATTGGAGATTTCACTTTTAAAATGATTGATCAGATCCATAGTTATGACCATATAGTCACATACCTAAACAGAAAGAGCTGTTCAAGAAGTGTGTATGTTTCCTCTCTGAGCGTCACTAATGTTTTAAAGCCTGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562255 234 - 636262 AAAAAGAAGACATACACCATCTTTGCTTCT-AGGACTGAGAGTGTCCCA-------------------TTTTCAATTTCATTGAGTTGAACTTATGTCCTAA--CCTATTATGGAGATTATACTTTCAAATTGGAGATTTTACTTTTAAAATGATTAATCAGATCCATAGTTATGACCATATAGTCAGATATCTAAATAAAAAGAGCTGTTCAAGAAGTGTGTGTGTTTCCTCTCTG----------ATGTTTTAAAGCCTGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65265 264 + 647215 AAAAAGAAGAGATACACCAT-TTCGCTGCTAAGGACTGACAGTGTCCTATGTTTTCAATTTCATTGAGTCTTCAGTTTCATTGAGTTGTAACTATCTCCTAAGCCCTATTATGGAGAGTATACTTTCAAATTGGAGATTTCACTTTTAAAATGATTGAACAGAT-CATAGTGATGACCAGATAGTCACATACCTAAACAGAGAGAGCTGTTCACGAAGTGTGTATGTTTCCTCGCTGAGCGTCACTAATGTTTTAAAGCCTGGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 69864 44 + 130230 AATGAATCTTGCCATGATCGACATAAGCATTCTAAAGCATGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562491 44 - 636262 AATGAATCTTGCCATGATCGACATAAGCATTCTAAAGCATGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 65529 44 + 647215 AATGAATCTTTCCATAATTGACACAACCATCTTAAAGAATGGTA + +a +s mr.mrrefChr0 69908 96 + 130230 CAATAAATATTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATATCTAGTGGTTGTGATAACAGTCCAGGGGGAGGCACCCATCTACTTTATCTAACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562535 96 - 636262 CAATAAATGTTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATACCTAGTGGTTGTGATAACAGTCCAGGGGGAGGCATCCATCTACTTTATCTAACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65581 96 + 647215 TAATAAATATTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATATCTAGTGGTTGTGAGGACACTCAAGGGAGATGCACCCATCTACTTTATCTAGCATT + +a +s mr.mrrefChr0 70004 23 + 130230 TATTTGGTAAGACTCCAGGCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74007 10 + 636262 T-TTGGGTA----AC-------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 65677 23 + 647215 TATTTGGTAAGACTCCAGGCTTA + +a +s mr.mrrefChr0 70027 308 + 130230 CATGCCGTTCAAGTAACCTTACCAGATTTCACAATGATGTTTGAGAGTCAGCTGTTGTAGAGCTTGTCTCATTTATAGCAGATGATCAAGTTGTTTATAGCAGATGATCAAGTGCAAAAGATAGTTATAGGGCCATTATTGGGAGCTACTGCATCTGAATTTTTGAACGTCAACACCATTTGCCAGAGTGATGAGTGCCAAAGAGGAGCAAACCCTTGATATAAGATAGTCTATCAAATCTTTTCTGGACAACTAGATTTTTTCACAATATGCACGATGACAAACCTTTTCTAGTCAAGATTCAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74017 295 + 636262 -------------TAACCCTACCAGATTACACAATGACGTATGGGAATCAGCTATTGTAGAGCTTGTCCCTTTTATAGCAGATGATCAAGTCCTTTATAGCAGATGATCAAGTCCAAGAGATAGCTATAGGGCCATTATTGGGAGCTACTGCATCTGAATTTTTGAACTTCAACACCATCTGCCACAGTGATGAGTGCCAAAGAGAAGCAAACCCTTGATATAAGATAGTCTATCAAATCTTTTCTGGACAACTGCATTTTTTCACAACATGCACGATGACAGACCTTTTCTGGTCAAGATTCAGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65706 289 + 647215 CATGCCGTTCAAGTAACCTTACCAGACCTCACAATGATGTTTGAGAGTCAGCTGTTGTGGTGCTTGTCTCATTTATAGCAGATGATCAAGTTGT-----------------GTGCAAAAGATAGTTATAGGGCCATTATTAGGAGCTACTGCATCTGAATT--TGTACGTCAACACCATTTGCCAGAGTAATGAGTCCCAAAGAGGAGCAAACTCTTGGTATAAAATGGTCTATCGAATCTTGTCTGGACAACTAGATTCTTTCACAATATGCATGATGGCAAACCTTTTCTAGCCAAGATTCAAAGT + +a +s mr.mrrefChr0 70335 177 + 130230 ATACTGGCTCTGGTAAAAGGAGGCTCTTGCCATGCCAAGGAAAAGAAATGTACACATTAACTGTTAACCATTTACAAACACTGACCTAAATTAAATAATGAATGACTGCAGGGTACCATGGATTCAGTGAATCATGCCTGCCCATGGGTAGTGTTAGTATTTCCTTGCTGAAGCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74316 177 + 636262 ATACTGGCTCTGCTAAAAGGACGCTCTTGCCATGCCAAGGAAAAGAAATGTACACATTAACTGTTAACCATTTACAACCACTGACCTAAATTAACTAATGCATGACTGCAGGGTACCCTGGATTCAGTGAATCATGCCTGTCCATGGTTAGTGTTAATATTGCCTTTCTGAAGCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65995 177 + 647215 ATACTGGCTCTGGTGAAAGGAGGCTCTTGCCATGCCAAAAGGAAGAAATGTAAGCATTAACTGTTAACCATTTACAAACGGTAACCTAAATTAAATAATCAGTGACTGCAGGGTACTATAGATTCAGTGAATCTTGCCTGCCCATGGGTATTGTTAGTATTTCCCTGCTGAAGCAAT + +a +s mr.mrrefChr0 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simRat_chr6.simRat.chr6 184505 7 + 647215 GGCTACC + +a +s mr.mrrefChr0 72051 174 + 130230 TGACATGAGGAACCAATGACTACTTCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAAACACCATGGACCCAGGAAGATTTTGGCCACTATGAACCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76263 174 + 636262 TGACATGAGGAACCAATGACTACTTCTGAGAGACTGTTAAATGCAGCTGGTCAGTTTGACAGCCACACTATTTAATGGGCACACCCTAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTTAAACTTTAGGGAGATGTCAAACACCATGAACCCTGGAGGATTTTAGTCACTATGAACCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 68334 172 + 647215 TGACATGAGGAATTGATGAC--CTTCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTTCTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAAACACGATGGACCCAGGAAGATTTTGGCCACTATGAACCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 184512 155 + 647215 -----------------TGC--GTCCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAGACACTATGGGCCCAGGAAGATTTTGACCACTACGAACCCATA + +a +s mr.mrrefChr0 72225 59 + 130230 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-------------AAAGATATGCTCCTAGAAACTAGACAGAGTGTCCCATTGTAATTGAACATATTACAGTCCTGCTAATCCTCTTTAACATGACCTGCTTGTCATAATCTGTCCCATTGTAGAACATTTCTCCCTTTGTTCCACAAAACTGTGCTATTTGCTATTTCTACAAATGTGTGGTGTTATTCACTTAGCATCAAGGCAAAGCTGAAAGCGGGGCATGATGGGCCACTGCCAACAATGCTTATACACATCTGTGTAGAATCTAGCTAATATGCCCACCTAATACAGAGATGGTCATTGTCCCTCGTACTCAAACCCATCAAAGCTGGATTACTGCAAGTTAGCTGTAAATATGTATGAATACACTCATCAG-ACACCAAGTCTAGCCAACTTATATAGGTCACAAGTGGACCAAAGACGCAGGATGTAAGACTGGTGGGGGGACCCCTAGTAGGTACCATTGTGGATCTATGGTAAATTAATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 68689 490 + 647215 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TTTGAATCATGTATGAGTTCAACTAATGGAATAATACCTAGTGACAATTGCCCAGCATATTTGTACCACAGCACACTCCAGGTTCATATGTCTCCATTTCCACATATTAAAACAGTTATGTGaggattgagactccaggttgatctacttgcttggtgtagttcacataacacctccagtttagtttcgtggctcagatctcaggtcCC + +a +s mr.mrrefChr0 73269 169 + 130230 ccagactgaaggctgcttggatatcaagaaggaagtttggagttgttacaaaatacccttgtagtgtctcatcttcaagacttaatatacaccaaatagaagacttttacggtatgagcactggggggtgggcaaacagcttcaggatcgccaccccaaccaagtgcca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77463 169 + 636262 ccagactgaaggctgcttggatatcaagaaggaagtttggagttgttacaaaatacccttgtagtgtctcatcttcaagacttaatatacaccaaatagaagacttttacggtatgagcactggggggtgggcaaacagcttcaggatcgccaccccaaccaagtgcca +s simRat_chr6.simRat.chr6 69804 169 + 647215 CCGGACTGAAGGCTGCTGGGATATCAAGAAGGATGTTCAGAGTTGTTACAAAATACCCGTGCAGTGTCTCAGCTTTAAGACTTAACATACACCAAATAAaagacttttatggtatgagcagtgaggagtgggcaaacaccttcaggattgccacaccatctaagtgcta + +a +s mr.mrrefChr0 73438 43 + 130230 gcattctttaagtagactgactatagacagaatgcagtggtgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77632 43 + 636262 gcattctttaagtagactgactatagacagaatgcagtggtgt +s simRat_chr6.simRat.chr6 69975 43 + 647215 gtattctttaagtagactgattatagacaagatgcagtgatgt + +a +s mr.mrrefChr0 73481 31 + 130230 aacttcacaaacacaaTGTCCCCTCCAAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77675 31 + 636262 aacttcacaaacacaaTGTCCCCTCCAAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 70024 31 + 647215 aacttcacaaacacgaTGTCCCCTCCAAGTC + +a +s mr.mrrefChr0 73512 19 + 130230 TGGAAAGTTGCTTGAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77751 19 + 636262 TGGAAAGTTGCTTGAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 70055 19 + 647215 TGGAAAGTTAGTTGAATCA + +a +s mr.mrrefChr0 73531 108 + 130230 CCTGCTTGGTTCTCAAATAGTACTGTAAGGTTGCCTGCTATTATTCGGTCTTACAATGCTGTGGAATTGTTACCCTACTGGGGATTGCTTTTTTAGATTCTATTGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77770 108 + 636262 CCTGCTTGGTTCTCAAATAGTACTGTAAGGTTGCCTGCTATTATTCGGTCTTACAATGCTGTGGAATTGTTACCCTACTGGGGATTGCTTTTTTAGATTCTATTGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 70075 108 + 647215 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TGAGACTGGCTGATTGTTAGAAAATGCGGCACCATTTGTTTATTTTAAATTAAATCCCGCGATGTAAACCATTTGGTGACTTAAGCACCAACTTCGGAGCATAGACGAGGCTCAGGGTTCGTACGAGGGGTCTAACTCACCCGGTAGTTAGTCGACCCTGCAAGAGAT---TTCCCTATCCTACACAGATCGGCTATCAGCTTCCCACGCTTAGTCCTTGTCTTTTGGGTGTGGGTATCTCTTAGATGCGGTTGGCAGCTTTTCTTACCGC--------------GTTCTGACCCAAGGCATAGGGATATCCCGTAAACTTCGGAGGACATGGCGCATTTATAGTTCGAGCGGTCAGAGTTATATTAGGTGCATGTTGCAGTATAATTTTAGGGTTAAAAGCTCAACCCACGGGCGTGCCAAACTCCCAAATGGGGGGGTCTGTCTTATTGTGGTGGCTTTGCACTGGCTAAAACTGAGCACTAAGATGTCAAAAGGTTAGCTACCTGCCATGAAGCAGGTTCTTGACTTTTACTTTCCCAGCTTCCCACACTATTGATGCATTCTTGATTATAGGGTAGCTGTCTTTGAAAGTTTATGCATCAGTAGTTGCACTATTTCATAAGCTCAGCCAA + +a +s mr.mrrefChr0 105040 84 + 130230 TCACATGGATTGTCAATCAAAGTGCTCACTGATCTCAACAGGCTGTTCAGTCTTCCTGTGTGTCCTTGTCATGATTCATTTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110190 84 + 636262 TCACATGGATTGTCAATCAAATCACTCACTGATCTCAACAAGCTGTTCAGTCTTCCTGTGTGTCCTTGGCATGATCCATTTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 102258 84 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 105984 162 + 647215 ---ATATGCAGGTCACAAATCTCAATAGCGTCCATAAACATTTTCCATAAACATTTCCACATAAAGAATTCATCTAGGAAAGGTTACGCAAAATACCTACTATGGAAATATTGACAACAGAAAGAAGTGGACTAAGACACCAGTCAATAAACATTCAAACAGTAA + +a +s mr.mrrefChr0 108503 206 + 130230 GACATGGGCTAATCATTGCATAATAATGCCAAGAATGAATTACCAAGAAAGAATAACCTTAATAGTTCCATGATATGGTGGTGGGGAAATCAGACCATTAGTGATCTACCACCATCTTATTGTGCCACATTAAAATGGAGGGGGGGCACAAAATGGACTCAATTATTGTAATGACAATACTTTGGTGGTAGGTTTAATCTTTAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113815 206 + 636262 GACGTGGGCTATTCATTGCATAATAATGCCAAGAATGAAGTACCAAGAAAGAATAACCATAATAGTTCCATGATATGGTGGTAGGGAAATCAGAACACTAGTGATCTACCACCATCTTATTGTGCCACATTAAAATGGAGGGGAGGCACAAAATGGACTCAATTATTGTAATGACAATATTTTGGCAGTAGGTTTAATCCTTAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 106146 205 + 647215 GACATGGGTTAATCATCGCATAATAAAGCC-AGAATGAATTGCCAAGACAGAAGAGGCTTAATAGTTCCGTGATATGGTGGTGTGGAAGTCAGACCATTAGTGAACTATCTCCATCTTAGTGTGCCACATTAAAATGGAAGGGGGGCACAAAGTGGACTCAATTATTGTAACAATAATCCTTTGGTGGTGGGTTTAATCTTTAGAA + +a +s mr.mrrefChr0 108709 94 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simRat_chr6.simRat.chr6 111535 53 + 647215 AAGGTTGAATTCAGAAGCAATTGTTGACTGAATGGGCTCTCTGTCTAGGACAT + +a +s mr.mrrefChr0 113512 11 + 130230 CTCCATGTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118826 11 + 636262 CTCCATGTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 111594 11 + 647215 CTCCATGTGCT + +a +s mr.mrrefChr0 113523 10 + 130230 TAGCACAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118838 10 + 636262 TAGCACAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 111605 10 + 647215 GACCATAACT + +a +s mr.mrrefChr0 113533 64 + 130230 TATCCTCCATGCGCTCACCATAATTCCTATGTTTACCACCACAGATAAGTTTGTATCCTGCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118848 64 + 636262 TATCCTCCATGTGCTCATCATAATTCCTATGTTTACCACCACAGATAAGTTTGTATCCTGCGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 111623 64 + 647215 TATCCTCCATGCACTGACCATAATTCATATGTTTGTAACCACAGATAAGTCAGTATCCTGCAGC + +a +s mr.mrrefChr0 113597 80 + 130230 TCACTATCCTATGATGGCCACCACAGATAGGTCCGTATCCTGCAGCACACTATGGAGGGCACAGCCGCCCAACTTTTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118912 80 + 636262 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TTGTTCTAGTTAACATATTGCATTATCTTACCCATAAGGCCAACCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 129929 47 + 647215 TTGCTCTAGTTGACATATTGCATTATCTTACCCACAAGTCCAACCAC + +a +s mr.mrrefChr0 126530 71 + 130230 AATACTGTCTCAATTATTTGCAAATAATTACAATGTTGTATTGGTTCACTCACAAGCACATTCTCATCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132177 71 + 636262 AATACTGTCTCAATTATTTGCAAATAATTACAATGTTGTATTGGTTCACTCACAAGCACATTCTCATCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 129976 71 + 647215 AATGTGGCCTCAAATATTTGCAAACAATTACTATGTTGTATTGGCTTGCTCGCAAATACATTTTTATCTCC + +a +s mr.mrrefChr0 126601 330 + 130230 AAGCAGAGAGAGGAGTTCAGAATTTTCCCTGCCACTCAGGAAGTTGAAATAGATGCAGGTACTTAGTTGGGTAGGACTTGTTTATCAGTATGCAATGTGCCCTTAGTAACAGCCAGCTAACACATGCATCTAGTGTTCAATTAATAGTTCTCCTATGCTCACTTCCCTCCCTACATGGAATGGTGGAGGGCCTTTATCTGGTGTGTACCAGTTCTCCGGTGTGCGGACCAGTTCTCTGGAGTTCATTTGCTCTTCCTGTCCAACGGATTCTGCAGATTGCATTGGCCCCTGTGATTCCAACTTATTGGTAGGTTAGCCTCCCCCAAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132273 317 + 636262 AAGCAGAGAGAGGAGTTCAGAATTTTCCCTGCTGCTCTGGAAGTTGAAATAGAAGCAGGTACTTAGTTGGGTAGGACATGTTTATCAGTATGCAATGGGCCCTTAGTAACAGCCAACTAACACATGCATCTAGTGTTCAATCAATAGTTCTCCTATGCTCACTTCCCTCCCTACATGGAATGGTGGAGGGCCCTTATCTGGTGTGTACCAGTTCTCCGGTGAACGGACCAGT-------------CTTGGTCTTCCTGTCCAACGGATTCTGCAGATCGGATTGGCCCCTGTGATTCCAGCTTATTGGTAGGTTAGCCTCCCCCAACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 130047 329 + 647215 AAGCAAAGAGAGGAGTTCAGAATTTTCCTTGCCACCCAGGAAGTTGAAATAGATGCATGTACTT-GTTGGGTAGGACTTGTTTATCAGTATGGAATGTGCCCTTAGTAACAGCCAGCTAACACATGCATCTAGTGTTCAATTTATAGTTCTCCTATGTTCACGTTACCCCCTATATGGAATGGTGTAGGACCTTTGTCTGTTGTGGACCAGTTCTCTGGGGTGCAGACCAGTTCTCTGGAGTTCATTTGCTCTTCCTGCCCAACGGATTCTACATATTGCATTGGCCCCTGTGATTCCAACCTATTGGTAAGTCAGCCTCCCCCTAATCA + +a +s mr.mrrefChr0 126931 136 + 130230 TGATATGCACCCCCATACCCCTTGATGAACAGGCCCACCCTTGTGAAAATACAGTTAGCCCAATGCTAAATGAAGGCTATTGCTAGACAAGAGCACATGGAACAAGACTAGGAAAAATGGAATCAAAATCAAGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132590 119 + 636262 TGATATTCACCCCCATACCCCTTGATGAACAGGCCCACCCTTGTGAAAATACAGTTAGCGCAATACTGAATGAAGGCTGTTGCTAGACAAGAGC-----------------GAAAAATGGAATCAAAATCAAGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 130377 136 + 647215 TGGTATGCGCCCCCAGACCCCTTGATGAACAGGCCCACTCTTGTGAAAATACAGTTAGCCCAATGGTAAATGAAGGCCAGTGCTAGACAAGAGCACATGGAACAAGACTAGGAAAAATGGGATCAAAATCCAGCGC + +a +s mr.mrrefChr0 127067 77 + 130230 AGTGAGGCCAAAGAAAGTGGATCTAAATCCTGGGGAAGTGTGCAAATGGGTGTGGTCCCTCTTGTTACTACCCTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132733 63 + 636262 AGTGAGGCCAAAGAAAGAGGATCTAAGTCCTGGGGGAGTGTGCCAATGGGTGTGGTCCCTCTT-------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 130513 77 + 647215 AGTGAGGCCAAAGAAAGTAGATCTAAATCCTGGGGAAGTGTGCAAATGGGTGTGTTCCCTCTTGTTACTACCCTTCA + +a +s mr.mrrefChr0 127144 33 + 130230 TCAACTCTAATGAACTAGGATGCATACCTTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132796 33 + 636262 TCAACTCTAACGAACTTGGGTGCATACCTTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 130595 28 + 647215 TCAACTCTAATAAACTAGGATGATGACC----- + +a +s mr.mrrefChr0 127177 39 + 130230 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mr.mrrefChr0 127424 78 + 130230 TCTCTAACTTTCATTTTTATAGCAGTATATCAAAGGTATACTTCCACTGTACACCTCCTTCATCAACAACAAGACACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133067 78 + 636262 TCTCTAACTCTCATTTGTCTAGCAGTATATCAAAGGTATACTTCCACTGTACAACTCCTTCATCAACAACAGGACACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 130871 78 + 647215 TCTCTAACTTTCCTTTTTATAACAGTATATCAAAGGTATACATCCACTGTACACCTCCTTCATCAACAGCAAGACGCT + +a +s mr.mrrefChr0 127502 247 + 130230 ATGAATACTTCTCTTGGTCCTAACTAACCAGGCTAATATACTCTGGGTCCTAACCAGCCAGGCTCTATCTTTGAGTGTCATGGGCATGAGGTTTCCCTTAATTGAAAGATTGATTAACAGAGTATCAGAATAGGTTCATGACTCCATACAATTTTAATCTTAGTCAAGGCCATGCCTTAGTAATCTGTATTTGCCCATAAGCTTTGTTAACCTACCTAGCAGTACTTAGGAATGGGAAAAACCTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133238 226 + 636262 ATGAATACTTCTCTTGGCCCTAGCTAACCAGGCTAATATACTCTGGGTCCTAACCAGCCAGGCTCTATCTTTGAGTGTCATGGGCATGAGATTTCCCTTAATTCAAAGATTGCTTAACAGAGTATCAGAATATGCTCATGACTCCATACAATTTTAATCTTAGTCAAGGCAATGCCTTAGTAAT---------------------GTTAACCTACTTATCAATACTTAGGAACGGGAAGAACCTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 130949 247 + 647215 ATGAATACTTCTCTTGGTCCTAACTGACCAGGCTAATATACTCTGGGTCCTAACCAGCTCAGCTCTATTCTTGAGTGTCATGGGCATGTGGTTTCCCTTAATTGAAAGATTGATTAACAGAGTGTCGGAATAGGTTCATGACTCCATACAACTCTAATCTTAGTTAAGGCCATGTCTTAGTAATCTGTATTTGCCCATAAGCTTTGTTGAGCTACCTAGTAGTACTTAGGAATGGGAAAAATGATAA + +a +s mr.mrrefChr0 127749 11 + 130230 GGAACTCTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133464 11 + 636262 AGAACTCCTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 131199 11 + 647215 GTAATTCTCGG + +a +s mr.mrrefChr0 127760 126 + 130230 TGATAATTGGTAATTCTCAAACTGTACATTTTAGATCCACTTGGGATAAATTATTCATGTCACCAGATTAGTAATGTTTTTTTGGTCTGGCACTCAGGACACGTCAGGCATAATATCTGGAGTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133475 126 + 636262 TGATTATTGGTAATCCTCAAACTGTACATTTTGGATCCACTTGGGATAAATTATTCATGTCACCAGATTAGTAATGTTTTTTTGGTCTGGCACTCAGGACATGTCAGGCATAATATCTGGAGTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 131216 125 + 647215 TGATAATTTGTAATTCTCAGACTGTACATTTTAAATACACTCTGGACAAATTCTTCATGG-ATCAGATTAGTGATGTTTTTTTGGTCTGGCACTCAGGACACTTCAGGTATAATATCTGGAGCCTT + +a +s mr.mrrefChr0 127886 338 + 130230 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TCCCACTCTTTGGTTTCTCAGGAGTTGCCTCTTGGGCTAGGTTAGGTGAAACCTTTAAGGTCAGCTAGCCTGTTCAGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 514546 80 - 647215 TCCCACTCTTGGGCGCCTCATGAGTTGCCTCTGGAGCTGGATTTGGTGAGACCTTTTAGGTCACCTAGCGTGTTCAGGGC + +a +s mr.mrrefChr0 130172 50 + 130230 ATGAGGAGTAGACGAAAGTGCCACTAGTGAAAAGTACCTACATAATTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135851 50 + 636262 ATGAGGAGTAGACGAAAGTGCCACTAGTGAAAAGTACCTACATAATTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 514627 50 - 647215 ATGAGCAGCAGATGGAAGCGCGACAGGTGAAAAGTATATACATAATTGTG + +a +s mr.mrrefChr0 130222 8 + 130230 ACATCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135902 8 + 636262 ACATCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 514677 8 - 647215 GCATCTCA + +a +s mr.mrrefChr1 0 107 + 670 TACTATGTGTCCATGGAGTTATGACAGGTTTGAGTCTCCAAACACCAGGAATCTGTTTGATCCTGAGGGTTTGTAATTTTCTATTCCAAGCCACCATCCAAAAGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635573 82 + 636262 TACTATGTGTCCATGGAGTTATGACAGGTTTGAGTCTCCAAACACCAGGAATCTGTTTGATCCTGAGGGTTTGTAA-------------------------AAGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 613 107 - 647215 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CCTTCCCTATATTTCCATCCTAGTGGCATAGTAGCTTTCGTGGAGCCATCTGCTGGGGGCCCAGGACTCAGTTGCAGCAGCTTAAGAAATCTCAACAACCTTAGACCCCCTAGCCTTAAATAGTGTATAAAGTGATGCTTGTTTCCAGAAATAACTTAGAACAACAAGGGTGATTAACATTACTCATGTTAGGTTCTGTTGGGTACTATACTGGGAAGAATGCATATAGTCAGTACATTCATACGCTGAATACCTGGGCAGGAAAGGATCCATCTTGGAAGAAGATCTGCCTTAAAGAACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442164 274 + 636262 CCTTCCCTATATTTCCATCCTAGTGGCACAGTAGCTTTTGTGGAGCCATCTGCTGGGGGCCCAGGACTCAGTTGCAGCAGCT----AAATCTCAACAACC-TAGACCCCCTAGCCTTAGATAGTGTATAAAGTGATGCTTGTTTCCAAAAATAACTTAGAACAACAAGGGTGATTAACATTACTCATGTTAGGTTCTGTTGGGTACTATACTGGGTAGAGTGCATATAGTCAGTACATTCATACGCTGAAAACCTGGGCAGGAAAGGATCCATCTTGAA------------------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 454233 303 + 647215 CCTTCCCTATATTTCCATCCTAATGGCATAGTAGCCTTCATAGAGCCATCTGCTGGGGGCCAAGGACTCAGTTGCAGCAGCTTAAGAAATCTCCACAACCTTAGACTCCCAAGCCTTAAATAGTGTATCAAGTGATGTATGCATCCAGAAATAACTTAGAACAATAAGGGTGATTAACATTACTCATGGAAGGTACTGTTGGGTACTATACTGGGAAGAATGCATATAGTCAGTACATTGATGTCATGAATACCTGGACAGGATGGGATCCATCTTTGAAGAAGATCTGCCTTAAAGAACAGG + +a +s mr.mrrefChr3 777 123 + 181019 ATCGTTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442438 119 + 636262 ----TTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 454537 123 + 647215 ATCGTTGTGATAAGGACCTGTAGTGTACCCACAGCACAGCATTAAAAGTCAGAGGTTAATGGGGTTGATAATTTTTTCTGTGGTGTGGGGCAGTTTTATAATACAGTTAGTGAGCCGCAGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 900 63 + 181019 AATAAAAGGATCACACATTAATGTTGCACCAATGGCACCAACCAGTGATACAGATCCAGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442559 63 + 636262 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-------------------------------------------ACCTGGTGGATTGGTAAATGTGCATATCAACTACTGGGAGATGGTTGGTTGCAGGCTTTTCTTCAGTGCTAGGGCAATAGAAATTTTAGCAGCTTAGTATCTACGATAAGTTATCTTTAACATCACAAATTATAACAGTCAGGTGTACTGT-CATGGTACTC-TATCACAGCAGTAATAAGAAGTCTAGGAACAGTGTATGAGAATTCTCAGTACTGTAAGCTTGTGGTGAACATATGCTACTCCTGTCTACCCCTTTTCCAAGTGCTGAATCAAGTTAGCCAAGATCCTATATGTAGTCCCTATTTTTGCCATCCTATGTACAGGATGTAGCATGC------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 456688 363 + 647215 AGAGTGATAGCCCACCATGATCCTTCAATGCTCCTTATTTGTGATCTGTTGGATTGGTAAATGTGTATATCATATCCTTGGAGAGGGTTG----CAGGCTTTTCTTCAGGGCCAGGGCGAGCAAAATTTTGGTGGTTTAGT-------TTAGATTATCTTTAACATCACAAATTCTGACCGTGAGGTGTACTGTACATGGTACTTTTATCA---CAGTAATAAGAAATCTAGAGACAGTGTATGGTAATTCTCAGTACTGTATGCTAGTGGTGAACATGTGCTACTCCTG--------TTATCCAA-TGCTGAATGGAGTTAACTGAGATTCTATATATAGTCCTTATCGTTGACATCCTATGTACAAGGTGTAGCATGCATGGCA + +a +s mr.mrrefChr3 3260 112 + 181019 GGAGCAACTGGAAATTCCTGGAATGTGTTTCAATCTTGATCCACTTAACCTGTATGACATTTTGCTGAGTACATCTCGGGATATATTCACAGACTGAAGTCGGCAATTCACA +s 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simRat_chr6.simRat.chr6 457527 43 + 647215 AGAAGTACCAGACATAATTGACATGTTTCCAATGGCTTACTGG + +a +s mr.mrrefChr3 3682 50 + 181019 ATGCACAGGTTAAAGGGTCACCAGCATTTCTGAGAGTGGGTTCATAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445245 50 + 636262 ATTCACAGGTGAAAGGGTCACCAGCATTTCTGAGAGTGGGTTCATAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 457570 50 + 647215 ATGCACAGGTTAAAAGGTCACCAGCATTTCTATGGGTGGATTCACAAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 3732 54 + 181019 TCAGCTGCTGGCGAAAGTTTACCCTCTATCTCACTCAACTGCTAGGCCTAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445296 54 + 636262 TCGGCTGCTGGCGGAAGTCTACCCTCTATCTCACTCAACTGCTAGGCCTAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 457620 47 + 647215 TCAGCGGCTGGCGAAAGTTTACCCTCTATCTCATTCAACTGC-ATGCT------ + +a +s mr.mrrefChr3 3786 60 + 181019 AGAATTGGCCCTAGTATTGGCTAGTCCCCTTGGTTTATATCACTTTAGATCCCACTTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445351 59 + 636262 AGAATTGGCCCTAGTATTGGCTAGTCCCCTTGGCTTATATC-CTTTAGATCCCACTTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 457667 60 + 647215 GGAATTGTCCCTAGTATTATCTAGTCCCCTTGGTTTATATCACTTTAGATCCCACTTCAG + +a +s 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28 + 636262 CTTAGACACACCTGAGTTTGGGAAGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 459829 28 + 647215 TTTAGACATGCTTAAGTCTGGGAAGGCC + +a +s mr.mrrefChr3 5941 75 + 181019 AACTCTATACTAAGTAATGGTACATAAGTGCTGTCGCCTTGCTGGCACAACAGAATGATAAGCAGAACATGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447727 75 + 636262 AACTCTATACTAAGTAATGGTACATAAGTGCTATCACCTTGCTGGCAGAACAGAATGATAAGCAGAACATGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 459857 75 + 647215 AACTCTATACTAAGTAATCGTACATTATTGCTGTCGCCACACTGGGACAGCAGAATGGTAAGGAGAACATGTCTC + +a +s mr.mrrefChr3 6016 45 + 181019 ATAATAAGTATCCAATCAATCTATCTGTTAAAGGCCAATTCCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447808 45 + 636262 ATAATAAGTATCTAATCAATCTATCTGTTAAAGGCCACACCCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 459932 34 + 647215 -----------CCAATCCTTTTCTTGGTTAATGTAGAATTCCTTA + +a +s mr.mrrefChr3 6061 16 + 181019 GTTAATGTACATTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447854 16 + 636262 GTCAAGCTATAGCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 459966 16 + 647215 GTTAGTGTACATTGTC + +a +s mr.mrrefChr3 6077 64 + 181019 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GTGCTACATCCCCAGTAAAAGGTTAGGAAACAAGAAAAGTAAAATTCCCTCTCAGGGTTGAGTGGGCAAGTCAACATTGAGAAATCTTCATTGACAATAATTTTTTGGGTGAACATTCTGTTATGTCCTTAGGATTTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 13582 11 + 181019 CATACCAGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455281 11 + 636262 CATACCAGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 467169 11 + 647215 CATACAAGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 13593 44 + 181019 TAGGATTTGAACATACAAGAATTTCATAAGTAGCCTGTGATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455292 44 + 636262 TAAGAGTTGAAAATACAAGAATTTCATAAGTAGCCTGTGATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 467240 44 + 647215 TAGGATTTGAACATACAAGAATTTTATAGGTGGCCTGTGGCCTT + +a +s mr.mrrefChr3 13637 179 + 181019 TCACCATTAGTCCTAGGCTTAGGACCTAAGATAGACCTACAAGGGCCTACCAGTATCACACAAAATAACCAAGAAACAAATATGACCAATCTTCTGTCAGTTGAGAAAAAGCATGTGTTGCTATACGATTTCTCAAACACCTGCCATCTGTGCATGTGTGTGTAAAAATACAGAATCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455336 179 + 636262 TCACCATTAGTCCTAGGCTTAGGACCTAAGATAGACCTACAAGGGCCTACCAGTATCACACAAAATAACCAAGAAACAAATATGACCAATCTTCTGTCAGTTGAGAAAAAGCATGTGTTGCTATACGATTTCTCAAACACCTGCCATCTGTGCATGTGTGTGTAAAAATACAGAATCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 467286 179 + 647215 TTACCATGAGTTCTAGGCTTAAGACCTAGGCTAGACCTACAAGGGTCTACCAGTATCACACGAAACAATCAAGAAACAGATATGATCAATCTTCTGTCAGTTAAGAAAATCCACTTGTTGCTATCTGATTTCTTAACCGCCTGCCACATGTGCATGTATTTGTGAAAATACAGAATTAC + +a +s mr.mrrefChr3 13816 107 + 181019 ATAATGCATGTTCTACACCTGGAGCCACCCTCATGATTTTAGTGCGTCCTAGTCCTGTTGCCGTAATACACATTAGAATGTGCTCCACCAAATGTGATAATGATACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455520 107 + 636262 ATAATGCATGTTCTACACCTGGAGCCACCCTCATGATTTTAGTGCGTCCTAGTCCTGTTGCCGTAATACACATTAGAATGTGCTCCACCAAATGTGATAATGATACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 467465 107 + 647215 ATTATGTATGTTCTACACCTAAAGCCACCCTCATGATTTTAGTGTATCCTAGTCTTGTTGCAGTAATGCACATTATAATGGGCTCCACCAATTGTAATAATGAGACT + +a +s mr.mrrefChr3 13923 31 + 181019 GATGGATGTTTATGCTACTACTTAAGGAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455627 31 + 636262 GATGGATGTTTATGCTACTACTTAAGGAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 467573 31 + 647215 GATGGATGTTTATCCTACTACTTAAGCAATA + +a +s mr.mrrefChr3 13954 299 + 181019 AAGTAAATTGAGTGAGGGTGTATAGAGCTGAAGATCTTAGGCTACAGGCAATGGGTGCCAAAAGTGTTCATTACCTAAACTAAATCATTAAGCACCTGGGACTGTTATTTTTTTTGGATGTGTGTAGGTGTTGGCAACTTAGGGTTTGATCCACATTGAGATCACAGGATATATATTATACTAGTTCAGTCATGGGACACTGCCTTGTTGGGATTGTAAAAGTCATGTCCCAATGGGATAATTCTAGGACAGTGATCTAGGACGGTGCAGATGAACTTCAAGTACATGGAGTCCAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455667 299 + 636262 AAGTAAATTGAGTGAGGGTGTATAGAGCTGAAGATCTTAGGCTACAGGCAATGGGTGCCAAAAGTGTTCATTACCTAAACTAAATCATTAAGCACCTGGGACTGTTATTTTTTTTGGATGTGTGTAGGTGTTGGCAACTTAGGGTTTGATCCACATTGAGATCACAGGATATATATTATACTAGTTCAGTCATGGGACACTGCCTTGTTGGGATTGTAAAAGTCATGTCCCAATGGGATAATTCTAGGACAGTGATCTAGGACGGTGCAGATGAACTTCAAGTACATGGAGTCCAAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 467604 299 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 459193 57 + 636262 ATGCGTCCACTTTAAGGTTGTGTCTTATCTAGGAGTCAAATTTGTCGACTTGTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 468456 55 + 647215 ATAGGGTCACTTTAAGGT--TGTCTAATCTAGGAGTCAAATTTGTCGATTTGTAAGT + +a +s mr.mrrefChr3 14838 25 + 181019 TGTACAGATGCTATTGGTGCTGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459122 25 + 636262 TGTACAGATGCTATTGGTGCTGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459250 25 + 636262 TGTACAGATGCTATTGGCGCTGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 468535 24 + 647215 AGTATAAATGATATTGGTG-GACTC + +a +s mr.mrrefChr3 14863 41 + 181019 AACGCACAAGCCTGAGATCACATTTTACAAGCATTACTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459152 41 + 636262 CACACACAAGCCTGAGATCACATTTTGCAAGCATGTTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459275 41 + 636262 AACGCACAAGCTTGAGATCTCATTTTACAAGCATTACTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 468559 40 + 647215 AATGC-CAAGCCTGAGTGCACATGTCTCAAGCATTACCCAA + +a +s mr.mrrefChr3 14904 35 + 181019 TACACCTTGATTTCTAAACTATGCAGCATCCAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459316 35 + 636262 TACACCTTGATTTCTAAACTATGCAGCATCCAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 468599 35 + 647215 TATATCTAGATATCTAAACTATGCAACATCCAGAC + +a +s mr.mrrefChr3 14939 33 + 181019 CACCCAGCATGAGATATAACATTTAGAGCTCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459356 33 + 636262 CACCCAGCATGAGATATAACATTTAGAGCTCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 468634 33 + 647215 TGCCCAGCATGAGATATAACATTTAGAGCTCGA + +a +s mr.mrrefChr3 14972 206 + 181019 GTTGTATGAGCTTTTATAACATACCATATGAGTATGTAAACTCATCAAGTTTTAGTACGTACAGACAATCTCCCATAAGTTTCAAGGATGCCCTTCAAGCACTGTCATTTAAACTGCCATTAAAGCTGATGCCATATATAATAACTAGTGGCTATCAAGATTTTTGGTTCTACAAACACTCATGCATTCTGTTGTACATTTTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459390 206 + 636262 GTTGTATGAGCTTTTATAACATACCATATGAGTATGTAAACTCATCAAGTTTTAGTACGTACAGACAATCTCCCATAAGTTTCAAGGATGCCCTTCAAGCACTGTCATTTAAACTGCCATTAAAGCTGATGCCATATATAATAACTAGTGGCTATCAAGATTTTTGGTTCTACAAACACTCATGCATTCTGTTGTACATTTTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 468667 206 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 459734 61 + 636262 TGCAAGGCTGCCCTTCAATTGCATGGCAACCTTCTGATCAAACCAGTGAACAATCTGATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 469048 61 + 647215 GGCAAGGCTGCCCCTCAATTGCATGGCAACCTTCTGATCGAACCAGTGAACAATCCCATAC + +a +s mr.mrrefChr3 15374 225 + 181019 TAGGGCCAAAAATCGAGTTGGTTGAAATTGACAGCCACTTCCCCACAGAGTAAAACAGTTTCATGCCCTGCATGCCACTCCTCAAGTTTGGTGATTCAGAACACTTGCCTATCGTGTCCACATCATCGCTAGGCCAACCAAAAaccttgatgagtctgagttttacaattttcaaatcactactgctggaagggctgcaagcaagttGATTGTCTAAAATGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459806 225 + 636262 TAGGGCCAAAAATCGAGTTGGTTGAAATTGACAGCCACTTCCCCACAGAGTAAAACAGTTTCATGCCCTGCATGCCACTCCTCAAGTTTGGTGATTCAGAACACTTGCCTATCGTGTCCACATCATCGCTAGGCCAACCAAAAACCTTGATGAGTCTGAGTTTTACAATTTTCAAATCACTACTGCTGGAAGGGCTGCAAGCAAGTTGATTGTCTAAAATGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 469109 225 + 647215 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AAGCATATAGGAGCCAGTAGGTGGGTCGGGCCATTCATAGCTAAGATTACACGTGGGGCAAGGAATGTCTTAAGCTGTTGAGAAGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 469443 88 + 647215 AAGCATATACAAGCCAGTAGGTGGGTCGAGCCATCTATAGTTAAGAGCACACATGGGGCAAGGAATGTCTTAAGCTGTTGAGAAGCAT + +a +s mr.mrrefChr3 15794 154 + 181019 AAAGTTCAGATGACGCAGATGAGACACCGATGGCTGGTAGCGTGAGGCGCCATGTAACCCCAAGCGACTAGGTAAGTTGCAGGTATCTCTTCGGACCAGTCAGAATAGCAACGAAACTGGATGCTCAATCTAACGTTCAGGCCAGCGGGCCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460233 154 + 636262 AAACCTCAGATGACGCAGATGAGACACGGATGGCTGGTAGCGTGAGGCGCCATGTAACCCCAGGCGACTAGGTAAGTTGCAGGTATCTCTCCGGACCAGTCAGAATAGCAACGAAGCTGGATGCTCAATCTAACGTTCAGGCCAGCGGGCCCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 469531 149 + 647215 AAAGT-----TGAAAAAGATAAAACAGCGTTGGCTGGTAGCGTGAGGCGTCATGTAACCCCAAGCGATTAAGTAAGGTGCAAGTATTTCTTCGGACCAGTCAGAATAGCAAAGAAATTGGCTGCTCAATCTAACGTTCGAGCTACAGGTCCCGT + +a +s mr.mrrefChr3 15948 64 + 181019 TGGAGATCAGGAGTGAGTCATAGCCAACTGTCTGGTAGTCTGGAGGTGGATTACATAGCACTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460387 55 + 636262 TGGAGATCAATAATAAGTCATAGCTAA---------ACTCTGGAGGTGGATTACATAGCACTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 469682 64 + 647215 GAGAGATCAGGAGTGAGTCATAGCCGACTGTCTGGTAGTCTGGAGATGGATTACATTGCACTTT + +a +s mr.mrrefChr3 16012 156 + 181019 TCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTATAGCTCAACAGGCTCCAATTGTGTAACCTCTAAGCTGTAAGTGACAGAGGGTTAGCTAGTAATATTGAGGATGTTAAAAGACAGGGGGGGAtggctGTGACAATACAAATATATGTGGAATGGAGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460442 156 + 636262 TCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTAGAGCTCAACAGGCTCCAATTGTGTAACCTCTAAGCTGCAAGTGACAGAGGGTTAGCTAGCAATATTGATGATGTTAAAAGATAGGGGGGGATGGCTGTGGCAATACAAATATATGTGGAGTGGAGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 469775 151 + 647215 CCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTATAGCTCAACATGCTCCAATTGCTTAACCTCTAAGCTGTAAGTGACAGAGTGTTAGCTAGTAATATTGAGGATGTTAAAAGACAGGGGGGGG-----GGGACAATACAAGCATATGCGGAATGGAGTATG + +a +s mr.mrrefChr3 16168 132 + 181019 AGAGgcaaaacggagtgggaatgttagcaacacaacacattcatgagggagtaatgtACTGACCCTATACGGTACACGATCAGGACGTCCTACCCTTCGAGAATAAATTAATATGAAGGGATTCTGGTCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460598 131 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CAAGGAACCTATGCATTCCTTCCCCCCCTTGTTCACTCACTGTTACCAGGGGGCTGGAATGTATTGGTTATTAAGCATGCTACTGGTATCAAATTCCAGGGTGCTGTGGTGACACCCAGGGGAAACAAAAGTATAACCTGGCATAACTCATTTGCTTAAAAAGCACCAAAAGATGTGTCCTTAACTAATTATAATAACTTACTATGCAGGTTCTATGTATCAAGGAATTACCTCTGCCTAACTTATTAACCGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTACCCTGCCTGATGGCTAAGGGTCTTTAAGACTGGGCAACTACCCTTCACAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 477373 337 + 647215 CTAGGTACCTATGTATTCCTTCCCCCCCTTGCACACTCACTGTTAGCAGGGGGCTGGCATATATTCATTATTAAGCATGCTACTGATATCAAATCCTAGGGCGCTGTGGTGACATTCAGGGCAAACAAAAGTACAACCTGGCATAATTCATTTGCTTAAAAAGCACTAGAAGGTGTGTTCCTCACTAATTACAATAACTTACTATGAGGGTTTTATGTGTCAAGGATTAACTTCTGCCTAACTTATGAAGTGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTATACTGCCTGATGGCTGAGGGTCTTTGAGACTGGGCAACTACATTTCACTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 23534 24 + 181019 GGCTAATCATGTTTCCATGTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467841 24 + 636262 GGCTAATCATGTTTCCATGTGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 477711 24 + 647215 GGCTAATCAGGGTTCCAAATTGTA + +a +s mr.mrrefChr3 23558 30 + 181019 ATCAGGAATATTGGCTATGATCCTTTTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467865 30 + 636262 ATCAGGAATATTGGCTATGATCCTTTTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 477787 30 + 647215 ATCAGCAGTATTGGCTATGATCCTCTTTAC + +a +s mr.mrrefChr3 23588 20 + 181019 CACCATAACTGCACCCCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467902 20 + 636262 CACCATAACTGCACCCCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 477817 20 + 647215 AGCCATAACTACACCCCAAG + +a +s mr.mrrefChr3 23608 13 + 181019 AGTTAGCTAAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467922 13 + 636262 AGTTAGCTAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 477840 13 + 647215 AGTTAGCTAAGCG + +a +s mr.mrrefChr3 23621 104 + 181019 TGTAAAGAAACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGATTGTCTTAGTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTCCCTATGCTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467938 104 + 636262 TGTAAAGAAACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGATTGTCTTAGTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTCCCTATGCTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 477853 104 + 647215 CGGCAAGATACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGCTTGTCTTATTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTTCCTATGCTTAT + +a +s mr.mrrefChr3 23725 98 + 181019 GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACTTGTTTTAAAGCACTTCACTGTCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468045 98 + 636262 GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGAATACCTTCCTTTGCAAGGTCTTGTTTTAAGGCACTTCACTGGCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 477957 98 + 647215 GGATTGTATTAGCACTGTCTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACATGTTTAAAAGCACTTCACTCTCTGGGCTACTCAAGGGACATGTATTATCA + +a +s mr.mrrefChr3 23823 58 + 181019 ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468168 32 + 636262 ACACAAGCCTCAGACAGCTTAATGCTCCAGGC-------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 478055 58 + 647215 ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA + +a +s mr.mrrefChr3 23881 356 + 181019 ACAGCTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCTGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAAACTTCCAGCTTCACCTAACCCCACCATGACAGGATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATGTGCAACTGTTTACCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCATCAGGGCTCCGATGTGGGGTCAACCATCACTATCAAGGATCAACCAAAATTCCAGGCTGGGTGTCACATTGTCTTTCTTCACACTTCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGACATTCATATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468200 337 + 636262 ACAGTTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCCGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAA-------------------CCCACCATGACAGAATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATTTGCAGCTGTTTGCCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCAGCAGGGCTCTGATGTGGGGTCAAGCATCACTACCAAGGATCAACCATCATTCCAGGCTGGGTGTTGCATTGTCTTTCTTCACACTCCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGGCATTCATATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 478117 353 + 647215 ACAGCTCCATTCAGATGTGCATTGGCTATGGACCTGCTGCTTCGACAGTTGCATCTGCTGCTTCCCACAGTTGCCATAGGTTGTATATCAACACTTCCAGCTTCACCTAACCCCACCCTGACAGGATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATGCATGACTGTTCACCATGCACAACCTTAAGGGCAAGTAAAAACTAATCTGTCTGCTTCCAGTATAATTTGACAATTCATCAGGGCTCCGATGTGGGGTCAACCATCACTATGACAGATCACCCAAAATTCCATGCCAGGTGTCACCTTGTCTCTCTTCACACTTCAAGCTGTG---CACCCAGGTATAATTTAGACATTCAAATT + +a +s mr.mrrefChr3 24237 313 + 181019 TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACCACACCACAGCCGTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAATGGAACTCCTCTGCATTGTGCTTTCCTGTGCTCTGTAATGACTTGTGGGATGATCCCATTGTATGAACTAAAGTACTGATGCCATTGAACACAAGGGGTTACAGAGTGGACATAAGACTGTGTCCTGCAACTTGGACAACATCTCAGGTTAAGGATTGTTATTAATACTGCAATCCATTTGCACTTTGGCTCTTTAATTAGATACTTGATAACTAACATTGTCACCCTCCAAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468537 308 + 636262 TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACTACAACACAGCTGTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAGTGGAACTCCTCTGCAGTGTGCTTTCCCGTGCTCTGTAATGACTTGTGGGATGATCCCATTGTATGAACTCAAGTACCGATGCCACTGACCACAACGGGTTAC-GAGTGGACATAAGACTCTCTCCTGCAACTTGGACAACATCT----TTAAGGATTGTTATTAATGCTCCAATCCATTTGCAATTTGGCTCTTTAATTGGATGCTTGATAACTAACATTGTCACCCTCCAAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 478472 313 + 647215 TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACCACACCACAGCCTTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAATTGGACTCCTCTACATTGTACTTTGCTGTGCTCTGTAAGGGCTTGGGGGATAATCCCATTGTGTGAACTAAAGTACTTTTGCCATTGAACCTAAGGCATTACAGAATGGACATAAGACTGTGTCCTGCAACTTCAACCACGTCTCAGGTAAAGGACAGTTATTAACAGTGCAATCCATTTGCACTTTGGCCCTTTAACTAGATAATTCGTGACTAACATTGTCCCTCTCCAAAGGG + +a +s mr.mrrefChr3 24550 131 + 181019 CTTCAAAGTTGCAAACAGAGCATACGCAAGTCAATTGCATACCGGAGCCCTCAAATGGCAATTAGTCCCAAGCCAACAATGATTGTGGGCCCACACGTTATGTTGTAGAATTCATTGGTTATAACGACTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468846 131 + 636262 CTTCAAAGTTGCAAACAGAGCATACGCAAGTCAATTGCATACCGGAGCCCTCAAATGGCAATTAGTCCCAAGCCAACAATGATTGTGGGCCCACACGTTATGTTGTAGAATTCATTGGTTATAACGACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 478785 131 + 647215 CTTCAAAGTTGCAAGCAAAGTATACACAAAGCAATTGCATACTGGAGCACTCAAATGGCAGATAGCCCCAAGCCAATAATGACTGTGGGCCCACCCGTTATGATGTAGCACTGACTGGTTATAACGACTTG + +a +s mr.mrrefChr3 24681 20 + 181019 GACCTGACTTATCACACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468985 20 + 636262 GACCTGACTTATCACACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 478916 20 + 647215 GACCTGGCTTATCACACTAT + +a +s mr.mrrefChr3 24701 512 + 181019 TGATTACCAACAAACTGTGGATTTACTGATCACTATACAGCACTCATTGCCTCGTTTATCATAGCCAAAGCAGTAAGAATCTTTAACAGCGCTGTCTGCAAGGTAGGCCGAATACAATTGAAGGCTTTGATTTCATCACAGGATAGTCACATGCTAATGAATAGTGTTAGTGGCAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTGCTGGTTTGTTCTAGTAGTGTAAATCTCCACAAGATATTGAGGTAATGGAAAATAAACAGTGTCAACGCGAGGTGATTGCTCTTTATATAATGGAATGTATATATAAGCTCTAATATGCTTGACACACATTTGAGACATGTGATACTGAACTACAAGAAATGCTCACAATTGCTAGGCTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTACGACTCATGTTGATTCTCAGTATATACTAGAACTGGACCAATAGTGGTCCATGAATACCTCCCTGTGCCTATCTTCTCGTCTTTCAAGCATATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469006 506 + 636262 TGATTACCAATGAA-TGTGGATTTACTGATCACTATACAGCACTCATTGCCCTGTTTATCATGGCCAAAGCAGTAAGAATCTTTAACAGCGCTGTCTGCAAGGTAGGCCGAATACAA-TGAAGGCTTTGGTTTCATCACAGGATAGTCACATGCTAATGAATAGTGTTAGTGGCAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTG--GGCTTGTTTTAGCAATGTAAGTCTCCACAAGATATTGAGGTAATGGAAAATAAACAGTGTCAACGCGAGGTGATTGCTCAGCTTATAATGGAATGTATATATAAGCTCTAATATGCTTGACACACATTTGAGACATTTGATACCAAACTACAAGAAATGCTCACAATTGCTAGACTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTACGACTCATGTTGATTCTCAGTATATACTAGAACC--ACCTATAGTGGTCCATGAATACCTCCCTGTGCCTATCTTCTCGTATTTCAAGCATGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 478936 472 + 647215 TGGTTACCAACAAACTGTGGA----------------CAGCACTCACTGGCTCGTTTATCACAGCCAAAGCAGCAAGGATCTTTAGCAGCTCTGTCTGCAAGGGAGGTTGAGTACAATTGAAGGTTTTGATTTCATCACAGG-TGGGTACATGCTAATGAATAGTGTTGGTTACAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTGCTAGTTTGTTCTGGTAGTTTAGATCTCCACAAGATATTGCAGTAATGGAAAATA-----------------------GCTTTTTATATAATGGAATGCATATATAAGCCCTAAAATGCTTGACACACATTTTAGACATGTGATACTGTACTACAAGAGATGCTCACAACTGCTAGGTTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTATCATTCATATTGACTCTCAGTACATACTAGAGCTGGACCAATAGTGGTCCATGAATGCCTTGCTGTGCCTATCTTCTTGTCTTTGAACCATATGTT + +a +s mr.mrrefChr3 25213 451 + 181019 TGGAGCCAGTCACCTGGATGGAGATGTTACTATGACTGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAGGTGGCACCATATAAGGTAGGGGGTCCCTTTGTTTATAATTCACAAATACGCATATACCATTGAAACACACCAAAACCCTGCGTACACAAGCCTGGTAATAGCTAATATTAACTTGCAAGATTGGAACACAGGATTGGCCAGGTTACCTGGCTGGCAGGAGAGACCCTTTAGCATTGGCATCCCTTGACAGCCTGAGTTGATGATTTAGGGTTAGTCTACAAAAAACAATAAATGTAAGAACCATCATTTTTCTCATACAGTTAATTGTCTCATACAGGTGAAGGTAGTCTAAAGGCTGCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTGACCTTGTTTTACAAGGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGTTACCAGTCTTTAGGTAGAATAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469515 435 + 636262 TGGA---------ATGGA----GATGTTACTATGACTGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAG-TGGCACCATATAAGGTAGGGAGACCCTTTATTTATAAT-CACAAATACGCATGTACCATTGAAACACACCAAAGCCCTGCGTACACAAGCTTGGTGATAGCTAATATTAACTTGCAAGATTGGAACACAGGATTGGCCAGGTTACCTGGCTGGCAGGAGAGACCCTTTAGCACTGGCATCCCTTGATAGCCTGAGTTGATGATGTAGGATTAATCTACAAAAAACAATAAATGTAAGAACCATCATTTTTCTCATACAGTTAATTGTCTCATACAGTTGAAGGTAGTGTAGAGGCTGCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTGACCTTGTTTTACAAAGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGT-ACCAGTCTTTAGGTAGAATAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 479408 426 + 647215 TGAAGCCAGTCACCTGGATGGAGATCTTACTATG--TGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAGGTGGCACCATATAAGGTAGGGGGTCCCTTTGTTTATAATTCACAAATACACACATACCATTGAAACACACCAAAACTCTGCGTACAC----CTGATAATAGCTAATATTAACTTGAAAGATTGGAACACAGGATTGGCAAGGTCACCTGGCTGACAGTAGAGACCCTTTAGCATTGGCATCC--TGGCAGCCTGAATTGATGATTTACGGTCAGTCTATGAAAACCAATAAATGTAAGAACCACCATTT-----------------GCCTCATTCAGGTAAAGGTAGTCCAATGGCTCCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTCATCTTGTTTTACAAGGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGTTACCAGTCTTTAGGTAGAATACT + +a +s mr.mrrefChr3 25664 19 + 181019 TAAAATTTGTATGAAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469950 7 + 636262 TAAAATT------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 438821 19 + 647215 TAAAATTTGTATGAAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 479834 19 + 647215 TAAAATTTGTATGAAACTT + +a +s mr.mrrefChr3 25683 1 + 181019 T +s simRat_chr6.simRat.chr6 479853 1 + 647215 T + +a +s mr.mrrefChr3 25684 42 + 181019 AAGGCTCTTAAGAATGAACAGCTTCAAGAGGTAACGATAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469957 4 + 636262 --------------------------------------AATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 438840 42 + 647215 GAGGCTCTTAAGAATGAACAGCTTCACGGGGTAACGATTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 479854 42 + 647215 AAGGCTCTTCGAAATGAACGGCTTCAAGAGGCAACGATAATT + +a +s mr.mrrefChr3 25726 134 + 181019 CATACATTTTTGTCAGAGACATGGCCCAGTGTAAACTTAGCATCATAAAAACTTTTATTTCTGGTACATTTATACTATGTCAACTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTGTGAATTTCTACCAAAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469961 133 + 636262 CGTACATCTTTGTCATAGACATGGCCCAGTGTAAACCTAGCATTGTAAAAACTTTGATTTCCTGTACATTTATACTATGCCA-CTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTCTGAATTTCTACCAAAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 438886 133 + 647215 CACACATTTTTGTCAGAGACATGGCCCAGTATGAACTTAGCATCATATAAATTTTTATTTCTGGTACATTTATACTATGTAAACTAAAGTAAGAATTTTGCTACTGGAGGAGTTTGTGAATTTCTATCCAAG-C +s simRat_chr6.simRat.chr6 479896 130 + 647215 CATACATTTTTGTCAGAGGTATGACCAAGTGTAAACTTAGCATCATAAAAACTTTTA---CTGGTACATTTATACTACATCAACTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTGTGAATTCCTACCAAAG-A + +a +s mr.mrrefChr3 25860 10 + 181019 ATCTCCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470094 10 + 636262 ATCTCCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 439022 10 + 647215 ATCTCCCGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 480026 10 + 647215 ATCTCACAAA + +a +s mr.mrrefChr3 25870 430 + 181019 AATGAGTTTGTAAAATCAATGGATTGATAGTGATGGGGTTGTATATATGACTCCTTTCACTCTGCATGCTAACATTGTTCAGAATTTATTTTTGTAGATGACTTTTCATGTTATGGCAGGAGTATCAATTGGCTTGAGCCATCAGAAAATTGTTCATCCCTGAATAGCTTGTGCACTTGGAGACAGCTGTGATCTCTGAGTGAACCTCTTAGACAAGATAGCTACATAAACCTATAGAGTACACCTAAGTTCTCTTTGCACTACCCCTCAGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCACACGTCCTAAATTACTTACACTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTGTGTTCAAGTCCACCCAACACTCTGGATCACTATGTTATCAAAACCACTACAAATCTCCACATGTTTCGCATTAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470104 429 + 636262 AATGAGTTTGTAAAATCAATGGATTGATGGTGGTGGGGTTGTATGTAGGACTCCTTTCACTCTGCATGCTAACATTGTTCAGAATTTATTTTTGTAGATGACTTTTCATGTTATGGCAAGAGTATTAATTGGCTTGAGCCATCAGAAAATTGTTGATCCTTGAATAGCTTGTACACTTGGAAACAGCTGTGATCTCTGAGTGAACCTCTTAGACAAGATAGCTACATAAACCTATAGAGTATACCTAAGTTCTCTTTGTGCTACCCCTCAGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCA-ACGTCCTAAATCACTTACAGTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTACATTCAAATCCACCCCACACTCTGGATCACTATGTTATCAAAACCACTACAAATCTCCACATGTTTCACATAAGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 480036 430 + 647215 AATGAGTTTGTAAAATCGATGGATTAATAGTGATTGGGTTGTATATGTGACTCCCGTCACTTTGCATGCTAATCTTGTTCAGAATCTATTTTTGTAGGTGACTATTCTTGTTATGACTGGAGTATCAATTGGCTTGGGCCATCAGAAAAATGTTCATCCCTGAATAGCTTGTGCACTTGGAGACAGCTATGACCTCTGAGTGAGCTTTATAGACAAGATTGCTACATAAACCTTGATAGTACACCCAAGTTCTTTTTGCACCACCCCTCGGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCACAGATCCTAAATTACTTAAACTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTGTGTTCAAGTCCACCCAGTACTCTGAATCATTATTTTATCAAAACCACTACACACCTCCAGGTGTTTCGCATTAGGCA + +a +s mr.mrrefChr3 26300 55 + 181019 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simRat_chr6.simRat.chr6 480590 110 + 647215 GTATTACATCTGATCTAGGCACAAAAACTCAATTTATGACTGACGCTTTTATGACCGTAGCTAAGCCCAACTAATAAAGGAAGTAGCAACGAAAAAATCAGCTTACCAGT + +a +s mr.mrrefChr3 26511 71 + 181019 AACACCAGGTTGAGACAACTGTCTTCAACCTGGTTAGGTAGACACAAGAAGGGCCTTTATTATGTTCTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470751 71 + 636262 AACACGGCATTGAGACAACTGTCTTCAACCTGGTTAGGTAGATGCAACAAGGGCCTTTATTATGTTCTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 480700 71 + 647215 AACACCAGGTTGAGACAACTATCTTCAACCTGGTGAGGTAGACATAAGGAGGGCCATTATTATGTTCTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 26582 100 + 181019 TCCACCCACAGAAAGCAGGAGTTATCTTACACTTGAGGTTCCACTTAGGGAGGTTTGTGGAAGATTTACTACAAGGGTGAGGGGCAGGCTCGTTGAGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470823 100 + 636262 TCCACCCACAGAAAGCAGGAGTTATCTTACACTTGAGGTTTCACTTAGGAAGGTTTGTGGAAGATTGACTACAAGAGTGAGGGGCCGGCTGGTTGAGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 480771 86 + 647215 TCCACCCACAGAATGC-----------TACACTTGTGGTTCCACTTAGGGAGGTTTGTGGAA---TTACTACAAGGGTGAGGGGTAGGTTCATTGAGCTC + +a +s mr.mrrefChr3 26682 37 + 181019 TAGATGCAGAATTATGTAGGGACTATTACTAGGGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470935 37 + 636262 TAGATGCAGAATTATGTAGGGACTATTACTAAGGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 480857 37 + 647215 AAGATGCAGTTTTATGTAGGGACTATTACTAGGCTAG + +a +s mr.mrrefChr3 26719 137 + 181019 CAAAAGACATTTACTGCATGGCCTTAAAGACAGATATCAATTTTGCCCCTGTATCTTCCTGTCTTGGCATGTAATGACTCTCACATTCTTCAGGAGTATGTTGTCCAGGAGACCTTAGTAAATCTTTGCTCATTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470976 137 + 636262 CAAAAGACATTCACTGCATGGCCTTAAAGACAGAAATCAATTTTGCCCCTGTATTTTCCTGTCTTGGCAGGTAATGACTCTCACATTCTTCACGAGTATGTTGTCCAGGAGACCTTAGTAAATCTTTGCTCATTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 480894 136 + 647215 -GAAAGCCATTTACTGCATCACCTTAGAGTAAGATATCCATTTTGCCCCTTTACCTACTTGTCTTGGCATGTAATTACTCTCATATTCTTCAGGAGTCTGTTGACCGGGAGGCCTTATTAACTCTTCGCTCATTAGA + +a +s mr.mrrefChr3 26856 144 + 181019 TATGCTAACCCTCATCTGCCATCACCATTATTTAAGAACATTGGTCTATGAGCTTATGCTTAAGAGGACCCCTGGCTGTGTCCGTGTTTGGTATTGTTTGGCTTTTGTCTGCATCCATCCTTAGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471113 144 + 636262 TATACTAACCCTCATCTGCCATCACCATTATTTAAGAACATTGGTCTATGAGTTTATGCTTAAGATGAACCCTGGCCGTGTCCGCGTTCCATATTGTTTGGCTTTTGTCTGCATCCATCCTTGGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 481032 144 + 647215 TGTGCTAACCCTCAACTGCCATCCCCATTGTTTAAAAACACTGGTCTATGAGCTTGTGGTTAAGAGGACCCCTGGATGTGTCCATGTTTGGTATTGTTTAGCTTTTGTCACCAACCATCCTCAGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC + +a +s mr.mrrefChr3 27000 52 + 181019 ATAGGCTGACAATCAAATCATTCCACCTGTTATTATCATCAATTCATAGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471257 52 + 636262 ATCGGCTGACAATCAAATCATTCCACATATTATTATCATCAATTCATAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 481184 52 + 647215 ATAGGCTAACAACCAAACCATTCCGACCGTTATCATCATTAATTCATAGAGA + +a +s mr.mrrefChr3 27052 23 + 181019 ACAGGGTTAGGATACTTGATTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471313 21 + 636262 ACAGGG--TGGATGCTTGATTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 481236 23 + 647215 ACAGGGTTAGGATACTTGATTGG + +a +s mr.mrrefChr3 27075 132 + 181019 AAGAAATGCTAACATTGCAAATTGGCATTGGGATTTGTCTAAATCTGCTTAGAGTATCTAGTTGAACAGCCCCCAGAAGGTGACCAAACGTTGGAGAAAGCAGATAACACTCAATACAATAAAGCTGGGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471334 131 + 636262 AAGAAATGCTAACATTGCAAATTGGCATTGGAATTTGTCTAAATCTGCTTAGGGTATCTAGTTGAATAGCCCCCAGAAGGTGACC-TACATTGGAGAAAGCAGATAACACTCAATACAATAAAGCTGGGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 481261 132 + 647215 CAGTAGTGCAAACATTGCAAATTGGCGTTGGGATTTGTCTAAATCCGCTTAGAGTATCTAGTTGATCAGCCCTGGGAAGGTGACCAAATGTTGGAGAAAGCAGAAAACACTCAAGACACTAAAGCTGGGGGA + +a +s mr.mrrefChr3 27207 204 + 181019 TGAGATGGACAAACCATCATCAGAGGGACCAATTTTCTCTGATTATGCTGAGTTAGTGTACATCCAGATTTGATCTCTCTTAGAATCTCAAATGGCAAATGTTAGACAATCTTTTGGATGCAATTTCTAGAGCATAGGTTCTAATTCATGCCAATGGAGAGGCAAGGATGTATAACACTTATTTTATGAGGCATGCTTGTTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471466 200 + 636262 GGAGACGGACATACCATCATCAGAGGGACCAAGTTTCTCTGATTATACTGAGCCAGGGTACATCCAGGTTTGAACTCTCTTAGAATCTCAAATAGCACA--CTAGATAATCTTTTGGATGCAATTTCTAGAGCATAGGTTCTAATCCATGCCAAAGGAGAGGCAAGGATATATAACACTCATTTTA--AGGCATGCCTGCTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 481393 176 + 647215 TGAGATGGACAAACCCTCCTCAGAGGGACCAATTTTCTCTGATTATGCTGAGTTGGTGTACTTCTAGATTTGATTTCTCTTCGAATCTCAAATGGCAAATGTTAGACAATC----------------------------TCTAATTCATGCACATAGAGAGGCAAGGATGTATAACACTTATTTTATGGGGCATGCTTGTTACA + +a +s mr.mrrefChr3 27411 156 + 181019 GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTTACTGATATCATTGGACCTACCTGTAATGGGGAAGCCCTCTGGACCATGCAAGGCTGAGGAGTGGACCACTAGATGGAATTGCTAGTACAAGAATTAAATAGATCATCATGATTGTAGCACTATAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471666 131 + 636262 GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTT-------------------------ATGGGGAAGCCTTCTGGACCATGCAAGGCTGAGGAGTAGACCACTAGATGGAATTGCTAGTATAAGAATTAAATAGATCGTCATGATTGTAGCACTATAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 481570 156 + 647215 GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTTACTGATATCATTGGACCTACCTGTAATGGGCAAGCCCTTTGGTCCATGCAAGGCTGAGGAGTGGACCACTAGATGGAATTGCCAGTACAAGAATTAAATAGATCATTATGATTGTAGCACTATGAA + +a +s mr.mrrefChr3 27567 11 + 181019 AAAGGGTAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471797 11 + 636262 AAAGGGTAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 481730 11 + 647215 AAAGATTAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 27578 192 + 181019 CCTGCTCATATCAATGATTAAAAGGAAAAACCAAGGATGTTCAAGTGAGAAAACAAGAAAATGGATGATCCTACTAGTAAGGAGGTGTAAATTATTCAATTAGCATCTATGGTCAGTTACATTAATGGTACAGAAGCAGGGGTACTCAGATGCTTAATAATTTTGACCTTGAGCTATTCCAGATCTAATGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471808 192 + 636262 CCTGCTCATGTCAATGACTAAAAGGAAAGACCAAGGATGTTCAAGTGAGAAAATAGGAAAATGGATGATCTTACTAGTGAGGAGGTGTAAGTTATTCAATTAGCATCTATTGTCAGTTACATTAATGGTAAAGAAGCAGGGGTCCTCAGATGCTTAATAATTTTGACTTTGAGCCATTCCAGATCTAACGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 481830 191 + 647215 ACTATGAATATCAAAGATTAAATGGAAAAAGCAAGGATGTTTAA-TCAGAAAACAAGAAAATGGATCATCCTACTAGTAAGGAGGTGTAAAGTATTCAATTAGCATTTATGGTCAGTTACATTAATCGTACAGAAGCATAGGTACTCAGATGCTTAATAATTTTGACCTTGAGCTGTTCCCAATCTAGTGTA + +a +s mr.mrrefChr3 27770 94 + 181019 ACTTACTACACTTCACCCTGCCTTAGTGCATGGTCCTGGCCTGAGCTCTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAACTCTGATTGCAGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472004 94 + 636262 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AAGCAAGCGACCAACAAAAACAGGTGACTAACTGCAGAATTGTACGATTATGACTCTGCTCATTTGGAGGACCATATCTAATGCAGGTACCAGCACCCCTAGCCACCCTATCCAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCAATGCACCTCCTTGTTGATTGGAATCCATCATCTAATGTACCCCAGACTGAGAGCCAACTCAAATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472203 219 + 636262 AAGCAAGCGACCAACAAAAACAGGTGACTAACTGCAGAATTGTACGATTATGACTCTGCTCATTTGGAGGACCATATCTAATGCAGGTACCAGCACCCCTAGCCACCCTATCCAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCAATGCACCTCCTTGTTGATTGGAATCCATCATCTAATGTACCCCAGACTGAGAGCCAACTCAAATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 163646 219 - 647215 GTGCAAGCAACCAACAAAACCAGATGGCTAACTACAGAATTGTACTATTGTGACTCTGCTCGTTCGGAGGACAATTTCTATTTCAGGTACCAGTATCCCTAGCCACCCTATACAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCGATGAGCCTCCATGTTGAGTGGAATCCATCATCTAATATACCCCAGACTAATAGCCAATTTAAATCGC + +a +s mr.mrrefChr3 28183 172 + 181019 CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCCTACACTCATAGCCACCTCAAAAGGTGGCAGCCACCCCTTACATATGTAAAAAGATCTAAGGGGCTTATATGGATTTCAAGCCTACTCATGTTTTTAGATTATCTGCTGAGTGTTTTTGGCTTGCACCTGTATCCTGGATATCTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472422 172 + 636262 CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCCTACACTCATAGCCACCTCAAAAGGTGGCAGCCACCCCTTACATATGTAAAAAGATCTAAGGGGCTTATATGGATTTCAAGCCTACTCATGTTTGTAGATTATCTGCTGAGTGTTCTTGGCTTGCACCTCTATCCTGGATATCTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 163870 172 - 647215 CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCATATACTAATAGCCACCACAAAAGGTTTCGACCCTCCCTTACATATATATGAAGATCCAAAGGGCTCACGTGGACCTCAAGCCTACTCATGTTTTTAGATTATCTGTAGAGTGTTTTTGGCTTGCATCTGTATCCTGGATATCTATT + +a +s mr.mrrefChr3 28355 206 + 181019 CTGGATGCCTGACATTGGAAAAGATGGGGGCCATGGATGAATTAAATGTATAAAGTTGAGGACACACTATCATGTAACAGTCTGGTCAGTAATCAATTAAAAGAAGCCAAACTCGGAAGGCTCCAGACCAGGGGTACATTGAGTGCTACATGGATTGCAAATTCACAGTCAATAGTGAATATTGGCTACCAGTACATTCTTAAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472595 202 + 636262 CTGGATGCCTGACATTGGAAAAGATGGGGACCATGGATGAATTAAATGCATAAAGTTGATGACACACTACCATTTAACAGTCTGGTGAGTAATCAATTAAAAGA--CCAAACTCGG-AAGCCCCAGACCAGGGGTACATTGAGTGCT-CATGGATTGCAAATTCACAGTCAATAGTGAACATTGGCCACCAGTACGTTCTTAAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 164042 203 - 647215 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CTCGTATTGAATTGGAAGTTAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 164330 24 - 647215 TTGAAATCGAATTGCAAGTTAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 28669 261 + 181019 TTCTTTTCCTTGTTTGGTTTGTCTGCTAGAAGGATTAGTACGTCATGTTTTGTCTTCTACAATGGCAGTGTAGCTGACCTGAAAACTAAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTCTTATGGAGCTTTCTATGGTGTGACCTTGAGGGGGAGATCTAGAGGAACTTATCTTATAAGTGAAGATAGTAGCTCTGACATGATGGATGAGGAATCCCTCTTGAGTATACAGTGCCACCCAGGATGAAATCTCAAGGAACTCCAAAGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472920 251 + 636262 TTCTTTTCCTTGTTAGATTTGTCTGCTAGAAGAACTAGTACATCATGTTTTATCTTCTGCAATGGCAGTATAGCCGACCTGAAAACTGAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTATTATGGGGCTTTCAATGGTGTGAC----------AGATCTAGAGGAACTTATCTTATAAGTGAAGATAGTAGCTCTGACATGATGGATGTGGAATCCCTCTTAAGTATACATTGCCACCCAGCATGAAATCTCAAGGAACTCCAAAGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 164355 258 - 647215 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181019 TACTAAAGGCATGCAGATGTGTTGCCAGCTCTCAACCAAGAGTCAAGAGTCAATTTAATCTGCAGATTAATAAAGATGCTGTCCAGTGCTCATGCAGTAGCTTTCTGCCTTGAATTATTCTGATGTCCATCCATCAATAACTCTGATCACTTGAGAGCAGGACTGTCTACAGGTTGTGCACCTGTGTTGAAAGGTGCTAGACTGGACCTGGGTCCATATTCAGAAGAGATCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473768 232 + 636262 TACTAAAGGCATGCAGATGTGTTGCCAGCTCTCAACCAAGAGTCAAGAGTCAATTTAATCTGCATATTAATAAAGATGGTGTCCAGTGCTCATGCAGTAGCTTTCTGCCTTGAATTATTCTGATGGCCATCCATCAATAGCTCTGATTACTTGAGAGCAGGACTGTCTACAGGTTGTGCACCTGTGTTAAAAGGTACTA-ACTGGACCTGGGTCCATATTCAGAAGAGATCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 483837 232 + 647215 TACTAAAGGCATGCGGATGTGTTGCCAGCTCTCATTCAAGAGTCAAGCGTCCATTTAATATGTAGCTTAATAAAGTTGCTGTCCAGTGATCATTCAGTAACTTTCTGCCTTGAATTG-TCTGATGTCCATCCATTAATAACTCTAATCACTTGAGAGCAGGACTGTCCACAGGTTGTACACCTCTGTTGAAAGGTGCTAGACTGGCCCTTAGTCCATATTCAGAAGAGATCCT + +a +s mr.mrrefChr3 29760 22 + 181019 GCACCATTGTCACTTCTTTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474000 22 + 636262 GCACCATTGTCACTTCTTTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 484070 14 + 647215 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474256 39 + 636262 ATAGAAAGTACGGTGCCCTTGTGTGAATTCAAGTTACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 484202 39 + 647215 ATAGAAAGCGCAGTGCCCTGGTGTGAATTCAAGTTACTT + +a +s mr.mrrefChr3 30017 123 + 181019 GGACTAGAAAATACATGATGCTGAAGCCTGCCATTCAAGGATTAATAATACCCAAGAAGGCACTCCTCTTATCCCCATGTATAAAAACAACCGCATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474298 123 + 636262 GGACTAGAAAATACATGATGCTGAAGCCTGCCATTCAGGGATTAATGATACCCAAAAAGGCACTCCTCTTATCCCTATGTATAAAAACAACCGCATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 484241 123 + 647215 GGACTAGAAAGTACATCATGCTGAAGTCTACTATTCAAGGATGAGTAATACCCATGAGGGCACTCCTCTCATCCCCATGGGTAAAAACAACCACATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 30140 12 + 181019 AAGATGGATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474722 12 + 636262 AAGATGTAACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 484364 12 + 647215 GAGATGGATTTG + +a +s mr.mrrefChr3 30152 367 + 181019 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ATATTTACTTAAACATAGAGGCCTGACAAGCCTTTTTAGAGAGAAATGGACGATTGCAAATAATAACATTTCCCTTGGTTCTCGTAACAAGATTGTAATGTTGGGTTGGAACTAAGGTAGTTAGAACTTAGCAATGCAGCAGTCGAGTACTTGTAGGTGACACACGGTTGGAATGGCTCACCCAATCCCAAGCTCCCTGAATTGAGTGATTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACATCTAGAAGGTTAGCAAGCACAAAGGTGATGATTGACTCTTCAAGTGTCGATGGATAGGACAGCAAGGGGTTGCAAGGTTCCAGCAGGTTTCCATGTTCAACACAAGGTATTGTAATCCTCTCTAGATTGGGAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 30519 31 + 181019 CCCATGCATCCCAGACTCAGCATTTTCAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475049 31 + 636262 CCCATGCATCACAGACTCAGCATTTTCAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 484743 31 + 647215 CCCATGCATCCCTGACTCAGCATTTTCAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 30550 174 + 181019 CTACTATGGCTGTTAGCTGGCTTTTTAAGCACAATTAATCCAAACGTTGAGACGCAACGATCATTAGAAGACCTTCATGGGCCATCCATTGTTATAGACAAACAGTGTTCATAGAGTGATAGTGAACAGGGATGGTCTACAGCCTGAGTGGCCCACCTAATTCACATCGAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475084 160 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 476499 42 + 636262 TTTTAGCGTGTATGTTTCATTGGTAATATTTAGCATGTATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 485560 42 + 647215 TTCAAACAAATATAAAGGATTGGTAATAATTAGCATCTGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 31348 148 + 181019 AGTCTATGGATTGTGAATATTTAGAATTGGCAGGCAGGAATTTAAAATCAATTTGGCAGACACACGTACTGGCTTTAACATCAATTCAATAAGCCAACAAACCCTCCCTTCAACATCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATTAATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476550 148 + 636262 AGTCTATGGATTGTGAATATTTAGAATTGGCAGGCAGGAATTTAAAATCAATTTGGCAGACACACGTACTGGCTTTAACATCAATTCAATAAGCCAACAAACCCTCCCTTCAACATCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATTAATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 485602 148 + 647215 ATTTTAGGCGTTGTGGACATTTAGAATTTGTGGGCAGGAATTTAAAATCAACTTGGCATACACACGTACTGGATTTAACATCAAATCAATAAGCCAACAAACCTTCCCTTCAACAGCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATCAGCTTG + +a +s mr.mrrefChr3 31496 21 + 181019 TTCCCTCTGCATCAATATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476699 21 + 636262 TTCCCTCTGCATCAATATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 485750 21 + 647215 TTCCCTCTGCAACACTCTATA + +a +s mr.mrrefChr3 31517 23 + 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CCTGTACTAGGCGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 39696 15 + 181019 TTAGGACCTGGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485573 15 + 636262 TTAGGACCTGACCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 493921 15 + 647215 TAAGGACCAGGACGC + +a +s mr.mrrefChr3 39711 158 + 181019 CCTGTTTGGCAATGAGAAGCCTTGAATATGACAACACAGAAACATTCAGTTCAAGATATAATCATCTTGCAAGACAAGTCAAGTAGTAAGATGTTTAAGGTACTGAGCATGCTGATCATTCTCAGTAGGCATAACATCAATAGGAGACTAATGACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485588 158 + 636262 CCTGGTTGGCATTGAGAAGTATTGAATATGACAGCACAGAAACATTCAGTTCAAGATATAATCATCTTGCATGACAAGTGAAGTATAAAGATGTTTAAGGTACTGAGCATGCTGATCATCCTCAGTAGGCATAACATCAATAGGAGACTAATGACATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 493937 158 + 647215 CCTGTTTGGCAATGAGAAGCCTTGAATATGATAACACAGAAACATTCAGTTTAAGATATAATGACCTTGCAAGACAAGTCGAGTAGTAAGATGTTTAATGTACTGAGCATGCTGATCATTATCAGCAGAGATAACATCAATAGGAGAATAATGACACA + +a +s mr.mrrefChr3 39869 52 + 181019 GACTTTCCACAACCCTCATACCATCTCTCATGCTATGGCAGGTACTCAAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485746 50 + 636262 GGCTTTCCACAACCCTCATACCA--TCTCATGCTATGGCAGGTACTCAAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 494097 51 + 647215 GAGTTTCCACAACTCTCATACCTTCTC-AATGCCATGGCAGGGACTCAAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 39921 100 + 181019 TGTTGCTGTGTAAAGTAGAACAAGTGCCTTAGTGGTCAGATCAATAGTTATTAATTCATTGCAGATATACTGCTTTGGATGTCTGAGCTCTTTCACAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485800 100 + 636262 TGTTGCTATGGAAGTTAGAACAAGTGCCTTAGTGGTCAGATCAGTAGTTATTAATGCATTGCAGATATACTGCTTTGGATGTCTGAGCTCTTTCACAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 494148 97 + 647215 TGTTGCTGTGTCAAGTAGAACAAGTGCCTTAGTGGTCGGATCAACAGTTATTAATTCATTGTGGATAT---GCTTTGGATGTCTGAGCTCTTTCACAGGC + +a +s mr.mrrefChr3 40021 109 + 181019 AGGGAGCCCTCCCAAGGAAAAAGCAGGGAATGAAACCTACCCTTAGAAGCCCAGGCCAAATGGTAGTGGGGACAGCCTCTCAGAGGGTGCCACTCTTTGGACCAGTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485901 109 + 636262 AGGGAGCCCTCCCAAGAAAAAAGCAGGGAATGAAACCTACCCTTAGAAGCCCAGGCCAAATGGTAGTGGGGACAGCCTCTCAGAGGGTGCCACTCTTTGGACCAGTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 494245 109 + 647215 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+a +s mr.mrrefChr3 40379 65 + 181019 GCCATAACAGGATAGATTACCCCCAATGTCTCTGTCACCAGATAGCTATATTCACTTCCTACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486260 64 + 636262 GCCATAACAGAATAGATAACCCCCAA-GTCTCTGTCACCAGATAGCTACATTCACTTCCTAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 494609 65 + 647215 GCCATTACAGGATAGATTACCACCAATGCCTCTGTCACCAGTTAGCTATATTCACTTCCTACAAA + +a +s mr.mrrefChr3 40444 91 + 181019 TCATTATTTACCTCGTATTATGACTGAGTTTAGGGGCCCTAGTATAATAGACAAATCATTTGTAATAGATCACCTTATAGAAAAGACGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486325 80 + 636262 TCATTATTTACCTCGTATTATGCCTGAGTTTAGGGGCCCCAATATAATCGACAGATCATTTGTAATAGATCACCGTATAG----------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 494674 91 + 647215 GCATTATTTACCTCGTATTTTGACTGAGTTCAGGGGTCCTAGTATAATAGACAAATCACTTGTAGTTGATCATCTTATAGAAAAGACGATA + +a +s mr.mrrefChr3 40535 576 + 181019 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-----------GAGCCTCCAAGCTAGGGAGTTTAGGACTTTCGTAGCTTACTTCTACATGCATCGTAAA---CACAACTGATGTAAAATGGCCATTAAGCAACAAATCATTCCAGCCATGGCTACATGTATAGTGAGCAGACCTACTCATCTTTGCTCTATCCTAGGAACCTTGTTTACAGTAGATACATGGCACATAGGTTCCATCGATTGCTATGTTTAGAATTTGATAGTGCTACTTACAATAGTACTATGTAGCATGAACTTCCTATCTTCATCTGAACATTTCCGGTGGGTTGGGATTCCTTCAAGTAGTAAAGAGTAACACCAGTTAATGTATAGGCCTAACACATCATCACTGCTATTGCGGTGGTTGGAGTTTGTTAGTGTCTGGAGTGAGTTAGGATGCGAAGTGTTTTGACCCATGT-------ATGATGTTATAGTTATTTGAGAACTTGTATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAAAATATACAAACTCCGACGAACACCACCATTCAGGTATGATACATTCATATGTTTAATATATTTGTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 494770 562 + 647215 TACCTGTATGAGAGCCTCCAAACTAGGAAGTTGAGGACTTCTTTAGCTTACTTCTACATGCATCTTAAAACTCACAATTGATTTAACATGGCCACTAAGGAACAAACCATTCCAGCCATGGCTTTATGTATAATGATCAGTACTACTCTTCTTTGCTCTATCCTTGGAATACATTCTACAGTAGATACATGGCAGGTAGGTGCCATTGATTTCTATGTTGAGAATTTAGTAGTGCCACTTACAATAGTACTATGTAGGATGA-CTTCATATCTTCATCTCAACATTACCAGTTGGTTGGGATTCCTTCTGGTAGTAAAGAGTGAGATCAGTTAATGTATTGGCCTAACATGTCAGTGCTGCTATTGTGGTGGTTGGATTTTGTTGGTAGTTGGAGTGTGTTTGGGTGCGAAGTGTTTTGGCCGATGTTACTTAGATGATGTTATCATTATTTGCGAGCTCATATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAGAATATACAAACTCCAACCAACACCACCATTCAGGTATGGTAGCTTCACATGTCTA------------- + +a +s mr.mrrefChr3 41111 120 + 181019 ACAGCCCATAGCTGTACAGCCCATTGTCTGACCAACTTGGAATCTAAGTTTTTCCTTCTTTAGGGACAGACAAGCCTTAGGTAAAACCTCCATGATGAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486962 120 + 636262 ACAGCCCATAGCTGTACAGCCCATTGTCTGACCAACTTGGAATCTAAGTTTTTCCTTCTTTAGGGACAGACAAGCCTTAGGGAAAACGTGAATGATGAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 495332 68 + 647215 ----------------------------------------------------CCCATCTTTAGGCACAGAAAAGCTTTAGGTAAACCCTCCATGGTTAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG + +a +s mr.mrrefChr3 41231 143 + 181019 AGCACTACTCTCTTCCTGTTCAAGATTAGGGAGTATTTTAATCTTAGATAGGCCCTAGCATCTGCTTTTTTAAAAACAATCTACCTCACTTCCCTGAGGAAAACCTATAGCTGCTCTATCGTTGCGGATGAAGCTCTATTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487084 143 + 636262 AGCACTACTCTCTTCCTGTTCAAGATTAGGGAGTATTTTAATCTTAGATAGGCCCTAGCATCTGCTTTTTTAAAAACAATCTACCTCACTTCCCTGAGGAAAACCTATAGCTGCTCTATCGTTGCGGATGAAGCTCTATTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 495400 143 + 647215 AGTACTACTCTCTTCCTGTTAAAGTTTAGGGAGTATTTTAATTCTAGGTAGGGCCTAGCACTTTCTTTTTTAAAAGCAATCTACCCCACTTCCCTGAGGATAACTTAAATGTGTTCTATTCTTGCAGATGAAGCTCTATCCTA + +a +s mr.mrrefChr3 41374 24 + 181019 TACACAATTACTTTCTTCACTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487251 24 + 636262 TACACAATTACTTTCTTCACTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 495543 24 + 647215 TAGACAATTACTTGCTTCACTTCA + +a +s mr.mrrefChr3 41398 130 + 181019 CGTCAGATAGCTCGAGACTCTAAAGTATTCTGCACAATATGTATATAGACAAATCAAAGGGGTGAGATTTAGTGGACATAAACTAGGTACAACCTAGTACTACTGAGCTTACGTTGTTGTAGAACAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487276 130 + 636262 CGTCAGATAGCTCGAGACTCTAAAGTATTCTGCACAATATGTATATAGACAAATCAAAGGGGTGAGATTTAGTGGACATAAACTAGGTACAACCTAGTACTACTGAGCTTACGTTGTTGTAGAACAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 495567 130 + 647215 TGTCGGATAGCTAGAGATTCCTAAGTGCTCTGCACAATATGTATATAGACCAATCAGAGGGGTAAGATTTAGTGGACGTAAACTGGGTACAACCTAGTACTACTGAGGTTAAACTGCTGTGGAACAAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 41528 33 + 181019 AAATGGAACATTATGTTGTTTGCGGAGAAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487407 33 + 636262 AAATGGAACATTATGTTGTTTGCGGAGAAATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 495697 33 + 647215 AAATGCAACATTATGCAGTTTGCAGAGAAATGT + +a +s mr.mrrefChr3 41561 29 + 181019 ATACCTCTTTTACACACAATTTCTAACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487445 29 + 636262 ATACCTCTTTTACACACAATTTCTAACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 495730 29 + 647215 ATACCTCTTTTATACACAACTTCTAACCC + +a +s mr.mrrefChr3 41590 22 + 181019 TACCAATAGTCACTTGGGTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487476 22 + 636262 TACCAATAGTCACTTGGGTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 495759 22 + 647215 TACCAATAGTCTCTTGTGTGCC + +a +s mr.mrrefChr3 41612 59 + 181019 ATTTCAGTCCACTATACATGGCCACTTCAAGATTATTCTAATAATGCATAATGCCTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487501 59 + 636262 ATTTCAGTCCACTATACATGGCCACTTCAAGATTATTCTAATAATGCATAATGCCTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 495781 59 + 647215 ATTTCAGTCCACTATGCATGGCTACTCCAAGATTGTTCTAATAACCCATAATGCCTAGA + +a +s mr.mrrefChr3 41671 147 + 181019 CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCACACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTGTCTATGTGAGATATTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487567 147 + 636262 CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCCCACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTATCTATGTGGGATGTTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 495840 147 + 647215 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TTGTAAGTTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAATGGATGGAGCGCTGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 496603 48 + 647215 TTGTAAATTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAGTGGATGGAGTGCTGGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 42831 14 + 181019 AGTGCTTTGGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488817 14 + 636262 AGTGCTTTGGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 496651 14 + 647215 AGTGCTTTGGCTGT + +a +s mr.mrrefChr3 42845 115 + 181019 CATGTTAATCCACTCCACCCTCCAAGGGCAATATTGCAGTCACCTGGTTTCACACACATGCTAGTGGTTTACTCCTAAACAGGCCTGTTCTTCAATCATTAGCTCTTGCAGCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488831 114 + 636262 CATGTTAATCCACTCCACCCTCCAAAG-CAATATTGCAGTCACCTGGTTTCACACACATGCTAGTGGCTGACTCCTAAATGGGCCGGTTCTTCAACCATTAGCTCTTGCAGCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 496670 115 + 647215 CATGTTAATCCACTCGACCCTGCAAGGGCAATATTGCAGTCACCTGATTTTGCACACATGCTAGTGGTTTACTCCTAAACAGGCCTGTTCTTGAATCATTAGCTCTTGCTGCGTA + +a +s mr.mrrefChr3 42960 35 + 181019 AGCCCAGAGTTTAGGCCTCATTTGAGATTGTGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488958 33 + 636262 AGCCTAGAGTTCAG--CTAATTTGAGATTGTACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 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80 + 636262 TTGTGTTTTTTCCTGGAGTGAGGCCAAGGTATAAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTG--------CAGATT-----TTGTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 496944 93 + 647215 TCGTATTTATTCCTGGACTGAAGCCAGGGTATTAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTGTTGCTGTGCAGATGATAAATTGTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 43208 217 + 181019 TGAGGCAAACTCTCCCCATGGGCACTGAGCCTCTATTGATTGTCATGCCTCCATCTTATCTACTTGCTTTTCAAACTTTGTAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGGGCATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCGCTCATTCAGGGTTTAGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTCTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489202 214 + 636262 TCGGGTGAACTCTCCCCATGGGCACTAAGCTTCTATTGATTATCATGCCTCTATCTTATCTACTTCCTTCTCAAACCTTGCAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGG-CATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCACTCATTCAGGGGTTCGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTC--TT +s simRat_chr6.simRat.chr6 497037 215 + 647215 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------------GGGATGGAGTTTAGGCTCAGCATCATGGATGGTCAACTGGAGCCTAATGTCTAGCACAAGA + +a +s mr.mrrefChr3 48124 52 + 181019 tttgtgtgtgtaaagtcacgatgttgggaccctttgaggggtattttgtata +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493955 52 + 636262 tttgtgtgtgtaaagtcacgatgttgggaccctttgaggggtattttgtata +s simRat_chr6.simRat.chr6 502062 52 + 647215 TCTGTGTATATAAAGTCATGATGTTGGGCTCCTTTGGGGGGCATCTTATATA + +a +s mr.mrrefChr3 48176 24 + 181019 acctgctaaagttagttgctcccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494007 24 + 636262 acctgctaaagttagttgctcccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 502115 24 + 647215 ACCTGCGAGAGTGAGTTGCCCTCC + +a +s mr.mrrefChr3 48200 18 + 181019 tcaagcatcaactgatgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494031 18 + 636262 tcaagcatcaactgatgc +s simRat_chr6.simRat.chr6 502158 18 + 647215 TCCAGCATCAGCTGATGC + +a +s mr.mrrefChr3 48218 76 + 181019 agcatcctAGACCTACCTACATGAATGAACAATGTATAGTGAAGGGTGATGACATATCTCATGCAATGTGAGACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494049 76 + 636262 agcatcctAGACCTACCTACATGAATGAACAATGTATAGTGAAGGGTGATGACATATCTCATGCAATGTGAGACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 502177 76 + 647215 AGTATCCTAAACCTACCTACATGAATGAACAATGCATAGTGAAGAGTGATGACATGTCTGATGCAATATGAGACTC + +a +s mr.mrrefChr3 48294 9 + 181019 TTTTTATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494411 9 + 636262 TTTTTATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 502253 9 + 647215 TTTTAAAGT + +a +s mr.mrrefChr3 48303 64 + 181019 AAGTATGAGGGGGTGAGGACCCTAGTTCTAGATGTGGTAAAATAggagtggggggggaggaggg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494420 64 + 636262 GAGTAGGAGGGGGTGAGGACCTTAGTTCTGGATGTGGTAAAATAggagtggggggggaggaggg +s simRat_chr6.simRat.chr6 502264 64 + 647215 AATGATGAGGGGGTGAGGACCCTAGTTCTAGAGGTGGTAAAATAGGGGCagggggggaggaggg + +a +s mr.mrrefChr3 48367 232 + 181019 agggtgggggggggggaggggagggAAGTAAAGGAGGTAAAGTTTAAAGCATAACAGTGCTTTGTAAACAAATTTCACAAAATAGCATATTGCGCCAAGTTTTATAAATTGAATTCTGTTATGGTTAGGCACAGATAAGGGCTCACATTGGGTCATGACTGGTTATGTTAAAGGTAGACTCATTTTTTCTTCAATTAACAACTTGGCAAAGGCTTTTAGGTTTAAATATGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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---CCTGG-TAGACTTTGCACATCTGACAACTTCAATTCACAGGTTCATTA + +a +s mr.mrrefChr3 50348 15 + 181019 CTCCAGTCATGGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195127 15 - 636262 CTCCTATCATGGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496349 15 + 636262 CCCCAGACCTGGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 197043 15 - 647215 CTCCTGTCATGGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 508778 15 + 647215 CCCCAGTGATAGAAG + +a +s mr.mrrefChr3 50363 1 + 181019 C +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496364 1 + 636262 C +s simRat_chr6.simRat.chr6 508793 1 + 647215 C + +a +s mr.mrrefChr3 50364 8 + 181019 CAATAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195142 8 - 636262 CAATAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496365 8 + 636262 CAATTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 197058 8 - 647215 TAATAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508794 8 + 647215 CAATAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 50372 7 + 181019 TTTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496373 7 + 636262 TTTAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508802 7 + 647215 TTTAACT + +a +s mr.mrrefChr3 50379 53 + 181019 CACAAGTCATGACCCCAAGTCATGGAAGCCAACAGAAACACATGGGAGCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195150 53 - 636262 ACACAGCCATGGCCCCAATCTGTGGAAGTGAACAGAAACACATGGGAGATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496380 53 + 636262 CACAAGTCGTGACCCCAAGTCATTGAAGCCAACAGAGACACACGGAAACTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 197066 53 - 647215 CACAAGTCATGGCCCCAAGCCATGGAAGTGAACAGAAACACATGGGAGATTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508809 53 + 647215 TACAAGTCATGACCCCAAGTCATTGAAGCCAACAGAAACGCATGGAAACTTGG + +a +s mr.mrrefChr3 50432 13 + 181019 TCAGGAACTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496433 13 + 636262 TTGGGAACTAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 197119 13 - 647215 TCAAGAACCAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508862 13 + 647215 TCTGGAATTAAAA + +a +s mr.mrrefChr3 50445 6 + 181019 TTTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195203 6 - 636262 TATCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496446 6 + 636262 CTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 197132 6 - 647215 TTCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508875 6 + 647215 TGTCAT + +a +s mr.mrrefChr3 50451 47 + 181019 CTATCTTAAGCTTAAGGGGTCAAAGGAATAGACCTAGTACCTTAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496452 47 + 636262 ATAGCTTAAGCTTAAGGGGTCAAAGGAACAGACCTAGTACCTTAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 197138 47 - 647215 CTTTCGCAAGCTTAACGAATCAAAGGAATAGACCTAGTACCTTAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 509109 38 + 647215 CTACGTTAAGCTTAA---------GGGGTAGACCTAGAACCTTAGTC + +a +s mr.mrrefChr3 50498 1 + 181019 C +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496499 1 + 636262 C +s simRat_chr6.simRat.chr6 509147 1 + 647215 C + +a +s mr.mrrefChr3 50499 29 + 181019 TGACACCTACACATGAGCTAGCAATTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496500 29 + 636262 TGACACCTACACATGAGCTAGCAATTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 197185 29 - 647215 TGATGCTTACAAATGAGCTTGCAATTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 509148 29 + 647215 TGACACCTACACATGAGCTAGCAATTCAA + +a +s mr.mrrefChr3 50528 17 + 181019 GTGGAAGAAGGTGACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496529 17 + 636262 GTGGAAGAAGGTGACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 197215 17 - 647215 GTGGAGGAAGACGGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 509177 17 + 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 496720 259 + 636262 TTTTAGTAGTCATAGTTGTCTTGGCTATCCAGTTTGGTACCTCTGGGGCCGAGTGGTATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAGTTGTTGGCTCCTTCCTGCAACACTAGTCCATTTCAGGTGGGCTCTCACAAATTGAAGATCCAAAGCCACCTGCTATGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCTCTTCGTACTAGAGCATCTGTATACATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 509358 258 + 647215 CTTTAGTAGGCTTAGTTGTCTTTGCCATGCAATTTGTTACCTCTGGGGCCAAGTGA-ATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAATTGCTATCTCACTCCTACAACGCTAGTCAGTTTCAGGTGGACTCTCACATATTGAGGATCCAAAGCCACCTGCTGTGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCCCTTTGTACTAAAGCATTTGTATATATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 50969 73 + 181019 GGATATTATAATTGTAACACCTGGCAGATTAAATGATTTGCAAATGAGTAACTTTGTTAATTTGAAGAATATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496979 73 + 636262 GGATATTATAATTGTAACACCTGGCAGATTAAATGATTTGCAAATGAGTAACTTTGTTAATTTGAAGAATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 449557 73 + 647215 AGATATTCAAATTGTGATACCTGGCAAATTAAATGATTTGCAGATGAGTAACTTTCTTAATTTGAAGAATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 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simRat_chr6.simRat.chr6 509838 78 + 647215 CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCATACAAGGCACTTCTAAAGTCAGCAGCCTGAGCATAGGTGACCCCTCGTACA + +a +s mr.mrrefChr3 51252 28 + 181019 TCATATTGTATCCCACTAGTTTACAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497263 28 + 636262 TCATATTGTATCCCACTAGTTTACAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 509916 28 + 647215 TCATATTGTAACCCACTAGTTTACAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 51280 365 + 181019 TGTCATACTCAAGAGACAAAACTTTAGAAATGAGAGTTTTCAGAATTAGACCTGTAACTTCGTGCTACCTCACGACAACTCAGCAGCACCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGGAAGTTAATGTAGACGGGAAACTAACTTGTACACCTGCAAAATGAATACACATTCTTACACAGTACCTTGTTGTACCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTGGACATTATGAAGCCCTTAATTTGAAGCTTCAGGCAATTTGAGGATTAGATAATACAACCAGAAaatgggcaaggtctctgattcactttgcacacgggagaaatggtacttc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497293 365 + 636262 TGTCATACTCAAGAGACAAAACTTTAGAAATGAGAGTTTTCAGAATTAGACCTGTAACTCCATGCCACCTCACGACAACTCAGCAGCACCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGGAAGTTAATGTAGACGGGAAACTAACTTGTACACCTGCAAAATGAATACACATTCTTACACAGTACCTTGTTGTACCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTGGACATTATGAAGCCCTTAATTTGAAGCTTCAGGCAATTTGAGGATTAGATAATACAACCAGAAaatgggcaaggtctctgattcactttgcacacgggagaaatggtacttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 509944 365 + 647215 TGTCATACTCAAGAAACAGAGCTTTTGAGATGAGATTTTTTGGAATTGGATCTGTAACTTCGTGCTACCTCATGACAACTCAGCAGCTCCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGATAGTTGATATAGACAGGAAACTAACTTGTATACCTGCAAAATGTATACACTTTCTTACACATTACTTTGATGTTCCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTACTCATTATAAAGCCCTTAATTTGAAGCTTTAGGCAATGTGAGGATTAGATAACACAATCAAAAagtgggcaagacctctgattcactctgcacatgagaaagatgTTACGCC + +a +s mr.mrrefChr3 51645 85 + 181019 tgagggtggcgttccgcccacagactctactaccccactgctgggtgcccctgggttcttttttgaaggattCATAGTGGTAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497712 85 + 636262 tgagggtggcgttccgcccacagactctactaccccactgctgggtgcccctgggttcttttttgaaggattCATAGTGGTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 510309 85 + 647215 TgagggtggcattccgcccacagagccacctaccccattgcttggtgtccctgggttctctttgAAGGGATCTATAGTGGTAGTT + +a +s mr.mrrefChr3 51730 50 + 181019 GAAGATATGGTCAATGTGAATAAAAGGCAGTGGTCATGTACACGTGATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497798 50 + 636262 GAAGATATGGTCAATGTGAATAAAAGGCAGTGGTCATGTACACGTGATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 510394 50 + 647215 GAAAATATGGTCAATGAGAATAAAAGACAGCGATCATGTACATGTGGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 51780 133 + 181019 GTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCGCTTGACAAGATGTCAACCGATCACAGAAGATGTCTGCCCACCTCATGGAAGAGGTTTGTCATGCATAGTTCCCCCTGCATGTTACTATTACTAGACCTTACTGACGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497848 133 + 636262 GTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCGCTTGACAAGATGTCAACCGATCACAGAAGATGTCTGCCCACCTCATGGAAGAGGTTTGTCATGCATAGTTCCCCCTGCATGTTACTATTACTAGACCTTGCTGATGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 510445 133 + 647215 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ACTGAGCTCACAGTGATGATT + +a +s mr.mrrefChr3 56007 71 + 181019 AGCAGTTGATTGAACCCATACTTCCAGTGGGAGCATATATTGTGAATAATAAACAGATAGTGACAGGGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503503 71 + 636262 AGCAGTTGATTGAACCCATACTTCCAGTGGGAGCATATAGTGTGGATAATAAATAGATAGTGACAGGGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 514791 71 + 647215 AGCAGTTGATTGAACCCATACTTCCAGTAGGAGCATATATTGTGAATAATGAACAGATAGTGACAGGGGCT + +a +s mr.mrrefChr3 56078 270 + 181019 GGGGATCTCTCATATTACCTATCTCCCTCATGCACAGACTGGAGCTTCATGAAACAATAACTTGCCAATGGGATGACTCTGGGTTATCTATGCATGCATAAATACCTATTTACTTACATATTCATTGCCATAGGTCAGTTATAACAATAAGAATGTGCATTTATTGCCATGCCAACTTCTAAACACCTGAATAAGAGGTATTTTGACAGACAAATTGGTAATTCCTCTAACAACCGAACATGAAGAATTCTTATACACTGAATACTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503574 265 + 636262 -TGGATCTCTCATATTACCTATCTCCCTCATGCAGAGACTGGAGCTCCATGAAACAATAACTTGACAAC--GATGACTCTGGGTTATCTATGCATGCATAA--ACCTCCTCACTTACATATTCATTGCCATAGGTCAGTTATAACAATAAGAATGTGCATTTACTGCCATGCCAACTTCTAAACACCTGAATAAGAGTTATTTCGACAGACAAATTGGTAATTCCCCTAACAACCGAACATGAAGAATTTTTATGGACTGAATGCTAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 514863 270 + 647215 GGGGATCCCTCATGCTATCTACCTCCCTCATGTACAGACTGGAGCTTCATGAATCAATAACTTGCCAATGGGACCACTCTGGGTTATCAAGGCATGCATAAATACCTATTTACTTACATATTCATCACCACAGGTCAGTTATAACAATGAGAATGTGCATTTATTGCCATGCCAACTTCTAAACAACTGAATAAGATGTACTTTGGCAGACTAAATGGTAATTCATAAAATGACCAAACATGAAGTATTCTTATACACTGAATACTAATT + +a +s mr.mrrefChr3 56348 114 + 181019 TTTAACTTTTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAGAACAATAAAACAATTGTGTACACTGTAGTGAGAGGTGAATGCCATGAGTATTCAATTACATGCTAGGGTTTCATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503839 108 + 636262 ------TTGTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAAAACAATAAAACAATTGTGTACACTGTACTGAGAGGTGAATGCCATGAGTATTCAATTATGTGCTTGGGTTTCATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 515135 107 + 647215 TTTAACTTTTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAGAACGATAAAGCTATTGTGTTCACTGTAGTGAGGGATGAATGTC-------TACAATTACATCCTAGGGTTTCATTC + +a +s mr.mrrefChr3 56462 286 + 181019 ATTTAATCAACTTGCGATGAAAAGCCATCTCTTAGTTACTATTGCTTGGTCTTATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGAACTCATTGTAACGTAAAGTTCAGTCATTTTGATTTTGTATAATAATAAGTGATTTCCTGTGCTGCTTTATCACTGTAGGGCCTGCAGAGGCCCGCCCTTACCCAGCAGTCTGGCGGAAGTACTCACAGGGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAATAACAATGTAGGTGGGATATGAGTTAAATGTCATTGAACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503947 285 + 636262 ATTTAATCAACTTGCGATGAAAA-CCATCTCTTAGTTACTATAGCTTGGTCTTATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGAACTCGTTGTAACATAAAGTTCAGTCATTTTGATTTTGTATAGTAATAAGTGATTTCCTGTGCTGCTTTATCACCGTAGGGCCTTCAGGGGCCCGCCCTTACCCAGCAGTTTGGCGGAAGGACTCACAGTGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAAGAACCATGTAGGTGGGATTTGAATTAAATGTCATTGAACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 515244 283 + 647215 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CACAGCACCCAAAGCCGCCCACTTGGAACCCTACTTGTAATCAATTTCTAGTCCATAAGTTCAGTGAAGCAAAATATAATTGTTACAACAGAAGAGGATAAATGGAGCCACATGCATAATTCCCTTCAGAGTGTCTCATCTTCAGACAAAGTTATCGTCTTTGTGCCCCGAAGGACTTTGTATAGA-ACCATGTGAGGGCGGCAGAAACTAATAGAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 56967 226 + 181019 AAGCATTATTGACCCCCTGTAGGGAGACTTATCTGCCCAACTATTTACACAAACACTAAGTTGAAACTGTCTCCTGAAGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCAAGTGATTTAATACTTGGAACCAACTCAGTAGCTTTGCAAGCAGATAAGGAACAGCGGGATCAAGAGAAGCTAGAAAATTTTAAAACAGGTGTGTTCTCAGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 504451 226 + 636262 AAGCATTATTGACCCCCTGTAGGGAGACTTATCTGCCCAACTATTTACACAAACACTAAGTTGAAACTGTCTCCTGAGGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCGAGTGATTTAATACTTGGAACCAACTCAGTAGCTTTGCAAGCAGATAAGGAGCAGCGGGATCAAGAAAAGCTGGAAAATTTTAAAACAGGTGTATTCTCAGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 515762 226 + 647215 AAGCATGATTGACCCTTTGTAGGGAGGCTTATCTGCCCAACTATTTACATGAACACTAAGTTGAAGCTGTCACCTGAAGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCAAGTGATCTAATACTTGGTACCAACTCGGTAGCTTTGCAAGCAGATAAAGAACAGCAGGATCAAGAGAAGCTAGAAAATTTTAAAATGGGTCTGTTCTCAGATG + +a +s mr.mrrefChr3 57193 571 + 181019 CAGGTACGTATTCCAGGTTGGATGCCTATTATTACCTGCTGATCAACTGTTTCCATCCTATGAGCTGACCTCGATCATGCATAGTCTAATTTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATGAAACCAATGATTGATAAGGAGATAAACTATGGTGAGTGCTTTAGTATGGGTCTGGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAAATAGTTGATGTAGGCTTACTAATAGATATGTATCGACATTGTCTAACTATTTCTTCTAGGACAGGACAGAATCCTGGTTGCAGCTGATCTTGGCACTCGAGGTGTCCATGATGTGTCTCACATTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTTGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCATGAATAGTAGGCCATCTCTGTTAGCTTTTCATACCTCTCACTGTAGACCACCATAATTGCCCTTCATGAGTGTACTGCATACTCACAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCCATCAGAATAAAATATCTTATCCATTGGAGTCCCAAATCTATGAATAAATTATCAAACACAAGTTAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 504678 565 + 636262 CAGGTACGTTTTCTAGGTTGGGTGCCTATTACTACCTGCTGACCAACTGTTTCCATCCTATGAGCTGACCT--GTTATGCATAGTCTAATCTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATGAAACTGATGATTAATCAGGAGATAAACTATGGTGAA-GCTTTAGTATGGGTCTAGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAAATAGTTGATGTAGGCTTACCAATAGATATGCATCGACAGTGTCCAACTATTTCTTCTAGGACAGGACAGAATCCTGGTTGCAGCTGATCTTGGCACTCGAGGTGTCCATGAGGTGTCTCACACTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTAGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCTTGAATAGTAGGCCATC---GTTAGCTTTTCATACCTCTCACTGTAGACCACTATAATTGCCCTTCGTGAGTGTACTGCATACTCCTAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCCATTAGAATAAAATATCTTATCCATTTGAGTCCTAAATCTATGAATAAATTATCAAACACAAGTTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 515988 571 + 647215 CAGACACGTATTCCAGGTTGCATGCGTATTATTACCTGCTGATCAACTGTTTCCGTCCTATCAGATGACCTCGATCATGCATAGTCTAATTTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATTAGACCAACCATTGCTAAGGAGATAAACTATGTTGAGTGCTATCGTATGGGTCTGGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAGATAGTTGATGTAGGCTTACTAATAGGTAAGTATCGACATTGTCTAACTACTTCTTCTAGGACAGGACAGAATGCTGGTTGTGGCTGATCTTGGGACTCGAGGTGTCCACGATGTGTCTCACATTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTTGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCATGAAAAGTAGGCCATCTCTGTTAGCTTTTCATACCTCTCGCTGTAGGCCACCATAATTGTCCCTCATGAGTGTAGTGAATGCTCACAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCTATCAGAATAAATTATCTTATCCATTGGAGTCCCAAGTCTAAGAGTAAATGATCAAACACAAGTTAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 57764 253 + 181019 CTGTATGCCATTGTCTCTTGTGCCACCTATTTGTAAGCAGAACTGGTGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATATTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCATCATTTCATGCACACTGTTAATTAGACGAAAACTCCTGCTAATTCATTCAGGCAACTGCACCAGAAAAGGAATATGGGATATACCAAGAGTGAAGGACATATCCATGGAGTCTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505243 253 + 636262 CTGTATGTGATCGTGTCTTGTGCCACCTATTTGTAAGAAGAACTGGTGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATATTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCATCATTTCATGCACCCTGTTGGTTACACGAAAACTCCTGCTAATCCATTCAGGCAACTGCACCAGAAAAAGAGTATGGGATATACCAAGAGTGAAGGACATATCCATGGAGTTTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 516563 252 + 647215 CTGTATGCCATTGTCTCTTGTGCCACCTATTTGGAAGCAGCACTGGCGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATGTTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCA-CATTTCATGCACACTGTTAATTAGACCAAAACTCCTGCTACTTCATTCAGGCAACTCCACCAGAAAAGGAATGTGCGATATACCTAGAGTGAATGACATATCCATGGAGTCTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 58017 95 + 181019 ATAACAAGGTATGGATATGGGTACCCACAACAGAGAGAGTCAACATATGGTTTATATGGTTTAAACTGTTTGAGCTTGTTTAATTGCTTCAGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505501 42 + 636262 ATAACGAGGTAT-----------------------------------------------------CTGTTTGAGCTTGTTTAATTGCTTCAGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 516815 95 + 647215 ATAACAAGGTATGGATATGGGTACCCACAACAGAGAGAGTCAACATATGGTTTATATGGTTTAAACTGTATGAGCTTGTTTAATTGTTTGAGGTC + +a +s mr.mrrefChr3 58112 23 + 181019 AACTGTGAATTTAGCTTAAAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505545 23 + 636262 AACTGTGAATTTAGCTTAAAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 516910 23 + 647215 AACTGTGCATTTAGTTTAAAGGG + +a +s mr.mrrefChr3 58135 31 + 181019 CAGTTCTATGAACATGTAGGCGTTAACAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505568 31 + 636262 CAGTTCTATGAACATGTAGGCGTTAACAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 516934 31 + 647215 CAGTTCTCTGAACATGCAGGTGTTAATGGGA + +a +s mr.mrrefChr3 58166 81 + 181019 CTAAAACTTATTACCCCTTAGCAGGTAAGAATGCCCCTGGCAACTTCATATCTGAACAGCTATATTGACAACCTGCTCTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505600 81 + 636262 CTAAAACTTATTACCCCTTAGCAGGTAAGAATGCCCCTGGCAACTTCATATCTGAACAGCTATATTGACAACCTGCTCTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 516965 81 + 647215 CTAAAACTTATTACCCTTTAGCAGGCAAGAATACCCCTGGTGTCTTTGTATCTGAACAGCTATATTCACAACCTGCTCTGC + +a +s mr.mrrefChr3 58247 18 + 181019 AACTCATATCTCACAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505696 18 + 636262 AACTCATATCTCACAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 517046 18 + 647215 AACTCATATCTCACAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 58265 23 + 181019 ACACAATAATAAGAAGTTGGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505715 23 + 636262 ACACAATCATAAGAAGTTGGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 517064 23 + 647215 ACACAATACTAAGGATTGGGTCT + +a +s mr.mrrefChr3 58288 232 + 181019 CAGAGCATCCCAGAAGAGCTAGTTTCAATGGTTGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGAGGAGTGAGATGGAGAGAAAGATGGAAAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCACCAATTTTTTCAGGGAGGCAGGTGTGGTACCTCCAACTATATTATTGGCTTTTAGCTACAAAACTGCTTACTCTAGATGCTAGTAGAAATGTTTTCAATTAGTTCCCATTACTTTGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505739 226 + 636262 CAGAGCATCCCAGAAGAGCTAGTTTCAATGGTTGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGCGGACTGAGATGGAGAGAAAGATAGAGAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCACCAGTTTTTTCAAGGAGGCAGGTGTGGTACCTCCAACTATATTATTGGCTTTTAGCTACAAAGCTGCTTACTCTAAATGC------AAATGTCTTCAATTAGGTCCCATTACTTTGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 517087 232 + 647215 CAGAGCATCCCGGAAGAGCTAGTTTCAATGGTCGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGAGGAGTGAGATGGAGAGAAAGATGGAAAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCATCAATTTTTTCAGGGAGGCAGGTGTGGTACCTTCAACTACACTATTGGCTTTTAGCTACAAAACTGCTCACTCAAGATGCTAGTAGGAATGTTTTCAATTATTTTCAATTACTTTGGCT + +a +s mr.mrrefChr3 58520 262 + 181019 AGTATACAAGCAACTGTTCCCATCGTTTATTCAAAATTTTAAGGCTCTCAGGATGCATTGATGGTGCCAAAAGATGGGCCTCTGTTCTTGATAATGAGATATCTTACTCTGGGAAATCTAGATGTAAACCAACATTTCGGGGTTTTGTGGACTCACCAAGACTTGATTAATCCGAAAGGCAGGCCTATTCACATGATGCTGAGATATCTTATTCTGGGAGATGTAGATGTAAAAGCTCTACACAATGAAGGACCTTAGTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505965 260 + 636262 AGTGTACAAGCAGCTGTTTCCATAGTTTATTCAAAATTTTAGGGCTCTCAGGATGAACTGATGGCACCAAAAGGTGGGCCT--GTTGTTGATACTGAGATATCTTACTCTGGGAGATCTAGATGTAAACCAACATTTCGGGGCTTTGTGGACTCACCAATACTTGATGAATCCGAAAGGCAGGCCTATTCACTTGATGCTGAGATTTCTTATTCTGGGAGATGTAGATGTAAAAGCTCTACACAACGAAGGACTTTAGCGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 517321 262 + 647215 AATATACAAGCAACTGTTCCCATCGTTTATTCACAATTTCAAGACTCTCAGGATGCCTTGATGGTGCCAAAAGATGGGCCCCTATTCCTGATAATGAAATATCTTACTCTGGGAAATCTTGATGTAAACCGACATTTTGGGGTTTTCTGGACTCACCAAGACTTGATTAAGCCAAAAGGCAGGCTTATTGACATGATACTGAAATATCTTACTCTGGGAGATGTCAATGTAAAAGCTCTAAACAATGAAAGACCTTAGTGGC + +a +s mr.mrrefChr3 58782 53 + 181019 GGGTGAAAAATAATTGTAAACATATAATGTATAAGCCTTGGGAAGGTATAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506279 53 + 636262 GGGTGAAAAATAATTGGGAACATATAATGGATAGGCCTTGGGAAGGTATAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 517583 53 + 647215 GGTTCAAAAATAATCATAAATATATGATGTATAAGCCTTGGGAAGGTATAATG + +a +s mr.mrrefChr3 58835 31 + 181019 GCATAATCCTACATACTAAGGCTATATAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506334 31 + 636262 GAATAATCCTACATACTAAGGCTATATAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 517636 31 + 647215 GCATAGTCCTACATGCTGAGGTTATATAACA + +a +s mr.mrrefChr3 58866 160 + 181019 TAATGCCACTTGGCTTTTGATAAAGGTAGAGACAAGCGGTAACCCATTATACATAATGGGTATTTGGAAATCTGGGACCCAATGTAAAATATAATGTATGATCCTACATACTGAGACCACATTAATAATTGGTCAACTAGTCTTCCATTAGGGCAGAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506365 160 + 636262 TAATGCCACTTGGCTTTTGATAAAGGTAGAGATAAGCGGTAACCCATAATACATAATGGGTATTTGGGAATCCAGGACCCAATGTAAAATACAATGTATAATCTTACATACTGAGACCACATTAATAACTGGTCAACTAGTCTTCCATTAGGGCAGAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 517681 160 + 647215 TAATTCCACTGGGCTATGAATAAAGGTAGAGACAAGCAGTAATCCATTATACAAAATGGGTACTTGGAAATCTGGGACCCTATGCAAAATATAATGTATGAGCCTACATACTGAGAACACATTAAAAATTGGTCTACTAGTCTTCCTCTAGGGCAGAGGC + +a +s mr.mrrefChr3 59026 207 + 181019 CACATTTTAACTACTTGTACAGGGTCATGAAATGGGTACCTTGAAGACTTTGCTTGGAAGACCAATAATTTTTTGATTGTGCAGGTGCTTATCTTTTCCAGGGCACTGCTGATGATAAAGATTCTTCTAGTGTAATGTTAGAATAATTCACCTATTAGTAGCTCAGTAAAAAATGGTTTTGGTACTCTAGTAAGCCTGGAGACATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506525 205 + 636262 CGCAGTTTAACTACTTGTACAGGGTCATGAAATGGGTACCTTGAAGACTTTGCTTGGAAGACCAATAATTTTTTGATTGTGCAGGTGCTTATCTTTCCCAGGTCACTGCTGATGATAAAGATTCTTCT-GTGTAATATTAGAATCATTCACCTATTAGTAGCTTAGTAAAAAATG-TTTTGGTACTCCAGTAAGTCTGGAGACATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 517849 192 + 647215 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TTAACCAGAAAAGAATATTCTGAAGCAGCTAAAATGCTAACATATTCAGG + +a +s mr.mrrefChr3 59371 98 + 181019 CAGAAAAAACAAAGATCCATCAGTGGCTAGTACCCCATAAGGAATTTGTGTTTCCCCCAGTTGGTAATAATCCTATTGTGCAGAATTAAGGATAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506883 98 + 636262 CAGAAAAAACAAAGATGCAGCATCAGCAAGTACCCCATGAGGGATTTATGTTTCCCCTGGTTGGTAATAATCCTATTGTGCAGAATTGAGGATAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 518187 98 + 647215 CCGAAAAAACAAAGATCCATGAGTGGCTAGTAACCCACAAGGAATTTGTGTTTCCCCCAGTTGGTAATCATCCTATTGTGCAGAATTAAGGATAACAT + +a +s mr.mrrefChr3 59469 123 + 181019 TTTTTGGCTTGGCTGATCAATTGAAAATGACTTGCCATGTCAGTATGGAATTGCATTATTCCTAATGTAAAGAAGGCTGGTATATCCAGACTTTCTTTGGTTCAATTTCACCAAGGAGAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506982 123 + 636262 TTTTTGGCTTGGCTCAGTAACTGAGAAAGGCTTGCCATGTCAATATGAAATTGCATTATTCCTAATGTAAAGAAGGCCGGTATATCCAGACTTCCTCTGGTTCAATTTCACCAAGGAGAGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 518285 123 + 647215 TTTCTGGCTTGGCTGATCAATTGAAAATGACTTGCTATGTCAGTATGGAATTGCATTATTCCTAATGTATAGTAGGCTGCTATATCCAGACTTTCTTTGGCTTAATTCTACCAAGGAAAGAGG + +a +s mr.mrrefChr3 59592 103 + 181019 TAATAGCAAAATTAGGGAGTCCTCTCTCTTAGTTGTATAAGTACCACCAAATTGAATGAGGGTCAATCTATCTCCCAGTTACATTCACATGAAGCTATCAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507105 103 + 636262 TATTAGCAAAATTAGGGAGTCCTCTCTCATAGTTGTATAAATACCACCAAATTGAATGAGGGTCAATCTATCTCCCAGTTACATTCACGTGAAGCTATCAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 518409 103 + 647215 TAATCTCAAAATTAGGTAGTTCTCCCTCTTAATTGTATAAGTACCACTAAATTAAATGAGGGCCTATCTCTCTCCCAGTTGCATTCACATGAAGCTATAAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 59695 180 + 181019 ATCCTCTCATCAAACGTAATGAAAGTTCACAGAACGTCACATGTCTTGCAATACTTTAAGAAGTTGGTTTCTGTGAAGAGTCTGACTCCCAAAAATGTTATGTTTCAAGGAAGTCTCCTTTGACCTATGGACACTATAACACTGCTTGTCCCAAATTTCCATGCCATTAGATTCCTTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507208 180 + 636262 ATCCTCTCATCAAACGTAATGAAAGTTCACAGAACGTCACATGTCTTCCAGTACGTTAAGAAGTTGGTTTCTGTGAAGAGTCTGACTCCCAAAAATGTTATGTTGCAAGGAAGTTTCCTTTGGCCTATGGACTCTATAACACTGCTTGTCCCAAATTTCCATGCCATTAGAGTCCTTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 518513 177 + 647215 ATCCTCTTGTCTAATTTCATGAGAGTTCACAGAAAGTCACATGTCTTGCAATACTTTAAGAAGTCGGATTTTGTGAACAGGCTGATTTCCTAAAATGTTATGCTTCAAGCAGGACTCCTTTGACCTATGGGCACTATAACACT---TTTCTCAAATTTTCACGCCATTAGGTTCCTTTGC + +a +s mr.mrrefChr3 59875 28 + 181019 AAGGAGACAAGTGACACATTGGAACTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507389 26 + 636262 AAGGAAACAAGTGACACATTGGAGCT-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 518690 28 + 647215 AAGGAGACAGGCGACACATTGGAAATTT + +a +s mr.mrrefChr3 59903 100 + 181019 TTTGAATCAGCCATGTCTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAGCCTCTGCATCTATCATCCAAGGCTGCTTTTTATTGAAAGTTGCCCGCTGGATTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507415 93 + 636262 -------CAGCCATATTTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAGCCTCTGCGTCTATTATCCAAGGCTGCTTTTTATTGAAAGTTGCCCGTGGGATTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 518750 97 + 647215 TTTGAATCACCCAAGTCTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAACCTCTGCATCTATCATCCAAGGCTGCTCTTTATTGAAAGTTGCCCGCTGGAC--- + +a +s mr.mrrefChr3 60003 641 + 181019 CACCTTAATGTACTTGTTATCTTGGGAAGGCTGTCAACTAGATTTACAGCGGCACACCAGCAGCATTAGATACATAGGTCAGCATACAGCATGATGCTGTTTAAGAAATGTTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACTCTGGGTCCTAACTTATGTAAGGGTAGAGTGTCTAAGGGGCCAAAAAAGTAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACGTAATTTACAGAAGTCTAGCACGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCACACTTTGAAATCTAAAGTGAATAGGGTGACTAGGACAATGGACACAGGCATATAATAGTGCCAAAGAAATACCACCCCATAACAGATCAGTCTATCTTGTCCTTCATACAAGTAAACTCTAATACATTCCAAGTGGGACCATTATGACCCTATTACCTGTACCCTTCTCTTGCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTTAAGGGGAAGACTTGTGGTACAAAAGTTGAGTCAGAATCTCCTGAAATGGGCAGGAGCTGAGCCCAATGTGATCTTGACACCCTGGAGCCATAGCAACAAATAATTCATAGGAGGCTGTCAGACAGGGCATATGTCACAGAGAGGCAGAATCTTGCTACTTATGACAATTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507509 641 + 636262 CACCTTAATGTACTTGTGATCTTTGGGAGGTTGTCAACTAGATTTATAGCAGCACATCAGCGGCATTTTATACATGCATCACCATACAGCATGATGCTGTTTAAGAAATGCTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACTCTGGGTCCTAACTTATGTAAGGGCAGAGTGTCTAAGGGTCCAAAAAAGAAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACGTAATTTACAGAAGTCTAGCACGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCACACTTCGAAATCTAAAGTGAATAGGGTGACTAAGACAATGGACACAGGCATATATTAGTGCCAGAGAAATACCACCCCATAACAGATCAGTTTACCTTGTCCTTCATACAAGTAAACTCTAATACATTCCAAGTGGGACCATTATGGCCCTATTACCTGTACCCTTCTCTTGCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTCACGGGGAAGACTTGTGGTACAAAAGTTGAGCCAGAATCTCCTGAAATGGTCAGGAGCTGAGCCCAATGTGGTCTTGACACCCTGGAGCCATAGCAACAAATAATTCATAGGAAGCTGTCAGACAGGGCATGTGTCACAGAGAGGCAGAATCTTGCTACTTATGACAGTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 518847 631 + 647215 CACCTTAATGTGCTGGTTATCTTGAGAAGGCTGACAACTAAAAGTACAGCGGCACACCAGCAGCATTAGATACATAGGTCAGTGTACAGCATGATGTTGTTGAAGAAATGTTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACGCAGGGTCCTAACTTATTTAAGGATAGAATGTCTATGAGGCCTAAAGAGTAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACATAGTTTACAGAAGTCTAGCATGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCATACTTTGGAATCTAAAGTGAATAGGGTGAATAGGACTGTGGACCCGGGCAAATAATAATGCCAAAGGAATACCACCACATAACAGATCAGTCTATTTTGTCCTTCATACACATAAACTCTAATACTTTCCAAGTGGGACCATTATGACCATATTACCTGTACCCTTCTGTTCCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTTAAGAAAAGGACATGCAGTACAAAAGTTAAGTCAGAATCTCCTGAAATGGGCATGAGGTGAGCCAAAGGTGATCTTGACACCCTGG--------CAACAAATAATTCATAGGAGGTTGTCTGGCAGAGCATATGTCACAGAGA--GAAAATCTTGCTTATTTTGACAATTCC + +a +s mr.mrrefChr3 60644 155 + 181019 GTAGACCTAACAGAAAAATCAACTTCTGAGTTACTCATGATTGTCTGGGCTATTCAGGGGGCTATAGTATGAACACATTTAAAGATTTCAAAGAAGCTCTAAGATCTCCTCATTTTTAGATCAGCCTTCTTCAAAGTTCAGATTGAGTCAGTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508152 151 + 636262 GTAGACCAAACAGAAAAATCAACTTCTGAGTTACTCATGATTGTCTGGGCTATTCAGGGGGCTATAGTATGAACACATTTAAAGATTTCAAAGAAGCACTAAGATCT----ATTTTTAGATCAGCCTTCTTCAAGGTTCAGACTGAGTCAGTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 519478 155 + 647215 GCAGACCTAACAAAAAAATCAACTTCTGATTTACTCATGACTGTTTGGGCTATTCAGCGGGCTATAACAAAAAGACATTTAAAGATTTCAAAAAAGCTCTAAGATCTCCTCATTCTTAGAGCAGCCTTCTTCCAAGTTCAGATTAAGTTAGTAAA + +a +s mr.mrrefChr3 60799 83 + 181019 GATGGAACAGTTTCCTGCCCCAAAAGTTCAACCACTTGGCCGGCATTACCACAACCAATCAGCACTACTAATAGAACTGTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508305 83 + 636262 GATGGAACAGTTTCCTGCCCGAAAAGTTCAACCACTTGGCCGGCATTACCACAACCAACCAGCACTACTAATAGAACTGTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 519633 83 + 647215 GATGGAATAGTGTCCTGCCACAAAAGGACAACGGCTTGGCCAGCATTACCACAACCAATCAATCCTACCAATAGACCTGCTAG + +a +s mr.mrrefChr3 60882 5 + 181019 TGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508388 5 + 636262 TGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 519721 5 + 647215 GATGA + +a +s mr.mrrefChr3 60887 135 + 181019 GTCCAAAGGTCTGCTTCTTCCAATAAAATAATGATACTATGTGGTGCCATTCAGAAGATTCACACCCCTCAACACTTTGTTACACTATCCCGTGTCACATTGGATATACTTGGAGCCATAGGTACTCCCAGTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508425 135 + 636262 GTCCAAAGGTCTGCTTCTTCCAATAAAATAATGATACTATGTGGTGCCATTCCGAAGATTCACACCCCTCAACGCTTTGTTGCACTACCCCGTGTCACATGGGATATATTTCGAGCCATAGGTACTCCCATTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 519726 134 + 647215 GTCCAAAGGTCTGCTTCTTCCAATAAAATAATGATACCATGTGGTGCCATTAAGAAGATTCACGCCC-TCAAAACTTTGTTATACCATCCATTATCACATTGGATACACTTGGAGCCATAGGTACTCCCAGTTGA + +a +s mr.mrrefChr3 61022 161 + 181019 ATCCATTGTTTCACAGGGCAGTATAAAGGGGAAGCAATTGATTGAGACTGTGGAACACAGTGTCTTAGTACGAAATAAAAGATTGACACTTTCAGGAACTCTAATTACAATGCATTTATATGGGACCCTTTAGAATGTAGCTTTGAGTAACCTAGGACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508568 161 + 636262 ATCCATTGTTTCACAGGGCAGCATAAAGGGGAAGCAATTGATTTAGACTGTGGAACACAGTGTCTTAGTACGAAATAAAAGATTGACACTCTCTGGAACTCTAATTACAATGCATTTATACGGGACCCTTTAGAATATAGCTTTGTGTAACCTAGGACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 519860 160 + 647215 ATCCATTGTTTCATAGGGCAGTGTAAAGGGGAGGCATAAGATTGAGAGTGTGGAACCTAGTGTCTTAATATGAAAGAAAAGATTGA-ACTTCCAGGAACTCGAATTATAATGCAGTTATATGTGACCCTTTAGAATGTAGCTTTGAGTAACCTGGGACAGG + +a +s mr.mrrefChr3 61183 97 + 181019 TCTGCAAGTTACTGGGATTGCTTTACTGTCCCTCAAGGTTCCTAATCTTGACTTTACAATTAACAAGTGTGGTCCTTGGAAAATGCGTTTCCTTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508729 97 + 636262 TCTGCAAGGTACTGGGGTTGCTTTACTGTTGCTCAAGGTTCCTAATCTTTACTCTACAATTAACAAGTGTGGTCCTTGGAAAATGTGTTTCCTTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520021 96 + 647215 TCTGCAAGTTACTGGCATTGCTTTACTGTCCCTCAAGATTCCTAATCTTGACTTTACAATTAACAAGCGTGGTCCT-GGAAAATGCGTTTCCTTTGC + +a +s mr.mrrefChr3 61280 130 + 181019 GTTTTTACTACAGGAAAACTTTAGCAATGTTCCTGGTACTCAGGACAGGTTATATCACAACAGGGTTACTGTTCTAGTTAGAGTATTCTGACACTGTTGATACCCTGGCCATCAATTGTGCTCAATCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508826 130 + 636262 GTTTTTACTACAGGAAAACTCTAGCAATGTTCCTGGTACTCAGGACAGGTTATATCACAACAGGGTTACTGTTCTAGTTAGAGTATTCTGACACTGTTGATACCATGGCCATCAATTGTGCTCAATCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 520120 130 + 647215 GTTTTTACTACAGGGAAACTTTAGCAATGCTCCTTGTACTCAGGACAGGTTGCATCACAACAGGGATCCTGTTCTAGTTAGAGTATTCTGATACTGTTGATACCCTGGCCATTAACTGTGCTCAATCTAT + +a +s mr.mrrefChr3 61410 31 + 181019 CCAGCCATCATCCCTCGGAGGATACCTAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508956 31 + 636262 CCAGCCATCATCCCTCAGAGGATACCTAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520251 31 + 647215 CCATCCATCATCACTTGGAGGATACCTAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 61441 45 + 181019 CAGGCCTATTAGGACTACAGATTGTGATCCAATCTTACACACTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508987 45 + 636262 CAGGCCTATTAGGACTACAGATTGTGTTCCAATCTTACAAACTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520287 45 + 647215 CAGGCCTATTAGGACTACAGGTTGTGATCCAATCTTAAACACTCC + +a +s mr.mrrefChr3 61486 165 + 181019 ATTTAGCTTTCATACTGACCTGCTATCCATACATAGGCCTAAGGCATCAGGTAAGTCCAGCAACCCCCATTACTGCCAGGGTGGATGGTTCAATAACATATAGAACAGGACAGCTTATAGTAATGGGGATGCTAAAAAAAATCTAAGGACAGTCCTGAGCCAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509035 162 + 636262 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CATTTTAATTCATTTCAGGGCGTCAAGTTATAGGAGGCACAGTAATCTCTGGACTCAGAGAAGTAATCTGCCACCCAAGTAGACTTGAGGTAGACTTCAAGGACATGTGGTACCAGACTGTATAAGGTTAGCCACTATCCCCGACCAATACTTTCTAGCATTACCAGAAAGAGGGATTTTAAAGGATTGAGGGGTACAGATAGCACATTAATTCCTCAATCTATTATGGGAAATAAAACCCAGTTGATGATGGAGAGTTGTAGGGCTCACCTCAGGGTGATTCAGGGATATAAGCAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520495 289 + 647215 ---------TCATTTCAGGGAGTGAAGGTACAGGAGGCACTGTAATCTCTGGTGCCTGAGAAATAATCTGACACCTAGGGAGACTTGAGGTAGACTTCAAGGACATGTGTTAAAAGACTGTACACGATTAGCCACTATCCATGACCAATACTTTATAGGAGTACAAGAAAGATCGATTTAAAAGGATTGAGGAATACGGATAGCACATTAATTCCTCAAGCTATTATGGGAA-TAAAACCCAGTTGATGACAGAGAGTTGTAGGCATGACCTGAGGGTGATTCAGGTATACAAGCAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 61950 22 + 181019 TACATAAACATATAACTTCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509505 22 + 636262 CACCTAAACATATAACTTCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 520806 22 + 647215 TCCATAAACATATAACTTCTTG + +a +s mr.mrrefChr3 61972 84 + 181019 GTCTTATGCAATAGCTGAAAAATAAAAAATTACTGGTGACAACCAGTTATGAGATGCTTCTTAGCTCTGGGCATTATGGTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509532 80 + 636262 GTCTTATGCAATAGCTGAAAAATAAAAAATTACTGGCAACTACCACTTATGAGATG----TTAGCTCCGGGCATTATGGTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520828 84 + 647215 GTCTTATGCAATAGGTGAGACATAAGAAATTACTGGTGACAACCAGTTTTGAGATGCTTCTTAGCTCTGGGCATTATGGTGTAC + +a +s mr.mrrefChr3 62056 54 + 181019 CCAGTTTGTGAAGAAGGATGTAACAGCTTCATATTTGTCCAATTCTTACCAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509622 43 + 636262 CCAGTTTGTGAAAAAGGATGAGAC-----------TGTCCAATTCATACCAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520912 54 + 647215 CCAATTTGAAAAGAAGGATATAACAGCTTCATATTTGTCCAATTCTTACTGGAC + +a +s mr.mrrefChr3 62110 276 + 181019 AAGTAGAGAGTGACATACTTGGCAATTCCGGATCTACCTAGCCGGCTGGACACACCTTGAAAGACAAATACCTAGCTCAGTGATTGAATATGATTGATAATTGTTCTACCTCAATGCTGAATGTACTGGTCTCTGTGTTAATGTGACTAGACATACAGATACATGGATGAACACAGAAAAATAAATTTGGTCATCCAAAGATGTATGGCTTTTAGAAAAAAACTAGTGGAAAGAAATCCAGATAAGGTTCCTGGGTCCACACCTTCCATGTTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509666 276 + 636262 AAGTAGAGAGAGTAATACTTGGCTATTTCGGATCTACCTAGCCGGGTTGACACGCCTCGAAAGACAAATACCTAGATCAGTGATTGAATATGATTGGAAATTGTTCTACTTCAATGCTGAATGTACTGGTCCCTGTGTTAATGTGACTAGACATACAGAGTCATGGATGAAAACAGAAAAGTAAATTTGGTCATGCAAAGATGTATGGCTTTTAGAAGAAAACTAGTGGTAAGAAATCCAGATAAGGTTTCTGGTTCCACACCTTCCATGTTTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 520966 272 + 647215 AACTAGAGAATGACATACTTGGCAATCCCTGACCTACCTAGCCAGCTGGACACACTTTGAAAGACCAATACTTAGCTCAGTGATTGAATATGATTGATAATCGTACTACCTAAAGCCTGGATGTACTGGTCTGTGTACTAATGTGACTAGACATACAGATACATGGCTGAACACAGAAAAATAAATTTGGTCATCCAAATGTGTATGGCTTTTAGAAAAAGACTAGCGGAA----GTCCAGATAAGGTTCCTGGGTCCACACCTTCCATGCTTGCA + +a +s mr.mrrefChr3 62386 7 + 181019 TGAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509942 7 + 636262 TGAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 370153 7 - 647215 TGAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 521238 7 + 647215 TGAGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 62393 3 + 181019 TAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509949 3 + 636262 TAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 521245 3 + 647215 TAC + +a +s mr.mrrefChr3 62396 13 + 181019 AAGACATTTCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509952 13 + 636262 AAGACATTTCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 370160 13 - 647215 AAAAGTTCACTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 521248 13 + 647215 AAGACATTTCTAC + +a +s mr.mrrefChr3 62409 2 + 181019 TT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509965 2 + 636262 TT +s simRat_chr6.simRat.chr6 521261 2 + 647215 GT + +a +s mr.mrrefChr3 62411 7 + 181019 TTAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509967 7 + 636262 TTAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 370173 7 - 647215 TCATCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 521263 7 + 647215 TTAATAG + +a +s mr.mrrefChr3 62418 4 + 181019 GCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509974 4 + 636262 GCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 521270 4 + 647215 GCTA + +a +s mr.mrrefChr3 62422 146 + 181019 GTTGGGGATTAATGGCCTGCCAAATTGGTTTTATAGCATGTGTTACAGCATGGCTGTAGGAGTCCTAGTGTGCAGTGGATCTCTGTTTCTAAACTTGATGATATAATTATCATCCTTGTTTCATATATCTGGAACATGCCTGAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509978 143 + 636262 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mr.mrrefChr3 62601 37 + 181019 ACATATACAAGTCTGAGGTCAATGCATCATAAGAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510154 35 + 636262 ACATATACAAGTTTGAGATCA--GCATCATAAGAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 370357 37 - 647215 AGATATACTTGGCTAGGGTAAATGCATCAGAACAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 521454 35 + 647215 ACATATACAAATCTGAGGTCA--GCATCATAAGAAAC + +a +s mr.mrrefChr3 62638 14 + 181019 ACTTTATGTCACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510189 14 + 636262 ACTTTATGTCACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 521489 14 + 647215 ACTTTATGTCACAA + +a +s mr.mrrefChr3 62652 247 + 181019 GAGGTGATTCTTAATTGCAGTATTCGGGCAAAAAGGGTTTATGTGTAAGACTGTTTCTGCAAGATATAATTGTTCGCTTGCCAGAAAATGTCATGGATTGTTTGGCATAACCTCACAAAATCAGCCATCATTTCCTTAGAAGTGGGTTTGATAATTCATATGTAGACATACAGGAAGTGCTTACATTCACTCTTGTCTAGTCTTCAGTCTCTTGTCATCTTCCTGCAATCCCTTATCCGCCTGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510203 232 + 636262 GAAGTGATTTTTGATTGCAGTATTCGGGCAACAAGGGTTCATGTGTAAGACTGTTTCTGCAAGACATAATTGTTCGCATGCCAGAAAATGTCATGGATTGTTTGGCATAACCTCACAAAAGCAGCCATCATTTCCTTAGAAGTGGGTTTGATAATTCATATGTAGACATAA---------------TCACTCTCGTCTAGTCTTCAATCTCTTGTCATCTACCTGCAATCCCTTATCCGTATGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 521541 246 + 647215 GGGGTGATTCTCAATTGCAGCATTCGGGCAAAAAGGGTTTATGTGTAAGGCTGTTTCTGCAAGATCTAATTGTTTGCTTGCCAGAAAAAGTCATGGATTGTTTGGCATAGCTTCACCAAATGGGCCATC-TTTCCTTAGAAGTGTTTTTGATAATTCGTATGTAGACATACAGGAAGTGCTTACATTCACTCTTGTCTAGTTTCCAGTCTCTTGTGATCTTCCTGCAATCCCTTATCCTCCCGCGCA + +a +s mr.mrrefChr3 62899 35 + 181019 CACTTAACTTAAGTCCCTGTGTGACGCTAAGGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510435 35 + 636262 CGCTTAACTTAAGTCCTTGTGTGATGCTAAGGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 521792 35 + 647215 CACTTAACTTAAGTCCCTGTTTGACATTAAGGACA + +a +s mr.mrrefChr3 62934 171 + 181019 TTTTGTTATCAACACAGTAGATAGATAGATAAATCAATTTAATATGTAGCTTCTCAGTCTATACAGTTGATGGTCCTGCAAGGGGCATGCCTCACTTAGCTGGAGGTACTCTGATACACACTTGAAGACCTAAAGTCAAGCATAGAGAGTGAATATCTAGCTGATCCCAAT +s 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 510704 27 + 636262 AATCAAAGGCTGTCATGTATACACTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 522087 27 + 647215 GATCAAGAGCTGTCGTGTATACACTGC + +a +s mr.mrrefChr3 63198 108 + 181019 TGAAGTGTGGAACTGTTCTTTGGTGTTGCAAAATGGTGTTTGTCCCCAAAGATGGGCCCATTGTTGCCAATCCATGGTGAGAGCCTCAGTAAGTTGCACGTCTCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510736 108 + 636262 TGAAGTGTGGAACTGTTCTTTGGTGTTGCAAAATGGTGTTTGTCCCCAAAGATGGGCCCATTGTTGCCAATCCATGGTGAGAGCCTCAGTAAGTTGCACGTCTCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 522114 108 + 647215 CAGAGTGTGGAACTGTTCTTTGATGTTGTGAAATGGTGTTCATCCCCAAAGATAGGCCCTTTTTTGCCAATCCGTGAAGAGAGTCTCAGTAAGCTGCAAGTGTCTTTG + +a +s mr.mrrefChr3 63306 18 + 181019 TATTCGATCACAAGTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510856 18 + 636262 TATTCGATCACAAGTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 522222 18 + 647215 TATTCCATCACAAGTTCG + +a +s mr.mrrefChr3 63324 43 + 181019 ATACTCCAATTAGCATTATACACTATCTAGGGATAGATACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510879 42 + 636262 ATACTCCAATTAGCATTCTACACT-TCTAGGGATAGATACATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 522240 43 + 647215 ATAATCCAATTAGAATTATACACTATCCAGGGAAGGATACATA + +a +s mr.mrrefChr3 63367 37 + 181019 CCAAGCTTCTTCCATTAACAACTGATAAACATTCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510922 37 + 636262 CCAAGCTTCTCCCACTAACAAATGATAATCATTCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 522283 37 + 647215 CCAAGCTTGTTCCATTAAAAACTGATAAACTTTCCAA + +a +s mr.mrrefChr3 63404 42 + 181019 TAAACCATCTTAAGGCAGTGGGGCTCAGTACTCTCTACATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510960 38 + 636262 TAAACCATCTTAAGGCA----GGCTCAGTACTCTCTACATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 522320 42 + 647215 TAAACCATCTTAAGGCAGTGGGGCTCAGTACTCTCTACATGA + +a +s mr.mrrefChr3 63446 81 + 181019 TTGTAGGACAGTATAGTAAACACTAAAAAGCTCCCACAAAGGATGCCAATCCTCTCGTTGGTTGGTCTGGCTAAGAAAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511002 81 + 636262 TTGTAGGACAGTATAGTAAACACTAAAAAGCTCCCACAAAGGATGCCAATCCTCTCGTTGGTTGGTCTGGCTAAGAAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 522362 81 + 647215 TTGTAGGACAGCGTAGCAAACTCTAACTAGCCCCCACAAAGGATGACAATCCTCTGGTTAGTTGGTCTTGATAAGAAAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 63527 58 + 181019 GTTGTTCTTGTACCCCATCATATTTTTATGATTTTGTTAACTATGAACATACTTAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511089 57 + 636262 GTTGTTCTTGTACCCCATCATA-TTTTATGAGTTTGTTGACCATGACCATACTTAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 522443 58 + 647215 GGTGTTCTAGTACCCTATCACATTTTTACAATTTTGTTAACTATGAACATACTTAAGA + +a +s mr.mrrefChr3 63585 145 + 181019 AAGAATCAGCAAGGATGTGCAGAAAAAATACCTAGTAATTGGCGAATTTTGTTCACAATCTATTTACAAGTCATTAATTGGATGTTTTATTATTCTATTAACCTGTTATCTTGCCTCTGTTGTAAGGATACTCATAGGAACCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511146 135 + 636262 -------AGCAAGGATGTGCATAAAAAATACCTATTCGTTGGCGAATTCTGTTTAAAATCCATTTACAAGCCATTAATTGGATGTTTTG-TACTCTATTAACCTGTTATCTTGCCTCTGTTGGAAGGATA--CATAGGAACCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 522504 143 + 647215 AAGAATCAGTAAGGATGTGCAGAAAAAATATCTAGTAATTGGCCAATTTTGTTCCCAAACTATTT-CAAGTCATTAATTGGATGTTTTATTATTCTACTAACCTGTTATCTCATCTCT-TTGTGAGGATACTCCTAGGACCCCCC + +a +s mr.mrrefChr3 63730 994 + 181019 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 511281 934 + 636262 CAGACTAGGAGCTATAAAATTCGAAATAAGCTGGCAAAAAGATACACCTCATGCTGTTCATAGAGAAGAATAACAATGAAGAACATGAAGTCTTCCTAACATAGACTTGTAAGTTTATTGTATTGGAAAACATGTTTTTTCTTTATTCCTTTGATCACGGATCCCTTCCTTCCTTTTTTGTATCCGACCAAAAGGACATACCACACCTCCCGACACCTTCAGGTAGTTCTTCTACTATGGGCATATATCTATCATTGGGACAACATCTGAGAATTTTGGTAAGCTAACCCCTTGGACATGGATGTTCCAGCAGGAATTCATGGACCCAATTTGCCGGAGCCACCATGGTTGCTAACTTTTTTGCTTGGAATGCTTGCTCAAATTTACAGCTATATGATAGTGGG------------------ATATATTATAGCTGCCAGATAGGTGGAACTTAATACCCGGTAACTCTGGCA------TAAATAATTGTGATGAAAAAGTGCAACCCACATTGTGTCTGGTGACATAAAATGTGAC-TAAACACCAGAGAATGGGCCTTTAGCAATAAAAAGCATTTTGACAAATAAATTACACACAATTCCTATTGTACAGCTGGACTATGTACAATATTTTTGGATTCATTTTGTTCCCTCACAGTTCTCCATGACTTGCCCCAGCGATCTCTACTGCTGGCAGATCACCATCTGGGGGGTGACATACATAAAGGATCTGCTAGTGCAATCACAAGTATTGTGATTTGTTAGTGTTTGAACGTAGGGCTAATGGTGCTTCTGCTTGTGATTCAATTCTTACTGTCATGATCTTATTGTGAAATCACACTCTCTGGTTGATATCAAGTCCCAACTTTAGACACTGGGCTGTGGAGAACATATAACGTGCATTCCTGGTTCTAACCTGCTATCTTTTGTATGATTCAAGCCTGGCCATAGGCTTATGT----------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 522649 974 + 647215 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+s mr.mrrefChr3 64724 45 + 181019 CTCACCTTatctttgaaCTCCTTATCACtAGCTgatctggaagtc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512215 28 + 636262 -----------------CTTATTATCACTAGCTgatctggaagtc +s simRat_chr6.simRat.chr6 523624 44 + 647215 CTCACCTTATCTTTGAACGCCTTATCAC-AGCTGATGTGGAAGTC + +a +s mr.mrrefChr3 64769 502 + 181019 tcttaaaaattgggaagccaagacctattgagctgtactgtgtcatagtaaccaaactagaaaagggatatggaatctaGGTCGACAGTATTGAATCACAGACTCTCTACAATTGATTGTCACTGTTCAATCTAACTATTTTTGGGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTTCAAGTGGAGTGGCTACTGCAGTAGGCTTGTCTATAGCAAACCTAAACAAGTTTCTGCCTAATGTATCGGAACACTAATACCTCTATAACACTAAACTAAGATCAAGGTTCACTTGCTCGGCCTTTTTATTGGCCTTTAAACAATATTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCAACATAACTAGGAGCATCAAATAACGGAATTGTCAAAAGGTCCTTTTAGTATGTAATGCATTCTAGAATTTTTGGGACTAGGAGTAAACATGCCCTAGAGTATCCCTCCAGGTTTATACAAAATGTGCTTAGGGTAGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512244 476 + 636262 tcttaaaactgggcaagccaagacctattgagctgcactgtgtcatagtaaccaaactagaaaagggatatggattctagGTAGACAGTATTGAATCATAGACT---TACAATTTATTATCGCTGT------------------GGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTTCAAGTGGAGTGGCTATTGCTGTAGG-TTGGCTCTAGCAAACCTAAACAAGTTTCTCCCTAATGTATCAGAACACTAATACCTCTATAACACTAAACTAAGATCAAGGTTCACTTGCTCGGCCTTTTTATTGGCCTTTAAACAATACTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCAACACAACTAGGCACATCAAATAACGGAATTGTGGAAAGGTCCTTTTAGTATGTAATGCAGTCTAGAAATTTTGGGACTAGGAGTAAACATGCCCTAGAGTATCCCTT---ATTCATCCAAAATGT-CTTAGGGTAGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 523668 502 + 647215 TCTTAAAAATTGGGAAACCAAgacctattgagctgtgctgtgccatagtaaccaaattagaaaagggatatggaatctaTGTCGACTGTATTGAATGACTGACTCTCTACTATTGATTGTCACTGTTCAATCTAACTATTTTTGGGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTCCCAGTGAAGCGGCTACTGCAGTAGGCTTGTATATAGTAAACCTAAACTAGTTTCTGCCTAATGAATGGGTACACTAATACCTCCATAACACTAAACTAAGATCTAGGTTCACTTTCTTGGCCTTTTTATTGGCCCTTAAACAATGTTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCGACATAATTAGGAGCATCAAATAACTGTGTTGCCAAAAGGTCCTTTTATTATGTAAACCATCCTAGAATTTTTGGGACTAGGAATAAACATGCCCTAGAGTAACCCCCCAGGTATGTACAAAATGTGCTTAGGGTAGCCC + +a +s mr.mrrefChr3 65271 167 + 181019 TGTACACCCCGAATAAGTGATTTGTGTACTTCAAATAACCCCCATGAGCTTTGAGATTCCCCATACATGTCTCTTGTCTAGAATTAATAATTGACTGTCTAGATTGCCAGGACTTCTGGTCTAGACAGGAACTGTGTTGGCTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512721 167 + 636262 TGTACACCCCGAATAAGTGATTTGTGTACTTCAAATAACCCCCATGAGCGTTGAGATTCCCCATACATGTCTCTTGTCTAGAGTTAATAATTGACTGTTTTGATTGCCAGAACTTCTGGTCTAGACAGGAACAGTGTCGGCTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 524170 161 + 647215 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TCAGTTTTTCCATCAACCAGACATCTTACCACTAAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520256 39 + 636262 TCAGTTTTTTCATCAACAAGACACTTTACCACTAAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 531686 39 + 647215 TCAGTTTCTCCATCAAACAGGCATCTTACAACCGAATCT + +a +s mr.mrrefChr3 72637 19 + 181019 AATGTGTTACCTGTTGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520295 19 + 636262 AACGTGTTACCTGTTGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 531726 19 + 647215 AATGTGTTACCTGTTGTCT + +a +s mr.mrrefChr3 72656 163 + 181019 AATCACATTACAGTGTTACAGATGGTTCTCTCTTTGAGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTCAATACCACTCATGCTGATAGAAATCACTAGTCTGCCAGCTTTGGCAGTGAGTGGTGCATTTGGGCCATAAGGTATGTTACTATGCTTGCTATGTAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520315 149 + 636262 AATCACACCACAGCGTTACAGATGGTTCTCTCTTTGCGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTCAATACCACTCATGCTGATGGAAATCACTAGTT--------------GTGAGTGGTGCATTTGGGTCATAAGGTATGTTACTATGCTTGCTATGTAGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 531745 163 + 647215 AATCACATTACAGTGTTACAGACGGTTCTCTCTTTGAGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTGAATACTACTCATGCTGATAGAAATCATTAGTCTGCCAGCTTTGGCAGTGAGTGGTACACTTGGGCCATAAGGTATCTTCCTATGCTTGCTATTTAGTAT + +a +s mr.mrrefChr3 72819 100 + 181019 TAATGTAGCCTTGTGTTTCTCCTGTGTCTAGTTACCTGACAGAATTTCCACTCAGTTAAATACGAACCCAGCCACTTCAAATGTCAAGTGACAGTAGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520465 100 + 636262 TAACCTGGCCTTGTGTTTCTCCTGTGTCTAATTAACTGACAGAATTTCCACTCAGTTAGATACGAACCCAGCCACTTCAAATGTCAAGAGACAGTAGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 531908 100 + 647215 TAATGCACCCTGGTGTTTCTCCTGTGTCTAGTTACCCGAAAGAGTTTCCATTCAGTTAAATATGTATCCAGCCACTTCAAATGTAAAGTGACAGTAGTAT + +a +s mr.mrrefChr3 72919 7 + 181019 AGGGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520565 7 + 636262 AGGGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 532011 7 + 647215 AGAGACA + +a +s mr.mrrefChr3 72926 8 + 181019 GTGGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520573 8 + 636262 GTGGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 532018 8 + 647215 GTAGTATA + +a +s mr.mrrefChr3 72934 151 + 181019 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mr.mrrefChr3 73184 734 + 181019 GACTTACACAGTATATAAATACACAGAAAGCACCTGGTGAGCAGCAGAACAGACAGATACACAGCTGCAGGCATTAGACTGCACGCAGGTATCTAACACTGGCATATAGGGAATCTCAAGGACTTTAGAATATTTCAAGCAAGAGTCTCCCAAAAATGGTGGCAACTAGAGTGGTCTTTAATATGAGGCATGTAAGGTTTTAGGAAATAGGTGAAATGCGGCCTTGTCACTGTAATGCTTTTTTGGCCTCAATTGAATTAATTGTATGCTCATTGGATAGAAGTCTTGCAACTTGAGAACTGGAGACTGGAGGTTGGTGCTAAGTTATGATCCTGCTAAATCAGATGGCACAGGAGGTTAAAGTCCATTGAGCCTCATGGTGAAAGGTTAAAGTCTATAATGAAAAATAAAGATAAGGGAGACCCATATGGTTTGTTGGTATGGAAGATATGGTAGGTGAGTAGGAGGCCCATACACTTTATCCCCCCACAGAATACAGGGCAAAACTGTTGTTATTATATTTTGTGGGTCACAAATGGAGCATAAAAGACACTTGTACAAGTGAACACCAGTACCTATCAGCATGCACATGACAAAATGACAAGGTCATTTTAAGTACTAACTAAACAAATATGGTATTTGTCTCAAAGGTACAATGTGGTGGTATCTGGCATTATCACAGCATAAACTATGACTGGTGCAAGTTAGTTATTAGCCGGGGGGACATGTACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520846 719 + 636262 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TATTATAATTCTTTATAGCTACACTTGCATCACAATTACAGGTGAGGTGATACATCAGCAGTTGGATAATGATGAAAGAGTTCATTGGGTTTAAGA----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 535485 101 + 647215 TATTATAATTCTTTATGGCTACATTTGCAGCACAGTTACAGGTGAGGTGATACATTAGCAATTGGACAATGTTGAAAGAGTCTATTGGGTTTAAAAACTCA + +a +s mr.mrrefChr3 76419 5 + 181019 CCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 535587 5 + 647215 CCAAG + +a +s mr.mrrefChr3 76424 94 + 181019 CAATCAATTCTGATATCAATAATATGCCAGTTTTGTCCCTTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAGTTAATCCAATATTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524631 92 + 636262 CAATCAATTCTGATATTAATAATAAGCCAGTTTTGTCCCTTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAATAACACC--TATTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 535593 94 + 647215 CAATCTATTCTGATATCTATAATATGCTAGTCTTGTCCATTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAGTTAATCCAATATTGA + +a +s mr.mrrefChr3 76518 233 + 181019 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37 + 647215 CTGCCACACACTGTATCACATCCAGCGTACCTGAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 76788 125 + 181019 GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGGGAGTGTAGTGAGTAAATAGCCTAGTAATGGGCTGTTTCTGTGATCAACATCATGTTCCCCTGATACTACTTCCCAAGGAGTCACTCTGTCATGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524978 125 + 636262 GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGGGAGTGTAGTGAGTAAATAGCCTAGTAATGGGGTGATTCTGTGATCAACATCATGTTCCCCTAATGCTACTTCCCATGAAGTCACTCTGTCATGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 535962 125 + 647215 GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGAGGGTTTATTGGTTAAATAGCCTAGTAATTGGCTGTTTCTGTGATTGACATTATGTTTCCCTGATACTAATTCCCAAAGAGTCACTCTATAATGATG + +a +s mr.mrrefChr3 76913 177 + 181019 TACCATTACCTGATAGTTAAATACTACCAGTTCACTGAAAAACCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTTCACTAAGCTGTTACAGGTGAGTTAGAGCCCTATCTCCCTTTACTGGACTGTACCCTTGGAATAGGCAAGGATCAATAGGAAGCTCTGGATCAGTACTATTTATATGTTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525105 176 + 636262 TACCATTATCTGGTAGTTAAATACTACCAGTTCACTGAAAAACCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTTCACTAAGCCGTTACAGGTGAGTTAGAGCCCTATCTCCCTTTACTGGACTGTACACTCGG-ATGGGTAAAGATCAATAGAAAGCTCTGGATCAGTACTATTTATATGTTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 536087 175 + 647215 TACCATTACCTGATAGTTAAATACTACCAGTTCATGGAAAACCCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTCCATTAAGCTGTTACAGGTGAGTTATAGCCCTACCTCCCTTTACTGGACTATACCCATGGAAAAAGCAAGGATCAATAGGAAGCTCTGGG--AGTACTATTGATATGTTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 77090 66 + 181019 CATTGCTATCAGAGGATAAGTGCACAGATGACAGGTGCACTCAGGGAGGCTAAGGAGGGAATGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525281 45 + 636262 -------GGTAGAGGACAAGTGCACAGATGACAGGTGCACTCAGGGAGGCCA-------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 536265 66 + 647215 CATTGCTATCAGAGGATAAGTGCACAGTGGACAGGTGCACTCAGGGAGGCTAAGGAGGGAATGGCT + +a +s mr.mrrefChr3 77156 12 + 181019 GTGCAGTTAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 536365 12 + 647215 GTGCAGTTAATT + +a +s mr.mrrefChr3 77168 224 + 181019 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mr.mrrefChr3 77417 47 + 181019 AAAAATTACCTCCAAAGAGGGACGGTGAAATGTACAGATCAATGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525550 44 + 636262 AAAAATTACCTCCAAAGAAGGACGGTGAAA---ACAGATCAATGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 536631 46 + 647215 GAAAATTACCTCCACAG-GGGAGGGTGAGATGTACAGATCAATGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 77464 145 + 181019 TACCTATATCCATAGTTGTTTAAGATCTTGACTGTCTTGCCTACCAAAAACTACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCCTGCAGGACAATAACTTGTGAGTAATGTCATTCTGTGGTCACTGCCTTCCTATCTCAGTTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525594 145 + 636262 TGCCTATATCCATAGTTGTTTAAAATTTTGACTGTCTTGCCTACCAAAAACGACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCCTGCAGAACAATAACTTGTGAGTAATGCCATTCTGTGGTCACTGCCTTCCTGTCTCAGAAGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 536697 145 + 647215 TACCTACATCCATAGTTGTTTAAGATCTTGACTCTCTTGCCTACCAAAAAATACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCTTGCAGGACAATAACTTGCGAGTAATGTCCTTCTGTGTGTACTGCCTTCCTATTTGAGTTGAGT + +a +s mr.mrrefChr3 77609 310 + 181019 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GAGCTAGGGATAACTAACTAAGCTCCCTTTTCACTTGGCTTCAGCAGACGTTTATGTCACTTATCTATCATTACATCTGATATC------------------CTGCACTGAGCTAACCAACAGGTGATCCAGATCAAGGGAGAAGCCACATATGCAAAGCACAATCTTGTATTGGCTTGTCAGGCTGGAGATTGTATTCACCCTACTTGATTAACATCCTTAATCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 539067 197 + 647215 ------------------------CTCTTGTCTCTTG------GCAAACGTTAATGTCATTTATTGATCATTACATCTGATATCTGCTACTACTTGAGTGAATCGCACTTAGCTAACAAACATATGGTCCAGCTCAAGGAAGAAGCCGCATATGCAACACACAATTCTCTATC-GTTGGCCAAGCTAGAGATTGTACTTCTCCAACTTGATCAACATCCTTAATCCAT + +a +s mr.mrrefChr3 80124 21 + 181019 GCGTTTTGTGGATATTGACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528175 21 + 636262 GCGCCTTGTGGATATTGACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 539264 21 + 647215 GAGTTGTGTGGATATTGAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 80145 626 + 181019 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CCACAAAGGAGTGACTGTAAGAACTATGACAAACTACTCATACTTGTTCATGTGTTCTAA-TGGTTGATGTCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAACTATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGGGGCACTTATGATTTAGGTCACAATCATGAATTTAAAATTCAGTAGCTTTTAGTACCAGCTATCAGTAACTATGAAAATAGATGACATCCATTCACTATGTCCTGGCTGGAATCACCTGGATGATAAAGAACTTTCCTAATTACTCCCAAATATAAGTTTTCGTCAGCAGACTATGGCAAAGTGGCTTCAATTCTCTTTAAGGCATAGGCCTCTACCATGGCTGATGAGTTGTGTTCTGATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGGTTTTGACAGTAAACTGGAGCATCACATTGACTAACAAAGAATCACGTCATGTGAATACTGCAACGTTCAGGGTTAATATTAGCCTAGTCAATCAGTACCAATTATGGTATCTCCGACTGTCACTTGCCACACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTATCAGCATACACTAACACAAGAGGAATACTTGTTTGCACCCCTTTAACAGCTAGTGCACGATGCATGACTT-ACGAGGAATCTG + +a +s mr.mrrefChr3 80771 13 + 181019 TTTGGTCAATAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528827 13 + 636262 TTGGGTCAATAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 539910 13 + 647215 TCTGATCTATATG + +a +s mr.mrrefChr3 80784 8 + 181019 ATCTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528840 8 + 636262 ATCTGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 539928 8 + 647215 GTCTGACA + +a +s mr.mrrefChr3 80792 19 + 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-----AAGGGGAAAACCAGCTTAGTTTTAACTTCAAGTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 23080 41 - 647215 GTGAGAAGGCGAGAACCAACTTAGTTTTATCTTCAAGTAGC + +a +s mr.mrrefChr3 98350 146 + 181019 AACCTGTCACCCCCAAGTCAGCCTGGTTGATACCCCCCCTGCGAGGAATCACTAACCAGCCGCTCTGCAGACACGATATGGGGACGTCTCATGTGCCGTCGTCGCAGACGCAATGCGGGGTGGGTATGTTCGCGCGGCGTTGGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548231 146 + 636262 AACCTGCCCCCCCCAAGTCAGCCTGGTTGATACCCCCCCTACGAGGAACCACTAACCAGCCGCTCTGCAGACACGATATGGGGACGTCTCATGTGCCGTCGTCGAAGACGCAACGCGGGGTGGGTATGTTCGTGCGGCGTTGGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 23122 146 - 647215 AACCTGTCAGCCCCAAGTCGGCCTGGTTGATACCCCCCCTGTGAGGAATTACTGACCGGCCGCTCTGCAGTCACGATAAGGGGACGTTTCATGTGCCGTCGTCGCAGACGTAGTGCGGGGTGGGTATGATCGCGCGGCGTTGGGCA + +a +s mr.mrrefChr3 98496 67 + 181019 ATACGCCCCATCGCTTATTGATTGAGCTCAATATCATCTCTGAGCTCCATGGTCTCCAGCTCCATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548377 67 + 636262 ATACGCCCCATCGCTTATTGATTGAGCTCAATATCATCTCTCAGCTCCACAGTCTCCAGCTCCATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 23289 67 - 647215 ATACGACCCACCGCTTATTGATTGAGCTAAATATCATCTCTGAGCTCCATGGTCTCCACCTCCACTG + +a +s mr.mrrefChr3 98563 145 + 181019 TTTTCCCTGCGACAAGTACCACTGTGGGCATTATCCTGTTCCATTGTACAATGCAAACATTATGTAAAACTGGTTTGAGTGGGGAGCTCAACATACAAGGTCTCCCTTCACATCATAAACAATGACCAAGGTTTATACTAGACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548444 145 + 636262 TTTTCCCTGTGACAAGTACCACTATGGGCATTATCCTGTTCCATTGTGCAATGCAAGCATTATGTAAAACTGGTTTGAGTGGGAAGCTCAACATACAAGGTCTTCCTTCACATTATAAACAATGACCAAGGTTTATACTAGACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 23358 145 - 647215 TTTTCCCTGCAACAAGTACCACTGTGGGCATTATCCTGTTCCATTGTACCTTGCAAACATTATGTATAACTGGTTTGGGTTGGGAGCTCAACATACAAGGTCTCCCCACATATCATAAACACTGTCCAAGGTTTATACAATACAT + +a +s mr.mrrefChr3 98708 70 + 181019 CTTATCCTACTCCACACGCTTCATAACACTAATATGCACTGACCACATGGATCCTATCTGTGGGCATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548605 70 + 636262 CTTATCCTACTCCACACGCTTCATAACACTAATATGCACTGACCACATGGATCCTATCTGTGGGCATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 23503 70 - 647215 CCTATCCTACTCCACATGGTTCATAACACTAGTCCAGACTGAAAAAATGGATCCTATCTGTGGGCATACA + +a +s mr.mrrefChr3 98778 93 + 181019 GGCGCAGCAAAGAAGCTTTCATTCCCACTATACCACAAAAAAATGCATTTTTCTATGTGATGCAGGTTATTCAGCCAAGGATATCTCTTCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548676 93 + 636262 GGCGCAGCAAAGAAGCTTTCATTCCCACTATACCACAAAAAAATGCATTTTTCTATGTGATGCAGGTTATTCAGCCAAGGATATCTCTTCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 23573 93 - 647215 GGCTCAGCAAGGAAGATTTCTTTCTCATTACACCACACAAAAATGCTGTTTTCTATATGATATGGGTTTTCCAGCCATGGCTGTCTCTTCCTA + +a +s mr.mrrefChr3 98871 55 + 181019 TCTATTGTTAGAATGGGAGAGGACTGACCTTTTCTGTGTTGCAAAATAGGCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548769 55 + 636262 TCTATTGTTAGAATGGGAGAGGACTGACCTTTTCTGTGTTGCAAAATAGGCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 23689 55 - 647215 TCTATTGTTGGAATGAGGGATAGCTGACCTGTTCTGAGTTGCATAATAGGCATAT + +a +s mr.mrrefChr3 98926 64 + 181019 TAATTATCTACCCAATAGCATTTGTGTTACAGGGCATATAAAGTTCAAGTGTCTCCTAGTCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548824 64 + 636262 TAATTATCTACCCAATAGCATTTGTGTTACAGGGCATATAAAGTTCAAGTGTCTCCTAGTCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 23752 64 - 647215 TACTTATCTACCCAATAGCATTTGCGTTACAGGGCATATAAATCTCAAGTAACTTCTAGTCCTT + +a +s mr.mrrefChr3 98990 51 + 181019 GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548888 51 + 636262 GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 23817 51 - 647215 GATCCAGCATGAAGTGGATGCGCTAAAAGAGAGACATCAAGCATTTTGGGA + +a +s mr.mrrefChr3 99041 243 + 181019 CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCAAAGAGCTATTGATGTGCTACTAGGTATGAGAGGCTGGTCTAATGATAACCAGAATGTCCCTGCCAGCGGGTGTACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTGGCTGCTGTTGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATTTGGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548939 234 + 636262 CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCGAAGAGCTAT-GATGTGCTACTAGGTATGAGAGACTGGTCTAATGATAGCCAGAATGTCCTTGCCAGCGGGTGAACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTG--------TGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATCTAGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 23871 235 - 647215 CGTAATCAACCAGGCAGAAATGTAGTACCAGCCAAGAGCCCTTGTCCAAATAGGTATTGATGTGCT-CTAGGTATTTGGGGCTGGT-TATTGATAACCAGAACGTCCCTCCCAGCGGGTGTACACAATCGTTCGGCCGTTTACATAATTATTTGGCTGCTGTTGTAAGCCTGCGTCCCGTGAGTGTTGAATTTGGAAGTGAGCGCGGGGCGAATATACCCTCGTTTCTGCAT------CTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 99284 81 + 181019 TACAGGAAGAGTGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAGCTATTCGATTCTGACCCAGTAAGAACTATTGGATTCTGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549173 81 + 636262 TACAGGATGAGCGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAACTATTCGATTCTGACCCAGTAAGAACTATTATATTCTGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 24107 81 - 647215 TGCAGGAAGAATGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAGCTATTGGATTCCGACGCAGTCAAAACTATTGGATTCCGACT + +a +s mr.mrrefChr3 99365 21 + 181019 TACCACTGGATCCGTATTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549254 21 + 636262 TACCCCTGGATCCGTATTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 24228 21 - 647215 TACCACTGGATCCGTATTTAA + +a +s mr.mrrefChr3 99386 70 + 181019 GTCGCATAACCGCTGGAACGACTTAAATAAGAGCAACGTCGCTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549275 70 + 636262 GTCGTGTAACCGCGGGAATGACTTAAATAAGAGCAACGTCGCTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 24251 70 - 647215 GTCGCAGAACCGCTGGGACGACTTAAATGTGAGCAACGTCGTTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAACG + +a +s mr.mrrefChr3 99456 92 + 181019 CTGCTGGGAAAGGGGATCTGTAAAGGATGCTCAGTAAAGGTTATGCCCACATTAGCTTATGTCACTGCAGGAAGAGATATGGACTACACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549345 92 + 636262 CTGCTGGGAAAGGGGAACTGTAAAGGATGCTCAGTAAAGGTTATGCCGACATTAGCTTACGTCGCTGCAGGAAGAGATATGGACTACACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 24322 92 - 647215 CTGCTGGGAAAGGGGATCTGCAAAGGCTGCTCAGTAAAGGTTATGCCCACGTTAGGTTATGTCACTGCAGGAAGAAATATGGACAACACCCC + +a +s mr.mrrefChr3 99548 90 + 181019 TTTCTTGGTCCTGTGTCATCCTACAAATTTTCCTAGGTCATTTGAAACCATGCACTCATGCAATAAATTAGCTGCTTGACATCACAAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549438 90 + 636262 TTTCTTGGTCCTGTGTCATCCTACAAATTTTCCTGGGTCATTTGAAACCATGCACTCATGCTATAAATTAGCTGCTTGACATCAGAAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 24414 90 - 647215 TTTCTTGGTCATGTCTCATCCTACAAGTTTTCCTAGGTCATTTGAAACCATGCATTCGTGCAATAAATTAGCTGCTTGACATCACAAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 99638 93 + 181019 TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTCTACGTCTAATACCACCAGTGTGTGTGAGCACACAGTTGATAGCTTAGACAGTCAAGTTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549528 93 + 636262 TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTCTACGTCTAATACCACCAGTGTGTGTGAGCACACAGTTGATAGCTTAGACAGTCAACTTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 24506 93 - 647215 TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTGGACGTCTAATACCTCCAGTGTTTGTGAACACACAGTGGATAGCTTAGACAGTCAAGTCAAA + +a +s mr.mrrefChr3 99731 231 + 181019 CCCTCACTGTAGTACAGAGATTGAGAGTCATGAGCCTTAAGCTCTTGAGTGGAAAGAGGTTATAAACTTGTCATAGCTACGGGCTGCTATTATCCATCTAGAAAAGTAGCTGGTGGTAATTTTCATGTCCATAGTGTAAATGAGGGATAATAGTGCTACAACCCCTGACAGGGGAGTTTAAAAGAGCTCTTACCTGTAGCTAGAATACTGCTCATTGATAAGACACTACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549621 231 + 636262 CCCTCACCGTAGTACAGAGATTGAGAGACATGAGTCTTAAGCTCTTGAGTGGAAAGAGGTTATAAACTTGTTATAGCTAGGGGCTGCTTTTATCCATCCAGAAGAGTAGCTGGTGGTAATTTCCATCTCCATAGTGTAAATGAGGGATAATAGTGCTACAACCCCTGGCAGGGGAGTTTGAAAGAGCTCTCACCTGTAACTAGAATACTGCTCATTGATAAAACACTGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 24617 231 - 647215 CACTCACTGCAATACAGAGAGTGAGAGTCATGGGCGTTAAGCTCTTGAATGTAGAGAGGTTATAAACTTGTCATAGCTACGGGCTGCTATTATCCATATAGAAAAGTAGCGGATGGTAATTTTCATGTCCATAGTGTATACGAGGGATAATAGTGCTTCAACCCCCGACAGAGGAGTATAAAGGAGCTCTTACCTGCAGCTAGAATACTGCTCATTGACAAGACACCACTG + +a +s mr.mrrefChr3 99962 58 + 181019 CTGGAATTAGAGACACAGTAACTGACCCAGGATATGGATCGGTATTCTCCTAAATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549857 58 + 636262 CTGGACTTGGAGACACAGTAACTGACCCGGGATATGGATCGGTATTCTCCTAAATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 24848 58 - 647215 CTAGAATTAGAGACACAGTGACTGACGCAGGATATGTATTGGTATTCTCCTAAATCTT + +a +s mr.mrrefChr3 100020 23 + 181019 CTGTATGAGCCACCTGCGTGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549938 23 + 636262 CTGTATGAGCCACCTGCGTGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 24906 23 - 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CATACCAGCCTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACAGTAACTTGTAGTTATCATACCCAAGTGAAAGGGCCATTGGCACCCAAGGTCCACAAAAGTAACAGTTTGTAACCACGCTAGAAGGCAGCTTATAGCCATCTACACATTTCTTCTTAAATCCCAGTGGCACTCTTCTTCTCCTTTTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCTCACAACTATAAACATTTCAGATTGAAAAGAGTAAGGGAGAGTGTACTGCAGACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550498 282 + 636262 CATACCAGCCTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACAGTAACTTGTAGTTATCATACCCAAGTGAAAGGGCCATTGGCACCCAAGGTCCACAAAAGTAACAGTTTGTAACCACGCTAGAAGGCAGCTTATAGCCATCTACACATTTCTTCTTAAATCCCAGTGGCACTCTTCTTCTCCTTTTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCTCACAACTATAAACATTTCAGATTGAAAAGAGTAAGGGAGAGTGTACTGCAGACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 25461 282 - 647215 CGTATCAGTTTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACGGTAACTTGTAGTCATCATACCCAAGTGAATAGGCCACTGGCACCAAAGGCCCACAAAGGTAAGAGTTTAGAACCACATTAGCAGGCAGTCTATGACCTTCTAAACATTTCTTCTTCAATTCCAGTACCTCTCTTCTTCTCCCTTTCTTTTCTCCTAGTCCTTTTCTCACAACTATAAACACTCTAGAGCGAGAAGAGTAAAGAAGGTTGTACTGTGGACAC + +a +s mr.mrrefChr3 100802 176 + 181019 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TTCTGCCATTTTGCCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGATGTCAAGCTCTTTCTCATCCCAGTGTGGATTCTTAACTAGGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 101089 59 + 181019 AATGAAGTATGTACTTAATCAACATATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551083 59 + 636262 AATGAAGTATGTACTTAATCAACATATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 26039 59 - 647215 AATGAGGTATGTACTTAATCAATGCATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC + +a +s mr.mrrefChr3 101148 154 + 181019 ATCATCTTCAAGTCAGGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGCTGCAAGGTAGTGTAACACTTAATGGATGACAAACGTTTAGGTATGTTTAGATAGGGGCACATGGAATTAGGGTTGTTTGTCTAAAAGTGCATACGTACATCAACTTATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551142 154 + 636262 ATCATCTTCAAGTCAGGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGCTGCAAGGTAGTGTAACACTTAATGGATGACAAACGTTTAGGTATGTTTAGATAGGGGCACATGGAATTAGGGTTGTTTGTCTAAAAGTGCATACGTACATCAACTTATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 26101 154 - 647215 ATTATCTTTAAGTCAAGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGTTGAGGAATAGTGTAACACTCAATGGACAGCAAATGTCTAGGTATGTTTAGATTGGGGTACATGGAATTAGGGTTGTTTCTCTAAAAATGCATACATACATCAGCTTGTGG + +a +s mr.mrrefChr3 101302 91 + 181019 TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551297 91 + 636262 TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26255 91 - 647215 TACCCTACCAAAAATCAAGGAAGTTATTTTTCAAGCATAACATAGCAAACCTTGCAGGTTACAATGCCTTATCGATTCTTTGAACTTACAT + +a +s mr.mrrefChr3 101393 13 + 181019 ATGTGAGAGATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551397 13 + 636262 ATGTGAGAGATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26346 13 - 647215 ATGTAAGAAATTA + +a +s mr.mrrefChr3 101406 7 + 181019 TGCTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551412 7 + 636262 TGCTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26359 7 - 647215 TGCTAAT + +a +s mr.mrrefChr3 101413 15 + 181019 CATCAGTGATATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551421 15 + 636262 CATCAGTGATATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26366 15 - 647215 CATCAGTGATATTGA + +a +s mr.mrrefChr3 101428 95 + 181019 TACAAGCAATTATTTAATGCTATGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCTCCTCTGTCCTTTGAAGAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551437 92 + 636262 TGCAAGCAATTACTTGATGCTATGATAAAAGTGCAGGTGAACTTAAGTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCCCCTCTGTCCTTT---GAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26381 94 - 647215 TACAAGCAAT-ATTTAATGCTAGGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCATCCAGTTGTGGTCAGTGGTCTCCTCTGTCCGTTGAAGAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 101523 1 + 181019 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551574 1 + 636262 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 26475 1 - 647215 G + +a +s mr.mrrefChr3 101524 15 + 181019 ACCTGTTACCCTCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551575 11 + 636262 GTCTGT----CTCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 26478 15 - 647215 ACTTATTACCCTTGT + +a +s mr.mrrefChr3 101539 353 + 181019 ATAAGCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTACCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGTCGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTGATTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTTGGGCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTGCCAAGCCAGCCTAGACTAATCTAGGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAAATGCCACCTCACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551586 352 + 636262 ATGACCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTGCCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGCTGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTCCTTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTCAGCCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTACCAACCCAGCCTAGACTAATCTAGACTTAAGACACACAATAACCA-TGTTAAAATGCCGTCTAACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAGAGAAGCACCACTGACAATACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26498 352 - 647215 AGAGGTGGCTTGCTTCTCGCTTGAGTTACCATTAGCCTACCCCCTCAACTCACTGAAGGATTAATATCGGCAGATGCATGTCGTGATGGGCCAGCACAGTCTTTATAAAGATTTGATTCAATTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCGAAGCTTGGGCCGAGAAGAATTTGGAAAAATCTTACATCCTAGCTGAGTGCCCACTACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGTA-GCCTGCCAAGCCAGCCTAAACTAACCTGAGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAGGTGCCACCTCACTGTTCTAGATGGACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT + +a +s mr.mrrefChr3 101892 51 + 181019 TCCCCTACTTGCATTTATGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551938 51 + 636262 TCCCCTACTTGCATTTATAAGTACTAGCACCATAGTTTTTTCAGCTTTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26863 51 - 647215 TCCACTACTGACATTTGTGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA + +a +s mr.mrrefChr3 101943 169 + 181019 TCAAATCACCGTAAGGGATCCTATCTGGTTAGCACTGGCATCTATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGTTGAGATTGCGACATGCAGCACTTAGGATTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551992 155 + 636262 TCAAATCACTGTAAGGGTTCCTATCTGGTTAGCACTGGCACCAATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCTATCAGACCCA--------------GCAGTTCTGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGCTGAGATTGCAACATGTAGCACTTAGGATTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26914 169 - 647215 TCAAACCACCGAAAGGGATCCTATCTTGTTAGCACTGGCATCTATTATCAAAGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTGGATAAAGTTGAGAAGATACAACTGTTGAGATTGTGACATGCAACACTTAGGATTAT + +a +s mr.mrrefChr3 102112 113 + 181019 AATCAGAGTATATTCTGCAGCACCCCGATTGGGGACAAATACAGAACAATAGTGTCCTGAGCCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAGACCAAGAAATAACTGAATGGGATATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552151 112 + 636262 AATCAGAGTATATTCT-CAGCACCCCGCTTGGGGACAAATATAGAACAATAGTGTCCTGAATCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAGACCAAGAAATAACTGAATGGGATATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 27083 112 - 647215 ACACAGAGGATATTGTGCAGCTCCCCCATTGGAGACACATACAGCACAACAGCGTCCTGAGCCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAAACCAATAAATA-CTGAATGCGATGTGTT + +a +s mr.mrrefChr3 102225 205 + 181019 GTAAGTAGCCCTATCATATGGCTTTTTCAGGATTTAGCAGTCTTCACAGAGGCTGTTCATTTGCTGAGGACATTATGAGATACTCTAGAATGAATCCATTATGATGGCCAATGAGGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGACATGGATCATAGGCCATTCGGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGAGTGCTTAGAATTCAAAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552263 202 + 636262 GTAAGTAGCCCTATCATACGGTGTTTTCAGGATTTAGTAGTCTTCACAGAGGCTGT--ATTTGCTGAGGACATTATGAGATACTCTAGAATGAATCCATTATGATAGCCAATGAGGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGAGAGGGATCATAGGCCATTCAGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGAGTGCTTA-AATCCAAAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 27196 205 - 647215 GTAAGTAGGCCTATCATATTGCTTTTTCAGAATTTAGCAGTCTTCACAGAGGCTGTTCATTTGTTGAGGACATCAGGAGATACTCTAGAATGAGTCCATTATGATGGCCAATGAAGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGACATGGATCATAGGCCATTCGGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGTGTGCTTAGAATTCAAAGACA + +a +s mr.mrrefChr3 102430 54 + 181019 AGATGAATCTATGCTTAAATGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552465 54 + 636262 AGATGAGTCTATGCTTAACTGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 27499 54 - 647215 AGGTTAATTTATGCTTAAATGCCATTCTGATTTTAATAGACACTTTGTCTGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 102484 11 + 181019 AATCTCAAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552519 11 + 636262 AATCTCAAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 27557 11 - 647215 AATCCCAAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 102495 38 + 181019 CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552531 38 + 636262 CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 27568 38 - 647215 CGCATGCACCAAAGTCATTAGTAGGACTAGGTCAAAGC + +a +s mr.mrrefChr3 102533 494 + 181019 AAGCGTTCTATATATGATGATGCTGAGCTACAGAGCCTCAATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATGGAAGTAAAAACAGCCTTTCCCACTTATACATGTGCTGGTAGGAATTTCAACTTCAACTGCTGTACTTTTTTTTTAAGGCATGCACATCTTTTGTCTGGGGACAGAGAGGCACTACCCTAACATATGAACTCGCTCACTTGTAAGCTAGGGTGACAAAACAATCTGCCCTCTTAAATGTGATTTTATAATTACGTTACTCTCTGCCTAGAAGTGACATTACAGGCTGCTTGAATAAGAAACTCCCTGTCTGGGTCTGTGCCTAGTCAATTGTGATCCTCCATAGAAATCCAGTTGTGGATATGCTTGGGCACCAAACTCTCATTGTTGTACTGAGAGAACTGACATCAGTTGAAGATAGATTTATTATAGAGGGCTCTAAGTACTCCCTCATATAGTTATTTGTTTATGGGGGCTATGGGCAATAGGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552569 492 + 636262 AAGCGTTCTATATATGA-GATGCTGAGCTACAGAGCCTCAATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATAGAAGTAAAAACAGCCTTTCCCACTTATACATGTTCTGGTAGGGATTTCAACTTCAACTGCTGTACTTTTTCTTTAAGGCATGCACATCTTTTG-CTGGGGTCAGAGAGGCACTACGCTAACATATGAACTCGTCCACTTGTAAGCTAGGGTGACAAAACAATCTGCCCTCTTAAATGTGATTTTATGATTATGTTACTCCCTGCCTAGAAGTGACGTTACAGGCTGCATGAATAAGAAACTCCCTGTCTGGGTCTGTGCCTAGTCAATTGTGATCCTCCATAGAAATCCGGTTGTGAATATGCTTGGGCACCAAACTCTCCCTCTTGTACTGAGAGAGCTGACATTAGTTGATGATAGATTTATTATAGAGGGCTCTGAGTACTCCCTCATATAGTTATTTGTTTATGGGGGCTATGGGCAATAGGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 27615 488 - 647215 AAGCATTCTATCTATGATGATGCTAAGCTACAGACCCTCTATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATGGTAGTAAAAACAGCCTTTCCCGCTTATACATGTGCTGGTAGGAATTTCAACTTTAACTGCTGTACTTTTCTTTTGAGGCATCCACATCTTTTGTCTGACGACAGAGAGGCACCACCCTAACATATGTACTCACTCACTTGTAAGCTAGCGCGACAAAACAATCTGGACTCTTAAATCTGTTC----AATTACTTTACTCTCTGCCCAGAAGTGACAT--CAGGCTGCTTGAATAAGAAAATCCCTGTGTGGGTCTGTGCCTAGTCCATTGTGATCCTCCATAGAAATCCAGTTGTGGATATTCTTGGGCACCAAACTCTCATTGTTGTACTGAGAGAACTGACATCAGTTAAAGACAGATTTAATATAGAGGGCTCTAGGTACTCCCTAATGTAGTTATTTATTTATAGGGGCTATGGGCAATGGGCCC + +a +s mr.mrrefChr3 103027 319 + 181019 TGGACAAACTCTTGGAATAAGATAAGCAGCCAGACTCTATAATAGCACCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCAAAATTCAAGTTCTGTCATTGTTGAGTTTGTAAGTTTCTCCCCATCACTCTTACTATAATGTTGACCCCATATGGGGACGCATATCTTAAATGCCTACTGTTAGGTTAAAATAAACATCATGAGAGCACCTTATCTAATGCTGGTTTCACATGACCCTTGTCGGCCTTGAGTCATCTCTTTATCCAAGCTAATACCCATGTGATGTGCCTAATGGGAATGCTTTGGTGCAGCTATGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553062 314 + 636262 TGGACAAACTCTTGGAATAAGATAAGC-GCCAGACTCTTTAATAGCACCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCCAAATTCAAGTT---TCATTGTTGAGTTTGCAAGTTTCTCCCCATCACTCTTATTATAATGTTGACCCCATATGGGGACGCATATCTTAAATGCCTACTGTTAGGTTAAAATAAACATCATGACAGCACCTTATCTAATGCCGGTCTCACATGACCCTTGTCGGCCTTGAGTCATCTCTT-ATCCAGGCTAATCCCCATATGATGTTCCTAATGGGAATGCTTTGGTGCAGCTATGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 28103 312 - 647215 TGGACAAACTCTTGGAGTAAGATAAGCAGCCAGACCCTATAATAGTAGCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCAAACTTCAAGTTCTGTCATTGTTGAGTTTGT-------TCCCCATCATTCTTACTATTATGTTGACTCCATATGGGGATGCGTATCTTAAATGCCTACTGTTATGTTAAAATAAACACCATGGGAGCACCTTATCTAATGCTGGTTTCACATGACCCTTGTAGGCCTTGAGTCCTCTCTTTATCCAAGCTAACACCCATGTGATGTGCCTAATGGGATTGCTGTGGTGCAACTGTGCTT + +a +s mr.mrrefChr3 103346 57 + 181019 CTGTGTATGAATACAGGATTAATAACTTAATGACATGTCTGATTTAGCCCCTCAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553376 57 + 636262 CTGTGTATGAATATAAGATTAATAACTTAACGACATGTCTGATTTCGCCCCTCAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 28416 57 - 647215 CAGTGCATAAATACAGGATTAGTGATTCAATGACATGTCTGATTTAGCCCCTCAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 103403 32 + 181019 GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553433 32 + 636262 GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 28481 30 - 647215 GAGACCAATAATCTCATAAACGGAAGGTAA-- + +a +s mr.mrrefChr3 103435 167 + 181019 GGCAGTCCCTCCTGTATATTGTATCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGCATAGTGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553467 167 + 636262 GGCAGTCCCCCCTGTCTATTGTGTCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGTTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGGATAGAGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 28511 167 - 647215 GGCAGTCCTTTCCGTATATTGTATCAGAAGGATCAGGGAAAGATTTACAAGCCAATATAAGTATCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATATAATGTGACCACTGGAGGACCAGCTCAGTGGATGGGTGGCTGGACATCTGAGCAAATTCAACTTGGGCTAACTTATTCC + +a +s mr.mrrefChr3 103602 217 + 181019 TCCAGTTCAATTAGTGGCGGGGATAAGGGGTCCATGCCACTACAGTTTTGGGCAAAGCCATCTTACTCAGCCAGTTATATAAATAAGGGAAGGGAACTTAGTAATCAACCATAATAGGACTGCATATAGTTAATTATGAGCCTTTGATATGCATGGATGTATAATACCCTGATTTCATAGTGTAGTGATTTTATACCCCGGCTTTACATTATACCGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553634 216 + 636262 TCCAGTTCAATTC-TGGCGGGGATAAGGAGTCCATGCCGCTGCAATTTTGGGCAAAGCCATCTTGCTCAACCAGTTATACAAATAAGGGAAGGGAACTTAGTAATCAATCATAATAGGACTGCATACAGTTAATTAGGAGCCTTTGATATGCATGGATGTACAATACCCTGATTTCATAGTGTAGTGATTTTATAACCCGGCTTTATATTATACCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 28787 215 - 647215 TCCAGTTCAATTAGGGGTGGGGGTAAGGGGTCCATGCCACTAGAGCTTTGGGCAAAGCCATCTTACTCAGCCAGTTATATAGATAAGAGAAGAGAACTTAGTAATCAACCATAATAGGACTACATATGG--AATTATGAGCCTTTGATATGCATGGATGTATTCTACCCTGATTTTATAGTGTAGTGATTTTATACCCTGGCTTTACACTATACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 28678 109 - 647215 TCCAGTTCAATTAGTGGCAGGGCTAAGTGGTCCATGCCACTACAGTTTAGGGCAAAGCCATCATACTCAGCCAGTTATATAAATAAGGGAAGGGAACCTAGTACTCAAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr3 103819 187 + 181019 CGTGCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAATATTTATTATCCAATTATTTGATTTTTGATTGGGTATGACACCCTGTCCCCCCCTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAGGTTTGGTGGCAATGTTACACTATTACCACTATATTTACAATGAGTAACAGATTCCTTTGCACCCTTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553850 186 + 636262 CGTGCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAA-ATTTACTATCCAATTATTTACTTTTTGATTGAGTGTGACACCCTGTCCCCCCCTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAGGTTTGGTGGTAATGTTACACTACTACCACTATATTTACAATGAGTAACAGATTTCTTTGCACCCTTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 29005 175 - 647215 TACTCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAATGTTTATTATCCAATTATTTGATTTTTGATTGGGTATGTAACCCTGTCCCCCTTTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAAGTTTG-TGGCTATGTTACACTTTTACCATTATATTTACAGTGGGTAACAGTTTCCTTA----------- + +a +s mr.mrrefChr3 104006 105 + 181019 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TCACTCCAGAGGTTAGGGCACACACATTGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29355 32 - 647215 TCACTCCAGGGGTTCGGGCACACACATTGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 104213 164 + 181019 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGTCCTGAAAGAATAAGCTCCAGTAATCAGGTTCATGTGGTTAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGTGGTGGAGCAAGTAACCTTAATTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474459 164 + 636262 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGCCTTGAAAGAATAGGCTCCAGTAATCAGGTTCATGTGGTTAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGTGGTGGAGCAAGTAACCATAAGTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554240 155 + 636262 AAATAAA------GGCAGGTGGTCCTGAAAGATTACGCTCCAGTAAACAGGTTCATGTGGTAAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGCAGTGGAGCAAGTAACC---ATTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 29387 164 - 647215 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGTCCTGAAAGAATAAGCTGCAGTGCTCAGTTTCCTGTGGCTAGCAGTTTCCCTAATCTCAAGGGAGTATATTTAACTGGTGGAGCATGTAACCTTAATTTTGCCAGTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATATATAAGTCCCC + +a +s mr.mrrefChr3 104377 48 + 181019 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AAGATGTACCTGTGCATATCGAGGTATAATTCTTGAGTTAATTCCTTGCAATGGGTGATGACAACCTCAGCCTATCCAAGAATTAGTGTGGTTTACATGTGACCTAAAACCCTCAGAGACTTCAAATTGCCTCCCCCTTTTCTGGGAGTTCCTGTATCGTTGATACTAAAACAAGCTGAACAATCATTTAGTAGAGAGGCCCTGGGAAGGTGGCCTCCTTACTAAGAAACTTGCTCAATGACTGAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554494 248 + 636262 AAGATGTAACTGTGCATATCGAGGTATAATTCTTGAGTTAATTCCTTGCAACGGGTGATGACAATCTTAGCCTATCCAAGAATTAGTGTGGTTTACATGTGACCTAAAACCCACAGAGACTTCAAATTGCCTCCCCCTTTTCTGGGAGTTCCTGTACCGTTGATACTAAAACAAGATGAATAATCATTTAGTAGAGAGGCCCTGGGAAGGTGGCCTCCTTACTAAGAAACTTGCTCAATGACTAAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29659 214 - 647215 AAGATGTACCTGTGCACATCAAGGTATGGTTTCTGAGGTAATCCCCTACAATGGG-GATGACAGCCTCAGTCTACCCAACAATTAGTGTGGTTTGCATGTGACCTAAAATCCTCAGACACTTCAAATTTCCTCCCCCTTTTGTGGGAGTTCCTGTATGGTTGAGACTAAAACAAGCTGAACAATTATTTAGTA---------------------------------AAACTTGCTCAATGGCTGAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 104724 142 + 181019 TTGAATTCTTTTGTCAAGGATTAATACATATTTCGAGTATGAGTCTTGTTAGGTTGAATGAAGAAAGGATGCTGGACTGAAGATCTGATCAACTGGTCTCCAACCAAGATTGGTGATGCTGGAGGACTATTTGCACCTAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554749 142 + 636262 TTGAATCCTTTTGTCAAGGATTAGTACATATTTCGAGTATGAGTTTTGCTAGGTTGAAAGAAGAAAGGATGCTGGACTGAAAATCTGATCAACTGGTCTCCAACCAAGATTGGTGATGCTCGAGGAATATTTGCACCTAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29873 141 - 647215 TTGAATTCTTTTGTCAAGGATTAATATATATTTCTAGTATGAGGCTTGTTAGGTTGAATGA-GAAAGGATGCTGGACTGAAGGTCTGATAAATTGGTTTCCAAACAAGATTGGTGATGCTGGAGGACTATTTGGACCTAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 104866 33 + 181019 AGCTTAGATTTTAGGGCTATAAGCATAATTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554891 33 + 636262 AGCTTAGAATTTAGGGCTATAAGCACAATTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 30015 33 - 647215 AGCTTTAATTTTAGGGTTACAAGCATAATTTGT + +a +s mr.mrrefChr3 104899 240 + 181019 TTAAAATGTGTGTGGTCCTGGATGCACTGTATCTTTGCAACTCTATTCTAGAGCCCTTAAAGTACAACCAGGCCTCTACAAATGCACGTGATTGTAAGGCACCAGCAATTGCTGGTGTGGAATAAATGTGCAGCATTCCAGTAAACCTTTATTGATTACAAAGCAAGCATATATGGTTGTCCTCAATGCAGCTCTCATGCATAGCAAACTTTCCTTCAAATATTAGCAACTCTCGGCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554924 239 + 636262 TTAAAATGTG-GTGGTCCTGGATGCACTGTATCTTTGCAACTCTATTCTAGAGCTCTTAAAGCACAACCAGGCCTCTACAAATGCACGTGATTGTAGGGCACCAGCAATTGCTGGTGTTGAATAAATGTGCAGCATTCTAGTAAACCTTTATTGATTACAAAGCAAGCATATATGGTTGTCCTCAATGGAACTCTCGTGCATAGCGAACTTTCCTTCAAACATTAGCAACTCTCAGCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 30057 232 - 647215 TTAGAATGTTTGTGGTCCTGGATGGACTGTACGTTTGCAAATCTATTCTACAGCCCTTAAAGTACAACAGGGCCTCTACAAGTGCACATAATTGTAAGGCACTAGCAATTGCTGTTGTGGAATAGATGTGC--CATGCCACTAAAACTTTATTGGTTACAAAGCAAGCATACATGGTTGTCCTCAATGCAGTTCTCATGCATAGCAAA------TTCAACTATTAGCAACTCTCGGCCCA + +a +s mr.mrrefChr3 105139 250 + 181019 TTTGGAACTAATGGGCTCATTTTGGACTAATGGTGGTACTTCCTGAATGTTTCCTGTTTAACAAGGGTCCCTATTGGGACCCATAGCGTAGAGCAATGCACTGTAACCAATTTTCAAGTATTGCAATGCATTCCCCCAGCACATTAAGTATGGGGAGGAGAAGAATTCCTGACCAGTATTTGTTTGTTTTTAATGATGATTTTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACTCAACCCTCATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 555163 248 + 636262 TCTGGAACTAATGGGCTCATTTTGGACTAATCGTGGTACTTCCTGAATGTTTCCTGTTTAACAAGGGTCCCCATTGGGACCCATAGCGTAGAGCAACGCACCATAACCAATTTTCATGTATTGCAATGCATACCCCCAGCACATGAAGTATGGGGAGGAGAAGGATGCCTGACCAGTATTTGTTTGTCTTTAATGATGATTCTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACT-AACCCTCATG- +s simRat_chr6.simRat.chr6 30308 250 - 647215 TTTTGACCTCATGGGCCCAGTTTGGACTAATGGTGGTGCTTCCTGAATATTTCCTGTTTAACATGGGTCCCTATTGGGACCCGTAGTGTAGAGCAATGCACTGTAACCAGTTTTCAAGTATTGCAATGCATTCCCCCAGCACATTAAGTATGGGCAGTAGAGGAATTCCTGACCAGTATTTGTTTGTTATTAACGATGATTTTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACTCAACCCTCATGT + +a +s mr.mrrefChr3 105389 481 + 181019 ATGCCCATAGCTGGCGAGGGTACCATATATCAGTCAGGTTTCATCTAGTGTAGGTTCTGTTTTCCTACTGCTAGCAGGCAAAAATAGCCAAGATCATCATTCATGAGTAAGCTGCCATGTTGGCTAATGAGAACTACTGAGAAAACTTCACACATTAGAAAAAGCAGTCTGTAGGTTGTATTTTTGAAAGTGGTTTGTAGGGCAGTCCCTCATTTTAATGTGACTTTGAGTAACCTCAAACTCTATGCCCACTGTTGTGTGCTGAACTGGCCAACAATCCTTGCATCTAAAAGACCCCCTACCCTCCCATATAATTGGATAATTCTCTATGTCCTTGAGGAAAAAATAACCATGTTATACTTTGAAACATAATATACCAGCTCTATATCTTGGTAAAAGCATTGCGTGAATTTGCCTAATCCCCATGAGCACTCTTGTACCAAGACTAAAAACATTGAAACTGTCTCAGGTCAAGATTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 555411 476 + 636262 ---CCCATAGCTGGCGAGTGTACCATATATCAGTCAGGTTTCATCTAGTGTAGGTTCTGTTTTCCTACAGCTAGCAGGCGAGAATAGCCAAGATCATCATTCGTGAGTATGCTGCCATGTTGGCTAATGAGAACTACTAAGAAAAATTCACAC-TTAGAAAAAGCAGTCTGTAGGTTGCATTTTTGAAAGTCATTTGTAGGGCAGTCCCTCATTTTAATGTGAC-TTGAGTAACCTCAAACTCTATGCCCACTGTTGTGTGCTGAACTGGCCAACAATCCTTGCATCTAAAAGACCCCCTACCCTCCCATATAATTGGATAATTCTCTATGTCCTTGAGGAAAAAACAACCATGTTATGCTCTGAAACACAATACACCAGCTCTATATCTTGGAAAAAGCATTGCGTGAATTTGCCTAATCCCCATGAGCACTCTTGTACCAAGACTAAAAACATTGAAATTGTCTCAGGTCAAGATTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 30559 448 - 647215 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GTGCACCAGGGCTAAAGACCCCAAGTATGTTTTAGGTTAAATTTGATGGAAAGAAT-CAGTAATGGTGCAGTGGGCCAATCTATGACAGATCAATGCAAAATTGGTGACTTAGCTTTAAAGTTCTATCACATACTCTTCTACATCTGGAAACCGTATCATGAGCAACACCCATTTTGTGACTGTAT + +a +s mr.mrrefChr3 106056 101 + 181019 TTAGGATTTAGCTTTCCCTCAACTGATGAACTCAAACAATGCTTTAACTGGTCAAACAAGCAAATTAAAGAGTACAATTAGTTACTCTCTGCAATCTCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556078 101 + 636262 TTAGGATTTGGCTTTCCCTCAACTGATGAACTCAAACAATGCTTTAACTGATCAAACAAGCAACTTAGAGAGTACAATTAGTTACTCTCTGCAATCTCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 31192 101 - 647215 TTAAGATTTAGCTTTCGCTCAGCTGATGTACTCAAACAAAACCTTAGCTGGTCAAACAAGCAAATTAAAGAGTACAATTACTTACTCCCTGCAATCTAAAG + +a +s mr.mrrefChr3 106157 288 + 181019 TGAAATTTGGAACAATTAAACAAGTAGTAGCTAAGCCATCAGATTAAATTATGAATAGTTGCACAATCTGCAATCTTGATCATCAGTTCCTAATCACATTACACAGGACCAAGCACTATTCTTTTATGGCAAAGGCTTCGACTAATCACCCTGTGTAAACTTAAATGAATCCACCCAACCCCCAGTAGAAGAGTGGGATAAGTTCAGTGTTGGCTCTGTTGGTACACCTGTCTCCTTTAAGTTAGTGTTCTAGGGGCTCATATAGTAGGTGCCACTGAACTACATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556184 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TGTTTGGTTCAGTAATTGAATCTGTGCTAGGCAAACCTGGGTCTAACAATAGGCCATTTCAACATAAGCACAGCAAGATCAAGTCAGCACTATATCACTGAAACCACCTTGTCTTATATAGTGTTTATGTTGAAATCAGATTGCGACTGTAGTTTTCACTTCTTTTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556522 162 + 636262 TGTTTAGTTCAGTAATCAAATCTGTGCTAGGCAAACCTGGGTCTAATGATAGGCCATTTCAACATAAGCACAGTAAGATCAAGTTAGCACTATACCACTGATA-------GTCCTACAAAGTGTTTATGTTGAAATCAGATTGCGATTGTAGTTTTCACTTCTTTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 31595 166 - 647215 TGTTTGGTTCAGTAACTGAATCTATACTA--CAAACCTGAG-CTAACAATAAGCCATTTCAACCTAAATACAGCGAGCTCAAGTCAGCACTATATCACTGAAACCACCTTATCTTATGTAGCATTTATGATGGAGTCAGATTGCAACTGTAATTTTCACTTCTTTTCAA + +a +s mr.mrrefChr3 106657 107 + 181019 AACGAAACTCCTAGATTGTCTGGCACATACTTTCTTTGACAAGTTCAACAAATTAGGAACTCAAACACCTGATCCTTACATGGCCTTAGTACCCACTGTTACCCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556687 106 + 636262 AACGAAACTCCTAGATTGTCTGGCACATGCTTTCTTTGACAAGTTCAACAAATTAGGAACTCAAACACCTGATCCTTAC-TTGCTTTAGTACCCTCTGTTACCCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 31761 107 - 647215 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GTAACTGAAGACAACCAATGCAA-AGTACTAAGATAGGCCTGTGGATGGGTTTGCCCGTGCTTGAGCCTAAGGACAACAATTGAGAGGGGGATTAATGAGGATCTGAGCCTATAAGTTACAGGGTGCTGGCAATGAGCCTAGGTATGGTTTCTATTAGTACAC + +a +s mr.mrrefChr3 107845 28 + 181019 CGCTTGCCCCACATATTAATCTATGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557867 28 + 636262 CGCTTGCCCCACATATTAATCTATGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 33102 28 - 647215 CCCTTGCCCCACATGTTAATCTATGTAG + +a +s mr.mrrefChr3 107873 10 + 181019 GCCTCAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557896 10 + 636262 GCCTCAGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 33130 10 - 647215 GCTTCAGAGG + +a +s mr.mrrefChr3 107883 8 + 181019 ATGTGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557911 8 + 636262 ATGTGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33140 8 - 647215 ATGTGCAG + +a +s mr.mrrefChr3 107891 19 + 181019 ACAGTCTTAATATCTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557919 19 + 636262 ACAGTCTTAATATCTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33150 19 - 647215 ACAATCTTTATAGCTCAAC + +a +s mr.mrrefChr3 107910 79 + 181019 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ACATGAGGTGGATAGGTTCCTTCTTGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558153 68 + 636262 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTAGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33311 68 - 647215 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTACAGATGCTGGTGATTATTTGGCAGCACATGAGGCAGGTGGGCT + +a +s mr.mrrefChr3 108119 58 + 181019 CAGCAGCCAAGTAATGACTGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTAATGGGAGCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439501 58 + 636262 CAGCAGCCAAGTAATGACCGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTGATGGGAGCTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558222 58 + 636262 CAGCAGCCAAGTAATGACTACATGCACATGGCCGTGTTTGCCCTTAATGGGAGCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 33379 58 - 647215 CACCAGCCAAGTAATGACAGCACGCACATGGCCATGTTTTCCTTTAATGGGAGCTTTG + +a +s mr.mrrefChr3 108177 58 + 181019 CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439559 58 + 636262 CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558280 58 + 636262 CACATGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33438 58 - 647215 CACAAGGAGCACTTGAAATCTTGACAACATTAAGGAGGTCCAAAAAGAGTTTAAGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 108235 33 + 181019 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558338 33 + 636262 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33496 33 - 647215 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT + +a +s mr.mrrefChr3 108268 21 + 181019 ATAGGCCAAATGTTTGATCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558388 21 + 636262 ATAGGCCAAATGTTTGATCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33529 21 - 647215 ATAAGCCAAATGTTGGATATC + +a +s mr.mrrefChr3 108289 29 + 181019 ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558409 29 + 636262 ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 33553 29 - 647215 ATTTATCAGGCTACAGCGATACAGAGACA + +a +s mr.mrrefChr3 108318 35 + 181019 TGAGTTACAACCCTGGGGCAACACAATATGTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558450 35 + 636262 TGAGTTACAACCCTGGGGCAACACAATATGTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33582 35 - 647215 TGAGTTGCAACCTTGGGGCAGCACAATATCTGAAC + +a +s mr.mrrefChr3 108353 84 + 181019 TCTCTTCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGGGAGTGCAATGCAGGACCTTCCCTGGTACATGTTGGTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558492 84 + 636262 TCTCTTCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGGGAGTGCAATGCAGGACCTTCCCTGGTACATGTTAATTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33617 84 - 647215 TGTCTCCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGTGAGTGCAGTGCAGGACCTTCCCTGGTAAATGTAGGTTAT + +a +s mr.mrrefChr3 108437 422 + 181019 ATATAAGATTATTCACATAGTGCACATCAAGGTAAGCAACATTTAATAATGCCTGGTAGCTTCTCCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAATAGATAGTTGAACTGTTCCAATTATAAACTTGTATTCACAATTGCTATCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATTTAATAGCAAGGGAATTTGTTCTTCCAAACAACTGTTCTATGTTGACCTACTCAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTCCCCTTACTGGTGTTATGAATGCTAGTATAGTCTTCAGCTCAAATGCTAGTATAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCGTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558576 370 + 636262 ATATAAGACTATTCACATAGTGCACATCAAGGCAAGCAACATTTAATAGTGCCTGGTAGCTTC-CCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAAGAGACATTAGAACTGTTCCAATTATAAACTTG--TTCACAATTGCTTTCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATCTAATAGCAAGGGAATATGTTGTTCCAAACAACTGTTCTA--CTGGCCTACTTAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTGCCTT-----------------------------------------------TAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCACAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33703 413 - 647215 ATATAAGGTTATACTCATAGTGCACATCAATGTAAGCAACATTTAATAATGCCTGGAAGCTTCTCCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTCGTAAAATTGGGAAATAGATAGTTGAACTTTTCCAATTATAAATTTGTATTCACAATTGCTATCTCATTTCTTTCACTTAAGCAGCTACTTTTCCTCTGTTTGATTAAATAGCAAGGGAATTTGTTCTTCCAAACAACTGTTCTATGTTGACCTACTCAACTGTGTAGCACAGTAATTGTTGGCTTG---------GGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTCGCCTTACTGGTGTTATGAATGCTAGTATAGTCTTCAGCTCAAATGCTAGTATAGTCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTCGGACAGGTTTTAATATTTATGATCCCGTAGT + +a +s mr.mrrefChr3 108859 57 + 181019 ATCCTGTCGTCGTGGACAATAGATTATAGGCCCAGACCAAAGCAACTGTCTACTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558953 57 + 636262 ATCCTGTCGTCGTGGACAATAGATTATAGGCCCAAACCAAAGCAACTATCTACTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 34116 57 - 647215 CGCCCGTAGTCGCGGACAATAGATTATAGGCCCAGACCAAAGCAACCGCCTATTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 108916 434 + 181019 ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCATATCTCCCAAGGCAGTGGACAGGGGCCACTAAACTCTCTTAGCTTCAGAGCCTCAAATGAGTAGGTCTTGTTGTGGTTGCAGGAGTCATACACTGTGGCCCTAATGACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCAGTGGCACTAATCTAGAGCTAAATTAGGCTTAAAAACCGCTCACTGGCTAGTGAATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACAGGAGACTATTACCTAGCACTCGTGCAATTAAGTGTGACCAAATCTCCTGAATTATAGAAATTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAAACGGTCGGACCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559010 418 + 636262 ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCACGTCTTCCAAGGCAGTGGATGGGGGCCAATAAACTCTCTTAGCTTCAGAGGTTCAAATGAGTAGGTCCTGTTGTGGTTGCAGGACTCATACACTGTGGCCCTAATAACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCCGTGGCACTGATCTAGGGCTAAATAAGGCTTAAAAACC---------------CATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACTGGAGACTATTACCTAGCACTC-TGCAATTAAGTGTGCCCAAATCTCCTGAATCATATAAACTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAATCGGTCGGACCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 34176 433 - 647215 ATGTACCCATCAGATACTCTAATCAATGACAGTTCAACCCATAAATCCCAAGGCAGTGGACAGGGGCCACTAAAATCTCTCAGCAC-AGAGCCTCAAATGAGTAGGTCTTGTTGTGGTTGCAGGCGCCATACACCACGGCTCTAATGAACATGCACCTTGGGGAGTGACTACTATGAATCTTTGACTCAGTGGTACTAATCTAGAGCTAAATTTGGCTTAAAAACCGCTCACTGGCTAGTGAATATCTGCTTTTCTCTCTTTGCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACAGGAGACTATTGCCTAGCACTCGTGCAATTAAGTGGGACCAAGTCTCCTGAATTATAGAAATTCACCTCCTTTCAGTAAACTGTACAGAATAAAAATAAAGGTAGGTTTACACAGAAGGAATCAGGGAATGAAACGGCCGGACCTA + +a +s mr.mrrefChr3 109350 171 + 181019 GCGATGTTCCGGCCCTTCGCAAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCGACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559429 171 + 636262 GCGATGTTCCGGCTCTTCGTAAACAGCTTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCACGACAAACATGTATCAGGCGGTCTTCGACCACTTCTGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 34609 171 - 647215 GCGATGGTCCGGCCCTTCGCCAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGTCTCTAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCTACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTAATCCCTCTAACCAGATGGCAGTCTTAATTCAATTACTACGCGTGTCTTGCGCG + +a +s mr.mrrefChr3 109521 365 + 181019 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 560051 13 + 636262 AGCATTCACTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 35247 13 - 647215 AGCCTTCACTTTA + +a +s mr.mrrefChr3 109993 153 + 181019 TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGAATTATAATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCAACTGGGATCATGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560064 151 + 636262 TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAAT-GTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGGATTATGATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAACTACTGCAGCTGGGATGATGG- +s simRat_chr6.simRat.chr6 35273 153 - 647215 TGATTATTGTCAATATATGTAATGGGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTTTATGATTTGGTGAGCTTATCAAAAAAAATAATGTGAATACTATTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCGACTGGGATCACGGG + +a +s mr.mrrefChr3 110146 20 + 181019 TCTGTTTGTCACAGACTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560215 17 + 636262 ---GTTTGCTACAGACTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 35427 20 - 647215 TCTGTTTGTCACACACTTGA + +a +s mr.mrrefChr3 110166 353 + 181019 CATCTAATGCACTTTGCTCATGAACTCACTACAATCTGCAGCTAAGTCAGACTATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATGGCCCGGGTCTTACAATACAAGTTCTACACCACCATTAGAAGCTAGTTGTAGTCTTAAGTCTAAATGAGGGAAACTCTCAGGTGAGGCAATTTAAGTCTGAGGGACACCACTACAATTGTGTATGCAAGGTGTAGCaGTACAAAAAATTTGAGTGCAAGGAGAAGGAGTAACAatgtTAATATGCATTAAGTGGTGGCAGGTGTTGTCAGTACTCTGAAGTGTACTAGCAATAGGCCCGATTCCCTTGCATGTTTAATATATGGCTCCTCAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560282 322 + 636262 CATCTAATGCACTTTGCTCATGAACTCACTACAATCTGTAGCTAAGTCAGACTATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATGGTCCGGGCCCTACAATACAAGTTCTACACCACCATTAGGAGCTAGTTGTAGTATTATGTCAAAATGA----------CAGGTGAGGCAATTT-----TGAGGGACACCACTACAATTGTGTATGCAAGGTGTAGT-GTACAAAAAATTCGAGTTCAAGGAGAAGGAGCAACA----TAATAT-----------TGGCACGTGTTGTCAGTACTCTGAAGTGTACCAGCAATAAGCCCGATTCCCTTGCATGTTTAATAAATGGCTCCTCAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 35447 353 - 647215 CATCTAATGCTGTTTGCTCATGAACTCACCACAACCTGCAACTAAGTCAGACCATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATAGCCCGGGTCTTACAATACAAGTTGTACACCACCAATAGAAGCTAGTTGTAGGCTGAAGTCTAAATAAGGGAAACTCTCAGGCGAGGCAATTTAAGTCTGAGGGACACCACTACAATTCTGTATGCAAGGTGTAGCAGTACAAAAAATTTGAGTGCCAGGAGAAGGAGTAACAATGTTAATATGCATTAAGTGGTGGCAGGAGTTGTCAGTACTCTGACATGTACTATCAATAGGCCCTATTCCCTTGCATGTTTAATATATGGCTCCTCAGACA + +a +s mr.mrrefChr3 110519 78 + 181019 AACCAAGGGACGGACCTTATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGTTATGCCATTCTTATCAGCTTGAGTCTGGGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560604 78 + 636262 AGCCAAGAGACGGACCTCATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGCTATGCCATTCTCATCAGCTCGAGCTTGGGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 35801 76 - 647215 AAGCAGGGGATAGACCTTACT--TATTACATTTGCCTGCTGTTCATTGTGCCATCCTTATCAACTTGAGTCTGGGTAC + +a +s mr.mrrefChr3 110597 168 + 181019 ATCTCAATGCCACCACCAAGGGATCCAACCTAAATTATATCTGGGATGAGTTTCCAGTAAGAAACCTCTCCTTTAGTTGAGCTCTGTCTTTCCATGCTGACTATGGTGAGCATGCTCTAATTAACACACTCACCTTATTGCTAGGTACCCTGCATGTTGCATTGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560682 168 + 636262 ATCTCAATGCCACCACAAAGAGATCCAACCTAAATTATATCTGGGACGAGTTTCCAGAAAGAAACCTCTCCATTGGTTGAGCTTTGTCTTTCCACACTGACTATGGTGAGCATGCTCTAATTAACACACTCACCTTATTGCTAGGTACCCTGCATGTTGCATTGCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 35878 168 - 647215 ATCTCAATCCCACCACCAAGGGATCCAACCTAAATTATGGCTGGGATGAGTATCCAGTAAGAAACCTCTTCTTTAGTTGAGCTCTGTCTTTCCATGCTGAGCATGGCGAGCATACCCTAATTAACGCACTCTCCTTATTGCTAGGTACCCTACAAGTTGCATTGGATG + +a +s mr.mrrefChr3 110765 10 + 181019 AAGGTTTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560851 10 + 636262 AAGGTTTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36046 10 - 647215 AAGTTTTAAT + +a +s mr.mrrefChr3 110775 45 + 181019 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATATTGATGAGATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560861 45 + 636262 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATAATGATGAGATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 36067 45 - 647215 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATATTGATGAGATTA + +a +s mr.mrrefChr3 110820 254 + 181019 TGTGCCCAAATATAGGGTATATTCCTTGAAGAACATAGCCTGTCTTATGAAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACACAGAAATGAAGGATAATTAAAGAATCTCTATAAGGACCAACATACAAACGATCGTTAATACATACTCATCTCTATTGTTCAACTTACCCAGCTCTAGTTTGGCACTTCTTAATGGACAATACGGTACCATCTCACCCCAAGCCCCCCACGTAGCTATCACCTGTAGCTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560906 240 + 636262 TGTGCCCAAATATAGGGTATATTCCTTGAAGAACATAGCCTGTCTTATGGAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACGCAGAAATGAAGGATAATTAAATAGTCTCGATA-----------ACAAACGATTGTTAATACATTC---TCTCTATTGTTCAACTTACTCAGCTCTAGTTTGGCACTTCTTAACGGACAATACGGTACCATCCCACCCCAAGCCCCCCACGTGGCTATCACCTGTAGCTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 36113 254 - 647215 TGTGCCCAAATATGGGGTATGTTCCTTCGAGAACATACGCTGTCTCATGAAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACACAGAAATGAAGGATAATTAAGGAATCTCTATAAGGACCAACATACAAATGATCGTTAATACATACTCATCTATATTGTTTAACTTGCCCACCTCTAGTTTGGCACTTCTTAATTGACAATTTGGTACCATCTCCCCCCAAGCCCCCCACATAGCTATCACCTGTGTCTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 111074 47 + 181019 TGTCTATCTACCTCCTAGTTCACATAACAGGATACCAAAGTGGACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561147 47 + 636262 TGAGTATCTACCTCCTTGTTCACATAACAGGATACCAAAGTGGACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36367 47 - 647215 TATCTATCTATCTCCTATTTCACATCACAGGATACCAAAGTGAAACT + +a +s mr.mrrefChr3 111121 19 + 181019 GGAGTGGACCTGGGATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561194 19 + 636262 GGAGTGGACCTGGAATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36417 19 - 647215 GGAGTGGACCTGGGTTCAT + +a +s mr.mrrefChr3 111140 67 + 181019 TCTCCAAATCCATAGCTGACCCTCATGCCAGAGGCTTTCCTCATGCTGGAGTGGCGGCCCCAGAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561213 60 + 636262 TCTCCAAATCTGTAGCTGACCCTGATGCCAGAGGCTTTCCCCATGCTGGAGTG-------CAGAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 36439 67 - 647215 TCTTCAAATCCATAGCTGACCCTCATGCCAGAGGCTTTCCTCATGCTGGAGTGGCGGCCCCAGAATA + +a +s mr.mrrefChr3 111207 83 + 181019 TTGTTAACATCATCAGTCATTCTTAGAAACAATTAGAAGAAGAACTTGCCTATAAGTTATATGGCACGCAGCAGTTTATTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561273 83 + 636262 TTGTTAACATCATCAGTCATTCTTAGAAACAATTAGAAGAAGAACTTGCCTCTAAGTTATATGGCACGCAGCAGTTTATTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36507 83 - 647215 TTGTTAATATCATCGCTTGTTTTTAGAAACACTTTGAAGAAGAACTTGCCTATAAGTTATATGGCACGCAGCAATTTATCCTT + +a +s mr.mrrefChr3 111290 27 + 181019 GGCCTATGGAAGAATGAGTACATACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561356 27 + 636262 GGCCTATGGAAGAATGAGTACATACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 36641 27 - 647215 GGCCTATGGAAGAATGAATACATACAC + +a +s mr.mrrefChr3 111317 13 + 181019 AATCTTTCATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561383 13 + 636262 AATTTTTCATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 36669 13 - 647215 AATCTTTCATATG + +a +s mr.mrrefChr3 111330 137 + 181019 TATAATTATGTGCAATTCTTGACTGATATTCTAAGTTTTATTGAATGAGTCAGAACTTGGTTAAACTGTGGTGATTGGTATGACTGTGGACTTATCGTCAACAGGGATGAATCTGAAGCCATGGACTATATCAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561397 135 + 636262 TATAATTATGTGCAATTCTTGACTGATATTCTAAGTTTTATTGAATGAGT-AGAACATGGTTAAACTGTGGTAATTGCTATTACTGTGGGCTTATC-TCAACAGGGATGAATCTGAAGCAATGGACTATATCAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36682 133 - 647215 TGTAATTATGTGCAATGCT----TGATATTCTAAGTTTTATTGAGTGAGTCAGAATTTGGTTAAACTGTAGTGATTGGTATGACGGTGTACTTATTGTCAACAGGGACAAATCTGAAACCATGGAGTATCTCAACAT + +a +s mr.mrrefChr3 111467 397 + 181019 GCACTTTGTGACCAGGTGTATCAATATGGGATTCTTGTGTATTAGTATTTGCAGACAAGCTTGTACTTTGGACCATAAATCCAAGATTCACCCTTGACTTGTGGTTGATGCACTTGCCACTTAATATTATTTGGCTGTCAGGTGTATTGTCCTGAAATGATGGCTTATAGCAGCTAGAAAAATGTGACATATCTGGTGACAGATACAATTTCCTTTAACAATTCAATATGATTTTTATACAGTTCAAAGAAAGTTTCTCACTGAACTGCCAATCATACCAACCAAAAAGAGTTGTATTAGCAAGCAATCTATTGTTTATGAGTGCCGAGGAATTATTATGAATTTAATTACACATTGAGGCCCTGGGAGTCTTGAGACCACACAAGAGGCATGTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561532 397 + 636262 GCACTTTGTGACCAGGTGTATCAATATGGGATTCTTGTGTATTAGTATTTGCAGACAAGCTTGTACTTTGGACCATAAATCCAAGATTCACCCTTACCTTGTGGTTGATGCACTTGCCACTTCATATTATTTGGCTGTCAGGTATATTGTCCTGAAATGATGGCTTATAGCGGCTAGAAAAATGTGAAATAGCTGGTGACAGATACAATTTCCTTTAACAACTCAATATGATTTTTATACAGTTTGAAGAACGTTTCTCACTGAACTGCCAATCATAACAACCAAAGAGAGTTGTATTAGCAAGCAATCTATTGCTTATGTGTGCTGAGGAATTATTATGAGTTTAATTACACATTGAGGCCCTGGGAGTCTTGAGACCACACAAGAGGCATGTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36816 386 - 647215 GCACTTTGTGACCAGTTGTAGCAATTTGGAATTC-TGTGTATTTGTAT------ACAAGCCTGTACTTTAGACTATAGATGCTAGATTCAC--TTGACCTGTGGTTGATACACTTACCACTGAATATTATTTGGCCGTCAGGTGTATTGTCCTGGGATGATGGCTTATAGCAGCTAGTAAAATGTGGCATATCTTGTGACAGATACAATTTGTTTTAACAATTCAATATGATTTTTATACAGTTCAAAGAGAGCTACTCACTGA--TACCAATCATACCAACCAAAAAGAGTTGTATTTGCCAGCAATCTATTGTTAATCAGTGCCGAAGAATTATTATGAATTTAATTATGCATTGAGTCCCTGGGAGCCTTGGGACAATGCAAGAGGCATGTGGT + +a +s mr.mrrefChr3 111864 10 + 181019 GTACATATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561931 10 + 636262 GTACATATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 37202 10 - 647215 ATACATAAAA + +a +s mr.mrrefChr3 111874 120 + 181019 CTTAAAACTGCAGCCCTCCGATTTATTTTGACTCTAGAAACATTGCAGCTGGTGCCCCTTGAATTGGCCATTGATTTGGAGGGCAAGAGTGCTGTTACACCTTCATCAGCTGAGTTGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561941 120 + 636262 CTTAAAACTGCAGCCCTCCGATTTATTTTGACTCTAGAAACATTGCAGCTGGTGCCCCTTGAATTGGCCATTGATTTGGAGGGCAAGAGTGCTGTTACACCTTCATCAGCTGAGTTGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 37213 120 - 647215 CTTGTAATTGCAGGCCTCTGATTTATTTTGTGTCCAGAAATATTGCAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGGCCATCAATTTGGAGGACTTGAGTGCTGTCATACCTTCACCAACTGAAATGGGG + +a +s mr.mrrefChr3 111994 8 + 181019 GAGGTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562065 8 + 636262 GAGGTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 37333 8 - 647215 GGAGTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 112002 33 + 181019 TCAACCTGCTCAGGACACGCAGAATCGGTCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562073 33 + 636262 TCAACCTGCTCAGGACACGCAGAATCGGTCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 37347 33 - 647215 TCAACCTAGTCAGGACACACAGAACCAGTCCGA + +a +s mr.mrrefChr3 112035 18 + 181019 GACCCCACAAGAGACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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simRat_chr6.simRat.chr6 38640 10 - 647215 GTGTACCACA + +a +s mr.mrrefChr3 113234 217 + 181019 TCTTGAATTCCTTAGCCACGCCAGGTTGTTCTTAGTAAGATCCCCCTCAGTGGTAATAATTTCAGGGGCTTCCACAAGTTCTCTCAAGTTGTGGCACTGTTTTTAATACTTTACATCAGATGGGTCTGTGGGGAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGTTGATCACAACTCTAGCCAGACCCTTGCAATAGCGTGCAGCTCTGTAAGACAGTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563352 217 + 636262 TCTTGAATTCCTTAGCCCCGCCAGGTTGATCTTAGTAAGATCCCCCTCAATGGTAATAATTTCAGGGGCTCCTACAAGTTCTCTCAAGTTGCGGCACTGTTTTTCATATTTTATGTCAGATGGGTCTGTGGGAAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGTTGATCACAACTCTAGCCAGACCCTTGCAATAGCGTGCAGCTCTGTAAGACAGTTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 38650 211 - 647215 TCTTGAATTCCCTAACCACACCAGGTTGTTCTTCGTAGGATCCC---CTG---CAATAATTTCAGGGTCTTCCACAAGTTTTCTCAAGCTATGGCAATGTTTTTAATACTTTACATCAGATGGGTCTGTGGGGAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGCTGGTGGCAACTCTAGCCAGACCATTGAATTAGCGTCCAGCTCTGTAATACTGTTCCA + +a +s mr.mrrefChr3 113451 109 + 181019 TTCATGCTGCAGATAAAATGGGACCATGGATCAAACTGGGAGAACCTGTAAGATAGTACAGATGTTTATGGAAGGGTCTTATAGTTACTACTACCTCTGCTAGTTCCAG +s 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agatcgactcaacaaagaagctatggtgtcacaggggttgaattctaactggaccctcaatgccccaac-aaaagtcactcatcgacaagcagacatagagattacagggtctactgacgcaagctccactgacacacagtaaaacagaggagttggaaccatttctgcacaaaccacaatccattcaggttggctccattctatatgcactgaaacc--tgtaaagcaagtgagaggagaatacggattgcaaggcatgtttttgccaatgtcaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 41367 263 - 647215 ------actcaacaaagaagctatgctgtcacaagggttgaatcctaaatagaccctcaatgccccaactaaaa-----ttatcaacaagcagacaaagagattacagggtctactgacataagctccactgacacgcactaaaacagaagagttggaatcatttctgcacaaaccacaatc--ttgaagatgaCTCAATCCTATATGCACTGAAACCCATATAAAGCAAATGAGAGAGGAATACAGAAT-CAAGGCATGTTTTTTCTCATGTCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 116217 276 + 181019 tgctggagatctgtgatcagtgtactagacatcatgcactggacatttgcaatcagaacactagtcaactgaataattgattagaaagcccatctactatgaaccagtatataagatgtgtggaactataagttatgtaacctattaactgaaccatcatgaatcacatgatattattgtgaggacacattgaatacaccaggccagtttacatattaagaatcctgaactgagggaaattaccaatgttgtttgggtgattaaagaataagcaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566356 275 + 636262 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atgaagcaaaagtgggccctcaactcaaattaagggaTGAATTCAC--------ACAAAAAGGAAACGAAAGTTAGAATGGTTTATGTCTGGCAGCAAAAtaggagcgagagtgaaacacccatccaattgaacagagtagctcttgcagaccttaagaagatatcaagggCT-----TCAGACCCTATATCTGAGGGGGAGTATTTAAGTAAAGAATTGACAGTGAGGCACACACTCCCACAGAGTGGTTCACATACGAAGAAATAAT + +a +s mr.mrrefChr3 117112 20 + 181019 GGAGAAGCACCTTACTTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567233 20 + 636262 GGAGAAGCACCTTACTTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 42550 20 - 647215 GGAGAAACATGTTGCTTTAG + +a +s mr.mrrefChr3 117132 127 + 181019 TTATCATGCTATGGCTGATTGGCCTCATTAGTCTAGTGTAATCTCCTTAATCAATTATAGTGGaCAATAGCGAGGAAATAGGTATGAAGCACTCATTCAGCTaaggggaGAGGGTTGTGTTTCAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567263 127 + 636262 TTATCATGCTATGGCTGATTGGCCTCATTAGCCTTGTGTAATCTCCTCAATCAATTATAGTGGACAATAGCGAGGAAATAGGTACAAAGCACTCATTCGGCTAAGGGGAGAGGGTTGTGTTTCAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 42570 119 - 647215 TTATCACGCCATGGCTGCTTGGTCTTGTTAGTGTAGTGTAATTTCCTTAATCAATTATAGTGG-CAATAGCGACAAAATAGGTATGAAGTACTCATTCAGCA-------GTCAATCATGGTTCACAA + +a +s 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TTCATGAGATTAGAATTCTAGATAATTGCATCATGAATTATTGGACAGAGATGAAATCCACATGTCATATGGATTAACTCATAGGTTGCCGGGTATCCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 47690 101 - 647215 TTCATGGGATTAGAATTCTAGATAGTTGCATCATGAATTAATGGACGTTGATGAGATCCTCATGGCATATGGACTAACTCATAGATTGCCAGCTATACCTT + +a +s mr.mrrefChr3 122229 19 + 181019 AGAAATTGTAGTGCTGACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572304 19 + 636262 AGAAATTGTAGTGCTGACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 47791 19 - 647215 AGGAATTGTAGGGCTGACT + +a +s mr.mrrefChr3 122248 45 + 181019 TCAAGTTCCTGTTTCCAATGTGACTATTGGTTTGGGGGAGAAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572329 45 + 636262 TCAAGTTCCTGTTTCCAATGTGACTATTGGTTTGGGGGAGAAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 47810 45 - 647215 TGAAGTTCCTGTTTCCAATCGGACTATTGGTCTAGGGGAAATGGA + +a +s mr.mrrefChr3 122293 59 + 181019 ATAAACATTGCACCTGGCACCATAGGAGTTGGCTGTCAGTCGGGGGGACACTAGATCGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572374 59 + 636262 ATAAACATTGCACCTGGCACCATAGGAGTTGGCTGTCAGTCGGGGGGACACTAGATCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 47856 59 - 647215 ATAAATATTGCACCAGGCACAATAGGTGTTGGCTGTCAGTCCGGGGGATACTAGATTGC + +a +s mr.mrrefChr3 122352 40 + 181019 ACCCTCACTTATCAAACTCTTCTGTTGGTCAAACTGAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572433 40 + 636262 ACCCTCACTTATCAAACTCTTCTGTTGGTCAAACTGAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 47951 40 - 647215 ACCCTCGCTTATTAAACCCCTCTATTGATAAAACTGAAGG + +a +s mr.mrrefChr3 122392 118 + 181019 TTAACATGGATTCCACTGAATAAGGGGGTACATCACACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGCATGAGCCAGCTGGGTTTAAGAGGGCCGTATCTATGGGGTCCTATCAAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572473 118 + 636262 TTAACATGGATTCCACTGAATAAGGGGGTACATCACACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGCATGAGCCAGCAGGGTTTAAGAGGGCCATATCTATGAGGTCCTATCAAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 47992 118 - 647215 GTAACACAGATTCCACTGAACAAAGGGGCACATCATACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGTATGAGCCAGCTGGGTTTCAGAGGGCTGTTTTTATGGGGTCCTATTAGGCC + +a +s mr.mrrefChr3 122510 57 + 181019 ACTTTTTGACAAAAACTTTATTCATAGAATAAAATGTGGAGATAATCTCAAACATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572595 57 + 636262 ACTTTTTGACAAGAACTTTATTCATAGAATAAAATGTGGAGATCATCTCAAACATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 48110 57 - 647215 ACTTCTTGACAAAACCTTTATTCATAGAATAACATGCAGAGATAATCGCAAGTATAC + +a +s mr.mrrefChr3 122567 45 + 181019 AATAGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATCTTCCATCAATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572652 45 + 636262 AATAGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATTTTCCATCAATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48215 45 - 647215 AATGGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATCTTCCATCAATTTG + +a +s mr.mrrefChr3 122612 249 + 181019 AACACCAAAACATTAAATATTGAGTGTAACCAAAGTGACCAGGCCAATAGTTGAACGGCTTACAGGATCTCTAGTTTATCGTGTTTAAACAAATCTCTAGACCCGTTGAATCTCTAAGCAACCAAAAGTAAAGAAACTGTGTGCAGAGATGTTTTGGAGGTTATATTAGTTATTTTACCTACTTACTTCTGTACAAGTATTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGCGCTGGGAAGGTGCATTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572703 239 + 636262 AACATCAAAATATTAAATATTGAGTGTAACCACAGTGACCAGGCCAATAGTTGAACGGCTTACAGGA--TCTAGTTTACCGTGTCTAAACAAATCTTTAGACC--------CTCTAAGCAACCAAAAGTAAAGAAACTGTGTGCATGGATGTTTTGGAGGTTATATTAGTTATTTTACCTACTTACTTTTGTACAAGTATTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGCGCTGGGAAGGTGCATTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48260 246 - 647215 AGACCCAAAACATTAGATATTGAGTGAGACCAAAGTGACCAGGCCAATAGTTGAAAGGCTTACAGGATCTCTAGTTGATTGTGTTTAAACAACTCACTAGACCCGTTGAATCTCTAAGCAACCAAAATTAAAGAAACAGTGCACAGAGAGGTATTGGAGGTTATATTAGTTATTTTGCTTACTTACTTCTACACAAGTACTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGAAC---AAAGGTGCATTCAG + +a +s mr.mrrefChr3 122861 161 + 181019 TAGGACCATCCTCTACACATATGGCTCCTATTGAATGGGATAATGTATCCATATTTTAAGCACAGTATATTAAGCCTAAACCTTATCTCCTCACCCACTGGGCACTTTGGTGCACCCATACTCTTGCTGTATTTACTTTCCTTATTAGTCTGAGGCTTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572943 161 + 636262 TAGGACCATTCTCTGCACATATGGCTCCTATTGAATGGGATAATGTATCTGTATTTTAAGCACAGTATATTAAGCCTAAACCTTATCTCCTCACCTACTGGGCATTATGGTGTACCCATACTCTTGCTGTACTTACTTTCCTTATTATTCTGAGGCTTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48506 161 - 647215 TAGGACCATCCTCTACACATCTGGCTCCTATTAAATGGGATAATGTATCCATGTTTTCAGCACGATATATTAAGGCTACACCTTATCTCCTCACCCACTGGGCACTTTGGTGCACCCATACTCTTAATGTATTTACTTTCCTTATCAGTCTTAGGCTTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 123022 7 + 181019 GAGAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573104 7 + 636262 GAGAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48668 7 - 647215 GAGAAAG + +a +s mr.mrrefChr3 123029 177 + 181019 TGCTGCTTTCAGCGCAGGTTGCGCTAACCATCATGGGTGACCTTTAAATACACATATAGTTATATCGCGTGGCTAAGTATATATTATGCAGATGTATATATGATATTAATTACTGTAGCCATGAGGAGTAAGATTGTTCTGCTCCACCCTTCATACATGTGATAGACACTAATATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573111 177 + 636262 TGCTGCTTTCAGGGCAGGTTGCACTAACCATCATAGGTGACCTCTAAATACACATATCATTATATCGCGTGGCTGACTGTATAATATGCAGATGTATATATGATATTAATTACTGTAGCCATGAGGAGTAAGATCATTCTGCTCCACCCTTCATACATCTGATAGACACTAATATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 48677 177 - 647215 TGCTGCTATCAGCGCGGGTTCAGCTAACCACCATGGGTGACCTTTAGACACAGATATAGCTACATCTTGTGGCTAAGTACATATTATGCAGATGTATTTATGATATTAATTACTGTAGCCACGAGGAGTCAGGCTGTTCTGCTCCACCCTTCATACATGTGATAGACACTAATATCT + +a +s mr.mrrefChr3 123206 10 + 181019 AAGGGAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573288 10 + 636262 ACGGGAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 48855 10 - 647215 AAGGGAGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 123216 106 + 181019 AACCAGACAAGACATGAATAACTATGTGGGGTCAATGAGAAAACTGTTCTCATAACTGAACACTTCAAGGTACAGATCCTGACTGTATTGGAATCTTGAAAATCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573299 106 + 636262 AACCAGACAAGACATGAATAATTATGTGGGGTCAGTGAGAAAACTGTTCTAATAACTGAACACTTCAAGGTAGAGCTCCTGACTGTATTGAAATCTTGAAAATCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 48865 106 - 647215 GACTAGACAAGACATGAATAACTATGTGGGGTCAATGAGAAAACTGTTCTCATAACTGAACACTTCAAGGTACAAATTCTGACTGTATTGGAATCTTGAAAATCCA + +a +s mr.mrrefChr3 123322 53 + 181019 CTTGAAGCTGCATGTACATATTCCAAGGGGTGTACTAGATTTAATCAGTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573411 53 + 636262 CTTGAAGCTGCATGTACATATTCCAAGGGGTGTACAAGATTTAATCAGTCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48971 53 - 647215 ATTGAAATTACATGTACATATTCTAAGGGGTGTACTAGATTTAATCAGTCAGG + +a +s mr.mrrefChr3 123375 840 + 181019 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ACAAGTAAGGCCAAGACGCACAAATGAGACCACAAATTTCTATAACAATTGCTCCCATGGATCTTTACAGTCTTAAGATCAAATTATCCCAGTGCCACTAAAGGACACGTAATGTGTTTTCACAAGTGGCTTCTCTGAAGCAGTAATTCAAGCCAGTAATTCGAGTCAAAAGTTTAGGGAACTGAGCTTCTAAAAGCCCCAACCAGCAAGTAGAACTGTTTGGGAACAAGGTAAGTGGGATGCACTCACCTACCAGAATAAGGAAGCCCCTCAGCAGTCCCTCTCTAGTATTTGCCCATGAAATCACCCTACATTAGCCACTTTTGAATAACTTTACCATGCATCTTGCAACACTAAAACGATCT--GTGCCCTGAATATGATTGAGTTACACTCTAATGCCTCAAGACTATATTGAGGATATTTGATGTACAGATTAGCGATGCAACCTCCTAGCTATGAGCTGATGGAAGCAGAGTTTATGCAGAGGTAATTCTACTAACTTCTGGGAGCTTTTTGAGAGGAACAATTGTGATTGGCTTAGAGACACACCCAGCTGGACGTCTGGATGATCAGCCTTCCATAGGCTTAGCTCAGACACTAGAAAAGTTGGGTTTTGTAGTAGGCAGATTGAAAACTGGAACACCTCCCCGAATTGCCAAAGAGTCTATCAATTTTAGTATCCTTAATAAACATATACCAGATAATCCTTCCACCCCATTTGGCTTCACCAATGAGACTGTTCACAGGTGGTCTGGTCTCTTTCCCCCTATGTGGAGGAAATTTGAACTTTCATTGTACTCCTGTTGTACAGATGGTAATA-TGTTGTTCTGGTATCTC + +a +s mr.mrrefChr3 124215 62 + 181019 CTCGCAGTCTATAACATAAAGTGTTTCCGGCACTTAAAGCAGAAGCACACTTGACATCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574285 62 + 636262 CTTGCAGTCTATAACGTAAAGTGTTTCTGGCACTTGAAGCAGAAGCTCACTTGACATCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 49891 59 - 647215 TTCCCAGTCTTTAACATAAAGTGTTTCCGGTACTTAAAGAAGAAGCATGCTTGGCTTCC--- + +a +s mr.mrrefChr3 124277 169 + 181019 AATCATAAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTTACTTTGACCACTCACAAATTGTAGGTATACATTATGCTTGGCTTAGCTTTGGGATTTTTAGAGCCAACTTGTGGTTGGACCAGTAGAATTGTAGTATAGAACATAATTAGAATAACCAAGTTCTCATATCGGTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574348 167 + 636262 AATTATAAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTTACTTTGACCACTCACAAATTGTAGGTATACCTTATTCTTGGCTGAGCTTTGGGATTTTTAGGGCCAACTTGTGGTTGGATCAGTAGAATCGTAGTATAGAGCATAATTAGAATAACCAAGTTCTCATATCGCTTG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 49950 156 - 647215 AGTCATGAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTCACTTTGACCAT-------------GTATTCATTATGCTTGGCTTAGCTTTGAGATTTTTAGAGGCAACTTGTGGTTGAACCAGTAAAATTGTAATTTAGAACATGATTAGACTAACCATGTTCTCATATGGGTTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 124446 118 + 181019 TGACTCATTTGGAGGATACCAGATTAAAGGGATGGTGAAAATCTCTACCATTAATATTTTGGTAGTGTCTCTAAGACCTCATTAGTGATCTTATGCACTACTTGTTTGTTAGGAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574515 85 + 636262 ---------------------------------GGGGTAAATCCCTACCATTAATATTTTGGTTGTGTCTCTAAGACCTCATTGGTGATCTTATGCACCACTTGTTTGTTAGAAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 50109 116 - 647215 TGACTCATTTGGAGGATACCAGATTAAAGGGATGGTGATAATCTCTACCATT--ATTTTCAGTAATGTCTCTAAGACCTCATTAGTGATCTTATGCACTACTGGTTTGTTGGGAATCT + +a +s mr.mrrefChr3 124564 14 + 181019 CCATGAGTGTGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574600 14 + 636262 CCAAGAGTGTGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 50231 14 - 647215 ACATGAGGGTGAAA + +a +s mr.mrrefChr3 124578 168 + 181019 TAAATGTGAGTTTGGAGGCAGTGTTGGATCTTCAAGCAGTTAGACACAAAAGTTGTTATAGGTATGGCACTACACGCCTGGATGTATTAAATATCTGTGAAGAATTAACTGGTTGCCATGCCTGAGTTACATTATTTTGTAACGAGGCTGTCACCATTTCAAGCTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574614 168 + 636262 TAAGTGTGAATTTGGAGGCAGTGTTGAATCTTTACACAGTTAGACACAAAAGTTGTTATAGGCATGGCACTACACGCCTGGATGTATTAAATATCAGTGAAGAATTAACTGGTTGCCATGCCTGAGTTACATCATTTTGTAACGGGGCTGTCACCATTTCAAGCTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 50272 167 - 647215 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GTGACTAACGTTTTTTTTATTGACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579921 27 + 636262 GTGACTAACGTTTCTTTTATTGACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 55483 27 - 647215 ATGACTATTGTTTTTTATATTGACACA + +a +s mr.mrrefChr3 129765 285 + 181019 CATCTTGAGATTGACCTTTTACACATGGATAAACTTAGTAATTAGCAGTTACACACCTAATATCCAGGCTGATCTAAGTTCTCTGTGGAATCTTCACTTAGTTAGGTGAATAACAATGACACAGGTAGAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTGTTCTAGTCTGGAGATCAGCTACCATGTTACCTCACTCATACCAACCCAAGAGTTGAGGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGTGGACCAAGGTATAGCTAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579948 280 + 636262 CATCTTGAGATTCACCTTTTACACATGGATAACTT----AATTAGCAGTTACACACCTAATATCCAGGCAGATCTAAATTCT-GGTGGAATCTTCACTCAGTTAGGTGAATAACATTGACACAGGTCAAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTATTCTAGTCTGGGGATCAGCTACCATGCTACCTGACTCATACCAACCCAAGAGTTGAAGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGTGGACCAAGGTATAGCCAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 55515 285 - 647215 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+s mr.mrrefChr3 130676 97 + 181019 ACTCCTCTGTGCAACCTACTTGAGGTTCAATTTATCTTCATGTTCAAAGTATAATTCAAAAAAAGTGAGTTGTGAGGAGCTTGCATGCAAATGTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580855 97 + 636262 ACTCCTTTGTGCAACCTACTTGAGGTTCAATTTATCTTCATGTTCAAAGTATAATTCAACAAAAGCGAGTTGTGAGGAGCCTGCATGCAAATGTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 56418 97 - 647215 CCTCCTCTGTGCAACATACTTTAGGTTCAATTGATCTTCATGTTGAAGGTATAATTCAAAAAAAGTGAGTTGTGAGAAGCTTGCCCACAAATGTTAA + +a +s mr.mrrefChr3 130773 404 + 181019 AAAATACTTTGCCTTACCTAGATTAATCCTTCCCTAATGTCTTTGCTCTTGAAGAATGAGGGTCTGCGGTCCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCAACCCCTCTTTAGAGGCACATCTGTTGCAACGACTTTTCTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACTACCAGCTACAAGGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTGGTTAACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCTGCTGTGCTGTTTTATAAACATTGGTACAGGTCTGTCTATAACAAGTCAACTGAGTCCTTTGTACTCAGATCAGTTCTGGCTTGACATTGTGGTTGTGTTGATTTTCTGTATAGTAATGATACCTGCTCTTAAAATAACCTTCTGCAATCCCCATTCTAAGCAAGCAGGAATAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580952 402 + 636262 AAAATACTTTGCCTTACATAGATTAATCCTTCCCTAATGTCTCTGCTCTTGAAGATTGAGGGTCTGCGGTTCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCAACCCCTCTTTAGAGGCACATCTGTTGCAGCGACTTTTCTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACTACCAGCTACAAGGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTAGTTGACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCTGCTGTGCTGTTTTATAAACATTGGTACAGGTCTATCTATAACAGGTCAACTCAGTCCTTTGTACTCAGATCAGTTCTGGCTTGACATTGTGGTTGTGTTGATTTTCTGTCTAGTAATGACACCTGCT--GAAAATAAACTTCTGCAATCCCCATTTTAAGCAAGCAGGAATGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 56518 403 - 647215 AAAATACTTTCCTTTACCTAGATTAATCCTTCCTTAATGCCTTTGCTCTTGTAGAAGGAGGGTCTGCCGTCCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCATCCCCTCTTTAGAGGCCCAACTGTTGCAACGACTATTTTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACAACGAGCTACAAAGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTGATTAACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCGGCTGTCCAGTTTTATGAATGTCGGTACAGGTCCGTCTGTAACAAGTCAACTGAGTCATT-GTACTCAGTTCAGCTTTGGCTTGAAATTGTGGCTCTATTGATTTTCTGTATAGCAATGATGCCTGCTCTTAAAATCACCTTCTGCAATCCCCATGCTAAGCAACCAGGAATAGGC + +a +s mr.mrrefChr3 131177 28 + 181019 AACCACCTGGGCCAATCTAGTCCTAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581354 28 + 636262 ACTCACCTGGGCCAGTCTAGTCCTGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 56928 28 - 647215 AACCACCTGGGCCAATTTTGTCCTAAGG + +a +s mr.mrrefChr3 131205 51 + 181019 AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCATAGGAACTATTGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581383 51 + 636262 AAACAAACTACCCAACTGCTCTTATACCATGATCATAGGAACTATCATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 56956 51 - 647215 AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCACTGGAACTATTGTGTG + +a +s mr.mrrefChr3 131256 34 + 181019 TCGTATCTCTGCAGATCTAACTGTTCAGAACCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581439 32 + 636262 TCGCATCTCTGCAGATCTAACTGTT--GAACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57007 34 - 647215 TCGTAGTTCTACAGATTTAACTGTTCAGTACCTG + +a +s mr.mrrefChr3 131290 130 + 181019 CATTACATTCCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCTCCAGGCTTGAATGATCGGGTGGTAGCGAAGGATTGTTTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581471 120 + 636262 CATTACATTCCCTTGCACTCTGTA----------ATCAACCACAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCTGAATAATCCTATATCGTATAGCTCCAGGCTTGAATCATTGGGTGGCAGCGAAGGATTGTTTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57044 130 - 647215 TATTACGTTTCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATTGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCGCCAGCCTTAAATGATCTGGTGGTGACTAAGGATTGTTTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 131420 157 + 181019 CTGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGGCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCTAGTGCCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGCGTAAGCTGGAAACATTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581637 157 + 636262 CCGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGCCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCCAGTGCCACTGAGGGGGTATCTTAACAGTATGCGTAAGCTGAAAACATTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 57174 155 - 647215 CTGAATTT-ACCACAACACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAATTGCCAATGCATGGCAGCCCC-TGCTAACGGTAGGGGGGAATGAATGCACAGGTACCTATTGTCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGTGGAAGCTGGAAACATTGG + +a +s mr.mrrefChr3 131577 51 + 181019 AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTATTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581794 51 + 636262 AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTGTTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57330 51 - 647215 AATCCCAATTCTAACACCACTGGATTAATTGGGTAAGTTTTAATGGGGAAG + +a +s mr.mrrefChr3 131628 58 + 181019 ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581845 58 + 636262 ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 57382 57 - 647215 GGCTTCAAGACGTAATTCTGACTTCAT-GAGAAGAGATTATAGTCAACCTTCCCACTT + +a +s mr.mrrefChr3 131686 104 + 181019 ACATAGAACTATTTCACACCCTCATGTACTTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACCCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581903 104 + 636262 ACATGGAATTATTTTACACCCTCATGTACCTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACGCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 57443 104 - 647215 ACATAGAACTATTTCACAAAATAATATACTTTGGATTCATGGAGGTATACATGACCCTCTTTAATACTGAGGGCACAAAAGCTTGTGAAAATTAGTACCACCCC + +a +s mr.mrrefChr3 131790 231 + 181019 CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCAAGGCCGTGTATGCGCTCAGTAATACCTAACAGCTACCCTTATCCCAAATAAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582007 230 + 636262 CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTGACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCTAGGCCGTGTATGCGCTCCGCA-TACCTAACAGCTATCCTTATCCCCAATAAGGCAACCAGTCCCCATTGAGAGCACACCGGATACTCTGGAAAGCTCTCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 57548 228 - 647215 CTGAGAAGAGAGGTCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTACAGCCAGGGCACAACCAGGGTAGTGGAGGGAAATGCAAGGCCATGTATG---TCAGTAATGCCTAAAAGTTACCCTTAGCCGAAATGAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAAGCCCCCAAGAGACATCATGCAGGAAGATCAGCCCTTCTAAGGCCATATGAAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 132021 679 + 181019 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CAATGCTTTGTTGAATATGTACACTAACTGGCTCTTTGATTGTTGTGCCAGTGTCTGGTATTAATACACTGAGGAGACTATAGTATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCTAGCTGTTCAGGTGGCCAAGTGCCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCAATGCCAGTTTACGGGTTAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATCAGCCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTCATTGATGGGGTTCCCGCACTGGGCACCAGTGAACCCTATTACATGTTTGCAAGCTGGGTTGAATTCCGTTTGTCGCTGCATCCTGATAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCGTCAGGAGTGAACATATTATTCTGAACGACATTTCAGTGAATTGATATTTATTTTGTGAAGAATAAAGGCATTTCTCTATCTGATAGTGTTCTGCATTGCATTCTCGACTCCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCGGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAGGATGGAATATCAGTGCTAAGGTCTATTGAATTTTTCAGTTCAAGGTGGAATAAATTGGTTCCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGTAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAAATCTCTATAAAATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57776 676 - 647215 CAATCCTTCGTTGAATATGCAGACCAACTTGCTCTCTGATTGTCATCCCAGCATCTGGTATTATTACACTGAGGAGACTATAGCATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCCAGCTGTTCAGA---CCAAGTGTCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCATTGCCAGTTTACGGGTGAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATTAGTCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTGATTGATGGTGTTCCCACACTGGGCGCCAGTGAACCCTATTGCATGTTCACTAGCTGGGTTGAATTCTGTTTGTCACTGCACCCTGACAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCATCAAGAATGAACATATTAGTCTAAATGACATTGCTGTAAATTTATACCTATTTTGTGAAGAATACAGACATTTTTCTAACAGATGGTGTTCTGCATTGCACTATCAACTTCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCAGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAAGAAGGGATATCAGTGTTAAGATCTATTGAATTTTTTAGTTCAAGGTGGAACAAATTGGTACCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGCAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAATTTTCTATAAAGAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 132700 9 + 181019 GTACCCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582920 9 + 636262 GTACCCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 58452 9 - 647215 GTACCATGG + +a +s mr.mrrefChr3 132709 16 + 181019 AGTCATGCTTGTATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582929 16 + 636262 AGTCATGCTTGTATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 58462 16 - 647215 AGTAATGCTTGTATTA + +a +s mr.mrrefChr3 132725 205 + 181019 TTCACCTGTACAGTCCCTCAACCAATATCTGGCTAAAGGAGTAAACCTCCCCTCTTTTCAAGCAGCATACCATACTAATGTGATGGCTCTCTTGTCTCTTTAGCAACAAGGGCTGCAAGTGATCCCCTAGATCTTTCATGGCTATGTACAAGGGTTATTTTTACACCTACTTAGTCACCTTCATGGCAGCTTCTAACCTCTAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582946 205 + 636262 TTCACCCGTACAGTCCCTCAACCAATATCTGGCTAAAGGAGTAAACCTCCCCTCTTTTCAAACAGCATACCGTACTAATGTGATGGCTCTCTTGCCTCTTTAGCAACAAGGGCTGCAAGTGACTCCCTAGATCTTTCATGGCTATGGACAAGGGTTATTTTTACCCCTACTTACTCACCTTCATGGCAGCTTCCAACCTCTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 58478 195 - 647215 TTCACCTGTACAGCCCCTCACCCAATATCTGGT----------AACCCGCCCTCTTTTCAAGCAGCATACCATACTAATGTGATGGCTTTCTTGTCTCTTTATCAACAAGGGCTACCAGTGATCTCCTAGAGCTTTCGCGGCTATCTACAAGGGGCATTTTAACACCTACTTAGTCACCTTCATGACAGTTTCTAACCTGTACTT + +a +s mr.mrrefChr3 132930 60 + 181019 TTTGTACCTCTTTGCAAAGTTAGTCCCTACCAATTGACAACTCTTAGACTACAGAACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583152 60 + 636262 TTTGTACCTCTTTGCAAAGTTAGTCCCTACAAATTGACGACTCTTAGACTACAGAACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 58673 60 - 647215 TTTGTACCTCTTTGCAAGGTTAGTGCCAACCAATGGGCAACCCTTAGACCACAGAACCTT + +a +s mr.mrrefChr3 132990 33 + 181019 GTCCTTTACACCCATGTCACCTTTAGTTGAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583212 33 + 636262 GTCCTTTACACCCATGTCACCTGTAGTTGAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 58735 33 - 647215 GTCCTTTACACCCATGTAGCATTTAGTTGAATC + +a +s mr.mrrefChr3 133023 74 + 181019 TGGCAATGAAGTCACAAAGGGGGGGCAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGAGGGGTAGCAGCGACTCAGCCCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583246 74 + 636262 TGGCAATGAAGTCACCAAGGGGGGGCAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGAGGGGTAGCAGCGACTCCGCCCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 58768 69 - 647215 -----ATGAAGTCACAAAGGGTGGGTAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGGGGGGGGGTAGGGACTCAGCCCCTG + +a +s mr.mrrefChr3 133097 21 + 181019 AAATTAACTATTACAGCCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583320 21 + 636262 AAATTAACTGTTACAGCTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 58838 21 - 647215 AAACTAACTATTACTGCCTCC + +a +s mr.mrrefChr3 133118 70 + 181019 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simRat_chr6.simRat.chr6 59191 443 - 647215 -TCCACACCACAGATTTC---------CCTCAGTAAACATTTTCACATTGTTACTTCAAACTGCACTGGTCAGACCATAGCATTCTTGCTCACCAATTTCAGACAATTCCACTAAAGACTTTATCATCCACCACTAGACCATATCAGCTGCTCACCTCCCTTTCAGAGAGCCA-TGTGCAAATCCTGACTAGTGGACTGGTTAAGCCAATTCCAGTGGAGAGGTGCTCAAATGC-------TGGTTATTGCTAATATAGGTATAAACCAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATTACCCATAAGTGCACCTACATGGAGTAAATGTATTTGGAGGTAAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTTTCAATCATCAGTGAACTTCAGGGGAGGTGTATTCACCAACCACTATTACATATGCAGGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATCTAGGTGTGTA + +a +s mr.mrrefChr3 134027 14 + 181019 TTCACCACAAGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 584317 14 + 636262 TTCACCACAAGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 59754 14 - 647215 TTCACTACAAGAGT + +a +s mr.mrrefChr3 134041 360 + 181019 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mr.mrrefChr3 135049 92 + 181019 CTAGCACAAGGGCACCCAGTACCATAATATTTGGGTCTCTTAGGTAGTTATGACAACCCCCTAAACTTTTTGCAAATATGTGGGTCTTCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585434 91 + 636262 CTAGCACAAGGGCACCCAGTACCATAATATTTGGTTCTCTTAGGTAGTTATGACAACTCC-TAAACTTTTTGCAAATATGTGCGTCTTCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 60769 91 - 647215 CTAGCACAAGGG-CTCCAGTACCATAATACTTGGGTCTCTTAGGTAGCTATGACAACCCCCTAAACTTTTCACAAATATGTGGGTCTCCATG + +a +s mr.mrrefChr3 135141 34 + 181019 TTTGGTCTAACATCTTATCATGCCGATATGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585530 34 + 636262 TCTGGTCTAGCATCTTATCATGCCGATACCAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 60860 34 - 647215 TTTGGTCTAACATCCTAACATGCCCATGTGGATT + +a +s mr.mrrefChr3 135175 154 + 181019 CCATTACTCCAGGGGTATCTTATATCTGACTTATTTGTGAGTCTGCTAATTTCCGTTGGCTCTGGAGATTTGCGTAAGTAATATCTCTCATATGTTCACTATAGGCCACAGTTATAACTGTAGCCCCTACATCAGATGGCCCCTATCTGTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585564 140 + 636262 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gaacccaaggcagaaccttttcttattgaaaaaaatcaggggagtgcgatcatatcctcgaactttaagtgttactcttgagtaacagtttggaaagcaacactatattagcatcaaaagatcattacaatacaccatgggattagtagtgatggagctaccacacttagg + +a +s mr.mrrefChr3 136048 52 + 181019 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586448 52 + 636262 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat +s simRat_chr6.simRat.chr6 61906 52 - 647215 aaacgcttcatattatgatgagaaattttaacaaggactcattattcaatct + +a +s mr.mrrefChr3 136100 73 + 181019 gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586509 73 + 636262 gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 61958 73 - 647215 gaatcagtttattaccttccaaaaattaaaacttgacatttccccattaccttataccatgattaatacaagc + +a +s mr.mrrefChr3 136173 37 + 181019 tgtaactaatctaaagaattgaggttcggagctacca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586583 37 + 636262 tgtaactaatctaaagaattgaggttcggagctacca +s simRat_chr6.simRat.chr6 62031 37 - 647215 tgttactggtctaatgaattgaggttctcatccccca + +a +s mr.mrrefChr3 136210 44 + 181019 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586628 44 + 636262 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta +s simRat_chr6.simRat.chr6 62068 44 - 647215 aaaagtgttaagggctgagtagattttctgagaaggacctttta + +a +s mr.mrrefChr3 136254 24 + 181019 caatatgtacttagggaattggtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586674 24 + 636262 caatatgtacttagggaattggtt +s simRat_chr6.simRat.chr6 62112 24 - 647215 agatattggaacgggggaatggtt + +a +s mr.mrrefChr3 136278 59 + 181019 atacaaaaaaaccacaaggatagagtggccataacatggacatatgtcttgcagaactc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586869 59 + 636262 atacaaaaaaaccacaaggatagagtggccataacatggacatatgtcttgcagaactc +s simRat_chr6.simRat.chr6 62136 59 - 647215 atacaataccaccacaaggatagtgtgggcataacatgcaaatatgtcttgcaaagccc + +a +s mr.mrrefChr3 136337 63 + 181019 aagataaatgatcaacaaacatgagtgggatgtaaacaagggaaagagcacacttacagtaaa +s 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+a +s mr.mrrefChr3 136566 28 + 181019 cccggtgcaaggaagcaccataggaagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587158 28 + 636262 cccggtgcaaggaagcaccataggaagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 62452 28 - 647215 cccgttgcaaggaaccaccataggcagt + +a +s mr.mrrefChr3 136594 21 + 181019 gtgctgaggtttttcaggacC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587186 21 + 636262 gtgctGAGGTTTTTCAGGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 62481 21 - 647215 gcactgaggtttttctgatcC + +a +s mr.mrrefChr3 136615 11 + 181019 CCTCCGTAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587207 11 + 636262 CCTCCGTAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 62504 11 - 647215 TCACAGTAAGC + +a +s mr.mrrefChr3 136626 6 + 181019 GCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587520 6 + 636262 GCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 62515 6 - 647215 GCCATA + +a +s mr.mrrefChr3 136632 168 + 181019 GCAGTTATCTATCTCTCAGTCGGCCTGTCAAAGAGGCCTCTGTGGCCACTGCAGTGCTACTCCAATGAGTAACTACAGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGCACAACTTAAACAGGACACTGCATAGCTTGTGATATTAAATGCTTAGCAGAAGGGCACAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587526 168 + 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ATGTATCAGCTAACTCAACACTAGCAACCTAACATGCCTATTTACTGCAGTCTTAATAGTAGACATTATAGGTAGAGGTAGTCCTGTGTGAGCTAGATTCCTAGAATCCCTGTCAACAGAAGCAAGAATGTCTTGAGTATAGGCTAAATCCGTCAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590496 181 + 636262 ATGTATTAGCTAACTCAACACTAGCAACCTAACATGCCTATTTACTGCAGTCTTAATAGTAGACATTATAGGTAGAGGTAGTCCTGTGTGAGCCATATTCCTAGGATCCCGGTCAACAGAAGCAAGAATGCCTGGAGTATAGGCTAAATCCGTTAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65147 177 - 647215 ATGTATCAGGGAACATGACACTACCAACCTATCATGCATC----CTGTAGTCTTAATAGTAGACATTATAAGTAGAGGTCGTCCTGTGTGAGCTAGCTTCCTAGAATCCCTGTCAACAGAAGCAAGAATGTCTTGAGTATAGACTAAATCTGTCAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATAT + +a +s mr.mrrefChr3 139495 63 + 181019 GTTTAGGTGGTGCTGTTATCATCTAGGAGGATACTGGTCGCCACCTACATTGACAGAATAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590677 63 + 636262 GTTAAGGTGGTGCTGTTATCATCTAGGAGGATACTGGTCGCCAACTACATTGACAGAATAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 65326 63 - 647215 GTTTATGTGGTGATGTTATCATCTCGGAGGTTACTGGCCACCACCTACATTGATAGAATAATA + +a +s mr.mrrefChr3 139558 27 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CATAGATATGGATGTGTATGAGTCCTTGATTGATGTCTGTATGAGTACTGTCTACTCAGTAACAATAGACTGGGCAAGTCTTGCCCTATGAGTTACCATAAAAATCGTTCCATAAGTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65863 120 - 647215 CAGAGACATGGATGTGCATGAGTCTATGATTGATGTTTGCACGAGTATTGTCTACTTAGTAACAATAGATTGGGCAAGTCTTGCCTTATGAGTTACAGTAAAAATTATTCCCTAAGGTAC + +a +s mr.mrrefChr3 140140 49 + 181019 TCTGCAGAAGTCTCAGTCCTCAATATACACCACCAACTTGCCTCTACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591418 49 + 636262 TCTGCAGAAGTCTCAGTCCTCAATATACACCACCAACTTGCCTCTACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 65983 49 - 647215 TGTACTGAAGTCTCAGACTTCAACATACACCTCGAATATGCATCTACCA + +a +s mr.mrrefChr3 140189 53 + 181019 AACAGGTAGGATATTTATGCCTTTCCTGCACGGATGAAAATGAATCTTCTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591473 53 + 636262 AACAGGTAGGATATTTATGCCTTTCCTGCACGGATGAAAATGAATCTTCTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 66032 53 - 647215 AACAGGTGGGATGTATATTCATTTCCTGGATGGATGAGAACAAATTCTCTAAA + +a +s mr.mrrefChr3 140242 71 + 181019 GATCATACTGGGGTGCCCCAGATATTCTATTATTCAGCAATTCCCTAGCTCCCATACAACATCAAAGGTAG +s 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CTATGGTGGGAGACATTAGGTAGGATGACATTCACGCTAGACAAACCATCCTCACTGTTGTCAAAAGTACAATAGTGCTCTGCATTAGCAGTACCAAAAGTCTGTTTGATTTCTGCTTCTGCCATCCAGGGGACATCTTCTGTTTAGCCCTCCCTATACATATTTTTAGTTGCAATCCATGGCATTGGATCGGGACTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66442 155 - 647215 CTATGGTGGGAGACGTTAGATAGGATGACATTC----------------------------------------------CTGCATTACCAGTACAAGACGTCCATTTGATTTCTTCTTCTTTCATCTAGGGGGCATAGACTGTTTATCTATTCCTATACATATTTCTAGTTGCAATACATGGCATTGGATAGGGACTCTGT + +a +s mr.mrrefChr3 140757 16 + 181019 GGCTGTCCTTATTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592048 16 + 636262 GGCTGTCCTTATTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66597 16 - 647215 GGCTGTCCATATTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 140773 250 + 181019 AGCTCCAGTACATGGCATTCGATAGGGTGCTACATTTATTTATATCCCCTAGTGAGGGCTAAAACTAGTCACATTACCTGGTACATTACACAATTAAACCAGATTTAGGGTCTGCTCTGATGGTTTACATAGTCTGATTTATCCCTATGGTGATGCTGGCTCAATTACTCCAACCTTTTGGTTTACAGTAGTTGAGGATAAGTGATAATGGACTTATGTTATTGTCTTACAATTTCTCTATTTATCCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592066 250 + 636262 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TAGATTGCATATCCTTGTAACAGAAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAAAAATGCATATTCTCCAGAGCCATCCGTATCCTGTTCTCAATAAGATGAA-ATCATGCTTAA--GGGAAGTGCTTACCATAGCATCATAGATCATTTTAGAGCAACA--TAGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 68873 165 - 647215 TACCTTGCAGATCATCTGAACAGGAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAACAATACATAGTCTACTGAACCATCCAGAACATGTTCTCAGTGAGATGAGTAGGAGGCAAAATCTAGAAGTCCCTACTGTCGCATCATAGATCGTTTTACAGCAACACATAGAAG + +a +s mr.mrrefChr3 142608 114 + 181019 TGATGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTATGGCAAATAACGCCTCTTTAGCAGTAAGTTAACTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594004 114 + 636262 TGATGAACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTCTGGCAAATAACGCTTCTTTGGCAGTAAGTTAATTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 69038 110 - 647215 CAAAGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGGTCCTCACCTATGGCAAA----ACCTTGTTACCTTTTAATGAACTGATGGATTTCAACTAGGCCTATT + +a +s mr.mrrefChr3 142722 86 + 181019 GCTTTTTAATGGACTGATGGGCTTCGCCTATGCCTATTTGATGGCATATCTAACATGTACATAGGGTTTTATGTTATCCACTTTAG +s 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TTAAGGGGTAATGACCATCCCAAGATTTCATCCTTGTTTAACCGCTTTGACACATCAATTCACAGGTTTTTCAGAGATTGCTCCTGGAATACTACATTTGGATTGCAACCATTTACTTATGGTCATTTGTGATAGCTTTCACTTCCCTTGACTATGATTTGCCTTGGCCATCATTTGATTAGCACTTGTAGAATCAACCCCACCAATAAAGCACACTACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 72768 207 - 647215 TTAACAGGTAGTAATCACCCCAAGATTTCCTCTTTGTTCAACCACTTTAACTCATCAAC--------------AAGATTACTCCTGGAATACTACATTCAGATTCTGCACATTTACTTACAGTCATTTGTCATAGCTTTCAGTTCCCTTGTCTATGA-TTGCCTTGGCCATCATATGATCAGCACTTATAGAATCAACCCCACCAATAGAGCACACTACAAT + +a +s mr.mrrefChr3 146484 65 + 181019 CAGATTCGGAAACTGAGGGCAACCTTCAGACATCTATCTTCCTACGGCAAAAGAATTTAGGTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598584 65 + 636262 CAGGTTCAGAAACTGAGAACAACCTTCAGACACCTATCTTCCTACGGGCAAAGAATTTAGATGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 72975 65 - 647215 CAGATTCGGAGACTGAGGGCAACCTTCAGACATGTATCTTCCTATGGCAAAATAATTTAGGTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 146549 18 + 181019 CATATGGCTTGAAAATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598649 18 + 636262 CATATGGCTTAAAAATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 73041 18 - 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 598785 287 + 636262 TAGTTGCTCCATATAACTCCAGGGCGGTGGCCTGGGAACATTCATCATACAAATGATTGTGCTCAATTTCTCCATTGTGTGGAGCTGCTTCTGTGCCTCAAGGATGGTCTTCATTATCATTTTCAGCCTGTTTAGTTCAGCATTTTAATGTAGGTTTTGTGTCGATACACATAGCAATTTTTTTGAGATAACATACTAGTTCCATTGGGGGTCAACATAGGGAATTAGTCATTATATGGCTGCAATATGACCTGGTCTTAGCAGGGAGACTTATAATCTTCATCATG-------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 73174 295 - 647215 TAGTTCCTACATATAACTGCAGGGCGGTCTCCTGGGAACATACATCATACAAATGATTGCACTCCATTTTTCCATAGTGTGGAGCTGCATTTGTGCCTCATGGATGGTCTTCGTTGTCACTTTCAGCCTCTTTAGTTCAGCATTTTAATGTTGGTTATATGTGGACACATATAGCAATTTTTTTAAGATAACATTCTAGTCCCATCGGGGTTCAAGATTGGGAATTAGTCATTATATGGTTGCAACATGACCTGGGCTTAGCAGAGGGGTTTATGATCCTCATCATGTGTGTACA + +a +s mr.mrrefChr3 146978 71 + 181019 CTTGTGTTGTTCTGGCAAAAAACATACCCCTGTTCAGCTTGCTAAGAGTGGTTTGTGGTACTAATCTAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599072 71 + 636262 CTTGTGTTGTTCTGGCACAAAGCATACCCCTGTTCAGGTTGCTAAGACTAGTTTGTGGTACTAATCTAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 73489 71 - 647215 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636262 ttccaatgggtaagttcatgatgggcttcattgaagatga +s simRat_chr6.simRat.chr6 74108 40 - 647215 ttccaatgggttagtgcatgatgggcttcattgaagatga + +a +s mr.mrrefChr3 147622 26 + 181019 agctgcattgagatttaagcttacac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599745 26 + 636262 agctgcattgagatttaagcttacac +s simRat_chr6.simRat.chr6 74148 26 - 647215 acctgcattgagatttaggcttacac + +a +s mr.mrrefChr3 147648 86 + 181019 tacatcttgtatctaatTTTCACTAGTAATAGCTTAATATCTTAAAGATGGCAATAAATGTACATTAGGTCTAGTGTATAGTTTCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599771 85 + 636262 tacatcttgtatctaatTTTCACTAGTAATAGCTTAATAACTCAAAAATGG-AATAAATGTACATTAGGTCTAGCATATAGTTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 74176 86 - 647215 tacatctcgaatctgatTTTCACTAGTAATAACTTCATATCTTAAAGATGGCAATAAATGTACATTAGGTCTAATGTATAGTTTCG + +a +s mr.mrrefChr3 147734 76 + 181019 TGTGTCTTTCCCATTATCAGAGATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTAACAGTGAATCACATCTCACCTGCTTCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599856 75 + 636262 TGTGTCTTTCCCATTATCAAAGATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTAACAGTG-ATCACATCTCACCTGCTTCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 74273 76 - 647215 TGTGTATTTCCCATTATCAGAAATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTGACAGTGAATCATATCTCACCTGCTTTTCC + +a +s mr.mrrefChr3 147810 47 + 181019 AATTCTAAATACTTTTGTCTATGATGTGATGTTCAAAAATTATTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599939 47 + 636262 AATTCTAACTACTTTTGTCTATGATGTGATGCTCGAAAATTATTCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 74349 47 - 647215 AATTCTAAATACTTTTGTCTATGATGTGATGTTCAAAAATTATTCCA + +a +s mr.mrrefChr3 147857 120 + 181019 TATGCCCAGTTTGCAAATCTGGGGATTAATTTTATGCCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCTGGGCTAGCACCTACCCTGCACCTTACATTGGCATAAGTGGAGATACAGTTGAACCCATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600018 120 + 636262 TATGCCCAATTTGCAAATCTGGGGATTAATTTTATGTCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCAGGGCTAGCACCCACCTTGCACTTTACATTGGCATAAGTGGAGATACAGTTGAACCCATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 74396 120 - 647215 TATGCCCAGGCTGCAAATCTGGGGATTGATTTTATGCCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCTGGGCTAGCACCTACCCTACACCTCACATTGGCATGAGTGGAAATACAGTTGAACCCGTCTT + +a +s mr.mrrefChr3 147977 443 + 181019 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--------------CTTGAATAAAAAAAACATCATTTTGATGTGATACCCCTGTATTATTTTGTATTAGCCACTTACGAGTCTGTCGTGATATACCAGCAATTACAAGAAATCAAGGGAGTTCAACAAGATGATGCCCTCCAGCTCCCAAAAGACCTCGATTATTTAACAATCAGGGATGTTACGCTAACACATGAACTAAGGGCAAAGTTACATTTTAGTCCTCCACAGACTGTTGCATATAGTAGTCCTATATGAGGAGTTGTCATACGGAAAAAAGTGTATCTTGAAGTTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 74975 296 - 647215 GGTTGATCTGTGCACTTGAATAAAAAAAACATCATTGTGATGTGATACCCCTGTATTATTTTGTTTTAGCTACTTACGAATCTGTCTTGATATATCAGCAGTTACAAGAAATCAAGGGAGTTCAGCAAGATGATGCCCTCCAGCTCCCAAAAGACCTGGATTATTTGATGATCAGGGATGTTACACTAACACATGAACTAAGGGCAAAGTTACATTTTAGTCCTCCACAAACTGTCGTATATCGTAGTCAAAAGCGAGGAGTTGTCATATGGAAGAAAGTATATCTTGGAGCTAAA + +a +s mr.mrrefChr3 148716 164 + 181019 CTCCTGGTCTGATCCAGTCATAAGAACTGCAATAGAGATTGCTAACAGTTACCCAATTGAGGGTTTCCAGACTCTGGACACCCCCATATAAATAACCTGTTAGGTCTACAAATGCATGGTCTGCCAAGAAAAGACATAAGTAAAGATAGTCTTCTATGAAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600870 164 + 636262 CCCCTGGTCTGATCCAGTCATGAGAACTGCAATAGGGATTGCTAATAGTTACCCAATTGAGGGCTTCCAGACACTGGACACCCCTATACAAATAACCTGTTAGGTCTACAAATGCATGGTCTGCCAAAAAACGACATAAGTAAAGATAGTTTTCTATGAAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 75271 163 - 647215 CTCCTGGTCTGATCTGGTCATAAGAACGGCAGTAGAGTCTGCTAACAGTTACCCAATTCAGTGTTTTCAGACTCTGGGCGCCCCCATATAAAAAACCTGTTAGGTCTACAAATGCATGGTCTGCCATGAAAAGACATAAG-AAAGGCAGTCTACTATGCAAATT + +a +s mr.mrrefChr3 148880 5 + 181019 TTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601034 5 + 636262 TTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 75436 5 - 647215 TTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 148885 149 + 181019 CTCACACCCATGATGATATCTCATGGGGATATTCCAATTTCAGAGTTCCAAGAACAATATAGTTTTGGTAATGGATTCTTATCTTGTCTACCACACACTGATTTGTTTCACATTAGGCTAATCACTTTTTCAACTGAACCTAATTAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601039 149 + 636262 GTCACACCCATGATGATATCTCGTGGGGACATTCCAATTTCAGAGTTCCAAGAACAATATAGTTTTGGTAGTGGATTCTTATCTTGTCTACCACACACTGATTTGTTTCACATTAGGCTAATCACTTATTCAACTGAACCTAATTAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 75442 149 - 647215 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AAGCCATGTACTGGCAATGTCTGTTGAACAATGGATTAACAAGAATAACGATACACAAACTAAATAAACCTCATATAAACACTAGCATCAGTACAGCTAGCAAGTCATTGCAAAGTCATACCTTAAGTTTGACTCTGATCTGTCACAATACATGTTACTTAAATAATTGGGCTCCTGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601498 179 + 636262 AAGCCATGTACAGGCAATGTCTGTTGAACAATGGATTACCAAGAATAAC--TACACAAACTAAATAAACCTCATATAAACACTAGCATCAGTACGGCTAGCAAGTCATTGCAAAGTCATACCTTAAGTTTGCCTCTGATCTGTCACAATACAGGCTACTTAAATAATGGGGCTCCTGCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 75907 180 - 647215 ATGCCATGTACTGGCAATTTTTGTTAAACAATGTATTAACAAGAGTAGCGACACACATACTAAGTAAACTTCATACAAACACTCGCATCAGTACAGCCAGCGAGTCATTGCAAAGTCGTACCTTAACTTTGACTCTGATTTGTCACAATACATGTTACTTAAA-AACTGCGCTCCTGCACT + +a +s mr.mrrefChr3 149512 221 + 181019 GATAATGTAAACATCGAGGGAGGTCTCTGTGTGTTCCCACAGCCAATCAGAGTACTCATGGGAGTAGTTGCCAGGGCATAGCACTACCACTTATCACTATCTGACTGAGGGTTTTGCGAATAGGATTCAGGTCTCTCAGGCCTGACAGAGAGGTATTATTCTCCATTACCTTAATCATCGGGGGAAGGTTAAAGATTTCATGTTGTTCTTTTTTTTTAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601686 221 + 636262 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-----TTCCTGGATTGCTTGCACCGCAGCTTGTCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGATTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATCTTGGTGAATTCTACTCAACGACAGTCTGCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGCGGACCGTCTACAGGAAATAGAATTACAGCCACCCTGCTATAAGAACTGATGATGAAAAATCATGCATAGCAGCTATGGCAGACTGCAGGTAATGCTATAACCATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATATGCTGCACTATAGGCAGATGTGGAAGGAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCGCAATTGATGCTCCAATGTCCTATGTCCATAATCATGCTTTTATTTTCATTCTGGAGATTAGGGTTGGAAGCATGTCAATTTAGA-TCAGACCAGACATCCTTCAAGTGTTATACCAGTAGATGGAATTACATGGTATGAACAGCATGTATAAACAGCAAATTAAACAGCCA-CTTACTGGCCATATATACTACAGGCATTGACCCAAAGACCCCTAAGCCTTCAGATTTGGCATAGTTTAGAACCCAAGCTTAATATTATGTTGCTCAATGTGTGACAAACACCCTGCTGCTATGCATCAGTGTCACCTGGCTGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 78043 652 - 647215 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mr.mrrefChr3 152191 32 + 181019 ATAGGCACAGAACACTGGGCCCTGTGGCCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604439 27 + 636262 -----CACAGCACACTGGGCCCTGTGACCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 78738 32 - 647215 ATAGGTGTAGAACGCTGGGCCCTTTGGCCAAG + +a +s mr.mrrefChr3 152223 272 + 181019 CCAAGTACCTTGTTAGGGGGAAGATTGATGAAGTTGTTAGGGGTTATGAGTTTATTATCAGCTACTTTATCAGGAAATACTTGTACATGGTTGCAGTCACCCCTGCACAGAACGCTGTGGGTTTCTTAAGGAAGCTGTGGATTTCTTCAAACTACAGTCCTGCAAAACTTCACAAACAGTACCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTTAACCTTCTTAAACTTCATTCAAAGGTTGTATGCCACGATCAAATAACCATCCGTACAGAGCGAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604467 272 + 636262 CCAGGTACCTTATTAGGGGGAAGATTGATGGAGTTGTTAGGGGTTATGAGTTTATTACCAGCTTCTCTATCAGGAAATACTTGTACATGGTTGCAGTCACCCCTGCACAGAACGCTGTGGGTTTCTTAAGGAAGCTGTGGATTTCTTCAAACTACAGTCCTGCAAAACTTCACAAACAGTATCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTTAACTTTTTTAAACTTCATTAAGAGGTTGTATGCCACGATTAAATGACCGTCCGTACAGAGCGAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 78770 272 - 647215 CCAAGTACCTTGTTCTTAGGAAGGTTGATGAAGTTGTTAGGGGCTAAGAGTTTATTATCAGCTACTTTATCAGGAGATATTCGTAGATGGTTGTGTTCACCCCTGCAAAGAAAGCTGTGCACTTCTTAAGGAAGTGGTGAATTTGCTCACACTACAGTTCTGGAAAACTTCTCAAACAGTACCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTAAACCTTCTTAAGCTTCATTCAAAGGTTGTATGCCACTATCAGATAACCATCTGTACAGAGTGAATG + +a +s mr.mrrefChr3 152495 24 + 181019 ATGAAAAAAGTTCAAGAGGACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604750 24 + 636262 ATGAAAAAAGTTCAAGAGGACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 79042 24 - 647215 ATGAAAAAAGTTCAAGAGCGCCCC + +a +s mr.mrrefChr3 152519 7 + 181019 TTAATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604775 7 + 636262 TTAATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 79066 7 - 647215 TTGATGC + +a +s mr.mrrefChr3 152526 91 + 181019 TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604783 91 + 636262 TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79073 91 - 647215 TTTTTGGCTCATAGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCTGGCTTTTGGACTGGGGGACGTGTACATAAAATATTGCAGCTGGCACCATTTGA + +a +s mr.mrrefChr3 152617 20 + 181019 GGACATTAGATTACACCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604874 20 + 636262 GGACATTAGATTACACCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 79213 20 - 647215 GGATATTAGATTACACCCTC + +a +s mr.mrrefChr3 152637 8 + 181019 TATACCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604894 8 + 636262 TATACCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 79239 8 - 647215 TGTACCCC + +a +s mr.mrrefChr3 152645 157 + 181019 CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAACAAAGGACTTGGTACTCTCCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604915 157 + 636262 CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAATAAAGGACTTGGTATTCTCCCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 79247 157 - 647215 CCCCCATTAGTTGAACTGGGGCACTAAGATAGATTCTGCTGAACAGGGAGGGACGTCACATATGATCCTTGGCCAACCTAATTTGCTTTAGCAAGCTTCTACAATTGTGTCTCTATTTATCACCTGTAAACTAACAAAGGACTTGGTACTCTGCCAT + +a +s mr.mrrefChr3 152802 43 + 181019 ATCTCCCTTGGGTAGGTCTATTTTAGACAAGATAATGCAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605073 43 + 636262 ATCTCCCTTGGGTAGGTCTATTTTAGACAAGATAATGCAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79404 43 - 647215 ATTTCCCTTGGATAGGTCTATTTCAGACAAGATAATGCAGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 152845 90 + 181019 TCACCATTGCCTGCCAGATTCTTTATAAAGGTGTCCTTACTCAGTCCTGGTGCAGAAAAATTACAGGCAATAGCATTAGACTCCCCCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605116 90 + 636262 TCATCATAGCCTGCCAGATACTTCATAAAGGTGTCCTTATTCAGTCCCGGTGCAGAAAAATTACAGGCAATAGCATTAGACTCCCCAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79448 89 - 647215 TCACCATTGCCTTCCAGATTCCTTATAAAGGTGTCCTTACTCAGTCCTGGTGCAGAAGAATTAGAGG-AATAGCATTAGACTCCCCCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 152935 250 + 181019 CCAATTGCAGATGACCTACAGTTCCTTGTCTGTGTATGATTTCAGTTCAAGGACTCTTTGCACCAAGGTATGAGATAATCTTTGCTTGTTGCAGATCATTTCCATAGCAATTCAGTATTTTTAAAGGTAGGAGGATTCTACAAAGCCTACAAACCATTCTATTCTTGTTAGATGCCCTTGATTGGCCAATGTACATCACCTATTGAAACATTTATCCTTTAATCAGTACCACATCTGTGGTGAACCAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605206 250 + 636262 ACAGTTGCAGGTGACCTACAGTTCCTTGTTTCTGTATGATTTCAGTTCAAGGACTCGTTGCACCAAGGTATAAGATAATCTTTGCCAGTTGCAGGTCATTTCCATAGCAATTCTGTATTTTAAAAGGTAGGAGGATCCTATAAAGCCTACAAACCATTCTATTCTTATTAGATGCCCTTAATTGGCCAATGTACATCACCTATTGAACCATTCATCCTTTAACCAGTACCACATCTGTGGTGAACCAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 79538 250 - 647215 CCAATTGCAGATAACCTCCAGTTCCCTGTCCGTTTATGATTTCAGGTCAAGAAATTTTTGCACCAAGGAAGGAGATAATCTTTGCTTGTTGCAGATCATTTCCATAGCAATTCAGTATTTTTTAACGTAGGAGGATTCTACAAAGCCTAGCAAGCATTCTATTCTTGTTAGATGCCCTTGATTGGCCGATGTACGTCACCTATTGAAACATTTACCCTTTAATCAGTACCACGTCTGTAGTGAACAAAGG + +a +s mr.mrrefChr3 153185 56 + 181019 TTAGCTGGCCTTTGTTTTTACCTCAAGCTGGCAATTGTACTAAGATCTAGTACAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605458 51 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 79963 50 - 647215 ATGACT----ATAAGTATTAAGCATTGATCCTTTAACACGGACCACACCATTGG + +a +s mr.mrrefChr3 153413 74 + 181019 GCTGTTTAGTCTCTAGAGGAACAGAACCCGCCATTGTGTTGTTTAGTTTTGAGATGTGAGTATAAGTTAAGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605669 74 + 636262 GCTGTTTAGCCTCTAGAGGAACAGAACCCGCCATTGTGTTGTTTAGTTCTGAGATGTGAGTATAAGTTAAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 80019 66 - 647215 GCTCTTCAGTCTCTAGAGGAACAGAAACCACCA--------TGTAGTTTTGAGATGTGAGTATAACTTTAGGGA + +a +s mr.mrrefChr3 153487 220 + 181019 GTACCCCAGCTTCAACCTGTATGGTGCAAGATTGTTGTCCCTTCAAGAAGGAGTAACCATCATATGCCTTCATGGTAGTTAGCTACTGAACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTAATAAAGCACTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTACCCTTTTGAAAGGATCAGATAGCACCATAAACATGTGACTCTGTTAAGAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605743 220 + 636262 GTACCCCAGCTTCAATCTGTATGGTGCAAGATTGTAGTCCCTTCAAGAAGGAGTAACCATCATATGCCTTGATGGTAGTTAGCTACTGGACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTATTGAAGCAGTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTAACCTTTTGAAAGAATCAGATAGCACCATAAACATATGACTCTGTTAAGAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 80086 220 - 647215 GTACCCCCGCCTCTACCTGTATGGTGAAAGATTGTTGTCCCCGCAAGAATGTGTAACCGTCATATGCGTTCATGATAGTTAGCTGCTGAACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTAATAAGGCACTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTACCCTTTAGAAAGGATCAGATAGCACTATAAACTTGTGACTCTGTTACAAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 153707 102 + 181019 GTCTTGTAGGCGCCTAGAACTCACTTGAACTCTATGCAAGTCTGTAACATGGAGTAAACAAGCAGTTACAAAATCATAGGACAGTCTTCTGTACAAAATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605963 102 + 636262 GTCTTGTAGGCGCCTAGAGCTCACTTGAACTCTATGCAAGTCTGTAACATGGAGTAAATAAGCAGTTACAAAATCATAGGACAGTCTTCTGTACAAAATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 80335 102 - 647215 GTCATGTAGGTGGCTAACATCCACATGAACCCTATGCAAGTCTGTCATATGGAGTAGACAAGCAGTTACAAAATCATAGGTCAGTCTTCCGTACAAAATCAT + +a +s mr.mrrefChr3 153809 332 + 181019 AGAACAGTCGTCTGAGGTTTCTTATGTTCATTTACAGTTATTGTTGCATGTCCTGTAATTCAGTAAACTTTTGGCAATGCTGTATATTGCCCTACTAGGGTTGGCATCACTATAGGAATGATTCCCTCAAAACTCATGACTGTAGAGAGGCAGTGGCTCATACTTATGAGACTGCTGGTAGTGGTTTGCACAACTCTAGCTGTTAATCAAGTCATTGCATAGAACCACTAACTCAGGAGAAATGGTAAGTTCACAACCAGTATATAGGTGCAGCAATTGTGTGCAGGCCCTAAGAGCCATATGTATTGGCACTTTGGAGTCAACCCTTTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606065 332 + 636262 AGAACAGTCGTCTGAGGTTTCTTATGTTCATTTGCAGTCATTGTTGCATCTCTGGTGATTCAGTAAACTTTTGGCAATGCTGTATATTCCCCGACTAGGGTTGGCATCACTATAGGAATGATTCCCTCAAAACTCATGACTTTAGAGAGGCAGTGGCTCATATCTATAAGACTGCTGGTAGTGGTTTGCACAACTCTAGCTGTTAATCAAGACATTGCACGAAACCACTAACTCAGGAGACATGGTAAGTTCACAACCAGTATATAGGTGCAGCAATTGTGTGCAGGCCCTAAGAGCCATATGTATTGGCACTTTGGAGTCAATCCTTTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 80443 307 - 647215 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CGGACTGTGTATTTGAACTCAGAGTACACACAACATTCGTCTGCTACTCCTGCCTGGTATATGAGTGTGGTCAAGCCTTGGGCTGACTGTGTACTGTAAATGTAACCCACAGAAGTGAGCACTACCCCCGGTTCCCAGTGTCTGGTGTGCTGACAATGGTAATTGGAGCAAGATTCCCCTCCAAGTTTCAGATGCAGTATGTTGTTGATTGTTGGCAGACAGCCTCCCAGTTTAAGTAAGGAACTATAACTGTAAGTAAATCTATGTATACAGAACTGGTTTATATCTTCGGTCTTAATGTAGCAGGATGGTTGTTCATGTGATCGGTTATAACGTAGCAGGATGTGAGTAGAGAGAGCCCCACTTCTAGTTCTTCCAGTTTTTCATGGTAGC + +a +s mr.mrrefChr3 158770 97 + 181019 GACAGGCATGCATTTCTAAAATCGATTAAAATTGGATGCAGCTAACTGTTGACAGTGTGGAAACTGCCCCCTGTACATTAGGGAGGGAATGCCTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610823 87 + 636262 GACAGGCATGCATTTCTAAAATCGATTAAAAGTGGATGCAGCTAACTG--GACAGTGTGGAAACTGCCTG--------TAGGGCGGGAATGCCTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 85484 92 - 647215 GTCAGGCATGTATTTACAAAAT-CATTAAAATCGGGTGCAGCTAAGTGTTGGCAGTGTGGGAACTGCCCCCTGTACATTAGGGAGGGCATG----CC + +a +s mr.mrrefChr3 158867 25 + 181019 TAGAGTGGAATTGACAATTTAGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610913 25 + 636262 TAGATTGGAATTGACAATTTAGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 85576 9 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mr.mrrefChr3 159085 32 + 181019 AGATCTCTGTATGTGACATGTGTTTAAGGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611159 32 + 636262 GGATCTCTGTATGTGACATATGTTTAAGGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 85789 32 - 647215 AGTCTTTTTTATGTGAGATGTGTTTAAGGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 159117 195 + 181019 AGGATGATATGCTCATTTGTCATGGAGTGATTTGACCATTTATGCAAATGCATCCTTTTAATGACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGATTCATAGGGATATGCAATTTGTGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGACTAGCAGTTATCTGTCACATAAGGCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611191 195 + 636262 AGGAGGATATGCTCATTTGTCATGGAGAAATTTGACCATTTATGCAAACGCATCCTTTTAATCACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGGCTCATAGGGATATGCAATTTATGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGATTAGCAGCTATCTGTCACATCAGGCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 85828 181 - 647215 AGGATGATATGCTCCTTGGTCATGGAGTGACTTGACCATTTATGTAAATACAT-CTATTAATGACATTTACTGCTCCCCGTGAGGT-------------AGACAAGATTCATAGGGATACGCAATTTGCAAATTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAGAAGGCTATTAGTTATCTGTCACATAAGGCCCC + +a +s mr.mrrefChr3 159312 49 + 181019 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TTCCCTAATGCCCTCTCCCCCATGATAATGGTGCAGATTTCAGTTCTCTCTTCAAATACAAAACTGTTGTTACTGAAATATCAGCTGGAGGTTTATCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 87620 100 - 647215 TTCCCCAAGCCCCTCCTCCCCATGATAATGGTGCAGATTTCAGTCCTCTGTTTAAATATAAAACTGTTGTCACTGAAATATCAGTTGGATGTTTATCTTC + +a +s mr.mrrefChr3 160726 12 + 181019 GCAAGACCATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612863 12 + 636262 GCAAGACCATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 87720 12 - 647215 ACAAGACCCTCT + +a +s mr.mrrefChr3 160738 19 + 181019 TAAGACTAGGTCAGGCGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612875 19 + 636262 TAAGACTAGGTCAGGCGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 87738 19 - 647215 TAAGACTAGGCCATACGAG + +a +s mr.mrrefChr3 160757 104 + 181019 TGAATGAACAATTGCACACAACTACAAGGGCTTCCATGAAGTCCCCCTATCACGTAGACACCTGAGAACTGCCAGGAATCTAATAGTCAAGGCCTTCTGGATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612894 104 + 636262 TGAATGAACAATTGCACACAACTACAAGGGCTTCCATGAAGTCCCCCTATCACGTAGACACCTGAGAACTGCCAGGAATCTAATAGTCAAGGCCTTCTGGATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 87791 104 - 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 629236 28 + 647215 TCTAAGACCCCAGTTGTTATATCATAAA + +a +s mr.mrrefChr3 164615 254 + 181019 GTTAACTTATTACCTATTCTTGACTCCTCCAAAAAAATTACAGCGCTATGTACCTGATGCTATAGCAGAACAGACATTGCATTGGGGTTGAAGTACCACATTTTGGTTGCCTGAAGTACCACACACCAGTTGACAAAATTCAAAAAAAAGGTACACTGCTTGTTGTATGGGTAGGTTAGCATGAGTAGAAATGGACCATGTGTATTGTGTTGAAAGCCTTGCTACTTAGCCTATGTCACTATTCCCCCACAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617359 250 + 636262 GTTAACTTATTACCTACTCTTGACTCCTCCAAAAAAATCACAGCGCTATGTACCTGATGCTATAGCAGCGCAGACAGTGTATTGGGGTTGATGTATCACATT----CTGCCTGAACTACCACAAACCAGTTGACAAAATTCAGAAAAAAGGTACACTGCTTGTTGTATGGGCAGGTTAGCATGACCAGAAATGGACCATGTGTATGGTGTTGAAAGCCTTGCTACTTAGCCTATGTCACTATTCCCCCACAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 629265 252 + 647215 GTTAGCTTATTACCTATTTTTGACTCCTCCAAAAAAATTACAGTACTATGTACCTGATGCTACAGCAGAACGCACATTGCATTGGGTTTGAAGTACCACATTTTGGTTGCCTGAAGTACCACACACCAGTTGACAAAATTAAAAAAACAGGAACACTGCTTGTTGTACTGGTAGGCTAGCATGAGTAGAAATGGACCATGTGTATTGTGTTGAAAGCC--GCTACTTAGCCTATGTCACTATTTCCCCACTAGG + +a +s mr.mrrefChr3 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CACCTGATAATATCTCCCCTTTGACTAATTGCTAGCTGCAACCATAGTGTACCACATCTTACTTTAATTTGAATTCATACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGCAAAGGTGGTGTGCTGTCAGATCACTTGTGCTCCATTATCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGAACCCATGGATATGTAATAAGCCGATACTTACCATGGATAGGCATAGACTGTCTCACTCATGGGATTGGTGAGGTGACAACTGTGAACCTCCAT-TTCAGCCCAAATAATTAACTATTATATCAAGAACACAGAACCCCAAACTTAGCACGCACTTGATGGCT + +a +s mr.mrrefChr3 169710 17 + 181019 TGTTCTCCTTGTGGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622957 17 + 636262 TGTTCTCCTTGTGGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 634569 17 + 647215 CATGCTACTTGATGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 169727 19 + 181019 AAATCATTGTCCTGATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622974 19 + 636262 AAACCATTGTCCTGATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 634721 19 + 647215 AAATCATGACAATGGTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 169746 12 + 181019 CATGTGGCCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622993 12 + 636262 CATGTGGCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 634743 10 + 647215 CATGAGGGGA-- + +a +s mr.mrrefChr3 169758 31 + 181019 AGGCTGAGAGTGCTTCTCACTCCTCATCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623006 31 + 636262 AGGCTGAGAGTGCTTCTCACTCCTCATCATG + +a +s mr.mrrefChr3 169789 81 + 181019 TAAGCGTTGTATATAAGATAGGCATATTTGTACTGAATCATTACATACTGAACACACAAGCATTGTATCAAGTAGCATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623065 81 + 636262 TAAGCGTTGTATATAAGATAGGCATATTTGTACTGAATCATTACATACTGAACACACAAGCATTGTGTCAAGTAGCATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 634753 20 + 647215 -------------------------------------------------------ACAGATATTGTATA------CACGGT + +a +s mr.mrrefChr3 169870 321 + 181019 AGGCGACTGTATAGGCTAAAACTGTGTTACAGGTGAAATATCATGCAAATTTAATACTGATATCTTGTACATTGTTTCACATCACTATATGTAGAAAACCAGCCACCAAAGGCTAGTATAATTTGTATGAGGATGAGTAGTGACAATGCAGCAATTCTTCCTCACTCATTCTAGTTCCTAAATATATCTGTGCCTGAGTAACAACTCTGAAAACATACAGGTACTATTTTATATGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATTATATCGATTAATGGCTCTCCCAATGAGCACTATCAATTATCCCTCACATCCCACTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623146 321 + 636262 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TTACTTTCTTTATGAAGGTTGGGGCTTGTGTTAATAACTGAGGAGTTGGAACGCATCCCCTACTGGGGTTTTGTTTGCTCCTAGCCTCCTGTTGACCCCATATTGGCAATCAGAGGCTCCATGTAGTTGAGCATAACACCTTGGGCATAGATAAAGTGCACCCTTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 635094 168 + 647215 CTACTCTCCTTACAAGGGTTGGTGCTTATGTTGATAACTGAAGAGTTGGAGCACATCCCCTACTGGGGTTTTGTTCGCTCCTAGCCTTCTGTTTGCCGCTTAGCGACAATCAGAGGCTCCATGCAGTCAGGCGTAACACCTTAGGCAAAGATAAAGGGCACCCCTCTA + +a +s mr.mrrefChr3 170359 13 + 181019 TCACCTATTTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623636 13 + 636262 TCACCTATTTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 635263 13 + 647215 TCACCTATATAAC + +a +s mr.mrrefChr3 170372 25 + 181019 AATGCTCATACTATCTAGCACTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623650 25 + 636262 AATACCCACACTATCTAGCACTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 635276 25 + 647215 AATGCTCGTACTATCTAGCACTCCA + +a +s mr.mrrefChr3 170397 239 + 181019 CTACTCTATCACTATTTATCTCTTAGCCAGAGGTCATCAATTTGATGCAGTCAGGATAACTTTGTGAATTCTCTAAATATGTCTGGCCTACTTTGTTGAATTGGGCTTGTACCTCTTGCATGACCAAAATAATTTTGCAGAGACATGTCATGTCATGTGGTACTTCAGAGTGTGTTTGTGCTCAGAAGGCATCAATTCTAAACAGAGTCACATCATGCCATGGTTGTAGTGACTTATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623675 239 + 636262 CTACTCTATCACTATTTATCTCTTAGCCAGAGGTCATCAATTAGATGCAGTCAGGATAACTTTGTGACTTCTCAAAATATGTCGGGCCTATTTTGTTGAATTGGGCTAGTACCTCTTGCATGACCAAAGTAATTTTGCAGAAACATGTCATGTCATGTAGTACTTCAGACTGTGTTTGCAATCAGAAGGCATCAATTCTAAACGTAGTCACTTCATGCCATGTTTGTAGCGACTTATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 635305 239 + 647215 CTACTCTATCACTATTTATCTCTCAGCCAGAGGTCATCAATTTGATGCAGTTGGGATAACTTTGTGTATTCTCTACATATGTCTGGCCTACTTTGTCAAGTTGGGCTTGTACCTCTTGCATGACCAAAATAATTTTGTAGAGACATGTTATGTCATGTGGTACTTCAGAGTGTGTTTGTGCTCAGAAGGCATCAATTCTAAACAGAGTCACATCATGCAATGGTTGTACTGACTTATAT + +a +s mr.mrrefChr3 170636 206 + 181019 ATGGTCCCTTCACTAGGTTTAATCCTCATGAAATGGTAGTTAGCTTTTATTCATGATTCCGAACCAGACTGGCTTTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCAGTAGAGAAGGTCTACCCAGGAATAGGTCACTTCTGACTCGGTTCGTTGTATCTCAATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCAAAAAAAATGCACTCCTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623921 206 + 636262 ATGGTCCCTTCACTAGGTTTAATCCTCATGAAATGGCATTTAGCTTTCCTTCATGATTCCGTACCAAACTGGCTTTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCGATAGAGAAGGTGTACCCAGGAATAGGTCACTTCTGACTCGGCTCGTTGTATCTCAATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCACAAAGAATGCACGCCTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 635544 200 + 647215 GTGGTCCCTCCAGTAGGTTTAATCCTCATGAAATG-TAGTTAGCTTTTACTCACGATTCCCATACTGGTGGGGTCTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCAGTAGAGAGAGACTACCCAGGTATAGGTCACTTCTGACTTGGTTCTTTGTATCTCGATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCAAAAAAAACGCATTC----- + +a +s mr.mrrefChr3 170842 103 + 181019 AGTATCACGCACGATAAGTGTCACACGCTCTGCTGCATTAAGTACATGCCATGTCCGATGACATCAAGACCTAACCTAGTATGTCCTGTATCTTGATTTCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624133 103 + 636262 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TACCATTGTAATCGTAATATAACCCATGAATGTTAGAAATGAGTTCAGCAGGCAGGTTTTACCACCTGACTAGTATTAGTGGTAGCCTCTGGTATTTAACCATCTGAATTCATCTCGTGTTCTAACACTTCAGAGCCATATGGCAATATCCATCAGAGCCGCAAATTAAGAACTTTCCTTGACACTTAGATGACTTATGTTGTCTGTACTAAACCTTTTTTGATTTATTGGTCTGATTGAGTAATAATTACAGCAACCACACACTATACCAAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 171220 67 + 181019 TACATTGTTATGGACGTTGTTCCAGCTTACATTCACTTAAGAATGGCTGGCGCATTAAGCCATTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624516 67 + 636262 TACATTGTTATGGACGTTGTTCCAGCTTACATTCACTTAAGAATGGCTGGCGCATTAAGCCATTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 636106 67 + 647215 TACATTGTTACAGACATTGTAACAGATTACATTCACCTAAGGATGACTGGGGCACTGAGCCAACAGG + +a +s mr.mrrefChr3 171287 320 + 181019 TAAAAAACAACTTATGTTACAATGTTAAATCTTTCTCCAGATTTTATAGTGTGACACTCTGTTGTAACACGGGGGTTCAGTCTCGCCAGAAGTGATATGTATACATTTGGAAATTACTAAATTCACAATGTGATTGATACCATATTTAGTTGGGGGAGGTTTATGGGTGCCAACAAATTTGGCCCAGCATGATTGTCATGTCTGCCTTGAAATTGAAATAAAGTCACTTTCATAGCTGTAGTTCTAATCATTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGGATATGTGCAATCAGACAGAATTGAGTAATTCTTCCCTGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624584 320 + 636262 TAAAAAACAACTTATGTTACAATGTTAAATCTGTTGCCAGACTTTGTAGTGTGACACTCTGTCATATCTCGGGGGTTCAGTCTCGCCAGAAGTGATAAGTATACATTTGAAAGTTACTAAATTCACAATGTGATCAATACCATATTTAGTTGGGGGAGGTTTATGGGTGCCAACAAATTTGGCCCAGCATGATTATCTTGCCTGCCTTGAGATAGAAATAAAGCCACTTTCATAACTGTAGTTCTAATCATTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGGATATGTGCAATCAGACAGAATTGAGTAATTCTTCCCTGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 636173 320 + 647215 CAAAAGACAACTTATGTTATAGTGCTAAACCTTTCTCCAGGTTTTATAGTGTGACACTCTGTTGCAACATGGGGGTTCAATCTCTCGAGAAGTGATATGTATACATTTGGTGATTACTAGATTCACAATGTGACTGATACCATATTTAGTTGGGGTAAGTTTATGCTTGCCAACAAATTTGGTCCAGCATAATTGTCATGTCTGCCTTGAAATTGAAATAAAGTCACTCTCATAGCCATAGGACTATTCGTTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGTATACGTTCAATCAGACAGCATTGAGTAATTCTTCCCAGAAC + +a +s mr.mrrefChr3 171607 109 + 181019 CAGGTCTTTAATGGAGAGTATTGTATTGCCAGGGAGTGACTCCCAGGGAGTGACTGACAGTTCTTCTTCTATTCCCCTCCCCTGTCTTCCCCCACTATTAAGTTTTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624904 109 + 636262 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TAGTGGGTTGTTGTGAGATACATGATGCCCACCCTGCTGAGTGTTATAATACACAAAATGATGCTGACAATTACCAATATCCCAATGAACAAACCAATTGAAGATATGTACACTCATTAACTAGTATAGAACATTCAAGTGGGTACTCATATTAATGTAGAAAGATATGGCAGTTCTTGGAAACTTACAGATTTGCATTAC-TGAGAGGACACTTAGATTTCTGAGGTCATTAGAAACTTTACAAGGTCTACTAATTTCACTCGATAAAGTATGTCTATATAGAGATAGCAAGGCTATGAGCTTTTGAGAGACCCACACGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 636608 312 + 647215 CAGTTGGTCCATGTCATATACATGATGCCCACTCTGCCGGGTGTTGTAATACATAAGATAATGGTGACAATTATCAATATTCCAATGAACAAACCATTTGAAGAGATGTATACTCATTAATTATTATAGAACACTCAACTGGGTACTCATACTAATGTAACAAGGTTTGGCAATCCTTGGATACTTACAGATTTGCATTACCTGAGAGGATACTTAAGTTTGTGAGGTCATTAAAAATTTTACAGAGTCTACT----------GATAAACTATATCTGTATTGAGATAGCCAG-CTATCAAGTTTTGAGATACCCAAATGTTT + +a +s mr.mrrefChr3 172039 22 + 181019 CAGCACTACAGGAGTATGTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625353 22 + 636262 CAGCACTACAGGAGTATGTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 636920 22 + 647215 CAGCACCACAGGAGGATGTGTG + +a +s mr.mrrefChr3 172061 97 + 181019 AGACACTCCATGTGACATTGTCTACTGGGCTAGATAGGATTGTCTCTCATGAAATCTAATTGTTGTATTAGCCAACTTAATGGCATCAATTACGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625375 96 + 636262 AGACACTCCATGTCACATTGTCCAGTGGGCTAGATAGGATGGTCTCTCATGAA-TCTGATTGTTGTATTAGCCAACTTAATGGCATCAATTACGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 636944 97 + 647215 AGACTCTCCATTTGGCATTGTCTACTGGGCTAGAAAGGATTTTCTTTCACGAAATCTAATTGTTGTATTAGCCAACTTAATTGCATCAATTAGGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 172158 41 + 181019 GCTGGTTGCGGATTACATCAGGCTTATTCCTTGGCTTCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625475 41 + 636262 GCTGGTTGCAGATTACAACAGGCTTGTTCCTTGGCTTCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 637041 41 + 647215 GCCAGTTGCGGATCACGTTGCGCTTATTCCTTGGGTTCCCA + +a +s mr.mrrefChr3 172199 106 + 181019 TTGATTAGGGTCCCAAGCTTATCCTGAACTCCAGTGAATAATTCAGATATATTAGGCCCAGGTAGACCCTCCATATGCTATTATCCTTTTACATGCACATAAAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625517 104 + 636262 TTGATTAGGGTCCCGAGCTTATCCTGGACTCCAGTGAATAATCCAGATATATTAGGCCCA--CAGACCCTCCATATGCTATTTTCCGTCTACATGCACATAAAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 637082 95 + 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AGTGGAGGTACAAATGCTAGAACCAGAATCGATCACATCCCAGCCAGAGCTGTGGACTCAATGCTTAAGTGGGAACCCAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTGTGGTCACTCAAGGGCATGTGAGGTGAAGAGGGGAT-----GTGTACACAGGGGGGGCTGTGCATTACAAACCTCTCATGTGGGGATCAGGCTCCCTCTACAGGTGCCTGTGATCACTTGATACCATGTCAGGTGGCACAGTCTTATAGCTAAGTACTATCTGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCATTTATTGGAGCTTTGCACGAGGCACTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 640591 324 + 647215 AGTGGGAGCACATATGCTACAACCATAATTCATTACATCATAGCCAGAGCTGTGGACTCAGTGCTTAAGCAGGGACCTAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTATGGTCACTCAAGAGCATGTGGGGTGAACAAGGGGTCTAGAATGTATGCAGGGGGAGCTGTGCATGACAAACCTCTTGTGTGGGGAGCAGGCTCTTTATACAGCTGCCTGTGATCGCTCTACATCATGTCAAATGGAGGAGGCTTATAGCCAAGCACTAACCGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCTTTTATTGGAGCTTTGCATGAGGCACTGC + +a +s mr.mrrefChr3 175786 47 + 181019 GTCTGAACAATGTTATGTGTCCTCCATATGCACAACCTATTTTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629378 47 + 636262 GTCTGAACAATGTCACAAGTCCTCCATATACACAACATATTTTTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 640923 44 + 647215 ATCTAAACAATGTTATGTGTCCTC---ATGTACAACCTATTGTTTTA + +a +s mr.mrrefChr3 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+ +a +s mr.mrrefChr3 179318 81 + 181019 ACCCATGCTTACCAGTTTATCTCTTGTTTTTGACCAGCTATTAAGAGGTCACAATGCAATGTCTTTTAAATGGAACAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633213 81 + 636262 ACCCATGCTTACCAGTTTATCTCTTGTTTTTGACCAGCTATTAAGAGGTCACAATGCAATGTCTTTTAAATGGAACAGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 644389 81 + 647215 ACCCATGCTTACCAGTCTATCTCTTGTTTTTGACCAGCTATTAAGAGGATAAAGTGCAATGTCTTCTCAATAGAACAATAT + +a +s mr.mrrefChr3 179399 57 + 181019 GAGGTTGTCTCTTATTTAATAAGCTGTAAAACACTGTGGACTACCTATCACTAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633298 57 + 636262 GAGGTTGTCTCTTATTTAATAAGCTGTAAAACACTGTGGACTACCTATCACTAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 644470 57 + 647215 GAGGTTTTCTATTATTTAATAAGCTACAAAACACTGTGGACTATCTATCACCAGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 179456 20 + 181019 GTAGTCCCTCCATAGCAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633355 20 + 636262 GTAGTCCCTCCATAGCAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 644538 20 + 647215 GTAATCCCTTCATACCAACT + +a +s mr.mrrefChr3 179476 63 + 181019 CTAGATATCATAAGGACAGGAGAATAGAATAAATAGATTCCTTGTAGACTAATTCTAATGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633376 63 + 636262 CTAGATATCATAAGGACAGGAGAATAGAATAAATAGATTCCTTGTAGACTAATTCTAATGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 644558 63 + 647215 CTAGATGTCCTGAGGACAGGAGAATTGACTAAATAGATGCCTTGCAAACTAAGTGTGACGGAT + +a +s mr.mrrefChr3 179539 145 + 181019 GCTGCCTGGAATAGTTTGCATATAATGCTGTCAAGCGGATTTTGTGTAGATCATCCAATGATCTGCGGCCACGAAGGGCAAACCTGTGGCGGTTAAAAAGGCACTAATTTCTCAATGGACAAAATTGTCTGATAGAAGGCTTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633448 145 + 636262 GCTGCCTGGAATAGTTTGCATATAATGCTGTCAAGCGGATTTTGTGTAGATCATCCAATGATCTGCGGCCACGAAGGGCAAACCTGTGGCGGTTAAAAAGGCACTAATTTCTCAATGGACAAAATTGTCTGATAGAAGGCTTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 644621 145 + 647215 GCTGCTTGGAGTCGTTAGCATAAACTGCTGTCAAGCGCATTTCGTGTAGATCATCCACTGAGCTGTGGCCCCCAAGGGCAAACCTGTGGTGATTAAAAAGGCACTAATTTCTCAATTGAAAAAATTGTCTGATAGAAGACTTCGT + +a +s mr.mrrefChr3 179684 24 + 181019 GATTCATGATTGTGTAGAGGCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633593 24 + 636262 GATTCATGATTGTGTAGAGGCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 644767 24 + 647215 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TTAAATTTGTGCGGATAATTCAAAAGGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 644993 30 + 647215 TTAAAATTATGCAATTAATTTAAAGGGTAA + +a +s mr.mrrefChr3 179926 110 + 181019 GTGAATGGCCCAATGATTTGGTTCCCAGATGTTTCAATCCGACAACATAATATGACTAGTCCTACAAGAGGCACTACACCATTAGACCCTCCTTCAGAGATAAATTATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633837 110 + 636262 GTGAATGGCCCAATGATTTGGTTCCCAGATGTTACAATCTGACAACCTAATATGACTAGTCCTCAAAGAGGGACTATACCATTAGACCCTCCTTAAGAGATAATTTATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 645023 110 + 647215 GTGAATGGCCCAGTGAATTGGTTCCCAGATGTTTCAATCCAACAACATAACATGACTAGTCCTACAAGGGGCACTACATCATTAGAGCCTCCTTCAGAGATAAATTATAA + +a +s mr.mrrefChr3 180036 37 + 181019 GTAGAAGTCTATCGATGGTGTGGGGTAATCACCTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633947 37 + 636262 GTAGAAGTCTATCGATGGTGTGGGGTAATCACCTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 645136 37 + 647215 GTAGAAGTCGATCGATTGTGTCAGGTAACCATCTTTA + +a +s mr.mrrefChr3 180073 67 + 181019 AGGGGACACACATGGTGCGTTGACTTATGTACTTTCTTGCCGGACGATCCATACCATTTGTCTACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634039 67 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 1437 173 - 636262 ATGGGACCACATCCCAT-------------CCCAATCAGAAAAAACAACCAACCGATGCAACTGGCCTGGGTGTG-TAGTGTGGATCTGCATAGCACTGATCTTTGCCAATTAAGTGGGGGGATCCAACACCTGATTGCCTTGAATCCCAGCTTGGCGTGGTCTCCTTTCTGACCAACAGGTGGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 645927 163 + 647215 ACAGGACTGCATCCCAGTCAAAAAATACAACCCACCCATGCAATACAACCCACCTATGCAACTGGCCTGGGTGTGTTATTGTGGAACTGCATAGCACTGATTTCTGCCAATTTGGTGGGGAGATCC--CACCAGATTGCCCTTAA----------------------ATGTGACCAACAGGTGGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 181013 6 + 181019 GGACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1610 6 - 636262 GGACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 646101 6 + 647215 GGCCTA + +a +s mr.mrrefChr4 0 68 + 409 TGCTGATAAATTAGATTGACATATTGTAATTACCAGTAAAGTAAGGCCAGCACTTTGCAAGGATTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 499913 62 - 636262 ------TAAATTAGATTGACATATTGTAATTACCAGTAAAATAAGGTCAGCACTTTGCAAGGATGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 132120 68 + 647215 TGCTGATAAATTAGATCGACATACCGTAATTACCAGCAAAGTAAGGCCAGCACTTTGCAAGGATTAAC + +a +s mr.mrrefChr4 68 6 + 409 TGACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500011 6 - 636262 TAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 132188 6 + 647215 TGATCA + +a +s mr.mrrefChr4 74 297 + 409 ATCAACCAGGATGGATCTACTCAGGAAGTTGAAATACAATATTGCAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATCTTTTTATGGAGCAATACAATCTGCAGGACAGAGAGTTCTGCTTACTAATCAAGCTATAAAGTTATTAAGGAGGGTGAGGATTAACAGAATGTAGTCTAAAGCTATTGAGGTCTGGCCTTATATCTTCACACTTATCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGTGGAGAACCCCACCATATGTTCTCATAAAAAAATATTCACATATGGCATTGGTAAAGGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500017 296 - 636262 ATCAACCAGGATGGATCTACTCAGGAAGTTGAAATACAATATTGCAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATATTTTTATGGGGCAATACAATCTGTAGGACAGAGAGTTCTGCTTACT-ATCAAGCAATAAAGTTATTAAGGAGGGTCAGGATTAACAGAATGTAGTCTAAAGCCTTTGAGGTCTGGCCTTATGTCTTCACACTTATCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGTGGATAACCCCACTATATGTTCTCATAAAAAAATATTTACATATGGCATTGGTAAAGGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 132197 294 + 647215 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CTGTGCTCACTCCTTCTCACCTTCCAGACATGTATTATTGTCATACTACAACCCAAACTATCTGGATCGGGGCTGCTACAACTTGTAGACAGGAGCTATGAGCCTAAGGCATTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137102 58 + 636262 ----------------------------------------------------------TATCTGGATCGAGGCTGCTACCACTTGTAGAAAGGAGCTATGAGCCTAAGGCACTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 134919 116 + 647215 CTGTGCTCACTCCTTCTCACCTTCCAGACATGTATTATTGTCATACTACAACCCAAACTGTCTGGACTGGGGCTGGTACAACTTGTAGGCAGGAGCTATGAGCCTAAGGCATTACA + +a +s mr.mrrefChr5 878 42 + 294542 ATATGCACTTGCTTGTGCATTTGGATGAGAGTAGATGTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137162 42 + 636262 ATATGCACTTGCTTGTGCATTTCGATGAGAGCAGATGTTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 135035 42 + 647215 ATACGCACTTGCTTGTGCATTTGGATGAGAGTAGATGTTGCA + +a +s mr.mrrefChr5 920 1 + 294542 G +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136958 1 + 636262 G +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137204 1 + 636262 G +s simRat_chr6.simRat.chr6 135077 1 + 647215 G + +a +s mr.mrrefChr5 921 12 + 294542 TATTACTGAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137205 12 + 636262 TTTTACTGAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 135078 12 + 647215 TATTATTGAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 933 86 + 294542 ATACATCTAGAGCATGCTCTGTGTGCTCCTCTTCTAATGGAGTGCAcagctaccaagttGTGCTCCTgttctaaTGGAGTGCACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136959 54 + 636262 ATACATCTAGAGCATGCTCTGTGTGCTCCTCTTCTAATGGGGTGCA-------------GTGCTCCT------------------- +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137217 54 + 636262 ATACTTCTCGAACATGCTCTGTGTACTCCTCTTCTAATGGAGTGCA-------------CTGCTCCT------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 135090 86 + 647215 ATACAACTAGAGTGTGCTCTGTATGCTCCTGTTCTAATGGAGTGCACAGCTACCAAGTTATGCTCCTGTTCTAATGGAGTGCACAG + +a +s mr.mrrefChr5 1019 80 + 294542 CTAAGTTGATGCAGCACATTTCTTGTAGATAAGAGGCGACTTTCTAGTAAGTCATCAAATGCAAACTAATGAACTCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137013 79 + 636262 CTAAGTTGATGCAGCACATTCCTTGTAGATAAGAGGCGACTTTCTAGCAAGT-ATCAAATGCAAACCAATGAACTCAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137271 79 + 636262 CTTAGTTGATGCAGCACATTTCTTGTGGATATGCGGCGACTTTCTAGTAAGT-ATCAAATGAGAACTAATGAACTCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 135179 78 + 647215 CCAAGTTGAAGCAGCACATTTCTTGTAGATAAGAGGCAACTTTC--GGATGTCATCAAAGGCAAGTTGATGAACTCAATG + +a +s mr.mrrefChr5 1099 9 + 294542 TTAGATTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137093 9 + 636262 TTAGATTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137350 9 + 636262 TTAAATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 135257 9 + 647215 TTAGATTGT + +a +s mr.mrrefChr5 1108 33 + 294542 CTGTGCCCCATGTATATAAAGTAGTGCCATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137359 33 + 636262 CTGTGCCTCGTGTATATAAAGTAGTGCCATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 135266 33 + 647215 CTGTGCCCTATGTATATATAGTAGTGACATATG + +a +s mr.mrrefChr5 1141 67 + 294542 ACCAGCCTGACAAGTGCGTGACATATGGAATGAGAAAGACAAGGGTGCTAACACACAACATTTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137392 59 + 636262 GCCAACCT--------CGTGACATATGGAATGAGAAAGACAAGGGTGCTAACACACAACATTTTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 135301 16 + 647215 ATAAGAAAGACAAGTG--------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 1208 78 + 294542 AAGCCTCAGTTTTAGTTTCCTCAGGGCTATAAATATGGCGCGGAAGTAAACCTATAGTCAGGGCAAAGGAGCCTCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137457 78 + 636262 AAGCCTCAGTTTTAGTTTCCTCAGGGCTATAAATATGGCGCGGAAGTAAACCTATAGTCAGGGCAAAGGAGCCTCTAA + +a +s mr.mrrefChr5 1286 14 + 294542 TCCAGGAGATGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137536 14 + 636262 TCCAGGAGATGGAG + +a +s mr.mrrefChr5 1300 113 + 294542 TCCTTCTGACACAAAGGTCTGTCACTTTTATGGGGTGGCCACACTTATCCACTAACACACCCAGTTTTCCTTCCCTACTTGTACAAGTATATTTGACTTTCATATTCGGATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137552 113 + 636262 TCCTTCTGACACAAAGGTCTGTCACTTTTATGGGGTGGCCACACTTATCCACTAACACACCCAGTTTTCCTTCCCTACTTGTACAAGTATATTTGACTTTCATATTCGGATAG + +a +s mr.mrrefChr5 1413 927 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 136965 288 + 647215 ACTCTCTTTGATCCCAAAGGAGCCTGTACTGTTCAAGGTTAATTCCAACACAACAGATAAGACAGTTAAGAAAGAGATGGTTAAGATATTTGTAGTATATCTAGACCCCCTATGGGCACCATGGGGTGTGTATGGCGAGCTCGTTTCTCTAGGTTGATCTTCTATGCACAATTCAAGAAAGTTTGCTTTCATCATTCATATACAACAGCTCCCCCCCACAAAAGGAGGAGGACCTTCA--CTAGTTGACTGTGCCACCATCTATCAACGTCATGTCA--ACATTACCACATG + +a +s mr.mrrefChr5 3082 148 + 294542 GGTGGTGGGTCCGACTGTTATCCAATTGGCCTATGACAATTGCTGCCAAGGCTAAAGCTATTAGAAAGAGTGTTAAGATGTTGGCCATGTGTAACCAGGATACTTAAGAGAGTAACAAGCTGCACCGAGTCAAAACATGCAGGACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139401 148 + 636262 GGTGGTGGGTCCGACTGTTATCCAATTGGCCTATGACAATTGGTGCCAAGGCTAAAGCTATTAGAAAGAGTGTTAAAATGTTGGCCATGTGTAACCGGAATACTTAAGCGAGTAACAAGCTGCACCAAGTCAAAACATGCAGGACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 137257 145 + 647215 GGTGGAGGGTCCAGCTGTTATCCAATTGGCCTATGGCAAACGCTACCAAGGCTACAGGTATCTGAAAGAGTGTTAAGATGTTGGCCATGTGGAACCAGGATACTTAAGATAATAACAAACTGCACCGAGTCA---CATGTGGGACAAT + +a +s mr.mrrefChr5 3230 16 + 294542 GAGAGTCAACAAAAGC +s 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AACTTAGTCTACAAGGTGCTGCAGACTTTTTTCTATGTAAAATTCTTATGTTGGTCTAGAAATTGTTATCTTGATCTAGACAGACCCCATTATGCCAGGATGTCCATATTGCCAGAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 139448 120 + 647215 GACTTAGTCTACAAAGTGCTATTGACTATTTCCTATGTAAAATTCTTAAGTTGGTCTAGAATTCCATATGTTGAACTAGACAAACCCCATTATGAAGGGATGTGCATATTACCAGAGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 5269 391 + 294542 GATTATGTAAACCCCTACTCCCTCTTCAGTACAATTTTGTTCCTTACCCCAAACTGCCATTGTAGAAGGCTATTTCGCTACTATTCAATTGTCCCTTCCTCATGACCTTATGGATTCCACTGTAGTTATGATTACATTGCAGGTCATAAAGCTCTCGTTCCTTATTCGCCTGCATCACAGCACTTTGTTGATGCTGCATGTTGGTGTATGCCCAGCTTGGTGTATAATGTCTATGTGTACTGGTACATGGTGAGATGATGAGAAAAATATGGACAAATGTGAGTGCATACTGTGAAAGTCCGATAGGCCGGTTCTTAAGATCCCCATTCGCCACCCTATGACCTGAGGGTCCATAGACAGACAGCTGAATCAGCCTGCTCCAATACCCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141599 380 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 141171 78 + 647215 TTCGGATAACCTGATTTGTGTGAGATGGACTGCCTCCTGAACAGTCACCCCTTCAATTTGGTGCAATAATTGGAGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 6972 9 + 294542 CTTGTAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143577 9 + 636262 CTTGTAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 141253 9 + 647215 CTTGTAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 6981 10 + 294542 TCAGATTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143586 10 + 636262 TCAGATTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 141268 10 + 647215 TTAGATTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 6991 98 + 294542 CAATAAGTGGAGGTAGGGCACTTGCAGTGTTAGGGGACCTTCTGTGGAGCATGGTAGCACAAAATCCTAATAAAGGCTTAAGTGTGGGTAGGTTTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143601 98 + 636262 CAATAAGTGGAGGTATGGCACTTGCAGTGTTAGGGGACCTTCTGTGGTGCATGGTGGCACAAAATCCTAATATATGCTTAAGTGTGGGTAAGTTTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 141278 98 + 647215 CAATAATTGGATGTTGGGCACTTGCAGTGTTAGTGGACCTTCTGTGGAGCATGGTAGCACTAAATCCTAATAAAGACCTAAGTGTAGGTAGGTTTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 7089 334 + 294542 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TTGGGAGGGCCTTGAATCAGATCATTCAAACTGAGGGCTGGGAAAGAGCTCCCGGGTTTGGAGGGATCGGTACCC-ATGCTGTACATTCAAGATATTTTCACAAAAAGTTGAAACAATAGAAATAAAGATACACAGTAGAGTGGGGGACCTGCCCTGAGATGAGACCTTCTTGGGTAGAGTCAATAGAACCCGGTGGGCCAGAATTTATAATAGTTCCTGAGTCACTAATGTGCTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCATAGGATGGTCAAGCTCGAACTCTAACTATCATAGTCATATAAAAGTGGAGAATGTGCATTTAGCCTAATT + +a +s mr.mrrefChr5 7423 34 + 294542 ATAAAGAAATCGAATTCCACCCTTTCTTAGCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144038 34 + 636262 ATAAAGAAATCGAATTCCATCCTTTCTTAGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 141710 34 + 647215 ATAAAGAAATCGAATCCCACCCTTTCTTAGCTTT + +a +s mr.mrrefChr5 7457 19 + 294542 AAAGGTATTCCATGTTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144124 18 + 636262 AAAGG-ATTCTATGTTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 141744 19 + 647215 AACGGTATTCCATGTTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 7476 72 + 294542 CCCCAAGTCACTTTTGTGTTATACCATCTCAATATACAGGTTAGATGATCTACTAATGCAAAGATCTGCGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144143 72 + 636262 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AAGCTGCCTTGCCATTATGTTCACCTTGTCCTATGACTCATTGTTGTGTCTGCAATGTCCCGTGACTGGTGTGCAAGGCAAGCCATAACACTGCTCAAATCCCATCATATGTCACATGCCATCATAGCTCATTCTTTCAAACTTCTGCTTTGGATGAATGTAGTGGTCCTTTGGAGCAAACAAATGCAATGCAGGTGTCCTGTGATCAAT--------AGTGGTCTCCCACTCATTAGCAGTGAATTCAGCTCCCTTGGACATCCTTTGGTCATCATTTTTCCTATAAAATGCTTTTTACTTTTGACAGGAAACACTAATGCCCTTATGTAGATTTGCTCTATTTGTAGGTATTGCGCACAGTACCCCAGTGAGAGTGTTAACGAACAGACACTATGCTTGGTGGGTAGTACAGTTGAGGGGATTCATAACAATATATGGTGACTTCGTCCTTTGCCCTGCAATTATAATACCCAGCTAGCCTATCTCTACTTCAGGTGTGCTGTGCAAGAGGTCATGCATATAGGTAAAAAGCAGTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 142128 525 + 647215 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TAGTGTACACTAGTAGGGTGCCAGCTCCTCCTAGGTAGCTGCTATCTGGGAAAGCTGGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147927 61 + 636262 TAGTGTACACTAGCAAGGTGCCAGCTCATTCCAGGTAGCTGCTATCTGGGAAAGCTGGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 145378 61 + 647215 TAGTGTATGCTAGTAGGGTGCCAGCTCCTCCTAGGTAGCTGCTACCTGGCAAAGCTGATTA + +a +s mr.mrrefChr5 11146 308 + 294542 TGGGTAGGTACCAGGTGACTGTAAAACATTACGAAATGTATGTAGAGACAGGGCCTGCTTTTGTTTGCTCTAGAGCCTAGGGCTGTTAATGCAGTCCCTGGTTGAGACCTCTCACAGAGCAAATGATGTTCTTTTCATATATACCTACAATTAACATTAGTTTTGCCCTACACTACTTGCAGAATATGGTGGGCTTCTAAGAAATTCCGCACCACAATGCTTTATATCAACGAAGGGATCTGGTGTTCAAGCAGAGTGAGAATCCCCAAGGTAGACAAATCCTTGTTACAACATCTTTACCTTATAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147991 294 + 636262 TGGTTAGGTACCAGGTGACTGTAAAACATTACGAAATGTATGTAGAGACAGGGCCTGCTTTTGTTCACTCTATAGCCTAGGGCTGTTAGTGCAGTCCCTGGTCGAGACCTCCCACAGAGCAAATGATGTTCTTATCATATACACCTACAACTAACATTAGTTCTGCCCTACACTACTTGCAAAATATGGTGGGCTTCTAAGAAATTCCACACCACAATGCTTTATATCAACGATGGGATCTGGTGTTCAAGCAGAGTGAGAATCCCCAAGGTAG--------------CAACATCTTTACCTTATAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 145439 299 + 647215 TGGGTAGGTACCAGGTGACTGTGAAACATTACGAAATGTT--------CAGGGCCTGCTTTTGTTTGCTCTAGAGCCTAGGGCTGTGAATGCAGTCCATGGTTGGGACCTCTCACAGAGGAAATGATGTTCTATTCATATTT-CCTACAATTAACACTAGCTTTGGCCTACACTACTTGCAGTATATGGTGGGCTTCTTAGGAATTCCGCACCACAACACTTTATATCAACGAAGGAATCCGGTGTTCAAGCAGAAAGAGAATCCCTGAGGTAGACAAATCCTTGTTACAACATCTTTACCTTATAAG + +a +s mr.mrrefChr5 11454 129 + 294542 TAGGGGGCATGTGGACCAATTCTACTGGGTATAAGTATTGGGTTTCTTGCATAATAGGCTATTCACACCAGTTAACTGTTTTTGTGTTGATCAATTTCTAATAGCTCATTACCGTTAAACTGTAAAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148285 125 + 636262 TAGGGGGCATGTGGACCAATTCTTCTGGGTATAAGTATTGGGTTTCTTGCATA----GCTATTTACACCAGTTAACTGTTTTTGTGTTGATCAATTTCTGATAGCTCATCACCGTTAAACTGTAAAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 145741 129 + 647215 TAGCAGGCCTCTGGATCAATTCTATTGGGAATGAGTATATGGTTTCTTGCATAATAGGCTATTCACACCAGTCAACTGTTTTTGTGTGTATCAATTTCTAATAGCTCGTTACTGTTAAACTGTAAAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 11583 85 + 294542 TGCAAACCATAAGCATAGGGAGCTAGAGTTTCTGCATGTATAAGTTTAACATGCTGAGATCATGTGGTGATGCATCATGGTTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148411 81 + 636262 TGCAAACCATAAGCATAGGGAGCTAGAGTTTCTGCATGTAGAAGTTTAACATGCTGAGATCATGTGGTGATG----ATGGTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 145870 85 + 647215 TGCAAAGCATAAACATAGGGAGCCAGAGTTCCTGCATGTATAAGCTTAACATGCTGAGATCACATGGTGTTGCATCAAGGTCGTA + +a +s mr.mrrefChr5 11668 81 + 294542 TCCTGTGGGAAAAGTTGTAAGCTTGGTGGGCATTTCTTTGACATGCAATTTTTCATACCTAAAGGACAAGATTTATCACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148492 60 + 636262 TCCTGTGGGAAAGGTTGTAAGCTTGGTGGG---------------------TTCATACCTAAGGGACAAGATTTATCACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 145956 81 + 647215 TCCTGTGGGAAAAGTTGTAAGCTTGGTGGGCATTTCTTTGACATGCAATTTTTCATACCTAAAGGACAAGATTTGTCATGA + +a +s mr.mrrefChr5 11749 168 + 294542 GCACACTCAATTTTACTAAGTTATACAGTCCATTAACTCAAGAAGGATTGCATTAACTTGGGCCCAAGATTTACGGAGGATAGCAATTGTGGTACAGAGCCTAGTGGGCATAATTAGTCATAAATTTGGAAGCCTAGTAAACACAAGGGAAACACAGAACATGACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148552 168 + 636262 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AATCCTGGGCTTGATAGCAAGGGACAGGCTCCCATATGCACATCATGTTATTAAAATCTATCCCTCGGAGCTCAATTCATTACTGAGGCAATAAATCATCCCTCCTGTGTGTAGAAGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149705 120 + 636262 AATCCTTGGCTTTATAGCAAGGGACAGGCTCCCATATGCACATCATGTTATTAAAATCTATCCCTCGGAGCTCAATTCATTACTGAGGCAATAAATCATCCCTCCTGTGTGTAGAAGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 147297 120 + 647215 TATCCTGGGCTTGATGGCATGGGACAGACTCCCATATATGCAACATGTTACTTAACTCTATCCCTTGGAGCTCAATTCATTACTGAGGCATTAAATCATATCTTCTGAGTGTACATGATC + +a +s mr.mrrefChr5 13044 82 + 294542 TGCCACAGTTCACAAATGCTCAAAATTCAATGGGCAGCATGTACTTAGTCATGGTTAAAGTGATTTCATGCTATACCTTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149825 60 + 636262 TGCCACAGTTCACAAATGCTCAAAATTCAATGGG----------------------AAAGTGATTTCATGCTATACCTTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 147423 82 + 647215 TTCCACAGCTTACAAATGCTGAAAATTCCATGGGCAGCATGTACTTAGTCATGGTTAAAGTGATTTCATGCTCTACGCTCGG + +a +s mr.mrrefChr5 13126 34 + 294542 CATGACTGGAACTGGGATGAGAAATGCTATGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149886 34 + 636262 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AATCTTGTAACTCATTGTTCAAAGCTAATTTGTATTAGTAGGCTTTGTACTCATAACTGCCAGCATTTATGGTAACTAGCCCTTGAATATCTGTCCAATTATGAACTGGGATAGGAATTATAAAAACTATGTAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCCATATATATAGAGACATTTTAATATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150974 179 + 636262 AATCTT-TCACTCATTGTTCAAAGCTAATTACTATTGGTAGGCTTTG---TCATAACTGCCAGCATTTATGGTACCTAGCCCTTGGAGATCTGTCCAATTATGAACTGGGGTAGGAGATATAAGAACTATGTAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCCATATATACAAAGACATTTTAATATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 148581 179 + 647215 AATCTTGTAACTCATTGTGCAAAACTAATTTGTATTAGTATGCTATGTACTTATAACTGCCAGCCCTTATGGTAACTAGCCCTTGAATATC-GTCCAATTATGAACTGGAATAGGAATTATAAAAACTACGCAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCTGTATATATAGAGAC---CTAATCTATG + +a +s mr.mrrefChr5 14252 149 + 294542 TAAGTTGTTGTCCAGCCTCTATTCCCCATGTTCACATGGCATACACTATCAGTTTTACCAGATTTTAGTATTCTAAACCCTCTATATGGGATCTACCTGTGAGTGTAATTTACTAGTGGGCTGAATATTGGATGGGAACTGCCCATAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151153 149 + 636262 TAAGCTGTTATCCAGCCTCTATTCCCCGTATTCCAATGGCATACACTATCAGTTTTACCAGATCTTAGTATTCTAAACCCCCTATATGGGGTCTACCTGTGAGTGTAATTTATTAGTGGGCTGAATATTGGATGAGAACTGCCCATAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 148764 149 + 647215 TGAGTTGTCGTCCAGCCTCCATTCCCCATGTTCACATGTCATGCTCTATGAGTTTTACCAGATTTCAATATTCTAAGCCCTCCATATGGGATCTACCTGTGAGTGTAATTTACTAGTGGGCTGAATATTGGATGGGAACTGCCTATAGA + +a +s mr.mrrefChr5 14401 7 + 294542 GGACTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151302 7 + 636262 GGACTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 148914 7 + 647215 GGATTGA + +a +s mr.mrrefChr5 14408 7 + 294542 CTGGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151309 7 + 636262 CTGGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 148959 7 + 647215 CTGAGCA + +a +s mr.mrrefChr5 14415 39 + 294542 CTAACCAATTCCTAATCCATAGATCATTTGTTGAGACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151316 39 + 636262 CTAACCAATTCCTAATCCATAGATCATTTGTTGAGACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 149027 38 + 647215 CTAACCAATTCCTAAT-CATAGATCATTTGTTGAGACAT + +a +s mr.mrrefChr5 14454 42 + 294542 ACACTTGGGCCTACCATTTGGGCCAGATAGGATTAAGTGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151356 42 + 636262 ACACTTGGGCCTACCATTTGGGCCAGATAAGATTTAGTGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 149065 42 + 647215 ACAGTTGGGCCTGCCATTTGGGCCAGATAGGATTAAGTGGCC + +a +s mr.mrrefChr5 14496 7 + 294542 ATAAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151399 7 + 636262 ATAGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 149107 7 + 647215 ATAAATA + +a +s mr.mrrefChr5 14503 40 + 294542 GGAATACCATTGAGGTAGGATTTTGTGTTGTAGATCAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151406 14 + 636262 --------------------------GTTGCAGATCAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 149119 40 + 647215 GGAATACCATTGAGGTAGGATTTTGTGTTGTTAACCAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 14543 19 + 294542 AGTAAAAATGAAGTGTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151420 19 + 636262 GGTAAAAATGAAGTGTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 149165 19 + 647215 AGTGACAGTGCAGTGATTT + +a +s mr.mrrefChr5 14562 102 + 294542 GACCAGTAAATTAAGTTGCTGTCTCTTAGATAACATGTGTCCAAGATGTGTAACTTGCTAAGTTTCGTTAAAATAACTTAAATTTAAGGAAGTACCTGTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151439 102 + 636262 GACCAGTAAATTAAGTCGCTGTCTCTTAGATAACATGTGTCCAAGATCTATAACTTGCTAAGTTTCGTTAAAATAACTCAAATTTAAGGAAGTACCTATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 149242 102 + 647215 GACCAGTAAATTAAGTTGCTGTCTCTTAGGTAACATGAGTCCAAAAGGTGTAACTGGCTAGGTCTCGTTAAAATTCCTTAAATTTAAGGAAGCACCTGTCCT + +a +s mr.mrrefChr5 14664 339 + 294542 AACTCAAGTTATCATTAGCCATATGTTACCCAAATCCATGCAACTTAAGAACCTGAAATGGTTATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGATGAGGGCAGGCTCCTTGGATAAGTCCCAACACCATGGCGTGGGGGCTCACTGGACTGAGTCTAACTCTCACAGTTGGGAGTATCAATTTCTGATATGGAGCCCTTTTTAGCACAATAAGGTTACCTTACTACAGTCATTAGCAATATACCATAGGGCTCATGGCACGCTACTACAGTAAGCATGTAAGTGAACAACTGCAAGGATGTAAGAGATCATGATATGTGGGCTACCTGAGATAGAATTAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151541 335 + 636262 AACTAAAGTTATCATTAGCCATATGTTACCCAAATCTGTGCAACTTAAGAACCTGGAATGGTTATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGATGAGGGTAGGCTCCTTGGATAAGTCCCATTACCATGGCGTGGGGGCACACTGGACTGAGTCTAACTCTCACAGTTGGGAGTATCAATTTGTGA----GAGTCCTTTTTAGCACAATAAGGTTACCTTACTACACTCATTAGCAACATACCATAGGGCTCATGGCACGCTACCACAGTAGGCATGTAAATGAACAACTGCAAGGATGTAAGAGATCGTGATATGTGGGCTACCTGAGATAGAATTAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 149345 339 + 647215 AACTCAAGTTATGATTAACAATATGTTGCCCAAAGCCATGCACCTGAAGAGCCTTAAATAGTAATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGGTAAAGGCAGGCTCCTTGGATCTGTCACAACATCATGGTGTGGGGTCTCACTGGACTGAGTCTACCTATGCCAGTTGGAAGTGTCAAATTCTGATATGAAGCCCTTTTTAGCGCAATAAGGTTTACTTACTACAGACATTAGCAATATAGCATAGGGATCATGGCACACTGCTACAGGAAGTATGTAAGTAGACAATTGCAAGGATGTAAGAGATCATGATATGTGGGTTACCTGACATAAAATCAATTT + +a +s mr.mrrefChr5 15003 678 + 294542 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AATCCTAAGCCTACCAAAAATCCATTCTTCCCAGTTAACAAATCAGGTATGACCACTGATACTGGGTGGTGTGGAGTGAATGTCACTAGAAACAATTGGTCTTGTTAGCAAAGTGGGG--CAAGCTTAATAGGAGGCAGTTTTATTCTGGTGTGTGCATCATTTAATTTGACTAATATAGGGAAAGGTATGACAAGTTGCACTTGGTTAAAGAAGTTGCACCAGGTCATGAAATGACGAATACTAGATAGTCCTTC---ACTAAATGTACAGGTTCAATCAGTAACCCCATCTAGGTTACCAGTCAGCAGTGCTGGTAAAAGGTCCCTAATTGGAGTTGATATAGGCTGGGTTCCACTGGGCTCCATGTCACTCTTTGAGTACGAGTTAACACTTAATGACACTATCACTACTTCACATTGGACACCATATCGACTAGCTAGCTCTTTAAATCTTGCAGCGTATAACTGGGTTTCGAGGCAGAATTCGTTAGGCTAAATCCAATACTGACAACCCTTTCCATTTCATGATGTCTGATTGGGAAGAATAGGAACAAGAAAGAATCTTTAGACAATAGGATTTTAAACGCAAAAATAGTTAATTATGTGTTCTATGGAAGTAAAGTAATTGTTGCATGTCCAAGAGTGGCCTCGGTTTTACACTTGAGGGGATAAAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 149684 676 + 647215 AATCCTAAGCCTACCAAAGATTGATTCCTCTCAGCTAACAAGTCAGGTATAAGTACTGATAGCGGGTGGTGTGGAGTGCATGCCACTAAAAACAGTTGGTCTTGTTGGCAAAGTGGGGAAGAAGCTGAATAGAAGGCAGTTCTATTCTGGTGT-TGCATCAGTTGCTCTGACTAATATAGGGAAAGGAATGACAAGTTGCACTGGGTTAAAGAAGTTGCACTGGGTCATGAAACAACGAATACTAGATTGTCCTTCAATACTAAATGTACAGGTTCACTAAGTAGCCCCACCCAGGTTACCACTCAGAATTGCTGATAAAAGATCCCTAGTTACAATTGAAATAGGCTGGGTTCCACTGGGCTTCATGTCACTCTTTGAGTGGGAGTTAAGACTTAATGACACTATCACTACTTCACATTGAACACCATATTGACTTGCCAATCCTTTAAATCATGCAGCGTATAACTGGGTCTCCAGGCAAAATTCCTTAGGCTAAATCCAATAATGGCGATTCTTTCCATACCATCATGTCAGATTGGGAAGTAGAGGAACAAAAAAGAAACTTTAGACAATA-GATTTTAAACACAAAAATATTTAGTTATGTGTTCCATGGAAGAAAGGTGATTGTTTCATGTCCAAGAGTGGTCTTGGTTTTACACTTGAGGGGGTAAAGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 15681 116 + 294542 GGAGAATTAGCTCCTAATCACCTTGAGCCAGTGTGACACTCAAGACATAGTCAAAATGAAATCAATCACTGAGATTGCACCTATTAGAGGACACAACAACAAGCTATTCAGCCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152558 110 + 636262 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TTTCCTCCTAGAGATTGCTCTCTTCTGGTGGCTTCTTTGAGGACTCATGCTTCTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152839 46 + 636262 TTTCCTCCTAGAGATTGCTCCCTTCT------TTCTT-----ACTCATGCTTCTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 150685 57 + 647215 TTTTCTCCTAGAGATTGCTCTCTTCTGGTGGCTTCTTTGAGGACTCATGCTTCTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 16031 86 + 294542 GGACCAGTTATTGGATCATATTGATATGATAGGATGTGGAGCGTATTCAAGTCTCTTCCAGCCTTGTCTCGGCACCCTATATAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152886 86 + 636262 GGACCAGTTATTGGATCATATTGATATGATAGGATGTGGAGCGTATTCAAGTCTCTTCCAGCCTTGTCTCGGCACCCTATATAGCC + +a +s mr.mrrefChr5 16117 28 + 294542 CTGCAAGATAATATCTTACTCTGCAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152978 28 + 636262 CTGCAAGATAATATCTTACTCTGCAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 150742 17 + 647215 -----------TATCTTTCTCTGTGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 16145 91 + 294542 GGTGTCTATCTTGGTGTTTAATCCATAATAGGGGAAGCAGGCATGTTAGCATCCCTGGTTTTAATAAGGAAAATGAGACTCAGGCTATTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153006 91 + 636262 GGTGTCTATCTTGGTGTTTAATCCATAATAGGGGAAGCAGGCATGTTAGCATCCCTGGTTTTAATAAGGAAAATGAGACTCAGGCTATTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 150761 91 + 647215 GGTGTGTATCTTGGTGTTTACATCATGGTAGGGGCAACAGGCGAGTTAGCATCCCTGGTTATAAGAAAGAAAGAGATACTCAGACAGTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 16236 34 + 294542 AAGTACAAGCTCCAAGTAAGTGGAACCATAGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153097 34 + 636262 AAGTACAAGCTCCAAGTAAGTGGAACCATAGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 150853 34 + 647215 AAGTACAAGCTCCAAGTAAGTGGAGCCATAGTTC + +a +s mr.mrrefChr5 16270 123 + 294542 TGAGTAGCACAGGCACCACATAAATGATCACAAACACACTTGTTTAGTAAATGGTATAATTGTTTGATCATGATAGATAAAACTTTGACTCAAACATCTCTATCGCCTGGGTTTATCACATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153131 123 + 636262 TGAGTAGCACAGGCACCACATAAATGATCACAAACACACTTGTTTAGTAAATGGTATAATTGTTTGATCATGATAGATAAAACTTTGACTCAAACATCTCTATCGCCTGGGTTTATCACATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 150901 123 + 647215 TGTGTAGTACAGACCCCACATAAATGATCAAAAACACACTTGTTTAGTAAATAGTATAAGTGTTTGATCATGATAGATAAAACTTTGACTCAAAGATCTCTATTGCCTGGGTTTAATGCACTG + +a +s mr.mrrefChr5 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simRat_chr6.simRat.chr6 151313 457 + 647215 TCTAGTGGTAGGTATCTCTGCTGACCTTGATGCTACTCATGTTCAGTTCCCCTAGTGTACTGCAGCCCTTTACTTTCTTATGCTGATCTTTTGGAGGCATGGACGTGGCATCTATGGTAATGACTATCACTGAGATTCTTATTAATTACCCTTCAATCTTATTATGATTATAGATTGTGCG---GCGACAGAAGGTTACTTTTTATCACTACAACCACTTTTTTTTTCTGATAGCCACAAGTGAGATGACAGTCCA-GGGCATCCCTC-GAATGCTTTGAGTTGTACCTTCACATGGTGATGAGAGTGACATACACAGAAAACCACTGTGTCTAATAGAATTGTTATACAAAGTCCTTCAGTCTTACCAAGAGCACATACCTTGGGGATATGTTACGTAAGTTATACTGTTGATTGGAAAAGGGAAAATCAGACTCTTCTGCATTTAAATTTTACCGGCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 17133 35 + 294542 GGCAGTCTAGCGGACTTGGCTTTGGCATTACTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154110 35 + 636262 GGCAGTCTAGCGGACTTGGCTTTGGCATTACTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 151770 35 + 647215 GGCAGTCTAGCAGACTTGGCTTTGGCATCACTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 17168 175 + 294542 ACATAAAATGTTCACTCATATGAATTTAGTGCTTCGGTGTAGTATTAATTAAGCTGGGCATGGCACATGTTTTCTATCATTACCTCTTATGGGACAGAACTAGCTTGTCTTAGGAAGTCTCAGTGTTCATTTCTTCAACCTCTCATTTTCCCACCTACTTCCCTCTGTCTGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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simRat_chr6.simRat.chr6 52352 3 - 647215 ATG + +a +s mr.mrrefChr5 17448 73 + 294542 ATGATAGGAAGGAAAGTAAGCTTTATTGAATTTGTTGCCACAATTATCAACACTCAAGAACTGAACCATAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154435 64 + 636262 CCAATAGTAAGCAAAGTAAGCTTTATTAAATTTGTATCC---------AACACGCAAGAACTGAACCATAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 152111 73 + 647215 ATGATAGGAAGGAAAGCAAGCTTTATTGGATTTGTTGTCACAATTATCAACATTCAAGAACTGAACCATAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 52355 63 - 647215 ATGATAGGAAGGAAAGTAAACTTTATCGAATTTGTTGCCACAATTATC----------AACCGAACCATAATA + +a +s mr.mrrefChr5 17521 133 + 294542 GCCTGGTGTGATGATGGAGAGGGAGCATTCGCTATCTAGCATTAGCTATGTCTACTCCTGGTTATTATACTACATGAGACTTGCCCCCTGATATCAGAACACATGTCAGTTGAAGCCATATGAGGAGGTGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154499 120 + 636262 GCCTGGTGTGATGGTGGAGAGGGA-------------AGCATTAGCAATGTCTACTCCTGGTTATTATACTACATGAGACTTGCCCCCTGATATCAGAACACATGTCAGTTGAAGCCATATGAGCAGGTGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 152184 133 + 647215 GTATGGTCTGATGATGGAGAGGGCGCATTCACTATCTAGCATTAGCTATCTCTACTCCTGGTCATTATACTACATAAAACTTGCCACCTAACATCTCAACACATGTCAGTTGAAGTTATACAAGGAAGTGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 52419 43 - 647215 GCGTAGTGTGATGACGGAGAGGAAGCATTCGCTATCTATCATT------------------------------------------------------------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 17654 485 + 294542 ATGTCAATACTAAGCCCTTAATGATATCTAATGTCTTATTACCACATTGGATAGAAGGTTCATGGACTAAGACATTCAGAGTTGAGTGGAAAAGTTAGCCATAATCCAACCAAAATAGAGAAATTTTGTTAAATTAATACATAGAAGCCCATGTGTCATATTAATAGCAATGCAGGACATTTCAACTATCCAATGAATATATCAGATAAATATGTCTCAAGGACCAGCATAATATGACTTTCAGATCACCACTTGAGTGTCTTAAAATGAATAATAGTGGTCATCAGCTAAGCCAGAAAGATTGTGTAAGTTGTTATGCCAGGTTAGTATCACTCGATAAAGTTACATTTTCTTTTGGGCACTGTACAGTATTTTTGGACTTTTATTAGTACAAGTATAAAATAAATCTATGCAGTTGTTCTAGGGCCCTCAATGTTGTTCATTCATTGATAAGTTCAACATACTCTAAGATAGCTATTTCACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154619 474 + 636262 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TGGGAGAAGTGGTCTTGACTTTGTCTAAAGAATGTGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 153073 39 + 647215 TGTGATAAGTGGTCTTGACTTAGTCTAGAGAATATGATT + +a +s mr.mrrefChr5 18444 36 + 294542 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155425 36 + 636262 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 153112 36 + 647215 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAGCATG + +a +s mr.mrrefChr5 18480 10 + 294542 AGATAGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155523 10 + 636262 AGATAAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 153148 10 + 647215 AGATAGCATG + +a +s mr.mrrefChr5 18490 498 + 294542 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AACGAAGGCATAATTTGAAGGTCCAACAGTCTATACCCAATGTACTACGTAATTTTGTTGGAACTCTTTACACTCTAGACACTGGCAGCCCTCACCTTGTCATACTGCATAATGCATAGTTTTTAGCATTTCATGCTAATTTAAATGACTAGTACCTCATTGCCACCTGAAGACATCCAATGCCATGTTTAAAACTCACATTTGTATCAGTATGGGAATAGGAAGCGAACATAGGAGACCCACAAT---------------ATCTTCTCTATCTTAGGGGTAATCTGCCAATCAAGTGCCCCCTGTTGGGGTAACAACCAGAATTCTGTACATGTAATTTACGCAATCCCAAACACTGTCAGAGGAGGACTGACTTCATGGGATCATTTGACCAAACCTGTGGCAGTATTGAGACAATTGTATTTATCACTGTACACATTTGTGCAAAACATTCAACCAAGCTTGTCAAACAGTAAATAGGCCCACCAATGAGTCATG + +a +s mr.mrrefChr5 18988 344 + 294542 AAGATCGGGCCACAAAAACAGATGAGTCATGAAAGGTCAGGCCACAAAAACAGGACTGAAAGCCTAGGTTCAGACTTAGGATACCTCATTATGTGTAATCTCTCCAATTTCCAGGGAAATAAAGATAGTTGTGGTAAGCTGATCTGGGATGTTTCTATGATTCTTGTCTTTCCAGACCAAGGTGCAATCATGGGATGAGTCTAGGATGATATTAGCAAAGAACAGGATTACTAATTCTCACACCTATACCTAGGTTACACTTATTAATTTTTGACCATATCATATATTCACTGTGTCTCCCGGTCTTACATGTCTAGCTGTACATTTATAACTCCTACAAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156014 323 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 156549 114 + 636262 CCTATCTTGTCCAAAGTGAGGAGAGGTTTAGCACTAATCTATTAGTACTAGTGTCTTACACCAGCTGGGCAGTCTATTGCATCCGCGATCTAAATATTATTACTCAGTTAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 154117 114 + 647215 CATATCTTGTACAAAGTGAAGTGAGGTTTAGCACTCATCTTTCAGTACTAGAGTCTTACACCAGCTGAGTACTCTGCTGCATCCTCTATCTTGATGCTATTATTCAGTTATACT + +a +s mr.mrrefChr5 19636 124 + 294542 CTAAGTCTGGGGATTCACCTGTCTTCCACTATCAATATGAAATAGAAGCTGTCCAATTATATTCTGCACATATGCCAGTTTTGGATAGGATTCAAATCCTGCACACATTGCAGTTCTTGTGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156664 117 + 636262 CTAAGTCTGGGGATTCACCTGTCTTCCACTATCAATATGAAATAGA-------CAATTATATTCTGCACATATGCCAGTTTTGAATAGGATTCAAATCCCGCACACATTGCAGTTCTTGTGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 154231 124 + 647215 CTAATTCTGGGGATTCACCTGTTTTCCACTATCAATATGAAATAGAAGCTGTCTGACTACATTCTGCACATATCCCAGTTTTGGATAGGATTCAAGTCCTGCACACACTGCAGTTCTTGTGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 19760 243 + 294542 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TAGAGCTTGATGGA--ATTTGTGGCACTGGGTTGAGATAAGCCGAT + +a +s mr.mrrefChr5 20825 273 + 294542 TACTTTGGGAATTTGCAATGCAATCTACACCTTGTATGTGAATCCAGAAGCTTAAGGGCTTCAGGATACCACATTTAGCTATAGAGAATTATTGATTGTTATTCTTGTTTTGGTTCCTATGAACCGTGAGTCTCATAGCTGATGCAAAAGTATCGTCACTATTCAGAGGAAAAATCAAAACTCCATTGCACCCAACTTGCCCAATCATGTGTATGAATCCCCACTTGGGTTCAAGTACCAGTAAGTTGCATTATGAGACCAGGTGCCCCATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157908 268 + 636262 ---TTTGGGAATTTGCAATGCAATCTACACCTTGCATGTGAATCCAGAAGCTTAAGGGCTTCAGGATACCACATTAAGCTATATAGAATTATTGATTGTTATTCTTGTTTTGGTTCCTATGAACTGTGAGTCTCATAGCTGA--CAAAAGTATCGTCACTACTCAGAGGAAAAATCAAATCTCCATTGCACCCAACTTGCCAAATCATGTGTATGATTCCCCACTTAGGTTCAAGTTCCAGTAAGTTGTATTATGAGACCAGGTGCCCCATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 155439 273 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 164357 28 + 636262 GCATTTGCCTTTTATTGGAACTTTGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 162114 28 + 647215 GCATTTGCCTTTTATTGTAGCTTTATTC + +a +s mr.mrrefChr5 27246 76 + 294542 GAGGTACTGTGCAACTTCTAAACAATGTTAAAGTTTCATTCACACTAGTACTGGAGGAAATCCTGCATTGAAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164385 76 + 636262 GAGGTACTGTGCAACTTCTAAACAATGTTAAAGTTTCATTCACACTAGTACTGGAGGAAAGCCTGCATTGAAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 162149 76 + 647215 AAGGCATTGTGTAAAGTCTAAACAATGTTAGGGTTTCATTCACACTACCAGTGGAGGAAATCCTACATTGAAGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 27322 10 + 294542 CTAATCTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164461 10 + 636262 CCAATCTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 162294 10 + 647215 CTAATCTAGC + +a +s mr.mrrefChr5 27332 17 + 294542 ATGTAACCTCTTCCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164474 17 + 636262 ATGTAACCCCTTCCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 162304 17 + 647215 ATGTAACCTCTTCCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 27349 126 + 294542 ATTGACCTTTCCAACCAGACTGTAGCACCATACCGTTAGTCTAAACAGAGGTATTTATGCCATCTCACAATGAAAAACCCTGAGTAGTGAAACTTGGTCAGTCAATTGGCATGTCAACTCTGTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164491 65 + 636262 ATTGACCTTTCCAACTAGACTGTA-------------------------------------------------------------AGTGAAACTCGGTCAGtcaattggcatgtcaactctgtgag +s simRat_chr6.simRat.chr6 162329 126 + 647215 ATTGACCTTTCCAACCAGACGGTAGCACCATACCGTTAGTCTAAACAGAGGTATTTATGCCATCTCACAATGAAAAACCCTGAGTAGTGAAACTTGGTCTGTCAATTGGCATGTCAACTCTGTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 27475 85 + 294542 ATGATTATGTGGTTCTTTTAATGAGAGCAGGCTATAGGTTCCATCACATTTAGAGGcttTCAGCTGCAACAGAGGTTCATGGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164556 85 + 636262 atgatttcatggttctttgaatgagagcaggctataggttccatcacatttagaggcttTCAGCTGCAACAGAGGTTCATGGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 162460 85 + 647215 ATGATTATGTGGTTCTTTTAATGAGCGCTGGCTACCCGTTTCATTTCATTTAGAGGCTTTGAGCTGCAGCAGAGCTTCATGGCAG + +a +s mr.mrrefChr5 27560 100 + 294542 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CTTTCACACACTGCCTCACTAGCCCTGGTAAAATTGTGTAAAACTTAAATTATACTCACTCCAAAAATGTCAAAGTTGTCAAGCTAGGGGTTCTAACATTCCAAAGGCATCCTCCCATGGCAAGTTGTATGTAAACTAGATAAGGCAGCATTTTAAAAACTATTCCTACCTTAAATTTTCATTCAAAGACCTACTCGTCCTCCCCTTTCCTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTGAGCCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167785 261 + 636262 CTTTCACACACTGCTTCACTAGCCCTGGTAAAATTGTGTAACACTTAGATTATACTCACTCCGAAAGTGTAAAAGTTGTCAAGCTAGGGGTTCTAACATTCCAAAGGCATCCTCGCACGGCAAGTTATATGTAAACTAGATAAGGCAGCATTTTAAAAACTATTCCTACCTTAAATTTTCATTTAAAGACCTATTTGTCCTCCCCTTTCCTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTGAGCCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 165485 256 + 647215 CTTTCACACACTGCCTCACTACCCCTTGTCAAATTGTGTAAACCTTAAATTATACTCACTCCAAAAATGTCAAAGTTGTTAAGCTAGGGGTTCTAACATGCCAA----ATCCTCCCATGGCAAGTTGTATGTAAACTAGATTGGGCAGTGTTTTAAAAACCATACCTACCTTAAATTTACATCCAAAGACCTACACGTCCTCCCCTTT-CTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTAAGCCTGT + +a +s mr.mrrefChr5 30709 64 + 294542 GTCCTAGGGCAAGATGTATTATGAGTACTAAGTACTGACAGGATATAGGGAATAAGGAACACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168046 64 + 636262 GTCCTAGGGCAAGATGTATTATGAGTACTAAGTACTGACAGGATATAGGGAATAAGGAACACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 165742 64 + 647215 GTCCTAGGGCAATATGTATTATGGGTACTGAGCACTGATAGGATATTGTGTATAAAGAACATAC + +a +s mr.mrrefChr5 30773 13 + 294542 TTGTTAATTACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168111 13 + 636262 TTGTTAATTACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 165806 13 + 647215 TTGTTAATTAATA + +a +s mr.mrrefChr5 30786 18 + 294542 CCTGCCAACTCATCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168124 18 + 636262 CCTGCCAACTCATCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 165822 18 + 647215 CCTGTCAACTCACCATTA + +a +s mr.mrrefChr5 30804 75 + 294542 TGTTATTGTATGTAATGTACCAAACGATAGGCTATCTATTCAAAGCAACCTAGCATAAAGTTGAGGGTGGACCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168142 75 + 636262 TGTTATTGTATGTAATGTACCAAACGATAGGCTATCTATTCAAAGCAACCTAGCATAAAGTTGAGGGTGGACCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 165909 75 + 647215 CGTAATTGTATGTATTGTACCAAATGATGGGCTATCTGTTCCAAGCAACCTAATATAAAGTTAAGGGCAAACCTA + +a +s mr.mrrefChr5 30879 82 + 294542 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GGTAAAGTCCGGTGAAATGCCAATAGATCCCTTCAGTGTGGTGCTCTTGCTCTACCAACTGGCCATGTAGCTCCAAGGGTAACTGAGACGGGGTTAGCCAATAGGGGAAGCCCACAAGTGGCCCTCACAGACAAATATCCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 166346 114 + 647215 GGTGAAGCCAGGTGAAAAGCTGATAGATCCCTTCGGATT--TGCTCTTGTGCTAGTAACTGAGAATGTAGCTGC---------------------------TAGGGGAAGCCCTCAAATGGCTCTCACAGGAAAACATCCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 31423 32 + 294542 GGGGAGGTCTAGAACTTCAGCAGGCACCGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168784 32 + 636262 GTGGAGGTCTAGAACTTCAGCAGGCACCGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 166460 32 + 647215 GGGGAGGTCTAGAATTTTAGCAGGCACTGGCC + +a +s mr.mrrefChr5 31455 47 + 294542 CATTAAGTGTCAAGCTTATTAGCTAGTTTTGACCAACTTGATAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168819 47 + 636262 CATTAAGTGTCAAGCTTATTAGCTAGTTTTGACCAACTCGGCAATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 166492 47 + 647215 CATTAAGTACCAAGCCTATTAGTTAGTTTTGATCAACTTGATAATTA + +a +s mr.mrrefChr5 31502 227 + 294542 TATCTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAGATAACAGGATTTAAAATCAGTTCAATGTTATGGTGGTGAACTGGAGGCCACCATTCAAGGTTCTTAAATTCATACTTGTTTTATTACTTCTTGTGGCAGCTCACATATTGCCTCAAAGACATTCTTTCACATAAAAATTAGAACTTCATCATCCTGTCCCCCCCGAGTAGAGATATGTACAATAAGTGGCGATGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168874 227 + 636262 TATCTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAGATAACAGGATTTAAAATCAGTTCAATGTTATAGTGGTGAACTGGAGGCCACCATTCAAGGTTCTTAAATTCATACTTGTTTTATTACTTCTTGTGGCAGCTCACATATTGCCTCAAAGATATTCTTTCACATAAAAATTAGAACTTCATCATTCTGACAGCCCCGAGTAGAAATATGAACAATGAGTGGCGATGCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 166539 224 + 647215 TAACTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAAATACCAGCATTTAAATTCAGTTCAGCGTTATGGTGGTGAACTGGAGGCCACCTTTCTAGGTTCTTA---TCATATTTGTTTTATTACTTCTTATGGTATATCACATATTGTCTCAAAGACATTCTTTCATATAAAGATTAGAACTTCATCATCCTGTCCCCTCCGAGTGGAGGTCCGTACAATAAGTGGAGATGCACC + +a +s mr.mrrefChr5 31729 19 + 294542 AAAGATTTCCAGGTGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169101 19 + 636262 AGAGATTTCCAGGTGGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 166764 19 + 647215 AAAGATTTCCAGGTGGACT + +a +s mr.mrrefChr5 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AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTAGAAGTACTACACTTAGTTGAAAACTGACAGATAAGTCATACTGTATGCTGGTATAGTGCATTTTCGGCCATGCTGGGAAATTAGAGGTCATGGCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169560 140 + 636262 AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTGGGAGTACTACACTTAGTTGAAAACTAACGGATAAGTCATACTGTATGCTGGTATAGTGCATTTTCGGCCATGCCAGGAATTTAGAGGTCATGGCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 167235 140 + 647215 AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTAGAAGTACTACACTTAATTGAAAACTGACAGATAAGTCATACTGTATGCTTGTATAGTGCATCGTCTGCCATGCTGGAAAATTGGAGGTCATGGCCCG + +a +s mr.mrrefChr5 32331 15 + 294542 CTCTTTCTTTTGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169700 15 + 636262 CTTTTTCTTTTGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 167379 15 + 647215 CTCTTTCTTTTGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 32346 198 + 294542 CATCTTGGGAAAAACAACAACTGCCAAGGGGGGGTAAATTATGAATCCCTTGAGCACCATACATAACCATCCAACCATTCCAGTTATTAGGTATCAACTTTGCCTTTGCTCATCTTGTATTCCTCTTGAACACTTTTACACCATCCTGACAGCCTTTGAATTTAACAGACAGGCAATCTAGACAGCCTCTTAACCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169715 198 + 636262 CATCTTGGGAAAAACAACAACTGCCAAGGGGGGGTAAATTATAAATCCCTTGAGCACCATACATAACCATCCCACCATTCCGGCTATTAGATATCAACTTTGCCTTTTCTCATCTTGTATTCCTCTTGAACACTTTTACACCATCCTGACAGCCTTTGAATTTAACAGACAGGCATTCTAGACAGCCTTTCGATCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 167396 197 + 647215 CATCCTGGGAAGAACAACAACTGCCAAGGGGGGCTGGATTATGAATCCCTTGAGCATCATAAATGACCATCCAAGCATTCCAGTGATTAGGTATCAACATTGTGCTCGCTCTTCTTGTATTCATCCTGAACACTTTTACACCATCCTGATCACCTTTGAATTGAA-AGACAGCCAATCTGGACAGACTCTTAACCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 32544 23 + 294542 ATGGAAACAATTTAAAGCAAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169913 23 + 636262 ATGGAAACAATTTAAAGCAAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 167601 23 + 647215 ATGGAAACAACTTAAAGCAAATA + +a +s mr.mrrefChr5 32567 86 + 294542 GATAGTTTGCTGTTGAGAGCTTTGACACCACAGAGCAAGAGGAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAGCCATTAGGGCAAGCTTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169936 86 + 636262 GATGGTTTGCTGTTGAGAGCTTTGACACCACAGAGCAAGAGGAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAACCATTAGGGCAAGCTTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 167628 67 + 647215 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294542 CCACTTCATATTATGTGTCTGTATCTTTGATTTGCAAGAATAGTGTTTCCTAAGAGTGGCTGCCTTCTGAGAGCCCTCCTCAAATGGATGTTATACAGCAAGAGTGCATGAGTTGAAAACATTGTGCATCCTGAAGAGAAAAAGAATGGGATTATGGAAATTAAACTGTCAAATTGCAGTGTAGACATAGAAACTACTGCAAATCTTCAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170185 209 + 636262 CCACTTCATATTATGTGTCTGTATCTTTGATTTGCAAGAATAGTGTTTCCTAAGAGTGGCTGCCTTCTAAGAGCCCTCCTCAAATGGATGTTATCCAGCAAGAGCGAACGAATTGAGAACATTGTGCATCCTGAAGAGAAACAGAA---GATTATGGAAATTAAACTGTCAAATAGCAGTGTAGACACAGAAACTACTGCTAATCTTCAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 167854 212 + 647215 CCACTACATATTATGTGTCTGTACCTTTGATTTGCAAGAATAGCGTTTTCTAAGAATGGTTGCCTTCTGAGAGCCCTCCTGAAATGGATGTTATACAGAAAGACTGCATGAGTCGAAAACATTGTGCATCCCGAGTAGAAAAGGAATGGGATTATGGAAATTAAACAATCAAATTGTAGTGTAGACATAGAAACTGCTGCAAACCTTCAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 33020 125 + 294542 CTGATGTGGTCCACTAATCAATACACCTACAATCTACTTCTCTAACTAATCCGGCCCCTTGCAGTGCACAAATACAAATTACTGCAATCTTAGATGAACCACTGGCTGTAGTCCACTAATTAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170394 125 + 636262 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GAGCCCCCTTCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTCATGCGGGCCCCGTCAGTTTGGGATGTGTCATGTCCAGCCATAGGCGATAAGGCCAAGTCTATAGAGCTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170640 130 + 636262 GAGCCCCCTTCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTTATGCGGGCCCCATCAGTTTGGGATGTGTCATGTCCAGCCATAGGCGATAAGGCCAAGTCTACAGAGCTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 168314 130 + 647215 GTACCCCCTCCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTCCTGCTGGCCCTGTCAGTTTGGGGTGTGTCATGTCCAGCCATAGGTGATAAGGCCAAGTCCATAGAACTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT + +a +s mr.mrrefChr5 33391 76 + 294542 ACTATCATGAGTGTACTGATGGGTCTAGACAATTTGCATGTCTCATAATGGATTGCTTACACCTAAATGTTGAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170771 76 + 636262 ACTATTACAAGTGTACTGATGGGCTTAGACAATTTGCGTGTCTCATAATGGATTGCTTACACCTAAATGTTGAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 168444 69 + 647215 GCTATCATGGGTGTACCGATGGGTCTCGACAATTGGCATGTCTCATAATG-------TACACCTAAATGTTGAATT + +a +s mr.mrrefChr5 33467 564 + 294542 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TGACAGAGATGCAATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAACATATAGTCTTCGATATCTATGTGACTTCAATCAGTGATATCCCTATCCCAAAATCCCATTGGAACTAGGAGGGCTGACTGATTGTTCTTGTTCTA--GAATGCTCTCACTCCACAACTGTAATGAGAGAAAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGAGAGTGTGAGCG--------CACCTTCCTGTTTCTCACTGAATTACTTAACCTACAATAATGCCACAACTACCTTCGCAAAACAAGTCAGTATCTCAAATAACCTAATAGACACAAAAGAAACAGCTATTAGCATTCCATATGTCCAACCAGCAATGTGCTCCATGAGAGGGAGTTTTTAAACTAAGTCATCTCCTTTACATCCATCCTCTATTTATCTAGTGGAATCCACTAGTAACTATTCTTCCCTTCAGGAGTAACATTATCTTATGGATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTATATAAGTCACCCCCATTAGTCAGAAATATGTCCGGTTGTTTGTAAGAAAGGTCTGAATAAGATAGTAAATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 168514 544 + 647215 CGACAGAGATGCGATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAATGGACAGTCTTTGACATCTATGTGATTTCAACAAGCAATATCCCTATCCTGAAATCCCATTGGAACTGGGAGGACTGATTCATTGTTCTTGTTCTATTGA---CTATCCCTCTGCAATTGTAAGGATAACTAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGGGAGTGTATGTGCAGTGCCTCACATTCCTGTTTCTGACTGAACTACTTAACCTAAAATAATGGA------TGCTTTGCAAAACACCTCAGTATCTCAAAAATCCTAATAGACACAAAAGAAAAAGCCATTACCAGTCCATATGTCCAAGCAGCAGTGTGCT----------GAGTTTTTGAACGAAGTCATCTCCTTTACATTCATCCTCTATTTATCTAGTGGGATCCA-GAGTAACTATTCTTCCTTTCAGGAGTAACGGTATGGTATGAATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTGTATAAGTCACCCCCATTAGGTAGAAATATGTCCAGTTATTCGCAGGAAAAGTCTGAATAAGATACTAAATGTG + +a +s mr.mrrefChr5 34031 229 + 294542 CCTACAGTGCCATGTTGCGTAGTTCAAATAAGTCAGGAAAAAGCAGAGTTGTGGTTCGATGCAGACATGGGTATTACGGTGCATTTAATCTTCCCTCATTTTGAGACTAATAAGGTTAAGAGTGAAAGGTAAACCAGACAAATAACTCAGAATGGAAGGCAAATTTACATCCTAGCTTAGCCATAATACTTACAAAGTGGAAAGTTTAACGTCAAATTATGCATTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171415 223 + 636262 CCTACAGTGCCATGTTGCGTAGTTCAAATAAGTCAGGAAAAAGCAGAGTTGTGGTTCCATGCAAACATGGTTATTACAGTGCATTTAATCTTCCG------TGAGACTAATAAGGTTAAGAGTGAAAGGTAAACCAGACTAATAACTCAGAATGGAAGGCAAGTTTACATCCTAGCTCAGCAGTAATACTTAAAAAGTGGAAAGTTTAACGTCAAATTATGCATTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 169058 172 + 647215 -------------------------------------------------------TCGTTGCCGATATGGGTATTACGGTGCATTTAATCTTCCCTCATTTTGAGATTAACAAGATTAAGAGTAACAAGTAAATCAGACAAATA--TTAGAATGGAAGGCAAATTTACTTCCTAGCTTAGCCATAATACTTACAAAGTGAAAAGTTTAAATGCAAATTATGCATCTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 34260 74 + 294542 TGTCGACTGAGGAGATCCGAGTGGCCAATGGATGTGGAGACAGTTTTTTAGTGCCCACCTGTTTTCATAAGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171638 73 + 636262 TGTCGACTGAGGAGATCTGAGTGGTGAATGGATGTGGAGACTGTTTTTTAGGGCCCACCTGTTTTTATAgtta- +s simRat_chr6.simRat.chr6 169236 74 + 647215 TGTTGACTGAGGAGATCCAGGTGGCCAATGGATGTGGGGACAGTTTTTTGGTGCCTACCTGTATTCATAAGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 34334 36 + 294542 ATATCTTCTCTGCTGCAGTAGATCTCCTAAATTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179059 36 + 636262 GTGTCTTCCCTACTGCAGTAGATCTCCTAAATTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 169310 36 + 647215 ATATCTACTCTGCTGCAGTAGATCTCCTAAATTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 34370 27 + 294542 GATTACCTCCCCCTTTTCAATTACTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179095 27 + 636262 GATCACCTCACCCTTTTCAATTACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 169347 26 + 647215 TACTACCTCCCCGTTTTCAATTACTT- + +a +s mr.mrrefChr5 34397 117 + 294542 CAGCCAAATAATATCATGAACATCTCAGAATTTACCACTTGGGTGCACATGCTCTACTAGTTCACTAGCTCCTGTGGCAGGTTACAAAAACAGCCAGCCCAGGATTTGGGGATATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179133 117 + 636262 CAGCCAAATAATATCATGAACATCTCAGAATTTACCACTTCGGTGCACGTGCTCTACTAGTTCACTAGCTCCTGTGGCAGGTTATAAAAACAGCCAACCCAGGATTTGGGGATATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 169373 112 + 647215 -----CAATAATATCATAAACATCTCCGAATTTGCCACTTGGGTGCACATGCTCTACTAGTTCATTAACTCCAGTAGAAGGTGACAAAAACAGCCAGCCCAGGATTTGGGGATATAC + +a +s mr.mrrefChr5 34514 99 + 294542 GTAAACCATTTCTTGCTGCATTTAGGGCAAGACTTTTGACCTCCTCCTGACACCATGATGCTACTGCAGAGACCTGGTATAATGCTACATTCTTATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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CACAAGCTTATACTGCTCTCCTTAGTGTTTTTATGGCCAGACACAGAACAAACTCTTCATGTTGTGCTTAATGTTGGATATGTGCTTCTGAGCATGCCTGTTTTTGAGTAGTTACTCAAGGATGTATTTTGGCTTAGGTAGAGTGGTAATAAGGTTGCATACATACACTGCCAACATTGTTTGACTTGTGCATTAAGCTGACCACAACTCAAATTTAACCTGGCTGTCCCATATACCTGTCCAATCTGCACTCTCTTATCCATTTACAGTTTCTTTCCTGAAGGCCTGAAACCCTAACTTGTCAGGCACACACTTAGACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179443 320 + 636262 TACAAGCTTATACTGCTCTCCTTAGTGTTTTTATGGCCAGACACAGAACAAACTCTTCATATTGTGCTTAATGTTGGATATGCGCATCTGAGCAAGCCTGTTTTTGAGTAGTTACTCAAGGATGTATTTGAGCTTAGGTAGAGTGGTAATAAGGGTGCATACATACGCTGCCAACATTGTTTGACTTATGCATTAAGCTGACCACAACTCAAATTTAGCCTGGCTGTCCCATTTACCTGTCTAATCTGCGCTCTCTCATCCATTTACAGTTTCTTTCCTGGAGGCCTGAAACCCTAACTT-TCAGGCACACACTTAGACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 169679 321 + 647215 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TCGGATCATCAAACACATATTTTGACTCTACGTATACAAAGAGAATTTGCAGAGTAAAAATCTCTCAACATGAAAGTGGAGCTCCCATGTTGTGCGTGGTGCACTGTGCATGGGCACAATGAACAGCTGCAGCGTAGTATCCCTCTGACTGTTTACGACTACAATGGCACATGCTTTGTTTCTACCTACAAACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180133 196 + 636262 TCTGATCATCAAACACATATTTTGACTCTACGCATACAAAGAGAATTTGCAGAGTAAAAATCTATAAACATGAAAGTGGAGCTCCCATGTTGTGCGTGGTGCACTGTGCATGGGCACAATGAACAGCTGCAGCGTAGTATCCCTCTGACTGTTCACGCCTACAATGGCACATGCTTTGTTTCTAGCTACAAACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 170334 174 + 647215 TCGGCTCACCAAACACATATTTTGATTCTATGTATACAAAGAGAATTTGCAGAGTAGAAATCTCTCAACATGAAAGTGGAGCTCCCACGTTGTGTGTGGTGCACTGTGCATGGACACGATGAACAG----------------------CAGTTTATGACTACAATGGGACATACTTTGATTCTACCTACGAGCAAC + +a +s mr.mrrefChr5 35579 6 + 294542 ATACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180329 6 + 636262 ATACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 170509 6 + 647215 ATACAG + +a +s mr.mrrefChr5 35585 66 + 294542 CAGAGCACAGTCCATCTTTAGAAAGTCAAAACTGCAAAATAGGGTAGGTCTCTAAATGCTCTGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180336 66 + 636262 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tgtttacatactggcccctccctcaggttATGCGTACCCTGAGTGGAATAATataagacagctgtgttaattctccaattaagtcaagttgcacaggtgccgcaatcattctgcactacctatttatggtcctaccccttagactgagggtaatatgtaccttcaaagtggctggatttctctcaagtatggtcctcccaacagagtcatggttgaccctccacttatatatctaagtgtg--ccttctcctttaggtatttaaggtgaggctaagctgatcttttaagggggctgcttaggtgttgctacaatacagtacacttttgtga-----ttcctgcagtatttctaggttgatcaaagcaaaaaccactataaagataataagaaggtaccttttcctatttaattgccaccttggc + +a +s mr.mrrefChr5 37540 21 + 294542 cagagacatctgaccatgtaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182315 21 + 636262 cagagacatctgaccatgtaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 172586 21 + 647215 catagaaatctgactatgtag + +a +s mr.mrrefChr5 37561 199 + 294542 aaggtatccaggtcccttgctcatttattaaatcattcttatcaggtatctgtgaaattttgcctgcatagccagtctctttcagacaaataagtggcagatataacactcagtttgttggtcaggattggtcatggtcttttctttttttgtctttaccttccttcagccaattagggcccctaacttgatattagtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182336 199 + 636262 aaggtatccaggtcccttgctcatttattaaatcattcttatcaggtatctgtgaaattttgcctgcatagccagtctctttcagacaaataagtggcagatataacactcagtttgttggtcaggattggtcatggtcttttctttttttgtctttaccttccttcagccaattagggcccctaacttgatattagtg +s simRat_chr6.simRat.chr6 172608 199 + 647215 agggaatccaggtcctttgcccatttattaaaacattcttagcaggtatctgtaaaagtttgcctgcatagctagtctctttcaaatgaataagaggcaaatataacactcagtttgttagccaggtttggtcctggttttttccttttttgtctttacgttctttcagccagttaggaccttaaacctgatattagcc + +a +s mr.mrrefChr5 37760 14 + 294542 cgctctcactcaac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182537 14 + 636262 cgctctcactcaac +s simRat_chr6.simRat.chr6 172807 14 + 647215 cactctcactcaat + +a +s mr.mrrefChr5 37774 27 + 294542 ttgcatccattttaggccccttgagca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182551 27 + 636262 ttgcatccattttaggccccttgagca +s simRat_chr6.simRat.chr6 172825 27 + 647215 ttggctccattttgggcaccttaagca + +a +s mr.mrrefChr5 37801 8 + 294542 taggtccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182579 8 + 636262 taggtccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 172852 8 + 647215 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taatcaaaggtattagatctgtacattttatttgcagaacaatatgtttatgtgcatgggtttaccatcttcaggt + +a +s mr.mrrefChr5 38411 34 + 294542 gaaaacattgagcctatagacccatgaacgacta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183226 34 + 636262 gaaaacattgagcctatagacccatgaacgacta +s simRat_chr6.simRat.chr6 173482 34 + 647215 gtaatcattgagcctattgatccatgaactaata + +a +s mr.mrrefChr5 38445 54 + 294542 aacatatataaagtcatatatcttgatcgtatgcacttgatgccttgggtaaac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183260 54 + 636262 aacatatataaagtcatatatcttgatcgtatgcacttgatgccttgggtaaac +s simRat_chr6.simRat.chr6 173540 54 + 647215 aacatatataaagttacatatcctgatcatatgtacttgatgtcttgggtaaac + +a +s mr.mrrefChr5 38499 22 + 294542 ggggggttcattcatctggaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183315 22 + 636262 ggggggttcattcatctggaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 173594 22 + 647215 ggggggttcattcatctggaat + +a +s mr.mrrefChr5 38521 85 + 294542 caatggtcagaggttactacactaggctctcgattgggctTGCCTGGGTGAAAGACTAAAGGAGACCTCAGAACTTGTGCTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183347 85 + 636262 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TGAGATTGATCCTTTAAGACAGCATGCCCTGTTAACCTGATGTTGGTCCATTAAGACAGCACATATAATGAACTCAGCACTTTATATCTCGTGGACCGCTTACCGGATGTTATTGGCTAATCCAAGCATACATGCAAAGCTTTGCCAGGCCCTTGAGCAGAAAAGAATGTGTTGCTGCATCCGTTGTGGGAGCAGATTTAAGCTGATGACCGCTCCTGTTATATACCAATTACGGTTACCCAGATTCAGGCACAGTCTGACCCTTTCAAGACTTCTTCTAGACAACATACCTCTCCTAAAGTC-----------------CTAAGATGGGTGTATGATGAAAGGACACAGAAGTATAGCCCTGCCATAGCACATTAGGTGCAATCAGGTGTAGGGAGATTGTTGGTAAGTGTCCTGGGGCACCACTGTAGCCCGTAATGACTTGCCCAGTTGGCTGGCACACAGTGGATATTG-----GTTAATTTAAGCGCGCGACGGACTAATGAAGGGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 182515 504 + 647215 TGAGGTTGATCCTTTAAGATAGCAGGCCCTGTCAACATGATGTTGGTCCTTTAAGACAGCACGTATAACGAACTCAATACTTTATGTCTCATAGACTGTTCACCGGATGTTATTGGCTAGTCCAAATATACATGCAAAGCTTTGCTAGGCCCTGGAGCAGCAAAGAATGTGTTGCTGCATCTGTCCTGTGAGCAAATTTTAGCTGATGGCCACTCCTGTTATAAACCAATTAAAGTTACTCGGACTCAGGCACAGACTGACTCTTTCAAGACTGCTTCTAAAGAACATACATCTCCTAAAATCATAAGATGGGTAAATCGTTAAGATGGGTGTACGAAGAAAGGACACAAAAGTA--------CTGTACCACATTAGGTACAATCATGTGTAGGGAGATTATTGGTGAGTGTCCTGGGCTACCACTGTAGCCCATAATGACTTGCCCAGCTGGCTGACACACAGTGGATATTGTAGCTGTGAACATAAATGTTCTATG--CTGATCAATAATCA + +a +s mr.mrrefChr5 47725 10 + 294542 TGTGAACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192825 10 + 636262 TGTGAACATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 183019 10 + 647215 TCCAGACACC + +a +s mr.mrrefChr5 47735 230 + 294542 AATGCAATCCAACCTACCAATCTACATATCCCAAGAGGAGTGCTGCCCAGTAAGTCTCCAGAAAACAATAGGAAAAATCCATGTATTATTCTGTTTATTTGGTTTCTCACACATAGGTGGCCCAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCTGCTCAGGTGCTCTTCAGGGATAGAAATATTCCCAGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTGATATCTCAGAGGCTGTATCAATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192835 230 + 636262 AATGCAATCTAACCTACCAATCTACATATCCCAAGAGGAGTGCTGCCCAGAAAGTCTCCAAAAAACAATAGGAAAAATTCACGTATTGTTCTGTTTGTTTGGTCTGTCACACATAAGTGGCTCAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCGGCTCTGGTGCTCTTCAGGGATAGAAATATTCCCAGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTGATATCTCAGAGGCTGTATCAATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 183030 226 + 647215 AGTGCAATCCAATCTACAAATCTACATAT----AGAGGAGTGCTTCCGAGTAAGTCTCCAGAAAACAATAGGAAAAATCCGTATATTATTGCAATTATTTGGTTTCCCATACATGGGTGGCCTAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCTGCACAAGTGGCCTTCAGGAACAGAGATATTTCCGGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTTATATCTTAGAGGCTGTATCAATGCT + +a +s mr.mrrefChr5 47965 23 + 294542 TCACGGCTATGACTGTGGGTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193070 23 + 636262 TCACGGCTATGACTGTGGGTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 183256 23 + 647215 TCATGTCTATGACTATAGGTTCG + +a +s mr.mrrefChr5 47988 135 + 294542 GGAAAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTAAGCATAAGGACTCTATGAGAATGATTGCTTTTCTGATGTAGGAGTGGGGCCACCTCCCTACTAAGTCTGGAATGCAGCACATACATCCTCATCTATTAGGCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193093 135 + 636262 GGAAAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTAAGCATAAGGACTCTATGAGAATGATTGCTTTTCTGATGTAGGAGTGGGGCCACCTCCCTACTAAGTCTGGAATGCAGCACATACATCCTCATCTATTAGGCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 183290 135 + 647215 GGACAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTCAGCATGAAGAAACTATGAGAATGACTTCTTTTCAGATGTAGGAGTGGAGCCATCTCCCTTGTAAGTTTGGTACGCAGCACTTATGTCCTCCTCTATTAGGTATAA + +a +s mr.mrrefChr5 48123 63 + 294542 AAAGGGGGTGGTTCTGCATGACTAAGGGCAAATACTTCTAGCTCTTTATATTTGGTGAAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193228 63 + 636262 AAAGGGGGTGGTTCTGCATGACTAAGGGCAAATACTTCTAGCTCTTTATATTTGGTGAAGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 183426 63 + 647215 AAAGGGGGTCTCTCTGCATGACTCAGGGCAGATACTTCTACCTCTTTATATTTGGTGAAGCAG + +a +s mr.mrrefChr5 48186 83 + 294542 AGACCTCTGTTTTATTTTATCAATCTACATTTGGTCTAAGCCTCAGCAGCCCTAATAACCCTTTGGGCTGGGGACATGGAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193291 83 + 636262 AGACCTCTGTTTTATTTTATCAATCTACATTTGGTCTAAGCCTCAGCAGCCCTAATAACCCTTTGGGCTGGGGACATGGAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 183492 83 + 647215 AGACCTCTTTTTTATTTTGTCAATCCACATTTGGTTAACGCCTCAGCAACCCCAATAACCCTTCAAGCTGGGGACATGGAACC + +a +s mr.mrrefChr5 48269 20 + 294542 TTATGTCATGGCTTCACGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193375 20 + 636262 TTATGTCATGGCTTCACGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 183575 20 + 647215 TTATGTCATGGCCTCATGCA + +a +s mr.mrrefChr5 48289 205 + 294542 TACGAATGAACCTTTCAGGTTAATGAAGTGGGAGTACAACTGCTTTACCATTGTAGGCTTCTGTTATTACGGGGTGGAATCTCAAGGGTTTCAAAAACCCCAGGCATTACTCGATCAACTTATATTGTGGGCTTCATCTACTTCAGTCATGACTTTAGCAGGTGTACAAATGCTTTAGGCTCGAGAAGTGGGAGAATAAACTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193413 205 + 636262 TACGAATGAACCTTTCAGGTTAATGAAGTGGGAGTACAACTGCTTTACCATTGTAGGCTTCTGTTATTACGGGGTGGAATCTCAAGGGTTTCAAAAACCCCAGGCATTACTCGATCAACTTATATTGTGGGCTTCATCTACTTCAGTCATGACTTTAGCAGGTGTACAAATGCTTTAGGCTCGAGAAGTGGGAGAATAAACTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 183595 205 + 647215 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TCACAGTGACCACGCCTGTTGTAAGTACCTGTTGTTAGAATTTCAACATATGGTTCACATCCACCCATTAAACCTTCCATTTCAGTAACTGGAAGGTCCTAATGTTGCTGTGATATTATAT-CCATTTCACAGCATACTGAGTCAGTTATTGCTTGCAGTACTCACTAAGATCTAAATTAC-ATAGTAAACCTGACCCTTATCTGCATAGGGATATAATGGACTCACTACAAATCAACTCAGAAGGGTCCATCTCAATTGTACAAATTCTCTACCTTAGCACATGGAGCAAAATCCATCTGCTAGGCCAGGAAAAATTGCAAGGTCAGTGGTTTTAGCTAAGCTGGGGGAAAGAACAATCAATTAATATTGAAAATACCAAATTCATGGAGAAGACTTATATACCCTCATTAAACTGATCTTAGGATACATTAAGCCTCTACAATACTGAAGTGCAGGTTATATGTGTTTGAAGGCAGGGGAGAAATAAAGAGTTTTCTCATGCAATGATGTACCAGTTAAGTACCCTCATTCACCTGCATCAAAATAATGAGGGAGTTAAATCACTCATATTTACTGGTTTAAGTTGCCACGCTGCTTATATAGAGAACATATCAACAACATAGCACTATGGCATGTACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 185182 577 + 647215 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GACAATTTAGTAAGCATCAAAATTAAAAATCAGCCAATCAGTT--GCCTG---TGTTTGTACTCCCCTTGATTCTTTAATAGATAGCTTTTTATGTGCAGATGGTGATGATGTTTCTAGAGGGTGGGGGAAAGCTAATTAGTGGTCTTGGTTATGTCTACTGAAGTGGCACAGTCTCTTGGCACTAAGTTGTGATTTACATAAAGTCAAACTTGAAAATCTGCAAGCACAAACTATGTTGTATAACCCATCATTATGCTGATGCTGAACAATAAATCAAAACCAACTGCCCACAACACTTTTTCAGCCGAGTGGGGTGTTTGTGTATAATCAGTATTAAGATGGGTTTGATATATACGGTGGCCTGGTGAGAGCCTGATCTTTGAGAATCTCTTCTTAGTTCAACTCTTTAGTTCAACAAAAATGTAGATTTTCAATCTCACCAATAATTTCAATCACTACCAGTATCCTGGCAGTAGTTTGGGAAGGGCCCAATACATATGATAAGCTACCACTGTCCCCGTGTGTCTTATTT--AAGTTTTAATAGGTGATGTCAGC------AAAC-CCTGTCAGTAAAAATTTTCAACTTTGTATAATTTATGTCAGTCTGATTATGCTAGGCTTGAAAGCCTGAGGCCTTCCCCCAGCATTAGT + +a +s mr.mrrefChr5 58134 7 + 294542 GATCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203472 7 + 636262 GATCCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 193592 7 + 647215 TATTCGT + +a +s mr.mrrefChr5 58141 37 + 294542 TTTATTATTACCTGGGGAGAAATTCAATGCGATTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203479 37 + 636262 TTTATTATTACCTAAGGATGAATTCAATGCGATTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 193650 37 + 647215 TTTATTAATACCTGGGGAGAAAGTCAATGCAATTTGG + +a +s mr.mrrefChr5 58178 13 + 294542 TTCATGCAGGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203517 13 + 636262 TTTATGCAGGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 193687 13 + 647215 TTCAGGCAGGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 58191 261 + 294542 GATCAGACCAGTCCCTCTAAACAACCTTATTGTTACCTAAAGGACATTGAGGTTTCTATCAAGATTGAATAACAATGGAAAGAAATGGGGAAGATGTACTTTATAAGTTAGTCTCAGACAGTTCTACACTTGATGTAGGTTGAATGAGATTTCAGATAATAAAAAGAGAAGGTCTGACAGTTCCTATCTTTAGGGTAAACAATTCTCTTGAAGTGAAGCATGTGTGTAATGACTGATGATTTGTTCAGTTATTCTGTGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203530 248 + 636262 GATCAGAACAG--------AACTACCTTATTGTTAACTAAAAGACATTGAGATCTCTATCCAGATTAAATAACAATGGAGAGAAATGGTGAAGATGTACTTTATAAGTTAGTC-CAAAGAGTTCTACACTTGATGTAGGTTGAATGACATTTCAGATAATAAAAAGAGAAGGTCTGACAGTTCTCATCTTTA----AAACAATTCTCTTGAAGTGAAGCATATGTGTAATGACTGATGATTTGCTCAGTTATTCTGTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 193787 260 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 194071 235 + 647215 TTTCTCCAGTACCACACAAAATCATGCTATGTACTGGAGATTTGACCAGTACAGTTATGGGTCATGAAGTGTCAATATGTCCAGGG-CATATGACGTCCTCACTCGAAGGTATATTTGTATGATGTGTGATG---------CCCTAACAGAATCTTTTTATAGCTATGACACTATGTAAATTATGACTTC-TTGAAGGGAAAATGACTGGCTAAAATTCCCATGTGTTGACCATTGGAGTGCATTG + +a +s mr.mrrefChr5 58702 39 + 294542 TGCTTTTGCAGACCATTGTTGCCACTACATCTATGGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204027 38 + 636262 GGCTTTC-CAGACCATTGTTGCCACTACATCTATGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194317 39 + 647215 TGCATTTGCAGCCCATTGTTGCCACTACATCTATGGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 58741 208 + 294542 AGTGATGGACCTGTGGCAGAACATATACTTCCTTTCTATAGGAGTCACATGTTTGAGGGCCTGAAGGATGTGTGGCTAACCCCTCCATTGAAGCTTTCATGGATCTAGTGATAAACTTTTATCTGGATGGCACTTCAGCAGACTTCACACACTGTAGCTATGCCACACATCAGGGGTGTCATAACTCTAATTACCAGTCAGTCATGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204180 197 + 636262 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CTGTAACCCTGGAAACTGAAGCATGCG + +a +s mr.mrrefChr5 59822 22 + 294542 TGTCTGAAATCAGACTGTGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205203 18 + 636262 ----TGAAATCAGACTGTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 195495 22 + 647215 TGTCTGTAATCAGACTGTGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 59844 92 + 294542 CCTGTGGTGCATTGCTACATAGAGGATTTACGATGCTTACAGCATACTTATCTACATAACACAGTACCCACATTCCCTATTGAATTGCTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205221 92 + 636262 CCTGTGTTGCATTGCTAGATAGAGGATTTATGATGCTTACAGCATACTTATCTACATAACACAGTACCCACATTCCCTATTGAATTGCTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 195518 92 + 647215 CTTGTGGTGCATTGCTACATAGAGGATTTACTATGCTTACACCATACTTATCTACATAACACAGTACCCACATTCCCTATTGAATTGCTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 59936 40 + 294542 TTGAGGCTACACACCATGATGTTGTGCCGCTTGAGCCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205313 40 + 636262 TTGAGGCTACATACCATGATGTTGTGCCGCTTGAGCCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 195615 23 + 647215 TTTAGGCTACACACCATGATATT----------------- + +a +s mr.mrrefChr5 59976 103 + 294542 GCTTTCATTCTTTAGGCATCCTTCGATAACCTTGTGGGGACGACACTGGCTGCCCTGAATTCTTTACTTCTTAGCCAGTTCACTGACTTCAGAGAGTCGGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205354 103 + 636262 GCTTTCATTCTTTAGGCATCCTTCAATAACCTTGTGAGGATGACACTGGCTGCCCTGAATTCTTTACTTCTTAGCCAGTTCACTGACTTCAGAGAGTCAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 195638 95 + 647215 ----TCATTCTTTAGGCACCTTTCGATAACCTTGTGGGTACGACACTGGCTGTCCTAAATTCTTTACTTCTCAGCCAGCTTGCTGAC----GAGGATTGGAGG + +a +s mr.mrrefChr5 60079 38 + 294542 TTTTACAGGCTTGCTGTGATAACACCGCAGTATGTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205457 38 + 636262 TTTTACAGGCTTACTGTGATAACACTGCAGTATGTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 195734 38 + 647215 TTTTCCAGGCTTGCTGTGATAACACCGCAGTATGTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 60117 355 + 294542 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TGAGCATGTTGGTGGAGCAACATATTACTAGTCAGACAAGGCAGTAAGCTGGTTATTTTTAACCATACCCTTAGCCTTAGTGGTCTAGACCAAATCCTCTTCTAGACCAAATCCTTTTGGTTTGTCCCCAAAACAAAACAGGGTAGTGGAGTCTCACTTTCCTGCTTGGTGTGACTATCCCTTGTAAC-AAACCTCAGGATGCAAAATAAAAGCAGTCTTCAAGTCCCCATCTTATATCTGAAAAGAAGAAAGGATGTATGAATTTGGTTATGATATCCGGCTGAGTTTTGTGCCTAGCTTGATATATTTTTTTCCCTTGGCTGCAATAATGT-TCCCTGCCTTCCTTTGCCAGC + +a +s mr.mrrefChr5 60472 694 + 294542 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ATAGTTAAGCCACATTTGGTCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 208753 20 + 647215 ATAGTTGACCCACATTTGGT--- + +a +s mr.mrrefChr5 72328 118 + 294542 AACTACCCCCATGCAAGGCATCCCCAGATGATTCTGGTAGGCCAGTAGCCACCTTAGGTTTAAGAAAGCAAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTTGATGTACTCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217799 118 + 636262 AACTACCCCCATGCAAGGTATCCCTACATGATTCTGGTAGGCCAGTAGCCACCTTAGGTTAAAGAAAGCAAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTTGATGTACTCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 208773 102 + 647215 ----------------TGCATCCCCAGATGATTCTGGTAGACCAGTAGCTCACATAGACTTAAGAAAGCGAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTCGACATACTCTTG + +a +s mr.mrrefChr5 72446 47 + 294542 GTGCTGAGGAGGGGGGAGCACCTAGTGTGAGACTGTGAATATTTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217933 47 + 636262 GTGCCAAGGAGGGGCAAGCACCTAGTGTGAGACTGTGACTATTTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 208875 47 + 647215 GTGCTGAGGGGAGGGGAGCACCTAGTGTGAGACTGTGAATATTTCTC + +a +s mr.mrrefChr5 72493 92 + 294542 CTGCTTGGATTTGCTCTTTCACCCCAATAACTATCAGAATGGCAGATGCTCTAAGCCAAATGAGGAGAAACTGATTACCAGCAGGACCGGTC 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simRat_chr6.simRat.chr6 209014 283 + 647215 TGCTTGTGGTGGGGTGGTTAAGTACATGTATCAGGACCTCCCATTTCACTTGATTTCAACCTGATTTATCAAATCCTCTGTCACTTCCCACATGAATGGCATCAAATTGGGAATCTTTGAGTTGTATTACATC------CTAA-----------GATATTAAAAGTCTATATTCCCATTGAGCAACTTGGAGTGATAACCATCACTAAGCAGTTTAACAGTTGAGGGATAATCCCACCAACCAAAGTGATTGCACAATTGAGGAAACACACCAAGTGGCAACCTAACAAATGCGAGCATT---- + +a +s mr.mrrefChr5 72889 32 + 294542 AGAATGTTTTAAATGTGGGTAGGCCACAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218386 32 + 636262 AGAATGTTTTAAATGTGAGTAGGCCACAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 209297 32 + 647215 AGAATGTCCTAAACGTTGGTAGGGCCCAACCA + +a +s mr.mrrefChr5 72921 112 + 294542 TGTTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTCCATAGGCAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCGTATGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218425 111 + 636262 TGTTGATTGTAATTTTCAACAAGAACTTTAATCTTTCTCTAT-GGCAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCGTATGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 209329 109 + 647215 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TACAGTCATTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTCCCTTGGACCTTGGACCACCACGATCAAGGGCCCTCACTACCTATCTTTTACCTCATTTGCACTTGCAAGTATAGAGAAGCTAGGCTCTCTAAGGAGGTCAGTCTGAGACTCCAATGGTTTAGTTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218682 186 + 636262 TACAGTCGTTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTCCCTTGGACCTTGGACCACCACGATCAAGGGCTGTCACTACCTATCTTTTACCTCATGTGCATTTGCAAGTATAGAGAAGCTAGGCTCTCTAAGGACGTCAGTCTGAGACTCCAATGGTTTAGTTTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 209620 146 + 647215 TACAGTCATTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTC-------ACTGGGATGACCACGATTAAAGGCCCTCACTACCTATCTTTTACCTCTTTTGCACTTGCAAGTATTGAGAAGC-AGGCT------GGAGGTCAGT-------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 73363 21 + 294542 AGAACCCATGACATTATATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218870 21 + 636262 AGAACCCATGACATTATATCT + +a +s mr.mrrefChr5 73384 59 + 294542 AGACTAACTGTGATGCTGGTAGAGGAACATACCCATGCATTTATCACCTTACAATTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218892 59 + 636262 AGACTAGCTTTGATGCTGGTAGAGGAACATACCCATGCATTTATCACCTTATCATAAGG 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mr.mrrefChr5 75274 24 + 294542 CATGCATTACAGCCATCTTCTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221063 24 + 636262 CATGCATTACAGCCATCTTCTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 211792 24 + 647215 TATGCATTACAGCCATCTCATCTA + +a +s mr.mrrefChr5 75298 74 + 294542 ACAGACGGTTATTGTGAGTATGTGCATCAATATGCCCTCCTTTCAATTATACCAAGCCAATGCGACTGTAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221087 74 + 636262 ACAGACGGTTATTGTGAGTATGTGCATCAATATGCCCTCCTTTCAATTATACCAAGCCAATGCGACTGTAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 211821 74 + 647215 ACAGATGGATGTTTTGAGTATGTGCAACAATATGCCCTCCCTTCAATTATGCCAGGCCAATGCAACCGTAGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 75372 138 + 294542 ACCCCTGGATCAGTCTTGCTTGCTCTCTTATTGCAGTGCAATGACCGTTAGTCTCTCAGTGTAAGACTTATCAAAGGGGTGAGTTCTCATATGTACTAACAGTACCCTGACATGTCATTAACTCCAATATTATTGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221163 138 + 636262 ACCCCTGGATCAGTCTTGCTTGCTCTCTTATTGCAGTGCAATGACCGTTAGTCTCTCAGTGTAAGACTTATCAAAGGGGTGAGTTCTCATATGTACTAACAGTACCCTGACATGTCATTAACTCCAATATTATTGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 211895 138 + 647215 ACCCCTAGATCAGTTATGCTTGTTCCTTTATTGCAGTGTAATCACTTTTAGTCTCCCGGTGTAAATCTTGTTAAAGGGGTGAGTTCTCATATGTACTAATAGTACCCTGTCAAGTTAGTAACTCCAATATTGTTGAAG + +a +s mr.mrrefChr5 75510 8 + 294542 AGTGGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221302 8 + 636262 AGTGGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 212033 8 + 647215 AGTGGGCT + +a +s mr.mrrefChr5 75518 10 + 294542 ATTGTGTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221328 10 + 636262 ATTGTGTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 212041 10 + 647215 ATTGTGTGGG + +a +s mr.mrrefChr5 75528 110 + 294542 ATTATAACCTCAGCATTAGACACATTGGTAGGTTGTTTGCAGCCCCCCAATATTCATCAACACACTATGCTTGGAGATTTGTGATCATCACTCAACAGACCTTATAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221338 110 + 636262 ATTATAACCTCAGCATTAGACACATTGGTAGGTTGTTTGCAGCCCCCCAATATTCATCAACACACTATGCTTGGAGATTTGTGATCATCACTCAACAGACCTTATAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 212076 110 + 647215 ATCATAACCTTGGCATTAGACACATCGATAGGATGTTTACAGCCCCCCACTATTCACCTACTCCCTATGCTTGGAGATTTGTGACCATCACTCAATTAGCCTTTTCATTT + +a +s mr.mrrefChr5 75638 62 + 294542 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acagaagaataaccaacaaatgattcaaagaatgactggatccccttctatggttgacctggtgtgcagtaggctcttaggaacacagtttgcacaatacaggtacctacataataggatttgcagccctgccttgaaactaataag +s simRat_chr6.simRat.chr6 215380 147 + 647215 acaacagagtaaccaacaaatgattcaaagaatagatggatcaccttctatggttcacctagagggaagttagttcttaggaacacagcttgcacaatacagggaccaacatactaagatttgcaaccctctcttgagattaataag + +a +s mr.mrrefChr5 78890 38 + 294542 acacaagctaatatgcagatttagcaggaccaccaaca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224715 38 + 636262 acacaagctaatatgcagatttagcaggaccaccaaca +s simRat_chr6.simRat.chr6 215669 38 + 647215 acacaagctaatatgcagatttagcacgaccaccaaca + +a +s mr.mrrefChr5 78928 10 + 294542 acaccaatgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224753 10 + 636262 acaccaatgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 215709 10 + 647215 acactgatgg + +a +s mr.mrrefChr5 78938 100 + 294542 cgtaaaaaaaccactgtcaaattagcctggaatcaaaaaagagaacctatggcaaacttagttctaggtaaaaaaaattgagctggttggatcatgttgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224763 100 + 636262 cgtaaaaaaaccactgtcaaattagcctggaatcaaaaaagagaacctatggcaaacttagttctaggtaaaaaaaattgagctggttggatcatgttgc +s simRat_chr6.simRat.chr6 215722 100 + 647215 tgcaaaaaagccactgtcaaatcagcctggaaacaaaaaagagaacccatggcaaaattaattctatgtaaaagaaattgagctggtgggaccatgttgc + +a +s mr.mrrefChr5 79038 15 + 294542 AGattacaatcaatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224863 15 + 636262 AGattacaatcaatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 215828 15 + 647215 ACATTACAATCAATG + +a +s mr.mrrefChr5 79053 77 + 294542 ttcatataggtaggggccaaggattcactagttgatagtggtgttggaggaactggttgtctatcttccaagagcta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224879 77 + 636262 ttcatataggtaggggccaaggattcactagttgatagtggtgttggaggaactggttgtctatcttccaagagcta +s simRat_chr6.simRat.chr6 215843 77 + 647215 TTCGTATAGGTGGgggccaagaattcactatttgatagcagtgttggaggaactggttgtctatctagcaagaggta + +a +s mr.mrrefChr5 79130 23 + 294542 ttcttagtgccttatacaggttt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224956 23 + 636262 ttcttagtgccttatacaggttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 215932 23 + 647215 ttcttaatgctttatacaggttt + +a +s mr.mrrefChr5 79153 112 + 294542 agaaaagggtctaaatgttagtggatgatcccagaaacactgtccaagatattggcatgggacaacatctatttagataccaaagtcaactgctgtgaattgcaaaatcgat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224979 112 + 636262 agaaaagggtctaaatgttagtggatgatcccagaaacactgtccaagatattggcatgggacaacatctatttagataccaaagtcaactgctgtgaattgcaaaatcgat +s simRat_chr6.simRat.chr6 215970 112 + 647215 AAAGAGAAGACTAAACCTTCGCGGATGATCtcagaaacaccatctgggatattggcatagaagaacatctgtttagtcaccaaagtcaactgcagctaaactcaaaatcgat + +a +s mr.mrrefChr5 79265 21 + 294542 gagcacaagtgagatatggac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225091 21 + 636262 gagcacaagtgagatatggac +s simRat_chr6.simRat.chr6 216089 21 + 647215 gagcacaactgagacataaac + +a +s mr.mrrefChr5 79286 24 + 294542 aagagcctgcatggattgaaagaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225118 24 + 636262 aagagcctgcatggattgaaagaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 216110 24 + 647215 aaaagcctgagtggattgatagaa + +a +s mr.mrrefChr5 79310 9 + 294542 tggttacaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225152 9 + 636262 tggttacaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 216134 9 + 647215 TGGTTAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 79319 116 + 294542 atttgaacttggcatgagatctttccaacttattcctctcacacagttacacaaaaggaaaaccaataacaggattaaatgataggttagggacatgaacaggtgctaactggcaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225172 116 + 636262 atttgaacttggcatgagatctttccaacttattcctctcacacagttacacaaaaggaaaaccaataacaggattaaatgataggttagggacatgaacaggtgctaactggcaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 216143 116 + 647215 ATTTAAATTTGGAATGAGAGCTTTGCAACTTATTCCTctcacacaattacccaagaagaagaccaataacatgaacaaatgatgggctcgggacatgaacaggcactaactggcaa + +a +s mr.mrrefChr5 79435 12 + 294542 ttgcagtgaaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225297 12 + 636262 ttgcagtgaaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 216259 12 + 647215 ttgtggcgaaaa + +a +s mr.mrrefChr5 79447 96 + 294542 agcaccagaggaaatgtaattttccttgaacagtttgtcacaggtctattgcatggggagtcatggtagaacaatgccactatgatgcACTACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225309 96 + 636262 agcaccagaggaaatgtaattttccttgaacagtttgtcacaggtctattgcatggggagtcatggtagaacaatgccactatgatgcACTACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 216276 96 + 647215 agcaccagaggaaatgtaatttttcttgaACAGTTCGTCACAGATCTATTGCATGGGGCGTCATGGTAGAACAATGCCACTATGATGCACTATAAT + +a +s mr.mrrefChr5 79543 15 + 294542 ATAAAGTAGACGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225405 15 + 636262 ATAAAGTAGACGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 216374 15 + 647215 GTAAAGTAGGCGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 79558 49 + 294542 GGGTGCACTCCAGGAAGGCGTTTTCCTGGTCCCAAAGCCACAAACAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225424 49 + 636262 GGGTGCACTCCAGGAAGGCGTTTTCCTGGTCCCAAAGCCACAAACAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 216389 49 + 647215 GGGCGTGCTGCAGGAAGGCCTTTTCCTGGTCCCGAGGCCACAAATAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 79607 90 + 294542 TTTTATGCAACAATACTGGACAACACTATTTTGAGACATAATAGAACGGGTGAACACACTAGGCTGTATATGCAGGAAGCCAACAGTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225473 90 + 636262 TTTTATGCAACAATACTGGACAACACTATTTTGAGACATAATAGAACGGGTGAACACACTAGGCTGTATATGCAGGAAGCCAACAGTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 216439 90 + 647215 TTTTATGCGACAATACTGGATAAGACTATTTTGAGACATAATAGAAGGGGTGAACAAATCAGGCTGTATTTGCGCAAAGCCAACAAACCA + +a +s mr.mrrefChr5 79697 59 + 294542 GCAGTACTTCCTAGGCTGCCAACCAACCGATGCCTGTTAGAAATCCGACTAGTCCCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225564 59 + 636262 GCAGTACTTCCTAGGCTGCCAACCAACCGATGCCTGTTAGAAATCCGACTAGTCCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 216529 59 + 647215 GTGGTACTTTCTAGGCTGCCAACTAACCAATGCCTGTGAGAAATCCAACTAGTCCCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 79756 118 + 294542 GCTCAGGGAGGTAGGTGAGTATCTTCGCTCATAGTTGTGCTCAGCATGATGATGTAGGACTATAGTAAATAAGAAATCACATAAACCTTTTCATAATTCTAGTACATGAGAAGACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225624 118 + 636262 GCTCAGGGAGGTAGGTGAGTATCTTCGCTCATAGTTGTGCTCAGCATGATGATGTAGGACTATAGTAAATAAGAAATCACATAAACCTTTTCATAATTCTAGTACATGAGAAGACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 216588 118 + 647215 GCTCAGGGAGGCAGGCAAGAATTTTGGCTAATAGTTGTGCTCGGTATGATGATGCAGGACTATAGTAAATAAGATATCACATAAACCTTGCCATAATTCTAGTACATGAGAAGACACA + +a +s mr.mrrefChr5 79874 11 + 294542 AAGAGTGGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225748 11 + 636262 AAGAGTGGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 216706 11 + 647215 AAGAGTGTGAG + +a +s mr.mrrefChr5 79885 161 + 294542 ATGGAGCCCCAAAGAATGTTGGTTACAAATATCGTGCGATGGATGGCATCCCATTTGTTTTATCGGGTAATGTGTGTTGGTCCCATCAACAGGTGCCTGTGGTCACCTAACATTGTATGAGGCCAGCATGCTCTTTCTACAGGTGTCTCAGATTACTTGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225763 161 + 636262 ATGGAGCCCCAAAGAATGTTGGTTACAAATATCGTGCGATGGATGGCATCCCATTTGTTTTATCGGGTAATGTGTGTTGGTCCCATCAACAGGTGCCTGTGGTCACCTAACATTGTATGAGGCCAGCATGCTCTTTCTACAGGTGTCTCAGATTACTTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 216717 161 + 647215 ATGGAGCCCCAAAAAATATTCGTTACAAGTGTCAAGTGATGGATAGCATACCACTTGTTTTATGGGGTAATGTGTTTTGGGCCTACCAACAGGTGACTGTGGTTGCCTGCCAGTGTGTGAGGCCAGCTTGCTCTTTCTACAGGTGTCTCCAATTGCTTGAC + +a +s mr.mrrefChr5 80046 52 + 294542 GGCATGGGAGGTCAGGCAAGCTCAGCAACTAATTGAGCACATAACACGTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225925 45 + 636262 GGCATGGGAGGTCAGGCAAGCTCAGCAACTAATTGAGCACAT-------TTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 216878 52 + 647215 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TGTCAGCAATAGGAACTGAAAATACAAGAATTTTATTGGTTGCATTCATCACCATTAATCCTGTACTCATTATCAATGAGGCTTTAAGAGAAAATAATAGAGTGAAGCATGATATTACACTTGGGAGGAGTGACACTCTGTTGAAGATAGAGATAGATAGTTCTAATCTTGCAGCATTCTGTAATAGGCACATAGTATCCAGTACCCATCCCAACCATTGGGCCAATACACCCCAAAAACTGACAGAAGCTTGAAATTAGCAAGACCTACTGGACAAAGCTCCACTGGGGGGGCATAAGGTGGAGTGCGGTGCATCTTCAACCTGCTTGTTTTACAGTGTATTCACCAACATTTAGATGTGCTGAATATAGCCTACAGAGATTAATTTTAAGCTATACCATGGAGTAGCCAACTCTATTTTAGATGCCAAATTATAAATTAAGACTAACACTTGGTGGCCTGGAAGTGAACACAGGACGCTTTTAATGGTTCGCAAATATTATGGCCATCTTGTGCTTGTCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 226536 508 + 636262 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TGTCAGCAATAGGAACTGAAAATACAAGAATTTTATTGGTGGTATTGATCACCATTAATCCTGTACTCATTATCATTGAGGTTTTAAGAGAGGAGTATTAAGTGAAGCATGATATTTCACTTGGGCTGAGTGACACTCTGCTGAAGATAGAGATTGATAATTCGAATCTTGGAGCATTCTGTAATAGGCATGTAGTCTCCAGTTCCCATCCCAACCATCGGACCCATACACCCCAAAAACTGGCAGAAGCTTGAAATTAGCAAGACCTACTGGACAAAGCTCCACTGGGGGGATAGAAGGTGGAGTGTGGTGCATCTTAGACCTGCTCGTTTTACAGTATATTCACCAACATTTAGATGTGCTGAACATAGCCCACAGAGATTAATTTTAAGCTATGCCATGGAGTAGCCACCTCTATTTTAGATGCCAAATTATAAATTATGACTATTGTTTGGTAGCCTGGAATAGAACACAGGAGGCCTTTAGTGATTAGCAAACATTATGCACATCTTGTGCCAGTCACC + +a +s mr.mrrefChr5 81265 258 + 294542 AAAGTACCCGCATTTATACCTATGATCTAGTGTATATGTCATTGGAATCCTAAAAGAACACCACAGGAGTCAGTATATGTTGGTTAGAACAGATAGTAGTAATTAAATCAGTGACTGTCCTGCATAACCAATGCATCTCAATTCATAGTTTAAGGCAACAGTAGGTTAGTATCTTCACCTACACTGAAGAGAAAACAGACATGTACATGCACATGGCCCTGTCTAAGGTTCATGTCTCTATGGAGTAAGGAGAGACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227046 258 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 221733 37 + 647215 AATGGGTTGGACACAGTCTGGGGAACGTGTAAGTACA + +a +s mr.mrrefChr5 84580 43 + 294542 CCATTCAAGTAGGCAATTGGCCTGAGGGAGATTGGATTGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230590 43 + 636262 CCATTCAAGTAGGCAATTGGCCTGAGGGAGATTGGATTGCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 221770 43 + 647215 CCATTTGAGTTGGCAATTGGCCTGGGGGATATCAGGTTATACC + +a +s mr.mrrefChr5 84623 11 + 294542 GTTTACCAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230636 11 + 636262 GTTTACCAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 221813 11 + 647215 GTGTATCAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 84634 89 + 294542 ACCCGACCAGTTGAACTAGGGGACTAAAATGGATTCAACTGAGAATGGAGGTATGTCACACACGGGTGTTTGCCAGCCTGTGAAGTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230647 89 + 636262 ACCCGACCAGTTGAACTAGGGGACTAAAATGGATTCAACTGAGAATGGAGGTATGTCACACACGGGTGTTTGCCAGCCTGTGAAGTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 221825 89 + 647215 CCCCAATCAGTTGAACTAGAGAACTAAGATGGATTCAACTGAGGATGGAGGTCTGTCACATAAGGGTGCCTGCCAGTCTGTGAAGTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 84723 11 + 294542 CAGGTTTGCCT +s 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ATCATGATTCTTCCATTCTTCTCTGCTTCTTCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231200 54 + 636262 ATCATGATTCTTCCATTCTTCTCTGCCTCTTCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 222041 54 + 647215 ATCATGATTCTTCCATCCTGCTCGGCTTCATCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA + +a +s mr.mrrefChr5 84886 77 + 294542 TCACCAATGTGCTTCCAAGCAATTATCATGCTGCTGTGCTAAGTTAAGGGGTTGATAGTTCACAACTTTTACCTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231254 77 + 636262 ACACCAATGTGCTTCCTAGGAATTGTGGTGCTGCTGTGCTAAGTTAAGGGGTTGATAGTTCACAACTTTTACCTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 222105 77 + 647215 TCATCAATGTGCTTCCAAGCAATTATCATGTTGCTGCATTAAGTTAGGGGCTTGATAGTCCACAACTTTTACCTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 84963 673 + 294542 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AGTAGAAGTCACAGCTGGTCACTCACTTATTGGGCAGTTAAGTTCTCAATTGTGTCCCTCACATGTAGCTGATTGCAGGACAGTCTAATTGAGCAA + +a +s mr.mrrefChr5 94797 55 + 294542 CCGTTCCATAAAGTTTTAAAGGAACCTGTATCATGAAGTGGACCTCAATATGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241734 55 + 636262 CCGTTCCAAAAAGTTTTAAAGGAACCTGTATCGTGAAGTGGACCTCAGCATGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 232246 55 + 647215 CCGTTCCATAGAGTTTTAAATGAACCTGTATCATGATGCGAACCTCAATATGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 94852 103 + 294542 ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATAAATGTGGGAATGTACAAAGCCAGTAGAAAAACATGCCTCTGTAATGACATCGACTGTTACACTGTAAGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241789 101 + 636262 ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATAAATGTGGGAATGTACAAAGCCAGT--AAAAACATGCCTCTGTAATGACATCGACTGTTACACAGTACGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 232302 98 + 647215 ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATGAATGTGGGAATGTA-----CCAGTAGAAAAACATGTCTCTTTAATAACATCGACTGTTACACTGTTAGCAG + +a +s mr.mrrefChr5 94955 208 + 294542 TGAGCTACAGCAGGAGTAGACCTCAGAATGACCTAGGATAACATACGGTAATCGGCCCACGAAGTGAATCAGCTAACCATGTGAGTTGTGAGTTTAACTTAATACTTCTAGTACTCACACAATGCAAGGTATCATTTAGAGCCCCCAGCTGTAGTGAGGGTTCACTTCAGAAGACCCTGGGATTACACATGGAGACTCCTGGAGAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241917 200 + 636262 TGAGCTACAGCAGGAGTAGATCTCAGAATTATCTAGGATAACATGCAGTAATCTGCCCACGGAGTGAATCAGCTAACCTTGTCAGTCGTGATTTTAACTTAATACTTCCAGTACTCACACAATGCTAGGTATCATTTAAAGCCCCCAGCTGTGGTGAGGGTT--------AAGACCCTGGGATTACACATGGAGAGTCCTGGAGAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 232400 208 + 647215 TGGACTACAGCAGCATTAGGCCTCAGAATGCCCAAGGATAACATATGGTAAGCGGCCCAAGAAGTGACTCGGCTTACCACATGAGTTGTGAGTTTTACTTAATACTTCTAGTACTCTCACAATGCAAGGAATCGTTTGGAGCCCCCAGCTGTAGTGAGGGGTCACTTCAGAAGAGCCTGGGATTACATATGGAAACTACTGGAAAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 95163 94 + 294542 GTCACAGGTAGTCACAGGGCTTGTGGGCATGTTTTGAACTTTACAGTGATGGATGGCACATGCCATGAATATACCGCAAATACCTCTTGAATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242117 66 + 636262 ----------------------------ATGTTTTGAATTTTACAGTGATGGATGGCACATGCCATGAATATACCGCAAATACCTCTCGAATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 232616 94 + 647215 GTCACAGGTAGTCACAGGGCTTGTGGGCATGTTTTGAACTTTACAGTGATAGGTGACACATGCCATGAATAGACCACAAATACCTATTAAATAA + +a +s mr.mrrefChr5 95257 97 + 294542 CTGTAGTCTACTTAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGTGAGGCCCATTTTCTAAGGTTCCCAGCACCATAAAGAAATCCAGCAGGGCGCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242194 97 + 636262 CTGTAATTTACTTAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGCGAGGCCCATTTTCTAAGGTTCCCAGCACCATAAAGAAATCCAGCAGGGTGCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 232710 97 + 647215 GTGTAGTCTACTCAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGTGAGGCCCATTTCCTAAGGTCCCCAGCATCATAGAGAAATCCAGCAGGGCGCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 95354 77 + 294542 GTGAACAAGCCTATCAATTTGTGAATGTATGCTATTTCCTAAAATTGAGGTCAGAACAGGCATGTTCTGAGATCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242295 57 + 636262 GTGAACAAGCCTATCAATTTGTAGATAT--------------------GGTCAGAACACGCATGTTCTGAGATCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 232807 77 + 647215 GTCAATAAGCCTATCAATTTGTGAATGTATGCTATTTCCTAAAATTGAGGTCAGAAAAGGCATGTTCTGAGATCTGG + +a +s mr.mrrefChr5 95431 369 + 294542 GTTCTGAGATCTTGACCCAGAATACATTTAGTACGATTCTTTTGTGAGCTCTCAGTCAGATGAAACAAGAGACATGCAAGATTCTAAATGCCTTGTGAAGTAAGTCAGATTGTGAGGACCCAGATTAGGAGACATATATGGATTGACTGTCCCACTAAGCTTGCTGCACATCACTAAGCGAGCCTCCAGATGATTTACATCTTACCATAGTTTTTCCTTTGCCATTGTGAAAGGCTACAAAAAGTAATGCGTACTCTCTAACAATGATGTGAGTCAGTCTTGATAGGTTGTCAGGATTAAGTGATATATATCAGTAGATGATACACTAGATGATATGAAACGCTAGACCTCTTACAATCATGGGCTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242354 364 + 636262 GTTCTGAGATCTTGACCCAGAATACATTTAGTACGATTCTTCTGTGGGCTTTCAGCCAGATGAAACAAGAGACATGCAAGATTCTAAATGCCTTGAGGAGTAAGTCAGTTTGTGAGGACCCAGATTAGGAGACATGTATGGATTGACAGTCCCACCACGCTTGCTGCACATCACTAGGCGAGCCTCCAGATGATTTACATCTTACCATAGTTCTTCCTTTGACATTGCGAAAGGCTACAAAACATATTGCATACTTTCTAACAATGATGTGAGTCAGTCTCGACAGGTTGTCAGGATTAAGTGATGTATATCAGTAGATGATACACTAGATAATATGAAACACTAGACCTCTTATAATCATGGG----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 232884 326 + 647215 ------------------------------GTACACTTCTTTTGCGAGCTCCCAGTTAGATGAAACTGGATA-------------AAATGCCTTGTGAAGTGAGTCAGATTGTGAGGTCCCAGATTAGGAGACATATATGGATTGACTGTCTGATTAAGCTTGCTGCACATCGCTAAGCAAGCTGCCAAATGATTTATATATTACCATAGTTTTTCCTTCGCCATTGTGAAAGGCTACAAAAAGTAATGCGTACTCTCTAACAATGATGTGACTCAGTCTTGTTAGGTTGTCAGGATCAAGTGATACATCTCAGTTAATGATACATTAGATGATGTAAAACGCTAGACCTCTTCCAATCATGGGCTCAC + +a +s mr.mrrefChr5 95800 8 + 294542 AAtccAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 689 8 - 636262 AATCCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 352577 8 + 647215 ccaccTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66880 3 - 647215 AA-----A + +a +s mr.mrrefChr5 95808 24 + 294542 GACTTCGAAGTCGCAAACAAAGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242718 24 + 636262 GACTTCAAATTCACAAACAAAGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 697 24 - 636262 GACTTCGAAGTCGTGAACAAAGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 352588 24 + 647215 GGCTTCTAAGTCGCAAACAATGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 66883 19 - 647215 GG-----AAGTCGCAAACGAAGCA + +a +s mr.mrrefChr5 95832 4 + 294542 TACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242742 4 + 636262 TACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 721 4 - 636262 TACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 66902 4 - 647215 TATG + +a +s mr.mrrefChr5 95836 61 + 294542 CAAGGCAGTCGCATACCAGAGTGCTCAGTTAGCAAATCGTCTCGAGCGAATCATGACCGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242746 61 + 636262 CGAGGCAGTCGTATACAAGAGTGTTCAGTTAGCAAATCGTCTCGAGCGAGTCATGACCGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 725 61 - 636262 CAAGGCGGTCGCATACCAGAGCGCTCAGTTAGCAAATCGTCTTGAGCGAATCATGACCGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 352612 61 + 647215 CAAGGCTATAGCAGACCAGAGGACTCAAATGGTGGATAATCCCGAGCCAATAATGGCTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 66906 61 - 647215 GGAGGCCATAGCATACCAGAGTGCTCAAGTGGCAGATAGTCCTGAGCTAATAATGACTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 95897 19 + 294542 GGCCCAGACAGTACGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242807 19 + 636262 GGCCCAGACAGTATAATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 786 19 - 636262 GGCCCAGACAGTACGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66967 19 - 647215 GGGCCACACAATTCGATGT + +a +s mr.mrrefChr5 95916 31 + 294542 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- 647215 CT + +a +s mr.mrrefChr5 95997 110 + 294542 CGTTTATCACGGCCACATGAGTCCCCCTATCCCAATTTGAAATGTGTcactcatgggctcgcttatgatggccagtggtcaaggcctcggattcacctcgcacatgaaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242925 97 + 636262 CGTTAGTCACCGCCACATGAGTCCTCCTTTC-------------TGTcagtcatgggctcgcttatgatggccagtggtcaaggcctcggattcaccttgcacatgaaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 996 7 - 636262 TGCTTTT------------------------------------------------------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 352675 110 + 647215 CGTTTATCACGGTGACATGAGTCCCTTTATCCTGATTTGAAATGTGgcacttagggggtcgtctatgatggcctgtggccaaggcctcggattcacctcgcacatgaaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 67050 110 - 647215 CGTTTATCACGGCCACGTGGGTCCCCCTATCCCAATTTGAAGTGTGAcactcatgggctcacttatgagggccagtggtcagggcttcggattcacctcacacacaaaag + +a +s mr.mrrefChr5 96107 103 + 294542 atggtacttcctgtacaacggttccaccgaacatgatgtcaggtcactgggtcagtacagatgccgagggcagagtcccccccacagaatcgcctaccccatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243022 103 + 636262 atggaacttcctgtacaatggttccagcgaatatgatgtcaggtcactgggtcagtactgatgccgagggcagagtcccccccacagaatcgcctaccccatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 353021 103 + 647215 atggtccttcgtgtacaacggtaccaccaaacatgatgtcaggtcactgcgtcagtacagatgccgagggtggcgtcccacccacaaagtcacccaccccact +s simRat_chr6.simRat.chr6 67160 65 - 647215 atggtacttcctgtacaacagtgccactgtacatgatgtcaggtcgctgggtcagtacagatacc-------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 96210 10 + 294542 TAGGTATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243131 7 + 636262 CAAGTAT--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 233210 10 + 647215 TAGGTATAGC + +a +s mr.mrrefChr5 96220 42 + 294542 CAGTCTCAAGAAGAGTTAGGGTGCTTCGTGGTGAATTTCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243138 41 + 636262 -AGTTTCAAGAAGAGTTAGGGTGCTTCGTGGTGAATTTCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 233221 42 + 647215 CAGTCTGAAGAAGAGTTAGGGTGCTTTGTGGTGAATTCTTGG + +a +s mr.mrrefChr5 96262 148 + 294542 CTATCTTCCATTGTGAGACCCAACTGGGTTCTATCTGAAGCTTTACTGCATCAATCAGGCAGTGAACTATAGTCTTGTTTTGTCTTTTAACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAATAGGGGCTTTAAGCGTTTGCATGTATTAATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243184 148 + 636262 CTATCTTCCATTAGGAGAACCAACTGGGTTCTATCTGAAGCTTTACTTCATCAATCAGGCAGTGAACTATAGTCTGGTTTTGTTCTTTAACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAATAGGGGCTTTAAGCGTTTGCATGTATTAATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 233263 136 + 647215 CTATCTTCTGTTGTGAGACCCAACTGGGTTCTATTTGAGGCTTTACTGC---------GCAGTGAACTATAGTCTTGCTTTTTCTTTTGACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAACA---GCTTTAAGTGTTTGCATGTATTGATACA + +a +s mr.mrrefChr5 96410 255 + 294542 TTCCCTAGCACATACATTTAAGAGTCAGGATGAATAATTGAGAGAGAAGTGATGCTTGAACTCAAGAACGCAGAACTGGAATGTATGAATGACTTAACCATGAATTCAGACTGTAATGCACTCCTACGCTAGATATCCTAGACTCTGTATCAATGAGAGCTGCAGCCGAGTAGCTTCTTATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTTGCCCTGTTAAGCCTTACTTTGATATGTTTCCTTGAGACTATCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243333 243 + 636262 TTCCCTGGCACATACATTTAAGAGTCAAGAAGAATAATTGAGAGAGAAGTGATGCTTGAACTCAAGAACGCAGAACTGGAATGTATAAATGACTTAACCATGAAAACAGTC--TAATGCACTCCTACGCCAGATATCCTAGACTCT-TGTCAATGAGAGCTGCAACCTAG--------CATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTCGCCCTGTTAAGCCTTACGTTG-TATGTTTCCCTGGGACTATCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 233399 254 + 647215 TTCCCTAGCACATACCATTAGGAGCCAGGATGAATAACTGAGAGTGAAGTTATGCTTGAATTCAAGAA-ACAGAACTGGAATATATGAATGACTTAACCATAAATTCAAACTGTAATGCACTCCTTCTCTAGATATCCTAGACTCTGCATCAATGAGAGCTACAGTAGAGTAGCTTCTTATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTTGCCCTGTTAAGCCTTACTTTGATGTGTTTCCTTGAGACTATCG + +a +s mr.mrrefChr5 96665 319 + 294542 TGATCGCACACCATTATTGCATTACTGGTTGGGTTGGCCTTCTCTCATCACATATAATGTCTAATACGGAGTTGCACAAAGTTTTAGTACCTGCTGTTGGTCATTAGGGAAACATAATGTGATATTTAAAGTAGAAGATGATGGCCTTGTCCTGCCTCATTCTTGAGATCTACATTTTATTAGTAAAAATTGGGTTCACCTATCACCTGTATAGATAATTCATAGTTGTGGTAGATGCACCTTTACCCTAAACATGGAAATTCAACAGATTGAGTGACTTTAGTGACCACATGATGGGTCAGTCCTGCCCTTTAGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243592 309 + 636262 TGATCGCACACCCTTAT--CATTACT-GTTGGGTTGGCCTTCTCTTATCACAT-TATTGTCTAACACGGAGTTACACAAAGTTTTAGTA------GTTGGTTATTAGGGAAACATAAAGTGATATTTAAAGTAGAAGACGGTGGTCTTGTCCTGCCTCATTCTTGAGATCTACATTTTATTAGTAAAAATCGGGTTCACCTATCACCTGTAGATGAAATTCATAGTTGTGGTAGATGCACCACCACCCTAAACATGGAAATTCAACCGATTGAGTGACTTCAATGACCATACGATGGGTCAGTCCTGCCCTTTAGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 233653 318 + 647215 TGATCGCACACCATTATTGCATTACTGGTTGGGTTGGTCTTCTCTCATCACATATAATGTGTAATACAGAGTTGCACAAAGTTTTAGTACCTGCTGTTGGTCATTAGGGAAACATAATCTGATATTTAAAGTAGAAGATGATGGCCTTGTCCAACCTCATTCCTGAGATCTACATTTTAACACTAAAAATTGGGGGCACCTATCACCTGTATAGATAATTTATAGTT-TGGTAGATGCATCTTTACCCTAAACATGAAAATCCAACAGATTCAGTGACTTTGGTGACCGCATGATGGGTCTGTCCTGCCGTTTAGCACA + +a +s mr.mrrefChr5 96984 200 + 294542 CAAATGGAGGAAGGACATTCACTACAAGATATAATTATTCACATTACAGGATTTTTCGTTGTTTATCCTCCTTGGGTTGTGGTTCATCAAGATGAAAGTTCTTCTCCAGTTGTGGTATGTTGGAACTAAGATACCATTAAACAAAAATAGTGAACAATATATCACCTCCTCTCGTGACTTGATGGAAAGATAGCTAGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243902 199 + 636262 CAAGTGGAGGAAGGACATTCACTACAAGATATGATTACTCACACTACAGGATTTTTCGTTGTTTATACTCCTTGGCTTGTGGTTTATCAAGGTGAAAGTTCTTCTCCAGTTG-GGTATGTTGGAACTGAGATACCATTAAACAAGAATAGTGAACAATATATCACCCCGTTTCGTTACTTGATGGAAAGATAGCTAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 233971 200 + 647215 CAAATGGAGGTAGGATATTCACTACAAGACATAATCATTCACATTACACGCCTCTTCATTGTGTATCCCCTTTGGGTTATGGTTCATCAAGATGAAGCTTCTTCTCCAGTTGTGGAATGTTGGAACTAAGATTCCATTAAACAAAAATATTGACCAACATATCACCTCCTCTCATGACTTGATGAAAAGATTGCTAGGGA + +a +s mr.mrrefChr5 97184 93 + 294542 TTATTATTGAGTAAACCAAGATATTTTTCAGCAAGAAAAGTGTAATAGTAGAAGCAGGAAATGAAACAAATCAGTTAAAGATTGGTGTTGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244102 93 + 636262 TTATTATTGACTAAACCAATATATTTTCCAGCAAGAAAAGTGTAATCATAGAAGCAGGAGAAGAAACAAATCAGTTAAAGATTGGTGTTAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 234171 93 + 647215 TTATTATTGCGTAAACAAAGATATTTTTCAGCAAGAAAAGTATAATAGCAGAAGCAGGAAATGAAACAAATCAGTTAAAGATTGGTGTTGGAT + +a +s mr.mrrefChr5 97277 68 + 294542 CTATCCTATGAATTTATTGGTGTTCATGAAACTTCACTGGGATGGATGAACTCGACTGTGGTTTATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244195 54 + 636262 --------------TATTGGTGTTCATGAAACTTCACTGGGATGGATGAACTTGACTGCATATTATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 234265 68 + 647215 CTATCCTATGAATTTATCCGTGTCCATGAAACTTCACTGGGGTGGATGAACTCGACTGTGGTTCATAA + +a +s mr.mrrefChr5 97345 380 + 294542 CCCACTGAATCAGATGAAAGGGGTATTGTCAAGTGCACATTGCCAATTCTCAGTGAAGTAGTGTAGTGATTGACCATCAGGCACTACTATCAGTGTGAACATCAGTGTGAACAGCATTCTTTAGTGATTAAGCTTTTGATAGAAGACAGCTTCATTGAGAGCACATGAGGTATCTTTTGCTTTCAATAGCAGATGTCCTACCAACTAGAGTCTTTCAATTTCTTTTGTGCACAAATTAATGAGTGCCACATTGCCACAATGTTCGTAGCCCCTATAAGGAGGTTGTTTGTCTTACAAGCATGGGAACCAGAGTGTACTCACTGCCGGTGCTTTCCAGCATCTAGAAAGAATACAGATCAGGATGTTAGAGAGCACTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244251 371 + 636262 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-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GATGTCCTACCAACTAGAGTCTTTCAATTTCTTTTGTGCACAAATTAATGAGTGCCACATTGCCACAATGTTCGTAGCCCCTATAAGGAGGTTGTTTGTCTTACAAGCATGGGAACCAGGGTGTACTCACTACCGGTGCTTTCCGGCATCTAGAAAGAATACAGATCAGGATGTTAGAGAGCACTCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 97725 38 + 294542 GTAACACCTTTTCATGATATATTGAACATGAAGATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244668 38 + 636262 GTAACACCTCTACTTGATATATTCACCATGAAAATCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 234710 38 + 647215 GTAACACCTTTTCATGATATATTAAACATGAAGATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 235065 31 + 647215 GTAACACCTTTT-------TATTGAACATGAAGATCTT + +a +s mr.mrrefChr5 97763 128 + 294542 CATGAAGTTGAGACTGGTTAGCACTGGGATGATATGGCTTGCCACAGTCAAGTCCCCTGTGCGAAGCCTAAGGAAGTTAATAGATCAGATCATTCTGACTTTCTTCATAAAGTTGACTTTGAAAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244707 128 + 636262 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ACCACATTGAGCCTCAGATTCAACTGTTATTCTAATCTCCTACTTTTGAAAGGGGCCTTAATGCATTGTCCCAGACCAGCAAGGAAGAAGCCCTTCTTGAGACACTTGTTGCTCCCACTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 235261 121 + 647215 ACCACATTGAGCCTCAGATTCAACTG-TACTCCAATCTCCTAATTTTGAAAGGGGCCTTAATGCACTGTGCTGGTTTGGCAAGGAAGAAGCCCTTCATGAGACGCTCATTGCTCCCACTCAC + +a +s mr.mrrefChr5 98046 78 + 294542 TATTTAAGTTGAGCTACATTGGGGACCTCTGAACAACAATTACCTGGGTCTTCCCCACCTGTTAGGTGAACATCCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244991 72 + 636262 TATTTAGGTTGAGCTACATTGGGGACCT-TGAACAACAACTGCCTAGGTCT-----ACCTGTTAGGTGAACATCCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 235382 78 + 647215 TATGTAAGTTGAGCTACATTGGGGACCTCTGAACAACAATTACCTGAGTCTTCCCCACCTGTTAGGTGAACATCCAGC + +a +s mr.mrrefChr5 98124 119 + 294542 ATAGCAGTTTTATTTTCCCCTGGCCTCTACTCACATACATGATGCATGCAGCTGCTAGAAACTGGAACAGTTGAACAAGCTAATCCCAATGATTGACTGTGCTCAACGAGATGAATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245063 107 + 636262 ATAGCAGTTTTATTTTCCCTTGGCCTCTACTCACATACATGATGCATGCAGCTGCTAGAAACTGGAACAGTTGAACATGCTAATCCCAATGATTGACTGTGCTCAAC------------ +s 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actagacctgatgcagactttttttacctacaacaacgttaggg--aggattacctcctcaGACAGCTATGGTCATAAGATAATTGTCTGACTCAACTAAGTGCAATGGTTCTACATACAATGTTCAACAATTTTATTTTACTGTGGGACATATAACAATGGCTAAGATTGCCTCCGCCAGTTCAAAAATTTTTATTCCCCAGTTGGAATATTTTTACAGCTCTGAAAAACTGCTGGGTATATTACGCATAAGTATTAAAAGAAGTGCTAGTGGGATGCAAACATACAGCTTTACACATGCCTACAAGCTGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 102689 193 + 294542 TCCTGGCCATATTCGCCCCTTTACCCTGTGCACTGTAGTTCTGAAGACCCTAAGATTGAGTACTAGTTCATTCCAAAACAATTGTTTAACTACTTCCTTCTAAGTCTGATTTCCTCCTTAAGAGATCAGAGGGGTCTGAGATACTCAAGTAGCTCCAAACCTGTGAGGTTCTATTTCAATTGTGATATGGGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250003 193 + 636262 ACCTGGCCATATTCGCCCCTTTACCCTGTGCATTGCAGTTCTGAAGACCCTAAGATTGAGTACTAGTTCATTCCAAAACAATCACTTAACTACTTCCTTCTAAGTCTGATTTCCTCCTGAAGAGATCAGAGGGGTCTGAGATACTCAAGTAGCTCCAAACCTGTGAGGTTCTATTTCAATTGTGATATGGGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 240042 191 + 647215 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TCTTTCTATTACTCATCCCTGAGAACACTCGGGTCATCTAACCCAGAAACTGGATAGCAAAGCAGAGAGAGCAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 241475 77 + 647215 TGCATCTTTTACTCATCCTTGAGAACAGTTGGGTCATCTGAACTAGAAACTGGACAATAATGCAGAGAGAGCAAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 104367 6 + 294542 TGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251717 6 + 636262 TGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 241553 6 + 647215 TGATGT + +a +s mr.mrrefChr5 104373 46 + 294542 ATAGACTGCTGGAAAACTTTCGACGAGACTTCTGAAAAAATTAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251723 46 + 636262 ATAGACTGCTGGAAAACTTTCGACGAGACTTCTGAAAAAATTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 241560 46 + 647215 CTAGATTGCTGGAACACTGTGAACAAAACTTCTGGACAAATGAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 104419 14 + 294542 GGACCAGGCACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251769 14 + 636262 GGACCAGGCACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 241709 14 + 647215 GGAGCAGGCACAGG + +a +s mr.mrrefChr5 104433 59 + 294542 GCACTGGAAACCCATTTGTCCACCTGTGTTGGACGTTATGCTGCAAAATTAGTGAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251784 59 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 375650 16 - 636262 -------------------------------------------------------GGGCCTAATTATCGTC------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 251456 83 + 647215 TAAGATGATAAGATGGGTGATACACTGTGGAGGTGATGCCTGGCCAGCACAGCATAGGCCTAATTGTCATTAAAGGCATATTC + +a +s mr.mrrefChr5 114298 53 + 294542 TTCACCACCAGGACAAATAAACCCATCATTGAGTCAGACAGGGAATGGTCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261769 47 + 636262 TTCACCACCAAGGCAAATAAACCCATCATTGAGTCA------GAATGGTCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 251539 53 + 647215 TGCACCACCAGGACAAATAAACCCATCATTGAGTCAGACAGGGAATGGTCATC + +a +s mr.mrrefChr5 114351 60 + 294542 AAGCCTATCTTTCACTGACTACAACATATTTAACTTGTAGGAACAGTCATATATGCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261816 49 + 636262 -----------TCACTGACTACAACATATTTAACTTTTAGGAACAGTCATATATGCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 251594 59 + 647215 AAGCCTATCTTTCACTAACTTCAACATATTTAACTTGTAGG-ACAGTCATATATGCCGAA + +a +s mr.mrrefChr5 114411 45 + 294542 CTTGGCTTGTTGTATTCAAGACTAGAGACAGCAACCAATTCAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 263282 18 + 636262 TGTGCTTCATGCCACTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 253058 18 + 647215 TGTGCTTCATGCCACTCC + +a +s mr.mrrefChr5 115860 32 + 294542 AAGGCCCAAAATACAAGGGATTTTAGTTAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263300 32 + 636262 AAGGCCCAAAATACAAGGGATTTTAGTTAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 253077 32 + 647215 AAGGCCCAAATTATAAGGGATTTTAGTGAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 115892 107 + 294542 CATTTGGTATTCAACAAAGAAAGAATTAAGCTTTTATGTGCAGCTTAATATGACGTGTGGAGTGATTTATAGAGTACATTTCCTTAGAACATCTTCACATAGTATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263335 107 + 636262 CATTTGGTATTCAACAAAGAAAGAATTAAGCTTTTATGTGCAGCTTAATATGACGTGTGGAGTGATTTATAGAGTACATTTCCTTAGAACATCTTCACATAGTATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 253109 107 + 647215 CATTTGGTATTCAATAAAGAAGGAAGTAAGCTTTGATGTACAGTTAAATATGGTATATCAAGTGGTTTATAGAGTACATTTTCCTAGAACATCTTGATATAGTATTA + +a +s mr.mrrefChr5 115999 170 + 294542 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--------------CAGTACAATAGGGCTCTGTCTGTTCAGATGATATTGCTCAATAGAATTACTTTCAAACAAAATTCCAAAAGCTTCTCATGTTTGGATAGACCCACCTCAAGCATATCCACTGAGGTTTATTGACAAAAGCCTTACATAGCATTCTATTAAATCACTGATCCTGTATAAGGTTCTACCACAGAAAGCTGTCACTTTCAAAGGCTGGGTTTAAACATTCATTGGAC + +a +s mr.mrrefChr5 117509 104 + 294542 AGTATCAATTGGtgactggttgactggatcctggcatgtagcaggtgtattcagtgtccttacagagacaacattcttgggttatctctagcagccagcttcct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265164 104 + 636262 AGTAGCAATTGAtgactggttgactggatcctggcatgtagcaggtgtattcagtgtccttacagagacaacattcttgggttatctctagcagccagcttcct +s simRat_chr6.simRat.chr6 254696 104 + 647215 AGTATCAATTGGTGCCTGGTTGACTGgtgcctggcatgtagcaggtgtatttagtgtctttccagagatggccttcttgggttatctctagcagctggcttcCC + +a +s mr.mrrefChr5 117613 8 + 294542 aaggattg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265279 8 + 636262 aaggattg +s simRat_chr6.simRat.chr6 254800 8 + 647215 AAGGattg + +a +s mr.mrrefChr5 117621 291 + 294542 taaaagcagtctattaaaataataatgatgaatgttgcatccctcaagggatcattttgggagctagaagtctgggctgcagtactgctggcaccatcagcatcacatctccattttttaaaagcactctatcaggaacttgcaattctcgtaatgtaatGAAggtcattatggtaccccagtatttctgctatcgggaaggcttggtgtatgaccaaaccagacttggcatgcacccatgtatgTCCCCTGCACTTGCTCACCACAGATTAACAAAGGTGACCACGAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265288 291 + 636262 taaaagcagtctattaaaataataatgatgaatgttgcatccctcaagggatcattttgggagctagaagtctgggctgcagtactgctggcaccatcagcatcacatctccattttttaaaagcactctatcaggaacttgcaattctcgtaaTGTAATGAAggtcattatggtaccccagtatttctgctatcgggaaggcttggtgtatgaccaaaccagacttggcatgcacccatgtatgTCCCCTGCACTTGCTCACCACAGATTAACAAAGGTGACCACGAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 254808 291 + 647215 tataagcagtctattaaaataataacaaagaatgttgaatctctcaagggatcattttgcgagccagaagtctgggctgcagtattactgacaccatcagcatcacatttccatcttttaaaagcaccctatcaggaacttgcaattttcataatataatGAAGATCATTATGGTAtgccagtatttctgctatctggaaggcttggtatatgaccagaccagacttggcatacacccaagtgtgCCCTCTGCACTTGCTTACCACAGGTTAAAAAGGGTGACCACATGTC + +a +s mr.mrrefChr5 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mr.mrrefChr5 119598 52 + 294542 AAATTAGAGAAGCTGCCTCACTTGGATGAGCAACTGAGGTGAGCAATTTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268039 52 + 636262 AAATTAGAGAAGCTGCCTCACTTGGATGAGCAACTGAGGTGAGCAATTTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 256958 52 + 647215 AAGTTAGAGATGCTGACTCATTTGGGTGAGCAACTGAGACAAGCAATTTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 119650 132 + 294542 TGTCCTACCTCCATGGGGCGCATTCTTCATAGATGACTAGAGAACCACAAAAGGCAAATCATATAGCCTGCATCTCCACCTCCACTTATTACACAGACTGACCCCCTAGTCATGCCCCTGTTTTAGCTGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268094 132 + 636262 TGTCCTACCTCCATGGGGCGCATTCTTCATAGATGACTAGAGAACCACAAAAGGCAAATCATATAGCCTGCATCTCCACCTCCACTTATTACACAGACTGACCCCCTAGTCATGCCCCTGTTTTAGCTGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257010 132 + 647215 TGTCCTACCTCCGTGGGGTGCATTCATCACAGATGACTAATGAACCACAAAAGGCAAGTCATGTAGCCTGCATCACCATCTCCACTTATTACACAGAGTGATCCCCTAGTCATACCCCTGGTTTAGCTTGGG + +a +s mr.mrrefChr5 119782 16 + 294542 AATCTTGGCGTAGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268226 16 + 636262 AATCTTGGCGTAGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 257144 16 + 647215 AATCCATGTGGAACTT + +a +s mr.mrrefChr5 119798 14 + 294542 CGACACAATGCGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268242 14 + 636262 CGACACAATGCGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257171 14 + 647215 CGCTACAACATTCG + +a +s mr.mrrefChr5 119812 14 + 294542 GAGGCATGGGATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268256 14 + 636262 GAGGCATGGGATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 257188 14 + 647215 GTGCCATCAAGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 119826 19 + 294542 AATGTCTTTAGTCCAGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268270 19 + 636262 AATGTCTTTAGTCCAGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 257204 19 + 647215 CAGGTCTATAGTCCAGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 119845 135 + 294542 ATAGTTTCATGACAACCACATGTGACAAACATAGTAGCCCAGACAGGACTAGAAATGATAAGTATGCCAACCATTCTGCAGTGGACATTTAATTTCAATCGAGAGACTATTCGATGAGTATTTCATATGGCTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268292 135 + 636262 ATAGTTTCATGACAACCACATGTGACAAACATAGTAGCCCAGACAGGACTAGAAATGATAAGTATGCCAACCATTCTGCAGTGGACATTTAATTTCAATCGAGAGACTATTCGATGAGTATTTCATATGGCTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 257223 135 + 647215 ATAGTTTCATGACAACTACATGTGACAAACATAATAGCCCAGATAGGGATAGAAATGATAAGTATGACAACCATAGAGCAGTGGACATTTGATTTCAGACAAGAGGCTATTCAATGAGTATTTCATATGGCTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 119980 20 + 294542 CTGATACTTCCAGTGGGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268427 20 + 636262 CTGATACTTCCAGTGGGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 257380 20 + 647215 TTGATATTTCCAGTGGTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 120000 42 + 294542 TAAATTTCTAGACAGCAGCGAAAGCTAGTCAGCATTAAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268447 42 + 636262 TAAATTTCTAGACAGCAGCGAAAGCTAGTCAGCATTAAATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 257404 42 + 647215 TAAATTTCTTGACATCAAGATAAGTTAGTCAGCATTACGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 120042 37 + 294542 TCATCACTTATTTTGTGCCTGACTGGAAATGTCCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268494 37 + 636262 TCATCACTTATTTTGTGCCTGACTGGAAATGTCCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 257446 37 + 647215 TCATCACATATTTCGAGCCTGTCTGTACATGTCCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 120079 12 + 294542 GACTTAGACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268531 12 + 636262 GACTTAGACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257484 12 + 647215 GATTTAAACTGG + +a +s mr.mrrefChr5 120091 25 + 294542 CATTTAGAAACTTTCTGGCTCCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268543 25 + 636262 CATTTAGAAACTTTCTGGCTCCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 257500 25 + 647215 CATTCAGAGACTTTCTGGCACCACT + +a +s mr.mrrefChr5 120116 131 + 294542 GCATAGATTTGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAAGCTCAAATGGTGAGCAACTTCAACATAGATATGTGATACATTAGTGGAAGATATTTGGCTCATCAGACACACGATTTTACTTTACCCTGAGTGATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268570 131 + 636262 GCATAGATTTGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAAGCCCACATGGTGAGCAACTTCAACATAGATATGTGATACATTAGTGGAAGATATTTGGCTCATCAGACACATGATTTTACTTTACCCTGAGTGATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 257525 129 + 647215 GCATAGATTGGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAGGCTCAAATGGTGAGCGACTTCAACATAGATATGTGGTACGTTAGTGCAAGATATTTGGCTTATCAGACACACA--TTTACTTTACCCTTAGTGCTTA + +a +s mr.mrrefChr5 120247 23 + 294542 TTGTAACAATGCGTGGTTATCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268703 23 + 636262 TTGTGACAATGCGTGGTTATCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257654 23 + 647215 TTGTAACAATGTGTGATTATCAG + +a +s mr.mrrefChr5 120270 100 + 294542 CTTAGTCCAACATTGCTCTATGTCCAGAACTATATTGTGATGCTCATGTGATATTTTTATTATCCTATAGGTGCACCTGGCCCCCGTACTATAAAGTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268726 100 + 636262 CTTAGTCCAACACTGCTCTATGTCCAGAACTATATCATAATGCTCATGTGATATTTTTATCATCCTATAGGTGCACCTGGCCCCCGTACTATAAAGTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 257679 100 + 647215 CTTAGTCCAACATTCCTCTACGTCCAGGACTATATTGTGATGCTCATGTGATATTTTTATTATCCTATAGGTGCACCTGACCCCCATACTATAATGTAGC + +a +s mr.mrrefChr5 120370 3 + 294542 CTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268828 3 + 636262 CTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257779 3 + 647215 CTG + +a +s mr.mrrefChr5 120373 185 + 294542 TGTATCTAGTTTTTGTTCTCTCCTAACCTGATGCTTCCCAAAGGTTTACCTTCTTCGATACTATTTCTAAGAAAAAATGGTGGATATTAGGCACACTTCAACATCCTCAATGTAACAAAGGTAGTTATCTGGGCAATTGTCATCTAGTTTACCGTTGGTAAGATCAATCTATTGTTGCCATTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268832 184 + 636262 TGTACCTAGTTTTTGTTCTCTCCTAACCTGATGCTCCACAAAGGTTTACCTCCTTCGATACTATTTCT-AGAAAAAATGGTGGATATTGGGCACACTTCAACATCCTCAATGTAACAAAGGTAGTTATCTGGGCAATTGTCATCTAGTTTACCGTTGGTAAGATCAATCTATTATTCCCATTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 257782 180 + 647215 TGTGTCTAGTTTTTATTCTCTCCTAACCTGATGCTTTCCAAAGGTTTACCTTCTTTGATACTATTTTTAAGAAAAAATAGTGGATATTAAGCACACTTCA-----TTCAATGTAGCAAAGGTAGCTATCTGGGCAATTGTCATATATTTTACCATTGGTAAGATCGATCTATTGATGCCAGTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 120558 84 + 294542 TTTCTACTACTAGAGAGTGCACTGAAGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTTCCAGTGTTGTTAATTTGGTACGAAGACATGAAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269024 84 + 636262 TTTCTACTACTAGAGAGTGCACTGAAGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTTCCAGTGTTGTTAATTTGGTACGAAGACATGAAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257962 84 + 647215 TTTCTGCTATTAGAGAGTGAACTGGGGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTAAATGCATAGGTAATTTGGTACAGAAACATGAAATG + +a +s mr.mrrefChr5 120642 10 + 294542 AACATTGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269108 10 + 636262 AACATTGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 258047 10 + 647215 AACATTGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 120652 45 + 294542 CAACTTGACAGCTCGGGGAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269119 45 + 636262 CAACTTGACAGCTCGGGGAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 258057 45 + 647215 CTACCCGACAGCTAGGGCAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGACAG + +a +s mr.mrrefChr5 120697 105 + 294542 GCAATCACTCTTAGATCAAGGATTCAACACAATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCGAAAAAGATATGTTACTTGTTGTTAGGTAGTGCAAGATCAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269164 105 + 636262 GCAATCACTCTTAGATCAAGGATTCAACACAATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCGAAAAAGATATGTTACTTGTTGTTAGGTAGTGCAAGATCAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 258138 105 + 647215 GCAATGACACTTAGGTCAAGGATACAACACTATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCAAAAAAGAAATGTTACTTGTAGTTAGGCAGTGTGATATCAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 120802 15 + 294542 TTTGTTTTGTTCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269296 15 + 636262 TTTGTTTTGTTCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 258243 15 + 647215 TTTGTTTTGTTCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 120817 41 + 294542 GTATAGCTTACTTACGTCGGGAGGCCTTCCCATTTACTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269312 41 + 636262 GTATAGCTTACTTACGTCGGGAGGCCTTCCCATTTACTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 258258 41 + 647215 GTACAGCTTACTTGCATCAGAAGGCTTTCCCATTTACTATT + +a +s mr.mrrefChr5 120858 213 + 294542 TGTGGGATCCAAAAAGCAGGTTGAAGAGCTAGGTGAGGCAAGAAGCCCAGGCTGCTTCTAGAAAAAACAGTTCTGGATTGTGTAGCAAGGCTTCAACTTTAATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTAGGTTAGGAATTTACTGTGTACTCAGCAACACATGAAGTAGCAACACAAGAAGTATTTAATTGTCTGTCTTGGTACTATGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269353 213 + 636262 TATGGGATCCAAAAAGCAGGTTGAAGAGTTAGGTGAGGCAAGAAGCCCAGGCGGATGCTAGAAGATACAGTTCAGGATTGTGTAGCAAGGCTCCGGCTTTAATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTAGGTTAGGAATTTACTGTGTACTCAGCAACACATGAAGTAGCAACACAAGAAGTATTTAATTGTCTGTCTTGGTACTATGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 258336 212 + 647215 TGTGGGTTCCCAAAAGCAGGTTGAAAAGCTAGGAGAGGCAGCAAGCCCAGGCTGCTTCAGGAAATAACAGTCCTGGCATGTGCAGTAAGGCTTCAACTTTTATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTGAGTTAGAAGTTTGTTGTGTACTCTGCAACACAAGAAGTAGCAACACAAGAAGTATATACTTGTCTGTCTTGGTACTATGTA- + +a +s mr.mrrefChr5 121071 45 + 294542 TCCTATCTCATTTAATATCAAGTAGCATTTATTGTCAAAGACATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269581 45 + 636262 TCCTATCTCATTTAATATCAAGTAGCATTTATTGTCAAAGACATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 258548 45 + 647215 TCCTATCTCATTTAAAATCAAGTAGTATTTATTGTCAAAGACATC + +a +s mr.mrrefChr5 121116 150 + 294542 AAGGCAGAAACACACTCTTTAACTAGAGATGTACTTAAAGTTGGAAATTTGTTGTATACGTTGCAACAGAAAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATTAACTTTTTGAAAATTGGGAGCATTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269631 149 + 636262 AAGGCAGAAACACACTCTTTAACTAGAGATGTACTTAAAGTTGAAAATTTGTTGTATACGTTGCAACAGAGAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATCAACTTTTTTAAAGTTGGGAGTACTT- +s simRat_chr6.simRat.chr6 258593 150 + 647215 AAGGTAGAAATAAACTCTTTAACTGGAGATGTACCTAATATTGGAAATTTGTTGTGTACATTGCAGCAGAAAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATTAACTTTTTGAAAATTGGGAGCATCTA + +a +s mr.mrrefChr5 121266 192 + 294542 TTGTCAAAGACATTAAGACAGAAACAAACTCCTCAACCAATTCCTGAACTAATTCAAGGAAAGCCTCTTTTTAAGACTAATATTCAGTATAAAGGCCAAGCAATTGACCCAGCTCTTCCAGATGCACAATCATCAGCTTGACATATGAGCTATTTGTCAATCCTGCCATGCACTTCCCCTTTTGCTTTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269780 184 + 636262 ---TCTAAGACACTCAGACAGAAACAAACTCCTCAACCAATTCCTGAACTAATTCAAGGAAAGCCTCCTTTTAAGACTAATATTCAGTTTAAAGAGCAAGCAATTGACCCAGCTCTTCCACA-----AATTATCAGCTTGACACATGAGCTATTTTTCAATCCTGCCATGCGCTTCCCCTTTTGCTTTTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 258744 191 + 647215 TTGTCAAAGACATTAAGACAGAAACAAACTCCTCAAGTAGTTCCTCAACTA-TTCAAGGAAAGCCTCTCTTTAAGACTAAAATTCAGTATAAAGGCCAAGCAGTTGACCCAGCTCTCCTAGGTGCACAATCATCAGTTTGACATATGAGCTATTTGTCAATCATGCCATGCACTTCCCCTTTCGCTTTTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 121458 74 + 294542 ATGATAGTCTGAATCCCAATGTGTGACACCTAAAATTTTGATTGAGGCAATGAAATACAGTTCGATATGAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269965 44 + 636262 ATGATAGTCCGA------------------------------TGTGGCAATGAAATACAGTTTAATATGAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 258935 74 + 647215 ATGACAGTCTGAATCCCAATGTGTGACACCTAAAATTTTGATTGAGGCAACGAATTACAGTTCGATATGAAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 121532 701 + 294542 TGAAACCTCTTGTGAGCCAGGCCTAGTTTCTTATGCTGCTTTGGTTAAGAGGTCTACTATATTTGCTTTTTGACATGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTACTGGCTTGATTGCCTACACAGAAAAGAACCTCCATCATCATATAGGTAAATGTACAGGGATGCCTTCAAACACTCAGCCAATATATAATATGGAATAGTCTTGCTAGACTCAATTGAGGGCACAAGCCCAATTAGTTACTCATGGCACAAGGTCAATGAAATACTTGAGGCCCGCAAGATAAATGAGTTGAGCACTGCAATTACAACATTATCATTGTTACTCTTGGGTTAATAACATGCCACCAGGTACCAATCTATCATTCCATTCAGAGAGTGGCTGATTCATGTTGGAAAGTAAACAAAGTGTTCAGGATTCTAACTAATGATCATAAATTGGGACTGGTCTTATGCAAAGTACTGTGGTTCAATACTTCAATTAGTAGCAGCATTTGTAATTATCTGTGACACTACCCAGCCCCACCATAGCAGGGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTGGCTACAAAACCTTCTAGGAGCTGGCCATTCACTCATTGAGGCTTGGATGAGGTTGAGATGAAGTGTAGGCAGCAGAGATTTACTTACTGTTAAAAAGGCACATTTGTTAAATAAACCTATTAGGTCAGGTGATGCACCCACTTTACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270009 691 + 636262 TGAAACCTCTTGTGAGCCAGGCCT-GTTTCTTATACTGCTTTGGTTAAGAGGTCTACTATGTTTGCTTTTTGACATGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTATTGGTTTGATTACCTACACAGAAAAGAACCTCCATCATTGTATAGGTAAATGTACAGGGAAGCCTTCTAACACTCACCCAATATGTAGTATGGAATGGTCTTGCTAGACTCAATTGAGGACACAAGCCCAATTAGTTACTCATGGCACAAGGTCAATGAAATACTTGAGGCCCGCAAGATAAATGAGTTGAGCACTACAATTACAACCTGATCATTATTACTCTTGGGTTAGTAACATGCCACCAGGTACCGATCTATCATTCCATTCAGA---------ATTCATGTAGGAAAGTAAACAAAGTGTTCAAGATTCTAACTAATGATAATAAATTGGGACTGGTCTTATGCAAGGTATTGTGGTTCAATACTTCAATTAGCAGCAGCATTTGTAATTATCTGTGACACCACCCAGCTCCACCATAGCAGGGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTAGCTACAAAGCCTTCTAGGAGCTGGTCATTCACTCATTGAGGCTTAAATGCGGTTGAGATGTAGTGTAGGCAGCAGAGATTTACTTACTGTTAAAAAGGCACATTTGTTAAATAAACCCATTAGGTCAGGTGATGCACCCATTTTACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 259010 694 + 647215 TGATACTTCTTGTGAGCCAGGGCCAGTTTCTTATGCTGCTTTCGTTACCAGGTCTACTATATTCACTTTTTGACACGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTACTACCTTGATTGCCTACACAGAAAAGAACCTCCGACATCATACAGGTAGATGTACAGGGATGCCTTCAAACACTCAGCCAATATATGATATC-AACAGCCTTGCTAGACTCAATTGAGGGCACAAGGCCAATTAGTGATTGTTGGCACAAGGCCAATGCAATACTTGACCACTGCAATATAAATTAGTTGAGCACTGCAATTAGAACATTAACATTGTTACTCTTGGGTCAATAACAAGTCACAAGGTACCAATCTATCATTTTATGCTGAGAGTGGCTGATTCATGTTGGAAAGTAGACAAAGTATTCTGAACTCTAACTCACGATCATAGATTGAGACGGGTCTTATGCGAAGTACTGTGGCTCAATACTTCCATTAGTGGCAGCATCTGTAATTATCTGTGACACTACGCAGCCCCACCATGGCAGAGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTGGTTACAAAAGCTTCTAGAAGCTGGCCATGCACTTATCAAGGCTTGGATGAGGTTGAGATGAAGTGCAAGCAGCAGAGAATCACTTAC------AAAGACACATTTGTTAAAAAGACATATTAGGTCAGGTGATGCACCCACTTTACTG + +a +s mr.mrrefChr5 122233 68 + 294542 CTACAGATCTCCAGACCAATTATTAGTTAATTAGTTGGTGTGGCATGTATCTGTGAGGAGGTGATGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270702 66 + 636262 CTACAGATCCCCAGACCAATTAT--GTTAATTAGTTGGTATGGCATGTGTCTGTGCGGAGGTGATGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 259704 68 + 647215 CTATAAATCTGCAGAGCAATTATTAGTTAATTAGTTGACGCGGTATGAATCTGTGAGGAGGTGGTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 122301 430 + 294542 GTTGCTACCTACTGCACTTTTCATTCTACATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAACAGGAGCCTCAGCAATATCTCCAGTTTGACAGCATAAATAACTGTATTGAGTGTGGGTATGTGTAGAACTTACTGATTTATGCACTGATGCTGGTGTGACTAGGGGAGATGTACCCAGCTCTGCCTTCCTGTCCATCTAATTGCAACTACATATTTTCGTCTGGTTACAGTAAAGTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGACATCACTCACAGACTAGGTAAAAGTTCCAACATGAGGTAGGAGACCTGTGTTCCACTGCCTAGATGTTGGTACAGATCCATACAACTAAATGGTGACACCATTCCTGTCTAGACATCTATCTCATGCATGATGCATAAGAACGGTGCCATGTGAAAGGTCCCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270768 429 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 278326 261 + 636262 TTCCCTTAAGAGGCTTGCTGCATAGAGTCCTGTATTTTGCCCTTCTAGTTCTCTCTGCCCGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGCATTTTGAATATCACTTGACCTGGACATCTGGCTATTGCCATAAGAATGGACTAGCAGAGGAGGTCTATATTACTGTAAGTTGCTGCTCACATGAAGCAATACCTTATTATAACAAGCAGGCGGTCTCTATGGTACCCTACAATTCAAGATAGTCTCCAAGCATTTCGTCGGCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 267559 231 + 647215 TTCCCTTAAGAGATTTGCTGCCTCAAGTCTGTGATTTTACCCTTCTAGTTCTCTCTGTCGGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGTGATTTGAATATCATTTGACCCGGGCTTCTAGCTCTCACTATAAGAATGGACTAGGAGAGGATGTCTAGAATACTGTAGGTTGTTATTCACATGAAACAATACTTTCTTATAACAAGCAGGTGGTCTATAAGGGACCCTACAATT------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 130031 161 + 294542 GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCGGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTACCATGAGAGGAAGTCTAGAACACTGTAAGTGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278590 161 + 636262 GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCAGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTAGTGTGAGAGGAAGTCTGGCACACTGTAAGTGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 267790 86 + 647215 ---------------------------------------------------------------------------AGACCCGGGCTTTTGGCTCTCACCCTAAGAATGGTCTGGGAGAGGAAGTCAACCATGAGAGGAAGTCTAGAACCCTGTAGGTGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 130192 291 + 294542 AACACATGGAACTATAATTTCTTATAACAAGCAGGCAGTCCATAATGTGGCCTACAATCCTCCATACTCTCCAATCATTTGGTTGGCACTAAGCAGCAACTGGATTCATTGTACCACAGTAGGGGTTATTGGAAGTGATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTCCAGGTGGATGGTATATATACCAAGCTGGTGAAAATATTTTTCAAGTCATCTGGTGTGGTTGCTCTTATAGCTTCATTCTTAGTATGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGATCTGAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278751 291 + 636262 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mr.mrrefChr5 130734 126 + 294542 CTAGCTGTCCAGATCAAAACTAGTGGTATGGTCCAAATTACAGTCTAGCCCAGGGCAGCATGGTGCAGACCAAGAGGACAGTATAATGGAGGAAGCCTAAAAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279637 124 + 636262 CTAGCTGTCCAGGTCAGAACTAGTGGTATGGTCCAAATTACA-TCTAGCCCAGGGCAGCATGGTGCAGACCAAGAGGACAGTATAAT-GAAGAAACCTAAAAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 268358 126 + 647215 CCAGCTGTCCAGATCAAAACTAGCGGTATGGTCCAAATTACAGTCTATCCCATGGGAGCATAGTACAGACCAAGAGGACAGTATTATGGAGGAAGCCTAAGAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 130860 171 + 294542 TACATGCCTAATGGAGTTTAACTTGGAGTACTCATGGTCAGTATCAAAGATACTATTGATCCCAGTCCCTCAGCTTCAGGAGGCAGGTTAGGATAACAATGCACTTTGTCAAAAATTTTCTTACAATTATGTCATCAAAAAATGTGTTCCATTCCGCCTTCATCTTGAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279761 171 + 636262 TAAATGCCTAATGGAGTTTAACTTGGAGTACTCACTATCAGTATCAAAGGTACTATGGATCCCAGTCCCTCAGCTTCAGGAGGCAGGTTAGCATAACAATGCACTTTGTCAAAAATTTTCTTACAATTGTGTCATCAAAAAATGTGTCCCATTCCGCCTTCATCTTGAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 268485 171 + 647215 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GAGAGTGAGCCAATGATACAACATGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGCCCATCAAATTTATTCCTCAGGCTGGAGTTTTACAGTAACACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 270835 70 + 647215 ------------------CAACGTGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGTGTGTCAAATGTATTCCTGAGGCTAAAGTTGAACAATGATATT + +a +s mr.mrrefChr5 133463 28 + 294542 CTAAATAGTGCATGGAAGTTCCAGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282497 16 + 636262 CTAAATAGTGCATGGA------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 270905 18 + 647215 ----------CATGGAAGTTCCAGCACA + +a +s mr.mrrefChr5 133491 56 + 294542 CCACTAGATACCTAACCTTGGTTGGGTTCTAAACAAACACAAAGAATAACCAACGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 270927 56 + 647215 CCACTAGATACCTAACCTTGGTTGGGTTCTAAACAAACACAAAGAATAACCAACGA + +a +s mr.mrrefChr5 133547 20 + 294542 GATTTCCTGTGCTGACTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282513 20 + 636262 GATTTCCTGTGCTGACTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 270986 20 + 647215 GACTTCCTGTGCTGCCTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 133567 22 + 294542 ATGAATTGCTCTGCATTGTGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282533 22 + 636262 ATGAGTTGCTCTGCATTGTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 271009 22 + 647215 ATGAATTGCTCTGCATAGTGAC + +a +s mr.mrrefChr5 133589 138 + 294542 TCTTACTTGTGCCATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAATCTTTGCAGCTAAACCCACCTCTCAATTTTTAGTGATCGTGCTTTGAGCTAGAAATACAGTAATATTTCTTGGACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282555 133 + 636262 -----CTTACGCCATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAATCTTTGCAGCTATACCCACCTCTCAGTTTTTAGTGATCATGCTTTGAGCTATAAATACAGTAATATGTCTCGGACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 271032 138 + 647215 TCTTACTTGTGCGATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAACCTTTGCAACTAAACCCACCTCTCAATTTTCAGTGATCGCACTTTGAGCTGGAAATACAGTAATATTTCTTGGACAG + +a +s mr.mrrefChr5 133727 79 + 294542 CTGTGTTCTGGATAGGATAGTGCCACTAGCTCTAGTGTTATGAGAGGTTGTATCAATTAACATAGATAGAATCTTGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282692 79 + 636262 CTGTGTTCTGGATAGGATAGCACCACTAGCTCTAGTGTTATGAGAGGCTGTATCAATTAACATATATAGAATCTTGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 271170 74 + 647215 CCGGGCTGT-----GGATAGTGCCACTAGCTCTAATGTTATGAGAGGTTGTAGAAATTAACATAGATAGAGTCCTGATA + 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mr.mrrefChr5 133951 422 + 294542 TCCTGTCTACCGATGCCAAGGAGCGGTCATGATATCAGTGAAAGTTCACTCTGTGTCTGTTGAGTGGTGTTATAGAATGCCAGTGAAGGCCAAACTCTTGCTTAACTCAAGGCAAGAAGGAAATCTAGACATGGGCACAATAGAGCGGCTTCCAATGTACCTGTAGGAGAGTTTTGGATGAACTACCCTATATACCTCTATGCCAAGAAGGAGGCAATCAGTGCACACAGTACGGAGTGTTCCTGAGTTGGAATAACTTCATGGACAGATGGATAAATTAGGAAGGGGAGAGAGTAGAGACAACCAGTTCTTATTCTCCTGAAGACAGAATGTAGGCCAGAAATAGTACCAGGTTAGGCAGGCATTAGCTCAACATATTGCATCCAATGATCGGTGTGGTATTGCATAGGCTGCCCATTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282925 420 + 636262 TCCTGTCCAAAGATGCCAGGGAGTGGTCATGATATCGGTGAAAGTTCACTCTGTGTCTGTTGAGTGGTGTTATAGAATGCCAATGAAGGTCAAACTCTTGCTTAACTCAAGGCAAGAAGGAAATCTAGACATAG--ACAATAGAGTGGCTTCCAATTTACCTGTAGGAGAGTTTTGGATGAACTGCCCTCTGTACCTCTATGCCAAGCAGGAAGCAATCAGTGCACACAGTACGGAGTGTTCCTGGGTTGGGATAGCTTCATGGACAAATGGATAAATTAAAAAGGGGAGAGAGTAGAGTCAACCAGTTCTCATTCTCCCGGAGACAGAATGTAGGCTAGACATAGTACCAGGTTAGGCAGGCAGTAGCTCAACATATTGGATCCAATGATTGATGTAGTATTCCATAGGCTGCCCATTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 271424 422 + 647215 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ATGCCAGTCTCTAATTTGACAATAGATGACATCATTAGTTTGGCTAAACATGACCTTAGCCATGGTCTGAGGCCTGAGCAGCTGGAATTGTGGGTATTCTTCATCTGTCCTCAAAAAATGGAATATTTTGATGGGTTTACCTGATTGCTGCATA-TTGGAGACTGACCTCTAAACTCTTGTCCATCTTTATGTCTTGATTCACAGCATCTAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 272361 214 + 647215 ATGCTGGTCACTATGTTGGCTACAGATGACGTTACTAATTTGGCTAGAGATGACCATAGTCATCATCTGAGCCCTGAACAACTGGAAAAGTGGATATTCTGCCTCCGTTCTCTAAGAATGGAATGTTTTTGTGGGTTTACCTGATTGCTGCATATTTGGAGACTGACCTCCAAACACTAGTCCATCTTTATGTCTTGATTCATAGCATCTAGGA + +a +s mr.mrrefChr5 135093 83 + 294542 GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCCAGACTCAAATAATGCCTGCATTTCATAGCTGATGCCTACACAGGGGAAAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283952 83 + 636262 GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCCAGACTCAAATAATGCCTGCACTCCATACCTGATGCCTACACAGGGGAAAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 272575 77 + 647215 GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCAAGACTTAAATAATGCCTGCTTTTCACAGCTGATGCCTTCACAGGGG------ + +a +s mr.mrrefChr5 135176 42 + 294542 AGGCACAGGAATAGATGAGGGCTGGGATCTTAGAAACAGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284048 42 + 636262 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TGTGGCTGAAGTAACTTGCACAGTTAATATGGTAAAGGATGCCACCTACAGGCATTAAGCTAACCCTAACATCTGAGGCACTATCTGAGAATTGTGTAATGGAGGGAGAGTAATCATGTCAAATTGGAGATTGGTTGGAATATGCAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGTTAGTATATACAAGAATCTCTCTCT----TTTTCCGGTACATGTTGCTTGTGGAACCTTTGCCCCAACAGGAGTCAAAAAAGGACCACTGGAGTACTACATGGTACTTTTCAGGATTGCAATATACTACTATCAGACAGATGGGAAGAGTGGGGGTTTGATGCTTGGGTAATTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 272652 320 + 647215 ------------------------CAACATGGTAAAGAATGCCACCTACAGGCATTAAACTAATCATAATGTCTGAGGCACTATCTCAGAACTGTGTAATGGAGAGGGAGTAATCATGTCAAGTTGGAGGTTAGTTGGAATACACAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGGTAATATATACAAGAATCCTTCTCTTTGATTTTCTGGTACATGTTGCTTACAAAACCTTTGCCTTGACAGCAGTCTATAAAGAACCACTGGAATATTACTTGGAAGTTTTTAGAATTGCAATATATTACTACCAGAAAGATGGAAAGGAG--GGGTATGATGCTAGGGTACTTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 135629 73 + 294542 ATGTGCAGTGGTTCTACCACTTGTGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284577 62 + 636262 ATGTGC------TTTACC-----TGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 272977 73 + 647215 CTTTGCAGTGGTTCTTCCACTTGTGCCACTGTATTAGTCTTGCAAACTCAGTCGCTGCAAGGTGAATCTCTGT + +a +s mr.mrrefChr5 135702 55 + 294542 ACCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284639 55 + 636262 GCCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 273051 55 + 647215 ACCCTTTACAGCCATGAGTACTATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAGCTCTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 135757 68 + 294542 CCTACTTACTCGAACAGAGCTCATTTTGCAACTGTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284694 63 + 636262 CTTACATACTTGAACAGAGCTCATTTTGCAGCTGTACTTGATCGACCTAGGTAGCCAGAGCTA----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 273107 68 + 647215 CCTACTTTCTCGAGCAGAGCTCATTTTGCAACTTTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG + +a +s mr.mrrefChr5 135825 348 + 294542 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CTTTATGCATGACTTGGGTTCACTATAAAGGAAAATAGTGACAGATTTATTGAGTCCATGTCTTGGAAAATTGGAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGAAAGAAGGCCATGAACATACCTCTCCAGCATTGTCTCTGAACACTTTGGGTGGCCCAGGGCAGTGTAGATCGTGTGATCATATCTTACAGAAGTGCTCCCATGCTAGTAAAAGAAGATAGCTGATTATTGCCACAAACATACAGTTCCTGTTCAGGCCCTTTTTTTAAGCAGATGGGAGTTGCTATAAACCATAAGTTATGTCAGACTGACATTAAGGGCCCTAGGTTGACTTTTGTTCT--------- + +a +s mr.mrrefChr5 136173 27 + 294542 AACATTGACTTTTATTCTACTCTAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285095 27 + 636262 AACATTGACTTTTATTCTACTCTAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 273520 24 + 647215 ---ATTCACTTTTATTCTACTCTACGG + +a +s mr.mrrefChr5 136200 257 + 294542 AACTTCTTCCAAGTGCCACTGCTATCAGCTAGTGCCTTACCTTGTGATTGCCAGAACATCAGTCTACACTCACAGAATGTCTCCTGTAACCAAATTAACAAAATTAACCTTAACAAAACTAACCTTACTGAAGGTCCTTAGTCTCTTTTATGTGTTTAACATGCAGTTAACAACTTGTTAGCTTACAATTGTTGGACACAATAATATTGCCAGTGTAACCCATTCAAGTCATATAATTTGTTGTCTCATCAGCCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285122 242 + 636262 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ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAATACACAGATCCAAAGGATAGTAAGAATAGACCAATGCAATAGACCACACAGATAGCAACTGGCAACTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGACTGTTACAGCAGCCTGACCTT + +a +s mr.mrrefChr5 136966 133 + 294542 GTCTTCTGAATCAGGCAATATATTAATTTTAATAGAAAGATTTTAAGGTCAGGGGCATCTTATCTTTGCCAAAATGAAGGTTAATGATACATTACAATTTTCAAGTTGCTCAGCTGAGAAGGTTAAGACCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285881 133 + 636262 GTCTTCTGAATCAGGCAATATATTAATTTTAATAGAAAGATTTTAAGGTCAGGGGCATCTTATCTTTGCCAAAATGAAGGTTAATGATACATTACAATTTTCAAGTTGCTCAGCTGAGAAGGTTAAGACCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 274341 133 + 647215 GTCTTCTGAATCAGCCAATATATTAATATTCACAGAAAGATTATAAGGTCAGGAGTATCTTACTTTTGCCAAACTGAAGATTTACTGAACATTACAAGTTACAAGGTGCTCAGCTGAGAAGGCTAAGACGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 137099 170 + 294542 CAAGTCCAGCACTTTATTTTGTTTAGGCACTGGACTCTTCATAGCCACTAGAGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAACTCCTCCGCTATCAGTATCTTCATCTACAGGTCCAGTCCTTCAATCGTCTTTCCATCAGGACCCTCATTGTGGACACAGGCGCAGATTCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286031 170 + 636262 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TGTCTGAGTTGAGCATTGCAACCTGATAACAATTTCTTACAGTACATACTCTCCTAGACATCAAGCATAAGACCAGACTGCAACACAAGTTCACTAAACAGTACCTGTTCGGCTCCCAAAACAAGGGTGATGGATACTAGAGGTGTCCATAAAAAATTGTCTGCTGAATCTGGAATTTATGCCCTGCTCCACATCCCTATTTACTAGATGGTACCAGGCTTTGCCAGTAATCTCTGTTGTAAGCTCCCACTGAAATATCTAGTCTTGGTATTTTATCACTGTCAAATGAGGGATAGTTCAAACCAGAGTTGCAGCTTAGTACAGTTCTTTTGAGAAGCCACCCACTGGTAAATTGCA + +a +s mr.mrrefChr5 138097 119 + 294542 TAGAATACTAAGCTCACAGACCTGAAGAAGTTCATAGTACTTGGTAGAGATAATAGGCTGCTTCTATAACTAACATATAGCTTACGGTTAGCATACCAAGGGTATTCCTGAGTCCTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287053 118 + 636262 TAGAATACTAAGCTCACAGACTTGAAGAAGTTCATAGTACTTGGTAGAGATAATAGGCTGC-TCTGTAACTAGCACATAGCTTACAGTTAGCATACTAAAGGTATTCCTGATTCCTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 275374 119 + 647215 TAGAATACTAAGCTCACAGACCTGAAGAGGTTAATAGTACTTGGTAGAGATAATGGGCTACTTCTATAACTAACATATAGCTTACGGTTAGCATACCAAGGGTATTCCTGAGTCCCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 138216 104 + 294542 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CCTTCTACAATACACTAATTTCACGTAAACCAACGATCAAGAAGTGAAGTGTGATATGGTAGCAAAGTTGAGGCCAGAGATTTTGG + +a +s mr.mrrefChr5 144026 95 + 294542 TCCCTTTCCTGGATCTCATATCATGGACTTCGTTAGGCTAATTTGGTCAGGTAGCATCTATGTTGTTTCCTGATCCACACCTGTCGAGTTCATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293096 95 + 636262 TCCCTTTCCTGGATCTCATATCATGGACTTCGTTAGGCTAATTTGGTCAGGTAGCATCTATGTTGTTTCCTGATCCACACCTGTCGAGTTCATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 281895 95 + 647215 TCCCTTCCCTGAATCTCAAATATTGGACTCCAATAGGTTAACTTGGTCAGATAACATCTAGGTTGTTTCCTGACCCACACCTGTGGAGTTCACAG + +a +s mr.mrrefChr5 144121 273 + 294542 GAAGATAGTTTTTGAGACAAAGGGAACTCCTCTGTACTAGTGGCATGGACTGAGTTGCAAAGTGGGACAATGCCAGCCAGAATGAAAAACCCTAGAAGGCATTGAAAAATCTGACACTATTGTGTCGACGTATAACTACCTCCAAACATGATGTAAGTGCACTAAAACCACAAATTTGAATTTGACAAGAGCCATATCTCTGTACACTCACTAACCCATATGTCAGCTGGTGTGACTCTTCCATGGATTCAGTTAAACATGAGAGCTCTGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293192 250 + 636262 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TGTAGGTCAGTATAGGTAGGACGGATAACAACAGTCTTGTCCCCTGTGACCAGGCAGTGTTCTCATATCGTCATTTTAAAACTTCAGTACACAATATATTCCAATGTGATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 282773 112 + 647215 TGTGGGACAGTATGTGTAGGGCAGATAACAACAGTCTTGTCCTCTGTAACCATGCAGTGTTCTCATATTATCATTTTAAAACTTCAGTACACTAGATATTCCAGGGTGATAA + +a +s mr.mrrefChr5 145021 10 + 294542 TATAAGCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294067 10 + 636262 TATAGGCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 282885 10 + 647215 TAAAAGCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 145031 63 + 294542 GGGAATCTGACCAGTATCCATGGTTAGCAATATGACATTGGAGTGTGTACAGCTGATAACTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294078 63 + 636262 GGGAATCTGACCAGCATCCTTGGTTAGCAATATGACTTTGGAGTGTGTACAGCTGATAACTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 282895 63 + 647215 TGGAATCTGGCCAGTATCCATGGTTAGCAATATGACATTGAAGTCTGTACAGCTTATAACTAG + +a +s mr.mrrefChr5 145094 25 + 294542 AGATAAGTACTAGGTCAAGGCAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294141 25 + 636262 AGATAAGTACTAGGTCAAGGCAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 282959 25 + 647215 AGATAAGTACTAGGCCAAGGCGATT + +a +s 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AAGCTGGCAAAACATGAGTGCAGATAAGAGACTCCCAAAAAGTATCCAAAACTGCTACCCTTATCGTTATAGGGACGTTAGTAGTGTCTGTCCTTATCTGTGATCCAACCTGACTTACATCTTGTGTTGTCCTGTGTAATGACTGTGATTCGGCAATATGGTAGCCCCCACATAGCCATTGACCTTTGAGAAGGCAGACTCCAACCTAGGGTGATTGTAGTATACCTAACAATGTGACTCTCTGTGTTGGCATGCCCCTACATAAGGCGCTGAATGAGAGAAATAGAGCAAAGAGTCCTTGACTTATGTCATTTAGACCAAAATCGTTAATATGGATACAACTGACAACCTCCAGCTGAGCATTTTGATGCAAGAAAATGAGAGGTACGATATCAATATGTTGTAGCAACAATGGAAGGACATACTAACTCGTTAGTGGGTGCCAACTGGTGCCGTAGATCCTTCAACAAGTACAAAATGATACAATCTACACCGCATGTCAAAGAATCCTACTTAGATGTTGGATCTCCTTTGACTTACACTGATGTAAcatttaatattagaataacaaaccagttagc + +a +s mr.mrrefChr5 145700 61 + 294542 ttatttaacagtgtgattctttaaggtgatgtaaatagaagtcggtcttattctgcttaga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294755 61 + 636262 TTATCTAACAGTGTGATTCTTTAAGGTGATGTAAATAGAAGTCGGTCTTATTCTGCTTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 283586 61 + 647215 gtatttaacagtgtgactctctaaggtgatgtaagtagtagtcagtcttatgctgcttgga + +a +s mr.mrrefChr5 145761 57 + 294542 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AAAACAGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 149052 53 + 294542 ATTTGCACACGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAACATTTTGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298434 44 + 636262 ATTTGCACACGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAAC--------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 289300 53 + 647215 ATTTGCACATGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAACATTTTGAGG + +a +s mr.mrrefChr5 149105 52 + 294542 AGCTACATTACTCTATTCATGGCCTAGGGCAATTTAAGGAAAGGGTGAACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298478 39 + 636262 -----CATTACTCTGTTCATGG--------AATTAAAGGAGAGGGCGTACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 289354 52 + 647215 AGCTACATTACTCTATTCATGGCCTAGGGCAAATTAAGGAAAGGGTGAACTG + +a +s mr.mrrefChr5 149157 197 + 294542 AGACATGAGACATGCATCGCCACCTAATTATCTCATAAGGCAACATAAAATAGTTAAGAGTATGATGTGTGGTGATGGCATAAGGCTGCACTTTGAGAAAATCTAAAAACAGAGAGTTACCTCTAGCCACAGCAATGTGCTCGCACAAGCAGTCTAACAGCACAGCGATGGGCTTGTTCAAAGCATGGAATAAGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298517 193 + 636262 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TAGGGGGTGCACACTAAAGGAACAACGCAACATATCCCTACCTTGTAAGCCTGAAGTCACCGTCCGCATTGTGAGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 289676 78 + 647215 TAGGAGGTGCATGCTAAAGGAACAACACGACATATCCCTACCTTAAGAGCCTGAGCGCGCCTTCTGCATTGTAGGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 149500 22 + 294542 TGTCACTTTGGGAAAGCAAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298865 18 + 636262 TCTCACTTTGGAAAAGCA---- +s simRat_chr6.simRat.chr6 289754 22 + 647215 TGTCACTTTAGGAAAGAAAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 149522 36 + 294542 GAATGGTGGTGGATCATTAGAAATACCAGTTTGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298883 36 + 636262 GAATGGTGGTGGATCATTAGAAATACCAGTTTGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 289777 36 + 647215 GGATGGTAGTGGATCATTAAAAATAACAGTTTGGGT + +a +s mr.mrrefChr5 149558 8 + 294542 GAGGTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298942 8 + 636262 GAGGTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 289813 8 + 647215 GAAATCTA + +a +s mr.mrrefChr5 149566 138 + 294542 CTGCCCTACAGCTCAATCCAGGATTAAGTGGTGTAGCGAAAAATGGTAAAAAATACTATGGTCCCATAGCATAGTAGATGTCTGCTTGCTACACCAGCAAGTCCTAGGTCTTGGGATTAGGTACTCCAACTGCCGACT +s 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---CCTGCTATCTGATCTAGCGTGTGAATCAATCCTAGGCCCACAAATGTTGCTTTGATAGCATGCGTTATGGGTGCTGTCAT---TCAGCAATATAGAATTGACTGTCTAAAACTCATGAGTTATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 295312 128 + 647215 GTCCCTGCTACCTGATCTAGTGGGTGAATCAATCCTATGCCTGCATATGTTGCTTGGCAAGCATGAGTTATGGGTGTTGTTACCCTTCAGCAATGTGGAATTGAATGCTTAATGCTCATGAGTTATGG + +a +s mr.mrrefChr5 154142 18 + 294542 GTGCCATCGGTTGGCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303696 18 + 636262 GTGCCATCGGTTGGCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 295441 18 + 647215 GTGTCATTCTTTGGCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 154160 149 + 294542 ACTGCTTAAAACTAGGCATTGCTAGAACCCCTGCTCACAGTGCATCAAGATGCAAGATACATGAGAAAGGTGCAGATTCTAGCTGTGCATGCCTCCCAGCTTTGGGTTCCAACTTTAACCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303723 149 + 636262 ACTGCTTACAGCTAGGCATTGCTAGAACCCCTACTCAAAGTGCATCAAGATGCAAGATACATGAGAAAGGTGCAGATTCTAGCTGTGTGTGCCTCCCAGCTTTGGGTTCCAACTTTCACCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 295459 149 + 647215 ACTGCTTAAAACTAGGCACTGCTAAAACCCTTGCTCACAGTGGATCAAGATGCAAGATACAGGAAAAAGGTGCTGATTCTAACTGTGCATGCCTCCCAGCTATGGGTTCCAATCTTAAGCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG + +a +s mr.mrrefChr5 154309 57 + 294542 CAAGATTAGGTTGGTTTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACATTGTCCCAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303873 57 + 636262 CAAGATTAGGTTGATGTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACACTGTCCCAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 295608 53 + 647215 CAAGATTAAGTTGGTTTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACATTGTCCC---- + +a +s mr.mrrefChr5 154366 316 + 294542 GAAACCCAAGCTTCACCAATGTAGTAATGACTATCTTGGATCTATAAGATCTTCCTCTAATAACTGGGGAAGGGCAGAATATTGATGAGTTGACTCTAGAGGTGCTAAAATGCTAATATAAATGAATTGTGATACTGAGCCACATGAGTAGTGAAACAAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCTGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCTAGAGCATTCTCTAAGGCTGACAGACATACTTGAGTTTTTACTCCGATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACATAGGGGGAGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303931 306 + 636262 GAAACTTAAGCTTCACCAATGTAGTATTGACTATCTTGGACCTACAAGATCTTCCCCTAATAACTAGGGAAGGGCAGAATATTGATGAGTTGACTCTTGAGGTGCTAAAGTGCTAATATAAAGGGATTGTGATACTGAGCCACATGAGTAGTCAAACAAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCTGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCT----------CTAAGGCTGACAGACATATTTGAGTTTTTACTCCGATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACATAGGGGGAGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 295661 312 + 647215 ----CCCAAGCTTCACCAATGTAGTGATGACTATCTAGGGTCTATAAGATCTTCCTCTAATAACTGGGGAAGGGTAGAATATTTATGAGTTGACTCTAGAGGTGTTAAAATGCTAATATGAATGAATTGCAATACTGAGTCACATGAGTAGTGAACCCAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCCGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCTAGAGCATTCTTTAAGACTGACAGACATACTTAAGCTCTTACTCCCATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACACAGGGGGAGGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 154682 14 + 294542 TAGTGAACAACCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304237 14 + 636262 TAGTGGACAACCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 296021 14 + 647215 TAGTGAACAACCAC + +a +s mr.mrrefChr5 154696 364 + 294542 TACGGGATGACTCTGTGTGGTTAGTTAATTAAGCACCCTTGCCCTAACTTGGGTTCAGTCACGCTTCTCATCTTACTGTTTAACATCAGATCTTTGAAGCCATATCAAAGCTCCCCTATTGTATAACCCTCACAACAGCTCAAGGAACATTTTGCATTCAATCATGGAGGTGAGATTGCTGATGATTCATTTCTACCAGCCTAGGATACCACAAGACCCATGGTGATGAGTGGTTGTGTTAAGGACACACATCTAAGTGTGATCAAGGCACCCAGGGGCCTATGGTTCCTTGAATATCCTAAGAAGTAATTGTAGACTGTCATGATAAGACTGTGATTTGCTTGCAATTTAGTCAGTGTCAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304251 357 + 636262 TATGGGATGACTCTGTGTGGTTAGTTAATTAAGCACCCTTGTCCTAACTTGGATTCAGTCACGCTTCACATCTTACTGTTCAACATCAGATCTTTGAAGCCATATCAAAGCTCCCCTATTGTATAACCCTCACAATAGCTCAAGGAACATTTTGCATTCAATCATGGAGGTGAGATTGCTGATGATTCATTTCTACCAACCTAGGATAACACAAGACCCATAGTGCTGAGTGGTTGTGTTAAGAACACACATTTAGGTATGATCAAGGCAACCAGGGGGCTATGTTTCCTGGAATATCCTAAGAAGTGATTGTAGACTG-----ATAAGACTGTGATTTGCTTGCAATTTCGTCAGTGTCAG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 296038 342 + 647215 TACTGGATGACTCTCTGTGGTTAGGTAATTAAGCACCCTTGCCCTGACTTGGGTTCAGTCAAGCTTCTCATTTTACTGTTTAGCATCAGATCTTTGAAGCCACATCAAAGC-------------------CACAACAGCTCAAGGAACATTTTACATTCAATCACAGATGAGAGATGGCTGCTGATTCATTTCTACTGGCCAAGGATACCACAATACCCATGGGGATGAGTGGTTGTGTCAAGGACACACATCTAAGTGTGAACAAGGCACCCAGAGGCCTATAGTTCCTTGATTATCCTAAGAAGCAATTGCAGACTGTCATGGTAAGACTGTGA---GCTTGCAATCTAGCCAGTGTCAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 155060 54 + 294542 TAGACAGGGTGTCTAACACTGTGAGTATACTAGGTTTGTGGGAGTTATTATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304608 41 + 636262 -------------TGACATCGTGAGTATACTAGGTTTGTGGTAGTTATTATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 296381 54 + 647215 TAGACAGGGTGTCTAACACTGTGAGTATACTAGGCTGGTGAGAGTTACTATTTG + +a +s mr.mrrefChr5 155114 38 + 294542 TCCTATCAACCCAATGGGGTTATGAAATGCCAACTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304650 38 + 636262 TCCTATCAACCCAATGGGGTTATGAAATGCCAACTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 296435 37 + 647215 TCCTATCAACCCAATGGGATTATGAAGTGTCAACTCA- + +a +s mr.mrrefChr5 155152 390 + 294542 TTTTCAGCGGCATTTTTTCAGTGAGTATAGCATGAATTAGATGTACAGGGAGGACAAATTTATTGGCATACACTGATAAAACTTAGGGCAATTTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATGTTACAAGGCAACTGTTCATGCCCTGTTAGATTGCTTTAACACACCATGATCATTCCTACTATTGCTACTGTATACTTGCCTCGGGCATGTGGGCACATGTGTTTGGTATTAATATGCCATGAACCTGCTGTTAATCCTCTAACAATGCTGATTACAATCTTCTTACCTAGGAAAACCAGATAGGCTAACCACATTATTAGGACCTGTATTGGAGGTGTTCGTTTACCCACGTCATGCTCCCAAGTGTGATCCCCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304690 390 + 636262 TTTTCAGCAGCATTTTTTCAATGCGTATAGCATGAATTAGGTGTGCAGGGAGGACAAATTTAATGGCATACACTGATAAAACTTAGGGCAATTTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATATTACAAGGCAACTGTTCATGCTCTGTTAGATTGTTTTAACACACCATGATCATTCCTACTATTGCTACTGTATACTTGCCTCGGGCATGTGGGCACGTGTGTTTGGTATTAATATGCCATGAACTTGTTATTAATCCTCTAACAATGTGGTTTGCAATCTTCTTACGTAGGAAAACCAGATAGGCTAACCACGTTATTAGGACCTGCATTGGAGGTGTTTGTTTACCCACGTCATGCTCCCAAGAGTGATTCCTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 296472 373 + 647215 ---TCAGCGGCATTTTTTCAGTGAGTATAGCATGAATTAGATGTACAAGGAGGACAAATTTATTGGCAAACACTGATAAAACTTAGGGAAATCTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATGTCACAAGGCAACTGCACATGTCCTGTGAGATTACTTTAACACACAATGCTCATT--TACTATTGCTATTGTATACGTGCCTCGGGCATGTGGGCTCATATGTTTGGTATTAATATGCCAGGAGCCTACTGTTAATC----------GCTGATTACAATATTCTTCCCTAGGGAAACCAGATAGGCCAACTACATTATTAGGACCTGTATTGGAGATGTTCTTTTACCCACGTCA--CTCCCAATTGTGATCCCCAGA + +a +s mr.mrrefChr5 155542 247 + 294542 ACCCTTTGCATTAGTCTCAAGGTTATACATATTAGGCTGGATCTCATGTTATCTGAATACATCTGTAGTTGCATCATCACTAAGCTTAATTTGTAATAGTCCATTTTAAAGTCCAATTGATTTTAAGTTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGAGGCCTAAACTATGTGGCATCATCTACCTAACGTTTGGGTAACAATGAGAGTGAAAAAATTTTTCTTTGATGGAGATGTGTAGACAGGGCTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305082 197 + 636262 ACCCTTTGCATTAGTCTCAAGGTTGTACATATTAGGCTGGATCTCACGTTATCTGATTATATGTGTTGTTGCATCATCACTAAGCTTAATTTGTAATAGTCCATATTAAAGTCCAATTGATTTTAAGTTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGACGCCTAAACT--------------------------------------------------TTTCTTTGATTGAGACGTGTAGACAGGGCTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 296845 240 + 647215 ACCCTTTGCATTAGCCTCAAGCTTATACATATTAGGCTGGATCTCATGTTATCTGGATACATCTGTAGTTGCATCATCGCTAAGCTTAATTGGTAATAGTCCATTTTCAAGTCCAATTGATGTTGAGGTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGAGGCCTAAGCTATGTGGCATCATCTACCTAACGTTTGGGTAACAATGAGAGTGAAAAAATTTTTCTTTGATGGAGATGTGTAGACAGG------- + +a +s mr.mrrefChr5 155789 91 + 294542 AACTTATATATCAGCTAAATGACTATGTAAAAAAAATAATATTCCTCTGAGAGATGACGTACACCATATATTACCCTAGGGGATGTAACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305281 91 + 636262 AACTTATATATCAGCTAAATGACTAAATAAAAAAAATAATATTCCTCTGAGAGATGACGTACACCATATATTACCCTAGGGGATGTAACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 297085 60 + 647215 AACTTATAGATCACCTACATGACTATGTTAAAAAAATAAAAT-CCTCTGAGAGATGACGTA------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 155880 128 + 294542 TTGCATAACAGCCATGCCCCCATAACCCAGGTCTTTGTTCCTAATCTGTGTGACATCATTGGAGAGAACAACTGGCATCCAGGTCATCTACTCCTCCAAAGTTATGGCATGAACTCTTAAGCTGTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305373 128 + 636262 TTGCATAACAGCCATGCCCCCATAACCCAAGTCTTTGTTCCTAATCTGTGTAACATCATTGGAGAGAACAACTGGCATCCAGGTCATCTACTCCTCCAAAGCTATGGCATGAACTCTTAAGCTGTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 297145 118 + 647215 ----------GCAATGCCCCCATAACCCAGGTTTTTGTTTCAAAGCTGTGTGACATCATTGGGGAGAACAACTTCCATCTAGGTCATCTGCTCGTCCAAAGTTGTGGCATGAGCTCTTAAACAGTAGT + +a +s mr.mrrefChr5 156008 12 + 294542 GGAAGTGTTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305503 12 + 636262 GGAAGTGTTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 297263 12 + 647215 GGAAGTGTTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 156020 252 + 294542 TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTCTGCTCTATTACATTTATCTATGGAGACTAACGTTCCCTTAAAGTTCTGGTGCTTATCCCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCATATAAGGCCAATCTGTCTACTGCCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCATGATATAACTGAGCTGAGGTTTTTGAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305515 252 + 636262 TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTGTGCTCTATTACATTTATCTATAGAGACTAACGTTCCCCAAAAGTTCTGGTGCTTATCTCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGGACAGCTGGGTCATATAAGGACAATCTGTCTACTGGCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCACGATATAACTGAGCAGAGGTTTTTGAAAATAGAGGATTAAGGTTTAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 297277 252 + 647215 TGAAGCTGTAATTGCTATAATACCCTGGGAAGTTCATGCCTCTTCTGTTCTATTACATTTGTCTATGGAGACTAATGTACTCTTAATGTTCTGGTCCTTATCCCCGAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCACATAAGGCCAATCTGTCTGCTGCCATAACTTTGAAGCATACCTTTTGCCCATCTCCATGATATAACTGAGCTAAGGTTTTTTAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA + +a +s mr.mrrefChr5 156272 72 + 294542 CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAGAAGGTGAGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACAGGGTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305769 68 + 636262 CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAG----TGGGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACTGGGTGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 297529 72 + 647215 CCTGAAGCAATGGGTTTGTGTAGAAGGTGAGTGAGCCCGATTCACATTGAGCTCTATCTGGACAGGATGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 156344 64 + 294542 ATTTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACTTAGAATGGCTAACCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305910 64 + 636262 ATCTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACCTAGAATAGCTGGCCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 297601 64 + 647215 ATTGAGGGGGTTAGCCTGCTCATCAGCACTTACTAATCCGCCGTACTTAGAATGACTAACCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 156408 477 + 294542 CAGTCTGGTGGTTGATGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGGATTGGTATTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATGCCTTTATGTTTCTTTTATCTTAGGCATACTTCCGTCATAAACAGAGTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTCAACCTTATGCTTACACAAGTAAGAACTTAGGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGACAGTCTTGTTAGCACCATTCCTTGTACAGGAACCTCTGATTCGCATTCACAATTCTGCACTACCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACTAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCATACACAAGCTTTTCTCACAGCATGGGTGAGGTGTGGTATAGTGGCTTAATATTTTGGGCACTTTTTCTCTCTGGAAAATCAGTTCAAAGAAGAGCTACATCCAGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306031 473 + 636262 CAGTCTGGTGGTTGATGATTGAAAATTATAAGGTGTGTGTTCTAGTGGATTGGTGTTACAAGGTACGCAT-GCAAGTGTTATGCCTTTATGTCTCTTTTATCCTAGGCATGCTTCCGTCATAGACAGAGTTTGATGTGATG---TTGGGTGACCTCAACCTTATGCTTACACAAGTAAGAACTTAGGTATAGTGTGATAGTCCCATCCAGTTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGACAGTCTTGTTAGCGCCATTTCTTGTACTGGAATCTCTGATTCGCCTTCACAATTCTGCACTACCTGATGAAAGTAGGTACTCACAAAACTAACACATGATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATATATCATACACAAGCTTTTCTCACAGCATGAGTGAGGTGTGGCATAGTGGCTTAATATTTTGGGCACTTTTTCTCTCTGAAAAGTTAGTTCAAAGAAGAACTACATCCAGCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 297665 457 + 647215 CAGTCTGGTGGTTGGTGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGG-----TAGTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATCC------GTTCCTTTTATCTTAGTCATACTTCTGTCATAAAAAGATTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTTAACCTTATGCTTAGACAAGTGAGAACTTAAGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGATAGTCTTGTTAGCACCACTCCTTATACAGGAACCTCTGCTTCACATTCACAATTCTGCACTGCCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACGAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCACGCAAAAGCT--------TGCATGGGTGAGGTGTAGTATAGTGGCTTAGTATTTTGGGCACTTTTTCTCTGTGGAAAATCAG-TCAAAGAGGAGGTACATCCAGCACC + +a +s mr.mrrefChr5 156885 208 + 294542 ATGTAGGATGTCACCCTTGAGTGGCATGGGCAGTGAAACAGCTGGTTTATTAATGTACAACTTCAAGCAGTGTCCCAATGGGTGTAGTCAACATATAATATCAGACCTTCACTACAGAAGGCTCCATACAGAGGTTACACTCACATGCTCTGTCAATCAGAAAGACCCTACATCTATAGGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTATGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306505 208 + 636262 AGGTAAGATGTCACCCTTGAGTGGCACGGGCAGTAAAACAGCTGATTTATAAATGTACGACTTCAAGCAGCGTCCCAATGGGTGTAGTCAACATATAATATCAGACCTTCACTACAGAAGGCTCCATACAGAGGTTACACTCACATGCTCTGTCAATCAGAAAGACCCTACATCTATAGGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTATGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 298122 208 + 647215 ATGTAGGATGTAACCCTTGGGTGGCATGGGCAGTGAAACAGCTGGTTTATTAATGTACAACTTCGAGCAGTGTCCTAATGCGTGTAGCCAATATATAATGTCAGACTTTCACTAGAGAAGGCTCCATACGGAGATTACACTCGCATGCTGTGTCAATCAGAAAGACGCTACATCTATAAGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTGAGCA + +a +s mr.mrrefChr5 157093 196 + 294542 CTTGCTGATAATTTTCCTGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTTACAATCATGTAACAGTGGCTACTTCAATTCCATATGTGAAAGCCAATGCTAGTTGATGATAAAGGTATAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTTAAGTGGCAGACTTGCTGATGCACCAATAAGTTACACACATACTCTAGTCTACAGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306720 196 + 636262 CTTGCTGATAATTTTCCCGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTTACAATCATGTAACAGTAGCTACTTCAACTCCGTATGTGAAAGCCAATGCTAGTTGATGATAAAGGTATAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTCAAGTGGCAGACTTGTCGATGCACCAATAAATTACACACATACTCTAGTCTACAGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 298330 196 + 647215 CTTGCTGATAATTTTTCTGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTCAAAATCACGTAACAGTGGCTACTTCAATTCCATATATGAAAGCCAATGCTACTTGATAACAAAAGTGTAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTTAAGTGGCAGACTTGCTGATGCACCAATAAGTTACACACATACTCTAGACTACAATTGT + +a +s mr.mrrefChr5 157289 182 + 294542 TGCTGCTCTCATGACAGGTAAAAGTGTCTAGGGTTATTCATGTAAATTTCTAGGAACCAACAATTAACCATGACTACAAGGAGCTTGATTTTCACATGTTTCAACATTAAATATCTTTAATCCACATAAGCTGCACCTCAAGACTAACCCTTCTACTATACGACCCTACGCATAGTCCATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306918 181 + 636262 TGCTG-TCTCATGACAGATAAAAGTGTCTAGGGTTATCCATGTAAACTTCTAGGAACCAACAATTAACCATGACTACAAAGAGCTTGGTTTTCACATGTTTCAACATTAAATATCGTCAATCCACATAAGCTGCACCTCAAGACTAACCCTTCTACTATACGACCCTACGCATAGTCCATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 298526 182 + 647215 TGCTGCTTTCATGACAGGTAAAAGTGTCGAGGGTTATTCATGTAAATTTCTAGGAACCCACAATTAACCATGACTACAAGGAGCTTGATTTTCACTTGTTTCAACACTTAATGTCTTTAATCCACACAAGCTGTACCTCTAGACTAGCTCTCCTACTATATGACCCTATCCATAGTCAATGT + +a +s mr.mrrefChr5 157471 86 + 294542 CATGGTCATCTCTATTTGTAACTTAGCCAGTGAATGGCTTCTTGTGGTGCCCTTGAAACACTAGTACCAGATGATGTGGATTCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307099 86 + 636262 CATGGTCATCTCTATTTGTAACTTAGCCAGTGAATGGCTTCTTGTGGTGCCCTTGAAACACTAGTACCAGATGATGTGGATTCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 298709 86 + 647215 CATGGTCGTCTGTAGTTGTAACTTAGTCAGTGAATGGCTTCCTGTGATACCCTTGGAACACCAGTACCAGATGATGTGGATTGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 157557 27 + 294542 ACACTGGTTAACAAGATGCTAATGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307185 27 + 636262 ACACTGGTTAACAAGATGCTAATGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 298799 27 + 647215 AAACTGGTTAACTAGATGCTAATGCCT + +a +s mr.mrrefChr5 157584 28 + 294542 TCTCTTCCTGCTCTGAAACTAAGGTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307212 26 + 636262 TCTCTTCCTGCTC--AAACTAAGGTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 298827 28 + 647215 TCTCCTCCCACTCTGACACTAAGGTGAG + +a +s mr.mrrefChr5 157612 11 + 294542 TTTTGAGTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307240 11 + 636262 TTTTGAGTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 298855 11 + 647215 TTTTGAGTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 157623 366 + 294542 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TATTTGCTTGCTCATCTGCTCTTCTG-TGTGCCATTAATCTTATTTTGGGTTGAATCTATGATTGATATAATGATAAGATCAGTACGATTAATTGGGGGAAACAAACACTGGTGTCTAGAGACACTCCACCTTACAGTTGATTCCTTATTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGTATAGTAGTGCCATTAAGTGGTGTCTATTGTCAAAGGCAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTGACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGTTTTTTCTGTTGCCACTGCCCGTACGTTCCCAGTAAACCAAATTGACCTGAAGATTAATTGCTCTGTCACTCCAGGCATGC---TAGAAGATGT + +a +s mr.mrrefChr5 157989 157 + 294542 AGATCTGTCGGAAATTGTACATTGCTGGAGCAGCAGCACCACACAACCGTATGAGCAGTAAAAAATTGAGGATACCTGTTGAAGAAGAAGTACACTTAGTTGGTGAGAACTATCTGATTGTACCTGATATGTAATTAAGCCAGTTAAAAAAACATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307625 156 + 636262 AGATCTGTCGGAAATTGTACATTGCTGGAGCAGCAGCACCACACAACTGTATGAGCAGTAAAAAATTGAGGATATCTGCTGGAGA-GAAGTACACTTGGTTGGTGAGAACTATCTGATTGTACCTTACATGTAATTAAGCCAGTTAAAAAAACATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 299228 157 + 647215 AGATCTGTCAAAAATTGTACATTGCTGGAGCAGCAGCACCACACAGCCATATGAGCAGTAAAAAATTGAGGATACCTGTTGAAGAAGAAGTACACTTAGGTGGTGAGAAATATCTGATTCTACCTGATATGTAATTAAGCCAGTTAGAAAAACATAC + +a +s mr.mrrefChr5 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GAAGTTTGTTGGGACATCAAGAAGAGTGTCTTGCTGTAGGATCATTTAATCTGGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 305157 57 + 647215 GAAGACTGTTGGGATATCAAGAATAGTGTCTTGCTGTAGGATCACTTAATCTGGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 163687 55 + 294542 TTAATTGTTATATCTAGGCAGATTGGTTAATATAAACCTATTAGAGGTTGCACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313528 55 + 636262 TTAATTGTTATATCTAGGAACGTTTGTTCATATGAACCTATTAGAGGTTGCACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 305215 39 + 647215 TTAATTGTTATATTTAGGCAGATTGGTTAATGTAAATCT---------------- + +a +s mr.mrrefChr5 163742 142 + 294542 CGTTGAACCCTCCTTGGGTAGCTGGCTTGATATGTGTATACTAGACATGATGTGAAGCTGATGCAGTTACAGTCTCATTGTGACAAGCTATTATTAGTGTACTTATTTCAGGTATGTTTAGGTGCTATATGTAGGTAGCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313591 142 + 636262 CGTCTAACCCTCCTTGGGTAGCTGGCTTGATATGTGTATACTGGACACAATGTGAAGCTGATGCAGTTACAGTCACATTGTGACAAGCCATTATTAGCGTACTTGATTCAGGTATGTTTAGGTGCTATGTGTAGGTAGCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 305254 140 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 315566 63 + 636262 TCATGTAGGTCTATGACTATTATCTGGTAGAGGAATGGGGGATTGGGATTACACATGATTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 307213 25 + 647215 TTATGCAGGTCTATGTGTATTATTT-------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 165695 249 + 294542 CATCCAGCACCAACCACCCTAATGTTAGCTCCAAAATGATGTGCCAGAACTCCAGATATGTGGAAAATTAGGTAAGCTTCACCTGACCGAGCTTTGGAATTTGTGGAGGTAAGCCCTAGTATTAATCCTGACTGGATAGCAACTGAAATAAGCTACATTTCACCCAGATGAGTTTAGTGTTTATCAATCATGCAACCAGGAAGGGTTAAACTGGGGCAATCTGGACTTGTACAGCTATATGAGTATCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315635 242 + 636262 CATCCAGCACCAACCACCCTAATGTTAGCTCCAAAATGATGTGCCAGAACTCTAGATATGCGGAAAATTAGGTAAGCTTCATCTGACTGAGCTTTCAAATTT-------CAAGCCCTAGTATTAATCCTGACTGGACAGCAACTGAAATAAGGTACATTTCACCCAGATGAGTTTAGTGCTTATCAATCATGCAACCAGGAGGGGTTAATCTGGGGCAACCTGGACTTGTACAGCGATATGAGTATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 307238 206 + 647215 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aggtcttcatatcttgcacactcctgggatccctggggtgagttgcaagtgattgtaatgtattggctttccgaccatttgctggtagtttcggttggcaagtatctggttcaagttcctgtcttgcaagatcaaaaccacaggtctaactctctgtcctctcactatggctttacttggtttggataccagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta +s simRat_chr6.simRat.chr6 315332 227 + 647215 atgtcttcatttcttgcaccatcctggcattcctggggcgaattctgagtggttgtaatgaattaactgtctggccatttgctggtagtttcgcttggcaagtgtctgggtcaggttcccatctttcaagatcaaaaacaaaggtctaactctctgttctctcactgtggctttactcgatttggatatcagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta + +a +s mr.mrrefChr5 172060 95 + 294542 tccccttaatttcaatggactgtggatcaagaaCTTTAGCAGCTGTGTGGAATGACCTGGAACCATAGCATAGGTAGTCAAAACCAAAAATGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324025 95 + 636262 tccccttaatttcaatggactgtggatcaagaaCTTTAGCAGCTGTGTGGAATGCCCTGGAACCATAGCATAGGTAGTCAAAACCAAAAATGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 315559 95 + 647215 tccccttgctttcaatgaattgtggctcgggAACTTTACCAGCTGTGTGGAATGACCTGTAACCATAGTGTGGGTAGACAAAATCAAAAATGTTC + +a +s mr.mrrefChr5 172155 104 + 294542 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ATAAGGTAGAGGAGGGACAAGGATTAGAACTCTAGAGACCCATATGTTCCAAGAGTTCGCTGAAGCCCATATGTGCACAGAGTTTGCTTTTGAACAATTATATGGGATCCTGGACAGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 320298 120 + 647215 ATAAGGTAGAAGAGTGACCAGGATCAGAACTCTAGAAACCCATATGTTCTCAGAGTTTGCTGAAGCCCACCTGTACCCAGAGCTTGCTTTTGAACAATTATACGGGCTCACAGACAGCGA + +a +s mr.mrrefChr5 177004 66 + 294542 TTTAAATATTATGCATCCTGACCTTGACCTTTAGCTCCCTGCTCTGAAACAACAATACATTAGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328970 66 + 636262 TTTAACTATTATGCATCCTGACCTTGACCTTTAGCTCCCTGCTCTGAAACAACAATCCATTAGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 320424 65 + 647215 TTTAAAT-TTATGGATCGTGACCTTGACCTTTACCTCCCTGCTCTGAAACAACGACACATTAGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 177070 40 + 294542 GCTTACTACTCAGATAATGCTCAATTATTCATAGGAGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329036 40 + 636262 GCTTACTACTCAGATAATGCTCAATTATTCATAGGAGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 320490 40 + 647215 GATTACTCCTCAGATAATGCTGAATTATTCATGGTAGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 177110 40 + 294542 CTACAACTCAGTTGAAATCATGAAAGAAAGAAAGGCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 330537 62 + 636262 TGGTGTAGTTTGAGCATCACTGTGAGGATTAATTGGATGTTTCGGAATCCCAGATGTTTCGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 321881 62 + 647215 TGGTGTAGTTCGAGCATCACTGTGAGAACTAATTGGATGTTTCGGAATCTCAGATGTTTCGG + +a +s mr.mrrefChr5 178485 61 + 294542 AATCCCGGCAGCTATCCTGAGGTAACCGACCTTACTCGGGCTCAATTGGAATCGTTCCGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330600 61 + 636262 AATCCCGGCAGCTATCCTGAGGTAACCGACCTTACTCGGGCTCAATTGGAATCGTTCCGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 321943 61 + 647215 AATCCCAGCAGCTAACGTGAGGTAACCGACCTCTGTTGGGCTACATTGGAATCGTTCCGGG + +a +s mr.mrrefChr5 178546 35 + 294542 TAAACACATTGGGCAGGCTCATTCTAGATGCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330661 35 + 636262 TAAACACATTGGGCAGGCTCATTCTAGATGCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 322016 35 + 647215 TAAACATATCAGGCAGGCTCATTCTAGATGCGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 178581 134 + 294542 AGTGCCGGTCATTGCTTGACAGTGTTTGAATCGGACAGGGGATCTACAATGTACACAGGGGCCTGTCATTGCTTGACAGTGCATGAATCGGACAGGGGATCTACAATGTATGTGAGGAGATCATTTGATGTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330698 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TATACCAGATTATTGGCAGATAGCTCACAGGGCTTAAAGGACTGAATAACATTAGACTAAGTGAAACTTCTTGCAGACCACTCAGTCTCAATCCAGAAACTACTAGCTTCCATTTCCTA + +a +s mr.mrrefChr5 179827 60 + 294542 TTATGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATCTAAAGGGGTGTACTCATGTCAAACACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332312 60 + 636262 TTATGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATCTAAAGGGGTGTACTCATGTCAAACACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 323280 60 + 647215 TTGTGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATTTAAAGGGGTGTACCCCACTCAAATACC + +a +s mr.mrrefChr5 179887 31 + 294542 ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332373 31 + 636262 ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 323340 31 + 647215 ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAGATTT + +a +s mr.mrrefChr5 179918 9 + 294542 CCGGACAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332404 9 + 636262 CCGGACAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 323383 9 + 647215 CCTTACTGC + +a +s mr.mrrefChr5 179927 129 + 294542 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ATTTTGTATTAGGAAGGTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 193765 22 + 647215 ATTTTTTATTAGGAAGGTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 326365 22 + 647215 ATTTTTTATTAGGAAGGTGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 182821 259 + 294542 TCATGGACTAACCAATCCCTCTACACCAAGGGACTGCCTTAAGAAGATAGCCCTTGTACCCAGATCATCTAAGAGCCACTAGAAGTAGGGCACAGTATTAACCTTTCCAGGCACGTGGAGGGAATGTGTCATATTGAGATACCTGCTATATTAATTAATGAAGAGGCCGTGTCAGTAGCACATTTGCCTTAATAATATGGGCTTCCAGCCCTGCCCTCAATTCTCTTATGTTCTAGACATATCCATGAGGCTATGTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335377 259 + 636262 TCATGGACTAACCAATCGCTCTACACCAAGGGACTGCCTTAAGAAGATAGCCCTTGTATCCAGATCATCTAAGAGCCACTTGAAGTAGGGCACAGTATTAACCTTTCCAGGTACGTGTAGGTAATGTGCCATATTGAGAAACCTACTATATTAATTGATGAAAAAGCTGTGTCAATAGCACATTTGCCCTAATAAGATGGGCTTCCAGCCCTGGCCTCAATTCTCTTAGGTACTATACATGTCCATGAGGCTATGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 326387 254 + 647215 CCATG----CACCAATCCCTCTACACCAAGGGATTGCCTTAAGAAGACAGCCCTTGTACCTAGATCATCTAAGAGCCACTAGAAGTAGGGTCTAGTATTAACCTTTCCAGGCACACGGAGGGAACGTGTCAT-TTGAGATACCTGCTATATTAATTAATGAAGAGGTCGAGTCAGTAGAACATTTGCCTTAAGAATATGGGCTTCCAGCCCTGCCCTCGATTCTCTTATGTTCTAGATATATCCATGAGGCTATAGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 183080 130 + 294542 AGCTAGGCTATGCCTACGTATCTGATCCCTTTAGAGTCATATCCACCCCCAGCTTCGACACGACTAAGACAGTGGATACCTAAGCTGGGCCTGCTATACAGTGGTCGGTAGCACCTATTTGACATTTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335636 105 + 636262 ------------------------ATCCCTTTGGCGTCATATCCACCCCCAGCCTCGGCACGACTAAGACAGTGGATACCTAAGATGGGCCTGC-ATACAGTGGTCGGTAGCACCTATTTTACATTTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 326725 130 + 647215 AGCTAGGCTATGCCTACGTATCTGATCCCTTTAGAGTCATATACGCCCCCGGCTTGGACGCTGCTAAGACACTGGATACCTAAGCTGGGCCTGCTGTACTGTGGTCAGTAGCACCAATTTGACATTTATA + +a +s mr.mrrefChr5 183210 94 + 294542 TTGAAAGGGATAGCATACATATGGCCATTGCAGGAGAGTGTCTTAGTGCCCATATAGTCTTACACTCACTTGGTGACAGACAGGATGCAGTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335741 92 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 342963 36 + 636262 ggtagcgaaataaatttgggatatgtacaccaacca +s simRat_chr6.simRat.chr6 334499 36 + 647215 cgtaggaaaatgattttgggatatgtacaccaacca + +a +s mr.mrrefChr5 190542 111 + 294542 cctatcgagctctttatgaaggATCGAACCAACATGTGACCCAAACTTAGTAATTCACCTTCCACCTTACTAGATATAATTGACATGTAACAAGGGCCTACACTAAAATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343000 79 + 636262 cctatcgagctctttaTGAAGGATCGAACCAACATGTGACCCAAATTTAGTAATTCACCTT-------ACTAGATAT-------------------------CTAAAATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 334535 111 + 647215 cttatcgagctctttatgtagaATCAGGCCAGCATGTGACCCAAACTTAGTAATCCACCTTCCACCTTACTTGATATAATTGACATGTAACAAGGGCCTACACTAAAATGA + +a +s mr.mrrefChr5 190653 54 + 294542 GTTATCCCTACCAAGCCTGCACGTGAGCCGGCCACTGATGACATTGGCAAGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343080 52 + 636262 GTTATCCCTACCAAGCCCACTCGTG-GCCGGCCACTGATGACATTGGCAAGGT- +s simRat_chr6.simRat.chr6 334646 54 + 647215 GTTATCCCTACCAAGCCTGCACATGAGCCGGCCACTGATGACATTGGCAAGGTT + +a +s mr.mrrefChr5 190707 221 + 294542 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AATCAACCTCATATTCATTGTCATTTCTTACTTGCCAATTAAGGTTGACACTTGGTGGCACACTGCAAGTAAGGATACCAACCTTAGAAGCCAAAACCAACCTACAAGTACCAGAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343412 119 + 636262 AATCAACCTCATATTCATTGTCATTTCTTACTTGCCAATTAAGGTTGACACTTGGTGGCACACTGCAAGTAAGGATACCAACCTTAGAAGCCAAAACCAACCTACAAGTACCAGAGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 334934 119 + 647215 AATCAACCTCATATTCACTGTCATTACTTACTGGTCAATTAAGGCTGACAATTGGTGGCACACTGCAAGCAAAGATATCAACCTTAGAGGCCAAAACTGACTTACAAGTACCAGAGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 191055 408 + 294542 GTAAAAGAACTGTTACAGTGGCTTAATACTTTTTTAGATGGTTATTTTACATATGGCATTATCTACCGTGGTGGACTAGTTTCTCCAAGAAACATTTTAGTTATAATCTAGTCAAGCTACAATTAAACTCAATGGTGTAAAAAAGCCTTTACTAATGAACTAAACCCTAGACAGGTTTCATTACATGAGGTGGTGGACATACCGGCCACTCAGATTATGGAGATTAAAATGGGTAACAACAAATCGCTAGATTGACTTTCTCCTGGACACAAAGTACTTATGTTAATTTCCCAGGCTCAAATGCTAAGGTCCCTCTTTGTAGATCTGACATGGATTTTTAAGGCAGGGTGCTGGGTATTCAGGGTTTAATATTGTTAATACTGGTGGGGCCTGTATGTGCATTAAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343531 408 + 636262 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GCTGGAGTATGGGAATAATAATGGGATCTAGTTGGATAGAGTATGCTTATATTACTATTTGGGTCCTGCATTAGTTTAGCCACCACCATGAATGATAAGTAGTGGTGGACCCAGGGACTTCTGTGGCTGGCAGGCCCAGTGTAAAGTGCCTATGCCTAGGATCCGCTCCCAAAGGCTCGCAAGTACCTCAAATGTACTAGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGACATATCCCCTTACACTTATACAATTTTTCGGTGCATCAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345087 270 + 636262 GCTGGAGTATGGGGATAATAATTGGACCTAGTTGGATAGAGTATGCTTATGTTGCT-TTTGGGTCCTGCACTAGTTTA-CCACCACCATGAATGATAAGTGGTGGTGGACCCAGGGACTTCTGTGGCTGACAGGCCCAGTGTAAAGTGCCTATGCCTAGGATCCACTACCAAAGGCTCGTAAGTACCTCAAATGTACTAGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGAGATATCCCCTTATACTTATACAATTTTTCGGTGCATCAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 336523 268 + 647215 GTTGGAGAATGGGAATAATAATGGGATCTAGTTGGATAGTGTGTGCTTATATTACTATTTGGGTCCTGCATTAGTTTAGCCGCCACAATTATTGATAAACATTGATGGACCCGGGGACTTCTGTGGCTGGTAGGCCCAGTGCAAAGTGCCTATGTCTGAGATCTGCTCCCTGAGGCTCGCAAGTACCTTAAATGTACTGGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGACACATCCCTTTACACTTACAAAATTTTTTGGTGTATC---- + +a +s mr.mrrefChr5 192814 185 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 338450 39 + 647215 CCATGGTGGCCCTATAAAAGGGGGTCCAAGTGAAGTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 194426 9 + 294542 ACCCCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346972 9 + 636262 ACCCCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 338491 9 + 647215 AACCCATTG + +a +s mr.mrrefChr5 194435 38 + 294542 TGCTGGGTTATTTATGGGGGACAAGACCCTGGTGTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347143 38 + 636262 TGCTGGGTTATTTATGGGGGACAAGACCCTGGTGTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 338500 38 + 647215 TGCTGCGTTATTTATGGGGAACAAGACGCTTGTAGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 194473 175 + 294542 GAAAACATTGAAATAACCGCATTGATCACTGCCAAACTCCATTTCAAAGGGCTATTGGAAAACCGTTCAATCGGAAAAGGTGGTTTTAAGTAATGGTGATGCAGGATTACTGGGATGAATCCAGGTGCTGGGCAGTAGAAAAGTCACTATCTTTAAAAAATAGTAAAAACAGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347181 175 + 636262 GAAAACATTGAAATAACCGCATTGATCACTGCCAAACTCCATTTCAAAGGGCTATTGGAAAACCGTTCAATCGGAAAAGGTGGTTTTAAGTAATGGTGATGCAGGATTACTGGGATGAATCCAGGTGCTGGGCAGTAGAAAAGTCACTATCTTTAAAAAATAGTAAAAACAGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 338543 175 + 647215 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CAAGTGCTCTTTCACAGGTATCAGGTATAGGTGGGATTCAACACCCCAAAGTTATAAACAAAAAAGTTACATTTTACAAAGGTGTGTGCTACAACCATAATTGAGCTTATAGTAAGCCAAGCTTCTCAAAGGTTAACTCATTTGGGAATACAACCCTTATATATCCATGGGGATGACAGAACAGTCCTAAATGTGGACACTCCTAACTAGCCCATTCCTAGTTATTGAGGCCACACTTGTGCTTGTCTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGACTATGAGTGGGGTGCGGCCATTGGCAAGGTTCTGTAGGAGTTGCTGTGAGGTTTGAATGGCCACCCTATTTTATGAAGCTTGAAACTAAGGGGTCAATGTTTTTTTCTGTGTTGATGCTATCCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351713 407 + 636262 CAAGTGCTCTTTCACAGGTATCAGGTATAGGTGGGATTCAAAACCCCAAAGTTATAAACAAACAAATTACATTTTGCAAGGCTGTGTGCTACAACCATAATTGCACTTATAGAGAGCCAAGCTTCTCAAAGATTAACTCATATGGGAATACAACCCTTATATATCTATGGAGCTGACAGAATGGTCCTAAATGTGGACACT-CTAACTAGCTCATTCCTAGTTATTGGGGCCACACTTGTGCTTGCGTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGAGTATGAGTGGGGTGCGGCCACTGGCAGTGTTCTGTAGGAGTTGCTGTGGGGTTTGAATGGCCACCCTATTCTATGAAGCTTGAAACTATGGGGTCAATGTTTTTTTCTGTGTTGATGCTATCCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 343008 389 + 647215 -------------ACAGGTATCA-GTATAGCTGGGATTCAACACCCAAAAGTTATAAGCAAAAAAGTTCCATTTTACAAAGGTGTGGGCTACAGCCATAATTGAGCTTATGGTATG-CAAGGTTCTCAAAGGTAAACTCATTTGGGAATACAACCTTTCAATGCCCATGGGGATGACAGAACAGTCCTGAATGTGGACACTCCTAGCTACCCCATTCCTAGTTATTAAGGCCACATTTGCGCTTGTCTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGACTATGAGTGGGGTGAGGGCATTGGCAAGGTTCTATAGGAGTTGCTGTGAG----GAATGGACACCCAATTTTATGAAACTTGAAACTAAGGGGCCAATGTTTTTTTCCTTCTTGATGCTATCCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 199271 46 + 294542 CCTATAGACAGAGAACCAAATGAATTGTGCTACAGTGGCTGGTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352120 46 + 636262 CCTATAGACAGAGAACCAAATGAATAGTGCTACAGTGCCTGGTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 343429 46 + 647215 CCTATAGACAGATAACCAAATGAATTGTGCTACAGTGGCGGGTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 199317 83 + 294542 GAAGCTTCTTGTTGCATATTTCTGGCACTCATTATAAAGTGGTCAGTGTCTCCAGCCAACCATGCTCAACAGGCTTTAATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352167 83 + 636262 GAAGCTTCTTGTTGCATATTTCTGGCACTCATTACAAAGTGGTTAGTGTCTCCAGCCAACCATGCTCAACGGGCTTTAATATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 343475 76 + 647215 GAAGGTTCTTGTTGCATAATTCTGGCACTCATTATAAAGCGGCCAGTGTC-------AACCATTCTCAACAGGCTTTAATGTT + +a +s mr.mrrefChr5 199400 347 + 294542 CAGGGCCCAGATCTAACACATAATGAACCCAATTCTTTGTAGGTAGGAGGTTTGTGGAACAACAAGTTACTGTGTATAAACTGTTTTTACCAGTTTTGATGCCTTAGCTCCCCGACAAGCAAGCTACTGTTCTATCTGTATTATGTTAGTAGCAAAGAGCATAATAATTCAGTGGGCAACATTTGGCTGATCTATCTTTTATTGCTAACTGATTATCTGAAGGGCACCTAGAAGTGCTTTGTGCCATCACCATTAATCTATGTGCACTAGTTGGCTTTCACGTCCCCGTACTGGCATCCAAATAGTGAACAAGGCCTGCTGGACACTCTGTAAATAGGAACTAACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352251 342 + 636262 CAGGACCCAGATCTAACACAT-ATGAACCCAATTTTTTGTAGGTAGG----TTCAGGAACAACAAGTTACTGTGTATAAACTTTTTTTACCAGTAGTCATGCCTTAGGTCCCCGCCAAACAAGCTACTGTTCTATCCGTATTATGTTAGTAGCAGAGAGCATAATAATTCAGTGGGCAACATTTGGCTGATCTATCTTTTATTGCTATCTGATTATCTGAAGGGTACCTAGAAGTTCTTTGTGGTATTACCATTAATCTAAGTGCACTCCCTGGCTTTCACGGCCCTGTACTGGCATCCAAATATTGAACAAGGCCTGCTGGACACTCTGTAAATAGGGGCTAACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 343551 346 + 647215 CAGGGTCCAGAACTAACACATAATGAAACCCGTTCTTTGTAGGGAGGAGGTTTGTGGAAGAACAAGTTAGTGCGTATAAACCGTGTTTACCAGTTTTGATGTCTTAGCTCCCCAACAAGAAAGCTACTGTTCTGTCTGTATTATACTGGTAGCAAAGAACCCAATAATTCAGTCAGCAACATTTGGCTGATCTATCTTTTATTGCTAACTGATTATCTGAAGGGCACCTAGAAGTGCTTTGTGCCCTCACCTTTAATGTATGTGCACTAGTTGGCTTTCACCTCCCCGT-CTGGCATCCAAATAGTGACCAAGGCCTGCTAGACACTCTGTAAAAAAGAACTAACCC + +a +s mr.mrrefChr5 199747 50 + 294542 ATGCCAAAGAGATGCACTCTACAATAACCCCTTGATAACCTTAAGAGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352596 50 + 636262 GTGCCAAAGAGATGAACTCTACAATAACCCCTTGACAGCCTTAAGAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 343897 49 + 647215 ATGCCAAGGAGATGCATTCAACAATAACCCCCT-ATAACCTTAAGAGAGA + +a +s mr.mrrefChr5 199797 151 + 294542 GCATGTGAAAATTACCTCATGTTTAGGCCAAAATAACCCTTAGGTCCATGTAACTCAGGGCAATTGTTGCCAGAGAGATAGGAAGTTGATTTGAACTTCAGTGTTGCAAATACCTCATTCAATAAGTTCCTTCTGTTCCAGGTACCAGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352646 139 + 636262 GCATGTGAAAATTACCTCATGTTTAGGCCAAAATAACCCTTAGGTCCACGTAACTTACGGCAATTGTTGCCAGGGAGATAGGAAGTTCATTTGAACTTC------------ACCTCATTCAATAAGTTCCTTCTGTTCCAGGTACCAGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 343978 151 + 647215 GCATGTGAAAATTACCTCATGTTTAGGCCAACATAACCTCAAGGGCCATGTAACTCAGGACAATTATTGCCGGACAGATAGGAAGCTGATTTGAACTTCAGTGTTGCAAATACCTCATTCAATAAGTTCCTTCCATTCCAGGTGCCAGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 199948 6 + 294542 TTTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352785 6 + 636262 TTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 344137 6 + 647215 TTTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 199954 126 + 294542 GAATGTAGCTCTGTTTGAGACTAAGCTCCAATGTTGCCTCTCCTCATGAGAGCTCTGTAGCGATGTAGTAAGCAGGTTATTTTCGCTCATATTCTAGCTCAAGAACAGGCTCTAAGAGAATCAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352791 123 + 636262 AAATGTAGC---ATTTGAGACTAAGCTCCAATGTTGCCTCTCCTCATGAGAGCTCTGTAGCGATGTAGTAAGCAGGTTATTTTCGCTCATATTCTAGCTCAAGAACAGGCTCTAAGAGAATCAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 344151 126 + 647215 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CCTGAAGTAAACAACTTCATGTATACATCACATGCTGCTTCACGTGTACTGCTGCGTCCTCTCAGTGAGACTCATCTTATGGCCATTGGGTATTTGCCCATAAGCTGGTATATTCCCAAGTATGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 344836 127 + 647215 CATGAAGTAAACAACTTCATGTATACATCACACGCTGGTTCACCTTTACTGCTGCATCCTCTCAGGGAGATTCTCCTCATGGCCATTGGGTATCTGCCCATAAGCTGGCATATTCCCAGGTATGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 200667 31 + 294542 CCAGGCTGGTATAGCCCTTGAGAAGTGACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353205 29 + 636262 CCA--CTGGTACAGCCCTTGAGAAGTGACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 344963 31 + 647215 CCAGGCTGGTATAGCCCTTGAGAAGTGACCA + +a +s mr.mrrefChr5 200698 64 + 294542 ATCAAACTGGTTTAGACATTTTAGATGAATCTAACGGGTTCTTAAGATTGCGACATAATAGGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353236 63 + 636262 ATCAAACTGGTTTAGACATTTT-GATGGATCTAACGGGTTCTTAAGATTGCGACATAATAGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 344994 64 + 647215 ATCAAGCTGGTCTATACATTTTAGATGAATCTTTCAGGTTTTTAAGATTGCAACATAATAGGGC + +a +s mr.mrrefChr5 200762 105 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 345232 86 + 647215 TCTGATACAAGTCTCACCTGAGTGCAAACAAGTCTCACCTTAATGTAAATTATTGCCGCAAACTGAACTAATAATGCACAGTGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 201013 130 + 294542 AGAAAGAGGTGGTATAAATAGTGGATTTAGTTAGCTCTCATAGTAGGCAGCATAATCCTCACCAATGTTGTTAAAAGGGCACTGACAGCGCAATTCCTATGCATAATCATTTGAACAAGACATTGTCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353537 130 + 636262 AGAAAGAGGTGGTATAAATAGTGGACTTAGTTAGCTCTCATAGTAGGCAGCATAATCCTCACCAATGTTGTTAAAAGGGCACTGACAGCGCAATTCCTATGCATAATCATTTGAACAAACCATTGTCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 345318 122 + 647215 AGAAAGAGGTAAGATA-------GATTTAGTTAGCTCTCATAGTAGGCAGCATAATCCTCTCCAATGT-GTTAAAAAGGCATTAACATCCCAATTCCTAGACATAATCATTTGAACAAGACACAGCAGAC + +a +s mr.mrrefChr5 201143 8 + 294542 CTGATTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353667 8 + 636262 CTGATTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 345458 8 + 647215 CTGATTCA + +a +s mr.mrrefChr5 201151 55 + 294542 TACAGCCTCATATGTATGACCCTGACTTCCTTCATTCTCGAAAGGGGTATATGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353677 34 + 636262 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TGACTGCTTAGAGTTCATAAGGATCTTACAATATAGACTCTCTTCACAGACATGACAGAATGATATGGAATCAAGTTACTACAATGAGAATTTAGACTGTATCTGCTATGCTGCAAGGTGTGTCTTCCACCCTCAGGCTGTCTGATTGGACCAGTTGAGACCCCCACAGAAGCCTATATCACATTCTACAGCACTGAGAGCAGGCCATGGGTAGGGGTAGCTGTCAGACATGTTGCTGATACACAGCCAATGGGAGTCAAACTTCAGACTCCATAACCCTGTGCTAGGACTCAACACAAGAGCAAGACACAATTTTTCTTGGACCCATTTCTTTTTCCTATTAAGAATTAGAACAGCAAGGGAAAGGGCGTTGCCAGTAGGGAAGAAAATATGGTGAAAAGAGTAATCATAAGTGATCTGTAGACATAACCTCACAGGAGGATATAGCCTCTAAAGCGAGGCTTGCAACAGCTTTCCATCATTGGGACTTCACACAGGCTACATTGTGGCACAGAGTATGATATCATGATTCAATGTGTTGGTAAGGATTGGTTGACCTACCTTGATCCACAA-TTGAGGCTAAGCTGTAAGGCAGTCTTTTACCCCCCTTGCTTCAAACTTTCATAGGGCCAGGTATGGACCACTAATATCACTAAAGGAAAGTGAGGCCAATATACTATATACATGATAGTTGATC + +a +s mr.mrrefChr5 201984 32 + 294542 CATTGCTAAATTGAAGTAGCATAGGATGCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354484 32 + 636262 CATTGCTAAATTGAAGTAGCATAGGATGCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 346298 32 + 647215 CATTGCCAAATTGGAGTAGCATAGGGTGCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 202016 72 + 294542 ACTTCATCCTAAAGGATCACCCTGATCAAAGTCTGCTTAGTCATGGATGTGTAGATCAGTCTGAACAAGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354516 72 + 636262 ACTTCATCCTAAAGGATCACCCTGATCAAAGTCTGCTTAGTCATGGATGTGTAGATCAGTCTGAACAAGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 346331 72 + 647215 ACTTCACCCTAAAGGATCACCCTGATTAAAGTCTGCTTAGTGACAGATGTGTAGATCAGTCTGAACAAGCGC + +a +s mr.mrrefChr5 202088 17 + 294542 AGAGATTCAATTGGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354599 17 + 636262 AGAGATTCAATTGGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 346403 17 + 647215 AGAGATTCAATGGGCCT + +a +s mr.mrrefChr5 202105 8 + 294542 tgtcagga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354616 8 + 636262 TGTCAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 346425 8 + 647215 tttaagga + +a +s mr.mrrefChr5 202113 90 + 294542 cagaagaaaagaagtttgtggatatagggcaccaaaagcttaggccttgggacaaattcttcaatacttatttggctgaaaaggtacagg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354624 90 + 636262 CAGaagaaaagaagtttgtggatatagggcaccaaaagcttaggccttgggacaaattcttcaatacttatttggctgaaaaggtacagg +s simRat_chr6.simRat.chr6 346434 90 + 647215 caaaagaaaagaagtttgtggatatagtgaactaccagcttaggacttggaacaaatttttcaacacttatttggctgaaaagggacagg + +a +s mr.mrrefChr5 202203 66 + 294542 ctgggttaagaaacaaaaaggagtacagatgaccttttcagaacaagcgtacaatacacaaaaaga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354714 66 + 636262 ctgggttaagaaacaaaaaggagtacagatgaccttttcagaacaagcgtacaatacacaaaaaga +s simRat_chr6.simRat.chr6 346528 66 + 647215 ctggcttaagaactgagatggattacgaatggcctgttcacaacaagtgcgcaatacacaaaaaca + +a +s mr.mrrefChr5 202269 34 + 294542 gaataacatgattaaaaaatgaactagacatcaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354784 34 + 636262 gaataacatgattaaaaaatgaactagacatcaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 346594 34 + 647215 gaatggcatgattaaaaattgaagtacaaaccag + +a +s mr.mrrefChr5 202303 93 + 294542 gcacccaattgcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacgagaagaactgtgtttattcatggtcagcctattgcactcgtctagaccaggg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354821 93 + 636262 gcacccaattgcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacgagaagaactgtgtttattcatggtcAGCCTATTGCACTCGTCTAGACCAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 346628 93 + 647215 gcacccaatggcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacaagagtaagtttgttgagtcatgatcggcctattgcaccagtaagcatcaggg + +a +s mr.mrrefChr5 202396 44 + 294542 aactttaccttttcctGATTGGTCCATCATACAAATGTGCTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354921 44 + 636262 AACTTTACCTTTTCCTGATTGGTCCATCATACAAATATGCTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 346721 44 + 647215 aactttaccttttcctGATTAGTCCAGCATACAAATGTGCTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 202440 137 + 294542 GTGTGATAATACAGTGTAGAGAACAAGGTGTTATGGTTCCATGTAACACCTATCTAATAGTCCTATAACAAGATTGAAGGGACAAAAGAATAAATAAAATACAAGAGGATACTGTCATTTCAAATTTAGTTAGGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354970 137 + 636262 GTGTGATAATACGGTGTAGAGAACAAGGTGTTATGGTTCCATGTAACACCTATCTAATGGTCCTATAACGAGATTGAAGTGACAAAAGAATAAATAAAATACAAAAGGATACTGTCATCTCATATTTAGTTAGGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 346765 134 + 647215 GTGTGATAA-ACAGTGTGTAGGACAAGCTGCTATGGTTCCATGAATCACCCATCTAATAGTCCTGTAACAAGATTGAAGGGACAAAAGAATAAATGAAAGACAAGAGGGTACTGGCACTTCAAATTTAGT--GGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 202577 77 + 294542 GTTTGATATTTGGTTAGACAATTAATGAGCAGTTAAGCAGTGAATCAACCCCACCCTACCATCCTAGGTAGAGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355118 77 + 636262 ATCTCATATTTAGTTAGACAATCAATGAGCAGTTAAGCAGTGAATCAACCCCACCCTACCATCCTAGGTAGAGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 346899 77 + 647215 GTTTGTGAGATGTTTAGGCAAATAATGAGCAGTTACGTAGCGAATGAACCCTACCCTACCATCCCAAGTAAAGGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 202654 39 + 294542 ATGTGATTGGGTTTGTGGTAGCTGAGTGGCTAGTACCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355198 39 + 636262 ATGTGATTGGGTTTGTGGTAGATGAGTGGCTAGTACCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 346976 39 + 647215 ATGTGATTAGCTTTGTGGTAGCTGAGCGGCTAGTGCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 202693 237 + 294542 TCTTAGACCATAATGAAAAGTAACTAAATAATCAGTCCTAGGAATAATTACTCAAATATTGTTATGTTGCATATATATAACTATCCAATGACAGATCCATATTCCTGCTTGTATATTATAGATACCGTAAGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGTAGTTCCCCTGAATTAGTAATGAAATTGTAGCAACCTGCAGCTGGTCTCATCCACATTGTAAGGACATGTGTTGGGGCTAGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355237 237 + 636262 TCTTAGACCATAATGAAAAGTGACTAAATAATCAGTCCTAGGAATAATTACTCAGATATTGTTATGTTGCATGTATATAACTATCCAATGACAGATCCAGATTCCTGCTTGTATATTATAGACACCATAGGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGTAGTTCCCCTAAATTAGTAATGAAATTGTAGCAACCTGCAGCTGGTCTCATCCACATTGTAAGGACATGTGTTGGGGCTAGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 347061 235 + 647215 TCTTGGACCGTAATGAAAAGGAAATACATCCTCAGTCCTGGGAATAATTACTCAAATGTTGTTATGTTGCTTATATATAACTATCCAATGACAGATTCATATTACTACTCGTATATTATAGATACCGTAAGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGCAGTTCCCCTGAATTAGTAATCGAATTGTAACAACCTGCAGCTGGTCTAATCCACATTGTGAGGACATGAGT--AGTCCAGTATG + +a +s mr.mrrefChr5 202930 120 + 294542 AGTAGAGATGGAGTACACTGGATAAGAGTACTAGTCCACGCTAAGCAACAACACCTGTCTTGAGACTCAAATATTAGCAGAGTCAAGGATGGTGTTACAGTGTATGATAGTCCATCATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355474 119 + 636262 AGTAGAGATGGAGTACACTGGATGAGAGTACTGGACCACGCTAGGCAACAACGACTGTCTTGAGACTCAAATATGAGCAGAGTCAAGGATAGTGCTAC-GTATATGATAGTCCATCATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 347296 120 + 647215 AGTAGAGATAGAGCACACTGGATAAGAGTGCTAGTCCACGCTTAGCAACATCACCTGTCTTGAGACTGAAATATTAGCAGAGTCAAGGATGGTGTTACAGAGTATGATAGTCCATCATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 347416 97 + 647215 CAT----------------------GTGTACTAGTCCACGCTAAGCAACAACACCTGTCTTG-GACTCAAATATTAGCAGAGTCAAAGATGGTGTCACAGGGTATGATAGTCCATCATGG + +a +s mr.mrrefChr5 203050 554 + 294542 CATGTCATCTTGACCACAATTTGACCAATGCAGATAACACGATTGTAATGTTGGGTCCCTGTTGCAAGCAGCTCAAGGTTAGGATGATGTTTATATCTGATCACAGTGCAAAGTTGTGCAAATTCTGTGGCCTTTAACTTTTACATGAGTGCTGGTAGTGTATCAAGACACCGGAATTTCTAAAGTGCAGGGAACTCAGTATTGTGGAACATGGGAGTTATGCATGGTGACTTTTGAATAGGATATTAAAAGTTGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAATAATTTCAGATCCTCCTATAAGTTCCTGTGAGGCTGCTTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGACACTCCTTGTTGATCATTTTACTGTCTAGTTCCTATGTATTATTATGCCTTCTGTGAGTTTCCCTTCTGCTCCACTATAACAGTTTGGATGCTGCAGAGGGACTGGATAAACATGAATGAACGTGAATTCTATTATTGCATCAAATCACTGGATAAACACATCATTAGACCCTCTAATGATTATCACACTGTTTATAGCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355593 544 + 636262 CATGTCATCTTGACCACAATTCGACCAATGCAGATAATAGGATTGTAATGTTGGGTCCATGTTGCAAGCAGCTCAAGGTTAGGATGATGTTTATATCTGATCACAGTGCAAAGTTGTGCAA----TGTGGCCTTTAACTTCTACATGAGTGCTGGTAGTGTACCAAAACACCGGAGTTTCTAAAGTGTAGGGAACTCAGTATTGTGGAAGATAGAAGTTATGCATGGTGACTTTTGAATATAATATTAAAAGTGGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAATAATTTCAGATCCTCTTAT-CGTCCCTCTGAGGCTGCTTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGATGCTCCTAGTTGATCATTTTACTGTCTAGTTCCTATGTATTACCATGCCTTCTGTGAGTTTCCCC-----TCCACTATAACAGTTTGGATGCTGCAGAGGGACTGGACAAACATGAATGAACGTGAATTCTATTATTGCATCAGATCACTGGATAAACACATCATTAGAGCCTCTAATGATTACCACACTGTTTATAGCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 347513 536 + 647215 CATGTCATCTTGACCATAATTTGACCAATCCAGATAACACCAGCAT-ATGTTGGGTGTCGGTTGCAACCAGTTTAATGCTAGGATGGTGTTTATATCTGATGACGATGCAAAGTTGTGCAAATTCTGTGGCCTTTTACTTTTACATGATTGCTGGTAGTGTATCAAGACACGTGAATTTCTAAAGTGCAGGGAACTCAGCATTGTGGAACATGGGAGTGATCTGTGGTGAGTCTTGAATAGGATATTAAAAGTTGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAGTAATTTCAAATCCTCCTAGAAGTTCCTGTGAGGCTGCCTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGACACTTGTTGATGATCATTTTAC----------------ATTATTATGCCTTCTGTGAGTTTCCCTTCTGCTCCACTATAACAGTTTGGATGTTGCAGAGGGACTGGATAGACATGAATGAACATGAATTCTATTATTGCATCAAATCATTTGATAAACAC-TCATTGGACCCTCTAATGATTATCTCACTGTTTCTAGCTCA + +a +s mr.mrrefChr5 203604 27 + 294542 AGTCATTATGAAAAAATCTAGGATGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356137 27 + 636262 AGTCATTATGATAAAATCTAGGATGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 348052 22 + 647215 AGTCATTATGAAAAAATCTATG----- + +a +s mr.mrrefChr5 203631 389 + 294542 AAGGGCAGACTAAGGTGAGTCTTGCCATTGGGTGGTTCCCACTAAGTACTGATTGCAAGGCATCCTCAGAGCTGGTCAAACACACATACTTGCCGCACAGATTGTAGTGACATATTACTAACTTGATTCACTCAGTTGTACAATTGTTAAATTCTACAAAGGAGGTGAATAAAGTCTGTTGTGCCAGATTTACTGGTCATGACGCATACTGAATGAGAATCATGATTCAATTGTGTTAATAAGGTCATGCCCTGTGCTTTTGGGTAAGAAGACAGTAGCAAGCTAAGTTGCTGTACCACCAGATGTGGCAGTCAATTTTTGTCCTCACCATAGGGGATCTTGTGTGATACATAGCACATATAAATTCACAGCTGCACTTTATTTACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356170 372 + 636262 AAGGACAGACT--GGTAAGTCTTGCCATTG------TCCCACTAAATACTGATTGCAAGGCATCCTCAGAGCTGGTCAAACATACAT--------CACAGACTGTAGCGACATATTATTAACTTGATTCATTCAGTTGTACAATTGTTAAATTCTACAAAGGAGGTGAATAAAGTTTGTTGTGCCAGATTTACTGGTCATGATGCATACTGAACAAGAATCATGATTCAATTATGTTAATAAGGTCATGCCCTGTGCTTTTGG-TAGGAAGACAGTAGCAAGCTAAGTTGCTGTACCACCAGATGCGGCAGTCAATTTTTGTCCTCACCACAGGGGATCCTGTGTGATACACAGCACATATAAATTCACAGCTGCACTCTATTTACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 348074 381 + 647215 -AGGGCAGACTAAGGTGTGTCTTGCCACTGGGTGGTTCACAGTAAGTACTAGTTGTAAGGCATCCACAGAGCTGGTCAAACCCACATACTTGCCGTACAGATTGAAGTGACATATTACTAACTTGATTCACTCAGTTGTACAATTGTTACATTCTACAAA--AGGTGAATAAAGTCCGTTGTCCCACATCCACTGATCACGACGCATACTGAATGAGAATGACGATTCAATTGTGTTAATAAGGTCGTGACCTGCGCTTTTGGGCCAGAAGACTATAGCAAGTTATGTTACTGTACCGCCAGATGTGGCAGTCAATTCTTGTCCTCCCCATAGGGGATCTTGTTTGATGCTTAGCACATATACATTCA-----GCATTTTATTTTAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 204020 341 + 294542 ATACGGTTCCCCAAGGCAGCCTATATCAAACTACAGAAAGTATGTCAGCTTAGACTGGTTAATTGAAACTAAACCAACATATTAAGTCGATCTGGCAGCCCTTCGAAAGGAATCCCTTAGCACGGACTTCAGTCCACCAGCGCTTTTATGGCCCGCTGGTCCGCGACAATAACGGAGATGAAGGTGAAAAAAAAGACGTACGAAGTTCGTGGTTGGATCATGTCCGACCTTGCCCGAAGAACCTAACTGGCCTACTGCACTCATCAATCACAGAACTTTCTTTCAGTATCATGCTGGTCTATCCATAGATATGCCACATCATAGAGACCCTATGGTTATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356543 337 + 636262 ATACGGTTCCCCAAGGCAGCCTATATCAAACTACAGAAAGTATGTCAGCTTAGATTGGTTAATTGAAACTAAACCAACATATTAAGTCGATCTGGCAGCCCATCAGAAAGAATTCCCTAGCACGGACTGCAGTCCACCAGCGGTTTCATGGCCCGCTGGTCCGCGATAATAACGGAGATCAAGGTGAAAAAAAAGACGTACGAAGTTCATTGTTGGATCATGTCCGAC----CCTGAAGAACCTAACTGGCCTACTGCACTCATCAATCACAGAACTTTCTTTCAGTATCATGCTGGTCTATCCATAGATATGCCACATCATAGAGACCCTATGGTTATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 348455 328 + 647215 ATACAGTTCCCCAAAGCTGCCTATATCTAACTACAGAAAGAATGCCAACTTAGACTGGTTAATTGAGACTAAGCCAACATACTAAGACGATCTGGCAGCCCTTCGAAAGAAATCTCTTAGCACGGACTTCAGTCTACCAGCGCTATTATGGCCTCCAGGTCCGCGACAATAACGGAAATGAAGGTG-------------ACGGAGTTCGTGGTTGGATCATGTTCGACCTTGCCCGAAGAACCTAACTGGCATATTGCACTCATCAACCACAGAACTTTCTTTCAATATCATGCTGGTCTATCCATAGATGTGCCACATCATAGAGAGCCTATGATTATCC + +a +s mr.mrrefChr5 204361 254 + 294542 CCACCATTTATTGCTGAGACAAGATTTAGCTATCTTAATATATGGCTCTATTTAGACATACCTATGTCCTACCATATTGCCCGTTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTGTCCTTGACCTCAGAGAACTCCTGGATAAAGTATCAACACTAAAGAGTGAACTGTCATTGCCTATGAGCATGTGCCCTTTTCATTGATCCAGCCCTTTGGCTGCTCTTTACAAGCTAGGTTAGTTGCAATGTGTTGGATCAAATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356881 252 + 636262 CCACCATTTATTGCTAAGACAAGATTTAGCTATCTTAATATATGGCTCTATTTAGACATACCTGTGTCCTACCATATTGCCCGTTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTGTCCTTGACCTCAGAGAACTCCTGGATAAAGTATCAACACTAAAGAGTGAACTGTCATTGCCTAT--GCATGTGACCTTTTCATTGATCCAGCCCTTAGGCTGCTCTTTGCAAGCTAAGTTAGTTGCAATGTGTTGAATCAAATACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 348783 228 + 647215 CCACCATATATTGCTGAGACAA-------------------------CCCTTTAGACATACCTA-GTGCTACCATATTGCCCATTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTATTGTTGACCTCAGAGAACACCTGGGTAAAGTATCAACTCAAAAGAGTGAACTGTCATCGCCTATGAGTGTGTGCGCATTTCATTGATCCAGCCCATTGGCTGCTCTTCACGAGCTAGGTTATTTGTAATGTGTTAGATTGAATATT + +a +s mr.mrrefChr5 204615 15 + 294542 CGTCAATTGGTAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357133 15 + 636262 CGTCAATTGGTAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 349096 15 + 647215 CATCAATTGGTAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 204630 54 + 294542 CTGAGGCATCTACAGCTAGGTTACTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357148 54 + 636262 CAGAGGCATCTACAGCTAGGTTACTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 349117 54 + 647215 CTGATACATCTGCAGCTAGGTCATTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCGTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 204684 180 + 294542 TTGGTAGTACAGAGCCCGAGGCATCTACAGCCCTATCTTGCCCCAGCTAGTACTTGATCAGCAGAGGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTATATTTCCTCTATTGGACACTAGTGAATTGTGCACTCAAATTCAATATGACCAAACGTACAAGAGGTACATTCTACGCCTCCTCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357206 180 + 636262 TTGGTAGTACAGAGCCCGAGGCATCTACAGCCCTATCTTGCCCCAGCTAGTACTTGGTCAGCAGACGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTAGATTTCCTCTATTGGACACTAGTGAATTGTGCACTCAAATTCAATATGACCAAACGTACAAGATGTCCATTCTATGCCTCCTCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 349171 169 + 647215 TTGGTAGTGTAGAGTCAGAGACATCTACAGCCTTATCTGG-CCCAGCTAGTACTCAATCAGCAGAGGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTATATTTCCTCTTTTGGACACTAGTGGATTGTGCACTGAAATTCAATATGACCAAACGGACAAGAGGTACATTCTACG---------- + +a +s mr.mrrefChr5 204864 222 + 294542 GAGTCTAGACTTGACATGGTTTAATAAAATTATACAGGAAAAGATGAAGTGATGTGACTGAGCCAATTGATAAATCAGTTTCCCTAACTATATGTCTAGCATTTGGTGCTACAAAAGGGTACCGGCCCTCTACAATCCACTTTCAAAAGATTGCATCTCCTGTATGTTATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTAAGTCTGCACAGCTTTATAGGCATGCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357392 209 + 636262 GAGTCTAGACTTGACATGGTTTAATAAAATTATACAGGAAAAGATGAAGTGATGTGACTGAGCCAATTGATAAAGCAGTTTCCCTAACTACATGTCTAGCATTTGGTGCTACAAAAGGGTACCGGC-------------CTTTCAAAAAACTGCATCTCCTGTATGATATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTAAGTCTGCACAGCTTTATAGACATGTGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 349340 199 + 647215 -----------TGACATGGTCTAATAAGATTATACAGG-AAAGATGAAGTGATGTGACT-----------TAAATCAGTTTCCATAACTATATGTCTAGCACTTGGTGCTACAAAATGGTACTGGCCCTCTACAATCCACTTTCAAATGATTGCATCTCCTATATGTTATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTCAGTCTGCACAGCTTTATAGGCATGCAGTT + +a +s mr.mrrefChr5 205086 254 + 294542 TATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTACAGCTAGTTAACCTTGTTTTGATACTCTTGTCTAGAGTTATTGTTTGATACCTAGTTAAACAAAAAACGGAGTAATGTATATACTCTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGTGGAACAGTTCTCATAGACAAAAATTGTCATTTATTGTTGAAGATAGTAGTACAAGAATCCATTCTCAATTTATCCCCTATGCATCATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357611 251 + 636262 TATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTACAGCTAGTTAAGCTTGTTTTGATACTCTTGTCTAGAGTTAGTCTTTGATACCTAGTTAAACAAAAAACGGAGTAGTGTAT-TACTCTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGTGGAGCAGATCTCATAGACAGAA--TGTCATTTCTTGTTGAAGATAGTAGTACAAGAATCCATTCTCAATTTATCCCCTATGCATCATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 349539 253 + 647215 GATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTCCAGCTAGTTAGCCTTGTATTGATACTCTTGTCTAGAGTTATTGTTTCATACCTAATTAAATGAAAAACAGAGTCATGTATATACTTTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGCAGAACAGTTCTCATAGACAAAAATGGTCACTTATTA-TGAAAATAGTAATACAAGAATTCATTCTCCATCTATCCCCTATGCATTATTTA + +a +s mr.mrrefChr5 205340 55 + 294542 TCTTTCTTTGTTCTCATGCCAAAGTGCCCTGGGTGTGGTCCGTTTATAGTTTAAC +s 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AATTTGAGCTTAAGATCAGAACAGGGTGACCGTATGATGGTGCTTCATGACAACTATCTCTTTATTATCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 350234 73 + 647215 AATTTGAGATTAAGATCAGAACAGAGTGACTATATGGTAATGCATCATGACAACTATCTCTTTATTATCACTG + +a +s mr.mrrefChr5 205805 9 + 294542 gcagctcTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358347 9 + 636262 GCAGCTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 350497 9 + 647215 gcagcccTT + +a +s mr.mrrefChr5 205814 11 + 294542 GAGTGACTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358357 11 + 636262 GAGTGACTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 350506 11 + 647215 GAGTGGCTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 205825 108 + 294542 TTTGGCTCCTGAGGGGATGAGCATGCAATCAGGgatcacttctttgtttcaccattaattccctttcatttcttggattgcaattagttaatgccattttttcacctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358369 108 + 636262 TTTGGCTCCTGAGGGGATGAGCATGCAATCAGGGATCACTTCTTTGTTTCACCATTAATTCCCTTTCATTTCTTGGATTGCAATTAGTTAATGCCATTTTTTCACCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 350517 108 + 647215 TTTGGCTCCTGGGGGGATAAGTATGCAATCAGGgcttccatctttgtttcactgttaattccctttcatttcttggattgcaattagttaatgacctcatctcacctc + +a 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AAGAGTCCAAGCATTAACTGCTTTGTTTATCAaatcagttggccagaattagtgttacagcaaggagtactttgctttt + +a +s mr.mrrefChr5 207994 22 + 294542 gcctctaatgcactcctactaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360931 22 + 636262 gcctctaatgcactcctactaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 352555 22 + 647215 gcctctaatgcacccctactaa + +a +s mr.mrrefChr5 208016 148 + 294542 atatgattatgtgtgtgctgaactccctatataactgatgttataagggcccagtccctgctggtgatgattccattaatgcagtgcctttaggtactataattagcctctacattgggctgactctcccccagtcccaccatgaccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360969 148 + 636262 atatgattatgtgtgtgctgaactccctatataactgatgttataagggcccagtccctgctggtgatgattccattaatgcagtgcctttaggtactataattagcctctacattgggctgactctcccccagtcccaccatgaccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 353215 148 + 647215 ATATAATTACGTGTGTGCCGAACTCCGTATAAAACTGAGGctataaggacccagctcctgctggtgatggttccatcaatgcggtgcttttaagtactatgattagtctccacattgggctgactctcccccagtcccaccatgactc + +a +s mr.mrrefChr5 208164 89 + 294542 ctatctgatacttcaggtagagatctctcactgttcatttcataatacaccactgatctctccactgaactacggtcttcaatctgaac 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 361269 118 + 636262 TTCAGAGCATGATGTGGTAGTTGGTAGAAACTTACTCATAGAGTGACTCAGTTCAAAAGTCACTCAGTTTAAACAACGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 353529 118 + 647215 gtgggAGCATAATGTGGTAGTTGGTAGAAATTTACTCATAGAGTGATTCAGCTCAAGACTCACCCAGTTTATACAATGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 208413 119 + 294542 AGAAGCCGTCATTTCCAGCAAGACAGCAATGGGGTAAAACTTGAGGACCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAAGAATACAGCTTGAGGGGGGCCCGAGATTTAAGATCATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361387 119 + 636262 AGAAGCCGTCATTTCCAGCAAGACAGCAATGGGGTAAAACTTGAGGACCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAAGAATACAGCTTGAGGGGGGCCCGAGATTTAAGATCATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 353648 119 + 647215 AGAGGTCTTCATCTCCAACAAAACAGCAATGGGGTAAAACTTGATGTCCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAGGATTACAGCTTGAGGGGGGCCCCAGATTTAAGATCATGG + +a +s mr.mrrefChr5 208532 50 + 294542 CCATGATTCTAATGCATGTCAACACTAGCCCCTTGGCACTTAATTCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361508 50 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 361728 18 + 636262 CTTGTGAGAGACCCACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 354042 18 + 647215 CTTCTGATTGCCTCAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 208765 72 + 294542 GGAATCCTTGCAGCTCCTTGTTTAGAGGCTCCATGGGAAGCTGTGGCAAGCAATCCCAAGTGACTCCCTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361746 72 + 636262 GGAATCCTTGCAGCTCCTTGTTTAGAGGCTCCATGGGAAGCTGTGGCAAGCAATCCCAAGTGACTCCCTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 354068 72 + 647215 GAGATCCTCACAGCTACTTGTTTAGGGGTTCCACGGGAAGCTGGATCCAGGAATGCCAAGTGACTCCCTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 208837 193 + 294542 TGGTAGATTCAATCCTACTCCACTAGTTCCCCCACAAGTTCTACTAACGATGCCCATATGCCCCCCAGAGTGGTAACCAACCCAAAAGCCAGCTGTATGACTCTATGTGTGCCATATAGATTGAAGGGCCGCAGCTTCCAGATGGTATGCCGACAATCTCCAGAGGTGTTAAAACTTTCTGGATGTGAGGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361821 193 + 636262 TGGTAGATTCAATCCTACTCCACTAGTTCCCCCACAAGTTCTACTAACGATGCCCATATGCCCCCCAGAGTGGTAACCAACCCAAAAGCCAGCTGTATGACTCTATGTGTGCCATATAGATTGAAGGGCCGCAGCTTCCAGATGGTATGCCGACAATCTCCAGAGGTGTTAAAACTTTCTGGATGTGAGGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 354140 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AAGATCACTTACATTTCACCTAAGTGCTCAGAAGTACAGTCCATACTTAAGTTCAATGGACCTTTTAACCTGGCCATGAGCCATCCAAAATTATGTGTATCCATACATCCACACACTTGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 356310 121 + 647215 GAGATCACTTACACTCCACCTAAGTACTTAGA--GGTAGCCCACAAGTAACTTCAATGGATCTTTTAACTTGGCCATGAGTCATCCAAAATTATGTGTATCCATACACCCACACATTTTTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 211060 104 + 294542 GTAGTTTTGAGGCTGCATTGCTGTCATTCATAATGTTTGAGTCCAGCAATAAACTTGTACATCACAATTATGGCATTAAGCCCACCGCCAGCTGTACCCATATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364012 97 + 636262 GTGCTTCTGATGCTGCATTGCT----TCCCTAATGTTTGAGTCCAGCAATAAACTTGTACATCACAATTATGGCATTAAGCCCACCGC---CTGTTCCCAGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 356431 104 + 647215 GTAGTTTTGTGGCTGCATTGCTGTCAGTCACAATGTTTGAGTCCAGCAATAAACTTGTACATCACAATTATGGCATTAAGCCCACCTCCAGCTGTACCCTTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 211164 1 + 294542 C +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364109 1 + 636262 C +s simRat_chr6.simRat.chr6 356539 1 + 647215 C + +a +s mr.mrrefChr5 211165 131 + 294542 ACCCTAAACTAGGCATGCATTACACCTTTTGATGATGAACCCAATAAAACCATTGAAACAACTGAAAAAATAAAATTGGATGCATTGGCATTCCATGCCCAATGACACACACAACCACTGTGTAGGTCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364111 131 + 636262 ACCCTAAACTAGGCATGCATTACGCCTTTTCATGATAAACCCAATAAAATCATTGAAACAAAAGGAAAAATAAAACTGGATGCATTAGCATTCCATGTCCAATGACACACACCACCACTGTGTAGGTCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 356540 131 + 647215 ACCCTAAGCTATGCATGCATAACACCTTTTGATGATGAACCCAATGAAACCATTGAAACAACTGAAAACATAAAATTGGATGCATTGGCAGTTCATACCCAATGACACACACAACCACTGTGAAGGTCGAT + +a +s mr.mrrefChr5 211296 49 + 294542 ATAAAGGCAAAATTATTAACATTAAAGTCTAGGTCAACCATGTTGTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364242 49 + 636262 ATAAAGGCAAAATTATTAACATTAAAGTCTAAGCCAACCATGTTGTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 356703 46 + 647215 ATAAAGGCAAAATTATTAAGATTAAAGTCTGGATCCAC---ATTGCCAG + +a +s mr.mrrefChr5 211345 52 + 294542 CTTAAGATTAAGAGGAGTGAGTAGCCTACAGTACAATTTTATGCATTTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364295 52 + 636262 CTTAAGATTAAGAGGAGTGAGTAGCCTACAGTACAATTTTATGCATTTGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 356749 52 + 647215 CTTAAGATCAAGATGAGTGAGTGGCTCACAGCACAATTTTATGCATTTTGCA + +a +s mr.mrrefChr5 211397 87 + 294542 TCCCAAGCGACCCTAGGTGTCCTCATTGCCTAGTTTATGAGAGTGTTGGCCAAACACAGCTTTGGTGATGGGATTTTCACTAGCGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364348 87 + 636262 TCCCAAGCGACCCTAGGTGTCCTCATTGCCTAGTTTATGAGAGTGTTGGCCAAACACAGCTTTGGTGATGGGATTTTCACTAGCGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 356801 87 + 647215 CCCCAAGCAACCTTAGGTGTCTTCATTGCTTAGTTTATGAGAGTGTTGTCCAAACACAGGTTTAGTGATGGGATTTTCACTGGTGGT + +a +s mr.mrrefChr5 211484 42 + 294542 TAAGAATACATCTGTATTTTAAACAAGAATTTGGGTGCTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364435 42 + 636262 TAAGAATACATCTGTATTTTAAACAAGAATTTGGGTGCTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 356894 42 + 647215 TAAAAAGAAGTCTGTATCTTTAGCGAAAATTTGGGTGCTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 211526 19 + 294542 CTGACTCTGCTAGTGGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364479 19 + 636262 CTGACTCTGCTAGTGGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 356936 19 + 647215 TTGACTCTACCAGTGGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 211545 204 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 369780 48 + 636262 ATACACACTTCCTTATGTAGCCCTGCTACATTAGCATCTCATGTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 362205 48 + 647215 ATACACACTTTCCTTTGTAGCCCTACTACATTAGCATCGCATGTATGT + +a +s mr.mrrefChr5 216888 40 + 294542 GAGTCAGACAGGCCCATGGTTACTATATGCTAGAAGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369870 40 + 636262 GAGTCAGACAGGCCCATGGTTACTATATGCTAGAAGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 362253 40 + 647215 GAGACAGACAGGCCCATGGTTACTATATTCTAGAAGCATA + +a +s mr.mrrefChr5 216928 309 + 294542 ATCTATCTGGTATCACCTGTGTATTCTCATGGCTACATAGACAAGAGGTTGCAAACAATGCATATCAATTTCCAAAATTTCCAAAATAGAGACAAATTTGAGGACTTCATAGGATGTAGGAACAATGAAATCTTTCAAAGTGTTTGGCTGTCTGTAGTACTCCCAGTGTTTGTGGCTCTATGTCATTTTAATTTGGGAAGTTGCAGGAGATGAGACCACTAGGACCCAATCCTAATTTGTGTCAAGGTCCATGATTCAGCTAATTCTATAATGCCATTGCCTTAAAGACATCTGTCACTTAATACAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369910 306 + 636262 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CCCGCACTAGTATACATCAAGTAATAGCAAATCCAGGCTGTATTTATATATGGTC-TTATCAGTGGTCATAAGCTCCTTCAGTGTCCTCCTGATAGAGCTGGATGCAGTCTGCTGGTCTCTTTAGAGTCAGAACGGTTAAATGCAGATGTCTTTTCTTAATGTCTGTTCTAGTTACTTGTCTTATGAGTAGGCAACTTTGTAGTACTTACCTCAGGTCATGGCACTGGTACTACAGCAGGTAAGGCTTACCAGTAAGTTGTTGTATGATATCCGAAACAAGATGAGAGGTGACAGTCATTCATTGTACAGAGATGTGCAGGGAAAAAGATCATTATGATACTCCCAGTAGCCATGATAGTTGGGAATAATTGAATAGGGCCAAAGTTCATTATGGTTTCCCCAGTAGCCATGGTAGTTGGGAACAATTGAATGGGGCCAAAGCAGCTACAACCAATAAGCTCCTAC--------------------------GTAAAACATTGTGATATGCATACCGTGGTTGAACTTAGATTTGAGAGGGAGAGGGAATAACAATTTATGTCATACTAGATTCACCTGCTGTAGGGAGGGGGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 224006 182 + 294542 TGTATGCATGGTTATAGACCTCTTATGTCTCCTTTACAAATTGTTTAAGTGTCTCGCTTAGTGTTGGTATTTATAAGTTTCCATTACAACCACCCGTATAATATTATCCTAATGGAAAAACCAAACTGTTCTAAGCACAGAATGATGTGTTTATGTCTTGCCTTAATGTCAGAACATTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 175065 182 + 636262 TGTATGCATGGTTATAAACCTCTTATGTCTCCTTTACAAATTGTTTAAGTGTCTCGCTTAGTGTTGGTATTTATAAGTTTCCATCACAACCACCCGTATATTGTTATTCAAATGGAAAAACCAAGCTGTTCTAAGACCAGAACAATATGTTTGTTTCTTGCCTTTATGTCAGAACACTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 369650 182 + 647215 TGCATGCATGGGTATAGACCTATTATGTATTCTTTGTGTATTGTTTAAGTGTCTCACTTAGTGTTGGTATTTATAAGTTCCCATTACAACCACCCGTATAATATTATCCTAATGGAAAAACCAAACTGTTCTAAACACAGAATGATGTGTTTAAGTCTTACATTAATGTCAGAACATTTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 224188 715 + 294542 CACCCATGTGAAAAAAGTGTTTCTTAGAGGAATGTAATGATGTGGACATAACATGATAGGTGTGTAACTGTGCATTTCTCTTGTGCTTTATCTAGATACAATCTCTAATTTTTGTAAGGATGAAAGACAAAATCCCCCATGGACTCCAGTACTACTCTTGGTGTAAGAAATATGGCTTTAGTCCCAGTGCCAGTTGAATTAAATCTTGCTAAACATAGATATTGTATATTCTGCTTTACTGGGTCTTTCTCTAGCAACTCACCCAAAGGCTCCGCCCCCTTTCTGATGCTCTTGTAAGTCCATAACTTATGATGCCAATAATGAAGCTGAACTGCCTTTCATGTCATGTTAACTAAGTAACAGGTGATGGGCTGTGGCATCCTTATTACTGCTCTAGACAACTAGCACCTTGGGAGTGCACACCAGGTTGCTGTGAGCATGTGTCAGCACTGTAAAAGTTCCACTGCACTAGGATACATGGTCTAAAAGTTAGGATTTAACAGTAACAAAGGTCTGGCGTTCTACCCCCCTCCCAGTGCTAATGTGAAACATCTCTTTTTCTACTGGAATAGGCTGAGCATAAAGACTTAAAGTTGCTGTTACATGCTATGTGCAAAGAGGTGGCACGCTAAATGTAAGGCCAACGAATTAGCAGAGATGATATGATGAGTTCAGTTCTTCAATTCTGTCCTACACAGGGGAATATAGTTCCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 175249 711 + 636262 CACCCATGTGAAAAAAGTGTTTCTTAGAGGAATGTAATGATGTGGACATAACATGATAGGTGTGTAACTGTGCATTTCTCTTGTGCTTT-TCTAGATACAATCGCTAATTTTTGTAAGGATGAAAGACAAAATCCCCCATGGACTCCAGTACCTCTCTTGGTGTAAGAAATATGGCTTTAGCCCCAGTG-CAGTTGAATTAAATCTTGCTAAAGATAGATATTGTATGTTCTGCTTAACTGGGTCTTTCTCTAGCAACTCACCCAAAGGCTCTGCTCCCTTTCGAGTGCTCTTGTAGGTCCATAACTTATGATGCCAATAACGAAGCTGAACTGCCTTTCATGTCATGTTAACTAAGTAACAGGTGAT-GGCTGTGGCATCCAAATTACTGCTCTAGACAACTAGCACCTTGGGAGTACACACCAGGTTGATGTGAGCATGTGTCAG-ACTGTAAAAGTTCCACTGCTCTAGGATACATGGTCTAAAAGTTAGGATTTAACAGTAACGAGGGTCTGGCGTTCTACCCCCCTCCCAGTGCTAATGTGAAAGATCTCTTTTTCTACTGGAATAGGCTGAACATAAAGACTTAAAGTTGCTGTTACATGCTATGTGCAAAGAGGTGGCACTCTAAATGTAAGGCCAACGGATTAACAGAGATGATATGATGAGTTCAGCTCTTCAATTCTGTCCTACACAGGGGAATATGCTTCCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 369832 702 + 647215 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CAAAATGCTAGTGCTGAGGTCCCAACAAATCCTTTGATGTATATAGAATATAACTTGAGGACTCCCAACCTACAAACTTTATATA + +a +s mr.mrrefChr5 225187 75 + 294542 gacgacatCTGGTAGACTCCACCTAAGAAGCAGCCCTAAGTGCATCCCAATTGATATATGTGTGTGTACTACCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176262 75 + 636262 gacgacatCTGGTAGACTCCACCTAAGAAGCAGCCCTAAGTGCATCCCAATTGATATATGTGTGTGTACTACCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 370807 75 + 647215 GACAGAATGCAGTCGCCTCCACCCAAGAACCAGCCTTAAGTGCATACAAATATATATATGTTTGTGTACTACCCG + +a +s mr.mrrefChr5 225262 41 + 294542 TTTTTCAACATTTAAAATAAGACCCAATTTCATTGCAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176337 41 + 636262 TTTTTCAACATTTAAAATAAGACCCAATTTAATTGCAGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 370883 41 + 647215 TTTTTCAACATTTAAGAGAAGACCCAATTTCATTGCTTAGG + +a +s mr.mrrefChr5 225303 278 + 294542 AGTTCAATGGTTCTATGACTGAGACAGCAGAATTGAGGCCTGGGACGAGCATAATTGAGGCCTTGATGGGGATGATTGCAGTATGAAGCATGAGCAATGGTGGATACTGAATCCAGATTATAACTCACAGGGTTACAATGACCATTCTCAGCTGTCTTTGTGTCCCTCTTTACCATCACCTTAAGCAGGTACCTTGGAATCGCCAGGGCTGGTGTCCCAAACTATTATAGAAATAATTATAGAGAAAGTTGGGGACACCAGGGCCTTGAGCCATTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176378 160 + 636262 AGTCCAATGCTTCTATGACTGAGACAACAGAAGTGAGGACTGGGACCCGCATAATTGAGGCCTTGATGGTGATGTTTGAAGTATGAAGCATGAGCAATGGTGGATCCTGAATCCAGATCATAACTCACAGGGTTACAATGACCATCCTCAGCTGTCTTTG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 370926 278 + 647215 AGTTCAATGGTTCTATGTCTGAGACAGCAGAATTGAGGCCTGGTACGAGCATAACTGAGGCCTCCATGGGGATGATTGCAGTACGAAGAATGGGCAATGGTGGATACTGACTTCAGGGTATATCTCACAGGGTTACAATTACCATTCTCAACTCGCTTTGTGTCCCTCTTTACCATCACCTTAAGCAGGTACCTTGGAATCGCCAGGGCTGGTGTCCCAAACTATTATAGAAATAATTATAGAGAAAGTTGGGGACACCAGGGCCTTGAGCCATTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 225581 39 + 294542 TCATTTTGATGGGCGCAATTTGGTACATTGGACTTTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 371206 39 + 647215 TCATTTTGATGGGCGCAATTTGGTACATTGGACTTTATA + +a +s mr.mrrefChr5 225620 9 + 294542 ACATTCGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 371248 9 + 647215 ACATTCGAA + +a +s mr.mrrefChr5 225629 248 + 294542 CTATATAGATGAAATGAAACAGAGTTGCCAAGTTAAATGTCCTAGTGGTTTTCACATGAATCATTATGCTTTTTTGAGCCCAGCTGGAGCCAGAGTTGTGTAAAGGCTTTCCTACTCAAGCTACTGAAAACTCATTCTGGTTCTTGTGCATCTGGTAATGTTATTATTATCTCTAAGTCACATAAATATCAGAACCTGAGCTACACAAGCAAAATCAGAACATCTGACATCTTTTTGTAGCTCATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176538 231 + 636262 ----------GAAATGAAACAGAGTTGCCAAGTTGAATGCCCTAGTGGTCTTCACATGATTCATTATGCTCTTTTGAACCCAGCTGGAGCCAGAGTTGTGTAAAGGCTTTCCTACTCAAACTACTGAAAACTCATTCTGGTTCTTGTGCATCTGGTAGTGTTATTAGTATTTCTAAGTCACACAAATA--AGAACGCGAGCTACACAAGCAAAATCAGAACATCTGACATCTTTTTGTAGCTC----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 371319 245 + 647215 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TGTGGTAGGTCTAGGTCCTGGGTAGTTACATAATTTAGTTCCATACATTAATGTGAG------AAAGGTGTGTCCACACCTCTAAGGCTAGCCTGGCGAGACAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 373453 69 + 647215 TGCGGTAGGCCTGGGTTTTGGGTAGATACATAATTTAGTTCCATACATTCGTGTGAGGCAGCCAAAGGT------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 227887 60 + 294542 CCGCCAGGCTCTGACTAGAATAGATATGTATGTAGCTTTGACCACTTGATGAGACCATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179004 55 + 636262 CCGCCAGGCTCTGAGTAGAATAGATATGTATGTAGTTTTGA-CAATTGACGAGA----AA +s simRat_chr6.simRat.chr6 373522 60 + 647215 CTGCCAGGCTCTGACTAGAATAGATGTGTATGTAGCTTTGACCACTTGATGAGACCATCC + +a +s mr.mrrefChr5 227947 112 + 294542 CTACCCTAAAGGTATGCTGTCATAGTAGGTTCCCAGACTATGGAGATTAAACACTGTCTCATTGTATGTCACTATTACATTACCCCTTCCTCAATGTATCTTAACAAGTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374277 112 + 636262 CTACCCTAAAGGTGTGCAGTCATAGTAGGTCTGCAGACTATAGAGATTAAATACTGTCTCATTTTGGGTCACTATTACATTCCCTCCTCCTCAATGCATCTTAACAAGTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 373582 112 + 647215 CTACCCTGAAGGCATACTATCATAGTAAGTTCCCAGAATTTGGAGATTAAACACTGTCTCATTGTATGTTGCTATTACATTAACCCTCCCTCAATGTATCTCAACAAGTTGA + +a +s mr.mrrefChr5 228059 73 + 294542 TTGATTTATATGAGCCTCTACAAAGTCTTATGAATATGCAAGCTACAAGATGCCTTTTTTAGGCTCACAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374390 73 + 636262 TTGATTTAGATGAGGCTCTACAAAGTCTTATGAATATGCAGGTTACAAGACACCTTTTTTAGGCTCACAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 373694 73 + 647215 TTGATTGATATGAGCCTCCACGAAGTTTTATGAGTTTGCAAGCTACAAGATGCCTTTTTTAGTTTCACAGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 228132 321 + 294542 GAAAAGTGAGGATCTAAGTAAAGGTAAACCGTAAGGAACAAAAAGAACAAAGTCTAGGATAGAGGACACAAGAGTTAACTTTGCTCTTACCAAAGACAATTTTTAGATACTTTCACTCACTCAAGACGCCACTAAGTATACTGAGCTTTAAGTTACTTAGAAATGCATGGATAGTTTTGTATTCCCCTCAATTCCAGGTCTCTCAGGACCTCACTTTGGGCAAAAGACCAGAATCACACAGGTATAATCAGCTGTGTTGTGCATGTCAGCGATGGTGCAACTCTTATTATGCAATCCTGAATGGCTATTACATACCATTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374463 321 + 636262 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TGTTGTTTAGATTTCAGCACAGTGCCTGATGCAATGCTATAATAAAAGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 229427 222 + 294542 AACACAGCCATGTACTTTTGGTTATTGCTTGGCCATGAGCCTGCCCACTTTAGGAGATGTTAAGCGATCACAGAAGGAGTCTGCCCACATCATGCAAGAGGTTAGTCATGCACAGCTCCCTACGTACATTCTATATCCCCTGTCCACCTCATGCTAATGCATCTTCATTGTGGTGGCAGAAACAAGGAAAGAGAGAAGGAAAGCCTTCAATGGTAATTTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375862 218 + 636262 AACACAGCCATGTACTTTTGGTTATTGCTTGGCCATGAGCCTGCCCACTTTAGGAGATGTTAAGCGATCACAGAAGGAGTCTGCCCACATCATGCAAGAGGTTAGTCATGCACAGCTCCCTACGTACATTCTATATCCCCTGTCCACCTCATGCTAATGCATCTTCATTGTGGTGGCAGAAGCAGG----GAGAGAAGGAAAGCCTTCAATGGTAATTTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 375059 220 + 647215 AACACAGCCATGTACTCATGGTTATTGCATGGCTATCAGTCTGCCCTCTTGAGAAGATGTTTAGCGATCACAGAAGAAGTCTGCCTGCCTCATGCAAGAGGTTTGTCATGCAGAGCTGCCCACGTACATTTGAGATCCCCTGCCCACCTCATGCTTATGCACCTTTATTGTGGTGGCAGAAACAAGGAAAGAAAGAAGGAAAGCCTTCAATGG--GTTTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 229649 156 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 375663 230 + 647215 GATCACATGAGTGGGTGACTCATGAGGACTACTGTCTG-ATCCTTTTGATTGTACAATACAAAGTATACTGAAAATACAAATGCCATAAAGCTGCCATGG-TATGGTCAGTCATAACAATAACTCTAAACAATACCCTACCATTCCTATATTTTGGTTCAAAAAACAATCCATTTTATCCCCTTTATCCACACACCTTGCCAGCATGACTATAGAACCTTGCTCTCTAAGAG + +a +s mr.mrrefChr5 230206 261 + 294542 AAATGCACGCATTGTACAACACTGACCCTATGCATGTGAAACTTGCACCTTATTATCCTTTGACCAGCAATATTTTTGGTAATTGTGTGTACCTAGTGTTAGACAGTGATTTCTCCATAGATACATGGTGACCACCAGGCTTTTCATAATTGGGAGTATGGAACCCTAGTAGCTACGAGCAAACCCATCAGTCATTTGCATGGGAGAGTATATTCTTCTCAGCATGATGATACCTTCCTTTTTCCAGAATAGACCAGCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376628 261 + 636262 AAATGCATGCATTGTACAACACTGACCCTATGCATGTGAAACTAGCAGCTTATTATCCTTTGTCCAGCAATATTTTTGGTAATTGTGTGTACCTAGCATCAGACAGTGATATCTCCATAGACACATGGTGACCACCAGGCTTTTGATAATTGGGAGTATGGAACCCTAGTAGCTACGAGCAAACCCATCTGTCATTTGCATGGGAGAGTATATTCTTCTCAGCATGATGATACCTTCCTTTTTCCAGAATACACCAGCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 375894 259 + 647215 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TATTCAGGGAGTATCTTCTGTGTTTTTTTGAAGAGACTATTTTCCGCTGGGATCGACTGTTGTAATGGACACTCAAGTAACTGGTAAACCTGAGCAGTAGTCAGGCATGCATGAAACGGTCTTACTAAGTTGTTGCAGGGCATTCTAGCCATGAAAATGCACCAATTAGTGGGGAGACCATTTTTTTAGGCAGAAACTTGTGTCTGGTTTTTTAGGCTGAAACTCATGTTGGTTTGCTGTACAAGAGTAAATATCTAATATCAGCATAGAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377887 261 + 636262 TATTCAGGGAGTATCTTCTGTGTTTTTTTGAAGAGACTATTTTCCGCTG------------GTAATGGACACTCAAGTAACTGGTGAACCTGAGCAGTAGTCAGGCATGCATGAAACGGTCTTACTAAGTTGTTGCAGGGCATTCTAGCCATGGAAATGCACCAATTAGTGGGGAGACCATTATTTTAGGCAGAAACTTGTGTATGGTTTTTTAGGCTGAAACTCATGTTGGTTTGCTGTACAAAAGTAAATATCTAATATCAGCACAGAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 377199 262 + 647215 TATCTAGAGAGTATCTTCTGTGTTGTTTTGAAGAGACTATCTACCAATGGGATCGACTGTTGTAATGGACACTCAAGTCGCTGGTAGACCTGAGCAGTAATCAGGCATGCATGAAACAGGCTTACTAAGTTG----------TTCTTGCCATGAAAATGTACCAATTAGTGAGAAGACCATTTTTCTAGGCCGAAA-TTGTGTCTGGTCTTCTAGGTAGAAACTTGTGTTGAGTTGCTGTACAAGGATAAATATCTAATATCAGAATACAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 231720 18 + 294542 CTATAATATGAGATTAAA +s 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simRat_chr6.simRat.chr6 379295 1 + 647215 c +s simRat_chr6.simRat.chr6 194599 1 - 647215 c + +a +s mr.mrrefChr5 233480 7 + 294542 ctgtgca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380087 7 + 636262 ctgtgca +s simRat_chr6.simRat.chr6 379296 7 + 647215 ccatgaa + +a +s mr.mrrefChr5 233487 38 + 294542 ggcaaaatgttactcttaattggtatattcacagttgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380120 38 + 636262 ggcaaaatgttactcttaattggtatattcacagttgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 379303 38 + 647215 ggcgacattcctgtcttaattggtaggtacacacctgg + +a +s mr.mrrefChr5 233525 49 + 294542 gtggcaacagtcttttgttcctatgacccacacagcatgttatggacca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380160 49 + 636262 gtggcaacagtcttttgttcctatgacccacacagcatgttatggacca +s simRat_chr6.simRat.chr6 379341 49 + 647215 gtggtaacgggcttttgatcctttggcccacacaGCAcattatggacct + +a +s mr.mrrefChr5 233574 43 + 294542 gtgaaaccaggcccctcttagatgaataagtggcagaattttt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322446 43 + 636262 gtgataccaggctcctctcaaatgagtaagtggcaaaATTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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simRat_chr6.simRat.chr6 194665 4 - 647215 gtgg + +a +s mr.mrrefChr5 233643 83 + 294542 taatagtctcttgctcctttgccccacacaatgcctttgacttaataatatcccactcccgtttgttgattcgcagcctcgca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380284 77 + 636262 taacaatctcttgctcctttgccccacactatgctttttacttaataatatcccactcccctttgttgattcacagc------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 379457 83 + 647215 taatggtctattgctcctttgccctacacaatgccattgacttaataatatcccactcctgtttgctgattcgcagcccctca +s simRat_chr6.simRat.chr6 194697 82 - 647215 ttat-gtttgttgctgctttgacccacacagtgtctttgacttaatgatatcaaactcacgtttgtcaattcgtggttttgca + +a +s mr.mrrefChr5 233726 16 + 294542 ttcgcatctttttttg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380361 16 + 636262 ttcacatcttttctgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 379540 16 + 647215 ttcgcagctgtttttg +s simRat_chr6.simRat.chr6 194792 16 - 647215 tttgcaactttttttg + +a +s mr.mrrefChr5 233742 25 + 294542 gagtgttaagcatcaagggctcttc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322489 25 + 636262 CAATGTCAAACATCAAGGCCCTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380377 22 + 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TGTGGTGCCTGCATATTGTCAGGTCGCTCTACACTCTCACAAAAAGCAACTGTTACAGTGTCCACGATCATTTCTCAGCCTACAATTCCGGGGCTCACCCGT + +a +s mr.mrrefChr5 237648 30 + 294542 AGATTTTTCAGTGGTCAAATACTCTAGctg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383773 30 + 636262 AGATTTTTCAGTGGTCAAATACTCTAGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 265178 30 - 647215 AGATTTTTCAGTGGTCAAATACTCTAGctg + +a +s mr.mrrefChr5 237678 362 + 294542 aACTTGTAGTGGGGCTTCACTATCTCCTCTGAGAGCCGTTGAGGTTGGTAAGAACATCTTCATTTCTTGATATTGAGACATAGCAGCAAAAAAAGCTATGCTTACTTTTAAAGGCACCAGTACGTCCATATCCAGTAGTCTATTAGTGTTAGTCCATGATAGGTCAGACATGTTTACTTGAGGGATTGGGATGAGGGGATCTTCATTTCCATAACTTATAGAAGTGTGACATTTTTATAAGAGAGGGGTGTAGGGCTCACTCACATTCGAGTGAAATCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTCCTAACCTTGTAGGGGCCTTTTTTGCAACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383805 362 + 636262 AACTTGTCGTGGGGCTTCACTATCTCCTCTGAGAGCCGTTGAGGTTGTTGAGAACATCGTCATTTCTTGAGATTGGGACATAGCATCAAAGAAAGCTATGCTTACTTTTAAGGGCACCAATACGTCCATATCCAGTAGTCTATTAATGTTAGTCCATGAGAGGTCAGACATGTTAACTTGAGGGATTGGGATGAGGGGATATTCATTTCCATAACTTATAGAAGTGTGACATATTTACAAGAGGGGGGTGTAGGGCTGACTCACATCCGAGTGAAATCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTCCTTACCTTGTAGGGGCCTTTTTTGCGACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 383917 362 + 647215 aACTTGCAGTGGGGCTTCACGCTCTCCTCTGAGAGCCGTTCAGGCTGGCAAGAATATCTTCATTTCTTGATATAGAGACATAGTAGCAAAAAAAACTATGCTTACTTTTAAAGGCACTAGTGTGTCCATATCCAGTAGTCTATTAGCTTTAGTCCATGATAGGTCAGACATGTTTACCTCAGGGATTGGGATGAGGGGATCTTCGTTTCCATAATTTTTAGAACTGTAACATTTTTATAAAAGAAGGGTGTAGGGATCACTCACATTCGAGTGAAGTCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTGTTATCCTTTTAGGGGCCTTATTTACAACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 238040 34 + 294542 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGATGTGACATTACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384167 33 + 636262 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGATGCAACATTGCC- +s simRat_chr6.simRat.chr6 384280 34 + 647215 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGACGTGAACTTATTT + +a +s mr.mrrefChr5 238074 306 + 294542 ATTATGAGCCCTTGTTCTGTTCCACTTAGGAAGATTCCTGAATATGTTACAGATTGTATCCATGTTGTAGCACCTACTTACCATCCAGCCACTAGTGAAGCAGATAAGCGAGTGTCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTTTTGTGGATGCTGTATGCAGACTTTGACTCTTTTGGCTCTTATATAATCTAGGCCCTATCCTTGTTAGAACCTATTGCAAGTGTTTTTGCGAAAAGGATTCCACCATTAGTATTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAATCTGATAGAATCAGTTTTGATCTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384200 303 + 636262 ---ATGAGCCCTTGTTTTGTTCCATTTAGGAGGATTGCTAAGTTTATTACAGACTGTATCCATGTTGTAGCACCTACTTACCATCCAGCTACTAGTGAAGCAGATAAGCGAGTGTCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTCTTGTGGATGCTACATGCAGACTTTGACTCTTTTGGCTCTTATATAATCCAGGCCCTATCCTTGTTAGAACCTATCGCAAGTGTTTTTGTGAAAGGGATTCCACCATTAGTGTTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAACCTGATAGAATCAGTTTTGATCTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 384318 301 + 647215 ATTGTACGCCCTTGTTCTTTTCCACCTAGGAAGATTCCAGAATATGTTACAGATTGTATCCATATTGTAGCACCTACTTCCCATCTAGCCCCTAATGCAGCAGATAAGCGAGTTCCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTTTTGTGG-TGCTGTATGT----TTTGACTCTTTTGACTCTTGTATAATCTAGGCCCTATCCTTACTGGAACCTCTTGCAAGTGTTTCTGCGTAAAAGGTTCCACCATTAGTATTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAATCTGATAGAATCAGTTTTGATGTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 238380 81 + 294542 AGCATTGTAATTTGACAGTTCCTCATTCACTGAGAGGACTGATGAGTGCAAACTATGTATAACCATTACTAAATTATAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384568 81 + 636262 AGCATTGTAATTTGACAGTTCCTCATACACTGAGAAGACTGATGAGTGCAAACTATGTATAACCATTACTAAATTATAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 384619 76 + 647215 AGCATTGTAATTTGACAGTTTTTTATTCACTGAGAGGACTG-----TGCAGACTATGTACAACCACTACTAAACTATAGCC + +a +s mr.mrrefChr5 238461 67 + 294542 GCCTTATTGATGGTATTGTATCTGGTTCATATCCTTGTCAGTTAGCTTGGGCTCTCAGTAGTGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384650 67 + 636262 GCCTTATTGATGGTATTGTATCTGGTTCATATCATTTTCAGTTAGCTTGGGCACTCAGTAGTGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 384695 67 + 647215 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CATCTCTAACATTCATGCATTATACTATGATTGCGATTAGCAGTTATTACTAGTCCACTCCAAAATGAATTTAGCAATTCCATCTACACTGCCCCCTTATTGT---CAAGGCAAGTTGGTCCAATTCTCTGCAGAAAATTTCTCAAAAACTTATAAAATTAATCATCCTTACAAAATACAACATTCAAAGCCTGGCTTAAACTCCCGTTGCCAGAGGCTCAGCTTCAACTATTGGAAGAACATCTAAATAATTGAACAATTGCTATATATACCTATTTGTGCCCACTATGTTTAATCAGCATTGATCAGTTGATTTGCTATAGAAGATGAGAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 387209 335 + 647215 CGTTCCTTACATTCATGCATTATATTATGATTACAAGAAGGAGGTATTACTAGTCCATTCCAAAATGAATGTGGCTATTCCATCTACACTGCCCCCTTACTGTGTTACAGGCTTATCGGTTCAATTCTCTGCAGAAAATTTCTCAGAGACTTATTAAATTACCCACCTTTACAAAGAATGATCTTTAGAGCCTGGCCTAAACTCCCATTGCCAGAGGCTCAGCTTTAACTATTGGAAGAACACCTAATTAATTGAACAATTGGTATATATACCTATTTGTGCCCACTATATTTCATCAGCAGTGATCAGTTGCTTCACTATAGAATGTGAGAGCC + +a +s mr.mrrefChr5 241399 9 + 294542 CCAGAAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387568 9 + 636262 CCAGAAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 387544 9 + 647215 CCAGAAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 241408 94 + 294542 TCAACAATCAAAAAGCATAAGGACAACTTGCAGATTTGCACATACCTATCAACCCAAAGGCTGCTGCTTTAATATTTTATGTATATAATATGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387579 94 + 636262 TCAGCAGTCAAAAAGCATAAGGACAACCTGCAGATTTTCAAATACCTGTCAACCCAAAGGCTGCTGCTTTAATATTTTATGTATATAATATGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 387553 94 + 647215 TCAACAACCAAAAAGCATAAGTATAACTTGCAGATTTGCACATACCTATCACCTCAAAGGCTGCTGCTACAATACTTTATGTAGATATTATGAC + +a +s mr.mrrefChr5 241502 128 + 294542 CTTCATAACATATTTTGACATCTCAGGTGTAAGATGGTAGAAAGTGTGACAATGGCACCTATGATATTAATATGATTCATATAAGCAGGTTGAATTGTCCCATTGGTTGTAGAAGTTTTGCTGTCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387703 128 + 636262 CTTCATGACATGTTTCGACATCTCAGGTGTAAGATGGTACAAAGTGTGACAATGGCACCTATGATATTAATACGATTCATATAAGCCGGCTGAATTGTCCCATTGTTTGTAGAAGCTTTGTTGTCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 387647 128 + 647215 CTTCATAACATATTTTGACATCACAGATGTAAGATGGTAGAAAGTGTGACAATGGCACCTATGATATTAATATGATTCATATAAGCAGGTTGAATTGTCTCATGGGTTGTAGAAGTTTTGCTGTCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 241630 120 + 294542 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---------------------------------TATTACAGATTGCAAATTTGGTTCAAATTCTCAATAGTGTAAACATTCTCCTGTGAGATTTAGTAATGCTATGCATGAATTGTTGCTCAGAAGGACCACTTTAACCCTAATTGTGCTTGTTGACAGCTGGTCCATCCTATTAGCCTCCAATGTATTCCACCATACCCTTAAGGCTGTTTCTAATGGGGTTGATGACTATGGATAATTTGATTGTGTATTTAATACATATAGAGACTGAAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 387901 271 + 647215 CCACATAAATAACACATAGTGGTCATGATTCATCATTACAGATTGCAAGTTTGGTTCAAATTCTCCATAGTGTAAACATTTTTCTGTGAGATTTGGTAATGCTATGCATGAATTGTTGC--ATCAGGACCAGGTTAACCCTAACTTTGCTTGTTGATAGCTGGTCCATCCTATTAGTCTCCAATGTATTCCACCATATCCCT--GGCTGTTTCTGACGGTGCTGATGACTATTGATAAGCTGAGTGTGAATTGAATACATATAGAGGCTTAAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 242025 65 + 294542 TTAGGCAAAATTGATTACTTGGTTAGCTCACCATCATAACAGTGGGGGAATAATAGGACCACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 388192 65 + 636262 TTAGGCAAAATTGATTACTTGGTTAGCTCACCATCATAACAGTGGGGAAATCATAGGACCACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 388172 65 + 647215 GTAAGCAAAATTGATTACTTGGCTATCTCAGCATTATAACAGTGGGAGAATAATGTAACCATATT + +a +s mr.mrrefChr5 242090 40 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 389340 27 + 647215 ATCCATTTTTTTTCTGCCACTCAGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 243132 271 + 294542 TCTTCTGCCATTTAGATAAGACCAACCTGGCATGCAAAGAGTGACTGGTATGTGATTTGAGATCTAGGACTGTGCTACCTTGTCTGTCTGCTTCCACCTTGCTTGTAGTTGTCATGACGACGTCACCCCTTGATATACTTCAATAATAGATTTAATATTCACTTCAGTCTTTCCCTTCAGCCTAAAAGCTTCTCAGAGTTCAACACTGTTTTCTCTACTGTAAATACCCTGCCACCTATTTGTTTGGCTCTGGCTACCATGTGTTCAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389320 271 + 636262 TCTTCTGCCATTTAGATAAGACCAACCCAGCATGCAAAGAGTGACTGGTACGTGATTTGAGATCAAGGACTGTGCTACCTTGACTGTCTGCTTCCACCTTGTTTGTAGTTGTCATGACGACGTCACCCCTTGATATACTTCAAGAATAGATTTAATATTCACTTTAGTCTTCCCCTTCAGCCTAAAAGCTTCTTAGAGTTCAACACTGTTTACTCTACTGTAAATACCCTGCCACCTGTTTGTTTGGCTCTGGCTACCATGTGTTCAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 389381 250 + 647215 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TGTCATACACTTTTATGGCATACTAGTTACAGACTAGAACCACTCCTCGTGGCTTACTTGGGGTTAGTTGGGGGTGATTCACTTGACATTATCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACATATTTGCTCCACACGCGACTTGCCTGAAAATGTAAGGAATACAATTAAAACAATATAGCTACCAATGGGCACTTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391511 191 + 636262 TGTCATACAC----ATGGCATACTGGTTACAGACTGGAACCACTCCTCATGGCTTACTTGGGATTAGGTGGGGGTAATTCACTTGACATTACCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACGTATTTGCTCCACACACGACTTGCCTGAAAATGTAAGGAATACAATTAAAACGATATGGCTACCAATGGGCACTTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 391475 195 + 647215 TGTCTTACGCTTTTATGGCTTACTAGTTACAGACTAGAACCACTCCTGGTGGGATACTAGGGGTTAGTTGGGGGTGACTCACTTGTCATTATCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACACACTTGTTCCACACGCTACTTGCCAGAATGTGTAAGGAATACAATTAAAACACTATAGCTACCAATGGGCACCTtgc + +a +s mr.mrrefChr5 245464 54 + 294542 TGAGGGTGTCTAGGCCATTTGCATTGGGATCTATTGCTTATATCCTGCTTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391702 54 + 636262 TGAGGATGTGTAGGCCGTTTGCATTGGGATCTATGGCTTATATCCTGCTTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 391875 54 + 647215 TGGGGGTGTCTAGGCCATTTGAGTTGGGATCTATTGCTTATATCATGCTTCAAA + +a +s mr.mrrefChr5 245518 284 + 294542 TAATAAGAAAGCATCATGCATGCAGTAAGGGATCATACTACATTACACATAGCAAGATGGAGTATTGACTCCCTTTATTTGATTAGGCCATCTGAAGTCAACACACCAGACAGGCAGTACTTGAACTAGAAGCTTTACAAATTCTGCTTCTTAGTGCACGGTGACGGGTCTGGCAAGCGAGACACTCCTGATCTTGGTTGCTACATGATAGCGCTTACCCACGACTCCGTCTCATACAACGACGAAAAGTAATGGGCGTTCGGTCTAGGAATTTTTCCAGGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391756 284 + 636262 TAATAAGAAAGCATCATGCATGCAGTAAGGGATCATACTACATTACACATAGCAAGATGGAGTATTGACTCCCTTTATTTGATTAGGCCATCTGAATTCAACACGCCAGACAGGCAGCACTTGAACTAAAAGCTTTACAGATTCTGCTTTTTAGTGCCCGGTGACGGGTCTGGCAAGCGAGACACTCCTGATCTTGGTTGATACAGGATAGCGCTTACCTACGACTCCGTCTCATACAACGACGAAAAGTAATGGGCGTTCGGTCTAGGAATTTTTCTAGCGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 391931 282 + 647215 TAGTAGGAAATCATCATAAATGCAGTAAGTGATCATACTACATTGCACATAGCGAGATGGAGTACTGTCTCCCTTTGTTTGATT-GGCCATCTGAAGTCAACACACCAGACGGGCAGTACTTGAACTAGAAGCTTTAAAAATTCTGCTACTTAGTGCACGGTGAGGGGTCTGGCAAG-GAGACACTTCTGATCTTGGTTGCTACATGACAGAACCTATCCACGATTTCGTCTCATACAACGACGAAAAGTCATGGGCGTTCGGTCTAGGAGTTTTTCCGGGAGC + +a +s 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 393000 9 + 636262 TCATAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 393113 9 + 647215 TCATATGTG + +a +s mr.mrrefChr5 246686 67 + 294542 CACTATGTTAACCCTGAGCATAGCAGTAAATCCTGTTTTAGATACTATTTCACTAAGGCAAGCTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393009 67 + 636262 CACTATGTTAACCCTGAGCATAGCAGTAAATCCTGTTTTAGATACTATTTCACTAAGGCAAGCTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 393123 67 + 647215 CACTATGTTAACTCTGAGCATAGCAATAAAACCTGTTTTAAGTAATCTTGCACTGAAGCAAGCTGGA + +a +s mr.mrrefChr5 246753 59 + 294542 GACAGACAGAATAGAAAATCATGTGGCGCCATTGCATGCAGTCATACAATGTGCGCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393077 59 + 636262 GACAGACAGAATAGAAAATCATGTGGCGCCATTGCATGCAGTCATACAATGTGCGCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 393190 59 + 647215 GACAGACAGGGTGGAAAATCATGAGGTGCCATTGTATGCAGTCACACAATATGAGCAAC + +a +s mr.mrrefChr5 246812 284 + 294542 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636262 ACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 394980 3 + 647215 GCT + +a +s mr.mrrefChr5 248486 242 + 294542 GGTGTCCTCTAACCACCATGATTTGTACTTTGTTTTTCATGTAAAGACTGGTTGCTTAACATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTTGACCCCTAAAGGATGACTGGCTAGAGCCCAACCTGAGATTTTCCTGCAGAACTCCTTTAATCAATACCACTCTACACCAGGAGGACTCTCCAGTGAAGCTACAGCCTAACATGCAGAGTACTCTCATGATGAACTTTCTCCATGAGAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394712 240 + 636262 GGTGTCCTCTAACCACCATGATTTGTACTTTGTTT--CATGTAAAGAGCGGTTGCTTAACATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTTGACCCCTAAAGGATGACTGACTAGAGCCCAATCTGAGATTTTCCTGCGGAACTCCTTTAATCAATACCACTCTACACCAGGAGTACTCCCCAGTGAAGCTACAGCCTAACATGCAGAGTACTCTCATGATGGACTTTCTCCATGAAAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 394985 232 + 647215 GGTGTCCTTTATACACCATGATTTGAGCTTTTTGGTTCATGTAATGACTG----------ATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTCCGTTGCTAAAGGATGACATGCTAGAGCCCTACCTGAGGTTTTCCTGCAGAACTCCTTTAATCAAGACCACTCTACACCAGATGGACTCTCCAGTGAAGCCACAGCCTAAGATGCAGAGTACTTTCATGATGAACCTTCTCCATGAGAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 248728 68 + 294542 ACCGTCCAGAGGGGTACAGACTCATATTCCCCACCCTCTTTTGAGTCCCTATTCTATCTTTCTCTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394954 68 + 636262 ATCCTCCAGAGGGGTACAGACTCATATTCCCCACCCTCTTTTGAGTCCCTACCCTATCTTTCTCCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 395217 66 + 647215 ACCGTACAGAGGGGTACAGACTCATA--CCCCGCCCTCTTTTGAATCCCTATTCTATCTTTCTCTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 248796 192 + 294542 GTCTCCCTTGTTTATCTTTTAGTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATCATCTCCAACAACATTCAGCATTCATCTCTACCTTTTAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGCCAATAAAAGGCTCACGCATCATGTAGGCACTCGAGAAATTAAATACAGACATAAAGACCGAATCACACAATACTAGCTCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395023 191 + 636262 GTCTCCCTTGTTTATCTTTTACTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATAATCTACAACAACATTCAGCAGCCA-CTCTACCTTTTAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGCCAATAGAAGGCTCACGCATCATGTAGGCACTTGAGAAATTAAATACAGACATGAAGACTGAATCACCCAATACTAGCTCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 395283 192 + 647215 GTCTCCCTTGCTTATCTTTTAGTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATCATCCCCAACCACATTCAGCATTCATCTCTACTTCTAAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGAAAATAAAAAGCTCACATATCATGCAGGCACTCGAGAAATCAAATACAGCCATAAAGACCGAATCACACAATACTAGCTCATA + +a +s mr.mrrefChr5 248988 46 + 294542 TGGAGTGACTCTGCAACATCTTCCTGCATCGGCCATGTCCAAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395293 46 + 636262 TGGATTGACTCTGCAACACCTTCCTGCATCAGCCATGTCCAAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 395475 46 + 647215 TGAAGTGTCTCTGCAATATCTTCCTGCATCGGCCATGTCCAGATTT + +a +s mr.mrrefChr5 249034 7 + 294542 ACCTACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395339 7 + 636262 ACCTACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 395526 7 + 647215 ACTCACT + +a +s mr.mrrefChr5 249041 20 + 294542 CACACATATACACATAGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395346 20 + 636262 CACAAATATACACATAGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 395534 20 + 647215 CACACATACACACATTGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 249061 449 + 294542 AAACCCAATTACTTGTTGATGAACAGTAGTTACTGTAGTACCTTGGAAAGGGCCTACTTTAATTATAACTATGAGCTTGTCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCATTCCATGAAAGATGTAGAAGTGAAGAGAAAACATCTTTTTCAGAGCCGCAGATGAGATTATTATTTAAAAGCAAGACTATGCAAGACACTCATGTGATTGACATGGTACTGAATAAGGACAATGCTGTATTTTTGTTCTCTAGCATGTACAATACAGCCCAAGGTACTCCTTATAAAAAACCCCCATCGGTTGTTGAACCACAATTCTTTGTTCCAGTTCTACTTCCACTACTGAGAGTTAGGTTCACCACAACATAGGAGCATTGCAGAGTTCTCAGTTCTTGGCGCAATAGACAATTTGCAATAGATTTAGACTCTTGAATAAAAGAATCCATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395366 449 + 636262 AAACCCAATTACTTGTTGATGGAGAGTAGTCAATGTAGTGCCTTGGAAAGGGCCTACTTTAACTATAACTATGAGCTTGGCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCATTTCATGAAAGATGTAGAAGTGAAGAGAAAACATCTTTTTCAGACCCACAGATGAGATTATTACTTAAAAACAAGTCTACACTAGACAGTCATGTGATTGACATCGTACTGAATAAGGACAATGCTGTATTTTTGCTCTCTAGCATGTACAATACAGCCCAAGGTACTCCTTATAAAAAACCCCCATCGGTTGTTGAACCACAATTCTTTGTTCCAGTTCTACTTCCACTACTGAGAGTTAGGTTCACCACAACATAGGAGCATTGCAGAGTTCTCAGTACTTGGCGCAATAGCCAATTTGCAATAGATTTAGACTCCTGAATAAAAGAATCCATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 395622 445 + 647215 AAACCCAATTACTTGTTGATGAACAGTAGTTACTGTAGTACCTTGGAAAGGGCCTACTTTAATTATAACTATGACCTTCTCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCACTCCA----AGAGGTAGAAGTGAAGGGAAAACATCCCTTTCAGAGCAGCAGATGAGATTATTTTTCAAAGGCAAGACTATGCAAGACACTCATGTGCTTAACAAGGTACTGAATAAGTATAACGCTGTATTTTAATTCTCTAATGTGTACAATACAGTCCAAGCTACTCCTTATAAAAGGGCCCCATCAGTTCTTCAACCACAATTCTTTACTCGAACTCTAATACAACTACTGAGAGTTAGGTTCATCACAAGCGAGGAGAATTGCAGAGTTCTTGGTTCTTGGTGCAATAAATAATTTACAATAGATTTGGACTCTTGAATAAAAGAATCCTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 249510 48 + 294542 GTGATCACCCCCAACATGTGCCCCCGTCTGATATTTCATTAAATGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395823 48 + 636262 GTGAGCACCCCCAACATGTGCCCCCGTCTGATATTTCATTAAACATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 396067 48 + 647215 GTGATCACCTCCAACATGTGCCCCCGTCAGAAAGTTGATCAACTGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 249558 276 + 294542 GTCCTGACTCTATCAGCAGGGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACCACAGATTAGATGAGGAAAAATGGTTTGAGCTGGTGCTTGCAATCCAACAAAAAGGACCTGCTAAATGCATGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAACATGGACCAACCAGTATCTGATACAGGTGTGGCAGAAGTAGGTCCCTACATTATGAGCAGCTATCAGCAACAGAGAAAGTCATGCATTGGATTTCACTATAGTATCCGGCCTCAAGTAATCCTCAAGTTGTTGCTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395871 274 + 636262 GTACTGACCCTATCAACAAGGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACAATAGATTGGATGAGGAAAAATGGTTGGAGCTGGTGGTTGCAATTCGAGAAAAAGGACCTGCTAAATGCGTGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAGCATAGACAACCCAATATCTGATACGAGTGTGGCAAAATCAGGTTGCTATATTATGAGCAACTATCAGCAACAGGTGAAGTCATGTACTGGATTTCACTATAGTATCAAGCCTCATATAATCTTCAAGTTGTTGCTG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 396115 272 + 647215 GTCCTGACTCTATCAGCAGAGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACCACAGATTAGATGAGGAAAAATGGTTTGAGCTGGTGCTTGCAATCCAACAAAAAGGACCTGCTAAATGCCTGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAACATGGACCAACCAGTCTCT----CAGGTGTGGCCGAAGTAGGTCCCTACATTATGAGCAGCTATCAGCAACAGAGAAAGTCATGCATTGGATTTCACTATAGTATCCGGCCTCAAGTAATCCTCAATTTGTTGGTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 396397 263 + 647215 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CTGAATCCTATTACGTTTTGTCTGAGTGAAAAGGGGTGAGGTGTAGTCATATATCTTAACTTTATGAGCTTAATGGG + +a +s mr.mrrefChr5 249929 54 + 294542 CTTGGGCCATTTCCTTTATGTTGGTACTATAGGCAACCATTAGTTTGTCAATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396240 54 + 636262 CTTCAGCCATTTCCTTTATGTTGGTATTGTAGGCAACCATTAGTTTGTCAATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 396757 54 + 647215 AGTGGGCCGTTTACTTTATGTTGGTACTATAGACAACCACTAGTTTGTTAATGT + +a +s mr.mrrefChr5 249983 64 + 294542 TTACATCATCTACTCCAGTCTGATCCTTAGTAATTATGTAATTCTTCAACACCTAAGCTTTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396294 64 + 636262 TTACATCATCTACTCCAGTCTGATCCTTAGTAATTATGTAATTCTTCAACACCTAAGCTTTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 396815 64 + 647215 TTACATCCTCTACCCCGGTCTGATCCTTCATAATAACTTAATTGTTTAGCACCTCAGCTTTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 250047 146 + 294542 TGGGTGAGTGAGATAGTATGAGTAATATGAGCATTTATTTGTTGCTCCCTGCTTATACTGTATGGTTTACCCTTGGGACAGGATCTATCAAAGAGGCACGTGTCAGGGCGCATATGCTGTTTCACTCAAACTCCACTGTAAGCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396369 146 + 636262 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CACCATCAAGTACTTAACTCAAG--TAGGCACTAATAGGGACTCTAAGGGTGTCTAACAACTGTTCCCATTCAACCGAGGTTTGTGCCAGTGTCAATGCATTAAGCTGTCTCGTATACTCAGCACGCAGACCAACTCAATGTCATGTTAAGTAGTACAGATGC---------TAGGCATTTATTAATGCTAAAAAGACTCATATGACGCTACTCCATGGAGGCTGACAGATCACAGCATATACCACTAGTTTTGGGGGGATATTAGATGTAAATTCCTGACTCTGATTGATTGGCTCGACAATTGTGTCCTGCTTGGATTTCTTGTTATCTAAATGTCTGGATGGTGATTAAGGCTTTCAATGGGGTAGTAACATCCTTTTCAGGTAAACAAGGCAGTGGACATGGGGTCCAATGAATATGGTGTGGGTTGATGGACTTACCTCAGGATGTTGCCAAAATATGATTTTTGTTTGCTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 397198 472 + 647215 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TTTGTGGCAGCAATTGACTTGGTACAGTGGTGCAATGATGATAGAACCTTTGTTGTGGGCTCAACATCATCCACGCTTACTGTTCGGTTCAACAGGAAATGTTTATTGATTCATTTCCTTACAAGGTCATAAGGCCAGTTAAGTCAGGCTCACAGGGTAGGTAGGTTGCATTTTGCTGTTC--GTTCAGCTATTGGGGTGCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 397691 204 + 647215 TTGGTGGCAACAATTGACTTGATGCAGGTGGGCAATGATGATAGAACCTTTGTTGTGGGCACAACATCACCGCCGCTTACTGTTCAGTTCAACAGGAAACATTTATTAATTCATTTCTTTACAAAGTCCTAATGCAAGTAAAGTCAGGCTCACAGAGTAGGTAGGTTGCATTTTGCTGTTCTAGTAGAGCTATTAGAGTGCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 251064 137 + 294542 GCGGCTTGGAGGTCATAGCTTTCAGACTTTTAGCTCATGAGCTCTGGAGGGTTGGCAGGGATAATGGGGGTATAAACATGGGGAGCAGAGGAAATGATGTCAGCAACACAACCAAACAACTGAAGTATAAGGTCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397489 137 + 636262 GCAGCTTGAAGGTCATAGCTTTCAGACTCTTAGCTCATGAGCTCTGTAGGGTTGGCAGGGATAACGGGGGTATAAACATGGAGAGCAGAGGAAATGATGTCTGCAACACAACCGAACAACTGAAGTGTAAGGTCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 397907 137 + 647215 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AGGGGATACTCAATTTGCAATTATCTCAGAAATCTTAGAAGGGAGTTACAGCAATATATCCATCTTCAATCCTTGAGACACTAGGGGTTGGGACTAGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397956 97 + 636262 ----GATACTCAATCTGCAATTATCTCAGAAATCTTAGAAGGGAGTTACAGCAATACAACGATCTTCAATTCTTGAGACACCAGGGGTTGGGACTAGATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398277 101 + 647215 AGGGGATACTCAATTTGCAATTATCTCAGACATCTCAGACGGGAGTTACAGCACCATATCCATCTTGAATCCTTGAGACACTAGGGGTTGGGACTACATAT + +a +s mr.mrrefChr5 251527 155 + 294542 ATATTGGAGGCAAAAAGGGGTGCATTCAAGAACAAAAAAATTCTTGCATTAAAATATACTGAATTGCACAGTACTTACCTCTTTTGATATCATTGCTATCAGCCAATATAGCAAATGAATAAAGAGCTAAGATAAGGTTGCAAAAGTGCCGATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398053 155 + 636262 ACATTGGAGGCTAAAAGGGGTGCATTCAAGAACAGAAAAATTCTTGCACTAAAATATACTGAATTGCACAGTACTTACCTCTTTTGATATCATTGCTATCAGCCGAGATGGCAAATGAATGAAGAGCTAAGATAAGGTTGCAAAAGTACCAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 398379 155 + 647215 ATATTGGAAGCAAAAAGGGATGCCCTCAAGAACAAAAAAATTCTTGCATTAAAATATATTGAATTGCAGAGCACTTACCTATCCTGACATCATTGCTATCAACCAATACAGCAAATAAATAAAGAGCTTAGATAAGGTTGCAAACATGCCGATAC + +a +s mr.mrrefChr5 251682 46 + 294542 AAGCCCGCAGTGGGAGGCTGCTGCATTTACAACCATTTCAGGAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398208 45 + 636262 AAGCCCGCCGTGGGAGGCTGCTGCATTTACAACCATTTCAGG-GCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398538 46 + 647215 AAGTCAACAGTGGGAGGCTGCTGTGTTTACAACCATTTCAGGAGCT + +a +s mr.mrrefChr5 251728 4 + 294542 TGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398253 4 + 636262 TGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398585 4 + 647215 TGGC + +a +s mr.mrrefChr5 251732 189 + 294542 TGGTGGCTAGTAGTGATATATACAATTTTGGTAGGCAGCAGAGTATTCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTGGCAATGACTACCATATGAGAAATGCAGGCAGTGTATTTCCCTTCAATATTCATGAGACAATAGTGCAAGTAATAATTTGTAGCCAGCAGGGCATTCAAGGAACATAGGAAGCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398257 189 + 636262 TGGTGGCTAGTAGTGATATAGACAATTTTGGTAGGGAGCAGAGTATCCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTGGCAATGACTACCATATGAGAAATGCAGGGAGTGTATTTCCCTTCAATATTCATGGAACAATAGTGCAAGTAATAATTTGTAGCCACCAGGGTATTCAAGGAACATAGGAAGTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398505 183 + 636262 TGGTGGCTAGTAGTGATATATATGATTTTGGTGGGTAGGAGAGTATGCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTG-CAATGACTACCATATGAGAATTGCAGGCTGTGTATTTC-----AATATTCATGAGACAATAGTGCAAGTCATAATTTGTAGCCAGCAGGACATTCAGGGAACATAGGAAGCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398589 181 + 647215 TAATGGCTAGTACTGATCTATACAATTTTGGTAGGCAGCAGAGCATTCAAGACCCTCGAAAGTAGATTACATTGGCAACCACTACCAT--GAGAAACGCAGGCAGTG-ACGCA-----AATGTCCATGAGACAATAGTACAAGTAGTAATTCGTAGCCAGCAGGGCATTCAAGAAACACAGGAAGCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 251921 7 + 294542 CATTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398446 7 + 636262 CATTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398688 7 + 636262 CATTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398771 7 + 647215 CATTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 251928 52 + 294542 GTATATGTAAACAGCTGATTAAAGGTGGACCACACTAGACAGGATGCCATAA +s 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aaagcttctttcacatacatatgctcacattttttgttaacccctcaagtagttgaagttgcacctttgtaaccaaactagggtagttatatgcaatccactgaaagagaacaatgacatggGTTtGCCAGCCTGCTAAGTGGAATGGGCCAAGGTTATGAATAGGATTCAGAGAAATATGTGCAAAGAACACTAAAAAAGATACAAAGAACAAAGAAACATATGCTGTGCTTCCTAATAAGCACCTTGGCTCCAGTACAGATATTTGTGATAGCTGTGAGGTGGAAATATCATCATATGTCTGAGACTTTAGTAAGTGGTGAGCTTGTTCTGGTAAGGGGAAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400754 347 + 636262 gaaacttcttcctcatacctatgctcacactttttgttagcccctcaagtggttgaagttgcacctttgtaaccaaactagggtaattatatgcaatccaCTGAAAGAGAACAATGACGTGTGTTTGCCAGCCTGCTAAGTGGAATGGGCCAAGGTTGTGAATAGGATTAAGAGAAATATGTGCAAAGAACACTAAAAAAGGTACAAAGAACAAAGAAACATATGCTGTGCTTCCTAATAAGCACCTTTGCTCCAGTACAGATGTTTGTGATAGCTGTGAGGTGGAAATATCATGATATGTCTGAGACTTTAGTAAGTAGTGAGCTCGTTCTGGTAAGGGGAAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 400646 346 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 402024 23 + 647215 TGCGAGCACAATAA---------GCACTTGGG + +a +s mr.mrrefChr5 255217 83 + 294542 ATTCCCTGAGGAAGTCTCCAATTTGCATCTGACTTTCTGACTTCATAAGGAGACAGAATTGGAAGGTGAGGGTAGGGGTGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402193 83 + 636262 CTTTCCTGAGGAAGTCTCTAATTTGCATCTGACTTTCTGACTTCAAAAGGAGACAGGATTGAAAGGTGTGGGTTGGGGTGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 402048 83 + 647215 ATTCCCTGAGGAAGTCTCCAATTTGCATCTGACTTTCTGACTTCGTAAGAAGACAGAATTGGAAGGCGAGGGTAGGTGTGGAA + +a +s mr.mrrefChr5 255300 104 + 294542 AGTTGCACAACCTGAAAAAATCATAGCTCTCATCTTGGGATCTTGTGTCACTATTGAATATCAAACACTTTCTTCTGACTATCCTGCTATGGCAAAATTTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402276 103 + 636262 AGTTGCACAACCCGAAAAATTCACAACCCTCATCTTGG-CTCTTGTCTCACTATTGAATATCAAACACTTTCTTCTGACTAGCCTGCTATGGCAAAATTTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 402148 102 + 647215 AGTTGCACAACTTGAAAAAATTATAGCTCTCATCTTGGGATCTTGTGTCACTATTGACC--CAAACACTTTCTATTGACTGTCCTGCCATGGCAAAATGTAATT + +a +s mr.mrrefChr5 255404 76 + 294542 CCACACATGTAGTCCTACAACCTGGCGATCTTCAAAGGATGCAGTTCTTTGATATGGGAGTTGATAGTTGATGCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402380 71 + 636262 CCACACATGTAG-----CAACCTGGCAATCTTCAAAGGATGCAGTTCTTTGATATGGGGGTTGATAGTTGATGCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 402250 64 + 647215 CCAATGATGTAGTCCTACAACCTGGTGATCTTCAAAGGATTCAGCTCCTTGATATGGAAGTTAA------------ + +a +s mr.mrrefChr5 255480 19 + 294542 GCGTCAGGCCTAAATAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402452 19 + 636262 GCGTCAGGCCTAAACAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 402314 19 + 647215 GCATCAGGCCTAACTAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 255499 403 + 294542 AAGCTATGACACTAAGTTGGGAATTGTGTATAACACCTGGCATTCCTCAGTTGATTTGGGAGCAAATCTGAATGGTGTAAGCTGGCTCTAGTATCGGATCCTCTTACCTATAGTGTAATCTTTGGAAAATCAGATGAACTTTGAGATCTGGAATACATAAATCCTGCCAAATAAGCAGCTGCTAACATAGCTAGTTATGTTGTTATACACCATAAATTAACCCAGTATGTGAAAGATAAGCCAATGAGGGTGGAATGAGGGTGGAATCAACTAATGAGCAGTTATGACTGTCTTGTAAGTAGAGGACATAGAATTTGGCCCAGGTGGTGTGTCCCTAGCTATCTCCCCTGCCAACCATCTCTTGATTTGTTGACCTACCTCCTAAAGTTACAGAACTCTAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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ATGGAACTCTCCCATGATATTGTTGCTCAAGACTTAGTACATCTTTCTCACCAAAAAGATAAAGTGTAGTTTGTCTATGAGGTCCTGGACTTGATAGCTATTAAATGTGGCTCTGGGGAGTGATCAAGAGCTGGGACATATATTAGCATTTTAACCACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402869 157 + 636262 ATGGCCCTCTCCCATGATATAGTTGCTCAAGACTTAGTACATTTTTCTCAGCAACAAGATAACGTGTAGTTTGTCTATGAGGCCCTGGACTTGACAGCCATTAAATGTGGCTCTGGGGAGTGATCAAG----GAGACATATATTAGCATTCTAACCACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 402736 157 + 647215 ATGGAACTCTTCCATGATATTGTTGCTCAAGACTCAGTATATCTTTCTCACCAAAAAGATAGAGTGTAGTTTGTCTATGAGGTCCTGGACTTGATAGCTATCAAATGTAGCTCTGAGGAGCGATCAAGAGCTGGGAGATATATTAGCATTT----AGCATT + +a +s mr.mrrefChr5 256063 25 + 294542 GGACACTCTTTCCCCATTTCCAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403026 25 + 636262 GGACACTCCTTCCCCATTTCCAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 402894 25 + 647215 TGACACTCTTTCCCCATTACCAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 256088 11 + 294542 AAGACAAGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403052 11 + 636262 AAGACAATGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 402919 7 + 647215 ----CAAGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 256099 199 + 294542 TGAGGCTGGTCATGATACATGATAAACGTTTGTGAGTGAGTCATTGCTAGACAAGGCAGCATTAATTATCCATGATTCAAGGGTTATAGGAGTTGTCAGTTGAGTGTGTATTTATAGGCCTTTCTAGTAAATTGAAATACTAACTCCCCTGTACAGGCACACCCAGACTAGCCCTATCGAGTGGATGAAATTTAACTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403340 199 + 636262 TGGGGCTGGTCATGATACATGATAAACGTTTGTGAGTGAGTCATTGCTAAACAAGGCAGCATTACTTATCCAAGATTCAAGGGTTATAAGAGTTGTCAGTTGTGTGTGTATTTATAGGCCTTTCTAGTAAATTGAAATGCTAACTCCCCTGTACAGGCACATCCAGACTAGCCCTATCGAGTGGATGAAATTTAACTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 402926 198 + 647215 TGAGGCTGATCATGATACATGTTAAACATTTGTGAGTGAGTCATTACTAGACAAGGCAGCAT-AATTATCCATGATTTAAGGGTTATAGGAGCTGTCAGTTGAGTGTGTATTTATAGTCTTTTCTAATAATTTGGAACACTAACTCCCCTGTACAGACACACCCAGACTAACGCTATCGAACAGGCTAAATTTAACTGC + +a +s mr.mrrefChr5 256298 77 + 294542 AAAGATAGCATAATATTCAGGGAATGTGGGCATGGACTATATATATTCTACCCTACTTTCATCTCGCCGAGCATCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403540 76 + 636262 AAAGATAGCA-AATATTCAGGGGATGTGGGCATGGACCATCTATATTCTACCCTACTTTCATCTCGCCGAGCATCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 403124 66 + 647215 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GCTGAGCAGAGATAATTATGTATAAACATGGTAAGACTATTGCCCAACTATTGAGCATCACATGTGGTCTCTCAAGGATGCAGGATCCTGG--------ACTGAGGGCTGGGAAGAACTTTAGCTTTTATGAGTATGAGAAACTAGTTTGGGTT----------TTTGAAAACCAGACTATTAGTGAGCTTTTTGGTCAGTGGTGACACCTGTAATGCACAGCAGCACAGTGGGATTCAGTTCTGGCTAATATTCTACCATTGTACAGGTGTAATCTTCTTAAGCAAAGTAGGGTTCTTTCAGTAGCCCCAGTGGTGACTCCTAACCTTAAAGCCAACTTGCAAGCATAATCAGCAGATTAGCTTTGAGCAAGGTAACACCGTACATCTT----CACCCTCATTCAGGATACTTATAGGATGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 403190 379 + 647215 -----GCAGAGATAGTTATGTAGAAACAGAGTAAGGATATTACCCAACTATTAAGTGTCATAGACGGTCTCTCAAGGATGCAGGATCCTGATCAGTCCAACTGTGAGTTGGGCGGAACCTTAGCTTTAATGAGTATGAGAAACTACTTAGGCTGGTTAATATGGTTTGAAAACTAGACTATCAGTGGGGTTTATGGTCAGTGGTGACACATGTAATGCACGGCAGCACAGTGAGATTCAATCGTGGCTAATATTCTATCATTG--CAGGTGTA---------------------------------------TGGTGACTCCTAACCTTAAAGCCAGCTTACAAGCATAGTTAGCAGATTAGCTTAGTGTAAGGTAACACCATATATATTATAACTCCCTCATTCATGATGCTGATAGGATGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 256800 98 + 294542 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GTACGCAGTATGTGGATATTCAAGTAGTTGGAGTCTAGAAGCAGCATCCTTCACAGTTCTTGGCTTTGGCTGCAATAACAGTCAGTACGATCAAGAACGTTTGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404251 106 + 636262 GTACGCAGTATGTGGATATTCAAGTAGTTGGAGTCTGGAAGCAGCATCCTTCACAGTTCTTGGCCTTGGCTGCAATAATGGTCAGTACGATCAAGAATGTTTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 403817 98 + 647215 GTACGTACTACGTGAATATTCAAGAAGTTAGAGTCTAAAAGAAGCCTCCTTCAC--------GCTTTGGCCGCAATAACAGTCAGTATGACCAAGAACATTTGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 257136 254 + 294542 GCTCTAATTGTACCTCATGCTGATTTATCTCCAGACTACTCACTCTGCCGTACTCGCTTGTAGTTGTGGAGCTGAGCACATCCATAGGTATACCCTACAATAATCCGAGGGTGAAAGCACCATCCCTAGCTCTATGTGTCAGTCATGCTAGTGCTCACTAAACTCACACTGGCAAAACTTATGGAAAGATAGCTTGGTGGGGACACCAAAGCATATCAGTGACACAACACCCAGCAGATCAAATAGCCCAGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404358 254 + 636262 GCTCTAATTGTGCCTCATGCTGATTTGTCTCCAGATTACTCACTCTGCCATACCCATTTGTAGTTGTGGGGCTGACCACATCCATAGGTACACCCTACAATAATCCGAGGCTGAAAGTGCCATCACTAGCTCTATGTGTCAGTCATGCTAGTGCTCACTAAACTAGCACTGGCAAAACTTATGGAAAGATAGCTCGGTGGGGACACCAAAGCATATCAGTGACACAACACCCAGCAAATCAAATAGCCCAGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 403915 254 + 647215 GCTCTAATTGTACCTCATGCTGATTTATCTCCAGTCTACTCACTCTGCCGTACTCGCCTGTAGTTGTGGAGCTGAGTGCACCCATAGGTATAGCCTACAATAGTCCGAGGGTGAAAGCACCATCCCTGGCTCGATGTGTCAGTCATGCTAGTGCTCGCTTAAATCACACTGGCAAAACATATCCAAAGATAGCTTGGTGGGGACACCTATGCATATCAGTGACACAACACCCAGCAGATCAAATAGCCCAGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 257390 121 + 294542 TAAAAAAAATGGCAATATATGCTGTAAGGGTGTTAGTGAGCCGAAGAATAACCTGAGAACATCAGTAAGTGTCAACAGCTAGTGATAATAAAATCACAACCCAGCCAGTTCCAGAAGAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404619 108 + 636262 TAAAAAAAATGGCCACATATGCTGTAACGGTGCTAGTGAGCCGAAGAATAACCTGAGAACTTCACTAAGTGTCACC------------TAAGTTCACAACCCAGCCAGTTC-AGAAGAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 404169 121 + 647215 CAAAAGAAATGGCAGTATATGTTGTAAGGGGGTTAGTGACTCAAAGAATAACCTGAGAACATCAGTAAATGTCAACAGCTAGTGATAATAAAAGTACAACCCAGCCAGTTCCAGAAGAACC + +a +s mr.mrrefChr5 257511 82 + 294542 CCCAAGATACATTGATACACTGGAAGGGAGCATCGTGTTTGGGACTATGCTGATTTAGTTGAGAGCCAGCTGTTAAAGTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404734 82 + 636262 CCCAACATGCATTGATACACTGGAGGGGAGCATTGTGTTTGGGACCATGCTGATTTAGTTGAGAGCCAGCTGTTAAAGTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 404290 82 + 647215 CCTATGATACATTGATACCTTCATAGGGAGCATCATATGTGGGACTATGCTGATTTAGTTGAGAGCCAGCTGTTAAAGATAG + +a +s mr.mrrefChr5 257593 19 + 294542 CAAATGTAGACGACTGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404816 19 + 636262 CAAATGTAGACGAGTGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 404374 19 + 647215 CAAATATAGTCAACTGCCC + +a +s mr.mrrefChr5 257612 363 + 294542 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TGAATTTGGCCTAGACAATTAATACATT------TTGGTAATTAACCCAGTGATTCCGTGATAATGTGACAATAATCCAGCCAACGAGAGACTACATCCCTTCTCCATGGGAGTGTGTGACTGACAATACAGCCTACTAGTGCACTATTGATTGTGTGGGGTACCCATACCTGGTTGCCCTCTGTTCTAATTAAAACCTTCTAATTGATGCTAAGATGGCATGGAATGCAGTGAAAGAATCCAGTTCAAACATGTGTGATACCATAAAGAGTTGAACTCTCTAGCCAAGCACCCTAATTGCTACCTTATACTATCTGA--------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 257975 8 + 294542 AGTTGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405203 8 + 636262 AGTTGGAA + +a +s mr.mrrefChr5 257983 6 + 294542 ACCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405213 6 + 636262 ACCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 257989 34 + 294542 GTAGGGCCTTCAAAGGTCAGGACCACCTATCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405222 34 + 636262 GTAGGGCCTTCAAAGGTCAGGACCACCTATCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 258023 3 + 294542 GCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405258 3 + 636262 GCT + +a +s mr.mrrefChr5 258026 152 + 294542 TCTGCTCCTTGTGTCCCTATATGTCACTTCATCATCAACACTTTCATGAGATCATGTAAAACCCCTTAAATTGGTGGGAATAAGGGCACAATCCTAAAAGTATCAATATTGCCACATTTTTGTCTTTCATATTCAAAGGTCCATTTATCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405262 152 + 636262 TCTGCTCCTTGTGTCCCTATATGTCACTTCATCATCAACACTTTCATGAGATCATGTAAAACCCCTTAAATTGGTGGGAATAAGGGCACAATCCTAAAAGTATCAATATTGCCACATTTTTGTCTTTCATATTCAAAGGTCCATTTATCATT + +a +s mr.mrrefChr5 258178 11 + 294542 AACATATTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405415 11 + 636262 AACATATTGCC + +a +s mr.mrrefChr5 258189 191 + 294542 CAATGATTCATTCAATTTAACACCCCTATTAAGTAAGGATGAATCCCCTTATTATGGATTATGATCACCCTAATCATGCTGTGTTTATGCCCTGTCTTTCTCATTACTAGGTGCAAACAGGAGTGCTGGGAGTTCTTGATCCCTTTGATAGACAGGTCCCATACATCTTTTCTTAGTGAGATTTACAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405443 191 + 636262 CAATGATTCATTCAATTTAACACCCCTATTAAGTAAGGATGAATCCCCTTATTATGGATTAAGATCACCCTAAACATACTGTGTTTATGCCCTGTCTTTCTCATTACCAGGTGCAAACGGGAGTGCTGGGGGTTCTTGATCCCTTTAAGAGACAGCTCCCATACATCTTTTCTTAGTGAGATTTACAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 404705 138 + 647215 -----------------------------------------------------ATGGATTATGATCACTCTAATCAAGCTGTGTTTATGCCCTGTGTTTCTCACTACTAGTGGCAAACAATAGTGCTGGGAGCTCTTGATCTCTTTGATAGACAGGTCCCATACATCATTCCTTAGTGAAATTTACAACAT + +a +s mr.mrrefChr5 258380 8 + 294542 CCTGTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405634 8 + 636262 CCTGTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 404861 8 + 647215 CCTGTATA + +a +s mr.mrrefChr5 258388 101 + 294542 ACCCCTTAAGTATTGGTTTGTATGCAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTAAATGAAATAGAGGTAATTCCTCGCCTAGTGACTAATACGGTGAGGCTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405642 101 + 636262 ACCCCTTAAGTATTGGTTTGCATACAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTCAATGAAATAGAGGTAATTCCTCGCCTAGTGACTAATACGCTGGGGCTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 404871 76 + 647215 ACCCCTTAAGTAT-GGTCTGTATGCAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTAAATA------------------------AGACTAATACGGTCAGGCTCCA + +a +s mr.mrrefChr5 258489 127 + 294542 TGTAATCCATGCCACTACGCATCTCCTTAGTGATCATCTCTACAATGTAGATTTCATGTAGTTGCAAAATTCTACCAATTATGTGGTGTCTTTATCTTACATTAATTAATTCGAGCAAATATAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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TATCCAGTCCTGAGCTCTAGACCATAAATAACAGTTCTCATATAATGGTTACAAAGATGAGAGTCACCAGGATACACCTTGATATTGTGTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409389 93 + 636262 TATCCAGTCCTGAGCTCTTGACCAGAAATAACAGTTCTGATATAATGGTTACAAAGATGAGAGTTACCAGGATACACCGTGATATTGTGTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 415981 93 + 647215 TATCCAGTCCTGAGCTCTAGACCATAAATAACAGTTCCCATATAACGATTACAAAGGTGAGAGTCACCTGGATACACCTTGACATTGTGTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 262377 188 + 294542 AGATAGATGGTGTCCCAAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACGTGACAATCACCTTCTGGTTTTTCCAGGAGTGTATCCTATTGATGATTGGTCCATGGGTCAGTCCTTAGTCATTTGTGTCAGTTGCTAGTCATTAGGACGTTTAGTAGATGATCAAGGGTTTAACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409482 184 + 636262 AGATAGATAGTGTCCCCAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACGTGACAATCACCTTCTGGTTTTTCCAGGAGTGTATCCTATTGATGATTGCTCTATGGGTCAGTCCTTAGTCATTTGTGTCAGTTGCTC----CTAGGACGTTTAGTAGATGATCTAGAGTTTAACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 416075 188 + 647215 AGATAGATGGTGTCCCAAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACATGACAGTCACCTTCCATTTTTTCGAGGAGTGTATCCCATTGATGATTGGTCCATGAGCCAGTCACGAGTCATCAGTGTCAGTTGCTAGTCATTAGGACGTTTTGTAAATGATCAAAGCTTTCACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG + +a +s mr.mrrefChr5 262565 7 + 294542 CCAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409667 7 + 636262 CCAATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 416263 7 + 647215 TCAATTT + +a +s mr.mrrefChr5 262572 5 + 294542 TGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409714 5 + 636262 TGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 230251 5 - 647215 TGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 262577 21 + 294542 CTCCTCATTTACCATTACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409719 21 + 636262 CACCTCATTTACCTTTACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 230268 21 - 647215 CTATACATTTACCATTACAAC + +a +s mr.mrrefChr5 262598 357 + 294542 CTGGTATAGGAGATGTTTCACTTACTCTATTAGGGTGATGATGAATCAAGACTTAGGTCAGCCTAAACACATGTACAATGTTTTTGCTTCTATTTAGTTCAGTCCAGTCGTTGTGCATGTGTGTGCACTGTACAGTTTCCCTTCCTTCAAATTCATATGATTACAATGCCACTAACAATCTTAAATCTTTCCTATTATAACAAACTGAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTGGATGAGGTCTCACCACCTCACTCCATTGTCCATAACAGATTTGTCAGCATTGTCCAAGAAGCTCCAAAGAGAAATACCACATGACAGATGGCTCTACTGACCCATGGTATTCCAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409740 341 + 636262 CTGGTACAGGAGGTGTTTCACTTACTCTATTAGGGTGATGTTGTATC--------TGTCAGCCTAAACACATGTAGAATGTTTTTGCTTCTATTTAGTTAGGTCCAGTCATCATGCAAGTGTGTGTACTGTACAGTTACTCTCCCTTCTGATTCATATGATGACAATGCCACTAACAATCTTAAATCTTTTCTATTATAACAAACTGAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTGAATGAGGACACACCACCTCTCTCCATTGTCCATAACAGATTTGTCAGCATTGTCCAAGAAGCTTCAAAGAGATATATCTCATGACAGATGGCT--------CCATGGTATTCCAGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 230292 357 - 647215 CTGGTATAGGAGATGTTTTGCTTACTCTATTAGGTTCATCATTAACCAAGACTTAGGTGAGCCCTAACACATGCACACTGTTTTTGCTTCTATTTAGTTCAGTCCATTTGTTGAGCATGTGTGTGCACTGTACAGTTTTCCATCCTTCAAATTCATATGAGTACAATGCCACTAACAGCCTTCAATCTTTCCTATTATAACAAACTAAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTAGATGAGGTCTCACCACCTCACTCCAATGCCCATAACAGATTAGTCAGTATTGTCCAGGAAACTCCAAAGAGAAATACTACATGACATATGGCTCTACTGACCCATGGTATTCAAGAAG + +a +s mr.mrrefChr5 262955 4 + 294542 CTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410090 4 + 636262 CTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 230649 4 - 647215 CTTG + +a +s mr.mrrefChr5 262959 14 + 294542 GCAAATGTTTGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410096 14 + 636262 GCACATGGTTGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 230653 14 - 647215 GCAAAAGTTTAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 262973 7 + 294542 TACAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410259 7 + 636262 CACAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 230667 7 - 647215 TACAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 262980 7 + 294542 ATTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410267 7 + 636262 ATTCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 230674 7 - 647215 ATACAGG + +a +s mr.mrrefChr5 262987 7 + 294542 AAAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410274 7 + 636262 AAAGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 230684 7 - 647215 ACAGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 262994 125 + 294542 TTCTCTAGTGCACCATGATGTTCACAACTCTTGAGAAATATGTTTATGGCATTGTACATTGAAGTGGGATGCTATTTGCATCTTACTAGACTCTTACCACCCCAATTTGCCTGCTCATTGTCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410282 119 + 636262 TTCTTTTGTGCACCATGATGTTCACAACTCTTGAGGAATATGTTTATGGCATTGCATATTAAAGTAGGGTGCT------ATCCTACTAGACTATTACCACCCCAACTTGCCTGCTCATCGTCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 230691 121 - 647215 TTCTCTAGTGCACCATGATGTTCACAACTCTTGAGAAATATGTTTATGGTATTGTACATTGGAGTGGGATGCTATTTGCATCTCACTAG-CTCCTACCACCCCAATTTGCCTGC-CGTTGCCA-- + +a +s mr.mrrefChr5 263119 148 + 294542 TGGTTCTAGTGTTTCTTAGTGTCTAGGATTATGCCTGTCACTTACTTGTCTCTCTTCACAATAAGTTAGTTACTGACTGTGTGGCTATGTTATCACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTAACACAAAAACCTTGCAAGTAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410408 148 + 636262 TGGTTCTAGTGTTTCTTAGTGTCTGGGATTATGCCTGTCACTTACCTGTCTCTCTTCACAATAAGTTAGTTACTGACAGTGTGGCTATGTGATCACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTAACACAAAAACCTTGCAAGTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 230812 133 - 647215 ---------------TTAGTGTCAAGGATTATGCCTGTCACCTACTTATCTCTCTTCACAATAAGTCTGTTACTGGCTGTGTGGCTATGTTATAACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTCGCACAAAAATTTTGTAAGTGATT + +a +s mr.mrrefChr5 263267 64 + 294542 ATCATGTGCTCCTGGTCACCAGTCATATTGATCTAGCTTAGGGGCCCCCTACAATTTTATTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410557 64 + 636262 ATCATGTGCTCCTGGTCACCAGTCATATTGATCTAGCTTAGGGGCCCCACACAATTTTATTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 416976 51 + 647215 -------------GGTCACCAGTTATATTGATCTAGCTTAGGGGCCCCCTGCAAATTTATTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 263331 14 + 294542 ACTAGTATAAAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410622 14 + 636262 ACTAGTATAAAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 417027 14 + 647215 ACTAGAATAAAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 263345 647 + 294542 TCTTCCTTGTTCACTATTACCCAAGCATGATATTTTCAAATGTTCTGTCACCATTTGCACCCCAACCTCTCCAGGTATTTAAACTTTCTTGAGAATCTTCACCATATCTGAGACACCATATGGACGGGGGGTGGTGCAATATGACCAGTACCAAATATATGTCTGGTGCTTGGGGGTGAAAAGGGTGCTTGGGGGTCAAAAGGACTATGACATAGGACCTTGATAACAATGATTAGTTGACCAATAATTGAAGGAGGTCAAAGTGTGGTGTTAAGGATTGGCCTTTTGTCTTAAGGACATGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGAATAAAAAGTCATCTGGTAAGGATACTGGAGTAAGGGGTCAAAAAGGAGTACTGGATGCTATCCCCCATATGTAAGCTCCCTCTTAAGACTTTGCTGAGTAAAGGACCACCACATTGTTAGCCTCACTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTTACCATGGGATGGTTTCTTGGGACCTGAGTGAGGAGTGCAATGATCCATAGATGGAACACAATGATCTAAGGGTAAGAGATCCTTGTTGTAATGGTATCACCTAATAGGCAGTTTTACCTTCTATGAGCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410639 644 + 636262 TCTTCCCTGTTCACTATCACCCAAGCATGATATTTTCAAATGTTCTGTCACCATGTGCACCCCAACCTCTCCAGGTATTTAAACTTTCTTGAGAATCCTCACCATATCTGAGACACCATATAGACGGGGGG-AGTGCAATATTACCAGTACCACATATATGTCTGGTGCTTGGGGGTGAAAAGGGTGCTTGGGGGTCAAGAGGACTATGACATAGGACCTTGATAACAATGATTAGTTGACCAATAATTGAAG-AGGTCAAAGTGTGGAGTTGAGGATTGGCCTTTTGTGCCAAGGACATGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGCATGAAAAGTCATTTGGTAAGGATACTGGAGTAAGGGGTCACAGAGGAGTGCTGGGTGCTATCCCGCATATGTAAGCTCCCTCTTATGACTTTGCTGAGAAAAAAACCAC-ACATTGTTAGCCTCACTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTAACCGTGGGATGGTTTCTTGAGACCTGAGTGAGGAGTGCAATGATCCATAGATGGAACACAATGATCTAAGGGTAATAGATCCTTGTTGTAATGGTATCACCTAATAGGCAGTTTTACCTTCTATGAGCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 417041 623 + 647215 TCTTCATTGTTCACTAATACTCAACCATAATATTTTCAAATGTTCTGGCACCATTTGCACCCCAACCTCTCCAGGTAT--AGACTTTCTTGAGAATCTTCACTGTATCTGAGCCACCATATGGACGGGGAGTGGTGCAATATGACCAGTACCAAATATGTGTGTAGTGCTTGGGGGT-------------------CAAAAAGACCATGACATATGACCTTGATAACAATGGTTAGTTGACCAATAATTGAGGGAGGTCAAAGTGTGGTCTTAAGGATTCGCCTTTTGTCTTAAAGACTTGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGAATAAAAAGTCATCTGGTAAGGATACTGGAATAAGGGGGCAAAAAGCAGTACTGGATGCTACCCCCCATATGTA---TCCCTCTTAAGACTTAGCTGAGTAAAGGACCACCACATTGTTAGCCTCGCTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTTACCATAGGATGGTTTTTTGGGACCTGAGTGAGGAGTGCAGTGATCCATAGATGGAGCATAAAGATCTAATGGTAAGAGATCCTTGATGTATTGGTATCAGCTAATAGGCAGTGTCACCTTCTATGGGTCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 263992 80 + 294542 ACCAAAAAAGCATAGAACTGTGTATTAACTGTAAGTTGACCATTCAGAATCTATTGCTCTAAACATATGGCAAATTGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411288 80 + 636262 ACCAAAAAAGCATAGAACTGTGTATAAACTGTAAGTTGACCGTTCAGAATCTATCGCTCTAAACATATGGCAAATTGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 417664 64 + 647215 ----AAGAAGCATAGAACTGTGTATTA-CTGTAAGTTTCCCATTCAGAATCTATTGCCCTAAACATATG----------- + +a +s mr.mrrefChr5 264072 12 + 294542 ATTGTGGACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411369 12 + 636262 ATTGTGGACAAA + +a +s mr.mrrefChr5 264084 18 + 294542 GCATGCAAGCTCACTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411392 18 + 636262 GCATGCAAGCTCACTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 264102 58 + 294542 AATATGAACTACGTCAGATGAGATGCCACCTTAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411421 58 + 636262 AATATGAACTACGTCAGATGAGATGCCACCTTAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 417728 51 + 647215 -------ACTACATCAGATGAGATGCTACCCCAACATGAGTTTTAGAAAAGGAACCTG + +a +s mr.mrrefChr5 264160 253 + 294542 TTGCACCACACGGCCAAAGTGTAAGCTCACTTCTGATACCCACAGAATTCGAATTACAATAAATGAGATGCCACCTCAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTGGTAGTCTGTTGCACCACACAGCTAAACAAAGTGAAGTCATTCCACACTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGCAATGCACCCAACTATACAAAGCCTAATTGCTAGGCAAGTTACTATAACACAGGATCATAGTGAGGTTCTTCGGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411487 244 + 636262 TTGCACCACACGGCCAAAGTGTAAGCTCACTTCTGATACCCACAGAATTCAAATTACAACAAATGAGATGCCACCGCAACATGGG----AGGAATGGAACTTGGTA-----TTACGCCACACAGCTAAACAAACTGAAGTCATTCCACACTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGAAATGCACCCAACTATACAAAGCCTAATTGCTAGGCAAGTTACTATAACACAGGATCATAGTGAGGTTCTTCTGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 417779 252 + 647215 TTGCACCACACAGCCATAATGCAAGCTCACTTCTGATTTCCAGAGAATTTGAATTACAATAAACGAGATGCTACCTCAGCAAGAGTTTTAGGAATTGAAGTTGGTAGTCTGTTGCACCACACAGTGAAACAAAGTGAAGATATTCCAC-CTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGCAATGCACCCAACTATACAAAGCTTAATGGCTAGGCAAGTTACTACAACCCAGGAGAATAATGGGGTTCTTTGGAAG + +a +s mr.mrrefChr5 264413 44 + 294542 CTAGCTGGCAAAGGTAAATACATGACATGGAAGAAATAAGACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411740 44 + 636262 CTAGCTGGCAAAGGTAAATACATGACATGGAAGGAATAAGACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 418031 44 + 647215 CTAGCTGGCACAGGTAGATACATGACATGGAAGAAATAAGACAG + +a +s mr.mrrefChr5 264457 287 + 294542 TACAGTTGAAGTCAGCACTGCCTTTTCACTTCAGTCCCTGTGTCTAAATCATGATTCACACCCGGTGTGTAATGTGTGGAAAGAGGTCAGACAATGACTACCATTTTAAGACAACCAACTATGTTGTTTTACATAGCTGTTGCAAGCGGTTAGCTGCACTTTCTAGGCTTCAGGGTCATAGAAAAGAAACAATGGGAATGTGGGCCACCTTACACTTACATTAATACATGCAATAATAGTGAGAGTTGAATACATTGCTGGCCAACTGATGGGTGGGGAAAACGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411784 279 + 636262 TACAGCTGAAGTCAGCACTGCCTTTTCACTTCAGGCCCTGTGCCTAAATCATGATTCACACCCGGTGTGGAATTTGTGGAAAGAGGTAGGACAATGCCTACCATTTTAAGACAACCAACTATGTTGTTTTACACAGCTGTTGCAAGCGATTAGCTGCACTTTCTAGGCTCCAGGGTCATAGAAAAGAAACA--------GTGGACCTACTTACACTTACATTAATACATGCAACAATAGTGAGAGTTGAATACATTGCTGGACAACTGATGGGTGGGGAAAGCGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 418077 285 + 647215 TACAGTTCAAGTCAGCAATGCCTTTTTACTTTGGTTCCTATGTCTAAATTATGATTCAAATCCCGTATGTAATGTATGGAAGGAGGTCAGACAATGACTACCATTTTAAGACAACCAGCTATGTTGTTCTGCATAGCTGTTGCAAGCAGTTAGCTGCACTTTCTAGGCTTCAGGGTCATAGAAATGAAATAATGGGAATGTGGGCCACCTTATACTTACATTAA--CATGCAATAATAGTGAGAGTAGAATACATTGTTGGCCACCTCACGGGTGGGGAAAACACCA + +a +s mr.mrrefChr5 264744 58 + 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 412201 147 + 636262 ATATGGGGTCTTATTATATTTTATTTTTTTCAGAGTTTATCTATAAAGTTGTATCATTTGATAATGCCTAGAAAAAAGCACTAAACCACAAAATATAGGAAAGAAACCTGATTTGCCTCAACAACAGAGCTAGCCAAGAAGAAAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 418493 105 + 647215 ---------------------------------------TCCATAAAGTCATATCATTGGATAATGCCTAGGACAAAGCACTAAACCACAAAATATAGGAAAGAAACCTGACTTACCTGAACAACAGAGCTAACCAAGTAGATG--- + +a +s mr.mrrefChr5 265032 18 + 294542 TGGGTGCACTGAGCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412351 16 + 636262 TGGGTGCACTGAG--ATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 418598 18 + 647215 TGGGTGCACTGAGCAATG + +a +s mr.mrrefChr5 265050 119 + 294542 CATGTAAATATTGCTATGGCACAATAACTCAACTATTAGGCCTTAAAGTCTAATAACTCTAATCTTTGTGAGTATAAAATCATGGGGCTGAGGCTCTGAAAGTGCTGAGCAATGTCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412368 119 + 636262 CATGTAAATCTTGCTATGGCACAATAACTCAACTATTAGGCCTTAAAGTCTAATAACTCCAATCTTTGTGAGTATAAAATCATGGGGCTGGGGCTCTGAAAGTGCTGAGCAATGTCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 418616 119 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 419920 121 + 647215 TGTAAGGTGAACACTCAGAATCTATTGCTCTACACAAATGGGATAGATCCCATCATGGACAAATTTAGGAGGCCATATGCCAGCTTGCTACCAATACCCTTACAATTAAAATTGTAACAGA + +a +s mr.mrrefChr5 266383 14 + 294542 TGAGATCACACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413720 14 + 636262 TGCTATGACACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 420041 14 + 647215 TGAGATCACACCTT + +a +s mr.mrrefChr5 266397 71 + 294542 TTATGAAAGGAACTCAGTAGTCTACTGAGTGAAACAGCTAAACAGGGTGAACTCATCCTGCACTAGCTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413743 69 + 636262 TTATGAAAGGAACTCAGTAGTCTACTGAGTGAAACAGCTAAACAGGGT-AGCTCATCCTGCAC-AGCTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 420055 71 + 647215 TTATGAAAGGGTCTAAGTAGTCTATTGAGTGAAATAGCTAAACAAGTTGAACTCATTCTGCACTAGCTATC + +a +s mr.mrrefChr5 266468 255 + 294542 AAATTCCATACTAAGCTGCACACCCAACCGCACAAAGCCTGATTGCTAAGCAAGTTGCTATAACTCAAGCACGTGTGATGAGGTGCTTTGGAAGCCAGGTAGATACATACCATGGAAGAAATGACACATCACATAATCGTTACAGTTCAAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGCCCCTGAGTCTAAACTGTGATTCACACCAGCTGTGTAATTAAAGCAACAAGAGTGAGAGTTGAATGTTGGTCTGGGGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413812 201 + 636262 ---------------------------------------------------AAGTTGCTATAACTCAAGCACATGTGACGAGGTGCGTTGGAAGCCAGGTAGATACATACCAGGGAAGAAGCGACACATCACATAATCGCTACAGTTCAAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGC---TGAGTCAAAGCTGTGATTCACACCAGCTATGTAATACATGCAACAAGAGTGAGAGTTGAATGTTGGTCTGGGGGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 420129 253 + 647215 AAATTCCATACTAAGCTGCACACCCAACCGCACAAAGCCTGATTGCTAAGCAAGTTGCTATAACTCAGG-GTGTTTGATGAGGTGCTTTGGAAGCCAGGTAGATACATAACATGGAAGAAATGACACATCACATAAGCATTACAGTCAGAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGCCCCTGAGTCTAAACTGTGCTTCACACCAG-GGTGTAATTAAAGCAACAAGAGTGAGAGTTGAGTTCTTGGATGGCTATTG + +a +s mr.mrrefChr5 266723 6 + 294542 AGCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414030 6 + 636262 AGCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 420382 6 + 647215 GGCCGG + +a +s mr.mrrefChr5 266729 116 + 294542 GGCTCTCAGTCTGAGAGTTATCACACTCTTATTTGCGACCTTTCCCATTAGCTGATCCATAAGACTAACATGAAATTCTGCTAAATGATATGGTGTGCCACATGAGATCCCCCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414049 116 + 636262 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CCAGTTGAGCTGGACTGGGGTATCACAAAGTCATTATTTCTCTGTTACCTCCGTATATGTCCAAAGTGACTATCTTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACTCACCATATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417101 126 + 636262 CCAGTTGAGCTGGACTGGGGTATCACAAAGTCATTATTTCTCTGTTACCTCCCTATATGTCCAAAGTCACCATCTTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACCCAGCATATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 423136 126 + 647215 CCGGTTGAGCTGGACCAGGTTATCACAAAGTCTTTATTTATCTCTTACCTCCGTATATGTCCAAGGTGACTATCCTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACTCACCATATTG + +a +s mr.mrrefChr5 269632 47 + 294542 CCTACTCAATAATTGTCTAGTCATTGGTCAGGTTGCTATTTTGAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417228 47 + 636262 TCAACTCCATAATTGTCTAGTCATTGGTCAGGTTGCTATTTTGAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 423262 47 + 647215 CCTGCTCAATAATTGTCTAGTCATTGGTCATGTTGCTATATAGAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 269679 88 + 294542 ACACCCAGTAATGGGCCCTCTAATCATGGAAGCAAGGCAGGGCAACTACTAAAAAGAGCGATCCATGTCAACTATGTTGGGGTGCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417277 88 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 423469 90 + 647215 ATGTGCTACTCTGCCTGTGGTCAACCAAGGGGGAGCCAGTATCAAGGCTTCGCATTCTCTCCTGGAACCCTCATCACTTTCACAGTATGT + +a +s mr.mrrefChr5 269928 108 + 294542 CTGCCCACTCTCGTGTCTAATGGACCTTCCCATGAATGTTTGCATCAATCCTTGGCCAACAGATATGACCAGTTCTGGTGGGGCATACACGAAAGGGATGGAACTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417528 108 + 636262 CTGCCCACTCTCGTGTCTATCAAACCTTCCCATGAATGTTTGCATCACTTCTTGGCCAACAGATATGACCAGTTCTGGTGGGGCATACATGAAAGGGATGGAACTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 423559 108 + 647215 CTGTCCACCCTCTTATCTAATGGACCTTCCCATGGATGTTTGGATCAATCTTTTGCCAACAGATATGACCAGTTCTGGTGTCTCATACACGAAACGGATGGAACTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 270036 90 + 294542 CATGGTGCATATTCCCAAAAGGATGGGAATGTCTCAAAAACCATCATCCAGGTGAATGGAGGGGGGTTGACAGGGTGTCTGTTGCATTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417637 90 + 636262 CATGGTGCATGTTCCCGAAAGGATGGGAATGTCTCAATAACCATCATCCAGGTGAATGGAGGGGGGTTGACAGGGTGTCTGTTGCATTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 423667 90 + 647215 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31 + 647215 CTGAAGTTCATCTCCATGTGGTTGCAAGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 270350 61 + 294542 TACCAGAAATCTGATGTACACTGATAGGCCTACTAAGCTCCACTGCCTCGTCTTAGTAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417951 61 + 636262 TACGAGAAATCTGATGTACACTGATAGGGCTACTAGGCTCCACTGCCTCGCCTTAGTAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 423999 61 + 647215 TACCAGAAATCCAATGTACACTGGTAGGCCTACTGAGCTCCACTGCCTTGTCTTGGTTGAC + +a +s mr.mrrefChr5 270411 54 + 294542 ACCACACTTTGTAAGTTAAGTTGTGGTAGGACATAGAACCCTACTAACATGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418012 44 + 636262 ACCACACTTTGTAAACTATGTTGTGGT--------GAACCCTACTAACATGG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 424061 54 + 647215 ACCACACTCTGTAAGTTAAGATGTGGTAGGACATAGAACCCTACTAACATGGGA + +a +s mr.mrrefChr5 270465 265 + 294542 ACATCAATGTCACTACCTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCCCTGGATATGAGATCTTCGTTTCATATAAAATAGTCAGAACTTCCTAGTTTGGTTACAGACACAGGCATCCCTATTAACCTAGTAGTTCCTGCTCTGCCACCGGCAGTTTGAGGACCCTTGACTGTTCGTTCTTTCTACACTTGGTGCCATCTTTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATTCATCTTTTTCTCTATCAATTGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418056 262 + 636262 ---CTAATGTCACTACTTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCCCTGGGTATGAGATCTTTGTTTCACGTAAAATAGTCAGAGCTCCCTAATTTGGTTCCAGAAACAGGCATCCCTATTAACCTAGTAGTTCCTGCTCTGCCACCAGCAGTTTGAGGACCCTCGACTGTTCGTTCTTTTTACACTTGGTGCCATCATTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATTCATCTTTTTCTCTATCAGTTGCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 424116 259 + 647215 ACATCAACGCCACTACCTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCTCTGGATATGAGATCTTCGTTTCATATAAAATAGTCAGAACTTCCTAGTTTGGTCACAGACACAGGCATCCCTATGAGCCTAGTAGTGCCTGCTTTTACACCGG------GAGGACCCTTGACTGTTCGTGTTTTCTACAATTGGTGCCATCTTTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATACATCTTTATCTCTATCAATTGCACT + +a +s mr.mrrefChr5 270730 282 + 294542 CCAATACTTGTATAGACCTCTACAGCATTGAGATAATGAGCAGACCATGTATCCTTTCTTGATGCCCATGCTATTGCAGTATTTGCTTGGAACTTTTACAGGGCTAGAATGCACAAAAGTGCCCAAACAATTTATTTATATCCTGAGCCATAACTTAGTTTAGGGAGATCTACAGGATTTCATGTTCACATGTTTCACTAGAGTTCTCATGTTGTGCCCTAACCATTCCTCCCAACTGCATGGATAACTCTACGTTTTAGAAATATCTGGTGTAGGATGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418318 273 + 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------------------------CATTGGCAGCTATGATGTGGAAGAATCTCCAATTCCAAAGGAGGATCCCATCCAGGACATCAGGACCCATAAAGGAGAGACAACTGACCAAGCAATTCTATACTTAACCAGAGGGCAAGATACAGTGCAACATGCATCACAGGAAGCATATTCAGAGTCATGATGGTGCGCA--------------CATCACAGGACCACATGCTCTAGTTTAGAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 424857 243 + 647215 CAGAGACAACTACCTAAAATTTCACATTGGCGGCTATAATGTGGAAGAGTCTCCAGTTACAAAGCAAGATACCATCCAGCACATCAGGACCCATAAAGGAGAGACAACTGACAAAGTGATTCTATACTCAACCAGAGGGCAAGATATAGTGCACTATACATCACAGACAACGAGATCAGAGTCATGAGGGTATCCAACCACTAATGATAGCATCACAGGGCCACGGGCTCTAGTTTAGAGAGA + +a +s mr.mrrefChr5 271440 56 + 294542 TTTGCCCTGCTGTGTGAGAGAATCACCATAAGTGTCGTCCGCCCTAATCGACAACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418973 56 + 636262 TTTGCCCTGCTGCGTGAGACAATCACCATAAGTGTCGTCCGCCCTAATCGACAACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 425100 33 + 647215 TTTGCCCTGCTGTGTGAGAGAATCACCATAAGC----------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 271496 114 + 294542 GGCCACGTGGTACAGACAGTGTGTAAGTAAGAATGATATCGATTTTGCATTAAGTCACTATACATACACCAGCCTAGATAGGAGGAGAAAAATTAAATGAAAATTGACGGTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419034 114 + 636262 GGCCACGTGGTACAGACAGAGTGTAAGTAAGAATGATATCGATTCTGCATTAAGTCACTATACATACACCAGCCTAGATAGGAGGAGAAAAATCAAATGAAAATTGACGGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 425133 98 + 647215 ---------------ACAGTGTGTAAGTAAGAATGATATCAATTTTGCATTAAGTCACTATACATGCACCAGC-TAGATAGGAGGACAAAAATTGAATGAAAATTGACAGTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 271610 11 + 294542 CGTACAAGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419148 11 + 636262 CGTACAAGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 425250 11 + 647215 CGTGCAAGGCT + +a +s mr.mrrefChr5 271621 48 + 294542 TTTTTCTACTTGATAGAAAAGTTGAAAAGTTCTAATTGACTAGTGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419279 48 + 636262 TATCTCTACTTGATAGAAAAGTTGGAAAGTTCTAATTGACCAGTGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 425261 48 + 647215 TTTTTCTACTTGATAGAAAAGTTTAAAAGTTCTAATTGTCTAGTGCAC + +a +s mr.mrrefChr5 271669 216 + 294542 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TCTATTGACTCATCCCAGTGCAACACACATAGTCCCTGTAATTTGCACTAAGTGAGTTGATTGTACATGAAACCTCTCATAATCTCTCTGGTAACAAAATAATTCCTACTACTAAGTGTGATCTGTGCATACACTAGTACCTTATAGATGCCAACAATTGTGATCACCCATAGAAAGACAAAAGACTTAC----CTGTTATGTCCCCTCTTCTATATCGTGGGTTCATAAAGACTAG-CACATGAGGACATAGAAGATGAGTACTGTACATTTCCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 429325 271 + 647215 TTTATTGACTCATGCCAGTGAAGCACATTTAGTCTCTGTGATTTGCACTAGGTGAGCTAATTGTGCATGAACTCTCTTATAATCACTCTGGTACCAAAATAACTCACACTACCAAGTGTGATCTGTGCATACACCAGTACCTTATAGATTCCAACAATCGGGATCACCTACAGAGAGACAAAAAACGTACAGACCTGTTTTGTCCACTCTTCTAGGTCATAGG-------GGACTAGACGGGTGAAGACATAGAAGATGAGTATTGTACATTTCCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 275713 118 + 294542 ACATACCCAGCGAAGGAAGTCTGGTATAGGATTACAATTCCATTCATCCACCACGGGCCATCAGTCAACTCAACTCATCTGGTCTCAAATTAAACATAACTTCGCACCCTCTAAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423382 118 + 636262 ACATACCCAGCGAAGGAAGTCTGGTATAGGATTACAATCCCATTCATCCACCATGGGCCATCAGTCAACTCAACTGATCTGGTCTCAAATTAAACATAACTTGGCAGCCTCTAAGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 429596 111 + 647215 ACAAACTCAGTGAAGGAAGTTTGGTATAGGATTACAAGTCCGTTCATCCACCACAGGCCA-------ACTCAAATCAACTGATCTCAAATTAAATATATCTTCGCACCCTCTAAGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 275831 9 + 294542 CCTTTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423500 9 + 636262 CCTTTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 429762 9 + 647215 CCTTCTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 275840 149 + 294542 CAACCATTTGAAAGCTATAAAGCATGAACATTGCCAAAACTTTAAGAGAGACCTTAGACTTAGGATGAGAGGCATCTGAACTGTGCTGTGACTCCACTTGGGGCTGTTTAAGCATTACAATCAAGGATGGTAGATGGTGAAGTAAGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423509 149 + 636262 CAACCATTTGAAAGCTATAAAGCATGAACATTGCCAAAACTTTAAGAGAGACCTTAGACTTAGGATGAGAGGCATCTGAACTGTGCTGTGACTCCACTTGGGGCTGTTTAAGCATTACAATCAAGGATGGTAGATGGTGAAGTAAGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 429779 12 + 647215 CTACCATCTGAG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 275989 17 + 294542 GATGTTATTAATCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423668 17 + 636262 GATGTTATTAATCTAAG + +a +s mr.mrrefChr5 276006 87 + 294542 GGGGCAATGGTTGTGTAGATATAGGATGAACATCCTCTACCCAGTATTGTATTGTGGTTATCATGTGGACTCACCATGATGCACAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423686 87 + 636262 GGGGCAATGGTTGTGTAGATATAGGATGAACATCCTCTACCCAGTATTGTGTCGTGGTCATCATGTGGACTCACCATGATGCATAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 429791 60 + 647215 ---------------------------GAACATCCTCTACACAGTATTGTATTATGGTTATCATGTGGACTCACTATGATGCACAGT + +a +s mr.mrrefChr5 276093 215 + 294542 ACATCAAAGCCAGTCATGTGCAACAGTAAAATTGTCTAATCTTACTCCTTGTCTGCAAGAACACTCCTCTAACATCCTGATAGATTTAAATTCCTTACGAGACATCATGTTGTGTTGTATTCTCCTTTAGGAACAATGTATGACTGAACCTGCACACCCTGCAAGTGGCAATGCTACAAGTTGATTGATCACCTTACACCATTAGTGAAATGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423773 215 + 636262 ACATCAAAGCCAGTCATCTCCAACAGTCAAATTGCCTAATCTTACTCCTTGTCTGCAAGAACATTCCTCTAACATCCTGATAGATTTAAATTCCTTACGAGACATCACGTTGTGTTGTATTCTCCTTTTGGAACAATGTATGACTGAACCTGCACACCCTGCATGTGGCAATGCTACAAGCTGATTGAGTACCTTACATCTTTAGTGAAGTGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 429861 215 + 647215 AAATCAAAGCCAGTCATGTGCTACAGTAATATTGTCTAATCTTACTCCTTGTCTGCCAGACCACTCCTCTAACATCCTGATAGGTTTAACTTCCTTCCGAGACAGCATATTGTGGTGTATTCCCCTTTAGGAACAATGTATGGCTGAACCTACAAGCTCTGCAAGTGTTAATGCTGCAAGTTGATTGATCATCTTACACCATGAGTGAAATGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 276308 13 + 294542 CTTTTTTTAGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423989 13 + 636262 CTTTTTTTAGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 430076 13 + 647215 CTTTTTTTAGTCC + +a +s mr.mrrefChr5 276321 126 + 294542 CATGCTGAAAACCCTCACTATAAAGTCTTTACTAGACACAGTACATATATAAGATGAACCACATAAACAAAGCACCAACTAATGGACGGTCTCGTATCATGGCCTGCATGCCATCCCCAAAAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424003 120 + 636262 CATGCTGAAAACCATCACTATAAAGTTTTTACTAGACACAGTACATATATAAGATGAACAACATAAACAAAGCACCAACTAA-----GGTCTCGCATCATGACCTGCATAC-ATTCCCAAAAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 430089 126 + 647215 CATACTGACAACCCTCACTATAAAGTCTTTAATAGACACAGTAAATATACAAGCTGGACCACATAAACAAAGGACCGAGTACTGGACGGTCTGGTGTCATGGCCTGCATGCCATCCCCACAAATAG + +a +s mr.mrrefChr5 276447 336 + 294542 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TGATGTTGGCTATTGCTTTTTGGCGTCTTCTCTGCCCTCTTCTTATTCTTGTTCCACACTCAAGTTAAACAAGTGTAGTGTGTCAACCAATTCTTTCACAGGTGTTGTCAACATCCAACAGTAAGTCCATGGAACACTGAGCAAAAAAGCAGTCCAACAG-----------ATAATACTACATTTTTTAACAAAGTCGGGTCCTATGCCTTTGAACATCTATGGCTTTGAACATTGAACTGGCCAGAGCCCTGGCATCTGTGATAGCCTTTGCCACACAAAATAATCCAAGTTTGGGGTACATGGCAGTGGGATCCTTATCTGTGACACTCTAATC + +a +s mr.mrrefChr5 276783 189 + 294542 AGTGACCCCTTTGGACCTGGGATGAAGGGTGTCGTGTCCTTCTAAAGGTGCTTGCAATCAGATGACAGCATGTGAAGTGGGCACATGAGCCAGGCAGGGTCCTCCTACAGGTGCCTGTAATCACTTGAGAGCGCATAAGTGGGGCCGGCTCAGAGCCACGCACTAACCATGTGCACATGGCCACATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424448 189 + 636262 AGTGACCCCTTTGGACCTGGGATGAAGGGTGTCGTGTCCTTCTAAAGGTGCTTGCAATCAGATGACAGCATGTGAAGTGGGCACATGAGCCAGGCAGGGTCCTCCTACAGGTGCCTGTAATCACTTGAGAGCGCATAAGTGGGGCCGGCTCAGAGCCACGCACTAACCATGTGCACATGGCCACATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 430542 189 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 430777 93 + 647215 TTGAGTCTTTCACTGCAACAGGCACCTAAGAAGCCTATAGGAAACATGATTTAACA----TTGTTGAGAATTTGCACAGCACCTTGTGTAAAGCTCC + +a +s mr.mrrefChr5 277103 14 + 294542 CTGGGCCACACAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424782 14 + 636262 CTGGGCCACACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 430879 14 + 647215 CTGGTCCACAAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 277117 27 + 294542 ATGTAGTCTGAAGTATCAGTTAGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424796 27 + 636262 ATGTAGTCTGAAGTATCAGTTAGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 430894 27 + 647215 ACATAGTCTGAAGTATTGGTTAGAGTC + +a +s mr.mrrefChr5 277144 30 + 294542 CAGTTACCTAGGGATGAGTGGCTGTGGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424823 30 + 636262 CAGTTACCTAGGGATGAGTGGCTGTGGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 430922 30 + 647215 CAGTTACCTGGGGATGAGTGGCTATTGGGT + +a +s mr.mrrefChr5 277174 92 + 294542 AGGTCCCTGTCTAAACTCAGTGGATCAGTGGTTTGAGCGCTGATGAATGGGTGCAGATAAACCTGATGCATGAAGGGTGCAGCCCTATGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424853 88 + 636262 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CCCCAGGATTCAACTATTCAGCCTTTTTCTGAAAAACCACAAAATAGAACCAACAGCTTATATTAATAAGCAAATAAACTGACTCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 432711 88 + 647215 CCCCAGAATTCAACTATTCAGCCTATTTCCGAAAAACCACCAAATAGAACCAACAGCTTGTATTAATAAGCCAATAAACTGACTCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 279055 203 + 294542 TCCTGCAACTCTTCATGGTACTCAAAAATAGCTGCCCATTTGCAAGCTTGGATTACCTGACTTGTCTCAGCTTAAATTGCAAAGAAGATTTTGTATGTAGGGTAGATGCTTTCCAAAAGATGGTTTAAGTCGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGACAACACTCATAAGATTCACATCCGCCAATGTTTTATAAGGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426737 203 + 636262 TCCTGCAACTCTTCATGGTACTCAAAAATAGCTGTCCATATGCAAGCTTGGATTAACTGACTTGTCTCAGCTTAAATTGCTAAGAAGATTTTGTACATAGGGTAGATGCTTTCCAAAAGATGGTTTAAGTCGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGACAACACTCATAAGATTCACATCCGCCAATGTTTTATATGGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 432799 198 + 647215 TCCTGCAACTCT-----GTACTCAAAAATAGCTGCCCATTTGCAAGCTTGGATAACCTGACTTATCTGAGCTTGAATTGCAAAGAAGATCTTGTATGCAGGGTACATGCTTTCCAATCGATGGTTTAAATTGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGAAAACACTCATGGGATTCATATCCGCCAATGATTTATAAGGTTC + +a +s mr.mrrefChr5 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simRat_chr6.simRat.chr6 435952 28 + 647215 TATAGATGAACAACCATTGTTGTTTTGA + +a +s mr.mrrefChr5 282271 437 + 294542 AATCTCTAGCATTGCGAGGCAATGCCAAAAATTTGAACACCAATGATGATAATCTATAGGTAAGAAACATATGCATACATGGAATAAGAAAAGTATATATAATGTTTGGATTTAAGCAGACACATGAGCCTAAGCACATGTGGCTGCTATTCATCAGTTTAAATACTGATAGGCCACAGGAAGTACTAACTAAATAGCAAAAAATTGCTGTCTAAATGTCTTATCATATTTACTTTACAGACTACCAATTACTAGCATAATTTTCTGCTGGAGCAGCTTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACATGCAACTTATCTTCACCACGAGCAATTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTAATTAAACACTGAAGTGAATGGAAACACATTTAATTTGAATTCAAGATTAGTTTTGTAGCATGCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429820 419 + 636262 AAT---TAGCATTGCCTCACAATACTAAAAATTTGAA-ACCAATGATGGTTGTCTA--------AAACATATGCATACATGGAATAAGAGAAGTATATATAATGTTTGGTTTTAAGCAGACACATGAGCCTAAGCGCATGTGGCTGCTATTCATTAGTTTAAATACTGATAGGCCACAGGAAGTACTAACTAAAGAGCAAAAAATTGCTGTCTGAATGTCTTATCATATTTACTTTACAGAGTACCAATTACTAGCATAATTTTCTGCTGGAGCAG-TTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACACGCAACTTATCTTCACCACGAGCAAGTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTAATTAAACACTGAAGTGAATGGAAACACATTTAATTTGAAT-----ATTAGTTTTGTAGCATGCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 435980 429 + 647215 AATCTCTAGAAATGCGAGGCAATGTCAATTGTATGAGCATCAAGGTTGATAATTTGTAGGTAAGGAAGATATGCAGACATGGAATAAGAAAAGTGTATATAATGTTTGGATTTAACCAGACACACGAGCCTAAGGACATGTGGCTGCTATTCATCAGTTTAAATAC----AGGCCTCAAGAA----TCACTAAATAGCAAAAATTTGCTGTCTAAATATCTCATCGTATTTACTTTAGAGACTACCAATTAATAGCGTAATTTTCTGCTGGAGCAGCTTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACATGCAACTTATCTTCACCAGGAGCAATTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTATTTAAACGCTGAAGTGAATTGAAATGCATTTGACTTGACTTCAAGAGTAGTTTTATAGTGTGCCATA + +a +s mr.mrrefChr5 282708 56 + 294542 TTATTCACATACAGTAATCATTGTTTTAGAGTGCACTTTTGTTATTAATGAACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430239 56 + 636262 TTATTCACATACACTAATCATTGTTTTAGAGTGCACTTCTGTTGTTAATGAACAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 436416 56 + 647215 TTATTCACATACAGTAATCATTGTTTTAGAGTGCACTTTTTCCATTAATGAGCAGA + +a +s mr.mrrefChr5 282764 171 + 294542 CTGTGGAATCCTGTCTCACACTCTTATTTGTGTGAGCTAAGCTTGCAAAGGACTTGATCCAAGGCAGGATGTGCTGCACAGATCTTAGACTTTGTCTAATCTGGCTCTAAAGACAGGAATAGATTAGATGGGATTGCTTAAATATCTGTACAAAAGAAATAATCTACTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430298 171 + 636262 CCGTGCAATCCTGGCTCACACTCCTATTTGTGTGAGCTTAGTTGGCAGAGGACTTGATCCAAGGCAGGATGTGCTGCACATATCTTAGACTTCATCTAATGTGGCTCTAAAGACAGGAACAGATCAGATGGGATTGCTTAAATATCTGTACAAACGAAATAATCTATTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 436472 171 + 647215 TTGTGGAATCCTGTCTCACACTCTTATTTGTGTGGGCTAGGCTTGGCATGGACTTGATCCAGGGCAGGATGTGCTGCACAGATCTTAGACTTTGTCTAATCTGGCTAAAAAGACAGGAATAGATTAGATGGGATTGCTTAAATATCTGTACAAAAGAGATAATCTACTACA + +a +s mr.mrrefChr5 282935 392 + 294542 CAACCCAGGGTTTTGGATACAACTGTGGCTTTACAAATAGGTTGAAGCCCTTCTCTTCCTATTTTGCCACTGGACTCCCAAGGCAGCATGCCATGATAGTCACCCTAAATGACCACACACCATGAGAGTTGTAAATCCTTTCTTTACTCTATTTGCTATATATAATATATGCCTATCATGACAGCACCTGACAGCAATAATAAGAGGTAGAGACAATGGATAACCTGTGGGCTAGAAAGATCAATCTTGGTGGGCCTCCTGCACAAGCAGGATCCCAAGCACATTCTTAAGTGCCCATAATTTGCCCCTTTTGGAGCCAACTATACTAAAGTGAAAACAGCTTGAGAAAAACCATAGGATGGAGGAGCGTAATGACAGTGTTGCAGGGAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430480 354 + 636262 CAACCTAGGGTTTTGGATACAACTGTGGCTTTACAAATAGTTTGAAGCCCTTCTCTTCCTATTTTGCCTCTGGACTCCTAATGCAGCATGCTATGATAGTCACCCTAAATGACC--------TGAGAGTTGTAAATCCTTTCTTTACTCTATTTGCTATATATAATAGATGCCTATCATGACAGCACCTCACAGCTATAATAAGGGGTAGAGACAATGGATAACCTGGTGGCTA------------------------------AAGCAGGATCCCAAGCACATTCTTAAGTGCCTATACTTTGCCCCTTTTGGAGCCAACTATACTACAATGAAAACAGCTTGTGAAAAACCATAGAATGGAGGAGCATAATGGCAGTGTTGCAGGGAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 436643 391 + 647215 CAACTCAGGGTTTTGGCTACAACTGTGGCTTTACATATAGGTTGGAGCCCTTCTCTTCCTACTTTGCCATTGGACTCCCAAGGCAGCATGCCATGATAGTCACCGTAAATGATCACACACCATGAGAGTTGTAAATCCTTTCTTTACTCTATTTGCTATATATAATATGTGCCTAACATGCCAGC-CCTGACAGCAATAATAAGAAGTAGAGACAATAGATAACCTGTGGGCTAGAAAGATCAATCTTGGTGGGCCTCCTGCACAACCAGGATCCGAAGCACATTGTTAAGTGCCCATAATTTGCCCCATTTGGAGCCAACTATACTAAAGTGAAAAGAGCTTGAGAAAAATCATAGGATGGAAGAGCGTAATGACAGTGTTGCAGGGCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 283327 29 + 294542 CAAATGCAGGATGCATAGGTGAGTGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430836 29 + 636262 CAAATGCAGGATCCATGGGTGAGTGGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 437034 29 + 647215 CAAATGCAGAATGCATAGGTGAGTGGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 283356 26 + 294542 GGTCCCATCTGCCAAACGGCCATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177774 26 - 636262 GGTCCCATCTGCCAAACGGCCATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 437063 24 + 647215 GGTATC--CTGCCAAAAGTTCATGTT + +a +s mr.mrrefChr5 283382 496 + 294542 AATGTACAGGTGTATACCTCTATGGTGTTAGCTCAGCCACCGCATGGGAGAGCCCTAGATGGCAGAAGCAATAATTGTGACAGAGTTGAGTTTCATTGGAAGGATTCTGGCATTTTTAGCACAGGTTAATTCAAACCACCTCCTTACTTGCCCCAATGCCCGGAGCCTGTTGGCACATCCTATATGTAGCCATACCAGGATCGGGTTTGTTTCTATCTATGGGCATAGACATCACTATAAAAGATTGCCTAACATGAGTAAAATGCCAATGGGCCTGGTAAGAGAACAAGACTAGTGCACTCTGAGTATGAAAGAAGTGAATTGTGTGTGGCCCCTGAATGTCTCAGTGTGCACATTTATGCTCTTTCACTAGGTGAAGTTCTCCAGAACACCTGCCCCAAGGTGGTCTCTTGTTTTAAGTTGAGCTAGTTGCAGAAGGTGGCACACAAAGTTCAGATCCTTACTAATGGATATTCTTTGTTCATAGATGTATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177800 483 - 636262 AATGTACAGGTGTATACCTCTATGGTGTTAGTTCAGCGACCGCATAGGAGAG-------------AAGCAATAATTGTGATAGAGTTGAGTTTCATTGGAAGGATTCTGGCATTTTTAGCATAGGTTAATTCAAACCATCTCCTTACTTGCCTCAATGCCCGGAGCCTGTTGGCACATCCTATATGTAGCCATACCAGGATCGGGTTTGCTTCTATCTATGGGCATAGACATCACTATAAAAGATTGTCTAACATGAGTTAAATGTCAATGGGCACAGTAACAGGACAAGACTAGTGCACTTAGAGTCTGAAAGAAGTGAAGTGTGTGTGGCCCCTGAATGTCTCAGTGTGCACATCTATGCTCTTCCACTAGGTGAAGTTCTCCAGAACGCCTGCCCCAAGGTGGTCTCTTGTTTTAAGTTGAGCTAGTTGGAGAGGGTGGCACACAAAATTCAGACCCTTACTAAAGGATATTCTTCGTTCATTGATGTATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 437088 491 + 647215 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TACATAGATTGACAGACAGCTAGTGACAGAGGTAACTAGATATGAATTAGTAGGTATCAACAGTCATCTTTTCCCTAATAAGTGTATAAGGATGTGTCAGTTCCTGATACTTTAGGTAATGTAATGACTAACGGATCTTACTTTTTGATAGGCTATTGAATTTTATTCAGTACACAAGGG--AAGTCCCATTTATGTGAGAATTTGTGTGAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 437579 204 + 647215 TACATAGATTGACAGACAGCTAGTGATAGATGTAACCAAACATGAATTAGTAGGTATTAATAGCAATCTTTTTCCTAATAAGTGTATAC-GATGTATCAGTTCCTGC---------TGGCGGAATGACTAACAGATCTCATCTATTGATAGGCTCTTGAATTTTATTGAGTACAACAGGGCCAAGCCCCATTTGTGTGAGAATTTGTGTGAGAA + +a +s mr.mrrefChr5 284092 35 + 294542 ACATGGTAGACTCAGGGTTTGAACCATTCTCTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178496 35 - 636262 ACATGGTAGACTCAGGGTTTGAACCATTCTCTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 437845 35 + 647215 ACATGGTAAACTCAGGGTGTGAACCATTCTCAGAA + +a +s mr.mrrefChr5 284127 58 + 294542 CCATTCACAGAGATTCTGTTGAAAATGGAACTAGTTCATGCTCTGTTGTATTAAAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178544 58 - 636262 CCATTCACAGAGATTCTGTTGAAAATGGAACTAGTTCATGCTTTGTGGTATTAAAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 437880 20 + 647215 -------------------------------------ATGCTCTGTTGTATTAAAAC- + +a +s mr.mrrefChr5 284185 15 + 294542 ATGAGGTTTGTTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178603 15 - 636262 ATGAGGTTTGTTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 437900 14 + 647215 -TGAAGTTTGTTTCC + +a +s mr.mrrefChr5 284200 184 + 294542 TTAGGTGGTGATTTATATTTTACATTTCTCTATTGACAGGACTGCCTTGTTCTTTGTTATGTTGTCAGTAAGCTTTCCATGTAATTACAGCACAGTTTAAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTTTAAAGTTTGCAGACAGCCATATGGTCCATGATCTATCTGTGTCATCCCGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178618 184 - 636262 TTAGATGGTGATTTATATTTTACATTTCTCTATTGTCAGGACTGTCTTGTTCTTTGGTATGTTGTCAGTAAGCTTTCCATGTAATTACAGCACAGTTTCAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTATAAAGTTTGCAGACAGCCATCTGGTCCATGACCTATCTGTGTCATCCTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 437915 184 + 647215 TTAGGTGGTGATTTATATTTTACATTCCTCAAATGACAGGACTGCCTTGTTCTTTGTTATGATGCCAGTAGGCTTTCCATGTAATTATAGTACAGTTTAAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTTTAAAGTTTGCAGGCAGCCATATGGTCCATGATCTATCTGTGTCACCCCATAA + +a +s mr.mrrefChr5 284384 132 + 294542 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TGCACAATGGAACATCTGGCCCCTGTCACGCATGCAGCAGCTGAAATTCACCGTGTGCACCGAGGAGGCAAATTATTGTTTAAAACTTCTGTAGACTTCTTGTTTAACCTCTCTGACAAGATTCTTAGGAGGGGTTGTGTACTCACCAGTCGTAATAGCTTCAAAAGGCCAAGCAGGCAAAGTTCCTGATCATTTGTCACCTACCACACTCAGTAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179196 218 - 636262 TGCACAATGGAACATCTGGCCCCTGTCACGCATGCAGCAGCTGAACTTCACCATGTGCACCAAGGAGGCAAATTAGTGTCTACAACTTCTGTAGACTGCTTGTTGAACCTCTCTGACAAGATTCTTTGGAGGGGTTGTGTTTTCACCAGTTGTGATAGCTTCAAAAGGCCAAGCAGGCAAAGTTCCTGATCATTAGGTTCCTACCACACTCAGTAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 438280 188 + 647215 TGAATAATGGAACATCTGGCCTCTGTGACAAATGCAGCAGCCGAAATTCACTGCATGCACCGAGGAGGCAAACTATTGCTGAAAATTTCTGTAGACTTCTTGTCTAACCTCTCTGACATGATTCTCAGGAGGGGTTGTGTACTCACCAGTCACAATAGCTTCAAAAGGACAAGCTGGCA-----------AGGTTGTCA------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 284770 53 + 294542 TGAATGCACTAGTTCGTTGTGTCTGGTTTGGAAATGATCTGGGGTCTTGACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179418 53 - 636262 TGAATGCACTAGTTCGTTGTGTCTGGTTTGGAAATGATCTGGGGTCTTCACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 438468 50 + 647215 ---ACATACTAATTCATTGTTTCTGGTTTAGAAATGACCTGGGGTCTTGACTA + +a +s mr.mrrefChr5 284823 216 + 294542 ATGTCTTGCATGTGTCCAGTTTTGATTGAGTGGCTTTAGTGAGTGGTTTTATTGTTGACTGAGATTCGAATAGACTTTGACCAAGATTCCAAGAGGATTTGAATCTTTGAACAGGGCACCAGCTGATTCATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATATGGATAAGGTCCTTGATAAGGAGCATTTCATATGATAGGGCAGTGAATAGAGAACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179481 216 - 636262 ATGTCTAGCATGTGTCCAGTTTTGACTGAGTAGCTTTAGTGAGTGGCTTTATTGTTGACTGAGTTTTGAGCAGACTTTGACCAAGATTCCAAGAGGATTTGAACCTTAGAACAGGGCACCAGCTGTTTTATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATGTGGATAAGGTCCTTGATAAGGAGCATTTCATATGATAGGGCAGTGAATAGAGAACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 438518 216 + 647215 ATGTCTTGCATGTGTCCATTTTTGGTTGAGTGGCTTTCGTGAGTAGTCTTATTGTTGATTGAGATTCGAATAGACCTAGAACAAGATTACAAGAGGATTCAAATCTTTGAACAGGTTACCAGCTGACTCATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATATGGCTAAGGCCCTTGATAAGGAGCATTTCGTATGATAGGACAGAGAATGGAAAACAGG + +a +s mr.mrrefChr5 285039 87 + 294542 CGTAGGCAAAGGGTGAACAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGATAAACTCAAGACAAATACTCACCCTTAGATAAGATATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179697 87 - 636262 CGTAGGCAAAGGGTGAACAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGATAAACTCAAGACAAATACTCACCTTTAAATGAGATATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 438735 86 + 647215 AACAGTCAAAGGGTGAGCAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGAGGGCCACAAGACAAATACTGAGTCTTTGGTAGAATACT- + +a +s mr.mrrefChr5 285126 94 + 294542 AAATGGCATAGCAGCATGAATTTGATTAATAATAAATGATGCACTATTAACACTGTTGTACAAATTATCGTTACCCAAGTTATGGAGCACTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179784 94 - 636262 AAATGGCATAGCAGCATGAATTCGATTTATAATAAATGATGCACTATTAACACTGTTGTACAAGTTGTCGTTACCCAGGTTATGGAGCACTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 439032 94 + 647215 AAGTGGCATAGCAGCATGGACTTGATTAATATTATATGATGCACTATTAACACTGTGACACAAATTATTGTTACACAAGTTATGGAACACTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 285220 129 + 294542 CACAAGTTAAATCTTTGTGGGCCCTAGGGTGAGCAAAGTTTTTACAGAGATTTTTGAGACAAGGTACAGCTGTTTGAAATCTTCTGTCATCCTGGGATGATAGGCATTCTGGGATGACACATTAGGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179878 129 - 636262 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