Mercurial > repos > galaxy-australia > cactus_cactus
diff test-data/hal2maf.maf @ 15:098506c54016 draft default tip
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/main/tools/cactus commit 8fc43fe1e8c12438a14dbd174a8af3e7cb8b55dc
| author | iuc |
|---|---|
| date | Thu, 08 Feb 2024 08:52:28 +0000 |
| parents | 94b8c6013083 |
| children |
line wrap: on
line diff
--- a/test-data/hal2maf.maf Mon Aug 28 23:10:21 2023 +0000 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,30423 +0,0 @@ -##maf version=1 scoring=N/A -# hal (simMouse_chr6:0.084509,simRat_chr6:0.091589)mr; - -a -s mr.mrrefChr0 0 143 + 130230 TTTTCTCAGTTGCAATACCCAACCTGGAGACACTTTCAGTGAGCACACCTCAGGTTCCTATATCAAGCAGACAGTCTTGCATAGCAAATGGTCTCTGATAGACGGTGCACTCAATCTATGTGAGGGATAGAAAACAAAGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 0 142 + 636262 TTTT-TCAGTTGCAATACCCAACCGGGAGAAACTTTCAGTGAGCACACCTCAGGTTCCTATATCAAGCAGGCAGTCTTGCATAGCAAATGGTCTCTGGTAGACGGTGCACTCAATCTATGTGAGGTATAGAAAATAAAGGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 0 141 + 647215 TTTTC--GGCTGCAATACCCAACCTGAAGACATTTTCAGTGGGCCCACCTCAGGTTCTTATATCAAGCAGACAGTCTTGCGCAACAGATGGTCTCTGATAGACAGTGCACTCAATCTATGTGAAGGATAGAAAACAAAGGACT - -a -s mr.mrrefChr0 143 277 + 130230 ACACATCTCATCAAGTATCCTGTCGTATTTGTGCTTTAGACTCAGCAAAACACGCGTACAAATGCACACCTGATGGTACTTGCCTGGAATATGACTCTAGGTTGATCCCTGGCACACAGGCAGGTCAATTCCCGAATGATGGTCTGCTTGTCCAGTTCTAGATAATCATTACATTGGTGAACTCACTAAAACACAGTTAAAATTACAAATCCTTTTTAACCAAGCCTAAAGTACAGAAAGTGAATGTTACCCTTGTGATATGAACCAGTATATAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144 259 + 636262 ACACATCTCATCAAGTATCCCGTCATATTTGTG-----------GCAAAACACACGTACAAATGCACACTTGATGGTACTTGCCTGGAATATGACTCTAGGTTGATCCCTGGCACACAGGCACATTAATTCCCGAATGATGGTCTGCCTGTCCAGTTCTAGATAAT-GTTACATTGGTGAACT---TAAAACACAG---AAATGACACATCCTTTTTAACCAAGCCTAAAGTACAGAAAGTGAATGTCACCCTTGTTATATAAACCAGTATATAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 141 275 + 647215 ACTCATCTCATCAAGTATCCTGTCGTATTTGTGCTTTAGACTCAGCAAAACAAGTGTGCAAGTGCACACCTGATTGTACTTGTCTGGAATATGACTCTAGGTTGAGCCCTGGCACACACTCAGGTCAACTCC--AATGATGGTCTGCTTGTCCAATTCTAGATAAACATTACATTGGTGAACTCACTAAAACACAGTTAAAATTACTAATCCTTTTTAGCACAGCCTAAAGTACAGAGAGTGAATGTTACCCTTTTGATATGCATCAGTATATAGGG - -a -s mr.mrrefChr0 420 89 + 130230 AGCCACTGCCCTCTTAGCATTTATTTGCTGTAAGGTAACTGATGAGCTAAAGTCGTCTAGAATGTATAAGTAAAAGTCTGTAAGCATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404 89 + 636262 AGCCACTGCTCTCTTAGCATTTATTTGCTGTAAAGGAACTGATGAGCTAAAGTCGTCCAGAATGTATAAGCAGAAATTTGTAACCAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 416 88 + 647215 AGCCACTGGCCTCTTAGCATTCATTTGCTGTAAGGTAA-TGATGCGCTAAAGTCATCTAGAATGTATAGGTAAAAGTCTGTAAGCATTG - -a -s mr.mrrefChr0 509 89 + 130230 TAAAGGCAGCAGCTTTGGTTATGACGCACAATTCAAGACCACCTGCTGGATCCAGCTACATTTAGCAATATTACTGATCTGTTGCACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494 89 + 636262 TAAAGGCAGCAGCTTTGGTTATAACGCACAATTCAAGACCACCTGCTGGATCCAGCTACATTTAGCAATATTACTGATCTGTTGCACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 504 46 + 647215 TAAAGGCACCGGCTTTGGTTATGATGCACAATTCAAGACCATCTGC------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 598 192 + 130230 ATCCATCAGGGTGATAGAAATGCAACACACATAACTTGTTGTCCAAGAGGTTAATTAGTGTGACCGGATCTACATCCACCTATCAGTGGTCCTCTCTATTCAAGGCTCAAAAACTAGTAGAGTAATAGGGTCTCCAATAAACTATAAGGGCGATAGGGAACTCTAGCTTTTACTTAGCACAACAGCCTACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585 192 + 636262 ATCCATCAGGGTGATAGAAATGCAACACACATAACTTGTTGTCCAAGAGGTTAATTATTGTAAGCGCATCTACATCCATCTATCAGTGGTCCTCTCTATTCAAGGCTCAAAAACTCGTAGACTATTAGGGTCTCCAATAAACTATAAGGGCGATAGGGAACTCTAGCTTTTACTTAGCACAACAGTCTATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 550 146 + 647215 ------------------------------------------CCA----GTTAATTAGTGTGACTGGATCCACATCCACCTATCAGTGGTCCTCTCTATTCAAAGCTCAAAAACTAGTAGAGTAATAGGGGATCCAATAAACTTTAAGGGCGATAGGGAACTCTAGTTTTTACTTAGCAAAACAGCCTACAG - -a -s mr.mrrefChr0 790 120 + 130230 CCTGCATCTGGTCACCAGTCACCTTTCTTCTAGCAACAAGGTACAGAGTAGGGCTGTGTGGTGGTGAGTGATGTGTACCTTGGCATGAACCCACTGTAGGTAGCAATACTCCAATTGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 777 120 + 636262 CCTACAACTGGTCACCAGTCACTTTTCTTCTAGCAACAAGGTACAGAGGAGGGCTGTGTGGTGGTGAGTGATGTACACCTTGGCATGAACCCACTGTAGGTAGCAATACTCCAACTGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 703 120 + 647215 CCTGGATCTGGTCATCTGTCACCTTTCTTCCAGCAACAAGATACAGAGTAGAGCTGTGGGGTGGTTAGTCATGCGTACCTTAGCATGAGCCCACTGTAGGTAGCAATCCTCCAATTGAAG - -a -s mr.mrrefChr0 910 506 + 130230 GTTAACCCAAGGAGAAATGCAAATGGGAGTCCGTGCTATTGCAAAATTGTTATATATTCAATTTACTGGCCTTAACTGCATTCCCCGCAGTATTACATACCAATAACCCACATGGTCTCTAAAGACTCTGTTTCGCTTTGGATATTGACTCTAATCTATGTGGCGAAGCACACCCTTAAACTAATCTTCACCTTTCAAGTAATCTTGTGTCTCTATTTGCACAGAGTATGATTATTGTGGGATTGACAGGAGCACTTGTTGGTAATTACAATCagattggattccatattgctcattcagttatcaggatgcaatatgactcaagtagtcccaggttttaagccatcaGAGCTCACTGATGGGGGTTTGCTGGTAACCTATATAGATCCAGGGAAGAGGCCACCCGCAACATGTGCGCCTTGTCTACCTTATGTAAGATTAAAGTTGTCAAGATGGAATCTTGCAGAGAATCGGATACTTTGTATAGTTATCTCATTCTCTCCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 898 505 + 636262 ATTAGCCCGAGGAGAAATGCAAGTGCGAGTCCGTGCTATTGCAAAATTGGTATATATTCAATTTACTGGCCTTAGCTGCATTCCCCACAGTATTACATACCAATAACCCACATGGTCTCTAAAGACTCTGTTTCGCTTTGGATGTTGACTCTCATCTATG-GGCCAAACACACCTTTAAACTAATCTTCACCTTTCAAGTGATCTTGTGTCTCTATTTGCACAGAGTAAGATTATTGTGCGATTGATAGGAGCACTTGTTGGTAATTACTATCagactggattccatattgctcactcagttatcaggatgcaatatgactcaagtagtcccaggttttaaaccatcagAGCTCACTGATAGGGGTTTGCTGGGAACCTATATTGATCCAGGGAAGAGGCCACCTGCAACATGTGCGCCTTGTCTACTACATGTAGGATTGAAGTTGTCAAGATCGAATCTTGCAGAGAATCGGATACTTTGTATAGTTATCTCATTCTCTCCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 823 504 + 647215 GTTAACCCAAGGAGAAATGCAAATGGGAGTCCATGCTATTGT-ATATTGTTATATATTCAATTTGCTGGCCTTAACTGTATCCCCTGCAGTGTTACATACCAACAACCCACATGGTCTCTAAAGACTTTGTTTTGTTTTGGATATTGGCTTTACCCTATGTGGTGAAGCAAACCCTTAAACTGATGTTCACCTTTCAAATAGTCTGGTGTCTCCATTTATACAGAGTATGGTTATTGTGGGATTGTCAGGAGCACTTGTTGGTAATTGCAACCAGATCGGATTCCATATTGCTCATTCAATGATCAGGATGCAATATGACACAAGTAGTCCCAGGTTTTAAGCCATTAGAGCTCACTGATGGAGGTTTGCTGGTAACCTA-ATAGACCCTAGGAAGAAGCCACCCACAACATGTGCACCTTGTCTACCTTATGAAAGATTAAAGTTGTCAAGATGCAATCTTGCAGATAATTAGATACTTTGTACAGTTATCTCATTCTCTCCTCC - -a -s mr.mrrefChr0 1416 131 + 130230 AACACTACCTCTCAAATAGCACCTTCTGAATGCCAACTAGTACTCATATTTTGCTTTTTCAGGTCTACAATTACATGTCTTAGGTGCTCCCATATAGGGACTGCTCCACCATGAAAGAGACTAAACACCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1420 131 + 636262 ACCACTACCTCTCAAATAGCACCTTCTGAATGCCAACTAGTACTCTTATTTTGCTTTTTCAGATCTACAATTAGATGTGTTAGGTGCTCCCATATAGGGACTGCTCCACCATGAAAAAGACTGAACACCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 1327 130 + 647215 AACACTACCTCTCAAATAGCACCTTCTCAAT-CCAACTAGTATTCATATTTTCCTTTTTCCGGTCTACAATTACACCTCTTAGATGCTCCCATATAGGGACTGCTCCCCCATGAAAGAGACCAAAAACCAT - -a -s mr.mrrefChr0 1547 345 + 130230 GTGTATAGCATCCTTTGACTGATGTTGTACAGTATTGTTTAAACATTAGCTGTTCTAGTACACTCCATGGTACCTTGACTACATTCTGAGGGATTCCTTCTGAGATGTTAACACTGTTCCTAATAACTTATAATATAGTTTACTAGATAGTATAGTTTACTAGGTGAGGAGTCATGTTGCTTCCACAGACAAAATTAATTCAACAGGAAGTCTGTAACCCAATACAATGCTGGCAGTGAAGTATAATTAGTGCTGTCAATTAATCATGATTAAATGGCCTCCTTGAAAGGGCTAGATGTTTTGGAGCTGTAGTATACCTCCTAGTTCTTTAATATGTTAGCTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1552 345 + 636262 GTGTATAGCATCCTTTGACTGATGTTCTACAGTATTGTTTAAACATTACCTGTTCTAGTACACTCCATGGTACCTTGACTACATTCTGAGGGATTCCTTCTGTAATGTTAACACTGTTCCTAATGACTTATAATATAGTTTACTAGATAGTATAATTTACTAGGTGAGGAGTCATGTTGCTCCCACAGACAAAATTAATTCAACAGGAAGTCTGTAACCCAATACAATGCTGGCAGTGAAGTATGATTAGTGCTGTCAATTAATCATGATTAAATGGCCTCCTTGAACGGGCTAGACGTTTTGGAGCTGTAGTATACCTTCTAGTTCTTTAATGTTTTAGCTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 1457 342 + 647215 GTGTATAGCATCCTTTGACTGATGTTGTACAGTATTGTTTAAACTTTAGCTGTTCTAGTTCGCTCCATGAAACCTTGACTACATTCTGAGATATTACTTCTGAGCTGTTAACACTGTTCCTAATAGCCTATAATATTGTTTACTAGATA-TATAGTTTACTAGGTTAGGAGTCATGTTGCTTTCACAGACAAACTTAATTCAACAGGAAGTCTGTAACCCAATACTATGAAGGGAGTCAATTATAATTAGTGCTGTCAATTACTCAGGATTAAATTGCCT--TTGAAAGGGCTAGATCTTTTGGAGCTGTAGTCTACCTCCTAGTACTTTAATATGTTAACTTAA - -a -s mr.mrrefChr0 1892 229 + 130230 TTAAACATATGCTATTGTGATTCACACTTTTCTTTGGCCTATCTGCATTATACATTGAGGTTGAGAGTACAATAACACTTCTGTTGTGTGAACTGTACTGATAGTAATATATCACCCTAATGCATGCATGTGATTGAGCACGGTGAAATTGAGAGTCCAGAAAGGGGTAGTTCCTCAGCTCATCATAACTCGATCTGATACACCTTTAATACTGAGTACGGTGAAATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1897 229 + 636262 TTAAACATATGCTATTGTGATTCACACTTTTCTTTGGCCTATCTGCATTATACATTGAGGTTGAGAGTACAATAACACTTCTGTTGTGTGAATTGTACTGATAGTAATATATCACCCTAATGCATGCATGTGATTGAGCACTGTGAAATTGAGAGTCTAGAAAGGGGTAGTTCCTCAGCTCATCATAACTCGATCTGATACACATTTGATACTGAGTACGGTGAAATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 1825 227 + 647215 TTAAACATATGCTACTGTCAGTCACACTTTTCTTTGGGCTAGCTGCATTATATGTTGAGGTTAAGAGTAGAATAAAACTTCTGTTGTGTGAACTGAACTGACAGAAATGTATCACCCCAATGCAAGCTTGTGATTGAGCAAGGTGAGATT-AGACTCCAG-AAGAGGTCATATGGCAGCCCATCATAGCTCAACCGGATACACCCTCAGGAATGATTAGGGTGAAATTG - -a -s mr.mrrefChr0 2121 92 + 130230 ACTCTAGAAAGGGGTAATTCTTCAGCTCATCATCATCCTTTGTGAACCACCTCTTTGGTCCCAACTGAGATGTTCACAATTAGCCTAAAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2128 92 + 636262 ACTCTAGAAATGGGTAATTCTTCAGTGCATCATCATCCTTTGTGAACCACCTATTTGGTCCCAACTGAGATGTTCACAATTAGCATAAAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 2052 88 + 647215 ----TAGAAAGGGGTAACTCTTCAGCTCATCATCATCCTTCATGAACCACGTCTTTGGTCCCAACCGAGATGTTCACAATTTGCCTAAAGGC - -a -s mr.mrrefChr0 2213 299 + 130230 GTATACACTAGCTGGATTATGGATGTGTAATATAAATTGCAGTGCTTCCATAGGACAGAGAACAGAAGTTGGTGACCCTTTTATTTGTTTGTTCTTATCCCCTGAGCTGTAAAGCAAGGAGGTCAGCTTAATTCATGGGACAGGCAGGCCCGTGAAATTTTTCTTGAAAAAGTGCACTTGTCATCAGTTGTGTAGGAGCCACACTATAGGACTGTTAATGAACGAAATGGGGGGTAGAGTCTCACATACACGAGATCAGTGTGATCCTTCTTAGCCCAGCTAATCCTAATGGGGAGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2220 290 + 636262 GTACACACTAGCTGGATTATAGATGTATAATATAAATTGCAGTGCTTCCATAGGACAGAG-ACAGAAGTTGGTGACCCTTTTATTTGTTTGTTCTCATCCCCTG--------AGCAAGGAGGTCAGCTTAATTCATGGAACAGGCAGGCCCGTGAAATTTTTCTTGAAAAAGTGCACCGGTCATTAGTTGCATAGGAGCCACACTATAGGACTGTTAATGAACGAAATGGGGGGTAGAGTCTCACATACACGAGATCAGTGTGATCCTTCTTAGCCTAGCTAAACCTAATGGGGAGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 2144 294 + 647215 GGTTACACTGACTGGCTTAAGGATGTGCAATATAAATTGCTGTGCTTCCATAGGACAGAGAACAAAAGTTGGTGACTCTTTTTTTTGTTCATTCTTGTTCCCTGAGCTGTAAAGCAAGGAGGTC-----GATTCATGGGACAGGCAGGCCTGTGAAATTTTTCTTGATAAAGTGCCTTTGTCATCAATTGTGTAGAAGCCACACTAAAAGAGTGTTAATGGACTAAATGGGGGGTAGAGTCTCACATACATAAGATCAGTGTGAACCTTCTTAGCCCAGCTAATCCTAATGGGGAGTTG - -a -s mr.mrrefChr0 2512 95 + 130230 CTATTACAGGTTGCTTGTTGAGTTGCATGCTGGAAACCATAGGTTAAGTGTAACTTGCTTTGGCAATTTGGGAAATACCACCCTTGGTTAAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2512 95 + 636262 CTATTACAGGCTGCTTGTTGAGTTGCATGCTGGAAACCATAGGTTAAGTGTGACTTGCTTTGGCAATTTGAGAAATACCACCCTCGGTTAAGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 2438 93 + 647215 CCATTACAGTTTGCTTGTTGAGCTGTGTGCTGGAAACCTTAGGTTAAGTGAAACTTGCTTTAGCTATTTGGGAAATACCACCCTTGGTTAAGT-- - -a -s mr.mrrefChr0 2607 27 + 130230 TTTTGAGGGATGCCAGTTTTGACAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2623 27 + 636262 TTTTGAGGGATGCCAGTTTTGACAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 2531 15 + 647215 ------------CTCATTTTGCAAAGT - -a -s mr.mrrefChr0 2634 40 + 130230 TCAGGTTGATAGAATGACCTTTCTTTATGCATAGTGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2659 38 + 636262 TCAGGTTGATAGAGTGACCTTTCTT--TGCATAGTGGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 2546 40 + 647215 TCAGGTTGATAGAATGACCTTTCTTTATGCATAGTAGACT - -a -s mr.mrrefChr0 2674 22 + 130230 TCCAGACCTTATCAGCCTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2697 22 + 636262 TCCAGACCTTATCAGCCTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 2607 22 + 647215 TCCAGACCTTATCGACCCAAAT - -a -s mr.mrrefChr0 2696 341 + 130230 TGACCCTGCCCCATGTGGCCATGTACACATGGCCAGTGCATGGCTACATTTGCTCCATGTGGCCATGTACACACGGTCAGTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCTACATGATGAAATGTTGGGTGATCTCCCCGCATACATTGTGCATTCCCCTGTCCGATTCAGGCACTGTGAAGCGATGACAGACCCCCGCGTACATTGTCGCCAGGATTAAAAGTTCACCTCATGATTTTACAACTCCATTCCCCTAACTGAGAGGATATTACTTATATAATAATACTTGTGACTGATACAGAGAATCACATCTATCTTGCCTTGTACAGACTAGAAACTTAAATAGGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2719 340 + 636262 TGACCCTGCCCCATGTGGCCATGTACACATGGCCAGTGCATGGCTACATTTGCTCCATGTGGCCATGTACACACGGTCAGTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCACTTGATGAAATGTCAAATGATCTCCCCGCATACATTCTGCA-TCCCTTGTCCGATTCAGGCACTGTGAAGCGATGACAGACCCCCGCGTACATTGTCGCCAGGATTAAAAGTTCACCTCATGATTTTACAACTCCATTCCCCTAACTGAGAGGATATTACTTATATAATAATACTTGTGACTGATACAGAGAATCACATCTATCTTGCCTTGTACCGACTAGAAACTTAAATAGGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 2703 339 + 647215 TGACCCTGCCCTGCATGGCCATGTACACATGGTCAGTGCTTGGCTATGCCTGCCCTGCGTGGCCATGCACACACAGTCAGTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCTGCATGACAAAATGTTGGGTGATCTCCCCGTGAACATTGTAGATTCCCCTGTCCTTTTCACGCACTGTCAAACAATGACAGTCCCCTGCGTACATTGTTGCCATGATTAAAAGTTCACCTCATGATTGTACAACTCCGTTCCCCTAACTGAGGAGATGCCACTTA-ATAATAATACTGGTGACTGATACAGAGAATTGCAT-TATCTCTCCTTGTACAGATTAGAAACTTAAATAGGACT - -a -s mr.mrrefChr0 3037 23 + 130230 ACAGGATAATTAGTGGATTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3059 23 + 636262 ACAGGATAATTAGTGGATTTCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 3047 23 + 647215 ACAGGATATTTAGCCGATTTCCA - -a -s mr.mrrefChr0 3060 177 + 130230 AACTGGAACTAACCAATGTAATGAAGGTTATCTCCACAATACTAATTATAGCTTTTTAAGACTAAGATCTATTACACCTGTGAGCATGAAATGTGCTTGACCTTGAAGAGATAAAACCCTATTAGCATACAACTAGTGCTGGTGAAGTTAACACATGTGTCAACAAACTATTAGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3084 172 + 636262 A-CTGGTACTAATCAATGTAATGAAGGTTATCTCCACAATACGAATTATAGCTTTTCAAGACAAAG---TATTACACCTG-GAGCATGAAATGTGCTTGACCTTGAAGAGATAAAACCCTATTAGCATACAGCTAGTGCTGGTCAGGTCAGCACATGTCTCAACAAACTATTAGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 3070 177 + 647215 CACTGTAACTATCCAATGTGATGAAGGTTATGTCCACGATACTAATTATAGCTTTTTAAGACTAAGATCTATTACACCTGTGAGCAGGCAATGTGCTTGCCCTTGGAGAGATAAAACCCTAATAGGATACAACTAGTACTGTTGAAGTTAACACATGTGACAACACACGATTAGTAG - -a -s mr.mrrefChr0 3237 56 + 130230 AATTATCACTATTAGTGGAAATTATATATTCCTAGGAAGGCTCCTCAATTCCAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3256 55 + 636262 AATTATCACTATCAGTGGAAATTATATA-TCCTAGGGAGGTTCCTCAATTCCAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 3248 56 + 647215 AATTATCACTATTAGTAGAAATTATGTATTCCTGGGAAGGCTCCTCAATTCCAACC - -a -s mr.mrrefChr0 3293 82 + 130230 GGTTGAATCTTTGGCATAAAAGCATTGAGGATCTGTTCTTCATCGTGAGCCCAGTGGTTAGTTGACATATAGATCTAACCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3315 76 + 636262 GGTTGAATCTTTGGCATAAAAGCATTGAGGATCTGTTCTTCATCGTGAGTCCAATGG------GACATATAGATCTAATCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 3304 74 + 647215 --------CTTTGGCATAAAAGCATTGAGGATCTGTTCTTCATGGTGAGCCCAGTGGTTAGTTGACATATAGATCTAACCAG - -a -s mr.mrrefChr0 3375 44 + 130230 ATCTGCAATACCTAGCATGATAAAAGTTAACCATGGAACTTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3391 44 + 636262 ATCTGCAATACCTAGCATGATAAAGGTTGACCATGGAACTTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 3390 44 + 647215 ATCTGCAATACCTAGCATGATAAAAGTCAACCATGGAACTTGGC - -a -s mr.mrrefChr0 3419 47 + 130230 CATAAAAAGAAACCATCCGATCTCCCAAATCCCTGAGATCTGTAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3435 47 + 636262 CATAAAAAGAAACCATCCGATCTCCCAAATCCCTGAGTTCAGTAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 3436 40 + 647215 TATAAGAGGAAATCATCCGATC-------TCCCTGAGATCTGTAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 3466 6 + 130230 AGTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3485 6 + 636262 AGTGGG - -a -s mr.mrrefChr0 3472 149 + 130230 ACAGGCATTATGTCTTCACTAGCAATAGATACAGCAGCTACGATAGTTGTGCTGTCTGCATTGCCCATTTTACATTTGCATCCCTGACCACCAATCCCCTACCAAATCAATGATTGATATATGGTGTCAATGCTGTTCAATACAAAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3492 149 + 636262 ACAGGCATTATGTATTCACTAGCAATAGATACAGCAGCTACGATAGTTGTGCTGTCTGCATTGCCCATTTTACATTTGCATACCTGACCATCAATCCCCTACCAAATCAACGATTGATATATGCTCCCAATGCTGTTCAATACAAAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 3476 144 + 647215 --AGACATTATGTCTTCATTAGCAATAGATACAGCAGCTACTATAGTTGTGCTGTCTGCATTGCCCATTTTACATTTGCCTCCCTGACCACCAATCCCCTACCAAGTCTATGATTGATAA---GTGTGAACACTGTTCGATGCAAAGGT - -a -s mr.mrrefChr0 3621 94 + 130230 ACCCAAAGTACATTCCCTAGAGAATCCAAATAGAAGGTGTGCTGTGTATTTAGGTTTGCTGATGATAAGCATGCTGCCATCACCTCACTCCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3641 90 + 636262 --CCAAAGTACATTCCCTAGAGAATCTAAATAGAAGGTGTGCTGTGTATTTAGGTTTGCT--TGAGAAGCACGCTGCTATCACCTCACTCCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 3621 94 + 647215 ACCCAAAATACATGCTCTAGAGAATCCAAATAGAACGTGTGCTGTGTGGATAGGTTTGCTGATGGTAAGCATGCTGCCATAACCTCATGCCTCT - -a -s mr.mrrefChr0 3715 176 + 130230 GTAAGGTCAATAGACTGAGGTTCATTTCCTCACAAAACATCACAAATCAAGGTCTAGATCCTATTACTGGTGGAACATCTTGTGTGCAAAGCTTGCGGAAACTTGTTTTACTGTTGTTAGAGCCCTCTTCAATTCCACTGCACATGAATATCAAGAGATAGAGAGCATCTCACTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3795 176 + 636262 GTAAGGTCAATAGACTGAGGTTCATTTCCTCACAAAACATTACAAATCAAGGTCTAGATCCTATTACTGGTGGGAGATCTTGTATGCAAAGCTTGCGGAAACTTGTTTTACTGTTGTTAGAGACCTTTTCAATTCCACTGCACATGAATATCAAGAGATAGAGAGCATCTCACTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 3715 168 + 647215 ATAAGGTCAATAGACTGAGGATTATTTCCTAACAAAACATCGCAGCTCAAGGTCTCAATTCTATCACTGGTGGAACACCTTGTGTGAAAAGTTTGTGAAAACTAGTTTTTCT--------CGCCCCCTGCAATTCCAGTGCACATGAATATCAAGTGATAGAGAACATCTCACCAG - -a -s mr.mrrefChr0 3891 39 + 130230 CTTTGTGAGGTGAAGAGTCTTGGGTCCTTTGTGTGCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3971 39 + 636262 CTTTGTGAGGTGAAGAGTCTTGGGTCCTATGTGTGCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 3884 39 + 647215 TTTTGTGGGGTAAAGAGTCTTGGGTCCTTTGTGTGTGTG - -a -s mr.mrrefChr0 3930 182 + 130230 AAGCCTAGTTATCCCACTCAATATGCGGGTGTAATGTTCAATTTTGCTATGTGCTTAGCATATCCTAATCTCAGTATTTTCTAGCTCCTGAATTCATCAGGTCTATTTTTATCAAGGTGTACGCTATCAATCAATACATCTTACAATGCATTCTCTCTAAAGGGTCATTTAGTCACAATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4091 181 + 636262 AAGCCTAGTT-TCCCACTCAATATGTGGGTGTAATGTTCAATTATGCTAGGTGCTTAGCATATCTCAATCTCAGTATTCCCTAGCTCCTGAATTCATCAGGTCTATTTTTATCAAGGTGTACCCTATCAATCAATACATCTTAGAATGCATTCTCACTAGAGGGTTAGTTAGTCACAACTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 3923 180 + 647215 AAGGCTAGTTATGCCACTCA--ATGCGGGTGGAATGTTGAATTTTGTTATGTTCTTAGCATATCCTAATATCAGTATTTTCTAATTCTTGAATACATCAGGTCTATTTTTATCAAGGTGTAAGCTATCAATCAATACATTGAACAATGCAATCTCTCTAAAGGGACATTTAGTCACAATTTG - -a -s mr.mrrefChr0 4112 63 + 130230 TACATCCTGCAACATAAAACTTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTATGTAGTGGCATAGTAGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4322 60 + 636262 TACATCCTGCAACATAAAACTTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTATGTAGTGGCATA---GCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 4103 63 + 647215 TAAATCTAGCAACATAAAACCTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTTTGTAGTGGCATAGTAGTGG - -a -s mr.mrrefChr0 4175 17 + 130230 CACACCCTATTCTACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4382 17 + 636262 CACACCCTATTCTACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 4174 17 + 647215 CACACCCTATTCTACAA - -a -s mr.mrrefChr0 4192 19 + 130230 TACTCTTATCCTCAAGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4401 19 + 636262 TACTCTTATCCTCAAGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 4191 19 + 647215 TACTCTTTCCCTCCAGGGA - -a -s mr.mrrefChr0 4211 136 + 130230 GTGTTTGGTAGGCTCAGAGGCATAGTTAGCAATAGTTGCTACTGCACTGCAAGGATCCCAAAGGCATGCACCATGATTTGCTCATCCCAATGAATAAGAATCATGAACCCACCCTAACTTTGTGGGCCCAGATGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4421 135 + 636262 GTGTTTGGTGGGCTCGGAGGCACAGTTAGCAATAGTTGCTACTCCATTGCAAGGATCCCAAAGGCTTGCACCGTGATTTGCTCATCCCAATGAATAAGAATCATGAACCCACCTT-ACTTTGTAGGCCCAGATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 4210 136 + 647215 GTGTTTGGTAGACCCAGATGCATAGGTAGCAGTAGTTGCTACTGCACTGCGAGGATCCCAAAGGCATGCACCATGATTTGCTCATGCTGATGCCTAAGAAGCACAAACCCACCCTAACTTTGTGGGTCCAAATGCT - -a -s mr.mrrefChr0 4347 14 + 130230 TGACAACGGGAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4564 14 + 636262 TGACAACGGGAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 4346 14 + 647215 TGACAAAGGGAATT - -a -s mr.mrrefChr0 4361 37 + 130230 TTATTAATAGGCTAGGGGTGTTGTTCACAGTACCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4578 37 + 636262 TCATTAATAGGCTAGGGATGTTGTTCACAGTACCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 642057 18 - 647215 TTGCTATTCGTCCAGGGG------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 4398 23 + 130230 CATCGTACACCAAGGTATAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4616 23 + 636262 CATCGTACACCAAGGTATAACCA - -a -s mr.mrrefChr0 4421 255 + 130230 ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATAGTGAAGATTGCAAGACAAAGAATGTGCTGATCTAAATTTTTTGATTAGTGGATGCAGCTGGTTGCACCATCAACACAGACGGCAGCAGCATTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCACTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGTGGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4650 255 + 636262 ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATACTGAAGATTGCAAAACAAAGAATGTACTGATCTAAATTCTTTAATTAGTGGATGTGGCTGGTTGCACCATCAACACAGACAGCAGCATCACTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCGCTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGCAGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 642075 254 - 647215 ACCTTAGCTTGCACCCATGTATATCAAGCCCCCCTGTTAGTCACAGTGAAGATTGCAAGACAAAGAAAGTGCTGATCTAAATTTTTTGATTAGTGGATACAGCTGGTTGCTCCATCAGCACAGATGGCAGCAGCATTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATGCCACTGCAGACCTTATTGCAGCTTATTA-GGAAAGTGCTGTGGACAGTGGCAGCTTCCATGGGGTGATACCCGATGCCAGTGGCAACTG - -a -s mr.mrrefChr0 4676 108 + 130230 CTGTGCTGCAACTCTTGAAAGTATGAGAGATGAGCTACAGAGAGTACACAGTAGCCAGGGAGGTATTTTACCAATGTAGTAGGATCTTGCTAACATGGGATTGCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4905 108 + 636262 CTGTGCTGCAACTCTCGAAAGTATGAGAGATGAGCTACAGACAGTACACAGCAACCAGCGGGGTATTTTACCAGTATAGTAGGATCCTGCTAACATGGGATTGCTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 642397 108 - 647215 CTATGGTGCAGCTCTTGAAAGTATAAGAGATGGGCTGCACAGGGTACGCAGTAGCCAGGTAGGTATTTTACCAATGTAGTAGGATCTTCCTAAGATGGGATTGTTAAG - -a -s mr.mrrefChr0 4784 151 + 130230 GATATGCTGTACTGAGAAGGGTGGAGGAACATATAGATTCAACTAGTGATCACAAGAAAAAAGCATTTATGGTGAATTGTTATAGGGCTATATTTGATGACAATATAGTATAAGCTGTTAAAATGGAAAAATGATGAGCAGCATAATATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5013 135 + 636262 GATATGCTGTACTGAGAA-----GAGGAACATATAGATTCAACCAGTGACCACAAAAAAAAAGAATTTATGGTGAATAGCTATAGGGCTATATTTGATGACAATATAGTATAAGCTGTTAAAATGGA-----------CATCATAATATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 642515 151 - 647215 GTTATACTGTACTGAGAAGGGTGGAGGAACATATAGATTCAACTAGGGATCACAAGAAAAAAACATTTATGGTGAATTGTTATAGGGCTATATTTGAGGACAATATAGTATAAGCTGTTGAAATGGAAAAATGATGAGCAGCGTAATATGC - -a -s mr.mrrefChr0 4935 32 + 130230 AGGCTTCTTTAATGTATATAACAACAGAGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5149 32 + 636262 AGGCTTCTTTAATGTATATAACAACAGAGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 642666 32 - 647215 AGGCTTCTTAAATGTATTTAACAACAGAGTAC - -a -s mr.mrrefChr0 4967 209 + 130230 CATGGTTAGACTTAGCACAGAATGGATAATTCAGACAGTATGGATAATTCAGAGAGCTACCTTGAACCTTGAAATATGAGTAGTGGGAAGGAAAGGTTCAAGAAAAGTACCTATTTCATGAATCTGTCTTATGATATGCTATGTTTTGCTTAACATCACCTTGAGGGGTGGGGCCCTGGCAGCTGTTAAAATCTGATAATTCTAGCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5182 209 + 636262 CATGGTTAGACTTGGCACAGAATGGATAATTCAGACAGTATGGATAATTCAGAGAGCTACCTTGAACCTTGAAATATGAGTAGTGGGAAGGAAAGGTTCAAGAAAAGTACCTAGCTCATGAATCTGTCTCATGATATGCTATGTTTTGCTTAACATCACCTTGAGGGGTGGGGCCCTGGCAGCTGTTAAAATCTGATAATTCTAGCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 642698 152 - 647215 CATGGTTAGATTTAGCACGGTATAGATAATTCAGACAGTATTGATAATTCAGAGAACTACCTTGTATCTTGAAATAGGATTAGTAGGAGAGAAAAT----AAAAAAGTACCTATTTCATGGATCTGTCTTGTGGTATGCTATGTTTTGCTTAACAT----------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 5176 100 + 130230 TGAGATGTTGAGACCATTTCTAGTGTAGATTTAACAGGAAATTTCAGTATTTTTTAAGAGTTGAGCAGGACTTCACACCACTGAACACTTATCATGAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5449 100 + 636262 TGAGATGTTGAGACCATTTCTAGTGTAGATTTAACAGGAAATTTCAGTATTTTTTAAGAGTTGAGCAGGACTTCACACCACTGAACACTTATCATGAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 5276 41 + 130230 TCATAAGAGCATGTAGAGTAAAATTCAGCACAGGACTAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5551 41 + 636262 TCATAAGAGCATGTAGAGTAAAATTCAGCACAGGACTAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 5317 204 + 130230 AGGCTATGCCTTTGTCACTAGAAATGCACACCACGTTTCTAATTTGAATCAACGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTATAATAAGTTGCAGCCTATGCTTTTATCACTAGAAACGCACACCACATATCTAATCTGAATCAATATTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGATAGGTCATGTCTCTACACTTAAATGTTCTGGTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5603 204 + 636262 AGGCTATGCCTTTGTCACTAGAAATGCACACCACGTTTCTAATTTGAATCAACGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTATAATAAGTTGCAGCCCATGCTTTTATCACTAGAAACGCACACCACGTATCTAATCTGAATCAATGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTAGATCATGTCTCTACACTTAAATGTTCTGATTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 5192 116 + 647215 ----------------------------------------------------------------------------------------TGAAGGCTACGCTTTTGTCACTAGAAACTCACACCACATATCTAATTTAACTCAACATTACAATAAGTGTTGAAAGTTAGATATGTCATGTCCCTACACTTAAGTGTTCTGGTTTC - -a -s mr.mrrefChr0 5521 169 + 130230 AACTCCAAAGAACCTGGCAACCCTCTACCTTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGCATTATATACTTAATGCATAAACAATTGAAGGGGATGCAAGTGCCACCACTAGAACATGCAAAGGTATAAAGGGAACTCACATAAGAGAGCAGTTGAGTTTATCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5807 169 + 636262 AACTCCAAAGAACCTGGCAACACTCTACCGTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGCACTATATACTTAAGGGATAAACAATTGAAGGGGAAGCAAGTACCACCACTAGAACATGTATAAGTACAACGGGAACTCACATAAAAGAACAGTTGAGTTTATCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 5309 169 + 647215 AACTCAAAAGAAACTGGTGACCCTCTACCTTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGAATTATATACTTAATGCATAAACAATTGAAGGGGCTGCAAGTGCCACCACTAGAACATGCAAAGATATAAAGGGAGCTCACACAAGAGAGCAGTTGAGCTTATCTA - -a -s mr.mrrefChr0 5690 128 + 130230 CTTGCATGTTACTAGAGAGTCCATGAGCTCTTTAGTTAGATGACTTGTGGGTGTCATAAGGTTAATGTGGACAAGTAAGCTAGGGGCTTTCATAAGGTAGGGGCTTTCAAACTGCTGGAAGTTCAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5976 128 + 636262 CTTGAATGTTATTAGAGAGTCCATGAGCTTTTTAGTTAGATGACTTGTGGGTGCCATAAGATTAATGTAGACAAGTAAGCTAGGGGCTTTCATAAGGTAGGGGCTTTCAAACTGCTGGAAGTTCAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 5479 111 + 647215 CTTGCATGTTACTAGAGAGTCCATAAGCTCTTTAGGTAGATGACTTGTGGGTGTCATAAGGTTAATGTGGACAAGTA----------------GAGGTAGGGGCTTTCACCCTG-TGGAATTTCAGGA - -a -s mr.mrrefChr0 5818 327 + 130230 TGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTCTCATACATTCCAGGCATTGGCATAGACATCCGAACTTCAGACAGCTCTTCAATTAAAATCCTCTCCTCCTAATTGTTGAGAGAGTGATGGCTAAGCAACATGGGCTTCATTTAGTCCAGTCCACTGCTCCCGGCATCCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAGTGCAGGCAGCAATTGCCTTACAATCTTCGAGAGGGTGACGGCTAAGCACCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAATGCAGGCATAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAACACTCACAATCTGATGTACTTATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6110 327 + 636262 TGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTCTCATACATTCCAGGCACTGGCATAGACATCCGAACTTCAGACAGCTCTTCAATTAAAATCCTCTCCTCCCAATTGTTGAGAGAGTGCTGGATAAGCAACATGGGCTTCATTTAGTCCAGTCCACTGCTCCCGGCATCCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAGTGCAGGCAGCAATTGCCTTACAATCTTCGAGAGAGTGATGGCTAAGCACCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAATGCAGGCACAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAATACTCACAATCTGATGTACTTATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 5590 327 + 647215 CGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTATCATACCGTACTGGCATCGGCATGGACCTCCGAACTGCAGCCAGTTCTTCAAGTAAAATCAACTTCTCCTAATTGTTGAGAGAATGATGACTAAGCAACATGGGCTTCAATTTGTCCAGTCCAATGCTCCCAGCATCCTGTAGATGCAGCAATACAGGCTTTAGTGCAGACAGCAAATGCCTTACAATCCTTGAGAGGGTGACGGCTAAGCACCTGTGGATGCAGCAGTACAGCCTGTAATGCAGGCATAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAACACTCACAATCTGATGTACTTATCA - -a -s mr.mrrefChr0 6145 52 + 130230 CAATTTATTAATGTATATGAGGGCTAACAACCGGTGGTCAGTAGATTCAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6437 52 + 636262 CAATTTATTAATGTATATAAGGGCTAACATCCAGCGGTCAGTAGATTCAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 5918 52 + 647215 AAATTTATTAATGTATATGAGGGCTATCAATGGGTGGTCAGCAGATTCAAAG - -a -s mr.mrrefChr0 6197 9 + 130230 TGCATTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6489 9 + 636262 TGCATTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 5975 9 + 647215 TGCATTTGT - -a -s mr.mrrefChr0 6206 90 + 130230 ATTTGTAGTAACTAAAATAACCAATAGACAATTAGTACACAGAAGGTGTTATTGAGCTATCAGCCCCACAAGCTTCACCTTAGTTAGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6498 89 + 636262 ATCTGTAA-AACTAAAATAACCAACAGACAATTAGTACACAAAAGGTGTTACTGAGCTATCAGTCCCACAAGCTTCACCTTAGTTGGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 5985 90 + 647215 ATTTGTAGTAACTAAAATAACTGATAGACAGTTAGTGCTCAGAAGGTGTTATTGGGCTATCAGCCCCATGAGCTTCACCTTAGTTAGGAA - -a -s mr.mrrefChr0 6296 12 + 130230 TAACGTGAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6592 12 + 636262 TAACGTGAACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 6075 12 + 647215 TAACGCTAACCA - -a -s mr.mrrefChr0 6308 52 + 130230 CAGGTTCAGATAGCTTCCTGTGCCCATGTCTGCATGACTCCCAGAGCCTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6604 52 + 636262 CAGGTTCAGATAGGTTCCTGTGCCCATGTCTGCATGACTCCCAGCGCATGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 6088 52 + 647215 CAGGTTCAGATAGCTTCCCGTGCCCATAAATGCATGACTCCCAGAGCCTGTG - -a -s mr.mrrefChr0 6360 7 + 130230 CACCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6658 7 + 636262 CACCGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 6140 7 + 647215 CACCACT - -a -s mr.mrrefChr0 6367 184 + 130230 TATTAATGCACCAAAGCATTATGATCTTAAGTAGCACTAGCACTGAATTTCAATCTAGACCGTCTGGCCCAAAAGCAATCTGAGATGGAAAGGAATCACACAGAGAGAAGGGTAGTATTGATGAAGCCAGGCTACAGCTTGAAACCAACTAGCAAGTTTTAATTCAATAGCCATAAAGAACTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6674 182 + 636262 TATTAATGCACCAAAGCATTAGGATCTTAAGTAGCACTAGCACTGAATTTCAATCTAGACCGTTTGGCCCAAAAGCAATCTGATATGGAA--GAATCACACAGAGAGAAGGGTAGTATTGATGAAGCCAGGCTACAGCTTGAAATCAACTAGCAAGTTTTAATTCAATACCCATAAAGAACTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 6147 180 + 647215 TATTAATGCATCAGTGCATTATGATATTAAGTAGCATTAGCACTGAATGTCAATCTA----GTCTGGCCCAAAAGCAATCTGAGATGGAAAGGAATCACAAAGAGGGAAGGGTAGTATTGGTGGGGCCAGGCTATGGCTCGGAACCAACCAGCAAGTTTTAATCCAATAGCCATATAGAACTAA - -a -s mr.mrrefChr0 6551 178 + 130230 AACCAAGCGCAGTAATGTAACAGGCAGCATGGAGTGGCAAGTGACCAGAGCAGTGCAGTATTGGTCATTTATGTATTAGCAATTCTAAGCACAATTGGTGTCATACTATGTAAAACAGTTTTGGTGAAACCATCACAGATCAGCAATGTGTCTTTGAATGGAGCCCAATGATAAGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6856 178 + 636262 AACCAAGCACAGTAATGTAACAGGCAGCATGGAGTGGCAAGTGACCAAAGCAGTGCAGTATTGGTCATTTATGTGTTAGCAATTCTAGATGCAATTGGTGTCAAACTATGTAGAACAGTTTTGGTTAAACCATCACAGATCAGCAATGGGTTTTTGAATGGAGCCCAATGATAAGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 6375 174 + 647215 AACCAAGCGCAGTCATGTAATAGGCA----GGAGTGGCAAGTGACTAGCGCAGTTCAGTATTGGTCATTTATGCAGTAGCAATTCTAAGCACAACCAGTGTCATACTATGTAAAACAGTTTTGGTGAAACCATCACAGATCAGCAATGTGTCTTTGAATGGAACCCAATGAAAAGATT - -a -s mr.mrrefChr0 6729 63 + 130230 CAATGCCCTATTGCTAGAGGGAAATTGACCACCCAGCTACTACACATGATGATGGAGTACCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7034 63 + 636262 CAATGCCCTATTGCTAGAGGGAAATTGACCACCCAGCTACTACACATGATGATGGAGTACCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 6550 63 + 647215 CAATTCCCTATTGTTAGAGGGAGATTGACTACCCAGTGACTACTCATAATGACAGTGCATCAA - -a -s mr.mrrefChr0 6792 14 + 130230 TCCTGAGGATATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7098 14 + 636262 TCCTGAGGATATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 6613 14 + 647215 CCCTGAGGATATGA - -a -s mr.mrrefChr0 6806 73 + 130230 AATTTCCATTGGAGCTGAATCAGGGGATAGACTGCTGACATCCAACAAAGGTGATGAAGTTACACAAAATTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7112 73 + 636262 AATTTCCATTGGAGCTGAATCAGGGGATAGACTGCTGACATCCAACAAAGGTGATGAAGTTACACAAAATTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 6630 73 + 647215 AATTTCCATTTTAGGTGAATCAGGGGATACACTGCTGATATCAAACAAAAGTCGTGAAGTTGCACAAAATTAC - -a -s mr.mrrefChr0 6879 58 + 130230 ACTAAATCATAGTCATGGCTAAAAGGTATGGACAACTACATACAGTTTATTTAGGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7185 58 + 636262 ACTAAATCATAGTCATGGCTAAAAGGTATGGACAACTACATACAGTTTATTTAGGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 6704 58 + 647215 ACTAAATCACTGTCATGGCTAGGAGGTGTAGACAAATACATACAGTTCAATTATATTG - -a -s mr.mrrefChr0 6937 31 + 130230 TACTCTGCTTTGCTATTTGCTGAGTGGCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7243 31 + 636262 TACTCTGCTTTGCTATTTGCTGAGTGGCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 6764 31 + 647215 TATTCTACTTTGCTATTTGCAGGGTGACTTC - -a -s mr.mrrefChr0 6968 4 + 130230 TAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7281 4 + 636262 TAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 6795 4 + 647215 TAAT - -a -s mr.mrrefChr0 6972 57 + 130230 ATCAATCCATTTTTGGGATGTCATGACCCTTGTAGAAGGTGACCTGCCTTAGCTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7290 57 + 636262 ATCAATCCATTTTTGGGATGTCATGACCCTTGTAGAAGGTGACGTGCCTTAGCTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 6799 57 + 647215 CTTGATCCATTTTTGGGATGTCATCACCTTTGGAGGAGGTGACCCACCTTAGCTGCT - -a -s mr.mrrefChr0 7029 53 + 130230 GTATTTACCGATCAGCATTGCTGTCACCAAGTGCCGGGAAGTTGTCTTCTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7347 53 + 636262 GTATTTACCGACCAGCATTGCTGTCACCAAGTGCCGAGAAATTGTCTTCTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 6857 53 + 647215 GTATTTACCAATCGACATTGCTGTTGCCAAGCACCGGGAAGTTGTCTTCTTGG - -a -s mr.mrrefChr0 7082 10 + 130230 ATGACTCTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7409 10 + 636262 ATGACTCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 6910 10 + 647215 ATGACTCTAA - -a -s mr.mrrefChr0 7092 13 + 130230 GTCCACATGCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7420 13 + 636262 GTCCACATGCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 6920 13 + 647215 GTCCATATGCATG - -a -s mr.mrrefChr0 7105 42 + 130230 ATACCACAAGCCTTTGGGAGCTGGTACTGACTCAAATGGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7467 42 + 636262 ATACCACAAGCCTTTGGGAGCTGGTACTGACTCAAATGGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 6933 42 + 647215 ATACCACAGGTCTTGGGAAGCTTGTACTGTCTCAGATGATCA - -a -s mr.mrrefChr0 7147 58 + 130230 AGTGATCATCAACAGAACGAGACAGCTGAGCAGTCATGAGCCTACTTTCTCTTGGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7926 58 + 636262 AGTGATCATCAACAGAACGAGACAGCTGAGCAGTCATGAGCCTACTTTCTCTTGGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 6975 58 + 647215 AGTGCTCATCAATAGAACAAGCCAGCTGAGCAGTCATGAGTCTATCTTCTCTTGGATG - -a -s mr.mrrefChr0 7205 61 + 130230 CTGGGATGGGACTAGCAATCATTCATACCTGAGAGAAGTAATAGAGTAAGCCTCTTATACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7984 61 + 636262 CTGGGATGGGACTAGCAATCATTCATACCTGAGAGAAGTAATAGAGTAAGCCTCTTATACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 7041 61 + 647215 CTGGGATGGGACTAGCAACCACTGGCACCTGAGAGAAGCACTAGAGTAAGCCTCGTACATA - -a -s mr.mrrefChr0 7266 9 + 130230 CCTATGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8048 9 + 636262 CCTATGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 7102 9 + 647215 CCTATGTTG - -a -s mr.mrrefChr0 7275 38 + 130230 GCTACAGACTTGATAGCGAGGTACAAAAGGAAGCTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8057 38 + 636262 GCTACAGACTTGATAGCGAGGTACAAAAGGAAGCTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 7112 38 + 647215 GCTTCAGACTTCACAGCAAGTTCCGAAAGGAAGCTATA - -a -s mr.mrrefChr0 7313 24 + 130230 TTTGGTTCATATCTATGAAGTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8096 24 + 636262 TTTGGTTCATATCTATGAAGTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 7150 24 + 647215 TTTGGTTCATGTCTACAAAGTGTG - -a -s mr.mrrefChr0 7337 18 + 130230 AGTGTGTGGGGCAGTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8129 18 + 636262 AGTGTGTGGGGCAGTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 7174 18 + 647215 GGGGGCAAGGGCAGCATT - -a -s mr.mrrefChr0 7355 480 + 130230 ATCCAGGACAGAAAGATCAGATATTACTGACTTCTTAAAAATTTTTTTCACTTTTTGAGGTATATTGGGACAACCACACCATCAATGGATAGGAAAAACAATACATGGAAATGACAAGCCTTTCAATCCTGATATGCTGCAAAATTGATTCGCACCAGAGGTGATACACAAAGTCTCTACACCTGGACCACCTGGTCACAGGTTTCAGGAGTGCTTAATTTTTTGTGCAGAGTATTAAAAAGAAGGTGCACTTCAGTTTGCTTCTGACAGGGGTTAGGTTGTCAGGCATACTAACCTCGTTATCTAGTCCATCAGGGATAGAATGCAGGAAAAAATGCATTATTATGAGATTCAGGGCACCGCTGGCATACTGCTCGGACCCAACATCCCTCACCATCACCATTGGCTGAGAGTGGTCAAGTATCGAGTGATGCTGCACAACTTAAGGGGGGAAGGTTGTAGTCTTTGGAGCTATTGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8148 480 + 636262 ATCCAGGACAGAAAGATCAGATATTACTGACTTCTTAAAAATTTTTTTCACTTTTTGAGGTATATTGGGACAACCACACCATCAATGGATAGGAAAAACAATACATGGAAATGACAAGCCTTTCAATCCTGATATGCTGCAAAATTGATTCGCACCAGAGGTGATACACAAAGTCTCTACACCTGGACCACCTGGTCACAGGTTTCAGGAGTGCTTAATTTTTTGTGCAGAGTATTAAAAAGAAGGTGCACTTCAGTTTGCTTCTGACAGGGGTTAGGTTGTCAGGCATACTAACCTCGTTATCTAGTCCATCAGGGATAGAATGCAGGAAAAAATGCATTATTATGAGATTCAGGGCACCGCTGGCATACTGCTCGGACCCAACATCCCTCACCATCACCATTGGCTGAGAGTGGTCAAGTATCGAGTGATGCTGCACAACTTAAGGGGGGAAGGTTGTAGTCTTTGGAGCTATTGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 7192 480 + 647215 ATCCAGGACAGAAAGATCAGATTTTACTGGGTTCTTAATAATTTTTTTCACTTTTTGAGATATTTTGGGACAATCACTCCATCAATGCGTGGAAACGACAATACATGGAAATGACAAGCCTCTTAACCCTGATGTGCCCCGGAACAGAGTCACACCAGAGGTGATACACAAAGTTTCTAAACCAAGATCACCTGGTTGCAGGTTGCAGGATTGCTTACTTTTTTATGCAGAGTATTAAAAAGAAGGTGTCCCTCCAGTTGCTTCTGATGCAGGTCAGCTTGACAGGCATACCAACCTCTTTATCTAGTCCATCAGGGATGGCATGCAGGAAAAAATGCATTGTTATGAGGTTTAGGTCACCGCTAGCACACTGCTAGGACCCAGTGTCCCGCACTATCCCTATTGGCTGGGAGTGGTCAAGTATCAAGTGGTGCTGGACTACTTAAGGGGGGAAGGTTGCAGTCTTTGGAGCTATTGAGA - -a -s mr.mrrefChr0 7835 98 + 130230 GCTTTGGTTAGACTGTGACTGATAGCCTAACGTTAGCGATAGAACAATGGCTACTAATTTGGTTCCAATTGTGGGTGCTGATAGCCCCAAGCctaaac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8628 98 + 636262 GCTTTGGTTAGACTGTGGCTGACAGTCTAACGTTAGTTATTGAACAACGGCTATTAATTTAGTTCCAATTGTGGGTGCAGATTGCCccaaccctaaac -s simRat_chr6.simRat.chr6 7672 98 + 647215 GCTTTGGTTAGACTGTGACTGATAGCCTAACGTTAGCGATAGAACAATGGCTACTAATTTGGTTCCAATTGTGGGTGCTGATAGCCCCAAGCCTAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 337508 92 + 647215 GCTTTGGTTAGACTGTGACTGATAGCCTAACGTTAGCGATAGAACAATGGCTACTAATTTGGTTCCAATTGTGGGTGCTGATAGCCCCAAGC------ - -a -s mr.mrrefChr0 7933 49 + 130230 aaagttttgacaaatagttcgagactggattgtaatgctgaaagatggc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8726 49 + 636262 aaagttttgacaaatagttcgagactggattgtaatgctgaaagatggc -s simRat_chr6.simRat.chr6 7776 49 + 647215 ATAACTTTAACAAATAGTTCAAGAGTGAATTATAATCTTGAAAGATTGC - -a -s mr.mrrefChr0 7982 138 + 130230 acctcctagagtcaacagatcccaagctgaatccacttcaagcacattatgaagtcagtggccgttGTAGATCACTCAACCTGTACTATATACAGAAGACTAGAACGTCAACTCTTAAGTTACTATGTCAGCTAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8775 138 + 636262 acctcctagagtcaacagatcccaagctgaatccacttcaagcacattatgaagtcagtggccgttGTAGATCACTCAACCTGTACTATATACAGAAGACTAGAACGTCAACTCTTAAGTTACTATGTCAGCTAACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 7830 138 + 647215 ACCTCCTAGAGTCAACAGATCCTAAGCTGAATTCAATGCAATTACATTATGAAGTCAGTGGTTGTTGTAGGTCACTCAACCTGTGCTATATACAGAAGACTAGAACGATAACTGTTAAGGCACCATGTCAGCTAAACA - -a -s mr.mrrefChr0 8120 46 + 130230 TATTGTCAGTGAGGAGTACCTCAAATGGTGCCAGACAGACTTTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8913 46 + 636262 TATTGTCAGTGAGGAGTACCTCAAATGGTGCCAGACAGACTTTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 7971 46 + 647215 TTCTGTCAGTGAGGAGTAGCCCAAATGGTGCCAGACAGAATTTGGC - -a -s mr.mrrefChr0 8166 76 + 130230 AATAGGTTATGAACACTCCTCCTACCAATCACAGTAGTGATACATGACTTCCCCCAGGATAGATCATGTGGGTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8960 76 + 636262 AATAGGTTATGAACACTCCTCCTACCAATCACAGTAGTGATACATGACTTCCCCCAGGATAGATCATGTGGGTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 8017 76 + 647215 GGTAGGTTATAAACCCTCCTCCTACCAATCATAGTAGTGCTACATAGCATCCCCCAGGATAGGTCATGTGGGTTAC - -a -s mr.mrrefChr0 8242 102 + 130230 TACATGGGGCCTGTTCACCCCACCCGCCAAACTAACAAGGCCAAGAAAGGAAGGAGCTTTAGCCTGAGTTTCTCTAACTCCAGGTGTAATTCCCTTAGGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9036 102 + 636262 TACATGGGGCCTGTTCACCCCACCCGCCAAACTAACAAGGCCAAGAAAGGAAGGAGCTTTAGCCTGAGTTTCTCTAACTCCAGGTGTAATTCCCTTAGGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 8132 102 + 647215 TGTATGGGGCCTGTTCACCCCACCTGCCAAACTAACAAGGCCAAGAAAGGAAGGAGTTTGAGCCTGAATGTCTCTAACTCCACTTGTAAGTCCCTTAGGGCT - -a -s mr.mrrefChr0 8344 14 + 130230 TTTCCGGCCCTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9138 14 + 636262 TTTCCGGCCCTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 8235 14 + 647215 TTTCTAGCCCTATG - -a -s mr.mrrefChr0 8358 37 + 130230 GCAACAATAAATTTGGTTCTGAATATGAGGTGCCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9152 37 + 636262 GCAACAATAAATTTGGTTCTGAATATGAGGTGCCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 8282 37 + 647215 GCAAAAATGAATTTAGTTCCAACTCGGAGGTGCCCAT - -a -s mr.mrrefChr0 8395 32 + 130230 ACAAACCACTCTAATTGGATTCTACTATTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9189 32 + 636262 ACAAACCACTCTAATTGGATTCTACTATTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 8320 32 + 647215 ACAAACCATTCTGATTGGACTCTACTATTCAA - -a -s mr.mrrefChr0 8427 68 + 130230 CAAACATTTCTAAGAGAGTTACTAAATATGGCGTAAGGAGAAACTTTTTAAAAACTCTTATCATGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9225 68 + 636262 CAAACATTTCTAAGAGAGTTACTAAATATGGCGTAAGGAGAAACTTTTTAAAAACTCTTATCATGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 8352 68 + 647215 CAAACACAGGTAAGCGAGTTACTAAATATGGTGTAAGGAGAAATTTTTTAAAAACTCTTATCAACCCA - -a -s mr.mrrefChr0 8495 91 + 130230 AAGGGGAATAACAGgcatccataaaatccacctctcatgcttgcctggtacattggtgcacttgagattaaggggtgacaataggaccatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9294 91 + 636262 AAGGGGAATAACAGgcatccataaaatccacctctcatgcttgcctggtacattggtgcacttgagattaaggggtgacaataggaccatc -s simRat_chr6.simRat.chr6 8420 91 + 647215 AAAGGAAATAACTGGCATCCATACAATCCACCTCCCTTGCTTGCCTGGCATGTTGGTGCGCTCAAGATTAAGGGCTGACAATGAGACCATC - -a -s mr.mrrefChr0 8586 56 + 130230 atcagaagtggacaaagaaaaagggtgggaatttagttccaaccaacaagtcagac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9391 56 + 636262 atcagaagtggacaaagaaaaagggtgggaatttagttccaaccaacaagtcagac -s simRat_chr6.simRat.chr6 8511 56 + 647215 ACCAGAAGGGTATATAGAAAAGGGTTGGGAATTTAGTTCCAACGCACAAGTCAGAC - -a -s mr.mrrefChr0 8642 110 + 130230 aaggataaaagggggataataaagggcattcaagtgaagtccaaaggcactaacccatctcaaaggtcaaaccattctaagtgtttgcccgctttatatatgggcattat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9473 110 + 636262 aaggataaaagggggataataaagggcattcaagtgaagtccaaaggcactaacccatctcaaaggtcaaaccattctaagtgtttgcccgctttatatatgggcattat -s simRat_chr6.simRat.chr6 8567 110 + 647215 Aaggataaaagcgggataaaaaaggtcatccaagtgaagtccaaaggcacaaaccctcctcaaacgttaacccattctaagtgtttgccagcttaatatatggggattat - -a -s mr.mrrefChr0 8752 150 + 130230 aatacacatcatgtgtgaatctcagatagGGCCTGAAATATGCTTGTACTGGAAATTCAAGCTGGTTGTCAACTTCTTCACGTACAGAATCTAGTGAATGTCAATTCAACAGTATCAACCAATCTAAGATTCAATTGAAACTGCCTAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9590 150 + 636262 aatacacatcatgtgtgaatctcagatagGGCCTGAAATATGCTTGTACTGGAAATTCAAGCTGGTTGTCAACTTCTTCACGTACAGAATCTAGTGAATGTCAATTCAACAGTATCAACCAATCTAAGATTCAATTGAAACTGCCTAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 8677 150 + 647215 aatatgcagcatgtgtgaatctcagaCGTGGTCTGAAATATGCTTGTTCTGGAAAACCTGCCTGGTTGCCAGCATCTTCACACACAGAGTCTAGTGAATGTCAATCCAACAGTGTTAACCAATCTAAGATTCAATTGACACTGCCTGGAC - -a -s mr.mrrefChr0 8902 13 + 130230 AGGTAGctgctta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9740 13 + 636262 AGGTAGCTGCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 8854 13 + 647215 AGGTACctgctta - -a -s mr.mrrefChr0 8915 71 + 130230 ttttctctgctctacctatgcccactcaaaccaggcactcaagtgaggaccaaagactttgttggtattgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9754 71 + 636262 TTTTCTCTGCTCTACCTATGCCCACTCAAACCAGGCACTCAAGTGAGGACCAAAGACTTTGTTGGTATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 8867 71 + 647215 ttttctctgctctacttatgcccactcaaaccaagcattcaagtgaggaccaaagattgcgttggtattgt - -a -s mr.mrrefChr0 8986 4 + 130230 gccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9825 4 + 636262 GCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 8946 4 + 647215 gccc - -a -s mr.mrrefChr0 8990 17 + 130230 tgtgcaaggctatgttt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9829 17 + 636262 TGTGCAAGGCTATGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 8964 17 + 647215 tctgcaaggccgtgtct - -a -s mr.mrrefChr0 9007 41 + 130230 acaatacaagtaacagcaaaaaacggctgctgacaacatgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9846 41 + 636262 acaatacaagtaacagcaaaaaacggctgctgacaacatgt -s simRat_chr6.simRat.chr6 9203 41 + 647215 acaatataACTACCAGTAAAAATGGGCTGCTGACACCAGGT - -a -s mr.mrrefChr0 9048 21 + 130230 caacagtgatccaaagattat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9887 21 + 636262 caacagtgatccaaagattat -s simRat_chr6.simRat.chr6 9245 21 + 647215 CAGTAGTGCTCCAAAGATCAT - -a -s mr.mrrefChr0 9069 12 + 130230 gaatggaaaagc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9908 12 + 636262 gaatggaaaagc -s simRat_chr6.simRat.chr6 9284 12 + 647215 GAATCGAAAACC - -a -s mr.mrrefChr0 9081 16 + 130230 gtgagagctcacacct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9927 16 + 636262 gtgagagctcacacct -s simRat_chr6.simRat.chr6 9296 16 + 647215 GTGGGCCTCTACTCGT - -a -s mr.mrrefChr0 9097 18 + 130230 ccaaggatgattagactg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9943 18 + 636262 ccaaggatgattagactg -s simRat_chr6.simRat.chr6 9313 18 + 647215 CCGAACATGGTTAAACTG - -a -s mr.mrrefChr0 9115 15 + 130230 ggtcatcaaggtaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9961 15 + 636262 ggtcatcaaggtaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 9334 15 + 647215 GGTCATCAGAGTTAA - -a -s mr.mrrefChr0 9130 41 + 130230 tttgagctaagagagatcaagaggcaaaggataatgtctaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9976 41 + 636262 tttgagctaagagagatcaagaggcaaaggataatgtctaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 9352 41 + 647215 TCTGAACTAAAAGAAATCAAGAGGTTAAGGATAATGTCTAA - -a -s mr.mrrefChr0 9171 20 + 130230 tcggccagtgagagagtcgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10017 20 + 636262 tcggccagtgagagagtcgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 9395 20 + 647215 TCAACTGGTGTGATAGTAGG - -a -s mr.mrrefChr0 9191 53 + 130230 ttttgctggtcttgaggttagattaatgaaattcacaggcctcaactggacat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10037 53 + 636262 ttttgctggtcttgaggttagattaatgaaattcacaggcctcaactggacat -s simRat_chr6.simRat.chr6 9418 53 + 647215 TTCTGCTGGTCTATAGACTAGATTAATGAAATTTGCAGGCCTCTGCTGGACAT - -a -s mr.mrrefChr0 9244 22 + 130230 gcatgtagagtaacaaAGGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10090 22 + 636262 gcatgtagagtaacaaAGGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 9473 22 + 647215 TCATGTTGAGTAACAAAGGATG - -a -s mr.mrrefChr0 9266 49 + 130230 ATATCTTCAAATATACACCAATCAGTTGCACTAACTTCTTTCTGCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10112 49 + 636262 ATATCTTCAAATATACACCAATCAGTTGCACTAACTTCTTTCTGCTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 9498 49 + 647215 ACATCTTCAAATACACTTCAATCTGTTGAACTAATTTCTTTGTGCTAAT - -a -s mr.mrrefChr0 9315 20 + 130230 AAGACAGCTTGGTGGTAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10165 20 + 636262 AAGACAGCTTGGTGGTAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 9547 20 + 647215 AAGACAACTTGGGGGTATTT - -a -s mr.mrrefChr0 9335 47 + 130230 CACAATGAGACCCCTGGGGAAAACTTAGTTGTGATTGAGGATTTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10187 47 + 636262 CACAATGAGACCCCTGGGGAAAACTTAGTTGTGATTGAGGATTTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 9567 47 + 647215 CACAATGAGTCACCTAGGCAAAACTTAGTTGTGGTTGAGGATAATCG - -a -s mr.mrrefChr0 9382 46 + 130230 GACCCCTGGGGAGGGGGGGAAGGGGAGCACCTGAGAGTCGGAGACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10235 46 + 636262 GACCCCTGGGGAGGGGGGGAAGGGGAGCACCTGAGAGTCGGAGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 9614 46 + 647215 GACCCCTGGGGAGAGGGGTAGGGAGGGCAGCTGAGAGCTGGAGACC - -a -s mr.mrrefChr0 9428 16 + 130230 ATTTCTATAAAATGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10281 16 + 636262 ATTTCTATAAAATGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 9692 16 + 647215 GTTTCTATGGCTTGAA - -a -s mr.mrrefChr0 9444 30 + 130230 TTGACTATCATGACTCAGTGCATGTTGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10297 30 + 636262 TTGACTATCATGACTCAGTGCATGTTGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 9710 30 + 647215 TTGACTATCATGAATCAGTGTGTGTTGTAA - -a -s mr.mrrefChr0 9474 8 + 130230 GTGGTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10340 8 + 636262 GTGGTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 9740 8 + 647215 GTGGTCAA - -a -s mr.mrrefChr0 9482 37 + 130230 TTTATTACTAGTGAAGTTCTACAGGCAGTATAGAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10389 37 + 636262 TTTATTACTAGTGAAGTTCTACAGGCAGTATAGAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 9748 37 + 647215 CTTGCTACCACTGAAGTTCTACAAGCAGCATAGAGGC - -a -s mr.mrrefChr0 9519 22 + 130230 ATATGTCAGTTTCACTTGCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10433 22 + 636262 ATATGTCAGTTTCACTTGCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 9785 22 + 647215 ATATGTCAGTTTCACATCTAAT - -a -s mr.mrrefChr0 9541 3 + 130230 ATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10458 3 + 636262 ATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 9807 3 + 647215 ATG - -a -s mr.mrrefChr0 9544 69 + 130230 ACTACTTCTTCAATGTCTGAATCTAGCAAAGGTATGATAAAAGGAACACAGAGCTACCAGGTGAAAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10468 69 + 636262 ACTACTTCTTCAATGTCTGAATCTAGCAAAGGTATGATAAAAGGAACACAGAGCTACCAGGTGAAAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 9810 69 + 647215 AGTACTTCTTGAATGTCTGAGTCTGTCAAAGATATGATGAAAGGAGCACAGAGCTACTATGTCAAAAGC - -a -s mr.mrrefChr0 9613 303 + 130230 Catagggaagcccacgcattgacaatcacttgagattcagtctggagaagctgggatggcttgggatgtataaacttataaatttcacaagactcatggtatgtaatggaatatattaacagaatcacatgattagatcattggataatggtggtgcacagattgaattaaacaaacaggatcacatcacaggttagccataatgaatgagttagaaagtgaccgataacagtgcctgaatgttgcctgcacaagcataaagctgctttccagtggttatggttggacacttgtgtaatccct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10547 303 + 636262 Catagggaagcccacgcattgacaatcacttgagattcagtctggagaagctgggatggcttgggatgtataaacttataaatttcacaagactcatggtatgtaatggaatatattaacagaatcacatgattagatcattggataatggtggtgcacagattgaattaaacaaacaggatcacatcacaggttagccataatgaatgagttagaaagtgaccgataacagtgcctgaatgttgcctgcacaagcataaagctgctttccagtggttatggttggacacttgtgtaatccct -s simRat_chr6.simRat.chr6 9879 303 + 647215 CACAgggaagcttgtacatttacaattacttgagactcattctggagaagctgggatggcttgggatatatagacttgtaaatgtcacaagactcatgctatataatggagtatattaatggaattagatcaggagatcaatggataatggtgatggacaaattgaattaaacaaacaggatcacatcacagggtaaccacaatgaacaagttaagaattgacgcatgaccgcacctgaatgttggcagCATAAGCACAAAGCTGCTTTCCAGTGATTATGGTTGGACACTTGTGTAATCACT - -a -s mr.mrrefChr0 9916 47 + 130230 ttgagtgtcactagagggcaccaaggacgttccataatcatcGAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10850 47 + 636262 ttgagtgtcactagagggcaccaaggacgttccataatcatcGAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 10226 47 + 647215 TTGACTGGCACTAGAGGACAACGAGGATGTTGCATAACCATTACGTA - -a -s mr.mrrefChr0 9963 84 + 130230 CCCAATTGTTAAAGGATCTCAAATATTCCCAGATCAGATTACAGGATCACAATCTGTCAATGCTAGAAGAATAGTGGTCTAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10897 84 + 636262 CCCAATTGTTAAAGGATCTCAAATATTCCCAGATCAGATTACAGGATCACAATCTGTCAATGCTAGAAGAATAGTGGTCTAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 10298 84 + 647215 CCCAATTGTTACAGGATTTCGAATACTCCCGAATCAAATTACAAGATCACAACCTGCTAGTGATAGAAGCCTAGTGTTCTAGCA - -a -s mr.mrrefChr0 10047 160 + 130230 GTAATTACCGATTGCTTTCTTAAGTCATTAGGGTAGGTTGTCAAAGAGGTGTGAATAAACATGCCCGCACACTTGAGCTTTGACCTACTCTAGGGGATTGACCATCTCTGAAGCTACTGTAGCCTAAGTAGGATGCTGCTGAAGTCAGATTCTTGCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10981 160 + 636262 GTAATTACCGATTGCTTTCTTAAGTCATTAGGGTAGGTTGTCAAAGAGGTGTGAATAAACATGCCCGCACACTTGAGCTTTGACCTACTCTAGGGGATTGACCATCTCTGAAGCTACTGTAGCCTAAGTAGGATGCTGCTGAAGTCAGATTCTTGCATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 10384 160 + 647215 GTAATAACCTATTGCTTTCTTGAGTCTCTAAGAAAGGTTGCCAAAGAGGCATGAACAAACAAGCCCACACAATTGAACTTTGACTTACTCCTGGGGCTGAACCATCTCTGAAGCTACTGTAGCCTGAATGGGACCCTGCTGAAGTCAGGTTCTGGCATTA - -a -s mr.mrrefChr0 10207 64 + 130230 ACACTTAAACAAGTCATCGGTTACCTGTTTGGGGCATGTCTTTATATTTGAAGCCAGCAAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11142 64 + 636262 ACACTTAAACAAGTCATCGGTTACCTGTTTGGGGCATGTCTTTATATTTGAAGCCAGCAAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 10544 64 + 647215 ACACTTAAACAGGTCATCGGTGACCTGTTTGGGGCATGTCTTTATATTTGAAGACAGCAAACTA - -a -s mr.mrrefChr0 10271 19 + 130230 CATCTTGATATTAGCCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11208 19 + 636262 CATCTTGATATTAGCCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 10608 19 + 647215 CATCTTGATATTAGCCTCA - -a -s mr.mrrefChr0 10290 29 + 130230 TGTTAATTCCCATATGTATCAGGGGTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11227 29 + 636262 TGTTAATTCCCATATGTATCAGGGGTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 10630 29 + 647215 TGTTACCTCCCATATGTATCTGGGGAGTT - -a -s mr.mrrefChr0 10319 17 + 130230 GCTTCTTCTGTCACTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11257 17 + 636262 GCTTCTTCTGTCACTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 10659 17 + 647215 GCTTCTTGTGTCGCTGT - -a -s mr.mrrefChr0 10336 68 + 130230 CTGTAACACCCAATACAGACACTACAAAGAACATTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGCAGTGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11274 68 + 636262 CTGTAACACCCAATACAGACACTACAAAGAACATTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGCAGTGCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 10677 68 + 647215 CTGCAATATCCAATACAGACACTATAAAGAATGTTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGTAGTGCCT - -a -s mr.mrrefChr0 10404 47 + 130230 ACGAAGGTTTTTACCATGAAAATGGTATTGAGCAAATGACCCTGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11342 47 + 636262 ACGAAGGTTTTTACCATGAAAATGGTATTGAGCAAATGACCCTGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 10763 47 + 647215 ACAAAGGCCCTCACCATGAAAATGGTATTGAGCAAATGGCTCTGCCT - -a -s mr.mrrefChr0 10451 59 + 130230 TCACTAGAAGGAACATTCCCAGATAATAAAGGTCTGTTCAAGACTGAGACAACTTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11395 59 + 636262 TCACTAGAAGGAACATTCCCAGATAATAAAGGTCTGTTCAAGACTGAGACAACTTTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 10810 59 + 647215 TCACTAGAAAGAACATTCCCAGATAATAAAGGTCTGTTCAAGACTTAATCAACATTCCA - -a -s mr.mrrefChr0 10510 9 + 130230 TGTTAATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11454 9 + 636262 TGTTAATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 10871 9 + 647215 TGTTAATAC - -a -s mr.mrrefChr0 10519 146 + 130230 GCGTATTGAACCTGGGATTGAAAGACTGTGGTCATCTGGTGTGGCTCTATTAACTACCACACTGATATAACATTGATGTTCGTCAATGTTACACTAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACAGCATATAACCACAGTCTCTTAATCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11463 146 + 636262 GCGTATTGAACCTGGGATTGAAAGACTGTGGTCATCTGGTGTGGCTCTATTAACTACCACACTGATATAACATTGATGTTCGTCAATGTTACACTAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACAGCATATAACCACAGTCTCTTAATCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 10910 146 + 647215 GCGTGTTGAGCCTGGGAGTAAGAGACTATGGTTATCTGGTGTGTCTCTGCTAATTACCACACTAATGTAACATTGATGTGTATCAGTGTTACACCAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACACCAGATGGCCACAATCTCTTAACCCCA - -a -s mr.mrrefChr0 10665 3 + 130230 ACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11609 3 + 636262 ACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 11058 3 + 647215 ATC - -a -s mr.mrrefChr0 10668 19 + 130230 TCAGTCAGAAGAAAAATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11612 19 + 636262 TCAGTCAGAAGAAAAATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 11067 19 + 647215 TCAGTTAGAGTAAGGATAC - -a -s mr.mrrefChr0 10687 16 + 130230 TTTCAGTATTAGCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11632 16 + 636262 TTTCAGTATTAGCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 11086 16 + 647215 TTTCAGTATTAGTATG - -a -s mr.mrrefChr0 10703 9 + 130230 AATGCTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11648 9 + 636262 AATGCTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 11157 9 + 647215 AATTATACA - -a -s mr.mrrefChr0 10712 124 + 130230 CTCAGTCTTGGACCAATTCTGATTGTCTAGGAATTTTCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTCGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACGTTTGTTGGTCTATTCACTGGTTAGAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11657 124 + 636262 CTCAGTCTTGGACCAATTCTGATTGTCTAGGAATTTTCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTCGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACGTTTGTTGGTCTATTCACTGGTTAGAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 234007 124 - 647215 CTCAGTCTTGGACAGATTTTGATTGTCTAGGAATATGCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTTGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACTTTTGTTGGTTTATTCACTGATTGGACTG - -a -s mr.mrrefChr0 10836 65 + 130230 CTACCTGAATATAGTACTCCTGTAGTGGCACATACTTTGTAGTGTCTGTATTGGATATTGCAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11783 65 + 636262 CTACCTGAATATAGTACTCCTGTAGTGGCACATACTTTGTAGTGTCTGTATTGGATATTGCAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 234131 65 - 647215 CTACCCGAATACAGTACTCCTGTAGTGGAACATTCTTTGTATTGTCTGTATTAGATATTGCAAGA - -a -s mr.mrrefChr0 10901 51 + 130230 CAGGTTAAGTACACATTTAAGGTATAGTACTTCTTGCAATTTATGATGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11849 51 + 636262 CAGGTTAAGTACACATTTAAGGTATAGTACTTCTTGCAATTTATGATGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 234196 51 - 647215 CAGATCAAGTTCACATTTAGGGTATAGTACTTCTTGCAACTTATGATGATA - -a -s mr.mrrefChr0 10952 45 + 130230 ACTGTAATTATTGATTTGGTCTTTAGCAACCTCAGGTAAAATGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11900 45 + 636262 ACTGTAATTATTGATTTGGTCTTTAGCAACCTCAGGTAAAATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 234250 45 - 647215 ACTGTAATTATTAATTTGGTGTCTAGAAACCTCAGATAAAATGTT - -a -s mr.mrrefChr0 10997 44 + 130230 AGTGATCCAGGCACAGCTTACTCCCAGCCTAACAAAGTCAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11945 44 + 636262 AGTGATCCAGGCACAGCTTACTCCCAGCCTAACAAAGTCAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 234296 44 - 647215 AATGATCCAGGCACAGTTTGCTCCCAACCTCACAAAGTCAAATT - -a -s mr.mrrefChr0 11041 23 + 130230 TTAAGCACAAACCTGTACTCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12022 23 + 636262 TTAAGCACAAACCTGTACTCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 234340 23 - 647215 TTAAGCACGAACCTGTACTCATG - -a -s mr.mrrefChr0 11064 69 + 130230 CCTATTCCGACACCCCCATTTTAATACCCTTATGCATATTCCATTATTGAGTGACCCCGTGTTTGTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12045 69 + 636262 CCTATTCCGACACCCCCATTTTAATACCCTTATGCATATTCCATTATTGAGTGACCCCGTGTTTGTCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 234364 69 - 647215 CCTATTTCCACACCCCCATTTTAATACCCTTAGGCATAATCTATTATGGGGGGACCCTATGATTGTCAT - -a -s mr.mrrefChr0 11133 66 + 130230 TGAACCCTTGGTAGGGGGACCCACAGTTCTTGAAAGTCTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12114 66 + 636262 TGAACCCTTGGTAGGGGGACCCACAGTTCTTGAAAGTCTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 234436 66 - 647215 TGACCCCATGGTGGGGGGACCCAGAGTTGCTGAAGGTTTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA - -a -s mr.mrrefChr0 11199 5 + 130230 TATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12180 5 + 636262 TATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 234506 5 - 647215 TATGC - -a -s mr.mrrefChr0 11204 116 + 130230 GAGGTGCTTCCTTGTTTGGATTGAATTGTTATCTATTTTCCTTTTCTGACATGATCTCCTTTCTTGTGTCTATCTTTTAGGACACTTATCTCAGTTGACTCCTAGGTAAATCCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12392 116 + 636262 GAGGTGCTTCCTTGTTTGGATTGAATTGTTATCTATTTTCCTTTTCTGACATGATCTCCTTTCTTGTGCCTATCTTCTAGGACACTTATCTCAGTTGAGTCCTAGGTAAATCCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 234511 116 - 647215 GAGATTCTTCCTTGTCAGGATCGATTTGTTACCTATTTTCCTCTCATCACCTGAGCTCCTTTTTTGTGTCTATCTTTTAGGACACTTATATCAGTTGACTCCTAGGTACCTCCCTT - -a -s mr.mrrefChr0 11320 92 + 130230 AGCACTTAGTGAAAAAATTACTCCTATATTTTGGCACTGGGCACCTACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATATGTGAGCAGGAGAAGTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12509 92 + 636262 AGCACTTAGGGAAAGAGTTACTCCTACATTTTGGCACTGGGCTCCTACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATATGTGAACAGGAGAAGTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 234627 92 - 647215 AGGACTTAGTGAAAAAATTACTCCTCTTTTTTGGCACTGGGCACCCACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATACGTGAGCAGGAGAGGTCTC - -a -s mr.mrrefChr0 11412 49 + 130230 TGGCTACTGATCCCGCTCCTACTTCTATCTCTCACCAAAACTCATTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12618 49 + 636262 TGACTACTGATCCCACTCCTACTTCTATCTCTCACCAAAACTCATTGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 234719 49 - 647215 TGGTTACTGATCCTGCTCTTTCTTGTGTCTCTGACCAAAACTCATTGCA - -a -s mr.mrrefChr0 11461 142 + 130230 ACTCCTCCAAGTGATGTTATACAAATACGTTGTCTATTAATATATCCACACAAAGTTGTTATCCTAGCACTAATGCATGAGCTACACATGGGTGAGTACCATACACTGAAGGGTCATTAAACCATTGATAGCTTTTGGGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12669 142 + 636262 ACTCCTCCAAGTGATGTTATACAAATATGTTGTCTATTAATATATCCACACAAAGTTGTTGTCCTAGCACTAATGCATGGGCTACACATGGGTGAGTACCATACTCTGAAGGGTCACTGAACCATTGATAACTTCTGGGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 234768 142 - 647215 ACTCCTCCAAATGATGTTGTAAAAATACGTGGTCTATTAATATATACACACGAAGTTGTTATCTTAGCACTAATGCATGAACTACACATGGGTGAGTACCATACACTGAAGGGTCATTAAACCATTGATAGCTTTTGGAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 11603 195 + 130230 GTCCTCAATGTGTTACAATGGCTTTTTATCCCTCTAAATTCAGAATTGGGTATGATATGAGTGAAGCTATTTTCAGATGGACCACTCTAATGTCCGATGGACCTCTCATTCATCAGTCATTCCTCCATCCTAAACAGAAGATAGCTTGTATTGATAAAGGACACTGGTACTCTTCACAACAGATTTTCAAACTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12811 168 + 636262 GTCCTCAATGTGTTA--------------------AAATTCAGAATTGGGCATGATATGATTGAAGCTGTTTTCAGATGGACCACCCTAATGTCCGATGGACCTCTCATTCAT-------TCCTCCATCCCAAACAAAAGATAGGTTGTATTGATAAAGGACACTGGTACCTTGCACAACAGGTTTTCAAACTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 234917 187 - 647215 GTCCTCAATGTGTTACAATGGCTTTTTATCCCTCTAAATTCAGAATTGGGTATGATATGAGTGAAGCTATTTTTAGATGGACCACTCTACTATCCAATGGACCTCTCAGTCATCAGTCATTCCCCCCTCCTGAACAGAAGATATCTT--------AAAGGGCACTGGTACTCTTCACAACATACTTCCAAACTAA - -a -s mr.mrrefChr0 11798 42 + 130230 CTATGACTGGTTGGTCTCTGTTATTAATCATATACTAGAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13004 42 + 636262 CTATGACTGGTTGGTCTCGGTTGTTAATCATATACTAGAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 235104 41 - 647215 CGATGACTGGATGGTCTCTGTCAT-AATCAAATACTAGAGAC - -a -s mr.mrrefChr0 11840 169 + 130230 TAAGGCCATGTAACTTGATTCTTGTAGAGCTTAATATTCTCATCTGTATCCTGTCAAGCATTGAATGGCATTTACTGATAACCTATAATGTTGGTAATATGGAGATGGTAATAAAGAGTACAATGGACTGATAAAGATTAGTTAGTTTTGTATCTACAACCACCCTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13050 164 + 636262 TAAGGTCATATAACTTGATTCTTGTAGGGCTTAATATTCTCATCTGTATCCTGTCAAGCATTGAGTTGCATTTACTAATAACCTATAATGTTGGTAATATGGAGATGGTAATAGAGA-----ATGGACTGGCAAAGGTTAGTTAGTTTTGTATCCAAAACCACCCTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 235145 163 - 647215 TAAGGCCATGTGACTTGACTCTTGTAGAGCTTAATATTCTCACA---ATGCTGCCAAGCATTGAATGGCATTTACTGATAAGCTATAATGTTA--AATA-GGAGATGGTAATAAAGAGTACAATGGACTGATGAAGATTGGTTAGTTTTGTATCTGCAAGCGCCCTAAA - -a -s mr.mrrefChr0 12009 111 + 130230 TTGCTTTTCACAATTCTTTATCCTAATGGGCTTGGAGCACATGGCAAGAACCTTACAGCAATTTTTCAAGCTTGTTTCTATTCCTTGGTGTCCTTTCACTTCTAAACAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13214 97 + 636262 TTGCTT--CACAATTC------------AGCTTGGAGCACATCGCAAGAACCTCTCAGCAACTTTTCATGCTTGTTTCTATTCCTTGGTGTCCTTTCACTTCTAAACAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 235309 105 - 647215 TTGCTTTTCACAATTCTTTATCCTAATGGGCTTGGAGCACATGGCAAGGTCTTTACAGCGATTTTTGAAGCTTGTTTCTATTTCTTGGTATGCTTTCACTTTCAC------ - -a -s mr.mrrefChr0 12120 70 + 130230 TTCTGGAGCAAATCAAGGTACTCCAATAGACCATTGTCAACTACTCTACCAACTGCCAGATGAAGGACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13318 70 + 636262 TTCTGGAGCAAATCAAGGTACTCCAATAGACCATTGTCAACTACTCTATCAACTGCTAGATGAAGGACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 235414 68 - 647215 TTTTAAAAAAAATAAAGGTACTCCAATAAACCATTGTCAACTACTCAACCAACTGCCAGC--AAGAATCC - -a -s mr.mrrefChr0 12190 161 + 130230 AGGCCTAGCTTAGTCTCCAAAAGCGAATCCTTTTTTAGCCACAATTACCCTGTATGATGACTTAGGAGGCTCATACCTCCATCAGAAACTGGCTTCATTCCTCCATCAGAAAACAAGCCTTATAGGTCAACATACACTCATCATTAATTAGCCTTCTCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13388 140 + 636262 ---------------------AGCGAATCCTTTTTTTAACACAATTACCCTGTATGATGACTTAGGAGGCTCATACCTCCATCACAAACTGGCTTCATTCCTCCATTAGAAAACAAGCCTTATAGGTCAATATACAATCATCATTAATTAGCCTTCTCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 235514 149 - 647215 AGGCCTAGCTTAGTCTCCAAAAATGAATTCTCTTTTAGCCACAATTACCCTGTATGATGACTGAGGATGCTCATATCTCAATCAGACACTGGCTTCATTTCTCCATCAGAAAACAAGTCTTATAGGTCAACATACACTCATCAATAATT------------ - -a -s mr.mrrefChr0 12351 104 + 130230 AGCTCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTGGGCTCAAAGGCCAGGAGGCACCTTAGTCGTGACTGACTTTAGATACATGCTGTTAGAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13532 104 + 636262 AGCTCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTGGGCTCAAAGGCCAGGAGGCACCTTAGTCGTGACTGACTTTAGATACATGCTGTTAGAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 235663 104 - 647215 GGATCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTTGGCTGGAACGCTAGGGGAAACCCAAGTCATGACTGACTTTAGGTACATGCTGTTAGAAACT - -a -s mr.mrrefChr0 12455 19 + 130230 GTGTGAATTGTAATGAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13636 19 + 636262 GTGTGAATTGTAATGAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 235786 19 - 647215 GTGGGAATTGTAATGAAAG - -a -s mr.mrrefChr0 12474 50 + 130230 TAGGACTCATACTATCATTAGTAAAGACCTGTGATTAAAAGGCAGTTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13659 50 + 636262 TAGGACTCATACTATCATTAGTAAAGACCTGTGATTAAAAGGCAGTTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 235805 50 - 647215 TAGGACTCACACTGTCCTTAGTAAACACTCATGATTAAAAGGCAGTTATA - -a -s mr.mrrefChr0 12524 56 + 130230 CGCATGCCAAATGTTGGTCATTTGCACTGTTAGTGTGCACTGGATGCATGGTAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13709 56 + 636262 CGCATGCCAAATGTTGGTCATTTGCACTGTTAGTGTGCACTGGATGCATGGTAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 235859 56 - 647215 CTCATGCTAAACGTTGGTCATTTTCACTGATTCTATGCACTGGGTGCGTGGTAGGC - -a -s mr.mrrefChr0 12580 81 + 130230 TGCAGAGATGTACCATGCTTCAGAAATGGTTCAACTGCACCCAATGTTATCGTGGTCGTATGATGTCCAATACTTGAGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13765 81 + 636262 TGCAGAGATGTACCATGCTTCAGAAATGGTTCAACTGCACCCAATGTTATCGTGGTCGTATGATGTCCAATATTTGAGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 235916 81 - 647215 TGCAGGGATGTACCATGCTCCAGATCTGGCTCAACTACACCCAATGTTATTGTGGTCGTATAATGTCCAATACTTGAAGTT - -a -s mr.mrrefChr0 12661 28 + 130230 TGAATTATGAGTAGACTTTTGAAACGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13847 28 + 636262 TATATTATGAGTAGACTTTTGAAACGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 235997 28 - 647215 TGAATTATGAGTAGACTTTTGAAATGAG - -a -s mr.mrrefChr0 12689 136 + 130230 ATTATCCACAGGAGTCAGGTGTAGTCATGTTCCCCCTCTGTAGCATTTTACTCATTGAGTAGCTTAGCTTTTAAGATTTTAAGACTCCCTTGAAGTGGGCTGGAATTTGCAATGAAGATATATGGTGGTGAGTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13876 136 + 636262 ATTATCCACGGGAGTCAGGTGGAGTCATGTTCCCCCTCTGTAGCGTTTTAATCATTGAGTAGCTTAGCTTTTAAGCTTTTAAGACTCCCTTGAAGTGGGCTGGAATTTGCAATGAAGATATGTGGTGGTGAGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 236025 136 - 647215 ATTACCCACAGGAGTCAGGTGTATTGATGTTCCCCCTCTCAAGCATTTAACTCATTGAGCAGCTTAGCTTTTAAGATTTTAAAACCCCCTTGAAGTGGGCTGGAATTTGCAATGAAAACATATGGTGGTGATTCCA - -a -s mr.mrrefChr0 12825 76 + 130230 GAGCATATCTGTATTAGACTATGTATCACTGTACAGAAGAATGTAGCTTAGTTTGCAAAGGTTGTTAGATAGCCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14039 76 + 636262 GAGCACATCTGTATTAGACTATGTACCACTGTACAGAAGAATGAAGCTTAGTTTGCAGAGGGTGTTCGATGGCCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 236161 72 - 647215 GAGCATATCTGTATTAGACTATGTATCACTGTGCAGGAGAATATA----AGTTTGCAAAGTTTGTTAGATAGCCGT - -a -s mr.mrrefChr0 12901 137 + 130230 AATGAAAGAATTATCATTACCACTTTCTTTCAGGAGGTATTTACTTTACATCATGAAGGTGACTTTTTCTCTGATACAGCCTTCTCATCCAGTGAAGCTGTCCACATGAGCTCTAATACCGGGTATATACATCAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14115 136 + 636262 AATGAAAGAATTATCATTACTACTTTCTTTCAGTAGGTATTTACTTTACATCATGAATGTGACTTTTCCTCTGATA-AGCCTTCTCATCCAGTGAAGCTGTCCACATGAGCTCTAATACCGGGTATATACATCAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 236237 117 - 647215 AATGAAAGAATTATCATAGCCACTTTCTTTCTGGAGGTATTTACTTTACATCATCAAGGTGGCTTCTTCTCTGACACAGTCTTCTCATCCAGTGTAGCTGTCAG--------------------GTATACATCAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 13038 14 + 130230 GTTGCACTAAAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14252 14 + 636262 GTTGCACCAAAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 236354 14 - 647215 GTTGCACTAAAGTT - -a -s mr.mrrefChr0 13052 201 + 130230 CATCGTATTGTGCCCATATATTTGAGGGTTGGCCTTGTCAATTCAGGGTTGCCCTGAGGATCACCACTAGGCCACTCACTGGCTTACTATCATTGAGCATTGCTGCCTTTGATGTCTTATGTCTTCGATGGATGTTACAGCTGCAGGTGCACCCCACAAACGCTAGATTGTGGGCGAAATCACTACTCAACAGAAGTGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14266 201 + 636262 CATCGTATTGTGCCCATATATTTGAGGGTTGGCCTTGTCAATTCAGGGTTGCCCTCAGGATCACCACTAGGCCACTCACTGGATTACTATCATTGAGCATTGCTGCCTTTGATGTCTTATGTCTTTGATGGATGTTACAGCTGCAGGTGCACCCCACAAATGCTAGATTGTGGGTGGAGTCACTACTCAACAGAAGTGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 236369 200 - 647215 TACCATATTGTGCCT-TGTATGTGCAGGTTGGGCTTGTTAATTCAGGGTTGCCATGAGGATCACCACTAGGCCACTCGCTGGCTTACTATCATGGAGCATTGCTCCCTTTGATGTCTCATGTCTTCGATGAATGTTATAGCTGCAGGTGCACCCCATAAACACTAGATTGTGGGCGACATCACTACTCAACAGAAGTGTAT - -a -s mr.mrrefChr0 13253 132 + 130230 TAGCACTGGACCACAGAGATTGCCTCCAATTCTCCTACAGCAGAACCTGGTGCATGAACATGTCTTGTTGTCTGCTGACCTCTCTACAGTCATTGACCATGGTTTGGCATCTGGAGAAGTTACCTTGCCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14467 125 + 636262 TAGCATTGGACCACAGAGATCGCCTCCAATTCTCC---AGCAGAACCTGGTGCATGAACATG----GTTGTCTGCTGACCTCTCTACAGTCATTGACCATGGTTTGGCATCTGGAGAAGTTACCTTGCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 236571 132 - 647215 TGGCACCAGACCACAGTGATTGCCTCCAATTCTCCTACAACAGACCCTGCGGCATGAACATGTCTTGTTGTCTGCTGACCTCTCTACAGTCATGGACCATGCTTTGGCATCTTGATAGGTTACCTTGCCAGC - -a -s mr.mrrefChr0 13385 465 + 130230 AAAACCCTAACTTGTAATAGTCAAATCCTCCAACCATTGGTAACCTGTATTTTCTTAAAACACTACAAACTGACCACACAGGTTGAATTAATACCTATTACAATTAAGGATGTTGTTCCTACTCTACTTTATGTTTGGCCATTCACAATCACAGCTCAAACTATGAATGACACAAGTAAATGATATAGAGATATTTAGTCCGATGAGTTCTAAGTCACTAGTTTGAGCTGTAGGTAGTAGAAGAGTGCTATTTCAATTCTATGTTCTACAATTTAAGAAGCTAGCAGAATGTAACACGACCTGCATAGGATAACCCTCCAGAGGCCCCCTGATAGATAGTTAAGGTAGGTACAATGTCATGATTACTAACCACTTTGTTATCCAGATAAGAAAACGGACTCTATGGGTAGTGATTAAGCTATTCTAATATTAAGTCCTATATTATGACCCTAATGGGTACTATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14599 460 + 636262 AAAACCCTTACTTGTAATAGTCA--TCCGCCAACCATTGGTAACTTGTATTTTCTTAAAACACTACAAACTGACCACACAGATTGAATTAATACCTATGG-AATTAAGGATGTTGTCCCTACTCTACTTTATGTTCGGCCATTCACAATCACAGCTCAAACACTGAATGACACAAGGAAATGATATAGAGATATTTAGTCCGATGAGTTCTAAGTCACTAGTTTGAGCTGTAGGGAGTAGAAGAGTGCTATTTCAATTCTATGTTCTATAATTTAGGAAGCTAGCAGAATGTAACACAACCTGCATAGGATAACCCTTTAGAGGCTCCCTGATAGATAGTTAAGGTAGGTACAATGTCATGACTACTAAACACTTTGTTATCCAGATAAGAAAAC--ACTCTATGGGTAGTGATTAAGCTATTCTAATATTAAGTCCAATATTATGACCCTAATGGGTACTATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 236703 465 - 647215 AAATCCCAAACTTGTAATACTCAAATCCTCCAGCCATTGATAACCTGTATTGTTTTAAACTACTACGAGCTGACCACACAGGTCAAATTAATACCTATTACAATTCAGGATGTTGTTCCAACTCTACTTTATGTCTGGCCATTCACAATCACTGTTCAAATTATGAATGACACAAGTAAATGATATACAGAAATTTAGTCCGATGTGTTCTAAGTCACTAGTTTGAGCTGTAGGTAGTAGAAGTGTGGTATTTCAATTCAATGTTCTACAATTCAAAAAGCTAGCAGAATGTAACACGACCTGCATAGGATAACCCTCCAGAGGCCCCCTGATATATAGTTAAGGTAAGTACAATGTCATGATTACTAACCATTTTGTTATCCAGATAAAAATACGGCCTCTATGGGTAGTGATTAAGCTATTCTAATATTAAATCCTACATTATGACCCTAATGGGTACTGTGT - -a -s mr.mrrefChr0 13850 20 + 130230 AAAACCATCCATGCTCGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15118 20 + 636262 AACACCACCCATGCTGGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 237168 20 - 647215 ACAACCATCCATGCTCCATC - -a -s mr.mrrefChr0 13870 38 + 130230 CTACCATATACAAAAGGCTGTCGATACTTTCCAGCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15142 38 + 636262 CTACCATATATGAGAGGCTGGCGAAACTTTCCAACCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 237188 38 - 647215 CTACCATATGCAAAAGGCTGTCGATACATTCTAGCCAC - -a -s mr.mrrefChr0 13908 90 + 130230 TCAGGGAATTGCTAAGGATAGACTAGTCAAGCTGCTGTACCAGTCCGGGTCAGATGTGGTGACCAACATCATTATCCCATGCATAGCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15186 90 + 636262 TCAGGGAATTGCTAAGGATAGACTAGTTAAGCTGCTGCACCAGCCCGGGTCAGATGTTGTGACCAACATCATTATCCCGTGCATAACCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 237226 90 - 647215 TCAGGCAATTGCTAAGGTTAGACTAGTCAAGCTGCTGTACCAGTTGAGGTCAGATGTGGTGACCAACATCATTATCCCATGAATAGCCAT - -a -s mr.mrrefChr0 13998 130 + 130230 CTATGGGGGAGTAAATTCAACTTATAGGACTTGATACATATTAGGACTGTCTTATGTAATGCTACTTAGGACTTTGTGCTAGTTGGCTGAAAGTTGAAACAGATTGGCAACTTACCCCCACACAGTAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15276 130 + 636262 CTATGGGGGAGTAAATTCAACTTATAGGACCTGATACATGTTAGGACTGTCTTATGTAATGCTACTTGGGACTTTGTGCTAGTTGGCAGACAGTTGAAACAGATTGGCAACTTACCTCCACACAGTAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 237354 130 - 647215 CTGTGGGGGAGTAAATTCAACTTATAGCATTTGATACATATTAGGACTGTCTTATGTAATGCTACTTAAGACTTTGCGCTAGTTGGCTGAAAGTTGAAGCAGATTGCCAGCTTATCCCCTAGCAGTAATA - -a -s mr.mrrefChr0 14128 21 + 130230 GTATATGTGATGCAAGACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15406 19 + 636262 GTATATGTGAT--AAGACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 237489 21 - 647215 GTATATGTGATGCTAGACATT - -a -s mr.mrrefChr0 14149 167 + 130230 CTTTTGTTCTACTTCCACCAGCCGCTTCAGACATTAAGTGGGCAGGCACGTTCTAGACTCAAAACAGGTGCCTGACATCACTTGACAGTGTGTGAATTGGACCCTGACAAACCTCTTGTGTGAGACAGACAGGCTCTGTGGTTGCTTGACATCTTGTCAAGCCGGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15425 167 + 636262 CTTTTGTTCTACTTCCATCAGCCGCTTCAGCCATTAAGTGGGCAGGCACGTTCTAGACTCAAAACAGGTGCCTGACATCACTTGACAGTGTGTGAATTGGACCCTGACAAACCTCTTGTGTGAGACAGACAGGCTCTGTGGTTGCTTGACATCTTGTCAAGCCGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 237515 167 - 647215 TGTTTGTTCTACTTCCACCGGCAGTTTTAGAGATTAAATGGACAGGCTCATTCTAGCCTCAAAATAGGTGCCTGTCATCACTTGACAGTGCGTGTATCAGGCCCTGACAAAACTCTTGTGTGAGCCGAACAGACTCTGTGACTGCTTGACATCTCGTCAAGCCGGGC - -a -s mr.mrrefChr0 14316 33 + 130230 AGGCTCATAGCAAGGCACTAACCATGTGTACGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15592 33 + 636262 AGGCTCATAGCAAGGCACTAACCATGTGTACGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 237683 33 - 647215 AGGCTCATAGCCATACACTAACCATGTGAACAC - -a -s mr.mrrefChr0 14349 95 + 130230 AGCACTAACCATGTGTACATAGCCGCATTTGCCTTTTTTTGGAGCTTTGCACGAGGCACTATGAGAAATCTAAACAACGTTAAGGTACTCTCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15651 95 + 636262 AGCACTAACCATGTGTACATAGCCGCATTTGCCTTTTTTTGGAGCTTTGCACGAGGCACTATGAGAAATCTAAACAACGTTAAGGTACTCTCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 237716 95 - 647215 GGCACTAATCATGTGTATGTGGCTGCATTTGCCTTTTTTTGGAGCCTTGCATGAGGCACTGTGCGAAATCTAAACAATGTTAAGCTACTCTCTAC - -a -s mr.mrrefChr0 14444 147 + 130230 ATCTCTTCAGATTCTATAAGTGACACTAATAAAAGTTGTTGTCGCTGTTTTCATAAAACGCGCATCAGGCACATCATGAAGACCTGAAAACTTTGGAAATGTGACTTTGGGGTAGTTTGGTGTAGTTTTTGTCAGATTCCATGCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15747 147 + 636262 ATCTCTTCAGATTCTATAAGTAACACTAATAAAAGTTGTTGTCGCTGTTTTCATAAAACGCGCATCAGGCACATCATGAAGACCTGAAAACTTTGGAAATGTGACTTTGGGGTAGTTTGGTGTAGTTTTTGTCAGATTCCATGCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 237811 147 - 647215 ATCTGTTTAGATTTTATTAGTGACATTAATATAAGTTGTTGTCAGTGTTTTCATATGACTAAAATAAGCCACATCATGAAGAAGTGAAAATTTTGGAAATGTAATTTTGGGGTAGTGTGGTGTAGTCTTTGCCAGCTTGTACCCATA - -a -s mr.mrrefChr0 14591 29 + 130230 CTAGGCAGGCAACACATGACCAGTAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15896 29 + 636262 CTAGGCAGGCAACACATGACCAGTAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 237958 29 - 647215 CTACGCTGGCAATAAGTAACTATTTAACT - -a -s mr.mrrefChr0 14620 96 + 130230 TTTTCTACTTCTGGACTGCACCACATATTCTATTCATTCCAGTCCCTTGCTCTTTCATGGATACAAATTTAATCTCACCAACACATGTTGGGTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15927 96 + 636262 TTTTCTACTTCTGGACTGCACCACATATTCTATTCATTCCAGTCCCTTGCTCTTTCATGGATACAAATTTAATCTCACCAACACATGTTGGGTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 237987 96 - 647215 TTTTCTCCTTTTGGACTGTGACACATATCCTGTCCATTCCAGTCCCTTGCTCTTTCACGGCTACAAATTTAATCTCACTAACACATGTTGGGTAGG - -a -s mr.mrrefChr0 14716 9 + 130230 CAAAGTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16076 9 + 636262 CAAAGTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 238083 9 - 647215 CAAAGTCAC - -a -s mr.mrrefChr0 14725 14 + 130230 TGAAATGGGCATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16086 14 + 636262 TGGAAAGGGCCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 238092 14 - 647215 TGAAATGGGCATCG - -a -s mr.mrrefChr0 14739 69 + 130230 TTGAGTCATCTTAGTCACCTTGCAGATGGGGCTTACACGCGAACCAGACAAATCAATTGGCTTGTGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16114 49 + 636262 TTGAGTCATCTTAGTCAC---------------TACCC-----CCAGACAAACCTATTGGCTTGTGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 238106 69 - 647215 TTGAGTCACCTTAGACACCTTGCAGATGGGGCTTACACGCGAACCATACAAATCAATAAGTTTGTCTGG - -a -s mr.mrrefChr0 14808 51 + 130230 GCGGGGTGACTAGGGTGCCCCAATCAATGTCAAGGATCAATGCCCTTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16183 37 + 636262 GCAAGGTGTCTAGGGTGACTCAAT--------------GATGCCCATTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 238175 51 - 647215 GGGGTGTGACTAAGGTGCCCCAATCAATGTCAAGGATCAAAGCCCTTTCCA - -a -s mr.mrrefChr0 14859 45 + 130230 GTGACTTTGTAATAGTCGTGAGTAGTATAGAGCACTGCTTGCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16220 31 + 636262 GTGACTTTGCC--------------TATAGAGCACTGCTTGATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 238227 45 - 647215 ATGACTTTGTAATAGTCGTGAGTAGTATGGTTCAGGCCTTGCCAC - -a -s mr.mrrefChr0 14904 391 + 130230 AAACACATGATAGAAAGGGTTGACAGGGCTAAAGTGTTGGGTAAAAAGTGACAAGGCCTGGAAGCATACTTATTTCAGACTGCAGCTTCATGTCCAATTTGTGGGCCTAATAACTGCTAAAGAATTCCACAAGAATAGTGTTTAATATATTAACCATTAACCACTTGAAACAGACTACATTGTCTTGGAGGACGTGTCTTTTCACTGAGAGGTTGTTCATTTTTTGGAGGGTTTAATAGGCAAGTAGGTGAATCCATCTCTGATCTAAACAAAATAAGACACTGTATTCTACATTAGAGTGTCATTCACTAATTCACTGATGGATCAGGGCCCAGCACACAAATTGGGAAATTCGCAGTACTTTACTGTAGTGTGGCAGTGCCACCATTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16251 391 + 636262 AAACACATGATAGAAAGGGTTGACAGGGCTAAAGTGTTGGGTAAAAAGTGACAAGGCCTGGAAGCATACTTATTTCAGACTGCAGCTTCATGTTCAATTGCTGGGCCTAATAACTGCTAAAGTATTCCACAAGAATGATGTTTAATATATTAGCCATTAACCACTTGAAACAGACTACATTGTCTTGGAGGATGTGTCTTTTCACTGAGAGGTTGTTCATTTTTTGGAGGGTCTAATAGGCAAGTAGGCGAATCCATCTCTGATGTAAACAAAATAAGACACTGTATTCTACATTAGGGTGTCATTCACTAATTCACTGATGGATCAGGGCCCAGCCCACAAGTTGGGAAATTCGCAGTACTTTACTGTAGTGTGGCATCACCACCATTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 238291 384 - 647215 AAACACATGACAGAAAAAATTGACAGGGCTAAAGTGTTGGGTAAAAAGGGACAAAGCCTGGAAGCATACTTATTTCACACTGCAGCTTCATGGCTGATTTGTGGGCCTAATAGCTCCTAAAGAATTCCACAAGAATAGTGTTTAATATATTAACCATTATCCACTTGAAACAGACTACATTGCCTTAAAGGACGTGTCTTCCCACTGAGAGGTTGTTCATTTTTTGGAGGGTTTAATTGGCAAATAGATGAGTCCATATCTGAGCTAAACAAAATAAGGCACTGTTTTCTACATTACAGGCTCATTCATTAAGTCACTGACGGATCAGGGCCCAGCACACAAATTCGGAAATTAGC-------TACCGTAGTGTGGCAGTGCCACCATATT - -a -s mr.mrrefChr0 15295 126 + 130230 GATCTAACTAGAACTGTTTAACAGAATAGATAGTAAGCAAAAGTAGCTAAGGGTCTTGCAACTCAGATGAACATATTCTGGCAAGAACTATGGCAAGCAAGATACTATAGGAGTCAAGCAATTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16642 126 + 636262 GATCTAACTAGAACTGTTTAACAGAATAGATAGTAAGCAAAAGTAGCTAAGGGTCTTGCAACTCAGATGAACATATTCTGGCAAGAACTATGGCAAGCAAGATACTATAGGAGTCAAGCAATTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 238682 126 - 647215 GATCTAGCTAGAACTGTTTCAAAGACCAGATAGTGAGCAAAAGTAGCTAAGGGTCTTGCACCTCAGATGGACATATTCAGGCAGGAACTATGGTATTCAAGCTACTATAGGAGTCAAGCAATTACA - -a -s mr.mrrefChr0 15421 54 + 130230 ATCCCAGTTAGGAATTAGCCTAACTTATGGATGAAAATATGAAGGGGTGTAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16768 54 + 636262 ATCCCAGTTAGGAATTAGCCTAACTTATGGATGAAAATATGAAGGGGTGTAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 238812 54 - 647215 ATCCCAGTTAGGAATTAACCTAACTTGTGGATGAAAATATGAAGGGGTGTTAGG - -a -s mr.mrrefChr0 15475 3 + 130230 CTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 238876 3 - 647215 CTA - -a -s mr.mrrefChr0 15478 93 + 130230 GCCAGATGGGAGAAGGTAGAGATGAGAACCTCTCCTTTAGAGAAGTAATTAATGCACTACATGGAGGAACTTGTCACATCACCCAGAATGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16822 84 + 636262 ---------GAGAAGGTGGAGATGAGAGCCTCTCCTTTAGAGAAGTAATTAATGCACTACATGGAGGAACTTGTCACATCATCATGAGTGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 238880 92 - 647215 GCCAGATGGGAGAAGGTAGAGATGCGAACCTCTCC-TTAGATAAGTAATTACTGCACTACATGGAGGAACTTATCACATCACCCAAAACGGAA - -a -s mr.mrrefChr0 15571 90 + 130230 AATATCTTGAGTGAGAGTAGTGAATCAAGCAGGGTGAGGAACCTGCGTTGCTGAAACTACATTAGTACCTTGACCTAGGAGATTGGTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16910 90 + 636262 AATATCTTAAGTGAGAGTAGTGAATCAAGCAGGGTGAGGAGCCTGCGTTGCTGAAATTACATGAATACCTTGACCTAGGAGATTGGTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 238972 90 - 647215 AATATCTTGAGTGTGAGTAGTGAATTAAGCAGGGTGAGGAACCTGTGTTGCTGAAACTACACTAGCACCTTCACCTGTGGGATTGGTAAT - -a -s mr.mrrefChr0 15661 54 + 130230 CTAATTGATCAACTTAGACACATTTAGCAGAGTGTCCTATTCGTGGAAATGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17000 54 + 636262 CTAATTGATCAACTTAGACACATTTAGCAAAGTGTCCTATTCGTGGAAATGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 239064 54 - 647215 CTAATTGATCAACTTAAACACATTCAGCAGAGTGTCCTACTCATGGAAATAAGT - -a -s mr.mrrefChr0 15715 253 + 130230 GACTCAATTTGACCTACTCATGTAAATGGCTCGAAATAGCTTAAGGCTAGGATTTGTATTGTCCCAAGGCCTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGCATCAATCTACAACTGTGCCTGTGTTTAGATCACACTCTAGCACTAGAAGCAAAGTGCCATTTTCTAGAAATTTCTGGGATCAGAACTATTAAAAAGTGAAGATTTACATGCTAGCTACCACTAGGGGCCACCAGGACTGCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17055 253 + 636262 GGCTCAATTTGAGCTACTCATGTAAATGGCTCGAAATAGATTAAGGCCAAGATTTGTATTGTCCCAATAACTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGCATCAATCTACAACTGTGCCAGTGTTTAGATCACACTCTAGCACTAGAAGCAAAGTGCCATTTTCTTGAAATTTCTGGGACCAGAACTATTAAAAAGTGAAGATTTACATGGTAACTACCACTAGGGGCCACCAAGACTGCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 239118 253 - 647215 GACACAATTTGACCTACTCATGGAAATGGCTCGAAATAGCTTAAGGTTAGGATTTGTGTTGTCCCAAGGCCTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGAATCAGCCTACAGCTGTACCTGGGGTTAGATCACACTATAGCACTGGAAGCAAAGTGCCATTTTCTAGAAATTTTTGGGATCGGAACTATTAAAATGTGAAGATTTACAAGCTAGCTACCAGTGAGGACCACCAGGATTGCAGG - -a -s mr.mrrefChr0 15968 229 + 130230 CTCTTTCACCCTGGACTCATGCCCTAAATATTATAAATCTAAGCCATAAAATAACCTCTGAGGACAGCTTATAGCTGGATACCTGTTGTGGCATTATGTGGAGCAGGTGGAGGTTACAAGCATCCTCAATTCTCAGGCTCTGACACCATATCCCTCCCCCTACCCCTAGCTTAGACATTCTATTCAAACAGGCACTTGGTAAGCTTTGGTGAATCAACACAGATTGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17308 229 + 636262 CTCTTTCACCCTGGACGCATGCCCTAAATATTATAAATCAAAGCCATAAAATGACCCCTGAGGACAGCTTATAGCTGGACACCTGTTGTACCATTATGTGGAGCAGGTGGAGGTTACAAGCATATTCAATTCTCAGGCTCTGACACCATATCCCTCCCCCTACCCCTAGCTTAGACATTCTATTCAAACAGGCACTTGGTAAGCTCTGGTGAATCAACACAGATTGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 239379 228 - 647215 CTTTTTCACCTTGGACTTATGCCCTAAATA-TATAAATCTAAGCCATAAAATAATCTAAGAGTACAGCTTAGAGCTGGATACCTGTTGTGGCAACGTGTGGAGCAGGTGGAGGTTACAAGCATCCTCAATTCTCAGGCACTGATAACACATCCCTTCCCCTACCCCTAGCTTAGACATTCTACTCAAACAGGCACTTGGAAAGCTTTGGTAAATCAACACAGATTACTT - -a -s mr.mrrefChr0 16197 208 + 130230 AGATGACTAAGAGTTAAATGAAGGGGTTCCCACCTTGTTGTTGTATATGATAGTTGATATTGGGCTCTGATTCAGAACTCCTCATTCATAAGGTATGGGATCTTACTCACAGCAAGCACAACTTCTGGACTACTTATGAGGGTTGAGTACTGATGTGATAGAGAATCATGGTGAAAAGTAGCAAACCAGGCTTAACCTTAAATCCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17541 207 + 636262 AGATGACTTATGATTAACTGAAGGGGTTCTCACCCTGTTGTTGTATATGATAGTTGATATTGGGCTCTGATTGAGGACTCAACATTCATAAGGTATTGGATCATACTCACAGCAAGCATGACTTCTGGACTACTTATG-GGGTTGAGTACTGATGTGATAGAGAATCATGGTGAAAAGTAGCAAACCAGGCTTACCCTTAAATCCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 239607 206 - 647215 --ATGAATAGGAGTTAAATGAAGGGGTTTCCACCTTATTGTTGTATATGATAGTTGATATTGGGCTCTGATTCGGAACTGCTCATTCATACGGTATGGGATCTTACTCACAGCAAGCACAACCTCTGGGCTACTTATGAGGGTTGAGTACTGATGTGATAGAGAATCATGGTGAAAAGTTGCAAACCAGGCTTAACCTTAAATCCATA - -a -s mr.mrrefChr0 16405 111 + 130230 GAAAAGTTTGATGTGTACAAGTCACGCCCTTCACGCCATTAGTGAACTCATGGATAACAGCAATCACACAGCTGTCGGTCTTTCCATAGTAGAAAGCCAAGGAGGGTAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17754 111 + 636262 GAAAAGTCTGATGTGCACAAGCCACGCCCTTCACGCCATTATTGGATTCATGGATAACAGCAATTGCACAGCTGCCGGTCTTTCCATGGTAGCAAGCCAAGGAGGGTAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 239813 111 - 647215 GAAAAGTTTGATGTGTACAGGTCACACCCTTGACATCATTAGTGAACTCATGGATAACATCAATCACACAGCTGTCGGTCTTTCCATAGTAGAAAGCCAAGGAGGGTAACT - -a -s mr.mrrefChr0 16516 118 + 130230 CTATAAGCTGGGAGAGCCTGTTACCCCTAACAAGTAGAATTGTAATTCATTAAAATTAAGTATAATGAAGGGTAAAGTGTAATGAGGTGTATGCTGTTGCTATGTGCAATAGCGGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17868 117 + 636262 CTATAAGCTGGGAGAGCCTGTTACCCCTAA-AAGTGGAATTGTAAAATGTTAAGATTAAGTATAGCAAAGGGTAAAGTGTAATGAGGTGTGTGCTGTTGCTATGTGCAATATCAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 239924 118 - 647215 CTATAAGCTGGGATAGCCTGTTACCCCGAACAAGTAGAACTGTAATTCATTAAAATTAAGTATAATGAAGGGTAACATGTAATGAAGCGTATGCTGTTGCTATGTGCATTAGTGGAAA - -a -s mr.mrrefChr0 16634 46 + 130230 CATCAAGGGAGTTTCTGTCATGAATTAGTGAACCTGAACACAAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17986 46 + 636262 CATCGAGGGTATGTCTGTCATGAATTAGTGAACCTGAACACACGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 240042 46 - 647215 CATCAAGGGAGTTTCTGTCATGAATTAGTGAACCTGAACACAAGCC - -a -s mr.mrrefChr0 16680 82 + 130230 TTAAGTTTAATACTATGATTATGGTATGCTGACTCAATTGCAATTGGGGTAAGATTAAGGCCAGGTCAGGGTAAATTACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18033 82 + 636262 TTAAGTTTAATACTGTGATTATGGTATGCTGACTCAATTCCAATTGGGGTAAAATAAAGCCCAGATCAGGGTGAATTACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 240088 82 - 647215 TTAAATAGAATACCATGATGATTGTATGCTGACTCAATTGCAATTGGGGTATGATTAAGGCCAGGTCAGGGTAAATTGCAAC - -a -s mr.mrrefChr0 16762 95 + 130230 ACTAAACACACACTATTTCCATGTGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGTCACCCTGTTGTCCGTAGTGCATGAATTGATACAGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18115 95 + 636262 ACTAAACACACAGCATTTCCATGCGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGTCATCCTGTTGTCCGTAGTGCATGAATTGATACAGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 240174 71 - 647215 ACTAACCACACACTATTTCTATGTGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGCCACCCTGTTGTCA------------------------ - -a -s mr.mrrefChr0 16857 165 + 130230 TTTGAGTAACCGAACCCCTATAATAGCAGTTATACAGCACAATATTGAATGTGCTGAATATGCTCTTTTACCCTAATGACATGAACCTCTGTTCATTCTTGAATTTGGTGGGACTATTAATCTTGATGTTGTGTGTTTATGTCATCCCATGGTAAATGACAAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18211 164 + 636262 TTTGAATAACCGAACCCCTATAATAGCAGTTATACAGCACAATATTGAATGTGGTTAATATGCTCTTTTACCCTAATGACTTGAACCTCTGTTCATTCTTGAA-TTGGTGGAACTATTAATCTAGATGTTGTGTGTTTATGTCATCCCAAGGTAAATGACAATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 240245 165 - 647215 TTTGAGTAACCGAACCCCTGTAATAGCAGTTACACTGCACAATATTCAAGATGCTGAATATTGTCTTTTTCCCTAACGCCATGAACCTCTGTTTATTCTTGAATTTGGTGGGACTATAAATCTTGATGTTGTGTGTTTATGTCATCCCGTGGTAAATGACAAGAC - -a -s mr.mrrefChr0 17022 195 + 130230 CCAAGGAGGTAGAAGCCAATACCTCTCCCCAGACGACCCCTAGTCTTTAGATCCATTCAGTGTTTAAAATCTAATAACATTGTGTCTGCAGGATCCATATATGCCTCTAATGCACCTGCTATAGAACTGTACAATGTGGTGTGATGATAAGTTGAATCTGGAGTCTTGCTAATGGAGAGCCAGATAGCTCAGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18375 193 + 636262 CAAAGGAG--AGAGGCCAATACCTGTCCCAAGACAACCCTTAGCCTTTAGATCCATTCAGTGTTTAAAATCTAATAACATTGTGTCTGCAGAATCCATATATGCCTCTAATGTCCCTGCTATAGAACTGTACAATGTGTTGTGATGATAGGTTGAAACTGGGGTCTTGCTGATGGAGAGCCATATAGCCCAGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 240415 194 - 647215 CCAAGGAGGTAGAAGCCAAAACCTCTCCCCAGGCGACACCAAGTCTTTGGATTCATTCAGTGTTTAAAATCTTATAACATTGGGTCTGCAAGATCCATACA-GCCTCTAATGCACATGCTTTAGAACTGTACCATGTGGTGTGATGATAAGTTGAATCTGGAGTCTTGCTAATGGAGAGCCGGATAGCTCAGTAG - -a -s mr.mrrefChr0 17217 100 + 130230 CATTTGTCCAAAGGCAAGATCATTGTTGGTTTTTCCCTAACTGTTGCATAACAGTAATCAAATGTCTTTGAAACCAATATAATTTTTGATAACCTTAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18568 100 + 636262 CAATTGTCCAAAGGCAAGATCATTGTTGGTTTTTCCCTAACTGTTGCCTAACGGTAATCAAATGTCTTTGAAACCAGTGTAACCTTCGATAACCTTGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 240614 100 - 647215 GATTTGTCCAAAGGCAAGATCATTTTTGGTTTTTCCCTAACTGTTGCATAACAACAATCAAATGTCTTTGAGATGAATATAATTTTTGATAACCTTAACT - -a -s mr.mrrefChr0 17317 33 + 130230 GATGCTCTAATGCTCTGGATTGCCTGATAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18668 33 + 636262 GATGCTCTAATGCTCTGGGTTGCCTGATAGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 240716 33 - 647215 GATGCTCTAATGCTCTGGATTGCCTGATAGCAA - -a -s mr.mrrefChr0 17350 139 + 130230 TAACAAGGTAGTTGGTGCTACATCTTTAAGCAATAGCTCACACAAGCAAACAAGATAATGCACAGCCACGTATTTGCACTGACCAGCATCAACTATGTGATGGACCCGCCATAATGGGGCAGCATTATTCAGTCCAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18702 138 + 636262 TAACAAGCTAGTTGGTGCTACATCTTTAAACAATAGCTCACACAAGCAAACTAGACAATGCACAGCCACATATTTGCACTGATCAGGATCAACTATGTGATGGACCCGCCATCATGGAGCAGCATTATTCAGTCCAGG- -s simRat_chr6.simRat.chr6 240749 139 - 647215 TAGCGAGGCAGTTGGTGCTACATCTTACAGCAATACCTCACACAAACAAACAAGATAATGCACAGTCCTGTATTTGGACAGACCAGCATCAGCTATGTGATGGACCCGTCACAATGGGGCAGTGTTATTCAGACCAGGT - -a -s mr.mrrefChr0 17489 18 + 130230 TAACATTGATGAGGCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18840 18 + 636262 TAACATTGATGAGGCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 11458 10 + 647215 TAATATTGAC-------- - -a -s mr.mrrefChr0 17507 189 + 130230 CTCCCAAACCCAGCGGCAGCGCATGTTGACAGCCCAACTATAGTTCTATTATACTTATTTATAGTTGTATACATATCAAGTATATTCATTATCCCAAACTACAATTCCCCTACTTTTGTTGTAAAAGTTGATTTTCTTCCCCCTGATGGGAGGATCTTTTGGCTCTTTTTTAGCTGCTGTGTACCAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18861 189 + 636262 CTCCCAAACCCAGCGGCAGCGCATGTTGACAGCCCAACTATAGTTCTATTATACTTATTTATAGTTGTATACATATCAAGTATATTCATTATCCCAAACTACAATTCCCCTACTTTTGTTGTAAAAGTTGATTTTCTTCCCCCTGATGGGAGGATCTTTTGGCTCTTTTTTAGCTGCTGTGTACCAACT - -a -s mr.mrrefChr0 17696 162 + 130230 ATGTAATTGAGTATACATTCCGAACTGCCTAATGTGCCTGCAATCTATCAGTAGTGAAGCCTTGCCCATGCCTGAGGTAGCTCACAGGTCAGAGGAATATGCCCAGCACTTTAGGACATTATAGGATTCCCCAGCAAATCAACAATCATCCACTGGTGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19051 162 + 636262 ATGTAATTGAGTATACATTCCGAACTGCCTAATGTGCCTGCAATCTATCAGTAGTGAAGCCTTGCCCATGCCTGAGGTAGCTCACAGGTCAGAGGAATATGCCCAGCACTTTAGGACATTATAGGATTCCCCAGCAAATCAACAATCATCCACTGGTGGACT - -a -s mr.mrrefChr0 17858 21 + 130230 CTACAGAGAGAATTATGTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19352 21 + 636262 CTACAGAGAGAATTATGTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 11468 11 + 647215 ----------ACATATGTTCA - -a -s mr.mrrefChr0 17879 13 + 130230 GTACTTAGTGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19373 13 + 636262 GTACTTAGTGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 11482 13 + 647215 GTACCAGCTGCAC - -a -s mr.mrrefChr0 17892 9 + 130230 TGCCACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19391 9 + 636262 TGCCATTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 11495 9 + 647215 TGCCACCTT - -a -s mr.mrrefChr0 17901 178 + 130230 ACTTAGGCTTGATGAGGAAGTCCTTTAATTCCTGGTGTGTCCCTCTTTCACTACCTCAGCTCTTCTGTCGTCTGCCAGACAGACTTTTTATGCTGAGTATAATGACTCATCAAGCCTGGCAATACTCACTGTTTTTTTGACTTGTTTTCAATGTAAGTTTCAGGTGCTCTGTTAGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19400 178 + 636262 ATATAGACTTGAGGAGGAAGTCCTTTGATCCCTGGTGTGTCCCTCTTTCACTACCTCAGCTCTTCTGTCATCTGCCAGACAGACTTTTTATGCTGAGTATAATGACTCGTCAAGCCTGGCAATACTCACTGTTTTTTTGACTTGTTTTCAATGTAAGTTTCAGGTGCTCCATTAGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 11511 178 + 647215 ACTCAGGGCTAATGAGGAAGTCCTTTAATTCACCGTCTATCTCTCTTTCACTACCTCAGCTCTTCTGCCGTCTGCCACAGAGACTTTTTATGCTGAGTATAATGACACATCAAGCCTGGCAATACTCACTGTTTTTTTGACCTGTTTTCAATGTAAGTTTCAGGTCCTCTGTTAGAAG - -a -s mr.mrrefChr0 18079 91 + 130230 GACACTGTAATCCCTCTTAGGTAAGCCATGCTAGTGTAATTAATCAAGCTACGAGGCATAGACCCTATAGAATTGCTGCTTCATTACCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19581 91 + 636262 GACACTGTAATCCCTTTTAGGTAAGCTATGCTAGTGTAATTAATCAAGCTACGAGGCATAGACCCTATGGAATTGCTGCTTCATTACCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 11689 91 + 647215 GACACTGTGGTCCCTCTTTGGTAAGTCATGTTCGTATGATTAATCAAGCTACGAGGCCTAGACCCTACAGAATTGCTGCTTCATTACCATC - -a -s mr.mrrefChr0 18170 136 + 130230 TATTATGATTTATGCTAGGTGAAGAGTTGTAATGTTAACTTAGTTCTGAGCCTTAAGATAAAGACTTGCTCCACTATAGTACATGATAGAGTGACATAACTCAATTGGGGGCGGTAAGGACTTAGTCATCCATATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19678 128 + 636262 TATTATGATTTATGCTAGGTGAAGAGT------GTTGACTTAGTT--GAGCCTTAAGATAAAGACTTGCTCCACTATAGTACATGATAGAGTGACATAACTCAATTGGGGGCAGTAAGGACTCGGTCATCCATATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 11780 135 + 647215 TATTATGATT-ATGCTAGTTGAGGAGTTGTAATGGTAACTTAGTTCTGAACCTTAAGAGAAAGACTTGCTCCACTATAGTACATGGTAAAGTGACATAACTCAATTGGGGGCGGTAAGGACTTAGTCATCCATATC - -a -s mr.mrrefChr0 18306 15 + 130230 CTTAGAGATAACCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19830 15 + 636262 CTTAGAAATAACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 11915 15 + 647215 CTTAGAGATAACCCC - -a -s mr.mrrefChr0 18321 146 + 130230 TCTCCCCCACCAGGATGTGGCATAGACTGGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGTGTGACAGTAGGCCAACAAGAGCATATAATGCACCAAGCAGCTTGGATGTTTGGCCATTGGCACATCAGCAACTGGTGGCTCACCCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19845 146 + 636262 TCTCCCCCACCGGGATGTGACATAGACTGGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGTGTGAATGCAGGCCGACAAGAGCATATAATGCACCAAGCAGCTTGGTTGTTTGGCCATTGACATATCAGCAACTAGTGGCTCATCCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 11931 146 + 647215 TCTCCCCCACCAGGATTTGGCATAGAGTAGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGCATAACAGTAGGCCAGCAAGAGCTTATAATGCACCAAGCAGCTTGCATGTTTGGCCATGAGCACATCAGTAACTGGTGGCTCACCCAAT - -a -s mr.mrrefChr0 18467 167 + 130230 GGTATTGACAGGTTCAGTAAACACTTGTAGGAACCAAGGTGAATGATTTTCCTTTATGAACCCAATATAGTAACTTTAATTCTTTGTTTAAGACCTAGTAACTATAGCCAATTGTTAAGGACCCACTTTGCAATCAGGATGGATGTTAAATGACTTATGTAATGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19991 153 + 636262 GGTATTAACAGGTTCAGTAAACACCTGTAGGAACCAAG--------------TCTATGCACCCAATATAGTAACTTTAATTCTTTGTTTAAGACCTAGTAACTATAGCCAATTGTTAAAGACCCACTTTGCAATCAGGGTGGATGTTAAGTGACTTATGTAATGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 12082 167 + 647215 GGTACTGAAAGGTTCGGTAAACACTTGTAGGAACCAAGGTGAATGATTTTCCTTTATGAACCCAATATAGCAACTATAGTGCTTTGTTTAAGACCCAGTAACTATAGCCAATTGTTAAGGACCCAATTTGCGATCAGGATAGATGTTAAATGACTGATGTAATAGAG - -a -s mr.mrrefChr0 18634 190 + 130230 ACTGATGTAATGGAGCACATAATTATGCACTTTTGAAACCAAGGTTGTGAACATAATTGTGAGCTTATGAAGTCAAGCTAGCAAGACATAGGACTGGCTTGATGTTTTAAAGTTTAGTAAATGTAAATTGGTTGCTCTTTTTGTGGTTCCATCTATCATGTGATGTCTCAGCTTGGAATTAAGGCATGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20284 185 + 636262 ACTGATGTAATTGAGCACATAATTTTGCACTTTTGAAACCATGGTTGTGAACATAATTGTGAGCTTATGAAGTCAAGCTAGCAAGACATAGGACTGGCTTGATGTTTTAAAGTTTAGTAAATGTAAATTG-----TTTTTTTGTGATTCTATGTATCATGTGATGTCTCAGCTTGGAATTAAGGCATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 12249 190 + 647215 ACAGATGTAATGGAGCACATAATTATGCACTTTTGAAACCAAGGTTGCTAACATAATCGTGATCATATAGAGTCAAGCTAACAAGACATAGGACTGGCTTGATGTTTTAACATTTAGTAAATGTAAATTGGTTGCTCTTTTTCTGGTTCCATCTACCATGTGATCTCTCAGCCTGGAGTTAAGGCATGGT - -a -s mr.mrrefChr0 18824 196 + 130230 AAACTAAATGAAGTTACACCATGACCATCCTACTGAGTGCCTAAACTGGCTAACACTGGTTTAGCCTACATGGCTACACAAATGTGGGCACCCTTCAGATGTCAAGAGCTTACTATAACTGCCAACCAGTGGGCCAGGATCTGCAGTGCAGCCCTCTCCATCCACCCACTGAATGGAATGAATGTTGATGTCACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20470 196 + 636262 AACCTAAATGAAGTTACACCACGACCATCCTACTGAGTGCCTAGACTGGCTAACTCCGGTTTAGCCTACCTGGCTACACAAATGTGGGCACCCTTTAGATGTCAAGAGCTTACTATAACTGCCAGCCAGCGGGCCAGAATCCACAGTGCAGCCCTCCCCATCCACCCACTAAATGGAATAAATGTTGATGTCACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 12439 195 + 647215 AAACTAAATAAAGTTACACCATGACCATCCTACTGAGTGCCTAAACTGGCTAACACTGGTTTAGC-TACATGGATACACAAATGTGGGCAACCTTCAGATGTCTACAGCTTCCTATAACTGCAAACCAGTGGGCCAGGATCTGCAGTGCAGCCCTCTCCATCCACTCACTGAATGGTATGAAAGTTGATGCCACCA - -a -s mr.mrrefChr0 19020 32 + 130230 TCACCCCTACTATTGGTACACATGTAGATGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20666 32 + 636262 TCACCCCTACTATTGGTACACATGTAGATGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 12638 32 + 647215 TCACCCCTACTATTGATACACACTCTGACAAA - -a -s mr.mrrefChr0 19052 23 + 130230 TTTTATGAGTATGTGCAATCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20703 23 + 636262 TTTTATGAGTATGTGCAATCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 12670 23 + 647215 TTTTGATAGGATATGCAATCCTG - -a -s mr.mrrefChr0 19075 70 + 130230 CCTGCATGTGGGCACACATTGACAAAATATTGTCAATCACCCCTCTTGTCAAACATCAGGCACTGGCCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20772 70 + 636262 CCTGCATGTGGGCACACATTGACAAAATATTGTCAATCACCCCTCTTGTCAAACATCAGGCACTGGCCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 12693 70 + 647215 CCTTCCTGGGCATCCGCATTGACAGTATATTGTCAATAACTCCTCTTTTCAAACATGAGGCGCAGGCTAG - -a -s mr.mrrefChr0 19145 7 + 130230 GATCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20842 7 + 636262 GATCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 12767 7 + 647215 GATCTTA - -a -s mr.mrrefChr0 19152 43 + 130230 AGCATTCTCTCTAGTCAGCAGTATAATTAGATTAGACTGACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20849 43 + 636262 AGCATTCTCTCTAGTCAGCAGTCTAATTAGATTAGACTAACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 12778 43 + 647215 AGCACTCCCTCTAGTCAGCAATATAATTAGATAGGACTGACAC - -a -s mr.mrrefChr0 19195 72 + 130230 ATTTGTAATCTTGTGCTTTATAACAAAGGTGTGTGACGTACATATAAATTGTGTAATGAGCTGCAGTGTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20893 72 + 636262 ATTTGTAATCTTGTGCTTTATAACAAAGGTGTGTGACATACATATAAATTGTGTAATGAGCTGCAGTATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 12821 72 + 647215 ATTTGTAATCTTGTGCCTAATAGCAAAGGTGTGTGACGTACATCTAGATTGTGTAATGACCTGTAGTGTCAA - -a -s mr.mrrefChr0 19267 190 + 130230 CCAATTGGGACCTTATAATGCTTCAGTTTAGAATCATCTTATAAACCATGTGAAATCAATAATGTCAGACACATTGGTCTATATATCTTAAAGTTATGTGCATGTGACCCCTCAAGTGTCTGCATTGCTGGATTAATATATATGTTAATCTTAGAATTTACACCTAAGAGGATCAGTGTACATCCCTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20967 189 + 636262 CCAATTGGGACCTCGTAACGCTTCAGTCTAGAATCAACTTATAAACTATGTGAAATCAATAATGTCAGACACATTGGTCTGTATATCTTAAAGTTATGTGTATGTGACCCCTAAAGTGTCTACATTGCTGCATTAACATATATGTTAATCTTAGAATCTACACATAAGAGGATCAGTGTACATCCC-TTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 12893 190 + 647215 CCAATTGGGATCTTATAATGCTTCAGTTTAGAAACATCTTATAAACCATGTGAAATCAATAATGTCAGACATATTGGTCTATATATCGTAAAGTTATGTGCATGTGACCCCTCGAGTGTCTGCATTGCTAGATTAATATATATGTTAATCTTAGAACTTACTCCTAAAAGGATCAGTGTACATCCCTTTC - -a -s mr.mrrefChr0 19457 324 + 130230 AATGTCCCATGTATCTGCACTAGTCATTTATACGTAGTTCAATAGTTCCTATATCTTAGTATTTACTTGATATCGCAGATTTTGAGCATGAGGCTCACATCCAGTGGCTGTCCATCAACAAACCTATCCATAGGTCATGAGAATACATGTCTTTGCTTCCCTTGTCTTGAGAATGATCTCTGAATACCACATGTAAAAGGATATGGTTACAGCTAGTCCTTTTTTACCGAGCTTGTTTTCTGCAGTTTATCCAACACACTTCCAGTTATGCAAATACTTGCATTTCTTCACTATGTAGATGTGGAAGCCTTCTGAGGGCCAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21156 324 + 636262 AATGTCCCATGTATCTGCACTAGTCATTTATACAAAGTTCAATAGTTTCTATATCTTAGTATTTACTTGATATTGCAGGTTTTGAGCATGAGGCTCACATCCAGTGGCTGTCCATCAACCAACCCATCCATAGGTCATGAAAATACAGGTCTTTGCTTCCCTTGTCATGAGAATAATCTCTGAATACCACAGGTAAAAGGATATGGTTACAGCTAGGTCTTTTTTACCGAAATTGTTTTCTGCAGTTTATCCAACACACCTCCAGTTATGCAAATACTTGCATTTCTTCACTATGTAGACGTGGAAGCCTTCTGAGAGCCAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 13088 323 + 647215 AATGTCCCATGTATCTGTACTAGTCTTTTAGACGTAGTTCAATAGTTCTTATATCTTAGTATTTACTTGATACCGCAGATTTTGAGCATGAGGATCACATGCAGTGGCTGTCCATCAACAAATCTATCCATAGGTCATG-GAATACATGTCTTTGCTTCCCTTGTCTTTAAGATGATCTCTGAATACCACATGTAAAAGGATATGGTTACAGCTAGTCATTTTTTACCGAGCTTGATTTCTGTACTTTATCCAACACACTCCCAGCTATGCAAATACTTGCATTTCTTCATTATGTAGGTGTGGAAGCCTTCTGAGGACCAAGC - -a -s mr.mrrefChr0 19781 68 + 130230 TGTGCTGGCAAAATAGATGCAGGAAAATGAAACAAAGTTGTCTGAGGCATAACTTGATCATGCCATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21481 66 + 636262 TGTGCTAGCAAAATGGATGCAGGAAAAT--AACAAAGTTGTCTGAGGCATAACTTCATCATGCCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 13411 67 + 647215 TGTGATGGCAAAG-AGATGCTGGAAAATGAAAGAAAGTTGTCTGAGGAACAACTTGATCATGCCATAT - -a -s mr.mrrefChr0 19849 285 + 130230 CATACATGGGTAGAAAAGTAGACTTATATGAATGTTCTTGTTTTAGTGGTATGACCTATTGGTTTTCTTAGACATTTCAGCCACTTAATATGGTGGGTCCTACAAAGTGCTTCTCCCCAGTATGCCTTCCTTAAGGGCTAAAGCATAGAGTGCTGGTGCTGATACAGAGCATGTATTGTATGTGAATAATGTGTATTTAATCCTCTTTCTCCACAAGTGTCTGTTATTACCTGGGATCTTCCCTTGTCATGTTTAACAAAAATGGTAAATTGCTACTAAGATGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21549 277 + 636262 CATACATGGGTAGAAAA-------TATATGAAGGTTCTTGTTTTAGTGGTATGACCTATTGGTTTTCTTAGGCATTTCAGCCATTTAATATGGTGGGTTCTAAAAAGTGC-TCTCCCCAGTATGCCTTCCTTAAGGGCTAAGGTATAGAGTACTGGTGCTGATACAGATCATGTATTGTATGTGAATAATGTGTATCTAATCCTCTTTCTCCACAAGTGTCTGTTATTACCTGAGAACTTCCCTTGTCATGTTTAACAAAAATGGTAAATTGCTACTAAAATGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 13478 284 + 647215 GATGCAGGGGTAGAATAGTAGACTTATATGAATGTCCTTGTTTTAGGGGTATGACCTATTGGTTTTCTTAGACATTTGAGCCACTTAATAGGGTGGGTCGTACACAGTGCTTCTCCCAAGAATGTCTCCCTTAAGGGCTAAATCATAGAGTGCT-GTGCTGATATAGAGCACGTATTGTATGTGAATAATGTGTATTTAATCCTCTTGCTCCACAAGTGTCTGTTGTTCCCTGGGATCTTCCCTTGTCATGTTTAACCGAGATGGTAAATTGCTACTAAGGTGTG - -a -s mr.mrrefChr0 20134 16 + 130230 GTATGCAATACACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21840 16 + 636262 GTATGCAATACACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 13762 16 + 647215 GTATACTGTACACATA - -a -s mr.mrrefChr0 20150 61 + 130230 TGCAATATACATGTGTAATGAGATATAATCACTAACTAGAACCCATTACATGCAGACACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21862 59 + 636262 TGCAATATACATGTGTAATGAGATATAA--ACTAACTAGAACCCATTACATACAGACACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 13778 61 + 647215 AGCAATAAACAAGCGCAATGAGATATAATCCCTAACAAGACACCATTACATGCAGACACTA - -a -s mr.mrrefChr0 20211 5 + 130230 ACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21922 5 + 636262 ACATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 13839 5 + 647215 ATATT - -a -s mr.mrrefChr0 20216 38 + 130230 GAGCTTTATATTCTAATAAGGAGTTCTTGGCTGGCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21930 38 + 636262 GGGATTTATATTCTAATAAGGGGTTCTTGGCTGGCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 13844 38 + 647215 GAGCTTTGTATTCTAATGGGGACTTCTTGGCTGGCATG - -a -s mr.mrrefChr0 20254 75 + 130230 ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTTTATTATTATGATTACTATAGGTCTGACACTGCTATAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21968 75 + 636262 ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTTTATTATTATGATTGCTATAGGTCTGACACTGCTATAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 13892 75 + 647215 ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTCCTTTATTACACTTAACGTAGGCCTGACATTGCTGTAGGT - -a -s mr.mrrefChr0 20329 238 + 130230 TGTAGACTGTATTAGCTTCAATGGGAAACCCTCTCATTACTACAACTGCTGGCATCCTAAAAAAATGAGCCCCTCTAACATAATACAGGCTACCTCCCTGCTGAATGCTGGGCATTTTTAACTTTAGAATAGACCATGTAGTCAGCTACAGAGAGATAATGCATGTTGTAGCCTGGATCAGCTACAGTGGGACAATGAACTATATAGCCTGGCAAAGGCAAAATGCCACAGACTTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22044 231 + 636262 TGTAAACTGTATTAGCTTCAAAGAGA------CTCATTACTACAACTGCTGGCATCCTAAAAAAATGAGCCCCTCTAACATAATACAGGATACCTCCGTGCTGAATGCTGGGCATCTTTAACTTTAGAAAAGACCATGTATTCAGCTACAGAGAGATAATGCATGTTGTAGCCTGGATCAGCTACAGTGGGACAATGAACTATATAGCCTGGCAAAGGTAAAA-ACCACAGACTTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 13967 238 + 647215 TGTAGCCTTTATTAGTTTCAATGGCAAACCCTCTCATTACTGCAACTGCTGGCATCCTAAAAAAATAAGCCCCTCTAACATAATACAGGCTACCTGACTGCTGAACACTGGGCACTTCTAATTTTGGAATAGACCATGTAGTCAGCTTCAGAAAGATAATGCATGGTGTAGCCCGGATCAGCTACAGAGGGACAATGCACTATATAGTCTGGCAGAGGCAAAATGGCACAGACTTTTT - -a -s mr.mrrefChr0 20567 77 + 130230 TTTTGCCCACATATTTTATCATGTACATCTCTTGTGATGCACTCGCCTCAACCTTGTAAAGCCTTTTATCATAGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22275 77 + 636262 TTTTGCTCACATATTTTATCATGTAAATCTCTTGTGATGCACTCGCCTCAACCTTGTAAAGCCTTCCACCACAGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 14208 77 + 647215 TTTTGCCCACATATTTTATCATGTACATCCCTCATGATGCACTAGTCTCTTCCCTTTGAATCCTTTTATCATAGGTG - -a -s mr.mrrefChr0 20644 54 + 130230 GTGTGTATTTATCAGTATGTGAGGGCATAAAGGTGCCAGTTAGAATGATTGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22353 54 + 636262 GTGTGAATTTATCAGTGTGTGAGGACATAGAGGTGCTGGTTCGAATGATTGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 14285 54 + 647215 TTGTGTATTTACCATTATGTCAGGGCATAAAAGTGACAGTTAGAATCATTGAAA - -a -s mr.mrrefChr0 20698 13 + 130230 TTTGAACCATTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22407 13 + 636262 TTTGAACCATTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 14340 13 + 647215 TTGGAATCATTGG - -a -s mr.mrrefChr0 20711 29 + 130230 CGCTTCCTTGCTCATTTAAACACTGGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22434 29 + 636262 CGCTTCCTTGCTCATTTAAACACTGGCAT - -a -s mr.mrrefChr0 20740 11 + 130230 CACATCAGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22467 11 + 636262 CACATCAGGAT - -a -s mr.mrrefChr0 20751 40 + 130230 TAAGTGCCTAATATTGGGTGCAAATATTGTTACATGTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22479 31 + 636262 TAAGTGCCTGATATTGGGTGCAA----TGTTGGAT----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 14353 35 + 647215 -----GCGCATTGTCGGGTGCAAATATTGTTACATGTAGA - -a -s mr.mrrefChr0 20791 13 + 130230 CATGAACTTGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 14390 13 + 647215 CATGAACTTGTTG - -a -s mr.mrrefChr0 20804 32 + 130230 AATCTCAGATTACTTGCACAGCTATGATTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 14411 32 + 647215 AATCTCAGATTACTTGCACAGCTATGATTACT - -a -s mr.mrrefChr0 20836 19 + 130230 GGATGGAGCACAGGATAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 14449 19 + 647215 GGATGGAGCACAGGATAAC - -a -s mr.mrrefChr0 20855 54 + 130230 TCATGTAGCACCTTCAGGCCAGATCAAGTGTTTGGATGAAAATTCCTCTCAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 14469 54 + 647215 TCATGTAGCACCTTCAGGCCAGATCAAGTGTTTGGATGAAAATTCCTCTCAAAT - -a -s mr.mrrefChr0 20909 132 + 130230 TGGCAAAGTGACAGTAAGACATGACCAGTACTTTGCTGCTCTTATATTTTGTGCATCCATAGGAGCAGGTGTTCAGCATGACATCATAGGGAGGAGCAGGTAAGCTGTTGTATAACAGGTTTGTGCCAAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22510 97 + 636262 -----------------------------------CTGCTCTTATATTTTGTGCATCCATAGGAGCAGGTGATCAGCATGACATCATAGGGAGGAGCAGGTAAGCTGTTGTATAACAGGTTTGTTCCAAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 14525 132 + 647215 TGGCAAAGTGACAGTAAGACATGACCAGTACTTTGCTGCTCTTATATTTTGTGCACCTATAAGAGCAGGTGTTCAGCAGTACACCATAGGGAGGAGCAGGTACACTGTTGTATAACAGGTTTGTGCAAAAAC - -a -s mr.mrrefChr0 21041 104 + 130230 ACAGTGATTTAAAAGGGTACAGATACCTTTGATCTGGGGAAAGCACCTGGATATCATATCATGAGGAGCGAACAGCATGAGATTCAATTTATTGCATTGAATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22607 103 + 636262 ACAGTGATTTAAAAGGGCACAGATACCTTTGATCT-TGGAAAGCACCTAGATATCACATCATGAGGAGCGAACAGCATGAGATTTAATTTAGTGTATTGAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 14662 103 + 647215 ACAGTGATTTAAAAGGGTACAGATACCTTTGATATGGGGAAAGCACCTGCATCTTATATC-TGAGGAGCGAACAGCATGAGATTCGGTTTATTGCATTGAAGTT - -a -s mr.mrrefChr0 21145 37 + 130230 GAAGACAGATATTGTAATGCATTTGGGGGGTTTCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22710 17 + 636262 GAAGACGGTTACTGTAA-------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 14834 37 + 647215 GAAGACAGATATTGTAATGCATTTGGGGGGTTTCTAT - -a -s mr.mrrefChr0 21182 56 + 130230 GTATGGCAGATCAATTACACAAATCTGTTGTGATGATCCTACAAAGTAATTGAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22727 41 + 636262 ---------------CACACAAATCTGTTGTGATGATCCTACTGAGTAATTGAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 14872 56 + 647215 GTATGGCAGATCAATTGCACTAATCTCTTGTGCTGATCCTACAAAGTAATTGAGGT - -a -s mr.mrrefChr0 21238 25 + 130230 GACCCCCATCAATTAGCAAGTAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22768 25 + 636262 GACCCCCATCAATTAGCAAGTAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 14967 25 + 647215 AACCCCCATTGATGAGCACGTAAGT - -a -s mr.mrrefChr0 21263 641 + 130230 CTTACCAGAAGCAGACCAGTTGTATTAGTGTAGAATATATGTAGGTGCTACTTGTCACTGACAACCACTTTTACCATTAAGAGCAGCTAAAATCTTCCTGTTTTACATCTAGCTATGAATGTTCTCTCTTGGCATCGATAACCATTTGCAGTACTAGACACACAAAGGGCATCGCTTAGCATGTGCCAACCTTCAACTTCAATTTCTTACTCTTTGACAAGTATATAACTTAATATACCTTACACTTCCAACCCTGTAACAGATAGCTGATTTATTTCCCTGCCAGGTTTCCTTTCCATAATGTCTAGTCCCTGCAGTGTTTCGTTTGCTGGGTAGCTAACTTAGCCTGCTATGATGCTGCCAATTTACAGTCTCCCAAACCTAACACATTGCCCCCTAGACTTTGCCCATACCCTCGTATAGAGACAGTCCAAGTGGTTTCGGTTTCTTTAATTTAGTAATCTCTACACTCTAGAGGTGTGCTATACTAACAGGATGAAGGGGTCTCACATACCAGGGGTTGCCCTTTGAGGTGATAAAACACTATGACTTTATATTTCATGGCAAAATTTGAGACAAAGCTGGTTGTCCCTATGGGCAGTAACTGACTTTGTTTGATCTGTATTGTATGTGATCTGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22804 633 + 636262 CTTACCAGAAGCAGACCAGTTGTATTAGTGTAGAATATATGTAGGTGCTACTTGTCACTGACAACCACTTTTACCATTAAGAGCAGCTTAAATCTTCCAGTTTTACATCTAGCTATGAATGTTCTCTCTTGGCATCGATAACCATTTGCAGTACTAGACACACAAAGGGCATCGCTTAGCATGTGCCAACCTTCAACTTCAATTTCTTACTCTTTGACGAGTATATAACTTAATATACCTTACACTTCCAACCCTGTAACAGATAGCCGATTTGCTTCCCTGCCAGGTTTCCCTTCCATAATGTCTAGTCCCTGCAGTATTGCATTTGTTGGGTAGCTAACTTAGCCCGCTATGCTGCTGCCAATTAACAG-----CAAACCTACCACATTGCCCCCTGGACTTTGCTCATGCCCTCGCATAGAGACAGTCCAAGTGGTTTCGGTTTCTTGAATTTACTAATCTCTACACTCT---TGTGCACTATACTAACAGGATGAAGGGGTCTCACATACCAGGGGTTCCCCTTTGAGGTGATGAAACACTATGACTTTATATTTCATGGCAAAATTTGAGACAGAGCTGGTTGTCCCTATGGGCAGTAACTGACTTTGTTCAATCTGTATTGTATGTGATCTGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 14992 615 + 647215 CTTACCGGAAGCAGACCAGCTGTGTTAGTGAAGAATATATGTAGGTGCTACTTGTC-------ACCACTTGTA--ACTGACAGCAGCTAAAATCTTCCTGATTTACATCTAGCTATGAACGTTCGCCCTTGGCATCACCAACCATTTGTAGTACTGGAGATAGGTAAGGCACTGCTTAGCATGAGCCAACCTTCAACCT-GATTTCTTACTCTTCGACAAGTATATAGCTTAATATA-----------CAACCCTGTAACAGATAGCTGATTCATTTCCCTGTCAGATCTCCTTTCTGTAATGTCTAATCCCTGCAATGTTTCGTTTGCTGGGTAGCAAACTTAGCCTGCTATGATGCTGCCAATTTACAGTCTCCCAAACCTAACACATTGCTCCCTAGACTTTGCCCACACACTAGTAAAAAGACAGCCCAATTCGTTTCAGTTTCTTTAATTCAGTAGTCTCTACACTCTAGAGGTGTGCTAAACTAACAAGAAGAAGGGGTTTCACACACCAGGGGTTGCCCTTTGAGGTGATAAAACACTATGACTTTATATTTCATGGCAGAATTTGAGACAAAGCTGGTTGTCCCTATGGGCAGTAACTGACTTTGTCTGATCTGTATT-----TGATCTGTCT - -a -s mr.mrrefChr0 21904 53 + 130230 CAATAGTACTTTTTATGATTGTATGTGTTAATGATCATTCAGGAATCCGCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 23437 53 + 636262 CAATAGCACTTTTTATGAGTGTATGTGTTAATGATCATTCCAGAATCCGCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 15608 53 + 647215 CAGTAATGCTTTTTATGATTGTATGTGTTAATGATCATTTAGGAATCAGCTGA - -a -s mr.mrrefChr0 21957 42 + 130230 AAGACAAATTATCTGAGAGGTGGCGAACTAAAGCATAGACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 23490 37 + 636262 AAAA-----TACCTGAGAGGTGGCGAACTAAAGCATAGACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 15664 42 + 647215 TGGACAAATCATCTGAGAAGTGGCAAACTAATGCTTAGACAA - -a -s mr.mrrefChr0 21999 319 + 130230 AATACCTGAAGAGTGGTGAGTAGTTGAGTGTGATGTCTATCAATGAGGAAGCTCGCACTTCACTGTAAGAGAACCTACTAAAAGCTATGATGAGTACAACCAAGATTGACCACTGGGCATGGATTGGAGTCTGACTAGAGCATATCTTATCTTCAATTCTCACACATCTGTAGTGTGTTATTCCTGGAAGTTTTAAAGCTAGTTTATGTTTGACCTAATGCAGTTAAGGCCCCACTTATTTTAAAGCTAAGACATAACTAACAGTCTGGAGGCTAGGACTGATTTGGGGTTGCATAATCTTGCCACACTTTACCTGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 23535 304 + 636262 AATACCTGAAGAGTGGTGGGTAGT---------------TCAATGAGGAAGCTCGCACTTAGCTGCAAGAGAACCTACTAAAAGCTATGATTAGTACAACCAAGATTAACCACTGGGCATGGATTGGAGTCTGACTAGAGCATATCTTATCTTCAATTCTTACACATCTGTAGTATGTTATTCCTGGAAGTTTTAAAGCTAGTTTATGTTTGACCTAATGCAGTTAAAGCCTCACTTATTTCAAAGCTAAGACATACCTGACAGTCTGGAGGCTAGGACTGATTTGGGGTTGCATAATCTTGCCACAGTTTACCTGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 15706 316 + 647215 AATACCTGAAGACTGGTGAGTAGTTGAGTGTGATGTCTATCAATGAGGCAGCTGGCACTTCACTGTAAGAGAACCTACTAAAAGCTAT-ATGAGTACAATCAAGATTGACCACTGGGCATGGATTGGAGTCTGGCTAGAGCGTATCTTATCTTCAATTCTCACACCTCTGTTTTGTGTTATCCCTGGAAGTTTTAAAGCTAGCTTATGTTTAACCTAATCCAGTC-AGGCCCCACTTATTTTAGG-CCATGACATAACGAACAGTCTGGAGGCTAGTACTGATTTGTGGTTGCATAATCTTGCTACACTTTACCTGTTT - -a -s mr.mrrefChr0 22318 27 + 130230 CCTAACCTATCAAAAGATGCTTCATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 23839 27 + 636262 CCTAACCTATCAAAAGGTGCTTCATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 16024 27 + 647215 CCTAACCTATCAAAAGATGCTTCCTTG - -a -s mr.mrrefChr0 22345 223 + 130230 CAATTCCATGAGGACAGATAGGTAATTAAGGATATGAGAGCAGACACATATTTGTAATAAAGTACACATCTAACTGATCAAGGGCCAATTCTAATTTATTGCCTATTTAGATCCCCAATTTAAATCCCTATATAGCAACTAGTCTCATCCCAAACATGCATGATATAGCACCTCTGCGATTGTAGTAACCTCTACTAGACCTAAGGACCGTTTGTAGGCATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 23869 222 + 636262 CAATTCCATGAGGACAGATAGGTAATTAAGGATATGAGAGCAAACACCTATTTGTAATAAAGTACACATCTAACTGATGAAGAGTCAGTTCTAATTTATTGCCTATTTAGATCCCCAATTTAAATCCCTATATAGCAACTAGTCTCATCCCAAACATGCATGATATAGCACCTCTGCGATTTTAGTAACCTCTACTAGACCTAAGGACAATTTGTAGGTGTG- -s simRat_chr6.simRat.chr6 16051 222 + 647215 CAAGTCTGCAAGGACAGATAGGTAATTTA-GATATGAGAGCAGACACATATTTGTATTAAAGTACACATCTAACTAATCAAGGGCCAATTCTAGTTTATTGGCTATTTAGATCTCCGATGTAAATCCTTAGATATAATCTAGTCTCATCCCAAACATGCTTGATATAGCACCTAAGTGACTGTAGTCACCTCTGCTAGACCTGAGGACCGTTTGTAGTCATGT - -a -s mr.mrrefChr0 22568 367 + 130230 GGGAGCAAATACTCATACCCATACTCAGTTGCTATTATAGTGATACAGTTCTCTTGGCTAGCTTTCCATAATGTCAGCTGGTGAGGCCCACTTTAATGATACAGTGTTCACAACTGTAGCCCACACTCACTGGTGTAAGTTGCTTGTGAGACTGACCATGCTCACGAACTCTGTCTCAACCTAGTTAGCAAGCGTGTCATTAATTACCTTAGTAATATTAGTCAGAAGTAAGGGTTGTCACAGGTGGCCAGCATCACCTCCAAGAAGCAGTGTTCTGTGCACACAATGGATACTGGATCTACACGGAGCTAAACTTGCAGAAGAGGCCTCCAGTCCATGAGTTTCCAATTAAAGTGCCATTTTTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24091 367 + 636262 GGGAGCAAATACTCATACCCATACTCAGTTGCTATTATAGTGATACAGTTCTCTTGGATAGCTTTCCATAATGTCAGCTGATAAGGCCCACTTTAATGGTACAGTGTTCGCAACTGTAGCCTACACTCACCAGTGTATGTTGCTTGTGAGACTGACCATGCTCATGAACTCTGTCTCAACCTAGTCAGGAAGCCTGTCATTAATTACCTTGGTAATATTAGTCAGAAGTAAGGGTTGTCACAGGCAGCCAGCATCACCTCCAAGAAGCAGTGTTCTGTGCACAAAATGGGTACTGGATCTACAAGGAGCTAAACTTGCGGAAGAGGCCTCCAGTCCATGAGTTTCCTATTAAAGTGCCATTTTCGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 16277 365 + 647215 AGGAGCAAATACTTGTACCCACACCTGGTTGCTATTGTAGTGATACTGTACACTTGGCTAGCTTTACATAATGTCAGCTGGTGAGGCACACTCTAATGATGCAGTGTTCACAACTGTAGCCCACACTCATTGGTGTAAGTTGCCTATGAGACTGACCATGCTCACGAACTCTGTCTCGTCGTAGTTAGCAAGTGTGTCATCAATTATCTTAATAATATTAG--GGAAGTAAGAGTTGACACAGATGGCCACCAGCACCTCCAAGAAGCAGTATTCAGTGCACACAATGGATACTGGATCTACACGGAGGTAAACTTGCAGAAGAGGCCTCCAGTCCATTAGTTTCCAATCAAAGTGCCATTTCTGTG - -a -s mr.mrrefChr0 22935 79 + 130230 AATAACAACTCCAAGCAAAATCAGGGTGACAGTAATAAAGTGTGCTAGTGGACCAGAATAGTCAGGCGAGTTAGGCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24458 79 + 636262 AATAACAACTCCAAGCAAAATCAAGGTGACAGTAATAAAGTGTGCTAGTGGACCAGAATAGTCCGGGGAGCTAGGCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 16647 79 + 647215 GACAACCAGCTCAGGCACAGTCAGGGTGACAGCAATAAAGTGTCCTAGTGGATCAGAATAGTCAGGCTAGTTAGGCCAA - -a -s mr.mrrefChr0 23014 160 + 130230 TAAATTAGAGCTGCAAGCAACAAAATTACTGGAGTAGCAGAATTTGTGTCTGGCCCCTAATCCTGCTTAAATAACAACCTGGAAGTTTATAGCAGGGGGAGATTATGCTAGGCAAGAATTACAGGAGCTTCATAAATATAAATGGTTATACCGTAAAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24537 160 + 636262 TAAATTAGAGCTACAAGTAACAAGATTATTGGAGTAGCAGAATTTGTGTCTGGCCCCTAATCCTGCTTAAATAACAACGTGGAAGTTTATAGCAGGGGGAGATTCTGTTAGGCAAGAATTACAGAAGCTTCATAAATATAAATGGTTATACCGTGAAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 16727 159 + 647215 TGATTTAAAGCTGCAAGCAACAAAATTACTGGAGGAGCAGAATTCGTGT-TGGCCCCTAATCCTGCTTAAATGACAACCTGGAAGTTTATAGCAGGGGGAGATTATGCTGGGCTAGAATTACAGGAGCTTCATAAATATAAATGGTCATAGCATAAAATC - -a -s mr.mrrefChr0 23174 96 + 130230 CAACTTTTAGTTGTAGGTCCTATACCGGATACAACTGAGTGGAAAGACACAGACAAGGACAATAAATGTTATTATGTACAGATCCCCTGGCCCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24701 96 + 636262 CAACTTTTAGTTGTAGGTCCTATACCGGATACAACTGAGTGGAAAGACACAGACAAGGACAATAGATGTTATTATGTACAGATCCCCTGGCCCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 16886 49 + 647215 -----------------------------------------------CACAGACAAGGACAATAAATGTCATTCTGTACAGATTTCCTGACCCTCC - -a -s mr.mrrefChr0 23270 160 + 130230 CCTGCCCAGGATACATAAGCTTACTGCATTGGATTATTTGAGATATCGCAGCATAATATCTTGATGCACTCCATTTTTGGTCAATAATGTCAGGCTGGCATGAGATCCTATGTGATTCAGCTCCTTGTTCTAGTCAATTCCACCTTATTCCTGCAGTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24797 157 + 636262 CCTGCCCAGGATACATAAGTTTACTGCATTGGA-TATTTAAGATATCGCA-CACAGTATCTTGATGCACTCCATTTTTGGTCAATAAGGTCAGGCTGGCATGAGATTCTATGTGATTCAGCTCCTTGTTC-AGTCAATTCCACCTTATTCCTGCAGTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 16936 160 + 647215 CCTGCCCAGGAGGCATAGGCTTATTGCATTGGATTATTTGAGCTATCACAGCATAATATCTTCATGCACTCTATTTTGGGTCAATACTGTCAGGCTGGCATGAGATCCTGTGTGATTTAGCTCCTTGTTCTAGCCAACTCCACCATATCCTTGCAGTATA - -a -s mr.mrrefChr0 23430 12 + 130230 GGCTAAGGAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24955 12 + 636262 GGCTAAGGAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 17096 12 + 647215 GGCTAGGGAATC - -a -s mr.mrrefChr0 23442 196 + 130230 ATTAGTGCACATTAATTTTGATGATGCCATAGTGCATTTGAAATGTATTAATAGGTATATTCTTAACTCAGTGTGACGGGTTATAAATTATTTCTTATCATGGAAGTAAAATACATTTTGTTTGGTGTGAAATACAAACCCCATTCTAACCACCCCTAAAGGAGGGAGACTAACCTGTATTCCTCCCACTGCAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24967 193 + 636262 -TTAGTGCACATTAATTTTG-TGATACCATAGTACATTTGAAATGTATTAATAGGTATATTCTTAACTCAATGTAACGGGTTATAAATTATTTCTTATCATGAAAGTGAAATACA-TATGTTTGGTGTGAAATACAAACCCCATTCTAACCACCTCTAAAGGAAGGAGACTAACTTGTATTCCTCCCACTGCAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 17113 196 + 647215 ATTAGTTCACATTAATTTTGAGGATGCCATAGTGCCATTGTAATGAATTAATAGGTATATTCTTACCTCAGTGTGACAGGTTATAAATTATTTCTTATCGTGGAAGTAAACTAGATTTTGTTTGGCATGAAACACAAACCCCATTCTAACTACCCCTAAAGGGGGCAGACTAACCTGCATTCCTCCCTCTGTAACC - -a -s mr.mrrefChr0 23638 34 + 130230 TGCAGACAGAGAAACATGCATCATCAACACCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25161 34 + 636262 TGCAGACAGAGAAACATGCATCATCAACACCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 17309 34 + 647215 TGCAGACAGAGACACATGCATCATCAAAACCTTT - -a -s mr.mrrefChr0 23672 11 + 130230 CTACAACACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25197 11 + 636262 CTACAACACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 17343 11 + 647215 CTACAACACTA - -a -s mr.mrrefChr0 23683 40 + 130230 ATTTGCACATCAAGACTATATTTACACATCAAAAATATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25209 40 + 636262 ATTTGCACATCAAGACTATATTTACACATCAAAAATATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 17354 40 + 647215 ATTCGCACATCCAGACTCTATTTGCAAATCAAAAATATGA - -a -s mr.mrrefChr0 23723 195 + 130230 CAATTCTAAACTTGTCAGTACCCCAGACACACAATCTTTTATTGAGTCACCAGTCATCTTTTTCACATACTGTCATGATTTCTGTATCCCATGCTTTTTGTAAGTCAATGCTTATATTTCTGTATATGGATGGATTGCTATTGGTGTAAACTTCAAAATCTAGTGTGTGGCTTCTCTATGGTGTGGTTACCAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25249 195 + 636262 CAATTCTAAACTTGTCAGTACCCCAGCCACACAATCTTTCAATGAGTCACCAGTCATCTTTTTCACATACTGTCATGATTTCTGTATCCCATGCTTTTTATAATTCAATGCTTATATTTCTGTATATGGATGGATTGCTAGTGCTGTAAACTTCAAACTCTAGTATGTGGCTTCTCTGTGGTGTGGTTACCAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 17401 194 + 647215 CAATTCTCAACTTGACAGTACCCCAGACACACAATCTTATATTGAGTCACCAGTTATCTTTCTTACATACTGCCATCATTTCTGTATCCCATGC-TTTTGTAAGTCAATACTTATATTTCTGTATCTGGATGGATTGGTATTGGTGTAAACTTCAAAAACTAGTGTGTGGCCTCTCTATGGTTTGGTTGCCAGCA - -a -s mr.mrrefChr0 23918 18 + 130230 GAAATTTCCCCTGGGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25445 18 + 636262 GTGATTTCTCCTGGGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 17595 18 + 647215 GAAATTCCCCCCAGGGCC - -a -s mr.mrrefChr0 23936 357 + 130230 AATACGTTAACTGGCTTAGTGTACAAATGCTGCTAAAGAACATATGAATATCCAAATTGCTCCATGTTGACATCCCATGTGATTTAACCCACATACTTACCATCTCTTCCACTTAATGTTCAACCTCTGAACCCAATGTGGTCCCCTTGTGAGGGATTCCATGAGAATTCCTTTTAAAAGGAGTGTCAATCTTGCCAGTGGTTATGCCTTAATCCCTCCACCTGAGAGTTGCCCATGCAGCCAGTGTCAGTTAGTGTTTTGGTTGATGCCCCAGATTGATGCCCCACAGTATAGCAACCACAGTTTGCCAGCAACCATCTGAATAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGCCTTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25465 357 + 636262 AATACGTTAACTGGCTTAGTGTACAAACACTGCTATAGAACATATGAATATCCGAATTGCTCCATGTTGACATCCCATGTGATTCTACCCACATACTTACCATCTCTTCCACTTAATGTTCAACATCTGAACCCAATGTAGCCCCCTTGTGAGGGATTCCATGAGAACTCCTTTCAAATGGGGTGTCAATCTTGCCAGTGGTAATGCCTTAATCCCTCCACCTAAGAGTTGCCCATGCAGCCAGTGTCAGTTAGTGTTTTGGTTGATGCCCCAGATTGATGCCCCACAGTATAGCAACCACAGTTTGCCAGCAATAATCTGAGTAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGCCTTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 17613 342 + 647215 AATACGTTTACTAGCTTAGTGTACAAATGCTACTAAAGAACATATCAATCTCCAAATTGCTCCATGTTGACATCCCATTTGATTTAACCCACATACCTACCATCC----------ATGTGTGACCTATAAACCCAATGTGGTCCCCTTATGAGGGATTCCTTGAGAATTCCTTTTGAAAGGAGTGTCCATCTTGCCAGTGGTTGTGCCTTAATTCCTCCACCTGAGG-----CTATGCAGCCAGTATTGGTTTTTGTTTTGATTGATGCCCCAGATTGATGCCCAACAGTATAGTAACCACAGTTCACCAGCGACCATCTGAATAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGGCTTGCA - -a -s mr.mrrefChr0 24293 82 + 130230 CACAGGTGAGTCAATTAGAATTGAAGGACTCTGAGGTGAGATGAGCTTTTTGGGGGACACTTGCCATTTTGAGTTATATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25823 82 + 636262 CACAGGCAAGTCAATTAGAATTGAAGGACGCTGAGGTGAGATGAACTTTTGGGGGGACACTTGCCATTTTGAGTTATATAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 17955 78 + 647215 CACAGGTGAGTCAATTAGAATTGAAGGACTCTGAGGTGAGATGAGCTTTTTGGGGGACACT----ATTTCGAGTTATATAGC - -a -s mr.mrrefChr0 24375 15 + 130230 ATGTATCAATGACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25905 15 + 636262 ATGTATCAGTGACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 18034 15 + 647215 ATGTTTCAATGACCC - -a -s mr.mrrefChr0 24390 5 + 130230 ATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25924 5 + 636262 ATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 18049 5 + 647215 TCCAA - -a -s mr.mrrefChr0 24395 69 + 130230 AATTCCTTTGTAGTTAATCTTCAGAAATATAACACAAGGCACATAGCTCTGCTGACTGCTGGCAAAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25929 69 + 636262 AATTCCTTTGTAGTTTACCTTCAGAAATATAACACAAGGCACATAGCTCTGCTGACTGCTGGCACACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 18058 67 + 647215 ATTTCCTTTGT-GTTAATTTTCGGAGATTTAACACAAGGCGCATA-CTCCAGTGACTGCTGGCAAGACC - -a -s mr.mrrefChr0 24464 166 + 130230 ATTGGTATATCTCCACATGTTGTAGGGGGACCAATGGCACAATGTGGATGTGGATGAGGGATCTATAATTCAAACTAATCCCCCACTTATCTTTTCTATTTTTATGCCAATCATGTTAGGCTTATGAGATAGGTTAGGTCATGTGATGGATCTAAAGAACTGCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26010 145 + 636262 ATTGGTATATCTCCACATGTGGTAGGGGGTC--------CAATGTGGCTGTGGATGAGGGATCTATAA-----ACAAATCCTCCACTTATCTTTTCTATTTTTATG-----CATGTTAGGCTCCTGAGATAGGCTAGGTCATGTGATGGGTCTAAAGAACTGC--- -s simRat_chr6.simRat.chr6 18125 166 + 647215 ATTGGTATATCTCCACATGTTGTAGGGGGACCAATGGCACAATGTGGATGTGGATGAGGGATCTATATTTCAAAGTAATCCCCCCCTTATCTTTATTATTTTTATGCCAATCATGTTAGGCTTATGATGTAGGTTAGGTAATGTGATGGATCTAAATAACTGCCAC - -a -s mr.mrrefChr0 24630 81 + 130230 CATCCAATGAGTCATCATTTTATGACACTGACTGACCTTCTTAATCACGGCTGTAGCCTCTTAGTTAGAAATGCAACAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26155 79 + 636262 --TCCAGTGAGGCACCGTTCTATGACACTGACTGACCTTCTTAAGCAGGGCTGTAGGCTCTTAGTTAGAAATGCAACAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 18292 81 + 647215 CATCCAATGAGTCATCATTTTATGACACTGAGAGTCCTTCTTAATCACGGCTATAGCCTCTTAGTTAGAAATGCAACAGAC - -a -s mr.mrrefChr0 24711 120 + 130230 TGTACTCAACCATTCATAAGGAAAGTTTCAAAACCATTTGACATCCAGAGCACCCGTTGTACAATCACCCATTGATAACAATGTGAGGTATGGTGGAGCCAGAACTCCATGGGTCAGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26242 118 + 636262 TGTACCCAACCATTCATGAGGAAAGTTTCAAAACCATTTGACATCCAGAGCATCCGTTGTACAATCACCCAT--ATAACAATGTGAGGTACGGTGGGGCCAGAACTCCATGGGTCAGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 18373 120 + 647215 TGCACTCAACAATTCGTAAGGAAGGTTTCAAAACCATTTGACATCCAGAGCACCCATTGTACAATCACTGATTGAACACAATGCGAGGTATGGTGGAGCCAGAACTCCATGGGTCAGCCC - -a -s mr.mrrefChr0 24831 94 + 130230 GGGTGTATTACCATTAGCCTCAATTCCTTGGACCTCATTTTAAAATATTATCTTTAACCCCTCCTGTAATTACGAAAAATTAGAGCAGAGAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26361 94 + 636262 GGGTGTATTATCATTAGCCTCAATTCCTTGAACCCCATTCTATGATATTATCTTTAACCCCTCCTGTAATTACGAAAAACTAGAGCAGAGAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 18493 84 + 647215 AGGTGTATTACCATTAGCCTCAATTCCTTGGTCATGATTTTAAAATATTGTCTCTAACCCCTCCTGTAATTAGGAAAAATTAGA---------- - -a -s mr.mrrefChr0 24925 144 + 130230 GGCAACCACTAGAATGTATAAGTGGGCAAGATTATTTAAGGGATCTAATCTCTTGCACTGGTGATAGGTTTACGGTTGGCTAATTGACTCACAGACAAACAAATGGTCACGACTTAGCTGAATTTCTCCATTGGCTCCTACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26457 140 + 636262 GGCAACCACAAGAATGTGTAAGTGGACAAG---ATTTAAGAGATCTAATCACTTGCACTGGTGACAGGTTT-CGGTTGGCTGATTGACTCACAGACAAACAAATTGTCCCGGCTTAGCTGAATGTCTCCATTGGCTCCTACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 18577 142 + 647215 -GAAACCACTGCAATGTATAAGTGGGCAAGATTATTTCAGGGATTTGATCTCTCACACTGGTGATAGGTTTACTGTTGGCTAATTGACTAATAGACAAAC-AATGGTCACGACTTAGCTGAATTTCTCCTTTGGCTCTTACATT - -a -s mr.mrrefChr0 25069 358 + 130230 TCCTCATATCACAAAAGAGGGTAAGCAGTGGCACTCAGAAGACACAGAGCTGTCACCTGGGAGAGCAGATGTGGCCTGAGAGACCAGACTCAGTCATTTGATGGTGTAATGGTTGGCCCTGATCATCAGGGACTGCAGTGTCAACAAGATAAGTATTTAGTAAGCATAAGTACCTGGATGTGGGGCTAGAGCCCCTAGGGTCCAGACAACTATGTAAGAGAGTTTGAGATCTGGCAAAAGTGTAATGTTCCCCATTGGCTGTCTTTGTTGTTATCATCTAGATTTTTTCTCATGGTGGGACATTGATCCTTTAACCAAAAACAAAGGTATCTACTGCCAATCAAGAGTACATACTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26597 358 + 636262 TCCTCATATCACAAAAGAGGGTAAGCAGTGGCGCTCAGAAGACACAGAGCTGTCACCTGGGAGAGCAGATGTGGCCTGAGAGACCAGACTCAGTCATTTGATGGTGTAATGGTTGGCCCTGATCATCAGGGACTGCATTGTCAACAAGATAAGTATTTAGTAAGCATAAGTACTTGGATGTGGGACTAGAGCCCCTAGGGTCCAGACAACCATGTAAGAGAGTTTGAATTCTGGCAAAAGTGTAATGTTCCCCATTGGCTGTCTTAGTTGTTATCATCTAGATTTTTTCCCAGGGTTGGACATTGATCCTTTAATCAAAAACAAAGGTGTCTACTGCCAATCAAGTGTACATACTGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 18727 355 + 647215 TCCTCACGTTGCAAAGGAGGGTAAGCAGTGGCACTCAGAAGACTCAGAGGCAGCACCTGGGAGAGCAGATGTGACCTGAGAGACCAGACTTAGTCAATTGGTGGTGTAATGCTTGGCTCTGATCATCAGGGACTGCAGTGTCAACAAGATAAGTATTTAGTAAGCATAAGTACCCAGA---GGAGCTAGAACCCCTAGGGTCCAGACAACTATGTAAGAGAGTTTGGGACCTGGCAAATGTGTAATGCTCCCCATTGGCTGTCTGTGTTGTTATCATCTAGATTTTTTCTCATGGTGGGACATTGGTCCTTTAACTAAAAACAAAGGTATCTACTGCGAATCAAGAGCACATACTGCC - -a -s mr.mrrefChr0 25427 66 + 130230 ACTTACTGCCTTAAACAGACCCTTTCCAAGAAGGCCCTACTCACTAAAATGTTAGTCAAGTTAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26961 66 + 636262 ACTTACTGCCTTAAACAGACCCTTTTCAAGAAGGCCCTATTCACTAAAATGTCAGTCAAGTTAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 19082 66 + 647215 ACCTGCTGCCTTAAACAAACCCTTTCCAAGAAGGCCCTGCTCTCTAAACTGTTAGTCAGTTTAATG - -a -s mr.mrrefChr0 25493 391 + 130230 TACTTACTGAGTTGATCCCACTTCCACTAGAGGTAGTTACAATCATATGGAAGTTTAGTAGTTATGGTCCTTTAAGATTTATAATGTTTCTCCCTTTTCCCCCATACTATCTGTCCAAGGTTGATTGGGGTCCTTTCCTTTGCCAAGACTCTTACCGAATAACTTAGCTAGTGGGCATACAACCAAGCTGGTTTTTTTGGATTTCAGAGGGAATCTCGTCCTGTGGGCTTTGAGTTGCGTTCCTTCAACTTCAGTACAGTTCTTTGGGCTATCTGTACATATAAGTCTGAACTCCTGCCCACATATAAGGTACAGATTAAATCTAATCTCATGACATTACTTCCTTTCCAATCTAAGTAGCAGTCACACTTATGTGAACTCACTCGCTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27027 388 + 636262 TACTTACTGAGTTGATCCCACTTCCACTAGAGGGAGTTACAATCATTTGAAAGTTTAGTAGTTATGGTCCTTTAAGATTTATAATGTTTCTCCCCTTTCCCCCATACTATCTGTCT---GTTGATTGGGGTCCTTTCCTTGGCAAAGACTCTTACCGAATAACTTAGCGAGTGGGCATACAACCAAGCTGGTTTCTTTGGGTTTCAGAGGGAATCTCGTCCTGTGGGCTTTGAGTTGCGTTCCTTCAACTTCAGTACAGTTTTTTGGGCTATCTGTACATATAAGTCTGAACTCCTGCCCTCATATAAGGTAGAGATTAAATCTAATCTCATGACATTACTTCCTTTCCACTCTAAGTAGCAGTCACACTTATGTGAACTCACTCGCTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 19151 369 + 647215 TACTTACTTGGTTGATCCCACTTTCACTAGAGGTAGTTATAATAATATGGAAATTTAGTGGTTATGGTCCTTTACGACTTATAATGTTTCTCCCTTTTCCCCCATATTATGTGTTCAAGGTTAATTGGGGTCCTTTCCTTTGACAA---TCTTACCAGATAACTTAGCTAGTGGGCATACAACCAAGCTGGTTTTGTTGCATTTCAGA---------GTCCTGTTGGCTTTGAG----GTTCCTACAACTTCAGTACAGTTCTCTGGACTATCTG------TAAGTCTGAACTCCTACCCAGATATAAGGTACACATTAAATCCAATCTCATGAACTTACTTCCTTTCCAATCTAAGTAGCAGGCACGGTTATGTAAGTTCAATTGCTTTC - -a -s mr.mrrefChr0 25884 79 + 130230 CAATTTAAGTTGCAGTCTCACTTATAAGAATTTTAATGTGTTTCAGCCTTCATAATCAGCGTGATATAATCATAAGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27415 79 + 636262 CAATTTAAGTTGCAGTCTCACTTATAAGAATTTCAATGTCTTTCAGCCTTCATAATCAGTGTGATATAATCATAAGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 19522 79 + 647215 CAATCTAAGTAGCAGTCACACTTATATGAATTTTGATGTGTCTCATCTTTCATAATCAGCATGATGTAATCATAAGCCC - -a -s mr.mrrefChr0 25963 161 + 130230 TCACAAGCACATGATTCCCCCCTCAGCACAGCCTGGACAAATGAACAGCCTGGAGTAGACACATGATTCTCTTTAGAATGAAATCATAAGGTTATTCCTGCGCACAGTTATATGCCTTGCTTGTAATTATCATGGGCCTAGCCCTTCACAAGAACATTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27498 160 + 636262 TCACAAGCACATGATTCCTCCCTCAGCACAGTCTGGAAGAACGAACAGCCTGGAGTGGACACATGATTCTCCTTAGAATGAAATCATAAGGTAATTCCTGTGCACAGTTATATGTCTTGCTTGTAATTATCATGGGCCTGGCCC-TCACAAGAACATTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 19601 159 + 647215 TCACAAGCACAAGACTCCCCCCTCAGCACAACCTGGACAAATGAACAACCTGGAGTAG-CACATGATTCTCTCTATAATGACATCATAATGGTATT-CTGCGCACAGTTGCATGCCTTGCATGTAATTATCATAGGCCTAGCCCTTCACAAGGACATTAAG - -a -s mr.mrrefChr0 26124 227 + 130230 CATTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAATTAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTAAATGAATAGTCGTATTAGTTTACATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGTCTCCCAATCATCCTACTGCAATGTGTTGGGATTAGATGTTGACAGATCATTTTGAAGAGCCCTCAAGGGCTCTGCATCTCAAATAGAACTACTAAAGTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27659 221 + 636262 CATTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAATTAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTAAATGAATAGTCATATTAGTTTACATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGTCTCCCAATCATCCTGCTGCAA-----TGGGATTAGATGTTGACAGATCATGTTGAAGAG-CCTCAAGGGCTCTGCAGCTCAGATAAAACTACTAAAGTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 19760 221 + 647215 CGTTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAAATAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTACATGAATAGACGTATCAGTTTAGATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGT------ATCACCCTACTGCAATGTGTTGGGATGAGATGTGGACAGATTACTTTGAAGAGCCCTCAAGGGCTTTGCATCCCAAAAAGAACAACTAAAGTAGT - -a -s mr.mrrefChr0 26351 26 + 130230 AACATAGGCCTATTATGAACATGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27881 26 + 636262 AACATAGGCCTATTATGAACATGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 19981 26 + 647215 ACCTTAGGCCTATTATGAACCTGTTA - -a -s mr.mrrefChr0 26377 37 + 130230 GTGTACATAGGATAATAGATAGTGCTCTAGCAGTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27907 37 + 636262 GTGTACATAGGATAATAGATAGTGCTCTAGCAGTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 20008 37 + 647215 GTGTATATGGAATAATAATTAGTTCTATAGTGGCAGT - -a -s mr.mrrefChr0 26414 59 + 130230 AAGACTATCATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGCCTCCCAATCATCCTACTGCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27945 59 + 636262 AAGACTATCATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGCCTCCCAATCATCCTACTGCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 20045 59 + 647215 AAGACTATCATTCTTTTAGCCATACTCTTTACTGGACTCCCAATCATCCTACTGCAATG - -a -s mr.mrrefChr0 26473 22 + 130230 TGTTGGGATCAGGTGTGGACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28004 22 + 636262 TGTTGGGATCAGGTGTGGACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 20113 22 + 647215 TGTTGGGGTCAGATGTGGACAG - -a -s mr.mrrefChr0 26495 6 + 130230 CTTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28026 6 + 636262 CTTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 20137 6 + 647215 TTTATT - -a -s mr.mrrefChr0 26501 89 + 130230 ATTTTATTGAAGAGCCCGCAAGGGCCTCGCAGCCCAAATAAAACAACTAAAGTAGTAAGCTTAGGCTTATTATGAACATGTTATGTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28032 83 + 636262 ------TTGAAGAGCCCTCAAGGGCTCCTCAGCCCAAATAAAACAACTATAGTGGTAAGCTTAGGCTTATTATGAACATGTTATGTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 20162 89 + 647215 ATTTTATTGAAGAGCCCGCAAGGGCCTGGCAGCCCAAATAAAACAACTAAAGTAGTAAGCTTAGGGTCATTATGAATATGTTATGTGCA - -a -s mr.mrrefChr0 26590 71 + 130230 CACAGAATAATATTTAGTTTGCTAGCAGTGGTAAGACTATCACCAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28116 69 + 636262 CACAGAATAATATTTAGTTTGCTAGTAGT--TAAGACTATCACCAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 20251 71 + 647215 CATAGGATAATAATTAGCTCTCTAGCAGTGGTAAGACTATCATTAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGG - -a -s mr.mrrefChr0 26661 216 + 130230 CTACCAATGGCACACGTCCACACAACATTGTCCAGATTGAATACTAAAACTGGACCTTGGGGGGAGCTGATGGTTCTCCTCTTTTTCTCTCATCCTGCCTGTCACATCTGAAGAATTTTGTGACTACACTGCTTGAAGAGAGCATCTATTCACCAGAGGTTGCTCTGCTCTAGTAAACCAGATGGGGGTGACTAACTAGATAAATTATTGCACTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28188 213 + 636262 CTACCAACGGCATGCGTCCACACAACATCCTCCAGATTGAATACTAAAACTGGACCTTGGGCGGAGCTGATAGTTCTCCTCTTTTTCT---ATCCTGCCCGTCATATCTGAAGAATTTTGTGACTACACTGCTTGAGGAGAACACCTATTCGCCAGAGGTTGCTCTGCTCTAGTAGACCAGGTGGGGGTGACCAACTACATAAATTATTGCACTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 20322 214 + 647215 CAACCAATGGCACACGTCCACACAACATTGTCCAGTTTGTATACGAGAACTGGACCTTGGGGGAAGCTGATGGGTCTCCTCTTTTTCTCTCATCCTACCTG--ACATCTGAAAAATTTTGTGATTACACTGCCTGAAGGGAGCATCTATTCACCAGAGGTTGCTCTGCACTAGTAAACCAGATGGGGGTGACTAACTAGTTAAATAATTGGGCTAT - -a -s mr.mrrefChr0 26877 46 + 130230 TGGTCAAGAAAAGAGGTGCCCACATCAATCCTAACCAGAATAAGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28407 46 + 636262 TGGTCAAGAAAAGAGGTGCCCACATCAATCCTGACTAGAATAAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 20536 41 + 647215 -----ATGAAAAGAGGTGTCTACATCAATCCTAACCAGAATAAGCG - -a -s mr.mrrefChr0 26923 187 + 130230 GAGACCTGTGGCTTACTCTTAATAGCAATGTTTGTTTACTAATCTCTTACATGGGGCATTAACAGATTGCAAACTGTTAACTACCAACCTATTGAAATGTGTTCTATGGTTTCATGTTATACCTGGAGTTATGTCAATAGTATTGACTGTCAAGTTTATTTTATGGTAGTAGGGGTTGGTACTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28458 175 + 636262 GAGACCTGTGGCTTAGACTTAATAGCAATGTTTGTTTACTAACCTCTTACATGGGGCATTAACAGATTGCAAACTAGTAACTACCAACCCATTGAAATGTGTTCTATGGTCTCATGTTATACCTGGAGTTATGTTAATAGTATTGACTGTCAAGTTTATTTTATGGTAGTAGGGG------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 20577 187 + 647215 GAAACCTATGGCTTACTCTTAATAGCGATGTTTGTTTACTAATCTCTTACATGGGGCACTAACAGATTGCAAACTGTTAACTACCAACCTATTGAACTGTGTTCTATGGTTTCATGTTATACCTGGAGTTATGCCAATAGTAGTGACTATCAAGTTTATTTTATGGTTGTCGGGGTTGGTACTGTAC - -a -s mr.mrrefChr0 27110 5 + 130230 CCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 20765 5 + 647215 CCAGC - -a -s mr.mrrefChr0 27115 34 + 130230 ACTTTTAGGGCACTTGTTTGGGGGCTTGTCCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28633 30 + 636262 ACTTTTAGGGCACTTGTTTGGGG----GTCCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 20772 34 + 647215 ACATTTAGGGCACTTGTTACGGGGCTTGTCCACA - -a -s mr.mrrefChr0 27149 206 + 130230 TAGTTAATAAGCTGTGTTGTGGAGCTATGGAGCAGGCATGAATTGTGGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCGGTTCCTCATAACCAGTTATGTAGATATGAGTGCATGCATTTTTCTCTTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCCCCAGATCCAGTGGGTGTGCTTTGTCATGAGTGAGAGACCTACTGGCTATTTAAATTGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28678 206 + 636262 TAGTTAATAAGCTGTGTTGTGGAGCTATGGAGCAGGCATGAATTGTGGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCGGTTCCTCATAACCAGTTATGTAGATATGAGTGCATGCAGTTTTTTCTTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCCGCAGATCCAGTGGGTGTGCTTTGTCATGAGTGAGAGACCTACTGGCTATTGAAATTGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 20806 206 + 647215 TAGTTAATAAGCTGTGTTGGGCAGCTATGGAGCAGGCATGAATTATAGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCAGTACCTCATAACCAGCTATGTTGGCACAATTGCACGCATTGTTCTCCTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCTCCAGATCCAGTGGGTGTACTTTGTCATGAGTGAGAGACCTAGTGGATATTTGAATTGTAG - -a -s mr.mrrefChr0 27355 42 + 130230 ACTGCGCATTATGGTATTTGTTTACTTCTAGTCCCTGCATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28891 42 + 636262 ATTGCGCATTATGGTATTTGTTTACTTCTAGTCCCTATATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 21012 42 + 647215 ACTGCACGTTAAGGTATTTATTTACTCCTAGTCCCTGCATAG - -a -s mr.mrrefChr0 27397 160 + 130230 CTACCACTGTTGTGTACCTGGAGTCATGTTCCAATACATATAGCGATGTCAGGCACCGCAGTGAGCCAAAGTGGGATGTAGTGAGAGAGTATCCAGAATTAGGATATGCAAAACTGTATTGACTAAAGCTAGGTAGAACAAGGGACCCTTAAGTGTTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28934 160 + 636262 CTACCACTGTTGTGTACCTGGAGTCGTGTTCCAGTTTATATAGCGATGTCAGGCACCGCAGTGAGCCAAAGTGGGATGTAGTGAAAGAGTATACAGAATTAGGATATGCAAAACTGTATTGACTAAAGCTAGGTAGAACAAGGGGCCCTTAAGTGTTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 21054 157 + 647215 CTACCTCTGCTGTGTACATGGAGTCATGTTCCAATACATATAGTGATATCCGGAACTGCAGTGAGTC-AAGTAGGATGTAGTGAGAGAGTATCCAAAAGTAG--TATCCAAAACTATATTGACTAACACTAGGTAGACCAAGGGACCCTTGAGTGTTAAG - -a -s mr.mrrefChr0 27557 176 + 130230 ATGTCCACTAGTCTTACTCCTAACTTTTGGCCTTCTCTGTAACATTGTGCTTATCTTGAACGAGATCCATTTGATTTGTCCTCTTTCTAGAAGCCTGGCTCTATTCAATGATTGTTCTAGTCTGTTCATTTAGTTTCTTGTGTTGCATGTAGTTACACACACCCATCATTATGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29095 176 + 636262 ATGTCCACCAGTCTCACTCCTTACTTTTGGCCTTCTCTGTAACATTGTACTTATCTTGAACGAGATTCATTTGATGTGTCCTCTTTCTAGAAGCCTGGGTCTATTCATTGATTGTTCTGGTCTGTTTATTGAGTTTCTTGTGTTGCAAGTAGTTACACACATCCATCATTATGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 21211 168 + 647215 ATGTCCACTAGTCTTACTCCTATCTTTTGGCCTTGGATGTAACGCCGTGCTTATCTTGAACGACAGCTATTTGATTTGTCCTCTTT--------CTGGCCCATTTTAATGATTGTTCTAGTCTGTTCATCTAGTTTCTTGTGTTGCATGTAGTTACAAACACCCATCATTACAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 27733 68 + 130230 TAGAGTGAGGGACCCACCATCAGATAAGACCTTCTGGGGTAGAGGAAATAGAAGGCATTTGGACCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29271 68 + 636262 TAGAGTGAGGGACCCACCATCAGATAAGACCTTCTGGGGTAGAGTAAATAGAAGACATTTGAACCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 21395 68 + 647215 TAGAGTGGGGGACCCACCCTCAGATAAGACCTTCTGGGGTAGAGGAAATAGTGGGCATTTGGACCAAA - -a -s mr.mrrefChr0 27801 45 + 130230 CAATCCCTTCAGTTGCAAAAGAAGCTGGAAACCACAAGCTAATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29340 45 + 636262 CAATCCCTTCAGTTGCAAAAGAAGCTGGAAACCATAAGCTAATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 21463 45 + 647215 CAATCCCTTCAGTTGCAAGAGAAGCTGGATATCACAAGGTAATTA - -a -s mr.mrrefChr0 27846 15 + 130230 GCCTTACCTAAATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29385 15 + 636262 GCCTTGCCTAGATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 21509 15 + 647215 GCCTTACTTAAATAG - -a -s mr.mrrefChr0 27861 100 + 130230 ATAAACTATAATTATCATGACTTCAGGCATTTCAGCCTTTCTTGTATCCAACAATAGTTGACTATGGCACTTAGATTTTCCAGCTCCGATATGAGGTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29403 98 + 636262 ATAAACTATAGTTATCATGACTTCAGGCATTT-AGCCTTTCTTGTCTCCACCAATAGTTGACC-TGGCACTTAGATTTTCCAGCTCCGATATGAGGTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 21524 100 + 647215 ATAAACTATAATTATCATGACTTCAGGCGTTTCCGCCTCTCTTGTACCCAACAGTAGTTGACTACGGCACTTAGATTTTCCAGCTCTGATAAGAGATTCA - -a -s mr.mrrefChr0 27961 63 + 130230 AATATAGCCCAAGATTTGGCTTTACTAGAGAGATGCCAATGATTTCAAAGGGTGTTAAGAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29503 63 + 636262 AATATAGCCCAAGATTTGGTTGCACTAGAACAATGCCAATGATTTCAAAGGGTCTTAAGAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 21624 63 + 647215 AAAATACCCCAAGATTTGGCTTTACAAGAGAGATGCCAATGATTCCAAGGGTTGTTAAGAATA - -a -s mr.mrrefChr0 28024 5 + 130230 GGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29567 5 + 636262 GGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 21687 5 + 647215 GTATG - -a -s mr.mrrefChr0 28029 102 + 130230 TTGGGTGTTTATCTAATGTGAACAACCTAGACTGTCTGTTGGTCTTTGGCCTTACTGGGGCATAAGACTGGATCTCTTTTTTGATTTATTGGTAGCCAAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29572 102 + 636262 TTGGGTGTTCATGTAATGTGAACAGCCTAGACTGTCTGTTGGTCTTTGGCCTTACTGGGGCATAAGACTGGATCTCTTTTTTGATTTATTGGTAGCCAAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 21807 102 + 647215 TTGGGTGTTTATCTAATGAGAACAACCTAGACTGTACATTTTCCTTTGACCTTACTGTAGCACAAGGCTGGGGCTCTTTTTTGAGTCATTGGTAGCCAAAGT - -a -s mr.mrrefChr0 28131 178 + 130230 GGCAGAGGTTCTTTTTGGACAAAACCAAAGAAAAAACTGAAAAAAGTAAAATCAGGTCCCTTCCAGAATTTTAGACCCGGTTGGTTTGTCACTAGGCTTGAAAGTAGGTCTAAGTGACTCCTTGCATCTAAGAAGTCAGATGAAGAACCACAGTGCTTGTGATTAAGGCACCACCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29674 178 + 636262 GGCAGAGGTTCTTTTTGGACAAAACCAAAGAAAAAACTGAACAAAGTAAAATCAGGTCCCTTCCAGAATTTTAGACCCGGTTGGTTTGTCACTAGGCTTGAAAGTAGGTCTAAGTGACTCCTTGCATCTAAGAAGTCAGATGAAGAACCACAGTGCTTGTGATTAAGGCACCACCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 21933 178 + 647215 GGTAAAGAATCTTTTTGGACAAAACCAAAGAAAAAAATGAAAAAAGTAAACTCAGGTCCCTTCCAGAATTTTAGACTGGGTTGGTTTGTCACTAGGCTTGAAAATACGTCTACGTGGCTCCTTACATCTAAGAGGTCAGATGAAGAACCACAATGCTTGTGATTAAGGCACCACCTGA - -a -s mr.mrrefChr0 28309 16 + 130230 TTTGGGAAGGCCCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29853 16 + 636262 TTTGGGAAGGCCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 22111 16 + 647215 TTTGGGAAGCCCCATT - -a -s mr.mrrefChr0 28325 26 + 130230 ACTGAGTTCCCACCTACTTTTGTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29873 26 + 636262 ACAGAGTTCCCACCTACTTTTGTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 22127 26 + 647215 ACTGAGTCCCCACCTACTTTTGTTCC - -a -s mr.mrrefChr0 28351 94 + 130230 ACTTTTTACCAGGCTGCTTGCTTTAGGAGAGTACCTATAAACTTGGTGCTTCCCCATGGTAAGTTTGTATGATAGTCATCAGGGTTACTAGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29904 94 + 636262 ACTTTTTACCAGGCTGCTTGCTTTAGGAGAGTACCTATAAACTAGGGGCTTCCCCATGGTAAGTTTATATGATAGTCATCAGGTTTACTAGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 22153 94 + 647215 ACTTTAAACCAAGCTGATTGCTTTAGGAGAGGACCTACGAACTTAGTGCTTCCTCATGGTAAGTCTGTAGAATAGTCATCAGGGTTCCTAGAGA - -a -s mr.mrrefChr0 28445 12 + 130230 TTGTTATAAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29998 12 + 636262 TTGTTATAAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 22255 12 + 647215 TGATTCCAAAGA - -a -s mr.mrrefChr0 28457 86 + 130230 GGATGTTGGGTGTTTATCTGTTAAATGTGAACAGGGTTGCATTATGTGCTTTGTCTTTACTCCTGCTACTGGGGCCTGAGGACTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30010 86 + 636262 GGATGTTGGGTGTTTATCTGTTAAATGTGAACAGGGTTGCATTATGTGCTTTGTCTTTACTCCTGCTACTGGGGCCTGAGGACTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 22274 86 + 647215 AGATGTTGGGTATTTATCTGTTAGATGTGAACAGGGTTGTAATATGTGCTTTCTCTTTAGTCTCACTACTGGGGCCTGAGGACTAG - -a -s mr.mrrefChr0 28543 160 + 130230 GTCTGACTCTTCATACACAGGTGGCCAAAGTGGCAGCAATTCTTTTTGGACAAAACCAAGGAAAAAACTGAAGAAAGTAAAATTGTGTCCTTTGCAGAATATTAGACCCAGTTAGTTAGTCACTAGGCTCAAAAACAGCTATAAGTGGACCTTCTTGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30096 160 + 636262 GTCTGACTCTTCATACACAGGTGGCCAAAGTGGCAGCAATTCTTTTTGGACAAAACCAAGGAAAAAACTGAAGAAAGTAAAATTGTGTCCTTTGCAGAATATTAGACCCAGTTAGTTAGTCACTAGGCTCAAAAACAGCTATAAGTGGACCTTCTTGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 22376 160 + 647215 GTCTGACTCTCCATACATGGGTGGCCAACGTGGCAGCAGTTCTTTTCAGACAAAACAAAGGGAAAAACTGAAGAAAGTAAGATCGTGTCCTTTTCAGAATTTTAGACCCAGCTAGTTAGTAACTAGGCTTGAAAACAGGTATAAGTGGACCTCCTGGCAT - -a -s mr.mrrefChr0 28703 103 + 130230 CTATGAAATCAGATCAAGTAGCATGGTGCTTGTGGTTAAGGCACTACTTGATTTGAGAAGTCCCACCACTAAGTTCCCACTTAATTTTTACTAGACAGGATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30376 103 + 636262 CTATGAAATCAGATCAAGTAGCATGGTGCTTGTGGTTAAGGCACTACTTGATTTGAGAAGTCCCACCACTAAGTTCCCACTTAATTTTTACTAGACAGGATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 22536 103 + 647215 CTATGCAATCAGATCAAGTAGCATTGTGCTTAAGATTAAGGCACAACTTGATCTGAGAAATCCCACCACTAAATTCCCACTTAATTTTTACTAGACAGAATTT - -a -s mr.mrrefChr0 28806 39 + 130230 CACCTTGGGAAAGTATTCACAAATTTGAGGCTTCCCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30479 39 + 636262 CACCTTGGGAAAGTATTCACAAATTTGAGGCTTCCCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 22641 39 + 647215 CACCTTAGGTAAGTATCCACAAACATGGGGCTCCCTTGT - -a -s mr.mrrefChr0 28845 33 + 130230 GTAAGTATGTATGTGAGCCATCAATCAGCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30519 33 + 636262 GTAAGTCTGTATGCTAGCCATCAATCAGCAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 22680 33 + 647215 GTAAGTATGTATGTGGGCCACCAATCAGCTGTA - -a -s mr.mrrefChr0 28878 180 + 130230 TTTAGTCTTCTTAAGGAACAGCTGGTAGTTTGGGGTGTAAGTTTACTCTAATCACTCACTATAAAATGACCAGTGTCCTGTCCCTATGGTTGGCTACTACTCTTGATATACGCAGGATTAACAGCCAAAGGTTAGCCGTTCCATTGGTATGCTATGTCTGTAGCTACAACCTGATACACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30552 179 + 636262 TTTAGTCTTCGTAAGG-ACAGCTGGCAGTTTAGGGTGTAAGTTCACTCTAATCACTCACTATAAAATGACCAGTGTTCTGTCCCTATGGTTGGCTACTACTCTTGACATACGCAGGATTAACAGCCAAAGGTTAGCCGTTTCATTGGTATGCTAAGTCTGTAGCTACAACCTGATACACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 22714 180 + 647215 TTTAGTGTTCTTAAGGAACAATTGGTAGCTCGGGGTGTAAGTTTACTCTAGTCACTCACTATAAAATTACCGGTGTCTTGTCCCTATGCTTGGCTACTACTTATTATATACACAGGATTAACAGCCACAGGTTAGCCCTCCCATTGGTATGCTATGTCTGTAGCTATAACCTGATACACC - -a -s mr.mrrefChr0 29058 26 + 130230 TGTATTATAGGGATATTAGACATCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30732 26 + 636262 TGTATTATGGGGATATTAGACATCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 22894 23 + 647215 TGTATTATAGGGATATTAGACAT--- - -a -s mr.mrrefChr0 29084 42 + 130230 CTTGCACCACAAGGTGGTGATGCACCATGAGTCTACTAATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30759 42 + 636262 CTTGCACTACATGATGGTGATGTACCATGAGTGTACTAATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 22917 42 + 647215 ACTGCACCACAAGGTGGGGGTGCACGATGAGTCTAGTAATGA - -a -s mr.mrrefChr0 29126 28 + 130230 CCAGAGAACTTGAGAAAATGTGGTAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30898 28 + 636262 CCTGAGAACTTGAGAAAATGTGGTAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 22959 27 + 647215 CCAAAGAACTAGAGAAAATGTGGTTGC- - -a -s mr.mrrefChr0 29154 9 + 130230 GTGCCCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30927 9 + 636262 GTGCCCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 22986 9 + 647215 GTGCCCCTA - -a -s mr.mrrefChr0 29163 38 + 130230 CAGGCCTTCCCCAATTTCAATTTATATGCTGCTATCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31028 38 + 636262 CAGGCCTTCCCCAATTTCAATTTATATGCTGCTATTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 22995 38 + 647215 CAGGCCTTCCCCAATTTCTATTTATATGCTGCTATCCA - -a -s mr.mrrefChr0 29201 41 + 130230 AGGTTAACATTAAGTTAGTTAGATGTTGCTTGATTTTCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31098 41 + 636262 AGGTTAACATTAAGTTAGTTGGATGTTGCTTGATTTTCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 23033 41 + 647215 AGTTTAACACTGAGTTAGTTAGACGTTGCTTGATCCTTAAG - -a -s mr.mrrefChr0 29242 129 + 130230 CTTCTCTCTGCACTTGGATGTGCATATGATCGATGGAACATTTGCCAATCTGCATAAGAGTAATTCTTATATATTCCTGAATAGAGATCATCAGTAGATAAATAGCACCATCCTAGCATCATGGAGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31139 119 + 636262 ---------GCACCTGGATGTGCATATGATCAATGGAACATTTGCC-TTCTGGGTAAGGGTAATTCTTATATATTCCTGAATAGAGATCATCAGTAGATAAATAGCACCATCCTAGCATCATGGAGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 23090 129 + 647215 CTTCTCTCTGCACTTGGATGTGCATATGCGCGATGGCACAAACGTCAATCTGCATAAGAGTAATTCTTATATATTCATGGTTAGAGATCATCAGTAGATAATTAACAACATTCTAGCATGACAGAGGGC - -a -s mr.mrrefChr0 29371 77 + 130230 CATTAGTACTACGCTTTCTCCTTTTCTTCCCATAAGCTGTGTGTGAGTGCCTGACTTACTTAAGAGTTCTCCCCTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31258 77 + 636262 CATTAGTACTACGCTTTCTCCTTTTCTTCCCATAAGCTGTGTGTGAGTGCCTGACTTACTTAAGAGTTCTCCCCTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 23247 77 + 647215 CATTAGTAGTATGCTTTCTCCTTTTCTTGCCATAAGCTGTATGTCAGTGTTTGACTTACTTAAGAGTTCTCCCTTTC - -a -s mr.mrrefChr0 29448 69 + 130230 CCTGTACCATACCTGTGTGGTATGGGGGATGCCATCCTCTCTTATGAAAAGTAACTTAAAGTCCTGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31335 69 + 636262 CCTGTACCATACCTGTGTGGTATGGGGGATGCCATCCTCTCTTATGAAAAGTAACTTAAAGTCCTGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 23327 69 + 647215 CCTGCACCATACCAGTGTGGTATGAGAAATGCCATCCTCTCTAATCAAAAGTAACTTAAAGTCTTGTCA - -a -s mr.mrrefChr0 29517 7 + 130230 GATAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31518 7 + 636262 GATAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 23396 7 + 647215 GATATCA - -a -s mr.mrrefChr0 29524 24 + 130230 CACTCCCATAATATTACATTCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31526 24 + 636262 CACTCCCATAATATTGCATTCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 23403 24 + 647215 CACTCACATAATATTACATTCATT - -a -s mr.mrrefChr0 29548 42 + 130230 AAGGTGAATATTAATTATCTCTGTGCATTCATGATAGCACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31550 42 + 636262 AAGGTGAATATTAATTATCTCTGTGCATTTATGATAGCGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 23429 42 + 647215 AAGGTGAATATTAATTATCTCTGTGCATTCATGGTAGCAATG - -a -s mr.mrrefChr0 29590 44 + 130230 TGGAACTTTTTCTGTGTACCAGCAGGCAACTACACCTATATTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31592 44 + 636262 TGGAACCTTTTCTGTGTACCAGCAGTCAACTACACTTACATTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 23479 41 + 647215 TGCAACTTTTTCTGTGTACCAGCAGGCA---ACACCTATTTTTT - -a -s mr.mrrefChr0 29634 183 + 130230 GGACTCTGCTGCTCAACGGGTCCTTCTACCCATGAGTCGCTCTGTATGTTCCATTGTGGCCTTTACTGTTACACCTTGTGAGGACAAACCACTAGAGGCTTTTATTAAAGTGGTTGTTTGGATGGGTGTGGTCAGAATATTGGTGAAGTTACATTCTAGATATAGTCTTTGTAGGATACCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31639 173 + 636262 GGACTCTGCTGCTCAACGGGTCCTTCTACCCATGAGTCGCTCTGTATGTTCCATTGTGGCCTTTATTGATACACCT---------AAACTACTAGAGGCTTTTATTAAAGTGGTTGTTTGGATGGGT-TTGTCAGAATATTGGTGATGTTACATTCTAGATATAGTCTTTGTAGGATTCCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 23520 182 + 647215 GGG-TCTGCTGCTCAATTGATCCCTCTACCCATGACTCACTTTGTATGTTCGATTGTGCCCTTTACTGTTACACCTTGTGAGGACAAGCCACTAGAGGTGTTTATTAATGTTGCTGTTTGGTTGAGTGTGGCCAGAATATTGGTGAAGTTACATGCTAGATAGAGTCTATGTAGGTTACCCCT - -a -s mr.mrrefChr0 29817 93 + 130230 TCAACTAATCCTTTCTAAGAGGCCTACTGAACTCTCCAATGTCGCCATTCTTGTTTTGTTGATAGCCAGTTCCAACCCACTCTGATTTTGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31812 61 + 636262 TCAACTAATCCTTTCTCAGAGGCATACTGAACTCTCCAATGCCACCATTCTTGTTTTGTTG-------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 23703 93 + 647215 TCAACTAATCGTTTCTAAGGGGCCTACTGGACTCTCCGATGTTGCCATTCTTGTTTTGTTGATAGCCAGTTCCAACCCACTCTGATTTTGATG - -a -s mr.mrrefChr0 29910 19 + 130230 ACTATTCTTAGATGTTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31873 15 + 636262 ----TTCTTAGATGTTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 23798 19 + 647215 ACTACTCTTACATGTTGTA - -a -s mr.mrrefChr0 29929 234 + 130230 TTTTTAAACAGGCTTCTCTTGTACAGCTATACCAACCAGTCACTAACTTGTCAGGTGACTCCAGGGCTGCTAAGGGCTGCATGCCTTTCTAGGCCTGTATCAAGTTATTCAGCGTTACAGATAAAGTAGTATTCCAATTGGAATAGGGGTGGTGTCTGACTCATTTTAGGGGCGAAGAAGTTTGTAGCAAATTTTGAAAAAATGTTAACTTAACCACCAACTATCAATAGAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31889 234 + 636262 TTTTTAAACAGGCTTCTCTTGTACAGCTATACCAACCAGTCACTAACTTGTCAGGTGACGCCAGGGCTGCTGAGGGCTGTATCCCTTTCTAGGCCTGTATCAAGTCATTTAGGGTTACAGATAAAGTAGTATTCCAATTGGAATAGGGGTGGTGTCTAACTCATTTTAGGGGCGAAGAAGTTTGTAGCAAATTTTGAAAAAATGTTAACTTAACCACCAACCATTAATAGAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 23817 220 + 647215 TTTTTAAATAGGCTCCTCTTATACAGCTATATTAATCAGTCACTAACTTGTCAGG-GGCTCAAGGGCTGCTAAGGGCTGCATGCCTTTCTAGGCCTGTATCAAGTTATTCAGCGTCAGAGATAAAGTAGTATACCACTTGGAT-AGAGGTGGAGTCTG---------AGGGGCGAGGAAGTTTGTAACAACTTTTGAAAAAATGTTA---TAACCTCCAACTATCAATAGAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 30163 130 + 130230 ATACTGATGTCCTGTCCTAGTCCAAGTCTTGATGCCTAGATAGTGGGTAAAGACAAAATATGGTCACCAAAGGGAACTATATAATGAACCAGTAAATACAGAACATTTGGTATCAGTGTGGAAGTCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32124 130 + 636262 ATACTGGTGTCCTGTCCTAGTCCAAGTCTTGATGCCTAGATAGTGGGTAAAAACAAAATATGGTCACCAAAGGGAACTATATAATGAACCAGTGAATACAGAACATTTGGTATCAGTGTGGAAGTCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 24037 127 + 647215 ATACTGATACTCACTCTTAGTT---GTCTTGAAGTCTAGATTGTGGGTAAAGACAAAATATGGTCACCAAAGGGAACTATATAATGAACCAGTAAATACAGAACATTCGGTATCAGTGTGGAAGTCTGTA - -a -s mr.mrrefChr0 30293 81 + 130230 TCCCAGATTTCATGTATATGACTCAATAGATTATGTTGGGGCTCTTTCCCCATTCGTAGTAGTCAAGGGCTGAAGATCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32254 67 + 636262 TCCCAGATTTCATGTATA--------------ATGTTGGGGCTCTTTCCCCATTCGTAGTAGTCAAGGGCCGAAGATCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 24165 81 + 647215 TCCCAGATTTCATGCATATGACTCAATAGATTATGTTGGGGCTCTTTCCCCACTCGTAGTACATAAGGTCTGAAGATGATC - -a -s mr.mrrefChr0 30374 90 + 130230 CATCTCGCAACGATACTTGGAACATGACCTGGTAGTCAGCCCACCTTGAAACAGCAGAGTAAGTATGAGTTACTGACAAACATGACTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32321 89 + 636262 CATCTCGCAACGATACTTGGAACATGACCT-GTGGTCAGCCCACCTTGAAACAGCAGAGGAAGTATGAATTACTAACAAACATGACTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 24559 90 + 647215 TATCTCGCAAGTCTACTTGGAACACGACCTGGTAGTAACCCCACCTTGCAACAGCAGAGTAAGTCTGAGTTACTGACAAACATGACTCTG - -a -s mr.mrrefChr0 30464 373 + 130230 ATTGATATAACAAGGGCAATTAACGCCAAGCATCAATGAGAAGATGGTCGATGCGGATGATATAAGGCGTTTTTAAATTACAGTAACTGTCACATAGAACGTTAAATCAGGTTTTTCAGCAACACTCTCATATAATAATTCTATGGTGGACAAAAAATGGTTGAGGCCAGATCAGTTACTACAGGTTAATTAAATTCTTAGAATGTTTTAGTGCTCCAATGCTTCATCCTGATTGTTGATGAATACAGGAGCACTATAGGAAAACTTTCACGGAATGCTTAATAGGATATGATAGGCTCCTTTTGTTCCAATTTGAAAATTTACTACCAGTGATGCCTAGTACCATTCTACAGATCGCACAAGAACAAGGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32410 373 + 636262 ATTGATATAACAAGGGCAATTAACGCCAAGCATCAATGAGAAGATGGTCGATGCGGATGATATAAGGCGTTTTTAAATTACAGTAACTGTCACATAGAACGTTAAATCAGGTTTTTCAGCAACTCTCTCATATAATAATTCTATGGTGGACAAAAATTGGTTGAGGCCAGATCAGTTACTACAGGTTAATTAAATTCTAAGAATGTTTTAGTGCTCCAATGCTTTAGCCTGGTGGTTGGCAAATACAGGAGCACGCTAGGTAAACTTTCATGGAATGCTTAATAGGATATGATAGGCTCCTTTTGTTCCAATTTGAAAATTTACTACCAGTGATGCCTAGTACCATTCTACAGATCGCACAAGAACAAGGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 24650 372 + 647215 ATGGGTAGAACACAGGCAAATTAGGCCATGCATTGATGAGAAAATGGTAAACGCAGATGATATAAGATCTTGTTAAAAATCAGTCACTGTCACATAGAGTGTTAAATCAGGTTTCTCAGTCAGACTCTCACATAATAATTCTATGGTGGACAAAAAATGGTTGAGGCCACATCAATTAGTACAGGTTACTTAAATTCTTAGAATGTTTTAGTGCTCAAATGC-TCATCCTGATTATTGATGAATACAGGAGCACTATGGGAAAACTTTCACAGAATGCTTAATAGGATACGATCAGCTCCTTTTGTTCTAATTTGAAGATTTACTACCAGTGCTGCCAAGAACCACCCTACAGATCATACAAGAACAAAGCAC - -a -s mr.mrrefChr0 30837 74 + 130230 AGACATATGCTTAGGGCACTTCCAGGCTATGGCAATCTCTTTCTGTGGTAATTTGAAGCTTCACTACCAGTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32783 74 + 636262 AGACATATGCTTAGGGCACTTCCAGGCTATGGCAATCTCTTTCTGTGGTAATTTGAAGCTTCACTACCAGTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 25038 69 + 647215 AGAAATATGCCTAGGGCACTTCCAGGCTATGACAATCTCTTTCTGTGGGGACTTGAAG-----CTACCAGTGGT - -a -s mr.mrrefChr0 30911 79 + 130230 ATTTAATTACTACTCTATGAATAACCCAAGAGCTAAGCGCTCTTAAGTTTACTCCAGTCATATCATTAAAGGCAATTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32857 78 + 636262 ACTTAATTACTACTCTCTGAATAA-CCAAGAGCTAAGCGCTCTTATGCTGACTCCAGTCATATTATTAAAGGCAATTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 25114 79 + 647215 GTTTAATTACTACTCTATGAATAACCCAAGAGCTAAGCACTCTCAAGTTTACTTCATTCCTGTCATTAAAGGCAATTCC - -a -s mr.mrrefChr0 30990 339 + 130230 AGACTAAGTCACAACACAAATTTGAACAAGGTGGGGTACAAGGGACCTTTTGTTAATTGTCTGATATTGTGTGGATTATTTATATCGTCTTACATCGTTCCTGCTGCCCAATTGCATACCTTTCAGCATAGTAGTCCTTGCTCCCCACTCACATACAAACACACTGGGGCATATATAAATGTAAACTACACTCCACCAAACTAGAAGAGTAATGAGGTGTCTCCACCTTCAATGGGAGCAACTCTACATATGTATGGTATTGCCTATATGCTAGCCACACTACCCCAAAGCAAGGGCGAACTGGTTGTATGAAAGCCTCCTTTTAGTTTCAAGGACTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32936 331 + 636262 AGACTAAGTCACAACACAAATTTGAACCAGGTGGGGTAGAAGGAACCCTTTGTTAATTGTCTGATATTGTG-GCATTATTTATAT--TCTCACATCGTTACTGCTGCCCAATTGCATACCTTTCAGCATAGCAGTCCTTGCCCACCACTCACATCCAAACACACTGGGGCATATATAAATGTAAACTGCACTCCACCAAACTAGAAGAGAAATGA-----CTCCACCTTTGATGGGAGCAACTCTACATATGTATGGTATTGCCTATAAGCTAGCCACACTACCTCAAAGCCAGGGCGAACTGGTTGTATGAAAGCTTCCTTTTAGTTTCAAGGACTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 25193 327 + 647215 AGACTAAGTCACAACATCAACTTGCACAGGGTGGCATACAAGGGACCTTTTGTTACTTGTCTGATATTGTGTGGGTTATCTGAATCGTCTTACATCATTCCGGCTGCCCAATTGCATATCTTTCAGCATAGTAGTCCCTATTCCCCACTCA-ATACAAACACACTGGGGCATTTAT---------TTACATTCCACCAATCTAGAAGAGTAATGCGGTGTCTCCACCTTCACTGGGAGCAAATCTACATGTGTATGGTATTGCCTATATGCTCTCCACACTGCCCCAAAGTAAGGGCTAACTTGTTGTACGAAAGCCTCCTTTTAGTT--GAGGACTGA - -a -s mr.mrrefChr0 31329 91 + 130230 CAAACATTAAGTAAAAGGGAGTCATTCTGCATTCTATGTACATGTATGTCTATGCACCTAAGTGTACATAGCTGGGCTGCTCCAATATAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33267 91 + 636262 CAAACATTAAGTATAAGGGAGTCATTCTGCATTCTATGTACAGGTATGTCTATGCACCTAAGTGTACATAGCTGGGTTGCTCCAATATAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 25521 86 + 647215 CAAACCTTAAGCAAAAG-----CACTTTGCATCCTCTCTACATGTATGAATCTGCACCTAGGTGTACATAGCTGGGCTGCTCCAATATAGC - -a -s mr.mrrefChr0 31420 34 + 130230 TCTACCGTTACTCCAATATATCAGTTTATCAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33360 34 + 636262 TCTACCGTTACTCCAATATATCAGTTTATTAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 25607 34 + 647215 TCTACCGTTACTCCAATATATCAGTATATCAAAT - -a -s mr.mrrefChr0 31454 156 + 130230 CATGCAAAGTGAAATAACACTAAATTGCTGGGTGATTTTCTCAAGACCTAGGGAGTCAAGAGTAAGCGCATTGTGTTTATTTGTAGAGTTCTAAGCCCTGAGTTTACTCTGATTTCCTTACTTTCTAATCTAACCAGCATGAATCCCCTTAGGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33394 156 + 636262 CATGCAAAGTGAAATAACACTAAATAGCTGGGTGATTTTCTCAAGACCTAGGGAGTCAAGAGTAAGCACATTGTGTTTATTTGTAGAGTTCTAAGCCCTAAGTTTACTCTGGTTTCCTTACTTTCTAATGTAACCAGTATGAATCCCCTTAGGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 25643 137 + 647215 CATG----------------TAAATTGCTGGGTGATTATCGCCAAACCTAAGGAGTTGAGAG--ATCGCATTATGTTTCTTTGTAGAGTTCTAAGCCCTGACTTTACTCTCATTTTCTTACTTTCTAATCTAA-CGGCATGAATCCCCTTAGGTCT - -a -s mr.mrrefChr0 31610 196 + 130230 CTCCCTTTTCTTTATTATCTCGTTATCTTTATTAGCTGCTTCCATTCATCCCAGCTGAACTGCACATCTCTTCAACTGACTTAAGACTCCTACTAACCTGTGGGCCCAGAAGTCACTCTAAGACTAGTGAACTTACTATCAGGATTATCCTCAAGACTTAATAACAGGCTCCTTTCCATAGCCCTCCAAATGGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33551 196 + 636262 CCCCCTTTTCTTTATTATCTCGTTATCTTTATTAGCTGCTTCCATTCATCCCAGTTGATCTGCACAGCTCTTCAACTGGCTTAAGACTCCTACTAACCTATGGGCCAAGAAGTCACTCTAAGACTAGTGAACTTACTATCAGGATTATCCTCAAGACTTAATAACAGGCTCCTTTATATAGCCCTCCAAATGGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 25780 186 + 647215 CTCCCTTTTCTTTGTTAACTAGTTATCTTTATTAGGTGGTTCCATTCATCCCAGCTCAACTGCAAATCTCTTCAACTGACTTAAGATTCCTACTAACCTGCGGGCCCAGAAGCCACTCTAAGACTAGTGAATTTATTACCAGGATTATCCTCAAGGCTGAATAACAGGCTCCTTTCCAT-GCCCTCC--------- - -a -s mr.mrrefChr0 31806 102 + 130230 GATGAACTACTGCCCAACCAGATCAAGACTCCTAGTGAAACCTTGCCTCTCATCTCAGTAGGGTTGCTGAAGACACCACCACAAGTGATACTATAGTTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33752 102 + 636262 GATGAACTACTGCCCAACCAGACCAAGACTCCTGGAGAAACCTTGCCTATCATCCCAGTAGGGTTGCTGAAGACACCACCATGAGTGTTACTATAGTTATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 25966 85 + 647215 ----------------ACCTGATCAAGACTCCCAATGGCACCTTGCCTCTTATCTCTGT-GGGTTGTTGAAAACACTACCACAAGTGATACTCTAGTTATTA - -a -s mr.mrrefChr0 31908 28 + 130230 AGATGTACTTTCAGATATGAACTGCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33855 28 + 636262 AGATGTATTTTTAGATATGAACTGCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26051 28 + 647215 AGCCGTACTTTCCGATATGAAGTACTTT - -a -s mr.mrrefChr0 31936 43 + 130230 TTTGAATCTGGACTACTAGACCCTTCTTTAGTGCTTCATGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33888 43 + 636262 TTTGAATCTGGACTACTAGACCCTTCTTTAGCGCTTCATGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26079 33 + 647215 ----------GGCTACTACACCCTTCTTTAGTGCTTCatggac - -a -s mr.mrrefChr0 31979 158 + 130230 GTACATTCACTGTGATTAGCCTTAGGCTCTCATACATTGAGTGGTGGCACCCAGCTGGTTGAACATGATCACCTATGACACATTTCACTCTGTGAGATAGTGGTATGACATATCACAGGGGCTGGCTTGGGAGTCAATGTGGCTCCTTGTCCCGCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33931 158 + 636262 GTACATTCACTATGATTAGCCTTAGGCTCTCATACATTGAGTGGTGGCACCCAGCTCGTTGAACATGATAACCTATGACACATTTCACCCTGTGAGATAGTGGTATGACATATCACAGGGGCTGGCTTGGGAGTCAATGTGGCTCCTTGTCCCGCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 156489 154 + 647215 GTACATTCACTGTGTTTAGCTTTAGGCTCTCATACATTGAGTGGTGGCACCCAGCTGGTTGAACATGGTCACCTATGACACATTTAACTCTGTGAGATAGTGGTATGAC----CACAGAGGCTAACCAGGGAGTCAATCTGGCTCCTTGTCCAGCAGA - -a -s mr.mrrefChr0 32137 2 + 130230 tc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34089 2 + 636262 TC -s simRat_chr6.simRat.chr6 26173 2 + 647215 cc - -a -s mr.mrrefChr0 32139 20 + 130230 aagcactaggggagtagcaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34091 20 + 636262 AAGCACTAGGGGAGTAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26192 20 + 647215 gagcactaggggggtaggaa - -a -s mr.mrrefChr0 32159 31 + 130230 ttttaacgtatggacactaatcagccactCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34115 31 + 636262 TTTTAACGTATGGACACTAATCAGCCACTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26212 31 + 647215 ttttgatgtctggacactaatcaggtgctCA - -a -s mr.mrrefChr0 32190 9 + 130230 AATAGTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34146 9 + 636262 AATAGTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26244 9 + 647215 AATAGTTTA - -a -s mr.mrrefChr0 32199 27 + 130230 GGATTTGCAATCCAGTTGAGTGCTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34155 27 + 636262 GGATTTGCAATCCAGTTGAGTGCTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26254 27 + 647215 GGATTTGCAACCCAGCTGAGTACTATT - -a -s mr.mrrefChr0 32226 61 + 130230 AAACTTGTCTTGTCTCATGAGTCCCCTTGCATAATTTTTCCATGACAGAGTAAATATCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34182 61 + 636262 AAACTTGTCTTGTCTCATGAGTCCCGTTGCAGAATTTTTCCATGACAGAGTAAATATCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 26284 61 + 647215 AAACTTGTTTTGTCTTATGAGTCCCCTTGCATAATTTTCCCATGACAAAGTAAATATCTAT - -a -s mr.mrrefChr0 32287 246 + 130230 ATTTTGTTGTAGGGAACCTACTTAATTGGAAAGTCATTATGGATAGTTAGTGTTGCTGTGTGTGTGGCTTACACCCTCATCTACTAATTATGATAGGTGGAGATACAATAATATAGAATCCAAGCTTGAGAGGAAAGGTTTCAATAGGTCAAGAGCAATACCAAATTGTCATACACTGTGATGTGGATTATCTCTGCTTTCATCATGTACATTTATAAACTCACTTGTCCTTTTGCAGTGCCCGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34259 245 + 636262 ATTTTGTTGTAGGGAACCTACTTGATTGGAAAGTCAATATGGG-AGCAAGTGTGGCTGTGTGTGTGGTTTACATCCCCATCTACTAATTATGACAGGTGGAGATACAATAATATAGAATCCAAGCTTTAGAGGAAATGCTTCAATAGGTCAAGAGCAATACCAAATTGTGATACACTGTGGTGTGGATTATCTCTGCTTTCATCATGTACATTTATAAACTCACTTGTCCTTTCGCAGTGCCCGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 26345 243 + 647215 ATTTTGTTGCAGTGAACCTACTTAATTCAAAAGTCATTATGGATAGTTAGTGTTACTGCGTGCGTGGCTTACACCCTCATCTACTAATTATGATAGGTGGAAAT---ATAATATAGAATCTGAGCTTGAGAGGGAAGGTTTCAATAGGTCAAGAGCAATATCAGATTGTCATACACTGTGATGTGGAATATCTCTGCTTTCATCATGTACATTTAAAAGCTCACTTGTCCGTTTGCAGTGCCCGTG - -a -s mr.mrrefChr0 32533 96 + 130230 CTACTCCTATTAACTTACATTCCTTATTTCCCTCTAATTTTTCACTCATTGCCCCCATCTCAGTCAAAATACTGCTGGACCCCTCTCCAATTCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34510 96 + 636262 CTACTCCTATTAACTTACATTCCTTATTTCCCTCTAATTTTTCACTCAGTGCCCTCATCTCAGTCAAGATACTGCTGGACCCCTCTCCAATTCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26588 96 + 647215 CTACTCCTATTACAGTACATTCCTTGTTCTCCCCTAATTTTTCACTCATTGCCCCCATCTCAGTCAAAATACTGCTGGACCCCTCTCCAAGTCCCT - -a -s mr.mrrefChr0 32629 66 + 130230 GAATTTGCAGAAAGTTGGCCCCAATATCGCTATTACATTGCAAATTGTTATGACAAAGATAGCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34630 66 + 636262 GAATTTGCACAAAGTTGGCCCCAATATCGCTATTACATTGCAAATTGTTATGACAAAGATAGCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 26684 63 + 647215 GAATTTGCAGAAAGTTGGCCCCAAGA---CTATTACAATGCAATTTGTTATGACAGAGATACCTCC - -a -s mr.mrrefChr0 32695 17 + 130230 CAGTCCTAGAGTAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34699 17 + 636262 CAGTCCTTGAGTAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26747 17 + 647215 CAGGCCTAAAGTAACAT - -a -s mr.mrrefChr0 32712 54 + 130230 GTTGTGGGCAATGCCTGCTGTCCAGTGATCTTGACATCAACAGTTCTTACGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34716 54 + 636262 GTTGTGGAGAACACCTCCTGTCCAGTGATCTCGACATCAACAGTTCTTACAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26765 54 + 647215 GTTGTGGGCCATGCCTGCTGCCGAGTGATCTTGACTTCAACAGTTATCACGGCA - -a -s mr.mrrefChr0 32766 81 + 130230 GCACTTGTTGCCATTGGGAGGAAGGTATCATCAGATTAACAAGTTAATTCCCCAGGGCCAGAGGCTATAAATGGTGGTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34770 81 + 636262 GCACTTGTTGCCAATGGGAGGAAGTTACCATCAGATTAACAAGTTAATTCCCCAGGGCCAGAGGCTATAAATGGTAGTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26820 64 + 647215 GCATTTGGTGCCATTGGGAGGGAGGTATAATCAGGTTAACAAGTT-----------------GGCTATGAATGGTGGTAGA - -a -s mr.mrrefChr0 32847 189 + 130230 CTGAAGAGAAGTTCATATGTTGCACATCATCTGTACCTATGCTCAACTGCACCTTTCCTGGAATTCCATTTTGAAGTGAAGTGCTGGATTTTTTGAAATGCTGCTCACTAATCAAGATTAACAATTCAGAATAAGTTTCTACTTGTATAATAGGTTTCTCAGCTAGCTCAGTATTTCATTTCCATCTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34851 185 + 636262 CTGAAGAGAAGTTCATGTGTTGCACATCATCTGTACCTATGCTCAAATGCACCTTTCCTGGAATTCCATTTTGAAGTGATGTGCTGGATTTTTTGAAATGCTG----CTAATAAAGATTAACAATTCAGAATAAGTTTCTACTCATATAATAGGTTTCTCAGCTAGCTCAGTATTTCATTTCCATCTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 26890 189 + 647215 ACAAAGAGAAGTTCATATGAAGCACATCATTTGAATCTATGTTCGACTGCATCTCTCCTGGGATCCCATTTTTAAGTGAAGTGTCGGATTTTTTGAAAACCTGCTCACTAATCAAGATGAACAACTCAGAATAAGTTTCTACTTGCATAATCGGTTTGTCAACTCGCTTAGTATCTCATTTCCATCTAG - -a -s mr.mrrefChr0 33036 237 + 130230 TAAATTTAGATTTTGTTAGAAAGGTCACTAAATCTTAATGGCAACAAGTGGCACTGTTGGACTCCCATGTGAATCTAGAACAAGCCACTCACCGCTAAACAAAGGGATCATAGGAGCAAAGAGGGTTTCCTTGAATGGGCTCAAACAGCATTTGCGTCAAATGATTCACTCACAAAATAGACTTTGAATGTGTCACGAGACTTTTAACTTGAAGTCCAATCAAGGATAACTGACAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35036 209 + 636262 TAAATCTAGATTTTGTTAGAAAGGTCACTAAATCTTAATGGCAACAAGTGGCACTGTTGGACTCCCATGTGAATCTAGAACAAGCCACTCACCGCTAAACAAAGGGATCATAGGAGCAAAGGGGGTTTCCTGGAATGGGCTCAAACAGCACTTGCGTCAAATGATTCACTCACAAAATAGACTTTGAATGTGTCATGAGACTTTTAACT---------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 27099 236 + 647215 TAAATTTAGATTTTGTCAGAAAGGTCACTAAACCTTAACGGCGACAAGTGGTAATGTTGCACTACTATATGACTCTAGAACAAGCCACTCACTCCTAAACAAAGGGACCATCGGTGCAAAGAGAGTTTCCTTGAATGTGATTAAACAGTATTTGTGTCAAATGA-TCACTCACAAAATAGACTTTGAATGTGTCACGAGACTTTTAACCTGAAGTCCAATCAAGGATAACTGACAGT - -a -s mr.mrrefChr0 33273 101 + 130230 CGTTGGTCTAGGGGACATTAGTTTGCAACCTTGTTTAACGAACCCCCAACTAATTGAACTGGAATACTAAGATGGATTCCTCTGAACAAGGAGACATGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35245 101 + 636262 CGTTGGTCTAGGGGACATTAGTTTGCAACCTTGTTTAACGAACCCCCAACTAATTGAACTGGAATACTAAGATGGATTCCTCTGAACAAGGAGACATGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 27556 101 + 647215 CGTTGGTCTGGGGGACATTAGATTGCAACCTTGTTTAATGAACCTCCAACTAATTGAACTGGAGCACTAAGATGGATTCCCCTGAACAAGGAGACATGCTA - -a -s mr.mrrefChr0 33374 81 + 130230 GATCCTTGCCAGCCTAACAAGAGGACAGTACCACACCCCCTGCTAATAATGGGACTGAATCAACTATAATCAACTATTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35346 81 + 636262 GATCCTTGCCAGCCTAACAAGAGGACAGTACCACACCCCCTCCCAATAATGGGACTGAATCAACTGTAATCAACTATTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 27662 81 + 647215 GATCCTTGCCAGCCCAACAAGAGGACAGTACCACACCCCCTGCTAATAACAGGACTGAATCAGCCATAGTCAACTATTGGC - -a -s mr.mrrefChr0 33455 150 + 130230 AATAAGTGATATCATAATTTTGTATAATTGATTAACAATCTTCTTACAGCTATAACAAGTTCCACAACACAATGATAGCAAAAGTACCCAGGGTAATAAGTAACCATATGATAAAGCTCAAGAACTTAACCATTGCACACTCTTCCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35429 148 + 636262 GATAAGTGATATCATAACTTTGTATAATTGATTAATAATCTTCTTACAGCCACAACAAGTTCCACAATACAATGATAGCAAAAGTACCCAGGGTGATAATTAGCCATATGATCAAG--CAAGAACTGTACCGTTGCACACTCTTCCAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 27743 150 + 647215 AATAAGTGATATCATAATTTTATATAATTGAGAAACAATCTTCTTACAGGTATAACAAGTTCCACAACACCATTATAGCAAAAGTACCCAGGGCAATAAGTAACCATATGATAAATCTCAAGAATCTAACCATTGCACACTCTTCCAGTT - -a -s mr.mrrefChr0 33605 211 + 130230 AAAGCCTGTGTATGATGAATTACAAATCCTACAAAGGACAAAAGATTCTCTCGCCTGTGAGAACAACCCCTACAGGGTTTTAGCCCCTGAAGCTTTAGACTGTGCCTACCCTTATTATGAACAGAAAGTGCACACTCTGTTCACCTTAACTTAGGGCAGCATGAGATCATGTTAATTGCTCATAAAAGATGTATTGACAATTTGAGGGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35589 206 + 636262 AAAGCCTGTGTATGATGAATTACAAATCCTCCAAAGTACAAAAGATTCTCTCGCCTGTGAGAACAACCACTACAGGGTTTTAGCCCCTGAAGCTTTAGACTCTGTGTTCCCTTTTTATGAACAGAAAGTGCACACTCTG-----CTTGACTTAGGGCAACATGAAATTATGTTAATTGCTCGTAAAAGATGTATTGGCAATTTGAGGGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 27893 211 + 647215 AAAGCCTGTGTATGATGAGTTACAAATCCTACAAAGGACAAAAGATTCTCCTGCCTGTGAGAACAACCCCTGCAGGGTTTTAGCCCCTGGGTCATTAGGCTGTGCCAACCCTGATTATGAACAGAAAGTGCACACTCTGTTCACCTTAGTTTAGGGCAGCCTGAGATCATGTTAGTTGCTCATAAAAGATGTATTGACAATTTGAGGACGT - -a -s mr.mrrefChr0 33816 481 + 130230 ATTCTTGCTTTATGTGGTTGCCATCCATCTCAATGTCATACTTCCATCAGCATGTGGCCTGTCCTCAGCCCTTTATCTCTATGCCCAAAGCTCCAAACCCAATTTTTGCAGCTACACTACACCTACAAGCTACAACCTTAGTGAATACTCTGCATGGCCACTACATGTTATGTCACATTCACCAGCTATGGATACTTTACAGAGTGATCAAGAGCAATGGGGTACAAAGTGGAATGCACACTCAATTAAGACAAAGAATGTAAAGAGAATGTATACACAGGGTGTCTACATAGTCAATGATCTTGCTCTTGTTGCTTGGTCTTCGTTGCTTGCTCTTGTTGACAGTCACATTACATCTGAACAACGTATACTGGTGCTTCAAAGTACACTCCCCTAGGTAGATAAATAGGCTGCACACTGGAAGGCCATGAAAGTCCATGACAATTACTGCTAGTAGCTAGTAACTTTCTAGAGAAAGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35796 467 + 636262 ATTCTTGCTTTATGTGGTTGCCATCCATCTCAATGTAATACTCCCATCAGCGTGTGGCCTGTCCTGAGCCCTTTATCTCTATGCCCAAGGCTCCAAACCCAATTTTTGCATCTACAC------------CTACAACCTTAGTGAATCCTCTACATGGCCACTACATGTTATGTAACAT--ACCAGCTATGGATACTTTACAAAGTGACCAAGAGCAATGGGGTACAAAGTGGAATGCACACTCAGTTAAGCCAAAGAATGTAAAGAGAATGTGTACACAGGATGTCTACATAGTCAATCATCTTGCTCTTTTTGCTTGGTCTTCGTTGCTTGCTCTTGTTGACAGTCACATTACATCTGAACAACGCATACCGGTACTTCAAGGCACACTCCCCTAGGTAGATAAACGGGCTGCAGACTGGAAGGCAATGAAAATCCATGACAATTTCTGCTAGTAGCTAGCAACTTTCTAGAGAAAGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 28104 477 + 647215 ATTCTTGCTTTATGTGGTTGCCATCCATGTCAGTCTCATATCTACATCAGCATGTGGTCTGTCCTCAGCCCTTTCTCTCTATGCCCAAAGCTCAAAACCCAATTTTTGCAGCTACACTACACCTACAAGCTATAACCTTAGTGAATACTCTGCATGGCCACTACATGTTATGTCACATTCACCAGCTATGGATGGTTGGCTGAGTGGTCAAGAGTAATGGGGCAGAAAATGAAATGCACTCTAAATTAAAACAACGAATGTAAAGAGAATGTACACATAGGGTGTCTACATAGTCAATGTTTTTGCTCTTGTTGCTTGTTCTTTATTACTTGCTCTTGTTGACAGTCATATTAAATCTGAACAACGTATACTGATGCTTCAAAGTACACTTCTCTAGGTAGAT---TAGGCTGCACACTGGAAGG-CATGAAAGCCTGTGACAATTACTGCTCATTACTAGTAACTTTCTAGAGAAAGGTG - -a -s mr.mrrefChr0 34297 105 + 130230 TTGGAGGATTGGACACACTGGTGGTTATGACAAGCTATTGAGGCCAGCATTGAAACAGAAGCAATTGATAGTCCAAACATGTGACATTAACATTGTTTAGATTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36263 102 + 636262 TTGGAGGATTGGACACACTGGTGGTT---ACAAGCCATCGAGGCCAGCATTGAAACAGAAGCAATTGACAGTCTAAACATGTGACATTAACATTGTTTAGATTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 28589 105 + 647215 GTGGAGGATTGGACACACTGGTGGGCATGATAAGCTGTTGAGGCCAGCATTGAAACAGAAGAAATTGATGGTCCAAACATGTGACATTAACATTGTTTAGATTTT - -a -s mr.mrrefChr0 34402 37 + 130230 ATGACGCACTGTCAAGCAATCACATGCACCTGTAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36371 37 + 636262 ATGACGCACTGTCAAGCAATCACATGCACCTGTAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 28694 37 + 647215 GTGATGCACTGTCAAGCAATCACAGGCACCCTTAGAA - -a -s mr.mrrefChr0 34439 30 + 130230 GCGCCTGCTTGCCTCATGTAAGAGGTTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36408 30 + 636262 GCGCCTGCTTGCCTCATGTAAGAGGTTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 28732 30 + 647215 GAGCCTGCTTGCCTCATGCCAGAGATTTGT - -a -s mr.mrrefChr0 34469 77 + 130230 CATGTAACTCGCTGTGTATATTCTAGATCCCCTGTCCAACTCGCACACTGTTGAGTGATCATAGGCAGTTGTAGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36438 77 + 636262 CATGTAACTCGCTGTGTATATTCTAGATCCCCTGTCCAACTCGCACACTGTTGAGTGATCATAGGCAGTTGTAGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 28764 77 + 647215 CATGCAGCTCCCTGTGTATATTCTAGATCCCCTGTCTAACTTGCATGGTGTTGAGTGATCACAGGAAACTGTAGAAG - -a -s mr.mrrefChr0 34546 37 + 130230 ACTCAGTACCCTTCACCTGTGGAAGAAGCCTGGATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36515 37 + 636262 ACTCAGTACCCTTCACCTGTGGAAGAAGCCTGGATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 28842 37 + 647215 ACTCAGTGCCCTTCATCTGTGGCAGGAGCCTGCCTGA - -a -s mr.mrrefChr0 34583 143 + 130230 CCGAACAACCTTAATGTACCAATAGTAAAGGCACATAAAAAGCAAGCTAGTCGGCCTGTCTAACTAGCCAAGTTTTTAGACCAAACATGATGTCCCCTTATGACCAATCACTAATCTTTCATTCATATTAGGAGCAATTAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36558 143 + 636262 CCGAACAACCTTAATGTACCAATAGTAAAGGCACATAAAAAGCAAGCTAGTCGGCCTGTCTAACTAGCCAAGTTTTTAGACCAAACATGATGTCCCCTTATGATCAATCACAAATCTTTCATTCATATTAGGAGCAATTAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 28879 143 + 647215 CCAAACAACCTTAATGTACCAATAGGAAAGGCACATAAAAAGCAAGCTAGTCAGCCTGTCTAACTAGCCAAGTTCTTAGGACAATCATGATGTCCCATCATGACCAATCACTAATCTTTAACTCATGTTAGGAGCAATTAACT - -a -s mr.mrrefChr0 34726 603 + 130230 ATGTTAGCAGCAATTTGGTGACTTATGAGGCTACTACTGGTGTCTCTGGACATGCAATATCACACTTTGCACACATGTCTTTATTTGCAGTAACAACAAACAATCTTGATATATTTCTAATTGGCCAGATCAGCACATGAATTATTCAAACCAATGGTGGTTTTGAAAAATGAATGCATCTCACATGCATTTGACATGAgattgatttctattaacatgccTGTACATCAGTGTCATCTACATATGGGGTGACGATGTTGTTAATGGTTATTCAAATAAAACTTCAAATCTGCAACTGACATAAAGTGCTTCCTCATTTCACACTACCATGTAGCCTGTTGATGTGTACCCCCCCAGGTTCACTCATTCAATATGTTCCCACACTCATCTAGCCCAATTTCCTGAGTTGGATTATACTTGAGGAAAGCCCTAGAAAATTTCCAACCTTCAATGACAAAATGGCATGATCCTTCTGGCAAAAAGTCTTAGTACACTCATAATAATTTCCCTAACCACCTCTGCAGTTCACTTCTAGGGGCTATGTGCACAGCCCAGTCGCAGGATCGATGGAGGATCTCATGATAGCTATTGTGTATCTAGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36701 572 + 636262 ATGTTAGCAGCAACTTGGTGACTTATGAGGCTACTACTGGTGACTCTGGACATGCAATATCATACTTTGCACACATGTCTTTATTTGCAGTAACAACAAACAATCTTGACATATTTCTAATTGGCCAGATCAGCACATGAATTACTCACACCAATGGTGGTTTTGAAAAATGAATGCATCTCACATGCATTTGACATGA----------------------TGTACATCAGTGGTATCTACATACGGGGTGACGATGTTGTTAATGGTTATTCAAATAAAACTTTAAATCTACCACTGACATAAAGTGCTTCCTCATTTCACACTACCATATAGCCTGTTGACACGTACCCCCCCAGGTTCACTCATTCAATATGCTCCCTCAACCATCTAGCCCAATTTCCTGAGTTGGATTATACTTGAGGAAAGCCCTAGAAAATTTCCAACCTTCAATGACAAAATGGCATGATCCTTCTG-CAAAAAGTCTTAGTACACTCATAATAATTTCCCTAA--------GCAGTGCACTTATATGGGCTATGTGCACAGCCCAGTCACAGGATCGATAGAGGATCTCCTGGTAGTTATTGTGTATCTAGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 29023 602 + 647215 AAGTTAGCAGCAATTTGGTGACTTATGAGGCTACTACTGGTGTCTCTAGACATGCAATGTCACACATTGCACACATGTCTTTATCTGCAGTAACAACAAACAATCTTTGTATATTTCTAATTGGCCAGATGAGCACATGAATTATTCAAAACAGTGGTGGTTTCCAACAATGAATGCACGTCACATACATTTGACATGAGATTGATTTCTATTAACATGCCTATACATCAGTGTCATCTACATATGCGGAGAGGATGTTGTTAA-GGTTATTCAGATGAAACTCCAAATCTGCAACTGACATAAAGTGCTTCGCCATTTCATACTACCATGTAGCCTGTTGATGTGTACCCCTCCAGGTTCAGTCATTCAATATGTTCCAATACTCATCTAGCCCAATTTCCTGAGTTGGATTATACTTGCGAAAAGCCCTAGAAAATTTCTGACCTTTAATGACAAAATGGCATGATCCTTCTGGCAAAAAGTCTCAGTACACTCACAATAATTTCCCTAGCCACCTCTGCAGTTCACTTCTAGGGGCTCTGTGCACAGCCAAGTCGCAGGATCCATGGAAGATCTCATGATAGCTATTGTCTATCTAGCAT - -a -s mr.mrrefChr0 35329 15 + 130230 TGAGCACCTTATTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37291 15 + 636262 TGAGCACCATATTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 29625 15 + 647215 TGAGCACCTTGTTCT - -a -s mr.mrrefChr0 35344 63 + 130230 TTAGGAAAACCACAGCTCTGATAGGGGGTCAATTAGGAAAACGGCAGTTCCACTTGATTGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37306 40 + 636262 -----------------------GGGGGTCAATTAGGAAAACGGCAGCTCCACTTGATTGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 29649 63 + 647215 TTAGGAAAACCACAGCTCTGATAGGGGGTCAATTAGGAAAACCGCAGTTCCGCTAGATTAGCA - -a -s mr.mrrefChr0 35407 34 + 130230 GTAAGAGTAAGTGGTGAAACTAATAGTGACATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37346 34 + 636262 GTAAGAGTAAGTGGTGAAACTAGTAGTGACATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 29718 34 + 647215 GTAAGAGTAAGTGGTGAAACTAATAGTGACAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 35441 69 + 130230 CAATTACATATTCGGTCATATGTAGCCCAAACTTTTTTAACAATCAATCTTTTGAAGAATATTTACATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37553 69 + 636262 CAATTACATATTCGGTCATATGTAGCCCAAACTTTGTTAACAATCAATCTTTTGGAGAGTATTTACATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 29752 69 + 647215 CAATTACATATTCCGTCATATGTAGCCCAAACTTTTTCAACAATTAATCTTTTGAAGAATAATTACATG - -a -s mr.mrrefChr0 35510 83 + 130230 CCTCTATATTGCACTGTCTACTTTTCAGTTGATTTGCTGAGTGGCATTAGCATATGTAGTACCATTTACTTTGTAATCAATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37622 83 + 636262 CCTCTATATTGCACTGTCTACTTTTCAGTTGATTTGCTGAGTGGCATTAGCATATGTAGTACCATTTACTTTGTAATCAATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 29823 83 + 647215 CCTCTATATTGCACCATCTACTTTTCAGTTGATTTGCTGAGCGGCATAGGCATATGTAGTACCATGTACTTTTTAATCAATAT - -a -s mr.mrrefChr0 35593 15 + 130230 GCTGAGTGGCCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37705 15 + 636262 GCTGAGTGGCCTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 29907 15 + 647215 GCTGACTGGCGTAAG - -a -s mr.mrrefChr0 35608 16 + 130230 GCTTGAATATGAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37722 16 + 636262 GCTTGAATATGAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 29922 16 + 647215 GGATGAATTTGAGCAT - -a -s mr.mrrefChr0 35624 19 + 130230 GGGTAATAAAATATTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37738 19 + 636262 GGGTAATAAAATATTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 29939 19 + 647215 GGGTAATAAAATATTGTTT - -a -s mr.mrrefChr0 35643 202 + 130230 ATGATGCATGAATGAGGTTCATATCTGCATATCATCTGCGTATTAATACAAAGGCTGATGTACACAACACCTTGAAAGTTGTGAACATCATGAAGCCTGAAAGGATGTCAGTCCAGTTTTGAGTATCAGGTGATAGATAGCCTGTTTTATGGGGTGAAGGGTGTTGAGTCCTTCTGCACGTGCCCGTGATCACTTGTCACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37766 202 + 636262 ATGATGCATGAATGAGGTTCATATCTGCATATCATCTGCGTATTAATACAAAGGCTGATGTACACAACACCTTGAAAGTTGTGAACATCATGAAGCCTGAAAGGATGTCAGTCCAGTTTTGAGTATCAGGTGATAGATAGCCTGTTTTATGGGGTGAAGGGTGTTGAGTCCTTCTGCACGTGCCCGTGATCACTTGTCACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 29958 202 + 647215 ACTATGCATTAAAGAGGTTCATATCTCCATAGGATCTGCGTATTAATACAGAGGTTGATGTACACGACACCCTGAAAGTTGTGAACATCATGAAGCCTGAATGGATGTTAGTCCAATTATGAATGTCAGGTGATAGATAGCATGTTTTGCAGGGTGAAGGGTGTTGGGTCGTTCTGCACATGCCTATGATCATTTGTCACCA - -a -s mr.mrrefChr0 35845 30 + 130230 TGAGGCGGGCAGACCCCTTCTAGAGGTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37970 30 + 636262 TGAGGCGGGCAGACCCCTTCTAGAGGTGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 30160 30 + 647215 TGAGTCAGGCATGACCCTTCTAGAGGTGCC - -a -s mr.mrrefChr0 35875 28 + 130230 TGATTGTTTCACATCATGTGAAGCAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38000 28 + 636262 TGATTGTTTCACATCATGTGAAGCAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 30192 28 + 647215 TGATTGTCCAACATCATGTGAAACAGGG - -a -s mr.mrrefChr0 35903 60 + 130230 AGGCTCAGCAGCCTGGTACTAACTGTGCCTGCATGACCATGCTTGCCTTTTAATGGAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38029 60 + 636262 AGGCTCAGCAGCCTGGTACTAACTGTGCCTGCATGACCATGCTTGCCTTTTAATGGAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 30220 60 + 647215 AGGCTCAGCAGCCTGGTCCTAACCGTGTGCACATGACCATGCTTGCTCTTGATTGGAGCT - -a -s mr.mrrefChr0 35963 5 + 130230 CATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38092 5 + 636262 CATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 30280 5 + 647215 CATGA - -a -s mr.mrrefChr0 35968 43 + 130230 TACTGTATGAAATCTGAACAAGGTAAAGCATAACCCATTTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38099 43 + 636262 TACTGTATGAAATCTGAACAAGGTAAAGCATAACCCATTTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 30285 43 + 647215 CACTGTATGAAATCTAAATAAGGTTAAGCATAACCCATTTCAA - -a -s mr.mrrefChr0 36011 60 + 130230 CATATTCTGATCCCCTCTGAGATACCTCAATATTTTCCACTTTTTGGTTTAATGGGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38143 60 + 636262 CATATTCTGATCCCCTCTGAGATACCTCAATATTTTCCACTTTTTGGTTTAATGGGTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 30328 60 + 647215 CATAATTTGGTCTCCTCTGAGATACCTCAATATTTCCCACTTTTTTGTTTAATGGGTCTG - -a -s mr.mrrefChr0 36071 36 + 130230 TGGGAGGGTATCTTAGTCTAATAACTTGTCCTAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38204 36 + 636262 TGGGAGGGTATCTTAGTCTAATAACTTGTCCTAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 30388 36 + 647215 TGCAAGGGTAACCCAGTCTAATAACTTGTCCTGCTG - -a -s mr.mrrefChr0 36107 20 + 130230 ATTTTCAAGGTTATATATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38241 20 + 636262 ATTTTCAAGGTTATATATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 30424 20 + 647215 ATTTTCAAGGTTATAGATCC - -a -s mr.mrrefChr0 36127 23 + 130230 CACACTATCTGAGGTGCCCACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38265 23 + 636262 CACACTATCTGAGGTGCCCACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 30444 23 + 647215 CACACCATTTGAAGTTCCCACTT - -a -s mr.mrrefChr0 36150 15 + 130230 ATTACCACCAGCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38288 15 + 636262 ATTACCACCAGCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 30468 15 + 647215 GTTAGCGCCCGCTCC - -a -s mr.mrrefChr0 36165 236 + 130230 TAAAGTGTGAGTTTTAACTCTTCACTTTGCCTAATCAATAACTGAGTATGTTCCTTTCTTATCTCATCACAATCTTATCCTCTGGGTAGCATTCCTGAGGTCTATAACACATTATACCCAGACCAGAAACAATTCAAGTGAGAACATAGGCAACTGAACCAGTTAGTTCAGATAACCAGAACTTGCTAGCTTTAATGTACTTGATCCATTTTCTCATAAATGAAAGGATAACAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38303 236 + 636262 TAAAGTGTGAGTTTTAACTCTTCACTTTGCCTAATCAATAACTGAGTATGTTCCTTTCTTATCTCATCACAATCTTATCCTCTGGGTAGCATTCCTGAGGTCTATAACACATTATACCCAGACCAGAAACAATTCAAGTGAGAACATAGGCAACTGAACCAGTTAGTTCAGATAACCAGAACTTGCTAGCTTTAATGTACTTGATCCATTTTCTCATAAATGAAAGGATAACAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 30499 236 + 647215 TAAAGTGTGAGTTTCAACTCCACACTTTGTCTAATCAATAACTGAAAATGCTCCTTACTTTTCTCATTACAACCTTATCCTCTGGGTAGCACTCCTGAGGCCTATATCACATTATACACAGACCAGAAACCATTCAAGGGAGAACATAAGTGACTGAACCAGTGAGTTAAGATAATTAAAACTTGCTAGCTCTATTGTCCTTGATTCATTTTCTCGTAGTCGAAAGGATAACAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 36401 63 + 130230 ATTCATTTATGCTCAATTTGGTATGCACTTGCACAAACCACTTGAGATGAAAACAATTTACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38539 63 + 636262 ATTCATTTATGCTCAATTTGGTATGCACTTGCACAAACCACTTGAGATGAAAACAATTTACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 30738 63 + 647215 ATTCATTTATGTTCAATTTGGTGTGCAATGGTATAAACCACTTAAGATGAACACAATTTACAT - -a -s mr.mrrefChr0 36464 9 + 130230 CACCATTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38602 9 + 636262 CACCATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 30802 9 + 647215 CGCCATTGT - -a -s mr.mrrefChr0 36473 34 + 130230 TAAATATTGGGGCTCACACACCTCAAGGTCTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38616 34 + 636262 TAAATATTGGGGCTCACACACCTCAAGGTCTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 30811 34 + 647215 CAAATATCGGAGCTTATGCACCTTAATGGTTTCT - -a -s mr.mrrefChr0 36507 48 + 130230 GCAAGATGGCAGGTCCAGTCCTTTTATGAGCAGTATGATAGGCCCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38655 48 + 636262 GCAAGATGGCAGGTCCAGTCCTTTTATGAGCAGTATGATAGGCCCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 30845 48 + 647215 GCCAGATGGCAGGTCCAGTCCTCTTATGATCAGTCTGGCAGGCCCATT - -a -s mr.mrrefChr0 36555 56 + 130230 ATCTTAATCCTACACAAACCTGCATAGTTGACTTTTATGTTTAACTAGTCCTGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38738 56 + 636262 ATCTTAATCCTACACAAACCTGCATAGTTGACTTTTATGTTTAACTAGTCCTGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 30893 56 + 647215 ACATTAATCCTACAATGAACTGTGTAGTTGACTTTTATGTTTAACTACTCCTGAAC - -a -s mr.mrrefChr0 36611 63 + 130230 CAGTTCACAGCCTTTTGAGTTGGTATAAATGTCCATGGACATCATATGGCCTCTGGATGCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38808 63 + 636262 CAGTTCACAGCCTTTTGAGTTGGTATAAATGTCCATGGACATCATATGGCCTCTGGATGCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 31062 63 + 647215 CAGTTTACAGCCTTTTGTGTTGGTATAAATGTCCTTGGACATCATATGGCCTCTGGATGCCCC - -a -s mr.mrrefChr0 36674 33 + 130230 CAGACAGTTGTGTGAGGACACAATATTGTGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38872 33 + 636262 CAGACAGTTGTGTGAGGACACAATATTGTGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 31125 33 + 647215 CAGACAGTTGTGTGAGCACACATTATTGTGATC - -a -s mr.mrrefChr0 36707 144 + 130230 AAAAGCATTTGTCACACATGAACCCAGCCTGAATTGGATTGATTGTGTCAATCATACCCTGGCCAAGTATGGGAGGGAATTGGTGATCAGGTTGACATATACTCTGTTACCCAAAAGCAAGACATCAGTCCACCATTTGTCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38905 141 + 636262 AAAAGCATTTGTCACACATGAACCCAGCCTGAATTGGATTGATTGTGTCAATCATACCCTGGCCAAGTATGGGAGGGAATTGGTGATCAGGTTGACATATACTCTGTTACCCAAAAGCAAGACA---GTCCACCATTTGTCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 31160 144 + 647215 AAGAGCATCTGTCACACATGGACCGAGCCTGAATTGGATTGATTGTGCCAATAATCCCCTGGCCAAGTACAAGAGGAAATTGTTGGTCAGGTTGACATATACTCTGTTACCCAAGAGCAAGACATCAGTCCACCATTTGTCATC - -a -s mr.mrrefChr0 36851 255 + 130230 TATTAAGCAGGCTTTGTTAAGGAGCATCAACAGGTACTAGATACCTCCTTGCCACCTGCCTCCTTGCACAGGGCTGCGGAGAGAAGATATGATGTGGTAATGGTGTTGGGGTAGTGAGATTGAGATAGTAGTGTGCATGGTATATCACCTTACTGGACTGTTTCTTACATTGGTATAATGGAGTAGTCCAAGGGAACAAGGACAAGTTCCAGGAGGAATGGTGGACATTCCAATTTTCCCTAGATTAGTTAAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39046 255 + 636262 TACTAAGCAGGCTTTGTTGAGGAGCATGAACAGGTACTAGATACCTCCTTGCCACCTGCCTCCTCGCACAGGGTTGCGGAGAGAAGATATGATGTGGTAACGGTGTAGGGGTAGTGAGATTGGGATAGTAGTGTGCATGGTATATCACCTTACTGGACTGTTTCTTACATTGGTATAATGGAGTAGTCCAAAGGAACAACGACAAGTTCCAGGAGCAATGGTGGACATTCTAATTTTCCCTAGATTAGTTAAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 31311 255 + 647215 CATTTGTCACTTATTGTTAAGGAGGAACAGCAGGTACTAGCTACCTGCCTGCTGCCTGCTTCCTTGCACAGGGCTGAGGAGAGAAGATGTGATGGGGTAATGGTGGTGGGGTAGCAAGATTGAGCTAGTAGTGTGCATCGTATATGACCTTACTAAACTGTTTCTGACATTGGTATAATGGAGTAGTCCACGGGAACAAGGAAAAGTTCCAGAGGGAATGGTGGACGGTCCAATTTTCCCTAGATTAGTTAACAC - -a -s mr.mrrefChr0 37106 51 + 130230 TACAAAGAGATACGAATGTGTTGATGTTAAAAAGTTCCAACTTCTGCCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39301 51 + 636262 TACAAAGAGATACGAATGTGTTGATGTTAAAAAGTTCCAACTTCTGCCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 31567 51 + 647215 TACAAAGAGATAGAAATGCACTGTTGTTAAAAAGTTCCAACTTCTGCCTGA - -a -s mr.mrrefChr0 37157 367 + 130230 TATCTATTAGAGGAGTTATTACATTACCATAACTAGAGAAGCCTTGTATGAAGCGGAAGGCACAGACTCCACACACCCTATTGGCAGACCAGAACTTTTATCTGGTTGGTTGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTATATTGAAACAGGTAGAACCCAGATCGCAGTTAGGCGCATGAATCTGTGAGAGCAGCAGGGCCTTTGCTATCCCTTCGCAATTCAGATGGAATAGTACCATACAGTACCATTAATTGAGCCATTGGATGAGGTGATCTCCTGTCAGATGCTCCCAAAGTAGGCAGGTAACAATGAAGGCTGATTGCAGCATATCTAATGGAATAGATAACACTTGATGCCGGTCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39360 364 + 636262 TATCTATTAGAGGAGTTATTACATTACCATAACTAGAGAAGCCTTGTACGAAGTGGAAGGCACAGACTCCACACACC---TTGACAGACCAGAACTTTTACCTGGTTGGATGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTATATTGGAACAGGTATAACCCAGATCGCAGTTAGGCGCATGAATCTGTGAGAGCAGCAGGGCCTTTGCTATCCCTTCGCAATTCAGATGGAATAGTACCATACAGTACCATTAATTGAGCCATTGGATGAGGTGATCTCCTGTCAGATGCTCCCAAAGTAGGCAGGTAACAATGAAGGCTGATTGCAGCATATCTAATGGAATAGATAACACTTGATGCCGGTCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 31618 367 + 647215 TGTCTATTGGAGGAGTTACTGCATTACCATATCTAGAGAAGCCTTGTGTGAAGCGGAAGGCACAGACTCCACACACCCTATTGGTAGACCAAAGCTTTTATCTGGGTGATTGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTGTATTGAAACAGATAGAACCCAGATCACAGCTAGGCACATAAGTCAGTATGATTAGCAGGGCCTTTGCTGCCCCTTAACAATTCAAATGAAACCGTGCCATATAGTACCATTAATTAGGCCATCAAATGAGACGATCTCCTGTCTGATGCTCCCAAAGTAGGTGGGGAACAATGAAGGCTGATCACAGAATATCTGATGGCATGGGTAACAATTAAGCTCGATCATA - -a -s mr.mrrefChr0 37524 552 + 130230 CAGGGAAGCTTCGGCTTCTTCCTTCTTCCTCAGCTGGCTAATAGAAAGAGGACTCCTAAGTAATGGCTCTTAAGTGACTCCTAATTTACTAGTTACCTCCTTTTATACCTGACCAGCTAATATTAGTCCTACTTGTTGATGGTTGAAGGCCCCACCCTTGACTCCTCTGCTTTAGTAGGTGGATAGGCTTCTACTTAACTAAGTCAATAGGTTCACCATTTGTACTTCATGCAATGAATGAATACAAGCATATTTTACTTCTAAACACAAGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGTTAGAGGAATCAGCTAGGGTCAACTTTCTTGTAGGTGATACATACAATTTGGATAAGCATTAGCGTAAACTGGAGTTTAGATCTTGACAGGTGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTCATGAGATTTCGTTAGTGGCTTTTCAGGTTCAGTGTGTCCTGGCACCCTCAACCTTAAGAGAATGAGTTAAAATGGGATACTTCATAGCTGCAAATATTTCCAGGTATCTAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39725 552 + 636262 CAGGGAAGCTTCGGCTTCTTCCTTCTTCCTCAGCTGGCTAATGGAAGTAGGACTCCTAAGTAATGACTCTTAAGTGACTCCTAATTTACTACTTACCTCCTTTTATACCTGACCAGCTAATATTAGTGCTACTTGTTGATGGTTGAAGGCCCCATCCTTGACTCCCCTGCTTTAGTAGGTGGATAGGCTTCTACTTAACTAAGTCAATAGGCCCACCATTTGTACTTCATACAATGAATGAATACAAGCATATTTGATCTCCAAACACAGGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGGGAGAGGAATCATCTAGGGTCCATTTTCTTTTAAGTGATACATAAAATTTGGATAAGCATTAGCGTAGACTGGAGTTTAGATCTTGACAGGTGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTCATGAGATTTCGTTAGCGGTTTTTCAGGTTCAGTGTGTCCTGGCACCCTAAACCTTAAGAGAATGAGTTAAATTGGGATACTTCATAGCTGCAAATATTTCCAGGTATCTAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 31985 520 + 647215 CAGGAAAGCTTTGCCTTCTTCCTTCTTCCTCACCTGGCTAATAGAAAGAGGACTACTAAGTGATCGCTCCTAAGTGACTCCTAATTTACTAGTTACCTGCTTTTATTCCTGACCAGCTAATATTAGTCCTACTTGTTGATGGTTGAAAGCCCCACCCTTGACTGCTCTGCTTTAATAGGTGGATAGGCTTTTAATTAACTAAGTCAATAAGTTTGAAATTTGTACTTCATGCAATGAATGAATACAAGCACATTTTACTTCTAAGCACAAGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGTTAAAGGAATCAGCTAGGGTCAGCTTGCTTGTAGGTGATACATAC-----------GCATTAGTGTAAACTGGAGTTTGGATCTTAGCAGGGGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTTATGAGATTTCATTAGTGGCTT---------------------CACCCTCAACCTTAAGAGAATGAGTTAAAATGGGATACTTCATAGGTGCAAATATTTCCAGATATCTAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 38076 329 + 130230 GTACAGGTATGCCTAAATATGATGCCAATCCATTATAGCAAGTGACTACAGTAGAGAATGTATAACAATTGTGAGCAGCCCATCCCTCCTAGATTACACACCTATATTAGGTATAGTTACTTAGATAAATTAACCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTACTTCAGAGGGTGTCTTCTTCTCATAGGTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCATATGGGTTCACATTTGGGGTCCTATCTCTTGATGGTGTGCTAGATGGAGGAAGCTAATTTGATATTTGTAATGGATCACCAGTCACTTAATGTGTCAGAAACAAACATTGCTTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40289 329 + 636262 GTACAGGTATGCCTAGATAGGATGCCAATCCATTATAGCAAGTGACTACAGTATAGAATGTATAACAATTGTGAGCAGCCCATCCCTCCTAGATTACACACCTATATTAGGTATAGTTACTTAGACTAATTGGCCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTGCTTCAGAGGATGTCTTCCTCTCATAGGTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCGTATGGGTTCACATTTGGGGTCCTGTCTCTTGATGGTGTGCTATACGGAGGAAGCTCATTTGATATTTGTAATGGATCACCACTCACTTAATGTGTTACAAACAAACATTGCTTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 32505 329 + 647215 GTCCAGGTATGCCTAAATCTGATGCCAATCCATTTTAGCAAGTTACTACAGTAGAGAATGTATGGCAATGGTGTGCAGTCCATCCCTCCGAGATTATACACCTATATTATATATAGCTATTTAGATAAATTAACCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTACTTCAGAGGGTTTCTTCTTTTCATAGTTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCATATGGGTTCACATTTGGGATCCTATCTGTTGATGGTACACTAGATGGAGGAAGCTAATTTGGTATCTGTAATGGATCACCAGTCAGTTAATGTGTCAGAAACAAACACTGGTTCCT - -a -s mr.mrrefChr0 38405 95 + 130230 AGGGCTAAGAAGCAGAGAGTGCTTGCACAAACACCTTAAACTGTTGTTAGCCATATAttgtgttcctgaagttagtctctcattactgcctttct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40622 95 + 636262 AGGGCAAAGAAGGAGAGAGTGCTTGTGCAAACACCTTAAACTGTTGTTAGCCATATAttgtgttcctgaagttagtctctcattactgcctttct -s simRat_chr6.simRat.chr6 32834 94 + 647215 AAGGCTAGAAAGCAGAGAGTGCTTGCACAAACACCTTATACTGTTG-GAGCCATATAttgtgttcctgaagtaagtctctcaaaactgcctttct - -a -s mr.mrrefChr0 38500 139 + 130230 tggacattctgtttacttaaagagcttgttagcatatggtcaatgtgcagaccctgaaattgctgcttaactccttagtgTACTTGACTgtaccttgtctgcatctacaaaagttgtttgctgatgcccctgttcctaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40717 139 + 636262 tggacattctgtttacttaaagagcttgttagcatatggtcaatgtgcagaccctgaaattgctgcttaactccttagtgTACTTGACTgtaccttgtctgcatctacaaaagttgtttgctgatgcccctgttcctaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 32929 139 + 647215 tctacattctgtttgtttaatgagcttgttagcgtatggtcggtgtgcagatcccaaaaatgttgctcaactccatagtgTACTTGACTgtaccttgtgaacatcttcacaaattgtttgctgataccccttttctcaa - -a -s mr.mrrefChr0 38639 43 + 130230 gttacaccatcattactgaagaaaagagttatacagggtccag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40858 43 + 636262 gttacaccatcattactgaagaaaagagttatacagggtccag -s simRat_chr6.simRat.chr6 33068 43 + 647215 attgcaccaccattactggagaaaagagttatacagagtcaag - -a -s mr.mrrefChr0 38682 67 + 130230 gaggactgacttggatcttcagcctCGACCAGTGGGCCCGTGACCAAACACTGTTGTCTGTGCCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40901 67 + 636262 gaggactgacttggatcttcagcctCGACCAGTGGGCCCGTGACCAAACACTGTTGTCTGTGCCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33113 67 + 647215 gaggagtgacctggatttctagcctTGACCAGTGGCTCCTTGGCTAAACACTGTTGTCTGTGCCCTC - -a -s mr.mrrefChr0 38749 97 + 130230 CCTTTCATTCCTAGTCTCATGCACCTCCCTGTAACAACTGCGGGCTCCCTGGAGTGTCCTCTTTGAGTGACCTCTTTGAGAGGGAGGTTTGTACTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40968 97 + 636262 CCTTTCATTCCTAGTCTCATGCACCTCCCTGTAACAACTGCGGGCTCCCTGGAGTGTCCTCTTTGAGTGACCTCTTTGAGAGGGAGGTTTGTACTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 33202 97 + 647215 CCTCTCATTTCCAGTCTTATACACTGCCCTGTACCAACTGTGGGCTCCCTGGAGTATCCTCTTCGTGTGACCTCTTTGAGAGGGAGGTTTATACTGA - -a -s mr.mrrefChr0 38846 26 + 130230 CATGTGTGAGTATGTTCCAATTCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41066 26 + 636262 CATGTGTGAGTATGTTCCAATTCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33299 26 + 647215 CATATGTACGTATGTTATAATCTGGT - -a -s mr.mrrefChr0 38872 8 + 130230 CAGCTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41092 8 + 636262 CAGCTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 33326 8 + 647215 CAGCTTCA - -a -s mr.mrrefChr0 38880 3 + 130230 CAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41101 3 + 636262 CAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33334 3 + 647215 CAC - -a -s mr.mrrefChr0 38883 86 + 130230 CCATAGTAAACCTGTCTTGCCCAACCCACACCATCTGCCCCGGCTTCAATTTGTCAAGATGGTGCAAAGGCAGTCCTGGACACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41107 86 + 636262 CCATAGTAAACCTGTCTTGCCCAACCCACACCATCTGCCCCGGCTTCAATTTGTCAAGATGGTGCAAAGGCAGTCCTGGACACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 33337 86 + 647215 CCATAGTCAACTGGTCTTGCCTAAGCCACACCATCTGCTCTGTCTTCAACATGTCAAGATGGTGTAAAGGTAACCCTGAACACATG - -a -s mr.mrrefChr0 38969 365 + 130230 TCAGGAGCTGGATCCCTTATCTTTTTTAACTTATCAACGTGTCTTTGCCCTATCACTCCCACAGTTATGCGCCAGTCACTCTGAGTAGCACAGACAACTCTATTTCGACATTCAACATTCGAATTTGTATCTAGAACACAACACGTGGAATTGTTTTCAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAAGCAGCATATTTTGTCTTGAAAGGGCTGAGTGTGGAACCAACAGTGACTTGTTCCTCTACTCTAGTGTGGGGGTGTCACAGGACAGATTATACATATAGCAGGAATAGAAATTTAGACAGATGTTTGGCAGGATGTTATCTACAGATAATATTATCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41193 364 + 636262 TCAGGAGCTGGATCCCTTATCTTTTTTAACTTATCAACGTGTCTTTGCCCTATCACTCCCACAGTTATGCGCCAGTCACTCTGAGTAGCACAGACAACTCTATTTCGACATTCAACATTCGAATTTGTATCTAGAACACAACACGTGGAATTGTTTTCAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAAGCAGCATATTTTGTCTTGAAAGGGCTGAGTGTGGAACCAACAGTGTCTTGTTCCTCTACTCTAGCGTGGGGGTGTCACAGGACAGATTGTACATATAGCAGGAATAGAA-TTTAGACAGATGTTTGGCAGAATGTTATCTACAGATAACATTATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 33425 365 + 647215 TCTGGGGCTCAATCCCATCTCTTTTTTAACTTATCAGCGTGTCCTTGTCCCATCACCACCACAGTATTGTCACAGTTGCGCAGAGTAGCACAGACAACTCCATTTGGAAATCCAACAATCAAGCCTGTATTCAAAACACAACACTTTGAATTGTTTTGAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAGGCAGCATATTTTGTCTTGGAAGGGCTGAGTGTGGAGCCATCAGTGAGATGTTACTCTACTCTGGTGTGGGGGTGTCACAGGACAGAGTATACATATAGCAGGAATAGAAATTTACATAGATGTTTGGCAGGATGTTATCTACAGATTATATTATCTG - -a -s mr.mrrefChr0 39334 86 + 130230 TGCGGCAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTTTTCTCAAGCTAGATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCACCATATTAACAATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41574 85 + 636262 TGCGGCAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTTTTCTCAAGC-AGATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCAGCATACTAACAATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 33790 86 + 647215 TGCAATAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTATTCTCAAGCTATATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCACCAGATCAACAATAA - -a -s mr.mrrefChr0 39420 40 + 130230 TGAACTTACATACTTAGGGTTCCTGAGTCTTTGAAGGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41659 40 + 636262 TGAACTTACATACTTAGGGCTCCTGAGTCTTTGAAGGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33946 40 + 647215 TGAACTTACATACGTGGAGTTCGTGAGTCTTTAAAGGAAT - -a -s mr.mrrefChr0 39460 39 + 130230 CTGGTAGAAAAGCCAAAATGGACCTACCACAGGGCCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41699 39 + 636262 CTGGTAGAAAAGCTAAAATGAACCTACCACAGGGCCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 612973 39 - 647215 CTGGTAGAAAAGCCAAAATGGACCTACCACAGGGCTACT - -a -s mr.mrrefChr0 39499 18 + 130230 TTACTATAGGAGTAAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41738 18 + 636262 TTACTATAGGAGTGGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 613017 18 - 647215 TTACTATAGGAACAAAGG - -a -s mr.mrrefChr0 39517 16 + 130230 CAGAAATAAGCTATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41756 16 + 636262 CAGAAATAAGCTATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 613038 16 - 647215 CTGAGATAAGCTATTA - -a -s mr.mrrefChr0 39533 57 + 130230 GGAAAGCAAATAGACAATAAACTGTGGAAACCACACATCTACAAGATGACTGCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41773 57 + 636262 GGAAAGCAAATAAACAAGAAACTGTGGAAACCACACATCTACAAGATGACTGCTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 613054 57 - 647215 GGAAAGCAAATAGATAATAAACTGTGGAAACCCCCCATCTACAAGACAACTGCTAAG - -a -s mr.mrrefChr0 39590 70 + 130230 TGGAGTCTCTGAAATGATATGTGATATGTTTACCAATCACTTTTCCACATATGTGTGATGCACTATAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41830 70 + 636262 TGGAGTCTCTGATATGATATGTGATATGTTTATCAATCATTTTTCCACATATGTGTGATGCACTATAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 613146 70 - 647215 TGGAGTCCGTGAAATGATATGTGATATGTTTACCAATCACTTTTCTACAAACATATGATGCACTATAGGA - -a -s mr.mrrefChr0 39660 3 + 130230 TGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41900 2 + 636262 -GG -s simRat_chr6.simRat.chr6 34242 3 + 647215 TAA - -a -s mr.mrrefChr0 39663 13 + 130230 TACTGGGCCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41902 13 + 636262 TACTGTTCCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 34246 13 + 647215 TGCTGGGTATGTA - -a -s mr.mrrefChr0 39676 87 + 130230 GTACTAACCACCAACATGTGAGACATGGTGAACATAAAAAGTCCTGTGGTCACAGTAAACTTTTGAAAACATAAGCTAAGGAAAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41923 86 + 636262 GTACTAACCACCAGCATGTGAGACATGGTGTGCATAAAAAG-CCTGCGGTCACATTAGACTTTTGAAAACATAACCTAAGGAAAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 34259 87 + 647215 GTAACAACCACCAACATGTGCGCCATGGTGAACATCAAAAGTCCTGTGGTCACTGTAAACTCTTGAAAACATAAGCTAAGGAAAGCT - -a -s mr.mrrefChr0 39763 49 + 130230 TTGCTCACACATGACTAGAGATATACCAACCATCCCAATAAGATAATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42009 49 + 636262 TTGCTCACACATGACTAAAGATCTACCAACCATCCCAATAGGAGAATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 34353 49 + 647215 TTGCTCACACATGACTAGAGACATACCAACCATCCCAATAAGATAATTG - -a -s mr.mrrefChr0 39812 268 + 130230 TGATTGTGCTAGTTGATGATAATGCAGTATCAGACAGAAAGAAGGATTAACTTCATTACATCACTTTGTAGTAAGGGTATTCCTGACCATGCTAGAGCGTTTTGGACCACCTCTGGTTAAAGGCTCATTATATAATCCATAACTGCTGTCAGGTCAGGTGTAAGTGGTTTAGACTCTACTGCATAGCTCATAGTTTTCAGCTGGTGCTTAATTGGGTGCCAATCAACTGTATCCAATGAACTGTAGTCTTGCACTTGGTGCTTCACGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42058 264 + 636262 CCAT----CTAGCTGATGATAATGCGGTATCAGACAAAAAGACGGATTAACTTCATTACATTGCTTTGTAGTAAGGGTAATCCTGACCATGCTAGAGCGTTTTGGACCACCTCTGGTTAAAGGCTCATTATATAATCCATAACTGCTGTCATGTCAGGTGTAAGTGGTTTAGACTCTACTGCATAGCTCATAGTTTTCAGCTGGTGCATAATTGGGTGCCAATCAACAGTATCCAATGAATTGTGGTCTTGCACTTGGTGCTTCACGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 34404 245 + 647215 TGATTGTGCTAGTTGATGATATAGTAGTATCAGACAGAAAGAACGATTCACTTCATT-CATCACTTTGGAGTAAGGGTATTCCTGTCCATGC-----ATTTTCAGACCAT--------AAAGGCTCATTATACACTCCGTAACTGCTGTCAGGTCAGGTGTA---------GGCTGTACTGCAAAGCTCATAGTTGTCAGCTGATGCTTAATTGGGCGCCAATCAACTGCATCCAATGAACTGTAGTCTTGCATTTGGTGCTGCACGA - -a -s mr.mrrefChr0 40080 165 + 130230 TCCACGAGAACATTATTCCATTGGGAATACTAGATGATTTACTAACACTTAAGGGGTTGGAGACAATATCACAGTACTGGCAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGTTGGGAGTTTGATGTAGTGGCAAAGGACTGGGAACTCTTTACAGCTAGAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42336 165 + 636262 TCCACGAGAACATTATTCCATTGGGAATACTAGATGATTTACTAACACTTAAGGAGTTGGAGACAATATCACAGTGCTGACAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGTTGGAAGTTTGATTTAGTGGCAAAGGACTGGGAATGCTTTACAGCCAGAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 34649 165 + 647215 TCCACGAGAACGTCATTCCATTGGGAGTACTAGATGAACTGCTAACACTTGAGGGGTTGGAGACAATATCTCAGTACTGGCAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGATGGGAGTTTGATGTAGTGGCAAAGGACTGGGAACTCTCTACAGCTATTAAA - -a -s mr.mrrefChr0 40245 115 + 130230 TAGTGGAAGGGGCCTGGAGAACATTTGGAGAACATTAACAGTAATGACTAGTAACAAATGGAAGAACTTAGCAAGAAGGATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42502 115 + 636262 TAGTGGAAGGCGCCTGGAGAACATTTGGAGAACATTAACAGTAATGAATAGTAGTGAATGGAACAACTTAGCAAGAAGGATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 34814 114 + 647215 TAGTGGAAGGGGTCTGGAGAACATTTGGATAACATCAACAGTAATGACTAGTAACAAA-GGAAGAACTTAGTGAGAAACATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATGCC - -a -s mr.mrrefChr0 40360 124 + 130230 TCTTGTTTGGTAGATTCCAGTATACGACTGTTAAGAGGCTGAGGACAAACTAGGTTTACTTTCTTAATAGACATCAAGCAGCTGAACTTAGAGAGGCTCTCTTACAGTGCACCATTTTGATCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42617 124 + 636262 TCTTGTTTGGTAGATTCCAGTATACAACTGTTAAGAGGCTGAGGACAAACTAGGTTTACCATCTTAATAGACATCAAGCAGTTGAACTTAGAGAGGCTCTCTCACAGTGCACCATTTTGATCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 34933 123 + 647215 TCTGGTTGGGTGAATTCCAGTATATGACTGTTAAGAGACGGAGGACAAACTAGGTT-CATTTCTTAATAGACATCAAGCAGCTGAACTTAGAGAGGCTCTCTTACAGTGCACCATTGCGACCTA - -a -s mr.mrrefChr0 40484 150 + 130230 AAAGCTTCAGGTGACCACATTAAGATTTAAAGCAGGACATCTGATTGCAGGCTTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGCACTTCAGATGTACGTCCCTAAAGAACAGCTAAGACTGTCCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42745 145 + 636262 AAAGCTTCAGGTGACCACATTAAGATTTAGAGCAGGACATCTGATTGCAAGCCTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGAATTCCCGATGTATGTCCCTAAAGAACAGCTGAGACTGT----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 35056 150 + 647215 AGAGCTTCAGGTGACCAAATTAAGATTTAAAGGAGAACATCTGATTGCAGGCTTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGCACTTCAGATGTACGTCCCTAAAGAACAGCTAAGTCTGTCCACA - -a -s mr.mrrefChr0 40634 475 + 130230 AATGTAAACCAATAGTCCATCTATATCCTTGCAAGTTCAATCTCCTTTTCACATAGTTGGTAACTTGTATATACCCTCAGGGTCAAACAGATCGAGTGTAAGAAAACACTTGGGGAATGACTTGGCACATTGATTTTAATTCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAATCCTCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGGGCATATCATGCTATTACCTCAATGCAGACTAACTACCTTGTACATGTACAATCTGTCATATTTGGTACAATGGTTTTCAGGTTCACAAGAAGTGTCAAGGAAATAACATGGTGTTTATGCCAATTGCCAAAAACTATCAAGAAAATAACCTGAGTACAATTACTTAATTTCATGGGGAAGCTGGTTGTCACCTTTATAGTTCAAGGTGGGTGGCCACGGCAAACCCATTGTAAGTATGATCCATTCATCCTGATGACACTCATAATTACACAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42890 457 + 636262 AATGTAAGCCAATAGTCCATCTACATCCTTAGAAGTTCAATCTCCTTTTCACATAGTTGGTAACTTGTATATACCCTCAGGGTCAAACAGATT-----------AACACTTTGGGAATAACTTGGCACATTGATTTTAATTCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAAGCATCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGAGCATATC--GCTATTACCTCAATGCAGACTAACTACCTTGTACATGTACAATCTGTCATATGTGGTACA-----TTTTAGGTTCGCAAGAAGTGTCAAGGATATGACATGGTGTTTATGCCAATTGCCAAAAACTATCAAGAAAATAACCTGAGTACAATTACTTAATTCTATGGGGAAGCTGCCTGTCACCTTTATAGTTCAAGGTGGGTGGCTACGCCAGACCCATTGTAAGTATGATCCATTCCTTCTGATGACACTCATAATTACCCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 35208 470 + 647215 AATGTAAACCAATAGTCCATTTATATCCTTGCTAGTTCAATCTCCTTTTCACACAGTTGAT----TGTATATACCCTCAGAGTCAAACAGATCGAGTGTAAGAAAACACTTGGAGAATGACTTGGCAGGTTGATTTTAAACCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAATCCTCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGGGCATATCATGCTATGACCTCAATGCAGACTATCTATCTTGTACATATACAATATGTCATACTTGCTACAATGGTTTTCAGGTTCACAAGAAGTGTCAAGCAAATAACATGGTATGTATGCCAATTGCCAAA-ACTATCAAGATCATAACCTGAGTACAGTTACTTCATCTCATGGGGAAGCTGGTTGTCACTTTTGTAGTTCAAGGTGAATGGCCATGGCAAACCCATTGTAAGTATCATCTATTCATCTTGATGACAATCATAATTACAAGTG - -a -s mr.mrrefChr0 41109 130 + 130230 TGTAAAGAATTTATTTTGTCATTTGCTTTTTTGACATTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGGACTATGTCCTGGGTTGGTTGCTCTAGCACAGGCTAATGTTCCTCAGTTATATTGGACTTAGATTCAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43347 130 + 636262 TGTAAAGAATTTTTTTTGTCACTTGCTTTTTTAACATTGGATGGATCAATCCATTTTAAGGAATATGTCCTGGGTTGGCTACTCTAGCATAGGCTAATGTTTCTCAGTTATATTGGACTTAGATTCAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 35678 130 + 647215 TGAGAAGAGTTTATTTTGTCATTTGCTATTCTGACGTTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGGACTATGTCCTGGGTTGGTTGCTCTAGCACAGGGTAATGTTCCTCAGTTATATTGGACTTAGAACACAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 35808 130 + 647215 TGTAAAGAATTTATTTTGTCATTTGCTCTTTTGACATTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGAACTATGTCATGGGTCGGTTGCTCTGGCACAGGTTAATGTTCCTCAGTTGTATTGGACTTAGATTCAAAG - -a -s mr.mrrefChr0 41239 171 + 130230 CCTGATAAATTGATCTATATTTGTTGGATTGATCACCTGCCATTTGTCATGTGAAACACAATCACAACTGTGGCTAGTTCCGATGTTTAGATATTTCCTTACTATAAGCGAGTGCATGTTTGGTGGGCACCCAGTCTTCTTGGCCCATATGTTAGATGAGAAGGACTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43477 165 + 636262 CCTGATAAATTGATCTATATTTGTTGGATTGATCACCTGCCATTTGTCATGTGAAACACAATCACAACTGTGGCTAGTTTTGATGTTTAGATACTTCCCTGCTCTAAGCGAGTGCATGTTTGGTGGGCACCCAGTCTTCTTGGCCCATATGTCAGA------GGACTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 35938 170 + 647215 CCTGATAAA-TGATCTACATTTGTTGGATTGATGCCCTGCTTTTTGTCATGTGAGACACAATCACAAGTGCGGCTCGTTCCTAAGATTAGATATTTCTTTACTATAAGTGAGTGCATGTTTTGTGGGCATCCAGTCTTCTTGGCCCATATGTTAGATGAGAAGGACTAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 41410 186 + 130230 CATATCCTCATGGTTGATCACAGCTATCCCTTGGGCAGGAAAGTAAACTTTATTTTTCTTTCATATAATGAATTACTAATAGATTTTCTGCCTTCTTTCTTGGTTGAGTAACACAATGCATAAAAGTAGACTCAGACTCAAGCAGATCGAACACCATACAAACTCAATCTGATGGAACATCATCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43642 186 + 636262 CATATCCTTATGGTTGATCACATCTATCCCTTGGGCATGAAAGTAAACTTCATTTTTCTTTCATATAATGAATTACTAATAGATTTTCTGCCCTCTTTCTTGGTTGAGTAAGACAATGCATAAAAGGAGACTCAGGCTCAAGCAGATCGAACACCATACAAACTCAATCTGACGGAACATCATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 36109 186 + 647215 CATACCCTCACGGTTGATCACAGCTATCCCTTGGGCAGGAAAGTAAACTTTATTTTTCTTTTCTATCATGAATTACTAATAGATTTCCTGTCTTCTTTCTTGGTTGAGTAACACAATGCATAAAAGTAGACTCAAACTCAAGCAGATCGAACACCATACTAACACAATCTAATGGAACATTATCCA - -a -s mr.mrrefChr0 41596 129 + 130230 TACCCATGGCCTTAAAGCACATTGATTTAAAGTGAATTGTCCCAAATGGCATTACAAGTTGTTGTCCATTGGCTGACTAATTAATtcgtTGGCTGACTAATTGATTCTTTCTACTGAGACTCCATCTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43829 129 + 636262 TGCCTATGGCCATAAAGCACATTGATTTAAAGTGAACTGTCCCGAATGGCATTACAAGTTGTTGTCCATTGGCTGGCTAATCAATTCGTTGGCTGACTAATTGATTCTTTCTACTGAGATGCCATCTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 36295 129 + 647215 TACCCATGGCCTTAGAGCACGTTGATTTAAAGAGAATTGTCGCAGATGGCATTACAAATTGTTGTCCATCGGCCTACTAattgattgattggctgactgattgattCTTTCTACTGAGACTCCAGCTAG - -a -s mr.mrrefChr0 41725 10 + 130230 GGCCTGTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43958 10 + 636262 GGGCGGTCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 36442 10 + 647215 GGCCTGTCTC - -a -s mr.mrrefChr0 41735 68 + 130230 ATTTGAACAATCCTCTGCATTTAAGCAATCCACCAGCCATTACCCTGCTTAGCTCCGAATATATATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43969 68 + 636262 ATTTGAACAATCCTCTGCATTTAAGCAATCCACCAGCCATTACCCTGCTTAGCTCCGAATATATATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36452 68 + 647215 ATTAGAGCAACCCTTTGCATTTAAGCAATCCACCAGCCATTACCCTGCTCAACTCGGAATATATATAT - -a -s mr.mrrefChr0 41803 55 + 130230 GTTGATTAATCCCACACCCAGCACCATGGTGTCAGTGTGCATTAGGAACACAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44041 55 + 636262 GTTGATTAATCCCACACCCAGCACCATGGTGTCAGTGTGCATTAGGAACACAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 36520 55 + 647215 ATTGGTTACTCTGACACCCAGCACCATGGTGTAAGTGTCCATTTGGAACACAGAC - -a -s mr.mrrefChr0 41858 226 + 130230 TAACAAAATGGTCTTGCAACCAGTTAAGCCACTGCCTATTTATGCAGCCAGTCCGTACCCCCACTTGCATACACTTTTGAAATTATGCATAGAATTCAGAGCTGTGAATTTGATCCAGTTGGGTCCTGTGCTATGATGCACTTGAACACCATGCAGAGCCAATTTTCCAATTGCCTTAGTGGGATGATTGTCTCAGAATTTCTCCTGATGTTCAACTAAGCCAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44096 221 + 636262 TAACAAAATGGTCTTGCAACCAGTTAAACCACTGCCTATTTATGCAGCC-GTCTGTACCT----TTGCATACACTTTTGAAATTATGTGTAGAATTCAGAACTGTGAATTTGATCCAGTTGGGGCCTGTGCTATGATGCATTTGAACACCGTACAGAGCCAATTTTCCAATTGCCTTTGTGGGATGATTGTCTCAGAATTTCCCCTGATGTTCGACTAAGCCAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 36576 219 + 647215 TAACGAGATG-------AACCAGTTTAGCCGCTGCCTATTTATGCAGCCAGTCCTAACCCCCACTCACATACACTTTTGAAATTGTACATAGAATTGAGAGCTGTGAATTTGGTCCAGTTGTGTCATGTGCTATGATGCACTTGAACACCATGCAGAGCAGATTTTCCAATTGCCTTAGTGGGATGATTGTCTCTGAATTTCTCCTAATGTTCAACTAAGCCAATC - -a -s mr.mrrefChr0 42084 227 + 130230 ACAGCTGAGTCAACAGCCAAAGAGTAAATATAAGAGAGTGCTAGTGATCAGAAATTATCTTGTTAATACCATCAGAGGATGTAATACATGGATAGGCTGGGAGCATCTTCAGTCAAGTAGCATATAGCTATGATAATTGGGATGAACCCTTCATATCACGCAGTGTGTATATGTAGTTGAAAGAAGTGCACAATCCAGTCATAAACACAGAGTAATGATTTGCCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44317 222 + 636262 ACAGCTGATTCAACTGCCAGAGAGTAAATATGAGAGAGTGCTACTGATCAGAAATTAGCTTGTTAATACCATCAGAGGATGTAATACATGGATAGGCTGGGAGCATCATCAGTCAAGTGGCATAT-----TGATAATTGGGACGAACCCTCCATATCACGTAGTGTGTATATGTAGTTGAAAGAAGTGCACAATCTAGTCATAAACACAGAGTAATGATTTGCGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36870 227 + 647215 ACTGCTGAGTCAACAGCCAAAGAGTAAATATAAGAGAGTGCTAGTGATCAGAGATTTTCTTGTTAATACCATCAGAGGATGTAATACATGGATAGGCTGGGACCATCTTCTGTCAAGTAGCATATAGCTATGATAATTGCGATGAACCCTTCATTTCACACAGTGTGTATATGTGATGGAAAGAAGCGCCCAAACCAGTCACAAACGTAGAGTAATAATTTGCCATA - -a -s mr.mrrefChr0 42311 10 + 130230 GCTATTGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44540 10 + 636262 GCTATTGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 37097 10 + 647215 GCACTTTCAC - -a -s mr.mrrefChr0 42321 39 + 130230 TTTCACATCACTATGTATGTGTTGGCATGTGAGATATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44550 39 + 636262 TTCAACATGACTATGTTTGTGTTGGCATGTGAGATATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 37113 38 + 647215 CTTCACATCA-CATGCATAGGCTTACACGCGAGATATGG - -a -s mr.mrrefChr0 42360 327 + 130230 TCAGGCTGTCTGGTCTGCCACACTGGAGGGTGATATCCTAGGAGTCAATAGGAGGCAGCTGAGACACTATCAGGGGGCCAACTAGTTTTTTCAAAACCGTATAATAATTGGCATAACTCCAAGACAACAGAAAATTATAACAGTATAACTGGCCTCAGTCATTCAAGAACTGCAGCAACTGGGCCCACCTACCTGCTGTTTATCAATCTTTGATAGAGTACTGAATTTTACTAGATATAAAAAAACTATAGCCATTGAGCAAACTCATGCGATTCACTGATCAGAATCATATGGGTGAATGATACATTATACTGGCTGTGATACTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44589 327 + 636262 TCAGGCTGTCTGGTCTGGCACATTGGAGGGTGATATGCTAGGAGTCAATAAGAGTCAGCTGAGACACTATCAGGAGCCCAACTAGTTTTTTTAAAACCATATAATAATTGGCATAACTCCAAGGCAACAGGAAGTTATAACAGTATAACTGGCCTCACTCATTAAAGAACTGCAGCAACTGGGCCTGCCTACCTGCTGTTTATCAATCTTTGATAGAGTACTGAATTTTACTAGATATAAAAAAACTATAGCCATTAAGTAAACTCATGCTATTCACTGATAAGAATCATATGGGTGGATGATATATTGTACTGGCTGTGATAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 37152 317 + 647215 TCTACCAGTCTGGTCTGCCACACTGGAGGGTGATATCCTAGGAGGCCATAGGAGGCAGCTGAGACACTATCAGGGGGCTAACTAGCTTTTTCAAGACTGTATAATGAGTGGCATAACTCCAAGACAGCAGAAAATTATAATAGTATA---GACCTCAGTCATTCAAAAACTGCAGCAACTGGGCCCATGTACCTGCTGTTAATCAATCTTTGATAG-GTTCTGGACTTTAGTAGATGTAAAAAAACTAT------TGAGCAAACTCATGCGATTCACTGACCAGAATTATATGGGTGAATGATACGTTATACTGGCGGTGATACTCT - -a -s mr.mrrefChr0 42687 211 + 130230 GATCTAACATGTAATTTAACAAGAGACTTAAGCTACGCAACAGGCCTCTCATCAGGAGACTAGTAACTGGGGCAGCGAAGGATTAGAAAGCTGTTTCTGATTCTCTGGTACCTCTGAATGAGCATGCTTCTACTGAGGGTTTATCAAGGTCTATGGGTGAAGTATATTGGAGGGACCTTTGCACTGGGAACCAAAGTGTGGTCCTCCCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44916 211 + 636262 GATCTAACATGTAATTTAACAAGAGACTTAAGCTATGCAACAGGCCTCTCATCAGGAGACCAGTAACTGGGGCAGCGAGGGATTAGAAAGCTGTTTCTGATTGTCTGGTACCTCTGAATGAGCATGCTTCTACTGAGGGTTTATCAAGGTCTATGGGTGAAGTATATTGGAGGGACCTTTGCACTGGGAACTAAAGTGTGGTCCTCCCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 37484 198 + 647215 GTTCTAATGTGTAATTTAACAAATAACTTAAGCTAC-------------TATCAGGCGACTGCTAACTTGAGCAGTGAAGGACTAGAAAGCTGTTTCTGATTCTCTGGTACCTCTGAATGAGCATACTTCTACTGAGGATTTACCAGGGTCTGTGGGTGAAGTGTATTGGAGGGACCTTTGCACTGGGAACCAGAGTATGGTCCTCCCAAT - -a -s mr.mrrefChr0 42898 48 + 130230 ATTTATAGTGATGCATGCCTGGGAGTCAATGCATTACAGAATCATATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45128 48 + 636262 ATTAATAGTGATGCATGCCTGGAAGTCAATGCATTACAGAATCATATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 37682 48 + 647215 ATTTAGAGTGATGCATGCCTGGGGGTCAATGCACTACAGAATCATATA - -a -s mr.mrrefChr0 42946 16 + 130230 TGATCTTCAATAGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45177 16 + 636262 TGATCCTCAATAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 37730 16 + 647215 TGATCTTCAATAGGGA - -a -s mr.mrrefChr0 42962 20 + 130230 TTAGATGTAATATTGTTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45193 20 + 636262 TTAGATGTAATATTGGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 37755 20 + 647215 TTAGATGTAATATTGTTGCA - -a -s mr.mrrefChr0 42982 35 + 130230 CAGCATCCACTGAAGAGGTAACTGGTTGTACTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45224 35 + 636262 CAGCATCCACTGAAGAGGTAACTGATTGCACTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 37775 35 + 647215 CAGCATCCACTGAAGATGTAACTGGTTGTACTATA - -a -s mr.mrrefChr0 43017 248 + 130230 TGACATTAGAGGACCATTGCTTATGCAAAGATCTTATGGTCCACTACCCTGTTGATTTAGATTTGACTGACTATGATGCAGGTAGTGTCTAGCAGTCCTAAGTCAACACATGGGTGTGTGTAAACTAATTGTTCTTTAGGTCCCTTGCATTCAGGCAATCACATGCCACACAATGGAGATGGCTGTAATGGGTGGAGACTATGTGGCACTTGATGAAGACACATCAGCTTTAAGAAGAGGACAGCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45261 248 + 636262 TGACATTAGAGGACCATTGCTTATGCAGAGATCTTATGGTCCACTACCCTGTTGATTTAGATTTGACTGACTATGATGCAGATAGTGTCTAGCAGTCCTAAGTCAACACATGGATACGTGTAAACTAATTGTTCTTTGGGTCCCTTGCATTCAGGCAATCACATGCCACACAATGGAGATGGCTGTAATGGGTGGAGACTATGTGGCACTTGATGAAGATACATCAGCTTTAAGAAGAGGACAGCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 37810 244 + 647215 TGACATCGGAGGACCATTGCTTATGCAAAGATCTTATGATCCACTACCCTGTTGGTTTAGATTTGACTGACTACGATGCATGTAGCGCCTAGCATTCCCAAGTCAACTCATGGGTGTGTGTAAACTAATTGTCCTGCAGGTCCCTTGCATTCAGGTAATCACATACCACACA---GAGATGGCTGTA-TGGATGGAGACTATGTGGTACTTGAAGAAGACACATCAGCTTCAAGAATAGCACAGCTGA - -a -s mr.mrrefChr0 43265 90 + 130230 CAGCAGTCTTTGTAACTAATGATGAACAAGCCTTGTGGTGAGGCCAGGCCCTATCCTGACAAACTAGTGTTCCCACTAAACTCACAACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45510 90 + 636262 CAGCAGTCTTTGTAACTAATGATGAACAAGCCTTGTGGTGCGGCTAGGCCCTATCCTGCCAAACTAGTGTTCCCACTAAACTCACTATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 38054 90 + 647215 CAGCAGTCTTTTTACCTAATGATAAACAAGCCTGGTGGTGAAGCCAGGCCCTATCCTGACAAACTGGTGTTCCCACTAAACTCATACCAG - -a -s mr.mrrefChr0 43355 31 + 130230 GATGATTGGACAATAATGACTGTTGAGGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45600 31 + 636262 GATGGTGGGACAATGATGACTGTTGAGGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 38152 31 + 647215 GATGATTGGACAATAATGACTGTTGAGGCCT - -a -s mr.mrrefChr0 43386 21 + 130230 ACTTGCTATTACCAGTTTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45636 21 + 636262 ACTTGCTATTACCAGTTTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 38183 21 + 647215 ATATACCATTATCAGTTAGTT - -a -s mr.mrrefChr0 43407 224 + 130230 GTCGGCTCTGTTGGGAAAGCCAACAATTGATCCACAGCTAAGTAAACAAATGGCAATTAGGAGCATAGCTTCAAATGCTAGAATGGTCTGTCTGTATGTTACAGGGCCCATATTGTCTTGTGTAATGACCCAAGGTCTGTAATGACCCAAGGTATGTGCTACATATGCCATGCCACCATGTCCTATATCCTGCACACCCCCCCTAGAACAGTATTCTAGAGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45660 220 + 636262 GTCGGCTCTGTTGGGAAAGCCAACAATTAATCCACAGCTAAGTAAACAAATGGCAATTAGGAACATAGCTTCAAATGCTAGAATGGTCTGT----AGGTTACAGGGCCCATATTGTCTTGTGTAATGACCCAAGGTCTGTAATGACCCAAGGTATGTGCTACATATGCCATGCCACCATGTCCTATGTTCTGCACACCCCCCCTAGAATAGTATTCTAGAGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 38379 204 + 647215 ---AGAACTGTTGGGAAAGCCATCGATTGATATACAGCTAAGTAAACAAATGGCAATTGGGAGCATAGCTTCAAATGCTAGAATGGTCTGTCTGTATGTTACAGGGCCCATTTTGTGTTGTATAATGACCCAAGGCTTT-----------------TGCTACATATGCCATGCCACCATGGCCTATATCCTGCACACCCCCCCTAGAACAGTATTCTAGAGCTA - -a -s mr.mrrefChr0 43631 40 + 130230 GAGCTCTTAATTTTATCCTTACTGTCATCTAGCTAGTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45880 40 + 636262 GAGTTCTTAGTTTTATCCTTACTGTCACCTAGCTAGTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 38599 40 + 647215 GAGCTCTTAATTTTATCCTTACTGGCATCTAGCTAGTCAG - -a -s mr.mrrefChr0 43671 7 + 130230 CACTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 38642 7 + 647215 CACTAGT - -a -s mr.mrrefChr0 43678 139 + 130230 GGACTTAGAAATTGGCATAAGGATGATTAGTTGCACCTTAAACTTTAATTGTTCAGTCTTAATAACCTTGCACAATCTGACTCAGGCTGAACATCCCCTAGTACAACCTATTGGAGTGGTGTGAATGTGTTATGTGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45920 92 + 636262 -----------------------------------------------ATTGCTCAGTTTTATTAGCCATACACAATCTGAGCCAGGCTGAACATCCCCTAGTACAACCCATTGGAGTGGTGTGAATGTGTCATGTGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 38655 139 + 647215 GGACTTAGAAATTGGCATAAGGATGATTAGTTGCACCTTAAACTTTAATGGTATAGTCTTAACAATCTTGCACCATCTGACTGAGGCTGAATATCCCCTAGCACAACCTATTGGAGTGGTGTGAATGTGTTATGTGGTG - -a -s mr.mrrefChr0 43817 15 + 130230 GAATCTGCTATGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46013 15 + 636262 GAATCTGCTATGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 38794 15 + 647215 GAATCTGTTATGTGT - -a -s mr.mrrefChr0 43832 23 + 130230 ACTCTCTAGCAAATGGATAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46036 23 + 636262 ACTCGCTGGCAAATGGATAGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 38809 23 + 647215 ACCCTGTAGTGAGTGGATAGTGT - -a -s mr.mrrefChr0 43855 346 + 130230 TAGGTAGCCAATACCTATGGACGTGACTGATATCCAGAAAGCTAAAATAAATATAGGATGATTGGCAGGAACCAAGTTTTAGAGCCGTCTTAAGGTCCCTGAGGCATAGCAAAGCAACAGCTGCTAATTGCAGTCTTAGGACTCCTCCCCATCAAGACTCCATCTGCAAGTTGCATGAGTACCCTGGTGAAAGTGTTGTGTGGCTCAGCATCAAAAGGTAGGTAGTATAATTCACCTTTTGCTAGACTTGTTTATGCATATTTATAAAGCTTGATTATTGCTTCTTGAGAGGATGTGTTCTTAACATGTTTATAGCACAAAATAATTTATAATTGATTTGGAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46061 346 + 636262 TACGTAGGCAATACCTATGGACATGACTGATATCCATGAAGTTAAAATAAATATAGGATGATTGGTAGGAACCAAGTTTTAGAGCCGTCTTAAGGTCCCTGAAGCATAGCAAACCAACAGCTGCTAATTGCAGCCTTAGGACTCCTCCCCATCAAGACTCCATCTGCAAGTTGCATGAGTACTCTGGTGGAAGTGTTGTGTGGCTTAGTATCAAACGGTAAGTAGTATAGTTCACCTTTTGCTAGACTTGTTTATGCATATTTAGAAAGCCTGATTTTTGTTTATTGAGAGGATGTGTTCTTAACATATTTATATCACATAATAATTTATTATTGATTTGGAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 38832 346 + 647215 TAGATAGCCAATACATATGGGCGTGACTGATATCCAGAAAGCTAAAATAAATATAGAAAGATTGGCAGGAACCAAGTTTTAGAGCCATCTTAAGGTCCCTGAGACATGGCAAGGCAACAGCTGCTAACTGTAGTCATAGGACTCCTCCCCATCAAGACTCCAGCTGCAAGTAGCATGAGCGCCCTAGTGAGAGTGTTGTGTGGCACAGCATCAAAAAGTAGGTAATATAATTCACCTTTTTCTAGACTTGTTTATGCATATTTATAAAACTTAATTACTACATCTTGAGAAGATGTGTTCTTAACATGTTTATAGCACAAAATAATTTAAAATTGATTTGGAACTT - -a -s mr.mrrefChr0 44201 262 + 130230 CTAAACTTCTCACTCCTACAATGGTGCAGTGCGTAGAAGGCACCAGAGATTTTAGAGGCAAGACAAAAAACCAATATTGCTAGACTTGTGATATATTCACAATTTGAACAAAGCCTGTATCGCCTATGTTAACCTATGGTATTCTTCCAACCTTGAAAAAGCAGAGTGGAAAACACATGTTGGAATTGCAAATGTGAAGCATACACATCAAATCACACATTCTAACAAACCCAACTGATTTAATACATCAACATCACAATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46407 260 + 636262 CTAGACTTCTCACTCCTACAATGGTGCAGTGTGTAAAAGGCACTAGAGATTTTAGATGTAAGACAAAAAACCAATATTGCTAGA--TGTGAAATATTCACAATGTGAACATAGACTTTATTGCCTATGTTAACCTATGGTATTCTTCCAACCTCGAAAAAGTAGAGTGGAAAACACATGTTGGAATTGCAAACGTGAAGCATACACATCGGATCACACATTCTAACAAACCTAACTGATTTAATACACCAACATCATAATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 39179 262 + 647215 CTAAACTTCTCACTCCTGCAATAGTGCAATGCGTAGAAGGCACCAGAGATTTTAGAGGCAAGACAAAACACTAATATTGCTAGACTTGTGATATATTCACAATTTGAACAAAGCCTGTATCGCCTAAGTAGACCTATGGTATTCGTCCAACTATGGAAAAGCAGAGTGGTAAACACATGTTGGAATTGCAAGTCGGAAGCATACACAACAAATCACACATTCTAACAAACCCAACTGGTTTTATACATCAACATCACAATAT - -a -s mr.mrrefChr0 44463 260 + 130230 GAGACTATCATATTAGAATCCTGGTGGAGGATGCCAGGTGGATGTTTACACACAGGATAATTAGATGAATTAGACGATGGAAGCAACTGAGTCCTCTGCAGCTCTAACGCCTTATTCACAATTTCACCCTACTCTTCAGTGGTATACAGACTAAGCCGAGCTGGTATTACTGTGGACAACTAGGCACTACTGTTTAGATGAGCCTGACATTAGCAAGCATACACAAGGTTATTGATTGGAGCCTTCCAATGAGAATGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46692 255 + 636262 GAGGATGTCATATTAGAATCCTGTTGGAGGATGCCAGGTGGATGTTTGCACACAGGATAATTAGATGAATCAGACGATGGAAGCAACTAAGTCTTCTGCAGCTCTAACGCCTTATCCACAATTTCACCCTACTCTT-----GTATACAGACTAAGCCGAACTGGTATTACTGTGGCCAACTAGGCACTACTGTTTAGATGAGCCTGACATTTGCAAGCATACACAAGGTTAGTGATTGGAGCCTTCCAATAAGAATGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 39441 260 + 647215 AAGACCATCATATTAGAATCCTGGTGGAAGACGCCAGGTGGATGGTTACACACACGATAGTTAGATGAGTTAGAAGATGGAAACAACTGAGTCCTCTGGAGCTCTAACACCTTATTCACAATTTCACCCTACTCTCCAGTGGTATACAGACTAAGCCAAGCTGGTATTACTGTGGACAACTAGGCACCACTGTTAAGATGAGCCTGACACTAGCAAGCATGTACAAGGTTATTGATTGGAGCTTTCCAATGAGAATGGTG - -a -s mr.mrrefChr0 44723 161 + 130230 CAGTCACAGTGCATGCAAAAAAGTACATATGGACTTTAAGTGAGAGTGAGGCCCAAAATCTTACAAGGTGGACAATCAGCATAAGCTAAACTGCCTAACCACCCTGTTGTTGCAGGATTGCTAAACCTAGTGATTATGACCTAAGCTTCAGTGCTGAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46947 161 + 636262 CAGTCACAGTGCATGCAAAAAAGTACATAAGGACTTTAAGTGAGAGTGAGGCCCAAAATCTTCCAAGGTGGACAATCAGCATAGGCTAAGCTGCCTAACCACCCTGTTGTTGCAGGATTGCTAAACCAAGTGATGATGACCTAAGCTTCAGTGCAGAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 39703 161 + 647215 CAGTCATGGTACATGCATAAAAGTACATATGGAATTTAAGTGAGAGTGAGGCCCAAAACCTTACATGCTGGACAATCAGCATAAGCTGAACTGCCTAACCTCCCTGTTGTTGCAGGGTTGCTAAATCTAATGATTGTGACCTAAGCTTCAGCACTGAGTAT - -a -s mr.mrrefChr0 44884 105 + 130230 TATTCTAACACTAGCATTATATGGCAATTAGATTATATCCAACTGGATAGTAGATTGATGGGATACAGGAGGAGCACAAATCAAGACAATTCCAGTAGATGTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47108 103 + 636262 TATTCTAACCCTAGTATTATATGGCAATTAGATTATATCCAACTGGATAGCA-ACTGATGGGATATGGGAGAAGCACAAATCAAGACACTTCCAGT-GATGTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 39867 105 + 647215 TATTCTAACACTAGCATTACATGGCAATTAGATTTTATCCAACTGGATAGTAGATTGATGTGATACAGGAGGAGCACAAATCAATGCAATTCCAGCAGATGTGTG - -a -s mr.mrrefChr0 44989 188 + 130230 CCTTACACTTTAGTAGGGCTAGATGAGAGAGGGCATAGACATGCAGACTACAATCGATGATAACCCTTTGTCAGTCAGATTCAAGCACTTTGCAGCTGGGTTCGTGATTACCAGCTTTTGCTATGCCTAATGATGGTGTTTCAGGGCCTTCAGAAGTAGGCCAATCCTAGCAAGGTTAAATAGAAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47213 185 + 636262 CCTTACACTTTAGTAGGGCTAGATGAGAGAGGGCATAGACATGCAGACTACAAT---TGATAGCCCTTTGTCAGTCAGATTCAAGCACTTTGCAGCTGGGTCCATAATTACCAGCTGTTGCAATGCCTAATGATGGTGTTTCAGGGCCTTCAGAAGTAGGCCAATCCTAGCAAGGTTAAATAGAAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 39972 181 + 647215 GCTCAAACCTTAGTAGGGCTAGATGAGAGAAGGCATAGACATGCAAACTACAATCGATGATAACCCTTTGCCAGTCAGGTTCAAGCCCTTTGCAGTCAGGTTCGTGATTATCAGCCTTTGCTATGCCTAATGATGGTGTTTCAGGGCCTTCAGAAGTAGGCCAATC-------GTTTAAATCAAAGAA - -a -s mr.mrrefChr0 45177 121 + 130230 AGGCTTAAAGATTTTCTCACTCTAACACAGGTGTTAGATCACATGTACAGATTCTGTGGATTAAAAAGGAGCTACAGGTAGTGTATACACACAAATTGAGTCAAAAATAAAGATCATGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47398 121 + 636262 AGGCTTAAAGATTTTCTCACTCTAACACAGGTGTTAGATCACACGTACAGGTTCTGTGCGTTAATAAGGATCTCCAGGTAGTGTATGCACACAAATTGAGTCAAAGATAAAGGTCATGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 40157 121 + 647215 AGGCTTAAACATTTTCTAACCCTGACACAGGTGTTAGAACATATGTACAGATTATGTGGACTAAAAAGGAGCTACAGGTAGTGTATACACACAAATTCAGTCAAAAATAAAGAGCATGTGG - -a -s mr.mrrefChr0 45298 102 + 130230 ATATGTGTTAAGATCCATGGCTAGCATTGGCCCACTAGGATAGTCATAGTTTGAGGGGGTGGCAGACCTAAACCTTGGGGAAAGAACAATAGAGAATTAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47519 102 + 636262 ATATGTGTTAAGATCCATGGCTAACATTGGCCCACTAGGATAGTCATAGTTTGAGGGGGTGGCAGACCTAGACCTTGGGGAAAGAACCATACAGAATTAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 40279 102 + 647215 ATACGCGTTAAGATCCATGGCTAGCATTAGCCCACTAGGATAGTCATAGTCTGAGGGGGTGGCAGACTTAATCCTTCAAGAAAGAACAATAGAGAATAAGTA - -a -s mr.mrrefChr0 45400 20 + 130230 TGCCAGGCTATCTTACCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47621 20 + 636262 TACCAGGCTATCTTACCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 40384 17 + 647215 TGCCAGG---TCTTACCTAT - -a -s mr.mrrefChr0 45420 203 + 130230 ATGTATAGAACAATAGAGCAGGTACATAAAACAATATTTTAGTTGATAATTCTTAGATCTTTGCTAATTCTTCGTTCTTTGCCCATGCACTGCTCCATGTTAAAGTGCTTGAAGAGGGCAAGAACCTCTTTCTAATCACACTTTAGGACCCATGATGTTATAATGATCTTCAAGTGAAGCAGAAATTCCATTCATATTTATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47641 186 + 636262 ATGTATGGAACAATAGAGCAGGTAGACAAAACAATATTTTAGTTGATAATTCTTATATCTTTG------------TCTTTGCCCATGCACTGCTCCATGTTAAAGTGCTTGAAGAGGGCAGGAACCTCTTTCTAATCA-----TAGGACCCATGATGTTATAATGGTTTTTAAGTGAAGCAGAAATTCCATTCATATTTATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 40404 203 + 647215 TTGTATAGAACAATACAGCAGGTACATATAACAATATTATAGTTGATAATTCTTCGTTCTTTGCTAATTCTTCGTTCTTTGCCCATGCACTGCACCATGTCATAGTGCTTGAAGAGCGCAAGAACCTCTTTCTAATCACACTTTAGAATCAATAACATTATAATGATCTTCAAGTCAATCCAAAATTCCATTCATATTTATGG - -a -s mr.mrrefChr0 45623 135 + 130230 ACTACCATGTACGCCCCAGAGAAATTCTCATATCTGACTAGGTTACATAGCTATCGTCTACTGGGTTTAGTTCAGGGCAACCTTTTAATAAACTGATTCAATTGCTATTGAGTGCAAGAATCACTGACAAACCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47831 135 + 636262 ACAACCATGTACGCCCCAGAGAAACTGTCATATCTGACTAGGTTACATCGTGGTCATCTACTGGGTTTAGTTCGGGGCAACCTTTTAATAAACTGATTCGATTACTATTGAGTGGAGAAATCACTGACAAACTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 40607 135 + 647215 ACTACCATGTACACCTCAGAGAAATCCTCATTTCTGACTAGGCTACATAGCTATTGACTAATGGGTTTAGTACAGGGCAACCTCTTAATACATTGATTTAATTGCTATTGAGTGCAAGAATCACTGACAAACCAT - -a -s mr.mrrefChr0 45758 58 + 130230 TGAATATTGAAGAAATCAGCTGTGGCTAGTTTGAGGGCAAACCCTAATATCTGGTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47972 58 + 636262 TGAATATTGAAGAAATCAGCTGTGGCTAGTTTGAGGGCAAGCCCTAATATCTGGTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 40742 58 + 647215 TGAATGTTGAACAAATCAACTGTGGCTCGTTTGAGGGCAAACCCCAATTTCTGACAAA - -a -s mr.mrrefChr0 45816 65 + 130230 TGGTTAGTCCCCTCTGCTCATACAGGTATCCCCATCCCTATACACCACTAACACCACAGAACTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48031 64 + 636262 TGGTTAGCCCCCCCTACTCATACAGGTATCCCCATCCCTATACACCACTA-CACCACAGAACTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 40800 65 + 647215 TGGTCAGTCCTCTCTGCTCATACAGGTATCCCTATCCCTATACACCACTAACACCACAGAACTAC - -a -s mr.mrrefChr0 45881 180 + 130230 TCAGATATTATGAGTTACATCCATGTAGGCTAGCAATATTTTTTAGTACTCCTGCACTTGGTTGCAGACAAGGTGTCATACAGATTTCATACTGAACTGGACCCTCTGTTTAGACTACGGGGCTGACCTGTTAATATGTATCCTTAAAAAAATGGATTCAATCATTATTGGAGCAAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48097 179 + 636262 TCAGATATTA-GAGTTACATCCATGGGGGCTAGCAATGTTTTTTAGTGCACCTGCACTTGGTTGCAGACAAGGTGTCATGCAGATGTCATACTGACCTGGACCCTCTGTTTAGACTACGGGGCTGACCTGTTAATATGTATCCTTAAAAAAATGGATTCAATCATTATTGGAGCAAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 40865 173 + 647215 TAAGATATTATGAGTTACATTCATGTAGGGTAACAATATTTTTTAGCACTCCTGCACTTGGCTGCGGACAAGGTGTCATACAGATTTCATACTGGACTGGACCCTCTGTTTAGACTAGGGTGCTAACCTGTTAATATGTAGCCTTATAAA-------TCAATCATTATTGGGGCGAAGAA - -a -s mr.mrrefChr0 46061 131 + 130230 TGTACAAGTTCTTGATTGTAGAAGGTAGAAGCATCATACATCAGAGAGATTGTGTCATCCTAATTCCCAGAATATATTTCCAGTTTAACAGTTGGCTCCAGGAGGATTGAATGGAAATAGTGCTTTTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48277 131 + 636262 TGGGCAAAGTCTTGATTGTAGAAGTTAGAAGCATCATACATCGGAGAGATTGTGTCATCCTAATTCCCAGAATATATTTCCAGTTTAACAGTTGGCTCCAGGAGGATTGAATTGAAATAGTGCTTTTTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 41038 131 + 647215 TGTACAAGTTGTTGATTGTAGAAGGTAGAAGCATAGTACACGAAAGAGATTGTGTCATTCTAATTCCCAGAATATATTTCCAGTTTAACACTCGGCTCCAGGAGGACTCAATGGAACTCGTAATTTTTGAG - -a -s mr.mrrefChr0 46192 7 + 130230 CCTATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48408 7 + 636262 CCTATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 41171 7 + 647215 CCTATCA - -a -s mr.mrrefChr0 46199 296 + 130230 AATCATTATTTACCTACATATCCCCATATACTATGATGATAACGGTAGCAGAAAAAGTGTTGCTATTGGGAAGTAAGTATTGTCCACTTTTAGCCTCTTGTACTTAAACAGCAAGCTCAAGGTCACATTCACTGTAAGCACCTAAGATCAAATATATATTGCTGCCATGGCAACAAAATAAACACTCGAGGTTGATAGCAAAGAATGCTGACAGATCTGATGAACTGCATAACGGTCTTAGCAGGGCACTGATGCTACCTGGCTTCACATATCCAACTCTCCATCCATGCAACTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48422 294 + 636262 AAGTATTATGTACCTACATATCCCCATATACTATGATGATAACGGTATCAGAAAAAGGGTTGCTATTAGGAAGTAAGTATTGTCAACTTTTAGCCTCTTGTACTTAAACAGCAAGCTCAAG-TCACATTCACAGTAAGCACCTAAGATCAA-TGTATATTGTTGCCATGGCAACAATTTAACAACTCGAGGTTGGTAGCAAAGAATGCTTACAGATCTGATGAACTGAATAACAGTCTTAGCAGGGCACTGATGCTACCTGGCTTCACCTATACAACTCTTCATCTATGCAACTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 41178 296 + 647215 AATCATTGTTTACCTACAAATCCCCATTTACTATGATAATAATGCTAGCTCAAATAGTGTTGCTATTGGGAGGTAAGTATTGTCCACTTATAGGCTCTTGTACTTAAGCAGCGCACTCAAGGTCACGTTCACTGTAAGCACCTAAGATCAAATACATATTGCTACAATGGCAACAAAATAAACCCTGCAGGGTGAATGCAAAGAATGCTGAGAGATCTGATGAACTGCATAATGGTCTTAGCAGGGCACTGATGCTACCTGGCTTCACATATCCAACTCTCCAACCACACAATAAG - -a -s mr.mrrefChr0 46495 69 + 130230 AGCTGTTTGTGTATGGAACATTCTTGTTTGTATTATTCTCACAGGTTGTGACACAAAAATCTTGAAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48755 69 + 636262 AGCTGTTTGTGTATGGAACATTCTTGTTTGTATTATTCTCACAGGTTGTGACATAAAAATCTTGAAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 41474 69 + 647215 AACTGTTTTTGTATGGAACATTCTTGTCTGTATTATTGACATAAGTTGTAACACAAAAGTCTTGGAGTG - -a -s mr.mrrefChr0 46564 259 + 130230 CTATGTGCACATCTCCCAGATTGATTGACTGACACTCCAGAAACTGTTTAGGAAGGAATTGCCCTGGTTGATTCTGTTTATAAGTCAGAACCACCTATTATACACATGAACAGTCTTGTATTTTTCAAACCTTCGTGATGACAAAAATACAATAGTAGGACAGTGCAAGCATCTATTAGTATCATCATTAAGTTTCTCCAGATATCTTGATGTTTCAACAAGCTGGCTTTAACTTGTATTCGAAAAATTAGTCCGTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48824 258 + 636262 CTATGTGCACATCTCCCAGATTGATTGACTGACACTCCAGAAACTGTTCAGGAAGGAATTGCCCTGGTTGATTCTGTTTATAAGTCCGACCCACCTATTATGCACATGAACAGTCT-GTATTTATCAAACCTTCGTGATGACAAAAATACAATAGTAGGACAGTGCAAGCATCTATTAGTGTCATCATTAAGTTTCTCCAGATATCTTGATGTTTCAACAAGCTGGCTTTAACTCGTATTCGAAAAATTAGTCCGTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 41560 251 + 647215 CTATGTGCACATCTCCAGGATTGATGGACTGTCACTCCAGAGTGTGTTTAGGAAGGAGTTGCCCTGGTTGATTC--------AGTCAGAACCACCTATTATATACATGAACAGTCTTATATTTTTCAAACCTCCGTCATGACAAAAATACAATAGTTGGACAGTGCACGCATCTATTAGTATCATCATTAGATTTCTCCACATATCTTGATGTTTCAACAAGCTGGCCTTGATTTGTATTCAAAAAATTAGTCCTTCCA - -a -s mr.mrrefChr0 46823 59 + 130230 GTTTAAAATGCGTGTTTTTTAGCAAGCATATGTCTTTATTGCTTCTAGGTTTGCAGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49083 59 + 636262 GTTTAAGATGCGTGTTTTTTGGCAAGCATATGTCCTTATTGCTTCTAGGCTTGCAGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 41811 57 + 647215 GTTTAAAATGCGT--TTTTCAGCAAGCATATGTCTTTGTTGCTTTTAGGTTTACAGAAG - -a -s mr.mrrefChr0 46882 241 + 130230 TTAAGCTGAGTCCTGACAATGCAGAGATAAATTCCCTGTCTAAGCACCCCAGAAGCAAACACCATCTATATTAGTTCCCTAGCCTCTATTCTGGTTGGGAACTCAAATCTATAAAATATAGTATCTCCACATGAAACAGAACCCCTTTATGACGAGGACTCAATTAGAATAATTAGAATGTTGCTCAAACAGTGGAGTATTTTATTGCCATTTTTATTGCCTTGAGATTATGCTCAAAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49143 241 + 636262 TTAAGCTGAGTCCTGACAATGCAGAGATCAATTCCCTGTCTAAGCACCCCAGAAGCAAACACCATCTATATTAGTTCCCTGGCCTCTATTCTGATTGGGAACTCAAATCTATAAAATATAGTATCTCCACATGAAACAGAACCCCTTTATGACGAGGACTCAATTAGAATAATTAGAATGTTGCTCCAACAGTGGAGTATTTTATTGCCATTTTTATTGCCTTGAGATTATGCTCAAAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 41868 240 + 647215 TTAAGGTGAGTCATGACAATGCAGAGATAAATTCTATGTCTAACCACCCCACAAGCAAACAA-ATCTGTATTGGTTCCCTAGCCTCTATTCTGGTTGGGGACTCAAAGCTATAAAATACACTATCTCCACACGAAACAGACCCCCTTTATGACAAGGACTTAATTGGAATAATTAGAATGTTGCTCAAACACTGGAGTTTTTTATTGCCCTTTTTATTGCCTTGAAATTATGTTCAAAGGT - -a -s mr.mrrefChr0 47123 59 + 130230 CATGTCAAGTGAATCTGATTCCATTTTGTTGCTGTATTAATGTATCATCTTTGCTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49389 59 + 636262 CACGTCAAGTTAATCCAATTCCATTTTGTTGCTGTATTAATGTATCACCTTTGCTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 42108 59 + 647215 CATGTTAAGAGAATCTGATTCCATTTTGTTGCTGTATTAATGTATCATCTTTGCTTTGA - -a -s mr.mrrefChr0 47182 21 + 130230 TATAGGGTATCTTTGACAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49455 21 + 636262 TATGGGGTATCTTTGACAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 42167 21 + 647215 TATAGGGTATCTTTGACAACT - -a -s mr.mrrefChr0 47203 44 + 130230 TAATGCCTCAAAATAACATATTAGCTGGTCCATATTAAAAAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49476 44 + 636262 GGATGCCTCAAAATAACATATTAGCTGGTCCATATTAAAAAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 42206 44 + 647215 TAATGCCTCAAAATAACATATTAGCTGGTCCATATTAAAAAGCA - -a -s mr.mrrefChr0 47247 28 + 130230 TCCTCATTTAACTTGTATCACCTGCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49544 28 + 636262 TCCTCATTTAACTTGTATCACCTGCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 42250 28 + 647215 TCCACATTCAACTTGTACCACCTACTTT - -a -s mr.mrrefChr0 47275 5 + 130230 TTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49646 5 + 636262 TTCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 42278 5 + 647215 TTAAG - -a -s mr.mrrefChr0 47280 94 + 130230 CAGAGGTTGCTAATTACTTATATTGGAGAATTTATATTAGTCACTTACGTAGTGGGTATGCTTTTTCTCAATTATACAGATCATTTCAAGAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178941 93 - 636262 CCGAGGTTGCTGATTACTTATATTGGAGAATGTATATT-GTCACTTACGTAGTGGGTATTCTTTTTCTCAATCATACAGATCATTTCAAGAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 42283 94 + 647215 CAAAGGTTGCTAATTACTTATGTTGGAGAATTTATATCAGTCACTTACATAGTGGGTACGCTTTCTCTCAATTATACAGATCATTTCAAGAGGA - -a -s mr.mrrefChr0 47374 140 + 130230 TAGGCCTATGGTTTGTAGGTATCTTACACACATGGTTCTATTAGTTTTGTGAATTGCACTTTGCAACTCATTATTCTATGATACTCCCACTTCACTTCCCTTTTCACTGCACTAGTCACCAAGTctactatagtccttct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179036 124 - 636262 TAGGCCTTTGGTTTGTAGGTATCTTACACACATAGTTCTATTAGTATTGTGAATTGCACTTTGCAACTCATTATTCTATGATACTCCCACTCTACTTCCCTTTTCACTGCACTAATCACCAAGT---------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 42377 140 + 647215 TAGGCCTAGTGTTTGTAGGTATCTTACACACATGGTTCTATCAGTTTTGTGAATTGCACCTTGCAACTCATTATTGTATGATGCTCCAACTTCACTTCCCTTTTCACTGCACTAGGCACCAAATCTACTATAGTCCTTCT - -a -s mr.mrrefChr0 47514 32 + 130230 TATACTTTGTTGACTTCAATACCTTATACTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49651 32 + 636262 TATACTTTGTTGACTTCAATACCTTATACTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 42530 32 + 647215 TGTACTTTGTTGACTTCAATACATTTTACTAA - -a -s mr.mrrefChr0 47546 59 + 130230 GATTATGTGTATATCTATACAACTGGTAGGCAGAGGTGTAGCAAATTGCATTTGCATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49683 59 + 636262 GATTATGTGTATATCTATACAACTGGTAGGCAGAGGTGTAGCAAATTGCATTTGCATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 42575 59 + 647215 GACCATGTGTATATCTGTACAACCGGTAGGCATAGGTGTAGCAAATTGCATTTGTATCA - -a -s mr.mrrefChr0 47605 51 + 130230 TGAAGTCCTTAAAGACCTCAATTCTAAATTCATTTGCCAACCGTGCATCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49748 51 + 636262 TGAAGTCCTTAAAGACCTCAATTCTAAATTCATTTGCCAACCGTGCATCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 42634 51 + 647215 TGAATTTCTTAAAGACTTCAAGCCTAAATTCATTTGCCGATTGTGCAGCAC - -a -s mr.mrrefChr0 47656 31 + 130230 TTTGCAATGATTGAGCTTTAAACTTCTAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49813 31 + 636262 TTTGCAATGATTGAGCTTTAAACTTCTAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 42685 31 + 647215 TTTGCAATGATTGCGCTTTAAAGCCGCAGCC - -a -s mr.mrrefChr0 47687 99 + 130230 AGAATAGATGAGCAATGTGGAACCTTGCCTTAGATCTTGGCCTTGCTCTTTCACTGTGCAAAATGCTGTTTCATGCTGTAATTTCAGGTGATACCTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49844 99 + 636262 AGAATAGATGAGCAATGTGGAACCTTGCCTTAGATCTTGGCCTTGCTCTTTCACTGTGCAAAATGCTGTTTCATGCTGTAATTTCAGGTGATACCTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 42731 99 + 647215 CAAATAGATGAGCAATGTGGAACCTTGCCCTGGATCTTGGTCTTGCTCTCTTGCTGCACAAAATGCAGTTTCATGCTGTACTTTCAGGTGTTACCTACT - -a -s mr.mrrefChr0 47786 9 + 130230 AGGTGATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49948 9 + 636262 AGGTGATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 42830 9 + 647215 GGGTTGTAT - -a -s mr.mrrefChr0 47795 14 + 130230 TTGTGACACTCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49965 14 + 636262 TTGTGACACTCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 42839 14 + 647215 TTATGTCACTCTCA - -a -s mr.mrrefChr0 47809 126 + 130230 CTTAAAAATGACCAGTCACCCATGGTTTTGTAGCTTTGAATTAGATGTGTACAGAAGTAGATATTCTTCTTCCAGTAAATCAACTATAGCAGTATCGTCATTTCAGCCCTTGTGAGTCTCATAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49979 126 + 636262 CTTAAAAATGACCAGTCACCCATGGTTTTGTAGCTTTGAATTAGATGTGTACAGAAGTAGATATTCTTCTTCCAGTAAATCAACTATAGCAGTATCGTCATTTCAGCCCTTGTGAGTCTCATAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 42856 126 + 647215 CTTAATAATGACTAGCTACCCATGGTATCGTAGCTCTGTATTAGATATGAACAGAAGTAGATATTCTTCTTCCAGGAAATCATCTATAGCAATATGGTCATTTTAGCCCTTGTGAGTCTCATAACT - -a -s mr.mrrefChr0 47935 31 + 130230 CATTGGTCTTGTAACCCTATAGCTTGTCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50106 31 + 636262 CATTGGTCTTGTAACCCTATAGCTTGTCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 42982 31 + 647215 CATTGGTCCTTAAGCCCTGTAGTTTGTGGAC - -a -s mr.mrrefChr0 47966 41 + 130230 AGGACAGAAATTACTTGTACACTCTTATACTTGCTGTAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50138 41 + 636262 AGGACAGAAATTACTTGTACACTCTTATACTTGCTGTAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 43013 41 + 647215 AGGACAGAAATGACTGGTAGGCTATTATACGTGCTGGGATA - -a -s mr.mrrefChr0 48007 9 + 130230 TGAGTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50180 9 + 636262 TGAGTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 43054 9 + 647215 TTAGTTTGA - -a -s mr.mrrefChr0 48016 18 + 130230 CTTGGCAGACTTATTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50192 18 + 636262 CTTGGCAGACTTATTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 43063 18 + 647215 TTTGGCATACTCATTCTG - -a -s mr.mrrefChr0 48034 14 + 130230 ATTGCCGGATGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50210 14 + 636262 ATTGCCGGATGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 43082 14 + 647215 ATTGCAGGACACCT - -a -s mr.mrrefChr0 48048 18 + 130230 ACTCAGTAGCATTAAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50224 18 + 636262 ACTCAGTAGCATTAAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 43097 18 + 647215 GCTCAGTAACATTAAGTT - -a -s mr.mrrefChr0 48066 126 + 130230 GTATTTGGTACATTGGCTTCCATCTTCAAAGTTACAATAGCTTACAGGTTCACTTTGTCTTTTTGCACCTTAGGCAAGTTGAAGTATCAAGACCTTCATTCTGATAATTCAAATTAAGTTGGTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50242 88 + 636262 GTATTTGGTACATTGGCT--------------------------------------GTCTTTTTGCACCTTAGGCAAGTTGAAGTATCAAGACCTTCGTTATGATAATTCAAATCAAGTTGGTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 43123 126 + 647215 TTATTTGATACATTGGCTTCCATCTTCAAAGTTACAATAGCTTACAGGTTCACTTTGTCTTTTTGCACCTTAGGCAAGTTGAAGTATCAAGACCTTCATTCTGATAATTTGAATTGAGTTGGGGTA - -a -s mr.mrrefChr0 48192 90 + 130230 GCCATAATCTGTATTGAGGGTAGATCATGGTCCTTGTCCTAGTATACAGTAAAAAGTGAGAAACTTCCAATCAATGACTTTAAGGTTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50330 72 + 636262 ------------------GGTAGATCATGGTCCTTGTCCTAGTATACAGTAAAAAGTGAAAAACTTCCAATCAATGACTTTAAGGTTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 43253 90 + 647215 GCCATAATCTGTATTGAGGGTAGATCATGGTCTTTGTCCTAGTATGCAGTAAAAAGTGCGAGACTGCAAATCAATGACTTTAAGGTTACA - -a -s mr.mrrefChr0 48282 150 + 130230 TTTTATCCTATCTTTTTTCTCAATAACTCCTCAAGTGAGTTAATTTGTCTGGACGATTATAAGTGCTCTATACCCTCACATTGCAATTTCAGCGTCTGCTGCAACATCTTAACTTACCAGTAAGGGTATTGACACCTCAGGCTGAGTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50402 150 + 636262 TTTTATCCTATTTTTTTTCTCAATAACTCCTCAAGTGAGTTAATTTGTCTGGATGATTATAAGTGCTCTATACCCTCACACTGCAATCTCAGCGTCTGGTGCAACATCTTAACTTATCAGTAAGGGTAATGACACCTCAGGCTGATTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 43350 150 + 647215 TTTCATCCTATCTTTTTTCTCAATAACTACTCAGGTGAGTTAATTTGTCTGGACGATGGTAAGTGCTTTACACCCTCACCTTACAATTTCAGTGTCTGCTGCAACATCTTAACTTACCAGTAAAGGTATTAACAACTCAAGCTGAGTAAT - -a -s mr.mrrefChr0 48432 289 + 130230 ACAAACAATGACAGTGGGTCAAAGTAATCCTTACAACTTCCCCAATAGGTTGTTCAGCCACAATGCAATTAAGTAAACCAAAGTTCATGATCATTGATGATAGACCTTTCATTAATCATGACTACATTGCTATTATTATCCCTTTATTTCCTTGGTTTAGACCCTGACTTATTCCTTTCAGTGTAGGTCTACTCCTTTTACTGTATTCTAATTTTCTATGGCAGAGCATTCCTTATCAATGAACCCACCCATAGTCTATATTGCAGGAGTCACATGGAGATCCTGAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50600 287 + 636262 ACAAACGATCACAGTGGGTCAAAGTAATCCTTACAACTTCCCCAATAGGTTGTTCAGCCACAATGCAATTAAGTAAACCAAAGCTCATGATCATTGGTGATAGACCTTTCAATAATCAGAACCACATTGCCAT-ATTAACCCTTTATTAACTCAGCC-AGACCCTGACTTATTCCTTTCAGTGTAGGTCTACTCCTTTTACTGTATTTTAATTTTCTATGGCAGAACATTCCTTACCCATGAACCCATGCATAATCTATATTGCAGGAGTCACATGGAGATCCTGAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 43500 289 + 647215 ACAAACAATGTCAGTGGGTCAAAAAAACCCTTACAACTTATCCAATAAGTTGTTCAGCCACAATGCAATTGAGTAAGCCAAAGTTCAGGACCCTTGATGATAGACCTTCCATTAATCATGACTACACTGCTATTATTATCCCTTTTTTTCCTTGGTTTGGACCCTGATTTATTCCTTCCAGTGTAGGTCTACTCTTTTCACTGTGTTCTAATTTTGTCTGGCAGAGCATTGCTTATCAATGACCCCACCCATAGTCCGTATTCCTGGAGTTGCATGGTGATCTTGAGCT - -a -s mr.mrrefChr0 48721 12 + 130230 GTTGGTTAATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50888 12 + 636262 GTTGGTTAATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 43789 12 + 647215 GCTGGTTAGATG - -a -s mr.mrrefChr0 48733 3 + 130230 CTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50902 3 + 636262 CTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 43801 3 + 647215 CTG - -a -s mr.mrrefChr0 48736 4 + 130230 GTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50905 4 + 636262 GTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 43805 4 + 647215 GTGG - -a -s mr.mrrefChr0 48740 318 + 130230 CTCTAGCCAGTCTCTTCTATTAACATACGTGGTCACCTTATAGTACATGAATACCTTGTGCAATGATCACCTAATGCCATAAGGCCAGGAATCTATGTTAATCATGACTCAACCCTATGACTCAAGGGCTTAAATGATATATACACACCAGCCTTTTTACAAAACACCAGCCTTTTCATTGATTTACACATGTATTTAAGTATACCTGTTTATGGGATGTTATCAATAAAAGAAACTATAATATCTTATAATTTTGAGATGCATTATGTTAGATCAGAGATACAGCTGCTTCAATAATTAGGCCACCCTGTTCATTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50953 314 + 636262 CTCTAGCCAGTCTCTTCTATGGACATATGTGGTCACCTTATAGTACATGAATACCTTGTGCAATGATCACCTAATGCCATAAGGCCAGGAATCTATGTTAATCATGACTCAACCCTATGACTCAAGGGCTTAAATGATATATACACACCAGCCTTTTTACAAAACACCAGCCTTTTCATAGATTTA----TGGATTTAAGTATACCTGTTTATGGGACGTTATCAATAAAAGAAACTGTAATATCTTATAAATTTGTGATGCATTATGTTAGATCAGAGATACAGTTGCCTCTATAATTAGGCTGCCCTGTTCATTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 43809 314 + 647215 CTCACTTCATTCTCCTCGATTAGCATGCGTGGTCACTATATAGTACATGAATCCCTTGTGCAATGATCACCTAATGCCATAAGGCCAGGAATCTATGTTAATCATGACTCAATCTTAT---TCAAGGGCTTGAATGATATATACACACAAGCCCTTCTACAAAACACCAGCCTTTTCATTGATTAACACATTTATTTAAGTATACCCATTTATGGAATGTTATCAATAAAAGAAACTATAATATCTTATAATTTTAAGATGCATTATGTTAGATCAGAGATACAGCTCCTTCAATAAT-AGCCCAACTTGTTTATTTC - -a -s mr.mrrefChr0 49058 19 + 130230 GCATTGTGTCAACTATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51268 19 + 636262 GCATTGTGCCAACTATTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 44123 19 + 647215 CCATTGTGTCAATGGTTAA - -a -s mr.mrrefChr0 49077 11 + 130230 TAATTTGTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51287 11 + 636262 TAATTAGTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 44144 11 + 647215 TGATTTGTAAC - -a -s mr.mrrefChr0 49088 90 + 130230 GAACAAGGCCTCTCCTGTGCCACATCCCAAGAACTGTAGGGCTTAGCAAAATTGAAAAGGTTGTTAGGACAAACTAGTATAGGTAATACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51299 90 + 636262 GAACAAGGCCTATCCTATGCCACATCCCAACAATTGTAGGGCTTAGCAAAATTGAAAAGGTTGTTAGGACAAACTAGTATAGGTAATACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 44155 90 + 647215 AAACAAGGTCTCTCCTGTGCCACATCACAAGAACTGTGGAGCTTAGTAAAATTAAAGAGGGTGTTAGGACAAGCTAGTATGGGTAATACA - -a -s mr.mrrefChr0 49178 140 + 130230 TGAATGAGTATCAGAGGCTAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGTTTCGTGTGGCATTAATGGGATTAAACAGCTGAGTTCACAAATCCACTGGTTGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCTGGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51392 140 + 636262 CGAATGACTATCAGAGGCTAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGTTGCGTGTGGCATTAATGGAATTAAACAGCTGAGTTCACAAATCCCTTGGTCGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCTGGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 44245 140 + 647215 TGAACCAGTATCAGAGGATAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGCTTTGTGTGGCACTAATGGGATTAAACAGCTGAGTTCACACATACACTAGTTGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCCAGATG - -a -s mr.mrrefChr0 49318 108 + 130230 TTGTGAGTACAGTATCCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGATACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTATGCCTGCTAATCTTCATTATTGGTTGATTCATATGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51532 108 + 636262 TTGTGAGTACAGTATCCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGATACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTATGCCTGCTGATTTTCATTATTGGTTGATTCATATGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 44400 108 + 647215 TTATGATTGCAGTACTCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGTTACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTACACCTGCTAATCTTCATTATTGGTTGCTTCATATGAT - -a -s mr.mrrefChr0 49426 42 + 130230 GATCTCCACAGGTGAGCTAGTTTTAATACTGACTGATCATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51640 42 + 636262 GAGCTCCACAGGTGAGCTAGTTTGAATACTGACTAATCATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 44519 42 + 647215 GATCTCCATAGGTGAGCTAATTTTAATCCTGACTGATCATCA - -a -s mr.mrrefChr0 49468 31 + 130230 CCTTTCCAGGTTTCACCCTGTTCCCTCCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51682 27 + 636262 CCTTTC----TTTCACCCTGTCCTTTTCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 44562 31 + 647215 CCTTTCCAGGTTTCACCCTGTTCCCTCCTAT - -a -s mr.mrrefChr0 49499 198 + 130230 ATAGAGGAACCTGGGTGTGTAGGAGCTTGATGTCAATTCTGCAGAGTAGTACATTGCTGCTTCTGAATCCACTCAGAGTTTAATCTCACCATCTAGGAACCGTGCTCCTTGCTACTATTAATTTACACACCTCTTTAAAATTTCTGTTATCACCCTTGTGGTCCATAACAATAATATCACCCTTTTACTTATAACTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51742 197 + 636262 ATAAAGGAACCTGGGTGAGTAGGAGTTTGATGTCAATTCTGCAGAGTGGCACATTGCTGCTTCTGAATCCACTCAGA-TTTAATCTCACCATCTAGGAACCACACTCCTTGCTACTATTAATTTACACACCTCTTTAAAATTTCTGTTATCACCCTTGTGGTCCATATCAATAATATCACCCTTTTACTTATAACTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 44593 198 + 647215 TTAGAGGAACCTGGGTGTGTAGGATCTTGATGTCAATCCTACAGAGTAATAGATTGCTGCTTCTGAATCCACGCAGAGTTTAATCTCAGCATCTAAGAACCGTGCTCCTTGGTACTACTAATTTACACACCTCTTTAAAGTTTCTGTCATCACCCTTGTGGCCCATAACAATCATATCACCCTTTTACTTATTACTGA - -a -s mr.mrrefChr0 49697 227 + 130230 TGGCCTGTGAGCTGGAGGTTCTCAAGGCAACATTTACTTATGGTTCTGGTGCAATATCCAACTTATGTCTTTAATGTATCTTGTCTGGGGTCGTGCCTTTGATTTACAATCACTTTTGTCAGTGTGCATAGTGCTATATGATGTCAGAACTCTTACTTGGAGAAACTCATCTCATCAAGTAAATGTATCTGTCACATGAAGGGGAGCAGCTAGGGGGATATGCTGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51946 215 + 636262 CATCCTGTGAGCTGGAGGTTCTCAAGGCAACAATTACTTATGGTTCTGGTGCAATATCCAACTTGTATCTTTAATGTATTTTGTCTGGGGTCCTGCCCTTGATTTACACTCACTTTTGTCAGTGTGCATAGTGCTATATGATTTCAGAACTCTTATTTGGAGAAAATCAT-TCATCAAGTAAATTTATCTGTC---TGAAGGGGAG--------GGGATATGCTGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 44791 227 + 647215 TGGCCTGTGAGCTTGAGGTTCTCAAGGCAACATTTACTTATGATTCTGGTGCAATATCCAATTCATGTCTTTAATGGATCTTGTCTGGCGTGGTGCCTTTGATTTCCAATCACTTTTATCAGAGTGCACAGTGCTATATGATGTCAGAACTCTTACTTGGAGAAACTCATCTCATCAACTAAATGTATCCGTCACATGAAGGGGAGCAGCTAGGGGGATACGTTGAC - -a -s mr.mrrefChr0 49924 167 + 130230 GACTACTCATCTGTCAATGGACCTAACCCAAACCTGGGGTACCATGAAATATTTTTTAATTCTTGCTATTTCTCACATTGCACCACATAGGGTTCAGATGACTGGTGGTAGAGCAAGATTAAGCCAGCTGAACAACTGTTCAGGATCTAAGTCTCCCATCACCAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52162 167 + 636262 AACTACTCATCCATCAATGGACCTAACCCAAACCCAGGGTACCATGAAATATTCTTTAATTCTTGCTATTTCTCACAATGCACCACATAGAGTTCAGATGACTGGTGCTAGAGCATGATTAAGCCAGCTGAACAACTGGTCAGGATCAAAGCCTCCCATCACCAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 45018 167 + 647215 GACTACTCATCTGTCAATGGACCAAACCCAGACCTGGGGCACCATGAAATATTTTTTAATTCTTGTTCTTTTTCATATTGCACCACATATGGTTCAGATGACTGGTGGTGGAGCAAGATTAAGCCATCTGAACAATTGTTCGGGATCTAAGTCTCCCATCACCAAGG - -a -s mr.mrrefChr0 50091 117 + 130230 GACCCTCTCAGACATTAACTGTCATTCACTGTAGGTGATCCAGTAGTGGATGTAAAGTAGTGCATGTTCATATACAAACTCTATATGCTATGTGAATGCTGCAACTGAGAGTCCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52330 117 + 636262 GACCCTCTCAGACATTAACTGTCATTCACTGTAGGTGATCCAGTAGTGGATGTAAAGTAGTGCATGTTCATATACAAGCTCTATATGCAATGTGAATGCTGCCACTGAGAGCCCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 45185 86 + 647215 GACCCTCTCAAATATTAACTGTCAATCACTGTAGTTA------------------------------TCTTATACAAACT-TATATGCTATTTGAATGCTGCAGCTGAGAATCCCTA - -a -s mr.mrrefChr0 50208 103 + 130230 AGGCATGGTTAACAATATCATTGATGTGACTGTCAAGTGTCCCTAAGTCCCAGCTGACAGTCCATATATTAATATGCTCAAATGACCCCATTGAAGTCCTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52447 103 + 636262 AGGCATGGTTAACAATATCATTGATGTGACTGTAAGGTGTCCCTAAGTCCCAGTTAACAGTCCATATATTAATATGCTCAAATGACCCCATTGAAGTCCTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 45274 103 + 647215 AGGCATGGTTAAGAATATCATTGATGTGACTGTCAAGTGTCCTTAAGTCCCAGCTGACAGTCCATGTATTAATATGCTTAAATGACCCCATTGAAGTCCTGAT - -a -s mr.mrrefChr0 50311 141 + 130230 CACACTGCATAGATTAGGGAGTGTAGTGGTGGGTGAAGAGAAGAATCTTCATTCCCAATTCCCATCCCAAAAGACTCAGCAACTGTTTGTAAGTAACAATTCCCTTTACTAATGAACATCAATGAAAATGCAGGATACGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52550 140 + 636262 CACACTGCGTGGGTTAGGGAGT-TAGTGGTGGGCGAACAGAAGAATCTTCATTCCCAATTCCCATCCCAAAAGACTCAGCAACTGTTTGTAAGTAATAATTCTCTTTACTAATGAACATCAATGGAAATGCAGGATACGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 45385 134 + 647215 CACCCTGCATATATTAGGGAGTGTAGTGGTTGATGAAGAGAAGAATCTT-------AATTCCTATTCCTAAAGACTCAGCAACCGTTTGTAAGTAACAATTCCCTTTACTAATGAACATCAATGAAAATGCAGGATTCTAT - -a -s mr.mrrefChr0 50452 75 + 130230 CTGAGGAACTATATTCAGGAAAGATTAGTTAGATGACACTGACAAATGAAGCAAAAGCCTCCCATTTTAGTACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52718 75 + 636262 CTGAGGAACTATATTCAGGAAAGACTAGTTAAATGACACTGACAAATGAAGCATAAGCCTCCCATTTTAGTACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 45519 75 + 647215 CTTAAGCACTATATTGGGGAAGGATTAGCTAGATGACAGTGGTAAATGAAGCAAAAGCCTCCCAGTTTAATACAG - -a -s mr.mrrefChr0 50527 85 + 130230 GCCTCTTTCGAGGGACCTAAGAAGGGTTAGGCATTTTAGGATTCTGTTCCATAATCTCTTAGTACACCACTCCTGGCTCAACTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52793 85 + 636262 GCCTCTTTCGAGGGACCTAAGAAGGGTTCGGCATTTTAGGATTCCGTTCCATAATCTCCTAGTACTCCACTCCCAGCTCAACTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 45596 66 + 647215 GC-------------------AAGGGTAAGGCATTTTAGGATTCTGTTCTATAATCTCTTAGTACACTGTTCCTGGCTCAACTAA - -a -s mr.mrrefChr0 50612 109 + 130230 AAGTGCATACATCTTCCAGCAAGTGGAAGCTCACAGGTCTCAGGATAATGTGTAGCGTCATTATTGACTTGTTTCATGGCTTTTGCATCTAAATTGTGCTTTACCTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52878 57 + 636262 ----------------------------------------------------TAGCGTCATTATTGACTTGTTTCATGGCTTTTGCATCTAAATTGTGCTTTACCTGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 45881 109 + 647215 AAGTGCATACATCTTCCAGCAAGTGGAAGCTCACAGGTCTCAGGATAATGTGTAGCATCACTATTGACTCATTTTACTATTGACTCACTCATTTTATGTCTTTCATACC - -a -s mr.mrrefChr0 50721 9 + 130230 TATATAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52947 9 + 636262 TATATAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 45990 9 + 647215 TAAACACTG - -a -s mr.mrrefChr0 50730 24 + 130230 CACAACTGAATTTCAGCCAATGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52973 24 + 636262 CACAACTGAATTTCAGCCAATGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 45999 24 + 647215 TACAACCGATTATTATGCAATGAG - -a -s mr.mrrefChr0 50754 93 + 130230 CACAGATAACATATAAGAGCATGAGCCATGCAATATAGTCAGAAGACAGGTGGGAGTCATGAATTACTGGGATTCTCAATCAATCATTGGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53003 93 + 636262 CACAGATAACATATAAGAGCATGAGCCATGCAATATAGTCAGAAGACAGGTGGGAGTCATGAATTACTGGGATTCTCAATCAATCATTGGCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 46023 93 + 647215 CACAGATAACATGTAGGAGCATGAGCCATGCAATATAGTATGGAGACAGGTGGGATACTCTAATTACTGGGATTCTCAACAACTCATCAGCTC - -a -s mr.mrrefChr0 50847 30 + 130230 GACACTGATGCAGGTCCAAGATGATATATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53102 30 + 636262 GACACTGATGCAGGTCCAAGATGATATATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 46116 30 + 647215 GACACTGACACAGGTCCAATCTGATGCTTA - -a -s mr.mrrefChr0 50877 71 + 130230 TGGAGAAAGATGGGATAGGTAGGCTTTCCTAGTTGTGAATAGAGAACGCATCATACTACTTGCACCTTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53158 71 + 636262 TGGAGAAAGATGGGATAGGTAGGCTTTCCTAGTTGTGAATAGAGAACGCATCATACTACTTGCACCTTGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 46146 71 + 647215 TGGAGAAAGATTAGATATGTAGGCTTCCCTATTTGTGAATCAAGAATGCATCATACTACTTGCACCATGTC - -a -s mr.mrrefChr0 50948 111 + 130230 ATAACCTGACCTACTGGTTGCAAAATAATTGTGATCCTTATCACATTTCTTATTGACACATGTCTCTGGTAGACAAGACACATAGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTGTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53229 111 + 636262 ATAACCTGACCTACTGGTTGCAAAATAATTGTGATCCTTATCACATTTCTTATTGACACATGTCTCTGGTAGACAAGACACATAGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTGTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 46348 111 + 647215 ATAACCTGACCTATTGGTTGCACGATATTTGTGATCCATACCACATCTCTTATTTCCACATGTCTTTGGTAGACAAGACACGTGGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTATGGG - -a -s mr.mrrefChr0 51059 13 + 130230 TGATGACTGTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53340 13 + 636262 TGATGACTGTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 46502 13 + 647215 TGATAACTGTGAA - -a -s mr.mrrefChr0 51072 34 + 130230 ACCTACTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATGACGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53353 34 + 636262 ACCTACTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATGACGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 46516 34 + 647215 ACCTGCTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATTACGG - -a -s mr.mrrefChr0 51106 8 + 130230 ACTTCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53387 8 + 636262 ACTTCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 46551 8 + 647215 AATTCTAC - -a -s mr.mrrefChr0 51114 13 + 130230 ACATAGTGGTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53411 13 + 636262 ACATAGTGGTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 46559 13 + 647215 ACATCATGGTTGG - -a -s mr.mrrefChr0 51127 41 + 130230 CTAAAGGTGGCCTtcactgggagggacctcctgtatgatag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53444 41 + 636262 CTAAAGGTGGCCTtcactgggagggacctcctgtatgatag -s simRat_chr6.simRat.chr6 46572 41 + 647215 CTAAAGGTGGCCTTCACTGGAAGGGATCTCCTGTATGTTGG - -a -s mr.mrrefChr0 51168 24 + 130230 cttgaggtggcctagcccccactc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53527 24 + 636262 cttgaggtggcctagcccccactc -s simRat_chr6.simRat.chr6 46613 24 + 647215 CTAGaggtggcctaccccccactt - -a -s mr.mrrefChr0 51192 65 + 130230 agtccctttgtttgttaccaggtgcactagcgttttctttggaaagtttccagtAGCTCATAAGt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53551 65 + 636262 agtccctttgtttgttaccaggtgcactagcgttttctttggaaagtttccggtAGCTCATAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 46638 65 + 647215 ggtccctgactttgctaccaggggcactagcgttttctttggaaagtttccagtagctcataagt - -a -s mr.mrrefChr0 51257 10 + 130230 gaggcccagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53618 10 + 636262 GAGGCCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 46703 10 + 647215 gagacccagt - -a -s mr.mrrefChr0 51267 38 + 130230 AAGGGTGATCACACAAATTAGCTCTCTATCTGGTCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53628 38 + 636262 AAAGGTGATCACTCAAATTAGCTCTCTATCTGGTCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 46763 38 + 647215 AAGGGTGATCACACAAATTAGCTTGCTATCGGGTCAAT - -a -s mr.mrrefChr0 51305 353 + 130230 TTTTATCAAGTACCCAGTGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCCCTAATCATGCATTCATAGAGGTCACCAAAGAGTATGCATACTAAGTTGACACTGCTTAGCTCTAGAGGTAGTTAAGGGCGCTCAAATTTTATACAAAATAAGACTATCAGAACTCCAATTCAGTTGACAAGCCACCAACTGAGTTTGGCTACCTCTAGCAATGCCCTTAAGGCTCTTATGTCCAATGTGATCCTAATCTAATCATCATAATGTTCATTGACCTCCAGGAGTTTATTGTTTAATGATTAACTATTTAAACTTCCTATCTCGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53685 350 + 636262 TTTTATCAAGTACCCAGTGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCACTAATCATGTATTCATAGAGGTCACCAAA-AGTATGCACACTGAGTTGCCATAGTTCAGCTCCAGAGGTAGTTAAGGGCGCTCAAATTTTATACAAAATAAGACTATCAGAACTCCAATTTAGTTGATGTGCCAGCAACTGAGTTTGGCTACCTCTAGCAGTGCCCTTAAGGCACTTAAGTCCAGTGTGAT--TAATCTAATCATCATAATTTTCATTGACCTCCAGGAGTTTATTGTTTAATGATTAACTATTGAAATTTCCTATCTCGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 46801 353 + 647215 GTTTATCAAGTACCCAGCGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCCCTAATCATGCATTTATAGAGATCACCAAAGAGTATTCATACTAAGTTGACACTGCTTAGCTCTAGAGGTATTTGATGGATTTCAAATTTTCTATAAAATAAGACTCTCAGAACTCCAATTCAGTTGACAAGCAACCAATCAAGTTTGGCTACCTCTAGCAATGTCCTTGAGGCTCTTATATTCAATGTGATCCTAATCTAAACATCATAGAGTTCATTGAGCTCCAGGAGTTTATTGCTTGATGATTAAATATTTAAGCTTCCTACCTTGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT - -a -s mr.mrrefChr0 51658 347 + 130230 ATAAGACAGACCCCCCACACTCTAGGAGCTTATTAAATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACTCAAGGGAGTGATGCTGGCAAGAAGGCAATAAGCCAATAAGAAAAGTCCCCAGAGGTCCCAGAAGAGTTCCAACTGCCCAGCAGTGCAATGGCTGTGACCATTTCACAGGTTAAGAGCTATCGAGGGAGATCATGATGGGGTCTTGACATATTGTATTTCAACAATCATTAAATTAGCTGGGGTTGGGGAGTTTGTGGGTTCATAAACCATTAGTTAAGTCCTTAAATGGGTCAGATGAATGAGATTAGCTGTGCCGGCTGAGTGATAAATGATCATGATGCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54037 335 + 636262 ATAAGACAGACCCCCCACACTCTAGGAGCTTATTAAATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACTCAAGGGAGTG----TGGCAAGAAGGGAACAAGCCAATAAGAAAAGTACCCAGAGGTCACAGAAGAGT--------CCCAGCAGTGCAATGGCTGTGACCATTTCACAGGTTAAGAGCTATCAAGGGAGATCATGATGGGGTCTTGACATATTGTATTTCAACAATCATTAAATTAGCAGGGGTTCGGGAGTCTGTGGGTTCATAAACCATTAGTTAAGTCCTTAAATGGGTCAGGTGAATGAGATAGGCTGCGCCGGCTGAGTAATAAATGATCATGATGCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 47154 341 + 647215 ATAAGACACACCCCCCATACTCTAGGAGCTTATTAGATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACCCAAGGGAGTGATGCTGGCAAGAATGCTGTAACCCAATAAGAAAAGTCCCCAGTGGTCCCAGAAGAGTTCCAACTGCCCAGCAGTGCAATT------ACCATTTCACAGGTTAAGAGCCATCGAGGGAGATTATGATGGGATCCTGATATACTTTATTTCAACAATCATTAGGTTAGCTGAGGTTGGGGAATTCGTGGGTCCATAGACCATCATTTAAGTTCTGAAATGGATCAGATGAACAAAATTAGCCGTGCCGGCTGAGTGATAAATGATCAGGATGCATG - -a -s mr.mrrefChr0 52005 11 + 130230 TAAGTTGCTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54376 8 + 636262 TAAGTTTT--- -s simRat_chr6.simRat.chr6 47495 11 + 647215 TAAGTTGCTAG - -a -s mr.mrrefChr0 52016 77 + 130230 GGCAATGAAAAATGCTTAGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTACATCCTTCTTTTTGGGGTTTAAAAGGACTGCTGACATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54384 77 + 636262 GGCAATAAAAAGTGCTTAGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTAAATCCTTCTTTTTGAGGTTTAAAAGGACTGCTGACATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54578 77 + 636262 GGCAACGAAACATACTTAGTGTCCCAAGAGTTTTGTTTACATCCCTCTTTTTGGGGTTGAAAAGGAATGCTGACATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 47506 62 + 647215 GGCAATGAGAAATGCTTCGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTACATCCTTCTTTTGGGGGAGT---------------ATC - -a -s mr.mrrefChr0 52093 6 + 130230 CTAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54461 6 + 636262 CTAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54656 6 + 636262 TTAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 47568 6 + 647215 CTGAAC - -a -s mr.mrrefChr0 52099 1 + 130230 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54662 1 + 636262 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 47574 1 + 647215 A - -a -s mr.mrrefChr0 52100 24 + 130230 TATTGTTGGAGATATGAGATGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54467 24 + 636262 TATTGTTGGAGATATGAGGTGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54663 24 + 636262 TATTGTTGGAGATATGAGATGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 47575 24 + 647215 TATTATTGTAGATATGAGATGCTG - -a -s mr.mrrefChr0 52124 1 + 130230 T -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54687 1 + 636262 T -s simRat_chr6.simRat.chr6 47599 1 + 647215 T - -a -s mr.mrrefChr0 52125 82 + 130230 TCCTAAAGACTTTCCTCTAGGTAACCGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATACCATACTGGACCAAGGCACAGTTTGATTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54491 82 + 636262 TCCTAAAGACTTTCCTCGAGGTAACAGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATATCATACTGGACCTAGGCACAGTTTGATTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54688 82 + 636262 TCCTAAAGAATATCCTCTAGGTAACCATTATGTTGTTTGCTTTGCATGTACCATACTGGACCAAGGCACAGTTTGATTAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 47600 79 + 647215 TCCTAAAGACTTTCCTCTAGGTAACCGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATGCTATACTGGACTAAGGCACAGTTTGATAA--- - -a -s mr.mrrefChr0 52207 29 + 130230 TCACACTTTGGTTATCACACAAATTTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54789 29 + 636262 TCACACTTTGGTTATCACACAAATTTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 47679 29 + 647215 TCACACTTTGATTATCACATAAGTTTGAT - -a -s mr.mrrefChr0 52236 5 + 130230 TATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54573 5 + 636262 CATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54818 5 + 636262 TATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 47708 5 + 647215 TATTG - -a -s mr.mrrefChr0 52241 80 + 130230 CACAGCATCTTGTCATTGTCTAGATTATGCTTCCAAGGACCCATAGGCATAAAATATAACAACCAATAGGCAATGTGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54823 78 + 636262 CACAGCATCTTGTCATTGTCTAGAATATG--TCCAAGGACCCATAGGCATAAAATATAACAACCAATAGGCAATGTGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 47713 80 + 647215 CACACCACCTTGTCATTGTTGAGATTATGCTTCCAAGGACCCATAGGCATGAAATATAACAACCAATAGGCAATGTCAGA - -a -s mr.mrrefChr0 52321 55 + 130230 ACAGGACAGTAGTGAATCACCTGGCACTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54901 55 + 636262 ACAGGACAGTAGTGAGTCACCTGGCACTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 47824 55 + 647215 ACAGGACAGTAGTGAATCACCTGGTATTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG - -a -s mr.mrrefChr0 52376 23 + 130230 AAATTCGAGGACTATCATCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54956 23 + 636262 AAATTCGAGGACTATCATCATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 48100 23 + 647215 AAATCTGAGGACTATCGTCATTA - -a -s mr.mrrefChr0 52399 224 + 130230 TTTACTTCCTACTGAGTATGTGCCAGGCCTACATATTTTTCCACTGAGTATGTACCAGGTGTGCAACTGTTCCTTCATTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCCTGAAATTTTTGCCTGCCTGTATCAGGCCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTCGGCATACCTATCTTTTGCATTCATTAGGTAGAATTGGCACAATGTCCACTGAAGCTCCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54979 224 + 636262 TTTACTTCCTACTGAGTATGTGCCAGGCCTACATATTTTTCCACTGAGTATGTACCAGGTGTGCAACTGTTCCTTCATTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCCTGAAATTTTTGCCTGCCTGTATCAGGCCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTCGGCATACCTATCTTTTGCATTCATTAGGTAGAATTGGCACAATGTCCACTGAAGCTCCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 48124 224 + 647215 TTTGCTTCACACTTAGTATGTGCCAGGTCTAAATCTGATTTCACTGAGTATGTGCTAGGCCTGCAACCATTTCTTCGTTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCTTGAAATTATTGCATTGATGTATCAGACCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTGGGCATACGTGTCTCTTGCATTCAGTAGGTATAATTAGAGTAATATGCACTGAGGCTCCATG - -a -s mr.mrrefChr0 52623 99 + 130230 TGACATCTAACACAGTATGCCCCTTGTGATTGGCTCACCAGAAGATTGAGTTTAAATGCAATTGTGTGTCTATATACATTGAGCGGCCAACGTTGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55203 99 + 636262 TGACATCTAACACAGTATGCCCCTTGTGATTGGCTCACCAGAAGATTGAGTTTAAATGCAATTGTGTGTCTATATACATTGAGCGGCCAACGTTGTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 48349 99 + 647215 TGACAACTAACACAGTATCTCCCGTGTGAATGGCCCACAAGAGGATTCAGTCGAAGAGCAATTGTGTGGCTGTATACAATGAATGGCCAACATTGAATG - -a -s mr.mrrefChr0 52722 111 + 130230 CCATGAGTGCCTATTGGATCTCTTAACTTGGCGCGGGCAGGTTGCACCCCATGTAAGCTGAAACTACACTATTGCAATTATGGCAGAGCCTGATAGACAACCTGCTGTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55302 109 + 636262 CCATGAGTGCCTATTGGATCTCTTAACTTGGCGCGGGCAGGTTGCACCCCATGTAAGCTGAAACTACACTATTGCAATCA-GGCAGAGCCTG-TAGATAACCTGCTGTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 48487 111 + 647215 ACATAGGTGCCTATTGGATCTCTTAACTCGGCACGGGCAGGTTGTGCCCCATGTAAACCGAAGGCACATTATTGCAATTATGGCAGGGCCTGATAAACAACCTGCTGTAAT - -a -s mr.mrrefChr0 52833 50 + 130230 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACATTGACCTTGCAACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55411 50 + 636262 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACAATGAACTTGCAACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 48601 50 + 647215 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACATTGACCTTGCAACTA - -a -s mr.mrrefChr0 52883 110 + 130230 TAAACTTTTGAGAGCATTGGATAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAATGTTTTCATAAGCATAAATTATTGGTTTTTCTGGCTTTTCAAGATCATGGGTCTTAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55473 103 + 636262 TAAACTTTTGAGAGCACTGGATAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAACGTTTTCATAAGCATGAATTATTGATTTTTCGGGCTTTTCAAGATCATGGGT------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 48651 110 + 647215 TAAATTTTTAAGAGCATTGGACAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAATGCTTGCACAAGCATAAATTATTGGTTTTTCTGGCTTTTCAAGATCATGGATCTTAATT - -a -s mr.mrrefChr0 52993 266 + 130230 TCTAATTAACTACACCACTTGTTCTGAGGAATTAATACTAAGGGGGATGACATTTCCCTAGCTATCAGAGCATTGCCGGATGACATTGGTTGGCTTCCCGGACCTGCAGAAGAACAAACCACCCAAACATGTTGCACTGAAGATGATTCTGTTGTCCTCCCACATGACAGCTTATGGTAACAAAACACTCATTGGAAGGAGTGAAAGGGTGACTCACAGTCCGCAGAGAGGGAAGGGGACACAAACCCACTATAGAGATGTTCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55576 265 + 636262 TCTAACTAACTACACCACTTGTTCTGAGGAATTAATACTAAGGGGGATGACATTTCCCTAGCTATCAGAGCATTGCCGGATGACATTGGTTGGCTTCCCGGGCCTGCAGAAGTACAAACCACCCAAGCATGTTGTGCCAAAGATGGTTCTGTTGTCCTTCCACATGACAGCTTAAGGTAACAAAACACTCATTGGAAGGAGTGAAAGGGTGACTCACAGTCCACAGAGAGCGAAAGGG-CACTAACCCATTATAGAGATGTTCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 48765 263 + 647215 TTTAATTAACTACACCACTTGTTCTGAGGAATTCATACTAAGGGAGATGACATTTTCCTAGCTATAGGGGCATTGCTGGAGGGCATTGGTTGGCTTCCTGGACCTGCAGGAGAACAAAC-GCCCAAACATGTTGCACTGAAGATAATTCTGTTGCCCTCCCATATGACAGGTTATGGTAACAAAACACTCATTGGAATGAGTGAAACGGTGACTCACAATGCGCT--GGAGCGAGTGGACACAAACCCGCTATAGAGATGTTCTGG - -a -s mr.mrrefChr0 53259 205 + 130230 GCCCTCAATGATAAGGGCAAGGCCCCACCACTTAGGAGAGAGCAACTTCAGAGTAGTCAGTAGTCATAAAAAATTAGCTTAGCAAATGCAATTGGAAGTTATGAACAGGATGAAGTTGCTCACTACGAACATGCTTTATATAATATGAGACATGTTAAATCGATATGAGAAGTGGTGGACTGAATAGTAGTGCCTTCCCAATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55842 204 + 636262 ACGCTCAATGATAAGGGCAAGGTCCCACCACTTAGGAGAGAGCAGCTTCAAAGTAGTCAGTAGTCATTAAAAATTAGCTTAGCAAATTCAATTGGAAGTTATGAACAAGATGAAGTTGCTCACTATGAACATGCTTTATATAATATGAGACATGTTAAATCGATATGAGAAGTGATGGACTGAATACTTGTGCCTTCCCAATAC- -s simRat_chr6.simRat.chr6 49028 189 + 647215 GCCCTCAATGCAAAGGGCAAGGCCCCACCACTTAGGAGAGAACAACTTCAGAGTAGTTAGTATTCATAAAA---TAGCTTAGCAAATG-----GGATGCTAAGGACAGGATGAAGTGGCTCAGTACGAACGTGCTTTATACAATATGAGTCGTGTTGAATCGATAT--------GTGGACGGAATTGTAGCGCCTTCATAATTCA - -a -s mr.mrrefChr0 53464 61 + 130230 TGTGGGTTCCTACCACAAGCAAACTTATAATTCTTGTAAAGTTAGAAAGTCTGCTTGGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56046 61 + 636262 TGTGGGTTCCTACCACAAGCAAACTTATAACTCTTGTAAAGTTAGAAAGTCTGCTTGGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 49221 61 + 647215 CGTGCGTTCCTGCCACAAACAAACTTAAAATTCTTGCAAAGTTAGAAGGTCTGCTTGGTAT - -a -s mr.mrrefChr0 53525 8 + 130230 GGGATTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56111 8 + 636262 GGGATTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 49282 8 + 647215 GAGATTGC - -a -s mr.mrrefChr0 53533 3 + 130230 ATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56131 3 + 636262 ATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 49290 3 + 647215 ATA - -a -s mr.mrrefChr0 53536 271 + 130230 ATCACTGTATAATTTTGATAAACTGGTTCCCACTAAATAAGTTTAAAATTGGAGTGATCTATGAGTCTGCATTTTGGTATGGATTTGTGCCACATCCACAACCAGGGCTCAAGATGTAAGCAGTGGTGGTGGTATAGGGTATCCCACTTAGTTTCAGTGATCAACATTTCTTTGTTAATATGAGTGTTGTATATATAGCATCAGTTGTACAGGTAGCATCAGAACTGGCATTGATGATAAAGGGTAACGGATCAGCAAAGCTGTCAGGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56134 267 + 636262 ATCACTGTGTAATTTCAATAAACTGGTTCCCACTAAATGAGTTAAAAATTGGAGTGATCTATGAGTCTGCATTTTGGTATGGACTTGTGCCACATCCACAACCAGGGCTCAAGATGTAAGCAGTGGTGGTGGTATAGGGTACCCCAATTAGTTTCAGGGATCAACATTTCTGTGTTAATATGAGT-TTGTTCATATATCATC---TGTACAGGTAGCATCAGAATCGGCATTGATGATAAAGGGTAACGGATCACCAAAGCTGTCAGGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 49294 266 + 647215 ATCACTGAATAATTTTGATAAACTGGTTCCCACTAAATAAGTTTAAGATTGGAAAGATTTATGAGCCTGCATTTTGGTATGGATTTGTGCCAGATCCGCAACCAGGACGCAAGATGTAAGCAGTGGTGATGGTATTGGATATCCCACTTAGTTTCAGTGATCAAAATTTCTTTGTTAATATGAGTGTTGTATATATAGCATCAGTTGTACAGGTATCATCA--ACTGGCGTTGATGATAAAGGGTAACGGATCAGCAAAGCCG---GGCAA - -a -s mr.mrrefChr0 53807 29 + 130230 CCACATCTTCCATAACTGAATTCTATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56401 29 + 636262 CCACCACTTCCATAACTGAACTCTATTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 49561 29 + 647215 CCACATCTTCCATAACTGACTTATAGTAA - -a -s mr.mrrefChr0 53836 37 + 130230 TTGAATGTTTAAAGATACAGAAAGCACTTGGTATTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56430 37 + 636262 TTGAATGTTTAAAGATACAGAAAGCACTTGGTATTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 49856 37 + 647215 TTAAATGTTTAAGGATACAGAAAGCACTTGGTATTTC - -a -s mr.mrrefChr0 53873 94 + 130230 CATAGGATCAACATAGTCTTTACACCAACCCACTCAACTTTACTGTACAGATGTATTAAGACTGTCTAGCTGTTTCTTCTCAAGTGCATGTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56467 94 + 636262 CATGGGATCAACATAGTCTTTACAGCAACCCACTCAACTTTACTGTACAGGTGTATTAAGACTGTCTAGCTGTTCCGTCTCAAGTGCATGTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 49895 94 + 647215 CATAGGATCAACATAGTCTTTACACCAACCCACCCAACTCTACTGTACAGATGTATTAAGACTGACTAGTGGTTTCTTCTCAAGTCGTTGTGGT - -a -s mr.mrrefChr0 53967 133 + 130230 AATGTTAGATCAGTGTCCACTAAATGTATGTCTTAAGAATTGTTCATTGGAGAGAGTGCATAAAGCATCCTAGAATCTTAGCCCAATACATATATGAGATATTCAACTGGAGCCGTAATTACATGACTTGACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56562 133 + 636262 AATGTTAGATCAGTGTTCACTAAATGTATGTCTTAAGGATTGTTCATTGGAGAGAGTGCATAAAGCATCCTAGAACCTTAGCCCAATACATATACTAGATATTCAGCTGGAGCCATAATTACATGACTTGACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 49989 133 + 647215 AATGGAAGATCAATGTCCACTAAATGTATGTTTTAAGAATTGGTCACTGGGGAGGGTGCATAAAGCATCGTAGAATCTTAGCCCAATACATATATGAGATATTCAACTGGGGCTGCAACTACATGACTTTGCG - -a -s mr.mrrefChr0 54100 123 + 130230 AGAAATTCTTGGGGATCAATGGGTGTCATTGCCTGACTGACACTAGTTGATGGAGGTCTGCTGTCTAGGAAAGTTATGATATTTAAACTAGGTTGTAGCGGAAGACTTGCATATCCATTTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56794 120 + 636262 AGAAATTCTTGGAGATCAATGGGTGCCGTTACCTGACTGACACTAGTTGATGGAGGTCTGCTGTCTAGGAAAGTTATAATATTTAAACTAGCTAGTAGCGG---ACTTGCATATCCATTTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 50122 123 + 647215 ACAAATTCTAGGGGAGCAATTGATGTCATTGCCTGACTGACACTAGTTGATGGAGGTCTGCTATCTAGGAAAACTATGATATTTAAACTAGGTTGTAGTGGAAGACTTGCATTTCCATTTAGA - -a -s mr.mrrefChr0 54223 304 + 130230 GTATGTGCCTAATCCAGTCATTAAGAGTTTTGAATGTCATTTTGTCAATGGCACAGAGATAGGGGCACTAGCAACAACCCCTTGACCACTTCAGGGCATATTGCCAGTGATGGGGAATAAGGATAGGTAATCAATCTCCAAGGAGGTAAACTCAAGGAAGGGGCCACTGGTCTTGTAGATTAACTATCAATGTATTTATATATTTTACACCCACAGATGCTCAGCAATTCTTTAGTAGTCTTGGGTCAACAACCCCATTGCTGTTTCAAACTACTCAGAACCCTTCTGCTACATTAAAACACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56917 295 + 636262 GTATGTGCATAATCCAGTCATTAAGAGTTTTGAATGTCATTTTGTCAATGACACAGGGATAGGGGCACTAGCAACAACCCCTTGACCACTCCAGGGCATATTGCCAGTGATGGTGAA---------GTAATCAATCTCCAAGGAGGTAAAATCAAGGAAGGGGCCACTCGTTTTGTAGATTAACCATCAATGTATTTATATATTTCACACCCACAGATGCTCAGCAAGTCTTTAGTAGTCTTGGGTCAACAATTCCATTGCTGTGTCAAACTACTCAGAAGCCTTCTGCTACATTAGAACACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 50245 297 + 647215 GTATGAGCCTAATCCAGTCATTAAGAGTTTTGAATGTCATTTTGTCAATGGCACAGAGATAGGGGCACTAGCAACAACCCCTTGAACACTTCAGCACGTATTGCCAGTAATAGGGAATAAGGATAGGTAATCAATTTACAAGGAGGTAAACTCAAGGAGGCGGCCACCGATCTTGTAGATTAACTATCAATGTGTTTATTCATTTTACACCCACAGATGCTCAGCAATTCTTTAGGAGTCTAGGGTCAACGACCCCATTGTTGTTTCAAACTACTCAGAACCATTCTGCTACATTAA------- - -a -s mr.mrrefChr0 54527 64 + 130230 CCTAGCCCTTCTTGATGACCCTAGGGTTTTCTCATTCATAAGACATCACACCAGGTCCATGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57215 64 + 636262 CCTAGCCCTTCTTGATGACTCTAGGGTTTTCTCATTCATAAGACATCACACCAGGTCCATGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 50542 45 + 647215 -------------------CCTAGGGTTTTCTTATTCATAAGACCTCATGCCAGGTCCATGACA - -a -s mr.mrrefChr0 54591 160 + 130230 CTGATGAGGCTCCCTACTTTTGAGGAATGAAGATGCATTACTTTCTATTCCATACGTTGTTTAGTGTCAGTCATGCCCTACAATCACACTGACACAAGTTCAGTTTAACAGGGGTTATAACTATATATCTACTTTCATTGTCCCAATAACTGACCTATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57279 160 + 636262 TTGATGAGCCTCCCTACTTTTGAGGAATGGCAATGCACTATTTTCTATTCCATACATTGTTTAGTATCAGTCATACCCTACAATCACAATGACACAAGTTCAGTTTAACAGGGGTTATAGCTATATATCTATTTTCATTGTCCCATCAACTGACCTATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 50591 160 + 647215 CTGAAGAGGCTCCCTATTCTTGTGGAACAAAGATGTGTTACTTTCTATTCCATGTGTTGTTTAGTGCCAGTTGTGCCCTACAATTACACTGACACAAGATCAGTTTAACAGGGGTTATAACTATATATCTACCTTCATTGTCTCAATAACTGACCTACTT - -a -s mr.mrrefChr0 54751 226 + 130230 CAACAGATTCCCCTGAAAAGTCTATCTTCTGGGTATTTTGGCCATGAACATCAAATCAATAGTGGATTCATAGTCATGTTCTGGGGGACATCAGTTTATGAGAATGGTCATGCAGGCCCAAGAAGGACCAAGAGTCATTCTGCCAATGTCATCAGTCTGGAGCATGTCCATGCTCTAGAGATACCCAATGACTGCCCTGCAGAAGCCAGCTTAACCAAAAATTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57439 226 + 636262 CAACAGATTCCCCTGAAAAGTCTATCTTCTGGGTATTTTGGCCATGAACATCAAATCAGTAGTGGATTCATAGTCATGTTCTGGGGGACATCAGTTTATGAGAGTGGTCATGCAGGCCCAAGAAGGACCAAGAGTCATTCTACCAGTGTCATCAGTCTGGAGAATGTCCATGCTCTAGGGATACCCAATGACTGCCCTGCAGAAGCCAGCTTAACCAAAAATCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 50759 225 + 647215 CATCAGATTTCCCTGGAACGTCTATGTTCTGGGGATTTTGGCCATGAATATCAAATCAATAGTGGATTCATAGTCATGTTCTGGAGGACATCAGTTTATGAGAATG-TGATGTAGGACCAAGAGGGACCAAGAGTGATTCTGCGAATTTCATCAGTCTATAGCATGTCCATGCTCCAGAGATACCCAATGACTGCCCTGCAGAAGCCAGCTTAAGCAAAAATTTAT - -a -s mr.mrrefChr0 54977 70 + 130230 GTGGTCCCTAGAGTGGTGCCTGAACCAGACTGTTAACACAAACAAACAAGATGTTCTCATTCAGCTAACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57672 70 + 636262 GTGGTCCCTAGGGTGGTGCTTGAACCAGACTGTTAACACAAACAAACAAGATGTTCTCATTCAGCTAACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 50984 70 + 647215 ATGGTCCCTAGAGTGGTGCCTGAACAAGACTGTTCACACAAGCAGACAAGATGTTCTCATTCAGTTAACA - -a -s mr.mrrefChr0 55047 42 + 130230 TGGATCATTGCAAAATTAGGGCACAGGATCATGCGTCACTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57748 42 + 636262 TGGATCATTGCAAAGTTAGGGCACAGGACCATGCGTCACTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 51054 42 + 647215 TGGATGATTGCCAAATTAGGACACAGGATCACGCGTCACTTT - -a -s mr.mrrefChr0 55089 50 + 130230 TGGACACCTCTCTCTTAGACATTCCTACATGTGAACAGGACAACATACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57791 50 + 636262 TGGACACCTCTCTCTTAGACATTCCTAGATTTGAATAGGACCACATACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 51096 50 + 647215 TAGATACCTCCCTTTTAAACATTGCTACGTGGGAACAGGACAACATACAT - -a -s mr.mrrefChr0 55139 45 + 130230 TCCATTGCACCTGTTTGTACCTGGCCTGGGTAAACTGTATACCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57843 45 + 636262 TCCATTGCACCTGTTTGTACCTGGCCTGGGTAAACTGTATACCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 51146 45 + 647215 TCCATTGCACCTGTTTGTACCTAGCCTGGGTAAACTTTATACCAC - -a -s mr.mrrefChr0 55184 178 + 130230 GGATAACAGATCACTAACTTTTGCAGCATCTATGTGATAAATCTGTTTGGGTGAAAGTCTGATTGGGTGTCTGGATGCAATGTCAGTATGCTAATGACCTATGGGTGTATTCTTGTTCAGTACTTCCTATGCACAAGACCATAGTGCACATCAAGCACTTCTTATAGACACTAATAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57888 178 + 636262 GGATAACAGATCACTAACTTTTGCAGCATCTATGTGATAAATCTGTTTGGGTGAAAGTCTGATTGGGTGTCTGGATGCAATGTCAGTATGCTAATGACCTATGGGTGTATTCTTGTTCAGTACTTTGTATGCACAAGACTATAGTGCGCATCAAGCACTTCTTATAGACACTAATAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 51193 178 + 647215 GGATAACCGATCACCAACTTTTGAAGCATCTATGTAATAAATCTGGTTGAGTGCAAGTCTGGATGGGTGCATGGATGCAATGTCAGTGTGCTAACGACCTATGGGTGAATTCTTGGCCAACACTTCCTATGCACAGGATCATGGTGCACATCATGCACTCCTTATAGACACTGGCAAT - -a -s mr.mrrefChr0 55362 84 + 130230 GATGACAAGAGCATTATTTGATACTTGTTAAGGGTGGATCAACTTGTATCCTCTCTGTCAGTTTTGATCATCTGTGTCTATGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58066 84 + 636262 GATGACAAGAGCATTATTTGATACTTGTTAAGGGTGGATCAACTTGTATCCTCTCTGTTAGTTTTGGTCATCTGTGTCTATGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 51372 84 + 647215 GATGACAAGATCATTATTTGATACTTGTCAAGGACGGATCAACTTGTATCCTCTCTGTCAGCTTTGATCATCTGTGTTTATGCC - -a -s mr.mrrefChr0 55446 175 + 130230 ACATACCCACACAATCTGTGTCCATACCACATATTACACATTCATTATTTAGATTAGATAATTTAAACAATCCTTGCAGCCACTGGATCACCTGATGCTTACCATGCATGTGCCCTGCATGTGACTATAATTGATGGGGTAAAGATATTAAAATGATGGCCTTTATCATACTTCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58150 172 + 636262 ACATACCCAGACAATCTGTGTCCACACCACATATTACACATTCATTATTTAGATTAGATAATTTAAACAATCCTTGCCGCCACTGGG-CACCTGATGCACACCATGCATGTGCCCTGCATGTGACTATAACTGATGCG-TAAAGATATTAAAATG-TGGCCTTTATCATACTTCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 51457 168 + 647215 ACATACCCACACAATCTGTCTCCATGCCACATATTACACATTCA-------GATTAGATAATTTAGACAATCCTTGCAGCCACTGGATCACCTCATGCTTACCATGCATGTGCCATGCATGTGACTATAATTGATGGGGTAAAGATATTAAAATGATGGCCTTTATCATACTGCG - -a -s mr.mrrefChr0 55621 101 + 130230 TGTAACTACACAGTTTAATGAGCATTCCAAGTGTCACACATATTCAGTTTGTTATGTTTGATATTCAATCATTGTGTGTCTTACAGAAACCCTTGTAAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58322 101 + 636262 TGCAACTACACAGTTTGTTGAGCATTGCAAGTGTCACACATATTCAGGTTGTTATGTTTGATATTCAATCATTATATGTCTTACAGAAACCCTTGTAAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 51626 96 + 647215 TATAACTACACAGTTCAATGGGCATCCCAGGTGTCACACATATTCAGTTTGCTA-----GATATTCATTCATTGTGTATCTTACAGAAACCTCTGTAAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 55722 89 + 130230 ATGTAAACTACAATGATGCGCTCTGACTCAATACTTGTATAACTGAGTCAAGACAAATATTAACATCTGCATGTGTTCACATCACAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58482 89 + 636262 ATGTAAACTACAATGATGCACTCTGACTCAATGCTTAAATAACTGAGTCAAGACAAATATTAGTGTCTGCATGTATTCACATCACAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 51722 89 + 647215 ATGTAAACTACAATGATGCGCTTTGACTCAATACTTGTGTAGATGAGTCAAGACAAATATTAACATCTGCATGTGTTCACATCACAAGG - -a -s mr.mrrefChr0 55811 362 + 130230 ACTGTGAGTTTGCTAGGAGTGTGTCTTAGGGAAGACATCTGCATGAATCAATTTAGGGTATTTTGTGAATAGTCACTATACCGAGGTGAAGACATATTTTGAAAAAATTGTAGGTATCAAGCCCTTTAACATAAAGGGAAATATAAGAATAGGCCTTGTACGAGTTCTGACATGCCTGCACTGAGATGATGTCTTAAAATAACTTGCATTTGGTCTGGGGCCATTAATATTTAATTGCAAACAATGAGGTTGTCAACATGTTCTTATAAGTGAGGGTAGAAAGAGACTGGCTGATTCAGTAAGTGTTACAGTACATAGTCTCAATGTTATGGGTACTTCTGAGGTACTTACAGTGCTACATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58572 341 + 636262 ACTGTGAGTTTGCTAGAAGTGTGTCTTGGGGAAGATGTCT------ATCAATTTAGGGTATTTTGTGAATAGTCACTATTCCGAAGTGAAGACAT-----CAAAAAATTGCAGGTATCAAGCTCTTTAACATAAAGGGCAATATAAGAATCAGCCTTGTACGGG-----ACATGCCGGCACTGAGATGATGTCTTAAAGTAACCTGGCTTTGGTCTAGAGCCATTAATATTTGATTGCCAACAATGAGGTTGTCAACATATTCTTATAAGTCTGGGTAGAAAGGGACTGACTGATTCAGTAA-TGTTACAGTCCATAGTCCCATTGTTATG----CTTCTGAGGTACTTACAGTGCTAAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 51811 361 + 647215 ACTGTGAGTTTGCTAGGAGTGTGTCTTAGGGAAGACATCTGCATGACTCAATTTAGGGTATTTTGTGAATAGTCACTTTACCGAGGTGAAGACATATTTTGAAAAAATTGTAGGTATAAAGCCCTTTAACATAAATGGAAATAGAAGAATAGGCCTTGTAGGAGTTCTGACATGCCTGCACTGAG-TGATGTCTTAAAAAAACTTGCATTTGGTTTGGGGCCATTAGTATTTAATTCCAGACAATGAGGTTGTCCACATGCTCTTATAAGTGAGGGTAGAAAGAGACTGGCTGACTCAGTAAGTGTTACAGTATATAGTCTCAACGTTATGGGTACTTCTGAGATACTTACAGTGCTACATA - -a -s mr.mrrefChr0 56173 89 + 130230 AAATTATTAAGTTAATTCAACCATAGTTAATCTTAATTCAACTATAGCCTTTTTTGTTCCTATCAAAAGGTTGTTGTAAAAAAACCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58913 88 + 636262 AAATTATTAACTTAATTCAACCATAGTTAATCTTAATTCAACTATTGCCTTTTTTGTTCCTATCAAAAGGTCGTTGTAAAAAAACCT-T -s simRat_chr6.simRat.chr6 52179 89 + 647215 AAATTATCAAGATAATTCAACTATAGTTAATCTTAATTCAACTATAGCCTTTTTAATTCCTGTCATAAGATTGTTGTAAAAAAACCCAT - -a -s mr.mrrefChr0 56262 20 + 130230 GTCCAGCGTGCAATTCACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59001 20 + 636262 ATCCAGCGTGCAATTCACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 52321 20 + 647215 GTCCAGCATGCAATTTACCT - -a -s mr.mrrefChr0 56282 235 + 130230 TAACCATTGTAAATCAGTTGATTGCACTTAATGACTGACACTGTATGGGGCTGGTGCAAATCACTTAGCTTTTGTTCTTTTTGTATAGTTAAAAGAAAGTTGTGTGAAATGCAATTTTTAAAATTTGGTGAAATTTGCTGAGTTTAGAGCAATGATCCTCCATATTCATTTCAAGTATGAGAATTGACATTTGTTACATATCCTGCATCCTAAACATAGTTTGGATATGATATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59030 235 + 636262 TAACCATTGTAAATCAGTTGATTGCACTTAATGACTGACACTGTATGGGGCTGGAGCAAATCACTTAGCTTTCGTTCTTTTTGTATAGTTAAAGGAAAATTGTGTGAAATGCAATTTTGAAAATTTGGTGAAATTTGCTGAGGTTAGAGCAATGATCCTCCATGTGCATTTTAAGCATGAGAATTGACGTTTGTTACATATCCTGCGTCCTAAACATAGTTTGGATATGATATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 52341 232 + 647215 TAGCCATTGTAGATCAGTTGATTACACTTAATTACTGACACTGTATGGGGCTCGTGCAAATTACTTGGCTTTTGTTCTTTTTGTATAGTTAAAAGAAAGTTGTGTGAAATGCAATTTTTGAAATTTGGTGAAACTTGCTGAGTTTAGAGCAAAAATCC---ATATTCATCTCAAGTATGATAATTGACATTTGTTTCATATCCTGCATCCTAAACTTAGTTTGGGTATGATATGA - -a -s mr.mrrefChr0 56517 209 + 130230 TAAGCTAGTTCAACGAAGGCTATGGAACAATGCTGGCAACCCAAGACTTAACCAGTATTAATCACTTTTATTACTCCACAGGCTGTGCGTTCCAGTCATCAGTCAAGCTGTTCGGTCACACTCATGTCAGCAAGTATACAGCCAGGGACTTACAGTCTGTATAATTTGTCGTTGCTTTTTCTTGTGGCAACAGAAGTCATCTTATTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59265 156 + 636262 TAAGCTAGTTCAACGAAGGCTATGGAACAATCCTGGCAACCCAAGACTTAAC------TAATCACTTTTATTACTCCACAGGCTGTGCGATC--------------------------CACTCATGCCAGCAAGTATACAGCCAGGGATTTACAGTCTGTATAATTTGTCTGTATAATTTATTGTTGC--------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 52580 209 + 647215 GAAGCTAGTTTAAAGAAGGCTATGAAACAATGATGGTAATGCAAGATTTGACCAGTATTAATCACTTTTATTACTCCACAGGATGTGCATTCCAGTCATCAGTCAAGCTGTTCGGTCACACTCATGTCAGCAAGTATACAGCCAGGGACTTACAGTATGTATAATTTACCGTTGCTTTTGCGTGAGGAAACAGAAGTCATCTTATTACT - -a -s mr.mrrefChr0 56726 207 + 130230 TTTATCACAAGGCAACAGAAGTCATCTGGCCAGTTCTCTCCTATGTTATAACTTAGAGGTGCTAAAGACTGCATTCCCAAGGTAATTCTACCTACACTAGCAGATGGAATCAACTGCATCCTTTTCACTAAGTGAAATAATATTCTTTGAATTTGGCTATCTGGTTGATTGTCCATACTAACATAGATGCTATAAACTCTTTTTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59421 207 + 636262 TTTATCACAAGGCAACAGAAGTCATCTGGCCAGTTCTCTCCTATGTTATAACTTAGAGGTGCTAAAGACTGCATGCCCAAGGTCATTCTACCTACACTAGCAGATGGAATCAACTGCATCCTTTTCACTAAGTGTAATAATATTCTTTCAATTTGACTATCTGGTTGATTGTCCATACTAACATAGATGCCATAAGCTCTTTTTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 52878 207 + 647215 TTTATCATGAGGGAACAGAAGTCATCTTGCCAGTCCTCTCCTATGTTATAACTTAGAGGTGCTAAAGACTGCACTCCCAAGGCAATTCTACCTACACGAGCAGATGGAATCAACTGCATCCTTTTCACTAAGCGAAATAATATTCTTTGGATTTGGCTATCTGGGTGATTGACCATACTAATATAGATGCTATACACACTTTTTAGG - -a -s mr.mrrefChr0 56933 210 + 130230 CTTCATTCTGCTCTTGGTTACAATGTAATTCATCACAGATGTGAATTGGTCACAGAATGTACAGGGCAATGTGGTCCTGCTGCTTTTAACACCAAGTTACTCCCATGGGGAGAACTGCACCTGCTTGTACTGCTCTCACATATTCAAAGAGTATATACAACACTAATTGTATTAGGGGCCAATGTACCATCTAAAGAAAGGTTAACAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59638 204 + 636262 CTTCATTCTGCTCTTGGCCACAATGCAAACC-TCACAGATGTGAATTGGTCACAGCACGTACAGGGCAATGTGGTCCTGCCACTTTTAACAGCAAGTTACTCCCATGGGGAGAACTGCACCTGCTTGTACTGCTCTCACATATTCAAAGAGTA-----AACACTAATTGTATTAGGGGCTAATGTACTGTCTAAAGAAAGGTTAACAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 53085 207 + 647215 CTTCATTCTGCA---AGTTAAAGTATAGTTCACCACAGATGAGAGTTGGTCACAGAATGTACAGGACTATGTGGTCCTTCTGCTTTGAACACCGAGTTACTTCCATGGGGATAATTGCTCCTGCTTGGACTGGTCCCACATATTCGACGAGTATATACAATACTAATTGTATTGGGGGCCAATGTACCATCTATAGAAAGGTTAACAGCT - -a -s mr.mrrefChr0 57143 153 + 130230 CCATATATTCTTTAAGTTGCCAGTAACCCAGCTACGTGTCTGGTCACAGGGAAATTGTGTATGTTTGCATGTTTTGTGTATACATTATTAAACTGTCTATGATTTTTAGTGAACATTGTAAGAGCTGTGCTTTGATTTACGTGGGGTTTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59842 142 + 636262 -----------TTGAGTTGCCAGTAACCCAAATACGTGTCTGGTCACAGGGAAATTTTGTATGCTTGCATGTTTTGTGTGCACATTATTGAACTGTCTATGATTTCTAGTGAACATTGTAAGAGCTGTGCTTTGATTTACGTGGGGTTTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 53294 149 + 647215 CCATATATTCTTTAAGTTG---GTAACCCAGCTATGTATGTGACCACAGGGAAATTGTGTATGTTTGCATGTTGTATGTATACATTATCAGATTGTCTATCATTTTTAGTGAACATTATAAGAGCTAT-CTTTAATTTATGTGGGGCTTAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 57296 7 + 130230 GAGTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59984 7 + 636262 GAGTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 53444 7 + 647215 GAGTGCT - -a -s mr.mrrefChr0 57303 3 + 130230 AAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60022 3 + 636262 AAT - -a -s mr.mrrefChr0 57306 11 + 130230 TCTAGAGACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60027 11 + 636262 TCTAGAGACTA - -a -s mr.mrrefChr0 57317 55 + 130230 AGTAAGTACAAAGCTGTCAGATCCCCTTCCAAAAGTTAAATGTAATGTCCAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60042 55 + 636262 AGTAAGTACAAAGCTGTCAGATCCCCTTCCAAAAGTTAAATGTAATGTCCAAACA - -a -s mr.mrrefChr0 57372 133 + 130230 TTTAGAAATAACAGGTGTCTATGTGTAGGCCAGTAAAGGTCATTTTGTACTTTCTTGGATGTCCTCTAGAAAGAGGATATAGGTAGGCTGGCTGCAACATTACTAGAGATCCTTCGGTAAGGACTTTTAAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60098 133 + 636262 TTTAGAAATAACAGGTGTCTATGTGTAGGCCAGTAAAGGTCATTTTGTACTTTCTTGGATGTCCTCTAGAAAGAGGATATAGGTAGGCTGGCTGCAACATTACTAGAGATCCTTCGGTAAGGACTTTTAAGGA - -a -s mr.mrrefChr0 57505 48 + 130230 TATGATGGCCTGTGACCTGTGTGAATGCATGCGTGTTCTTTACTCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60235 48 + 636262 TATGATGGCCTGTGACCTGTGTGAATGCATGCGTGTTCTTTACTCTTG - -a -s mr.mrrefChr0 57553 11 + 130230 TAGGGTATACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60285 11 + 636262 TAGGGTATACT - -a -s mr.mrrefChr0 57564 25 + 130230 TTAGTGGAAATTTCTCAGGTACCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60299 25 + 636262 TTAGTGGAAATTTCTCAGGTACCCT - -a -s mr.mrrefChr0 57589 12 + 130230 GTGCCTCTCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60326 12 + 636262 GTGCCTCTCCAT - -a -s mr.mrrefChr0 57601 35 + 130230 GTCATCTAGGTCTATAACTTCACTAGACTTTTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60380 35 + 636262 GTCATCTAGGTCTATAACTTCACTAGACTTTTTCT - -a -s mr.mrrefChr0 57636 16 + 130230 TTCTATTAGTCAAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60419 16 + 636262 TTCTATTAGTCAAGTT - -a -s mr.mrrefChr0 57652 9 + 130230 GTGGTTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60436 9 + 636262 GTGGTTCAT - -a -s mr.mrrefChr0 57661 41 + 130230 TGATTGCCAGGTGGGTTGCATGCCATCTGTCATTGCACCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60477 41 + 636262 TGATTGCCAGGTGGGTTGCATGCCATCTGTCATTGCACCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 53469 41 + 647215 TGATTGCCAGGTGGGTTGCAAGCCATTTGTCATCACATCCT - -a -s mr.mrrefChr0 57702 173 + 130230 TAATACCCTGTAGGCATGGTTATGTCTCCCAAGAGAGCCTGCTAGATAGATGACAGTTCGATAGAATTGGTATCTAACTTGGAACCACTCTTGCCAATTTACTATTTGGTTCATGTTCCGCAGTATGCTCTTCGAGCTTTTATGCGTGTGGGTAAGAAGGGAGGGTTGAGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60518 173 + 636262 TAATACCCTGTAGGCATGGTTATGTCTCCCAAGAGAGCCTGCTAGATAGATGACAGTTCGATAGAATTGGTATCTAACTTGGAACCACTCTTGCCAATTTACTATTTGGTTCATGTTCCGCAGTATGCTCTTCGAGCTTTTATGCGTGTGGGTAAGAAGGGAGGGTTGAGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 53512 173 + 647215 CAATACCCTGTAGGCTGACCACTGTCTCCCAATAGGGCCTGATAGCTAGATGACAATTTGATAGAATTGGTATCTAACTTGGAACCAAATTTGGCAATTTACTATTTGGTTCATGTTCCACAGGATACTCCTCGAGCTTCTTCGCACGGGGGTAAGAAGGGAGGGTTGAGTTT - -a -s mr.mrrefChr0 57875 27 + 130230 GATCTAAGCGGGAACTTATACCCATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60691 27 + 636262 GATCTAAGCGGGAACTTATACCCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 53690 27 + 647215 GATCTAGACAGGAACTTATACCCATAT - -a -s mr.mrrefChr0 57902 81 + 130230 ATCCTAGGTAGTGGGTAGGATTGGATTGAGCTAAAGGGTTACCAGTAAATTAATACAGTCTGTGCATGCAACATGACTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60718 81 + 636262 ATCCTAGGTAGTGGGTAGGATTGGATTGAGCTAAAGGGTTACCAGTAAATTAATACAGTCTGTGCATGCAACATGACTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 53718 81 + 647215 ATCCTAGGTAGTGGGTAGGATTGGATTAAGCTAAAGACTTACCAGTAAATTAATACAGTCTGTGGGATCAACATGACTTTT - -a -s mr.mrrefChr0 57983 54 + 130230 GCAAATAACCTATAGTATAAGGAATGGAAGTGTTAAAGGCCGAAATATCCTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60808 54 + 636262 GCAAATAACCTATAGTATAAGGAATGGAAGTGTTAAAGGCCGAAATATCCTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 53799 54 + 647215 GGAAATAACCGTTAGTATAGGGGGTGGAAGTGTTAAAGGCCGAAATATCTTTCA - -a -s mr.mrrefChr0 58037 42 + 130230 GTTCTCAGTTCAAAGAGGCATGGGTTAGATCCAGTGGTTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60862 42 + 636262 GTTCTCAGTTCAAAGAGGCATGGGTTAGATCCAGTGGTTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 53857 42 + 647215 GTTCTCAGTTCAAGATGGAATGGATTAGTTCCACTGGTTTCT - -a -s mr.mrrefChr0 58079 288 + 130230 ACTGGTAAAAGTAAAATTGAATAGGATTAGGATGTAACATTCATCTTTCTTAGTCTATGAATTCAACCATTATGGTAAATCTTTCCCCAAAGTTGCATTCCAGGGGTCTGGATTTCCTATTAACTTTTGAACATTTATCTATGCTTCTACTACCCCAACTATACAAGAGATAGACATCTACAATGGTGGTCAGGTCTGTAGACCCAATTGTGCTGGCTGTCCGATAGGCAGGGGTATCATTTTAACGACTACCAACCAGCCCCATAGACACTGTCAGCTTTCCTAGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60916 280 + 636262 ACTGGTAAAAGTAAAATTGAATAGGATTAGGATGTAACATTCATCTTTCTTAGTCTATGGAATCACCCATTATGGTAAATCTTAGCCGAAAGTTGCATTCCAGGGGTCCAGACTTCCTATTAACTTTTGAA--------TATGCTTCTACTACCCCAACTATATGAGAGATAGGCATCTACAATGGTGGTCAGGTTTGTAGACCCAATTGTGCTGGCTGTCCAATAGGCAGGGGTATCACTTTAACGGCTACCAACCAGCCCCATAGACACTGTCAGCTTTCCTAGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 53899 287 + 647215 ACCGGTAAAAGTAAAATTGA-TAGGATTAGGATGTAACGTTCGATTTTCTTAGTGAATCAATTCAACCATTATGATAAATCTTTCCCCAAAGTTGCATTCCAAGTGTCTGGATTTCCTATTAACTTTTGAACATTTATCTATGCATCTACTACCCCAACTATACAAAAGATAGACGTCTAGAATTGTGGTCAGTTCTGTAGACCCAATTGTGCTGGCTGTCTGATAGGCAGGGGTATAATTTTAACGACTACTAATCAGCCCCCCAGACACTGCTATCTTTCCTAGGG - -a -s mr.mrrefChr0 58367 10 + 130230 AAAATAGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61196 7 + 636262 ---ATAGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 54202 10 + 647215 AAAATAGTAG - -a -s mr.mrrefChr0 58377 247 + 130230 CATCTCATATATTACTGTGCCTAATTCTATGAACCACTTTTACTAAAAATTGTATGATTTTCCTTAGCTGTTACATTCAGACAATGGCTAAATTTTATAGAAAGTACTACTGGGAGCCACTAAAGGAACGCGAACCATTTCAGATGATAAGATGGCGTGCAACTCTTGCAGAATGCCCTGACCACTTTTTTCATTCATGCGGTAAGACCCTATGAAAAGCATTGAGTGCACTGATAACTACCAATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61205 247 + 636262 CATCTCATATATTACTGTGCCCAATTCTATGAACCACTTTTACTAAAAATTGTATGATTTTCCTTAGCTGCTACATTCAGACAATGGCTAAATTTTATAGAAAGTACTACTGGGGGCCACTAGAGGAACGCGAACCATTTCAGATGATAAGATGGCGTGCAACTCTGGCAGAATGCCCTGACCACTTTTTTCATTCATGCGGTCAGACCCTATAAAAAGCATTGAGTGCACTGATAATTACCAATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 54212 244 + 647215 CAACTCATATATTACTG-GCCTAATTCTATTAACCACTTTAACTAAAAATTGTATGATTTTCCCTAGCCGTTA--TTCAGACAATGGCTAAATTTTATAGAAAGTACTACTGGGAGCCACTAAAAGGACGTGAACCATTTCTGACGATAAGATGGCGTACAACTATTGCAGATTGCCCTGACCACTTTTTTCATTTATGTGGTAGGACCCTATGATAAGCATTGAGTACACTGATAACTACCAATCC - -a -s mr.mrrefChr0 58624 67 + 130230 ATGGCCTGACCTCTAATAGAGAGTATAAAACAATCTCAACACTTAGTTTTAAAACTTAATATACACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61458 67 + 636262 ATGGCCTGACCTCTAATAGAGAGTATAAAACAATCTCAACACTTAGTTTTAAAACTTAATATACACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 54456 67 + 647215 ACAGCCTGACCGCTAATAGAGAATATGAAACTATCTCAACACTTAGTTTTAAAACTTAATATACACT - -a -s mr.mrrefChr0 58691 37 + 130230 TAGTCTCTAAACTTAATATACACTCCATTGCTACTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61535 37 + 636262 TAGTTTCTAAACTTAATATACACTCCATTGCTACTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 54523 37 + 647215 TAATCTCAAAACATAACATACATCCCATTGATACTAT - -a -s mr.mrrefChr0 58728 29 + 130230 GTGACTTTGGAGCCTAAGGTAGGAGACGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61607 29 + 636262 GTGACTTTGGAGCCTAAGGTAGGAGACGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 54560 29 + 647215 GTGACTTTGGAGCCTAAGGTAGGAGATGT - -a -s mr.mrrefChr0 58757 525 + 130230 GGTTCCCAAAAAATTTTGCCTATATCTGTTGTGTGTAGAAGTTGAAAGTAAGATTGCAGGTCATATGCAATGATCATTGAGTTGAAATATATCTTGGCATTGTTGTGTCTGTCATCGAATAATGATCTTAGTAAACAGACATTGTGCAAAGTAGACAGACACAATGACTCTTTTGAATCTCCCAGCAGGGATGTCTTGACAAAGCTTGCAAGATTCTATGATGCACTGTTGCATCCATCACTGTTTTTCCATATCATTAAAAATATCATATGGTATTCATGGCCCTGTTCATACAACTAAAGTGCCTATAGTCTGTTATTGTAATAGATGCAAGTGTGAGGGTGATTTGACAGATCATGTACCCATCAGTCATTGCTAGTTTCGCAAGCTATTTGGAGCTACATTTTCCTGGTCCTGATGTCATGTGCTATGAGATCAGTTGACTAATTAAGAGAGTGTGTTGTTTATAAAGGATCGTTTCCTGCTGATAGTTCACATTCTGAGGTAACAAGATGGATAGCGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61640 512 + 636262 GGTTCCCAAAAAATTTTGCCTATATCTGTTGTGTGTACAAGTTGAAAGTAAGGTTGCAAGTCATATGCAATGAGCACTGAGTTGAAATATATCCTGGCCTTGTTGTGTCTATCATCGATTAATGATCTTAGTAAACAGACATTGTGCAAAGTAGACAGACACAATGACTCTTTTGAATCTCCCAGCAGGGATGTCTTGACAAAGCTTTCAAGATTCTATGATGCACTGTTGCA-CCATTACTGTTTTTCCATATCATTAA--------TTTGGTATTTGTGGCCCTGTTCATACAACTAAAGTGC----AGTCTATCATTGTAATAGATGCCAGTGTGAGGGTGAATTGACAGATCATGTACCCATGAGTCATTGCTAGTTTCGCAAGCTATTTGGAGATACATCTTCATAGTCCTGATGTCATGTGCTATGGGATCAGTTGACTGATTAAGAGAGTGTGTTGTTTATAAAGGATCATTTCCTGCTGATAGTTCACATTCTGAGGTAACAAGATGGATAGTGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 54589 524 + 647215 GGTTCCCCAAAAATTTTGCCTATATCTGTGGTATGTAGAGGTTGACAGTAAGATTGCAGGTCATTTGCAATGATCATTGAGTT-AAATATATTTTTCCATTGTTGTGTCTGTCGTCGAATAATGGTCTTAGTAAACAGGCATTGTTCAAAGTAGACAGACACAATGACTATTTGGCATCTCCTAGCAGGGATGTCTTGACAAAGCTTGCAAGATTCAATGATGCACTGTTGCATCCATCACTATTTTTCCATATCATTAAAAATATCATATGGTATGCATGACCCTGTTAATACAACTAAAGTGCCTATGGTCTGTTATTGAAGCAGATGCAAGTGTAAGGGTCTTCTGACAGGTCGTGTACCCATCAGTCATTACTAGCTTTGCAGGCTATTGGGAGCTACAGTTTCCTGGTCATGATGTCATGTGCTATGAGATGAGCTGGCTAATTGAGAGAGTGTGTTGTTTATAAAGGAGCGTTCACTGCTGATAGTTCACATTCTGAGGTAACAAGATGCATAGCGAAA - -a -s mr.mrrefChr0 59282 24 + 130230 TAGTGCCGCAATTTAAGAAGCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62152 24 + 636262 TAGTGCCGCAATTTAAGAAGCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 55114 24 + 647215 TACTGTCGCAACTTAAGAAGCTGA - -a -s mr.mrrefChr0 59306 174 + 130230 TGTGTTATCATGTATTGTAACATTTTAAAAAAAGAGCAAAGGTGGAGAAAACCAAAATCTAGGGAGTGTAATGTCTTCTTTTAAGACACATTCAGATAACATGGTCAGAGCTTGCTTGTAGCATAAGATTAGTTGCCATGGGTTATCTGCCCAGCTTAGTAGATAAGATGCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62181 174 + 636262 TGTGTTATCATGTATTGTAACATTTTAAAAAAAGAGCAAAGGTGGAGTAAGCCAAAATCTAGGCAGTGTAATGTCTTCTTTTAAGACACATTCAGATAACATGGTCAGAGCTGACTTGTAGCATAAGATTTGTTGCAATGGGTTATCTGGCCAGTGTAGTAGATAAGATTCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 55138 173 + 647215 TGTGGTATCATGTATTGTAACATTTTAAAAAATGAGCAAAGGTGGAGAAAACCCAAATCCAGGGAGTGTAATGTCTTCTTTTAAGACAC-TTCAGAGAACATGGACAGAGCTTGCTAGTAGCATAAGATTACTTGCCATGGGTTATCTGCCCAGCTTAGTAGATAAGATGCAAA - -a -s mr.mrrefChr0 59480 210 + 130230 CTGTCAGCCTAAGCTTTTATTAAACTGCTGGGAGTTTAGGATAGCTTGATATGCCTGAACTCTGTGACAATAATCCCAGTGCAGAGAGACGCAGTTTTTAATGTTCTTTACTGATACTTAGACTTTGGTTGGATGCACCACGCCCTTTTATATTTCATAACCCTTATTCGTAGTGAATTGCAGCAATTGTCAGTGCAAATCAACTCAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62356 208 + 636262 CTGTTGGCCTAAGCTTTTAATAAA-TGCTGGGAGTTTAGGATAGCCTGATATGCCTGAACTCTATGACAATAATCCCAGTGCAGAGAGACACAGTTTTTAATGTCCCTTATTGATACTTAGACTTTGGTTGGATGCACCACGCCCTTTTATATTTCATAACCCTTGTCTGTAGTGAATCGCAGCAATTGTCAGTGCAAATCAAC-CAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 55311 210 + 647215 CTCTCAGCCTAAGCTGTTATTAAACTGCTGTGAGTTTAGGATAACTTGATATGCCTGCACTCTGTGACAATAATCCTAGTGCACAGAGGGGTGGGTTTTAGTGTTCTTAACTGATACTTATACTTTGGTTGGATGCACCAGGCCCTTTTATATTTCATAATCCTTATTCGTAGTGAATTGCAGCAATTGTCAGTACAAATCAACTCAAGG - -a -s mr.mrrefChr0 59690 54 + 130230 TTAGTGCATGCTGACAATAATGTACTTACTATATTAACCAGTCCTCCTCTCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62564 54 + 636262 TCAGGGCATGCTAACAATAATGTACTTGTTATATTAACCAGTCCTCCTCTCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 55523 53 + 647215 CTGGTGCACACTGACAATAATTTAATTACTAT-TTAACCAGTCTTCCTCTCTAC - -a -s mr.mrrefChr0 59744 292 + 130230 AGTAGTCAGACTAACACCATCCCCCAATATCCTCTTTTTGAACTATGGATGGCATCTTTACCTGGGACTTGGCCAGCACCTGTATACAACTGATCAGTGGATAGGTGAAAATACATATTGAAACTATTTGAAACTATAATGCTGTGGTTGGGCAGTGCACAGCAAAGGGTTCTTTAAGAACTCCTGAGCAGCACAACCTTGGGCCCTTGTACTAAATTAAACAAAGCTTTGACAGACAGCTAGCATGCTGTGGTGTCCCTCAGGGGATAAACCCTTCCACAATGCACTACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62619 279 + 636262 AGTAGTCAGACTAACACCATCCCCCAATATCCTCTTTTTGAACTATGGATGGCATCTTTACCTGGGACTTGGCCAGCGCCTGTATACAACTGATTAGTAGATAGGTGGAAATACATATTGAAACTA------------ATGATGTGGTTGGGCAGCGCACAGCAAAGGGTTCTTTAAGAACTCCTGAGCAGCACAACCGAGGGCCCTTGTACTAAATAAGACAAAGCTTTGACAGACAGCTAGC-TGTTGTGGTGTCCCTCAGGGGATAAACCCTTCCACAATGCACTACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 55576 287 + 647215 AGTAGTCAGACCAATACCATCCCCGAATATCCTCTTTTTGAACTATGGATGGCATCTTTACCTGGGACTTGGTCAGCACCTGTATACAACTAATCAGTGAATAGGTGAAGATACATATTGAACCTATTTGAAACTATAAGGCTGTGGTTGGGCAGTGGACAGCAACAGGTTCTTTAAGAACTCCTGAGCAGCACAATCTTGGGCCCTTATTCTAAATTAAACAAAGCTTCATCAGACAACTAGCATGCTGTGGTGTCCCTCAAGGGATAAACCCT-----AGTGCACTACCG - -a -s mr.mrrefChr0 60036 68 + 130230 GAAATTACCACCCTGCCTTTATCTCAGACATGTGGAGTGTGGCAGCTCAGGAGCTTCTGTGCAATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62899 68 + 636262 GAAATTACCACCCTGCCTTTATCTCAGACATGTGGAGTGTGGCAGCTCAGGAGCTACTGTGCAACAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 55863 68 + 647215 GAAATTACCACCCTGCCTTTGTCTTAGACATGTGGCGTGTGGCAGCTCAGGGGCTTCTGTGCAATGGC - -a -s mr.mrrefChr0 60104 29 + 130230 ATGAATTAGTCAAGAAATAATTGCACACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62968 29 + 636262 ATGAATTAGTCAAGAAATAATTGCACACT - -a -s mr.mrrefChr0 60133 6 + 130230 TCAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62998 6 + 636262 TCAAAT - -a -s mr.mrrefChr0 60139 140 + 130230 TGCCTGCTCACCAGCTGTTACGGGTGCTAAGGACATTCCTCTCCTGTAGGCTGAGGGTCCACATCTTCACTTAACCCAAATGCCGCTTTATACTGGGTCTAATGGGATGATACAAGAACAACAGCAATGATGTGGCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63005 139 + 636262 TGCCTGCTCACCAGCTGTTACGGGTGCTAAGGACATTCCTCTCCTGTAGGCTGAGGGTCCACTTCTTCACCTAACCCAAATGCTGCTTTATACTGGGTCTAATGGGATGATACAAGA-CTACAGCAAAGATGTGGCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 55931 120 + 647215 -----------------GTATGGGTGCTAAGGACATTCCTCTCATGTAGGCTGAGGGTCCATATCTTCACTTAA---AAATACCACCTGATACTGGGTTTCATGGGTTTATACAAGAACAACAGCAATGATGTGGCATAA - -a -s mr.mrrefChr0 60279 136 + 130230 AAAATTAGTTAGGAGGAATAATGGAACATGAAAGTTAGAGATCCCATGCACTTACTTCTGATATACAAGAAATAAACTTTACATGTCTCAAATAGTCACATAGTCACAAATACTTGTGCAAACCACATGTCTCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63144 113 + 636262 AAAATTAGTTAG-AGGGATAATGGGACATGAAAGTTAGAGGTCCCATGCACTTACTTCTGATATACAAGAAATAAACTTGACATGTCTCAAATAGTCACATTGTCACGAATACT---------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 56054 131 + 647215 AAAATAAGTTAGGAGGAATAATGGAACATGAAAGTCAGAGATCCTGCGTACTTTCTTCTGATATA-AAGAAATAAACTTTACACATCTCAAATCTTC----AGTCACAAATACTTGTGCAAACCACATGTCTCTGG - -a -s mr.mrrefChr0 60415 168 + 130230 GGTTTAATGCACCCAGGCAGACATTAAAGACATCCTTGACTGACATAAGTGCATGTACACTCTTAAGCAACTAAGCCTTGATGGAGGCATGTTGGTGCCTTAGCAAGACAGCAAAACACAGTAGACAGTGGGTCATTTTTTGAACTAGTGTAAAATAAGTTCATACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63257 126 + 636262 ---------------------------AGACATCCTTGACTGACAT-------TGTACACTCTTAAGCAACTAGGGCTTGATGGAGGCATGTTGGTGCCTCAACAAGACA--------CAGTAGACAGTGAGTCATTTTTTGAACTAGTGTAAAATAGGTTCATACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 56197 167 + 647215 GGTTTAATGCACCCAGGCAGACATTAAAGACATCCTTGACTGATATAAGTGCATATGCACTCCTAAGCAATTGAGCCATGATGGAGGCA-GTTGGTGCCTTAGCAAGACAGCAAAACACATTAGACAGTGGGTCATATTTTGAACTAGTGTAAAATAAGTTCAAACTA - -a -s mr.mrrefChr0 60583 63 + 130230 CTTAATGTACCTGCAAATCATTTGCTTCTCACAAGATTCCCAATAGTGGTGTTACAAATATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63383 63 + 636262 CTTAATGTACCTGTACATCACTTGCTTGTCACAAGATATCCAATAGTGGTGTTGCAAATACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 56367 63 + 647215 TTTAATGTACCTGCAAATCATTTGCTTCTCACAAGATTCCCAATAGTGGTGTTACAAATATTG - -a -s mr.mrrefChr0 60646 101 + 130230 AGAACTGACACAGGATCATGAGTCGGTAACAACTTCATAAAGTTCGCACCCTAATTAGCTTAGCAGAAGTGCCAGGTATTGGCACCTGGGCAAGTGACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63446 101 + 636262 AGAACTGACATAGGATCATGAGTCGGTGATAGCTTCATAAAGTTCACACCCTAATTAGCTTAACAGAAGTACCAGGTATTGGCACCTGGGCAAGTGACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 56431 81 + 647215 AGAACTGACACAAGATCGTGAGTCAGTAACAACTTCATAAAATATGCTCTCTAATAAGCCGAGCAGAAGCGCCAGTTATTG-------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 60747 489 + 130230 CAGATCAAGTGACATTATAATTAACTCAGTATTCAACAATGGAGGTCCCTCCCCTCCACCACCACTTGATGAACTTTTGAGTTATGGTGGAGAATTTTCAGTTGCAGTTTCATTGTCAATTTAATGAATGAGTACTCAGTTACAAGCGAATGATTTGGAAAAGCTATATCCTCAAACGGATGATTTGAGAATTGCTGACCTTATCTTTACCTGTTGGCTATGATTATGACTTTGTTTGAAAGCCTATCATGATAGTGCTCACTAGGCTCATATCAAGCATTGATGTTGTGTAGATTTAATTAAATTCAGTAGCTGTGTATGAAAGCCTAACATGCTAGAGCTTCCCAGGCTCATATCAAAGATGGATGTATTACAGGCTTAAATAAATTCAGTACTGGGAGGGAAGGAAACCAGAAGAATCATTGTTAAATATTTGTGACCCCGACACCCCTCTAGAGCATTCTTAATGCTGGATACCATCCAGCTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63549 489 + 636262 CAGATCAAGTGACATTATAATTGACTCAGTATTCAACAATGGAGGTCCCTCCCCTCCACCACCACCCGATGAACTTTTGAGTTATTGTGGAGAATTTGTAGTTGCAGTTTCATTGTCAATTTAATGAATGAGTACTCAGTTACAAGCGGGTGATTTGGAAAAGCTATATCCTCAAACAGATGATTTGAGAATTGCTGACCTTATCCTTTCCTGTTGGCTATCATTATGACTTTGTTTGAAAGCCTATCATGATAGTGCTCACTAGGCTTGTATCAAGCATTGATGTTGTGTAGGTTTAATTAAATTCAGTAGCTGTGTATGAAAGCCAAACATGCTAGAGCTTGCTAGGCTCATATCAAAAATGGATGTGTTACAGGCTTAATTAAATTCACTACTGGGAGGGAAGGAAACCAGAAGAATCATTGTTAAATATTTGTGACCCCGACACCCCTCTAGAGCATTCTTAATGCTGGATACCATCCAGCTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 56512 468 + 647215 --------------------TTAACTCAGTATTCGACAATGGAAGTCCCTCCCC-CCACGACCACTTGATGAACTTTTGAGTTATGGTGGAGGATTTTCAGTTGCAGCTTCATTGTCAATCTAATGAATGACTACTCAGTTACAAGGGAATGATTTGGAAAAGCTACATTCTCAAATGGATGATTTGAGAATTGCTAAGCTTGTTTTTACCTCCTGGCTATGATTATGATTTTGTTTGAAAGCCTATCATGGTAGTGCTCACCAGGCTCATATCAAGCATTGATGTTTTATAGAGTTAATGAAATTCAGCAGCTATGTATGAAAGCCTACCATGCTGGACCTTCCCAGGCTCATATCAAGGATTGATGCATTACAGGCTTAAATAAACTAAGTACTGGGAGGAAAGGAAATCAGAATAAACATCGTTTAATCTTTGTGACCCTCACACTCCTCTGGACCATTCTTAATACTGGATACCATCCAGCTTAC - -a -s mr.mrrefChr0 61236 48 + 130230 GATAATTACTTTAATACCTGTACAGGCTAGCTAGTCTATTGCAGTACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64038 48 + 636262 GATAATTACTTTAATACCTGTACAGGCTAGCTAGTCTATTGCAGTACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 56984 48 + 647215 GATTGGGACACTAATACCTGTACAAGCTAGCTATTCTACTGCAGTACT - -a -s mr.mrrefChr0 61284 137 + 130230 TGTGAGGGTTGGGTTATATAATCCTTAAGTACCCGATAAGTCACATCCGTGATTACTCTAAACAGTCGGAATGATCAAGTCTTTATTTGACACATTAATCGCTTAAAAGGTCCATTCAAAATGAGTACAAGATTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64151 137 + 636262 TGTGAGGGTTGGGTTATATAATCCTTAAGTACCCGATAAGTCACATCCGTGATTACTCTAAACAGTCGGAATGATCAAGTCTTTATTTGACACATTAATCGCTTAAAAGGTCCATTCAAAATGAGTACAAGATTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57032 137 + 647215 TGTGAGGGTTGGGTTGTATGGTCTTTAAGTTCCTGATAAGTCGCATCTGTGAGTACTTTACACAGTTGGAGTGATCACGTCTTTATTTGACACATTAATTACTTGAAAGGTCCACTCAGAATAAGTGCATGATTTAG - -a -s mr.mrrefChr0 61421 10 + 130230 GTTAGAGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64380 10 + 636262 GTTAGAGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 57169 10 + 647215 GTTAGAGGTT - -a -s mr.mrrefChr0 61431 42 + 130230 TGTTAATAAACAGTGTGTAGAGGATAAACAGCAGTTATACGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64390 42 + 636262 TTTTGATATTCAGTGTGTAGAGGATAAACAGCAGTTATACGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64700 21 + 636262 TGCTACTCAACTATACGTTGA--------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 57179 42 + 647215 TGTTAATAAACAGTGTGTAGAGGATAAACAGTAATTATAAAT - -a -s mr.mrrefChr0 61473 13 + 130230 ATGAGATTTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64435 13 + 636262 ATGAGATTTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64721 13 + 636262 ATGAGATTTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 57221 13 + 647215 ATGAGATTTGAGT - -a -s mr.mrrefChr0 61486 14 + 130230 TTGGCTGATAGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64452 14 + 636262 TTGGCTGATAGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64734 14 + 636262 TTGGCTGATAGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 57234 14 + 647215 TTGGCTGATAGCAT - -a -s mr.mrrefChr0 61500 12 + 130230 GTAAATCAAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64466 12 + 636262 GTAAATCAAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64748 12 + 636262 GTAAATCATAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57250 12 + 647215 GTATATCAAAGG - -a -s mr.mrrefChr0 61512 1 + 130230 G -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64760 1 + 636262 G -s simRat_chr6.simRat.chr6 57262 1 + 647215 G - -a -s mr.mrrefChr0 61513 151 + 130230 AGGGACCTTGCAGACACAATGGTATGTTGAGGGTAGACAATAATTGTATATTTAACATTTTAATCCAAGGTAGCAGGTTTTTGGGGGACAGGAGTGTGGCAATCGTAAAGAGGTTATTTGCGGAGACCTTCGTGTAACCAAAGGATGCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64478 151 + 636262 AGGGACCTTGCAGATGCAATGGTATGTTGAGGGTAGACAATAATTGTATATTTAACATTTTAATCCAAGGTAGCGGGTTTTTGGGAGACAGGAGTGTGGCAACCGTAAAGAGGTTATTTGCGGAGACATGCGTGTAAACAAAGGATGCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64761 151 + 636262 AGGGACCTTGCAGACACAATGGTATGTTGAGGGTAGACAATAATTGTATATCTAAAATTTTAATCCAAGGTAGCAGGTTTTTGGGGGACAGGAGTGTGGCAATCGTAAAGAGGTTATTTGCGGAGACCTTCGTGTAACCAAAGGATGCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 57263 150 + 647215 AGGGACCTTGCGGACACAATGGTATGCCGAGGGTAAACAATAACTATATATTAAACATTTTAATCCAAGGTAGCAGGTTTTTGGGGGACAG-AGTGTTACAATCATAAACAGGTTATTTGTGGAGACCTTTGTGTAACCAGAGGATGCACC - -a -s mr.mrrefChr0 61664 25 + 130230 TTTGAAACTGAGTTGGGAGAGATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64675 25 + 636262 TATGAAACTGAGTTGGGAGAGATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64912 25 + 636262 TTTGAAACTGGGTTGGGAGAGATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 57413 25 + 647215 TTTAAAACTGAGTTGGAAGAGTTTA - -a -s mr.mrrefChr0 61689 49 + 130230 TGCCACTCAACTAGAAGGGCTACAAGGTATTACCGCCAAATAAAATGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64937 49 + 636262 TGCCACTCAACTAGAAGGGCTACAAGGTATTACCGCCCAATAAAATGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57438 49 + 647215 TGCTGCTCAACTAGATGGGCTACAAGTTATTGCCACTATATAAAACGGG - -a -s mr.mrrefChr0 61738 244 + 130230 TAGCCAATTTCTTATTGCACTGGGACCAAATAGCAGAAAGTTATTTAGACAACTTAATCTTTTGATGATGAATGTGCATTGTCTGTTATTTGTCATGATCAAGTTGTGTCTGGTACCTGACAATGAAGCCCCATCTCGTAAGATATGTGGCTGACGATGGGGCAGAATCTGTGCTGTGACCCCCTGATAAGTATTCCTTTCCTAAACACCAAAAGAATCATTAAATTCTTAGCCTAATCTCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64992 244 + 636262 TAGTCAATTTCTTATTGTACTGGGACCAAATAGCAGAAAGTTATTTAGACAACTTAAACTTTTGATGATGAATGCGCATTGTCTGTTATTTGTCATGATCAAGTTGTGTCTGGTACCTGACAATGAAGCCCCATCTCGTAAGATATGTGCCTGATGATGGGGCAGAATCTGTGCTGTGACCCCCTGATAAGTATTCCTTCCCTAAACACCGAAAGAATCATTAAATTCTTGGCCTAATCTCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 57487 244 + 647215 TAGCCTATTTCTTATTGCACCGGGACTAAACAGTGGAAAGTTATTTAGATAACTTAATCATGTGATGATGAGTGTGCATTGTCTGTTATTTGTCATGGTCAAGTTGTGTCTGGTACATGACAGTGAAGTCTCCTGTAGTAAGATATGTGGCTGACAATGGGGCAGAATCTCTGATGTGACCCCTTGATAAATATTCCTTTGCTAAACACCAAAAGAATCATTAAATTCTTAGCCTAATCTCACC - -a -s mr.mrrefChr0 61982 82 + 130230 GTCAAGAATCAATATAATTGCTCTAGGTCAATATGGTTCGTGGTGCCGTGTTGATTTGATATAATTGCTCTAGGTCAATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65244 82 + 636262 GTCAAGAATCAATATAATTGCTCTAGGTCACTATGGTTCGAGGTGCCGTGTTGATTTGATATAATTGCTCTAGGTCAATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57731 82 + 647215 GTCAAGAATCAATATAATTGCTCTAGGTCAATCTGGTTCGTGGTGCCAGGTTGAATCAGTATAATTGCTCTAGGTCAATATG - -a -s mr.mrrefChr0 62064 84 + 130230 TTCATGCTGCCATGCTGGGTCTGGCGTTAATGGTTTAACTTGTGTCCAATGCCTGACACTTTTGTACCATAGGTATCACAGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65327 80 + 636262 TTCATGCTGCCATGCTGGGTCTGGCATTAATGGTTTAACTTGTGTCAAATG----GCACTTCTGTACCATAGGTATCACAGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 57813 84 + 647215 GTCATGGTGCCATGTTGGGTCTGGTGTTAACGATTTAACTTGGGTCCAATGCCTGACACTTTTGTACCAAAGGTATCACAGCAC - -a -s mr.mrrefChr0 62148 117 + 130230 TTGCTGCTAAGAGCTGCTGTGGTACTTATTTAGTTAATGATAGTGCCTGAGCTAGCAGAAAACCATGATATGGGCGGGAGCTCAGTAACTAGGTTGGGTAACTAATAACTAAATATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65411 117 + 636262 TTGCTGCTAAGAGCTGCTGTGGTACTTATTTAGTTAATGATAGTGCCTGAGCTAGCAGAAAACCATGATATGGGCGGGAGCTCAGTAACTAGGTTGGGTAACTAATAACTAAATATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 57897 117 + 647215 TTGCCTCTAAGACATGATGTAGAACTTATTTAGTTAATGATGGCGACTAAGCTAGCAGAAAGCCATGATATGGGAGGGAGCTCAGTAACTAGGTTGGATAACTAACAACTAAATATT - -a -s mr.mrrefChr0 62265 136 + 130230 GACTTGCCTCTCAATATGACAAGCCTTTACAGTGAATAGACATGAAGGTTCAGTTTTCAAGCTAATCAGGGAGAAGATCCAGTTAAGTATGGACAAGTCTTTAATTGATTACTAGTTCCCTATTGGTTCATTTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65580 136 + 636262 GACTTGCCTCTCAATATGACTAGCCTTTACAATGAATAGACATGAAGGTTCAGTTTTCAAGCTAATCAGGGAGAGGATCCAGTTAAGTATGGACAAGTCTTTAAATGATTACTAGTTCCCTACTGGTTCATTGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 58014 136 + 647215 GAGTTGCCTCTCTATATGACAAACATTTACAGTGAATAAACATGAAGGTTCAGTTTTCAAGCTAAGCAGGGAGGAGATCCAGTTAAGTATGGACAAGTTTACAATTGATTACTGGTTCCCTATTGGTTCATTTTGG - -a -s mr.mrrefChr0 62401 77 + 130230 ATATGGGCAATAGCTAAGCCAGTGAAGAAAGATCTTCTAAATAGCCCTCATCTAACAGCTAAGTATCATACTGTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65741 63 + 636262 ATATAGGCAATAGCTAAGCCAGTGAAGAGAGAT--------------TCATCCAACAGCTAAGCATCATACTGTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 58150 77 + 647215 ATATGGGCAATAACTGAGCCAGTGAAGAAAGATCTTCTAAATAGCCCTTATATAACAGCTTAGTATCATACTGTAGT - -a -s mr.mrrefChr0 62478 238 + 130230 ACCCCTTATGATTCCAAAACCATAACACAGCCTGTTCAAAGAGTCACACAGAGAATAACTGGAGACATAGTAAAGACTGAGCGCCAATTGACAATGGGGACATTCAGGACTACATGCAAGCAATAGAACAAGTTTGACGCAGAATTATTGCACTGTAGGTTAATTTTTGATAGGATGATTTCCAATATTATGCACAAATGGACACTGAAGCATATACTGCTCAGAGGGGAGCGTAcga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65808 238 + 636262 ACCCCTTATGATTCCAAAACCATAACACAGCCTGTCCAAAGAGTCCCACAGAGAAGAACTGTAGACATATTAAAGACTGAGCGCCAATTGACAATGGGGACATTCAGGACTACGTGCAAGCAATAGAACAAGTTCGACGCAGAATTATTGCACTTTAGATTAATTTTTGATGGGATGATTTACAATATTATGCACCAATGGACACTGAAGCATATACTGCTCAAAGGGGAGCGTACGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 58227 209 + 647215 --------------------------ACAGCCTGTTCAAAGAGTCACACAGAGAATGACTGGAGACGTAGTAAATACTGAGCGCCAATTGACAATTGACACATTCAGGACTACATGCAAGCAATAGAACAAGTTTGGTGCAGAATTATTGCACTGTAGGCTAATTTCTGAAAGGATGATTTCCAATATTATGCACAGATGGACACTGAAGCATATACTGCTCAGAGGAGATCATA--- - -a -s mr.mrrefChr0 62716 152 + 130230 gaatacaactaaatttctctgtcataaaTCTAGTGCTCTTGTTTGTCTGTGCAATGCAACAAGAGGACagTGATGAGTATTTTTGATTAGATcAAGAACAGgttcaaatATCCACCTTTTGCGGCTACATTATGGTTTATCTAAGGAACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 66048 151 + 636262 GAATACAACTAAATTTCTCTGTCATAAATCTAGTGCTCTTGTTTGTTTGTGCAATGCAACAAGAGGACAGTGATGAGTAATTTTGATTAGAT-AAGAACAGGTTCAAATATCCACCTTTTGCGGCTACATTGTGGTTTATCTAAGGATCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 58436 114 + 647215 ----------------------------TCTACTGCTCGCGTTGGTCTGGGCAATGCAACATGAGGAC--TGATGAGTATTTCTGATTAGATCAAGAACAA--------ATCCACCTTTTGCAGCTACATCATGGTTTATCTAAGGAACCTT - -a -s mr.mrrefChr0 62868 171 + 130230 TTATGAGCACCTACCCATACTGACTTGCTTTAAATGAaagcatgttaagtaaGATCTCTGGCTACAAACAACATGCTGCAACCCAGCTGCCTCAAATCACTTTCAACCATCAGTTCCAATCATAAAGTTACTAGGATATTACATACACTAGATACccaagtgagctcatta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 66206 155 + 636262 TTATGAGCACCTCCCCATACTGACTTGCTTTAAATGAAAGCATGTTAAGTAAGATCTCTGGCAACAAACAACATGCTGCAACCCAGCTACCTCAAATCACTTTCAAGCACAAGTTCCAATCATAAAGTTACTAGGATATTACATACACTAGATAC---------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 58550 156 + 647215 TTATGAGCACCTAACCATCATGATTTGCTCCGAATGA---------------AGTCTCTGGCTACAAACAACATGCTGCAACCCAGCTGACTCCAATCACTTTCAGCCATCAGTTCCAATCATAAAGCTGCTAGGATATGACATACACTAGATACCCAAGTGAGCTCATTA - -a -s mr.mrrefChr0 63039 86 + 130230 GCTAATTGGAGtatataATTTGTATTGCAACTAATAAGTAGCACTCAATCTGAGTAAGACATATTATCTGTGGATTATGGCCTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 66806 80 + 636262 GCTAATTGGAG------ATTTGTATTGCAACTAACAAGTAGCACTCAATCTGAGTAAGACATATTATCTGTGGATTATGGCCTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 58706 86 + 647215 GATAATTGGAGTATATAATTTTTATTGCAACTAATAAGTAGCATCCAATCTGAGTCCGACACATTATCTGTGGATTATGGTCTCAG - -a -s mr.mrrefChr0 63125 66 + 130230 TGTGTTAAACTTGAACTCACTAGCTTTACTCAAAGGAAGATAGTCAAACAAGATCCTTACACCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 66886 66 + 636262 TGTGTTAAGCTTGAACTCACTAGCTTCACTCAAAGGAGGATAGTCTAACAAGATCCTTACACCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 58795 66 + 647215 TGTGTTGAACTTGAATTCACTAGCTTTACTCAAGGGAAGATAGGCAAACCAGATCCTTACACCCCT - -a -s mr.mrrefChr0 63191 210 + 130230 CCCTTTCACCCCCTACATTATGGCTATGTACTAACCAGGAGATCTGAACCAAAGACAAGGGCAAAAGACCCGGGCCAATGAGTTCTCTGTACAACATTATGTGTCCTTACCTATCTATGTATTCCATTCTTAATGATTTGGCAAGAAACACTGAGTTAAgCCTTCACTCTGTCCCATAGGTGGTGCTGGTAATCAAGTTAACATGTTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 66952 209 + 636262 CCCTTTCACTCTCTACATCATGGGTATGTACTAACCAGGAGATCTGAACCAAAGACAAGAGCTAAGGACCCAGGCCAATGAGTTCTCTGTACAACATTACATATCCCTACCTATCTATGTATCCCATTCTTAATAATTTGGCAAAAAACACTGAGTTCA-CCTTCACTCTGTCCCATAAGTGGTACTGGTAATCAAGTTAACATGTTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 58876 207 + 647215 CCCTTCCATCCCCTACATTATGGCTATGTAGTAACCAGGAGATCTGAACCCAGGAC---GGCATAAGACCTGGTCCAATGAGTTCTCCGTACAACATTATGTGTCCTTAAGCATCTAAGCACTTGATTGCTAATGATTTGGAAAGAAACAGTGAGTTAAGCCTTCACTCTGTCCCATAGGTGGTGCTGGTTTTCAAGTTAACATGTTCTT - -a -s mr.mrrefChr0 63401 145 + 130230 ccttcctcctttgcccaagttaaacaccggatgctgatagaactctcaatcttcaaacagtgccagaaattaatagtaaaaactattctagtctatacccttcaaagtactggtgcttagaaaatgcttatgtaacagagacttc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67163 145 + 636262 CCTTCctcctttgcccaagttaaacaccggatgctggtagaactctcaatcttcaaacagtgccagaaattaatagtaaaaactattctagtctatacccttcaaagtactggtgcttagaaaatgcttatgtaacagagacttc -s simRat_chr6.simRat.chr6 59083 71 + 647215 -----CTCCTTTGCCCAAGTTAAACACCAGGTGCTGACAGAAGTCTCAGTCTtc-aacagtgcaagaaaataatagt-------------------------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 63546 100 + 130230 attgcaaactgcaaggctataaattgggacaacatatatgccgtacttattcatacaaaggaggtgagacttccagttcaacaTGCAATCGATAAGAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67398 100 + 636262 attgcaaactgcaaggctataaattgggacaacatatatgccgtacttattcatacaaaggaggtgagacttccagttcaacaTGCAATCGATAAGAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 59154 100 + 647215 atagcaaaccacaaagctataaattgggacaacatatatgccgtacttattcctacaaaagaggTGAGACTTCCAGTTAAGCAAGAGATCAATAAGAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 63646 131 + 130230 CCCACACTGCACCTCACCCTTTTAGCATTGTACTGAAGAAACTGTGTCATGTCAGGCAATATAGCGCACACCCAAGACTAGCACATTAAACAACACCTGACAAAGTGTACTTTCACATAGTTCATCTTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67498 131 + 636262 CCCACACTGCACCTCACCCTTTTAGCATTGTACTGAAGAAACTGTGTCATGTCAGGCAATATAGCGCACACCCAAGACTAGCACATTAAACAACACCTGACAAAGTGTACTTTCACATAGTTCATCTTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 59260 131 + 647215 CCCACACTGTACCTCACCCTTTTAGTGTTGTACTCGAGAATCCATGTCATGTTAGGCAATATAGCGCACACCTAAGACTCGCACATAAAACAACACCTGAAATAGCGTACTTTCACATAGCTCATCTTAAC - -a -s mr.mrrefChr0 63777 9 + 130230 AAGTGAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67629 9 + 636262 AAGTGAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 59392 9 + 647215 AAGTGAGTA - -a -s mr.mrrefChr0 63786 17 + 130230 CTTCCCAGTCTCCTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67638 17 + 636262 CTTCCCAGTCTCCTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 59404 17 + 647215 CTTCCCAGTCTTCTTAG - -a -s mr.mrrefChr0 63803 32 + 130230 AAAGCACCGACTTGTCTTGAAAGAGAGCTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67655 32 + 636262 AAAGCACCGACTTGTCTTGAAAGAGAGCTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 59446 32 + 647215 AAAGCACCTACTTGTGTTGAAAGAGAGCTGAT - -a -s mr.mrrefChr0 63835 104 + 130230 ACACTAAAGAAGAGCTGGAAAGTCCAGAAGTAAAGCTGGTAAACACTGCATACTGTTAACTTGTAACTTAACACAGTTGACTTTTTAACTCAATCTAAGGGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67693 104 + 636262 ACACTAAAGAAGAGCTGGAAAGTCCAGAAGTAAAGCTGGTAAACACTGCATACTGTTAACTTGTAACTTAACACAGTTGACTTTTTAACTCAATCTAAGGGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 59478 104 + 647215 CCACTAAAGAAGAGCTGGAAAGGCCAGAAATAAACCTGGTAAACACTGCATACTATTGACTTTTAACTTAACACAATTGACATTTTAACACAATTTAAGTGAGC - -a -s mr.mrrefChr0 63939 45 + 130230 TACCAAGCATGAAAGCCATTCTGAAAATGAGGACCATACCTTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67797 45 + 636262 TACCAAGCATGAAAGCCATTCTGAAAATGAGGACCATACCTTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 59583 45 + 647215 AACCAAGTGTGAAGGCCATTTTGAAAATGAGAACTATACCTTTCC - -a -s mr.mrrefChr0 63984 98 + 130230 AATTCAACCTACAGATGGTCCTAATCAAGGCAGAAATGTCGTCAATGAGGAGGAGTATGTAATTGTTGCACATGTGTCTTCAACTTCAGCATGAAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67883 98 + 636262 AATTCAACCTACAGATGGTCCTAATCAAGGCAGAAATGTCGTCAATGAGGAGGAGTATGTAATTGTTGCACATGTGTCTTCAACTTCAGCATGAAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 59628 98 + 647215 AATTCAACCTACAGATGGTCCTAGTTGAGGCAGAAATGTTGTCAATGAGGAGGAGTATCTAATTATTGTACATGTGATTTCAACTTCACCATGAAAGC - -a -s mr.mrrefChr0 64082 19 + 130230 TTAAGAGAGTTATAAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67981 19 + 636262 TTAAGAGAGTTATAAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 59727 19 + 647215 TTAATAGAGTTATAAGAAC - -a -s mr.mrrefChr0 64101 60 + 130230 TTGAGTGATTTGTGTTAAATGCATGTATTAGTTTATGCTTTGAGTCCTAATCTCTGTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68001 60 + 636262 TTGAGTGATTTGTGTTAAATGCATGTATTAGTTTATGCTTTGAGTCCTAATCTCTGTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 59746 60 + 647215 TTGGATGATTTGTTTTAACCACATGTATTAGTTTATGCTTTGACTCCTAATCCCTGTATT - -a -s mr.mrrefChr0 64161 23 + 130230 GAACTTGTTGCCCTGTCTGTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68061 23 + 636262 GAACTTGTTGCCCTGTCTGTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 59808 23 + 647215 GAACTTGTTGCCCTGCCAGTCCA - -a -s mr.mrrefChr0 64184 50 + 130230 ACCATTGACTTCTAACAGATTCCTTGACTTCTAACAGATTCTGAGTTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68093 50 + 636262 ACCATTGACTTCTAACAGATTCCTTGACTTCTAACAGATTCTGAGTTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 59831 50 + 647215 GCTATTGACTGCTAATGGATTCCTTGACTTCTAACGGATTCCAAGTTTGA - -a -s mr.mrrefChr0 64234 84 + 130230 CCAAGGAGACACTCACACTATCTTCTAATCATTTACCTACAAGCACTTGGGGGCATTCAATGTGCTATGGCTGATTGAGGTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68144 84 + 636262 CCAAGGAGACACTCACACTATCTTCTAATCATTTACCTACAAGCACTTGGGGGCATTCAATGTGCTATGGCTGATTGAGGTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 59881 84 + 647215 CCAGGAAGAAGCTCACACTATCTTCTATCCACTTACCTACAACCACTTAGGGACATTCAATGTGCTATGAGTCATAGACAATCT - -a -s mr.mrrefChr0 64318 85 + 130230 CTTTAGATATGTCCCAATGATAGAATCAATTGTGCTTGCTTCCATGCATACAATATATcagcaacaattgacttgaagcaaatga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68228 85 + 636262 CTTTAGATATGTCCCAATGATAGAATCAATTGTGCTTGCTTCCATGCATACAATATATcagcaacaattgacttgaagcaaatga -s simRat_chr6.simRat.chr6 59967 85 + 647215 TTTTGGGTATGTCACAAGGATAGAATCAATTGTGCTTGCTTTCATGCATGCAATAGACCAGCAGCAATTAAGATGAAGCAAAGCA - -a -s mr.mrrefChr0 64403 36 + 130230 tttcctagtaatacaagtggtggcagtcatcaaggg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68313 36 + 636262 tttcctagtaatacaagtggtggcagtcatcaaggg -s simRat_chr6.simRat.chr6 60059 36 + 647215 Tttcataggcatacaagtggtggcagttgccaagga - -a -s mr.mrrefChr0 64439 246 + 130230 ccacaaattaaggatcacaatccttgctgatcttggcattttataatggaagccactaatagttcaaaggttattagatgttcttggggcacactgttgtgaattcatttgtggacctcgaatttacttaagctaatatacagctttagcaggactgccactgagacactgatggccctgttcaccacatgtaaaaaaacctctgtggaattcacctgtaacaggaaaaggggacttgtgatagag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68350 246 + 636262 ccacaaattaaggatcacaatccttgctgatcttggcattttataatggaagccactaatagttcaaaggttattagatgttcttggggcacactgttgtgaattcatttgtggacctcgaatttacttaagctaatatacagctttagcaggactgccactgagacactgatggccctgttcaccacatgtaaaaaaacctctgtggaattcacctgtaacaggaaaaggggacttgtgatagag -s simRat_chr6.simRat.chr6 60095 246 + 647215 ctataaattaaggttcacaacccttgcaattctcgacatttcataatagaagccactaatagttcaaagattattagaagttctcggggcttgatgttgtgaatttatttgtccacctcaaatttactttagcgaagatatagccttagcaggactgctactgaggtaccgatggccccaatcaccacatgtaaaaaaacctccgtggaattcacctctaaccaaaaaaggggacctgtggtaagg - -a -s mr.mrrefChr0 64685 41 + 130230 tgattccgagttaaaaaaattggccagccgaataacattac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68596 41 + 636262 tgattccgagttaaaaaaattggccagccgaataacattac -s simRat_chr6.simRat.chr6 60342 41 + 647215 tgactctgagttaaaaaaattgaccagcaaaataacattac - -a -s mr.mrrefChr0 64726 18 + 130230 gatttcaggtttcacaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68639 18 + 636262 gatttcaggtttcacaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 60383 18 + 647215 gattttaggttccacagt - -a -s mr.mrrefChr0 64744 2 + 130230 tg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68658 2 + 636262 tg -s simRat_chr6.simRat.chr6 60401 2 + 647215 tg - -a -s mr.mrrefChr0 64746 84 + 130230 caaccattgccgaaacaacactccactggtataaacagatcattactatacaatatgcgtataagatagaTCATTCTAGGGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68660 84 + 636262 caaccattgccgaaacaacactccactggtataaacagatcattactatacaatatgcgtataagatagaTCATTCTAGGGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 60409 84 + 647215 caaccattaccgaaacaacactccactggtatataaacatcattactatacaatatgggtataagatggaTCACCCTAGGGATA - -a -s mr.mrrefChr0 64830 35 + 130230 CCCACACCCTTAAGTAATTTGACACCTTAGGGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68745 35 + 636262 CCCACACCCTTAAGTAATTTGACACCTTAGGGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 60493 35 + 647215 CCCACACCCTTAAGGAAATCGACTCCTCAGGGTTT - -a -s mr.mrrefChr0 64865 169 + 130230 AGAAAGCTGTTGTCATGTATACAGCAGCAAGAAGACCACACCTgcttcaggttcaccccattgaaggtaactcatgcatgcaattgtcaattggtattgtccattggtcctccttgtcctgtgacttgagcatattaattttataaccagacacattctacaaccctca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68780 169 + 636262 AGAAAGCTGTTGTCATGTATACAGCAGCAAGAAGACCACACCTgcttcaggttcaccccattgaaggtaactcatgcatgcaattgtcaattggtattgtccattggtcctccttgtcctgtgacttgagcatattaattttataaccagacacattctacaaccctca -s simRat_chr6.simRat.chr6 60529 169 + 647215 ATAAAGCCGTTGTCATGTATACAGCAGCAAGAGGGCCACACCTGCTCGAGATTCACCCCACTGAGTGTgactcatgcatgcaattgtccattggtattgtccattggtcatccttatcttacaacttgagcacattaattttacaaccagatacatttgacaaccctca - -a -s mr.mrrefChr0 65034 47 + 130230 ctgaggaatttgaggaggttactggattcctggatggtataggctta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68949 47 + 636262 ctgaggaatttgaggaggttactggattcctggatggtataggctta -s simRat_chr6.simRat.chr6 60703 47 + 647215 ctgatgaatttgacaaggttactggattcctggatggtataggctca - -a -s mr.mrrefChr0 65081 32 + 130230 tttgggtgtacgataatgtcatctgcaaatcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68997 32 + 636262 tttgggtgtacgataatgtcatctgcaaatcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 60750 32 + 647215 tttgggtgtacaatcctttcatctgcaaatcc - -a -s mr.mrrefChr0 65113 20 + 130230 aaccttaatctcctcttcat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69029 20 + 636262 aaccttaatctcctcttcat -s simRat_chr6.simRat.chr6 60785 20 + 647215 aagattaatctcctcttcat - -a -s mr.mrrefChr0 65133 278 + 130230 gtcacgcatcttgcacctttcccctagcatattgTAACTTAAATTATACGACACCCTATCAGGATACCATACAATGTAGTGTTGTGGCTTGTTTGACATCCTATTTCAATGAGGTCATTCCTGTGTAAGAGAGAAATACTTGAAAGTGTCTGCATAGTTCCTCTAGAACATGCATTTCCCCTCAAGTTGGTACAGGTGCAGCTCAGAACTTGACACTTGGGATAACTGGTTTCTGGAAGGCTTCTACCAGGGTGGATCACAACCCAACAGTAAACGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69052 278 + 636262 gtcacgcatcttgcacctttcccctagcatattgTAACTTAAATTATATGACACCCTATCAGGATACCATACAATGTAGTGTTGTGGCTTGATTGACATCCTATTCCAGTGAGGTCACTTCTGTGTATGAGAGAAATACTTGAAAGTGTCTACATGGTCTCTCTAGGACATGCATTTCCCCCCAAGTTGGTCCAGGTGCAGCTCAGAACTTGACACTTGGGATAGCTAGTTTCTGGAAGGTTTCTACCAAGGTGGAACACGACCCAACAGTAAATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 60805 276 + 647215 gacacacagcttgcaccttttccctagtatattgTAACTTGAATTATACGACACCCCATCAGGATACCACACAATGTAGTATTGTGGC-TGTTTGACCTCCTATTTCAATGAGGTCTTTCCTGTGTAAGAGAGAAATACTTGAAAGTGTCTGCATAGTTCCTCTAGAACA-GCATTTTCCCTCAAGTTGATACAGGAGCAGCTCAGAACTTGACACTTGCGATAACTGGTTTCTGGAAGGCTTCTACCAGGGTGGATCACAACTTAAAAGTAAACGTG - -a -s mr.mrrefChr0 65411 78 + 130230 AAGAGACACAGAGTAGTTTGCATTTGCTCTGAGATGCACCTCCGTTAGCATGAAGAAGTTCAAGCATTCCAGGCATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69334 78 + 636262 AAGAGACACATGGTAGTCCGCATTTGCTCTGACATGCACCTCCGTTAACGTGAAGAAGTTCAAGCATTGCAGGCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 61081 78 + 647215 AGGAGACACCGAGTAGTTTGGTTTTGCTCTGAGATGCACCTCTGTTAGCATGAAGAAGTTCACACATCCCAGGCACAT - -a -s mr.mrrefChr0 65489 83 + 130230 TCATGCTTCACTTCGACTAATTGAAGAAGCCTTGCACAAAAGGAGGGAATGGTATTACTTCATCTATAATCCTTGCTGTTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69412 77 + 636262 TCATGCTTTACTT------ACTGAAGAAGCCTTGCACAAAAGGAAGGAATGGTATTACTTCATCTAGAATCCTTGCTGTTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 61184 82 + 647215 TCATGCTTCACTTCGACTAATTAAAGAAGCTTGGCAC-AAAGGAGGAAATGGTATCAGTTCATCTATGATCCTTGCTGTTATG - -a -s mr.mrrefChr0 65572 11 + 130230 GCCTAAGATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69493 11 + 636262 GCCTAAGATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 61266 11 + 647215 GCCTAAGATTA - -a -s mr.mrrefChr0 65583 71 + 130230 GTACTCAGAAAAATGCCACACTGTTCTGGGCGGACCCCCATAAAAGATATGACCTCTCTTCTTGGAGTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69504 71 + 636262 GTGCTCAGAAAAATGCCCCACTGTTCTGGGCGGACCCCCATAAAAAATATGACCTCTCTTTTTGGAGTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 61278 71 + 647215 GTACTCAGAAAAATGCCACGCTGATATGGGCGGCCCCCCATAAAAGATATGACCTCTCTTCTTGGAGTTGT - -a -s mr.mrrefChr0 65654 244 + 130230 AGAGTGGTGACACTGTCCCCATCCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAATTAAATGAAACACATTTTATGTCAGCGGACTCCAATTTAACTAAGGAGTATAAAAGTGACATTTCTCACACACTTGCCAATGCCCTGCTACAAATTTCCCTATGCAGGTACTCACACCAGTATACTTCTTCTTGCACCTGAAAACAGCTGGATGAATGTACACCCACCACAATAGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69576 243 + 636262 AGAGTGGTGACACTGTCTCCATCCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAATTAAATGAAACACATTTTATGTCAACGGACTCCAGTTTAACTATGGAGTATAAAAGTGACATTTCTCACAC-CTTGCCAATCCCCTGGTACAAAGTTCCCGATGCAGGTACTCACACCAGTATACTTCTTCTTGCACCTGAAAACAGCTGGATGCATGTACACCTACCACAATCGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 61349 229 + 647215 AGAGTGGT---TCTGTCCCCAACCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAT--AAATGCAACACGTCTTATGTCAGCTGACTCCAATTTAACTAAGGA----------GATGTTTTTCACACACTTGCCAATGCCCTGCTACAAATTTCCCTATGCAGGTACTCACACCAGTAGACTTCTTGTTGCGACTAAAAATGGCTAGATGAAACTATACCCACCACAATAGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG - -a -s mr.mrrefChr0 65898 143 + 130230 AGTTGTGTGCAACATTGACTTTAAAGGGATGAACACCTGTTGAAGTCAGCCTGAAAAAAAGTATAAAACAACATTCCTTTGCATGAAATTGCCTATAAAACCAGGAAAAGGCAGCCACATCCTACCCTTACTTAACTGCGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69821 137 + 636262 AGTTGTGTGCAACATTGACTTTAAAGGGATGAACACCCATTGAAGTCAGT------GAAAGTATAAAACAACATTCCTTTGCATGAAATTGCCTATAAAACCAGGAAAAGGCAGCCACATCCTACCCTTACCTAACTGCGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 61578 142 + 647215 AGCTGTGTGCAACATTGACTTTAAAGGGATGAACACCTGTTGAAGTCAGCCTGAAAAAAAGTATAAAACAACATTCCATT-CATGAAATTACCCATAAAACCGGAAAAAGGCAGCCACATCCTACCCTTACTTAACTGCATAC - -a -s mr.mrrefChr0 66041 236 + 130230 TGTTTTAATCTACCTAGCATGGTTATGAATGTTTTAGTCTGTGCAAGTGGAAAGCCCTTCCACTATTGCTTTCTTTAATGGGAACACTGTGAATTGAGCACAAGCCTGCCAGTCCACGGCACTATTGGTGCCTTGTCACTGGTCCAGCTTTTTTCTAAGTTCAAGAACTCTACGCCATCTTAACGCTAGACTCAATTCATGCACAATTGGGTGTAAATGAGTTAGACCATACCCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69958 235 + 636262 TGTTCTAATCCACCTAACATGGTTATGAATGTTTTAGTCTGTGCAAGTGGAAAGCCCTTCCACCATTGCTTTCTTTAAT-GGAACACTGTGCATTGAGCATAAGCCTGCCAGTCCACGACACTATTGGTGCCTTGTCACTGGTCCAGCTTTTTTCTAAGTCCAAGAACTCTACGCCATCTTAACGCTAGATTCGATTCATGCATAGTTGGGTGTAAATGAGTTAGACCATACCCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 61723 208 + 647215 TGTTTTAATCTACCTAGTATGGTTATGAA------------TGCAAGTGAAGAGCCCTTCCACTATTGCTTTTTTTAATGGGAACACTGTGAATTGAGGACAAGTCTGCCAGTACATGGTACTATTGGTGCCTTGTCACTGGTCCAGCTTTTTTCTAAGTTCAAGAACTCTGCGCCATCTTAACCCTAGACTCAATTCATGTGCAATTGGGTGTAAATGA---------------- - -a -s mr.mrrefChr0 66277 267 + 130230 CTGCTGTACTTCAGTTGGTGCAGGAGCATTGTTAACACCGGGATTCAATGTCTGGTGCTCTGCATCTAGGTTCTAGGACCAAGTGAGACACAAGTTTGCAGTTGAAATGTGCAGGAAAGAAAGAAGCACTCACTGTGTGTCATTGTATAGTTCCAAAAACATCAATTTGAACCTGGTCAAATACACAGAGTAGCCACTGTGTCAGGATATTCATCTGGGGTTGGAATGAACTTACTGCGGGTGTGAGTCAGGCCTGTATAATGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70196 266 + 636262 CTGCTGTACATCAGTTAGTGCA-GAGCATTGTTAACACCGGGATTCAATGTCTGGTGCTCAGCATCTAGATTCTAGGACCAAGTGAGTCACAAGTTTGCAGTTGAAATGTGCAGGAAAGAAAGAAGCACTCACTGTGTGTCATTGTACAGTTCCAAAAACATCAATTTGACTCTGGTCAAATACACAGAGTAGCCACTGTGTCAGGATACTCATCTGGGGTTGGAATGAACTTACTGCGGGTGTGAGTCAGGCCTGTATAATGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 61931 261 + 647215 ------TACTTCAGTTGGTGCAGGAGCATTGATAACATCAGCATTCAATGTCTGGTGCTCTGCATCTAGGTTCTAGGACTGAGTGAGACACAAGTTTGCAGTTGAAATGTGAAAGAAAGAAAGGCACACTCACTGTGTGTCATTATATAATTCCGAAAACATCAATTGGAACCTGGTCAAATACACAGAGTAGCCAAGGTGTTGGGATATTCATCAGGGCTTGGATTGAACTTACCGTGAGGGTTAGTAAGGCCTGTATGATGATGA - -a -s mr.mrrefChr0 66544 80 + 130230 CCTTTTCCAAGATGTGAAATTGGGGATTGAGAATGAGTGGCGTGCAAGGATTTTTACTTAGTCTACTGTCATTCAATCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70462 77 + 636262 CCTTTTCCAAGACGTGAAACTGGGGATTGAGAACGAGTGGCGTGCAAGGATTTTTACTTAATCTGCTGTCATTCAAT--- -s simRat_chr6.simRat.chr6 62195 79 + 647215 TCTTTTCCAAGATGTGAAATTGGGGATTGAGAATGAGTGG-GTGCAAGGATTTTTACTTAGTCTACTGTCATCCAACCCT - -a -s mr.mrrefChr0 66624 175 + 130230 AATCCTCATGAACTGTCTGTCAATAATCTGGCATATATTGTCCTGTTGTGAATAGATGGTTATGTGCCCTAACTTAAATCCATCTTAGGATATTTCACCCTCCACTAAGGATAATCATGTTTTACTAAGTCTAATAAAAAGTATATTAGCTCCAACCAGATTTGATGTGATAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70631 169 + 636262 ------CATGAACGGTCTGTCAATAATTTGGCATATATTGTCCTGTTGTGAATAGATGGTTATGTGCCCTAACTTAAATCTATCTTAGGATCTTTCACCCTCCACTAAGGATACTTATGTTTTACTAAGTCTAATGAAAAGTATATTAGCTCCAACCAGATTTGATATGATAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 62276 175 + 647215 AATCCTCAAGAATTGTCTGTCAATAATCTGGCATATATTGTCCCATTGTGAATAGATGGTTATGTGCCCTGATTTAAATCCATCTTAGGATATTTCCCCCTCCACTGAGGATAATCATGTTCTACTAAGTCTAATAGAAAGTATATCAGCTCCAACCAGATTTGATGTGATAAAT - -a -s mr.mrrefChr0 66799 296 + 130230 CATACATAGGTAGAAGGAACTATTCATGTCTAGGGAGGCTCATGATATCAGCTTCCTTGATGTTTATTACCCAGCCCACAAAATCCTTACAAAACTTTGGTCCCATTGGGCAGAACACCCAACTAGATCCAAAGTCTAATGTTCTAATGTGTGTTTCTTAGGGACAAGCCCAATTTGGTCTTCAAGCATTCATGGACTCTATAATGCACCCCTGGACACATGTAAGGTACATAAGCTTTTTAGCTTCTCCTGCTCCTCCCTAACTATGGCAAGTTAAGTTTCACCATATCATGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70801 296 + 636262 CATACATAGGTAGAAGGAACTATTCATGTCTAGGGAGGCTCATGATATCAACTTCCTTGATGTTTATTACCCAGCCCACAAAATCCTTACAAAACTTTGGTCCCATTGGGCAGAACACGCAACTATATCCAAAGTCTAATCTTCTAATGTGTGTTTCTTAGGGACAAGCCCAATTTGGTCTTCAGGCATTCATGGACTCTATAATGCACCCCTGGACACACATAAGGTACATAAGCTTTTAAGCTTTGCCTGCTCCTCCCTAACTATGGCAAGTTAAGTTTCACCATATCATGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 62451 290 + 647215 CATACATAGGTAGAAGGAATTATTCATCTCTGGGGAGGCTCATGATATCAGCTTCCTTGAAATTTATTACCTAGCCCACAAAATCCTTCCAAAACTTTGGTCCCATTGGGCAGAACACCCCACTTGATCTAAATTCTAATGTTCTAATGTATGTTTCTTATGGACAAGCCCCATCTGGCCTTCAAGCACTCGTGGACTCTATAATGCACCCCTGGACACATGGAAGGCACATAAGCTTATTAGCTTCTCCTGCTCCTCCCCAACTAT------TTAAGTATCACCATATCATGCTT - -a -s mr.mrrefChr0 67095 148 + 130230 AATAAGAGTGTAATGTTATTGATGGCATCTCATTTTTGGATGCCCAAGATGATCACAGGGTTCGGCATGACAAAAGTTATTCAATTTTTGCAGGTCTTTCAACTAGTATTGTTCAGCATCTAAAATCCTTTACAGTCTTATCTCCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71097 147 + 636262 AATAAGAGTGTAATGTTATTGATGGCATTTCATTTTTGGAAGCCCAAGATGATCACAGGGAACGGCATGCCAAAAGTTTTTTGATTTATGCAGGTCTTTCAACTAGTATG-TTCAGCATCTAAAATCCCTTACAGTCTTATCTCCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 62743 148 + 647215 AATAAGAGCGTACTGTTATTGATGGCACCTAATCTTTGGATGCCCAGGATGATCATAGGGTTCAACATGACAAAAGTTATTCAATTTTTGCAGGTCTTTCGACTAGTATTGTTCAGCATCTCAAATCCTTGACAGTCTTATCTCCACC - -a -s mr.mrrefChr0 67243 25 + 130230 TGAATCTCTTTGTTTGTTTTTAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71264 25 + 636262 TGAATCTCTTTGTTTGTTTTTAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 62891 25 + 647215 TGAATCTCTTTGTTTGTTTTTAATG - -a -s mr.mrrefChr0 67268 35 + 130230 TGCATATAGGTAGCTGCATTAACTGAGCTATAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71294 35 + 636262 TGCATATAGGTAGCTGCATTAACTGAACTATAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 62916 35 + 647215 TGTATTTAGGTAGCTTCATCAACTGAGCTATAGTC - -a -s mr.mrrefChr0 67303 298 + 130230 ACACACCTCATTCGCGATTCTCCTATTTTTCCTCTGTGATGAGGCTTATATTGCCTTACGAGATGCAAGGGACGAAGACACTTCTGCACCATTGAATTTGTTATCAGGTCTATAATTCTGTGTGCATGAAAGGCAATGGAACTAAGAATTAAACCCCTCATTCTAGGTAACTCCCCCTTACATCAGTGATTCATTATCTGTGCATGCAGATGGATATGCACATAGATTTCCACTCATTGCATACACCTGATTTCTAAGGTGGTATTCCACCTCTTGCCACACCCTTATACAGATTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71329 297 + 636262 ACACACCTCAT-CGCAATCCTCCTATTTTTTCTCTGTCATGAGGCTTATAATGCCTTACGAGATGCAAGGGACGAAGACACTTCTGCACCATTGAATTTGTTATCAGGTCTATAATTCTGTGTGCATGAAAGGCAATGGAACTAAGAATTAAACCCCTCATTCTAGGTATCTACCCCTTACATCAGTGATTCATTATCTGTGCATGCAGATGGATATGCACATAGATTTACACTCATCGCATACACCTGATTTCTAAGGTGGTATTCCACCTCTTGACAGACCCTTATACAGATTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 62952 298 + 647215 GCACACCTCATTCCCGGTTCTCCTATTTTTCCTCTGTGATGAGGCTTATATTCCCTTATGAGACACAATTTACAAAAGGATTTCTGCACCATTGAATATGCTATCAGGCCTATATTTCTGTGTGCATGAAAGGCATTGGAGCTAACAGTTAAACCCCTCATTCTTGATAACTCCCCCTTACATCAGTGATTCATTATCTGTGCATGCAGATGGATATGCACATAGATTTCCACTCATTGCATACTCCTGATTTTTAAGGCGGTATTCCACCGCTTGCCACATCCTTATACAGAGTTCT - -a -s mr.mrrefChr0 67601 174 + 130230 CTTGCCACATCCTTATACAATGTGTGGTTATGTGCACATGTGCCATGGTAATGACATCAATATAGTTGCCCAGTTTTGTTGCAGCCCAATAGGTACATAACTAGAGAATCACTTGGACGTGGAGGATCACCTGGGAATATAAGACTAAGGCACTCAGATTTATAGGATGGCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71626 174 + 636262 CCTGCCACATCCTTATACAATGTGTGGTTATGTGCACATGTGCCATGGTAATGACATCAATATAGCTGCCCAGTTTTGTGGCAGCCCAATAGGTACATAACTGGAGAATCACTTGGACGTGGAGGATCACCTGGGAATATAAGACTAAGGCACTCAGATTTATAGGATGGCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 63267 174 + 647215 CTTGCCACATCCTTATACAATAAGTACTTATGTGCACATGAGCCATGGTAATGTCATCATCATAGTTGCCCAGTTTTGTTGCAGCCCATTAGGTACATAAGTAGAGAATCCCCTGGGAGTGGAGACTTACCTGGGAATCTAAGACTAAGGCACTCAAATTTATACGATGGCTTT - -a -s mr.mrrefChr0 67775 745 + 130230 GTGGGCTGGGGGAGAAGGAGAGTATCATAGGCATGCACAGGGTTCAGGCCATCCAGTGATAGCTTCCCCTAGGAGCAATTTCCAGAAAGCCCCAATAACCAAGTCCACTTCCAGTCTTAGACTTCAAAATAAATGGGCTATGCTTTAGCCCATTTAGTACATCCTGATTGAAGAATCAGCTGGGGGGAATTAGTCCAAGTTAGAACAGAAGTGACAGAAGGGAACATTGTATATGCACCTTTGCAGTTAGATCAAATCATCATATAGGTTCACATATACTCCTGCATGCCCAACCTCTAGGTAACTGTATAAATTAGTTCCATCCATGGAATAACGGCTGCGTAGTGGTTAGTGAAGTGTTGTGCAAGGCTTAGCAGACAGTGCCAGAGTCAAGGTCTGGAAGTTCTGTTTCTGATAATAACAGATATTCAACTTTTAATGCCGTCTTTTTGGGAAAATTAGCAGCTCACTCCACATTCCTCCAGAAGTACCTTGAGGAAACTACATTTGCTGATACATAGACTTCCCCACTGTGCTGTTTAGTAACCAACCAGTACATAACAATGCAATAATGTACCACTCCCTTGGTTAAATCTCTTGACTATCCATTGTCAATTGAAGGACCATGTCTGAGTAACCCAAGTGATAAGTGAACCAAATAAGAAAGTCATGAAAATTAATTATGTTACTATTAAGAGTGGCCAATGGAACCAGCCCATCTCATGCGTTTAAACTATCAAGACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71814 737 + 636262 GTGGGTTGGGGAAGAAGGGGACTATCATAAGCATTCACAGGGTTTAGGTCACCCAGTGATAGCTTCCCCTAAGAGCAATTTCTGGAAAGCCCCAATTACCAAGTCCACTTCCAGTCCTAGACTTCAAAATAAATGGGCTATGCTATAGCCCATTTAGTGCATCCTGGTTGAAAAATCAGATGGGGGGAATTAGTCCAAGTTAGAACAGAAGTGTCAGAAGGGAGCAATGTATATACACCTTTACAGTTAGATCAAAGCATCATATAGGTTCACATATACTCCTGCATGCCCAACCTCTAGGTAACTGTATAAATTAGTTTCATCCATGGAATAACGGCTGCGTAGTGGTTAGTGAAGTGTTGTGCAAGGCTTGGCAGACAGTGCCAGAGTCAAGGTCTGGAAGTTCTGTGTCTGATAATAACAGATACTCCACTTTTAACGCCGTCTTTTTGGGAGAATTAGCAGCTCACTCCACATTGCTCCAGAAGTACCTTCAGGAAACCACATTTGCCAATACATAGAC--CCCCACTGTGCTGTTTAGTAACCAACCAGTACATTACGATGTAATA---TACCACTCCCTTGGTTA--CCTCTTGACTATCCATTACCAATTGAAGGACCATGTTTTAGTAACCCAAGTGATAAGTGAAGCAACTAAGAAAGTCATGAAAATTAATAATGTTACTATCAAGAGTGGCCAATGGA-CCAGCTCATCTCATGCGTTCAAATTATCAAGACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 63441 738 + 647215 GTGCGCTGGGAGAGAAGGAGAGTATCATAGGCATGCACAGGGTTCAGGCCATCCAGTGATAGCTTCCCCTAGGAGAGATTTCCAGAAAGCCCCAATAACCAAGTCCACTTCCCCTCTTAGACTTCAAAATATATGGGCTATACGTTAGCCCATTTAGTACATCCTGATTGAAGAATCAGCTGGGGGGAATTAGTCCAAGTTAATATGGAAGTGACAGAAGGGAACATTGGACATGCACCATTGCAGTTAGATCAAATCATTATACAAGTTCATATACACTCCTGCATACCCAACCTTTAGGTAACTGTATAAGTTAGTTCCGTCCATGAAATAATGGCTGCATAGTGGTTAGTGAAGTGTTGCGT--GTCTTAGCAGACAGTGCCAGAGCCAAGGTCTGGAAGTTCTGTTTCTAATAATAATACATATTCAACTTCTAATGTC-----TTTTGTAAGCTTCGCAGCCCACTCAACATTCCACCAGAAGGACCTTGAGGAAACTACATTTGCTGATACCTAGACTTCCCCACTCTGCTCTTTCGGAACCAACCAGTACATAACAATGCAATAATGTATCACTCCCTTGGGTAAATCTCCTGACTATCCCTTGTCAATTGAAGGACCATGTCTGGGTAACCCAAGCGGTAAGTTAACCAAATAAGAAAGTCATGAAAATTAATTATGCTGCTGTTAAGAGTGTCGGATGGAACCAGCCCATCTCATGCGTATAAACTATCAAGACGC - -a -s mr.mrrefChr0 68520 252 + 130230 CTTGCTTGCTACCTACAATAGTGTGCTCATACTCCAACAAAGAGAGCTTAAGCTCCTATAGCAACTAAGTCCCTATAAAACCATGAGCTGGTGAAGCTAAGTCGTATAACCAGGCTGTTGGCAAAGGTCATCCACTTTGTAATTGACTATCCTTTATGTCTCCCTGTCACAAGTTGGTTGTCATTACAACGATTCCTAGGTTACCTAAATTACTGGTGCAAACGTAGCCCATGTCCAAACATTCAAAGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 72555 252 + 636262 CTTGCTTGCCACCTACAATAGTGTGTTCATACTCCAACAAAGAGAGATTAAGCTCCTATAGCAACTAAATCCATATAAAACCATGAGCTGGAGAAGCTAAGTCGTATAGCCAGACTGTTGGAAAAGGTCATCCACTTTGTAATTGACTATCCTTTATGTCTCCCTGGGACAAGCCAGTTGTCAGTACAATGCTTCCTAGGTTACCTAAATTACTGGTGCAAATGTAGGCCATGTCCAAACATTCAAAGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 64179 252 + 647215 CTTGCTTGCTACCTACAATAGTGTGCTCATACTCCAACAAAGAGAGCTTAAGCTCCTATAGCAACTAAGTCCCCATAAAACCTCTAGCTGGTGAAGCTAAGTTGTATAACCAGGCTGTTGGCAAAGGTCATCCACTTTGTAATTGACTATGCCTTATGACGACCTGTCACAAGTTGGTTGTTATTACTACGATTCCTAGGTTACCTAAATTACTGGTGCAAACATAGCCCATGTCCAAACATCCAAAGCACA - -a -s mr.mrrefChr0 68772 28 + 130230 TTATACTATTAAAAGTATCCCAACACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 72810 28 + 636262 TTATACTATTAAAAGTATACCAACACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 64431 28 + 647215 GTATACTAATCAAAATATCCCAACATAG - -a -s mr.mrrefChr0 68800 209 + 130230 CATCAAATGCAATGTCTATTGTCCACTCCTAATTTCTTCTTACTGCAATGAACATGTACAGCTTTCTGACTGAATGGATCCCTACATGTTACAGTGACCACATTTGACTGTATTGTAAGTTGTCAAACATATACCACTCAGAGAACGGGTTAATTAACCTCATATTAATTTTTATCACCTATCCTTGTCAACTGAGGCTAATAATCGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 72840 209 + 636262 TCTCAAATGCAACGGCTATTGTCCACTCCCAATTTCTTCTTACTGCGATGAACATGTACAGCCTTCTGACTGAATGGACCCCTACATGTTACAGTGACCACATTCGACTGTATTGTAAGTCATCAAACATATACCACTCAGAGAACGGGTTAATTAACCTCATATTAATTTTTATCACCTATCCTTGTCAACTGAGGCTAATAATCGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 64459 209 + 647215 CATAAAATGCAATGTCTATTGTCCAGGCCTAATTTCTTTTTGCTGCAGTGAACATGTACAGCTTTCTGACTGGATGGATCCCTACATGTTATAACGACCACATTTCGTTGTACTGTAAGTTGTCAAACATATACTGCTCAGAGAATGTATTAATTAACCTCATAGTAATTTTTATCACTCGTCGATGTCAACTGAGACTAATGAGCAGT - -a -s mr.mrrefChr0 69009 35 + 130230 GACATACTGCAAGTCAGGATACCAACCTTAGATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73049 35 + 636262 GACATACTGCAAGTCAGGATACCAACCTTAGATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 64669 35 + 647215 GACACACTGCAACTCAGGATACCAACTGTAAATTC - -a -s mr.mrrefChr0 69044 14 + 130230 AAGATTTATTAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73089 11 + 636262 AAGATTTATTA--- -s simRat_chr6.simRat.chr6 64704 14 + 647215 AAGATTTATTAATA - -a -s mr.mrrefChr0 69058 30 + 130230 CAGATGCAGGTGCTACACATACTGAAGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73100 13 + 636262 -----------------CATACTGAAGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 64719 30 + 647215 CAGATGCAGGTGCTACACATCCGGAAGAAC - -a -s mr.mrrefChr0 69088 477 + 130230 CCAGGACTTCCTTTACATATTTCATAGGAATGTGGAGTGAGTTGAATCAATCCTCCAAGCTGCATCCTGACTTACTTAAGAACTGGAAGCAAGTATAATATGTGTAGTCCTATCCAGGCATATATATGGTGAACTAACTGAGATCTGATATTAACCTGAAGTTGTTTTTACCAAACCATTTGTGCAACAGACTTTATAAGGTTTACTTGATTATTCAACATAGGGATACTTTCTTGTTTCTCTGCATGTAAGGAACCCAATACTGCTGACCAACTAGTCTTCCCTGACTGGTAATTTCATGATTGTATATTGGGAAGGGAAGACTAATCATTGCCCTATGTTTCTCTTAGGGGTTGCCTAACATCAAAATCCACCCATCTAAATACACCAGGTCTTTATCTACCTCAAATGAATTTATAAGCAAAGTACTGTGCTCAGGTAATTTCACCCCCCCTCATAGCATCCACTGAGCACAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73113 459 + 636262 CCAGGACTTCCTTTACATATTTCATAGGAACGTGGAGTGAGTTGAATCAATCCTCCAAGC-GCATCCTGACTTTCTTAGGAACTGGAAGC--------------CAGTCCTATCCAGACATATATATGGTGAACTAACTGAGGTCTGATATTAACCTGAAGTTGTTTTTACCAAGCCGTTTGTGCA---GACTTTTTGAGGTTTACTTGATTATTCAACATAGGCATACTTTCTTGTTTCTCTGCACGTAAGGAACCCAATACTGCTGACCAACTAGTCTTACCTCACTGGTAATTTCACGATTGTATATTGGGAAGGGAAGACTAATCAATGCCCTATGCTTCTCTTAGGGGTTGCCTAACATTGAAATCCACCCATCTAAATACACCAGGTCTTTATCTACCTCAAATGAATTTATAAGCAAAGTACTGTGCTCAGGTAATTTCACCCCCCCTCATAGCATCCACTGAGCACAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 64750 469 + 647215 CCAGGGCTTCCTCTGCATATTTCATAGGAATGTGGAGTGAGTTGAATGAATTCTCCAAGCTGCATCCTGACTTACTTAAGAACTGGAAGCAAGTATAATATGTGTAGTCCTATCCAGGCATATATATGATGAACTAACTGAGATCTGATATTAACCTGAAGTTGTCTTTAACCAACCATCTGTGCAACAGACTTTATAAGTTCTATTTGATTATTCAATATGGGGATACTTTCTTGTTTCTTGGCATGTAAGGAACCCAATACCGCTGAGCAACTGGTCTTCCCTGACTGGTAATTTCATGATTGTATATTGGGCTGGGAAGACTATTCATTGCCCTATGTTTCTCTTAGGGGTTGCCTAACATCAAAATTCACCGATCTAAATACACCAGGTCTTTATCTACCTCAAATGAATTTATAAGCAAA--------CTCAGGTAACTTCAACCCCCCTGAGAGCATCCACTGAGTACAGG - -a -s mr.mrrefChr0 69565 33 + 130230 GGAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTACACCGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73572 33 + 636262 GGAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTGAACAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 65232 33 + 647215 GCAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTACCCCGC - -a -s mr.mrrefChr0 69598 266 + 130230 AAAAAGAAGAGATACACCATCTTTGCTTCTAAGGACTGACAGTGTCCCATGTTTTCAATTTCATTGAGTCTTCAATTTCATTGAGTTGAACTTATCTCCTAAGCCCTATTATGGAGATTATACTTTCAAATTGGAGATTTCACTTTTAAAATGATTGATCAGATCCATAGTTATGACCATATAGTCACATACCTAAACAGAAAGAGCTGTTCAAGAAGTGTGTATGTTTCCTCTCTGAGCGTCACTAATGTTTTAAAGCCTGGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562255 234 - 636262 AAAAAGAAGACATACACCATCTTTGCTTCT-AGGACTGAGAGTGTCCCA-------------------TTTTCAATTTCATTGAGTTGAACTTATGTCCTAA--CCTATTATGGAGATTATACTTTCAAATTGGAGATTTTACTTTTAAAATGATTAATCAGATCCATAGTTATGACCATATAGTCAGATATCTAAATAAAAAGAGCTGTTCAAGAAGTGTGTGTGTTTCCTCTCTG----------ATGTTTTAAAGCCTGGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 65265 264 + 647215 AAAAAGAAGAGATACACCAT-TTCGCTGCTAAGGACTGACAGTGTCCTATGTTTTCAATTTCATTGAGTCTTCAGTTTCATTGAGTTGTAACTATCTCCTAAGCCCTATTATGGAGAGTATACTTTCAAATTGGAGATTTCACTTTTAAAATGATTGAACAGAT-CATAGTGATGACCAGATAGTCACATACCTAAACAGAGAGAGCTGTTCACGAAGTGTGTATGTTTCCTCGCTGAGCGTCACTAATGTTTTAAAGCCTGGTAT - -a -s mr.mrrefChr0 69864 44 + 130230 AATGAATCTTGCCATGATCGACATAAGCATTCTAAAGCATGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562491 44 - 636262 AATGAATCTTGCCATGATCGACATAAGCATTCTAAAGCATGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 65529 44 + 647215 AATGAATCTTTCCATAATTGACACAACCATCTTAAAGAATGGTA - -a -s mr.mrrefChr0 69908 96 + 130230 CAATAAATATTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATATCTAGTGGTTGTGATAACAGTCCAGGGGGAGGCACCCATCTACTTTATCTAACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562535 96 - 636262 CAATAAATGTTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATACCTAGTGGTTGTGATAACAGTCCAGGGGGAGGCATCCATCTACTTTATCTAACATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 65581 96 + 647215 TAATAAATATTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATATCTAGTGGTTGTGAGGACACTCAAGGGAGATGCACCCATCTACTTTATCTAGCATT - -a -s mr.mrrefChr0 70004 23 + 130230 TATTTGGTAAGACTCCAGGCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74007 10 + 636262 T-TTGGGTA----AC-------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 65677 23 + 647215 TATTTGGTAAGACTCCAGGCTTA - -a -s mr.mrrefChr0 70027 308 + 130230 CATGCCGTTCAAGTAACCTTACCAGATTTCACAATGATGTTTGAGAGTCAGCTGTTGTAGAGCTTGTCTCATTTATAGCAGATGATCAAGTTGTTTATAGCAGATGATCAAGTGCAAAAGATAGTTATAGGGCCATTATTGGGAGCTACTGCATCTGAATTTTTGAACGTCAACACCATTTGCCAGAGTGATGAGTGCCAAAGAGGAGCAAACCCTTGATATAAGATAGTCTATCAAATCTTTTCTGGACAACTAGATTTTTTCACAATATGCACGATGACAAACCTTTTCTAGTCAAGATTCAAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74017 295 + 636262 -------------TAACCCTACCAGATTACACAATGACGTATGGGAATCAGCTATTGTAGAGCTTGTCCCTTTTATAGCAGATGATCAAGTCCTTTATAGCAGATGATCAAGTCCAAGAGATAGCTATAGGGCCATTATTGGGAGCTACTGCATCTGAATTTTTGAACTTCAACACCATCTGCCACAGTGATGAGTGCCAAAGAGAAGCAAACCCTTGATATAAGATAGTCTATCAAATCTTTTCTGGACAACTGCATTTTTTCACAACATGCACGATGACAGACCTTTTCTGGTCAAGATTCAGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 65706 289 + 647215 CATGCCGTTCAAGTAACCTTACCAGACCTCACAATGATGTTTGAGAGTCAGCTGTTGTGGTGCTTGTCTCATTTATAGCAGATGATCAAGTTGT-----------------GTGCAAAAGATAGTTATAGGGCCATTATTAGGAGCTACTGCATCTGAATT--TGTACGTCAACACCATTTGCCAGAGTAATGAGTCCCAAAGAGGAGCAAACTCTTGGTATAAAATGGTCTATCGAATCTTGTCTGGACAACTAGATTCTTTCACAATATGCATGATGGCAAACCTTTTCTAGCCAAGATTCAAAGT - -a -s mr.mrrefChr0 70335 177 + 130230 ATACTGGCTCTGGTAAAAGGAGGCTCTTGCCATGCCAAGGAAAAGAAATGTACACATTAACTGTTAACCATTTACAAACACTGACCTAAATTAAATAATGAATGACTGCAGGGTACCATGGATTCAGTGAATCATGCCTGCCCATGGGTAGTGTTAGTATTTCCTTGCTGAAGCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74316 177 + 636262 ATACTGGCTCTGCTAAAAGGACGCTCTTGCCATGCCAAGGAAAAGAAATGTACACATTAACTGTTAACCATTTACAACCACTGACCTAAATTAACTAATGCATGACTGCAGGGTACCCTGGATTCAGTGAATCATGCCTGTCCATGGTTAGTGTTAATATTGCCTTTCTGAAGCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 65995 177 + 647215 ATACTGGCTCTGGTGAAAGGAGGCTCTTGCCATGCCAAAAGGAAGAAATGTAAGCATTAACTGTTAACCATTTACAAACGGTAACCTAAATTAAATAATCAGTGACTGCAGGGTACTATAGATTCAGTGAATCTTGCCTGCCCATGGGTATTGTTAGTATTTCCCTGCTGAAGCAAT - -a -s mr.mrrefChr0 70512 1 + 130230 T -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74495 1 + 636262 T -s simRat_chr6.simRat.chr6 66172 1 + 647215 T - -a -s mr.mrrefChr0 70513 5 + 130230 TGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74496 5 + 636262 TCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 66179 5 + 647215 TGTAT - -a -s mr.mrrefChr0 70518 113 + 130230 ATATCCTGACACCTGCTAAGGTGGAGGTGCCCAGGTGGCTAACTTGGCCTATTCCTCTGATTGGGAATGTGCCACTGATTCATGTTTGAGGTCTACATCCAAGCATGTCATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74501 109 + 636262 ATATCCACACACC----AAGGTTAGGGTGCCCAGGTGGCTAACTTGGCCTGTTCCTCTGATTGGGAATGTGCTACTGATACATGTTTGAGGTCTACATCCAAGCATGTCTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 66187 113 + 647215 ATAGCGTGAAACCTGCTAAGGTGGAAGTGCCCAAGTGGCTAACTTGGCCTATTCCTCTGATTGAGAATGTGCCACTGATTCATGTTTGAGGCCTACTTCCAAGCATTTCATAG - -a -s mr.mrrefChr0 70631 36 + 130230 AGCAGGCCCTTGCTTGAAATAGCCTGTGTTGCCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74844 29 + 636262 AGTTGGCCTTTGCTTGA-------TGTGCTTACTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 66300 36 + 647215 AGCAGGTCCTCGCTTGAAATAGCCTGAATTGCCCCC - -a -s mr.mrrefChr0 70667 7 + 130230 TGAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74873 2 + 636262 TG----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 66338 7 + 647215 TGAAACA - -a -s mr.mrrefChr0 70674 21 + 130230 GATGAGCTCATGCAAGTTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74875 20 + 636262 -ATAGGCCCCTGCAAGTTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 66359 21 + 647215 GATGAGCTCAGGCAAGTTGTT - -a -s mr.mrrefChr0 70695 279 + 130230 CAATGCAAAGTAGGATTCTTATTTCTCCTATTGCCAGCAGCCTCCCAGGTGTCTGGCCTAGTTAGGGATATTTATGGGGATGGGTTCACCTGAAAATTTGTAGCCCAAGCACTGCATACACCTCCTTCTAGACCCATAAACTCACCATTAACCCTACCCCCCAAATTGGTTCAGTTGCTCAACCGAACTCAGCTGAACTACAAAAGGTTAAAGCTGATTGAATGATGATAACCTGTGGGTGAGTCCTTTCTTGTTATTCCTCTCTATTTTGATTACAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74895 279 + 636262 CAATGCAAAGTAGGATTCTTACTTCTCCTATTGCCAGCAGCCACCCAGGCGTGTGGCCTAGTTAGGGATACTTTTGGGGATGGGTTCACCTGAAAATTTGTAGCCCAAGCTTTGCATACACCCCCTTCTAGACCCATAAACTCGCCATTACCCCTACCCCCCAAGTTGGTTTGGTTGCTCAACCAAACCCAGCTGAACTACAAAAGGCTAAAGCTGCTTGAATGATGATGACCTGTGGGTGAGTCCTTTCATGTTATTCCTCTCTATTTTGATTACAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 66400 279 + 647215 CAATGCAGTGTAGGATTCTTATTTTGCCTATTGCCATGAGTCTCCCAGGTGTCTGGCCCCAGTAGGGATATTTATGGGGATGGGGTCACCTGAGAATTTGTAGCCCAAGCACTGCATACACCTCCTTCTAGAGCCATGAACTCACCATTAACCCTACCCCCCAAATTGGTTCAGTTGCTTAACCGAACTCAGCTGAACTACAAATGGTTAAAGTTGATTGAATGATGATAACCTGTGAGTGAGTCCTTTCTTGTTATTCCTCCGTATTTTGATTACAGC - -a -s mr.mrrefChr0 70974 13 + 130230 CAAGGTTCTTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75182 13 + 636262 CAAGGGTCTTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 66679 13 + 647215 CAACGTTTTTTTG - -a -s mr.mrrefChr0 70987 44 + 130230 ACAGCTTTTCAGTAGGAAGCAAGCGCCAAAAAAAACAACTTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75195 44 + 636262 ATAGCTTTTCAGTAGGAAGCAAACGCCAGAAAAAACAACTTGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 66693 44 + 647215 ACAGATTTACGATAGGAAGCAAGCACCAAAAAAATCAACTTGTC - -a -s mr.mrrefChr0 71031 15 + 130230 AAGATGGAGTTTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75239 15 + 636262 AAGATGGAGTTTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 66977 15 + 647215 AGGATGGAGCTTTCC - -a -s mr.mrrefChr0 71046 14 + 130230 GTGGCAGGGGATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75254 14 + 636262 GTGGCAGGGGATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 66994 14 + 647215 GTGGCACAGGAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 71060 268 + 130230 AAAGGGAGGGGTATTTAAGTTTGAACCTGTTTAGGAACCTTTAAGTGGATGAACTTAGTGCTGGGGATTTTCACATAATTTGTTCCCCCATCTGTTGCTATAATTGGTATATCATCAACCACTAGGGAGAGCCTGCTGAAACTTGCAAGTGCATCTCCACCATACTCAATCATTCTTGCCATATAGCAACATGTGATCATTTTGCTGAATGATTTGCTGCCAGCTTGGTTATAAACCTCTAAGAATAATCATCATTGTCTCGCATATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75272 268 + 636262 AAAGGGGGGGGTATTTAGGTTTGAACCTGTTGAGGAATTTTTAAGTGGATGAACTTAGTGCTGGGAATTTTCACATCATTTGTTCCCCCATCTGTTGCTATAATTGGTATATGATCAACCACTAGGGAGAGCCTGCTGAAACTTGCAAGTGCATCTCCACCATACTCAATCATTCTTGCCACATCACATCATGTGATCATGTTGCTGAATAATTTGCTGCCAGTTTGGTTATAAGCCTCTAAGAAAAATCATCATTGTCTCGCATATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 67008 267 + 647215 AAAGGGAAGGGTATTTAAGTTTGAACCTGTTTAGGAACCTTTAAGTGGTTGAACTTAGTGCTGGGGATTTTCACATAATTTGTGCCCCCATCTGTTGCTACAATTGGTATATCATCAACCACTAGGGAGAGCCTACTCTAAGTCGCAGGTGCATCTCCACTATAGTCAGTCATTCTTGGCATATAGCAACATGTGATCATTTTACTGAACGATTTGCTGCCAGCTTTGTTATAAACCT-TAAAAATAATCATCATTGTCTCATGTATC - -a -s mr.mrrefChr0 71328 119 + 130230 TATTGAAGCCTAGTTTTGTATAGATTATTTGTGTGTAGCTGGCTGGAAAAGTGCTCATGACGAAAGAGATATAGAGACTATGTTGTGACTCCTTTGTCAGCTCCAAAACATTATTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75541 119 + 636262 TTTTGAAGCCTAGTTTTGTATAGATTATTTGTGTGTAGCTGGTTGCAAAAGTGCTCATGACGAAGGAGATATAGAGACTATGTAGTGACTCCTTTGTCAGCTCCAAAACATTATGTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67275 119 + 647215 CATTGAAGCTTGGTTTCTTATAGATTATTTGTGTGTAGTTGGCTGGAAAAGTGCCCATGACACAAGAGATATAGAGACTTTGTTGTGACTCCTTTGTCAGCTCTAAAACATTATTTGAT - -a -s mr.mrrefChr0 71447 29 + 130230 GATCTGCAATGACTTGCTTACCTCTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75660 29 + 636262 GATCTGCAATGACTTGCTTACCTCTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67427 29 + 647215 GATCTGCAATGACTAGCTTACTTTTGAAT - -a -s mr.mrrefChr0 71476 139 + 130230 TATCAAGACATGGATCAAAGGGGATGAGTGTCCCTTACAGGGCTGTATGAGGCTCTTTTACTCTGGAGAGAATCCCCTCATTATCTGACCAAAATTGGGACATTTGGCTATATTGAGGGACACAATAATCTTGGTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75689 139 + 636262 TATCAAGACATGGATCAAAGGGGACGAGTGTCCCTTACAGGGCTGTATGAGGCTCTCTTACTCTGGAGAGAATCCCCTCATTATCTGACCAAAATTGGGACATTTGGCTATATTGAGGGACACAATAATCTTGGTTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67460 138 + 647215 TATTAAGACACGGATCAAAGGGGATGGGTGTCCCTTACACAGATGTATTAAGCTGTTTTACTCTGGAG-GAATCCCCTCATTATCTGGCCAAAATTGGTACATGTGGCTATATTGTGGCACACAATAATCTTGGTTGAT - -a -s mr.mrrefChr0 71615 43 + 130230 GGGCTTATATACATCAATTATGGAATGATTGTGCTGCTGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75828 43 + 636262 GGGCTTAAATACATCAATTATGGAATGATTGTACTGCTGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67761 43 + 647215 GGGCTTATATACATCAATTATGGAATGATTGTGTTGCTGATGT - -a -s mr.mrrefChr0 71658 72 + 130230 TGAGTTTCCCTACAATTAGGGAGCAGGATTACTGAAATGTAGCAGTGCATAAGGCCAACAATTCACAGAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75878 72 + 636262 TGAGTTTCCCTACAATTAGGGAGCAGGATTACTGAAATGTAACAGTGCATAAAGCCAACAATTCACAGAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 67804 72 + 647215 GGAGTTTCCCCACAATTAGGAAGCAGGACTACTGAAATGTAGCAGTGTATAAGGTCAACAATCCCCAGAGAG - -a -s mr.mrrefChr0 71730 116 + 130230 AAAATCCTGTCTCCTAGAACAACAGTAACATTGAGCGTTGCAAATCAAGACAGATGTAAATCAACTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGAAGAACCACAAAGATCCAAGAGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75950 116 + 636262 AAAATCCTGTCTCCTAGAACAACAGTAATATTGACCGTTGCAAATAGAGATAGATGTAAATCTTCTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGAAGAACCACAAAGATCCAAGAGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67884 116 + 647215 AAAATCCTGTCCCCTAGAACATCAGTAACATTGAGCATTGCAAAGCAAGACAGATGTAAATCAACTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGATGAACCATAAAGATCAAAGAGGCT - -a -s mr.mrrefChr0 71846 162 + 130230 TTCCCATACTGCCAAAATTATTGATTCCCTTCCTGGTCTCCTGGCAGGGGAGGGATTGAATCTTGCACTGAACAGTTTACAGACCTTTACACTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGAGAAAAGATGAAAGATGGATAGCACAACCGAGTTCTCCTGATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76066 161 + 636262 TTCCCATACTGCCAAAATTATTTATTCCCCTCCTGGTCCCCTGGCAGGGGAGGGATTGA-TCTTGCACTGAACAGTCTGCAGACCTTTACTCTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGAGAAAAGATGAAAGATGGATTGCACAACCGAATTCTCCTGATACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 68001 162 + 647215 TTACTATACTGCCAAAATTAATGATTCCCTTCCTGGTCTTCTGGCAGGGGAGGGGTTGAATCTTGCACTCAACTGTTGATGGACCTTTACACTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGTGAAAAGATGAAAGATGAATAGCACAACCGAGTTCTCCTGATAGC - -a -s mr.mrrefChr0 72008 17 + 130230 TGGCATATCTAGGGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76227 17 + 636262 TGGCATATCTAGGGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 68172 17 + 647215 TGCAAACTGCAGGGTGG - -a -s mr.mrrefChr0 72025 4 + 130230 TATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76244 4 + 636262 CTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 68249 4 + 647215 TACA - -a -s mr.mrrefChr0 72029 15 + 130230 GCTCTAATCCAAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76248 15 + 636262 GGTCCAATCCTAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 68257 15 + 647215 GCGATAATTCAAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 72044 7 + 130230 GGCAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 68286 7 + 647215 GGCAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 184505 7 + 647215 GGCTACC - -a -s mr.mrrefChr0 72051 174 + 130230 TGACATGAGGAACCAATGACTACTTCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAAACACCATGGACCCAGGAAGATTTTGGCCACTATGAACCCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76263 174 + 636262 TGACATGAGGAACCAATGACTACTTCTGAGAGACTGTTAAATGCAGCTGGTCAGTTTGACAGCCACACTATTTAATGGGCACACCCTAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTTAAACTTTAGGGAGATGTCAAACACCATGAACCCTGGAGGATTTTAGTCACTATGAACCCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 68334 172 + 647215 TGACATGAGGAATTGATGAC--CTTCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTTCTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAAACACGATGGACCCAGGAAGATTTTGGCCACTATGAACCCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 184512 155 + 647215 -----------------TGC--GTCCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAGACACTATGGGCCCAGGAAGATTTTGACCACTACGAACCCATA - -a -s mr.mrrefChr0 72225 59 + 130230 GGTAGGCACCCTATCAGTCTAGGAGGCAAGTCCTTCTGCCCTTTGCAGTTGTGCTTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76437 59 + 636262 GGTAGGCACCATATCAGTCTAGGAGGCAAGTCCTTCTGCCCTTTGCAGTTGTGCTTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 68506 59 + 647215 GGTAGGCAGCCTATAAGTTTAAGAGGCAAGTCCTTCTGCCCTTTGCAGTTGTATTTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 184668 10 + 647215 GGTAGGCACC------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 72284 39 + 130230 CATAAGCAAGAAACACCAATTCTCATGAATCAATGCTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76496 39 + 636262 CACAAGCAAGAAACACCAATTCTCATGGATCAATGCTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 68566 39 + 647215 CATAAGAAAGAAACACCAATTATTGTGAATCAATGCTCC - -a -s mr.mrrefChr0 72323 85 + 130230 TCCTAAGAAGAACTGGCAGCAAACCCGATGCCCCTCCCCCAAAGATGACAAGCTGTGGGCCTGGGAATGATACTAACAGGCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76535 78 + 636262 TCCTAAGAAGAACTGGCAGCAAACCAGATGCCCCTCCCCCAAAGATGACAAGCTGTGGGTCTGGGAATGATACTAACC------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 68609 79 + 647215 TTCAGAGGAGAACTGGCAGCAAACCCGATGCCC------CAAAGATGACAAGCTGCAGGCCTGGGAATGATACTAACAGGCCAAA - -a -s mr.mrrefChr0 72408 490 + 130230 TTCATCAGGCCAAAAAGATATGCTCCTACAAACTAGACATAGTGTCCCATGGTAATCAAACATATCACAGTCCTGCTGATCCTCTTTAACATGAGCTGCTTATAATAATCCGTACCATTGTAGAACATCTCTCCCTTTGTTCCACAAAACTCTGCTATTTGCTATTTCTACAAATGTGTGGTGTTATTCACTTAGCATCAAGGCAAAGCTGAAAGTGGGGTATGATGGGTCACTGCCAACAATGCCTATACACATCTGTGTAGAATCTAGCTAATATGCCCACCTAATACAGAGATGGTCATTGTCCCTCATACTCAAACCCACCAAAGCTGAATTACTGCAAGTTAGCTATAAATATGTATGAATTAACTGGTCAGAACACCAAGTCTAGCCAACTTATATAGGTCACAAGTGGACCAAAGACGCAGGATGTAAGACTGGTGGGGGGACCCCTAGTAGGTACCATTGTGGATCTATGGTAAATTAATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76613 476 + 636262 -------------AAAGATATGCTCCTAGAAACTAGACAGAGTGTCCCATTGTAATTGAACATATTACAGTCCTGCTAATCCTCTTTAACATGACCTGCTTGTCATAATCTGTCCCATTGTAGAACATTTCTCCCTTTGTTCCACAAAACTGTGCTATTTGCTATTTCTACAAATGTGTGGTGTTATTCACTTAGCATCAAGGCAAAGCTGAAAGCGGGGCATGATGGGCCACTGCCAACAATGCTTATACACATCTGTGTAGAATCTAGCTAATATGCCCACCTAATACAGAGATGGTCATTGTCCCTCGTACTCAAACCCATCAAAGCTGGATTACTGCAAGTTAGCTGTAAATATGTATGAATACACTCATCAG-ACACCAAGTCTAGCCAACTTATATAGGTCACAAGTGGACCAAAGACGCAGGATGTAAGACTGGTGGGGGGACCCCTAGTAGGTACCATTGTGGATCTATGGTAAATTAATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 68689 490 + 647215 TTCATCAGGCCAAAAAGATATGCTCCTACAAACTTGACATAGTTTCCCATGGGAATCAAACATATCACAGCCCTTCTGATCCTCTTTGACATGAGCTGCTTATAGTAGTCCGTACCATAGTAGAACATCTCTCACTCTGTTCCACAAAACTCTGCAATTTGCTAGTTCTACAAATGTGTGGTGTTATTTACTCAGTACCGACACGAAGCTGAAAGTGGGGTATGATGAGTCATTGCCAAGAATACCTACACACATCTGTGTAGAATCTAGCTAGCATGTCCACCCAAGACAGAGATGGTCATTGTCCCTCATACTCAAACCAACCAAGGCTGAAGTCCTGCAAGTTAGCTATAAATATGTATTAATTAACTGGTCAGAACACCAAATCTAGTAGCCTTAAATAGGTCACAAATGGACCATACACACAGGATGTCAGACTGATTGGGGGACTCCTAGTAGGTACCATTGTGGACTTATAGTTAATTAATTC - -a -s mr.mrrefChr0 72898 129 + 130230 TTTATGACAGAGATGTGTACTTGTTCACTTCCCCATCATCTCTTACCTAGGATCACTCTGCCCATTTGTCAGCCACACTGTTTACCATCCATGGGCGGTTCTCTTTCCTCTGCGTTATGGGATGGCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77090 129 + 636262 TTTATGACAGAGATGTGTACTTGTTCACTTCCCCATCATCTCTTACCTAGGATCACTCTGCCCATTTGTCAGCCACACTGTTTACCATCCATGGGCGGTTCTCTTTCCTCTGCGTTATGGGATGGCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 69179 129 + 647215 TTCATGACAGAGATGTATACCTGTTCACATCCCCATCATCTCTTGCCTAGCATCTGTCTGCCCATGTGTCAGCCACCCTGTTTACCATCCATGGGAGGTTCTCTTTCTTCTGTGTCTCGGATAGGACCT - -a -s mr.mrrefChr0 73027 33 + 130230 TGGTACCATGGAGCTGATGCTTCTCACACAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77219 33 + 636262 TGGTACCATGGAGCTGATGCTTCTCACACAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 69558 33 + 647215 TGGTACCATGAAGCTGATGATTATCACACAGAG - -a -s mr.mrrefChr0 73060 209 + 130230 TTTGAATCATCTATGAGTTCAACTAATGAAATAACACCTAGTGACAACTGCCCAGCATATCTGTACCACAGTACACTCCAGGTTCATAGGCCTCCATTTCTAGATACTAGAATAATTATGTGaggattgagacttgaggttgatcttattgttcggtgtagttcacatcacacctccagttcagtttcattgctcagatctcaggtccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77254 209 + 636262 TTTGAATCATCTATGAGTTCAACTAATGAAATAACACCTAGTGACAACTGCCCAGCATATCTGTACCACAGTACACTCCAGGTTCATAGGCCTCCATTTCTAGATACTAGAATAATTATGTGaggattgagacttgaggttgatcttattgttcggtgtagttcacatcacacctccagttcagtttcattgctcagatctcaggtccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 69591 209 + 647215 TTTGAATCATGTATGAGTTCAACTAATGGAATAATACCTAGTGACAATTGCCCAGCATATTTGTACCACAGCACACTCCAGGTTCATATGTCTCCATTTCCACATATTAAAACAGTTATGTGaggattgagactccaggttgatctacttgcttggtgtagttcacataacacctccagtttagtttcgtggctcagatctcaggtcCC - -a -s mr.mrrefChr0 73269 169 + 130230 ccagactgaaggctgcttggatatcaagaaggaagtttggagttgttacaaaatacccttgtagtgtctcatcttcaagacttaatatacaccaaatagaagacttttacggtatgagcactggggggtgggcaaacagcttcaggatcgccaccccaaccaagtgcca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77463 169 + 636262 ccagactgaaggctgcttggatatcaagaaggaagtttggagttgttacaaaatacccttgtagtgtctcatcttcaagacttaatatacaccaaatagaagacttttacggtatgagcactggggggtgggcaaacagcttcaggatcgccaccccaaccaagtgcca -s simRat_chr6.simRat.chr6 69804 169 + 647215 CCGGACTGAAGGCTGCTGGGATATCAAGAAGGATGTTCAGAGTTGTTACAAAATACCCGTGCAGTGTCTCAGCTTTAAGACTTAACATACACCAAATAAaagacttttatggtatgagcagtgaggagtgggcaaacaccttcaggattgccacaccatctaagtgcta - -a -s mr.mrrefChr0 73438 43 + 130230 gcattctttaagtagactgactatagacagaatgcagtggtgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77632 43 + 636262 gcattctttaagtagactgactatagacagaatgcagtggtgt -s simRat_chr6.simRat.chr6 69975 43 + 647215 gtattctttaagtagactgattatagacaagatgcagtgatgt - -a -s mr.mrrefChr0 73481 31 + 130230 aacttcacaaacacaaTGTCCCCTCCAAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77675 31 + 636262 aacttcacaaacacaaTGTCCCCTCCAAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 70024 31 + 647215 aacttcacaaacacgaTGTCCCCTCCAAGTC - -a -s mr.mrrefChr0 73512 19 + 130230 TGGAAAGTTGCTTGAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77751 19 + 636262 TGGAAAGTTGCTTGAATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 70055 19 + 647215 TGGAAAGTTAGTTGAATCA - -a -s mr.mrrefChr0 73531 108 + 130230 CCTGCTTGGTTCTCAAATAGTACTGTAAGGTTGCCTGCTATTATTCGGTCTTACAATGCTGTGGAATTGTTACCCTACTGGGGATTGCTTTTTTAGATTCTATTGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77770 108 + 636262 CCTGCTTGGTTCTCAAATAGTACTGTAAGGTTGCCTGCTATTATTCGGTCTTACAATGCTGTGGAATTGTTACCCTACTGGGGATTGCTTTTTTAGATTCTATTGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 70075 108 + 647215 CCAGTATGATTCTAAAACAGTAATGTAAGGGTGCCTTCTACTATTTTGTTCTACAATGCTATGGAATTGCTACCCTAGTGGGGATTGCTTTTTTAAGTTCTCAGGCTA - -a -s mr.mrrefChr0 73639 29 + 130230 TAATATTACAACATCAGGTGTTGGAAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77879 29 + 636262 TAATATTACAACATCAGGTGTTGGAAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 70183 29 + 647215 CAATATTACAACCTCAGGTGTTGGAAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 73668 18 + 130230 AAAGGGTGAGGTGACGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77914 18 + 636262 AAAGGGTGAGGTGACGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 70212 18 + 647215 AAAGGGTGAGATGATGGG - -a -s mr.mrrefChr0 73686 72 + 130230 TGGACTAGTTCCAGGAAATCCCCTTTCTGTGTGTGTGTGGCATGCTGATTGACTGCTTTTTTCTGTCTGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77932 72 + 636262 TGGACTAGTTCCAGGAAATCCCCTTTCTGTGTGTGTGTGGCATGCTGATTGACTGCTTTTTTCTGTCTGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 70231 72 + 647215 TGAACTGGTTCCAGGAATCCCACTTTATGTGTGTGTGGGCCCTGCTGGTTGACTGCTCTTTTCTATCTGTAT - -a -s mr.mrrefChr0 73758 41 + 130230 CTAGATACCTATGTATCAGATTTTATGCACTATCAGCATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78004 41 + 636262 CTAGATACCTATGTATCAGATTTTATGCACTATCAGCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 70349 41 + 647215 CTAGATATCTATGTATCAGATTTGATGCACCCTCACAATAC - -a -s mr.mrrefChr0 73799 20 + 130230 TCTATGCACTATCAGCAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78045 20 + 636262 TCTATGCACTATCAGCAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 70391 20 + 647215 TCTACCCAATGACAGTAAGC - -a -s mr.mrrefChr0 73819 135 + 130230 CATCTACCCAATGATAATAAATAAGCTGCAACAGGCAGGAAGGTGGCCTGTCCAAATAACAAATAAGCCTTCACACAATCCATCATGCTCAGCTCCAATATAAGGCAGATGTGGCCATGTACATGTGGTAGGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78065 135 + 636262 CATCTACCCAATGATAATAAATAAGCTGCAACAGGCAGGAAGGTGGCCTGTCCAAATAACAAATAAGCCTTCACACAATCCATCATGCTCAGCTCCAATATAAGGCAGATGTGGCCATGTACATGTGGTAGGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 70415 135 + 647215 CATCTACCCAATGACAATAAATAAACTGCAACAGGCCGGAAGGTGGCCTGTCTAAATAACAAGCAAGCTTTCACACAATGCATCATGCCAAGCTCCATTACAAGGCAAACATGGTCATGTACATGTGGTAAGTAC - -a -s mr.mrrefChr0 73954 62 + 130230 TCGGCTCTGAGCTCCTCAGGTGGCCAATCACCATCTAGCTTCAGTGCAAATTCTAGTTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78201 62 + 636262 TCGGCTCTGAGCTCCTCAGGTGGCCAATCACCATCTAGCTTCAGTGCAAATTCTAGTTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 70550 62 + 647215 TTGGCTCTGAGCCCCTCAGGTGGCCAATCACCATCTAGCTTCAGGGCAAATTCTAGCTAAGT - -a -s mr.mrrefChr0 74016 79 + 130230 GATAGCACCCCCCATTTGGATCCAGGGACTAGTGGGCAGTTAATCTTTTGCTCTAGCCCATGCGTATCAATAATTAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78294 79 + 636262 GATAGCACCCCCCATTTGGATCCAGGGACTAGTGGGCAGTTAATCTTTTGCTCTAGCCCATGCGTATCAATAATTAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 70612 79 + 647215 TATAGCACCCCCCATTTGGATCCAGGCACAAAAGGGGAGTTTGTCTCTTGCTCTAGCCCATGTGTATCGAAAATTGGAA - -a -s mr.mrrefChr0 74095 40 + 130230 TGCTTCCATGGGCATCACAAATTATAAGACAAGTAGTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78432 40 + 636262 CACTCCCATGGGCATCACAAATTATAAGACAAGTAATAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 70691 40 + 647215 TGCTTCCATGGGCATCACAGATTAGAAGACAAGTAGTAGA - -a -s mr.mrrefChr0 74135 41 + 130230 ACTTATCTTGCCTGGATACACTTAAACAACTAGCACTCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78472 27 + 636262 ACTTATCTTGCCT--CTACCCTAAAAAAA------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 70751 41 + 647215 ACTTATCTTGCCTGGATACAGTTAGACAACTAGCACTCTAT - -a -s mr.mrrefChr0 74176 88 + 130230 AAAAAAAGCCCAAACCAAAAAAAGCTTAAAGGTAGTTATGTAGCTGTCAACAAGCACCTTTGGGCGAAGTGGTAAACCATGTTAACGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78499 88 + 636262 AAAAAAAGCCCAAGCCAAAAAAAGCTTAAAGGTAGTTATGTAGCTCTCAACAAGCACCTTTGGGCGAAGTGGTAAACCATGTTAACGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 70795 88 + 647215 AAAAAAAGCCAAAACCAAAAAAAGCTTAAAGGTAGTTATGCAGCTGTCAACAAGCAACTGTGGTGAAAGTGGTAAACCATGTTAGCAA - -a -s mr.mrrefChr0 74264 42 + 130230 CAGCAGAGTTTGGTCCGGGTCTGTGCAGGGAAAGAATTGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78592 42 + 636262 CAGCAGAGTTTGGTCCGGGTCTGTGCAGGGAAAGAATTGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 70883 42 + 647215 CAGTAGAGTTTGGTTGGGGTGTGTGGAGGGAAAGAATTGCCG - -a -s mr.mrrefChr0 74306 330 + 130230 CTTAGACCAGAGTTTATCACATGCTAGCTCTGAGTAGCTTTGGTGCCTAGTCTGTGTCGAATGGCAATTCCCACCATATCATTGTTGCACTTATGCTGTTTTCATACATTCTTTGTACATCTTATGCCACATAAATTTTTAGCTTGCTCACTATCTAGTATATACAGTTTTATACCAACCGATAACAGCTGTTTCTTTGAGACCAGTGCTTTTGGAAGCCTTTCATTTATAATGTGGGTACATGTGAGGTGGATTTCTTATCACTTTGCAGTTTTTGTAGCTTGTATCATTTTCATAACATTAATTACATCATCTTAAAGTTTATACAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78635 325 + 636262 CTTAGACCAAAGTTTATCACATGCTAGCT----GTAGCCTTGGTGCCTAGTCTGTGTGGAATGGCAAT-CCCACCATATCATTGTTGCACTGATGCTGTTTTCATATATTCTTTGTACATCCTATGCAACATAAATTTTTAGTTTGCTCACTATCTAGTATATACAGTCTTACACCAACCGATAACAGCTGTTTCTTTGAGACCAGTGCTTTTGGAAGCCTTTCATTTATAATGTGGGTACAAGTAAGGTGCATTTCTCATCACTTTGCAGTTTTTGTAGCTTATATCATTTTCATAACATTAATTACATCATCTTAAAGTTTATACAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 70925 330 + 647215 CTTAGACCAGAGTTTACCACATGCTAACTCTGAGTAGCTTTGGTGCCTAGCCTATGTCTAATGGCGTTTCCTACCATATCATTTTTGCACTTATGCTATTTTCATACATTCTTTGTACATCTTATGCCACACAAATTTTTAGCTTGTCTACTATCTAATATATACAGTTTTATACCAAACGATGACAGCTGTTTCTGTGAGACCAGTGTTTTTGGAAGCCTTTCATTTGTAATGTGGGTACATGTGGGATGGATTTCTTATCACTTTGCAGTTTTTGTCACATGTACCATTTTCTTGGCCTTAATTACATCATCTTTAGGTTTATACAAT - -a -s mr.mrrefChr0 74636 47 + 130230 ATGATGTTTTAACAGGCTGGCGTTGGCTTCGGCTTATGTCTAAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78961 47 + 636262 ATGATGTTTTAACAGGCTGGCGTTGGCTTCGGCTTATGTCTAAGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 71255 47 + 647215 ATGATGTTTTAACAGGCTGGCCTTGGCTTCAGCTTACATCTAAATGT - -a -s mr.mrrefChr0 74683 380 + 130230 TTTATGTGTCTTCAAGCACCTATGTGGACAGTACTGACATTGCTTCACTGCCTGCTTCCTATATATGTATATTTCTTTTAGGTGTTTACATCCTGTCATCACAAAGCGCCACACTGATTACTTATTTCTAAAACACTAGCAATGGCTCCACCTACAACTTTTCTACTTTTTACTGCTAACTCTATCATCTGGGCTTTGTTAAACTCAACATGTGTTCTTTGCTTGTTGGCTTACTCTAAAAGGCTGAAATCATTGTGGCTATGTATGTGTTAAATCCATATCAGGGCTTCATACATCTGGGCCTCCCTTGTTTTGGTAGAACTCTGACACTCTCCATGATATACCGAACAGACTTGTTTCAATGAATGTTAGTCTCAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 79008 363 + 636262 -----------------ACCTGTGTGGACAGTACTGACATTGCTTCACTGCCTGCTTCCTAAATATGTATATTTCTTTTAGGTGTTTACATCCTCTCATCACACAGCGCCACACTGGTTACTTACTTCTAAAACACTAGCGATGGCTCCACCTACAACTTTTCTACTTTTTACTCCTAACTCTATCATCTGGGCTTTGTTAAACTCAACATGTGTTCTTTGCTTGCTGGCTTACTCTAAAAGGCTGAAACAGTTATGTCTATGTATGTGTTAAATCCATATCAGGGCTTCATACATCTGGGCCCCCCTTGTTTTGGCAGAACTCTGACTCTCCCCATGATATACCGAACAGACTTGTTTCAATGAATGTTAATCTCAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 71304 370 + 647215 TTTATGTGTCTTCAAGCACCCACGTGGACAGTACTGACATTGCT-CACTGCCTGCTTTCTATATATGTATAATTCTTTTAGGTGTTTACATCCTGTCATCACAAAGGGGCACACTAATTACTTATTTTTAAAACACTAGCAACGGCTCCACCTAGAACTTTTCTACTTTGTACTGCTAACTCTATCAGCTGGGCTTTGTTAAACTCAGC---------TTGCTTGTTGGCTTACTCTAAAAGGCTGTAATCATTGTGGCTTTGTATGTGTTAAATCCATATCAGGGCTTCATACATTTCGGCCTCCCTTGTTTTGGTAGAGCTCTGGCAATATCCATGTGATACCCAACGGGCTTGTCTCAACGAATGTTAGTCTCAGCT - -a -s mr.mrrefChr0 75063 20 + 130230 AAGAGGCTGGTTTCTGAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 79372 20 + 636262 AAGAGGCTGGTTTCTGAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 71674 20 + 647215 AAGAGGCTGGTTTCTGAGAG - -a -s mr.mrrefChr0 75083 567 + 130230 AATTGGCAGACTATACCATTGTGATTCTTAATTACACATCCTGGGACCTCCCTATCTGTGTTGGAGTTTGTCAGATTGTGACCTTTAACAGCAACGGAGAGCAACTTTACTGCTCAGCACTCAGATTTAATTAGTGTTTATTACAGTTGTGCCTGCCTTGGAATCTACACCTATCATTCTCTCTAACTGAAGAAGCAAAATCTGATCACCACATTTCAGCATTATCTCTCCCACTCTGCGCACTCTCTGAGTCTTATTGTGAAGGGCCAATAGAGTTTTAGATCAACGAACCTCTAGCCCAATGCACCCGAGCATTTATGAATACGGCCGTCTGTGTATTCTGTACTTCCAATCCTGGACACCAGATGTCTCTTCAGTACAGGAAATGATAGTGGTTCTAAAAAGTTTGTGATTACAGTGATTTCTACTCTAGTGTTCTTTAGCAACTAAGTGCACAATTTTTGTTTTTAAGTTGAAAGTTGAGAAGTTGATGCGCCTTGGAAATCTGAGAACCTTTCCCTCCCACTGGGATTTGAGTACATAAATCTGACACGTTCCATTCTCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 79393 566 + 636262 AATTGGCAGATTATACCATTGTGGTTCTTAATTACACATCCTGGGACCTTCCTATCTGTGTTGGAGTATGTCAGATTATGACTTTTAACAGCAACGGAGGGCAACTTTACTGTTCAGCACTCAGATTTAATTAGTATTTATTGCAGTTGTGCCTGCTTTGGAATCTACTCCTGTCATTCTTTCTA-CTGAAGAAGCAAAATCTGACCAATGCCCTCAAGCATTATCTCCCCCACTCTTCGCACTCTCTGGGTCTTATTGTGAAGGGCCAGTAGAGTTTTAAATCAACGAACCTCTAGCCCAATGCACCCGAACATTTATGAATACGGCCGTTTGTGTATTCTGTACTTCCCATCCTGGACACCAGATGTCTCTTCAGTACAGGAAATGATAGTGGTTCTAAAAAGTTTGTGATTACAGCGATTTCTACTTTCATGTTCTTTAGCAACTAAGTGCACAATTTTCGTTTTTAAGTTGAAAGTTTAGAAGTTGATGTGCCTTGGACATCTGAGAATCTTGCCCTCCCACTGGGATTTGAGTACATAAATCTGACACGTTCCATTCTCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 71694 539 + 647215 AATTGACAGACTATACCATTGTGATCCTTAATTACACATCCTGGGACCTCCCTATCTGTGTTGGAGTTTGTCAAAGTGTTACCTTTCACAGCAATGGGGAGCAACTTTACTGCTCAGCAATCTGATTTAATTAGTGTTTATTACAGTTGTGCCTGCCTTGAAATCTACACCTAGCGTTCCCTCTAACTGAAGAAGCAAAGTCTGATCACCACATTTCACCATTATCTCTCCCACTCTGAGTACCCTCTGAGTCTTGTTGGGAAGGGC--ATAAAGTTTCAGATCAATGAAC------------------AAGCATTTATGAATAGGGCCATCTGTGTATTCTGTACTTCCAATGCTGGACCATAGATGTCTCTTCAGTACA-----TGATATTGGTTCTAAAAAGTTTGTGATTACAGTGATTTCTACTCTAGTGTTCCTTCACAACTAAGTGCA---TCTTTGTTTTTAAGTTGAAAGTTGAGAAGTTGATGCGCCTTAGAAGTCTGATGACCTTTCCCTCCCACTGGAATTCGAGCACATAAACCTGAGACATTCCATCCTCTCT - -a -s mr.mrrefChr0 75650 536 + 130230 TCAACGATCACAATCTGTGTTACTTCTAGGACACTACAGCCTGGCAAGTATTCTGCCCATCTTGAGATAATCTGTAAAAATTCCATAAGATGTCTGAATTATCTTAGATTTGCGAGAAGAGATGACTTGGTATAGAGAAGAGGGATCAGATGCCTCCTGCCAGTGGGTGGTTGGCCACCATGCAGGATCTTACCTCTAGCACTTGTGGGGCATTTCAGTACTGACGGTTTCCCTAATGAATGAAAGCACAAATCAATAATAAAGTGACCTGTCTTAATAATCATTGAAATACATTGTGTTATAGTTATTCCACATACATATGATTGGTATGAACACTATAAGGGTGGCATAAACTAAGATGTTCTACCTGACATCTTAAATCTCCCTATGAGATAACAGAATAATGAGTAGAGGCATCCCCATCCAAACATGCTCATTACATGAAAGATGGGGGAACGCTCCTTTTATTCATGCAATGGCACAATGAATCGAATAGGCTCTGGATTCTCAGTTGCACAATGATGATTGGTGTCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 79959 531 + 636262 ----CAATCACAATCTGTGTTACTTCTAGGACACTACAGCCTGGCAAGTATTCTGCCCATCTTGAGATAATCTGTAAAAATTCCATAAGGTGTCTGAATTATCTTAGATTTCCGAGAAAAGATGACTTGGTATAGAGAAGAGGGATCAGATGCCTCCAGCCAGTGGGTGGTTGGCCACCATGTAGGATCTTACCTCTAGTACTTGTGGGGCATTTCAGTACTGATGGTTTCCCTAATGAATGAGAGCACAAATCAATAATAAAGTGACCTGTCTCGATAATCATTAAAATACACTGTGTTATAGTTATTCCACATACATATGATTACTAGGAACACTTTAAGGATGGCATAAACTAAGATGTTCTACCTGACATCTTAAATCTCCCTATGAGATAACAGAATACTGAGTAGAGGCATCCC-ATCCAAACATGCTCATTACATGAAAGATGGGGGATCGCTCCTTCTATTCCTGCAATGGCACAATGGATCGAATAGGCTCTGGGTTCTCAGTTGCACAATGACGATTGGTGTCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 72239 536 + 647215 TCAATGATCACAATCCGTTTTACTTCTAGGACACTACAGCCCGGCAAGTATTCTGCCCATCTTGAAATAATCTGTAAAAGTTCCATAAGACGTCTGAATTATCTTAGATTTGCAAGGAGAGATGACTTGGTATAGAGAAGGAGGATCAGATGCCTCCTGCCAGTGGGTGGCTGGCTACCGTGCAGGATCCTACCTCCAGCTCTTTTGGGGCATTTCAATACTGACAGTTCCTCTAATGAATGAAAGCACAAATCACTAATAAAGTGACCTGTCTTAATAATCATTGAAATAGATTGTGTTATAATTATTCTACATACATATGATTGGTATCAATGCTATAAGGGTGGCATAAACTAAGACGTTCTACCTGACATCTCAGATCTCCCTCAGAGCTAACAGAATAATGAGTAGAGGCATCCCCATCAAAACATGCTCATTACATGAAAGATTGGGGAAGGCTCCTTTTATTCATGCAATGGTGTTGTGAATTGAATAGGCTCTGGATTCTCAGTTGCACAATGATGATTGGTGTTATT - -a -s mr.mrrefChr0 76186 120 + 130230 AAGGTCCAATTAGTGTGGCTACAAATTGACATGAGTGAACATTATGAAAAATTATCTTGTTTGTTCACCATCCATAACATTGCAGGCAATACTACAAATTGTAGTTTTACCTACCTTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80490 120 + 636262 ACGGTCCAATTAGTGTGGCTACAAATTGACATGAGTGAACATTATGAAAAATTATCTTGTTTGTTCACCATCCATAACATTGCAGGCAATACTACAAATTGTAGTTTTACCTACCTTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 72776 120 + 647215 AAGGTCCAATTTGTGTGGCTACAAATTGACACGAGTGAGCATTATAATAAATTTTCTAGTTTGTTTATCATCCATAAAATTGCAAGCAATACCTCAGATTTCAGTTTTATCTACCTCCTT - -a -s mr.mrrefChr0 76306 7 + 130230 ATCTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80611 7 + 636262 ATCTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 72896 7 + 647215 ATCTGTT - -a -s mr.mrrefChr0 76313 5 + 130230 CTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80627 5 + 636262 CTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 72903 5 + 647215 CTAAC - -a -s mr.mrrefChr0 76318 42 + 130230 CATTATATGTAATGCAGCCAGGATTCATCTGCATCTTCTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80633 42 + 636262 CATTATATGTAATGCAGCCAGGATTCATCTGCATCTTCTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 72908 42 + 647215 CATTATCTGTAATTAAACCAAGATTCATTTTCATCTTGTAAT - -a -s mr.mrrefChr0 76360 85 + 130230 TACGTGGCCCCACTTGATATGCCCTCCTAAACATGGCCCCACCTGAGGTCTCCTCCCAATTTTTTTGGGACTCAGGACCCCATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80675 85 + 636262 TACGTGGCCCCACTTGATATGCCCTCCTAAACATGGCCCCACCTGAGGTCTCCTCCCAATTTTTTTGGGACTCAGGACCCCATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 72951 85 + 647215 CACATGGCCCCACCTGATGCGCTCCCCCAAACATGGCCCGACCTGAGGTGCCCTCCCAATTTTTTTCAGACTCAGGACTGCATAA - -a -s mr.mrrefChr0 76445 9 + 130230 AGAACAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80763 9 + 636262 AGAACAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 73036 9 + 647215 GGAACAACC - -a -s mr.mrrefChr0 76454 69 + 130230 TTGTGTCTTCTGTTCCAGCGGATTAATGGGGTTGGTGAGTCTGCAGAACTCTGGATAAGGCTATCCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80773 69 + 636262 TTGTGTCTTCTGTTCCAGCGGATTAATGGGGTTGGTGAGTCTGCAGAACTCTGGATAAGGCTATCCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 73045 69 + 647215 TTGTGTCTTTTGTTCCATTGGATTAATGGGGTTGGTGAATCTACAGAACTCTGCATAAAGCTATCCTTT - -a -s mr.mrrefChr0 76523 89 + 130230 CTGTTGTTGGGAACTAGGCTCTGGATTCTCGGTTATACAATGAATTAGATTTGGTACTCTTAACAGTCCAGTCAGTGTGGCTATAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80849 89 + 636262 CTGTTGTTGGGAACTAGGCTCTGGATTCTCGGTTATACAATGAATTAGATTTGGTACTCTTAACAGTCCAGTCAGTGTGGCTATAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 73114 89 + 647215 GTGTTGTTGGAAACAAGGCTCTGGATTCTCAGTTACACAATGAATTAGATTTGGTATTCTTAACAGTCCAATCAGTGTGGCTATAAACT - -a -s mr.mrrefChr0 76612 111 + 130230 GAATGAGCATATTCTCCTGTTTGTTTATCATCCATAAAATTGCGGGCAATTCTACAGATTTCAGTTTGACATATCTCCTTATCTGTAATTCAGTCAAGATTCATCTGCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80938 111 + 636262 GAATGAGCATATTCTCCTGTTTGTTTATCATCCATAAAATTGCGGGCAATTCTACAGATTTCAGTTTGACATATCTCCTTATCTGTAATTCAGTCAAGATTCATCTGCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 73208 111 + 647215 GAGTGATCATATTATCCTGTTTGTTTGCCATCAATAACATTGCAGGCAATACCACAGATTTCAGTTTGACCTATCTCCTTATCTGTAATTCAGTCAAGACTTGTCTGCATC - -a -s mr.mrrefChr0 76723 40 + 130230 GTAAATGCCCCATATGGCCCCACCTTATGTGCCCTCCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81051 40 + 636262 GTAAATGCCCCATATGGCCCCACCTTATGTGCCCTCCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 73319 40 + 647215 ATAAATGCCTCACATGGCCCCACCTTATGTGCCTTCCCAA - -a -s mr.mrrefChr0 76763 47 + 130230 TCTGCTCTCCCAATTTATTTGCCCTCCCAATTTATTTCGGACTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81091 47 + 636262 TCTGCTCTCCCAATTTATTTGCCCTCCCAATTTATTTCGGACTCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 73360 47 + 647215 TCTGCCCACCCAATTTATTTGACCTCACAATTTATTTGGGACTCAGG - -a -s mr.mrrefChr0 76810 86 + 130230 TAGAGGACAACCTTCTGTCTTCTGTTCCAGAGGATTATTGGGGCTGGACTCTATAGAACTCTGGATAAGGCCACTCTGACAACTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81138 86 + 636262 TAGAGGACAACCTTCTGTCTTCTGTTCCAGAGGATTATTGGGGCTGGACTCTATAGAACTCTGGATAAGGCCACTCTGACAACTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 73413 86 + 647215 TAGAGGACAACCTTCTGTCTTCTGTTCCAGAGGATTATTGGAGCTGGACTCTTCAGAACTCTGTATAAGGCTATCCTGACAACTCA - -a -s mr.mrrefChr0 76896 24 + 130230 CTTCTCTCATCTTGTGTTGATGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81224 24 + 636262 CTTCTCTCATCTTGTGTTGATGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 73500 24 + 647215 TTTCCCTCATTTTGTGTTGTTGGA - -a -s mr.mrrefChr0 76920 21 + 130230 TCCTCTTGAGCCACCCAAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81249 21 + 636262 TCCTCTTGAGCCACCCAAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 73524 21 + 647215 TCCTCTTGAGCCACCTAAAGG - -a -s mr.mrrefChr0 76941 6 + 130230 TATCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81270 6 + 636262 TATCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 616153 6 - 647215 TGACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 73545 6 + 647215 TATCAG - -a -s mr.mrrefChr0 76947 72 + 130230 ATTGTATTACTATGATCATCTCCAAACTTTCAGGCACACCTTGCCTCTAGCCCAGAATAGCTACCTCAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81276 72 + 636262 ATTGTATTACTAAGATCATCTCCAAACTTTGAGGCAGACCTTGCCTCTAGTCCAGAATAGCTACCTCAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 616162 72 - 647215 ACTGTATTACTATGATCATCTCAAAACTTTCAGGCACACTTTGCCTCTAGCCCAGAATAGCTACCTCAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 73551 72 + 647215 ATTGTATTACTATGATCATCTCCAAACTTTCAGGCACACCTTGTCTCTAGCCCAGAATAGCTACCTTAATTT - -a -s mr.mrrefChr0 77019 29 + 130230 TGATCTGTGTATGTATACATATTGCTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81350 29 + 636262 TGATCTGTGTGTGTATACACATTGTTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 616234 29 - 647215 TGATCTGTCTATGTATACATATTGCTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 73623 29 + 647215 TGATCTGTGTATGTATACCTATTGCTCTT - -a -s mr.mrrefChr0 77048 1 + 130230 C -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81379 1 + 636262 C -s simRat_chr6.simRat.chr6 73652 1 + 647215 C - -a -s mr.mrrefChr0 77049 3 + 130230 ACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81380 3 + 636262 GTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 616263 3 - 647215 ACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 73653 3 + 647215 ACT - -a -s mr.mrrefChr0 77052 56 + 130230 CTAACCATGTTCCTTAACCTAACCTGGAACAGTTGAATTTTACTTATAGTGGACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81383 56 + 636262 CTAACCATGTTCCTTAACCTAACCTGGAACAGTTGAATTTTACTTATAGTGGACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 73656 56 + 647215 CTAACCATGTTGTTCAACTTAACCTGGGACCGTTGAATTGTATGCATAATGCACTG - -a -s mr.mrrefChr0 77108 73 + 130230 TAATCGTTGAACGGGTTACTATGAGGTGCTCTTTCTTCCTCTTGAGTATTATGTGGTCCATATCCAACTGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81444 73 + 636262 TAATCGTTGAACGGGTTACTATGAGGTGCTCTTTCTTCCTCTTGAGTATTATGTGGTCCATATCCAACTGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 73712 73 + 647215 TAATCATTGATCAGATTACTCCAAAGCGCTCCCTCTTCCTGTTGATTAAAATGTGGACCATATCGAATTGCTT - -a -s mr.mrrefChr0 77181 146 + 130230 CTGTAGTCAAGAGCGGATTATGAATTTGTGGGGCCAGCCACACTCCCCTAAAATAAACTCTTATCTACTATAGACTTGTGCACCTATTAAGACTTGTGCCATTATTATTTACCATTTAAGGATGTTATAACCTAAGCGCTGTGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81605 143 + 636262 CTGTAGTCAAGAGCGGATTATGAATTTGTGG---CAGCCACACTCCCCTAAAATAAATTCCTATCTATTATAAACTTGTGCACCTATTAAGACTTGTGCCATTATTATTTACCATTTAAGGATGTTATAATCTAAGCGCTGTGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 73785 146 + 647215 TGGTAGCCAACAATAGATTTTGAATCTGCTGGGCCAGCCACGTCCCCTGAAAATAAACTCTTACCTACTATAGATTTGTGCACTTATTAAGACTTGTGCCATTATTATTTACCATTTAAAGATGTTATAACCTATGCGCTGTGGCA - -a -s mr.mrrefChr0 77327 67 + 130230 TGTCTGTTAGAACCTAATGTGGGATAACTGGTGCCAAGGTCAGTTCAGACTCAGCATGCAAACATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81755 67 + 636262 TGTCTGTTAGAACCTAATGTAGGATAACTGGTGCCAAGGTCAGTTCAGACTCAGCATGCAAACATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 73931 67 + 647215 TGTCTGTTAGGATCTAATGTGGGATAACTGGTGCCAAGGTCACTTCAGACTCAGCCTGGAAATGTAT - -a -s mr.mrrefChr0 77394 19 + 130230 GACTTCTATAAACTCTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81822 19 + 636262 GACTTCTATAAACTCTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 73999 19 + 647215 GACTTCTATAAATTCTATA - -a -s mr.mrrefChr0 77413 51 + 130230 AGGTTTGTCATTTTCTACATGTGGCACACTAGTGATTTGCACTTCTCTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81841 50 + 636262 AGGTTTGTCATTTTCTACATATGG-ACACTAGTGATTTGTACTTCTCTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 74019 51 + 647215 ATGTTTGTCATTCTCTACATGTGGCACACTAATGATTTGCACTTTTCTTGT - -a -s mr.mrrefChr0 77464 42 + 130230 GCTCATGGTATGTTTGGGTGGGGAGTTCACAAGATTCTCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81908 42 + 636262 GCTCATGGTATGTTTGGGTGGGGAGTTCACAGGATTCTCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 74070 42 + 647215 GCTCATGGTATGATTGGGTGGTGAGTTCACAAGTTTCTCTGT - -a -s mr.mrrefChr0 77506 101 + 130230 GAAAAATCCATCCTAGTTTGCTGATGCCAGTGTTAATGAGGGAAATTTGACTTTTGTATAAGATCGGTGTGTGTTGTTTCTGCAAACCAGGGTTTATGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81950 101 + 636262 GAAAAATCCATCCTAGTTAGCTGATGCCAGTGTTAATGAGGGAAATTTGACTTTGGTGTAAGATCGGTGTATGTTGTTTCTACAAACCAGGGATTATGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 74113 101 + 647215 GAAAAACCCATCCTAGTTTGCTGATGCCAGCGCTAATGAGGGAAATTTAGCTTTTGTATAAGATCAGTGTGTATTATTTCTGCAAATCAAGGTTTATGACT - -a -s mr.mrrefChr0 77607 110 + 130230 ACAATCCTCCCATACAATCTGTTGAATTTCCACTAACATTAGTGGTGACTTTAAGGCTGCTGAGTTTAATACCTCACGTTAATTTTAGAGGCGTTTTAATTACAGTAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82054 110 + 636262 ACAATCCTCCCATACAATCTGTTGAATTTCCACTAGCATTAGTGGTGACTTTAAGGCTGCTGAGTTTAATACCTAACGTTAATTTTAGAAGCGTTTTAATTACAGTAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 74214 110 + 647215 ATACTCCTCCCATACAATCTGTTGAATTTTCACTTACATTAGTACTGACTCTAAGGCCACTGAGTTTAATACCTCAAGTTAATTTTAGAGGCATTTTAATTATAGTAACT - -a -s mr.mrrefChr0 77717 158 + 130230 AGCTACAGAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCTGACACAATTTTGATAATTGTAAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATAGATGGCAATGGTGGGGTATAACCATGTCTTGTTAATATGGGTTTGTCCAGCCCATTAAGTATAGTCAATGTAAGGGGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82164 158 + 636262 AACTATAGAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCTGATACAATTTTGATAATTGTCAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATAGATGGCAATGTTGGGGTATAACCATGTCTTGTTAATATGGGTTTGTCAAGCCCATTAAGTATAGTCAATGTAAGGGGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 74387 158 + 647215 AGCTACAAAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCGGACTCAATTCTGAGAATCGTAAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATATATGACAATGGTGGGGTATAACCATGTCTTGATAATATAGGTTTGTCCAGCCTGTCAAGTATAGTCAATGTAAGGGGGC - -a -s mr.mrrefChr0 77875 301 + 130230 TGTGATGAACAGGTTATGATCTATATGTTAATGATCTAGAAGAAGCATGTTACCAAATACTGCCATCGCATTCAGATCCATAAATAGACATCTAGGGCAAAGCACATATTACTTTTTAACCATGCCACATATCTTTCCTTAACCTGAGTATCCAGCATATAATAATGGGAACATTAATCAAAGCTACTTGGGTACCTAAGGTGATCGGTCTGCATGCTCAAATTCTTAGAGCTCACATTACGTTTAACACCACTAGGAAAAGTGACTAGCCTGTCAGAAGGTGTCATGTCACTAATAATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82324 298 + 636262 TATGATGAACAGGTTACGACCTATATGTTAATGATCTAGAAGAAGTATGTTACCAAACACTGCCATCGCATTCAGATCCATAAGTAGACATCTAGGGCAAAGCACATATTCCTTTTTAACCATGCCACTTATCTTTCCTTAACCTGAGTATCCAGCATATAATAATAGGAACA--AATCAAAGCTACTTGGGTACCTAATGTGATCGGTCTGCATGCTCAAATTCTTAGAGCTCAC-TTACGTTTAACACCACTAGGAAAAGTGACTAGCCTGTCAGAAGGCGTCATGTCACTAATAATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 74545 284 + 647215 CGTGATGAACAGGCTATGATCTATATGTTAACGACTTAGAGGAAGCATGTTACCAAATG-TGCCATCAAATTCAGATCCATAAATAGACATCTAGAGCAGAGCACATATTACTTTTTGACCGTGCCACATATCTTTCCTTAACCTGAGTATCCAGCATATAATGATGGGAACATTAATCAAAGCTACTTGGGTAC-TAAGGT---------------TCAAATTCTGAGAGCTTACATCACGTTTAATACCACTAGGAAAAGTGACTAGCCTGTCAGAAGGTGTCATGTCACTAATAATAT - -a -s mr.mrrefChr0 78176 177 + 130230 TCCTGCTTTCATACACCCTACTAAATGTCATTACAGCATAAGGTTATGTTGTTGATATTACTCCCTTTCCACTGCACATTTTTAATTCTCAGTTTaTTGACTGACTCCCTAATGACtacACATGcttcaataatatactgctcaagaacTATCACATCCTAGTGACTGAACCCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82622 176 + 636262 TCCTGATTTCATACACCCTATTGAATGTCATTACTGTATAAGGTTATGTTGTTGATACTACTCCCTTTCCACTGCACATTTTTAATTCTCAGTTT-TCAACTGACTCCCTAATGACTACACATGCTTCAATAATATACTGCTCAAGAACTATCACATCCTAGTGATTGAACCCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 74844 149 + 647215 TCCTGCTTCCATACACCCTACTAAGTGTCATTACAGCATGAGGCTATGCTGTTGAGATTACTCCCTTCCCACTGCGCATTTTTAATTCTCTGTTTATTGACTGACTCCCTAATGAC---ACATG-------------------------TATCACATCTTAGTGACTGAACCCAATG - -a -s mr.mrrefChr0 78353 130 + 130230 GGGGAAAGGAAAGTAAATCGCAGAGTTAACATCTCCAGACCATTTTTCTATAGATCATCACCTATGCAAGTGGAGGCTGGGTCTACTTGGTTAGATCCCAACTGACATCAGTTGGCATACCCAGCACGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82798 126 + 636262 GGGGAAAGCAAAGTAAATCGCAGAGTTAACATCTCCAGACCATTTTTCTATAGATCATCA----TGCAAGTGGAGGCTGGGTCTACTTGGTTAGATCCCAACTGACATCAGTTGGCATACCCAGCACGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 74996 130 + 647215 GGGGACAGGTAAGTAAATTGCAGAGTACACATCTTGAGACAATCTTTCCATAGATCATCACCTATGCAAGGGGAGGCTGGGTCTCCTTGGTCAGAGTCAGACTGACATCAGTTGGCATACCCAGTATGGG - -a -s mr.mrrefChr0 78483 91 + 130230 GCGGCCTTCTAAATCCAACCATCCATGCAGACCCTTATCCTCACAGGAGGTTAGCTTGGGACACCAAAGCATAGGGTATCAGGAACCTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82924 91 + 636262 GCGGCCTTCTAAGTCCAACCATCCATGCAGACCCTTAGCCTCACAGGAGGTTAGCTTGGGACACCAAAGCATAGGGCATCAGGAACCTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 75191 91 + 647215 GAGGCCTTCCAAATACAACCATCCATGCAGACCCTTATGCTCAGAGGATGCTAGCTTGGGACACCAAAGCACAGGGTGTCATGAACCCCTG - -a -s mr.mrrefChr0 78574 108 + 130230 GCCTCCGAACCCAGGGCACTCTATGGAACACTATTCTCTCATCGTCCCAGAAATTATATAGTTTCTGAGCTTGTACTTCAAACTCATCCATAGGTAGGTCCAGTCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83021 108 + 636262 GCCTCCGAACCCCGCACACTCTATAAAACACTATTCTCTCATCGTCCCAGAAATTATATAGTTTCTGAGCTTGTACTTCAAACTCATCCATAGGCAGGTCTAGTCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 75282 108 + 647215 GCCTCCAAACCCAGGGCACTCTATGGGACACTATCCTCTCATCAACCTAGAAATTACATAGCATCTGAGCCGGTGCTTCAAACTCATACATAGGTAGGGCCAGTCTAT - -a -s mr.mrrefChr0 78682 239 + 130230 TTCACCCCTCAAGCTGCTTATTTTGTAAATAGGTAATGTAGCGCCTGTCCAGTCTACATGGTCCAACTGGTTGTTGTATAGAGATTCTTATTGCTGATATTCCATGATCTAGCCATTGTTTTGTGGTACAATTGTTGCCCTTCTGCTCTCAAATCAGAACCAAGAAACATTCGTAATATGTAATTTTTCAATCTAGACAAGAAACTTAACGATGTTTAGATTTTGCGCTGTGCCTGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83129 239 + 636262 TTCACCCCTCAAGCTGCTTTTTTTGTAAATGGGTAATGTAACGCCTGCCCAGTCGACATGGTCCATCTGATTGCTGTATAGAGATTCTTATTGCTGATATTCCATGATCTAGCCATTGCTCTGTGGTACAATTATTACCCTTCTGCTCTCAAATCAGAACCAAGAAACATTCGTAATATGTAATTTTTCAATCTAGACAAGAAACTTAACGATGTTTAGATTTTGCGCTGTGCCTGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 75391 239 + 647215 TTCACCCATCAAGCTGCTTATTTTGTAAATAGGTAATGCAGTGCCTGTCCAGCCTACATGGTCCAACTAGTTGTTGTATAGCAACTCTTATTGCTCATATTCCATGATCTAGCCATTGTTTTGTGGTACAATTGATGCCCTTCTGCACTTAAATCAGAGCCAAGAAACATCTGTAATATGCAATTTTTCAACCTAGACAAGAAACTTAACATTGTTGAGATTTCGCACAGCACCCTGTG - -a -s mr.mrrefChr0 78921 22 + 130230 CAAAGCCCCAGAAAAAGGCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83368 22 + 636262 CAAAGCCCCAGAAAAAGGCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 75631 22 + 647215 CAGAGCTCCAAAAACAGGCAAA - -a -s mr.mrrefChr0 78943 85 + 130230 TGTGGGTATGTACACACGGGTAGTGCTTGGCTATGACCATGTGCCACATCGCCATGTACAGACGGTTAGTGGCTGGGTATGAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83396 85 + 636262 TGTGGGTATGTACACACGGGTAGTGCTTGGCTATGACCATGTGCCACATCGCCATGTACAGACGGTTAGTGGCTGGGTATGAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 75653 85 + 647215 CGTGGCTATGTACACACAGTTAGTGCTTGACTATGAGCCTGCCCTGTGTGCCCATGTACACATGGTTAGTGCCTGGCTATGAGCC - -a -s mr.mrrefChr0 79028 31 + 130230 CACAGAGTCTGCCTGCCTCACACAAGAGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83481 31 + 636262 CACAGAGTCTGCCTGCCTCACACAAGAGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 75766 31 + 647215 CACAGAGTCTGTCAGCCTCATGCTTGAGGTT - -a -s mr.mrrefChr0 79059 46 + 130230 TGCCAGGCGTAGTTCCCCACATTGTAGATCTCCTGTCCGATTCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83512 46 + 636262 TGCCAGGCGTAGTTCCCCACATTGTAGATCTCCTGTCCAATTCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 75809 46 + 647215 TGTCAGGCGAAGTCCCCCACTATGTAGAGCTCCTGTCCGATTCACA - -a -s mr.mrrefChr0 79105 102 + 130230 GATAGGCACCTACTTCATGTCCAGAATGAGCCTCCCCATAGTACTGTGACTGGGCTATACCGTCTGTGTCTATTAGTCTGATAGTTCTTATAGCAGGTATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83558 102 + 636262 GACAGGCACCGGCGTCATGTCCAGAATGAGCCTCCCCATAGTACTGTGACTGAGCTATACCGTCTGTGCCTATTAGTCTGATAGTTCTTATAGCAGGTATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 76185 101 + 647215 GATACGCACCTATTTCATGTCCAGAATGAGCCTCCGCACAGTATTGTG-CTGGGCTATCACATCTGTGTCTATTGGTCTGATAGTTCCTATGGCAGGTATGG - -a -s mr.mrrefChr0 79207 6 + 130230 CAATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83660 6 + 636262 CAATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 76287 6 + 647215 CCACTG - -a -s mr.mrrefChr0 79213 11 + 130230 ACCTTGACAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83666 11 + 636262 ACCTTGACAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 76295 11 + 647215 ACCCTGTAAGC - -a -s mr.mrrefChr0 79224 90 + 130230 ATTTTGTAATTTTTCTAGAGCATAGTTAGTTGGCGTTACAGTTAGTTGGCAGGTAGGAAAAATAGCATGTCAAGGAAATGCCCACTAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83677 90 + 636262 ATTTTGTAATTTTTCTAGAGCATAGTTAGTTGGCGTTACAGTTAGTTGGCAGGTAGGAAAAATAGCATGTCAAGGAAATGCCCACTAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 76309 90 + 647215 ATTTTGTAATTTTTCTAGAGCATAGTTAGTTAGCATTACAATTAGTTGGCAGGTTAGGAAAATTACATGTCAAGGAAACGCCCACTAAGT - -a -s mr.mrrefChr0 79314 29 + 130230 GCCTAGCTGTGTGTCTTTATAGGTTTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83892 29 + 636262 GCCTAGCTGTGTGTCTTTATAGGCTTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 76399 13 + 647215 ----------------TTACAACTTTTCA - -a -s mr.mrrefChr0 79343 10 + 130230 TTACAATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83921 10 + 636262 TTACAATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 76419 10 + 647215 TTACAACCAT - -a -s mr.mrrefChr0 79353 561 + 130230 CCACATGGAAAATTAGCTCGGTCTTATTTTGCCTCTGTCATATATCCCTAGGTCGTTTGGCATTTGGGGTGATAGCAACAGATTAATGCCACCAATGCCCAACTCCCAGTTGCAAATGAAATGTAGCTTCTGGAGCATTGTCAACACCAACAGGCAGCATAAGCTCAAATGAATATTGTATATGTTAAATACATAGCCCAAAAATACATTCATTTACCTATATGTGTTGTTGCTGTGGTCCAGGAGATCTATGTCACTGCATGGTACGTACCATTGGAATGGATCACACATTATGGCTTTGGCGTTAAGATCAAGACTCTGTCCAGGAAGACTATGGATCCATTGTCTCAGTCATAGCTGCTGGTTGTGTTACAGTGAGGTTGATCAAAACTTGGCGAGTTTTGAGGGAAAGTCACCTAATCGATTTTAAATGCTAGTCACCTATGGGTTGAGATCTATGAAAGCTACATTGGATGATCTCCTCTCTATTGGTTTGATTAGTTTTTTGGGTTTTTAGTCAGAAATGCTAGCAACTCAAAGTATGGGCTTAGCGTTAGACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83931 557 + 636262 CCACGTGGAAAATTAGCTCGGTCTTACTTTGCCTCTGTCATATATCCCTAGGCCGTTTGGCATTTGGGGTGATATCAACAGATTAATGCCACCAATGCCCAACTCCCAGTTGCAAATGAGATCTAGCTTCTGGAGCATTGTCAACACCATGAGGGAGGGTAACCTCAAATGGATATTGTATATGTTA--TACATAGCCCAAAATTACATTCATTTACCTATATGTGTTGTTGCTGTGGTCCAGGAGATCTATGTCACTGCATGGTACGGACCATTGGAATGGATCACACATTTTGGCTTTGGCGTTAAGATCAAGACTCTGTCCAGGAAGACTATGGATCCATTGTCTCAGTCATAGCTGCTGGTTGTGTTACAGTGAGGTTGATCAAAACCTGGCGAGTTTTGAGGGACAGTCAGCTAATCAATTTTAAATGCTAGTCACCTATGGGTTGACATCTATGAAAGCTA--TTGGATTATCTCCTCTCTATTGGTTTGATTAGTTTTTTGTGTTTCTAGTCAGAAATGCTAGCAACTCAAAGTATAGGCTTAGCGGTAGACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 76430 560 + 647215 CTGCATCACCAATTAGCTCGGTCTTATTTCGCCTCTGTCATAAATTCCAAGGTCGTTTGGCATTTGGGGTGATAGCAACAGATTAATGCCACCAATGCCCACCTTCCAGTTACAAAGGAAATGTAGCTTCTGGAGCATTGTAAACACCAACAGGCAGCATAAGCTCAAATGACTATTTTATATGTTAAATCCATAGCCAAAAAATACATTCTTGTATCTATATGTGTTGTTGCCATTGTACAGGAGATCTATGCCACTACATGGCATGTACCATTGGAATGGATCACACATTATGTCTTTGGCGGTGAGATCAAAACTCTTAACAGAAAGACTGCGGGTGCATTGTCTCAGTCAAAGCTGCTTGTTGTGTTAAAATGTGGTTGATCAAAGCTTGGCAAGTTTGGAGGGAAAGTCACCTAATCGATCTTCAATGCTAGTCACCTATGGGTTGAGATCTATGAAAGCTACATTGAATGATCTCCTCTCCATTGGTTTGACTAGTTTTTTGGGTTTTTAGTCAGAAATGCTAGAAACTTAAAGTATGGGGTCAGTGTTAGACT- - -a -s mr.mrrefChr0 79914 18 + 130230 GTGAGACAACACTACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84490 18 + 636262 GTGAGACAACACTACAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 76990 13 + 647215 -----ACAACACTACATG - -a -s mr.mrrefChr0 79932 7 + 130230 ATATAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84508 7 + 636262 ATATAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 77009 7 + 647215 ATATCAC - -a -s mr.mrrefChr0 79939 74 + 130230 CCAGAAGTAGTAATGATGGTCAGTCATATCATGGATATAGCAATCAATCTCTATCTGGCTACTTCTCCGTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84520 74 + 636262 CCAGAAGTAGTAATGATGGTCAGTAATATCATGGATATAGCAATCAATCTCTATCCAGCTACTTCTTTGTATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 77016 64 + 647215 ----------TAGCGATGGTCAGTCACATCATGGATATAGCCATCAATCTATATCTGGCTACTTCTCCGTATTG - -a -s mr.mrrefChr0 80013 182 + 130230 TACACGCCTGGGACATACATTTTTAAGCAGAATAAAGCTTTTCTAAATTTAGGAATCATATGTATAAAACGAAGATGGAGGTTAACTGCATCAACAACAACTTTGTAATGTCTCTATACATTGCATTGTGGCCCATCATGACTCTTGGGCTAGTATTGCTAGTTTATAGCAACTCCACATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84595 182 + 636262 TACATGCCTGGGACATACTTTTATAAGGAGAATAAAGCTTTTCTAAATTTAGGAATCACATGTATCACACCAAGATGGAGGTTAACTGCATCAACAGCACGTTTGTAATGTCTCTATACATTGCATTGTGGCCCATCATGACTCTTGGGCTAGTATTGCTAGTCTATAGTGACTCCACCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 77080 182 + 647215 TACACTCCTGGTACATACATTGTTACCCAGAATAAAGCTTTTGTAAATCTAGGAATCATATTTATAAAGCGAAGATGGAGGTTAACTGCGTCAACAACAACTTTGTAAGATCTCTATACATTGCATTGTGGCCCATGATGACTCTTGGGCGAGTATTGCCAGATTATAGCAACTCCACATGC - -a -s mr.mrrefChr0 80195 96 + 130230 GACTGAGACTGGAGGTGCTAAGAAGTCCTACTGAGTATTATGGCGATCAACTTGCAATAAGAACCTGGTATAGTAAAAAGTAAGGCAACCTGTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84777 96 + 636262 GAGTGAGACTGGAAGTGCCAAGAAGTCCTACTGAGTATTATGGCGAGCAACTTGCAATAAGAACCTGGGATAGTAAAAAGTAAGGCAACCTGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77263 90 + 647215 TACTAAGACTGGAGGTGCTAAGAA------CTGAGTATTATGGTGATCAACTTCCAATAAGAACCTGGTATAGTAAGAAgtaaggcaacctgttaa - -a -s mr.mrrefChr0 80291 84 + 130230 ATAAAAAGACTCACatGATCTTAttATGTGGACAATGATGAGGTGTCCGCAAAATAGAATTATGTACATCTGACCAATCATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84873 84 + 636262 ATAAAAAGACTCACATGATCTTATTATGTGGACAATGATGAGGTGTCCGCAAAATAGAATTATGTACATCTGACCAATCATGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 77360 84 + 647215 ataaaaagaatcacacgatcttattgtatggacaATCATCAGATATCGGCAAAATAGAATTATGCACATCTGACCAATCATGTG - -a -s mr.mrrefChr0 80375 26 + 130230 TTCCCCCACATGCCTTGCCTTTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84957 26 + 636262 TTCCCCCACATGCCTTGCCTTTTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77450 25 + 647215 CCCCCCCACATGCCTCGCCAC-TTTA - -a -s mr.mrrefChr0 80401 73 + 130230 ACGAAATGGCTGGAACTGTAAAGCCAGGCAACTTTATTGCATCTCCTGACCGGGGGGGCACAACTCTAGCGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84989 73 + 636262 ACGAAATGGCTGGAACTGTAAAGCCAGGCAACTTTATTACATCTCCTGACCGGGGGGGCACAACTCTATGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77475 73 + 647215 ACGAAATGGTTGGTACTGTAAAGCCAGGCAACTTTATTGCTTCTCCTGACTGAGGGGGCAGAACCCTAGCGTA - -a -s mr.mrrefChr0 80474 100 + 130230 AAACAGAGTTGACTAGTGTGGTTGAAGATACTAAGAAGTCTGCCACTGTTTAATGTTCTTTTTGGGGACAGAACACTTATGGGCAAGCCAAGTTGTAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85120 100 + 636262 AAACAGAGTTGACTAGTGTGTTTGAAGATACTAAGAAGTCTGCCACTGTTTAGTGCTCTTTTTGGGGACAGAACACTTATGGGCAAGCCAAGTTGTAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77548 100 + 647215 AAACAGAGTTGACTAGTGTGGTTGAAGATACTAAGAAGTGTGCTGTTGTTTAATGTTCTTTTTGGGGGCAGAACACTTATGGGCAAGCCAAGTTGTAAGA - -a -s mr.mrrefChr0 80574 65 + 130230 ATGATAAGAAAGTACTCCATGCCTCAAACTAATGGATATAGCAAATTGATACATGAAGGTGAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85222 65 + 636262 ATGATAAGAAAGTACTCCGTGCTTCAAACTAATGGATATAGCAAATTGATACATGAAGGTGAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77648 65 + 647215 ACAATAAGAAAGTACTCCATGCCTCAAACCAACGGAGATAGTAAATTGACACATGAAGGTGAAGA - -a -s mr.mrrefChr0 80639 281 + 130230 GTCCAGTCTAGTGGTCATGTACTACAGTTTGCGGCTTGTTTGAGGGAATCCTTATGACTGTGTGCGGTACTGGTCCCTAGGAGGCAAGAGGTATTATGCTGGAAACAAAAACATTAGCCTTTTAAAGCAAGTACCTAAAAGCACAGACAAGAGAGTGCTGGATGAGACCATAGAGACCTTCCTGATGGATATGAAAATAGGCATAGAAAATAAGCATGAGATGATCTGATGGTTATGCCTAGTCACTAAGATCTGACATATACGGGCTACAGTCTACTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85305 277 + 636262 GTCTGGTCTAGTCGTCATGTACTACAGTTTGCAGCTTGGTTGAGGGAATCCTTATGACTGTGTGCGGTACTGGTCCCTAGAAGGCAAGAGGTCTTATGCTGGAAACAAAAACATTAGCCTTTTAAAGCAAGTACCTAAAAGCACAGACAAGAGAATGAAGGATGA--CCATAGAGACTTT--TGATGGATATGAAAATAGGCATAGAAAATAAGCATGAGATGATCTGATGGTTATGTCTAGTCACTAAGATCTGACATATACGGGATACAGTTTACTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 77713 276 + 647215 GTCCAGTATAGTGGTCATGCACTACAGTGTGCGGCTTTTT----GGGGCTCCTATGTATTTGTGGCGTATTAGTCCCTAGGAGACAGAAGGTATTATGCTGGAGACAAAAACATTAGCCTTCTAAAGCAAGTGCCTAGAAGCACAGATAAGGGAGTGCTGGATGAGACCATAGAGACCTTCCTGATGGATATGAAAATAGGCATAGAAAATAAGCATGAGTTGATCTGCTGGT-ATGCCTAGTCAGTAGGATTTGCCACATACGGGCTACAGTCCACCAAC - -a -s mr.mrrefChr0 80920 77 + 130230 CCATTAGCTTAGCCAACCCTAAGATCATGACATCTCTAAGATTGCAATGACCTAACACGGGGCTAGGGATTATGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85583 77 + 636262 CCGTTAGCTTAGCTGACCCTAAGATCATGACATCTCTAAGATTGCGATGACCTAACACGGGGCTAGGGACTATGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77989 76 + 647215 CCATTAGCTTAGCCAACCCTA-GATCATGACATCTCTAAGATTGCAATGGCCTAACACACGGCTAGGGATTATGGAG - -a -s mr.mrrefChr0 80997 121 + 130230 ATTATCTAGCTAGTTTTCAGTTTTGGCACTGCCCCCCCCTTTTGTTTACCTCATCAGTCTTCCATAAAATTAGTTTGGCAGTTCAGCTTGAAATAGCTCTCACAGGATGTTGCCCCATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85660 121 + 636262 ATTGTCTAGCTAGTTTTCAGTTTTGGCACTGCCCCCCCCTTTTGTTTACCTCATCAGTCTTCCATAAAATTAGTTTGGCAGTTTGGCTTTAAATAGCTCTCACAGGATGTTGCAATATTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 78066 103 + 647215 ATTACCTAGCCAGTTTTCTGTTCTGGCACTGCCCCCCCCTTTTGTTGATTTCATCAGTTTTCCGTAAAATTTGTTTAGCAGTTCAGCTTGA------------------TTGCCCCATTTG - -a -s mr.mrrefChr0 81118 17 + 130230 AGGGTAGTGACTCAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85786 11 + 636262 AGGGTAGTGAC------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 78169 17 + 647215 AGGATAGTGACTCAGTC - -a -s mr.mrrefChr0 81135 127 + 130230 AATGGTGTATTGAATATCTTAACTCTGGAAGACACAGAATACGCACCCTTGAATAAGTTTTTCCTGAAATGGGGTATCAAAAATCTTAACTCTGGAAGACATAGAATCTGTATTCTTGAGTGAGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85797 127 + 636262 ATTGTTATATTGAATATCTTAACTCTGGAAGACACAGAACACACACCCTTGAATAAGTTTCTCCTGAAATGGGGTATCAAAAATCTTAACTCTGGAAGACATAGAATCTGTATTCTTGAGTGAGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 78187 127 + 647215 AATGGTGTATTGAAAATCCTAACTCTGGAAAACGTTGAATAAGCACCCTTGAATCAGTTTTTCCTGAAAGGGGGTATCAAAAATCTTAGCTCTGGAAAACATAGAATCTGTATTCTTGAATCAGCTT - -a -s mr.mrrefChr0 81262 22 + 130230 TACAAGAAGGTAGGTGTTCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85932 22 + 636262 TACAAGAAGGTAGGTGTTCCTT - -a -s mr.mrrefChr0 81284 170 + 130230 TTCTAGTATCAGATGGAAAGAGTGAACTCACATGTGAAAGTGCAGATGGGATTGTTGATGGAATGTTTAGATCCCCAATATTTGTCCCACCTCAGTCACCTACAAAATGTGATGCTACTGGGCCTGATCGAGAAGGGAGTTATGAAGTGTCCTTTGCCCCAATCCACTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85955 170 + 636262 TTCTAGTATCAGATGGAAAGAGTGAACTCACATGTGAAAGTGCAGATGGGATTGTTGATGGAATGTTTAGATCCCCAATATTTGTCCCACCTCAGTCACCTACAAAATGTGATGCTACTGGGCCTGATCGAGAAGGGAGTTGTGAAGTGTCCTTTGCCCCAATCCACCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 78314 36 + 647215 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGAGTCATGATGCATCCTTTGTCCCAATCCACTAC - -a -s mr.mrrefChr0 81454 61 + 130230 ACCCGGCCTTGATATGTGTCTGCAACCTGTAGGATGTACCCTGACCTGTTGGATTTTCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86128 61 + 636262 ACCCGGCCTTGATATGTGTCTGCAACCTGTAGGATGTACCCTGACCTGTTAGATTTTCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 78350 61 + 647215 ACCTGGCCTCAATATGTGTCTGCGACCTCTAGGATGTACCCTGACCTGTTGCATTTTCTTT - -a -s mr.mrrefChr0 81515 104 + 130230 TTATAGTTAATGACTGGCATGTTCTGTACATTGATTGGGAGATTAATTGATTAGTTAACTGACTACTTTAGTTAGTGTTCTTTGTAGCTCCTCACTCACATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86196 104 + 636262 TTATGGTTAATGACTGGCATGTTCTGTACATTGATTGGGAGATTAATTGATTAGTTAACTAACTACTTTAGTTAGTGTTCTTTGTAGCTCCTCACTCACATGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 78411 104 + 647215 TTATAGTTAATGACCGGCATGTTCTGTACGTTGATCTGGAGATTAATTGATTAGTTAACTGACTACTTTAGTTGGTGTTCTTTATAGTTCCTCACTCACATGTG - -a -s mr.mrrefChr0 81619 20 + 130230 ATATGATACTGTGCTTCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86399 20 + 636262 ATATGATACTGTGCTTCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 78515 20 + 647215 ATATGATACTCTGCTTCCTA - -a -s mr.mrrefChr0 81639 19 + 130230 CTTTCATCTAGGCGTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86420 19 + 636262 CTTTCATCTAGGCGTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 78535 19 + 647215 CATTCATTTAGGCATGAGT - -a -s mr.mrrefChr0 81658 6 + 130230 CTGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86442 6 + 636262 CTGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 78554 6 + 647215 CAGGTC - -a -s mr.mrrefChr0 81664 75 + 130230 ATAGGAGATGGGGAAGATGGGAAGGCTGGCAGTATTTCGCCATAGTATGTCACTGCTGTGGTCCTAAACTAAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86452 75 + 636262 AGAGAAGATGGGGAAGATGGGAAGGCTGGCAGCATTGCGCCATAGTATGTCACTGCTGTGGTCCTAAACTAAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 78560 65 + 647215 ATAGGAGATG------ATGGGAAGGCTAGCAGTATCTCGCCATAGTATGATGTTGCTGCTGCT----ACTGAGTT - -a -s mr.mrrefChr0 81739 55 + 130230 TTCACTTATGCTGCTGCCACCCACTCAATTGCTTGCTTTTTTTTTATAGTTGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86527 55 + 636262 TTCACTTATGCTGCTGCCACCCACCCTATTGCTTGCTTTTTTTTTATAGTTGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 78626 55 + 647215 TCCACTTATGCTGGTGCCACCCACTCAATTGCTTCCTCTTTTTTTATGGTTGTAT - -a -s mr.mrrefChr0 81794 14 + 130230 CCCCGGGCCATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86584 14 + 636262 CCCCGGGCCATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 78681 14 + 647215 CCCTGGGCCAGATG - -a -s mr.mrrefChr0 81808 32 + 130230 GATTCATCCATCCTCTTCCTGATACCCCAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86598 32 + 636262 GATTCATCCATCCTCTTCCTGATACCCCAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 78706 32 + 647215 GATTTGTTGGTCCCCCTTCTGGCACCCCATGA - -a -s mr.mrrefChr0 81840 26 + 130230 CAGATGAGTACTAGGCCCACAAGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86703 26 + 636262 CAGATGAGTACTAGGCCCACAAGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 78738 26 + 647215 CAGATGAGTACTATGCCCATGAGTCC - -a -s mr.mrrefChr0 81866 35 + 130230 AGTTCAATCTTATTCACAGCATctgggtgacgctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86729 35 + 636262 AGTTCAATCTTATTCACAGCATCTGGGTGACGCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 78765 35 + 647215 AGCCCATTCTTATTCACAGCATttccgtgacgcct - -a -s mr.mrrefChr0 81901 11 + 130230 tcctaggttgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86784 11 + 636262 TCCTAGGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 78800 11 + 647215 ttctaggttgt - -a -s mr.mrrefChr0 81912 82 + 130230 ggaatgggctcttcaaccacttggttaacaaaggtgcacatcaggatccccaaatccattagggtgtcagcaaataatcatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86796 82 + 636262 GGAATGGGctcttcaaccacttggttaacaaaggtgcacatcaggatccccaaatccattagggtgtcagcaaataatcatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 78811 82 + 647215 tgaatgatcacttcaactatgtggttaacaaaggtgcacatcaggatctccaaacccattaaggtgtcagcaaataattatg - -a -s mr.mrrefChr0 81994 37 + 130230 atgcaagcacaacttgaatggtcacagcttcaaaact -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86879 37 + 636262 atgcaagcacaacttgaatggtcacagcttcaaaact -s simRat_chr6.simRat.chr6 78893 37 + 647215 atgtaattacaatttgaatggtctcagcttgaaaact - -a -s mr.mrrefChr0 82031 21 + 130230 ccatacacaaagtatgtcttg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86918 21 + 636262 ccatacacaaagtatgtcttg -s simRat_chr6.simRat.chr6 78930 21 + 647215 ccatacacaaagtatgtcttg - -a -s mr.mrrefChr0 82052 67 + 130230 ttggtcctagcttctggactaggactcttatgttctgagaacttggcgaatagcaaatagttctaga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86939 67 + 636262 ttggtcctagcttctggactaggactcttatgttctgagaacttggcgaatagcaaatagttctaga -s simRat_chr6.simRat.chr6 78952 67 + 647215 ttggtcatagtttcaggagtaggactcttatgttctgagtactgggggaatagcaaatagttctaga - -a -s mr.mrrefChr0 82119 19 + 130230 cggtcgggtacctgagcac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87006 19 + 636262 cggtcgggtacctgagcac -s simRat_chr6.simRat.chr6 79021 19 + 647215 tgttctagaatttgcacac - -a -s mr.mrrefChr0 82138 12 + 130230 aaccaagcacct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87025 12 + 636262 aaccaagcacct -s simRat_chr6.simRat.chr6 79041 12 + 647215 aactaagcacCT - -a -s mr.mrrefChr0 82150 10 + 130230 aaactattta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87039 10 + 636262 aaactattta -s simRat_chr6.simRat.chr6 79053 10 + 647215 AACATGTTCA - -a -s mr.mrrefChr0 82160 14 + 130230 CTGTGCACTATTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87049 14 + 636262 CTGTGCACTATTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 79066 14 + 647215 CAGAGTATAATTAG - -a -s mr.mrrefChr0 82174 10 + 130230 GGAGTTAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87068 10 + 636262 GGAGTTAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 79080 10 + 647215 GGCAACAATT - -a -s mr.mrrefChr0 82184 15 + 130230 CTAGTTATACTTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87081 15 + 636262 CTAGTTATACTTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 79090 15 + 647215 CCAAGTACACCATAT - -a -s mr.mrrefChr0 82199 62 + 130230 GAACATGTTAACATCATAATTGTTGACCGGTATTCTAATGTGTGACAGTCAAACAGCTTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87103 62 + 636262 GAACATGTTAACATCATAATTGTTGACCGGTATTCTAATGTGTGACAGTCAAACAGCTTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79105 62 + 647215 AAAGTTCTAAATATAGTGATTGTTGACTGGTATTCTAACGTCTGACAATCAAACAGCTTCTA - -a -s mr.mrrefChr0 82261 38 + 130230 AAGTACATAACAAAAGGTTAATGATTCACATACCCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87196 38 + 636262 AAGTACATAACAAAAGGCTACTGACTCACATACCCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79167 38 + 647215 AAGTACATAACAAAACGTTAATTATTCACATACCCTCA - -a -s mr.mrrefChr0 82299 160 + 130230 ACCTGCTCTGTACCAAGGAGTATGTTTATTGCTTACATAAATTGGTAATGATACTTTTCCTCATATCACTCTGAACACTATAGGTATCTCATAGTGGGATGCGCCTAGCTGTATAGTTCTGGGTAAAGTCAATAACAATGACCTATGACCAATGGTACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548632 160 - 636262 ACCTGCTCTGTACCACGGGGTATGTTTATTGCTTACATAAATTGGTAATGATACTTTTCCTCATGTCACTCTGAACACTATAGGTATCTCATAGTGGGATGCGCCTAGCTGTATAGTTCTGGGTCAGGTCAATAGCAATGACCTATGACCAATGGTACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 79205 157 + 647215 AACTGTTC---ACCAAGGAGTATGTTTGTTGCTTATTGAAATTGGTAATAACACTATTCCACATATCACTCTGAACACTATAGGTATCTCATAGTGGGATGCAACCAGCTGTAGAGTTCTGGGTAAACTCAATAACAATGACCTATGACTGATGATACAG - -a -s mr.mrrefChr0 82459 207 + 130230 ATACCAATCTTCAAAGGAAAACATCAGGCAAGAACCCCCAACCCAGGAGAAAAAGAGCTGCTTGCATTAACTGGATTCACTGGTGAGCAGCATATCTAGAGTGCTCCAGTATATAGATATTCTGCAAATCATAGACTTCTTTGTGGGGCAACTATTCATGGAGCCTGGTCTTCTCAGTTTAAAAAACCTCAGGTAGGTGTTTGTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548793 188 - 636262 ATACCAATCTTCAAAGGAAAACATCAGGCAAGAACCCCCAACCCAGGAGAAAGAGAGCAGCTTGCATTATCTGGATTCACAGGTGAGCAGCATATGTAGAGTGCTCCAGTATATAGATATTCTGCAAACTATAGTCTTCATTGTGAGGCAACTATTCATGG-------------------AAAAAACCTCAGGTGGGTGTTTGTCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 79362 207 + 647215 ATATCAATCTTCAAAGGAAAACATCAGGTAAGATCCCCCACCCCAGGAAAAAAAGAGCTGCTTGCATTAACTGGATGCACTGGTGAGCAGCATATCCAGAGTGCTCCAGTATATAGATATTCTGCAAATCATAGACTTCTTTGTGGGTCAACTATTCATGGAGCCTGGTCTTCTCAGTTTAAGAAACCTCAGGTAGGTATCTGTCAT - -a -s mr.mrrefChr0 82666 37 + 130230 TTACCAGCCTGAACATAAGGAAATATTAACACCGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548981 37 - 636262 TTACCAGCCTGATCATAAGGAAATATTAACACCGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 79571 37 + 647215 TTACCAGCCTGAACATAAGGAAACATTAACACAGGTT - -a -s mr.mrrefChr0 82703 2 + 130230 CA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549018 2 - 636262 CA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79609 2 + 647215 CA - -a -s mr.mrrefChr0 82705 28 + 130230 TAGTGCCAGCCTTCATATGGCTTTAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87633 28 + 636262 TAGTGCCAGCCTTCATATGGCTTTAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 79622 28 + 647215 TCACGATGGCCTTCATCTGGCTGTAACC - -a -s mr.mrrefChr0 82733 33 + 130230 GGAGCATCCAAGAGTCAAAAAGTAAAACTGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87668 33 + 636262 GGGGCATCCAAGAGTCAAAAAGTAATACTGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 79650 33 + 647215 GAAGCATCCAAGAGTCAAAAAGTAGAACTGTAG - -a -s mr.mrrefChr0 82766 11 + 130230 TACACAGGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87705 11 + 636262 TCTGCAGGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 79683 11 + 647215 TACACAACCAC - -a -s mr.mrrefChr0 82777 68 + 130230 GGTCACATGTTACTCATAAAGCTATTATAGTCCAGACTACACAGTTGGGCCTCTTGCAATGAATAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87719 37 + 636262 GGTCACATGTTACTCATAAAGCTATTATAGTCCAGAC------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 79694 68 + 647215 GGTCACATGGTACTCATAAAGCTATTATAGTCCAGACTACACAGTTGGGCCTCTTGCAATGAATAATA - -a -s mr.mrrefChr0 82845 87 + 130230 TACAGAGATCTTCCAAGTCGGCTTCGAAACATACTCATGTGCTCAATCCTGTTATTCCTAAAACAGACACACTGCTGGGCAGTTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 79767 87 + 647215 TACAGAGATCTTCCAAGTCGGCTTCGAAACATACTCATGTGCTCAATCCTGTTATTCCTAAAACAGACACACTGCTGGGCAGTTACT - -a -s mr.mrrefChr0 82932 373 + 130230 GAACACAAGGGTGGTACTATCTGATGAACTCTCACATTTTGGCTTCAGTACGCTCCATCAAATCATAGAGTAATGCTCATTAACTGGGAATCTTCTCTCCTGAAGCCAACCCATGTGTAACCAGGTGTCTCTGTATGATTGACTTCCTCCAGACCAGCATTATCAGCAAAGGCAGATTTATTGCCAGGCCCTCAGCTGCAAGTTGCTATAGTTAATTTCTTGTCTCTGTGCCTCATCATTATTAACCAATGTCGATTTCATGGTGGATGGTCAACGGGTTTACTGGAGATTAGCAAATTATATGACACTAGCAGAACAATAGGAAGGTTCAGCTGGAGAAAGATCACAAGCTACAGCTGCCAAGACTCAAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87756 280 + 636262 ----------------------------------------------------------------------------------------AATCTTCTCTCCTGAAGCCAACGCATGTGTAACCAAGTGTCTCTGTATGATTGACTTCCTCCAGACCAGCATTCTCAGCAAAGGCAGATTCATTGCCAGGCCCTCAGCTGCAAATTGCTATAGTTAATTTCATGGCTCTGTGCCTCATCATTATTT-----TGTAGATTTCATGGTGGATGGTCGACGGGTTTACTGGCGATTAGCAAACTATATGACACTAGCAGAACAATAGGAAGGTTCAGCTGGAGAAAGATCACAAGCTATAGTTGCCAAGACTCAAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 79856 373 + 647215 GAACACAAGGGTGGTACTATCTGATGAACTCTCACATTTTGGCTTCAGTACGCTCCATCAAATCATAGAGTAATGCTCATTAACTGGGAATCTTCTCTCCGGAAGCCAACCCATGTGTAAACAGATGTCTCTGTATGATTGACTTCCTCCAGACCAGCATTATCAGCCAAGTCAGATTTATTACCATGCCCTCAGCTGCAAGTTGCAATAGTTAATTTCTTGTCTCTACGCCTCATCATTATTAACCAATGTCAATGTCATGGTGGATAATCAACGGATTTAATGGAGATTAGCGGATTATATGACACTAGCAGAACAATAGGAGGGTTCAGCTAGAGAAAGGTCATGAGCTACAGCTGCCAAGACTCAACTG - -a -s mr.mrrefChr0 83305 387 + 130230 AGGGGTTATAGCAGCATCAAACAAATAAGCTGATGGATGTAAGCTTAAGCTGAAAGAGAATTGAAAATTACCTCTCGCCAAAAAGGTGAAAGTACTTTGTCGGAACACAATATCAGACTTTGGCTAATTCCAGAGAAAATTCTAATATGAATATTAGCGTGAATAGTAGAAGGGGGTTAAATGCACAGAGGGGATAGGGCTCTACTGGGATCAGACAAACATGAAGCTAAGTAGTAGTTTAGGACAGTTGTAGCCCCAAGGGACCAATTGTCATGTATCTGATACACCGGACCTGTCCTCATGGTCCCTGTCTTCATAAAACAAATCTCAATACGGTAATTAATCCTGAGAAGCAAAGAATGAATAACCAAAGCATTACTTGACAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88040 380 + 636262 AGGGGCTATAGCAGCATTAAACAAATAAGCTGACGGATGTAAGCTTGAGCTGAGAGAGAATTGAAAATTACCTCTCGCCAAAGAGGTGAAAGTACTTTGTC-------ATTATCAGACTTTAGATCATACCAGAGAAAATTCTAATATGAATATTAGCATGAATAGTAGAAGGCGGTTAAATGCACAGAGGGGATAGGGCTCTACTGGGATCAGACAAACATGAAGCTAAGTAGTAGTTTAGGACAGTTGTAGCCCCAAGGGACCAATTGTCATGTATCTGATACACCGGTCCTGTCCTCATGGTCCCTGTCTTCATAAAACAAATCTCAATATGGTAATGTGTCCTGAGAAACAAAGAATGAATAACCAAAGCATTACTTGACAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 80229 384 + 647215 ---AATTATAGCAGCATCAAACAAATAAGCTTATGGATGTAAGCCTAAGCTGAAAGAGAATTGAAAATTACCTCTCACCAAAAAGGTGAAAGTACTTTGTCGGAACACAATATCAGACTTTGGCTAATTCCAGAGAAAATTGGAATATGAATATCAGCGTGAATAGTAGAAGGGGATTGAATGCACAGAGGGTATAGGGCTCCACTGGGGTCAGACAAACACCAAGCTGACTTGTAGCTTAGGACAGTTGTAGCCTCAAAAGACAAATTGTCATGTATCTGATACACTGGACCTGTCTTCATGGTCCCTGTCCTCATGAAGCAAATCTCAATACGGCAATTAATCCTGAGAAGCACAGTATTAATAAGCAAAGCATTACTTGGCAAG - -a -s mr.mrrefChr0 83692 39 + 130230 TGATAGTTAACACATTGTCTGAGCCTTCTGGTTGGCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88435 39 + 636262 TGATAGTTAACACATTGTCTGAGCCTTCTGGTTGGCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 80613 39 + 647215 TGATAGTTAACACATTGTCTGAGCCCTCTAGTTGTCAGA - -a -s mr.mrrefChr0 83731 44 + 130230 CCAGACAATTCACCTTTTAGTGGTTGCATAATGCAAACCATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88476 44 + 636262 CTAGACAAGTCACCTTTTAGTGGTTGCATAATGCAAACCATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 80652 44 + 647215 CCAGACAATTGACCTTTTAGTGGTTGCATAATGCAAACTATCAA - -a -s mr.mrrefChr0 83775 22 + 130230 CTCCATCATTTACTATTGGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88520 22 + 636262 CTTCATCATTTACTATTGGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 80697 22 + 647215 CTCCATCATTTACTATTGGAGC - -a -s mr.mrrefChr0 83797 7 + 130230 AGTTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88542 7 + 636262 AGTTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 80720 7 + 647215 AGTTAAT - -a -s mr.mrrefChr0 83804 22 + 130230 CTTCTTCCACCATTGAACATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88550 22 + 636262 CTTCTTCCACCATTGAACATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 80727 22 + 647215 CTTCTTCCACTATTGAATGTTA - -a -s mr.mrrefChr0 83826 87 + 130230 GACTCATCTTGTAAGTATACCCCCCATACATAGGCTAAGAATCCATTTCAGTCTGTGGTACGAAATTTAGTCTGTTAGGGGAAATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88575 87 + 636262 TACTCATCTTGTAAGTGTACCCCCCATACATGGGCTAAGAATCCATTTCAGTCTGTGGTACGAAATTTAGTCTGTTAGGGGAAATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 80749 86 + 647215 GACTCATCTTGTAAGTATACCCCTCACACATAGGCTAAGA-TCCATTAAAGTCTGTGGTATGAAATTTAGACTATTAGGGGGAATTT - -a -s mr.mrrefChr0 83913 50 + 130230 ATGAAATCCCAACCTATGGGATGCAGATCTGGCAGAAAGGTAACAACAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88662 50 + 636262 ATGAAATCCCAACCTATGGGATGCAGACCAGGCAGAATGGTAACAACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 80836 50 + 647215 ATGAAATCTCAACCAATGGGGTGCAGATCTGGCAGATAGGTAACAACATA - -a -s mr.mrrefChr0 83963 59 + 130230 CCACTCACTTTAATAACACAAAAAAGCAATTGAATCACTGTGTCCTCTACTGAATTCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88713 59 + 636262 CTACTCACTTTAATAACACAAAAAAGCAATTGAATCACTGTGACCTCTACTGTATTCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 80886 59 + 647215 CCCCTTATTTTAATAACACAGAAAAACAATCAAATCACTGTGTCCTCTACTGACTTCGC - -a -s mr.mrrefChr0 84022 18 + 130230 AATGGTATCCCACCATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88780 18 + 636262 AATGGTATCTCACCATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 80945 13 + 647215 AATGGTATCCCAC----- - -a -s mr.mrrefChr0 84040 50 + 130230 TCAAATTACCATCATGAGTTCATTAATGGAGGGATAGGGAATTTAACAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88800 44 + 636262 TCAAATTA------TGAGTTCATTAATGGAAGGACAGGGAACTTAACAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 80958 50 + 647215 TCAAATTACCATCATGAGGTCATTAATGGAGGAATAGAGAATTTAAGAAG - -a -s mr.mrrefChr0 84090 230 + 130230 GTAACATAATCCAGGACAGTAGAAGTCTAGTGTCAATGCCTGCAATTCTATTAGTAAGGTGCTAGCTGTCATTGGCTGCAAATACCAATTTATGACAAGTACCCACTTGTGACCCTGTTTTGCACCATAACTTCCTTTCCTGCATGGAACCTCCATCCTTATTATTCACATCTTCATGAACTGACTCTTGCATCAGAGATTTTACGATAGCAACCCTCTTAGCCTGCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88844 230 + 636262 GTGACATAATCCAGGACAGTAGAGGTCTAGTGCCAATGCCTGCAATTCTGTTAGTAAGGTGCTAGCTGTCATTGGCTGCAAATACCAATTTATGACAAGTACCCACTTGTGACCTTGTTTTGTGCCATAACTCCCTTTCCTGCATGGAACCTCCATTCTTATTATTTATATCCTCATGAACTGACTCCTGTATCAGGGATTTTACGATAGCAACCCTCCTGGCCTGCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 81171 217 + 647215 GTAACATAATCCAGGACAGTAGAAGTCTTGTGTCAGTGCCTGCAATTCTATTAGTAAGGTGCTAGC-------------AAATACCAATTTATGACAAGTACCCACTTGGCACCCTGGTTTGCACCATAACTTCCTTTCCTGAATGGAACTACCATCCTTATTATTCACATGTTTATGAACTGACTCTTGCATTAGAGATTTTACTATAGCAACCTTCTTAGCCTGGCTT - -a -s mr.mrrefChr0 84320 350 + 130230 AAATAGACAGAAGGAATATTATAATATATTTTGCTTAAGGTACCAATGCAGAGGTCCCTGTCCCCACACTATAGACTTTTTGCTGCTGCCAAACCACATCCTGGTGGGTGATAATAGCCCATCAAGACATTAGTAGCATGGTGTGTTTCTGTAAGTTCTCCCATACTAAAACATAACTGCTAGTTGCCAGTGATGTGTCATACAATGCTCCTGTGGCACATGCTTGCGGCTAGAGCCATGCCTAACTCCCAATGAAAGCCCTTAGGTGGGCAAAATTGTCATCACAATATTTAAAAAGCCATCTTCCTTGCCTCAACAGTGATGAGCTAAAAACTTTAAGAATAAGTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89081 340 + 636262 AAATAGATAGAAGGAATATTATAATATATTCTGCTTAAGGTACCAATGCAGAGGTTTCTGTCCCCACACTATAGACTTTTTGCTTCTGCCAAACCAC-TCCTG-TGGGTGATAGTAGCCCATCAAGACATTAGTAGCATGGTGTGTTCTTATAAGTTCTCCCATACTAAA--------GTTAGTTGCCAGTGATGTGTCATGTAATGCTCCTGTGGCACATGCTTCCGGCTAGAGCCATGCCTAATTCCCAATGAGAGCCCTTAGGTGTGCGAAATTGTCATCACAATATTTAAAAAGCCATCTTCCTTGCCTCAACAGTGATGAGCTAAAAACTTTGAGAATAAGTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 81388 348 + 647215 AAGTAGACAGAAGGAATACCGTAATATATTTTGCTTAGGGTACCAATGTAGAGGTCCCTGTCCCCACTCTAGAGACTTTTTGCTGCTGCCAAACCACATCCTGGTGGGTGATAATAGCCCACCAAGACATTAGTAGCATGGTGTGTTTCTGTAAGTTCTCCCATACCAAAACATAACTGCTAGTTGGCGGTGATGTGCCATACAATGCTC-TGTGGCACATGCTTGCGGCTAGAGCCATGCCTAACTTCCAATGAAAGCCCTTAGGTGGGCAAAATTGTCATCACAATATTTAAAAAGCCATCTTCCTTGCCTTAACAGTGATGTTCTAAGAACCT-AAGAAGATGTAAC - -a -s mr.mrrefChr0 84670 47 + 130230 AACGTATCAGCACTACACTGCTTTGTAATAAGTATATCATCTGCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89421 47 + 636262 AACCTTTCAACATTACGCTGTTTTGTAATAAGTATATCATCTGCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 81737 41 + 647215 AAAGAAGCAGCACTCCAATACTTTATG-TAGG-----CGTCCCCCAG - -a -s mr.mrrefChr0 84717 133 + 130230 GAATATGTAGCCACAAAAGCACTTTTATCTTCTACTCATCCACAAAGCACCAGCTTATAGTAAGCCTTGCAACTTCAGACCAGTGCATTGCATACCCTGAACTATGAATGGGTGTCAATGGACTAGCTTTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89468 122 + 636262 GAAGATGTAGCCAAAGAAGC-----------ATACTCATTCATAAAGCACCAGCTTATAGTAAGCCTTGCAACTTCAGACCAGTGCATTGCATACCCTGAATTATGAACGGATGTCAATGGACTAGCTTTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 81780 133 + 647215 GAATAGTCAACTGCAAGAGCACTTTTATCTTCTACTCATCCACAAAGCACCAGCTTACAGGAAGCCTTGAAACTTCACAGCAGTGTGTTGCATACCCTGAACTATTAATGGGTGTCAATGGACTAGCTCTCAA - -a -s mr.mrrefChr0 84850 140 + 130230 GTATCACATGGTGTCTTGGTCATGGGTACtaaagagttcaataggacttggttggagtgtgagtcccaaaactttatactttcccctcagcacttacaccctgagaaagaggctacgttccatgaggcgtcttATATAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89592 140 + 636262 GTATCACATGGTGTCTTGGTCATGGGTACtaaagagttcaataggacttggttggagtgtgagtcccaaaactttatactttcccctcagcacttacaccctgagaaagaggctacgttccatgaggcgtcttATATAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 81913 140 + 647215 GTACCAGATACTGTCTTGGTCATGGGTACtaaagagttcaatagcacttggttggagtacaaatcccaaaactttctactttcccgtcagcacttactccctgagaAACAGGCTGCCTTCCATGTGCCTTCTTATATAGT - -a -s mr.mrrefChr0 84990 55 + 130230 GATTCCAGTTAACTCCTCTGGTTCACTTGACAAAGTTACACCCTCATATAGCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89733 55 + 636262 GATTCCAGTTAACTCCTCTGGTTCACTTGACAAAGTTACACCCTCATATAGCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 82053 55 + 647215 GATTCCAGTTAACTGCTATAGCTCACTTGACAAAGTTGCACCCTCATATCACAAA - -a -s mr.mrrefChr0 85045 60 + 130230 AATCTTTTAGAGACCCCCCAAGATGCATTCTGTGAACGTCAAGATTTGGTGCTTTATCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89788 60 + 636262 AATCTTTTAGAGACCCCCCAAGATGCATTCTGTGAACGTCAAGATTTGGTGCTTTATCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 82118 60 + 647215 AATCTTTTAAAGACCCCCCAAGATGCATTTTGTGAACATTGAGATTTGGTACTTTATCTA - -a -s mr.mrrefChr0 85105 20 + 130230 ACCCAGAGCTGTGACCCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89849 20 + 636262 ACCCAGAGCTGTGACCCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 82178 20 + 647215 ACATAAAGTTCTGAGGCTGT - -a -s mr.mrrefChr0 85125 59 + 130230 CAATCAGCCATTGGTCTGAGGCACCTGGGGTTACGCTCTCATTAAGTAAACTATGAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89869 59 + 636262 CAATCAGCCATTGGTCTGAGGCACCTGGGGTTACGCTCTCATTAAGTAAACTATGAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 82200 59 + 647215 CAATCAACCATTGGTGTGGGGGACCTGAGGTCACACTCCCATTAAGCAAACTATAAAAG - -a -s mr.mrrefChr0 85184 17 + 130230 TATAGGAGTCCACTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89928 17 + 636262 TATAGGAGTCCACTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 82260 17 + 647215 TATAGGAGTCCACTCAA - -a -s mr.mrrefChr0 85201 407 + 130230 GAAGTGTGTCATGGTATTACCAGCTCATCCTGTTCCACTCCATCTTCTTGCTAAGAGGCACCAGAAAACAGAGGCAGCATATTTGAATGCCAGCTTGAACATAGCAGGCAAGCGGGTGCAATTGTCCAAACTCATGTAGAGATAAAGGTGAGCCTAGGTCTGGTGTGTGGGATATACCTGGCTAATTGAGTGAATAGCAAACTGTGCAAAGGTCCCACTGGTGCTGCCAAATCCCCCACTCACTCACTCACTCAACCTTATAACAGTGTTTTATCAGTAAGTAGTACTTGTGTGTAACTTATGTCACAGTCCATCCAAGCATGAGGAGCTATCAGGGAGGCCCTCGGTCAGTTCTTCTTTTTTCAGATCAGAGTTTTTGCCATGGATACAGGTACCTTTAATGGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89953 398 + 636262 GAAGTGTGTCATGGTATTACCAGCTCATCCTGTTCCACTCCATCTTCTTGATA----GCACCACAAATCAGAGGCAGCATATTTGAATGCCAGCTTGAACACAGCAGGCAAGCGGGTGCAAGTATCCAAACTCATGTAGGGATAAAGCTAAGCCTAGGTCTGGTGTGTGGGATATACCTGAATAATTGAGTGAATAGCAAACTGTGCATGGGTCCCACTGGTGCTGCCAAATACCCCACTCATTCACTCACTCAACCCTATAACAGTATTTTATCAGTAAGTAGTATTTGTGTGTAGCATATGTCACAGTCCATCCCAGCATGAGGACCTATCAGGGAGGCCCTTGGTCAGTTCTTCTTGT-----ATCAGAGTTTTTGCCATGGATACAGGTACCTTTAATTGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 82277 399 + 647215 GGAGTATTTCGTGGTATCCCCTGCTCATCTCATTCCACTTCATCTTCTTGCTAAGAGGCACCAGAAAACAGAAGCAGTATACTTGAATGCCAGCCCGAACATAACAGGCAAGCAGGTGCAATTGTCCAGACTCATGTAGAGATGAAGGTGAGCCTAGGTATGGCGTGTGGGATAGACCTGGCTAATCGAGTGAATGGCAACCTGTGCAAAGGTCCCACTGGTGCTGCCAAATCCCCCACTCACTCGC--------ACTTATGACAGTGTTTTATCAGTAAGGCGTGCTTGTGCGTAACTTTTGTCACAGTCTGTCCAAGCATGAGGAGCTATCAGGGAGGCCCTCGATCAGTTCTTCTTTTTTCAGCTTAGAGTTTTTGCCCTGGGCACAGGTATCTTTAATGGTAT - -a -s mr.mrrefChr0 85608 49 + 130230 TAGCCATAAATGGTACTGGGCAGAGCAGGTGTTAGACTAAGGTTGTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90357 49 + 636262 TAGCCATAAATGGTACTGGGTTGAGCAGGTGTTAGACTGAGGTTGTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 82676 45 + 647215 TAGCCATAAATGGTACCGGACAGAGCAGGTG----ACTAATGTCGTCAA - -a -s mr.mrrefChr0 85657 22 + 130230 CCATTTGTCAAGCAAGGTAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90406 22 + 636262 ACATTTGTCAAGCAAGGTAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 82722 22 + 647215 CCATTTGTCAAGCATGGTAATA - -a -s mr.mrrefChr0 85679 203 + 130230 TGCCAGAAGTGCTCTGGCAACACTGTTGGAGCCACATTTTCTTCTAACCCAGAGGGGGGTTGTGAAGTGGGTTTAATGTTATCAGGATAGGTGGTGCATTGAGAACCTATAATCAATCCAAGGTTAAAAGGTTAGTCAGAACAATACTGATGCCAGTATTGTTGATGGGCCGGTAGTAATGTCCAAACGACGGGATGATCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90430 198 + 636262 TACCAGAAGTGCTCTGGCAACACTATTGGAGCCTCATTTTCTTCTAACCCAAAGGGGGATCGTGAAGTGGGTCTAATGTTATCAGGATAGGTGGTGCATTGAGAACCTCTAATCGATCCAAAATTAAAAGGTTAGTCAGGACAATACTGATGCCAGTATT-----TGGGCCGGTAATAATGTCCAAACGACGGGATGGTCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 82744 203 + 647215 TGCCAGAAGCGCTGTGGCAACACTGTAGGAGCCACATTTTCTTCTAACCCAGATGGGGGTTGTGAAGTGGGTTTAATGTTATCAGGATAGGTGATGCATTTTGAACCTATAATCAATCCAAGGTTAAAAGGCTAGTCAGAACAATACTGATGCTGGCATTGTTGATGGGCTGCTCGTAATGTCCAAACAATGGGATGATCATA - -a -s mr.mrrefChr0 85882 11 + 130230 GGTGCTCTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90628 11 + 636262 GGTGCTCTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 82990 11 + 647215 GGTGCTCTATC - -a -s mr.mrrefChr0 85893 67 + 130230 AGGTACTTACTTGGGTACTACTCTTCTGGCTATGCACTACAATGATGCAGATATGATAGGTCCCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90640 67 + 636262 AGGTACTTATTTGGGTACTACTCTTCTGGCTATGCACTACAATGATGCAGATATGATAGGTCCCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 83001 67 + 647215 AGGTAATTACTTGGGTACTACTCTCCTGGTTATCCACTACAATGATGCAGATATGATGGGTCCCTTT - -a -s mr.mrrefChr0 85960 84 + 130230 GGAATTACAAAAGACATGCATATTATTGGGGAGACGTACTATAAGTAAGCATTTTAACCTCAACAGTAGATGAGGAAATGCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90712 83 + 636262 GGAATTACAAAAGACATGCATATTATTGGGGAGACGTACTATAAGTAAGCATTTTAACCTCAACAGT-GATGAGGAAATGCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 83068 84 + 647215 GGAATTACAAAAGACGTGCATATTTTTGGAGAGAAGTACTATAAGGAAAACTTTTTAACTCCACAGGAGATGAGGAAACGCAAG - -a -s mr.mrrefChr0 86044 8 + 130230 CAAGATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90797 8 + 636262 CAAGATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 83152 8 + 647215 CAAGATGG - -a -s mr.mrrefChr0 86052 235 + 130230 AACATAGGACTATTGAGAACTCCAAGGCGAGGGGGCTGGTGCAATAAAGCTCTCACTGCATAGAAGAGATAGGGTGGCAATACTCCCCAATAGAAAATAATCCAGCATAGACTCATTGGGTTGCAGGAGTGGGGGACCACAGTCAATTGGCAGTGCCTGGAAAAGTCTAAACTCTATCTAGGAAAGTCATCTGCACTTAGAAACCTAGATGGGGGTTGCAACAACGGGGGACCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90808 235 + 636262 AATACAGGACTATTGAGAACTCCAAGGCGAGGAGGCTGGTGCAATAAGGCTCTCACTGCATAAAAGAGATAGGGTGGCAATGCTCCCCAATAGAAAATAATCCAGCATAGACCCATTGGGTTGCAGGAGTGGGGGACCACAGTCAATTGGCAGTGCCTGGAAAAGTCTAAACTCTATCTAGGAAAGTCATCTGCACTTAGAAACCTAGATGGGGGTTGCAACAACGGGGGACCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 83160 232 + 647215 AACATAGGACTATTGATAACTCCAACGTGAGGGGGCTCGTGCAACAAAGCTCTCACTGCATAGGAGAGATAGGGTGGCAAAACCCC---ATAGAAATTCATCTAGCCTAGACTAATTGGGTCGCAGGAGTGGGGGACCACAGTAAGCTGGCAGTGCCTGGAAAAGTCTAAACTCCAGCTAGGAAAGTCATCTGCACTTAGAAGAGAGTCTGTAGGTTGCAACAATCGGGGACCAC - -a -s mr.mrrefChr0 86287 9 + 130230 GTCAGTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91044 9 + 636262 GTCAGTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 83392 9 + 647215 GTTAGTTGA - -a -s mr.mrrefChr0 86296 159 + 130230 CTATGCCTATAAATGGTCTAAATTCTAGCTAAAAAAGTCAACTACATTTAGGACTTGCTAATATACATAAGAGTACCCACAATGGACCTGGTGTAGTCTGTGAGAAAACTATCAAAGACTTAGTGGCTCTGGGGTTGAAGATATCTGATAAGATGGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91056 159 + 636262 CTATGCCTATAGATGGTCTAAATTCTAGCTAAAAAAGTCAGCTACATTTAGGACTTGCTAATATACATAAGAGTACCCACAATGGACCTTGTGTAGTCTGTGACAAAACTATCAAAGACTTAGTGACTCTGGGGTTGAAGATATCTGATAAGATGGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 83401 150 + 647215 CTATGCCTAGAAATGTACTAAATTCTAGCTAAAAAAGTCCAATACATTTAGGACTTGCTAATATACATAAGA---------ATGGAGCTGGTGTAGTCTGTGAGAGAACTATATGAGACTTAGTGGCTCCGGGGTTGAAGATATCTGATAAGAGGGTCA - -a -s mr.mrrefChr0 86455 91 + 130230 AGTAATATATTAATCGTCCACCTTGCATAAAGGTGACCCACGCCATGGCAAAATTTAATTGGGTTCCATGTGCTATGGTACCTCCAATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91215 90 + 636262 AATAATATATTAATC-TCCACCTTGCATAAAGATGACCCACGCCATGGCAAAATTTAATTGGGTTCCATGTCCTATGGTACCTCTAATTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 83553 91 + 647215 AGTAATAGATTATTCGTCCACCTTGCATAAAGGTGAACCAGGCCATGGCAAAACATAATTGGACTCCATGTGCTATGATACCTCCAAGCGG - -a -s mr.mrrefChr0 86546 42 + 130230 TCTGGTCATAGTAGCTTGGGAAAAATAAATCAAGACAAGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91305 42 + 636262 TCTGGTCACAGTAACTTGGGAAAAATAAATCAAGACAAGGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 83646 15 + 647215 CAGGGTCATAGTAGC--------------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 86588 13 + 130230 AATTTAAATGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91381 13 + 636262 AATTTAAATGGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 83661 13 + 647215 ACACTAACTGTGT - -a -s mr.mrrefChr0 86601 9 + 130230 TCCATGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91394 9 + 636262 TCCATGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 83675 9 + 647215 TACATGGCC - -a -s mr.mrrefChr0 86610 12 + 130230 ATGGTACCTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91404 12 + 636262 ATGGTACCTCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 83684 12 + 647215 ATGTGAAGTCTA - -a -s mr.mrrefChr0 86622 303 + 130230 TTAATCTGGTCACAGTAACTTGGGAAAAAATAATTAAGACAAGGGTGGCTGTTTATTATGTGAGGCTAGAACAGTGTCTAGATTATCTCTACTTAGTATACTCTCACTACATGTGGTGGGGACAGATTATCCTCAATTAATATTGTTGGGACTGTCCCTGAACCATCAATATATTCTTTATCTTAGGGTTGCCCGATACAACCGTCAACTAATATAATATGGATGCCTATAACTTGATGCCCTCAGGTCAATGTATGGAGAGCAAGAAGTAAACATGATTCTTCAATAGCAGCACACTTCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91417 303 + 636262 TTAATCTGGTCACAGTAACTTGGGAAAAATAAATCAAGACAAGGGTGGCTGTTTATTATGTGAGGATAGAACAGTGTCTAGATTATCTCTACTTGGTATACTCTCACTACATGTGGTGGGGACAGATTATCCTCAATTAATATTGTTGGGATTATCCCTGAACCATCAATATATTCTTTATCTTAGGGCCACCCAACACAACCGTCAACTAATCTAACATGGATGCCTATAACTTGATGCCCTCAGGTCAATGTATGGAGAGCAAGAAGTAAACATGATTCTTCAATAGCAGCACACTTCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 83696 303 + 647215 TTAATCTGGTCGCAGTAACTTGGGAAAAAATAATTGAGATAAGGGTAGGTGTTAAATATGTGGGGCTAGCACAGTGTCTAGATTATCTTGACTCAATATACTCTCACTACATGGGGTGGGGACAGTTTACCCTCAATCAATATTGTTGGGACTGTCACTGTATCATCAATATATTCTTTATCTTAGGGTTGCCTGATACAACCGTCAACTAATATAATATTGATGCCTATAACATTGTGCCCTCAGGTCAATGTATGGAGAGCAAGATGAAAGCATGATTCGTCAATAGCAGTGCACTTCAAT - -a -s mr.mrrefChr0 86925 55 + 130230 ATATTATCAACCCGGAGCTTCGCAGGCTAGTACCCACCCTTATATCAGATAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91721 55 + 636262 ATATTACCAACCCAGAGCTTCGCAGGCTAATACCCACTCTTATATCAGATAGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 83999 53 + 647215 ATATTATCAACCCGGAGCTTGGCCGG-TAGAACTGACCCTATTATCAGATAGAC- - -a -s mr.mrrefChr0 86980 5 + 130230 GCCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91778 5 + 636262 GCCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 84052 5 + 647215 GCCAG - -a -s mr.mrrefChr0 86985 152 + 130230 CCAGCACTGTGGAAACAAACAATTATAAACTATGGGAAGGTGTAAAAACTGTATAGATCTATTGTGTTCTGTACCACTTTGGAGTTCCATTGGCCTATCATCAGGACATGTTAGTGGTAGTTGTCATGGAGAGTTAGCCAGACCTGAGCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91789 152 + 636262 CCAGCACTGTGGAAACAAACAATTATAAACTATGGGAAGGTGTAAAAACTGTATAGATCTATTGTGTTCTGTACCACTTTGGAGTTCCATTGGCCTATCATCTGGACATGTTAATGGTAGTTGTCATGGAGAGTTAGCCAGACCTGAGCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 84057 92 + 647215 ------------------------------------------------------------ATTATGTTCGGTATCATTATGGAGTCCCATTGGTCTATCATCAGGACATGTTAGTGGTAGTTGTCATGTGGAGTTAGCCAGACCTGAGCTCG - -a -s mr.mrrefChr0 87137 284 + 130230 TTCAGATTTGATTCAGATACCACTCTTGAACCTCTAGAAACATTTGCTGTACTGAGAGGTAAGTATGTTACTCCCTCATCAACAGGTGCAATGCACTGTGTTGCAGAATACAGTCCTTGCATCATAACAGATTTTGTCTGGTTGCCCAAACCCCTAGCACTTGAGCTGAGAATCCTCAGACTGGCACCCAAGAAGCTGTGTTACATAGTATTACTCAAGCTGGAGCAGTGATATTGTATGCACCAGGTTTTGATTCGGCTTTATGTTTATAGCTGCTCAAATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91941 284 + 636262 TTCAGATCTGATTCAGGTGCCACTCTTAAACCCCTAGAAACATTTGCTGTACTGAGAGGTAAGTATGTTGCTCTCTCATCAACAAGTGCAGTATACTGTGTTGCAGACTACAGTCCTTGCATCATAACAGATTTCATCTGGTTGCCCAAACCCCTAGCACTTGAGCTGAGAGTCCTCAGACGGGCGCCCAAGAAGCTGTGTCACATAGGATTACTCAAGCTTGAGCAGTGATATTGTATGCACCAGGTTTTGATTCGGCTTTATGTTTATAGCTGCTCGAATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 84160 278 + 647215 TTCAGATTTGATTCATATACCAGTATTGAACCTCTGGAAACATACATTGTCCTGCGAGGTAAGTATGTTACTCCCTCGTCGACAGGTGCAATGCACCATGTTGCAGAAATCAGTCCCTGCATCATACTAAATTTTGTCTGGTTGCCCAAACCCCTAGCACTGG---TGTGAATCCTCA--CTGGCACCCGGGAAGCTGTGTTGCACAGTATTACTCAAACTGGAGTAGTTATATTATATGCACCAAGCTG-GCTTCAGCTTTATGTTTATAGCTGCTTAAATAA - -a -s mr.mrrefChr0 87421 82 + 130230 TTATAATTTACTTATGTTTACAGATGATGCCTAAACAGATTTAGATGTGGGTAAGTGAATTATAGACTAATGTTTAAGCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 92232 82 + 636262 TTATAATTTACTTATGATTACAGATTATGCCTAAACAGATTTAGATGTGGGTAAGTAAATTATAGACTAATGTTTAAGCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 84438 68 + 647215 CTGT-----------GTTTACAGATGAT---TAAACAGATTTAGATATGGGTAAGTGAATTATGGACTAATGTTTATGCATT - -a -s mr.mrrefChr0 87503 372 + 130230 GGTGGATACCCATACCTGCTAGCAGTATCTGAGGGCATGGCTACACAAGCCCCCAATAAGTATGACATGATCTGCTGTGCAATGCTCCTCCCTGCATAGAATGGCTATGATCAAATAAGAGCCAATTTAGTACATAGTACTAGTGCCTTGAATACTGCCTAACATTGTTTAGATTTTGCACAGTGCCTCGTGCAAAGCTCCAATTAAAGGCAAATGCGTGCATTCCCATTTAGTACTTGACATGCTGTCGAGCACTCATAGGTGCCTATAGAAGGAGCCTGCCCTCCTCATGCAAGCACCCTAATGGTCCAAAATGTCACTGCTATTCAAAGTACTATAAACCTTGTAAAATTTTACAAACATAGTTGTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 92315 362 + 636262 GGTGGATACCCATACCTGCTAGCAG---------GCATGGCTACACAAGTCCCAAATAAGTATGATATGATCTGCTGTGCAATGCTCCTCCCTGCATAGAATGTCTATGATCAAATAAGAGCCAATTTAGTACATAGTACTAGTGCTTTG-ATACTGCCTAACATTGTTTAGATTTTGCACAGTGCCTCGTGCAAAGCTCCAATTAAAGGCAAATGCGTGCATTCCCATTTAGTACTTGACATGCTGTCGAGCACTCATAGGTGCCTATAGAAGGAGCCTGCCCTCCTCATGCAAGCACCCTAATGGTCCAAAATGTCACTGCCATTCAAAGTACTATAAACCTTGTAATATTTTACAAGCATAGTTGTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 84506 362 + 647215 GGCAGATACCCAACCCTACTAGCAGTATCTGAGGGTGTGGCTTCAGAAGCCCCCA----------CATAATCTGCTGTGCAATGCTCCTCCCTGCATAGAATGGCTATGATCAAGTAAGAGTCAATTTAGTACATAGTAATAGTGCCTTGAATACTGCCTAACTTTGTTCAGATTTTGCGCAGCAGTTCGTGCAAAGCTCCAATAAAAGGCAAATGTCTGTATACACATTTAGCACTTGACACGCTATCAAGCAGTCAAAGGCACCCATCGAAGGAGCCTGCCCACCTCATGCAAACACCCTACTGGTCCAAAATGTCACTTCTATTCAAAGTACTATAAACCTTGTAAAACTCTACAAACATGATTGTCAG - -a -s mr.mrrefChr0 87875 20 + 130230 TATGATATGGAATGCTAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 92677 20 + 636262 TATGACATTGAATGCTAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 84869 20 + 647215 TATGATGTGTGATGACAGAA - -a -s mr.mrrefChr0 87895 146 + 130230 CTTAAAAGAAGAACATCACAAGCTTAAGAGTTTTTCAGCCAAATAATCTTTGATGGAAGAAGCTGAAGAGATTACTGACAACTACTTACACGCCTTGTTGACCACTCATTCCCTTGGAAACAGCATTATGGGAAGGAGTAACAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 92701 146 + 636262 CTTAAAAGAAGAACATCACAAGCTTAAGAGTTTTTCAGCCAAATAATCTTCAATGGAAGAAGCTGAAGAGATTACTGACAACTACTTACACGCCTTGTTGACCACTCATTCCCTTGGAAACAGCATTATGGGAAGGAGTAACAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 84889 145 + 647215 CTTAAAAGAAGAACATCACAAGCTTAAGAGTTCTTCAGCCAAATAATCTCTGATGGAA-AAGCTGAGGAGATTACTGACAACTACTTACACACCCTGTAAACCGCTAATTCCCTTGGAAAGAGCCTTATAGGAAAGAACATCAGGT - -a -s mr.mrrefChr0 88041 575 + 130230 GCCTAGGAAGACCTAGTCCCTCTGATGCATCCTTTATGAGTTCAGCAGTGAAAATGTATTTGAGATCCATAGGACAGAAAGCATATAAGTACAAACACTAGTATGATTTGTCCATGACTTGTGATGTGACTGTTCCAGACACTAGGTCTCCTTGCTGCATGCACTATGCGACCTGTTGAATCCTGCCCAGTTAAATATATTGTTGAAATAAATTCTGTCTTCTGATTTTTGATAGACCAGATCTTGTCCTCCACATTAATAGGTGATGGGGCAAGGGTACAATAACTGAAAGGGAACGCCGACCCTACTAAAAGGATAGACAGAGTTAAACCGCCTTCAGTTACAAATGTTTGAATTGGTGATTGGGATTGATAACATAACGTAGGTAGTTGCTTTTAGCATAGCATTATAACACAGGTACCCTAATAATCAGAAACTAGATCTAAGATGCAATGGTGAACCATCTTTTTAAAGCGCATAAGCAGGCTTGAGCTTGGGTGCTGAAACAGCATAGGTGCCCAGTGGAGTCATCCCAGTGCCCTGAATTTGGCAAGGAAGCACCACTGAAGGTCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 92885 567 + 636262 GCCTGGGAAGACCTAGTCCCTCTGATGCACCCTTTATGAGTTCAGCAGTGAAAA-GTATTTGAGATCCATAGGACAGAAAGCATATAAGTACAAACACTAGTATGATTTGTCCATGACTTGTGATGTGAATGTTCCAGACACCAGGTCTCCTTGCTGGATGCACTATACGACCTGTTAAATCCTGCCCAGTTAAAGATATTGTTGGAACAAATTCTGTCTTCTGATTTTTGATAGACCAGATCTTGTCCTCCGCA------GGTGATAGGGCAAGGATACAAAAA-TGAAAGGGAACGCCGGCCCTACTAAAAGGATAGACAGTGTTAAACCGCCTTCAGTTGTAAATGTTTGAATTGGTGATTGGGATTGATAACATAATGCCGGTAGTTGCTTTTAGCATAGCATTATGACACAGGTACCCTAATAATCACAAACTAGATATAAGATGCAATGGTGAACCATCTTTTTAAAGCGCACAAGCAGGCTTGAGATTGGGTGTTAAAACAGCATAAGTGCCCAGTGGAGTCATCCCAGTGCCCTGAATTTAGCAGGGAAGCACCACTGAGGGTCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 85034 534 + 647215 GCCTAGGAAGACCTAGTCCCTCTGATGCATCCTTAA-GAGTTCAGCGGTGAAAATGTATTTTAAATCCAAAAGACAGATAGCATATAAGTGAAAACAGTAGTATGATCTGCCCATGACTTGTGATGTGACTGTTCCAGACACTAGGTCTCCTTGCTGCCTGCATAATGTTACCTGTTGAATCCTGCCCTGTTAAATATGTTGTTGAAATAAATTCCGACTTCTGACTTTTGCTAGACCAGATTTTGTCCTCCACATTAATAGGTGATGGGGCAAGGGTATAATAACTGAAAGGGAAAGCGGACCTTACTAAAAGGATAGACAGAGTTAAACCACCTTTAGTTAC------------------------TTCATGACATAACATAGGTA----------------TGATATAACACAGGTACCTTAATAATCAGGAATTAGATCTAAGGCGCAATGGTCAACCACCTTTTTGAAGAGCATAAGCAGGCTTGATCTTGGGTGCTGAAACAGCTTAGGTGCCCAGTGGAGTAATCCTGGTGCCCTGAATTTGGCAAGGAAGCACCACTGAAGGTCCTG - -a -s mr.mrrefChr0 88616 48 + 130230 AACATATCCCTATCCCCACTCACCGGTAGTGATTGGATCAAAAGTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 93482 48 + 636262 AACATATCCCTATCCCCACTCACCGGTAGTGATTGGATCAAAAGTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 85568 48 + 647215 AACACATTCCTATCCCTAGCCACCGGTAGGGATTGGATCAAAAATAGG - -a -s mr.mrrefChr0 88664 18 + 130230 AGGACTTGCAATTGTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 93530 18 + 636262 AGGACTTGCAATTGTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 85618 18 + 647215 AGAACTTGTAATTGTTCC - -a -s mr.mrrefChr0 88682 106 + 130230 CTCTTGGCCAGCCAATTTTCCAATATCTGGTAATAGGCAGAACCACCTCTTCTGTGAAGGCATTAGATTCCAATATAATGGAGGATGTCGATTCCTCTGAATGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 93549 106 + 636262 CTCTTGGCCAGCCAATTTTCCAATATCTGGTAATAGGCAGTACAACCTCCTCTGTGAAGGCATTAGATTCCAATATAATGGAGGATGTCGATTCCTCTGAATGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 85636 102 + 647215 CTCTTGGACAGCCAATTTTCCAATATCTGGTAATAGGCAGAACCACCTCTTCTG----GGCATCAGATTCCAACGTAATGGAGGATGTTGATTCCTCTGAATGTGC - -a -s mr.mrrefChr0 88788 418 + 130230 ACTGAAGTGAGATTCCTGGGTTAGTTTCACATTCAATGGCAGTGGGTCAATGTAGCAATGTCAACTTTTCAGCTATACTACTCTCCACTATCAACAATATTGGGGTCAGTTGAGCCAGGGTGCATAATGGAGGCACAACTTGTCCAGTCAGGAAGGATAGACATGCACATTGACTGTTGGGGCAATGCCAGCTAATATTATAAAGATCTGCCTGAGGGTGGAAAACTAGCATTCCCAAACTAATGTCCTAGAGATTTTTATGGGTACAGATGAAACAAAGTCACAAGGACCCTTTCAGCTCTATGAGGAGGAAGAATTGAGGGGCAAGTAATTACATGGCAGAGAAGGAACACAAATTGGAAACTTGTGCCCATGACAATGGTATCAAGTCAAATAGATTAATATATAATAAGCTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 93655 412 + 636262 ACTGAAGTGAGATTCCTGGGTTAGTTTCACATCCAATGTCAGTGGGTCAATGTAGCTACGTCAACTTGTCAGTTATACTACTCTCCTCTATCAACAATATTGGGGTCAGTAGAGCCAGTGTGCATAATGGAGGCACAACTTGTCCAGTCAGGAAGGATAGACATGCACATTGACTGTCGGGGCAATGCCAGCTAATATTCTAAAGATCTGCCTGAGGGGGGAAAACTAGCATTCCCAAACTAATGTCCTAGAAATTTTTATGGGTACAGATG------AGCCACAAGGACCCTTTCAGCTCTATCAGGAGGAAGAATTGAGGGGCAAGTAAATACATGGCAGAGAAGGAACACAAATCGGAAACTTGTGCCCATGACAATGGTACCAAGTCAAATAGATTAATATATAAAAAGTTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 85781 418 + 647215 ACTGAAGTGAGATTCCAGGGTTAGTTATACATTCAATGGCAGTGGGTCAATGTGGCAATGTCAACTTTTGAGCTATACTACTCTCCACTATTAACAATATTGGGATCAGTTGGGCCAGGGTGCATAATGGAGGCATAACTTGTCCCGTCAGGAGGGATAGACATGCACATTGACTGTTGGAGCAATGCTCGCTAATATTATAAAGACCTGCCTGAGGGTGGAAAACTAGGATTCCCAAACTAATGCCCTAGAGATTTTTGTGGGTACAGATGAAACAAAGTCACAAGGACCCTTTGAGCTCTATGGGGAGGAAGAATTGAGGGTCGAGTAATTACATGGCGGAGAAGGAATACAAATTGGAAACTTGTGCCCATGACAATGGTGTCAAGTCAAATAGATTAATATATAATAAGCTTAA - -a -s mr.mrrefChr0 89206 78 + 130230 TATACAATAATTAGATGCAAAATTGACTAAGCATCTGTGTGGACATGTGCTGATTGTTATATTAACTGCCTGTGCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94070 78 + 636262 TATACAATAATTAGATGCAAAATTGACTAAGCATCTGTGTGGACATGTGCTGATTGTTATATTAACTGCCTGTGCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86199 78 + 647215 TATACAATACTTAGATGCAAAATTGATAAAGCATTTGTGTCAACATGTGCTGATAGTAATATTAACTACCTGTGCCAA - -a -s mr.mrrefChr0 89284 161 + 130230 GCATATTGACATATACTATGACATGCTTAACTCTCTTACTTACAAGCCAAGGTTCCCTATTTTGCTTATACCTCACAGTGATCCAGATTGGCCCATGAGTTCATGTGAAAGGTTACATTAATCTATGTGCTATTAACACCTGTGGAAGGAGTGTGCCCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94149 161 + 636262 GCATATTGACATATACTATGACATGCTTAACTCTCTTACTTACAAGCCAAGATTCCTTATTTTGCTTAAACCTCACAGTGATCCAGATTGGCCCATGAGTTCATGTGGAAGGTTACATTAATCTATGTGCTATCAACACCTGTGGAAGGAGTGTGCCCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 86277 161 + 647215 GCATATTGACTTGTACTATGACATGCTCGACTCTCTTACTTACAGGCCGAGGTTCCCTATTTTGCTCGTACCTCACAGCGATCCAGATTGGCCCATGAGTTCATGTAAAAGATCACATTACTCCATGCACTATTGACACCTGTGGAAGGAGCATGCCCGCC - -a -s mr.mrrefChr0 89445 226 + 130230 CACTCACTGTCAAGGAATCACACTTGTATATCATAAGATGATCTAGCACCACACTGACAGTGATGTCTAGTTAGACATCTAATGCCCATGTTGAACTATTTCACACCACCATCTGGCATATAAATATAAGTAGACATCTGCATCATATGACAGCTGAAACTAGTCTGAGCAAAAGCATGTCCTGAGATGCGAGTATAGAAGTACCATCCAGTAAAAAGCACCTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94310 226 + 636262 CACTCACTGTCAAGGAATCACACTTGTATATCATAAGCTGATCTAGCACCACACTCACAGTGATGCCTAGTTAGACATCTAATGCCCATGTTGAACTATTTCACACCACCATCTGGCATATAAATATAAGTAGACATCTGCATCATATGACAGCTGAAACTAGTCTGAGCAAAAGCATGTCCTGAGATGCGAGTATAGAAGTACCATCCAGTAAAAAGCACCTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86439 226 + 647215 TACTCACCATCAAGGAACCACACCTGTATATCATAAGATGACCTAGTACCACACTGACAGTGATGTGTAGTTAGACACCTAATGCCCAGGTTGAACTGTTTCACACCACTACCTGGCATATACATGTAAGTACGCATCTGCATTATAGGACAGCTGGCGCTAGTCTGAGGAAAAGCATTTCCTGAGATGTAAGTTTATAAGCACCATCCAGCAAAAAGCACCTAAA - -a -s mr.mrrefChr0 89671 139 + 130230 TATCATAGCAATAGAATCAAACAGAATGTGGTTGAAGGCCTGACATGCCAACTACCCTTTGGCTATTATGACCGCTCCTCCCTCCTTTGGCCCCAAGCTATCAGTGGACACTTTGCTGAGCTGATATAACAACCTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94536 139 + 636262 TATCATAGCAATAGAATCAAACAGAATGTGGTTGAAGGCCTGACATGCCAACTACCCTTTGGCTATTATGACCGCTCCTCCCTCCTTTGGCCCCAAGCTATCAGTGGACACTTTGCTGAGCTGATATAACAACCTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 86671 139 + 647215 TATCATAGGAGTAGAATTGAAAAGGATGTGGTTGATGGTCTGACATGCCCACTACCCTTTGGCCATTATCACCACTCCTCCCTCATTTGGCCCCGAGCTATCAGTAGATGCTTTGCTGAGATTACATGACAAACAATCT - -a -s mr.mrrefChr0 89810 21 + 130230 CCATATTTCCAATTGGTGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94677 21 + 636262 CCATATTTCCAATTGGTGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86810 21 + 647215 CCATATTCCCAAATGGTGACA - -a -s mr.mrrefChr0 89831 21 + 130230 CTTCAAAGTGTATTAACATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94730 21 + 636262 CTTCAAAGTGTATTAACATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 86831 21 + 647215 TTTCAAAGTACATTAAGACCT - -a -s mr.mrrefChr0 89852 127 + 130230 GGACTCAGAGACAGAAAATTGGAGCTATATAAAATATTGTATTCCATAGCCAAATGAAACAGTAACGGAATGGGCAGTCATGTGTGGTACACCCAAAAAGAAAATCTCAGGACGATTGTTATTGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94787 127 + 636262 GGACTCAGAGACAGAAAATTGGAGCTATATAAAATATTGTATTTCATAGCAAAATGAAACACTGACGGAATGGGCAGTCATGTGTGGTACACCCAAAAAGAAAATCTCAGGAAGATTGCTATTGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86852 116 + 647215 GGACTC-GAGACACAA------ATCTGTAT-GAATATTGTATTCCATAGCCCAATGAAACAGTAATGGAATGGGCAGTCACACTTGGTACACCTGAAAAGAAAATCTCAGGACCATTGTTAT---TG - -a -s mr.mrrefChr0 89979 92 + 130230 TTGTAACCAAAAGAGTGAAGGTAGACACTAAAACTCCGATCTCAGTAAACACCTTATGATTTACATACAGTCAAGGTTGGTTTTATCAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94914 83 + 636262 TTGTAACCAAAAGTGTGAAGGTAGACACTAAAACTCTGATCTCAG---------TATGATTTACATACAGTCAAGGTTGGTTTTATCGACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 86969 92 + 647215 TTATAACCAAAAGAGTGAAGGTAGACACTAAAACTCCGATCTCAGTAAACACCTCCTGATTTACATACAATCAAGGTTGGTTTTATCAACAT - -a -s mr.mrrefChr0 90071 58 + 130230 ACCAATTAAAAACCATACTGTTGTGAGTTTTTTGAGTTCTGTCTGCCACATAAAGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94997 55 + 636262 ACCAATTAAAAACCATATTGCTGTGAGTTTTTT---TTCTGTCTGCCACATAAAGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 87079 58 + 647215 ACCAATTAAAATCCATACTGTCGTTAGTTTTTTGAGTTCTGTCTGCCACATAAAGGAG - -a -s mr.mrrefChr0 90129 55 + 130230 TTCAAGTCCCAATATAAAGGAGTTTAGCAGAATAATGGCACAGCAGGTAGAAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95052 55 + 636262 TTCAACTCCCAATAAAAAGGAGTTTAGAAGAATAATGGTACAGCAGGTAGAAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 87138 55 + 647215 TTCAGGCCCCAATATAAAGGAGTTTAGCGGAATAATGCCATAGCTCGTAGATAGA - -a -s mr.mrrefChr0 90184 90 + 130230 GCACTACCTGCATTGGTAGGTTGAGGCTTTCTTACTGAGCATCCCTCCTTGGCCTTTGCAATGGCCACTGACTGGACATGTCAAGAAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95119 89 + 636262 GCGCTACCTGAATGGGTGGGTTGAGTCTTTCTTACTGAGCA-CCCTCCTTGGTCTTGGCTATGGCCACGGACTGGACATGTCAAGAAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 87193 90 + 647215 GCACTACCCGCATTGGTAGATTGAGGCTTTCTTACTGAGAATCCCTCCTTGGCCTTTGGAATGGCCACTGACTGGGCATGTCAAGAAATG - -a -s mr.mrrefChr0 90274 162 + 130230 ATGGTTTCAAGCAAGATAGGGACACAAGGTTGTTATAAAACCAGCAATGTACTAATGGAAAGGGCCCAATCAAGGTACAGCACTTAGTTTATGTATTGACTCCTGTAGGAGTGCTGTGTGAGGTTGGTGTGATCATTACAAATAGTGGACTGAGCACTCGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95208 145 + 636262 AGGGCTTCAAGCAAGATCAGGACGCAAGGTTGTTAT---ACCAGCAATGTACTAATGGAAAG--------------ACAGCACTTAGTTTATGTATTGACTCCTGTAGGAGTGCTGTGGGAGGTTGGTGTGATCATTACAAATAGTGGACTGAGCACTCGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 87285 162 + 647215 ATGGTCTCAAGCTAGATAGGGACACAAGGTTGTTATAAAACCAGCAGTGTACTCATGCAAAGGGCCCAATCAAGGTACAGCACTTAGTTTATGTACTGACTGCTTTATGAGTGCTGTGTGAGGGTGGTGTAATCGTTACAAGTAGTGGACTGAGCACTCGGC - -a -s mr.mrrefChr0 90436 172 + 130230 AAGTAATTCAAGTAACCCTGATCTACCTGTCTGCATACTGATGCCGCATGGTGATTTCCGGGGATTTAAAATAACATAAGTACTGTGTGTGTAGCCTTGTCCTAAAACTTGCTGGTGGTCTATATAGTTACATGGCAATAATGGCATTTTCTATGAAGAATGTGAGGGAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95355 164 + 636262 AAGTAATTCAA--------AATCTGCCTGTCTGCATACTGATACCGCATGGTGATTTCCGGGGATTTAAAATAATATCAGTAGCGTGTGTGTAGCCTTGTCCTAAAACTTGCTGGTGGTCTACATAGTTACATAGCAATAATTGCATGTTCTATGAAGAATGTGAGGGAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 87447 167 + 647215 AAGTAATCCAAGTAACCCTGATCTACCTGTCTGCATACTGATGCCATAAGGTGATTTCCAGATATTTAAAATAACATAAATACTGTGTGTCTAGCCTTGTCCTAGAA----GTGGTGGT-GATATAGTTACATGGCAATAATGGCAATTGCTATGATGAATGTGAGGGAGGT - -a -s mr.mrrefChr0 90608 32 + 130230 CATTGGCCACCTCCTGCTTCTGGCATAGCTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95519 32 + 636262 CATTGGCCACCTCCTGCTTCTGGCATAGCTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 87615 32 + 647215 CACTGGCCACCCCCTGCCTCTGGCATAGCTTC - -a -s mr.mrrefChr0 90640 157 + 130230 GGTAGACCTGGTAAGTACCAGTAAATGGACACAAGTATAAGCTACATATAGGACCATGACAAACAATAAAGTCAGTTAATGACAACTCTTTTCAGAGAATCAAAAGAAAAGGCAAATGCAGTCTACTTAGATAGGAACGGCAATTAAAATATGCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95563 157 + 636262 GGTAGACATGGCAAGTACCAGTAAATGGACACAAGTATAAGCTACATATAGGACCATGACAAACAATAAAGTCAGTTAATGACAACTCTTCTCAGAGGATCAAAACAAAAGGCAAATGCAGTCTACTTAGATAGGAACGGCAATTAAAATATGCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 87647 134 + 647215 AGTAGAGCTGGTGAGTACTATTAAATGGAC-CAAGTATAATATACATATAGGACCATGGGAAATAATACAGTCAGTCAATGACAACTCTTTTCAGAGAATCAAAAGTAAAGGTGAACGCAGTCTACTTAGATAGA---------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 90797 10 + 130230 AAAATTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95726 10 + 636262 AAAATTATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 87781 8 + 647215 --AATCATTG - -a -s mr.mrrefChr0 90807 59 + 130230 TTGGTGCTAATAATTTATGGAAAATTAAAGTAGACAACATTCCCGTTACTAGCTTTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95736 59 + 636262 TTGGTGCTAATAATTTATAGAAAATTAAAGTAGACAACATTCCCGTTACTAGCTTTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 87790 25 + 647215 TTGGTGCCAATAGTTTATGGCAAAT---------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 90866 22 + 130230 AGTACCAATAAGTTCATAAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95796 22 + 636262 AGTACCAACAAGTTCATAAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 87815 15 + 647215 -------ATAAAGTCATAAAGA - -a -s mr.mrrefChr0 90888 117 + 130230 AAGGGGCGGGACTAACCATAGTGTGGTGTTATTATCCACATTCTTACTCTATGCCTCTTAAAGATTGCTCCTGGCCACATGTCACTGGATTCATGAGCCTGATAAGTTTTGGCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95820 116 + 636262 AAGGGGCGGGACTAACCATAGTGT-GTGTTATTATCCACATTCTTACCCTATACCTCTTAAAGATGGCTCCTGGCCACATGACACTGGATTCATGAGTCTGATAAGTTTTGGCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 87830 117 + 647215 AAGCGGTGGGACTAACCATAGTGTGGTGTTATTATCTACATTAATCCTCTATGCCTCTTAAAGATTGCTCCTTGCCACATGTCATTGGGTTGATGAGCGCGATGAGTTTGGGCTGCA - -a -s mr.mrrefChr0 91005 277 + 130230 GGGAACATTAATAGCATTGATGTACATGGATTAGGTGTGATATAACCTAAGGAATAATAATGCATCTCAAGTGATGATATATTCATCACCTTTGTTTAGGATAAAGAGCTGCAAACTGAAAAATGACATATGAACTGTTAATGTTGTTTGGCTGGCTGTGGGACCCAGCACTTTTTATGGATCTTGACCAATCACAGCTTTGCATGCTAAATACAACTGCCATCTACATACTTCATGTCAAATACACAATTGATGGATTGAGCACTGTCATGTATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95936 276 + 636262 GGGAACATTAATAGCATTGATGTACACGGATTGGGTGTGATATAGTCTGAGGAATAATAATGCATCTCAAGTGATGATATATTCATCACCTTTGTTTAAGATAAAGAGCTGCAAACTGAAAAATGACATATGACTTGTTAATGTTGTTTGGCTGGCTGTGGAACCCAGCACTTTTTATGGATCTTGACCAATCACAGCTCTGCATGC-AAATACAACTGCCATCTACATACTTCATGTCAAATATACAATTGATGGATTGAGCACTGTCATGTATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 87949 277 + 647215 GGGAGCATTAATAGCATTGATGTACATGGATTAGGTGTGATATAACCTAAGGAATAACAATGCATCTCAAGTGATGATACATTCATCACCTTTGTTTAGGATATAGAGCTGTAAACTGAAAAACTGCATATGAACTGTTAATGTTGTTTGGCTGGCTGTGGGACCCAGAACTTTTTATGGATCTTGACCTATCACAGCTTTGCATGCTAAATACAACTGCCTTCTACATTCTGCATATCAATTACATGATTAATGGATTGAGCACTGTCATGTTTAT - -a -s mr.mrrefChr0 91282 61 + 130230 GTTGTGATGGTTGTGTCTTCAATACTGCTAATTGTTCTGTATTAAGCCATTAGCCTTGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96216 60 + 636262 GTTGTGGTGGTTGTGTCTTCAAT-CTGCTAATTGTTCTGTATTAAGCCATTAGCCTTGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 88226 61 + 647215 GTTGTGATGGTTGTGTCTTCAATACTGTTACTTGTTCTGTATTAAGCCATGAGCCTTGAGG - -a -s mr.mrrefChr0 91343 11 + 130230 CATATTTATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96277 11 + 636262 CATATTTATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 88287 11 + 647215 CATATTTATGA - -a -s mr.mrrefChr0 91354 26 + 130230 CTAATGGGGTACTGACCTCTGATCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96288 26 + 636262 CTAATGGGGTACTGACCTCTGATCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 88301 26 + 647215 CTAATGGGGTACTGACCTCTGATCCT - -a -s mr.mrrefChr0 91380 32 + 130230 TAACATCTACAGAAGGGCTGCTTGCCTCTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96314 32 + 636262 TAACATCTACAGAAGGGCTGCTTGCCCCTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 88408 28 + 647215 TTACGTCTACA----GGCTGCTTGCCTCTGGC - -a -s mr.mrrefChr0 91412 138 + 130230 TCATAGGATGGTGCTGTTACACTTCTCATCCATGGTTCCTAGCTTTTTTGTGATGTTGCTGTGCTTGCAGTATACACCATGGTGCAGTATACACCATGTTTCAACTGGTCTAGCTAAAATTGTCAGTGGGTAAGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96346 138 + 636262 TCATAGGATGGTGCTGTTACATTTCTCACCCATGGTTCCTAGCTTTTTTGTGATGTTGTTGTGCTGGCAGTATACACCATGGTGCAGAATACAGCATGTTTCAACCAGTCTAGCTAAAACTGTCAGTGGGTAAGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 88441 138 + 647215 TCATAGGATGGTGCAGTTACACTTTTCATCCCTGGTTCCTAGCTTTTTTGTGGTGTTGCTGTGCTTGCAATATACACCATGGTGCAGTATACACCATGGTTCAGCTGGTCTAGCTAAAATTGTAAGCTGGTAAGCACA - -a -s mr.mrrefChr0 91550 7 + 130230 AATACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96484 7 + 636262 ACTACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 88582 7 + 647215 AATACAA - -a -s mr.mrrefChr0 91557 62 + 130230 TATATACTAATGAAAACTGATAAAGATGTTGGAGCTCAGATAATTGTATTTCGTCTGGATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96491 61 + 636262 TATA-ACTAATGAAAACTGATAAAGATGTTGGAGCTCAGATAATTGTATTTCGTCTGGATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 88596 62 + 647215 TATATGTTAATGAAAACCGATAAGGACGTGGCAACCCAGATAATCGCATTACGCCTGGAACA - -a -s mr.mrrefChr0 91619 7 + 130230 TACACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96552 7 + 636262 TACACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 88662 7 + 647215 TATGCAA - -a -s mr.mrrefChr0 91626 108 + 130230 ATACTGTGGGGGCCATGTAATTGCAGTTACAGTGAGGGACTAGCTTAACTCATACACCAGGATATGGGTGCACCAGGATATGGAGGGATATGCAAGATACTGATTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96559 108 + 636262 ATACTGTGGGGGCCATGTAATTGCAGTTACAGTGAGGGACTAGCTTAACTCATACACCAGGATATGGGTGCACCAGGATATGGAGGGATATGCAAGATACTGATTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 88670 108 + 647215 ATACTATAGGAGTCATGCAATTGCAATCACAGTGAGGGACTGGCTTAACTTGTGCACCTGGATATGGGTGCACCAGGATATGTAGGGGTATGGGAGATACTGATTGCA - -a -s mr.mrrefChr0 91734 31 + 130230 ACAACATTAAGATTGCATCAAACATTAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96667 31 + 636262 ACAACATTAAGATTGCATCAAACATTAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 88783 31 + 647215 AAAACATTAAGATTGCAACAAACATTAATTT - -a -s mr.mrrefChr0 91765 40 + 130230 ATTGGCCTTAAAAATTGATTTCCCCACTCCTAAGGTTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96698 40 + 636262 ATTGGCCTTAAAAATTGATTTCCCCACTCCTAAGGTTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 88815 40 + 647215 ATTGGCCATAAAAATTGAGTTCACTGCTCCTAAGGTTATT - -a -s mr.mrrefChr0 91805 176 + 130230 GACAAATTTGTAAGAAACACCAGGTGAGCAGGTTCATATGATTTCAATCCAATTCGCAGATCCTACTTTGCATCATTTAGTACTGCTATATGCATAATCCTGGCTTAGCCCAATGACCTTTCTGCTGAAAGCCACTTCCCACGATTATAGGCACATCTGACACTCAGATCTCCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96738 169 + 636262 GACAAATTTGTAAGAAACACCAGGTGAGCAGGTTCATATGATTTCAATCCAATTCGCAGATCCTACTTTGTGTCATTTAGTCCTGCTATATACATAATCCTGGCTTAGCTAAATGACCTTTCTGCTGGAAGCCACTTCCCACGATTAAAGG-------GACACTCAGCCCTCCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 88857 176 + 647215 GACAAAATTGTAGGAAGCACAAGGTGAACAGGTTCATATGATTCAATCCTATTTTGCAAATCTTACTTTGCATCATTTAGTACTGCTATATGCATAGTCCTGGCTTAGCCCAATGACCTTTCTGCTGAAAGCCACTTCCCACAATTATCGGCACATCTGACACTCAGATGTCCCAT - -a -s mr.mrrefChr0 91981 28 + 130230 CCTCTTTTGGCTAGTCAGGTCACACCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96907 28 + 636262 CCTCTTTTGGCTAGTCAGGTCACACCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 89034 28 + 647215 CCTCTTTTGACTAGCCAGGTCACAGCCT - -a -s mr.mrrefChr0 92009 319 + 130230 TTAAATTGTTTAATGATGTCTACACATTTCTAGTCTAAACATTTCTAATGTTCACAAATTTAACAAGAACACCTGTAAGTATAAGCCTAGTATTGTGTGCATGGTGTGGAATTGTGCTCTTTTATTCATGTCATAGCTGACATCCCCATAAAGAATCCTCTGATGGAAGCCCAGTGTAAGTCTTAACTGGTACTTGTTCATAGGCTGGATAGAGAAGAGAACACATGGTCTGAATTGGATTCCAAAGCAGTAACAAAATAGATTCCAAAACAGCAGTGTATCTAGATATGGTTCTATTCATGTTTTCAAATTGGAATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96935 318 + 636262 TTAAATTGTTTAATGATGTCTACACATTTCTAGTCTAAACATTTCTAATGTTCACAAAATTAACAAGAACACCTGTAAGTATAAGCCTAGTATTGTGTGCATGGTGTGGAATTGTGCTCTTTTATTCATGTCATAGCTGACATCCCCATAAAGAATCCTCTGATGGAAGCCCAGTGTAAGTCTTAACTGGTACTTGTTCATACGCTGGATAGAGAAGAGAAT-CACGGTCTAAATTGGATTCCAAAGCTGTAACAAAATAGATTCCAAAACAGCAGTGTATCTAGATATGGTTCTATTCATGTTTTCAAATTAGAATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 89067 307 + 647215 TTGAATTGTTCAATGAAGTCTACACATTTCTAGTCTAAACAATTCGAATGTTTGCAAATTTATCAAGAACACCCATAAGTATAAGCCTTGTATTGTGTGCATGGTGTGGAATTGTGCTCTTTTATTTATGTCATAGCTGACATCCCCATAAAGAATCCTCTGATGGAAGCCCAGTGTAAATCTT-ACTGG-----------AGGCTGGATAGAGAAGAGAACACATGGTCTGGATTGGAGTCCAAAGCAGTAACAAAATAGATACTAAAACAGCGGTGTATCTAGAGATGGTTCTATTCATGTTTTCAAATAGGAGTGC - -a -s mr.mrrefChr0 92328 173 + 130230 ATCAAAAATTATGAATAGCCTAGTGTGATTGATGCATATGAGATTAAAACAGAGCCCACTTCACTACAAATTGGTTGTAAACATATCAGACTATATTTTACTAATGCTTTGGGATCGACTTTTGTTCTATCATACCCTCCCGATAATCATATACTTAGATGAGGCCCCCTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97253 173 + 636262 ATCAAAAATTCTGAATAGCCTAGTGTGGTTGATGCATATGAGATTAAAACAGAGCCCACTTCACTACAAATTGGTTGTAAACATATCAGACAATATTTTACTAATGTTTTGGGATCGACTTTTGTTCTATCATACCCTCCCGATAATCATATACTTAGATGAGGCCCCCTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 89375 173 + 647215 ATCAAAAATTATGAACAGCCTAGTGTAATTGCTGCATATGAGATTGGAACAGAGTGCACTGCACTACAAATGGGTTGTAAACATATCAGACTATATTTTACTAATTCTTTGGGATTGACTCTTGTTCTATCACCTCCACCCGAGAATCACATACTCTGATGTGCTCCGCTCTG - -a -s mr.mrrefChr0 92501 211 + 130230 GAAACAATAAATGTTTCATGAACTGGCCCTCTCTTCAACAGTAGGCAAGCTCCCCTAGGTATTGTCTGTCCACATTTCTTGAGCTAAGCATATTTGTATGAATCACTCTACAAAGAGCCAAGTGGTTTTTCTGGTCAACATAAATTCTAGATGTCATCTTAATGTAGGGTTATATGCCTGCCATTGAGAATGTATTTCTGCGGAAGCAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97427 211 + 636262 GAAACAATAAATGTTTCATGAACTGGCCCTCTCTTCAACAGTAGGCAAGCTCCCCTAGGTATTGTCTGTCCACATTTCTTGAGCTAAGCATATTTGTATGAATCACTCTACAAAGAGCCAAGTGGTTTTTCTGGTCAACATAAATTCTAGATGTCATCTTAATGTAGGGTTATATGCCTGCCATTGAGAATGTATTTCTGCGGAAGCAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 89548 211 + 647215 AAAGCAATAACTGATTCATGAACTGGCCCTCTCTTTAGCAGTAGGCATGCTTCCCTAGGTATTGTATGTTGACATTTCTGGAGCTAAGCATATTTGCATGTATCACTCTACAGTGTGCTAAGTAACTTGTCTTACTAACATAACTTCTAGGTGTCATCTTAATGTGAGGCTATGTGCCTGCCATTAAGAGTATATTGCTGCAGCAGCAATT - -a -s mr.mrrefChr0 92712 29 + 130230 GGACTTACTGAGCTTAACTTTGTTCTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97638 29 + 636262 GGACTTACTGAGCTTAACTTTGTTCTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 89760 29 + 647215 GGACTTACTGAATTTAACTTTATTTAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 92741 42 + 130230 TTAACACAGTGCCTCATGCAACACCCCAGTAAAAGACAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97667 42 + 636262 TTAACACAGTGCCTCATGCAACACCCCAGTAAAAGACAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 89805 42 + 647215 TTCACACAGTGCCTCATGCAACACTCCAATAAAACGCAAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 92783 69 + 130230 CATCCGGGTATATGAGGCTAGTGCTTGGAGCTATACCAATGTAATACTATACTTCATGATCTCTCTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97709 69 + 636262 CATCCGGGTATATGAGGCTAGTGCTTGGAGCTATACCAATGTAATACTATACTTCATGATCTCTCTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 89854 69 + 647215 CGGCCAGGTATGTGCAGTTAGGGTTTTGAGCTATAACAATTTAATACTATATTTCACAGCCTCTCCTGT - -a -s mr.mrrefChr0 92852 12 + 130230 ATGAGCCTTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97778 12 + 636262 ATGAGCCTTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 89925 12 + 647215 ATGTGCCTTTAT - -a -s mr.mrrefChr0 92864 62 + 130230 TCTTCTTCTGCTTTGGCAATGGATCTGTAATGTTGTAAAACATCTGCCTAAACAGTTTATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97791 62 + 636262 TCTTCTTCTGCTTTGGCAATGGATCTGTAATGTTGTAAAACATCTGCCTAAACAGTTTATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 89937 62 + 647215 TCTTCTTCTGACTTGGCAATGGACCTGTAATGTTGTAAAACACCTGCCTAAATAATTTATAC - -a -s mr.mrrefChr0 92926 189 + 130230 CCCTAAGCCTTATTTAAGAGAAGCAGCTTTGCAAAGCTATGCTTGGTCATGCCCGCCAGTTAATTTGTTTATATTGTGTTCTTCGGAGATGTATTTTCTATGATCAGGATCGGTTTGGTATGTATGCCATGACTGCTAACAAAGAATTTAACAGGTTCAAAGGAGAAATCAATGCCCAGGTAGACTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97855 189 + 636262 CCCTAAGCCTTATTTAAGAGAAGCAGCTTTGCAAAGCTATGCTTGGTCATGCCCGCCAGTTAATTTGTTTATATTGTGTTCTTCGGAGATGTATTTTCTATGATCAGGATCGGTTTGGTATGTATGCCATGACTGCTAACAAAGAATTTAACAGGTTCAAAGGAGAAATCAATGCCCAGGTAGACTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 89999 189 + 647215 CCACTATCCTTATTTGAGAGAAGCAACTTTGCAAAGCTACACTTGGTCATGCCTGCCAGTTAATTTGTTTATATTGTGTTTGCGGGAGATGTATTCTCAATGATTAGGATCGGATTGGTATGTGTGCCACAATTGTTAACAAAGAGTTGAACAGATTCAAGGGAGAACTCAACATCCAGGGAGACTGGT - -a -s mr.mrrefChr0 93115 31 + 130230 GGCACCTCCTAACCTGGTGATGAGTACTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98044 31 + 636262 GGCACCTCCTAACCTGGTGATGAGTACTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 90189 31 + 647215 GGCACCACCTAACCTGGTGATCAATACCTTT - -a -s mr.mrrefChr0 93146 34 + 130230 CCTAGCTGAGGTTGTGTATGTGACTTTACTGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98081 34 + 636262 CCTAGCTGAGGTTGTGTATGTGACTTTACTGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 90220 34 + 647215 CTAAGCTGAGTTTGTGTATGTGACTTTACTACTT - -a -s mr.mrrefChr0 93180 35 + 130230 AGCTCACAGTAGGTGTGCTTCTCACTCCCCTGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98116 35 + 636262 AGCTCACAGTAGGTGTGCTTCTCACTCCCCTGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 90254 35 + 647215 AGCTCACAATAAGTGTGCTTCTCACTCCCCTGGGA - -a -s mr.mrrefChr0 93215 213 + 130230 GAACATATAGATTCAAGGCAACACACTCTCTATGGGTATGGAAATATCAAAGTAAATTGGTTATGTGCATCACATTTTATTGCAAGTCTGTCAAAACTTGCTACGTCTGGGATTATCTTTGGTTCCCACCGACACAATGGTGTTACAGAATGTATTTAGTGACAATTAATCACTTTTTGAGGTCTGCATGACCTCTAAAATATCAGTTTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98151 213 + 636262 GAACATATAGATTCAAGGCAACACACTCTCTATGGGTATGGAAATATCAAAGTAAATTGGTTATGTGCATCACATTTTATTGCAAGTCTGTCAAAACTTGCTACGTCTGGGATTATCTTTGGTTCCCACCGACACAATGGTGTTACAGAATGTATTTAGTGACAATTAATCACTTTTTGAGGTCTGCATGACCTCTAAAATATCAGTTTTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 90292 213 + 647215 AAACATATAGTCCCAAGGCAGCACCCTCTCTATGGGTATGGAAATATCAAAGTAAAATTGTTAGGTTCACCACATTCTATTACAAGACTGTCAAATCTTGCTACTTCTGGGACTTTCGCTGGCTCCTACCAACACAAAGGTGTTGTAGAATGTATTGAAGGACAATTAATCATTTTTTAAAGTCTGCATGACCCCAAAAATATCAGCTTACCA - -a -s mr.mrrefChr0 93428 43 + 130230 ACTAGCATTCAACCAGACAGTTTTTTACTGGTTAGGACTATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98364 43 + 636262 ACTAGCATTCAACCAGACAGTTTTTTACTGGTTAGGACTATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 90513 43 + 647215 ACTAACATTCAACCAGACAGTTCTCTACCAGTTAGGACTAGCC - -a -s mr.mrrefChr0 93471 38 + 130230 ATCCTTTCCCACAAGATGCCGACCCTGTAAGATATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98407 38 + 636262 ATCCTTTCCCACAAGATGCCGACCCTGTAAGATATTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 90557 38 + 647215 ATCCTGTCCCACAAGATGCAGACCTTGTAAGGTTTAAA - -a -s mr.mrrefChr0 93509 42 + 130230 TTTTTTTTACTGATTTTGCAGGTCATATTGAATGACTATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98448 42 + 636262 TTTTTTTTACTGATTTTGCAGGTCATATTGAATGACTATTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 90595 42 + 647215 TACATCCCACTGGCTTTGCAGATCATATTGAAGGACCATTAA - -a -s mr.mrrefChr0 93551 38 + 130230 TCGTTTTCTGAGTCCTGCACGACCTCTATAATATCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98490 38 + 636262 TCGTTTTCTGAGTCCTGCACGACCTCTATAATATCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 90639 38 + 647215 TCATATTCTCAGGCCTGCCTGACCTCTATAATATCAGC - -a -s mr.mrrefChr0 93589 55 + 130230 TACCAACTAGCATTCAACCATACAGTTCTCCTATCCTATTGTTTCTCATAAGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98528 55 + 636262 TACCAACTAACATTCAACCAGACAGTTCTCCTATCCGACTGTTTCCCATCAGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 90678 54 + 647215 TAACGGCTAGCATT-ACTCCTTCAGTTGTCCTATCCTATTGTTTCTCACAAGATG - -a -s mr.mrrefChr0 93644 6 + 130230 GACCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98583 6 + 636262 GACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 90734 6 + 647215 GACTAC - -a -s mr.mrrefChr0 93650 36 + 130230 TTGCAAGGTTTAAGCATCTCTCCATCTGGCTACAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98589 36 + 636262 TTGCAAGGTTTAAGCATCTCTCCATCTGGCTACAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 90743 13 + 647215 TTG--AGGTTGTAGC--------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 93686 9 + 130230 CCTTGTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98626 9 + 636262 CCTTGTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 90756 9 + 647215 CCTTGTCCT - -a -s mr.mrrefChr0 93695 8 + 130230 TACAGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98643 8 + 636262 TGCAGGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 90765 8 + 647215 TACAGGGT - -a -s mr.mrrefChr0 93703 84 + 130230 GTGGTCTAATTTGTGGGAAGCCTAGGATATGTTTGCCAAACTCTCTCACCAGCAAAACACCAGCAAAACTTGACCCAGAATCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98651 84 + 636262 GTGGTCTAATTTGTAGGAAGGCTAGGATATGTTTGCCAAACTCTCTCACCAGCAAAACACCTGCAAAACTTGCCCCAGAATCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 90774 82 + 647215 CTGGTCTAATTTGTGGGAAGCCTAGG--ATGTTTGTCAAACTCTCTCACCAGCAAAACACCAGCAAAACTTGACCAAGAATCCT - -a -s mr.mrrefChr0 93787 187 + 130230 GTTTTAAGTTGTAATAGTTATCAGATTATATTAACTCTTTAAATACAATTAGATAATTGTTGTAGTAATACAAAATAATTAAATAAGCAGCAAGTGCCTCAAACTTCTTGTCACATCAGTCTAACAACTCCTACACAAATACACAATGCCATTTTTGTTGCCATCCAGGCCACAAGAAGCTTGCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98735 187 + 636262 GTTTTAAGTTGTAATAGTTATCAGATTACATTAACTCTTAAAATACAATTAGATAATTGTTGTAATAATACAAAATAATTAAATCAGCAGCAAGTGCCTCAAACTTCTTGTCACATCAGTCTAACAACTCCTACACAAATACACAATGCCATTATTGTTGCCATCTAGGCCACAAGAAGCTTGCCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 90859 186 + 647215 CTTTTAAGTTGTAATATTTATCAGATTATCTTAACTCCTTAGGTACAATTAGATAATTGTTGTAGTATTAGAAAATAATTAAATAGGCAGCAAGTACC-CAAACTTCTTGTTACATCAATCTGACAACTCCCACACAATTACATAATGCCATTTTTGTTCCTATCCAGGCCACAAGGAGTTTGCCAA - -a -s mr.mrrefChr0 93974 103 + 130230 CCCCACAAAAACAGGAATCATTCCAGCTTACTACTAACTTGCTAGGCTCAAAATTTGTCAATTTATGAGCAGCTGGAATGTGGGGTTGGTAAATACCATATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98922 103 + 636262 CCCCACATAAACGTGGATCATTCCAGCTTACTACTAACTTGCTAGGCTCGAAATTTGTCAATTTATGAGCAGCTGGAATGTGGGGTTGGTAAATACCATATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 91046 103 + 647215 CCCCACAAGAACAGGAATCATTCCAGCTTACTATTAGCTTTCCAGGCTCAAAATTTGTCAATTCATGAGCAGCTGGAATGTGGGGTTGGCAAATACTATATAT - -a -s mr.mrrefChr0 94077 9 + 130230 GTTGGTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99039 9 + 636262 GTTGGTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 91149 9 + 647215 GATGGTGAA - -a -s mr.mrrefChr0 94086 22 + 130230 ACGATCATTAGGTTTATTAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99049 22 + 636262 ACCATATTTAGGTTTATTAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 91158 22 + 647215 ACGAACATTAGGTTTAATTGGA - -a -s mr.mrrefChr0 94108 114 + 130230 CCATTAGGCTTTGGGCACATGAACCATTGACTTTAGTGAAAAGCCTGTAGCCTAGTTCAGAATTCCTTAATTCACTAGCCCGGCTCACACCCCATATAATGACTGTCCGTCTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99085 114 + 636262 CCATTAGGCTTTGGGCAAATGAACCATTGACTTTAGTGAAAAGCCTGTAGTTTAGTTCAGAATTCCTTAATTCACTAGCCCGGCTCACACCCCATATAATGACTGTCCGTCTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 91180 112 + 647215 CCACTGGGCTTTGGGCACATGAACCATTCACTTTAGTG--AAGCCTGTAGCCTAGTTCAAGATTCCTCCGTCGACTAGGCCGGCTCACACCCCATATAACAACCTTCCATTTAG - -a -s mr.mrrefChr0 94222 31 + 130230 AACTCCTAAAATGGATGTGCAGCAACCCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99201 31 + 636262 AACTCCTAAAATGGATGTGCAGCAACCCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 91292 31 + 647215 AACCTCCTAAATGGATCTGCAGCAACCCCCT - -a -s mr.mrrefChr0 94253 40 + 130230 AACAGGAAAATAGGATATAGGACAGTTTCCAGAGAGGACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99232 40 + 636262 AACAGGAAAATAGGATATAGGACAGTTTCCAGAGAGGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 91324 40 + 647215 AACCGGGAGATAGGATATAGGAGAGTTTCCAGAGAGGACC - -a -s mr.mrrefChr0 94293 13 + 130230 GGCTCCTGTTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 91365 13 + 647215 GGCTCCTGTTTAT - -a -s mr.mrrefChr0 94306 78 + 130230 TCTTAAACATATTGCTCAACCACCTCTTTGGGAATTTGCATCCGCTTGCTTCAGCTCATTGATGAAGATATGGAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99272 53 + 636262 -------------------------CTTTGGTAATTTACATCCGCTTGCTTCAGCTCATTGATGAAGATATGGAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 91381 77 + 647215 TCTTAAACATATTGCTCAACCACCTCTTTGGGAATTTGCACCCACTCGCTTGAGCCCATTGATGAA-ACAGGCAGCAT - -a -s mr.mrrefChr0 94384 42 + 130230 GCAGCATATGTGGGCAGGCAATTCCTAGGATTTCTCAATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99325 42 + 636262 GTAGAATATGCGGGCAGGCAATTCCTAGGATTTCTCAATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 91463 42 + 647215 GCAGCATTTGTGGGCAGGTAATTCCTAGGATATCTCAATTCA - -a -s mr.mrrefChr0 94426 92 + 130230 CTTAGACAAATCAGATTCATGCACCAAGAACTAACCAAACGCCTCTTCTTGGGAATGTGAAATGGCGACATGCGGAACAATAAATTCTGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99368 91 + 636262 CTTAGACAGATCAGATTCATACACCAAGAACTAACCAAAC-CCCCTTCTTGGGAATGTGAAATGGCGACATGCGGAACAATAAATTCTGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 91505 91 + 647215 CTTATACAAATCAGAATCATGCAC-AAGAACTAACCAAATGCCTCCTCTTGGGAATGTGAAATGGTGACATGCAGAACATTAAATCCTGTCT - -a -s mr.mrrefChr0 94518 85 + 130230 GGAGTCCTCAATGCTTTCTCCAAGGGTAGAGTCCTTAGTGCTTTTTTGAAGAGGCCTCTGTGTATGCAGACTGTTGTAATGTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99474 85 + 636262 GGAGTCCTCAATGCTTTTGTCAAGGGTAGAGTCCTTAGTGCTTTTTTGAAGAGACCTTTGTGTATGCAGACTGTTGTAATGCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 91596 85 + 647215 GAAGTCCTCAATGCTTTCTCCAAGGGTAGAGTCCTTAGTGCTTGTTTGAAGAGGCCTCTGTATATGCAGACTGTTGTGATGTCAG - -a -s mr.mrrefChr0 94603 26 + 130230 TGCCAATGGAAAATACCACCAACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99559 26 + 636262 TGCCAATGGAAAATACCACCAACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 91682 26 + 647215 TGCCAATGGAAAATACCACCATCACA - -a -s mr.mrrefChr0 94629 3 + 130230 AGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99586 3 + 636262 AGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 91708 3 + 647215 AGA - -a -s mr.mrrefChr0 94632 184 + 130230 TATTAAGTCACAGAACAGTGGAGTGATTCAGAAGCCTCCCATCACCAGGACTAATGAACCTAAAAAAGGGTATTGACAGGCAGGTCATATTTCAGACAAACATTTGGCCATCACAAACTAAGGTTTCACATGGGACTTAAACAATGACAACTTCCAGAGGACATGACCTCTATCATGGGGTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99597 139 + 636262 TATTGAGTCACAGAACAGTGGAGTGATTCAGAAGCCTCCCATCATCAGGGTTAAT---------------------------------------------CATGTGACCATCACAGACTAAGGTTTCACATGGGACTTAAACCATGACTACTTCCGCAGGACATAACCTCTATCATGGGGTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 91711 184 + 647215 TATCAAGTCACAGACCAGTGGAGTGATTCAGAAGCCTCCCAGCACCAGTACTAATGAACCTAAAAAAGGGTATTGACAGGCAGGTCATATTTCAGACAAATATTTGGCCATCACAAACTAAGGTTTCACATGGGACTTAAACAGTGACAACTTCCAGAGGACATGTCCTCCATCACGGGGTTGG - -a -s mr.mrrefChr0 94816 410 + 130230 TGCATACACCAACTTGACCTGTTTCGATGGTGCTGGGATACTTCATACAACAGATATAGTGTATCAAGATAGCCTACATCAGGTCTGCAAACCTATATCAAAGTTTAATGAATGGGTTACAATAGCTAATTGCATTGGATAGTCACGTACATACACATAATTAATGAAGGCCACCGACACTGGTATGAGCAAAGTAGGCTTTTCCATGCAACCCCCACATCTATGCTCCCTCCCTCCATACTATACTTGTCCAGCCATGCAGGTGATTATGACTAACCACTCTGCCCATCACTGTTAGGCAAGTATACCACCAACACTTGTACTGTCCGCTGGGTTATCTAAGGCATAATTAATGTAGTATTGGTAGAACAAATAGTTGACACCCAAGATGGCTTACTTTGTCCACAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99736 407 + 636262 TGCAAGCACCACCTTGACCTGTTTCGATGGCGGTGGGATACTTCACACAACAGATATAATGTATCAAGATAGAATACATCAGGTCTGCAAACGTATATTAAAGTTTAATGAATGGGTTACCATAGC---TTGCATTGGATTGTCACGTACATACACATAATTAATGAAGGCCACCGACACTGGTATGAGCAAAGTAGGCTTTACCATGCAACCCCCACATCTATGCTCCCTCCCTCGATACTATACTTGTCCAGTCACACAGCTGATTATGACTAACCACTCTGCCCATCACTGCTAGGCAAGTATACCACCAACACTTGTACTGTCCGCTGGGTTATCTAAGGCCTAATTAATGTAGTATTGATAGAACAAATAGTTGACACCCAAGAGGGCTTACCTTGTCCACAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 91896 397 + 647215 TGCATACACCGATTTGACCTGTTTACATGGTGCTCGGATGCTTCATGCAACAGTTATAGTGTACCAAGCTAGCCTACATCAGGTATGCAAACCTACATCAAAGT--------TAGGTTACAATAGCTAATTGCATTGGATAGTCACATATGTACACATGATTAATAAGGGTGACCCACATCGGTATGACCAAAGTAGGCTTTTCCTTGCAACCTCCACATCTATGCTCCCTCCCTCCACACTATCCCTGTCCAGCCATGCAGGTGATTATGACTAACCATTCTGCCCAT-ACTGTTAGGCAAGTATACCACCAACACTTGTACTGTCTGCTGGGTCATCTAAGGCATAATTAATGTAGTATTCGTAGAACTAATAGTTGACACCCAAGATGGCTTACTGT----ACAGGA - -a -s mr.mrrefChr0 95226 143 + 130230 TGATTCGACAATTTCTCTTGACAGGCTTTTGAAACTAACTAAGTTTTGGTGACATCTAGAGCCATGTCAAGTGCCACTTACACAATGTTCCATTTACTTAACCAACGTGTGGCCAAAATATCATTTCTAACCAGACCAGCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100144 142 + 636262 CGATTCGACAATTTCTCTTATCAGGCTTGCGAAACTAACTAAGTTTTGGTGACATCTAGAGCCATGTCAAGTGCCACTAACACAATGTTCCATTTACTTAACCAACGTGTGGCCAGAATATCATTTCTAG-CAGACCAGCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 92293 143 + 647215 TGATTCGACAATTTCTCTTGAGAGGCTTTTGAAACTAACTAAGTTGTGGTGACATCTAGAGCCATGTCAAGTGCCACTTACACGATGTTCCATTTACTTAATCAATGTATGGCCAAAAAATCATTTCTAACCAGACCAGTGTG - -a -s mr.mrrefChr0 95369 20 + 130230 GCAACTGTACAATATCTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100286 20 + 636262 TCAACAGTGCAATATCTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 92438 20 + 647215 GCAACTGTACAAAATCTGGC - -a -s mr.mrrefChr0 95389 33 + 130230 TCCTGCAATTGGTAGGGCATTCATGGTATACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100306 33 + 636262 TCCTGCAATTGGTAGGGTATTCATGGTATACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 92463 33 + 647215 CCCTGTAATTGGTAGTGCATTCATGGTATGTTT - -a -s mr.mrrefChr0 95422 21 + 130230 TTAGTTGTTAAGGTCCTAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100343 21 + 636262 TTAGTTGTTAAGGTCCTAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 92496 21 + 647215 TTAGTTGCCCAGGTTTTAGGA - -a -s mr.mrrefChr0 95443 19 + 130230 AAGCTATACTCTTCTAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100369 19 + 636262 AAGCTATACCCTTCCAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 92517 19 + 647215 AAGCTATACTCTTCTAAGG - -a -s mr.mrrefChr0 95462 374 + 130230 CTATTAAGCCAAGAATTTAGGGGTCTTGAGGGTTTCTCCATGGAAATAATCTCCATAAGAACCTGGATTGTATTCACTGTCTCACTTAAGTTTTTCTTAATAGTCTGACATGCTTTGCAAGTCTATTTCAGATATAGGTCCAGTCCTAGAGTAGACAAGTCCTAGAATAGACATGGCTTATGCTAGCCTGCCGAGAAGAGATTAGCAAGTTGAATGCTGCATATACTGCATCTGAATTCACTGCAATAAGGCCATTATTATATGTAACACATAGGGGAAGGCTATGGCTCCATGTGAAGAGGCGAGAACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCTAACGTACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCCAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100388 366 + 636262 CTATTAAGCCAAGAATTTAGGAGTCTTGAGGGTTTCCCCATGGAAATACTCTCCATAAGAACCTGGATTGTATACACTGTCTCACTTAAGTTTTTCTTAATAGTCCGACATGCTTTGCAAGTCTATTTCAGATATAGGTCCAGTCCTAGAGTAGACAAGTCCTAGAATAGACATGGCTTATGCTAGGCTGCCGAGAAGAGATCAGCAAGTTGAATGCTGCATATA------CTGGATTCACTGCAATAAGGCCATGATTATATGTAATGCATAGAGGAAGA--ATGGCTCCATGTGAAGAGGCGAGACCCTTTACAGTTCAGTCTACCCTCTCTCTAACGTACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCCAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 92537 370 + 647215 CTATTGAGCCCAGAGTTTAGGGGTCCT----GTCTTTCCATGGAAATAATTTCCCTAAGAACCTGGATTGTATTCACTGTCGCACTTGAGTTTTTCTTAATAGTCTGACATGCTCTGCAAGTCTATTGCAGATATAAGTCCAGTCCTAGAGTAGATAAGTTCTATAATAGGCATGGCTTATGCTAGCCTGCCGAGAAGAGGTTATTAGGTTGAATGCTGCATATGCTGCATCTGAATTCACTGAAATAAGGCCATTACTATATGTAACACGTAGGGGAAGGCTATGGGTCCATGTGAAAGGGCATGAACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCTAACATACCATTATGATTCATTCTGCCCTCTCTCTGACT - -a -s mr.mrrefChr0 95836 25 + 130230 TAATGATGGTGATGAAATGGTCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100754 25 + 636262 TAATGATGGTGATGAAATGGTCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 92908 25 + 647215 GAATGATGTTGATGAAATGGTCATT - -a -s mr.mrrefChr0 95861 65 + 130230 CAAACTCATGTGGATTAGATGGTGTTTAATCAGGAGTATGTACACATAATGTCCACAACCTTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100797 61 + 636262 CTAACTCATGTGGATTAGATGGTG-TTAATCAGGAG---ACACACATAATGTCCACAACCTTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 92933 65 + 647215 CAAACTCATGTGGATTATATGGTGTTTAATAAGGAGTATGTAAACATGACGTCCACAACCTACCT - -a -s mr.mrrefChr0 95926 26 + 130230 TCTTCAGGATCACCTCTTTAGCAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100882 26 + 636262 TCTTCAGGATCACCTCTTTAGCAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 92998 26 + 647215 TCTTCAGGATGTCCTCTTTAGCAAGA - -a -s mr.mrrefChr0 95952 144 + 130230 GCACCAAAATGACATGCACCTGGTCTTGATCACTCACAGGATGTGAGTATCTCACAGGAGGGATCTACACTATTACAGAATGCACCTGTACTATCCTGGATTCTCACAACACATTTGCAGCGATCAAGGAGCTTCAAATACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100908 144 + 636262 GCACCAAAATGACATGCACCTGGTCTTGATCACTCACAGGATGTGAGTATCTCACAGGAGGGATCTACACTATTGCAGAATGCACCTGTACTAGCCTGGATTCTCACAACACATTTGCAGTGATCAAGGAGCTTCAAATACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 93027 144 + 647215 GCACCAAAATGACATGCATCTGGTCTTGATCACTCACAGGGTGTGAGTATCTCACAGAAGGGATCTACACTATTACAGAATGCACCTGTACTATCCTGGATCCGCACAACACATTTGCAGCCATCAAGGAGCATCAAGTGCACA - -a -s mr.mrrefChr0 96096 270 + 130230 CATTGCAACAATATTTTGAACCCCATAGACTCTTATAGATGGCCTACAAACAGTGCGAAATCCACTACTTGGACACTGTATGCCTGCTTAGATAGCACACTTGCTTTATATCGGTGATAACACATTATTGCTAATATTCCCATAGGAATGAAACTATTGCTCAGTGCCACTGACAACAAATTAGAAGCTCATACCAAGTGCTACAGGAACTAGGAGGTGTGGTTGCATGATTAAGTTTTTAGACTGTAGGTATGCCAATCAAATCAGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101096 270 + 636262 CACCGCAACAATATTTTGAACCCCATAGACTTTAATAGATGGCCTACAAACAGTGCGAGATCCACTACTTGAACACCGTATGCCTGCTTAGATAGCATAATTGCTTTATATCGGTGATGACACATACTGGCTAGTATTCCCATAGGAATGAAACAATTGCTCAGTGCAACTGACTACAAATTAGAAGCTCATACCAAGTGCTACAGGAACTAGGAGGTGTGGTTGCATGATTAAGTTTTTAGATTGTAGGTATGCCAATCAAATCAGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 93171 270 + 647215 CATTGCATTAATATTTTGAACCTCATATAATCTTATAGATGGCCTACCAACAGTGCAAAATCCACTACTTGGACACTGCATGCCTGCTTAGATAGCACACTTGCTTTGTACCAGTGATAACACATTATTGCCTATATTCCAATAGGAAGGTAAATTATCCAGAGTGCCACTGACAACAAGTTAGAAGATCATACCTAGTGCTAAAGGAACAAGTAGGTGTGGTTGCATGAATAATTTTTTAGACTGCAGGTATGCCAACCACATCAGGTG - -a -s mr.mrrefChr0 96366 25 + 130230 TTTGGTCAACTATTACCTCATACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101367 25 + 636262 TTTGGTCAACTATTACCTCATACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 93441 25 + 647215 TTTGGCTAACTATTACTTCATACTA - -a -s mr.mrrefChr0 96391 51 + 130230 ATATTCTGTGGGCTATCAATGACTGGCAAACTTTGCAGTGAACGGTGCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101392 50 + 636262 ATATTCTGTGGGCTATAAATGACTTGCAAAC-TTGCAGTGAGCGGTGCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 93468 51 + 647215 ATATTCTGTAGACTATCAATGACTGGCAAACTTTGCATGAAACAGTGCTTG - -a -s mr.mrrefChr0 96442 113 + 130230 CTAAGTTAGATGTCTAGGGGATGCTTGTTGATAGGTAAGGGAGGAGCCTAATGTTGTGATAAAAAAAAAAAACCCCACTAGGACAAAGAAAAGCCAATTAGAACAATACCGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101442 113 + 636262 CTAAGTTAGATGTCTAGGGCATGCTTGTTGTTAGGTAAGGAAGGAGCCTAATGTTGTGATAAAAAAAAAAAACCCCACTAGGACAAAAAAAAGACAACTAGAACAATACCGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 93526 113 + 647215 CCTAGTTAGATGTCTAGGGGATGCTTGTTGATATGTAATGGAGGAGCCTAATGTTGTGATAAAAAAAAAAAATCCCACTAGGACAAAGAAAAGCCCATTAGAACAATACTGAA - -a -s mr.mrrefChr0 96555 269 + 130230 ATTGATTATTCCAGTGGAAGATGCTTGAAAAAATTAAATCTCCTGTTGATCCGATATCGCCAGGGAAGAAAGACCCTGAAGAGGGTGCTTTCTGGAGATGCTCAAAAACTCATGTGTTTACCTCACAAATAGTTATCACTTGTTAACATCGCTGACCCTGGACCCAGGAGGGGACAGTCAAATCAACAGATATTTCTGTTCTGATGTGTATAGATGAATTCATTGATCACCACTTGGCTATCAACTGGATAGGATTGTTTTCACTTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101560 235 + 636262 ATTGATTATTCCAGTCGAAGGTGCTCAAAAAAATTAAATCTCCTGTTAATCCGATATCACCAGGGAGGAAAGACCCCGGAGAGGATGCTTTCTGGAGATGCTCAAAAACTCATGTGTCTACCTCACAAATAGTTATCACTTGTCAACATTGCTGACCCTGGAGCCAG----------------------------------TGATGTGTATAGATGATTTCATTGATCACCACTTGGCTACCCACTGGATATGATTGTTTTTATTTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 93639 266 + 647215 ATTG--TACTTCAGTGGAAGATACTTG-GAAAATTAAATCTTCAATTGATCTGATATCGCCAAGGAAGAAAGACCATGAAGAGAGTGCTTTCTGGAGATGCTCAAAAACTCATGTGTTTATGTCACAAATGATTATCAATTGTTAATGTCGCTGATGCTGGACCCAGGAGGGGACAGTCAAATCAACAGATATTTCTGTTCTGGTGTGTATAGATGAATTTCTTGATCACCACTTGGCTATCAGCTGGATAGGATTGTTTTCACTTTTG - -a -s mr.mrrefChr0 96824 23 + 130230 GGGTGTAACAAGCTTTTAAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101795 23 + 636262 GGGTGTAACAAGCTTTTAAGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 93906 23 + 647215 GAGTGTAACAAGCTGTTAAGTGT - -a -s mr.mrrefChr0 96847 22 + 130230 CTTAGTAAGGAAACTAATGCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101818 22 + 636262 CTTAGTAAGGAAACTAATGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 93930 22 + 647215 TTTAGTAAGGGAACTAACGCGA - -a -s mr.mrrefChr0 96869 348 + 130230 TGTTGTGTGCTCATGGAATGTAACAATTGTTGTAGTGCACATCATGAGCCGTATGAGTCAGCAGGCCTTCAATAGATGGCCACAGACTCTTGACTAACAGACTTTGTGATGTCAGGAGTAGGAAGTATCAAAGAATCATGTTGGCAAGTTGTAGCCTATTTGAACCTCTCACATGTGATCTGAGATTTAACGATCTTATAGGGGACTCTGTGATGTCTGCAATAAATTACCTAGATGTCATTTGCATCATTGGTGCTGCTCACACTTTTTGGTAAGTGGCTGCATTCTGAGATGACACCAATGTTTAACAGGCTTGGTTTGAGCTCTCCTGTCTCTGTATGGCAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101840 334 + 636262 TGTTGTGTGCTCCTGGAATGCAACAATTGTTGTAGTGCACATCATGAGCCGTATGAGTCACCAGGCCTTCCATAGCTTGCCACAGACTCTTGATTAACAGGCTTTGTGATTTCAGGAGTAGGAAGAATCAAAGAATCATGTCGGCAAGTTGTAGCCTATTTCAACCTCTCACATGTGATCTGAGATTTAACGATCTCATAGGGGACTCTGTTATGTCTGCAATAAATTACCTAAATGTCATTTGGATCATTGGTGCTGCTGACACTTTTTGGTAAGTGGCTGCATTCTGCAATGGCACTAATGTTTAACAGGCTTGGTTTGAGC--------------ATGGCAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 93953 348 + 647215 TGTTGTATGCTCATAGAATGTGACAATTGTGGTAGTGCACATCATGAGCAGAATGAGTCAGCAGGCCCTAAATAGATGGGCACAGACTCTTGACTAACAGACTTTGTGATGTCAGGAATAGGAAGTATCAAAGAATCATGTTGGTAAATTGTAGCCTATTTGAACCTCTCGCATGTGACCTGAGATTTGATGATCTTATAGGGGACTCTGTGGTGTCTGCAATAAATTACCTAGATGTCATTTCCATCATTGGTGCTGCCCACACTCTTTGATAAGTGGCTGCATTCTGAGATGACACCAATATTTAACAGGTTTGGTTTGAGCTCTCCTGTCTCTGTATGGCAAACA - -a -s mr.mrrefChr0 97217 139 + 130230 AAAGAGTCAAACATTAAGAATCATCCTGGAGGTATCCGACCATTCGTACACTCACAGAAGTTTTAGCGCGCATGCAAAGGAAAATGGCCTCCTCTCCATATGGTTTTGTCTATATGGTTCTACTTAATCTTTAACCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102174 139 + 636262 AAAGAGTCAAACATTAAGAATCATCCTGGAGGTATCCGACCATTCGTACACTCACAGAAGTTTTAGCGCACATGCTAAGGAAAATGACCTCCTCCCCATATGGTTTTGTCTATATGGTTTTATTTAATCTTTAACCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 94302 139 + 647215 AAAGAATCCAACATTAAGCATCATCCCAGAGGTATCCAACCATTCGTACACTCACAGAAGTTTTAGCTCGCATGTAAAGGAAAATGGGCTTCTATCCATATAGTTTTGTCTATCCGGTTCTACTTAATCTTTAGTGTAA - -a -s mr.mrrefChr0 97356 3 + 130230 GAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102313 3 + 636262 GAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 94458 3 + 647215 GAA - -a -s mr.mrrefChr0 97359 323 + 130230 TTCTTAATCAAGTTGGCATTTTTGCCCATGGCACCTCAAGTGACATCAACTCTAACGTTGACATTGTGCTTACCTGATGGTTGCAGCATGATCTTGTATAGATGGCTTCTCACAAAAGATGCCTTGCAAGGAAACAGTAGCTTACCATGGATGCTTTTGTTTAAACGGAGTTATACATGAGTGTTATTTCTCTGTATCTATGTCAACAAGCTCTGTATATACAATGGAACTTGCATGGGTTTTGACGGCTCGTATGTCATCAAATATGATGTCTAAGTTGGGATACCATCCAGAAGGGGAGGACATTACCAGCTCCTCAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102316 319 + 636262 TTCTTAATCAAGTTGGCA--TTTGCCAATGGCACCTCAAGTGACATCAACTCTAACGTTGGCATTGTGCTCTCCTGATGGTTGCAGCATGATCTGGTATAGATGGCTTCTCACAAAAGATGCCCCGCAAGGAAACAGTG--CTACCATGGGTGCTTTTGTTTAAGCGGAGTTATACCTGAGTGTTGATTCTCTGTATCTATGTCAACAAGCTCTGTATATACAATGGAACTTACATGGGTTTTAACAGCTTGTATGTCATCAAATATGATGTCTAAGTTGGGATACCATCCAGAAGGGGAGGACATTACCAGCTCCTCAGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 94464 322 + 647215 TTCTTAATCAAGTTGGCATTTTTGCCCCTGGCGCCTCAAGTGACATCAACTCCCGGGTTGACATTGTGCTTACCTTATGGTTGCAGCATGATCTTGTATAAATGGCTTCTCACAAAAGGTGCCTTTCAAGGAAACAGTAGCTTACTATGGATGCTTTTGTATAAACAGAGTTATATATGATTGTCATTTCTCTGTATCTATGTCAACAAGCTCCCTGTACACAAAGGAACTTGCATGGGTTTTGTTGGCTCATATGTCATCAAATATGATGCATAAGTTGGGATACCA-CCAGACGGGGAGGACGTTGCTAGCTCCTCAATTT - -a -s mr.mrrefChr0 97682 115 + 130230 AACACTAGGAAGATAACAGTAGTTTTTGCTTATGCCACCCTAAAGAATATATTTATTTTCTTTGACCTATTGATTGCCCTATGGATGCTCTGCCACAGTTCACTTTTATTGATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102635 115 + 636262 AACACTAAGAAGATAATAGTAGTTTTTGCTTATGCCACCCTAAAGAATATATTTATTCTCTTTGACCTATTGATTGCCCTATGGGTACTCTGCCACAGTTCACTTTTACTGATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 94788 115 + 647215 AACACTAGGAAAATAGCATCAGTTTTTATTTATTCCACCCTAAAGAATATATTTATTTTCTCTGACCTATTGATTGCCCTATTGATGCTCCGCCACAGTTCACTTCTATAGACTT - -a -s mr.mrrefChr0 97797 135 + 130230 AACATTGCTAAGTACATGTGTGTGTAGTCTTACATATTTTATCCAGTAGTAAGCTTTATAACTTTCATGTACAGTAAGGCACATCAAATAATCACCCTCATCTGGAGAGATAATCATCCTTGCATTTGTATATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102750 135 + 636262 AACATTGCTAAGTACATGTGTGTGTAGTTTTACATATTTTAGCCAGTAGTAAGCTTTATAACTTTCATGTACTGTAAGGCACATCAAATAATCACCCTCATCTGGAGAGATAATCATCCTTGCATTTGTATATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 94914 122 + 647215 AACATTGCTAATTA-------------TCTTCCATATTTTCTCCAGTAGGGAGTTTTATAACCATCATGTACAGAAAGGCACAGCAAATAATAACCCTCATCTGGAGAGATAATCATCCTTGCATCTGTATATAT - -a -s mr.mrrefChr0 97932 307 + 130230 GTCTAAATGGTATACAGTAGTTGCCCTCCCATTAATAACTGTTTATAGAACTTTCTCTTGGAGTTGTGTTGTGCATGTGATGCCTGTCTTGATTAGTGCAAAGTCTACTCCAAAAACCTTGGGTACACACCGATAACACTGCAATTGACCAATCTGGCTCATCCGAGTGTAGATCATATACCTGAGCCTAGTTCCTATCTGTCCTAACTAATTTTTAATTGCTGTAGTTTACATACATACTGAGCATAGGACTGAGTAAACATTATTGGGCTAAAGGACAGAGAGTTAGGTCACTTTGGACAGTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102885 305 + 636262 GTTTAAATG--ATACAGTAGTTGCCCTCCCATTAATAACTGTTCATAGAACTTTCTCTTGCAGTTGTGTTGCACATGTGATGCCTGTCTTGATTAGTGCAAAGTCTACTCCAAAAACCTTGGGTACACACCGATAACACTGCAATTGACCAATCTGGCTCATCCGAGTGTAGATCATATACCTGAGCCTAGTTCCTATCTGTCCTAACTAATTTTTAATTGCTGTAGTTTACATACATACTGAGCATAGGACTGAGTAAACATTATTGGGCTAAAGGACAGAGAGTTAGGTCACTTTGGACAGTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 95073 307 + 647215 GTCTAAATGGTATACAGTAGTTGCCCTCCCATAAATAACTGTTTATAGTACTTTGTCTTGGTGTTGTGTTGTGCATGTGATGCTTGCCTTGATTGGTGTAAAGTCTACTCCGAAACCTTTGGGTATACCCCAATAACACTGCAATTGACCAATCTGGCTTTTCCCAGTGTAGATCAAATACCTTAGCCTAGTTACTAGCTCTCCTAACTAATTTTTAATTGCCATAGTCCACATACATACTGAGCACAGGACTGAGTAAACATTATTGTGCTTAAGCACAGAGAGTTAGGTCAGATTAGAGAGTTGC - -a -s mr.mrrefChr0 98239 31 + 130230 CGCATTTTGTATGTTAGAGGTGTCTACCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103190 31 + 636262 CGCATTTTGTATGTTAGAGGTGTCTACCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 95381 31 + 647215 CATATTTTGTATGTTTGAGGTGTCCACCTGA - -a -s mr.mrrefChr0 98270 6 + 130230 GCCGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103227 6 + 636262 GCCGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 95412 6 + 647215 GCCTGC - -a -s mr.mrrefChr0 98276 170 + 130230 AACAGGCTGACATTAGCTTGATAGTATTTCTAACTGGCATGCCAAATGTTTAAACTTATAACAGGAGGTAGGTCAAGTGGGACAACATATCTTTGCAATATCTTATAGACACACATGGTCCATAAAAAGTGGTTCACCACTGATGGAAGTCACATGAGGAGGGTATCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103234 170 + 636262 AACAGGCTGACATTAGCTTGATAGTATTTCTAACTGGCATGCCAAATGTTTAAACTTATAACAGGAGGTAGGTCAAGTGGGACAACATATCTTTGCAATATCTTATAGACACACATGGTCCATAAAAAGTGGTTCACCACTGATGGAAGTCACATGAGGAGGATATCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 95418 170 + 647215 AGCAGGTTGACATTAACTTGAGAGTATTCCTGACTGACATGCCAAACATTCAAAATTATAACAGGGGATACGTGAAGTGGATCAACAAATCTTTGCAGTACCCTATGGGCACAAATAGTCCACACAAAGTGGTTCACCACTGATGGAAGTCACATGAGGAGGGTATCAAG - -a -s mr.mrrefChr0 98446 201 + 130230 GTTAGACCATGTGTGCTACAATGCAACAGATGGGGCTTCCACATCCAGGGAAGAATAATTGACTAAGACTGCATTAAACTATAGTAGCCTAGCCCATTTGCCAGTGTAACCACACCTCACTCGGTACAGTAGGTCAGAACATATCATACTCTGATATGGGGGAGTGTACAATAGTGTGAAGGAGCAGGTCACCTAGATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103407 182 + 636262 GTTAGCCCATGTGTGCTACAATGCAACAGATGGGGCTTCCACATCCAGGGAAGAATAATTGACTAAGAATGCATTAA----TAGTAGCCTAGCCCATTTACCAGTGTGACCACACCACACTTGGTACAGTGGGTCAGTACATATCATACTCT---------------CCAATAGTGTGAAGAAGCAGGTCACCTAGATTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 95588 173 + 647215 GTTAGACCATGTGTGCT----------------------------CAGGGAAGAATAATTGACTAAGACAGCATTGAACTATAGTAGCCTAGTCCATTTGCCAATGTAACCACACCTCACCCGGTACAGTAGGTCAGAACATATCATACTCTGATATGGGGGAGTGTACAATAGTGTGAAGGAGCAGGTCATCTAGACTAA - -a -s mr.mrrefChr0 98647 101 + 130230 CTGCTCATAGTAGTTACAGGCTAAAGAGCGCTTATCATTGTCCAGTGAGTGATTGCTTCAGCAATTTAACAAGACAACCATGAAGTAAACAGTGGAATCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103594 101 + 636262 CTGCTCATAGTAGTCACAGGCTAAAGAGCGCTTATCATTGTCCAGTGAGGGATTGTTTCAGCAATTTAACAAGACAACCATGAAGTAAACAGTGGAATCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 95761 101 + 647215 CTGCTCATAGTAGTTGCTGGCTCAAAAGTGCTAATCATTGTCCAAGGCTTGATTGCTTCAGCAATTTAACAAGACAACCATGAATTAAACAATGGAATCCT - -a -s mr.mrrefChr0 98748 209 + 130230 TACTAGTATAGGCAATGCATTGTTTATAACTTCCACCAAGATACTCCTTTAGTTAGGCTATATAGGATGAAAAGCCTTAACCTGTAGGATGTATCCAAATGTAGGGGGCAAGCCAGGAGTGTGCTGGACAGAAAGGTTTTCGTCACACAGACAGTCAGAAACAGGTGGATGGCAAAGAATGTTACAACAATCCTAACTAAGGTCAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103695 209 + 636262 TGCTAGTATAGGCAATGCATTGTTTATAACTTCTGCCAAGATACTCCTCTAGTTAGGCTATATAGGATGAAAAGCCTTAACCTGTAGGATGTATCCAAATGTAGGGGGCAAGCCATGAGTGTGCTGGACAGAAAGGTTTTCGTCACACAGACAGTCAGAAACAGGTGGATGGCAAAGAACGCTACAACAATCCTAACTAAGGTCAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 95887 203 + 647215 TACTTGTATAGGCATTGCATTGTTTATAACTTCCACCAAGATACTCCTTTAGTTAGGCAGCATAGGATGAAAGGCCCTAACCTGTAGGATGGATCCAAATGTAGGGGGCAAGCCAGGAGTGTGCTGGACAGATAGGTCTTCGTCACACATACAGTCAGAAACAGGTGGATGGCAAAGAATGTCATAACAATCATGACTAACAT------ - -a -s mr.mrrefChr0 98957 18 + 130230 TCCACATTGAATTGATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103907 18 + 636262 TCCATATTGAATTGATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 96090 16 + 647215 --CACATTGAATTGATTA - -a -s mr.mrrefChr0 98975 45 + 130230 GGTTGGTGTTTCTTTAAGTACCACTGTCACACTAAGTAACACACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103944 45 + 636262 GGTTGGTGTTTCTTTAAGTACCACTGTCACACTAAGTAACACACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 96106 45 + 647215 GGTTGGTGTTTCTTCAAGTACCACTGTCACACTAAGCAACACACG - -a -s mr.mrrefChr0 99020 27 + 130230 AGGGAGAGTGAGAATAGCTTGACGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103989 27 + 636262 AGGGAGAGTGAGAATAGCTTGACGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 96170 27 + 647215 AAGGAAAGCGAGAATAGCTATATGTAT - -a -s mr.mrrefChr0 99047 48 + 130230 TACATGGTCCTGTCCCCTTGTTCAATGTATCTACCTCTCGTCCCTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104016 48 + 636262 TACATGGTCCTGTCCCCTTGTTCAATGTATCTACCTCTCGTCCCTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 96203 48 + 647215 TACGTGGCCCTGTCCCCTTATTCAATGTATGTACCTCTCGTCCCTTTT - -a -s mr.mrrefChr0 99095 116 + 130230 CATTGCGTGTATCTTTGCCCATCACCTGTTAGGTGATGCCAAGTTTAAGGGTGACACCTCTTGATAGATCACAATTTTTATCCTCCAAAACGAATGAACTCAGTACTCTATTTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104064 116 + 636262 CATTGCGTGTATCTATGCCCATCACCTGTTAGGTGATGCCAAGTTTACGGGTGACACCTCTTGATAGATCACAATTTTTATCCTCCAAAACGAATGAACTCAGTACTCTATTTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 96255 63 + 647215 CATTGTGTGTATTTTTACCCATCATATGTTATGTGATGACAAGTTTAAGGCTGACACCT-----------------------------------------------------TCAA - -a -s mr.mrrefChr0 99211 8 + 130230 TCACTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104180 8 + 636262 TCACTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 96321 8 + 647215 TCTCTTTT - -a -s mr.mrrefChr0 99219 127 + 130230 AGCGACTTCAGCCAATGTCATCCCAAGGTTATTCAACTGAGGTGGCCACAGTGAAGTGCTTTTTCTTGGAAACCTCTTTTGTGAACCTCCTTTTCTGGCTATCCAAGCTTTCATTCAGGTCTAATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104199 127 + 636262 AGCGACTTCAGCCAATGTCATCCCAAGGTTATTCAACTGAGGTGGCCACAGTGAAGTGCTTTTTCTTGGAAACCTCTTTTGTGAACCTCCTTTTCTGGCTATCCAAGCTTTCATTCAGGTCCAATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 96329 127 + 647215 AGCAAAGTCAGCCAATGTCATTCCAAGTTTATTCAACTGAGGTGGCCACAGTGAATCGCTTTTTTTTGTCAACCTCTTTTGCAAACTGCCTTTTCTGGCTATCCAAGCTATCATTCAGGTCTAATGT - -a -s mr.mrrefChr0 99346 93 + 130230 CTGACCCATGACTACCAAGATATCATATAGTTATGCCTCCAAATTCCAGTCCTGGGCTTTGCTCCCTGGAGTTTCAGGCCTCGGCTTTTGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104326 93 + 636262 CTGACCCATGACTACCAAGATATCAGATAGTTATGCCTCCTAATTCCAGTCCTGGGCTTCGCTCCGTGGAGTTTCAGGCCGCTGCTTTTGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 96460 85 + 647215 CTGACCCATGA--------ATACCATATATTGATGCCTCCAAATTCCAGTCCTGGGCTTTGCTGCCTGAAGTTTCAGGCCTCGATTTTTGTCT - -a -s mr.mrrefChr0 99439 167 + 130230 TTTACAATACATAAATGGGGGACCTTTTTAAAAGTGTCATTAAATCATGCAACCTATTATTAGCCATGTGTGGAAGAAGAGAAGAAGGTGAAGCTTTCTTTTTTGATTGAGCTCATTTCTTACCCATTCATATCAGATATTCTATGATAAGCCTGAATTGTTACTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104423 164 + 636262 TTTACAATACATAAATGGGGGACCTTTTTAAAAGTGTCATTAAATCACACAACCTATTATTAGCCATGTGTGGAAGAAGAGAAGAAGGTGGAGCTTTCTTTTATGATTGAGCTCATTTCTTACCCATTCATATCAGATATTCTATGATAAGCCTGAATTGTTAC--- -s simRat_chr6.simRat.chr6 96545 167 + 647215 TTTACAATACATAAATGGGGGACCTTTTTAAAAGTGTCATTACATCATGCAGCCTATAATTCACTATGTGTGGAAGAAGAGAAGAAGGTGAAGTTTTCTTTTTGGATTGGGCTCATTTGTTACCCATTCGTGTCAGATATAGTATGATAAGCCTGAATTGTTACTTA - -a -s mr.mrrefChr0 99606 71 + 130230 CGTTACATTGGGAGTAACCTAGCAGTCCCATTGGGAGTATCAGAGAAGAAATCGAGATAGTCCCCCTCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104587 53 + 636262 ------------------CTAGCAGTCCCTTTGGGAGTATCAGAAAAGAAATCGAGATAGTCACCCTCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 96714 71 + 647215 CGTTACATTGGGAGTAACCTAGCAGTTACATTGGGAGTATCAGAGAAGATATCGAGATAATCCCCTTCCAT - -a -s mr.mrrefChr0 99677 289 + 130230 AGCCTAATTAATGCTACAGGTCCATTTTGATTGCTTAGGCTACTTTTGTAAAGCTTGTATCTCTGAAGCCCTCTGACTATCACATATGGTCGGGGTGGGGACAGCCCTGTTGCTCTCATAGAGTTATGTGCTTAGCTGCATTTAGATGTGCCATCATATTTGGTTCCATGAAATAGTTGTTGTTTAATGACATAATGAGGAATAGCCTCACCATCACTACTACCCCATGATCTCACTGCTTTAGCGTGGGGAGTGGGTTAGGGCATCCCAGAACACCTCAAGAGAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104641 279 + 636262 AGCCTAATTGATGCTACAGGTCCATTTTGATTGCTGAGGCTACTTTTGTAAAGTTTGGATCTCT-AAGCCCTCTGACTATCACATACAGTCAGGGTGGGGACAGCCCTGTTGCTCTCATAGAGTTATGTGCTTGGCTGCATTTAGATGTGCCATCATATGTGGTTCCATGAAATAGTTGTTGTTTAATGACATAATGAGGAATAGCCTCACCATCACTACTACCCCATGATCACACTGCTTTAGCATGGGGA-----TTAGGGCATTCCAGAAC----CAAGAGACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 96785 287 + 647215 AGCCTAATTAATGCTCCA--TCCACTTTGATTGCCTAGGCTACTTTTGTAAAACTTGTATCTCTGAAGGCCTCTGACTATCACATATGGTCGGGGTGGGGACAGCCATCTTGCTCTCATAGAGTTATGTGCTTAGCTACATTTAGACGTGCCATCATCTTTGGTACCATGAAGTAGTTGTTGTCTAATATCATAACGAGGAATAGCCTCACCATCACTACTACCCCATGATCTCACTGCTTATGCGTGGGGAGTGGGTTAGGGCATCCCAGAACACCTCAATAGAGAAA - -a -s mr.mrrefChr0 99966 103 + 130230 ATCATTTCTAGGATTATGGACGAGGCAAGCACTACAAATACAGAAGTATGCAACACCATTGCACATAGGTACCTCTATATGAAGCCAATATTCTTGCTACCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104924 90 + 636262 ATCTTTTTTAGGATTATGGGCAATACAAGCACTATAA------AAGTATGCAACACCATTGCACATAGGAACCTCTATGTGAAGCCAATATTCTTG------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 97072 103 + 647215 ATCATTTCTAAGATTATAGATGAGGCAAGCACTACAAATACAGAAGTATGCAACATCATTGCACATAGGTACCTCTATATGAAGCCAATATTCTTGCTACCTC - -a -s mr.mrrefChr0 100069 13 + 130230 TGAAGTCAATATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105014 1 + 636262 ------------T -s simRat_chr6.simRat.chr6 97179 13 + 647215 TGAAGTCAATATT - -a -s mr.mrrefChr0 100082 64 + 130230 ACAATTCAATATGTCAAATTTCCACAAGTGACCATCCGTAACCAAGAGATCACAGTGACAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105015 64 + 636262 AAAATTCAATATGTCAAATTTCCACAAGTGACCATCCGTAACCAAGAGACCACAGTGACAAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 97197 64 + 647215 ACAATTCAATATGTCAAATTTCCACAAGTGATCATCCATAACCAAGAGATCACAGTGACAAATT - -a -s mr.mrrefChr0 100146 60 + 130230 GATCTTTTGATTCATTTGAGACCTGTTTCCAGGTGGACTTGATAGGTCCTAATGTAATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105089 59 + 636262 GATCTTTTGATTCATTTGAGACCTGTTTCCAGGTGGACTTAATAGGTCCT-ATGTAATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 97261 60 + 647215 GACCCTTTGATTCACTTGAGACCTGTTTCCAGGTGGACTTGATAGGTCCCAATGTAATAG - -a -s mr.mrrefChr0 100206 200 + 130230 ACTCCCACATGCACCAGGATGATTTCTACTACAAAAACAAGTCTACTGGTGATTCCAAGCTTACTCTACCATCTTGTGTATAAGTACACTGACCATAGCAAGTCTATTTTGAAATCTATTAGATGTGGCTGCTGAGTCTCTAACTCGGTGCTCATCTGTTTGCATTCTGTAGATTGAAGTATCATACTTCCATTCCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105150 179 + 636262 ACTCCCACATGCACCA--ATGAATTCTACTACAAAAACAAGTCTACTGGTGATCCCA-------TCTACCATCTTGTGTATAAGTACACTGACCATAGCAAGTCTATTTTGAAATCTATTAGGTGTGGCTGCTTA------------GTGCTCAACTGTTTGCATTCTGTAGATTGAAGTATCATACTTCCATTCCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 97321 200 + 647215 ACTCCCCCATGCACCAGGATGATTTCTGCTACAAAAACAAGTTCACTGGTGATTCCAAGCTTACTCTACCTTCCTGTGTATAGGTACACTGACCATAGCAAGTTTATCTTGAAATCTATTAGATGTGGCTGCTGAGTCTCTAACTCGGTGCTCATCTGTTTGCATTCTGTAGATTGAAGTATCATACTGCCGTTCCTGCA - -a -s mr.mrrefChr0 100406 113 + 130230 AATTTCTGTAAGGAGATCACCCCCCTCCTGCACTTCAACTTCCTTCTTTTACACAATTCAGAATGTAACTTGTCTGTTGGGGGCATGCTTGTCCTCCAATCTAAATACAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105329 113 + 636262 AATTTCTGTAAGGAGATCACCCCCCTCCTGCACTTCAACTTCCTTCTTTTAGACCATTCGGAATGTAACTTGTCTGTTGGGGCCATGCTTGTCCTCCAATCTAAATACAGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 97531 112 + 647215 AATTTCTGCAAGAAGAGCACCCCCCTCCTGCACTTCAACTTTCTTTTTCTACACAATTCAGAATGTAACTTGTCTGTTGGGGGCATGCTTGTTGTCCAATCTAAATACGGAA- - -a -s mr.mrrefChr0 100519 89 + 130230 CTCTTCAGCCTGTGCACTCCACTCTCCCACTCAGGTTTATTAGCATTCACAGTAGGAGCATACTGTTCCCAGTTGATGATTCCCAATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105443 89 + 636262 CTCTTCAGCCTGTGCACTCCACTCTCCCACTCAGGTTTATTAGCACTCACAGTAGGAGCATACTGTACCCAGTCGACGATTCTCAATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 97643 88 + 647215 -TTTCCAGCCTGCGCATTCCACTCTCCCACTCAGGTTTAATAGCATTCTGAGTAGGAGCATACTATTTCCAGTTGATGATTCCCAATGC - -a -s mr.mrrefChr0 100608 43 + 130230 TGGTTTACTCTTGGATGTTCACTTCCAATTAGCTAAATTCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105536 43 + 636262 TGGTTTACTCTTGGATGTTCACTTCCAATTAGGTAAATTCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 97731 43 + 647215 TGGTTTACTCTTGAATATTCACTTCCAATTAGCTAAATTCTGA - -a -s mr.mrrefChr0 100651 383 + 130230 TAGGCCCTTCCAAGTCTCCATTAGCCAGCAAGGTCTGCTGAAATCTGCTGGTGATCATAGAAAGGGATTAACTTTAACTTTGTTCCATATTACCTCAAGAATAGCTGTAGGTCCCAGTAAGTACAAACAGTAACATATGTAGATATGTCATTTACCACCCCTTATTACTATTTGTGTATAATTTGGAAGGTAATACTTTGGCAGGGCTTTGAAGTTTCAATGAATTTAGTTATCGTGACCCTTTTCTCAGAGTCATTATATTTTGTGCCCTCCCTATTTCTTTCATCTGTTTTCATTGGAATGATGGTAGTCAGAATGTGTAGTGATTATCAGTATGGCAGTAATTTTAATCACTGATGGTTACAAGGCACATGGGTGTATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105579 383 + 636262 TAGGCCCTTCCAAGTTCCCATTAGCTAGCAAGGTCTACTGAAATCTGCTGGTGATGATAGAAAAGGATTAACTTTAACTTTGGTCCATATTACCTCAAGAATCGCTGTAAGTCCCAGTAAGTGCAAACAGCAACATATGTAGAAATGTCATTTACCACCCCTTACTACTATTTGTGTATAATTTGGAAGGTAACACTTTGGCAGGGCTTTGAAGTTTCAATGAATTTAGTTATCGTGATCCTTTTCTCAGAGTCATTATATTTTGTGCCCTCCCTATTTCTTTCATCTGTTTTAATTGCAATGATGGTAGTCAGAATGTGTAGTGATTATCAGTATGGCAGTAATTTTAATCACTGATGGTTACAAGGCACATGGGTGTATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 97791 383 + 647215 GAGGCCCTTCCAAGCCTCCATTACCCAGCAAGGTCTGCTGAAATCTGCTGGTGATCATAGAAAGCGATTAACTTTAACTTTGTTCCATATTACCTCAAGAGTAGTTGTAGGTCCCAGTAAGTACAAACAGTAAGATATGAAGATATGTCATTTACCACCCCTTATTACTCTTTATTTGTATTTTGAAAGGTAGTACTTTAACAGGGCTTCAAGGGTTCAATGAATTTAGTCATCATGACCCTTTTGTCAAAGTCTTTATATTTTGTGCCCTCCCTACTTCTTTCACCTGCGTTCATTGGAATTATGGTAGGCAGAACGTTTAGTATTTATCACTATGACATTAATTTTAATTACTGATGGTTACCATGCATGTGAGTGTATTA - -a -s mr.mrrefChr0 101034 581 + 130230 TTTGATCAGGTACAAGATGACATCTTCCACTTCCATACCTAAGTCTTGCATATCACTCTCCCATAAAAGCTCTTGTATGTTGATTGGTGTGCTGCTGTAACCATTGCAGCTGGGTACCCAGTGCAGTAATTGTCTCCTTGTTAACAACATTTGCAACTGAATTTAGTTACAACATTGTTGCTTTGTTTAGCACATCCATATGTTTGGGACATAACCAATAAAAACTTTCAAGGGGCCTGTGGATATGACCTTGTTTAACTATAGTGGTAGTTGCATTTAATGTGAAACATCTTTTTCTGGATACCTGGAACAACATGACATCATGTTCTAGTGGGTCTAAGGCATTCACGAGTTTGGAGAACACCATCCGGGTAGTCAAAATGCCTATCTGTCCCATACGATGGGAGGTCTGCATTAACTTGGTAGAGGTCTAGAGGTCATCTATTCACCAACCACAATGGGAGTGAGCCAAAGCAAGCTGGTGACTGGCCAAATGGGATATTCCTTCTTGTTCAATGGGGTCCATCTTAGGCCCCCAGTGTGATTAATAGGGGCTTCGATAACCTAGGGTGTGACATAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105967 580 + 636262 TTTGATCAGGTACAAGATGACATCTTCCACTTCCATACCTAAGTCTTGCATATAATTGTCCCACAAAAGCTCTTGTATGTTGATTGGTGTGCTGCTGTAACCACTGCAGCGGGGTACCCAGTGCAGTAATTGTCTTCTTGTTAACAACCTTTGCAACTGAATTTAGTTGCAACATTGTTGCTTTGTCTAGCACATCCATATGTTTGGGACATAGCTAATAAAAACCTTCAAGGGGCCTGTGGATATGACCTTGTTTAACTATAGTGGTAGTCACATTTAATGTGAAACATCTTTTTCTGGATACCTGGAACAACATGACATCATGTTCTAGTGGGTCTAAGGCATTCAC-AGTTTGGAGAACACCATCCCGGTGGTCAAAATGCCTATCTGTCCCATACGATGGGAGGTCTGCATTAACTTGGTAGAGGTCTAGAGGTCAGCTATTCACCAACTACGATGGGAGTGAGCCAAAGCAAGCCGGTGACAGGCCTAATGGGATATTCCTTCTTGTTCAATGGGGTCCATCTTAGGCCCCCAGTGTGATTAATAGGGGCTTCGATAACCTAGGGTGTGACATAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 98174 552 + 647215 TTTGATCAGGTACATGATGGCATCTTCCACTTCCATACTTAAGTCTTGCATATCACACTCCCATACAAGCTCTTGTATGGTAATTGGTGTG-TGCTAAA---ATTGCAGCTGGGTTGCCATTACAGTAATTTTCTCCTTGTTAACAACATTTACAACTAAATTTAGTTACAACATTGTCAGTTTGTTTAGCATATCTGTATGTTTGAGACATAACCAATAAAAACTCTCAAGGGGCCTGTGGATATGACCTTGTTTAACTATAGTGGTAGTTGCATTTATTGTGGAACCTCTTCTTCTGGACACCTGGAACAACATGGTGTCATGTTCTAATGGGTCTAAGGCTTTCACGACTTTGGAGAACACCATCCGGGAAGTCAAAATGCCTATATGTCCGACACGCTGGGAGGTCTGCATTAACTTGGCAGAGGCCTAGAGGTCATCTATTTACCAACCACAATGGAAGAGATCCAGGGCAAGCTGGTGACTGGTCAA-------------------------GGGTCCATCTTAGGTCTCCAGTGTGATTAATGGGGGCTTCAATAACCAAGGGTGTGACCTAAT - -a -s mr.mrrefChr0 101615 40 + 130230 TTCGCCAGCCCAATTGCCAGCTCAAATAGCACCAGCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106547 40 + 636262 TTCGCCAGCCCAATTGCCAGCTCAAATAGCACCAGCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 98727 40 + 647215 TCCCCCAGCCCAATTGCCAGCTCACATGGATCTGGTTGTA - -a -s mr.mrrefChr0 101655 14 + 130230 TGTACACATCATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106587 14 + 636262 TGTACACATCATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 98785 14 + 647215 TATACACATCGCTC - -a -s mr.mrrefChr0 101669 69 + 130230 GGCCAACGGCCAGTGCAATGAGGTCAAGTCTTACTTAATGTATGCAACAAAGATCAGATGGGCTCATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106601 69 + 636262 GGCCAACGGCCAGTGCAATGAGGTCAAGTCTTACTTAATGTATGCAACAAAGATCAGATGGGCTCATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 98800 69 + 647215 GGTCAATGGCCAGTGCAAAGAGCTCATGTCATACTTTATGCATGCAACAAAGATCAGATGGGCGGATTT - -a -s mr.mrrefChr0 101738 64 + 130230 ACTGTCATAGATTGATTCTAGGTAGGTTTGCCATGTAAAAATGTTACAACACTTTGATGTCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106670 64 + 636262 ACTGTCATAGATTGATTCTAGGTAGGTTTGCCATGTAAAAATGTTACAACACTTTGATGTCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 98870 64 + 647215 ACTGTCATAGATCTGTTCTAGGTAGGTTTGCCATGTAAAGATGTAACAACACTTTGATCTCTTA - -a -s mr.mrrefChr0 101802 190 + 130230 ATGTCTTAGTGACCAGAAACCTCAGATTTACTCATAGATAATTAAAATAAAATGTCACATGAACCTGTGCGGCTGTAGGTTATTAGATCAAAGAGGCCTGTCTAGATGCCGAAGAGTGTAATGGAGATTGTGTACCGGAGTGGTTTCTTTTCAGTGACTTTTCTGACTATCATCATTAATGTTTGTTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106736 190 + 636262 ATGTCTTAGTGACCAGAAACCTCAGATTTACTCATAGATAATTAAAATAAAATGTCACATGAACCTGTGCGGCTGTAGGTTATTAGATCAAAGAGGCCTGTCTAGATGCCGAAGAGTGTAATGGAGATTGTGTACCGGAGTGGTTTCTTTTCAGTGACTTTTCTGACTATCATCATTAATGTTTGTTGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 98934 190 + 647215 ATTGCTTAGTGACCAGAAATCTCAGATTTACTCATCGATAATTAAAAAAAAAGGTGACATAAACCTGTGTAGCTGTCGGTTATTAGATCAAAGAAGCCTGTGTATATGCAGAAGAATGTAGTGGAAATTGTGTACCCAAGTGGTTTCTTTTCAGTGTCTTTTCTGACTATCATCATTAAGGTTTGTTCTC - -a -s mr.mrrefChr0 101992 22 + 130230 TATAAGTTGATCCCAACTCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106972 22 + 636262 TATAAGTTGATTCCAACTCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 99124 22 + 647215 TACAAGTTGATCCCAAATCACA - -a -s mr.mrrefChr0 102014 215 + 130230 TGTTAGAATGCTGGTGGTTATGTGAAATTTTTAAACACACCACATATTACCCAAACCTCCCACAGATGTGCAGACTAACCTCACTTACTTTTTAGTACTTTGCCAGCGTGAAGCAACAATAAAATCTAGAGGATGAGCATAAATAAATCGAGAATTAGGCTAATCCTTTGAAGTTTGGCATCTGAGAGCACATCTGCTCCAATGCATACCTATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107040 208 + 636262 TGTT-------TGGTGGTCATGTGAAATTTTTAAACACACCTCATATTACGCAAACATCCCACAGATGTGCAGACTAACCTAACTTAGTTTTTAGTACTTTACCAGCGTGAGGCAACAATAAAATCTAGAGGATGAGCATAAATAAATCGAGAATTAGGCTAATCCTTTGAAGTTTGGCATCTGAGAGCACATATGCTCCAATGCATACCTATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 99146 208 + 647215 TGTTAGAATGCTGGTAGTTATGTGAAATTTTTAAATACACCACATACTACCCAAACCTGCCACAGATTTGCAGACTAAACTCACTTACTTTTTAATCCTTTGCCAGCTTGAAGCAACGG-------TATAGGATGAGCACAAATAAATAGGGAATTAAGCTAGTCCTTTGAAGTTTGGCATCCCAGACAAGATCTGGTCTGATGCATACCTATAC - -a -s mr.mrrefChr0 102229 153 + 130230 TGGTTTGTGGTGCCCTGTGTATATACATCTCTAGTACATACCACAATTCATGGCCCTGCACAGATAGCTTGTGGTCTAGTTTGTTCCCCAATGTTCCCTCTTTTACCCCACAGCCACAACCAAGACAAATTACTTATGGAATGTAGCTATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107248 153 + 636262 TGGTTTGTGGTGCCTTGTGTATATACATTTCTAGTACATACCACAATTCAAGGCCTTGCACAGATAGCTTGTGGCCTAGTTTGTTCCCCAATGTTCCCTCTTTTACCCCACAGCCACAACCAAGACAAAATACTTATGGAATGTAGCTATAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 99372 153 + 647215 TGGTTTGTGGTGCCCTGCGTATATACACCTCTAGTACATAGCAGAACTCATGACCCTGCACAGATAATTTGTGGTGCAGTTTGTTCCCCAATGTTCACTCTCATACCAAACAGCCACAACCAAGACCAGTTACTTATAGAATGCAACTATAGC - -a -s mr.mrrefChr0 102382 142 + 130230 ATATTGTCAGGGGTCATGGTGTGATGAACTAAGGTGTGGACTAGGACATAGCTGGATGGTAACTGCATATGGCTTTCACCCAGCTACCTAACCTTACAGTAAGACAGAACCTAAGCACTAGCTATTTAATATCTCATGGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107406 142 + 636262 ATATTGTCAGGGGTCATAGTGTGATGAACTAATAAGTGGACTAGGACATGGCTGGCAGGTAACTGCATATGGCTTTCTCCCAGCTACCTAACCTTACAGTAAGACAGAACCTAAGCACTAGCTATTTAATATCTCATGGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 99525 90 + 647215 ATATTGTCAGGGGTCACGGTGTGATGAACTAAGGTGTGGACTAGGACATAGCTGAATGGCAACTGCATATAGCTTTCACCTAGCTACCTG---------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 102524 16 + 130230 AAACATGGGTGACAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107549 16 + 636262 AAATGTGGGTGACAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 99615 16 + 647215 AATCATAGGTGACGAT - -a -s mr.mrrefChr0 102540 17 + 130230 GCAAGCATATACAACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107565 17 + 636262 GCAAGCATATACAACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 99632 17 + 647215 ACAAGCGTATACAACAG - -a -s mr.mrrefChr0 102557 4 + 130230 AGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107586 4 + 636262 AGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 99649 4 + 647215 AGCT - -a -s mr.mrrefChr0 102561 57 + 130230 AAAAATCAATCTTGAGGCGAAAGTGTCCCTTATGTCTGGAGTTTCATTCCATATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107599 57 + 636262 AAAAACCAGTCTTGAGGCGAATGTGTCCCTTATGTCTGGAGTTTCACTCCATATATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 99653 57 + 647215 AAAAATCAATCTTGAGGTGAAAGTGTCCCTTATGTCTGAAGTTTCATTCCATATACG - -a -s mr.mrrefChr0 102618 282 + 130230 TAGAGGCCATCATAAGATTGTACTCAACAAACATCACCACCCCTGCTTTATCTTGTCTGGTTACAACACAGTTACCTTCTTGGTGGTAAAGACTACTTCATCTGTCTCAAAAAGTAATCATCAGGCAATGAGAGGTCAAGCATTTGGATAGTACCTACTTATCAGGGATTAGCTCAAAGTGAAACTGAATAACAAGTTGAAGGTGCTAACGCTTATTGATAGCACAAAATGATTCCACGTACAATACTGAGAAAGGAATGCAAACAGGAACGCAAAAGGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107656 280 + 636262 TAGAGGCCATCATAAAATTGTACTCAACAAACATCACCACCCCTCCTTCATCATGTCTGGTTACAACACAGTTACCTTCTTGGAGGTAAAGACTACTTC-TTTGTCTCAAAAAGTAATCATCAGGCAATGAGAGGTCAAGCATTTGGATAGTACCTACTTATCAGGGACTAGCTCAAAGTGAAACTGAATAACAGGTTGAAGGTGCTAA-GCTTATTGATAGCACAAAATGGCTCCACGTACAATACTGAGAAAGGAATGCAAACAGGAACGCAAAAGGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 99718 281 + 647215 TAGAGGCCATCATAAGATTGTAGTCATCAACCATCACCACCCCTGCTTTGTCTTATCTAGTTACAACTCAGTTATCTTCTTAGTGGTAAAGGCTACTTCATCTGTCTCAAAAAGTAATCATCAGGGAATGAGAGGTCAAGCATTTCGTTAGATCCTACTTATCAGGGATTCACTCAAAGT-AAACCGAATAACAAGTTGAAGGTGCCAACGCTTATTGATAGCACAAAAGGATTCCACGTACAATACTGTGATGGGAATGGAAATGGGAATGCAAAAGGACA - -a -s mr.mrrefChr0 102900 97 + 130230 GTAATCTATCAATACAGTAAATCCTAATATTGATCTCACATGTAACTCATAAGTGATTAAGGACATTAAAAAGTAAAGCAGCAGTTACTGTCTGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107936 97 + 636262 GTAATCTATCAATACAGTAAATCCTAATATTGATCTCACATGTAACTCATAAGTGATTAAGGACATTAAAAAGTAAAGCAGCAGTTACTGTCTGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 100008 97 + 647215 GTAATCTATCCAAATATTAAATAATAACATTGATCTCACATGTGACTCACATGTGATCAAGGACATTAAAAAGTAAATCAGCAGTTACTGTCTGTAA - -a -s mr.mrrefChr0 102997 340 + 130230 TAACGTGTGGTTCTTTGTAAAGTATCCCACTCGTCGGCAGGTGCCAAGAGTATGCTGGGGTATGGAGGTTGCCTGGGCGAATGTGGAAAATTATGAGGGGCAAAATTTGTCCTACAATAAATCTTGGCTTAGTGGCCTGACACAATAGCCCTTTGGACTTGTCATGTGAATGTAGTATAGTAATATACAGTTGTATTTAGGGCATCATTCATAATATTGTTACAGTGGGTGTTAGATCATTTTGGGTTTGTGCAACTTTGCTTCTGCAGCACATTCACTCAAATCTATTGTTATACCATACTTACAAGACAAGATGGTGGAAGAGGAGCTAAAGATGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108163 340 + 636262 TAACGTGTGATTCTTTGTAAAGTATCCCACTCGTCGGCAGGTGCCAAGAGTATGCTGGGGTATGGAGGTTGCCTGGGCGAATGTGGAAAATTATGAGGGGCAAAATTTGTCCTACAATAAATCTTGGCTTAGTGGCCTGACACAATAGCCCTTTGGACTTGTCATGTGAATGTAGTATAGTAATATACAGTTGTATTTAGGGCATCAATCATAATATTGTTACAGTGGGTGTTAGATCATTTTTGGCTTGGGTGACTTTGCTTCTGCAGCCCATTCACTCAAATCTATTGTTATACCATACTTACAAGACAAGATGGTGGAAGAGGAGCTATAGATGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 100105 335 + 647215 TAATGTGTGGTTCTTTGTAAGGTATCCCTCTCATTGGGAGGTGCCAAGAGTATGCTAGGGTATAGAGCTCGCCTAGGCAAATGTGGAAATTTATGAGGTACAAAATTTGTCCTACTATACATCTTGGCTCATTGGCCTGATGCAGTAGACCTTTGGACTTGTCATGTGGACGTAATATACTAATATACAGTTGGCTTTAGGGCGCCATTCATAATATTGTTACAGGGCCTGTTAGATC----TGGGTTTGTGCAGCTTTGCCTCTGCATCACATTCATTCAAATTCGTTG-AATACCATGCTTACAAGACAAGATGGTGGAGGAGGAGATAAAGCTGGTT - -a -s mr.mrrefChr0 103337 81 + 130230 CTGTCCATTTATGGACAGATTATGGATGATCTATAACTTGAATTCTGTGCCCATTAGTAGTGTACACACAACTTTCTGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108503 81 + 636262 CTATCCATTTATGGACGGATTATGGATGATCTATAACTTGAATTTCGGGACCATTAGTAGTGTACACATAACTTTCTGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 100441 81 + 647215 CCGTCCATTTATGGACAGACTATGGGTGATCTATGACTTGAATTCTGTACCTATTAGTAGTGTACACACAACTGTCAGCTG - -a -s mr.mrrefChr0 103418 163 + 130230 TACTATATATCACTTTGCCATTACCCTGCCATAAACAATCTGTATAATCATTTTATCTCCTGTTTGTTTGGAACTGCTTTTTTGATGCACTCCTACAGCATTGATGTAAACCCTGTCATCAATAAGTTATTGGTTACTTCTAAAGTACTTAAAAAGAGCCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108584 161 + 636262 TACTACATATCACTTTACCATTACCCTGCAATGAACAATCTGTATAATCATTTTATCTCCTGTTTGTTTGGAACTGCTTTTTTGATGCACTCCTACAGCA--GAGGTAAACCCTGTCATCAATAAGTTATTGGTTACTTTTAAAATACCCAAAAAGAGCCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 100523 160 + 647215 TACTATATATCACTTTGC---TACCCTGCCATAAACAATCTGTATAATCATTTTATCTCCTGTTTGTTTGGAAATGCTTTTTTGATGCACTCCTACACCATTGATTTAAACCCTATCATCAATAAGTCATCGGTTACTTCTAAAGTACTTAAATAAAGCCATA - -a -s mr.mrrefChr0 103581 182 + 130230 TTTGTTTACCTTGTCAAGGTAGATTAGGATAACACACATGTTTCTCATGCTAAATGGCTTTTCTCTAAATCACTTTTGTTCCAGAGTGTTCATTATTGTATATAGTAGAGCTTTAGGAGGCTGACCAATATCTACTCCCCACTGATGCCTGTCTGCTGGGTATCTGTATACTATAACCGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108745 182 + 636262 TTTGTTTGCCCTTTCAAGGTAGATTAGGATAACACACATGTTTCTCATGCTAAATGGCTTTTCTCTAAATCACTTTTGTTCCAGAGTGTTCATTATTGTATATAGTAGAGCTTTAGGAGGCTGACCAATATCTACTTGCTACTGATGCCTGTCTGCTGGGTGTCTGAATACTATAACCGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 100685 165 + 647215 TTTGTTTACCTGGTCAAGGTAGATTAGGTTAACACACTTGTCTCTCATGCTAAATAGCTTTTCTCTAAATCAATTTTGTTCC-GAGTGTTCATTATTGTATATAGTAGAGCTATAGGATGCTGACCAATATCTACTCCACACTGATGCCTGGCTGCTTTG-ATCTGT--------------- - -a -s mr.mrrefChr0 103763 35 + 130230 AAACCCCAACACAAAGGCCAAAAATCCAAAGAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108935 35 + 636262 AAACCCCAACACAAAGGCCAAAAATCCAAAGAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 100850 35 + 647215 GAACTCCAACACAGAGGCAAAAGATCCAAAGAATT - -a -s mr.mrrefChr0 103798 183 + 130230 CCCAGGAATTGCTCTGCTAGAGGATTTGACTTACTCATACTATCTTGCATAGCACTTGTGTCCTATGGCAGCAAACATGCCAGTACTTTTCCTACTCTCTGTGCAATCTTATTCATCTCTCACTAGCAAGTATGCACAATTTTAGGCTTTTCACAACTGCTTTTGTGTCATGTAGTTTTTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108981 183 + 636262 CCCAGGAATTGCTCTGCTAGAGAATTTAACTTACTCATAGTATCTCGCATAGCACTTGTGTCCTATGGCAGCAAACATGCCAGTACTTTTCCTACTCTCCCTGCTACCTTATTCATCTCTCACTTGCAAGTATGCACAATTTTAGGCTTTTCACAACTGCTTTTGTGTCATGTAGTTTTTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 100885 179 + 647215 CCC----ATTGCTCTGCTAGAGGATTTGGCTTACTCATGCTATCTTGCATAGCACGTGTGTCCTATGGCAGCAAACGTGTCGGTACTTTTCCTACTGTCTGTGCAATCTTATTCATCTCTCACTAGCAAGTATGCACTAATTTCGGTCTTTCACAACTGCTTTTGTGCCATGTAATTTTTTAA - -a -s mr.mrrefChr0 103981 29 + 130230 TAAGGTAATGGCTGAGAAGGTCTTCTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109164 29 + 636262 TAAGGTAATGGCTGAGGAGGTCTTCTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 101072 29 + 647215 TAAGGCAATAGCTGAGAAGGTTTTCTAAC - -a -s mr.mrrefChr0 104010 230 + 130230 TTACTTATGCTTAGAGACACATCTAACTAAGAACTAAGTGCCAACCATAACCCTTGACTGTATATATCAATATCTTCATTCTATTAAAGACTATAGAGCAGACATCGTGGAAGAAGGGTGTAGCTCTCTTGTGGCCCCTACTGTCAAGATATATCATTCCTAGTTTGCCTTGTATATAAGAGATCTATCAGTGGGGATCATAATAAACAAAAATACCTCACTGCTTTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109194 208 + 636262 TTACTTATGCTTAGAGACAGATCTAACTAAGAACTAAGTGCCAACCATGACCCTTGACTGTATATTTCTATGTATTCATTCTATTAAAGACTATAGAGTAGACATCGTGGAAGAAGGGTGTAGCTCTCTTGTGGCCACTACTGTCAAGATATATC----------------------AAGAGATCTATCAGTGGGGATCATAATAAACAAAAATACCTTACTGCTCTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 101101 229 + 647215 TTAAGTATACTTAGAGACACATCTAACCAAGAACTAAGCGCTAGCCATAACCTTCAACTGTATATATCAATATCTGCGTTCTATTAAAGACTATAGACCAGAC-TCATGGGAGAAGGGTGTAGCTCTCTTGTGGCTCCTACTGTCAAGATATATCATTCCTAGTTTGCCTTGTATATATGAGCCTCAGCAGTGGGGATCATAATAAACAAAAATACCTCAATGATTTGTA - -a -s mr.mrrefChr0 104240 23 + 130230 ATGCACTATCTCATTGAGTGACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109402 23 + 636262 ATGCACTATCTCATTGAGTGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 101331 23 + 647215 ATGCATTATCTTGTTGAGTGAAC - -a -s mr.mrrefChr0 104263 118 + 130230 TATGCGCAGCAGCAATGTTTGTGCTGATGTGATTTAAAATTTTTGTGATCATGACTTTTGAAACATGCAATCCACCCACATTGTCCAGTGACTGCCTTGTATTATTTATTCTGTTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109425 115 + 636262 TATGCCCAGCAGCAATGTTTGTGGTAGTGTAATTAATAAGTTTTGTGAT---GACTTTTGAAACATGCAATCCAACCATATTATCCAGTGACCACCTTGTCTCGTTTACTCTGTTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 101354 118 + 647215 TATGCGCAGCAGTAATGTATGTGCTGATGTGATTTAAAATTTTTGTGATCATGACTTTTGAAACATGCAATCCACCCACATTGTCCAGTGACTGCCTTGTATTATTTATTCTGTTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 101497 118 + 647215 TGTGCGCAGCAGCAATGTTTGTGCTGATGTGATTTAAAATTTTTGTGATCATGACCTATGAAACATGCAATCCACCCACATTGTCCAGTGACTGCCTTGTATTATTTATTCCGTTTAT - -a -s mr.mrrefChr0 104381 25 + 130230 TAAAAAATCCATTGTGCAACACTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109544 25 + 636262 TAAAAAATCCACTATGCAGCACTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 101472 25 + 647215 TAAAAAATCCATTGTGCAACACCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 101615 25 + 647215 TAAAAAATCCATTGTGCAACACTTC - -a -s mr.mrrefChr0 104406 634 + 130230 GGAGACTGCCTGATTTTTAGAAAATGCAGCACCATTGGTTTATTTTAAATTAAAACCCGCGAGCTAAATCATTTGGTGACTTAAACACTAACTTCGGAGCATAGACGAGGCTCGGGGTTCGTACGAGGGGTCTAATTCACCCAGTAGTTAGTCGGCCCTGCCGGAGATCTATTCCCTATCCTACACAGATCGGCTAACAGCTTCGCACGCTTAGTCCTCGTCTCTTGGGTGTGGGTATCTCTTAGATGCGGTTGGCAGCTTTCCTTACCGCACCAGGAGAGGCGTGTTCTGGCCCAAGGCATAGGGATATCCGGTTAAATTCGGAGAGCAAGGCGCATTTATAGTTCGAGCGACCAGAGTTATATTAGGTGCACGTGGCAGTATAATTTTAGGGTTCAAAGCTCAACCCACGGGCGTGCCAAACTCCCGAATGGGGGGGCTTGTGTTATTGTGGTGGCTTTGCACTGGCTAAACTTGAGCACTAGGATGTAGAAAGGTTAGCTAGCTGCTGTGAAGCAGGTTCCTGACTTTTACTTTCCCAGCTCCCCACACTATTGATGCATCCTTGATCATAGGGTAGCTGTCTTTGAAAGTTTATGCATCAGTAGTTGCACTACTTCTTAAGCTCGGCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109569 621 + 636262 GGTGACTGCCTCATTTTTAGAAAATGCAGCATCATTGGTTTATTG-AAATTAAAACCTGCGAGCAAAATCATTTGGTGACTTAAATACT--CTTCGGAGCATAGACGGTGCTCGGGGTTCGTGCGACGGGTCTAATTCACCCAGTAGTTAGTCGGCCCTGCCGGAGATCTACTCCCTATCCTAGACAGATCGGCTAACAGCTTCGAACGCTTAATCCTCGTCTCTT-------GGTCTCTCTTAAA-GCGGTTGGCGGCTTTCAGTACCCCACCAGGAGAGGCGTGCTCTGGCCCAAGGCATAGGGATAGCCGGTTAAATTCGGAGAGCAAGGCGC--TTATAGTGCGAGCGACCAGAGTTATATTAGGCGCACGTGACAGTATAATTTTAGGGTTCAAAGCTCAACCCACGGGCGTGCCAAACTCCCGAATGGGGGGGCTGGTGTTATTGTGGTGGCTTTGCACTGGCTAAACTTGAGCACTAGGATGTAGAAAAGTTAGCTGGCTGCTGTGAAGCAGATTCCTGATTTTGACTTTCCCAACTCCCCACACTATTGGTACATCCTTGATCATAGGGCAGCTGTCTTTGAAAGTTTATGCACAAGTAGTTGCACTACTTCTTAAGCTCGGCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 101640 617 + 647215 TGAGACTGGCTGATTGTTAGAAAATGCGGCACCATTTGTTTATTTTAAATTAAATCCCGCGATGTAAACCATTTGGTGACTTAAGCACCAACTTCGGAGCATAGACGAGGCTCAGGGTTCGTACGAGGGGTCTAACTCACCCGGTAGTTAGTCGACCCTGCAAGAGAT---TTCCCTATCCTACACAGATCGGCTATCAGCTTCCCACGCTTAGTCCTTGTCTTTTGGGTGTGGGTATCTCTTAGATGCGGTTGGCAGCTTTTCTTACCGC--------------GTTCTGACCCAAGGCATAGGGATATCCCGTAAACTTCGGAGGACATGGCGCATTTATAGTTCGAGCGGTCAGAGTTATATTAGGTGCATGTTGCAGTATAATTTTAGGGTTAAAAGCTCAACCCACGGGCGTGCCAAACTCCCAAATGGGGGGGTCTGTCTTATTGTGGTGGCTTTGCACTGGCTAAAACTGAGCACTAAGATGTCAAAAGGTTAGCTACCTGCCATGAAGCAGGTTCTTGACTTTTACTTTCCCAGCTTCCCACACTATTGATGCATTCTTGATTATAGGGTAGCTGTCTTTGAAAGTTTATGCATCAGTAGTTGCACTATTTCATAAGCTCAGCCAA - -a -s mr.mrrefChr0 105040 84 + 130230 TCACATGGATTGTCAATCAAAGTGCTCACTGATCTCAACAGGCTGTTCAGTCTTCCTGTGTGTCCTTGTCATGATTCATTTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110190 84 + 636262 TCACATGGATTGTCAATCAAATCACTCACTGATCTCAACAAGCTGTTCAGTCTTCCTGTGTGTCCTTGGCATGATCCATTTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 102258 84 + 647215 TCACATGGATTGTCAATTAAAGTGCTCACTGATCTCAACAGACTGTTCAGTCTTCCTGTGTGTTCTTGTCATGATTTATTTGGG - -a -s mr.mrrefChr0 105124 31 + 130230 ACACCTTGTGTTGTTGCTGCACCTCTGGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110274 31 + 636262 ACATCTTGTGTTGGTGCTGCACCTCTGGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 102348 31 + 647215 ACACAGTGAAGTATTGCTACCAATGTTGTCT - -a -s mr.mrrefChr0 105155 272 + 130230 CAGCCATGTCAATGATCATAAGCAACACAGTGAAAGCATGCTGGCCCAACCAAATAAATTGGTATCATAAGCCAAATTTGCCTTGCAGTTACCTGTCAATCAGCTGTGTCTGGCCAGTTGCAATAACTTGTGGTAGACATATATAACATCATCTATGCCCACTGGGGTTCTAATTTAATAGTTTGCTTGTCACTCCCTATCCACCAATATTTggtaacctccccaagctaattaataatctgagtgacatccctggttacaaagttaatgtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110305 271 + 636262 CAGCCATGTCAATGATCATAAGCAACACAGTGAAATATTGCTGGCCCAACCAAATAAATTGGTATCATAAGCCAAATTTGCCTTGCAGTTACATGTCAATCAGCTGTGTCTGGCAAGTTGCAATAACTTGTGGTGGACATATATAACATCATCTATGCCCACT-GGGTTCTAATTTAATGGTTTGCTTGTCACTCCCTATCCACCAATATTTggtaacctccccaagctaattaataatctgagtgacatccctggttacaaagttaatgtg -s simRat_chr6.simRat.chr6 102381 258 + 647215 CAGCTATGT------TGATTAGCAACCTATTGTAAGCAT-----CCCAACCAAGTCAATTTGTATCTTAAGCCAAATCTGCCTCGCAGTTACCCGTCAGTCAGCTGTGT---GCCAGTGGCTATAACTTTTGGTAGACATAGATAACTACTGCTACACCCACTGGGGTTCTAATTTAATAGTTTTCTTGACACTGACTATCCACCAGTATTTggtaacctccccaggctaattaatactttgagtgacatcactggttacaaagttaatgtg - -a -s mr.mrrefChr0 105427 102 + 130230 ctctctcaaaattattaagggaagccgctagtaattcacaaaatactagatgttcatgggttggcctgcagaaagttttgaatctgagaattttaatcttac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110576 102 + 636262 ctctctcaaaattattaagggaagccgctagtaattcacaaaatactagatgttcatgggttggcctgcagaaagttttgaatctgagaattttaatcttac -s simRat_chr6.simRat.chr6 102783 102 + 647215 ctttttcaagattaataagggaagccactagtaatacaaaaaataccagatgttcatgggttgacttgcagaaagttttgaatctgagaattttgatcttgc - -a -s mr.mrrefChr0 105529 47 + 130230 gactgataacaaatctaattcaaagttaaaaaaattgagcaagcaga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110678 47 + 636262 gactgataacaaatctaatTCAaagttaaaaaaattgagcaagcaga -s simRat_chr6.simRat.chr6 102989 47 + 647215 gactcatagcaaatccaatttaaagtcaaaaaaattgggccagcaaa - -a -s mr.mrrefChr0 105576 37 + 130230 tcaggttactatgaatgagttttaccaccaagttacc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110725 37 + 636262 tcaggttactatgaatgagttttaccaccaagttacc -s simRat_chr6.simRat.chr6 103037 37 + 647215 tcaggatatagtaaataatttttactgccaagttacc - -a -s mr.mrrefChr0 105613 52 + 130230 agccggcactactggtatgaaagtgtgaataacagtcttttcactagttcaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110769 52 + 636262 agccggcactactggtatgaaagtgtgaataacagtcttttcactagttcaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 103074 52 + 647215 acccagcactactggtatgaaagtgtgaataacggtcttttcactagttcaa - -a -s mr.mrrefChr0 105665 41 + 130230 atggagccatcaacaaatagttttgtacgccagccaattga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110821 41 + 636262 atggagccatcaacaaatagttttgtacgccagccaattga -s simRat_chr6.simRat.chr6 103142 41 + 647215 atagggcgctgtacaaatagtttgattccccagccaactga - -a -s mr.mrrefChr0 105706 12 + 130230 ttgcttaatgtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110864 12 + 636262 ttgcttaatgtt -s simRat_chr6.simRat.chr6 103183 12 + 647215 ttgcttaatgtt - -a -s mr.mrrefChr0 105718 71 + 130230 gagccagggatccattaatcaataagtggtgttggacaaatgtgttatctatccacaaagaattaaagctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110902 71 + 636262 gagccagggatccattaatcaataagtggtgttggacaaatgtgttatctatccacaaagaattaaagctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 103195 71 + 647215 gaaccaaggatacacgaattaataagtattactggggaaatgtgttatctatccacagaaagtaaaggctt - -a -s mr.mrrefChr0 105789 30 + 130230 tcctaacttcttatatcagctgcaatggga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110980 30 + 636262 tcctaacttcttatatcagctgcaatggga -s simRat_chr6.simRat.chr6 103266 30 + 647215 tcctaaggtcttatataagctgtgagggga - -a -s mr.mrrefChr0 105819 51 + 130230 acaaccaagaattaaaacttgactttttcttcactccttatgtgaactgta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111010 51 + 636262 acaaccaagaattaaaacttgactttttcttcactccttatgtgaactgta -s simRat_chr6.simRat.chr6 103298 51 + 647215 acaaccaagaattaaaacatgactttttcataacactttgtgtgaactgta - -a -s mr.mrrefChr0 105870 20 + 130230 gactacaaatcagaactcct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111065 20 + 636262 gactacaaatcagaactcct -s simRat_chr6.simRat.chr6 103349 20 + 647215 gaccacagatcagaattcct - -a -s mr.mrrefChr0 105890 75 + 130230 gccaaaaaaaacattgtaaaatgccacctaacatttggcacggggaaaatatatatctgaaggcaccaaaaacaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111085 75 + 636262 gccaaaaaaaacattgtaaaatgccacctaacatttggcacggggaaaatatatatctgaaggcaccaaaaacaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 103370 75 + 647215 gtcaaaaaaaacattgtaaaacaccactgaacatttggcacagggaaaatatgtatctgaaggcgctaaaaacaa - -a -s mr.mrrefChr0 105965 103 + 130230 tacagccaaacctaaaattgtgtggagtgaaagaaaagatgtctgcgggcatggtgaactccaggcctagaattttggacaaaaccgtcacctcctatgcccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111161 103 + 636262 tacagccaaacctaaaattgtgtggagtgaaagaaaagatgtctgcgggcatggtgaactccaggcctagaattttggacaaaaccgtcacctcctatgcccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 103445 103 + 647215 tacacctaaacctaaaattgtgtggagtgaaagtaaagacatctgtgggtatggtgaactccaggcttagaaatttggacaaaatcgtcaccacttatatccc - -a -s mr.mrrefChr0 106068 42 + 130230 aaaaggggtcgagcctcccgggttcggaaggaacccacaaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111265 42 + 636262 aaaaggggtcgagcctcccgggttcggaaggaacccacaaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 103548 42 + 647215 aagaggggactagtcccccggtttcagaaggaacccacaaag - -a -s mr.mrrefChr0 106110 68 + 130230 tccaaaaagaatgccaatgcactaatcagaagatggactagaaacattaacagtctgtcagtgtttgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111312 68 + 636262 tccaaaaagaatgccaatgcactaatcagaagatggactagaaacattaacagtctgtcagtgtttgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 103590 68 + 647215 tccaaaaagagaaccaatgccacaatcagaagatggactagagacattaatagtcggtcagtgttttg - -a -s mr.mrrefChr0 106178 50 + 130230 attgccagaggaagtgtgcttcttccccatcagctcattggatgggcaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111387 50 + 636262 attgccagaggaagtgtgcttcttccccatcAGCTCATTGGATGGGCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 103658 50 + 647215 agtgccagaggaagtctgcttcttcctcatcagcccattgcacagccaag - -a -s mr.mrrefChr0 106228 77 + 130230 caccaggggaagtaagacttttcctgaggcctatcgtgcaggtattggtggtaggacaacactatgttgtgtcaggc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111438 77 + 636262 caccaggggaagtaagacttttcctgaggcctatcgtgcaggtattggtggtaggacaacactatgttgtgtcaggc -s simRat_chr6.simRat.chr6 103708 77 + 647215 caccaggggaagtgagacttttcctgaggcctatcatgcaggtattggtggtaggacaacgccatgctgtgctatgc - -a -s mr.mrrefChr0 106305 38 + 130230 aatgagtaacgatggagaaacctttttctaatatCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111515 38 + 636262 aatgagtaacgatggagaaacctttttctaatatCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 103786 38 + 647215 aatgagtaacaatcgagaaacctttttctaatatCTAT - -a -s mr.mrrefChr0 106343 33 + 130230 ACAAGCATAATAAAAATGGTGACCTTATACAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111553 33 + 636262 ACAAGCATAATAAAAATGGTGACCTTATACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 103851 33 + 647215 ACCAACATAAGAAAGATGGTGGCCTTATACAGC - -a -s mr.mrrefChr0 106376 279 + 130230 AAAGCCCTTTTTCCTTGCCACAAGCTACCCACAGGTTTAACTGCACTTTAACTACATGATAAAATATAGCTGTGCACCAACATTGCTGGGCTTGTTAGAGTATCAATATTACAGTAGTAATTGGATGGTATGTGGGTCACCAAAATCCCTTTATGCCAAAGGGTACTATTCATGTATTACAACCCACAATGCCCTCCACTCTGAAAGTAAGATGTTACCAGAGTTCTAACAATTCATAATGTAGATGTAGTTGCCTTACAATGTCATAGAGGACATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111614 274 + 636262 AAAGCCCTTTTTCCTTGCCACAAGCTATCCACAGGTTTGACTACACTTTGACTACATGATAAAATATAGCTGTGCACCAATATTGCTGGGCTTATTAGAGTATCAATATTACAGTAGTAATTGGATGGTATGTGTGGCACCAAAATCCCTTTATGCCAAAGGGTACTATCCATGTATTACAACCCACAATGCC-----CTCTGAAAGTAAGATGTTGCCAGAGTTCTAACAATTCATAATGTAGATGGAGTTGCCTGACAATGTCATGGAGGACATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 103884 269 + 647215 AAGGCCCTTTTCCCTTGCCACAAGCTACCCACAGGTCTAACTGCAGTTTAACTACCTGATAAAATATAGCCGTGCACCAACATTGCT-GGCTGGTTAGAGTATC---------GTAGTAATTGGATGGTATGCGGGTCACAAAAATCCCTTTATGCCGTAGGGTACTATTCATGTATTACAACCCACAATGCTCTCCACTCCGAAAGTAAGAAGTTATCAGAGTTGTAACAATTCATAATGAAGATGTAGATGCCTTACAATCTCATAGAGTGCATATG - -a -s mr.mrrefChr0 106655 7 + 130230 TGGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111894 7 + 636262 TGGCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 104153 3 + 647215 T----CA - -a -s mr.mrrefChr0 106662 103 + 130230 TTTTTAGTGGTTATGCCATTTGTTCATTCCAAGAGGAACAGCCCTCTTATTGTTCACCAACACAAGTTTAGGATATAAAGCTTATATTTTGTAACATGCTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111914 103 + 636262 TTTTTAGTGGTTACGCCATTTGTTCATTCCACGTGAAACAGCCCTCTTATTGTTCACCAACATAAGTTTAGGATATAAAGCTTGTATTTTGTTACAAGCTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 104156 103 + 647215 TTTTTAGTGGGTATGCCATTTGTTCATTCCAAGAGGAACAGCCTTCTTATTGTTCACCAAAACAAGTTTAGGATATAAAGCGTATAATCTGTAACATGCTCCT - -a -s mr.mrrefChr0 106765 151 + 130230 TTCCATTTAGGATATAAAGCCTATAATCTGTAACATGCTCCTGTCCTATTCATTATGGGCATTATCTCTATTCATTATGGGCATTGTGAGTCTGAGTGAGAGGTGCAGTAACTTGTTGAAAGAAGTCAGAGACAAGTTCTTCCTGAGGACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112017 150 + 636262 TTCCATTTAGGATATAAAGCCTATAATCTGTAACATGCTCCTGTCCTATCCATTATGGGCATTATCTCTATTCATTATAGGTATTGTGAGTCTGAGTGAGAGGTG-AGTAACTTGTTGAAAGAAGTCAGAGACAAGTTCTTCCTGAGGACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 104264 151 + 647215 TTCCGTTTAGGATATAAAGCCTCTAACGTGTAGATTGCTCCTATTGTATTCATTATGGGCATTATCTCTATTCATTATGGGCATTGTGAGTCTGAGTAAGAGATGCAGTAACTTGTCAAAAGGAGTCAGAGACAAGTTCCTCATGAGGATG - -a -s mr.mrrefChr0 106916 138 + 130230 ATTAATTCCCAGGAGAGGACCATGTGGGGAGGTGCTATCTTAGCCTCACATCATAGAGTTATTGCAAATCTTTTTCATACCTGTCAGAAAAACCTGGCATAGATAGCTAAAGTCAGAGATGTCAGCTCAATCTAAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112167 137 + 636262 ATTAACTCCCAGGAGAGGACCATGTGGGGAGGTTCTATCTTAGCCTTACATCATAGAGTTATTGCAAAGCTTTTTCATACCTG-CAGATTAACCTGGCATAGATAGCTAAAGTCAGAGATGTCAGCTCAATCTAAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 104418 138 + 647215 ATTAATTCCCAGGAGAGGACCAAGGTGGGAGGTGCTATCTTACTGTCACGTCACAGAGTTATTGCACATCTTTTTTATACCTGTCAGAAAAACCTGGCATAGATAGTTAAAGTCAGAGGCATCAGCTCAATCTAAGGA - -a -s mr.mrrefChr0 107054 94 + 130230 TCAGAGATATGTCTGCCCAGTCTTAAGTATAATTCAATTTATTCTCTCTGCAGAGATAATTCCCATGTCCTTCACAATAAATTTAACTTAGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112324 92 + 636262 TCAGGGATATGTCTGCCCAGTCTTAAGTATAATTCAATTTATTCTCTCTGCAGAGATAATTCCCATGTCC--CACAATAAATTCAACTTAGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 104556 94 + 647215 TCAGAGACATGTCCGGCCAGTCTTGAGTATAATTGAATTTACTCTCTCTGCAGAGATAATTCCCATGTCCTTCATAATAAATTTCACTTAGATC - -a -s mr.mrrefChr0 107148 20 + 130230 TCATTACTCATGGATAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112416 20 + 636262 TCATTCCTAATGGATAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 104695 20 + 647215 TCATTACTCATGGATAAACC - -a -s mr.mrrefChr0 107168 170 + 130230 GAACTTCTTTGAGCCTGTAGGCAATTAAAAGAAGTTAAGGAGACTGGTTTTTTAAAAGGCCCTCAGTGTTGCATTAGTCATAAACCTCAAGATGAAGGTGGTGGACTCCTAGAAATGTGTCAACCTATAACCTTCAGTATTCATTGTTAAAACTTATACTATTTCATTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112436 170 + 636262 GAACTTCTTTGATCCTGTAGGCAAGTAAAAGAAGTTAAGGAGACTGGGTTTTTAAAAGGCCCTCAGTGTTGCATTAGTCATAAACCTCAAGAGCAAGGTGGTGGACTCCTAGAAATGTGTCAACCCATAAGCTTCAGTATTCATTGTTAAGACTTATACTATTTCATCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 104747 167 + 647215 GAACTTCTTTGAGCCTGTAGGCAATTAAAAGAAGTTGAGGAGACGGGTTTTGTAAAAAGTCCTCAGTGTTGCATCAGTCATAAACCTCAAGCTGAAGGTGGTGGACTCCTAGAAGTGTGTCAACTTATAGCCTTCAGTGTTCATTGTTAAAACTTATATTGTT---CTAG - -a -s mr.mrrefChr0 107338 275 + 130230 TGGATGTTGTTGTAGTCTAGGACACACAATCCTTAGTTCATAAATTTCATGCATTGTCTTCTTGCAGGGTGGCCTTCACTGCCAAGACTTGCTGTTGTTATATGAAAGACTATAGTGCTGATACTGACCCACCGGCAGCCAGGGGCTCCTTTTCTCACGTTGCCTGATATAACCTTCTTGTTAAACTGTAACTACTAAAGATCTATCATGGATTTATCCTACCCTGCAGCAACTATGTTGCATAGTCAGCAAATGAGTATAATACAAGTAGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112609 273 + 636262 TGAATGTTGTTGTAGTCTAGGACGCACAATCCTAAGTTCATAAATTTCATGCATTGTCTTCTTGCAGGGTCGCCTTTACTGCCAAGACTTGCTGTTGTTATATGAAAGACTAT-GTGCTGA-ACTAACCCACCGGCAGCCAGGGGCCCCTTTTCTCACGTTGCCTGCTATAACCTTCTTGTTTAACTGTAACTACTAAAGATCTATCATGGATTTATCCTACCCTGCAGCAACTATGTTGCATAGTCAGCCAAAGAGTACAATACAAGTAGATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 104914 273 + 647215 TGGGTCTTGTTGTAGTCTAGAACACCCAATCTTTAGTTCACAAATTTCATGCATTGCCTTCTTGCAGGGTGGCCTTCACTGCCAAGATTTGCTCTTATTATATGAAATACTATAGTGCTGATACTGACCAACCAGCAGCCAGGGGGTCCTTTTCTCACCTCGCCTGATATAACCTTCTTGTTAAACTATAACTACTAA--ATTTATCATGGATTTATTCTACCCTGCTGCAACTATGTTGCATACTCAGCAGTTGAGTATAGTACAAGAAGATAG - -a -s mr.mrrefChr0 107613 19 + 130230 ATTTGTTTATTTGGAGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112885 19 + 636262 ATTTGTTTATTTGGAGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 105187 19 + 647215 GTTTGTTTATTTTGAGTAG - -a -s mr.mrrefChr0 107632 24 + 130230 AAACTGAGTTTGATACCAGTACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112905 24 + 636262 AAACTGAGTTTGATACCAGTACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 105206 24 + 647215 CAACTGAGTTTAATTCTGGTCGAT - -a -s mr.mrrefChr0 107656 47 + 130230 TAACATTTGTTCATTTCAGCCATGGAACAAAAGTAGTGCAATACAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112932 47 + 636262 TAACATTTGTTCATTTCAGCCCTGGAACAAAAGTAGTGCAATACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 105230 47 + 647215 TAACATTTGTTCATTTCAGTCACGGAACAATGGTAGTGCAATAAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 107703 85 + 130230 ATTGTGTTCTTGGTGAGTTGACTTGTCACAAAACCCATAAATAACAAAGGGTGACAGGTAATTAGAGACGATAACCCCCCCTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112979 85 + 636262 ATTGTGTTCTTGGTGAGTTAACTTGTCGCAAAACCCATAAATAACAAAGGGTGACAGGTAAGTGGAGACGATAACCCCCCCTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 105281 84 + 647215 ATTGTCTTCTTGATGAGTTGACTTGTCACAAAACCCATAAATAAT-AAGGGTGATAGGTAATTAGAGACCATAGCCCCCCCTATC - -a -s mr.mrrefChr0 107788 174 + 130230 AAATTGAAGCACCTGTAGTAAGACTATAGTGGCTGGTTGACCAGTAAACCATTGTGGGTCTCCCTCTAGGAGGGGAATTGGGGCATACATGGTTGCCAAGGAAAGGGGCAGAGCAGGGTGAAGGGGCAGAGCAGAGTATAGTTGGGCAGGTAAACAAATAGTCCCACACATGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113064 174 + 636262 AAATTGAAGCAACTGTAGTAAGACTATAGTGGCTGGATAAGCAGCAAACCATTGTGGGTCTCCCTCTAGGAGGGGAATTGGGGCACACATGGTTGCCAAGGAAAGGGGCAGAGCAGGGTGAAGGGGCAGAGCAGAGTATAGTTGGGCAGGTAAACAAATAGTCCCACACATGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 105367 174 + 647215 AAATTGAAGCACCTGCAGCAAGAATATAGGGGCTGGTGGACCAGTACACCAATGTGGGTCTCCCTCTAGGGGGGGAATTGGGGCATACATGGTTGCCATGGAAAGGGGCAGAGCAGGGGAAAGGGGCACAGCAAGGTATAGTTGGGCAGGTAAACAAATAGTCCCACACATGTG - -a -s mr.mrrefChr0 107962 34 + 130230 TCTAAACTGTGGTGAGGGTAGTACAGAGCCGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113238 33 + 636262 TCTAAACTGTGGTGAGGGAAGTACAGA-CCTCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 105543 34 + 647215 TCTAACCTGTGGTGAGGGTAGTACAGAGCAGGGT - -a -s mr.mrrefChr0 107996 158 + 130230 GTCATAGCTCTTTGCAAAGGTTCTCTATCACAAGCTTCAGATTGAGGTTTTGTATGCTGCAAATGGGATATATACTTAGAAGTATGGGTTTGGGCACACATCCCTAGTCTGAAAGAAGTTTCTCACAAGAGTCTACGTCAATTATGTGACTGACAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113271 157 + 636262 GTCATAGCTCTTTGCAAAGGTTCTCTATCACAAGCTTCAGATTGAGGTTTTGTATGCTGCAAATGGGATATATACTTAGAAGTATGGGTCTGGGCACACATCCCTAGTCTGAAAGAAATTTCTCACAGGAGTGTA-ATTAATTATGTGACTGACAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 105587 158 + 647215 GTCATAGCTATTTGCAGAGGTTCTCAACCACAAGCTTCAGATCAAGGTTTTGTATGCTGCAGACAGGACAACTTCTTGGAAGTACGGATTTGGGCACACTTTCCCAGTCTGAAAGAAGTTTCTCACAAGAGTCTACGTCAATTATGTGACTGACAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 108154 174 + 130230 GAGACTATGTCTAGGGGAATGCAGCCCTGGATGGCGGGTATGTTATGTATTATCAGGAGATCCAGTTCACTAGCAAACCTGACAAGTATATAAACATAAACGCTCAGAACACATTTCGGAGGCATATATCAGGGTACTTTACAGGTTTTGGAAGCAATGCGCCATGCATTGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113428 174 + 636262 GAGACTCTGTCTAGGGGAACGCGGCCCTGGATGGCGGGTATGTTATGTATCATCAAGAGATCCAGTTCACTAGCAAACCTGACAAGTATATAAACATAAGAGCCCAGAACACATTTCAGAGGCATATATCAGGATACTTTACAGGTTTTGGAAGCAATGCACCATGTATTGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 105751 166 + 647215 GAGACTATGTCTAGG---ATGCAGCCCTTGGTGGTGAGTA---TATGCATTATCAGGAGATACAGTTCACTACCAAACCTGCCACATGTATCAACATAAACGCTCAGAATAC--TTAGGAGGCATATATCAGGGTACTTTACAAGTCTTGGAACCAATGCGCCATGCATTGTTG - -a -s mr.mrrefChr0 108328 10 + 130230 GATAATCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113602 10 + 636262 GATATTCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 105974 10 + 647215 GATAATCTAT - -a -s mr.mrrefChr0 108338 165 + 130230 ATCATATGCAGGTCACAAATCTCAATAGTGTCCATAAACATTTTCCATAAACATTTCCACATAAAGAGTTCATCTAGGAAAGGTTATGCAAAATGCCTACTATGGAAATTTTGACAACAGAAAGAAGTGAACTAAGACACCAAACAATAAACATTTAAACAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113613 153 + 636262 ATCACATGCAGGGCATA-----------TGTCCATAAACATTTTCCATAGACACTTCCACGTAAAGAGTTCATCTAGGAAAGATTATGCAAAGTGCCTACTATGGAAATTTTGACAACAGAAAGAAGTGAACTAGGACACCAAACAAT-AACATTTAACCAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 105984 162 + 647215 ---ATATGCAGGTCACAAATCTCAATAGCGTCCATAAACATTTTCCATAAACATTTCCACATAAAGAATTCATCTAGGAAAGGTTACGCAAAATACCTACTATGGAAATATTGACAACAGAAAGAAGTGGACTAAGACACCAGTCAATAAACATTCAAACAGTAA - -a -s mr.mrrefChr0 108503 206 + 130230 GACATGGGCTAATCATTGCATAATAATGCCAAGAATGAATTACCAAGAAAGAATAACCTTAATAGTTCCATGATATGGTGGTGGGGAAATCAGACCATTAGTGATCTACCACCATCTTATTGTGCCACATTAAAATGGAGGGGGGGCACAAAATGGACTCAATTATTGTAATGACAATACTTTGGTGGTAGGTTTAATCTTTAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113815 206 + 636262 GACGTGGGCTATTCATTGCATAATAATGCCAAGAATGAAGTACCAAGAAAGAATAACCATAATAGTTCCATGATATGGTGGTAGGGAAATCAGAACACTAGTGATCTACCACCATCTTATTGTGCCACATTAAAATGGAGGGGAGGCACAAAATGGACTCAATTATTGTAATGACAATATTTTGGCAGTAGGTTTAATCCTTAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 106146 205 + 647215 GACATGGGTTAATCATCGCATAATAAAGCC-AGAATGAATTGCCAAGACAGAAGAGGCTTAATAGTTCCGTGATATGGTGGTGTGGAAGTCAGACCATTAGTGAACTATCTCCATCTTAGTGTGCCACATTAAAATGGAAGGGGGGCACAAAGTGGACTCAATTATTGTAACAATAATCCTTTGGTGGTGGGTTTAATCTTTAGAA - -a -s mr.mrrefChr0 108709 94 + 130230 GAAGTATTCCTAAAAAGAATAAGCACTCTTCTGTCTGAGCTTGGCTGCCCAAGGCTTTGATAGGCAAAAGGACACAGGTTGAGGGCACAAAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114026 93 + 636262 GAAGTATTCCTAAAAAGAATAAGCACTCTTCTGTCTAAGCTTGGCTGCCCAAGGCTTTGATAGGC-AAAGGACACAGGTTGAGGGCACAAAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 106351 92 + 647215 GATGTCTTCCTAGAAGAAACAAGCACTCTTTAGTCTGAGCTTGGCTGCCCAAGGCTTTGATAGGCAAAAGGATACAGGAT--AGGCACAAGGTT - -a -s mr.mrrefChr0 108803 70 + 130230 ACTTACAGGAGTGTCAATGGGGATGTTGATCGGGGAAGTCTTCTTGAACCTGGCTTTTGACCAAGATGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114119 54 + 636262 ACTTACAGGAGTGTCAATGGGGATGTTGA---------TCTTCTGAAACCTGGCTTTTGACCA------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 106451 70 + 647215 ACTTTCAGGAGTGTCAATGGAGATGTCAATCGGGGAAGTCTTCTTGGACCTGGCTTTTGACCAAGATGAT - -a -s mr.mrrefChr0 108873 52 + 130230 TGCTATTGGATTATTCCCAAACAAGAAGTCCTCTCTATTTTGATCTTGGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114173 52 + 636262 TGCTATTGGATTATTCCCAAACAAGAAGTCCTCTCTATTTTGATCTTGGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 106530 52 + 647215 TGCTATTGACTTATTCCCAAGGAAAAAGTACTCTCTATTTTGATCTTGGCTG - -a -s mr.mrrefChr0 108925 39 + 130230 CTAAGGCTTTGATAGACACTGCATCACAGGTTGACATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114225 39 + 636262 CTAAGGCTTTGATAGACACTGCATCACAGGTTGACATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 106607 39 + 647215 CTAAGACTTTGATAAGCACTGCATCACAGGTTGGCAGCT - -a -s mr.mrrefChr0 108964 15 + 130230 TGGGAATGTCAATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114273 15 + 636262 TGGGAATGTCAATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 106646 15 + 647215 TGGCACCTTTATTGG - -a -s mr.mrrefChr0 108979 316 + 130230 GGAAGGTATTATTGGACCATACTTTTTTCATCTATGATTATCTCAAGTCATATTGCTACTTGATTATAGTAAGGAATCCTCCTCACATACTTATTGGTACTTCAAATCCTAATACTATGGAAGCCAAGTACTGGGGCTCTCTGAGATAGCAGGCCTTAACCTATTTATCCAATGGTTTAGTTATCTCCTGGCTGCCATTTTGGACAGATGTTAATCAGATCATAAGACTAGAGTACCTTGTAAGTGACATTTTGGGGGAGAAAAAAACCTACAAAGACAAAGAAGTGAGCTCAAACATGCAATTGACTTACCTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114288 314 + 636262 GGAAGGTATTATTGGACCATACTTTTTTCATCTATGATTATCTCAAGCCATATTGCTGCTTGATTAGAGTAAGGGATCCTCCTCACATACTTATTGGTACTTCAAATCCTAATACTATGGAAGCCAAGTACTGGGGCTCTCTGAGATAGCAGGCCTTAAGCTATTTATCGAATGGATTAGTTATTTTCTGGCTGCCATTTTGGACAGATGTTAATCAGATCATAAGGCTAGAGTATCTTGTACGTGACATTTTGGGGGAG--AAAAAACTACAAAGACAAAGAAGTGAGCTCAAGCATGCAATTGACTTACCTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 106664 314 + 647215 GGAAGGTATTATTGAGCCGTACTGTTGTCATCTAGGATTATCACAAGTCATATTGTTACTTGATTATAATAAGGAAG-CTCCTCACAAACTTATTGGTACTTCACAACTTAACACTATGGAAGCAAAGTACTGGGGCTCTCTGAGATAGCAGGCCTTAACCTATTTAACCAATGGTTTAGTTATCTCCTGGCTGCCTTTCTGGACAGTTGTTAATCAGATCATAAGACTAGAGTACCTTGTAAGTGACATTTTGGAGGAGAAAAAAAC-TACAAAGACAAAGATGTGAGCTCAAACATGCAACCGACTTACTTTCT - -a -s mr.mrrefChr0 109295 15 + 130230 TCTGAGTTCTGGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114603 15 + 636262 TCTGAGTTCTGGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 106978 15 + 647215 TCTGAGTTCGGGAAA - -a -s mr.mrrefChr0 109310 396 + 130230 GAAATTCCTAGTGACTTATCCTACTGCACTACAAAATGAGAGTTTTTCTCTGTAAAAATACAAGTGTTCACTTGCTATTAGCATGATATTTGAATGACAATACTAGCCACTTTCACATTCACAGTTAGATATTCGACTAGGTGTTATGGGATAGGAACCTGCCTCAATTCAGGCTTACAACCCATATTCCCTTATCAAATATCTAAGTGTGCCTGTTAACTGGCTAGCATGTCCAATTGAATATCTTACTAACTGCAGCTGCAGGAAAACACTTCTATTTCTGTGATAGGTCCATGTCAGGAACAGTGCTGGCAAAGCTAGTAATTGCCGCTTTACTTTGCAATTTGCTCGATCAAATGTGTGCTACACGTGAGATCAATATTACAATTTATTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114619 396 + 636262 GAAATTTCTAGTTAGTTATCCTACTGCACTACAAAATGAGAGTGTTTCTTTGCAAAAATACAAGTGTTCACTTGCTATTAGCATGATACTTGAATGACAATACTAGCCACTTTCACATTCACAGTTAGATATTCGACTAGGTGTTATGGGATGGGAACCTGCTTCAATTCAGGCTTACAACCCATATTCCCTTATCAAATATCTAAGTGTGCCTGTTAACTGGCTAGCATGTCCAATTGAATATCTTACTAACTGCAGCTGCAGGAAAACACTTCTATTTCTGTGATAGGTCCATGTCAGGAACAGTGCTGGCAAAACTAGTAATTGCCGCTTTACTTTGCAATTTGCCCGAGCAAATGTGTGCTACACGTGAGATCAATATTACAATTTATTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 106993 393 + 647215 GAAATTCCTAGTGACTTATCCTACTACACTGCGACATGAGAGTTTCTCTCTGTAGAAACACAAGTGTTCACTTACTGCTAGCATGATATCTGGATGGCAATTCTAGCCACTTCCATATGCACAGTTAGATATTCAACTAGGTGTTATGGGATAGGAACCTGCCT---TTCAGGCTTGCAACTCACATTCCCCTATCAAATATCTAAGTGTGCCTGTCAACTGGCTAGCCTGTTCAATCGAATATCCTACTAACTGCAGCTGCAGGAAAACACTTGTATTTCTATGATAGTTCCATGTCAGGAACAGCGCTGGCAAAGTTAGTAACTGCCACTTTACTTTGAAATTTGCTCGATCAAATGTGTGTCGCATGTAAGATCATTATTACAATTTATTATA - -a -s mr.mrrefChr0 109706 71 + 130230 ATGGGTGACTTATTCAGGGCTTACACTCTTTGTCCTGAACGTGAAATTTGTGACATTACAATTATATCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115015 71 + 636262 ATGGGTGACTTATTCAGGGCTTACACTCTTTGTCCTGAACGTGAAATTTGTGACATTACAATTATATCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 107441 71 + 647215 ATAGGTGGCTTATTCAGGGCTTGCACTCTTTGTCCTGGACGTTAAATTTATGACCTTACAATTATATCTTG - -a -s mr.mrrefChr0 109777 14 + 130230 TGAAGTAAGACTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115086 14 + 636262 TGAAGTAAGACTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 107513 14 + 647215 TGAAATAAGACTCT - -a -s mr.mrrefChr0 109791 50 + 130230 AGCTAGTTAGATGTGGGTCAAGCAAAGTACAAAAAGTGGTGAGAACTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115100 50 + 636262 AGCTAGTTAGATGTGGGTCAAGCAAAGTACAAAAAGTGGTGAGAACTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 107532 50 + 647215 AGCCAGTTAGATGTGGGACAAGCAAAGTACAAAATGTGGTAAGAACTGAG - -a -s mr.mrrefChr0 109841 230 + 130230 TTGAAGTTGGGTACCAAGTAGAGAAAGTAGCAAAAGACAGGAGATTGTGTGGAAGGACATCTTTGACAGTGATCTGAGACATCCAATCTGACCTTTCTCTATTGCATACCACAGAAATGGTGTAAGATTGTTCCTTCTTTATCGGTTGCATAATCTCAGAGAACACATCATAATTTTTGCATAACTATTAGGGTCCACATCTGATGATTAGTATGGTGAGTACGGCATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115163 229 + 636262 TTGAAGTTGGGTACCAAGTAGAGAAAGTAGCAAAAAACAGGAGATTGTGTGGAAGGACATCTTTGACAGTGATTTGAGACATCC-ATCTGCCCTTTATCTATTGCACACCACAGAAATGGTGTAAGATTTTTCCCTCTTTATCAGTTGCATAATCTCAGAGAACACATCACAATTTTTGCATAACTATTAGGGTCCACATCTGATGATTAGTATGGTGAGTACGGCATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 107582 230 + 647215 TTTAAGTTGGGCACCACGTAAAGAAAGTAGCAAAAGACCGGAGATTGTGTGGAAGGACATCCGTGACAGTTATCCAATACATCCAACCTAACCTTTCTCTATTGCATACCACAGAAATGGTGTAAGATTGTACCTTCTTTATCGGATGCATAATCTCAGAGAACCCACCATAATGTTTGCATAACTATTAGGGTCCACATCTGATGATTAGTAGGGTGAGTGCGGCTTGT - -a -s mr.mrrefChr0 110071 234 + 130230 TTCTATAACCCCCACAGATAAGACTAAGGTGGGCCCCTATCTGCAGTCGCAATGGTTCTATCCTGTTGGGAGCTGGTGAACGTTGCTCACGTAAAGTAAGAGAGAGCAGAGCCACTCCTTGCTGCAAATCCTATGACTTGACTGGGAGACTGCATAGAAAAAGATATAAGGTGATTGAGCAAAGAAAGTCACAAAAGCAACACTTGAAAGGGAAATGGCTATACTGTTTTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115394 218 + 636262 TTTTATAACCCCCACGGATAAGACTAAGGCAGGCCCCCATATGCAGTCGCAA---TTCTATCCTGCTGAGAGCTGGTGAACATCGCTCATGCGAAGTAAGGGAGA--------ACTCCTTGCTACAAATCCTTTGACCTGACTAGGAGACTGCATAGAACAAGATACAAGGTGAT-----AAAGAAAGTCACAAAAGCAACACTTGAAAGGGAACTGGCTATACTGTTTTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 107812 232 + 647215 TTCTATAACACCCA-AGATAAGACTAAGGTGGGCCCCTATCGGCA-CCGCAATGGTTCTATCCTGTTGGGAGCTGGTGAACGTTGCTCACATAAAGTAAGAAAGGGCAGAGCCACGTCTTACTGCAAATCCTACGACTGGACTGGGAGACTGCATAGAAAAAGATTTGAGCTGATTGAGCAAAGAAAGTCAAAAAAGCAACGCTTCAAAGGGAAATAGCTATACTGTTTTAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 110305 204 + 130230 CACTGCTAGTTTGCACTTTTATCATTATTTATAAGTGTATCTTTTGAGAGCTGGATCATATTGTAACTTTGACATGACGTTTTGTTAATAAGGCCAGTGCCAGAGAATGCACATTTGCCAATCAATGCATACTAACTAAAACTTCAGTGTATGCTAACTACTACTAATACTCTTCACTGTCTTGTGTCACAACTGACAGTGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115612 203 + 636262 CACTGCTAGTTTGCACTTTTATCATTACTGATAAGTGTTTCTTTTGTGAGCTGGATCATATCGTA-CCTTGGCATGACGCTTTGTTAATAAGGCCAGTGCCAGAGAGTGCACATTTGCCGATTAGTGCATACTAACTAAAACTTCAGTGTATGCTAACTCCTACTAATACTCTTCACTGTCTTGTGTCACAACTGGCAGTGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 108045 201 + 647215 CACTGCTACTTTGCATTTTTACTATTATCTATAAGTGTAGCCTTCGAGAGCAGGATGATATTGTAATTTTGACACAACTTTTTCTTAATAAAGCCAGTGCCAGAGAATGCATATTCGCCAATCAAT---TACTAACTAACACTTCAGTACACACTAACTACTGCTAATACTCTTCACTGTCTTGTGTCACAACTGACAGTGAGC - -a -s mr.mrrefChr0 110509 10 + 130230 AAAAGTTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115839 10 + 636262 AAAAGTTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 108246 10 + 647215 AAAAGTTATT - -a -s mr.mrrefChr0 110519 248 + 130230 GGTGGAGAAAGTAGCTGTCATCAGACTTTGGATGTTTCATGCCAAGCTGGACTTATCAATGCGAGGCAAGCCAAGCTGATGGTCTTCCAGGCGTAGCAGACCTTATAAGGGAATATCAGCATTAGTAGATGTCCAAAAGTGAATCCCACTACTATGGTGACTGAAAACAGTCCGGTTCCAGTAAGTGTATCTATCATTTTCTGTCCATAGCCTTATGATTACTTTGTCTCTATGCTCTGAACTTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115849 245 + 636262 GGTGGAGAAAGTAGCTGTCAGCAGACTTTGGATGTTACATGCCAAGCTGGACTTATCAATGCGAGGCAAGCCAAGCTGATGGTCTTCCAGGCGTAGCAGACCTTATAAGGGAATATCAGCATTAGTAGATGTCCAAAAGTGAATCCCACTACTATGGTGACTGAAAACAGTCCGGTTCCAGTAAGTGTATCCATCATTTTCTGACTATAGCCTTTTAATAACTCTGTCTCTGTGCTGTGAAC---GAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 108258 244 + 647215 GGTGGAGACAGTAG-TGTCATCAGACTTTGGATGTCTCATGCCAAGCTGGACTTATCAATGTGATGCAAGCCAAGCTGAAGGTCTTCCAGGTGCAGTGGACCTTATAAGTGAACATGAGCATTAGTAGATGTCCAAAAGTAAATCCCA---CCATGGTGACTGAAAACAGTCTGGTTGCAGTAAGAGCATCTATTATTTTCTGTCCATAGGCTCATGTCTACTTTGTCTCTATACTCTGAAGTTTGAT - -a -s mr.mrrefChr0 110767 36 + 130230 GCAATGGTTTATGCACGTATGGTCATGCTAACTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116094 35 + 636262 GCAATG-TTTATACACTTATGGTCATGCTAATTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 108505 36 + 647215 GCAATGGATTATGCATGTATGGTAGTGGTGCCTAGT - -a -s mr.mrrefChr0 110803 252 + 130230 TAAATATTGAGATACTATCTTCAACACTCTTCTAAGCATATCTTGGTGGGTGTGGAGTCAAGGCATGATGTTCTAGTCAGGGGTACCCTTAGTCTCAGAAGGTACTCTTCATACTCTATCCCTAAGCTTAAGCAAGTGGAAATAAAGCTGAGATATTCTGTAAAGAATAAACAGTTGTTGGGTATATAAAAGTATATGAAACACACTCACTGTTACCTGGGATTAGTCTAGAATTGATGAGGCTATATGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116133 251 + 636262 TAAATATTGAGATTCTATCTTCAACACTCTTCTAGGCATATCTTGGTGGGTGTGGAGTCAAGGCATAATGTTCCAGTCAGGGGTACCCTTAGTCTCAGAAGGTGCTCTTCATACTCTATCCCTCAGCTTAAGCAAGTGAAAATAAAGCTGAGACATTCTGTAAAGAATAAACAGTTGTTGGGTATATAAAAGTATATGAAA-ACACTTACTGTTACCTGGGATTAGTCTAGAATTGATGTGGCTATATGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 108541 252 + 647215 TAAATATTGAGATACTATCTTGAACACTCTACTAAGCATATCTTGGTGGGTGTGGAGTCAAGGCATGTTGTTCTAGTCAGGGGTACCCTTGGTCTCAGAAGGTACCCTTCATACTCTATGACTAGGCTTAAGCGAGTAGAATTAAAGCTGAGATATTCAGTAAAGAGTAAACAGTTGTTGTGTATATAAGAGTATAAGAAACACACTCACTGTTACCTGGGATTAGTCTAGAATGGATGAGACTATATTTTG - -a -s mr.mrrefChr0 111055 264 + 130230 ACCCTCTCCAATAGGGATGGGTCATCTATTCTTTCATGACGACTATGGAGTTATTGATCATGATCCTGGGACATGCACCATGTCCTTTTATTGGGCACCCCAATGTCCAGGAGCACACCCTAAATTTGCATCTGGGGGAGGTTGAGGCCATAGTTTACCAACATGCAAGCTTGCCTTCATTTCTTGTCTGACCCCCATCATGTGTAAAAATAACAATATTTTTGAAAAACACCAGGGTGTATCTGGTGATCTAAAAGTGAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116394 249 + 636262 ACCCTCTCCAATAGGGATGGGTCATCTATTCTTTCATGACGACTATGGAGTTATTGATCATGATCCTGGG---------------TTTTATTGGGCACCCCAATGTCCAGGCGCACACCCTAAATTTGCATCTGGGGGAGGTTGAGGCCATAGTTTACCAACATGCAAGCTTGCCTTCATTTCTTGTGTGTCCCCCATCATGTGTAAAAATAACAATATTTTTGAAAAACGCCAGGGTGTACCTAGTGATCTAAAAATGAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 108793 263 + 647215 ACCCCCTCCAATAGGAATAGGTTATCTGTTCTTTCATGGAGACCATGGAGTTATTCATCATGATCCTGGGACATGCACCATGTCCTTTTATTGGCCACCCCAATGTTCAGGAGTACACCGTAA-TTTGCATCTGAGGGAGGTTGAGGCCACAGTTTACCAACATGCAAGTTTGCCTTCATTTCTTGTCCGATCCCCATCATGTGTAAAAATAACAATATTTTCGAAAAACACCAGGGTGTATCTGGTGATCTATAAGTGAAAAA - -a -s mr.mrrefChr0 111319 136 + 130230 CAAATACTTTCATGCTTGTTGTGATGTAGGAATATTTAGAACACCCAAAAAGCATGAGGTTGTGGGAGTTCCTCTTTGGTTACAGCAGTATCATTCAGTGTGAGAAGATTCGGACTGACAGTTCTCCCTAGTTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116644 136 + 636262 CAAATACTTTTATGCTTGTTGTGATGTAGGAATATTCAGAACACCCAAAAAGCATAAGGTTGTTGGAGTTCCTCTCTGGTTACAGCAGTATCATTCAGTGTGAGAAGATTCAGACTGACAGTTCTTCCTAGCTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 109056 136 + 647215 CAAAGACTTTCATGCTTGTTATGATGTAGGAATATTTCGAGCACCAGAAAAGCATGAGGTTGTGGGGGTTCCTCTTTGGTTACGGCAGTATCATTCAGTGTGAGAAGATTCGGACTGACAATTCTCCCTAGTTTTC - -a -s mr.mrrefChr0 111455 25 + 130230 AAGGTATCTGTGAGGATGTACCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116780 25 + 636262 AAGATATTTGTGAGGATGTACCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 109194 25 + 647215 AAGGTATCTGTGAGGATGTATCATG - -a -s mr.mrrefChr0 111480 9 + 130230 TTAACAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116808 9 + 636262 TTAACAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 109219 9 + 647215 TTAACAACA - -a -s mr.mrrefChr0 111489 187 + 130230 GAATTGTCAAGGTCAATGTCTCCTGAGAAGTCAACATATTATTAACTTCACGGTTTCCACTGACTGGCTACTATCCCCAGACCGGATCAGGAAGGGGAAGCATTGTGTTCAACAGGAAGTGTTCAACATCTAATCTGCTAATCCCAATAAGTATTGAGTCAAAAACAACTTCACCTGATGAGCCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116819 187 + 636262 GAATTGGCAGGGTCAATGTCTCTTGAGAAATCAACATATTATTAACTTCCCAACTTCCACTGGTGGGCTACTGTCCCCAGACCAGATCAGGAAGGAGAAGCATTGTGTTCAACAGGAAGTGTTCAACATCTAAACTGCTGACCCCAATAAGTATTGAGTCAAGAACAACTTCACCTAATGAGGAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 109228 178 + 647215 GAATTGTCAAGGCCAATATCTCCTGAGAAGACAACATTTTATTAACTTCACGGTTTCCACTGACTGGCCACTATCCCCAGATTGGATGAGGAAGGGGAAGCATTGTGTTCAACA---------CAACATCTAATCTGCTAATCACAATAGGTATTGAGTTAAAAACAACTTCACCTGATGAGCCAAC - -a -s mr.mrrefChr0 111676 18 + 130230 AAAATGCCTCAATAATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117008 18 + 636262 AAAATGCCTCAATAATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 109406 18 + 647215 AATATCCCTCAATAATGA - -a -s mr.mrrefChr0 111694 330 + 130230 GGAATTACTCAGGGCTTGGCTGTTTGGTCATACTCAAATAATGGTACCCAAAGTGAAGGGTAGTAGGGAGTTCCTCTGGAGGTGTCCACTTCTTATAAGGAATTTAGTAGTCTCAATAGGTATATAAAACTTTGCTAACTTAATAAAGAACAGTAAAGACCAATCTGCTGACTCAAAGGCCAAGAAAAATGTTATGTCTGTCTGTTAATGAGTATGTTTAATGATGGTGCAGTATAAAGCCTATAGCTCTACTAGATTATCTCTTGTGAACATATTCACTCCAGCTAGCGAACAGTAAAACAATGGACCATTATGCCTCCTGTGTTAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117026 325 + 636262 TGAATTACTCAG----TAGGCGCTTGGTCATACTCAAATAATGGTTCCCAAAGTGAAGGGTAGTAGGGAGTTCCACTGGAGGTGTCCACATCTCATAAGACAT-TAGTAGTCTCAATAGGTAAATAAAACCTTGCTAACTTAATAAGGAACAGTAAAGACCAATCTGCTGACTCACAGGCCAAGAAAAATGTTATGTCTGTCTGGGAATGAGTATGTTTAATGATGGTGCAGTATAAAGCCTATAGCCCTACTAGATTATCTCTCGTGTACATATTCATTCCAGCTAGCGAACAGTAACACAATGCACCATTATGCTTCCTGTGTTAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 109424 330 + 647215 GGAATCACTCATGGCTTGGCTGTTTGGTCATACTCAAATGATGGTACCCAAAGTGAACGGTAGTAGGGAGTTCCTCTGGAGGTGTCCACTTCTTATAAGGGATTTAGTGGTCTCAATAGGTATATAAAACTTTGCTAACCTAATAAAGAACAGTAAAGACCAATCTGCTGACTCAAAGACCAAGAAAAATGTTATGTCTGTCTGTTAATGAGTATGTTTATTGATCGTGCAGTACAAAGTCTATAGCTCTACTAGATTATCTCATGTCAACATATTCACTCCAGCTAGCGAACAGTAAAACAATGGACCATTATGCCTTGTGTGCTAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 109899 330 + 647215 GGAATTACTCAGGGCTTGACTATATGGTCATACTCAAATAATGGTACCCAAATTGAAGGGTGGTAGGGAGATCCTCTGGAGGTGTCCACTTCTTATAAGGAATCTCGTAGTCTCAATAGGTATATAAAACTTTGCCAGTTTAATAAAGAACAGTAGAGACCAATCTGCTGACTCAAAGGCCAAGAAAAATGCTATGTCTGTTTGTTAATGAATATGTTTAATGATGGTGTAGTATTAAGCCTATAGTTGTACTAGATTATCTCTTGTGAACATATTCACTCCAGCTAGCGAACAGTAAAACTATGGACCATTATGCCTCCAGTGTTAGTC - -a -s mr.mrrefChr0 112024 1 + 130230 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117352 1 + 636262 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 109754 1 + 647215 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 110229 1 + 647215 A - -a -s mr.mrrefChr0 112025 3 + 130230 CAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117353 3 + 636262 CAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 110230 3 + 647215 CAC - -a -s mr.mrrefChr0 112028 185 + 130230 ACACCCTGAGGTGAGAAAACTTTTGATGGCCATCATATAGTTTTAGAATACCTAGGGTCTACCCCCTCAGCAACTCTAATGTCAAAACAACTGACCATGCCATGGTAGTCACTGAGCATGCCTTTGATAACCATGTGGCCAAATAAGTAAAGCTATGTAATCAGACTGACATGGAACACCACCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117356 184 + 636262 ACACTCTGAGGTGAGAACATTATTAACGGCCATCAGATTGTTTT-GAATACCTAGGGTCTACCCCCTCAGCAACTCTAATGTCACAACAACTGACCGTGCCATGGCAGTCACTGAGCATGCCTTTGATAACCGTGTGGCCAGGTCAGTTAAGCTATGTAATCAGACTGACATGGAACACCACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 109755 144 + 647215 ACACCTAGAGGTGAGAAAACTTTTGATGGCCATCATATAGTTTTAGAATACCCAGGGTCTG----CTCAGCAACTCTAATGTCAAGACAACTGGCCATGCCATGGTAGACATTGAGCATGCCTG-GATAACAATATGTCTCAATAACTA------------------------------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 110233 47 + 647215 ACACCCTGAGGTGA-------TGTGATGGCCATCATATAGTTTTAGGATACCTA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 112213 116 + 130230 TGTGTGCAGTACCAAAGAGCATAAGACCACAAAAGTCTTGGGAGTCCAGAAAGTCAGCCAGCATAAAGTGGCTGACTGGAGTCAGTCTGCATTAAATGGCTGGCTGGAAAAGAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117540 116 + 636262 TGTGTGCAGTACCAAAGAGCATAAGACCACAAACCTCTTGGGAGTCCAGAAAGTCAGCCAGCATAAAGTGGTGGGCTGGAGTCAGTCTGCATTAAATGGCTGGCTGGAAAAGAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 110280 116 + 647215 TGTGTGCAGTACCAAAGGGCATAAGACCACAAAAGTGTTGCAAGTCCAGAAAGTCAGCCAACATAAAGTGGCTTACTTGTGTCAGTCTGCATAAAATGGCTGGCTGGAAAAGAAGA - -a -s mr.mrrefChr0 112329 42 + 130230 AAAAGTAAGAAGACACTGTACTCACTATTATTCTATGTTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117658 42 + 636262 AAAAGTAAGAACACACTGTACTCACTATTATTCTATGTTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 110396 42 + 647215 CAAAGTATGAAGACACTGTACTCACTACTATTCCATGTTTGT - -a -s mr.mrrefChr0 112371 344 + 130230 ACAATGCAACTACATCCATGCTCTTCCCAATTTTGTAAGCTAGTTCATCTCTAATATGTTGATTATTTATTGACTGTCTCCTGTCTAAACTGCGAGGACTACAGTGATGGCTGCATCTGTGAATTGCAGACCTTGTCTAATTCAGTGAGGGCATTCAACTCAAACTGGATATTCTATTAGACTGCTGCCAATTTGTCCTAGTTGATTTTTCCCATTCTTAATGGTGTATAGGTGAAGGTTTTGTTACCTGTATTTTGCAGCTCAAAGTTTCAATGCCAGAGCAGGTTTAGGAGAGTAGCTGTGTTCAACATTCAGTTCTTCAGCTACTCATCTGCCTAGATTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117700 333 + 636262 ACAATGCAACTACATCCATGCTCTTCCCAATTTTGTAAGCTAGTTCATCTCTAATATGTTGATTACTTATTGACTGTCTCCTGTCTAAACTGCGAGGACCACGGTGATGGCTGTATCTGTGAATTGCGGACCTTGTCTGATTCAGTGAGGGCATTTAACTCAAATTGGATATTCTATTAGACTGCTGGCAATTTGTCCTAGTTGATTCTCCCCATTCTTAATGGTGTAGAGGTCAAGGTTTTATTACCTGTATTTTGCAGCTCAAAGT------GCCAGAGCAGGTTTGGGAGAGTAGCCGTGTTT-----TCAGTTCTTCAGCGATTCATCTGCCTAGATTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 110442 344 + 647215 ACACTGCAACTACAGCCATGCTCTTCTCAGTTTTTTAACCTAGTTCACCTATAATATGTTGGTTATTTATTGACTGTCTCCTGTCTAAACTGCCAGGACTACAGTGATGGCTGCATCTGTGCATTACAGACTTGGTCTAATTCAGTGAGGGCATTCCACTCGAACTGGATATTCTATTGGACTGCTGCCAATTTGTCCTAGTTGATTTTTCCCATTCTTCATGGTGTATAGGTGAAGGTTTTGTTACCTGTATTTTGCAGCTCAAGGTTTCAATGCCAGATTAGCTTTAGGAAAGTTGCTGTGTTCAACATTCCATTCTTCAGCTACTCATCTGCCTAGATTTT - -a -s mr.mrrefChr0 112715 44 + 130230 CTTGATTACACCAACTAATCAAAAGTATTCACATCTCTACTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118033 37 + 636262 -------ACACCAACTAATCAAAAGTATTCACATCTTTACGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 110788 43 + 647215 CTTGATTACACCAACTAAT-AAAAGTAGCTACATCTCTGCTGAG - -a -s mr.mrrefChr0 112759 172 + 130230 AGTTCACTAAAACATACATGTTACAGGCTATTACAGTTAAGGCCTACTCATGTGGATCCCTTGATCCTGGCGTACTGCGTAATAGCATTGTGTATGTTGAGAATTGTACAGCACTGTTAGATCTGCCCTCACACCAACCGAGTTGCATACACCAAAGTGGGATTAGATCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118071 170 + 636262 CGTTCACTAATACATACATGTTACAGGCTATTACAGTTAAGGCCTGCTCATGTGGGACCCTTGATCCTGGTGTACTGCGTAATAGCATTGTGTATGTTGAGAATTGTACTGCACTGTTAGATCTGCCCTCAC--CAACCGAGTTGCATACACCAAAGTGGGATTAGATCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 110831 170 + 647215 AGTTGACTAAAACATATCTGTTACAGGCTATTATGGTTTTGGC--ACTCATGTGCATCTCTTGATCCCAGCGTAATGCATAATAACTTTATGTATGGTGAGTATTGTACAGCACTGTTAGATCTGCCCTCACACCAACCAATTTGCATACACCAAAATGGGATTAGATTGAA - -a -s mr.mrrefChr0 112931 157 + 130230 ACTCATCCTTGGCTTTAAGAAAACCAACCATGATTCACGACCCACAATCATCAAAAACTCTCAGTTATATGCTTGTCTTTCAATGCTAAACTTGTTGCTCCTAACATTTCATCAGGTAAACTATGCACCTGTGATTAGAACAATATGGCCAATCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118241 142 + 636262 ACTCATCATTAGCTTTAAGAAAACCAACCATGATG-ACGACCCACATTCATAAAAAACTCTCAGTTGAATGCTTGTCTTTTGATGCCAAA--------------CATTTCATCCGGTAAACTACGCACCTGTGATTAGAACAATATGGCCAATCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 111004 157 + 647215 ACTCATCCTTGGCGTTAAGAAAACCCACCATGATTCATGCCCCAAAATCATCAAAAACTCTCAGTCATATGCTTATCTCTCAGTGCTAAACTTGTTGCTCCTAACATTTCATCAGGTAAATTATGCACCTGTGACTAGAACAATAAGGCTAATCATG - -a -s mr.mrrefChr0 113088 371 + 130230 CACTCATTATTATAACAGCAACAATACGGGGTCCCTAGTGCTGTACCTAGTACATATCCTTGTCCACTAGCAGTTCATATATTGTCCACTAGCTGGTTAAACAATACCTACTCCCCTAGTGTCAAAAAACAAGATTCATCAGACATGGTACATAATAAGGTACTTGATTATATTACGTCCATTCTTGTTGAAGTTTATCCATCCCAGCAGAGTGTGAGAGTCATCTATAGGTAAAACTCCAGTCAGTAGCAAGTGGTGTGTATTAAATGAGGTATGTATTGTGATCACGAGGAGAATATGTGGATCCACAACTTCCATTAAGGGGGAGTTCACCCTGATATCAGGGGAATTAGCTGATGCAAAGTGCACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118383 368 + 636262 CACTCATTATTATAACAGCAACAAT-CGGGGTCCCTAGTGCTGTACCTAGTACATATCCTTGTCCACTAGCAGTTCATATATTGTCCACTAGCTGGTTAAACAACAACTACTCCCCTACTGACAATAAACAA--TTCATCAGACATGGTATATAATAAAGTACTTGATTATATTACGTCCATTCTTATTGAAGTTTATCCATCCCAGCATAGTGTGAGAGTCATCTATAGGTAAAACTCCAGTCAGTAGCAAGTGGTGTGTATTAAATGAGGTATGTACTGTGATCACGAGGAGAATATGTGGGTCCACAACTTCCATTAAGGGGGAGTTCACCCTGATATCAGGGGAATTAGCTGATGCAAAGCACACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 111164 371 + 647215 CACTTGTTATTGTAACAGCAACAATACGGGGTCCTTAGTGCTGCACCTAGTACATATCCATGTCCACTAGCAGTACATATATTGTCCACTAGCTCGTTATACAATACCTACTCCCCTAGTGTCAAAAAACAAGATTCATCAGACATGGTACAGAATTAGGTACTTGATTATATTACATCCATTCTTGTTGAAGTTTATCCATCCCAGCAGAGTGTGAGAGTCATCTATGGGTAAAACTCCAGTTACTAGCAGGTGGCGTGTATTAATTGAGGTATGTATTGTGATCATGTGAAGAGTATGTGGATTCACAACTCCCATTCAGGGGTTGTTCAGCCTGGTACCAGGAGAGTTAGCTGACATAAAGTGCACAA - -a -s mr.mrrefChr0 113459 53 + 130230 AAGGTTGAATTCTGAAGCAATTGTTGACTGAATGGGCTCTCCTTGTAGCACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118773 53 + 636262 AAGGTTGAATTCTGAAGCAATTGTTGACTGAATGGACGCTCCTTGTAGCACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 111535 53 + 647215 AAGGTTGAATTCAGAAGCAATTGTTGACTGAATGGGCTCTCTGTCTAGGACAT - -a -s mr.mrrefChr0 113512 11 + 130230 CTCCATGTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118826 11 + 636262 CTCCATGTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 111594 11 + 647215 CTCCATGTGCT - -a -s mr.mrrefChr0 113523 10 + 130230 TAGCACAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118838 10 + 636262 TAGCACAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 111605 10 + 647215 GACCATAACT - -a -s mr.mrrefChr0 113533 64 + 130230 TATCCTCCATGCGCTCACCATAATTCCTATGTTTACCACCACAGATAAGTTTGTATCCTGCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118848 64 + 636262 TATCCTCCATGTGCTCATCATAATTCCTATGTTTACCACCACAGATAAGTTTGTATCCTGCGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 111623 64 + 647215 TATCCTCCATGCACTGACCATAATTCATATGTTTGTAACCACAGATAAGTCAGTATCCTGCAGC - -a -s mr.mrrefChr0 113597 80 + 130230 TCACTATCCTATGATGGCCACCACAGATAGGTCCGTATCCTGCAGCACACTATGGAGGGCACAGCCGCCCAACTTTTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118912 80 + 636262 TCACTATCCTATGATGGCCACCACAAATAGGTTCCTATCCTGCAGCACACTATGGAGGGCACAGCCGCCCAACTTTTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 111689 80 + 647215 TCTATATCCTATGTTTGCCACCACAGATGAGTCGGTATTCTGCAGCACACTAGGGACGGCACAGGTCCCCAACTTTTTTG - -a -s mr.mrrefChr0 113677 13 + 130230 TATGTGACCACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118992 13 + 636262 TATGTGACCACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 111783 13 + 647215 TATGTGACCACCC - -a -s mr.mrrefChr0 113690 281 + 130230 TCTGGACACAATAGTAGCACTCTTTTTGCCAGTATATGGCTGAGCATGAGTTACTCTTACTAATTGGATCATGCGATCTAAATTAGAAACACTTTATGGGGTGGAGATGGCCCCTGCTAGTCATGTACTGCTAAATAAATGCATTGAATACATAGTCCTGTTAACATCTGACACAGCTGGCTTTTCGAGCTGGCTGTGCTCAACCTTATCATGTACTATGATAAAGCTCACCAATGTTGGATACACTGAGATCTCTGCTTTTTATGAATTACTGGGAAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119006 281 + 636262 TCTGGACACAATAGCAGCACTCTCTGTGCCAGTATATGCCTGAGCATGAGTTACTTTTACTAATTGGATCACACCATCTAAATTAGAACAACTTTATGGGGTGGAGATGGCCCCTCCTAAGCATGTACTGCCAAATAAATGCATTGAATACATAGTCCTGTTAACATCTGACACAGCTGGCTTTTCGAGCTGGCTGTGCTCAACCTTATCATGTACTATGATAAAGCTCACCAATGTTGGATACACTGAGATCTCTGCTTTTTATGAATTACTGGGAAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 111796 281 + 647215 TCTGGGGAGAATAGTAGCACTCTTTTTGCCAGTATATGGCTGAGCATGAGTTACTCTTACTAATTGGATCATGCGACCTAAATCAGAAACACTTTATGGGGTGGAGATGGCCCCTGCTAGTCATGTACTGCTAAATAAATGCACTGAATACATAGTCCTGTTAATAGCTGACGAAGCTCGCTGTTTGAGCTGGCTGTGCTCAATATTATCACGTGCTATGATAAAGATCACCAATGTCGGATACACTGAGATCTGCGCTTTTTATGGACTACTGGGAAGTA - -a -s mr.mrrefChr0 113971 17 + 130230 AGAGATTTACTGTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119288 17 + 636262 AGAGATTTACTGTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 112077 17 + 647215 AGGAAGTTACTGTTTGC - -a -s mr.mrrefChr0 113988 8 + 130230 CAGCCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119305 8 + 636262 CAGCCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 112105 8 + 647215 TAGCCCTT - -a -s mr.mrrefChr0 113996 48 + 130230 TAAGCTTTTCTATATTTAGCGTTGAAGAGCTAGCCAGTTTTAATGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119313 48 + 636262 TAAGCTTTTCTATATTTAGCGTTGAAGAGCTAGCCAGTTTTAATGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 112131 48 + 647215 TAAGCTTTTCTATATTTTGAGTTGGAGTACTAGCCAGTTTTAATGAGC - -a -s mr.mrrefChr0 114044 33 + 130230 AAAGGACATATAGACCCAATTAGACTTCAAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119361 33 + 636262 AAAGGACATATAGACCCAATTAGACTTCAAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 112180 33 + 647215 AAAGGACCTGTTGACCTAATTAAATCTCAAGTG - -a -s mr.mrrefChr0 114077 30 + 130230 ACTAGTCTTCTGACATCCTGCGCTGGCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119394 30 + 636262 ACTAGTCTTCTGACATCCTGCGCTGGCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 112231 30 + 647215 ACTAGTCTTCTGTCATCTTTCCCTGGCAGT - -a -s mr.mrrefChr0 114107 8 + 130230 CACAGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119425 8 + 636262 CACAGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 112261 8 + 647215 TACATCAT - -a -s mr.mrrefChr0 114115 35 + 130230 TGCCAGTCAAAATTAGTGGTTCTGTATCGGGAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119474 35 + 636262 TGCCAGTCAAAATTAGTGGTTCTGTATCGGGAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 112269 35 + 647215 TCCATGTTAAAATCAGTGGTTCTGTAGCTAGAATT - -a -s mr.mrrefChr0 114150 23 + 130230 GACTTTCTTATCTTCATCTATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119509 23 + 636262 GACTTTCTTATCTTCTTCTATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 112305 23 + 647215 GAATTTCTTATCTTCATCTATCC - -a -s mr.mrrefChr0 114173 10 + 130230 ACATGAACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119537 9 + 636262 ACA-GAACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 112328 10 + 647215 ACATGAACAC - -a -s mr.mrrefChr0 114183 8 + 130230 AGCTATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119547 8 + 636262 AGCCATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 112338 8 + 647215 AGCTGTCA - -a -s mr.mrrefChr0 114191 174 + 130230 GGTGCTTTAATTCATTTAGAACCCCTAATCTATAAATGCAGCGATTGCAATGTATGTATAAATTAACTAGGTCCTGGCCACATGGGTATTGATCTTTGAAGACATCTGTTTGTATCTTGAAGAAATGATTTTGTGGCTGAGTATTAGTGTGCACGAGCAAATAGTGGGTTCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119638 172 + 636262 AGTGCTTTAATTCATTTAGTACCCCTAATCTATAGATGT-GCGATTGCAATGTATGTATAAATTAGCTAGGTCCTGGACCCATGGGTATTGATCTTTGAAGATGTCTGTTTGTATTTT-AAGAAATGATTTGGTGGCTGAGTATGAGTGCGCATGGGCAAATAGTGTGTTCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 112346 170 + 647215 GGTGCTTTAATTCATTTAGAATGTCTAATCCATAAATGCAGAGGTTGCAATGTATATATAAATTAACTAGG----GGCCACATGGGTATTGATCTTTGAAGACATCTATTTGTATCTTGAAGTAGTGATCTTGTGGCTGAGTACTAGTGTGCACGAGCAAATAGTGGGTACAAC - -a -s mr.mrrefChr0 114365 56 + 130230 TAACTATGTCTGTCCAAAAGGGCTTAAATTAAAGGATGAACTGCACTCTTGGTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119811 56 + 636262 TAACTATGTCTGTCCAGAAGGGCTTAAATTAAAGGATGAGCTGCACTCTTGGTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 112516 56 + 647215 TAACTATGTCTGCTGAAAAGGGCTTAAATTAAAGAATGAACTGCACTCTTGGTTTA - -a -s mr.mrrefChr0 114421 185 + 130230 TAATTTCCAAGTTTAGGATGACCTAACCCCAGCCTAGCCTTGAGCTTGTTGTCCACATGACATGTTAAAGGGACACAGAGAATGAGTAGTCAGGCTTAACAAAATTTGGTACACCAGTGCTAGCATCTTAGTCCCACACATTGTTTAACAGGGGGTTCAGGTAACAAGGGTGTAATCTAATGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119867 183 + 636262 TAATTTCCTAGTTTAGGATGACCTAACCCTAGCCTAGCTTTAAGCTTGTTGTCTACATTACATGTTAAAGAGACACAGAGAATGAGTAGTTAGGCTTAACAAAAT--GGTACACCAGTGCTAGCATCTTAGTCCCACACATTGTTTAACAGGGGGTTCAGGTAACAAGGGTGTAATCTAATGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 112575 185 + 647215 GAATGTCCAAGTTTAACATGATCTAATCCCAGCCTAGCCTTGAACTTGTTGTCCACATGGCATGTAACAGGGATACAGAGAATGAGTAGTCAGGCTTAACAAAATTTGGTACACTAGTGCTAGCATCTTAGTCCTACACATTGCTTAATGGGGGGTTCAGATAACAAGGGTGGAATCTAATTTCC - -a -s mr.mrrefChr0 114606 26 + 130230 AAGATTGATATCTGTCCCCAAGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120050 26 + 636262 AAGATTGATATCTGTCCCCAAGATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 112761 26 + 647215 AAGATTGATATCGATCCCCAAGATTG - -a -s mr.mrrefChr0 114632 11 + 130230 TAGCCCACTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120077 11 + 636262 TAGCCCACTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 112787 11 + 647215 CAGCTAACTCA - -a -s mr.mrrefChr0 114643 161 + 130230 TGTACCTGCATATAATTGTCAATAACAGAACTGCATGACAAAAAGAGAATATCAGAGTGTGAATCTGCTTCTACCGCCTTGGGAGGCCTGCATACTTAAACCTACATCTTAGGCTCTGTGTCCTACATCCAGATGGATATAGAGCTAATAACAGAACTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120092 161 + 636262 TGTACCTGCATATAATTGTCAATAACAGAACTGCATGACAAAAAGAGAATATCAGAGTGTGAATCTGCTTCTACCGCCTTGGGAGGCCTGCATACTTAAACCTACATCTTAGGCTCTGTGTCCTACATCCAGATGGATATAGAGCTAATAACAGAACTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 112798 161 + 647215 TATACCTGTGTACCATTGTTAATTACTGAACCGCATGACAAAAAGAGAATAGCAGAGTGTGAATCTGGTTCTATAGCCTTGAAAGGTTTGCATACTGATACATACATCTTTGGTTCCACGTCCTACATCCAGGTGGATAAAAAGCTAATAACAGAACTTGA - -a -s mr.mrrefChr0 114804 84 + 130230 ACACATAGTACTGTAACCCTTTGAGCCATATTGAATGTGGCATCGCTGCAATTGCAGTGTTTGCCATGTCATGACCAATCCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120253 84 + 636262 ACACATAGTACTGTAACCCTTTGAGCCATATTGAATGTGGCATCGCTGCAATTGCAGTGTTTGCCATGTCATGACCAATCCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 112975 84 + 647215 ACACATAGTGCTGTAACCCTTTGAGCCATATCAAATGTGGCATTCGTGCAATTGCAGTGTATGCCATGTTTTGATCAATTGAAC - -a -s mr.mrrefChr0 114888 362 + 130230 TAAAACTGTTCTAAAAGACAAGTCAATAAGCACTATTACAACATAAACATATCCAGACTCTGTTACCAAGAACAGCTAATGATGTTGTGCCTCAGTTGATTCCAGCCTATCAATTAGCAGAACACACAAGCCTGTGGCAGACTACATTAACTTTTTTTATTATACACCTTGTATTATACACCCCCACACCAAAAAGTTCAAAATCAAAAAAAACTATAGCACATCTACTAGATTGATGAACGTAGGGCCTTCCGGGCCTGATAGGTAAAGGTATAATTGAGTGCATCTGTGAGAGATGCATTAAGTAGAGGGAGTTCTATGGCTATCTCTCCAGATAAACCTTACCACTGCGGGGCTGGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120337 362 + 636262 TAAAACTGTTCTAAAAGACAAGTCAATAAGCACTATTACAACATAAACATATCCAGACTCTGTTACCAAGAACAGCTAATGATGTTGTGCCTCAGTTGATTCCAGCCTATTAATTGGCAGAACACACAGGCCTGTGGGAGACTGCATTAACCTTTTGTATTATACACCTTGTATTATACACCCCCACACCAAAAAGTTCAAAATCAAAAAAAACTATAGCATATCTACTAGATTGATGAACGTAGGGCCTTCCGGGCCTGATAGGTAAAGGTATAATTGAGTGCATCTGTGAGAGATGCATTAAGTAGAGGGAGTTCTATGGCTATCTCTCCAGATAAACCTTACCACTGCGGGGCTGGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 113061 222 + 647215 TAAAACTGTTCTAAAAGGCAAGTGAGTAAGTACTATTACTACATAATTGCATCCAAACTCTGTTACCAAGAAAAGCTAATGATGTTGTCCCTCAGTTGATTCCACCCCATCAATTAGCAAAACACACGAGCCTATGGCACACTACATTAACTTTCTTTA--------------TCATACACCCCCACACCAAAAAGTTCAAGGTCAAAAAAGACTATAGCACATCTACCAGGCCGA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr0 115250 52 + 130230 CTAGGTTTAGCTACAGTGAACGTTGAAGAATGAGAAGGTTGAACAGGTCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120709 52 + 636262 CTAGGTTTAGCTACAGTGAACGTTGAAGAATGAGAAGGTTGAACAGGTCAGT - -a -s mr.mrrefChr0 115302 75 + 130230 GACTAGAAACTGACATTTCTTTCCACTAAAGAGGGAGGGACAGGATGGTTCTAACATACTGGCCATAGCTGAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120762 75 + 636262 GACTAGAAACTGACATTTCTTTCCACTAAAGAGGGAGGGACAGGATGGTTCTAACATACTGGCCATAGCTGAGTT - -a -s mr.mrrefChr0 115377 41 + 130230 ATTGTTTAGGAAGCAAAATGGTGAGTGAGTGATGTTTTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120849 41 + 636262 ATTGTTTAGGAAGCAAAATGGTGGGTGAGTGATGATTTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 113283 41 + 647215 ATTGTCTAGGAATCAAAATGGAGAGTGAGTGATGTTTTAGA - -a -s mr.mrrefChr0 115418 15 + 130230 AAATACCTGCCCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120893 15 + 636262 AAACACCTGCCCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 113324 15 + 647215 AAATACCTGGCCAGC - -a -s mr.mrrefChr0 115433 164 + 130230 ACAATGGTATTAACCCTTAACCGTGACACAATTTTATTTGTATGCAGCAGGTCCAGCAAAGGCCTACAACAGTACTTTTATTGGTTTTAGCTCATATCTGTGGGTGGCAACCCCATTGTAAAGGCAATGTGTGGATCCTCTACTTACACTGCACCTGACCATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120908 157 + 636262 AAAATGGTATTAACCCT-------GACACAATTTTACTTGTATGCAGCAGGTCCAGCAAAGGCCTACAACAGTACTTTTATTGGTTTTAGCTCATATCTGTGGGTGGCAACCACATTGTAAAGGCGATGTGTGGATCCTCTACTTACACTGCACCTGACCATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 113344 163 + 647215 ACAATCTTACTAACCCTTAACCGTGGCACAATTTTATTTGTATGCAGCAGGTCCAGCAAAGGCTTATAACAATACTTTCATTGGTTTTGGCTAATATGTGTGGGTG-CAGACCCATAGTAAAGGCAGTGTGTGAATCCTCTACTTATACTGCACCTGACTATGG - -a -s mr.mrrefChr0 115597 355 + 130230 GAGAGAAAAATATTAGTGTCTGGGAATTCTTAAGTAAGATGTAGCTCTTGCTTATTCCTTTAGGACACGGCACTAATGGGTGAGACCATAGTATTAATCTTTCTGCATGATATGAAGAATGCCAAGACTTGTTATTTTTCTTAAAACTTAAGAAATCCTCCTACAGATGTGAGGTTTGTCAAACATAGCTAGGCAGTATCAAAACATCAAAAACTTCCATGTACCATTCTTAATCCTTAATCATGTCAGCGCAGTTCCCTACTTTTCACAGTTTATGTAATTGATTGTGATCTTCACAATACATTATAAGTGTTTGGATCTTTTGAGTCTTGATATGATGAGTTACCACCTTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121065 338 + 636262 GAGAGAAAAATATTTGTGTCTGGGAATTCTTAATTAAGATGTAGCTCTTGCTTATCTCTTTAGGACACG--ATTAATGGGTGATACCATAGTTTTAATCTTTCTGCATGATATGAAGAATGCCAAGATTTGTTATTTTTCTTATAACTTAAGAAATCCTCCTATAGATGTGGGGTATGTCAAACATAGCTAGGCAACATCAAAACATCAAAAAGTTCCATGTACCATTCTTAATCCTTAATCATGTCAGCGCGGTTCCCTACTTTCCACAG---------------GTGATCTTCACAATACAGTATAGGTGTTTGGATCTTTTGAGTCTTGATATGATGAGTTACCACCTTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 113510 348 + 647215 GAGAGAAAGATATTAGTGTCTGGGAAGTCTTAAGAAAGATGTAGCTCCTGCTTATTCCTTTAGGACACGGCACTAATGGGTGAGACCATAGTATTAATCTATTTGCATAATATGAGGAATGCCAAGACTTGTTATTTTTCCTAAAACTTAAGAAACCCTCCTACAGGTGTGAGGTTCGTCAAACATAGCTGGGCAGTATCAAAA-------AACTCATGTATACCATTCTTAATCCTTAATCACGTCAGCGCAGTTTCCTACTTTTCACAGTTTATGTAATTGATTGTGGTCCTCACAACTCATTATAAGTATTTGGATCTTTTGAGTCCTGATATGATGAATTACTGTCTTGAA - -a -s mr.mrrefChr0 115952 81 + 130230 TCCAGGAGGAATCCCTCGAAGTACAGTGACAACTTCTCAACAGGATGTGTACAGCCAGCATAGCATATAAAAGCTTGATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121403 81 + 636262 TCCAGGAGGAATCCCTTGCAGCATAGTGACAACTTCTCAACATGATGTGTACAGCCAGCATAGCATATAAAAGCTTGATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 113859 81 + 647215 TCTATGAGGGATCCCTCAAGGTGCAGTGACAACTTCTCAACAGGGTGGGTACAGCCATCATAGAGTATAAAACCTTGATAT - -a -s mr.mrrefChr0 116033 19 + 130230 AACATGGCTTAATTATATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121487 19 + 636262 AACATGGCTTAATTATATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 113940 19 + 647215 CACATGGCTTAGTTATATT - -a -s mr.mrrefChr0 116052 71 + 130230 TATTACCACAGCACTTCATCCATTTAATGACCTGGAGCTACCTTTGGCGTTCCAACCCTGAATAGCACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121506 71 + 636262 TATTACCACAGCACTTCATCCATTTAATGACCTGGAGCTACCTTTGGCGTTCCAACCCTGAATAGCACATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 113962 71 + 647215 TATGAACATGGCGCTTCATCGATCTAATAACCTGGAGGTAGCTTTGGTGTTTCAACCCTGAATAGCACGTT - -a -s mr.mrrefChr0 116123 16 + 130230 CATATTATTTCCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121579 16 + 636262 CATATTATTTCCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 114033 16 + 647215 CATCTTATTTCTTGTC - -a -s mr.mrrefChr0 116139 38 + 130230 CTAGGTCTTATCATCCGTTAACACAGACAGTTGTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121615 38 + 636262 CTAGGTCTTATCATCCGTTAACACAGACAGTTGTATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 114049 38 + 647215 CTAGGTCTTGTCATCAGTTAAGACAGGGAGTTGTATGG - -a -s mr.mrrefChr0 116177 60 + 130230 TGAGCCTCCAGGAGATCTGCAGTATTTACGCATAACAATGTATAGACATGCTGCTATTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121653 60 + 636262 TGAGCCTCCAGGAGATCTGCAGTATTTACGCATAACAATGTATAGACATGCTGCTATTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 114093 60 + 647215 GGAGCCTCCAGGAGACCTGCAGTATTTTCACATAGCAATGTGTAGACATGCTGCTATTGA - -a -s mr.mrrefChr0 116237 24 + 130230 CTGTCTGGCTCAGGTATGATGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121713 24 + 636262 CTGTCTGGCTCAGGTATGATGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 114154 24 + 647215 CTGTCTGGCTCAGGTATGGTGGTT - -a -s mr.mrrefChr0 116261 93 + 130230 TCTAAGATTCATACTTGGTTCGGGCCTATTAGTTATTTGTGCACTTTGGCATGCTGCTCTGTGTGTTGACTATATCATAAGACATTATACCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121737 93 + 636262 TCTAAGATTCATACTTGGTTCGGGCCTATTAGTTATTTGTGCACTTTGGCATGCTGCTCTGTGTGTTGACTATATCATAAGACATTATACCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 114181 93 + 647215 TTTAAGATTCATACTTGGTTTGAGCCTATTAGTTATTAGTGCACTTGGGCAGGCTGCTCTGTGTGTTGACTACATGATTAGTGATTATGCCAA - -a -s mr.mrrefChr0 116354 138 + 130230 AAAGGATAGCCTCTGTTGTGCTTCTTTGTCACTATCTCATCCTAACTGTGTGAAAGTAATTGTTAGAGATCACCTAGGCATACATATAAGTCTTCGCACCTGTTTCATTCTCTTGGTGATCCCAATGAGCAAAGGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121834 138 + 636262 AAAGGATAGCCTCTGTTGTGCTTCTTTGTCACTATCTCATCCTAACTGTGTGAAAGTAATTGTTAGAGATCACCTAGGCATACATATAAGTCTTCGCACCTGTTTCATTCTCTTGGTGATCCCAATGAGCAAAGGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 114274 138 + 647215 AAAAAATAGCCTCTTTTGTGCTTTGTTGGCATTATTTCATCCTGACTGTGCAAGAGTAGTACTTAGAAATCATGTAGACATACATATAAGTCTTCTGAACTGTTTCACCCTCTTGGTGACCCCGATGAGCAAAGGTTG - -a -s mr.mrrefChr0 116492 133 + 130230 CTACAAAGTGCCACTCTACATATTGATAAGAGACTCCATTAATTCTTCCTGAGGTTTCCATTGATGACAAGGATGATTGTTTTTCTCTTTTATTTTTGACTTGATCATTGGGAACAATAATGGCCTTATTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121975 133 + 636262 CTACAAAGTGCCACTCTACATATTGATAAGAGACTCCATTAATTCTTCCTGAGGTTTCCATTGATGACAAGGATGATTGTTTTTCTCTTTTATTTTTGACTTGATCATTGGGAACAATAATGGCCTTATTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 114412 133 + 647215 CAACTAAGTGCCACTCTGCAGATTGATAACAGACCCCATTAAACCTTCCTGAGGTTTCCATTGATGTCAAGAGTGATTTTTTTCCTCTTTTATATTTGATGTCTTTAGCTTAGTTGTCCTTGGGCTTAGTTAC - -a -s mr.mrrefChr0 116625 452 + 130230 ACCTGGTCATTGGGAACAATAATGGCCTTACTTGAAAAATATTTAAGGGGCTATCAAGTTCTACAAGTTGACCCATATCAGCCCAATATGCTGCACATCGCATAAGTTATTTACAGTATGTGATTATCTTGCCAATAGGCAGCAAAATCCCCGGGTTCTTTGGTTTAGACACATCAGCAACTTGGGATGAGGTTGAACATGAGCTGTAAAGGAAGTGAGATACTTGGCCCATCGAAGATTTGTGCTTTTAATGCACAATAAAGCATTGCTCCAAGTAGTTCAAGAATGGCTATTTTATCCTATAGATTTTATTGGAACTCCTGCATTAAACTTAACGAAACCAGATGTGCTAACCATGATAATGATATGTAAGGTTGGTGGGTTCCGTCATGACTGTAAGTGCGTATCAAACACTGATGGCTTTTGCAAAGATTAGGATTCGCAATCTGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 122108 438 + 636262 ACTTGATCATTGGGAACAATAATGGCCTTATTT-AAAAATATTTCAGGGGCTATCAAGTTCTACAAATTGACCCATATTAGCCCAATATGCTGCACATCATGTAAGTTATTTCCAGTAGGCGATTATGTTGCCAATAGGCAGCAAAATCACCGGGTTCTTTGGTTTAGACACAT--------TGGGATGAGGTTGAACATCAGCCGTAAAGGAAGTGAGCTACTTGGCCCATCGAAGAATTGTGCTTTTAATGCACAATAAAGCAT-GCTCCAAGTAGTTCAAGAATGGCTATTTTATCCTATAGATTTTATTGGAGCTCCTGCATTAAGCTTAACAAAACCAGATGTGCCAACCATGATAATGATATGTAAGGTTGGTGGGTACCGT----ACTGTAAGTGCGTATCAAACACTGATGGCTTTTGCAAAGATTAGGATTCGCAATCTGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 114550 452 + 647215 ACCTGGTCATTGGGAACAATAATGGCCTGACTTGAAAAACACTTAAGGGGCTGTCAAATTCTACAAGTTGACCCATATCAGCCCAATATGCTTCAACTTGCATAAGTTATTTACAGTATGTGATTATCTCTCCAGTAGGCAGCTAAACCCCCAGGTTCTTTTGTTTAGACACATCAGCAACTTGGGATGAAGTTGAACATGAGCTGTGCAGGAAGTGAGATACTTGGCCCATTGAATATTTGTGCTTTTAATGCACAATAAAGCATTGGTCCAAGTAGTTCAGTAATGGCTATTTTTTCCTATAGATTTTATTTGAACTCCTGCATTACACTTTATGAAACCAGATGTGCTAACCAGGATAATGATATGTAAGATTGGTAGGTTCTGTCATGACTGTAAGTGTATATCAAACACTGATGGCTTATGCAAAGATTAGGATTCGCAATCTGTCA - -a -s mr.mrrefChr0 117077 210 + 130230 TCCTGGAACCTAGGAAAGTGGCACACCCTGCTAAACTATTGTGTTGTGCCTTTTACCATGAACATATAGATAGCAAAAATGAGCCCCCTTCTTGAAAACCCCATAAGCCAACTGGCATTCATTAGACGACCATCTTATCTTATAGGTTGGGCCTTTTGTGTTGCTGGGACATAAGCTTCAGACTCCTGCTATGCTTGTATTATAAAGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 122546 209 + 636262 TCCTGGAACCTAGGAAAGTGGCACACCCTGCTAAACTATTGTGTTGTGCCTTTTACCATGACCATATAGATAGTAAAATCGAACCCCCTTCTTGAAAACCCCATAAGCCAACTGGCATTCATTAGACGACCATCTTATCTTATAGGTTGGGCCTTTTGTGTC-GTGGGACATAAGCTTCAGACTCCTCCTATGCTTGTATTATAAAGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 115006 209 + 647215 TCCTGGAAC-TAGGAAAGTGGGACACCCTGCTAAACTATTGTGTTGTGCCTTTTACCACGAACATATATATAGCAAAAATGAGCCCCCTTCTTGGAAACCCCATAAGGCAACTGGCATTCATTGGACAACCATCTTGTCTTACAGGTTGGGCCTTTTGTGTTGCTTGGATGTAAGCTTCAGTCTGCTGCTATTCTTGTGTTATAAAGAGA - -a -s mr.mrrefChr0 117287 82 + 130230 TCTTCTTTTCAGCATTTAGAGGTAAAACATTGTGCTCACAAAGGCTATACCATTGATGAATGATTTAGTCCCACGTAGAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 122755 82 + 636262 TCTTCTTTTCAGCATTTAGAGGTAAAACATTGTGCTAACAAAGGCAATACCATTGATGAATGTTTTAGTCCCCTGTAGATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 115251 81 + 647215 TCTTCCTTTCAGCATTTAGTGGTAAA-CATTGTGCCCACGAAGGCTATATCATTGATGAACGATTTAGTCCCACGTAGAGGC - -a -s mr.mrrefChr0 117369 38 + 130230 TACACAATTGTGGCGTCCTTATTGAGAGTTTGATCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 122841 38 + 636262 TACACAATTGTGGTGTCCTTATTGAAAGTTTGATCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 115332 38 + 647215 TACACAATTGTGGCATCCTGATTGAGAGTTTGATCAAG - -a -s mr.mrrefChr0 117407 219 + 130230 AAAATTTTGATCAAGATGTGAGTGCAAAGCACTCACTATGAGTTTTTAACTGACACAACTTGGGTGGAGCTTTTAAATACTACTCAAAAGATTTTAACTCTAACTCATGTGTTCCTTTGCACCAGGTGGAACTATTGAATACTAACTATAAGCTCTAACTCATTTGTTCCTTTGAGCCTTTCAGCTTTAGTTAGAGTTTCACAGTTTGTGAATAGCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 122880 219 + 636262 AAAATTTTGATCAAGATGTGAGTGCAAAGCACTCACTATGGGTTTTTAACTGACGCAACTTGGGTTGAGCTATTAAATACTACTCAAAAGATTTTAACTCTAACTCATGTGTTCCTTTGCACCAGGTGGAACTGTTGAATACTAACTATAAGCTTTAACTAATTTGTTCCTTTGAGCCTTTCAGCTTTTGTTAGAGTTTCACAGTTTGTGAATAGAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 115370 218 + 647215 AAAATTTTGATCAAGATGTGAGTGTAAATCATT-GCTATGAGTTCTTAACTGACACAACTCGGGTGGAGCTTTCCAATACTAATTAAAGGATTTTAACTCTAACTCATTTGTTCCTTTGCACCAGGTGGAACTATTGAATACCAATTAAAAGCTCTAACTCATATGTTCTTTTTAGTCTTTCAGCTTTAGTTAGAGTTTCACAGTTTGTGAATAGCTCC - -a -s mr.mrrefChr0 117626 170 + 130230 AATAATTAGCAGTCATTATTTGCTTGTATTGCTATGATAAGCAACCATAGCTGAGCTATGACTGTGTTGCTGTGAAGTACTAGATAAAGGACTCTGCTTATTAGCATGGTCCAGGTTACTATCCGACTTCAAGTGCCCCCAATGTCCTTAGCTCATATGACCAACAGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123101 170 + 636262 AATGATTAGCAGTCATTATTTGCTCGTATTGCTATGATAAGCAACCATAGTTGAGCTATGACTGTGTTGCTGTGAAGTACTAGATAAAGGACTCTGCTTATTAGCATGGTCCAGGTTGCTATCCGACTTCAAGTGGCCCCAATGTCCTTAGCTCATATGACCAACAGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 115588 170 + 647215 AATAACTAGCAGTCATTATTTTCTTGTATCGCGATGATAAGCAACCATAGCTGAGCTATGACTGTGTTGCTGCGAAGTACTAGATAAAGGTCTCTGCTTACTAGCATCGTCCAAGCTATTATCTGACTTCAAGTGCTCCCAATGTCCCCAGCTCATATAACCAACAGATC - -a -s mr.mrrefChr0 117796 281 + 130230 TAAGATACATCATTCTAGGTAGATTAGATTTGGTCAGCTGGTATAGCACTACATGATTTATAAATTTGGCAACAATTATAAATTTAGGCACAATAGTGTGGAGGTTATCATGACTTTGGTATTTCTAAATAAAGAGACTAGGCCTAATTTTTTAAATGCATGCAACTGCACAGCTTCAGTCTCTCTCCACCTTCCACACATGTAAACAGGGTAATTCAGCATATTTTTGGTTGACGGTGCTCCCCCCAAAGAATCCACTGTAAAAACAAACTCTCATGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123272 256 + 636262 TAAGATACATCATTCTAGGTAGCTCAGATTTGGTCAGCTGGTATGGCACTATATTATTTATAAATTTGGCAACAATTATAAATTTAGGCACAATAGTGTTGAGGTTATCAGGACTTTGGTATTTCTAAATAAAGAGACTAGCCCTAATTTTTTAATTGCATGCAACTACACAGCTTCAGTCTCTCTCCACCTTCCACACATGGCCACAGGGTAATTCAGCACATTTTTA-------------------------CCACTGCAAAAACAGACTCTCATGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 115758 281 + 647215 TAAGATACATCATTCTAGGTAGATTAGATTTAGTCAGCTGGTATAGCACTACATGATTCATAAGTTGGGCAGCAATTGTAAATTTAGGCACAATAGTGTGGAGGTTATCATGACTCTGGTATTTCTAGGTAAAGAGACTAGGGCCAATTTTTTGAATCCACGCAACTGCACAGCTTCAGTCTCTCTGCACCTTCCACACATGTAAGCAGGGTAATTCAGCATATTTTCGGTTGACGGTGCTCCCCCCAAAGAATCCACTGTAAAAACAAACTCTCATCCTT - -a -s mr.mrrefChr0 118077 20 + 130230 ACCAGACTATGATTTTAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123547 20 + 636262 ATCAGACTATGATCTTAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 116039 20 + 647215 ACCAAACAATGATTTTAATT - -a -s mr.mrrefChr0 118097 23 + 130230 AATGCAACATCAAAAATACAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123567 23 + 636262 AATGCAACATCAAAAATACAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 116060 23 + 647215 AATGCAACATCAAATATACAATT - -a -s mr.mrrefChr0 118120 123 + 130230 CATCAAAAGACATATATATTGATGTTTCAACCTCCCATAAGCTCATATGTGTTCATACTGGATTCAAGAACATGACAAGACAGATTTTTATGCAGTTTTCAAAGGTGATTAATCCAATTCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123592 123 + 636262 CATCAAAAGACATATATTTTGATGTCTTAACCTCCCATAAGCTCATAAGTGTTCCTACTGGATTTAAGGACATGACAAGACAGATTTTTATGCAGTTTTCAAAGGTGATTAATCCAATTTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 116083 123 + 647215 CACCAAAAAACATATATATTGATGTTTCAACCTCCCATAAGCTCATATGTGTTTATACTGGATTCAAGAACATGACATGACAGGTTTTTATGTAGTTTTCAAAGGTGATTGACCCAATTCTCT - -a -s mr.mrrefChr0 118243 161 + 130230 TTTCACATGAAATTTGCTTTGTAATTGTTAATATGAATTTTATACTCTATTCTATGACATGCTTTCACACGTCAGGGATTGCTGTAAACTGCTGTTCACATGGGGTAAGCTATTGTCTGATGTCTTGATGGCAGTATGAAATATGATTAAAAAATTTGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123716 161 + 636262 TTTCACATGAAATTTGCTTTGTAATTGTTAATATGAATTTTATACTCTATTCTATGACATGCTTTCACACGTCAGGGATTGCTGTAAACTGCTGTTCACATGGGGTAAGCTATTGTCTGATGTCTTGATGGCAGTATGAAATATGATTAAAAAATTTGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 116206 65 + 647215 CTCCACATGAAATTTGCTTTGTAATCATTAATGTGATCTTTATACTCTATTACATGACAGGCTTT------------------------------------------------------------------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr0 118404 92 + 130230 AACAAACATAACTGCTTAACTTGCAACAAATGAGGATGCATGGCTTGTTTCTGTATTTGAGGGTTATACTGAGCCGAGTACACTCACCTGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123906 92 + 636262 AACAAACATAACTGCTTAACTTGCAACAAATGAGGATGCATGGCTTGTTTCTGTATTTGAGGGTTATACTGAGCCGAGTACACTCACCTGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 116271 92 + 647215 GTCAGACTTAGCTGCTTAACTTGTGACAGATGTGGATGCTTGGCTCGTTTCTGTATCAGAGGGCTAGGCTGAGCCGAGTACACTCACCTGAC - -a -s mr.mrrefChr0 118496 502 + 130230 TCAATAGTCCCTGCCCTAACCCACTCATTTATCGTTATATTTTTTTTCACATTTGTATTGCTCCCAGTCACACAGGGGGCATCTTTCAAACTAAAGTCTATGTCTGTGCTATTTGGCTAGGACGCGCCGTTGACTTCCACATAAACCTCAACTGCAAGCTGACACATAACGGATTTTCACTTTGGGCTTTAGAAAATACAGCAACTCAGTTCCAATAACTCTGTACCTCAAGTTAATTTCAATGAGGGCCTTTTGGGTGGTAGTAGGGTAAAATAGACATTTAGCTAAAGCTTCTTTTAAGGTACAACAGCATAATATATTGTCATTATATGTAAAAGCTCATTGCTGTTTTGGAAAATGGTGAACAAGCAGGTAAGTGCTCAGCAAGGTGGCACAATCACATTCTGACTTAACCTACTTATTTGACTTGCATTCACTGTGGCAGGATCAATTCTGGTAAATTGTCAGTGATGGCTATAAACTTCAAATTAGGATTGTCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123998 491 + 636262 TCGATTGTCCCTGCCCTAACCCACTCATTTATTGTTATATTTTTTTTCACATTTGT--TGCTTCCAGTCACACAGGGGGCATCTTTCAAACTAAAGTCTATGTCTGTGTTATTCGGTTAGGATGCGTTGTTGACTTCCACATAAACCTCAACTGCAAGCTGACACATAACGGATTT-CACTTTGGGCTTTAGAAAATACAGCAACTCAGTTCCCATAGCTCTGTACCTCAAGTTAATTTCAATGAGGGCCTTTTGGGTGGTAGTAGGGTAAAATAGACATTTAGCTAAAGCTTCTTTTAAGGTACAACAGCATAAAATATTGTCATTATATGTAAAAGCTCATT--------GGAAAATGGTGAACAAGCAGGTAAGTGCTCAGTCAGGTGGCACAATCACATTCTGACTTAACCTATTTATTTGACTTGTGTTCATTGTGGTAGGATCAATTCTGGTAAATTGTCAGTGATGGCTATAAACTTCAAATGAGGATTGTCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 116365 482 + 647215 TCAATAGTCCCTGCCCTAACTTTCTCACTTATCGTTATTTTTTTTTTCACATTTGTATTGCTCCCAGTCACACAGGTGGCATCTTTCAAACTAAAGTCTACGTTTGTGCTATTTGGCTCGTACGCACCATTGGCCTCCACATAAA--------------------ACAATGGATTTTCACTTTGGGCTTTGGAAAATACAGCAACTCAGTTACAATAACTCCGTACCTTAAGTTAATTCCAATGAGGGCCTTTTGGTTGGTAGTAGGGAACAATAGATATTTAGCTAAAGCTTCTTTTAGGGTACAACAGCATAATAAATTGCCATTATATGTAAAAGCTCATTGCTGTTTTGGAAAGTGGTGAACAAGCTGGTAAGTGCCAGGCAGGGTGGTACATGCACATTCTGACTAAACCTACTTATTTGACATGCATGCACTATGGCAGGAGTGGTTCTGGTAAATTGTCGATGATGGCTATAAACTTCAAATTAGGATTGTCACT - -a -s mr.mrrefChr0 118998 19 + 130230 GGGATCTTTATTCAATGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124489 19 + 636262 GGGATCTTTATCCAATGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 116848 19 + 647215 GGGATCTTTATTCAGTGAT - -a -s mr.mrrefChr0 119017 71 + 130230 CTGAGTGTGACAGCACAATCCACACAATGCTAGCTAAATGCGCATGACAGCTTGATCTCGGTTGTTCAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124509 71 + 636262 CTGAGTGTGACAGCACAATCCACACAATGCTAGCTAAATGTGCATGACAGCTCAATCTTGGTTGTTCAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 116867 71 + 647215 CTGAATGTGACAGCACAAGACACATAATGCTAGATAAATGCACATGACACCTTGATGTCGGTTGTCacact - -a -s mr.mrrefChr0 119088 411 + 130230 GTCCGAGACCACGGTAAGGCCAGGCCTATGGACCAAGGAACATTGATCTAAATTGGACTATGAGCACAAGTCAAGCTTTTTTGGGTTAAGGTCACCCTTAAAGGATTGTATGCATTAATATCCAGAGGCCAATGGCAGTGTACGGATTAAAATCAGGATGGTTTGTAATTTTATTGCACTAACATGCAGAGGCCAATGGCAGTATTTTGGCTTATATCCAGATGATTCGCTTAGAGAGTTATCAGTTACAGGCCATTATTTGGATGGCCTGTGTAGTGAGAGAGCCACTTGATAACTGAATTATGCAGTTAGAATAGCACCAACCTCGAGTAAATTTGGAGGCTAGCCAAACCCCCCCCACCCCTGACTCAACCTCAGGTATAATCATACCAATACCAGCCATATTAGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 118690 411 + 647215 GTCCGAGACCACGGTAAGGCCAGGCCTATGGACCAAGGAACATTGATCTAAATTGGACTATGAGCACAAGTCAAGCTTTTTTGGGTTAAGGTCACCCTTAAAGGATTGTATGCATTAATATCCAGAGGCCAATGGCAGTGTACGGATTAAAATCAGGATGGTTTGTAATTTTATTGCACTAACATGCAGAGGCCAATGGCAGTATTTTGGCTTATATCCAGATGATTCGCTTAGAGAGTTATCAGTTACAGGCCATTATTTGGATGGCCTGTGTAGTGAGAGAGCCACTTGATAACTGAATTATGCAGTTAGAATAGCACCAACCTCGAGTAAATTTGGAGGCTAGCCAAACCCCCCCCACCCCTGACTCAACCTCAGGTATAATCATACCAATACCAGCCATATTAGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 119121 411 + 647215 GTCCGAGACCACGGTAAGGCCAGGCCTATGGACCAAGGAACATTGATCTAAATTGGACTATGAGCACAAGTCAAGCTTTTTTGGGTTAAGGTCACCCTTAAAGGATTGTATGCATTAATATCCAGAGGCCAATGGCAGTGTACGGATTAAAATCAGGATGGTTTGTAATTTTATTGCACTAACATGCAGAGGCCAATGGCAGTATTTTGGCTTATATCCAGATGATTCGCTTAGAGAGTTATCAGTTACAGGCCATTATTTGGATGGCCTGTGTAGTGAGAGAGCCACTTGATAACTGAATTATGCAGTTAGAATAGCACCAACCTCGAGTAAATTTGGAGGCTAGCCAAACCCCCCCCACCCCTGACTCAACCTCAGGTATAATCATACCAATACCAGCCATATTAGACT - -a -s mr.mrrefChr0 119499 20 + 130230 GTGGAGGAAAGCAGGGGCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 119101 20 + 647215 GTGCAAGAAAACAGGGGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 119538 20 + 647215 GTGGAGAGAGGCACGAGCCG - -a -s mr.mrrefChr0 119519 55 + 130230 CAGGAATCATGGACCAGGGGGTGTAACTTGTTCTGCAGATAAAAGAACAATCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124580 55 + 636262 CAGGAATCATGGACCAGAGGGTGTAGCTTGTTCTGCAGATAAAGGAACAATCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 123093 55 + 647215 caggaatcattgaCCAGGGAGAGTTACTTGTTTTGCAGATGAAAGAACAATATTG - -a -s mr.mrrefChr0 119574 20 + 130230 AGTGGAGGAATTAACAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124636 20 + 636262 AGTGGAGGAATTAACAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 123148 20 + 647215 GGCGGAGGAATGAACAGAAT - -a -s mr.mrrefChr0 119594 250 + 130230 AAACAAGCCCCAAAATAACACCTGAGCAGCTATTGTGAGACCTATGTCAGATTGTGACTGATGCAATGTTTGATCAGCAGAACAATAGCAGGGAGCCGAGAAGTGTATGAATGTATGGTGATGAGCCCGAAGTGTTCTGGGTTTTCAGTATAGCACCATTGCCCTGCTCAAGAGGGTTCAGTATTGTTGCCCAATGTTGCGATGTGATCCTCTTAGAAGGAAATGCAAATAGCTGGTAGACATCAGCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124663 250 + 636262 AAACAAGACCCAAAATAACACCTAAGCAGCTATTGTGAGACCCATGTCAGATTTTGACTGATGCAATGTTTGATCAGCAGAACAATAGCAGGGAGCTGAGAAGTGTATGAATGCAGGGTGATGAGCCCGAATTGTTCTGGGTTTTCAGTATAGCACCATTGCCCTGCTCAAGAGGGTTTAGTATTGTTGCCCAATGTTGTGGTGTGATCCTCTTAGAAGGAAAAGCAAATAGCCGGTAGACATTATCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 123168 245 + 647215 AAACGAGCCCCAAAATAACGACTGAGCAGCTATTGTGAGACCTGTGTCAGATTGTGACTGATGCAATGTTTGATCAGCAGAACAATAGCG-----CCGAGAAATTTATGAATGTATGGTCATGAGCCTGAAGTGTTCCGGGTTTTCAGTATAGCACCACTGCCCTGCTCAAGAGGGTTCAGTATTGTTGCCCAATGTTGCGATGTGAGCCTCTTAGAAGGAAATGCAAATAGCTGGTAACCATCAGCGGT - -a -s mr.mrrefChr0 119844 175 + 130230 GTGGCAATAGTGAGGATGGTCCTCATATACGATGTTTGCTACAAACTTAGCATCCTGGGATGTTGATTCATAGGAAGGTCCAGACAGGGATGCCACCCCATAAGAAGCATGCTTTATATCATATCTTACTGAGATGTAACTTAATGCAAAGTGTGAGTTTGTACTGATCTACTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124914 172 + 636262 GTCGCAATAGTGAGGATGAGCCTCATATACGATGTTTACTACAAACTTACCATACTGGGATGCTGATGG---GGAAGTTCCAGACAGGGATGCCACCCCATATGAAGTATGCTTTATATCCTGCCTTACTAAGGTGTGACTTAATGCAAAGTCTAAGTTTGTACTAATCTACTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 123413 174 + 647215 GTGGCAATTGTGAGGATGGTCCTCATATAGGATGTTTGCTACACGCTTAGCTTCCTGGGATGTTGGTTCATAGGGAGGTCCACACAGGGATGCCACCCCATAAGAAGCAT-CTTTATGTCACATCTCACTGAGATGTAACTTAATCCAAAGTGTGAGTTTGTACTGATCTATCCA - -a -s mr.mrrefChr0 120019 235 + 130230 ACGAGAAGGCTCGTAAATATCATGACCAGAATTGGATGTGTTCATTAAGGCCAGCGCAAAGCAGTTCAAGTGAATAAAGCCACCCTACCCTTAACCTCTCATAAGCACCTAACCTATGGTGGGAGGCTGATTGGACTCCACTAACTGTAGGATGCACAGTTCTATGGTAACTGTTCTCTTTTTTCAACAACATTTTATGTCTAGACTGCTAGGGCCTAGCAAGCTAAGTAGCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125086 231 + 636262 ACGAGAGGGCTCGTAAATATCATGACCAGAATTGGATGTGTTCATTAAGGCCAGCGCAAACCTGTTCAAGTGAATAAAGCCACCCTACCCTTTACCTCTCTAAAGCACCTAACCTATGATGGGAGGCTGAT-GGACTCCACTAACTGTAGGATGCACAGTTCTACGGTAACTGTTCTCTTCTTTCAACACTATTTTATGTCTAGA---CTAGGGCCTAGCAAGCTAAGTAACAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 123588 222 + 647215 ACGAGGAGCCTCATAAATATCATGACCAGAATTGGATTTGTTCGTTGAGGTCAGTGCAAAGCAGTCCCAGTGCATAAAGCCGCCCTACCCATAACCACTCATAAGCACCTAACCTATGGTGGAAGGCTGATTGGACTCCACTA-------------CAGTTCTATGATAATCGTTCTTTTTTTTCAACAACTTTTTATGTCTAGACTGCTAGGGCCTAGTAAGTTAAGTAGCAAT - -a -s mr.mrrefChr0 120254 123 + 130230 TACCACCACTTCAGCCCTCAACTGATGCTAACATATCATGTGATGGATTACTCTGGGACTTCAACTTATTGTGTTATTGGGCAATGCTATGTGTGGTTTACCTTTACCAACCGCTTGAGCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125317 123 + 636262 TACCACCACTTCAGCCCTCAACTGATGCTAACATATCATGTGATGGATTACTCTGGGACTTCAACTTATTGTGTTATTGGGCAATGCTATGTGTGGTTTACCTTTACCAACCGCTTGAGCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 123812 123 + 647215 TACCACCACTTCAGCCCTTAACCAACGCCAACATATCATGTGATGGATTACTCTTCAACTTCAACTTTTTACATCATTGGGCAAGGCTATGTGCGGTTTACCTTTACCAACCACTCGCTCATT - -a -s mr.mrrefChr0 120377 43 + 130230 TCAAACACCCCTATTACTACTTAATAGCATTAGGAATTATAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125442 43 + 636262 TCAAACACCACTAGTACTACTTAATAGCATTAGGAATTATAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 123935 43 + 647215 TCAAACACCCCTATTACTACTTAGTAGCATTAGGAATTATAAC - -a -s mr.mrrefChr0 120420 125 + 130230 ATAAATTATTAATCCCCAATCAAACCACTCCCTCACTTCTCAAACACCCCAATTATTGGATAATATAGGCATAAGGAATTATAACTGACACTGATGAATTATTAATTGACAATTGAATCAGTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125493 122 + 636262 ATAAATTATTAATCCCCAATCAAACTACTCCCTCACTTCTCAAACACCCCAATTACTG---CATATAAGCATAAGGAATTATAACTGACACTGATGAATTATTAATTGACAATTAAATCAGTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 123978 113 + 647215 ATAAATTATTAATCCCCAATCGAACC------------CTAAAACACCCCTATCATTAGATAATATAGGCATAAGGAGCTATAACAGACCCTGATGAATTATTAATTGACAATTGAATCACTGAA - -a -s mr.mrrefChr0 120545 332 + 130230 CTTTTCCATACATTCAGCATTTTTTCTTTTGTAAAACCTGCGCCTTTAGATCATATTCTAAGTAAGGGTAAGAATAGATTCACTTCCTTGTGGCATTCTGCAGCAGTATACACTATTGTCTGTCTCAGATAACAATCAAATAGTTAGCAGCCAGTTAAAGACAAATGACATATCTTAAGAAGAAGGTACTCTCCAAACTGACTGGCAAATATACCTCAAACTACTCACTAACCTAAAATATGCAAGTTCCCCAATGGGCTGACCACGAATTGAAGTTAACTAACAGATGTTACTCATTTTTTATCATTCAACTCTCACAAGGGTCATGTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125616 331 + 636262 CTTTTTCATACATTCAGCATTTTTTCTTTTATAAAACCTGCGCCTTTGGATCATATTCTAAGTAAGGGTAAGAATAGATTCACTTCCTTGTGGCATTCTGCAGCAGTATACACTATTGTCTGTCTCAGATAACAATCAAATAGTTAGCAGCCAGTTAAAGACAAATGACGTATCTTAAGAAGAAGGTGCTCTCCAAACTGACAGGCAAATATACCTCAAACTACTCACTAACCTAAAATATGGAAGTTCCCC-ATGGGCTGACCACGAATTGACGATAGCAAACAGATGTTACTCATTTTTTATCATTCAACTCTCACAAGGGTCATGTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 124091 327 + 647215 CTTTTCCATACATTCAGCATTTTTTCTTTTGTAACACCTGCGCCTTTAGATCATATTCTAAGTAAGGGTATTAATGGACTCACTTCCTT-TCACATTCTGCAGTGGTAGACACTATTGTCTGTCTCAGAT-ATAATCAAATAGCAAGCAGCCAGTCAAAGACAAATGACATATCTTAAGAAGAAGGTACTCTCCAAACTTACTGGCAAATATCCCTCAAACTACTCACTAACCTAAAATGTGCAAGTTCCCCAATGGGCTGACCACAAATTGAAGTTAACTAGCAGATGTTCCTCATTTTTTATCATTCAACTCTCATAAGGG---TGTGCA - -a -s mr.mrrefChr0 120877 87 + 130230 TCTAAATACAGATACCTTAATTTCTTCCAATGAAAAAAAGTGAAAAAAGACACCACCCTATGTGGTGTCACTGCTCCTCTGGTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125971 87 + 636262 TCTAAATACAGATACCTTAATTTCTTCCAATGAAAAAAAGTAAAAAAAGACACCACCCTATGTGGTGTCACTGCTCCTCTGGTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 124418 87 + 647215 TCTAAATACAGATACCTTAATTTCCTCCAATGGAAAAAAGTGAAAAAAGACACCGCGCTACGTGGTGTCACTGCTCCTGTGGTGTAC - -a -s mr.mrrefChr0 120964 16 + 130230 ATCTGACAGGTCCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126063 16 + 636262 ATCTGACAGGTCCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 124505 16 + 647215 TTCTGATAAATCCAGC - -a -s mr.mrrefChr0 120980 47 + 130230 TACCGTTTTAACCGACAAGTATGTCAGTAGAGGCGGATTAGGGTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126079 47 + 636262 TACCGTTTTAACCGACAAGTATGTCAGTAGAGGCGGATTAGGGTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 124524 47 + 647215 TACTGTCTTAGCGGACTAGGATGTCAGCAGGGGTGACTTAGGGTATT - -a -s mr.mrrefChr0 121027 53 + 130230 GTAACTCACGGATCATGCGAGGAATGATAGTATGCAACACACTATAGGAGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126129 53 + 636262 GTAACTCACGGATCATGCGAGGAATGATAGTATGCAACACACTATAGGAGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 124571 53 + 647215 GTACCTCACATGTCTTGCCAGGAATGATAATATGCCACACACTACAGGAGTCA - -a -s mr.mrrefChr0 121080 19 + 130230 CACAATTACCATCCCAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126197 19 + 636262 CACAATTACCATCCCAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 124624 19 + 647215 CACAATCACAATCCCAGCA - -a -s mr.mrrefChr0 121099 158 + 130230 GGATTCGCAGGAAACATTTATTAATAGGTAACAGGCCAGATACTTGTCTCTTGGTGACATTGTCTCTTAGTAATAACAATGTACTAACTCTCCAGCCATTCTTAAATACACCTGTAGAGAAAGAGATATGAATTAGTATATGTAAGAATCACAACCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126218 158 + 636262 GGATTCGCAGGAGACATTTATTAATAGGTAACAGGCCATATACTTGTCTCTTGGTGACATTGTCTCTTAGTAATAACAATGTACTAACTCTCCAGCCGTTCTTGAACACACCTGTAGAGAAAGTGATATGAATTAGTATATGTAAGAGTCACAACCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 124643 151 + 647215 GGATTCGCAGGAAACATTTATTTATAGGTAACAGGCCAGATACTTGTCTCGTGGTGATATTGTCTCTTAGTTATAACAAAGTACTTATTCTCCAGCCATTCTTAAATTCACCTGTAGGGAAAGAGATC-------GTATATATAAGAATCACAATCAG - -a -s mr.mrrefChr0 121257 319 + 130230 GGTCATCCCCTTATTATAACTTCTGTCTGGGACTATACTTCTGGTTGGGACTATATAGGGCAGCTGTCTCAGGGTTGCTCATTACAAACTAACATGACATATTATGACATGAATGATATGAAGGCATGCAAAGACATTTTTTTCTTCTGTGCTCACCTAACTCTACCGAATCAGTGACAGCCTAAAGCTTAATAATGTTACTCACCTCCCAATTTGATCGTCCTAAGAATGCTACCCGGGTGTGACTAGCTGAGCCACTCTGTGCAATGACCTGGTCAAACAGTTAATGAAATATTCTAGCTCAAAGCTCAACTTAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126376 303 + 636262 GGTCATCCCCTTGTTATAACTTCTGTCTGGGACTATACTTCCGGTTGGGACTATATAGGGCAGCTGACTCAGGGTTGCTCAGTACAAACTAACATGACATATTATGACATGAATGATATAAAGGCATGCAAAGACATATTTTTCTTCTGTGCTCACCTTACTCTACCGAATCAGTGACAGCCT--------------TTACCCACCTCCCATTTTGATTGTCCTAAGAATGGTACCCGGGTGTGACTAGCTGAGCCACTCTGTGCAATGAACTGGTCAAACACTTAATGAAATATTCTATCTCAAAGCTCAACTTAA-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 124795 319 + 647215 AGAGTTCCCCTTATTATAACTTCTGTTTGGGACCATACTCCTGGTTGGGACTATATAGGGCGGATGTTTCAGGGTTGCTCATTACAATCTAACATAACATATTATGGCATGAATGATATGAAGGCGTGCAAAGAGATTTTGTTCTTCTGTGCTCACCTAACTCTACCAAATCACTGGCAGCTTAAAGCTTAATAATGTTCCTCTCCTCCCAATTTGATCGTCCTAAGAATGCTACCAGGGTGTGACTAGCTGAGCCACTGTGTGCAATGACCTGGTCAAACAGTTAATGAAATATTCTAGCTCAAAGCTCAACTTGTAG - -a -s mr.mrrefChr0 121576 24 + 130230 TGGGGAAATATACCTACACAGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126679 23 + 636262 -TGGGAAATACACCTACACAGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 125117 24 + 647215 TGGGGAAATATATCCATACAGGAG - -a -s mr.mrrefChr0 121600 102 + 130230 AATATGTAGTGGCATTGCCTGCAAGTAGGTGCAAATTAATACCTTCTTCAGTGCACCAGCTGTATAGGAGGACCTCACACACTTGCAGACTCGCACTAGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126703 102 + 636262 AATATGTAGTGGCATTGCCTGCAAGTAGGTGCAAATTAATACCTTCTCCAGTGCACCAGCTGTATAGAAGGACCTCACACACTTGCAGACTTGCACTAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 125141 87 + 647215 AATATGTAGTGACATTGCCTGCCTGCA-----------ATACCTTCTTCAGTGTACCAGCTGCATAGGAGGACCTCACATAC----AGATGCTTACTAGAAC - -a -s mr.mrrefChr0 121702 46 + 130230 AATTTATTTGTGATATCCCATAGCAGATGTACCAGAGGATGCACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126809 46 + 636262 AATTTATTTGTGATATCCCATAGCAGATGTACCAGAGGATGCACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 125228 46 + 647215 AATTATTTTGCAATATCCCGTAGCAGATGTACCAGGGGATCCCCAA - -a -s mr.mrrefChr0 121748 321 + 130230 GACCACTTTGAGTTACAATCTAACACTAATGCTGAGAAAATAAAATAAGCACAGCTCCAAATCACCACAGTTGATTGATACAAGCAAAACTAACACTGCTCTGTGTCTTCTGGTACTCATCAGAAACACCATAAGTTGTATTAACATCCATTCTGGGGCCAAGCCATGAGGGATCACTTATGGGATTCAAGGCTTTGGAGAGAGGTAACTTCATTACCTCCTCTAGAATAGCCATGACCATTCAGTGTTCTTATGTCCAAACTACACTTACTGTATCTCATAACACAAACTGGATGAATCAATGATGTCATCCTGTGTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126855 320 + 636262 GACAACTTTGAGTTATAATCTAACACTAATGCTGAGAAAATAAAATAAGCACAGCTTCAAATCACCACAGTTCATTGATACA-GCAATACTGACACTGCTCTGTGTCTTCTGGTACTCATCAGAAACACCATAAGTTGTATTAACATCCATTCTGGGGCCAAGCCATGAGGGATCACTTATGGCATTCAAGGCTTTGGAGACAGGTAACTTCATTACCTCCTCTAGAATAGCCATGACCATTCAGTGTTCTTATGTCCAAACTACACTTACTGTATCTCATAACACAAACTGGATGAATCAATGATGTCATCCTGTGTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 125275 319 + 647215 GACCAATTTGAGTTACAATCTAACACTAATGCTGGGAAAATAAAATAGGCACAGCTCCAAATCACCACAGTTGATTGTTACAAGCAAAAGTAACACTGCTCTACGTC--CTGGTACTCATCAGAAGCATCAGAAGTTGAATTAACATCCATTTTGGGGCCAAGCCATGAGGGATCACTTATGGGATTCGGGGCTTTGGAGAGAGGTATCTTTGTTACCTCCTCTAGAGAAGCCATGCTCATTCAGTGTTCTTATGTCCAAACTACACTTTCTGTATCTCATAACAGAAACTGTATAAATCAATGATGACATTCTGTGTAGA - -a -s mr.mrrefChr0 122069 192 + 130230 GGTGCAACTCAATGCTGTGAAGAGAATAGTTTGTCTTATAAACTAGCATATATTGTCCTGTTGCTTGGGGAATAGATGAAGATTCGCACCTTGCACCAACCTGGATTCCTGCTAGGATATCTCATCACCTCACCAGCATGAGATCTCAAATCAATAGCTCTAACAATCTGTCAGAAAAGAAATTTTACCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 127175 192 + 636262 GGTGCAACTCAATGCTGTGAAGAGAATAGTTTGTCTTATAAACTAGCATATATTGTCCTGTTGCTTGGGGAATAGATGAAGATTCGCACCTTGCACCAACCTGGATTCCTGCTAGGATATCTCATCACCTCACCAGCATGAGATCTCAGATCAATAGCTCTAACAATCTGTCAGAAAAGAAATTTTACCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 125597 192 + 647215 GGTGCAACTCAATGTCATGAAATGAACAGACTTTCTTATAATCTGACATATATTGTCCTGTTGCTTGGGGAATGGATGAATATTTGCACCTTGCATCAACCTGGATTCACGTTAGGATATCTCATCACCTCACCAGCATGAGATCTCAAATCAATAGCTCCAATGATCTGTCACAAAATTAACTTTACCAGC - -a -s mr.mrrefChr0 122261 421 + 130230 GCTAACCCAGACATTTTAAGTATCCAGTTCCCTTTCCGGCAGACATCTCAGCAACATTAGGTTGTCTGCAAAAGCCAGGTTATGTTCTACACCTGAGAGGTACTCTTGATGCACTGAGCCTTTACCACCCTCTAAAGTTTCAAGCTTTATAGAATAGGTAGAATTAGAAATGAACGGTACACACCATGGACATGAGGGGCTAAATTCTGCAGAGTGAAAGGCTGATCCAACCAAATGCCTTTTAATGTCTTTTATTTGTAGATGCCCTGACTCCTGTATGTTTCATAGCAATCTATGTGTATATCAGCGGCCTACTTGTTATTGAATGGTTCTGAAGTGCAAAGTTATCCTTCAAGTAAAAAGCATATAACCAAACAAAACTTGGCCGTGGTGAATCAACACAAAATTCTTAGATAGTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 127367 420 + 636262 GCTAACCAAGACATTTTAAGTACCCAGTTCCCTTTCCGGCAGACATCTAAGCAACATTAGGTCGTCTGCAAAAGCCATGTTATATTCTACACCTGAGAGGTACTCCTGATGCACTGAGCCTTTACCACCCTCTAAGGCT-CAGACTTTATAGAATAGGTAGAATTAGAAATGAACGGTACACACCATGCACATGAGAGGCTAAACTCTGCAGAGTGAAAGGCTGCTCCAACCAAATGCCTTTTAATGTCTTTTATTTGTAGATGCCCTGACTCCTGTATGTTTCACAGCAATCTATGTGTATATCAGCGGCTTACTTGTTATTGGATGGTTCTGAAGTGCAAAGTTATCCTTTAAGTAAAAAGCGTATAACCAAACAAAACTTGGCCGTGGTGAATCAACACAAAGTTCTTAGATAGTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 125791 417 + 647215 GGTAACCCAGACATTTTAAGTATCCAATTCCCTTTGCGGCAGAGATCTCAGCAATGTTAAGTTGTCTGCAAAAGCCAGGTTATGTTCTACATATGAAAGGTACTCTTGATGCACTGAGTTTTTACAACCCTCTAAAGTTTCAAGCTTTATTGAATAGGTAGAATTAGAAATGAATGGTACACACCATGGACTTGAGGGGCTGAATTCTGCAGAGTGAAAGGCCAATCCAACCAAATGCCTCTCAATGACCTTA----GTAGGTGCCCTAACTCATGTATACTTTATAGCAATCTATGTGTATATCCGTGGCCTCCTTGTTATTGAATGGCTCTGAAATGCAAGGCTGTCCTTCAAGTAAAAAGTATAAAACCAAACAAAACTTGGCCGTGGTGAATCAACATAAAATTCTTACATAGTGAT - -a -s mr.mrrefChr0 122682 234 + 130230 TCAAAGCCTTGTTACCTACTACACATAATCTTGTGTTCCTAACATTATGGCATGTCACTAGACCCTAGCAGGTCTCATTACCTCCAACAGGCTGCCTTGTGTCACCAACATTGCTCACTCTTTGGTGCATCAAAGCATCTGAAAAAATATGACATACAATATTCTTTGAAAGGGGCTCAACGGATCTGAACAAAGTCCAGCTTTGTCCCTTGACACTTAAAAAGGATGGTGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 127787 233 + 636262 TCAAAGCCTTGTTACCTACTACACATAATCTTGTCTTCCTAACATTATGGAATGTCACTAGACCCTAGCAGGCCTCATTACCTCCAACAGG-TGCCTTGTGTCAGCAACATTGCTCACTCTTTGGTGCATCAAAGCATCTGAAAAAATATGACATAAAATATTCTTTGAAAGGGGCTCAACGGATCTGGACCAAGTCCACCTTTGTCCCTTGACACTTAAAAAGGATGATGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 126217 229 + 647215 TCAAAGCCTTGTTACCTGCTAGACATAATCTTGTGTTCCTAACATTATGGCATGTCACTAGATCCTAGCAGGTCCCATTACCTTCAACAGGCTGTCTTGTGTCACCAACATTGCCCACTCTTTGGTGCATCAAAGCATCTGAGAGAATATAACATACAATATTCTTTGAAAGGAGGTCAACGG--CTGAACAGAGCCCAGCCTTGTCCTTTGACACTTAAAAAGGATGGTG--- - -a -s mr.mrrefChr0 122916 533 + 130230 CCCTGAGAAATACATATTAAGGTTTGATAGGCATCCACTGGGAATGCCACCTTTAGGTAGAAGATTATAACAATACATTGCTTAACCAATACATTGCTCTTGAGGAGAAGATGCGAAAATACTTATCTGTTCATATAGTCTGAGTCTGTATGTAAATGTAGATATGTGTGGAAATGTAGCTGTGTGTTGCAATTCAAGCTCCCTCTGGATCATCATATGTTATACTCTTCATGTATAGGTAGGTATACCAGAGCACCAATGGAACTTTTAATCAGTGACAGTGTCAGAGAATTAGTCATTCTGAATGCACAAAATTCTGGGAAACTTTAGGTCACAATCTGGCCCAAAAAAGTTGCTTGCATTTAATTTCCACATTATTCCCATGGATGATTAACAACCAGATTAGCACGAGCTTTGCCACATTACTTGCATTTCATTATTTTTACAAATTAAGGCTGCCACTATTGAAAGTCCATCTGTTCCATTAGTGAAAATTCTTGATTGAAAAGATCACTCACAATATAGACTATAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128023 529 + 636262 CCCTGAGAAATACATA---ATGTTTGACAGGCCTCCACTGGGAATGCCACCTTTAGGTAGAAGATTATAACAATACATTGCTTAACCAATACATTGCTCTTGAGGAGAAGATGCGAAAATACTTATCTGTTCATATAGTCTGAGTCTGTATGTAAATGTAGATATGTGTGGAAATGTGGCTGTGTGTTGTGATTCAAGCTCCCTCTGGATCATCAGATGTTATACTCTTCATTTATGGACAGGTATACCAGAGCACCAATGGAACTTTTAATCAGTGACAGTGTCAGATAATTAGTCATTCTGAATGCACAAAATTCTGGGAACCTTTAGGTCACAATTTGGCCCCAAAAAGTTGCTTGGATTTAATTCCCACATTATTCCCATGGATGATTGACAGCCAGATTAGCATGAGCTTTGCCACATTACCTGCATTTCATTATTTTTTCAAATTAAGGCTGCCACTATTGAAAGTCCATCTGA-CCATTAGTGAAAATTCTTGATTGACAAGATCACTCACAATATAGACTATAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 126446 524 + 647215 CCCTGAGAAATACATATTAAGGTTTGATAGGCATCCATTGGGAATGTTACCTTTTTGTTGAATATTGTACCAATACATTGCTTAACCAATACATTGCTTACTAGGAGAAGATGCAAAAATACTTATCTGTTCATACACCCTGACTCTGTATGTAAATCTAGCTATGTACAGAAATGTATCTGTGTGTTGCAATTCAAGCTCCCTCTGTATCATCGTATGTTATGCCCTCCATGTATAGGTAGGTATACCAGAGCACCAATGGAGATTTTAATCAGTGACAATGTCAGAGAATTA--CATCCTGGATGCATAAAATTCTGGAAAACTTTAGGTCACAATCTGGCCCAAAAA-GTTGCTTGCATT-AATTTCCACACGATTCCCATGGATGATCATCAACCAAATTAGCACAAGC-----CACATTACTTGCAGTTCATTATTTTTACAAAGTAAGGCTGCCACTATTGAAAGTCCATCTGTTCCATTAGTGAGAATTCTGGATCAAAAAGACCAGCCACAATCTAGACTATAAG - -a -s mr.mrrefChr0 123449 14 + 130230 TGCGCATTGCTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128552 14 + 636262 TGCGCATTGCTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 126971 14 + 647215 TGCACATTGCTGAC - -a -s mr.mrrefChr0 123463 26 + 130230 CAGGCCTTACGAGGCGGCAAACCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128567 26 + 636262 CGAGCCTTACGAGGCGGCAAACCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 126985 26 + 647215 CAGGCCTTACGAGGCAGCAAACCAGC - -a -s mr.mrrefChr0 123489 234 + 130230 AATTAGCAACCAATTGAGCAAGCAGGTTATGATGCACATTTAAAATAACCTGAGAGTAGTTTTTCTATCATCCATGTGACGAACTAAACTAGCCGCTACCCTAACACCACTTTTGTGTGATGTACATGAGCAAAGGAAAGCAATAATCTACCTATAGCCATGTTGTACTTCAACCTTTGTTTTGCTAGTTTACTCCACATTGTAATACCAGCAAACCATTGCTAAATATTATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128593 229 + 636262 AATTAGCAACCAATTGAGCAAACAGGTTATGATGTGCATTTAAAATAACCTGAGAGTAGTTTTTCCATCATCCATGCGGCAAACTAAACTAGCTGCTACCCAAACACCACTTTTGTGTGATGTACATGAGCAAAGGAAAGTGATAATCTACCTATAGCCATGTCATAC-----CCTTTGTCTTGCTAGTTGACTCCACATTGTAATACCAGCAGAACATTGCTAAATATTATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 127044 232 + 647215 AGTTAGCAACCAATTGAGCAAGCAGGTTATGAAGCACATTTAAAATAACCTTAGAGTTGTTTTTCTGTCATCCATGTGATGAGCTAAACTAGCCGCAACCCTAACAACACTTTTGTGTGATGTACAGGAGCATATGAAAGCAATAAT--ACCTATAATCATGATGTACTTCAACCTTAGTTTTGCTAGTTTAGCCCACATTGTAACACCAGCAAACTGTTGTTAAATATTATTT - -a -s mr.mrrefChr0 123723 19 + 130230 ATTTCAATTTAACCAGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128822 19 + 636262 ATTTCAATTTAACCAGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 127277 19 + 647215 ACTTCAATTTAAGCAGACC - -a -s mr.mrrefChr0 123742 209 + 130230 GTTTACAATCCACTAACCCTCTCAGATCACTCAATGTGTTGAATCCGCTGGAATATTACATCAGAAGTGAATCCCCAGTATATAGGTATTTGTAAGTGTTGACATCTGAATGTTAATATTTCGAGATGCAAGGTGTCACATGAGGTTTCTCGCCAGTCCCAGGAGGTTAGGTTTCTCACCAACATCACATGATGAGGTGTATGAGGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128841 209 + 636262 GTTTACAGTCCACTGACCCTCTCAGATCACTCAATGTGTTGAATCCGCTTGAATATTACATCAGAAGTGAATCCCCAGTATATAGTTATTTGTAAGTGTTGACATCTGAATGTTAATATTTCGAGATGCAAGGTGTCACATGAGGTTTCTCGCCAGTCACAGGAGGTTAGGTTTCTCACCAGCATCACATGATGAGGTGTATGAGGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 127297 138 + 647215 GTTTACAATCCACTAACT---TCAGATCACTCCATGTGTTGAATCCACAGGAATATTACAGCAGAAGTGATTCCCCAGTATACAAGTGT---------------------------------------------------------------CCAGTCCCATGAAGTT-----TCTTGCCAACATCACGTGATGAGGTGCATGAGGTGT - -a -s mr.mrrefChr0 123951 195 + 130230 CTTCATATAACATGGGTCCACAAAAGTTCTGTGTCCAGGGGCACTGGGGTCTTGCCTAAGCAATAGAGAATGTACAGTATCTTATGACTTATAATGTGAGGACTTGACTTTGGTACTGACTTTGACCTACTTATGTGGCTCTAGAAGTGCTGACAACTCTTATATGGTAGATGTTACTGAGATCACTATATAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129056 194 + 636262 CTTCATATAACATGG-TCCACAAAAGTTCTGTTTCCAGGGGCACTGGTGTCTTGCCTAAGCAATAGAGAATGTACAGTATCTTATGACTTATAATGTGAGGACTTAACTTTGGTACTGATTTTGACCTACTTATGTGGCTCTAGAAGTGCTGACAACTCTTATATGGTAGATGTTACTGAGATCACTATATAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 127435 125 + 647215 CTTTACAAAACATGGGTTCACAAAAGTTCTGGGTCCAGGGGCACTGGGGTCTTGTCTAAGCAA----GAATGTACAGTATCTTATGACTTACAATGTGAGGACTTGAATTTGGTACTGACTTTGACCTA------------------------------------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr0 124146 88 + 130230 TATTATGACAGTCCTTTGTGATTATAGGAAAACTTTAAAAACTCTTTGATCTATCATGCAGAACATGGTCTCAAGTCGATGAAATTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129262 88 + 636262 TATTATGACAGTCCTTTGTGACTATAGGAAATCTTTAAAAACTCTTTGATCTATCATGCAGAACATGGTCTCAAGTCGATGAAATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 127560 88 + 647215 TATTATGACAGTCCATTGTGATTATAAGAAAACTTTCGAAACTATTTGATCTATCATGCAGAACATGGTCTCAAGTTGATGAGATGGT - -a -s mr.mrrefChr0 124234 2 + 130230 AT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129350 2 + 636262 AT -s simRat_chr6.simRat.chr6 127653 2 + 647215 AT - -a -s mr.mrrefChr0 124236 355 + 130230 AGTTGTAACCAATTATATTGCATATGTGTTATTCAACAAGAAAGCAGTAACATTTTTCAAGTATACCCAAGTTACTATGAAGGTCAATTGCTACAAGTCTGATGGTTGTTTGCTCACAAGAGGGTCCAATGATTAATGTTATCATTCATATGTTTGAACTTGAGATAGGTTGCATTGCACACCCATAGGCTATTACAATGTTCCTCAATTGAGTTTTTCTATCTAGTATCTTTCCATATCAATTAATATTCTTTGTCAAAAGTCTTTATGGATATCAAGTCATTCCATGTTCGGATTAGCAATCAGTAATTAACCCAAACGCTGGAGTTCCAGTATATATTTGCCCAATCTGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129352 355 + 636262 AATTGTAACCAATTATATTGCATAGGTGTTATTCAACAAGAAAGCAGTAACATTTCTCAAGTATACCTAAGTTACTATGAAGGTCAATTGCTACAAGTCTGATGGTTGTTTGCTCACAAGAGGGTCCAATGATTAATGTCATCGTTCATATGTTTGGACTTGAGATGGGTTGCATTCCACACCCAGCGGCTATTACAATGTTCCTCAATTGAGTTTTTCTATCTAGTATCTTTCCATATCAATTAATATTCTTTCTCCAAAGTCCTTACAGATATCAAGTCATTCCATGTTCAGATTAGCCATCAGTAATTAACCCAACCGCTTGAGTTCCAGTATGTATTTGCCCAATCTGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 127657 353 + 647215 AGTTGTAACCAATTAGATTTCATATGTGTTATTCAACAAGAAA-CAGTAACACTTTTCCAGTATACCCAAGTTACTATGAAGGTCAATTACTATAAGTCTGATGGTTGTTTACTTGCAAGAGAGTCCAATGATTAATGTTATCATTCATATGTTTGAATGTGAGATAGGTTGCATTGCACACCCATAGGCTCTCACAATGTTCCTCAATTGAGTTTTTCTATCCAGCAATTTACCATTTCAATTAATATTCTTTGTCAAAAGTCTTTATGGATATCTAGTCATTCCATGTTCGGATTAGCAATTAGAAATTAATCCAAAC-CTGGAGTTCCAGTATATATTTGCCTAAACTGTTC - -a -s mr.mrrefChr0 124591 33 + 130230 TAACTACTGTGAACAGTAATACAGGGGGCCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129707 33 + 636262 TAACTCCTGTGATTAGTAATACAGGGGGCCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 128011 33 + 647215 CAACTACTGTGAACAGTGAAATAGGGGGCCTAC - -a -s mr.mrrefChr0 124624 133 + 130230 TGCAACACAGCACCCACAAAAGAGTGAGAACTACTTTGGCCAGATCTTGTCCATTTCAATAATCATGTGCACCCATCATGCCCCCATCACTGACATCTAAGGCCTTGGATGTATTAATATGGCAAGAGGCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129757 133 + 636262 TGCCACACAGCACCCACAAAAGTGTGAGAACTACTTTGGCCAGATCTTGTCCATTTCAATAATCATGTGCACCCATCATGCCCCCATCACTGACATCTAAGGCCTTGGATCTATTTATTTGGCAAGAGGCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 128044 133 + 647215 TGTAACACAGCATCCACAAAAGAGGGAGAACTACTTTGGCCAGATCTTGCCCATTTCAGTAATGATGTGCACCCATCATGCCCCCATCACTGACATCTAAGGCCTTGGATGTATTAATATGGCAAGAAGCCTG - -a -s mr.mrrefChr0 124757 274 + 130230 AATGCTTACGGAGCGGTCCCCAGTAATTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAATGGGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTAACCCCTCCTTAGTTGGAATTGAAATCGAACAATATTATCTTAAGGACAACCTGGCTTCATACAATGTGGCAATCAGTAGCGGTTGCTTTGTTATTCTTTTGGTAATCTACAAGAATGTGTGCCGTTAACAGGCTGGAACGGGGACTCATGTAATACAGCTCCTTGTTTGGTGGATTACAGCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129990 259 + 636262 AATGCTTACGGAGCGGTCCCCAGTAACTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAAT-GGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTAACCCCTCCTTAGTTGGAATTGAAATCGAACAATATTATCTTAAGGA--------------ACAATGTGGCAATCAGTAGCGGTTGCTTTGTTATTCTTTTGGTAATCTACAAGAATGTGTGCCGTTAACAGGCTGGAACGGGGACTCATGTAATACAGCTCCTTGTTTGGTGGATTACAGCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130311 259 + 636262 AATGCTTACGGAGCGGTCCCCAGTAATTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAAT-GGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTAACCCCTCCTTAGTTGGAATTGAAATCGAACAATATTATCTTAAGGA--------------ACAATGTGGCAATCAGTAGCGGTTGCTTTGTTATTCTTTTGGTAATCTACAAGAATGTGTGCCGTTAACAGGCTGGAACGGGGACTCATGTAATACAGCTCCTTGTTTGGTGGATTACAGCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 128177 247 + 647215 --------------------CAGTAATTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAATGGGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTGACCCCTCCTTCGTTGG----AACATCCAACAATATTATCTTAACAACAACCTGGCTTCATACAATCAGCCAATCAGCAGGGGTTTCTTTGCTATTCTTTTGATTAT---CAAGAATGTGTGCTGTTAACAGGTTGGAAGGGAGACTTATGTAATGCAGCTCCTTGGTCGGTGGATTACAGCTTA - -a -s mr.mrrefChr0 125031 62 + 130230 CCCTCTTGTTTAATTAATGAGGGGGCTTGAACCTCTTGCAGCTCCTTGTTTAGTGGTTCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130249 62 + 636262 CCCTCTTGTTTAATTAATGAGGGGGCTTGAACCTCTTGCAGCTCCTTGTTTAGTGGTTCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130570 62 + 636262 CCCTCTTGTTTAATTAGTGAGGGGGCTTGAACCTCTTGCAGCTCCTTGTTTAGTGGTTCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 128441 61 + 647215 CCCTCTTGTATAATTAATGAAAGGCCAAGGGTCCCATGCAGCTCCTTGTGTGGTGATTC-TA - -a -s mr.mrrefChr0 125093 52 + 130230 CCCCTTCAGTCCGATTGATGAGGGTGTGACCCTAATGTCTCTCAGACCGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130632 52 + 636262 CCCTTTCAGTCCGATTGATGAGGGTGTGACCCTAATGTCTCTCAGACCGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 128502 52 + 647215 CCCCTTCCATCCGGTTGATGAGGGTGTGACCCTAAAGTCCCTCAGTCTGATA - -a -s mr.mrrefChr0 125145 23 + 130230 CCACCCAAAACACATTACAAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130684 23 + 636262 CCACCCAAAACACATTACAAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 128556 23 + 647215 CTACCCAAAATACATCACAAAAT - -a -s mr.mrrefChr0 125168 447 + 130230 AGATTTTATGTAGACTTGAATATGTGACCAGGCTATACTACCTGTTTATCATTCTGTACCCCAAGCAAATCTTTCTTGGAAATTGAAATGATTCCCCCTGTGACCCATTAACAATGGTTGGCCTTCATCCATTCCTTGGGAATGCCCTGAGACCTACAGTCTGGGCTGTATGAGGTTTTGAAAAGGCAATTAGCTGTTATTGGAACAATACGCCAGGTGCGAGCACCAGCTGGTGGGAAACCACTCCTGTAGCCATTCTTACTGGACGAGCTCGATTTCCATCATCAGAAGCTAGCTGTGCACTCCAATACGATCTCTCACCAGATCTGTTTGGTCAGAGTTATATACTAGTATCTTTGAAAGATTTCTAGCACCACCTGTCTGGGGTGGTCATCGAATACAACTGTTTCCTGGTAGTTGGGCAGTTGATATCCAAGAACACCCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130729 375 + 636262 AGATTTTATGTAGACTTGAATATGTGACGAGGCTAGACCACCTGTCTATCATGCCGTACCCCAAGCAAAT--------GAAAGTGAAATGATTCCCCCTGTGACCCATT-ACAATGGTTGGCCTTCATCCATTCTTTGGGAATGCCCTGAGACCTACAGCCTGGGCTGTACGAGGTTTTGAAAAGGCAATTAG-TGTTATTGGAACGATACACCAGGTGCGAGCACCAGCTGCTAGGAA--CACGACCGTAGCCATTCTCACTGGTCGAG------------------------------------------------------------TTGGTCAGAGTTATATACTAGTATCTCTGAAAGATTTCTAGCACCACCTGTCTGGGGTGGTCATCGAATACAACTGTTTCCTGGTAGTTGGGCAGTTGATATCCAAGAACACCCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 128579 447 + 647215 AGATTTCATGTAGACTTGGATATGTGACCAGGCTATACTACCTGTTTATCATTCTGTACTCAAAGCAAATCTTTCTTGGAGATTGAAATGATTCCCCCTGTGACCTATTAACAATGTTTGGCCTTCATCCATTACTTGGGAATGCCCTGAGACCCACAGTCCGGGCTGTATGAGGTTTAGAAAAGGTAATTAGCTATTATTGGAATAATACGCCAGATGTGACCACCAGCTGGAGGGGAACCACTCGTGTAGCCGTTCTTACTAGATGAGCTCGATTTCCATCATCAGAAGCTAGCTGTGCACTCCAATACGATCTCTCACCAGATCTGTTTGGTCAGGGTTATAGACTAGTATCTTTGAAAGATTTCTAGCACTATCTGTTTGGGGTGGTCATCCAATACTGCTGTTTGCTGGTAGTTGAGTAGTTAATACCCAGGAACACCTAAT - -a -s mr.mrrefChr0 125615 14 + 130230 GTCAAAATTACCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131104 14 + 636262 GTCAAAATTACCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 129039 14 + 647215 GTCAAAATTACCTC - -a -s mr.mrrefChr0 125629 23 + 130230 CATTTGTTTGAGCCATTTAGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131119 23 + 636262 CATTTGTTTGAGCCATTTAGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 129053 23 + 647215 CCTTTGTTTGAGCCATTTAGCTA - -a -s mr.mrrefChr0 125652 42 + 130230 GCATAACAGAACAATCCTCAAGTACGTTTAGGTGGATCATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131142 42 + 636262 GCATAACAGAACAATCCTCAAGTACGTTTAGGTGGATCATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 129077 42 + 647215 GTGGAACAAAACAATCCTCAAGCATGTTGAGGTGGATCAGTG - -a -s mr.mrrefChr0 125694 104 + 130230 GTACCCATAGAAAGGAGGAATCCTGGGCTTACTACACTGGGAACACAGGGGTTAAAAAAAAAACCACACTTAGTTTACTTGTACTGCGCATAGGGTAACTGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131196 104 + 636262 GTACCCATAGAAAGGAGGAATCCTGGGCTTACTACACTGGGAACACAGGGGTTAAAAAAAAAACCACACTTAGTTTACTTGTACTGCGCATAGGGTAACTGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 129119 104 + 647215 GTACCCATAGAAAGGAGGGATCCTCAGCTTACTACAGTGGGAAGACAGGGGTTAAAAAAAACACCGCACTTGGTTGACATGTACTGTGCATAGGGTAACTGTGA - -a -s mr.mrrefChr0 125798 263 + 130230 CTTAGGAGACCTATTGTATAGAAAAACTCTACTGGAATTTGAGCAAGTACAAGAAAAAACATAGTATTGAGATTGCTAAGTAGAAGTTGTCCTGTTAGTCTTGTTAATAAAATGTCTAAAGAATCCCTCAGCCCCTGTTTGTGAATTGAAGGCTATGAACAGTGGTCTCAGCAAGGCATGTCATAATGATATTAACTACAATTTTTACACTATTCAGTATCTCATCATGATATGATACTAACACATGATGCTATGTATAGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131300 263 + 636262 CTTAGGAGACCTATTGTATAGAAAAACTCTACTGGAATTCGAGCAAGTACAAGGAAAAACATCGTATTGAAATTGCTAAGTAGAAGTTGTCCTGTTAGTCTTGTTAGTAAAATGTCTAATGAATCTCTCTGCCCCTGTTTGTGAATTGAAGGCTATGAACAGCGGTCTCAGCAAGGCATGTCATAATGATCTTAACTACAATTTGAACACTATCCAGTATCTCATCATGATATGATACTAACACGTGATGCTATGCATAGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 129232 257 + 647215 CTTATGAGAACTATTGTATAGAATAACACTACTGGCCTTTGAGCTAGTACAAGAAAAAACATAGTATTGAGGTTGCCAAGTAGAATTTGCACCACTAGGTTTGTCAATAAAATGTCCAAAGAGTCCGTAAGCACCT--TTGTGAATTGAAGGCAATGA----TGGTCTCAGCAAGGCATGTCATAATGATATTAACTACAATTTTTACTCTAATCAGTATCTGGTCATGATGTGAAACTAACACATGATGCTATATATAGAGC - -a -s mr.mrrefChr0 126061 48 + 130230 TCAAGATAATGCAAGCCTGCTTGGGACAATTCTAGCCTCTATATGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131580 48 + 636262 TCAATATAATGCAAGCCTGCTTGGGACAATTCTAGCCTCTATATGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 129489 30 + 647215 TAAAGATAATGCAAGCCTGCTTGGGACAGT------------------ - -a -s mr.mrrefChr0 126109 12 + 130230 CTCAATGCACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131695 12 + 636262 CTCAATGCACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 129519 6 + 647215 ------GCACTT - -a -s mr.mrrefChr0 126121 18 + 130230 ATGCAAAAAACTAACACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131707 18 + 636262 ATGCTAAAAACTGACACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 129526 18 + 647215 ATGCAAAAAACTAACACT - -a -s mr.mrrefChr0 126139 246 + 130230 GATACATCACACTTTGCTTCATGACCGTCCCAGGTTATAATTTTTGTCTGAGAACAACTGGTTATTTACCAGCACATTTATCCTGCAAGCTGGAGCTTCATTCATTGCTGCAACACCAACATGATCCAATATACCTTGTTGGGTGTTGAAGGAGCCTTTAGTGTTCAAGGATTTAAGTAGGATTAGACTGATATAAGCAGGGCTCAATCTGTGTGACAATGTCTTGGATTTATCAAATGATTAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131725 246 + 636262 GACACATAACACTTCGCTTCATGACCGTCCCAGGTTATAATTTTTGTCTGAGAACAGCCAGTTATTTACTAGCACATTTATCATGCAAGCTGGAGCTCCATTCATTGCTGCAACACCAACATGATCCAATATACCTTGTTGGGTGTTGAAGGAGCCTTTAGTGTTCAAGGATTTAAGTAGGATTAGACTGATATAAGCAGGGCTCAATCTGTGTGACAATGTCTTGGATTTATCAAATGATTAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 129579 245 + 647215 GTTGCGTCACAGTTTGCTTCATGACCGTCCCAGATTATAATTTTTGTCTGAGAACAACTGGTTGTTTACCAG-ATGTTTATCCTGCAAGCTGGAGCGTCATTCATTTCCCCAACATCAAGAAGATCCAACATGTCTTGTTGACTGTTGAAGGAACCCTTAGGGTTTGAGGATTTACATAGAATGAGATTGATATAAGCAGGGTACAGTCTATGCAACAGTGTCTTGGATTCAGCAAATCATTTGTT - -a -s mr.mrrefChr0 126385 84 + 130230 TCACTTTTACTGTACACACATAACCCTGTAATGTCTAATCTGATGCTTATTATATCAGATTGTCCTGACCTAGGTATGTAGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131971 84 + 636262 TCACTTTTACTGTACACACATAACCCTGTAATGTCTAATCTGATGCTTATTATATCAGATTGTCCTGACCTAGGTATGTAGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 129829 84 + 647215 TCACTTTTAATGCACACAAATAACACTATAAGGTCTAATCTGATGATTACTTCAACAGATTGCCCTTACCTAGGTATGTAATCA - -a -s mr.mrrefChr0 126469 14 + 130230 TCCAGCTCTAGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132055 14 + 636262 TCCAGCTCTAGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 129915 14 + 647215 TCCAGCTCTAGTGT - -a -s mr.mrrefChr0 126483 47 + 130230 TTGTTCTAGTTAACATATTGCATTATCTTACCCATAAGGCCAACCGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132075 47 + 636262 TTGTTCTAGTTAACATATTGCATTATCTTACCCATAAGGCCAACCGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 129929 47 + 647215 TTGCTCTAGTTGACATATTGCATTATCTTACCCACAAGTCCAACCAC - -a -s mr.mrrefChr0 126530 71 + 130230 AATACTGTCTCAATTATTTGCAAATAATTACAATGTTGTATTGGTTCACTCACAAGCACATTCTCATCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132177 71 + 636262 AATACTGTCTCAATTATTTGCAAATAATTACAATGTTGTATTGGTTCACTCACAAGCACATTCTCATCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 129976 71 + 647215 AATGTGGCCTCAAATATTTGCAAACAATTACTATGTTGTATTGGCTTGCTCGCAAATACATTTTTATCTCC - -a -s mr.mrrefChr0 126601 330 + 130230 AAGCAGAGAGAGGAGTTCAGAATTTTCCCTGCCACTCAGGAAGTTGAAATAGATGCAGGTACTTAGTTGGGTAGGACTTGTTTATCAGTATGCAATGTGCCCTTAGTAACAGCCAGCTAACACATGCATCTAGTGTTCAATTAATAGTTCTCCTATGCTCACTTCCCTCCCTACATGGAATGGTGGAGGGCCTTTATCTGGTGTGTACCAGTTCTCCGGTGTGCGGACCAGTTCTCTGGAGTTCATTTGCTCTTCCTGTCCAACGGATTCTGCAGATTGCATTGGCCCCTGTGATTCCAACTTATTGGTAGGTTAGCCTCCCCCAAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132273 317 + 636262 AAGCAGAGAGAGGAGTTCAGAATTTTCCCTGCTGCTCTGGAAGTTGAAATAGAAGCAGGTACTTAGTTGGGTAGGACATGTTTATCAGTATGCAATGGGCCCTTAGTAACAGCCAACTAACACATGCATCTAGTGTTCAATCAATAGTTCTCCTATGCTCACTTCCCTCCCTACATGGAATGGTGGAGGGCCCTTATCTGGTGTGTACCAGTTCTCCGGTGAACGGACCAGT-------------CTTGGTCTTCCTGTCCAACGGATTCTGCAGATCGGATTGGCCCCTGTGATTCCAGCTTATTGGTAGGTTAGCCTCCCCCAACTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 130047 329 + 647215 AAGCAAAGAGAGGAGTTCAGAATTTTCCTTGCCACCCAGGAAGTTGAAATAGATGCATGTACTT-GTTGGGTAGGACTTGTTTATCAGTATGGAATGTGCCCTTAGTAACAGCCAGCTAACACATGCATCTAGTGTTCAATTTATAGTTCTCCTATGTTCACGTTACCCCCTATATGGAATGGTGTAGGACCTTTGTCTGTTGTGGACCAGTTCTCTGGGGTGCAGACCAGTTCTCTGGAGTTCATTTGCTCTTCCTGCCCAACGGATTCTACATATTGCATTGGCCCCTGTGATTCCAACCTATTGGTAAGTCAGCCTCCCCCTAATCA - -a -s mr.mrrefChr0 126931 136 + 130230 TGATATGCACCCCCATACCCCTTGATGAACAGGCCCACCCTTGTGAAAATACAGTTAGCCCAATGCTAAATGAAGGCTATTGCTAGACAAGAGCACATGGAACAAGACTAGGAAAAATGGAATCAAAATCAAGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132590 119 + 636262 TGATATTCACCCCCATACCCCTTGATGAACAGGCCCACCCTTGTGAAAATACAGTTAGCGCAATACTGAATGAAGGCTGTTGCTAGACAAGAGC-----------------GAAAAATGGAATCAAAATCAAGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 130377 136 + 647215 TGGTATGCGCCCCCAGACCCCTTGATGAACAGGCCCACTCTTGTGAAAATACAGTTAGCCCAATGGTAAATGAAGGCCAGTGCTAGACAAGAGCACATGGAACAAGACTAGGAAAAATGGGATCAAAATCCAGCGC - -a -s mr.mrrefChr0 127067 77 + 130230 AGTGAGGCCAAAGAAAGTGGATCTAAATCCTGGGGAAGTGTGCAAATGGGTGTGGTCCCTCTTGTTACTACCCTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132733 63 + 636262 AGTGAGGCCAAAGAAAGAGGATCTAAGTCCTGGGGGAGTGTGCCAATGGGTGTGGTCCCTCTT-------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 130513 77 + 647215 AGTGAGGCCAAAGAAAGTAGATCTAAATCCTGGGGAAGTGTGCAAATGGGTGTGTTCCCTCTTGTTACTACCCTTCA - -a -s mr.mrrefChr0 127144 33 + 130230 TCAACTCTAATGAACTAGGATGCATACCTTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132796 33 + 636262 TCAACTCTAACGAACTTGGGTGCATACCTTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 130595 28 + 647215 TCAACTCTAATAAACTAGGATGATGACC----- - -a -s mr.mrrefChr0 127177 39 + 130230 CTGCTTACTTGCTGACTTTGTTATTTATAAGAAGTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132836 39 + 636262 CTGCCTACTTGCTGACCTTGTTATTTATAAGAAGTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 130623 38 + 647215 -TGCTGACCTGCAGACTTTGTTACTAATAAGAGGTTTGA - -a -s mr.mrrefChr0 127216 208 + 130230 CTGGCCAGCTTTTCATTATCAGTTCCATTGTCCGAGAGAGATATTTTGGCTGGGATATGAATAGTGCAGTGGATGTCTTAGGTATAAGAAGACTTTTATTGGCCCACTGGCAAGTCGTCAAAATAGCAGGATCTTAGTGTATAAACTATCTTGATAACCTTATAATGGGCTTATTTGGCAGTTACAAGTCTTTCTAAATTTCACCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132875 192 + 636262 CTGGCCAGCTTTTCATTATCAGTTCCATTGTCCGAGAGAGATATTTGTGATGGGATATGAATAGTGCAGTGGATGT-TTAGGTATAAGAAGACTCTTGTTGGCCCACTGGCAAGTCGTCAAA--------------GTGTATAAATTATCTTGATA-CCTTATAATGGGCTTATTTGGCAGTTACAAGTCTTTCTAAATTTCACCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 130662 208 + 647215 TTGGCCAGCTTTTCATTATCAGATCTATTGTCCAAGAGAGATATTTTGACTGGGATATGAATAGTGCAGTGGATGTCTTAGATATAAGAAGACTTTTATTGGCCCCCTGGCAAGTCATCAAAATAGCAGGATCTTAGTGTACAAACTATCTTGATAACCTTATATTGGACTTATTTGGCAGCTACAAGTCTTTCTAAATTTCACCCTA - -a -s mr.mrrefChr0 127424 78 + 130230 TCTCTAACTTTCATTTTTATAGCAGTATATCAAAGGTATACTTCCACTGTACACCTCCTTCATCAACAACAAGACACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133067 78 + 636262 TCTCTAACTCTCATTTGTCTAGCAGTATATCAAAGGTATACTTCCACTGTACAACTCCTTCATCAACAACAGGACACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 130871 78 + 647215 TCTCTAACTTTCCTTTTTATAACAGTATATCAAAGGTATACATCCACTGTACACCTCCTTCATCAACAGCAAGACGCT - -a -s mr.mrrefChr0 127502 247 + 130230 ATGAATACTTCTCTTGGTCCTAACTAACCAGGCTAATATACTCTGGGTCCTAACCAGCCAGGCTCTATCTTTGAGTGTCATGGGCATGAGGTTTCCCTTAATTGAAAGATTGATTAACAGAGTATCAGAATAGGTTCATGACTCCATACAATTTTAATCTTAGTCAAGGCCATGCCTTAGTAATCTGTATTTGCCCATAAGCTTTGTTAACCTACCTAGCAGTACTTAGGAATGGGAAAAACCTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133238 226 + 636262 ATGAATACTTCTCTTGGCCCTAGCTAACCAGGCTAATATACTCTGGGTCCTAACCAGCCAGGCTCTATCTTTGAGTGTCATGGGCATGAGATTTCCCTTAATTCAAAGATTGCTTAACAGAGTATCAGAATATGCTCATGACTCCATACAATTTTAATCTTAGTCAAGGCAATGCCTTAGTAAT---------------------GTTAACCTACTTATCAATACTTAGGAACGGGAAGAACCTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 130949 247 + 647215 ATGAATACTTCTCTTGGTCCTAACTGACCAGGCTAATATACTCTGGGTCCTAACCAGCTCAGCTCTATTCTTGAGTGTCATGGGCATGTGGTTTCCCTTAATTGAAAGATTGATTAACAGAGTGTCGGAATAGGTTCATGACTCCATACAACTCTAATCTTAGTTAAGGCCATGTCTTAGTAATCTGTATTTGCCCATAAGCTTTGTTGAGCTACCTAGTAGTACTTAGGAATGGGAAAAATGATAA - -a -s mr.mrrefChr0 127749 11 + 130230 GGAACTCTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133464 11 + 636262 AGAACTCCTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 131199 11 + 647215 GTAATTCTCGG - -a -s mr.mrrefChr0 127760 126 + 130230 TGATAATTGGTAATTCTCAAACTGTACATTTTAGATCCACTTGGGATAAATTATTCATGTCACCAGATTAGTAATGTTTTTTTGGTCTGGCACTCAGGACACGTCAGGCATAATATCTGGAGTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133475 126 + 636262 TGATTATTGGTAATCCTCAAACTGTACATTTTGGATCCACTTGGGATAAATTATTCATGTCACCAGATTAGTAATGTTTTTTTGGTCTGGCACTCAGGACATGTCAGGCATAATATCTGGAGTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 131216 125 + 647215 TGATAATTTGTAATTCTCAGACTGTACATTTTAAATACACTCTGGACAAATTCTTCATGG-ATCAGATTAGTGATGTTTTTTTGGTCTGGCACTCAGGACACTTCAGGTATAATATCTGGAGCCTT - -a -s mr.mrrefChr0 127886 338 + 130230 GATATGCATAAGAGTAACCAGCATCGGAGTACTAAGTGGGTTTTTTAGGAGACACTATACATGGTCAAGAGAGAAGGCTATTACAGACTGTGGCTTTGCATGAACCTGTCAACAGCTTAACTATCAATCAGTTCCTACCAGTGCTCACAACTGTCAAATTCTTACTGGATAATGGCCATCATATAAGAGAGCATATAGCCCAAATGTTTTAAAACTTTCTTATTCACACCATGGACATTGAACATTAGATGATAAATGGGAATACAATCTTGTATACTTCAGCAACCAGATATAAATCTCTGCCCAATACATCATGCTAAATTAAGCACTGCAAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133613 334 + 636262 GATATGCATAAGAGTAGCCAGCATCGGAGTACTAAGTGGGTTTTTTAGGAGACACTATACATGGTCAAGAGATA----TATTATAGACTGTAGCTTTACATGAACCTGTCAACAGCTTAACTATCAATTAGTTACTACCAGTGCTCACAACTGTCAAATTCTTACTGGATAATGGCCATCATATGAGAGAGCATATAGCCAAAATGTTTTAAAACTTTCTTATTCACACCATGGACCTTGGACATTAGATGATAAATGGGTATACAATCTTGTATAATTCAGCAACTAGATATGAATCTCTGCCCAATACATCAAGCTAAATTTAGCACTGCAAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 131341 336 + 647215 GATATGCATTTGAGAAATC--CGTTGGAGTACCAAGTTGGATTTTTAGGAGACACTATACAGGGTCAAGAGAGAAGGCTATTTCAGACTGTGGCTTTGCATGAACCTGTCAACAGCTTAACAATCAATCAGTTCCTACCAGTGCTCACAACTGTCAAATTCTTACTGGATAATGGCCATCATATAAGAGTGCATGTAGCCCAAATGTTTTAAAACTTTCCCATTCACACCATGGCCATTGAACATTAGATGATAAATGGGAATACAATCTTGTGTACTTCAGCAACCAGAAATAAATCTCTGCCTGATACGTCATGCTAAATTAAGCAAAGCAAACTT - -a -s mr.mrrefChr0 128224 450 + 130230 TTATTTTAGGCAGCACTGTACCGAGGAAAGAGGATAGTCCTTGCTCACAGGTGATGCTTGGGGAAGCATAACAATGCACAACATTGAAAAGCATCCACCCATAGCATAGACGCATTAACATTATGCTAACGCCAACAATTGTGGGAACAAGACCCCCTAGGGAGTCACTCTTCAATTACGAGGAGTCTACGTTCCGTGTCTTTTCCAATGGACTGCACATGTGTAGGCATCCTTGGGGTTGGTGCACACCAAGGACTTCATGAAACCCTTAATACCTGGTTCTAAAAAGTGGATTAATGGTGAGTAGAAACAAATGTTCTTGTCTGTTGGCCATAATACATGGTGCAAGTCTCTATGTCCAAAAATGATGCCTAACAGTAAATGTGCCTTTATCACGTGGTTATTTACAACCTGGTTATTTACAGATGTTATTACAAAGTATATATTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133947 450 + 636262 TTATTTTAGGCAGCTCTGTACCGAGGAAAGAGGATAGTCCCTGCTCACAGGTGATGCTTGGGGAAGCATAACAATGTACAACATTGAAAAGCATCCACCCATAGCATAGACACATTAACATTATGCTAATGCCAACAATTATGGGAACAAGACCCTCTAGGGAGTCACTCTTCAATCATGAGGAGTCTACGTTCCGTGTCTTTTCCAATGGACTGCACATGTGTAGGCATCCTTGGGGTTGGTGCACACCAAGGACTTCATGAAACCCTTAATACCTGGTTCTAAAAAGTGGATTAATGGTGAACAGAAACAAATGTGCTTGTCTGTTGGCCATAACACATGGTGCAAGTTTCTATGTCCAAAAATGATGCCTAACAGTAAATGTGCCCTTATCACGTGGTTATTTACAACCTGGTTATTACCAGATTGTATTACAAGGTATATATTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 131682 434 + 647215 TTATTTTAGGCAGCACTGTACCGCGGAGAGAGGATTGGCCTTGGTCACACATGATGCTT---------CACCACTGCACAACATTGAAAAGCGTCCACCCACAGCATAGAAGCATTAAC-TTATGCTAACGCCAACAATTGTGGGAGCAAGACCCCCTAGGGAGTCAATCTTTAATTACCAGGAGTCCATATTCCATGTCTTTTCCAATGGCCTGCACATGTGTAGGCATCCTTGGGGTTTATGCACACCAAGGACTTTATGAAACCCTAAATACCTGGTTTTAAACAGTGGATTAATGGTGAGTAGAAACAAATGTTCTTGTCTGGTGGCCATAATACATGGTGCAACTCTCTATGTCCTAAAATGATGCTTAACAGTAAATGTGCCTTTCTCACATCGTTACTTACAACCTAGCTATTTACAAATGTTATTCCAAAGTATAT------ - -a -s mr.mrrefChr0 128674 497 + 130230 CTATGGATGATAAAATAGCTTTGTAGGACTTTTTTTGGTCCACATGAAAAGGGTCATAATCTGGTCATCCATCCATATCCATTACAGAATACAGGATATTCTATCTCTTGTAGTCCTATTTACTGAAATATACCACTTAGACAAAATAGTGTACAAATGGAGTGAATACATGGTATACCAATGTGAGGGATGTACATGTGTTCATATGCATGGATTCTGGCTAATGTACTTCCAAAAAGTATAAAAATTAATTACACCAATTTAACCATGGTCATACAGTTCATATAGTTATAGACCAAGTCTGAGGACGCTCAAGTTGTACGAATTCCAGTATGATTTCCCCTCGACAAACCAAAACTGTCTGCACTTCCAAAGTGGGGTGGAACAAGAACTAGGTGTTCTATCTCTACATCACCACATATCCAAGCTTATGTCAGTCTAACTAAATCATGATTCTCTGCTTTTGTCTCCCTTCTAATAGCCTGACACGCTTTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 134397 491 + 636262 CTATGGATGATAAAATAGCTTTGTAGGACTTTTTCTGGTCCACATGAAAAGGGTCATAATCTGGTCATCCATCTATATCCTTTACAGAATACAGGATACTCTATCTCATGTAGTCCTATTTACTGAAA-ATACCACTTAGACAAAAGAGTATACAAATAGACTGAATACATGGTATACCAATGTGGGGGATGCACATGTGTTCATATGCATGGATTCTGGTCAATGTACTTCCAAAAAGTATAAAAATTGATTACACCAATTTAACCATAGTCATACAGTTCATATAGTTATAGACCAAGTCTAAGGACGCTC--GTTGTACGAATTCCAGTATGACTTCCCCTTGACAAACCAAAATTGTCTGCACTTCCAAAGTGGGGTGGAACTAGG---AGGTGTTCCATCTCTACATCAGCACATATCCAAGCTTATGTCAGTCTAACTAAATCATAATTCTCTGCTATTATCTCCCTTCTAATAACATGACACACTTTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 513099 486 - 647215 TTAAGGATGATAAAACGGCTTTGTAGGACTTTTTTTAGTCCACATGAAAAGGGTCATAATCTGGTCATCCATCCATATCCACTACAGAATACAGGATATTCTATCTTTTGTAGTCCTATTTACTGAAATATACCTCTTAGAAAAAATAGCGTACAAATGGAGTGAATACATGGTATACCAATGTGATGGAGGTACATGTGGACATATGCATGGATTCTGGCTAATGTACTTCCAAAAGGTATAAAAAGTAATT-TGCTAATTTAATCATGGTCGCTCAGGTTATATGGCTATAGACCAAGTCTGAGCAGGATCAAGTTGTACCGATTCCACTTTGATTTCCCCTCCACAAA-CAAAACAGTCTGGAATTCCACAGTGGGGTGGACCAAGAACTAGGTGTTCTATCTCTACATCACCACATCTCCAAGCTTATGACAGTCTAACTATATCATG---------TTTTGTCCCTCTCCTAACAGCCTGACAAGCTTTAAT - -a -s mr.mrrefChr0 129171 9 + 130230 TTGAACAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 513591 9 - 647215 TTGAACAAG - -a -s mr.mrrefChr0 129180 38 + 130230 TTACTACTTTAATTTGGCAGGGGACTGGTGCATGGGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 513603 38 - 647215 TTACTACTTTAATTTGGCAGGGGACTGGTGCATGGGGT - -a -s mr.mrrefChr0 129218 21 + 130230 ATGAGGGCTAGGATCTTTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 134888 20 + 636262 -TGAGGGCTAGGATATTTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 513642 21 - 647215 ATAAGGGCTAGGAGCTTTGGG - -a -s mr.mrrefChr0 129239 359 + 130230 CTGAACAATTGATCTCCTATAGTACATCCTAAACTCACTCCCAGGCATAGTAAGCAACTATATCTGGCAAGGCCTTCTGCCATTTTCTACTGTGTTCTTTAATTAGACCTGAAGTTTTCTGAGGATCTGTCACATTTGGCTTGGCTGAATTCTCAGGTTCTCAAGTTGAAATTGTTCTGATTAATTTTCACTCTTCTTATGGTAACCCTCAATACATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTACATACATGCATGGCTGGGGGTCTACCTTTATGCATCACACTGGGTGGGCTGATTGGGTTTTGCTGTAGAAGGGGCCCAGGATAGTTGGGAATGTTATGATCACTTTGTCCTTGTTAGAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 134910 359 + 636262 CTGAACAATTGAACCCCTATAGTACATCCTAAACTCACTCCTAGGCATAGTCAGCAACTATATCTGGCAAAGCCTTCTGCCATTTTCTACTGTGTTCTCTAATTAGACCTGAAGTTTTCTGAGGATCTGTCACATTTGGCTTGGCTGAATTCTCAGGTTCTCAAGTTGAAATTGTTCTGATGAATTTTTACTCTTATTATGGTAACCCTCAATGCATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTCCATACATGCATGGGTGGAGGTCTACCTCTATGCTTCACACTGAGTGGGCTGATTGGGTTTTGCTGTAGAAGGGGCCCAGGATAGTTGGGAATGTTATGAGCACTTTGTCCTTGTTAGAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 513663 359 - 647215 CTGAACAGTTGATCTCCTATAGTACCTCCTAAGCTTACTCCCAGGCATAGTAAGCAACTATATCTGGCTAGCCCTTCCGCCATGATCTAATGTGTTCTTTTAATAGACCTGAAGTGTTCTGAGGATCTGTCATGTTTGGCTTGGCTGAATTGTTAGTTTCTCAGGTTGAGATTGTTCTGACTAATTCTCACCCCTCTTATGGTAACCCTCAGCACATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTACATACATGCATGGCTGAGGGTCTGCTTTTATGCATCACACTGGATGAGCTAATTGGCTTTTGCTGTAGAAGTGACCCAGGATAGTTGGGAAAATAATCATCACTTTGTCTCTGTTACAAAG - -a -s mr.mrrefChr0 129598 125 + 130230 CCTTCTCAGGCTCTGACAATCAGGCATAACACAGCTAGTTAATCAATCCTTGATGTGCTCAGCTGTGAATGGGAGTGGGATCTTGAAGGAAGTTGGTTAATAAAAAGTATATCAACTCAATTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135275 125 + 636262 CCGTCTCAGGCTCTAACAATCAGGCATAACACAGCTAGTTAATCAATCCTTGATGTGCTCAGGCGTGAACGGGAGTGGGATCTTGAGGGAAGTTGGTTAATAGAAAGTATGTCAACTCAGTTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 514022 125 - 647215 ACTTCTCAGTCTCTGACACTTGGGCATAACTCAGCTAGTTAATCAATCCTTGATATGCTCTGCTGTTAATGGGAGGGGGATCTTGAAGGAAGTTAGTTAATAAAGAGTAAATCAACTGAATTAAT - -a -s mr.mrrefChr0 129723 87 + 130230 GTGCCAAAATAATGTTTGCTTGTCTATAGCACAAATACAACGGAAAAGTAACAGAATGTATAAAGCACCCTGCAAGATTTAAAAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135400 87 + 636262 GTGCCAAAATAATGTTTGCTTGTCTATAGCACAAATACAATGGAAAAGTGACAGAATGGATAAAGCACGCTGCAATCTTTAAAAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 514150 87 - 647215 GTACCAAGATAATGTTCCCTTGTTTGTAGCATGAATACATCTGAAAAGTAACAGTATGTATAAATCACCCTGTGAGATTTAAATGCG - -a -s mr.mrrefChr0 129810 62 + 130230 GGGGTTTTGACATTAGATGTACGCACCCTGCAATCACCCTGGGGTGTTGTTATATATATCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135487 62 + 636262 TGGGTTTTGACATTAGATGTACGCACCTTGCAATCACCCTGGGGTGTTGTTATATATATGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 514253 62 - 647215 GGCGTTTCGAAATTAGATGTACGCACCCTGCAATCACCCCGGGGTGTTGTTATATATATCTC - -a -s mr.mrrefChr0 129872 104 + 130230 AGGATGTCTCAACCTGCTCACATCTCTCAACTTGGGGTCTAAGGGCCTGTCTTCATATAAATAACTAGGACTACTTAATTTGAACAAATGAAAAACAGACAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135550 102 + 636262 AGGATATCTCAACCTGCTCACATCTCTCAACTTGGGGTCCAAGGGCCCA--TTCATATAAATAGCTAGGACTACCCAATTTGAATAAACAAAAAACAGACAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 514315 104 - 647215 AGGATGTCTCAACCTGCTCACATCTCTCACCTTGGGGTCTAAGGGTCTGTCTTCATATAAATAACTAGGATTACTTGATTTGAACAAATGAAAAACAGACAGAT - -a -s mr.mrrefChr0 129976 105 + 130230 GGATAATTTTCTAGAGGGTAACAACCATCTGCCATACAATTAGCATTCTCCTAACGTAGGAGGGACAGGAGAAAGTGTAGGCCTACAGATTTTCAGTACAGGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135652 105 + 636262 GGATAATTTGTTAGAGGGTTACAACCATCTGCCATATAATTAGCATTCTCCTAACGTACAAGGGACGGGAAAAAGTGTAGACCTACAGATTTTCAGCACAGGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 514426 105 - 647215 GGATAACTTTCTAGAGGGTAACAACCAACTGCCATACAATCAGCACTCTCCTAATGTAGGACAGACAGGGGAGAGTGTAGGCCTACAGATTTCCAGTACAGGGGG - -a -s mr.mrrefChr0 130081 11 + 130230 CATTCTTATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135757 11 + 636262 CATTCTTATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 514535 11 - 647215 CATTCTTATAA - -a -s mr.mrrefChr0 130092 80 + 130230 TCCCACTCTTTGGTTTCTCAGGAGTTGCCTCTTGGGCTAGGTTAGGTGAAACCTTTAAGGTCAGCTAGCCTGTTCAGGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135771 80 + 636262 TCCCACTCTTTGGTTTCTCAGGAGTTGCCTCTTGGGCTAGGTTAGGTGAAACCTTTAAGGTCAGCTAGCCTGTTCAGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 514546 80 - 647215 TCCCACTCTTGGGCGCCTCATGAGTTGCCTCTGGAGCTGGATTTGGTGAGACCTTTTAGGTCACCTAGCGTGTTCAGGGC - -a -s mr.mrrefChr0 130172 50 + 130230 ATGAGGAGTAGACGAAAGTGCCACTAGTGAAAAGTACCTACATAATTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135851 50 + 636262 ATGAGGAGTAGACGAAAGTGCCACTAGTGAAAAGTACCTACATAATTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 514627 50 - 647215 ATGAGCAGCAGATGGAAGCGCGACAGGTGAAAAGTATATACATAATTGTG - -a -s mr.mrrefChr0 130222 8 + 130230 ACATCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135902 8 + 636262 ACATCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 514677 8 - 647215 GCATCTCA - -a -s mr.mrrefChr1 0 107 + 670 TACTATGTGTCCATGGAGTTATGACAGGTTTGAGTCTCCAAACACCAGGAATCTGTTTGATCCTGAGGGTTTGTAATTTTCTATTCCAAGCCACCATCCAAAAGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635573 82 + 636262 TACTATGTGTCCATGGAGTTATGACAGGTTTGAGTCTCCAAACACCAGGAATCTGTTTGATCCTGAGGGTTTGTAA-------------------------AAGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 613 107 - 647215 TACTACATGGCCATGGAGTTTTACTGGGTTTGAGTCTCCAGGCGCCAGAAACCTGTTCGATCCTGAGGTTTTGTAATTTTCTATTCCAAGCCACCATCCAAAAGGGA - -a -s mr.mrrefChr1 107 22 + 670 TATCTGTACTAGATGCCTCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635659 22 + 636262 TGTCTCTACTAGTTGCCTCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 720 22 - 647215 TATCTGTACTAGATGCCTCATC - -a -s mr.mrrefChr1 129 44 + 670 CAGGAGGTTATCTGTGCTTGATACCTGCCATTAGTGTGAAATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635684 44 + 636262 CAGCAGATTATCTGTGCTTGATACCTGCCATTAGTGTGAAATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 742 44 - 647215 CAGGAGGTTACGTATGCTTCATATCTGCCAGTAGTGTGAAATGG - -a -s mr.mrrefChr1 173 218 + 670 CTATTCTTACTGCGACCCACTTGAGTAGTATTGATGTGATCTAGTGGCCATCCTGATAACAGACGAGATGCCAAGGATTAGAAGCGAAAAATTTAAAACTAATTTGAACACAAGATGAGAACCTATAAGTTGGCCAAAGACAGTGAGAAATACCCTGAACCAACCTAGGTGCCAACAATCTCTACAGTTCAGTGCCTGAGATTCAAGAGAGGCCCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635728 215 + 636262 CTATTCTTACTGTAACCCAATTGAGTAGT---TATGTGATGTAGTGGCCATCCTGATAACAGACGAGATGCCATGGATTAAAAGTGAAAAATTTAAAACTTATCTGAACACAAGATGAGAACCTATAAGTTGGCCAAAGACAGTGAGAAATACCCTGAACCAACCTAGGTGTCAACAATTTCTACAGTTCGGTGCCTAAGATCCAAGAGAGGCCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 787 218 - 647215 CTATTCTTACTGCGACCCACTTGAGTAGTATTGATGTGCTCTATTAGCCATCCTGATAACAGACAAGATGCCAAGGGTTAGAAGCAAAAAATTTAGAACTAATTTGAATACAAGACGAGAACCTATAAGTTGGCCAAAGACAGTGAGAAATGCCCTGCACCAACCTAGGCGCCAACAATCTCTACAGTTTAGTGCCTGAGGTTCACAAGTGGCACAGA - -a -s mr.mrrefChr1 391 101 + 670 CTCTTTTGACCCCTTTGCTAGCTGTAACTACGATATTATGACATTTGGCAGTATGACCCTCACACTGAGACTTTAGAACTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635943 101 + 636262 CCGTTTTGACCCCTTTGCTAGCTGTAACTACGATATTGTGATGTTTGGCAGTATCACCCTCACACTGAGACTTTAGATCTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 1007 101 - 647215 CTCTCTTGACCCCTTTGCTAGCAGTAAATACAATACTATGACATTTGGCAGTATGACCCTCACACTGAGACTTTAGAACTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA - -a -s mr.mrrefChr1 492 62 + 670 ATGAACCACTCAAGAACATTATGAGCCTTATAGGGACAACATATTATTAACCTCATGGAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 636055 62 + 636262 ATGAACCACTCAAGAACATTATGAGCGTTATAGGGACAACATATTATTAACCTCATGGAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 647041 62 + 647215 CAGTACCACTCAAGAACATTATGAGCCTTATAAGGACAACACATTGTTAGCCTCATGGAGAC - -a -s mr.mrrefChr1 554 116 + 670 ATTGCCAAAGATGTATTAAATACTGTTATCCCATGTTATATTCACAAACAACTCTCATCCCAACAAATGCTTTGTACACATTAAGACTCACAAATTGAAGACACTGTTGTGAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 636146 116 + 636262 ATTGCCAAAGATATATTGAATACTGTTATCCCATGTTATATTCACAAACAACTCTCATCCCAACGAATGCTTTGCACACATTAAGACTCACAAATTGAAGACACTGTTGTGAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 647103 112 + 647215 ATTGCCAAAGATGTATTAAATACTGTTATCCCATGTTATATTCACAAACAAC-CTCATCCCAACAAATGCTTTGTACACATTAAGACTTACA---TAAAGACATTGTTGTGAGAAT - -a -s mr.mrrefChr2 0 16 + 16 CCTATAGTATAGGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 370394 16 - 647215 CCTATAGTATAGGGTG - -a -s mr.mrrefChr3 0 202 + 181019 ACTGTCCTTATACAGCTTTTTGTGTCTATCCTGGTGAAAAAATTAAGCTGATTGGAGCTCTAGTGGCGTAAAAGAAATCAGAATGGGAATCATACATACAAGGGGGCTTGGTTTCACTCCCTGCAACTACTTTAGATACAGCTAAGAAGGAAAGATAGGACTTGAGGGCTAGGATGCTCCACACTGTTGTGTTTTAACCTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 441679 201 + 636262 ACTGTCCTTATACAGCTTTTTGTGTCTATCCTGGTGAAAAAATTAAGCTGATTGGAGCTCTAGTGGCGTAAAAGAAATCAGAATGGGAATCATACATACAGGGGGGCTTGGTTGCACTCCCCGCAACTACTTTAGA-AAATTTAAGAAGGAAAGATAGGACTTGAGGGCTAGGATGCTCCACACTGTTGTGTTTTAACCTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 453762 202 + 647215 GCTGTCCCTATACAGCTTTTTTTGTTTATCCTGTTTAAAAAATTAAACTGGTTGGAGCTTTAGTGGCATCCAGGAAACCAGAATGGGAGTCATACATACAAGGGGGCTTGGGCTCACTGCCTGCAACTACTTTAGATACAGCTAAGAAGGAAAGATAGGACTGGAGGGCTAGCATGCTCAACACTTTTGTGTTTTAACCTGC - -a -s mr.mrrefChr3 202 47 + 181019 AACACCCAATCCATCACCTACCTCACCTTATCAATACGTTTTACTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 441880 47 + 636262 AACACCCAATCCATCACCTACCTCACCTTATCAATACGTTTTACTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 453965 47 + 647215 AACACCCAATCCATCACCTCCCTCACCTTGTCGATTTGTTTTACTGT - -a -s mr.mrrefChr3 249 74 + 181019 CTGGTAGGAGTGCACACTTTTTGCCTTATTTGACAGGACACTGACTTTTTCTCTTTGTTGTCAGTAATGTTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 441929 74 + 636262 CCGGTAGGAGTGCACACTTTTTGCCGCATTTGACAGGACACTGACTTTTTCTCTTTGTTGTCAGTAATGTTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 454012 74 + 647215 CTGGTAGGAGAGCACACTCTTTCCCTTATTTAACAGGACACTGACTTTTTCTATATGTTGTCAGTAATATTGCG - -a -s mr.mrrefChr3 323 151 + 181019 CCTCTCTGTTACTTCTCATCGAGTTTTGTTTGAAGCTACTCCTTTCGAACAGTCTTTAATTGTCCAAACTGAATGAAACAAAGCATAAACATACGTTATATTCATGGCTGCTGGTCATCTAATTACAGAGAGTGATAAGGTAGATAACTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442003 151 + 636262 CCTCTCTGTTACTTCTCATCGAGTTTTGTTTGAAGCTACTCCTTTCGAACAGTCTTTAATTGTCCAAACTGAATGAAACAAAGCATAAACATACGTTATGTTCATGGCTGCTGGTCATCTAATTACAGAGAGTGATAAGCGAGATAACTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 454087 146 + 647215 TCTCTCTGTTACTGCTCATTGAGTTTTGGTTGAAACTACTCTTTGTGAACAGTCTTTAATTATCCAAACGAAATGAGACAAAACATACACATACCTTATATTCAT-----CTGGTCATCTAATTACCAAAAGAGATAAGGTAGATAACTCA - -a -s mr.mrrefChr3 474 303 + 181019 CCTTCCCTATATTTCCATCCTAGTGGCATAGTAGCTTTCGTGGAGCCATCTGCTGGGGGCCCAGGACTCAGTTGCAGCAGCTTAAGAAATCTCAACAACCTTAGACCCCCTAGCCTTAAATAGTGTATAAAGTGATGCTTGTTTCCAGAAATAACTTAGAACAACAAGGGTGATTAACATTACTCATGTTAGGTTCTGTTGGGTACTATACTGGGAAGAATGCATATAGTCAGTACATTCATACGCTGAATACCTGGGCAGGAAAGGATCCATCTTGGAAGAAGATCTGCCTTAAAGAACAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442164 274 + 636262 CCTTCCCTATATTTCCATCCTAGTGGCACAGTAGCTTTTGTGGAGCCATCTGCTGGGGGCCCAGGACTCAGTTGCAGCAGCT----AAATCTCAACAACC-TAGACCCCCTAGCCTTAGATAGTGTATAAAGTGATGCTTGTTTCCAAAAATAACTTAGAACAACAAGGGTGATTAACATTACTCATGTTAGGTTCTGTTGGGTACTATACTGGGTAGAGTGCATATAGTCAGTACATTCATACGCTGAAAACCTGGGCAGGAAAGGATCCATCTTGAA------------------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 454233 303 + 647215 CCTTCCCTATATTTCCATCCTAATGGCATAGTAGCCTTCATAGAGCCATCTGCTGGGGGCCAAGGACTCAGTTGCAGCAGCTTAAGAAATCTCCACAACCTTAGACTCCCAAGCCTTAAATAGTGTATCAAGTGATGTATGCATCCAGAAATAACTTAGAACAATAAGGGTGATTAACATTACTCATGGAAGGTACTGTTGGGTACTATACTGGGAAGAATGCATATAGTCAGTACATTGATGTCATGAATACCTGGACAGGATGGGATCCATCTTTGAAGAAGATCTGCCTTAAAGAACAGG - -a -s mr.mrrefChr3 777 123 + 181019 ATCGTTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442438 119 + 636262 ----TTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 454537 123 + 647215 ATCGTTGTGATAAGGACCTGTAGTGTACCCACAGCACAGCATTAAAAGTCAGAGGTTAATGGGGTTGATAATTTTTTCTGTGGTGTGGGGCAGTTTTATAATACAGTTAGTGAGCCGCAGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 900 63 + 181019 AATAAAAGGATCACACATTAATGTTGCACCAATGGCACCAACCAGTGATACAGATCCAGCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442559 63 + 636262 AATAAAAGGATCACACATTAATGTTGCACCAATGGCACCAACCAGTGATACAGATCCAGCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 454660 63 + 647215 AATAAAAAGATTGCACATTAATGTTGCACCAACGGCACCGGCCAGGGATACAGATCCAGCATG - -a -s mr.mrrefChr3 963 27 + 181019 GTTCAACTCTCTATTACACATCAAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442625 27 + 636262 GTTCAACTCTCTATTACACATCAAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 454723 27 + 647215 GTTCATCTCTCTATTACACATCAAACC - -a -s mr.mrrefChr3 990 19 + 181019 CAGTAATGAAAGAGTCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442654 19 + 636262 CAGTAATGAAAGAGTCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 454750 19 + 647215 CATTAATAAAAGAGGCTCA - -a -s mr.mrrefChr3 1009 156 + 181019 TTTACAGTGTGAGAGATGCATTAGCATAGCATAACTCATAAGGATGGATGGTCATTTCTGTCTGATATGGGCTTGTAACATCCTACTATATAGGGCTGACTAAAGTCAATATTACAATGTGTAGGTAGTACAAAAACTGATTCTCAATTACTTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442674 156 + 636262 TTTACAGTGTGAGAGATGCATTTGCATAGCATAACTCATAAGGATGGATCGTCTTTTCTGTCCAATATGGGCTTGTAACATCCTACTATATAGGGCTAGCTAAAGTCAATATTATAATGTGTAGGTAGTACAAAGACTGATTCTCAATTACTTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 454769 155 + 647215 TTTATGGTGTGAGAGATGTATTAGCATAGCATAACACATAGGGATGG-TGGTCATTTTTGTCTGATATGGCCGTGTACCATCCTACTATATAGGGCTGATTACAGTCAACATTACAATGTGCAGGTAGTACAAAAACTGATTCTCAATTACTTTCT - -a -s mr.mrrefChr3 1165 491 + 181019 GCTTCTTACAAGGGGTGCCTTGCGGCACCCTGGGTAGAGACCCATACACATATACACCACGGAAACCATGGTCGACCAAATGATCTTAATAAGACTGGCAAATGTTTCTTCAAAGGGCTAAATAGGCAGCCTACTATAACAGCTAAGGGGCTCACGCATTAATCAGTATCCATGTGCTGTATGCACATAGAATTCTTACTTAAGGAAGGATATGATAGCTTAGTTTGAATGCAATAGCCTCACATGATCAAATTGTACTTTCAAGTGAGGTTCCACAGCAATAAAATGGAGTAGACTGACCTTTGGAAAGACACTTTACACTCCGTCAGGTCAATATTGTCTTAAGTTACATCTCAGGACAGCCCTTTTCCCACTCAAGCCGGAGTTATAACTACACTCAGCAGACCAGCAAAACCAGAAGCCATTAGTATCAATACACCAACGCGGCGGGAAAGTACATGGGCTTGCGGGTGCTCCGCCGCCACGTTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442830 468 + 636262 GCTTCTTACAAGGGGTGCCTTG-------CTGGGTAGAGGCCCACACACATATACCCCACGGAAACCATGACCGTCCAAATGACCTTAATAAGACTGGCAAATGTTTCTTCAAAGGGCAAAATAGGCAGCCTACTATAACAGC-AAGGGGCTCACGCATTAATCAGTATCCATGTGCTGTATGCACATAGAATTCTTACTTAAGGAAGGATATGATAGCTTAGTTTGGATGCAATAGCCTCACATGATCAAATCGTACTTTCAGGTGAGGTTCCACAGCAATAAAATGGAGTAGACTGACCTTTGGAAAGTCACTTTACACTCTGTCAGGTCAATACTGTCTTAAGTAACATCTCAG--CAGCCCTTTTCCCACTCAAGCCAGAGTTATAACCACACT---TGGACCATGAAAA-------CCATTAGTATCAACACACCAACGCGGCGGTAAAGTGCATG---TTGCGGGTGCTCCGCCTCCACGTTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 454925 480 + 647215 AATTTTTAGAAGGGGTCCCTTGCGGCACCCTGGTAAGAGACCCATATATATATACACCACGGATAGCAAGGTGGACCAAATGATCTTAATAATACTAGCAAATGT-----------GCTAAATGGGCAGCCTACTATAACAGCTAAGGGGCTCATCCTTCAATCAGTATCCAAGTGCTGTATGCACATAGAACTCTTACTTAAGGAAAGATATGCTAGCTTAGTGTGAATGCAATAGCCTCACATGAACAAATTGTACTTTCAAGTGAGGTTCCACGGCTATAAAATGGAGTAGACTGACCTCTGGAAAGAAACTCTACACTCCGGCAGGTCAATATTGTCTTAAGCTACATCTCAGGACAGCCCCATTCCCACTCAAGCCGGAGTTATAACTACACTCAGCAGGCCAGCAAAACCAGAAGCCATGAGTATCAATCCACCAACGCGGCGGGAAAGTACATGGGCTTGTGGGTGCTCCGCCGCCACGTTTTC - -a -s mr.mrrefChr3 1656 79 + 181019 GCCGGTCGTGATGCTCGCGTTCATGTCCGCAGGACCCGCCCGGGGCCCTACTCCCTTGACCAACGATATCTCGTCGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443298 79 + 636262 GCCTGTCGTGATGCTCGCGTTCATGTCCGCAGGACCCGCCCGGGGCTCTACTCCCTTGACCAACGATATCTCGTCGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 455475 73 + 647215 GCCGGTCGTGATGGTCGTGTTCATGTCCGCGAAACCCGCCCGAGGCCCCACTCCCTTGACCAACGTTATCACG------ - -a -s mr.mrrefChr3 1735 57 + 181019 GGACGGGCGGAAACTGAATGTTGCATTTTCCGCGCAATGGAGACGTGCTATATCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443378 57 + 636262 GGACGGGCGGAAACTGAACGTTGCATTTTCCGCGCAATGGACACGTGTTATATCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 455548 53 + 647215 ----GGGTCGAAACTGAATGTTGCACTTTCCGCGCAATGGAGATTTGCTACATCAGA - -a -s mr.mrrefChr3 1792 146 + 181019 TGTCATAGGTCAAAATATTCCGGTCGATGGGGCGGCTAAAGCAATTCATGCGTTGGCCTTTTAAATAACCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATCTACTGATTGGTTGACTTGCAACAGTCCCATAGTGATTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443435 146 + 636262 TGACATAGGTCAAAATATTCCGGCCGCTGGGGCGGCTAAAGCAATTCATGCGTTAGCCTTTTAAATAGCCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATGTACTGACTGGTTGACTTGCAACAGTCCCATAGTGATTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 455602 146 + 647215 TGTCAAAGGTCGAAATACTCCGGTCGATGGGGCGGCTAAAACAATTCATGCGTTGACCTTTTGAATAACCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATCTACAGATTGGTCAACTTGCAACAGTCCCATAGTGGTTTGA - -a -s mr.mrrefChr3 1938 30 + 181019 AACAAGCCACAGTTCCATAGTGGTTTAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443589 30 + 636262 AACAAGCATCAGTCCCATAGTGGTTTAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 455748 30 + 647215 AACAAGCCACAGTTCCATAGTGGTTTGACA - -a -s mr.mrrefChr3 1968 417 + 181019 AGCAAGAATGTCCTGTCCTATCTGGTCCGTATCACCTCTGTGATCTATAGACATCTCAGATTCAATACATTAATAGACTTAAATTGGGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGACAGCCTAGCACTGCAGTGAGGAACATGGGCCTAATGTCTTCATACCATAGCATAACCATTTCGTATATAATTTGGCTATGAAGATATAGTTTTAATGTGACCCAGCTAAAGAATTGGAAGTCAAATTACTGGGCTCACCAGTGATCGGTGTTACACGATCGGTTTGTATAGTTGCATGCCTCAGCACTAGGCATGTTTGCAAGCCTAACCAAGGCTACAAGAAAGAAGGCAAAACAGGAGGATTACTGGGCTATAGCAACATAGTACTACATGACCAGGTGGAGCAATGCAAAATTTCTGCATGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443633 416 + 636262 AACAAAAATGTCCTGTCATATCTGGTCCGTATCACCCCTGTGATCTATAGACATCTCAGATTCTATACATTAATAGACTTAAATTGGGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGGCAGCCCAGCACTGCAGTGAGGAACATGGGTCTAATG-CTTCATACCATAGCATAACCATTTCGTATATAACTTGGCTATGAAGTTATGGTTTTAATGTGACCCAGTTAAAGAATTGGAAGTCAAATTACTGGGCTCACCAGTGATCGGTGTTACACGATCGGTTTGTATAGTTGCATGCCTCAGCACTAGGCATGTTTGCAAGCCTGACAACGGCTACAAGAAAAAAGGCAAAACAGGAGGATTACTGGGCTATAGCAACATAGTACTACATGACCGGTGGGAGCAATACAAAGTTTCTGCACGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 455778 415 + 647215 AGAAAGAATGTGCTGACCTATCTGGTCTGTACCAACTCTGTGATCTACGGACAACTAAGA-GCAATACATTAATGGAC-TAAATTGAGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGACAGCCTAGCACTGCAGTGAGGAACATGTGCCTAATGTTTTCATACCATGTCTTTATCACTTCGTATCTAATCTGGCTATGAAGATATAGTGTTAATATGACCCAGCGAAAGAATTGGAAGTCTGATTACTAGGCTCACCAGTGGACGGTGTTGCATGTTCCGTCCATATAGCTGCATGCCTCAGAACTAGGCATGTCTGCAAGCCCAACCAAGGCTACAAGAAAGAAGGCAATGCAGGAGGATTACTGGGCTATATTAACATAGTACTACATGACCAGGTGAAGTATTGCAAAATTTTTGCATGCCT - -a -s mr.mrrefChr3 2385 489 + 181019 GTGTTAGCTGGTCCAGACAAGCCTTAAGTTTAGATTATGAATACTGGATCTAACCTAACAGAGATACCTGGAGATAGTACTAGGGTCCGTAATTGAAGTTAATTTCAGTAGCTAACAATAATGCCTGCATGATGGCATGAAAACATTGTTGGCTTTATGTTCACATTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCACAGCTTGCATTACCTCCTTTATATTGGCTGGAATCTTACAACAAACAATATGCGGACCTCATTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGACACTAATACTTCGACATCAAGCATAGGCCTCAGGGAATGCTGTTTCCCAGTGTGCACAAAAAAATTCTTAACACTCCTTTAATCATGGGTGCATGGTAGACGAATTTCTTAAATAAACTGTTGTGTTGTCTCAGTATCTGATGTTGGGTGTGGGAATGATAAGTTTAAGCCTCGCACTCTTAGTCCCATTGTCAGCCTGACTTATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444050 446 + 636262 GTGTTAGCTGGTCAAGACAAGCCTTAAGTTTAGATTGTGAATACTGGATCTAGTCCAACTGAGATACCTGGAGACAGTAGTAGGGTCCGTAATTCAAGTTCATTTCAGTAGCCAATAGTAATGCCTGCATGATGGCATGGAAGCATTGTTGGCTTTACACTCACATTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCACAGCTTGCATTACCTCCTTTATATTGGCTGGAGTCTTACAACAAACAATATGCGAACCTCCTTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGACACTGACAC-TCGGCATCAAGCATAGGCCTCAGGGAATGCTGTTTCCCAGTGTGCACAAAAAAATCCTTAACACTCCTTTAATCATGGGTGCATGGTAGACGAATTTCTTAAATAAACCGTTGTGTTATCTCAGTATCTGATGTTGGGTGTGGGAATGGTAAGTTT------------------------------------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 456193 489 + 647215 GTGTTGGCTGGTCCAGACAAGCCTTAACTTTAGATCATGAATACTGGATTTAACCTTACAGAGATACCTTGAGATAGTACTTGTGTCTGTAATTGAAGTTAACTTCAGTAGTTAACAATAATGCCTGCATGATGGCATGAAAACATTCTTGGCTTTATGTTTACACTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCCCAGCTTGCATAACCTCCTTTATATCGGCTGGAATCTTACAACAAACAACATGTGGACCTCATTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGCCACTAATACTTTGACATCAAGCATAAGCCTCAGGGAATGCTGTTTACCTGTGTGCACAAAAAAATTGTTAAGACTCCTTTAATCATGGCTTCATGGTAGACAAATTTCTTGAATAAACTGTTGTGTTGTCTCAGCATCTGATGTTGGGTGTGGGTATGATAAGTTTAAGCCTCGCACTCTTAGTCCCATTGTCAGCCTGACTTATATG - -a -s mr.mrrefChr3 2874 386 + 181019 AGAGTGATAGCCCACCATGATCCTTCAATGCTCCTTATTTGTGATCTGGTGGATTGGTAAATGTGTATATCATATCCTGGGAGAGGGTTGGTTGCAGGCTTTTCTTCAGTGCCAGGGCAATAGAAATTTTAGCAGTTTAGTATCTACGTTAAATTATCTTTAACATCACAAATTATAACAGTGAGGTGTACTGTACATGGTACTCTTATCACAGCAGTAATAAGAAATCTAGGGACAGTGTATGGTAATTCTCAGTACTGTATGCTTGTGGTGAACATGTGCTACTCCTGTCTACCCCTTTTCCAAGTGCTGAATCGAGTTAACCAAGATTCTATATATAGTCCTTATTTTTGCCATCCTATGTACAGGATGTAGCATGCATGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444496 335 + 636262 -------------------------------------------ACCTGGTGGATTGGTAAATGTGCATATCAACTACTGGGAGATGGTTGGTTGCAGGCTTTTCTTCAGTGCTAGGGCAATAGAAATTTTAGCAGCTTAGTATCTACGATAAGTTATCTTTAACATCACAAATTATAACAGTCAGGTGTACTGT-CATGGTACTC-TATCACAGCAGTAATAAGAAGTCTAGGAACAGTGTATGAGAATTCTCAGTACTGTAAGCTTGTGGTGAACATATGCTACTCCTGTCTACCCCTTTTCCAAGTGCTGAATCAAGTTAGCCAAGATCCTATATGTAGTCCCTATTTTTGCCATCCTATGTACAGGATGTAGCATGC------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 456688 363 + 647215 AGAGTGATAGCCCACCATGATCCTTCAATGCTCCTTATTTGTGATCTGTTGGATTGGTAAATGTGTATATCATATCCTTGGAGAGGGTTG----CAGGCTTTTCTTCAGGGCCAGGGCGAGCAAAATTTTGGTGGTTTAGT-------TTAGATTATCTTTAACATCACAAATTCTGACCGTGAGGTGTACTGTACATGGTACTTTTATCA---CAGTAATAAGAAATCTAGAGACAGTGTATGGTAATTCTCAGTACTGTATGCTAGTGGTGAACATGTGCTACTCCTG--------TTATCCAA-TGCTGAATGGAGTTAACTGAGATTCTATATATAGTCCTTATCGTTGACATCCTATGTACAAGGTGTAGCATGCATGGCA - -a -s mr.mrrefChr3 3260 112 + 181019 GGAGCAACTGGAAATTCCTGGAATGTGTTTCAATCTTGATCCACTTAACCTGTATGACATTTTGCTGAGTACATCTCGGGATATATTCACAGACTGAAGTCGGCAATTCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444831 100 + 636262 ------------AATTCCTGGGATGTGTTTCAATCTTGATCCACTCAATATGAATGGGACTTTGCTGAGTACATCTTGGGGTATATTCACAGACTGAAGTTGGCAATTCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 457052 111 + 647215 GGAGCAACTGGAAATTCCTGGAATGTGTTTCATTCTTGATCTACTTAACCTGTACGACATTTTGCTGAGTACGTCTCGGGATATATTCATAGACTGAAG-CGGTAATCCACA - -a -s mr.mrrefChr3 3372 9 + 181019 ACTGAAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444932 9 + 636262 ACTGAAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 457163 9 + 647215 ACTGAAGTC - -a -s mr.mrrefChr3 3381 44 + 181019 CATTGTGCAGCTATCATTGTCAGGTAATTCTGAGCAGGCCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444943 44 + 636262 CATTGTGCAGCTATCATTGTCAGGTAATTCTGAACAGGCCCGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 457172 44 + 647215 CATTGTGCAGCTAGTACTGTCAGGTAAATCTGAGCAGGCCTAAG - -a -s mr.mrrefChr3 3425 56 + 181019 TACCCATTTCAAGGCAGTTGAAAGATTTGAGTGGAAAGTGTCACCTCCATGTAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444987 56 + 636262 TTCCCATTTCAAGGCAATTGAAAGATTTGAGTGGAAGGTGTCACCTCCATGTAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 457226 49 + 647215 TACCCATTTCAAGGCGGTTTGAAGATTTG-------AGTGTCACCTCCATGTAACA - -a -s mr.mrrefChr3 3481 73 + 181019 CTTCTTGAGAATCCAAGTCCTAATTACTGCCCTATATGTGTGGATTTAATGTGTCAGGATTAGGTCACAAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445043 71 + 636262 CTTCTTAAGAATCCAAGTCCTAATTACTGCCCTATATGTGTGGCTTTAATGTGTCAAG--TAGGTCACAAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 457278 73 + 647215 CCTCTTGAGAATCCAGGTCCTAATTACTACCCTATATGTGTGGATCTAATGTGTCAGGATTAGGTGACAAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 3554 85 + 181019 AAGGACCTAACAAAGCCAACTTACTTCGCTAAATAGATCCTGTCTTACCCAAAGCAATATATTCTTGTTCATAATAAGTAATTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445115 85 + 636262 AAGGACCTAACAAAGCCAACTTACTTCACTAAATAGATCCTGTCTTACCCAAAGCAATATATTCTTGTTCATAATAAATAATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 457351 85 + 647215 AAGGACCTAACAAAGCCAACATACTTTGCTAAATGGATCCTGTCTTATCCACAGCAATATATTCTTGTCTATAATAAGTAATCAT - -a -s mr.mrrefChr3 3639 43 + 181019 AGAAGTTCCAGACATAATTGACATGTTTCCAATGTCTTACTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445200 43 + 636262 AGAAGTTCCAGACATAGTTGACATGTTTCCAATGTCTTACTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 457527 43 + 647215 AGAAGTACCAGACATAATTGACATGTTTCCAATGGCTTACTGG - -a -s mr.mrrefChr3 3682 50 + 181019 ATGCACAGGTTAAAGGGTCACCAGCATTTCTGAGAGTGGGTTCATAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445245 50 + 636262 ATTCACAGGTGAAAGGGTCACCAGCATTTCTGAGAGTGGGTTCATAATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 457570 50 + 647215 ATGCACAGGTTAAAAGGTCACCAGCATTTCTATGGGTGGATTCACAAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 3732 54 + 181019 TCAGCTGCTGGCGAAAGTTTACCCTCTATCTCACTCAACTGCTAGGCCTAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445296 54 + 636262 TCGGCTGCTGGCGGAAGTCTACCCTCTATCTCACTCAACTGCTAGGCCTAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 457620 47 + 647215 TCAGCGGCTGGCGAAAGTTTACCCTCTATCTCATTCAACTGC-ATGCT------ - -a -s mr.mrrefChr3 3786 60 + 181019 AGAATTGGCCCTAGTATTGGCTAGTCCCCTTGGTTTATATCACTTTAGATCCCACTTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445351 59 + 636262 AGAATTGGCCCTAGTATTGGCTAGTCCCCTTGGCTTATATC-CTTTAGATCCCACTTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 457667 60 + 647215 GGAATTGTCCCTAGTATTATCTAGTCCCCTTGGTTTATATCACTTTAGATCCCACTTCAG - -a -s mr.mrrefChr3 3846 157 + 181019 TCCCACTTCAAGCAACATGTAAGTTCCATAGAAGTGCTTATCACATCTAGTTTCAAAATTCTCTAAACCTATAACTACAGAGGCATACAACCCTCTTCTGCAGGCTTCCAAACAAAGGAAGAGACCTGCTGTGGTGGGCTCATCAGTCACTCTCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445410 154 + 636262 TCCCACTTCAAGCAACATGTAAGTTCCATAGAAGTGCTTATCACATCTAGTTTCAAAATTCTCTAAACCTATAAGTATAGAAGCATACA---CTCTTCTGCAGGCTTCCAAACATAGGAAGAGACCTGCTGTGGTGGGCTCATCGGTCACTCTCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 457728 157 + 647215 TCCCACTTCATGCAACATGTAAGTTCCATACGAGAGCTTATCACATATAGTTTCAGAATTCCCTAGGCCTATAACTACACAGGCATACAACCCTTTTCTACAGGCTTCCAAACAAAGGAACAGACCTGCTTTGGTGTGTTCATCAGACATGCCCTAG - -a -s mr.mrrefChr3 4003 70 + 181019 CCTGGATTGTGTTTAGTGGCATTACAATAATTGCCCCAATGATTCCCATGGGGGTTTCAAGTCATACTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445566 70 + 636262 CCTGGATTGTGTTCAGAGGCATTACAATAATTGCCCCAATGATTCCCATGGGGGTTTAAAGTCATACTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 457885 70 + 647215 TGTGGATTGTGCTTGGTGGCATTACAATAATTGCTCCAATGATTCCCATGGGGGTTTCAAGTCAAACTTC - -a -s mr.mrrefChr3 4073 131 + 181019 TTCTCAATTTCTAAGTGAAAGGTTTTCTATGCCACCTACCCTGGTCCAGAACATCTCAGTAGCGATCAGTGATGTAGAAAAATGAATCATTATCAATCAACTGTGGGAGTTGATTGGTGGAGATTCCTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445637 131 + 636262 TTCTCAATTTCTAAGTGAAAATTTTTCTATGCCACCTACCATGGTCCAGAACATCTCAGTAGCGGTCAGTGCTGTAGAAAAATGAATCATCATCAATCAACTGTGGGAGTTGATTGGTGGAGGTTCCTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 457955 115 + 647215 --------TTCTAAGTGAAAGGCTTTCTATGCCACCTACCCTGGTCCAGATCATTTCAGTAGCGATCGGTGATGTAGAAAAATGAATCATTAT--------TGTGGGAGTTGATTGGTGGAGATTCCTATG - -a -s mr.mrrefChr3 4204 14 + 181019 TGTGAGAGTTTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445892 14 + 636262 TGTGAGAGTTTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 458070 14 + 647215 GGTGAGAGTTTAGT - -a -s mr.mrrefChr3 4218 4 + 181019 CATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445906 4 + 636262 CATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 458094 4 + 647215 CATG - -a -s mr.mrrefChr3 4222 4 + 181019 GAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445910 4 + 636262 GAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 458106 4 + 647215 GAAA - -a -s mr.mrrefChr3 4226 22 + 181019 CATCAAACTTTGAGTTGGAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445914 22 + 636262 CATCAAACTTTGAGTTGGAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 458117 22 + 647215 CATCAAACTGTGAGTTGGAGAT - -a -s mr.mrrefChr3 4248 138 + 181019 TACTAAACTAATTTTCACAGCTAAGAGGTTCAGTCACAAGGTGCAATAGTGATTTTAATGATATTATCTATTGTTTAATTATTCCATGATCAGATACAATGAAGATGTCTGAGACAATCTATCCAACCTGCAAACAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445936 138 + 636262 TACTAAACTAATTTTCACAGCTAAGAGGTTCAGTCACAAGGTGCAATAGTGATTTTAATGATATTATCTATTGTTTAATTATTCCATGATCAGATACAATGAAGATGTCTGAGACAATCTATCCAACCTGCAAACAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 458142 138 + 647215 TACTAAACTAATTTTCATGACTCAGAGATCCAGTCACAAGCTGGAATAGTGATTTTAATGATATTATCTATTGTTCAATTATTCTATGACCAGATCAAATGCAAATGTTTGAGACAATCTAGTCAACCTGTAACTAAT - -a -s mr.mrrefChr3 4386 52 + 181019 GCAAATTACTTCTAACATGTAGTGTAAGGAGGCAGTGAAGGGCTCCATGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446074 52 + 636262 GCAAATTACTTCTAACATGTAGTGTAAGGAGGCAGTGAAGGGCTCCATGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 458281 52 + 647215 GTAAATTATCTCTAACATGTAGTTAAAGGAGCCAGTCAAGGGCTCAGTGATG - -a -s mr.mrrefChr3 4438 78 + 181019 TTTATATTATTGGTACAAAGAGAGGGGGGTCCCAGTTTTAAGGATTTCGGGTGATGAGTTCCTTAATGTTATTTAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446127 78 + 636262 TTTATATTATTGGTACAAAGAGAGGGGGGTCCCAGTTTCAAGGATTTCGGTTGATGAGTTCCTTAATGTTATTTAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 458333 78 + 647215 TTTATATTTTTGGTACAAGAAGAGGGGGGTCCCAGTTTTAAGGATTTCAGGTCATGAGTTCCCTAATGTTGTTTAGAT - -a -s mr.mrrefChr3 4516 93 + 181019 TTCGAACAAGGTCTCATGCAAAGCTCCAAAAAAAGGCAAATGTGGCTATGTACACATGGTTAGTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCACGTGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446219 93 + 636262 TTCGAACAAGGTCTCATGCAAAGCTCCAAAAAAAGGCAAATGTGGCTATGTACACATGGTTAGTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCACGTGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 458411 93 + 647215 TTCGCACAGGGCCTCATGCAAAGCTCCAAAAAAAGGCAAATGTGGCAATGTACACATGGTTAGTGCTTGGCCATGGGCCTGCCCCGTACGGCC - -a -s mr.mrrefChr3 4609 12 + 181019 TGTACACTCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446313 12 + 636262 TGTACACTCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 458504 12 + 647215 TGTGCACACAGT - -a -s mr.mrrefChr3 4621 24 + 181019 TAGTACTTGGCTATGAGCCCACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446325 24 + 636262 TAGTACTTGGCTATGAGCCCACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 458525 24 + 647215 TAGTGTTTGACTATGAGCCTGCCC - -a -s mr.mrrefChr3 4645 75 + 181019 actaGGGGATTAGCAAATATCAGCTGCTTTGATAATAGGGAGTGATATTCTTCAAAAAAGACTTTTGGGTAGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446355 74 + 636262 ACTAGGGGATTAGCAAATACCAGCTGCTTTGATAATAGGGAGTG-TATTCATCAAAAAAGACTTTTGGGTAGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 458549 71 + 647215 ----GGGGATTAGCAAATATCAGCTGCTTTGATGATAAGGAGTGATTTTCTTCAAATAAGACTTGTGGGTGACTT - -a -s mr.mrrefChr3 4720 74 + 181019 AAACTTCTGGCATGGATCTCGGCTGCTGCATCAGGTGTCAACCCTGCAGCCTTGACAGCATACAGAGAGACCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446429 74 + 636262 AAACTTCTGGCATGGATCTCGGCTGCAGCATCAGGTGTCAACCCTGCAGTCTTGACAGTATGCAGAGAGACCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 458632 71 + 647215 AAATTTCTGGCATGGATCTCGGCTGCTGCATGAGGTGTCAGCCC---AGCCTTGACAGCCTACAGAGAGATCAG - -a -s mr.mrrefChr3 4794 221 + 181019 TTACCTTTTAAGAGGCTAGAACCTACACAGGGAGGTAATAGTAGCAAGAAGTTCTATAACTGCCCAAAGGGAGCCCAAAGGGAAAGCACATGGAGGTGCTTGACTTTAAGATTTTAAAAATGGGGTGAACACATGCAACATCATGTGCAATTAGCAGCTGGGATCTAGCATCCCTAGCACTTATCCAAGGTATGCATCAATCAATCATAGACAGTTATACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446507 221 + 636262 TTACCTTTTAAGAGGCTAGAACCTACACAGGGAGGTAATAGCAGCAAGAAGTTCTATAACTGCCCAAAGGGAGCCCAAAGGGAAAGCACATGGAGGGGCTTGACTTTAAGATTTTAAAAATGGGGTGAACACATGCAACTTCATGTGCAATTAGCAGCTGGGATCTAGCACCCCTAGGATTTATCCAAGGTATGCATCAATCAATCATAGACAGTCACACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 458703 219 + 647215 TTA--TTTTAAAAGGGTACAACCTCCACAGGGAGGTAATAGTAGCAAGAATTTCTATAACTGCCCAAAAGGAGCCAAAAGGGAGAGCACATGTAGGTGCTTGACTTTAAGATTTTAAAAATGGGGTGAACACATGCAACATGATGGGCAATTGGCACCTGGGATCTAGCATCCCTAGCACTTACCTAAGGTATGCATGAATTCATCATACACAGTTATACT - -a -s mr.mrrefChr3 5015 143 + 181019 AAATAACTAGTATCACTGGATTGATCTACTGTAACAGAACTGTTATCAGTCCCAGCTATAACAAACGTAATGAATACCTCATACACAGTCCTAATAGAATTGCACGTCATCTGGAAAGTAAGCTTCACAACATTACTTGTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446778 142 + 636262 AAATAACTAGTATCACTGGATTGATCTACTGTAACAGAACTGTTATTAGTCCCAGCTATAATAAACCTAATGAATACTTGATACACAGTGTTAATAGAATTGCA-ATCATCTGGAAAGTAAGCTTCACAACATTACCTGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 458922 139 + 647215 AAATAACTAGTATCACTGGATTGATCTACTGTCATAGGAATGTTATCAGTCCCAGCTATAACAAAAGTAATG----CCTCATGCACAGCCCTAATAGAATTGCACGTCATCTGGAAAGTAAGCTTCACAACATTACTTGTTCT - -a -s mr.mrrefChr3 5158 109 + 181019 CTTATGGAGTGGTATCCTCCCATAGGATGGTATAATTAAAATTTCTTCCTCTTCACTCCATTCCCTATCCAGTACCATTGCTCACTTCACGTTATAGTGGTTTGCTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446920 105 + 636262 CTTATGGAATGGTATCCTCCCATAGGATGGTATAGTTAAAATTTCTTCCTCTTCACTCCATTCCCTATCCACTATCATTGCTCACTTCATGTTATAGTGGTTTGC---- -s simRat_chr6.simRat.chr6 459093 109 + 647215 CTCATAGGGTGGTATCCTCCCATAGAATGGCATAATAAATATTTCTTCCTCTTCACTTCATCTTCTATTCAGTACCATTGCTCAATCTACGTTATAGTGGTTTGCTTAC - -a -s mr.mrrefChr3 5267 68 + 181019 TAGGATGACTCCCTCTCCACTCTGCAGAGTATCCAGCATGTGACTTCCTGAGCCATGTTGCATCCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447025 68 + 636262 TAGGATGACTCCATCTCCACTCAGCAGGGTATCCAGCATGTTACTTCCTTAGCCATGTTGCATCCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 459203 63 + 647215 TAAAGTAACATGCTGGATACTCTGCAGAGT-----GGAGATGGAGTCCTGAGTCATGTTGCATCCCAA - -a -s mr.mrrefChr3 5335 78 + 181019 ACTAGAAGGTTCAGAAGGCAATGTATTAGTACGCTGTGAGTTATATGGAACTATAACCTGACAAGCATTGCAGCCTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447099 73 + 636262 ACTAGAAGGTTCAGAAGGCAATGTATTAGTA----GTGAGTTATATGGAACTATAACA-GACAAGCATGGCAGCCTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 459266 69 + 647215 ACTAGAAGGTTCAGAACACAATGTATTCGTACGCTGTGAGTGATAT---------ATCTGTCAAGCATTGCAGCCTAG - -a -s mr.mrrefChr3 5413 35 + 181019 TTTAGGTTTAGAACTGAGTCTGTGTTAACTGGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447173 35 + 636262 TTTAGGTTTAGAACTGAGCCTGTGTTAACTGGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 459335 34 + 647215 TTTAGGTTTAGAACTGAGTCTGTG-TAATTTGTAG - -a -s mr.mrrefChr3 5448 48 + 181019 TGACAGAGATATAGAATCTGTAGATAAGAGAAGGACTCATTTGATGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447208 48 + 636262 GGGCAAAGACACAGAATCTGTAGATAAGAGAAGGACTCATTTGATGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 459370 12 + 647215 TAAGAGAAGTAT------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr3 5496 90 + 181019 TATTAACTACAAGCTGAATTGGAAATCAGGAAATCATCTTAAATAATTCAAGTGTGATTACAAGTTACTTGTGGGTGCTGGGAGTATTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447258 87 + 636262 TATTGACTATGAGCTAAATCAGAAATCAGGAAATCATCTTAAATAATTCAAGTGTGATTACAAGTTACCTGTGGGTGCTGGGAG---TCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 459382 86 + 647215 ----AACTACAAGCTGTATTGGAAATCAGGCAATCATCTTAAATAATTCAGGTGTGATTACAACTTACTTGTAGGTGCTGGAAGTATTTT - -a -s mr.mrrefChr3 5586 56 + 181019 CCCTTGCAAAGAGAACAGAGGAGGAATAACAAGAGCAACTTTCCTTGAGCATAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447345 56 + 636262 CCCTTGCAAAGAGAACAGAGGGGGAATAACAAGAGCAACTTTCCTTGAGCATAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 459505 56 + 647215 CCCATGCAAAGAGAACAGAGGAGGAATAACAAGAGCAACTTTCCTCGAGCATAAAG - -a -s mr.mrrefChr3 5642 19 + 181019 CATAACACAAGTCTATTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447425 19 + 636262 CATAACACAAGTCTATTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 459561 19 + 647215 CATAATAGAACTCTATTTC - -a -s mr.mrrefChr3 5661 252 + 181019 ATCAATTTTTACGATGTACCTATAGAATCTTTTTTAGCTAATTCAAACAATGTCATCACCAATCTATTCAACTGAGGTGACCACAATGGATTGCTTTATAATAATACATAATTGTGAAAGAAAAGAACCAGGCCAGCAGACCACAATTAAGGTAACTCATGGGGTGCGTGGCTCTGAGGATATAAGCGCAACAGTAGTATGACCACCAGAATATACATGATTCTGATAGGGAGGGGAACGGATACCACAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447444 252 + 636262 ATCAATTTTTACGATGTACCTATAGAATCTTTTTTAGCTAATTCAAACAATGTCATCACCAATCTATTCAACTGAGGTGACCACAATGGATTGGTTTATAATAATACATAATTGTGAAAGAAAAACACTAGGCCAGCAGACTACAATTAAGGTAACTTATGGGGTACGTGGCTCTGAGGATATAAACACAACAGTAGTATGACCACCAGAATATACATGATTCTGATAGGGAGGGGAACGGATACCACAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 459581 248 + 647215 ACCACTTTTTACAGTGTACCTAAAGGATTTCTCTTAGCTAGTTTAGACAATGTCATCCCAAACCTATTCATCTGAGGTGGCCACAATGGATCGCTTTATAATAGTACATAACTATGAAAGAAATGAACCAGGCCGGCAGACCACAATTAAGGTAACTCACGGGGTGTGTGGCTCTGAGGATATAAGTGCAACAGCAGTATGAGCACCAAAATATACAGGATGTTGAGAGGGA----GACAGACACCACAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 5913 28 + 181019 TTTAGACACGCCTGAGTTTGGGAAGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447698 28 + 636262 CTTAGACACACCTGAGTTTGGGAAGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 459829 28 + 647215 TTTAGACATGCTTAAGTCTGGGAAGGCC - -a -s mr.mrrefChr3 5941 75 + 181019 AACTCTATACTAAGTAATGGTACATAAGTGCTGTCGCCTTGCTGGCACAACAGAATGATAAGCAGAACATGTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447727 75 + 636262 AACTCTATACTAAGTAATGGTACATAAGTGCTATCACCTTGCTGGCAGAACAGAATGATAAGCAGAACATGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 459857 75 + 647215 AACTCTATACTAAGTAATCGTACATTATTGCTGTCGCCACACTGGGACAGCAGAATGGTAAGGAGAACATGTCTC - -a -s mr.mrrefChr3 6016 45 + 181019 ATAATAAGTATCCAATCAATCTATCTGTTAAAGGCCAATTCCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447808 45 + 636262 ATAATAAGTATCTAATCAATCTATCTGTTAAAGGCCACACCCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 459932 34 + 647215 -----------CCAATCCTTTTCTTGGTTAATGTAGAATTCCTTA - -a -s mr.mrrefChr3 6061 16 + 181019 GTTAATGTACATTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447854 16 + 636262 GTCAAGCTATAGCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 459966 16 + 647215 GTTAGTGTACATTGTC - -a -s mr.mrrefChr3 6077 64 + 181019 TTTTAAAACCAGCAAGCCTAAAATATCACTTCAAGAAACCCTTACTAGATGATCATAAATCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447878 64 + 636262 TTTCAAAACCAGCAAGCCTAAAATATCACTTCAAGAAACCCTTACTAGATGACCATAAATCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 459982 64 + 647215 TTTTAAAACCAGCAAGCCTAAAATATCACTTCAAGAAATCCTTATTAGATGATCATAAATCTAC - -a -s mr.mrrefChr3 6141 17 + 181019 TCTTGCACCCAGAGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447943 17 + 636262 TCTTGCACCCAGGGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 460046 17 + 647215 TCTTGGGACCAGAGACA - -a -s mr.mrrefChr3 6158 163 + 181019 TCATAGTATCCTTCCTGCTGTATGTTTAAGATCCCAAAATTGATATTCAAGGTTTTGTATCCTTTGTTGTTGGTTTGACTATTATGGGTGGCACAGCGGTGTTTCCATCATCACACGATATTTTGGAGGGCCAACCATGGAGGTTTGCAACTTTGCATCGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447963 162 + 636262 TCATAGTATCCTTCCTGCTGTATGTTTAAGATCCCAAAATTGATATTCACTGTTTTGTATCCCTTGTTGTTGGTTCGACTATTATGGGTGGCACAGCGGGGGTTCC-TCATCACACGATATTTCGGAGGGTCAACCATGGAGGTTTGCAACTTTGCATCGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 460063 162 + 647215 CCATAGTATTCTTGCCGCTGTATGTTTAAATCCCCAAAATTAATATTCGAGGTTTTGTATTCTTTGTCATTCGTTTGACTATTATGGGTGTTACAGCAGTGTTTCCAGCATCACATGAGATTTTGGAGTGCCAAACATGGAGGTTT-CAACTTTGCATCACAC - -a -s mr.mrrefChr3 6321 335 + 181019 CAACAATTATCTAGTATCAGGGTGTATACATTCCAATAAGATACTCAATTGGAATAGGGGACTAATAACACATGAGTTACATGAAAGACCTGAGCTAGGCCCCATGAGAAAGAAGGAAACAAGGTACGTTCTTTACTGGAAGGAAATAGAAGATGAAATCTCTTTTATGGCTGATAGTGAAAGATCACCGGAATAACAACAAGAACAGCATTTATTGTCTTACTTCTATTCTTGTACCAATCTGACTGAATCTCACATAGATAATTATCAACACCCTGACTAATGTATGTGGAACAATGTCCAAAAAGGGAGACCTTGGGGGTTTGAAACAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448142 335 + 636262 CAACAATTCTCTAGTATCAGGGTGTATGCATTCCAATAAGATCCTTAGTTGGAATAGGGGACTAAGAACACATGAGCTACATGAAAGACCTGAGCTAGGCCCCATGAGAAAGAAGCAAACAAGGTACGTTCTTTACTGGAAGGAAATAGAAGATGAAATATCTTTCATGGCTGATAGTGAAAGATCACCTGAATAACATCAATAACAGCATTCATTGTCTTACTTCTATTCTTGTACCAATCTGACTGAATCTCACATAGATAATTATCAATACCCTGACAAATGTATGTGGAACAATGTCAAAAAAGGGAGACCTTGGGGGTTTGAAACAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 460225 312 + 647215 CAACAATTAGCTAGTATCAGGGTGAATATATTCCAATAAGATACTCAATTGGAATAGGGGACTAGTAACACATGAGTTACATGAAAGAC--------------------AAGACGGAAACAACGTACGTTCTTTA---TAAGGAAATAGAAGATGAAATCTCTTTTGTGGCTGATAGTTAAAGATTACCGTAATAACAACAAGAACAGCATTTGTTGTCTTACTTGTATTCTTGTACTAAACTGAATGAATCTCACATAGATAATTATGAACACCCTGACTAATGTATGTGGAACGAGGTCCAAAGAGAGAGACCTTGGGGGTTTGAAACAGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 6656 122 + 181019 AATGGAATGTCAGTTTAGTATTGATATAGCGAACTTTGCTCTTGAAGGCAAAGTCTCTACAATCTGACCAATCAGATAACTGTGGTGGAAACTCAGCCCTCTGCCACGTCCACAATGTGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448477 122 + 636262 AATGGAATGTCAGTTTAGTATTGATATAGGGAACTTTGCTCTTGGAGGCAAAGTCTCTACAATCTGACCAATCAGATAACTGTGGTGGAAACTCAGCCCTCTGCCACGTCCACAATGTGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 460551 122 + 647215 AATGGAATTTCAGTTTAGTATTGATGTAGCGAACTTTGCTCGTGAAGGCAAAGTCTCAACAATTCTACCAATCAGATAACAGTTGTGGAAACTCAGCCCTCCGCCACATCCACAATGTGGAT - -a -s mr.mrrefChr3 6778 138 + 181019 ATCAAGTGAAGAAAAAGCCACAGCCATTCCCTTAAGCTGGGATGGTATGGAACTTTGCCATAAACATAACAACATTTGTTGTTACTGATCTTATATTCTGAAGTGGGACTGTATAAATTTCTAAAATGTACTCTGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448607 138 + 636262 ATTAAGTGAAGAAAAAGCCACAGCCACTCCCTTAAGCTGGGATGGTATGGAACTTTGCCATAAACATAACAACATGTGTTGTTACTGATCTTATATTCTGAAGTGGGACCGTATTAATTTCTAAAATGTACTCTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 460673 138 + 647215 ATCAATTGAAGAAAAAGCCACAGCCATTCCCTTAAGCTGGGATGGCATGGACGTATGCCATAAACATAACAACATTTGTTGTTACTGATCTTATATTCTGGAGTGGGACTGTATAAATTTCTAAAATGTACTCTGAAA - -a -s mr.mrrefChr3 6916 37 + 181019 TGTACTCAATTGAAGGATCTAGTAGTTGTTGAGCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448745 37 + 636262 TGTACTCAATTGAAGGATCTAGTAGTTGTTGAGCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 460812 37 + 647215 TGTATTCAATTGAAGAATCTAGGAGTTTATAAGCCTA - -a -s mr.mrrefChr3 6953 23 + 181019 CAGAGCTTCATAATGGTTAGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448784 23 + 636262 TAGAGCTTCATAATGGTTAGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 460849 23 + 647215 CGGAACTTCATAGTGGTTAGGCA - -a -s mr.mrrefChr3 6976 420 + 181019 GGTAGTTTCTCCCATGGCTTATTGATAATCTAGGCCAAAATAATGCTAGACCATACACCATACTGATGAATTTGTGTAAAGGACTAATGCAGCTATCACTCTTAGCTGTCCCACTTCCATGTGTTCTAGTCTTCTATCCCCCAGTCAGTCTGACGTTCCATGGTAGTTCTCCCACACAATCTGCCATGGTCCAAGCATGCTGGCTGATAAACCCTGACAAAGAATCCACTATCACTCTTAGCTATTAGTTTTAATCATGAGATTTAGTTTTTCATTTCCACATTGGGCTTGCAATCCATCACAGTTCTTTCACACAAGCCACCAACTTCATGAACTGTCAAATTTGAACTTGGACCTGAATGGTTAACCCCAAGTACTACCTGTGGTCCTCATTCTGAGCTTGGAAAATGTGCTGCATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448808 415 + 636262 GGTAGTTTCCCCCATGACTTATTGATAATCTAGGCCTAAA----GCTAGACCATACACCATACTGATGAATCTGTGTAAAGGACTAATGCAGTTATCGCTCTTAGCTGTCCCACTTCCATATGTTCTAGTCTTCTATCCCGCAGTCAGTCTGACGTTCCATGGTAGTTCTCCCATGCAATCTGCCATGGTCCAAGCATGCTGGCTGATAAACCCTGACAAAGAATCCACTATCATTCTTAGCTATTAGTTTTAATCATGAGATTTAGTTTTTCATTTCCACATTGGGCTTGCAATCCATCACAGTTCTCTCATACAGGTTACCAACTTCATGAACTGTCAAATTTGAACTTGGACCTGAATGGTTAACCCCAAGTACTACCTGTGGTCCTCATTCGGAACTTAGAAAATGTGCTGCATC- -s simRat_chr6.simRat.chr6 460872 399 + 647215 GGTAGTTCCTCCCATGGCTTATTGATAATATAGGCCAAAATAATGCTAGACCAT-----GTACTTATGAATTCGTGTAAAGGACTTATGCTGCTATCACTCTTAGCCGTCA-------ATGTGCTCTAGTCTTCTATCCCCCAGTTGTGCTGAAGTTCGATGGTAGTTCTCCCACACAATCTGCCATGGCCGAAGCATGCTGGCTGATTAACCTTGACAAAGAATCCACTAT-GCTCTTAG-TATTAATTTTAGTCATGTGAATTAGTTTTTTATTTCCACATTGGCCCTGCAATCCGTCACAGTTCTTTCACACAAGCCACCAACTTCATGAACTGTCAAACTTGAAGTTGACCTTGAATGGTTATTGCCAAGTACTACCTGTACTCCTCATTCTGAGGTTGG-------GCTGCATCT - -a -s mr.mrrefChr3 7396 4 + 181019 TTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 461272 4 + 647215 TTCT - -a -s mr.mrrefChr3 7400 853 + 181019 AACAAATGCAGAAATTCTACCAAAGTACTCCAAAGATGCCTATCTTGCTATCAAATGGGAAGTTGTTGCAAGAAAGGAGTAGACAAATACTGAAAGGCTGATTGACTGATAGAGGCATTAATCCAGGATATGCACCTTCAGACTCCAGTTCATGGCTAATTTGCGACAACACACCTGCAAGTTACTAAAAATGTGGAGATTATTCACACATCTATGTTTAGATTTCACTGCCAGACTAAAAAGGAGTAGGTAACTAGACATGCACTGATTGTTATGGATATGTTGCATTAAGTTGACACAAGGGGGGGGATGATGATTTACAGATCTTATTAAGGTATTACAGTTTTAGTTGAAAGTACAGCATGACAGCCACAGATACCTTCTAATAAACATTGTCTTGTTTCTCCACCTTGTAATATCAATAGCCATATAGTACATGTCCTGCCCAAATTGTAGCTGTGAAGAGTCCCTATGATCTAGTGACTGGGTCCCATGCATCTTCACAGAACCATTGGGATACTGCTTTACTGGCTGCTTCAGGTGATCGTTGAATACCTGACTTGTTAGTAGCCTGAAGAGTTTGCTGGGTCCCAGCATCCTGCACCTTGACAGGAGAACCTTGAGTTCCAACCTCCTGTACTTTAACAGAGCGTTGTGTCCCAGTGTCTCGAGGCTCCACTGGTCGTTGTGTGCCAGCTTCCCTCACAGCTATTGAGGAGCGCTTAGTCTTGGATTTCTGTGTGGCTACATCTTTAGCAAGGGCTTTCCCCGAACCTTGCAATGTTATGAAACATACCATGTCTATTTGTCTCCACATGAGCTGTAGTGGAAACATGACAGATGATCATTCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 449223 839 + 636262 AACAAATGCAGAAATTCTACCAAAGTACTCCAAAGACGCCTGTCTTGCTATCAAATGGGAAGCTATTACAAGAAAGGAGTAGACAAATACTGAAAGGCTGATTGACTGATAGAGGCATTAATCCAGGATATGCACCTTCAGACTCGAGTTCATGGCTAATTT-------CATACCTGCAACTTACTAAAAATGTGGAGATTATTCACACATCTATGTTTAGATTCCACTGCCAGACTGAAAAGGAGTAGGTAACCAGACATGCACTGATTGTTATGGATATGTTGCATTAAGTTGACACAAGGGGGGGTATGATGATTTACAGATCTTATTAAGGCATTACAGGTTTAGTTGAAAGTGCAGCATGACAGCCACAGATACCTTCTAATAAACATTGTCTTGTTTCTCCACCTTGTAATATCAATAGCCATATAGTACATGTCCTGCCCAAATTGTAGCTGTGAGGAGTCCCTATGATCTAGTGACTGGGTCCCATGCATCTTCACGGAACCATTGGGATACTGCTTTACTGGCTGCCTCAGGTGATCGTTGAATACCTGACTTGTTAGTAGCCTGAAGAGTTTGCTGGGTCCCAGCATCCTGCACCTTGACAGGAGAACCTTGAGTTCCAACCTCCTGTACTTTAACAGAGCGTTGTGTCCCAGTGTCTCGAGGCTCCACTGGTCGTTGTGTGCCAGCTTCCCTCACAGCTATTGAGGAGCGCTTAGTCCTGGATTTCTGTGTGGCTACATCTTTAGCAAGGGCTTTCCCTGAACCTTGCAATGTTATGAAACATACCATGTCTATTTGTTTCCTCATGAGCTGTAGTGGAAACATGCC-------CATTCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 461283 804 + 647215 AAGAACTGCAGAAATTCTACCAAAGTACTCCAAAGATCCCTATCTTGCTA--AAATGGGGATTTGTTGCAAGGAAGGGGTAGACAAATACTGAAAGACTGACTAACTGATAGAGGCATTAAATCAGGAAATGCACCTTCAGACTCCAGTACATGGCTAATTTGCGACAATACAGCTGCAAGTTACTAAAAATGTGGAAACTATTCACACATCCATGTTTAGATTTCACTGCCAGACTAAAAAGGAGTAGCTAACTAGACATGCACTGATTATTATGGATATGTTGCA--AAGTTGATAAAAAGGGAGGGATGATGATTTATAGATCTTATTAAGGTATTACAGTGTTAGTTGAAAGTACAGCATGACAACCACAGATTCCTTCTAATAAACATTG-----------------------------------------ATGTCCCACCC----TATAGTTGTGAAGAGTCCCTATGATCTAGTGACTGGGTCCCAAGCATCTTCACAGAACCATTGGGATACTGCTTTACTGGCTGCTTCTGGTGAGCGTTGAATACCTGACTTGTTAGTGGCCTGAAGAGTTTGCTGGGTCCCAGCATCCTGCACCTTGACAGGAGAACCTTGAGTTCCAACCTCCTGTACTTTAACAGAGCGTTGTGTCCCAGTGTCTCGAGGCTCCACTGGACGTTGTGTACCAGCTTCCCTCACAGCTATTGAGGAGCGCTTAGTCTTGGATTTTTGTGTGGCTACATCTTTAGCAAGGGCTTTCCCCGAACCTTGCAATGTTATGAAATATACCGTGTCTAATTGTCACCACGTGAGCTGTAGTGGAAACATGACAGATGATCAGTCAGT - -a -s mr.mrrefChr3 8253 130 + 181019 TCTTAGACAGGTCATGTATTCCAACAGGTCAATAAGTGTTTAGTGCCCTACCATGATTGGTAAAGAAGACCTGCCTAGCAGATGGAATTAAGACATAAACCATTTCATAGTTTCCACAGCCTTTGAACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450065 130 + 636262 TCTTAGACAGGTCATGTATTCCAACAGGTTGATAAGTGTTTAGTGCCCTACCATGATTGGTAATGAAGACTTGCCTAGCAGTTGAAATTAAAACATAAACCATTTCTTAGTTTCCACAGCCTTTGAACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 462087 129 + 647215 TCTTAGACAGGTCATGTATTCCTACAGATCAACAAGTGTTTAGTGCCCTACCATAATTGGTAAAGAGGACCTGACTAGCAGATGGAATTAAGACATAAACCATTTCAAAGTTTC-ACATCCTTTGAACAA - -a -s mr.mrrefChr3 8383 25 + 181019 CATTACCAGCTCAAACTGACTAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450195 25 + 636262 CATCACCAGCTCAAACTGACTAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 462220 25 + 647215 CATTACCAGCTCAAACTGTCTAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 8408 22 + 181019 ACACAGAAAACCTTTTGCCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450220 22 + 636262 ACACAGAAAACCTCCTGCCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 462246 22 + 647215 ACACGGAAAACCTTTTGCCCAA - -a -s mr.mrrefChr3 8430 494 + 181019 AGCAAGTGATGATAGTCAGCCAGGTTCATAATCATTTTTATGTCTTCCTGGAAGGAAGATCTTCCAAATACCAGGATTTCTGCTTCACCATTAGGATCTAGGCGATTGACATGAACTAAGATTTGAGACATACCCTGGACATGTGGAATACGTTCCCCACCCCGGCCTGTGTGGGATGGACTAGCATGTGCAAGGAAATGATCAGCTTTATTTTGTGCAAGACAGGAGGGCTGCACTAAGTGACCTGCTGATCCACAACTACTCAAGAAAGTTACCACAGATCACAATCACCTCTTACCAAAGATCTTGTCCACCAACCAGACCTCCAGCCGTACTACTTTTGGATTCTTGAGGAACTCTGAGTGAAACCAAGAAAATTGCTGAGGGAGGTGACTGAGCACCTCTACTGGCATTGCCCTAAGCTGCATCAAATGTACAAGCGATGGGCTGGGAGCATCCATAGCAGACAGGCAATCATAAGGTACTTACTTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450289 381 + 636262 AGCAAGTGATG---------CAGGTTCATAATCATTTTTATGTCTTCCTGGAAGGAAGATCTTACAAATATCAGGATTTCTGCTTCACCATTAGGATCTAGGCGATTGACATGAACTAAGATTTGAGACATACCCTGGACATGTGGAATACGTTCCCCACCCCGGCCTGTGTGGGATGGACTA--------------------------------------------------------------------------------------------------------TGACCTCTTACCAAAGATCTTGTCCACCAACCAGACCTCCAGGCGTACTACTTTTGGATTCTTGAGGAACTCTGAGTGAAACCAAGAAAATTGCTGAGGGAGGTGACTGAGCACCTCTACTGGCATTGCCCTAAGCTGCATCAAATGTACAAGCGATGGGCTGGGAGCATCCATAGCAGACAGGCAATCATAAGGTACTTACTTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 462268 488 + 647215 AGCAAGTGATGATAGTCAGCCAGGTTCATAATCATTGTTATGTCTTCCCAGAAGGAAGATCTTCCAATTACCAGGAATACTGCTTCACCATTAGGATCTAGGCAATTGACATGAACTAGGATTTGAGACATACCCTGGACATGTGGAATACGTTCCCCACCCCGGCCTGTGTGGGATGTATTAGCATGTGCAAGGAAATGATCAGCTTTATTTTGTGCAAGACAGGAGGGCTGCACTAAGTGACCTGCTGATCCACAACTACTCAAGAAAGTTACCACAGATCACAATCACCTCTCACC------CTTGTCCACCAACCAGACCTCCAGCTGTACTACTTTTGGATTCTTGAGGAACTCTAAGTGAAACCAAGAAAACTGCTGAGGGAGGTGACTGAGCACCTCTACTGGCATTGCCCTAAGCTGCATCAAATGTACAAGTGGTGGGCCGGGAGCATCCATGGCAGACAGGCAGACATAAGGTACCTGCTTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 8924 148 + 181019 ACTTCGCCTGGAGTCAACCCTGCAAGATTCAACTACTTCCCTAGAAGTGCATCACAGTAGAACTGAGGGATATAAGCAGGCAGGGCCACTATAAGATTATTGAGACTTCTGCTGCAATAGAGACTTTGCAATTAAGCAGTCTTGGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450670 141 + 636262 ACTTCTCCTGG-------CCTGCAAGATTCAACTACTTCCCTAGAAGTCCATCACAGTAGAACTGAGGAACATAAGCAGGCAGGGCCACTATAATATTATTGAGACTCCTGCTGCAATAGAAACTTTGCAATTAAGCAGTCTTGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 462759 148 + 647215 ACTTCGCCTGGAGTCAACCCTGTAATATTCGACTACTGCTCTAGAAATGCATCATAGTACAACTTAGGGATATAAGCAGGCAGAACCACTAAAAGATTATCAAGACTTCTATTGCAATAGAGACGTCGCAATTAAGCAGAGTTGGTGT - -a -s mr.mrrefChr3 9072 91 + 181019 AAGTGTTAGGTCTTTTGCTTAGTTGCTTTTAGCGTTGTGTCTTGGCCCTTATTCGCTTCATACAACCACACAGACACATTTTCAGCTATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450816 91 + 636262 AAGTGTTAGGTCTTTTGCTTAGTTGCTTTTAGCGTTGTGTCTTGGCCCTTATTCGCTTCATACAACCACAGAAACACAGTTTCAGCTATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 462907 90 + 647215 AAGTGTTATGTCTTGTGCACAGTCACTGTTAGTGTTATGTCTTG-CCCTTAGTTGCTTAGCACAACTACACAGACAGATTAACAGCTATAA - -a -s mr.mrrefChr3 9163 53 + 181019 TAACACCATGTCTGTATGAGAATCCATTGTCTTCCAAGGGGAAGCACTTGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450907 53 + 636262 TAACACCATGTTTGTATGAGAATCCATTGTCTTCCAAGGGGAAGGACGTGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 462998 53 + 647215 TAACACCATGACTATATGACAATCCATTGTCTTCCAAGGGGAAGCACTTGTAA - -a -s mr.mrrefChr3 9216 125 + 181019 TGAGTCTACTATTCATTGGGCTAGATGCCTATGTTTACATGTTTCAAACTATAATGCATGTTCTAGTTTAACTTGCTTTGCTTTTCTGCAGGTCATCCCCTCGAGCAGATGAATACTATCTCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450960 124 + 636262 TGAGTCTACTATTCACTGGGCTAG-TGCCTGTGTATGCATGTTTCAAACTTTAATGCATGTTCTAGTCTAACGTGCTACCCCTTTCTACAGGTCATCCCCTCGAGCAGATGAATACTATCTCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 463052 125 + 647215 TGAGTCTACTATTCATTGGGCTAGATGCCTATATTTACACATTTCAAACTATAATGCATCTTCTAGTTTAGGTTGCTTTGCTTTTCTGCAGGTCAGCCCCTCGAGCAGATGAATACTATCTCTAT - -a -s mr.mrrefChr3 9341 96 + 181019 TAATGGCTACAAGGCAACAACAGAAGCTTATTAGGTGTAAGATCCGAGAGACATCTCTATGACTACTAATCTCCAAGAACTATAATCTGCAGCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451084 95 + 636262 TAATGGCTAC-AGGCAAGAACAGAAATTTATTAGGTGTAAGATCCGAGAGACATCTCTATGACTAGAGATCTCCAAGAACTATAATCTGCAGCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 463192 79 + 647215 TAATGGCTACAAGGCAACAACAGAAGCTTACAA-----------------ACATTTCTATGACTACTAATCCACAAGAACTATAATCTGCAGCTCT - -a -s mr.mrrefChr3 9437 9 + 181019 CAGCTCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451183 9 + 636262 CAGCTCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 463271 9 + 647215 CAGCTCATA - -a -s mr.mrrefChr3 9446 193 + 181019 CTCGGATTCTGTACTATGAATTTACAGAACCCTGGTATAGGTCTGTGAAAATGTTGTCATGTTAATTTCATTACTGTCATATCATGATGAATTAATCCCTGTGCTGTCCATAGAAGTTAATAGGCTAGGCATAAATACACAGATCTTGTTTTGGGTCTTAAGATGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451193 193 + 636262 CTCGGAGTCTGTACTATGCAATTACAGAACCCTGGTATAGGGCTGTGAAGATACTGTCATGTTAATTTCATTATTGTCATATCATGATGAACTAATCCCTGTGCTATCCATAGAAGTTAATAGGCTAGGCATAAATAAACAGATCTTGTTTTGGGTCTTAAGGTGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 463280 190 + 647215 CTCGGATTCTGTACTATGAATTTAAAGAACCCTGGTATAGGTCTGTGAAAATGTTGTCATGTTAAGTTTATTACTGTTGTATCATGATGAATCAATTCCTGTGCTGTCCATCGAAGTTAATAG---GGGCATAAATACACAGATCTTGTTCTGGGTCTTAGGATGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT - -a -s mr.mrrefChr3 9639 36 + 181019 CTACTTACCTTGGTGTTTTCCCTCAAGACAAGCGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451388 36 + 636262 CTACTTACCATGGTGTTTTCCCTCAAGACAAGCGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 463470 35 + 647215 CTACTTACCTCGGTGTTTTCCCTCAAGATAAGTGC- - -a -s mr.mrrefChr3 9675 74 + 181019 AGTGGTATGCAAATAAATACTGATAGATTGACATTGATGGAAGTTGAACACATGGGAAGTGACGACTATCTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451433 53 + 636262 AGTGGTATGCAAATAAATACTGATAGGTTG---------------------ATGGGAAGTGATGACTAACTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 463505 73 + 647215 AGTGGTATGCAAATAG-TACTGATAGATTGACATTGATGGAAGTTGAACACATGGGAAGTGACGACTATCTTGA - -a -s mr.mrrefChr3 9749 9 + 181019 CAGGTAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451489 9 + 636262 CAGGTAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 463578 9 + 647215 CAGGGAATG - -a -s mr.mrrefChr3 9758 198 + 181019 TCTTACTAGCCACAGTGAAGATTATCTTGAACCCAGGTAATTATTAAATGTCTTACTAGTCACTGTACTAGGGGAAGCCGGACCAGTTGGGATTCCTAGATATGGGTCAGGTGGTCCCTGTATGCATTTTCATATTCAATAGTTCACATGCGAATGCTCTGTGGAAGCTAATGAGCGATACTGTCTTCTGGTACTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451498 198 + 636262 TCTTACTAGCCACAGTGAAGATTATCTTGAACCCAGCTAATTATTATATGTCTTACTAGTCACTGTACTAGTGGAAACCGGACCAGTTGGGATTCCTAGATATGGGTCAGGTGGTCCCTGTATGCATTTTCATATTCAATAGTTCACATGCGAATGCTCTGTGGAAGCTAATGAGCGATACTGTCTTCTGGTACTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 463595 100 + 647215 CCACACTAGCCACAGTGATGACTATCCTGAACCCAGGCAATTATTAAATGTCTTACTAGTCACTGTACTAGGGGAAGCCTAACCAGTTGGGATTCCTAGA-------------------------------------------------------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr3 9956 64 + 181019 CTTTGGTTGGGACAACCATTAATCATCAACACAAGCTTTTGAGTACATTCTAAAAACTCAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451700 64 + 636262 CTTTGGTTGGGACAACCATTAATCATCAACACAAGCTTTTGAGTACATTCTAAAAACTCAACTT - -a -s mr.mrrefChr3 10020 74 + 181019 TCTAGTGTGAATGTTGTTGAACTCCTGTTTTGTTAATGGTTCAAAAACAGCCTTCCCTTGGTTTAAATAAGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451769 69 + 636262 TCTAGTGTGAATGTTGTTGAACTCCTGTTTTGTTAATGGTTCAAAAACAGCCTTCCCTTGGTTTAAATA----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 463695 5 + 647215 ---------------------------------------------------------------------AGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 10094 22 + 181019 AATCATTATGAGGTATTGCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451838 22 + 636262 AATCATTATGAGGTATTGCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 463724 22 + 647215 AATCATGATGAGGTTTTGCCCA - -a -s mr.mrrefChr3 10116 360 + 181019 CAAATGCTAATGGGTTGACTTAGGGGGGCTACTGCCACAAATATCAGTAGGGTGACATACGGGGACTAGTGTAAGCCCCCTTGTAGACCAAGATAATGACAGATTGCTATAAAATGCATGTGATGTTCATACTATACCAGTATTCAAGGTGTCTCCCTAACTCTATGTTCCCTTTTTGATCTAAGCTCCTGTCTCCCTGTAATCCTTTTCCTGCCCCAGCTTCCCCAGTGTATCAACCAAGAATTGAATAACCTGAATAAATTGCACGATTTCTGTGTATAGCTGGAAACCAGTATATTTATGGTTCACCTGCATTGGTGAACCATTTTCCATAAGTATGTACACCAGCAAAGTAATGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451865 354 + 636262 CAAATGCTAATGGGTTGACTTAGGGGGGCTACTGCCACAAATATCAGTGGGGTGACATACGGGGACTGGTGTAAGCCCCCTCGTAGACCAAGATA---ACAGATTGCTATAAAATGCATGTGATATTCATACTATACCAGTATTCGAGGTGTCTCCCAAATCCTATGTTCCCTTTTTGATCTAAGCTCCTGTCTCCCTGTAATCA---GCCTGCCCCAGTTTCCCTAGTGTATCACCCAAGAATTGGATAACCTGGATAAATTGCACGATTTCTGTGTATAGCTGGAAACCAGTATATTCATGGTTCACCTGCACTGGTGAGGCATTTTCCATAAGTATGTACACCGGGAAACTAATGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 463746 360 + 647215 CAAATACTAATGGGTTGACTTAGGGGGCCTACTGTCGCAAATATCAGTAGGGTGACATATAGGCACTACTGTTAGCCCCCTTGTAGACCAAGATAATGACAGATTGCTATAAAATGCATGTGATGTTCATACTATACCAGTACTCAAGGTGTCTCCCTAACTCTATGTTCCCATTTTGATCTAAGCTTCTGTCTCCCTGTACTCCTTTTCCTTCCCCAGCTTCCCCAGTGTATCAACCAAGAATTGAATCACCTAAATAAATTGCACGATTTCTGTGTGTAGCTGGAAACCAATATATTTATGGTTCACCTGCATTGGTGAACCATTCTCAATAAGTATGTACACCAGCAAAGTAATGGA - -a -s mr.mrrefChr3 10476 396 + 181019 AATTTCTTTTTGTGTGATGTGAAGTGTAGACCCCCGTGGCAAGTACAGAGAGTAGAAGGTATTACTGTGTTTGGGTTTGTGGACTTGAAATGACAATCAGGGATGATCATTGTCCCTTGAAGAGTTGAGCAGTATTTCCACAACTCTTGCCATAGTGATAATTGGCTGTGCTCAGCAGTGCTACTCTATGTCAAGAGTACAACTCCATTAAAAATATGCATGTCTTAACATTGATCATTACTAGGACATGTTATTGAATTTGCCAATTTTGCAGGTGTAGTAATGAAACTAGCTTGCATATGAAGGGACTTGTTTCCTTGTTAAAACAGGAGCAGAGCTGTGAATTTCATTGATCAAATCAGTATAACAACAGGAACAGGGATGTGAATTCTACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 452237 395 + 636262 AATTTCTTTTTGTGTGATATGAACTGTAGACCCCCGTAGCAAGTACAGAGAGTAGAAGGTATTACTGCGCTTGGGTTTGTGGACTAGAAATGACAATCAGGGATGATCATTGTCCCTTGAAGAGTTGACCAGTATTTCCACAACTCTTGCCACAGTGATAATTGGCTGTGCTTAGAACTACTACTCTTTGTCAAGAGTACAACACCATTAAACTTATGCATGTCTTAACATTGATCCTTACTAGGACATGTTATTTAATTTGTCA-TTTTGCAGGTGGAGTAATGAAACTAGCTTGCATACGAAGGGACTTGTTTCCTTGTTAAAACAGGAGCAAAGCTGTGGACTTCATTGATCAAATCAGTATAACAACAGGAACAGGGATGTGAATTCTACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 464106 394 + 647215 AATTTCTCATTGTGTGTTGTGAAGTGTAGACCCCAGAGGTAAGTACAGAAAGTAGATGGTATCAGTGTGTTTGGGTTTGTGGACTTGAAATGACAATCACGAA-GATCATTGTCTCCAG-AGAGTTGAGCAGTATTTTAACAAGTCTTGCCATAGTGGCAATTGGCTGCCCTCAACAGTGCTACTCCATGTCAAGAGTGCAACTCCATTAAAAATATGCATGTCTTAACAATCATAATTACCAGGACTCGTTATTGAATTTGCAAATTTTGCAGGTGTAGTAATGAAACTAGCTTGCTTATGAAGGGACCTGTTTCCTTGTTAAAACAGGAGCAGAGCTGTGAATTTTATTGATTAAATCAGTATAGCAACAGGAACAGGGATGTGAATTCTACAT - -a -s mr.mrrefChr3 10872 53 + 181019 ACATGGGTTCAATCAAAGTAAGAGCCTACATTTTATACACATGAGCTCAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 452632 53 + 636262 ACATGGGTTCAATCAAAGTAAGAGCCTACATTTTATACACATGAGCACAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 464513 53 + 647215 ACATGGGTCCAATCAAAGGAAGAGCCTACATTTTATAGACATGAGCTCAATAA - -a -s mr.mrrefChr3 10925 47 + 181019 CACTCAATACCAATGTCAATGGTCATGTCAAGATGCCTGGTCTTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 452686 47 + 636262 CACTCAATACCAATGTCAATGGTCATGTCAAGATGCCTGGTCTTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 464566 47 + 647215 CGCTCAATACAAACATTAATGCTCATGTCAAGATGCCTGGACTTGCT - -a -s mr.mrrefChr3 10972 77 + 181019 GATTGGTTCAGCTGAAAGAGGTGTAGTGTTTAGAAAATCCTCTTAATGGATGGCATGTTATCCTTAATAAATCAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 452733 77 + 636262 GATTGGTTCAGCTGAAAGAGGTGTAGTGTTTAGAAAATCCTCTTAACAGAAGGCACCATATCCATAATAAATCAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 464614 77 + 647215 GATTGATTCAGCTAAAAGAGGTGTAATGTTTAGAAAAACCTCTTAATGGATGGAATGTTATCCTTAAAAAATTAATA - -a -s mr.mrrefChr3 11049 252 + 181019 AAGTTGGGCACATCAAACAAGAACCATATAATTCCAAAGAGTGGCAATCCTGTGATAGCCAGAGACAATGGGGCTGTCTACAGCCTGGCAGTGTATTCCCAGATACAGCATCAAGGTTTCTATAATCTCAGTAGAGTTATTTTAAATTGGAAAACATGTGGTGAAGTAAAATGTAAACATGTCCTCCTAATCCCTGGCCTTTGCAGAAAATGTTGTCATGATGATATCCTTGACACTTATATCAGCTATCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 452810 247 + 636262 AAGT--GGCACATCAAACAAGAACCATATAATTCCAAAGAGTGGCAATCCTGTGATAACCAGAGACAATGGGGGTGTCTATAGCCTGGCAGTGTATTCCCAGGTGCAGCATCAAGGTTTCTATAATCTCAGTA--ATTATTTTAAATTGGAACACATGTGGTGGAGTAAAATGTAAACATGTCCTCCTGATCCCTGGCCTTTGCAGAAAATGTTGTCATGATGATATCCTTGACACCTATATCAG-TATCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 464692 251 + 647215 AAGTTGGGCACATCAAACTAGAGCCATATAAGTGCAACGAGTGGCAATCCTGTGATAGCCTGCGACAATAGGGCTGTCTACAGCTT-GCAGTGTATTCCCAGATACAGCACCAAGGTTTCTATAATCGCAGTAGAGTTATTTTAAATTGGAAAACATGTGGTGAAGTAAAGTGTAAACCTGATCTCCTAATTCTTGGCCTTTGCAGAAAATCTTGTCATGATGGTACCCTTGACACTTATATCAGCTATCAG - -a -s mr.mrrefChr3 11301 417 + 181019 GTTTTGGAGGTTTCACTCCAATGAGAACCTATGCTAGTTCCTTTCTTCCAAATACACTGACTCTTGTGTATCAGAAACAAACCTGAAAGAAATCGTGAGTGTAACTGATCGGGGTGAGTGGATTAGACATTACATCCATACATATTTACCTGGCCTATACAATAAACTCCCCCTAAAAACTGCAACAAAAATGAAGCCTTTGAGAAACTGTAAGACAAATGAAATGGCTTGTCAGTAGTTGAATAAGCCTAACCAATGCAAAAAATATCCACAGGTCACTTGAAGCTGTGTACCAGGCCTAGCTTGGATTTCCTATCTCTGGCTGATGCTGGTGAGAAGCTCTGCACAGGCACCAATACCAATAGAACACTTGCCCCCTCAGGCAATGGTTACAACCACATGGAAAATTCATCTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453057 389 + 636262 TTTTTGGAGGTTTCACTCCAATGAGAACCTATAATAGTTCCTTTCTTCCAAATACACTG---------------------------AAGTAACCGTGAGTATAACTAATCGGGGTGAGTGAATTAGACATTACATCCATACACATTTACCCAGCCTATACAATAAACTCCCCGTAAAAACTGCAACAAAAATGAAGCCTTTGA-AAACTGTCAGACAAATGAAATTGCTTATCAGTAGTCAAATAAGCCTAACCAATGCAAAAAATATCCACAGGTCACTTGAAGCGGTGTACCAGGCCTAGCTTGAATTTCCTATCTCTGGCTGATGCTGGTGAGAAGCTCTGCACAGGTACCAATACCAATAGAACACTTGATCCCTCAGGCAATGGTTACAACCACGTGGAAAATTCATCTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 464945 413 + 647215 GTTTTGGAAATTTTACTCCAATGAGAACCTATGCTAGTTCCTTTCTTCCAAATACACTGACTCTTGTGTATCAGAAACAAACCTGAAAGAAATCCTGAGTGTAACTGATCAGGGTGCGTGGACTAGACATTACATCCATGCATATTTA--TGGCCTATACAATAACCTCCCCCTAAAAACTGCAACAAAAATGAAGCCTTTGAGAAACCATAATACAAATGAACTGGCTTGTCATTAGTTGAATAAGCCTAACCAATGCAAAAAATATCCACAGGTCACTTGAGGCTGTGTACCAGGCCTAACTTGGATTTTCTATCTCTGGCT--TGCTGGTGGGAAGCTCAGCACAGGCACCAATACTAATAGAACACTTGCCCCCTCAGGCTACGGTTACCACCACATGGGAAAGTCATCTGGA - -a -s mr.mrrefChr3 11718 316 + 181019 TGGCAAAGTCCATCTTGATTATAATTGAGGGACATGTGATTATACAATGGGCATCATGCTACAAAAAGTTGTGGAAACACTCAGTAAGCAGAAAGTTTTTTGGACAGGTGAATGTATCAAAAAATCTACTGCATGACCATGTGATGAGAATATGCAGGTTAAGGGCCAGACTAAACTAATAGGTTTAGTACAGGTGTGAACACTCTTAAATAATTTAGGACAAAGCAACAAGTGGGAAACTATAGGGTACAGGTGTGAACACTCTTTAATAATTTACAACAAAGAAACAAAGAAACAAGTGGTAAACTATAGGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453446 236 + 636262 --------TCCATCTTGATTATAATTGAAGGACATGTGGTTATACAATGGGCAGCATGCTACAAAAAGTTGTGGAAACACTCAGTAAGCAGAAAGTTTATTGGACAGGTGAATGTATCAAAAAATGTACTGCATGACCACATGATGAAAATATGCTGGTTAAGGGCCAGACT---CTAAGATGTTCA-------------------------------------------------------------ACAGGTATGAACACTCTTTGATAATTTACAACAAAGA--------AACAAGTGGTAAACTATAGGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 465362 316 + 647215 TGGCAAAGTCCATCTTGATTATGATTGAGGGACATGTGATTATACAATGGGCATCATGTGACAAAAAGGTGTAGAAATAGTCAGTAAGCAGAAAGTTTTTTGGATGGGTGTATGTATCAAAAAATCTACTGCATGACCATGTGATGAGGATAAACAGGTTAAGGGCCTGAGTAAACTAATAGAAGTTGTACAGGTGTGAACACTCTTAAATAATTTAGGACAAAGCAACAAGTGGGAAACTATAGGGTACAGGTGTGAACACTCTTTAATAATTTACAACAAAGAAACAAAGAAACAAGTGGGAAACTATAGGGAA - -a -s mr.mrrefChr3 12034 116 + 181019 GCAGTCAGCTAGGCTTATTAAAAACCTGGCAGTTTTGAAGGTCAGAATATGGGGGGTGCGACTACAAGCAACTATGGGGAAGCTGGACACTTGGCAGTCAGGACTAGACAAGAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453683 116 + 636262 GCAGTCAGCTAGGCTTATTAAAAACCTGGCAGTTTTGAAGGTCAGAATATGGGGGGTGCGACTACAAGCAACTATGGGGAACCTGGACACCCGGCAGTCAGGACTAGACAAGAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 465678 105 + 647215 ACAGTCAGCTAGGCTTATTAAAGACCTGGCAGTTTTGAAAGTCAGAATATGGGGGGTGCAACTACAAGCAACTATGGGGAAGCTAGACACTTGGCAGTCAGGTCT----------- - -a -s mr.mrrefChr3 12150 28 + 181019 TATGTGTCTAAGCCTGACTTAGCCGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453809 28 + 636262 TATGTGTCTAAGCCTGACTTAGCCGGCA - -a -s mr.mrrefChr3 12178 16 + 181019 CTATCAGACAATCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453847 16 + 636262 CTATCAGACAATCACA - -a -s mr.mrrefChr3 12194 22 + 181019 GGGCTGACAGGCTGCAATGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453867 22 + 636262 AGGCTGACAGGCTGCAATGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 465783 22 + 647215 GGGCTGACAGGCTGCAATGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 12216 344 + 181019 AGTAAAATTTACTCCATGGAAGAATGGAAGATATGATTTGGATTCTCCTGGCTTGGCCTATTTTCTTGTTCTTGCTATGTGGTTTGTGAGATATATGGTGTCCATCAGAAATTATTCTAGTAATCTGATTAGTAGAAAGGGATAAGAAGAATAAGGTTCAACAGTGAGACAAGTTAGGTCCACTAACTAGTTGTTCAGATCACATCCCATGGTTGGAACTCTCTTTCATCTGCCTCTGGGGTCTCTTATTAATAGTTCGATGCTCAGTCAGAGTTGTTTTGGCCTGGTGTCTTTAATGTTTCAATGCATTAAACCCTTAATGCCCCCATCATTGGTACACCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453897 344 + 636262 AGTAAAATTTACTCCATGGAAGAATGGAAGATATGATTTTGATTGCCCTGGCTTGGCCTATTTTGTTGTTCTTGCTATGTGGTTTGTGAGATATATGGTGTCCATCAGAAATTATACTAGTCATCTGATTAGTAGAAAGGGATAAGAAGGGTAAGGTTCAACAGTGTGACAAGTTAGGTCCACTAACTAGTTGTTAAGATCACATCCCATGGTTGGAACTCTCTTTCATCTGCCTCTGGGGTCTTTTATTAATAGTTCGATGCTCAGTCAGAGTTGTTTTGGCCTGGTGTCTTTAACGTTTCAATGCATTAAACCCTTAATGCCCCCATCATTGGTATACCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 465805 343 + 647215 AGTAAAATCTACTCCACAGAATAATGGCAGATGTGATTTGGATTCTCCTGGCTTGGCCTATTCTCTTGTTCTTGCTATGTTGTTCGTGAGA-ATATGGTGCCCATGAGAAATTATTCTAGTAATCTGATCAGCACAAAGGGATCTGACTAATAAGGCTCAACAGTGATACAAGTTAGGTCCACTAACTAGTTGTTCAGATCACATCCCATGGTTGGAACTCTTATTCGTCTGCCTGTGGGGTCTCTTATCAATTGTTCAATCTTCAGTCAGAACTGTGTTGGCCTGGTTTCTTTAATGTTTTAATCCATTAGACCCTAAATGCCCCTGGCATTGGTACACTCAT - -a -s mr.mrrefChr3 12560 82 + 181019 TACTGACAAATACAGTGACTTTCCACAAAAGTGATAAAAAGTAATCATCATAGAAGTTTCAATCATTCTATGGAGGGTTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454241 82 + 636262 TAATGACAAATACAGTGACTTTCTATAAAAGTGATAAAAAGTAATCATCATAGAAGTCTCAATCATTCTGTGGAGGGTTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 466153 82 + 647215 CACTTACAAATACAGTAACTTTCCACGAAAGTGATAAAAAGTAATCATCTTAGGATTTCCAATCATTCCATGAAGGGTTCTT - -a -s mr.mrrefChr3 12642 19 + 181019 TGATGTTATGAGTCATGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454323 19 + 636262 TGATGTTAAGATTTATGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 466241 19 + 647215 TGAAATTATGAGTCATTGC - -a -s mr.mrrefChr3 12661 64 + 181019 CGAGCACCCCTAATAAACCAATGTGGAACCCTACTCAACCAGAGAGAGCCCAACTGTGTTATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454342 64 + 636262 CGAGCACCCCTAATAAACCAATGTTAAACCCTACTCAACCAGAGAGTGCCAAACTGTGTTATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 466276 63 + 647215 CACGCA-CCCTAATAGGCCAATGTGGAACTGCACTTAACTAGAGAGAGCCCATCTGTGTTATGT - -a -s mr.mrrefChr3 12725 26 + 181019 CCTTTATTCTTAGAATCTAGATCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454406 26 + 636262 CCTTTATTCTTAGAATCTAGATCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 466340 11 + 647215 CCTTTATTGTT--------------- - -a -s mr.mrrefChr3 12751 54 + 181019 TGGTGTTTAGATACCAACCTAAGGTGATGTGCTCTCTCCTAGCTTGGTCAGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454440 54 + 636262 TGGTGTTTAGATACCAACTCAAGGTGATGTGCTCTCTCCTAGCTTGGTCAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 466351 41 + 647215 -------------CCCACCTAAGGTCATGTGTTTTCCCCTAGCTTGGTTAGACG - -a -s mr.mrrefChr3 12805 70 + 181019 AACTTTTATGGGCAAACACAGATAGCAATTCCAATGAATATGAGTGTTAACCTGATAAGTAAACTTAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454494 70 + 636262 AACTTTTGTGGGCAAACACAGATACTAATTCCAATGAATATGAGTGTTAACCTGACATGTGAACTTAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 466393 68 + 647215 AACTTTCATGGGC--ACACAGATAGCAATTCCAATGAATTTGAGTGTTAACCTGATAAGTAAACTTAAGT - -a -s mr.mrrefChr3 12875 567 + 181019 AGTTAGTAGCACACTGGGGGACATTCGGGTCTAACCAAGTATGAAAAAGGGAGGTTCCCTCGTGTTTACAAGCCAACCTCCTACCCTGTAGCCTGTTTTGCATCCATGAGTAATTAAAAAATTACTGAAGTGGCACATGCCTTTTTACAATGCCACAGAGATCCTTTAAGTTCTTCTTCTCAACTGTATAGATATTGCGTGCTGTAAATATTCCATTGTTTATGCGGGGCATGTTACATAAACTTCTCAGTCTCAGTCATATATGACAACTTACTATTTAAGCACCCTAATTTGCTGCCCTGATTTCAGCTGCCCTAGCTCCACTCTAGGAGGTCAATGACTGGCATTGACCATGTTTGAACTGGCATTAACCATGTATGAGCCTCAGGTACGTCTTTCTTAATTTTATACTACTATGTATATCAAATAGATGAATAATGCTTGCTTGTAGTGAGAATAAGAAATACCTATATAGCCCCTTACAAATTTTGTCAATACGATTAAGAGTTAGTCCTCTCTAGGGCAATAGGTTAGCAGAAGTAAAATTGTGCTGAAGATGTAAATTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454571 560 + 636262 AGTTAGTAGCACACTGGGGGACATCCGGGTCTAACCAAGTATGAAAAAGGGAGGATCCCTCGTGTTTACAAGCCAACCTCCTACCCTGTAGCCTGTTTTGCATCCATGAGGAATTAATAAATTACTGAATTG------GCCTTTTTACAATGCTGCAGAGATCCTTTAGGTTCTTCCCCTCGACACTATAGATATTGCGTGCTGTAAATATTCTATTGTTTATGCGGGGCTTGTT-CATAAACCTCTCAGTCTCAGTCATATATGACAACTTACTATTCAAGCACCCTAATCTGCTGCCCTGATTCCAGCTGCCCTAGCTCCACTCTAGGAGGTCAATGACTGGTATTGACCATGTTTGAACTGGCATTAACCATGTATGAGCCTCAGGTACGTCTTTCTTAATTTTATACTACTATGTATATCAAATAGATGAATAATGCTTGCTTGTAGTGAGAATAAGAAATACCTATATAGCCCCTTACAAATTTTGTCAATACGATTAAGAGTTAGTCCTCTCCAGGGCAATAGATTAGCAGAAGTAAAATTGTGCTGAAGATGTAAATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 466461 567 + 647215 CATTAGTAGCACATTGGGGGACATTTTGGTCCAACCAAATATGACAAAGGGAGGTTCTCTTGTGTTTACAAGCCAACCTCCTAACCTGTAGCCTGTTTTGCATCCATGGGTAATTAGAAAATCAGTGAAGTGGCACATGCCCTTTTACAATGCCACAGAGATCCTTTAAGCTCTTCTTCTCAACTGTATAGATATTGCGTCCTGTCACTATTCCATTGTTTGTGCTGAGCATGTTATGTAATCTCCTCAGTGTCAGTCATATATGACAACTTACTACTTAGGCACCCTAATTTGCTGCCCTGACTTCGGCTGCCCTAGCTCCACTGTAGGAGATCAATGACTGGCATTAACCATGTTTGAACTGGCATTAACCATGTATGAGCCTCAGGTACATCTTTGTTAGCTTTATACTACTATGTATGTCAAATTGATGAATCATTCTTGCTTGTGGTGAGAATAAGAAATACCTATATAGCCCCTTACAAATTTTGTCAAAACATGTAAAAGTCAGCCCCCTTTAGGGCAATAGGTTAACATAAGAAAAAATGGGCTGAAAATGTAAATTGT - -a -s mr.mrrefChr3 13442 140 + 181019 GTGCTACATCCCCAGTATAAGGTTAGGAAACAACAAAAGTAAAATTCTCTCTTAGGGTTGAGTTGGCAAGTCAACATTGAGAAATCTTCATTGACAATAATTTCTTGCATGAACATTCTGTTATGTCACTCAGAGCAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455131 139 + 636262 GTGCTACATCCCCAGTATAAGGTTAGGAAGTAACAAAAGTAAAATTCTCTCTTGGGGTT-AGTTGACAAGCCAACATTGAGAAATCTACATTGACAATAATTTCTTGCATGCACATTCTGTTATGTCACTCAGAGCAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 467029 140 + 647215 GTGCTACATCCCCAGTAAAAGGTTAGGAAACAAGAAAAGTAAAATTCCCTCTCAGGGTTGAGTGGGCAAGTCAACATTGAGAAATCTTCATTGACAATAATTTTTTGGGTGAACATTCTGTTATGTCCTTAGGATTTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 13582 11 + 181019 CATACCAGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455281 11 + 636262 CATACCAGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 467169 11 + 647215 CATACAAGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 13593 44 + 181019 TAGGATTTGAACATACAAGAATTTCATAAGTAGCCTGTGATCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455292 44 + 636262 TAAGAGTTGAAAATACAAGAATTTCATAAGTAGCCTGTGATCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 467240 44 + 647215 TAGGATTTGAACATACAAGAATTTTATAGGTGGCCTGTGGCCTT - -a -s mr.mrrefChr3 13637 179 + 181019 TCACCATTAGTCCTAGGCTTAGGACCTAAGATAGACCTACAAGGGCCTACCAGTATCACACAAAATAACCAAGAAACAAATATGACCAATCTTCTGTCAGTTGAGAAAAAGCATGTGTTGCTATACGATTTCTCAAACACCTGCCATCTGTGCATGTGTGTGTAAAAATACAGAATCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455336 179 + 636262 TCACCATTAGTCCTAGGCTTAGGACCTAAGATAGACCTACAAGGGCCTACCAGTATCACACAAAATAACCAAGAAACAAATATGACCAATCTTCTGTCAGTTGAGAAAAAGCATGTGTTGCTATACGATTTCTCAAACACCTGCCATCTGTGCATGTGTGTGTAAAAATACAGAATCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 467286 179 + 647215 TTACCATGAGTTCTAGGCTTAAGACCTAGGCTAGACCTACAAGGGTCTACCAGTATCACACGAAACAATCAAGAAACAGATATGATCAATCTTCTGTCAGTTAAGAAAATCCACTTGTTGCTATCTGATTTCTTAACCGCCTGCCACATGTGCATGTATTTGTGAAAATACAGAATTAC - -a -s mr.mrrefChr3 13816 107 + 181019 ATAATGCATGTTCTACACCTGGAGCCACCCTCATGATTTTAGTGCGTCCTAGTCCTGTTGCCGTAATACACATTAGAATGTGCTCCACCAAATGTGATAATGATACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455520 107 + 636262 ATAATGCATGTTCTACACCTGGAGCCACCCTCATGATTTTAGTGCGTCCTAGTCCTGTTGCCGTAATACACATTAGAATGTGCTCCACCAAATGTGATAATGATACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 467465 107 + 647215 ATTATGTATGTTCTACACCTAAAGCCACCCTCATGATTTTAGTGTATCCTAGTCTTGTTGCAGTAATGCACATTATAATGGGCTCCACCAATTGTAATAATGAGACT - -a -s mr.mrrefChr3 13923 31 + 181019 GATGGATGTTTATGCTACTACTTAAGGAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455627 31 + 636262 GATGGATGTTTATGCTACTACTTAAGGAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 467573 31 + 647215 GATGGATGTTTATCCTACTACTTAAGCAATA - -a -s mr.mrrefChr3 13954 299 + 181019 AAGTAAATTGAGTGAGGGTGTATAGAGCTGAAGATCTTAGGCTACAGGCAATGGGTGCCAAAAGTGTTCATTACCTAAACTAAATCATTAAGCACCTGGGACTGTTATTTTTTTTGGATGTGTGTAGGTGTTGGCAACTTAGGGTTTGATCCACATTGAGATCACAGGATATATATTATACTAGTTCAGTCATGGGACACTGCCTTGTTGGGATTGTAAAAGTCATGTCCCAATGGGATAATTCTAGGACAGTGATCTAGGACGGTGCAGATGAACTTCAAGTACATGGAGTCCAAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455667 299 + 636262 AAGTAAATTGAGTGAGGGTGTATAGAGCTGAAGATCTTAGGCTACAGGCAATGGGTGCCAAAAGTGTTCATTACCTAAACTAAATCATTAAGCACCTGGGACTGTTATTTTTTTTGGATGTGTGTAGGTGTTGGCAACTTAGGGTTTGATCCACATTGAGATCACAGGATATATATTATACTAGTTCAGTCATGGGACACTGCCTTGTTGGGATTGTAAAAGTCATGTCCCAATGGGATAATTCTAGGACAGTGATCTAGGACGGTGCAGATGAACTTCAAGTACATGGAGTCCAAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 467604 299 + 647215 AACTAAGTTGATGGAGGGTGCATAGAGACAGAGCTCCTAGGATACAGGCAATGAGTGTCAAAAGTGTCCCTGACTTAAAATAAATTGTTAAGCACCTGGGACTGTTATTTTTTTTGGATGGGTGTAGGTGTTGGCAACTTAGGGTTTGATCCAGATTGAGAGCACAGGATATATACCATACTGGTTCAATCATGGGACACCATTTTGGTGGGATTGTAAAAGTTATGTCTCGATGGAACAATTCAAGAATAGTAATCTTGGAAAGCATAGACAAACTTCAAGTACATCGAGTCCAAAGT - -a -s mr.mrrefChr3 14253 44 + 181019 AAATAGGACCCTTATCTCAGATTATAAGTAAACCCCAACAGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458523 44 + 636262 AAATAGGACCCTTATCTCAGATTATAAGTAAACCCCAACAGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 467923 44 + 647215 TGACAGGACTCTTATCTCAGGTTTTAAGCGAGCCCCAACAGACT - -a -s mr.mrrefChr3 14297 270 + 181019 GTTTATGATTGTTGGAAAGGGCTAACTGGGATTCGTCATCCAAAGATTTGCCTTTGAGCGTTCTAGACCACGGTTTGATACTGGATGTGATGGACCTTGAGCAGTAGATTATCGAGGCATGTGTGGTTATTAGGGAGTCAGTCAATAAACTGAGAATTAAAAATGTCCAGTGGAAAGGGAGTAATGTCAACAGCACAAGCTTATACTGAAATGTTATTCAATAAGTTGTATGGAAGCAGGAATATTAACAGTGACACAACACCTTCTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458568 270 + 636262 GTTTATGATTGTTGGAAAGGGCTAACTGGGATTCGTCATCCAAAGATTTGCCTTTGAGCGTTCTAGACCACGGTTTGATACTGGATGTGATGGACCTTGAGCAGTAGATTATCGAGGCATGTGTGGTTATTAGGGAGTCAGTCAATAAACTGAGAATTAAAAATGTCCAGTGGAAAGGGAGTAATGTCAACAGCACAAGCTTATACTGAAATGTTATTCAATAAGTTGTATGGAAGCAGGAATATTAACAGTGACACAACACCTTCTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 467967 270 + 647215 GTTTGTGATTGTTGGAAAGGGCTAACTACAATTCGTCATCCAAAGATCTGCCTTTGAACAGTCTAGACCATTGTTTGACACTGGATGTGATGGATCTTGACCAGTACATTATTGAGGCATCTATAATCATTACGGAGTCAGTTGATAAACTGAGGATTAAATATGTGCAGTGGAAAGGGAGTAATGTCAACAGCACAGCCTTATACTGAAATGACATTCAATAGAGTGCATGTCAGCAGGAATATTATTAGTGACACAACACCTTCTGAC - -a -s mr.mrrefChr3 14567 10 + 181019 AGTTGCTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458838 10 + 636262 AGTTGCTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 468242 10 + 647215 AGTTGATTTT - -a -s mr.mrrefChr3 14577 9 + 181019 CCAGTGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458849 9 + 636262 CCAGTGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 468252 9 + 647215 CTAGTGGTG - -a -s mr.mrrefChr3 14586 39 + 181019 TTAAACATGATGAAGGCTCTCAGAATTTGAATATGCCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458859 39 + 636262 TTAAACATGATGAAGGCTCTCAGAATTTGAATATGCCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 468261 39 + 647215 TTAAAAATGATGTAAGCTCTCAGAATTTGAACATACAGA - -a -s mr.mrrefChr3 14625 156 + 181019 ATGAGCATTGGTACTCAAGTAACTTTGATTAATGTTCCCATTATTATATTGAGCTGGTATGATCAGGCTAAGCAATGATATGTGAGATGGCCAAAGTAATATGCACTTTGCTCCAGGTGTCTATTTTTGGAACTGAACCTGATGGCAGCATTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458909 156 + 636262 ATGAGCATTGGTACTCAAGTAACTTTGATTAATGTTCCCATTATTATATTGAGCTGGTATGATCAGGCTAAGCAATGATATGTGAGATGGCCAAAGTAATATGCACTTTGCTCCAGGTGTCTATTTTTGGAACTGAACCTGATGGCAGCATTTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 468300 156 + 647215 ATCAGCATTGGTACTCAAGTAGCTTTGATTAATGTTCCCATCATTCTATTCAGCTGGTATGCTTAGGTTATGGAAAGATATGTGACATGGTTAAAGTAATATGTGCTTTGCTCTAGAGATCTATTTTTAGATCTGAATGTGATGGCAGCATTTGGT - -a -s mr.mrrefChr3 14781 57 + 181019 ATAGGGTCACTTTAAGGTTGTGTCTTATCTAGGAGTCAAATTTGTCGACTTGTAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459065 57 + 636262 ATAGGGTCACTTTAAGGTTGTGTTTTATCTAGGAGTCAAATTTGTCGACTTGTAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459193 57 + 636262 ATGCGTCCACTTTAAGGTTGTGTCTTATCTAGGAGTCAAATTTGTCGACTTGTAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 468456 55 + 647215 ATAGGGTCACTTTAAGGT--TGTCTAATCTAGGAGTCAAATTTGTCGATTTGTAAGT - -a -s mr.mrrefChr3 14838 25 + 181019 TGTACAGATGCTATTGGTGCTGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459122 25 + 636262 TGTACAGATGCTATTGGTGCTGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459250 25 + 636262 TGTACAGATGCTATTGGCGCTGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 468535 24 + 647215 AGTATAAATGATATTGGTG-GACTC - -a -s mr.mrrefChr3 14863 41 + 181019 AACGCACAAGCCTGAGATCACATTTTACAAGCATTACTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459152 41 + 636262 CACACACAAGCCTGAGATCACATTTTGCAAGCATGTTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459275 41 + 636262 AACGCACAAGCTTGAGATCTCATTTTACAAGCATTACTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 468559 40 + 647215 AATGC-CAAGCCTGAGTGCACATGTCTCAAGCATTACCCAA - -a -s mr.mrrefChr3 14904 35 + 181019 TACACCTTGATTTCTAAACTATGCAGCATCCAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459316 35 + 636262 TACACCTTGATTTCTAAACTATGCAGCATCCAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 468599 35 + 647215 TATATCTAGATATCTAAACTATGCAACATCCAGAC - -a -s mr.mrrefChr3 14939 33 + 181019 CACCCAGCATGAGATATAACATTTAGAGCTCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459356 33 + 636262 CACCCAGCATGAGATATAACATTTAGAGCTCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 468634 33 + 647215 TGCCCAGCATGAGATATAACATTTAGAGCTCGA - -a -s mr.mrrefChr3 14972 206 + 181019 GTTGTATGAGCTTTTATAACATACCATATGAGTATGTAAACTCATCAAGTTTTAGTACGTACAGACAATCTCCCATAAGTTTCAAGGATGCCCTTCAAGCACTGTCATTTAAACTGCCATTAAAGCTGATGCCATATATAATAACTAGTGGCTATCAAGATTTTTGGTTCTACAAACACTCATGCATTCTGTTGTACATTTTTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459390 206 + 636262 GTTGTATGAGCTTTTATAACATACCATATGAGTATGTAAACTCATCAAGTTTTAGTACGTACAGACAATCTCCCATAAGTTTCAAGGATGCCCTTCAAGCACTGTCATTTAAACTGCCATTAAAGCTGATGCCATATATAATAACTAGTGGCTATCAAGATTTTTGGTTCTACAAACACTCATGCATTCTGTTGTACATTTTTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 468667 206 + 647215 GTTGTATATGCTCTTATAACATACCATATGAGGGTGTAAACTCATCAAGGTTTAGTATGTACAAATAACCCCCCATAAGTTTCAAAGATGACCTTTCAGCTCTGTCATTTAAACTGCTATTAAGACTGAGGCCATCTATGATAATTGGTGGCTATCAAGTTTTTTGGTTCTACAAATACTCATGCATTCTGTTGTACATTTTCGTT - -a -s mr.mrrefChr3 15178 84 + 181019 GGAAATCCCTCCCTTAGCATCTGAATTGTCTTAGCAACATCATTCCTTAATTGGAGGATGCCCACAACAAGATGCACACCTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459597 84 + 636262 GGAAATCCCTCCCTTAGCATCTGAATTGTCTTAGCAACATCATTCCTTAATTGGAGGATGCCCACAACAAGATGCACACCTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 468873 84 + 647215 GGAAATCCCCCCCTTAGCGTCTGAATTGTCTTGGTAAAATCATTCCTTAATGGAAAGATGCCCTCACCAAGAGGCACACCTTAT - -a -s mr.mrrefChr3 15262 51 + 181019 TCCCTGTCTCAGCCTGATCAGTTCATTGAACTTGACATGGAAGAAAATTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459683 51 + 636262 TCCCTGTCTCAGCCTGATCAGTTCATTGAACTTGACATGGAAGAAAATTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 468957 51 + 647215 TCCCTGTCTCAGCCTGATCGGTTAATTGAACTTGACATGGGAGAAAATTTT - -a -s mr.mrrefChr3 15313 61 + 181019 TGCAAGGCTGCCCTTCAATTGCATGGCAACCTTCTGATCAAACCAGTGAACAATCTGATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459734 61 + 636262 TGCAAGGCTGCCCTTCAATTGCATGGCAACCTTCTGATCAAACCAGTGAACAATCTGATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 469048 61 + 647215 GGCAAGGCTGCCCCTCAATTGCATGGCAACCTTCTGATCGAACCAGTGAACAATCCCATAC - -a -s mr.mrrefChr3 15374 225 + 181019 TAGGGCCAAAAATCGAGTTGGTTGAAATTGACAGCCACTTCCCCACAGAGTAAAACAGTTTCATGCCCTGCATGCCACTCCTCAAGTTTGGTGATTCAGAACACTTGCCTATCGTGTCCACATCATCGCTAGGCCAACCAAAAaccttgatgagtctgagttttacaattttcaaatcactactgctggaagggctgcaagcaagttGATTGTCTAAAATGTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459806 225 + 636262 TAGGGCCAAAAATCGAGTTGGTTGAAATTGACAGCCACTTCCCCACAGAGTAAAACAGTTTCATGCCCTGCATGCCACTCCTCAAGTTTGGTGATTCAGAACACTTGCCTATCGTGTCCACATCATCGCTAGGCCAACCAAAAACCTTGATGAGTCTGAGTTTTACAATTTTCAAATCACTACTGCTGGAAGGGCTGCAAGCAAGTTGATTGTCTAAAATGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 469109 225 + 647215 TAGGGCGAAAGATCGGGTTAGTTGAAATTGACAGCCACTCCCCCATAGAGCAAAACAGTTTCATGGCCTGCATATCACTCTTCTAGTGTGGTGATTCAGAACACTTGCCTATCATGTCCACATCATCACTAGGCCAACCAAAAaccttgatgagtctgaactttgcgactttcaaatcactagtgctggaagggctgcaaacaagttGATTTTGTAAAATGATGT - -a -s mr.mrrefChr3 15599 98 + 181019 AAGAGGGAGTAAGTCAGTGACACAACCTTATTGTAAGTTAGACAGTGAAAAGGAGATTCTAACAGCTCCATAGCTTTATGTCAAGATACTTACCTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460032 98 + 636262 AAGAGGGAGTAAGTCAGTGACACAACCTTATTGTAAGTTAGACAGTGAAAAGGAGATTCTAACAGCTCCATAGCTTTATGTCAAGATACTTACCTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 469334 98 + 647215 AAGAGGGAGTAAGTCAGTGACACAACCTTATTGTAAGACAGACATTGAAAAGGAGATTTTAATAGCTCCATAGCTTTATGTCAAGATACTTACCTTAC - -a -s mr.mrrefChr3 15697 9 + 181019 AGTTACACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460130 9 + 636262 AGTTACACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 469433 9 + 647215 AGTTATACT - -a -s mr.mrrefChr3 15706 88 + 181019 AAGCATATAGGAGCCAGTAGGTGGGTCGGGCCATTCATAGTTAAGAGCACACGTGGGGCAAGGAATGTCTTAAGCTGTTGAGAAGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460139 88 + 636262 AAGCATATAGGAGCCAGTAGGTGGGTCGGGCCATTCATAGCTAAGATTACACGTGGGGCAAGGAATGTCTTAAGCTGTTGAGAAGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 469443 88 + 647215 AAGCATATACAAGCCAGTAGGTGGGTCGAGCCATCTATAGTTAAGAGCACACATGGGGCAAGGAATGTCTTAAGCTGTTGAGAAGCAT - -a -s mr.mrrefChr3 15794 154 + 181019 AAAGTTCAGATGACGCAGATGAGACACCGATGGCTGGTAGCGTGAGGCGCCATGTAACCCCAAGCGACTAGGTAAGTTGCAGGTATCTCTTCGGACCAGTCAGAATAGCAACGAAACTGGATGCTCAATCTAACGTTCAGGCCAGCGGGCCCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460233 154 + 636262 AAACCTCAGATGACGCAGATGAGACACGGATGGCTGGTAGCGTGAGGCGCCATGTAACCCCAGGCGACTAGGTAAGTTGCAGGTATCTCTCCGGACCAGTCAGAATAGCAACGAAGCTGGATGCTCAATCTAACGTTCAGGCCAGCGGGCCCGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 469531 149 + 647215 AAAGT-----TGAAAAAGATAAAACAGCGTTGGCTGGTAGCGTGAGGCGTCATGTAACCCCAAGCGATTAAGTAAGGTGCAAGTATTTCTTCGGACCAGTCAGAATAGCAAAGAAATTGGCTGCTCAATCTAACGTTCGAGCTACAGGTCCCGT - -a -s mr.mrrefChr3 15948 64 + 181019 TGGAGATCAGGAGTGAGTCATAGCCAACTGTCTGGTAGTCTGGAGGTGGATTACATAGCACTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460387 55 + 636262 TGGAGATCAATAATAAGTCATAGCTAA---------ACTCTGGAGGTGGATTACATAGCACTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 469682 64 + 647215 GAGAGATCAGGAGTGAGTCATAGCCGACTGTCTGGTAGTCTGGAGATGGATTACATTGCACTTT - -a -s mr.mrrefChr3 16012 156 + 181019 TCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTATAGCTCAACAGGCTCCAATTGTGTAACCTCTAAGCTGTAAGTGACAGAGGGTTAGCTAGTAATATTGAGGATGTTAAAAGACAGGGGGGGAtggctGTGACAATACAAATATATGTGGAATGGAGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460442 156 + 636262 TCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTAGAGCTCAACAGGCTCCAATTGTGTAACCTCTAAGCTGCAAGTGACAGAGGGTTAGCTAGCAATATTGATGATGTTAAAAGATAGGGGGGGATGGCTGTGGCAATACAAATATATGTGGAGTGGAGTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 469775 151 + 647215 CCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTATAGCTCAACATGCTCCAATTGCTTAACCTCTAAGCTGTAAGTGACAGAGTGTTAGCTAGTAATATTGAGGATGTTAAAAGACAGGGGGGGG-----GGGACAATACAAGCATATGCGGAATGGAGTATG - -a -s mr.mrrefChr3 16168 132 + 181019 AGAGgcaaaacggagtgggaatgttagcaacacaacacattcatgagggagtaatgtACTGACCCTATACGGTACACGATCAGGACGTCCTACCCTTCGAGAATAAATTAATATGAAGGGATTCTGGTCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460598 131 + 636262 AGAGACAAAACGGAGTGGGAATGTTTGCAACACAAC-CATTCATCAGGGAGTAATGTACTGACCCTCTACGGTACACGATCAGGACGTCCTACCCTTCGAGAATTAATTAATATGAAGAGATTCTGGTCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 469956 132 + 647215 AGAGgcaaaatggagggggaatgttagcaacacaacacactcatgagggagtaacatACTGACCCTATACGGTACACGATCAGGACGTCCTACCCTTCGAGAATATATTAATATGAAGGAATTCTCGTCTTT - -a -s mr.mrrefChr3 16300 7 + 181019 GGGCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 351919 7 - 647215 GGGCAGG - -a -s mr.mrrefChr3 16307 18 + 181019 AGAGCATTCCCCAACCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 351930 18 - 647215 AGTGCATTCCCCAACCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 470088 18 + 647215 GAATCATTGACCCACCCA - -a -s mr.mrrefChr3 16325 33 + 181019 GTGTGATTAGATCAGTAAACTATCCCACCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 351948 33 - 647215 GTATGATTAGATCAGTAAACTATCCCACCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 470110 33 + 647215 GTGTGATTAGTTCAGTAAACTATCCCACCCAGT - -a -s mr.mrrefChr3 16358 6 + 181019 CTAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 470143 6 + 647215 CTAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 16364 55 + 181019 GATTGATTTGTAGAGATTGAAAGGACGTGATGCTTGGCCTATAATGCTCCATAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 470156 55 + 647215 GATTGATTTGTAGAGATTGAAAGGACGTGATGCTTGGCCTATAATGCTCCATAAA - -a -s mr.mrrefChr3 16419 24 + 181019 AGATCTATAGATAAAGTTGGAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 351981 24 - 647215 CTGTCTATAGATAAAGTTGGAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 470211 23 + 647215 AGA-CTATAAATAAAGTTGGAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 16443 1 + 181019 T -s simRat_chr6.simRat.chr6 470234 1 + 647215 T - -a -s mr.mrrefChr3 16444 96 + 181019 GAAGGGCTCACATGCTAAGCCTGTAATATCCAGGTGAATACAGTAGAACCATATTGACCCAAAAGAATTTGCTGTTCTTGGATGGTATGGTACTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 352005 96 - 647215 GAAGGGCTCACATGCTAAGCCTGTAATATCCAGGTGGATATAGTAGAACCATATTGACCCAAAAGAATTTGCTATCCTTGGATATTATGGTACTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 470235 96 + 647215 GAAGGGCTCACATGCTAAGCCTGTAAAACCCAGGTGAATACAATAGAACTTTATTGACCCAAGAGATTTTGCTGTTCTTGGATGGTATGGTACTAG - -a -s mr.mrrefChr3 16540 22 + 181019 ATGTGTGATTGACCCACACTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460732 17 + 636262 -----TGATTGACCCACACTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 352101 5 - 647215 ATGTG----------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 470332 5 + 647215 ACCTC----------------- - -a -s mr.mrrefChr3 16562 21 + 181019 TGTTCATCAGGGTTTTTACCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460749 21 + 636262 TGTTCATCAGAGTTTTTACCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 470337 21 + 647215 TGTTCATTAGGGTTTTTACCG - -a -s mr.mrrefChr3 16583 42 + 181019 TATGGATGATGGTCCCGGCAACGACACGTCACACACGGATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460772 42 + 636262 TATGGATGATGGTCCCGGGAACAACACGTCACACACGGATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 470358 42 + 647215 TATGGATGATGGTCCCGACAACGACACGTCACACACGGATTG - -a -s mr.mrrefChr3 16625 437 + 181019 GTCAAAAAGGGGTCAGTCATTTCTACTGGTAGAATCTATTGACCTATTGTCAGCGTGCATACGAATGCAAACTCATTCCCTCCATGTTATATGCCCTTTAACCCACCCGAAACGAAGAGTAGCCGGATCAGAAGAACTTGATGGCAGCAGGCCCAATAGATTGCTGTCTAGCCGGGCCAGACTTAGAGGTGTGGACACTGAATAGAGAATTATAGGTATTTTGGTAAATCGTCGACCATGCACAGGAAGTCGTAGAACCGCGCCGCGGGAGCGGCGGCGGCCAGAACCATTCCGTGACAAGTGGGATATTCAGCAACCTAGTATCTCGTTGCCACTAGCACACACACCTGACAGACCCTTACTCGCAGCCCTTTAAGATTAAATGAAGTTGTTGAACTTTTAACAACAACCATGCAGGTATGCTGCAAGCAGGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460822 432 + 636262 GTCAAAAAGGGGTCAGTCATTTGTACTGGTAGAATCTATTGACATATTGTCAGCGTGCATACGAATGCAAAGTCATTCCCTCCATGTTATATGCCTTTTAACCCACCCGAAACGAAGAGTAGCCGGATCAGAAGAACTTGATGGCAGCAGGCCCAATAGATTGCTGTCTAGCCGGGCTAGACTTAGAGGTGTGGACACTGAATAGAGAATTGTAGGTGTTTTGGTAAATCGTCGACCAGGCACAGGAAGTCGTAGAACCGCGCCACGGGAGGGGCGGCGGCCAGGGACATTCCGTGACAAGTGGGAT-TTCAGCTACCTAGTAACTCGTTTCCACTAGCATACACACCTGACAG----TTACTCGCAGCCCTTTAAGATTAAATGAAGTTGTTGAACTTTCAACAACAGCCATGCAGGTATGCTGCAAGCAGGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 470400 436 + 647215 GTCAAGAAGGGGTCAGTCATTTCTACTGGTAGAATCCAG-GACCTATAGTGAGCGTGCCTACGAATGCAAACTTACTCCCTCCATGTTATATGCTCTATAACCCACCCGAAAGGAAGAGTATCCGGATCAGAAGAATTAGATGGCAGCAGGCCCAATACATTGCAGTCTAGCCGGGCCAGACTTAGAGGTGTGGACATTGAATAGCAATTTATATGTATTTTGGTAAATCGTCGACCATGCACAGGAAGTCGTAGAACCACGCCGCGGGAGCGGCGGCGGCCAGAACCATTCCGTGACAAGTGGGATATTCAACAACCTCGTATCTCGTTGCCACTAGCACACAGACCTGTCGGACCCTTACTTGCAGCCCTTTAAGACTAAATGAAGTTGTTAGACTTTTAACAACAACCATCTAGGTATATTATAGGCAGGCACA - -a -s mr.mrrefChr3 17062 563 + 181019 GGAAGGGTTTACAGTGAGTTGTACAATGGAGGCAGTGAACTAGGAGGCCTCAAGGTTTTGACACAACCATTGATTATAATGCAACCCTAATATGGTAATCTCAGCGCCAATTGTTTGGTACCATCAGACCCAGAACATTCAGACCAAGGGAATGCAGGAGCAGCTCCAAAACAACTAACACAAAGGGAGCCTTAAAGATTGTGTAGGCCATTCCCCTCGCAATTAACACCAAGCTAAAGTTGGTTCAGATCTTTTGCATAGCCATTTGCTACAAAAGACCAAACCACAGAGTTCTCAGACCTTTTCATAATTTCAGTATGGTTTGAGGGCAGCACCTACTTATGAGAGTTTGAATGTCATGTTAGCAATCTCTAAGCTTCACATGTGTGGCTCTGGCCCTTTTTTCCTCATCCATCTACCATGCAAAACTCCCAATGACTAAGGTCAGAAGATCTATGTGGACTCGTTAGATTGGCACGGTTTGTATAAATCCATGTTTGATGTCGTGATCAGTATATCATTGGCCTGACAACTAGTTGTGAGGTATTCTCTTATCGCAGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 461254 542 + 636262 GGAAGGGTTTACAGTGAGTTGGACAGTGGAGGCAGTGAACTAGGAGGC-TCATGGTTTTGACACAACCTTTGATTATAATGCAACCCTAATATGGTAATCTCAGCGCCAATTGTTTGGAACCATCAAGCCCAGAACATCCAGACCAAGGGAATGCTGGAGTAGCTCCAAAACAACTAACACAAGGGGAGCCTTAAAGATTGTGTCAG--------------------ACCAAGCTAAAGTTGGCTCAGATCTTTTGCATAGCCATTTGCTACAAAAGACCAAACCACAGAGTTCTTAGACCTTTCCATATTCTCAGTATGGTTTGAGGGCAGCACCTACTTATGAGAGAATGAATGTCGTGTTAGTGATCTCTAAGCTTCACATTTGTGGCCCTGGCCCTGTTTTCTTCATCCGTCTGCCATGCAAAACTCCCAATGACTAAGGTCAGAAGATCTATGTGGACTTGTTAGATTGGCACAGTTTGTATAAATCCATGTTTGATGTCGTGATCAGTATATCGTTGGCCTGACGATTAGTTGTGGGACATTCTCTTCTCGCAGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 470847 560 + 647215 GGACGAGTTTAGAGTGAGTTGTACAACGGAGGCAGTGAACTAGGAGGCCTTAAGGTTTTGCCAGGAACAATGATTGTAATGCTACCCTAATATGGTAGATTCAGCACGAATTGTTTGGTACCATCAGACTCAGAACATTCAGCCCAAGGAAATGCAGGAGCAGCTCCAAAAAAGCTAACACAAAGGGAGCCTTAAAGATTACATAGGCCATTCCCCTCGCAATTAACACCAAGCTAAAGTTGGTTCGGATCTTTTGCATAGCCATTTACTACAAAAGACCAAATCACAGAGTGCTCAGAACTTTTCAAAATTTCAGGATGGTTTGTGGGCAGCACCTAATTATGGGAGTTTGAATGTCATGTTAGCAATCTCTAGGCTTCACATGTGTGGCTCTGGCCATTTTTTCCTCATCCATCTACCACGCAAAACTCCCCATGACTAAGGTGAGAAGATCTATTAGG---CTTTAGATTGGCACGGTTTGTATATATCCATCTTTGATGTTGTTATCAGTATATCATTGGCCTGGCAACTCGTTGTGAGGTATTCTCTTATCGCAGAAG - -a -s mr.mrrefChr3 17625 179 + 181019 TAACTCTTCCAGACAGCATTGCTATACAGCACACCCTACACTATCCTCAGGTTAGGTGACTATTTTATAATCATGTTTTGTGCTTTTTGTTTTGATTGTTAAACTCTTGACTCGTTTGGAATTGGTTCAGTTGCACTTTTGACCTGTACCAATATCATACATTGCAAAGCACTAATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 461799 178 + 636262 TAACTCTTCCAGACAGCACTGCTATACAGCACACCCTACACTATCCTCAGGTTAGGTGACTATTCTAGAATCATGTTTTGT-CTTTTTGTTTTGACTGGTACACTCTTGACTCGTTTGGAATTGGTTCAGTTGCACTTTTGACCTGTACCAATATCATACATTGCAAAGCACTAATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 471407 179 + 647215 TAACTCTTCCAGACAGCATTGCAATACAGCACACTCTACGCTATCCTCAGGTTAGGTGACTATTTTATAATCATGTTTTGTGCTTTTTGTTTCAATTGTTAAACTCTTGACTGGTTTGGGATTGGTTCAGTTGCACTCTTGACCTGTACTGACTGCATATATTGCAAAGTGCTAATCAT - -a -s mr.mrrefChr3 17804 11 + 181019 TCATCTTCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462007 11 + 636262 TCATCTTCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 471586 11 + 647215 TCATCTTCCTG - -a -s mr.mrrefChr3 17815 11 + 181019 CCAGCCTTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462018 11 + 636262 CCAGCCTTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 471598 11 + 647215 CCAGCCTGGAA - -a -s mr.mrrefChr3 17826 14 + 181019 GATTAGTTCTCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462031 14 + 636262 GATTAGTTCTCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 471609 14 + 647215 GTTTAGTTCTCCCC - -a -s mr.mrrefChr3 17840 165 + 181019 TTAATAACTTGAATGGTCCTCACCAGAGGAAGAACTTAAGCTTTTGGCTGCATAATGTTTGAATACTGGTGTTTAGATTTAAGTGGTTGCCTGTACACTAGAGTGTTTCCAGCACTTGAGGAAAATTATTGAATTGCCTGTAAATAAATGTCAAATCTGTGAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462045 158 + 636262 TTAATAACTTGAATGGTCCTCACCAGAGGAAGAACTTAAGCTTTTGGCTGCATAATGTTTGAATACTGGTGTTTAGATTTAACTGGTTGCCCGTACACTAG-------CCAGTACTTGAGGAAAATTATAGAATTGCCTGTAAATAAATGTCAAATCTGTGAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 471643 165 + 647215 TTCATGACTTGAATGATCCTCACCAGAGGAAGAACCTCATCTTCTGGGCCAATATTGTTTGAATACTTGTGTTCAGATTTAAGTGGTTGCCTGGTCACTAGAGTGTTTCTGGCACTTGAGGCAACTTATTGAATTGCCTGTAAATAAATGTCAAATCTGTGAAGT - -a -s mr.mrrefChr3 18005 231 + 181019 CATTTTAGTAAATATTCTCAGAAGCTGTGCATTACATAGATCAGCATCAACCTGTAAGATGCAGAACATCCTATGTCAAATTTAATTAGTATAATAGGGTGCAATAAGTAGCTTTTCTGGTCATCACTATGAATGTGTAGGCAAGTGTGTAGACCTAAAAACCTAACAATTGTACTCGTTGCACATTTCTATATCCTTCAATATCCTTCTGCATGAGTGGAGCTAGCCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462203 231 + 636262 CATCCCAGTAAATGTTCTCAGAACCTGTGCATTACATAGACCTGCATCAACCTGTAAGATGCAGAACATCCTATGTCAAATGTAATTAGTATAATAGGGTGCAATAAGTAGCTTTTCTGGTTATCACTATGAATGTGTAGGCAAGTGTGTAGACCTAACAACCTAACAATTGTACTCGTTGCACATTTCCATACCCTTCAATATCCTTCTGCATGAGTGGAGCTAGCCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 471819 231 + 647215 TATTTTAGTAAACAGTCTTAGAAGCTATGCATTACATAGATCAGAATTAACCTGTAAGATACAGAACATTCTATGTTAAACTTAATTAGTATGATAGCGTGCAATAAGTAGGTTTTCGGGCCATCACGATTAGTGTGTAGGCCAGTGCGAAAACCTAAAAACCTGACAATTGTACTCATTGCACATTTCTATATCCCTCAATACCTGGATTCATGAGTTGAGCTAGTCCCT - -a -s mr.mrrefChr3 18236 70 + 181019 CATTGTCCACCTTCATTAACTTCAGATATGGTTGGTCGTAATAGTGCTTACTCTCTTATCCATTAAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462434 70 + 636262 CATTGTCCACCTTCATTAACTTCAGATATGGTTGGTCGTAATAGTGCTTACTCTCTTATCCATTAAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 472131 70 + 647215 CCTTAGCCATCTTTATTAACTTCAGATATGGTTAGTTGTAATAGTGCTTACTCTCTTATCTGTTAAAACA - -a -s mr.mrrefChr3 18306 41 + 181019 ATTTTAGCTAAATTGGTCAAAACATGGCATACACTGCAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462504 41 + 636262 ATTTTAGCTAAATTGGTCAAAACATGGCATACACTGCAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 472203 41 + 647215 ATTTTAGCTAGATTGGTCAAAACATGGCACACACTGCAAGT - -a -s mr.mrrefChr3 18347 265 + 181019 AGTGACGCCACAGATTTTACTACAGTGTAAAACTTGAACTGCAGACCCCCAGGGCATCTGAATCATCAGTTAAACTACTCAAGGATACAATGCACAATTAATGTGCCCCTTATATGTTATTGACTTCTTTTCATGAGTCTGACATCTTATATGTCTATCCTATGTTAAACACAATGTCTAGCAAGTATGGACCTTCCAGGTTGATTCCTCCTCAGTCCTCATCAGAAAGACTGGTGAAAAATCCACTTTTAACATCACTGTGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462545 264 + 636262 AGTGACGCCACAGATTTTACTACAGTGTAAAACTTGAACTGCAGACCCCCAGGGCATCTGAATCATCAGTTAAACTGCTCACGGATACAACGTACA-CTAATGTGCCCCTTATATGTTATTGACTTCTTTTCATGAGTCTGACATGTTATATTTCTACCGTATGTTAAACACAATGTCTAGCAAGTATGGACCTTCCAGGTTGATTCCTCCTCAGTCCTTATCAGAAAGACTGGTGAAAAACCCACTTTTAACATCACTGTGCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 472246 221 + 647215 AGTGACACCACAGATTTTACTACAGTGTAGAACTTGAACTGCAGAGCCCCAGGGTATCTGAATTATCAGTAAAACTACTCAAGGATACAATGCACAATTAATGTGCCCCTAATATGTCATTGACTTATTTTCATGAGTCAGACATCTTATGTGTCAATCCTATGTTACACTA--------------------------------------------CCTCATCAGAACGACTGATGAAAAATCCACTTTTAACATCATTGTGCTT - -a -s mr.mrrefChr3 18612 126 + 181019 AAGGGCGGGCTGTGGATATACCCTTAGGGCCTGGGAGACCATGGTCACTGTATGTTGAAACTGTTGAATAAAGAAACAATGGTCCCTGAATGCCACCCAGGTAGTGGAACACTAAATGCGATAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462809 126 + 636262 AAGGGCGGGCTGTGGATATACCCTTAGGGCCTGGGAGACCATGGTCACTGTACGTTGAAACTGCTGAATAAAGAAACAATGGTCCCTGAATGCCACCCAGGTAGTGGAACACTAAATGCGATAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 472484 126 + 647215 AAGTGTGGGCTACCAATCTACCTTTAGGGCCAGGGAGACCATGGTCACTGTATATTGAAACTGTTGAATAAAGAAACAATGGTCCCTAAATGCCACCCAGCTAGTGGGACACTAAATGTGCTAGGT - -a -s mr.mrrefChr3 18738 61 + 181019 ACTTTATTGAGTCTGAATTGTAGATAGGGATGTGTAAACCATCATAGAATTTAATAGTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462935 61 + 636262 ACTTTATTGAGCTTGAGTTGTAGATAGGGATGTGTAAACCATCATAGAATTTAATAGTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 472650 57 + 647215 ACTGTATTGAGTCTGAATTGTAGGTAGGGATTTGTCATCCA----AGGATTTAGTGGTACA - -a -s mr.mrrefChr3 18799 20 + 181019 TGTGGTGAATCCTGAAATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462996 20 + 636262 TGTGGTGAATCCTGAAATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 472708 20 + 647215 TATGGTGAATCCTAAAATAG - -a -s mr.mrrefChr3 18819 8 + 181019 TGTTTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463022 8 + 636262 TGTTTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 472728 8 + 647215 TGAATCCT - -a -s mr.mrrefChr3 18827 14 + 181019 ACTAGACTGCCCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463038 14 + 636262 ACTAGACTGCCCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 472736 14 + 647215 AAAAGACTACCCAA - -a -s mr.mrrefChr3 18841 38 + 181019 ATAGGAACTCAACAATAACTGGAGTACCTTAGGTAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463057 38 + 636262 ATAGGAACTCAACAATAACTGGAGTACCTTAGGTAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 472750 38 + 647215 ATAGGAATTCAAGAATAACTGGAGTAGCCTGCAATATG - -a -s mr.mrrefChr3 18879 392 + 181019 AGCAACTGGGGAATTTTACTGTAAAAGACTCTAGATTGTGTCCAGAAAGCATTACAAAATCAATGTGATGACCCCATAAGGAAAAGGTGCAGCTCTGTTAGAACAGCTGCTAGGCGGCAGGTGAGTCCAGCAATGACCTGAGTAACTTACACGATGATCTGAGTACTATATATATATATAGATGTCAGCATCCATAGAATTTTTTCATTCTAGTCTCTGGAGTCTCCTTGAGACTTTATGAACATAAATGGCAGCATTAGAAGTTTTGTAGCTTTACCTATGTACTGCCATAGGTGTATTATCTCACTAAGTCGACTCTTGTGTCATGTGGTAATACTTTATAGGATTCACCTCAGCACCTGCATTGCTCACCATTGAACTGATGGAGGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463095 385 + 636262 AGCAACTGGGGAATTTTACTGTAAAAGACTCTAGATTGTGTCCAGAAAGCATTACAAAATCAATGTGATGACACCATAAGGAAAAGGTCC---TCTGTTAGAACAGCTGCTAGGCGGC----GAGTCCAGCAATGACCTGAGTAACTTACACGATGATTTGAGTACCATATGTATATATAGATGTCAGCATCCATAGAATTTTTCCATTCTAGTCTCTGGAGTCTCCTTGAGACTTTATGAACATAAATGGCAGCATTAAAAGTTTTGTAACTTTACCTATGTACTGCCATAGATGTGTTATTTCACTAAGTTGACTCTTGTGTCATGTGGTAATACTTTATAGGCTTCACCTCAGCACCCGCATTGCTCACCATTGAACTGATAGAGGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 472790 384 + 647215 AGCAGTTGAGGTATTTTACTTCGTAAGACTCTAGCTTATGTCCAGAAAGCATTACAAAAAGAGTGCGATGACCCCATAAGCAAAAGGTGCAGCTCTGTTAGAACAGCTGCTAGGCGGCAGGTGGGTCCAGAAATGGCCTGAGCAACTTACATGATGAACTGAGTACTATATATATATATAAATGTCAGCATCCACAGATTTTCTTCATTCTAGTCTATGGAATCTCCTTGAGACTTTATGAACATAAATGGCAGCATTAGAAGTTTTGCAGTTTTACCTA--------CATAGGTGTATTATCTCACTTAGTCAACTCTTGTGTCATGGGGTATTACTTGATAGGATTCACCTCAGTACCTGCATTACTCACAGTTGAACTGATGGAGCTGA - -a -s mr.mrrefChr3 19271 62 + 181019 CAAGTCAACCTGTTGACTGGATGCACTAAGTGGGGCTGCTTATGTGTACTGACTAATGGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463480 14 + 636262 CAAGTCAACCTGCT------------------------------------------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 473178 62 + 647215 CAAGTCAACCTGTTGACTGGATGCACTAAGTGGGGCTGCTTATGTGTACTGACTAATGGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 19333 18 + 181019 AACACAATGATATGCTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463494 16 + 636262 --CACAATGATATGCTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 473243 18 + 647215 AACACAATGATACGCTTG - -a -s mr.mrrefChr3 19351 62 + 181019 TCAGAGATGAAAACAGCATTTACATCTACGCTAGACAAATGCAACATTTGTCTCACAAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463513 41 + 636262 TCAGAGATGAAAACAGCATTTACAT---------------------TTTGTCTCACAAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 473261 60 + 647215 TGAGA--CGAAACCAGAATTCACGTCTACGCTAGACAAATGCAACATTTGTCTCACACAATT - -a -s mr.mrrefChr3 19413 176 + 181019 GGACTTCTTAAGTTTGAGTTTGTAGAAATAAAAGGCAATTGCTGTGATCCCGTAGAGATAAATGTGAAAGGTAACATTATCAACTGCTAATAGTAAATGTTATCAAGGTTAGAGATGGAGTTACATACCTATTAGACATCAGACATATAAGTGACACCAAAATTTGATGTTGGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463554 172 + 636262 GGACTTCCTAAGTTTGAGTTTGCAGAAATAAACGGCAATTGCTGTGATCCCGTAGAGGTAAATGTGAAAGGTAACATTATCAACTGCTAATAGTAAATGCTACCAAGGTTGGAGATGGAGTTACATACCGATTACATATCAGACATATAAATGACACCAAAATTTGATATTG---- -s simRat_chr6.simRat.chr6 473331 176 + 647215 AAACTTCTTAAGTTTGAGTTTGTAGAAATAAAAGGCAATTGCTATGGTCCTGTAGAGATAAATGTGAAAGGTAACATTATCAACTGCTAATAGTAAATGTTGTCGAGGTTAGAGATGGAGCTACACACCTATTAGACATCAGGCATATAAGTGACCCCAAAATTTGGTGTTGGGTG - -a -s mr.mrrefChr3 19589 11 + 181019 GCGTAAGGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463726 10 + 636262 -CCTAAGGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 473509 11 + 647215 GAGTAAGGAAA - -a -s mr.mrrefChr3 19600 217 + 181019 CATATGGAGTTTGAGCCCCTGACACAGATCAGCATCAAATATCTCTGTGCCAAATTATACTAGGCACACCTGGATACTAAGACTGGCCTGGTTTAGATAGCTTGTCCCAATATTTATGCACACATTTATGAAGGGTGGGAAAGATGAGACAAGGGATCTAATAATATCAGTAGAGAGGTCTGCAAAAGTCCTAGTAGTTTTGGGTGTGTTGGGTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463736 217 + 636262 CATATGGAGTTCGAGCCCCCAACACAGATCAGCATCAAACATCTCTGTGCGAAATTATGCTAGACACAGCTGGATACTGAGACTGGCCTGGTTTAAACAGCTTGTCCCAATATTTATGCACACATTTATGAAGGGTGGAAAAGATGAGACAAGGGATCTAATAATATCAGTAGAGAGGTCTGCAAAAGTCCTAGTGGTTTTGGGTGTGTTGGGTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 473523 215 + 647215 CGTATGGAGTTTGAGCACCTGACACAGATCAGCATCAAATGCCTCTGTGTCAAATTACACTAGGCACACCTGGACACTAAGACAGGC--GGTGTAGATAGCTCGTCCCAATATTTATGCACACATTTATGAAGAGTGGGAAAGATGAGATGAGGGATCTGAGACTGTCCGTGGAGGGGTCTGCAAGAGGCCTAGTAGTTTCAGGTGTGTTGGGTATG - -a -s mr.mrrefChr3 19817 132 + 181019 GTGGAATATCTCTCCTGAACATGTCAGTTCATACAGGCTCCATATAATTCCCAAGATTGGATACACACACACATCGTGTGAGTGTAGATGATGAGAGGTTGTTAGGTTGGCAAAACTGCCATATGGAGTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463953 132 + 636262 GTGGAATATCTCTCCTGAACATGTCAGTTCATATAGGCTCCATATACTTCCCACGATTGGATACACACACACATCGTGTGAGTGTAGATGATGAGAGGTTGTTAGGTTGGCAAAACTGCCATATGGAGTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 473740 132 + 647215 GTGGAATATCTCTCCTGAACATGTCAGTTCATACCGGCTCCATATAATTCCCAAGATTGTATACACACACACATTGTGTGAGTGTGGACCCTGAGAGGTTGTGAGCTTGGCGAAGCTGGCATATGGGATGTT - -a -s mr.mrrefChr3 19949 102 + 181019 AACCACAGCTACCTAACAGTATTATTAATACCAGAGTGGAGCTGGAAAAATGCTAGACCATCTACTGTGTTACACTTAGACCTGGTAAGGGGAAGATGTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464085 98 + 636262 AACCACAGCTACCTAACAGTATTATTAATACCAGAGTGGAGCTGGAAAAATGCTAGACCATCT----TGTTACACTTAGACCTGGTAAGGGGATGATGTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 473882 102 + 647215 AGCCACAGCTACCCAACAATGTTATTCGTACCAGAGTGGAGTTGGAAAAATGCTAGACCATCGACTGTGTAACACTTGGACCTGGTAAGGGGAAGATGTTTA - -a -s mr.mrrefChr3 20051 214 + 181019 TTGAGGAAGTTTAATGCTAAGACCTGAGTCAATCTATAGCACTCCAAAAATGAGTTGTCTGTCCATTGTTTTCATAGTGAGCCCTAGTGCGTGAAAGTTTAGAATAGTAAAACCAAATTGGGGAGGGGGAGGGTCAAATCACTTCTGATGATATAGTATTTTTATCATTCACCTTAGTAGTGTACATATGTGCAGGTGTAAGAACATACATGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464184 214 + 636262 TTGAGGAAGTTTAATGCTAAGACCTTAGTCAATCTATAACACTCCAAGAATGAGTTGTCTGTCCATTGTTTTTATAGTGAGCCCTAGTGCGTGAAAGTTTAGAATAGTAAAACTAGATGGGGGAGGGGGAGGGTCAAATCACTTCTGACGAAATAGTATTTTTATCATTCACCTGAGTAGGGTACATATGTGAAGGTGTAAGAGCATACATGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 473984 213 + 647215 TTGAGGAAGTTTAAAGTGAAGAC-TGAGTCAATCCAAAGCACTCTAAAACTGAGTTGTCTGTCCATTGTTTTCATAGTGAGCCCTAGTGCATGAAAATTTAGGATAGTAAAATCAAATTGAGGAGGGGGAGGGTCAAGTCACTTCTGATGATACAGTTTTTTTATAATTCACCTTAGTGGTGTACATATGTGCAGGTGTGAGGACATACATGGA - -a -s mr.mrrefChr3 20265 57 + 181019 GCTACATAAATATCTGTAGCACATTGTTGACAGATAGGAGCTATAATATCTTGTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464398 54 + 636262 GCTACATAAATATCTGTA---CATTGTTGACAGATAGGAGCTATAATATCTTGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 474198 57 + 647215 GCTAGATAAATATCTGTAGCACATCGTTGACAGATAGAAGCTACAAGATCTTGCTGA - -a -s mr.mrrefChr3 20322 36 + 181019 GAAAACTTCTATTCACAAGCTCCTTAGATCTACTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464452 36 + 636262 GAAAACTTCTATTCACAAGCTCCTTAGATCTACTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 474261 36 + 647215 GAAAATGTCTACTCTCAAGCTCATTAGTTCTACTTA - -a -s mr.mrrefChr3 20358 22 + 181019 GTCTTTATGACTTTCCAGCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464488 22 + 636262 GTCTTTATGACTTTCCAGCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 474298 22 + 647215 GCCTTTATGTCTTCCTGGCCTT - -a -s mr.mrrefChr3 20380 51 + 181019 CCTATTCCAAATGTAAATTGATTTGAACTAGGCAACAGGGTCACCTAAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464510 51 + 636262 CCTATTCCAAATGTAAATTGATTTGAACTAGGCAACAGGGTCACCTAAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 474334 51 + 647215 CCTTTTCCAAATGTATATTGACTTGAACTAGATGATGGGGTCAACTAAAAT - -a -s mr.mrrefChr3 20431 13 + 181019 ATAACCTGGACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464561 13 + 636262 ATAACCTGGACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 474391 13 + 647215 AAAACCTGGACAC - -a -s mr.mrrefChr3 20444 14 + 181019 TGAGGGAGAACCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464692 14 + 636262 TGAGGGAGAACCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 474404 14 + 647215 TGAGGGAGAACCTC - -a -s mr.mrrefChr3 20458 45 + 181019 ATGGTCTTTCCCGTGTTAATTGTCTTGGATGGAAAGCACTGGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464706 45 + 636262 ATGGTCTTTCCCGTGTTAATTGTCTTGGATGGAAAGCACGGGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 474420 45 + 647215 ATGACATTTCCTGTGTTAATTGTCTTGGATGGAAAGCACTGGATC - -a -s mr.mrrefChr3 20503 51 + 181019 AGTTCATTAGAACTCCAGACTCAATGTTGTTCAGGCAGCATTTCAAGACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464761 51 + 636262 AGTTCATTAGCACTCCAAACCCAATGTTGTTCAGGCAGCATATCAAGACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 474465 42 + 647215 ---------GAACTCCAGGCTCAATGTTGTCGAGTCAGCATTTTAAGACTC - -a -s mr.mrrefChr3 20554 247 + 181019 AACTTTCAATATATTACGATACTTAACAGACAGTTGGTATTGGAGGATGTGACTGCTAGGGTTTACCACATAGATCAATACCAACCAGTGGATACCTTAGCTTGTAGCATCATCTAGTACAAATTGTATGTTAGTCAGTTCAAGAACCTCCAAGCACTAACATAGCCACTTACTCAAACACTAGATAATAGCCATTATCTTTAGAGTACTACTCCCTTGCTCACACCTGAATGGTAAGAGATCACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464821 247 + 636262 AACTTTCAATATATTACAATGTTTAACAGACAGTTGGTATTAGAGGATGTGACTGCTAAGGTTTACCACATAGATCAACACCAGCCAGTGGATGCCTTAACTTATGGCATCATCCAGCCCAAATTGTATGTTAGTCAGTTCAAGAACCTCCAAGCACTAATGTAGCCACTTACTCGAACACTAGATAATAGCCATTATCTTTAGAGTACCACTCCCTTGCTCACACCTGAATGGTAAGAGATCACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 474507 247 + 647215 AACTTTCAATATATTAGGATACTTAACAGACAGTTGGTATTGGAGGCTGTGACTGTCAGGGTTTAGCACATAGATCAATACCAACCAGTGGGTACCTTAGCTTGTAGCATCGTCTAGTACAAATTGTATGATAGTCAGTTCAAGAATTTCCATGTACTAACATAGCCACTTACTCAAACACTAGATAATAGCCATTATCTTTAGAGTACTACTCCCTTGATCACACCTTAATGGTTAGAGATCACCG - -a -s mr.mrrefChr3 20801 157 + 181019 AAAAGTTATTATAATAACAGATGAGTTATCTTCCCAAGTAATTGGTTTCTCTTGGTAACTGTGTTGTGAACAGTTATTTTCTTCCAGTCAGTGGGATGAGCATTTTGGTTGTGACAGTACAACTGATATGAGTTCTTGTGCCATTAACAATGCATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465078 157 + 636262 AAAAGTTATTATAATCACAGATGAGCTATCTTCCCCAATAATTGGTTTCTCTTGGTGACTGTGTTGTGAACAGTCATTTTCTTCCAGTCAGTGGGATGAGTATTTTGGTTGTAACAGTACAACTGATATGAGTTCTTGTGCCATTAACAATGCATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 474754 157 + 647215 AGTAGTTATTATATTAACAGGTGAGTTATCTTCCCAAGTAGTTGGTTCCTCTTAGTAACTGTGTTGTGAACAGTTATTTACTTCCAGTCAGTGGGATGAGCGTTTTGGTAGTGACAGTACAACTGATATGAGTTCTTGTGCCATTAACAATACATTC - -a -s mr.mrrefChr3 20958 440 + 181019 ACTTGAGGTTGTGCAGCACTGTTTAATCTAATAGTGTTGTGTTGAAGTCAGTAGCATGCATTGGGCTAATGACATGTGATATTGCTACTTGCTTAAGGATGTCAGTAACAAGTTGCTACTTGTTAAGGACCACATAATAAAACAGCCTATCTGTTCACTAGCATCAAACTTTTTAACACCATGATTCTTGGAGAGCCCAAATTAATACTAATGTGAGGGATCCAATTGAAGATCCAACAGTCAATGGGACCTGAGGTGGCTCAGGTCCATACGGGAGAAATACATGTGGATTAGAGCCACATGCTCTTGGCATTTAATTTAACTATGTGCGGTGTGTAATGGTTGTCCACAATCCCTAATTGTGAAAGCGTTAGAACATTTGGTCCTATAAGGCCATACATGAGTTTTCTGTCATTATCATTAGGAGCTAGGAACCAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465235 412 + 636262 ACTTGAGGTTGTGCAGCACTGCTGAATCTAATAGTGTCGTGTTGAAGTCAGTAGCATGCATTGGGCTAATGACATGTGATATTGCTGCTTGCTTAAGGATGGCAGTTACAGGTTGCTACTTGTTAAGGACCACATAATAGAACAGCCCA--------CTGGCATCAAACTTTTTAACACCATGATTCTTGGAGAGCCCAAATTAATACTAATGCAAGGGATCCGTTTGAAGATCCAACAGTCAATGGGACCTGAGGTGGCTCAGGTCCATACGGGAGAAATACATGTCAATTAGAGCCACATGCTCTTGGCATTTAATTTAACTATG--------------------CACAATCCCTTATTGTGAAAGTGTTAGAACATTAGGTCCTATAAGGTTATACATGAGTTTTCTGTCATTATCATCAGGAGCTAGGAACCAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 474913 440 + 647215 ACTTGAGTTTGAGCAGCACTGTTTAATCAAATAGTGTTGTGTTGAAGTCAGTAGCATGCGTTGGGCTAATGAGGTGTGATGTTGCTACTTGCTTAGGGACATCAGTAATGAGTTGGTACTTGTTAAGGACCTCATGACAAATCAGCCTATCTGTTCACTAGTATCAAACTTTTTAACACCATGAATCTTGGAGAGCCCAAATTAACACTAATGTGAGAGATCCAATGTAAGCTCCAACAGCAAATGGGACGTGAGGTGGCTCAGGTCTATAGGAGAGAAATACATGTGGATTAGAGCCACATGCTCTTGGCTTTTAATTTAACTATGTGCGGTGTGTAATGGTTGTCCGCTATCCCTAATTTTGAAAACTTTTGAACATTTGGGCCTATAAGGCCATATGCGAGTTTTCCGTCATTGTCAATAGGAGCTAGGGACCAGTC - -a -s mr.mrrefChr3 21398 49 + 181019 TAACCAGCTTTAGCTAAATATAAGTGCTGATGTGATTTGTCATGATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465655 48 + 636262 TAACCAGCTTTACCTCAATA-AAATGATGATGTGATTTGTCATGGTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 475353 41 + 647215 --------TTTAGCTAAATATAAGTGCTGATGTGATTTGTCATGATTTG - -a -s mr.mrrefChr3 21447 46 + 181019 GCAGGATCTGCCCCATGTTGTCCGACTGGGGATAAAGGATGGAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465712 46 + 636262 GCAGGATCTGCCCCATGTTGTCCGACTGGGGATAAAGGATGGAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 475394 46 + 647215 GCAAGATCTGCCCCATATTGTCAGACTGGGGACAAAGGATGTAGTG - -a -s mr.mrrefChr3 21493 47 + 181019 CATTGAATGGTACCAGTGACATTGGAATTACCAGGGATACTCATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465758 47 + 636262 CATTGAATGGTACCAGTGACATTGGAATTACCAGGGATCCTCATAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 475512 47 + 647215 CGTTGAAAGGTACCCGTGTCATTGGAATTACCAGGGATACTCATAGC - -a -s mr.mrrefChr3 21540 145 + 181019 AATAGACAAAGCACTACACTGTCAAAGCCATTTGCAGTTCGTCAGGAACTTGACTTAATAAGTTTATCCAGTTGTACTTGCAGCACCAAGCAGTACAACCTGACTGGACTTTGCCTCTCTCCTAGATAAGACTTTTAAGGTAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465806 145 + 636262 AATAGACAAAGTACTACACTGTCAAAGCTATTTCTAGTTCGTCAGGAACTTGACTTAATAAGTTCATCCAGTTGTACTTGCAGCACCAAGCAGTACAACCTGACTGGACTTTGCCTCTCTCCTAGATAAGACTTTTAAGGTAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 475559 137 + 647215 ATTGGACAAAGCAATACACTTTCAAAGCCATTTGCAGTT--------GCTTGACTTAATAAGTTTATCCAGCTGTACTTGCAGTACCAAGCTGTACAATCTGACTGGACTCTGCCTCTGCCCTAGATAAAACTTTTAAGGTAATA - -a -s mr.mrrefChr3 21685 82 + 181019 GCAAAATTTGGGTTTCCCTCTGTGATCACCTGGAGTACAACGCTCTGCACCTGTGGTCCTGATTATCATCATAGTGGAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465951 82 + 636262 GCAAAATTTGGGTTTGCCTCTGTGATCACCTGGAGTACAACGTTCTGCATCTGCGGCCCTGATTAACATCATAGTGGAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 475699 82 + 647215 GCAAGATTTGGGTTTCCCTCTGTGACCACCTGAAGTACAACGCTCTGCACCCGTGGTCCTGAGTATCATCATAGTGGCAACA - -a -s mr.mrrefChr3 21767 12 + 181019 TAGCTGACATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466033 12 + 636262 TAGCTGACATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 475969 12 + 647215 TTGGTGACTTGC - -a -s mr.mrrefChr3 21779 15 + 181019 TAGGGCCTCAATGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466045 15 + 636262 TAGGGCCTCAATGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 475994 15 + 647215 TGAAGTCTAAATAGC - -a -s mr.mrrefChr3 21794 308 + 181019 GTGATTGTATAATTATGCGATCTGGCCTACAAACAGTCCTATCTGACTACAATGATGTGTAGGGGAACAgggatcccttatggtgtaatatgtgttgatattttaaaattgtatgctgatcctcctgtatggcctgaagtcTTAAACTCATAAGGAATCCTAATCTTGTCTCATCTACATGCACATTAACTAAGCAAATCCTATTTCATTAAAAAGGTTAAGCAAAGCACAAAAAAATCCAGAAGAATGGGAAGCACAAACTAGTAGTTAAGAAAGCAGAAAGAGCAGTGGTGGAGTAGGGAAAAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466061 308 + 636262 GTGATTGTATAATTATGCGATCTGGCCTACAAACAGTCCTATCTGACTACAATGACGTGTAGCGGAACAGGGATCCCTTATGGTGTAATATGCGTTGATACTTTAAAATTGTATGCTGATCCTACTGTATGGCCTGGAGTCTTAAACTCATAAGGAATCCTAATCTTGTCTCATCTACATGCACAGTAACTAAGCAAATCCTATTTCGGCAAAAAGGTTAAGCAGAGCGCAAAAAAATCTAGAAGAATGGGAAGCACAAACTAATAGTTAAGAAAGCAGAAAGAGCAGTGGTGGAGTAGGGAAAAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 476009 305 + 647215 ---GTTAAATAATTATGTGCCCTGGCCTACAAACCGTCCTATCTGACTATATTGATGTGTAGGGGAACAgggatccctccttgtgtaatatgtgttgattttgtaaagttatatgctgatcctcctgtatggcctgaagtcTTAAACTAATAAGGAACCCTAATCTTGTCTCATCTACATGAACATTAGCTAAGCAAATCCCATTTCATTATAAAGGTTAAGCAAAGCACAAAAAACTTCTGATGAATGGGAAGCACAAACAAGTACTTAAGAAAGCAGGAAGACCAGTGATGGAGTAGGGAAAAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 22102 175 + 181019 GCATTAAGTCAGATTATAGTTAATTCTGGATTACCAATCTTCGATAGCACTATATCCTACAAGTAGTCGGCATTTTACACCTGACAGCCATCAAATATAAAGTGCCACAAGGGTAACAGGGCAGGCTCAGAAAGCTTAAATGGCTGTGACTGTTGGTTAAACAAAATGCAGATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466370 172 + 636262 GCAT---GTCAGATTATAATTAAGTCTGGATTTCCAATCTTCGATAGCTCTATATCCAACAAGTAGTCGGCATTTTACACCTGACAGCCATCAAATATAAAGTGCCACAAGGGTGACAGCACAGGCTCAGAAAGCTTAAATGGCGGTGACTGTTCGTTAAACAAATTGCAGATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 476314 172 + 647215 GCATTAAGTCAGATTATAGCTAATTCTGGACTAGCAATCATAGATTGTACTATATTTTACTAGTAGTCAGCATTTTACACC---CAGCCATCAAATGAAAAGTGCCACAAGGGTAACAGGGCACGCTCAGAAGGCTTAAATGGCTGTGACCGTTGGTTACACAAAATGCAGATAC - -a -s mr.mrrefChr3 22277 129 + 181019 ACTGCACCCCATCACTCAGTGGTTGCTCTTGGAAATGACATATGCATATATCACTGTCTACATGGCTGCTACCTAAGTGCCTAGGGCTTGTGCTCCGTCATAAAGACTGCTTCAAGGAGTGCAATAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466542 127 + 636262 --TGCACCCTATCAGACAGTGCTTTACCTCGGTAATAACATATGTATATATTACTGTCTACATGGTGGCTACCTAAGTGCCTAGGGCTTGTGCTCCGTCATAAAGACTGCTTCAAGGAGTGCGAAAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 476487 127 + 647215 ACTGTGCCCCATCACTCAGTGGTTGCTCTTGCAAATGACATATGCATATATCATTGTCTATATTGCTGC--GCCAAGTGTCTTAGGCTTGTGCTCCGTCATAAAGACTGCTTCAAGGAGTGCAATAATC - -a -s mr.mrrefChr3 22406 263 + 181019 GATACTTCATGTTTTATGTAAATACTCCAAGCCAACATTTTAGGGCAGGGTTTCCCATTATGAGAGTAGTGATCATTGTCCAAATTACAGCCAGTTCTATAGTCCTTACACTCCACCTTGAACAGGCCACATTAACCAGCACAGTCGGGCATGTCAGTTATCCTAAAAGCAGAATCAGATTAACTTACTACTTGTCACACTAAAATTAACTTTAGGTAAAGATAGTGTCTAACCAGTGACTATTCAATATACTAACCAGTGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466670 261 + 636262 GATACTTCATATTTTATGTAAATACTCCAAGCCTACATTTTAGGCCAGGGTTTCCCATTATGAGAGTAGTGATCATTGTCCCAATTACTGCCAATTCTATAGTCCTTACATGCCACCTTGAACAGGCCATATCAGCCA--ACAGTCGGGCATGTCAGTTATCCTAAAAGCAGAATCAGATTAACTCCCTACTTGTCACACCAAAATTAACTTGACGAAAAGATGGTGTCGAACCAGTGACTATTCAGTGTACTAACCAGTGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 476614 257 + 647215 GATACTTTATGTTTTATACAAATACTTCAAGCCAACATTATA-GGCCGGGTTTCCCATTATAAGAGTAATGATCATGGTCCAAATTACAGCCAGTTTTATAGTCCTTATACTTCACCTTCAACAGGCCACATTGACCAGCACTGTCGGGCATGTCAGTTATCCTAAAAGCAGAATCTGA----CTTACTACATGTCATGCTAAAATTTATTTTAGGTAAAGATAGTG-TTAACCAGTGACTATTCAATATACTAACGAGTGAC - -a -s mr.mrrefChr3 22669 171 + 181019 CAGCCAACGTGCACCATGCTGCTTCTGGTAGAACATGCTGTCATACTTAACTCAACTGATTAGGAGGCAAGTCACCCAGATCTTTTCAAGTTATGTATATCTCTGAGTTTAGCTAGGAGCCAGATGAAGTGACTATGCACTAGATGGGGTGTGGTATGGGCTGCTATATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466935 165 + 636262 CAGCCAACGTGCACCATGCTGCTTCTGGTAGAACATGCTGTAATACTTAACTCAACTGATTACGAGGCAAG------AGATCTTTCCAAGTTATGTATATCTCTAAGTTTAACTAGGAGCCAGATGAAGTGACTATGCACTAGATGGGGTGTGGTATGGGCTGCTATATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 476871 136 + 647215 CAACCAACGTGCACCATACTGCTTCTGGTAGAAAAGGCCGTCATACTTAACTCATCTGATTAGGAGGCAAGTCACCCAAATCATTTCAAGTTATGTATATCTCTGAGTTTAGCTAGGAGCCAGGC-AACTGACTATG---------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr3 22840 86 + 181019 TAGGTAGCTAGAGTAAGGGTACAAAGTGGTCCATGTTACCCAAGGACTGCTCAAAGTGAAAGCATCGAAGAGTATTAGACAGGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467107 86 + 636262 TAGGTAGCTAGAGTAAGGGTACAAAGAGGTCCATGTTACCCAAGGACTGCTCAAAGTGAAAGCATTGAAGAGTATTAGACAGGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 477007 73 + 647215 TGGGTAGCTAGAGTAAGAGTACAAAGTGGCCCATGTTCTCCAAGGACTGCTCAAAGTGAAAGCAGCGAAGATT------------- - -a -s mr.mrrefChr3 22926 55 + 181019 CAGGTGTGAGTTAATATCACCTATATTGAAAGTTACTATCAGAAATACTACTACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467194 55 + 636262 CAGGTGTGAGTGAATATCACCTATATTGAAAATTACTATCAGAAATACTACCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 477080 55 + 647215 CAGGTGTGAGTTAATATCACTTATATTGAAGGTTACTATCAGAAATACTACTGCC - -a -s mr.mrrefChr3 22981 6 + 181019 CATAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467254 6 + 636262 CATAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 477135 6 + 647215 CATAAA - -a -s mr.mrrefChr3 22987 39 + 181019 CTTAATAAAACATAGCTAATAATCCCAACTTTCTATCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467266 39 + 636262 CCTAATAAAACATAGCTAATAATCTCAACTTTCTATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 477141 37 + 647215 CTTAA--AAACATAGCTAATAATCCCAACTGTCTATCCA - -a -s mr.mrrefChr3 23026 96 + 181019 GAGGGGGTTCATTCATGCCACAAAGATGCTGTCAATAAGCCAGTTGAGCCCAGTGAAGGGCACAATAGCCATGGAGGGTCCCTAAAGAAATTGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467305 96 + 636262 GAGGGAGTTCATTCATGCCGCAAAGATGCTGTTGATAAGCCAGTTGAGCCCAGTGAAGGGCACAATAGCCATGGAGGGTCCCTAAAGAAATTGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 477180 96 + 647215 GAGGGGGTTCATTCAGGCCACAACAATGCTGTCAATAGGCCAGTTGAGTCCACTGGAGGTCTCAATGGCCACGGAGGGTCCCTCAGGAAACCATCA - -a -s mr.mrrefChr3 23122 57 + 181019 TGCCGCTTGTATTTTAAAAGTGGGCAAACAAATTCTCTGCTGTTATCACTGGGGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467428 57 + 636262 TGCCGCTTGTATTTTAAAAGTGGGCAAACAAATTCTCTGCTGTTATCACTGGGGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 477276 57 + 647215 TGCAGCTTCTATTTTAATAGTTAGCGAGCAAATTCTATGCTGTTATCACTGGCACTT - -a -s mr.mrrefChr3 23179 18 + 181019 TGAACTGCTCTCAATGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467485 18 + 636262 TGAACTGCTCTCAATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 477355 18 + 647215 TGAGCTGCTCTCAGTGGT - -a -s mr.mrrefChr3 23197 337 + 181019 CAAGGAACCTATGCATTCCTTCCCCCCCTTGTTCACTCACTGTTACCAGGGGGCTGGAATGTATTGGTTATTAAGCATGCTACTGGTATCAAATTCCAGGGTGCTGTGGTGACACCCAGGGGAAACAAAAGTATAACCTGGCATAACTCATTTGCTTAAAAAGCACCAAAAGATGTGTCCTTAACTAATTATAATAACTTACTATGCAGGTTCTATGTATCAAGGAATTACCTCTGCCTAACTTATTAACCGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTACCCTGCCTGATGGCTAAGGGTCTTTAAGACTGGGCAACTACCCTTCACAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467504 337 + 636262 CAAGGAACCTATGCATTCCTTCCCCCCCTTGTTCACTCACTGTTACCAGGGGGCTGGAATGTATTGGTTATTAAGCATGCTACTGGTATCAAATTCCAGGGTGCTGTGGTGACACCCAGGGGAAACAAAAGTATAACCTGGCATAACTCATTTGCTTAAAAAGCACCAAAAGATGTGTCCTTAACTAATTATAATAACTTACTATGCAGGTTCTATGTATCAAGGAATTACCTCTGCCTAACTTATTAACCGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTACCCTGCCTGATGGCTAAGGGTCTTTAAGACTGGGCAACTACCCTTCACAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 477373 337 + 647215 CTAGGTACCTATGTATTCCTTCCCCCCCTTGCACACTCACTGTTAGCAGGGGGCTGGCATATATTCATTATTAAGCATGCTACTGATATCAAATCCTAGGGCGCTGTGGTGACATTCAGGGCAAACAAAAGTACAACCTGGCATAATTCATTTGCTTAAAAAGCACTAGAAGGTGTGTTCCTCACTAATTACAATAACTTACTATGAGGGTTTTATGTGTCAAGGATTAACTTCTGCCTAACTTATGAAGTGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTATACTGCCTGATGGCTGAGGGTCTTTGAGACTGGGCAACTACATTTCACTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 23534 24 + 181019 GGCTAATCATGTTTCCATGTGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467841 24 + 636262 GGCTAATCATGTTTCCATGTGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 477711 24 + 647215 GGCTAATCAGGGTTCCAAATTGTA - -a -s mr.mrrefChr3 23558 30 + 181019 ATCAGGAATATTGGCTATGATCCTTTTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467865 30 + 636262 ATCAGGAATATTGGCTATGATCCTTTTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 477787 30 + 647215 ATCAGCAGTATTGGCTATGATCCTCTTTAC - -a -s mr.mrrefChr3 23588 20 + 181019 CACCATAACTGCACCCCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467902 20 + 636262 CACCATAACTGCACCCCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 477817 20 + 647215 AGCCATAACTACACCCCAAG - -a -s mr.mrrefChr3 23608 13 + 181019 AGTTAGCTAAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467922 13 + 636262 AGTTAGCTAAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 477840 13 + 647215 AGTTAGCTAAGCG - -a -s mr.mrrefChr3 23621 104 + 181019 TGTAAAGAAACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGATTGTCTTAGTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTCCCTATGCTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467938 104 + 636262 TGTAAAGAAACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGATTGTCTTAGTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTCCCTATGCTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 477853 104 + 647215 CGGCAAGATACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGCTTGTCTTATTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTTCCTATGCTTAT - -a -s mr.mrrefChr3 23725 98 + 181019 GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACTTGTTTTAAAGCACTTCACTGTCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468045 98 + 636262 GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGAATACCTTCCTTTGCAAGGTCTTGTTTTAAGGCACTTCACTGGCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 477957 98 + 647215 GGATTGTATTAGCACTGTCTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACATGTTTAAAAGCACTTCACTCTCTGGGCTACTCAAGGGACATGTATTATCA - -a -s mr.mrrefChr3 23823 58 + 181019 ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468168 32 + 636262 ACACAAGCCTCAGACAGCTTAATGCTCCAGGC-------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 478055 58 + 647215 ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA - -a -s mr.mrrefChr3 23881 356 + 181019 ACAGCTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCTGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAAACTTCCAGCTTCACCTAACCCCACCATGACAGGATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATGTGCAACTGTTTACCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCATCAGGGCTCCGATGTGGGGTCAACCATCACTATCAAGGATCAACCAAAATTCCAGGCTGGGTGTCACATTGTCTTTCTTCACACTTCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGACATTCATATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468200 337 + 636262 ACAGTTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCCGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAA-------------------CCCACCATGACAGAATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATTTGCAGCTGTTTGCCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCAGCAGGGCTCTGATGTGGGGTCAAGCATCACTACCAAGGATCAACCATCATTCCAGGCTGGGTGTTGCATTGTCTTTCTTCACACTCCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGGCATTCATATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 478117 353 + 647215 ACAGCTCCATTCAGATGTGCATTGGCTATGGACCTGCTGCTTCGACAGTTGCATCTGCTGCTTCCCACAGTTGCCATAGGTTGTATATCAACACTTCCAGCTTCACCTAACCCCACCCTGACAGGATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATGCATGACTGTTCACCATGCACAACCTTAAGGGCAAGTAAAAACTAATCTGTCTGCTTCCAGTATAATTTGACAATTCATCAGGGCTCCGATGTGGGGTCAACCATCACTATGACAGATCACCCAAAATTCCATGCCAGGTGTCACCTTGTCTCTCTTCACACTTCAAGCTGTG---CACCCAGGTATAATTTAGACATTCAAATT - -a -s mr.mrrefChr3 24237 313 + 181019 TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACCACACCACAGCCGTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAATGGAACTCCTCTGCATTGTGCTTTCCTGTGCTCTGTAATGACTTGTGGGATGATCCCATTGTATGAACTAAAGTACTGATGCCATTGAACACAAGGGGTTACAGAGTGGACATAAGACTGTGTCCTGCAACTTGGACAACATCTCAGGTTAAGGATTGTTATTAATACTGCAATCCATTTGCACTTTGGCTCTTTAATTAGATACTTGATAACTAACATTGTCACCCTCCAAGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468537 308 + 636262 TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACTACAACACAGCTGTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAGTGGAACTCCTCTGCAGTGTGCTTTCCCGTGCTCTGTAATGACTTGTGGGATGATCCCATTGTATGAACTCAAGTACCGATGCCACTGACCACAACGGGTTAC-GAGTGGACATAAGACTCTCTCCTGCAACTTGGACAACATCT----TTAAGGATTGTTATTAATGCTCCAATCCATTTGCAATTTGGCTCTTTAATTGGATGCTTGATAACTAACATTGTCACCCTCCAAGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 478472 313 + 647215 TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACCACACCACAGCCTTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAATTGGACTCCTCTACATTGTACTTTGCTGTGCTCTGTAAGGGCTTGGGGGATAATCCCATTGTGTGAACTAAAGTACTTTTGCCATTGAACCTAAGGCATTACAGAATGGACATAAGACTGTGTCCTGCAACTTCAACCACGTCTCAGGTAAAGGACAGTTATTAACAGTGCAATCCATTTGCACTTTGGCCCTTTAACTAGATAATTCGTGACTAACATTGTCCCTCTCCAAAGGG - -a -s mr.mrrefChr3 24550 131 + 181019 CTTCAAAGTTGCAAACAGAGCATACGCAAGTCAATTGCATACCGGAGCCCTCAAATGGCAATTAGTCCCAAGCCAACAATGATTGTGGGCCCACACGTTATGTTGTAGAATTCATTGGTTATAACGACTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468846 131 + 636262 CTTCAAAGTTGCAAACAGAGCATACGCAAGTCAATTGCATACCGGAGCCCTCAAATGGCAATTAGTCCCAAGCCAACAATGATTGTGGGCCCACACGTTATGTTGTAGAATTCATTGGTTATAACGACTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 478785 131 + 647215 CTTCAAAGTTGCAAGCAAAGTATACACAAAGCAATTGCATACTGGAGCACTCAAATGGCAGATAGCCCCAAGCCAATAATGACTGTGGGCCCACCCGTTATGATGTAGCACTGACTGGTTATAACGACTTG - -a -s mr.mrrefChr3 24681 20 + 181019 GACCTGACTTATCACACCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468985 20 + 636262 GACCTGACTTATCACACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 478916 20 + 647215 GACCTGGCTTATCACACTAT - -a -s mr.mrrefChr3 24701 512 + 181019 TGATTACCAACAAACTGTGGATTTACTGATCACTATACAGCACTCATTGCCTCGTTTATCATAGCCAAAGCAGTAAGAATCTTTAACAGCGCTGTCTGCAAGGTAGGCCGAATACAATTGAAGGCTTTGATTTCATCACAGGATAGTCACATGCTAATGAATAGTGTTAGTGGCAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTGCTGGTTTGTTCTAGTAGTGTAAATCTCCACAAGATATTGAGGTAATGGAAAATAAACAGTGTCAACGCGAGGTGATTGCTCTTTATATAATGGAATGTATATATAAGCTCTAATATGCTTGACACACATTTGAGACATGTGATACTGAACTACAAGAAATGCTCACAATTGCTAGGCTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTACGACTCATGTTGATTCTCAGTATATACTAGAACTGGACCAATAGTGGTCCATGAATACCTCCCTGTGCCTATCTTCTCGTCTTTCAAGCATATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469006 506 + 636262 TGATTACCAATGAA-TGTGGATTTACTGATCACTATACAGCACTCATTGCCCTGTTTATCATGGCCAAAGCAGTAAGAATCTTTAACAGCGCTGTCTGCAAGGTAGGCCGAATACAA-TGAAGGCTTTGGTTTCATCACAGGATAGTCACATGCTAATGAATAGTGTTAGTGGCAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTG--GGCTTGTTTTAGCAATGTAAGTCTCCACAAGATATTGAGGTAATGGAAAATAAACAGTGTCAACGCGAGGTGATTGCTCAGCTTATAATGGAATGTATATATAAGCTCTAATATGCTTGACACACATTTGAGACATTTGATACCAAACTACAAGAAATGCTCACAATTGCTAGACTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTACGACTCATGTTGATTCTCAGTATATACTAGAACC--ACCTATAGTGGTCCATGAATACCTCCCTGTGCCTATCTTCTCGTATTTCAAGCATGTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 478936 472 + 647215 TGGTTACCAACAAACTGTGGA----------------CAGCACTCACTGGCTCGTTTATCACAGCCAAAGCAGCAAGGATCTTTAGCAGCTCTGTCTGCAAGGGAGGTTGAGTACAATTGAAGGTTTTGATTTCATCACAGG-TGGGTACATGCTAATGAATAGTGTTGGTTACAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTGCTAGTTTGTTCTGGTAGTTTAGATCTCCACAAGATATTGCAGTAATGGAAAATA-----------------------GCTTTTTATATAATGGAATGCATATATAAGCCCTAAAATGCTTGACACACATTTTAGACATGTGATACTGTACTACAAGAGATGCTCACAACTGCTAGGTTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTATCATTCATATTGACTCTCAGTACATACTAGAGCTGGACCAATAGTGGTCCATGAATGCCTTGCTGTGCCTATCTTCTTGTCTTTGAACCATATGTT - -a -s mr.mrrefChr3 25213 451 + 181019 TGGAGCCAGTCACCTGGATGGAGATGTTACTATGACTGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAGGTGGCACCATATAAGGTAGGGGGTCCCTTTGTTTATAATTCACAAATACGCATATACCATTGAAACACACCAAAACCCTGCGTACACAAGCCTGGTAATAGCTAATATTAACTTGCAAGATTGGAACACAGGATTGGCCAGGTTACCTGGCTGGCAGGAGAGACCCTTTAGCATTGGCATCCCTTGACAGCCTGAGTTGATGATTTAGGGTTAGTCTACAAAAAACAATAAATGTAAGAACCATCATTTTTCTCATACAGTTAATTGTCTCATACAGGTGAAGGTAGTCTAAAGGCTGCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTGACCTTGTTTTACAAGGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGTTACCAGTCTTTAGGTAGAATAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469515 435 + 636262 TGGA---------ATGGA----GATGTTACTATGACTGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAG-TGGCACCATATAAGGTAGGGAGACCCTTTATTTATAAT-CACAAATACGCATGTACCATTGAAACACACCAAAGCCCTGCGTACACAAGCTTGGTGATAGCTAATATTAACTTGCAAGATTGGAACACAGGATTGGCCAGGTTACCTGGCTGGCAGGAGAGACCCTTTAGCACTGGCATCCCTTGATAGCCTGAGTTGATGATGTAGGATTAATCTACAAAAAACAATAAATGTAAGAACCATCATTTTTCTCATACAGTTAATTGTCTCATACAGTTGAAGGTAGTGTAGAGGCTGCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTGACCTTGTTTTACAAAGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGT-ACCAGTCTTTAGGTAGAATAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 479408 426 + 647215 TGAAGCCAGTCACCTGGATGGAGATCTTACTATG--TGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAGGTGGCACCATATAAGGTAGGGGGTCCCTTTGTTTATAATTCACAAATACACACATACCATTGAAACACACCAAAACTCTGCGTACAC----CTGATAATAGCTAATATTAACTTGAAAGATTGGAACACAGGATTGGCAAGGTCACCTGGCTGACAGTAGAGACCCTTTAGCATTGGCATCC--TGGCAGCCTGAATTGATGATTTACGGTCAGTCTATGAAAACCAATAAATGTAAGAACCACCATTT-----------------GCCTCATTCAGGTAAAGGTAGTCCAATGGCTCCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTCATCTTGTTTTACAAGGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGTTACCAGTCTTTAGGTAGAATACT - -a -s mr.mrrefChr3 25664 19 + 181019 TAAAATTTGTATGAAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469950 7 + 636262 TAAAATT------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 438821 19 + 647215 TAAAATTTGTATGAAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 479834 19 + 647215 TAAAATTTGTATGAAACTT - -a -s mr.mrrefChr3 25683 1 + 181019 T -s simRat_chr6.simRat.chr6 479853 1 + 647215 T - -a -s mr.mrrefChr3 25684 42 + 181019 AAGGCTCTTAAGAATGAACAGCTTCAAGAGGTAACGATAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469957 4 + 636262 --------------------------------------AATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 438840 42 + 647215 GAGGCTCTTAAGAATGAACAGCTTCACGGGGTAACGATTGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 479854 42 + 647215 AAGGCTCTTCGAAATGAACGGCTTCAAGAGGCAACGATAATT - -a -s mr.mrrefChr3 25726 134 + 181019 CATACATTTTTGTCAGAGACATGGCCCAGTGTAAACTTAGCATCATAAAAACTTTTATTTCTGGTACATTTATACTATGTCAACTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTGTGAATTTCTACCAAAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469961 133 + 636262 CGTACATCTTTGTCATAGACATGGCCCAGTGTAAACCTAGCATTGTAAAAACTTTGATTTCCTGTACATTTATACTATGCCA-CTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTCTGAATTTCTACCAAAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 438886 133 + 647215 CACACATTTTTGTCAGAGACATGGCCCAGTATGAACTTAGCATCATATAAATTTTTATTTCTGGTACATTTATACTATGTAAACTAAAGTAAGAATTTTGCTACTGGAGGAGTTTGTGAATTTCTATCCAAG-C -s simRat_chr6.simRat.chr6 479896 130 + 647215 CATACATTTTTGTCAGAGGTATGACCAAGTGTAAACTTAGCATCATAAAAACTTTTA---CTGGTACATTTATACTACATCAACTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTGTGAATTCCTACCAAAG-A - -a -s mr.mrrefChr3 25860 10 + 181019 ATCTCCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470094 10 + 636262 ATCTCCCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 439022 10 + 647215 ATCTCCCGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 480026 10 + 647215 ATCTCACAAA - -a -s mr.mrrefChr3 25870 430 + 181019 AATGAGTTTGTAAAATCAATGGATTGATAGTGATGGGGTTGTATATATGACTCCTTTCACTCTGCATGCTAACATTGTTCAGAATTTATTTTTGTAGATGACTTTTCATGTTATGGCAGGAGTATCAATTGGCTTGAGCCATCAGAAAATTGTTCATCCCTGAATAGCTTGTGCACTTGGAGACAGCTGTGATCTCTGAGTGAACCTCTTAGACAAGATAGCTACATAAACCTATAGAGTACACCTAAGTTCTCTTTGCACTACCCCTCAGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCACACGTCCTAAATTACTTACACTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTGTGTTCAAGTCCACCCAACACTCTGGATCACTATGTTATCAAAACCACTACAAATCTCCACATGTTTCGCATTAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470104 429 + 636262 AATGAGTTTGTAAAATCAATGGATTGATGGTGGTGGGGTTGTATGTAGGACTCCTTTCACTCTGCATGCTAACATTGTTCAGAATTTATTTTTGTAGATGACTTTTCATGTTATGGCAAGAGTATTAATTGGCTTGAGCCATCAGAAAATTGTTGATCCTTGAATAGCTTGTACACTTGGAAACAGCTGTGATCTCTGAGTGAACCTCTTAGACAAGATAGCTACATAAACCTATAGAGTATACCTAAGTTCTCTTTGTGCTACCCCTCAGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCA-ACGTCCTAAATCACTTACAGTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTACATTCAAATCCACCCCACACTCTGGATCACTATGTTATCAAAACCACTACAAATCTCCACATGTTTCACATAAGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 480036 430 + 647215 AATGAGTTTGTAAAATCGATGGATTAATAGTGATTGGGTTGTATATGTGACTCCCGTCACTTTGCATGCTAATCTTGTTCAGAATCTATTTTTGTAGGTGACTATTCTTGTTATGACTGGAGTATCAATTGGCTTGGGCCATCAGAAAAATGTTCATCCCTGAATAGCTTGTGCACTTGGAGACAGCTATGACCTCTGAGTGAGCTTTATAGACAAGATTGCTACATAAACCTTGATAGTACACCCAAGTTCTTTTTGCACCACCCCTCGGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCACAGATCCTAAATTACTTAAACTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTGTGTTCAAGTCCACCCAGTACTCTGAATCATTATTTTATCAAAACCACTACACACCTCCAGGTGTTTCGCATTAGGCA - -a -s mr.mrrefChr3 26300 55 + 181019 TATGGGCACTTGCTATGACCACTACCTGAGGAGTGGTAGGTAGAGCGAGGAGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470536 55 + 636262 TGTGGGCGCTTGCTATGACCACTACTTGAGGAATGGTAGGTAGAGCGAGGAGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 480466 55 + 647215 TATGGGCACTTGCTATGACTACTACCTGAGGAGTGGTAGGTAGATTGAGGAGTAG - -a -s mr.mrrefChr3 26355 8 + 181019 AGGTAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470591 8 + 636262 AGGTAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 480522 8 + 647215 AGGTAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 26363 38 + 181019 TAAATATACAAATACATACGACTGAGCACTAATTAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470599 38 + 636262 TAAATATACAAATACGTACGGCTGAGCACTAATTAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 480534 38 + 647215 TAAACATATAAATACATATGACTGGGCACTAATTAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 26401 110 + 181019 GTATCACATCAGATCTAGGCACTAAAACTCAATTTATGACCAGTGCTTTTATGACCATAGCTAAGCCCAACTAAAAAAGGAAGTAGCAATGAAAAAATCAGCTTAGCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470637 110 + 636262 GTATCAAATCAGATCTAGGTACTAAGACTCAATTTAAGACCAGTGCTTTCATGACCATAGCTAAGCCCAACTAAAAAAGGAAGTAGCAATGAAAAAATCAGATTAGCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 480590 110 + 647215 GTATTACATCTGATCTAGGCACAAAAACTCAATTTATGACTGACGCTTTTATGACCGTAGCTAAGCCCAACTAATAAAGGAAGTAGCAACGAAAAAATCAGCTTACCAGT - -a -s mr.mrrefChr3 26511 71 + 181019 AACACCAGGTTGAGACAACTGTCTTCAACCTGGTTAGGTAGACACAAGAAGGGCCTTTATTATGTTCTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470751 71 + 636262 AACACGGCATTGAGACAACTGTCTTCAACCTGGTTAGGTAGATGCAACAAGGGCCTTTATTATGTTCTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 480700 71 + 647215 AACACCAGGTTGAGACAACTATCTTCAACCTGGTGAGGTAGACATAAGGAGGGCCATTATTATGTTCTTCT - -a -s mr.mrrefChr3 26582 100 + 181019 TCCACCCACAGAAAGCAGGAGTTATCTTACACTTGAGGTTCCACTTAGGGAGGTTTGTGGAAGATTTACTACAAGGGTGAGGGGCAGGCTCGTTGAGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470823 100 + 636262 TCCACCCACAGAAAGCAGGAGTTATCTTACACTTGAGGTTTCACTTAGGAAGGTTTGTGGAAGATTGACTACAAGAGTGAGGGGCCGGCTGGTTGAGCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 480771 86 + 647215 TCCACCCACAGAATGC-----------TACACTTGTGGTTCCACTTAGGGAGGTTTGTGGAA---TTACTACAAGGGTGAGGGGTAGGTTCATTGAGCTC - -a -s mr.mrrefChr3 26682 37 + 181019 TAGATGCAGAATTATGTAGGGACTATTACTAGGGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470935 37 + 636262 TAGATGCAGAATTATGTAGGGACTATTACTAAGGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 480857 37 + 647215 AAGATGCAGTTTTATGTAGGGACTATTACTAGGCTAG - -a -s mr.mrrefChr3 26719 137 + 181019 CAAAAGACATTTACTGCATGGCCTTAAAGACAGATATCAATTTTGCCCCTGTATCTTCCTGTCTTGGCATGTAATGACTCTCACATTCTTCAGGAGTATGTTGTCCAGGAGACCTTAGTAAATCTTTGCTCATTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470976 137 + 636262 CAAAAGACATTCACTGCATGGCCTTAAAGACAGAAATCAATTTTGCCCCTGTATTTTCCTGTCTTGGCAGGTAATGACTCTCACATTCTTCACGAGTATGTTGTCCAGGAGACCTTAGTAAATCTTTGCTCATTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 480894 136 + 647215 -GAAAGCCATTTACTGCATCACCTTAGAGTAAGATATCCATTTTGCCCCTTTACCTACTTGTCTTGGCATGTAATTACTCTCATATTCTTCAGGAGTCTGTTGACCGGGAGGCCTTATTAACTCTTCGCTCATTAGA - -a -s mr.mrrefChr3 26856 144 + 181019 TATGCTAACCCTCATCTGCCATCACCATTATTTAAGAACATTGGTCTATGAGCTTATGCTTAAGAGGACCCCTGGCTGTGTCCGTGTTTGGTATTGTTTGGCTTTTGTCTGCATCCATCCTTAGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471113 144 + 636262 TATACTAACCCTCATCTGCCATCACCATTATTTAAGAACATTGGTCTATGAGTTTATGCTTAAGATGAACCCTGGCCGTGTCCGCGTTCCATATTGTTTGGCTTTTGTCTGCATCCATCCTTGGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 481032 144 + 647215 TGTGCTAACCCTCAACTGCCATCCCCATTGTTTAAAAACACTGGTCTATGAGCTTGTGGTTAAGAGGACCCCTGGATGTGTCCATGTTTGGTATTGTTTAGCTTTTGTCACCAACCATCCTCAGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC - -a -s mr.mrrefChr3 27000 52 + 181019 ATAGGCTGACAATCAAATCATTCCACCTGTTATTATCATCAATTCATAGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471257 52 + 636262 ATCGGCTGACAATCAAATCATTCCACATATTATTATCATCAATTCATAGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 481184 52 + 647215 ATAGGCTAACAACCAAACCATTCCGACCGTTATCATCATTAATTCATAGAGA - -a -s mr.mrrefChr3 27052 23 + 181019 ACAGGGTTAGGATACTTGATTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471313 21 + 636262 ACAGGG--TGGATGCTTGATTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 481236 23 + 647215 ACAGGGTTAGGATACTTGATTGG - -a -s mr.mrrefChr3 27075 132 + 181019 AAGAAATGCTAACATTGCAAATTGGCATTGGGATTTGTCTAAATCTGCTTAGAGTATCTAGTTGAACAGCCCCCAGAAGGTGACCAAACGTTGGAGAAAGCAGATAACACTCAATACAATAAAGCTGGGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471334 131 + 636262 AAGAAATGCTAACATTGCAAATTGGCATTGGAATTTGTCTAAATCTGCTTAGGGTATCTAGTTGAATAGCCCCCAGAAGGTGACC-TACATTGGAGAAAGCAGATAACACTCAATACAATAAAGCTGGGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 481261 132 + 647215 CAGTAGTGCAAACATTGCAAATTGGCGTTGGGATTTGTCTAAATCCGCTTAGAGTATCTAGTTGATCAGCCCTGGGAAGGTGACCAAATGTTGGAGAAAGCAGAAAACACTCAAGACACTAAAGCTGGGGGA - -a -s mr.mrrefChr3 27207 204 + 181019 TGAGATGGACAAACCATCATCAGAGGGACCAATTTTCTCTGATTATGCTGAGTTAGTGTACATCCAGATTTGATCTCTCTTAGAATCTCAAATGGCAAATGTTAGACAATCTTTTGGATGCAATTTCTAGAGCATAGGTTCTAATTCATGCCAATGGAGAGGCAAGGATGTATAACACTTATTTTATGAGGCATGCTTGTTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471466 200 + 636262 GGAGACGGACATACCATCATCAGAGGGACCAAGTTTCTCTGATTATACTGAGCCAGGGTACATCCAGGTTTGAACTCTCTTAGAATCTCAAATAGCACA--CTAGATAATCTTTTGGATGCAATTTCTAGAGCATAGGTTCTAATCCATGCCAAAGGAGAGGCAAGGATATATAACACTCATTTTA--AGGCATGCCTGCTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 481393 176 + 647215 TGAGATGGACAAACCCTCCTCAGAGGGACCAATTTTCTCTGATTATGCTGAGTTGGTGTACTTCTAGATTTGATTTCTCTTCGAATCTCAAATGGCAAATGTTAGACAATC----------------------------TCTAATTCATGCACATAGAGAGGCAAGGATGTATAACACTTATTTTATGGGGCATGCTTGTTACA - -a -s mr.mrrefChr3 27411 156 + 181019 GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTTACTGATATCATTGGACCTACCTGTAATGGGGAAGCCCTCTGGACCATGCAAGGCTGAGGAGTGGACCACTAGATGGAATTGCTAGTACAAGAATTAAATAGATCATCATGATTGTAGCACTATAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471666 131 + 636262 GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTT-------------------------ATGGGGAAGCCTTCTGGACCATGCAAGGCTGAGGAGTAGACCACTAGATGGAATTGCTAGTATAAGAATTAAATAGATCGTCATGATTGTAGCACTATAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 481570 156 + 647215 GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTTACTGATATCATTGGACCTACCTGTAATGGGCAAGCCCTTTGGTCCATGCAAGGCTGAGGAGTGGACCACTAGATGGAATTGCCAGTACAAGAATTAAATAGATCATTATGATTGTAGCACTATGAA - -a -s mr.mrrefChr3 27567 11 + 181019 AAAGGGTAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471797 11 + 636262 AAAGGGTAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 481730 11 + 647215 AAAGATTAAAT - -a -s mr.mrrefChr3 27578 192 + 181019 CCTGCTCATATCAATGATTAAAAGGAAAAACCAAGGATGTTCAAGTGAGAAAACAAGAAAATGGATGATCCTACTAGTAAGGAGGTGTAAATTATTCAATTAGCATCTATGGTCAGTTACATTAATGGTACAGAAGCAGGGGTACTCAGATGCTTAATAATTTTGACCTTGAGCTATTCCAGATCTAATGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471808 192 + 636262 CCTGCTCATGTCAATGACTAAAAGGAAAGACCAAGGATGTTCAAGTGAGAAAATAGGAAAATGGATGATCTTACTAGTGAGGAGGTGTAAGTTATTCAATTAGCATCTATTGTCAGTTACATTAATGGTAAAGAAGCAGGGGTCCTCAGATGCTTAATAATTTTGACTTTGAGCCATTCCAGATCTAACGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 481830 191 + 647215 ACTATGAATATCAAAGATTAAATGGAAAAAGCAAGGATGTTTAA-TCAGAAAACAAGAAAATGGATCATCCTACTAGTAAGGAGGTGTAAAGTATTCAATTAGCATTTATGGTCAGTTACATTAATCGTACAGAAGCATAGGTACTCAGATGCTTAATAATTTTGACCTTGAGCTGTTCCCAATCTAGTGTA - -a -s mr.mrrefChr3 27770 94 + 181019 ACTTACTACACTTCACCCTGCCTTAGTGCATGGTCCTGGCCTGAGCTCTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAACTCTGATTGCAGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472004 94 + 636262 ACTTACTACACTTCACCCTGCCTTAGTGCATGGTCCTGGCTTGAGCTCTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAGCTCTGATTACAGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 482021 94 + 647215 ACATACTACACTTCACCCTGCCTTACTGCATGGTCCTGGCCTGAGCTTTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAAATCTGATTGCAGACA - -a -s mr.mrrefChr3 27864 32 + 181019 GCAGTTGCATGACTATGATGATCCTTGTACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472098 32 + 636262 GCAGTTGCATGACTATGATGATCCTTGTACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 482123 30 + 647215 GCAGTTACATGATTATGATGATCCTTTCAT-- - -a -s mr.mrrefChr3 27896 27 + 181019 TTGGCCAGACAAAGTCTTAATGTTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472133 27 + 636262 TTGGCCAGACAAAGTCTTAATGTTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 163578 27 - 647215 TTGGCCAGATAAAGTCTTAAAGTTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 27923 41 + 181019 AGGGGGAGTTATCGTCACTTTCTATTGTCTGGTGTCCTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472161 41 + 636262 AGGGGGAGTTATCGTCACTTTCTATTGTCTGGTGTCCTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 163605 41 - 647215 AGGGGGAGTTACCTTCCCTTTCTATTATCTGGTGTCCTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 27964 219 + 181019 AAGCAAGCGACCAACAAAAACAGGTGACTAACTGCAGAATTGTACGATTATGACTCTGCTCATTTGGAGGACCATATCTAATGCAGGTACCAGCACCCCTAGCCACCCTATCCAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCAATGCACCTCCTTGTTGATTGGAATCCATCATCTAATGTACCCCAGACTGAGAGCCAACTCAAATGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472203 219 + 636262 AAGCAAGCGACCAACAAAAACAGGTGACTAACTGCAGAATTGTACGATTATGACTCTGCTCATTTGGAGGACCATATCTAATGCAGGTACCAGCACCCCTAGCCACCCTATCCAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCAATGCACCTCCTTGTTGATTGGAATCCATCATCTAATGTACCCCAGACTGAGAGCCAACTCAAATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 163646 219 - 647215 GTGCAAGCAACCAACAAAACCAGATGGCTAACTACAGAATTGTACTATTGTGACTCTGCTCGTTCGGAGGACAATTTCTATTTCAGGTACCAGTATCCCTAGCCACCCTATACAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCGATGAGCCTCCATGTTGAGTGGAATCCATCATCTAATATACCCCAGACTAATAGCCAATTTAAATCGC - -a -s mr.mrrefChr3 28183 172 + 181019 CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCCTACACTCATAGCCACCTCAAAAGGTGGCAGCCACCCCTTACATATGTAAAAAGATCTAAGGGGCTTATATGGATTTCAAGCCTACTCATGTTTTTAGATTATCTGCTGAGTGTTTTTGGCTTGCACCTGTATCCTGGATATCTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472422 172 + 636262 CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCCTACACTCATAGCCACCTCAAAAGGTGGCAGCCACCCCTTACATATGTAAAAAGATCTAAGGGGCTTATATGGATTTCAAGCCTACTCATGTTTGTAGATTATCTGCTGAGTGTTCTTGGCTTGCACCTCTATCCTGGATATCTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 163870 172 - 647215 CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCATATACTAATAGCCACCACAAAAGGTTTCGACCCTCCCTTACATATATATGAAGATCCAAAGGGCTCACGTGGACCTCAAGCCTACTCATGTTTTTAGATTATCTGTAGAGTGTTTTTGGCTTGCATCTGTATCCTGGATATCTATT - -a -s mr.mrrefChr3 28355 206 + 181019 CTGGATGCCTGACATTGGAAAAGATGGGGGCCATGGATGAATTAAATGTATAAAGTTGAGGACACACTATCATGTAACAGTCTGGTCAGTAATCAATTAAAAGAAGCCAAACTCGGAAGGCTCCAGACCAGGGGTACATTGAGTGCTACATGGATTGCAAATTCACAGTCAATAGTGAATATTGGCTACCAGTACATTCTTAAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472595 202 + 636262 CTGGATGCCTGACATTGGAAAAGATGGGGACCATGGATGAATTAAATGCATAAAGTTGATGACACACTACCATTTAACAGTCTGGTGAGTAATCAATTAAAAGA--CCAAACTCGG-AAGCCCCAGACCAGGGGTACATTGAGTGCT-CATGGATTGCAAATTCACAGTCAATAGTGAACATTGGCCACCAGTACGTTCTTAAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 164042 203 - 647215 CTGGGTGACTGACATTGGAAAAGATGGGGGTTGTGGATGAACTAAATGTAAAAAGTTGAGGACA---TATCATGTTACAGTTTGGGCAGTAATCAATTGAAAGAAGCCAAACTCGGAAGGCTCCAGACCTGGGATACATTGAGTGCTACATGGATTACAAATTCACAGTCAATAGTGACTATTAGCTACTGGTACATTCTTTAAAC - -a -s mr.mrrefChr3 28561 57 + 181019 ATCTAAGCTTAAACCTAATAGTCAGGATATTGCAATGTAGTGCCTGGAACTTTGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472799 57 + 636262 ATCTAAGCTTAAACCTAATAGTCAGGATATTGCAACATAATGCCTGGAACTTTGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 164245 57 - 647215 ATCTAAGCTTAGCCCAAATAGTCAGGATATTGTAATGTAGTGCCTGGAAGTGTGCAT - -a -s mr.mrrefChr3 28618 10 + 181019 TCAATTCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472857 10 + 636262 TCAATTCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 164302 10 - 647215 TCAATTCCAT - -a -s mr.mrrefChr3 28628 17 + 181019 CCTATATTCCCACAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472867 17 + 636262 CCTATACTTCCACAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 164313 17 - 647215 CCTGTATTCCCACAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 28645 24 + 181019 CTGGAATTGAATTGGAAGTTAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472896 24 + 636262 CTCGTATTGAATTGGAAGTTAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 164330 24 - 647215 TTGAAATCGAATTGCAAGTTAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 28669 261 + 181019 TTCTTTTCCTTGTTTGGTTTGTCTGCTAGAAGGATTAGTACGTCATGTTTTGTCTTCTACAATGGCAGTGTAGCTGACCTGAAAACTAAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTCTTATGGAGCTTTCTATGGTGTGACCTTGAGGGGGAGATCTAGAGGAACTTATCTTATAAGTGAAGATAGTAGCTCTGACATGATGGATGAGGAATCCCTCTTGAGTATACAGTGCCACCCAGGATGAAATCTCAAGGAACTCCAAAGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472920 251 + 636262 TTCTTTTCCTTGTTAGATTTGTCTGCTAGAAGAACTAGTACATCATGTTTTATCTTCTGCAATGGCAGTATAGCCGACCTGAAAACTGAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTATTATGGGGCTTTCAATGGTGTGAC----------AGATCTAGAGGAACTTATCTTATAAGTGAAGATAGTAGCTCTGACATGATGGATGTGGAATCCCTCTTAAGTATACATTGCCACCCAGCATGAAATCTCAAGGAACTCCAAAGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 164355 258 - 647215 TTCTTCCCCTAGTTTGGTTTGTCTGCTAGAAGGATTGGTACGTCATGTTTTGTGCTCCACAATGTGAGTGTAGCTCACCTGAAAATTAAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTCTTATGGAGCTTTCTATGGTGTGACCTTGAGGGGGAAATCTAGAGGAAC---TCTAATTAGTGAAGATAATAGCTCTGATGTGATCAATGAGGAATCCCTCTTGAGTATACAGTGCCACCCAGGATGAAATCTCAAAGACCTCCAATGACA - -a -s mr.mrrefChr3 28930 62 + 181019 CAGGAATCCCCACCTCACTGTCTTGAAATAGCTCACATAAAGGAAAGAGTCTTTTAAGAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473172 62 + 636262 CAGGAATCCCCACTTCACTGTCTTGAAATAGCTCACATAAAGGAAAGAGTCTTTTAAGAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 164613 62 - 647215 CAGGAATCCCCACCTCACTGGCTTGAAATAGTTCACATAAAGGAAAGAGTCTTTCAAGAGAC - -a -s mr.mrrefChr3 28992 19 + 181019 CTCCACTTATATGAGTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473234 19 + 636262 CTCCACTTATATGAGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 164677 19 - 647215 CTCATCTTATATGAGTTAA - -a -s mr.mrrefChr3 29011 110 + 181019 GGTGATGTTTTAGGTGTCACTCCCTTAGGTGTCGCTTCTTTGACACTGTTCATGACACTTAGTATGATATATTCATATGGCTTGCCATCCCGATTATATGGTCAAATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473253 110 + 636262 GGTGATGTTTTAGGTGTCACCCCCTTAGGTGTCGCTTCTTTGACACTGTTCATAACACTTAGTATGATATATTCATATGGCTTGCCATCCCGATTATATGGTCGAATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 164697 110 - 647215 GGTGAGGTTTTGGGTGTCACTCACTTGGGTGTCACTGCCTTGACACTGTTCATGCCACTTAGTATGATATATTCATATGGCTTGCCATCCCGATTATATGGTCAACTTTG - -a -s mr.mrrefChr3 29121 114 + 181019 AATAGAGCAGGGGTAGACCATGATATTGGGTAGAACAGGATTTTCCAATACCAATACTTCTGTCAAGCACCAGAGGAATATAGATCAAGGTTGAGAAAGTATTGATATTTTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473363 113 + 636262 AATAGAGCAGGGTTCGACCATGATATTGGATAGAACAGGATTTTCCAATA-CAATACTTCTGTCAAGCACCAGAGGTATACAGATCAAGGTTGAGAAAGTATTGACATCTTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 164849 114 - 647215 AATAGAGCAGGGGTAGAATATGATATTGGGTATAATGGGCTTTTCCACTACCAATACTTCTGTCTAGCATCAGAGGAATCTAGATCAAGGTTAAGACAGTATTGGTATTTTTCT - -a -s mr.mrrefChr3 29235 99 + 181019 TTGCTACAGCTGTTGAGCATTTCTATGTGTTTTGGAATCTTGGGCAGATCACAAGAATAGGTTTATTTGGGGTAAATAAAGTCACTTTAAGATGAGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473477 99 + 636262 TTGCTACAGCTGTTGAACATTTCTATGTGTTTTGGAATCTTGGGCAGATCACAAGCATAGGTTTATTTGGAGTGAATAAAGGCACTTCAAGATGAGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 164963 99 - 647215 TTGCTAGAGCTGTTGAGCACTTCTATGCATTTTGGAATTTTGGGCAGATCACAAGAAAAGGTTTACTTGGGGTAAATAAGGTCGCTTTAAGATGTGTAC - -a -s mr.mrrefChr3 29334 193 + 181019 TAGTTAAGCTACATCATCGGAATTGGTGGATGAGTATAATTGCATCAAAGGCATAGAAGAAGTAACGTGGAGAACGATTCAGCTTTTCATGACATGCTAGAAAGTTTACCCCCTATCAATAATCACCAAGGTGAGTAATCTTGACGACCAGGGGACCACTAGGAATCCTTACTGATAGAACTTATATCATGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473576 192 + 636262 TAGTTAAGCTGCATCATCGGAATTGGTGGATGAGTATAATTGCATCAACGGCATACAAGAAGTGACGTGGAGAATG-TTCGGCTCTTCATAACATGCTAGAGAGTTTTCCCACTGTCAAGAATCACCAAGGTCAACAATCTTGACGACCAGGGGACCACTAGGAATCCTTACCGCTAGAGCCTATATCATGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 483642 191 + 647215 TAATTAAGCTACATTATCGG-ATTGGTGGATGAATATAATTGCATCAAAGGCATAGAAGAA-TAAGGTGGAGAACGATTCAGCTTTTCATGACATGCTAGAAAGGTTACCCCCTATTAATAATCACCAAGGCGAGTAATCTTGACGACCAGGGGACCTCTAGAAAACCTTGCTGATAGAACTTATATCATTCA - -a -s mr.mrrefChr3 29527 233 + 181019 TACTAAAGGCATGCAGATGTGTTGCCAGCTCTCAACCAAGAGTCAAGAGTCAATTTAATCTGCAGATTAATAAAGATGCTGTCCAGTGCTCATGCAGTAGCTTTCTGCCTTGAATTATTCTGATGTCCATCCATCAATAACTCTGATCACTTGAGAGCAGGACTGTCTACAGGTTGTGCACCTGTGTTGAAAGGTGCTAGACTGGACCTGGGTCCATATTCAGAAGAGATCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473768 232 + 636262 TACTAAAGGCATGCAGATGTGTTGCCAGCTCTCAACCAAGAGTCAAGAGTCAATTTAATCTGCATATTAATAAAGATGGTGTCCAGTGCTCATGCAGTAGCTTTCTGCCTTGAATTATTCTGATGGCCATCCATCAATAGCTCTGATTACTTGAGAGCAGGACTGTCTACAGGTTGTGCACCTGTGTTAAAAGGTACTA-ACTGGACCTGGGTCCATATTCAGAAGAGATCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 483837 232 + 647215 TACTAAAGGCATGCGGATGTGTTGCCAGCTCTCATTCAAGAGTCAAGCGTCCATTTAATATGTAGCTTAATAAAGTTGCTGTCCAGTGATCATTCAGTAACTTTCTGCCTTGAATTG-TCTGATGTCCATCCATTAATAACTCTAATCACTTGAGAGCAGGACTGTCCACAGGTTGTACACCTCTGTTGAAAGGTGCTAGACTGGCCCTTAGTCCATATTCAGAAGAGATCCT - -a -s mr.mrrefChr3 29760 22 + 181019 GCACCATTGTCACTTCTTTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474000 22 + 636262 GCACCATTGTCACTTCTTTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 484070 14 + 647215 GTAACAAAATCAGT-------- - -a -s mr.mrrefChr3 29782 179 + 181019 TGCCAGATACCAAATTGAAACCTCTGTATTAGTATAGCATGTGCATTATTTATAACAACAGCTCCTAATGGCCCTACCTAGAAGGGGCAAAAGGCAAGGCAGATTGAGGGAGCCTGACTTGTCATAATTCGCGCTTTTCCAAAGGGCCTTCCATGATGATGTTGGTCAAATCATTTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474036 179 + 636262 TGCCAGATACCAAATTGAAACCTCTGTATTAGTATAGCATGTGCATTATTTATAACAACAGCTCCTAATGGCCCTACCTAGAAGGGGCAAAAGGCAAGGCAGGTTGAGGGAGCCTGACCTGTCATAATTGGCGCCTTACCAAAGGGCTCTCCAAAATGATGTTGGTCGAATCATCTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 484084 106 + 647215 ----------------------------------------------------------------------GCCCTACGCAGAAGGGGCAAAATGCAAGGCAGATTGAGAGAGCTTGACTTTTCATAATCCGCGCTTTTCCACAGGGCCTTCCGTGATGATGT---TCAAATCATTTTTG - -a -s mr.mrrefChr3 29961 17 + 181019 TGAATATAGGTCTAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474233 17 + 636262 TGGATAGAGGTCTAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 484190 12 + 647215 TTAGTGT-GGTCT---- - -a -s mr.mrrefChr3 29978 39 + 181019 ATAGAAAGTACGGTGCCCTTGTGTGAATTCAAGTTACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474256 39 + 636262 ATAGAAAGTACGGTGCCCTTGTGTGAATTCAAGTTACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 484202 39 + 647215 ATAGAAAGCGCAGTGCCCTGGTGTGAATTCAAGTTACTT - -a -s mr.mrrefChr3 30017 123 + 181019 GGACTAGAAAATACATGATGCTGAAGCCTGCCATTCAAGGATTAATAATACCCAAGAAGGCACTCCTCTTATCCCCATGTATAAAAACAACCGCATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474298 123 + 636262 GGACTAGAAAATACATGATGCTGAAGCCTGCCATTCAGGGATTAATGATACCCAAAAAGGCACTCCTCTTATCCCTATGTATAAAAACAACCGCATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 484241 123 + 647215 GGACTAGAAAGTACATCATGCTGAAGTCTACTATTCAAGGATGAGTAATACCCATGAGGGCACTCCTCTCATCCCCATGGGTAAAAACAACCACATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAGA - -a -s mr.mrrefChr3 30140 12 + 181019 AAGATGGATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474722 12 + 636262 AAGATGTAACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 484364 12 + 647215 GAGATGGATTTG - -a -s mr.mrrefChr3 30152 367 + 181019 GTATTTGCTTAAATATAGAGGCCTGACAAGTCTTTTTGGACAGAATTGGAGGATTGCAAATAATAACATTTCCCTTGGTTCTCGTAACAAGATTGTAATGTTGGGTTGGAACTAAGGTAGTTAGAATTTAGCATTGCAGCAATCTAGTACTTGTATGTGACACACGGTTGGAATGGCTCACCCAACCCCAAGCTCCTTGAATTGAGTGACTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACATCTTGAAGGTTAGTAAGCACAAAGGTGATGATTGACTCTTCAAGTGTTGATTGATAGGACAGCAAGGGGTTGCACAGTTCCAGCAGGTTTCCATGTCCAACACAAGGTATTGTAATCTTCTCTAAATTGGGAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474735 313 + 636262 GTATTTGCTTAATTATATAGGCCTGACAAGTCTTTTTGGACATAATAAAAGGATTGCAAATAATAACATTTCCC---------------------------------------------------ATTTAGTATTGCAGCAATCTAGTACTTCTATGTGACG---GGTTGGAGTGACTCACCCAACCACATACTCCTTGAATTGAGTTACTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACACCTTGGAAGTTAGTAAGCACAAGGGTGATGATTGAGTCTTCAAGTATTGATTGATACAACAGCAAGGGGTTGCACAGTTCCAGCAGGTTTCCATGTCCAACACAAGGTATTGTAATCTGCTCTAAATTAGGAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 484376 367 + 647215 ATATTTACTTAAACATAGAGGCCTGACAAGCCTTTTTAGAGAGAAATGGACGATTGCAAATAATAACATTTCCCTTGGTTCTCGTAACAAGATTGTAATGTTGGGTTGGAACTAAGGTAGTTAGAACTTAGCAATGCAGCAGTCGAGTACTTGTAGGTGACACACGGTTGGAATGGCTCACCCAATCCCAAGCTCCCTGAATTGAGTGATTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACATCTAGAAGGTTAGCAAGCACAAAGGTGATGATTGACTCTTCAAGTGTCGATGGATAGGACAGCAAGGGGTTGCAAGGTTCCAGCAGGTTTCCATGTTCAACACAAGGTATTGTAATCCTCTCTAGATTGGGAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 30519 31 + 181019 CCCATGCATCCCAGACTCAGCATTTTCAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475049 31 + 636262 CCCATGCATCACAGACTCAGCATTTTCAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 484743 31 + 647215 CCCATGCATCCCTGACTCAGCATTTTCAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 30550 174 + 181019 CTACTATGGCTGTTAGCTGGCTTTTTAAGCACAATTAATCCAAACGTTGAGACGCAACGATCATTAGAAGACCTTCATGGGCCATCCATTGTTATAGACAAACAGTGTTCATAGAGTGATAGTGAACAGGGATGGTCTACAGCCTGAGTGGCCCACCTAATTCACATCGAGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475084 160 + 636262 CTACTATGGCTGTAAGCTGGCTTTTTAAGCACAATTAATTTGAACGGCAAGACCCGACGATCATTAGAAGACCTCCATGGGCCATCCGTTGTTCCAGACAAACAGTATTCTTAGAGTGATGGTGA--------------CAGCCTGAGTGGCCCACCTAATTCACATCGAGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 484774 174 + 647215 CTACAATGGCTGTTAGCTTGCTTTTTAAGCACAATTAATCCAAATGTTGAGACGCAACGATCCTTAGACGGCCTTCATGGGCCATCAATTGTTATAGACAAATAGTGTGCAAAGAGTGATAGTGAACAGGGATGGTCTATAGCCTTAATGGCCCACCTAATTCATATAGACAGT - -a -s mr.mrrefChr3 30724 37 + 181019 GAATGATTCGGGGTTAGCATTCCTCCAGCTGTAGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475638 37 + 636262 GAATGATTCGGGGTTAGCATTCCTCCAACTGTAGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 484948 37 + 647215 GTATGAGTTGGGGTTAGGTTTCCTCCAGCTGTAGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 30761 54 + 181019 TGCACAAGTAATAGAATGTGCTGGATGATGTGTTAAATATTGCTACATTGGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475675 54 + 636262 TGCACAAGTAATAGAATGCATTGGATGATGTGTTAAATATTGCTACATTGGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 484988 52 + 647215 TGCACAAGT--CAGAATGTGCTGGACGATATGCAGGATATCACTACATTGGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 30815 101 + 181019 GAGTCCTACCAGGGTGCTTTAAACATCAAGACGCGTTGCCAGCAGCAAACCACCCATTCATTGGACATTTGGGTACAGCAACCAGGAAGACTGACCAAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475729 101 + 636262 GAGTCCTACCAGGAGGCTTTAAACATCAAGACGCGTTGCCAGCAGCAAACCACCCATTCATTGGACATATGGGTACAGCAACTAGGAAGACTGACCAAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 485044 101 + 647215 GAGCCCTACCAGAGTGATTTGAACATCAAGACTGGTCACCAGCAGCAAACCACCCATTCATTGAACATTTGGGTACAGCAACCAGAAAGACTGACCAAGAC - -a -s mr.mrrefChr3 30916 70 + 181019 AACCAGTACATAGATATCCGTCCTATTTGGGTGTAAAATGGAGCTAACAGCTTATCCTACGAGCAGTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475830 70 + 636262 AACCGGTACATAGATATCCGTCCTATTTGGGTGTAAAATGGAGCTAACAGCTTATCCTACGAGCAGTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 485147 70 + 647215 AACCAGTACATAAATATCCGTCCCGTCTGGGTGTAAAATTGAGCTAACAGCTTATCCTATGAGCAATGGG - -a -s mr.mrrefChr3 30986 80 + 181019 ACTGTTTAGACTTCACACAGTGCCGTGTGAAAATTTCTAAAAAAAGGCAAACACGGCCCGGTAAACATGGCTAGTGCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476109 80 + 636262 ACTGTTTAGACTTCACACAGTGCCGTGTGAAAATTTCTAAAAAAAGGCAAACACGGCCCGGTAAACATGGCTAGTGCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 485217 80 + 647215 ATTGTTTAGACTTCACATAGCGCCTTGTGCAAATCTCTAAAAAGAGGCAAACGTGGCCAGGTAAACATGGTTAGTGCTTA - -a -s mr.mrrefChr3 31066 40 + 181019 GGCCATGTACACACAGTTAGTCCTTGGCGACGAGGCTACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476189 40 + 636262 GGCCATGTACACACAGTTAGTCCTTGGCGACGAGGCTACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 485317 40 + 647215 GATCATGTACAAGCAGTCAGTGCTTGGCTATGTGCCTGCC - -a -s mr.mrrefChr3 31106 62 + 181019 CGAGAAGTCAAGCAATCTCCCTGCATGCATTGTCGATCCCCTGTTCAATTCACACATCCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476236 62 + 636262 CGAGAAGTCAAGCAATCTCCCTGCATGCATTGTCGATCCCCTGTTCAATTCACACATCCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 485357 62 + 647215 TGAGAAATCAAGCACTCCCCCTGCATACATTGTTTATCCCATGTCTGTTTCACACACGTCAA - -a -s mr.mrrefChr3 31168 14 + 181019 GTCCTGACAGGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476317 14 + 636262 GTCCTGACAGGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 485419 14 + 647215 GTGATGACAGGTCC - -a -s mr.mrrefChr3 31182 23 + 181019 CCAATTCATGCACTGTCAAGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476355 23 + 636262 CCAATTCATGCACTGTCAAGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 485433 23 + 647215 CCGATTCATGCACTGTCAAGTAA - -a -s mr.mrrefChr3 31205 27 + 181019 GACAGGCATCTGGTTCATGTCTAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476379 27 + 636262 GACAGGCATCTGGTTCATGTCTAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 485456 27 + 647215 GACAGGCACCTAGTTTGCATTCAGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 31232 56 + 181019 GCCTGCCCGCACTACAGTGGACAGTAACTCATTGTCTATTGGTGGGCATAGTGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476406 56 + 636262 GCCTGCCCGCACTACAGTGGACAGTAACTCATTGTCTATTGGTGGGCATAGTGCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 485485 56 + 647215 GCCCGCCTACGCTACAGTAAACAATAACTGATTGCCTGTTGATGGACATAGTGTTC - -a -s mr.mrrefChr3 31288 18 + 181019 AGTCACCTCTTTCAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476462 18 + 636262 AGTCACCTCTTTCAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 485542 18 + 647215 AGTAACTTCTTTCAAACA - -a -s mr.mrrefChr3 31306 42 + 181019 TTTTAGCGTGTATGTTTCATTGGTAATATTTAGCATGTATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476499 42 + 636262 TTTTAGCGTGTATGTTTCATTGGTAATATTTAGCATGTATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 485560 42 + 647215 TTCAAACAAATATAAAGGATTGGTAATAATTAGCATCTGTGT - -a -s mr.mrrefChr3 31348 148 + 181019 AGTCTATGGATTGTGAATATTTAGAATTGGCAGGCAGGAATTTAAAATCAATTTGGCAGACACACGTACTGGCTTTAACATCAATTCAATAAGCCAACAAACCCTCCCTTCAACATCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATTAATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476550 148 + 636262 AGTCTATGGATTGTGAATATTTAGAATTGGCAGGCAGGAATTTAAAATCAATTTGGCAGACACACGTACTGGCTTTAACATCAATTCAATAAGCCAACAAACCCTCCCTTCAACATCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATTAATGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 485602 148 + 647215 ATTTTAGGCGTTGTGGACATTTAGAATTTGTGGGCAGGAATTTAAAATCAACTTGGCATACACACGTACTGGATTTAACATCAAATCAATAAGCCAACAAACCTTCCCTTCAACAGCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATCAGCTTG - -a -s mr.mrrefChr3 31496 21 + 181019 TTCCCTCTGCATCAATATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476699 21 + 636262 TTCCCTCTGCATCAATATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 485750 21 + 647215 TTCCCTCTGCAACACTCTATA - -a -s mr.mrrefChr3 31517 23 + 181019 GTCCTCTGTCGAACTCACAGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476730 23 + 636262 GTCCTCTGTCGAACTCACAGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 485771 23 + 647215 GTCCTCTGTTAAACACACAAATG - -a -s mr.mrrefChr3 31540 109 + 181019 AAGTTACTGCATGGTGTATCAAGGTTTAGTTTTGAGTCTAAGTGACCTGATTTCTATGCAAAGTGGTATTGCATCAAACTTGAGGATTGTCTATTGGAAATATACAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476753 109 + 636262 AAGTTACTGCATGGTGTATCAAGGTTTAGTTTTGAGTCTAAGTGACCTGATTTCTATGCAAAGTGGTATTGCATCAAACTTGAGGATTGTCTATTGGAAATATACAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 485801 109 + 647215 AAGTTATCGCATGGTGTATCAAGGTTTAGTTTTGAGTGTAGGTGACCTGATCACTATGCAAAGTGGTATTTCATCAAACTTCAAGATTGTCTTTTGGAAATATACAAAG - -a -s mr.mrrefChr3 31649 8 + 181019 CATAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476863 8 + 636262 CATAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 485910 8 + 647215 CATAAGAT - -a -s mr.mrrefChr3 31657 85 + 181019 TGTCCACAATACTTTAAGtcacttctcataggaaggatggcatctcccctgcaactgtaacaatgaatgtacacactagaatggt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476885 85 + 636262 TGTCCACAATACTTTAAGtcacttctcataggaaggatggcatctcccctgcaactgtaacaatgaatgtacacactagaatggt -s simRat_chr6.simRat.chr6 485918 85 + 647215 TGTACACAATACTTTAAGTTACTCCTTATAGGAAGAATGGCATCTCCCCTGCAACTGTAACACTGAATGTACACACTAGTATGGG - -a -s mr.mrrefChr3 31742 63 + 181019 acagggaaaagcataacttctcaaactgagccatccacTGGCACACAGCTTATTGGAAGGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476970 63 + 636262 acagggaaaagcataacttctcaaactgagccatccacTGGCACACAGCTTATTGGAAGGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 486010 63 + 647215 ACAGGGAAGAGCATAACTTCTCAAGCTGAGTCATCCACTGGCAAGTAGCTTACAGGAAGGCAC - -a -s mr.mrrefChr3 31805 23 + 181019 AGGAGAAAGCATAGTACTAATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477033 23 + 636262 AGGAGAAAGCATAGTACTAATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 486083 23 + 647215 AGAAGGAAGCATAGTACTAATTC - -a -s mr.mrrefChr3 31828 113 + 181019 TTCACTCACCTACTAGTCCACATTCAATTGTAGGTGCTCTGTGAGAATGCACACCCCCCCTCCCTGGAGGGCATGGTCTGAAGGCTTTAGAACCTTGAGTTATAATCCGGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477061 113 + 636262 TTCACTCACCTACTAGTCCACATTCAATTGTAGGTGCTCTGTGAGAATGCACACCCCCCCTCCCTGGAGGGCATGGTCTGAAGGCTTTAGAACCTTGAGTTATAATCCGGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 486106 113 + 647215 TTCATTCACCTATTCGTCCACATTCAATTGTAGGAGCTCTGTGAGTATGCACACCCCCCCTCCCTGCAAGGCATGGTCTGAATGGTTTAGACCCTGGAACCATAACCCAGCCT - -a -s mr.mrrefChr3 31941 81 + 181019 GTTATTGTGTACAGGCTGAATGGAGGACTAGTGATGGAGAATCTTTAAGTGCACAATTATATACTCAAAGTTTGATAAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477175 81 + 636262 GTTATTGTGTACAGGCTGAATGGAGGACTAGTGATGGAGAATCTTTAAGTGCACAATTATATACTCAAAGTTTGATAAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 486219 81 + 647215 GCTAGTGTGTAAAGGCTCATCAGAGGACTAGCGCTGGAAAATTTTTAAGAGCACAATTCTGTACCCAAAGTTTGGTAAAAT - -a -s mr.mrrefChr3 32022 108 + 181019 CTATAACCTGTTAGAGTTCAAAAGCACTCTCTCTGTCTCACCAGACTGTTCGAAGTTCGAGCTAATGCCATTATTAATACTTAATTCCCTTTTGCTGGTTAAAAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477256 108 + 636262 CTATAACCTGTTAGAGTTCAAAAGCACTCTCTCTGTCTCACCAGACTGTTCGAAGTTCGAGCTAATGCCATTATTAATACTTAATTCCCTTTTGCTGGTTAAAAGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 486314 108 + 647215 CTAAACCCTGTTAGAGTTCAAAAGCCATCTCTCTGTCCCACCAGTCTGTTAGAAGTGGGAGCTAATGCCATTCTTCATACTTAATTCCCTTTTACTTGTTAAAAGGCA - -a -s mr.mrrefChr3 32130 20 + 181019 GGGCCTCCCAGCTTGTATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477364 20 + 636262 GGGCCTCCCAGCTTGTATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 486424 20 + 647215 GGGCCTCCCAGCATTTATGG - -a -s mr.mrrefChr3 32150 77 + 181019 CAATCAAACTATTGTAACTGTCTCAAACGAGTGTAACTGTGGCAGGGTAACCTGAACTCACATAATCTTGGCTGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477747 77 + 636262 CAATCAAACTATTGTAACTGTCTCAAACGAATGTAACTGTGGCGGGGTAACCTGAACTCAAATGATCTTTGCTGGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477824 77 + 636262 CAATCAAACCATTGTAACTGTCTCAAACAAGTGTAACTGTGGCAGGGTAACCTGAACTCACACAATCTTGGCCGTAG - -a -s mr.mrrefChr3 32227 113 + 181019 GGTTCAGCCCCCTGGCTGTAAAGATTTAACTGCTGTGTGAGGTTGTACATTGTGGCTATGACGACTTGGGCTGAAGAGAAGACCATTAGAATGTGTCCCCAGAAGTGTAATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477938 113 + 636262 GGTTCAGCCCCCTGGCTGTAAAGATTTAACTGCTGTGTGAGGTTGTACATTGTGGCTATGACGACTTGGGCTGAAGAGAAGACCATTAGAATGTGTCCCCAGAAGTGTAATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 486444 113 + 647215 GGTTCAGACCCCTGGCTGTATAGAATTAGATGCTGTGTGATGTTACACATTGTCGCTATGACAACTTGGGCCAAGAATAAGACCATTAGAGCCTGTCCCCAGAAGTGTAATTA - -a -s mr.mrrefChr3 32340 80 + 181019 AAGATTCCAGCTTTACTGCCTGAAAGGGGCTGAGTACTATTGTGTGCACACCTATTATTGCCCCTGGGTTTAGGAAGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478051 80 + 636262 AAGATTCCAGCTTTACTGCCTGAAAGGGGCTGAGTACTATTGTGTGCACACCTATTATTGCCCCTGGGTTTAGGAAGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 486562 80 + 647215 AACATTCCAGCTTCACTACCTGAAAAGGGTTGAGTACTATTGTGTGAACACCTATTATTACCCCTGGGTTCAGGAAGCAT - -a -s mr.mrrefChr3 32420 22 + 181019 ACATTGTGAAGGGAATACTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478131 22 + 636262 ACATTGTGAAGGGAATACTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 486643 22 + 647215 ACGTTGTAATGAGAATATGAGT - -a -s mr.mrrefChr3 32442 19 + 181019 CCTCCTCTTGTTCATCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478197 19 + 636262 CCTCCTCTTGTTCATCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 486665 19 + 647215 CCTCCACTTGTTCATTGGA - -a -s mr.mrrefChr3 32461 11 + 181019 CATCAGACACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478218 11 + 636262 CATCAGACACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 486684 11 + 647215 CACCATATGAC - -a -s mr.mrrefChr3 32472 750 + 181019 TTTTCGGATTTGATTGTAAAGTTAGGAGTACCAGCTAGCAATCACTGAGTGCATTCAATGCAGTGTTGCATCCAGTCTCCCAGACTGAGAGTGCTAGGGTGTCAAAAAAAACCCTTAAAAGGCGTTCAGGCTGAGAGTGCTGGGTCTTTAAGAAAAGCCTTAAGAAGATAAACACATGAAGAGATTCACCATGAGACATAATTTTTCTTACCAAATATCAGACTGCTAGAGCATGGGATAAGGAGACTCATCTTAAAATGGACTGTAGACCATGGTTTTGACATGGTGCCAGTAGATATCTCTAAAGCCTCGTGCATGTCCGCTTAATTGCAGGTGTGACCAGTAGGCTATTGAATGTGCTAATCAAGGCAAGTCAAGAATATTATTGGATAGACTAAGGTTGTTCTCCACACTACCTCATTATGCATCAAGCTACCAATAATTATTTCAACCACTACACAACCCATGAGCTTTTGTTGGGGCTACACACACTGCATTTTGAAAAGTGTCTACAATTGAACTTTTCTTTGTTCAAGGTTGGATGCTGTTGAAATTGAATGAGTGTTTCAGTGACATGCCACTATAAGTGTTACCATCAGTTTGGAGAGAGGTAGGTTTCTATCCACCCGACTGCCTTCAGATAGAGGTAACTTTTCTAGGGCAGACACTTCATTCACTTATCTTCACTCTACCTATGGTATGTGATAAATCAGCTCATAATCAAGAATAAAAAGTAATTGAACACGCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478230 750 + 636262 TTTTCGGATTTGATTGTAAAGTTAGGAGTACCAGCTAGCAATCACTGAGTGCATTCAATGCAGTGTTGCATCCAGTCTCCCAGACTGAGAGTGCCAGGGTGTCAAGAAAAACCCTTAAAAGGCGTTCAGGCTGAGAGTGCTGGGGCATTAAGAAAAGCCTTAAGAAGATAAACACATGAATAGATTCACCATGAGATGTAATTTTTCTCACCAAAGATCAGACTGCTAGAGCATGTGATAAGGAGACTCATCTTAAAATGGACTGTGGACCATGGTTTTAACATGGTGCCAGTAGATATCTCTAAAGCCTCGTGCTTTTCCCCTTAATTGCAGGTCAGACCAGTAGGCTATTGAATGTGCTAATCAAGGCGAGTCAAGAATATTATTGGATAGACTAAGTTTGTTGTCCACACTACCTCATTATGCAGTGAGCTACCAATAATTATTTCAACCACTACACAACCCATGAGCTTTTGTTGGGGCCACACACACTGCATTTTGAAAAGTGTCTACAATTGAATTTTTCTTTGTTTAAGGTTGGATGCTGTTGAAATTGAATGAATGTTTCAGTGACATGCCACTATAAGTGTTACCATCAGTTTGGAGGGAGGTAGGTTTCTATCCATCCGACTGCCTTCAGATAGAGGTAACTTTTCTAGGGCAGACACTACATTCACTTATCTTCACTCTACCTATGGTATGTGAAAAATCAGCTCATAATCAAGAGTAAAAAGTGATGGAACACGCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 486695 726 + 647215 TCTTCAAATTTGATCGTAGGGTGATAAGTACCAGCTAGCAATCACTGAATGCGTTGAATGCAGTGTCACATCCAGTCTTCCAGACTAGGAGTGCTGGGGTGTCAAAAAAAACCATTAAAAGGTGTTCAACTGGAGAGTGCCGGGTCTTTATGAAAAACCTTAAGAAGATAAAAACATGAAGAGATTCACCATGAGACATAATTTTACTTTCCAAATATCAGACTGCTAGTGCATGGGATAAGGAGACTCATCTTAA-GTACACTGTAGACCATGGTCTTGATGTGGTGCGAGTAGATATCTCTAAAACCTCGTGCATGTCCGCTTAATTGCGGGTGTGACAAGTAGGCTATTGAATGTGCTAATCAAGGCAAGTTGAGAATATTGTTGGATAGACTAAGGTTGTTCTCCACACTACCTCGTGATGAATCAAGTTACCAATAATTATTGCATGCAATACACAACCCATGACCTTCTGTTGCGGCTACACACACTGCAATCTGAATGGGGTCTACAATTGAACTTTTCTTTGTTCAAGGATGGATGCCGTTGAAATTGAATGAGTATTTGAGTGACATGCCACTATAAGTGTTACCATTAGTCTGGAGAGTGTTGGGTTTCTAGCCACCAGA-----------------------TTCTAGGGCAGACCCTTTGTTCGCTTATCTGCACTCTACCTATGGTATGTGATAAATCAGCCCATAATCAAGAATAAAAAGTAATTGAACACACTTG - -a -s mr.mrrefChr3 33222 274 + 181019 GAAGACAATGAGTGTCCCCAAATCCATTTGACTTGGCAGGCTAGCAAATTTGTGATCTAGTTTTCTTCTTTGCCAGATTGTGACAGTGGTACAGGATGGCCATGGTATGGCTCTGGGCTTTAGGGACTGGTCTCATTTTCAACAGAAGAGGGTTGAAGGATTCTCCCATGGAATAACACTGGATCAATCTAAGACATTTGGAATGTGCACTGGAGATGTTAATGTCTTCACAAAAATGTAATTACAGCTTCTTATACAATGTCAATGTTAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478980 273 + 636262 GAAGACAATGAGTGTCCCCAAATCCATTTGACTTGGCAGGCTAGCAAATTTGTGATCTAGTTTTCTTCTCTGCCAGATTGTGATAGTGGTACAGGATGGCCATGGTATGGCTCTGGGCTTTAGGGACTG-TCTCATTTTCAACAGAAGAGGGTTGAAGGACTCTGCCATGCAATAACTCTGGATCAGTCTAAGACATTTGGAATGTGCACTGGAGATGCTTCTGTCTTCACAAAAATGTAATTACAGCTTCTTATACAATGTCAATGTTAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 487435 274 + 647215 TAAGACAATGAGTGTCCCCAAATCCATTTTACTTGGGGGGCTCGCAAATTTGTGATCTGGTTTTCTTGTTTGCCAAATTGTGACAGAGGTACAGGATAGCCAGTGCATAGCTCTGAGCTTTAGGGACTGGTCCCATTCTCAAGAGGAGAGGGTTGAAGGATTCTCCCATGGAATACCACTGGACCAATCAACGAAAATTAGAATGTGCACTGGAGATGTTAATATCTTCATAAAAATGTAATTACAGCCTCTTACTCAATGTCAATGTCAATTT - -a -s mr.mrrefChr3 33496 209 + 181019 CTATGCACATAAGGGGTGGGCAGAGAATCCCAAATATAGACCATCTCTCTAGCCCCAATGCCAAGCTGCTGTAGTGCACACAGAGGTCGTACTAAAGGAACATTTAAGAAGATACACACTTTTCAAGCCCCTTACACTATTTAGTCTGAATCTGATTCTCTATTTATTGTCCAATGATGGTGGGCCCCCGATTTAGTGTCTGCTTATCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 479274 209 + 636262 CTATGCACATAAGGCGTGGGCAGAGAATCCCAAATATAGACCATCTCTCTAGCCCCAATGCCCAGCTGCTGTAATGCACATAGAGGTCGTATTAAAGGAACATTTAAGAAGATACACACTTTTCATGCCCCTTACACTAGTTCATCTGAACCTGACTCTCTATTTATTGTCCAATGATGGTGGGCCCCCGATTTAGTGTCTGCTTATCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 487709 194 + 647215 CTATGCACATAAGGGGTGGGTAGAGAATTCCAAATATAGACCATCTC--------------CAAGCTGCTATAGTGTACACAGAGGCCAAACTAAAGGAACATTTAAGAAGATACATATCTGTCAAGCCCCTTAC-CTATTTAGTCGGAATCTGATTCTCAATTCGTTGCCCCATGGTGGTGGGCCCCCGATTTAACGTCTGCTTATTG - -a -s mr.mrrefChr3 33705 213 + 181019 CATGCAATTTCAGTCTTATTGGGTTTGACATATTAGTGTCTCAAAGTATCGTTTGCACTTTAAAGATGTACCATGTGGCCGATCAACTGGCAACCACTGTGAGGCTTCTGCCTTTTTGTCCCTATACATCCACCATGTAATAGTTCCCCAATCTCAGACTTATCATAACTACCACAACAAATAAATCCTACATACTGTCAGCAAGCTCACTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 479487 213 + 636262 CATGCAATTTCAGTCTTATTGGGTTTGACATATTAGTGTCTCAAAGTATCGTTTGCACTTTAAAGATGTACCATGTGGCCGATCAACTGGCAACCACTGTGAGGCTTCTGCCTTTTTGTCCCTATACATCCACCATGTAATAGTTCCCCGATCTCAGATTTATCATAACTACCACAACAAATAAATCCTACATACTGTCAGCAAGCTCACTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 487903 78 + 647215 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTAATAGTTCCCCAATCTCAGACTTATCATAACTACCACTGCAAATAAATCATATAGACTGTCGGCAAGCTCACTTT - -a -s mr.mrrefChr3 33918 414 + 181019 TATACACTGTCAACAAACTCACCTTTATTTCATGGTGCCCATGTCCACTACTTATTGCAGATTCTGACCAAAGTGCATAAGTCCACTAATCAAACTTAAGAAATACTGCCATAATGTTAGTGTGTCACTGTCTCTTCAATCTGCACGTCTGGTAGATACATGTCATTCTTGACCTTGAGCAGTTGATGACTTTATGTATAAAAAGCTTTTACTGATTAATTGATTTTGCTGATTAGTACAAAGTCATTGGCAGTTCTCTAACTTAAGACATTATGGGCTCAGGCCCCTTACATCCCATACTTGAAATAAACAGTTTTGACAGCAACTGTCCGAGTTGGAAATCGCAAGCTCCTTTTGTGCTGACCTTTGTGGTTGTGTGTGGGTTGTTACTTTCAATTAATCGGGTCTCCCGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 479707 414 + 636262 TATACACTGTCAACAAACTCACCTTTATTTCATGGTGCCCATGTCCACTACTTATTGCAGATTCTGACCAAAGTGCATAAGTCCACTAATCAAACTTAAGAAATACTGCCATAATGTTAGTGTGTCACTGTCTCTTCAATCTGCACGTCTGGTAGATACATGTCATTCTTGACCTTGAGCAGTTGATGACTTTATGTATAAAAAGCTTTTACTGATTAATTGATTTTGCTGATTAGTACAAAGTCATTGGCAGTTCTCTAACTTAAGACATTATGGGCTCAGGCCCCTTACAACCCATACTTGAAATAAACAGTTTTGACAGCAACTGTCTGAGTTGGAAGTTGCAAGCTCCTTTTGTGCTGACCTTTGTGGTTGTGTGTGGGTTGTTACTTTCAATTAATTGGGTCTCCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 487981 414 + 647215 TATACATTGTCGGCAAGCTCACTTTTATTTCATGATGCCCATGTCCACAAATCATTGCAGATTCCAGCCAAAGTGCATAAGTCCCCTAATCAAATTTAAGAAGTACTGCCAAAATGTTAATGTGTCACTATATCTTCGATCTGGACCTTTGGCAGATATATGTCATTATTGACCTTGAACTGTTGATAACTTTATGTATGAAAGGCTTGTCCTGTTTAGTTGAATCTGCTGACTAGTACAAAGTCACTGGCAGTTCCCTAACTTAAGACATTATGGGCACAGGCCCCTTACATCTCGTACTTGAAATAAACAGTTTTGACTGCTACTGTCCGAGTTCAAAATCGTAAGCTCCTTTTGTGCTGACCCTTGTGCATGTGTGTGGGTTGTAACTTTTACTTGATCAGGTCTCCCGTA - -a -s mr.mrrefChr3 34332 11 + 181019 CCCATGCAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480123 11 + 636262 CCCATGCAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 488395 11 + 647215 CCCATGCAATC - -a -s mr.mrrefChr3 34343 52 + 181019 TAAAGCACCATGCTCCGTCTAAGCTCCCATCCTGTTCCAGTAAACAAGCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480135 52 + 636262 TAAAGCACCATGCTCCGTCTAAGCTCCCATCCCGTTCCAGTAAATAAGCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 488406 52 + 647215 TAATGCAGCATGCTCAGTCTAAATTCCCGTCCTGTTCCAGTAAACAAGCCAC - -a -s mr.mrrefChr3 34395 103 + 181019 TCACAGATGCACTCTGAGACCCACCCCACTAAGATAGTCTACACCACTCAGCTTGCAGTGGAGACTGTTCCTTAATGAACATAGGGGCCTACATAAGTTGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480189 103 + 636262 TTGCAGATGCACTCTGAGACCCACCCCACTAAGATAGCCTACACCACTCAGCTTGCAGTGGAGACTGTTGCTTAATGAACATAGGGGCCTACATAAGTTGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 488458 103 + 647215 TCACAGATACACACTGAGATGCACCCCACTGAGGTAGTCCACACCAGCCAGCTTGCAGTGGAGACTGTTCCCTAATGAACATTGTGGTCTACATAAGTTGGAT - -a -s mr.mrrefChr3 34498 272 + 181019 ACCATAGAGGCAACATTTGCCATGGTCAGACTTCAATAAGCAGCTGGCACAGAAACAGTTACTTCTCTGATCTCGTACCACATCCTGTTATTATACCACCCCCTACCAATAATCTACTAGAGCCAAGATTAGGGGGAATGCCCCAACCTCTTGACCCACGACATTTGTAATTTATGAACATAAGGTAAACATAGGTACATTATTGTGCATAGGAGGAACGCACGTTCACATCTGTATCTTCCCATGGCATAGTCTCTCTAACAAGCATCGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480292 272 + 636262 ACCATAGAGGCAACATTTGCCATGGTCAGACTTCAATAAGCAGCTGGCACAGAAACAGTTACTTCTCTGATCTCGTACCACATCCTGTTATTATACCACCCCCTACCAGTAATCTACTAGATCCAGGATTAGGGGGAATGCCCCAACCTCTTGACCCACGACATCTGTAATTTATGAAGGTAAGGTAAACATAGGTACATTATTGTGCATAGGAGGAACGCACGTTCACATCTGTATCTTCCCATGGCATAGTCTCTCTAACAAGCATCGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 488565 239 + 647215 ACTATAGAGGCAACATTTGCCATGGTCAGATTAC-----------------------------ACTCTGATCTCATACCTCGTCCTGTTATTATACCACCCCCTACCAATAATCTACTAAAGCCAAGATTAGGGGGAATGCCCGAACCTCTTGACCCACAACATTGGTAATTTATGAACATAAGGT----ATAAGTAAATTATCGTGTACAGGAGGAATGTGCATTCACACCCGTATCTTCCCATGGCATAGTCTCCCTAACAATCGTCGCA - -a -s mr.mrrefChr3 34770 38 + 181019 ATAGTCTCTATGCCCATAGGTCGGTCTTGTGGTTAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480569 38 + 636262 ATAGTCTCTATGCCCATAGGTCGGTCTTGTGGTTAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 488804 38 + 647215 ATAGTCTTTAATCCCATGGGTCTGTCTTGTTTTAGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 34808 26 + 181019 GCTGTACTTTGACATGTCAAGGGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480610 26 + 636262 GCTGTACTTTGACATGTCAAGGGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 488842 26 + 647215 GCTGCACTTTGACATGTTAAGGGGTG - -a -s mr.mrrefChr3 34834 198 + 181019 CTAGATTGCATGCCCGTGGCAGACCATCTCAACCAAGGCTTGCATGGTTGCATGGGAAACCACACAGTAGGCTCTTGTTTAACTAAAGTAGATTAACAATCTGCAAGGGGACCAAGATACATGAGATTGCATTAAGACTTCATTTACTCACTGACTATAGTTTGATATGAGCACCAATGCCAATGTCTGGAGTGTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480637 198 + 636262 CTAGATTGCATGCCCGTGGCAGACCATCTCAACCAAGGCTTGCATGGTTGCATGGGAAACCACACAGTAGGCTCTTGTTTAACTAAAGTAGATTAACAATCTGCAAGGGGACTAAGATACATGAGATTGCATCAAGACTTCATTTACTCACTGACTATAGTTTGGTATGAGCACCAATGCCAATGTCTGGAGTGTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 488868 198 + 647215 CAAGATTTCATCCTCATGGCAGACCATCTCAACCAAGGCTTGCATGTTTACATGTGAAACCACACGGGAGGCTCTTGTTTCACTAAAGTAGCTTAACAATCTACAAGGGGACCAAGATACATGAGCTTGCATTAAGACTTTATTTACTCACTGACTATGGTTTGATATAAGAACCAATACCAATTCCTAGAGTGTATT - -a -s mr.mrrefChr3 35032 35 + 181019 GGAAAGACGTGCGATGCACTGTCAATTTTCCAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480835 35 + 636262 GGAAAGACGTGCGATGCACTGTCAATTTTCCAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 489072 35 + 647215 GGAAAGATGTGTGATGCACTGTCGATTTTCCAAGC - -a -s mr.mrrefChr3 35067 137 + 181019 ATAGAGCTAAATAATGAGTTATACTGGTACTCTACTTGAATCAGCTAGGTCTCTTTCTGCCTGTCCAACCACCATATAGCACTTTTTAGCATCACATTGCCTTTGATTCCAATCTGAAGCTGAGTACAGGATACTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480870 137 + 636262 ATAGAGCTAAATAATGAGTTATAATGGTACTCCACTTGAATCAGCTAGGTCTCTTTCTGCCTGTCCTACCACCATATAGCACTTTTTAGCATCTCATTGCCTTTGATTCCAACCTGTAACCAAGTACAGGATACTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 489116 137 + 647215 ATAGTGCTAAATAATAAGATATACTGTGACTCTGCTTGAATCAGCTAGGTTTGTTCCTACCTGGCCAACCAACACATAGCAGCTTTTAGCATAACATTGTCTTTGATTCCAGTCCAAAGCTGAGGACAGGACACTGA - -a -s mr.mrrefChr3 35204 92 + 181019 ATATGATGACGGACAGATACCTCTAACATGGGGGAGTTTCACTCCTTATAAGTTAAGAAGATGCCACCTCCAGTCATTGGATTAGTCAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481007 92 + 636262 ATATGATGATGGACAGATACCTCTAACAAGGTGGAGTTTCACACCTTATAAGTTAAGAAGATGCCACCTCTAGTTCTTGGATTAGCCAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 489255 92 + 647215 ATATGATGACGGACAGATACCTCTAATATGGGGGAGTTTTACTCCTAGTAAGTTAAAAAGATGCCACCTCCAGTCACTGGATTAGTCAAAAA - -a -s mr.mrrefChr3 35296 58 + 181019 CAAGTCACCCTCACCCAGGAGATGAAGCATGCCAGGCTAGTTAATGTGGCATAGTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481100 58 + 636262 CAAGGCACCCCCAACCAGGAGATGAAGCATGCCAGGCTAGTTAATGTGGCATAGTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 489347 58 + 647215 CAAGTCGCCCTCACCTTGGAAGTGAAGCATGCCAGGCTAGTTAATGTGGCATAGTAGA - -a -s mr.mrrefChr3 35354 9 + 181019 ATAGTTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 489408 9 + 647215 ATAGTTAGA - -a -s mr.mrrefChr3 35363 31 + 181019 GAGATATTTACGAAAGTCATCCTGGGGGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 489421 31 + 647215 GAGATATTTACGAAAGTCATCCTGGGGGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 35394 242 + 181019 ACTGGCTGTGACAAAGGAATACCACAGCATTTACCTGGTAACTTATAGGCATTTGAACTAAAAGGGTATGATGTCCTCATTTGTCTCAGCTGGGATCTGGGGCCCAATAGCCTGAGAGACATGCCTGAGGAATGCCCTGAGATTAGCACAAGGCATAAGGGTATCCACCTCAGCTCTCTAGAGTGCTGGCAAATGAAAGACTAAGTCCAGTACATATATAAACGTGAGTGGTGTCTCCTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481158 169 + 636262 -------------------------------------------------------------------------TCCTCATTTGTCTCAGCTGGGATCTGAAGCCCAATAGCCTGAGAGAAATGCCTGAGGAATGCCTTGAGATTAGCACAAGGCATAAGGGTATCCACCTCAGCTTTTTAGAGTGCTGGTAAATGGAGAACTAAGTCCAATGCATATACACACCCAAGTGGTGTCTCCTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 489455 242 + 647215 ACTGGCTGTGACAAAGGAATACCACAGCATTTACCTGGTAACTTATAGGCATTTGAACTAAAAGGGTATGATGTGCTTATTTGTCTCAGTTGGGATCTGGGGCCCAATTGCCTGAGAGACATGCCTGAGACATGCCCTGATATTAGCACAAAGCATAAGGGCATTCACCTCAGCTCTCTAAAGTGCTAGCAAATGAAAGACTAAATCTCGTACCTATATAAACGTGAATGGCATCTGACCCA - -a -s mr.mrrefChr3 35636 41 + 181019 ATCAGTACAGCCCATTAAACCTTCTGTGGATTGCTTGAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481371 41 + 636262 ATTAGTACAGCCCATTAAACCCTCTGTGGATGGCTTGAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 489697 37 + 647215 ATCAGTACAGCCAATTAAACCTTC----ACTTGCTTGGACA - -a -s mr.mrrefChr3 35677 16 + 181019 TTAAGACAAGCCTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481412 16 + 636262 TTAAGACAAGCCTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 489739 11 + 647215 TTAAGAAAAGT----- - -a -s mr.mrrefChr3 35693 208 + 181019 ACTAATCAGTTACCCTCAGGTCTGACCCACATCCTTTCTTGTATTGTTTACCAAGCTACATCCCACATTCCAGTGCTTGCCCATTAAGTCCACCATCCATGAATATATATACTGATAGTAGAGAAATAACTGAGTTCAGTGCAAGAGACCCATGCGTTTGATGTGGATCACGATAATAATACCTAATGGATAACGTGCAATCATTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481429 208 + 636262 ACTAATCAGTTACCCTCAGGTCTGACCCGCATCCTTGCTTGTATTGTTTACCAAGCTACACCCCACATCCCAGTGCTTGCCGATTAAGTCCACCATCCATGGATATATATACTGATAGTAGAGAAATAACTGAGTTCAGTGCAAGAGACCCATGCGTTTGATGTGGATCACGATAATAATACCTAATGGATAACGTGCAATCATTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 489750 204 + 647215 ----ATCAGTAATCCTCAGCTCTGACCCACATCCTTTCTTGTATTGTTTACCAAGCTACATTCCACATTCCAGTGCTTGCCCACTAAGTCCACCAGCCATGAATATATATGTTAATAGTGGGAAAATTACCGAGTTTGCTGCAAGAGACGCATGAATTTGATGTGGTTAATGATAACAATACCTAATGGATAACTTGCAATCATTAGA - -a -s mr.mrrefChr3 35901 118 + 181019 TAAAAATTTATTAAGCTCTTGTAGTAAGGGGCACCTGCACAGATGTTGCCTTCTCACTTAGTTGTCCTGCATTACATGTATGATGTTCTCCTTACAGATGAGTTGGATCAAAACCTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481637 118 + 636262 TAAAAATTTATTAAGCTCTTGTAGTAAGGGGCACCTGCACAGATGTTGCCTTCTCACTTAGTTGTCCTGCATTACATGTATGATGTTCTCCTTACAGATGAGTTGGATCAAAACCTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 489955 118 + 647215 TAACAACCTATTATACTGGTGTAGCAAGGAGCACCTGCAAGGATGCTGCCTTCTCATTCAGTTGTGATGTGTTACATGTATGATGTTCCCCTTACAGATGAGTTGGATCAAAGCCTGC - -a -s mr.mrrefChr3 36019 2 + 181019 CA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481756 2 + 636262 CA -s simRat_chr6.simRat.chr6 490073 2 + 647215 CA - -a -s mr.mrrefChr3 36021 19 + 181019 TCAGTGGGTGCAAGAAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481767 19 + 636262 TCAGTGGGTGCAAGAAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 490075 19 + 647215 TCAGTGGGTGCAAGAAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 36040 35 + 181019 CAACAAAGTAAGCACTTCTCTCCCAGATACTGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481787 35 + 636262 CAACAAAGTAAGCACTTCTCTCCCAGATACTGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 490094 35 + 647215 CAATGAAGTAAGCACTTCTCTCCCAGACCTCGCTC - -a -s mr.mrrefChr3 36075 23 + 181019 ACAATCAATCCAGCTGCTAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481823 23 + 636262 ACAATCAATCCAGCTGCTAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 490129 23 + 647215 ACAATCAATTTAGCTGCTAACAT - -a -s mr.mrrefChr3 36098 122 + 181019 TCTTAATGAAGTTGTGAGGATGTTAGATGATTATGTCACGGTGTTACATACTGCACATAAGTTCAATATCTTGTCATGATAACCCCTATTTTGAGGCATCTATCCCCCTGAGCAGGAATGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481848 122 + 636262 TCTTAATGAAGTTGTGAGGATGTTAGATGATTATGTCACGGTGTTACATACTGCACATAAGTTCAATATCTTGTCATGATAACCCCTATTTTGAGGCATCTATCCCCCTGAGCAGGAATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 490152 122 + 647215 TGTTAACGAAGTTTTGAGGATCTTAGATGATTATGTCACAATGTTACACACTGCACATAATTTTACTAGCTTGTCCTGATAACTCCTGTTTTGAGGTCTCTATCCCCCTGACCAGGGCTGCT - -a -s mr.mrrefChr3 36220 79 + 181019 GATGATTCAGTGGAGACTATTGATGATTCAGTGGGTTTCAATACATGATTCCTGAATAGTTGGCACACACTGCTGAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481970 79 + 636262 GATGATTCAGTGGAGACTATTGATGATTCAGTGGGTTTCAATACATGATTCCTGAATAGTTGGCACACACTGCTGAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 490276 79 + 647215 GATGATTCAGTGGGGACTATTGATAATTCAGTCGGTTTTAATACAAGATGCCTGGGTAGTTTGCACCCACTGCCGAATA - -a -s mr.mrrefChr3 36299 68 + 181019 ATAAGCGTGCTTTAATACACCAAAATGCATTACCAGCAAGCATTATTTTTGGAGCTGGTCATGCCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482049 68 + 636262 ATAAGCGTGCTTTAATACACCAAAATGCATTACCAGCAAGCATTATTTTTGGAGCTGGTCATGCCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 490356 68 + 647215 ATAAGCTCACTTTTAGAGACCAAAATGCATTACTAGTGAGCATTATTATTGAAGCTGGACATGCCTAT - -a -s mr.mrrefChr3 36367 52 + 181019 CTACCCCACTACTGAAGTCGCTCCTAGGGCATTACCTGCACCAACTAGCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482136 52 + 636262 CTACCCCACTACTGAAGTCGCTCCTAGGGCATTACCTGCACCAACTAGCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 490424 52 + 647215 CTACTCCATAATTGAAGTCACTACCAAGGTGTTACCTGCACCAACTAGCTAT - -a -s mr.mrrefChr3 36419 16 + 181019 TGTGCACCATACCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482194 16 + 636262 TGTGCACCATACCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 490476 16 + 647215 TGTGGCCCGTACTTGT - -a -s mr.mrrefChr3 36435 71 + 181019 ATTCCATTGGTAAGCCCATGTGAAAAAATATTTATAGCTAAATTCTTGGATTAGCAGACCACAATCCTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482210 71 + 636262 ATTCCATTGGTAAGCCCATGTGAAAAAATATTTATAGCTAAATTCTTGGATTAGCAGACCACAATCCTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 490493 71 + 647215 ATTCCACTGTTAAGCCAATGTGAAAAAATAAATATAGCTAAATTCTGGGATCACCAGACCACAATCTTGCA - -a -s mr.mrrefChr3 36506 14 + 181019 CCAGTGTTGCCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482298 14 + 636262 CCAGTGTTGCCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 490564 14 + 647215 CCAATACTGCCCCA - -a -s mr.mrrefChr3 36520 318 + 181019 TAATTTTATCACCTCTCTACATCAAATGATATCATGCTAGTAGGAAAACTATTTAACAGACTGAGCAATGTTTTGATTTGGTTGATGATAATTATACCTAATGGTCAACATGAAATTATAGGGTAGAAATCTATAATGCTCTTGTAGAGCAGGGCATGGAATGTCTTATTGTAGTATGTTGCCTTCTTATTCAGATGCCCTGTGTCTGAAATATTTCTCCAATCAGATAAGCTGTATCTAAACTTGGTCACTGAAACTCTCATTGTATCGTGTACAAATGGAAACAATAAAGCAAATATTTATCAATAAAGCATGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482312 318 + 636262 TAATTTTATCACATCCCTACATCAAATGATATCATGCTAGCAGGAAAACGACTTAACAGACTGAGCAATGTTTTGATTGGGTTGATGATAGTTATAACTAATGGTCAACATGAAATTATAGGGTAGAAATCTATAATGCTCTTATAGAGCAGGGCATGGAATGTTTTATTGTAGTATGTAGCCCTCTTATTCAGATGCCATGTATCTGAAATACTTCTCCAATCAGATAAGCTGTATCTAAACTTGGTCACTGAAACTCTCATTGCACCATGTACAAATGGAAACAATAGAGCCAATACTTATCAATAAAGCATGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 490579 315 + 647215 TAATTTTATCACCTCTCTCCATCAAATGATATCATCCTATTAGGAAAACTATTTAACAGCCTGAGCAATGTTATGATCTGGTTGATAATAATTATACCTAATGGTCAACATGAAATTATGGGGTAGAAATCTATAATGCCCT-GCAGAGCAGGGCATGGAATTTCTTATTGCAGTATGTTGTCTT--TATTCGGATGCCCTGTGTCAGAAATATTTCTCCAATCAAATAAGCTGTATCTATACTTGGTCACCAAAACTCTCAGTGTGTCGTGCACAAGTGGAAGCATTAAAGCAAATATTTATCAATACAGCAAGCAT - -a -s mr.mrrefChr3 36838 231 + 181019 CTCTCCGTAATACTCTACTAAGTTTTCTAGCTGCTGACGTGTTGTTATGAGGTTTTCAAGTTGATAAACATCCTGGGGCTACATGCTGTACTTGAACCTGGTGTGGTGGGGACTGTAGGAGTACTACTGATTAGCTGGCACTTAACCCAAGTGTCCAACTGTAAATTCAGCATGGTTTTGGGGATCTGAGTCTGAAAACTGTTATTTCAAAAGTTTTGTCTCTTGAGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482633 214 + 636262 CTCTCCGCAATACTCTTCTAAGTTTTTTAGCTGCTGACGTGTTGTTACAAAGTTTTCAAGTTGAGATACATCCTGGGGCTACATGCTGTACTTGAACCTGGTGTGGTGGGGACTGTAGGAGTACTACTGATTAGCTGGCACTTAACCCAAGTGTCCAACTGTAAATTCAGCATGGTTTTGGGGATCTGAGTCTGAAAACTGTCATTTCAAAAGA----------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 490894 228 + 647215 CTCACTGTAATACTCTACTAACTCTTCTAGCTTCTGAC---TTGTTATGAGGTTTTCAAGTAGATAAAAATCCTGGGGCTACATGCTGTACTTGAGCCTGGTGTGGTGGGGACTGTAGGAGTAATATTGATTACCTGGCACTTAACCCAAGTATCCAACTGTAAATTCAGCATGGAGTTACAGATCTGACTCTGAAAGCTCTTGTTTGAAAAGTTTTGTCTCTTGAGTATG - -a -s mr.mrrefChr3 37069 22 + 181019 CAACCTGTGAACTAGTGGGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482847 22 + 636262 CAACCTGTAAACTGGTGCGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 491123 22 + 647215 CAACCTGTGAACTAGTGGGATA - -a -s mr.mrrefChr3 37091 11 + 181019 AAATATGATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482869 11 + 636262 AAATATGATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 491147 11 + 647215 AAATAAGATGT - -a -s mr.mrrefChr3 37102 66 + 181019 GTATGAGGAGTCCCCTTTGTTCAGAGATGATGTAGAATAGCTAATGACACTGTAATAAGTCAATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482880 66 + 636262 GTATGAGGTGTCCCCTTTGTTCAGAGATGATGTAGCATAGCTAATGACACTGTAATAAGTCAATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 491168 66 + 647215 GTATGAGGAGTCCCCTTTGTTCAGAGCTAATGTAGAATAGCTAATGACCCTGTAATAAGTGAACAC - -a -s mr.mrrefChr3 37168 60 + 181019 ATTATCATCAACTATGTTTATTAGAATTGGACATGGTGTAACTCATATGCCATTGGGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482948 60 + 636262 ATTATCCTCAACTATGTCTATTAGAATTGGACATGGTGTAACTCATATGCCATTGGGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 491234 59 + 647215 ATTATCATCAACTATGTTTATTAGAACTCAACATG-TGTAACTCCTCTGCCATCGGCATT - -a -s mr.mrrefChr3 37228 57 + 181019 GCTACCATGCCCTTACTTGAATAAAACAATGTACTCAAATGTATATTGTATATACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483008 57 + 636262 GCTACCATGCCCTTACTTGAATAAAACAATGTACTCAAATGTATATTGTACATACGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 491299 57 + 647215 GCTACCACTCCAATACTTGAATAAAACAATGTACTTAAAGGTATACTGTATGTACTC - -a -s mr.mrrefChr3 37285 31 + 181019 CCATTGTTATGTCAGTGCTGAGCCAAAATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483065 31 + 636262 CCAGTGTTATGTCAGTGCTGAGCCAAAATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 491391 23 + 647215 CCATTGTCATGTCAGTGCTGAGC-------- - -a -s mr.mrrefChr3 37316 14 + 181019 GAACTGTTATTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483097 14 + 636262 GAACTGTTATTATA - -a -s mr.mrrefChr3 37330 106 + 181019 ATTTGTAAGTAGATTGACCACAGTCATACATCATTAAGAAGCAAGATATATAGTGGGATAATTCAAGAACAGTGCCCCTAGGATGACTGATCTCAATGACTGATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483116 93 + 636262 ATTTGTAAGTAGATTGACCACAGTCATACCTCATTAAGAAACAAGATATATAGTGGGA-------------GTGCCCCTAGGATGACTGATCTCAATGACTGATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 491414 103 + 647215 --TTGTA-GTAGATAAACCACAGTCATACATCGTTAAGAAGCAGTATATATAGTGTGATAATTCAAGAACAGTGCCCATAGAATGACTGATCTCGATGACTGGCCT - -a -s mr.mrrefChr3 37436 61 + 181019 CTAATAAAAAATGTATTAGGGTAGCAAAGTGTTTGTATATAGGAAAGGTTCTGTGCCCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483209 61 + 636262 CTGACAAAAAAAGTATTAGGGTAGCAAAGTATTTGTATATAGGAAAGGTTCTGTGCCCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 491518 60 + 647215 CTAATAAAAAATGTATTAGGATAGCAAAGTGTTTGTAT-TAGGAAAGGTTCTGTGCCCACT - -a -s mr.mrrefChr3 37497 32 + 181019 CCTAAACAATACTCTCCATCATTGTTACGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483270 32 + 636262 CCTAAACAATACTCTCCATCATTGTTACGGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 491579 32 + 647215 CCTAAACAATACTCTCCGTCATTGTGATGGGT - -a -s mr.mrrefChr3 37529 48 + 181019 ATAAACATCCTTACAAGGAATACACTACATGTGTTCAAGTTATTGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483303 48 + 636262 AGAAACATCCTTACAAGGAATACACTACATGTGTTTGAGTTATTGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 491611 48 + 647215 ATAAACATCCTCACAAGGAACTCACTACATGTGTTCAAGTTATTGGGG - -a -s mr.mrrefChr3 37577 115 + 181019 TCTAAACTCAGTGTGGGTCATGCTCTGGCATTAACGTAGTAGTCAAAATCAAGTGGGTGTGGATTGTCTGAGTATGACCTGAGTAGGAGAATTGCCTCATTGAAACAGTCCTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483470 105 + 636262 TCTAAGCTCAGTGTGGGTCATGCTCTGGCATTAACGTAGTAGTCAAAATCAAGTGGGTGTGGATTGCCTGAGTATGACCTGAGTAGGAGAATTGCCTCATTGAAA---------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 491659 115 + 647215 TCTAAACCCAGTGTGGGTGATGCTCTGGCATTAACGTAGTAGTCAAAATCAAGTAGGTGTGGATTGTGTGAGTAGGACCTCAGTCAGAGGATTGCCACATTGGAACAGTCCTCAT - -a -s mr.mrrefChr3 37692 33 + 181019 ACAATCGGGTGTTGGAGGTAATTGGTATTCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483575 33 + 636262 ACAATCGGGTGTTGGAGGTAATTAGTATCCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 491778 33 + 647215 ACAGTGGGGCGTTGGAGGTAATTGGTATTCTTT - -a -s mr.mrrefChr3 37725 376 + 181019 GTTATTTGTTGAAATCTTGTTCTCATATTTAATCAGTATAAGACACCTGGTGTCTTGCCCCTTTATGCATATATAATGTCTCACCATCGGGGAGCCCCTAAAGCCTCCACCTGTGTTATTGCCAGTCGGCGTAGTTTAACAGTGTCACAAGCCCCTGATAGGAGACCAGCAGGAGAATTAAATTGGTCAGGTCCCGAAGGGTATAGTGTAGGCAGAGGTGGTTGTTGGAGGGCTACCTCAAGACACCCAGAGGCAGTTGCTGTGGGTCCTGATGAGCTATTGTTTCTTGCACTTACAAGCCACTTTGTTGGTGCAGTAATTAGTCAATCTCCTACCAAAATGCATGGGGTAACACTGGGGTTGGACCAACACAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483608 372 + 636262 GTTATTTGTTGAA-TCTTGTTCACAT---TAATTGGTAAAAGACACCTGGTATCTTGCCCCTTTATGCATATATAATGTCTCACCATCGGGGAGCCCCTAAAGCCTCCACCTGTGTTATTGCCAGTCGGCGTAGTTTAACAGTGTCACAAGCCCCTGATAGGAGACCAGCAGGAGAATTAAATTGGTCAGGTCCCGAAGGGTATAGTGTTGGCAGAGGTGGTTGTTGGAGGGCTACCTCAAGACACCCAGAGGCAGTTGCTGTGGGCCCTGACGAGCTATTGTTTCTTGCACTTACAAGCCACTTTGTTGGTGCAGTAATTAGTCAATATCCTATCAAAATGCATGGGGTAACACTGGGGTTGGACCAACGCAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 491812 375 + 647215 GTTATTTGGTGAAATCTGGTACTCGTATTTAATCAGTATAAGACACCTGGTGTATTGCCCCTTTATGCATATATAATGTCACACCATCGGGGAGCCCCTAAAGCCTCTACCTGTGTTATTGCCAGGCGGCGTAGTTTAACAGTGTCACAAGCACCTGATAGGAGACCAGCAGGAGAATTAAATTGGTCAGGTCCCGAAGGGTATAGTGTAGGCAGAGGTGGTTGTTGGAGGGCTACCTCACGACACCCGGAGGCAGTTGCAGTGGGTCCTGATGAGCTATTGTTTCTTGCACTTACAAGTCACTTTGTTGGTGCAGTAATTAGTCATTCTCCTACCAAAAAGCACGGGGTAACAA-GGGTTCGGACCAACACAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 38101 85 + 181019 CAGAGTTTAAGTCTATCTCCTACTCTGCTAGCCCAATGCTCCTCTTAATACCATGACACCTGATATGGAATAGGCATAGGTACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483980 85 + 636262 CAGAGTTTAAGTCTATATCCTACTCTGCTAGCCCAATACTCCTCTTAATACCATCACACCTAATATGGAATAGAAATAGGTACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 492188 85 + 647215 CAGGGTTTAAGTCTATCTCTTACTCTGCTAGGTGGATGCTCCTCTTAACACCATGACACCTGATATGGAATAGGCATAGGTACCC - -a -s mr.mrrefChr3 38186 203 + 181019 AAGAAGTGTTAGTATAAAATAGAATAATGTGTTAGCTAGGGTACACGCACACATGCAGTTCCTTCCTGGTGACCCACCTGTACCCAGATCTTGGCACCAGTATGTTCCACAACTTCTCAACTGCCCTTCCCCTACCAATTAATTAAGCAGGTTGTGTTTACGACATAAAGCTTTCCAAAGTTGGCAATAATGGGACTATGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484066 203 + 636262 AAAAAGTGTTAGTATAAAATAGAATAATATGTTAACTAGGGTACATGCACACATGCAGCTCCTTCCTGATGACCCACCTGTACCCAGATCTTGGCACCAGTATGTTCCACAACTTCTCAACTGCCCTACCCCTACCAATTAATTAAGCAGGTTGTGTTTACGACACAAAGCTTTCCAAAGTTGGCAATAATGGGACTATGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 492273 203 + 647215 AAGAAGTGTTAGTATAAAATACAATAATGTGTTAGGTTGGGTACACGCACACATGCAGTTCCTTCCTGGAGACCCACCTGTACCCGGATCTAGGCACCAGTATGTTCCACAACTTCTCAACTGCCCTTCCCCTACCAATTAATTAAGCAGGTTGTGTCTATGACATACAGCTTTCCTGAGTTGGCAATAATGGGCCTATGATT - -a -s mr.mrrefChr3 38389 73 + 181019 CAGTGATTGGCATCTGTGTAGGCATCTGTCTTTTTGCAGGTGAACACTTTTCTATCATGGATGTGAGGGTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484273 73 + 636262 CAGTGATTGGCATCTGTGTAGGCATCTGTCTTTTTGCAAGCGAACACTTTTCTATCATGTATGTGAGGGTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 492476 73 + 647215 CCATGGTCGGCATCTGTGTAGGCATCGGTCTTTTTGCGGGTGAACACTTTTCTATCAAGGATGTGAGGGTCCT - -a -s mr.mrrefChr3 38462 60 + 181019 TGTTGATAGGCCTACAGAAATTCACAGAGTTGGCAAATATAATTGACACAGTTGGCATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484346 60 + 636262 TGCTGAGAGACTTACAGAAATCCACAGAGTTGGCAAATATAATTGACACAATTGGCATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 492656 60 + 647215 TGTGGATAGGGCTACAGAAACTCACAGAGTTGGCAAATATAATTGACATGGTTGGCACAC - -a -s mr.mrrefChr3 38522 324 + 181019 ACCTATAGTGCTGTTGGGAGACCTTTACTAGTCGGGCATGCCCAACATTGGTCTTGTGTCTAAAATTGTGATGAGCTGGTATTATAATGCACACTATATTGTTTTGATTAGCAAAACCCTACTGGTTCTTTGCAACTACAGGGAGCTGTGCAGGACTCTCAAACCAGTGTCAAGGGGTTTTCCAAGTGTTTTGCATATCCAGATGAGGAAGATTATGGAACAAAATGTCAAACATCCAACTCCTTATATTGTCTTAACACAAAAATGAAATAAAAAATACAACATAGCACAGGAATTATAATTCCCGCTAGTGTTCCAAGAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484406 319 + 636262 ACCTATAGTGCTGTTGGGAGACCTTTACTAGTTGGGCATGCCCAGCATTGGTCTTGTGTTTAAAATTGTGATGAGCTGGTATTCTAATGCACTCTATATTGTTTTGATGAGCAAAACCCTACTGGTTCTTTGCAACTACAGGGAGCTGTGCAGGTCTCTCAAACTAGTGTCAAGGGGTTTTCAAAGTGTTTTGCACATCATGATGA-----ATTATGGAACAAAATGTCAAACATCCAACTCCCTATATTGTCTTAACACAAAAATGAAGTAAAAAACACAAGATAGCACAGGAATTATAATTCCCACTAGTGGTCCAAGAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 492718 324 + 647215 ACCTATAGTGCTGTTGGGAGCCATTTACAAGTCGGGCATGCCCAAAATTGGTTTTGTGTCTAAAATTGTGATGAGCCGGTATTATAATGCAGACTATATTGTTTTGATTAGCAAAAGCCTACTGGTTCTTTGCAACCACAGGAAGCTGTGCAGGACTCTCAAACCAGTGTCAAGTGGTTTTCCAAGAGTTTTGCATATTCAAATCAGGAAGATTATGGAACAAAATATCATACATCCAACTCCTTATATTGTCTTGACATAAAAATGAAATAAAAAGTACAACATAGCACAGGGATTATAATTCCAGCCAATGTTCCAAAAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 38846 40 + 181019 TGCGAATTACAGTGGTATTGCACCTTGCGCACTATTTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484725 40 + 636262 TGTGAAATACAGTGGCATTACACCTTGCGCACTATTTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 493043 39 + 647215 TGCGAATTACAGTGGTATTGC-CCTTGTGCACTATGTATA - -a -s mr.mrrefChr3 38886 14 + 181019 CCATTTAAGGTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484765 14 + 636262 CCATTTAAGGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 493084 14 + 647215 CTATTTAAGGTTAA - -a -s mr.mrrefChr3 38900 415 + 181019 TAAACAAATTAGAATTTATGTCCCACAATTCTTGAAATGTTTCTATTTAAAAGTCATCTGTTACTATATCAAATTCCTTTAAAAGCTTCACTCTGCTTAATGAATGGTTTTCAGTGATGTCCCAGTCCTATTATGAACAATGCTCATTATTTAGCAACGCATGTTATCTGCCCTATCAAGTGTTAGTCCATAGAGAGATTCGAGTTGGAAGGTTAGAACAAATAAATTTATCAGTTTTTGGTTCTCCAGTATCTTCACTAATTAACCACTAACTGTGCTGACTAGTAAACCTATGATCCTGATTTGTTTTGCGATAGCAGACCTATTGTACTGAATCACTATTTATGCAGTTTTTATCACAGTTCCTGTCCTGTTCTGACTTGTATGCGTACAAACACCTTTGCTAAGTATGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484779 404 + 636262 TTAACAAATTAGAATTTGTGTCCCACAATTCTTGAAATGTTTTTATTTAAAAGTCACCTGTTACTATATCAAATTCCTTTAAAAGCTTCACTCTGCTTAATGAATGGTTTTCAGTGATGTCCCAATCCTATTATGAACAATGCTGATTACTTAGCAACGCATGTTATCTGCCCTGTCAAGTGTTAGTCCATAGAGAGATTCGAGTTGGCCAGTTAGAACAAA---ATTTGTCAGTTTTTGGTTCTCCAGTATCTTTACTAATTAACCACTAACTGTGCTGACTAGTAAACCTATGATCCTGATTTGTTTTGCGATAGCAGACCTATTGTACTGAATCACTATTTATGCAGTT---ATCAC----CCTGTCCTGTTCTGACTTGCATGCGTACAAACAT-TTTGCTAAGTATGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 493100 415 + 647215 TAAACAAATTAGAATTTATGTCCCACAGTTCTTGAAATGTTTCTATTTAAAAGTCATCTGTTACTATTTAAAATTTCTCTATAAGCTTCACTCTGCTTAATGAATGGCTTTCAGTACTGTCCCAGTCCTATTATTAACAATGCTCATTATTTAGCAATGCATGTTAGCTGCCCTATCAAGTGTTAGTCCATAGAGAGATTCAAGTTGGAAGGTTAAAACAAATAAATTTATCGGTTTTTGGTTCTCCAGTATTTTCACTAATTGACCACTAACTGCCCTGTCTTGTAAACCTATGATCCTGATTTGTTTTGCAAAAGCGGACCTATTGTTCTGAATCACTATTTATGCAGCTTTTATCACAGTTCCTGTCCTGTTCTGACTTGTGTGTGCACATACACCTTTGCTAAGTATGAGT - -a -s mr.mrrefChr3 39315 38 + 181019 GCAAGCGATTGCCCTAGACTCCTTGTCTAATATTTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485183 38 + 636262 GCAAGCGATTGCCCTAGACTCCTTGTCTAATATTTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 493516 38 + 647215 GCGAGCGATTGCCCAAGACTTCTTGTCTAATATTTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 39353 104 + 181019 GACAAAATGATTGATTGAGGTCATCTAGAGACTGCCCCATTAATTTCGTTCCCATATATAATTCTAAAGGTTCTCTTCTCTCAGCATATTTCACTCAAGGAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485222 104 + 636262 GACACAATGATTGATTAAGGTCATCTAGAGATTGCCCCATTAATTTCATTCCCATATATAATTCTAAAGGTTCTCTTCTCTCAGCATATTTCACTCAAGGAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 493554 104 + 647215 GACAAAATAAGACGCTGAGGTCATCTAGAGACTGCCTCATTAATTTAGTTCACATATATAATTCTACGGGTTCTCTTCGCTCAGAGTATTTCACTTAAGGAAAC - -a -s mr.mrrefChr3 39457 10 + 181019 TGCACAGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485332 10 + 636262 TGCACACTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 493658 10 + 647215 TGCACAGTAA - -a -s mr.mrrefChr3 39467 18 + 181019 AGGTTCTCAACCAAACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485342 18 + 636262 AGGTTCTCAACCAAACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 493677 18 + 647215 AAGTCTTCAACCAAACCT - -a -s mr.mrrefChr3 39485 62 + 181019 TTACACTATGATCTGATATTGCTTGCCTTTGCCTACAGTTGTCACTTCATGTAGATAACAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485360 62 + 636262 TTACACTATGATCTGACATTGCTTGCCTTTGCTAGCAGTTGTCCCTTCATGTAGATAACAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 493697 62 + 647215 TTACACCATGATCTGATATTGCTTGCCTTTGCCTACAGTTGTCACTTCATGTAGATAACAAG - -a -s mr.mrrefChr3 39547 133 + 181019 TTGACCAGTACCAAACCTGGTAAAGAGCACATCTTGGAAATGGATAGGGGTATCTTGGGGCATACTGAGCAATATATGTTGGTAGGCAGGTTAGTTAAGGTAAGTGAGTAAAGACATGGCAAGCCACCCCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485422 133 + 636262 TTGACCAGTACCAAACCTGGTAAAGAGCACATCCTGGAAATGGATAGGGGTATCTTGGGATATACTGAGCAATATATACTGGTGGTCAAGTTAGTTAAGGTAAGTGAGTAAAGACATGGCAAGCCACCCCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 493764 133 + 647215 TTGACCAGTACCAAACCTGGTAAAGAGCAGATCTTGGAAATGTACAGGGGTATCTTTGGGCATACTGAGCAATATATGTTAGTAGGCAGGTCAGTTAAGGTAAGTGAGTAAAGACATGGCAAGCCGTTCCTAT - -a -s mr.mrrefChr3 39680 16 + 181019 CCCATACTAGGGGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485557 16 + 636262 CCCATACTAGGGGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 493897 16 + 647215 CCTGTACTAGGCGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 39696 15 + 181019 TTAGGACCTGGCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485573 15 + 636262 TTAGGACCTGACCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 493921 15 + 647215 TAAGGACCAGGACGC - -a -s mr.mrrefChr3 39711 158 + 181019 CCTGTTTGGCAATGAGAAGCCTTGAATATGACAACACAGAAACATTCAGTTCAAGATATAATCATCTTGCAAGACAAGTCAAGTAGTAAGATGTTTAAGGTACTGAGCATGCTGATCATTCTCAGTAGGCATAACATCAATAGGAGACTAATGACATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485588 158 + 636262 CCTGGTTGGCATTGAGAAGTATTGAATATGACAGCACAGAAACATTCAGTTCAAGATATAATCATCTTGCATGACAAGTGAAGTATAAAGATGTTTAAGGTACTGAGCATGCTGATCATCCTCAGTAGGCATAACATCAATAGGAGACTAATGACATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 493937 158 + 647215 CCTGTTTGGCAATGAGAAGCCTTGAATATGATAACACAGAAACATTCAGTTTAAGATATAATGACCTTGCAAGACAAGTCGAGTAGTAAGATGTTTAATGTACTGAGCATGCTGATCATTATCAGCAGAGATAACATCAATAGGAGAATAATGACACA - -a -s mr.mrrefChr3 39869 52 + 181019 GACTTTCCACAACCCTCATACCATCTCTCATGCTATGGCAGGTACTCAAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485746 50 + 636262 GGCTTTCCACAACCCTCATACCA--TCTCATGCTATGGCAGGTACTCAAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 494097 51 + 647215 GAGTTTCCACAACTCTCATACCTTCTC-AATGCCATGGCAGGGACTCAAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 39921 100 + 181019 TGTTGCTGTGTAAAGTAGAACAAGTGCCTTAGTGGTCAGATCAATAGTTATTAATTCATTGCAGATATACTGCTTTGGATGTCTGAGCTCTTTCACAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485800 100 + 636262 TGTTGCTATGGAAGTTAGAACAAGTGCCTTAGTGGTCAGATCAGTAGTTATTAATGCATTGCAGATATACTGCTTTGGATGTCTGAGCTCTTTCACAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 494148 97 + 647215 TGTTGCTGTGTCAAGTAGAACAAGTGCCTTAGTGGTCGGATCAACAGTTATTAATTCATTGTGGATAT---GCTTTGGATGTCTGAGCTCTTTCACAGGC - -a -s mr.mrrefChr3 40021 109 + 181019 AGGGAGCCCTCCCAAGGAAAAAGCAGGGAATGAAACCTACCCTTAGAAGCCCAGGCCAAATGGTAGTGGGGACAGCCTCTCAGAGGGTGCCACTCTTTGGACCAGTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485901 109 + 636262 AGGGAGCCCTCCCAAGAAAAAAGCAGGGAATGAAACCTACCCTTAGAAGCCCAGGCCAAATGGTAGTGGGGACAGCCTCTCAGAGGGTGCCACTCTTTGGACCAGTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 494245 109 + 647215 AGGGAACCCTACCAAGGAAAAAGCAGGGAATGAGACCTACCCAGAGAAGCCCAGGCTGAACGGTAGTGGGGTTGGTCACTTGGGGGGTGCCACTCTTTGAACCAGTACC - -a -s mr.mrrefChr3 40130 249 + 181019 AACCCAGTAtttcttcttaagtcagcaacatacagtctttcttgttatgtgattggtcagattgtagtgaaaatatctaaggacccctgagacaaggatggagtgaacttagccctggagcacaaccccacaggttggtgtactccattccaattcataAACATGGAAAGTTAGGCCCACAGCAACATGGAAGCTGCGCAGAGTCTTGGCTCAATGGTTAGTTTTCACAATATGTGTAGAACTCATACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486010 249 + 636262 AACCCAGTAtttcttcttaagtcagcaacatacagtctttcttgttatgtgattggtcagattgtagtgaaaatatctaaggacccctgagacaaggatggagtgaacttagccctggagcacaaccccacaggttggtgtactccattccaattcataAACATGGAAAGTTAGGCCCACAGCAACATGGAAGCTGCGCAGAGTCTTGGCTCAATGGTTAGTTTTCACAATATGTGTAGAACTCATACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 494360 249 + 647215 AACCCAGTAGTTcttcttaaggcaggatcatactgtctttcttgtgatgcaattggacacactgcagtgggaatatctaggggcccctaagaccaggacgaggcagacttagccctggagcacaaccccacaggttggtgtactccattccaatTCATGATCACGAAAAGTTAGGCCCATGTCAACATGGAAGCTGCACAGAGTCTTGGCTAGATGATTAGTTCTCGCAATATGCGTAGAACTCATACA - -a -s mr.mrrefChr3 40379 65 + 181019 GCCATAACAGGATAGATTACCCCCAATGTCTCTGTCACCAGATAGCTATATTCACTTCCTACAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486260 64 + 636262 GCCATAACAGAATAGATAACCCCCAA-GTCTCTGTCACCAGATAGCTACATTCACTTCCTAGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 494609 65 + 647215 GCCATTACAGGATAGATTACCACCAATGCCTCTGTCACCAGTTAGCTATATTCACTTCCTACAAA - -a -s mr.mrrefChr3 40444 91 + 181019 TCATTATTTACCTCGTATTATGACTGAGTTTAGGGGCCCTAGTATAATAGACAAATCATTTGTAATAGATCACCTTATAGAAAAGACGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486325 80 + 636262 TCATTATTTACCTCGTATTATGCCTGAGTTTAGGGGCCCCAATATAATCGACAGATCATTTGTAATAGATCACCGTATAG----------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 494674 91 + 647215 GCATTATTTACCTCGTATTTTGACTGAGTTCAGGGGTCCTAGTATAATAGACAAATCACTTGTAGTTGATCATCTTATAGAAAAGACGATA - -a -s mr.mrrefChr3 40535 576 + 181019 TACCTGTATGAGAGCCTCCAAACTAGGGAGTTTAGGACTTTTTTAGCTTACTTCTACATGCATCTTAAAACTCACAATTGATGTAAAATGGCCATTAAGCAACAAATCATTCCAGCCATGGCTTCATGTATAGTGAGCAGTACTACTCATCTTTGCTCTATCCTAGGAACCCAGTTTACAGTAGATACATGGCACATAGGTTCCATTGATTGCTATGTTGAGAATTTGGTAGTGCTACTTACAATAGTACTATGTAGGATGAACTTCATATCTTCATCTGAACATTTCCGGTTGGTTGGGATTCCTTCTGGTAGTAAAGAGTAACACCAGTTAATGTATTGGCCTAACACATCATTGCTGCTATTGTGGTGGTTGGAGTTTGTTGGTGTTTGGAGTGAGTTAGGGTGCGAAGTGTTTTGGCCCATGTTACTTAGATGATGTTATCGTTATTTGAGAACTCATATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAGAATATACAAACTCCAACCAACACCACCATTCAGGTATGATACATTCACATGTTTAATATATTTGTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486405 555 + 636262 -----------GAGCCTCCAAGCTAGGGAGTTTAGGACTTTCGTAGCTTACTTCTACATGCATCGTAAA---CACAACTGATGTAAAATGGCCATTAAGCAACAAATCATTCCAGCCATGGCTACATGTATAGTGAGCAGACCTACTCATCTTTGCTCTATCCTAGGAACCTTGTTTACAGTAGATACATGGCACATAGGTTCCATCGATTGCTATGTTTAGAATTTGATAGTGCTACTTACAATAGTACTATGTAGCATGAACTTCCTATCTTCATCTGAACATTTCCGGTGGGTTGGGATTCCTTCAAGTAGTAAAGAGTAACACCAGTTAATGTATAGGCCTAACACATCATCACTGCTATTGCGGTGGTTGGAGTTTGTTAGTGTCTGGAGTGAGTTAGGATGCGAAGTGTTTTGACCCATGT-------ATGATGTTATAGTTATTTGAGAACTTGTATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAAAATATACAAACTCCGACGAACACCACCATTCAGGTATGATACATTCATATGTTTAATATATTTGTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 494770 562 + 647215 TACCTGTATGAGAGCCTCCAAACTAGGAAGTTGAGGACTTCTTTAGCTTACTTCTACATGCATCTTAAAACTCACAATTGATTTAACATGGCCACTAAGGAACAAACCATTCCAGCCATGGCTTTATGTATAATGATCAGTACTACTCTTCTTTGCTCTATCCTTGGAATACATTCTACAGTAGATACATGGCAGGTAGGTGCCATTGATTTCTATGTTGAGAATTTAGTAGTGCCACTTACAATAGTACTATGTAGGATGA-CTTCATATCTTCATCTCAACATTACCAGTTGGTTGGGATTCCTTCTGGTAGTAAAGAGTGAGATCAGTTAATGTATTGGCCTAACATGTCAGTGCTGCTATTGTGGTGGTTGGATTTTGTTGGTAGTTGGAGTGTGTTTGGGTGCGAAGTGTTTTGGCCGATGTTACTTAGATGATGTTATCATTATTTGCGAGCTCATATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAGAATATACAAACTCCAACCAACACCACCATTCAGGTATGGTAGCTTCACATGTCTA------------- - -a -s mr.mrrefChr3 41111 120 + 181019 ACAGCCCATAGCTGTACAGCCCATTGTCTGACCAACTTGGAATCTAAGTTTTTCCTTCTTTAGGGACAGACAAGCCTTAGGTAAAACCTCCATGATGAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486962 120 + 636262 ACAGCCCATAGCTGTACAGCCCATTGTCTGACCAACTTGGAATCTAAGTTTTTCCTTCTTTAGGGACAGACAAGCCTTAGGGAAAACGTGAATGATGAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 495332 68 + 647215 ----------------------------------------------------CCCATCTTTAGGCACAGAAAAGCTTTAGGTAAACCCTCCATGGTTAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG - -a -s mr.mrrefChr3 41231 143 + 181019 AGCACTACTCTCTTCCTGTTCAAGATTAGGGAGTATTTTAATCTTAGATAGGCCCTAGCATCTGCTTTTTTAAAAACAATCTACCTCACTTCCCTGAGGAAAACCTATAGCTGCTCTATCGTTGCGGATGAAGCTCTATTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487084 143 + 636262 AGCACTACTCTCTTCCTGTTCAAGATTAGGGAGTATTTTAATCTTAGATAGGCCCTAGCATCTGCTTTTTTAAAAACAATCTACCTCACTTCCCTGAGGAAAACCTATAGCTGCTCTATCGTTGCGGATGAAGCTCTATTCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 495400 143 + 647215 AGTACTACTCTCTTCCTGTTAAAGTTTAGGGAGTATTTTAATTCTAGGTAGGGCCTAGCACTTTCTTTTTTAAAAGCAATCTACCCCACTTCCCTGAGGATAACTTAAATGTGTTCTATTCTTGCAGATGAAGCTCTATCCTA - -a -s mr.mrrefChr3 41374 24 + 181019 TACACAATTACTTTCTTCACTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487251 24 + 636262 TACACAATTACTTTCTTCACTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 495543 24 + 647215 TAGACAATTACTTGCTTCACTTCA - -a -s mr.mrrefChr3 41398 130 + 181019 CGTCAGATAGCTCGAGACTCTAAAGTATTCTGCACAATATGTATATAGACAAATCAAAGGGGTGAGATTTAGTGGACATAAACTAGGTACAACCTAGTACTACTGAGCTTACGTTGTTGTAGAACAAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487276 130 + 636262 CGTCAGATAGCTCGAGACTCTAAAGTATTCTGCACAATATGTATATAGACAAATCAAAGGGGTGAGATTTAGTGGACATAAACTAGGTACAACCTAGTACTACTGAGCTTACGTTGTTGTAGAACAAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 495567 130 + 647215 TGTCGGATAGCTAGAGATTCCTAAGTGCTCTGCACAATATGTATATAGACCAATCAGAGGGGTAAGATTTAGTGGACGTAAACTGGGTACAACCTAGTACTACTGAGGTTAAACTGCTGTGGAACAAAAT - -a -s mr.mrrefChr3 41528 33 + 181019 AAATGGAACATTATGTTGTTTGCGGAGAAATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487407 33 + 636262 AAATGGAACATTATGTTGTTTGCGGAGAAATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 495697 33 + 647215 AAATGCAACATTATGCAGTTTGCAGAGAAATGT - -a -s mr.mrrefChr3 41561 29 + 181019 ATACCTCTTTTACACACAATTTCTAACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487445 29 + 636262 ATACCTCTTTTACACACAATTTCTAACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 495730 29 + 647215 ATACCTCTTTTATACACAACTTCTAACCC - -a -s mr.mrrefChr3 41590 22 + 181019 TACCAATAGTCACTTGGGTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487476 22 + 636262 TACCAATAGTCACTTGGGTGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 495759 22 + 647215 TACCAATAGTCTCTTGTGTGCC - -a -s mr.mrrefChr3 41612 59 + 181019 ATTTCAGTCCACTATACATGGCCACTTCAAGATTATTCTAATAATGCATAATGCCTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487501 59 + 636262 ATTTCAGTCCACTATACATGGCCACTTCAAGATTATTCTAATAATGCATAATGCCTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 495781 59 + 647215 ATTTCAGTCCACTATGCATGGCTACTCCAAGATTGTTCTAATAACCCATAATGCCTAGA - -a -s mr.mrrefChr3 41671 147 + 181019 CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCACACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTGTCTATGTGAGATATTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487567 147 + 636262 CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCCCACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTATCTATGTGGGATGTTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 495840 147 + 647215 CCCAGGGCATAGATCCCATCAATCATTCTCTTCATGTTCTGTTAGCCTATTAGATCTACGGAGCTTTGGTGTCATATTTCAAATACCACCATTTAGCATGCTCCCTTTGTCTATGTGAGATATTAGGTAAGCCTGATAAATACTACT - -a -s mr.mrrefChr3 41818 64 + 181019 TGGTTGACTTTCAATTTGTCCCAAATCTCAATCTTTGTTTTTATTCATCTTACCAGTTCTTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487718 64 + 636262 TGGTTGTCTTTCGATTTGTCCCAAATCTCAATCTTTGTTTTTATTCATCTTACCAGTTCTTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 495987 64 + 647215 TGGTTGACTTTCAATTTGGCCCAAATCTTAATCTTTGTTTTTATTCATCTTACCAGTTCTTGGT - -a -s mr.mrrefChr3 41882 11 + 181019 AGGACCACCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487786 11 + 636262 AGGAGCACCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496051 11 + 647215 ATGACCACCTA - -a -s mr.mrrefChr3 41893 18 + 181019 TGGTCAAGCCACAATGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487798 18 + 636262 TGGTCAAGCCACAATGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496062 16 + 647215 TGGTAGAGTCACAATG-- - -a -s mr.mrrefChr3 41911 46 + 181019 ATGAATGTCTGAATCTCAGCAGGATACCAATACCTAACGGCAACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487817 46 + 636262 ATGAATGTCTGAATCTCAGCAGGATACCAATACCTAACGGCAACAG - -a -s mr.mrrefChr3 41957 97 + 181019 GGTAAGGCTAGATGACATATGTACTTTCATATGGAGTAATCAAAGAGAGTTTCCAGGAATCACTCACCCCCATCCATCAGAGTGTCTAATCTGCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487864 97 + 636262 GGTAAGGCTAGATGACATATGTACTTTCATATGGAGTAATCAAAGAGAGTTTCCAGGAATCACTCACCCCCATCCATCAGAGTGTCTAATCTGCCCC - -a -s mr.mrrefChr3 42054 56 + 181019 AGGACTCACGGGAGACAGACATATAGCAGTAATTTTCCAGACAAGGCGATGTGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487962 56 + 636262 AGGACTCACGGGAGACAGACATATAGCAGTAATTTTCCAGACAAGGCGATGTGCTG - -a -s mr.mrrefChr3 42110 50 + 181019 GAGGCTATCCTAGTTGGAAATCAAGTTTTCATTAAAGTACCCACACTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488024 50 + 636262 GAGGCTATCCTAGTTGGAAGTCAAGTTTTCATTAAAGTACCCACACTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496078 36 + 647215 --------------TGGAAATCAAGTTTTCATTAAAGTGCCCACACTTAC - -a -s mr.mrrefChr3 42160 40 + 181019 TTCAGAGGAAGGATACAGTCATGCAAAAGTGGAACCCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488076 40 + 636262 TTCATAAGAAGGATACAGTCATGCAAAAGTGGAACCCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496114 40 + 647215 TTCAGAGGGAGGATACAGTCATGTAAAAGCGGAACCCTAA - -a -s mr.mrrefChr3 42200 17 + 181019 CTATCAGGCAAAGGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488135 17 + 636262 CTGTCAGGCAAAGGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 496154 17 + 647215 CTATCAGGCAAAGGTGG - -a -s mr.mrrefChr3 42217 123 + 181019 CCTAACAGCCTAAAATCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCCAGGGAGAATGGGAAATGGAAAAATCAACAAATGGAGAAATCAACAACATGATGTGCAATTCTCTATATACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488154 123 + 636262 CCTAGCAGCCTAAAACCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCCAGGGAGAATGGGAAATGGAAAAATCAACAAATGGAAAAATCAACAACATGATGTGCAATTCTCTATATACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 496171 101 + 647215 CCTAACAGACCAAAATCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCAAGGGAGAA----------------------ATGGAGAAATTAGCAATATGATGTGCAATTCTCCATATACATG - -a -s mr.mrrefChr3 42340 54 + 181019 AGTCAGATCAAATAAACAGTTGATGTACCCGCTTCATATTAGTGCAAAAGTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488291 54 + 636262 AGTCAGATCAAGTAAACAGTTGGTGTCCCTGCTTCATATTAGTGCAAAAGTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 496272 33 + 647215 AGTCAGATCAAATAAACAGTTGATGTACCCACT--------------------- - -a -s mr.mrrefChr3 42394 26 + 181019 CATTGAATCACTGCAGGCTTAGGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488373 26 + 636262 CATTGAATCACTGCAGGCTTAGGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 42420 27 + 181019 TACAGATTCATAAATTCTCATTCCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488400 27 + 636262 TACAGATTCATAAATTCTCATTCCCAC - -a -s mr.mrrefChr3 42447 18 + 181019 TAGAGAGACGAGAGACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488430 18 + 636262 TAGAGAGACGAGAGACAA - -a -s mr.mrrefChr3 42465 295 + 181019 TCAAATGACAGGCCCAGGAATGGTGAACTTCAAATAGATATTTTTATGACACCCAGAACATTGTTATAATGTTTATAGAATTACTTCATACACCAGTAAGAGTAAATACTGTAGGAAAAATATTCTTAGATGTGTAGTCCCATTCAATTCTAGTGGCATTTCTGGTCTAGCAGCTCCTGGTATTTGTAAGCAAGCTCTGGCCTCAGGTAACTATAGTATTTATTACGTACCAGTATTAGACAATGAGTTCAAGTTGCGCTAGTAAGTGCCTTGGCATTTTACTTGTTACCACTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488449 295 + 636262 TCAAATGACAGGCCCAGGAATGGTGAACTTCAAATAGATATTCTTATGACACCCAGAACAGTGTTATAATGTTTATAGAATTACTTCATACACCAGTAAGAGTAAATGCTGTCAGAAAAATATTCTTAGATGTGTAGTCCCATGCAATTCTAGGGGCACTTCTGGTCTTGCAGCTCTTGGCATTTGTAAGCAATCTCTGGCCTCAGGTAACTATAGTATTTATTACATACCAGTATTAGACAATGAGTTTAAGTTGCGCTAGTGAGTGCCTTGGCATTTTACTAGTTACCACTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496305 269 + 647215 -------------CCAGGAATAGTAAACTTCAAATAAATATTTTTACGCCACCCAGAACATTGTTATAATATTTATAGAGTTACTTCATATACCAATAGGAGTAAATACTGTAGGAAA------------CGTGTAGTCCCATTCAATTCTAGTGGCATTTCGGATCTAGCAGCTCCTGGTATTTTTAAGCAAGCCCTGGCCTCAGGTCATTACAGTATTTATTAAGT-CCAGTATTAGACAATGAGTTCAAGTTGTACTAGTAAATGCCTTGGCATTTTATATGTTTCCACTGC - -a -s mr.mrrefChr3 42760 23 + 181019 TGGATGGATAACAAGCGCCACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488744 23 + 636262 TGGGTGGATAACAAGCGCCACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496578 23 + 647215 TGGATAGATAGCAAGCACCACCC - -a -s mr.mrrefChr3 42783 48 + 181019 TTGTAAATTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAGTGGATGGAGCGCTGGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488767 48 + 636262 TTGTAAGTTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAATGGATGGAGCGCTGGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 496603 48 + 647215 TTGTAAATTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAGTGGATGGAGTGCTGGTGT - -a -s mr.mrrefChr3 42831 14 + 181019 AGTGCTTTGGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488817 14 + 636262 AGTGCTTTGGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 496651 14 + 647215 AGTGCTTTGGCTGT - -a -s mr.mrrefChr3 42845 115 + 181019 CATGTTAATCCACTCCACCCTCCAAGGGCAATATTGCAGTCACCTGGTTTCACACACATGCTAGTGGTTTACTCCTAAACAGGCCTGTTCTTCAATCATTAGCTCTTGCAGCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488831 114 + 636262 CATGTTAATCCACTCCACCCTCCAAAG-CAATATTGCAGTCACCTGGTTTCACACACATGCTAGTGGCTGACTCCTAAATGGGCCGGTTCTTCAACCATTAGCTCTTGCAGCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496670 115 + 647215 CATGTTAATCCACTCGACCCTGCAAGGGCAATATTGCAGTCACCTGATTTTGCACACATGCTAGTGGTTTACTCCTAAACAGGCCTGTTCTTGAATCATTAGCTCTTGCTGCGTA - -a -s mr.mrrefChr3 42960 35 + 181019 AGCCCAGAGTTTAGGCCTCATTTGAGATTGTGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488958 33 + 636262 AGCCTAGAGTTCAG--CTAATTTGAGATTGTACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496785 35 + 647215 AGGCCAGAGTTTAGGCCTCATTTGATATTGTGCTT - -a -s mr.mrrefChr3 42995 53 + 181019 TCAAACTCACATAAGGTCAAAGCTCATGTACACTGGGAGGCTCCATACTCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488992 53 + 636262 TCAAACTCATATAAGGTTGAAGCTCATGTACACTGGGAGGCTCCATACTCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496820 53 + 647215 TCAAACTCACATAAGCTCAAAGCTCATGTACACTGGGAGGTTCCGTACTCTAC - -a -s mr.mrrefChr3 43048 21 + 181019 CTGTCTTATTATAGCCTGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489054 21 + 636262 CTGTCTTATTATAGCCTGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496873 21 + 647215 CTGTCTTATCATAGCCTGATT - -a -s mr.mrrefChr3 43069 46 + 181019 AAGCATGATTTATACTGTGACATGACTCTCTATTCAACATAGTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489075 45 + 636262 AAGCAT-ATTTATACTGTGACATGACTCTCTATTCAACATAGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496898 46 + 647215 AAGCATGATTGTTATTCTGACATGACGCCCTATTAAAGATAGGTAA - -a -s mr.mrrefChr3 43115 93 + 181019 TTGTATTTTTTCCTGGAGTGAAGCCAGGGTATAAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTGTTGCTGTGCAGATTATAAATTGTGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489121 80 + 636262 TTGTGTTTTTTCCTGGAGTGAGGCCAAGGTATAAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTG--------CAGATT-----TTGTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496944 93 + 647215 TCGTATTTATTCCTGGACTGAAGCCAGGGTATTAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTGTTGCTGTGCAGATGATAAATTGTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 43208 217 + 181019 TGAGGCAAACTCTCCCCATGGGCACTGAGCCTCTATTGATTGTCATGCCTCCATCTTATCTACTTGCTTTTCAAACTTTGTAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGGGCATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCGCTCATTCAGGGTTTAGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTCTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489202 214 + 636262 TCGGGTGAACTCTCCCCATGGGCACTAAGCTTCTATTGATTATCATGCCTCTATCTTATCTACTTCCTTCTCAAACCTTGCAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGG-CATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCACTCATTCAGGGGTTCGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTC--TT -s simRat_chr6.simRat.chr6 497037 215 + 647215 TGAGACAAACTCTCCCCATGGGCACTGAGCCTCTACTGATTGTCATGCCTCCATCTTATCAACTTGCTTTTCAAACTTTGTAGGTTTGCC-ACATATAGCAGGGAGATATGTTTGAATGGGTATTGTAGAGATAGTCCCTCACCAGTGCCCGTTCATTCAAGGTCTAGCTTATGCACTTCAGACTGCATTAGATTTCTCC-TCTTGTCCCTTCTGTT - -a -s mr.mrrefChr3 43425 118 + 181019 CCAATCACCAACAATCCCATTGCGTTTATCAATCAATCTTGTATCCTGATGACCAGGTAGCACATAATAAATAAAAATGGAGTGACAACAATACACCAGTTGCTATATGTTGTCTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489417 118 + 636262 CCAGTCACCAGCAGCCCCATTGCGTTTATCACCCAATCTTGTATCCTGATGACCAGGTGGCATCCAATAAATAAAAATTAAGTGACAACAGTATACCAGTTGCTATATGTTATCTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 497252 118 + 647215 CCAATCACCAACAATCAAATTGCGTTTATCAATCAATCTTGTATTCTGATGACCAAGTAGCACATAATAGATAAAAATGGAGTGACAACAATACACCAGTTGATATATGTTGTCTCCC - -a -s mr.mrrefChr3 43543 368 + 181019 GAATCTAGGTACTTTGGGGAAGGACTCTTGGGAGTTCACAGTCCTGGGACACACTATTAGAATCTGATTCACCCAGATTATACAGGAACAGCCTGAATCATTAGTCAAGGTCTTTGGCAGTAAGGCTATGCAATCTAAAGCAAAAGCGGTAATTGAAAATTTTGTTAAAAAGTTGGAAGAAAATTACAATCCAGAATGTGGAATTGGTGCATTCCATGACTCAGATCTAGTCCAAAGGTTATGTCAGTGTAAAGGGTTTGGATGTGAATTCTGGTACCAACATAAAGGGGACTACATACCAAGTGTTACTGTACAAATTCATGGTCAGATCTAAATTTATACACTAAGTAATCGTGATTTTCAGCTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489535 323 + 636262 GAATCTAGGTACTTCGGGGAAGGACTCTTGGGCGTTAACAGTCCTGGGACACACTATTAGATTCTGATTCACCCAGATAATACAGGAACAGCCTGAATCATTAGTCAAGGTCTTTGGCAGTAAGGCTATGCAATCAAAGGCAGAAGCGGTAATTGAAAATTTTGTTAAAAAGTTGGAAGAAAATTACAATCCAGAATGTGGAATTGGTTCATTCCATGACTCAGATCTAGTCCAAAGGTTATGTCAGTGTAACAGGTTTGGATGTGAATTCTGGTATGAACACAAAGGGGACCACGTACCAAGTCTTACCGTACAAATTCATG--------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 497371 366 + 647215 GAATCTAGGTACTTTGTGGAAGGACTCTTGGGAGTCCGCAAGCCTGGAACGTGCTATTAGAATCTGATTCACCCAGATTATACAGGAACAGCCTGAATCATTAGTCAAGGTCTTTGGCAGTAAGGCTATGCAATCTAAAGCAAAAGCCATCATTGATAATTTTGTTAAAAAGTTGGAGGAAAATTACAATCCAGAATGTGGAATTGGTGCATTCCATGACTCATATCTAGTCCAAAGGTT-TGTCAGCATAAAGAGTTTGGGTGTGAATTCCGTTACCAAAATAAAGGG-ACTACAGACCAGGTGATACTGTAAAAATTCATGGTCAGATCTAAATTTATACACTAAGTAATCGTGATTTTCAGCTGC - -a -s mr.mrrefChr3 43911 27 + 181019 CTCCAAGGTGAATCAGTGTTGTGTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489858 19 + 636262 --------TGAATCAGTCTTGTGTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 497740 27 + 647215 CTCCAAGGTGAATCAGTGTTGTGTCAA - -a -s mr.mrrefChr3 43938 19 + 181019 CCTATTAATTCCATTGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489881 19 + 636262 CCTATTAATTCCATTGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 497767 19 + 647215 CCTATTTATTCCATTGGTG - -a -s mr.mrrefChr3 43957 49 + 181019 TAGTTACTTGAAAGCTCCAGTGCTTGCTTAATGCCACAATATCATACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489900 49 + 636262 TAGTTACTTGAAAGCTCTGGTGCTTGCTTAATGCCACAATATCATACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 497801 49 + 647215 TAGTTATCTAAAGGCTCCAGTGCTTGCTTAATGCCACAATATCATACCT - -a -s mr.mrrefChr3 44006 41 + 181019 TACAGCACATCAGGGAAATGATAGTTCACTATATTATCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490065 41 + 636262 TACAGCACACCAGGGAAATGATTGTTCACTATATTACCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 497850 40 + 647215 TACAGAACATGAGGGAAATGATAATTCACCATATGATCCT- - -a -s mr.mrrefChr3 44047 119 + 181019 GAACCACTAAGCAATCACATCTACAAGATGAGAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCTGGAAGGTATGGCTCTAACCTGTGCAGTCTGTATCAATGGGTGGCTCAACTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490109 119 + 636262 GAACCACTAAGCAATCATATCTACAAGATGAGAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCGTGAAGGTAAGGCTCTAACTTGTGTGGTCTGTATCAGTGCGTGGCTCAACTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 497890 116 + 647215 GAACCACTAAGTAATCTCATCTGCAGTATGACAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCTGGTAGGTGTGGCTCT---CTGTGCAGTCTGCATCAATGGGTGGCTCAATTCA - -a -s mr.mrrefChr3 44166 76 + 181019 TCTTGACATGATGAAGTTCTTACAGTGGTTCCTGGGGAGAAATAATGGAAAGGTGCAATAGATATCTGTAGTCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490228 76 + 636262 TCTTGACATGTTGAAGTTCTTACAGTGGTTCGTGGGGAGAAATAATGGAAAGGTGCAAAAGACCTCTGTAGTCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 498010 76 + 647215 GCTTGACATGATGAGGTTCTTACAGTGGTGCCTAGGGAGAAATAATGGAAAGGTGTAATAGATATTTGTAGTCCAA - -a -s mr.mrrefChr3 44242 10 + 181019 TAAACTGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490305 9 + 636262 TAAATTGTC- -s simRat_chr6.simRat.chr6 498086 10 + 647215 TAAACTGTTA - -a -s mr.mrrefChr3 44252 15 + 181019 ATGACTAACAACTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 498112 15 + 647215 ATGACTAACAACTAT - -a -s mr.mrrefChr3 44267 152 + 181019 CTCTGAGTACTCAGCAGGGGGGTGATCCTTAACAATGCACAACATTGGTTAATTCCATACTAATGTGTTTATTACACACATTATCAAAGGATGACCTATGCAACTCTCAGGAGAGTTCAATGGCAATGAAGATTACTCAAAATCCAATCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 498129 152 + 647215 CTCTGAGTACTCAGCAGGGGGGTGATCCTTAACAATGCACAACATTGGTTAATTCCATACTAATGTGTTTATTACACACATTATCAAAGGATGACCTATGCAACTCTCAGGAGAGTTCAATGGCAATGAAGATTACTCAAAATCCAATCATT - -a -s mr.mrrefChr3 44419 20 + 181019 TCCTTTTATTGCCCAGTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 498287 20 + 647215 TCCTTTTATTGCCCAGTGTG - -a -s mr.mrrefChr3 44439 69 + 181019 AGGTGAGTGAGCAAAAGCAAACTACTGCTAAAGCTCAAGTTCCTAACATTATATTGAACTAGATTCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 498308 69 + 647215 AGGTGAGTGAGCAAAAGCAAACTACTGCTAAAGCTCAAGTTCCTAACATTATATTGAACTAGATTCTCC - -a -s mr.mrrefChr3 44508 385 + 181019 CTTGGTACCAATGCACTGGGAACCTCTTTTATCTTGCAGCCAAGAACTTACACATGTGCTGCATACCTACTTACTTATATATCCCAGATAAGATTATTATATATCCCCAACACACAGTGCATCAATTAAGGATGCCCTATGAGGGACTTAGACAGAACTATCTCGGTGAGATCATTAGTGTTGAATGCCATGTTGCAGTACGATGGTGAGGTGACTGGCTCAGATCTCAAGCCGGTGTTATAGAGTACAGACCACTGCCGAAGTAGACATTGGGTAATTTAAATTAGATGGTGTAAGTTGCCAGCAAGAGTTGCTACAAGATCTCATAAACTTACACACCTTGACAGGATCCAGGAAAAACCCTGATCTCTCAACTCTATCCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490314 382 + 636262 CTTGGTGCCAATGCACTGGGAACCTCTTTTATCTTGCAGCCAAGAACTTACACATGTGCTGCATACCTTCTTACTTATATATCCCAGATAAGTTTATTATATATCCCCAACACACAGTGCATCAATTAAGGATGGCTTATGAGGGACTTTGACAGAACTATCTCGGTGTGATCATTAGTGTTGAATGCCATGTTGCAGTACAATGGTGAGGTGACTGACTCAAATCTCAAGCTGGTGTTATAGAGTGCAGACCAT-GCCAAAGTAGACATTGGGTAATTTAAATTAGATGGTGTAAGTTGCCAGCAAGAGTTGCTACAAGATCTCATAAACTTACGCACCTTGACTGGATCCAGGAAAAACCCTGATCTC--AACTCTATCCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 498386 384 + 647215 CTTGGCACCAATGCACTGGGAACTTCTCTTATCTTGCAGCCAAGAACTTACACATGTGCTGCATACCTACTTACTTATATATCCCAGATAAGAGTATTATTTA-CCCCAAGACATGGTGCATCAATCAAGTATGCTCTATAAGGGACTTAGATAGAACTATCTAGGTGAGATCATTAGTGTTGAATGCCATGCTGCAGTACGATGGTGAGGTGACTGGCTCAGATCTTGAGCCGGTGTTATAGAGTACAGACCACTGCTGGAGTAGGCATTGGGTAATTTAAATTAGATGGTACATGTGGCCAACAAAAGTTGCTTCAGGATCTCATAACATTAAATACCTTGACAAGATCCAGGAAAAACCCTGCTCTCTCGATTCTAGCCATT - -a -s mr.mrrefChr3 44893 77 + 181019 TTTCCTTTGAATTCAGTTCAACACCTCCCCATCACATTCAGGACCATTTTCCTGGGGCTGAGTTCACAATGCCATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490702 76 + 636262 TTTCCTTTGAATTCAGTTCAACACCTCCCCATCACACTCAGGACCATTT-CCTGAGGCTGGGTTCACAATGCCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 498770 77 + 647215 TTTCCTGTGAATTCAATTCTACACCTCCCTATCACATTCAGGACCATTTTCCTGGGGCTGAGTTGACAATGCCATAT - -a -s mr.mrrefChr3 44970 27 + 181019 GTAACATAACATAATAGTAAGGGGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490784 27 + 636262 GTAACATAACATAATATTAAGGGGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 498847 27 + 647215 GTAACACAACCTAATAGTAAGGGGTGC - -a -s mr.mrrefChr3 44997 64 + 181019 CCCTCTTTCTGTAAGGGGTGCTCCTTTTTGTTGTACAACCAGCCACAAAATTGGCCCAAAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490811 62 + 636262 CCCT--TTCTCTAAGGGGTGCTCCTTCTTCTTGTACAACTAGTCACAAAATTGCCCCAAAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 498923 64 + 647215 GCCTCTTTCTGTAAAGGGTGCCCTTTTTTGTTGTACCACCAACCATAAAATTGGCCCAAAAATT - -a -s mr.mrrefChr3 45061 31 + 181019 ATTTTAACCTATAGTGCAAAGTGTCCCAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490874 31 + 636262 ATTTTAACCTATAGTGCAAAGTGACCCAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 498987 31 + 647215 ATTTCAACCTATAGTGCAAGGTGTCCCAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 45092 71 + 181019 TTTTGTCTTTTAGTTCATCAATTGGGATACAACTATAGCATAGGGAGTTCCAGTTTCTTGCCTCTGAATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490905 71 + 636262 TTTTGTCTTTTGGCTCATCAATTGGGATACAACTATAGCATAGGGAGTTCCAGTTTCTTGCCTCTGAATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 499044 71 + 647215 TTTTGTCTTTCAGTTCACCAATTGGGATACAACTATCGCGCAGGGAGTTCCAGGTTTTTGCCTCTGAATCC - -a -s mr.mrrefChr3 45163 161 + 181019 TTAAGAGACACTTAAAAATATTCACATGTATTGATGGCTAGTAGGGGGGGGCATGTTTAAAGCAGGAGGATGTGTTGCCAGGTGTTCAGTACTAGCTTATGCATTATGCATGAAGTACACTGGATCCTGAGTACATATGAATAGAGGCCTTCGTGGAATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490981 159 + 636262 TTAAGAGACACTTAAAAATATTCAAATGTATTGATGGCTAGTA-GGGGGGGCATGTTTAAAGCAGGAGGATGTGCTGCCAGGTGCTCAGTACTAGCTTATGCATTATGCATGAAGTACACTGGATATTGAGTACATATGAGTAGTGGCCTTCGTGGAATG- -s simRat_chr6.simRat.chr6 499115 161 + 647215 TTAAGAGACACTTAAGCATATGCACGTGTATTGACGGCTAGTAGGGGGGGGCATGTTTAAAGCAGGAGGATGTGTTTCCAGGTGTTCAGTACTTGCTTATGCATTATGCATGAAGTACGCTGGATCCTGAGTACATGTGAATAGAGGCCTTCGTGGCATGT - -a -s mr.mrrefChr3 45324 606 + 181019 TCATTGGCATTAGAAAAATTACTTGCAGATTCCCAGCCACCAACTGGAAAAGATGGAAGAATGACAGATAATAATGTTATCTCAGGCCAGCAACCACTAATAGATTGGGATCAAATCAAGGAGGAGGGATTAAAATGGCAAAAGAGTGAGTGGGCAGGTTGGGCCTGTTGACCATGTACTCCAAAGTTATCCATGTGTTAGGGTGCTTTTGATACCTTGGTGTTTCTATACTTGAATCACAGGATAAGCATTCACTAGACTAGTACCAGCTGTCATAATGTAAACGGTCTATATCTTTACTGCCGACAAGGAATGGTGAGAACCAGTTCAACATGTCTAGTTTACAATTGAAACTACCCTACACATGACCTCAATGGCCCATCTGGCCCCACTAGGTGATCAGAAGTAACTAGGGGCCTTTGTCTTGTAAACAAATTGCTAAGAGTTAAAGTAATGTAATAAGACATGTCAACCTGCTTGGTGTCTAGCGAAACAACCAGCAAATTCCAATGTGTGTGCTTTGTTTTGATAGATTATAAAACAAGTATGATGATTTTCATTTGTTAAGTGATAATCACGATTTGTCATCTGTGTGTCTAGCCCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 491140 560 + 636262 TCATTGGCATTAGAAAAATCACTTGTAGATTCCCAGCCACCAACTGGAAAAGATGGAAGAATGACAGATAACAATGTTATCTCAGGCCAGCAACCACTAATAGATTGGGATCAAATCAAGGAGGAGGGATTAAAATGGCAAAAGAGTGAGTGGGCAGGTTGGGCCTGTTGACCATGTACTCCAAAGTTATCCATGTGTTAGGGTGCTTTTGATACCTTCATGTTTCTATGCTAGAATCACAGGATAAGCATTCACTATACTAGTACCAGCTGTTGTAATGTAGACGTTCTATATCTTTACTGCCGACAAGGGATGATGACAACCAGTTCAACATGTCTAGTTTTCCATCAAAACTACCCTGCACATGACCTAAATGGTCCATCTGGCCCCACTAGGTGATCAGAAGTGACTAGGGGCCTTTGTCTTGCAAACAAATTGCT-AGAGTTAAAGTAATGTAATAAGACATGTCAACCTGCTTGGTGTCTAGTGAAACAACCGGCAAATTCCAATGTGTGTGCTTTGTTTTGATAGATTATAAGACACATATAATAACTTTCATT--------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 499279 593 + 647215 TCATTGGTATTAGAAAAATTACCTGCAGATTCCCAGCCACCAACTGGTAAAGATGGAAGGACGACAGACAATAACGTTATCTCAGGCCA------ACTAATAGATTGGGATCAAATCAAGGAGGAGGGATTAAAATGGCGAAAGAGTGAGTGGGCAGGTTGGGCCTGTTGATCATCTACTCCAAAGTTATCCATGTGTTAGCGTGCATTTGATACCTTGGTGTTTCCATACTTCAATCACTGAATGAGCATTCAATGGACTGGTACCGGCTGTCAGAGTGTAAACCGTCTATATCTTTACTGCCGACAAGGAATAGTGAGAACCAGTTCAACATGTCTAGTTCACAGTTGAAACTACCGCACCCATGACCTCAATGGCCCATCAGGCCCCACTAGGTGATCAGAAGCAACTAGGGGCCTTTGTCTTGTAATCAAATTGCCAAGAGTTAATG------AATAAGACATGTCAACCTGCTTGGTGTCCAGC-CAACAACCAGCCAATTCCAATGTTTGTGCTTTGTTCTGATAAATTATAGAACAAGTATGATGATTTTCATTTGTTAAGTGATAATCACGATTTGTCATCTGTGTGTCTAGCCCATT - -a -s mr.mrrefChr3 45930 107 + 181019 AGTAAAACAGAAAATTCTGTGATACACTGACAAGGTTCCTGCAGAAATATTCCTTATGCAGCCTTTTCTAGGAATGGCCAGTGTGTTTGTTTCCTTTACTTCAATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 500061 107 + 647215 AGTAAAACAGAAAATTCTGTGATACACTGACAAGGTTCCTGCAGAAATATTCCTTATGCAGCCTTTTCTAGGAATGGCCAGTGTGTTTGTTTCCTTTACTTCAATGG - -a -s mr.mrrefChr3 46037 285 + 181019 ACTACAACACAGCTACATTCctgtaatgcaatggaaaggactatatgacattggtacTgGAGAGACAGCTGGAGACACTTGATTCTAGACCCTCACTTGATTTCTACAGCATGTCACTTCCTACTCGTTTCAATATGGTAGTACTTGAGAATTGATGGTATGCCAATAGTTTTTGAAACGATTGGTTTGGATTGTCTGACTAGGCAAATGTTATATGTGTCTGATGACCAGCTAACTAATCAGTTACTGAGATATGAACACATGGTAATTCACAAGCCTAATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 491700 226 + 636262 ---------------------------------------------------------T-GAGAGACAGCTGAAGTCACTTGATTCTAGACCCTCACTTAATATCT-CAGGTTGTCACTTCCTACTTGTTTCAATATGGTAGCACTTGAGAATTGATGGTATGCCAATAGTATGTGAAGCGATTGGTTTGGAATGTCTGACCAGGCAAATGTTATATGTGTCTGATGACCAGCTAGCTAATCAGTTACTGGGATATGAACACATGGTAAATCTCAAGCTTGATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 500175 283 + 647215 ACTACAACACAGCTACATTCCTGTAATGCAATGGAAAGGACTATATGACATTGGTACTG-AGAGACAGCTGGAGACACTTGATTGTAGACCCTCACTTGATTTCTACAGCATGTCACTTCCTACTCATTTCAATATGGTAGTGCTTGAGAATTGATGGTATGCCGATAGTTTTTCGAACGATTGGTCTGGATTGTCTGATTAGGCAAATGCTATATGTGTCTGAAGACCAGCTAACTAATCAGTTACTGAGATATGAACACATGGCAATTCAC-AGCCTAATCAA - -a -s mr.mrrefChr3 46322 69 + 181019 TTTTATGAGATTGGATGTTAACACACTAGGATGGAGAACGTCTCATGAGCAGGGTATACTCCCTTTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 491930 69 + 636262 TTTTATGAGATTGGATGTTAACACTCTAGGATGCTGTACATCTCATGAGCAGGGTATACTCCCTTTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 500458 69 + 647215 TTTTATGAGGTTGGATGTTAACACACTAGGATGGAGAACGTCTCATGAGCAGGGTATACCCCCTTTTCT - -a -s mr.mrrefChr3 46391 47 + 181019 ATCGACCCGCAGGTTCAGGGACCCAATGCTCATAAGAGACCATGGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 491999 47 + 636262 ATCCACCCACAGGTTCAGGGACCCAATGCTCATAAGAGACCATGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 500529 47 + 647215 ATCGTCCAGCAGTTTCAGGGACCCAATGCTCATAAGGGGCCACCAGC - -a -s mr.mrrefChr3 46438 30 + 181019 ATCCTTGTTAAGTCTGTTAATAGTAAGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492046 30 + 636262 ATCCTTGTTAAGTCTGTTAATAGTAAGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 500577 30 + 647215 ATCTTCGTCCAGTCTGTTAACAGTAAGCAT - -a -s mr.mrrefChr3 46468 97 + 181019 ATCAGACCAAATAATGGGTTTGCTTATGTATACCTGGTTGGCATCAACTTTTTAATTGACTCTTCCAATGGACTCTCTATTGTGTCTGGATCTTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492081 97 + 636262 ATCAGACCAAATAATGGGTTTGCTTATGTATACCTGGTTGGCATCAACTTTTTAATTGACTCTTCCAATGGACTCTCTATTGTGTCTGGATCTTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 500607 97 + 647215 ACCGGACCAGATAATGGGTTCGCTTATGTATGCCTGGCTGGCATCAACTCTCTAATGTACTTTTACAATAGACTCTTTATTGTGTCTGGATCTTAAG - -a -s mr.mrrefChr3 46565 88 + 181019 ATTTTTGCCAACTTTGTGGGTGGACTAAGTACAAGAGGCGAGCACCCTATCTTGACCAGCTGGATCTGGCTCATGTCATGAACAGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492182 88 + 636262 ATTTTTGCCAACTTTGTGGGTGGACTAAGTACAAGAGGCGAGCACCCTATCTTGACCAGCTGGATCTGGCTCATGTCATGAACAGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 500704 88 + 647215 ATATTTGCTAATTTGGTGGGTGTATTAAGTACAGGAGGGGAACACCCTATCTTTAGCTGCTGGATCTGGCTGATGTCATGAACAGCTA - -a -s mr.mrrefChr3 46653 7 + 181019 GAAGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492270 7 + 636262 GAAGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 500793 7 + 647215 GGAGATA - -a -s mr.mrrefChr3 46660 18 + 181019 GGATCCTCTTCCAGTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492287 18 + 636262 GGATCCTCTTCCAGTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 500800 18 + 647215 GGATCATGTAACATAACA - -a -s mr.mrrefChr3 46678 75 + 181019 CACCAAGGACACAACTGTGTGAAAAAGCCTTTAGTGGGAAATCTAGGACTCCATCCATAAGTCATGCTTGCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492305 75 + 636262 CACCTAGGATGTAAATGGGTGAAAAAGCCTTTAGTGGGAAATCTAAGACTCCATCCATAAGTCACGCTTGCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 500835 75 + 647215 CACCAAGGACACAACTGTGTGAAAAAGCCTTTGGTGGGAAATCTTGGACTCCATCCATAAGTCATCCTTGCAATA - -a -s mr.mrrefChr3 46753 223 + 181019 GAGAAGCATTTATAACCTAGGGCATCAAATAGGACTGACCCCTCAGGCAAAATTGTCAGAGACATGCTATTGTAGTGAGGTCTTAAGGAGACAAGTGTCATGATAGCTTGTTGAATCATAAAGTTAAAGAATACTAGGTATGTGCATAATAACTGTGCTGGAAAACATCAGTGACATTACGCAAACTTGATTAGCCATATGCAGTTGTAAGCATTGACGGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492381 223 + 636262 GAGATGCATTTATAACCTGGAGCATCAAATAGGACTGACCCCTCAGGCAAAATTGTCAGAGACCTGCTATTGTAGTGAGACCTCAAGGAGACAAGTTTCATGATAGCTTGTTGAATCATAAAGTTAAAGAATACTAGGTATGTGCATGATAACTGTGCTGGAAAACATCAGTGACATTACGCAAACCTGATTAGCCATACGCAGTTGTAAGCATTGACGGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 500910 221 + 647215 GAGAAGCGTTTATAACCTATGGCTTCAAATAGGACTGACCTCTCTGGCAACATTAT--GAGACAAGCTATTGTAGGGAGGTCTTAAGCAAACAAATGTCATGATACCTTGTTGAATCATAAAGATAGAGAACATTAGGTATGTGCACAATAACTGTGCTGGAAAACACCAATGACGTTATGCAATCTTGATTAGTCATATGCAGATGTGGGCATTGAAGGGAG - -a -s mr.mrrefChr3 46976 44 + 181019 TCTGCTACAATGATAGAGGTCTGTTAAAATGACTTTGGCTAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492609 44 + 636262 TCTGCTGCAATGATAGAGGTCTGTTAAAATGACTTTGGCTAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 501131 44 + 647215 TCTGCTACAATGATACTGGTCTGTTAAAATAGTCTTGGCTAGAT - -a -s mr.mrrefChr3 47020 16 + 181019 TGGTTGAAACTTGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492689 16 + 636262 TGGTTGAAACTTGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 501175 16 + 647215 TGGTTGAGACATAGTG - -a -s mr.mrrefChr3 47036 6 + 181019 CCTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492760 6 + 636262 CCTAGA - -a -s mr.mrrefChr3 47042 65 + 181019 GCAAAAGATCAGTCTAGTCCTGTCCAGCAACCATGCATTTGAGATCAAAATCCAGAGGAAAGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492780 65 + 636262 GCAAAAGATCAGTCTAGTCCTGTCCAGCAACCATGCATTTGAGATCAAAATCCAGAGGAAAGGAT - -a -s mr.mrrefChr3 47107 88 + 181019 TATTAGTTGAGATGGAAAAGTGGCCTTAAGGTCCCGATCTGCATTTATGACACCTTAGTTTAATGTTAAAGGCCTCTAGCCAGTTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70543 88 + 636262 TAATCCTTGAGATGGAAAAGTGGCCTTAAGGTCCCGATCTGCATTTATGACACCTTAGTTTAATGTTAAAGGCCTCTAGCCAGTTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492845 88 + 636262 TATTAGATGAGATGGAAAAGTGGCCTTAAGGTCCCGATCTGCATTTATGACACCTTAGTTTAATGTTAAAGGCCTCTAGCCAGTTCTA - -a -s mr.mrrefChr3 47195 24 + 181019 GTCTTGATTTGATTGCCGAAGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492933 24 + 636262 GTCTTGATTTGATTGCCGAAGGAT - -a -s mr.mrrefChr3 47219 37 + 181019 TTGCTGTGGCCCCTAAAAGGTCTGATGAAAGTATAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492959 37 + 636262 TTGATGTGGTCCCTAAAAGGTCTGATGAAAGTATAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 501208 37 + 647215 CTGCTCTGGCCCCTAAAAAGCCTGATAAAAGTATAAT - -a -s mr.mrrefChr3 47256 43 + 181019 ACAGCCAGTGATAATAACAGACAGTGTAATGTCATGACAGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492996 43 + 636262 ACAGCCAGTGATAATATCAGATGGTGTAATGTCATGACAGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 501246 43 + 647215 ACAGCCAGTGATAATAATAGACAGTTTAATGTCATGACAGCAG - -a -s mr.mrrefChr3 47299 214 + 181019 TACAAAAATAATATGGATGGTTAAGAGTAGTGGGTACAGAATTGAAGGATGCAGCATAATACAAAGGCCCTTGACATTGGACCATCATTACTGTCGCTGACAACTTCATCTAGGCTTGATACTCTTCGCAACCCAATGGTAGAGCATTCAATAACTATGTTTGGCTTGGTTAACACCACCCTAAGCTCCTAGTACTGATTAATTAGCTTTAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493039 208 + 636262 TACAAAAATAATATGGATGGTTAAGAGTAGTGGGTACAGAATTGAAGGATGCAGCATAATACAGAGGCCCTTGACATTGAACCATTATTACTGTCGCTGACAACTTCATCTAGGCTTGATACTCCTCGCAACCCAATGGTAGAGCATTCAATAACTATGTTTGGCTTGGTTAACAGCACCCTAAGCTC------CTGATTAAATAGCTTTAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 501290 207 + 647215 AACAAAAATAATATGGATGGTTAAGATTAGTGGGGAC------GAAGGATGCATTA-AATACAAAGGCACCTGAAACTGGACCGCCATTACTGTCGCTGACAACTTCATCAAGGCTTGATACTCTTTGCAACCCAATGGTAAAGCACTCAATAACCAAGTTGGGCTTGGCTAAGACCACCCTACGCTCCTAGTACTGATTAATTAGCTTTAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 47513 128 + 181019 AGCAGACCAGCAGAGATTGGTCTTTTTTATTTTGGAACCCTTGCCCTTGGCTTGCACAGGTTAAGGAAGATGACAACCTTAACTTGATGCCTGTAAGTTCATCAAGTTCAGCAGCTTTGTGAAATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493250 128 + 636262 AGCAGACCAGCAGAGATTGGTCTTTTTTATTTTGGAACCCTTGCCCTTGGCTTGCACAGGTTGAGGAAGATGACAACCTTAACTTGATGCCTGTAAGTCCATCAAGTTCAGCAGCTTTGTGAAATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 501497 83 + 647215 AGCAGAC------------------------------------------GCCTGCACTAGTTAAGGAAAATGACAACCTAAACTAGATGCCTGTAAGTTTAACAAGTTCAGCAGCTTTGTGAAAT--- - -a -s mr.mrrefChr3 47641 8 + 181019 CCCTAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493387 8 + 636262 CCCTAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 501580 8 + 647215 CCCTAAGG - -a -s mr.mrrefChr3 47649 31 + 181019 CTTCAGTAGAGGAAATGAAGGTGCTGGTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493403 31 + 636262 CTTCATTAGAGGAAATGAAGGTGCTGGTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 501588 31 + 647215 CTTCAGTAGAGGAAATGAAGGTACTGGTGCT - -a -s mr.mrrefChr3 47680 3 + 181019 ACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493434 3 + 636262 ACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 501636 3 + 647215 ATT - -a -s mr.mrrefChr3 47683 12 + 181019 CTATAGGTACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493510 12 + 636262 CTATAGGTACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 501639 12 + 647215 CTACTGGTCCAA - -a -s mr.mrrefChr3 47695 16 + 181019 CTTACAACATTTTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493522 16 + 636262 CTTACAACATTTTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 501656 16 + 647215 CATACCTCATCTTCTC - -a -s mr.mrrefChr3 47711 9 + 181019 GAAGAGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493542 9 + 636262 GAAGAGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 501672 9 + 647215 AAAGTCCTG - -a -s mr.mrrefChr3 47720 331 + 181019 GTGCTGTGTCATTCAACCATAATGAAAAGAGATCCAAATGAATTGTTTCACCCTGTTATCATTGTTACCAAGCATGTGACCTCAGTGTAAGTTTCAGTCATAAGGATGAGTATCTTCCCCCAGACCTACCACCAATCAAGAAAAACTTTTATAAGGAGTCCACTGCAATGAGCACCATGACAAAAGTGCAAGCAGATAGTTGGAAGTATATCCCCATCCCACCATAGAGGGAAACAGAAATACTGTGCCACTGGACTGTGATAATGTATATGGACATATGTCAATGGGAGAATAATGTTAAGTCATAGCATCTGAGAATAATGTTAAGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493552 327 + 636262 GTGCTGTGTCATTCAACCATAATGAAAAGAGATCCAAATGAATTGTTTCACCCTGTTATCATTGTTACCAAGC-TGTGACCTCAGTGTAAGTTGCTGTCATAAGGATGAGTATCTTCCCCCAGACCTACCACCAATCAAGAAAAACTTTTATAAGGAGTCCACTGCAATGAGCACCATGACAAAAGTGCAAGCAGATAGTTGGAAGTATATCTCCATCACACCACAGAGGGAAACAGAAATACTGTGCCACTGGACTGTGATAATGCATATGGACACATGTTAA---GAGAATAATGTTAAGTCATAGCATCTGAGAATAATGTTAAGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 501681 316 + 647215 GGACTGGGAGGTCTAACAATAATGAAAAGAGATCCTAATGAATTGTTTCAACCTGTTGCCATTGTTTGCAGCCATCTAACTTCAGTGTAAGTTTCAGTCATAAGGATGGGTATCTTCCCCAAGACCTACCACCAATCAAGAAAAACTTTTATAAGGAGTCCACTGCAATGAGCACCATGACAAAGGTGCAAGCAGATAGTTGGAAGTATACCCCCACTCCATCATAGGGGGAAAGAGAAATAATGCGCCACTGGGCTGTGATAACCTATATGGATTTACGTCAATGGGAGAATAATGTTAAGTCATAGCATCTGGT--------------- - -a -s mr.mrrefChr3 48051 73 + 181019 TAGCATCATGAAGGGATGGAGTTTAGGGTCAGCATCATGGATGGTCAATTGGAGCCTAATGTCTAGCACAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493882 73 + 636262 TAGCATCATGAAGGGAAGGAATTTAGGGTCAGCATCATGGATGGTCAATTGGAGCCTAATGTCTAGCACAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 501997 61 + 647215 ------------GGGATGGAGTTTAGGCTCAGCATCATGGATGGTCAACTGGAGCCTAATGTCTAGCACAAGA - -a -s mr.mrrefChr3 48124 52 + 181019 tttgtgtgtgtaaagtcacgatgttgggaccctttgaggggtattttgtata -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493955 52 + 636262 tttgtgtgtgtaaagtcacgatgttgggaccctttgaggggtattttgtata -s simRat_chr6.simRat.chr6 502062 52 + 647215 TCTGTGTATATAAAGTCATGATGTTGGGCTCCTTTGGGGGGCATCTTATATA - -a -s mr.mrrefChr3 48176 24 + 181019 acctgctaaagttagttgctcccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494007 24 + 636262 acctgctaaagttagttgctcccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 502115 24 + 647215 ACCTGCGAGAGTGAGTTGCCCTCC - -a -s mr.mrrefChr3 48200 18 + 181019 tcaagcatcaactgatgc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494031 18 + 636262 tcaagcatcaactgatgc -s simRat_chr6.simRat.chr6 502158 18 + 647215 TCCAGCATCAGCTGATGC - -a -s mr.mrrefChr3 48218 76 + 181019 agcatcctAGACCTACCTACATGAATGAACAATGTATAGTGAAGGGTGATGACATATCTCATGCAATGTGAGACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494049 76 + 636262 agcatcctAGACCTACCTACATGAATGAACAATGTATAGTGAAGGGTGATGACATATCTCATGCAATGTGAGACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 502177 76 + 647215 AGTATCCTAAACCTACCTACATGAATGAACAATGCATAGTGAAGAGTGATGACATGTCTGATGCAATATGAGACTC - -a -s mr.mrrefChr3 48294 9 + 181019 TTTTTATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494411 9 + 636262 TTTTTATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 502253 9 + 647215 TTTTAAAGT - -a -s mr.mrrefChr3 48303 64 + 181019 AAGTATGAGGGGGTGAGGACCCTAGTTCTAGATGTGGTAAAATAggagtggggggggaggaggg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494420 64 + 636262 GAGTAGGAGGGGGTGAGGACCTTAGTTCTGGATGTGGTAAAATAggagtggggggggaggaggg -s simRat_chr6.simRat.chr6 502264 64 + 647215 AATGATGAGGGGGTGAGGACCCTAGTTCTAGAGGTGGTAAAATAGGGGCagggggggaggaggg - -a -s mr.mrrefChr3 48367 232 + 181019 agggtgggggggggggaggggagggAAGTAAAGGAGGTAAAGTTTAAAGCATAACAGTGCTTTGTAAACAAATTTCACAAAATAGCATATTGCGCCAAGTTTTATAAATTGAATTCTGTTATGGTTAGGCACAGATAAGGGCTCACATTGGGTCATGACTGGTTATGTTAAAGGTAGACTCATTTTTTCTTCAATTAACAACTTGGCAAAGGCTTTTAGGTTTAAATATGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494485 210 + 636262 agagtggggggggggtaggggagggAAGTAAAGGAGGTAAGGTTTAAAGCATAACAGTGCTTAGTAAACAAATTTCACAAAATGGCATATTGCGCAAAGTTATGTAAATTGAATTCTGTTATGGTTAGGCACAGATAAAGGCTCACATTGAGTTATGACTGGTTATGTTAAAGGTAGACTCATTTTTTCTTTGATT----------------------GGATTAAATATGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 502328 230 + 647215 agggtgggggggagggaggggagggaggTAAAGGAGGTAAAGTTTAAAGCATAATAGTGCTCTGTAAACAAATTTCACAAAATAGCACATTGC-CCAAGTTTTATGAATCGTATTCTGTTCTGGTTAGGCACAGATAAGGGCCCACATTGGCGCATTACTCACTATGCTAAAGGTATACTCA-TTCTTCTTCAATTAACAACTTGGCAAAGGCTTTTAGGTTTAAATATGAC - -a -s mr.mrrefChr3 48599 524 + 181019 GAGAAGGTTTTTCATATCATTTTTCATGCAAGTCAAAATGCTCAGTTGGACAAGGTAATTTTCCTATTGGGGAATTTAATAATTATGATCTAACTTACTGTAAAGGCACAATCAGAGTTACTTTATCTAGGGATTACATACTGTCAGATCCAGTTGCCTTTAATATCTCTCCACAAGTTTCCTCCATAACTATAAACTGATTGTATAGGGTAATCAGCTGTGAAGCCTAATAATAAGTAAGTTATTGGATAGTGCTCTTTTAGTCTGGATGTTTTTTTAATTTAAAGGGAAGAAAATTTTAACTTAACATGGGATGACTTAAAGGATGGAGAAAAACATCCCTCCAACCCCTGTACTTTCGACGATGCTTCTCCATGTTATCATCCTGATGTTACCGAAAACATCAAGAAGACCTTTCAGAAACCTACACCAATTCATGTAAGATAGTGTGACTGAACAATGGATGTAACACTGCTGGGTTTATTGGGTTCAATGCGACCTCTCTTTAGAAAGAAGATAATGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494695 519 + 636262 GAGAAGGTTTTTCATATCATTTTTCATGCAAGTCAAAATGCTCAGTTGGACAAGGTAATTTTTCTATTGGGGAATTTAATCATTATGATCTAACTTACTGTAAAGGCACGATCAGAGTTACTTTATCTAGGGATTACATACTGTCAGACCCAGTTACTTTTAATATCTCTCCACAAGTTTCCTCCATAACTATAAACTGATTGTATAGGGTAATCAGC-----AGCCTAATAATAAGAAAGTTATTTAATAGTGCTCTTTTAGTTTGGATGGCTTTTTAATTTAAAGGGAAGAAAATTTTAACTTAACATGGGATGACTTAAAGGATGGAGAAAAACATCCCTTGAACCCCTGTACTTTCGACGATGCTTCTCCATGTTATCATCCTGATGTTACCGAAAACATAAAGAAGCCCTTTCAGAAACCTATGCCAATTCATGTAAGATAACGTGATTGAACAATGGATGTAACACTGCTAGGTTTATTGGGTTCAATGCGACCTCTCTTTAGAAAGAAGATAACGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 502559 510 + 647215 GAGGAGGCTTTTCATATCATTTTTCATGCAAGTCAAAATGCTTAGTTGGACAAGGTAATTTTCCTATTTTCAAATTTAATAGTAGTGATCTAACTTACTGTAAATGTACAAACGGAGTTACCTTGTCTCGGGATTACATACTGTCAGATCCAGTTGCCTCCAATATCTCTCCACAAGTTT-GTCCATAATTAT-------------ATGGCTAACAGCTGTGAAGCCTAATAATAAGTAAGTTATTGGATAGCGCTCTCTTAGTCTGGATGTTTATGTAATTCAAAGGGAAGAAAATTTTAACTTAACATGGGATGACTTACAGGATGGAGAAAAACATCCCTCCAACCCCTGTACTTTCGACGATGCTTCTCCATGTTATCATCCTGATGTTACAGAAAACATCAAGAAGACCTTTCAGAAACCTACACCAATTCATGTAAGAGAGTGTGACTGGACAATGGATATTACACTGCTGAGTTTATTGGATTCAACACGGCCTCTCTCTAGAGAGAAGATAATGTA - -a -s mr.mrrefChr3 49123 109 + 181019 GGGTGCTGCCTCTTCTTTTCTGGGACAGGAGGAACTGACCTTACCTGGGTCAGTCTCTGTTGCACAGGTATTGTATTTGGGTACACTCATTCACCCCTTCAGTTGTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495217 109 + 636262 GGGTGCTGCCTCTTCTTTTCTGGGACAGGAGGAACCGACCTTACCTGGATCAGTCTCTGGTTCACAGGTACTGTATTTGGGTACACTCATTCACCCCTTCAGTTGGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 503069 109 + 647215 GGGTGCTGCCTCTTCTTTTCTGGGACAGGATGAACTGACCTTACCTGGGTCAGCCTCTGTTGCACAGGTATGGTATTTGGGTTCACTCATTCACTCCTTCAGTTATTCC - -a -s mr.mrrefChr3 49232 323 + 181019 TAGAGATAAAGTGACTCAATGCTCACTTCTGAGATACAGAGGTTTGATCATAACACAATGAACATCACCTAGGACAGAGTGACCTCATTCTAGGAAATAGCGTGTACTAAGCAACGAAGTACAGGGTTTGGTAAAAATTCTGAGCACTGCCAGGAACTGTTCTAATAAGAGCAAAATTATTTTAGTCCCATGCGTGGCCACTATTGTATGGTATAGATCTGATAGGTGTAGCCCGTGCTGGCACAGGGAAGACGTTGTGCTATGTAATGCCCGGTCTCATTCACCTGGTGCTCCAGCCCAGGTCACCTTATGTATTATTCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495326 323 + 636262 TAGAGATAAAGTGACTCAATGCTCACTTCTGAGATACAGAGGTTTGATCATAACACAATCAACATCACCTAGGACAGAGTGACCTCATTCTAGGAGACAGTGTGTACTGAGCAACGAAGTACAGGTTTTGGCCAAAATTCTGAGCACTGCCAGGAGCTGTTCTAATAAGAGTGAAATTTTTTTAGTCCCATGCGTGGCCACTATTGTATGGTATAGATCTGATAGGTGTAGCCCGTGCTGGCACAGGGAAGACGTTGTGCTATGTAATGCCCGGTCTCATTCACCTGGTGCTCCAGCCGAGGTTGCCTTATGTATTATTCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 503179 304 + 647215 CAGAGATGGAGCGACTCAATGCTCACTTCTGAGATACGGAGGTTTGATCACAACATAACGAACATTATCTAGGTC-------------------GAATAGCATGTTCTAAGCAAAGAAATACAGGGTTTGGTAAAAATACTGAGCACTACCAGGAACTGTTCTAATGCAAGCAAAGTTATTTTAGTCCCATGCGTGGCCACTATTGTATGGTATAGATCTGATAGGTGTAGCGCGAGCTGGCACAGGGAAGACATTGTGCTATGTAATGCCCGGTCTCATTCACCTGGTGCTCCAGCCCAGGTCACCTTATGTACGATTACTG - -a -s mr.mrrefChr3 49555 83 + 181019 TTCTGATCTCCTGGATGCCGCTGAAGCTCGAATGAGtTTTACCTTCTTCAACAGGATCAACAAAAAAACTTTATAAGGGCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495649 83 + 636262 TTCTGATCTCCTGGATGCCGCTGAAGCTCGAATGAGTTTTACCTACTTCAACAGTATCAATAAAAAAACTTTGTAAGGGCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 507966 83 + 647215 ttcgggtatcctgggtgccgctgaagctccattgagttttcccttcttcaacaggattaacaaaaaaaccttataagggcgGC - -a -s mr.mrrefChr3 49638 5 + 181019 TGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194583 5 - 636262 TGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495732 4 + 636262 TGA-A -s simRat_chr6.simRat.chr6 193453 5 - 647215 CAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 508049 5 + 647215 TGGTG - -a -s mr.mrrefChr3 49643 40 + 181019 TAATTTGCTTCACTGCAGATTGTGATGATGCTTATAATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495736 40 + 636262 TAATTTGCCTCCCTGCAGATTCTTATGATGCTTACAATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 193458 40 - 647215 TGGTTTGGTTCACTTCAGAGTGTGACAATAATTATAAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508054 39 + 647215 TTATTTGCTTCA-TGCAGATTATGATGGTGCTTATAATAT - -a -s mr.mrrefChr3 49683 19 + 181019 GTTGACAGCAGCCACGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495776 4 + 636262 GTTG--------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 193498 19 - 647215 GTAAACAGCAGCCACGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508098 4 + 647215 GTTG--------------- - -a -s mr.mrrefChr3 49702 5 + 181019 TGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495780 5 + 636262 TGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508102 5 + 647215 TGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 49707 82 + 181019 TCTCTTGACTAAAACCACCCAGTTTTGTAGTACTACTGCAGTACACAACCTTGTTAGACTGCACTGAACCTATCATTAGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495785 82 + 636262 ACTCTTGACTCTAACCACCCAGTTTTGTAGTACTACTGTAGTGCACTACCTTGTTAGACTGCACTGAACCTATCATTAGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 193517 82 - 647215 TCTCTTGATCAAGGCCAAGCAGTTTTGAAGTACGATTGCAGCACACAACCATGTGAAACTGTGTTGAACCTAACATTAGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508107 82 + 647215 TCTCTTGACTAAAACCACTCAGTTTTGTAGTACTACTGCAGTACACAACCGTGTTAGACTGCACCGAACCTATCATTAGTAC - -a -s mr.mrrefChr3 49789 21 + 181019 ATGACAATGACACGGGTTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495879 21 + 636262 ATGACAATGACATGGGTTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 193599 21 - 647215 GTAACAATGACACAGCTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 508189 21 + 647215 AGGACAATGGCACGGGTTCAA - -a -s mr.mrrefChr3 49810 4 + 181019 TTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495900 4 + 636262 TTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 193627 4 - 647215 CCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 508210 4 + 647215 TTAA - -a -s mr.mrrefChr3 49814 29 + 181019 GATTGGCTAGAGTGAACTGTCCACATCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194588 29 - 636262 GAATGGCTAGTGTGAACTGTTCATGACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495904 29 + 636262 GATTTGGTAGAGTGGACTATCTACATTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 193631 29 - 647215 GAATGGCTAGTGTGAACTGTCCACATCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 508214 29 + 647215 GATGTGGTAGAGTGAGCTGTCCACATTTA - -a -s mr.mrrefChr3 49843 1 + 181019 G -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495933 1 + 636262 G -s simRat_chr6.simRat.chr6 508243 1 + 647215 G - -a -s mr.mrrefChr3 49844 6 + 181019 AGACGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194617 6 - 636262 AAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495934 6 + 636262 AGAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 193660 6 - 647215 AAACGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508244 6 + 647215 AGTGGT - -a -s mr.mrrefChr3 49850 5 + 181019 TATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194623 5 - 636262 TATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495941 5 + 636262 TATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 193666 5 - 647215 CAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 508250 5 + 647215 ATTAG - -a -s mr.mrrefChr3 49855 42 + 181019 CTGTATTTAAAAAAGGAAAAGCTATACAGTAAGTGAAATCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194628 42 - 636262 CTGTATTTAGAAAAGGACAAGTTGTATAGTAAGTTATATCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495946 39 + 636262 TTG---TTAAAAGAAGAAAAGCGATACAATAAGTGGAAACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 193671 42 - 647215 CGGTATTTAGACAAAGAAAAGTTGTAAAGTAAGTCATATCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 508305 42 + 647215 TTGGATTGAAATGAGGAAAAGCCATACAGCAAGTGAAAACAG - -a -s mr.mrrefChr3 49897 60 + 181019 TGAGGATATTCCAATTGTTAAGGCTCTGCCAGGTTCTACATCTGTCATCCTATATAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194679 60 - 636262 TGAGGATATTTCAATAGTTAATTCTCTACCAGGTTCTGCATCTGTAATCATATATAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495985 52 + 636262 TGAGGAAATTCCAATTCTTGAGGCTCTGCCAGGTTCTATGG--------CTATACAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 193713 60 - 647215 TGAGGACATTCCTACAGTGAATGCTCTGCCAGGTTATGCATCTGTGATCCTATATGAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508347 60 + 647215 TGAGGATATTCCAATTCTTGAGGTACTGCCAGGTTCTATATTAGTCATGTTATACAAAAT - -a -s mr.mrrefChr3 49957 6 + 181019 CAGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194746 6 - 636262 CGGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496037 6 + 636262 CAGCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 193773 6 - 647215 TAGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 508407 6 + 647215 CATTTG - -a -s mr.mrrefChr3 49963 1 + 181019 C -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496043 1 + 636262 C -s simRat_chr6.simRat.chr6 508413 1 + 647215 C - -a -s mr.mrrefChr3 49964 15 + 181019 CCATGTATAATCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194752 15 - 636262 CCATGTATAATCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496044 15 + 636262 CCATGTATGAAGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 193779 15 - 647215 CCATGTATAATCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 508414 15 + 647215 CCATGTATTATCAGA - -a -s mr.mrrefChr3 49979 2 + 181019 AT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194767 2 - 636262 AT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496059 2 + 636262 GT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508429 2 + 647215 AT - -a -s mr.mrrefChr3 49981 14 + 181019 CTCTTAGTTATGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194769 14 - 636262 CTACTAATTAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496061 14 + 636262 TTCTTAGTTATGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 193794 14 - 647215 CTGTTAGTTAAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 508431 14 + 647215 CTCTTAGTTATGCA - -a -s mr.mrrefChr3 49995 38 + 181019 GTAGAGAGGTGGATCATCAGCAGTTTTTTTGCAGCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194783 38 - 636262 GAAGAGAGGTGGGCCATCAGCAATTTTTTTGCAACATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496075 38 + 636262 GTAGATAGCTCAATCATCAGCAGTTTTATTGCAGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 193808 38 - 647215 GAAGAGAGGTAGGCCATCAGCAGTTTTTTTGCAACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 508451 38 + 647215 GTAGATAGCTTGATCATTGGCAGTTTTGTTGCAGTATA - -a -s mr.mrrefChr3 50033 4 + 181019 CAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496113 4 + 636262 CAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 193846 4 - 647215 TGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 508489 4 + 647215 CAAC - -a -s mr.mrrefChr3 50037 5 + 181019 AGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194821 5 - 636262 TGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 193850 5 - 647215 AGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 508493 5 + 647215 AGATG - -a -s mr.mrrefChr3 50042 1 + 181019 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 508498 1 + 647215 A - -a -s mr.mrrefChr3 50043 91 + 181019 TCACATCACAAATGGTCTCTGAGGTAAATGTATCTGGTAGCTTATCTATCAAAGGGTATCCTCTCCTTGCCTAGATATTAACACTAGTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194826 88 - 636262 TCACATCACAAATGGTCTCTAAGGTT---GTAACTGGCAGCTTGTCTATCAAAGGGTATCCTCTCCTTGCCTAGGTATTAACACTAGTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496117 48 + 636262 -------------------------------------------ATCTATCAAAGGGTATCCTCTTCTTGCCTAGAGATTAGCACTAGTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 193855 91 - 647215 TCACATCACAATTGGTCCCTGAGGTAAATATATCTGGTGGCTCATCTATCAAAGGGTATCCTCTCCTTGCCCAGATATTAACACTAGTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 508499 90 + 647215 TTACATCATAAATGGTCTCTGAGGTAAGTGTATCTGGTAATCT-TGTATCAAAGGGTATCCTCTTTTTGCCTAGACATTAGCGCCAGTGGC - -a -s mr.mrrefChr3 50134 9 + 181019 ATGATCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194914 9 - 636262 ACAATCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496165 9 + 636262 ATGATTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 508589 9 + 647215 ATCATCATG - -a -s mr.mrrefChr3 50143 16 + 181019 ACTTGCTACACATACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194923 16 - 636262 ATTTGCAACACCTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496174 16 + 636262 ACTTGCTATGCATACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 196843 16 - 647215 ACTTGCAACACATATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508598 13 + 647215 A--TGCTATGC-TACT - -a -s mr.mrrefChr3 50159 40 + 181019 TTCCTGATTCTTGTTCTCAGGGTTGAAGAGCACGGGGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194939 40 - 636262 CTCCTGATTCTTGTTCCCAGGGAAAAAGAGCATGGGACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496190 10 + 636262 TTC------------------GT------------GGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 196862 40 - 647215 CTCCTAATTCTTGTTCTCATGGTCGTAGAGCACGAGACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508611 22 + 647215 TTC------------------ATTGCAGAGAGCCGGGGTA - -a -s mr.mrrefChr3 50199 1 + 181019 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496200 1 + 636262 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 508633 1 + 647215 A - -a -s mr.mrrefChr3 50200 58 + 181019 TCATCTTTGAATTCCTGATTTCCTTTACATTCAGCTTCTAGAACTAATTCTGGTGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194979 58 - 636262 TCATCCTTGTATTCCCAATTGCCTTTACACTTAGCTTCTAGAACTAACTCTGGTGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496201 58 + 636262 TCATTTTTAAATTCCTGATTTCCTTTACATTCAGCTTGTAGAACTGTTACAGGTGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 196902 58 - 647215 TCATCTTTGAATTCCCAATTGCCTTTACACTCAGCTTCTAGGACTAACTATGGTATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508634 58 + 647215 TCGTTTCTGAATTCCTGAGTTCCTTTGCATTCAGCTTGTAGAACTGTTACAGGTGTCT - -a -s mr.mrrefChr3 50258 13 + 181019 TATCTCAGTAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195044 13 - 636262 TGTCCCACTAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496259 13 + 636262 TATCTCAGTAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 196960 13 - 647215 TGGGTCACTAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508692 13 + 647215 TATCTCAGTAATC - -a -s mr.mrrefChr3 50271 7 + 181019 GAAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496272 7 + 636262 GAAGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 508705 7 + 647215 GAAGACA - -a -s mr.mrrefChr3 50278 9 + 181019 TATTCCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195057 9 - 636262 CATTCCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496279 9 + 636262 TATTCCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 196973 9 - 647215 TATTCCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 508712 9 + 647215 TATTCCCAA - -a -s mr.mrrefChr3 50287 9 + 181019 GATAAGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195067 9 - 636262 GATAAGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496288 9 + 636262 TATAAGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 196982 9 - 647215 GATAAGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 508721 9 + 647215 CATAAGCCC - -a -s mr.mrrefChr3 50296 1 + 181019 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496297 1 + 636262 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 196991 1 - 647215 G -s simRat_chr6.simRat.chr6 508730 1 + 647215 A - -a -s mr.mrrefChr3 50297 51 + 181019 TACCTTAATCATAGTTTGCACATTTTACAACTTCAATTTACAGGTTCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195076 51 - 636262 TAGCTCCATCATAGATTGAACATTTTACCATATCAACTTCCAGGTTCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496298 47 + 636262 ---CATAA-CACACTTGGCACTTTTGACAACTTCAATTCAAAAGTTCATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 196992 51 - 647215 TACCTCAATCATAGATTGAACATTTTACTATATCAACTTACAGGTTCATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 508731 47 + 647215 ---CCTGG-TAGACTTTGCACATCTGACAACTTCAATTCACAGGTTCATTA - -a -s mr.mrrefChr3 50348 15 + 181019 CTCCAGTCATGGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195127 15 - 636262 CTCCTATCATGGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496349 15 + 636262 CCCCAGACCTGGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 197043 15 - 647215 CTCCTGTCATGGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 508778 15 + 647215 CCCCAGTGATAGAAG - -a -s mr.mrrefChr3 50363 1 + 181019 C -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496364 1 + 636262 C -s simRat_chr6.simRat.chr6 508793 1 + 647215 C - -a -s mr.mrrefChr3 50364 8 + 181019 CAATAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195142 8 - 636262 CAATAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496365 8 + 636262 CAATTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 197058 8 - 647215 TAATAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 508794 8 + 647215 CAATAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 50372 7 + 181019 TTTAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496373 7 + 636262 TTTAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508802 7 + 647215 TTTAACT - -a -s mr.mrrefChr3 50379 53 + 181019 CACAAGTCATGACCCCAAGTCATGGAAGCCAACAGAAACACATGGGAGCTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195150 53 - 636262 ACACAGCCATGGCCCCAATCTGTGGAAGTGAACAGAAACACATGGGAGATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496380 53 + 636262 CACAAGTCGTGACCCCAAGTCATTGAAGCCAACAGAGACACACGGAAACTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 197066 53 - 647215 CACAAGTCATGGCCCCAAGCCATGGAAGTGAACAGAAACACATGGGAGATTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 508809 53 + 647215 TACAAGTCATGACCCCAAGTCATTGAAGCCAACAGAAACGCATGGAAACTTGG - -a -s mr.mrrefChr3 50432 13 + 181019 TCAGGAACTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496433 13 + 636262 TTGGGAACTAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 197119 13 - 647215 TCAAGAACCAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 508862 13 + 647215 TCTGGAATTAAAA - -a -s mr.mrrefChr3 50445 6 + 181019 TTTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195203 6 - 636262 TATCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496446 6 + 636262 CTCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 197132 6 - 647215 TTCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 508875 6 + 647215 TGTCAT - -a -s mr.mrrefChr3 50451 47 + 181019 CTATCTTAAGCTTAAGGGGTCAAAGGAATAGACCTAGTACCTTAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496452 47 + 636262 ATAGCTTAAGCTTAAGGGGTCAAAGGAACAGACCTAGTACCTTAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 197138 47 - 647215 CTTTCGCAAGCTTAACGAATCAAAGGAATAGACCTAGTACCTTAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 509109 38 + 647215 CTACGTTAAGCTTAA---------GGGGTAGACCTAGAACCTTAGTC - -a -s mr.mrrefChr3 50498 1 + 181019 C -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496499 1 + 636262 C -s simRat_chr6.simRat.chr6 509147 1 + 647215 C - -a -s mr.mrrefChr3 50499 29 + 181019 TGACACCTACACATGAGCTAGCAATTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496500 29 + 636262 TGACACCTACACATGAGCTAGCAATTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 197185 29 - 647215 TGATGCTTACAAATGAGCTTGCAATTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 509148 29 + 647215 TGACACCTACACATGAGCTAGCAATTCAA - -a -s mr.mrrefChr3 50528 17 + 181019 GTGGAAGAAGGTGACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496529 17 + 636262 GTGGAAGAAGGTGACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 197215 17 - 647215 GTGGAGGAAGACGGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 509177 17 + 647215 GTGGAAGAAGGTGACTG - -a -s mr.mrrefChr3 50545 41 + 181019 TTGTAAATATTTTCACAAAGGGCTCCAGAGGTGGATAGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496546 41 + 636262 TTGTAAATATTTTCACAAAGGGCTCCAGAGGTGGATAGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 197254 41 - 647215 GTGGGAACTTTTTCTCAAAGGCGTCCAGAGGCAAATAGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 509194 41 + 647215 TTGTAAATATTTTCACAAAGGGCTCCAGAGGTGGATAGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 50586 2 + 181019 AT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496587 2 + 636262 AT -s simRat_chr6.simRat.chr6 509235 2 + 647215 AT - -a -s mr.mrrefChr3 50588 101 + 181019 TTGTTCTCTCCAGCATTACCTGTACCATTGTAGTACTCTGATAATTACGCCCTTTCATTCTTTACCTTTATTTTTTTGGGTACAAATTCTCCTCTCAGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496589 100 + 636262 TTGTTCTCTCCAGCATTACATGTACCATTGCAGTACTCTGATAATTAAGCCCTTTCATTCTTTACTTTTATTTTTTTGGGTGCAA-ATCCACTCTCAGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 197295 101 - 647215 CTGGTCTCTCAAGCATTACCTGTACCATTGTACTCCCCTGATACTTCCTCTCTTTCATACTTTATCTTCTTTTTTTTAGGTACAAATTCTCCTATCAGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 509237 100 + 647215 TTGTTCTCTCGAGCATTACCTGTACCCTTTTAGTACTCTGTGAATTATGCCCTTTCATTCTTTACCTTTACTTTTTTGGGTACAA-TTCTCCTCTTGGTTC - -a -s mr.mrrefChr3 50689 14 + 181019 TACCTCCTTGCTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496689 14 + 636262 TACCTCCTTGCTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 509337 14 + 647215 TACCTCCTTACTTC - -a -s mr.mrrefChr3 50703 1 + 181019 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496703 1 + 636262 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 197396 1 - 647215 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 509351 1 + 647215 A - -a -s mr.mrrefChr3 50704 6 + 181019 GAAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496714 6 + 636262 GAAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 197397 6 - 647215 GGAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 509352 6 + 647215 GAAGAT - -a -s mr.mrrefChr3 50710 259 + 181019 CTTTAGTAGTCATAGTTGTCTTGGCTATCCAGTTTGGTACCTCTGGGGCCGAGTGATATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAGTTGTTATCTCACTCCTACAACGCTAGTCCGTTTCAGGTGGACTCTCACATATTGAGGATCCAAAGCCACCTGCTATGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCTCTTCGTACTAGAGCATTTGTATATATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496720 259 + 636262 TTTTAGTAGTCATAGTTGTCTTGGCTATCCAGTTTGGTACCTCTGGGGCCGAGTGGTATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAGTTGTTGGCTCCTTCCTGCAACACTAGTCCATTTCAGGTGGGCTCTCACAAATTGAAGATCCAAAGCCACCTGCTATGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCTCTTCGTACTAGAGCATCTGTATACATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 509358 258 + 647215 CTTTAGTAGGCTTAGTTGTCTTTGCCATGCAATTTGTTACCTCTGGGGCCAAGTGA-ATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAATTGCTATCTCACTCCTACAACGCTAGTCAGTTTCAGGTGGACTCTCACATATTGAGGATCCAAAGCCACCTGCTGTGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCCCTTTGTACTAAAGCATTTGTATATATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT - -a -s mr.mrrefChr3 50969 73 + 181019 GGATATTATAATTGTAACACCTGGCAGATTAAATGATTTGCAAATGAGTAACTTTGTTAATTTGAAGAATATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496979 73 + 636262 GGATATTATAATTGTAACACCTGGCAGATTAAATGATTTGCAAATGAGTAACTTTGTTAATTTGAAGAATATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 449557 73 + 647215 AGATATTCAAATTGTGATACCTGGCAAATTAAATGATTTGCAGATGAGTAACTTTCTTAATTTGAAGAATATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 509616 73 + 647215 GGATATTATAATTGTAACACCTGGCAGACTAAATGATTTGCAAATGAGTAACTTTGTTAATTTGAAAAACATA - -a -s mr.mrrefChr3 51042 26 + 181019 ACTTACTTGGTGTCAGGTCTATCGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497052 25 + 636262 ACTTACTTGGTGTCAGG-ATATCGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 449632 26 + 647215 CCTTACTTGGTGTGAAATCTATTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 509689 25 + 647215 ACTTATTTGGTTTCAGG-CTATCGGA - -a -s mr.mrrefChr3 51068 9 + 181019 GGTTAGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497077 9 + 636262 GGTTATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 449748 9 + 647215 GATTAGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 509714 9 + 647215 GGTTAGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 51077 1 + 181019 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497086 1 + 636262 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 509723 1 + 647215 A - -a -s mr.mrrefChr3 51078 42 + 181019 TCATATCCTCAGAGTGAATGGTTGAGGGTTGGTTACCCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497087 42 + 636262 TGATATCCTCAGAGTGAATGGCTGAGGGATGGTTACCCACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 449757 42 + 647215 TCCTTGCTGCATGGTGTGCAGTTTAGTGTTAATAATACAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 509724 42 + 647215 TCATATCCTCAGAGTGAATGGTTGAGGGTGGGTTACCCATTA - -a -s mr.mrrefChr3 51120 24 + 181019 GTTGGCCATAGTAGCTGTTTAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497129 24 + 636262 GCTGGCCATAGTAGCTGTTTGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 449800 12 + 647215 TTTG------------ATATAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 509766 12 + 647215 GTTG------------GTTTAATA - -a -s mr.mrrefChr3 51144 9 + 181019 GTCTGTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497153 9 + 636262 GGCTGTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 509778 9 + 647215 GTCTGTTAA - -a -s mr.mrrefChr3 51153 21 + 181019 GATAGGAATATAACGCTGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497162 21 + 636262 GATAGGAATATAACGTGGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 509798 21 + 647215 GATAGGAATATAACACTGTCT - -a -s mr.mrrefChr3 51174 78 + 181019 CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCATATAAGGCACTTCTAAAGTCAGAAGCCTGAACAAAGGAGACTCCTCATACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497183 78 + 636262 CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCTTATAAGGCACTTCTAAAGTCAGAAGCCTGAACAAAGGAGACTCCTCATACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 509838 78 + 647215 CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCATACAAGGCACTTCTAAAGTCAGCAGCCTGAGCATAGGTGACCCCTCGTACA - -a -s mr.mrrefChr3 51252 28 + 181019 TCATATTGTATCCCACTAGTTTACAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497263 28 + 636262 TCATATTGTATCCCACTAGTTTACAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 509916 28 + 647215 TCATATTGTAACCCACTAGTTTACAGGT - -a -s mr.mrrefChr3 51280 365 + 181019 TGTCATACTCAAGAGACAAAACTTTAGAAATGAGAGTTTTCAGAATTAGACCTGTAACTTCGTGCTACCTCACGACAACTCAGCAGCACCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGGAAGTTAATGTAGACGGGAAACTAACTTGTACACCTGCAAAATGAATACACATTCTTACACAGTACCTTGTTGTACCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTGGACATTATGAAGCCCTTAATTTGAAGCTTCAGGCAATTTGAGGATTAGATAATACAACCAGAAaatgggcaaggtctctgattcactttgcacacgggagaaatggtacttc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497293 365 + 636262 TGTCATACTCAAGAGACAAAACTTTAGAAATGAGAGTTTTCAGAATTAGACCTGTAACTCCATGCCACCTCACGACAACTCAGCAGCACCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGGAAGTTAATGTAGACGGGAAACTAACTTGTACACCTGCAAAATGAATACACATTCTTACACAGTACCTTGTTGTACCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTGGACATTATGAAGCCCTTAATTTGAAGCTTCAGGCAATTTGAGGATTAGATAATACAACCAGAAaatgggcaaggtctctgattcactttgcacacgggagaaatggtacttc -s simRat_chr6.simRat.chr6 509944 365 + 647215 TGTCATACTCAAGAAACAGAGCTTTTGAGATGAGATTTTTTGGAATTGGATCTGTAACTTCGTGCTACCTCATGACAACTCAGCAGCTCCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGATAGTTGATATAGACAGGAAACTAACTTGTATACCTGCAAAATGTATACACTTTCTTACACATTACTTTGATGTTCCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTACTCATTATAAAGCCCTTAATTTGAAGCTTTAGGCAATGTGAGGATTAGATAACACAATCAAAAagtgggcaagacctctgattcactctgcacatgagaaagatgTTACGCC - -a -s mr.mrrefChr3 51645 85 + 181019 tgagggtggcgttccgcccacagactctactaccccactgctgggtgcccctgggttcttttttgaaggattCATAGTGGTAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497712 85 + 636262 tgagggtggcgttccgcccacagactctactaccccactgctgggtgcccctgggttcttttttgaaggattCATAGTGGTAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 510309 85 + 647215 TgagggtggcattccgcccacagagccacctaccccattgcttggtgtccctgggttctctttgAAGGGATCTATAGTGGTAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 51730 50 + 181019 GAAGATATGGTCAATGTGAATAAAAGGCAGTGGTCATGTACACGTGATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497798 50 + 636262 GAAGATATGGTCAATGTGAATAAAAGGCAGTGGTCATGTACACGTGATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 510394 50 + 647215 GAAAATATGGTCAATGAGAATAAAAGACAGCGATCATGTACATGTGGTTA - -a -s mr.mrrefChr3 51780 133 + 181019 GTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCGCTTGACAAGATGTCAACCGATCACAGAAGATGTCTGCCCACCTCATGGAAGAGGTTTGTCATGCATAGTTCCCCCTGCATGTTACTATTACTAGACCTTACTGACGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497848 133 + 636262 GTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCGCTTGACAAGATGTCAACCGATCACAGAAGATGTCTGCCCACCTCATGGAAGAGGTTTGTCATGCATAGTTCCCCCTGCATGTTACTATTACTAGACCTTGCTGATGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 510445 133 + 647215 ATGCTTGACTATGAGCCTGCCCTGCTTGATGAGACGTCAAGCAATCACAGAAGTTGTCTGCCCGCCTCATGCAAGAGGTTTATCCTGCATAACTCCCCCTGCATATTACTATTATTAGGCCTTACTAACGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 51913 111 + 181019 CTAAAGTTGAATGTTCTAACATACCTATACTCTCTTCCCTCCTACTAGAGTTATCAGTTATGCAGAGTTGCTTGGGACTCGACATTACCCTTATGCATCTGGCTTGTTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497981 111 + 636262 CTAAAGGTTAATGTTCCAACATACCTATACCCTCTTCTCTCCTACTAGAGTTATCAGTTCTGCAGAGTTGCTTGGGACTCGACATTACCTTTATGCATCTGGATTGTTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 510579 109 + 647215 CTAGAGTTGAATGTTCTAACATACCTATACTCTCTTCCCTCCTACTGGAATTATTGGTCAT--AGAGTTGCTTGGGATTGGACATTACCCTTATGCATCTGGCTTGTTTAG - -a -s mr.mrrefChr3 52024 329 + 181019 TTCAGCCACAATGTTAGTTGTGAGTATTTAGGTGCATTATTCCTGGTTAAGGATCTGCAATTTTGTTAAGGTCTTACTGTATGAGAGATATTTGAGGGTACCAAGCACTGAGCACCCATCGGACCTTTTGGCGGTGTATAGACCATGGTGACTCTCTTGGGTGTGATGTGTGTTGTAATTTAAACAAATTTGAAGCTAGCTGCCTGTTCTCTTATTCAGGGCTGTTAGTCTAAGTCTGACAATTAAAATTAGGACTAAATAGATGTCTCTTCTAACTTTGATTTGGGAATTGACTAATTTTTTGGGATTACACTTGATCAGGCTAGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498098 329 + 636262 TTCAGCCACAATGTTCGTTGTGAGTATTTAGGTGCATTATTCCTGGCTTGGGATCTGCAATTCTGTTAAGGCCTTACTGTATGAGAGATATTTGAGGGTGCCAAGCACTGGGCCCCCAACGGACCTTTTGGCGGTGTAGAGACCATGGTGACTCTCTTGGGTGTGATGTGTGTTGTAATTTAAACAAATTTGAAGCTGGCTGACTGTTCTCTTATTCAGGGCTGTTAATCTAAGTCTGACAATTAAAATTAGGACTAAATAGATGTCTCTTCTAACTTTGATTTGTGAGATGACAAATTTTTTGGAATTACCCTTGATCAGACTAGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 510688 316 + 647215 ATCAGCCACAGTGTTAGTTGTGAGTATTTAGGTGCACTAATCCTGGTTAAGGATCTGCAATTTTGTTAAGATCTTACTGTAT-------------GGGTACCAACAACTGAGCACCCATTGAGCATTTTGGCAGTGTGTAGACCATGATGATTCTCTTGGGTGCACTGTGTGTTGTAATTTATACAAATTTGAAACCAGCTGCCTGTTCTCTTATTCAGGGCTGTTAGTCTAAGTCTGACAATTAAAATTAGGACTAAATAGATGTTTCTTCTAACTTAGTTTTGGGGATTCACTAATTTTTTGGGACTACACTTGATCAGGGCAGGCC - -a -s mr.mrrefChr3 52353 7 + 181019 ATTATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498427 7 + 636262 ATTATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 511011 7 + 647215 ACTACGT - -a -s mr.mrrefChr3 52360 234 + 181019 TGACAGTCAGTAGATAGGTTGTATTGTTGATATGGGTTCTGGTGGAGGAGTCTAAACAACTCAAAGGAGGTTTTGGATGACGCGAAAAGGATGTTAGAGATGGGTTATAAACCCCAAGTAATGAGGATTCTATTAGATGTATGTCCAGACAAACAAGCATTGATGACCAGGTTGGAAATCACAAACAGGCATTGACATGACCAGGTTGGGAATTGCACTTCCCTAAGTGCTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498434 234 + 636262 TGACAGTCCACAGAAAGGTTGTATTGTTGATATGGGTTCTGGTGGAGGAGTCTAAACAATTGAAAGGAGGTTTTGGATGACGCGAAAAGGATGTTAGAGATGGGTTATAAACCCCAAGTAATGAGGATTCTACTAGATGTATGTCCAGACAAACAAGCATTGATGACCAGGTTGGAAATCACAGACCAGCATTGACATGACCAGGTTGGGAATTGCACTTCCCTAAGTGCTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 511022 234 + 647215 TGACAGTCAGTAGATAGATTGTATTGTTGATATGGGTTCTGGTGGAGGAGACTAAGCAACTCAAAGGAGGTCTTGGAGGACGCAAAAAGAATGTTAGAGATGGGTTACAAACCCCAAGTAATGAGGATTCTATTAGACGTATGTCCAGACAAGCAAGCATTGATGACCAGGTTGGAAATCACAAGCAGACATCAGGATGATCAGACTGGGAATCGCACTTCCCTAACTGGTATG - -a -s mr.mrrefChr3 52594 71 + 181019 ACTATGAAGATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTCGCCTTTTGCTTTGTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498670 71 + 636262 ACTATGAAGATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTCGCCTTTTGCTTTGTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 511256 71 + 647215 ACTGTGAACATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTTGCCTTTTGCTTTATTGA - -a -s mr.mrrefChr3 52665 10 + 181019 AAAGTGTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498743 10 + 636262 GCAGTGTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 511327 10 + 647215 AAAGTGTAAG - -a -s mr.mrrefChr3 52675 63 + 181019 CAGGTCTTGGGGCAATATTAGGAGGTTAATAAACTTTTGTTATAATCTCGAGTGCATAGTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498753 31 + 636262 CAGGTC--------------------------------GTTATAATCTCGAGTGCATAGTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622335 31 + 636262 CAAGTC--------------------------------GTTATAATCTCGAGTGCATAGTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 511337 63 + 647215 CAGGTTTTGGGGCAATATTAGGAGGTTAATAAACTTTTATTATACTCTTGAAGGTATAGCGAG - -a -s mr.mrrefChr3 52738 48 + 181019 ATAATGCAGAAATGGACCCCATCACCCATCAGACCAGATAACCCTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498784 48 + 636262 ATAATGCAGAAATGGACCCCATCACCCATCAGACCAGATAACCCTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622366 48 + 636262 ATAATGCAGAAATGGACCCCATCACCCATCAGACCAGATAACCCTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 511403 48 + 647215 ATAATGCAGAAATGGACCCCTTCACCTATCAGACCAGATAATCCTAAA - -a -s mr.mrrefChr3 52786 194 + 181019 CCCTTTCCAATTGGTGAATACTTTTCCACTATATTAAGGTGTCACTAATAGGTACACGTGCCAATATTCTATACTACCAGTAGGGATAAGGAAGGCAGGCAACCAATTGCCTTCTATTTGCACACTTGCTTACTGAGACCTGTAGTCCTTATTTAGATGATTCTCTCATGGGCTAGGGAGGTTGGCCCAGCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498832 194 + 636262 CCCTTTCCAATTGGTGAATACTTTTCCACTATATTAAGGTGTCACTAATAGGTACACGTGCCAATATTCTATACTACCAGTAGGGATAAGGAAGGCAGGCAACCAATTGCCTTCTATTTGCACACTTGCTTACTGAGACCTGTAGTCCTTATTTAGATGATTCTCTCATGGGCTAGGGAGGTTGGCCCAGCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622414 194 + 636262 CCCTTTCCAATTGGTGAATACTTTTCCACTATATTAAGGTGTCACTAATAGGTACACGTGCCAATATTCTATACTACCAGTAGGGATAAGGAAGGCAGGCAACCAATTGCCTTCTATTTGCACACTTGCTTACTGAGACCTGTAGTCCTTATTTAGATGATTCTCTCATGGGCTAGGGAGGTTGGCCCAGCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 511454 194 + 647215 CCCTTTCCAATTGGTGAATACTTTTCCACTATTTTAAGGTGTCCCTAACAGGTATACATGCTAATGTTCTATATTACCTGTAGGGATAAGGAAGGCAGCCAACTAATTGCCTTCTACTGGCACACTTGCTTACTGACACCTGTAGTCCTTCTTTAGACGGTTCACCCATGGGGCAGGGAGATTGGGCCATCCCT - -a -s mr.mrrefChr3 52980 9 + 181019 AACCCTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 499026 9 + 636262 AACCCTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622608 7 + 636262 AAGGC--TC -s simRat_chr6.simRat.chr6 511649 9 + 647215 AACCCTTTC - -a -s mr.mrrefChr3 52989 274 + 181019 GAACTGGTGAACACTCCTCCATTATCTTAAGACATATATTGTTTCACTTATGCTATTGCCTATTGCAAAAGTCTTTGTATGTACAGCTAGTTAAGAACTAATTGCAGGGCAATGCGGATCTATGAAACTTTCCTCCATTTCACACTCTGCCAGTGTTTTATTCTCTTATTTGCAATAACCACATCCAGTTAACAAGTCAGTCTGTGACGACCACATAAAGTTGACACATGGTCATGGAAATGAGGACAAACCCCGCAATTCTAATACACTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 499035 269 + 636262 GAACTGGTGAACACTCCTCCATTATCTTAAGACATATATTGTTTCACTTATGCTATTGCCTATTGCAA----CTTTGTATGTACAGCCAGTTAAGAACTCATTGCCAGGCAATGCGGATCTATGGAACTTTTCTCCACTTCACACACTGCCAGTATTTTA-TCTCTTATTTGCAATAACCACATCCAGTTAATGAGTCAGTCTGTGACGACCACATAAAGTTGACACATGGTCATGGAAATGAGGACAAACCCCGCAATTCTAATACACTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622615 18 + 636262 AAAT-------AACTCCTAC-------TGATA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 511669 274 + 647215 CAACTGGTGAACACTTTTCCACTATCTTAAGCCATATTTGGTTTCAGTTATACTATTGTCTATTGCAAAAGTCTTTGTATCTACAGTTAGTTAAGAACCAATTGCAGGGCAATGCTGTTCTCTGAGACTTTCCCCCATTTGACACTCTGCCAGTGAGTTATTCTCTTATTAGCAATAACCACATCCAGTTTACAAGCCAGTCTGTGATGACTGGATAAAGCTAACACATTGTCATGGAAATGAGGAGGAAGCCCGCAATTCTAATCCACTTCCA - -a -s mr.mrrefChr3 53263 311 + 181019 TCAGGGATGGTATATGACACCCTCAGCAAGTCACATAGGTTAGCTCATTGGGCATATGCAGAGAAAACAGATCTGATCAAACCCTGTCTTAGGGAGGAGGGTAAAATATTCCTGTAGTCACACCCTTTGGGGGAGTTGTTTCACTGCAATTGGAGGATTGTCTAAGTGGAGTCCTTCCTAAAACAAAACGCAGATGCAAAAATGGACATAGGGTTACAATGGCACCAAATCATTTAATGTCTAACAATTAAATATGTCAGACTCTGTACCTATGGTCACTCATAAGAAGAGAGCCAAGTGTAAATTTTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 499329 311 + 636262 TCAGGGATGGTATATGACACCCTCAGCAAATCTCATAGGTTAGCTCCTTGGGCATATGCAGGGAAAACAGATCTGATCAAACCCTGTCTTAGGGAGGAGGGTAAAATATTGTTGTAGCCACACCCTTTGTGGGAGTTGTTTCACTGCAATTGGAGGACTATCTAAGTGGAGTCCTTCCTAAAACAAAACACAGATGCAAAAATGGACATAGGGTTACAATGGCACCAAATCATTTAATGTCTAACAATTAAATATGTCAGACTCTGTACCTATGGTCACTCATAAGAAGAGAGCCAAGTGTAAATTTTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500913 114 + 636262 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAAAATGGACATAGGGTTACAATGGCACCAAATCATTTAATGTCTAACAATTAAATATGTCAGACTCTGTACCTATGGTCACTCATAAGAAGAGAGCCAAGTGTAAATTTTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 511943 305 + 647215 TCAGTGATGGTATTTGACACCCTCATCAAGTCACATAGGTTAGCTTATTGGGCAGATGCTGAGAAGGCAGATCTGATCATACCCTGTCTTAGGGAGGAGGGTAAAATATCCCTGTGGTCAGACCCTTTGGGGGAGTTGTTTCACTGCATTTGGA-TATTGTCTAAGTGGAGTCCTCCCTAAAACAGAATGCAAATGCACAAATAGACATGAGGTTACAATGACACCGAATCGTTTAATGTCTAACTGTTAAATACATGAGACCCTGTACC-----TCACTCATAAGAAGAGAGCCAAGTGTAAATTTTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 53574 390 + 181019 GGACGCATTTTTGGCCACATACCCTGTGCCCTAGCACCTTACTGTACCAAATTTGTCTTTAAAAATGTGGTTATATTATTACTGGAATATCCTAGCTACGTGCTGACTTCTATTGTGCTTTAGTAAAGCTCTGGCTGCGGACACCTATCATGCTGAGTGGTTTAGTAAAGCTTTTTGGAATAAATTTCATCATGTTTCCTGCTAAGTTCGCCCTATGTCCACATGTACTAGTACAAAAACAGACCTATGAAAAAGATCCAAAAGGATTGCAGACCATTCCAGTCAAGGAGAATCATTTTTAAAGGAGTTAAAAATATACTTTGGTATTATTAAGATGATATGAGCAATACTTACCCTAGGACCCTGTTTGTGTGATTAGAATCCCATACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 499640 378 + 636262 GGACGCATTTTTGGCCACATACCCTGTGCCCTAGCACCTTACTGTACCAAATTTGTCTTTAAAAATGTGGCTATATTATTACTGGAATATCCTAGCTACGTGCTGACTTCTATTGTGCTTTAGTAAAGCTCTGGCTGCGGACACCTATCATGCTGAGTGGTTTAGTAAAGCTTTTTGGAATAAATTTCATCATGTTACCTGCTAAGTTCGCCCTATGTCCACATGTACTAGTACAAAAACAGACGTATGAAAA------------ATTGCAGACCATTCCAGTCAAGGAGAATCATTTTTAAAGGAGTTAAAAATATACTTTGGTATTATTAAGATGATATGAGCAATACTTACCCTAGGACCCTGTTTGTGTGATTAGAATCCCATACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501027 378 + 636262 GGACGCTTTTTTGGCCACATACCCTGTGCCCTAGCACCTTACTGTACCAAATTTGTCTTTAAAAATGTGGTTATATTATTACTGGAATATCCTAGCTACGTGCTGACTTCTATTGTGCTTTAGTAAAGCTCTGGCTGCGGACACCTATCATGCTGAGTGGTTTAGTAAAGCTTTTTGGAATAAATTTCATCATGTTTCCTGCTAAGTTCGCCCTATGTCCACATGTACTAGTACAAAAACAGACCTATGAAAA------------ATTGCAGACCATTCCAGTCAAGGAGAATCATTTTTAAAGGAGTTAAAAATATACTTTGGTATTATTAAGATGATATGAGCAATACTTACCCTAGGACCCTGTTTGTGTGATTAGAATCCCATACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 512281 368 + 647215 AGATGTATTTTTGATCAGATACAATGTGCCCTAGCAC---------CCAGATGTGCCTTTAAAAATGTGGTTATATATTTACTGAACTGTTCTAGTTGGGTGCTGACATCTATCATAGTTTAGTAAAGCTCTGGCCACTGACACCTATCATGCTGAGTGGTTCAATAAAAC-TTTTGGAATAAATTTCATCATGTTTCCTGC------------ATGTCCACTTGTACTAGTCCATGAACATACCTTTGAAAAAGATCCAAAAGGGTTGCAGCCCACCCCAGCCAAGGAAAATCATTTTCAAAGGAGTCAAAAATATACTCTGGTATTATTGAGATGATATAAGAAATGCCCACCCTAGGACCCTGTTTGTGTGATCAGAATCCCATACT - -a -s mr.mrrefChr3 53964 303 + 181019 TAAAAGGTCTACCATTTGCAGATTTAAGGTAAGTGCCTAAGTTGAGACAGTatggctgttaaaaattagtctcccagctatccaattacttgatgtttgagcaaaatccttcagtgggctatgagtttgaacttgaccctttaggcccagagttcattattcaataaatgatactgggggaaccgggttatctgtccatcaagagtttaaatttgatactttttcttaaacacccgatgtgttttatactaagattaagaccatatgcaagcggactaaagatgtaaattcttgttcctcaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500018 303 + 636262 TAAAAGGTCTACCATTTGCAGATTTAAGGTAAGTGCCTAAGTTGAGACAGTatggctgttaaaaattagtctcccagctatccaattacttgatgtttgagcaaaatccttcagtgggctatgagtttgaacttgaccctttaggcccagagttcattattcaataaatgatactggaggaaccgggttatctgtccatcgagagtttaaatttgatactttttcttaaacacccgatgtgttttatactaagattaagaccatatgcaagcgcactaaagatgtaaattcttggtcctcaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501405 303 + 636262 TAAAAGGTCTACCATTTGCAGATTTAAGGTAAGTGCCTAAGTTGAGACAGTatggctgttaaaaattagtctcccagctatccaattacttgatgtttgagcaaaatcctttagtgggctatgagtttgaacttgaccctttaggcccagagttcattattcaataaatgatactgggggaaccgggttatctgtccatcaatagtttaaatttgatactttttcttaaacacccgatgtgttttatactaagattaagaccatatgcaagcggactaaagatgtaaattcttgttcctcaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 512650 299 + 647215 GAAGACATCGACCATTTGCGGAGTTAAGGAAAGTGCCTAAGTCGAGACAACATGGCTGTTGAAGTTCAGTCTcccaactattcaattacttgatgtttaaggaaaatccttcagtgggctatgagtttgaacgtgaccc-ttgggcccaaagtgcattatccaataaatgatgctggtggaact-ggttatctatccaccaacagtttaaatttgctcc--tttcttatacaccctatatgttttataccgagattaagaccatgtgcaagtggactaaagatgcgaattcttgttcctcaaa - -a -s mr.mrrefChr3 54267 7 + 181019 gagtaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500321 7 + 636262 gagtaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501708 7 + 636262 gagtaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 512951 7 + 647215 gagtaaa - -a -s mr.mrrefChr3 54274 19 + 181019 aggacagaagaattgtcta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500328 19 + 636262 aggacagaagaattgtcta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501715 19 + 636262 aggacagaagaattgtcta -s simRat_chr6.simRat.chr6 512998 19 + 647215 aggacagaagaattgccta - -a -s mr.mrrefChr3 54293 26 + 181019 tcctgaagctgtcaaaatcaatggca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500347 26 + 636262 tcctgaagccgtcaaaatcaatggca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501734 26 + 636262 tcctgaagctgtcaaaatcaatggca -s simRat_chr6.simRat.chr6 513019 26 + 647215 cactgaagatgccaaagtcaaaggca - -a -s mr.mrrefChr3 54319 76 + 181019 gttaaacccacaatccacaagaatgtgaatgtacacatttaaagacgccatgtaggttacaagaagagaagtctTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500373 76 + 636262 gttaaacccacaatccacaagaatgtgaatgtacacatttaaagacgccatgtaggttacaagaagagaagtctTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501760 76 + 636262 gttaaacccacaatccacgagaatgtgaatgtacacatttaaagacgccatgtaggttacaagaagagaagtctTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 513046 76 + 647215 gttcaacccataatccacaagaatgtgaatgtacacaatcaaagaggccatgtgtattacaagaagagaagtctTG - -a -s mr.mrrefChr3 54395 69 + 181019 AAAGCATATTGTAAGATAAGATGTGCCCAGTGCCCAATTATCTTTTGGGTTTTAATCACTGTGATGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500449 69 + 636262 AAAGCATATTGTAAGATAAGATGTGCCCAGTGCCCAATTATCTTTTGGGTTTTAATCACTGTGATGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501836 69 + 636262 AAAGCATATTGTAAGATAAGATGTGCCCAGTGCCCAATTATCTTTTGGGTTTTAATCACTGTGATGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 513127 40 + 647215 AAAGCATATTGCAAGGTA------------TGCCCAGTCATCTTTTGG-----------------GGAT - -a -s mr.mrrefChr3 54464 285 + 181019 TCGCTGTGACACTGGTCTGAATGCATCTACCTCTGAGGAAACAAATGGTTATTGTTGCATAAATAGTTAATTGACCCTACTTTTTGACCCTAGCTACCTTAGTTATCCATAGCTTTTAATAGCATGAGTCAAGAATCGGGGGTTATTTGGGATGGAAGTAGTTGGTTTCAGATCCTATGGCAAAAAAGTAAGGTGTGGGAGCCGCAATGTATGTTAGGTGCCACCCAAATCTACCGTGTGCCACATACAGCATGACAACTATTGAATAGCAACACAACTTCACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500533 283 + 636262 TCGCTGTGACACTGGTCTGAATGCATCTACCTCTGAGGAAACAAA--GTTATTGTTGCATAAATAGTTAATTGACCCTACTTTTTGACCCTAGCCACCTTAGTTATCCATAGCTTTTAATAGCATGAGTCAAGAATCGGGGGTTATTTGGGATGGAAGTAGTTGGTTTCAGATCCTATGGCAAAAAAGTAAGGTGTGGGAGCCGCAATGTATGTTAGGCGCCACCCAAATCTACCGTGTGCCACATACAGCATGACAACTATTGAATAGCAACACAACTTCACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501905 283 + 636262 TCGCTGTGACACTGGTCTGAATGCATCTACCTCTGAGGAAACAAA--GTTATTGTTGCATAAATAGTTAATTGACCCTACTTTTTGACCCTAGCTACCTTGGTTATCCATAGCTTTTAATAGCATGAGTCAAGAATCAGGGGTTATTTGGGATGGAAGTAGTTGGTTTCAGATCCTATGGCAAAAAAGTAAGGTGTGGGAGCCGCAATGTATGTTAGGTGCCACCCAAATCTACTGTGTGCCACATACAGCATGACAACTATTGAATAGCAACACAACTTCACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 513167 246 + 647215 TTGCTGTAACACCGATCTGACTGTTTCAACCTTTGTGGAAAAGAATGGTTGTCATTGCAC--ATCGTTAATTGACTCTAGTTTTTGAGCTTAGCTACCTTAGTTATTCATACCTTTCAATAGCATGAGTCAAGAACTGGGGGTTATTCAGGGTGAAAGTACTAGGTTTCTGATCCTAAGCCAA-------------------------------------TCGCCCAAGTCTGCCTTGTGTCACATGCTGCATGACAAGTATTGAATATCAACACATCTCCACCA - -a -s mr.mrrefChr3 54749 97 + 181019 AGTCCACTGTGGGTCCAACAGAGTGTAATACTCCCCACAACAGTTTTAGGGACCATCCACTTTCAAGTGCAAAATGTGGAAGGATGTCTCAATACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500816 97 + 636262 AGTCCACTGTGGGTCCAACAGAGTGTAATACTCCCCACAACAGTTTTAGGGACCATCCACTTTCAAGAGCAAAATGTGGAAGGATGTCTCAAGATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502188 97 + 636262 AGTCCACTGTGGGTCCAACAGAGTGTAATACTCCCCACAACAGTTTTAGGGACCATCCACTTTCAAGTGCAAAATGTGGAAGGATGTCTCAATACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 513414 97 + 647215 AGTCCACTGTGGGTTCACCACAGTGTAATACTCCCCGCAAGAGTTTGAGAGACCATCCACTTTCTAGTGCGAAACGTGGAAGGATGTCTCAATACTG - -a -s mr.mrrefChr3 54846 9 + 181019 TCTTACCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502285 9 + 636262 TCTTACCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 513511 9 + 647215 TCTTACCCT - -a -s mr.mrrefChr3 54855 11 + 181019 TTCTCCCATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502295 11 + 636262 TTCTCCCATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 513520 11 + 647215 TCCTCTCATGA - -a -s mr.mrrefChr3 54866 274 + 181019 CATTTTTGTCCACCTCCATGTGCTATTAACTATGTCAGCACTTATCATCAGATACATACTTCTAGTGGAGTTATACTGGATTCTAATATTTATAGGGGAGTTTAATATTGCTAATTTCTATTGGCCCTGAGTGTGATTTCTCTGGCCCCCTTGGTGCCCACTTAGTATGCTACTAAATAAAGAGGCTGAGAGACAGCTCGATGTGATTTGGACCTCAATAAGTCTTCTTTGTTTGCATAGTCGTTAATAACTCTCTCACCACATTGTTGCCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502309 274 + 636262 CATTTTTGTCCACCTCCATGTGCTATTAACTATGTCAGCACTTATCATCAGATACATACTTCTAGTGGAGTTATACTGGATTCTAATATTTATAGGGGAGTTTAATATTGCTAATTTCTATTGGCCCTGGGTGTGAGTTCTCTGACCCCCTTGGTGCCCACTTAGTATGCTACTAAATAAAGAGGCTGAGAGACAGCTCAATGTGATTTGGCCCTCAATAAGTCTTCTTTGTTTGCATAGTCGTTAATAACTCTCTCGTCACATTGTTGCCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 513531 274 + 647215 CATTTTTGTCCACCTCTATGTGCTATCAGCTATGTCAGCACTTATCATCAGATACACACTCCTGGTGGAGTTATACTGTATTCTAATCTTTATGGGGGAGTTTAATATTGCTAATTCCTATTGGACCTGAGAGTGATTTCTCTGGCTCCCTTGGTGCCCACTTAGTATGCTACTAAATACATAGGCTGAGAGACAGCTCGATGAGATTTGGACCTCAATAAGTCTTCTTTGTTTGCATAGTCTCTAATAACTCTCCCACCACGTTGTTTCCACC - -a -s mr.mrrefChr3 55140 146 + 181019 CCAGTAATCTACTGCAGCATTGGGTAAATCTCGGTCTGGAAGTGTCACAACTATTGGGATCATAGTTAGAATGACTGGATGTTAACAGCTTAACCTGACTGTGCTTTACTGAGTTTGTATTTATTTATTCAGATCAAGGGTTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502591 146 + 636262 CCAGTAATCTATTGCAGCATTGGGTAAATCTCGGTATGGAAGTGTCACAACTATTGGGATCCTAGTTAGAATGACTGGACGTTAACAGCTTCACCTGACTGTGCTTCACTGAGTTTGTATTTATTTATTCTCATCAAGGGCACCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 513805 146 + 647215 CCAGTATTCTGCTGCAGCATTGGGTAAATCTCGGTCTGGAAGTATCACAACTATTAGGATCATAGTTAGAATGACTGGATGTTGATAGCTTACCATTACTGTGCTTTATCGAAGTTTCTCCCATGGATACAGATTACCAGTTTCCA - -a -s mr.mrrefChr3 55286 130 + 181019 CTTACCCTGGCTTGAGGAGCTAATTGAATTGTATTGTGGCACTTTAGATTGCTAGAACTTCAAAGAATCTGTCAAGACCATACTTGAAAAGGGAAGAGGGTGCAGTATGCACCAATCCATAAGTCAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502748 130 + 636262 CTTGCCCTGGCTTGAGGAGCTAATTGAATTGTATTGTGGCACTTTAGATTGCTAGAACTTCAAATAATCTGTCAAGACCAAGCTGGAAAAGGGAAGAGGGTGCTGTATGCACCAATCCATAGGTCAGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 513951 130 + 647215 CTTACCCTGGCTTGAGGAGCTAATTGAATTGTATCGTAGCACCTTAGATTGCTAGATCTCCAAAGAATCTGTCAAGACCATACTTGAAAGGAGAGAAGGGTGCACTATGCACCGATTCATAAGCAAATTA - -a -s mr.mrrefChr3 55416 149 + 181019 ATGTATATCTCATATAGAATATATGACTCTGCAAATGGAAGTCAAAAAATTAGGGGCAGTCCTGCGCATCAAGGACTCCCACGAACTATGGGAACTATGAGAGATGAGAGAAACAAGCCACATTGGTGACTACCTGAGCCTTATAGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502878 149 + 636262 ATGTATTTCTCATATAGAATACATGAATTCGCGAATGGAAGTCAAAAAATTAGGGGCAGTCCTGCACATCAAGGAATCCCACGAACTATGGGAACTATGAGAGATGAGAGAAACAAGCCACATTGGTGACTACCTGAGCCTTATGGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 514103 149 + 647215 ATGTATATCTCTTGTAGAATATATGACTCTGCAAATGGAAGTCAAGAAATTAGGGGCAGTCCTGCGCATCAAGTACTCCCACAAACTATGGGAATTACAGGAGATGAGAGAAACAAGCCACATTGGTAACTACCTGAGCCTTATAGGAT - -a -s mr.mrrefChr3 55565 6 + 181019 TTGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503027 6 + 636262 TTGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 514256 6 + 647215 TTTACA - -a -s mr.mrrefChr3 55571 55 + 181019 GTTGTCACACTTGGCTAAAGTTGGGATTGAACATGTCTTAAGGATTACAGTGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503033 55 + 636262 GTTGTCACACTTGGCTAAAGTTGGGATTGAACATGTCTTTAGGATTACAGTGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 514274 55 + 647215 GTTGTCACACTTGGCTAAAGTTAGGATTGAACACGTCTTAAGGATTACAATGTCC - -a -s mr.mrrefChr3 55626 36 + 181019 CCACAAGTTGACCTACATGCATTGCATTTTGCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503123 36 + 636262 CCACAACTTGACCTACATGCAGTGCATTTTGCAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 514329 35 + 647215 CCACAAGTTGA-CTACATGCATTGCATTTTGCCAAA - -a -s mr.mrrefChr3 55662 39 + 181019 CCCAATTCTACTGAACAAGATATATACAGTGTTTTAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503161 23 + 636262 GCCAATTCTACTGAACAAGATAT---------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 514364 39 + 647215 CCCAATTCTACTAAGCAAGATATATACAGTGTTTTAACA - -a -s mr.mrrefChr3 55701 248 + 181019 CTCTTAGACCTGACACCAGTGTTCCTCCTCAGTGTCTCACACAATCTTATTTAAAAGAGCCCATGATGGTTTATGTTGGGACTTTGGATCATATAGTCTAGGTGAAGGAATTTGCCTACTTCAGCTGTATACCTATTAGTTTTTGTTTATTGTGTACTTTGGAGAATGTGGATTTCTTTGGAAAATTTTAAACTTTTGAGAATCACTATCAGTAGTAGGTACCCATGGTCCACATCAGCCCACATGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503184 248 + 636262 CTCTTAGACCTGACACCAGTGTTCCTCCTCAGTGTCTCACACAATCTTATTTAAAAAAGCCCATGATGGTTTATGTTGGGACTTTGGATCATATAGTCTAGGTGAAGGAATTTGTCTACTTCAGCTGTATACTTATTAGTTTTTGTTTATTGTGTACTTTGGAGAATGTGGATTTCTTTGGAAAATTTTAAACTTTCGTGAATCACTATCAGTAGTAGGTACCCATGGTCCACATCAGCTCACATGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 514481 234 + 647215 TTCTCGGACTTGACACCAGTGTTCCTCCTCAGTGTCTCACACAATCTTATTTAAAAGAGCCCATGATGGTATATGTTGGGACTTTGGATCATATAGTGTAAGTGAAGGAATTTGCCTACTTGAGCTGTATACCTATTAGTTTTTGTTTATTGTTATCTTTGGGGAATATTGA--------------TTTAAATTTTTGAGAATCACTATCACAAGTAGGTACCCAAGGTCCACATCAGCCCACGTGTA - -a -s mr.mrrefChr3 55949 37 + 181019 TCAAGGACTCCACCTAGTGGAGATCAGTTCCTAGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503445 37 + 636262 TCAAGGACTCCACCTAGTGGAGATCAGTTCCTAGGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 514715 37 + 647215 TCAAGGACTCCACCTAGAGAGAATTAGTTCCAAGGGT - -a -s mr.mrrefChr3 55986 21 + 181019 ACTGTGCTCACAGTGCTGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503482 21 + 636262 ACTGTGCTCCCAGTGCTGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 514756 21 + 647215 ACTGAGCTCACAGTGATGATT - -a -s mr.mrrefChr3 56007 71 + 181019 AGCAGTTGATTGAACCCATACTTCCAGTGGGAGCATATATTGTGAATAATAAACAGATAGTGACAGGGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503503 71 + 636262 AGCAGTTGATTGAACCCATACTTCCAGTGGGAGCATATAGTGTGGATAATAAATAGATAGTGACAGGGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 514791 71 + 647215 AGCAGTTGATTGAACCCATACTTCCAGTAGGAGCATATATTGTGAATAATGAACAGATAGTGACAGGGGCT - -a -s mr.mrrefChr3 56078 270 + 181019 GGGGATCTCTCATATTACCTATCTCCCTCATGCACAGACTGGAGCTTCATGAAACAATAACTTGCCAATGGGATGACTCTGGGTTATCTATGCATGCATAAATACCTATTTACTTACATATTCATTGCCATAGGTCAGTTATAACAATAAGAATGTGCATTTATTGCCATGCCAACTTCTAAACACCTGAATAAGAGGTATTTTGACAGACAAATTGGTAATTCCTCTAACAACCGAACATGAAGAATTCTTATACACTGAATACTAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503574 265 + 636262 -TGGATCTCTCATATTACCTATCTCCCTCATGCAGAGACTGGAGCTCCATGAAACAATAACTTGACAAC--GATGACTCTGGGTTATCTATGCATGCATAA--ACCTCCTCACTTACATATTCATTGCCATAGGTCAGTTATAACAATAAGAATGTGCATTTACTGCCATGCCAACTTCTAAACACCTGAATAAGAGTTATTTCGACAGACAAATTGGTAATTCCCCTAACAACCGAACATGAAGAATTTTTATGGACTGAATGCTAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 514863 270 + 647215 GGGGATCCCTCATGCTATCTACCTCCCTCATGTACAGACTGGAGCTTCATGAATCAATAACTTGCCAATGGGACCACTCTGGGTTATCAAGGCATGCATAAATACCTATTTACTTACATATTCATCACCACAGGTCAGTTATAACAATGAGAATGTGCATTTATTGCCATGCCAACTTCTAAACAACTGAATAAGATGTACTTTGGCAGACTAAATGGTAATTCATAAAATGACCAAACATGAAGTATTCTTATACACTGAATACTAATT - -a -s mr.mrrefChr3 56348 114 + 181019 TTTAACTTTTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAGAACAATAAAACAATTGTGTACACTGTAGTGAGAGGTGAATGCCATGAGTATTCAATTACATGCTAGGGTTTCATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503839 108 + 636262 ------TTGTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAAAACAATAAAACAATTGTGTACACTGTACTGAGAGGTGAATGCCATGAGTATTCAATTATGTGCTTGGGTTTCATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 515135 107 + 647215 TTTAACTTTTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAGAACGATAAAGCTATTGTGTTCACTGTAGTGAGGGATGAATGTC-------TACAATTACATCCTAGGGTTTCATTC - -a -s mr.mrrefChr3 56462 286 + 181019 ATTTAATCAACTTGCGATGAAAAGCCATCTCTTAGTTACTATTGCTTGGTCTTATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGAACTCATTGTAACGTAAAGTTCAGTCATTTTGATTTTGTATAATAATAAGTGATTTCCTGTGCTGCTTTATCACTGTAGGGCCTGCAGAGGCCCGCCCTTACCCAGCAGTCTGGCGGAAGTACTCACAGGGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAATAACAATGTAGGTGGGATATGAGTTAAATGTCATTGAACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503947 285 + 636262 ATTTAATCAACTTGCGATGAAAA-CCATCTCTTAGTTACTATAGCTTGGTCTTATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGAACTCGTTGTAACATAAAGTTCAGTCATTTTGATTTTGTATAGTAATAAGTGATTTCCTGTGCTGCTTTATCACCGTAGGGCCTTCAGGGGCCCGCCCTTACCCAGCAGTTTGGCGGAAGGACTCACAGTGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAAGAACCATGTAGGTGGGATTTGAATTAAATGTCATTGAACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 515244 283 + 647215 ATTTAGTCCA-GTGCGGTGAAAAGGCATCTCTTGGTTACTATTGCTTGGTCCCATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGACCTCATTGTAACGTAAAGGTCAGTCA--TTGATTTTGTATAATAGTAAGTGATTTCCAGTGCTGCTTTAAAACTGTAGGGCCGGCAGAGGCCCATCTTTACCCAGCAGTCTGGCAGAAGTACTCACAGGGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAATAACAATGTAGGTGCGATATGAGTTAAATGTCATTGGACT - -a -s mr.mrrefChr3 56748 219 + 181019 CACAGCACCCAAAGCCTCCCACTTGGAACCATACTTGTAATCAATTTCTAGTCCATAAGTTCAGTGAAGCAAAATATAATTGTTACAACAGAAGAGGATAAATGGAGCCACATGCATAATTCCCTTCAGAGTGTCTCATCTTCAGACAAAGTTATTGTCTTTGTGCCCCGAAGGACTTTGTATAGAGACCATGTGAGGGCGGCAGAAACTAATAGAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 504232 219 + 636262 CACAGCACCCAAAGCCTCCCACGTGGAACCATACTTACAATCAATTTCTAGTCCATAAGTTCAGTGAAGCAAAATATAATCGTTACAACAGAAGAGGATAAATGGAGCCACATGCGTAATTCCCTTCAGAGTGTCTCATCTTCAGACAAAGTTATTGTCTTTGTGCCCCGAAGGACTTTGTAGAGAGACCATGTGGGGGCTGCATAAATTACTAGAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 515528 218 + 647215 CACAGCACCCAAAGCCGCCCACTTGGAACCCTACTTGTAATCAATTTCTAGTCCATAAGTTCAGTGAAGCAAAATATAATTGTTACAACAGAAGAGGATAAATGGAGCCACATGCATAATTCCCTTCAGAGTGTCTCATCTTCAGACAAAGTTATCGTCTTTGTGCCCCGAAGGACTTTGTATAGA-ACCATGTGAGGGCGGCAGAAACTAATAGAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 56967 226 + 181019 AAGCATTATTGACCCCCTGTAGGGAGACTTATCTGCCCAACTATTTACACAAACACTAAGTTGAAACTGTCTCCTGAAGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCAAGTGATTTAATACTTGGAACCAACTCAGTAGCTTTGCAAGCAGATAAGGAACAGCGGGATCAAGAGAAGCTAGAAAATTTTAAAACAGGTGTGTTCTCAGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 504451 226 + 636262 AAGCATTATTGACCCCCTGTAGGGAGACTTATCTGCCCAACTATTTACACAAACACTAAGTTGAAACTGTCTCCTGAGGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCGAGTGATTTAATACTTGGAACCAACTCAGTAGCTTTGCAAGCAGATAAGGAGCAGCGGGATCAAGAAAAGCTGGAAAATTTTAAAACAGGTGTATTCTCAGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 515762 226 + 647215 AAGCATGATTGACCCTTTGTAGGGAGGCTTATCTGCCCAACTATTTACATGAACACTAAGTTGAAGCTGTCACCTGAAGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCAAGTGATCTAATACTTGGTACCAACTCGGTAGCTTTGCAAGCAGATAAAGAACAGCAGGATCAAGAGAAGCTAGAAAATTTTAAAATGGGTCTGTTCTCAGATG - -a -s mr.mrrefChr3 57193 571 + 181019 CAGGTACGTATTCCAGGTTGGATGCCTATTATTACCTGCTGATCAACTGTTTCCATCCTATGAGCTGACCTCGATCATGCATAGTCTAATTTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATGAAACCAATGATTGATAAGGAGATAAACTATGGTGAGTGCTTTAGTATGGGTCTGGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAAATAGTTGATGTAGGCTTACTAATAGATATGTATCGACATTGTCTAACTATTTCTTCTAGGACAGGACAGAATCCTGGTTGCAGCTGATCTTGGCACTCGAGGTGTCCATGATGTGTCTCACATTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTTGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCATGAATAGTAGGCCATCTCTGTTAGCTTTTCATACCTCTCACTGTAGACCACCATAATTGCCCTTCATGAGTGTACTGCATACTCACAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCCATCAGAATAAAATATCTTATCCATTGGAGTCCCAAATCTATGAATAAATTATCAAACACAAGTTAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 504678 565 + 636262 CAGGTACGTTTTCTAGGTTGGGTGCCTATTACTACCTGCTGACCAACTGTTTCCATCCTATGAGCTGACCT--GTTATGCATAGTCTAATCTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATGAAACTGATGATTAATCAGGAGATAAACTATGGTGAA-GCTTTAGTATGGGTCTAGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAAATAGTTGATGTAGGCTTACCAATAGATATGCATCGACAGTGTCCAACTATTTCTTCTAGGACAGGACAGAATCCTGGTTGCAGCTGATCTTGGCACTCGAGGTGTCCATGAGGTGTCTCACACTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTAGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCTTGAATAGTAGGCCATC---GTTAGCTTTTCATACCTCTCACTGTAGACCACTATAATTGCCCTTCGTGAGTGTACTGCATACTCCTAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCCATTAGAATAAAATATCTTATCCATTTGAGTCCTAAATCTATGAATAAATTATCAAACACAAGTTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 515988 571 + 647215 CAGACACGTATTCCAGGTTGCATGCGTATTATTACCTGCTGATCAACTGTTTCCGTCCTATCAGATGACCTCGATCATGCATAGTCTAATTTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATTAGACCAACCATTGCTAAGGAGATAAACTATGTTGAGTGCTATCGTATGGGTCTGGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAGATAGTTGATGTAGGCTTACTAATAGGTAAGTATCGACATTGTCTAACTACTTCTTCTAGGACAGGACAGAATGCTGGTTGTGGCTGATCTTGGGACTCGAGGTGTCCACGATGTGTCTCACATTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTTGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCATGAAAAGTAGGCCATCTCTGTTAGCTTTTCATACCTCTCGCTGTAGGCCACCATAATTGTCCCTCATGAGTGTAGTGAATGCTCACAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCTATCAGAATAAATTATCTTATCCATTGGAGTCCCAAGTCTAAGAGTAAATGATCAAACACAAGTTAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 57764 253 + 181019 CTGTATGCCATTGTCTCTTGTGCCACCTATTTGTAAGCAGAACTGGTGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATATTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCATCATTTCATGCACACTGTTAATTAGACGAAAACTCCTGCTAATTCATTCAGGCAACTGCACCAGAAAAGGAATATGGGATATACCAAGAGTGAAGGACATATCCATGGAGTCTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505243 253 + 636262 CTGTATGTGATCGTGTCTTGTGCCACCTATTTGTAAGAAGAACTGGTGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATATTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCATCATTTCATGCACCCTGTTGGTTACACGAAAACTCCTGCTAATCCATTCAGGCAACTGCACCAGAAAAAGAGTATGGGATATACCAAGAGTGAAGGACATATCCATGGAGTTTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 516563 252 + 647215 CTGTATGCCATTGTCTCTTGTGCCACCTATTTGGAAGCAGCACTGGCGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATGTTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCA-CATTTCATGCACACTGTTAATTAGACCAAAACTCCTGCTACTTCATTCAGGCAACTCCACCAGAAAAGGAATGTGCGATATACCTAGAGTGAATGACATATCCATGGAGTCTGGG - -a -s mr.mrrefChr3 58017 95 + 181019 ATAACAAGGTATGGATATGGGTACCCACAACAGAGAGAGTCAACATATGGTTTATATGGTTTAAACTGTTTGAGCTTGTTTAATTGCTTCAGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505501 42 + 636262 ATAACGAGGTAT-----------------------------------------------------CTGTTTGAGCTTGTTTAATTGCTTCAGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 516815 95 + 647215 ATAACAAGGTATGGATATGGGTACCCACAACAGAGAGAGTCAACATATGGTTTATATGGTTTAAACTGTATGAGCTTGTTTAATTGTTTGAGGTC - -a -s mr.mrrefChr3 58112 23 + 181019 AACTGTGAATTTAGCTTAAAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505545 23 + 636262 AACTGTGAATTTAGCTTAAAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 516910 23 + 647215 AACTGTGCATTTAGTTTAAAGGG - -a -s mr.mrrefChr3 58135 31 + 181019 CAGTTCTATGAACATGTAGGCGTTAACAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505568 31 + 636262 CAGTTCTATGAACATGTAGGCGTTAACAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 516934 31 + 647215 CAGTTCTCTGAACATGCAGGTGTTAATGGGA - -a -s mr.mrrefChr3 58166 81 + 181019 CTAAAACTTATTACCCCTTAGCAGGTAAGAATGCCCCTGGCAACTTCATATCTGAACAGCTATATTGACAACCTGCTCTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505600 81 + 636262 CTAAAACTTATTACCCCTTAGCAGGTAAGAATGCCCCTGGCAACTTCATATCTGAACAGCTATATTGACAACCTGCTCTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 516965 81 + 647215 CTAAAACTTATTACCCTTTAGCAGGCAAGAATACCCCTGGTGTCTTTGTATCTGAACAGCTATATTCACAACCTGCTCTGC - -a -s mr.mrrefChr3 58247 18 + 181019 AACTCATATCTCACAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505696 18 + 636262 AACTCATATCTCACAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 517046 18 + 647215 AACTCATATCTCACAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 58265 23 + 181019 ACACAATAATAAGAAGTTGGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505715 23 + 636262 ACACAATCATAAGAAGTTGGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 517064 23 + 647215 ACACAATACTAAGGATTGGGTCT - -a -s mr.mrrefChr3 58288 232 + 181019 CAGAGCATCCCAGAAGAGCTAGTTTCAATGGTTGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGAGGAGTGAGATGGAGAGAAAGATGGAAAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCACCAATTTTTTCAGGGAGGCAGGTGTGGTACCTCCAACTATATTATTGGCTTTTAGCTACAAAACTGCTTACTCTAGATGCTAGTAGAAATGTTTTCAATTAGTTCCCATTACTTTGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505739 226 + 636262 CAGAGCATCCCAGAAGAGCTAGTTTCAATGGTTGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGCGGACTGAGATGGAGAGAAAGATAGAGAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCACCAGTTTTTTCAAGGAGGCAGGTGTGGTACCTCCAACTATATTATTGGCTTTTAGCTACAAAGCTGCTTACTCTAAATGC------AAATGTCTTCAATTAGGTCCCATTACTTTGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 517087 232 + 647215 CAGAGCATCCCGGAAGAGCTAGTTTCAATGGTCGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGAGGAGTGAGATGGAGAGAAAGATGGAAAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCATCAATTTTTTCAGGGAGGCAGGTGTGGTACCTTCAACTACACTATTGGCTTTTAGCTACAAAACTGCTCACTCAAGATGCTAGTAGGAATGTTTTCAATTATTTTCAATTACTTTGGCT - -a -s mr.mrrefChr3 58520 262 + 181019 AGTATACAAGCAACTGTTCCCATCGTTTATTCAAAATTTTAAGGCTCTCAGGATGCATTGATGGTGCCAAAAGATGGGCCTCTGTTCTTGATAATGAGATATCTTACTCTGGGAAATCTAGATGTAAACCAACATTTCGGGGTTTTGTGGACTCACCAAGACTTGATTAATCCGAAAGGCAGGCCTATTCACATGATGCTGAGATATCTTATTCTGGGAGATGTAGATGTAAAAGCTCTACACAATGAAGGACCTTAGTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505965 260 + 636262 AGTGTACAAGCAGCTGTTTCCATAGTTTATTCAAAATTTTAGGGCTCTCAGGATGAACTGATGGCACCAAAAGGTGGGCCT--GTTGTTGATACTGAGATATCTTACTCTGGGAGATCTAGATGTAAACCAACATTTCGGGGCTTTGTGGACTCACCAATACTTGATGAATCCGAAAGGCAGGCCTATTCACTTGATGCTGAGATTTCTTATTCTGGGAGATGTAGATGTAAAAGCTCTACACAACGAAGGACTTTAGCGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 517321 262 + 647215 AATATACAAGCAACTGTTCCCATCGTTTATTCACAATTTCAAGACTCTCAGGATGCCTTGATGGTGCCAAAAGATGGGCCCCTATTCCTGATAATGAAATATCTTACTCTGGGAAATCTTGATGTAAACCGACATTTTGGGGTTTTCTGGACTCACCAAGACTTGATTAAGCCAAAAGGCAGGCTTATTGACATGATACTGAAATATCTTACTCTGGGAGATGTCAATGTAAAAGCTCTAAACAATGAAAGACCTTAGTGGC - -a -s mr.mrrefChr3 58782 53 + 181019 GGGTGAAAAATAATTGTAAACATATAATGTATAAGCCTTGGGAAGGTATAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506279 53 + 636262 GGGTGAAAAATAATTGGGAACATATAATGGATAGGCCTTGGGAAGGTATAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 517583 53 + 647215 GGTTCAAAAATAATCATAAATATATGATGTATAAGCCTTGGGAAGGTATAATG - -a -s mr.mrrefChr3 58835 31 + 181019 GCATAATCCTACATACTAAGGCTATATAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506334 31 + 636262 GAATAATCCTACATACTAAGGCTATATAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 517636 31 + 647215 GCATAGTCCTACATGCTGAGGTTATATAACA - -a -s mr.mrrefChr3 58866 160 + 181019 TAATGCCACTTGGCTTTTGATAAAGGTAGAGACAAGCGGTAACCCATTATACATAATGGGTATTTGGAAATCTGGGACCCAATGTAAAATATAATGTATGATCCTACATACTGAGACCACATTAATAATTGGTCAACTAGTCTTCCATTAGGGCAGAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506365 160 + 636262 TAATGCCACTTGGCTTTTGATAAAGGTAGAGATAAGCGGTAACCCATAATACATAATGGGTATTTGGGAATCCAGGACCCAATGTAAAATACAATGTATAATCTTACATACTGAGACCACATTAATAACTGGTCAACTAGTCTTCCATTAGGGCAGAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 517681 160 + 647215 TAATTCCACTGGGCTATGAATAAAGGTAGAGACAAGCAGTAATCCATTATACAAAATGGGTACTTGGAAATCTGGGACCCTATGCAAAATATAATGTATGAGCCTACATACTGAGAACACATTAAAAATTGGTCTACTAGTCTTCCTCTAGGGCAGAGGC - -a -s mr.mrrefChr3 59026 207 + 181019 CACATTTTAACTACTTGTACAGGGTCATGAAATGGGTACCTTGAAGACTTTGCTTGGAAGACCAATAATTTTTTGATTGTGCAGGTGCTTATCTTTTCCAGGGCACTGCTGATGATAAAGATTCTTCTAGTGTAATGTTAGAATAATTCACCTATTAGTAGCTCAGTAAAAAATGGTTTTGGTACTCTAGTAAGCCTGGAGACATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506525 205 + 636262 CGCAGTTTAACTACTTGTACAGGGTCATGAAATGGGTACCTTGAAGACTTTGCTTGGAAGACCAATAATTTTTTGATTGTGCAGGTGCTTATCTTTCCCAGGTCACTGCTGATGATAAAGATTCTTCT-GTGTAATATTAGAATCATTCACCTATTAGTAGCTTAGTAAAAAATG-TTTTGGTACTCCAGTAAGTCTGGAGACATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 517849 192 + 647215 CACATTTTAACTACTTGT---------------GGGTACCTTGACAACTGCGCATGGAAGACCAATATTTTTTTCATTGCACAGGTGCTTATCTTTTCCAGGGCACTGCTGATGATAAAGATTCTGCTAGTGTAATGTTAGAATAACATGCCTATTAGTAGCTCAGAAAAAAATGGTTTTGGTTCTCTTGTGAGCCTGGATATATGT - -a -s mr.mrrefChr3 59233 51 + 181019 CTGGATGTATGCTTACTCACTTACCCACAACATACTTCACTCAAGAGTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506738 51 + 636262 CTGGATGTATGCTTACTCACTTACCCACAACATACTTCCCTCAAGAGTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 518041 51 + 647215 CTGGATGTATGCTTGCTCACCTACCCACAAGATACTTCACTCAAGTGTTAA - -a -s mr.mrrefChr3 59284 37 + 181019 TTCAGCATTGAAAACGAACCAGAGATCTCTTGTTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506796 37 + 636262 TTCAGCATTGAAAAGGAACCAGAGATCTCTTGTTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 518092 37 + 647215 TTCAGCATTGAAAACGAACCAGGGCTTTCTTGTTGGC - -a -s mr.mrrefChr3 59321 50 + 181019 TCAAACAGAAAAGAATATTCTGAAGCAGCTAAAATGCTAACATATTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506833 50 + 636262 TCAAACTGAAAAGAATATTCTGAAGCAGCTAAAATGCTAACATATTCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 518130 50 + 647215 TTAACCAGAAAAGAATATTCTGAAGCAGCTAAAATGCTAACATATTCAGG - -a -s mr.mrrefChr3 59371 98 + 181019 CAGAAAAAACAAAGATCCATCAGTGGCTAGTACCCCATAAGGAATTTGTGTTTCCCCCAGTTGGTAATAATCCTATTGTGCAGAATTAAGGATAAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506883 98 + 636262 CAGAAAAAACAAAGATGCAGCATCAGCAAGTACCCCATGAGGGATTTATGTTTCCCCTGGTTGGTAATAATCCTATTGTGCAGAATTGAGGATAAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 518187 98 + 647215 CCGAAAAAACAAAGATCCATGAGTGGCTAGTAACCCACAAGGAATTTGTGTTTCCCCCAGTTGGTAATCATCCTATTGTGCAGAATTAAGGATAACAT - -a -s mr.mrrefChr3 59469 123 + 181019 TTTTTGGCTTGGCTGATCAATTGAAAATGACTTGCCATGTCAGTATGGAATTGCATTATTCCTAATGTAAAGAAGGCTGGTATATCCAGACTTTCTTTGGTTCAATTTCACCAAGGAGAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506982 123 + 636262 TTTTTGGCTTGGCTCAGTAACTGAGAAAGGCTTGCCATGTCAATATGAAATTGCATTATTCCTAATGTAAAGAAGGCCGGTATATCCAGACTTCCTCTGGTTCAATTTCACCAAGGAGAGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 518285 123 + 647215 TTTCTGGCTTGGCTGATCAATTGAAAATGACTTGCTATGTCAGTATGGAATTGCATTATTCCTAATGTATAGTAGGCTGCTATATCCAGACTTTCTTTGGCTTAATTCTACCAAGGAAAGAGG - -a -s mr.mrrefChr3 59592 103 + 181019 TAATAGCAAAATTAGGGAGTCCTCTCTCTTAGTTGTATAAGTACCACCAAATTGAATGAGGGTCAATCTATCTCCCAGTTACATTCACATGAAGCTATCAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507105 103 + 636262 TATTAGCAAAATTAGGGAGTCCTCTCTCATAGTTGTATAAATACCACCAAATTGAATGAGGGTCAATCTATCTCCCAGTTACATTCACGTGAAGCTATCAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 518409 103 + 647215 TAATCTCAAAATTAGGTAGTTCTCCCTCTTAATTGTATAAGTACCACTAAATTAAATGAGGGCCTATCTCTCTCCCAGTTGCATTCACATGAAGCTATAAAAT - -a -s mr.mrrefChr3 59695 180 + 181019 ATCCTCTCATCAAACGTAATGAAAGTTCACAGAACGTCACATGTCTTGCAATACTTTAAGAAGTTGGTTTCTGTGAAGAGTCTGACTCCCAAAAATGTTATGTTTCAAGGAAGTCTCCTTTGACCTATGGACACTATAACACTGCTTGTCCCAAATTTCCATGCCATTAGATTCCTTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507208 180 + 636262 ATCCTCTCATCAAACGTAATGAAAGTTCACAGAACGTCACATGTCTTCCAGTACGTTAAGAAGTTGGTTTCTGTGAAGAGTCTGACTCCCAAAAATGTTATGTTGCAAGGAAGTTTCCTTTGGCCTATGGACTCTATAACACTGCTTGTCCCAAATTTCCATGCCATTAGAGTCCTTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 518513 177 + 647215 ATCCTCTTGTCTAATTTCATGAGAGTTCACAGAAAGTCACATGTCTTGCAATACTTTAAGAAGTCGGATTTTGTGAACAGGCTGATTTCCTAAAATGTTATGCTTCAAGCAGGACTCCTTTGACCTATGGGCACTATAACACT---TTTCTCAAATTTTCACGCCATTAGGTTCCTTTGC - -a -s mr.mrrefChr3 59875 28 + 181019 AAGGAGACAAGTGACACATTGGAACTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507389 26 + 636262 AAGGAAACAAGTGACACATTGGAGCT-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 518690 28 + 647215 AAGGAGACAGGCGACACATTGGAAATTT - -a -s mr.mrrefChr3 59903 100 + 181019 TTTGAATCAGCCATGTCTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAGCCTCTGCATCTATCATCCAAGGCTGCTTTTTATTGAAAGTTGCCCGCTGGATTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507415 93 + 636262 -------CAGCCATATTTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAGCCTCTGCGTCTATTATCCAAGGCTGCTTTTTATTGAAAGTTGCCCGTGGGATTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 518750 97 + 647215 TTTGAATCACCCAAGTCTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAACCTCTGCATCTATCATCCAAGGCTGCTCTTTATTGAAAGTTGCCCGCTGGAC--- - -a -s mr.mrrefChr3 60003 641 + 181019 CACCTTAATGTACTTGTTATCTTGGGAAGGCTGTCAACTAGATTTACAGCGGCACACCAGCAGCATTAGATACATAGGTCAGCATACAGCATGATGCTGTTTAAGAAATGTTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACTCTGGGTCCTAACTTATGTAAGGGTAGAGTGTCTAAGGGGCCAAAAAAGTAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACGTAATTTACAGAAGTCTAGCACGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCACACTTTGAAATCTAAAGTGAATAGGGTGACTAGGACAATGGACACAGGCATATAATAGTGCCAAAGAAATACCACCCCATAACAGATCAGTCTATCTTGTCCTTCATACAAGTAAACTCTAATACATTCCAAGTGGGACCATTATGACCCTATTACCTGTACCCTTCTCTTGCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTTAAGGGGAAGACTTGTGGTACAAAAGTTGAGTCAGAATCTCCTGAAATGGGCAGGAGCTGAGCCCAATGTGATCTTGACACCCTGGAGCCATAGCAACAAATAATTCATAGGAGGCTGTCAGACAGGGCATATGTCACAGAGAGGCAGAATCTTGCTACTTATGACAATTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507509 641 + 636262 CACCTTAATGTACTTGTGATCTTTGGGAGGTTGTCAACTAGATTTATAGCAGCACATCAGCGGCATTTTATACATGCATCACCATACAGCATGATGCTGTTTAAGAAATGCTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACTCTGGGTCCTAACTTATGTAAGGGCAGAGTGTCTAAGGGTCCAAAAAAGAAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACGTAATTTACAGAAGTCTAGCACGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCACACTTCGAAATCTAAAGTGAATAGGGTGACTAAGACAATGGACACAGGCATATATTAGTGCCAGAGAAATACCACCCCATAACAGATCAGTTTACCTTGTCCTTCATACAAGTAAACTCTAATACATTCCAAGTGGGACCATTATGGCCCTATTACCTGTACCCTTCTCTTGCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTCACGGGGAAGACTTGTGGTACAAAAGTTGAGCCAGAATCTCCTGAAATGGTCAGGAGCTGAGCCCAATGTGGTCTTGACACCCTGGAGCCATAGCAACAAATAATTCATAGGAAGCTGTCAGACAGGGCATGTGTCACAGAGAGGCAGAATCTTGCTACTTATGACAGTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 518847 631 + 647215 CACCTTAATGTGCTGGTTATCTTGAGAAGGCTGACAACTAAAAGTACAGCGGCACACCAGCAGCATTAGATACATAGGTCAGTGTACAGCATGATGTTGTTGAAGAAATGTTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACGCAGGGTCCTAACTTATTTAAGGATAGAATGTCTATGAGGCCTAAAGAGTAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACATAGTTTACAGAAGTCTAGCATGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCATACTTTGGAATCTAAAGTGAATAGGGTGAATAGGACTGTGGACCCGGGCAAATAATAATGCCAAAGGAATACCACCACATAACAGATCAGTCTATTTTGTCCTTCATACACATAAACTCTAATACTTTCCAAGTGGGACCATTATGACCATATTACCTGTACCCTTCTGTTCCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTTAAGAAAAGGACATGCAGTACAAAAGTTAAGTCAGAATCTCCTGAAATGGGCATGAGGTGAGCCAAAGGTGATCTTGACACCCTGG--------CAACAAATAATTCATAGGAGGTTGTCTGGCAGAGCATATGTCACAGAGA--GAAAATCTTGCTTATTTTGACAATTCC - -a -s mr.mrrefChr3 60644 155 + 181019 GTAGACCTAACAGAAAAATCAACTTCTGAGTTACTCATGATTGTCTGGGCTATTCAGGGGGCTATAGTATGAACACATTTAAAGATTTCAAAGAAGCTCTAAGATCTCCTCATTTTTAGATCAGCCTTCTTCAAAGTTCAGATTGAGTCAGTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508152 151 + 636262 GTAGACCAAACAGAAAAATCAACTTCTGAGTTACTCATGATTGTCTGGGCTATTCAGGGGGCTATAGTATGAACACATTTAAAGATTTCAAAGAAGCACTAAGATCT----ATTTTTAGATCAGCCTTCTTCAAGGTTCAGACTGAGTCAGTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 519478 155 + 647215 GCAGACCTAACAAAAAAATCAACTTCTGATTTACTCATGACTGTTTGGGCTATTCAGCGGGCTATAACAAAAAGACATTTAAAGATTTCAAAAAAGCTCTAAGATCTCCTCATTCTTAGAGCAGCCTTCTTCCAAGTTCAGATTAAGTTAGTAAA - -a -s mr.mrrefChr3 60799 83 + 181019 GATGGAACAGTTTCCTGCCCCAAAAGTTCAACCACTTGGCCGGCATTACCACAACCAATCAGCACTACTAATAGAACTGTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508305 83 + 636262 GATGGAACAGTTTCCTGCCCGAAAAGTTCAACCACTTGGCCGGCATTACCACAACCAACCAGCACTACTAATAGAACTGTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 519633 83 + 647215 GATGGAATAGTGTCCTGCCACAAAAGGACAACGGCTTGGCCAGCATTACCACAACCAATCAATCCTACCAATAGACCTGCTAG - -a -s mr.mrrefChr3 60882 5 + 181019 TGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508388 5 + 636262 TGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 519721 5 + 647215 GATGA - -a -s mr.mrrefChr3 60887 135 + 181019 GTCCAAAGGTCTGCTTCTTCCAATAAAATAATGATACTATGTGGTGCCATTCAGAAGATTCACACCCCTCAACACTTTGTTACACTATCCCGTGTCACATTGGATATACTTGGAGCCATAGGTACTCCCAGTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508425 135 + 636262 GTCCAAAGGTCTGCTTCTTCCAATAAAATAATGATACTATGTGGTGCCATTCCGAAGATTCACACCCCTCAACGCTTTGTTGCACTACCCCGTGTCACATGGGATATATTTCGAGCCATAGGTACTCCCATTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 519726 134 + 647215 GTCCAAAGGTCTGCTTCTTCCAATAAAATAATGATACCATGTGGTGCCATTAAGAAGATTCACGCCC-TCAAAACTTTGTTATACCATCCATTATCACATTGGATACACTTGGAGCCATAGGTACTCCCAGTTGA - -a -s mr.mrrefChr3 61022 161 + 181019 ATCCATTGTTTCACAGGGCAGTATAAAGGGGAAGCAATTGATTGAGACTGTGGAACACAGTGTCTTAGTACGAAATAAAAGATTGACACTTTCAGGAACTCTAATTACAATGCATTTATATGGGACCCTTTAGAATGTAGCTTTGAGTAACCTAGGACAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508568 161 + 636262 ATCCATTGTTTCACAGGGCAGCATAAAGGGGAAGCAATTGATTTAGACTGTGGAACACAGTGTCTTAGTACGAAATAAAAGATTGACACTCTCTGGAACTCTAATTACAATGCATTTATACGGGACCCTTTAGAATATAGCTTTGTGTAACCTAGGACAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 519860 160 + 647215 ATCCATTGTTTCATAGGGCAGTGTAAAGGGGAGGCATAAGATTGAGAGTGTGGAACCTAGTGTCTTAATATGAAAGAAAAGATTGA-ACTTCCAGGAACTCGAATTATAATGCAGTTATATGTGACCCTTTAGAATGTAGCTTTGAGTAACCTGGGACAGG - -a -s mr.mrrefChr3 61183 97 + 181019 TCTGCAAGTTACTGGGATTGCTTTACTGTCCCTCAAGGTTCCTAATCTTGACTTTACAATTAACAAGTGTGGTCCTTGGAAAATGCGTTTCCTTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508729 97 + 636262 TCTGCAAGGTACTGGGGTTGCTTTACTGTTGCTCAAGGTTCCTAATCTTTACTCTACAATTAACAAGTGTGGTCCTTGGAAAATGTGTTTCCTTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 520021 96 + 647215 TCTGCAAGTTACTGGCATTGCTTTACTGTCCCTCAAGATTCCTAATCTTGACTTTACAATTAACAAGCGTGGTCCT-GGAAAATGCGTTTCCTTTGC - -a -s mr.mrrefChr3 61280 130 + 181019 GTTTTTACTACAGGAAAACTTTAGCAATGTTCCTGGTACTCAGGACAGGTTATATCACAACAGGGTTACTGTTCTAGTTAGAGTATTCTGACACTGTTGATACCCTGGCCATCAATTGTGCTCAATCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508826 130 + 636262 GTTTTTACTACAGGAAAACTCTAGCAATGTTCCTGGTACTCAGGACAGGTTATATCACAACAGGGTTACTGTTCTAGTTAGAGTATTCTGACACTGTTGATACCATGGCCATCAATTGTGCTCAATCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 520120 130 + 647215 GTTTTTACTACAGGGAAACTTTAGCAATGCTCCTTGTACTCAGGACAGGTTGCATCACAACAGGGATCCTGTTCTAGTTAGAGTATTCTGATACTGTTGATACCCTGGCCATTAACTGTGCTCAATCTAT - -a -s mr.mrrefChr3 61410 31 + 181019 CCAGCCATCATCCCTCGGAGGATACCTAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508956 31 + 636262 CCAGCCATCATCCCTCAGAGGATACCTAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 520251 31 + 647215 CCATCCATCATCACTTGGAGGATACCTAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 61441 45 + 181019 CAGGCCTATTAGGACTACAGATTGTGATCCAATCTTACACACTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508987 45 + 636262 CAGGCCTATTAGGACTACAGATTGTGTTCCAATCTTACAAACTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 520287 45 + 647215 CAGGCCTATTAGGACTACAGGTTGTGATCCAATCTTAAACACTCC - -a -s mr.mrrefChr3 61486 165 + 181019 ATTTAGCTTTCATACTGACCTGCTATCCATACATAGGCCTAAGGCATCAGGTAAGTCCAGCAACCCCCATTACTGCCAGGGTGGATGGTTCAATAACATATAGAACAGGACAGCTTATAGTAATGGGGATGCTAAAAAAAATCTAAGGACAGTCCTGAGCCAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509035 162 + 636262 ATTTAGCTTTCATACAGACCTTCTATCCATACATAGGCCTAAGGTATCAGGTAAGTCCAGC---CCCCATTACTGCCAGGGTAGATGGTTCAATAGCATATGGAACAGGACAGCTTATAGTAATGGGGATGCTAAAAAAAATCTAAGGACAGTCCTGAGCCAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 520332 163 + 647215 AATTAGCTTTCATACTGATCTGCTATCAATACATAGGCCTAAGGCATCAGGTAACTCCAGCAACCACCATTGCTGCCAGGGTGGATGGTTCAATGACATGTAGGACAGGACAACTTATAGTAATGGGGATACTAAAAAAAACCTAAGGCCAGTCCTGAGCCTG-- - -a -s mr.mrrefChr3 61651 299 + 181019 CATTTTAATTCATTTCAGGGCGTCAAGTTACAGGAGGCACAGTAATCTCTGGTGCCAGAGAAGTAATCTGCCACCTAAGTAGACTTGAGGTAGACTTCAAGGACATGTGTTACCAGACTGTATACGATTAGCCACTATCCACGACCAATACTTTCTAGCAGTACCAGAAAGAGGGATTTTAAAGGATTGAGGAATACAGATAGCACATTAATTCCTCAATCTATTATGGGAAATAAAACCCAGTTGATGATAGAGAGTTGTAGGGCTCACCTCAGGGTGATTCAGGTATATAAGCAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509206 299 + 636262 CATTTTAATTCATTTCAGGGCGTCAAGTTATAGGAGGCACAGTAATCTCTGGACTCAGAGAAGTAATCTGCCACCCAAGTAGACTTGAGGTAGACTTCAAGGACATGTGGTACCAGACTGTATAAGGTTAGCCACTATCCCCGACCAATACTTTCTAGCATTACCAGAAAGAGGGATTTTAAAGGATTGAGGGGTACAGATAGCACATTAATTCCTCAATCTATTATGGGAAATAAAACCCAGTTGATGATGGAGAGTTGTAGGGCTCACCTCAGGGTGATTCAGGGATATAAGCAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 520495 289 + 647215 ---------TCATTTCAGGGAGTGAAGGTACAGGAGGCACTGTAATCTCTGGTGCCTGAGAAATAATCTGACACCTAGGGAGACTTGAGGTAGACTTCAAGGACATGTGTTAAAAGACTGTACACGATTAGCCACTATCCATGACCAATACTTTATAGGAGTACAAGAAAGATCGATTTAAAAGGATTGAGGAATACGGATAGCACATTAATTCCTCAAGCTATTATGGGAA-TAAAACCCAGTTGATGACAGAGAGTTGTAGGCATGACCTGAGGGTGATTCAGGTATACAAGCAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 61950 22 + 181019 TACATAAACATATAACTTCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509505 22 + 636262 CACCTAAACATATAACTTCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 520806 22 + 647215 TCCATAAACATATAACTTCTTG - -a -s mr.mrrefChr3 61972 84 + 181019 GTCTTATGCAATAGCTGAAAAATAAAAAATTACTGGTGACAACCAGTTATGAGATGCTTCTTAGCTCTGGGCATTATGGTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509532 80 + 636262 GTCTTATGCAATAGCTGAAAAATAAAAAATTACTGGCAACTACCACTTATGAGATG----TTAGCTCCGGGCATTATGGTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 520828 84 + 647215 GTCTTATGCAATAGGTGAGACATAAGAAATTACTGGTGACAACCAGTTTTGAGATGCTTCTTAGCTCTGGGCATTATGGTGTAC - -a -s mr.mrrefChr3 62056 54 + 181019 CCAGTTTGTGAAGAAGGATGTAACAGCTTCATATTTGTCCAATTCTTACCAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509622 43 + 636262 CCAGTTTGTGAAAAAGGATGAGAC-----------TGTCCAATTCATACCAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 520912 54 + 647215 CCAATTTGAAAAGAAGGATATAACAGCTTCATATTTGTCCAATTCTTACTGGAC - -a -s mr.mrrefChr3 62110 276 + 181019 AAGTAGAGAGTGACATACTTGGCAATTCCGGATCTACCTAGCCGGCTGGACACACCTTGAAAGACAAATACCTAGCTCAGTGATTGAATATGATTGATAATTGTTCTACCTCAATGCTGAATGTACTGGTCTCTGTGTTAATGTGACTAGACATACAGATACATGGATGAACACAGAAAAATAAATTTGGTCATCCAAAGATGTATGGCTTTTAGAAAAAAACTAGTGGAAAGAAATCCAGATAAGGTTCCTGGGTCCACACCTTCCATGTTTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509666 276 + 636262 AAGTAGAGAGAGTAATACTTGGCTATTTCGGATCTACCTAGCCGGGTTGACACGCCTCGAAAGACAAATACCTAGATCAGTGATTGAATATGATTGGAAATTGTTCTACTTCAATGCTGAATGTACTGGTCCCTGTGTTAATGTGACTAGACATACAGAGTCATGGATGAAAACAGAAAAGTAAATTTGGTCATGCAAAGATGTATGGCTTTTAGAAGAAAACTAGTGGTAAGAAATCCAGATAAGGTTTCTGGTTCCACACCTTCCATGTTTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 520966 272 + 647215 AACTAGAGAATGACATACTTGGCAATCCCTGACCTACCTAGCCAGCTGGACACACTTTGAAAGACCAATACTTAGCTCAGTGATTGAATATGATTGATAATCGTACTACCTAAAGCCTGGATGTACTGGTCTGTGTACTAATGTGACTAGACATACAGATACATGGCTGAACACAGAAAAATAAATTTGGTCATCCAAATGTGTATGGCTTTTAGAAAAAGACTAGCGGAA----GTCCAGATAAGGTTCCTGGGTCCACACCTTCCATGCTTGCA - -a -s mr.mrrefChr3 62386 7 + 181019 TGAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509942 7 + 636262 TGAGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 370153 7 - 647215 TGAATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 521238 7 + 647215 TGAGTTA - -a -s mr.mrrefChr3 62393 3 + 181019 TAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509949 3 + 636262 TAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 521245 3 + 647215 TAC - -a -s mr.mrrefChr3 62396 13 + 181019 AAGACATTTCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509952 13 + 636262 AAGACATTTCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 370160 13 - 647215 AAAAGTTCACTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 521248 13 + 647215 AAGACATTTCTAC - -a -s mr.mrrefChr3 62409 2 + 181019 TT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509965 2 + 636262 TT -s simRat_chr6.simRat.chr6 521261 2 + 647215 GT - -a -s mr.mrrefChr3 62411 7 + 181019 TTAATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509967 7 + 636262 TTAATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 370173 7 - 647215 TCATCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 521263 7 + 647215 TTAATAG - -a -s mr.mrrefChr3 62418 4 + 181019 GCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509974 4 + 636262 GCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 521270 4 + 647215 GCTA - -a -s mr.mrrefChr3 62422 146 + 181019 GTTGGGGATTAATGGCCTGCCAAATTGGTTTTATAGCATGTGTTACAGCATGGCTGTAGGAGTCCTAGTGTGCAGTGGATCTCTGTTTCTAAACTTGATGATATAATTATCATCCTTGTTTCATATATCTGGAACATGCCTGAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509978 143 + 636262 GTTGGTGATTAGTGGCCTGCCATATTGGTTTTATAGCATGTATTACAGCATGGCTGTAGGAGTCCTAGTGCGCAGTGGATCTCTGTTTCTAAACTTGATGATATAAGTATCATCCCTGTTTCAT---CCTGGAACATGCCTGAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 370180 146 - 647215 GTTGGGAATATAAAGCCTACTGAGTAAGCCTTGCTACATGTGTTACAGTGTGGTTGTAAGAGTCTTGGTGTGCAATTTGCTCCTCCTTCTACATTTGATGCTGGAATTATCCTTCTTGCTCCATGTATGAATGATAGGGCTGACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 521274 146 + 647215 GTTGGGGATTAATGGCCTGCCAAATTGGTTTTATAGCATGTCTCGCAGCATGGCTGCAGGACTCCTAGTGTCCGGTGGATCTCTGTTTCTAAACTTGATGATATAAATATCATCCTTGTTTCATAATTCTGGAACATGCCTCAGCT - -a -s mr.mrrefChr3 62568 31 + 181019 GGGTGGCGCATATATCATTCTTTTTTTGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510121 31 + 636262 GGGTGGCGCATATACCATTCTTTTTTTGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 370326 31 - 647215 TGGTGGTACGGTTATTCTCCATGCTCTGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 521421 31 + 647215 GGGTGGCGCATGTATCATTCTTTTTTTGGAT - -a -s mr.mrrefChr3 62599 2 + 181019 AC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510152 2 + 636262 AC -s simRat_chr6.simRat.chr6 521452 2 + 647215 AC - -a -s mr.mrrefChr3 62601 37 + 181019 ACATATACAAGTCTGAGGTCAATGCATCATAAGAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510154 35 + 636262 ACATATACAAGTTTGAGATCA--GCATCATAAGAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 370357 37 - 647215 AGATATACTTGGCTAGGGTAAATGCATCAGAACAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 521454 35 + 647215 ACATATACAAATCTGAGGTCA--GCATCATAAGAAAC - -a -s mr.mrrefChr3 62638 14 + 181019 ACTTTATGTCACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510189 14 + 636262 ACTTTATGTCACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 521489 14 + 647215 ACTTTATGTCACAA - -a -s mr.mrrefChr3 62652 247 + 181019 GAGGTGATTCTTAATTGCAGTATTCGGGCAAAAAGGGTTTATGTGTAAGACTGTTTCTGCAAGATATAATTGTTCGCTTGCCAGAAAATGTCATGGATTGTTTGGCATAACCTCACAAAATCAGCCATCATTTCCTTAGAAGTGGGTTTGATAATTCATATGTAGACATACAGGAAGTGCTTACATTCACTCTTGTCTAGTCTTCAGTCTCTTGTCATCTTCCTGCAATCCCTTATCCGCCTGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510203 232 + 636262 GAAGTGATTTTTGATTGCAGTATTCGGGCAACAAGGGTTCATGTGTAAGACTGTTTCTGCAAGACATAATTGTTCGCATGCCAGAAAATGTCATGGATTGTTTGGCATAACCTCACAAAAGCAGCCATCATTTCCTTAGAAGTGGGTTTGATAATTCATATGTAGACATAA---------------TCACTCTCGTCTAGTCTTCAATCTCTTGTCATCTACCTGCAATCCCTTATCCGTATGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 521541 246 + 647215 GGGGTGATTCTCAATTGCAGCATTCGGGCAAAAAGGGTTTATGTGTAAGGCTGTTTCTGCAAGATCTAATTGTTTGCTTGCCAGAAAAAGTCATGGATTGTTTGGCATAGCTTCACCAAATGGGCCATC-TTTCCTTAGAAGTGTTTTTGATAATTCGTATGTAGACATACAGGAAGTGCTTACATTCACTCTTGTCTAGTTTCCAGTCTCTTGTGATCTTCCTGCAATCCCTTATCCTCCCGCGCA - -a -s mr.mrrefChr3 62899 35 + 181019 CACTTAACTTAAGTCCCTGTGTGACGCTAAGGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510435 35 + 636262 CGCTTAACTTAAGTCCTTGTGTGATGCTAAGGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 521792 35 + 647215 CACTTAACTTAAGTCCCTGTTTGACATTAAGGACA - -a -s mr.mrrefChr3 62934 171 + 181019 TTTTGTTATCAACACAGTAGATAGATAGATAAATCAATTTAATATGTAGCTTCTCAGTCTATACAGTTGATGGTCCTGCAAGGGGCATGCCTCACTTAGCTGGAGGTACTCTGATACACACTTGAAGACCTAAAGTCAAGCATAGAGAGTGAATATCTAGCTGATCCCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510470 167 + 636262 TTTTGCTATCAGCACAGT----AGATAGATAAATCAATTTAGTATGTAGCTTTACAGTCTATACAGTTGATGGTCCTGCAAGGGGCATGCCTCACTTAGCTGGAGGTACTCTGATACACACTTGAAGACCTAAAGTCAAGCATAGAGAGTGAATATCTAGCTGATCCCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 521838 171 + 647215 TATTGTTATCAACACAGTAGATAGATAGATAAATCACTTTAATATGTAGCTCCTCAGTCTATACGGTTGATGGTACTGCAAAGAGCATGTCTTACTAAGCTGGAGGTACTCTGACATGCACTTGAAGACATAAAGTCAAACATAGAGAGTTAAGGTCTGGCTGAACTCAAT - -a -s mr.mrrefChr3 63105 46 + 181019 AGCTTATCTACCAACACAGTGCAGTATAATACTTGGGTTTCCAGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510637 46 + 636262 AGCTTATCTACCAACACAGTGCAGTATAATACTTGGGTTTCCAGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 522020 46 + 647215 AGCTTATCTGTCAACACAGTGCTACATAATACTTGGACTTCCAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 63151 20 + 181019 CAAAAGATGCAACTTGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510683 20 + 636262 CAAAAGATGCAACTTGCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 522067 20 + 647215 CAATAGATGAAACTTGCGCA - -a -s mr.mrrefChr3 63171 27 + 181019 AATCAAAGGCTGTCATGTATACACTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510704 27 + 636262 AATCAAAGGCTGTCATGTATACACTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 522087 27 + 647215 GATCAAGAGCTGTCGTGTATACACTGC - -a -s mr.mrrefChr3 63198 108 + 181019 TGAAGTGTGGAACTGTTCTTTGGTGTTGCAAAATGGTGTTTGTCCCCAAAGATGGGCCCATTGTTGCCAATCCATGGTGAGAGCCTCAGTAAGTTGCACGTCTCTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510736 108 + 636262 TGAAGTGTGGAACTGTTCTTTGGTGTTGCAAAATGGTGTTTGTCCCCAAAGATGGGCCCATTGTTGCCAATCCATGGTGAGAGCCTCAGTAAGTTGCACGTCTCTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 522114 108 + 647215 CAGAGTGTGGAACTGTTCTTTGATGTTGTGAAATGGTGTTCATCCCCAAAGATAGGCCCTTTTTTGCCAATCCGTGAAGAGAGTCTCAGTAAGCTGCAAGTGTCTTTG - -a -s mr.mrrefChr3 63306 18 + 181019 TATTCGATCACAAGTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510856 18 + 636262 TATTCGATCACAAGTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 522222 18 + 647215 TATTCCATCACAAGTTCG - -a -s mr.mrrefChr3 63324 43 + 181019 ATACTCCAATTAGCATTATACACTATCTAGGGATAGATACATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510879 42 + 636262 ATACTCCAATTAGCATTCTACACT-TCTAGGGATAGATACATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 522240 43 + 647215 ATAATCCAATTAGAATTATACACTATCCAGGGAAGGATACATA - -a -s mr.mrrefChr3 63367 37 + 181019 CCAAGCTTCTTCCATTAACAACTGATAAACATTCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510922 37 + 636262 CCAAGCTTCTCCCACTAACAAATGATAATCATTCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 522283 37 + 647215 CCAAGCTTGTTCCATTAAAAACTGATAAACTTTCCAA - -a -s mr.mrrefChr3 63404 42 + 181019 TAAACCATCTTAAGGCAGTGGGGCTCAGTACTCTCTACATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510960 38 + 636262 TAAACCATCTTAAGGCA----GGCTCAGTACTCTCTACATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 522320 42 + 647215 TAAACCATCTTAAGGCAGTGGGGCTCAGTACTCTCTACATGA - -a -s mr.mrrefChr3 63446 81 + 181019 TTGTAGGACAGTATAGTAAACACTAAAAAGCTCCCACAAAGGATGCCAATCCTCTCGTTGGTTGGTCTGGCTAAGAAAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511002 81 + 636262 TTGTAGGACAGTATAGTAAACACTAAAAAGCTCCCACAAAGGATGCCAATCCTCTCGTTGGTTGGTCTGGCTAAGAAAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 522362 81 + 647215 TTGTAGGACAGCGTAGCAAACTCTAACTAGCCCCCACAAAGGATGACAATCCTCTGGTTAGTTGGTCTTGATAAGAAAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 63527 58 + 181019 GTTGTTCTTGTACCCCATCATATTTTTATGATTTTGTTAACTATGAACATACTTAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511089 57 + 636262 GTTGTTCTTGTACCCCATCATA-TTTTATGAGTTTGTTGACCATGACCATACTTAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 522443 58 + 647215 GGTGTTCTAGTACCCTATCACATTTTTACAATTTTGTTAACTATGAACATACTTAAGA - -a -s mr.mrrefChr3 63585 145 + 181019 AAGAATCAGCAAGGATGTGCAGAAAAAATACCTAGTAATTGGCGAATTTTGTTCACAATCTATTTACAAGTCATTAATTGGATGTTTTATTATTCTATTAACCTGTTATCTTGCCTCTGTTGTAAGGATACTCATAGGAACCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511146 135 + 636262 -------AGCAAGGATGTGCATAAAAAATACCTATTCGTTGGCGAATTCTGTTTAAAATCCATTTACAAGCCATTAATTGGATGTTTTG-TACTCTATTAACCTGTTATCTTGCCTCTGTTGGAAGGATA--CATAGGAACCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 522504 143 + 647215 AAGAATCAGTAAGGATGTGCAGAAAAAATATCTAGTAATTGGCCAATTTTGTTCCCAAACTATTT-CAAGTCATTAATTGGATGTTTTATTATTCTACTAACCTGTTATCTCATCTCT-TTGTGAGGATACTCCTAGGACCCCCC - -a -s mr.mrrefChr3 63730 994 + 181019 CAGACTAGGAGCTATAAAATTTGAAATAAGCTGGCAAAAAGATACACCTCATGCTGTTTATAGAGAAGAATAACAATGAATAACATGAAGTCTTTCTAACATAGACTTGTAAGTTTATTGTATCGGATAACATGTTTTTTCTTCATTCCCTTGATCACCAACCCCTTCCTTCCTTTTTTGTATCAGACCAAAAGGACATACCACACCTCCCCACACCTTCAGGTTGTTTTTCTATTATGGTCATGTATCTATCATTGGGACAACATCTGAGGAGTTTCATAAGCTAACCCCTTGGACATGGATGTTCCAGCTGGAATCCATGAACCTAATTCACCAGAGCCAACATGGTTGCTAACTTTTGCGCTTGGAATGCTTGCTCAAATTTACAGCCATATGATAGTGGGATACACCCTTTTGGATGCATATATTATGGCTGCAAGATAAGTGGAACTTAATCTCCGGTAACTCTGGCAGTCTCTGAAATAATTGTGATGGAAAAGTGCAACCCACATTGTGTCTGGTGGCATAAAATGTGACTAACACACCAGAGAATGGGCCTTTAGCAAGAAAAAGCATTTTGACAAATAAATTACACACAATTCCTATTGTACAGACGGACCATGTACAATATTCTAGGATTTCTTTTGTCCCTTAATGTCTCTCCACGTCTTGCCCTAGCGATCCCCACTGCTAGCAGATCACCATCTGGGGGGTAACAAACATAAAGGATCTGCTGGTGCAATCACAAATTTTTTCGTTTGTTAGTGTTTGAACATAGGGGTAATGGTGCTTCTGCTTGTCATTCAATTCTTTCTGTCATGATCTTATTGTGAAATCACACTCTCTGGTTGATATCAAGTCCCAACTTTAGACACTGGGCTGTGGAGAACATATAACGTGCATTCCTGGTTCTACCCTGCTATCTTTTGTATGATTCCAGCCTGGCCATAGGCTTATGTtgctgacatcactaccttatactgcattgtTGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511281 934 + 636262 CAGACTAGGAGCTATAAAATTCGAAATAAGCTGGCAAAAAGATACACCTCATGCTGTTCATAGAGAAGAATAACAATGAAGAACATGAAGTCTTCCTAACATAGACTTGTAAGTTTATTGTATTGGAAAACATGTTTTTTCTTTATTCCTTTGATCACGGATCCCTTCCTTCCTTTTTTGTATCCGACCAAAAGGACATACCACACCTCCCGACACCTTCAGGTAGTTCTTCTACTATGGGCATATATCTATCATTGGGACAACATCTGAGAATTTTGGTAAGCTAACCCCTTGGACATGGATGTTCCAGCAGGAATTCATGGACCCAATTTGCCGGAGCCACCATGGTTGCTAACTTTTTTGCTTGGAATGCTTGCTCAAATTTACAGCTATATGATAGTGGG------------------ATATATTATAGCTGCCAGATAGGTGGAACTTAATACCCGGTAACTCTGGCA------TAAATAATTGTGATGAAAAAGTGCAACCCACATTGTGTCTGGTGACATAAAATGTGAC-TAAACACCAGAGAATGGGCCTTTAGCAATAAAAAGCATTTTGACAAATAAATTACACACAATTCCTATTGTACAGCTGGACTATGTACAATATTTTTGGATTCATTTTGTTCCCTCACAGTTCTCCATGACTTGCCCCAGCGATCTCTACTGCTGGCAGATCACCATCTGGGGGGTGACATACATAAAGGATCTGCTAGTGCAATCACAAGTATTGTGATTTGTTAGTGTTTGAACGTAGGGCTAATGGTGCTTCTGCTTGTGATTCAATTCTTACTGTCATGATCTTATTGTGAAATCACACTCTCTGGTTGATATCAAGTCCCAACTTTAGACACTGGGCTGTGGAGAACATATAACGTGCATTCCTGGTTCTAACCTGCTATCTTTTGTATGATTCAAGCCTGGCCATAGGCTTATGT----------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 522649 974 + 647215 CAGACTAGGAGCCTTAAAATTTGAAATAAGCTGTCAAAAAGATACACCTCATGCTGTTT-----GAAGAATAACAATGAGTAACATGAAATCTCTCTAACATAGACTTGTAAGTGTATTGTATCGGATAACATGTTTTTTCTTCATTCCCTTGATCACCAACCCCTTCCTTCCTTTTTTGTATCAGAG----------TACCACACCTCCCCACACCTTCAGGTTGTTTTTCTATTACGGTCATGTATCAATCATTGGGACAACATCTGA-GAGTTTCATAAGCTAACTCGTAGGACAAGGATGTTCCAGCTGGAATCCATGAACCTGATTCACCAGAGCCAACATGGTTGCTAAC--TTGCACTTGGAATGCTTGATCAAATTTACAGCCTTATGATAGTGGGATACACCCTTTTGGATGCATATACTATGGCTGCAAGATAAGTGGAACTAAATCTCCAGTAACTCTGGCAGTCTCTGAAATAATTGTGATGGTAAAGTGCAAGCTACATTGTGTCTGGTGGCATAGAATGTGACTAACACTCCAGAGAATGGGCCTTTAGCAAGAATAAGCATTTTAACAAATAAATTACACACAATTCCCATTGTACAGACGGACCATGTACAATATTCTAGGATTTCTTTTGTCCCTTAATGTCTCTCCACCTCTTGTCCTAGCAA--CCCACTGCTAGCAGATCATCATCTGGGGGGTAACAAACATCAAGGATCTGCTGGTGCAATCACAAATTTTTTCGTTTGGTAGTGTTTGAACATAGGGGTAATGGTGCATCTACTTGTCATTCAATTCTTTCTGTCAAGATCTTACTGTGAAATTGCACTCTGTGGTTGAAATCAACTCCCAACTTTAGACGCTGGGCTGTGGAGAACATATGATGTGCATGCCTGGTTATACCCTCCTATCTTTTGTATGATTCCAGCCCAGCCGTAGACTTATGTTGCTGACATCACTACCTTATACTGCATTGTTGCAG - -a -s mr.mrrefChr3 64724 45 + 181019 CTCACCTTatctttgaaCTCCTTATCACtAGCTgatctggaagtc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512215 28 + 636262 -----------------CTTATTATCACTAGCTgatctggaagtc -s simRat_chr6.simRat.chr6 523624 44 + 647215 CTCACCTTATCTTTGAACGCCTTATCAC-AGCTGATGTGGAAGTC - -a -s mr.mrrefChr3 64769 502 + 181019 tcttaaaaattgggaagccaagacctattgagctgtactgtgtcatagtaaccaaactagaaaagggatatggaatctaGGTCGACAGTATTGAATCACAGACTCTCTACAATTGATTGTCACTGTTCAATCTAACTATTTTTGGGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTTCAAGTGGAGTGGCTACTGCAGTAGGCTTGTCTATAGCAAACCTAAACAAGTTTCTGCCTAATGTATCGGAACACTAATACCTCTATAACACTAAACTAAGATCAAGGTTCACTTGCTCGGCCTTTTTATTGGCCTTTAAACAATATTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCAACATAACTAGGAGCATCAAATAACGGAATTGTCAAAAGGTCCTTTTAGTATGTAATGCATTCTAGAATTTTTGGGACTAGGAGTAAACATGCCCTAGAGTATCCCTCCAGGTTTATACAAAATGTGCTTAGGGTAGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512244 476 + 636262 tcttaaaactgggcaagccaagacctattgagctgcactgtgtcatagtaaccaaactagaaaagggatatggattctagGTAGACAGTATTGAATCATAGACT---TACAATTTATTATCGCTGT------------------GGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTTCAAGTGGAGTGGCTATTGCTGTAGG-TTGGCTCTAGCAAACCTAAACAAGTTTCTCCCTAATGTATCAGAACACTAATACCTCTATAACACTAAACTAAGATCAAGGTTCACTTGCTCGGCCTTTTTATTGGCCTTTAAACAATACTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCAACACAACTAGGCACATCAAATAACGGAATTGTGGAAAGGTCCTTTTAGTATGTAATGCAGTCTAGAAATTTTGGGACTAGGAGTAAACATGCCCTAGAGTATCCCTT---ATTCATCCAAAATGT-CTTAGGGTAGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 523668 502 + 647215 TCTTAAAAATTGGGAAACCAAgacctattgagctgtgctgtgccatagtaaccaaattagaaaagggatatggaatctaTGTCGACTGTATTGAATGACTGACTCTCTACTATTGATTGTCACTGTTCAATCTAACTATTTTTGGGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTCCCAGTGAAGCGGCTACTGCAGTAGGCTTGTATATAGTAAACCTAAACTAGTTTCTGCCTAATGAATGGGTACACTAATACCTCCATAACACTAAACTAAGATCTAGGTTCACTTTCTTGGCCTTTTTATTGGCCCTTAAACAATGTTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCGACATAATTAGGAGCATCAAATAACTGTGTTGCCAAAAGGTCCTTTTATTATGTAAACCATCCTAGAATTTTTGGGACTAGGAATAAACATGCCCTAGAGTAACCCCCCAGGTATGTACAAAATGTGCTTAGGGTAGCCC - -a -s mr.mrrefChr3 65271 167 + 181019 TGTACACCCCGAATAAGTGATTTGTGTACTTCAAATAACCCCCATGAGCTTTGAGATTCCCCATACATGTCTCTTGTCTAGAATTAATAATTGACTGTCTAGATTGCCAGGACTTCTGGTCTAGACAGGAACTGTGTTGGCTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512721 167 + 636262 TGTACACCCCGAATAAGTGATTTGTGTACTTCAAATAACCCCCATGAGCGTTGAGATTCCCCATACATGTCTCTTGTCTAGAGTTAATAATTGACTGTTTTGATTGCCAGAACTTCTGGTCTAGACAGGAACAGTGTCGGCTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 524170 161 + 647215 AGTTCACCCAGGATAGGTAATTTGTGTACTCCGAATAACCCCCATAAGGTTTGAGATTCCCAACACATGTCTCTTGTCTGGAATTAA----TGGCTTGCTAGATTGCCAGG--TTCTGCTCTAAACAAGAGCTGTGTTGATTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 65438 73 + 181019 TGTTAAATTCACATTCTTGTTATGCATAATTGCACCCAAATGTAAAAATTGAGTATAGCTGATAGCAAACTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512888 73 + 636262 TGTCAAATTCACATTTTTGCTATGCATAATTGGACTCAAATGTAAAAGGTGGGTATAGCTGATAGCAAACTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 524334 71 + 647215 TGTTAAATTCACAACCTTGTTATGCATAATGGCACCCAAATCTAAAAATAGAGTATA--TGATAGCAAACTTG - -a -s mr.mrrefChr3 65511 146 + 181019 AACATTAGATTTTACATTCTACCCTACTTTCAAATAGGAAGGTATGTTAAATGGCAGTGACTAAGACCCAGTATAAGTAGTAAGAGCAGCCTAACCATGATGTAGATTCTTAAATGCAATGTGGTGAATATGACAACAGTATTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512961 146 + 636262 AATATTAGATTTTACATTCTACCCCAGTTTGGGATAGGAAGGTATGTTATATGGCAGTGACTAAGGCCCAGTATAAGTAGTAAGAGCAGCCTAACCATGATGTAGATTCTTAAATGCAAAGTGGTGAATATAACAACAGTATTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 524407 146 + 647215 AACATTAGATTTTACATTCTACCCTACTTTCAAATAGGTAGGTATGTTAAATGGCAGTGACCAAGACCCAGTATAAGTAGTAAGAGCAGCCTAACCATGATGCAGATTATTAAAAGCAATGTGGTGAACATGACAACAGTATTAAT - -a -s mr.mrrefChr3 65657 69 + 181019 GGCAAGATAAGTATATCATTTGTCGATGATGTGGCCAATAATGACCATCCACACTACACCCATGGATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513107 69 + 636262 AGCAAGATAAGTATATCATTTGTCGATGATGTGGCCACTAATGACCATCCACACCACACCCATGGATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 524555 69 + 647215 GGCAAGATAATTATATCATTTGTCGATGATGTGGCGAATAATGACCATCCGCACTACACCCATGGATAG - -a -s mr.mrrefChr3 65726 129 + 181019 GAAGAGGATAAGGAGCGGGTTTTCTGCTTAAAGAGAACCTGAGAATCAAGGGAATCAGGTAATAAGAAAAGTCATCTACTCTGAGCCAGTACAATGCTAATTTGAAGGAGAACCTATACTTGATATGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513176 65 + 636262 GAAGAGGATAAGGAGCGAGTTTTCTGATTAAAG----------------------------------------------------------------TAACTTGAAGGAGAACCTATACTTGATATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 524626 129 + 647215 GAAGAGGATAAGGAGCGGGTTTTCTGCTTAAAGAGAACCTGAGAATCAAGGGAATCAGGTAATAAGAAAAGTCATCTACTCTGAGCCAGTACAATGCAAATTTTAAGGAGAACCTATACTCGATATGCT - -a -s mr.mrrefChr3 65855 23 + 181019 TAATTGGTAACTAAGTCACAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513241 23 + 636262 TAATTGGTAACTAAGTCATAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 524756 23 + 647215 TAATTGGTAACTAAGTCACAAAT - -a -s mr.mrrefChr3 65878 156 + 181019 AAGTGAATATTACCGATGCATGCTGAGATGGACAAGCAGTTAGATACCATTATGGAATCCAAGGTAGGGGTAGAAAGATAGGTGGTGGAATTTATGATCTATAAAAAACTGGGATAACACCAGCATTTAAGTACTTAATTTACCCCTCCAAAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513276 150 + 636262 AAGTGAATATTACCCATGCATGCTGAGATGGGCAAGCAGTTAGATACCATTATGCAATCTAAGGTAGGGGTACAAAGATAGGTAGTGGAATTTATGATCTATAGCAATAT------ACACCAGCATTTGAGTACTTAATTTCCCCCTCCAAAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 524779 145 + 647215 AGGGGAATATTAATGATGTATGCTAAGATGGAC-AGCAGTTAGATACCATTATGGAATCCAAGGTAGAGGTAGAAAGATAGGTGGTGGATTTTGTGAGCTATAAAAAACTGGGATAACACCAGCATTTAAGC-CTTAATTTACCCGT--------- - -a -s mr.mrrefChr3 66034 201 + 181019 CCAAAGAATTAGAGACTGTAGAGTACAGTTTTAAGGATGCTGAAAGTAATAAGCAAAGGAAAGTGAACCTGGATATAGGGGCTGGGTTGATCTAGGGTAAATATCTGATGAAAACAGTAGTTAGGTGCTAACGTGTGTTACTGTGGACCAAACCAGGGCACTATGACCTGAGCTACCATACTAAGTTCCTCAAAGAGGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513437 187 + 636262 CCAAAGAATTAGAGACTGTTGAGTACAGTGTTAAGGATGCTGAAAGTAATTAGCAAAGGAAAGTGAACCTGGATATAGGGGCTGGGTTGATTTATGGTAAATATCTGATGAAAACAGTAGTTAGGTGCTAACGTGTGTTACTGTGGACCAAACCAGGGCACTATGACCTGAGCTCCCAGACTAAGTT-------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 524924 192 + 647215 CCAAAGAATTAGATGCTGTAGAATACAGTTTTAAGGGTGCTGAAAGTAATAAGCAAAGGAAAGTGAACCTGGATATAGGTGCTGGGTCGATCTAGGGTAAATATCTGATGAAAACAGTAGTTAGGTGCAAA--------ATTGTGGACTGAACTAGGGCACTAC-ACCTGAGCTACCATACTAAGTTCCTCAAAGAGGCTT - -a -s mr.mrrefChr3 66235 32 + 181019 GAAGAGGCTTTTATCCACAAAGAGGCTTGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 525128 32 + 647215 GAAGAGGCTTTTATCCACAAAGAGGCTTGTTC - -a -s mr.mrrefChr3 66267 19 + 181019 TGGACTAGATGACTCTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 525236 19 + 647215 TGGACTAGATGACTCTCTT - -a -s mr.mrrefChr3 66286 147 + 181019 GGATGATGCGTTCTGTATAGTGAATGTGACTATTCAGGGTGGGGAGGGTCAAAATGGACTAGATACAACCTTAACTTTAAATATGAACTGTCCTTGAGTGTATTTGAAACGTTTCATTCTCTCAGTGCCCTAATGAACAGAAAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513624 124 + 636262 -----------------------ACATGACTATTCAGGGTGGGGAAGGTCAAAATGGACTAGATGTAACCTTAACTTTAAATATGAACTGTCCTTGAGTGTATTTGAAACGTTTCATTCTCTCAGTGCCCTAATGAACAGAAAATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 525265 147 + 647215 GGATGATGCGTTCTGTATAGTGAATGTGACTATTCAGGGTGGGGAGGGTCAAAATGGACTAGATACAACCTTAACTTTAAATATGAATTGTCCTTGAGTGCATTTGAAACACTTCATTCTGTCAGTGCTCTACCGAACAGAAAATCA - -a -s mr.mrrefChr3 66433 17 + 181019 CTATCATGTGGAATAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513749 17 + 636262 CTATCATGTGGAATAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 525412 17 + 647215 CTATCATGTGGAATAAA - -a -s mr.mrrefChr3 66450 65 + 181019 TCCCCACAAGGCAGCGTGTATGGCTGTGTATGCCACCACTTGCTCAGAAATGGTGTCTTTATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513767 65 + 636262 TCCCCACAAGGCAGCATGTATGCCTGTGTATGCCACCACTTGCTCAGAAATGGTGTCTTTATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 525429 65 + 647215 TTCCTGCAAGGCAATGTGTATGGCTGTGTATGTCCCCACTTGCTGAGAAGTGGTGTCTTTAGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 66515 197 + 181019 CCCGACTGTTTGCTATGTAACTCCCTGTGGCCCTGCTTTGTGTATAAACACTCAATATCCTTGGTATTCTGTAGTATGTCTTGGTTCATTTCTTCGAATAGCTGCTCTGTTATATACCATCTCCTTGTGTAGATAAAATCTAATATGAATATAGTAGCATCTATGTGTTGTGCATATTATGTTGACTATATGTGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513834 176 + 636262 CCCCACTGATTGCTATGTAATT-----------TGCTTTGTGTATAAACACTCAATATCCTTGGCATTCTGTAGTATGTCTTGGTTCATTTCTTCGAATAGCTGCTCTGTTATATACCATCTCA----------AATATCTAATATGAATATAGTAGCATCTATGTGTTGTGCATATTATGTTGACTGTATGTATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 525494 185 + 647215 CCTGACTGTTTGCTACGTAGCTCCCTGTGGCCCTGTTTTGTGTATAAACACTCAATATCCTTGGTATTCTGTAGTATGTCTTGGTTCACT------------TGCTCTGTTATATACTATCTCCTTGTGTAGATAAAAATTAATATGAATATAGTAGCATCTATGTGTTGTGCATATTAGGTTGACTATATGTGTTA - -a -s mr.mrrefChr3 66712 128 + 181019 ACATGCCCAGCCCATGTCCCAACTAGGATCAAAGGATGGAGCCTTAATGAAAGGACCGCTAGAGCCTTAATAAAGCCTTATTTGATAGAATAGGTATACCTGGCTTCCTATTTGCAGATAAATGAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 514010 128 + 636262 ACATGCCCAGCCTATGTCCCAACTAGGATCAAAGGATGGAGCCTTAATGAAAGGACCGCTAGAACCTTAATAAAGCCTTATTTGATAGAATAGGTATACCTGGCTTCCTATTTGCAGATAAATGAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 525684 123 + 647215 ACATGCCCAGCCCATGTCCCATCTAGGATCAAAGAATAGAGCCTTACTGAAGGGGCCGCTAGAGCCTTAATAAAGCCTTATTCG-----ATAGGTATACCTGGCTTCCTATTTGCAGATAAATGAGTG - -a -s mr.mrrefChr3 66840 132 + 181019 ATGGGTCAACAGCCCAGAGCCCTAGAGGTGATTGGCAGGTAAGAAAGGGGTATGATTAAAGACTTGTTCATTGATTTTGACTTGAGAATAAACACTCTAGGCAGACTTATAAATTGATATTTAGTCTTACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 514138 127 + 636262 ATGGATCAACACCCCAGAGCCCTAGA--CGATTAGCAGGTTAAAAAGGGGTATGATTAAAGACTTGTTCATTGATTTTGAC--GAGAAT-AACACTCTAGGCAGACTTATAAATTGATACTTATTCTCACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 525808 132 + 647215 AGGGGTCACCAGCCCAGAGCCCTAGAGGTGGTTGGAGGATAAGAAAAGGTAATGATTAAAGACTTGTTCATTGACTTTAACTTGAGAATAAACACTCTAGGCAGACCTATAAATCAATATTTAGATTTGCTA - -a -s mr.mrrefChr3 66972 103 + 181019 TCAGGGTGGCTGTGTGAGTCATGCCATTGCCACTATTATCTCTCCTAGAGACTCAACATCATCACATCAGATTTTTCCAGTGCTTTCTTCTTGATGTGTGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121557 103 - 636262 TCAGTGTGGCTGTGTGAGTCATGCCATTGCCGCTATTATCTCTCCTAGAGACTCAACATCATCACCTCAGATTTTTCCAGTGCTTTCTTCTTGATATGTGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 525940 103 + 647215 TCAGGATGGCTATCCGAGTGATGCCATTGCCACTATTATCGCTCCTAGAGACTCAACATCATCATATCAGATTTTTCCAGTGCTTCATTCTGGATGTGTGTGC - -a -s mr.mrrefChr3 67075 16 + 181019 GAAAGTAACTGATAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121663 16 - 636262 GTAAGTAACTGAGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 526043 16 + 647215 GAAAGTAACTGATAAA - -a -s mr.mrrefChr3 67091 14 + 181019 CACCAAGCCTACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121682 14 - 636262 CACCAAGCCTACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 526059 14 + 647215 TGCCAAGCCTGCAG - -a -s mr.mrrefChr3 67105 294 + 181019 GGGACACCATCACTTGATTTTATGACACTAACTGCAGTTGCAGCTAATTTGTTGATATAATGATTTGCCAATCTATCTAAAGAGTGTTAAGATACATCTAGGGAGTACACCCACAAGCATTCTTACATCTTGCTGTGGGAACTAATGAAGGAATACACTGAATAGAAGGTTACACGCAGTGGCTCAATACCGAAGGATATTAACAGTAGGAGGCATATGGCACTAAGCTTCAACATGTGAAAGTCAACTGTCATATGAGGAATCTACCCTCTGGCATAGTGTACACTGTGTAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121701 293 - 636262 GGGACACCATCACTTGATTTTATGACACTAACTGCAGTTGCAGCTAATTTGTTGATATAATGATTTGCCAATCTATCTAAAGAGTGTTAAGATACATCTAGGGAGTACACCCACAAGCTTTCTTACATCTTGCTTTGGTAAGTAATGTAGG-ATACTCTGGATAGAAGGTCACACGCAGTGGCTCAATACCGAAGGATATTAACAGTAGGAGGTCTACGGCACTAAACTTCAGAATGTCAAAGTCAATTGTCATATGAGGAATATACCCTCTGTCATAGTGTACACCATGTACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 526073 279 + 647215 GGGACACTGTCATTTGATTTTCTGATACTAACTGCAGTTGCAGCTAATTTGCTGATATAAGATGTTGCCAACCCATCTAAAGAGTATTAATATACATATAGGGAGTATACCTGAAAACATTCTTACATCTTGCTGTGGGAACTAATGAAGGAATACACTGAATAGATGGTTACATGCAAGGTCTCA---------------AACAGTAGGAGGCATATAGCACTAAGCTTCAACATGTGAAAGTCAACTGTCATATGAGGAATCCACCCTCTGGCATAGCGTACACTGTATAGC - -a -s mr.mrrefChr3 67399 80 + 181019 CAATGCAACTAAGTCCTGGTGACTACACAGGATAGTAATATAGATCTAGGGTGTTCATACTCTTGCCTTCCAAGATTGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 514705 80 + 636262 CAATGCAACTAAGTCCTGGTGGCTACATGGGGTGGTAATTTAGATCTAGGGTCTTCATACTCTTGCCTTCCAAGATTGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 526355 74 + 647215 CAATGCAACTAAGTC------ACTACACAGGATAGTAATATAGATCTAGGACGTTCATACTTTTGCCTTCCAAGAATGAC - -a -s mr.mrrefChr3 67479 35 + 181019 TATCACCCAGGGAAACTCTACCCAGTTACAACTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 514793 35 + 636262 TATCACCCAGGGAAACTTTACCCAACTACAACTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 526429 35 + 647215 CATTGCCCAGGGAAACTCTACCCAGTTGCAACTCT - -a -s mr.mrrefChr3 67514 315 + 181019 TGTAATTCAGACAGGCTTGACTCCAGGGTCTAAGCTAACTGCAGAAAGTTAACATGTTTAAACACTTGGGATGATTGCCTAATGTATTTCATGCAGACCATAAAAGAGCATGCTCGCCCTGTGGCATCATCAGAAAGGTTGCCCACTTGCAAGTGTTGCTGCATCAGGTTGGACTAGCACGTTGACATTGTGGTAGGTCAGAAATGCAGCTAGTGCTACATCAGGGCGGACTAGCATGATGACATTGTGGGAAATCAGAAATGCAGCTAGTAACTAATGAGTTGTTTGGGAATACTATCAGGGAGCTTCAAATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 514842 306 + 636262 TGTAGTTCAGACAGGCTTGACTCCAGGATCTAAGCTAACTGTGGAAAGTTAATATGTTTAAACACTTGGGATGATTGCCTAATGTATTTCTTGCAGACCCTAAAAGAGCATGCTCGCCCTGTGGCATCATC-GAAAGATTGCCCACTGGCAAGTGTTGCTGCAGCGGGTTGGACTAG--------CATTGTGGTAGGTCAGAAATGCAGATAGTGCTACATCAGGGCGGACTAGCATGATGACATTGTGGGAAATCAGAAATGCAGCTAGTGACTAATGAGTAATTTGAGAATACTATCAGGGAGCTTCAAATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 526464 315 + 647215 TGTAAATCAGACAGGATTGACTCCAGGGTCTAGGGCAACTGCAGAGAGTTAACATGTTTAAACACTTGTGATGATTGCCTAATACATTTCATGCATATCATAAAAGAGCATGCTAGCCCTGTAGCATTATCAGAAAGGTTGCCCACTTGCAAATGTTGCTGCATCAGGTTGGACTAGCACGTTGACATTGTGGTAGGTCAGAAATGCAGCTAGTGCTGCATCAGATTAGACTAGCATGGTGACATTGAGGGAAGTCAGAAATGCAGCTAGTAACTAGTGAGTTGTTTGGGAATGCTATCAGGGAGTTGCAAGTGG - -a -s mr.mrrefChr3 67829 371 + 181019 GGAAGAAGTGTAAGGATCTAGCAATCATCAGACCATATTGAATTGTATCTAAAAGGCAAAAGGTGGGTGCAGTGTACAGACTGATTCAGTTTGACAAGCCATAGTAAAGAAATCGATGACACCTGTCAAAGTAAAGTGAATCGATCAGGAGAAACACTGTTATTCTGTTAGTAAGGATAACATCTAGTGTCTTAAGATCAAAAATTGGGAGCACATGTGCAGAACAAGTTCTGTCTCTCAAGCAGATATGTTCCATCAGAATTAAGTGTGGCGCCAGCATCATATAAGAGAGTCTGATACAGCATTCAACTAGTGCACAAAGATGAGCATCTACCTTTTGTGATCACCTGGCTATTATTGTCTGATATATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 515185 366 + 636262 GGAAGAAGTGTAAGGATCTTGCAATTATCGGACCAT-TTGAATTGTATCTAAAAGGCAAAAGGTGGGTGCAGTGTACAGACTGGTTCAGATTGACCAGCCACAGTAAAGAAATAGATAACACCTGTCAAAGTAAGGTGGATCTATCAGGAGAAACACTGTTATTCTGTTAGTAAGGATAACATCTAGTGTCTTAAGATCAAAAGTTGGGAGCACATGTGCAGAACAATTTCTGGCTCTCAAGCAGGTATGTTCCACCAGAATTCAGTGTGGCGCCAGCACCATATAAGAGAGT----TACAGCATTCAACTAGTGCACAAACATGAACATCTACCTTTTGTGATCACCTGGCAGTTATTGTCTGATATATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 526779 371 + 647215 TGAAGAAGTGTAAGAATCCAGCAATCATCAGATCATATTGAATTATATCTAAAAGGCAAAGGGTGGGTGCAGTGTACAGACTGATCCAGTTTGATAAGCCATAGTAAAGAAATCGATGACACCTGTCCAAGTAAAGTGAATCGACAAGGGGAAACACTGTTATTCTGTCAGTAAGGACAATATCTAGTGTCTTAAGATCAACAATGGGGAGCACATGTGCAGAACAAGTTCTGTCTCTCAAGCAGATATGTTCCGTCAGGATTAAGTGTGCCGCGAGCATCATCTTAGAGAATCTGATACAGCATTCAACTAGTCCACAAAGATGAGCAACTACCTTTTGTGATCACCTGGCTATTATTGTCCGATATATA - -a -s mr.mrrefChr3 68200 52 + 181019 ATAGCCCTTAGTTGTTTGCCTCATTTAGATTACCTTCAGATCCTGTGGTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 515553 52 + 636262 ATAGCCCTTAGTTGTTTGCCTCATTTAGATTCCCTTCAGATCCTGTGGTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 527150 52 + 647215 ATAGCCCTTAGTTGTTCGTCTCATTTAGATTACCTTCAAATCCTGTGCAATA - -a -s mr.mrrefChr3 68252 12 + 181019 CAAACTATAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 515606 12 + 636262 CAAACTATAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 527202 12 + 647215 CAAGCTATAAAG - -a -s mr.mrrefChr3 68264 50 + 181019 ACACAAACCGGATTGTCATAAAGTGGAATCAAATTGATGCACCAACCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 515626 50 + 636262 ACAGAAACCGGATTGTTATAGAGTGGAATCAAATTGATGCACCAACCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 527214 50 + 647215 ATACAAATAGGAATATCATAAAGTCGAATCAAATTGATGCATCAACTAGA - -a -s mr.mrrefChr3 68314 366 + 181019 TCTACATTAATTATACGATGGTCTTCTTTTAACCAATATCTGTATTCAGACTTTTGTGCCTGTTACTTGAGGATCTAGGAGTGGAATAGGCAGTCATCGCATAAGTGACTTTACGGGTAACTCAAATTTTATCCATAATCCTGTTTCATTGAGAACATTTCTATACCCAAAGCGACTATAATTCAAGAGAACTGAGAAGTTATACTGCTTTTAGACATGTGTAGCACCAAAGCATCCTGTTGTGTTCTTAAGATGGCTGGACTCTTTTTTCTGCTCCTGCTAATTTATACATCAAAAGTACCACAAAGAGTTGGGATCAATTAAGTATTACAGAATCCATTGAGGCTTCAGCACTGTTAACAGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 515677 362 + 636262 TCTACATTAATTATACGATGGTCTTCTTTTAACCAATATCTATATTCAGAC----GAGCCTGTTACTTAAGGATCTAGGAGTGGAATAGACAGTCATCGCATAAGAGACTTTACAGGTAACTCAAATTTTATCCATAATCCTGCTTCATTGAGAACGTTTCTATACCCAATGCAACTATAATTCAAGAGAACTGAGAAGTTATACTGCTTTTAGACATGTGTAGCACCAAAGCATCCTGTTGTGTTCTTAAGATGGCTGGACTCTTTTTTCTGCTCCTGCTAATTTATACATCAAAAGTACCACAAAGAGTTGGGATCAATTAAGTATTACAGAATCCATTGAGGCTTCAGCACTGTTAACAGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 527264 366 + 647215 TCTACACTAATTATATAATAGTCTTCTTTTAACCAATATCTGTATTCGGACTTTTGTGCCTGTTTCTTGAGGATCTAGGAGTGGGGTAGGCAGTCATCACATAAGTGGCCTTACGGATAACTCCCATTTTAGCTTTAATCCAGTTTCATTGAGAACATTTCTATACCCAAAGCGACTATAATTCAAGAGAACTGAGAAGTTACACTGCTTTTAGACATGTCTAGCATCAACACATCATCTTGTGTTCTTAAGATGGCTGGACTGTTTTGCCTGCTCCTGCTAATTTATACATCAAAAGTACCACAAAGAGTTGGGATCAACTAAGTCTTACAGGATCCACTGAGGCTTCAGCATTGTTAACTACTT - -a -s mr.mrrefChr3 68680 28 + 181019 CTCTCATATTCATTATACCAGGTTGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516047 28 + 636262 CTCTCATATTCATTATACCAGGTTGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 527630 28 + 647215 CTGTTGTATTCTTTACACCAGGTTGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 68708 14 + 181019 GTAACAGCAGGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516075 14 + 636262 GTAACAGCAGGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 527666 14 + 647215 GTAACAGCAGAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 68722 89 + 181019 CATGTTCATTTCGTTAGAGAGGAGTCCATTCAACTGGGTCTAGTTCAAGATTGAGCTGGTAATAACCTCACTCTGCTTTATTGCCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516095 89 + 636262 CATGTTCATTTCGTTAGAGAGGAGTCCATTCAACTGGGTCTAGTTCAAGATTGAGCTGGTAATAACCTCACTCTGCTTTATTGCCCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 527680 89 + 647215 CATGTTCAGTACATGAGAGAGGAGTCCATTCAACTGGGTCTAGTTCAAGAATGAGATGATAATAACCTCACTCTGCTCTATTGCCCAAA - -a -s mr.mrrefChr3 68811 79 + 181019 CACTGCTATATACTACCCATAGAAGCTATTTCTCTTTATCATCTTGGCTGACTATCTACTTTCACACTTATAGCCAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516198 79 + 636262 CACTGCTATATACTACCCATAGAAGCTATTTCTCTTTATCATCTTGGCTGACTATCTACTTTCACACTTATAGCCAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 527769 79 + 647215 TACTGCTGTAGGCTTCCTAAAGGGGCTGTTTTTTCTTGTCATCTTTGGTGACTATCTATTTTCATGTTTACAGCCATTC - -a -s mr.mrrefChr3 68890 116 + 181019 TCTACTCATCAGAATATTATCCATGTAAATGGGTTATACATCAATTGCCTCACTCTAGATGTTTAGTCACTGTGGGCTACCCCACAGGTTCACACCACGAGACTAGCCAGGTCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516280 115 + 636262 TCTACTCATCAGAATATTATCCATGTAAATGGGTTATACATCAATTGCCTCACTCTAGATGTTTAGTCACTGTGGGCTACCCCACAGGTTCACACCACGAGACTAGGCAG-TCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 527848 116 + 647215 TCTAATCATCAGAATATTACGCATGCAAATTGGTTATATGCCAATTTCCTCACTCCAGATGTTTAATCAATGTGGGCTGCTCCATCGGCTCATACCAAGAGTCTAGCCAGGTCAGT - -a -s mr.mrrefChr3 69006 5 + 181019 AATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516397 5 + 636262 AATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 527964 5 + 647215 AATCG - -a -s mr.mrrefChr3 69011 14 + 181019 AGATAAGCCATCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516404 14 + 636262 AGAAAAGTAATCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 527969 14 + 647215 AGATAGGCCATCAC - -a -s mr.mrrefChr3 69025 165 + 181019 CCAGCCTAGTTCACTTGCATTAATGGCTCATTGTTAGTCTTTGAGAGCTGCCACTTTCACTTTTAGAAAGTAGATTTTTTGAGGTGACCATCAGTCAGCTTGGGGCTTAGTGGAACCCTCCTCCCTTTCCTGTGCTTGGATGGTAATTTGAGAGAAGGGAAGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516493 126 + 636262 CCA--TTGGCCCACATGCATTACTGTCTCATTGGTAGTCTTTGAGAGCTGCCACTTTCACTTTTAGGAAGTATAGTTTTTGAGGTGACCATCAGTCAGCTTGGGGCTTAATGGGACCCTCCTCCCTTT------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 527983 156 + 647215 CCAGCCTAGTTCACTCG-ATTAATGGGTCATTCTTAGGACGTAA--------AGTTTCACTTTTAGAAAGTAGATTTTTTAAGGTGACCGCCAGTCAGCCTGGGGCTTAGTGGAACTCTCCTCCCTTTCCTGTGCTTGGATGGTAATTTGAGAGAAGGGAAGCTG - -a -s mr.mrrefChr3 69190 93 + 181019 GTTGTAGATGTAGCTTGCTTGGGGTGCAATTGAAGAGAAGCATGTCACCACTGTAAATTAAGTCTATTGCATGAGGAAGAACAGGGATCTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 528140 93 + 647215 GTTGTAGATGTAGCTTGCTTGGGGTGCAATTGAAGAGAAGCATGTCACCACTGTAAATTAAGTCTATTGCATGAGGAAGAACAGGGATCTGCA - -a -s mr.mrrefChr3 69283 35 + 181019 TATAACAGCAAGCATACAAGGTATGGAAAGTTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516619 10 + 636262 -------------------------GAAAGTTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 528238 35 + 647215 TATAACAGCAAGCATACAAGGTATGGCAAGTTGGG - -a -s mr.mrrefChr3 69318 104 + 181019 CTAAATTCTTACGATTTCACATGAAATGAAGTCATGCAGCCCACAAAAAATAACTGTAATAACCCTGGTCTGCACATAGGGCTGTCAGAGTACTGCACATGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516703 100 + 636262 CTAAATTCTTT---TTTCACATGAAACAAAGTCATGCAGCCCGCAAAAAATA-CTGCAATAACCCTGGTCTGCTCATAGAGCAGTCAGAGTACTGCACATGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 528273 104 + 647215 CTAAATTCTTACGATTTCCCATTAAATGAGGTCATGCAGCCCACAAAAAATAACTGTAACAACCCTGGTCTGCACATGGGGCTCTCAGAGTACTGCACACGTTC - -a -s mr.mrrefChr3 69422 10 + 181019 ATGTGGTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516804 10 + 636262 ATGTGGTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 528377 10 + 647215 ATGTGGTTTC - -a -s mr.mrrefChr3 69432 18 + 181019 ACTAGTTCATACAGGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516815 18 + 636262 ACTAGTTCATACAGGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 528387 18 + 647215 ACTAGTTCATACAGGGCT - -a -s mr.mrrefChr3 69450 81 + 181019 CTAACACCATTTGAGCTATGGGGCTAAGAGTTAAGTCCATTGCCTCAGCATATTAACACTTATCTCAGGCTTGGCAGACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516833 81 + 636262 CTAACACCATTTGAGCTATGGGGCTAAGAGTTAAGTCCATTGCCTCAGCATATTAACACTTATCTCAGGCTTGGCAGACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 528421 81 + 647215 CTGACATCATTTGAGCTATGGGGCTAAGAGTTAAGTCCATTACCTCGGCATATTAATCCTTACCTCACCTCTGGCAGACTG - -a -s mr.mrrefChr3 69531 149 + 181019 ACTCAGGGTCCATTCTCAGTACCATCAACTATAATATATGAGGCTGTAGTGATCTCTTGGCCTGATAAAACAGCCTGACATATGGACGCCTGCAAAAGGCTAGCAGTGCCTATATTGTAACCATCAGTAGTATGGCATGTGTGTGGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516914 149 + 636262 ACTCAGGGTCCATTCTCAGTACCATCAACTATAATATATGAGGCTGTAGTGATCTCTTGGCCTGATAAAACAGCCTGACATATGGACGCCTGCAAAAGGCTAGCAGTGCCTATATTGTAACCATCAGTAGTATGGCATGTGTGTGGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 528507 149 + 647215 ACTCAATGTCCATTCTCAGTACCATTATCTATAATGTAGGAGGCTGTGGTGATCTCTTGGCCTGATAAAACAGCCTGACATATGGACACTTTCAAAAGGCTAGCAATGTCTATATTGTAACCATCAGTCATATGTAAAGTGTGTGGTGA - -a -s mr.mrrefChr3 69680 187 + 181019 AATCTACATTGTTTGGAACTTGATACCATCTTCAGGTTGTCAGGTCTACCACGGTACTGCTCACCTCAATGCTATCAGGATGCCCATTCGTCTGTTTATTATCTTGACATGGATATCCCCTCTTCAGGGAAGTGGAGAATTAGTGACACAGATAGTATAACATTATATATAGTAACCAGGCCGGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517064 187 + 636262 AATCTACATTGTTTGGAACTTGATACCATCTTCAGGTTGTCAGGTCTACCACGGTACTGCTCACCTCAATGCTATCAGGATGCCCATTCGTCTGTTTATTATCTTGACATGGATATCCCCTCTTCAGGGAAGTGGAGAATTAGTGACACAGATAGTATAACATTATATATAGTAACCAGGCCGGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 528656 187 + 647215 GATCTACATTGTAAAGCACTTGATACCATCTCCAGGTTGTCAGGTTGACCACAGTACTGCTGGCCTCATTGTTGTTACCACACCCATGTGTCTGTTTATTATCTTAACATGGATCTCCCATCCTCAGGGAGGAAGAGAGTTAGTGACAGAGATAGCTTATCATCATATGTAGTCACCAGGCTGGTCT - -a -s mr.mrrefChr3 69867 54 + 181019 TCCCCTTATCTATTGGAGATGACTGATTCTTCTGCTGTCTTTCCCTGAAGTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517252 54 + 636262 TCCCCTTATCTATTGGAGATGACTGATTCTTCTGCTGTCTTTCCCTGAAGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 528843 54 + 647215 TCCCCTTATCTAGTAGAGATAAATGATGCTTCTGCTGCCTGCCCCTGAAGTTAA - -a -s mr.mrrefChr3 69921 16 + 181019 CTATAATAAAAGGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517318 16 + 636262 CTATAATAAAAGGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 528897 16 + 647215 CTATAATAAAAGGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 69937 83 + 181019 ACGCACTAGCTTGCCATATGAAGGGGGGCTGACTTTAGATTTGCTGTGCTCGTTAAATGTAATTTGCTATTTCCCCAGTGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517695 83 + 636262 ACGCACTAGCTTGCCATATGAAGGGGGGCTGACTTTAGATTTGCTGTGCTCGTTAAATGTAATTTGCTATTTCCCCAGTGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 528913 83 + 647215 AAGCAATAGCTTGGCATATGAAGGGGGACTGACTTCAGATCTGCTATGCCCGTTAAATGTGATATGCTAATTCCCCAGCATAT - -a -s mr.mrrefChr3 70020 4 + 181019 TCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517778 4 + 636262 TCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 529023 4 + 647215 CCCA - -a -s mr.mrrefChr3 70024 416 + 181019 ATTGATAGTCCAATGTCTTGTAGCTTAGTTCACtcagtgtattccatacagctcttctaggtcagttcacaagggtgtgacttcatgtcatcctgggggttgtgcaaacaactttggaatttgtatacaaaGATCTAGAATGTGAGACACAGTCTGATTGGTCACATTTCAAGGGCTTATTCCTATCTTGCCAATTGCCTAGTACAATCTTAGCTTAAGGAACGAATATACCATGGCCATGGGATGGGCCCAGTGAGGGGGAGAACATCAGTGTCTAAAATATCCACCTGGCATGTGATGTATACATGAATTGCTAATTCCAAGGTAGGGTGAATTAATTGTTAATGTCAGAGATAAGAGGTCATAAATGATAAACATGACATACATTCTCTCTTGTTTCTTTTGCTGGCAGATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517782 306 + 636262 ATTGATAGTCCAATGTCTTGTAGCTTAGTTCACtcagtgtattccatacagctcttctaggtcagttcacaagggtgtgacttcatgtcatcctgggggttgtgcaaacaactttggaatttgtatacaaaGATCTAGAATGTGAGACACAGTCTGCATGATCATATATCAAGGGCTTATTCCTATCTTGCCAATTGCCTAGTACAG---TAGCTTAAGGAACGAATATACCATGGACATGTGGTGGGCCCTGTGAGGGGGAGAACATCAATGTCTAAAATATCCACCTGGCTTGTGATGTATACATGA----------------------------------------------------------------------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 529031 415 + 647215 ATTGATCGTCCAATGTTTTGTAGCTCAGTTCACtcaatgtaatccatgtagctcttctaggtcggttcacaggggtgtgacttcaagttatgctgggggtggcgtcaacaactttggaatttatatacaaaGATCTAAAATGTGAGACAC-GTCTGATTGGTTACATTTCAAGGGCTTACTCCTACCTTGCCAATTACCTAGTACAATCTTAGCTCAAGGAACGAATATACCATGGCCATGGGATGACCCCAATGAGGGGGAGAGCGTCAGTGTCTAAGATATCCACCTGGCATGTGATGTATACATGAATTGCTAATTCCAAGGTAGGGTGAATTAATTGTTAATGTCAGAGATAAGAGGTCATAAATGATAAACATGACATACATTCTCTCTTGTTTCTTTTGCTGGCAGATAT - -a -s mr.mrrefChr3 70440 8 + 181019 CTGTATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 529448 8 + 647215 CTGTATGA - -a -s mr.mrrefChr3 70448 16 + 181019 ACGCTCACCCCTCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 529458 16 + 647215 ACGCTCACCCCTCAGT - -a -s mr.mrrefChr3 70464 24 + 181019 ATTACATATGAGAAGATTTTGACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518088 21 + 636262 ---GCATATGAGAAGATGCTGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 529480 24 + 647215 ATTACGTATGAGAAGATTTTGACC - -a -s mr.mrrefChr3 70488 65 + 181019 GACAAAGGGGAGCCCATCTCTCTCACTATCCAAATAAGCTTGTATGCTGTACGTGCTTCCCTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518112 65 + 636262 GACAAAGGGGAGCCCATCTCTCTCACTATCCAAATAAGCTTGTATGCTGTACGTGCTTCCCTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 529504 65 + 647215 GACAAAGGGTAGCCCATCTTACGCACTATCCAAATAAGCTTGTATGTTGTATGTGCTTCCACCCT - -a -s mr.mrrefChr3 70553 133 + 181019 AAACTCCACAAGTTATACATGCAAGCACTGAAATCCCATATCCCATACACCAGGCGCTCATTTGGATCTAGCTGGCCATGGAGGTAATCTCAGAGTAGACTACAAGAGTGCTAGATGTAACAGCAACAAATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518177 131 + 636262 ACACTCCACAAGTTATATATGCAAGCACTGAAATCCCATATCCCATACACCAG--GCTCATTTGGATCTAGCTGGCCATGGAGGTAGTCTCAGAGTAGACTACAAGAGTGCTACCTGTAACAGCAACAAATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 529571 131 + 647215 AAACTCAACAAGT--TACATGCAAGCACCGAAATCCCATAGCCTATACACCAGGCGCTCATTTGGATCTAGCCGGCCATTGGGGTAATTTCAGAGCCGACTATGAGGGTGCTAGATGTAACAGCAACAAACGG - -a -s mr.mrrefChr3 70686 94 + 181019 TTGTAATAATTAACCATCTTGTATTCTGAAATGTATATTGGACTATATAACTGGTATATTTATTTGTATTTATTCTCACTATCCTTGAAGCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518312 94 + 636262 TTGTAATAATTAACCATCGTGTATTCCAAAATGTATATTGGACTAGATAGCTGGTATATTTATTTGTATTTATTCTCAGCATCCTTGAAGCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 529702 94 + 647215 TTGTAATAATTAACCACTTTTTATTCTGAGATGTATATAGGACTATATAACTGGTATATTTATTTGTATTTAATCTCACTATCCTTGAAGCAGC - -a -s mr.mrrefChr3 70780 97 + 181019 TAGATACAAGCCACCTGGCACAGTGCAAGCTTACAAGCCTATAATGTTCGGACTTGGGGATTAATTAACCTGTTACCATCAAACACCCTGTCTTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518407 97 + 636262 TAGATACGAGCCACCTGGCACAGTGCAAGCTTATAAGCCTATAATGTTCAGACTTGGGGATTAATTAACCTGTTATCATCAAACACCCTGTGTTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 529796 97 + 647215 CAGATACAAGCCACCTGGCACAGTGCAATCTTACGAGCCTCTAATGTTCGGGCTTGGGGATTAATTAACCTATTACCGTCAAACACCCTGTCTTAGG - -a -s mr.mrrefChr3 70877 221 + 181019 GATGTGACCTGTCTTAGTTTATAAAATTTTACAGTATTCAAGTGGCTTGTTAAGCCGCCATGATTGTTCCCAATGCTAAGTCACATTGGCCCACCAATGCATATTCTTTATGGTATTGTTCTGTGTGAGATCATTAGAGATGTAAACCCACAACAGAATGGTTGGATTGTCTCTTCAACGATGCTACAAAGGGAAATGGTATGTATGAAATCTGTGAGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518529 221 + 636262 GATGTGACCTGTCGTAGTTTATAAAATTTTACAGTATTCAAGTGGCTTGTTAAGCCGTCATGATTCTTCCCATTGTTAAGTCACATTGGCCCACCAATGCACATTCTTTATGGTATTGTTCTGTGTGAGATCACTAGAGATGTAAACCGACAACAGAATGGTTGGATTGTCTCTTCAACGATGCTACAAAGGGATATGGTATGTATGAAATCTGTGAGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 529893 218 + 647215 GATGTGACCTGTCTTAG---ATAAAATCTCGCAATATTCCAGTGGCTTGTTAAGCCACGATGATTGTTACCAATGCTAAGTCTCGTTTGCCCACCAATCCATATTCTCTATGGTATTGTTCTGTGTAAGATCATTGGAGATGTAAACCCACCACAGAATGGTTGCATGGTCCCTTCAGTGATGCTACCAGGGGAATTGGTATGTATGAAATCTGTGATGCT - -a -s mr.mrrefChr3 71098 43 + 181019 AGCAGGCATACCAAAAGATAGTTAGCTCAATGTGTTGATAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518750 43 + 636262 AGCAGGCATACCAAAAGATAGTTAGCTCAATGTGTCAAGAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 530114 43 + 647215 AGCAGGCATACTATAAGATAGTTAGCTCAATGTGTTGATAAAT - -a -s mr.mrrefChr3 71141 143 + 181019 AGATAATAGAGGATCACCAACACTTGATTGCGTACACTAATTGATCAACGAATACGAGCTTAAGTCACCTTTATGCTCAACACCTAGATTTCTCAGTATTGTTTGCTAAGAAGAGAGTCAACATGGTATATCCCCACTTACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518794 139 + 636262 AGATAATAGAGGATCACCAACACTTGATTGCTTATA-TAACTGATCAACGAATACGAGCTTAAGTCACCTTTATGCTCAACACCTAG---CCTCAGTATTGTTTGCTAAGAAGAGAGTCAACATGGTATATCCCCACTTACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 530157 135 + 647215 AGATAATAGATGATCACCAA--------TCCGTACACTAATGGATCAACGAATACGAGTTTGAGTCACGTTTATGCTCAACACCTAGATTTCTCAGTATTGTATGCTAAGAAGAGGGTTTAAAGGGTATATCTCCACTCACCA - -a -s mr.mrrefChr3 71284 173 + 181019 AACCCTCCAGGTTGTTTAAGCTAGGTTGCCAGGGTCAGGAATTCCCTACAGAGTCTTATAAGGACCTGGTATCCGAGTGACTGGGCATCCCAAGTTCATTGTGTTCACCTACTTCAATCCACAGTTTCTAGGCCATAGCAATAACCCACCATGCAATGTTTGCCAAGAAGCCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518933 156 + 636262 AACCCTCCAGGTTGTTTAAGCTAGGTTGCCAGGGTCAGGAATTCCCTAGAGAGTCTTATAAGGACCTGGCAT-----------------CCAAGTCCATTGTGTTCACCTACTTCAATCCATAGTTTCTAGGCCGTAGCAATAACCCACCATGCAATGTTTGCCGAGAAGCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 530295 173 + 647215 AACCCTCGAGGTTATCTAAAGTAGGTTGCCAGGGTCAGGAATTCCCTACAGAGTCTCATAAGGATCTGGTATCCGAGTGACTGGGCATCCCAAGTTCATCATGTTCACCTATTTCAATCCACAGTTTCTAGGCTATAGCAACGACCATCCATGCACTGTTTGCTAAGAAGCCG - -a -s mr.mrrefChr3 71457 26 + 181019 GGGCACAAAAATGTATTTGGGATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519091 26 + 636262 GGGCACAAAAATGTATTTGGGATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 530468 26 + 647215 GGGCACAAAAACATAATTGGGATTTG - -a -s mr.mrrefChr3 71483 24 + 181019 CTGGCAAAAAACATGCTCATAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519117 24 + 636262 CTGGCAAAAAACATGCTCATAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 530499 24 + 647215 CTGGCAAAAAACATGCTCATGACA - -a -s mr.mrrefChr3 71507 17 + 181019 AAAGGCAGGTGACACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519145 17 + 636262 AAAGGCAGGTGACACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 530523 17 + 647215 AAGGGCAGGTGACACAT - -a -s mr.mrrefChr3 71524 37 + 181019 GTGTTAGAGTATGAAGAGATTTTTTGTTACCCCCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519175 37 + 636262 GTGTTAGAGTATGAAGAGATTTTTTGTTACCCCCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 530540 21 + 647215 ----------------AGATTTTTTGTTAACCCCTTT - -a -s mr.mrrefChr3 71561 60 + 181019 GACGACTTATGCAAATGATAACAGGATTATGTCTGAATTTAAACAAATATGTGACACAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519213 60 + 636262 GACGACTTATGCAAATGATAACAGGATTATGTCTGAATTTAAACAAATATGTGACACAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 530561 60 + 647215 GACGACTTATGCAAATGATACCAGAATTTTGCCTTAGTCTCAACGAAAGCCACCCACAAC - -a -s mr.mrrefChr3 71621 8 + 181019 ATCGACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519273 8 + 636262 ATCGACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 530622 8 + 647215 ATAGACAT - -a -s mr.mrrefChr3 71629 54 + 181019 TGTATATTTTTTATTTTTCTGCAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519283 54 + 636262 TGTATATTTTTTATTTTTCAACAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 530630 54 + 647215 TGTATATTTTTGATTTTTCTGCAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTCAA - -a -s mr.mrrefChr3 71683 9 + 181019 TCAGCCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519338 9 + 636262 TCAGCCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 530684 9 + 647215 TCAGTCATA - -a -s mr.mrrefChr3 71692 334 + 181019 TGCACCAGGACCACCATGTACTGTGATTTCTGTATCTCTTCTTCTCACAGAGGAAATTAGTCAGCAATGGAGTAGGGTGATGGTTTTAGTAAGCTAGTCCAAAAAACATTTCCCTGTGAATCAATCTCATGATATGGTAGGTTCTGATTGTGATATTCAGTGACACCAGCCAGATCTTGAGTGTTTAGTTGTCTAGTCGCAGCCAAGGCACCATTGAGTTTGATAGTCAAGTTTTGTAACTGTCCTGGGGTTTAATTGAATCCAGCATAGACTACTATGATGTGGAGAAGTTAGTGAACTTGTATATCTTGCCTAGCCATTATTAGGTAATATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519347 306 + 636262 TGCACCAGGATCACCATGTACTGTGATTTCTGTATCTCTTCTTCTCACAAAGGAAATTAGTCAACAATGGAGTAGGGTGATGGTTTTAGTAAGCTAGTCCAAAAAACATTTCCCTGTGAATCATTCTCATGATC----------------------------ATGCCAGCCAGATCTAGAGTGTTTAGTTGTCTTGTCGCAGCCAAGGCACCTTTGAGTTTAATAGTCAAGTTTTGTAACTGTCCTGGGGTTTAATTGAATCCAGCATAGACTACTATGATGTGGAGAAGTTAGTGAACTTGTATATCTTGCCTAGCCATTATTAGGTAATATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 530702 334 + 647215 TGCACCAGGACCACCATGTGCTCTGATTTCTGTATCTCTGCTTTGCACAGGGGAAATTAGTCAGCAATGGAGTAGGGTGATGGTTTTAGTAAGCTAGACCAAAAAACATTTCCCTGTGAATCAATCTCGTGATATGGTAGGTTCTGATTGTGATATTCAGTGCCACTAGCGAGATCTTGAGTGGTTGGTTGTCTACTCTTGGCCAAATTACCATTAAGTTTGATAGTAAAGTTTTGTCACTGCCCTGGGGTTTAATTGAACCCTGCATAGGCTACTATGATAAGGAGAAGTTAGTGAACTTGTTCATCTTGCCTAACCATTATTAGGTAATATA - -a -s mr.mrrefChr3 72026 76 + 181019 CCCTTGTGAATCAGGTACAGTGATTTTATGCCGGCCTTGGCACCATCAaatagacatttggctgttagagaagaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519654 76 + 636262 CCCTTGTGAATCAGGTACAGTGATTTTATGCCGGCCTTGGCACCATCAaatagacatttggctgttagagaagaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 531036 76 + 647215 CCCTTATGAATCAGGTATAGTGATTTTATGCTGGCCATTGAACCATCAAATAGACACTCACTTGCCAAAGAAGAAG - -a -s mr.mrrefChr3 72102 76 + 181019 tccacgctccaaagaagcatttacaaaagtgtacattctcgtaactcgtctcaTGAAGCTTGTAAGGGATGTGCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519730 76 + 636262 tccacgctccaaagaagcatttacaaaagtgtacattctcgtaactcgtctcaTGAAGCTTGTAAGGGATGTGCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 531127 76 + 647215 tctacgctccaaagaagcatctacaaaagtgtacatgctcataacccgtcCCATGAGGATTGTAAGGGATGTACGT - -a -s mr.mrrefChr3 72178 65 + 181019 TGGTGAAGCCGCTGATATCTGCACTACAGTCTGCCCACTATAATTTCCCACACCCCACAACTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519828 65 + 636262 TGGTGAAGCCGCTGATATCTGCACTACAGTCTGCCCACTATAATTTCCCACACCCCACAACTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 531203 65 + 647215 TGGAGAAGCAGTCGATATGTGCACATAGGTCTGCCCACTATAAGTTCCCACACCTTTCTACTAAC - -a -s mr.mrrefChr3 72243 141 + 181019 GTGGGAGCGATACTCTGAAGAGCCATTAGAAGGACTTAAGAAGCCTAATATATGAGAAGGACAGTACAGAAACCTATCATAGTGGAAAAGCACATGAAGAGGACCAGCACTCAAACTCTGAAGAGCCATAACGTGGACAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519893 141 + 636262 GTGGGAGCGATACTCTGAAGAGCCATTAGAAGGACTTAAGAAGCCTAATATATGAGAAGGACAGTACAGAAACCTATCATAGTGGAAAAGCACATGAAGAGGACCAGCACTCAAACTCTGAAGAGCCATAACGTGGACAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 531269 141 + 647215 GTGGGGGTGTTACTCTGAAGACCCATGAAAAGGACTTAAGAAACCTAAGATATAAGAAGGATGTTTCAGAAGCCTAATGCAGTGGAGAAGCACACGAAGAGGACCAGCAGTGAAACTCTGAAGAGTCATAACACGGACAAT - -a -s mr.mrrefChr3 72384 23 + 181019 CAAGAAACACAATATAGTGGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520034 23 + 636262 CAAGAAACACAATATAGTGGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 531453 23 + 647215 CAAGGACAATCATATATTGGGGA - -a -s mr.mrrefChr3 72407 113 + 181019 GAAAGCGGTCATGGTCATAAGTGCCATCTCCAAGTACACCTAATATGGTGAGGGAACAAAAACAGTCAAGTAATCCTCACATGGCATGATGGACAGGAGAATGCAGGTAAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520064 113 + 636262 GAAAGCGGTCATGGTCATAAGTGCCATCTCCAAGTACACCTAATATGGTGAGGGAACAAAAACAGTCAAGTAATCCTCACATGGCATGATGGACAGGAGAATGCAGGTAAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 531476 113 + 647215 GAGAACGGCCATACTCAAAAGTGCCACCTTCAAGTACACCTAATATAGTGAGTGAACAAAAAGAGTCTAGTAAACCTCTCATAGCATGATGGACAAGAGCATTCAAGTAAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 72520 49 + 181019 CAAGCAAACCTCATCTGGTATAAAGGAGCATAAGAGATAGATTGTATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520177 49 + 636262 CAAGCAAACCTCATCTGGTATAAAGGAGCATAAGAGATAGATTGTATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 531602 49 + 647215 CAAGTAAACCTCATTCGGTATGAAGGAGCATAAGAAATAGATTGTATTA - -a -s mr.mrrefChr3 72569 12 + 181019 TAGTCAGACTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520226 12 + 636262 TAGTCAGACTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 531654 12 + 647215 TAGTAGGAGTAG - -a -s mr.mrrefChr3 72581 17 + 181019 ATGAAATGCATGTGCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520238 17 + 636262 ATGAAATGCATGTGCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 531669 17 + 647215 ATGAAATGCATGTGTGA - -a -s mr.mrrefChr3 72598 39 + 181019 TCAGTTTTTCCATCAACCAGACATCTTACCACTAAATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520256 39 + 636262 TCAGTTTTTTCATCAACAAGACACTTTACCACTAAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 531686 39 + 647215 TCAGTTTCTCCATCAAACAGGCATCTTACAACCGAATCT - -a -s mr.mrrefChr3 72637 19 + 181019 AATGTGTTACCTGTTGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520295 19 + 636262 AACGTGTTACCTGTTGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 531726 19 + 647215 AATGTGTTACCTGTTGTCT - -a -s mr.mrrefChr3 72656 163 + 181019 AATCACATTACAGTGTTACAGATGGTTCTCTCTTTGAGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTCAATACCACTCATGCTGATAGAAATCACTAGTCTGCCAGCTTTGGCAGTGAGTGGTGCATTTGGGCCATAAGGTATGTTACTATGCTTGCTATGTAGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520315 149 + 636262 AATCACACCACAGCGTTACAGATGGTTCTCTCTTTGCGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTCAATACCACTCATGCTGATGGAAATCACTAGTT--------------GTGAGTGGTGCATTTGGGTCATAAGGTATGTTACTATGCTTGCTATGTAGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 531745 163 + 647215 AATCACATTACAGTGTTACAGACGGTTCTCTCTTTGAGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTGAATACTACTCATGCTGATAGAAATCATTAGTCTGCCAGCTTTGGCAGTGAGTGGTACACTTGGGCCATAAGGTATCTTCCTATGCTTGCTATTTAGTAT - -a -s mr.mrrefChr3 72819 100 + 181019 TAATGTAGCCTTGTGTTTCTCCTGTGTCTAGTTACCTGACAGAATTTCCACTCAGTTAAATACGAACCCAGCCACTTCAAATGTCAAGTGACAGTAGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520465 100 + 636262 TAACCTGGCCTTGTGTTTCTCCTGTGTCTAATTAACTGACAGAATTTCCACTCAGTTAGATACGAACCCAGCCACTTCAAATGTCAAGAGACAGTAGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 531908 100 + 647215 TAATGCACCCTGGTGTTTCTCCTGTGTCTAGTTACCCGAAAGAGTTTCCATTCAGTTAAATATGTATCCAGCCACTTCAAATGTAAAGTGACAGTAGTAT - -a -s mr.mrrefChr3 72919 7 + 181019 AGGGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520565 7 + 636262 AGGGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 532011 7 + 647215 AGAGACA - -a -s mr.mrrefChr3 72926 8 + 181019 GTGGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520573 8 + 636262 GTGGTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 532018 8 + 647215 GTAGTATA - -a -s mr.mrrefChr3 72934 151 + 181019 AGGATCTAACCATAGTGTTGTCAGAGGATTGAACTTCACCATTGAGAGTAGCTTATACCATGATGAAATCTTGCTTTAATATGTTGTTCTTGCAGTTCCTCTGAGAGGCCTGCCCCTCTCAGGCAATTACCAAATATACCATGCATTAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520594 151 + 636262 AGGATCTAACCATAGTGTTGTCAGAGGATTTAACTTCACCATGGAGAGTAGCTTATACCATGATGAAATCTAGCTCTAATATGTTGTTCTTGCGGTTCCTCTGAGAGGCCTGCCCCTCTCAGGCAATTATCAAATATACCATGCATTAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 532026 150 + 647215 GGGGTCTAACCATAGTGTTGTCGGAGGGTTGAACGTTATCCGTGAGAGTAGCTGATATCATGATGAAATCTTGCCTTAATATGTTGCTCTTGCAGTTCCTCG-AGGGACCTGCCCCTCCCAGGGAATTACCAAATGTCCGATGGATGGGAT - -a -s mr.mrrefChr3 73085 99 + 181019 TCCCCAAATAGCAACTTAATGGTCAACTATACAGGGCCATGTAGTACCTGGATGCTAGATTATGTAAAGGGATGCTGCCTTGGCTAAAGAAACAAGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520747 99 + 636262 TCCCCAAATAGCAACTTAATGGTCAACTATACAGGGCCATGTAGTACCTGGATGCTAGATTATGTAAAGGGATGCTGCCTTGGCTAAAGGAACAAGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 532176 99 + 647215 TCCCCAAATAGCAACTTAATGGTCAACTATACAGGGCCATGTACTACCTGGAGGCTAGATTACGTAAGGAGATGCTGCCTTGGCTAAAGAAATAAGAGG - -a -s mr.mrrefChr3 73184 734 + 181019 GACTTACACAGTATATAAATACACAGAAAGCACCTGGTGAGCAGCAGAACAGACAGATACACAGCTGCAGGCATTAGACTGCACGCAGGTATCTAACACTGGCATATAGGGAATCTCAAGGACTTTAGAATATTTCAAGCAAGAGTCTCCCAAAAATGGTGGCAACTAGAGTGGTCTTTAATATGAGGCATGTAAGGTTTTAGGAAATAGGTGAAATGCGGCCTTGTCACTGTAATGCTTTTTTGGCCTCAATTGAATTAATTGTATGCTCATTGGATAGAAGTCTTGCAACTTGAGAACTGGAGACTGGAGGTTGGTGCTAAGTTATGATCCTGCTAAATCAGATGGCACAGGAGGTTAAAGTCCATTGAGCCTCATGGTGAAAGGTTAAAGTCTATAATGAAAAATAAAGATAAGGGAGACCCATATGGTTTGTTGGTATGGAAGATATGGTAGGTGAGTAGGAGGCCCATACACTTTATCCCCCCACAGAATACAGGGCAAAACTGTTGTTATTATATTTTGTGGGTCACAAATGGAGCATAAAAGACACTTGTACAAGTGAACACCAGTACCTATCAGCATGCACATGACAAAATGACAAGGTCATTTTAAGTACTAACTAAACAAATATGGTATTTGTCTCAAAGGTACAATGTGGTGGTATCTGGCATTATCACAGCATAAACTATGACTGGTGCAAGTTAGTTATTAGCCGGGGGGACATGTACATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520846 719 + 636262 GACCTAAACAGTATATAAATACACAG---GCACCTGGTGAGCAGCAGAACGGACAGATATACAGCTGTAGGCATCAGACAGCACACAGGTATCTAACACTGGCGTTTAGGGAATCTTGAGGACTCTAAG-----------AAGAGTCTTCCAAAAATGGTGGCAACTGGTGTGGTCTTTAGTAAGAGGCATGTAAGGCTTTAGGAAATAGGTGAAATGTGGCCTTGGCACTGTAATGCTTTGTTGGCCTCAATTGAATTAATTGTCTGCTCATTGGATAGAAGTCTTGTAACTTGAGAACTGGGGACTGGAGGTCGGCGCTAAGTTATGATCCTGCTAAATCAGATGCCACAAGAGGTTAAAGTCCATTGAGCCTCATGGTGAAAGGGCAAAGTCTATAATGAAAAATAAAGATAAGGGAGACCCATATGGTTTGTTGGTATGGAAGATCTGGTAGCTGAGTAGGGGGCCCATACACTTTATCCCCCCACAGAGTACAGGGCAGAACTGTTGTTATTATATCTTGTGGTTCATAAATAGAGCATAAAAGACACTTGTACAAGTGAACACCAGTCCCTATCAGCATGCACAAAACAAAATGACAAGGTCATTTCAAGT-CTAACTAAATAAATATGGTATTTGTCTCAAAGGTACAATGTGGTGGTATGTGGCTTTATCACAGCATAAACTATGACTGGTGCAAGTTAGTTATTAGCCGGGGGGACATGTACATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 532276 730 + 647215 GATTTACACAGTATGAAAATACACAGAAAGCACCTGGTGAGCAGCAGAACAGACAGGGACACAGCTGCAGGCATTGGACTGCCCGCAGGTATTTAACACTGA-ATATCGAGAACCTCAAGGACTTTAGAATATTTCAAGCAAGGGGCTCCCAAAAATGGCGGCAGCTAGAGTGGTCATTAATATCAGGCATGTAAGGTTTCAGGAAACAGGTGAAATGCAGCCTTGTCACAATAATGCATCTTTGGCCTCAATTAAATTAATTGTATGCTCATTGGATAGAAGTCTTGCAACTTGAGAACTAGAGACTGGAGCTTGGTGCTAAGTTTTGATCCTGCTAAGTCAGATGGCACAGGAGGTTAAAGTCCACCGAGCATGATGATGAAAGGTTAAAGTCTATAATGAAAAATAAAGACAAGGGAGACCCATATGGTTTGTCAGTATGGAAGATATGGTAAGTGAGTAGGAGGCCCATACACTCTATCCCCCCACAGAATACAGGGCAAAACTGTTGT--TTATATTTTGTGGGTCGCAAATGCAGCATAAAAGACACTTGTACAAGTGAACACCAGTACCTATCAGCATGCACATGACAAAATGACAAGGTCATTTTAAGTACTAACAAAACAAATATGGTATTTGTCTCAAAGGCAC-ATGTTGTGGTATCTGACATTATCACAGCATAATCTATGACTGGTGTGAGCTCGTTATCAGCCACAGGGACGTGTATATA - -a -s mr.mrrefChr3 73918 14 + 181019 GCTGTTCCAAGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 521858 14 + 636262 GCTGCTCCAAGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 533006 14 + 647215 GTTGTTCCAAGTGC - -a -s mr.mrrefChr3 73932 216 + 181019 CTACACAAATAAGTATAAGGAGACTGTTATAAAAGTGCTTATAGCTCATATCCCCTCAATTTACAACACAGAACCAGAGTTGTCCAAATAGTGGTTCTCTAGGCATGGCTTAAATAAATAAGGGCTTAATAATTGGACAATAAAGTTCACATAGAGTGGCAGATTTGTTCCAAATTTAGTGTAAATCATCTAGGGTGGACCCCTGACCTGGTTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 521879 216 + 636262 CTACACAATTGAGTATAAAGAGGCTGTTATAAAAGTGCTTATAGCTCATATCCCCTCAATTTACAACACTGAACCAGAGTTGTCCAAATAGTGCTTCTCTCGGCGTGGCTCAACTAAATAAGGGCTTAATAATTGGACGATTAAGTTCATATAGAGTGGCAGATTTGTTCCAAATTTAATGTAAACCATCTAAGGTGGACCCCTGACCTGATTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 533020 216 + 647215 CTACACAAACACGTATGAGGAGATTGTTCTAAAAGTGCTTATAGCTCATGACCCCTCAATTTACAACACAGAACCAGAGTTGTCCAAATAGTGGTTCTCTAGGCATGGTTTAAATAAATAAGGGCTTAATAATTGGACAATAAAGTTCACTTAGAGTGACAGACTAGTTCCAAATTTAGTGTAAATCATCTAGGGGGGACCCCTGGCCTGGCTGGC - -a -s mr.mrrefChr3 74148 55 + 181019 GAATGGCAAAGATCAATGCCCCATGACTACATGTAAATATCTGACACTTATGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522095 55 + 636262 GAAGGGAAAAGTTCAACGCCTCATGACTACATGTAAATATCTGACACTTATGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 533241 55 + 647215 GAATGGCAAAGATTAATGCCCCATGACTACATGTAAATATTTGACACTTATATTT - -a -s mr.mrrefChr3 74203 251 + 181019 ACACAATAGCCTGTTCAAGATTTCTTCTTCAGTTAATGTGATGGTTGGGAACAACATGTTAGTTTTGATGAACATCTGGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATGGAACCAAGAAATTAAAAGAAGTAGAAGAAAACTTAACTGCACATGAGGGAAAGACATCCTTGTTCTTCTGAGAACAGTATTGATATGATTGGCAATTGTATTTAGTAGTTGTACATGACCTCACAAGTAAGCTGAATCCCAAGTCCAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522166 242 + 636262 ACACAATAGCCTGTTCAAGATTTCTTCTTCAGTTAATGTGATGGTTGGGAACAACATGTTAGTTTTGATGAAAATCTGGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATGGAACCAAGGCAATAAAAGAAGT-GAAGAAGCCTTAACTGCACATGAGGGAAAGACATCCTTGTTCTTCTGAGAACAGTATTGATATGATTGGCAATTGTATATA--------ACATGACCTCACAAGTAAGCTGAATCCCAAGTCTAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 533296 251 + 647215 ACTCAATAGTCTGATCAAGATGTCTTCTTCAGGTAATGTGATGGTTGGGTACAACATGTGAGCTTTGATGAACATCTAGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATTGTACCAAGAAATTAAAAGAAGTAAAAGAAAACTTAACTGCACATGAGGGGAAGACATCATTGTTCTTCTGAGAACTGTATTGATTTCATTGGCAGGTGTACTTAGTAGTTGTACATGACCTCACAAGTAAGCTGTATCCTAAGTCCAAGC - -a -s mr.mrrefChr3 74454 14 + 181019 AGAAACAGAGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522408 14 + 636262 AGAAACAGTGTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 533550 14 + 647215 ATAAACAAACCACT - -a -s mr.mrrefChr3 74468 40 + 181019 ATAAACAGTGTGTGTAGGTGCAACATGCATTCAATCAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522437 40 + 636262 AGAAACAGTGTATCTAGGTGCAACATGCATTCAATCAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 533564 39 + 647215 ATAAACAGTGTGTGTAGGTGCAACATGCACTC-ATCAATA - -a -s mr.mrrefChr3 74508 249 + 181019 AAATGTTAGTAGACAGATGAGGCTAATCAACTAGCTAACCTTTACAATGTCATACCTAAGTGCGAGTGGGAACAAACATACAGGATTTTGTCCATAATTGTGCCAGATACCTAAATCAGTGGCATTTTATCTGCCTACTTCCCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGGCTTACTAGCACGACCACATCATTGCAGCACACATCCAAATGGGGATCAACTCCCATGTGTTATATGGCATATTAGAAGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522481 249 + 636262 AAATGCTAGTAGGCAGATGACTCTAATCAACTAGCTAATCTTTACAATGTCATACCTAAGTGCGAGTGGGAACAAACATACAGGATTTTGGCCATAATTGCACCAGATACCTAAATCAGTGGCATTTTATCTGCCTACTTCCCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGGCTTACTAGCACGATCACATCATTGCAGCACACATCCAAAGGGGGATCAACTCCCATGTGTTATATGGCATATTAGAAGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 533603 249 + 647215 AAATGTTAGTAGATAGCTGAGGCTAATCAACTAGCTAACCTTTACAATGTCATACCTGAGTGCGAGTGGAAACCAACATACAGGATTTTCTCCATAGTTGTGCCAGATACCTAAATCAGTGGCACTTTATCTGCCTACTTCTCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGCCTTAATAGAACCACCACATCGTTGCAGCACGCATCCAAATGGGGATCAACTCCCATGTGTTAGATGGCATGTCAAAAGAAG - -a -s mr.mrrefChr3 74757 66 + 181019 CAGCAAAAACTGAAATGGACGGGTGTGCAAATCTTTGATACAATGTAAGTCTATGACTCATGAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522731 66 + 636262 CAGCAAAAACTGAAATGGACGGGTGTGCAAATCTTTGATACAATGTAAGTCTATGACTCATGAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 533852 66 + 647215 TGGCAAAAACAGAAAGAGATGGGCGTGCAAATCTTCGATACAATGTAAGTATATGACTCATGAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 74823 159 + 181019 CTGGAAATTGGTTATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAGTTCTTTCTTGGGCAGGGCTATTCACACACTCACTTGCCAAAAGGAATGACCATTTACTACTTACCTTCCACCTAACCCATGAATAATTAAATAACAACCCTGCATTGGTACAAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522998 159 + 636262 CTGGAAATTGGTTATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAATTCTTTCTTGCGCAGGGCTATTCACACACTCGTTTGCCAAAAGGAATGACCATTTACTACTTACCTTGCACCTAACCCATGAGTAATGAGATAACAACCCTGCATTGGTACAAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 533918 158 + 647215 CTGTAAATTGGTGATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAGTTCTTTCTTGGGCATTTCCATTCACACACTCACTTGCCAACAGGAATGACTATTCACTATTTACCTTCCA-CTAACCCATGAATAGTTAAATCACAGCTGTACATTGGTACAAGAC - -a -s mr.mrrefChr3 74982 65 + 181019 AATATCCATGAGAAGCTCTGAATGGCACAAGTGGCCCTATCATCAATAAATCAATGTTTCCCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523157 63 + 636262 AATATCCATGAGAAGCCCTGAATGGCACAAGTGTCCCCATCATCAATGAATCA--GTTACCCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 534119 65 + 647215 AATGTCCATGAGAAGCTCTGCATGGCACAAGTGGCCCTATCATCAACAAATCAATGTTTCCCTGA - -a -s mr.mrrefChr3 75047 125 + 181019 CTGTCAGAATATTGTACTGATCACATTACATCAGGACACAATTTTTATTTTACTGTCAGCAGCAACTAGGGGATAATTGCGTTTAGTTTCCCTACTTAGAAATGAAGTGTCTTGAACAGGTGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523220 125 + 636262 CTGTCAGAATACTGTACCGATCACATTACATCAGGACACAATTTTTATTTTACTGTCAGCAGCAACCAGGGGATAATTGCGTTTAGTCTCCCTACTTAGAAATGTAGTGTCTTAAACAGGTGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 534185 124 + 647215 CTGTCAGAATATTGTACTGAGCACACTACATCAGGACACAATTTTTA-TTTACTGGCAGCAGTAACTGGGAGATAATCACATTTAGTTTCCCTGCTTAGAATTGAATTGTCTTGAACTGGCACAT - -a -s mr.mrrefChr3 75172 180 + 181019 GTACCCTCTAGCACCTATATGGTGAAATCCAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAACTAGTTTATTGTTTCTCCGTTGAGATTCACACTTAAGATCCACCTGACCTTAGGTGATCTCCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATGCCTACTAATTCAATGCATCCTTTGATGATACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523346 173 + 636262 GTACCCTCTAG-------ATGGTGAAATCAAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAACTAGTTTATTGTTTCTCCGTTGAGATTCACACTTAAGATCCACCTGACCTGAGGTGATCTCCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATGCCTACTAATCCAATGCATCCTTTGATGATACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 534309 175 + 647215 GTACCCTCTAGCACCTATATGATGAAATCCAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAGCTATTTTATTGCTTCTCTGTTGAGATTCACACTTAAGATCCG-----CCTTAGGTGATCTTCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATACCTACTAATTGAATGCATCCTTTGATGATACAT - -a -s mr.mrrefChr3 75352 121 + 181019 TGCGGAGGGTAAATGCCCATGCCACTCGTTACTAGACTACCCTAAGCTTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTACTTAACTATATTGCTTTGTGACAAAGTTTTGACATTAGACTATTATAGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523529 121 + 636262 TGCAGAGGGTAAATGCCCATGCCTTTTGTTACTAGACTACCCTGAGCCTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTATCTAACTATATTGCTTTGTGACAGAGTTTTGACATTAGACCATTATAGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 534484 119 + 647215 TGCGGAGGGTAAATGCCCATGCCACTCGTTACTAGACTACCCTATGCTTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTACTT-ACTATATCGCTTTGAGACAAAGTTTTAACA-TAGACTATTATATGGA - -a -s mr.mrrefChr3 75473 320 + 181019 TTTTGGTGCCATTTTTTGCTTCAGACTACCATGCTAACTGGACATGAGGACTGGCTGGAATCTAGGCCATTCCAGTAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGAGCTCTTATGTGCAGCAGACCACAAATTCATGAGAAATAGTCTTTCCAGAGCCATTTTGCTACTTATACATGAACCCGGTTCTCTAAATTGATTCCCAATGCAGATGAAATATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAGAGCAAATGTGTAACATTCATAGGTTTATAGTTTTCTGTTCCTACATCCTTAGTGCCAGACCATCCGACTTCCAGCCACTTGGACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523704 315 + 636262 TTTTGGTGCTGTTTTTTGCTTCAGACTACTGTGCTAACTGGACATGAGGACTGGCTGGAATCTAGGCCATTCCAGTAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGTGCTCTAATGTGCAGCAGACCACAAATTCATGAGAAGTAGTCTTTCTAGAGCCATTTTGCCACTTATACATCAACCCAGTCCTCTAAATCGATTCCCAATGCAGATGAAATATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAAAGCAAATGTGTAGCATTCATAGGTTTATAGTTTTCTGTTCCCACATCCATAGTGCCAGACCATCCGACTTCCAGCC-----GACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 534603 306 + 647215 TTTTGGTGCCATTCTTTGCTTCAGACTACCATGCTAATTGGACATGAGGACTGGCTGCAGTCTAGGCCATTCCAGCAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGAACTTCTA-------------ACAAATTCATGTGAAATAGCCTTTCCAGATCCATTTTGCTACTCATTCATGAACCTGGTTCTCCAGATTGATTCCCAATGCAGAGGAAGTATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAGAGCAAATGTGTAACATTTGTAGGTTTATAA-TTTCTGTTCCTAAATACTTAGTGCCAGTCCATCCAACTACCAGCCACTTGGACCA - -a -s mr.mrrefChr3 75793 214 + 181019 GCCCTTCCACAAGCTGCCATGGCCCAAATCTTAAAGTGTTGTCATTACAAACATGACAGGGCGCAGCCGTCTAGGAGGTCGAGAGTTGTGAGGGCGTACACTAATGACTCACACTCATGAAAGCATTATAGATTACTTGTGTATGGAGCATGGCCTTGTGTTATCTTCCAAGCACCATTCCTGCCAGGTGTGAATTGACACACTGGGCAGCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524022 214 + 636262 ACCCTTCGACAAGCTGCCATGGCCCAAGTCTTAAAGTGTTGTCATCACAAACATGACAGGGCGCAGCCGTCTAGGAGGTCGAGAGTTGTGAGGGCGTACACTAATGACTCACACTAATGAAAGCATTATAGATTACTTCTGTGTGGAGCATGGCCTTGTGTTATCTTCCAAGCACCATTCCTGCTAGCTGTGAGTTGACACACTGGGCAGCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 534909 211 + 647215 GTCCTTCCACAGGCTGCC---GCCCAAATCTTAAGGTTTTGTCATTACAAACATGACAGGGCCCACCCGTCTAGGAGGTTGAAAGCTGTGAGGGTGTACACTAATGACTCACACTCATGAAAGCATTATAGAATACTTGTGCATGGAGCATGTCCACCTATTATCTTCCAAGCACCATTTCTGCCAAGTATGAATTGACATACTAGCCATTCAC - -a -s mr.mrrefChr3 76007 149 + 181019 ATCCTGGTCTGAAGTGAAAAGGTACCATATAAAAGAAAGTTATGGGGACACATTCTCCATAGTATCAATAGGGTAATCATAGTCTTAGGAATTCCAAATTGTATCAAATTTTGACACAGTAAGCGGACACCTTCACATGTTAGAGGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524236 149 + 636262 ATCCTGGTCTGAAGTAAAAAAGAGCCATATAAAAGAGAGTTATGGGGAAGCATTCTCCATAGTATCAATGGGGTAATCATAGTCTTAGGAATTCCAAATTGTATCAAATTTTGACACAGTAAGCAGACACCTTCACATGTTAGAGGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 535178 142 + 647215 ATCCTG-------GGGACCAGGTACAGTAATGGAAGAAATTATGGGGACACATTCTTGATAGTGCCAACAGGGTAACCATAGTCTTAGGAACTCCATATTGTAACAACTTTTGACACAGTAAGAGGACACCTTCACATGTCAGAGGACA - -a -s mr.mrrefChr3 76156 162 + 181019 CGCTAAACTCCCCCAGATGCAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTTCAATGTGTTGTAATGCAGAAGTGAATGATGAGATATGGATGCATGCACATACTTCAAGCCTATCTTGGATGGTAAAATTTGTGAAACTTAACAGCTTCTATTGACTGGAAGGAAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524385 149 + 636262 -------------CAGACACAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTCTGATGTGTTGTAATTCAGAAGTGAATAATGAGATATGGATGCATGCACTTACCTCAAGCCTATCTTGGATGGTAAAATTTGTGAAACTTAACAGTATCTATTGACTGGAAGGAGAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 535324 161 + 647215 CGCTAAACTCCCCCAAATGCAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTTCAATGTGTTGTAATGCAGAAGTGAATGATCAGATATAG-TATGTGTGCATACTTCAATCCTATCTTGGATGGTACGATTTGTGGGACTTAACAGCTTCTATTGACTTGAAGGAAGAAG - -a -s mr.mrrefChr3 76318 101 + 181019 TATTATAATTCTTTATAGCTACATTTGCATCACAGTTACAGGTGAGGTGATACATTAGCAGTTGGACAATGATGAAAGAGTCTATTGGGTTTAAGAACTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524535 96 + 636262 TATTATAATTCTTTATAGCTACACTTGCATCACAATTACAGGTGAGGTGATACATCAGCAGTTGGATAATGATGAAAGAGTTCATTGGGTTTAAGA----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 535485 101 + 647215 TATTATAATTCTTTATGGCTACATTTGCAGCACAGTTACAGGTGAGGTGATACATTAGCAATTGGACAATGTTGAAAGAGTCTATTGGGTTTAAAAACTCA - -a -s mr.mrrefChr3 76419 5 + 181019 CCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 535587 5 + 647215 CCAAG - -a -s mr.mrrefChr3 76424 94 + 181019 CAATCAATTCTGATATCAATAATATGCCAGTTTTGTCCCTTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAGTTAATCCAATATTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524631 92 + 636262 CAATCAATTCTGATATTAATAATAAGCCAGTTTTGTCCCTTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAATAACACC--TATTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 535593 94 + 647215 CAATCTATTCTGATATCTATAATATGCTAGTCTTGTCCATTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAGTTAATCCAATATTGA - -a -s mr.mrrefChr3 76518 233 + 181019 ATGAGGATCATATACTCATCAGCACAAAGAATAAAACTAAACTTAAATGGATACTATGCCTTATCAATAAAAGTTGTTAGGGACCATGTTAGAAAACCAGTGTTAGGCTGGAGTCCTTAAGAAGGCTGGTCACTCAACTGGAGCCTTGGGTGGCCTCCAATCTCAGTTCAAATTTGAGCTACTGGATGGATTAATAGTTTGCTGTAGACAGTGAAGGAGCCATAATACTAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524723 217 + 636262 -------------ACACATCTGCACAAAGAATAAA---GAACTTAGATGGATACTATGCCTTATCAATAAAAGTTGTTGGGGACCATGTTAGAAAACCAGTGTTAGGCTGGAGTCCTCAAGAAGACTGGTCACTCAACTTGAGCCTTGTGTGGCCTCCAATCTCAGTTCAAATTTGAGCTACTGGATGGATTAATAGTTTGCTGTAGACAGTGAAGGAGCCATAATACTGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 535692 232 + 647215 ATGAGGATCATATACTCATTAGTACAAAGAATAAAACTAAACTTAAATGGATACTATGCCTTATCAATTAAAGTTGTCAGGGACCATGGTAGCAAACCAGTGTTAGGCTGGAGACCTTAAGAAGGCTGGTCACTCAACTGTAGCCTCGGGTGACCTCAAATTCCAGTTCAGGTTTGAGCTATTGGTTGTATTAATAGTTTACTGTAGACATTTAA-GAGCCATAATACTAGGA - -a -s mr.mrrefChr3 76751 37 + 181019 CTGCCATGCACTGTAGCACATCCTGCATACCTGAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524940 37 + 636262 CTGCCCTGCACTGTAGCACATCCTGCATACCTGAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 535925 37 + 647215 CTGCCACACACTGTATCACATCCAGCGTACCTGAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 76788 125 + 181019 GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGGGAGTGTAGTGAGTAAATAGCCTAGTAATGGGCTGTTTCTGTGATCAACATCATGTTCCCCTGATACTACTTCCCAAGGAGTCACTCTGTCATGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524978 125 + 636262 GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGGGAGTGTAGTGAGTAAATAGCCTAGTAATGGGGTGATTCTGTGATCAACATCATGTTCCCCTAATGCTACTTCCCATGAAGTCACTCTGTCATGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 535962 125 + 647215 GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGAGGGTTTATTGGTTAAATAGCCTAGTAATTGGCTGTTTCTGTGATTGACATTATGTTTCCCTGATACTAATTCCCAAAGAGTCACTCTATAATGATG - -a -s mr.mrrefChr3 76913 177 + 181019 TACCATTACCTGATAGTTAAATACTACCAGTTCACTGAAAAACCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTTCACTAAGCTGTTACAGGTGAGTTAGAGCCCTATCTCCCTTTACTGGACTGTACCCTTGGAATAGGCAAGGATCAATAGGAAGCTCTGGATCAGTACTATTTATATGTTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525105 176 + 636262 TACCATTATCTGGTAGTTAAATACTACCAGTTCACTGAAAAACCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTTCACTAAGCCGTTACAGGTGAGTTAGAGCCCTATCTCCCTTTACTGGACTGTACACTCGG-ATGGGTAAAGATCAATAGAAAGCTCTGGATCAGTACTATTTATATGTTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 536087 175 + 647215 TACCATTACCTGATAGTTAAATACTACCAGTTCATGGAAAACCCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTCCATTAAGCTGTTACAGGTGAGTTATAGCCCTACCTCCCTTTACTGGACTATACCCATGGAAAAAGCAAGGATCAATAGGAAGCTCTGGG--AGTACTATTGATATGTTGGG - -a -s mr.mrrefChr3 77090 66 + 181019 CATTGCTATCAGAGGATAAGTGCACAGATGACAGGTGCACTCAGGGAGGCTAAGGAGGGAATGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525281 45 + 636262 -------GGTAGAGGACAAGTGCACAGATGACAGGTGCACTCAGGGAGGCCA-------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 536265 66 + 647215 CATTGCTATCAGAGGATAAGTGCACAGTGGACAGGTGCACTCAGGGAGGCTAAGGAGGGAATGGCT - -a -s mr.mrrefChr3 77156 12 + 181019 GTGCAGTTAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 536365 12 + 647215 GTGCAGTTAATT - -a -s mr.mrrefChr3 77168 224 + 181019 TAAGTGAATAAAAGAGAACATAGTGAACAAAGAGGGGCATATGTCTTGAAAAATTGTTTCCCTGAAGGACGATCAGAGAACTACCACATACAGCAGCAAGACTTTTGGAATTGCCCAAGATTATGCAACCACCCTGCTGCCTCTAGGGGCCTTCTTTTCTAATCAGAGTAATGACTTGGGGTAAGGGTCTACACCCTTAGAAAAAGGGCCGGAGTAATAAAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525326 198 + 636262 TAAGTTAATAAAAGAGTAATTAGTGAACAAAGAGTGGCATATGTCTTGAAGAATTGTTTCCTTGAAGAACGATCAGAGAACTACCACATACAGCAGCAAAACTTTTGGAATTG-------TTATTCAACCACCCTGCTGCCTCTTGGGGCCTTCTTTTCTAATCAGAGTAATGATTTGGTGTAAGGGTCTACACCCTTAGATAAA------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 536378 224 + 647215 TAAGTGAATAAAAGAGAACATAGTGAACAGAGAGGGGAATATGTATTGAAAAATTGTTGCCCTGAAGGACAATCAGAGAATTACCACATACAGTAGCAAGACTTTTGGAATTGCCCAAGATTATGCAACCACTCTGCTGCCTCTAGGGGCCCTCTTTTCTAATCAGAGTAATGACAAGGGGTAAGGGTCTGCACCATTAGAAAAAGGGCCGGAGTAATAAAAAT - -a -s mr.mrrefChr3 77392 25 + 181019 TCCAGAGGAGGTTGGTGAAATGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525524 25 + 636262 TCCAGAGGAGGTTGGTGAAATGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 536606 25 + 647215 TCCAAAGGAGGATGGTGAAATGTAC - -a -s mr.mrrefChr3 77417 47 + 181019 AAAAATTACCTCCAAAGAGGGACGGTGAAATGTACAGATCAATGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525550 44 + 636262 AAAAATTACCTCCAAAGAAGGACGGTGAAA---ACAGATCAATGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 536631 46 + 647215 GAAAATTACCTCCACAG-GGGAGGGTGAGATGTACAGATCAATGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 77464 145 + 181019 TACCTATATCCATAGTTGTTTAAGATCTTGACTGTCTTGCCTACCAAAAACTACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCCTGCAGGACAATAACTTGTGAGTAATGTCATTCTGTGGTCACTGCCTTCCTATCTCAGTTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525594 145 + 636262 TGCCTATATCCATAGTTGTTTAAAATTTTGACTGTCTTGCCTACCAAAAACGACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCCTGCAGAACAATAACTTGTGAGTAATGCCATTCTGTGGTCACTGCCTTCCTGTCTCAGAAGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 536697 145 + 647215 TACCTACATCCATAGTTGTTTAAGATCTTGACTCTCTTGCCTACCAAAAAATACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCTTGCAGGACAATAACTTGCGAGTAATGTCCTTCTGTGTGTACTGCCTTCCTATTTGAGTTGAGT - -a -s mr.mrrefChr3 77609 310 + 181019 GGGCAATAAGGGTAGGAGGTGAATAAAATTTTTGAATAAAACTCTAGGTTGACACTCATCAGTGACACACATGCATGCATTCCTGCCATGCACAGGGAAGCATTGCATTGGCTAATCAAAGAGATGAGTAACTATATATGGTATAGATCAACTCTATCTTCCACAACAAATAAGCAGCCTTTTAATGGTGTGCTGTGGAATCTTTTGTTCTCATTGCCATCTGTTATCATTTAATCTGCAGCATATCTCAAGAAACAGTTAAAGGTCTGCAGAACAGGAAGGACCACATGTGTTTTTTCTTTATTACCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525741 271 + 636262 GGGCAATAAGGGTAGGAGGTGAATAAAGTGTTTGAATAAAACTCTAGATTGACACTTATCAG-------------------------------------GCGTTGCGTTGGCTAATCAAAGAAATGAGTAACTGCATATGGCATAGATCAACTCTATCTTCCACAACAAATAAGCAGCCTTTTAGTGGTGTGTTGT--AATCTTTTGTTCTCATTGCCATCTGTTATCATTTGATCTGCAGCATATTTTGAGAAACACTTAAAGGTCTGTAGAACAGGAAGGACCACATATGTTTTTTCTTTATTGCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 536842 310 + 647215 GGGCAATAAGAGTAAGAGGTAAATACAACTTTGAGATAAAACACTAGGTCAACACTCATCAGTGACACACATGCATGCATTCCTGCCATGCACAGGGAAGCATTACATTGGCTAATCAAAGAGATGAAAAACTATATATGGTATAAATCAACTCTTTCTTCCACAACAAATAAGCCGCCTTTTAATGGTATGCTGTGGAATCTGTTGTTCTCATTGCCATCTGTTGTCATTTAATCTGCAGCCTATCTCAAGAACCTGTTAGAGGTCTGCAGAGCAGGAAGGACAACATGTGTTTTTTCCTTATCACCCT - -a -s mr.mrrefChr3 77919 320 + 181019 ACCTTATTGACATGACCCTCAAATGATTAAAGATTTCTGCAATCATAACACCAGTTTACCTCACTCCTAGCTAACCAATGGGCCCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTACATCCCAAAGCTAAGAATTGTCAGGTGTTAAGAACCCAAGATATAGTTTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGTCTATGTCACCTAACCCTACCTTCCTCTTATTTATCCACTTGTCTATCTGACATCTGAAATTGGAGGCATCTAAAGCTAGAAGGCAATTGGAGGAGAGCAATAATAGACCTCTGTCAATCTAGTCATGGAATGATAATTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526012 305 + 636262 ACCTTGTTGACATGACCCTCAAATGATTAACGATTTCTGCAATCATAACACCAATTTACCTCACTCCTGGTGAACCAATGGGCCCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTACATCCCAAAGCTAAGAATTGTCTGGTTATAACAACCCAAGATATAGTCTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGGCTA--------AACCCTACCTTCCTCTTATTTATCCACTTGTCTTTCTGACATCTGAAA-------CACCTGAAGCTAGAAGCCAACTGGAGGAGAGCAATACTAGACCTCTATCAATCTAGTCATGGAATAATAATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 537164 319 + 647215 ACCTTATTGGCATGACCCTCTAATGATCAAAGATTTCTGGAATCATAACACCAGTTTACCTCACTCCGAACTAACCACTGGGTGCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTAGATCCCTAAGCTAAGAATTGTTAGATGTTAGGAACCCAAGATATAGTTTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGTCTGTGTCACCTAACCCT-CCTTCCTCTTATTTATCCACCTGTCTATCCGACCTCTGAAATTGGAGGCATCTAAAGCTAAAAGGCGATTGGAGGAGAGCAATAATAGACCTCTGTCAAGCTAGTCATGGAATGATAATTGT - -a -s mr.mrrefChr3 78239 93 + 181019 ATCCCAGATTGTCTCCACCCATGAAGTGCACAGAAGAACACCTAAGTATTAAGAGAAGAGATTAAAGCAGGCTAAAGTCATAGGGGGTCTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526327 93 + 636262 ATCCCAGGTTGTCTCCACCCATGAAGTGCACAGAAGAACACCTAAGTATTAGGAGAAAGGATTAAAGCAGGCTAAAGTCATAGACGGTCTCGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 537483 92 + 647215 ATCCCGGATTG-CTCCACCCATGAAGTGCATAGAAGAACAGCTAAATATTAAGTGAAGAGATTAAAGCAGACTAAGGTAATAGGGGGTCTTGG - -a -s mr.mrrefChr3 78332 58 + 181019 CGGATCAACAGGGTGTTAATGACAGCTATGTGTGGTAGATGGTGCTAGAAATGCTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526420 58 + 636262 CGGATCAACAGGGTGTTAATGACAGCTATGTGTAGTACATGGTGCTAGAAGGGCAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 537576 58 + 647215 TGGATCAACAGGGTGTTATTGACAGCTATGTGTGGTAGATGGTAGTAGAAATGCTAGT - -a -s mr.mrrefChr3 78390 17 + 181019 CATCCATTCATGTGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526484 17 + 636262 CGTCCATTCATGTGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 537634 17 + 647215 CATTCATTCATGTGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 78407 159 + 181019 CAGCCTGCAGCCTGTCATGTGCCAAAGAGACCCTCAGTCTCGGAGACTTGAACAACATCTACAGCATATGACTAGCCTGTAGCCTTTCTGCTGCAGAAATCAAACAGCATAGGCAGTATGTGAACTGAAAGTCCCCTCAGGTTATATCTCACAAGGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526592 158 + 636262 CAGCCTGCAGCCTGTCATGTGCCAAAGA-ACCCTCACTCTTGGAGACTTCAACAACATCTACAGCATATGACTGGCCTGTGGCCTTTCTGCTGCAGAAATCAAGCAGTATAAGCAGTATGCCAACTGAAAGTCCCCTCAGGTTATATCTCACAAGGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 537651 159 + 647215 TAGCCTGCAGCCTTTCATGTGCCAAAGAGACCTTCGGTCTCGGAGACACGGACAACATCGACAACATATGACTAGCCTGCAGCCTTTCTGCACCAGAAATCAGACAGCAGAGGCAGTAAGTGAACTGAAAGTCCCCTCATGTTATATCTCACAACGTAG - -a -s mr.mrrefChr3 78566 177 + 181019 CACACAAGAGAGACTAGAAGACAAATTGATTCTATATCACTCATTTTCTCTACTCTGGGTTCCTCTACAGAAAATAGTAAGCAGCAATACTTAGGTCCAATGTTTACTATGCCTGGACAACAGAAACCCAACTATCCACTATCCTTTTATCTGGGTTGCAACTCAGTTTCCCTAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526751 174 + 636262 CACACAAGAGAGACTAGAAGACAAATTGATTCTACATCACTCATTTTCTCTACTCCGGGTTCCTCTACAGAAAATAGTAAGCAGCAATACTTAGGTCCAATGTTTGCT---CCTGGACAACAGAAACCCAACTATTCACTATCCCTTTATCTGGGTTGCAACTCAGTTTCCCTAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 537810 174 + 647215 CACACAAGAGAGA-TAGAAGACAAACTGATCCTATATCACTCATCCTCTCTACTCTGGGTTCCTCTACAGAAGATAGCAAGCAGCAATACTTGGGTATGATGTTTACCATGCTTGGCCAACAGAAACCCCACTATCCACTATTCTTTTATCTGGGTTGTAACTCAGTTTCCCTAA-- - -a -s mr.mrrefChr3 78743 183 + 181019 CACTTTTGTTTAGTTTGGAATAAGTCACATTGATCAACTGGGACCCTAATGTCATGACTTCAGTCCTGCCACCACAATCCTGTTTTGAAAGATGTATTGTGCTACCTCTTTCCTGGTGACAAAGTGTCTGCCTTTCCCGAGCTAGTTCCTTATGATTACCTGTTCATATGTCTCATCAGATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526927 183 + 636262 CACTTTTGTCTAGTTTGGAATAAGTCACATTGATCAACTGGGACCCTAATGTCATGACTTAAGTCCTGCCACCACGATTCTGACTAGGAAGATGTATTGTGCTACCTCTTTCCTGGTGACAAAGTGTCTGCCTTTCCTGAGCTCTTTCCTTATGATTACCTGTTCATATGCCTCATCAGATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 537984 172 + 647215 CACTTCTGTTCAGTTTAGAATCAGTCACATTGCTCAACTGCCACCCTAATGTCACGGCTTCAGTCCTTCCACTACAATCCCGTTTTGAAAGATGTACT---CCCGCTCTTTCA----GACAAAGTTTCTGCCTTTCCCGAGCCAGTTCCTTATGAT----TGTTCAGATGTCTCATCAGATAG - -a -s mr.mrrefChr3 78926 200 + 181019 GAGCTCTAACATGATTGGATGTTGATAGAGTGATATTAAAATAATAGTAGCTGACGGCCCGTAGTTTAAGTCAATGATGCCCACTGGCTAGAAGTCCATGAAAACTTCTTAACTAATCATACGCAGAGATGACACTGTAACCTCAACAAGTTGCAGACTCGCTGAGGCGTCAGTAGAAATTTACAACAATTCACCCTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527110 200 + 636262 GACCTCTAACATGATTGTGTGTTGATAGAGTGATATTAAAATACTAGTAGCTGACGGCCCGTAGTTTAAGTCAATGATGCCCACTGGCTAGAAGTCCATGAAAACTTTTTAACTAATCATATGCAGAGATGACACTGTAACCTCAACAAGTTGCAGACTCGCTGAGGCGTCAGTAGAAATTTAGAACAACTCACCCTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 538158 131 + 647215 GAGTTGTAACATGATTGGATGCTGATAGAGTGGTATAAAAATAATTGT-------------TAGTTTAAGTCAATGATGTCTGCCGGCCAGAAGTCCATGAAAACTTCTTCACTAATCATAC--------------------------------------------------------ATTTACAACAATTCACCCTGGG - -a -s mr.mrrefChr3 79126 126 + 181019 TAACTAACTCAAGTCTATTGCTCCCCTGTGGAATTAATTGTTATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGTTCATATAGGAATGCACTAGTTCCACTGTTGTTTGTAACTGAACCATATGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527310 75 + 636262 TAACTAACTCAAGTCTATTGCTCCCCTGTGAAATTAATTGTTATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGT--------------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 538292 126 + 647215 TAACTAACTCAGGTCTATTGCTCCCCTGTGGAGTTAATTGTGATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGTTCATATAGGAATGCACTAGTTCCACTGTTGTTTGTAACTGAACCATATGCC - -a -s mr.mrrefChr3 79252 37 + 181019 GTACTGGGACGTAAGCAACATGGACATGGATATGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527385 34 + 636262 ---CTGGGACGTAAGCAACATGGACATGGATATGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 538420 37 + 647215 GTATTGGGATGTAAGCAACCTGGACATGGGTATGTGA - -a -s mr.mrrefChr3 79289 97 + 181019 TTTTGTTCTGAAtaaaagggctcaccaccacttgtagttgcagtccaaatcctagaactctttactaacccctgagtgcttgcaaccaaaaagtcac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527419 97 + 636262 TTTTGTTCTGAATAaaagggctcaccaccacttgtagttgcagtccaaatcctagaactctttactaacccctgagtgcttgcaaccaaaaagtcac -s simRat_chr6.simRat.chr6 538459 97 + 647215 TTTTGTTCTGAAtaaatgagttcaacaccacttgtagtcgcagtccaaatcctaaaactatttactaacccccgaatgcttgcgaccgaaaagtctt - -a -s mr.mrrefChr3 79386 130 + 181019 acaactccttgaaatgttttttgacatgttatttacatatggtccctaagctgggatgAATAGCGAATGGCCCACACTAATACTGCCCCTTTTCTCTATGGTTAATCTATTCTGTCCACATTAAGTCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527516 130 + 636262 acaactccttgaaatgttttttgacatgttatttacatatggtccctaagctgggaTGAATAGCGAATGGCCCACACTAATACTGCCCCTTTTCTCTATGGTTAATCTATTCTGTCCACATTAAGTCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 538558 130 + 647215 aaaaccccttggaatgttttttgacatgtcattcacatatggtccataagcagggaccAATAGCAAATTGCCCACTCGAATACATCCTCCTTTCTCTATGGTTAATTTATTCTGTCCACATTAAGACTTT - -a -s mr.mrrefChr3 79516 20 + 181019 CAGCTGGGACTCCTAAAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527654 20 + 636262 CAGCTGGGACTCCTAAAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 538688 20 + 647215 TAGCTGGCCCTCCTTGAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 79536 24 + 181019 GGTTACTGGTCTGGTGGTCAtgaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527675 24 + 636262 GGTTACTGGTCTGGTGGTCATGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 538708 24 + 647215 GGCTACTGGTTTGGGGGTCAtgaa - -a -s mr.mrrefChr3 79560 19 + 181019 ttacaccgttgtcaatagg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527699 19 + 636262 TTACACCGTTGTCAATAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 538733 19 + 647215 ttaaacccttgtcaactgg - -a -s mr.mrrefChr3 79579 17 + 181019 gatccagcaaaggaaga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527718 17 + 636262 GATCCAGCAAAGGAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 538770 17 + 647215 gatccagcaaaggacga - -a -s mr.mrrefChr3 79596 300 + 181019 gtcacatggaatccccagAAAACTTCTGTTCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCTTATGCAGCTGTTGACATGTGCATATCTACCTGTGCATATCTACCAGGTATAACATAGATGGAAATGAAGTTCTTACAAGACACAAGTATACTCATCCCCCTTAAGCAAGGTTAAAAAAACATTATTCCACTTTATGCAATTAAAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGGAGTAAATCTTCTACAACTACAAATATATTAATGCCTACTTTGCATTTTGAATGGTCTGAGGTCACTATTTCAGTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527735 198 + 636262 GTCACATGGAATCCCCAGAAAACTTCTGTTCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCTTATACAGCTGTTGGCATGTGCATATCTACCTGTGCATATC------------------------------------------------------------------------------------------------------AAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGGAGAAAATCTTCTACAACTACAAATATATTAATGCCTCCTTTGCGTTTTGAATGGTCTGAGGTCACTATTTCAGTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 538788 279 + 647215 gtcacatggaatccctagGCACCTTCTGTGCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCCTATGCGGCTGCTGACATGTGCATATCTACCTGTGCATATCTACCAGGTATAACATAGATGGAAATGAAGTTCTTACAAGACACAAGTATACTCATCCCCCTTAAGCAAGGTTAAAAAAACATTATTCCACTTTATGCAATTAAAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGAAGTAGGTCTTCTAGAACTACAAATA----AATGTCTACTTTGCATTTTGAATAGTATGAG----------------- - -a -s mr.mrrefChr3 79896 228 + 181019 GAGCTAGGGATAACTAACTAAGCTCCCTTGTCTCTTGGCTTCAGCAGACGTTTATGTCATTTATCTATCATTACATCTGATATCTGCTACTACTTGAGTGAACTGCACTGAGCTAACCAACATGTGGTCCAGATCAAGGGAGAAGCCACATATGCAAAGCACAATTCTGTATTGGTTTGTCAGGCTAGAGATTGTATTCACCCTACTTGATTAACATCCTTAATCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527935 210 + 636262 GAGCTAGGGATAACTAACTAAGCTCCCTTTTCACTTGGCTTCAGCAGACGTTTATGTCACTTATCTATCATTACATCTGATATC------------------CTGCACTGAGCTAACCAACAGGTGATCCAGATCAAGGGAGAAGCCACATATGCAAAGCACAATCTTGTATTGGCTTGTCAGGCTGGAGATTGTATTCACCCTACTTGATTAACATCCTTAATCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 539067 197 + 647215 ------------------------CTCTTGTCTCTTG------GCAAACGTTAATGTCATTTATTGATCATTACATCTGATATCTGCTACTACTTGAGTGAATCGCACTTAGCTAACAAACATATGGTCCAGCTCAAGGAAGAAGCCGCATATGCAACACACAATTCTCTATC-GTTGGCCAAGCTAGAGATTGTACTTCTCCAACTTGATCAACATCCTTAATCCAT - -a -s mr.mrrefChr3 80124 21 + 181019 GCGTTTTGTGGATATTGACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528175 21 + 636262 GCGCCTTGTGGATATTGACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 539264 21 + 647215 GAGTTGTGTGGATATTGAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 80145 626 + 181019 CCACAAAGGAGTGACTGTGAGAACTATGTTAAACTATTCATCCTTGTTCATGTGTTCTAACTGGTTGGTGTCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAGATATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGTAGCATTTATGATTTAGGTTACAATCATGAATATAAAATACAGTAGCTTTTGGTACCAGCTATCAGTAACCGTGAAAACAGATGCTGTACATTCACTAAGTCCGGGCTGGAAGCACATGAATGATAAAGAACTTTCTGAATTACTCCCAAATATAAAATTTCATCAGCAGACTATGGCAAAGTGGCTTCAATTCTTTTTAAGGCATAGGCCTCTACCATGGCTGATGAGTTGTGTTCTGATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGATTTTGACAGTAAACTAGAGCATCACATGGGCTAATGACGAATCACAGCATAGGAATACTGCAACCTTCAGGGTTAATATTAGTCTAGTCAATCGGTACCAATTATGGTATCTCTGACTGTCATTTGCCAGACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTATCTGCATACACTACCACAAGAGGAATACTTGTTTGCACTCCTTTAACAGCTAATGCACAATGTATGACTTGACGACAAGTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528196 622 + 636262 CCACAAAGGAGTGACTGTGAGAACTATATTAAACTATTCACCCTTGTTCATGTGTTCTAACTGGTCGGTGCCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAGAGATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGTAGCATTTATGATTTAGGTTACAATCATGAATATAAAATACAGTAGCTTCTGGTACCAGCTATTAGTAACCGTGAAAACAGATGCTGTACATTCACTAAGTCCGGGCTGGAAGCACATGAATGATAAAGAACTTTCTGAATTACTCCC--ATATAAAATTTCATCAGTAGACTATGGCACTGTGGCTT-AATTCTTTTTAAGGTATAGGCCTCCACCATGGCTGATGAGCTGTGTTCTTATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGATGTTGACAGTAAACCAATGCATCACATGGGCTAATGACGAATCATAGCATAGGAATACTGCATCCTTCAGGGTTAATATTAGTCTAGTCAATCGGTACCAATTATGGTATCTCTGACTGTCATTTGCCAGACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTTTCTGCATACACTACTACAAGAGGAATACTTGTCTGCACTCCCTT-ACGGCTAATGCACAATGTACAACTTGACCACAAGTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 539286 624 + 647215 CCACAAAGGAGTGACTGTAAGAACTATGACAAACTACTCATACTTGTTCATGTGTTCTAA-TGGTTGATGTCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAACTATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGGGGCACTTATGATTTAGGTCACAATCATGAATTTAAAATTCAGTAGCTTTTAGTACCAGCTATCAGTAACTATGAAAATAGATGACATCCATTCACTATGTCCTGGCTGGAATCACCTGGATGATAAAGAACTTTCCTAATTACTCCCAAATATAAGTTTTCGTCAGCAGACTATGGCAAAGTGGCTTCAATTCTCTTTAAGGCATAGGCCTCTACCATGGCTGATGAGTTGTGTTCTGATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGGTTTTGACAGTAAACTGGAGCATCACATTGACTAACAAAGAATCACGTCATGTGAATACTGCAACGTTCAGGGTTAATATTAGCCTAGTCAATCAGTACCAATTATGGTATCTCCGACTGTCACTTGCCACACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTATCAGCATACACTAACACAAGAGGAATACTTGTTTGCACCCCTTTAACAGCTAGTGCACGATGCATGACTT-ACGAGGAATCTG - -a -s mr.mrrefChr3 80771 13 + 181019 TTTGGTCAATAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528827 13 + 636262 TTGGGTCAATAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 539910 13 + 647215 TCTGATCTATATG - -a -s mr.mrrefChr3 80784 8 + 181019 ATCTGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528840 8 + 636262 ATCTGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 539928 8 + 647215 GTCTGACA - -a -s mr.mrrefChr3 80792 19 + 181019 TGACCCGGATTGTTAAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528850 19 + 636262 TGACCCGGATTGTTAAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 539936 17 + 647215 --ATCCGGATCAGTAATAT - -a -s mr.mrrefChr3 80811 10 + 181019 GTTTCATTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528869 10 + 636262 GTTTCATTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 539966 10 + 647215 ATCTCATTCA - -a -s mr.mrrefChr3 80821 19 + 181019 CATCAGACAGATTCCTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528879 19 + 636262 CATCAGACAGATTCCTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 539979 17 + 647215 CATTAAAC--CTGGCTTGT - -a -s mr.mrrefChr3 80840 135 + 181019 CTGAATACCTTGATCTACATAGTTAAGTCTATGGATGAAAGACAGAAGGATGAAGCTTTCATGCCTACAGCCTTTGTGGTTTAAGATAAGATATCCTTGGCTAATAGAGCCACTCATAGTGCTTACTTTATCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528898 135 + 636262 CTGAAAACCTTAATCTGCATAGTTAATTCTATGGATGAAAGACAAAAGGATGAAGCTTTCACACCTACTGCCTTTGTGGTTTAAGATAAGATATCCTTGGCTAATAGAGCCACTCATAGTGCTTACTTTATCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 540000 135 + 647215 CTGAATGCCTTGATCCACACAGTTAAGTCTATGAATGAAAGACAGAAGGATGAACCTTTCATGCCTACAGCCTTTTTGGGTTAAGATAAGATATCCTTGGCTAATAGAGCCACTCATAGTCCTTATGTTATCAGT - -a -s mr.mrrefChr3 80975 41 + 181019 TTCCAAGAAAGCGGAAACCTAACTGCATATGTTACCTCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529033 41 + 636262 TTCCAAGAAAGCGGAAACCTAACTGCATATGTTACCTCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 540138 41 + 647215 TTCCCAGAAAGCACAAACCTATGTGCTTATGTTACCTCAAG - -a -s mr.mrrefChr3 81016 71 + 181019 ATAATTGTATGCACCCCCTCAACAGCTAAAAGGAGATTGGGAAACTTGACCACAATTAATGTCAAATGCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529074 71 + 636262 ATAATTGTATGCACCCCCTCAACAGCTAAAAGGAGATTGGGAAACTTGACCACAATTAATGTCAAATGCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 540183 71 + 647215 ATAATTGTCTGCACCCCCTCAACAGCTAGAAGGAGATTGGGAAACTTTACCACAATTCATGTCAAATGTGT - -a -s mr.mrrefChr3 81087 14 + 181019 GGGAACGAGGTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529145 14 + 636262 GGGAACGAGGTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 540256 14 + 647215 GGGAAGAAGGTCCG - -a -s mr.mrrefChr3 81101 161 + 181019 ACTGGTAAGGATATGACTGACCTTGATTGTCAAACTGTTCCAAATAAATCACACAGATCCCTTGTCTGTACATCTTACCTTGCTTTTCGCAAATGCTCTACATAGTTAAGTGTATTAATCAAGGGCAGCAGGCTGCAGCTTTCATGTCTATAGCCTGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529159 161 + 636262 ACTGGTAAGGATATGACTGACCTTGATTGTCAAACTGTTCCAAATAAATCACACAGATCCCTTGTCTGTACATCTTACCTTGCTTTTCGCAAATGCTCTACATAGTTAAGTGTATTAATCAAGGGCAGCAGGCTGCAGCTTTCATGTCTATAGCCTGTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 540288 161 + 647215 ACTGGTAAGGATATGGCTGACTTTGATTGTCAAACTGTTCCAAACAAATGACACAGATCCCTTGTCTGTAGGTCTTACTCTACCTTTGGCAGATGCTCTACATAGTTAAGTGTCTTAATCAAAGGCAGAATGATGCAACTTTCATGTCTATAGCCTTCATG - -a -s mr.mrrefChr3 81262 454 + 181019 TCTCCTATTTTATCAGTATATCTTCTAGGGTTCATCACAAATGTTGCAGGACTCTGCATCCCGTCTACACACTTATAAATTGTTGATAAGAATACACTTGCTGTATGCCTAGGAAACGCTTAATATAAAATCACTCATGTAAGTACATGGGTCTGAAGTGGGGGAACAGGCACCCAGCGCACACTTAACCTTTTGCACTTAAAGTTCTCGTGCCCTTTATGACTAAGAATTAATAATTGAAAGTGTGCTGCCACCCAATAATACAAGACTCATATAGAATGGTATTGACAGATGAACAGTTTATACATCTCGCTGATTTTTCCTGAATGGGTTTGAAGAACATTACAACAAGGATGAGGCTACTCATGATGACCATTCACAACTTCAATATCCAGAGATCCCAAAGTAGGAAATAGCTATTGAAGTGAGCGGGGTTACACAGCAGGACTTAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529320 429 + 636262 TCTCCTATTTTATCAGTATATCTTCTAGGGTTCATCACAACTGTTGCGGGACTCTGCATCCCGTCTACATACTT---------------GAATACACTTGCTGTATGCTTAGGAAACGCCTAATATAAAATCACTCACGTAAGTACCTGGGTCTGAAGTGCAGGAACAGGCACCCAGCGCACACTTAACCTTTTGCACTTAAAGTTCTC-TGCCCTTTATGACTAAGAATTAATAATTGAAAGTGTGCTGCCACCCAATAACACAAGACTCATATAGAATGGCATGGACAGATGAACAGTTTATAC--CTTGCTGATTTTTCCT------GTTTGAACAACATTACAACAAGGATGAGGCTACTCATGATGACCATCCACAACATCAATAACCAGAGAT-CCAAAGTAGGAAAAAGCTATTGAAGTGAGTGGGGTTAAATGGCAGGACTTAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 540504 453 + 647215 TCTCCTATTTTATCAGTATGTCTCCTAGGGTTCATCACAAATATTGCAGAACTTTGTATCCCGTCTACACACCTATAAATTGTTGATAAGAATACACTTGCTGTGTGCCTAGGAAATGCTTAACATAAAAGCACTCATGGAAGTACATGGGTCTGAAGTAGGGGGACAGGCACTCAGTGCACACTTAACCTTTTGCACTCAGTGTTCTTGTGCACATTATGACCAAGAATTAATAATTGATAGTGTGCTGCCACCCAATAATACAAGACTTATATAGACTGGTATTGACAGATGAACACTTTATACATCTCTCTGATTTTTCCTGAATGGGTTTGAAGAACCTTACAACAAGGATGAGACT-CTCATGAAGACCCTTCACAACTACAATATCCAGAGATCCCGAAGTGGGGAATAGCTATTGAAGTGAGCGGGGTTACACAGCAGGCCTTAATG - -a -s mr.mrrefChr3 81716 57 + 181019 ATTGAGATTTTGAACAGCACCTCATACAAAGCTCCAATAAAAGGGCAAAAGTGGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529751 57 + 636262 ATTGAGATTTTGAACAGCACCTCATACAAAGCTCCAATAAAAGGGCAAAAGTGGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 540957 57 + 647215 ATTGAGATTTTGAACAGCACCTCATAGAAAGCTCTGATGAAAGGGAAAAAGTGGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 81773 50 + 181019 GATGTGTGTGGTTAGGATTCGGCGGATGAGCCTGCCGGCGTCATGCACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529808 50 + 636262 GATGCATGTGGGTAGGATTCAACGGATGAGCCTGCCGGCGTCATGCACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 541016 50 + 647215 GGTGTGTGTGGTTAGGATTTGGCTACTGAGCCTGCCTGCGTCATGCACTG - -a -s mr.mrrefChr3 81823 38 + 181019 TAGGTGATGACAGGTTCATCATATAGTGCAAAATCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529858 38 + 636262 TAGGTGATGACAGGTTCATCATATAGTGCAAAATCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 541067 38 + 647215 TAAGTGATCACAGGTTGGTCATACAGTGCAAAATCAGG - -a -s mr.mrrefChr3 81861 55 + 181019 GAAAGTCTTGAAGCTGGGTCCCTGTATACATAGTGCCTTGCAATCTTGCAACTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529896 55 + 636262 GAAAGTCTTGAAGCTGGGTCCCTGTATACATAGTGCCTTGCAATCTTGCAACTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 541128 55 + 647215 GACAGTCCTAAGGCAGGGTCCCTGTATACCTAGTACCTTGCAATCTTGCAACTGA - -a -s mr.mrrefChr3 81916 121 + 181019 CCCTATGAGTTATCCATTGGTCTGGGGGACATGAGGCTGAACTCTAATTAATTGAACTGAACCAGTCATGGATTTCGGTGAACAAAGGGGGAATGGAACAATTATGGTGAACACACATTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529952 121 + 636262 CCCTATGAGTTATCCATTGGTCTGGGGGACATGAGGCTGAACTCTAATTAATTGAACTGAACCAGTCATGGATTTCGGTGAACAAAGGGGGAATGGAACAATTGTGGTGAACACACATTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 541183 121 + 647215 ACCTATGAGTTATCCATTGGTCTGGGGGACATGTGGCCGAACCCTAATTAATCGAACTGAACCAGTCATGGATTCCAGTGAACAAAGGGGGAATGGGGCAATCATGCTGAATACATATTTA - -a -s mr.mrrefChr3 82037 86 + 181019 GGTTGTGCAGCTCACCTCACTGGTGCTTACTTACAAATTAACCACCCAGATTTGTAAGGTGAGTCAGGCTTTGAAAGATCATGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530081 86 + 636262 GGTTGTGCAGGTCACCTCACTGGTGCTTACTTACAAATTAATCCCCCAGATTTGTAAGGTGAGTTAGGCTTTAGAAGATCATGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 541304 85 + 647215 GGTTGTGCAGCTCACCTCACTGGTGCTTACTTACAAA-TAACCACTCAGATTTGTAAGGTGAGTCAGACTTTGAAAGGTTATGTGG - -a -s mr.mrrefChr3 82123 150 + 181019 TTTAAGTAGATTTGGAGCTAGATTGCTCTTAAACCAGTTTGCCTTAAACATAAACTCCATATCCCCTAATATCCACTCAGCATGTCTCAAAAGACATGCATGTACTTACTTACTATGTTATCATAGGCACATGCATAACATGATTTCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530167 150 + 636262 TTTAAGGAGATTTGGAGCTAGATTGCTCCTAAACCAGTTTGCCTTGAATATAAACTTCATATCCACTAATATCCACTCAGCATGTCTCAAAAGACATTCATGTACTTACTTACTATGTTATCATAAGCACATGCATAACATGATTTCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 541395 150 + 647215 TCTGGGTAGATTTGGAGTTAGATCACTCTTAAACCAGTTTGCCCTAAACATATACTCCACATCCCCTAGTGTCCACCCAGCATATCTCTAAAGACATGTATGTACTTAGTGACTATGTTATCCTGGGTACATGGTTAACATGATTTCTCA - -a -s mr.mrrefChr3 82273 223 + 181019 GTTTGATAATAGTTCTGTGGTGCATTTTGATTTTTGCAGTCTCTAGTTAGTCCTGGTCGATAAACTGGCTGATCTACCATTCTGGTCAAAGTTAGAGTTGGAAACATAGAAACTGGGCTAAGCTGCAAGTGGTGCTGGATATAGTTTATTGTCAGAAGCATGGGTATATGCAACATTAAGTTCATTCCTCCCTCTGTAGGTCTTAAGTTGTCTCCATGTTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530391 216 + 636262 GTTTGATGATAGTCCTTTGGTGCATTTTGCTTTTTGCAGTCTCTAGTTGGT-------GATAAACCAGCTGATCTACCATTCTGGTCAAAGTTAGAGTTGGAAACATAGAAACTGGGCTAAGCTGCGAGTGGTGCTGGATGAAGTTTATTGTCAGAAGCATGGGTATATGCAACATTAAGTTCACTCCTCCCTTTGTAGGTCTTAGGTTGTTTCTATGTTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 541545 223 + 647215 GTTAGATAATAGTTATGTGGTGTATTTTGATTTTTGCAGTCGCTAGTTAGTCCTGGTCAATGAACTGGCTGATCTACCATCCTGTACAAAGTTAGAGTTGAAAACATAGAAACTGGGCTAACCTGCAAGTGGTGCTGGACATAGTTTATTGTCAGAGGCATGGGTCTAGGCCACATTAAGTTCATTCCTCCCTCTGTAGGTCTTAAGTTGACTCCATGTTGTG - -a -s mr.mrrefChr3 82496 72 + 181019 TGGTGTTACTGGGAGGAGCCACATTAAATGCAGTAGTGAATATGATTTTCCAGAGAACAAGAACCTCAGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530650 72 + 636262 TGATGTTATTGGGAGGAGCCACATTAAATGCAGTATTGAATATGATTTTCCAGAGAACAAGGATGTCAGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 541768 72 + 647215 TAGTGTTACTGGGAAGAGCCATATCAAATGTAGAAGCAAATATGATTTTTCAGAGAACAAGATCCTCAGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 82568 156 + 181019 GTATCCTTATTCTTAATGTGAGTCTACCAAATTCTGACATATTCAAATCCACATCTGAAACTCCATTATAAGAAGACTGCGTCTGAGTTATGGCCTAGAAATACTGGCCAGAGTCATTAACTTGCATCTGTAGGTGTGGGAAATCTTCCTTTCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530722 156 + 636262 GTATCCTTATTCTTAATGTGAGTCTACCAAATTCAGACATATTCAAATCCACATCTGAAGCTCCATTATAAGAAGACTGCGTCTGAGTTATGGCCTAGAAATACTGGCCAGAGTCGTTAACTTGCATTTGTAGGTGTGGGAAATCTTCCTTTCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 541841 156 + 647215 GTATCCTTATTCTTAATGTGAGTTTACCAAATTCTGACAGATTCAAATCCACATCTAAAACTCCGTGATAAGAAGTCAGCATCCAAGTTGTGGCCTAGGAATACTTGCCAGCGTAACGGACTTGCATCCGTAGGTGTGACAAATTTTCCTTTCATA - -a -s mr.mrrefChr3 82724 84 + 181019 TAGTCACTGTATGCCTAACTCCATTTTCATTCCTTTTAGCATCACCCTTATTTGGTGTTCACCTTTTGGGAAAACTGCAGCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530878 82 + 636262 TAGTCACTGTATGCCTAACTCCATTTTCATTCCTTTTAGCACCACCCAGATTTGGTGTTCACCTTT--GGAAAACTGCAGCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 541998 84 + 647215 TAGTCACTGTATGCCTAACCCCATTTTCATTCCTTTTAGCATTACCTTTATTTGATGTTCGCCTTTTGGGAAAATTGCATCATA - -a -s mr.mrrefChr3 82808 80 + 181019 CCAAGTTCTCAAGGGGTACCTGTGGTTatacagaaagactttcaatgttggtgcatgacctaggaatggtaaatttccct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530998 80 + 636262 CCAAGTTCCCAAAGGTCACCTGTGGTTatacagaaagactttcaatgttggtgcatgacctaggaatggtaaatttccct -s simRat_chr6.simRat.chr6 542082 80 + 647215 ATAAGTCCTTGAGCGGTACCCATGGTTacacagaagaaccctcaaggttggtgcatgatttaggagcggtaaatctccct - -a -s mr.mrrefChr3 82888 19 + 181019 agaacagtcaatacagggt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531085 19 + 636262 agaacagtcaatacagggt -s simRat_chr6.simRat.chr6 542162 19 + 647215 aaaagattcagtacagcct - -a -s mr.mrrefChr3 82907 6 + 181019 gtcagc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531104 6 + 636262 gtcagc -s simRat_chr6.simRat.chr6 542767 6 + 647215 gacaac - -a -s mr.mrrefChr3 82913 81 + 181019 cagtgggtggatgctctagatcatgtcaaatgaaaacaaactccagttcttacataaggagtatgaacttgataaatatgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531665 81 + 636262 cagtgggtggatgctctagatcatgtcaaatgaaaacaaactccagttcttacataaggagtatgaacttgataaatatgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 542773 81 + 647215 CAGAgggtggacaatctacatcatgtcgaatgaaaacaaactacagttcttacatgaggaggatgaacttgataaatatgg - -a -s mr.mrrefChr3 82994 71 + 181019 tcactcactgagtgaagatgtgcaggtagcacttcctaccgacagaatagggaatgacaaacttcaatttt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531752 71 + 636262 tcactcactgagtgaagatgtgcaggtagcacttcctaccgacagaatagggaatgacaaacttcaatttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 542854 71 + 647215 tcactcaataagtaaaggtgagcaggtagtacttcctacccacgaaacagagtatgacaaactaggttttt - -a -s mr.mrrefChr3 83065 123 + 181019 cgcttagaataaagtaccacttagctggagtgaatctcaatgtagcttacagagtaggagctgtgatctattgtaccaagctctctatttaaagtgatctgtggcatctggggtagacacaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531829 123 + 636262 cgcttagaataaagtaccacttagctggagtgaatctcaatgtagcttacagagtaggagctgtgatctattgtaccaagctctctatttaaagtgatctgtggcatctggggtagacacaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 542925 123 + 647215 tgcttagaataaagtgccacttagctggagtgaatcttaatatatcttacacagtgggagatgtgctccaatgtactaagctctctatccagagtgatctgccacatctagggtaaacacaaa - -a -s mr.mrrefChr3 83188 28 + 181019 aactgaaattactactctgtctacaccg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531957 28 + 636262 aactgaaattactactctgtctacaccg -s simRat_chr6.simRat.chr6 543048 28 + 647215 aactgaaattactactccatctacactg - -a -s mr.mrrefChr3 83216 57 + 181019 ttaaagcttgaaactaaagtcctctacctgatgcttttcagcttgatattcatcaca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531986 57 + 636262 ttaaagcttgaaactaaagtcctctacctgatgcttttcagcttgatattcatcaca -s simRat_chr6.simRat.chr6 543076 57 + 647215 ttaaagcttgaaactaaagccctctaccttttgcttttcaccttaatattcatcaca - -a -s mr.mrrefChr3 83273 72 + 181019 ttgcagttcctcacaaggttaagcttgctctgtgttactagctcttttagccattcgatatcacatgctggg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532043 72 + 636262 ttgcagttcctcacaaggttaagcttgctctgtgttactagctcttttagccattcgatatcacatgctggg -s simRat_chr6.simRat.chr6 543135 72 + 647215 ttgcagttcctcacaaggttaagcttgttctgtgttactagctcttttagccactacatatcagatgttgga - -a -s mr.mrrefChr3 83345 16 + 181019 attgacctttgatagg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532115 16 + 636262 attgacctttgatagg -s simRat_chr6.simRat.chr6 543237 16 + 647215 attgattgatgatagg - -a -s mr.mrrefChr3 83361 124 + 181019 cccttcatcttgcattagtgcctggccaacgagataggtaaataagaggaatacaatcttggggagagaaatcagatgcctatacttctctagtaataccacagtggttgcagtgtgtattgtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532131 124 + 636262 cccttcatcttgcattagtgcctggccaacgagataggtaaataagaggaatacaatcttggggagagaaatcagatgcctatacttctctagtaataccacagtggttgcagtgtgtattgtt -s simRat_chr6.simRat.chr6 543254 124 + 647215 ccctttatctcgtattagtgtctgaccaacaagatagggaaataagagaaatgcaattgcggggagagaagtcgcttggctatagttcgttggtgctaccatggtggttgctgtgtgtattgtt - -a -s mr.mrrefChr3 83485 93 + 181019 gcatgttatcttcatcatgacaccgcatgtccaaaacgttatttgaaatataacacccaccaacaggcagagaaattgctggaaatgtgagtc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532355 93 + 636262 gcatgttatcttcatcatgacaccgcatgtccaaaacgttatttgaaatataacacccaccaacaggcagagaaattgctggaaatgtgagtc -s simRat_chr6.simRat.chr6 543378 93 + 647215 gcatgttatcctaatcatgacactgcatgtccaaaacattatttgaaatataacacccaccaacaggcagagaaatggctggatatgtgagtc - -a -s mr.mrrefChr3 83578 21 + 181019 agaacgctcaaatatgactgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532448 21 + 636262 agaacgctcaaatatgactgt -s simRat_chr6.simRat.chr6 543476 21 + 647215 agaatgcttgaatgtgaatgt - -a -s mr.mrrefChr3 83599 16 + 181019 gtataataccatagta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532482 16 + 636262 gtataataccatagta -s simRat_chr6.simRat.chr6 543497 16 + 647215 gtttgataccattgta - -a -s mr.mrrefChr3 83615 20 + 181019 tatgaataccttttccaacc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532498 20 + 636262 tatgaataccttttccaacc -s simRat_chr6.simRat.chr6 543515 20 + 647215 taagcataccttttccaacc - -a -s mr.mrrefChr3 83635 104 + 181019 ttgctaggaaggagaagatggagaataaagatagatacctctaatgttgagacagagtggaattaaacaaacaaaccttctgttgtgactgaggctggattagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532521 104 + 636262 ttgctaggaaggagaagatggagaataaagatagatacctctaatgttgagacagagtggaattaaacaaacaaaccttctgttgtgactgaggctggattagt -s simRat_chr6.simRat.chr6 543535 104 + 647215 ttactaggaaggagaagaaggaaaaaagagatagttacctctgatgttgaagcagaatggaattaaacaaagacaccctctgttgtgattgaagctggattagt - -a -s mr.mrrefChr3 83739 82 + 181019 gaagtgctgtaaggataacttccatatccagaacacagcgggcagcatggaactagtgtctgatggttcttctgggatactt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532626 82 + 636262 gaagtgctgtaaggataacttccatatccagaacacagcgggcagcatggaactagtgtctgatggttcttctgggatactt -s simRat_chr6.simRat.chr6 543639 82 + 647215 ggagttctgtagggataacttcaatatcctgaacacagctggcagcatggaactggtgtctgacgtttcttctgagaccctt - -a -s mr.mrrefChr3 83821 28 + 181019 ccctccccacagctaggtgcacccaccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532905 28 + 636262 ccctccccacagctaggtgcacccaccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 543721 28 + 647215 ctctccccacagataggtgcacccactc - -a -s mr.mrrefChr3 83849 79 + 181019 agaatacacagtagttaataaaatgggcagggaattggaaaggaggctatgggtggcagtactgtcagctggggacgtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532979 79 + 636262 agaatacacagtagttaataaaatgggcagggaattggaaaggaggctatgggtggcagtactgtcagctggggacgtt -s simRat_chr6.simRat.chr6 543749 79 + 647215 agaatacacagtagttaataaaaagggcagggaattggaaaggagggtttgggttgcagtagtgtcagctggggacatt - -a -s mr.mrrefChr3 83928 24 + 181019 gctggaccacatctgaaatatcca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533058 24 + 636262 gctggaccacatctgaaatatcca -s simRat_chr6.simRat.chr6 543859 24 + 647215 gctggacttcatctaaaacatcca - -a -s mr.mrrefChr3 83952 40 + 181019 gtgagaacatggaaccatcaggtatggagataatgagtag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533082 40 + 636262 gtgagaacatggaaccatcaggtatggagataatgagtag -s simRat_chr6.simRat.chr6 543884 40 + 647215 gtgagcacattgactgaccagatatggaaacaatgaggaa - -a -s mr.mrrefChr3 83992 10 + 181019 cattaggcta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533123 10 + 636262 cattaggcta -s simRat_chr6.simRat.chr6 543924 10 + 647215 aattaggcta - -a -s mr.mrrefChr3 84002 103 + 181019 tacatttatactacactggaccgacttaaggtgtcaatttactagaatccaagagcacaaaatttttttcaaccgcaaaagtgattcttgggcttaggctccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533133 103 + 636262 tacatttatactacactggaccgacttaaggtgtcaatttactagaatccaagagcacaaaatttttttcaaccgcaaaagtgattcttgggcttaggctccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 543936 103 + 647215 tacattcatatcacactggaccatcttaaggtgtcaattcactagaagccaagaacacaatattatttgaaggcacacaagtgattcatgggcttaggttttt - -a -s mr.mrrefChr3 84105 50 + 181019 gtaccctgtattgaaataacagataaaaaccacttttttccagagacagg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533236 50 + 636262 gtaccctgtattgaaataacagataaaaaccacttttttccagagacagg -s simRat_chr6.simRat.chr6 544144 50 + 647215 gagccttcttttcaaatatcagatgaagaccatttttttccaaagacagg - -a -s mr.mrrefChr3 84155 226 + 181019 attagatccatggcatagccctccctataatagctagcacatgaactgcttacacaaggtgactctctctgaagtgcaccgttgacacatgagccccggactcaggtgtctattttggcttctgaactgttggcacctgaaatgcaacctggcaaacaactgacacaggacctacttaatgacgatgcaagcaacagcatacctgagcaccctaactgtgtgagtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533286 226 + 636262 attagatccatggcatagccctccctataatagctagcacatgaactgcttacacaaggtgactctctctgaagtgcaccgttgacacatgagccccggactcaggtgtctattttggcttctgaactgttggcacctgaaatgcaacctggcaaacaactgacacaggacctacttaatgacgatgcaagcaacagcatacctgagcaccctaactgtgtgagtg -s simRat_chr6.simRat.chr6 544199 226 + 647215 atcaaatcagtggcatagccctcccgatcatacctaacatttgaaccactcactcaaggtaactctatctggagtgcactgttagcacatgaactgctgactcaggtgcctattttggttttcggactgttggagcctggaatgccacttggctaacaactgacacaggacctacctaacgaggatgctagcaacagcgttcctgagcaccctaattttgcgagag - -a -s mr.mrrefChr3 84381 166 + 181019 tgtctcagtttttgagcccaacgggctatgggcttggggatcagctgtacatggagacacatcactttgaaatacacgtccatgactcaaatcaacaactatctacccacccgcctacatgcggatcgtgttttgcctgcatccatatcaacaggatggtatacca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533523 166 + 636262 tgtctcagtttttgagcccaacgggctatgggcttggggatcagctgtacatggagacacatcactttgaaatacacgtccatgactcaaatcaacaactatctacccacccgcctacatgcggatcgtgttttgcctgcatccatatcaacaggatggtatacca -s simRat_chr6.simRat.chr6 544425 166 + 647215 tgcctgagtatttgagcccagtgggctatgggcttggggctcagctgtacctggagacacatcacttcgaaatacacatccataactcaaatcaacaactatccaccaacccccctacatgtggatcatattttgcctgcatccatatcaacaggatggtatatca - -a -s mr.mrrefChr3 84547 7 + 181019 cacagca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533689 7 + 636262 cacagca -s simRat_chr6.simRat.chr6 544593 7 + 647215 cagagca - -a -s mr.mrrefChr3 84554 111 + 181019 gatagatttgacatcggacggagaatacttgcttacaaatgtgctggggggataatacttacttatgtcgccagagagatgagcctacacattggagaaaaacacaggatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533696 111 + 636262 gatagatttgacatcggacggagaatacttgcttacaaatgtgctggggggataatacttacttatgtcgccagagagatgagcctacacattggagaaaaacacaggatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 544603 111 + 647215 gtttggtttgacatcggacggagaacacttgcatacaactgtggtggggtgataatactcacttatgtcgccatagagatgagagaacacaattgaaagaaatgcaagatg - -a -s mr.mrrefChr3 84665 3 + 181019 atg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533810 3 + 636262 atg -s simRat_chr6.simRat.chr6 544714 3 + 647215 acg - -a -s mr.mrrefChr3 84668 90 + 181019 gtatgttgggagtacatgggagcctccacaaggcacccgactaagagcggatcaaatactaattcactgtggtggtggagatgaactgca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533813 90 + 636262 gtatgttgggagtacatgggagcctccacaaggcacccgactaagagcggatcaaatactaattcactgtggtggtggagatgaactgca -s simRat_chr6.simRat.chr6 544719 90 + 647215 atacgttgggaggacatgggagcccccacaaggccctgaactaagtgcagatggaatactcgttcactgtggtggtggacatgaactgca - -a -s mr.mrrefChr3 84758 9 + 181019 tgactggat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533903 9 + 636262 tgactggat -s simRat_chr6.simRat.chr6 544812 9 + 647215 tggctggat - -a -s mr.mrrefChr3 84767 44 + 181019 agtcccccaactgaggctcagtacagcacataagatttgtagag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534097 44 + 636262 agtcccccaactgaggctcagtacagcacataagatttgtagag -s simRat_chr6.simRat.chr6 544821 44 + 647215 agttccaagactgaggctcagtagagcacataaaattagtagag - -a -s mr.mrrefChr3 84811 98 + 181019 tgatggtagaagaaatggctccccttcgtatgggtaacctctttagaaaggtttaatatactttgcgaaaggaatcatctaagaagaataacattgtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534147 98 + 636262 tgatggtagaagaaatggctccccttcgtatgggtaacctctttagaaaggtttaatatactttgcgaaaggaatcatctaagaagaataacattgtt -s simRat_chr6.simRat.chr6 544865 98 + 647215 tgatggtggaagaagtgcctccccttcatatgggtaacctctttagaaaggtttagtatactttgcctaaagaatcatctaaaaagactagcattgtt - -a -s mr.mrrefChr3 84909 59 + 181019 gacaatatggtgagtatactaatgctgagtcattctgtgcttaggggcatagtggatac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534245 59 + 636262 gacaatatggtgagtatactaatgctgagtcattctgtgcttaggggcatagtggatac -s simRat_chr6.simRat.chr6 544964 59 + 647215 gagattatggcaattagactaatgctgagtcattctgtgcttaggggcatagtggatac - -a -s mr.mrrefChr3 84968 74 + 181019 gcttgacatcaactctgccatcaaacggagtcatttcagtgcctgtgacatagtggcctaactatttccctatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534308 74 + 636262 gcttgacatcaactctgccatcaaacggagtcatttcagtgcctgtgacatagtggcctaactatttccctatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 545023 74 + 647215 acttgacatcaactctgctatcaaacagagttattttaatgcccgaggcataatggtctaactatttccttatt - -a -s mr.mrrefChr3 85042 131 + 181019 acgttgctttgaatagcttggaagggtggtctttccctttatgacttgttagctggctaggtgtacctctattaggaactgtattgatggaagattgtctcagccctatcattgagaaaggccttaggcat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534382 131 + 636262 acgttgctttgaatagcttggaagggtggtctttccctttatgacttgttagctggctaggtgtacctctattaggaactgtattgatggaagattgtctcagccctatcattgagaaaggccttaggcat -s simRat_chr6.simRat.chr6 545123 131 + 647215 acattgcttgggatagctaggaagggtggtctttccccctatgccttgtcatctggcctggtgtactctgataagggaatatactgacggaagattctctgagccctatcattgtaaaaggccttagacat - -a -s mr.mrrefChr3 85173 6 + 181019 agcctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534513 6 + 636262 agcctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 545258 6 + 647215 accctt - -a -s mr.mrrefChr3 85179 11 + 181019 cactggagctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534519 11 + 636262 cactggagctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 545265 11 + 647215 cactggaattt - -a -s mr.mrrefChr3 85190 5 + 181019 ccatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534530 5 + 636262 ccatc -s simRat_chr6.simRat.chr6 545296 5 + 647215 ccgtc - -a -s mr.mrrefChr3 85195 91 + 181019 atccacatgaaggtctttctaatagttaaatagagacccgacgctgtccactagaagcagtgtcctgcagacacagagttactataaaaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534535 91 + 636262 atccacatgaaggtctttctaatagttaaatagagacccgacgctgtccactagaagcagtgtcctgcagacacagagttactataaaaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 545302 91 + 647215 atccataccaaggtctttcttatagttaagtagagagccagggttgtcaaccagaagcagtgtcctgcagacacagggttactatgaaaat - -a -s mr.mrrefChr3 85286 40 + 181019 gtgacctctgatattgtctttatggtggactgtaaggctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534627 40 + 636262 gtgacctctgatattgtctttatggtggactgtaaggctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 545393 40 + 647215 gtgacttctgatattgccatttcggttgactgtaaggctc - -a -s mr.mrrefChr3 85326 63 + 181019 atattccccagtaactgcattcggcacttgaactgtaacttgacaggctgttcttttatagtc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534667 63 + 636262 atattccccagtaactgcattcggcacttgaactgtaacttgacaggctgttcttttatagtc -s simRat_chr6.simRat.chr6 545440 63 + 647215 ataatccccactaactgcgtatggcacttgaactgtaatgtgacaggctgttctattatagtc - -a -s mr.mrrefChr3 85389 176 + 181019 gcctcccagattgtagtgtgacacagggcattttgctttcaggcaatggaccggatgagggtcaactaactaccacctgccacttcgctatgggggtcagatgaggtgagtaatacatgtgcttgggttggatccaactatggtaaccaatctggcttggatgattagcaatgctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534733 176 + 636262 gcctcccagattgtagtgtgacacagggcattttgctttcaggcaatggaccggatgagggtcaactaactaccacctgccacttcgctatgggggtcagatgaggtgagtaatacatgtgcttgggttggatccaactatggtaaccaatctggcttggatgattagcaatgctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 545503 176 + 647215 acccctcagattgtaaggaaacacagggcattttgcttttaggctatggctaggatcgaagtcaactaactatcaccagccacttcataatgggggtcaaatgaggtgagtaatataccttcatgggttggatccaattatggtaactaatcttgctgggatgatcagcaatgcac - -a -s mr.mrrefChr3 85565 62 + 181019 attgggaaggaacgccaccacaccccagtagatcggtcatcaatgttatgaagatagtggtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534931 62 + 636262 attgggaaggaacgccaccacaccccagtagatcggtcatcaatgttatgaagatagtggtt -s simRat_chr6.simRat.chr6 545679 62 + 647215 attggcaaagaacgccaccacaccccagcagcttggtcaccaatgttctgaagatagtggtt - -a -s mr.mrrefChr3 85627 43 + 181019 ccataggccatcaatcttgacaccttgcaaggtgtcaaaatct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534993 43 + 636262 ccataggccatcaatcttgacaccttgcaaggtgtcaaaatct -s simRat_chr6.simRat.chr6 545750 43 + 647215 caataggtcatcaatcttgacaccttgcaaggtctgggaatct - -a -s mr.mrrefChr3 85670 89 + 181019 aacttgtgcaattggacaagtattttcgtcccaagcccaacacaggctacagtagtgcaccaccctatccttgctcggatgatatctgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535036 89 + 636262 aacttgtgcaattggacaagtattttcgtcccaagcccaacacaggctacagtagtgcaccaccctatccttgctcggatgatatctgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 545807 89 + 647215 agcttgtgcaattggacaagtatttttgtcccaagcccaacacaggctacagtagtgcctcaccccatcctaactgggatgatatctgg - -a -s mr.mrrefChr3 85759 22 + 181019 tggctgtcaacatagattgaga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535140 22 + 636262 tggctgtcaacatagattgaga -s simRat_chr6.simRat.chr6 545896 22 + 647215 gggCTGTCAACGTATGTTGAGA - -a -s mr.mrrefChr3 85781 64 + 181019 acagtaggagacagtgtttacgaacggacatcactggaaaagaccctcttggtgttttgttctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535163 64 + 636262 acagtaggagacagtgtttacgaacggacatcactggaaaagaccctcttggtgttttgttctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 545918 64 + 647215 ACAGTGAAAGACAGTgtttgcgagcagacatcgctggaaaagatcttcttagcagtttgttctt - -a -s mr.mrrefChr3 85845 27 + 181019 aactgtactcctcaccttgcttggaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535227 27 + 636262 aactgtactcctcaccttgcttggaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 545995 27 + 647215 aattgtacgtcttaccttgcttggaag - -a -s mr.mrrefChr3 85872 30 + 181019 tgactcctccaaacccaaataacacctgaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535255 30 + 636262 tgactcctccaaacccaaataacacctgaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 546022 30 + 647215 tgactactacagatccaaataacacctgag - -a -s mr.mrrefChr3 85902 7 + 181019 aagcact -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535285 7 + 636262 aagcact -s simRat_chr6.simRat.chr6 546053 7 + 647215 aagcact - -a -s mr.mrrefChr3 85909 12 + 181019 cccctgagaatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535298 12 + 636262 cccctgagaatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 546060 12 + 647215 cccctgacaatg - -a -s mr.mrrefChr3 85921 214 + 181019 aagctggtgaagctgacagagttcaaaggtctatggatatccctaggtattgagatcggatagtaccagaacatcaatgggtgggcttagcttcaccatgcaagcttggattgggagcaattgctatgcatgtactggcctaagccaggaggtgtaatagaagtggacaatcggatatagcatatcacatgaatgttttagccttggctgcagg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535310 214 + 636262 aagctggtgaagctgacagagttcaaaggtctatggatatccctaggtattgagatcggatagtaccagaacatcaatgggtgggcttagcttcaccatgcaagcttggattgggagcaattgctatgcatgtactggcctaagccaggaggtgtaatagaagtggacaatcggatatagcatatcacatgaatgttttagccttggctgcagg -s simRat_chr6.simRat.chr6 546077 214 + 647215 aagcacataaagctgatagagttcaaaggtctatggatatccctaggtattgggattgggtactaccaaaacatcaatgggtgggcttagattcaccaggcaagcttggaatgggaacaattgctatgcatgtacaggcctaagtctgggtgtgtaatgcaagtggacaatcggatatagcatatttcacaaacgtctgagccttggctgcagg - -a -s mr.mrrefChr3 86135 72 + 181019 aggttgcaactacaagcagtgccgattctactaggatgggacccagaccctggtgggatgtactgcatgttg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535525 72 + 636262 aggttgcaactacaagcagtgccgattctactaggatgggacccagaccctggtgggatgtactgcatgttg -s simRat_chr6.simRat.chr6 546291 72 + 647215 aggttgcccatacaagcagtgctgaatctactagggtgagacccggaccctggttggaagtactgcatggtg - -a -s mr.mrrefChr3 86207 13 + 181019 ctctctaacataa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535598 13 + 636262 ctctctaacataa -s simRat_chr6.simRat.chr6 546363 13 + 647215 ctctccaacataa - -a -s mr.mrrefChr3 86220 29 + 181019 taagaacacgtgggaaaatgagatatgta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535621 29 + 636262 taagaacacgtgggaaaatgagatatgta -s simRat_chr6.simRat.chr6 546376 29 + 647215 taagaacacctgaggaaatgagatgtgta - -a -s mr.mrrefChr3 86249 31 + 181019 gacagtcctatttcccgaatcacatagacca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535657 31 + 636262 gacagtcctatttcccgaatcacatagacca -s simRat_chr6.simRat.chr6 546405 31 + 647215 gacagtcctatttcctgaattgcgtagacca - -a -s mr.mrrefChr3 86280 137 + 181019 agattccaaccttttcaacagacagtctgagtcatccatcttgcttcctgcaaaaagtgacttgattcaataaatcagttgaccaactatctccttgtactcacatccctaatgtatctggagattcacccaacaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535688 137 + 636262 agattccaaccttttcaacagacagtctgagtcatccatcttgcttcctgcaaaaagtgacttgattcaataaatcagttgaccaactatctccttgtactcacatccctaatgtatctggagattcacccaacaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 546445 137 + 647215 aggttccagccttttccgcagacaatctggatcatccatcttgtttcatgaagaaagtgactttattcaataaatcagttgtccaactatctacttgtactcacatcactaatgtcactggagagtcatcccacagg - -a -s mr.mrrefChr3 86417 30 + 181019 attatttggaaaccctgcacatatcacatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535825 30 + 636262 attatttggaaaccctgcacatatcacatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 546583 30 + 647215 attatttggtggcgctccacaaatgtcaca - -a -s mr.mrrefChr3 86447 96 + 181019 ttggttgtaactggataaggacttgcacccttattttgctcgccattccctcttcctcttcataaacacttcacaaatacccaagtacctgtacat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535855 96 + 636262 ttggttgtaactggataaggacttgcacccttattttgctcgccattccctcttcctcttcataaacacttcacaaatacccaagtacctgtacat -s simRat_chr6.simRat.chr6 546663 96 + 647215 ttgtctctaactggataaggacttgcacccttgttttgcttgccattcctttttcctctttataaacactttgcaaatgccaaagaaattgtacat - -a -s mr.mrrefChr3 86543 43 + 181019 cataggaatcacttagatatcgccaattcattcaggaccataa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535952 43 + 636262 cataggaatcacttagatatcgccaattcattcaggaccataa -s simRat_chr6.simRat.chr6 546759 43 + 647215 catatgaattactgagatatcatcaatttatccgggaccaaaa - -a -s mr.mrrefChr3 86586 94 + 181019 atggattaatgccatatatttcaaccagcagttgattataagctattcctataactcagccgaagggtatcatcagtcacttggatacaatgag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535995 94 + 636262 atggattaatgccatatatttcaaccagcagttgattataagctattcctataactcagccgaagggtatcatcagtcacttggatacaatgag -s simRat_chr6.simRat.chr6 546803 94 + 647215 atggattaattcgatatatttcagtcagcagtggattatgagctattcatgtaactcagccgaagggtatcatcagatacttggatacaatgag - -a -s mr.mrrefChr3 86680 84 + 181019 caaatagcattgggagaacaggctaactctggataagattttggctggcactggcggtacatatttcatgctgaggggaaatca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536090 84 + 636262 caaatagcattgggagaacaggctaactctggataagattttggctggcactggcggtacatatttcatgctgaggggaaatca -s simRat_chr6.simRat.chr6 546897 84 + 647215 cagataggattgggtgaacaggataactctggataaaattttggctgacactggcagtacatgtttcatgctaggagtacatca - -a -s mr.mrrefChr3 86764 18 + 181019 atctgcacatccagaaga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536176 18 + 636262 atctgcacatccagaaga -s simRat_chr6.simRat.chr6 546981 18 + 647215 atctgtacatccaaaaga - -a -s mr.mrrefChr3 86782 101 + 181019 agttccaaatggaactattagaaagacattgcaaggacctataatgctggctatggagtcggtggtaaacacaggtaccgatgatcctttctcggggtggt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536198 101 + 636262 agttccaaatggaactattagaaagacattgcaaggacctataatgctggctatggagtcggtggtaaacacaggtaccgatgatcctttctcggggtggt -s simRat_chr6.simRat.chr6 546999 101 + 647215 agctccaaattgaactattaaaaagacattgcagggatttatagtgctggccatggtgttggtggtaaacacaggtatagatggtcctttcttggggtggt - -a -s mr.mrrefChr3 86883 81 + 181019 ctggtttggccactcgaagggctccatagctctggtaccAAATTTACCTCTAGTCAGCAATCTAATTAGACAAGACTGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536306 81 + 636262 ctggtttggccactcgaagggctccatagctctggtacCCAATTCACCTCTGGTCAGCAATCCAATTAGACAAGACTGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 547100 81 + 647215 ttggtttggccactcgaaggggtccatggctctggaactaagtttgccTCTAGTCAGCAATCTAATTAGATAAGACTGACA - -a -s mr.mrrefChr3 86964 152 + 181019 CATTTGTAAGCTTGTTCTTTATAACAAAGGTGTGTGACATACATATAAATTGTGTAATGACCTGTAGTGTCAACCAATTGGGACCTTATAATGCTTCAGTCTAGAATCATCTTATGAACCATGTGAAATCAATAATGTCAGACCCATTGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536387 149 + 636262 CATTTGTAAGCTTGTTCTTTATAACAAAGTTATGTGACATACATATAAATTGTGTAATGACCTTTAGTGTCAACCAATTGGGTCCTTATAATGCTTCAG---AAAATCATCTTATGAACCATGTGAAATCAATAATGTCAGACCCATTGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 547188 152 + 647215 CACTTGTAATCTTGTGCTTTTTAACAAAGGTGTATGTCATACATATAAATTGTGTGTTGACCTGTAGTGTCCACCAATTGGGACCTTATAATGTGTCCGTCTAGAAACATCTTATGAACCCCGTGAAATGAATTCTGTCAGACACATTGGTC - -a -s mr.mrrefChr3 87116 59 + 181019 ATATCTCCCAAAGTTTTGTGTATATGACGCCTCAAGTGTCTgctgatcattgttcccaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536536 59 + 636262 ATATACCCTAAAGTTTTGTGTATATGACGCCTCAAGTGTCTgctgatcattgttcccaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 547341 59 + 647215 ATATCTTCCAAAGTTATGTGTATGTGACCCTTCAAGTGTCTgccaaacattgtttccaa - -a -s mr.mrrefChr3 87175 36 + 181019 aacatacagaaggcagctgttggattccatgccatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536595 36 + 636262 aacatacagaaggcagctgttggattccatgccatc -s simRat_chr6.simRat.chr6 547401 36 + 647215 aacgcacagagggcagctgtcagattttgccccatc - -a -s mr.mrrefChr3 87211 29 + 181019 tgcagagtctggcccagaggtacctgtaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536638 29 + 636262 tgcagagtctggcccagaggtacctgtaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 547437 29 + 647215 tgcagagtctggcccagaggtaattgtaa - -a -s mr.mrrefChr3 87240 29 + 181019 aacagcaatgaaaactaagtagatgtctg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536670 29 + 636262 aacagcaatgaaaactaagtagatgtctg -s simRat_chr6.simRat.chr6 547466 29 + 647215 gacagcaaggaaaactaagcagatgtcca - -a -s mr.mrrefChr3 87269 126 + 181019 atgctttccaactgaacaatttgctgtttctagaaacaaagctgaattcacacttaaatgaggatgagagtaaatgcattttagacgccttgaacatcaaaaggtcctaaatagaaatgagaaaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536699 126 + 636262 atgctttccaactgaacaatttgctgtttctagaaacaaagctgaattcacacttaaatgaggatgagagtaaatgcattttagacgccttgaacatcaaaaggtcctaaatagaaatgagaaaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 547502 126 + 647215 atgatttgcaactgaataatttgctggttctagaagcaaggctgagttcacacttaaatgaggatgcgagtaattgctttctagacactttgaacatcaaaaggtcctatatagaaataagacaaa - -a -s mr.mrrefChr3 87395 11 + 181019 gacaacaaata -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536826 11 + 636262 gacaacaaata -s simRat_chr6.simRat.chr6 547628 11 + 647215 ggtaccaaatT - -a -s mr.mrrefChr3 87406 22 + 181019 attagcagttatgtagaaatgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536837 22 + 636262 attagcagttatgtagaaatgt -s simRat_chr6.simRat.chr6 547684 22 + 647215 GTTTACATTTCTACAGAACTGT - -a -s mr.mrrefChr3 87428 15 + 181019 aatcacacacatctg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536859 15 + 636262 aatcacacacatctg -s simRat_chr6.simRat.chr6 547710 15 + 647215 AATTACTTGCTGCTA - -a -s mr.mrrefChr3 87443 17 + 181019 tacagccaagTCCGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536879 17 + 636262 tacagccaagTCCGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 547725 17 + 647215 TACAGCAAGGTTCCTCA - -a -s mr.mrrefChr3 87460 25 + 181019 GCAAATCACTTCAGGAATAGAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537116 25 + 636262 GCAAATCACTTCAGGAATAGAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 547742 25 + 647215 GCAAATCACTTCAGGAATAGAATTT - -a -s mr.mrrefChr3 87485 5 + 181019 CCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537141 5 + 636262 CCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 547771 5 + 647215 CCCTG - -a -s mr.mrrefChr3 87490 89 + 181019 TCTGATTCATGTAACCATTCCCTTAACGAAATGTCGGAGATATCGTAGATTTTGGCCCCCATTCTGATGAAAGCAACCAGTTCCTATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537146 89 + 636262 TCTGATTCATGTAACCATTCCCTTAACGAAATGTCGGAGATATCGTAGATTTTGGCCCCCATTCTGATGAAAGCAACCAGTTCCTATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 547777 89 + 647215 TCTGATTCATGTCACGATTCCCTTGATGAAATGTCAGAGGTATGGTAGACTTGGGCCCCCATTCTGGTTTAAGTAACCAGTTCGTACAA - -a -s mr.mrrefChr3 87579 48 + 181019 TAGAATGTCACCTGCTCTCCTTGGAACACCATGGCCACAGATTGAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537235 48 + 636262 TAGAATGTCACCTGCTCTCCTTGGAACACCATGGCCACAGATTGAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 547867 48 + 647215 TAAAATGTCCCATGACCTCCTTGGATTGCCAGGGCTAAGGATCAAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 87627 154 + 181019 TGTAAATGAGCTAGAGAAGTATAATCAGCCCAACTAATTTTAGAGTTTCTGATGCCCAACAGGCTTGCATAAGTTTATACTTGCTGCTAGTATGCAGGTCCAAATCCTAGGAACTGTGTTGTTGATACAATGCGCCACTTCATGCCCACAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537285 147 + 636262 TGTAAATGAGCTAGAGAAGTATAACCAGTCCAACTAGCTTTA-------TGATGCCCAACAGGCTTGCATAAGTTTATACATGCTGCTAGTATGCAGGTCCAAATCCAAGGAACTGTGTTGTTGATACAATGTGCCACTTTATGCCCACAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 547915 154 + 647215 TGTATGGGAGCTAGAGAAGTGTAATCAGCCCAGCCAATTTTAGAGTTTCTAATGCCCAACAGGCTAGCATAAGTTTATACTTGCTGCTAGTATGCAGGTCCAAATCTTAGGAACTGTCTTGTTGATACATTGCGCCACTTCATCCCTACAGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 87781 286 + 181019 GTATCTCACCACTGGGATTGGCATGACTCACTGTATGATCAACTATCCATCAGTATTGATCACTGCTTGTCCTAGCAATATTTCAAGCAGAAGCCAGTAGTATAAGGTTCTACCTAGAGGATCATAAACACATCTTCCCTACTACTTTGCTCCCCCTCTAGACAAAGCTTATTTGTAACATTGCCCTAACCATGACCTACAATCCAAGCTTGTATATAGTTGATAGCTCTTGGCTTATTACCTGGGTGCTGATATGAGCTCAACACTGGGGCTCAAACCTTAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537432 286 + 636262 GTATCTCACCACTGGGATTGGCATGACTCACTGTATGATCAACTATCCATCGGTATTGATCACTGCTTGTCCTGGCAATATTTCAAGCAGAAGCCACTAGTATAAGGTTCTACCCAGAGGATCAGAAACACATCTTCCCTACTACTTTGCTCCCACTCTAGACAAAGCTTATTTGTAAGATTGCCCTAACTATGACCTACAATCCAAGCTTGTATATAGTTGATAGCTCTTGGCCTATTACCTGGGTGCTGTTATGAGCTCAACATTGGGGCCCAAACCTTAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 548099 267 + 647215 GTATTTCACGACTGGGATTGGCATTACTCACTGTATGATCTACAATGCATCACTATTGATCACTGCTTTTCCTAGCAATATTTCAAACAGAAGCCAGTAGTATAAGGTTCTACCTGGAGGATCAT-------------------CTTTGCTCGCCCTCTAGACATGGCTTCTTTGTAACATGACCCTAACCATCGCCTACAATCCAAGCTTGTATATAGCTGATAGCTCTTGGCTTATTACCTGGGTGATGATATGAGCTCACCACTGGGGCTCAAACCTTTATTT - -a -s mr.mrrefChr3 88067 94 + 181019 ACCAACCCACCCCACCACCTTTACTTATTGCTTTAACACACTAGAACGAATCCTCGTGTATCCAAATTTATTGTTTAGTAAATTCAACTATGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537718 94 + 636262 ACCAACCCACACCGCCACCTTTACTTATTGCCTTAACACACTAGAACGAATCCTCGTGTATCCGAATTTATTGTTTAGTAAATTTGACTATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 548367 94 + 647215 ACAATCCCACCCCACCACCTTTACTTATTGGTTTCACACACTACAAGGAATCCTTGCGTATCCAAATTTGTTGTTTAGTAGATTCAACTTTGGT - -a -s mr.mrrefChr3 88161 118 + 181019 TACTTAGACTTGTACTGTGCATGCAGTGGGCCGGTTCAGGCCATAATTCTACTGTACATAACTATCATTAGAAACCCTAATGTAATAGGACATGCTGATCCTCAGATACCTGCACAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537812 118 + 636262 TACTGAGAGGCTTACTGTGCATGCAGTGTGCTGGTTCAGGCCATAATTCTACTGTACATTACTACTATTTAAGACCTTAATGTTATAGGACATGCTGATCCTCAGATACCTACACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 548463 118 + 647215 CACTTATACTTGTCCTGTGCATGCAGTGGGCCAGTTCAGGCCATGGTTCTACTGTACATAACTATCATTAGAAACCCTAATGTAATAGGACATGCTGACCCTCAGATACCTGGACAAA - -a -s mr.mrrefChr3 88279 343 + 181019 TCCAATCCTGATTGCAGTTTTGTAAACTCTTGGCCAATCGTGTTGTATAGATACACCCTACCTTTGTGATACAGCCACTGTCTGGTGATTTATAGCTCAGGCACTGGAAGATTTTAAGGCCTGTCTGTCACTCTAGGACTCCCGGAGTGTCCCTGTATTAGCATGGAGCCTTTGAGCAGGCAGCGAACATCACTGGCAGGCACCTTTGACATTTTTTCAAGCATGGGTTTCACTGGCAGACCTGAAAGTTAAGGATGTCTTCAAGTAGTATAGCACAGGAGTTTCCTCTGTATAGATGTCAGAGTTTGACTGTCCAAAACAGTGCATATCCACCCCTTGAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537930 343 + 636262 TCCAATCCTGATTGCAGTTTTGAAAACTCTTGGCCAATCGTGTCGTATAGATACAGCCTACCTTTGTGATACAGCCACTGTCTGGTGATTTATAGCTCAGGCATTAGAAGATTTTAAGGCCTGTCTGTCACTCCAGGACCTCCGAAGTGTCCCTGTATTAGCATGGAGCCTTTGAGCAGGCAGCGAACATCACTGGCAGACACCTTTGACATTTTTTCATGCAGGGGTTTCACTGGCTCACCTGAAAGTCAAGGATGTCTTCAAGTAGTATAGCACAGGAGTTTCATCTGTATAGATGTCAGAGTTTGACTGTCCAATACAGTGCATATCCACCCCTTGAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 548584 327 + 647215 TTCAATCCTGATTGCAGTTTTGTAAACTCTTGGCCAATCCTGTTGTATAGATGCACCCTACCTTTGTGATACAGCCACTTTCTGGTGATTTGTAGCTCAGACACTGGAAGGTTTTAAGGCCTGTGTTTCACTCTGGGACTCCCGGAGTGTCCCCGTTTTCGCATGGAGTCATTGAGCGGGCAGAGAACATCATCGGCAGGCACCTT-GACATTTCTCCCAGCGTGGGTTGCACTAGCAGACCTGAGACTTAAGCATGTCCCCAAGTAGTGTAGCACAGGAGTTTTCTCTGTATAGATGGTAGGGTTTGACTGACCACAACGGTGCCTA--------------- - -a -s mr.mrrefChr3 88622 37 + 181019 CATGCCTTATGTGTGCTCAGCAGTGTATGTTGGATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538277 35 + 636262 CATGCCTTATGTGTGCTCAGCAGT--ATGTTGGATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 548911 18 + 647215 -------------------GCAGTGTATGTCGGATAC - -a -s mr.mrrefChr3 88659 18 + 181019 AGTTAGGCATTTAGGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538313 18 + 636262 AGTTAGGCATTTAGGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 548929 18 + 647215 AGTTATGCATGTAGGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 88677 18 + 181019 GCCATTTAGGTGTTGGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538331 18 + 636262 GCCATTTAGGTGTTGGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 548948 18 + 647215 GCCATGTAGGTGTTGGAC - -a -s mr.mrrefChr3 88695 18 + 181019 ATTTGTAAAATTTAATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538349 18 + 636262 ATTTGTAAAACTTCATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 550506 18 + 647215 atTTGTAAAATTTAATAG - -a -s mr.mrrefChr3 88713 60 + 181019 CATTAGCCTGTCCCATACATAAAAGTTAACACCACAAAGGCACCAATCATTATGTTCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538367 60 + 636262 CATTAGCCGGTCCTATACATAAGAGTTAACACCACAAAGGCACCAATCCTTATGTTCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 550526 60 + 647215 CATTAGCCTGTCCCATACATAAAAGTTAATACCACAAAAGCACCAATCATTATGTTCATA - -a -s mr.mrrefChr3 88773 221 + 181019 GAGATCTGGTCTTTTCAAGCTACACACTCGACTCTCTCCTGTGTAGCCTCGCCCCTGTGCAGAATAGCATAATAGCTCCAATATGCAGGTGCTCAAAACTTGGGTGCCTTGAGCCACTTATAAACCATAGGCAGGCCATAGCATGGTTATTTCCTAAGTGGACATCTTGTTTGTAAAACCAAGCTGATTTGCCATCTGCAGAGGGGTGTTAAATCTATGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538481 220 + 636262 GAGATCTGGTCTTTTCTAGCTACACACTCGACTCTCTCCTGTGTAGTCTCGCCCCTGTGCAGAATAGCATAATAGCTCCAATATGCAGGTGCTCAAAACTTGGGTGCCTTGAGCTACTTATAAACCATAGGCAGGCCATAGCATGTTTATTTCCTAAGTGGGCATCTTGTTT-TAAAACCAAGCTGATTTGCCATCTGCAGAGGGGTGTTAAATCTATGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 550586 174 + 647215 GAGATCTTGTCTTTTCAAGCTACACAC-----------CTGTGTAGC------------------------------------TCCAAGTGCTTAAAACTCAGGTGCCCTAAGCCACTTATGAACCATTGGCAGGCCATAGCATGGTTATTTCCTAAGTGGACATCTCGTTTGTGAAATGAAGCTGACTTGCCATCTGCAAAGGGGCCTTAAATCTGTGCA - -a -s mr.mrrefChr3 88994 139 + 181019 TCAATGGTCTTATATTGCTGCTATAATTTTTCTGGCCAATTTGGGTTGTATGTGGTCCTATGTACATACTTACTCCACAGACTTAACTATGCTACCCTGTCCACTTACTTAACAGAAGGGTATCATTGCCTTGATTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538701 139 + 636262 TCAATGGTCTTATATTGCTGCTATAATTTTTCTGGCCAATTTGGGCTGTATGTGGTCCTATGTACATACTTACTCCACAGACTTAACTATGCTACCCTGTCCACTTACTTAACAGAAGGGTATCATTGCCTTGATTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 550772 138 + 647215 TCAAGGGTGTTATATTGCCGCTATAATTTTTTTAGCCCAATTCGGTTGTATGTCGTCCTGTGTACATACTTACACCACAGACTTGA-TATGCCACCCTGTTCACTTACTTAACAGAAGGGTATCATAACCTGGATTATT - -a -s mr.mrrefChr3 89133 118 + 181019 AACTAATACATACACTAGTCATTATATGCCTCAATTTACATAGATTTTAGCCTAGACATGGAAAAGTCTGTAGTGGACTCCTGGATGACTTGTGCCAACATACTACATGCCAGATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538840 118 + 636262 AACTAATCCATACACAAGTCATTATATGCCCCAATTTACATAGATTTTAGCCTGGGCATGGAAAAGTCTGTAGTGGACTCCTGGATGCCTTGTGCCAACATACTACATGCCAGATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 550913 110 + 647215 ACCTAATACATAAACTAGTTATTATATGCCTCCATTTTCATAGTTTTTAGCCTAGACATGGA-------GTAATGGACTC-TGGATGACTTGTGCCTACATACTACATGCCAGATTCA - -a -s mr.mrrefChr3 89251 121 + 181019 ATAAAGATGGTCTCCGTGTCATATGATAAAACGAGCCAAATATAGACAATCAATAGGTTTATGTTACTATATGGTATACTACCAATGAATTGAATTTAATTAGTTTGTGTTCATTACATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538959 121 + 636262 ATAAAAATGGTCTCCGTGTCATATGATAAAACGAGCCAAATATTGACAATCTACAGGTTTATGTTACTATATGGTATACTACCAATGAATTGAACTTAATTAGTTGGTGTTCATTACATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 551023 99 + 647215 ATAAAGATGATCTCCGTGTTACATGATAAAACGAGCCGAATATAGACAATCAATAGGTT----------------------CCAATGAATTGAATTTAATTAGGTTGTGTTCATTACACTA - -a -s mr.mrrefChr3 89372 86 + 181019 GCAAACCGAAAAACAGTGCAATATACTAGACCTGGAACCACAAGTTACTATACATCAAATAATTCGTTCTGTTTCTCTCAGGCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539146 86 + 636262 GCAAACCGAAAAATAGTGCAATATACTAGACCTGGAACCACGAGTTTCTATACATCAAATAATTTGTTCTGTTTCTCTTAGGCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 551122 86 + 647215 GCAACCCCATAAACTGTGCAATATAGTCGACCTGGAACCACAAGTTACTATACATCAATTAATTCATTCTGTTTCTCTCAAGTCTC - -a -s mr.mrrefChr3 89458 70 + 181019 AACATAATAATTGAGCCAAATTGAGTTGGTGGGTCTACTAAGCCACCAGACTGGCCAGACAGCTGCAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539254 70 + 636262 AACATAATAATTGAGCCCAATTGAGTTGGTGGGTCCACTAAGCCACCAGACAGGCCAGACAGCTGCAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 551208 61 + 647215 CACATAATAATTGAGACACATTGAGTTCTTGTGTCTACTAAGCCACCAGGCTG---------CTGCAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 89528 123 + 181019 GAGTTCTAGGTATAGTAATATGcaaagacagcaatatttgataactggtgccagagtatttggtgtcctatctgttaggagctAAACTAAAATGAGCTGCATGGCACCCCTGGCCCTCTCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539325 121 + 636262 GTGTTCTAGGTATAGTAATATGCAAAGACAGCAATATTTGATAAC--ATGCCAGAGTATTTGGTGTCCTATCTGCTAGGAGCAAGACTAAAATGAGCTGCATGGCACCCCTGGCCCTCTCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 551269 123 + 647215 GAGTTGTAGGTATTGTaatacacaaaggaagcaatattcatcaactggtgccagagtatttggtatcctatctcttgagagctAAACTAAAATGAGTTGCATGGCATCCCTGGCCCTCTCAGT - -a -s mr.mrrefChr3 89651 179 + 181019 CTAGAGGAGTAATATGGACTCCACCAGACAAGGAACTACATCGTGTGGAATTCTACCCTACTCCTCATTCCTAATCctttcagctgccaaagtgtgttccagaggattatttgggtcacaggattcaatattctgacattaaaatgacttgcaagcttgagacaccaaggaaggtagag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539453 178 + 636262 CTAGAGGAGTAATATGGACTCCACCAGACAAGGAACTACATTGTGTGGAATTCTGCCCTACTCCTCATTCCTACTCctttcagctaccaaagtgtgttccagaggattatttgggtcacagaattcaatattctg-cattaaaatgacttgcaagcttgagacaccaaggaaggtagag -s simRat_chr6.simRat.chr6 551392 179 + 647215 CTAGAGGGGTAAGATGGACTCCACCAGACAAGGAAGTACATCATTTGGCATTCCACCCAACTCCCCATTCCTAATCctgtcagctgccaaagtctgttccagaggattatttgggtcacatgactcaatattctgacattaagatgtcttgcaagtttgtgacaccaaagaagggagag - -a -s mr.mrrefChr3 89830 98 + 181019 aaactgaggcttggtctacaagatggggatactacagTTAACTGcAAACCTACACAATATGTAATGTATTCATCATAAGAAGGCTAGCCTCATGGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539632 98 + 636262 aaactgaagctcagtctaccacatggggatactaCAGTTAACTGCAAACCTACACAATATGTAATGTATTCATCATAAGAAGGCTAGCCTCATGGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 551571 97 + 647215 aaactgaggcttggtctacaagatggggatactaccaCCAACTG-AAACCTACACAATATGTACTATATTCATCATAAGAAGGCTAACCACATGGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 89928 41 + 181019 AATATACAAAACTAACAATGGGCAAAGAATGTGAATAGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539730 41 + 636262 AATATACAAAACTAACAATGGGCAAAGAATGTGAATAGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 551672 41 + 647215 AACATATGAAACTAACAATGGGCAAGGAATGTGAATAGGTG - -a -s mr.mrrefChr3 89969 126 + 181019 CTAGGGAAGATATCCCTTAAGGATATACTAGTGCATAGCCCACTTTAGTGGCTGCGTTTTAACTGACATAGAGAAGGATTATAAACACTAATAACATAACTAATCAACCCCAAGGGAGACAGTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539771 126 + 636262 CTAGGGAAGATATCCCTTAAGGATATACTAGTGCATAGCCCACTTTAGTGGCTGCGTTTTAACTGACATAGAGAAGGATTATAAACACTAATAACATAACTAATCAACCCCAAGGGAGACAGTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 551718 126 + 647215 CTAGGGAGGATATCCCTCAAGAATAGACTTGCACATTGCCTGCTTTAATGGTTGTGGTTTAACCGACTTAGAAGAGGACTATAACCACTAATAACATAACTAATCAACCCCAAGGGAGACGGTAGT - -a -s mr.mrrefChr3 90095 9 + 181019 GCTGTCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539966 9 + 636262 GCTGTCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 551844 9 + 647215 GCTGAGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 90104 84 + 181019 TTAAAATATAAATGAAACAAGAGTGAGACCTTAAATCAGTTCTATggagtggtcattagaatacttcagagtaaaaatgagaca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539976 84 + 636262 TTAAAATATAAATGAAACAAGAGTGAGACCTTAAATCAGTTCTATGGAGTGGTCATTAGAATACTTCAGAGTAAAAATGAGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 551853 84 + 647215 TTAAAATATAAAAGAAATAAGGGTGAAACCCTAACTCAGTTCTATgaaatggtcattagactacttcagagtaaaagtgagaaa - -a -s mr.mrrefChr3 90188 14 + 181019 tttttgagaaaatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540060 14 + 636262 TTTTTGAGAAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 551964 14 + 647215 ttttcgagaaactt - -a -s mr.mrrefChr3 90202 36 + 181019 gagaataataAAAGCCTTGAGGTTTGATGCAAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540074 36 + 636262 GAGAATAATAAAAGCCTTGAGGTTTGATGCAAGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 551979 36 + 647215 aagaagaataAAAGCTTTGAGGTTTGATACAATTGT - -a -s mr.mrrefChr3 90238 66 + 181019 TCAAAAAACAAAAAAATAGAGGTGAAGGATCCACAGTCTAAGAATGGATTCGAAGATGAGACATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540110 66 + 636262 TCAAAAAACAAAAAAATAGAGGTGAAGGATCCACAGTCTAAGAATGGATTCGAAGATGAGACATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 552017 66 + 647215 TGTCAAAATAAAAGAATAGAAGTGAAGGATCCACAGTCTAAGAATGGATTCAAAGATGAGATGTGT - -a -s mr.mrrefChr3 90304 234 + 181019 AATGCAGAGCTCACTTAGTTAaatgtgatccacctagtgaattgaaaagcaagacctgggaaaatgaaaagaagctttcatatccactaagataattccaagaagcatgccaggcagtaggaatactccatgcagttaaagacctgttggaaactgttcccatcaaatttacaactcttaagaaggggtcacttgtttgacagatcacatacttcctgtgcattcaccacaaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540177 234 + 636262 AATGCAGAGCTCACTTAGTTAaatgtgatccacctagtgaattgaaaagcaagacctgggaaaatgaaaagaagctttcatatccactaagataattccaagaagcatgccaggcagtaggaatactccatgcagttaaagacctgttggaaactgttcccatcaaatttacaactcttaagaaggggtcacttgtttgacagatcacatacttcctgtgcattcaccacaaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 552083 234 + 647215 GATGCAGTGCTCAATTAGTTTAATGTGATCCAGCAAGTCAATTCAAAACCCAGATCTGGGAAATTGAAAAGAAGTTGTCATATCCAGTAAGATAATTCCAAGAAACATGCCAGGcagtaggcatactccatgtagttaaggtcctgttggaaactgttcccaacaaatttacaaccttaaagaaggggtcacttgtttgacaggttgcatacttcttgtgcattcaccacaagt - -a -s mr.mrrefChr3 90538 64 + 181019 ctcaaattgagcacagtttcaaaacataTAGAACATATTGTAGCACTACATTTAACCCCTTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540411 64 + 636262 CTCAAATTGAGCACAGTTTCAAAACATATAGAACATATTGTAGCACTACATTTAACCCCTTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 552328 64 + 647215 cttaaattgatcccagttacaaaacataTAGAACATACTGTGGCACCACACTTAACCTCTTTTC - -a -s mr.mrrefChr3 90602 72 + 181019 TATTTTTAGATGTCAATTATGTGATACTTATCAAGGGGCAATTGGGGTAGAAAGAGGGGTGTTCAACTGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540476 72 + 636262 TATTTTTAGATGTCAATTATGTGATACTTATCAAGGGGCAATTGGGGTAGAAAGAGGGGTGTTCAACTGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 552392 72 + 647215 TATTTTTAGATGTCAATTATGTGATACTTGTGGAGGGGCAATTATGGTGGTAGGAGGGATGTTCAACTGACA - -a -s mr.mrrefChr3 90674 30 + 181019 CAGCCCTCTAGCTGCTCTGCCTCTTAGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540550 30 + 636262 CAGCCCTCTAGCTGCTCTGCCTCTTAGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 552464 30 + 647215 CAGCCACCTACCTGCTCTGACTCTCAGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 90704 144 + 181019 TTAATCAATGTTAGCTTCTTCCATTCTACCTACCTTGACTCAGAGTGGTAAGGCAAACTTCATTAGACTGATTAGTTATGCCCTCAGAGCCTTCATCCCTGGTAAAATAAGGGGAAATGAGTAGAAGTGATAGCCCTCATCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540583 144 + 636262 TTAATCAATGTTAGCTTCTTCCATTCTACCTACCTTGACTCAGAGTGGTAAGGCAAACTTCATTAGACTGATTAGTTATGCCCTCAGAGCCTTCATCCCTGGTAAAATAAGGGGAAATGAGTAGAAGTGATAGCCCTCATCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 552494 144 + 647215 TTAATCAGTGTTAGCTTCTTCCATTGCACCTACCTTGACTCAGAGTGGTAAGGCAATCTTCATCAGCCTGATTAATTATGTCCTCAAAGCATTCATCCCTGGTGAAATAACAGGGAATGAGTGGAAGCAATAGCCCTAGTCAAA - -a -s mr.mrrefChr3 90848 118 + 181019 TTTTGTCTCTTAATTATTTTTGTGTGCTTCTAGCTCCTTAAACCCTTAGCTGCTCTAGTCTTGATAGGGCCCCAGTGCATGCTGTGTAGGTAATGGTGGCTATCGGGTGTTGACATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540731 118 + 636262 TTTTGTCTCTTAAGTATTTCTGTGTGCTTCTAGCTCCTCAAACCCTGAGCTGCTCTAGTCTTGATAGGGCCCCAGTGCATGCTGTGTAGGTCATGGTGGCTATCGGGTGTTGACATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 552638 107 + 647215 TTTTGCCTCTTGATTATTTTTATGTGCTTCTAGCTCGTTAAACCCTTGGCTGGTCTAGTCTTGA-----------TGCATACTGTATAGGTAATGGAGGCTATCGGGTGTTGACATTG - -a -s mr.mrrefChr3 90966 48 + 181019 CTTAGTGAATCTTTCTGTTTTAATGCAGAGAAAATTAGCTATTTACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540884 48 + 636262 CTTAGTGAATCTTTCTGTTTTAAGGCAGAGAAAATCAGCTACTTACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 552745 48 + 647215 CTTAGTGAATCTTTATGTTTTAATGCAGAAAAAATTAGCGATTCACTG - -a -s mr.mrrefChr3 91014 54 + 181019 TTGTGAATTGCAACTCACACTATATCAAGCGAAATAAAAATAATAATCATCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540942 54 + 636262 GTGTGAATTGCAACTCACACTATATCAAGCGAAATAAAAATAATAATCATCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 552793 54 + 647215 TTGTGAATTGCCACTCACACTATATCAAGCACCATAAAAATAATAATCATCAAC - -a -s mr.mrrefChr3 91068 6 + 181019 AGTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541013 6 + 636262 AGTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 552847 6 + 647215 AGTACA - -a -s mr.mrrefChr3 91074 146 + 181019 AATAGCTTGGTAGTATATCCCTGATAACACTACCACCTGCCCTCTGTATAGTACAAATTCTACACCTGTTCATATTTCTTAGTGATTCATTTGTCTCTCATAGACTGATGTGAGGTATATGGAGGAATCTCCAATTCCAGTACTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541022 146 + 636262 AATAGCTTGGTAGTATATTCCTGATAACACTACCACCTGCCCTCTATATAGCACAAATTCTACACCTGTTCATATTTCTTAGTGATTCATTTGTCTCTTATAGAGTGATGTGAGGTATATGGGGGAATCTTCAATTCCAGTACTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 552853 145 + 647215 AATAGCGTGGTAGTATATCCCTGATAACACTACCACCTGCCCTCTGTATAGTACACATTCTACACCTGTTCATATGTCTTAGTGATTCATTTGTCTCTCATGGACCGA-GTGAGTTATATGGAGGAATCTCCATTTCCAGTACTGA - -a -s mr.mrrefChr3 91220 219 + 181019 TTAGGGCTTGGGCAGCCATGATATTTAGGAGATAATCTGCTATGATTCACTGTTGATCTACTTGTCATTGGCTCACAAAAAGTTGTGGCCCCAAGTTAGATTGAGTAGGGATTTGTAACCTCAGATATGGCTTGTGAAGGGCACACACCTTAACTAATATGACTCCAACTCGCATACATATTCTAACTGTGCCTGCCTTAAGCTAACTACTGTCCTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541199 218 + 636262 TTAGGGCTTGGGCAGCCATGATATTTAGGAGATAATTTGCTATGATTCGCTGTTGATCAACTTGTTGTTGGCTCACGAAAAGTTGTGGCCCCAAATTAGATTGAGTAGGGATTTGTAACCTCAGATATGGCTTGTGAAGGGCACACATCTTATCTAATATAATTCCA-CTCGCATCCATATTCTAACTAGGCCTGCTTTAAGCTAAGTACTGTCCTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 552998 218 + 647215 TTAGGGCTAGGGCAGCCATGATATTTAGGAGATAATCTGCTATGATTTACTGTTGATCTATTTGTCATTGGCTCACAAAAAGTTGCAGCCCCAAGTTAAATTGAGTAGGGATTTGTAACCTCAGACGTGGCATTTGAAAGGCACATACCCGAACTAATATGACTCCAACTTGCACACATATTCTAACTGTGCCTGCCTTAAGCGAACTACTGTC-TGTG - -a -s mr.mrrefChr3 91439 48 + 181019 TTTAAAGTGGGAGATGGAATTAGTTGAATTTCAAAAAGTGAGAGTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541472 48 + 636262 TTTAAAGTGGGAGATGGAATTAGTTGAATTACAAAAAATGAGAGCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 553216 48 + 647215 TTTAGAGTGGGAGATGGAATTAGTTGAGTTTCAAGAAGCGAGAGTCTT - -a -s mr.mrrefChr3 91487 187 + 181019 ACTATGGTAGCCTTACCTGGGCCGTGAATAAAGTGACCCCTTAAGCCACAGGGCACCTAGCGCATATGAGTGGGGTGAGTAATTAATCACCTGCAGTCCACTACCACCCTAACATTGCCTATAACTAAATTCACCCCAGCCCATTGTTGGACTAGGACTGAAGGGCATTATGGGATGTACTGTAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541520 187 + 636262 ACTATGATAGCCTTACCTGGGCCGTGAATAAAGTGACCCCTTAAGCCAAAGGGCACCTAGCGCATATGAGTGGGGTGAGTAATTAATCACCTGCAGTCCGCTACCACCCTAAAACTGCCTATAACTAAATTCACCCCAGCCCAATGTTGAACTAAGACTGATGGGCATTATGGGATGTACTGTAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 553265 187 + 647215 GCTAGGGTAGCCTTACTTGGGCCATGAATAAAGTGACACTTTAAGCCACAGGGGACCTAGCACATGTGATTGGGTTGAATCATTAATCACCTGCAGTCCACTACCACCCTAACATTGCCTATAACTAAATTCACCACAGACCATTGTTTGACTAGGACTGAAGGGCATTATGGGATGTACTATAATC - -a -s mr.mrrefChr3 91674 96 + 181019 ACTATACCAGGGCCAAGGTGAGGTTACATGTAAATGTCTCAATATTTGATGTGGTCCACAATTTCCCCTTATTAGCATGGAATTGAACTTTTTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541717 96 + 636262 ACTATACCGGGGCCAAGGTGAGGTTACATGTAAATGTCTCAATATTTGTTTTGGTCCACAATTTCCCGTTATTAGCATGGAATCGAACTTTTTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 553452 78 + 647215 ACTATACCAGGGC------------------AAATGTCTCAATATTTGATGTGGTCTACAATTGCCCCTTATTAGTATGAAATTGAACTTTCTTTG - -a -s mr.mrrefChr3 91770 46 + 181019 CATCCTGCTTGCAGGCTTTTAACCATCCACCAGGAAACATAGGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541836 46 + 636262 CATCCTGTTTGCTGGCTTTTAACCATCCACCAGGAAATGTAGGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 553530 46 + 647215 CACTGTGCATGCAGGCTTTTAACCATCCACCAGGAAACATAGGTCT - -a -s mr.mrrefChr3 91816 488 + 181019 ATGGTATTGGCTCTAGTTGCAAGATATGATCTTGGTTAGACTTTACCATGTCATCTGGTTACTATTTTTGATCATCATCTAGGGGCATGTACACATCAACTCCTGCCTGGAGACAGAGGTTGAAGAATAGACATAACAGCAGGagaaatcccatttcagccataagcttgttccctctccacagcattctgactatttaaagagttcagtagtacctggttcgtgggcatatgctaagttctttactacttatggctgtcctcgcaacctgaaaactctcagatctaaaagctggaacccctaaggtgGTATCACATGTGGCTAGTCgCATTATAAAACTGGAGCCCACCAAGCTGTGTGACTTGCAAAGAGGTCTCTTGGATGGTTTCTGAAGCATTGTCACACTGGGATGTTGACAGCTCCAGGAGACTTGTTCACATTGCTTAAGTGGCAGCCACACAAAAAGGTTAGCCTTTAGATAGGCACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541882 458 + 636262 ATGGTGTCAGCCCCAGTTGTAAGAAATGATCTTGGTTGGGCTTCACCAAGTCATCTGGTTACTAATTTTGATCATCATCTAGGGGCATGCACACATCAACTCCTGTCTGGAGACAGGGGTTGCAGACTAGACATAAAAGCAGGagaaagtccatttcagccataagcttgctccctctc---agcattctgactatttaaagagttcagtagtacctggt----gggcatatgctaggtt--------------actgtccttgcaacctgaaaactctcagatctaaaagctggaacccctaaggtgGTAACACGTGTGGCTAGTCGCATTGTAAAACTGGAGCCCACCAAGCTGTGTGTCTTGCAAA---------TGGATGGTTTCTGAAGCATTGTCTCACTGGGATGTTGACAGCTCCTGGAGAATTGTTCACATCACTTAAGTGGCAGCCACACAAAAAGGCTAGCCTTCAGATAGGCACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 553725 487 + 647215 GTGGTATTGGCTCTAAGTGCAAGATACAATCTTGGTTAGACTTTACCATGACGTCTGGTTACTATTTTTGATCATCATCTAGGGGCATGTACACAACAACTCCTGCCTGGAGACAGAGATTGAAGAATAAATATAACAGCAGGagaaatcccatttcagccataagcttgttccctctccacagctttctgactatttaaagagttctgtggtacttggttcgtggtcatatgctaagttctttactaCTTATGGCTGTCCTCACTACTGGAATATTCTACGATCCAAAAGTTATAACCCCTAAGGTGGTATCATATGTAGCTAGTC-CATTATAAAACTGGAGCCTGCCATGCTGTGTGACCAGCAAAGAGGTCTCTTGGATGGTTTCTGAAGCATTGTCACACTGGCATGTTCATAGTTCCAGGAGACTCGTTCACATTGCTTTAGTGGCTGCCACACAAAAAGGTTAACCTTTTGATAGGCGCTA - -a -s mr.mrrefChr3 92304 63 + 181019 TACGACTAGAGCTACTGTTATTCATATATTCAGCATTTGCCCTATTGCTGTTAGCCCTAGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542340 63 + 636262 TACAACTAGAGCTACTGTTATTCATACATTCAGCATTCGCCCTATTGCTGTTAGTCCTAGGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 554213 63 + 647215 TATGAGTAGAGCTAGTGTTATTTATATATTCAGCATTTGCCCTATTGCTGTTAGCCCTAGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 92367 81 + 181019 TTCCCTCCACCTAATTTCAGCCCGATGTGGTAAATTGGATAAACACTATTGGTAAGGTACATCCATGTGTTTGATATAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542404 81 + 636262 TTCCCTCCAACTAATTTCAGGCCGATGTGGTAAATTGGATAAACACTATTACTAAGGTACATTCATGTGTTTGATATAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 554276 69 + 647215 TTCCCTCCACCTAA---CAGCCGGGTGTGGCAAA---------CACTATTGGCAAGGTACATCCTTGTGTTTAATATAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 92448 402 + 181019 ATGAAAGCAATCATTTAGTGTTTCTGTACTCACTAAATCCAGTCATCCTTCACTAATGGTACTTCCATGGTTCATTGGGAGGATTTACCACACCAGAGGGAATTACACAGACCCGACTGTATTATATCTCCACTAAAGCCCCTTGGGAGGTGTCAAAGAAGTGTGCCATATTCATGTGCAGAAATCTGGTGTCTCAGGTACCATTGAGATCGCTCAACAGGTGCCAGGGCAGGGTGAATCATCTATAAGTTTAGTATTAAGGGACCTAACTCATTGGATGTGTGGGTGAGCTTTTGCCTATTGAAACATAGTATATATACACAGGCACAAGTTATTAGCCAGGACAAAACTTGCCAGATATTTATATGCAGCATGCAAAACCATATATTTACATGGAACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542485 389 + 636262 ATGAAAGCAATCATTTAGTGTTTCTGTACTCACTAATTCCAGTAATCCTTCTCTAACAGTACTTCCATGGTTCATTGGAAGGATTTACCACACCAGAGGGAATTACAAAGACCTGACAGTATTATATCTCAACTTAAGCCCCTTGGGAGGTGTCAAAAAAGTGCGCCATATTCACATGCAGAAATCTGGTGTCTCAGGCACCATTGAGATCGCTCAACAGGTCCTAGGGCGGGGTGAATCATCTATAAGTTTAG---------ACCTATCTTATTGGATGTGTGGGTGAGCTTTTGCCTATTGAGACATAGTCTATATACACAGGCACAAGTTATTAGCCAGGGCAAAACTTGCCAGATAATTATAT----CATGCAAAACCATATATTTACATGGAACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 554346 385 + 647215 ATGAAAGCAATTGTTCAGTG------------CTAAATCCAATCATCCTTCACGAATGATACTTCCATGGTTCATCGGGAGGACTTACCACACCAGAGGGAATTACACAGACCCAACTTTATTATATCTACACTAAAGCTCTTTGGGAGGTGTCAAAGAATTGTGCCATATTCATGTGCAGGAAT--GGTGTCTCGGGTGCCAGTGAGATCACTCAATGGGTGCCAGGGCAGGGTGAATCAACTAT--GTTTAGTATTAAGGGACCTAACTCATTGGATGTATAGGCGTGCATTTGCCTATTGAAACATAGTATATATACATAGGCACAAGTTAT-AGCCGGTACAGAACTTGCCACATATTTATATGCAGCATGCAAAACCATATATTTACATAGAACCTG - -a -s mr.mrrefChr3 92850 74 + 181019 AAACATAGGAGAATGAGTTACTGGGAAGTTGGGATACTGGAAATCTAGTATCCACATAAATGTTTAATATTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542874 64 + 636262 AAACATAGGAGAATGAGTTACTGGGAAGTTGGGATACTGGAAATCTAGTTTCCA----------TAATATTCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 554735 74 + 647215 AAAAGTAGGAGAATGAGTTATAGGGAAGATGGGATACTGGGAATCTAGTATCCACATAAATGTTTAATATTCAT - -a -s mr.mrrefChr3 92924 34 + 181019 AAGATCAAGAAGGTTAATGTCTGGTGGATCCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542938 34 + 636262 AAGATCAAGAAGGTTAATGTCTGGCAGATCCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 554814 34 + 647215 GAGATCATTAAGGTTAATGTCTGATGGATCCATA - -a -s mr.mrrefChr3 92958 45 + 181019 TATGGCATGTTAGTTCCAATTCAAAGGATGTAAGAGCAATTTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542972 35 + 636262 TGTGGCATGTTAATTCCTATTCAAAGGATGTAAGA---------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 554852 45 + 647215 TATGGCATGTTAGTTCCAATTCACAGGATATAAGAGCAATTTCAG - -a -s mr.mrrefChr3 93003 18 + 181019 CAGAGACACAGTCAACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543007 18 + 636262 CAGAGACATGGTCAACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 554898 18 + 647215 CAGAGACACAGTCAACAA - -a -s mr.mrrefChr3 93021 82 + 181019 TATTGTCAGTTGGACTAATTTGTAGTTCATTTTAATAACAATTAACAAAGCAATACCTCAAGCTGTTACTATGAGTATGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543025 82 + 636262 TATTGTCAGTTGGACTAATTTGTAGTTCATTTTAATAACAATCAACAAAGCAATACCTCAAGCTGTTACTATGAGTATGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 554986 81 + 647215 TATTGTCAGCTGGACTGATTGGTAGTTC-TTCTAATAGCAATTAACAAAGCAATATCTCAAGCTGTTACTATGAGTATGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 93103 104 + 181019 AAGCCGATAGAGGTATTATATGTAAGAGATACACTTACTTTAGAACACTTTAGTGGTGCTACATAAAAACCCACTCTCACTGTGATGAATCTAACAAGGAGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543107 98 + 636262 AAGCCGATAGAGGTATTATATGTAAGAGATAAACTTGCTTGAGAACACTTTAGTGGTGCTACATAAAAACCCAC------TGTGATGAATCTAACAGGGAGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 555076 104 + 647215 AAGCCGATAGAGGTCTTATATGTAAGAGTTACACTTACTTTTGAACACTTTAGTGGTGCTACAGAAGAACTCACTCTCACTGTGATGAATCTAACAATGAGGAA - -a -s mr.mrrefChr3 93207 91 + 181019 GGCACCTGTGGTGTGTAAATATTCCTAGTTGCCTCAGGATCTCTTCTTGACTGATTTTGTGTCGTATTTAATTCCATGGAGGTTGTAGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543233 91 + 636262 GGCACCTGAGGGGTGTAAATATTCCTAGTTGCCTCAAGGTCTCTTCTTGAGTGATTTTGTGTTGTAGTTAATTCCATGGAGGTTGTAGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 555180 90 + 647215 GGCACATGTGGTGTGTAAATATTCCTAATTGCCTCAGGATCTCTTCTCAACTAATTTTGTGTCGTATTTA-TTCAACAGAAGTTGTAGTGG - -a -s mr.mrrefChr3 93298 103 + 181019 GTGTGTGGACACCCACATTCTAGACTTTTCCTTCACCGGTAAATAAGTTACTAAAAATATGCAATGGTCTCCTTATAAAGGATGGATCACTTCTCCTAATAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543324 103 + 636262 GTGTGCAGCCACCCACATTCTAGACTTTTCCTTCACTGGTAAATAAGTTACGAAGAATATGCAATGGCCTCCTTGTAAAGGATGGATCACTTCTCCTAATAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 555271 103 + 647215 GTGGTTGGACATCCACGTTGTACACTTTTCCTTCACCGGTAAATAAGTTACTAAAAATATGCGATGGTCCCCTTATAAAGGATGGATTGCTTCCCCTAGTAGT - -a -s mr.mrrefChr3 93401 95 + 181019 ACATGACTACTTTGACCATTTTGAATTTGAGCTCCTACATGCCTGTTTTCATTATTATGATTTTGAGCTTTGGGTGGGAGCCTTACTGGCAACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543429 95 + 636262 ACATGACTACTTTGATCATTTTGAATTTGAACTCCTACATGCCTGTTTTCATTATTATGATTTTAAGCTTTGGGTGGGAGCCTTACTGGCAACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 555374 95 + 647215 ACATGACCACTTTGACCATTTTGAATTTGAGCTCCTACATGCCTGGTTTCAGCATTATGATTTTGAGCTTTGAGTGGCAGCTTTACTGGCAACCT - -a -s mr.mrrefChr3 93496 93 + 181019 TCAAGGTCTTGATCCTGGTTGTCAGGGATCAGAATTTGGTCTAATTAGTATGGTTCAAAATAAGTCAGCCTAACCATGCACCTAACTTGTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543526 78 + 636262 TCAAGGTCTTGGTCCTGGTTGTCAGGGATCAGAATTTGGTCCAACTAGTGTGGTTCAAAGAAAGTCAGTCAAACCATG--------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 555469 93 + 647215 TCAAGGTCTTGATCCTGGTTGCCAGGGATCAGAATTTGATCTAATCAGAATGGTTCAAAATAAGTCAGCCTCACCATGCACCTAACTTGTATT - -a -s mr.mrrefChr3 93589 54 + 181019 TGGTTTTAATCATTTCCAAACTAACCTAGATTCAGTGCAAGTTAACTGATAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 555566 54 + 647215 TGGTTTTAATCATTTCCAAACTAACCTAGATTCAGTGCAAGTTAACTGATAAGT - -a -s mr.mrrefChr3 93643 36 + 181019 CATTCTTGCCAGGTCCAGGTCGGGGTTCTCTATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 555625 36 + 647215 CATTCTTGCCAGGTCCAGGTCGGGGTTCTCTATCCA - -a -s mr.mrrefChr3 93679 130 + 181019 GGCCCTAGTACTCTGTATTTAACATCCAGTACCAGTTACACCCTAAGACGGTGTGTCATTATCCTTAGAGTGGCACACGACACACATCATCATAAGTAGCCGAGCCATGATAGTGCCATGGGGGGTAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543604 56 + 636262 --------------------------------------------------GTGTGTCATTATCCTTAGACTGGCACACGACACACATCATCCTAAATAGCCGAATC------------------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 555662 130 + 647215 GGCCCTAGTACTCTGTATTTAACATCCAGTACCAGTTACACCCTAAGACGGTGTGTCATTATCCTTAGAGTGGCACACGACACACATCATCATAAGTAGACAAGCCATGATAGTGCCATGGGGGGTAGCT - -a -s mr.mrrefChr3 93809 124 + 181019 TAGGGGGGGGGGTGTATGGACTGTGATGCCTCATAGTTAGTTTTCATTATGTAAAGTCAATCTTTCACGTTAACAGCAAATTGTTGCCTATAATATATCTGGGACTACAAGCGACACATTGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543660 82 + 636262 ------------------------------------------TTCATTATGTAAAGTCAATCTTTCACATTAACAGCAAATTGTTGCCTATAATATATCTGGGACTACAAGCGACACATTGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 555805 124 + 647215 TAGGGGGGGGGGTGTATGGACTGTGATGCCTCATAGTTAGTTGTTATTATGCATGGTCAATCTTTCACGTCAACGGCAAATTCTTGCCTATAATATATCTGGGACTTCAAGCAAAACGTTGATT - -a -s mr.mrrefChr3 93933 43 + 181019 CCCCTGGTAAATATATTTAGAAGTATGAACCCCTCAAGGCTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543742 43 + 636262 CCCCTGGTAAATATATTTAGAAGTATGAACCCCTCAAGGCTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 555931 43 + 647215 CCCCTGGTGAATATTTACGGAAGTATGAACCCCTAAATGATAG - -a -s mr.mrrefChr3 93976 39 + 181019 CATGCAACTATCCTTGCAGTCTCCAAAATGGCTTCTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543785 32 + 636262 CATGCAACTATGCTTGCAGTCTCCAAA-------CAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 555975 39 + 647215 CATGCAACTATCCTTGCAGTCTCCGGAATGGCTTCTAGG - -a -s mr.mrrefChr3 94015 204 + 181019 ACCCCTCTGGCTGTGTGGAGACCGACACATTGATAGGATCCAACCACCGGCAGCACATTACTGTGGATTAACTTGCTGCCACACAGGGGAGTGTGGAAGAGGTGGATACTTGTTAACCCTACTGACCGCTGCAGCACATGAGGAGGGCTTGAACCAATGAAAGATCAGACCACCACACATTTCTGTACATGAACCGAAGGAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543817 203 + 636262 ACCACTCTGGCTGTGTGGAGACCGATACATTGATAGGATTCAACCACCGGCAGCACATTACTATGGATTAACTTGCTGCCACCCAGGGGAGTGTGGAAGAGGTGGATACTTGTTAACC-TACTGACCGCTGCAGCACATGAGGAGGGCTTGAACCAATGAAAGATCAGACCACCACACATTTTTGTACATGAACTGAAGGAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 556026 204 + 647215 ACCCCCTTGGCCATGTGGAAACTGACACATTGCTAAGATCCAACCACCTGCAGCACATTAATGTGGATTAACATGCTGCCGCACGGGGGAGTGTGGAAAATGTGGATACTTATTACCCCTACTGACCACTGTAGCATGTGAAGAGGGCTTGAACCAATGAAAGTTCAGATTACCACACATTTCTGTACATGAACCGAAGGAGAC - -a -s mr.mrrefChr3 94219 192 + 181019 CCAAGGGCTAGAACTGGAGTCCCCATAGGGAAGGGATAGCAGTTGGTCAGTGATCTGATCTAGGTTCTCTTGTTTTGAACATAAAATGGCACATCCCCTCTTGTCATGTCATCATGTCACCATCATAATTACTAATGCCTACTTCTATAAATATCCCACAGGATTGTATTTCTCCATGACCTCTTATTTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 544029 192 + 636262 CCAAGAGCTAGAACTGGAGTCCCCATGGGACAGGGATAGCAGTTGGACAGTGATCTGATCTAGGTTCTCTTGTTTTGGACATAAAATGGCACATCCCGTCTTGTCATGCCACCATGTCACCATCATACTTACTAAAGCCTACTTCTATAAATATCCGACAGGATTGTATTTCTCCATGACCTCTTATTTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 556230 187 + 647215 CCAGGGGCTAGAAC--GGGTCCCCATAGCGAAGGGATAACAGTTGGTGAGTGATCTGATCTAGGTTCTATTGTTTTTAACA---AATGACATATCTCCTCTTGTCAAGTCATCATGGCACCATCATAATTACTAATGCCTACTTCTATAAATATCCCACAGGATTGTATTTCTACATAAATTCTTATTTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 94411 197 + 181019 AAGAAACCTTACCTAAGAACATCTCACATCCCAAATTCTGAATGATCATTGCTGTGAGGGTGGGCTACACAAGCACCATTCCATCATCTGGTACAAGTGTTTCCCTTTTGAGCTAAATTGTTGAATTACAGTGACTCAGGTGAAAAGCAAGTTATAGGGGATAGCTATGGGGTTAAAAGGTGTACCCTAGTAGATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 544222 193 + 636262 AAGAAACCTTACCTAAGAACATCTCACATCCCAAACTCTGAATT----CTGATGTGAGGGTGGGCTACACAAGCACCGCTCCATCATCTGGTACAAGTGTTTCCCTTTTGAGCTAACTTGTTGAGTTACAGTCACTTGGGTGAAACGCGAGTTATAGGGGATAGCTATGTGGTTAAAAGGTGCGCCCTAGTTGATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 556417 194 + 647215 AAGAAACCTTACCTAGGATCATCTCACATCCCAAATTCTGACTGATCATTGCTGTAATGGTGGACCTCACAA---CCATTCCATCATCTGGTATGAGTGCTTCCCTTTTGAGCTAAATTGTTGAATTACAGTGACTCAGGTGAAAAGCAAGTAATAGGGGATAGCTATAGAGTTAAAAGTGGTACCCTAGTAGATTC - -a -s mr.mrrefChr3 94608 411 + 181019 ACTATCAACAGAAAAAACTAATAAATAATGATCAACCAACAATGCATTCTTGCTTTAGAGGGACTCTCATTTTTATCACCTCCACACGGTTCCCTGTTCACTGGGTATGTTTATTTTTGATAAATCATGGCCATAAGTAGGAATAGCAACTGTGTACATCCAAACTTGTACGAGAGTGTTTCATTTTCCTCTGAGTAATTGGGCCTGATCAGATATGGCCATCTGTCCTAACCAATTGGCTGAATCGGTGTGTAAGACAAGGTAGCTATGCATAAGCATTGATATTTAGCTGTGAGCTTTCACTTTGGGTGAGCCCATGTATGGACACATCTCTGTTCCCGTACTAGAAATAAAATTAATTCCTTTGCAAGTTTGGTAACTCCAATACAAGCTATATTCaataattatttg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 544417 405 + 636262 ACTATCAACAAAAAAAACTAATAAATAATGATCAAC----AGTGCATTCTTGCTTTAGAGGGACTATCATTGTTA-CACCTCCACACGATTTCCCATTCACTGGGTATCTTTATTTTT-ATGTATCTTGGCCACAATTAGGAACAGCAACTGTGTACATCCAAACTTGTACAAGAGTGTTTCATTTTTCTCTGGGTAATTGGGCCTGATCAGATATGGCCATCTGTCCTAACCAATTGGCTGAATCGGTGTGTAAGACAAGGTAGCTATGCATAAGCATTGATATTTAGCTGTGAGCTTTCACTTTGGGTGAGCCCATGTATGGACACATCTCTGTTCCCGTACTAGAAATAAAATTAATTCCTTTGCAAGTTTGGTAACTCCAATACAAGCTATATTCAATAATTATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 556611 411 + 647215 AATATCAACAGAAAAAACTCTTAAATAATGATCAACCAACAATGCGTCCTTGGTTTAGAGGGACTCTCATTTCTATCACCTCCACATAGTTCCCTGTTCACTGGGTATGTTCATTTTTGACAAATCATAGCCATAAGTAGGAATAACAACTATGTACATCCAAATTTGTATGACAGTGTTTCATTTTCCTTTGAGTAATTGGACCTGATTTGATATCCCCGTCTGTCCTAACCAATTGGCTGAATCTGTGTGCAAGACAAGGTGACTAGGCATAAGGATTGATATTTAGCTGTGAGCCTGCACTTTGGGCGGGCCATTGTATATAAACATCGCTGTTCCTGTACTAGAAATAAAATCAATTCCTTTGTAAGCATAGTAAATCAATTCCTAGCTACATTCaataattatttt - -a -s mr.mrrefChr3 95019 170 + 181019 attaatcgTCCAAACTAATGAGTGGATACAGTGAAATAACAGAATCCTCAGAGATGGAAAGTCTGAACCCGACCACCTAGTGTGAAAAACTATCTGAAGCCAAGGTGCTAAGGTGTTGGACACCAGAATCAGAATTGAAGAGCCCTTTCATCTGCAGGCAGGTTACATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 544822 170 + 636262 ATTAATCGTCCAAACTAATGAGTGAATACAGTGAAATAACTGAGTCCTCAGAGATGGAAAGTCTGGACCCGACCACCAAGTGTGAAAAACTATCTGATGCCAAGATGCTAAGGTGTTGGATACCAGAATCAGAATTGAAGAGCCCTTCCATCTGCAGGCAGGTTACATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 557029 170 + 647215 attaattatCCAAACCAATCAGTGGACACAGTGAAATAACAGAATCCTCAGAGATGGAAAGTCTGAACCCGATCACCTGGAGTGAAAAACTATCTGAAGCCAGGGTGCTAAGGTGTTGGACACCAGAATCCGAATTGAAGAGCCCTTTCATCTGCAGGCAGGTTACATTG - -a -s mr.mrrefChr3 95189 33 + 181019 TTCAATATAGGGCACCCCTAAAAAACAGTCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 544992 33 + 636262 TTCAATATGGGGCACCCCAAAAAAACAGTCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 557212 33 + 647215 TTCAATATAGGGCACCCCTAAAAAACAGTCACA - -a -s mr.mrrefChr3 95222 316 + 181019 ATGATAAGTAACAAAGTGGGTTTGCCTACCTTTTGAAACCTTTGAAGTGTAATTAACTTCTTATCTTAGGTGGAATTCAATCTGTGATCAAGTTGAAATGCATTTGCTTCTGGTTACCAAAACATATAATCTTGTGAGATTTAGGGTTCCTTTGAATCTGCATTCAACTGAGGATTAACAATTAACTAGGATAGAGTTGGGACAAAACTGCCATGGGGATCAGAGAGCCTCCAGAAATAAATTTGTTGTGTGATAAGCAAACCTGTGAGATTCAGAAAAGCACAACTGTTAGAAGGGAAGTGAAAAGCAGCATACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545027 316 + 636262 ATGATAAGTAACAAAGTGGGTTTGCCTACCTTTTGAAACCTTTGAAGTGTAATTAACTTCTTATCTTAGGTGGAATTCAATATGTGATCAAGTTGAAATGCATTTGCTTTTGGTTACCAAAACATATAATCTTGTGAGATTCAGAGTTCTTTTGAATCTGCATTCAACTGAGGATCAACACCAAACCAGGATAGAGTTGGGACAAAACTGCCAAGGGGATCAGAGAACCTCCAGAAATAAAGTTGTTGTGTGATAAGCAAACCTGTGAGATTCAGAAAGACACAACTGTTAGAAGGGCAGTGAAAAGCAACATACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 557245 314 + 647215 ATGATAAGTAGCAAAGTGGGTTTATCTACCTTTAGAAACCTTTGAAGTGTACTTAAGTTCTTACTTTATGTGGAATCCAATCTGCGATAAAGTTGAAGTGAATTTCCTTCTGGGTACAAAAACATAAA--CTTGTGAGTTTTATGGTTCCTTCGAATCTCCATGCAACTGAGGATTAACAATTAGCTAGGATAGAGTTAGGACAAAACTGCCGTGGTGATCAGGGAGCCCCCAGAAATATATCCGTTGTGTGATGGGCAAACCTGTGAGGTTCAGAAAAGCCCAACTATTAAAAGGGAAGTGAAAAGCAGCATACC - -a -s mr.mrrefChr3 95538 22 + 181019 AATTGAATTGATACTGATAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545343 22 + 636262 AATTGAATCGACACTGATTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 557561 22 + 647215 AATTAATTTGATACTGATAATT - -a -s mr.mrrefChr3 95560 135 + 181019 TGTTAAGTTTACCTGAGTGTGTGATTGCATGGTTGGCTCAGTCACTTTCCTGAGGAGTCCAACACTACTAGTTGCAAGATTGGGCTGCAACAGAATGTGACTGTGCAAGCAATAATGTGAGAGTCCTAAACCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545365 135 + 636262 TGTTAAGTTTCCCTGAGTGTGTGATTGCATGGTTGGCTCAGTCACTTTCCTGAGGAGTCCAACACTACTAGTTGCAAGATTGGGCTGCAACAGAATGTGACTGTGCAAGCAATAATATGAGAGTCCTACACCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 557588 134 + 647215 TGTTAAGTTTACCT-AGTGTGTGATTGCATGGTTGGCTCAGTCACTTGCCTAAGGAGTCCAACACTACTAGTTGCAAGATTGGGCTGCAACAGAATGTGACTGTGCAAACAATAATGTGAGAATCCTGAACCACA - -a -s mr.mrrefChr3 95695 36 + 181019 GCTTGGCATGTATACACCGAGGTGTGATGCAGGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545500 36 + 636262 GCTTGGCATGTATACATTGAGGTGCAAGGCCGGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 557723 36 + 647215 GCTTGGCATGTATACACCGAGGTGTGATGCAGGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 95731 233 + 181019 TTTTGCAGGATAGATTTTAAAGCAGAAAACAGAGCTTGAACATGTTTGAGGATGCAATGACTGTGCAGTATACTAGCATGCTGGGAGTATGGGACAGTGTGTCAGACTAAGGCTCTGGCAGCATTGTTCTTAGTCAGCATAGCCTAGTGAGAATTGCTAAGTCATGACAATAGTGCCAATGTTAGCTTCAGGCAAGCTATAATACAGTTAGTGAAGTACATTGCACAGGAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545536 233 + 636262 TTTTGCACGATAGATTTTAAAGCAGAAAAGAGAGCTTGAACATGTTTGAGGATGCAATAACTGTGCAGTATACTAGCATGCTGGGAGTATGGGACAGTGTGTCAGACTAAGGCTTTGGCAGCATTGCTCTTAGTCAGCATAGACTAGTGAGAATTGCTAAGTCATGACAATAGTGCCAATGTTTGATTCAGGCAAGCTATAATACAGATAGTGAAGAACATTGCACAGGAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 557760 227 + 647215 TTTTGCAGGATAGATTTTAAAGCAGAAAACAGAGCTTGAGCATGTTTGAGGATGCA-TGACTGTCCA-----CTAGCATGCTGGGAGTATGGGACAGTGTGTCAGACTAAGGCTCTGACAGAATTGTTCTTTGTCAGCATAGCCTAGTGAGAATTGCTAAGTCACGACAATAGATCCAATGTTAGCTTCAGTCCAGCTATAATATGATAAGTAAAGTAGACTGCACAGGAACA - -a -s mr.mrrefChr3 95964 218 + 181019 AGTCGAACATATGTGGATAACAGGCTCCCAGGTACAGTTGGCCTGGAATTAGATTAATGAGACCCAATATTTTGAGTGCTAAGATTACCTGGTCAGTTAGCCAGTATAACACAGATGTTTTTCAAGTGATACATGTTCATTAGCGACATTTCTGACCATAATGCACCACTAGTAGGGAGTGAATTAGAATGGAGTTCATCAGTATCTTAGCTACAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545769 213 + 636262 AGCCGAATATATGTGGATAACAGGCTCCCAGGTACCGTTGGTCTGGAATTAGATTAATGAGACCCAATATTTTGAGTGCTAAGATTACCTGGTCAGTTAGCCAGTATAACACAGATGTTTTTCAAGTGATACACGTTCATTAGCGACGTTTCTGACCATAATGCACCACTAGTAGGGAG---ATTAGAATGGAGTTCATCAGTATCTTAGCTACAG-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 557996 195 + 647215 AGTCAAACATACTAGGATAACAGGCTCCCAGATACAGTTGGCCTGGAATTGGAGTAACTACACCCAATATTTTGGGTGCTAGGATCACCTGGTCGGTTAGTCAGTATGACACAGATGTTTTTCAAGTGGTACATGTTCATTAGCAACATTTCCGACTGTAATGCACTACCAGTAGGGAGTGAATTAGAATAGA-----------------------CC - -a -s mr.mrrefChr3 96182 37 + 181019 CGAAGCGATCAAGATACCAAACTTGCCCTGATTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545982 37 + 636262 CGAAGCGATCAAGATACCAAACTTGCCCTGATTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 20785 37 - 647215 CACAGGAATCAGGATACCAAGCTTGTCTAGATTAATA - -a -s mr.mrrefChr3 96219 19 + 181019 TTAACTTCAGAGGGTGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546019 19 + 636262 TTAACTTCAGAGGGTGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 20828 19 - 647215 TAGATTTGAGCAGGTGGCA - -a -s mr.mrrefChr3 96238 14 + 181019 TTACAGTATCATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546038 14 + 636262 TTACAGTATCATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 20850 14 - 647215 TAAATTTGTCAAGA - -a -s mr.mrrefChr3 96252 5 + 181019 GTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546052 5 + 636262 GTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 20866 5 - 647215 GTCTC - -a -s mr.mrrefChr3 96257 5 + 181019 ACTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546063 5 + 636262 ACTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 20871 5 - 647215 ACCAT - -a -s mr.mrrefChr3 96262 9 + 181019 AGTGATTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546068 9 + 636262 AGTGATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 20879 9 - 647215 AGTGGGTGC - -a -s mr.mrrefChr3 96271 33 + 181019 ACCCACTAGAGCTAGCTAAAAAAAAAGCTATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546079 33 + 636262 ACCCACTAGAGCTAGCTAAAAAAAAAGCTATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 20888 33 - 647215 AAACACTAGAGCTAGCTGAAAAAAAAGCTATAA - -a -s mr.mrrefChr3 96304 95 + 181019 AGACCAAGTGAGTGCTACTGGGAGATGTGAGTTGCCTTTACTCTCTTATCAGAAATAGAGCCATGGGAGGGCTATTGGGTATCTGCGGCAGTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546133 95 + 636262 AGACCAAGTGAGTGCTACTGGGAGATGTGAGTTGCCTTTACTCTCTTATCAGAAATAGAGCCATGGGAGGGCTATTGGGTATCTGCGGCAGTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 626188 95 + 647215 AGACTAGATGTGTTCTACTGGGAGATGTGAGTTGCCTTTACTCTCCTATCAGAAATAGAGCCATGGGAAGGCTGCTGGATATTGGCGGATATGGC - -a -s mr.mrrefChr3 96399 174 + 181019 TTTCCACACAGGGCTTGTAGCATGCCCTCTGGCCAGTAAGCAAGCAACAATAAAGTGGAGTCAATTAATGAGAATAACATGGAACCATTTTGTGTACTGCCTGTGTATTGTGGATGGTTCTCTTAGGTTGGCCAGTCTTCTACAACAGTTTGGATGCCTCTGACCAGGGGCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546228 152 + 636262 TT----------GCTAGTTGCATGGCCTCTGGCCAATAAGTGAGCAACAATCGAGTAAAGTTAATTAATGAGAATAAC------------TGTGTAATGCCTGTGTATTGTGGATGGTTCTCTTAGGTTGGCCAGTCTTCTACAACAGTTTGGATGCCTCTGACCAGGGGCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 21134 174 - 647215 TTTCCACACAGGGCTTGTAGCATGCCCTCTGGTCAGTAAGCAAGCAACAATAAAGTGGAGTCAATTAATGAGAATAACATGGAACCATTTTGTGTACTGCCTGTGTATTGTGGATAATACTCATAGGTAGGCCAGTCGTCTACAACGGTTTGGACCCCTATGACTAGGGGCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 21027 106 - 647215 TTTCCACACAGGGGTTGTAGCATGCCCTCTGGCCAGTAAGCAAGCAACAATAAAGTGGAGTCAATTAATGAGAATAACATGGAACCATCTTGTGTACTGCCTGTGT-------------------------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr3 96573 11 + 181019 ATTTCTGACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546383 11 + 636262 ATTTCTGACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 21308 11 - 647215 ATTTCATGCTA - -a -s mr.mrrefChr3 96584 41 + 181019 GGGGACTGTATTACTAATAATTGGGTCTCAACAAGCAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546394 41 + 636262 GGGGACTGTATTACTAATAATTGGGTCTCAACAAGCAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 21324 41 - 647215 AGTGGTCAGATTACCAATAATTAGGTCTCAACAATCACCAA - -a -s mr.mrrefChr3 96625 46 + 181019 CGTCAAAGAAGTTGGCAGTGGGTCATTTGAAACTTATGCAGTAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546435 46 + 636262 CGTCAAAGAAGTTGGCAGTGGGTCATTTGAAACTTATGCAGTAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 21374 46 - 647215 CGTTAAAGAGGTTGGCATTGATTCATTTGAAAGCTTTGCATTAGGA - -a -s mr.mrrefChr3 96671 14 + 181019 ATGAGTCAACAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546481 14 + 636262 ATGAGTCAACAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 21421 14 - 647215 ATGACTCAACAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 96685 98 + 181019 TGCTCAAGGAATTGGAGCCTCTTAGTTGCCCTTTCTACTCCACCCAGTCCACCCAATCTGCTGCTTGAAAACTTGATTCTACATCCTTGAAAAGGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546495 98 + 636262 TGCTCAAGGAATTGGAGCCTCTTAGTTGCCCTTTCTACTCCACCCAGTCCACCCAATCTGCTGCTTGAAAACTTGATTCTACATCCTTGAAAAGGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 21438 98 - 647215 TGCTCAAGGGACTGGAGTGCCTTAGGTGCCCTTTCTAGTCCACCTGGGCCACCGAAACTGCTGCTCAAAAACTTGAATCTACATCTTTGAGAAAGCTT - -a -s mr.mrrefChr3 96783 88 + 181019 TAAGTTTTTCATTTGCCCCCCATCTTATGATCTTAGACACGTTTTCCTCCCACCTGTCTGTACAGGAGGTCTTACAAAAAACTCCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546597 88 + 636262 TAAGTTTTTCATTTGCCCCCCATCTTATGATCTTAGACACGTTTTCCTCCCACCTGTCTGTACAGGAGGTCTTACAAAAAACTCCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 21536 88 - 647215 TAAGTTTTCCATCTGACCCTCGCCATATGATCTTTGACAGGTTTTCCTTCCACCGGTCTGTAAAGGAGCTCTTACAGAAAAGTCCAGG - -a -s mr.mrrefChr3 96871 23 + 181019 AATGTCTTGTCAAAGTTTTGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546687 23 + 636262 AATGTCTTGTCAAAGTTTTGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 21624 23 - 647215 AAAGTATTGTCAAAGTTTTGCAT - -a -s mr.mrrefChr3 96894 131 + 181019 AGGACCTCAGGGAAATTGATCTCTGAGTGTGAGTGTGATGTTTTGTTAGATTAGTTTGGGGCAGTTGAAAATGAAAGGGCCTGCCCAGCTTATTTATTTCATATCTTTCAATTCTTTGGGTTAAGAAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546711 131 + 636262 AGGACCTCAGGGAAATTGATCTCTGAGTGTGAGTGTGATGTTTCGTTAGATTAGTTTAGGGTAGTTGAAAATGAAAGGGCTTGCCCAGCTTATTTATTTCATATCTTTCAATTCTTTGGGTTAAGAAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 21647 119 - 647215 AGGACCTCAGGGAAATTGATCTCTGAGAGTTAGTGCTATGTTTTGTTAGATTAGTTTGGGGCA------------AGTGTCTGCCCAGCATATTTATTTCATATCTTTTGATTCTTTGGGTTAAGGAACTT - -a -s mr.mrrefChr3 97025 89 + 181019 AAGCATTAACCACTAAGAGGTAAAGTGGTAAAACCAGTGTTTTGAGGAAAGCAATGTTACTAGGAAATATAATGTGATAAAAGACAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546842 88 + 636262 AATCATTAACCACTAAGAGGTAAAGTGGTAAAACCAGTGTTTTGAGGAAAGCAATGTCACTAGGAAATATAATG-GATAAGAGACAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 21787 89 - 647215 AAGTGCTAACCACTCAGAGGTAAAGTGATAAAACCAGTGTTTTGAGGAAAGCGATGTTATTAGATAACATAATGTGATAAAAGACAACC - -a -s mr.mrrefChr3 97114 78 + 181019 TTTATATTTCTTGTCTTGTATACCAGCTACATATTCTAAAATGTTCTGACTGGCATTGGGGGCCTTCTTGAGGTACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546930 78 + 636262 TTTATATTTCTTGTCTTGTATACCAGCTACATATTCTTAAATGTTCTGACTGGCATTGGGGGCCTTCTTGAGGTACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 21883 75 - 647215 TTTATATCTCTTGTCTTGGATACCAGCTCCATATTCTAAAATGTTCTG---GGCATTGGGGGCCCTCTTGAGGTACCT - -a -s mr.mrrefChr3 97192 378 + 181019 AACATCCCTTGTTGCAAAATCAATACGGCTGGTGATACAGTAAACCCATTACCATTAGTAGTGCCAAACTCCTCCTGCCCTGGTCTAGTATGCCTGTATAAATAGTAGTAGTACATAACAGATACTTTTGTCAATGTCAGTGTCTGTCACTGCTTGACACATTATATGTGTGTGCAGTGCCCTCAGCAGCCATTATGCCACATTGGTTTAGCCTAATATTGTAAACCCTTCTGGTTTGTATTAACCATCAGTGGCCGTTTTTCATTTGCCGCCTTTTTTTGTGTATTGATAGTTAGCGGAATTTATTGTTCCATTAGCCGCAGGTCAGCGAAATAAAATCCCAGTGGCTGCAGGTTAGCAGAAGAAAGTTGACTCGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547016 378 + 636262 AACATCCCTTGGTGCAAAATCAATACGGCTAATGATACCGTAAACTCATTACCATTTGTAGTGACAAACTCCTCCTGCCCTGGTCTAGTATGCCTGTATAAATAGCAGTAATACATAAAGGATACTTCTGCCAATGTCAGTGTCTGTCACTGCTTGACACATTATATGTGTGTGCAGTGCCCTCAGCAGCCATTATGCCACGTATGTTTAGCCTAATATTGTAAACCCTTCTGATTTGTATTAACCATCAGTGGCCGTTTTTCATTTGCCGCCTTTTTTTGTGTAATGAGACTTAGTGGAATGTATTGTTCTATTGGCCGCAGGTCAGCGAAATAAAATCCCAGTGGCTGCTGGTTAGCAGAAGAAAGTTGACTTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 21958 376 - 647215 AACATCCCTTGTTGTAAAATCAATATGGCTGGTGATACAGTATACCCATTACCATTAGTAT-GCCAAATTCCTCCTGCCCTGGTGTACTATGCCTGTATACATAGTAGTAGTACATAACAGATACTTTTGTCAATGTCAGGGTCTATCACTGCTGGCCACATTATAAGTGTGTGCAGTGCTCTCAGCAGCCATTATGCCACATTGGTTTAGCCTAAT-TTCTAAACCCGTCTGGTTTGTATTAACCATCAGTGGCTAATTTTCACTTGCTGCCTTTTTTTTTGCATTGGTAGTTAGCGGTACTTATTGTTCCAGTAGCCGAAGGTCAGCGAAATAAAATCCCAGTGGCTGCAGGTCAGCAGAAGAAAGTAGACTCGGT - -a -s mr.mrrefChr3 97570 2 + 181019 GT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547445 2 + 636262 GC -s simRat_chr6.simRat.chr6 22334 2 - 647215 TT - -a -s mr.mrrefChr3 97572 177 + 181019 AAGTTTTGTATTTCTAAGCTTGGGAGCTATGCTTGCCCAATTTGAATTTATGTGGAGATTCCATTGATGCTAACCAGGAAACCTTAGAAGGAGCCTTAATGGCCACAACACCTCAATCAACTCTAAAACCAAATTCATCATTGATGGGTCTTTCTGATGTTAGGTTTTATGATGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547477 177 + 636262 AACTTTTGTGTTTCAAAGCTTGGGAGCTATGCTTGCCCAATTTAAAGTTGTGTGGAGATTCTATTGATGCTAACCAGGAAACCTTAGAAGGAGCCTTAATGGCCACAACACTGCAATCAACTCTAAAACCAAATTCATCATTGATGGGTCTTGCTGATGTTAGGTTTTATGATGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 22336 148 - 647215 AAGTTTTGTATTTCTTAGCGCGGGAGCTATTCTTGCCCAATTTGAATTTATGTGGAGATTCCATTGATGCTA-----------------------------GCCACAACACCTCAATCAACTCTAAAACTGAATTCATCATTGATGGGTCTTTCTGGTGTTGAGTTTTATGATGTTG - -a -s mr.mrrefChr3 97749 226 + 181019 CTCATGATTTTTTGTGAGCATCAACCTCATGGGTAACACATTGATTGCATGCAGAGCTTGGCCAGAATTAGAACGCTTGTTTTGTACAATCCACTCTACATTCATTTTGAGAGAATTGAGCCTTACTATTCTCCATTAAACATAATTAGCCTCTCAACCTTATTAAACAGCAGCCTGTGCACTGTCTTATACATGTATTCTAGGTGCCACATCATTAGCCAGTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547654 221 + 636262 CTCATGAATTTTTGTGAGT-TCAACCTCATGCATAACACATTGGTTGCATGCAGAGCTTGGCCAGAATTAGAACGCTTGTTTTGTACAATCCACTGTACATTCATTTTGAGGGAACTGAGCCTTACTATTGTCCACTAAACATAATTAGCC---CAACCTTATTAAACAGCAGCCTGTACACTGTCTTATACATGTATT-TAGGTGCCACATCATTTGCGGGTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 22485 224 - 647215 CGCATGATTTTTTGTGAGCATCAACCTCATGGGTGAAACATTGATTGCATGCAGAGCTTGGCCAAAATTAGAACACTTGTTTTGTACCATCCACTCTACATTCATTTTGAGAGAATCTAG--TAGCTATTCTCCATTAAATATAATTAGCTTCTCAACCTTACTAAACAGCAGCCTATGCACTGTCTCATAGATGTACTCTAGGTGCTACACCATTAGCCAGTAAC - -a -s mr.mrrefChr3 97975 3 + 181019 TTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547884 3 + 636262 CTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 22709 3 - 647215 TTA - -a -s mr.mrrefChr3 97978 126 + 181019 CCAGTGTTAATGATATTGCCACGTGGTATCCTGATATCACACATACCACACTGCATACCTGAATGGCAACAAAGATCCCCACCCTCCAGAGCATTTAAGCCAGGGGGGCCTGGACTGAAGAATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547887 126 + 636262 CCGGTGTTAATGATATTGCCACGTGGTATCCTGATATCACACACACCACACTGCACACCTGAATGGCAATAAAGATCCCCACCCTCCAGAACATTTAAGCCAGTGGGGCCTGGACTGGAGGATTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 22720 125 - 647215 CCAGTGTTAGTGATATAGCCAGGTGA-ATCATGATATCACACATACCACACCACATACCTGAATGGCAACACAGATCACAACTCTCGAGAGCATTTCAGCCGGGGGGGCCTGGTATCAAGAATTGA - -a -s mr.mrrefChr3 98104 85 + 181019 GCACTTCAGGCTCACTGATTATTTAGACTTGATTAATCATATCCATCTGCAGTAAGCCAAATAACCAAACTGCTCAATTGGCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548013 85 + 636262 GCACTTCAGGCTCACTGATTATTTAGGCTTGATTGATTATATCCATCTGCAGTAAGCCAAATAACCAAACTGCTCAATTGGCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 22870 85 - 647215 GTGCTTCAGGCTATCAGATTATTCACACTTGATCAATCATATCCATATGCAGTAAATCAGATAACCAAACTGCTCAATTGGATGT - -a -s mr.mrrefChr3 98189 120 + 181019 TTATTTACGTCCTGGGGTTCATGGCTAACTGCAATGCTAAAGCGCTTTTCCCAACATGCCCCATTTTAAGTACCCACAGTTTACAAGCTCGAGTCCTAAACCCGGGAGTTATCATAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548098 97 + 636262 TTATTTACGTCCTGGGGTTCATGGCTAACTGCAATGCT------------CCAACATACCCCATTTTA---ACCCACAGTTTACAAGCTCGAGTCCTCAACCCGGGAGTTAT-------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 22956 118 - 647215 TTATCTACGTCCCGGGGTTCGCGGCTAAGTACAATGCTAAAGCGCTTTTCTGAGCATGCCCCATTTTAAGTACCCACAGTTT--AAGCTCGAGTCATAAACCCAGGAGTTATCATAGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 98309 41 + 181019 GTGAGAAGGGGAGAACCAACTTAGTTTTAACTTCAAGTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548195 36 + 636262 -----AAGGGGAAAACCAGCTTAGTTTTAACTTCAAGTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 23080 41 - 647215 GTGAGAAGGCGAGAACCAACTTAGTTTTATCTTCAAGTAGC - -a -s mr.mrrefChr3 98350 146 + 181019 AACCTGTCACCCCCAAGTCAGCCTGGTTGATACCCCCCCTGCGAGGAATCACTAACCAGCCGCTCTGCAGACACGATATGGGGACGTCTCATGTGCCGTCGTCGCAGACGCAATGCGGGGTGGGTATGTTCGCGCGGCGTTGGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548231 146 + 636262 AACCTGCCCCCCCCAAGTCAGCCTGGTTGATACCCCCCCTACGAGGAACCACTAACCAGCCGCTCTGCAGACACGATATGGGGACGTCTCATGTGCCGTCGTCGAAGACGCAACGCGGGGTGGGTATGTTCGTGCGGCGTTGGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 23122 146 - 647215 AACCTGTCAGCCCCAAGTCGGCCTGGTTGATACCCCCCCTGTGAGGAATTACTGACCGGCCGCTCTGCAGTCACGATAAGGGGACGTTTCATGTGCCGTCGTCGCAGACGTAGTGCGGGGTGGGTATGATCGCGCGGCGTTGGGCA - -a -s mr.mrrefChr3 98496 67 + 181019 ATACGCCCCATCGCTTATTGATTGAGCTCAATATCATCTCTGAGCTCCATGGTCTCCAGCTCCATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548377 67 + 636262 ATACGCCCCATCGCTTATTGATTGAGCTCAATATCATCTCTCAGCTCCACAGTCTCCAGCTCCATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 23289 67 - 647215 ATACGACCCACCGCTTATTGATTGAGCTAAATATCATCTCTGAGCTCCATGGTCTCCACCTCCACTG - -a -s mr.mrrefChr3 98563 145 + 181019 TTTTCCCTGCGACAAGTACCACTGTGGGCATTATCCTGTTCCATTGTACAATGCAAACATTATGTAAAACTGGTTTGAGTGGGGAGCTCAACATACAAGGTCTCCCTTCACATCATAAACAATGACCAAGGTTTATACTAGACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548444 145 + 636262 TTTTCCCTGTGACAAGTACCACTATGGGCATTATCCTGTTCCATTGTGCAATGCAAGCATTATGTAAAACTGGTTTGAGTGGGAAGCTCAACATACAAGGTCTTCCTTCACATTATAAACAATGACCAAGGTTTATACTAGACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 23358 145 - 647215 TTTTCCCTGCAACAAGTACCACTGTGGGCATTATCCTGTTCCATTGTACCTTGCAAACATTATGTATAACTGGTTTGGGTTGGGAGCTCAACATACAAGGTCTCCCCACATATCATAAACACTGTCCAAGGTTTATACAATACAT - -a -s mr.mrrefChr3 98708 70 + 181019 CTTATCCTACTCCACACGCTTCATAACACTAATATGCACTGACCACATGGATCCTATCTGTGGGCATACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548605 70 + 636262 CTTATCCTACTCCACACGCTTCATAACACTAATATGCACTGACCACATGGATCCTATCTGTGGGCATACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 23503 70 - 647215 CCTATCCTACTCCACATGGTTCATAACACTAGTCCAGACTGAAAAAATGGATCCTATCTGTGGGCATACA - -a -s mr.mrrefChr3 98778 93 + 181019 GGCGCAGCAAAGAAGCTTTCATTCCCACTATACCACAAAAAAATGCATTTTTCTATGTGATGCAGGTTATTCAGCCAAGGATATCTCTTCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548676 93 + 636262 GGCGCAGCAAAGAAGCTTTCATTCCCACTATACCACAAAAAAATGCATTTTTCTATGTGATGCAGGTTATTCAGCCAAGGATATCTCTTCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 23573 93 - 647215 GGCTCAGCAAGGAAGATTTCTTTCTCATTACACCACACAAAAATGCTGTTTTCTATATGATATGGGTTTTCCAGCCATGGCTGTCTCTTCCTA - -a -s mr.mrrefChr3 98871 55 + 181019 TCTATTGTTAGAATGGGAGAGGACTGACCTTTTCTGTGTTGCAAAATAGGCATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548769 55 + 636262 TCTATTGTTAGAATGGGAGAGGACTGACCTTTTCTGTGTTGCAAAATAGGCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 23689 55 - 647215 TCTATTGTTGGAATGAGGGATAGCTGACCTGTTCTGAGTTGCATAATAGGCATAT - -a -s mr.mrrefChr3 98926 64 + 181019 TAATTATCTACCCAATAGCATTTGTGTTACAGGGCATATAAAGTTCAAGTGTCTCCTAGTCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548824 64 + 636262 TAATTATCTACCCAATAGCATTTGTGTTACAGGGCATATAAAGTTCAAGTGTCTCCTAGTCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 23752 64 - 647215 TACTTATCTACCCAATAGCATTTGCGTTACAGGGCATATAAATCTCAAGTAACTTCTAGTCCTT - -a -s mr.mrrefChr3 98990 51 + 181019 GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548888 51 + 636262 GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 23817 51 - 647215 GATCCAGCATGAAGTGGATGCGCTAAAAGAGAGACATCAAGCATTTTGGGA - -a -s mr.mrrefChr3 99041 243 + 181019 CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCAAAGAGCTATTGATGTGCTACTAGGTATGAGAGGCTGGTCTAATGATAACCAGAATGTCCCTGCCAGCGGGTGTACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTGGCTGCTGTTGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATTTGGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548939 234 + 636262 CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCGAAGAGCTAT-GATGTGCTACTAGGTATGAGAGACTGGTCTAATGATAGCCAGAATGTCCTTGCCAGCGGGTGAACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTG--------TGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATCTAGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 23871 235 - 647215 CGTAATCAACCAGGCAGAAATGTAGTACCAGCCAAGAGCCCTTGTCCAAATAGGTATTGATGTGCT-CTAGGTATTTGGGGCTGGT-TATTGATAACCAGAACGTCCCTCCCAGCGGGTGTACACAATCGTTCGGCCGTTTACATAATTATTTGGCTGCTGTTGTAAGCCTGCGTCCCGTGAGTGTTGAATTTGGAAGTGAGCGCGGGGCGAATATACCCTCGTTTCTGCAT------CTTCT - -a -s mr.mrrefChr3 99284 81 + 181019 TACAGGAAGAGTGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAGCTATTCGATTCTGACCCAGTAAGAACTATTGGATTCTGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549173 81 + 636262 TACAGGATGAGCGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAACTATTCGATTCTGACCCAGTAAGAACTATTATATTCTGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 24107 81 - 647215 TGCAGGAAGAATGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAGCTATTGGATTCCGACGCAGTCAAAACTATTGGATTCCGACT - -a -s mr.mrrefChr3 99365 21 + 181019 TACCACTGGATCCGTATTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549254 21 + 636262 TACCCCTGGATCCGTATTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 24228 21 - 647215 TACCACTGGATCCGTATTTAA - -a -s mr.mrrefChr3 99386 70 + 181019 GTCGCATAACCGCTGGAACGACTTAAATAAGAGCAACGTCGCTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549275 70 + 636262 GTCGTGTAACCGCGGGAATGACTTAAATAAGAGCAACGTCGCTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 24251 70 - 647215 GTCGCAGAACCGCTGGGACGACTTAAATGTGAGCAACGTCGTTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAACG - -a -s mr.mrrefChr3 99456 92 + 181019 CTGCTGGGAAAGGGGATCTGTAAAGGATGCTCAGTAAAGGTTATGCCCACATTAGCTTATGTCACTGCAGGAAGAGATATGGACTACACCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549345 92 + 636262 CTGCTGGGAAAGGGGAACTGTAAAGGATGCTCAGTAAAGGTTATGCCGACATTAGCTTACGTCGCTGCAGGAAGAGATATGGACTACACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 24322 92 - 647215 CTGCTGGGAAAGGGGATCTGCAAAGGCTGCTCAGTAAAGGTTATGCCCACGTTAGGTTATGTCACTGCAGGAAGAAATATGGACAACACCCC - -a -s mr.mrrefChr3 99548 90 + 181019 TTTCTTGGTCCTGTGTCATCCTACAAATTTTCCTAGGTCATTTGAAACCATGCACTCATGCAATAAATTAGCTGCTTGACATCACAAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549438 90 + 636262 TTTCTTGGTCCTGTGTCATCCTACAAATTTTCCTGGGTCATTTGAAACCATGCACTCATGCTATAAATTAGCTGCTTGACATCAGAAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 24414 90 - 647215 TTTCTTGGTCATGTCTCATCCTACAAGTTTTCCTAGGTCATTTGAAACCATGCATTCGTGCAATAAATTAGCTGCTTGACATCACAAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 99638 93 + 181019 TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTCTACGTCTAATACCACCAGTGTGTGTGAGCACACAGTTGATAGCTTAGACAGTCAAGTTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549528 93 + 636262 TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTCTACGTCTAATACCACCAGTGTGTGTGAGCACACAGTTGATAGCTTAGACAGTCAACTTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 24506 93 - 647215 TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTGGACGTCTAATACCTCCAGTGTTTGTGAACACACAGTGGATAGCTTAGACAGTCAAGTCAAA - -a -s mr.mrrefChr3 99731 231 + 181019 CCCTCACTGTAGTACAGAGATTGAGAGTCATGAGCCTTAAGCTCTTGAGTGGAAAGAGGTTATAAACTTGTCATAGCTACGGGCTGCTATTATCCATCTAGAAAAGTAGCTGGTGGTAATTTTCATGTCCATAGTGTAAATGAGGGATAATAGTGCTACAACCCCTGACAGGGGAGTTTAAAAGAGCTCTTACCTGTAGCTAGAATACTGCTCATTGATAAGACACTACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549621 231 + 636262 CCCTCACCGTAGTACAGAGATTGAGAGACATGAGTCTTAAGCTCTTGAGTGGAAAGAGGTTATAAACTTGTTATAGCTAGGGGCTGCTTTTATCCATCCAGAAGAGTAGCTGGTGGTAATTTCCATCTCCATAGTGTAAATGAGGGATAATAGTGCTACAACCCCTGGCAGGGGAGTTTGAAAGAGCTCTCACCTGTAACTAGAATACTGCTCATTGATAAAACACTGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 24617 231 - 647215 CACTCACTGCAATACAGAGAGTGAGAGTCATGGGCGTTAAGCTCTTGAATGTAGAGAGGTTATAAACTTGTCATAGCTACGGGCTGCTATTATCCATATAGAAAAGTAGCGGATGGTAATTTTCATGTCCATAGTGTATACGAGGGATAATAGTGCTTCAACCCCCGACAGAGGAGTATAAAGGAGCTCTTACCTGCAGCTAGAATACTGCTCATTGACAAGACACCACTG - -a -s mr.mrrefChr3 99962 58 + 181019 CTGGAATTAGAGACACAGTAACTGACCCAGGATATGGATCGGTATTCTCCTAAATCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549857 58 + 636262 CTGGACTTGGAGACACAGTAACTGACCCGGGATATGGATCGGTATTCTCCTAAATCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 24848 58 - 647215 CTAGAATTAGAGACACAGTGACTGACGCAGGATATGTATTGGTATTCTCCTAAATCTT - -a -s mr.mrrefChr3 100020 23 + 181019 CTGTATGAGCCACCTGCGTGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549938 23 + 636262 CTGTATGAGCCACCTGCGTGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 24906 23 - 647215 CTGTATGAGCTACCTGCTTGTGG - -a -s mr.mrrefChr3 100043 60 + 181019 GAGATTATTGAACTGTACTTCACAATCTGGTAAACCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAAATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549965 60 + 636262 GAGATTATTGAACTGTACTTCACAATCTGATAAACCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 24929 50 - 647215 ---------GAACTGTACTTCACAATCTGGTAATCCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAA-TCT - -a -s mr.mrrefChr3 100103 82 + 181019 GGTATAAAAGGAGAATAGTATAATTGAAGGACAATAGTATGAAACCAAAACCTCTGCATCTTGGTACAAATTGAGGAATTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550025 82 + 636262 GGTATAAAAGGAGAATTGTATATTTGAAGCACCATAGTATGAAATGAAAACCTCTACACCTTGGTACAAATTGAGGAATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 25021 82 - 647215 GATATAAAAGGAGAATATTATAACTGAAGGACAATAGTATGAAACCAAAACCTCTGCATCTTGGTACAAATTGAGGAATTGT - -a -s mr.mrrefChr3 100185 21 + 181019 TGAATCTAGCCTTGGCCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550109 21 + 636262 TGAATCTAGCCTTGGCCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 25103 21 - 647215 TGGATATAGCCTTGGCTATAA - -a -s mr.mrrefChr3 100206 33 + 181019 GGTAATCCCTCAGTCATGTGTTGCTAACAGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550143 33 + 636262 GGTAATCCCTCAGTCATGTGTTGCTAACAGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 25124 33 - 647215 GGTAATCCCTCAGACATGTGTTCCTAACAGATA - -a -s mr.mrrefChr3 100239 37 + 181019 GAGAAATCAAATAATATACCTGTGTGTACAGTTCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550176 37 + 636262 GAGAAATCAAATAATATACCTGTGTGTACAGTTCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 25165 37 - 647215 GGAAAATCAAGTAATATTCCTATGTGTACAGGTACCA - -a -s mr.mrrefChr3 100276 56 + 181019 GCTCATGCCCTTCCTGCCCACAGCCCCCTTTTTGTGTACATATTATCAGTACAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550213 56 + 636262 GCTCATGCCCTTCCTGCCCACAGCCCCCTTTTTGTGTACATATTATCAGTACAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 25203 56 - 647215 GCTCATGCCCTTCCGGCCCACAGCCCCCTTCTTGTGTACATATTATCAGTACAACT - -a -s mr.mrrefChr3 100332 45 + 181019 GAGCAACTGACTCAAATGACCTAGCTACTGACCCATGGACCAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550269 45 + 636262 GAGCAACTGACTCAAATGACCTAGCTACTGACCCATGGACCAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 25272 45 - 647215 GAGTAACTGACTCAAATGACCTATCTACTGACCCATAGACCAATC - -a -s mr.mrrefChr3 100377 6 + 181019 CAGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550346 6 + 636262 CAGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 25317 6 - 647215 TAGTAT - -a -s mr.mrrefChr3 100383 86 + 181019 TTATTTATGATTTCAGTACTAACTGCTGGCAAATAAAACAGAGGTACACCAATGGGGATGGAATTGATCCAATTGATTGCCGTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550360 86 + 636262 TTATTTATGATTTCAGTACTAACTGCTGGCAAATAAAACAGAGGTACACCAATGGGGATGGAATTGATCCAATTGATTGCCGTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 25323 86 - 647215 TTATTTTTGATTACAGCACTAACGGCTGTCAAATAAAACAGAGATTCGTCAACGGGGGTGGAATTGATTCGATTGATTGCTGTTAG - -a -s mr.mrrefChr3 100469 51 + 181019 CATACATATATGGAACCTATACCATAAGAGATGAGCATTAAACCTCAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550446 51 + 636262 CATACATATATGGAACCTATACCATAAGAGATGAGCATTAAACCTCAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 25410 51 - 647215 CATGCATATATGGAACCTACACCATAAGAAATGAGCATTAAACCCCAGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 100520 282 + 181019 CATACCAGCCTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACAGTAACTTGTAGTTATCATACCCAAGTGAAAGGGCCATTGGCACCCAAGGTCCACAAAAGTAACAGTTTGTAACCACGCTAGAAGGCAGCTTATAGCCATCTACACATTTCTTCTTAAATCCCAGTGGCACTCTTCTTCTCCTTTTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCTCACAACTATAAACATTTCAGATTGAAAAGAGTAAGGGAGAGTGTACTGCAGACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550498 282 + 636262 CATACCAGCCTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACAGTAACTTGTAGTTATCATACCCAAGTGAAAGGGCCATTGGCACCCAAGGTCCACAAAAGTAACAGTTTGTAACCACGCTAGAAGGCAGCTTATAGCCATCTACACATTTCTTCTTAAATCCCAGTGGCACTCTTCTTCTCCTTTTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCTCACAACTATAAACATTTCAGATTGAAAAGAGTAAGGGAGAGTGTACTGCAGACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 25461 282 - 647215 CGTATCAGTTTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACGGTAACTTGTAGTCATCATACCCAAGTGAATAGGCCACTGGCACCAAAGGCCCACAAAGGTAAGAGTTTAGAACCACATTAGCAGGCAGTCTATGACCTTCTAAACATTTCTTCTTCAATTCCAGTACCTCTCTTCTTCTCCCTTTCTTTTCTCCTAGTCCTTTTCTCACAACTATAAACACTCTAGAGCGAGAAGAGTAAAGAAGGTTGTACTGTGGACAC - -a -s mr.mrrefChr3 100802 176 + 181019 CATTTTGGAAGTTGACAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTGATATGATGGTGTAGCCTGGGGAAGAGCAACCTCCCACATCCAGTAATGTTAGCCCAGCCTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGAATAAACACAGTTTCTGTAGTTCAGTGTCTGTGATAAGTAAAAGTATCATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550796 176 + 636262 CATTTTGGAAGTTGACAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTGATATGATGGTGTAGCCTGGGGAAGAGCAACCTCCCACATCCAGTAATGTTAGCCCAGCCTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGAATAAACACAGTTTCTGTAGTTCAGTGTCTGTGATAAGTAAAAGTATCATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 25743 176 - 647215 CACTTTTGAAGTTCATAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTAGTATGATGGTGTAGCCCAGGGAAGAGCAGCCTCCCACATGCAGTGATGTTAGCCCAGCTTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGGACTGATACAATTTCTCTAGTTCAGTATCTGTGATAAGTAAAAGTATCCTAG - -a -s mr.mrrefChr3 100978 111 + 181019 TCCTACAGTTTTGTCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGAAGTCAAGCTTTTTCTCATCCTAATGTTACTTTTTAACTATGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550972 111 + 636262 TCCTACAGTTTTGTCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGAAGTCAAGCTTTTTCTCATCCTAATGTTACTTTTTAACTATGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 25924 111 - 647215 TTCTGCCATTTTGCCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGATGTCAAGCTCTTTCTCATCCCAGTGTGGATTCTTAACTAGGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 101089 59 + 181019 AATGAAGTATGTACTTAATCAACATATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551083 59 + 636262 AATGAAGTATGTACTTAATCAACATATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 26039 59 - 647215 AATGAGGTATGTACTTAATCAATGCATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC - -a -s mr.mrrefChr3 101148 154 + 181019 ATCATCTTCAAGTCAGGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGCTGCAAGGTAGTGTAACACTTAATGGATGACAAACGTTTAGGTATGTTTAGATAGGGGCACATGGAATTAGGGTTGTTTGTCTAAAAGTGCATACGTACATCAACTTATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551142 154 + 636262 ATCATCTTCAAGTCAGGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGCTGCAAGGTAGTGTAACACTTAATGGATGACAAACGTTTAGGTATGTTTAGATAGGGGCACATGGAATTAGGGTTGTTTGTCTAAAAGTGCATACGTACATCAACTTATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 26101 154 - 647215 ATTATCTTTAAGTCAAGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGTTGAGGAATAGTGTAACACTCAATGGACAGCAAATGTCTAGGTATGTTTAGATTGGGGTACATGGAATTAGGGTTGTTTCTCTAAAAATGCATACATACATCAGCTTGTGG - -a -s mr.mrrefChr3 101302 91 + 181019 TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551297 91 + 636262 TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26255 91 - 647215 TACCCTACCAAAAATCAAGGAAGTTATTTTTCAAGCATAACATAGCAAACCTTGCAGGTTACAATGCCTTATCGATTCTTTGAACTTACAT - -a -s mr.mrrefChr3 101393 13 + 181019 ATGTGAGAGATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551397 13 + 636262 ATGTGAGAGATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26346 13 - 647215 ATGTAAGAAATTA - -a -s mr.mrrefChr3 101406 7 + 181019 TGCTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551412 7 + 636262 TGCTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26359 7 - 647215 TGCTAAT - -a -s mr.mrrefChr3 101413 15 + 181019 CATCAGTGATATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551421 15 + 636262 CATCAGTGATATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26366 15 - 647215 CATCAGTGATATTGA - -a -s mr.mrrefChr3 101428 95 + 181019 TACAAGCAATTATTTAATGCTATGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCTCCTCTGTCCTTTGAAGAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551437 92 + 636262 TGCAAGCAATTACTTGATGCTATGATAAAAGTGCAGGTGAACTTAAGTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCCCCTCTGTCCTTT---GAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26381 94 - 647215 TACAAGCAAT-ATTTAATGCTAGGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCATCCAGTTGTGGTCAGTGGTCTCCTCTGTCCGTTGAAGAGGT - -a -s mr.mrrefChr3 101523 1 + 181019 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551574 1 + 636262 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 26475 1 - 647215 G - -a -s mr.mrrefChr3 101524 15 + 181019 ACCTGTTACCCTCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551575 11 + 636262 GTCTGT----CTCGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 26478 15 - 647215 ACTTATTACCCTTGT - -a -s mr.mrrefChr3 101539 353 + 181019 ATAAGCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTACCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGTCGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTGATTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTTGGGCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTGCCAAGCCAGCCTAGACTAATCTAGGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAAATGCCACCTCACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551586 352 + 636262 ATGACCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTGCCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGCTGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTCCTTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTCAGCCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTACCAACCCAGCCTAGACTAATCTAGACTTAAGACACACAATAACCA-TGTTAAAATGCCGTCTAACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAGAGAAGCACCACTGACAATACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26498 352 - 647215 AGAGGTGGCTTGCTTCTCGCTTGAGTTACCATTAGCCTACCCCCTCAACTCACTGAAGGATTAATATCGGCAGATGCATGTCGTGATGGGCCAGCACAGTCTTTATAAAGATTTGATTCAATTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCGAAGCTTGGGCCGAGAAGAATTTGGAAAAATCTTACATCCTAGCTGAGTGCCCACTACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGTA-GCCTGCCAAGCCAGCCTAAACTAACCTGAGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAGGTGCCACCTCACTGTTCTAGATGGACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT - -a -s mr.mrrefChr3 101892 51 + 181019 TCCCCTACTTGCATTTATGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551938 51 + 636262 TCCCCTACTTGCATTTATAAGTACTAGCACCATAGTTTTTTCAGCTTTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26863 51 - 647215 TCCACTACTGACATTTGTGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA - -a -s mr.mrrefChr3 101943 169 + 181019 TCAAATCACCGTAAGGGATCCTATCTGGTTAGCACTGGCATCTATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGTTGAGATTGCGACATGCAGCACTTAGGATTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551992 155 + 636262 TCAAATCACTGTAAGGGTTCCTATCTGGTTAGCACTGGCACCAATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCTATCAGACCCA--------------GCAGTTCTGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGCTGAGATTGCAACATGTAGCACTTAGGATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26914 169 - 647215 TCAAACCACCGAAAGGGATCCTATCTTGTTAGCACTGGCATCTATTATCAAAGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTGGATAAAGTTGAGAAGATACAACTGTTGAGATTGTGACATGCAACACTTAGGATTAT - -a -s mr.mrrefChr3 102112 113 + 181019 AATCAGAGTATATTCTGCAGCACCCCGATTGGGGACAAATACAGAACAATAGTGTCCTGAGCCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAGACCAAGAAATAACTGAATGGGATATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552151 112 + 636262 AATCAGAGTATATTCT-CAGCACCCCGCTTGGGGACAAATATAGAACAATAGTGTCCTGAATCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAGACCAAGAAATAACTGAATGGGATATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 27083 112 - 647215 ACACAGAGGATATTGTGCAGCTCCCCCATTGGAGACACATACAGCACAACAGCGTCCTGAGCCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAAACCAATAAATA-CTGAATGCGATGTGTT - -a -s mr.mrrefChr3 102225 205 + 181019 GTAAGTAGCCCTATCATATGGCTTTTTCAGGATTTAGCAGTCTTCACAGAGGCTGTTCATTTGCTGAGGACATTATGAGATACTCTAGAATGAATCCATTATGATGGCCAATGAGGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGACATGGATCATAGGCCATTCGGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGAGTGCTTAGAATTCAAAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552263 202 + 636262 GTAAGTAGCCCTATCATACGGTGTTTTCAGGATTTAGTAGTCTTCACAGAGGCTGT--ATTTGCTGAGGACATTATGAGATACTCTAGAATGAATCCATTATGATAGCCAATGAGGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGAGAGGGATCATAGGCCATTCAGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGAGTGCTTA-AATCCAAAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 27196 205 - 647215 GTAAGTAGGCCTATCATATTGCTTTTTCAGAATTTAGCAGTCTTCACAGAGGCTGTTCATTTGTTGAGGACATCAGGAGATACTCTAGAATGAGTCCATTATGATGGCCAATGAAGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGACATGGATCATAGGCCATTCGGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGTGTGCTTAGAATTCAAAGACA - -a -s mr.mrrefChr3 102430 54 + 181019 AGATGAATCTATGCTTAAATGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552465 54 + 636262 AGATGAGTCTATGCTTAACTGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 27499 54 - 647215 AGGTTAATTTATGCTTAAATGCCATTCTGATTTTAATAGACACTTTGTCTGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 102484 11 + 181019 AATCTCAAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552519 11 + 636262 AATCTCAAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 27557 11 - 647215 AATCCCAAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 102495 38 + 181019 CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552531 38 + 636262 CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 27568 38 - 647215 CGCATGCACCAAAGTCATTAGTAGGACTAGGTCAAAGC - -a -s mr.mrrefChr3 102533 494 + 181019 AAGCGTTCTATATATGATGATGCTGAGCTACAGAGCCTCAATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATGGAAGTAAAAACAGCCTTTCCCACTTATACATGTGCTGGTAGGAATTTCAACTTCAACTGCTGTACTTTTTTTTTAAGGCATGCACATCTTTTGTCTGGGGACAGAGAGGCACTACCCTAACATATGAACTCGCTCACTTGTAAGCTAGGGTGACAAAACAATCTGCCCTCTTAAATGTGATTTTATAATTACGTTACTCTCTGCCTAGAAGTGACATTACAGGCTGCTTGAATAAGAAACTCCCTGTCTGGGTCTGTGCCTAGTCAATTGTGATCCTCCATAGAAATCCAGTTGTGGATATGCTTGGGCACCAAACTCTCATTGTTGTACTGAGAGAACTGACATCAGTTGAAGATAGATTTATTATAGAGGGCTCTAAGTACTCCCTCATATAGTTATTTGTTTATGGGGGCTATGGGCAATAGGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552569 492 + 636262 AAGCGTTCTATATATGA-GATGCTGAGCTACAGAGCCTCAATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATAGAAGTAAAAACAGCCTTTCCCACTTATACATGTTCTGGTAGGGATTTCAACTTCAACTGCTGTACTTTTTCTTTAAGGCATGCACATCTTTTG-CTGGGGTCAGAGAGGCACTACGCTAACATATGAACTCGTCCACTTGTAAGCTAGGGTGACAAAACAATCTGCCCTCTTAAATGTGATTTTATGATTATGTTACTCCCTGCCTAGAAGTGACGTTACAGGCTGCATGAATAAGAAACTCCCTGTCTGGGTCTGTGCCTAGTCAATTGTGATCCTCCATAGAAATCCGGTTGTGAATATGCTTGGGCACCAAACTCTCCCTCTTGTACTGAGAGAGCTGACATTAGTTGATGATAGATTTATTATAGAGGGCTCTGAGTACTCCCTCATATAGTTATTTGTTTATGGGGGCTATGGGCAATAGGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 27615 488 - 647215 AAGCATTCTATCTATGATGATGCTAAGCTACAGACCCTCTATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATGGTAGTAAAAACAGCCTTTCCCGCTTATACATGTGCTGGTAGGAATTTCAACTTTAACTGCTGTACTTTTCTTTTGAGGCATCCACATCTTTTGTCTGACGACAGAGAGGCACCACCCTAACATATGTACTCACTCACTTGTAAGCTAGCGCGACAAAACAATCTGGACTCTTAAATCTGTTC----AATTACTTTACTCTCTGCCCAGAAGTGACAT--CAGGCTGCTTGAATAAGAAAATCCCTGTGTGGGTCTGTGCCTAGTCCATTGTGATCCTCCATAGAAATCCAGTTGTGGATATTCTTGGGCACCAAACTCTCATTGTTGTACTGAGAGAACTGACATCAGTTAAAGACAGATTTAATATAGAGGGCTCTAGGTACTCCCTAATGTAGTTATTTATTTATAGGGGCTATGGGCAATGGGCCC - -a -s mr.mrrefChr3 103027 319 + 181019 TGGACAAACTCTTGGAATAAGATAAGCAGCCAGACTCTATAATAGCACCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCAAAATTCAAGTTCTGTCATTGTTGAGTTTGTAAGTTTCTCCCCATCACTCTTACTATAATGTTGACCCCATATGGGGACGCATATCTTAAATGCCTACTGTTAGGTTAAAATAAACATCATGAGAGCACCTTATCTAATGCTGGTTTCACATGACCCTTGTCGGCCTTGAGTCATCTCTTTATCCAAGCTAATACCCATGTGATGTGCCTAATGGGAATGCTTTGGTGCAGCTATGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553062 314 + 636262 TGGACAAACTCTTGGAATAAGATAAGC-GCCAGACTCTTTAATAGCACCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCCAAATTCAAGTT---TCATTGTTGAGTTTGCAAGTTTCTCCCCATCACTCTTATTATAATGTTGACCCCATATGGGGACGCATATCTTAAATGCCTACTGTTAGGTTAAAATAAACATCATGACAGCACCTTATCTAATGCCGGTCTCACATGACCCTTGTCGGCCTTGAGTCATCTCTT-ATCCAGGCTAATCCCCATATGATGTTCCTAATGGGAATGCTTTGGTGCAGCTATGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 28103 312 - 647215 TGGACAAACTCTTGGAGTAAGATAAGCAGCCAGACCCTATAATAGTAGCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCAAACTTCAAGTTCTGTCATTGTTGAGTTTGT-------TCCCCATCATTCTTACTATTATGTTGACTCCATATGGGGATGCGTATCTTAAATGCCTACTGTTATGTTAAAATAAACACCATGGGAGCACCTTATCTAATGCTGGTTTCACATGACCCTTGTAGGCCTTGAGTCCTCTCTTTATCCAAGCTAACACCCATGTGATGTGCCTAATGGGATTGCTGTGGTGCAACTGTGCTT - -a -s mr.mrrefChr3 103346 57 + 181019 CTGTGTATGAATACAGGATTAATAACTTAATGACATGTCTGATTTAGCCCCTCAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553376 57 + 636262 CTGTGTATGAATATAAGATTAATAACTTAACGACATGTCTGATTTCGCCCCTCAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 28416 57 - 647215 CAGTGCATAAATACAGGATTAGTGATTCAATGACATGTCTGATTTAGCCCCTCAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 103403 32 + 181019 GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553433 32 + 636262 GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 28481 30 - 647215 GAGACCAATAATCTCATAAACGGAAGGTAA-- - -a -s mr.mrrefChr3 103435 167 + 181019 GGCAGTCCCTCCTGTATATTGTATCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGCATAGTGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553467 167 + 636262 GGCAGTCCCCCCTGTCTATTGTGTCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGTTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGGATAGAGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 28511 167 - 647215 GGCAGTCCTTTCCGTATATTGTATCAGAAGGATCAGGGAAAGATTTACAAGCCAATATAAGTATCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATATAATGTGACCACTGGAGGACCAGCTCAGTGGATGGGTGGCTGGACATCTGAGCAAATTCAACTTGGGCTAACTTATTCC - -a -s mr.mrrefChr3 103602 217 + 181019 TCCAGTTCAATTAGTGGCGGGGATAAGGGGTCCATGCCACTACAGTTTTGGGCAAAGCCATCTTACTCAGCCAGTTATATAAATAAGGGAAGGGAACTTAGTAATCAACCATAATAGGACTGCATATAGTTAATTATGAGCCTTTGATATGCATGGATGTATAATACCCTGATTTCATAGTGTAGTGATTTTATACCCCGGCTTTACATTATACCGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553634 216 + 636262 TCCAGTTCAATTC-TGGCGGGGATAAGGAGTCCATGCCGCTGCAATTTTGGGCAAAGCCATCTTGCTCAACCAGTTATACAAATAAGGGAAGGGAACTTAGTAATCAATCATAATAGGACTGCATACAGTTAATTAGGAGCCTTTGATATGCATGGATGTACAATACCCTGATTTCATAGTGTAGTGATTTTATAACCCGGCTTTATATTATACCGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 28787 215 - 647215 TCCAGTTCAATTAGGGGTGGGGGTAAGGGGTCCATGCCACTAGAGCTTTGGGCAAAGCCATCTTACTCAGCCAGTTATATAGATAAGAGAAGAGAACTTAGTAATCAACCATAATAGGACTACATATGG--AATTATGAGCCTTTGATATGCATGGATGTATTCTACCCTGATTTTATAGTGTAGTGATTTTATACCCTGGCTTTACACTATACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 28678 109 - 647215 TCCAGTTCAATTAGTGGCAGGGCTAAGTGGTCCATGCCACTACAGTTTAGGGCAAAGCCATCATACTCAGCCAGTTATATAAATAAGGGAAGGGAACCTAGTACTCAAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr3 103819 187 + 181019 CGTGCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAATATTTATTATCCAATTATTTGATTTTTGATTGGGTATGACACCCTGTCCCCCCCTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAGGTTTGGTGGCAATGTTACACTATTACCACTATATTTACAATGAGTAACAGATTCCTTTGCACCCTTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553850 186 + 636262 CGTGCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAA-ATTTACTATCCAATTATTTACTTTTTGATTGAGTGTGACACCCTGTCCCCCCCTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAGGTTTGGTGGTAATGTTACACTACTACCACTATATTTACAATGAGTAACAGATTTCTTTGCACCCTTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 29005 175 - 647215 TACTCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAATGTTTATTATCCAATTATTTGATTTTTGATTGGGTATGTAACCCTGTCCCCCTTTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAAGTTTG-TGGCTATGTTACACTTTTACCATTATATTTACAGTGGGTAACAGTTTCCTTA----------- - -a -s mr.mrrefChr3 104006 105 + 181019 CAGAGTATCAGTGCTATAAACACTGGGCTTACAGACATCTGTAGAATAGGATTCTGGAAAAAAGTGAAGGAACACAATGCCAGAGTTAAAACAGCCATATCATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554037 101 + 636262 CAGAGTATCAGCGCTATAGACACTGGGCTTACAGACACCTGTAGAATAGGATTCTGGAAAAAAGCGAAGGAACACAATGCCAGTGTTAA----GCCATATCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 29180 104 - 647215 -AGAGTATTAGTTCCATAAACACCGGGGTAACAGACATCTGTAGAATAGGATTCTCGTAAAGAGTGAAGGAACATAATGCCAGAGTTAAAACAGCCATTTCATAT - -a -s mr.mrrefChr3 104111 70 + 181019 TCTTTGTTTGTATGAAGAGTCCACACTTCATCTCAAAAAATTTTAGAATGTGCATATAGATACTTTTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554138 70 + 636262 TCTTCATTTGTATGAAGAGTCCACACTTCATCTCAAAAAATTTTAGAATGTCCATATAGATACTTTTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 29285 70 - 647215 TCTTTGTTTGGATGAAGAGTCCAAACTTCATCTCAAAAAATTTTAGAATGTGCATACAGATACTTTTTCA - -a -s mr.mrrefChr3 104181 32 + 181019 TCACTCCAGAGGTTAGGGCACACACATTGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474426 32 + 636262 GCATTTGAGAGGTTAGGGCACACACATTGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554208 32 + 636262 TCACTCCAGAGGTTAGGGCACACACATTGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 29355 32 - 647215 TCACTCCAGGGGTTCGGGCACACACATTGTGT - -a -s mr.mrrefChr3 104213 164 + 181019 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGTCCTGAAAGAATAAGCTCCAGTAATCAGGTTCATGTGGTTAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGTGGTGGAGCAAGTAACCTTAATTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474459 164 + 636262 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGCCTTGAAAGAATAGGCTCCAGTAATCAGGTTCATGTGGTTAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGTGGTGGAGCAAGTAACCATAAGTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554240 155 + 636262 AAATAAA------GGCAGGTGGTCCTGAAAGATTACGCTCCAGTAAACAGGTTCATGTGGTAAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGCAGTGGAGCAAGTAACC---ATTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 29387 164 - 647215 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGTCCTGAAAGAATAAGCTGCAGTGCTCAGTTTCCTGTGGCTAGCAGTTTCCCTAATCTCAAGGGAGTATATTTAACTGGTGGAGCATGTAACCTTAATTTTGCCAGTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATATATAAGTCCCC - -a -s mr.mrrefChr3 104377 48 + 181019 AAAGCTGCTCATAGTATAACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474623 48 + 636262 AAAGCTGCTCATAGTATAACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554395 48 + 636262 AAAGCTGCTCATAGTATGACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 29552 48 - 647215 AAAGCTGTTCATGGTATAGCTGAATTCTAATGTCCATATCTGGAAATA - -a -s mr.mrrefChr3 104425 51 + 181019 GGTTGTACCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATTACCAACCAGGGGGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474671 51 + 636262 GGTTGTACCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATTACCGACCAGGGGGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554443 51 + 636262 GGTTGTGCCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATCACCAACCAGGGGAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 29608 51 - 647215 GGTTGCACCATGATGACAGTGACCCTACCTTAATTAATAACCACGGGGAAA - -a -s mr.mrrefChr3 104476 248 + 181019 AAGATGTACCTGTGCATATCGAGGTATAATTCTTGAGTTAATTCCTTGCAATGGGTGATGACAACCTCAGCCTATCCAAGAATTAGTGTGGTTTACATGTGACCTAAAACCCTCAGAGACTTCAAATTGCCTCCCCCTTTTCTGGGAGTTCCTGTATCGTTGATACTAAAACAAGCTGAACAATCATTTAGTAGAGAGGCCCTGGGAAGGTGGCCTCCTTACTAAGAAACTTGCTCAATGACTGAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554494 248 + 636262 AAGATGTAACTGTGCATATCGAGGTATAATTCTTGAGTTAATTCCTTGCAACGGGTGATGACAATCTTAGCCTATCCAAGAATTAGTGTGGTTTACATGTGACCTAAAACCCACAGAGACTTCAAATTGCCTCCCCCTTTTCTGGGAGTTCCTGTACCGTTGATACTAAAACAAGATGAATAATCATTTAGTAGAGAGGCCCTGGGAAGGTGGCCTCCTTACTAAGAAACTTGCTCAATGACTAAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 29659 214 - 647215 AAGATGTACCTGTGCACATCAAGGTATGGTTTCTGAGGTAATCCCCTACAATGGG-GATGACAGCCTCAGTCTACCCAACAATTAGTGTGGTTTGCATGTGACCTAAAATCCTCAGACACTTCAAATTTCCTCCCCCTTTTGTGGGAGTTCCTGTATGGTTGAGACTAAAACAAGCTGAACAATTATTTAGTA---------------------------------AAACTTGCTCAATGGCTGAGGT - -a -s mr.mrrefChr3 104724 142 + 181019 TTGAATTCTTTTGTCAAGGATTAATACATATTTCGAGTATGAGTCTTGTTAGGTTGAATGAAGAAAGGATGCTGGACTGAAGATCTGATCAACTGGTCTCCAACCAAGATTGGTGATGCTGGAGGACTATTTGCACCTAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554749 142 + 636262 TTGAATCCTTTTGTCAAGGATTAGTACATATTTCGAGTATGAGTTTTGCTAGGTTGAAAGAAGAAAGGATGCTGGACTGAAAATCTGATCAACTGGTCTCCAACCAAGATTGGTGATGCTCGAGGAATATTTGCACCTAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 29873 141 - 647215 TTGAATTCTTTTGTCAAGGATTAATATATATTTCTAGTATGAGGCTTGTTAGGTTGAATGA-GAAAGGATGCTGGACTGAAGGTCTGATAAATTGGTTTCCAAACAAGATTGGTGATGCTGGAGGACTATTTGGACCTAGGT - -a -s mr.mrrefChr3 104866 33 + 181019 AGCTTAGATTTTAGGGCTATAAGCATAATTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554891 33 + 636262 AGCTTAGAATTTAGGGCTATAAGCACAATTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 30015 33 - 647215 AGCTTTAATTTTAGGGTTACAAGCATAATTTGT - -a -s mr.mrrefChr3 104899 240 + 181019 TTAAAATGTGTGTGGTCCTGGATGCACTGTATCTTTGCAACTCTATTCTAGAGCCCTTAAAGTACAACCAGGCCTCTACAAATGCACGTGATTGTAAGGCACCAGCAATTGCTGGTGTGGAATAAATGTGCAGCATTCCAGTAAACCTTTATTGATTACAAAGCAAGCATATATGGTTGTCCTCAATGCAGCTCTCATGCATAGCAAACTTTCCTTCAAATATTAGCAACTCTCGGCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554924 239 + 636262 TTAAAATGTG-GTGGTCCTGGATGCACTGTATCTTTGCAACTCTATTCTAGAGCTCTTAAAGCACAACCAGGCCTCTACAAATGCACGTGATTGTAGGGCACCAGCAATTGCTGGTGTTGAATAAATGTGCAGCATTCTAGTAAACCTTTATTGATTACAAAGCAAGCATATATGGTTGTCCTCAATGGAACTCTCGTGCATAGCGAACTTTCCTTCAAACATTAGCAACTCTCAGCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 30057 232 - 647215 TTAGAATGTTTGTGGTCCTGGATGGACTGTACGTTTGCAAATCTATTCTACAGCCCTTAAAGTACAACAGGGCCTCTACAAGTGCACATAATTGTAAGGCACTAGCAATTGCTGTTGTGGAATAGATGTGC--CATGCCACTAAAACTTTATTGGTTACAAAGCAAGCATACATGGTTGTCCTCAATGCAGTTCTCATGCATAGCAAA------TTCAACTATTAGCAACTCTCGGCCCA - -a -s mr.mrrefChr3 105139 250 + 181019 TTTGGAACTAATGGGCTCATTTTGGACTAATGGTGGTACTTCCTGAATGTTTCCTGTTTAACAAGGGTCCCTATTGGGACCCATAGCGTAGAGCAATGCACTGTAACCAATTTTCAAGTATTGCAATGCATTCCCCCAGCACATTAAGTATGGGGAGGAGAAGAATTCCTGACCAGTATTTGTTTGTTTTTAATGATGATTTTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACTCAACCCTCATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 555163 248 + 636262 TCTGGAACTAATGGGCTCATTTTGGACTAATCGTGGTACTTCCTGAATGTTTCCTGTTTAACAAGGGTCCCCATTGGGACCCATAGCGTAGAGCAACGCACCATAACCAATTTTCATGTATTGCAATGCATACCCCCAGCACATGAAGTATGGGGAGGAGAAGGATGCCTGACCAGTATTTGTTTGTCTTTAATGATGATTCTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACT-AACCCTCATG- -s simRat_chr6.simRat.chr6 30308 250 - 647215 TTTTGACCTCATGGGCCCAGTTTGGACTAATGGTGGTGCTTCCTGAATATTTCCTGTTTAACATGGGTCCCTATTGGGACCCGTAGTGTAGAGCAATGCACTGTAACCAGTTTTCAAGTATTGCAATGCATTCCCCCAGCACATTAAGTATGGGCAGTAGAGGAATTCCTGACCAGTATTTGTTTGTTATTAACGATGATTTTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACTCAACCCTCATGT - -a -s mr.mrrefChr3 105389 481 + 181019 ATGCCCATAGCTGGCGAGGGTACCATATATCAGTCAGGTTTCATCTAGTGTAGGTTCTGTTTTCCTACTGCTAGCAGGCAAAAATAGCCAAGATCATCATTCATGAGTAAGCTGCCATGTTGGCTAATGAGAACTACTGAGAAAACTTCACACATTAGAAAAAGCAGTCTGTAGGTTGTATTTTTGAAAGTGGTTTGTAGGGCAGTCCCTCATTTTAATGTGACTTTGAGTAACCTCAAACTCTATGCCCACTGTTGTGTGCTGAACTGGCCAACAATCCTTGCATCTAAAAGACCCCCTACCCTCCCATATAATTGGATAATTCTCTATGTCCTTGAGGAAAAAATAACCATGTTATACTTTGAAACATAATATACCAGCTCTATATCTTGGTAAAAGCATTGCGTGAATTTGCCTAATCCCCATGAGCACTCTTGTACCAAGACTAAAAACATTGAAACTGTCTCAGGTCAAGATTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 555411 476 + 636262 ---CCCATAGCTGGCGAGTGTACCATATATCAGTCAGGTTTCATCTAGTGTAGGTTCTGTTTTCCTACAGCTAGCAGGCGAGAATAGCCAAGATCATCATTCGTGAGTATGCTGCCATGTTGGCTAATGAGAACTACTAAGAAAAATTCACAC-TTAGAAAAAGCAGTCTGTAGGTTGCATTTTTGAAAGTCATTTGTAGGGCAGTCCCTCATTTTAATGTGAC-TTGAGTAACCTCAAACTCTATGCCCACTGTTGTGTGCTGAACTGGCCAACAATCCTTGCATCTAAAAGACCCCCTACCCTCCCATATAATTGGATAATTCTCTATGTCCTTGAGGAAAAAACAACCATGTTATGCTCTGAAACACAATACACCAGCTCTATATCTTGGAAAAAGCATTGCGTGAATTTGCCTAATCCCCATGAGCACTCTTGTACCAAGACTAAAAACATTGAAATTGTCTCAGGTCAAGATTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 30559 448 - 647215 ATGCCCATAGCTGGCAAGGGTACCATAC--------GGTTTTA-------------CTGTTTTCCGACTGCCAGCAGGAAAAAATAGCCAAGATCATCATTGATGACTAAGCTGCCATGTTGGCTA----------CTGAGTAAACTTCATGCATTAGAAAAAGCAGTTTGTAGCTTGTATTTT--AAAGTGGTTTGTAGCGCAGTCCCTCATTTTAAGGTGACTTTGAGTTTCCTCAAACCTTATGCCCACTCTTGTCTGCTGAACTGGCCAGCAATCCTCGCATCTAAAAGACCAACTTCCCTCCTATGTAATTGGATAATTCTCTATGTCCTTGAGGAAAAAATAACCATGTTATACTTTGAAACATATTATACCGGCTCTATATCTTGATAAAAGCATTGCATTAATTTGCCTACTCCCCATGAGCACTCTTGTACCAAGACTATAAACACTGAAACTGTCTCAGGTTAAGGTTATT - -a -s mr.mrrefChr3 105870 186 + 181019 GTGTACCAGGGCTAAAAACCCTAAGTCTGTTTTAGGTTAAATTTGTTGTAAAGAATATAATAATTGTATAGCAGGCCAATCTATGACAGTTCAATGCATAATTGTTGACTTAGCTTTAAGGTTCTATCACACTGTCTTCTACATTTGGTAACTGTATCATGAGCAACACCCATTTTGTGACTGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 555888 186 + 636262 GTGTACCAGGGCTAAAAACCCTAAGTCTGTTTTAGGTTGAATTTGTTTTAAAGAATATAATAATTGTATAGCAGGCCAATCTACGACAGTTCAATGCATATTTGTTGGCTTAGCTTTAAGATTCTATCACACTGTCTTCTACATTTGGTAACTGTATCATGAGCAACACCCATTTTGTGACTGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 31007 185 - 647215 GTGCACCAGGGCTAAAGACCCCAAGTATGTTTTAGGTTAAATTTGATGGAAAGAAT-CAGTAATGGTGCAGTGGGCCAATCTATGACAGATCAATGCAAAATTGGTGACTTAGCTTTAAAGTTCTATCACATACTCTTCTACATCTGGAAACCGTATCATGAGCAACACCCATTTTGTGACTGTAT - -a -s mr.mrrefChr3 106056 101 + 181019 TTAGGATTTAGCTTTCCCTCAACTGATGAACTCAAACAATGCTTTAACTGGTCAAACAAGCAAATTAAAGAGTACAATTAGTTACTCTCTGCAATCTCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556078 101 + 636262 TTAGGATTTGGCTTTCCCTCAACTGATGAACTCAAACAATGCTTTAACTGATCAAACAAGCAACTTAGAGAGTACAATTAGTTACTCTCTGCAATCTCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 31192 101 - 647215 TTAAGATTTAGCTTTCGCTCAGCTGATGTACTCAAACAAAACCTTAGCTGGTCAAACAAGCAAATTAAAGAGTACAATTACTTACTCCCTGCAATCTAAAG - -a -s mr.mrrefChr3 106157 288 + 181019 TGAAATTTGGAACAATTAAACAAGTAGTAGCTAAGCCATCAGATTAAATTATGAATAGTTGCACAATCTGCAATCTTGATCATCAGTTCCTAATCACATTACACAGGACCAAGCACTATTCTTTTATGGCAAAGGCTTCGACTAATCACCCTGTGTAAACTTAAATGAATCCACCCAACCCCCAGTAGAAGAGTGGGATAAGTTCAGTGTTGGCTCTGTTGGTACACCTGTCTCCTTTAAGTTAGTGTTCTAGGGGCTCATATAGTAGGTGCCACTGAACTACATCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556184 288 + 636262 TGAAATTTGGAACAATTAAACAAGTAGTAGATAAGCCATCAGATTAAATTATGAATAGTTGCACAATCTGGAATCTTGATCATGAGTTCCTAATCACATTACACAGGACCAAGCATTATTCTTTTATGGCAAAGGCTCCGACTAATCACCCTGTGTAAACTTAAATGAATCCACCCAGCCCCCAGTAGAAGAGTGGGATACGTTTAGTGTTGACTCTGTTGGTACACCTGTCTCCTTTAAGTTAGTGCTCTAGGGTCTCATGTAGTAGATGCCACTGAACTACATCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 31293 259 - 647215 TTAAATTCAGAACAATTGAATAAGTAGCAGCTAAGCCATCAGATTAAATTATGCAAATTTGCACAATCTGCAATCTTGAACACCAGTTTGTAATCACATTACATAGGACCAAGCACTATTCTTCTATGGCAAAGGTTTCAACTAA-------------------ATG-------CCAAGCCCCAGTAGA---GTGAGATAAGTTCAGTGTTGGCTCTGTTGGTACACCTGTCTTCTTTAAATTAGTATTCTAGGGGCTCATATAGTAGGAGCCACTGAACTACATCTT - -a -s mr.mrrefChr3 106445 43 + 181019 GTTCAATTTAAAAGTTTATTAGGGTGCCGTATTGAGTGGTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556478 43 + 636262 GTTCAATATAAAAGTTTATTAGGGTGCCGTATTGAGTGGTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 31552 43 - 647215 GTTCAATTTAAAAATTTCTTGGGCTGCACTATTGAGTGGTGCA - -a -s mr.mrrefChr3 106488 169 + 181019 TGTTTGGTTCAGTAATTGAATCTGTGCTAGGCAAACCTGGGTCTAACAATAGGCCATTTCAACATAAGCACAGCAAGATCAAGTCAGCACTATATCACTGAAACCACCTTGTCTTATATAGTGTTTATGTTGAAATCAGATTGCGACTGTAGTTTTCACTTCTTTTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556522 162 + 636262 TGTTTAGTTCAGTAATCAAATCTGTGCTAGGCAAACCTGGGTCTAATGATAGGCCATTTCAACATAAGCACAGTAAGATCAAGTTAGCACTATACCACTGATA-------GTCCTACAAAGTGTTTATGTTGAAATCAGATTGCGATTGTAGTTTTCACTTCTTTACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 31595 166 - 647215 TGTTTGGTTCAGTAACTGAATCTATACTA--CAAACCTGAG-CTAACAATAAGCCATTTCAACCTAAATACAGCGAGCTCAAGTCAGCACTATATCACTGAAACCACCTTATCTTATGTAGCATTTATGATGGAGTCAGATTGCAACTGTAATTTTCACTTCTTTTCAA - -a -s mr.mrrefChr3 106657 107 + 181019 AACGAAACTCCTAGATTGTCTGGCACATACTTTCTTTGACAAGTTCAACAAATTAGGAACTCAAACACCTGATCCTTACATGGCCTTAGTACCCACTGTTACCCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556687 106 + 636262 AACGAAACTCCTAGATTGTCTGGCACATGCTTTCTTTGACAAGTTCAACAAATTAGGAACTCAAACACCTGATCCTTAC-TTGCTTTAGTACCCTCTGTTACCCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 31761 107 - 647215 AACAAAGCTTCTAGATTGTCTGGCACATACTTTCTTTGACAAGTTCAACTAATTAGGAATTCAAACACCTGATCCTTACATGGCCTTAGTACCCACTGTTATCCATT - -a -s mr.mrrefChr3 106764 29 + 181019 CATGGCTTGCTATTGCAACTTGCCACCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556793 29 + 636262 CATAGCTTGCTATTGCAACTTGCCACCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 31869 29 - 647215 CATGGCTTGCTATTGCAACTTGTCACCAA - -a -s mr.mrrefChr3 106793 14 + 181019 ACCGTTGATTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556822 14 + 636262 ACTGTTGATTTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 31901 14 - 647215 ACCGCAGATTTCCA - -a -s mr.mrrefChr3 106807 33 + 181019 ACTGCTTGGCTGTAGATGGTACGATTATATAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556836 33 + 636262 ACTGCTTGGCTGTAGATGGTACGAGTATATAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 31986 33 - 647215 ACTGCTTGGCTGTAGATGGTACGATTATATAAT - -a -s mr.mrrefChr3 106840 128 + 181019 AGCAGACAAAGAGTTATCAAGTACCATGTAGAGCTTAACCCATACAATTGGGACTATTGTTACAATGGATATGGAACAACCAAATTGCCAATGGGCTGTTGGTAAAATAGGAGAGAACATGGAGGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556883 128 + 636262 AGCAGACAAAGAGTTATCAAGTACAATGTAGACCTTAACTCATACAACTGGGACTATTGTTACACTGGATATGGAACCACCAAATTGCCAATGGGCTGTTGATAAAATAGGAGAGAACATGGAGGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 32019 128 - 647215 AGCAGACAAAGAGTTATCAAGTACCATATGGAGCTTAACCCTTGCAATTGGGACTATTGTTACAATGGATTTGGGACACCCAAATTGCCAATGGGCTGTTGGTAAAATGGGAGAGAACATGGAGGGGG - -a -s mr.mrrefChr3 106968 400 + 181019 CTTTTGCCTTTTACAGTTAAGGAGGAGGGCATGCATTTGAGACAAAACCATTGGTGCAATTTCTCAAAATAAAATCCTGGATAACCACAGATTGGGTTCTAACAAAGATCATCATGACTGGCCCCATGGAAGGGCAGGATGACTGATGCTCATATAGGGAAACAGTAAAGCGGATTTTCAAATAAAATGTCATACCCACATACCATGTTAAAATAGAGGGCCCCATTAGATCTCATCAGAGTTCTTACCACAATCACCCTCTAATCAAGTTTTGTAGTGTGACACCATTTTCTTCTAGGAGATGCATTTCTTGCTTTAAACCAAGTATCTGTAAAATTGCAATCTACAGAAGTTCAAATAAGCATAGCTGCACAAAGTTATTAAGGTGTGAAATATTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557012 397 + 636262 CTTCTGCCTATCACAGTTAAGGAGGAGGGTATGCATTTGAGACAAAAC-ATTGGTGGAATTTCTCAAAATAAACTCCTGGATAACCACAGATTGGGTTTTAACAAAGATCATTATGACTGGCCCCATGGAAGGGCAGGATAACTGATGCTCATATAGGGAAACAGTAAAGCGGATTTTCAAATAACAC--CCTACCCACATACCATGTTAAAATAGAGGGCCCCATTAGATCTCATCAGAGTTCTTACAACAATCACCCTCTAATCAAGTTTTGTAGTGTGACACCATTTTCTTCTAGGAGATGCATTTCTTGCTTTAAACCAAGTATCTGTAAAATTGCAAGCTACAGAAGTTCAAATAAGCATAGTTGCACGAAGTGATTAAGGTGTCAGATATTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 32147 397 - 647215 CTTTTGCCTTTTACAGTTAATGAAGAGGGC---CATTTGAGACCAAACCACTGGTGCAATTTCTCAAAATAAAATCCTGGATGACCAAAGATTGGGTTCTAACAGAGATCATCATGACTGGCCCCATGGAAGGGCAGGATGACTGATGCTCAGATCGGGAAACAATTAAGCCGATTCTCAAATAAAATGTCATACCCACATACCATCTCAAAATGGAGGGACCCACTAGATCTCACCAGAGTTCTTACCACAATCACCCTCTGATCAAGTTTTGTTGCGTGACACCAGTTTCTTCTGGGAGATGCAGTTCTTGCTTTAGACCAAGTATCTCTGAAATTGCAATCTACAGAAGTTCAAGTAAGCATAGCCGCACAAAGTTATTAAGGTGTGAAATATTATA - -a -s mr.mrrefChr3 107368 140 + 181019 CCAGATACTAATTATGCCGCCATGCAGATGTCTACATTTGTTAAGCCTTGATCCGCAAAAACCAGCAGCCTCATGACGCTGGGTTACATCAAAGCCAGAATGAAATCCTACCCAACCAATGTATTGGAATGAGAAAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557409 140 + 636262 CTAGATACTAATTATGCCGCCATGCAGATGTCTACATTTGTTAAGCCTTGATCCGCAAAAACCAGCAGCCTCACGACACTGGGTTACATCAAAGCCAGAATGAAATCCTACCCAACCAATGTATTGGAATGAAAAAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 32611 140 - 647215 CCAGATACTACTTATGCCGCCATGTAGATGTCCATATTTGTTAAGCCTTAATCCGCAAAAACCAGCAGCCTCATGACGCTGGGTTACATCAAAGCCAGGATGAAATACTACCCAACCAATGTCTTGGGATGAGGAAGAAA - -a -s mr.mrrefChr3 107508 55 + 181019 TACTTTTATGAGCTACTATGTGAGCATAAGGGTGCCCCTTGTGTAGTTTTCTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557550 52 + 636262 TACCTTTATGAGCTACTATGTGAGCATAAGGGTGCCCCTTGTGTAGTTTTCT--- -s simRat_chr6.simRat.chr6 32751 53 - 647215 --CTTTTATAAGCTATTATTTGAGCATAAGGGTGCCCCTTGTGTAGTTTTCTCAT - -a -s mr.mrrefChr3 107563 16 + 181019 CCAAAGAAGTGTAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 32808 16 - 647215 CCAAAGAAGTGTAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 107579 103 + 181019 GGTCCGAAGATCTCTTAATGGTCATCTCTGAAGATCATGGTCCTCCCCAGATCAGAAGGCGAGACCAGTTCCTTAACTATTGCAGGCTATCAATGAGTCTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557602 101 + 636262 GGTCCGAAGAACTCTTAATGGTCATCTCTGAAGATCATGGTCCTCCTC--ATCAGAAGGCGATACCAGTTCCTTAACTATTGTAGGCTATCAATGAGTCTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 32832 102 - 647215 GGTCCAAAGATTTCTTAATGGTCATCTCTGAAGATCACGGAGCTCCCCAGGTCAGAAGGCGAGACCGGTTCCTTCACTATTGCAGGGTATCAATGAATCTTA- - -a -s mr.mrrefChr3 107682 163 + 181019 GTAACTGAAGACAGCCAATGCAATAGTACTAAGATAGTCCTGTGGATGGGTTTACTTGTGCTTGTGCCTAAGGATAATAATTGAGAGGGGGATTAATGAGGATCAGAGCCTACAAGTTACAGGGTGCTGACAGTGAGCCTAGGTTTGATTTCTATTAGTACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557704 163 + 636262 GTAACTGAAGACGGCCAATATAATAATACTAAGATAGTCCTTTGGATGGGTTTACTTGTGCTTATGCCTAAGGATAATGATTGAGAGGGGGATTAATAAGGATCAGAGCCTACAAGTTACAGGGTGCTGACAGTGAGCCTAGGTTTGATTTCTATTAGTACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 32934 162 - 647215 GTAACTGAAGACAACCAATGCAA-AGTACTAAGATAGGCCTGTGGATGGGTTTGCCCGTGCTTGAGCCTAAGGACAACAATTGAGAGGGGGATTAATGAGGATCTGAGCCTATAAGTTACAGGGTGCTGGCAATGAGCCTAGGTATGGTTTCTATTAGTACAC - -a -s mr.mrrefChr3 107845 28 + 181019 CGCTTGCCCCACATATTAATCTATGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557867 28 + 636262 CGCTTGCCCCACATATTAATCTATGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 33102 28 - 647215 CCCTTGCCCCACATGTTAATCTATGTAG - -a -s mr.mrrefChr3 107873 10 + 181019 GCCTCAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557896 10 + 636262 GCCTCAGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 33130 10 - 647215 GCTTCAGAGG - -a -s mr.mrrefChr3 107883 8 + 181019 ATGTGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557911 8 + 636262 ATGTGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33140 8 - 647215 ATGTGCAG - -a -s mr.mrrefChr3 107891 19 + 181019 ACAGTCTTAATATCTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557919 19 + 636262 ACAGTCTTAATATCTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33150 19 - 647215 ACAATCTTTATAGCTCAAC - -a -s mr.mrrefChr3 107910 79 + 181019 TGTCCTATCATTACCCCAGTGAATATCATGGAACCCTGAGGTATCTCTGATATGGATATCATGTGATAGACAGCATCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557938 79 + 636262 TGTCCTATCATTACCCCAGTGAATATCATGGAACCCTGAGGTATCTCTGATATGGATATCATGTGATAGACAGCATCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33170 79 - 647215 TATCCTATCATTACCCCAGTGAACATCATGGTACCCTGAAGTATCTCAGATATGAATATCATGTGAAACACAGCATCCC - -a -s mr.mrrefChr3 107989 45 + 181019 ACTCGTTTTATAGGGTAAAATGTGTTGGGCCCTTCTCCAGATGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558090 45 + 636262 ACTCGTTTTATAGGGTAAAATGTGTTGGGCCCTTCTCCAGATGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33249 45 - 647215 ACTTGTTTTATGGCGTGAAATGTGTTGGGTCCTCCTACGGGTGCC - -a -s mr.mrrefChr3 108034 17 + 181019 AATGATTGGTTGATAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558136 17 + 636262 AATGATTGGTTGATAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33294 17 - 647215 AGTGGTTGCTTGACAAC - -a -s mr.mrrefChr3 108051 68 + 181019 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTAGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439433 68 + 636262 ACATGAGGTGGATAGGTTCCTTCTTGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558153 68 + 636262 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTAGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33311 68 - 647215 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTACAGATGCTGGTGATTATTTGGCAGCACATGAGGCAGGTGGGCT - -a -s mr.mrrefChr3 108119 58 + 181019 CAGCAGCCAAGTAATGACTGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTAATGGGAGCTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439501 58 + 636262 CAGCAGCCAAGTAATGACCGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTGATGGGAGCTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558222 58 + 636262 CAGCAGCCAAGTAATGACTACATGCACATGGCCGTGTTTGCCCTTAATGGGAGCTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 33379 58 - 647215 CACCAGCCAAGTAATGACAGCACGCACATGGCCATGTTTTCCTTTAATGGGAGCTTTG - -a -s mr.mrrefChr3 108177 58 + 181019 CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439559 58 + 636262 CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558280 58 + 636262 CACATGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33438 58 - 647215 CACAAGGAGCACTTGAAATCTTGACAACATTAAGGAGGTCCAAAAAGAGTTTAAGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 108235 33 + 181019 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558338 33 + 636262 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33496 33 - 647215 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT - -a -s mr.mrrefChr3 108268 21 + 181019 ATAGGCCAAATGTTTGATCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558388 21 + 636262 ATAGGCCAAATGTTTGATCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33529 21 - 647215 ATAAGCCAAATGTTGGATATC - -a -s mr.mrrefChr3 108289 29 + 181019 ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558409 29 + 636262 ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 33553 29 - 647215 ATTTATCAGGCTACAGCGATACAGAGACA - -a -s mr.mrrefChr3 108318 35 + 181019 TGAGTTACAACCCTGGGGCAACACAATATGTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558450 35 + 636262 TGAGTTACAACCCTGGGGCAACACAATATGTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33582 35 - 647215 TGAGTTGCAACCTTGGGGCAGCACAATATCTGAAC - -a -s mr.mrrefChr3 108353 84 + 181019 TCTCTTCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGGGAGTGCAATGCAGGACCTTCCCTGGTACATGTTGGTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558492 84 + 636262 TCTCTTCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGGGAGTGCAATGCAGGACCTTCCCTGGTACATGTTAATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33617 84 - 647215 TGTCTCCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGTGAGTGCAGTGCAGGACCTTCCCTGGTAAATGTAGGTTAT - -a -s mr.mrrefChr3 108437 422 + 181019 ATATAAGATTATTCACATAGTGCACATCAAGGTAAGCAACATTTAATAATGCCTGGTAGCTTCTCCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAATAGATAGTTGAACTGTTCCAATTATAAACTTGTATTCACAATTGCTATCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATTTAATAGCAAGGGAATTTGTTCTTCCAAACAACTGTTCTATGTTGACCTACTCAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTCCCCTTACTGGTGTTATGAATGCTAGTATAGTCTTCAGCTCAAATGCTAGTATAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCGTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558576 370 + 636262 ATATAAGACTATTCACATAGTGCACATCAAGGCAAGCAACATTTAATAGTGCCTGGTAGCTTC-CCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAAGAGACATTAGAACTGTTCCAATTATAAACTTG--TTCACAATTGCTTTCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATCTAATAGCAAGGGAATATGTTGTTCCAAACAACTGTTCTA--CTGGCCTACTTAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTGCCTT-----------------------------------------------TAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCACAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33703 413 - 647215 ATATAAGGTTATACTCATAGTGCACATCAATGTAAGCAACATTTAATAATGCCTGGAAGCTTCTCCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTCGTAAAATTGGGAAATAGATAGTTGAACTTTTCCAATTATAAATTTGTATTCACAATTGCTATCTCATTTCTTTCACTTAAGCAGCTACTTTTCCTCTGTTTGATTAAATAGCAAGGGAATTTGTTCTTCCAAACAACTGTTCTATGTTGACCTACTCAACTGTGTAGCACAGTAATTGTTGGCTTG---------GGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTCGCCTTACTGGTGTTATGAATGCTAGTATAGTCTTCAGCTCAAATGCTAGTATAGTCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTCGGACAGGTTTTAATATTTATGATCCCGTAGT - -a -s mr.mrrefChr3 108859 57 + 181019 ATCCTGTCGTCGTGGACAATAGATTATAGGCCCAGACCAAAGCAACTGTCTACTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558953 57 + 636262 ATCCTGTCGTCGTGGACAATAGATTATAGGCCCAAACCAAAGCAACTATCTACTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 34116 57 - 647215 CGCCCGTAGTCGCGGACAATAGATTATAGGCCCAGACCAAAGCAACCGCCTATTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 108916 434 + 181019 ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCATATCTCCCAAGGCAGTGGACAGGGGCCACTAAACTCTCTTAGCTTCAGAGCCTCAAATGAGTAGGTCTTGTTGTGGTTGCAGGAGTCATACACTGTGGCCCTAATGACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCAGTGGCACTAATCTAGAGCTAAATTAGGCTTAAAAACCGCTCACTGGCTAGTGAATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACAGGAGACTATTACCTAGCACTCGTGCAATTAAGTGTGACCAAATCTCCTGAATTATAGAAATTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAAACGGTCGGACCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559010 418 + 636262 ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCACGTCTTCCAAGGCAGTGGATGGGGGCCAATAAACTCTCTTAGCTTCAGAGGTTCAAATGAGTAGGTCCTGTTGTGGTTGCAGGACTCATACACTGTGGCCCTAATAACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCCGTGGCACTGATCTAGGGCTAAATAAGGCTTAAAAACC---------------CATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACTGGAGACTATTACCTAGCACTC-TGCAATTAAGTGTGCCCAAATCTCCTGAATCATATAAACTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAATCGGTCGGACCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 34176 433 - 647215 ATGTACCCATCAGATACTCTAATCAATGACAGTTCAACCCATAAATCCCAAGGCAGTGGACAGGGGCCACTAAAATCTCTCAGCAC-AGAGCCTCAAATGAGTAGGTCTTGTTGTGGTTGCAGGCGCCATACACCACGGCTCTAATGAACATGCACCTTGGGGAGTGACTACTATGAATCTTTGACTCAGTGGTACTAATCTAGAGCTAAATTTGGCTTAAAAACCGCTCACTGGCTAGTGAATATCTGCTTTTCTCTCTTTGCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACAGGAGACTATTGCCTAGCACTCGTGCAATTAAGTGGGACCAAGTCTCCTGAATTATAGAAATTCACCTCCTTTCAGTAAACTGTACAGAATAAAAATAAAGGTAGGTTTACACAGAAGGAATCAGGGAATGAAACGGCCGGACCTA - -a -s mr.mrrefChr3 109350 171 + 181019 GCGATGTTCCGGCCCTTCGCAAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCGACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559429 171 + 636262 GCGATGTTCCGGCTCTTCGTAAACAGCTTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCACGACAAACATGTATCAGGCGGTCTTCGACCACTTCTGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 34609 171 - 647215 GCGATGGTCCGGCCCTTCGCCAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGTCTCTAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCTACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTAATCCCTCTAACCAGATGGCAGTCTTAATTCAATTACTACGCGTGTCTTGCGCG - -a -s mr.mrrefChr3 109521 365 + 181019 GAACACGTTGCGTTTATTCCTGAATCATCGATTCCCCTACTCAAAACATAGCTTCACACCGCTGTAAAGGGCGCAAACTTTGACGACAGTTCGGTAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTGCGGGAGTGCTCCGATACCATTAGCTGTGGACCGACTTTATGGGTCGACAATATTGTTTAACGACTTGGCTTCCCTGCATCTTATTCTGCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTACCAAAGGTGGATGCCAGGGGGACAACTAGGGCTTAATAAATGGAAGCCTGCCCATGATACTCTGTTTCTGTTGTCTGCAGTCATTGAGCAACATATCGCTCAGAGAGACATCTATCCATAGATCTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559600 355 + 636262 GAACACGTT--GTT---TCCTGATTCATCGATTTCCCTACTCAAAACATAGCTTCACACCGCTGTAAAGGGCGCAAACCTTGACGACAGTTCGGTAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTACGGGAGTGCTCCGATACCATTAAGTGTGGGCCGTCTTTATGGGTCGACAATATCGTCTAACGACTTGGCTTCCCTGCATCTTATTCTTCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTACAAAAGGTGTATGCCAGGGGGACTACTAGGGCTTAATAAATGGAAGCCTGCCCATGATAC-----TTCTGTTGTCGGCTGTCATTGAGCAACATATTGCTCAGAGAGACATCTATCCATAGATCTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 34783 365 - 647215 TAATACGTTGCGTTTATTACTGAATCAACGATTCCCCTACTCAAAACATCGCTTCACAACGCTGTAAAGGGCGCAAACTTTGACTACAGTTCGATAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTGCGGGAGAGCTCCGATACCATGAGCTGCGGACCGACTTTATGGGACGACAATATTGTTTAACTACTTGGCTTCCCTGCTTCTTAATCTGCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTGCCAAAGGTGGATGCCAGGGGGGCAACTAGGGCTGAATAAATGCAAGCCTGCCCATGATACTCTGTTTCTGTTGTCTGCAGTCATTGAGCACCATGTCGCTCAGAGAGACATCTATCCAGAGACCTATG - -a -s mr.mrrefChr3 109886 83 + 181019 CTTTGAGATTGAGCCTTATGTGTGATGCAGCCATGAAAATTGGGTTATTTCAACATTATGTGATACATATTCTATCTTCCGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559957 83 + 636262 CTTTGTGATTGAGCCTGATGTGTGATGCAACCATGAAAATTGGGTTGTTTTAACAGTATGTGATACCTATTCTATCTTCCGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 35148 83 - 647215 CTTTGAGATTGAGCCTTCTATGTAATACAGCCACAAAAAGTGGATTATTTCAACATTATGCGATACACATTCTATCTTCCAAG - -a -s mr.mrrefChr3 109969 11 + 181019 GTCCAAGCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560040 11 + 636262 GTCCAAGCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 35235 11 - 647215 TTCCAAGTTCC - -a -s mr.mrrefChr3 109980 13 + 181019 AGCATTCACTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560051 13 + 636262 AGCATTCACTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 35247 13 - 647215 AGCCTTCACTTTA - -a -s mr.mrrefChr3 109993 153 + 181019 TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGAATTATAATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCAACTGGGATCATGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560064 151 + 636262 TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAAT-GTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGGATTATGATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAACTACTGCAGCTGGGATGATGG- -s simRat_chr6.simRat.chr6 35273 153 - 647215 TGATTATTGTCAATATATGTAATGGGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTTTATGATTTGGTGAGCTTATCAAAAAAAATAATGTGAATACTATTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCGACTGGGATCACGGG - -a -s mr.mrrefChr3 110146 20 + 181019 TCTGTTTGTCACAGACTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560215 17 + 636262 ---GTTTGCTACAGACTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 35427 20 - 647215 TCTGTTTGTCACACACTTGA - -a -s mr.mrrefChr3 110166 353 + 181019 CATCTAATGCACTTTGCTCATGAACTCACTACAATCTGCAGCTAAGTCAGACTATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATGGCCCGGGTCTTACAATACAAGTTCTACACCACCATTAGAAGCTAGTTGTAGTCTTAAGTCTAAATGAGGGAAACTCTCAGGTGAGGCAATTTAAGTCTGAGGGACACCACTACAATTGTGTATGCAAGGTGTAGCaGTACAAAAAATTTGAGTGCAAGGAGAAGGAGTAACAatgtTAATATGCATTAAGTGGTGGCAGGTGTTGTCAGTACTCTGAAGTGTACTAGCAATAGGCCCGATTCCCTTGCATGTTTAATATATGGCTCCTCAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560282 322 + 636262 CATCTAATGCACTTTGCTCATGAACTCACTACAATCTGTAGCTAAGTCAGACTATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATGGTCCGGGCCCTACAATACAAGTTCTACACCACCATTAGGAGCTAGTTGTAGTATTATGTCAAAATGA----------CAGGTGAGGCAATTT-----TGAGGGACACCACTACAATTGTGTATGCAAGGTGTAGT-GTACAAAAAATTCGAGTTCAAGGAGAAGGAGCAACA----TAATAT-----------TGGCACGTGTTGTCAGTACTCTGAAGTGTACCAGCAATAAGCCCGATTCCCTTGCATGTTTAATAAATGGCTCCTCAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 35447 353 - 647215 CATCTAATGCTGTTTGCTCATGAACTCACCACAACCTGCAACTAAGTCAGACCATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATAGCCCGGGTCTTACAATACAAGTTGTACACCACCAATAGAAGCTAGTTGTAGGCTGAAGTCTAAATAAGGGAAACTCTCAGGCGAGGCAATTTAAGTCTGAGGGACACCACTACAATTCTGTATGCAAGGTGTAGCAGTACAAAAAATTTGAGTGCCAGGAGAAGGAGTAACAATGTTAATATGCATTAAGTGGTGGCAGGAGTTGTCAGTACTCTGACATGTACTATCAATAGGCCCTATTCCCTTGCATGTTTAATATATGGCTCCTCAGACA - -a -s mr.mrrefChr3 110519 78 + 181019 AACCAAGGGACGGACCTTATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGTTATGCCATTCTTATCAGCTTGAGTCTGGGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560604 78 + 636262 AGCCAAGAGACGGACCTCATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGCTATGCCATTCTCATCAGCTCGAGCTTGGGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 35801 76 - 647215 AAGCAGGGGATAGACCTTACT--TATTACATTTGCCTGCTGTTCATTGTGCCATCCTTATCAACTTGAGTCTGGGTAC - -a -s mr.mrrefChr3 110597 168 + 181019 ATCTCAATGCCACCACCAAGGGATCCAACCTAAATTATATCTGGGATGAGTTTCCAGTAAGAAACCTCTCCTTTAGTTGAGCTCTGTCTTTCCATGCTGACTATGGTGAGCATGCTCTAATTAACACACTCACCTTATTGCTAGGTACCCTGCATGTTGCATTGCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560682 168 + 636262 ATCTCAATGCCACCACAAAGAGATCCAACCTAAATTATATCTGGGACGAGTTTCCAGAAAGAAACCTCTCCATTGGTTGAGCTTTGTCTTTCCACACTGACTATGGTGAGCATGCTCTAATTAACACACTCACCTTATTGCTAGGTACCCTGCATGTTGCATTGCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 35878 168 - 647215 ATCTCAATCCCACCACCAAGGGATCCAACCTAAATTATGGCTGGGATGAGTATCCAGTAAGAAACCTCTTCTTTAGTTGAGCTCTGTCTTTCCATGCTGAGCATGGCGAGCATACCCTAATTAACGCACTCTCCTTATTGCTAGGTACCCTACAAGTTGCATTGGATG - -a -s mr.mrrefChr3 110765 10 + 181019 AAGGTTTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560851 10 + 636262 AAGGTTTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36046 10 - 647215 AAGTTTTAAT - -a -s mr.mrrefChr3 110775 45 + 181019 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATATTGATGAGATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560861 45 + 636262 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATAATGATGAGATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 36067 45 - 647215 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATATTGATGAGATTA - -a -s mr.mrrefChr3 110820 254 + 181019 TGTGCCCAAATATAGGGTATATTCCTTGAAGAACATAGCCTGTCTTATGAAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACACAGAAATGAAGGATAATTAAAGAATCTCTATAAGGACCAACATACAAACGATCGTTAATACATACTCATCTCTATTGTTCAACTTACCCAGCTCTAGTTTGGCACTTCTTAATGGACAATACGGTACCATCTCACCCCAAGCCCCCCACGTAGCTATCACCTGTAGCTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560906 240 + 636262 TGTGCCCAAATATAGGGTATATTCCTTGAAGAACATAGCCTGTCTTATGGAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACGCAGAAATGAAGGATAATTAAATAGTCTCGATA-----------ACAAACGATTGTTAATACATTC---TCTCTATTGTTCAACTTACTCAGCTCTAGTTTGGCACTTCTTAACGGACAATACGGTACCATCCCACCCCAAGCCCCCCACGTGGCTATCACCTGTAGCTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 36113 254 - 647215 TGTGCCCAAATATGGGGTATGTTCCTTCGAGAACATACGCTGTCTCATGAAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACACAGAAATGAAGGATAATTAAGGAATCTCTATAAGGACCAACATACAAATGATCGTTAATACATACTCATCTATATTGTTTAACTTGCCCACCTCTAGTTTGGCACTTCTTAATTGACAATTTGGTACCATCTCCCCCCAAGCCCCCCACATAGCTATCACCTGTGTCTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 111074 47 + 181019 TGTCTATCTACCTCCTAGTTCACATAACAGGATACCAAAGTGGACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561147 47 + 636262 TGAGTATCTACCTCCTTGTTCACATAACAGGATACCAAAGTGGACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36367 47 - 647215 TATCTATCTATCTCCTATTTCACATCACAGGATACCAAAGTGAAACT - -a -s mr.mrrefChr3 111121 19 + 181019 GGAGTGGACCTGGGATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561194 19 + 636262 GGAGTGGACCTGGAATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36417 19 - 647215 GGAGTGGACCTGGGTTCAT - -a -s mr.mrrefChr3 111140 67 + 181019 TCTCCAAATCCATAGCTGACCCTCATGCCAGAGGCTTTCCTCATGCTGGAGTGGCGGCCCCAGAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561213 60 + 636262 TCTCCAAATCTGTAGCTGACCCTGATGCCAGAGGCTTTCCCCATGCTGGAGTG-------CAGAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 36439 67 - 647215 TCTTCAAATCCATAGCTGACCCTCATGCCAGAGGCTTTCCTCATGCTGGAGTGGCGGCCCCAGAATA - -a -s mr.mrrefChr3 111207 83 + 181019 TTGTTAACATCATCAGTCATTCTTAGAAACAATTAGAAGAAGAACTTGCCTATAAGTTATATGGCACGCAGCAGTTTATTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561273 83 + 636262 TTGTTAACATCATCAGTCATTCTTAGAAACAATTAGAAGAAGAACTTGCCTCTAAGTTATATGGCACGCAGCAGTTTATTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36507 83 - 647215 TTGTTAATATCATCGCTTGTTTTTAGAAACACTTTGAAGAAGAACTTGCCTATAAGTTATATGGCACGCAGCAATTTATCCTT - -a -s mr.mrrefChr3 111290 27 + 181019 GGCCTATGGAAGAATGAGTACATACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561356 27 + 636262 GGCCTATGGAAGAATGAGTACATACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 36641 27 - 647215 GGCCTATGGAAGAATGAATACATACAC - -a -s mr.mrrefChr3 111317 13 + 181019 AATCTTTCATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561383 13 + 636262 AATTTTTCATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 36669 13 - 647215 AATCTTTCATATG - -a -s mr.mrrefChr3 111330 137 + 181019 TATAATTATGTGCAATTCTTGACTGATATTCTAAGTTTTATTGAATGAGTCAGAACTTGGTTAAACTGTGGTGATTGGTATGACTGTGGACTTATCGTCAACAGGGATGAATCTGAAGCCATGGACTATATCAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561397 135 + 636262 TATAATTATGTGCAATTCTTGACTGATATTCTAAGTTTTATTGAATGAGT-AGAACATGGTTAAACTGTGGTAATTGCTATTACTGTGGGCTTATC-TCAACAGGGATGAATCTGAAGCAATGGACTATATCAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36682 133 - 647215 TGTAATTATGTGCAATGCT----TGATATTCTAAGTTTTATTGAGTGAGTCAGAATTTGGTTAAACTGTAGTGATTGGTATGACGGTGTACTTATTGTCAACAGGGACAAATCTGAAACCATGGAGTATCTCAACAT - -a -s mr.mrrefChr3 111467 397 + 181019 GCACTTTGTGACCAGGTGTATCAATATGGGATTCTTGTGTATTAGTATTTGCAGACAAGCTTGTACTTTGGACCATAAATCCAAGATTCACCCTTGACTTGTGGTTGATGCACTTGCCACTTAATATTATTTGGCTGTCAGGTGTATTGTCCTGAAATGATGGCTTATAGCAGCTAGAAAAATGTGACATATCTGGTGACAGATACAATTTCCTTTAACAATTCAATATGATTTTTATACAGTTCAAAGAAAGTTTCTCACTGAACTGCCAATCATACCAACCAAAAAGAGTTGTATTAGCAAGCAATCTATTGTTTATGAGTGCCGAGGAATTATTATGAATTTAATTACACATTGAGGCCCTGGGAGTCTTGAGACCACACAAGAGGCATGTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561532 397 + 636262 GCACTTTGTGACCAGGTGTATCAATATGGGATTCTTGTGTATTAGTATTTGCAGACAAGCTTGTACTTTGGACCATAAATCCAAGATTCACCCTTACCTTGTGGTTGATGCACTTGCCACTTCATATTATTTGGCTGTCAGGTATATTGTCCTGAAATGATGGCTTATAGCGGCTAGAAAAATGTGAAATAGCTGGTGACAGATACAATTTCCTTTAACAACTCAATATGATTTTTATACAGTTTGAAGAACGTTTCTCACTGAACTGCCAATCATAACAACCAAAGAGAGTTGTATTAGCAAGCAATCTATTGCTTATGTGTGCTGAGGAATTATTATGAGTTTAATTACACATTGAGGCCCTGGGAGTCTTGAGACCACACAAGAGGCATGTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36816 386 - 647215 GCACTTTGTGACCAGTTGTAGCAATTTGGAATTC-TGTGTATTTGTAT------ACAAGCCTGTACTTTAGACTATAGATGCTAGATTCAC--TTGACCTGTGGTTGATACACTTACCACTGAATATTATTTGGCCGTCAGGTGTATTGTCCTGGGATGATGGCTTATAGCAGCTAGTAAAATGTGGCATATCTTGTGACAGATACAATTTGTTTTAACAATTCAATATGATTTTTATACAGTTCAAAGAGAGCTACTCACTGA--TACCAATCATACCAACCAAAAAGAGTTGTATTTGCCAGCAATCTATTGTTAATCAGTGCCGAAGAATTATTATGAATTTAATTATGCATTGAGTCCCTGGGAGCCTTGGGACAATGCAAGAGGCATGTGGT - -a -s mr.mrrefChr3 111864 10 + 181019 GTACATATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561931 10 + 636262 GTACATATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 37202 10 - 647215 ATACATAAAA - -a -s mr.mrrefChr3 111874 120 + 181019 CTTAAAACTGCAGCCCTCCGATTTATTTTGACTCTAGAAACATTGCAGCTGGTGCCCCTTGAATTGGCCATTGATTTGGAGGGCAAGAGTGCTGTTACACCTTCATCAGCTGAGTTGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561941 120 + 636262 CTTAAAACTGCAGCCCTCCGATTTATTTTGACTCTAGAAACATTGCAGCTGGTGCCCCTTGAATTGGCCATTGATTTGGAGGGCAAGAGTGCTGTTACACCTTCATCAGCTGAGTTGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 37213 120 - 647215 CTTGTAATTGCAGGCCTCTGATTTATTTTGTGTCCAGAAATATTGCAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGGCCATCAATTTGGAGGACTTGAGTGCTGTCATACCTTCACCAACTGAAATGGGG - -a -s mr.mrrefChr3 111994 8 + 181019 GAGGTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562065 8 + 636262 GAGGTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 37333 8 - 647215 GGAGTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 112002 33 + 181019 TCAACCTGCTCAGGACACGCAGAATCGGTCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562073 33 + 636262 TCAACCTGCTCAGGACACGCAGAATCGGTCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 37347 33 - 647215 TCAACCTAGTCAGGACACACAGAACCAGTCCGA - -a -s mr.mrrefChr3 112035 18 + 181019 GACCCCACAAGAGACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562128 18 + 636262 GACCCCACAAGAGACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 37380 18 - 647215 GACCCCACAAGTGGCACA - -a -s mr.mrrefChr3 112053 52 + 181019 TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCGGCTGGTGCCCTCTAAGTTGGCCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562146 52 + 636262 TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCGGCTGGTGCCCTCTAAGTTGGCCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 37399 52 - 647215 TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCAGCTGGTGCCCTCTGAATTGGCAATT - -a -s mr.mrrefChr3 112105 17 + 181019 AGAGGACATGAGGTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562198 17 + 636262 AGAGGACATGAGGTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 37453 17 - 647215 GGAGGACATGAGGTTGC - -a -s mr.mrrefChr3 112122 23 + 181019 GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562215 23 + 636262 GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 37473 23 - 647215 GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG - -a -s mr.mrrefChr3 112145 59 + 181019 GACACATGGGACTCCTAGCCCCCTTGTCAATGGAACTGGAGCAGTTAGATAGATTCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562238 59 + 636262 GACACATGGGACTCCTAGCCCCCTTGTCAATGGAACTGGAGCAGTTAGATAGATTCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 37521 59 - 647215 AACACATGGAACCCCTGGCCCCCTTTTGAATGGAACCGGAACAGTTTTATGAATTTGCC - -a -s mr.mrrefChr3 112204 24 + 181019 AACAGGGAGCCCACATTCCATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562298 24 + 636262 AACAGGGAGCCCACATTCCATGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 37580 24 - 647215 AACAAGGAAGCCGCTTTGAATGTG - -a -s mr.mrrefChr3 112228 132 + 181019 CTAGCATCACAGGATCTAAGGAACCATGGAATTATAAATCAGTATGGAATGGGCAGCTTAGCATTAGCAAGTCATATGCTTGTGGCATCATATCCCCAAAACAGTACATAACAGTCTGACCCATGCAACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562322 132 + 636262 CTAGCATCACAGGATCTAAGGAACCATGGAATTATAAATCAGTATGGAATGGACAGCTTAGCATTAGCAAGTCATATGCTTGTGGCATCATATCCCCAAAACAGTACATAACAGTCTGACCCATGCAACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 37618 132 - 647215 CCAGCCTCACAGGGTCGAAGGAACCATGAAATTGTAAATCACTATGGAATGGGCACCTTAGCATTAACAAATCATATGCTTGTGTCATCATATCCCCAAAACAGTACACAACAGTCTGACCCATGCAACAAG - -a -s mr.mrrefChr3 112360 108 + 181019 CATGTTTCTGCATACAATGTGCAAAATCAAGTAGCAGTGGAAATTTAACACTAGACTTGACTTCCATCAAAGAATCGGGTTGTTTTTCCTTGTTATTATTATGCAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562454 108 + 636262 CATGTTTCTGCATACAATGTGCAAAATCAAGTAGCAGTGGAAATCTAACACTAGACTTGACTTCCATCAAAGAATTGGGTTGTTTTCCCTTGTTATTATTATGCAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 37754 108 - 647215 CATATTTGTGCATACAATGTGCAAAATCAAGTAGCACTGGAAATTTAACACTAGATTTGACTTCCATCAAAGAAACGGGTTCATTTTCCTTGTTAATATTATGCAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 112468 156 + 181019 GGGGACTCAGTTCAACAATTGGTAAAAGCCTGTTCTGAACGACTCCCTCTAATGTGCCAACAGCCTTGAGACTTAGGTGTCTCTGTCTAAAGGGCATTCTGTTCTGCTAGAAGAGGCAACCCAAAATTATACTTAAGACTTATAATCTCCAGGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562562 156 + 636262 GGGGACTCAGCTCAACAATTGGTAAAAGCCTGTTCTGAATGACTCCCTTTAATATGCCAACAGCCTTGAGACTTAGGTGTCTCTGTCTAATGGGCATTCTGTGCTGCTAGAAGAGGCAACCCAAAATTATACCTAAGACGTATAATCGCCAGGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 37863 156 - 647215 GGGGGCTCAGTTTAATGATTGGTGAAAGCCTGTTCTGAACGACTCCCTCTGATGTGCCAACCGCCTTGAGACTTAGGTGTCTCTCTCTAAAGGGCATCCTGTTCTGGTAGATGAAGCAACCCAAAATTATCCTTAAGACTGACAATCTCCAGGGTG - -a -s mr.mrrefChr3 112624 32 + 181019 ACCTACACCTACTATCATGAAACTACATAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562777 32 + 636262 ACCTACACCTACTATAATGAAACTACATAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 38019 32 - 647215 TCCTACGCCTACCATCATGAAACTACATAATT - -a -s mr.mrrefChr3 112656 212 + 181019 TCTCCAAGGAAAACATCAAATCATTCATCATTCTCTTCTCAACGTCCCATAGGGTTGTACTGCTGACAATCTACTTTACCTCATACCCAAAATCTATCTACCAATGCTCAGAACCTGACAGTCACACTTAAACTGGCTCTAATTTCATGCTGAAATTCaTGAAACTGGGAGTATATAACCAGACTAAAAACGTAAacagtgaagcctACGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562809 194 + 636262 TCTTCAAGGAAAACATCAAATCATTCATCATTCTCTTCTCAACATCCCATAGGATTGTACTGCTGACAATCTACTTTCCCTGATACCCAAGATCTATCTACCAATGCTCAGAACCTGACAGTCCCCCTTGAACTGGCTCTAATTGCATGCTGAAATTC-TGAAACTGGGAGTATGTAACCAGACTAAAGACTTAA----------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 38069 212 - 647215 GCTCCAAGGAAGACATCAAAACATTCATCATTCTCTTCTCAATGTCCCACAGGGTAGTACTACTGATAATCTATTTTACCTCATACCCAAAAACTATCCACCAATGCTGAGAACCTGTCAGTCACACTCAAACTGGCTCTAATTTCATGCTGAAATTCATGAATCTGGGAGTGTATAACCAGACTAAAAACGTAAACAGTGAAGCCTACGGT - -a -s mr.mrrefChr3 112868 72 + 181019 GCATCAGATATCAAAACTCTGATTTTGGTCCCCAGGACAATCATCTTCACTAAATTAGCTTACTGGTCGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563003 68 + 636262 ----CAGATAACAAAACTCTGACTTTGGTCCCCAGGACAATTATCTTCAATAAATTAGCTTACTGGTCGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 38282 72 - 647215 GCATTTGATATCAAAGCTCTGATTATGGTCCCCAGGCCAATCATCTTCACTAAATTAGCTTAGTGGTAGTAA - -a -s mr.mrrefChr3 112940 70 + 181019 TCATCTGACTATCAGATCTGACCTCTCTAGTGTAAAGTAAGAGATTGAGTAACACTCGACTTACAGACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563072 70 + 636262 CCATCTGGCTATCAGATCTAACCCCCCTAGTGTAAAGTAAGAGATTGAGTAACACTCGACTAACAGACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 38354 70 - 647215 TCATCTGACTATCAGATCTGACCTCTCTAGTGTTCACTGAGAGATAGAGTAACACTAACCCTAATCTTCT - -a -s mr.mrrefChr3 113010 59 + 181019 TAGTCTACAAGGAGTAATGTTCTCAGGGAACTCTTATTATGGGGGGATAAATTGCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563143 42 + 636262 TGGTCTACAAGGAGTGATGTTCTCAGGGAGCTCTTATT-----------------GATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 38424 58 - 647215 TAGTCTA-AAGGAGCAGTTTTCTCAGGGAACTCTTATTATGGGGGGATAAATTGCAATG - -a -s mr.mrrefChr3 113069 155 + 181019 TGACACATAGCATCTAAGATGTGCAATAGGAGTATAAGAAATTTTCTGGCTCAAGATCATCTTAATCTAACTCCAAGATTAAACGTAACAGGGGGCAGAAATTATGTACCAGTTCATTCTAGGGGGACAGTTGTTTTTGGGTGGCTCACAAGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563186 155 + 636262 TGACACATAGCATCTAAGATGTGCAATAGGAGTATAAGAAATTTTCTGGCTCATGATCATCTTAATCTAACTCAAAGATTAAACGTAACAGGGGGCAGAAATTATGTGCAGGACCATTCTAGGGGGACAGTTGTTTTTGGGTGGCTCACAAGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 38482 155 - 647215 TGACACGTAGCATCCAAGATGTGCAATAGGAGTATAAGAAATTTTCTGGTTTAAGATCATCTTAATCTAACTTCAAGCCTAAACGTAACAGGGGGCAGAAATTATGTACCAGTTCATTCTAGGGGGACAGTTGTTTTTGTGTGGCTCATAAGGAA - -a -s mr.mrrefChr3 113224 10 + 181019 GTGTACCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563341 10 + 636262 GTGTATGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 38640 10 - 647215 GTGTACCACA - -a -s mr.mrrefChr3 113234 217 + 181019 TCTTGAATTCCTTAGCCACGCCAGGTTGTTCTTAGTAAGATCCCCCTCAGTGGTAATAATTTCAGGGGCTTCCACAAGTTCTCTCAAGTTGTGGCACTGTTTTTAATACTTTACATCAGATGGGTCTGTGGGGAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGTTGATCACAACTCTAGCCAGACCCTTGCAATAGCGTGCAGCTCTGTAAGACAGTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563352 217 + 636262 TCTTGAATTCCTTAGCCCCGCCAGGTTGATCTTAGTAAGATCCCCCTCAATGGTAATAATTTCAGGGGCTCCTACAAGTTCTCTCAAGTTGCGGCACTGTTTTTCATATTTTATGTCAGATGGGTCTGTGGGAAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGTTGATCACAACTCTAGCCAGACCCTTGCAATAGCGTGCAGCTCTGTAAGACAGTTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 38650 211 - 647215 TCTTGAATTCCCTAACCACACCAGGTTGTTCTTCGTAGGATCCC---CTG---CAATAATTTCAGGGTCTTCCACAAGTTTTCTCAAGCTATGGCAATGTTTTTAATACTTTACATCAGATGGGTCTGTGGGGAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGCTGGTGGCAACTCTAGCCAGACCATTGAATTAGCGTCCAGCTCTGTAATACTGTTCCA - -a -s mr.mrrefChr3 113451 109 + 181019 TTCATGCTGCAGATAAAATGGGACCATGGATCAAACTGGGAGAACCTGTAAGATAGTACAGATGTTTATGGAAGGGTCTTATAGTTACTACTACCTCTGCTAGTTCCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563570 109 + 636262 TTCATGCTGCAAATAAAATGGGAGCATGGATCAAACTGGGAGAACCTGTAAGATAGTACAGATGTGTGTGGAAGGGTCTTATAGTAACTACTACCTCTGCTAGTTCCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 38861 109 - 647215 TTCATGCTGCAGATAAAATGGGACGATGGATCCAACTGGGAAAACCTGTAACACAGTACGAATGTTTATGGAAAGGTATAATAATTAACACTACCTCTGTTAGTTCCAG - -a -s mr.mrrefChr3 113560 472 + 181019 ATAATACCTCATGTGAAGGGAGCCTATGTCCTCTATGCCTGCAAAAGAAATCTAAGAGTGGATTTTTTCAGGATGAGATTGGACTACTGCTTGAAGAACCTCTAAGTCTCACAGATGTTAACAGTTGGATATTTCCTATGGCAGGCATAGTGCCAAGAATGTTTGGTATCCACTACTTCCAAACTCTGTTTAACTCTGAAGTTGAATTATGACAAGGATGGTGCTTTGTCATGATCTACTTGCGCATAGTTTATATAGACTTATGGCGGGCTAAAGGGGCCAACTTATTATCAAGCTGTTTTTTGTGACCATTCTCCTTTTACACTTCCAATCCGCCCAGAACCCTTTAAAAAGTTTTGTCTGAGCTATGAAGGAGTGGTAATGTCATCTTACATCACAGTCCTTACATGCTAGCCCAGGAACTTCAGGGAAACCACCCCAGAGGAGTATGTGGTTTGGCAAAGGTTCAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563679 472 + 636262 ATAATACCTCATGTGAAGGGAGCCTATGTCCTCTATGCCTGCAAAAGAAATCTAAGGGTGGATTTTTCCAGGATGTGATTAGACTACTGCTTGAAGAACCTCTCAGTCTCACAGATGTTAACAGTTGGACATTTCCTATGGCAGGTATAGTGCCAAGAATGTTTGGTATCCACTACTTCCAAACTCTGTTTAACTCTGAAGTTGAATTATGACAAGGATGGTGCTTCGTCATGATCTACTTGCACATAGTGTGTATAGACTTATGGCGGTCTAAAGGGGCCAACTTATTATCAAGCTGTTTTTTGTGACCATTCTCCAGTCACACTGCCAATCCGCCCAGAACCCTTCAAACAGTTTTGTCTGAGCTATGAAGGAGTGGTAATGTCATCTTACGTCACAGTCGTTACATGCTAGTCCAGGAACTTCAGGGAAACCACCCCAGAGGAGTATGTGGTCTAGCATAGCTTCAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 38971 464 - 647215 ATAATACCTCATGTCAAGGGAGCTTATGTCCTCTAGGCCTTCAAAAGAAATCTAAGAGTAGATATTCTTAGGATGAGATTGGAGTACTGCTTGAAGAACCTCTAAGTCTCACAGATGTTAACAGTTCAATATTTCCTATGGCAGGCATAGTGCCAAGGATTAT-----TCAACTACTTCTAAACTCTGTTTAACTTTGAAGTTGAATTATGACAATGGTGGTGCTTTGGGATGATCTACTTGAGCATAGTTTATATAGACTTATGGCAGGCTATA---GCTGACTTATTATCAAGCTGTTTTATGTAACCATTCTCCTTCTACACTTCCAATCAGCCCAGAACCCTTTAGAAAGTCTTGTCTGAACTATAAAGGAGGGGTAATGTCATCTTACATCACAGTCCATACATACTAGCCCAGGAACTGCCTAGAAACCACCCCAGAGGAGTTAGTGGATTGGCAAAGGTGCTACC - -a -s mr.mrrefChr3 114032 690 + 181019 AAGTGACATGAAATCACAGTAGCTGCTGGTAGGGCGCAACTTGAAGCAAATTGCAAATAAAGGAAATACATGATAAACTCATTCAACATGGAGGATAAAGTTGTAGACAATAAGCTGTACTAACTCTTATTATATTAACAAAGATTTCTCATATTATTTATATTAATAATGGCCAGATTCATGTCATGTAATCCCTCCTTTGGTGGCATTGGAAAAGGACATCTAATGCGAGAAGTAGATGCACTGGATGGGTTGTGTTCTCATATCTGTGACCAGTCTGGTGCCCTTTATAAAGTATTGAACCGTCGTAAGGGACCTGATGTGGTGGGGGGGTTGCGGGCACAGATTGATAGAAAACTTTATAAGCAGAACATGCAAGTAACAAATATAAAGCGTTATTGTAGCAGACCCGAGCATTGAATTCCTAGATGTAAGTGTAGACTCCACATTGAGAAAGAGATATTAAACACACCATTGTTGACAGTCCAAGAAGGAGCAGTTGAAGAGCTTACTCTCCCTGAACCAGAGCCTGAACACACTGGTGAATGTCATGTCAGTGGTGTTGTCTTAGGTTTGTATTTAAAACCTGTGATATATGATACTCCAAGATGGTTGTGTGCACAGATTATCTCTCCAAGTTGGTTCAGTACAGGCTCACAGGGAAAGTGATTTCTACGTGAAACCCCCCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564152 683 + 636262 AAGTGACATGAAGTCACAGTAGCTGCTGGCAGGGCACGACTTGAAGCAAATTGCAAATAAAGGAAATACATGATAAGCTCATTCAACATGGAGGATAAAGTTGTAGACAATAAGCTGTACTAACTCTTATTATATTAAC----ATTTCTCATATCAATTATATTAATGATGGCCAGATTCATGTCATGTAATCCCTCTTTTGGTGGTATTGGAAAGGGACATCTAATGAGAGAAGTGGATGCACTGGATGGGTTGTGTTCTCATATCTGTGACCAGTCTGGTGCCCTTTATAAAGTATTGAACCGTCGTAAGGGACCTGATGTGGTGGGGGGGTTGCGGGCACAGATTGATAGAAAACTTTACAAGCAGAACATGCAAGTAACAAATATAAAGCATTATTGTAGCAGCCCCGAGTATTGAATTTCTGGATGTAAGTGTAGTCTCCCCATGGAGAAAGAGATATTAAACACACCATTGTTGACAGTCCAAGAAGGTGCAGTTGAAGAGCTTACTCTCCCTGAACCAGAGCCTGAACACACTGGTGAATGTCATGTCAGTGGTGTTGTCTTAGGTCTGTACTTAAAACTTGTGATATATGATACTCCAAGATG---GTGTGCACAGATTATCTCTCCAAGTTGGTCCAGTACAGGCTTACAGGGAAAGTGATTTCTAGGTGAAACCCCCCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 39435 690 - 647215 AAGTGACATGAAATCACAGTAGCTGCTGGTAGGGTGCAACTTGTAGCAAGTTGCAAATAAAGCAAATATACAATTAACTCATTCAACCTGGAGGATAATGTTATAGACAAAAAACTGGACTAACTCTTATTACATTAACAAAGATTTCTCATATTATTTGTTTTAATAATGACCAGATTCATGTCATGTAATCCCTCCTTTGGGGGCATTGGAAAAGGACATCTAATGCGAGAAGTAGATGCACTGGATGGGTTGTGTTCTCATATCTGTGACCAGTCTGGTGCTCTTTATAAAGTCCTGAACCATCGTAGGGGGCCTGACGTGGTGGGGGGGCTGCGGGCACAGATCGATAGAAAGCTTTATAAGCAGAACATGCAAGTTACAAATATAAAGCGTTATTGTAGCAGATCCCAGCATTGCATTCCTAACTGTAAGTGTAGACTCCAGATTGAGAAAGAGATATTAAATACGCCATTGTTGACAGTTCAAGAAGGAGCAGTTGAAGAGCTTACTCTCCCTGAACCAGAGCCTGAACACACTGGTGAATGTCATGTCAGTGGTGTTGTCTTAGGTTTGTATTTAAAACCTGTGATACATGATACTCCAAGATGGTTGTGTTCACAGATTATCTCTCCAAGTTGGTTTGCTACAGGCTCACCAGGAAAGTGATTTGTACGTGAAACCCCCCGG - -a -s mr.mrrefChr3 114722 34 + 181019 CTGGTGACTACAAAACACCATGATCTTTTGCGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564835 33 + 636262 CTGGTGGCTACAAAATACCATGA-CTTTTGCGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 40128 34 - 647215 TTGGTGACTACACAACACCATGATCTTTTGAGAT - -a -s mr.mrrefChr3 114756 10 + 181019 AACTTTTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564869 10 + 636262 AACTTTTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 40162 10 - 647215 AACTTTTGTT - -a -s mr.mrrefChr3 114766 25 + 181019 TTGTATTGCCCTCTTGCTCCATCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564882 25 + 636262 TTGTATTGCCCTCTTGCTCCGATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 40172 25 - 647215 TTGTGTTGCCCTCTTGCTCCATCAC - -a -s mr.mrrefChr3 114791 51 + 181019 CATCTCATACGGTTCTCAGCTCTGGCGGACATCATAGATGGTAAATTGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564907 51 + 636262 CATCTCCTACGGTTCTCAGCTCTGGCGGACATCATAGATGGTAAATTGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 40202 51 - 647215 CATCTCATCCGGTTCTCATCTCTGGTTGACACCATAAATGATAAATTGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 114842 133 + 181019 TATATATCTACAATACAGCTTATAAGATAAAGCAAGATGCTTTCCACGCACTCAAAAGATAAGTCTGTTAATGAACCCATAACCTGTTTTTATGATGCTCTCATCTACTCAAAGTAATCCCCGCATGCTCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564958 133 + 636262 TATATATCTACAATACAGCTTACAAGACAAAGCAAGATGCTTTCCACGCACACAAGAGATAAGTCTGTTAATGAACCCATAACCTGTTTTTATGATGCTCTCATCTACTCATAGTAATCCCCACATGCTACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 40254 133 - 647215 TATATATCTACAATACAGCTTATAAGATAAAGCAAGATGCTTCCTACACACTCAAAAGATGGGTCTGTTAATGAACCCATAACCTGTTTTTATGATGCTATCATCTACTCAAAGTTAACCCGGCATGCTCCTC - -a -s mr.mrrefChr3 114975 45 + 181019 CTTAGCCTGCAAACAACCCAGGACAGTGATCCAACAGACATTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565091 45 + 636262 CTTAGCCTGCAAACAACCCAGGACAGTGATCCTACAGACATTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 40394 45 - 647215 CTTAGCCTCCAAACAACCCAGGACAGTGATCCAACCCATATTTAA - -a -s mr.mrrefChr3 115020 82 + 181019 GAAGAAGCGTCTAGTGTTATAAACCTAGCAATCTAGGGATCCAACATACTCACAGGCAGATGGGACACTCATGTGAAGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565136 82 + 636262 GAAGAAGCGTCTAGTGTTATAAACCTAGCAATATAGGGATCCAACATACTCATAGGCAGATGGGACACTCATGTGAAGATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 40440 82 - 647215 GAAGAAGTGTCTGGTACTATAAACCTACCAATCTACAGATCCAACATACTCACAGGTAGATTGGACACTCCTGAGAAGATTG - -a -s mr.mrrefChr3 115102 247 + 181019 CTCAGTTTGCTGTACAATACAAGGAATTTGTATGGGGTGACCTGAAGAGAAATCTGGCCAAGTGCTATACTATAGAACTGAATATGATATATTAGGGTATAATGGAGTCACTCCTATTAAAATACCCATGAAATGTTTAGCAGTCTAAAGGAAACGGTAAGGTACCATATAGTAGAATCTTTTGTTGAATAAGTGAAGCACAAATATTACCTCTCCTGATAAAAATCAATCATACTAAACATTAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565218 247 + 636262 CTTGGTTTGCTATACAATACAAGGGATTTGTATGGGGTGACATGAAGAGAAATCTGGCCAAGCACTATACTATAGAACTGAATATGATATATTAGGGTATAATGGAGGCACTCCCATTAAAATACCCATGAAATGTTTAGCAGTCTAAAGGAGCCTGTAAGGTACCATATAGTAGAATCTTTTGTTGAATAAGTGAAGCACAGATACTACCTCTCCTGATAAAAATCAAGCATACTAAACATTAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 40535 239 - 647215 CCCAGTTTGCTGT--------AGGAATCTGTATGGGGTGACCTGAAGAGAATTCTGGCCAAGTGCTATACTATAGAACTGAATATGATATAGTAGGGCAGAATGGAGTCACCCCTGTTAAAATACCCATGAAATGCTTAGCACTCTAAAGGAAACGGTAAGGTACCATATAGTATAATCTATCGTTGAATAAATGGGGCACAAATATTACCTCTCCTGATAAGAATCAATCATACTAAACATTAGCG - -a -s mr.mrrefChr3 115349 15 + 181019 GATGAAGGTTGTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565465 15 + 636262 GATGAAGGTTGTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 40782 15 - 647215 GATGAAGGTTGTGGG - -a -s mr.mrrefChr3 115364 60 + 181019 ACTGGGTATTATCTGAGAAATCTGAGTTAATTAGCCACCCAAAACAAAACCACTTATAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565480 60 + 636262 ACTGGGTATTATCTGAGAAATCTGAGTTAATCAGCCACCCAAAACAAAACCACTTATAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 40798 60 - 647215 AACAGGTAATAGCGAAGAGATCTGAGCTAATTAGCCAACCAAAACAAAACCACTTGTAAT - -a -s mr.mrrefChr3 115424 516 + 181019 GGTTGCTCTAAAGGTTCAACCAACTGAAGATCTTGGGATTAGACCTTAATGCCTGATCCTAGATCATAATCACCTTGGTGTCTCAGTTCAATGCCTGTCAGGTGGGGTGTCAAGGGGTATCCACATACAGTATGTAAGGTAAAGGGACTCTTGGTGGGAGAGGCTTTTCTTTGTCATACTTATGGTTCATTCAGCTGAAAAATTACTTTTCATGTCCTACATTCATCAGATGTCATCCATTAGCTAATGTGGCCATGATGGCCAAGCTCAAACTCTGTtgTTTtacaaatttaaccagatgaaataagcccctgttgtgaatggttaggaaaaaatgctcaaaaagtctcttggggaatcatccatagcacataaccactgaatctgctcttgttcaaatctgttgcaggaagtaagagaagtacaaacaaccaacctctttgtggcaagatatgtaactcagttaaagtagagcctttacattgtttaaccatatctattgttctccccacatca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565571 499 + 636262 GGTTGCTCTAGAGGTTCAACCAACTGAAGATCTTGGGATTAGACCTTAATGCCTGATCCTGGATCATAATCACCTTGGTATCTCAATTCAATGCCTGTCAGGTGGGGTGTCGAGGGGTATCCACATAGAGTATGTAAGGTAAAAGGACTTTTGGTGGGAGAGGGTTTTCTTTGTCATACTTATGGTTCATTCAGCTTGAAAGTTACTTTTCATGTCCTACATTCATCAGATGTCCTCCACTAGCTAATGTGACCATGATGGCCAA--CCAAACTCTGT--TTTTACAAATTTAGCCAGATGAAATAAGATCctattgtgaatggttaggaaaaaatgctcaaagagtctcttggggaatcatccatagcacataaccactgaatctgctcttgttcaaatctgttgcaggaagta-------------caacccacctctttctggcaagatatggaactcagataaagtagagcctttacattgtttaaccatatctattgttctccccacatca -s simRat_chr6.simRat.chr6 40858 509 - 647215 GGTTGCTCTAAACGTTCAACCAACTGAAGATCTTGGGATTAGACCTCAATGCCTGATCCTAGACCATAATCACCTTGGTGTTTCAGTTCAATGCCTGTCAGGTGGGGTGTCAAGGGGTCTCCGCATACAGGATATAAGGTAACGAGACTCCTGGTGTGAGAGGCTTTTCATTGTCATACTTATGATTCATTTAGCTGAAAAATTACTTTTCATGTCCTACATTTATCAAATGGCATCCATTAACTGATGTGGCCATGATGGCCAAGCTCAAACTCTGTTGTGTgacaaattcaacaagatgacataagcccctgttggaagtcattaggaaataatgctaaaaaagtctcttggggaatcatccatagcatataaccacggaatctgcttttgttcaaatctg-------aagtaagagaagtacaaacaaacaacctctttgtggcaagatatgtaactcagttaaagtagagcctttacattgtttaaccatatatattgtcctcgccacatca - -a -s mr.mrrefChr3 115940 277 + 181019 agatcgactcaacaaagaagctatggtgtcacaggggttgaattctaaatagaccctcaatgccccaactaaaagtcacttatcaacaagcagacaaagagattacagggtctactgacacaagctccactgacacacagtaaaacagaagagttggaaccatttctgcacaaaccacaatccattgaagatggctcaattctatatgcactgaaacccatataaagcaaatgagagaagaatacggaatgcaaggcatgttttttccaatgtcaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566082 274 + 636262 agatcgactcaacaaagaagctatggtgtcacaggggttgaattctaactggaccctcaatgccccaac-aaaagtcactcatcgacaagcagacatagagattacagggtctactgacgcaagctccactgacacacagtaaaacagaggagttggaaccatttctgcacaaaccacaatccattcaggttggctccattctatatgcactgaaacc--tgtaaagcaagtgagaggagaatacggattgcaaggcatgtttttgccaatgtcaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 41367 263 - 647215 ------actcaacaaagaagctatgctgtcacaagggttgaatcctaaatagaccctcaatgccccaactaaaa-----ttatcaacaagcagacaaagagattacagggtctactgacataagctccactgacacgcactaaaacagaagagttggaatcatttctgcacaaaccacaatc--ttgaagatgaCTCAATCCTATATGCACTGAAACCCATATAAAGCAAATGAGAGAGGAATACAGAAT-CAAGGCATGTTTTTTCTCATGTCAGA - -a -s mr.mrrefChr3 116217 276 + 181019 tgctggagatctgtgatcagtgtactagacatcatgcactggacatttgcaatcagaacactagtcaactgaataattgattagaaagcccatctactatgaaccagtatataagatgtgtggaactataagttatgtaacctattaactgaaccatcatgaatcacatgatattattgtgaggacacattgaatacaccaggccagtttacatattaagaatcctgaactgagggaaattaccaatgttgtttgggtgattaaagaataagcaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566356 275 + 636262 tgctggaggtctgtgatcagtgtactagacatcatgtgctggacatttgcaatcagaacactagtcaactgaataattcattagaaagcccatctactatgaaccagtatataagatgtgtggaactatatgttatgtaa-ttattaacgtaaccatcatgaatcacacaatattactgtgaggacacattgaatacaccaggccagtttacatgttaagaatcctgaactgagggatattaccgatattgtttgggtgattaaagaataagcaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 41686 276 - 647215 TACTGGACATCTGTGACCAGGGTGCCTGACACTAAGCACTGGACATTTGCGATCGGAGTGCTAACCAATTGAATAATTGATTAGAAAACCCATCCACTATGAATTAGTATATaagatgtgtggaactgtaagttatgtaacctattaactgaaccatcatgaatcacatgatattattgtgaggacacattggatacaccaggccagtttacatattaagattcctgagatgagggaaattaccaacgttgtgtgggtgtttaaagaatgataaag - -a -s mr.mrrefChr3 116493 82 + 181019 acatccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcctaagatgggcacaagaatgaaggaaacaaaatat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566631 82 + 636262 acatccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcccaagatgggcacaagaatgaaggaaacaaaatat -s simRat_chr6.simRat.chr6 41971 81 - 647215 acaaccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcctgagatgggaacaagaaTGAAGGAAACAAAATC- - -a -s mr.mrrefChr3 116575 103 + 181019 ttccacgttctcagatgatatgatgctctaccttggaaaccctAGCATGGCAAGTTGGGCACAGCTAGCCTAGATGTAATTGAGAGGTACGAGAACAAGAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566714 103 + 636262 ttccacgttctcagatgatatgatgctctacctaggaaaccctGGCATGGAAAGTTGAGCACAGCTAGCCTGGATGTAATTGAGAGGTACGAGAACAATAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 42052 78 - 647215 -------------------------CTCTACCTTGGAAACTCTAGCATGGCAAGCAGGGCACTGCTAGCCTAGATATAATTAAGAGGTATGAGAACTAGAGGT - -a -s mr.mrrefChr3 116678 165 + 181019 GGTAatactaaagaaacacccactggtaatactaaagaaacacccacctacagtttaggtaggaagatcatagttgggaaaggctaaagagacagccactccactcaattttatttttctcagtaggcacctccagcctcatcttaggcagggagacccttagcg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566818 165 + 636262 GGTAatactaaagaaacacccactggtaatactaaagaaacacccacctacagtttaggtaggaagatcatagttgggaaaggctaaagagacagctactccacccaattttatttttctcagtaggcacctccagcctcatcttaggcagggagacccttaggg -s simRat_chr6.simRat.chr6 42130 163 - 647215 GGTAACACC-AAGAAACACCCACCGGTTATACTGAAGAAacacccacctacagtttaggtaggaagatcatggttggaaaaggctaaagagacagccactccacttaattttatttttctcagtaggcacctccaaccttatcttaggcagag-gaccctcagcg - -a -s mr.mrrefChr3 116843 269 + 181019 atgaagcaaaagtgggccctcaactcaaattaagggaTGAATTCAGttttacccACAAAAAGGAAACGAAAGTTAGAATGGTTCATATCTAGCAGCAAAAtaggagtgagagtgaaacacccatccagttgaacagagtagctcttgcagaccttaagaagatatcaagggCTagtacTCAGACCCTAGATCTAAGGGGAAGTATTTAAGTAAAgaattgacagtgaggcacacACTTCCACAGAATGGTTCACATGTGAAGAAATGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566984 249 + 636262 atggagcaaaagtgggccctcaactcaaattaagggaTGAATTCAGTTTTACCCACAAAAAGGAAACAAAAGTTAGAATGGTTCATATCTAGCAGCAAAATAGGAGTGAGAGTGAAACACACATCCAGTTGAACAGAGTGGCGCTTGCAGCCCTTAAGAAGATATCAAGGGCTAGTACTCAGACCTTAGATCTAAGGGGAAGTATTTAAGTAAA--------------------ACCTCCACAGAATGGTTCTCATGTGAAGTAATGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 42293 256 - 647215 atgaagcaaaagtgggccctcaactcaaattaagggaTGAATTCAC--------ACAAAAAGGAAACGAAAGTTAGAATGGTTTATGTCTGGCAGCAAAAtaggagcgagagtgaaacacccatccaattgaacagagtagctcttgcagaccttaagaagatatcaagggCT-----TCAGACCCTATATCTGAGGGGGAGTATTTAAGTAAAGAATTGACAGTGAGGCACACACTCCCACAGAGTGGTTCACATACGAAGAAATAAT - -a -s mr.mrrefChr3 117112 20 + 181019 GGAGAAGCACCTTACTTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567233 20 + 636262 GGAGAAGCACCTTACTTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 42550 20 - 647215 GGAGAAACATGTTGCTTTAG - -a -s mr.mrrefChr3 117132 127 + 181019 TTATCATGCTATGGCTGATTGGCCTCATTAGTCTAGTGTAATCTCCTTAATCAATTATAGTGGaCAATAGCGAGGAAATAGGTATGAAGCACTCATTCAGCTaaggggaGAGGGTTGTGTTTCAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567263 127 + 636262 TTATCATGCTATGGCTGATTGGCCTCATTAGCCTTGTGTAATCTCCTCAATCAATTATAGTGGACAATAGCGAGGAAATAGGTACAAAGCACTCATTCGGCTAAGGGGAGAGGGTTGTGTTTCAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 42570 119 - 647215 TTATCACGCCATGGCTGCTTGGTCTTGTTAGTGTAGTGTAATTTCCTTAATCAATTATAGTGG-CAATAGCGACAAAATAGGTATGAAGTACTCATTCAGCA-------GTCAATCATGGTTCACAA - -a -s mr.mrrefChr3 117259 35 + 181019 TGTTCCAGCAAGAAgATACACACGTTCTATTCTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567390 35 + 636262 TGTTCCAGCAAAAAGATACAAACATTCTATTCTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 42695 34 - 647215 TACTCTATAAAGTC-ATGGACGCGTTTCATTCTTC - -a -s mr.mrrefChr3 117294 168 + 181019 TGGTGCCCAATAATACTACTCCATAAAGTCATAGACGTGTTTCatATTCTTCTTTTATGAGTCAAAAAGACTAAGAAACAGGTTCCCTTTGTGATTAGACATAAGTAACCCCCCTTTTTCAACATCCAGCCACCTCAGAAGAATTCTCAGAAAAAAACCATCAATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567426 168 + 636262 TAGTGCCCAATAATGTGACTCCATAAAATCACACAAGTGTTTCATATTCTTCTTTTATGAGTCAAAAAGACTAAGAAACAGGTTCCCTTTGTGATTAGACATAAGTAACCCCCCTTTTCCAACATCCAGCCACCTCAGAAAAATTCTCAGAAAAAAACCATCAATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 42729 163 - 647215 TGGTTTACAATAATACTACTCCATAAAGTCATGGACGCGTTTC--ATTCTTCTTATCTGAGTAAAAAAGACTAAGAAATAGATTCCCTGTGTGATTAGGCATAAGTAACCCCCCTTTTT---CGTCCAGCCACCTCAGAAGAATTCTCACAAGGAAACCATTATTTTG - -a -s mr.mrrefChr3 117462 22 + 181019 TCAGTTATCATTTGAATAAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567603 22 + 636262 TCATTTATCATTTGAATAAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 42892 13 - 647215 TCAGTTATCACTC--------- - -a -s mr.mrrefChr3 117484 356 + 181019 TGTTAGTCAAACATCAGGATCCACCCCATATGACCACTCTATTTGCCCTGCCCTATGAAATGTTGTGAGATATGGTGTATGGAATGTGAGTTCTAGGGAAGGGCGATCAAGGGCCCATAGGAATCAAGCATGTGGAATCCTGAGAGTAATCATATTTCAAGGGATAGCTGTCAAGGTATTTATTTTCTGACTAACCCCTCATCATGCCAACCTATTGTTCTTGCTTGTCTGATGTCTGTATTCTTGATTGTAAATCCATCTCTCCTGGCTTATCCAGTGTTTACACCAATAAAATGTGGGACTGAAAGGAATGTTAGGATTCAGTAGAACCAAGGGTTAAGGCAGCTGCATGTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567631 355 + 636262 TGTTAGTCGAACATAAGGATCCACCCCATATGACCACTCTATATGCCCTGCCCAATGAAATGTTGTGAGATATGGAGTGTGGAATATGAGTTCTAGGGAAGGGCGAACAAGGGCCCATAGGGATCAAGCATGTAGAAGCCTGAGAGTAATAACATTTCAAGGGATAGCTGTCAAGG-ATTTATTTTTTGACTAACCCCTCATCATGCCAACCTATTGTCCTTGCTTGTCTGATGTCTGTATTCTTGATTGTAAATCTGTCTCTCCTGGCTTATCCAGTGTTTACACCAATAAAATGTGAGACTGAAAGGAATGTTAGAATTCAGTAGAACCAAGGGTTAAGGCAGCTGCATGTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 42905 354 - 647215 --TTAGTCAAGCATCAGTATCCACCCCATATGACCACTCTATTTTCCTTTCCCTATGAAATGTTGTGAGATACAGTGGATGGAATGTAGGTTCTAGGGAATGGCCATCAAGAGCCCATAGGAATCAAGCATGTGGAATCCTGGGAGTAACCATATTTCAAGGGATGGCTCTCAAAGTATTTGTTTCCTCACTAACCCCTCATCGCGCCAACCCACTGTTCTTGCTTGTCTGATGTCTTTATTCCTGATTGTAAATCCAACTCTCTTGGCTTATCCGGTGTTTACACCAATAAAGCGTGGGACTGAAAGGTATTATATGCCTCAGTAGAACCTAGGGTTAAGACAGCTGCCTGTTAT - -a -s mr.mrrefChr3 117840 550 + 181019 TTTTGTGCATGGTGGGATGCATTGGATCTGCCCTTACCTACCAGACCAACACCTATTGATAGGAACTGTAAACATCTCACAGACCACTTGTAATATCTAATGATCAGACTAAAGAATATAATACTCTGTAGCATCTTGTCTGGGTACTGTGCACCAGTGCTGCTCTTGTTACCCTCCCATTAAGTAATGTGTCCACATTCCAAATTGGATGTAGTTTTGTATGGGTGATCTGAATTATTTAGTTTACAGTTGGAAAATAGTGCTGATGGGGGCCTACCATTTTGCACCTGGAATGTTTCCAACAGTGTTCAGTCCAGTGTGATAAGTGTCATCCTAATTTCTAAGCTCCCAGTGTTATTACAGTTAGAGTTCTCCAATGGAATAGGTGGATGCCAATTAATAAATGTATAATCACATTGAGGTCAGTAGAATAACTGGAAAAACAGCAGTAAGGTTGGTTACAGATATCTTGTGATGCACCTCCTGTACAAGAGCACCAACAGCACACCTAAACTTGCAGAATTCTGTGGACAACCATCCCGTTTTTCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567986 549 + 636262 TTTTGTGCATGGTGGGAT-TATTGGATCTGCCCTTACCTACCAGACCAACACCTATTGATAGGAACTGTAAACAGCTCACAGACCTCGTGTAATATCTAATGATCAGACTAAAGAATGTAATACTCTGTAGCATCTTGTCTGGGTACTGGGCACCAGTGCTGCTCTTGTTACCCTCCCATTAAGAAATGTGTCCACATTCCAAATTGGATGTAGTTTTGTATGGGTGATCTGAATTATTTAGTTTACAATTGGAAAATAGTGCTGATGGGGGCCTACCATTTTGTACCTGGAGTGTTTCCGACAGTGTTCAGTCCAGTGTGATAAGTGTCATACTAATTTCTAAGCTCCCAGTGTTATTACAGTTAGACTTCTCCAATGAAATAGGTCAATGACAATTAACAAATGTATAATAACATTGAGGTCAGTAGAATAACTGGAAAAACAGCAGTGAGGTTGTTTACAGATATCTTGTGATGCACCTCCTGTACAAGAGAGCCAACAGCACACCTAAACTTACAGAATTCTATGGACAACCATCCCGTTTTTCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 43260 538 - 647215 TTTTTGGCATGGTGGGATGCACTGTATCTGCCCTT------------AATACCTATTGATAGGAACTGTAAACATCTCACAGACCACTTTTAATATCTAACGCTCATACTAAAGAACATAATACTCTGTAGCATCTTGTTTGGGTACCATGCACCAGTGCTGCTCTGGTTACCCTCCCATTAAGTAATGTGCCCACATTCCAAATTTGATGTACTTTTGTATGGGTGATCTGAATTATTCAGTTTACAGTTGGAAGACAGTGCTGGTGGGGGCTTACCATTTTGCACCTGGGATGTTTCTAACAGTGTTCAGTCCAGTGTGATAACTGTCATCCTCATTTCTAAGCTCCCAGTGTTATTACAGCTAGAGTTCTCCAATGGAGTAGGTGGATGCCAGTTAATGAATGTGTAAGCACATTGAGGTCAGTAGAATAACTGGAACAACAGCAGCAAGGTTGGTGACAGATCTCTTGTGATTCACCTCCTGCACGAGGACATCAACAGCAAACCTAAACCTGCAGAATACTGTGGACGACCATCCCGTTTTTCGT - -a -s mr.mrrefChr3 118390 94 + 181019 TTCCCATTATTAGAAAGACCAAAAACTGTTAATTGCAGTAACATCTGTTCTGGTCTAGATGAATGCCTCATCACCAGCCTCCACAAGAAATGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568535 92 + 636262 TTCCTGTTATT--AAAGACCGAAGACTGTTAATTGCAGTAACATCTGCTCTGGTCTAGATGAATGCCTCATCACCAGCCTCCACAAGAAATGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 43799 94 - 647215 TTCCCATTGTTAGAGAGACCAAAAACCTTTAAGTGCAGTAACATCTGTTCCGGTCTAGATGAATGCCTCATCACTAGCCTCCACAAGAAATGAG - -a -s mr.mrrefChr3 118484 33 + 181019 ATCTGTGCAAGCATCTGGTTGGGGGGAACTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568633 33 + 636262 ATCTGTGCAGGTATCTGGTTGGGGGGAACTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 43893 33 - 647215 ATCTGTGCAAGCATCTTGCTGGGGGGAACTGGG - -a -s mr.mrrefChr3 118517 185 + 181019 ACTACCCCAATGCTTAAGACTAATTTATCTAGAATGCTAATAGACACCTGATGTGCTTCAATGATTAATCATTGTGAGAGGTAAGAATTCTTTTTTTGTTTGATCTGAGATTAAGGAGCTATTGGTTTAGGATTGCCTTAAATTGGTTTCACTTTTGCTTACTATGGGCGTCTCCTTTGGTAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568666 183 + 636262 ACTACCCCAATGCTTAAGACTAATTTATCTAGAATGCTAATAGACGCCTGATGTGCTTCAATGATAAATCATGGTGAGAGGTAAGAATTCTTTTTTTGTTTCATCAGAGATTAAGGAGCTATTGGTTTAGGATTGCC--AGAGCGGTTTCACGTTTACTTACTATGGGCGTCTCCTTTGGTAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 43930 183 - 647215 ACTACCCTGCTGCTTAAGACTAATTTTTCTAGAATGCT--TAGACACCTGATGTGCTTCAATGATTAATCATTGTGAGAGGTAAGAATTCTTTTTTTGTTTGATCTGAGATTCAGGAGGTATTGGTTTAGTACTGCCTTAAATTGGTTTCATTTTTGCTTGATTTGCGTGTCTCCTTTGGTAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 118702 100 + 181019 TTGGTCAGGGTCTTGTCTTCCTATTAAGATGAAATTCTTTACATGTTTCTTCACAATGTGAATGTCAGAAGAATGCGCCTCCATAACCTTTGCTGGTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568849 100 + 636262 TTGGTCAGGGTCTTGTCTTTCTATTAAGATGAAATTCTTTCCATGTTTCCTCACAATGTGAATGCCAGGAGAATGCGCCTCAATAACCTTTGATGGTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 44114 100 - 647215 TTGGTCAAGGTCTTGTCTTCCTATTAAGATGAAATTCTTTACATGTTTCTTCACAATGTGAATGTCACAAGAATGTAGCTCCATAACCTTTGCAGTTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 118802 15 + 181019 TTATTTTTGTTTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568949 15 + 636262 TTATTTTTGTTTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 44230 15 - 647215 TTATTTTTGTATTGG - -a -s mr.mrrefChr3 118817 32 + 181019 ACAACCTCCTTCTGTAACAGAGTAAAATCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568971 32 + 636262 ACAACCTCCTTCTGTAACTGAGTAAAATCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 44245 32 - 647215 ATGAGCTCCTTCTTTAATAGAGTGAGATCAAC - -a -s mr.mrrefChr3 118849 53 + 181019 AGTATGATCATGATGGATATATGAAAGTAGGCCTTCTATCAGCTAATGAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569005 53 + 636262 AGTATGATCGTGATGGATATATGAAAGCAGGCCTTCTATCAGCTAATGAGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 44277 53 - 647215 AGTATGATCATGATGGATATATGAAAGTAGGCCTTCTATCAGCTAATGAGAAA - -a -s mr.mrrefChr3 118902 133 + 181019 TGAGTATAGTCTTCCAAACTGTAGCACATAGGGGAGTGTATCAACAAACTATAGCTCCACTGACACACACAAGGCATTTAACCTAATATTTTTGTGCCATCATTCATTGACTAGCTGCAACTATGTTTGGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569058 133 + 636262 TGAGTGTAGTCTTCCAAACTGTAGCACATAGGGGAGTGTATCGATAAACTATAACTCTACTGACACACACAAGGCATTTAACCTAATATTTTTGTGCCATCATTCATTGACTAGCTGCAACTATGTTTGGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 44337 133 - 647215 TGAGTATCATCTTTCAAACTGTAACCGATAGGTGAGCGTATCAACAAACTATAGCTCCACTGACACACACATGGCATTTAACCTCATATGTTTGTGCCATCATTCATTGACAAGCGGACAATGTGTTTGGTGT - -a -s mr.mrrefChr3 119035 9 + 181019 TTGACACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569193 9 + 636262 TTGACACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 44470 9 - 647215 TTGACACAG - -a -s mr.mrrefChr3 119044 149 + 181019 AGTCCCTCCATTGCTAGGATCCTGGGTGTTCTTGCTGGGAACATTATTCTTGCAAGAAATTCTATAGCTGCCCCAAGAGGGCCCTAAGGTAGAGCACATGTAGGTGCTTGATTTTAATATTTTAAAAATGATGTGAACATATGTGACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569202 149 + 636262 AGTCCCTCCATTGCTAGGATCCTGGGTGTTCTTGCTGGGAACATTATTCTTGCAAAAAATTCTATAGCTGCCCCAAGAGGGCCCTAAGGTAGAGCACATGTAGGTGCTTGATCTTAATATTGTAAAAATGATGTGAACATATGTGACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 44480 149 - 647215 ACTACCTCCATTGCTAAGATCCTGGGTGTTCTTGCCTGGAACATTATTCTAGCATGGAATTCTATAGCTACCTAAAGAGAGCCCTAAGGTAGAGCACATATAGGTACTTGAATGTAAGATTTAAAAAATGGAGTGAACACATTCGACAT - -a -s mr.mrrefChr3 119193 302 + 181019 CATGTGCAATTAGCACGCAGAACCTTTCAATatcttgacactctttagtggttcagatttacttagatccctgatccatctgcacttagtctcagctttgatgtaaggagtgagcaaatgtgggggtccagcttcttgttgatggatgtccaatttcaatgtcacttcctgcggagtgactattagcaattctcttagccttctccctgaacaatgaaggatagaacgatcaatgaaagatagaacaatccagttcgctgagaagtaaacagaagtctcgacaagcccactttcttgccagg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569351 272 + 636262 CATGTGCAATTAGCATGCAGGATCTTTCAATATCTTGACCCTCTATACTGGTTCACATTTACTTAGATCCCTGATCCATCTGCACTTATTCTCAGCATTG-----------------------------AGCTTCCTGTTGATGGATGTCTAATTTCGATGTCACTTCCTGCGGAGTGACTATTAGCAATTCTCTTAGCCTTCTCCCTGAACAATGAAGGATAGAACGATCAatgaaagatagaacaatccagttcgctgagaagtaaacagaagtct-gacaagcccactttcttaccagg -s simRat_chr6.simRat.chr6 44635 302 - 647215 CATGTGCACTTAGCACGCAGAACCTCACCATatcttgacactctttagtggttcagaatcacttagatccctgattcatctgcacttagtctcagctttgatgtaaggagtgagcaaatgtgggggtccagcctcttgttgatggatgtccaatttcactgtcacttcttggggagtgactattaacaattctcttagtcttctccctggacaatgaaggatagaacagtcaatgaaggatagaacaatccagtttactgagaagtaaacagaagtctcaacaagcccactttcttgccggg - -a -s mr.mrrefChr3 119495 191 + 181019 tatggtttctgacctcctggtaccagcatattgggtttaatgctgttttggtcccatttactcATAATATATCCAAAAAACCAGGTAGtgaccTTCGAATTGAATTAGTGCTCCCTGCACTGACTAATCAGCATTGGAGAGGGACATAACCAAAGTGGGTGCTCACAGAATCTGCTACTCCTAACACAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569623 186 + 636262 tatagtttctgacctcctggtaccagcataTTGGGTTTAATGCTGCTTCGGTCCCATTTACTCATAATATTTCCAAAAAACCAGGTAG-----TTCAAATAGAATTAGTGCTCCCTGCACAAACTAATCAGCATTGGACAGGGACATAACCAAAGTGAGTGCTCACAGGATCTGCTACTGCTAACACAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 44940 191 - 647215 tatggtgtctgatctcctggtaccagcacattgggtttaatgctcttttggttgcatttgctcATAATATATCCGAAAAACCAGGTAGTGACCTTTGAATTGAATTAGTGCTCCCTGCACTGACTAATCAGCATTCGAGAGGGACCTCCCTAAAGAGGGTGCTCATAGAAGCTGCTTCTCCTAACACAACA - -a -s mr.mrrefChr3 119686 467 + 181019 AATAATCAAGTTCAAATGTATCAAATACTATAATGTTTGTGTGTATCTGTGTCATAGGGTTTCGGAAATGTTGATTCACTTACTGTTGTACTATTCCTTTAATAACCCAAGCCCTAGATAATAACCTCAACAACTAGCAAGCATAAACGGCTGAATGATTTGCCTAAGTCATTTTGGCCATCTCATGAAGATTAGCTTTTGGTCATAAAGTGTGGTAATTCTGTATTGACCTCAGAAGCTATCTGGTTCAGTGTAATTATTAGGTCATTGTCAACTGTAAGTTACAAGTTTCTACTAATAGAAGTCCTTTGTGTATCTATTGTCATTAAAAAGTGAGTGTCAACGAAATAATTTAAATATTGGGAACTGGGATTACCACAAAAACTACCTTGGCCTTTGCTGCATTTTGCATGGACAACTCAGTGTTATTGTGCTCAATGTATGAACCAGTGGTTTGTTCTATAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569814 459 + 636262 AATAATCAAGTTGAAATGTGTCAAATACTATTGTGTTTGTGTGTATCCGTGTCATAGGGTTTTGGCAATGTTGATTCACTTACTGTTGTACTACTCCCTTAATAACCCAAGCCCTAGATAATAACCTCAACAACTAGCAAGCATAGACGGCTGAAT--TTTGCCTAAGTCATTTTGGCCATCCCAGGAAGACTAGCTTTTAGTCATAAAGTGTGGTAGTTCTGTATTGACCTCAGAAGCTATCTGGTTCAGTGTAGTTATTAGGTCATGGTCAATTGTAAGTTACAAGTTTCTACTAATAGAAGTCCTTTGAATATCTATTGTCATTAAAAAGTGAGTGTCAACAAAATAATTTAAATATT------CGGGATTACCACAAAAACTACCTTGACCTTTACTACATTTTGCATGGACAACTCAGTGTTATTGTGCTCAATGTATGAACCGGTGGTTTATTCTACAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 45131 458 - 647215 AGTAACCTAGTTCAAATGTATCAAATATTATAATATTTGTGTGTATCTGTGCCATAGGGTTACGGAAATGTTGATTTGCTGACTGTTGTACTATTCCTTTAATTATCCTGGTCCTATATTATAA-CTCAACAAATAGCAAACGTAAACGGCTGAATGATTAGCCTAAGTCATTTTGGCTATTTCATGAAGATTAGCTTTTGGTCATAAAGTGTGGTAATTCTGTATTGACTTCAGAAGCTACCTGGTTCATAGTGACTACTAGGTCATTGTCAACTGTAAGTTAAACATTTGTACTAATTGAGGTGCTTTGTGTATCTATTGTCATTAAAAAG--------AAGGAAATAATTTGAATATTGGGAACTGGGATTACCACAAAAACTGCCTAGGCCTTTGCTGCATTTTGCATGGACAACTCAGTGTTATTGTGCTCCATGAGTCAACTAGTGGTTTGGTCTATAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 120153 20 + 181019 TCCATCCAGCAGTTTGTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570273 20 + 636262 TCCATCCAGCAGTTTGTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 45590 20 - 647215 CCCATCCAGTGATTCGTTCT - -a -s mr.mrrefChr3 120173 42 + 181019 ATGGAGTTCATCCATGGTGCATATCTAGTTCATCCATGGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570293 42 + 636262 ATGGAGTTCATCCATGGTGCATATCTAGTTCATCCATGGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 45612 42 - 647215 ATGGAGTCCATCCGTAGTGCATATCCAGCTCATCCATGGTGC - -a -s mr.mrrefChr3 120215 40 + 181019 AAAGTATCTCAGATGCTTTTGTTATTTGGCAAAAGCAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570335 40 + 636262 AAAGTGTCTCAGATGGTTTTGTTATTTGGCAAAAGCAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 45655 40 - 647215 AAAGTATCTCAGATGCCTTTGTTATTTGGTAAATGCAAAC - -a -s mr.mrrefChr3 120255 202 + 181019 AATTAGGTGGCATTGTAGCTGTGGGTGCAATGCTGAACTTAGCCTAGCAGGTGTAGGCTCCCACCATTCCCTTACCTTAGCTGTTTGTTTTGATCTGTGTAACTGCAGGCAAGGAAGATTAACTAGATAAACAAATCCCCTAGACTGCTTAGTCGTGGAAATTATCACAATAAATTGTGATAGTAGACAAGAGTCAGTGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570425 202 + 636262 AATTTGGTGACATTGTAGCTGTGGGTGCAATGCTGAACTTAGCCTAGCAGGTATAGGCTCCCACCATTCCCTTAGCTTAGCTGTTTGGTTTGATCTGTGTAACTGCAGGCAAGGGAGATTAACTAGATAAACAAATCCCCTAGACTGCTTAGGCATGGAGATTACCACAATAAACTGTGATAGCAGACAAGAGTCAGTGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 45695 202 - 647215 AATTAGGTGGCGGTGTAGCTGTGGGTGCAAACCTGAACTTAGCTTAGCAGGTGTAGGCTCCCACTATTCCCTTACCTTAGCTATTTGTCTTGATCTGTGTAAATGCAAGCAAGGAAGATGAACTAGATAAACCAATCCCCTAGACTGCTTAGTTGTGGGAATTATCACAATAAATTTTGATAATGGACAACAGTCAGTGGCA - -a -s mr.mrrefChr3 120457 14 + 181019 AAGGATTTGCAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570628 14 + 636262 AAGGATTTGCAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 45897 14 - 647215 AAGGATTTGCAGTC - -a -s mr.mrrefChr3 120471 158 + 181019 CACTTGGGTTCTAGTTAGGTAAGTATGAGGCATGGGGGACAATACCATATAGTAGTAGGATTCCTTCCACCTTGTTTACAGAGTCTCTTGACTTATACTCACGAGATAATTTCAATAACTGCACAGCCCCAAGACATTTGCTTGAGAGCAATGGTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570642 158 + 636262 CACTTGGGTTCTAGTTAGGTAAGTAGGAGGCATGGGGGACAATACCATATAGTAGTAGGATTCCTTCCACCTTGTTTGCAGAGTCTCTAGATTTATACTCACGAGATAATTTCAATAACTGCACAGCCCCAAGACATTTGCTTGAGAGCAATGGTCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 45966 158 - 647215 CACTTGGGTTCTAGTTAGCTAAGTATGAAGCTTGGGGCACAACACCATATAGTAGTAGGATTCCTTCCACCTTGATTACAGAGTCTTTTGACTTATAGTCACCAGATAGTTTCAATAACCTTTCAGCCCCAAGACATTTGCTTGAGAGAAATGGTTAT - -a -s mr.mrrefChr3 120629 158 + 181019 GCATATTGGACCAAGTGTTTCAGCCCTAAGGTGTAGAAAATTCTCCCCATGAATAATGCTCCTCCCAACACATTAGCAATCAATGTGGATGACACAAGATCCAAAATAGTCCTCATTGACATTATGGTCAAGACAGCTTTGTATCATGCAGTGCTACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570800 97 + 636262 GCATATATGACCAAGTGTTTCAGCCGTAATGTATAAAAAGTTCTCCCCATGAATAATGCTTCCCACAACACATTAGCAATCAATGCAGATGACACAA------------------------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 46125 158 - 647215 GGATATTGGGCCAAGTTTTTCAGCCCTAAGGTGTAGAAAATTCTCCCCATGAATAATGCTCCTCCCAACACATTAACAATCAATGTGGGTGATACAAGATCCAAAATAGTCCTCATTGACATTATGGTCAAGACAGCTTTGTATCATGCAGTGCTACC - -a -s mr.mrrefChr3 120787 50 + 181019 ATCGGTCAATCACCCAGCATACAAGACACCTATTCATTTTGACACCATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 46284 50 - 647215 ATCGGTCAATCACCCAGCATACAAGACACCTATTCATTTTGACACCATGA - -a -s mr.mrrefChr3 120837 5 + 181019 TGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 46393 5 - 647215 TGGGA - -a -s mr.mrrefChr3 120842 38 + 181019 TAAATGTTATTATTATTGCCCTGCTGGATAAAGCAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570897 19 + 636262 -------------------CCTGCTGGATAAAACAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 46401 38 - 647215 TAAATGTTATTATTATTGCCCTGCTGGATAAGGCAACC - -a -s mr.mrrefChr3 120880 169 + 181019 AATTAACCTTTTAAAAACAGTGTCTTATGGGATATCTAATGGTGAGGACCTAGCCAAACCCATATAAAATAGGCAACATTCCACTCCACAATTACATCAATTCTCCTGACACACTGCAGCATGGTCCCTGGGTGCAAGTTCATAAGGTATAATCTCTCCATAGTATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570917 164 + 636262 AATTAACTTTTTAAAAATAGTGTATTATGGGATATCTAATGGTGAGGACCTAGCCAAACCCATATATAATAGGCAACATCCCACTCTACAATTACATCAATCCCCCTGACACACTGCAGCATGGTCCCTAGATGCAGGTTCATAAGGTATAATCTCTCCAGTGT----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 46439 169 - 647215 AATTAACCTTTTAAAAACAGTTTCTTATGGGATATTTAATGGTGAGGGCCTGGCCAAACCCATATAAAATAGGCAACATTCCACTCCACAGATACATCACTTCTCCTGACACACTGCAGCATAGTCCCTGGGTCCAAGTTCATAAGGTATAATGTCTCCATAGGATGTG - -a -s mr.mrrefChr3 121049 143 + 181019 CAAGAATAAATGGAATGGGTGCCTCCAATGAACATAAACAACAAAGATACATACTAGGAGCAAAGGAAAACATCCATTATGCTGATCAGATCCTACTTCTGATTTTGCACTGCTCTTTTGATTTGCTGTTTAGGCTATGCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571081 141 + 636262 --AGAATAAATGGAATGAGTGCCTCCAATGAACATGAACAACAAAGATACATACTAGGAGCAAAGGAAAACATCCATTATGCTGATCAGATCCTACTTCTGATTTTGCACTGCTCTTTTGATTTGCTTTTTAGGCTATGCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 46613 143 - 647215 CAAGATTAAATGGAATGGGTGCCTCCAACGAACATAAACAACAAAGATACATACTAGGAGAAAAGGAAAACATCCATCATGCTGATTACATCCCGCTTCTGATTTTGCATCGCTCTTTTGATTTGCTGCTTAGGCTATGATGT - -a -s mr.mrrefChr3 121192 73 + 181019 TAGGGAGTCCTTATTCTGCATGAAATTGTGAGCCATAATGTGGCTTCTTACTGAATCTAGTTATATATACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571222 73 + 636262 TAGGGAGTCCTTATTCTGCATGAAGTTGTGAGCCATAATGTGGCTTCTTACTGAATCTAGTTATACATACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 46761 73 - 647215 TTGGGAGTCCTTATTCTGCATGAAATTGTGAGCCATAATGTGACTTCATACTAAATCTAGTTATATTTATACA - -a -s mr.mrrefChr3 121265 8 + 181019 CCTTGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571295 8 + 636262 CCTTGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 46835 8 - 647215 CCTTGCAG - -a -s mr.mrrefChr3 121273 18 + 181019 TGGATATACACACCTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571321 18 + 636262 TGGATATACACACCTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 46843 9 - 647215 ---------CTACCTTGC - -a -s mr.mrrefChr3 121291 63 + 181019 AGCTATGAAGATAGATAGTTGTGGTAATATGTTAGCCACAATGTGGTCTACTACTCCTAGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571341 60 + 636262 AGCTATGAAGATAG---GTTGTGGTAATATGTTAGTCACAATGTGCTCTACTACTCCTAGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 46852 63 - 647215 AGCTCTCAAGATAGATAGTTGTGGTGATATGTTAACCACTATGTGGTCTACCACTCCTGGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 121354 77 + 181019 CTTTTGATTTCACTTTAATAAATATGCACACCTTTGGTATAGAGGTATGTGCTTTCTGTTGCCCCTTAGGGGAGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571402 77 + 636262 CTTTTGATTTCACTTTAATAAATATGTACACCTTTGGTATAGAGGTTTGTGCTTTCTGTTGCCCCTTAGGGGAGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 46915 77 - 647215 CTTTTGATTTTACTTTAATAAATATGCACACCTTTGATATAGAGGTATGTGCTTTTTGTTGCCCCGTAGGGGAGTAC - -a -s mr.mrrefChr3 121431 29 + 181019 TCTTTTGGGGAGTACTCCTTTCTGCTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571483 29 + 636262 TCTTTTAGGGAGTACTCCTTTCTGCTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 46992 29 - 647215 TCTTTTGGGGAGTACTCCTCTCTGCTTTC - -a -s mr.mrrefChr3 121460 13 + 181019 GTCATCATACTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571512 13 + 636262 GTCCTCATACTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 47024 13 - 647215 GTCATCATACTCC - -a -s mr.mrrefChr3 121473 182 + 181019 AATCATTGCACTAAGTTAAGCGAAGGTGTGAGAGACTGAACATGGATGTATAGGTCATAGATTAGAGGCACTCCACCACGAAGGATAAGGACAGCTGGTGTGATAGCTGCAGATGTGACCAGAGGATCTCTGCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCAACTGCTGAATAAGATAGCATGCTCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571525 182 + 636262 AATCATTGCACTCAGTTAAGTGAAGGTGTGAGTGACTGAACATGGATGTATAGGACATAGATTTGAGGCATTCCACCGCAAAGGATAAGGACAGCTGGTGTGATAGCTGCATATGTGACCAGAGGATCTCTGCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCAACTGCTGAATCAGATGGCATGCTCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 47038 178 - 647215 AATCATTGCACTAGGCTAAGCAAAGATGTGAGAGACTGAACATGGGTGTATAGGTCATAGATCAGAAGCACTCCACCATGAAGGATAAGGACAGCTGGCATGAGTGCTACAGATGTGACCAGAGGAGCCCTCCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCATCTGCGGAATAAGATAGCATGCT---- - -a -s mr.mrrefChr3 121655 338 + 181019 GTGTTACTATAGTGCAAGCACTTACAGTCCCCATGGGACTCATTATCAAAGGCCACACCCTGTACATTTGAGTACCCATACATTAACATGTGATGTTTTTATGGTAATTAATGTATCCATAGAGATATAGATCTCAATGACTAAGATGCCTCTGATTGTAGTTTGTTTGGTGCATCATTTCAAAGAAATCAGAGTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACATTTTGTGGATGTTGGACTACACAAATTTGGATGCCAATGCATCCAGACGGAGCTGCGGGATTGAGATTAAGTGATGGTGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCAGTTCCATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571710 338 + 636262 GTGTTACTATAGTGCAAGCACTTACAGTCCCCATGGGACTCATTATCAAAGGCCACACCCTGTACATTTGAGTACCTATACATTAACCTGTGAAGTTTTGATGGTAATTAATGTATTCATAGAGATATAGATCTCAATGACTAATATGACTCTGATTGTAGTTTGTTTGATGCATCATATCAAAGAAATCAGAGTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACATTTTGTGGTTGTTGGACTACTCAAATTTGGATGCCAATGCATCCAGACGGAGCTGCGGGATTGAGATTGAGTGATGGTGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCAGTTCCATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 47216 338 - 647215 GTACTACTATAGGGGAGGCAATTACAGACCCCATGGGACTTATCATCAAGGGCCACCCCCTGTACATTTGTACAGCCATACATTAACATGTGATGTTTTTATGGTAATTAATGTATCCATAGAGATATTGATGTCAACGACTGAGATGCCTCTGATTGTCGTGTGTTTGGTCCATCATTCCAAAGAAGTCAGATTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACTTTTTACGGATGCAGGACTACACGAAAAAGAATTCCAATGCAACCAGACAGTGCTGATGGATTGAGATTAAGTCATGAGGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCCGTTCTTTTA - -a -s mr.mrrefChr3 121993 57 + 181019 ACTAAGCTCCATAATGCTTGGACTGCCCTGGAGGACTGTATATTAGGTGGGGTAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572049 57 + 636262 ACTAAGCTCCATAATGCTTGGACTGCCCTGGAGGACTGTATATTAGGTGGGGTGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 47554 57 - 647215 CCTGAGCTGCATAATGGTTGGACTGCCTTGGAGGACTGTTTATTAGGTAGAGCAGCT - -a -s mr.mrrefChr3 122050 10 + 181019 AAAGGAGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572112 10 + 636262 AAAGGAGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 47611 10 - 647215 AAAGGGGAGA - -a -s mr.mrrefChr3 122060 11 + 181019 GAGAGCACCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572123 11 + 636262 GAGAGCACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 47621 11 - 647215 GAGAACACCCC - -a -s mr.mrrefChr3 122071 57 + 181019 TAACATAAAACTTAAATTGAAGGGAGCTATAATTCTGACAAGGTGTTATTACCAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572135 57 + 636262 TAACATAAAACCTAAATTGGAGAGAGCTATAGTTCTAACAAGGTGTTGTTACCTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 47632 57 - 647215 TAACATAAGACTTAAATTGAAGGGAGCTTTAATTCTGACAAGATGCCATTGCCAAAA - -a -s mr.mrrefChr3 122128 101 + 181019 TTCATGAGATTAGAATTCTAGATAATTGCATCATGAATTATTGGACAGAGATGAAATCCACATGTCATATGGATTAACTCATAGGTTGCCGGGTATCCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572192 101 + 636262 TTCATGAGATTAGAATTCTAGATAATTGCATCATGAATTATTGGACAGAGATGAAATCCACATGTCATATGGATTAACTCATAGGTTGCCGGGTATCCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 47690 101 - 647215 TTCATGGGATTAGAATTCTAGATAGTTGCATCATGAATTAATGGACGTTGATGAGATCCTCATGGCATATGGACTAACTCATAGATTGCCAGCTATACCTT - -a -s mr.mrrefChr3 122229 19 + 181019 AGAAATTGTAGTGCTGACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572304 19 + 636262 AGAAATTGTAGTGCTGACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 47791 19 - 647215 AGGAATTGTAGGGCTGACT - -a -s mr.mrrefChr3 122248 45 + 181019 TCAAGTTCCTGTTTCCAATGTGACTATTGGTTTGGGGGAGAAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572329 45 + 636262 TCAAGTTCCTGTTTCCAATGTGACTATTGGTTTGGGGGAGAAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 47810 45 - 647215 TGAAGTTCCTGTTTCCAATCGGACTATTGGTCTAGGGGAAATGGA - -a -s mr.mrrefChr3 122293 59 + 181019 ATAAACATTGCACCTGGCACCATAGGAGTTGGCTGTCAGTCGGGGGGACACTAGATCGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572374 59 + 636262 ATAAACATTGCACCTGGCACCATAGGAGTTGGCTGTCAGTCGGGGGGACACTAGATCGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 47856 59 - 647215 ATAAATATTGCACCAGGCACAATAGGTGTTGGCTGTCAGTCCGGGGGATACTAGATTGC - -a -s mr.mrrefChr3 122352 40 + 181019 ACCCTCACTTATCAAACTCTTCTGTTGGTCAAACTGAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572433 40 + 636262 ACCCTCACTTATCAAACTCTTCTGTTGGTCAAACTGAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 47951 40 - 647215 ACCCTCGCTTATTAAACCCCTCTATTGATAAAACTGAAGG - -a -s mr.mrrefChr3 122392 118 + 181019 TTAACATGGATTCCACTGAATAAGGGGGTACATCACACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGCATGAGCCAGCTGGGTTTAAGAGGGCCGTATCTATGGGGTCCTATCAAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572473 118 + 636262 TTAACATGGATTCCACTGAATAAGGGGGTACATCACACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGCATGAGCCAGCAGGGTTTAAGAGGGCCATATCTATGAGGTCCTATCAAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 47992 118 - 647215 GTAACACAGATTCCACTGAACAAAGGGGCACATCATACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGTATGAGCCAGCTGGGTTTCAGAGGGCTGTTTTTATGGGGTCCTATTAGGCC - -a -s mr.mrrefChr3 122510 57 + 181019 ACTTTTTGACAAAAACTTTATTCATAGAATAAAATGTGGAGATAATCTCAAACATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572595 57 + 636262 ACTTTTTGACAAGAACTTTATTCATAGAATAAAATGTGGAGATCATCTCAAACATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 48110 57 - 647215 ACTTCTTGACAAAACCTTTATTCATAGAATAACATGCAGAGATAATCGCAAGTATAC - -a -s mr.mrrefChr3 122567 45 + 181019 AATAGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATCTTCCATCAATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572652 45 + 636262 AATAGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATTTTCCATCAATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 48215 45 - 647215 AATGGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATCTTCCATCAATTTG - -a -s mr.mrrefChr3 122612 249 + 181019 AACACCAAAACATTAAATATTGAGTGTAACCAAAGTGACCAGGCCAATAGTTGAACGGCTTACAGGATCTCTAGTTTATCGTGTTTAAACAAATCTCTAGACCCGTTGAATCTCTAAGCAACCAAAAGTAAAGAAACTGTGTGCAGAGATGTTTTGGAGGTTATATTAGTTATTTTACCTACTTACTTCTGTACAAGTATTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGCGCTGGGAAGGTGCATTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572703 239 + 636262 AACATCAAAATATTAAATATTGAGTGTAACCACAGTGACCAGGCCAATAGTTGAACGGCTTACAGGA--TCTAGTTTACCGTGTCTAAACAAATCTTTAGACC--------CTCTAAGCAACCAAAAGTAAAGAAACTGTGTGCATGGATGTTTTGGAGGTTATATTAGTTATTTTACCTACTTACTTTTGTACAAGTATTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGCGCTGGGAAGGTGCATTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 48260 246 - 647215 AGACCCAAAACATTAGATATTGAGTGAGACCAAAGTGACCAGGCCAATAGTTGAAAGGCTTACAGGATCTCTAGTTGATTGTGTTTAAACAACTCACTAGACCCGTTGAATCTCTAAGCAACCAAAATTAAAGAAACAGTGCACAGAGAGGTATTGGAGGTTATATTAGTTATTTTGCTTACTTACTTCTACACAAGTACTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGAAC---AAAGGTGCATTCAG - -a -s mr.mrrefChr3 122861 161 + 181019 TAGGACCATCCTCTACACATATGGCTCCTATTGAATGGGATAATGTATCCATATTTTAAGCACAGTATATTAAGCCTAAACCTTATCTCCTCACCCACTGGGCACTTTGGTGCACCCATACTCTTGCTGTATTTACTTTCCTTATTAGTCTGAGGCTTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572943 161 + 636262 TAGGACCATTCTCTGCACATATGGCTCCTATTGAATGGGATAATGTATCTGTATTTTAAGCACAGTATATTAAGCCTAAACCTTATCTCCTCACCTACTGGGCATTATGGTGTACCCATACTCTTGCTGTACTTACTTTCCTTATTATTCTGAGGCTTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 48506 161 - 647215 TAGGACCATCCTCTACACATCTGGCTCCTATTAAATGGGATAATGTATCCATGTTTTCAGCACGATATATTAAGGCTACACCTTATCTCCTCACCCACTGGGCACTTTGGTGCACCCATACTCTTAATGTATTTACTTTCCTTATCAGTCTTAGGCTTGGG - -a -s mr.mrrefChr3 123022 7 + 181019 GAGAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573104 7 + 636262 GAGAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 48668 7 - 647215 GAGAAAG - -a -s mr.mrrefChr3 123029 177 + 181019 TGCTGCTTTCAGCGCAGGTTGCGCTAACCATCATGGGTGACCTTTAAATACACATATAGTTATATCGCGTGGCTAAGTATATATTATGCAGATGTATATATGATATTAATTACTGTAGCCATGAGGAGTAAGATTGTTCTGCTCCACCCTTCATACATGTGATAGACACTAATATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573111 177 + 636262 TGCTGCTTTCAGGGCAGGTTGCACTAACCATCATAGGTGACCTCTAAATACACATATCATTATATCGCGTGGCTGACTGTATAATATGCAGATGTATATATGATATTAATTACTGTAGCCATGAGGAGTAAGATCATTCTGCTCCACCCTTCATACATCTGATAGACACTAATATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 48677 177 - 647215 TGCTGCTATCAGCGCGGGTTCAGCTAACCACCATGGGTGACCTTTAGACACAGATATAGCTACATCTTGTGGCTAAGTACATATTATGCAGATGTATTTATGATATTAATTACTGTAGCCACGAGGAGTCAGGCTGTTCTGCTCCACCCTTCATACATGTGATAGACACTAATATCT - -a -s mr.mrrefChr3 123206 10 + 181019 AAGGGAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573288 10 + 636262 ACGGGAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 48855 10 - 647215 AAGGGAGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 123216 106 + 181019 AACCAGACAAGACATGAATAACTATGTGGGGTCAATGAGAAAACTGTTCTCATAACTGAACACTTCAAGGTACAGATCCTGACTGTATTGGAATCTTGAAAATCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573299 106 + 636262 AACCAGACAAGACATGAATAATTATGTGGGGTCAGTGAGAAAACTGTTCTAATAACTGAACACTTCAAGGTAGAGCTCCTGACTGTATTGAAATCTTGAAAATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 48865 106 - 647215 GACTAGACAAGACATGAATAACTATGTGGGGTCAATGAGAAAACTGTTCTCATAACTGAACACTTCAAGGTACAAATTCTGACTGTATTGGAATCTTGAAAATCCA - -a -s mr.mrrefChr3 123322 53 + 181019 CTTGAAGCTGCATGTACATATTCCAAGGGGTGTACTAGATTTAATCAGTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573411 53 + 636262 CTTGAAGCTGCATGTACATATTCCAAGGGGTGTACAAGATTTAATCAGTCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 48971 53 - 647215 ATTGAAATTACATGTACATATTCTAAGGGGTGTACTAGATTTAATCAGTCAGG - -a -s mr.mrrefChr3 123375 840 + 181019 ACAAGTAAGGCCAAGACACACAAATGAGACCATAGATTTCTATAACAATTGCTCCCACAGATCCTTACAGTCTTAAGATCAAATTATCCCAGTGGCACTAATGGACATGTAATGTGTTTTTTCAAGTGGCTTCTCTGAAGCAGTAATTCAAGCCAGTAATTCGAGTCAAAAGTTTGGGCAACTGTGCTTCTAAAAGCCCCAACCAACAAATAGAACTGTTTGGGAACAAGGCAAGTGGGATGCGCTCACCTACCAGAATAAGGAAGCCCATCAGCAGTTCCTCTCCAATATTTGCACATGAAATCACCCTATATTAGCGACTTTTGAATAAGTTTACCATTTAGCTTGCAACACTAAAAAGACCTGCGTGACCTGAATAAAATCAAATTACACTCTAAGGCCTCAACACAATATTGAAGATATTTGATGTACAGATTAGCAATGCAACCTCCTAGCTATGAGCTGATGGAAGCAGAGTTTATGCAGAGGTAATTCTACTAACTTCTGGGAGCTTTTTGAGAGGAACAATTGTGATTGGCTTAGAGACACACCCAGCTGGACGTCTGGATGATCAGCCTTCCATAGGCTTAGCTCAGACACTAGAAAAGTTGGGTTTTGTGGTAGGCAGATTGAAAACTGGAACACCTCCCCGAATTGCCAAAGAGTCTATCAATTTTAGTATCCTTAATAAACATATACCAGATAATCCTTCCACCCCATTTGGCTTTACCAATGAGACTGTCTACAGGTGGTCAGGTCTCTTCCCGTATATGTGGAGGAAATTTGAACTTTCATTGAACTCCTGTTGTACAGATGGTAATCTTTTTGTTCTGGTATCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573474 811 + 636262 ACAAGTAAGGCCAAGACACACAAATGAGACCATAGATTTCTGTAACAATTGCTCCCACAGGACCTTACAGTTTTAAGACCAAATTATCCCAGTGGCACTAATGGACATGTAATGTGTTTTTTCAAGTGGCTCCTCTGAAGCAG------------------------AGAAGTTTGGGCAACTGTGCTTCTAAAAGCCCCAATCAACAAATAGAACTGTTTGGGAACAAGGCAAGTAGGATGGGCTCACCTACCAGAATAAGGAAGCCCATCAGCAGTTCCTCTCCAATATTTGCACATGCAATCACCCTATATTAGCGACTTTTGAATAAGTTTACCATTTAGCTTGCAACACTAAAAAGACCTGCGTGACCCGAATAAAATCAAATTACACTCTGAGGCCTCAACACAATATTGCAAA-----GATGTACAGATTAGCAATGCAACCTCCCAGCTATGAGCTGATGGAAGCAGAGTTTATGCAGAGGTAATTCTACTAACTTCTGGGAGCTTTTTGAGAGGAACAATTGTGATTGGCCTAGAGACACACCCAGCTGGACGTTTGGATGATCAGCCTTCCATAGGCTTAGCCCAGACGCTAGAAAAGTTGGGTTTTGTGGTAGGCAGATTGAAAACTGGAACACCTCCCCGAATTGCCAAAGAGTCTATCAATTTTAGTATCCTTAATAAACATATACCAGATAATCCTTCCACCCCATTTGGCTTTACCAATGAGACTGTCTACAGGTGGTTAGGTCTCTTCACGTATATGTGGAGGAAATTTGAGCTTTCATTAAACTCCTGTTATACAGATGGTAATCTTTTTGTTCTAGTATCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 49024 837 - 647215 ACAAGTAAGGCCAAGACGCACAAATGAGACCACAAATTTCTATAACAATTGCTCCCATGGATCTTTACAGTCTTAAGATCAAATTATCCCAGTGCCACTAAAGGACACGTAATGTGTTTTCACAAGTGGCTTCTCTGAAGCAGTAATTCAAGCCAGTAATTCGAGTCAAAAGTTTAGGGAACTGAGCTTCTAAAAGCCCCAACCAGCAAGTAGAACTGTTTGGGAACAAGGTAAGTGGGATGCACTCACCTACCAGAATAAGGAAGCCCCTCAGCAGTCCCTCTCTAGTATTTGCCCATGAAATCACCCTACATTAGCCACTTTTGAATAACTTTACCATGCATCTTGCAACACTAAAACGATCT--GTGCCCTGAATATGATTGAGTTACACTCTAATGCCTCAAGACTATATTGAGGATATTTGATGTACAGATTAGCGATGCAACCTCCTAGCTATGAGCTGATGGAAGCAGAGTTTATGCAGAGGTAATTCTACTAACTTCTGGGAGCTTTTTGAGAGGAACAATTGTGATTGGCTTAGAGACACACCCAGCTGGACGTCTGGATGATCAGCCTTCCATAGGCTTAGCTCAGACACTAGAAAAGTTGGGTTTTGTAGTAGGCAGATTGAAAACTGGAACACCTCCCCGAATTGCCAAAGAGTCTATCAATTTTAGTATCCTTAATAAACATATACCAGATAATCCTTCCACCCCATTTGGCTTCACCAATGAGACTGTTCACAGGTGGTCTGGTCTCTTTCCCCCTATGTGGAGGAAATTTGAACTTTCATTGTACTCCTGTTGTACAGATGGTAATA-TGTTGTTCTGGTATCTC - -a -s mr.mrrefChr3 124215 62 + 181019 CTCGCAGTCTATAACATAAAGTGTTTCCGGCACTTAAAGCAGAAGCACACTTGACATCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574285 62 + 636262 CTTGCAGTCTATAACGTAAAGTGTTTCTGGCACTTGAAGCAGAAGCTCACTTGACATCCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 49891 59 - 647215 TTCCCAGTCTTTAACATAAAGTGTTTCCGGTACTTAAAGAAGAAGCATGCTTGGCTTCC--- - -a -s mr.mrrefChr3 124277 169 + 181019 AATCATAAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTTACTTTGACCACTCACAAATTGTAGGTATACATTATGCTTGGCTTAGCTTTGGGATTTTTAGAGCCAACTTGTGGTTGGACCAGTAGAATTGTAGTATAGAACATAATTAGAATAACCAAGTTCTCATATCGGTTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574348 167 + 636262 AATTATAAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTTACTTTGACCACTCACAAATTGTAGGTATACCTTATTCTTGGCTGAGCTTTGGGATTTTTAGGGCCAACTTGTGGTTGGATCAGTAGAATCGTAGTATAGAGCATAATTAGAATAACCAAGTTCTCATATCGCTTG-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 49950 156 - 647215 AGTCATGAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTCACTTTGACCAT-------------GTATTCATTATGCTTGGCTTAGCTTTGAGATTTTTAGAGGCAACTTGTGGTTGAACCAGTAAAATTGTAATTTAGAACATGATTAGACTAACCATGTTCTCATATGGGTTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 124446 118 + 181019 TGACTCATTTGGAGGATACCAGATTAAAGGGATGGTGAAAATCTCTACCATTAATATTTTGGTAGTGTCTCTAAGACCTCATTAGTGATCTTATGCACTACTTGTTTGTTAGGAATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574515 85 + 636262 ---------------------------------GGGGTAAATCCCTACCATTAATATTTTGGTTGTGTCTCTAAGACCTCATTGGTGATCTTATGCACCACTTGTTTGTTAGAAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 50109 116 - 647215 TGACTCATTTGGAGGATACCAGATTAAAGGGATGGTGATAATCTCTACCATT--ATTTTCAGTAATGTCTCTAAGACCTCATTAGTGATCTTATGCACTACTGGTTTGTTGGGAATCT - -a -s mr.mrrefChr3 124564 14 + 181019 CCATGAGTGTGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574600 14 + 636262 CCAAGAGTGTGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 50231 14 - 647215 ACATGAGGGTGAAA - -a -s mr.mrrefChr3 124578 168 + 181019 TAAATGTGAGTTTGGAGGCAGTGTTGGATCTTCAAGCAGTTAGACACAAAAGTTGTTATAGGTATGGCACTACACGCCTGGATGTATTAAATATCTGTGAAGAATTAACTGGTTGCCATGCCTGAGTTACATTATTTTGTAACGAGGCTGTCACCATTTCAAGCTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574614 168 + 636262 TAAGTGTGAATTTGGAGGCAGTGTTGAATCTTTACACAGTTAGACACAAAAGTTGTTATAGGCATGGCACTACACGCCTGGATGTATTAAATATCAGTGAAGAATTAACTGGTTGCCATGCCTGAGTTACATCATTTTGTAACGGGGCTGTCACCATTTCAAGCTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 50272 167 - 647215 TTAATGTGAGTTCGGAGGCAGTGTTGGATATTCAAGCAGTTAGACAC-AAAGGTGTTATAGGTATGGCATTACACGCCTGGATGTACTAAATATCTGTGAAGAATTAATTGTTTGCCATGCCCAAGTTACATTATTTTGTAACGAGGCTGTCACCATCTCAAGCTCCA - -a -s mr.mrrefChr3 124746 73 + 181019 CTTCAGTCAATTGCATGATTGACTGACTGTCTTAGTATTACAATGATAGATTTAGAATCTCAAGGAATATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574782 73 + 636262 CTTCAGTCAATTGCATGATTGACTGACTGTCTTAGCATTACAATGATAGATTAAGAATCTCAAGGAATATAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 50440 73 - 647215 CTTCAGGCAATTGCATGATTGACTGACTGTCTGAGTATTACAATGATAGGTTTAGAATGTCAGGGAATATAGC - -a -s mr.mrrefChr3 124819 528 + 181019 TCTGAAATAATGTAGCATTGGTTTCAATTGTAATTATAAAATGTAGTGTAGCATTGGATGCAAATATAGTTGTAAGAGTTCAGTTATCACGTGGGTTTGTCAAGCACATCCAATGTCCTATCAACAATCCCCAAGACTTTGTGTGTACCATGGCACATAATTAGATCTGGCTCCCTGAATAGGGCAATACCTTAACACTCTACATCCTGTAGGCCATCATCAAACATGAAGTCAATAATACCTACTGTGGAAGGAGGACCTGACCAGTGAATCCTACAGTGCTAGTCCAGACTTTGGCCTGGTGAGTACAAATGAATGCCTGTCACCCCACCTTTTCCAATCTGGCTACTAGAATCCAAGGTGAACCATTGAACCCAAATTCTTGCTAACACCTCAGAGCTTGCAACCTGCTGAAAGATTAAAAAATGGGGACCCCCTGAGGAAAATTACTCCACATACAAAGCACTGTGCTGCTGAGATTATTTCTCCCTTCTGGGGCCATAATAGATTTCTATCCCAAGATAATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574855 527 + 636262 TCTGAAATAATGTAGCATTGGTTTCAATTGTAATTGTAAAATGTAGTGTGG-ATCGGATGCAAATATAGTTGTAAGAGTTCAGGTATCACGTGGGTTGGTCAAGCACATCCAATGTCCTATCAACAATCCTCAAGACTGTGTGTGTACCATGGCACATAATTTGATCTGGCCCCCTGAATAGGACAATACCTTAACACTCTACATCCTGTAGGCCATGAACAAACGTGAAGTCAATAATTCCCGCTTTGGAAGGAGGACCTGACCAGTGAATCCTACAGTGCTAGTCCAGACCGTGGCCTGGTGAGTACCAATGAATGCCTGCCACCTCACCTTTACCAATCTGACTGCTAGAATCCAAGGTGAACCATTGAACACAACTCCTTCCTAACACCTCAGAGCTTGTAACCTGCTGAAGGATTAAAAAATGGGGGCCCCCCAAGGAAAATTACTCCACATACAAAGCACTGTGCTGCTGAGATTATTTCTCCCTTCTGGGGCCATGATAGATTTCTATCCCAAGATAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 50584 515 - 647215 TTTGGAGTAATGTAGCATTGGGTTCAATTATAATTATAAAATGTAGTGTAGCATTGGATTCAAATATAGTTGTAGCAGTTCAGTTATCACATGGATTTGTCAGGCACATCCAA-GACTTATCAGCAATACCCAAGACTTCATGTGTACCATGGCACATCTTTACATCTGGCTCTGTGAATTGGGCAATA-CTCAACACTCTACTTGCTGTGGGTCATCATCAAACATGAAGTCAATAATACCTACTGTACAAGGAGGACCTGACCAGTGAGTCTTACAGAGCTAGTCCACACTTTGGCATGGTGAGTAGAAATAAATGCGTGTCACCCCATCTTTTCCAATCAGGCTACTA-----------GGACCATTGAAGCCAAATTCTTGCTAAAACCTCAGTGCCTGCAACTGGCTGAAAGTTTAAAAAATGGGGACCGCCTGAGGAAAGTTAATTCACATTCAAAGCACTGTGCTGCTAAGATTATTGCTCCTTTCTGGAGCCACAATAGATCTCTATCCCAAGGTTATCT - -a -s mr.mrrefChr3 125347 467 + 181019 AATCCCGAGATAAGATTGTACTGCCAAgATTACTCCCTCCTCCCCGCTGTGTCTAACATCTCAGCACAGATGCAAAGTTTATTCACTAATCCCCATGTGATCCTGACCTGATAGTCTTAACACTAGGCCTCTAAGAGCTGCATTGTgtctgagttgcaaattgaaaaccccaaaactggtactcaccaaactaGGCTGCGCCCACAAAAGTGAACAAGCGTGAATGGGCATCCTAGcTGATGATCTCGGACTATAGCAGTTGTGCCCCAATCTGTATACCATCCAAATGACCTAAGTGGAAGAGTAgTGTGGAATCCACTCTTGCTGGTTCCTCTGCCCATATCATGGACTATATCTTTGCTGCCATCATATCATGTCACACTCTATTTGTCAAGAAAGGGTAGAATGACACAATCTCTGCAGCCTGAAACAATTATTGTACTTTCTTTCATCCCCAATCAACTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 575383 467 + 636262 AATCCCGAGATAAGATTGTACTGCCAAGATTGCTCCCTCCTCCCCGCTGTGTCTAACATCTCAGCACAGATGCAAAGTTTATGCACTAATCCCCATGTGATCCTGACCTGATAGTCTTAACACTAGGCCTCTAAGAACTGCATTGTGTCTGAGTTGCAAATTGAAAACCCCAAAACTGGTACTCACCAAACTAGGCTGCACCCACAAAGGTGAACAAGCGTGAATGGGCATCCTAGCTGATGATCTCGGACTATAGCAGTTGTGCCCCAATCTCTATACGATCCAAATGAACTAAGTGGAAGGGTAGTGTGTGATCCACTCCTGCTGGTTCCTCTGCCCAGATCATGGACTATATATTTGCTGCCATCATATCATGTCACACTCTATTTGACAAGAAAGGGTAGAATGACACAATCTCTGCAGCCTGAAACAATTATTGTACTTTCATTCATCCCCAATCAACTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 51099 416 - 647215 ATCCCCAAGATAAGATTGTACTGCCAA-CTTACTCCCTCCTCCCCGCTGCGTCTAATATCTCAGCACAGATGGAAAGTTTATTCACTAATCCCCATGTGATCCTGACCTGATAATCTTAACACTAGGCTTCTAAGAGCTGCATTGT-----------------------------------------------GGCTGTGCCCACAAAAGTGAACAAGCTTGAATTGGCATCCTAG-TGATAATGTCGGGCTATATCAGTTGTGCCTAAATCTGTATCCCATCCATATGACTTAAGTGGAAGAGTA-TGTGGAATCCCTTCTTGCTGGTTCCTCTGCCCATAGCATGGACTATATCTTTGTTACCATCAAATCATGTCACACTCCATTTGTCAAGATTGGGTAGAATGACACAATCTCTGCTGCCTGAAACAATTATTGTACTTTCTTTCAT-CCCAATCAACTAAT - -a -s mr.mrrefChr3 125814 356 + 181019 CAAAGAGTGGTGCCACCCCACTTATGGCAAATTTTTGTCCCAGTTTCGAACTCACTACATGCTACTATAATAAGTACAGAGGTATTCACTTGTTCTCATAAGCTTCCATTTTGTGAACCCCACAGAGAAGGATCAGGAAACACACAGTTTTTACCTGACCATATTACTCAGCCCCAGTGGGTCTGGGAAGGTGTTGATAACAGCCTTGAGATTGACCCGACTTTAAATGCATTTTGTTGGCTCACAAGTTACTGACATGCACTACAGGCCCTGAATGTTAAATAGACAAGTTTTTAGCATGGTGCTTGTGGACGACAATGAAGCATTACCTCAGTTTCTTAAACACGCTCATCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 575880 355 + 636262 CAAAGAGTGGTGCCACCCGGCTTATGGCAAATTTTTGTCCCAGTTTCGAACTCACTACATGCTACTATAATAAGTACAGAGGTATTCACTTGTTCTCATAAGCTTCCATTTTGTGAACCCCACAGAGAAGGATCAGGAAACACACGGTTTTTACCTGACCATATTACTCAGCCTCAATGGGTCTGGGAAGGTGTTGAGAACAGCCTTAAGATTGA-CTGACTTTAGATGCATTTTCTTGGCTCACAAGTTAGCGACATGCACTACAGGCCCTGAATCTTAAAAAGACAAGTTTTTAGAATGGTGCTTGCGGATGACAATGAAGCATTACCTCAGTTTCTTAGACACGCTCATCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 51515 318 - 647215 CAAAGAGTGGTGCCGCCCCATGTACAGCAAATTTTTGTCCCAGTTTCAAATTCACGTCAAGCTGCTATAATAAGTACAGTGGTATTCACTTGTT--------------------------------------TCAGGAAACATACAGTTATTACCTCGCCTCATTACTCAGTCCCAGTGGGTCTGGGACGGTGTTGATAAGAGCCTTGAGATTGACCCAACTTTAAATTCATTTTGCTGGCTCACAAATCACTGACATGCACTACGGGCCCTGAATGTTAAATAGACAAATTTTTGGCATGGTGCTCGTGGACCACAATGATGCATTAACTCAATTACTTAAACACACTCCTCATG - -a -s mr.mrrefChr3 126170 64 + 181019 GGGTTGCTAGGTGCAGGGGTCTTATGTATAATAGGTAGTATATCGGAATGGAGATACAGTGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576235 64 + 636262 GGGTTGCTAGGTGCAGGGGTCATATGTATAATAGGAAGTATAACAGAATGGAGATACAGTGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 51853 64 - 647215 GGGTTGCTAGGTGCAGGGATCTTATGTATAATAGTTAGTATATCGGAATGGACATACAGAGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 126234 189 + 181019 GCCAGGTGAGAGTCACTAGTTGCTTGTCAAATTATGACTGGAGTTGCAGGGTGAGCAGGATATTCAGAGTCTCTCAAGCCACCTCAGCCATTCTCCCACAGATTGGACTGCATAGTCTCAGTTCCCTACACCACATCTGTTCTGGGATCTTGGAAGGCATCATAATGGCTGGAATCTATTGCAGTGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576299 187 + 636262 GCCAGGTGAGAGTC-CTAGTTGCTTGTCAAATTATGACTGTTGTTGCG-GGTGAGCAGGATATTCAGAGTCTCTGAAGCCACCTCAGCCATTCTCCCACAGATTGGATTGCATAGTCTCAGTTCCCTACACCACATCTGTTCTGGGATCTTGGGAGGCATCATAATGACTGGAATCTATTGCAGTGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 51924 188 - 647215 GCCAGGTGAGAGTCAATAGTTGCTTGTCAGACTATGACTGGAGTTGCAGGGTGTGCAGAATACTCGGAGTTTGACAAGCCACTTCAGCCATTCTGCCACAGATTGGACTGTATATTCCCAGTTCCTTACACCAAATCTGTTCTGGGAT-TTGGAAGACATCATAATGGCTGGAATGTATTGTAGTGAGC - -a -s mr.mrrefChr3 126423 72 + 181019 ACTCTACCCAAATGGCGAACCGCTCCACTAAGGGCAATGGGTTAAACTAATGCTTAACAGGGCTAACGTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576486 72 + 636262 ACTCTACCCAAATCGTGAATCGCTCCACTAAGGACAATGGGTTAAACTAATGCTTAACAGGGCTAATGTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 52113 72 - 647215 ACCATACCCAAATGGCGAACCGCTCCACTAAGGGCAATGTGATAAACTAATGTGTAACAGGGCTAACATCTA - -a -s mr.mrrefChr3 126495 4 + 181019 AGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576558 4 + 636262 AGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 52250 4 - 647215 AGTG - -a -s mr.mrrefChr3 126499 57 + 181019 GCACATAATTGTTGGGAAGGTAGTTTGTGAGATTTAATAAGGAATGTGTTCCATAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576562 57 + 636262 GCACATAATTGTTGGGAAGGTAGTTTGTGAGATTTAATAAGGAACATGTTCCATAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 52256 51 - 647215 GCACATAACTGTTGGGAAGGTAGTTTGTGTAACTCAATAAGGAATGTCTTC------ - -a -s mr.mrrefChr3 126556 38 + 181019 ACCAATCTGACTGTACATAGCCCAGATATCCCAACAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576621 38 + 636262 ACCAATCTGACCATACATAGTCCAGATATCCCAACAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 52467 22 - 647215 --CTATCTAACTGCACATAGCCCA-------------- - -a -s mr.mrrefChr3 126594 96 + 181019 AAAAAAAAAAAGAAGTTTGCTGTCCCATTTAGTGAGCAGCAATATGAGGGTATCTGGAGGTGCCAAGTCCCTTTTTGATACTATGACAGGCTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576665 96 + 636262 AAAAAAAAAAAGAAGTTTGTTGTCTCGTTTAGTGAGCAACAATATTAGGGTATCTGGAGGTGCCAAGTCTCTTTTTGATACTATGACAGGCTTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 52489 96 - 647215 AAAAAGAAAAAGAAGCGTACTATCCCATCTGTTGAGAAGTTATATGAAGGTATCTGGAGGTGCCAAGACCCTTTTTGATACTATGACAGGCTTGAT - -a -s mr.mrrefChr3 126690 34 + 181019 GTGCACATTTGCACTGGACATTCAATCTGAAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576783 34 + 636262 GTGCACATTTGGACTGGACATTCAATCTGAGGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 52585 34 - 647215 GTGCACTTTTGCATTGGACATTCAATCTGAAGAC - -a -s mr.mrrefChr3 126724 122 + 181019 TCCAAACAAACAGTAAGAAGTGGGATAGCTAGCACGCTATGGAAGAAGGAAGGTATGGAATCATAAAGGAGGGGATTATTAGTTGCAAATCAAGAAGGCTGATAGCACCTGCTAGGGACTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576831 122 + 636262 TCCAAACAAACAGTAAGGGGTGGGATAGCTAGCATGCTATGGAAGAAGGAAGGTATGGAATCATAAAGGATGGGATTTTTAGCTGCAAATCAACAAGGCTGATAGCACCTGCTAGGGACTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 52619 122 - 647215 TTCAGACAAACAGTAAGAAGAGGATTAGCTAGCACTCTATGGAAGGGCGAAGGTATGGAATCATAAAGGAGCAGTTTATTAGTTGCAAATGGAGAAGGCTGATAGCAACTACTAGGGATTAT - -a -s mr.mrrefChr3 126846 220 + 181019 ACCACCATTAGGACACTTTTCATTGTGCAGGAGCGAAGGCTTCAAGGTAGGTGGTGTGCCTAGGTACAGTGGTGTACTGTCTCTGAAATGATGAATTTTATTTACAGTCCCTGATATGGCAGACTTTCAGGAGAATGGGATTTATTCCCCATCTATTGAGTATAGAAGTCCCAAGTATTCACATTGCTTGATATGCTCTGATTCCAATTGGTAGTGGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576953 219 + 636262 ACCACCATTAGGACACTTTTCATTGTGCAGCAGCGAAGGCTTCAAGGTAGGTGGTGTGCCTAGGTACAGTGGTGTACTGCCTCTGAAATGATGAATTTTATTTACAGTCCCTGATACGGCAGACTTTCGGGAGAATGGTATTTACTCTCCATCTATTGAGTATAGAAGTCCCAAGTATTCACATGGCTGGATATGCTCGAGTT-CAATTGGTAGTGGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 52764 213 - 647215 ACCACCATTAGGATACTTTTCATTGTGCAGGAACGAAGGCTTCAAGGTAGGTGGTGGGCGTAGGTACA-TGGTGTACTGTCGCTGAAATCAT---TTTTATTTATGTTCCCTGAAATGGAGGACTTTTAGGGGAATGGGATTTATTCCCCATTTATTGAGTATAGAAGTCCCAAGTATTCACATTGCTTGATATG---TGATTCCAATTGGGAGTGGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 127066 220 + 181019 CTAATTCCCATACTCCTCAAACTTCTAGCCACAAAGACTTGTGGTTATCTACCGATGCAAATAGTCCGACACTGGCCAAGGACAAAACTCACGTATTATAGAAAAGTGGCAAATTCTCAGTGTACATCCTCAGTGAAGTATTGTTGATACTACTAGATTATAGATATTGAAGGTAGCAAAAAACGTGTGGCCAATATCAATAATTACCACTATCCAGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577184 212 + 636262 CTAATTCCCACACTCCTCAAACTTCTAGCCATAAAGACTTGGGGTTATCTACCGATTCAAGTAGTCTGACACTTGCCAAGGACAAAACTCACGTATTGTAGAAAGGTGGCAAATTCTCAG--------CTGAGTGAAGTATTGTTGATAATACCAGATTATAGATATTGAAGGCAGCAAAAAACATGTGGCCAATATGAATAATTACCGCCATCCAGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 52977 220 - 647215 ATAGTTCCCATACTCCTCAAACTTTTAACCACAGAGACTTGTGGTTATCTACCAATGCAAATAGTCCCACACTGTCCAAGGACAAACCTCATGTATTACAGAGAAGTAGCAAATTCTCAGTGTACATCCTCAGTGAAGTACTGCTGATACTACTAAATTATCCATATGGAAGGTAGTAAAAAACGTGTGGCCAATATCATTAATTACCAATATCCGGCTG - -a -s mr.mrrefChr3 127286 115 + 181019 TCCTACGGATAGTCTGAAGCAACACATCAACTAAGGTCCCCAGAGTAAAATAAGGCTGTAGTGAATTTAAACTGAGTTAGCATACTGAATCCTAGGTCCTAGGTAACTGCAAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577396 115 + 636262 TCCAACGGATAGTCTGAAGCAACACATCAACTAAGGTCCCCAGAATAAAATAAGGCTGTAGTCAATTTAAACTGAGCTAGCATACTGAATCCTAGGTCCTAGGTAACCGCAAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 53199 113 - 647215 TCCTACAGAGACTCTGAAGCAACACATCAAC--AGGTCCCCAGAGTAAAATACGGCTGCAGTGAATTTAAAGTGAGTGAGCATTCTGAATCCTAGATCCTAGGTAACTACAAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 127401 6 + 181019 GGACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577518 6 + 636262 GGACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 53312 6 - 647215 GGACAA - -a -s mr.mrrefChr3 127407 285 + 181019 TATTAGATAGATGAAAAGTCCATAGAAGGAGAGGATCATATTCAATGTAGTATATAAGGTGTATAATGTGTGGCTGGATCTGTGAGGCTTTAGTACCCAACCACATCTTAATATTTTTTCAAATGGAACTTCTCTAGTGTAGGTATACTGTTAATACAACGCAGCCAATCTGGCCCACTTTGCCTTCTTCTTAACGTGTAACAACCAGTATAGATGGTTAGCACTGTTTCCTCTGATGGGTTACTTGCACAACTGTTTATCTGATGGGTTACTTGTACAAACCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577525 285 + 636262 TATTAGATCGATGAAAAGTCCATAGAAGGAGAGGATCATAATCAATGTAGTATATAAGGTGTATAATGTGTAACTGGATCTGTGAGGCTTTAGTACCCAACCACATCTTAATATTTTTTCAAATGGAACTTCTATAGTGTAGGTATACCGTTAATAAAACGGAACCAATCTGGCCCACTTTGCCTTCTTCTTAAGGTGTAACAACCAGTATAGATTGTCAATACCTTTTCCTCTGATGGGTTACTTGCACAACTGTTTATCTGATGGGTTACTTGTACAAACCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 53318 283 - 647215 TATTAGATAGAGGAACAGTCCATAAACGGAGAGGACCGTATTCAATGTGGTATATAAGGTATATAATGAGTGGCTGGATCTGTGAGACTTTAGTACCCAACCACATCTTAATACTGTTTCAAATGGAACTTCCCTAGTGTAGGGATACTGTTAATACAAACCAGCCAATCTGGCCCGGTTTGTCTTCTACTTAACGTGTAACAACTAGTATGAATGGTTAGCACTGTTTCCTCTGATGTGTTACTTGCACAACTGT--ACCTGATGGGTTACCTGTACAAATCCA - -a -s mr.mrrefChr3 127692 123 + 181019 GTGCTTTGTGTTCTGAAATGTCCAAACAGTGTAGGAGTGCAACAGTGGGACGTAGGCACTGCAGTTGTAAATGGCCTGGGTTTAAATTTTCAATTGTATATAGTAACTACATGCAGGCTCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577813 121 + 636262 GTGCTTTGTGTTCTGAAATGTCCAAACAGTGTAGGAGTGCAACAGTGGGATGTAGGCACTGCAGTTGTA--TGGCCTGGGTTCAAATTTCCAATTGGATATAGTAACTACAGGCAGGCTCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 53601 121 - 647215 GTGGTTTGTATTCGGAAATGGCCAAACAGTGTAGAA-TGCAACAGTTGG-CGTAGGCACTGTATTTGTAAATGGTCTGGGTTTAAATTATCAATTGTATATGGTAACTACGTGCAGGCGCATT - -a -s mr.mrrefChr3 127815 71 + 181019 TAAAGGCGAAACAGGTGCCTGTTCTTGATCACTTGACGGTGTGTGAGATGGACAGGGGATCTACAATGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577935 71 + 636262 TAAAGGCGAAACAGGTGCCTGTTCTTGATCACTTGACGGTGTGTGAGATGGACAGGGGATCTACAATGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 53722 71 - 647215 TAAGAGCAGGACAGGTGCTTGTCCTTGGTCACTTGACAGTGTGTGAGTTGGACAGGGGATCTACAATTCAC - -a -s mr.mrrefChr3 127886 76 + 181019 GGGGAACTACACATGACAAACCTCTTTCGAGGTGGACATACTCTCTCTGTGATCGCTTGACATCTCGTCAAGTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578008 76 + 636262 GGGGAACTACACATGACAAACCTCTTTCGAGGTGGACATACTCTCTCTGTGATCGCTTGACATCTCGTCAAGTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 53793 76 - 647215 GGGGAACTACTCATGACAAACCTTGTGTGAGGTGGACAGACTCTTTCTGTGATCACTTGACACCTCATCAAGCGGG - -a -s mr.mrrefChr3 127962 41 + 181019 CAGGCTCATGGCCAAGCACTAACTGGGTGTACATGGCCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578084 41 + 636262 CAGGCTCATGGCCAAGCACTAACTGGGTGTACATGGCCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 53870 41 - 647215 CAGGCTCATGGCCGCGCACTAATTGTGTGTACATGGCCACA - -a -s mr.mrrefChr3 128003 8 + 181019 GAGGCGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578125 8 + 636262 GAGGCGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 53913 8 - 647215 GGGGAGGC - -a -s mr.mrrefChr3 128011 12 + 181019 TCTGAGTCAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578134 12 + 636262 TCTGAGTCAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 53921 12 - 647215 TCATAGCCAAGC - -a -s mr.mrrefChr3 128023 74 + 181019 CTAACCATGTGTACATGGCCGCATTTGCCTTTTATTGGAGCTATGCACGTGGCATGGTGTGAAATATAAACGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578146 74 + 636262 CTAACCATGTGTACATGGCCGCATTTGCCTTTTATTGGAGCTATGCACGTGGCATGGTGTGAAATATAAACGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 53934 74 - 647215 CTAACCGTGTGCGCATGGCCACATTTGCCTGTTATTAGAGCTATGCACATGGCATTGAGTGAAATCTAAACAAT - -a -s mr.mrrefChr3 128097 331 + 181019 ATTTGGGGTTATTGCATCTGACAACTTTGTACTGTTCTTAGACTCATGCTCTAGAGAGGCACTAGCAATCTAGGGTCCTGTACACTGATGAGAGAGTTGTGGCTTCATGTATATATACTGCTTGTAATTGTCTTCATGTTTATGGTGAAGTGTTGACTGCATTGCTGTTTGGCCAGCTAGTGCAGTTCTCACCACAGAGAAACCAAGGAATTTAGACCAGTCTGCGTCAAGCACCCTTTAAGGAAAAAGCAGGTGTTAGTAATGTACAGAACACCCTTTAACTAAGGTGGTTGAGGTTACCAGAAATTCCCTAATTGTAAGGGGTATATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578227 330 + 636262 ATTTGGCGTT-TAGCATCTGACAACTTTGTACTGTTCTTAGACTCATGCTCTAGAGAGGCACTAGCAATCTTGGGTCCTGCTCACTGATGATAGAGTTGTGGCTTCATGTATATATACTGCTTGTAATTGTCTTCATGTTTATGGTGAAGTGTTGACTCCATTGCTGCTTGGCCAGCTAGTGCAGTTCTCACTACACAGAAACCAGGGAATTTAGACCAGTCCGCGTCAAGCACCCTTTAAGAAAAAATCAGGTGTTATTAATGTACAGAACACCCTTTAACTAAGGTGGTTGAGGTTACCAGAAATTCCCTAATTGTAAGGGGTATATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 54008 314 - 647215 ATTTGGGGTTATTGCATCTGACAACCTTCTGCTCTTCTCATACTCATCCTCTAGAGAGGCACTAGCATCCTAGGGTCTTGTACAGTGATGAGAGAGTTGTGGCTTCATGTATATATACTGACTGTAATCGTCTCCATTTCTATGGCAAAGTGTTGATTGTATTGCTGTTTGGCCAACTAATGCAGTTCTCACCATGGAGAAACCAAGGAATTTAGGCCAGACTGCATTAAGCACCCTTTAAGGAGAAAGCAGGTGTTAGTAATGTAAAG-----------------GTGATCAAGGTTCCCAGAAATTCCCTAATTGTAAGGGGCATATGT - -a -s mr.mrrefChr3 128428 226 + 181019 GACTAGGCTCACATCTCTTCTACATTATCCAAGGCCCTGCACTGCATTGCTGAACTGTTAACCATTGTGCCAACTTATTCACCCAGTAAATCTACCTGCACCTTGTTACTGTTATGACCCTTCAGGATGTCCTTTGGAAGCCTCAATTGTCTTAGGATAAGCTAGTATGGTCATACAATCCTCATTAGCACCATGTCTGACAGGTAGCCCTTTTATGATGCATGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578558 218 + 636262 GACTAGGCTCACACCTCTTCTACATTATCCAAGGCCCTGCACTGCATGGCTGAACTGTTAACCATTCTGCCAACTTATTCACCCAGTAAATCTACCTGCACCTTGTTACTGTTATGACCCTTCAGGATGTCCTTTGGAAGCCTCAATTGTCTTGGGATTGGCTAGTATGGTCATAC--------TTAGCACCATATCTGGCAGGTGGCCCTTTTGTGATGCATGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 54322 221 - 647215 GACTAGGCTCACATATCTTCTACATTATCCAAGGCCCTGCACTGCATTGCTGTACTGTTAACCATTGTGCCAACTTATTTACCCAGTAAATCTACCTGCACCTTGTTACTGTTATGACCCTTCAGGATTTCCTTTGGAAGCCTCCATTGTCTTAGGACAAGCCAGTACGATCATACAATCCTCATTAGTACCATGCCTAACAGGTAA-----TTATGATGCATGCA - -a -s mr.mrrefChr3 128654 65 + 181019 TTGTCTAAGCTAGTGGATGTTTCTGCAATTGGAGAAGTCATCGTGGGTTGGTGGCAGCTTAACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578776 65 + 636262 TTGTCTAAGCTAGTGGATGTTTCTGCAATTGGAGAAGTTATCGTGGGTTGGTGGCAGCTTAACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 54545 65 - 647215 GTGTCTAAGCTAGTGGATGTTTCTGCAATTGGAGAAGTCATCATGGGTTGGTGGCAGCTTAACAA - -a -s mr.mrrefChr3 128719 159 + 181019 CTTAAAAATGTTTGGCCATAATTTTATAGGAGTGCTCTCAAAGCTATGCAACACAAATTAAGACACTAACTCAGTTTCCCTGTGATCATGGGTGGCTGTTCCCTCTCTCTTACATGAGGTATATAGAACCAGCATGACACCAACCTCCTATTCACAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578843 159 + 636262 CTTAAAAATGTCTGGCCATAATTTTATAGGAGTCCTCTCAAAGCTATGCAACACAAATTAAGACACTAACTCAGTTTCCCTGTGATCATGGGTGGCTGTTCCCTCTCTCTTACATGAGGCATATGGAATCAGCACAACACCAACCTCCTATTCACAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 54610 156 - 647215 CTTAAAAATATTTGGTCATAACTT-ATAGGAGTGCTCTGAAAGATATGCAGCACAAATTAAGAC--TAACTCAGTTTGCCTGTGATCATAGGTGACTGTTCCCTCTCTCTTAGATGAGGTATATAGAACCAGCATGACAATAAGCTCCTATTCACAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 128878 102 + 181019 GCAATGAGACCTGGTATTTGATCATTTGTATGCTTGTTAGACAACTTTGGTTTCCAGAGGTGCTACTATAGGCGTTAAGTGTCAATTCACTGTGGGGTGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579029 102 + 636262 GCAATGAGACCTGGTATTTGATCATTTGTATGCTTGTTAGACAACTTTGGTTTCCAGAGGTGCTACTATAGGCGTTAAGTGTCAATTCACTGTGGGGTGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 54766 32 - 647215 ACAATGAGACCTGGTATTTGATCATCTGTATT---------------------------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr3 128980 173 + 181019 TTCTGTAAGAGGTATGTTGTTCAGAATGTAGTATGGATCCTTGGCGGTGTAAATCACCTGGGGGCTCATTCTCATGGTGACTCAACTGGATGCAATATATAGGCTCCCATAATAGATCCCTCATAATACAGATTGGATTGGTCCAAGCAACCTCTCTGGTATCCATAAGGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579132 169 + 636262 TTCTGTAAGAGGTATGTTGTTCAGAATGTAGTATGGATCCTTGGCGGTGTAAATCACCTGGGGGCTCATTCTCATGGTGACTCATCTGGATGCATTATATAGGCTCCCACACTAGATGCCTCA----ACAGATTGGATTGGTCCAAGCAACCTATCTGGTATCTATAAGGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 54798 132 - 647215 -------------------------------------TCCTTGGTGGTATATGTCACATGTGGGCTCATTCTCATGGTGAGTCAACCGGATCCAATGTATAGGCTCCTATAATAAATCCCTCATAATACAGATTGGATTGGTCCAAGCAAC-TCTCTGGTACCCATAAGG--- - -a -s mr.mrrefChr3 129153 155 + 181019 TCTATGGCCCAGTTTATGCAATGTTTCAGCCATCGTCACTTAGCATTTTCATTCAAAACCATGTGTTAAATCAGCTTACTAAGCTGTTATGCAAAGATAATAACATTCAATAAGTGGGTCTTAAATTATAATCTCATGTTCCCCAAACCACAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579332 155 + 636262 TCTATGGCCCAGTTTATGCAATGTTTCAGCCATCGTCACTTAGCATTTTCATTCAAAACCATGTGTTAAATCAGCTTACTAAGCTGTTATGCAAAGATACTAACATTCAATAAGTGGGTCATAAATTATAATCTCATGTTCCCCCAACTACAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 54930 72 - 647215 -----------------------------------------------------------------------------------CTGTTATGCAAGGATAATAACCCTCAATTCGTGGGTCTTAAATTATAATCTCATGTTCCCCAAACCACAACA - -a -s mr.mrrefChr3 129308 119 + 181019 TTCTTAGCCAGCCATTGGTAACGATTTAGCAATACACTTCAAGGATTATAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACAGATGCATGGTAACATTTCAGCTTTACAGTGGTTGGAGTGACAGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579487 119 + 636262 TTCTTAGTCAGCCATTGGTAACGATTTAGCAATACACTTCAAGGATTATAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACAGATGCATGGTAACATTTCAGCTTTACAATGGTTGGAGTGACGGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 55006 119 - 647215 TTCCTATCCAGCCATTGGTAACGATCTATCAATAAACTTCAAAGATTTCAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACCGACGCATGGTAACAGTTCAGCTTTACAGTGGTTGAAGTGACAGTTC - -a -s mr.mrrefChr3 129427 76 + 181019 CCATCTTCTGCATGTTGACTACTCCCATACTAGAGAGTCCAGGGGAGATGATGACAGAGTGGCTAGAATTGTGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579609 76 + 636262 CCATCTTCTCCATGTTGACTACTCCTATACCAGGGAGTCCAGGGGAGTTGATGCCAGAGTGGCTAGAATTGTGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 55125 76 - 647215 CCATATTCTGCATGTTGACTACTCCCATATTAGAGAGTCCAGGCAAGATGGTGACAGGGAGGATAGCATTGTAGGG - -a -s mr.mrrefChr3 129503 128 + 181019 CACTATGGGTTGTTTTCGAGCCATAGTACTTTGTCTTTATAAGTTTTTTGGTGTAAACAAGAGAGTGTCAGATTGTGGGTACAGCGTAAAAGATAGTGCCCTGCTGGTTTATACTTGATGATAGAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579686 128 + 636262 CACTATGGGTTGTTTTCAAGCCATAGTATTTTGTTTTTATAAGTTTTTTGGTGTAAACAAAAGAGTGTCAGACTGTGGGTACAGCGGAAAACATGGTGCCCTGCTGGTTTATACTTGATGATAGAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 55201 124 - 647215 CACTATGGGTCGTTTTTGAGCAATAGCACTTTGTCTTAATAACTTTTTTGGTGTAAACCAGAGAGTGTCCAATTGTGGGTACAGGGTAAAAGATAGTGCC----TGGTTTATACTTGATGCCCACCCA - -a -s mr.mrrefChr3 129631 107 + 181019 CCCTTTTATATCTAATCCTGTATTACTTCAGCCTGTTGAAAACCTAGCCCATTTATTAAGTTATGGTTCTGTCCATTGTATTATGGGGAACTACTTTTCTAATGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579814 107 + 636262 CCCTTTTATATCTAATCCTGTATTACTTCAGCCTGATAAAAACCTAGCCTGTTTGTTAAGTTATGGTTCTGTCCATTGCATTGTGGGGAACTATTTTTCTAATGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 55326 107 - 647215 CCCATTTATATCCAATCTAGTATTACCTCATCCTATTGAAAACCTAGCCCATTTATTCAGTTATGGTCCTGTCCATTGTGTGATGGGGAAATACTTTTCTAGTGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 129738 27 + 181019 GTGACTAACGTTTTTTTTATTGACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579921 27 + 636262 GTGACTAACGTTTCTTTTATTGACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 55483 27 - 647215 ATGACTATTGTTTTTTATATTGACACA - -a -s mr.mrrefChr3 129765 285 + 181019 CATCTTGAGATTGACCTTTTACACATGGATAAACTTAGTAATTAGCAGTTACACACCTAATATCCAGGCTGATCTAAGTTCTCTGTGGAATCTTCACTTAGTTAGGTGAATAACAATGACACAGGTAGAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTGTTCTAGTCTGGAGATCAGCTACCATGTTACCTCACTCATACCAACCCAAGAGTTGAGGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGTGGACCAAGGTATAGCTAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579948 280 + 636262 CATCTTGAGATTCACCTTTTACACATGGATAACTT----AATTAGCAGTTACACACCTAATATCCAGGCAGATCTAAATTCT-GGTGGAATCTTCACTCAGTTAGGTGAATAACATTGACACAGGTCAAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTATTCTAGTCTGGGGATCAGCTACCATGCTACCTGACTCATACCAACCCAAGAGTTGAAGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGTGGACCAAGGTATAGCCAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 55515 285 - 647215 TATCTTGAGATTGCCCTTTTACACTTGGATAAACTTAGTAATTAGCAGTTACATGCCTAATATCCAGGCTGATCTAAGTTCTCTATAGAATCATCACTTGGTTGGGTGAATAACTATGACCTAGGTAGAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTGTTCTAGTCTGGAGATCAGCTACCATGTTACCTCACTCATACCAACCCAAGAGTTGAGGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGCGGACCAAGGTATAGGTAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 130050 98 + 181019 AATTTTAGAAATTCATTATGCCCTTTCGGCTTTTTATATCTGCTACTATTTCCCGAGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580228 98 + 636262 AATTTTAGAAATTCATTATGCCCTTTCGGCATTTTACATCTGCTACTATTTCCCGAGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 55804 95 - 647215 AATTATAGAAATTCATCATGTGCTTTCAGCTTTGTATACCTGCTA---TTTCCCGGGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 130148 433 + 181019 CCAAACCGCCTGCATCAAGTTTGGTTAGAGCCTGAGGGTATGGATTCAGAGCTTATATATCCTCAAGGGCTATCTATGACACTGCCCTCTGATTTACAGAAGAAGATGATTACATGTAACCGGGGCCTCGAGAAAGCCAAAGTCATTCAGCCAGGTAAGTTCCAGAAGAACATTTGATACAACAACAGCGGTAGTTTAATAGGATTATGTTTAGCTCAACAACAAAAACACAGAGACACTTGTAGCCAATAACCCCCCCTTTGTTAAACTGTTAAACTCACATGTCGTGCAGAAGCTAAGATGGAGTATTATTTTTATTGCCCAAGATGGAGTGTAATGGTGCAATAGGCCTGGCATACCATAAGCTCCCCCTGCCTGGTACCTAGACTTCACTTGTTACAATGAGGCTAGAAGGAACACAGACTTCCTGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580329 433 + 636262 CCAAACCGCCTGCATCAAGTTTGGTTAGAGCCTGGAGGTATGGACTCAGAGCTTATATATCCTCAAGGGCTATCTATGACACTGCCCTCTGATTTACAAAAGAAGATGATTACCTGTAACCGGGGCCTCGAGAAAGCCAAAGTCATTCAGCCAGGTAAATTCCAGAAGAACATTTGATACAACAACAGCGATAGTCTAATAGGATTATGTTTAGCTCAACAACAAAAACACAGAGATACTTGTAGCCAATAACCCCCCCTTTGTTAAACTGTTAAACTCACATGTTGTGCAGAAGCTAAGATGGAGTATTGTTTTTATTGCCCAAGATGGAGTGTAATGGGGCAATAGGCCTGGCGTACCATGAGCTCCCCCTGCCTGGTACCTAGACTTCAGGTGCTACAATGAGGCTAGAAGGACCACAGACTTCCTGTCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 55899 420 - 647215 CCAAACCGGCTGCATCAAGTTTGGTTAGAGCCTGAGGGGATGGATTCAGAACTTATATATCCTCAAGGGCTATCTATGACACTGCCATCTGATTTGCAGAAGAAGATGATTACATGTAACCGGGGCCTCGAGAAAGCCAAGGTCATTCAGCCAGGTAAGTATCAGAAGAACAATTGATACAACAACAGTGGTAGTTTAATAGGATTATGTTTAGCTCTATAACAAAAACACAGAGACACTTGTAGCCAATAACCCCGCCATTGTTTAA-------------ACCGCGTGCAGAAGCTAAGATGGAGTATTATTTTTATTGCCCAAGATGGAGTGTAATGGTGCAATAGGCCTGGCATACCATAAGCTCCCCCTGCCTGGTACCTGGACTTTACTTGTTACTATGAGGCTACAAGGAACACAGACTTCCTGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 130581 32 + 181019 GGTGTACTGTCATAGAAATTGTATAAGACTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580763 32 + 636262 GGTGTACTGTCATAGATATCGTATAAGACTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 56319 32 - 647215 GGTGTACTGTCATAGAAAGTGTTTAAGTCTCT - -a -s mr.mrrefChr3 130613 63 + 181019 CATCCAAATCTTAAAACACCATATAATGCTGTCTAAATTGGTGAGAATAAAGGATAACACCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580795 60 + 636262 CATCCAAATCTTAAAACAC---ATAATGCTGTCTAAATTGGTGAGAATAAAGGATAACACCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 56352 63 - 647215 CATCCAAATCTTTAAACACCATATAGTGCCGTCTGACTAGGTGAGAATACAGGATAGCACAAC - -a -s mr.mrrefChr3 130676 97 + 181019 ACTCCTCTGTGCAACCTACTTGAGGTTCAATTTATCTTCATGTTCAAAGTATAATTCAAAAAAAGTGAGTTGTGAGGAGCTTGCATGCAAATGTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580855 97 + 636262 ACTCCTTTGTGCAACCTACTTGAGGTTCAATTTATCTTCATGTTCAAAGTATAATTCAACAAAAGCGAGTTGTGAGGAGCCTGCATGCAAATGTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 56418 97 - 647215 CCTCCTCTGTGCAACATACTTTAGGTTCAATTGATCTTCATGTTGAAGGTATAATTCAAAAAAAGTGAGTTGTGAGAAGCTTGCCCACAAATGTTAA - -a -s mr.mrrefChr3 130773 404 + 181019 AAAATACTTTGCCTTACCTAGATTAATCCTTCCCTAATGTCTTTGCTCTTGAAGAATGAGGGTCTGCGGTCCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCAACCCCTCTTTAGAGGCACATCTGTTGCAACGACTTTTCTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACTACCAGCTACAAGGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTGGTTAACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCTGCTGTGCTGTTTTATAAACATTGGTACAGGTCTGTCTATAACAAGTCAACTGAGTCCTTTGTACTCAGATCAGTTCTGGCTTGACATTGTGGTTGTGTTGATTTTCTGTATAGTAATGATACCTGCTCTTAAAATAACCTTCTGCAATCCCCATTCTAAGCAAGCAGGAATAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580952 402 + 636262 AAAATACTTTGCCTTACATAGATTAATCCTTCCCTAATGTCTCTGCTCTTGAAGATTGAGGGTCTGCGGTTCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCAACCCCTCTTTAGAGGCACATCTGTTGCAGCGACTTTTCTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACTACCAGCTACAAGGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTAGTTGACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCTGCTGTGCTGTTTTATAAACATTGGTACAGGTCTATCTATAACAGGTCAACTCAGTCCTTTGTACTCAGATCAGTTCTGGCTTGACATTGTGGTTGTGTTGATTTTCTGTCTAGTAATGACACCTGCT--GAAAATAAACTTCTGCAATCCCCATTTTAAGCAAGCAGGAATGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 56518 403 - 647215 AAAATACTTTCCTTTACCTAGATTAATCCTTCCTTAATGCCTTTGCTCTTGTAGAAGGAGGGTCTGCCGTCCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCATCCCCTCTTTAGAGGCCCAACTGTTGCAACGACTATTTTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACAACGAGCTACAAAGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTGATTAACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCGGCTGTCCAGTTTTATGAATGTCGGTACAGGTCCGTCTGTAACAAGTCAACTGAGTCATT-GTACTCAGTTCAGCTTTGGCTTGAAATTGTGGCTCTATTGATTTTCTGTATAGCAATGATGCCTGCTCTTAAAATCACCTTCTGCAATCCCCATGCTAAGCAACCAGGAATAGGC - -a -s mr.mrrefChr3 131177 28 + 181019 AACCACCTGGGCCAATCTAGTCCTAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581354 28 + 636262 ACTCACCTGGGCCAGTCTAGTCCTGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 56928 28 - 647215 AACCACCTGGGCCAATTTTGTCCTAAGG - -a -s mr.mrrefChr3 131205 51 + 181019 AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCATAGGAACTATTGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581383 51 + 636262 AAACAAACTACCCAACTGCTCTTATACCATGATCATAGGAACTATCATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 56956 51 - 647215 AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCACTGGAACTATTGTGTG - -a -s mr.mrrefChr3 131256 34 + 181019 TCGTATCTCTGCAGATCTAACTGTTCAGAACCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581439 32 + 636262 TCGCATCTCTGCAGATCTAACTGTT--GAACTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57007 34 - 647215 TCGTAGTTCTACAGATTTAACTGTTCAGTACCTG - -a -s mr.mrrefChr3 131290 130 + 181019 CATTACATTCCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCTCCAGGCTTGAATGATCGGGTGGTAGCGAAGGATTGTTTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581471 120 + 636262 CATTACATTCCCTTGCACTCTGTA----------ATCAACCACAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCTGAATAATCCTATATCGTATAGCTCCAGGCTTGAATCATTGGGTGGCAGCGAAGGATTGTTTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57044 130 - 647215 TATTACGTTTCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATTGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCGCCAGCCTTAAATGATCTGGTGGTGACTAAGGATTGTTTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 131420 157 + 181019 CTGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGGCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCTAGTGCCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGCGTAAGCTGGAAACATTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581637 157 + 636262 CCGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGCCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCCAGTGCCACTGAGGGGGTATCTTAACAGTATGCGTAAGCTGAAAACATTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 57174 155 - 647215 CTGAATTT-ACCACAACACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAATTGCCAATGCATGGCAGCCCC-TGCTAACGGTAGGGGGGAATGAATGCACAGGTACCTATTGTCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGTGGAAGCTGGAAACATTGG - -a -s mr.mrrefChr3 131577 51 + 181019 AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTATTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581794 51 + 636262 AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTGTTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57330 51 - 647215 AATCCCAATTCTAACACCACTGGATTAATTGGGTAAGTTTTAATGGGGAAG - -a -s mr.mrrefChr3 131628 58 + 181019 ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581845 58 + 636262 ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 57382 57 - 647215 GGCTTCAAGACGTAATTCTGACTTCAT-GAGAAGAGATTATAGTCAACCTTCCCACTT - -a -s mr.mrrefChr3 131686 104 + 181019 ACATAGAACTATTTCACACCCTCATGTACTTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACCCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581903 104 + 636262 ACATGGAATTATTTTACACCCTCATGTACCTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACGCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 57443 104 - 647215 ACATAGAACTATTTCACAAAATAATATACTTTGGATTCATGGAGGTATACATGACCCTCTTTAATACTGAGGGCACAAAAGCTTGTGAAAATTAGTACCACCCC - -a -s mr.mrrefChr3 131790 231 + 181019 CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCAAGGCCGTGTATGCGCTCAGTAATACCTAACAGCTACCCTTATCCCAAATAAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582007 230 + 636262 CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTGACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCTAGGCCGTGTATGCGCTCCGCA-TACCTAACAGCTATCCTTATCCCCAATAAGGCAACCAGTCCCCATTGAGAGCACACCGGATACTCTGGAAAGCTCTCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 57548 228 - 647215 CTGAGAAGAGAGGTCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTACAGCCAGGGCACAACCAGGGTAGTGGAGGGAAATGCAAGGCCATGTATG---TCAGTAATGCCTAAAAGTTACCCTTAGCCGAAATGAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAAGCCCCCAAGAGACATCATGCAGGAAGATCAGCCCTTCTAAGGCCATATGAAAAT - -a -s mr.mrrefChr3 132021 679 + 181019 CAATCCTTTGTTGAATATGCACACTAACTGGCTCTTTGATTGTTGTCCCAGCATCTGGTATTATTACACTGAGGAGACTATAGTATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCCAGCTGTTCAGGTGGCCAAGTGTCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCAATGCCAGTTTACGGGTTAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATTAGCCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTGATTGATGGTGTTCCCACACTGGGCACCAGTGAACCCTATTGCATGTTTGCAAGCTGGGTTGAATTCCGTTTGTCACTGCACCCTGATAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCGTCAGGAGTGAACATATTATTCTGAATGACATTTCAGTAAATTTATATCTATTTTGTGAAGAATAAAGACATTTTTCTATCTGATAGTGTTCTGCATTGCACTCTCGACTTCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCAGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAAGAAGGAATATCAGTGTTAAGGTCTATTGAATTTTTCAGTTCAAGGTGGAACAAATTGGTTCCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGTAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAAATCTCTATAAAGAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582238 679 + 636262 CAATGCTTTGTTGAATATGTACACTAACTGGCTCTTTGATTGTTGTGCCAGTGTCTGGTATTAATACACTGAGGAGACTATAGTATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCTAGCTGTTCAGGTGGCCAAGTGCCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCAATGCCAGTTTACGGGTTAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATCAGCCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTCATTGATGGGGTTCCCGCACTGGGCACCAGTGAACCCTATTACATGTTTGCAAGCTGGGTTGAATTCCGTTTGTCGCTGCATCCTGATAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCGTCAGGAGTGAACATATTATTCTGAACGACATTTCAGTGAATTGATATTTATTTTGTGAAGAATAAAGGCATTTCTCTATCTGATAGTGTTCTGCATTGCATTCTCGACTCCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCGGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAGGATGGAATATCAGTGCTAAGGTCTATTGAATTTTTCAGTTCAAGGTGGAATAAATTGGTTCCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGTAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAAATCTCTATAAAATGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57776 676 - 647215 CAATCCTTCGTTGAATATGCAGACCAACTTGCTCTCTGATTGTCATCCCAGCATCTGGTATTATTACACTGAGGAGACTATAGCATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCCAGCTGTTCAGA---CCAAGTGTCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCATTGCCAGTTTACGGGTGAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATTAGTCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTGATTGATGGTGTTCCCACACTGGGCGCCAGTGAACCCTATTGCATGTTCACTAGCTGGGTTGAATTCTGTTTGTCACTGCACCCTGACAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCATCAAGAATGAACATATTAGTCTAAATGACATTGCTGTAAATTTATACCTATTTTGTGAAGAATACAGACATTTTTCTAACAGATGGTGTTCTGCATTGCACTATCAACTTCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCAGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAAGAAGGGATATCAGTGTTAAGATCTATTGAATTTTTTAGTTCAAGGTGGAACAAATTGGTACCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGCAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAATTTTCTATAAAGAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 132700 9 + 181019 GTACCCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582920 9 + 636262 GTACCCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 58452 9 - 647215 GTACCATGG - -a -s mr.mrrefChr3 132709 16 + 181019 AGTCATGCTTGTATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582929 16 + 636262 AGTCATGCTTGTATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 58462 16 - 647215 AGTAATGCTTGTATTA - -a -s mr.mrrefChr3 132725 205 + 181019 TTCACCTGTACAGTCCCTCAACCAATATCTGGCTAAAGGAGTAAACCTCCCCTCTTTTCAAGCAGCATACCATACTAATGTGATGGCTCTCTTGTCTCTTTAGCAACAAGGGCTGCAAGTGATCCCCTAGATCTTTCATGGCTATGTACAAGGGTTATTTTTACACCTACTTAGTCACCTTCATGGCAGCTTCTAACCTCTAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582946 205 + 636262 TTCACCCGTACAGTCCCTCAACCAATATCTGGCTAAAGGAGTAAACCTCCCCTCTTTTCAAACAGCATACCGTACTAATGTGATGGCTCTCTTGCCTCTTTAGCAACAAGGGCTGCAAGTGACTCCCTAGATCTTTCATGGCTATGGACAAGGGTTATTTTTACCCCTACTTACTCACCTTCATGGCAGCTTCCAACCTCTAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 58478 195 - 647215 TTCACCTGTACAGCCCCTCACCCAATATCTGGT----------AACCCGCCCTCTTTTCAAGCAGCATACCATACTAATGTGATGGCTTTCTTGTCTCTTTATCAACAAGGGCTACCAGTGATCTCCTAGAGCTTTCGCGGCTATCTACAAGGGGCATTTTAACACCTACTTAGTCACCTTCATGACAGTTTCTAACCTGTACTT - -a -s mr.mrrefChr3 132930 60 + 181019 TTTGTACCTCTTTGCAAAGTTAGTCCCTACCAATTGACAACTCTTAGACTACAGAACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583152 60 + 636262 TTTGTACCTCTTTGCAAAGTTAGTCCCTACAAATTGACGACTCTTAGACTACAGAACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 58673 60 - 647215 TTTGTACCTCTTTGCAAGGTTAGTGCCAACCAATGGGCAACCCTTAGACCACAGAACCTT - -a -s mr.mrrefChr3 132990 33 + 181019 GTCCTTTACACCCATGTCACCTTTAGTTGAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583212 33 + 636262 GTCCTTTACACCCATGTCACCTGTAGTTGAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 58735 33 - 647215 GTCCTTTACACCCATGTAGCATTTAGTTGAATC - -a -s mr.mrrefChr3 133023 74 + 181019 TGGCAATGAAGTCACAAAGGGGGGGCAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGAGGGGTAGCAGCGACTCAGCCCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583246 74 + 636262 TGGCAATGAAGTCACCAAGGGGGGGCAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGAGGGGTAGCAGCGACTCCGCCCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 58768 69 - 647215 -----ATGAAGTCACAAAGGGTGGGTAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGGGGGGGGGTAGGGACTCAGCCCCTG - -a -s mr.mrrefChr3 133097 21 + 181019 AAATTAACTATTACAGCCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583320 21 + 636262 AAATTAACTGTTACAGCTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 58838 21 - 647215 AAACTAACTATTACTGCCTCC - -a -s mr.mrrefChr3 133118 70 + 181019 TTGGGCCTTGACTGTGTGACACAATGGCCCACCCTGTTAGCAGATCTTACCAACTACCCTCTTGATTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583341 70 + 636262 TTGGGCCTTGACTGTGTGACACAATGGCCCACTCTGTTAGCAGATCATACCAACTACCCTCTTGATTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 58860 61 - 647215 TTGGGCCTTGACTGTGTGACACAATGGCCCACCCTGTTAGCAGATCTTACCTGCTACCCTC--------- - -a -s mr.mrrefChr3 133188 288 + 181019 AAAACCTAGAAATTAAGGGAATTGCAGATGTTAGTCTTTAGAATGGACCAGGAAGTGATATGTAAACTGCCCCTCCCCATGCAGGAATGACCACACCTACCCTGTCTTATCCAGCAATAAGAAGTCTGTGGCACACAGTTTCTGAAAGGGGAATGGAAATTTCCACTCCTCGACACCCTGATCATGAAGGTTGCACCACCCATCTCTTAAAGGATCCCATAATCCAATAGAATTGGTCAGTTATACTAGTCAGGTTTAAGAATGGGACCCTGTGCCAGGTGCAGCGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583413 282 + 636262 AAAACCTAGAAATTAAGGGAATTGCAGATGTTAGTCTTTAGAATGGACCAGGAAGTGATATGTAAACTGCCCCTCCCCATGCAGGAAC--CCGCACCTACCATGTCTTATCCAGCAATAGGAAGTCTGTGGCACACAGTTTCTGAAGGGGGAATGGAAATTTCCACTCCTCGACACCCCGATCATGAAGGTTGCACCACCCATCTCCTAAAGGATCCCATAATCCAATAGAGTTGGTCAGTTATTCTAGTCAGGTTTAAGAATGGGACCCTGTGC----TGCAGTGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 58921 264 - 647215 ------------------------CAGTTGCTAGTCTTTAGAATGAACCAGGAAGTGATATGTAAACTGCCCCTCCCCATACAGGAGTGACCAAACCTACCCTGGCTTATCCAACAATAAGAAGTCTGTGGCACACAGTTTCTAAAAGGGGAATGGAAATTTCCACTCCTCTACACCCTGATCATGAAGGTTGCACCACCTATCTCTTAAAGTAGCCCAAACTTCAATAGAATCAGTCTGTTATACTAGTCAGGTTTAAGAATGGGACCCTGTGCCAGGTGCAGCAGC - -a -s mr.mrrefChr3 133476 24 + 181019 GGTACTAATACGGTCAAAGTTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583745 24 + 636262 GGTACCAATACGGTCAAAGTTCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 59185 6 - 647215 TATCCT------------------ - -a -s mr.mrrefChr3 133500 61 + 181019 TCAGGTGCAGTGACTACCCTTCCTGTCTCTCATCTTGTCTCATCCAAGTTTACTACATGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583772 61 + 636262 TCAGGTGCAGTGACTACCCTTCCTGTCTCTCATCTTGTCTCATCCAAGTTTACTACATGTC - -a -s mr.mrrefChr3 133561 5 + 181019 TGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583844 5 + 636262 TGCAC - -a -s mr.mrrefChr3 133566 461 + 181019 TTCCACATTAGAGATTTATGTATGGTGCCTCAATAAACATTTTCACATTGTTACTCCAAACTGCGCTGGTCAGACCACAGTATTCTAGCTCACCAATTCCAGACAATTCCACTAAAGACTTTATAAGCCACCACTAGACCATATCAGCTACTCACCTCCCTTTCAGAGAGACAGTTTGTAAAACCTGACTAGTGAACTGGTTAAGCCAATTCCAGTGTAGTGGTCCTCAAATGCCCAATTCTGATTATCGCTAATATAGGTATAAACTAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATTACCTATAAGTGCACCTACATGGAGTAAATGTAGTTGGAGGTGAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTTTCAATCATCAGTAAATTTTAGGAGATGTGTATTCACCAAACCCTATTACATATGCATGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATTTAGGTACAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583857 460 + 636262 TTCCACATTTGAGATTTATGTATGGTGCCTCAATAAACATTTTCATGTTGTTACTCCAAACTGAGCTGGTCAGGCCACAGTATTCTAGCTCACCACTTCCAGACATTTCCATTAAAGACTTTATAAGCCACCACTAGACTATATCAGCTACTCACCCCCCTTTCAGAGAGACGGTTTGTAAAACCTGACTAGTGAACTAGTTAAGCCAATTC-AGTGTAGTGGGCCTCAAATACCCAATTCTGATTATCACTAATATAGATATAAACTAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATGACATATGAGTGCACCTATATGGAGCAAATGCAGTTAGAGGTGAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTATCAATCATCAGCAAATTGTGGGAGATGCGTACTCACAAAACCCTCTTACATATGCCTGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATTTAGGCACAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 59191 443 - 647215 -TCCACACCACAGATTTC---------CCTCAGTAAACATTTTCACATTGTTACTTCAAACTGCACTGGTCAGACCATAGCATTCTTGCTCACCAATTTCAGACAATTCCACTAAAGACTTTATCATCCACCACTAGACCATATCAGCTGCTCACCTCCCTTTCAGAGAGCCA-TGTGCAAATCCTGACTAGTGGACTGGTTAAGCCAATTCCAGTGGAGAGGTGCTCAAATGC-------TGGTTATTGCTAATATAGGTATAAACCAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATTACCCATAAGTGCACCTACATGGAGTAAATGTATTTGGAGGTAAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTTTCAATCATCAGTGAACTTCAGGGGAGGTGTATTCACCAACCACTATTACATATGCAGGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATCTAGGTGTGTA - -a -s mr.mrrefChr3 134027 14 + 181019 TTCACCACAAGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 584317 14 + 636262 TTCACCACAAGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 59754 14 - 647215 TTCACTACAAGAGT - -a -s mr.mrrefChr3 134041 360 + 181019 TGCTATTTGCATCAGTAACTAGATGACATATGAAATGAGGTAAAAGGAATATCCAATATGTGTTTTCACTGGTGGCAACTTCAAAGAAGCCAAGCATCCTGGTTTTGATGGCATGCTCTGATGTTTTCTGGGCTGGGGACTTGGATGCTCAGATGGTTCTTATGATGTACCCAGTAATTTGACAAAGCCTCCGAACCCTGTTAACTTTTATAATCCCTCACCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCCAATCAGATAAGAGAAAAAATATGGACAGCATTGTCTAACTAAGAAAGAAAAGAATACTGAAACAGTTTCATTGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 584431 360 + 636262 TGCTATATGCATCAGTAACTAGATGACATATGAAATAAGGTAAAAGGAATATCCAATATGTGTTTTCAGTGGTGGCAACTTCAAAGCAGCCAAGCGTCCTGGTTTTGATGGCATGCTCTGATGTTTTCTGGGCTGGGAACTTGGATGCTTGGATGGTTCTTATGGTGTACCTAGTAATTTGACAAAGCCTCCGAACCTTGATAACTTTTATAGTCCCTTGCCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCCAATCAGATGAGAGAAAAAATATTGACAGCATTGTCTAACTAAGAAAGAAAAGAACACTGAACCAGTTTCATTGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 59768 354 - 647215 TGCTGTTTGCATAAGTAACTAGATGACATATGAAATGAGATAAAAG-AATACCCAATGTGTGTTTTCACTGGTAGTAACTACAGAGAAGCCAGGCATCCCGGTCTTGATGGGGTGCTTCAATCTTTTTTGGGCTGGGGACTTGGATGCTCAGATGGTACTTATGATGTACTCAGTAATTTG-----GCTTTCAAACCCTGTTAAGTTTTATAATCCCACACCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCAAGTCAGATAAGAGAAAAAATATGGACAGCATTGTATAACTAAGAAAGAGAAGCATACTGAAACAGTGTCCTAGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA - -a -s mr.mrrefChr3 134401 354 + 181019 GCTGTGATAGGTATCTGTAAAAGAGCCCAGACATTTGTCTATCACCTCTGACAATATTTGAGGTCTGCCATATGCAATACCCGCCCACTGATATTAACTTCTGAATTGATTAAACAATGATTAACTAAAGTGATCGAGCTTACCATTGATTAGCTCAGGTATATCGGGTAGAGGATTGTTTGGTGCAAGTATCTACAGGCTGACCAATTTGGGGTAATTGTAATCAATGGGACAGGTGGCTCCATTAACTAATGCATGGTTCACACATCACATGTAAAAAAAAGAAGAATGCCATTTCACCTAGAGTACTACCTGAGTGATGGGTGATTGATTGTTACAAGTATTAATAGATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 584794 347 + 636262 GCTGTGATGGGTATCTGTAAAAGAGCCCAGACATTTGTCTATCACCTCTGACAATATTCGAGGTCTGCCATATGCAATACCCGCCCACTGATATTAACTTCTGAATTAATTAAAGAATCATTAACTAAAGTGATCGAGCCTAGCATTGATTAGCCCAGGTATATTGGGTAGAGGATTGTTTGGTGCAAGCATCTACAGGCTGACCAATTTGGGGTAATTGTAAACAATGGGAGAGGTGGCTCCGTTAAGTAATGTATGTTTCACACATCACATCTAAAAAAAAGAACAGT-------CACCTAAAGTACTACCTGAGTGATGGGTGATTGGTTGTTACAAGTATTAATAGATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 60122 351 - 647215 GCTTTGACAGGTATCTGCAAAAGAGCTCAAACATTTGTCTATCACCTCTGACAAT---TGGGGTCTGCCATATGTAATACCAGCCCACTGATATTAACTTCTGAATTGATCATACAAAGATTCACTAAACTGAGTGAGCTTACCATTGATTAGCTCACGTATATCGGGTGTAGGATTGTTGGGTGCAAATATCTACAGGCTGACCAATATGGGGTAATTGCAATCAGGGGGACAGGTGGCTCCATTAACTAATGCATGGTTCAGACATCACATGTAAAAAAAAGAAGAATGCCATTTCACCTAGAGTACTACCTGAGTGATGGGTGATTGATTGTTACAAGTATTAATAGATGA - -a -s mr.mrrefChr3 134755 294 + 181019 CTTCTAGTGGCAAGCTATGAGGCTTATTTCAACCCTTAATCCAGGCAGAGATGCGCTTGTTTGATCTACTGACTATTGACACTGTTAAAATCAGCATGATTGGGCGACCGATGAAACACTGCAGATGTGGTCTCTAATAATGTACAAGGCTCTATAGCAGTCAGATATTACTCAATTCCTCAGGCTGCACAGTTCACCTACAACTGATGTCACACATGCACACACCATGAAAGCTCTGGGGTATATAAGTAGGTAAGGAGGAATGCAATCCCTGATAGTGAGAGCCTAGATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585141 293 + 636262 CTTCTAGTGGCAGGCTATGAGGCTGATTTCAACCCTTAATCCAGGCAGAGATGCGCTTGTTTGATCTACTGACTATTGACACTGTTAAAATCAGCATGATTGAGCGACCGATGAACCACTGCAGATGTGG-CTCTAATAATGTACAAGGCTCTATAACAGTCAGATGTTACTCAATTCCTCAGGCTGCACAGTTCACCTACAACTGATGTCACACATACGCACACCACGAAAGCTCTGGGGTATATAAGTAGGTAAGCAGGAATGCAATCCCTGATAGTGAGAGCCTAAATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 60474 294 - 647215 CTTGTAGTGGCAAGCTATGAGGCTTTTTTCAACCTTTAATCCAGGCTCAAATGCACTTGTTTAATCTACTGAGTATTGGCACTGTTAAAAACAGCATGACTGGGCAACCAATGAAACACTGCAGAGGTGGTCTCTTATAATGTACAAGGCTCTATAGTAGTTGGATATCGCTTGATTCCTCATGGTTCCCAGTTCATCTACAACTGATGTCACACATGCAAACACCATGAAAGTTCTGGGGTATATAACTAGGTTAGGAGGAATACAATCCCTGATAGTGAGAGCCTAGATCAA - -a -s mr.mrrefChr3 135049 92 + 181019 CTAGCACAAGGGCACCCAGTACCATAATATTTGGGTCTCTTAGGTAGTTATGACAACCCCCTAAACTTTTTGCAAATATGTGGGTCTTCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585434 91 + 636262 CTAGCACAAGGGCACCCAGTACCATAATATTTGGTTCTCTTAGGTAGTTATGACAACTCC-TAAACTTTTTGCAAATATGTGCGTCTTCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 60769 91 - 647215 CTAGCACAAGGG-CTCCAGTACCATAATACTTGGGTCTCTTAGGTAGCTATGACAACCCCCTAAACTTTTCACAAATATGTGGGTCTCCATG - -a -s mr.mrrefChr3 135141 34 + 181019 TTTGGTCTAACATCTTATCATGCCGATATGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585530 34 + 636262 TCTGGTCTAGCATCTTATCATGCCGATACCAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 60860 34 - 647215 TTTGGTCTAACATCCTAACATGCCCATGTGGATT - -a -s mr.mrrefChr3 135175 154 + 181019 CCATTACTCCAGGGGTATCTTATATCTGACTTATTTGTGAGTCTGCTAATTTCCGTTGGCTCTGGAGATTTGCGTAAGTAATATCTCTCATATGTTCACTATAGGCCACAGTTATAACTGTAGCCCCTACATCAGATGGCCCCTATCTGTTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585564 140 + 636262 CCATTACTCCAGGGGTATCTTATATCTGACTTATTTGTGAGTCTGCTAATTTCCGTTG--------------CATAAGTAATATCTCTCATATGTTCACTATAGGCCACAGTTATAACTGTAGCCCCTACATCAGATGGCCCCTATCTGTTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 60910 154 - 647215 CCAGTACTCCAGGGGTATCCTGTATCTGATTTATTTGTGAGTTTGCTAACTTCTGTTGGCTCTGGAGATTTGCGTAAGTAATATCTCTCATAAGTTCACTATAGACTATAATGATAACGGTAGCCCCTACATCAGATTGCCCCTATCTGTTGCA - -a -s mr.mrrefChr3 135329 17 + 181019 CCTCTTTGTCAGACCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585705 17 + 636262 CCTCTTTGTCAGACCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 61064 17 - 647215 CCTCTTTGTCAGATCGG - -a -s mr.mrrefChr3 135346 64 + 181019 TTGTCTCACTATTGGATCACCGGCATCAATTGCACCAAGGATATGGATTGCATGCCTGTTTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585722 64 + 636262 TTGTCTCACTATTGGATCACCGGCATCAATTGCACCAAGGATATGGATTGCATGCCTGTTTGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 61082 64 - 647215 TTGTCTCACTGTCAGACCACCAGCATCAATTGCAATAGGGGTTTAGAGTGCATGCCTGTTTGTC - -a -s mr.mrrefChr3 135410 69 + 181019 TCTGAGGTATGCCAATTTAACCTAGTCATATGTGTTGCACTAGCAAGCTTCAATTTTAGTACCCTCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585789 69 + 636262 TCTGAGGTATGCCAATTTAACCTAGTCATATGTGTTGCACTAGCAAGCTTCAATTTTAGTACCCTCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 61146 69 - 647215 TCTGAGGTATGCCAAGTTAACCCAGTCATATGTGTTTCTTTAGCAGACTTTGACTTCAGTATCTTCGTC - -a -s mr.mrrefChr3 135479 26 + 181019 TTAAAATCACCCTCTTGTAAGCACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585870 26 + 636262 TTAAAATCACCCTCTTGTAAGCACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 61215 26 - 647215 TTAAAATCACCCTCTTGTAAGCCCAT - -a -s mr.mrrefChr3 135505 8 + 181019 TATCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585896 8 + 636262 TATCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 61254 8 - 647215 TACCAATG - -a -s mr.mrrefChr3 135513 98 + 181019 AGCTGTCCCTCCTTAAAGTGATATGTAAAGCTGGTGGTATCAATCAAAGGGTGAACTACCATCAATTAAGGTATCATCATTATACATTCCATCATGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585904 98 + 636262 AGCTGTCCCTCCTTAAAGTGATATGTAAAGCTGGTGGTATCAATCAAAGGGTGAACTACCATCAATTAAGGTATCATCATTATACATTCCATCATGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 61265 98 - 647215 AGCTTTCCCTTCTAAGAGTAACATGTGAATCTAGTAGCATCAATTAAAGGGAGAACTATCATCAATTAAGGTATCATCATAATACATTCCATCATGTA - -a -s mr.mrrefChr3 135611 2 + 181019 AT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586002 2 + 636262 AT -s simRat_chr6.simRat.chr6 61374 2 - 647215 AT - -a -s mr.mrrefChr3 135613 12 + 181019 AGAGATTTGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586005 12 + 636262 AGAGATTTGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 61376 12 - 647215 AGAGATTTACTA - -a -s mr.mrrefChr3 135625 28 + 181019 AGACAGGTTAAATTGCAGGACTAGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586017 28 + 636262 AGACAGGTTAAATTGCAGGACTAGTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 61397 28 - 647215 AGACACGCTAAATCGCAGGACTAGTATG - -a -s mr.mrrefChr3 135653 12 + 181019 GTCggaacacag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586045 12 + 636262 GTCggaacacag -s simRat_chr6.simRat.chr6 61449 12 - 647215 GTAGGAACACAG - -a -s mr.mrrefChr3 135665 6 + 181019 aacaca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586059 6 + 636262 aacaca -s simRat_chr6.simRat.chr6 61461 6 - 647215 GACTCA - -a -s mr.mrrefChr3 135671 22 + 181019 acccatcaaatacccacaaact -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586065 22 + 636262 acccatcaaatacccacaaact -s simRat_chr6.simRat.chr6 61473 22 - 647215 ATTTACTCAAAATCAGCAAGGT - -a -s mr.mrrefChr3 135693 16 + 181019 aagattcaaggaacat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586087 16 + 636262 aagattcaaggaacat -s simRat_chr6.simRat.chr6 61509 16 - 647215 AGGACTCAAGGTGCAT - -a -s mr.mrrefChr3 135709 59 + 181019 tcgtaaaatcagtaaggggaagccactaacaattcaaagattactgactgaacattctg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586103 59 + 636262 tcgtaaaatcagtaaggggaagccactaacaattcaaagattactgactgaacattctg -s simRat_chr6.simRat.chr6 61527 59 - 647215 tcttaaaatcagtaaggggaagctgctaacaattcagagattactgtctgaacattctg - -a -s mr.mrrefChr3 135768 32 + 181019 tcttagtcgttcaccggcaaacataattgagc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586162 32 + 636262 tcttagtcgttcaccggcaaacataattgagc -s simRat_chr6.simRat.chr6 61599 32 - 647215 tcttgatctttcaccagcaaatataattgagc - -a -s mr.mrrefChr3 135800 58 + 181019 accattatcgtgaaatcagtggccttgttcaccacacacagaaagaccactatagatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586197 58 + 636262 accattatcgtgaaatcagtggccttgttcaccacacacagaaagaccactatagatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 61631 58 - 647215 actattattgtgaaaccagtggtcttgttcaccacacctaaaaagaccattgttgaat - -a -s mr.mrrefChr3 135858 19 + 181019 tggcctggagtgagaaaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586258 19 + 636262 tggcctggagtgagaaaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 61689 19 - 647215 ctgcctggaatgagaaaag - -a -s mr.mrrefChr3 135877 171 + 181019 gaacccatggcagaatcctttcttagtgaaagaaatcaagggagtgcagtcatatccttgaactttaagtgttactatcaggtaactattgtgaaagcaacactatacttgcatcaaaagatcagtacaatacaccatggaattagaagtgatggagctaccacatttaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586277 171 + 636262 gaacccatggcagaatcctttcttagtgaaagaaatcaagggagtgcagtcatatccttgaactttaagtgttactatcaggtaactattgtgaaagcaacactatacttgcatcaaaagatcagtacaatacaccatggaattagaagtgatggagctaccacatttaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 61709 171 - 647215 gaacccaaggcagaaccttttcttattgaaaaaaatcaggggagtgcgatcatatcctcgaactttaagtgttactcttgagtaacagtttggaaagcaacactatattagcatcaaaagatcattacaatacaccatgggattagtagtgatggagctaccacacttagg - -a -s mr.mrrefChr3 136048 52 + 181019 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586448 52 + 636262 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat -s simRat_chr6.simRat.chr6 61906 52 - 647215 aaacgcttcatattatgatgagaaattttaacaaggactcattattcaatct - -a -s mr.mrrefChr3 136100 73 + 181019 gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586509 73 + 636262 gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt -s simRat_chr6.simRat.chr6 61958 73 - 647215 gaatcagtttattaccttccaaaaattaaaacttgacatttccccattaccttataccatgattaatacaagc - -a -s mr.mrrefChr3 136173 37 + 181019 tgtaactaatctaaagaattgaggttcggagctacca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586583 37 + 636262 tgtaactaatctaaagaattgaggttcggagctacca -s simRat_chr6.simRat.chr6 62031 37 - 647215 tgttactggtctaatgaattgaggttctcatccccca - -a -s mr.mrrefChr3 136210 44 + 181019 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586628 44 + 636262 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta -s simRat_chr6.simRat.chr6 62068 44 - 647215 aaaagtgttaagggctgagtagattttctgagaaggacctttta - -a -s mr.mrrefChr3 136254 24 + 181019 caatatgtacttagggaattggtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586674 24 + 636262 caatatgtacttagggaattggtt -s simRat_chr6.simRat.chr6 62112 24 - 647215 agatattggaacgggggaatggtt - -a -s mr.mrrefChr3 136278 59 + 181019 atacaaaaaaaccacaaggatagagtggccataacatggacatatgtcttgcagaactc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586869 59 + 636262 atacaaaaaaaccacaaggatagagtggccataacatggacatatgtcttgcagaactc -s simRat_chr6.simRat.chr6 62136 59 - 647215 atacaataccaccacaaggatagtgtgggcataacatgcaaatatgtcttgcaaagccc - -a -s mr.mrrefChr3 136337 63 + 181019 aagataaatgatcaacaaacatgagtgggatgtaaacaagggaaagagcacacttacagtaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586928 63 + 636262 aagataaatgatcaacaaacatgagtgggatgtaaacaagggaaagagcacacttacagtaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 62215 63 - 647215 gagataaatgatcaagaaatatgaatggggtgtaaacaaggtaaagagcatacttagagtaga - -a -s mr.mrrefChr3 136400 25 + 181019 ccaggagtttagcaaataggataga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586992 25 + 636262 ccaggagtttagcaaataggataga -s simRat_chr6.simRat.chr6 62278 25 - 647215 ccatgaggttagtaaataggataga - -a -s mr.mrrefChr3 136425 141 + 181019 acctttgtcacctatttgtccaaaaggggtccagtctctcaggtctcatagcaaactcacccaaatacacaaggagaagcccagtgacataatcaatagacagattggaaccataaacaggctctcactggtaaggggaga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587017 141 + 636262 acctttgtcacctatttgtccaaaaggggtccagtctctcaggtctcatagcaaactcacccaaatacacaaggagaagcccagtgacataatcaatagacagattggaaccataaacaggctctcactggtaaggggaga -s simRat_chr6.simRat.chr6 62310 141 - 647215 accttcgacacctacttgtccaaaaggggcccagtatctaaggtgccacagcaaactcacacagatacgcaaagagaaacccggtaacacgaccaatagatggactgaaaccataaatgggctctcataggcaaggggaga - -a -s mr.mrrefChr3 136566 28 + 181019 cccggtgcaaggaagcaccataggaagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587158 28 + 636262 cccggtgcaaggaagcaccataggaagt -s simRat_chr6.simRat.chr6 62452 28 - 647215 cccgttgcaaggaaccaccataggcagt - -a -s mr.mrrefChr3 136594 21 + 181019 gtgctgaggtttttcaggacC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587186 21 + 636262 gtgctGAGGTTTTTCAGGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 62481 21 - 647215 gcactgaggtttttctgatcC - -a -s mr.mrrefChr3 136615 11 + 181019 CCTCCGTAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587207 11 + 636262 CCTCCGTAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 62504 11 - 647215 TCACAGTAAGC - -a -s mr.mrrefChr3 136626 6 + 181019 GCCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587520 6 + 636262 GCCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 62515 6 - 647215 GCCATA - -a -s mr.mrrefChr3 136632 168 + 181019 GCAGTTATCTATCTCTCAGTCGGCCTGTCAAAGAGGCCTCTGTGGCCACTGCAGTGCTACTCCAATGAGTAACTACAGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGCACAACTTAAACAGGACACTGCATAGCTTGTGATATTAAATGCTTAGCAGAAGGGCACAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587526 168 + 636262 GCAGTTATCTATCTCTCAGTCGGCCTGTCAAAGAGGCCTCTGTGGCCACTGCAGTGCTACTCCAATGAGTAACTACAGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGCACAACTTAAACAGGACACTGCATAGCTTGTGATATTAAATGCTTAGCAGAAGGGCACAATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 62522 168 - 647215 GTGGTTAGCTACTGCTCAGTCAGCCCATCAAAGGGGCATTTGTGGCTACTCTAGTGCTACTCCAATGAGTAACCATGGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGTGCAACTCAAACAGGATACTGCATAGCATGTGATAATAAATGCTTGGCAGCAGGGCACAATAA - -a -s mr.mrrefChr3 136800 6 + 181019 ttagac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587701 6 + 636262 TTAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 62690 6 - 647215 ttagac - -a -s mr.mrrefChr3 136806 26 + 181019 cttttttaatagcattattgctagat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587710 26 + 636262 CTTTTTTAATAGCATTATTGCTAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 62696 26 - 647215 cttttataatcgcattattgctagat - -a -s mr.mrrefChr3 136832 17 + 181019 agtggttaaatccataa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587736 17 + 636262 AGTGGTTAAATCCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 62723 17 - 647215 agtggataaatccatag - -a -s mr.mrrefChr3 136849 13 + 181019 tatggtgatcaca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587753 13 + 636262 TATGGTGATCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 62743 13 - 647215 tgaggggattgaa - -a -s mr.mrrefChr3 136862 160 + 181019 ggagccaggaaacaagactttttctccttgtcacaACCTGGAGGAATCCTAGTTTTATCCCTAATGCTGCACTTGTTTTCACAAATTGGCCTTCTTTTTCTTTCCCAAAGTTGGAAACAAAGCACCCATGCTCTCCTTGATAACGATCAATAGTATACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587766 160 + 636262 GGAGCCAGGAAACAAGACTTTTTCTCCTTGTCACAACCTGGAGGAATCCTAGCTTTATCCCTAATGTTGCACTTGCTTTCACAACTTGGCCTTCTTATTCTTTCCCAAAGTTGGAGACAAAGCACCCATGCTCTCCTTGATAACGATCAATAGTATACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 62765 118 - 647215 gaaaccaggaaacaaagctttctctactagtcacaACCGGGAGGAATCCTAGTTTCATCCCTAATGCTGCACTTGTTTACATAAATTCGCCTTCTTTTTCCTTCCCAAAGTTGGAAAC------------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr3 137022 680 + 181019 TTGGAAAGTGAGGTGTATTGCTAGTATAATCAGAGCACTTTCCACTCCATTTTTGCAATGTATGACCCAAGCATTTACTCTCGCTCATTCATTACAAGTCTTAATCTACTTGTATGATCAAAACCCTGGGATTATGAGTATCAAGAGTAGGTTATGAAACATCACTTCCCATGTGCTTCAACAATATAGATCCACTGCCGTAGCTGCTCTGGCATACGCACAGCTATACTGCACTTGATAAGGACTTTTAGTATGGGATAGATTTGTTGGTAGGGTAGCCATGGTGTGTAAACGTACTGACCTTCCATCAACCACAGGCTTAGAAAACACAGATGATTGACAATATCATAGTACCTCCTAAAAAGCCAAAAACCCCAAACATATTTCAGTCACTATTGACAACCATTTTCCTTTCTATTATATATTCTTGATCATGTGGATTTGTATATTTACAACGCGCTGCACAGCTGTTTAAAAGTTAAAAATTCTTAGAACAAATTTGGAATCAGCAAGTGCTTCATGTGGAGGGATATCAGTTTCATGTATAAGTGAGTTGTATGATCCTCTAGATGGCATATGTTCCATCCCTGGCTGACCAAATCTGTGTCATTCATGGAGTGATCATCCAATAACAGTGCCACTAGCCGTCCTGTAGTCCCTCTTAGATCCATTTGTCTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587928 675 + 636262 TTGGAAAGTGAGGTGTATTGCTAGTATAGTCAGAACATTTTCTACTCTATTTTTGCAATGTGTGACCCAATCATTTACTCTCGCTCATTTATTGCAAGTCTTAATCTACTTGTATGATCAAAACCCTGGGATTATGAGTATCAAGAGTAGGTTATGAAACATCACTTCCCATGTGCTTCAACAATATAGATCCACTGCCGTAGCTGCTCTGGCAGACGCACAGCTATACTGCACTTGATAAGGACTTTTAGTACGGATTAGATTTGTTGGTAGGGTAGCCATGGTGTGTAAAC---CTAACCTTCCATCAGCCACAGGCTTAGAAAACACAAATGATTGACAATATCATAGTACCTTCTACAAAGCCAAGAACCCCAAACGTATTTCAGTCATTGTTGACAACCATTGTTCTTT--ATTATATATTCTTGATCATGTGGACTTGTATATTTACAACGCGCTGCACAGCCGTTTAAAAGTTAAAAATTCTTGGAACAAATGTCGAATCAGCAAGTGCTTCATGTAGAGGGGGAGCAGTTTCATGAATAAATGAGTTGTATGATTCTCTAGATGTCATATGTTCCACCCCTGGCTGACCAAATCTGTGTCATTCCTGTAGTCATCATCAGATAACATTGCCACTAGCCATCCTGAAGTCCCTCTTAAATCCATTTGTCCGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 62883 666 - 647215 --------------GGATTGGTTGCATAATCAGAGCACTTTCCACTCCATTTTTGCAATGCATGATCAAAGCATTTACTCTAGTTCACCCATTACAAGACTTACTTCTCTTGTAAGATCAAAACCTTAGGATTACGAGTATCAAGAGTAGGTTATGAAACACCACTTTCTATATGCTTGAATAGTATAGATCCACTGCTGTAACTACTTTGGCATACGCACAACTATACTGCACTAGATAAGGACTTTTAGTGTGGGATAGATTCGTTGGTAGGGCAGCCATGCTTTGTAATCGTACTGACATTCCACCAAACACAGGCTTAGAAAACACAGATGATTGACAATATCCAAGTACCCCCTAAAAAGCCAAAAACCCCATACATATTTCAGTCACTATTGACAACCATTTTCCTTTCTATTACATGTCCTTGATCATGTGGATTCATATATTTACAATGCGCTGCACAGCTGTTTAAGACTAAAAAATTCTTAGAACAAATTTGGAATCAGCAAGTGCTTCATGTGGAGGGATATCAGTTTCATGTATAAGTGAGTTGTATGGTCCTCTAGATGGCATATGTTCCATCCCTGGCTGGCCAAATATGTGTCATACATGGAGTGATCGTTCAGTAACAGTACCACTAGGTGTCTTGTAGTCCCCCTTAGATCCATTTGTCTGTC - -a -s mr.mrrefChr3 137702 38 + 181019 ATGGAGATAGAAAGATTATAGAAATATCCCCGTTGGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 588735 38 + 636262 ATGGAAATAGAAGGATCATAGAAATATCCCCGTTGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 63549 38 - 647215 AGGGGGATAGAAAGAGTGTAGAAATATCCCTGTCAGGC - -a -s mr.mrrefChr3 137740 157 + 181019 ACTCCTGTAAAGTGTGATATGGATAGTCTTTAAGTGCCTGAAAGATAAAAATATAGAGCATAGCCCAGCTCTTTGAGAGATGGTAATCATGAGGGAGTCATATAGGGTAGTTCTTATAAAATGAAGGGCCTGCCTGTTCTATGCTCTGGTATTGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 588773 156 + 636262 ACTCCTGTAAAGTGTGAT-TGGATAGTCTTTAAGTGCCTGAAAGATAAAAATATAGGACATGGCCTAGCTCTTTGAGAGATGGTGATCATGAGGGAGTCGTATAGAGTAGTTCTTATCAAATGAAGGGCCTGCCTATTCTGTGCTCTGGTATTGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 63597 141 - 647215 ACTCCTGTAAGGTGCGGTATGGATAGTC----------------ATAAAAATATAGAGCATAGCCCAGCTCTTTGAGAGATGGTAATAATGAGGGAGTCATATAGGGTAGTTCTTATAAAACGAAGCACCTGCCCGTTCTATACTCTGGTATTACAA - -a -s mr.mrrefChr3 137897 65 + 181019 ACACGGCATTGAATGCATAATATTGTAATATTTTGTTAGTGAGCCAGTTGTTAACATTCATCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589000 65 + 636262 ACACGGCATTGAATGCATAATATTGTAATATTTTGTTAGTGAGCCTGTTGTTAACATTCATCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 63738 65 - 647215 ACCAGGCATTGAATGTATAATATTGTAATATTTGGTTAGTGAGCCAGTTGTTAACATTCATCCTG - -a -s mr.mrrefChr3 137962 276 + 181019 TGTGCATTTGCATTCTTTGATTTGGGCTGCTGTGCCTTAGGGATATTGAGTGATATTGTGGTAGATAAGACAGTAAAGAATCATAGCTCATTTCCATGTGTGTCTCCTCAAGAGAGACATGTTAATGAAATGTTATTTCTACCACAGATCATTGACTCCAGAGAATACAATGTCTTTATCAGCTGTGCTTCAGCTTGCAAGTGGTACATTTATATGTAGAGGAAACAGAGTGGGGGTAAATGTGAAAAGGTTAGCTCTGTATGGCCATGTAGATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589163 269 + 636262 TGTGCATTTGCATTCTT-GATTTGGGCTGC-----CTTAGGGATATTGAGTGCTATTGCGATAGATAAGACAGTAGAGAATCATAGCTCATTTCCATCTGTCTCTCCTAAAGAGAGACA-GTTAATGAAATGTCCTTTTTACCACAGATCATTGACTCCAGAGAATACAATGACTTTATCAGCAGTGCTTCAGCTTGCAAGTGGTACATTTATATGTAGAGGAAACAGAGTGGGGATAGATATGAAAAGTTTAGCTCTGTATGGCCATGCAGATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 63803 250 - 647215 TGTGCATCTGCGTTCTTTGATTTGGGCTGCTGTGCCTCAGTGATATTGGGTGATATTGTGGTAGATAAGACAGTAAAGTATCAAAGC--AC----ATGATTGTCTCCTCAAGAGAAACATATTAATGAGACATTATTTCTACCACAGATCAT-------------------GTCTTCATCACCTGTGGTTCAGCTTGCAAGTGATACGTTCATATGTAGAGGAAACATAGTGGGGGTGAATGT-AAAAGGTTAGCTTTGTATGGAAATGTAGATAT - -a -s mr.mrrefChr3 138238 32 + 181019 CCAGCCCTGGGGAGATTACCAAGTATTGGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589444 32 + 636262 CCAGCCCTGGGGAGATTACTAAGTATAGGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 64053 32 - 647215 CCAGCCCAGGGGAGATTACCAAGTATTAGGGG - -a -s mr.mrrefChr3 138270 168 + 181019 GTTATGTACAATGATGTATTCAACAGCATGCCTGAACCTATAAAATAAAGTATCCTCCTATAAAATAAGGTATCCTGGATCTTGTAATGTTACCCTATTTTTATAATACATGATGGTATTCCTCTTATTGATCACACTGTGACCCCTTGTGTTAACATAATGAACCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589476 166 + 636262 GTTATGTACAATGGTGTATTCAACAGCATGCCTGAACCTATAAAATAAAGTATCCTCCTATAAAATAAGGTATCTTGGATCTTGTAATGGTACCCTATTTTTATAATACATGATCGTATTCCTCTTATTAATCACACTGTGACCCCTTG--TTAACATAATGAGCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 64087 163 - 647215 GTTATGTACAATGATGTTTTCAACAGAATGCCTTAACCTATAAAATAAAGTATCCTCCTATACAATAAGGTATCCTGGATCTGGTA-TGTTACCCTATTTTGAAAGGACATGATGGTATCCCTCCTATTGATCACACTGTGACCT----TGTTAACATAATGAATCTA - -a -s mr.mrrefChr3 138438 57 + 181019 AAGGTCTTGGGTAGTCCTCCCTAGGACATATAAGGGGAGATAACACTTTAGAACACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589642 56 + 636262 TAGGTCTTGGGTAGTCCCCCCTAGGACATCTAAGGGG-GATAACAGTTTAGCACACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 64251 57 - 647215 AAGGTCTTGGGTAGTCCTCCCTAGGACATACAAGGAGAGATAGCACTTTAGACCACT - -a -s mr.mrrefChr3 138495 138 + 181019 TTCCCAACTAATAGATGGAGTCTTTATCTGTTATTATAGTTCCACACTAAGCACTCAATTTATAGTGGTAATATGTTATGTGGAGACCACATCACGTCTAAATTGTCTGCGAAACCTCAACCCCTAACCTCACTACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589700 129 + 636262 TTCCTGACTAATAGATGGAGTCTTTACCTATTATTATAGTTCCACACTAAGCACTCTATTTATAGTGGTAATATGTTATGTGGGGACCACATCCTG--------ATCGGCGAAACCTCAACCTCTAACCTCACTACA- -s simRat_chr6.simRat.chr6 64308 138 - 647215 CTCTCAACTAATAAGTGGAGTCTTTATCTGTTCTTATATCTTCATACTAAGCACTCAATGTATACTGGTAGTATGTTATGTGGAGACCACATCACGTCTAAATTGTCTGCGAAACCTCAATCCCTAACCTCACTACAG - -a -s mr.mrrefChr3 138633 89 + 181019 GAGTTCACAGGTTTTTTTCTGCTTTTCACTCATAAGCATCTCTAATGGCATTGTGATGAAAGGTGAATCTATTGTGACAACTGTTAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589829 86 + 636262 GAGTTCACAGGTTTTTTTCTGCTTTTCACTCATAAGCATCTCAAATGGCATTGTGATGAAAGGTAAATCTATTGTGACAATTGTTA--- -s simRat_chr6.simRat.chr6 64447 85 - 647215 GAGTTCACAGGTTTTT----GCTTTTCACTTATAAGCTTCTCTAATGGCATTGTGATGAAAGGTGAATCCATTGTGACAACTGTTAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 138722 127 + 181019 TCCTAACACAAACTCTAATCCATCTTTCTGAAACAAATCTTCAAAACGTGAATTGGATATAAGATATGTCCACAGTTGTCTCCTAATTATTTAGTCTCTGCCTGTACACGTACTCTGTGGTTAATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589915 119 + 636262 --------CAAACTCCAATCCATCTTTCTGAAACAAATATTCAAAACGTGAATTGGATATAAGATATGTCCACAGTTGTCGCCTAATTTTTTAGTCCCTGCCTGCACACGCACTCTGCGGTTAATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 64534 127 - 647215 TCCTAACACAAGTGCTAAATCATCCTTCTGAAACAAATCTTCAAAATGAGCATTGGATGTGAAATATGTCCACTGTTGTCTCCTAATTATTTAGTCTCTGCCTGTACATGTACTCTGTGGTTAATAC - -a -s mr.mrrefChr3 138849 30 + 181019 TTTCCCCCTAGTGGAATTCAAATCTCTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590034 30 + 636262 TTTTCCCCTAGTGGAATTCAAATCTCTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 64663 29 - 647215 TTTCCCG-TAGTGGGAGTCAAATCTCTGTG - -a -s mr.mrrefChr3 138879 224 + 181019 CTTCATAATGTCTATTTGTAATGCTTTCTTGTCAGATATTATATCTATTTGCTCATGTGTCCACGTTTCTTACAAGCGTAACATTAATATAACATTTGAATAGTACACATGTACGTTAAAGTGACAATTGCTACCCGCAAAGGGTATTTTTCGTGCTTTTCAATCTAGGTGTTACCCCAAGTAGCCCAAAGCATGCTGAATAAGACATGTTATAGGGTCCACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590065 218 + 636262 CTTCATCATGTCTATGTGTAATGCTTTCTTGTCAGATATTATATCTGATTGCACATGTGTCCACATTTCTTACAAGCGTAACATTAATATAACATTTGAATAGTACACATGTATGTTAAAGTGACAATTGCTACCCGCAAAGGGTATTTTTCGTGCCTTTCAATCTAGGTGTGACCCCAAGTAGCCTAAGACATGTTGA------CATGTTATAGGGTGCACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 64692 223 - 647215 CTTTATAAAGTCTATTTGTAATGCTTTCTTGTCAGATAATATATCTAT-TGCTTGTGTGTTCATGTTTCTTGCAGGCAGAACATTAATATAACATTTGAATAGTACATACGTACGTTATAGGGACAATTGCTACCCACAAAGGCTATTTTTTGTGTTTTTCAATCTAGGTGTTACCCCAAGTAGCTCCAAGTTGCCTGAATAAGACATATTATAGGGTCCACAA - -a -s mr.mrrefChr3 139103 144 + 181019 AGTACAGTACATGTTAACAATTCTATGTAATACCATGCCATTAGCACCTGTTAGTATGGACTAGACTAAAATTCATCATTCTTTGCATTCACGTTTAATTTATGCAAATTCTAGAGTAAGAAAGGTTCAAAGTCAAACATCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590283 144 + 636262 AGAACAGTACATGTTAACAAGTCTATGCAATACTGTGCCATTAGCACCTGTTAGTATGGACTAGACTAAAATTCATCATTCTTTGCATTCACACTTAATTTGTGCAAATTCTAGAGTAAGAAAGGTTCAAACTCAAACATCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 64933 144 - 647215 AGTACACTACATGTTAACAATTCTATGTAATACCATGCCATTAGCACCTGTTAGAATGGACTAGACTAAAATTCATTATTATTTGCATTCACGTTTAATTTATGCAATTTCTAGAGTAAGGAAGGTTCAGAGTCAAACATCTGG - -a -s mr.mrrefChr3 139247 7 + 181019 TCTGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590429 7 + 636262 TCTGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 65077 7 - 647215 TTTGTGA - -a -s mr.mrrefChr3 139254 60 + 181019 TATCAATAACTGAAATAACTCCTATGTGGTGAGGTATGGGCCACAGAGAAGGAGACCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590436 60 + 636262 TATCAAGAACTGAAATAACTCCTATGTGGTGAGGTATGGGCCACAGAGAAGGAGACCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 65085 60 - 647215 TATCAATACCTGAGATAACTCCTATGTGGTGAGGTGTGGACCACAGAGAAGGAGACCTTG - -a -s mr.mrrefChr3 139314 181 + 181019 ATGTATCAGCTAACTCAACACTAGCAACCTAACATGCCTATTTACTGCAGTCTTAATAGTAGACATTATAGGTAGAGGTAGTCCTGTGTGAGCTAGATTCCTAGAATCCCTGTCAACAGAAGCAAGAATGTCTTGAGTATAGGCTAAATCCGTCAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590496 181 + 636262 ATGTATTAGCTAACTCAACACTAGCAACCTAACATGCCTATTTACTGCAGTCTTAATAGTAGACATTATAGGTAGAGGTAGTCCTGTGTGAGCCATATTCCTAGGATCCCGGTCAACAGAAGCAAGAATGCCTGGAGTATAGGCTAAATCCGTTAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 65147 177 - 647215 ATGTATCAGGGAACATGACACTACCAACCTATCATGCATC----CTGTAGTCTTAATAGTAGACATTATAAGTAGAGGTCGTCCTGTGTGAGCTAGCTTCCTAGAATCCCTGTCAACAGAAGCAAGAATGTCTTGAGTATAGACTAAATCTGTCAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATAT - -a -s mr.mrrefChr3 139495 63 + 181019 GTTTAGGTGGTGCTGTTATCATCTAGGAGGATACTGGTCGCCACCTACATTGACAGAATAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590677 63 + 636262 GTTAAGGTGGTGCTGTTATCATCTAGGAGGATACTGGTCGCCAACTACATTGACAGAATAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 65326 63 - 647215 GTTTATGTGGTGATGTTATCATCTCGGAGGTTACTGGCCACCACCTACATTGATAGAATAATA - -a -s mr.mrrefChr3 139558 27 + 181019 GGCTAAACATTCACTATTACCCCTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590741 22 + 636262 GACTAAACATCCACTATAGCCC----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 65389 27 - 647215 GGCTTAACATTCACTATTACCCCTACA - -a -s mr.mrrefChr3 139585 30 + 181019 AGTCTTCTCACTCAATAAATTTTTTTATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590763 23 + 636262 -------TCACTGAATAAATTTTTTTATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 65423 30 - 647215 AGTCTTCTCACTCAATAAATTTTTTTATGG - -a -s mr.mrrefChr3 139615 79 + 181019 CAGCATCACAATCAGGTAGCATCCAGACCTAAGGGCTCTCCTTGGCAATCTTAACTTGGGGGGTGTCAGAAATTCAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590786 79 + 636262 CAGCATCACAGTCAGGTGGCATCCAGACCTAAGGGCTCTCCTTGGCAATCTTAACTTGGGGGGTGTCAGAAATTCAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 65454 78 - 647215 CAGCATCATAATTGGGTAGCATCTAGACCTTAGGGCTCTCCTTGGCAATCTTAACTTGGGGG-TGTCAGGAATTTAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 139694 39 + 181019 GCTCCAAGATATATGTATAACTGGCTGACCAGATTAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590867 39 + 636262 GCTCCAAGATATATGTATAACTGGCTGACCAGATTAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 65532 39 - 647215 GCTCCAAGATATATGTGTGATTGGAGGACCAGATTAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 139733 76 + 181019 TGCTATAGCCCCTAGTACATTGCAGACCCAGTCATTGGGAGTTTGTAACCTGAGTTTATATATCTTAATGCATGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590924 76 + 636262 TGCTATAGCCCCTAGTACATTGCAGACCCAGTCATTGGGAGTTTGTAACCTGAGTTTATATATCTTAATGCATGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 65571 76 - 647215 TGCTGTAGCCCCTAGTACATTGCAAACCCAGTCATTGAGAGTTTGTGACTTGAATTGGTATATCTGAATGCCTGAC - -a -s mr.mrrefChr3 139809 13 + 181019 TGATCTATATCCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591002 13 + 636262 TGATCTATATCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 65647 13 - 647215 TGATCTATATCCT - -a -s mr.mrrefChr3 139822 62 + 181019 AATAATTCAAGAAGACTGCACACAGCACTAGTACACTTCTGTGCCTAACTCTAGTGCTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591023 62 + 636262 AATAATTCAAGAAGACTGCACACAGCACTAGTACACTTCTGTGCCTAACTCTAGTGCTTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 65660 62 - 647215 AATCATTCAGGGAGACTGTGCTCAGCATTGGTGCACTTCTGTGCCCAACTCCAGTGCTTGAT - -a -s mr.mrrefChr3 139884 6 + 181019 TTAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591086 6 + 636262 TTAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 65722 6 - 647215 TTCGCC - -a -s mr.mrrefChr3 139890 62 + 181019 TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTTGACAACTTTATGAAAGAGGGATAGCACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591145 62 + 636262 TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTTGACAACTTTATGAAAGAGGGATAGCACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 65728 62 - 647215 TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTAAGCCCCTTTATGAAAGAGGGATAGCATGG - -a -s mr.mrrefChr3 139952 68 + 181019 CAGGCATAAACTCTGAAAGGAACATATTCAATAGTCTGCAACTGCATATCCTCAATGACATTTTTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591226 68 + 636262 CAGGCATAAACTCTGAAAGGAACATATTCAATAGTCTGCAACTGCATATCCTCAATGACATTTTTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 65790 68 - 647215 TGTGCATAAACTCTGAAAAGGACATATTCAATAGCCTGTAGCTGCGTATCCTCAATGACATTTTTGCC - -a -s mr.mrrefChr3 140020 120 + 181019 CATAGATATGGATGTGTATGAGTCCTTGATTGATGTCTGTATGAGTACTGTCTACTCAGTAACAATAGACTGGGCAAGTCTTGCCCTATGAGTTACCATAAAAATCGTTCCATAAGTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591294 120 + 636262 CATAGATATGGATGTGTATGAGTCCTTGATTGATGTCTGTATGAGTACTGTCTACTCAGTAACAATAGACTGGGCAAGTCTTGCCCTATGAGTTACCATAAAAATCGTTCCATAAGTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 65863 120 - 647215 CAGAGACATGGATGTGCATGAGTCTATGATTGATGTTTGCACGAGTATTGTCTACTTAGTAACAATAGATTGGGCAAGTCTTGCCTTATGAGTTACAGTAAAAATTATTCCCTAAGGTAC - -a -s mr.mrrefChr3 140140 49 + 181019 TCTGCAGAAGTCTCAGTCCTCAATATACACCACCAACTTGCCTCTACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591418 49 + 636262 TCTGCAGAAGTCTCAGTCCTCAATATACACCACCAACTTGCCTCTACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 65983 49 - 647215 TGTACTGAAGTCTCAGACTTCAACATACACCTCGAATATGCATCTACCA - -a -s mr.mrrefChr3 140189 53 + 181019 AACAGGTAGGATATTTATGCCTTTCCTGCACGGATGAAAATGAATCTTCTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591473 53 + 636262 AACAGGTAGGATATTTATGCCTTTCCTGCACGGATGAAAATGAATCTTCTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 66032 53 - 647215 AACAGGTGGGATGTATATTCATTTCCTGGATGGATGAGAACAAATTCTCTAAA - -a -s mr.mrrefChr3 140242 71 + 181019 GATCATACTGGGGTGCCCCAGATATTCTATTATTCAGCAATTCCCTAGCTCCCATACAACATCAAAGGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591526 71 + 636262 GATCATACTGGGGTGCCCCAGATATTCTATTATTCAGCAATTCCCTAGCTCCCATACAACATCAAAGGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 66086 71 - 647215 GATCAGACGGGGGTGCCCTAGTGATTCTATTATTCAGCAATCCTCTAACTCCCATACAACACCAAAGGTTG - -a -s mr.mrrefChr3 140313 107 + 181019 TCTTGGCTTGGTGTGATCCATCATCTTAATCCCCCAGTCTGATAAACAGGGTGGTTCAATAAACAAGGGCGCAATCCAATGTCCCCCAGACTGATAAGCAACTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591597 107 + 636262 TCTTGGCTTGGTGTGATCCATCATCTTAATCCCCCAGTCTGATAAACAGGGTGGTTCAATAAACAAGGGCGCAATCCAATGTCCCCCAGACTGATAAGCAACTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 66185 107 - 647215 TCCTTGTTTGGTGGAATCCATCATCTTAATCCTCCAGTCTGATAAACGGGGGGGTTCAATAAACAAGAGTGCAATCCAATGTCCCCCACACCAATAACCAACTGAAA - -a -s mr.mrrefChr3 140420 18 + 181019 TCCAGTTGTAATACTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591704 18 + 636262 TCCAGTTGTAATACTCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 66296 18 - 647215 TCCAGCTGTAATACTCTA - -a -s mr.mrrefChr3 140438 11 + 181019 TGTATCCGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591722 11 + 636262 TGTATCCGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 66319 11 - 647215 TGTATCCGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 140449 26 + 181019 CTGATAGCCAATTCAAGGGGTTTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591739 26 + 636262 CTGATAGCCAATTCAAGGGGTTTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 66330 26 - 647215 CTAATAGCCAATTCAAGGAGTGTCAG - -a -s mr.mrrefChr3 140475 81 + 181019 TCATACTTTATATATGAGAACAAGATTGAAGGGACACAGAGTGCTATTTTGCATCACCCAATATCAGAAATCCATATCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591765 81 + 636262 TCATACTTTATATATGAGAACAAGATTGAAGGGACACAGAGTGCTATTTTGCATCATCCAGTATCCGAAGTCCATATCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 66359 81 - 647215 TCATACTTTATATATGCAAACAGGATTGATGTGACACAGAGTGCTATTTTGCATCACCCAATATCAGAAATCCATATCACT - -a -s mr.mrrefChr3 140556 201 + 181019 CTATGGTGGGAGACATTAGATAGGATGACATTCACGCTAGACAAACCATCCTCACTGTTGTCAAAAGTACAATAGTGCTCTGCATTACCAGTACAAGACGTCTGTTTGATTTCTTCTTCTGCCATCTAGGGGACATCTTCTGTTTAGCTCTTCCTATACATATTTTTAGTTGCAATCCATGGCATTGGATCGGGACTCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591846 201 + 636262 CTATGGTGGGAGACATTAGGTAGGATGACATTCACGCTAGACAAACCATCCTCACTGTTGTCAAAAGTACAATAGTGCTCTGCATTAGCAGTACCAAAAGTCTGTTTGATTTCTGCTTCTGCCATCCAGGGGACATCTTCTGTTTAGCCCTCCCTATACATATTTTTAGTTGCAATCCATGGCATTGGATCGGGACTCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 66442 155 - 647215 CTATGGTGGGAGACGTTAGATAGGATGACATTC----------------------------------------------CTGCATTACCAGTACAAGACGTCCATTTGATTTCTTCTTCTTTCATCTAGGGGGCATAGACTGTTTATCTATTCCTATACATATTTCTAGTTGCAATACATGGCATTGGATAGGGACTCTGT - -a -s mr.mrrefChr3 140757 16 + 181019 GGCTGTCCTTATTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592048 16 + 636262 GGCTGTCCTTATTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 66597 16 - 647215 GGCTGTCCATATTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 140773 250 + 181019 AGCTCCAGTACATGGCATTCGATAGGGTGCTACATTTATTTATATCCCCTAGTGAGGGCTAAAACTAGTCACATTACCTGGTACATTACACAATTAAACCAGATTTAGGGTCTGCTCTGATGGTTTACATAGTCTGATTTATCCCTATGGTGATGCTGGCTCAATTACTCCAACCTTTTGGTTTACAGTAGTTGAGGATAAGTGATAATGGACTTATGTTATTGTCTTACAATTTCTCTATTTATCCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592066 250 + 636262 AGCTCCAGTACATGCCATTCTATAGGGTGCTACATTTATTTATATCCCCCAGTGAGGGCTAACACTAGTCACATTACCTGGTACATGACACAATTAGACCAGATATAGGGTCTGCTCTGATGGTTTACATGGTCTGATTTATCCCTATGGTGATGCTGGCTTAATTAGTCCAACCTTTTGGTTACCAGTAGTTGAGGATAAGTGATAATGGACTTATGTTATTGTCTTACAATTTCTCTATTTATCCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 66613 240 - 647215 AGCTGCAATACATAGCATTCGATTGGGTGCTACATTTATTTATATGCACTAGTGAAGGCTAAAACTAGTCTCATTACCTGGTATGTTACACAATCAAATCA-ATTTAGGGTCTGCTCCGATGGTTTACATAGTCTGATTTAACCCTATGGTGGTGCTCATTCATCTACTCCAACCTTTTGGTTTACAGTAATTGAGGATAAGTGATAATGGACTTGTGTTATTGTCTTACAATTTCTCTAT--------- - -a -s mr.mrrefChr3 141023 53 + 181019 TCTAATTTATGTAGAGGTGGATAACCCAACCTATGAACATCCTACGCCCAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592319 53 + 636262 TCTAATTTATGTAGAGGTGGATAACCTAACCTATGAACATCCAACGCCCAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 66853 27 - 647215 -------------------------CCAACCCATGAACATCCTACGCCCAAG- - -a -s mr.mrrefChr3 141076 61 + 181019 GAAGAGGCAAGATCAGTATGTATGCCATCTCCATGACTAGTCAGACAGTCTTGACACACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592372 60 + 636262 AAAGAGGCAAGATCAGCATGTATGCCATCTCCATG-CTAGTCAGACAGTCTTGACACACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 67225 59 - 647215 gaagAG--AAGCTCAGTATGTATGACATCTCCATGACTTGTCAAACAGTCTTGACACACAA - -a -s mr.mrrefChr3 141137 113 + 181019 CTCGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAATATCATGACAAAGTTACCTTGAAGAAAAGTTACCTTCATAGAGATTCAGCAAAGCCTGCAACCATATTTAGAATGAGCTAAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592432 113 + 636262 CTTGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAGTATCATGACAGAGTTACCTTGAAGAAAGGTTACCCCCATAGAGATTCAGCAAAACCTGCAACCATATTTAGAATGAGCTAAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 67298 113 - 647215 CTCGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAATATCATGACAAAGTTACCTTGAAGAAAAGTTACCTTTATAGAGATATGGCAAAGCCTCCAACAATATTAAAGCTTGACTGGAGC - -a -s mr.mrrefChr3 141250 4 + 181019 TCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592551 4 + 636262 TCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67411 4 - 647215 ACAT - -a -s mr.mrrefChr3 141254 98 + 181019 GAGCTAAGTCTTGCTATCTCAACACTAACCCCAGGCTGGCAAGGCAGATATCCATGATGAATACATATAAGAGGTGCACCTGAAGCTAAGTAGAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592555 98 + 636262 GAGCTAAGTCTTGCTATCTCAACACTAACCCCAGGCTGGCAAGGCAGATATCCATGATGAATACATACAAGAGGTGCACCTGAGGCTAAGTAGAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67419 97 - 647215 GAGCTAAGGCTTGCTATCTCAACGCTAACCCCAGGCTGGCAAAGCATACATCCATGATGAA-ACATATAAGAGGTGCACCTGAAGTTAAGTAGAACTG - -a -s mr.mrrefChr3 141352 64 + 181019 TGGCACACTTTGGGTAGCCATGACTTGCACCTGAATGAGGTTACTCAGAGGCCATTAGTGGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592666 64 + 636262 TGGCACACTTTGGGTAGCCATGACTTGCACCTGAATGAGGTTACTCAGAGGCCATTAGTGGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 67516 64 - 647215 TTGCACACTTTGGGTGGCCATGACTATCATCTCAATGAGGTTATTCAGACATCATTGGGGGATG - -a -s mr.mrrefChr3 141416 31 + 181019 CAGTCAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592730 31 + 636262 CAGTCAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67583 31 - 647215 CAGTTAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT - -a -s mr.mrrefChr3 141447 11 + 181019 CAGGTTGTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592761 11 + 636262 CAGGTTGTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67648 11 - 647215 CAGGTTGTCTT - -a -s mr.mrrefChr3 141458 46 + 181019 TTGAGTACCATTAAGTATTGAGTATGGGTCTTGTATTTTAGATCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592772 46 + 636262 TTGAGTACCATTAAGTATTGAGTATGGGTCTTGTATTTTAGATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 67707 46 - 647215 TTGAGTACCATTGAGTATTGAGTATGTGTCTTGTATTTTGGATTTG - -a -s mr.mrrefChr3 141504 50 + 181019 ATAATACTCCCATAAAATATTATGTTATACACAGTCACTTGTGAATTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592836 50 + 636262 ATAATACTCCCATAAAAGAACATATTATACACAGTCACTTGTGAATTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 67753 49 - 647215 ATAATACTCCCATAAAATATTATGTTATACACAGTC-CTTGTGAATTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 141554 297 + 181019 GATATATGGCCCTCCTCATACTGAAAAATTGAGACTGCACACCTTGCCCCTTTTTAGCAATAGTGACACCCAAGGGTGACTAAGATCATTGGTATGTTGTCCCTGCAAAAAGCTTATGCCTGCGAATCAGCAATCCACATCATAATAGTTTCTTCACTAGGAGATGGTAAGCACAATGGTCCCAGGCAAATGCTAATTGAGGTAGGGTGCAGGTAGACATTTTGATCTCTAATTGAAGGGAGAAGCTCGTTGGAGAATCGAAAAAGAACTGAACCAGTGGACACCTCATAATTTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592958 293 + 636262 GAAATATGGCCCTCCTCATACTGGAAAGTTGAGACTGCATACCTTGCCCCTTTTCAACAATAGTGACACTCGAAGGTGACTAAGACCATTGGTATGTTGTCCCTGCAAAAAACTTATGCCTGCAAATCAGCAATCCACATTATAATGGTTTCTTCACTAGGAGATGGTATGCACAATGGTCCCAGGTAAATACTAACTAAGGTAGGGTGCAGGTAGACATTTTGATCTCTGAT----GGGAGAAGCTTGTTGGAGAATCAAAAAAGAACTGAACCATTGGACACCTCATAATTTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67802 292 - 647215 GATATATGGCCCTCCTCATACAGAAAAATTGAGACTGCACATCTTGCCCCTTTTTAGCAATAGTGACCCCCAAGGCTGACTAAGTTCATTGGTATGTTGTCCCTGCAAAAAGCTCATGCCTATGAATCAGCAATCCACATCATAACAGTGTCTTCACTAGGAGATGGTAAGCGCAATGGTTCCAGGCGAATGCTAATTGAGGTAGGTTGCAGGTTGACATTTTTATCTCTAATTGAAGGGAGAAGCTCGTTGGAGAAGTGAAAAA-----GAACCAGTGGACACCTCGTAATTTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 141851 25 + 181019 GGTAGTCATATTATCTTTCTCCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593251 25 + 636262 GGTAATCATATTATCTTTCTCCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 68124 25 - 647215 GGTAGTCATGTTATGTTTCTCCTCA - -a -s mr.mrrefChr3 141876 12 + 181019 CTCAGTGTCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593276 12 + 636262 CTCAGTGTCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 68155 12 - 647215 CTCAGTCTCTAA - -a -s mr.mrrefChr3 141888 95 + 181019 ATGGACTTGGACTGTTTCACATTGACAGCCCATTTGTGAAAGTAGTCCATGCAAATGGACTATGTAGCCTGATTAGGATCTTAAAGAACTCCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593288 95 + 636262 ATGGACTTGGACTGTTTCACATTGACAGCCCATTTGTGAAAGTAGTCCATGCAAATGGACTATGTAGCCTGATTAGGATCTTAAAGAACTTCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 68171 95 - 647215 GTGGCCTTAGACTGTGTCACATTGACAGCCTATCGGTGAAAGCAGTCCAAACAAATGGACTAGGTAGCCTGCTTAAGATCTTAACCAACTCTATA - -a -s mr.mrrefChr3 141983 45 + 181019 CCTGTCTCGGGGTCTGGGAGTGGGAGACTGGGATGGTTTAAACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593383 45 + 636262 CCTGTCTCAGGGTCTGGGAGTGGGAGACTGGGATGGTTTAAACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 68403 45 - 647215 TCTGTCTCGGGGTCTGAGAGTGGTAGACGGGGATGGTTTAAACAA - -a -s mr.mrrefChr3 142028 235 + 181019 ATATCAGAGCCTTTGGATGCTCTGCTTAGTCTTGATTCAATAAGCTGGATCTTATCCCAGTGAAGTTGTAACACATCTCTACAGAGCTCTAGACATTCTGAGATATGAGGAAGTTGACATGGCCTCATTGTCCAAAGCAGTTCCTGAATCCTTGAAGAAATACACTAAGTGCAGGGAATTGGCAGAAAGACTGAAGATAGAAGGTCAGGGTCAAAAGTGCCTTTTAAACCACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593428 235 + 636262 ATATGGGAGCCTTTGGGTGCTCTGCTTAGTCTTGATTCAATAAGCTGGATCTCATCCCAGCAAAGTTGTAACACTTCTCTACAGAGCTCTAGACATTCTGAGATATGAGGAAGTTGACATGGCTTCATTGTCCAAAGCAGTTCCTGAATCCTTGAAGAAATACACAAAGTGCAGGGAATTGGCAGAAAGACTAAAGATAGAAGGTCAGGGTCAAAAGTGCCTTTTAAACCACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 68449 232 - 647215 ATATCAGAGCCTTTGGATGCTCTGCCTACCCTTAGTTCACTAAGCTGGATCTTAGCCCAGTGAAGTTGTAACATACTTCTACAGAACTCTAGACATTCTGAGATATGAGGAAGTTGACATGGCCTCATTGTCCAAAGCAGTTCCTGAATCCTTGAAGAAATACACTAAGTGCAGGGAATTGGCAGAAAGACTGAAAATAGAAGGTCAGGGTCAAAAAT---TTTTAAACCACACA - -a -s mr.mrrefChr3 142263 180 + 181019 CTCTATTTAGAAGTGTGACCTAATTACACCCTACTGATGTCTTAGCTATCAAATATGCCCCTTCTCAAACATGTCACTCAGACTACCTGTTTAATTGGATATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGACTAGGTTAATGTCTCCATTACTGGAGTACATGTTACATGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593663 180 + 636262 CTCTATTTAGAAGTGTGACATTATTACACCCTACTTATGTCTTAGCTACCAAACATTCCCCTTCTCAAACATGTCACACAGACTATCTGTTTAGTAGAAAATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGGCAAGGTTAATGTCTCCATTACTGAAATTCATATTACATGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 68685 180 - 647215 CTCTATTTAGAAGTGTGACCTAATTAGACCCCACTGATGTCTTACCTATCAAATATGCCCCTTATCAAATATGTCACTTAGACTACCTGTTTAATTGGATATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGACTAGGTTAATGTCTCCATTACTGGAGTACATGTTACATGATT - -a -s mr.mrrefChr3 142443 165 + 181019 TACCTTGCATATCCTTGTAACAGGAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAAAAATGCATATTCTACAGAACCATCCATAACATGTTCTCAATGAGATGAATATGATGCTAAATCTAGAAGTGCCTACCATAGCATCATAGATCATTTTAGAGCAACACATAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593843 160 + 636262 TAGATTGCATATCCTTGTAACAGAAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAAAAATGCATATTCTCCAGAGCCATCCGTATCCTGTTCTCAATAAGATGAA-ATCATGCTTAA--GGGAAGTGCTTACCATAGCATCATAGATCATTTTAGAGCAACA--TAGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 68873 165 - 647215 TACCTTGCAGATCATCTGAACAGGAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAACAATACATAGTCTACTGAACCATCCAGAACATGTTCTCAGTGAGATGAGTAGGAGGCAAAATCTAGAAGTCCCTACTGTCGCATCATAGATCGTTTTACAGCAACACATAGAAG - -a -s mr.mrrefChr3 142608 114 + 181019 TGATGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTATGGCAAATAACGCCTCTTTAGCAGTAAGTTAACTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594004 114 + 636262 TGATGAACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTCTGGCAAATAACGCTTCTTTGGCAGTAAGTTAATTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 69038 110 - 647215 CAAAGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGGTCCTCACCTATGGCAAA----ACCTTGTTACCTTTTAATGAACTGATGGATTTCAACTAGGCCTATT - -a -s mr.mrrefChr3 142722 86 + 181019 GCTTTTTAATGGACTGATGGGCTTCGCCTATGCCTATTTGATGGCATATCTAACATGTACATAGGGTTTTATGTTATCCACTTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594118 86 + 636262 GCTTTTTAATGGACTGATGGGCTTCGCTTATGCCTGTTTAATGGCATATCTAATATGTACATCGGGTTTTATGTTATCCACTTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 69175 84 - 647215 GTTTGATTATCCACTTTTGGGCTTCACCTATGCCTATTTGATAGCATATCTCACATGTACATAGGGTTTGA--TTATCCACTTTAG - -a -s mr.mrrefChr3 142808 128 + 181019 AATTTCTTTTTATTGATGAATTACTGTTTATGCCAAAACTATAAGACTGTTTTCCATATTTGGAGTGAGTCCTGGGTGAGTTTCCCCAGCTGTGTTGCTATTATTTCTGCCCCTGTATGGGATACCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594204 128 + 636262 AATTTCTTTTTATTGATGAATTCCTGTTTATGCCATAACTATAAGACTGTTTTCCATATTTGGAGTGAGTCCTGGGTGATTTTCCCCGGTTGTGTTGCTATTATTTCTGCCCCTGTATGGGACATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 69272 124 - 647215 AACTTCTTTTTATTCATGAGTTACTGTTTATGCCAAAACTTTAAGACTATTTTCCATGTTTGGGGTGAGTGCTGGGCAAGTTTCCCCAGCTGTCTTGCTATTATTTTT----CTGTATGGAATACGCA - -a -s mr.mrrefChr3 142936 40 + 181019 TGGTGGGCCATGTACCATGGCACTTAGAAAATCAGTTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594332 40 + 636262 TGATGGGCCATGTACCATGGCACCTAGAAAATCTGTTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 69398 40 - 647215 TGGTGAGCCATGTACCATGGCACTTCGAAAATCAGTTGTG - -a -s mr.mrrefChr3 142976 135 + 181019 GGCTATTTACTTTGGTCAATGGTACTCCTGAATAGAAAAAAAGTCTTGAGACTCCCCAAGTGGTGAGTTGTCCCCATAAAATGGCAAACTGGACCCTTTGATTTGTTTTCTGTACGTAAAGGACTGCAGCTGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594372 135 + 636262 GGCTATTTACTTTAGTCAATGGTACTCCTGAATAGAAAAAAAGTCTTGAGACTCCCCAAGTGGTGAGTTGTCCCCATAAAATGGCAAACTGGACCCTTTGATTTGTTTTCTGTACGTAAAGGACTGCAGCTGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 69583 135 - 647215 GGCTATTTACTTTGGTCAATGCCACTCCTGAATAGAAGAAGACTATAGAGACTCCCAAATTGGTGAGTTGTCTCCATAAAATGTCAAACTGGACCCTTTAGTCTGTTTTTTGTACATAAAATATTGCAGCAGGAG - -a -s mr.mrrefChr3 143111 24 + 181019 TCCATTGAGTTGGCTATTAGTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594509 24 + 636262 TCCATTGAGTTGGCTATTAGTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 69718 24 - 647215 TCCGTTGAGTCGGCTATTAGCCCA - -a -s mr.mrrefChr3 143135 31 + 181019 ATGGGAGTGCACAAACTGTGGCACTAAGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594533 31 + 636262 ATGGGAGTGCACAAACTGTGGCACTAAGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 69748 31 - 647215 ATGAGAGTGCACAAACTGCAGGAGTAAGACG - -a -s mr.mrrefChr3 143166 36 + 181019 CCAGGAGATACATGGAATCCCTGGCCCCTCTGTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594576 36 + 636262 CCAGGAGATACATGGAATCCCTGGCCCCTCTGTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 69779 36 - 647215 CCTGGAGCTACATGGAATCACTAGCCCCTTCGTAAC - -a -s mr.mrrefChr3 143202 134 + 181019 TGGATGCTATACCACGTGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCCCAGATATAGTGAACTAGTCATTCGTAAAGCCAAACTGCAGGCCCTGTTTATGTGCTTCTTGTGCATCTAGGCTTACGAGAGAGGTTTGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594621 132 + 636262 TGGATGCTATACCACGTGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCCCAGATATAGTGAACTAGTCATC--TAAAACCAAACTGCAGGCCCTGTTTATGTGCTTCTTGTGCATCTGGGGTTACAAGAGAGGTTTGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 69815 122 - 647215 TGGGTGCCTTACCACATGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCACAGGTATAGTGAACTAGTCATTCGTAAAGCCAAAGTACAGGTCCTGTTTATGAGCTTCCTGTGCACCTAGGCTTACGAG------------ - -a -s mr.mrrefChr3 143336 9 + 181019 GCTCACTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594757 9 + 636262 GCTCACTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 69937 3 - 647215 ------TCT - -a -s mr.mrrefChr3 143345 224 + 181019 CTTAGTCTCAGCTTGGGGTGGCATGATACATCCTATACCATATGTCTCCACTTGCCAGATTGTGTAATGGGTACTAAGCCAAGCAAGTCAGACAAGTTATGAGTCAGCAACCAGTTGCCTAAGTTACTAGGTCTAATCTGGTAAAGTATAGTTCATTTGAGGTATTTCAAATGACTTTGAGCTATGCAGACTGTACCTGAATGCAATGCAACGTGGTGCATTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594767 223 + 636262 CTTAGTCTCAGCTTGAGGTGCCATGATACATCCTATACCATATGTCTCCACTCGCCAGATTGTGTAATGGGTACTTAGCCAAGCAAGTCAGACAAGTTATGAGTCAGCAACGAATTGCCTAAGCTACTAGGTCTAATTTGGTAAAGTATAGTACATTTGAGGGATTTCAAATGACTTTGAGCTATGAATAC-ATACCTGAATGCAATGCAACGAGGCGCACTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 69940 220 - 647215 CTTAATCTCA-CTTGGGGTGGCA--ATGCATTCTATACCACATGTCTCCACTTGTCAGAGTGTGTAATGGGTACTAAGCCAAGCACGTCAGACAGGTTATGAGTCAGCAACCAGTTCCATAAGTTACTAGGTCTAA-CTGGTAAAATATATTTAATTTTAGGTACTTCAAATGACTTTGAGCTATGCAGACTGTACCTGAATGCAATGCAACATGGTGCATTGC - -a -s mr.mrrefChr3 143569 18 + 181019 AAAAGCTCAGGTTTAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594990 18 + 636262 AAAAGCTCAGGTTAAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 70162 18 - 647215 AAAAGCTCAGGTTTAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 143587 105 + 181019 AAGTTCCCCCACAGTAACAAGCCTCGAATGCATATAAAAGCCCCTCTATCTTTAAATGAATAGCCAAGGAGTACAACACACCATGAAACACACATATCAATCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595009 102 + 636262 AAGTTCCCCCACAG---CAAGCCTCGAATGCATATGAAAGTCCCTCTATCTTTAAATGAATAGCCATGGAGTATGACGCACCATGAAACACACATATCAATCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 70180 93 - 647215 AAGTTCGCCCAGAGTAACAAGAC-----------TAAAAGCCCCTCTTTC-TTAAATGAATAGCTGAGGAGTACAACACACTGTAAAACACACATATCTACCAGT - -a -s mr.mrrefChr3 143692 22 + 181019 GTGACATTTCCTTAGGCAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595112 22 + 636262 GTGACATTTCCTTAGGCAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 70273 22 - 647215 ATGACATTCCCTTAGGCAAAAA - -a -s mr.mrrefChr3 143714 210 + 181019 GGGCTCAGAGGTAATGCTCAGGAATAGACAGTGTCACTGGGGTCAATTCAATTACTGCTAAGCTATAAGAACAATTGTGGATATGCTTGAAAACTAACAGATTCATTCAACCAATGCATGCATTCCATCTCTCAGATCACAAACAACAAATTGCTAGGAATCCTTACATAAGTAGCAGTTCCTAGGAGTTGGCACACCAGACCATGCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595135 210 + 636262 GGGCTCAGAGGTAATGCTCAGGAATAGACAGTGTCACTGGGGTCAATTCAATTACTGCTGAGCTATAAGAACAATTGAGGATATGCTTAAAAGTGGACAGATTCATTCAACCAATGCATGCATTCCATCTCTCAGATCACAAACAACAAATTGCTAGGAATCCTTACATAAGTAGCAGTTCCTAGGAGTTGGCACACCAGACCATGCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 70295 172 - 647215 GGGCTC-------------------------------------CAATTCAATTAC-GCTAAGCTATACGAACGATTGTGTATAGGCCTGTAAACTAACAGATTCATTCAAGCAATGCATGTGTTCCATCTCTTAGATCAGAAACAACAAATTGCTGGAGATTCTTACATAAGTAGCAGCTCCTAGGTGTTGACACACCAGATCTTGCCGT - -a -s mr.mrrefChr3 143924 42 + 181019 AGAGTTAATGTTTGTGTTAGTAGTCAGTTGTCAGCTGTCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595493 42 + 636262 AGAGTTAATGTTTGTGTTAGTAGTCAGTTGTCAGCTGTCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 70467 42 - 647215 AGAGTTAATCTTTGTGCTAGTAGTCAGCTGTCAGCTGCCGGT - -a -s mr.mrrefChr3 143966 160 + 181019 GGTGCTATGCCAGGTGGGTCGTAGAAACCACACAGTGTTCATTTACTTAACTGATACCTGCCCCACGTGGCCATTTACAGACGGTCAGTGCTTTGCTACACCTTCCCCATGCAGCCATGTACACATGGTATCCCTTATCTAAATGAAAGCTAGGCATCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595535 160 + 636262 GGTGCTATGCCAGGTGGGTCGTAGAAACCACACAGTGTTCCTTTACTTAACTGATACCTGCCCCACGCCGCCATTTACAGACGGTCAGTGCTTTGCTACGCCTTCCCCATGCAGCCATGTACACATGGTATCCCTTATCTAAAGGAAAGCTAGGCATCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 70518 155 - 647215 GGTGCTATGCCAGGTGGGTCATAGAAACCACACAAGGTTCATTTACTTAACTGATACCTGCCCTGCATGGCCATGTACACACGGTCAGTGCTTGGATACACCTGCCCCGCACGGCCGTGTACACACGGTATCCCTTATCTAAATAAAAGC-----ATCCT - -a -s mr.mrrefChr3 144126 232 + 181019 GGGACACCTATCCATGGTAGATGTCATACCACCATATACAGATTTCAGCTCAACCAGGCAGACTGCAGAGTCGTAATATCATGGCCAGAGCTCACCGTATGATATAGAGTCTTAGGACCATATAAAGGCTATAGGGATTTTAGTGCCTATTGTGGTCAAATCCCGTGTTTAATAATTAGGCAGATCAGTTTTTGTCATTCATTTAAAATCCATACCCTGTCAGGCTCAGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595696 232 + 636262 GGGACACCTATCCATGGTAGATGTCATACCACCATATACAGATTTCAGCTCAACCAGGCAGACTGCAGAGTCGTAATATCATGGCCAGAGCTCACCTTATGATATAGAATCTTAGGACCATATAGAGGCTATAGGGCTTTTAGTGCCTATTGGGGTCAAATCCCGTGATTAATAATCAGGCAGACCAGTTTTTGTCACTCATTCAAAATCCATACCTTGTCAGGCTCAGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 70673 218 - 647215 GGGACACATATCCATGGTATATGACATACCACCATTTACAGATGTCAGATCAACCATGCGGACTGCAGAGTCGTAATATC------------CACTGTATG--ATAGAGTTTTAGGGCCATATTAAGGCTATAGGGATTTTAGTGCCTATTGTCATCAATTCCCCTGTTTAACAATTAACAAAATCAGTGTTTGTCATTTATTTAAAATCCATACCCTGTCAGGCTAACAGT - -a -s mr.mrrefChr3 144358 338 + 181019 TTGTAACTACAGGTTATTGGTACTGACCCAACATGACCATTGAAGCATGCCAACCTTGTAAACAACACAGTAAACCTAGATTTTTAGCCTCAATACACACTCTACATAGTCTTATGATTCTAAAACATCATTGTTACTTATATCTTGATCCGAACTGCACCCAGTTTCTTGATCACTATTGTATAGTTATAAGTGTTATAGAATACAGAGTTCAATGGTTGAGGTGATGACAAATTGCATAATGGTAACAAAGACATGAGACTATTTATATCCTGTATTACATAAGGATTATTGGTCTAAGATACTGGCATAGGAAATTTTGCATGTCATCTTAGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595931 338 + 636262 TTGTAACTACAGGTTATTGGTACTGACCCAATATGACTGTTGAAGCATGCCAACCTTGTAAACAACACAGTAAAACTAGATTCTTAGCCTCAATACACACTCTACACAGTCTTATGATTCTAAAACATCATTGTTACTTATATCATGACCCAAACTGCACCCAGTTTCTTGATCACTGTTGTATAGTTATAAGTGTTATAGAATGCAGAGTTCAATGGTTCATGTGATGACAAATGGCATAACGGTAACAAAGGCATGAGAGTATTTATATCCTGTGTTACATAAGGATTATTGGTCTAACATACTGGGATGGGAAATTTTGCATGTCATCTTAGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 70891 311 - 647215 --------------------------CCCAACATGACCATTGCAGCATGGCAACCTTGTAACCAACACAGTTTACCTTGATTTTTAGCTTCAATACACACTCTGCATGGTCTTATGATTCTAAAGCATCATAGTTACTGACCTCTTGATCCGAACTGAACCTGGTTTCTTGATCACTATTGTATAGTTAATAGTCTTATAGAATAGAGAGTTCAATGGTTGAGGTAATGAAATATTGCATAATGGTAACAAAGACATGAGACTATTTATATCCTATATTACATAA-AATTATTGGTCCAAGTTACTGGCATAGGAAATTTTGCATGTCACCTTAGCTG - -a -s mr.mrrefChr3 144696 292 + 181019 ATGAGAGCAACACTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGAGTATAATAATTGCTACATATGTAATCCTAGCTTTATGAAGTCCACAATTTGAACAATATATAGTGGAAAGAGAAAGAATTGCATACATGCAATACATGACACAAATGATAATCTGACAGTTATATTATCCCTATCTGTAGCAATTACATGGTGCATGATGGCCCCCTCACTTGGTTAGGCAGGACAAAGACTGAATGCCTTTAAGGAGGTTTATCCTCAATTTCTGTTGCCAATGACCAAACAGGAAAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596271 292 + 636262 ATGAGAGCAACATTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGAGTATAATAATTGCTACATATGTAAACCTAGCTTTATGAAATCCACAATTTGAACAATATATAGTGGAAAGAGAAAGAATTGCATACATGCAATACATGTCACAAGTGATATTCTGAAAGTTATATTATCCATATTTGTAGCAATTACATGATGCATGATGGCCCCCCCACTTGGTTGGGCAGGACAAAGACTGAATGCCTTTAAGGAGGTTTATCCTCAATTTCTGTTGCCAATGAACAAACAGGAAAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 71202 279 - 647215 ATGAGAGCAACACTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGTGTATAATAATTGCTACATATGTAATCCTAGCTTTATGAAGTCTACAATTCGAACAATATATGGTGGAAAGCAAACGAATTGCATAGATGCAATACATGACACCAATGATAATCTGACAGTTATATTCTCCCTATCTGTAGCAATTACGTGGCGGAAGATGGTCCCCTCACTTGGTTAGGCAGGGCAAAGACTGAATGCCTTTAAGAAGGTTTATGCTC-------------AACAACCAAACAAAAAAACC - -a -s mr.mrrefChr3 144988 40 + 181019 ATACATAATAATTGCAGAATTCCATTATTATGAATCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596574 40 + 636262 ATACATAATAATTGCAGAATTTCATTATTATGAATAAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 71481 40 - 647215 ATACATAATAATTGCAGAATTCCATTATTATGAATCAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 145028 28 + 181019 CATTCTGAGGACAATCTAGCCAATCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596614 28 + 636262 CATTCTGAGGACAATCTAGCCAATCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 71522 28 - 647215 CATTTTGAGGACAATCTAGCCAAGCTGT - -a -s mr.mrrefChr3 145056 85 + 181019 ATATACACATTTAATGCAGATACGGCAGCATCCCTGGCCACCCAATACCAAATTGAAAAGCTCAGGATGGATCCTACTACTCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597072 79 + 636262 ATATACACATTTAATGCAGATACAGCGGCATCCCTGGCCACCCAATACCAAATTGA------CAGGATGGATCCTACTACTCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 71550 73 - 647215 ATATATAC------------TAAGGCAGCATCCCTGGCCACCCAATATCAAATTAAAAAGCTCAGAATGGATCCTACTACTCCTC - -a -s mr.mrrefChr3 145141 75 + 181019 TCTGTAAAAGAGTGCCTCTTAATATGCATTATCACTTAGCTGGACTGTCTGAGCCTGAGGTCTCATTCTCCACGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597154 75 + 636262 TCTGTAAAAGAGTGCCTCTTAACATGCATTATCACTTAGCTGGACTGTTTGAGTCTGAGGTCTCATTCTCCACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 71623 75 - 647215 TCTGTAAAGGGGTGCCTCCTAATATGCATTATCACTCAGCTGGACTGTCTGAGCCTAAGGTCTCACTCCTGAGGT - -a -s mr.mrrefChr3 145216 30 + 181019 CTCACTCTCTCCATACAATTATACTATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597230 30 + 636262 CTGGTATTGTCTTTACAATTACACTATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 71698 30 - 647215 CTCACTCTCCCCATGCAATTATACTATCAA - -a -s mr.mrrefChr3 145246 149 + 181019 TGTAGTTTAATGAGGATAAGAAAATGGTGCCATATTTACATTTATGAATTAGGAAATGTAGTTGCTACTTTGAACAGACATTGACCAACATGCCTGAAAGAGAACTGAATCTTAATATCTTTAATGCAAGCCTCACTATCTATCATGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597261 149 + 636262 TGTAGTTTAATGGGGATAAGAAAATGGTGCCAGATTTACATTTATGAATTAGGAAATATAGTTGCTACTTTGAGCAGACATTGACCAACATGCCTGAAAGAGGACTGAATCTTAATATCTTAAATGCAAGCCTCACTATCTATCATGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 71728 138 - 647215 TGTAGTTTAATGAGGATAAGAAGATGGTGCCATATCTAGATTTATGAATTAGGAAATGTAGTTGCTACTTTGGACAGACACTGACC-----------AAGAAAAGTGAATCTTAATATCTTTAATGCAAGCATCCATATCTATCATGAG - -a -s mr.mrrefChr3 145395 15 + 181019 AGCCAACAATGGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597410 15 + 636262 AGCCAATAATTGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 71893 15 - 647215 GACCAACAATGGCTT - -a -s mr.mrrefChr3 145410 97 + 181019 TTATCACACAAAGCCATGATGCTTGAGTAGAGTAACGGCATGTGATCATGCTTGTCAATGTTCACCTGTCTAAGTCTGTGCCAAGAAGTGTGCCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597426 88 + 636262 TGATCACACAAAGCTATGATGCTTGAGTAGAGTAACGGCATGTGATCATGCTTATCAATGTTCACCTGTCTA---------CAAGAAATGTACCTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 71908 94 - 647215 TTATCACAC---GCCATGATGCTTGAGTAGAGTAGCAGCAGGTGATCATGATTGTCAATGTTCACCTGTCTAAGTCTGTGCCAAGAAGTGTGCCTGT - -a -s mr.mrrefChr3 145507 88 + 181019 CCACCACCTATACTTTTTGTTTGCATCTTTGCTTATGTCAAACCCAGCCCCAGATAGTTCAAATTACTGAAAGAGGGATGTTGTCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597516 85 + 636262 CCATCACCTATACTTTTTGTTGGCATCTTTGCTTATGTCA---CCAGCCCCAGATAGTTCAAATTACTGAAAGAGGGATGTTGTCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 72002 88 - 647215 CCACCACCTATACTTTATGCTTGCATCTTTGCTTATGTGAAACCCAGCCCCAGGTGGTTCAAATTCCTGAGAGAGGTATGTTGTCTAC - -a -s mr.mrrefChr3 145595 39 + 181019 CAGAGAGGTGTGTTTGCTAGATAAACCCTCGTAGCTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597601 39 + 636262 CAGAGAGGTGTGTTTGCTAGATAAACCCTCGTAGCTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 72091 39 - 647215 CAGAGAGGTGTGTTTGCTAGATCAACCCTTGATGGTGCA - -a -s mr.mrrefChr3 145634 15 + 181019 CCAATCAATCTATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597641 15 + 636262 CCAATCAATCTATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 72130 15 - 647215 CCCATCAATCCAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 145649 120 + 181019 TATATACATAAACTATTTGCAACTTGATCTATTGTACATACCTAAAGTACTGTAGCTGGTGCCCTATGAGTTGGCTATCAGCCTCAGATTCATGGAGACTGGACGCTCATTTATTAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597727 120 + 636262 TATATACATAAACTATTTGCAACTTGATCTATTGTACATACCTAAAGTACTGTAGCTGGTGCCCTATGAGTTGGCTATCAGCCTCAGATTCATGGAGACTGGACGCTCATTTATTAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 72145 120 - 647215 TGTATACGTAAGTTAGGTGCATCTTGATCTATTGTACATACCTAAAGTATTGTAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGGCTATCAGCCTCAGAGCCATGGAGAGTGGATGCTCATTTTTTCAACT - -a -s mr.mrrefChr3 145769 57 + 181019 GGAGGAGAAGGATAGAATCGACCCAACCAGGATGGAATCCTTAGCTACCTCGTTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597848 57 + 636262 GGAGGAGAAGGATAGAATCGACCCAACCAGGATGGAATCCTTAGCTACCTCGTTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 72265 57 - 647215 GGAGGACAAAAATGGAATTGACCCAATCAGGATGGAATCGTTAGCTCCCTTGTTAAT - -a -s mr.mrrefChr3 145826 214 + 181019 GAAGGAATAGCATGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTGGCCTGTAGAGACATGATAGGCATACAAAGTACAGCCATGAGGGAACACCTAATATGCAAATACCCATTATCTGTAGGCCCACTTCCTATGGTTCATCCCTGTGTTTAATCTAGCCCTCAAGGCATAATAGCCATAGTGGTTTGACCCTAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597905 214 + 636262 GAAGGAATAGCATGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTAGCCCGTAGAGACATGATAGGTATACAAAGTACAGCCATGAGGGAACACCTAAGATGCAAATACCTATTATCTGTAGGCCCACTTCCTATGATTCATCCGTGTGTTAAATTTAGCCCTCAAGGCATAATAGCCATAGGGGTTTGACCCTAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 72326 212 - 647215 GAAGGAATAGTCTGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTGGACTGCAGAGACATGATAGGCACACAAAGTACAGCTATGAGGGAACACCTAATATGCAAATACCCATTATCTGTAGGCCCAC--CCTATGGTTCATCCCTGTGTTTAATCTAGCCGTCAAGGCGTAATAGCCATAGTGGTTTGACCCTAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 146040 67 + 181019 GGCTTTCAGACCACAAAATCAAGAATATTCCCATAGTATAGTATATTGAGGAAGACATGGGATCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598121 67 + 636262 GGCTTTCAGACCACAAATTCAAGAATATTCCCATAGCATAGTATATTGAGGAAGACATGGGATCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 72538 67 - 647215 GGCATTCATACCTCAAAATCAAGAATAATCCCATAGTATAATATAGTGAGGAAGACGTGGAATCTTG - -a -s mr.mrrefChr3 146107 84 + 181019 TTGGCTCCTTGTTCAGTGGAATCAATCCCTCCAGTTCAATCGACGAAGGGGCTATGGTGAAGGTGGATTCAGTGAGTCTAAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598188 84 + 636262 TTGGCTCCTTGTTCAGTGGAATCAATCCCTCCAGTTCAATCGACGAAGGGGCTATGGTGGAAGTGGGTTCAGTGAGTCTAAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 72613 84 - 647215 TTGACTCCTCATTCAGCGAAATCCATCCCTGCAGTTCAACCGATGAAGGGGCTATGGTGAAGGTGGATTTAGTGGGTCTAATGA - -a -s mr.mrrefChr3 146191 35 + 181019 ATTCCAGTGCTTGCAGGAACTGCAGAGATACAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598273 35 + 636262 ATTCCAGTGCTTGCAGGAACTGCAGAGATACAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 72697 35 - 647215 ATGCCAGTGCTTGCAGGAAATGCAGAGATCCATCC - -a -s mr.mrrefChr3 146226 36 + 181019 TATATCATGTTCCACAGGTCCTATAAGCCCCAAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598310 36 + 636262 TATATCATGTTCCACTGGTCCTGTAAGCCCCAAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 72732 36 - 647215 TGTATCATATTCGACAGGTCCTATAAGTCCCAAGAC - -a -s mr.mrrefChr3 146262 222 + 181019 TTAAGGGGTAATGACCACCCCAAGATTTCATCTTTGTTCAACCACTTTGACTCATCAACTCACAGGTTTTTCAAAGATTACTCCTGGAATACTACATTTGGATTCTAAACATTTACTTATGGTCATTTGTCATAGCTTTCACTTCCCTTGTCTATGATTTGCCTTGGCCATCATATGATTAGCACTTGTAGAATCAACCCCACCAATAAAGCACACTACAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598347 222 + 636262 TTAAGGGGTAATGACCATCCCAAGATTTCATCCTTGTTTAACCGCTTTGACACATCAATTCACAGGTTTTTCAGAGATTGCTCCTGGAATACTACATTTGGATTGCAACCATTTACTTATGGTCATTTGTGATAGCTTTCACTTCCCTTGACTATGATTTGCCTTGGCCATCATTTGATTAGCACTTGTAGAATCAACCCCACCAATAAAGCACACTACAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 72768 207 - 647215 TTAACAGGTAGTAATCACCCCAAGATTTCCTCTTTGTTCAACCACTTTAACTCATCAAC--------------AAGATTACTCCTGGAATACTACATTCAGATTCTGCACATTTACTTACAGTCATTTGTCATAGCTTTCAGTTCCCTTGTCTATGA-TTGCCTTGGCCATCATATGATCAGCACTTATAGAATCAACCCCACCAATAGAGCACACTACAAT - -a -s mr.mrrefChr3 146484 65 + 181019 CAGATTCGGAAACTGAGGGCAACCTTCAGACATCTATCTTCCTACGGCAAAAGAATTTAGGTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598584 65 + 636262 CAGGTTCAGAAACTGAGAACAACCTTCAGACACCTATCTTCCTACGGGCAAAGAATTTAGATGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 72975 65 - 647215 CAGATTCGGAGACTGAGGGCAACCTTCAGACATGTATCTTCCTATGGCAAAATAATTTAGGTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 146549 18 + 181019 CATATGGCTTGAAAATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598649 18 + 636262 CATATGGCTTAAAAATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 73041 18 - 647215 CATATGGCTTGAAAATAA - -a -s mr.mrrefChr3 146567 93 + 181019 TGGCCTCGGAATGGGATTTGATTGTGCACAGTGTACTTCATACGTAAACATTGCCTGAGTAGCCATACTATAAGGATACAAAATATTCAGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598668 93 + 636262 TGGCCTCGGAATGGGATTTGGTTACGCACAGTGTACTTCATACATAAACATTGTCTGAGTCGCCGTGCTATAAGTATACAAAATATTCAGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 73059 92 - 647215 TGGCCTCAGAATGGGATTTGATTGTCCACAGTGTACTT-ATATGTAGACACGGCCTGAGTAGCCATACTATAAGGATACAAGATATTCTGAAG - -a -s mr.mrrefChr3 146660 23 + 181019 AAATAATACATTTCTATTCCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598762 23 + 636262 AAATAGTACATTTTTATTCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 73151 22 - 647215 -AATAATACATTTCTATCCCCAG - -a -s mr.mrrefChr3 146683 295 + 181019 TAGTTCCTACATATAACTCCAGGGCGGTGTCCTGGGAACATACATCATACAAATGATTGTGCTCCATTTCTCCATTGTGTGGAGCTGCATCTGTGCCTCATGGATGGTCTTCATTATCATTTTCAGCCTCTTTAGTTCAGCATTTTAATGTAGGTTTTGTGTGGACACACATAGCAATTTTTTTAAGATAACATTCTAGTTCCATCGGGGGTCAACATTGGGAATTAGTCATTATATGGCTGCAATATGACCTGGTCTTAGCAGAGAGGCTTATGATCTTCATCATGTGTGTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598785 287 + 636262 TAGTTGCTCCATATAACTCCAGGGCGGTGGCCTGGGAACATTCATCATACAAATGATTGTGCTCAATTTCTCCATTGTGTGGAGCTGCTTCTGTGCCTCAAGGATGGTCTTCATTATCATTTTCAGCCTGTTTAGTTCAGCATTTTAATGTAGGTTTTGTGTCGATACACATAGCAATTTTTTTGAGATAACATACTAGTTCCATTGGGGGTCAACATAGGGAATTAGTCATTATATGGCTGCAATATGACCTGGTCTTAGCAGGGAGACTTATAATCTTCATCATG-------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 73174 295 - 647215 TAGTTCCTACATATAACTGCAGGGCGGTCTCCTGGGAACATACATCATACAAATGATTGCACTCCATTTTTCCATAGTGTGGAGCTGCATTTGTGCCTCATGGATGGTCTTCGTTGTCACTTTCAGCCTCTTTAGTTCAGCATTTTAATGTTGGTTATATGTGGACACATATAGCAATTTTTTTAAGATAACATTCTAGTCCCATCGGGGTTCAAGATTGGGAATTAGTCATTATATGGTTGCAACATGACCTGGGCTTAGCAGAGGGGTTTATGATCCTCATCATGTGTGTACA - -a -s mr.mrrefChr3 146978 71 + 181019 CTTGTGTTGTTCTGGCAAAAAACATACCCCTGTTCAGCTTGCTAAGAGTGGTTTGTGGTACTAATCTAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599072 71 + 636262 CTTGTGTTGTTCTGGCACAAAGCATACCCCTGTTCAGGTTGCTAAGACTAGTTTGTGGTACTAATCTAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 73489 71 - 647215 CTTGTGTTGTTCCAGCAAACTACATACCCCTGTTCATCTTGCTAGGAGTGATCTGGGGTACTAACCTAATT - -a -s mr.mrrefChr3 147049 92 + 181019 AAATTACCTCAGACACCATTATTATTTCTCCTGCCCATCATCATGTTATACAGAATTATCTTTGGCTTCACTGCAAGTGGTCAACACTGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599144 92 + 636262 AAATCACCTCAGACAGCATTTTTATTTCTTCTGCCCATTATCATGTTTTACAGACTTATCTTTGGCTTCAGTGCGGGTGGTCAACACTGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 73560 89 - 647215 ---TTACCTCAGACACCATTATTATGTCTCCTGCCCATCATCATGTTATACACAATTATCTTTGGCTGCACTGCAAGTGGTCAACACCGTGC - -a -s mr.mrrefChr3 147141 235 + 181019 ACTAAGTCTGTCATGCTAGATTACTGATGTTGGGTGGTGATACTCCATTCGGCACTTTTTTGTAAATATTATTGTTATCTAACTTCCACTCCCTCACTCCCCGGACCCTGGCAGTCATACATTGCTCTCACTTCATCGCACAAGCCACTTTGAACTAGGGGGACAAGTGGTATCTGGGTGGATGGTAACATCTTGAAGGGTAATTGTTGTCAGGTGTAACTGTCCAGTAGATTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599238 228 + 636262 GCTAAGTCTGTCATGCTGGATTGCTCATGTTGGGCGGTGATACCCCATTCGTCACTTTTTTGTAAATATTATTGTTGTCTAACTTTCACTCCCTCACTCCCCGGACCCTGGCAGTCATACATTGCTCTCACTTTGTC-------CCACTTTTACCTAGGGGGATGAGTGGTATCTGGGTGGATGGTAACATCTTGAAGGGTAATTGTTGTCAGGTGTAGCTGTCCAGTAGATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 73649 235 - 647215 ACTAATTCTGTCATGCTAGATTACTGATGTTGGGTGGTGGTACTCCATCTGGCACTTTTTTGTAAATATTATTGTCACCTAACTTCCACTCCCTCACTCACTGGACCCTGGCAGTCATACATTGCTCTCATTTCATCGCACAAGACACTTTGAACTGGTGGGACAAGTGGTATCTTGGTGGATGGTAACATCTTGGAGGATATTTGTTCTCAGGTGTAACTGTCCAGTAGACTGT - -a -s mr.mrrefChr3 147376 146 + 181019 ACCACCTCTACCTAAAGAGGCCCAAATATGAGCAGTCCTACAATGTGCCACCAGTACTGTGGAATTTACCCCCATGAGTCAACACAATAATAACATCTtatgtttttcagataagtagatatcttttttagcaggatgcttattaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599467 144 + 636262 GACACCTCTACCTAAAGAGGCCCAAATATGAAGAATCCTAAAATG--CCACCGGTACTGTGGAATTTCCCCCCATGAGTCAACACAATAATTACATTTtatgtttttcagataagtagatatcttttttagcaggatgcttattaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 73884 146 - 647215 ACCAGCTCTACCTAAAGATGCCCAGAAATGAGCAGCCCTACAATGTGACACCAGTACTGTGGAATTTACCCCCATGAGTCAACACAATAATAACAGCTtatgtttttcagataagtagatatcttctttagcaggatgcttatttg - -a -s mr.mrrefChr3 147522 11 + 181019 aggtatttctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599619 11 + 636262 aggtatttctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 74030 11 - 647215 aggtacttctt - -a -s mr.mrrefChr3 147533 23 + 181019 ttgttggttttattcttgtaagc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599637 23 + 636262 ttgttggttttattcttgtaagc -s simRat_chr6.simRat.chr6 74041 23 - 647215 ttgctggttttattctcgtgagc - -a -s mr.mrrefChr3 147556 9 + 181019 cttgttgta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599660 9 + 636262 cttgttgta -s simRat_chr6.simRat.chr6 74073 9 - 647215 cttgttgta - -a -s mr.mrrefChr3 147565 17 + 181019 agttcacacatgaggag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599669 17 + 636262 agttcacacatgaggag -s simRat_chr6.simRat.chr6 74091 17 - 647215 ggttcagacatgagggg - -a -s mr.mrrefChr3 147582 40 + 181019 ttccaatgggtaagttcatgatgggcttcattgaagatga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599704 40 + 636262 ttccaatgggtaagttcatgatgggcttcattgaagatga -s simRat_chr6.simRat.chr6 74108 40 - 647215 ttccaatgggttagtgcatgatgggcttcattgaagatga - -a -s mr.mrrefChr3 147622 26 + 181019 agctgcattgagatttaagcttacac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599745 26 + 636262 agctgcattgagatttaagcttacac -s simRat_chr6.simRat.chr6 74148 26 - 647215 acctgcattgagatttaggcttacac - -a -s mr.mrrefChr3 147648 86 + 181019 tacatcttgtatctaatTTTCACTAGTAATAGCTTAATATCTTAAAGATGGCAATAAATGTACATTAGGTCTAGTGTATAGTTTCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599771 85 + 636262 tacatcttgtatctaatTTTCACTAGTAATAGCTTAATAACTCAAAAATGG-AATAAATGTACATTAGGTCTAGCATATAGTTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 74176 86 - 647215 tacatctcgaatctgatTTTCACTAGTAATAACTTCATATCTTAAAGATGGCAATAAATGTACATTAGGTCTAATGTATAGTTTCG - -a -s mr.mrrefChr3 147734 76 + 181019 TGTGTCTTTCCCATTATCAGAGATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTAACAGTGAATCACATCTCACCTGCTTCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599856 75 + 636262 TGTGTCTTTCCCATTATCAAAGATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTAACAGTG-ATCACATCTCACCTGCTTCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 74273 76 - 647215 TGTGTATTTCCCATTATCAGAAATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTGACAGTGAATCATATCTCACCTGCTTTTCC - -a -s mr.mrrefChr3 147810 47 + 181019 AATTCTAAATACTTTTGTCTATGATGTGATGTTCAAAAATTATTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599939 47 + 636262 AATTCTAACTACTTTTGTCTATGATGTGATGCTCGAAAATTATTCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 74349 47 - 647215 AATTCTAAATACTTTTGTCTATGATGTGATGTTCAAAAATTATTCCA - -a -s mr.mrrefChr3 147857 120 + 181019 TATGCCCAGTTTGCAAATCTGGGGATTAATTTTATGCCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCTGGGCTAGCACCTACCCTGCACCTTACATTGGCATAAGTGGAGATACAGTTGAACCCATCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600018 120 + 636262 TATGCCCAATTTGCAAATCTGGGGATTAATTTTATGTCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCAGGGCTAGCACCCACCTTGCACTTTACATTGGCATAAGTGGAGATACAGTTGAACCCATCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 74396 120 - 647215 TATGCCCAGGCTGCAAATCTGGGGATTGATTTTATGCCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCTGGGCTAGCACCTACCCTACACCTCACATTGGCATGAGTGGAAATACAGTTGAACCCGTCTT - -a -s mr.mrrefChr3 147977 443 + 181019 TGACGTAATCTGCCCCATTGTCATGTCAAAATTCCTCTTGCTTGGTGCACACAGAATTTCTAGTTTCTGTGCACAAAGAACCATACTTTGTCCCTTAGGTAAATTTATGCGGTATGACGCACTTGCTAATTTTTAGATAAGACTTTCCAATTTTTAGATATTTGGATACACTCTGTGAAACTCTCAGTTCCTGTTTTGACTTTAATAGCCTTAAGCAGCCTCCCATAAATATCATGGTTGATTTGGATTCTTAATGCTGCTCTACACTTTCAGATTAGCCCAAGTGCCTCCCATAATGGTCCTGTGTTAGGATCCTCCTACACTGTCAATCCCTTTTATCTTGCTCCCTGAAATGGGGTGATTTCAAGGTGAGACCAAATATTTGGAAAAAATGAAATATGGATCATGATCACATGGTGCTGGAGCATGTTGAAGCTATCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600156 431 + 636262 TGATGTAATCAGCCCCACTGTCATGTCAAAATT--TCTTGCTTGGTGCACACAGAATTTCTAGTTTCTGTGCACAAAGAACCATACGTTGTCCCTTAGATGAATTG----GGTATGACGCACTTGCTAATTTTTAGATAAGACTTTCCAATTTTTAGATATTTGGATACACTTTGTGAAACTCTCAGTTCCTGTTTTGACTTAAATAGTCTTAAGCAGCCTCCCATAAATATCATGGTTGATTTAGATTCTTAATGCTGCTCTACACTTCCAGATTAGCCCAAGTGCCTCCCATAATGGTCCTGTCTTAGGATGCCCCTACACTGACAATCCCTTTTATCTTGCTTCCTGAAATGGGGTGATTTCAAGGTGAGACCTAATATTTGGAAAAAATGAAATATGGATCATGATCACATGGTGCTGGAGCATGTTGAAGCT------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 74516 441 - 647215 TGACTTAATCTGTCCCATTGCCATCTTAAAATTCCTCTTGCTTGGTGCACACAGAATTTCTAGTTTCTGTACACAAAGAACCATACTTTGTCCCTTAGGCAAATTTATGCGGTATGATGCAATTGCAAACTTTTAGATAGCACTACTCAATTTCTAGATATTTGGATACACTCTGTGAATCTCTAATTTCCTGTTTTGACTTTCATAGCCTTAAGCAGCCTTCTATAAATATCATGGTTGACTTGGATTCTTAATGCTGCTCCACACTTTCACCTTAGCCCAAGTGCCTGCCATAATGGTCATGTGGTAGGATCCTCCTACACTGTCAATCGCTTTTATCTTGCTCCCTGAAAAGGGGTGATTCCAAGGTGAGACCAAATGTTTAGAAAAAATCAAATATGGATCGTGAACACATGGTGCTG--GCATGTTGAAGCTATCTAA - -a -s mr.mrrefChr3 148420 296 + 181019 GGTTGATCTGTGCACTTGAATAAAAAAAACATCATTTTGATGTGATACCCCTGTATTATTTTGTATTAGCTACTTACGAGTCTGTCGTGATATATCAGCAGTTACAAGAAATCAAGGGAGTTCAGCAAGATGATGCCCTCCAGCTCCCAAAAGACCTCGATTATTTGACAATCAGGGATGTTACGCTAACACATGAACTAAGGGCAAAGTTACATTTTAGTCCTCCACAGACTGTTGTATATAGTAGTCCAAAGTGAGGAGTTGTCATACGGAAAAAAGTGTATCTTGAAGTTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600587 282 + 636262 --------------CTTGAATAAAAAAAACATCATTTTGATGTGATACCCCTGTATTATTTTGTATTAGCCACTTACGAGTCTGTCGTGATATACCAGCAATTACAAGAAATCAAGGGAGTTCAACAAGATGATGCCCTCCAGCTCCCAAAAGACCTCGATTATTTAACAATCAGGGATGTTACGCTAACACATGAACTAAGGGCAAAGTTACATTTTAGTCCTCCACAGACTGTTGCATATAGTAGTCCTATATGAGGAGTTGTCATACGGAAAAAAGTGTATCTTGAAGTTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 74975 296 - 647215 GGTTGATCTGTGCACTTGAATAAAAAAAACATCATTGTGATGTGATACCCCTGTATTATTTTGTTTTAGCTACTTACGAATCTGTCTTGATATATCAGCAGTTACAAGAAATCAAGGGAGTTCAGCAAGATGATGCCCTCCAGCTCCCAAAAGACCTGGATTATTTGATGATCAGGGATGTTACACTAACACATGAACTAAGGGCAAAGTTACATTTTAGTCCTCCACAAACTGTCGTATATCGTAGTCAAAAGCGAGGAGTTGTCATATGGAAGAAAGTATATCTTGGAGCTAAA - -a -s mr.mrrefChr3 148716 164 + 181019 CTCCTGGTCTGATCCAGTCATAAGAACTGCAATAGAGATTGCTAACAGTTACCCAATTGAGGGTTTCCAGACTCTGGACACCCCCATATAAATAACCTGTTAGGTCTACAAATGCATGGTCTGCCAAGAAAAGACATAAGTAAAGATAGTCTTCTATGAAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600870 164 + 636262 CCCCTGGTCTGATCCAGTCATGAGAACTGCAATAGGGATTGCTAATAGTTACCCAATTGAGGGCTTCCAGACACTGGACACCCCTATACAAATAACCTGTTAGGTCTACAAATGCATGGTCTGCCAAAAAACGACATAAGTAAAGATAGTTTTCTATGAAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 75271 163 - 647215 CTCCTGGTCTGATCTGGTCATAAGAACGGCAGTAGAGTCTGCTAACAGTTACCCAATTCAGTGTTTTCAGACTCTGGGCGCCCCCATATAAAAAACCTGTTAGGTCTACAAATGCATGGTCTGCCATGAAAAGACATAAG-AAAGGCAGTCTACTATGCAAATT - -a -s mr.mrrefChr3 148880 5 + 181019 TTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601034 5 + 636262 TTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 75436 5 - 647215 TTTCT - -a -s mr.mrrefChr3 148885 149 + 181019 CTCACACCCATGATGATATCTCATGGGGATATTCCAATTTCAGAGTTCCAAGAACAATATAGTTTTGGTAATGGATTCTTATCTTGTCTACCACACACTGATTTGTTTCACATTAGGCTAATCACTTTTTCAACTGAACCTAATTAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601039 149 + 636262 GTCACACCCATGATGATATCTCGTGGGGACATTCCAATTTCAGAGTTCCAAGAACAATATAGTTTTGGTAGTGGATTCTTATCTTGTCTACCACACACTGATTTGTTTCACATTAGGCTAATCACTTATTCAACTGAACCTAATTAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 75442 149 - 647215 CTCACTCCAACAATTATATCTCATGTGGATATTCCAATTTCACGGTTCCAGGAATAATATAGTTTTGGTAATGGATTCTTATCTTGTCTAACACACATTGAGTTTTATCACATTAGGCTAACCGCCTTATCAACTGAACCTAATCAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 149034 53 + 181019 TATGTCATGAATTGTAGAGTCCATTGCCATACGTATCACACCTGTTTAGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601214 53 + 636262 TATGTCATGAATTGTAGAGTCCATTGCCTTGCGTATCACACCTGTTTAGGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 75591 53 - 647215 TATGTCATGAATTGTGGCATCCATTGGCATACATATCACAGCTGTTTAGGACT - -a -s mr.mrrefChr3 149087 10 + 181019 AGCTGAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601267 10 + 636262 AGCTGAGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 75645 10 - 647215 AGCTGCAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 149097 65 + 181019 TTTCTGAAAGCCTTCTAGAAGGAGCTTCTAATCATCCAAACAAGGTCCTAGGTCAAGCATTACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601283 65 + 636262 TTTCTGAAACAATTCTAAAAGGAGCTTCTAATCATCCAAACAAGGTCCTAGGTCAAGCATTACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 75655 65 - 647215 GTTCTGCCAGCCCTGAAGAACGAGCTTCTAATCATCCAAACAAGGTCCTAGGTCAAGCGTTGCTC - -a -s mr.mrrefChr3 149162 82 + 181019 ATAACCCTTCACAAACAGCACATATTGCCATGTGTACTTTGATTACAGACACCCTACTGAGCAGGTGAAAGGACACAGAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601348 64 + 636262 ATAACCCTTCACAAACAGAACCTATTGCCATGTGTACTTTGATTACAGACACCCTATTGAGCAG------------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 75723 71 - 647215 ATAACCCTTCACAAACAGCACATGTTATCAT-----------TTAGAGACACCCTACTGGGCAGGTGAAAGGACACAGAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 149244 50 + 181019 TTCCATGTCCACACTGCAAACATTTGTGCACCCAAATATTTAAGGGATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601412 47 + 636262 ---CTTATCCACACTGCAAACATTTGTGCACCCAAATATTTAAGGGATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 75795 50 - 647215 TTCCATGTCCACACTGCAAACATTTGCACACCCCGATATTTAAGGGAGAT - -a -s mr.mrrefChr3 149294 37 + 181019 ATAAGACAACCTTAGACAGGGAAGTGTTGACTCCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601461 37 + 636262 AGAGAACAACCTTAGACAGGGAAGTGTAGACTCCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 75845 37 - 647215 ATAAGACAACAATAGACAGGGAAGTGCTGACTCCCAC - -a -s mr.mrrefChr3 149331 181 + 181019 AAGCCATGTACTGGCAATGTCTGTTGAACAATGGATTAACAAGAATAACGATACACAAACTAAATAAACCTCATATAAACACTAGCATCAGTACAGCTAGCAAGTCATTGCAAAGTCATACCTTAAGTTTGACTCTGATCTGTCACAATACATGTTACTTAAATAATTGGGCTCCTGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601498 179 + 636262 AAGCCATGTACAGGCAATGTCTGTTGAACAATGGATTACCAAGAATAAC--TACACAAACTAAATAAACCTCATATAAACACTAGCATCAGTACGGCTAGCAAGTCATTGCAAAGTCATACCTTAAGTTTGCCTCTGATCTGTCACAATACAGGCTACTTAAATAATGGGGCTCCTGCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 75907 180 - 647215 ATGCCATGTACTGGCAATTTTTGTTAAACAATGTATTAACAAGAGTAGCGACACACATACTAAGTAAACTTCATACAAACACTCGCATCAGTACAGCCAGCGAGTCATTGCAAAGTCGTACCTTAACTTTGACTCTGATTTGTCACAATACATGTTACTTAAA-AACTGCGCTCCTGCACT - -a -s mr.mrrefChr3 149512 221 + 181019 GATAATGTAAACATCGAGGGAGGTCTCTGTGTGTTCCCACAGCCAATCAGAGTACTCATGGGAGTAGTTGCCAGGGCATAGCACTACCACTTATCACTATCTGACTGAGGGTTTTGCGAATAGGATTCAGGTCTCTCAGGCCTGACAGAGAGGTATTATTCTCCATTACCTTAATCATCGGGGGAAGGTTAAAGATTTCATGTTGTTCTTTTTTTTTAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601686 221 + 636262 GATAATGCAAATATCGAGTGAGGTTTCTGTGTGTTCCTACAGCCAATTAGGGTACTCATGGGAGTAGTTGCCAGGGCATAGCATTATCAATTATCACTATCTGACTGAGGGTTTTGCGAATAGGATTCAGGTCTCTCAGGCCTGACAGAGAGGTATTATTCTCCATCACCTTGATCATCGGGGGAAGGTTAAAGATTTCATGTTGTTCTTTTTTTTTAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 76087 220 - 647215 GATAATGTAAACATCCAGGGAGGTCTCTATGTGTTTCCACAGTCAATCAGAGTGCTTATGCG-GTAGGTGCCAGGGCATAGTGCTACCACTTATCACTATCTAATTCCAGGTCTTGACAATCGGATTCAGGTCTTTCAGGCCAGACAGAGAGGTATTATTCTCCATTACCCTAATCACCAGGGGAAGACTAGAGATTTCATGTTGTTCCATTTGCTCAGTG - -a -s mr.mrrefChr3 149733 51 + 181019 tggctttcatataacatgtatcttagtctacgagcgtgcaacctcaggtca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601936 51 + 636262 tggctttcatataacatgtatcttagtctacgagcgtgcaacctcaggtca -s simRat_chr6.simRat.chr6 76307 51 - 647215 TGGCTTTCATATAACCCGTATTGTAGTCTAAGCGGGCGCAACCTCAGGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 149784 288 + 181019 tggcattaggacgtagcaccaatgttcaaggcaaaaaattttgatgtacaccaaacgcaactcgaaaggtcctaacttctagactctatgtatacaaattacatcttgtggagtGATGGTCAGATCTCTCCCCCCAGGTAGTTTTATCAGTTGTACTTTACTGCATGCACTGCGTTAGCAGGGTCACAATCAGGCACAATGCACTACTATGACTCTAGACACTGACAATCACTTTCCCTGCTCATCTTTTTATTGACAGATCTCCATGTCATCTGTCCTACTGCCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601987 277 + 636262 tggcattaggacgtagcaccaatgttcaaggcaaaaaattttgatgtacaccaaacgcaactcgaaaggtcctaacttctagactctatgtatacaaattacatcttgtggagtGATGGTCAGATCTCTCCCCCCAGGTAGTTTTATCAGCTGTACTTTACTAC-----------TAGCAGGGTCACAATCAGGCACAATGCACTACTATGACTCTAGACCCTGACAATCACTTTCCCTGCTCATCTCTTTATCGACAAAGCTCCATGCTATCTGTCCTACTGCCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 76367 281 - 647215 TAACATTAGGACATAGCACCAATGTTCAAGGCAAATAATTTTGATACACACAAAATGCAACTTGAAAAGTCCTCACTTCTAGACTGTATGCACACAAAATACATCCTGTGGAGTACTGGTCAAATCTCTCCACCCAGGCGGTTTTATCAGTTGTGCTTTACTGCATGCACTGCGTTAGTAGGGT-------AGGCACAATCCACTACTATGACTCTAGACACTGAAAATCACTTTCCCTTCTCATCTTTTTAATGACAGATCTTCATGTCATCCATGCTGTAGCACCC - -a -s mr.mrrefChr3 150072 33 + 181019 CTTATCTGTTTCCAACTGTAAGCATACATGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602272 33 + 636262 CTTATTTGTTTCCAAGGGTAAGCATACGTGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 76648 27 - 647215 CTTGTCTGTTTCCAGCTG------TACATGTCT - -a -s mr.mrrefChr3 150105 215 + 181019 GCCCAAACACATAAGGGCCAGAGGTCATTCAAATTAAGACACCTTCAGAACTGTCCTGGAGATTCTGAGGCATCTTTGTGCAAGCACAGCTGGGTTTTAATTGTGTTGTCGTCATCTGATAATTTTATAATAGAAGAAGGTACCTGGTTCTGAGACATTTAATATAGCCTTCTTCTCAGCCTAGTGCCACTTCAGCCACCCATCAGACATGCTCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602305 215 + 636262 GCCCAAACACATGAAGGCCAGAGCTCATCCTAATCAAGACACCTGCAGAACTGTCCTGGAGATTCTGAGGCATCTTTGTGCAAGCACATCTAGGTTTTAATTGTGTTGTTGTCATCTGGTAATTTTATAATAGAAGAAGGTACCTGGTTCTGAGACATTTAATACAGTCTTCTTCTCAGCCTAGTGCCATTTCAGCCACCCATCAGACATGCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 76676 215 - 647215 GCCCAAACACATAGGTGCCAGAGGTCAGTTACATTAAGACACCTTCAGAACCGTCCTGGAGATTCTGTGGGATATTCGTGCAAGCATAGCTGGGTTTTAATTGTGTTATCATCATCTGATAATTTTCTATTAGAAGAAAGTATCTGGTACTGAGGCATACAATATAGCCCCCTTCACAGCCAAGCACCACTTGAGCTGCCCATCAGCCATGCTCG - -a -s mr.mrrefChr3 150320 144 + 181019 GAACTTATAAGTTGAGTGGATAGGTTGCCGGCAACTCAAGCGCAGTGGAACTTGTTTCCTCAGAAGTAGAAGTTTGCATACCAAAAAGCTACCTTCAATGGAACCTGTACAAAATTGGACATGTGTAGTTTCTACCAATTATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602521 144 + 636262 GAACTTATAAGTTGAGTGGATAGGTTGCCGGCAACTCAAGCGCAGTGGAACTTGGTTTCTAAGAAGTAGAAGTTTGAATACCAAAAGGCTACCTTCAATGGAACCTGTACAAAATTAGACATGTGTAGTTTCTACCAATTTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 76891 144 - 647215 GAAGTTTTAAATTGAGCAGATGAGTTGGTGGTAACTCAAGCCCAGTGGAATTTGTTCCCTCAGAAGTAGAAGTTTGCATACTGAAAAGCTACCTTCAATGGAACCTGTACAAAATTGGACATGGGTAGTTCCTACCAATCATTT - -a -s mr.mrrefChr3 150464 31 + 181019 ACTTAGGTGGCTCACAATTAGCTTTCTCGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602666 31 + 636262 ACTTGGGTGGCTCACAATTAGCTTTCTCGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77035 31 - 647215 ACTTAGGTGGCTCACAATTAGCTTTCTTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 150495 47 + 181019 TTTGCTGTTAATCTCAGTCCAATTGCACCGTTGTTCAGCCAAATGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602698 47 + 636262 TTTGCTGTTAATCTCAGTCCAATTGCACCGTTGTTCAGCCAAATGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77066 47 - 647215 TTTGCCATCCATCTCGGTCTAATTGCACACTTGTTCATCCAACTGGA - -a -s mr.mrrefChr3 150542 15 + 181019 GGGAGTCCTAGCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602745 15 + 636262 GGGAGTGTTAGCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 77120 15 - 647215 GGAATTCCTCGGCCT - -a -s mr.mrrefChr3 150557 15 + 181019 TTGTAATTGAGATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602761 15 + 636262 TTGTAATTGAGGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77135 15 - 647215 TTGCAATTGAGATTA - -a -s mr.mrrefChr3 150572 74 + 181019 GTGATGGATTTGGCCCCCAAACAAGGGGTTACTGTGCATGAGGACCCTTACGAGCCCCACAGCCTGGTATTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602782 71 + 636262 GTGATGGATTTGGCCCCCAAACAAGGGGCTACTGTGCATGATGTCCCTTACGAGCC---CAGCCTGGTATTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 77150 71 - 647215 TTGATGA---TGCCCCCCAAACAAGGAGTTGCAATGCATGAGAACCCTTATTGGCCCCACAGCCTAGTATTTTG - -a -s mr.mrrefChr3 150646 60 + 181019 GTGAATAAGAAATGCATGTAGAGAACATCCATGACAGCTGCCTACTCCACTTTAACATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602855 60 + 636262 GTGAATAAGTAATGCATGTGGAGAATGTCCATGAAAGCTGCCTACTCCACTTTAACATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77221 60 - 647215 GTGAATAAGAAATGCATGCAGGAAACATCCATGACGGCTGCCTACTCCACTTTTACATGA - -a -s mr.mrrefChr3 150706 145 + 181019 AATCACCAAGTTGACTTTTGCTTCGGGCTGCTTGTTACAGTGCATGGGCTGACACAGGAGCATCCTCACAATGTCTGATACAGAAGCATTCTCACTATAATGAACATCTTGTAAACACATGTATAGACATTTGTGGTATGGGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602916 145 + 636262 AATCACCAAGTTGACTTTTGCTTCAGGCAGCTTGTTACAGTGCATGGGCTGACACAGGAGCATCCTCACAATGTCTGATACAGAAGCATTCTCACTATAATGAACATCTTGTAAACACATCTATAGGCATTTGTGGTATGAGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 77281 145 - 647215 AATTGCCAAGCTGACCTCTGCTTCGGGCTTCTTGTTACTGTGCATGGGGTGACACAGGAGTATTCTCACAATGTCTGATACACAAGTATTCTTACTATAATGAACATCTTGTAAACACATGTATAGACATTTGCAGTACGGGGAT - -a -s mr.mrrefChr3 150851 23 + 181019 AATCTAAATTAAACAAAAGTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603063 23 + 636262 AATCTAAGTTAAACAAAAGTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 77426 17 - 647215 ------AATTACACAAAAGTCTC - -a -s mr.mrrefChr3 150874 121 + 181019 TATTACATGAAAATCTGCAACAGAGATAGCGGTGAAATGAGATGTAAGTTTCTGCCCGGGAAGCTACAGCACTTAGCATGCCAGAGGGGGATATTACCTACTATTTGTGTCTCCCATTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603087 121 + 636262 TATTACATGAAAATCTGCAACAGAGATAGTGGTGAAATGAGATGTAAGTTTCTGCCCGGGAAGCTACAGCACTTAGCTTGCCGGAGGGGGACATTACCTACTATTTGTGTCTCCCTTTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 77443 100 - 647215 AGTTACATGAAAATCTGCAACAGAGACAGCGGTGAAATGAGATGCA---------------------AGCATTTACCATGTCAGAGAGGGATGTTACATACTATTTATGTCTCCCATTCCT - -a -s mr.mrrefChr3 150995 28 + 181019 GCTAAAGAAGCTTCTGTTGATGGCACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603208 28 + 636262 GCTAAAGAAGCTTCTGTTGATGGCACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 77545 28 - 647215 GATAAAGAAGCTTCTGTTGATGGCACCC - -a -s mr.mrrefChr3 151023 71 + 181019 TACTGTGTTGATACCTGCTCTCTCCATAGCCCAGGAGTGTGGTCTAAGAAATATTAAGGTATTTACCCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603244 71 + 636262 TACTGTGTTGATACCTGCTCTCTCCATAGCCCAGGAGTGTGGTCTAAGAAATATTAAGGTATTTACCCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77573 71 - 647215 TACTGTGTTGATACCTGCCTGGTCCATAGTGCAGGAGTGTTGTCTAGGAAATATTAAGGACTGTACCAACA - -a -s mr.mrrefChr3 151094 113 + 181019 TCACACCATGCTTAATGGTCCACGAGGCTGTAAATGAAATTCAGACAACAACCAGCATTATCAATTCCTGGCAGAATCATTCTGAAGACTGGTGCTATTCACTGCCCTCAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603316 113 + 636262 TCACACCATGCTTAATGGTCCACGAGGCTGTAAATGAAATTCAGACAACAACCAGCATTATCAATTCCTGGCAGAATCATTCTGAAGACTGGTGCTATTCACTGCCCTCAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 77644 113 - 647215 TCACACCATGCATAATCATCCATGAGGCTGTAAATGCAATTAAGCCAACAACCAGCATTATGAATTCCTTACAGAATCATTCAGAAGACTGATGTTATTCACTGCCCACAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 151207 282 + 181019 TGTGCCAAGGTCTCACAAAATCTGATAATAACCTTAAAGTTCACTCAAAGGCTCATGTGGACATTGCATTGGGCCCCCAGTTCACTTTTGTCTCATGGGTGGTGAAGACAAATGAGCCAATGGGGCCCTGAGCTCTGCATGATGCAGAGTGTAATCAGGGTGTTGCTACAAGAGATGGTGAAACACTGCCAACATGTCATACTCACCATGTCCTATCTAACTTCAGCATAAACCTGGTCGGGGCTAGAACCATATGTGGCCATATACTGACTTGATTCTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603480 282 + 636262 TGTGCCAAGGTCTCACAAAATCTGATAATAACCTTAAAGTTCACTCAAAGGCTCATGTGGACATTGCATTGGGCCCCCAGTTCACTTTTGTCTCATGGGTGGTGAAGACAAATGAGCCAATGGGGCCCTGAGCTCTGCATGATGCAGAGTGTAATCAGGGTGTTGCTACAAGAGATGGTGAAACACTGCCAACATGTCATACTCACCATGTCCTATCTAACTTCAGCATAAACCTGGTCGGGGCTAGAACCATATGTGGCCATATACTGACTTGATTCTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 77757 282 - 647215 TGTGCCAAGGTCTCACAGAATCTGATAATAACCTTAAAGTTCGCTCAAAGGCTCATGCTGACATTGCAATAGGCCCCCAGTTTACTTGTGTCTCATGGGGGGTAAAGACTGAGGAGCCAATGGAGCCCTGAACTGTGTATGATACAGAGTGTAATGAAGGTGTTGCAACAAGAGATAGTGAAACCCTGCCAACATGCCATACTCACAATGACCTGTCCAATTCCAGCATACACTTGGTCTGGACTAGAACCATATGTGGCCAAATACTAACTTGATTCATTT - -a -s mr.mrrefChr3 151489 663 + 181019 CCTCTTTACTGGATTGCTTGCACCGTTGCTTGTCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGCTTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATATTGGTGAATTCTACTCAACGACAGTCTGCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGCGGACCGTCTACAGGAAATAGAATTACAGCTACCCTGCTATAAAAACTGATGATGAAAAATCATGCATAGCAGCTATGTTAGACTGCAGGTAATGCTATAACCATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATTTGCTGCACTATAGGCAGATGAAGAAGAAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCACAATTGATGCTCCAATGTCCTAGGTCAATAATCCTGCTTTTATTTTCATTCTGGAGATTAGGGTTGAAAGCATGTTAATTTAGATTCAGACCAGACATCCTTCAAGTGTCATACCAGTGGATGGAATGACATGGTATGAACAGTATGTACAAACAGCAAATTAAGCAGCCATTTTACTAGCCATATATACTACAGGCATTGACCCAAAGACCCCTGAGCCTTCAGATGTGGCATAGTTTAGAACCCAAGCTTAATATTATGTCACTCAATGTGTGACAAACACTCTCCTGCTATTCACCAGTGTCACCTGGCTGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603762 656 + 636262 -----TTCCTGGATTGCTTGCACCGCAGCTTGTCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGATTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATCTTGGTGAATTCTACTCAACGACAGTCTGCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGCGGACCGTCTACAGGAAATAGAATTACAGCCACCCTGCTATAAGAACTGATGATGAAAAATCATGCATAGCAGCTATGGCAGACTGCAGGTAATGCTATAACCATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATATGCTGCACTATAGGCAGATGTGGAAGGAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCGCAATTGATGCTCCAATGTCCTATGTCCATAATCATGCTTTTATTTTCATTCTGGAGATTAGGGTTGGAAGCATGTCAATTTAGA-TCAGACCAGACATCCTTCAAGTGTTATACCAGTAGATGGAATTACATGGTATGAACAGCATGTATAAACAGCAAATTAAACAGCCA-CTTACTGGCCATATATACTACAGGCATTGACCCAAAGACCCCTAAGCCTTCAGATTTGGCATAGTTTAGAACCCAAGCTTAATATTATGTTGCTCAATGTGTGACAAACACCCTGCTGCTATGCATCAGTGTCACCTGGCTGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 78043 652 - 647215 CCTCTTTATTGGATTACTTGCACCCTTCCTCATCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGCTTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATATTGGTTAATTCTACTCAACGACAGTCTCCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGTCGACCGACTACAGGAAATAGAATTACAGCTACCCTGCTATAAAAACTGATGATGAAAAATCACGCATAGCAGCTATGTTAGAGTGCAGGGAATGTTATGACTATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATTAGCTGCACTATAGGCAGATGAAGAAGAAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCACAATTGGTGCTCCAATGTCCTAGGTCAAAAATCCTGCTTGTAATTTTATCCTGGAGATTAGGGTTGAAAGCATGTTAATTTAGATTCAGACCAGACATCCTTCAAATGTCATGCCAGTGGATCGACTGACACAGTATGAACAGTATATACAAACAGCAAATTAAGCAGCCATTTTACTAGCCATGTATAGTACAGGGATTGACCCAAAGACCCCTGAGCCTTCAGATGTGGCATAGTTTAG-----------AATATTATGTCACGCAATGTGTGACAAACACTCTCCTGCTATTCACCAGTGTCACCTGACTGAGG - -a -s mr.mrrefChr3 152152 20 + 181019 CTGTGCCTGAGCATAATCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604419 20 + 636262 CTGTGCCTGAGCATAGTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 78695 20 - 647215 CCGTACCTGAGCATAATCTG - -a -s mr.mrrefChr3 152172 19 + 181019 GCCGTTGGGCCCAAAGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 78718 19 - 647215 GCCGTTGGGCCCAAAGTGC - -a -s mr.mrrefChr3 152191 32 + 181019 ATAGGCACAGAACACTGGGCCCTGTGGCCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604439 27 + 636262 -----CACAGCACACTGGGCCCTGTGACCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 78738 32 - 647215 ATAGGTGTAGAACGCTGGGCCCTTTGGCCAAG - -a -s mr.mrrefChr3 152223 272 + 181019 CCAAGTACCTTGTTAGGGGGAAGATTGATGAAGTTGTTAGGGGTTATGAGTTTATTATCAGCTACTTTATCAGGAAATACTTGTACATGGTTGCAGTCACCCCTGCACAGAACGCTGTGGGTTTCTTAAGGAAGCTGTGGATTTCTTCAAACTACAGTCCTGCAAAACTTCACAAACAGTACCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTTAACCTTCTTAAACTTCATTCAAAGGTTGTATGCCACGATCAAATAACCATCCGTACAGAGCGAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604467 272 + 636262 CCAGGTACCTTATTAGGGGGAAGATTGATGGAGTTGTTAGGGGTTATGAGTTTATTACCAGCTTCTCTATCAGGAAATACTTGTACATGGTTGCAGTCACCCCTGCACAGAACGCTGTGGGTTTCTTAAGGAAGCTGTGGATTTCTTCAAACTACAGTCCTGCAAAACTTCACAAACAGTATCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTTAACTTTTTTAAACTTCATTAAGAGGTTGTATGCCACGATTAAATGACCGTCCGTACAGAGCGAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 78770 272 - 647215 CCAAGTACCTTGTTCTTAGGAAGGTTGATGAAGTTGTTAGGGGCTAAGAGTTTATTATCAGCTACTTTATCAGGAGATATTCGTAGATGGTTGTGTTCACCCCTGCAAAGAAAGCTGTGCACTTCTTAAGGAAGTGGTGAATTTGCTCACACTACAGTTCTGGAAAACTTCTCAAACAGTACCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTAAACCTTCTTAAGCTTCATTCAAAGGTTGTATGCCACTATCAGATAACCATCTGTACAGAGTGAATG - -a -s mr.mrrefChr3 152495 24 + 181019 ATGAAAAAAGTTCAAGAGGACCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604750 24 + 636262 ATGAAAAAAGTTCAAGAGGACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 79042 24 - 647215 ATGAAAAAAGTTCAAGAGCGCCCC - -a -s mr.mrrefChr3 152519 7 + 181019 TTAATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604775 7 + 636262 TTAATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 79066 7 - 647215 TTGATGC - -a -s mr.mrrefChr3 152526 91 + 181019 TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604783 91 + 636262 TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79073 91 - 647215 TTTTTGGCTCATAGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCTGGCTTTTGGACTGGGGGACGTGTACATAAAATATTGCAGCTGGCACCATTTGA - -a -s mr.mrrefChr3 152617 20 + 181019 GGACATTAGATTACACCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604874 20 + 636262 GGACATTAGATTACACCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 79213 20 - 647215 GGATATTAGATTACACCCTC - -a -s mr.mrrefChr3 152637 8 + 181019 TATACCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604894 8 + 636262 TATACCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 79239 8 - 647215 TGTACCCC - -a -s mr.mrrefChr3 152645 157 + 181019 CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAACAAAGGACTTGGTACTCTCCCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604915 157 + 636262 CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAATAAAGGACTTGGTATTCTCCCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 79247 157 - 647215 CCCCCATTAGTTGAACTGGGGCACTAAGATAGATTCTGCTGAACAGGGAGGGACGTCACATATGATCCTTGGCCAACCTAATTTGCTTTAGCAAGCTTCTACAATTGTGTCTCTATTTATCACCTGTAAACTAACAAAGGACTTGGTACTCTGCCAT - -a -s mr.mrrefChr3 152802 43 + 181019 ATCTCCCTTGGGTAGGTCTATTTTAGACAAGATAATGCAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605073 43 + 636262 ATCTCCCTTGGGTAGGTCTATTTTAGACAAGATAATGCAGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79404 43 - 647215 ATTTCCCTTGGATAGGTCTATTTCAGACAAGATAATGCAGTTA - -a -s mr.mrrefChr3 152845 90 + 181019 TCACCATTGCCTGCCAGATTCTTTATAAAGGTGTCCTTACTCAGTCCTGGTGCAGAAAAATTACAGGCAATAGCATTAGACTCCCCCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605116 90 + 636262 TCATCATAGCCTGCCAGATACTTCATAAAGGTGTCCTTATTCAGTCCCGGTGCAGAAAAATTACAGGCAATAGCATTAGACTCCCCAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79448 89 - 647215 TCACCATTGCCTTCCAGATTCCTTATAAAGGTGTCCTTACTCAGTCCTGGTGCAGAAGAATTAGAGG-AATAGCATTAGACTCCCCCAGA - -a -s mr.mrrefChr3 152935 250 + 181019 CCAATTGCAGATGACCTACAGTTCCTTGTCTGTGTATGATTTCAGTTCAAGGACTCTTTGCACCAAGGTATGAGATAATCTTTGCTTGTTGCAGATCATTTCCATAGCAATTCAGTATTTTTAAAGGTAGGAGGATTCTACAAAGCCTACAAACCATTCTATTCTTGTTAGATGCCCTTGATTGGCCAATGTACATCACCTATTGAAACATTTATCCTTTAATCAGTACCACATCTGTGGTGAACCAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605206 250 + 636262 ACAGTTGCAGGTGACCTACAGTTCCTTGTTTCTGTATGATTTCAGTTCAAGGACTCGTTGCACCAAGGTATAAGATAATCTTTGCCAGTTGCAGGTCATTTCCATAGCAATTCTGTATTTTAAAAGGTAGGAGGATCCTATAAAGCCTACAAACCATTCTATTCTTATTAGATGCCCTTAATTGGCCAATGTACATCACCTATTGAACCATTCATCCTTTAACCAGTACCACATCTGTGGTGAACCAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 79538 250 - 647215 CCAATTGCAGATAACCTCCAGTTCCCTGTCCGTTTATGATTTCAGGTCAAGAAATTTTTGCACCAAGGAAGGAGATAATCTTTGCTTGTTGCAGATCATTTCCATAGCAATTCAGTATTTTTTAACGTAGGAGGATTCTACAAAGCCTAGCAAGCATTCTATTCTTGTTAGATGCCCTTGATTGGCCGATGTACGTCACCTATTGAAACATTTACCCTTTAATCAGTACCACGTCTGTAGTGAACAAAGG - -a -s mr.mrrefChr3 153185 56 + 181019 TTAGCTGGCCTTTGTTTTTACCTCAAGCTGGCAATTGTACTAAGATCTAGTACAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605458 51 + 636262 TCAGCTGGCCCTTGTTTTGGCCTCAAGCTGTCAATTGTTC-----TCTAGTACAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79788 56 - 647215 TTAAGTCACCTTTGTTTTTACCTCAGCCTGGCAATTGTACTAAGATCTAGTACAGA - -a -s mr.mrrefChr3 153241 70 + 181019 AGAACAAAATGGTCCCTCAAGATCCTCTGAGGGCCCAAAACTGATTCCTTAATCTAACTGTGTCAAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605509 48 + 636262 AGAACAAAATGGTCCCTCAA----------------------GGTTCCTTAATCAAACTGTGTCAAGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79845 70 - 647215 AGAACGAGATGGTGCCTCAAGATCCTCTGAGGGCCCAAAACTGATTCCTTAATCTAACACTATCAAGTTA - -a -s mr.mrrefChr3 153311 48 + 181019 GAAGTAGACAGGATGGGCTGCACCAGGGTAGGTGAACAACCTATCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605562 48 + 636262 GAAGTAGACAGGATGGGCTGCACCAGGATAGGTGAACAACCTATCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 79915 48 - 647215 GAAATATACAGGATGGGCTGCACCAGGGTAGGTGGACAACCTATCTAC - -a -s mr.mrrefChr3 153359 54 + 181019 ATAACCAAAAATAAGTATTAAGCATTGATTCTTTAACACAGAACCTACCATTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605615 54 + 636262 ATACCCAAAAATAAGTATTAAGCATTGATTCTTTATTACAGCACCTACCATTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79963 50 - 647215 ATGACT----ATAAGTATTAAGCATTGATCCTTTAACACGGACCACACCATTGG - -a -s mr.mrrefChr3 153413 74 + 181019 GCTGTTTAGTCTCTAGAGGAACAGAACCCGCCATTGTGTTGTTTAGTTTTGAGATGTGAGTATAAGTTAAGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605669 74 + 636262 GCTGTTTAGCCTCTAGAGGAACAGAACCCGCCATTGTGTTGTTTAGTTCTGAGATGTGAGTATAAGTTAAGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 80019 66 - 647215 GCTCTTCAGTCTCTAGAGGAACAGAAACCACCA--------TGTAGTTTTGAGATGTGAGTATAACTTTAGGGA - -a -s mr.mrrefChr3 153487 220 + 181019 GTACCCCAGCTTCAACCTGTATGGTGCAAGATTGTTGTCCCTTCAAGAAGGAGTAACCATCATATGCCTTCATGGTAGTTAGCTACTGAACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTAATAAAGCACTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTACCCTTTTGAAAGGATCAGATAGCACCATAAACATGTGACTCTGTTAAGAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605743 220 + 636262 GTACCCCAGCTTCAATCTGTATGGTGCAAGATTGTAGTCCCTTCAAGAAGGAGTAACCATCATATGCCTTGATGGTAGTTAGCTACTGGACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTATTGAAGCAGTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTAACCTTTTGAAAGAATCAGATAGCACCATAAACATATGACTCTGTTAAGAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 80086 220 - 647215 GTACCCCCGCCTCTACCTGTATGGTGAAAGATTGTTGTCCCCGCAAGAATGTGTAACCGTCATATGCGTTCATGATAGTTAGCTGCTGAACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTAATAAGGCACTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTACCCTTTAGAAAGGATCAGATAGCACTATAAACTTGTGACTCTGTTACAAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA - -a -s mr.mrrefChr3 153707 102 + 181019 GTCTTGTAGGCGCCTAGAACTCACTTGAACTCTATGCAAGTCTGTAACATGGAGTAAACAAGCAGTTACAAAATCATAGGACAGTCTTCTGTACAAAATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605963 102 + 636262 GTCTTGTAGGCGCCTAGAGCTCACTTGAACTCTATGCAAGTCTGTAACATGGAGTAAATAAGCAGTTACAAAATCATAGGACAGTCTTCTGTACAAAATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 80335 102 - 647215 GTCATGTAGGTGGCTAACATCCACATGAACCCTATGCAAGTCTGTCATATGGAGTAGACAAGCAGTTACAAAATCATAGGTCAGTCTTCCGTACAAAATCAT - -a -s mr.mrrefChr3 153809 332 + 181019 AGAACAGTCGTCTGAGGTTTCTTATGTTCATTTACAGTTATTGTTGCATGTCCTGTAATTCAGTAAACTTTTGGCAATGCTGTATATTGCCCTACTAGGGTTGGCATCACTATAGGAATGATTCCCTCAAAACTCATGACTGTAGAGAGGCAGTGGCTCATACTTATGAGACTGCTGGTAGTGGTTTGCACAACTCTAGCTGTTAATCAAGTCATTGCATAGAACCACTAACTCAGGAGAAATGGTAAGTTCACAACCAGTATATAGGTGCAGCAATTGTGTGCAGGCCCTAAGAGCCATATGTATTGGCACTTTGGAGTCAACCCTTTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606065 332 + 636262 AGAACAGTCGTCTGAGGTTTCTTATGTTCATTTGCAGTCATTGTTGCATCTCTGGTGATTCAGTAAACTTTTGGCAATGCTGTATATTCCCCGACTAGGGTTGGCATCACTATAGGAATGATTCCCTCAAAACTCATGACTTTAGAGAGGCAGTGGCTCATATCTATAAGACTGCTGGTAGTGGTTTGCACAACTCTAGCTGTTAATCAAGACATTGCACGAAACCACTAACTCAGGAGACATGGTAAGTTCACAACCAGTATATAGGTGCAGCAATTGTGTGCAGGCCCTAAGAGCCATATGTATTGGCACTTTGGAGTCAATCCTTTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 80443 307 - 647215 AGGACAGGCTTTTGAGGTTTCTATTGTTCATTTACAGTTATGGTTGCATGCTCTGCAATTCAGTAAACTTTT-GCAACACTGTATATTGCCCTACTAGGGTTGGCATC-----------------------AGTCATGACTGTAGAGTGGCCATGGCTCATACTTATGAGACTAGTGGTAGTGGTTTACACAACTCTAGCCGCTAATTGAGTCATTGCATAGAATCACTGGCTCAGGAGAAATGGTAAGTTCACAACCAGTATATAGGTCCAGTAATTATGTGCAGGGCCTAAGAGCCATATGTA-TGGCACTTTGAAGTCAACCCCTTATA - -a -s mr.mrrefChr3 154141 35 + 181019 GGAGTAAATTTTAAACCTTACCAGACAAGCTTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606397 35 + 636262 GGAGTAAATTTTAAACCTTACCAGACAAGCTTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 80767 35 - 647215 GGAGTGAATTTTTGACCTTACCAGACAATCTTCTC - -a -s mr.mrrefChr3 154176 42 + 181019 ACCATCTAAGTAAAATTAATTAATAGGGCTGCTTTAATCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606432 42 + 636262 ACCATCTAAGTAAAATTAATTAATAGGGCTGCTTTAATCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 80803 42 - 647215 ACCATCTAAATAAAATTAATTAAAGGGGTTGCTTTAGTATGT - -a -s mr.mrrefChr3 154218 12 + 181019 CACAGTTTTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606478 12 + 636262 CACAGTTTTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 80845 12 - 647215 CCCTATCCTCTA - -a -s mr.mrrefChr3 154230 15 + 181019 AATGTTTTGTGTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606490 15 + 636262 AATGTTTTGTGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 80859 15 - 647215 ATAGCATTCACCTGT - -a -s mr.mrrefChr3 154245 58 + 181019 GCCTAGCCAACCCTTTTTATAAATTACTAATATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606505 58 + 636262 GCCTAGCCAACCCTTTTTATAAATTACTAATATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 80881 58 - 647215 GCCTAACAAACCCTTTCTACATATTACTCAAATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACGT - -a -s mr.mrrefChr3 154303 22 + 181019 AGTTCTGGTGGATTGCTCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606563 22 + 636262 AGTTCTGGTGGATTGCTCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 80940 22 - 647215 AGTTCTGGTGGACTGCTCAATG - -a -s mr.mrrefChr3 154325 39 + 181019 CCCATAAGCTGTTGGGATTGCAGGACTATGATGGTAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606585 39 + 636262 CCCATAAGCTGTTGGGATTGCAGGACTATGATGGTAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 80977 39 - 647215 CCAATATGCTGTTGGGATTGCAAGACTTTCATGGTAATT - -a -s mr.mrrefChr3 154364 26 + 181019 ATCATTGCCAATCTGTGAAGTCTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606629 26 + 636262 ATCATTGCCAATCTGTGAAGTCTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 81016 26 - 647215 ATTATCCCCAATCTGCGAAGTCTTTA - -a -s mr.mrrefChr3 154390 14 + 181019 GTAGATGGTAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606663 8 + 636262 GTAGATGG------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 81042 14 - 647215 GTAGCTGGTAACCA - -a -s mr.mrrefChr3 154404 94 + 181019 AATTATATCCCAAGTCATATCAATCCTGGTGGGCAGAGGGCAGAAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCAGGGGCCAGCAAAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606671 90 + 636262 ----ATATCCCAAGTCATATCAATCTTCGTGGGCAGAGGGCAGAAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCTGGGGCCAGCAAAGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 81059 94 - 647215 AATTATATCCCAAGTCTTATCAATCCTGGTGGGCAGAGGGCAGGAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCAAGGGCCCGCAAAGAGG - -a -s mr.mrrefChr3 154498 85 + 181019 TAACTAAGATATTATACCAATCTGCAACATATGCAATCCAATACCCCAATCAAACTGAGCTTGCCAAATTGAGCCAAAATCAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606776 76 + 636262 TAACTAAGATATTGTACCAATCTGTAACATATGCAATCCAATACCCCAATCAAACTGAGCTTGCCAAATTGAGCCA--------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 81153 85 - 647215 CAACTAAGATATTATACCAATCTACAGCATAAGCAATCCAATACACCAATCAAACCGAGCTTGCCAAGTTGGGCCAAAATCAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 154583 110 + 181019 AAAGGTGGATTGACTAAGTCTCGTATGCCTAAATTGACTATCTATTATGCTTTCCTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTGTGCCAGATGTCATGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606852 67 + 636262 --------------------------GCTTAAATTGACTACATATTAT-CTTTCCTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTG---------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 81244 110 - 647215 AAAGGTGGATTGACTAAGTCTCGTATGCCTAAATTGACTATCTATTATGCTTTCTTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTGTGCCAGATGTCATGCA - -a -s mr.mrrefChr3 154693 66 + 181019 ACGACTTTACAATTTACAAGAAAGCCAGACGCAAAAGTAGTGCTCATGGCTTTGCTACTGCTACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 81359 66 - 647215 ACGACTTTACAATTTACAAGAAAGCCAGACGCAAAAGTAGTGCTCATGGCTTTGCTACTGCTACAA - -a -s mr.mrrefChr3 154759 22 + 181019 AAATAGGTACAAAAATAGTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 81431 22 - 647215 AAATAGGTACAAAAATAGTTGC - -a -s mr.mrrefChr3 154781 17 + 181019 TAGAGCCACAACGTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 81456 17 - 647215 TAGAGCCACAACGTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 154798 123 + 181019 TTTATCATACAAGTCAATCCTGTTCTAATCACCTGGACAAGATCACTACAAGCTTGCTGCCACAGATCAAGCTCTTTCTGATAGGAGTCTTGTCTTTATGAAGTGTGTGGAGTGCCTACCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606919 123 + 636262 TTTATCATACAGGTCAACCCTGTTCTAATCACCTGGACAAGATCACTACAAGCTTGCTGCCACAGAGAAAGCTCTTTCTGATAGGAGTCTTGTCTTTATGAAGTGACTGGAGTGCCTACCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 81483 111 - 647215 TTAATCATAGAAGTGAATCCTGTTCAAGTCACCTTGATAAGATCGCTGCAAGCTTGCTGCCACAGATCAA------------ATGACTTTTGTCCTTATGAAGTGTGTGGGGTGCCTACTCAA - -a -s mr.mrrefChr3 154921 84 + 181019 TGCCTATGCAAGCATGGATAAGGCAACTTGGAGTGTAGCATTATGCAAGCATGGTATAGACTATTTGGAGTTTGACATACTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607042 84 + 636262 TGCCTATGCATGCATGGATAAGACAATTTGGAGTGTAGTGTTATGCAAGCATGGTATAGACTATTTGGAGTATGACATACTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 81618 84 - 647215 TGCCTATCCAAGCATGGATAAGGCAACTTGGAGTGTAGCATTATGCAGGCATGGTATAGACTATTTGGAGTTTGACATACTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 155005 109 + 181019 TTAGTAATTTTAGGTTCCAGTCTGAGCTTCTATTGGACATTATGCAAAAAGCCTTGCATATTGCTAGGAACTTTGGATATTCCAAGGCCATTGGTATAATATCACATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607130 109 + 636262 TTAGTAATTTTAGGTTCCAGTCTGAGCCTCTATTGGGCATTATGCAAAAAGCCTTGCATATTTCTAGGAATTTCAGATATTCCAAGGCCATTGGTATAATATCACATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 81702 103 - 647215 TTAGTACTTTTAGGTCCCAGTCTGAGCTTCTATTGGACACTATGTGAAAAGGCTTGTGTATTGTTAGGAACTTTGGATGTTCCAAGGCCATTGGTATAATATT------ - -a -s mr.mrrefChr3 155114 46 + 181019 CAGACATAGGCTAGTCAAGTCCTCCACAGTGACAGACTTAACATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607240 46 + 636262 CAGACATAGGCTAGTCAAGTCCTCCACAGTGACAGACTTAACATTT - -a -s mr.mrrefChr3 155160 191 + 181019 ACCACTGCCTGCTCATCAGAACCCCACAATTGCCAACATAAAGTTAGAATAATATGTTACTTGTATGTCGACATTAAAACTTTTATCTTAACAATGTTCTAAGAACTACAGCTAACCAGCGGCCTGCCATAATCAAGAATCCATTTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACCCAGTGCAGAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607297 191 + 636262 ACCACCGCCTGCTCATCATAATCCTACAATTGCCAACATATAGTTAGAATAAGATGTTACTTGTATGTCGACTTTAAAACTCTTATCTTAACAATGTTCTAAGAACTACAGCTAACCAGCGGCCTGCCATAATCAAGAATCCATTTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACCCAGTGCAGAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 81805 191 - 647215 ATCACTGCCTGCTCATCAGAACCCCACAATTGCTAACATAAAGTTAGAATAATATGTTACTTGTATGTCCACATTAAACCTTTTATCTTGACCATGTTCTAAGAACTACAGCTAATCAGCAGCTTTCCATAATCAACAATCCATGTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACACAGTGCAGAATG - -a -s mr.mrrefChr3 155351 222 + 181019 GGTTCACTAGGATGCAGCCCTAATGCGCACTGGATAGAGGTACATCTACAACATTGCTGAAAATCCAGGGCAAGAACACATCCATAACATTGCATAAATTTAAAAATGGAGAATGTTGGGGAATGTTGAGGGTATATGCTGGGAAGAATGGCACTCATAGAATAAGAATTGCAGGCTGCTGACATCATGGCTACTATATCACTTTCTGTCCACTGCTAAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607490 173 + 636262 GATTCACTAGGATGCAGCCCTAATGTGCACTGCATTGAGGTACATCTACAACATTGCTGAGAATCCAGGGCAAGAATACTTCCATAACCTTGCATAAATTTAAAAATGGAGAATGTTGGGGAATGTTGAGGGTATATCCTGGGAAGAGTGGCATTCA-------------------------------------------------TGTCCACTGTTAAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 81996 222 - 647215 GGTTCACTGGGATGCAGCCCAAAGGCGCACTGGAGAGAGGTACATCCACAATGTTGCTGGAAATCCAGGGCAAGAACACATCCATAACATTGCATAAATTTAAAAATGGAGAATGTTGGAGAATGTTGAGGGTGTATGCTGGGATGCATGGCACTTATAGAATAAGAATTGCAGGCTGCTGACATCATGGCTACTATATCACTTTCTGTCCACTGCTAAGAC - -a -s mr.mrrefChr3 155573 420 + 181019 CCCAGTGTTGCACACCAATCTTTCCAACCACTACACTCTCGTGTTCTTTTACACTCAATCTAAAGTAGTTACACCCGAGCGTCCCGATTTCTGGATCATGTGCACAGAGACTCACGATCCTGTGAGTTGGCTAAAGTTTTAGCACAAGTAGGCCAAGAACCAGAATAAGCCTTGATTGGACACATTTAGATCAAGCCTCTACTTAGGACTGACTTAATCTGACTTTAACAAGCTTGGCCCAATAGAAATGATATGACTGTTCTTACCGCTCTGATGTGCTAGTAGGACAAAAGATACCAATTGAAAAGATGCCAATGTAAGCTTGGGCCTACACTATATAGGTGAGAAGAGAGTATGATCACTCTTACCCTGAGGTATCGGGGAGCCAAGAATGGTAATTAGTGTTGTAAGATGCTGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607669 415 + 636262 CCCAATGTTGCACACCAATCTTTCCAACCACTACACTCTCGTGTTCTTTTACACTCAATCTAAAGTAGTTACACCCGAGCGTCCCGATTTCTGGATCATGTGCACAGAGACTCACGATCCTGTGATTTGGTTAAAGTTTTAGCACAAGTAGACCAAGAACCAAAATAAGCCTTGATTGGACACATTTAGATCAAGCCTCCACTTAGAACTGACCTAACCTGACTTTAGCAAGCTTGGCCCAATAGAGATGATATGACTGTTCTTACTGCTCTGACGTGC-----GGACAAAAGATACCAATTGAAAAGATGCCAATGTAAGCTTGGGCCTAGACTATATGGGTGAGAAGATAGTATGATCACTCTTACCCTGAGGTATCGGGGAGCCAAGTATGGTAATTAGTATTGTAAGATGCTGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 82218 404 - 647215 CCCAGTGATGCATGCCAACCTTTCCAACCACAACACTCTCGTGTCCTTTTACACTTGTTCTGAGGTAGTTACACCCGAGTATACCGCTGTCTGGATCATGTGTACAGAGGCTGACCATCCTGTGCGTTGGCAAAAATTTTAGCAGAAGTAGGCCAAGAACCAGAATATACCTTGATTGGACAC-TTTAGATCAAGCCTTTACTTAGGACTGACTTAATCTGACTTTAACAAGCTTGGCCCAATAGAAATGATATGACTGTTCTTATCGCTCTCATGTGCTAGTAGGACAGAAGCGAAC-------------CCAATGTAGGATTGGGCCTACACTATATAGGTGAGAAGAGAGTACGATTACTCTTACCCTGAGGTATCGCGGAGCCAAGAATGGTAAGTAATGTTGTAAAATGCTGC-- - -a -s mr.mrrefChr3 155993 40 + 181019 TAGTTCGAGTGCCCCCTAAATGGGCTGCACCAACTGAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608086 34 + 636262 TTGTTTGAGTGCTCCCTAAATGGGCCGCACTAAC------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 82622 40 - 647215 TAGTTCAAGTGCCCGCCAAATGAGCTGCACCAACTGAATA - -a -s mr.mrrefChr3 156033 304 + 181019 CACTTACAGATATATTGCACGCATCCATAGGTCCTCAAAATTTTACCTGAAGAAAGTCAATAATATACAATGGATGCTAACCTTACCCAATTTTAATCCAGCAAGAACCTAGCTGTAAAAGGCACTTCAGAGGATGTCTGTTACCATCATATGTGATCTAGCTGACCTAGAATTTCAGGAAAAGGGGCAGTCAACATTTTATAGCCATAGTAATAGGAGAAATTAGGAATTGATTTCATCACTGCAGACTCAGATGCTTTTACCTGGGCCTGAACCTTGCTCAATCACCACTTAATCTTTCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608120 304 + 636262 CACTTACAGATATACTGCACGCATCGATAGGTCCTCAAAATATTACCTGAAGAAAGTCAATGATATACATTGGATCCTAACCTTACCCAATTTTAATGCAGCAAGAACCTAGCTGTAAAAGGCATTTCAGAGGATGTCTGTTACCATCATATGTAATCTAGCTCAGCTAGAATTTCAGGAGAAGGGGCAGTCAACATCTCATAGCCATAGTAATAGGAGAACTTAGGAATTGATTTCATCACTGCAGATTCAGATGCTTTTACCTGGCCTTGAACCTTGCTCAATCACCACTTCATCTACCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 82664 299 - 647215 CACTTACAGATATATTGCACACATCCATAGGTCCTCAAACTTTTCCCTGAAGAAAGTCAATAATATGCAATGGATGCCAACCTTACCCGATCTTAATCCAGCAAGAACCTAGCTGTAAAGGGCACCCT----GATGTCTGTTACCATTGTATGTGATCAAGCAGACCTAGAATTTCATGAAAAGGGGCAGCCAACATTTTGTATGCATAGTAATAGAAGAAATTAGGAGGTGATGTCATCACTGCAGACTCAGATGCTTTTACCTTGGCCTGAACCTTGCTCAATC-CCACTTAGTCTTTCTTT - -a -s mr.mrrefChr3 156337 5 + 181019 GAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608425 5 + 636262 GAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 82963 5 - 647215 GAATA - -a -s mr.mrrefChr3 156342 9 + 181019 GGCATCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608430 9 + 636262 GGCATCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 82973 9 - 647215 GGCATTTCC - -a -s mr.mrrefChr3 156351 51 + 181019 ATATCATTTTATGTATACGAGAGGGCCCATCCTTAGATATAAGTAGAACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608439 51 + 636262 ATATCATTTTATGTATACGAGAGGGCCCATCCTTAGATATAAGTAGAACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 82996 51 - 647215 ACATTATCTTATGTATAGGAGAAGGCCCATCCTAAGATAAAAGTAGAACAG - -a -s mr.mrrefChr3 156402 6 + 181019 TGCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608492 6 + 636262 TGCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 83047 6 - 647215 TGCATA - -a -s mr.mrrefChr3 156408 7 + 181019 GACTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608501 7 + 636262 GACTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 83053 7 - 647215 GCTTGCA - -a -s mr.mrrefChr3 156415 42 + 181019 GCTTCCAGAGAAAGAACAGCTGGGCCTGAACCTTGCTCAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608510 42 + 636262 GCTTCCAGAGAAAGAACAGCTGGGCCTGAACCTTGCTCAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 83060 42 - 647215 GTTTCCAGAGAAAGATCAGTTGGGCCTGAACCTTGCTCAATC - -a -s mr.mrrefChr3 156457 14 + 181019 TCTTTCTTTTGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608552 14 + 636262 TCTTTCTTTTGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 83111 14 - 647215 CCTTTCTTTGGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 156471 60 + 181019 AGTCATCTCCAGTAGTCACACTATATATCATCTTATGTATACAAGAGCGCTCATCCTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608571 57 + 636262 AATCATCTCCAGTAGTCACACTATATATCATCTTATGTATACAAGAGCGC---CCCTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 83125 60 - 647215 AGTCATCTCCAGTAGTTACACTATATAATATCTTATGTATATGAGACAGTTCATCCTTAG - -a -s mr.mrrefChr3 156531 51 + 181019 CTATGTGTAGAGTTGACTGTCTGTCCAATCCACACTGCTTGCAGTTTCCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608638 51 + 636262 CTATGTGTAGAGTAGACTGTCTGTCCAATCTGCACTGCTTGCAGTTTCCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 83185 51 - 647215 CTATGTGTAGAGTTAACTGTCTGTCCAATCCACACTGCGTGTAGTTTCCAG - -a -s mr.mrrefChr3 156582 65 + 181019 AAGATCAGGCCACTCATCACTTGGTGAGCACAAGTTGGCAGATTTTATAACTCAAGTTATGAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608689 65 + 636262 AAGATCACGCTACTCATCACCTGGTGAGCACAAGTTGGCAGATTTCATAGCTCGAGTTATGAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 83239 62 - 647215 AAGATCAGGCCAC---TCACTTGTCAAGCACAATTTGGCACATTTTATAACTCAAGTTATGAATA - -a -s mr.mrrefChr3 156647 406 + 181019 GTAGCATCATTAAGTTCAATTGGACTCCTCTTTGCCAAAACTGATGCTATTCTCAGTACCATACTCACAGCATGACCCATATATGGGCTGTAATAACAAAAATTGTTATAGGCCCTGCTTGAATGACATTTCAAAGTTCAAGACTGGTGGCCCAATTTGCTGGCTGCTATCTTAGCCACTGATCTGTTGATGTGCAACACTGCTCGAAACTAAGCAACTTGCTCAGTAATGTACAACCCTAGGGTATAATCACACTTCTGTGCTGCTAATACTGTGCCAGTGCCTATTCCCCCCAGTATTTCCTTGGTGATCTGCTGGCTATAGGGTGTACCCCATAATTACACATAAAATGTGTCTACAAACTTAGCTTTACTTGGCACCAGCAACCCCTCTGGGACGAGGTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608755 405 + 636262 GTAGCATCCTTAAGTTCAATTAGACTCCTCTTTGCCAAAACTGATGCTATTCTCAGTAACATACTCACAGCATGA-CCATATATGGGCTGTAATTGCACAAATTGTTATAGGCCCTGTTTGAATCACATTTCAAAGTTCAAGACTGGTGGCCCAATTTGCTGGCTGCTATCTTAGCCACTGATCTGTTGATGTGCAACACTGCTTGAAACTAAGCAACTTGCTCAGTAATGTACAACCCTAGGGTATAATCACACTTCTGTGCTGCTAATACCGTGTCAGTGCCTATTCCCCCCAGTATTTCCTTGGTGATCTGCTGGCTATAGGGTGTGCCCCATAATTACACATAAAACGTGTCTAAAAACTTAGCTTTACTTGGCACCAGCAGCCCCTCTTGGACGAGGCGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 83301 402 - 647215 GTAGCATCACTAGTTTCAATTGGC--TCCCTTTGCCAAGACTGATGCTATTCTTAGGACCATACTCACAGCATGACCCGTATATAGGCTGTAATAATGAAAATTGTTATAGGCCCTGCTTGAATGACATCTCAAAGTTCAAGACCGGTGGCCTAATTTGCTGGTTGCTATCTTAGACACTCATCGATTGATGTGCAACACTGCTCCAAACTAAGCAACTTGCTCAGTAATGTATGACCCTAGGGTACAATCACACTTCAGTGCTGCTAATACTGTGCCAGTGATTATTCCCCCCAATATTTCCTTGGTGATCTACTGGCTATAAGGTCTACCCCATAATTACACATGAAATGTGTCTACAAATTTAGCTTTCCTTGG-CCCAGCAA-CCCTCTGGGACGATATAAT - -a -s mr.mrrefChr3 157053 9 + 181019 AACTTGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609160 9 + 636262 AACTTGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 83704 9 - 647215 AACTCGGTC - -a -s mr.mrrefChr3 157062 151 + 181019 AAAACAATATAATCTAAAGAGGACTCAAATGACCATGTATCAGGTATGAGGCTTCGAAGCCGCAAACAAAGCATACGCAAGGCAATTGCATACTAGAGCACTCAAATGGCAAATAGTCTTGAGTTAATAATGACTGTGGGCCCACACATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609169 151 + 636262 AAAACAACATAATCTAAAGAGGACTCAAATGACCATGTGTCAGGTATGAGGCTTCGAAGCCGCAAACAAAGCATACGCAAGGCAATTGCATACTAGAGCACTCAAATGGCAAATAGTCTTGAGTTAATAATGACTGTGGGCCCACACATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 83721 151 - 647215 ATAACTATAAAATTTAAAGAGGACTCAAATGACCATGTATCAGGTATGAGGCTTCGAAGTCACAAACAAGGCATACACAAGGCAACCGAATACCAGGATGCTTAAATGGCTAATATTCCTGAGTGATTAATGACTGTGGGCCCACACATTA - -a -s mr.mrrefChr3 157213 22 + 181019 ATGTAGCACTCACTGGTTATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609320 22 + 636262 ATGTAGCACTCACTGGTTATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 83874 22 - 647215 ATTTAGGACTCACTGGTTATAG - -a -s mr.mrrefChr3 157235 31 + 181019 CACTCACATACCCAGATCCGACTTATCACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609343 31 + 636262 CACTCACATACCCAGATCCGACTTATCACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 83896 31 - 647215 TGCTCACATACCGGGACCCAACTTATCACAC - -a -s mr.mrrefChr3 157266 29 + 181019 GTTACCAACGAACTGCGGATTTACCCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609374 29 + 636262 GTTACCAACGAACTGCGGATTTACCCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 83932 29 - 647215 GTTACCAACAAACTGCAGATTTACCCATC - -a -s mr.mrrefChr3 157295 16 + 181019 CATTGCAGCACTCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609404 16 + 636262 CATTGCAGCACTCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 83961 16 - 647215 CAATGCACAACTCATT - -a -s mr.mrrefChr3 157311 357 + 181019 GCTCATTTATCATGGTCACAGGAGTCCCCCTATCTCCATGTCTGTATAACTAATAAGGGACTAGTTTAATTGTTCTAACATGATCAGTAAAGAGACACAGAGACAAGACCCTACTGTCTCTATCCCATTAACTGTACATGGTGGGCGAGACATAACAATGATACCTTGTGGCAGTTGTTTATGAAGAGGGCTTAGTATACATGCTCTGATATTACTTACACTTTGGCAGGAGCCTTGTGCAGGTGCTTCTGGCAACTGGTGTTTTGTTGCCTGTGTTGATTAGCACCTTGTTCCCTTAGTTGATAATACAGGCAATTTCATGACATGTGGCAGATATCTGCCCTGTAAACCATCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609421 357 + 636262 GCTCATTTATCATGGTCACAGGAGTCCCCCTATCTCCATGTCTGTATAACTAATAAGGGACTAGTTTAATTGTTCTAACATGGTCAGTAAAGAGACGCAGAGACAAGACCCTACTGTCTCTATCCCGTTAATTGTTCATGGTGGGCGAGACATAACAATGATACCTTGCGGCAGTTGTTTATGAAGAGGGCTTAGTATACATGCCCTGATATTACTTACACTTTGGGAGGAGCCTTGTGCAGGTGCTTCTGGCGACTGGTGTTTTGTGGCTTGTGTTGATTAGCACTTTGTTCCCTAAGTTGATAATACAGGCAGTTTCATGACATGTGGCAGATATCTGCCCTGCAAGCCATCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 83977 352 - 647215 GTTCATTTATCACAGCTATGTGAATCCCTCTATCTCCATGTCTGTATAGCTGATAGCAGACCAGTTCTATTGTTCTAATATTATCAGTAAAGAGACACAGAGACAAGACCCTATTGTCTCTATCTCATTAACTATACATGGTGGGCGAGACATAACAATGA---ATTTTGGCAGTTGTTCATGTAGAGTGCTTAGTAGACATGCTCTGCTATTACTGACACTATGGCAGGAGCCTTGTGCAGGTGCTTCTGGCAACTGGTGTTCTGTTGCCTGTGTTGA-TAGAACCTTGTTCCCTTAGTTGATAA-ACAGGCAATTTCATGACATGTGGCAGATATCTGCCCTGTAAACCATCTAT - -a -s mr.mrrefChr3 157668 39 + 181019 TCTTTGCATCCCCTAATATTAGACATTCACACACAACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609779 39 + 636262 TCTTTGCATCCCCTAATATTAGACATTCACACACAACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 84329 20 - 647215 TCTTTGCATCCCCTCATATT------------------- - -a -s mr.mrrefChr3 157707 7 + 181019 TGATCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609819 7 + 636262 TGATCTT - -a -s mr.mrrefChr3 157714 52 + 181019 TGGCCTTTACCTGGAGGCAGCCGTACAGACAAGTCAAAGCCAACATGTTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609834 52 + 636262 TGGCCTTTACCTGGAGGCAGCCGTACAGACAAGTCAAGGCCAACGTGTTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 84349 35 - 647215 -----------------CAGCCGTCCAGACAAATCAAAGCCAACATGTTCTC - -a -s mr.mrrefChr3 157766 333 + 181019 TTATCTCAAGAGAGGATTTTGGAGTCTGTACAGGTGTCCTAACAATGAACTCACACAATCTCCCATCATTCAATCTTTTGCTCAGACTTTTGCCTGGTTGTCAAGACATTTCATTGAAAATGACAAGTGCATGCTTAGGTTCCCCGTACCACATCACTAGGTGGTGACTCAACTATTCAGTTACCTGTTCATTCCAAGCCAGGCTCAAGCTAATGGGAGTCTACATGGCTGTGGCTTTGTTTATACTCCTCTTGGTTTTAAATGAATGGGGATCCTGACCTTCTCAGTTTCGTGAAACCTAACTTGAAGCACTATTGCTTATAATTACAGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609886 332 + 636262 CTATCTCAAGAGAGGATTTTGGAGTCTGCACAGGTGTCCTAACAATGAACTCACACAATCTCCCATCATTCAATCTTTTGCTTAGCCTTTTGCCTGGTTGTCAAGCCTCTTCATTGAAAATGACAAGTGTATGATTAGGTTCCCCGTACCATATCACCAGGTGGTGACTCAACTATTCAGTTACCTGTTCAATTCAAGCCAGGCTCAAGCTAATGGGAGTCTACATGTCTGTGGCTTTGTTTATACTCCTCTTGGTTTTAAATGAATGGGGATCCTGACCTTCTCAGTTTCGTGAAACCT-ACTTGGAGCACTATTGCTTATAATTACAGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 84386 322 - 647215 TTATCTC-AGCGAGGATTTTGGAGTCTGTACAGGTGTGCTAGCAATGAACTCACACAATCTCCCATCATTCAATCTTTTGCTCAGACTTTTGCCTGGTTA-CAAGACATTTCATTGAAAGTGACAAGTGCATGCCTAGGTTCCCTGTACCACATCACTGGGTGGTGACTCAACTATTCAGTTACCTGTTTATTCGAGGC---------GCTTATGGGAGTCTACATGGCTGTGGCTCTGTTTATAGTCCTCTTGGATTTAGGTGAATGGGGATCCTGACCTTCTCAGTTTGGTCAAACTTAACTTGAAGCACTTTTGCTTAAATTAACAGCTT - -a -s mr.mrrefChr3 158099 29 + 181019 CATGATTCAAAATCACAATCAGGTAACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610219 29 + 636262 CATGATCCAAAATCACAATCAGGTGACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 84708 29 - 647215 CATGACTCAAGATCACACTCAGGGAACCC - -a -s mr.mrrefChr3 158128 76 + 181019 CACCACTGGAGTATTACAAGGTTCGAATATAATTACAATCATCTTTATGGATTACCTGTGTTTGTGACACAGTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610248 76 + 636262 CTCCACTGGAGTATCACCAGGTTCAAATACGATTACAATCATCTTTATGGATTACCTGTGTTTGTGACACAGTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 84752 76 - 647215 CACGACTGGAGCATTACAAGATTCGAATATAATTACAATCATCTTTATGGAGTACCTGTGTTTGTGACAGGGTATA - -a -s mr.mrrefChr3 158204 62 + 181019 CATATTGACAGACAACCATTTTAAATGGAAAAAAAAGTGATAATTATTCCTCTGGGTACTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610324 2 + 636262 ------------------------------------------------------------TG -s simRat_chr6.simRat.chr6 84851 62 - 647215 CATATTGACAGACAACCATTTTAAATGGAAAAAAAAGTGATAATTATTCCTCTGGGTACTTG - -a -s mr.mrrefChr3 158266 111 + 181019 CTGATGTTTAGTGTTAATGTCTAATTAAATTAAATAACTAAGAGGTTTGAAGTGGTCAACTTTTGATTATCAGTTCCCTTGTCTTAGGTGTGGATCATACTCATATGCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610326 104 + 636262 CTGATGTTTAATGTTAATGTCTAATTAAATTAACTAACCAAGAGGTCTGAAGTGGTCC-------ATCATCAGTTCCCTTGTCTTAGGTGTGGATCATACTCATATGCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 84924 111 - 647215 CTGATGTTTAGTTTTAATCTCTAATTAAATTAAATAACTAAGAGGTTTGAAGTGGTCAACTTTTGATTATCAGTTCTCTTGTCTCAGGCGTGGGTCGTACTCATATGCGGA - -a -s mr.mrrefChr3 158377 393 + 181019 CAGACTTTGTATTTGAACCCAGAGTACATACAACATTCATCTGCTACTCCTGCCTGATATATAAGTGTGATTGAGCCTAGGGCTGACTGTCTACTGTAAATGTAACCCACAGAAGTGAGCTCTGCCCCCAGTGTCCAGTCTCATGTGTGCTAACAGTGTTGCTTGGAGCAAGACCCCCCTTCAAGTTTCAGATGCAGTATGTTGTTGATTGTTGGCAGCCAGCCTCCCGGTTTAAGTGAGGAACTATAACTGTAAGTCAATCTATGCACATAGAACTGGTTTATGTCTTCGGTCTTAATGTAGCAAGATGGTGGTTCATGTGTTCAGTCATAATGTAGCAGGATGTGAGTAGAAAGAGCCCCATTTCTAGTTCTTCCAGATTTTCATGGAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610430 393 + 636262 CATACTTTGTATTTGAACCCAGAGTACATATAACGTTCATCTGCTACCCCTGCCTGATATACAAGTGTGATTGAACCTAGGGCTGACTGTCTAATGTAAATGTAACCAACAGAAGTGAGCTCTGCCCCCAGTGTGCTGTCTCATGTGTGCTAACAGTGTTGCTTGGAACAAGACCCCCATTCAAGTTTCATATGCAGTATGTTGTCGATTGTTAGCAGCCAGCCTCCCGGTTTATGTGAGGAACTATAACTGTAAATCAATCTATGCACATAGAACGGTTTTATGTCTTCGGTATTAATGTAGCAAGATGGTGGTTCATGTGTTCAGTCAAAATGTAGCAGAATGTGAGTAAAAAGAGCCCCATTTCTAGTTTTTCCAGATTTTCATGGAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 85082 393 - 647215 CGGACTGTGTATTTGAACTCAGAGTACACACAACATTCGTCTGCTACTCCTGCCTGGTATATGAGTGTGGTCAAGCCTTGGGCTGACTGTGTACTGTAAATGTAACCCACAGAAGTGAGCACTACCCCCGGTTCCCAGTGTCTGGTGTGCTGACAATGGTAATTGGAGCAAGATTCCCCTCCAAGTTTCAGATGCAGTATGTTGTTGATTGTTGGCAGACAGCCTCCCAGTTTAAGTAAGGAACTATAACTGTAAGTAAATCTATGTATACAGAACTGGTTTATATCTTCGGTCTTAATGTAGCAGGATGGTTGTTCATGTGATCGGTTATAACGTAGCAGGATGTGAGTAGAGAGAGCCCCACTTCTAGTTCTTCCAGTTTTTCATGGTAGC - -a -s mr.mrrefChr3 158770 97 + 181019 GACAGGCATGCATTTCTAAAATCGATTAAAATTGGATGCAGCTAACTGTTGACAGTGTGGAAACTGCCCCCTGTACATTAGGGAGGGAATGCCTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610823 87 + 636262 GACAGGCATGCATTTCTAAAATCGATTAAAAGTGGATGCAGCTAACTG--GACAGTGTGGAAACTGCCTG--------TAGGGCGGGAATGCCTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 85484 92 - 647215 GTCAGGCATGTATTTACAAAAT-CATTAAAATCGGGTGCAGCTAAGTGTTGGCAGTGTGGGAACTGCCCCCTGTACATTAGGGAGGGCATG----CC - -a -s mr.mrrefChr3 158867 25 + 181019 TAGAGTGGAATTGACAATTTAGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610913 25 + 636262 TAGATTGGAATTGACAATTTAGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 85576 9 - 647215 TAGAGTGGA---------------- - -a -s mr.mrrefChr3 158892 17 + 181019 TTTTCTGAAACAATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610947 17 + 636262 TTTGCTGAAACATTTCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 85585 16 - 647215 -TTTCTGAGACAATTCA - -a -s mr.mrrefChr3 158909 23 + 181019 TCCATCATAACTTCGCTCTATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610968 23 + 636262 TCCATCATAACTTCGCTCGATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 85601 23 - 647215 TCTAACATAACCTTGCTGTATAT - -a -s mr.mrrefChr3 158932 54 + 181019 AACTGTCCATACTATTCAGCTAACAGAACCTTTCTAGCATATCATGAGTGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611000 54 + 636262 AACTGTCCATGCTATTCAGCTAACAGAACCTTTCTAGCGTCTCATGAGTGCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 85624 54 - 647215 AACTGTCCATACTATTTAGCTAACAGAACGTTTCTTCCATATCCTGAGTGCACT - -a -s mr.mrrefChr3 158986 37 + 181019 GATCCCTGTGTGTGAAAGGAGTAGGTAATGGGTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611054 37 + 636262 GATCCCTGTGTGTGAAAGGAATAGGTAATGGGTATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 85679 37 - 647215 GACCCCTGTGTGTAATAGGAGTATGAAATGGGTATTG - -a -s mr.mrrefChr3 159023 9 + 181019 TGCCCCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611092 9 + 636262 TGCGCCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 85716 9 - 647215 TACCTCTAC - -a -s mr.mrrefChr3 159032 21 + 181019 CGTGGTCTATACTTACAGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611101 21 + 636262 CGTGGTCTATACTTACAGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 85727 21 - 647215 CGTCGTCTGATCTTAATCTAC - -a -s mr.mrrefChr3 159053 3 + 181019 TAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611123 3 + 636262 TAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 85748 3 - 647215 TAC - -a -s mr.mrrefChr3 159056 12 + 181019 CAGGGTATCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611127 12 + 636262 CAGGGTATCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 85751 12 - 647215 CCGGGAACCCCA - -a -s mr.mrrefChr3 159068 8 + 181019 GGATCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611139 8 + 636262 GGATCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 85768 8 - 647215 AGACCATT - -a -s mr.mrrefChr3 159076 9 + 181019 CCAAGTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611147 9 + 636262 CCAAGTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 85780 9 - 647215 CCTACTATA - -a -s mr.mrrefChr3 159085 32 + 181019 AGATCTCTGTATGTGACATGTGTTTAAGGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611159 32 + 636262 GGATCTCTGTATGTGACATATGTTTAAGGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 85789 32 - 647215 AGTCTTTTTTATGTGAGATGTGTTTAAGGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 159117 195 + 181019 AGGATGATATGCTCATTTGTCATGGAGTGATTTGACCATTTATGCAAATGCATCCTTTTAATGACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGATTCATAGGGATATGCAATTTGTGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGACTAGCAGTTATCTGTCACATAAGGCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611191 195 + 636262 AGGAGGATATGCTCATTTGTCATGGAGAAATTTGACCATTTATGCAAACGCATCCTTTTAATCACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGGCTCATAGGGATATGCAATTTATGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGATTAGCAGCTATCTGTCACATCAGGCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 85828 181 - 647215 AGGATGATATGCTCCTTGGTCATGGAGTGACTTGACCATTTATGTAAATACAT-CTATTAATGACATTTACTGCTCCCCGTGAGGT-------------AGACAAGATTCATAGGGATACGCAATTTGCAAATTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAGAAGGCTATTAGTTATCTGTCACATAAGGCCCC - -a -s mr.mrrefChr3 159312 49 + 181019 ACAGCTGATCATATGGCTTTAATAACATAACTGGGTAGGACTTGATGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611386 48 + 636262 ACAGCTGAT-ATATGGCTTTAATAACATAACTGGGTAGGACTTGATGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 86014 49 - 647215 ACGGCTGATCAGATAGCTTTAATCATGTAACTGGATAGGACCAAGTGAT - -a -s mr.mrrefChr3 159361 10 + 181019 ATCTCATAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611439 10 + 636262 ATCTCATAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 86063 10 - 647215 ATCTCATGAG - -a -s mr.mrrefChr3 159371 38 + 181019 AAAATATGTACATTGACTGTTGTGAAACCCAATTCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611449 38 + 636262 AAAATATGTACATTGACTGTTGTGAAACCCAATTCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 86074 38 - 647215 AAAATATGCTCATTGAATGTTGTGAAACCTGATTCTGG - -a -s mr.mrrefChr3 159409 43 + 181019 AAAGTGTAGGAGATACCCTAAGTGAAATTCTTCCCAACATTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611487 43 + 636262 AAAGTGTAGGAGATACCCTAAGTGAAATTCTTCCCAACATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 86114 43 - 647215 AAAATGTAGGGTATCCCGTAAGTTGAATTCTTCCCAACATTAT - -a -s mr.mrrefChr3 159452 17 + 181019 CCACTTCAGAGTGTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611530 17 + 636262 CCACTTCAGAGTGTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 86158 17 - 647215 TCACTTCAGAGTGTGGG - -a -s mr.mrrefChr3 159469 18 + 181019 TGACTTTGACCGAGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611548 18 + 636262 TGACTTTGACCGAGGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 86175 18 - 647215 TGACCTTGAATGAGTACT - -a -s mr.mrrefChr3 159487 90 + 181019 TATCTGGGTACTGTACTTGCAAAGCCCGAAAACATTGGCCTGAGATTCCCCTGGGCTACTTTAAGTAGAAGTTCTACCAACATTATGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611566 90 + 636262 TATCTGGGTACTGTACTTGCAAAGCCCGAAAACATTGGCCTGAGATTCCCCTGGGCTACTTTAAGTAGAAGTTCTACCAACATTATGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86231 90 - 647215 TATCTGGGTACTGTACTTGCAAAGCCTGAAAACATGGGCCTGGAATTCCCCTAGGACACCTTAGGTAGAAGTTCTCCCAACATCATGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 159577 12 + 181019 TTCAATGTGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611657 12 + 636262 TTCAATGTGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 86321 12 - 647215 TTCAATGTGTGG - -a -s mr.mrrefChr3 159589 111 + 181019 TTTATTAAAGGAGCCACAGCAGTTAAGCCTATGTTTGGTAGCTGGGTAGTGTACTGGCAAAGCCTGAAAACACTTGTTTGGGAAGCCCCTTGTATTGGGACTGGGGGCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611670 111 + 636262 TTTATTAAAGGAGCCACAGCAGTTAAGCCTATGTTTGGTAGCTGGGTAGTGTACTGGCAAAGCCTGAAAACACTTGTTTGGGAAGCCCCTTGTATTGGGACTGGGGGCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86333 111 - 647215 TTCATTGGAGGGTCCACAGCAGTTAAACCTATGGTTGGTGGCTGGTTAGTGTACTTGCAGAGCCCGGAAAGACTCGTGTGGGAACCACCTTGTATTGGGACTGGGTGCAGA - -a -s mr.mrrefChr3 159700 22 + 181019 GGTGGAAGCTACCAACATTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611790 22 + 636262 GGTGGAAGCTACCAACATTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86444 22 - 647215 GGTGGTAGCTACCAACGTTAGA - -a -s mr.mrrefChr3 159722 39 + 181019 GCGACTATGCCACCCTGGGCTAGATCTTAGGAACCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611816 39 + 636262 GCGACTATGCCACCCTGGGCTAGATCTTAGGAACCCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86466 39 - 647215 GCAACGATGCCACCCTGGGCTAGATCTTAGGAACTCGAA - -a -s mr.mrrefChr3 159761 36 + 181019 CTAGTTGGGCTGTGAGTATCTTGGGCTGGCGAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611858 36 + 636262 CTAGTTGGGCTGTGAGTATCTTGGGCTGGCGAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 86505 36 - 647215 CAAGTTGGGCCATGAGTATCTTGGGCTGGTGTGAAA - -a -s mr.mrrefChr3 159797 70 + 181019 AATATCTTACAGATATTTACCATGACTTATATAAGTCCCATGCAGCACACCTCATCATACTGCACCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611894 70 + 636262 AATATCTTACAGATATTTACCATGACTTATATAAGTCCCATGCAGCACACCTCATCATACTGCACCATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86552 70 - 647215 AATATCTTAGAGACATTAACCATGACCAATTTAAGTCCCACGCAGCACAGCTCATCATGCTGCACAGTTA - -a -s mr.mrrefChr3 159867 14 + 181019 CATAGTAGGAAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611965 14 + 636262 CATAGTAGGAAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86622 14 - 647215 CATATTAGACAACA - -a -s mr.mrrefChr3 159881 31 + 181019 TCCTGTGACCCTACCAAGGGGACATTCACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611980 31 + 636262 TCCTGTGACCCTACCAAGGGGACATTCACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 86636 31 - 647215 TCCTGCCACCCTACCAAGGGGAGGTTCATGC - -a -s mr.mrrefChr3 159912 34 + 181019 AAGATTTTAGTGCCACTAATCAGATCAGAAAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612011 34 + 636262 AAGATTTTAGTGCCACTAATCAGATCAGAAAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 86668 34 - 647215 AAGATTTTAGTGCCACTAATCAGATCAGAAAAGT - -a -s mr.mrrefChr3 159946 98 + 181019 TTAGCCTGTTGAATGAATGCCCTGATAACTATTAGTTGTACTGAGGTCGCAGCACTTGATGACTATTGGTTGTACTATTGCTCTAGCTTGGGCGTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612046 98 + 636262 TTAGCCTGTTGAATGAATGCCCTGATAACTATTAGTTGTACTGAGGTCGCAGCACTTGATGACTATTGGTTGTACTATTGCTCTAGCTTGGGCGTCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 86702 98 - 647215 TTAGCCTGTTGAATGAATGCCTTGATTACTGTTGGTTGGACTGCGGTCTCAGCACTTGATTACTGTTCATTGTACTATTGCTTCAGATCGGGTGACAT - -a -s mr.mrrefChr3 160044 26 + 181019 AAAGTATCAAGAGATGGAATGATGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612148 26 + 636262 AAAGTATCAAGAGATGGAATGATGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86800 26 - 647215 AAAGTAAAAAGAGATGGAATGATGGA - -a -s mr.mrrefChr3 160070 11 + 181019 AACCCCCTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612174 11 + 636262 AACCCCCTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 86837 11 - 647215 CACACCCTATG - -a -s mr.mrrefChr3 160081 75 + 181019 GAGGTCGCAGCATTTGTCATTTTGATTTGGTTAATCCCAGTCTTATGACCTCCAGGGCATTTAAGCATCCTTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612185 75 + 636262 GAGGTCGCAGCATTTGTCATTTTGATTTGGTTAATCCCAGTCTTATGACCTCCAGGGCATTTAAGCATCCTTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86850 75 - 647215 GAGGTCTCAGCATTTGTCACTTTGGTTTTGTTACTCCTAGTCTTATGATCTCCAGGGCATATGAGCATCCTTCAA - -a -s mr.mrrefChr3 160156 20 + 181019 CCACAGTTAAAAATCATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612260 20 + 636262 CCACAGTTAAAAATCATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 86930 20 - 647215 TCCCAGTTAGAAATCAAAGG - -a -s mr.mrrefChr3 160176 9 + 181019 TTCTTGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612291 9 + 636262 TTCTTGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 86950 9 - 647215 TTCTTACAC - -a -s mr.mrrefChr3 160185 34 + 181019 TGAATTCTTGCACTGGCCTAAGATAGAATTGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612301 34 + 636262 TGAATTCTTGCACTGGCCTAAGATAGAATTGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 86959 34 - 647215 TGAATTCTTGCACTGGCATAAGATAGAATAGAGA - -a -s mr.mrrefChr3 160219 52 + 181019 AAGAGATGATCGGCCCACCAGAGATATGTAAAGAAAGAACTGGTAGACCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612335 52 + 636262 AAGAGATGATCGGCCCACCAGAGATATGTAAAGAAAGAACTGGTAGACCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 87003 52 - 647215 AAGAGATGGTGGGCCCACCAGAGATATGTACAGAAAAAACTGGTGGACCCCA - -a -s mr.mrrefChr3 160271 8 + 181019 ATTCCGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612394 8 + 636262 ATTCCGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 87055 8 - 647215 ATTCTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 160279 74 + 181019 AAAACACTAAAGAATAATCCAGGTGGCAGAGCTAGAATAATGGTTTTACTCAAAGGCGTATTATTTCGCTCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612403 74 + 636262 AAAACACTAAAGAATAATCCAGGTGGCAGAGCTAGAATAATGGTTTTACTCAAAGGCGTATTATTTCGCTCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 87063 74 - 647215 AAACCACTGAAGAATAAACGGCGTGGAGGGGCTTGAATGCTAGTTATACTCTAAAGTGTATTATTTCGCTCCTG - -a -s mr.mrrefChr3 160353 60 + 181019 GTCCTGCCGATCTTGCTACTATTCTCTTGGCATCATACATTCTAAGCACCTTATCTCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612477 60 + 636262 GTCCTGCCGATCTTGCTACTATTCTCTTGGCATCATACATTCTAAGCACCTTATCTCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 87230 60 - 647215 ATCCTTCAGATCTTGCTACTATTCTCTTGGTATCGTACATTCTACGCACCTTGTCATCAA - -a -s mr.mrrefChr3 160413 17 + 181019 GGTTTACTGTGATTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612537 17 + 636262 GGTTTACTGTGATTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 87295 17 - 647215 GATTTATTGTGATTGAT - -a -s mr.mrrefChr3 160430 23 + 181019 AATATGATTTGAGTAGTCTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612559 23 + 636262 AATATGATTTGAGTAGTCTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 87312 23 - 647215 AATATGATTTGAGTGGTGTTTGA - -a -s mr.mrrefChr3 160453 21 + 181019 TGAACAGCCAAGAGACTGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612582 21 + 636262 TGAACAGCCAAGAGACTGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 87336 21 - 647215 TGAATAGCCGAGAGACTGACA - -a -s mr.mrrefChr3 160474 4 + 181019 ACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612610 4 + 636262 ACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 87357 4 - 647215 ACAG - -a -s mr.mrrefChr3 160478 22 + 181019 CAGGGGGCGAGTGTAGAAGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612614 22 + 636262 CAGGGGGCGAGTGTAGAAGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 87362 22 - 647215 GGGGGGGCAAGTGTAGAAGTAG - -a -s mr.mrrefChr3 160500 31 + 181019 GTGAGTTTATAGAATTGCTTAATCATGAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612636 31 + 636262 GTGAGTTTATAGAATTGCTTAATCATGAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 87488 31 - 647215 GTAAGCCTATACAATTGCTTGATTGTTAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 160531 95 + 181019 AACAAGGGGTATAGGACATGGTGTGTCTGTACATCCACCCACTCAATGTTTCTCTATTTGCTACTGGGGAGTTTCTTAACCTGGAGATATCCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612667 95 + 636262 AACAAGGGGTATAGGACATGGTGTGTCTGTACATCCACCCACTCAATGTTTCTCTATTTGCTACTGGGGAGTTTCTTAACCTGGAGATATCCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 87524 95 - 647215 AACAAGGGGTATAGGACATGGTGTGTCTGTACCTCTACCCACACGGCTTTTCTCTCTTTGCTACTGGGAAGTTCCTCAACCCGGACATATCCCCT - -a -s mr.mrrefChr3 160626 100 + 181019 TTCCCTAATGCCCTCTCCCCCATGATAATGGTGCAGATTTCAGTTCTCTCTTCAAATACAAAACTGTTGTTACTGAAATATCAGCTGGAGGTTTATCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612762 100 + 636262 TTCCCTAATGCCCTCTCCCCCATGATAATGGTGCAGATTTCAGTTCTCTCTTCAAATACAAAACTGTTGTTACTGAAATATCAGCTGGAGGTTTATCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 87620 100 - 647215 TTCCCCAAGCCCCTCCTCCCCATGATAATGGTGCAGATTTCAGTCCTCTGTTTAAATATAAAACTGTTGTCACTGAAATATCAGTTGGATGTTTATCTTC - -a -s mr.mrrefChr3 160726 12 + 181019 GCAAGACCATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612863 12 + 636262 GCAAGACCATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 87720 12 - 647215 ACAAGACCCTCT - -a -s mr.mrrefChr3 160738 19 + 181019 TAAGACTAGGTCAGGCGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612875 19 + 636262 TAAGACTAGGTCAGGCGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 87738 19 - 647215 TAAGACTAGGCCATACGAG - -a -s mr.mrrefChr3 160757 104 + 181019 TGAATGAACAATTGCACACAACTACAAGGGCTTCCATGAAGTCCCCCTATCACGTAGACACCTGAGAACTGCCAGGAATCTAATAGTCAAGGCCTTCTGGATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612894 104 + 636262 TGAATGAACAATTGCACACAACTACAAGGGCTTCCATGAAGTCCCCCTATCACGTAGACACCTGAGAACTGCCAGGAATCTAATAGTCAAGGCCTTCTGGATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 87791 104 - 647215 TGAATGAAGTTATACACACCACTACAACAGCTTCCGTGTGGTCCCCCTATCACGTAGACACCAGAGAACAGCCAGGGATCTAATGGCCAAAGCCTTATGGATTT - -a -s mr.mrrefChr3 160861 15 + 181019 CAAATTTGATAAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612998 15 + 636262 CAAATTTGATAAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 87897 15 - 647215 CAAATTTGATAAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 160876 40 + 181019 TGTTACTATTTAGCTATCATAACCACATCCTGGGCGATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613013 40 + 636262 TGTTACTATTTAGCTATCATAACCACATCCTGGGCGATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 87931 40 - 647215 TGTTCCTACTTATCTATCATCACCACATCCTAGACCCTAT - -a -s mr.mrrefChr3 160916 4 + 181019 ATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613053 4 + 636262 ATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 87972 4 - 647215 ATCA - -a -s mr.mrrefChr3 160920 131 + 181019 GGAATCGTGTCTGGGCATGAGTTATAGTTTTACCATCTTTGACAACAACAAGTCACTTTGACCTTTTATACCTGCTTCTCTCTATTGTTCTTAGAGCATAAAAAAAGGCTGATCTTAACAGCCAATGCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613057 131 + 636262 GGAATCGTGTCTGGGCATGAGTTATAGTTTTACCATCTTTGACAACAACAAGTCACTTTGACCTTTTATACCTGCTTCTCTCTATTGTTCTTAGAGCATAAAAAAAGGCTGATCTTAACAGCCAATGCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 87998 131 - 647215 GGAATAATGTTTGGGCATGAGTTACAGCAGTGACCTCTTTGACAACAGCAAGTGACTTTGACCTTTTATACCTGCTTCTCTCTATTGTTCTTAGAGCACAAAAAGATGCTGCTTCTAACAGCCAAGAGCAC - -a -s mr.mrrefChr3 161051 91 + 181019 ACATATATCAGATAGGCTCAAATGTTCACTCATCACTTTCGTTCATACAGACTGACAGTTCACTATGTTGAGGGTTACAGGGAGAGAGACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613188 91 + 636262 ACATATATCAGATAGGCTCAAATGTTCACTCATCACTTTCGTTCATACAGACTGACAGTTCACTATGTTGAGGGTTACAGGGAGAGAGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 88131 91 - 647215 ACATCCATCAGATAGGCTAAAATGTTGAATCATCACTTTTGTCCGTGCAGACTGATAATTCACTATGTTGAGGTTTATAGGGAGAGGGACC - -a -s mr.mrrefChr3 161142 234 + 181019 AATTATCAGGGCATCTTTATGAGATTGCTAACCTAAAAGTGTGGTAATCTGGAAAGCTGAGGAATCTTGTTTGTAGCCATCATGCACTCAGCACTGTACTTGGGGTAGTTTGAAGAGTGGCGCAAGCACATCTTGATTATTTTTTATTTTCCATGACTGCTTTCTTCAATCACGTCCTCAATCATGATATAATCTCTTTTTCTCTCTCATTGTACAGTTTCACTATCTATAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613279 234 + 636262 AATTATCAGGGCATCTTTATGAGATTGCTAACCTAAAAGTGTGGTAATCTGGAAAGCTGAGGAATCTTGTTTGTAGCCATCATGCACTCAGCACTGTACTTGGGGTAGTTTGAAGAGTGGCGCAAGCACATCTTGATTATTTTTTATTTTCCATGACTGCTTTCTTCAATCACGTCCTCAATCATGATATAATCTCTTTTTCTCTCTCATTGTACAGTTTCACTATCTATAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 88262 234 - 647215 AATTATCAGGGCATTTGTATGTGATTGCTAATCAAAAAGTGTTGTAATCTGGAAAGCTGAGAATGTTTGTTTGTGGCCATCATGCAATCAGCACTGTACTTGGAGTAATTTGAGGGGTGGTGCAAGTGAATCTTGTTTATGTTTTATTTTTCATGACTGCTTTCTTCAACCATGTCCTCAATCAAGATAGAATCTCTTTTTATTACTCATTGTACAATTTCACTGTCTATAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 161376 62 + 181019 TTTCATTGGTGCAAACACATTGTGGCAGTTAGTATTACTGAGTCTAACAACCTGGAAGGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613516 62 + 636262 TTTCATTGGTGCAAACACATTGTGGCAGTTAGTATTACTGAGTCTAACAACCTGGAAGGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 88496 62 - 647215 TTTCATTGGTCCAAACACATCGTGGCAATAAGTATCACTGAGTTTAATAATTTGAACCGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 161438 110 + 181019 ATGATGCTCCTGACTTTAGTCGATGAGTCTACACTCAGTCTGTAAGGGGCTGTGTGGGACAAAATAGATTTGCCCCAGAAGATTTGAAGCAATACCAACaccactacatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613579 110 + 636262 ATGATGCTCCTGACTTTAGTCGATGAGTCTACACTCAGTCTGTAAGGGGCTGTGTGGGACAAAATAGATTTGCCCCAGAAGATTTGAAGCAATACCAACaccactacatc -s simRat_chr6.simRat.chr6 88558 110 - 647215 CTGAAGTTCCTGTCTTTAATTGATGAGCCTACACTCACTCCGTAAGGGGCTGTGTGGGACAAACTAGGTCTGCACCAGAAGATTTGAAATAACACCAACACCACTACATC - -a -s mr.mrrefChr3 161548 364 + 181019 CAAGGTTTCTTTCTCTGGTTAGCCTTGAATCTCGGTTCATGAGTGTGAACTGATAGTCAACTTAATAACAAACAGCAGATTGAGGTGGACTCGTTATCTGGGACAATGGCTCTTTATATGTATTCTAGTGCATTGTTGTCCTAATTACAGTACACTCTACACACCAGCTGGCAGGTAGGGGCTCCAATGCACACTGTTTGTTTTTAGGTCTAGTCAAACTTGGCAACAAAAGCATAAATTGGCAAGGTTTGAAGTCCTCCATATCTTTCTAACATTCAATCATTATCAGTATGCACATAGATATCACAGATCTAGTGTAATGCAATAAAAGGGAAACTTGCAGCAGTTGATTATAAGTCTTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 614279 358 + 636262 CAAGGTTTCTTTCTCTGATTAGCCTTGAATCTCGGTTCATGAATGCGAACTAATAGCCAACTTAATGACAAGCAGCAGATTGAGGTGGACTTGTTATCTGGGACTATGGCTCTTTATATGTATTCTAGTGCATTGTTGTCCTAATTACAGTACACTCTACACACCAGCTGGCAGGTAGGGGCTCCAATGCACACTGTTTGTTTTAAGCTCTAGTCAAATTTGGCAACAAAAGCATAAATTGGCAAGGTTTG------TCCGTATCTTTCTAACATTCAATCATTATCAGTATGCACATAGATACCACAGATCTAGTGTAATGCAATAAAAGGGAAACATGCAGCAGTTGATTCTACGTCTTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 88668 349 - 647215 CAAGGTCTCTTTCTCTGGTTAGCCTTGAATCTCGGTTCATGAGTGTGATCTGATGGTCAACTTAATAAAAAACAGCAGATTGAGGTGGACTCAT----TGGAACAATGGCTCTTTATACGTATTCTAGTGCATTGTTGTCCTAATTACAGGACACGCTACACACCAGCTAGCAGGTAGAGGCTCCAATGCACACTGTTTGTCTTTAGGTCCAGTCAAGCTTGGCAACAAAGG----AATCCGCAAGGTTTGAAGTCCTCCATAACTTTCTAACATTCTATCATTATCATGATGCACATAGATATCACAAATCTAGTGTAATGCAATAAAAGGGAAGCTTGTAGCAGTTGATTATAAA------- - -a -s mr.mrrefChr3 161912 3 + 181019 GAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 614637 3 + 636262 GGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 626583 3 + 647215 GAG - -a -s mr.mrrefChr3 161915 231 + 181019 GGTCCACTTAAATTAGATGGCTCAAAAGAGCTTTGTGGATGGTACGAACCTACCTCTACAGAAGACAGAAATTACCAGCATGCCTATGAGATTGGTCAATTCATGACACACATCTCATATAGTGTCAAAATGCCTTCCAATGCCCACAAACATTCTGCCACGAGCTTGTGTCTCAATAAACTGGTCTTGCCCATGCACCATCTAGAGTAAGATTGTGAACTGCGGAGCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 614640 202 + 636262 GGTCCACTCAAATTAGATGGCTCAAAAGAGCTTTGTGGATGGTGCAAAC-----------------------------CATGCCTATGAGATTGGTCAATTCATGACACACATCTCATATAGTGTCAAAATGCCGTCCAATGCCCACAAACATTCTGCAACGAGCTTATGTCTCAATAAACTGGTCTTGCCCATGCACTATTTAGAGTAAGATTGTGAACTGCGGAGCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 626587 231 + 647215 GGTCCACTTGAATTAGATGGCTCAAAAGAGTTTTGTGGATGGTACGAAACTACCTCTACAGAAGACAGAAATTACCAGCATGCCTATGAGATTGGTCAGTTCATGCTGCACATCTCACACAGTGTCAACATGCCTTCCAAAGGCCACAAACTTTCTGCCACAAGCTTGTGTCTCAATGAACTGGTCTTGCCCATGCACCATCTAGAGTTACATTGTTAACTGAGGAGCCAT - -a -s mr.mrrefChr3 162146 302 + 181019 AAAATCAGATTGAATGTATGGTCCTAGGTCAGGAAGTCAGGCTTGAGACTGGAAAATAGTTGGGGTCTTTCTAGAGTGGTTCCTTGACAAGATAGGTGTCGCAATTGAAATACCAAGGTATACCATTTTAGTGTATACCACTTTAGTGGTCTAACAGAAAAGATGGGGTGGGCAAGCTTAAGTGGTCCTGATATGTCTGAGTGACCTCTGTGCCAGGTATGGTGGTCACTTGTGGGCCTTCCATGGATACATTTATGGTAACACTGGCTCTGTACATCCAGCAACATTGTCTTAGACTAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 614848 302 + 636262 AAAATCAGATTGAATGTATGGTCCTAGGTCAGAAAGTCAAGCGTGAGACAGGAAAATAGTTGGGGTCTTTCTAGAGTGGTTCCTTGACATAATTGGTGTCGCAATTGAAATACCAAGGTATACCATTTTAGTGTATACCACTTTAGTGGTCTAACAGAAAAGATGGGGTGGGCAAGTTTAAGTGGTCCTGATATGTCTGAGTGACCTCTGTGCCAGGAATGTTGGTCACTTGTGGGCCTTCCATGGATACATTTATGGTAACACTGTCTCAGTACATCTGGCAACATTGTCTTAGACTAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 626818 286 + 647215 AAAATCAGATTGAATGTATGGTCTTAGGTCAGGAAGTCAGGTTTGAGCCTGGAAAATAGGTGGGGTCTTTCTAGAGTGGTTCCTTGACAAGGTAGGTGTCACAATTGAGATACCAAGGTATACCATTTTAGTGTATACCATTTTAGTTGTCTAATGGAAAAGATGGGGTGGGCAAGCTCAACTG----------------GTGACCACTGTGCCATGTATAGTGGTTACATGTGGGCCTTCCATGCATATATTTATGGTAACACTGGCTCTGTACATCCAGCATCATCGCCTTAGACTAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 162448 44 + 181019 AAAATAATAGAGTCTTCCACTGACAGATCCAATTCTACCCCACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615150 44 + 636262 AAAATAATAGAGTCTTCCACTGACAGATCCAATTCTACCCCACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 627105 44 + 647215 AAAATAATAGAGTCTACCACTGAAAAACCTTCTTCTACCCCAAG - -a -s mr.mrrefChr3 162492 70 + 181019 CTCTACCCCAGGGTATAGTAGTAATTCAGGCCTCACATAATCCAACAGGATGCCATGCAAACAATGCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615194 70 + 636262 CTCTACCCTAGGGTATAGTAGTAATTCAAGCATCACACAATCCAACAGGATGCCATGCAAACAATGCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 627152 70 + 647215 CTCTACCCCAGTGTATGGTAGTAATGCAGGCCTCACATAATTCAACAGGATGCCATGCAAACAATGCAGA - -a -s mr.mrrefChr3 162562 19 + 181019 GATACATTGTAAGCAAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615266 19 + 636262 GATACATTGTAAGCAAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 627222 18 + 647215 GATATATT-TAAGCAAGTC - -a -s mr.mrrefChr3 162581 58 + 181019 AATTGCTGGTGGCCCTACCAGTAAACACCTGAGGATGAGCTCGTGAAGTGTCAAATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615287 58 + 636262 AATTGCTGGTAGCCCTACCGGTAAACACCTGAAGACGGGCTCGTGAAGTGTAAACTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 627240 58 + 647215 AATTGTTGGTGGCCCTACCAGTAAGCCCCTGAGGATGAGCTGCTGAAGTGTCAAATTG - -a -s mr.mrrefChr3 162639 120 + 181019 GCTATTGGGTAGGAGGCAGGACTCAGGTTCATGATGTGAGCACAGCATGCTGCCTGTGAATCTAGGGGCATGAGGTTTGTATTGTACTATGAGGTCTTGCATATTTGCTAATAGATCCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615357 117 + 636262 GCTATTGGGTAGGAGGCAGGACTCAGGTTCATAATGTGAGCACAGCATGCTGCCTGTGAATCTAGGGGCATGGGATTTGTATTGTACTATGAGGTCTTGCA---TTGCTAATAGATCCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 627298 110 + 647215 GCTATTGGGTAACAGGCAGGACTCTGATTCATGATGGGAGCACAGCATGCTGCCCTTGAACCTAGGGGCATGAGGTTATTATTTTACTATGAGGCCTCGCATATTTGCCG---------- - -a -s mr.mrrefChr3 162759 86 + 181019 CATATGCATGAGACCCAGAGCAAATGCTAAGTGGTTGAAAGCAAATCATCACACATATGATATTGTAGTATTGATTTGGGGGTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615475 86 + 636262 CATATGCATGAGACCCAGAGCAAATGCTAAGTGGTTGAGAGCAAATGGTCACACATGTGATATTGTAGTATTGATTTGGGGGTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 627408 49 + 647215 -----------------------------------TGAAGGCAAACCAT--CATATATGATATTGCAGTATTGGTATGGGGGTAAC - -a -s mr.mrrefChr3 162845 23 + 181019 AAATATATCAGATCAAACTCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615574 23 + 636262 ATATATATCAGATCAAACTCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 627457 23 + 647215 AAATATACCAGGTCAAAATCCTA - -a -s mr.mrrefChr3 162868 56 + 181019 TCTCTAGTTTAATCAAATCAGAGGCTAGTCAAAAAGAGAGAAGGACCATATGACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615598 56 + 636262 TATCTAGTTTAATTAAACCAGAGGCTAGTCAAAAAGAAAGAAGGACCATATGGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 627480 56 + 647215 TCTCTAGTTTAATCATATAAGAGGATAGCCGGAAAGAGAGAAAGACCATATGACAT - -a -s mr.mrrefChr3 162924 76 + 181019 GTGGGACCTGTATTGACAGGTATTGGCAAGTGTGGACCCTGTGTTAGTCAATGGGCATGAGACTATTTGAGTGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615658 76 + 636262 GTGGGAACTGTATTGACAGGTATTGGCAAGTGAGGTCCCTGTGTCAGTCAATGGGCATGAGACTATTTGAGTGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 627536 76 + 647215 GTGGGACCTGTATTGACAGGTATTAGCAAGTGTGGACTCTGTGTTAGTCAATGAGCATGAGACTATTTGAGTGACA - -a -s mr.mrrefChr3 163000 49 + 181019 GCTGTAAACCATCCCCTCACTACTAATACTAAGGGGGGACTACTCAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615734 49 + 636262 GCTGTAAACCATCCCCTCACTACCAATACTAAGGGAGGACTACTCAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 627619 49 + 647215 GCTGTAAACCATCCCCTCACTATTAATACTAAGAGGGGATTACTCAAAA - -a -s mr.mrrefChr3 163049 82 + 181019 TAGACCTCCCCACAGTAATTGCTTCTTTGCCTGGGCCCTACGGCAATAGCATATGCAGATATGTTAGCATTAGAAATCATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615793 80 + 636262 TAGACCT--TCACATTAATTGCTTCTTTGTCTGGGCCCTACAGCAATAGCATCTGCAAATATGTTAGCATTAGAAATCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 627668 82 + 647215 TAGACCTCCCCAAAGTAAGTGCTTCCTTGCCTGGGCCCTTCGGCCATAGCATATGCAGATATGTTAGCATTAGAAATCAAAC - -a -s mr.mrrefChr3 163131 36 + 181019 ATGAGATCTATATTGTAATTCCTGTAATGAGCATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615920 36 + 636262 ATGAGATATATATTATAATTCCTGTAATGAGCATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 627750 36 + 647215 ATGAGATCTATATTGTAATTCCTGTAAAAAGAAAAG - -a -s mr.mrrefChr3 163167 260 + 181019 GTGTAAAAGCATCGAACCTTGAATACAAAACAGTGTGTGAATGGGGGTTGTGGCCTAAGGCAAATTGAAGGGTAAGTTAAGAGCACTGATCTAATTTGGCGGCTCATAAGTGATGGTCAAGGCCTGATCTACAGCTAATAAACAAACAGTGCTTATGTAAACTGGTGCCTAGCATGTACACTTTGAAGGGATAATGGGGGAGTAATCAGAATAATTGACATAGTCTTAATGTTGTTTAGATCTGGCACTGTGACTGATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615956 259 + 636262 GTGTAAAAGCATCGAACCTTGAATACAAAACAGTGTGTGAATGGTGATTGTGGCCTAAGGCAAATTCAAGGGTATGTTAAGAGCACTGATCTAATTTGGCGTGTCATGAGTGATGGTCAAGGCCTGATCTACAGCTAATAAACAAACAAC-TTTATGTAAACTGGTGGCTAGCATGTACACTTTGAAGGGATAATGGGGGAGTAATCAGAATAATTGACATAGTCTTAATGTTGTTTAGATCTGGCACTGGGACTTATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 627790 255 + 647215 GGGTAAAAGCA--GAACCTTGAATTCAAAACAGTGTGTGAAGGGGGGCTGTGGCCAAAGGCAAATTGGAGTGTAAGTTCAGAGCACTGGTCTAATTAGG-GGCTCACAAGTGAAGGTCAACGCCTGGTCTACAGCTAATAAACAAATAGTGCTTATGTAAACTGGTGCCTAGT--TTACACTTTTAATGGCTAATGGAGGAGTAATCAAAATAATTGACATAGTCTTAATGTAGTTTAGATGTCGCACTGTGCCTGATGC - -a -s mr.mrrefChr3 163427 60 + 181019 AAAGCTCAAATAAAAGGCAAATGTGGCCATGTACATGCAGTTAGTGCTTGGTGATGAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616215 60 + 636262 AAAGCTCAAATAAAAGGCAAATGCGGCCATGTATATGCAGTTAGTGCTTGGTGGTGAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 628046 60 + 647215 AAAGCTCAAATAAAAGGCAGACATGGCCATGTACACGCAGTTAGTGCTTGGCTATGAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 163487 92 + 181019 CCGCTTGATGGGACAGAATACCACCAGAAAAACCTGTGTACATGATGCAAATAGTGAATATAATCTGACTTTGGCTCATAACATTACTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616279 92 + 636262 CCGCTTGATGTGACAGAATACCACCAGAAAAACCTGTGTACATGATGCAAATAGTGAATATAATCTGACTTTGGCTCATAACATTACTATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 628106 92 + 647215 CCGCTTGATGGCACAGAATACGACCAGAGAAACTTGTGTACATGATGCAAATATTGAATATAATCTGACTTTGGCTCATAACATTACTATTG - -a -s mr.mrrefChr3 163579 215 + 181019 AAACTTGCAAGGAACTGAATAGAGCCTACAATAAACAGCAAAGTTTCCCATCCTCTCAAAAATACTGCCTAGTGATACACCAGTTCTCTAAAGAGAATTACCTTTCTAGCCTTTTGGAAAGTGAAATCATCCCTGAGGAATGACACAAGTTCAATATACAGACAACTTGCCTGGACGGCTGGACTTAAGGTTGTTTGGATTCCGCAAAGTGCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616375 202 + 636262 AAACTTGCAAGGAGCTGAATTGAATCTACAATAAACAGCAAAGGTTCCCATCCTCTCAAAAATACTGCCTAGTGATACACCAGTGCTCTAAAGAAAATTACCTTTCTAGCCTTTTGGAAACTGAA-------------AATGACACAAGTTCAATATACAGGCAACTTGTCTGGACGGCCAGACTTAAGGTTGTTTGGATTCCGCAAAGTGCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 628198 215 + 647215 AACCGTGCAAGGAACTGCATAGAGCCTACAACAAACAGCAAAGTTTCCCATCCTCTCAAAAATACTGCCTAGTGACACACCAGTTCTCTAAAGAGAATTACCTTTCTAGCCTTTCGGAAAGTGAAATCATCCCTGAGGAAAGACACAAGTTCAATATACAGACAACTTGCCGGGATGACTGGACTTAAGGTTGTTTGGATTTCGCACAGTGCCTC - -a -s mr.mrrefChr3 163794 14 + 181019 AAATAAAAAACAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616588 14 + 636262 AAATAAAAAACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 628413 14 + 647215 CAATAAAAGGCAAA - -a -s mr.mrrefChr3 163808 11 + 181019 CTCAGCCATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616604 11 + 636262 CTCAGCCATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 628427 11 + 647215 CTCAGCCATGT - -a -s mr.mrrefChr3 163819 42 + 181019 ATGCAGTTAGTATTTGGCTATGAGCCTGCACTGCTTGGCGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616615 42 + 636262 ATGCAGTTAGTATTTGGCTATGAGCCTGCACTGCTTGGCGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 628440 42 + 647215 ATGCAGTTAGTATTTGGTCATGAGCTCGCCCTGCTTGGCGTG - -a -s mr.mrrefChr3 163861 155 + 181019 ATGTCAAGCGATCACAGGTACCTGTGAAGGAGCCTGCATGTGTCTCTCAAGAGTTTGTCCACCTGCCTCACACTAGAGGTTTGTCATGCATCTTGCACAGCTCCCCGCATACATTCTATATTCCCTGTCTGCCTCTTGTTCAGTTAAGTGATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616657 155 + 636262 ATGTCAAGCGATCACAGGTACCTGTGAAGGAGCCTGCATGTGTCTCTCAAGAGTTTGTCCACCTGCCTCACACTAGAGGTTTGTCATGCATCTTGCACAGCTCCCCGCATACATTCTATATTCCCTGTCTGCCTCTTGTTCAGTTAAGTGATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 628483 155 + 647215 ATGTCAAGTAATCACAGGTACCTGTACTAGAGCATGCATATGTCCCACAAGAGTTTGTCTGCCTGCCTCACACTACGGGTCTGCCATGTATCATGCAGAGCTCCCTGTATACATTCTAGATTCCCTGTCTGCCTCTTGCACAGTCAAGTGATCGC - -a -s mr.mrrefChr3 164016 9 + 181019 GGCACCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616813 9 + 636262 GGCACCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 628638 9 + 647215 GGCACCTGT - -a -s mr.mrrefChr3 164025 321 + 181019 CCTCTAGAAGGAGCCTGCCTGTGGGGCTATAATGGGCTCAGTCTTGCATTAGGCCATTTGTGAGCCATAGGGGATCAACCTGGCTTGTGCCAGGTTTGGCCAGCCTACAAGAATTACCAGCCTCCACCAAACCAGCTTCATCTACTATGATTGCCATGATTCTTCTTGTCAAGGTATCACTCACAAATCTATTGGTGATCAGACTTTGGTTATTACATTTCAAATAGTTGTATTGAAACCTCCCTATGTGATTGACACTATAAGTTGAAGTTCAATTTCTGCACTGCATTAGCTCTATAAAGGCAACACTCTCATAGAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616824 270 + 636262 CCTCTAGAAGGAGCCTGCCTGTGGGGCTATAATGGGCTCAGTCTTGGATTATGCCGTTAGTGAGCCATAGGTGATCAACCTGGCTTATGCCAGGT---------------------------------------------TCTACTATGATTGCCATGATTCTTCTTGTCAAGGTATCACTCA-AAATCTAGTGGTGATTAGACTTTGGTT-----ATTTCAGATAGTTTTATTGAAACCTCCCTATGTGATTGACAATATAAGCTGAAGTTCAATTTCTGCACTGAATTAGCTCTATGAAGGCAACACTCTCATAGAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 628647 318 + 647215 TTTGTAGAAGGAGCCTGCCTGTGGGGTTATTATGGGCTCAGTTTTGCATTAGGCCATTTGTGAGCCATAGGGGATGAACCTGGCTAGTGCCAGGTTTGGCCAGCCTACAAGAATTACCAGCCTCCACCAAACCAGCTTCATCTTCTATGATTGCCATGATTCTTCTTATCAAAGTATCACTCACAAATCTATTGGTGATCACACTTTGGTTATTACATTTAAAATAGTTGTATTAAAACCTCCCTATGTGATTGACACTATAAGTTGAAGATCAGTTTTTGCACTGCTTTAGCTCGATAATGGTAACACTCTCATAGA--- - -a -s mr.mrrefChr3 164346 84 + 181019 GGGCTGTATCAATAGGGGCTATCAGGTACCCACAAAATGTCTCCCTCAACTCACAGTGTAAGCCCTGGACACAGGAAAGAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617095 84 + 636262 GGGCTGTACCAACAAGGGCCATCAGGTACCCACTGAATGTTTCCCTCAACTCACAGTGTAAGCCCTGGACACAGGAAAGAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 628965 78 + 647215 ------TATCCATAGGGGCTATCAGACAACCACAAAATGTCTCCCTCAACTCAAAGTGTAAGCCCTGGATGTGGGAAAGAACTT - -a -s mr.mrrefChr3 164430 151 + 181019 ACATATACACACTCTTGAAGGGTCTACCAAGAGTAACACAACTTGGTAATGACTATGCTCTTTTCAATTGACCTTCTACACTAACATCACACTACAAATCAGGGGGTATAAGACATTCAAACAGTTTCACTAACAAAGTAGGCCAGAAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617179 143 + 636262 --------ACACTCTAGAAGGGTCTACCAAGAATAACAGAACTTGGTAATGACTATGCCCTTTTCAATTGACCTAATACACTAACATCACACTACAAATCAGGGGGTATAAGACATTCAAACAGTTTCACTAATAAAGTAGGCCAGAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 629059 151 + 647215 ACATATACACACTCTTGAAGGCTATATCAACAGTAACACAACTTGGTAATGACTATGCTCTTTTCAATTGACCTTCTACACTAACATCACACTACAAATCAGGGGGTATAAGACATTCAAACATTTTCACAAACCAAATAGGCCATTAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 164581 6 + 181019 ATGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617322 6 + 636262 ATGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 629230 6 + 647215 ATGAGC - -a -s mr.mrrefChr3 164587 28 + 181019 TCTAAGACCCCAGTTGTTATGTTATAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617331 28 + 636262 TCTAAGACCCCAGTTACTATGTTATAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 629236 28 + 647215 TCTAAGACCCCAGTTGTTATATCATAAA - -a -s mr.mrrefChr3 164615 254 + 181019 GTTAACTTATTACCTATTCTTGACTCCTCCAAAAAAATTACAGCGCTATGTACCTGATGCTATAGCAGAACAGACATTGCATTGGGGTTGAAGTACCACATTTTGGTTGCCTGAAGTACCACACACCAGTTGACAAAATTCAAAAAAAAGGTACACTGCTTGTTGTATGGGTAGGTTAGCATGAGTAGAAATGGACCATGTGTATTGTGTTGAAAGCCTTGCTACTTAGCCTATGTCACTATTCCCCCACAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617359 250 + 636262 GTTAACTTATTACCTACTCTTGACTCCTCCAAAAAAATCACAGCGCTATGTACCTGATGCTATAGCAGCGCAGACAGTGTATTGGGGTTGATGTATCACATT----CTGCCTGAACTACCACAAACCAGTTGACAAAATTCAGAAAAAAGGTACACTGCTTGTTGTATGGGCAGGTTAGCATGACCAGAAATGGACCATGTGTATGGTGTTGAAAGCCTTGCTACTTAGCCTATGTCACTATTCCCCCACAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 629265 252 + 647215 GTTAGCTTATTACCTATTTTTGACTCCTCCAAAAAAATTACAGTACTATGTACCTGATGCTACAGCAGAACGCACATTGCATTGGGTTTGAAGTACCACATTTTGGTTGCCTGAAGTACCACACACCAGTTGACAAAATTAAAAAAACAGGAACACTGCTTGTTGTACTGGTAGGCTAGCATGAGTAGAAATGGACCATGTGTATTGTGTTGAAAGCC--GCTACTTAGCCTATGTCACTATTTCCCCACTAGG - -a -s mr.mrrefChr3 164869 130 + 181019 CCCACTGGGCAAAGTTGTCTCATATAATCTAGATGAAAGAACAATTCAATTCTCACAAAATGGAACCGTGTTGTACTCTGGTTTTTTCATGGCACTGGGGAACCCTCCACAATTGCCAGGGATAATAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617617 130 + 636262 CCCACTGGGCAAAGTTGTCTCATATCATCTGGATGAAAGAACAATTCAATTATCACAAAATGGAAACATGTTGTACACTGCTTTTTTCATGGCACTGTGGAACTCTCCACAATTGCCAGGGATAATAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 629517 130 + 647215 CCCACTGGGTAAAATTGCCTCATATAATATAGATGAAAGGACAATTCAATTCTCATAAAATGAAGCCGTGTTATACTCTGGTTTTTTCATGGCACTGGGGAACCTACCACAATTGCCAGGGGTAATAACC - -a -s mr.mrrefChr3 164999 241 + 181019 TATATTCTTCATAGTTAAAAAAAGATTGCAAGAAAGCCTGAGTTTTTCCTGATAAGTTTTACAACCTTACCGGATAACTAGGAAAAATTGGCAATATAACGTAGGGGATATTAAGTGACATAATACCTAATCACCACAATAGATTGATACTGGTGAATGTTATATGGCAGAAGATTAGTAAAAGAACACATTAACTTCTCCTGTGGCTCAGAGGAAAGGATGGGGTTACACATAGGATGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617750 240 + 636262 TATTTTCTTCATGGTTAAAAAAAGATTGCAAGAAAGCCTGAGTCTTTCCTGATAAGTTTTACAACCTTAACGGATAACTAGGAAAAATTGGCAAAATAGCATAGGGGATATTAAGTGACATAATACCTAATCACCACTATATATTGATA-TGGGGAATGTTATATGGCAGAAGATTAGTAAAAGAACACATTAACTTCTCCTGTGGCTCAGAGGAAAGGATGGGGTTACACATAGGATGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 629647 241 + 647215 TAAATTCTTCATAGTTAAAAAAAGACTGCAAGAAAGCCTGAGTTTTTCCTGATAAGTTTTACAACCTTACTGGATAACTAGGAAAGATTGGCAATACGACGTAGTGGATATTAAGGGACATAATACCTACTCACCACAATAGATTGATACTGGTGAATGTTGTATGGCAGAAGATTAGTAAAGGAACACGTTAACTTCTCCTGTAGCTCAGAGGATAAGATGAGCTTACAGACAATGTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 165240 4 + 181019 GTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617990 4 + 636262 GTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 630115 4 + 647215 GTGA - -a -s mr.mrrefChr3 165244 47 + 181019 AGTGGACTGGTCTTTACACTATACCCTTTGTGGGCAAGAGGGGGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617995 47 + 636262 AGTGGACTGGTCTTTACACTATACCCTTTGTGGGCAAGAGGGGGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 630119 47 + 647215 AATGGACTGATAGTTACACTAGATCCTTTGTCAGCAAGAGGGGGGGA - -a -s mr.mrrefChr3 165291 18 + 181019 TCAACCAGCTGGGTCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618042 18 + 636262 TCAACCAGCTGGGTCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 630186 18 + 647215 TCAAATGGCTGGGTCCAG - -a -s mr.mrrefChr3 165309 39 + 181019 GTGGCTGGGTAAACCAGGAGTTGAAGGTCTCTAACAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618060 39 + 636262 GTGGCTGGGTAAACCAGGAGTTGAAGGTCTCTAACAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 630211 39 + 647215 GTGGCTGGGTAAATCCGGAGTTGGTGGTCTCTAACAAGG - -a -s mr.mrrefChr3 165348 5 + 181019 CCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618099 5 + 636262 CCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 630253 5 + 647215 CCCTA - -a -s mr.mrrefChr3 165353 12 + 181019 CTGAGTACCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618106 12 + 636262 CTGAGTACCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 630258 12 + 647215 CAAAGAACCATC - -a -s mr.mrrefChr3 165365 8 + 181019 AAAAAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618118 8 + 636262 AAAAAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 630274 8 + 647215 AAAAAACT - -a -s mr.mrrefChr3 165373 30 + 181019 GGTAATCATAGGTCAGTCAAAACCAGTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618129 30 + 636262 GGTAATCATAGGTCAGTCAAAACCAGTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 630282 30 + 647215 GGTTCTGACTGACCAATGGTTGCCTATACT - -a -s mr.mrrefChr3 165403 16 + 181019 TGGCGCAATGGCGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618160 16 + 636262 TGGCGCAATGGCGCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 630312 16 + 647215 TTGCTCGTTGGTGCTC - -a -s mr.mrrefChr3 165419 37 + 181019 ATTGTAGAGGGCCCTTGCAGATAGTTGTGTTGGGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618176 37 + 636262 ATTGTAGAGGGCCCTTGCAGATAGTTGTGTTGGGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 630330 37 + 647215 ATTATGGTTATGCTTTGCAGATAGTTGTGTTAGAGCT - -a -s mr.mrrefChr3 165456 22 + 181019 TATGTGATTAATGATATCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618213 22 + 636262 TATGTGATTAATGATATCAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 630371 22 + 647215 TATGTGATTAATGATATCAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 165478 97 + 181019 ACTTTCAGGATTTTAGCACCCTCCAAAAAGGTCAGAGATAAGCCAGGAAGTACTCAGATAACTGATTGGTGCGGGGTGCGCTGCTAGAAGATTGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618258 97 + 636262 ACTTTCAGGATTTTAGCACCCTCCAAAAAGGTCAGAGATAAGCCAGGAAGTACTCAGATAACTGATTGGTGCGGGGTGCGCTGCTAGAAGATTGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 630393 97 + 647215 ACTTTCAGGATTTCAGCACCCTCCAAAAAGGTCTCAAATAAGCCAGGCAGTACTCCGATCACTGATTGGTGTGGGGTGTACTGCTAGGAGATTGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 165575 32 + 181019 CATTAGGAAAGGTAGGTAGGGAACTTACATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618356 32 + 636262 CATTAGGAAAGGTAGGTAGGGAACTTACATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 630490 32 + 647215 CATTAGGAAAGATAGGTAAGGAACTTACACAC - -a -s mr.mrrefChr3 165607 8 + 181019 AAGGGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618388 8 + 636262 AAGGGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 630528 8 + 647215 AAGAGTAT - -a -s mr.mrrefChr3 165615 12 + 181019 CCAAAAGTGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618397 12 + 636262 CCAAAAGTGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 630536 12 + 647215 CCAAGAGTGGTA - -a -s mr.mrrefChr3 165627 54 + 181019 CATTTGGTGATTACTATGACCTGTGCATCTGACTTTGTATAACAACATCACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618409 54 + 636262 CATTTGGTGATTACTATGACCTGTGCATCTGACTTTGTATAACAACATCACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 630549 54 + 647215 GATTTGGTGATTACTACGACCTGTGCATCCAACTTTATATAACAACATCACAAC - -a -s mr.mrrefChr3 165681 7 + 181019 AAAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618463 7 + 636262 AAAATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 630613 7 + 647215 GAAATCA - -a -s mr.mrrefChr3 165688 17 + 181019 GGGGCCTTACAACATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618470 17 + 636262 GGGGCCTTACAACATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 630621 17 + 647215 GGGACAATACAATGTTC - -a -s mr.mrrefChr3 165705 100 + 181019 AAAAACATTTTCACGACCGGGGGTCATACAACGTTCAAAAGACAGTTTCACTAACAGAGTAGGCCAGGCGAAACAAGGTCCATGACGTAGGTTGTCAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618487 100 + 636262 AAAAACATTTTCACGACCGGGGGTCATACAACGTTCAAAAGACAGTTTCACTAACAGAGTAGGCCAGGCGAAACAAGGTCCATGACGTAGGTTGTCAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 630639 100 + 647215 AAAAACAGTTACACAATCAGGGGACATGCAACGTTCGAAAGACAGTTTCACTAATAGAGTAGGCCAGATAAAACAAGGTCCTTGACCTAAGTTGTCATTA - -a -s mr.mrrefChr3 165805 21 + 181019 TAGTCAAATTTCTTATTATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618587 21 + 636262 TAGTCAAATTTCTTATTATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 630740 21 + 647215 TAGTCAGATTACTTATTACCA - -a -s mr.mrrefChr3 165826 38 + 181019 ACTCTTAACTCCTTGAAAAAAAGCACAGCACGAGATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618608 38 + 636262 ACTCTTAACTCCTTGAAAAAAAGCACAGCACGAGATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 630762 38 + 647215 ACTGTTGACTCATTGAAGAGAAGCACAGCACAAGGTAC - -a -s mr.mrrefChr3 165864 27 + 181019 TACCTCATCTCAATTACCCCCCAGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618762 27 + 636262 TACCTCATCTCAATTACCCCCCAGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 630800 27 + 647215 CACAGTAGCTCAGTTACCCCCTGGTTC - -a -s mr.mrrefChr3 165891 191 + 181019 TAACAAACAATACAGGAACTAGAATAAACTGTTACTCTTACTGTATAGGTAGGTCAAGTTTGAGTAGACCATCTGTAGTATCACTATGTTACCACAACACAAGATGGCCTCATATAATAAAAATGAAAGGACAATCCCAGTCTCACAGTGAAGATGTGCTACACTCTTAGTTTTTGTTACCACTGGAGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618792 190 + 636262 TAACAAACAATACAGGAACTAGAATAAACTGTTACTCTTACTGTATAGGTAGGTCAAGTTTGAGTAGACCCTCTATAGTATCACTATGTTAGCACAACACAAGATGGATTCATATAACAAAGATGAAAGGACAATCCCAGTCTCACAGTGAAGATGTGCTACACTCTTAGTTTTTGTCACCACTGGAGGA- -s simRat_chr6.simRat.chr6 630827 191 + 647215 CAACAAACAATACAGGAAATAGAGTAAAATGTTACTCTTAATGTATGGGTAGGTCTGGTTTGAGTACACCATCTGTAGTATCACGATGTTGCCACCACACAAGATGGCCTCATATAATAAAAATGAAAGGACGATCCCAGTCTCCCCGTGAAGATGTGATACACTCTTAGTCTTTGTTACCACTGGAGGAG - -a -s mr.mrrefChr3 166082 127 + 181019 AAGGAATCCTCCATAGTTGCCAGGGATGCTAGCATTTATCATAATTAAAAGGATGTTGCAGGGGGCCCTGAGTTTTTAGTGATATAGGTCTGATAGCTTGTTGAGTACTTGTTTAGTAATATGGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618982 127 + 636262 AAGGAATCCTCCATAGTTGCCAGGGATGCTAGCATTTATCATAATTAAAAGGATGTTGCAGGGGGCCCTGAGTTTTCAGTGATATAGGTCTGATAGCTTGTTGAGTACTTGTTGAGTAATATTGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 631019 108 + 647215 ACTAGATCCTCCATAGTTGCCAGGGCTGCTAGCATTTATCATAATTAAAAGGACATTGGTGGGGGCCCGGAGTTTTTAATGATA-------------------AGTCTCAGTTTAGTAATATGGTTT - -a -s mr.mrrefChr3 166209 66 + 181019 GGATTTCACACAGTGCTCTTGTACAAAGCTTGAATGAAAGGCAAAGTGTGGTCATGCACCCATGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619109 61 + 636262 GGATTTCACACAGTGCTCTTGTACAAAGCTTGAATAAAAGGCAAAGTGTGGCCATGTACCC----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 631128 65 + 647215 AGCTGTCACATAGTGCTCTCATGCAAAGCTCCAATGAAAGGCAA-GTGTGGTCATGCACCCATGGA - -a -s mr.mrrefChr3 166275 16 + 181019 ATTAAAACATGCACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 631194 16 + 647215 ATTAAAACATGCACTA - -a -s mr.mrrefChr3 166291 126 + 181019 TTGCCTGAAATTATAACATGCGCTACTATCATAATCAGCTAAGCAGGTAGTGAAATAAAAACTCATATTTTATAAAAGCACACCTCTTCCAATTTATCTCCAGTAATTTTAGCCCACAATCCCCCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619170 121 + 636262 TTGCCTAAAATTAAAACATGCGCTATTATCATAATCAGC----CAGGTAGCAAAATAAAAACTCATATTTTATAAAAGCACACCTCTTC-AATTTATCTCCAGTAATTTTATCCCACAATCCCCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 631213 123 + 647215 TTGCATGCACTTATTGCATGCACTACTATCCTAATCAGCTAAGCAGGTAGTGAAATAAAAACTCATATTTTATAAAAGCCCACCT---ACAACTTGTCTCCAGTAATTTTAGTCCACAATCCCCCC - -a -s mr.mrrefChr3 166417 200 + 181019 ACATCACAGGTGAACTAATAATTGCAAGGGTAGTCTACAGTGTTTCTAGGGTTAAAACCACATGAGAGTTGTCCCTATGGAAGGCTCAAATAGAGTCTTGAAGGAACCCTTAGGCCATTTACTCTTGTTGATATTAAGAAATTGGTAGAGAAAGTAAGAAAAATGACAATCAAACACTTAGAACATACATTGTGCCACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619300 200 + 636262 ACATCACAGGTGCACTAATAACTGCAAGGGTAGTCTACAGTGTTTCTAGGGTTAAAACCATATGAGAGTTGTCCCTATGGAAGGCTCAAATAGAGTCTTAAAAGAACCCTTAGGCCATTTACTCTTGTTGATATTGAGAAATTGGTAGAGAAAGTAAGAAAAATGACGGTCAAACACTTAGAACATACATTGTGCCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 631336 200 + 647215 ACATAACAGGTGAATTAATAATTGCAAGGGGAGTATACAGTGTTTCAAGGGTAAAAACAACATGAGAGTTATCCTGATGGAAGGTTCAAATAGAGCCTTGAAGGAACCCCTAGGCCATTTACTCTTATTGATACTAAGAAATTGGTAGGGAAACTAAGAAAAATGACAATCAAACACTTAGAACGTGCATTGTGCCACAA - -a -s mr.mrrefChr3 166617 190 + 181019 GCAGACTTGCAGGCCTTTAGTTCTGTTCCCGGATTGTTTGGCACCTTCTTACTAGCCTCTCACCATCTGTCATGTCTGGGCATAATATCAGGCCACATATCTGTCCTTGTAAAGATGTTAGGCTACAAGAGCAATACCCTGTCACATCTCATTCATCCTTCAACCTGCATTTAGGAGATCTGAGCAATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619500 190 + 636262 GCAAACTTGCAGGCCTTTAGTTCTGTGCCCGGATTGTTCAGCACCTTCTTACTAGTCTTCCACCATCTGCCATGTCTGGGCATAATATCAGGCCGCATATCTGTCTTTGTAAAGATGTTAGGCTACAAGAGTAATACCCTGTCACATCTCATTCATCCATCAACCTGCATTTAGGAAATCTGAGCAATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 631544 190 + 647215 GCAGACTTGCAGGCGTTTAGTTCTGTTCCCAGATTGTTTGGCACCTCCTTACTAGCACCTCACCATCTGTCATGTCTGGGCATAATAGCAGGCCACATATCTGTTCTTGTAAAGATGTTAGACTACAAGAGCAATACCCCTTCACATCTCATTCATCCTTCAACCTGCATTTAGTAGATCTGAACTATGC - -a -s mr.mrrefChr3 166807 54 + 181019 CACTGACTGAACAAACCATTAGCTTACTAGAGGATAGGCAGGCAAGACCAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619730 54 + 636262 CACTGATTGAACAAACCATTAGCTTACTAGGGGAAAGACAGGCAAGACCAGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 631734 54 + 647215 CACTGACTGAGTAAACCATTGTCTTACCAGAGAATAGGCAGGCAATACCAGCGT - -a -s mr.mrrefChr3 166861 142 + 181019 TGGGTTTACTGGCCAATGATAATGCCACATGTTATAGTATGCTGAACAGTGTGTTCGGTTTGGTCCCAAGAGAGACAATTACTTGATTATTACCTGAATGGATATTTCAACACATAGAAGTGGGTGAGAAAGAAAAGTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619792 141 + 636262 TGGGTTTACTGCCCAATGATAATGCCACATGTTATAGTATGCTGAACAGTGTGTTCGGCTGGGTCCCAAGGTAGGCAATTACTTGATTATTACCTGAATGAATA-TTCAACACATAGAAGTGGGTGAGAAAGAAAAGTAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 631788 142 + 647215 TGGGTGTACTGGCCAATGTTAATGCCACATGTTATAGTATGCTGAATAGTGTGTTGGGTCTGGGCCCAAGAGAGACAATTACTTGATTATTACCTTAATGGATATCTCAACATCTAGAAGTGGGTGAGAAAGAAAAGTAAAA - -a -s mr.mrrefChr3 167003 285 + 181019 ATTTGGCTGTAAGACATGTATTGTGACTTTTATGGACTTAACTTACCTGGCCCAGACTTTTTGAAAGTAATTTCAAATCAAAGAGCAATAGAGTGAGATGCCTCATGCCCTATCATTAAAGCTAACCAAGATTAGACTACCTTAGTCATTCCATTTGAGTGATCTTTTAATAGCTGCAAATCCTGCAAATAAATGCATGCCTTCTTTGAGGTTCCATTTTAGAGGGCAATTGTGGATACATAAACTGTAAGAGTCTTATGAGGGCACCAAAAAGGATGCCACAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619933 284 + 636262 ATTTGGCTGTAAGACATGTATTGGGACTTTTATGGTCTTGACTTACCTGGCCCAGACTTTTTGAAAGTAATTTCAAATCCAACA-CAACAGAGTGAGATGCCTCATGCCCTATCATTAAAGCTAACCAAAATTAGACTACCTCAGTCATTCCATTTGAGTGATCTTTTAATAGCTGCAAATCCTGCAAATAAATGTATGCCTTCTTTGAGGTTCCATTTTAGAGAGCAATTGTGGATACATAAACTGTAAGAGTCTTATAAGGGCACCAAAAAGGATGCCACAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 631933 272 + 647215 ATTTGGCTGCAAGACATGTATTGTGCCTTTTGTGGAATGAATTTACCTGGCCCAGACTTTCAGAAAGTAATTTCAAATCAAAGAGCAATACA------TGCCTAATGCCCTATCACTAAAGCTAACCAAGATTAGACTACTTTTGTCATTCCATTTGAGTGATCTGTTGATAGTTGCTAACCCTGCAAATAAATGCATGCCTTCTTTGAGGTTCCATTTTAAATGTCAGTTGTGGATACATACACTGTAAG-------TGGGGGTGCCAAATAGGATGCCACAGA - -a -s mr.mrrefChr3 167288 32 + 181019 AATGAGACTAGGACAAGGTAACTGATTTACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620217 32 + 636262 AATGAGACTAGAACAGAGTAACTGATTTACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 632211 32 + 647215 AATGAGACTAGGAAAAGGGAACTGATTTATAG - -a -s mr.mrrefChr3 167320 24 + 181019 TAGTAAGTAGGCCACTGCTACTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620278 24 + 636262 TAGTAAGTAGGCCACTGCTACTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 632243 24 + 647215 TAGAAAGTAGACCACTGCTACTCT - -a -s mr.mrrefChr3 167344 146 + 181019 GTGCCCCCAAATTCGAACAATTACATGAGGTTCAATCATATAAAAATCATGTCACACAACATAACTAAATAACATATGAGGATCTTGCAGACATCTTTGGCCCCTCGTTCTCCAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTATTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620303 146 + 636262 GTGCCCCCAAATTCGAACAATTACATGAGGTTCAATCATATAAAAATCATGTCACACAACATAACTAAATAACATATGAGGATCTTCCAGACAACTTTGGCCCATGGTTCTCCAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTATTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 632267 94 + 647215 GTGCCCCCAAATTTGAACAATTACATGAGGATTAATCATATAAAAATCATGTCACACA-----------TAACATATGACG-TATTGCAGACATCTTTGGCCCCTC---------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr3 167490 133 + 181019 CAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTACTACAAAATTCCCTCATCAGCTGGTTTAAATGATGTCTTAGTGTAATCTAACTCTTTTGAGTCTCACCCTTTTGTGACTTATTGGAGTGTGGAAATGTTCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620495 132 + 636262 CAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTATTACAAAATTCCCTTATCAGCTG-TTTAAAGGACGTCTGAGTGTAATCTAACTCTTTTGAGTCTCACCATTTTGTGACTTATTGGAGTGTGGAAATGTTCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 632361 132 + 647215 CAATAGAGCCTTTGTCATTGCCTACTTGTACTACAAAATTCCATCAGCA-CTAGTTCAAATGTTGTCTTAGTGTGGCCTAACTCTTTGGAGTCTTGCCCTTTTGTGACTTATTGGAGTGTGGCACTGTTCTTT - -a -s mr.mrrefChr3 167623 17 + 181019 GCGGTCTGGAGTGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620633 17 + 636262 GCGGTCTGGAGTGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 632493 17 + 647215 GTAGCCTGGAGTGATGT - -a -s mr.mrrefChr3 167640 18 + 181019 TGTGAAGTGATGTTTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620655 18 + 636262 TGTGAAGTGATGTTTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 632510 18 + 647215 TGTCAAGTGATCTTTATC - -a -s mr.mrrefChr3 167658 22 + 181019 CCTATTCTTGCCAATCCATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620673 22 + 636262 CCTATTCTTGCCAATCCATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 632540 22 + 647215 CCTAGTGTTGCCAATCCATCAC - -a -s mr.mrrefChr3 167680 40 + 181019 GAAAGTTCCAGTGAGTTATTGGCAAGTGACCAGTCTGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620695 40 + 636262 GAAAGTTCCAGTGAGTTATTGGCAAGTGACCAGTCTGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 632564 40 + 647215 GAAAGTTCCAGTGAGTTATAACCAAGTGACCACTCAATTT - -a -s mr.mrrefChr3 167720 106 + 181019 GTATTCCATCAATTTTTGATGTTACCTACTTCACAAACAAAAAACCAGTCCATTACATCCTCTAACTAGCTTGTCCCAAGAGCTGGATGGCGTAGCTCTCCATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620735 106 + 636262 GTATTCCATCAACTTTTGATGTTACCTACTTCACAAACAAAAAACCAGTTCATTACTTCCTCTAACTAGCTTGTCCCAAGAGCTGGATGGCATAGCTATCCATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 632612 106 + 647215 GTATTCCATCAATTTTTGATGTTACCTACTTCACAAACAAAAAACCAGTCCATCACACTCTCTAACCAGCTTGTCCCAAGAGCTGGATGACGTAGCTCTCCATGTT - -a -s mr.mrrefChr3 167826 141 + 181019 GCCCAAAATGATCTGAGTTGACGGTGCTGAAAGAAGTCATAAGCTTTATACTATTTTTTTGATTTGAATGCCATCCAGTTTGGTATTGATAAATGTCTTGGATAGATGGTCTAAAGTTTGAGAAATTGACTTGATATCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620844 133 + 636262 GCCCAAAATGATCTGAGTTGACGGTGCTGAAAGAAGTCATAAGCTTTATATTATTTTTTTGACTTGAATGCTGTCCAGGTTGGTTTCGATAAATGTCTTGGATAGATGG--------TTGAGAAATTGACTTCATATCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 632718 134 + 647215 GCCCAAAATGATCTGAGCCAACGGTGCTGAAAGGAGTCATAAGCCTTATAC------ATTAATTTGAATGCCAT-CAGTTTGGTATTGATAAATGTCCTGGATAGATGGTCTAAAGTTTGAGAAATTGGATAGGTATCATG - -a -s mr.mrrefChr3 167967 106 + 181019 TCAACTTATCATAAGTTGTGCCATTGATGAGGCCCCCATTGCAACTATGCATACAGATGAAAAGGAGCTTATGTATAATAGGGGTATCATGAATTGTCAATGATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620979 106 + 636262 TCAACTTATCATAAGTTGTGCCATTGACGAGGCCCCCATTGCAACTATGCATACAGATGAAAAGGAGCTTATGTATAATAGGGGTATCATGAATTGTCAATGATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 632852 32 + 647215 --AATTTGCAATGATTGATCACACTGATTAGGTA------------------------------------------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr3 168073 45 + 181019 TGTGAAACCTAATTAAATATTTCTGTAGTACTAGGACCATGAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621086 45 + 636262 TGTGAAACCTAATTAAATATTTCTGTAGTCTTAGGACCATGAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 632884 27 + 647215 ------------------ATTTCTGTAGTACTAGAATCATGAAGC - -a -s mr.mrrefChr3 168118 147 + 181019 ACCTTACTAATTCCTTAATTGCAGGCAAGGGCTTACTGGTGCTTCAGTGCTAGGCAGGCATGCCTAGTGAAGTAGACCCAGGGTTACAACTGGACTTCTGTTGGACTGCTATTCTGGATTCGAAAACCTAAGGACTCAGGGCAGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621131 139 + 636262 ACCTTACTAACTCCTTAATTGCAGGCAA--------TGGTGCTTCAGTGCTAGGCAGGCATGCATAGTGAACTAGACCTAGGGTTACAATTGGACTTCTGTTGGACTGCTATTATGGATTCGAAAACCTAAGGACTCAGGGCAGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 632919 147 + 647215 ACCTTACTAATTCTCTAATTGGAGGTAGGGGCTTACTGGTGCTTCAGTCCTAGGCAGGCATGCCCACTGTAGTAGACCCAGGGTGACACCTGGACTTCTTTTGGACTGCTATTCTGAATTCAAAAACCTAAGGACTCAGGGCAGCAT - -a -s mr.mrrefChr3 168265 19 + 181019 GTCTCCCAAAAATGGTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621270 19 + 636262 GTCTCCCGAAAATGGTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 633074 19 + 647215 GTCTCCCAAAAATGGTGTC - -a -s mr.mrrefChr3 168284 170 + 181019 ATCATACATAGACAGGACAGCTCCTATTGGGATGTCCCTGAAATGCCCAGACCAAAGAAAAAATATCAACCCCAAATGATTGCATTGACTTGACTCCCACCTTGTAATATTGGGAAACTCTGCCAGCTAGTCTCAATTAGAGATGATAGGCTCGTCAGGTTCAGCCCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621290 170 + 636262 ATCATACATAGACAGGACAGCTCCTATCAGGATGTCCCTGAAATGCCCAGACCACAGAAAAAATATCAACCCCAAATGATTGCAATGACTTATCTCCCACCTTGTGATATTGGGAAACTCTGCCAGCTAGTCTCAATTAGGAATGACAGGCCTGTCAGGTTCAGCCCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 633093 170 + 647215 ACCATACATAGACAGGACAGCTCCTATTGGGATGTCCCTGAAGTGCCCAGACCAAAGAAAAAATATCAACCCCAAATGATTGCATTGACTTGACACCCACCTTGTAATATTGGGAAACTCTGCCAGCTAGTCTCAATTAGAGATGATAGGCTCGTCAGGATCAGCCTCCT - -a -s mr.mrrefChr3 168454 96 + 181019 TCTGGTATCAATTTGATACTGTGATCTTCATCTGTGTGAACTCATGACTTTAACAATGAAGATTATAGCCTTGAAAAATGCATCCTGTTGAATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621461 96 + 636262 TCTGGTATCAGTTTGATACTGTGATCTTCATCTGTGTGAACTCATGACTTTAACGATGAAGATTATAGCCTTGAAAAATGCAGCCTGTTGAATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 633263 96 + 647215 TCTGGTATCAATTTGATACCATGATCTTCTTTTGTGTGAAATCATGACTTTAACAAAGAAGATTACATCCTTGAAAAATGCATCCTGCTGAATGTT - -a -s mr.mrrefChr3 168550 113 + 181019 TTGGCATTTTTAACACTGGCTTTCCATTGTAACACCCTCTTTCCCAACAATTTTAATACTGCTGTCTGGCTAGATTAACTGTCTTGCTTAATGTGCTTGACTGAGAGTACTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621564 113 + 636262 TTGGCATTTTTAACACTGGCTTTCCACTGTAACACCCTTTTTCTCAACAATTTTAATACTGCTGTCTGGCTAGATTGACTGTCTTGCTTAAAGTGCTTGACTGAGAGTACTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 633359 112 + 647215 TTGGGATTTTTAACACTGGCTTCCCATCATAACACACTCCTTCCCAACAATTCTAATACTG-TGTCTAGCTAGATTAACTGTCTTGCTTAATGTGCTTGATTGAGAGTACACA - -a -s mr.mrrefChr3 168663 271 + 181019 AGTTGAACTAGACTCACCTTTTAGTTTCAATTCACTAGTCTGTATCATGTTCACTACTCCACAGGCCAGTCTACTCAGTTTGTTACCTTTTGTTTGCTAGTAGGCTGATCTATTTGAGCCAATATTTTACAACACAGAGATGGGCCTTCATAGACTTTTGTACGCTGTCCAAGCATTCTATGAGCCTAACAGAATTCAGCCCTTTATGGTTCAACATCTTGCATCCTTGAAACCTTGGAATTCCCGGTTGAGCAAATGAAACTTGACAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621677 270 + 636262 AGTTGAACCAGACTCACCTTTTAGTTTCAATTCACTAGTCCGTATCATATTCACTACTCCACAGGCTACCCTACTCAGTTTGTTACCTTTTGTTTGCTAGTAGGCTCATCTATTTCAGCCAATATTTTACAACACAGAGATGGGCCTTTGTAGACTTTTGTACGCTCTCCAAGCATTTTATGAGCCTAACAGAATTTGGCCCTTTATGGGTCAACATCTTGCATTCTTGAGACCTCGGAATTCCCGGTTGAGCAATTGAAACTT-ACAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 633473 258 + 647215 ATTCGAGCTGGAATCACCTCTTAATTTCAATTCACTAGCCTGTATCATGTTCACTA---------CCAGTCTACTCAGTTTGTTACCTGTGGTTCGCTAGTAGGCTGATCCACTTGAGCCAATATTTTACAACACAGAGATGCGCCTTCATAAGCTTTTGTAAGCTGTCTAAACATCCTATGGGCCTAACAAAATTCAGTCCTTT----TTCAACATCTTGCATCCTTGAAACCTTGGAATTCCCAGTTAAGCATACGAAACTTGACAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 168934 112 + 181019 AAGCTTTAGCAGATAAAGGGCACTGCAACCCTCAGTCAAGGAGCTTGGTTCCACAGCACACCATTGAGGATAACCATTGATGGTTCCAAGTTTAGAGGACATGAAGAATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621953 112 + 636262 AAGCTTTAGCAGATAAAGGACACTGCAACCCTCAGTCAAGGAGTGTGGTTCCACAGCACACCATTGAGGATAAGCATTGATGGTTCCAAGTTTAGAGGACATGAAGAATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 633731 112 + 647215 AAGTTGTAGCAGATAAAGGGCACTGCAACCCTAGGACAAAGACCTCGGTTCCACAGCACACCATTGAAGGTAACTTTTGATGGTTCCCAATTTAAAGGACATGAAGAATTTT - -a -s mr.mrrefChr3 169046 23 + 181019 GATCTCAAGGCCTAGTGACCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622065 23 + 636262 GATCTCAAGGCCTAGTGACCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 633844 21 + 647215 GGTCTCAAGGCC--GTGACCTAT - -a -s mr.mrrefChr3 169069 63 + 181019 TTATCTAAGTTCTTTCGTACTAATTTACTGACCATAAGGGTAGTGCATAATTTGATACTATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622088 35 + 636262 TTATCTAAGTTCTTTCGTACTAATTTACTGACCGT---------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 633870 63 + 647215 TTATCTAAGTTCTTTCATACTAATTTACTGACCACAAGGGTAGTGCATAATTTGATACTATAG - -a -s mr.mrrefChr3 169132 56 + 181019 GCAATCAATTAAAAATTGCCTTTCAAATTGCCCTTATTCAGTCCCAAGGGTGTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622123 30 + 636262 --------------------------ATTGCCCTTAATCAGTCCCAAGGGTGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 633944 56 + 647215 GCAATCAATTAAAAATTGCCTTTCAAATTACCCTTATTCAGTTTCATGGGCCTTCA - -a -s mr.mrrefChr3 169188 42 + 181019 CCCAACCTAGTGAGGAATGATTCCTAGAATAATATGACTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622153 42 + 636262 CCCAACCTAGTGAGGAATGATTCCTAGAATAATATGACTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 634025 42 + 647215 ACCAAACTAGTGAGGAATGATTCCTATAATAATATGACTTGC - -a -s mr.mrrefChr3 169230 77 + 181019 ATGCTTGAGCATTGTAAAGTTGAGAAGTGAATAGGCTTTAAGAGACAAAATACTCAAAGAGAGAAGAAACAATGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622195 77 + 636262 ATGCTTGAGCATTGTAAAGTTGAGAAGTGAGTAGGCTTTAGGAGACAAAATACTCAAAGAGAGAAGAAACAATGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 634072 67 + 647215 AAGCTTGAGCATCGTAAA----------GAATAGGGTTTAAGAGGCAAAATACTCAAAGAGAGAATAAACAATGCCC - -a -s mr.mrrefChr3 169307 51 + 181019 AATGACTGCGACCAACACTATCTGCCCTTTGACTCAAACAGGGAAGATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622272 51 + 636262 AATGACTGCGACCAACACTATCTGCCCTTTGACTCAAACAGGGAAGATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 634140 51 + 647215 AATGCCTGTGACTAACAGTATCTCCCCTTTGACTCAAAGGGTGAAGATCAA - -a -s mr.mrrefChr3 169358 6 + 181019 GAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622324 6 + 636262 GAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 634191 6 + 647215 GAGAGA - -a -s mr.mrrefChr3 169364 13 + 181019 GCCCAAATAACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 634206 13 + 647215 GCCCAAATAACTC - -a -s mr.mrrefChr3 169377 333 + 181019 CACCTGATACTATCTCCCCTTTGAGTAATTGCTAGCTGCAGCCCTTGTGTACCACATCTGACTTTACTTTGAATTCATACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGTAAAGGTAGTGTGCTGTCAGATCACTTATGCTCCATTGTCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGATCCCATGGCAATGTATTAAGCCAATACCTACCATGGGTAGGCATAAACTGTATCACCTGTAGGATAGATGGGGTGACAACTATGAACCTCCATATTCAGCCCAAATAAAGATATATTATATCAAGAACACAGACCACCAAAATTAGCACGCACTTGAATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622633 324 + 636262 ---------CTATCTCCCCTTTGAGTAATTGCTGGCTGCAGCCCTTGTGTATCACATCTGACTTTACTTTGAATTCCTACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGTAAAGGTAGTGTGCTGTCAGATCACTTATGCTCCATTGTCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGATCCCATGGCAATGTATTAAACCAATACCTACCATGGGTAGGCATAAACTGTACCACCTGTAGGATAGATGGGGTGACAACTATGAACCTCCATATTAAGCCCAAATAAAGATATATTATATCAAGAACACAGACCACCAAAATTAGCATGCGCCTGAATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 634224 332 + 647215 CACCTGATAATATCTCCCCTTTGACTAATTGCTAGCTGCAACCATAGTGTACCACATCTTACTTTAATTTGAATTCATACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGCAAAGGTGGTGTGCTGTCAGATCACTTGTGCTCCATTATCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGAACCCATGGATATGTAATAAGCCGATACTTACCATGGATAGGCATAGACTGTCTCACTCATGGGATTGGTGAGGTGACAACTGTGAACCTCCAT-TTCAGCCCAAATAATTAACTATTATATCAAGAACACAGAACCCCAAACTTAGCACGCACTTGATGGCT - -a -s mr.mrrefChr3 169710 17 + 181019 TGTTCTCCTTGTGGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622957 17 + 636262 TGTTCTCCTTGTGGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 634569 17 + 647215 CATGCTACTTGATGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 169727 19 + 181019 AAATCATTGTCCTGATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622974 19 + 636262 AAACCATTGTCCTGATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 634721 19 + 647215 AAATCATGACAATGGTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 169746 12 + 181019 CATGTGGCCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622993 12 + 636262 CATGTGGCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 634743 10 + 647215 CATGAGGGGA-- - -a -s mr.mrrefChr3 169758 31 + 181019 AGGCTGAGAGTGCTTCTCACTCCTCATCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623006 31 + 636262 AGGCTGAGAGTGCTTCTCACTCCTCATCATG - -a -s mr.mrrefChr3 169789 81 + 181019 TAAGCGTTGTATATAAGATAGGCATATTTGTACTGAATCATTACATACTGAACACACAAGCATTGTATCAAGTAGCATGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623065 81 + 636262 TAAGCGTTGTATATAAGATAGGCATATTTGTACTGAATCATTACATACTGAACACACAAGCATTGTGTCAAGTAGCATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 634753 20 + 647215 -------------------------------------------------------ACAGATATTGTATA------CACGGT - -a -s mr.mrrefChr3 169870 321 + 181019 AGGCGACTGTATAGGCTAAAACTGTGTTACAGGTGAAATATCATGCAAATTTAATACTGATATCTTGTACATTGTTTCACATCACTATATGTAGAAAACCAGCCACCAAAGGCTAGTATAATTTGTATGAGGATGAGTAGTGACAATGCAGCAATTCTTCCTCACTCATTCTAGTTCCTAAATATATCTGTGCCTGAGTAACAACTCTGAAAACATACAGGTACTATTTTATATGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATTATATCGATTAATGGCTCTCCCAATGAGCACTATCAATTATCCCTCACATCCCACTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623146 321 + 636262 AGGCGAATGTATAGGCTAAAACTGTGACACAGGTGAAATATCATACACATTTAATACTGATATCTTTAACATTGTTTCACATCACTACATGTAGAAAACCAGCCACCAAATGATAGTATGATTCGTATGAGGATGAGTAGTGACAATGCAGCAATTGTTCCTCACTCTTTCTAGTTCCTAAATATATCTGTGCCTGAGTAACTACTCTGAAAACATACATGTACTATTTTATATGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATTATATCTATTAATGGCTCTCCCAATGAGCACTATCAATTACCTCTCACAACCCACTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 634774 320 + 647215 AGTAGACTGCATAGGCTAAAACTGTGTTACAAGTGAAATATCATGCAAATTTGATACTGGTACCTTGTACTTCGTTTTAGATCTCTATATGTA-AAAACCAGCCTTCAAAGGCTACTATAACTTATATGTGGATGAGTAGTGACAACGCAGCAATTCTTCCTCACTCATTCTAGTTCCAAAATATATCTGTCTTTGAGTAACAACTCTGAAGGCATACAGGTACTATTTTATAGGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATGATATAGATTAATGGCTTTCCCAATTAGCACTATCAATTATCCCACACATCCCACTATA - -a -s mr.mrrefChr3 170191 168 + 181019 CTACTTTCCTTATGAGGGTTGGGGCTTGTGTTAATAACTGAGGAGTTGGAACACATCCCCTACTGGGGTTTTGTTTGCTCCTAGCCTCCTGTTGACCCCATATTGACAATCAGAGGCTCCATGCAGTTGAGCATAACACCTTGGGCAAAGATAAAGGGCACCCTTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623468 168 + 636262 TTACTTTCTTTATGAAGGTTGGGGCTTGTGTTAATAACTGAGGAGTTGGAACGCATCCCCTACTGGGGTTTTGTTTGCTCCTAGCCTCCTGTTGACCCCATATTGGCAATCAGAGGCTCCATGTAGTTGAGCATAACACCTTGGGCATAGATAAAGTGCACCCTTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 635094 168 + 647215 CTACTCTCCTTACAAGGGTTGGTGCTTATGTTGATAACTGAAGAGTTGGAGCACATCCCCTACTGGGGTTTTGTTCGCTCCTAGCCTTCTGTTTGCCGCTTAGCGACAATCAGAGGCTCCATGCAGTCAGGCGTAACACCTTAGGCAAAGATAAAGGGCACCCCTCTA - -a -s mr.mrrefChr3 170359 13 + 181019 TCACCTATTTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623636 13 + 636262 TCACCTATTTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 635263 13 + 647215 TCACCTATATAAC - -a -s mr.mrrefChr3 170372 25 + 181019 AATGCTCATACTATCTAGCACTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623650 25 + 636262 AATACCCACACTATCTAGCACTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 635276 25 + 647215 AATGCTCGTACTATCTAGCACTCCA - -a -s mr.mrrefChr3 170397 239 + 181019 CTACTCTATCACTATTTATCTCTTAGCCAGAGGTCATCAATTTGATGCAGTCAGGATAACTTTGTGAATTCTCTAAATATGTCTGGCCTACTTTGTTGAATTGGGCTTGTACCTCTTGCATGACCAAAATAATTTTGCAGAGACATGTCATGTCATGTGGTACTTCAGAGTGTGTTTGTGCTCAGAAGGCATCAATTCTAAACAGAGTCACATCATGCCATGGTTGTAGTGACTTATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623675 239 + 636262 CTACTCTATCACTATTTATCTCTTAGCCAGAGGTCATCAATTAGATGCAGTCAGGATAACTTTGTGACTTCTCAAAATATGTCGGGCCTATTTTGTTGAATTGGGCTAGTACCTCTTGCATGACCAAAGTAATTTTGCAGAAACATGTCATGTCATGTAGTACTTCAGACTGTGTTTGCAATCAGAAGGCATCAATTCTAAACGTAGTCACTTCATGCCATGTTTGTAGCGACTTATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 635305 239 + 647215 CTACTCTATCACTATTTATCTCTCAGCCAGAGGTCATCAATTTGATGCAGTTGGGATAACTTTGTGTATTCTCTACATATGTCTGGCCTACTTTGTCAAGTTGGGCTTGTACCTCTTGCATGACCAAAATAATTTTGTAGAGACATGTTATGTCATGTGGTACTTCAGAGTGTGTTTGTGCTCAGAAGGCATCAATTCTAAACAGAGTCACATCATGCAATGGTTGTACTGACTTATAT - -a -s mr.mrrefChr3 170636 206 + 181019 ATGGTCCCTTCACTAGGTTTAATCCTCATGAAATGGTAGTTAGCTTTTATTCATGATTCCGAACCAGACTGGCTTTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCAGTAGAGAAGGTCTACCCAGGAATAGGTCACTTCTGACTCGGTTCGTTGTATCTCAATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCAAAAAAAATGCACTCCTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623921 206 + 636262 ATGGTCCCTTCACTAGGTTTAATCCTCATGAAATGGCATTTAGCTTTCCTTCATGATTCCGTACCAAACTGGCTTTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCGATAGAGAAGGTGTACCCAGGAATAGGTCACTTCTGACTCGGCTCGTTGTATCTCAATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCACAAAGAATGCACGCCTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 635544 200 + 647215 GTGGTCCCTCCAGTAGGTTTAATCCTCATGAAATG-TAGTTAGCTTTTACTCACGATTCCCATACTGGTGGGGTCTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCAGTAGAGAGAGACTACCCAGGTATAGGTCACTTCTGACTTGGTTCTTTGTATCTCGATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCAAAAAAAACGCATTC----- - -a -s mr.mrrefChr3 170842 103 + 181019 AGTATCACGCACGATAAGTGTCACACGCTCTGCTGCATTAAGTACATGCCATGTCCGATGACATCAAGACCTAACCTAGTATGTCCTGTATCTTGATTTCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624133 103 + 636262 AGTATCACGCACGATAAGTATCACATGCTGTGCTGCATTAAGTTCATGCCATGTCGGATGACATCAAGATCTAACCTAGTATGTCCTGTATCTTGATTTCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 635744 87 + 647215 ---------------AAGTGTCAGACGCTCTGCTGCATTAAGTACATGCCATGTCCTATGACATCAAGACCTAACATAGTATGTCCTGTA-CTAGATTTCGGA - -a -s mr.mrrefChr3 170945 275 + 181019 TACCATTGTAATCATAATATAATGCATGAATGTTAGAAATGAGTTCAGCAGGCAGGTTTTCCCACCTGACTAGTATTAGTGGTAGCCTCTGGTATTTAACCGTCTGAATTCATCTTGTGTTCTAACACTCCAGGGCCCTACGGCAACATTTGTCAGAGCTGCAAATTAAGAACTTTCCTCAGCACTTAGGTGACCTACATGGTCTGTACTAATTCTTCCTTGATTTACTGGTCCAGTTGAGTATTAATTACAACAACCACATGCTATACCAAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624239 275 + 636262 TACCATTGTAATCATTACATAATGCATGAATATTAGAAATGAGTTCAACAGGCAACTTTTCCCACCTGACTAGTATTAGTGGCAGCCCCTGGTATTTAACCGTCTGAATTCATCTTGTGTTCTAACACTCCAGGGCCCTACGGCAACATTTGTCAGAGCTGCAAATTAAGAACTTTCCTCAGCACTTAGGTGACCTACATGGTCTGTACTAATTCTTCCTTGATTTACTGGTCCAGTTGAGTATTAATTACAACAACCACATGCTATACCAAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 635831 275 + 647215 TACCATTGTAATCGTAATATAACCCATGAATGTTAGAAATGAGTTCAGCAGGCAGGTTTTACCACCTGACTAGTATTAGTGGTAGCCTCTGGTATTTAACCATCTGAATTCATCTCGTGTTCTAACACTTCAGAGCCATATGGCAATATCCATCAGAGCCGCAAATTAAGAACTTTCCTTGACACTTAGATGACTTATGTTGTCTGTACTAAACCTTTTTTGATTTATTGGTCTGATTGAGTAATAATTACAGCAACCACACACTATACCAAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 171220 67 + 181019 TACATTGTTATGGACGTTGTTCCAGCTTACATTCACTTAAGAATGGCTGGCGCATTAAGCCATTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624516 67 + 636262 TACATTGTTATGGACGTTGTTCCAGCTTACATTCACTTAAGAATGGCTGGCGCATTAAGCCATTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 636106 67 + 647215 TACATTGTTACAGACATTGTAACAGATTACATTCACCTAAGGATGACTGGGGCACTGAGCCAACAGG - -a -s mr.mrrefChr3 171287 320 + 181019 TAAAAAACAACTTATGTTACAATGTTAAATCTTTCTCCAGATTTTATAGTGTGACACTCTGTTGTAACACGGGGGTTCAGTCTCGCCAGAAGTGATATGTATACATTTGGAAATTACTAAATTCACAATGTGATTGATACCATATTTAGTTGGGGGAGGTTTATGGGTGCCAACAAATTTGGCCCAGCATGATTGTCATGTCTGCCTTGAAATTGAAATAAAGTCACTTTCATAGCTGTAGTTCTAATCATTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGGATATGTGCAATCAGACAGAATTGAGTAATTCTTCCCTGACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624584 320 + 636262 TAAAAAACAACTTATGTTACAATGTTAAATCTGTTGCCAGACTTTGTAGTGTGACACTCTGTCATATCTCGGGGGTTCAGTCTCGCCAGAAGTGATAAGTATACATTTGAAAGTTACTAAATTCACAATGTGATCAATACCATATTTAGTTGGGGGAGGTTTATGGGTGCCAACAAATTTGGCCCAGCATGATTATCTTGCCTGCCTTGAGATAGAAATAAAGCCACTTTCATAACTGTAGTTCTAATCATTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGGATATGTGCAATCAGACAGAATTGAGTAATTCTTCCCTGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 636173 320 + 647215 CAAAAGACAACTTATGTTATAGTGCTAAACCTTTCTCCAGGTTTTATAGTGTGACACTCTGTTGCAACATGGGGGTTCAATCTCTCGAGAAGTGATATGTATACATTTGGTGATTACTAGATTCACAATGTGACTGATACCATATTTAGTTGGGGTAAGTTTATGCTTGCCAACAAATTTGGTCCAGCATAATTGTCATGTCTGCCTTGAAATTGAAATAAAGTCACTCTCATAGCCATAGGACTATTCGTTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGTATACGTTCAATCAGACAGCATTGAGTAATTCTTCCCAGAAC - -a -s mr.mrrefChr3 171607 109 + 181019 CAGGTCTTTAATGGAGAGTATTGTATTGCCAGGGAGTGACTCCCAGGGAGTGACTGACAGTTCTTCTTCTATTCCCCTCCCCTGTCTTCCCCCACTATTAAGTTTTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624904 109 + 636262 CAGGTCTTTAATGGAGAGTATTGTATTGCCAGGGAGTGACTCCCAGGGAGTGACTGACAGTTTTTCTTCTATTCCCCCCCCCTGTCTTCCCCCACTATTAAGTTTCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 636496 109 + 647215 CAGGTCTTTAATGGAAAGTATTGTATTGCCAGGGAGTGACTCCCAGGGAGTGGCTGACAGTTCTTCTTCAATTCCCATCCCCTGTCTTCCCCCACCATTAAACCTTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 171716 323 + 181019 TAGTGGGTCCTTGTGAGATACATGATGCCCACCCTGCTGAGTGTTATAATACACAAAATAATGGTGACAATTACCAATATCCCAATGAACAAACCAATTGAAGATATGTATACTCATTAATTAGTATAGAACACTCAAGTGGGTACTCATATTAATGTAGAAAGATATGGCAGTTCTTGGATACTTACAGATTTGCATTACCTGAGAGGATACTTAAATTTCTGAGGTCATTAAAAATTTTACAAGGTCTACTAATTTCACTCGATAAACTATGTCTGTATTGAGATAGCAAGGCTATGAAGTTTTGAGAGACCCACATGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625013 322 + 636262 TAGTGGGTTGTTGTGAGATACATGATGCCCACCCTGCTGAGTGTTATAATACACAAAATGATGCTGACAATTACCAATATCCCAATGAACAAACCAATTGAAGATATGTACACTCATTAACTAGTATAGAACATTCAAGTGGGTACTCATATTAATGTAGAAAGATATGGCAGTTCTTGGAAACTTACAGATTTGCATTAC-TGAGAGGACACTTAGATTTCTGAGGTCATTAGAAACTTTACAAGGTCTACTAATTTCACTCGATAAAGTATGTCTATATAGAGATAGCAAGGCTATGAGCTTTTGAGAGACCCACACGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 636608 312 + 647215 CAGTTGGTCCATGTCATATACATGATGCCCACTCTGCCGGGTGTTGTAATACATAAGATAATGGTGACAATTATCAATATTCCAATGAACAAACCATTTGAAGAGATGTATACTCATTAATTATTATAGAACACTCAACTGGGTACTCATACTAATGTAACAAGGTTTGGCAATCCTTGGATACTTACAGATTTGCATTACCTGAGAGGATACTTAAGTTTGTGAGGTCATTAAAAATTTTACAGAGTCTACT----------GATAAACTATATCTGTATTGAGATAGCCAG-CTATCAAGTTTTGAGATACCCAAATGTTT - -a -s mr.mrrefChr3 172039 22 + 181019 CAGCACTACAGGAGTATGTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625353 22 + 636262 CAGCACTACAGGAGTATGTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 636920 22 + 647215 CAGCACCACAGGAGGATGTGTG - -a -s mr.mrrefChr3 172061 97 + 181019 AGACACTCCATGTGACATTGTCTACTGGGCTAGATAGGATTGTCTCTCATGAAATCTAATTGTTGTATTAGCCAACTTAATGGCATCAATTACGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625375 96 + 636262 AGACACTCCATGTCACATTGTCCAGTGGGCTAGATAGGATGGTCTCTCATGAA-TCTGATTGTTGTATTAGCCAACTTAATGGCATCAATTACGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 636944 97 + 647215 AGACTCTCCATTTGGCATTGTCTACTGGGCTAGAAAGGATTTTCTTTCACGAAATCTAATTGTTGTATTAGCCAACTTAATTGCATCAATTAGGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 172158 41 + 181019 GCTGGTTGCGGATTACATCAGGCTTATTCCTTGGCTTCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625475 41 + 636262 GCTGGTTGCAGATTACAACAGGCTTGTTCCTTGGCTTCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 637041 41 + 647215 GCCAGTTGCGGATCACGTTGCGCTTATTCCTTGGGTTCCCA - -a -s mr.mrrefChr3 172199 106 + 181019 TTGATTAGGGTCCCAAGCTTATCCTGAACTCCAGTGAATAATTCAGATATATTAGGCCCAGGTAGACCCTCCATATGCTATTATCCTTTTACATGCACATAAAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625517 104 + 636262 TTGATTAGGGTCCCGAGCTTATCCTGGACTCCAGTGAATAATCCAGATATATTAGGCCCA--CAGACCCTCCATATGCTATTTTCCGTCTACATGCACATAAAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 637082 95 + 647215 TTGATTCGGGTCCCAAGTTTATCCTGAACTCCAGTGAATAATTCATATATATTAGGCCCAGGTAGACCCCCCATATGCTATTATCTTCTTACATA----------- - -a -s mr.mrrefChr3 172305 15 + 181019 TCTAGGAAGGGTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625633 15 + 636262 TCTAGGAAGGGTCTC - -a -s mr.mrrefChr3 172320 5 + 181019 TTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625659 5 + 636262 TTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 637177 5 + 647215 TTTGA - -a -s mr.mrrefChr3 172325 58 + 181019 TAGTCTGACGCACCTGCTATCAGCCCATGTAGTGGAAATTTGGACTGTTATCGGTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625665 58 + 636262 TTGTCTGACGCACCTGCTATCAGCCCATGTAGTGGAAATGTGGACTGTTATCGGTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 637182 58 + 647215 TAGTCTGACGCACCTGTTCTCAGCCCATGTAGTGGAATCTTGGACTGTTAGCGGTACC - -a -s mr.mrrefChr3 172383 104 + 181019 TCATCTATTTGTATTGTCCCTGAGTTACCAGTCACAGCAAAGGGACCAGCATACCAGTGCCACAGCACCCAGCTGGGTCCTATGGCAAGTTAGATCCAGATGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625723 80 + 636262 ------------------------GTACCAGTCACAGCAAACGGACCAGCATACCAGTGCCACAGCACCCGGCTGGGTCCTATGGCAATTTAGATCCAGGTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 637241 101 + 647215 TCATCTATTTGTATTGTCCCTGAGTTACCAGTC---GCAAAGGCACCAGCATACCAATGCCACAGCACCCAGCTGGGTCTTAGGGCAAGATAGATTCAGATGAG - -a -s mr.mrrefChr3 172487 106 + 181019 GTCTCAGAAGTCTAGACTCAATGATCAAGCAAGTTTACCATCTTTTTGATGTTGCAATACATTATGTGTTCATTGCATGATGTATGGAGTTGGCTCTCTATGATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625804 106 + 636262 GTCTCAGAAGTCTAGACTCAATGATCAAGCAAGTTTACCATCTTTTTGATGTTGCAATACATTATGTGTTCATTACATGATGTATGGAGTTGCCTCTCTATGATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 637342 106 + 647215 GTCTCAGAAGTCTAAACTCAATGATCAAGCAAGTTTACCATCTTTTTGATGTTGCAATGCATTATCCGTTCATTGCGGGATGTATGGAGTTGGCTCTCTATGATTC - -a -s mr.mrrefChr3 172593 28 + 181019 TAATACTCCTTGCAACCACTTGTGGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625927 28 + 636262 TACTACTTCTATAAATTACTTATAGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 637448 28 + 647215 TAATAATCCTTGCGACCACTTGTGGTGC - -a -s mr.mrrefChr3 172621 32 + 181019 CCCTGTTAAGTGGTCCTTACAGCCTCTTTCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625967 30 + 636262 CCCTGTTAAGTTTTCCTGTC--CCTCCATCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 637476 32 + 647215 CCCCTTTGAATGGTCCTTATAGCCTCTTTCGA - -a -s mr.mrrefChr3 172653 13 + 181019 TCAATTCAAGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625997 13 + 636262 TGAACTCATGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 637509 13 + 647215 TCAATTCAACAAA - -a -s mr.mrrefChr3 172666 11 + 181019 CAAGTTGATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626011 9 + 636262 TAAGTTGAT-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 637522 11 + 647215 CAAGCTACTGG - -a -s mr.mrrefChr3 172677 38 + 181019 AAGCATGCTTGTACTCCTTCTAGGAATTACTTATAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626020 36 + 636262 -ACCATGGTGGGATACCAT-TGGGAATACTGTAGAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 637536 38 + 647215 AAGCAGGCTTGTACTCCTTCTATGAATTACTTATAGGA - -a -s mr.mrrefChr3 172715 5 + 181019 GTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626060 5 + 636262 GTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 637574 5 + 647215 GTGAT - -a -s mr.mrrefChr3 172720 225 + 181019 CAACAATACCTTATACATTAGGATGAGGGATGAGGGTACAATCAAAAATGTTCTGGGCACCTGGGATTCTTTTAATATAAATGATTAGCCCCATCACCACCCAATATCAAATAGGCAGGGGCTGGGGATCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCATGTGACTGCCAAGGACATGAGTTGCTAAAGAATCTGGTCCCATCAGCCCGACCAGCCCAGATTTGTTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626071 225 + 636262 CAACAATACCTTATACATTAGGATGAGGGATGAGGGTACAATCATAGATGTTCTGGGCACCTGGGATTCTTTTAGTATAAGTGATTAGCCCCATCACCACCCAATATCAAATAGGCAGGGGCTGGGGATCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCATGTGACTGCCATGGACATGAGTTGCTAAGGAATCTGGTCCCATCAGCCCAACCAGCCCAGATTTGTTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 637579 225 + 647215 CAGCAATACCTTATACATCAGGATGAGGGATGAGGGTCCAATCAAAAATATTATGGGCATCTGGGATTCTTTTAATATAAATGATTAGCCCCATAAGCACCCAAGATCGAATAGGCAGGGGCTGGGGACCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCAGGTGACCACCAAGGACGTGAGTTGCTAAAGATTCTGGTCCCATCAGCCCGACCAGCCCAGATTTTTTGGA - -a -s mr.mrrefChr3 172945 166 + 181019 GCACAACTTAAATACTATCACTCAAACGAGACTCAAACAAATTCACTTCATGACCACATTCAGAATCAATAATTACGTTGCCTGGAGCATATTTTCAAACTTGGATATGTGCAGTATACTTGTAAATCTATACTTTTGAGTGCCTATTTTTTTGTTGGACCTGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626296 162 + 636262 GCACCACTTAAATACTATCACTCAAACAAGACTCAAGCAAATTCTTTTCATGACCACATTAAGAATCA----TTACATTGCCTGGAGTATATTTTCAAACTTGGATATGTGCAGTATATTGGTAAATCTATACTGTTGAGTGCCTATTTTTTTATTGGACCTGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 637814 159 + 647215 GCAAAACTTAAATACTATCACTCAAATGAGACTCAAACAG-TTCACTTCATGACCACACCCAGTATCAATAAGGACGTTGCCTGGAGCTTATTTTCAAACTTAAATATGTGTA-TATACTTGT-----TATACTTTTGAGTGCCTATTTTTTTGTTGGAATGGCTT - -a -s mr.mrrefChr3 173111 35 + 181019 ATTTGCTTTAGCAAATTGGTATGAAAACACTGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626627 14 + 636262 ACTTGCTAAAGCAA--------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 637973 35 + 647215 ATTCGCTTTAGCAAATTGGTATGAAAACACTGATA - -a -s mr.mrrefChr3 173146 12 + 181019 ACATCTTGTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 638009 12 + 647215 ACATCTTGTCAA - -a -s mr.mrrefChr3 173158 28 + 181019 TGGATATTTGCCCGAGGCACTGTGTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 638093 28 + 647215 TGGATATTTGCCCGAGGCACTGTGTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 173186 11 + 181019 TCTAAACAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626641 7 + 636262 ----ATGAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 638122 11 + 647215 TCTAAACAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 173197 40 + 181019 TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTCTCCTCCAGGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626651 40 + 636262 TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTCTCCTACAGGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 638133 40 + 647215 TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTGTCCTCCAGGGCC - -a -s mr.mrrefChr3 173237 10 + 181019 CACGGGGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626704 10 + 636262 CATGGGGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 638173 10 + 647215 CACGGGGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 173247 107 + 181019 GAACCTTGGGTAGAACCTAAAATCTGCATTTTTTTTGGAAGGTATGTTACTTTTTGCAGGTTAAGTTACTGCACTACACATACAACAGAATCATGCTGTATTCCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626714 106 + 636262 GAACCTTGGGCAGATCTTCAAA-CTGCGTTTTTTTTGGAAGGCATGTTACTTTTTGCAGGATAAGTTACTGCACTACACATGCAACAGAATCATACCGCATTCCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 638184 107 + 647215 AAACCTTGGGTAGAACCTAGAATCTGCATTTTTTTTGAAAGCTATGTTACTTTTCGCTGGTTAAGTTATTGCACTACATATATAACAGAATCATGCTGTATTGCCCT - -a -s mr.mrrefChr3 173354 38 + 181019 CCTGTTCTAAAAAGCTTGCCCAGGTCTAGGTCCTATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626842 34 + 636262 CCTGTTCTAAAAAGCTTGACCAGGTTTAGGTCCT---- -s simRat_chr6.simRat.chr6 638291 38 + 647215 CCTGTTCTAAAAAACTTGCCCGGGTCTAGGTCCTATAT - -a -s mr.mrrefChr3 173392 20 + 181019 TCATGTTTTCAATGTTATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626876 20 + 636262 TCATGTTTTCAATGTTATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 638339 20 + 647215 TCATGTTGCCAATGGTATTT - -a -s mr.mrrefChr3 173412 41 + 181019 TTTGCAGATCTGATGTGTATGAAGGCTATTTTGATTTCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626898 41 + 636262 TTTGCAGATCTGATGTGTATGAAGGCTATTTTGATTTCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 638359 41 + 647215 TTTGCAGATCTGATGTGTATGAAGGTTATTTTGATTTCTAT - -a -s mr.mrrefChr3 173453 73 + 181019 TCAACATGCCACAACAGCTTCTATCACTGCTGATTTGCATTTCAGCTTAGACTGATAAAGCATCTTAGAACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626939 73 + 636262 TCAACATGCCACAACAGCTTCTATCACTGCTGATTTGCATTTCAGCTTAGACTGATAAAGCATCTTAGAACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 638497 73 + 647215 TGATTATGCCACAACAGCTTCTATTACTGCTGATTTGCATTTTAGCTTATACTGATAAAGCATCTTAAGACAC - -a -s mr.mrrefChr3 173526 109 + 181019 AGTAGCTATGTTCCATTTACCACACTGTAGACTTGCAAACATTGTGTACTTGGGTTATTGACCCACTTTGCTTCTCCCACAGAACGAAATAATTACGGCATTGGACTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627066 109 + 636262 AGTAGCTATGTTCCATTTACCACACTGTAGACTTGCAAACATTGTGTACTTGGGTTATTGACCCACTTTGCTTCTCCCACAGAACGAAATAATTACGGCATTGGACTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 638570 109 + 647215 AGTGGCTTTGTTACTTTTACTGCACTGTGGACTTGTAAACATGGCATACTTGGGTTATTGGCCCACTTTGCTCCTCCTACAAAATGAAATAATTATGGCCTTGATCTCC - -a -s mr.mrrefChr3 173635 55 + 181019 ACACTCTTTCATAGCGTTCAAGTTTGGTTATTTATTCTATACCTATCTGGACTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627178 55 + 636262 ACACTCTTTCATAGCGTTCAAGTTTGGTTATTTATTCTATACCTATCTGGACTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 638679 55 + 647215 ATACTCTTTCATAGTGTTCGTGTTCGGTTATTAATTCTATACCTATCTGGATTTA - -a -s mr.mrrefChr3 173690 130 + 181019 AGGCAGAAGAGGGGACATATCTTTAACAATGCATATCTTTCAGGACTGGAGGCGTTTGACAAATTCTCAATATCTCTGCAGCAACAATACCCAGCATGATTAGAGACTAAACTACTCTATTCATACTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627235 130 + 636262 AGGCAGAAGAGGGGACATATCTTTAACAATGCATATCTTTCAGGACTGGAGGCGTTTGACAAATTCTCAATATCTCTGCAGCAACAATACCCAGCATGATTAGAGACTAAACTACTCTATTCATACTGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 638734 130 + 647215 AGGCCAAACAGGGGACGTATCTTTAACAATGCATGGCCTTCAAGACTGGAAGGGTTTGACACATGCTCAATATATACGCAGTAACAATCCCCAGCATGATTAGAGACTAAAATACTCTATTCATACTAGG - -a -s mr.mrrefChr3 173820 74 + 181019 CTTTTTTTAGATGACAATGACAATACCATGTATATACTTTACATCTATATGTCTAAGGATGACTGAGGGCTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627365 74 + 636262 CTTTTTTTAGATGACAATGACAATACCAGGTATATACTTTACATCTATATGTCTAAGGATGACTGAGGGCTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 638870 74 + 647215 CTTTTTTTAGATGACAATGACAAGACTATGTATATACCTTACATCTATATGTCTAAGGATGACTGAGGGCTTCG - -a -s mr.mrrefChr3 173894 112 + 181019 AGGGCACATATCTCTATGTAGGCCCTCCAATTAGGATCAAACTCATGCTGAACAAGCTTAACAGACTTCAACATCATGGCAAGATCTGAAGCTTGCTATAATAAAACATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627440 103 + 636262 AGGGCACATATCTCTATGTAGGCCCTCCAAT---------ACTCATGCTGAACAAGTTTAACAGACTTCAACATCATGGCAAGATCTGAAGCTTGCTATAATAAAACATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 638944 112 + 647215 AGGGCACATATCTCCATGTAGCCCCTCCAATTAGGATCAAACTCAAGCTGAACAAGCTTAATAAACTTTAACATCATGGCAAGATCTGAAGCTCACTATAATAAAAGACTCA - -a -s mr.mrrefChr3 174006 107 + 181019 CAAAATGTGGTCTATGTGTTTGTTCTGTTTGCTTTATGTCATGTACAGAGTTTTGGAGACATGTGCATAACCTACAAGTCACCTTTGGAAATCAATTGCTGCTCTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627544 107 + 636262 CAAAATGTGGTCTATGTGTTTGTTCTGTTTGCTTTATGTCATGTACAGAGTTTTGGAGACATGTGCATAACCTACAAGTCACCTTTGGAAATCAATTGCTGCTCTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 639056 107 + 647215 CAAAATGTGGTCTATGTGTTTGTCACACTCGTGTCATGTCATGTACAGAATTTTGGATACACGTGCTTAAGCTGCAAGCCAGCTTCAGAAATCAATTGCTTTACTGC - -a -s mr.mrrefChr3 174113 9 + 181019 GGGCAAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627660 9 + 636262 GGGCAAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 639163 9 + 647215 AGTCAAAAC - -a -s mr.mrrefChr3 174122 17 + 181019 AATATTTAATGCAGTCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627669 17 + 636262 AATATTTAATGCAGTCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 639175 17 + 647215 ATCATCTTACATGTCTG - -a -s mr.mrrefChr3 174139 15 + 181019 TAAGGCCTAACTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627686 15 + 636262 TAAGGCCTAACTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 639193 15 + 647215 TGAGGCTAAACTGCA - -a -s mr.mrrefChr3 174154 18 + 181019 ATCATGTAGAGTTAGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627701 18 + 636262 ATCATGTAGAGTTAGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 639213 18 + 647215 GTCATGTTGAGTTAGGAA - -a -s mr.mrrefChr3 174172 87 + 181019 AAAAAGCAAGTCATCGGCTATAAAAGCACACATGTCCAGTCCTACTCACCATTCTAATTGGGTCTAGACAGTGGGTGCAACAGCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627719 87 + 636262 AAAAAGCAAGTCATCGGCTATAAAAGCACACATGTCCAGTCCTACTCACCATTCTAATTGGGTCTAGACAGTGGGTGCAACAGCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 639232 87 + 647215 AAAAAACAAGTTATCAGCTATAAAACCACACATGTCTGGTCCTACTCACCATTATAATTGGGTCTAGATGGTGGGTGCAACAGCTTA - -a -s mr.mrrefChr3 174259 29 + 181019 CTTCAGCCACCTAATTGCAAAGTTTCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627806 29 + 636262 CTTCAGCCACCTAATTGCAAAGTTTCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 639347 29 + 647215 CTTCGCCCACCTAATTGCAAAGTTTCATA - -a -s mr.mrrefChr3 174288 122 + 181019 TTTCTCAATTGTGTGGCAGGGTCGAATTACAGACAGCTTGGAAGGAAGCACAGGCTATAGGCTTGCCCCTGCAAGTGCAAGTCAGTAATTTTTGGAACAGTATCAGGGCCATTACAAACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627835 122 + 636262 TTTCTCAATTGTGTGGCAGGGTCGAATTACAGACAGCTTGGAAGGAAGCACAGGCTATAGGCTTGCCCCTGCAAGTGCAAGTCAGTAATTTTTGGAACAGTATCAGGGCCATTACAAACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 639390 122 + 647215 TTTCTCTATTGTACAACAGGGTTGGATTACAGACACCTTGGGAGGAAACACATGCTATAGGTTTGTCCCTGCATGGGCAAGTCAGTAATTTTTGGAACAGTCTCAGGGTCATTACAAACAAC - -a -s mr.mrrefChr3 174410 45 + 181019 TACTTAAGGCCTGATTCTTATGCAACATAATCTGTACTTTTTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627957 45 + 636262 TACTTAAGGCCTGATTCTTATGCAACATAATCTGTACTTTTTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 639514 45 + 647215 TAATTATGGTCTGTGTCCTATGGAATATAATATGTACTTTTTATC - -a -s mr.mrrefChr3 174455 76 + 181019 TGATGCAGACTGTGCTCATACCTGCTTTTCCATCAGCTAACACATCTGTGTTAACAGGCTTTAGTGTTGTGTTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628012 76 + 636262 TGATGCAGACTGTGCTCATACCTGCTTTTCCATCAGCTAACACATCTGTGTTAACAGGCTTTAGTGTTGTGTTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 639559 76 + 647215 TAATGCAGACTGTGTCCATACCTGATTTTCCATCAGCTAACACATCTGTGTTAACAGGGTTTAGTGTTGTGTTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 174531 71 + 181019 TACCCGTGCAAGTCTTGAAGCCTGCCCTGGGTGACCCTCATCAGTTATATTAGTAATAAGCATTTGAGTCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628088 71 + 636262 TACCCGTGCAAGTCTTGAAGCCTGCCCTGGGTGACCCTCATCAGTTATATTAGTAATAAGCATTTGAGTCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 639636 71 + 647215 TACCTGCACATGTTTGGAAGCTTGCCCTGGGTGACCCACAGTGGTTGTATTAGTAATAAGCATTTGAGTTG - -a -s mr.mrrefChr3 174602 132 + 181019 GGTGTTTTAGAACTGTTCACAAACAGTTCAGTCAGAGGGGCATTTACTAGGTATTGCTCTGTGACACCTGTCCCTTTGCTGCTAGAATTATCCCTGTCTGTTCCTCTACAAATCCTACCTTATAAACATCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628159 132 + 636262 GGTGTTTTAGAACTGTTCACAAACAGTTCAGTCAGAGGGGCATTTACTAGGTATTGCTCTGTGACACCTGTCCCTTTGCTGCTAGAATTATCCCTGTCTGTTCCTCTACAAATCCTACCTTATAAACATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 639712 132 + 647215 GGTGTCGTAGAACTTTTAGCAAATAGTTCAGTCAGAGGGGCATTGACTAGGTATTGTTCTGTGACACCTGTCCCTTTGTTGCTCGAATTATCCCTATCTATTCCTGTACAAGACCTACGTTATAAAGATTTG - -a -s mr.mrrefChr3 174734 28 + 181019 AACATATCTACCCAGGCACAATGTTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628291 28 + 636262 AACATATCTACCCAGGCACAATGTTGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 639846 28 + 647215 AACATATCTACCCAAACACAATGTTGTC - -a -s mr.mrrefChr3 174762 45 + 181019 ACTCAATTAAGTAATATAAAGACTAGACCAAGACTAGCCTTACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628319 45 + 636262 ACTCAATTAAGTAATATAAAGACTAGACCAAGACTAGCCTTACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 639875 45 + 647215 ACTCAATTATGTCATATAACGACTAGACCAAGACTAGCCTCACCT - -a -s mr.mrrefChr3 174807 59 + 181019 AAATGGCGGTGACGAACGGTTAAGAGAATTAACATAGGCAGAGTGGGCAAGATATGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628364 59 + 636262 AAATGGCGGTGACGAACGGTTAAGAGAATTAACATAGGCAGAGTGGGCAAGATATGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 639921 59 + 647215 GAATAGCAGGGGTGGATGGTATAGAGAATCAACATCGGCGGCGCAGTCAAGAGATGATT - -a -s mr.mrrefChr3 174866 86 + 181019 GTCTCTGCTGCCATATCTACAGATTCCATGGGGGTCATTCTGTTCTGAGATGTCAAATCCATAGAATTGTACCATTGCCTCCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628426 86 + 636262 GTCTCTGCTGCCATATCTACAGATTCCATGGGGGTCATTCTGTTCTGAGATGTCAAATCCATAGAATTGTACCATTGCCTCCATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 639980 86 + 647215 GTCGCTGCTGCCATCTCTACAGATTCTGTGGACATCATTCTGGTCTTAGATGTCAAATCCATAGAATTAAACTATTGCCTCCGTTA - -a -s mr.mrrefChr3 174952 39 + 181019 GACTGAATTCACCATTAACTGGGGTGCATGTATAACCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628532 39 + 636262 GACTGAATTCACCATTAACTGGGGTGCATGTATAACCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 640066 39 + 647215 GTCTGAATTCATCATTGCCTGGGGTGCATGTATAACCGG - -a -s mr.mrrefChr3 174991 4 + 181019 TGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628571 4 + 636262 TGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 640111 4 + 647215 TAAC - -a -s mr.mrrefChr3 174995 61 + 181019 ACCTCTCCTGATCCCCAGAGTGGGGTTGAGTGGTGATGATCCTTGTACATAGTCAGTTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628575 61 + 636262 ACCTCTCCTGATCCCCAGAGTGGGGTTGAGTGGTGATGATCCTTGTACATAGTCAGTTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 640122 61 + 647215 GGCTCTCTTGATCCCCAGGGTGATGTTCTGTTGTTATGATTCATGTGCATTGTCAGCTTCA - -a -s mr.mrrefChr3 175056 145 + 181019 TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCACATCGATGGAATTAAAGCTGTATCCATCAACTAGACTTCTATTACAAGCAGTGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGTCTAGTATAATAACTGCGTTTAGCACATCCAGTCATTTGACATCCACTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628638 145 + 636262 TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCACATCGATGGAATTAAAGCTGTATCCATCAACTAGACTTCTATTACAAGCAGTGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGTCTAGTATAATAACTGCGTTTAGCACATCCAGTCATTTGACATCCACTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 640183 145 + 647215 TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCAAATTGAAGGAATTAAAGATGTAACCATCAACTAGACTTGTATTACAAGCAATGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGCTTAGTCTAATAACTGTGTTTAGCACATCCAGCCATTGGACATCCTGTAT - -a -s mr.mrrefChr3 175201 73 + 181019 TCAAACCATCAGCATAGGGCTTTTCTAAGCTCTCCAGTATATGACAACCTCAGAGCACCCCTAGAGAAGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628783 73 + 636262 TCAAACCATCAGCATAGGGCTTTTCTAAGCTCTCCAGTATATGACAACCTCAGAGCACCCCTAGAGAAGCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 640329 73 + 647215 TCAGACCGTCAGCATGGAACCTCTCAAAGCTCTCCAGTATGTGACAACCTCAGAACATCCCTGGAGAAGCACT - -a -s mr.mrrefChr3 175274 59 + 181019 GTATGTTAAACAAGGACTACTAGTTTAATTTCAAATCACATATGTATACTTGTGAATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628857 59 + 636262 GTATGTTAAACAAGGACTACTAGTTTAATTTCAAATCACATATGTATACTTGTGAATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 640402 59 + 647215 GTACCTAAAACAAGGACTACTAGTTCAATTTCAAATTATATATGTGTACTTGTGCATGA - -a -s mr.mrrefChr3 175333 60 + 181019 TACTTGACAACACAGCTCTCAAAGAGACATGTGCAAAGAACAGCATGGACAGAGAATATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628916 60 + 636262 TACTTGACAACACAGCTCTCAAAGAGACATGTGCAAAGAACAGCATGGACAGAGAATATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 640462 60 + 647215 TTCATGACAGCAGAGTTCTCAAGGGGACGTGTGCAAAGAACAGCGTGCACGGAGAATATC - -a -s mr.mrrefChr3 175393 69 + 181019 ATTCATGGGAAGGATTGACCCTTTAGCAAGCGCATTGAGTAATTTTTGAAAATTTGCCTTCTATTTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628980 69 + 636262 ATTCATGGGAAGGATTGACCCTTTAGCAAGCGCATTGAGTAATTTTTGAAAATTTGCCTTCTATTTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 640522 69 + 647215 ATTTGTGGGAAGGACTGATCCTTTGGCAAGAACACTGGGTAATGTTTGAAAATTTGCCTTCTATCTCTT - -a -s mr.mrrefChr3 175462 324 + 181019 AGTGGAGGTACAAATGCTAGAACCAGAATCGATCACATCCCAGCCAGAGCTGTGGACTCAATGCTTAAGTGGGAACCCAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTATGGTCACTCAAGGGCATGTGAGGTGAACAAGGGGTCTAGAATGTATGCAGGGGGGGCTGTGCATGACAAACCTCTCGTGTGGGGAGCAGGCTCCCTCTACAGCTGCCTGTGATCGCTCGATACCATGTCAAATGGCAGAGTCTTATAGCCAAGCACTATCCGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCATTTATTGGAGCTTTGCACGAGGCACTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629059 319 + 636262 AGTGGAGGTACAAATGCTAGAACCAGAATCGATCACATCCCAGCCAGAGCTGTGGACTCAATGCTTAAGTGGGAACCCAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTGTGGTCACTCAAGGGCATGTGAGGTGAAGAGGGGAT-----GTGTACACAGGGGGGGCTGTGCATTACAAACCTCTCATGTGGGGATCAGGCTCCCTCTACAGGTGCCTGTGATCACTTGATACCATGTCAGGTGGCACAGTCTTATAGCTAAGTACTATCTGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCATTTATTGGAGCTTTGCACGAGGCACTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 640591 324 + 647215 AGTGGGAGCACATATGCTACAACCATAATTCATTACATCATAGCCAGAGCTGTGGACTCAGTGCTTAAGCAGGGACCTAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTATGGTCACTCAAGAGCATGTGGGGTGAACAAGGGGTCTAGAATGTATGCAGGGGGAGCTGTGCATGACAAACCTCTTGTGTGGGGAGCAGGCTCTTTATACAGCTGCCTGTGATCGCTCTACATCATGTCAAATGGAGGAGGCTTATAGCCAAGCACTAACCGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCTTTTATTGGAGCTTTGCATGAGGCACTGC - -a -s mr.mrrefChr3 175786 47 + 181019 GTCTGAACAATGTTATGTGTCCTCCATATGCACAACCTATTTTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629378 47 + 636262 GTCTGAACAATGTCACAAGTCCTCCATATACACAACATATTTTTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 640923 44 + 647215 ATCTAAACAATGTTATGTGTCCTC---ATGTACAACCTATTGTTTTA - -a -s mr.mrrefChr3 175833 145 + 181019 CATCAGTCAATTAACCAGACTGGAGTTACATTTAAGGGATCCACTCCTTACAAGTGCAAACAATAAGCAGTTAGCTTCTGTGAGCATGCAGGCACAGAGTTGCGAGTTGTCATTTGTAAATTTACCCATTAAGGAATCCCATATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629509 144 + 636262 CATCAGTCAATTAACCAAACTGGAGTTACATTTAAGGGATCCACTCCTTCCAAGTGCAAACAATAAGCGGTTAGCTTCTATGAGCATGCAGGCACAGAGTTGCGAGTTGTCATTCG-AAGTTTACCCATTAAGGAATCCCATATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 640967 143 + 647215 CATCAGTCAATTAACTGGGTTGGAGTTACATGTAAGGGACCCACTCCTTACAAGTGCAAACAATAAGCAGTAAGCTTATGTGAG--TCCAGCCGCAGAGTTGAGAGTTATCTCTTGTAAATTCACCCATTGAGGAATCTCATACA - -a -s mr.mrrefChr3 175978 4 + 181019 GTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629664 4 + 636262 ATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 641110 4 + 647215 GTTC - -a -s mr.mrrefChr3 175982 278 + 181019 TAGTTGTTGAAGCTAGTAGCTACAAATTCTCCTATGTGAGAGAGCAGTCTGGACAGGTGGCAGTCTAAGCAGGCAAGGCATAGTGCCAGCTTATCCTTCTAGAATTCGAAAGTGTATAGAATTTGTTGGAACTCAGACAGGATGTTCTTACATCCAACAACTGCATGCCCAGTTAGTGAAAAAGTGCAGCTCACCCAAAAACCATATCTAATATCATAGGTTGCAGTCTGTGGGAATCCCTGGTGATTGCCAACTTCCCTGTTGTCCCCATGAACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629670 276 + 636262 TAGTTGTTGAAGCTAGTAGCTACAAATTCTCCTATGTGAGAGAGCAGTCTAGACAGGTGGCAGTCTAAGCAGGCAAGGCATGGTGCCAGCTTATCCTTCTAGA--TTGAAAGTGTATGGAATTTGTTGGAACTCAGACAGGATGTTCTTATGTCCAACAACTGCTTGCCCAGTTGGTAAAAAAGTGCAGCTCACCCAAAAAGTATATTTAATATCATAGGTTGCAGCCTGTGGGGAGCCCTGGTGATTGCCAACTTCCCTGTTGGCCCCATGCACATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 641114 266 + 647215 TGGTTGTTGAAGCTAGTAGCTACAAATTCTCATAAGTGAGAGAGCAGTCTGGAAAGGTGGCAGTTTAAGCAGGCAAGGCACAATGCCAGCTTACCCTTCTAGAATTCTAAAGTGTATAGAATTTGTTGGAACTCAGAC------------CATCCAACAACTGCATGCCCAGTCAGTGAAAAAGTCCAGCTCACCCAAAAACCATATCTAACATCAAAGGTTGCAGTCTGGGGGAATCCCTGGTGATTGCAAACTTCCCTGACATCCCCATGAGCATG - -a -s mr.mrrefChr3 176260 62 + 181019 TTGAGTTTCAATGGAATTATTAGCCTCATTGTCACACAGCTAGTCTTTCTGCCTTAATGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629947 46 + 636262 TTGAGTTTCAATGGAATTATTAGCCTCATTCTCACACAGCTAGTTT---------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 641380 62 + 647215 TTGAGTTTCAATAGAATTATTAGGCTCATTGTCGCGCAGCTAAACTTTCTGCCTTAATGTTC - -a -s mr.mrrefChr3 176322 69 + 181019 TGAATCATGACTGTGTGCATCCACTTTTATTGGTTCATTCAACTGCATTAGGAATTTACAGGTTCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629993 33 + 636262 ------------------------------------ATTCAACTGCATTAGGAATTTACAGGTTCATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 641443 69 + 647215 TGAATCATGACTGTGTGCATCCACTTTTATTGGTTCATTCAACTGCATTAAGAATCTAAAGGTTCATTA - -a -s mr.mrrefChr3 176391 16 + 181019 CCTCCCAAATTTTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630026 16 + 636262 CCTCCCAAATTTTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 641513 16 + 647215 CCTCCCAAATTTTGTA - -a -s mr.mrrefChr3 176407 29 + 181019 TTTCTTAGTTGTTGTCAACCTATTATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630043 29 + 636262 TTTCTTAGTTGTTGTCAACCTATTATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 641529 29 + 647215 TTTTTTAGTTGTTGTAACCCTACTATAAA - -a -s mr.mrrefChr3 176436 76 + 181019 CTGCATTAGGAATTTAAAGGTTCATTATCTTCCCAAATTTTATAGTTTCTTAGTTGTTGTCAACCAATTCTTCGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630072 75 + 636262 CTGCATTAGAAATTTAAAGGTTCATTATCTTCCCAAATCTTATGATTTCTT-GTTGTTGTCAACCAATTCTTCGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 641561 76 + 647215 CTGCATCAGGAATTTAAAGGTTCTTTAACTTCCCAAATTTTATAGTTACTCAGTCGTTGTCAACCAATTCTTGGGC - -a -s mr.mrrefChr3 176512 25 + 181019 GCTCACAACCACAGAGATACTGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630147 25 + 636262 GCTCACAACCACAGAGGTTCTGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 641656 25 + 647215 ACTCACTACCACGGAGATACTGAAC - -a -s mr.mrrefChr3 176537 579 + 181019 TGAAATTTTAATGAGTGTTTACTAGGGGCCTTTTTTTTGCAAAAAATATCTGTCCATCCCGTGAGTAAGTTCCAAAGCAGCACACACTGAGAATATTCTCTGGTATGTGAATTTCTCCACTTACACTCAGTACTTCTAATTTGCCTGGTGCAGCATTTTCTGATTTTAGCTTCTAGGCCTTTTCTTTATTTTTGGATCTTTAGGCCAGCTCTATCAATCTATGGGGTTCCACAGAATCATAACACATACTGCTCATGGCCTTGTAAACCCAAGTCCGGAGAGAAGCACTCTCCAGAGTTACACGAACATTGTTTATACGACTTGGAATTTTAGAAGGCCTCAATTTTTGTGCTACAGGCTAGTTCGCTCAGAGTTCTTCAAGCAATATTCCTCACTTGTTTAAATGTAGCCTGTATAATCTCCAGCCTTATTGAATCTGGACTGCAGCTGATTGGGCAACCCCAAGTTATTGTCAAGCTCTGTACATACTAGATTGGACATTCATGGATGAAACTGTGACTGAACAAAAAAAAAATCTTCTTCCTATTATCAGTTTGATTATTCTGAAAATCAGCTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630172 576 + 636262 TGAAATTTTAATGAGTGTTTACTAGGGGCCTTGTTTTTGCAAAAAAT--CTGTCCAACCCGTGAGTAAGTTGCGAAGCAGCATACACCGAGAATGTTCTCTGGTATGTGAATTCCTCCACTTACACTCAGTACTTCAAATTTGCCTGGTGCAGCATTCTCTGGTTTTATCTTCTAGGCCTTTTCCGTATTTTTGGAGCTGTAGGCCAGCTCTATCAATCTATGGGGTTCCACAGAATCACAACACGTACTGCTTATGGCCTTGTAAACCCAAGTCAGGAGAGAAGCACTCTCCAGAGTTACACGAACATTGTTTATACGACTTGGAATTTTAGAAGGCCTCAATTTTCGCGCTACAGGCTAGTCCGCTTAGAGTTCTTCATGCAATACGC-TCACTTCTTTAAATGTAGTCTGTATAATCTCCAGCCTTATTGAATCTGGACTGCAGCTGATTGGGCAACCCCAAGTTATTGTCAAGCATTGTACATACTAGATTGGACATTCATGGATGACAATGTGACTGAACAAAAAAAAAATCTACTTCCTATTATCAATTTGATTATTCTGAAAATCAGCTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 641692 563 + 647215 TAAAATTTTAATGAGTGTTTACTAGGGGCCTTTTTTCTGCAAAAAATATTTGTTCATACCGTGAGTAAGTTCCAATGCAGCACACACTGAGAATATTCTCTGGTATGTGAATTTTTCCAC------TCAGTACTTCTAATTGACCTGGTGCA--CTTTTCTGATTTTGGCTGCTAGGACTTTTCTTTATTTTTGGATCTTTAGGCCAGCTCTATCAATCTACGGGGTTCCACAGAATCATAATACATACTGCTCATGGCCTTGTCAACCCCAGTCCGGAGCGAAGCACTCTCCAGAGCTACACGAACATTGTTTATACGACTTGGAATTTTAGAAGGCCGTAATTTTTGTGCTACGGGCTAGTTCGCTCAGAGTTCTTCAAGCAACATTCCTCACTTGTTTAAATGTAACCTGTATAATCTCCATCCTTAT--AGTCTGGAATCCAGCTGATTGGGCAACCCCAAGTTATTGTCAAGCTCTGTAAATAGTAGATTGGACATTCATGGATGAAACTGTGCCTGAACAAAAAAAAAATCTTCCTCCTATTATCAGTTTGAT------GAAAAACAGCTAGG - -a -s mr.mrrefChr3 177116 56 + 181019 AATGAGCAAGATTGGGTAGTTACCATCAGCCCCAGATGGATGCCGAGGTGACCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630775 56 + 636262 GATGAGCTAGATTGGGTAGTTACCATCAGCCCAAGATGGATGCCGAGGTGAGCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 642255 53 + 647215 AATAAACAAG---GGGTAGTTACACTCAGCCCCAGATGGATGCCGAGGTGACCTTA - -a -s mr.mrrefChr3 177172 50 + 181019 GGTCCGACCGATCCCTCCACTGGAGGGTGTAACGCCTCTCTAGTGCTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630831 50 + 636262 GGTCCGTCCGATCCCACCACTAAAGGCTGTAACGCCTCTCTAGTGCTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 642311 50 + 647215 GGTCCGATCGATCCCTCTACTGGAGGGTGTAACGCCTCTTTAGTGCTGGG - -a -s mr.mrrefChr3 177222 288 + 181019 CTTGAAAGACATATTATCACCACTCGGCCGCGGACGGGTGAGATTTCTGAGCACAAGCTGGTATCCTGGGGGAGAAGAGGGATAATAGTGAACGAAGAAAACGAAAAGGCGCCAGGCAACGCCCTCAGGATCGCTTTCATGTGCCTTGGGGTACGCTGGGGAAAAACAAGTGTAAATTTGTTCCGCCGGCCTAGTACTAGAATACGGTAGCCGGCACCTAATTGAGTAACGGAGCACAGCCATCCAAAGGAAGTGCAGGTCTGGATGTCTGTATATCTGAACGTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630909 288 + 636262 CTTGAAAGGGATATTATCACCACTCGGCCGCGGACGGGTGAGATTTCTGAGCACAAGCTGGTATCCTGCGGGAGAAGAGGGATAATAGTGAACGAAGAAAACGAAATGGCGCGAGGCAACGCCCTCAGGATCGCTTTCATGTGCCTTGCGATATGCTGGGGAAAAACAAGTGTTAATTTATTCCCCTGGCCTAGTACTAGAATACGGTAGCCGGCACCTAATTGAGTAACGGAGCACTGCCAGCCAAAAGAAGTGCAGGTCTGGATGTCTGTATATCTGAACGTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 642361 283 + 647215 CTTGATAGACATATTATCACCACTCGGCCGCGGACGGGTGAGGTTTCTGAGCATAAACTAGTATCCTGGGGGAGAAAAGGGATAATAGTGACTGAAGAAAGCAAAAATGCGCCAGGCAACGCCCTCAGGATCGTTTTCAAATGTCTTGGGGTACG-----GAAAAACAAGTGTAAATTTGTTCCGCCGACCTAGTACTAGGATACGGTAGCCGGCACCTAATTGAGTGCCGCAGCACAGCCATCCAAAGGAAGTTCAAGTCTGGATGTCTGTATGTCTCAACATAAAA - -a -s mr.mrrefChr3 177510 320 + 181019 AGAAAATCTATGTTTTCAGCCATAAAAAAAAAAAATCTATGTTTCTGGCATGTTGTTTCTGTAAGGGCAGTCAACTTCGGTTGCTATCGGTTTCCCCGACATGACACCCAGGCTGCTGGGCCCACAAAATGAGACACCTGGATTGCCAGGGGTGTCCTCGGGAACATGGGGAATTTACTCGGATAATAGTGAACCTCCGTGTGATAATTGCAACTCATTTAACGTTTAAGAGGCTACTATTGTGTTGTCTCTCGGCATGTTGATGTACCACTCAAACTTACAGAGCATTGAAGTGGCACTTAACTATCTTATTCATTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 631199 320 + 636262 AGAAAATCCATGTTTTCAGCCATAAAAAAAAAAAATCTATGTTTCTGGCATGTTATTTCTGTAAGGGCAGTCAACTTCGGTTGCTATCGGTTCCCCCGACATGACGCCCAGGCTGCTGGGCCCACAAAATGAGACACCTGGACTGTCAATGGTGTCCTCGGGAACATGGGGAATTTACTCGGATAATAGTTAACCTCCGTGTGACAGTTGTAACTGATTTAACGTTTAGGAGGCTACTATTGTGTTGTCTCTCGGCATGTTGATGTACCACTCAAACTTACAGAGCATTGAAGTGGCACTTAACTATCTTATTCATTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 642644 300 + 647215 AAAAAATCTATGTTTACGGCCATAAAAAAAAAAAATCTATGTTTCTGGCATGTTGTTTCTGTAAGGACAGTC---TTCGATTGCTATCGGTTTCCCCGACATGACAGGCAGGCTGCTGGGCC-ACAGGATGA--TGCTTTGATTGCTAGGGGTCTCGTCCGGAACATGGGGGATTTACTCGGATAATAGTGATCCTTCGTGTGATAATTGCAAGTCATTTAACATTTAAGAGGCTACTATTGTCTTGTCTCTCGTCATGTTGATGTACCACACAAAGTTATAGAGCATTGA-GTCGCA----ACTCTCTTA--------- - -a -s mr.mrrefChr3 177830 136 + 181019 ATCTGTAATAAGTTTTTTTTCCATCTTCTTCTCATCTTTTCACTAGGGTCCATCTTCTGTAGTATCATTGCTATGTCATCCCATGGACTGAGTATCCTAGGCCAGCCTGGGATCTCGCGTGATGGGGCTAGTTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 631520 132 + 636262 ATCTGTAATAAGTTTTTTTTCCATCTTCTTCTCATCTTTTCACTAGGGCC----TTCTGTAGTATCATTGCTATGTCATCCCATGGACTGAGTATCCTAGGCCAGCCTGGGATCTCGCGTGATGGGGCTAGTTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 642944 136 + 647215 ATCTGTAATAAGTTTTTTTTCCGTCTTCTTCTCATCTTTTCACTAGGGTCCATCTTCTGTACTATCATTGCTATGCCATCCCATGGACTGAGTATCCTAGGCTGGTCTGGGATCTCAGGTGATATGGCTAGTTTTC - -a -s mr.mrrefChr3 177966 13 + 181019 TCCCCCAATTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 631654 13 + 636262 TCCCCCAATTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 643080 13 + 647215 TCACCGAATTGGG - -a -s mr.mrrefChr3 177979 314 + 181019 CTGGAGTTCCATGGTAGTTCTTCCCCATAATCTGTTAATGGTCCATTGTACAAGTTGAGAATGCATGCCGGCTGACAAGCCTTGACAAAGAATCCATACAGCTACCTCTCTAAGCTCCTTGCTGAGGTTGGAAAATTGTTGGTGATGTATTTTAATATTGGTCATTGACACCAAAAAACCTTGCTTTTGAGATGCCAGCTCTGCTAGCCGGACCTGGATCACCCATTAGAGCTTAGCTATCCAAGGTCTATCATGTTAACAGGAGAGTCAGCCTTGCATGGTAACTGGGGAGCCAGTGTTGGGCAACAGAAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 631667 314 + 636262 CTGGAGTTCCATGGTAGTTCTTCCCCATAATCTGCCAATGGTCCATTGTGCAAGTTGAGAATGCATGCCGGCTGACAAGCCTTGACAAAGAATCCATACAGCTACCTCTCTAAGCTCCTTGCTGAGGTTGGAAAATTGTTGGTGATGTATTTTAATATTGGTCATTGACACCAAAAAACCTTGCTTTTGAGATGCCAGCTCTGCTAGCCGGACCTGGATCACCCATTAGAGCTTAGCTATCCAAGGTCTATCATGTTAACAGGAGAGTCAGCCTTGCATGGTAACTGGGGAGCCAGTGTTGGGCAACAGAGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 643094 314 + 647215 CTGAAGTTTCATGGTAGTTCTCCCCCACAATCTGTTAACAGTCCGTTGTACAAAGTGAGAATGCATGCTGGCTGACAAACCATGACAAAGAATCCATACAGCTACCTCTCTAAGCTCCTTGCTGAGGTGGAAAAATTGTTGGTGATGGATTTCAATATTGGTCATAAGCACCAAAAAACCTTGCTGTTGGGATGCCAGCTCTGCTAACCAGAGCTGGGTCAACCTTTAGAGCTTAGCTGTGCAAGGTCTGTCATGTTAACGGGAGTGTATGCCTTGAATGGTAACTGAAGACCCAGCCTTGGGAAACCGAAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 178293 217 + 181019 CCCTGTCAGAGCAGCCCAATGGGTAGTCTCCAAGAGATCCTTATGATCCCAAAATATCTGTCACATTGCCCATCCTTGTTTTTGTAGCATAACTTATGATTCTTTATATTCTACTCATCCATAAACTCTAGTGTTGCTTTTGCCTTTAAAGATAAGTCATGCTTCATTTTCATCCTCATTCAGGTCCCTAAAAGAATCCCGTAAGTCTAGATGAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 631981 217 + 636262 CCCTGTCAGAGCAGCCCAATGGGTAGTCTCCAAGAGATTCTTAAGATCCCAAAATATCTGTCACATTGCCCATCCTTGTTTTTGTAGCATAACTTACGATTCTTTATATTATACTCATCCATAAACTCTAGTGTTGCTTTTGCCTCTAAAGATGAGTCATGCTTCATTTTCATCCTCATTCAGGTCCCTAAAAGAATCCCGTAAGTCTAGATGAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 643411 217 + 647215 CCCTGTCAGAGCAGCCCAATGGGTAGTCTCCAAGAGAGCCTTCTAATCCCAAAATATCTGTCACATTGCCCATCCTTGTTCTTGTAACATAACTTATGCTTTTGTATATTCTACCCATCCATAAACTTTAGTGTTGCTTTTGCATTTAAAGACAAGTCATGCTTCGTTTTCATCCTCATTTTGGACCCTACACGAATCCTGTAAGTCTAAATGAACT - -a -s mr.mrrefChr3 178510 353 + 181019 CATGAGAGTTGTCATGCTAGCAGTGATAGCAGGAAAGAATATAACCTAAGGTTGGATTCCAAGTCACTCCTCTAACTCAATTATTGAGATGTAAGACAGTTCTAGGATTCTCATAGACAACCTTAAGCTGTCACTTAGTTTTGTGGTACAACTGAGGTCAACAACCACAAACCATATAGTATAAAGACTTGTTTAGTGTATCAAATGTGCTAATGGTAACAACTAGATGAGCTGAAGTAATTGGTTAGGCATATATAGTGGCTTTAATGAAAGTTTGGTGAGGAGAAAATGAACTTGTTAATTGTTAGGTTGTATTAGTTTGTCTTGGCATTGGATTTGCTGGTCAAAGGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 632220 353 + 636262 CATGAGAGTTGTCATGCTAGCAGTGATAGCAGGAAAGAATATAACCTAAGGTTGGATTCCAAGTCACTCCTCTAACTCAATTATTGAAATGTAAGACAGTTCTAGGATCCTCATAGACAACCTTAAGCTGTCACTTAGTTTTATGACACAACTGAGGTCAACAACCACAAACCATATAGTCTAAAGACTTGTTCAGTGTATCAGATGTGCTAATGGTAACAACTAGATGAGCTGAAGTAATTAGTTAGGCATATATAGTGGCTTTAATGAAAGTGTGGTGAGGAGAAAATGAACTTGTTAATTGTTAGGTTGTATTAGTTAGTCTTGGCATTGGATTTGCTGGTCAAAGGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 643628 304 + 647215 CATAGGCAACCTTAAGCTGCCACT--TAGCTTTATGACATATTACAT----TTAGGTCACAAGTC------------------CTGAGAGGTGTGGTGGTGCTGAGATTGTC-----CAAC--------------------TGTGGTCAACTTGTGGTCAACAACCATAAATCATATAGTATAAAGACTTGTTTAGTGTATCAAATGTGCTAATGGTAACAACTAAATGAGCTGAAGTAATTGGTTAGGTGTATATAGTGGCTTTAATGAGAGCTTGGTGAAGAGAAAATGAACTTGTCCGTTGTTAGGTAGTATTAGTTTGTCTTGGCATTGGATATGCTGGTCAAAGGTAT - -a -s mr.mrrefChr3 178863 33 + 181019 TGCCTAGGCTATCTAACAAGTAATATAGGTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 632575 33 + 636262 TGCCAAGACTATCTAACGAGGAATATAGGTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 643932 33 + 647215 TGCCTAGGCTATCTAACAAATAATATGGGTCAG - -a -s mr.mrrefChr3 178896 31 + 181019 ATTGGGGGTTATTTACCGCCCTGCTATAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 632609 29 + 636262 ATTGGGGGTTATTTATCGCCCTGTTATAG-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 643965 31 + 647215 ATTGGGGGTTATTTACCACCCTGCTATTGGA - -a -s mr.mrrefChr3 178927 183 + 181019 TAATCCTACCAGTGTGACCGGGACCCATGGTCAGGTTTTGTAAGTGCAAAACTTCATTTGGCCAAATGTGCAAAAGATAAGGACAAATATTACTCCCATTTGAGGGTCGAAAATTTTAACAGGGTAGAACATTTTAACTCTTAAAGTTATCAGGTATACACCCTTGATTCAGCTGTCCTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 632638 175 + 636262 -AATCTTACCAG-------GGGACCCATGGTCAGGTTTTGCAAGTGCAAAACTTCATCTGGCCAAATGTGCAAAAGATAAGGACAAATATTACTCCCATTTGAGGGTCGAAAATTTTAACAGGGTAGAACATTTTAACTCTTAAAGTTATCAGGTATACACCCTTGATTCAGCTGTCCTTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 643997 182 + 647215 TAATGCTACCAGTGTGACCGGGACCCATG-TCATGTTTTGTAATTACAAAACTTCATTTGGCCAAATGTGCAGAACATAAGGACAAATATTCCTCCGGTTAGAGCGTAGAAAATTTTGACGGGGTAGAAGACTTCAACTCTGAAATTTATCAAGAAGGCACCCTTGATTCAGCTGTTCATTTA - -a -s mr.mrrefChr3 179110 83 + 181019 CAGACTAATGCACCACTTATAGAAAGCACTTGCCAAGTATTATGGGAGCTGTCAAGAATTTAAATGCTTGTAGAGTGCTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 632865 83 + 636262 CAGACTAATGCACCACTTATAGAAAGCACTTGCCAAGTATTATGGGAACTTTCAAGAGTTTAAATGCTTGTAGAGTGCTTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 644179 83 + 647215 CAGACTAACGCTCTTCTTATAGAAAGCACTTGGTAAGCATTACGGGAGCTGTCGAGAATTTAAATGCTTGTAAAGTGCTTTTA - -a -s mr.mrrefChr3 179193 57 + 181019 TTAAGACACCCTCATAGGACATCTATCTAAATACCTTAGTATAAAACATTGACTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633084 56 + 636262 TTAAGACACCCACATAGGACATCTA-CTAAATACCTTAGTATAAACCTTTGACTACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 644262 57 + 647215 TTAAGACACCCTTCTGGGACATCTATCTAAATACCTTAGTATAAAACATTGACTATG - -a -s mr.mrrefChr3 179250 68 + 181019 TTGTCCTTCCTCTTCATTGCTTTCCACCTTTTATCAGATGTCACAGCGCTAAATATTTCATATATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633145 68 + 636262 TTGTCCTTCCCCTTCATTGCTTCCCACCTTTTATTAGATGTCACAGCGCTAAATATTTCATATATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 644319 68 + 647215 TTGTCCTTGCTCCTCATCAGTCTACACCTTTTATCAGATGTCGCAGTGCTATATGTTCCATATATCGA - -a -s mr.mrrefChr3 179318 81 + 181019 ACCCATGCTTACCAGTTTATCTCTTGTTTTTGACCAGCTATTAAGAGGTCACAATGCAATGTCTTTTAAATGGAACAGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633213 81 + 636262 ACCCATGCTTACCAGTTTATCTCTTGTTTTTGACCAGCTATTAAGAGGTCACAATGCAATGTCTTTTAAATGGAACAGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 644389 81 + 647215 ACCCATGCTTACCAGTCTATCTCTTGTTTTTGACCAGCTATTAAGAGGATAAAGTGCAATGTCTTCTCAATAGAACAATAT - -a -s mr.mrrefChr3 179399 57 + 181019 GAGGTTGTCTCTTATTTAATAAGCTGTAAAACACTGTGGACTACCTATCACTAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633298 57 + 636262 GAGGTTGTCTCTTATTTAATAAGCTGTAAAACACTGTGGACTACCTATCACTAGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 644470 57 + 647215 GAGGTTTTCTATTATTTAATAAGCTACAAAACACTGTGGACTATCTATCACCAGTTA - -a -s mr.mrrefChr3 179456 20 + 181019 GTAGTCCCTCCATAGCAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633355 20 + 636262 GTAGTCCCTCCATAGCAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 644538 20 + 647215 GTAATCCCTTCATACCAACT - -a -s mr.mrrefChr3 179476 63 + 181019 CTAGATATCATAAGGACAGGAGAATAGAATAAATAGATTCCTTGTAGACTAATTCTAATGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633376 63 + 636262 CTAGATATCATAAGGACAGGAGAATAGAATAAATAGATTCCTTGTAGACTAATTCTAATGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 644558 63 + 647215 CTAGATGTCCTGAGGACAGGAGAATTGACTAAATAGATGCCTTGCAAACTAAGTGTGACGGAT - -a -s mr.mrrefChr3 179539 145 + 181019 GCTGCCTGGAATAGTTTGCATATAATGCTGTCAAGCGGATTTTGTGTAGATCATCCAATGATCTGCGGCCACGAAGGGCAAACCTGTGGCGGTTAAAAAGGCACTAATTTCTCAATGGACAAAATTGTCTGATAGAAGGCTTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633448 145 + 636262 GCTGCCTGGAATAGTTTGCATATAATGCTGTCAAGCGGATTTTGTGTAGATCATCCAATGATCTGCGGCCACGAAGGGCAAACCTGTGGCGGTTAAAAAGGCACTAATTTCTCAATGGACAAAATTGTCTGATAGAAGGCTTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 644621 145 + 647215 GCTGCTTGGAGTCGTTAGCATAAACTGCTGTCAAGCGCATTTCGTGTAGATCATCCACTGAGCTGTGGCCCCCAAGGGCAAACCTGTGGTGATTAAAAAGGCACTAATTTCTCAATTGAAAAAATTGTCTGATAGAAGACTTCGT - -a -s mr.mrrefChr3 179684 24 + 181019 GATTCATGATTGTGTAGAGGCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633593 24 + 636262 GATTCATGATTGTGTAGAGGCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 644767 24 + 647215 GATTCATGCTTGTGTAAAGGCAGG - -a -s mr.mrrefChr3 179708 148 + 181019 AATATGGGAATGCTCTGATTTCATGGGGGAGGCTTGATTGGTTTTCCTTTGTGCAAGTGACCTGACTGGAAAAGCAAATGGTGTACCACTGCCCACTAGGTCTTGCAATAATCTAGGGATGATTGTTTAGGGTTAGAACATAGGTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633618 148 + 636262 AATATGGGAATGCTCTGATTTCATGGGGGAGGCTTGATTGGTTTTCCTTTGTGCAAGTGACCTGACTGGAAAAGCAAATGGTGTACCACTGCCCACTAGGTCTTGCAATAATCTAGGGATGATTGTTTAGGGTTAGAACATAGGTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 644791 148 + 647215 CATATGGGGATGTTCTGGTTTCAGGGGGGAGGCTTGATTGGCTTTCATTTGTGCAAGTGACTCGACTGGAAAAGCAAGTGGTGTACCACTGCTCTCTAGGTCTTGCAGTAGTCTAATGATGAATGTGTAGTGTTGGACCATAGGTATT - -a -s mr.mrrefChr3 179856 40 + 181019 TGATTAGTCTAATGACTAATGCATAAAATCTGCTGAATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633766 40 + 636262 TGATTAGTCTAATGACTAATGCATAAAATCTGCTGAATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 644951 40 + 647215 TGATCAGTCTAATGACGAACATCTAATATCTGCTGGATAT - -a -s mr.mrrefChr3 179896 30 + 181019 TTAAATTTGTGCGGATAATTCAAAGGGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633806 30 + 636262 TTAAATTTGTGCGGATAATTCAAAAGGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 644993 30 + 647215 TTAAAATTATGCAATTAATTTAAAGGGTAA - -a -s mr.mrrefChr3 179926 110 + 181019 GTGAATGGCCCAATGATTTGGTTCCCAGATGTTTCAATCCGACAACATAATATGACTAGTCCTACAAGAGGCACTACACCATTAGACCCTCCTTCAGAGATAAATTATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633837 110 + 636262 GTGAATGGCCCAATGATTTGGTTCCCAGATGTTACAATCTGACAACCTAATATGACTAGTCCTCAAAGAGGGACTATACCATTAGACCCTCCTTAAGAGATAATTTATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 645023 110 + 647215 GTGAATGGCCCAGTGAATTGGTTCCCAGATGTTTCAATCCAACAACATAACATGACTAGTCCTACAAGGGGCACTACATCATTAGAGCCTCCTTCAGAGATAAATTATAA - -a -s mr.mrrefChr3 180036 37 + 181019 GTAGAAGTCTATCGATGGTGTGGGGTAATCACCTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633947 37 + 636262 GTAGAAGTCTATCGATGGTGTGGGGTAATCACCTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 645136 37 + 647215 GTAGAAGTCGATCGATTGTGTCAGGTAACCATCTTTA - -a -s mr.mrrefChr3 180073 67 + 181019 AGGGGACACACATGGTGCGTTGACTTATGTACTTTCTTGCCGGACGATCCATACCATTTGTCTACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634039 67 + 636262 AGGGGACACACATGGTGCGTTGATTTATGTACTATCTTGCCGGACAGTCGATACTATTTGTCTACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 645173 67 + 647215 AGGGGACACACACGGTGCGTTGACTTATGTACCTTCTTGCCGTACGATCCATACCATTTGTCTACCC - -a -s mr.mrrefChr3 180140 49 + 181019 CTTTGTGAAGCCATTTTTTTGGATGGGGTCAGCCTTCTAGGCTGCTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634355 44 + 636262 CTTTGTGAAGCCATTTTTTTGGCT-----CAGCATTCTAGGCTGCTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 645240 49 + 647215 CTCTGTGGAGCCAGTTTTCTGGATGGGGTCAGCCTTCTAGGCTGCATCA - -a -s mr.mrrefChr3 180189 112 + 181019 GTTCCATTTACCAATACACTCACATTTACGATTATACTATTTTACATCTCGAGTTGGATAAGATTAGACCTCCTAACAGGTGCTGCTCTCCATACATTTGTAATTACTCGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634400 109 + 636262 GTTCCATTTACCAATACACTCACATTTACAATT---CTATTTTACATCTCGAGTTGGATAAGATTAGACCTCCTAACAGGTGCTGCCCTCCTTACATTTATAATTAGTAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 645289 112 + 647215 GTTCCAGTTACCAATACACTCACATTTATGATCATACTACTTTACATCTTGAGTTGTATAAGATCAGACCTCATAACAGGTGCTTCTTGCCATACATTTGTAATTACTCGCA - -a -s mr.mrrefChr3 180301 24 + 181019 TGATATATTTCTTCCCAGCTATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634511 24 + 636262 TGGTATATTACTTCCCAGCTATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 645401 24 + 647215 TGATATATCTCTTACCAGCTATGA - -a -s mr.mrrefChr3 180325 44 + 181019 ACAAACCGCTTGTGTGAGGTGGGAAGACTCCTTCTGTGATCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634535 44 + 636262 ATGAACCGCTTGTGTGAGGTGGGAAGACTCCTTCTGTGATCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 645427 44 + 647215 ACAAACCACTTGTGTGATGCGGGCAGACTCCTTCTGTGATCATT - -a -s mr.mrrefChr3 180369 59 + 181019 GCCGCATCCATGCTGTGAAGCTTTGCCTGTCAGTGGACCGCAATTCCTCTTGGTCAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634579 55 + 636262 ATTGCATCCATGCTGTGAAGCTTTGCCTGTCAGTGGACCGCAATTCCTCTTGGTC---- -s simRat_chr6.simRat.chr6 645501 8 + 647215 GCCG---------------------------------------------------AGCA - -a -s mr.mrrefChr3 180428 269 + 181019 CTGACATGGGGATCATTAAACTACATATATACAAGTAAATATGTGGAACTTATCTTCGATAGGGAGAAACTAGTAAGTCTCTTCCAGAGCAGGCTAACCTATTGCTTATAAATACAAAGTTGTACTCAAATCTGTGCTAATTCAAACCAGTGCTTTGGGTTGCTCTTTTCAGATAACTGACACTTCCTCGATCATTTTATAGCGAGATTCCCTGCTCCTCCCTCATATCAACTGAAAAGAGCCCTGGCCCAAGTAGGGTGAATAGTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1003 269 - 636262 CTGACATGGGGATCATTAAACTACATATATACAAGTAAATATGTGGAACTTATCTTCTATGGGGAGAAACTAGTAACTCTCTCCCAGAGCAGGCTAACCTATTGTCTACAAATACAAAGTTGTACTCAAATCTGTGCTTACTCAAACCTGTGCTTTAGTTTAATCTTTTGAGATAACTGACACTTTCTCGATCATTTTACATCGAGATTCCCTGCTCCTCCCTCATATCAACTAAATAGAGCCGTGACCAAAGTAGGGTGAGTAGTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 645578 219 + 647215 --------------------------------------------------CATCTGTGATAGGGAGAAATTAGTAAGTCTCTTCCAAAACAGGCTTACCTATTGCTTATAAATACAAAGTTGTACTCAGATCTGTGCTAATTCAAACCAATGCTTTGGGTTGCTCTTTCCAGATAACTGACACTTCGTAGATCATTTTATAGTGAGATTCCCTGCTCCTCGCTCATATCAACTGAAAAGAGCCCTGGCCCGAGTAGGGTGAATAGTCTG - -a -s mr.mrrefChr3 180697 65 + 181019 TGTTAAATTGTTGAGGAATGGACCCATTTTATGTACACTCCCCTCTAAGTGATCTTGCTTGATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1293 63 - 636262 TGTTAAATTGTTGAGGAATGGACCCATTTTATGTACACTCCCCTCTAAGCGATCTTGTG--CTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 645797 65 + 647215 TGTTAAATTGTTGGGGAATGGAAACATTTTATGTATGCTCCCCTCTAAGTGATCTTGCTTGAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 180762 18 + 181019 GCTAACAGAACAGCCTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1358 18 - 636262 GCTAAAAGAACAGCCTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 645862 18 + 647215 GCTAACAGTACAGCTTAG - -a -s mr.mrrefChr3 180780 46 + 181019 CCAACTATCAACCATTCATCGCCTCCTATGACATTGCTTGCTACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1391 46 - 636262 CCAACTATGTGCCATTCATCGCCTGCTGTGACATTGCTTGCTACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 645880 46 + 647215 CCAACTATCAACCATTTATTGCCTCCTATGACATTGCTTGCTACAT - -a -s mr.mrrefChr3 180826 187 + 181019 ATAGGACCACATCCCATTCAAAAAATACAACCCACTCATGCAATACAACCAACCTATGCAACTGGCCTGGGTGTGTTATTGTGGATCTGCATAGCACTGATTTCTGCCAATTAGGTGGGGGGATCCAACACCTGATTGCCTTGAATCCCAGCTTGGCGTGGTCTCCTTTCTGACCAACAGGTGGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1437 173 - 636262 ATGGGACCACATCCCAT-------------CCCAATCAGAAAAAACAACCAACCGATGCAACTGGCCTGGGTGTG-TAGTGTGGATCTGCATAGCACTGATCTTTGCCAATTAAGTGGGGGGATCCAACACCTGATTGCCTTGAATCCCAGCTTGGCGTGGTCTCCTTTCTGACCAACAGGTGGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 645927 163 + 647215 ACAGGACTGCATCCCAGTCAAAAAATACAACCCACCCATGCAATACAACCCACCTATGCAACTGGCCTGGGTGTGTTATTGTGGAACTGCATAGCACTGATTTCTGCCAATTTGGTGGGGAGATCC--CACCAGATTGCCCTTAA----------------------ATGTGACCAACAGGTGGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 181013 6 + 181019 GGACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1610 6 - 636262 GGACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 646101 6 + 647215 GGCCTA - -a -s mr.mrrefChr4 0 68 + 409 TGCTGATAAATTAGATTGACATATTGTAATTACCAGTAAAGTAAGGCCAGCACTTTGCAAGGATTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 499913 62 - 636262 ------TAAATTAGATTGACATATTGTAATTACCAGTAAAATAAGGTCAGCACTTTGCAAGGATGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 132120 68 + 647215 TGCTGATAAATTAGATCGACATACCGTAATTACCAGCAAAGTAAGGCCAGCACTTTGCAAGGATTAAC - -a -s mr.mrrefChr4 68 6 + 409 TGACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500011 6 - 636262 TAACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 132188 6 + 647215 TGATCA - -a -s mr.mrrefChr4 74 297 + 409 ATCAACCAGGATGGATCTACTCAGGAAGTTGAAATACAATATTGCAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATCTTTTTATGGAGCAATACAATCTGCAGGACAGAGAGTTCTGCTTACTAATCAAGCTATAAAGTTATTAAGGAGGGTGAGGATTAACAGAATGTAGTCTAAAGCTATTGAGGTCTGGCCTTATATCTTCACACTTATCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGTGGAGAACCCCACCATATGTTCTCATAAAAAAATATTCACATATGGCATTGGTAAAGGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500017 296 - 636262 ATCAACCAGGATGGATCTACTCAGGAAGTTGAAATACAATATTGCAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATATTTTTATGGGGCAATACAATCTGTAGGACAGAGAGTTCTGCTTACT-ATCAAGCAATAAAGTTATTAAGGAGGGTCAGGATTAACAGAATGTAGTCTAAAGCCTTTGAGGTCTGGCCTTATGTCTTCACACTTATCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGTGGATAACCCCACTATATGTTCTCATAAAAAAATATTTACATATGGCATTGGTAAAGGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 132197 294 + 647215 ATCAACCAGGATGGATCCACTCAGAAAGTCAAAATACTATATTGGAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATCTTATTATGGAACAATACAATCTGCAGAACAGAGAGTTCTGCTGACTAACCAAGCTATAAACTTATTAAGGAGGGTGAGGATTGGCAGAATGTAGTCTAAAGATATTGAGGTCAGGCCTTTTATCTTCACACTTGTCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGCGAAGAACCCCACCAT---TTCTCATAAGAAAACATTCACAAATGGCATTGATAAAGGGGT - -a -s mr.mrrefChr4 371 33 + 409 AAGGTTAGCCTAGGAATCTGTGTGTCCTGGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500313 33 - 636262 AAGGTTAGCCTAGGAATCTGGGTTTCCTGGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 132492 33 + 647215 AAGGTTAGCCTAGGAATCTGTGTGCCCTGGAAC - -a -s mr.mrrefChr4 404 5 + 409 GCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500347 5 - 636262 GCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 132525 5 + 647215 GCACC - -a -s mr.mrrefChr5 0 98 + 294542 TTTCTAGTCTTGACTGATCTTTTCAAGAAGGTGTGAATTGTTTTCACTTTGACAACTAAAGTAAAATGCTCTGCCCACACCAAGCTCCAAGCCCATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136356 98 + 636262 TTTCTAGTCCTAACTGATCTTTTCAAGAAGGTGCGAGTTGTTTTCACTTTGACAACTAAAGTAAAATGCTCTGCCCACACCAAGCTCCAAGCCCATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 134116 98 + 647215 TTTCTAGTCTTGACTGATCTTTTCTAGAAGGTGTGAATTGTTTTCACTTTGATGACTAAAGTAAAATGCTCTGCCCACACCAAGCTCCAAGCCCATGC - -a -s mr.mrrefChr5 98 99 + 294542 AAGAACAAACACCTTAAGCAGAGACTTAATTGAACAGTTCATAAGTATGGGGCTTTCCCCCTCCCTGTCTCTATCTAGTTTTTTTGGCATCAACTTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136454 99 + 636262 AAGAACAAGCACCTCAAGCAGAGACTTAATTGAACAGTTCATAGGTATGGGGCTTTCCCCCTCCCTGTCTCCATCTAGTTTTTTTGACATCAACGTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 134215 99 + 647215 AAGAACAAACATCTTTAGCAGTGATTTAATTGGACAGTTCAAAAGTATGGGGCTTTCCCCCTCCCTGTCTGTATCTAGTTTTTTTGGCATCAACTCAAA - -a -s mr.mrrefChr5 197 104 + 294542 CCCAGGCCATAGCTGGCCTCTCATGATCAATAAATAAACATAATAAAACTTTAATTGCTAGCTAAGTTATCCTGGTGGCCAAGCAGTGTAGTTCTCACAGTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136553 104 + 636262 CCTGGGCCATAACTGGCCTCTCATGATCAATAAATAAACACAATAAGGCTTTAATTGCTAGCTAAGTTATCCTGGTGGCCAAGCAATGTTGTTCTCACAGTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 134322 104 + 647215 CCCAGGCCATAGCTGGCCTCTCATGATCAATAAACAAACGTAACAAAATTTTATTTGCTAGCTAAGTCACCCTGGTGGCCAAGCAGTGTAGTTCTCACACTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 301 86 + 294542 CCTCACCAGGGGCATGGTCATTGTACAGCTTCTGTCTTTGCCCTGTATGATCACCTTGCCTTTAAAAACTCCCAATCCTAATACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136684 84 + 636262 CCTCACCAGGGGCATGGTC--TGTACAGCTTCTGTCTTTGCCCTGTATGATCACCATGCCTTTAAAAACTCCCAATCCTAATACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 134426 86 + 647215 CCTCACCAGGAGGATGGGCATTGTACAGCTTCTCTCTTTGCCCTGTAAGATCACTTTGCCTTTAAAAACTCCCAATCCTAATACAT - -a -s mr.mrrefChr5 387 6 + 294542 GTGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136771 6 + 636262 ATGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 134512 6 + 647215 GTGGCT - -a -s mr.mrrefChr5 393 249 + 294542 CCCAATGTGTTAATTCTTATTTTATACACTTGAACTTACTCAGTGTATCACCAGCATGAGGTGAATAATTCCTCATTATTTTTTGCTGTGGCCTCTGGATGGATCTCTATGACCACATGTAAGAAGAGGCTGGGTCAATGAGATGGGCCCTGCATCAAATATATGGTCCATGAGATAGGACAACAAAAGTAGCCTTACAAAAGAAGTGCCAATAAATGGAAGCACAATAATGGAGTTGAATTTTGTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136783 175 + 636262 CCCAATGTGGTAGTTCCTATTTTATACACTTGAACTTGCTCAGTGTATCACCAGCATGAGGTGAATAATTCCTCATTATTTTTTACTGTGGCCTCTGGATGGATCTCTATGACCACATGTAAGAAGAGGCTGGGTCAACGAGATGGGCCCTGCATCAAATATATGGTCCCTGAGT-------------------------------------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 134518 246 + 647215 CCCAATGGGTTGATTCTTATTCTATACACTTATCCTTAC---ATGTATTACCAGCATGAGGTGAATAATTCCTCATTATTTTTTGCTGTGGCCTCTTGATAGGTTTCTATGACTACATGTAAGAAGAGGATGGGTCAATGAGATGGGCCATGCATGAAATAGATGGTCCATGAGATAGGACAACAAAAGTAGCCTTACAAAAGAAGTGCCAATAAATGGAAGCACAATAATGGAGTTGAATTTTGTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 642 120 + 294542 AGAAGGAGAGGGCTCAACATTAGGAAATGCTCTTTACCTTTAATATTTCTTATAGCACTCAGCTTAGGCCCAACACAAGTGTTCTGGTAGGCCTCTCTCTTGTATCGCAGGTGTGAACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 134786 120 + 647215 AGAAGGAGAGGGCTCAACATTAGGAAATGCTCTTTACCTTTAATATTTCTTATAGCACTCAGCTTAGGCCCAACACAAGTGTTCTGGTAGGCCTCTCTCTTGTATCGCAGGTGTGAACCC - -a -s mr.mrrefChr5 762 116 + 294542 CTGTGCTCACTCCTTCTCACCTTCCAGACATGTATTATTGTCATACTACAACCCAAACTATCTGGATCGGGGCTGCTACAACTTGTAGACAGGAGCTATGAGCCTAAGGCATTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137102 58 + 636262 ----------------------------------------------------------TATCTGGATCGAGGCTGCTACCACTTGTAGAAAGGAGCTATGAGCCTAAGGCACTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 134919 116 + 647215 CTGTGCTCACTCCTTCTCACCTTCCAGACATGTATTATTGTCATACTACAACCCAAACTGTCTGGACTGGGGCTGGTACAACTTGTAGGCAGGAGCTATGAGCCTAAGGCATTACA - -a -s mr.mrrefChr5 878 42 + 294542 ATATGCACTTGCTTGTGCATTTGGATGAGAGTAGATGTTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137162 42 + 636262 ATATGCACTTGCTTGTGCATTTCGATGAGAGCAGATGTTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 135035 42 + 647215 ATACGCACTTGCTTGTGCATTTGGATGAGAGTAGATGTTGCA - -a -s mr.mrrefChr5 920 1 + 294542 G -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136958 1 + 636262 G -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137204 1 + 636262 G -s simRat_chr6.simRat.chr6 135077 1 + 647215 G - -a -s mr.mrrefChr5 921 12 + 294542 TATTACTGAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137205 12 + 636262 TTTTACTGAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 135078 12 + 647215 TATTATTGAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 933 86 + 294542 ATACATCTAGAGCATGCTCTGTGTGCTCCTCTTCTAATGGAGTGCAcagctaccaagttGTGCTCCTgttctaaTGGAGTGCACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136959 54 + 636262 ATACATCTAGAGCATGCTCTGTGTGCTCCTCTTCTAATGGGGTGCA-------------GTGCTCCT------------------- -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137217 54 + 636262 ATACTTCTCGAACATGCTCTGTGTACTCCTCTTCTAATGGAGTGCA-------------CTGCTCCT------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 135090 86 + 647215 ATACAACTAGAGTGTGCTCTGTATGCTCCTGTTCTAATGGAGTGCACAGCTACCAAGTTATGCTCCTGTTCTAATGGAGTGCACAG - -a -s mr.mrrefChr5 1019 80 + 294542 CTAAGTTGATGCAGCACATTTCTTGTAGATAAGAGGCGACTTTCTAGTAAGTCATCAAATGCAAACTAATGAACTCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137013 79 + 636262 CTAAGTTGATGCAGCACATTCCTTGTAGATAAGAGGCGACTTTCTAGCAAGT-ATCAAATGCAAACCAATGAACTCAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137271 79 + 636262 CTTAGTTGATGCAGCACATTTCTTGTGGATATGCGGCGACTTTCTAGTAAGT-ATCAAATGAGAACTAATGAACTCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 135179 78 + 647215 CCAAGTTGAAGCAGCACATTTCTTGTAGATAAGAGGCAACTTTC--GGATGTCATCAAAGGCAAGTTGATGAACTCAATG - -a -s mr.mrrefChr5 1099 9 + 294542 TTAGATTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137093 9 + 636262 TTAGATTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137350 9 + 636262 TTAAATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 135257 9 + 647215 TTAGATTGT - -a -s mr.mrrefChr5 1108 33 + 294542 CTGTGCCCCATGTATATAAAGTAGTGCCATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137359 33 + 636262 CTGTGCCTCGTGTATATAAAGTAGTGCCATGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 135266 33 + 647215 CTGTGCCCTATGTATATATAGTAGTGACATATG - -a -s mr.mrrefChr5 1141 67 + 294542 ACCAGCCTGACAAGTGCGTGACATATGGAATGAGAAAGACAAGGGTGCTAACACACAACATTTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137392 59 + 636262 GCCAACCT--------CGTGACATATGGAATGAGAAAGACAAGGGTGCTAACACACAACATTTTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 135301 16 + 647215 ATAAGAAAGACAAGTG--------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 1208 78 + 294542 AAGCCTCAGTTTTAGTTTCCTCAGGGCTATAAATATGGCGCGGAAGTAAACCTATAGTCAGGGCAAAGGAGCCTCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137457 78 + 636262 AAGCCTCAGTTTTAGTTTCCTCAGGGCTATAAATATGGCGCGGAAGTAAACCTATAGTCAGGGCAAAGGAGCCTCTAA - -a -s mr.mrrefChr5 1286 14 + 294542 TCCAGGAGATGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137536 14 + 636262 TCCAGGAGATGGAG - -a -s mr.mrrefChr5 1300 113 + 294542 TCCTTCTGACACAAAGGTCTGTCACTTTTATGGGGTGGCCACACTTATCCACTAACACACCCAGTTTTCCTTCCCTACTTGTACAAGTATATTTGACTTTCATATTCGGATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137552 113 + 636262 TCCTTCTGACACAAAGGTCTGTCACTTTTATGGGGTGGCCACACTTATCCACTAACACACCCAGTTTTCCTTCCCTACTTGTACAAGTATATTTGACTTTCATATTCGGATAG - -a -s mr.mrrefChr5 1413 927 + 294542 CCGAATGCAATGTATGGAGTATTCTCTATATATCCTCTGCATTAGGTGTCAGGGGCATTACATTGTTTTGGTACTGCCTGTAATCAGTGTAAAGATTCATGGGATCATGAGTAAGTACACAGTAGTATTTGATACAGACAAAGGCTCACCCCTGATGGAAGTAGAAGATGGGACAATTCTCTATGATAGTTCAGTGAATATTTGAGCTACTCAGTCTTAGCGTTCCTTACTTTAGTATACAGTAAACTTAGAGTATGAACCTAGCAAAACCCAAAAGAAACTAGATGTAACAGACATGTTACTTGGGTATCAAACTGTGTACATCTCTATCTAACTGCCCTCCGGATCCATGCCTTCTCAACACTACTTTGCACCCAGCTGTACTTTAGCCTTGTTAAGAGTCCAACTGCAGCATGTCCACAGCTGTTATCACCCATATAGGTCCCACAATGATATGGATTTTTGGGTGAAATGCCTAATAGTCTTCTTTGTCCTCAAAACGCCCACAGGGACCAACCATCATGATTTGACTGTCCCTCATAAAAGTACCTATAGACATTAACTGATGCAATTCAAGAATTCCACAGCAGGGCGAGGATAAGCAGGTGGGGTACCAAACAAAAGTATAGTAGACAGTATGTTTGATGACCAAGATCTCAAAGGTGTAGATACTTGATCACCACAATTAGCGATCAACACCAACTCAGTAGAGTAATGGGAAGTAGTGAGATCTTTTTAGGGTGATTAATAACAGTGTCCAGAATCTAACACCAAATGAACTAGAATCCTTTCGTGCTCCTGTTTCTTAGCGCATCAGTTCTAGCAAAGTAGCTAATTAGATTAGACTGGAGATAAACAGCCCCTTTTTACCATTCCTTTTAACATGACCTATACTGTGAGAAGGACTCAGTCGACTTACCTTATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137673 925 + 636262 CCGAATGCAATGTATGGAGTATTCTCTATATATCCTCTGCATCGGGTGTCAAGGGCATTACAT-GTTTTGGTACTGCCTGTAGTCAGTGTAAATATTCATGGGATCAGGAGTA-GCACACAGTAGTATTTGATACAAACAAAGGTTCACCCCAGATGGAAGTAGAAGATGAAACAATTGACTATGATAGTTCAGTGAATGTTTGAGCTACTCAGTCTTAACATTCCTTACTTTAGTATATGGTAAACTTAGAGTATGAACCTAGCAAAACCCAAAAGAATCTAGATGTAACAGACATGCTACTTGGGTATCACACTGTGTACAGCTCTATCTAACTGCCCTCCAGATCCATGCCTTCTCAACACTACCTTACAACCAGCTGTACTTTAGTCTTGTTAAGAGGCCAACTGCAGCATGTCCACAGCTGTTATCACCCATATAGGTCCCACAATGATATGGATTTTTGGGTGGAATGCTTAATATTCTTCTTTGTCCTCAAAACGCCCACAGGGACCAACCATCATGATTTGACTGTCCCTCATAAAAGCACCTATAGACATTAACTCATGCAATTTAAGAATTCCACAGCATGGCGAGGATAAGCAGGTGGGGTACCAAACAAATATATTGTAGACAGTATGTTTGATGACTAAGATCTCAAAGGTATAGATACTTGATCACCACAACTAGCGATCAACACCAACTCAGAAGAGTAATGGGAAGTAGTGAGCTCTTTTTAGGGTGATTAATAACAGTGTCCAGAACCTAACACCAAATGCGCTAGAATCCTTTTGTGCTCCTGTTTCTTAGCGCATCAGTTCTAGCAAAGTCGCTAATTAGATTAGACTGAAGATAAACGGCTCCTTTTTACCATTCCTTTTAACATGACCTATACTGTGACAAGGACTCAGTCGACTTACCTGATAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 135317 878 + 647215 ---------------------------------------CACTAGGTGTCAGGGGCATTACCTTGTTTTGGTAATGCCTGTAATCAGC-TAAAGAGTCACAGGCTCATGAGTAAGTGCACAGTAGTATTTGATACAGACAAAGGCTCACCCCTGATGGAAGTAGAAGATTGGACAACTCTCGATGATAGTTCAGTGAATATTTCAGCTACTCGGTCTTAGTGTTCCTTACTTTAGTATACAGTACAATTAGAGTATGAACTTAGCCAAACCCAAAAGAAACTAGATGTAACAGACATGTTACTTGGGTATCAAGCTGTGTACATCTCCATCT--------TGCGGATCCATGCCTTCTCAGCACCACTTTGCACCTAGCTGTATTTTAGCCTTGTTAAGGGTCCACCTGCAGCATGTCCAGAGCTATTAGCACCCATATAGATCCCACAATGATATGGCTTTTTGGGTGAAATCCCTAATAGTCTTCGTTGTTCTCAAAACGACCACAGGGACAAAACATCATGATTTGACTGCCCCTCCTAAAAGTACCTATAGACATTAACTGATGCAACTCAAGAATTCCACAGCAGGGCAAGGATAAGCAGGTGGCATAACAGACAAAAGTATAGTAGACAGTATGTTTGATGACCAAGATCCCATAGGTGTAGATACTTGATCACCACAATTAGCAATCAACACCAACCCAGTAGAGTAATAGGAAGTAGTGAGAGCTTTTTAGGGTGATTAATAAGATTGTCCAGAATCTAGCACCAAAGGAACTAGAATCCGTTCGTGCTCCTGTTTCTGTGTGCATCAGCTCTGGCAAAGTAGCTGAT-AGACTAGATTGGAAGTAAACAGCCCCTTTTTACCATTCCTTTTAACATGACCTATACTGTGAGAAGGGCTCAGTAGACTTACCTTCTAGC - -a -s mr.mrrefChr5 2340 22 + 294542 TCATTCTTTGAATATAACCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138605 22 + 636262 TCATTCTTTGAATACCACCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 136195 21 + 647215 TCATTCTT-GAATATAACCTAT - -a -s mr.mrrefChr5 2362 23 + 294542 ACAATTGGTAGTTGGACAGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138627 23 + 636262 TCAATTGGTATTTGGACAACACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 136219 23 + 647215 ACAATTGGTAGTTGGACAGCAAT - -a -s mr.mrrefChr5 2385 17 + 294542 CTACCAATAATCTAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138651 15 + 636262 CTACCAATA--CTAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 136242 17 + 647215 CTCCCAATAATCTAGAG - -a -s mr.mrrefChr5 2402 122 + 294542 GGCAATTAGGACACAGTGAAAGTACAAGCGATATTTTATGTTCTATCTGCAATTGGTGCCAAGCTTGACTTGGTGACCCTTCTCTTGTTTAGTTAATCCTGGAGCCACCTTGGATAGCTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138667 122 + 636262 GGCAATTAGGACACAGTGAAAGTACAAGCGATATTTTATGTTCTATCTGCAATTGATGCCAAGCTTGACTTGGTGACCCTTCTCTTGTTTAGTTAATCCTGGAGCCACCTTGGATAGCTGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 136259 114 + 647215 GGAAACTAGGACATGGGCAAAGTACAAGCAATATTTTATGTTCTATCTG------GTGCCAACCTTGACTTGGTGACCCTTGTCTTGTTTAGCTAATC--AGAGCCACCTTGGATAGCCATC - -a -s mr.mrrefChr5 2524 132 + 294542 ATAATAATACAATACAGTTAGACATGTAAGGATACTGTTATTCATCTGAGAACTTGTTTACCTTCATTCTTGGGGTTGGCATACCAGATGATAATAAATAGATATGAGCTAAACTGTGATTAAGATTGTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138789 128 + 636262 ATAATAATACAATACAGTTAGACATGTAAGGATACTGTTATTCATCAGAGAGCTTGTTTACTTTCA----TGGGGTCGGCATACCAGATGATAATAAATAGATATGAGCTAAACTGTGATTAAGACTGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 136699 132 + 647215 AAAATGATACAATACAGTTAGAGATGCAAGAATACTGTTAATCATCTGAGAACTTGTTTACCTTCATTCTTGGGGTTGGTATACCAGGTGATAAGAAATAAATATGAGCTAAACTGTGATTAAGATTATTTT - -a -s mr.mrrefChr5 2656 134 + 294542 TGTCCTTTGCTCTGTTGTTTGGATTGAGTCCACGATGTTAATTACTGCTTGTGGCTAAACATAAATTTCCCATCTGAATACAAAATCAACTTTGTGTTCTTTCACTAACACCTCAATACAAAGTAATTACCCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138981 134 + 636262 TGTCCTTTGCTCTGTTGTTTGGATTGAGCCCACAATGTTAATAACTGCTTGTAGCCAAACATAAATTTCCCATCTGAACACAAAATCAACTTTGTGTTCTTTCACTAACACCTCAATACAAAGTAATTACCCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 136831 131 + 647215 TGTCATTTGCTCTGTTGTATGGATTGAGTC---GATGTTAATTACTGCTTGTGGCTAAACATAAATTTCCCATCTGAATACAAAATCAACTTTCTGTTCTTTCTCTAACACCTCAATAGAAAGTAATTACCCAG - -a -s mr.mrrefChr5 2790 292 + 294542 ACTCTTTTTGATCCCAAAGGAACCTGTACTGTTCAAGGTTTTTTCCAACACAACAGAGGAGATGGTTGAGAAGGAGACAGTTAAGATATTTGTAGTATATCCAGACCCCCTATAGGCACCATTCGGCGTGCATGGAGAGCTTGTTTCTTTAGATTGACCTTTTATGCACGATTCAAGACAGTTTGCTGTCATCATTCATATATAACAGCTCCCCCCCACAAAAGGAAGAGGACCTTCAATCTAGCTGACTGCGCCACCATCTTTCAACATAATGTCACAATATTACCACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139115 286 + 636262 ACTCTTTTTAATCCCAAAGGAACCTG----GTTCAAGGTTTTTTCCAACACAACAGGGGAGATGGTTGAGAAGGAGACAGTTAAGATATTTGTAGTATATCCGGACACCCTATAGGCAC--TTCGGCGTGCATGGAGAGCTTATTTCTTTAGATTGACCTTTTATGTATGATTCAAGACACTTTGCGGTCATCATTCAAATATAACAGCTCCCCCCTACAAAGGGAAGAGGACCTTCAATCTAGCTGACTGCGCTACCATCTTTCAACATAATGTCACAATACTACCACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 136965 288 + 647215 ACTCTCTTTGATCCCAAAGGAGCCTGTACTGTTCAAGGTTAATTCCAACACAACAGATAAGACAGTTAAGAAAGAGATGGTTAAGATATTTGTAGTATATCTAGACCCCCTATGGGCACCATGGGGTGTGTATGGCGAGCTCGTTTCTCTAGGTTGATCTTCTATGCACAATTCAAGAAAGTTTGCTTTCATCATTCATATACAACAGCTCCCCCCCACAAAAGGAGGAGGACCTTCA--CTAGTTGACTGTGCCACCATCTATCAACGTCATGTCA--ACATTACCACATG - -a -s mr.mrrefChr5 3082 148 + 294542 GGTGGTGGGTCCGACTGTTATCCAATTGGCCTATGACAATTGCTGCCAAGGCTAAAGCTATTAGAAAGAGTGTTAAGATGTTGGCCATGTGTAACCAGGATACTTAAGAGAGTAACAAGCTGCACCGAGTCAAAACATGCAGGACAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139401 148 + 636262 GGTGGTGGGTCCGACTGTTATCCAATTGGCCTATGACAATTGGTGCCAAGGCTAAAGCTATTAGAAAGAGTGTTAAAATGTTGGCCATGTGTAACCGGAATACTTAAGCGAGTAACAAGCTGCACCAAGTCAAAACATGCAGGACAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 137257 145 + 647215 GGTGGAGGGTCCAGCTGTTATCCAATTGGCCTATGGCAAACGCTACCAAGGCTACAGGTATCTGAAAGAGTGTTAAGATGTTGGCCATGTGGAACCAGGATACTTAAGATAATAACAAACTGCACCGAGTCA---CATGTGGGACAAT - -a -s mr.mrrefChr5 3230 16 + 294542 GAGAGTCAACAAAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139550 16 + 636262 GAGAGTCAACAAAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 137402 16 + 647215 GAGAGTCAACAAAAGC - -a -s mr.mrrefChr5 3246 27 + 294542 AAAAATTATGTTATTTAAAAGGTAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139566 27 + 636262 AAAAATTATTTTATTTAAAAGGTAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 137419 27 + 647215 AAAAATTGTGTTATTTAAAAGGCAACT - -a -s mr.mrrefChr5 3273 188 + 294542 AAAGTCAATTACATTAAGTAACAAACCATGTGAGCCTTAAGATCCAAAGTAGATTCCTGAGACTCTATAATTAGGAAATAGAGTTCACAGCTGCGCCCTGCTCTTTAGGCCTATGAATGTCTACCACATAGTTGAGGCACAGTTGCCACAGACCCAAACATGGCCTCGGTGATGGAGTAGAAGCCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139640 185 + 636262 AAAGTCAATCAC--CAAGTAACAAGCCATGTGAGCCTTAAGATCCAAAGTAGTTTCCTGAGACTCTATAATTAGGAAATAGAGT-CACAGCTGTGCCCTGCTCTTTAGGCCTATGAATGTCTACCACATAGTTGCGGCACAGTTGCCACAGACCCAAACATGGCCTCGGTGATGGAGTAGAAGCCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 137446 187 + 647215 AAAGTCAATTACATTAAGTAACAAACCATGCGAGTGTTAAGATCCAAAGTAGATGCCTGAGACTCTTTAATTAGGAAAGAGAGTTCACAGCTGCGCCCTACTCTTT-GGCCTATAAATGTCTACCACATAGTTGAGGCACAGTTGCCACAGGCCTAAACATGGCCTAAGTGGTGGAGTAGAAGCCATC - -a -s mr.mrrefChr5 3461 14 + 294542 TGATGGCAACCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139826 14 + 636262 TGATGGCAACCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 137633 9 + 647215 TGAT-----CCATG - -a -s mr.mrrefChr5 3475 158 + 294542 GGCCCCTAGCTGAGTGGGCGTATTATGACAGTGGAAGTCGTTACTAGGTAGTCGACACAAAGCTGGAGATGAAGTTTACTTCTTATCTACATCCTCCTAATTTGTACTGAtccAATGCTCAATATCAAATTTGGATATATTGATGAGTGGGGGCTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139840 120 + 636262 --------------------------------------CGTGCCTAGGTAGTCGACAGAAAGCTGGAGACGAAGTTTACTTCTTATCTGCATCCTCCTAATATGTACTGATCCAATGTTCAATATCAAATTTGGATATATTGATGAGAGGGGGCTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 137701 153 + 647215 GGCCCCTAGCTGAGTGGGCGTATTATGACAGTGGAAGTCGTTACTAGATAGTACACACAAAGCTGCAGATGAACTTTACTTCTGATCTAcatcctcctaatttgtactgatccaatgctcaatatcaaatttggagTTAATGATGAGTGGGAG----- - -a -s mr.mrrefChr5 3633 18 + 294542 GCTGGCATCTCACCCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139961 18 + 636262 GCTGGCATCTCACCCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 137854 18 + 647215 ACTGGCATCCCAGGCTGG - -a -s mr.mrrefChr5 3651 34 + 294542 TATTCACTTGAGAAGTCACTCAAACAAAGTGGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139982 34 + 636262 TATTCACTTGAGAAGTCACTCAAACAAAGTGGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 137872 34 + 647215 TGCTCACTTGAGAAATCACTCAAACATAATGGAA - -a -s mr.mrrefChr5 3685 153 + 294542 ACTTACACTCATGTCAGAAGTGGCTTGAACACCATTGAACACCTTACAAGCAACAAAGTAGGAAATGTAATTATTGAGTATAAAATCTATCAAGTAGCCAGTAGGTAGTATGGTTGAAGACTGCGTAAATAGTGTCTGTCAAATGTACATAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140016 153 + 636262 ACTTACACTCATGTCAGAAGTGGCTTGAACACCAATGAACACCTTACCAGCAACAAAGTAGGGAATGTAAATATTGAGTATAAAATCTATCAAGTAGCCAGGAGGTAGTATGGCTGAAGACTGCTTAAATAGTGTCTGTCGAATGTACATAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 137907 151 + 647215 ACTTACACTCTTATCAGAAGTGGTTAGAACACCATTGAACACCTTACAAGCGACAAAGTAGGAAATGTGATCATTGA--ATAAACTCTATCAAGTAGCCAATAGGTAGTATGGTTGATGACTGCGTAAATAGTGCCTGTCAAATGTACACAAT - -a -s mr.mrrefChr5 3838 104 + 294542 ATGAGGGGCTTTAATATACTCTACAGGTTATGCTTATGATACATTACTTAAGACTGGTCTTCTTGCTTGAAGAACACCCTCAAATCTGCATAATCAAAGACTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140170 104 + 636262 ATGAGGGGCTTTAATATAATCTACAGGTTATGCTTATGATACGTTACTTAAGACTGGTCTTCTTGCTTGAAGACCACCCTCAAATCTGCCTAATCAAAGACTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 138058 104 + 647215 ATGAGGAGCTTTGATATACTCTACAGGTTATGCTTATCATAAATTACTTAAGACTGGTCTTCTTGCTTGAAGAACACCCTCCAAACTGCAATATCAAAGACAGA - -a -s mr.mrrefChr5 3942 69 + 294542 TTGCTAGATTAATGGAGATTATTATGTATGGTATCCTACAGATGTATGAGTAACATTGCACTAATGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140274 55 + 636262 --------------GAGATTATTATGTACGGGATCCTACAGGTGTATGAGTAGCATTGTACTAATGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 138168 69 + 647215 TTGCTAGATTAATGGAGATTATTATCTATGGTATCCTACAGATGTATGAGCAACATTGCACTAATGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 4011 66 + 294542 TCCCTTGAAGCTTTTGGTCAAGGACCAGAAATTTTTTTGCCTGTGAGCACACTTAGGCAACCGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140330 66 + 636262 TCCGTTGTAGCTTTTGGTAAAGGGCCAGAAATTTTTTTGCCTGTGAACACACTTAGGCAACCGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 138237 66 + 647215 TCCCTTGAAGCCTTTGGTCAAGGACCAGAAATTTTTTTGGCTATGAGGACACTTAGGCAACAGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 4077 89 + 294542 TAGGTTACAAGCAATTGGCATAAGATTGGTCAGAGGCCGTTACTAGGATCCCTAGGCAAATGCTGGAGCTCACCATAGACATCTGTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140423 89 + 636262 TAGGCTACAAGCAATTGGCATAAGATTGGTCAGAGGCCGTTACTAGGATCCCTAGGCAGATGCTGGAGCTCACCATAGACATCTGTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 138303 89 + 647215 TGGGTTACAGACAAATGGCATAAGATTGATCAGAGGCCATTCCTAGGATACCTAAGCAAATGCTGGAGCTTATGATAGATATCTGTCCA - -a -s mr.mrrefChr5 4166 91 + 294542 GGAATGTGATGGTGGTACCAATTAACACTTCGATGGCTGAATGATTTAGGCTGGGCTCATTATTGCAACTGAATGACAATCTTATATTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140514 91 + 636262 GGAATGTGATGGTGGTACCAACTAACACTTCGGTGGCTGAATGATTTAGGCTGAGCTCACTATTGCAACTGAATGACAATCTTATATTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 138392 91 + 647215 GGAATGTGATGGTAGTACCAATTAACACTTAGATGGCTGAATGATTTAGGCTGGGCTCATTATTGCAGCTAAATGACAATCTTATATTTGG - -a -s mr.mrrefChr5 4257 249 + 294542 TCTGTAGCTAGACTTAGCTATAAAAATGATACAGCTGTCACAAAGAAGAATGGTTAAAGATGGAATTTTGTCTGTGGCCAAGGTGGTCACATAACAAAAAGTGAGTAAGTCAGATTAAACATGATGTAGGAACTACATACCATTTGAGCAAAGACATGCATAGTTACAGGAGACTGACATATCCCTGTGTGTGTGGACAGTACCTACACCTGGTGTGTATGGTTCTGAAGGCATAGAGTCGGGATTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140605 248 + 636262 TCTGTTGCTAGACTTAGCTATAAAAATGATACAGCTGTCACAAAGAAGAATGGTTAAAGATGGAATTTTGTCATTGGCCAAGGTGGTCACATAACAAAGAGTGAGTAAGTTAAATTAAACATGATGTAGGAACAACTTGCCATTTGAGCAAAGACATGCATAGTTAAAGGAGACTGA-ATATCCCTGTGTGTGTGGACAGTACCTGCACCTGGTGTGTATGGTTCTGAAGGCATAAAGTCGGGATTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 138487 241 + 647215 CCTGTAGCTAGACTTAGCTATAATAATGATATAGCTATCACAAAGAAGAATGGTTAAAGATGGAATTTTGTCTGAAGCCAAAGTG-TCACATAACAAAAATTGAGTAAGTCAGATTAAACATGATGTAGGTACTACAGACCATTTGAGCAAAGACATGCATGGTTACAGGAGACTGACATATACCTGTGTGTCTGGACGGTACCTACCCCTGGTGTCTATGGTTCTGGTATCATGGAGCCAG------- - -a -s mr.mrrefChr5 4506 171 + 294542 CCACACAAAGTACTGTGTTTTTGGCCACGAAACTGTCATTTGCTAAATCCCACCTGGCAACAAAGTTTTTCCCTCCTATGCACACCTTATAGCTGAAAAATCGTTCTACATATCAGTAGTTTCAGGTACTATCTGTGAAGTAATTACTGTACCAACACTGGGAAGCAAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140858 159 + 636262 CCACACAAAGTACTGTGTTTTTGGCCACGAAACTGTCATTTGCCAAATCCCACCTGGCAACAAAGTTTTTCCCTCCT--GCACACCTTATAGCTGAAAAATCGCTCCATATATCAGCAGTTTTAG-------CTGTTAAGTAATTACTGTACCAACA--GGGAAGTAAAG- -s simRat_chr6.simRat.chr6 138728 170 + 647215 -CACACCAGGTACTGTGCTCTTGACCACAAAGCTGTCATTTGCTAAGTCCCACCTGGCAACAAAGTTTTTCCCTCATATGGACACCTTATAGCTGAAAAATCATTCTACATATCAGTAGTTTCAGGTACTATCTATGGAGTGATTACTTTAACAACTCTGGGAAGCAAAGT - -a -s mr.mrrefChr5 4677 90 + 294542 AGTGTATTCAAAATGTCTTCCTCTAACAGGGGCAATGGTGCTTTTGTATTATTAGATCATTATAGTCAATATCTTACACATATATTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141017 88 + 636262 --TGTGTTCAAAATGTCTCCCTCTAACAGGGGCAATGGTGCTTTAGTACTATTAGATCATTATAGCCAATATCTTACACATATATTTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 138981 90 + 647215 AGTGTATTCAAAATGTCCTGATCAAACAGGGGCAATGGTGCTTTTGCATTACTAAGTCATTAGAGTTGATATCTTACACATATATTTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 4767 271 + 294542 GCGCTTTCATACATGACTCAGTTTGTGGTAATGATGCACAAATCAACAGACAATTGAGTACAGGCCTTTTTACCATGGGCTTTTTATTTCATTGGCCAGCTATTCATTCACATCACCTTCCCTCATTAAGGGTCAACAGATGAGTACCAGTCTATGATTTGAGCTCCTTTCCTAAAGATAAATCAAATCCTGTGTGTTAATTAAGTGCTTCAATGCTCAAGCCTTTATTTAAGACCAATCATGCCGTTAGTCTGCATAGGTTTTTGATTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141110 264 + 636262 GTGCTTGCATACATGGCTCAGTTTGTGGTCATGATGCACAAATCAACAGATAATTGAGTACAAGCCTTTTTACCATG---TCTTTATTTCATCGGCCAGCTATTCA----CATCACTTTCCCCCATTAAGGGTCAACAGATGAGTACCAGTCTATCATTTGGGCTTCTTTCATAGAGATAAATCAAATCCCATGTGTTAATTAAGTACTTCAGTACTCAAGCCATTATTTAGGACCCATCATGCCGTTAGTCTGCATAAGTTTGTGATTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 139071 266 + 647215 GCACTTTCATGTATGACTTAGCTTGTGGTAATGATACACAAATCCACAGACAATTGAGTGCAGGCCTTTT-GCCATGGGCTTTTTATTTCATTGGCCAACTATTCATTCACATCACCTTCCCTCACTAAGGGTCAACAGATACGTACCAGTCTATGATTTGAGCTCCTTTCCTAAAGATAAATCAAATCCTGCTTGGTAATTAAGTGCTTCAATGCTTAACCCTTTATTTAA----AATCATACTGTTAGTCTGCATAGGTTTTTGGCTGG - -a -s mr.mrrefChr5 5038 111 + 294542 CCACCTTGTATCATTATGTGTTGTTGTACAGGACCTCCATGCTTCCGATATAAATACTCAGATGTTCAACCAATGATTAGGTTGAGCTTTCCCATGGAGCGACTCACTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141375 99 + 636262 CCACCTTGTATCATTATGTGTTATTGTACAGGACCTCCATGCTCCCGATGTCAATACTCAGTTGTTCAACCAATGATTAGGTTGAGCTTTGCCATA------------AAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 139337 109 + 647215 CTACCCCGTATCATCACCTGTTGTTGTGCAGGGTCTCCATG-TTCCCATATA-ACACTCAGATGTTCAAACAATGATTAGGTTGCCCTTCCCCATGGAGCGACTCACTAAG - -a -s mr.mrrefChr5 5149 120 + 294542 AACTTAGTCTACAAGGTGCTACTGACTATTTTCTATGTAAAATTCTTATGTTGGTCTAGAAATTCTTATCTTGATCTAGACAAACCCCATTATGACAGGATGTCCATATTACCAGAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141474 120 + 636262 AACTTAGTCTACAAGGTGCTGCAGACTTTTTTCTATGTAAAATTCTTATGTTGGTCTAGAAATTGTTATCTTGATCTAGACAGACCCCATTATGCCAGGATGTCCATATTGCCAGAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 139448 120 + 647215 GACTTAGTCTACAAAGTGCTATTGACTATTTCCTATGTAAAATTCTTAAGTTGGTCTAGAATTCCATATGTTGAACTAGACAAACCCCATTATGAAGGGATGTGCATATTACCAGAGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 5269 391 + 294542 GATTATGTAAACCCCTACTCCCTCTTCAGTACAATTTTGTTCCTTACCCCAAACTGCCATTGTAGAAGGCTATTTCGCTACTATTCAATTGTCCCTTCCTCATGACCTTATGGATTCCACTGTAGTTATGATTACATTGCAGGTCATAAAGCTCTCGTTCCTTATTCGCCTGCATCACAGCACTTTGTTGATGCTGCATGTTGGTGTATGCCCAGCTTGGTGTATAATGTCTATGTGTACTGGTACATGGTGAGATGATGAGAAAAATATGGACAAATGTGAGTGCATACTGTGAAAGTCCGATAGGCCGGTTCTTAAGATCCCCATTCGCCACCCTATGACCTGAGGGTCCATAGACAGACAGCTGAATCAGCCTGCTCCAATACCCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141599 380 + 636262 GATTATGCAAACCCCTAATCCCTCTTCAGTACAATTTTGTTCCTTACCCT---------TTGTAGAAGGCTATTT-GCTACTATTCAATCGTCCCTTCCTCATGACCTTACAGATTCCACTGTCGTTATGATTACATTGCTGGTCATAAAACTCTCGTTACTCATTCGCC-GCATCACCACACTTGGTTGATGCTGCATGTTGGTGTATGCCCAGCTTGGCGTATAATGTCTATGTGTACTGGTACATGGTGAAATGATGAGAAAAATATGTACAAATGTGAGCACATACTATGAAAGTCCGATAGGCCAGTTCTTAAGATCCCCATTCACCACCCTATGACCTGAGGCTCCATAGGCAGACAGCTGCATCATCCTGCTCTAATACCCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 139568 388 + 647215 GATTATGTAAACCCCTACGCCCTCTTCAATCCAAGTTCGTTCCTTAGCCCAAACTGCCATTGTAGAAGGCTATTTCGCTACTATTCGATTGTCCCTTCCACTTGACCTCATGGATTCCACTGCAGCTAAGATTATCCCACAGGTCACAAAGCTACCGTTCATTGTTCACCTGCGTCACAGCACTTTGTTGATGCTGCATGTTGT---ATGCTCAGCTTGGTTTAGAATGTCTATGTGTACTAGTACTTGGACAGATGCTGAGAGAAATATGGACACATGTGAATGCAAACTGTGGAAGTCCAATAGGCCGGTTCTTAATATCTCCATTTGCCACCCTATCTCCTGAGTGTCCATAGACAGACAGCTGAATCAGCCTGCTCCAATACCCTTA - -a -s mr.mrrefChr5 5660 52 + 294542 CAACAATCTAGGGTTGGGTTCTGCTCCACAGACCAATTGGAAGATTAGCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141982 52 + 636262 CAACAATCTAGGGTGGGGTTCTGCTCCACAGACCAATTGGAAGACTAGTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 139956 52 + 647215 CAACAATCTAGGGTTGGGTTCTGCTCCACAGACCAATTGGACGATTAGCATT - -a -s mr.mrrefChr5 5712 105 + 294542 ACCCTTGTGTTTACGTCATATGCTCAATTTTTTTATGTTGTGCTTGGTAGATGTGACATGCCCTAGCGGGTGTCAAAGTTAGATCCCGGTGGTGCCTGGGTGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 142326 105 + 636262 ACCCTTGTGCTTACATCATATGCTCAATTTTTTTATGTTGTGCTTGGTAGATGTGACATGCCCTAGCGGGTGTCAAAGTTAGATCCCGGTGGTGCCTGGGTGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 140008 94 + 647215 ACCCTTATGTTCACGTCATATGCTCAATTTATTTATGTTGTGCTTGGTAGATGTGACATGTACCAGCAGGTATCAAAGCAAGATCCTGGTGGTC----------- - -a -s mr.mrrefChr5 5817 6 + 294542 AGATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 142441 6 + 636262 AGATAA - -a -s mr.mrrefChr5 5823 149 + 294542 TCTGTTTTATTGTTATTGTATAAGTGCTTAGGGATTAGTGGTATCTCTGTCAGTCTTTCCCAGTCAGCTATAATCATGATCCAAAACTGGATGGACTGACATGTCTTCTTTTCTTCCAGCAGAAACTAATTGTAGGAGCACCAACACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 142450 149 + 636262 TCTGTTTTATTGTTATTGTATAAGTGCTTAGGGATTAGTGGTATCTCTGTCTGTCTTTTCCTGTCAGCTATAATCATGATCCACAACTGGATGGACTGACATGTCTACTTTTCTTCCAGCAGAAACTAATTGTAGGAGCACCAACAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 140102 149 + 647215 TCTGTTTTATTGTTATTGTGTAAGTGCTTAGGGACCATTGGTATCTCTGTCAGGCTTTCCCAGTAAGCTGTAACCATGATCCAAAACCGGATGGACTGACATGTCATCTTTACTTTCAGCGGAAACTAATTGTGGGAGCACCAACACAT - -a -s mr.mrrefChr5 5972 320 + 294542 CACCCAGCGTAAATACGGCCACTATCATGACCTAAGTCAGATCCTTATTTAGTTTATGATTGACCCAGTGGGCACTAGCATTCAGGGGCAGTCTAAACAATATTGCCTTGCGTGGTTCGGGCAAACTATGCAGGTGGAGCATTAAAACTCTGCTTCTATGTGACTACCAGGCTCTTGCTTAACAAAGTCGTAAGTATTAAAGCTTCTAAATTGAAATGCTGCATACATGAGGCAGGACCATGAGTGCAGTGAGAGGGGCAAACCATATGGCACAAACTTACTGAATTATTGAATTGTCTCAGTATGTCTCCACCCCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 142599 308 + 636262 CACCCAGCGTAAATACGGCCACTATCATGACCTAAGTAAGATCCTTATTTAGTTTATGATTGACCAAGTGGGCACTAGCATTCAGGGGCAGTCTAAACAATATTGCCTTACCTGGTACGGGTAAACTATGCAGGTGGAGCACTAAAACTTTGGTTCTATGAGACTAC-------TTGCTTAACAAAGTCGTAAGTATTAAAGCTTCTAAATTGAAATGTTGCACACATGAGGCAGGACCATGGGTGCAGTGAGAGGGGCAAACCATATAGCACAAACTTACTGGATTATTGAATTGTCTCAGTATGTATCCACAC----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 140255 316 + 647215 CACCCAGCTTAGATAAGGCCACTA----GATCTAAGACAGATCCTTTTTTATGTTATGATTGACCCAGTGGGCACTAGCATCCAGGGGCAGGTCAAACAATATTGCCTTGTGTGGTTCGGGCAAACTATTCAGGTGGAGCATGAAAACTCTCCTTCTATGTGACTACCAGGCTCTTGCTTAACAAAGTCAAAAGTATTAAAGCTTCTGAATTGAAATCCTGTATACATGAGGCAGGGCCATAATTGCAATGAGAGGGGCAAACCATATGGCACAAACCTACTGAATTATTGAATTGTATCAGTATGTCTCTGCCCCATTA - -a -s mr.mrrefChr5 6292 318 + 294542 TTCATGTCAGGGTACACTGGTAGTGATCAGCACTTTACCTGTCAACTCAACCTATTTTTGCTGAATAAACATCTGTATAACTAAAAATGTTGGGGGATTAAGTTATTCTCTAATAGGAGAAAACACCAAGTGCCATCTCATGGAAAGCAAAATGTGTAGAAATAAAAGAATCCATCTTTAGGAGTTATATGGCATCATGTAGACATTTAGGATCTAAGATATAACACAGACTATACCTGAAATAAGATGCCCCTTCATCATACATCCCTTAATCAAGTTTCATGCCATGGATTTGAATAGCCAGTTTATCCAAATGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 142907 318 + 636262 TTCATGTCAGGGTACACTGGTAGTGATCAGCACTTTACCTGTCAACTCAACCTATTTTCGCTGAATAAACATCTGTATAACTACAAATGGTGGGGGATTAAGTTATTCTCTAATGGGAGTAAACACCAAGTGCCATCTCATGGAAAGCAAAATGTGTAGAAATAAAAGAATCCATCTTTAGGAGTTATATGGCATCATGTTGACATTTAGGATCTAATATATAACACAGACTATACCTGAAATAAGATGCACCTTCATCATACATCCCTTAATTAAGTTTCATGCCATGGATTTGAATAGCCATTTTATCTAAATGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 140573 303 + 647215 TTCATGTCTGGGTACACTGGTAGTGATCAGCACTTTTCCTGTCAATTCAACCTATCTTTGCTGAATAAACATCTGCATAACTAAGAATGTCGGGGGATCAAGTTATTCTCTTATAGTAGAACACACCAAGTGCCATCCCATGGAAAA------------AAATAAAAGAATCCATCTTTAGAAGTTATATGGCATCATGTAGAAGTGTAGGATCTAAGATATAACA--GAATATACCTGAAATTAGAT-CCTCTTCATCATACATCCCTTATTCAAATTTCATGCCATGGATTTAAATAGTCAGTTTATCCAAATGTC - -a -s mr.mrrefChr5 6610 22 + 294542 ATAAACTGTAATAACAATTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143225 22 + 636262 ATAAACTGTAATAACAGTTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 140884 22 + 647215 ATAAACCACAATAACAATTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 6632 225 + 294542 GCTCCTTCTGAATAACCAAGCAAGCTTAAAGGACACAATAATTGTTAATCCCCTTAAACAAGATTGAAAACTTGATTTTAATTTGGTGTACATTTGAATGTCCATCTTCAATAAAGGGTATAGGGTTAAATATCGCATTTAGTATTATCTCTGACCATTTAGAATTTAATTGATGACAACTTCTTGCAGTGCATGGCAGTTTCTGGGTCTGATTGAACTCCTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143248 225 + 636262 GCTCCTTCTGAATAACCAAGCAAGCTTAAAGGACACCATAATTGTTAATCCCCTTAAACAAGATTGAAAACTTGATTTTAATTTGGTGTACATTTGAATGTCCATCTTCAATAAAGGGGATAGGGTTAAATATCGCATTTAGTATTAGCTCTGACCATTTAGAATTTAATTGATGACAACTTCTTGCAGTGCATGGCAGGTTCTGGGTCTGATTGAACTCCTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 140906 225 + 647215 GCTCCTTCTGGATAACCAAGCAAGTTTAAAGGACACAACCATTGTTAGTCCCCCTGAACAAGATTTAAAAGTTGATGATAATTTGGTGTACATTTGAATGTCCGTCTTCAATAAAGGGTATAATGGTAAATGTAGCATTTAGCGTTATCTCTTACCATTTAGAGTTTACTTGATGACAACTTCTTGCAGTGCATGGCAGTTTCTGGGTCTGATTGAACTCCTCTC - -a -s mr.mrrefChr5 6857 37 + 294542 TGGTACCTTCAGAGCCTGATTGGACTCCTCTCTGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143474 35 + 636262 TGGTACCTTCAGAGCCTGATTGGACTCCACTCTGG-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 141131 37 + 647215 TGGTACCTTCAGAGTATGGCTGAACTCCTCTCTGGGT - -a -s mr.mrrefChr5 6894 78 + 294542 TTCGGATAACCTGATTTGTGTGAGATGGACAGCCTCCTGGACAGTCACCCCTTCAATTTGGTGCAATAATTGGAGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143509 68 + 636262 ----------CTGATTTGTGTGAGATGGACAGCCTCTTGGACAGTCACCCTTTCAATTTGGTACAATAATTGGAGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 141171 78 + 647215 TTCGGATAACCTGATTTGTGTGAGATGGACTGCCTCCTGAACAGTCACCCCTTCAATTTGGTGCAATAATTGGAGTAG - -a -s mr.mrrefChr5 6972 9 + 294542 CTTGTAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143577 9 + 636262 CTTGTAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 141253 9 + 647215 CTTGTAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 6981 10 + 294542 TCAGATTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143586 10 + 636262 TCAGATTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 141268 10 + 647215 TTAGATTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 6991 98 + 294542 CAATAAGTGGAGGTAGGGCACTTGCAGTGTTAGGGGACCTTCTGTGGAGCATGGTAGCACAAAATCCTAATAAAGGCTTAAGTGTGGGTAGGTTTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143601 98 + 636262 CAATAAGTGGAGGTATGGCACTTGCAGTGTTAGGGGACCTTCTGTGGTGCATGGTGGCACAAAATCCTAATATATGCTTAAGTGTGGGTAAGTTTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 141278 98 + 647215 CAATAATTGGATGTTGGGCACTTGCAGTGTTAGTGGACCTTCTGTGGAGCATGGTAGCACTAAATCCTAATAAAGACCTAAGTGTAGGTAGGTTTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 7089 334 + 294542 TTGGGAGGGCCTTGATTCAGATCATTCAAACTGAGGGCTGGGAGAGAGCTCCAGGGATCGGAAGGATTGGTACCCCATGCTGTACATTCAAGATATTTTTATAAAAAGTTAAAACAATAGAAAAAAATATACACAGTAGAGTGGGGGACCTGCCCTCAGATAAGATCTTGTTGGGTAGAGTCAATAGAAGCAGGTGGGCAAGAATTTTTAATAGTTCCTGGGTCACTAATGTGCTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCACAGGACAGTCAAATTCCACCTCTAACTATCATAGTAGTGTAAAAGTGGAGAATGTGCACTTAGTCTAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143704 334 + 636262 TTGGGAGGGCCTTGATTCAGATCATTCAAACTAAGGGCTGGGAGAGAGTTCCAAGGATCGGAAGGATTGATACCCCATGCTGTACATTCAAGATATTTTTATAAAAAGTTAAAACAATAGACAAAAATATACACAGTAGAGTGGGGGACCCGCCCTCAGATAAGATCTTGTTGGGTAGAGTCAATAGAAGCAAGTGGGCAAGAATTTTTAATAGTTCCTGGGTCACTACTGTACTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCACAGGACAATCTAATTCCACCTCTAATTATCGTAGTAGTGTAAAAGTGGATAATGTGTGCTTAGTCTAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 141376 333 + 647215 TTGGGAGGGCCTTGAATCAGATCATTCAAACTGAGGGCTGGGAAAGAGCTCCCGGGTTTGGAGGGATCGGTACCC-ATGCTGTACATTCAAGATATTTTCACAAAAAGTTGAAACAATAGAAATAAAGATACACAGTAGAGTGGGGGACCTGCCCTGAGATGAGACCTTCTTGGGTAGAGTCAATAGAACCCGGTGGGCCAGAATTTATAATAGTTCCTGAGTCACTAATGTGCTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCATAGGATGGTCAAGCTCGAACTCTAACTATCATAGTCATATAAAAGTGGAGAATGTGCATTTAGCCTAATT - -a -s mr.mrrefChr5 7423 34 + 294542 ATAAAGAAATCGAATTCCACCCTTTCTTAGCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144038 34 + 636262 ATAAAGAAATCGAATTCCATCCTTTCTTAGCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 141710 34 + 647215 ATAAAGAAATCGAATCCCACCCTTTCTTAGCTTT - -a -s mr.mrrefChr5 7457 19 + 294542 AAAGGTATTCCATGTTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144124 18 + 636262 AAAGG-ATTCTATGTTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 141744 19 + 647215 AACGGTATTCCATGTTGTG - -a -s mr.mrrefChr5 7476 72 + 294542 CCCCAAGTCACTTTTGTGTTATACCATCTCAATATACAGGTTAGATGATCTACTAATGCAAAGATCTGCGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144143 72 + 636262 CCCCAAGTCACTTTTGTGTTATACCATCTCAATATACAGGTTAGATGATCTATTAATGCAAAGATCTGCGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 141763 72 + 647215 CCCCAGGTCATTTTTGTGTTATACCTTCTCAATATACAGGCTAGATGATCTACTGATGCAAAGATCTGCACT - -a -s mr.mrrefChr5 7548 91 + 294542 TAAAACTGCTTTAATCTAAAAGTTTGGGGCGAGTGCTAATTTGTAAGGTCCCTCATGCCTCATCCATAGGATGCTAGATTTGTTGGACTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144215 90 + 636262 TAAAACTGCTTTAATCCAAAAGTTTGGGGCGAGTGCTAATT-GTAAGGTCCCTCATGCCTCATCCATAGGATGCTAGACTTGTTGGACTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 141839 91 + 647215 TAAAACTGCTTTAATCTAAAAGGTTGGGGTGAGAGCTAATTTGTAAGGTCCCTCATGCCTCATCTGTAGGATGCTAGATTTGTTGGACTTC - -a -s mr.mrrefChr5 7639 37 + 294542 CCCTATGTTACAATCAGTGAATTGTTGTCAGCAGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144305 37 + 636262 CCCTATGTTACAGTTAGTGAATTGTTGCCAGCAGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 141965 37 + 647215 CCCTATGTTACAATCAATGAATTGTCGTTAGCAGGGT - -a -s mr.mrrefChr5 7676 73 + 294542 TGTACACAGTCAATGGCAAGTCGTTTTATGAACTGTGACCACCATTAGAGGGTAGGCTATCTATAGTTCCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144342 73 + 636262 TGTACACAGTCAATGGCAAGTCGTTTTATAAAGTGTGACCCTCATTAGAGGGTAGGCTATCTATAGTTCCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 142003 73 + 647215 TGTACACAGTCAATCACAAGTCGTTTTATGAACTGTGACCACCATTAGAGGGTAGGCTATCTATAGTTACACA - -a -s mr.mrrefChr5 7749 21 + 294542 GAAGGCTATAGCCACACTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144415 21 + 636262 GAAGGCTATAGCCAGACTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 142079 21 + 647215 GAAGGCTACAGCCACTCTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 7770 25 + 294542 AAGGTTCACATTCAACTATCTGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144436 25 + 636262 AAGGTTCACATTCAACTATCTGCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 142101 25 + 647215 AAGTTTCATATTCAACTATCTGCTC - -a -s mr.mrrefChr5 7795 541 + 294542 AGGCTGCCTTGCCATTATGTTTACCTTGTCCTATGACTCATTGTTGTGTGTGCAATGTCCTGTGACTGGTGTGCAAGGGAAGCCATAACACCTCTCAAATCCCATCATATGTCACATGCCATCATAGCTCATTCTTTCAAACTTCTGCTTTGGATGAATGTAGTTGTCCTTTGGAGCAAACAAATGCAAGGCAGGTATCCTGTGATCAATTTATTCTAAGTGGTCTCCCACTCATTAGCAGTGAATTCAGCTCCCTTGGACATCCTTTGGTCATCATTTTTCCTATAAAATGCTTTTTAATTTTGACAGGAAACACTAATGCCCTTATGTAGATTTGCTCTATTTGTAGGTATTGCGCACAGTACCCCAGTGAGAGTATTAGCCAACAGACATTGTGCTTGGTGAGTAGTACAGTTGAGGGGATTCATAACAATATATGGAGACTTCATCCTTTACCCTGCAATTATAATACCCAGCTAGCCTATCCCTATTTCAGGGGTGCTGTGCAAGAGGTCATGCATATAGGTAAAAAGCAGTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144461 533 + 636262 AAGCTGCCTTGCCATTATGTTCACCTTGTCCTATGACTCATTGTTGTGTCTGCAATGTCCCGTGACTGGTGTGCAAGGCAAGCCATAACACTGCTCAAATCCCATCATATGTCACATGCCATCATAGCTCATTCTTTCAAACTTCTGCTTTGGATGAATGTAGTGGTCCTTTGGAGCAAACAAATGCAATGCAGGTGTCCTGTGATCAAT--------AGTGGTCTCCCACTCATTAGCAGTGAATTCAGCTCCCTTGGACATCCTTTGGTCATCATTTTTCCTATAAAATGCTTTTTACTTTTGACAGGAAACACTAATGCCCTTATGTAGATTTGCTCTATTTGTAGGTATTGCGCACAGTACCCCAGTGAGAGTGTTAACGAACAGACACTATGCTTGGTGGGTAGTACAGTTGAGGGGATTCATAACAATATATGGTGACTTCGTCCTTTGCCCTGCAATTATAATACCCAGCTAGCCTATCTCTACTTCAGGTGTGCTGTGCAAGAGGTCATGCATATAGGTAAAAAGCAGTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 142128 525 + 647215 AGGCTGCCTCACCATTATGTTTACTGTGTCCTGCGAGTCATTGTTGTGTGTGCAACGTTCTGTGACTTGTGTGCAAGGGAAGCCGTAACACCTCTCAAATCCAATCATACATCATATACCATCATACCTCATTTTTTCAGACTTTTACTTTGGATGAATCTAGTTGTTATTTGGAGTAAACAAATGCACGGCAGGTATCTTGTGATCAGTTTATTCTAAGTGGTTTCCCAATCATTAGCAGTGAATTCAGCCCCCTTGGACATGCCTTGGTCATCATTTTTCCTAAAAAATGGTTTTTAACTTTGACAGTAAACACTAATGCCCTTA----GATTTCCTCTATTTGTAGG-----CACGCAGTACCTTAGTGAGAGCATTAGCCAACAG-CATTGTGCTTAGTGAGTAGTACAGTTGAAGGGATTCATATCAATATATGGACACTTCATCCTTCACCCTGCAATTATAATAACCAGCTAGCCTATCCCTATTTGAGGGGTAATGTGCAAGTGGT------TATAGGTAAAAAGCAGTAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 8336 73 + 294542 TGGCTTCACCCTACAGTTAGCTCGAGCAGAAATCTGTCTATGTGTGTCCTTCCAACTGTTCTGGCTGGTACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145003 73 + 636262 TGGCCTCACCCTACAGTTAGCTCGAGCAGAAATCTGTCTATGTGTGTCCTTCCAACTGTTCTGGCTGGTACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 142653 73 + 647215 CGGCTTCACCCTACAGTTAAGTCAAGCAGAAATTTGTCTATATGTGTCCTTCCACCTGTGCTGGCTATTACAA - -a -s mr.mrrefChr5 8409 41 + 294542 ATGAAGGTGAAACATCCTGCCAATCAGATATCATGCCTCGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145076 41 + 636262 ATGAAGGTGAAACATCCTGCCAATCAGATATCATGCCTCGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 142735 41 + 647215 ATGAAGATGAATCATCCGGCCAACCCAATTTCATGCCTCAC - -a -s mr.mrrefChr5 8450 56 + 294542 CTCAACGGCACAGTAGGCATTTATTCATATGGAAAACTGGAATCTTGGGTTATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145117 56 + 636262 CTCAACGGCACAGTAGGCATTTATTCATATGGAAAACTGGAATCTTGGGTTATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 142780 56 + 647215 CTCAATGGTATGGTAGGCATTTATTGACATGGAAAACTGGAACCTTGAGTTATCAA - -a -s mr.mrrefChr5 8506 60 + 294542 CAAATATCTCCATGTCTTATCGTGTAAATGCCTGTAACTATCTGCATGTTGAATTTAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145193 60 + 636262 CAAATATCTCCATGTCTTATCGTGTAAATGCCTGTAACTATCTGCATGTTGAATTTAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 142836 60 + 647215 CAAATATCTCCACGCCTGATTGCGCCAATACCTGTAACTATCTGCATGTTCAATTCAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 8566 23 + 294542 AAGATGACTATAGTATTGAGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145254 23 + 636262 AAGATGACTATAGTATTGAGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 142896 23 + 647215 AAGATGGCTATTATATTGAGATG - -a -s mr.mrrefChr5 8589 85 + 294542 CAGTTGTGAACCCATACTGATTCTGAAGGGATAGATATACATTTCTGATCTCTTGACAGTGTGAGCTATCAATCTCATATATTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145278 85 + 636262 CAGTTGTGAACCCATACTGATTCTGAAGGGATAGATATACATTTCTGATCTCTTGACAGTGTGAGCTATCAATCTCATATATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 142919 85 + 647215 CAGTTGTGAACCCATACCGCTTCTGAAGGGATACATATACGTTTAAGAGTTCTTGACATTGTGCACTGTCAGCCTCATATACTAT - -a -s mr.mrrefChr5 8674 46 + 294542 TCTTAGGGATCCAGGTCCATTTGCCACACAGCTAAGCAGCTATCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145363 46 + 636262 TCTTAGGGATCCAGGTCCATTTGCCACACAGCTAAGCAGCTATCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 143005 46 + 647215 TGTTAGGGATCCAGGTCAAGTTACCACACTGTTAACCAGCTATCCT - -a -s mr.mrrefChr5 8720 97 + 294542 GAAGATGGTTTGGTGTGTCTGTGCCCATTCTAAGTCTGTCGCTGCTGTACAAATAGTCCACTTAAAGCAGGTCACCTATACAATCTGCATGCTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145410 97 + 636262 GAAGATGGTTTGGTGTGTCTGTGCCCATTCTAAGTCTGTCGCTGCTGTACAAATAGTCCACTTAAAGCAGGTCACCTATACAATCTGCATGCTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 143051 97 + 647215 GAAGAGTGTTTGGTGTGTCTGTGCCCATTCTGAGTCTGTCACTGCTGTATGAACAGTCCACTTGAGGTAGGTCACCTATACAATCTGCATGCTTTAA - -a -s mr.mrrefChr5 8817 32 + 294542 TAATGTGGGAATAATTCTTCAATGAGTACTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145508 32 + 636262 TAATGTGGGAATAATTCTTCAATGAGTACTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 143148 32 + 647215 TAATGTTGGAATAATTCTACAATGAGGACCAA - -a -s mr.mrrefChr5 8849 8 + 294542 GTTATATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145540 8 + 636262 GTTATATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 143208 8 + 647215 GTTATATC - -a -s mr.mrrefChr5 8857 12 + 294542 TGGTTGATACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145549 12 + 636262 TGGTTGATACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 143216 12 + 647215 TGGTCAGTACGG - -a -s mr.mrrefChr5 8869 94 + 294542 AGACTGAATCAAAGTCATTCACAATATAGGGCCCTTCTGGTGCCCACAGATTGAAGTCCATAATGATAATTATGGAAGACCACATGCCTGATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145676 94 + 636262 AGACTGAATCAAAGTCATTCACAATATAGGGCCCTTCTGGTGCCCACAGATTGAAGTCCATAATGATAATTATGGAAGACCACATGCCTGATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 143228 94 + 647215 AGACTGAATCAGAATTATTTATAATATAGGGCCCTTCTGGTGCCCACAGATTGAAGTCCATAGTGATAATTACGAAAGACCACATGCCTGATCT - -a -s mr.mrrefChr5 8963 186 + 294542 GCTCTTGAGGGATTCCAGCCTGAAGTATATTATTAAAGGTCAGGTCCCATAAACAGTGTAGTTGTAGAGGGAATACAAAAGTGTTCCATCATCATGCCATCTCCACAGATTTCCCAAGGTGTACCTTGCCAGCTGCAGAGTGCTATACCACAACTGTCTTCCTTCACATTAAAGTCCAACTTCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145777 164 + 636262 GCTCTTGAGGGATTCCAGCCTGAAGTATATTATTGAAAGTCAGGTCCCATAAACAGTGTAGTTGTAGGGGGAATACAATAGTGTTCCATCATCATGCCAT--------------------GTACCTTGCCAGC-GCAGAGTGCTATACCACAACT-TCTTCCTTCACACTAAAGTCCAACTTCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 143322 186 + 647215 TCTTTCAAGGGATCCAAGCCTGAAGTATATTATCAAAGGTCAGTTCCCATAAACAGTGTAGTTGTAGAGGGAATACCAAAGTGTTCCATCATCATGCCATCTCCACAGATTTCCCAAGGTGTACCCTGCCAGCTGCAGAGTGCTATACCACAACTGTCCTCTTTCACATTAAGGTCCAACTTCCTT - -a -s mr.mrrefChr5 9149 20 + 294542 TGTGACCAAGTTTCAACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145943 20 + 636262 TGTGACCGAGTTTCAACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 143508 20 + 647215 TGTGACCAAGTTTTAACATC - -a -s mr.mrrefChr5 9169 20 + 294542 TGAGTACTCAGTGAAACTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145964 20 + 636262 TGAGTACTCAGTGAAACTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 143528 20 + 647215 TGAGTATTCAGTGAAACTTA - -a -s mr.mrrefChr5 9189 276 + 294542 TACTTCTCAGTAAATTCTAATATTTGAGGCTTCAATATTGGTAGGCAGTGGGCGGACATCAGATCTGTGGGACTTGCAGGTAAGGTTAGGGTATAGTAAGAATTGCAGAACTGTAGTTACAGGAAATGATTTTGGTACAGTTTTGATCAGCTGGTTTTAATATTATTTTCATAGTGGTGTTTAGGCTACAACTGGTCATTTGTTTTTGCACACACTGGCAGGGAAGTTTGCTACTCTCTGTTGACACTGAGTAATGCCTATGATCTCCATATACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145985 272 + 636262 TGCTTCTCAGTAAATTCTAATATTTGAGGCTTGCATATTGGTAGGTAGTGGGCGGACGTCAGATCTGTGGGACTTGCAGGTAAGGTTAGGATATAGTAAGAATTG--GAACTGTAGTTACAGGAAATGATTTTGGTACAGTTTTGATCAGCTGGTTTTAATATTATTTTCATAGTGGTGTTTAGGCTACAACTGGTCATTCGTTTTTGCACACACTGGCAGGGAAGTCTGCTACTCTCTGCTGACACTGAGTAGTGCCTATGATCTCAATATAT-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 143548 274 + 647215 TACTTCTTAGTAAAATCGAATACTTTAGGCTTCAATATTGGTAGGCAG-GGGCGGACATCAAATCTGTGGGACTTGCAGGTAAGGTTAGGGTATAGTAAGAATTGCAGAACTGTAGTTGCAGGAAATGATTTTGGT-CAGTTTTGATCAACTGGTCTTAATATTATTCGCATAGTGGTGTTTAGGGTACAACTGGTCATTTGTTTCTGCACACACTGGCAGGGAGATTTGCTACTCTCTGTTGACATTGAGTAATGCCTGTGATCTTCATATACAC - -a -s mr.mrrefChr5 9465 364 + 294542 TTGGAGGTTGTTAAACCCCATTACAGTTAACTGTCTCTTCATGCAACATAGCTATTTTCTGTATATCTTCCAAACTACCAGCTGATTTTCCAACTTCTTCCATCTAAAATGCTCATAAAGAAGCACAACTCAGAAGTGTACATAACCAGAGAAGGCACAGATCCCCTCATCATCTAAGCTAATGCATACCCCTATACTTCCCATGAATGTGCTGAAGACCATAGTAAAAGTCATAATGATGTTCCTGTCATATTTTTGTTGCCTCTCCTAGAAGGTTTGTCTTTTTGCCATGAATTTATTTCATCCTAATAATATAGACCTGTCCCTGTCATATTTTTGTTTCCCCTCCAAGAAGTTTTATCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 146257 359 + 636262 TTGGAGGTTGTTAAACCCCATTACAGTTAACTGTCTCTTCATGCAACATAGCTATTTTCTTTACATCTTCCAAACTACCAGCTGATTTTCCAACTTCTTCCATCTAAAATGTGCATAAAG-----TAACTCAGAAGTGTACACATCCAGAGAAGGCACAGATTCCCTCATCATCCAAGCTAATGCCTAACCATATACTTCCCATGAATGTGCTGAAGACCATAGTAAAAGTCATAATGATGTTCCTGTCTTATTTTTGTTGTCTCTCCTAGAAGGTCTGTCTTTTTGCCATGGATTTATTTCATCCTAATAATATAGACCTGTCCCTGTCATATTTTTGTTTCCCCTCCAAGAAGTTTTATCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 143823 352 + 647215 TTTGGGGTTGTTAAACCCCATTACAGTTAACCGTCTCTTCATGCAACATAGCTATTTTCTGTATGTCTTCCAAACTACCAGCAAAATGTGCA------------CGAAATGCTCATTAAAAAGCACAATTCAGAAGTGTACATAACCAGAGAAGGCACTGATCCCCTCCACATCTAAGCTAATGCACACCCCTAAACTTCGCACAAATGTCCTGTAGACCATAGTATAAATCATAACTATGTTCCTGTCAGATTTTTGTTGCCTCTCCTAGAAGATTTGTTTTTTTGGCATAAATTTATTTCATCCTAATAACATAGACATATTCTCATTATATTTTAATTGCCCCTCCAAGAAGATTTATCTT - -a -s mr.mrrefChr5 9829 65 + 294542 GAAAAAAGATGATCCTAGTCCCTAGGAACAGGAAGAAAAGTTTCCACTAGTACAGTTGCTTGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 146659 64 + 636262 GAAAAAAGATGATGCTAGTCCCTAGGAACAGGAAGAAAAGTTTC-ACTAATACAGTTGCTCGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 144175 60 + 647215 -----AAGATGATCCTAGTCTTTAGAAGCAGGAAGAAAAGTTTCCACGAGTACAGTTGCTTGTCT - -a -s mr.mrrefChr5 9894 470 + 294542 CTGACACTCTTTAAGCTTTGAAGCCTATGTGGTTTCAAAACCACCACAGAGCCTTGATTATGATCTACCCTAGATTTACGTGCTCTAATCATGAACTTCCCCAATCTAAATGCTGCCAAGACTACAAACAGACTTTACTATGGATATGGGGATTTATCTAAAAATCTCTGAGCCATTAAGATGATTTTTTACTTTTATTGCTATACACAACCATGTTCTGGATGATCATATTAGTAACACAGACATACTAATAATTTTTACCTCTTATATAACTAAGATTTTTCTATCTAACATACGTTATTCTGTAAGGCACTTAGTCCTTAAATTCTATGTTCATCATTACCAGGATCATGATGTAATACTCTTATTTACCATGTACTAGACATCAATACCACAAATATAACTATGACTGCCAACAGGCTAGGATGCATTCTTTTGACCTCCCATCCCTACAGGGGACATAAAGTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 146728 470 + 636262 CTGACACTCTTTAAGCTTTGACGCCTATGTGGTTTCAAAACCACCACAGAGCCTTGATCATGATCTACCCTAGATCTACGTGCTCTAATCTTAAACTTCCCCAATCTAAATGTCATCAAGACTACAGACAGACTTTACTATGGATATGGGGATTTATCTAAAAATCTCTGAGCCATTAAGATGATTTTCTACTTTTATTGCTATACACAGCCATGTTCTGGATGATCATATTAATAACACAGACATACTAATAATTTTTACCTCTTATATAACTAAGATTTTTCTATCTAACATACGTTATTCTGTAAGGCACTTAGTCCTTAAATTTTATGTTCATCATTACTAGGATCATGATGTAATACTCTTATTTACCATGTACTAGACTTGAATACCACAAATATAACTATGACTGCCAACAGGCTAGGATGCATTTTTTTGGCCTCCCATCCCTACAAGGGACATAAAGTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 144235 464 + 647215 CTGACACCCTTTAAGCTTTGAAGCCTATGTGGTTTCAAAACCACCACTGAGCCTTGATTACGATCTACCCTAGATTTATGTGCTCTAATCATGAAAATCCCCAACCTAAATGCTGCCAAGACTACAAACAGACTTTCCTATGGATATGAGGATTTATCTAAAAGTCTCAGAGCCTTTAAGTCAATTTTTTACTTTTATTGCTATACACAACCATGTTCTGGATGATCATGTTAGTAAAACAGGCATACTAATAATTTTTACTCATTATATAACTAAGATTTTTCTATCTAACATGAGTCATTCAGTAAGACACTGAGTCCTTATATTCTATGTTCACCATTACCAGGATCAT------ACACTCTTATTTACCATGTACTAGACATCAATACCACAACTATAACTATGACTGCCAACAGGCCAGAACGCATTCTTTCGACCTCCCATCCCTACAGGGGGCATAAAGTAAG - -a -s mr.mrrefChr5 10364 54 + 294542 GCATCATACATCCCTATTATTTGAGGTAGCTCATTGTATGCTGAAGGAAAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147199 54 + 636262 GCATCATACATCCCTATTATTTGAGGTAGCTCATTGTATGCTGAAGGAAAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 144699 54 + 647215 GCCTCATACATCCCTATTATTTGAGGTAGTTCATTGCGTCCTGAGGGAAAAATT - -a -s mr.mrrefChr5 10418 59 + 294542 AATTCTTATCTAGCACTTGCCCGATGCTGTGAAGATGTTACTATCAACTTGTAACCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147253 59 + 636262 AATTCTTATCTAGCACTTGCCCGATGCTGTGAAGATGTTACTATCAACGAGTAACCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 144754 58 + 647215 AATTCTTATCTAGTACCTGCTCGATGACGTGAAGATGTTACTATCAACTTGTA-CCTCT - -a -s mr.mrrefChr5 10477 17 + 294542 ACAGTATGTGAAGCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147313 17 + 636262 ACAGTATGTGAAGCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 144812 17 + 647215 ACAGTCTGTGAAGTCAC - -a -s mr.mrrefChr5 10494 59 + 294542 CTCCATTTGTAGGTGCCACCACTTACAGTAGCAACTTGTGCAACTGTAGGTGGTAGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147330 57 + 636262 CTCCATTTGTAGGTGCCACCACTTACAGTAGC--CTTGTGCAACTGTAGGTGGTAGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 144831 59 + 647215 CTCCATTTGTAGGTGCCATCACTTACCGTAGCAACTTATGCAAATGTAGGTGGTAGGTT - -a -s mr.mrrefChr5 10553 262 + 294542 ACTTAAGCAATTAGCTTGGAATGTGGAGGCATTATTGGTTATCATGAGTGATGCATGACACAAGACTGTTAACAGTAGCAACTTGACTGCAATTATAGATTGCCCTACGTGGTACAAGCCCTTCACAGACAAGCCCCTATGACTCTGATGAAACAAAAATAAGAATAATTATATCAGTGTATGAGAAGTACCTGCATGAGTTATCCCATTGTATACCCACTGAACTGTTATACCTCCTGGTTCTCTGGTCTTAGTGACTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147387 262 + 636262 ACTTAAGCAATTGGCTTGGAATGTGGAGGGATTATTGGTTATCATGAGTGATGCATGACACAAGACTGTTAACAGTAGCAACTTGACTGCAATTATAGATTGCCCTACGTGGTACAAGCCCTTCACAGACAAGCCCCTATGACTCTGAAGAAACAAAAATAAGAATAATTATATCAGTGTATGAAAAGTAACTGCATGAGTTATCCCATTGTATACCTGCTGAGCTGTTATACCTCCTGGTTCTCTGGTCTTAGTGACTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 144891 245 + 647215 ACTTAAGCAATTAGCTCGGAATGTAGAGGCATTATTGGTTATCATGAGTGATGCATGATACAAGACTGATAATAGTGGCAACGTGATTGCAATTATAGATTGCCCTATGTGATATAAGCCCTTCACGGACAACCTCCTATGGCTCTGATGAAAAAACAATAAGAATCATTACATCACTGTATGAGAAGTACCTGCAGGAGTTATCCCATTGTATACGCACTGAACTGTTGAACCTCCTGGTTCTC----------------- - -a -s mr.mrrefChr5 10815 3 + 294542 CAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147650 3 + 636262 CAT - -a -s mr.mrrefChr5 10818 4 + 294542 ATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147654 4 + 636262 ATCC - -a -s mr.mrrefChr5 10822 23 + 294542 GAAATGCCTATCAACAGGTGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147663 23 + 636262 GAAATGCCTATCAACAGGTGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 145136 23 + 647215 AAAATGCCTACCAACAGTTGAGC - -a -s mr.mrrefChr5 10845 15 + 294542 ACATGGTACACAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147686 15 + 636262 ACATGGTACAGAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 145161 15 + 647215 ACATGGTACACAATA - -a -s mr.mrrefChr5 10860 147 + 294542 GCTTTAATGATATGGTTCTGCATTGAGTGCATCTAAGGGTCTGCTTGATACGGGCTAAGGTGGTATAACATTAGTCAAAGTATGAGCCCAAAAGCCCAAACTTGTGAAGCGATCTATACTCTGTAGATGATTCATAAGGTACACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147701 147 + 636262 GCTTTAATGATATGGTTCTGCATTGAGTGCATCTAAGGGTCTGCTTGATACGGGCTAAGGTGGTATAACATTAGTTAAAGTATGAGCCCAAAAGCCCAAACTTGTGAAGCGATCTATACTCTGTAGATGATTCATAAGGTACACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 145177 121 + 647215 GCTTTAACTATATGGTTTTGCATTGTGCGCATCTAAGGGTCTGCTTGGCACAGGCTAAGGTGGTATAACATTCGTCAAAGTAT--------------------------TGACCTATACTATGTAGAATATTCATAAGGTACACAAC - -a -s mr.mrrefChr5 11007 78 + 294542 TGGCTGAGTACCCTTTGGAGGACCCATAAAGTATACAACAAATAGCTGCGTCCTTTTCTTAGTGGCATTGCTGTGCGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147848 78 + 636262 TGGCTGAGTACCCTTTGGAGGACCCATAATGTATACAACAAATAGCTGCGTCCTTTTCTTAGTGGCATTGCTGTGCGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 145301 77 + 647215 TGGCTGAGCACCCCTTGGGGGACCTATAAAGAATACAACAAATGGCTGTGTCCCTTCCT-AGTGGCATTGCTGTGCTC - -a -s mr.mrrefChr5 11085 61 + 294542 TAGTGTACACTAGTAGGGTGCCAGCTCCTCCTAGGTAGCTGCTATCTGGGAAAGCTGGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147927 61 + 636262 TAGTGTACACTAGCAAGGTGCCAGCTCATTCCAGGTAGCTGCTATCTGGGAAAGCTGGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 145378 61 + 647215 TAGTGTATGCTAGTAGGGTGCCAGCTCCTCCTAGGTAGCTGCTACCTGGCAAAGCTGATTA - -a -s mr.mrrefChr5 11146 308 + 294542 TGGGTAGGTACCAGGTGACTGTAAAACATTACGAAATGTATGTAGAGACAGGGCCTGCTTTTGTTTGCTCTAGAGCCTAGGGCTGTTAATGCAGTCCCTGGTTGAGACCTCTCACAGAGCAAATGATGTTCTTTTCATATATACCTACAATTAACATTAGTTTTGCCCTACACTACTTGCAGAATATGGTGGGCTTCTAAGAAATTCCGCACCACAATGCTTTATATCAACGAAGGGATCTGGTGTTCAAGCAGAGTGAGAATCCCCAAGGTAGACAAATCCTTGTTACAACATCTTTACCTTATAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147991 294 + 636262 TGGTTAGGTACCAGGTGACTGTAAAACATTACGAAATGTATGTAGAGACAGGGCCTGCTTTTGTTCACTCTATAGCCTAGGGCTGTTAGTGCAGTCCCTGGTCGAGACCTCCCACAGAGCAAATGATGTTCTTATCATATACACCTACAACTAACATTAGTTCTGCCCTACACTACTTGCAAAATATGGTGGGCTTCTAAGAAATTCCACACCACAATGCTTTATATCAACGATGGGATCTGGTGTTCAAGCAGAGTGAGAATCCCCAAGGTAG--------------CAACATCTTTACCTTATAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 145439 299 + 647215 TGGGTAGGTACCAGGTGACTGTGAAACATTACGAAATGTT--------CAGGGCCTGCTTTTGTTTGCTCTAGAGCCTAGGGCTGTGAATGCAGTCCATGGTTGGGACCTCTCACAGAGGAAATGATGTTCTATTCATATTT-CCTACAATTAACACTAGCTTTGGCCTACACTACTTGCAGTATATGGTGGGCTTCTTAGGAATTCCGCACCACAACACTTTATATCAACGAAGGAATCCGGTGTTCAAGCAGAAAGAGAATCCCTGAGGTAGACAAATCCTTGTTACAACATCTTTACCTTATAAG - -a -s mr.mrrefChr5 11454 129 + 294542 TAGGGGGCATGTGGACCAATTCTACTGGGTATAAGTATTGGGTTTCTTGCATAATAGGCTATTCACACCAGTTAACTGTTTTTGTGTTGATCAATTTCTAATAGCTCATTACCGTTAAACTGTAAAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148285 125 + 636262 TAGGGGGCATGTGGACCAATTCTTCTGGGTATAAGTATTGGGTTTCTTGCATA----GCTATTTACACCAGTTAACTGTTTTTGTGTTGATCAATTTCTGATAGCTCATCACCGTTAAACTGTAAAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 145741 129 + 647215 TAGCAGGCCTCTGGATCAATTCTATTGGGAATGAGTATATGGTTTCTTGCATAATAGGCTATTCACACCAGTCAACTGTTTTTGTGTGTATCAATTTCTAATAGCTCGTTACTGTTAAACTGTAAAAAC - -a -s mr.mrrefChr5 11583 85 + 294542 TGCAAACCATAAGCATAGGGAGCTAGAGTTTCTGCATGTATAAGTTTAACATGCTGAGATCATGTGGTGATGCATCATGGTTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148411 81 + 636262 TGCAAACCATAAGCATAGGGAGCTAGAGTTTCTGCATGTAGAAGTTTAACATGCTGAGATCATGTGGTGATG----ATGGTTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 145870 85 + 647215 TGCAAAGCATAAACATAGGGAGCCAGAGTTCCTGCATGTATAAGCTTAACATGCTGAGATCACATGGTGTTGCATCAAGGTCGTA - -a -s mr.mrrefChr5 11668 81 + 294542 TCCTGTGGGAAAAGTTGTAAGCTTGGTGGGCATTTCTTTGACATGCAATTTTTCATACCTAAAGGACAAGATTTATCACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148492 60 + 636262 TCCTGTGGGAAAGGTTGTAAGCTTGGTGGG---------------------TTCATACCTAAGGGACAAGATTTATCACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 145956 81 + 647215 TCCTGTGGGAAAAGTTGTAAGCTTGGTGGGCATTTCTTTGACATGCAATTTTTCATACCTAAAGGACAAGATTTGTCATGA - -a -s mr.mrrefChr5 11749 168 + 294542 GCACACTCAATTTTACTAAGTTATACAGTCCATTAACTCAAGAAGGATTGCATTAACTTGGGCCCAAGATTTACGGAGGATAGCAATTGTGGTACAGAGCCTAGTGGGCATAATTAGTCATAAATTTGGAAGCCTAGTAAACACAAGGGAAACACAGAACATGACAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148552 168 + 636262 GTACACTCAATTTTACTAAGTTATACAGTCCATTAGCTCAAGAAGGATTGCATTAACTTGGGCCCAAGATTTACGGAGGATAACAATTGTGGTACAGAGCCTAGTGGGCATAATTAGTCATAAATTTGGAAGCCTAATAAACACAAGGGAAACACAGAACATGACAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 146040 165 + 647215 GCATACTCAATTCTACTAAGTTATACAGTGTATGAACTTAAGAATAATTGGATTAATTTGGGCCCAAGATTGAGGGAGGATAGCAATTTTGGTACAGAGCCTAG--GGCATAATTAGTCATGA-TTTGGAAGCCTAGTAAACACAAGGGAAACATGGAACACGACAAT - -a -s mr.mrrefChr5 11917 87 + 294542 CATAACTATGAAACCATGGGCTAGTTACAAGGGCAATTGTCAGAAACCCTGGAGTCCTATAATCACACTTGTATATGTACACAATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148737 87 + 636262 CATAACTATGAAACCATGGGCTAGTTACAAGGGCAATTGTCAGAAACCCTGGAGTCCTATAATCAGACTTGTATATGTACACAATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 146205 86 + 647215 CATAACTATGAAACCATGGGCTAGTCATAAGG-CCATTGTCAGAAACCCTGGAGTCCTATAATCACACTTGTACATGTATACAATCC - -a -s mr.mrrefChr5 12004 271 + 294542 TAAATAGAGACCGTGGCAGCCATAGGACCTCAACTTTGCTATCCCTGAGACATAGGAATACGTTGGCCCTATCTTCCAACCTAGGCTTGATGAATTACTCATTATAGAGCCTTTCATACGCATAATTATTTCCATACAATTTGACACAGTCAAATTTCTTGACTATTTGACTTCATGGGCAAAAAGGAGATGTAGATTACTCTCAGCAATTACCTGGGCAAAGAGGCACTGGACCTTGCTGGCATGGATAAAAACTGTCAGACAATTAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148825 233 + 636262 TAAACAGAAACCGTGGCAGCCATAGGACCTCAACTTTGCTGTCCGTGAGACATAGGAATGCGTTGGCCCTATCTTCCAACC----------------------------------ATACGAATAATTATTTCCATACAATTTGAGACAGTCAAATTTCTTGACTATTTGACTTCATGGGGAAAAAGG----GTAGATTACTCTAAGCAATTACCTGGGCAAAGAGGCACTGGACCTTGCTGGCCTGGATAAAAACTGTCAAACAAATAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 146291 268 + 647215 TAAATAGAGACCATGTCAGCCATGTGCCCTCAACTCTGCTATCCCCAAGACATAGGAATACATTGGGCCTATCTTCCAACCTAGGCTTGATGAATTACTCATTATAGAGCCTTTCATACACATAATTATTTCCATGCAATTTGACACAGTCAAATTTGTTGACTATTTGACTTTATGTGCAAAAAGGAGATGTAGATTACCCTCAGCAATTACCGGGGTAAAGACGCACTAGACCTTGCTGGCAC---TAAAGACTGTTAGACAATTAACT - -a -s mr.mrrefChr5 12275 122 + 294542 GGCCAGAGCTGATGTGTGGTAATTTTTATTGCACGGATGAATCATTCTCCACTCGGTTTAGCTGGGGCAAATTCTTTGATATACCCAATAAGCATTTTTGTCATATTTACTATCCTCTTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149059 122 + 636262 GGCTAAAGCTGATGCGTGGTAATTTTTATTGCATGAATGAATCATTCTCCACTCGGTTTAGCTGGAGCAAACTCTTTAATACACCCAATAAGCATTTTTGTCATGTTTACTATCTTCTTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 146559 122 + 647215 GGCCAGAGCTGATGTGTGTCAATTTTTATTGCACGGATGAACCATTCTCCACCCAGTTTAGCCTAGGCAAATTCTTTGATATGCCCAATAAGCATTTTTGTCATACTTACTATCCTCTTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 12397 90 + 294542 ATGACATTGTAGAAATGTGACAACTGGGGACTGGGGGCCTGCTGAGGGCCAATACACTGACAGCTGCTGGATACACCATATTGAATCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149181 90 + 636262 ATGACATTGTAGAAATGTGACAACTGGGGACTGGGGGCTCGTTGAGGGCCAATGCACTGACAGTTGCTGGAGACACCATATTGAATCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 146684 90 + 647215 ATGACAATGTAGAAATGTGAGAGCTGGGGCCTGGGGGCCTGCTGAGGGGCAATACACTGACAGCTACTGGATACACCATATCAAATCACA - -a -s mr.mrrefChr5 12487 140 + 294542 CAGTACTATTACTATTCTTCTCAGATTAGTGAGCAGAATGTTACTACAGCCAAGGGTCTCCATCATAATTCTATATGGTTCAATCCTTGTAAAATGCATGCCCCATCTGAATTTAAACAAATACATGCTTTAGTATGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149272 135 + 636262 CAGTACCTTTACTATTCTTCTCAGATTATTGAGCAGAATGTTACTACAGCCAAGGGTCTCCATCATAATT-TATATGGTTCAAGCCTTGTAAAATGCAG----CATCTGAATTTAAACAAACACATACTTTAGTATGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 146774 139 + 647215 CAGTACTATTACTATTCT-CTCAGATTAGGGAGCAGAGTGTGGCTACAGGCAAGGGTGTCCATCATAATTCTATATGGTTCAGTCCTTGTAAAATGCGTGCCCCATCTGGATTTAAACAAATACACGATATAGTATGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 12627 20 + 294542 TATGCCTGGGTCAAAATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149407 20 + 636262 TATGCCTGGGTCAAAATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 146994 20 + 647215 TATGCCTGGGTCAAAATTCA - -a -s mr.mrrefChr5 12647 277 + 294542 AGTTACATCTCAGATAGAGGGGGCATCTAATTTGACTTGTGTATGATGCCATAGAAAGATGTCTTATGGATAGTGCAATCTTATGAACACCACCTGGAGACATCCCAGTTTTCCCTGACTTGAAGCACCTCAGATAATGCCCCTGAGAAAAGACTGGCTAACACTAACACATGAGACCTGAATGTTGCTCTCTGTGTCATGGTTCAGCATGTTCTATTATCCAAGTGGTGTCAGTTAGGGAGTTTGGGTTGTAAGCGGGTTTGATGGCAAGGGACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149434 271 + 636262 AGTTATTTCTCAGATAGAGGGGGCATCTAACTTGACTTGTGTATGATGTCATAGAAAGATGTCTTATGGATAGTGCAGTCTCATGGACACCACCTAGAGACATCCCAGTTTTCCCTGACTTGAAGCACCTCAGATAATGCCCCTGAGAAAAGACTGGTTAAC------ACATGAGACCTGAATGTTGCTCTCTGTGATATGGTTCAGCATGCTCTAATATCCAAGTGGTGTCAGTTAGGGAGTTTGGGTTGTAAGCGGGTTTGATGGCAAGGGACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 147014 277 + 647215 ATTCCCATCCCAAAAATAGGGGGCATCTAATTTGACTTGTGTATGTTGCTATAGAAAGATGTCTTATAGAAAGTGCAATCTTATGAACACCGCCTGCAGACATCCCAATTTTCCCTGGCTTGAAGTACCTCAGATAATGCCCCTGGGAAAAGTCTGGCTAACACTAACACATGAGGCCTGAGTTTTGCTTGCTGTGTCATGGGCTAGCATATGCTATCATCCGAGTGTTGTCAGTTAGGGAGTGTGGGTTGTGAGCGGGTTTGATGACAAGGGATAG - -a -s mr.mrrefChr5 12924 120 + 294542 AATCCTGGGCTTGATAGCAAGGGACAGGCTCCCATATGCACATCATGTTATTAAAATCTATCCCTCGGAGCTCAATTCATTACTGAGGCAATAAATCATCCCTCCTGTGTGTAGAAGACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149705 120 + 636262 AATCCTTGGCTTTATAGCAAGGGACAGGCTCCCATATGCACATCATGTTATTAAAATCTATCCCTCGGAGCTCAATTCATTACTGAGGCAATAAATCATCCCTCCTGTGTGTAGAAGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 147297 120 + 647215 TATCCTGGGCTTGATGGCATGGGACAGACTCCCATATATGCAACATGTTACTTAACTCTATCCCTTGGAGCTCAATTCATTACTGAGGCATTAAATCATATCTTCTGAGTGTACATGATC - -a -s mr.mrrefChr5 13044 82 + 294542 TGCCACAGTTCACAAATGCTCAAAATTCAATGGGCAGCATGTACTTAGTCATGGTTAAAGTGATTTCATGCTATACCTTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149825 60 + 636262 TGCCACAGTTCACAAATGCTCAAAATTCAATGGG----------------------AAAGTGATTTCATGCTATACCTTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 147423 82 + 647215 TTCCACAGCTTACAAATGCTGAAAATTCCATGGGCAGCATGTACTTAGTCATGGTTAAAGTGATTTCATGCTCTACGCTCGG - -a -s mr.mrrefChr5 13126 34 + 294542 CATGACTGGAACTGGGATGAGAAATGCTATGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149886 34 + 636262 CATGACTGGGAATGGGATAAGAAAAGCTATGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 147505 34 + 647215 CATGACTGGAACTGTGATGAGAAATGATGTTATG - -a -s mr.mrrefChr5 13160 80 + 294542 AGTTGGGTTGGCATGTCAGACCCCAACAGTTATGTTGACTAGACTGGGTATGGGCTTAAGAGGGGCAGCATTAGCCACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150043 80 + 636262 AATTGGGTTGGCATGTCAGACCTCGATAGTTATGTTGACTAGACTGGGTATGGGCTTAAGAGGGGCAGCATTAGCCACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 147539 72 + 647215 AG--------GCGTGTCAGACACCAACAGTTATGTTGACTAGAATGGGTATGGGCCTAAGAGGGCCAGCATTGGGGGCAT - -a -s mr.mrrefChr5 13240 3 + 294542 GAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150123 3 + 636262 GAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 147642 3 + 647215 AAT - -a -s mr.mrrefChr5 13243 21 + 294542 GTCCCCAAATTATTTAGACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150168 21 + 636262 GTCCCTAAATTATTTAGATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 147645 21 + 647215 GTCTCCAAATTATTTAGACAT - -a -s mr.mrrefChr5 13264 489 + 294542 AACATAAATTCAGTAGATAATTGAGATCTCAAGTCGGAGTTCATAAGGTCAGCCCTTATAGACACCTGACATATTGTGTTTTAGTAGCCACATGCCACATCATTGTGAACCTGTTTTCAAACCCAAGCTATGGATATTTTAGATGCGCCATGCCTGCTAGTCCATTAGCTGCATTGTGTTTGCAGGGACCAACAAGAATGCTACTCATTATAGACATATGGTTTGAGACCCCTGTAAATCTAGTAGAGTGATAAGTAGTAGGCTTCCCTTTTCTAATGTGATTGCTTCTCTACTGTCAGCTCTCTAACTCGATTGCTTCTCTACTGTCAACTCTATCATCTATTGACCAGATGGAGGAAATATCATTTACCATTCCTGAACAGGTTAGTCATCCAGTTGGGGAAGTCACAAATTGGGTTATTATCATATGATGATATAAGCATACAACTCATTAGTCAACTTTGCATTATTGTTCCAAATCACACATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150189 478 + 636262 AACATAAATTCAGTAGATAATTGAGATCTCAGGTCGGAGTTCATAAGGTCAGCCATTATAGACACCTGACATACTGTGTTTTAGCAGTCACATGCCACATCATTGTGAACCTGTTTTCAAGTCCAAGCTATGGATATTTCAGATGCGCCATGCCTGCTAATCCATTAGCTGCATTGTGTTTACAGGGACATACAAGAATGCTACTCATTATAGACATAGGGTTTGAGACCCCTGTAAATCTAATAGAGTGAAAAGTAGTAGGCTTCTCTTTTCTAATGTGATTGCTTCTCTACTGTCAGCTCTCTAACTCGATTGCTTCTCTACTGTCAACCCTATCATCTATTGACCAGACGGAGGAAATATCATTTGCCATTCCTGAACAGGTTAGTCATCCAGTTGGGAAAGTTACAAA-----------TCATCTGATGATATAAGCACACAACTCATTAGTCAACCTTGTATTATTATTCCGAATCACCCATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 147772 489 + 647215 AGCATAAATCCAATATATAATTGAGATCTTAAGTAGGAGTTCATAAGGTCAGCCCTTATAGATACTTGACACATTGTGTTTTAGTAGCCTCATGCCACATCATTGTGAACCTGTCTCCATACCCAAGCTGTGGATATTTTAGATTCACCATGCCTGCTAGTCCATGAGCGGCATTGTCTTTGCAGGGACCAAAAAGAAAGCTACTCACTATAGACATATGGTTTAAGACCCCCGTAAATCTAGTAGAGTAATAAGTAGTAGGCTTCCCCTTTCTAACGTAATTGCTTCTCTACTGTCTACTCTCTAACTTGATTGCTTCTCTACTGTCAACTCTATCATCTATTGACCAGATGGAAAAAATATCATTTACCATTCCTGAACAGATTAGTGATCCAGTTGGGGAAGTCACGAGTTGGGTTATTATCATATGAGAATATAAACATACAACTCACTAGTGAACTTTGCATTATTGTTTCAAATTACACATGC - -a -s mr.mrrefChr5 13753 139 + 294542 ACTGGCTCTTCTCTAGTGATGATTGAGATCAGGGGTTCAAGCTTCTGTGGTTGTCCTGAAGTATACTTGGCAACCACACAGATGAGGAGTGGAATGGTATTCTAGTGGTATTCTTGTGCTGATTCTATAAAGGCCATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150667 138 + 636262 ACTGGTTCTTCTCTAGTGATGATTAAGATCAGGGGTTCAAGCTTCTGT-GTTGTCCTGACGTATACTTGGCAACCACACAGATGAGGAGTGGTATGGTATTCTAGTGGTATTCTTGTGCTGATTCTATAAAGGCCATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 148262 139 + 647215 ACTGGCTCTTCTCTAGTGATGACTGAGATCAGGGGTTCCAGCTTCTGTGGTTGTCCTGAAGTATACTTGGCAACCACACAGACGAGGAGTGGAATGGTTTTCTTGTGGTATTCTTGTGCTGATTCTATAAAGGCCGTCC - -a -s mr.mrrefChr5 13892 37 + 294542 TATTCTTGTATTTAATTGTAAGCATTCATGTTAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150805 30 + 636262 TATTCTTGTATTTAATTGTAA-CACTCATGT------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 148402 37 + 647215 TATTCATATATTTAATTTAAAGATTTCACATTAGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 13929 140 + 294542 TGCAACTGAGTGAACTGAATAATGTGGATTATGAACACAGATTAATTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAAGCAAGACAATTGAGGTGAGGACTAGTTGGTCACTGTTAGAAGGTAATAATCTATGAATACATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150835 139 + 636262 TGCAACTGAGTGAACTGAAAAATGTGGATTATGAACACAGATTAATTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAAGCAAGACAATTATGGTGAGGACTAGTTGGTCACTGTTAGAAGGT-ATAATCTGTGAATACATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 148440 140 + 647215 TGCAACTGAGCGAACTGAATAATGTGGTTTGTGAACACAGATTAACTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAATCAAGACAATTGAGCTGAAGGCTAGTTGGTCACTGTTAGTAGGTAATAATCTATGAAGACACAC - -a -s mr.mrrefChr5 14069 183 + 294542 AATCTTGTAACTCATTGTTCAAAGCTAATTTGTATTAGTAGGCTTTGTACTCATAACTGCCAGCATTTATGGTAACTAGCCCTTGAATATCTGTCCAATTATGAACTGGGATAGGAATTATAAAAACTATGTAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCCATATATATAGAGACATTTTAATATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150974 179 + 636262 AATCTT-TCACTCATTGTTCAAAGCTAATTACTATTGGTAGGCTTTG---TCATAACTGCCAGCATTTATGGTACCTAGCCCTTGGAGATCTGTCCAATTATGAACTGGGGTAGGAGATATAAGAACTATGTAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCCATATATACAAAGACATTTTAATATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 148581 179 + 647215 AATCTTGTAACTCATTGTGCAAAACTAATTTGTATTAGTATGCTATGTACTTATAACTGCCAGCCCTTATGGTAACTAGCCCTTGAATATC-GTCCAATTATGAACTGGAATAGGAATTATAAAAACTACGCAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCTGTATATATAGAGAC---CTAATCTATG - -a -s mr.mrrefChr5 14252 149 + 294542 TAAGTTGTTGTCCAGCCTCTATTCCCCATGTTCACATGGCATACACTATCAGTTTTACCAGATTTTAGTATTCTAAACCCTCTATATGGGATCTACCTGTGAGTGTAATTTACTAGTGGGCTGAATATTGGATGGGAACTGCCCATAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151153 149 + 636262 TAAGCTGTTATCCAGCCTCTATTCCCCGTATTCCAATGGCATACACTATCAGTTTTACCAGATCTTAGTATTCTAAACCCCCTATATGGGGTCTACCTGTGAGTGTAATTTATTAGTGGGCTGAATATTGGATGAGAACTGCCCATAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 148764 149 + 647215 TGAGTTGTCGTCCAGCCTCCATTCCCCATGTTCACATGTCATGCTCTATGAGTTTTACCAGATTTCAATATTCTAAGCCCTCCATATGGGATCTACCTGTGAGTGTAATTTACTAGTGGGCTGAATATTGGATGGGAACTGCCTATAGA - -a -s mr.mrrefChr5 14401 7 + 294542 GGACTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151302 7 + 636262 GGACTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 148914 7 + 647215 GGATTGA - -a -s mr.mrrefChr5 14408 7 + 294542 CTGGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151309 7 + 636262 CTGGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 148959 7 + 647215 CTGAGCA - -a -s mr.mrrefChr5 14415 39 + 294542 CTAACCAATTCCTAATCCATAGATCATTTGTTGAGACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151316 39 + 636262 CTAACCAATTCCTAATCCATAGATCATTTGTTGAGACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 149027 38 + 647215 CTAACCAATTCCTAAT-CATAGATCATTTGTTGAGACAT - -a -s mr.mrrefChr5 14454 42 + 294542 ACACTTGGGCCTACCATTTGGGCCAGATAGGATTAAGTGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151356 42 + 636262 ACACTTGGGCCTACCATTTGGGCCAGATAAGATTTAGTGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 149065 42 + 647215 ACAGTTGGGCCTGCCATTTGGGCCAGATAGGATTAAGTGGCC - -a -s mr.mrrefChr5 14496 7 + 294542 ATAAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151399 7 + 636262 ATAGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 149107 7 + 647215 ATAAATA - -a -s mr.mrrefChr5 14503 40 + 294542 GGAATACCATTGAGGTAGGATTTTGTGTTGTAGATCAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151406 14 + 636262 --------------------------GTTGCAGATCAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 149119 40 + 647215 GGAATACCATTGAGGTAGGATTTTGTGTTGTTAACCAAGC - -a -s mr.mrrefChr5 14543 19 + 294542 AGTAAAAATGAAGTGTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151420 19 + 636262 GGTAAAAATGAAGTGTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 149165 19 + 647215 AGTGACAGTGCAGTGATTT - -a -s mr.mrrefChr5 14562 102 + 294542 GACCAGTAAATTAAGTTGCTGTCTCTTAGATAACATGTGTCCAAGATGTGTAACTTGCTAAGTTTCGTTAAAATAACTTAAATTTAAGGAAGTACCTGTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151439 102 + 636262 GACCAGTAAATTAAGTCGCTGTCTCTTAGATAACATGTGTCCAAGATCTATAACTTGCTAAGTTTCGTTAAAATAACTCAAATTTAAGGAAGTACCTATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 149242 102 + 647215 GACCAGTAAATTAAGTTGCTGTCTCTTAGGTAACATGAGTCCAAAAGGTGTAACTGGCTAGGTCTCGTTAAAATTCCTTAAATTTAAGGAAGCACCTGTCCT - -a -s mr.mrrefChr5 14664 339 + 294542 AACTCAAGTTATCATTAGCCATATGTTACCCAAATCCATGCAACTTAAGAACCTGAAATGGTTATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGATGAGGGCAGGCTCCTTGGATAAGTCCCAACACCATGGCGTGGGGGCTCACTGGACTGAGTCTAACTCTCACAGTTGGGAGTATCAATTTCTGATATGGAGCCCTTTTTAGCACAATAAGGTTACCTTACTACAGTCATTAGCAATATACCATAGGGCTCATGGCACGCTACTACAGTAAGCATGTAAGTGAACAACTGCAAGGATGTAAGAGATCATGATATGTGGGCTACCTGAGATAGAATTAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151541 335 + 636262 AACTAAAGTTATCATTAGCCATATGTTACCCAAATCTGTGCAACTTAAGAACCTGGAATGGTTATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGATGAGGGTAGGCTCCTTGGATAAGTCCCATTACCATGGCGTGGGGGCACACTGGACTGAGTCTAACTCTCACAGTTGGGAGTATCAATTTGTGA----GAGTCCTTTTTAGCACAATAAGGTTACCTTACTACACTCATTAGCAACATACCATAGGGCTCATGGCACGCTACCACAGTAGGCATGTAAATGAACAACTGCAAGGATGTAAGAGATCGTGATATGTGGGCTACCTGAGATAGAATTAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 149345 339 + 647215 AACTCAAGTTATGATTAACAATATGTTGCCCAAAGCCATGCACCTGAAGAGCCTTAAATAGTAATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGGTAAAGGCAGGCTCCTTGGATCTGTCACAACATCATGGTGTGGGGTCTCACTGGACTGAGTCTACCTATGCCAGTTGGAAGTGTCAAATTCTGATATGAAGCCCTTTTTAGCGCAATAAGGTTTACTTACTACAGACATTAGCAATATAGCATAGGGATCATGGCACACTGCTACAGGAAGTATGTAAGTAGACAATTGCAAGGATGTAAGAGATCATGATATGTGGGTTACCTGACATAAAATCAATTT - -a -s mr.mrrefChr5 15003 678 + 294542 AATCCTAAGCCTACCAAAAATCCATTCTTCCCAGCTAACAAGTCAGGTATGACTACTGATACTGGGTGGTGTGGAGTGAATGCCACTAGAAACAATTGGTCTTGTTGGCAAAGTGGGGAACAAGCTTAATAGAAGGCAGTTTTATTCTGGTGTGTGCATCATTTACTTTGACTAATATAGGGAAAGGAATGACAAGTTGCACTGGGTTAAAGAAGTTGCACTGGGTCATGAAACAACGAATACTAGATAGTCCTTCAATACTAAATGTACAGGTTCAATCAGTAACCCCACCTAGGTTACCAGTCAGCAGTGCTGGTAAAAGATCCCTAGTTAGAGTTGATATAGGCTGGGTTCCACTGGGCTCCATGTCACTCTTTGAGTGCGAGTTAACACTTAATGACACTATCACTACTTCACATTGGACACCATATTGACTTGCCAATTCTTTAAATCTTGCAGCGTATAACTGGGTTTCCAGGCAGAATTCGTTAGGCTAAATCCAATAATGACAACTCTTTCCATACCATGATGTCTGATTGGGAAGAATAGGAACAAGAAAGAATCTTTAGACAATAGGATTTTAAACACAAAAATAGTTAATTATGTGTTCCATGGAAGTAAAGTAATTGTTGCATGTCCAAGAGTGGCCTTGGTTTTACACTTGAGGGGGTAAAGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151881 673 + 636262 AATCCTAAGCCTACCAAAAATCCATTCTTCCCAGTTAACAAATCAGGTATGACCACTGATACTGGGTGGTGTGGAGTGAATGTCACTAGAAACAATTGGTCTTGTTAGCAAAGTGGGG--CAAGCTTAATAGGAGGCAGTTTTATTCTGGTGTGTGCATCATTTAATTTGACTAATATAGGGAAAGGTATGACAAGTTGCACTTGGTTAAAGAAGTTGCACCAGGTCATGAAATGACGAATACTAGATAGTCCTTC---ACTAAATGTACAGGTTCAATCAGTAACCCCATCTAGGTTACCAGTCAGCAGTGCTGGTAAAAGGTCCCTAATTGGAGTTGATATAGGCTGGGTTCCACTGGGCTCCATGTCACTCTTTGAGTACGAGTTAACACTTAATGACACTATCACTACTTCACATTGGACACCATATCGACTAGCTAGCTCTTTAAATCTTGCAGCGTATAACTGGGTTTCGAGGCAGAATTCGTTAGGCTAAATCCAATACTGACAACCCTTTCCATTTCATGATGTCTGATTGGGAAGAATAGGAACAAGAAAGAATCTTTAGACAATAGGATTTTAAACGCAAAAATAGTTAATTATGTGTTCTATGGAAGTAAAGTAATTGTTGCATGTCCAAGAGTGGCCTCGGTTTTACACTTGAGGGGATAAAGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 149684 676 + 647215 AATCCTAAGCCTACCAAAGATTGATTCCTCTCAGCTAACAAGTCAGGTATAAGTACTGATAGCGGGTGGTGTGGAGTGCATGCCACTAAAAACAGTTGGTCTTGTTGGCAAAGTGGGGAAGAAGCTGAATAGAAGGCAGTTCTATTCTGGTGT-TGCATCAGTTGCTCTGACTAATATAGGGAAAGGAATGACAAGTTGCACTGGGTTAAAGAAGTTGCACTGGGTCATGAAACAACGAATACTAGATTGTCCTTCAATACTAAATGTACAGGTTCACTAAGTAGCCCCACCCAGGTTACCACTCAGAATTGCTGATAAAAGATCCCTAGTTACAATTGAAATAGGCTGGGTTCCACTGGGCTTCATGTCACTCTTTGAGTGGGAGTTAAGACTTAATGACACTATCACTACTTCACATTGAACACCATATTGACTTGCCAATCCTTTAAATCATGCAGCGTATAACTGGGTCTCCAGGCAAAATTCCTTAGGCTAAATCCAATAATGGCGATTCTTTCCATACCATCATGTCAGATTGGGAAGTAGAGGAACAAAAAAGAAACTTTAGACAATA-GATTTTAAACACAAAAATATTTAGTTATGTGTTCCATGGAAGAAAGGTGATTGTTTCATGTCCAAGAGTGGTCTTGGTTTTACACTTGAGGGGGTAAAGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 15681 116 + 294542 GGAGAATTAGCTCCTAATCACCTTGAGCCAGTGTGACACTCAAGACATAGTCAAAATGAAATCAATCACTGAGATTGCACCTATTAGAGGACACAACAACAAGCTATTCAGCCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152558 110 + 636262 GGAGAATTAGCTCCTAATCACCTTGAGTCAGTGTGACACTCAAGACTTAGTCAAAATGAAATCAATCACCGAGATTGCACCTATTAGAGGACATAACAATAAGCTATTCA------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 150360 111 + 647215 ----AACTAGCTTTTAATCACCTTGGGCAAATGTGACACCCAAGATATAGGCACATTGAAATCAATCACTGAGATTGCAC-TATTAGAGGGCACAATAACAAGCTATTTAGCCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 15797 177 + 294542 CCAATATTACTTGAATACAATGATTATGTCATAAGATGTCACTCATGTCTGATAACATGACTATGATTATGCTCTTACTGTTGCGTGCCCGAAGGGTATATAGAATCTCAAAAAGCTTGTTCACTTTAACCTAAAGTTTTAACGTTGTTCATTGTCTTTGTATCTATCAATGAAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152668 171 + 636262 CCAATATTACTTGAATACAATGATTATGTCATAGGATGTCACTCGCGTCTGATAACATGACTACGATTATGCCCTTACTGTTGCGTGCCCGAA------AAAGAATCTCAAAAAGCTCGTTCACTTTAACCTAAAGTTTTAACATTGTTCATTGTCTTTGTATCTATCAATTAAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 150473 176 + 647215 CCAATCTTACTTGTATACAATGATTATGTGATAAGATGTCACTTATGTCTGATAACATGGCTATGATTATACTCT-ACTGTTGCATGCCCTGAGGGTATATAGAATTTAAAAAAGCTTGTTCACTTTAACCTAAAGTTATGACGTTGTTCATTGTCTTTGTATCTATCAATGAATTG - -a -s mr.mrrefChr5 15974 57 + 294542 TTTCCTCCTAGAGATTGCTCTCTTCTGGTGGCTTCTTTGAGGACTCATGCTTCTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152839 46 + 636262 TTTCCTCCTAGAGATTGCTCCCTTCT------TTCTT-----ACTCATGCTTCTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 150685 57 + 647215 TTTTCTCCTAGAGATTGCTCTCTTCTGGTGGCTTCTTTGAGGACTCATGCTTCTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 16031 86 + 294542 GGACCAGTTATTGGATCATATTGATATGATAGGATGTGGAGCGTATTCAAGTCTCTTCCAGCCTTGTCTCGGCACCCTATATAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152886 86 + 636262 GGACCAGTTATTGGATCATATTGATATGATAGGATGTGGAGCGTATTCAAGTCTCTTCCAGCCTTGTCTCGGCACCCTATATAGCC - -a -s mr.mrrefChr5 16117 28 + 294542 CTGCAAGATAATATCTTACTCTGCAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152978 28 + 636262 CTGCAAGATAATATCTTACTCTGCAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 150742 17 + 647215 -----------TATCTTTCTCTGTGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 16145 91 + 294542 GGTGTCTATCTTGGTGTTTAATCCATAATAGGGGAAGCAGGCATGTTAGCATCCCTGGTTTTAATAAGGAAAATGAGACTCAGGCTATTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153006 91 + 636262 GGTGTCTATCTTGGTGTTTAATCCATAATAGGGGAAGCAGGCATGTTAGCATCCCTGGTTTTAATAAGGAAAATGAGACTCAGGCTATTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 150761 91 + 647215 GGTGTGTATCTTGGTGTTTACATCATGGTAGGGGCAACAGGCGAGTTAGCATCCCTGGTTATAAGAAAGAAAGAGATACTCAGACAGTTAC - -a -s mr.mrrefChr5 16236 34 + 294542 AAGTACAAGCTCCAAGTAAGTGGAACCATAGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153097 34 + 636262 AAGTACAAGCTCCAAGTAAGTGGAACCATAGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 150853 34 + 647215 AAGTACAAGCTCCAAGTAAGTGGAGCCATAGTTC - -a -s mr.mrrefChr5 16270 123 + 294542 TGAGTAGCACAGGCACCACATAAATGATCACAAACACACTTGTTTAGTAAATGGTATAATTGTTTGATCATGATAGATAAAACTTTGACTCAAACATCTCTATCGCCTGGGTTTATCACATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153131 123 + 636262 TGAGTAGCACAGGCACCACATAAATGATCACAAACACACTTGTTTAGTAAATGGTATAATTGTTTGATCATGATAGATAAAACTTTGACTCAAACATCTCTATCGCCTGGGTTTATCACATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 150901 123 + 647215 TGTGTAGTACAGACCCCACATAAATGATCAAAAACACACTTGTTTAGTAAATAGTATAAGTGTTTGATCATGATAGATAAAACTTTGACTCAAAGATCTCTATTGCCTGGGTTTAATGCACTG - -a -s mr.mrrefChr5 16393 14 + 294542 CTCTAGAGGTCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153254 14 + 636262 CTCTAGAGGTCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 151026 14 + 647215 CTCTACAGGTCACA - -a -s mr.mrrefChr5 16407 12 + 294542 TTACAAGAACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153270 12 + 636262 TTACAAGAACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 151040 12 + 647215 TTACAACAACAA - -a -s mr.mrrefChr5 16419 33 + 294542 AAATCGATTTAATGAGGCATTAATTGAGCAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153294 33 + 636262 AAATCGATTTAATGAGGCATTAATTGAGCAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 151052 33 + 647215 AGATCAATTTAATGAGGCATTAATTGAGCTGGG - -a -s mr.mrrefChr5 16452 19 + 294542 CAAGGCCTTTCTGTGTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153344 19 + 636262 CAAGGCCTTTCTGTGTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 151085 19 + 647215 CAAGACCTTTCTGTGTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 16471 58 + 294542 GACATAATGCCAATACTTGAGACAAGTGTATGTGACAGTGACAACTAAGGATGACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153363 58 + 636262 GACATAATGCCAATACTTGAGACAAGTGTATGTGACAGTGACAACTAAGGATGACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 151110 58 + 647215 GACACAATGCCTATACCTGAAACAAGTGGATGTGACATGGACACCTAAGGATGACCTC - -a -s mr.mrrefChr5 16529 34 + 294542 TATCTTGTATGGGAGTGGGACCCTATGTCCTCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153421 34 + 636262 TATCTTGTATGGGAGTGGGACCCTATGTCCTCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 151172 34 + 647215 TACTTTGTGTGGAAGTGGGACCCTGTGTCCTCCC - -a -s mr.mrrefChr5 16563 31 + 294542 TCCTCAAGCGGCCCCTTTACCTGCTTAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153460 31 + 636262 TCCTCAAGCGGCCCCTTTACCTGGTTAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 151206 30 + 647215 TCCTCAAGCG-CCCCTTTACCTGCTTAGCAT - -a -s mr.mrrefChr5 16594 77 + 294542 TGCTCACGCGGAGCAAGAAGTGCTGTTTTGCAGATACTTTTTATGAATTGATATCTTTTCAACTTTTATTAGAGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153573 65 + 636262 TGATCACACGAAG--AGAGGTGCTGTTTTGCAGATATTTTTTATGAA----------TTCAACTTTTATTAGAGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 151236 77 + 647215 TGCTCACGCCGAGCAAGAAGTGCTTTTTTGCAGATACTTTTTATGAATTGATATCTTTTCAATTTTTAATAGAGTTG - -a -s mr.mrrefChr5 16671 462 + 294542 TCTTGTGTTAAGTATCTCTGCTGACCTTGATGTTACTCATGCTCAGTTCCCCTAGCGTACTGCAACTCTTTACTTTCTTATGCTGATCTCTTGGAGGCATGGGCATGGCAGCTATGATAATGACTATCACTGAGATTCTTATTAATTACCCTTCAATCTTATTATGATTATAAATTGTGCGCTTGTGACAGAGGGTTTCTTTTTATCACTACAACCACTTTTTTTTTCTGATAGCCAAAAGTGAGATGACAGTCCAGGGGCGTCCCTCAGAATGCTTTGAGTTGTACCTTCCCATAGTGATGAGAGTGATATACACAGAAAATCACTGTGTCTAATAGAATTGTTATACAATGTCCTTCAGTCTTACTAAGAGCACATACCTTGGGGATATGTTACGTAAGTTATACTGTTGATTGGAAAAGGGAAAATCAGTCTCTTTCGCATTCAAATTTCACTGTCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153639 461 + 636262 TCTTGTGTTAAGTATCTCTGCTGACCTTGATGTTACTCTTGCTCAGTTCCCCTAGCGTACTGCAACTCTTTACTTTCATTTGCTGATCTCTTGGAGGCATGGGCATGGCGGCTACAATAATGACTATTCCTGAGACTCTTATTATTTACCCTTCAATCGTGCTATGATTATAAATTGTACGCTTGTGACAGAGGGTTTCTTTTTATCACTACAACCACTTGTTTTTTCTGACAGCTAAAAGTAACATGACAGTCCAGGGGTGTCCCTCAGAATGCTTCAGGTTGTACCTTCCCACAGTGATGAGAGTGATATACACAGAAAATCACTGTGTATAATAGAATTGTTATACAATGTCCTTCAGTCTTACTGAGAGGACATACCTGGGG-ATATGTTACGTAAGTTATACTGTTGATTGGAAAAGGGGAAATCAGTCTCTTTCGCATTCAAATTTCACTGTCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 151313 457 + 647215 TCTAGTGGTAGGTATCTCTGCTGACCTTGATGCTACTCATGTTCAGTTCCCCTAGTGTACTGCAGCCCTTTACTTTCTTATGCTGATCTTTTGGAGGCATGGACGTGGCATCTATGGTAATGACTATCACTGAGATTCTTATTAATTACCCTTCAATCTTATTATGATTATAGATTGTGCG---GCGACAGAAGGTTACTTTTTATCACTACAACCACTTTTTTTTTCTGATAGCCACAAGTGAGATGACAGTCCA-GGGCATCCCTC-GAATGCTTTGAGTTGTACCTTCACATGGTGATGAGAGTGACATACACAGAAAACCACTGTGTCTAATAGAATTGTTATACAAAGTCCTTCAGTCTTACCAAGAGCACATACCTTGGGGATATGTTACGTAAGTTATACTGTTGATTGGAAAAGGGAAAATCAGACTCTTCTGCATTTAAATTTTACCGGCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 17133 35 + 294542 GGCAGTCTAGCGGACTTGGCTTTGGCATTACTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154110 35 + 636262 GGCAGTCTAGCGGACTTGGCTTTGGCATTACTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 151770 35 + 647215 GGCAGTCTAGCAGACTTGGCTTTGGCATCACTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 17168 175 + 294542 ACATAAAATGTTCACTCATATGAATTTAGTGCTTCGGTGTAGTATTAATTAAGCTGGGCATGGCACATGTTTTCTATCATTACCTCTTATGGGACAGAACTAGCTTGTCTTAGGAAGTCTCAGTGTTCATTTCTTCAACCTCTCATTTTCCCACCTACTTCCCTCTGTCTGCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154145 175 + 636262 ACATAAAATGTTCACTCATATGAATTTAGTGCTTCGGTGTAGTATTAATTAAGCTGGGCATGGCACATGTTTTCTATCATTACCTCTTATGGGACAGAACTAGCTTGTCTTAGGAAGTCTCAGTGTTCATTTCTTCAACCTCTCATTTTCCCACCTACTTCCCTCTGTCTGCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 151808 175 + 647215 ACTCAAAATGGGCACTCATATGGGTTGAGTGATTAGGTGTAGTAATAATTAAGCAGGGCAAGGCACATGTTTTTTATTATCATTCTTTATGGGACAGAACTAGCTTGTCTTACGAAGTCTCAGTGTTCACTTAATCAAACTCTCATTTTCCCACCTATTTCCCTCTGTCTGCACC - -a -s mr.mrrefChr5 17343 13 + 294542 AGGACTTTGTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154330 13 + 636262 AGGACTTTGTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 151983 13 + 647215 AGGACTTTGCTGA - -a -s mr.mrrefChr5 17356 5 + 294542 GTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154345 5 + 636262 GTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 151996 5 + 647215 GTGGA - -a -s mr.mrrefChr5 17361 40 + 294542 CTGCAGGCACAACTCCATAGTTGAATTGTTTCACCTTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154350 40 + 636262 CTGCAGGCACAACTCCATAGTTGAATTGTTTCACCTTCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 152017 40 + 647215 CTACAGGCATAATACCATAGTTGAATTGTTTCACCTTCAC - -a -s mr.mrrefChr5 17401 4 + 294542 CACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154390 4 + 636262 CACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 152057 4 + 647215 CACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 52307 4 - 647215 CATA - -a -s mr.mrrefChr5 17405 20 + 294542 TAAATGATCTCTTTAAAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154394 20 + 636262 TAAATGATCTCTTTAAAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 152061 20 + 647215 TAAATGATGTCTTTAAAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 52312 20 - 647215 TAGATGATCTCTTTAAAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 17425 6 + 294542 GTGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154415 6 + 636262 GTGCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 152081 6 + 647215 GTTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 52332 6 - 647215 GTGCTC - -a -s mr.mrrefChr5 17431 14 + 294542 CTATAATGAAGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154421 14 + 636262 ATATAATGAACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 152097 14 + 647215 CTATAATGAAGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 52338 14 - 647215 CTATAATGAAGACA - -a -s mr.mrrefChr5 17445 3 + 294542 ATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 52352 3 - 647215 ATG - -a -s mr.mrrefChr5 17448 73 + 294542 ATGATAGGAAGGAAAGTAAGCTTTATTGAATTTGTTGCCACAATTATCAACACTCAAGAACTGAACCATAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154435 64 + 636262 CCAATAGTAAGCAAAGTAAGCTTTATTAAATTTGTATCC---------AACACGCAAGAACTGAACCATAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 152111 73 + 647215 ATGATAGGAAGGAAAGCAAGCTTTATTGGATTTGTTGTCACAATTATCAACATTCAAGAACTGAACCATAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 52355 63 - 647215 ATGATAGGAAGGAAAGTAAACTTTATCGAATTTGTTGCCACAATTATC----------AACCGAACCATAATA - -a -s mr.mrrefChr5 17521 133 + 294542 GCCTGGTGTGATGATGGAGAGGGAGCATTCGCTATCTAGCATTAGCTATGTCTACTCCTGGTTATTATACTACATGAGACTTGCCCCCTGATATCAGAACACATGTCAGTTGAAGCCATATGAGGAGGTGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154499 120 + 636262 GCCTGGTGTGATGGTGGAGAGGGA-------------AGCATTAGCAATGTCTACTCCTGGTTATTATACTACATGAGACTTGCCCCCTGATATCAGAACACATGTCAGTTGAAGCCATATGAGCAGGTGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 152184 133 + 647215 GTATGGTCTGATGATGGAGAGGGCGCATTCACTATCTAGCATTAGCTATCTCTACTCCTGGTCATTATACTACATAAAACTTGCCACCTAACATCTCAACACATGTCAGTTGAAGTTATACAAGGAAGTGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 52419 43 - 647215 GCGTAGTGTGATGACGGAGAGGAAGCATTCGCTATCTATCATT------------------------------------------------------------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr5 17654 485 + 294542 ATGTCAATACTAAGCCCTTAATGATATCTAATGTCTTATTACCACATTGGATAGAAGGTTCATGGACTAAGACATTCAGAGTTGAGTGGAAAAGTTAGCCATAATCCAACCAAAATAGAGAAATTTTGTTAAATTAATACATAGAAGCCCATGTGTCATATTAATAGCAATGCAGGACATTTCAACTATCCAATGAATATATCAGATAAATATGTCTCAAGGACCAGCATAATATGACTTTCAGATCACCACTTGAGTGTCTTAAAATGAATAATAGTGGTCATCAGCTAAGCCAGAAAGATTGTGTAAGTTGTTATGCCAGGTTAGTATCACTCGATAAAGTTACATTTTCTTTTGGGCACTGTACAGTATTTTTGGACTTTTATTAGTACAAGTATAAAATAAATCTATGCAGTTGTTCTAGGGCCCTCAATGTTGTTCATTCATTGATAAGTTCAACATACTCTAAGATAGCTATTTCACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154619 474 + 636262 ATGTCAATACTAAGCCCTTAATGATATCTAATGTCTTACTACCACATTGGATAGAAGGTTCATGGACTAAGACATTCAGAGTTGAGTGGAAAAGTTAGCCATAATCCAACCATAATAGAGAAATTTTGTTAAATTAATACATAGAAGCCCATGTGTCATATTAATAGCAATGCAGGACATTTCAACTATCCAATGAATATATCATATAAATATATCTCAAGGACCAGCATAATATGACTTTCAGATCACCACTTGAGTGTCTTAAAATGAATAACAGTGGCCATCAGCTAAGCCAGAAGGATTGTGTAAGTTGTTGTGCCAGGTCAGTATCACTTGGTAAAGTTACATTTTCTATTGGGCAGTGTACAGTATTTTTGGACCTTTAATAGTACAAGTATAAAATAAATCTATGCAGT-----TAGGGGCCTCAATGTTGTC------TTGATAAGTTCAACATACTCTAAGATAGCTATTTCACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 152319 456 + 647215 ATGTCAATACTGAGCCCTTAATGATATCTGTTGTC-TATTACCACATTGGATGGAAGGTCCATGGACTAAGACATTCAGAG----------------------ATCCAACAAAAATAGAGAAATCTTGTTAAATTAGTACATGGAAACCCATGTGTCGTATTAATGGCAATGTAGGATATTTCAACTATCAAATGGATATATCAGATGAAAATGTCTCAAGGACCAACATAATATGACTCTCAGATAACCACTTGAGTGTCTTGAAGTGAATAATAGTGGTGTTCAGCTCAGCCAGAAA------GTAAATTGTTATGCTAGGTTAGTATCGCCCAATAGAGTTACATTTTCTTTTGGGCACTGTACAGTATTTTTGTGTTTTTATGAGGACGAGTATAAAATAAATCTATGCAGTTGTTCTAGGGCCCTCAATCTTGTTCATTCATTGATAAGTTTAACATTCTCTACAATAGCTATTACACAA - -a -s mr.mrrefChr5 18139 76 + 294542 TATCCACTATAACTCCATAAGCTTGTCTCCAGTGGAACATATCAAACAGTATGTAGTCAATTTAACAACAGTTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155109 76 + 636262 TATCCACTATGACTCCATAAGCTTGTCTCGAGTGGAACATTTCAAACAGGATGTAGTCAATTTAAAAACAGTTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 152775 76 + 647215 TATCTACTATAACTCCGTGAGCTTGTCTCCAGTGGGTCATATCAAACAGTATGTAGTCAATTTAACCACAGTTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 18215 28 + 294542 ACGTAGAGGCCTTTGAATAATGAAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155189 28 + 636262 ACGTAGATTCCTTTGAAAAATTAAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 152851 28 + 647215 ATGTAGAGGCCTTTGAATAATGAACACT - -a -s mr.mrrefChr5 18243 46 + 294542 ATGAGAACGAATGATGTGGGATGCTACTAACTGATTGTAATGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155217 46 + 636262 ATGAAAATGAATGATGTGGGACGCTACTGACTAATTGAAAGGATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 152934 46 + 647215 ATGAGAACGAACGATGTGGGATGCTACTAACAGATCATGATGATTG - -a -s mr.mrrefChr5 18289 116 + 294542 ATAGTATCCTCACTATTTTGACCCAGGAGTACAAATCTTAATGAAAAAGTAGCATCTTTTTACACTGCTTCTCATCTAGATAGCTCAGGATCGACCCATGCAATAAGTGTCCTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155267 116 + 636262 ATAGTATCCTCACTATTTTGACCCAGGAGTACAAATCTTGATGAGACAGTAGCATCTTTTCCAACTGCTTCTCATCTAGATAGCTCAGGATCACCCCATGCAATAAGTGTCCTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 152980 93 + 647215 ----------TGCTATTTTGACCCAGGAGT----ATCTTAATGAAAAAGTAACATCTTTTTACACTG---------TAGATAGCTCAGGATTGACCCATGCAATAAGTGTCCTTGG - -a -s mr.mrrefChr5 18405 39 + 294542 TGGGAGAAGTGGTCTTGACTTAGTCTAGAGAATATGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155385 39 + 636262 TGGGAGAAGTGGTCTTGACTTTGTCTAAAGAATGTGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 153073 39 + 647215 TGTGATAAGTGGTCTTGACTTAGTCTAGAGAATATGATT - -a -s mr.mrrefChr5 18444 36 + 294542 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAGGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155425 36 + 636262 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAAGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 153112 36 + 647215 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAGCATG - -a -s mr.mrrefChr5 18480 10 + 294542 AGATAGGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155523 10 + 636262 AGATAAGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 153148 10 + 647215 AGATAGCATG - -a -s mr.mrrefChr5 18490 498 + 294542 AACGAAGGTATACCTTGAAGGTCCAACAGTCTATACCCAAGGTACTACATAATTTTTTTGGAACTCTTTACACTCTAGACATTGGAAGCCCTCACCTCGTCATGCTGCATAATGCATAGTTTTTAGCATTTCATCTGAATTTAAATGCGTGGTACCTCGTTGCCACATGAAGGCACCCAATGCCATGTTTAAAACTCACATTTGTATCAGTACAGGAATAGGAAGCGAACATGGGAGACCCACAATATCTTTTCCCACAACATCTTCTCTCTCTTAGGAGTAATCTGCCAATCAAGTGCCCCCAGTTGGGGTAACAACCAGAATTCTGTACATATAATTTACCCAATCCCAAACACTGTCAGAGGAGGACTGACTTGATGTGTTCATTTGACCAAACCTGTGGCATTATTGATACAATTGTACTTATGGCTGTACACATCTGTGCAAAACATTCAACCAAGCCTATCAAACAGCAAATAGGCCAACCAATGAGTCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155533 481 + 636262 AACAAAGGTATACCTTGAAGGTCCAACAGTCTATACTCAAGGTACTACATCATTGTTTTGGAACTATTTACACTCTAGATATTGGAAGCCCTCACCTCGTCATGCTGCATAATGCATAGTTTTTAGCATTTCATCTGAATTTAAATGCGTGGTACCTCGTTGCCACATGAAAGCACCCAATGCCATGTTGAAAGCTCACATTTGCATCAGTACAGGAATAGGAAGCAAACATGGGAGACCCACAATATCTTTTCCCACAACATCTTCTCACTCTTAGGAGTAATCTGCCATCCAAGTGCCCCCAGCTGGGGTAACAACCCGAATTCTGTACATATAATTTACCCAATCCCAAACACTGTCAGGGGAGGACTGACGTGATGTGTTCATTTGACCAAACCTGTGGCATTATTGATACAATTGTACTTATGGCTGCACACATCTGTGCAAAACATTCAACCAAGCCTAT-------CAAATAGGCCAACCA---------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 153163 483 + 647215 AACGAAGGCATAATTTGAAGGTCCAACAGTCTATACCCAATGTACTACGTAATTTTGTTGGAACTCTTTACACTCTAGACACTGGCAGCCCTCACCTTGTCATACTGCATAATGCATAGTTTTTAGCATTTCATGCTAATTTAAATGACTAGTACCTCATTGCCACCTGAAGACATCCAATGCCATGTTTAAAACTCACATTTGTATCAGTATGGGAATAGGAAGCGAACATAGGAGACCCACAAT---------------ATCTTCTCTATCTTAGGGGTAATCTGCCAATCAAGTGCCCCCTGTTGGGGTAACAACCAGAATTCTGTACATGTAATTTACGCAATCCCAAACACTGTCAGAGGAGGACTGACTTCATGGGATCATTTGACCAAACCTGTGGCAGTATTGAGACAATTGTATTTATCACTGTACACATTTGTGCAAAACATTCAACCAAGCTTGTCAAACAGTAAATAGGCCCACCAATGAGTCATG - -a -s mr.mrrefChr5 18988 344 + 294542 AAGATCGGGCCACAAAAACAGATGAGTCATGAAAGGTCAGGCCACAAAAACAGGACTGAAAGCCTAGGTTCAGACTTAGGATACCTCATTATGTGTAATCTCTCCAATTTCCAGGGAAATAAAGATAGTTGTGGTAAGCTGATCTGGGATGTTTCTATGATTCTTGTCTTTCCAGACCAAGGTGCAATCATGGGATGAGTCTAGGATGATATTAGCAAAGAACAGGATTACTAATTCTCACACCTATACCTAGGTTACACTTATTAATTTTTGACCATATCATATATTCACTGTGTCTCCCGGTCTTACATGTCTAGCTGTACATTTATAACTCCTACAAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156014 323 + 636262 ---------------------ATGAGTCATGAAAGGTCAGGCCACAAAAACAGGGCTGAAAGCCTAGGTTCAGATTTAGGATACGTCATTATGTGTAATCTCTCCAATTTCCAGGGAAATAAAGATAGGAGTGGTAAGCTGATCTGGGATGTTTCTATGATTCTTGGCTTTCCAGACCAAGGTGCAATCATGGGATGAGTCTAGGATGATATTAGCAAAGAACAGGATTACTAATTCTCACACCTATACCTAGGTTACACTTATTAATTTTTGACCATATCAGCTATTCACTGTTTCTCCCGGTCTCACATGTCTAGCTGTACACTTATAGCTCCTACAAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 153647 343 + 647215 AAGATCGGGCCACAAAAACAGATGAGTCATGAAAGGTCAGGCCACAAAAACAGGACTGAAAGCCTAGGTTCAGACTTAGGCTACCTCATTATGTGTAACCTCTCCAATTTCAAGGGAAATGAGGATAGTTGTGATAAGTTAAACT-GGATGTTTCTACAATTCTTGTCCTCCCAGACCAACATGCAATCATGGGATGAGTCCAGGATGATATTAGCAAAGAAATGGATTACTAGTTGACACACCTATACCTAGGTTACACTTATTAATTTTTGACCATGTCATATATTCTCTGTGTCTCCAGGTCATCCAGGTCTAGCTGCACATTTACAACTCATACAAAACA - -a -s mr.mrrefChr5 19332 51 + 294542 ACAGAAGAAGGTGGGTGTTTACCCACACTTAAGTGGCTAAGTTTTTGTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156344 51 + 636262 ACAGAAGAAGGTAGGTGTTTACCCACACTTAAGTGGCTAAGTTTTTGTCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 153990 17 + 647215 ACATTGGGTGGTGGGTG---------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 19383 8 + 294542 AGTGCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156404 8 + 636262 AGTGCTGT - -a -s mr.mrrefChr5 19391 52 + 294542 TAGTGTGTCCCATGACACTTTCAAGCAGAACTTAAGCATTGATGGGTAGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156416 52 + 636262 TAGTGTGTCCCATGACACTCTCGAGCAGAATTTAAGCATTGATGGGTAAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 154007 39 + 647215 -------------GCCACTTCCAAGCAGAACTTAGGCATGGATGGGTAGGGG - -a -s mr.mrrefChr5 19443 79 + 294542 TAATCAAAATTGCCTTAACAGCAGTTATAGAGCTGTTTCTTGTTAGCCTCATTGGAGTTGTACTTATAGGCCAAACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156469 79 + 636262 TAATCAAGATTGCCTTAACAGCAGTTACAGGGCTGTTTCTTGTTAGCCTCACTGGAGTTGTACTCATAGGCCAAACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 154046 71 + 647215 TAATCAAAATAACCCTAACAGCAGTTATAGAGCTGTTTCTTGTTAGCCTCAT--------TAATTATTGGCCAAACATA - -a -s mr.mrrefChr5 19522 114 + 294542 CATATCTTGTCCAAAGTGAGGAGAGGTTTAGCACTAATCTTTTAGTACTAGTGTCTTACACCAGCTGGGCAGTCTACTGCATCCGCTATCTTGATGCTATTATTCAGTTAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156549 114 + 636262 CCTATCTTGTCCAAAGTGAGGAGAGGTTTAGCACTAATCTATTAGTACTAGTGTCTTACACCAGCTGGGCAGTCTATTGCATCCGCGATCTAAATATTATTACTCAGTTAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 154117 114 + 647215 CATATCTTGTACAAAGTGAAGTGAGGTTTAGCACTCATCTTTCAGTACTAGAGTCTTACACCAGCTGAGTACTCTGCTGCATCCTCTATCTTGATGCTATTATTCAGTTATACT - -a -s mr.mrrefChr5 19636 124 + 294542 CTAAGTCTGGGGATTCACCTGTCTTCCACTATCAATATGAAATAGAAGCTGTCCAATTATATTCTGCACATATGCCAGTTTTGGATAGGATTCAAATCCTGCACACATTGCAGTTCTTGTGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156664 117 + 636262 CTAAGTCTGGGGATTCACCTGTCTTCCACTATCAATATGAAATAGA-------CAATTATATTCTGCACATATGCCAGTTTTGAATAGGATTCAAATCCCGCACACATTGCAGTTCTTGTGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 154231 124 + 647215 CTAATTCTGGGGATTCACCTGTTTTCCACTATCAATATGAAATAGAAGCTGTCTGACTACATTCTGCACATATCCCAGTTTTGGATAGGATTCAAGTCCTGCACACACTGCAGTTCTTGTGTGG - -a -s mr.mrrefChr5 19760 243 + 294542 GTACTTTCTAGGGGATTGATTGTGTAAGTATTTCTACATAACATATTATTGTTGGTTCAGCACCAATAAAGACTCCTCCATATGAAACTCATACATAATATAGTTTTTAACATAGATGTCTTTGTCACAAAGATGTCATCTTTTCCACATAGATGTCTCATACAGATTCAATTCCTGTGATTGGGCTCTTTGTAAAGTAATTAAACATTGAATTTTTGCCAAAAGTTTTAATTATGACATTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156781 233 + 636262 ----------GGGGATTGATTGTGTAAGTATTTCTACATAAGTTATCATTGTTGGTTCAGCACCACTAAAGACTCCTCTGTATTAAACTCATACATAATGTAGTTTTTAACATAGATGTCTTTGTGACAAAGATGTCATCTTTTTCACATAGATGTCTCATACAGATTCAATTCCTGTGATTGGGCTCTTTGTAAAGTAATTAAACATTGAATTTTTGCTAAAAGTTCTAATTATGACATTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 154356 243 + 647215 GTACTTTCTAGGGGATTGATTGTGTATGTATATCTACATAACATATTATTGTTGGTTCAGCACTAATAAAGACTCCTCCATATGAAACTGATATGTAACATGGTTTTTCACATAGATGTTTTTTTCATATAGGTGTCATCTTTTCCACATAGATGTCTCATACAGATGCAATTCCTGTGATTGAGCTCTTTATAAAGTAACTAAGCATTGAATTTATGCCAAAAGTTTTAATTATGACATTAT - -a -s mr.mrrefChr5 20003 187 + 294542 CTAGACGGGTGACTCTAATCTGTTTCCAAATTACCCATTGTGATTAAAGACTGAGGAACTGCATTCATTGATAGAGTCATGTTTTATCTGAACAGTGACTGTAAGTCGTTCGGCTGATTCAAGCAACATATTGGATGCTTCATTTTCAAAAACTGTCTTCTCCAGAATTCCAAACTCCAGCATTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157014 174 + 636262 CTAGGTGGGTGACTCTAATCTGTTTCCAAATTACCCATTGCGATTAAAGACTGAGGAACTGCATTCATGGATAGAGTCATGTTTTATCTGAGCAGTGCCTATAAGTC------CTGA-------AACATATTGGATACTTCATTTTTAAAAACTGTCTTCTCCAGAATTCCAAACTCCAGCATTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 154607 187 + 647215 CTAGACGGGTGACTCTAATTTGTTTCGAAATTACCCGTTGTGACTAAAGACTGAGGAACTGCATTCATTGATAGAGTCATGTCTCATCTGAACAGTGACTGTAAGTCGTTCGGCTGATTCAAGCAACATATTGGATGCTTCATTTTCAAAAACTGTCTTCTCCAGAATTCCGAACTGCAGCATTACT - -a -s mr.mrrefChr5 20190 42 + 294542 GAAAGGCCCTCCCAGAAATACTGTGATATAATAGGTAATAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157189 42 + 636262 GAAGGGCCTTCCCCGAAATACTGTGATACAATAGGAAATAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 154794 42 + 647215 GAAAGGCCCTCCCAGAAATACTATGATATAATAGGTAATGAA - -a -s mr.mrrefChr5 20232 72 + 294542 TAATACTTGGTCACATCCAACTGACAATGTACACACCATATTGAGAAAACTAGCAATAGGTGTGCTCCAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157233 72 + 636262 TAATACTTGGTCACATCCAACTGACAATGTATCCACCATATTGAGAAAACTAGCAATAGGTGTGCTCCAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 154836 72 + 647215 TGATACTTGGTCACGTCCAACTGACATTGTACACATCAAATCAACAGAACTAGCAATAGTGGTGCTCCAGAA - -a -s mr.mrrefChr5 20304 148 + 294542 CAGATAAAGTGCAAACCATACCTGCGTCAAAACAAATAAGGTGGGCTAACTCTGGAATAGATATCTCACTAACCCTTATTATAAGAGGATGTAGTGTTTTCTTTTAATACCAGATGAGTTCTGTATCTGCCTAGTCCCTTTCCTTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157305 148 + 636262 CAGATAAAGTGCAAACTATACCTGCGTCAAAACAAATAATGTGGGCTAACTCTGGAATAGATATCTCACTAACCCTTATTATAAGAGGATGTAGTGTTTTCTTTTAATACCAGATGAGTTCTGTATCTGCCTAGTCCCTTTCCTTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157460 145 + 636262 CAGATAAAGTGCAAACCATACCTGCGTCAAAACAAATAAGGTGGGCTAACTCTGGAATAGATATCTCACTAACCCTTATTATAAGAGGATGTAGTGTTTTCTTTTAATACCAGATGAGTTCTGTATCTGCCTAGTCCCTT---TTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 154908 144 + 647215 CAGATAAAGTGCAGACCATACCTGCTTCAGGACTAACAAGGGGGGCTAACTTTGGAATAGATATTTCACTAACCCTTATTATATGAAGGTGTAGTGTTTTCTTTCAAAACCAGATGAGTTCTGTGTCTGCCTAC-CCTTT---TTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 20452 7 + 294542 GCCCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157453 7 + 636262 GCCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157605 7 + 636262 GCCCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 155056 7 + 647215 ACCCATG - -a -s mr.mrrefChr5 20459 157 + 294542 GGGCCCCCAGCTATTAGATACCCGAGACACTAAGACCACATGGTGCTTCAATCAGGCATATGTGCTCCCATGTACAGTTCCATTGGGTTTAATTAGCATGTAGTACAGTAAAAAACTACTTAGTGGTAGTAGGTAGGGATTGTGAGTACCATGATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157612 75 + 636262 GGGCCCTCACCCATTAGACACCCAACAC----------------------------------------------------------------------------------CAAAACTACTTGGTAGCAGTAGGTAGGGATTGCGAGTACCACTATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 155063 157 + 647215 GGGCCACCTGCTGTTGTATGCCCGAGACACTAAGACCACATGGTGCTTCAATCAGGCATATGTGCTCCCATGTACAGTTCCATTGGGTTTAATTAGCATGTAGTACAGTAAAAAACTACTTAGTGGTAGTATGTAGGGATTGTGAGTACCATGATTC - -a -s mr.mrrefChr5 20616 14 + 294542 CCCACAAAACCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157688 14 + 636262 CCCACAAAACCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 155220 14 + 647215 CCCACAAAACCACT - -a -s mr.mrrefChr5 20630 149 + 294542 TGGAGATAATTTTGGAATTGATAAGCTTGGTGGTCTGGGGTTGTGAGATCTACTAAAGAGGAATTACTTGGCCTGTAGAGAAAGCCCTAGTAATCCTGGATTGTTTTCTGGGGCTTGGAGAGGTACTTCTCTCTGCCATGTCCTTACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157719 146 + 636262 TGGATATAATTTGGGAATTGATAAGCTTGGTGGTCTGGGGTTGTGAGATCTACTAAAGAGGAATTACT---CCTGTAGAGAAAGCCCTAGTAATCCTGAATTGTTTTCTGGGGCTTGGAGAAGTACTTCTCTCTGCCATGTCCTTACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 155234 149 + 647215 TGGAGATGGTTTTGGGATAGCTAAGTTTAGTGGTCTGGTGTTGCGAGATCTACTAAGGATGAATTACTTGGCCTTTAGAGAAAGCCCTAGTTATCCTGGATTGTTTTCTGGGGCTTGGGGAGGCATTTCTCTCTGCCATGTCCTTATTC - -a -s mr.mrrefChr5 20779 46 + 294542 TAGAGCTTGATGGACAATTTGTGACACCAGGTTGTGATAAGCCGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157865 43 + 636262 TAGAGCTTGATGGACAGTTTGTGACACCAGGTTGTGATAAGCT--- -s simRat_chr6.simRat.chr6 155393 44 + 647215 TAGAGCTTGATGGA--ATTTGTGGCACTGGGTTGAGATAAGCCGAT - -a -s mr.mrrefChr5 20825 273 + 294542 TACTTTGGGAATTTGCAATGCAATCTACACCTTGTATGTGAATCCAGAAGCTTAAGGGCTTCAGGATACCACATTTAGCTATAGAGAATTATTGATTGTTATTCTTGTTTTGGTTCCTATGAACCGTGAGTCTCATAGCTGATGCAAAAGTATCGTCACTATTCAGAGGAAAAATCAAAACTCCATTGCACCCAACTTGCCCAATCATGTGTATGAATCCCCACTTGGGTTCAAGTACCAGTAAGTTGCATTATGAGACCAGGTGCCCCATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157908 268 + 636262 ---TTTGGGAATTTGCAATGCAATCTACACCTTGCATGTGAATCCAGAAGCTTAAGGGCTTCAGGATACCACATTAAGCTATATAGAATTATTGATTGTTATTCTTGTTTTGGTTCCTATGAACTGTGAGTCTCATAGCTGA--CAAAAGTATCGTCACTACTCAGAGGAAAAATCAAATCTCCATTGCACCCAACTTGCCAAATCATGTGTATGATTCCCCACTTAGGTTCAAGTTCCAGTAAGTTGTATTATGAGACCAGGTGCCCCATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 155439 273 + 647215 TACTTTGGGAATTTGCAACACAATTATCGCCTTGTATGTGAAACCAGAAGCTTAAGGGCTTCAGGATACCACATTTAGCGATAGAGAATCATTGATTGTCATTCTTGTTTTGGTTCCTATGAACCGTGAGTCTCATAGTTGATGCAAAAGCATTGTCACTGTTCAGAGGACAAATCAAAACTCCATTGCACGCAATGTGGCCAATCATGTGTATGAATCCCCACTTGGGTTTATGTAACAGTAAGTTGCATGAAGAGACCAGGTGCGCCATCT - -a -s mr.mrrefChr5 21098 607 + 294542 GGGTCTATCTAACCATGTATGATGTCTGAATTCAGATAGAACAGCATTTGCAACCCTGGAAGGTGTTCTGCTGAGGCTACTAAAAATGGTCCCCAAATGTGGAACAACCCAGTACCACTCGGGTCATGTAACTATTGCTTAAGGAGGGTAAAGGTGTTGTGGGTATCAGATTCTGATGGGTGATGAGATTCTCAAAGCTGCTCTCTAGTACAGCATCCCTACTTCTCCCATCAGGGATCTGGTCTTATACTGACTAAAGATTGCCACAGTATAAGCCTCTCTTTAACTGAAAAGTCTGACTCGTTAGCCCCTTTATTAGGAGGCTCCCTTCGTCTTGCATGGCCAGAAGGCAGTCACATGATTGCCATACCACACAGAAGGGTTGCTGCAGAGCTTTGGGCTGCTACAACAATCTTAGCATGTCCTGAGTGCCACCGATATATCCTCTGTAAACATAATGTGTTATTTTACTTGGCTGCTGATAGTATACCACTGTCAAGCAAGTATTTAGGTAAGATTCTTGTGAGTGGTGGGAAAGTACTTGACTTGTCTGCTGTCTACCTGCCATAACACATCTGCACATTTTTTTCAACCACTGAACTTTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158176 607 + 636262 GGGTCTATCTAACCATGTATGATGTCTGAATTCAGACAGAACAGCATTTGGAACCCTGGAAGGTGTTCTGCTGAGGCTACTAAAAATGGTCCCCAAATGTGGAACAACCCAGTACCACTCAGGTCATGTAACTATTGCTTAAGGAGGGTAAAGGTGTTGTGGATAACAGATTCTAATGGGTGATGAGATTCTCAAAGCTGCTCTCTAGTACAGCATCTCTACTTCCCCCATCAGGGATCTGGTCTTATGCTGACTAAAGATTGCCACAGCATGAGCCTCTCTTTAACTGAAAAGTCTGACTCGTTAGCCCCTTTATTAGGTGGCTCCCATCGTCTTGCTTGGCCAGAAGGCAGTCACCAGATTGTCACACCACACAGAAGGGTTGCTGTAGAGCTTTGGACTGCTACAACAATCTTAGCATGTCCTGAGTGCCACCGATATATCCTCTGTAAACATAATGTGTTATTTTACTTGGCTGCTGATAGTATACCACTGTCAAGCAAGTATTTAGGTAAGATTCTTGTGAGTGGTGGGAAAGTACTTGACTTGTCTGCTGTCTACCTGCCATAACACATCTGCACATTTTTTTCAACCACTGAACTTTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 155714 598 + 647215 GGGTCTATCTAGCCATGTACAATGTCTGAATTCAGATAGAATAACATTTGCAACCCTGGAAGGAGTTCTGCTGAGGCTACTAAAAATGGTCCCCAAATGTGGATCAATCCAGTACCACTCGGGTCATGCAACTATTGCTTAAGGAGGGTAAAGGTGTTGCAGGGATCG-ATTCTGATGGGTGATGAGATACTCAAAGCTGTTCTCATGTACAGCATCCCTACTTCTCCCATCAAGGATCTGGTGTTATACTGACTAAGGATTGGATCAGTATAAGCCTCTCTTTAACTGAAAAGTCTGACTTGTTAGCC--TTTACTAGGAGGCTCCCTTTGTCTTGCATTGCCAGAAGGCAGT-ACATGATTGCCATACCACA-----GGGTTGCTTCAGAGCTTTGGGCTGCTACAACAATGTTAGCATGTCCTGAGTGCCACCAATGTATCCTCTGTAGTCATAATATGTTATTTTATGTGGCTGTTGATAGTATAGTACTGTACTGCAAGTATTAGGGTAGGATTCTTATGAGTGGTGTCAAAGTACTTGACTTGTCTGCTGTCTACTTGCCATAACATACCTGCACATTTTTTTCAACTACTGACCTTTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 21705 23 + 294542 ATGTTTTGACTGGGTGCCTGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158783 23 + 636262 ATGTTTTGACTGGGTGCCTGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 156314 23 + 647215 ATGTTTAGACTGGGCACCTGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 21728 27 + 294542 CCCATTCTCTTGAGCTCACATAGTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158806 27 + 636262 CCCATTCTCTTGAGCTCACATAGTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 156343 27 + 647215 CCCATTCTCTTGAACTCACACAGTGTG - -a -s mr.mrrefChr5 21755 31 + 294542 CTCGAACAATGACAGTGTAGTGAACCCAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158833 31 + 636262 CTCGAACAATGACAGTGTAGTGAACCCAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 156395 31 + 647215 CTTGGATGATGACAGTATAGTGAACCCAGAT - -a -s mr.mrrefChr5 21786 40 + 294542 AATGTCATTTCATGTGTGTCCTTCATTAATAGGCTCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158864 40 + 636262 AATGTCATTTCATGTGTGTCCTTCATTAATAGGCTCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 156427 39 + 647215 AATGTCATTCAATGCATGTCTCTCATAAATAAGCTCATA- - -a -s mr.mrrefChr5 21826 95 + 294542 AGAGTCTCATCTCGTTGACCTGGCCGCAGATGCAGCAGTCAGGTAACCTCTATTCCAGCAAATGCAAAATCTCACACATCTTACTTTAGTTGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158904 95 + 636262 AGAGTCTCAACTCGTTGACCTGGCCGCAGACGCAGCTGTCAGGTAACCTCTATTCCAGCAAACGCAAAATCTCACACATCTTACTTTAGTTGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 156651 86 + 647215 AAATTCTCATTTAGT---------CACAGATGCAGTAGTCGGGTGACCTCTCTTCCAGAAGATGCAAAATCTCGCACATCTTACTTTAGTTGGAG - -a -s mr.mrrefChr5 21921 33 + 294542 AGGGTTGCCAATCCTATATTTCAATGAATGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159000 33 + 636262 AGGGTTGCCAATCCTATATTTCAATGAATGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 156737 27 + 647215 GGGGTTGCCAATCCTATATTTCAATGA------ - -a -s mr.mrrefChr5 21954 3 + 294542 CTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159034 3 + 636262 CTC - -a -s mr.mrrefChr5 21957 198 + 294542 CAAACCCCTTAAGTTGTGTACCAACCATCTACTCCGTAATGCTTCGTACCATATGAAAGTGGGTGAGATTCTCTGCTAGCCATAAGTTGTATGTTCAGTATTTTTGGAATAGACACATTCTTGAAGGAGGACCAGCTCAATTGCAGTATGACTTGACAGGAATGATAGTCAGTAAGTTCTAGTAACTTCCATTATACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159038 196 + 636262 CAAACCCCCTAAGTTGGGTACCAACCATCTACTCTGTAATGCTTCGTACCATATCAAAGTGGGTGAGATTCTTTGCTAGCCATAAGGTGTGTGCTCAGTATTTTTGGCATAGACACATTCTTGAAGGAGGAACAGCTCAATTGCA-TATGACTTGACAGGAATGATAGTCAGTA-GTTCCAGTAACTTCCATCAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 156764 193 + 647215 CAAACCGATGAAGTTGTGTACCAGCCATCTACTCCGTAATGCTTCATACTATATGAAAATGGGGTA-----TCTGCTAGCTACAAGTGGTATGTTCAGTATTTTTGGAATAGGCACATTCTTGAAGGACGACTGGCTCAATTGCAGTATGACTTGACAGGAATGATAGTGAGTAAGTTCTAGTAACTGCCATTATGCT - -a -s mr.mrrefChr5 22155 342 + 294542 GCTCACTGCTTAGTTCACATGCTCAATGCTCAGTTCAGTTATCAACAGAACCTTGGGCAATACGGCGTGCGATTGAATATCAAACCACCAACACTGCAACATGAAAATAGATAACAAATGTTGCTGTGTGCATATGTTCAATCTTTAAACTGCCAACTGGAAACCATTCACACCGTTTGGAAGTAAACCCTAAATTATTGCTACTAGAACTTTTGGCGTGCATTCAGTAAAAGATAGCATATTACTCTTAAAGACCCTAACTTGATGGATGTTCCAAAGATTTTGGGATGTCAAAACAAATGATGGCCCACTGTGTCTCCACATCTGAGCTTGCATGCTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159238 336 + 636262 GCTCACTGCTTAGTTAACATGCTCAACACTCGGTTTAGTTATCAACAGAACCTTGGGCAATACGGCGTGCGATTGAATATCAAACTACCAACACTACAACATGAAAATAGATACCAAATGTTGCTGTTTGCATATGTTCAGTCCTTAAACTGCCAACTGGAAACCATTCACACAGTTTGGAAATAAACCATAGATCATTGCTACTAGAATTTTTGGCGTGCATCCAATAAAAGATAGCATGTTACTCTTAAAGACCCTAACTTGATGGA-GTTCTGAAGATTTTGGGATGTCAAAATAGATGTTGGCCCACTG-----CTGCATCTGAGCTTACATGCTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 156957 342 + 647215 GTCCACTGCTTAGTACACATGCTCAATGTGCAGTTCAGTTATTGTCAGAACCTCGGGCAATACAACGTGAGATCGCATATCAAACCACCAACACTGCAACATCAAAATAGACAACAAATGTTGCTGTGTGCATATGTTCAATCTTTAAACTGCAAACTGCAAACCATTCACACCGTGTGGCAGTAAACCCTAAACTATTGCTACTAGATCTTTTGGGATGCATTCAGTAAAAGATAGCACATTACACTTAAAGACCCTAATCTGATGGCTGTTCCAAAGATTTTGAGATGTCAAAACTAATGACGGCCGGCTTTGTCTCCACATCTCAGCTTGCACTCTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 22497 472 + 294542 ACACCCATGGGGCAGCTATTAAAGACATACCAATAACATGACCATTGTGCTTAATAAGGCGTAAGACCAATGGTATCCAGAGATCCACATATAGCTTGGCTAAACACTAATCATCCCTTAATAGATGGCAAATCAAATACTTAATAGCACAAATATAAAAATCAGCATTTAAAAGATCATGGACAGGCACCACACTCAACAGAGAAGCCTGCTACTAGTGTATACCCTGTTTTTAAATTCTATGACATTTTGCTTGTGGCCTGAGGCCACTATATCCAAAATGATAAACTACTCCACTAAGTCAATGCATGGAGAACATTTAGATTCTGGCCATTTGCCTTTATGTGTTAGGTTATCACCTTATGTAATGCCCTGCAAAGTTTTACTCATCAAGTGCAATTTTCGTAAATGTTCAAGGGTTTAGCACCTAACTGATCTGACACTGGAAGTTCAATTCTGACCTTACAATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159580 457 + 636262 ACACCCATGGGGCGGCTATTAAAGACATACCGATTACATGACCATTGTGCTTGATAAGGCGTCGGCCCAATGGTATCCATGGATCCGCATATAGCTTGGCTAATCACTAATCGTCCCTTAATAGATGGCAAATCAAATACTTAATAGCACAAATATGAAAAATAGCATTTAAAAGATCATGGACAGACACCACACTCAACAGAGAAGCCTGCTACTAGTGTGTACCCTATTTTTAAATTCTATGACATTTTGCTTGTGGCCTGAGGCCACTATA-CCAAAATGATAAACTG------------GATGCATGGAGAACATTTAGATTCTGGCCATTTGCCTTTATGTGTTAGGTTATCACCTTATGTAATGCCCTTCAAAGTTTTACTCACCAAGTGCAATTTTCGTAAATGTTCCAGGGTTTAGCGCTT--CTGATCTGGCACTGGAAGTTCAATTCTGACCTTACAATAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 157299 468 + 647215 ACATTGATGGGTCAGCAATTAAGGGCATACCAATACCATGAGCATTGTGCTTAATAGGGCATAAGAAAAATGGTTTCCAGAGATCCACATATAGCTTGGCTGAACACGAATCATCCCTTAATAGATGGCAAATCAAATACTTAATAGCACAAATATAAAGATCAGGATTTAAATGATCATGGACATGCACCACACTCAAAAGAGAAGCCTGCTACTAGTGTATACCCTGTTTTTCAATTCTTTGACATTTTTCCCGTGGCCTGGGGCCACTACATCCAAACTGATAAACTACTCCACTAAGTCAATGCGCGGAGAAAACTTAGGT-CTGGCCATTTGCCTTTATGTGTTAGGTTATCACCTTATGTAAGGGCCTGCAAAGTT--ACTCATCCAG-ACAATTCTGCTAAATGTTCAACAGTTTGGCACCTAACTGATCTGACACTGGAAGTTCAATTGTAGTCTTACAATAGT - -a -s mr.mrrefChr5 22969 261 + 294542 TTGGTTATGGTTCCCTTAATTGGGCCTCACCATCTTGAGTGTGCGATGCCAGATGACATCACATTAATCCATAATTATTTGCTTTAATAAATTAAAGAAGCTACCCAAGTTTGCAACCCTCCACAGACCCTGTCTGAAAATGTACTGTTCAGAATGCAGTCAAGTGTATTAATACCAAGATTTCCATTGTTATCTCTGACAATCTCCACTTTAACCTGAACTCTCAGAAGAGACAGTAATCAGTAACCTTACGGCAGCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 160037 256 + 636262 TTGGTTATGGTTCCCTTAATTGGGCCTCACCATCTTGAGTGTGTGCTGCCAGATGACATCACATTAATCCATAATTATTTGCTTTA-----TTAAAGAAGCTACCAAAGTTTGCAACCCTCCACAGACCCTGTCTGAAAATGTACTGTTCAGAGTGCAGTCAAGTGTGTTAATACCAAGATTTCCATTGTTATCTCTGACAATCTCCACTTTAACCTGAACTCTCAGAAGAGACAGTAATCAGTAACCTTACGGCAGCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 157770 199 + 647215 TTGGTTATGGTCCCCTTAATTGGGCCTTACCATCTTGAGTGTGCTATGCCAGATGCCATCACATTAATCCATGATTATTTGCTTTAATAAATTAAAGAAGCTCCCCAATTT-GCGACCCTCCACAGACCCTGGCTGAAAATGTACTGTTCAGAATGCAGTCAAGTGGATTAATACCGAGATTTCAATTGTGATCTCTGAC------------------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 23230 111 + 294542 AGGGCAGCAGACTGGGGTTGGCATTGAAAGATATTCTGTGATGCCTCTATTACACTACATAGACCCCCCATGAGTCAACCTATTAACCTGGCAGCTACATTTATAGCCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 160299 111 + 636262 AGGGCAGCAGACTGGGGTTGGCATTGAAAGATATTCTGTGATGCCTCTATTACACTACATGTACCCCCCATGAGTAAACCCATTAACCTGGCAGCTACATTTATAGCCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 157969 60 + 647215 ---------------------------------------------TCTATTAGAC--CTTAGACCCCTTATGAGCCAACCTATTAACCTGG----TCCATTTATAGACCTT - -a -s mr.mrrefChr5 23341 45 + 294542 CTCAGGACGTCAAAATTGTTCTATCAACTGCTGGCATAGGACTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 160411 45 + 636262 CTCAGGACGTCAAAATTGTTCTATCAACCGCTGGCATAGGACTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 158029 42 + 647215 ---GGGACGTCAAACTTGTTCTATCAATTGGTGACTTAGGCCTGG - -a -s mr.mrrefChr5 23386 332 + 294542 ATTTGTACAATTTAAGCAACACCTTGTGATGAAGACTTTCCATGCAATTCCACATGCAATACATTTCTCTCAATGATACATACAGTTGTGTTTGCAGGGAAGCTGTAAATGAAGTATGGGCAAAAGGAGAAAAGTGTAAGGACAAACTACCAACGTAAGAATTGAATGTAACTTGATATAAATTTTTTATATTAAACCTTTTTAAGCACATCACCTTGTACAAATAGTAAGGATGGATCTGAATATTGAATTAGTTGAGATTTACTAAGTGTTTCTCATTCCATAGCAATGACTTACTCTTCTGTTATAACCATTTGTCTATAAACAAGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 160456 330 + 636262 ATTTGTACAATTTAAGCAACACCTTGTGAT-AAGACTTTCCCTGCAATTCCACATGCAATACATTTCTCTCAATGATACATACAGTTGTGTTTGCAGGGAAACTATAAATGAAGTATGGGCAAAAGGAGAAAAGTGTAAGGACAAACTACCAACATAAGAATTGA-TGTAACTTGCTATAATTTTCTTATATTAAACCTTTTTAAGCACATCACCTTGTCCAAATAGTAAGGATGGATCTGAATATTGAATTAGTTGAGATTTACTAACTGTTTCCCTTTTCATAGCAATGCCTTACTCTTCAGTTATAACCACTTGTCTATAAACAAGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 158072 322 + 647215 GTTGGGACAATTTAAGTGACACATCGTGATGAAGACTTTCCATGTGATTGCACATGAGATACATTTCTCTCAATGATACATACTGTTATGTTTGCAGGGAAGCTGTAAATGAAGTATGGGCAAAAGGAG----------GGACACACTACCAATGTAAGAATTGAATGTAACTTGATATAAATCTTTTATATTAAACCTTTATAAGCACATCAGCTTGTACAAGTAGTAAAGGTGGATCTGAATACTGAATTAGTGGAGATTTACTAAGTGTTTCTCATTCCATAGCAATGACTTACACTTCTGTTATAACTATTTGTCTATAAACAAGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 23718 22 + 294542 CTTAGTGCTTCTTCTGCTTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473770 22 - 636262 CTTAGTGCTTCTTCTGCTTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 158394 22 + 647215 CTTAGTGCTTCTTCTGCCTTCC - -a -s mr.mrrefChr5 23740 60 + 294542 TAAATGCAAGATGGATGATACAGATTATATACAAAACAGAGTAGGTAGACACCTGTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473792 60 - 636262 TAAATGCAAGATGGATGATACAGATTATATACAAAACAGAGTAGGTAGACACCTGTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 158417 60 + 647215 TAAATTCAAGGTGGATAATACGGGTTGCAAACAAAACAGAGTAGGAAGACACCTGCAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 23800 28 + 294542 ATAAGAGAGGAGTAATATTTGACTCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473853 28 - 636262 ATAAGAGAGGAGTAATATTTGACTCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 158477 28 + 647215 ATAAGAGAGGAGTAGCATCTGACTCTTT - -a -s mr.mrrefChr5 23828 12 + 294542 CAGCAGTCAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473881 12 - 636262 CAGCAGTCAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 158506 12 + 647215 CACCAGTCAACC - -a -s mr.mrrefChr5 23840 32 + 294542 AAACCATCAGTTGAATCAGTTGAAGATTATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473893 32 - 636262 AAACCATCAGTTGAATCAGTTGAAGATTATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 158519 32 + 647215 AAACCATAAGTTGAATCAGCTGAAGGGTATGA - -a -s mr.mrrefChr5 23872 21 + 294542 GATGTTGCACACGCTTATTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473925 21 - 636262 GATGTTGCACACGCTTATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 158574 21 + 647215 GATGCTGCACACACTTATTGT - -a -s mr.mrrefChr5 23893 37 + 294542 ACCGAACACATACAATCCAGTATCATCTAAGCTCGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473946 37 - 636262 ACCGAACACATACAATCCAGTATCATCTAAGCTCGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 158598 37 + 647215 ACCAAAGACATCTGATCCAGTATCATCTAAGCTTGCA - -a -s mr.mrrefChr5 23930 13 + 294542 ACACTTATCGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473984 13 - 636262 ACACTTATCGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 158635 13 + 647215 ACACTTATCACCA - -a -s mr.mrrefChr5 23943 89 + 294542 GAGACATCTGATATAGTATCATCTAAAGTTAAAACATCTCGGCATGTGATTGGTGTCAACTAAATGAGAAACCCAACTGATTGTCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473999 89 - 636262 GAGACATCTGATATAGTATCATCTAAAGTTAAAACATCTCGGCATGTGATTGGTGTCAACTAAATGAGAAACCCAACTGATTGTCAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 158648 89 + 647215 GAGACATCTGAGCCAGTAACGGCTAAGCTTAAAACACCTGGGCATGTCATCAGTATCAACTAAATGAGAGACCCAACTGATTGTCAGTT - -a -s mr.mrrefChr5 24032 72 + 294542 GCATCATTCTTCCCCCATCATACTCCAACTAAATATAGAGAAGCCCTATCACACTCAGGTAGTGGCGCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474088 72 - 636262 GCATCATTCTTCCCCCATCATACTCCAACTAAATATAGAGAAGCCCTATCACACTCAGGTAGTGGCGCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 158753 72 + 647215 GCATCATTCTTCCTTCACCATGCTCCATCTAAATGTAGAGAAGCTAAATTACCCTCAGGTAGTGGTACATAA - -a -s mr.mrrefChr5 24104 162 + 294542 GTGACATGTGCCTGGACTCCTCCTCTTCTGAGGCTGGGAATTGAAGCCGCTTATTTTCATTGGAAGGTCAGTTACCATATACATACTTTGCAAAATGCAATAAAGTTTGGATGGGTCAATCAGCGTAGGGTCCCATTGCCTGCATGCATACTAAGTTTGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474161 162 - 636262 GTGACATGTGCCTGGACTCCTCCTCTTCTGAGGCTGGGAATTGAAGCCGCTTATTTTCATTGGAAGGTCAGTTACCATATACATACTTTGCAAAATGCAATAAAGTTTGGATGGGTCAATCAGCGTAGGGTCCCATTGCCTGCATGCATACTAAGTTTGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 158825 162 + 647215 GTGACATGTCCCTGGACTCCTCCTCTTCTGAGGCTGGGAATTGAAGTCACTTAGTTTCATTGGAAGGTTAGTTACCATACACATACTTTGTAAAATGCAATAAAGATTGGAGGGGCCAAACAGAGTAGGGTCCCATAGCCTGCATGTACACTAAGGTTGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 24266 117 + 294542 ATATCTATTACACCAAGAGGTAAAGCCATTCATTACAGTGTGGTCAGTCAGACCGTCTAGTCACTCAGGGCTTAGTGGTACCCAGCGCGTTTTATGTATGACAAAAGGAACTTGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474323 117 - 636262 ATATCTATTACACCAAGAGGTAAAGCCATTCATTACAGTGTGGTCAGTCAGACCGTCTAGTCACTCAGGGCTTAGTGGTACCCAGCGCGTTTTATGTATGACAAAAGGAACTTGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 159004 117 + 647215 ATATCCGTTACATCAAGCTATAAAGCCATACATTACAGTGTGATCACTCAGACAGTCCAGTCACTCCGGGATTAGTGGTACCTAGTGCATTTTTTGTATGGCAAAAGGAACTTGGAA - -a -s mr.mrrefChr5 24383 82 + 294542 AGGAACCCAAGTGGTCCACAGTAAATTAGATGGCCCCAGATTTCTGTAGCCTGTAACAGCTCATGTGGTCATGTCACCCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474440 82 - 636262 AGGAACCCAAGTGGTCCACAGTAAATTAGATGGCCCCAGATTTCTGTAGCCTGTAACAGCTCATGTGGTCATGTCACCCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 159155 82 + 647215 AGGAAACTAAGTGGCTGACATTAAATTAGGTGGCCCCAGATTTCTGTGGCCTGTCTCAGCTCATGTGGTCATGTCACACCAT - -a -s mr.mrrefChr5 24465 39 + 294542 GGCCTAGCTCAGCCACATCTAGCTATATCTAGAACATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474522 39 - 636262 GGCCTAGCTCAGCCACATCTAGCTATATCTAGAACATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 159246 39 + 647215 GGCATAGCTCAGCCACATCTAGCTGTATTTAGGACATAG - -a -s mr.mrrefChr5 24504 32 + 294542 ATATAAATAAGATAGCATCTCACTCATCAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474561 32 - 636262 ATATAAATAAGATAGCATCTCACTCATCAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 159291 32 + 647215 ATATGTATAAGATAGCATCTCACTCTTAAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 24536 107 + 294542 TGAAGCGTGTTGGATCCTTCTACAGGGGCCTGCGATCACTTGACACTGCACGAGGCGGGTAGGATCCTTTCACAGGTGCCTGTGATTGCTTGTTGTTGTAGACGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474593 107 - 636262 TGAAGCGTGTTGGATCCTTCTACAGGGGCCTGCGATCACTTGACACTGCACGAGGCGGGTAGGATCCTTTCACAGGTGCCTGTGATTGCTTGTTGTTGTAGACGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 159324 107 + 647215 TAAAGGGTGTTGGGTCCTTCTACAGGGGCCTGTGATCACTTGACACTGTATGAGGCATGTATGATCCTTCTACAGGTGCGTGTGATTGCTTGTTGTTGTGCACAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 24643 10 + 294542 CTGTAGGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474702 10 - 636262 CTGTAGGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 159431 10 + 647215 CTGTATGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 24653 107 + 294542 TCTCAACAACGTTAAGGCTATCAACACAAAATGGAGACAGGAAATTTTGTGATTTATGCCGCAAAAGGTTCCAAGATGGGTATCCATCACCCCAGAGACCCTCGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474747 107 - 636262 TCTCAACAACGTTAAGGCTATCAACACAAAATGGAGACAGGAAATTTTGTGATTTACGCCGCAAAAAGTTCCAAGATGGGTATCCATCACCCCAGAGACTCTCAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 159441 96 + 647215 TCTCATCAACGTTAAGGCTAT-----------GGAGACACGAAATTTTATGATTTATGCCGCAAAAGGATCCAAGATGGTTCTTCATTGCCCCAGAGACCCTCGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 24760 59 + 294542 AGTCTACCCGGAACTATTATATATCAAACATTTAGACCCACTACCTCCAAAATTATGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474854 59 - 636262 AGTCTACCCGGAACTATTATACATCAAACATTTAGACCAATTACCTCCAAAACTATGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 159539 59 + 647215 AGTCTACCTGGAATTATTATATATCAAACATTTAGACCCACTACCTCCAAAATTATGAA - -a -s mr.mrrefChr5 24819 141 + 294542 ATTTAAATACCATAGGTACGGTAGCAGATATAGCACATGTGACATTCCAAACCTGGTTAGTTAAGGTGGGTCAGTATTGCAAGTTTTGTAAAATTAATTGTCTAAGGAAATTTTTATTGTGATGACACAAGATGTCAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474913 141 - 636262 ATTTAAATACTATAGATACGCTAGCAGATATAGCACATGTGGCATTCCAAACCTGGTTAGTTAAGGTTGGTCAGTATTGCAAATTTTGTAAAATTAACTGTCTAAGAGCATTTTTATTGTGATGACACAAGATGTCAGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 159599 141 + 647215 AGCTAAATACCCTAGGTATGGTATGAGATATAGCACATGTGACATTCCAAACTTAGTTAGTTTAGGTGGGCCAGTATTGCCAGTTTTGTAAAATTAATTGCCCAAGGAAATTTATATTGTGATGACACAGGATGTCAGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 24960 44 + 294542 TGTTTTATAGTGAATAACAGAGAACACTGTGCTAGGGGGAGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475054 44 - 636262 TGTTTTATAGTGAATAACAGAGAACACTGTGCTAGGGGGAGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 159760 26 + 647215 TGTTTTACGGTGCA-------GAAAACTGTACT----------- - -a -s mr.mrrefChr5 25004 13 + 294542 TCATGATGCTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475102 13 - 636262 TCATGATGCTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 25017 9 + 294542 AGATAATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475124 9 - 636262 AGATAATAT - -a -s mr.mrrefChr5 25026 55 + 294542 CATGATGTTGCTTAATCAGTACCCACCCACAGCCCATTACTATAAGTGGGCTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475134 55 - 636262 CATGATGTTGCTTAATCAGTACCCACCCACAGCCCATTGCCATAAGTGGGCTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 159786 50 + 647215 -----TGTTGGGTAATCAGTACCCACCCACAGCCCATCACTACAAGTGGTCGAGA - -a -s mr.mrrefChr5 25081 183 + 294542 ACTATATATCTTAACCCTTCTGAGAATGAAGTTCTCTTTTAAGAAGTTGGGTATGGAACTGCAAACGCAGCACAAGGCAAGAGTTAGGTACCACAAACAAATCAAACTCTGAGCTGTATAACCATGGGATGTGTGCTGTTCTTTGTGAGGGTATAATATAGGGATCATCTATATAATATATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475189 183 - 636262 ACTATATATCTTAATCCTTCTGAGAATGAAGTTCTTTTTTAAGAAGTTGGGTATGTAACTGCAAACGCAGCACAAGGCAAGAGTTAGGTACCACAATCAAATCAAACTCTGAGCTGTGTAACCATGGGATGTGCGCCATTCTTTTTGAGGGTATAATATAGGGATCATCTATATAATATATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 159840 178 + 647215 ACTA-ATATCTTAACCCTTCTGAGAATGAAGTTCTCTTTTAAGAAGTTGGGTATGGAACTGGAAACACAGCACAAGGCAAGAGTTAGGTACCACAAACAAATT----CCTGAGCTGTATAACCATGGGATGTGTGCTGTTCTTTGTGAGGATATAACATAGGGATCATCTATATAATATATGT - -a -s mr.mrrefChr5 25264 26 + 294542 GCAGCACATGGATCAGAAAATTGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475372 26 - 636262 GCAGCACAGGGATCAGAAAATTGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 160028 26 + 647215 GCAACACATGGATCAGGAAATTGCTG - -a -s mr.mrrefChr5 25290 69 + 294542 TTGTGTTGACATATTAAGAAAGCATATACTGCATGTTTGCTGGAGATTTTGGATACTCTGTTAGGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475407 69 - 636262 TTGTGTTGACATATTAAGAAAGCATATACTGCATGTTAGCTGGAGATTTTGGATACTCTGTTAAGGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 160054 69 + 647215 TTGTGTTTACATACTAAGAAAGCATATACTACATGTTTGCTGGATATGTTGGATACTCTGTTAGGGACT - -a -s mr.mrrefChr5 25359 128 + 294542 GCAGTGCAGCTGCTGACTAGGTTATATTGAATCTTCCAGTGTGAAGCATGGTCATGGGTCTATGCAGTCAGAAATGTCATGTCATAGGCAGTTCATCAGATAACTTCACTTTCTAGCATCACAATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162497 128 + 636262 GCAGTGCAGCTGCTGACTAGGTTCTATTGAATCTTCCAGTGTGAAGCATGGTCATGGGTCTACGTAGTCAGAAATGTCATGCCATAGGCAGTCCATCCGATAACATCACTTTCTACCATCACAATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 160130 122 + 647215 --AGTGCAGCTGCTGGCTAGGTTATATAGAATCTTCCAGTGTCATGTATGGTCAAGGGTCTATGCAGTCAGAAATGTAATGTCATAGGCAGTTCATCAGATAACTTCATTTTCTAGCATCACAA---- - -a -s mr.mrrefChr5 25487 57 + 294542 ACCACTACTGTATCCACGCCAACTGCAAGCTTGTCCTAGGCCAATATAGACAACATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162626 45 + 636262 ACCACTACTGGATCCATGCCAACTGCAAGCT------------ATATAGACAACATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 160252 53 + 647215 ----CTACTGTATCCACGTCAACTGTAAACTTGTCCTAGGCCAATATAGACAACATC - -a -s mr.mrrefChr5 25544 50 + 294542 TTCCCATCATAAAGTTTGCATGCTGCACTGAATCTCAAAACCTGACAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162671 50 + 636262 TTCCCATCATAAAGTGTGCATGCTGCACTGAATCTCAAAACCTAACAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 160306 50 + 647215 TTCCCACCATAAAGTTTGCATGCTGCACTGAATCTCAAAACCTGTCAAGT - -a -s mr.mrrefChr5 25594 14 + 294542 ATTGGTTGAATCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162721 14 + 636262 ATTGGTTGAATCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 160358 14 + 647215 ATTGGTTGCATCCA - -a -s mr.mrrefChr5 25608 165 + 294542 CCCCTTGCTTAAACATCAGAAATGAATCAGTGAGAATGAAGCAGCAGAATGAATAGCCTATCTGGAGCAACCCTCCTGAACTTTGAAACCATTCAAGGGTCCTCTAAAAGTAGTCTTCAAGATTAGAGGAGTGGTTTTAGCTAAGGTTGGTTAGCCCGCTTACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162735 163 + 636262 CCCCTTGCTCAAACATCAGAAATGAATCAGTGAGAATGAAGCAGCAGAATGAATAGCCAATCTGGAGCAACCCTCCTGAATTTTGAAACCATTTAAGGGTCCTCTAAAAGTAGTCG--AAAATTAGAGGAGTGGTTTTAGCTAGGGTTGGTTAGCCCGCTAACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 160373 163 + 647215 CCCCTTGCTTAAACATCAGAAATGAATCAGTGAGAATGAAGCAGCAGAATGGATAGCCTATCTGGATCATCCCCCCTGAACCTTAAAACTATTCAAGGGTCCTCTAAAAGTAGTCTTCAAGCTTAGAGTAGTGAGC--ACCTAAGGTTGGGTAGCTTGCTTACCT - -a -s mr.mrrefChr5 25773 138 + 294542 CTAAAGGTCTCTATTGTGGGAGCAGGTGTGCGCGACTGTGTGAAATGTGAATGCATTTTATAAAGGAGCTGCTTCAGTGCCAGCATATTCAACTGTTCCCTCTCCCCCCCCACATGAGTTTTGGATCATCAGGAGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162898 134 + 636262 CTAAAGGTCTCTATTGTGGGAACAGGTGTGCGCGACTGTATG----GTGGATGCATTTTATAAAGGAGCTGCTTCAGTGCCAGCATATTCAATTGTTCCCTCTCCCCCCCCACATGAGTTTTGGATCATCAGGAGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 160585 138 + 647215 CTAAAGGCCTCAATTGTGGGGGCATGTGTGCGCAACTGTGTGAAATGTGAATACATTTTATAAAGGAGCTGCTCCAGGACCAGCATATCTAACTGTTCCCTCTCCTCCCCCACATGAGTTTTGGATCATCAGGAGTAG - -a -s mr.mrrefChr5 25911 337 + 294542 GTTAGAAGTACACACAGGCCGTTGGCACTCTCCCAAGGAGAACCCACTTACAAGATCACCTTTGACTTCTATCAGTGCAAGTGGGTCAAGCTTCCTGGATCAAAAAGTCTCTTGCCCACATGAGATCTTAAATTGTGATTCACTAGAACTGCTAGTGCCCTTCCAATAATGTTCACCCCACCAACACTTATTTCTTCCATCAGGATCTGGAGGCCATATGCTCATCTCTACACTCATTTCAACACTAGGGCCTGGTAATTGGATCCCAAAATGGTGTAATTGAGCATTTTTGAATGTTTCAACCTTTTTGAAAACCTTACTTGATACAGGGCAGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163032 336 + 636262 GTTAGAAGTACACACAGGCTGTTGGCACTCTCCCAAG-AGAACCCACTTACAAGATCACCTTTGACTTCTATCAGTGCAAGTGGGTCAAGCTTCCTGGCTCTAAAAGCCTCTTGCCCACATGAGGTCTTGAATTGTGATTCACTAGAACTGCTAGTGCCCTTCCAATAATGTTCACCCCACCAACACTTATTTTTTCTATCTGGGTCTGGAGGCCATATGCTCATCTCTACACTCATTTCAGCACTGGGGCCTGGTAATTGGATCTCAAAATGGTGTAATTGAGCATTTTTGAATGTTTCAACCTTTTTGAAAACCTTACTTGATACAGGGCAGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 160726 330 + 647215 GTCAAAAGTAAATACAGACCGTTGGCACTTTCCCAAGGAGAACCCACTAACAAAATCACCTTTGACTCCT------GCAAGCAGGTCGAG-GTCATGGATCAAAAAGTCTCTTGCCCACATAAGATCTTAAATTGTGATTCACTTGGAATGCTAGTGCCCTTCCAATAATGTTCACCCCACCAACACTTATTGCTTCCATCAGGATCTGGAGGCCATATGTTTGTCTCTACACTCATTTCAACACCAGGTCCTGGTAATTGGATCCCAAAATGATGTATTTTAACATTTTTGAATGTTTCAACTTTTTTCAAAACCCTACTTGGTACAGGGCAGTAG - -a -s mr.mrrefChr5 26248 116 + 294542 TCTGAGTCATTTAGAAACATATTATAAAGGAATCAACATGCACCAGATTTTGAAGCCAATTCTGTCAGGCCCAGTACACCCCCCCTGGTTGTACCACCGCTATTCAGGGCATTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163370 116 + 636262 TCTGAGTCATTTCGAAACATATTATAAAGGAATCAGCATGCACCAGATTTTGAAGCCAATTCTGTCAGGCTCAGTACACCCCCCCTGGTTGTACCACCGCTATTCAGGGCATTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 161056 110 + 647215 TCTA---CTTTTAGAAATATATTA---AGGGATCAACATGCCCCAGATTTAGAAGCCATTTCGGTCAGGCCTAGTACACCCTCCCTGGCTGTACCACTGCAATTCAGGGCATTGCA - -a -s mr.mrrefChr5 26364 87 + 294542 TGCACCAGATTGTCTGGTCATCATGGGGCTGGTGCCTGATGACTGCCCATAGATGCGGCCCATACACATGTAGTATGTGGTTCCTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163486 87 + 636262 TGCACCAGATTGTCTGGTTGTCATGGGGCTGGTGCATGATGACTGCCCATAGATGTTGCCCATACACATGTAGAATGTGGTTCCTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 161168 87 + 647215 TGCCCCAGATTGCTCGGTCATCATGGGGATGGTGCCTGATGACTGCCCATAGACGCGGCCCATACACACGTAGTATGTGGTTCCTAG - -a -s mr.mrrefChr5 26451 84 + 294542 AACCTGTGACTAGCATCACAAAGTAACCATCTGGGAAGTGGAATAATTAAGGAATAGCAAACAGTTATACATGTCTGTGTATCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163573 84 + 636262 AACCTGTGACTAGCATCACAAAGTAACCATCTGGGAAGTGGAATAATTAAGGAATAGCAAACAGTTATACCTGTCTGTGTATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 161260 77 + 647215 AACCTCTGACTAGCAT-------TAATGATCTGTGAAGTGAAGTAATTAAGGAATAGGAAACTGTTGTATATGTCTGCGTATCG - -a -s mr.mrrefChr5 26535 68 + 294542 GTGCAGTTATGACAGAAAACTTGCAGGGACCTGGAGGATGGTGTTATAATAGACTTGAAACAGGACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163657 68 + 636262 GTGCAGTTATGACAGAAAACTTGCAGGGACTTCTAGGATGGTGTTATAATAGACTTGAAACAGGACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 161339 68 + 647215 AGGCAGTTATGACTGAAAACTTGCAGGGACCAGGAGGATGATGTTACAATAGACTCGAAATAGGACTA - -a -s mr.mrrefChr5 26603 180 + 294542 TGGAGTTAGTGGTGCAATTCTAGGAAAATCTGGGGAAATTTGTTGTGTGTTTCATCTTTTTGTCACTATCAATATGTAGGACAAGAGGTCAGCAGACCCAGTACACTTGGTTTAGTGTAATGACCTCCATATATGGAGCAATGATAATCTGAATAGATAGATAGGATATATCTACTGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163725 179 + 636262 TGGAGTTAATGATGCAATTCTAGGAAAGTCTGGGGAAAGTCGTTGTGTGTTTCATCTTTTTGTCACTATCAATATGTAGGACATGAGGTCAGCCGACCCAGTACACCTGGTTTAGT-TAATGACCTCCATATATAGAGCAATGATATTCTGAATAGATAGGTAGGATATATCTTCTGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 161424 178 + 647215 TGGAGTTCGTGGTGCAATTCTAGGAAAATCTGGTGAAATTTGTTGTGTG--TGATCTTTTTCTCACTGTCAATATATAGGTCAAGGGGTCAGGAGTCCCAGTATACTTGGTTTAGTGTAGTGACCTCCATATATGGACCAATGATAACCCAAATAGACAGATACGACATGTCTACTGCAA - -a -s mr.mrrefChr5 26783 10 + 294542 CCGCAGTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163904 10 + 636262 CCGCAGTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 161631 10 + 647215 CCACAATGAG - -a -s mr.mrrefChr5 26793 26 + 294542 AGATCAGCGGTTTAGACAAATAGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163914 26 + 636262 AGATCAGCGGTCTAGACAAACTGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 161644 26 + 647215 AGATTAGTGGTTTAGACAAATAGTAA - -a -s mr.mrrefChr5 26819 157 + 294542 CTCCTGGCTGGGCTGGTTACCTATTGTGCATACACTGTGTGAGATGAGCCAGTTGGACAACTGGTGAGCACCAACTAGGTCCCTTGTTTGTGATCATGCTAAGAAAATTAATCCTATTGGCTGGTAATTTTAGCTGGCAAAACTATTCACGTCTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163940 157 + 636262 CTCCTGGCTGGGCTGGTTATCTATTGTGCATACACTGAGTGAGATGAGCCGGTTGGACAACTGGTGAGTACCAACTAGGTCCCTTGTTTGTGATCATGCTAAGAAAATTAATCCTATTGGCTGGTAATTTTAGCTGGCAAAACTATTCACGTCTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 161671 153 + 647215 CTCCTGGCTGGGCTGGTTACCTATCGTGTATGCAATGTGTGA----AGCCAGTTGCACCACTGGTAAGCACCAACTAGGTCCCTTGTTTGTGATCATGCTAAGAAAATTTACCCTGTCAGCTGATCACTGCAGCTGGTCCAACTATTCACATCTTAC - -a -s mr.mrrefChr5 26976 131 + 294542 TTGTGTGGCCGGAACTTGTGGATCTGCCAGTGAGTATGCACTCACGCAAAGAACCTCACATAACACAACCATTGGGCTGACCCAGAGTCCAAACATACCAACAAACTGCATTGCTTGTATTGACAACACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164113 131 + 636262 TTGTGTGGCCGGAACTTGTGGATCTGCCAGTGAGTATGCACTCACGCAAAGAACCTCACATAACACAACCATTGGGCTGACCCAGAGTCCAAACATACCAACAAACTGCATTGCTTGTAGTGACAACACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 161824 122 + 647215 CTGTGGGGCCGGAACTTCTGAGTCGGCCAGTGAGTATGTACTCACTCGAAGAACCTCACATAACACAACCATTGGGTTGAACTGGAGTCCAAAAATAC---------GCATTGCTTGTATTGACAACACAG - -a -s mr.mrrefChr5 27107 35 + 294542 TTAATTGAGATATCGCTTCAGCCTCATCTGACTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164245 35 + 636262 TTAGTTCAGATATCGCTTCAGCCTCATCTGACTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 161946 35 + 647215 TTAATTGAGATATCACTTTGGCTTCATCTGACTAC - -a -s mr.mrrefChr5 27142 16 + 294542 AGGAAGGGACGTTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164280 16 + 636262 AGGAAGGGACGTTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 161982 16 + 647215 GGGAAGGGATGTTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 27158 60 + 294542 ACACTCCCTCTCTGGGTCATGTGTACTCCTGAGTACCTTTATAGCAAATTGACCGGTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164297 60 + 636262 ACACTCCCTCTCTGGGTCATGTGTACTCCTGAGTACCTTTATAGCAAATTGACCGGTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 161998 60 + 647215 AGACTCCCTCTCTGAGTCATGCGTACTCCTGAATAACTTAATAGCAAACTCACCAGTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 27218 28 + 294542 GCATTTGCCTTTTATTGGAACTTTGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164357 28 + 636262 GCATTTGCCTTTTATTGGAACTTTGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 162114 28 + 647215 GCATTTGCCTTTTATTGTAGCTTTATTC - -a -s mr.mrrefChr5 27246 76 + 294542 GAGGTACTGTGCAACTTCTAAACAATGTTAAAGTTTCATTCACACTAGTACTGGAGGAAATCCTGCATTGAAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164385 76 + 636262 GAGGTACTGTGCAACTTCTAAACAATGTTAAAGTTTCATTCACACTAGTACTGGAGGAAAGCCTGCATTGAAGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 162149 76 + 647215 AAGGCATTGTGTAAAGTCTAAACAATGTTAGGGTTTCATTCACACTACCAGTGGAGGAAATCCTACATTGAAGTCT - -a -s mr.mrrefChr5 27322 10 + 294542 CTAATCTAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164461 10 + 636262 CCAATCTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 162294 10 + 647215 CTAATCTAGC - -a -s mr.mrrefChr5 27332 17 + 294542 ATGTAACCTCTTCCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164474 17 + 636262 ATGTAACCCCTTCCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 162304 17 + 647215 ATGTAACCTCTTCCTAT - -a -s mr.mrrefChr5 27349 126 + 294542 ATTGACCTTTCCAACCAGACTGTAGCACCATACCGTTAGTCTAAACAGAGGTATTTATGCCATCTCACAATGAAAAACCCTGAGTAGTGAAACTTGGTCAGTCAATTGGCATGTCAACTCTGTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164491 65 + 636262 ATTGACCTTTCCAACTAGACTGTA-------------------------------------------------------------AGTGAAACTCGGTCAGtcaattggcatgtcaactctgtgag -s simRat_chr6.simRat.chr6 162329 126 + 647215 ATTGACCTTTCCAACCAGACGGTAGCACCATACCGTTAGTCTAAACAGAGGTATTTATGCCATCTCACAATGAAAAACCCTGAGTAGTGAAACTTGGTCTGTCAATTGGCATGTCAACTCTGTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 27475 85 + 294542 ATGATTATGTGGTTCTTTTAATGAGAGCAGGCTATAGGTTCCATCACATTTAGAGGcttTCAGCTGCAACAGAGGTTCATGGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164556 85 + 636262 atgatttcatggttctttgaatgagagcaggctataggttccatcacatttagaggcttTCAGCTGCAACAGAGGTTCATGGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 162460 85 + 647215 ATGATTATGTGGTTCTTTTAATGAGCGCTGGCTACCCGTTTCATTTCATTTAGAGGCTTTGAGCTGCAGCAGAGCTTCATGGCAG - -a -s mr.mrrefChr5 27560 100 + 294542 TAGCTATTGCTCACGTAGCCCCCTTGAGAAGTTAAAGATGTGTGTGATATTAAAGCCATGTAAACCCAATTTGCTTCAGTACAATCTTTATAGCCATATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164642 94 + 636262 TAGCTATTGCTCACGTAGTCCTCTTGATAAGTTAAAGACGTGTGTGATATTAAAGCCATGTAAAC------TGCTTCAGTACTATCTTTATAGCCATATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 162545 100 + 647215 TACCTACTGCTCACATAGCCTCCTTGAGAAGTTAAAGATGTGTGTGATATTTAAGCCATGTAAATCCAATTTGCTCCAGTACAATCTTTATAGCCATATT - -a -s mr.mrrefChr5 27660 19 + 294542 GAATCACAATACTCAAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164969 19 + 636262 GAATCACAAGACTCAAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 162645 19 + 647215 GAAACACAATACTCACGGG - -a -s mr.mrrefChr5 27679 362 + 294542 TTGGTGTGATAAGGCTCTAGGGCTCTTTCTTCTTCATCTGATGAAGCTTGTGTGGGATGAACATAACCGCTACAGGAATCTCAATTGCATGTACCATTCATGCTATGGATGCCCCACAGAAATATGAACTGCATGCCCTAGTCACACAATGGATGTTGAGTCCACAGTACTGAGATAGGTCATGATACCATACTAATCATGACACAGTCAGTGTGATCAAGATAGCTCATTTAGGGCTATATCACTGCCTATATTCATCATAAAGTGTATGCACAACAAGAACCATGTATACTCCTAAGTTTTTCTAGACTGAGTACTACACTGGTGTGGTGACACTGTGCCATGTAGTATTGGTTGCAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164991 362 + 636262 TTGGTGTGATTAGACTCTAGGGCTCTTTCTTCTTCATCTGATGAAGCTTGTGTGGGATGAACATAACCGCTACAGGAATCTCAATTGCATGTACCATTCATGCTATGGATGCCCCACAGAAATATGAACTGCATGCCCTAGTCACACAATGGATGTTGAGTCCACAGTACTGAGATAGGTCATGATACCATACTAATCATGACACAGTCAGTGTGATCAAGATGGCTCATTTAGGGCTATATCACTGCCTATATTCATCATAAAGTGTATGCACAATCAGAACCATGCATACTCCTAAGTTTTTCTAGACTGAGTACTACACTGGTGTGGTGACACTGTGCCATGTAGTATTGGTTGCAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 162664 290 + 647215 TTGGTGTGATAAGGCTCCAGGGCTCATGCCTCTTGATCTGATGAGGCTCATGTGTGATGAAAATAACTGCCACAGAAATCTGAATTCCCTGCACCAGCCATGCTATGGATGCACCACAAAAATATGAATTGCATGCCCCAGCCACACAATTGATGCCGAGTCCACAGTACTGAAATAGGGCATGACACCATACTAATCCTGACACAGTCAGTGTGATAAGGATAGCTTGTTTAGGTTTATACCACTGCCTACACTCATCATAAAGTGTATGCACAACAAAAACCATGTAT------------------------------------------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr5 28041 187 + 294542 CAGGTAGAATGTAGCTTCATCTAATATTGGCTAATTAACGACTCAGTACGGAATTTCCAGATGTTGGATCTGTTTAGAGGAAATATGCACGAGAATTTCAGTGCCAAGCGATGATTTCAGTACTTGACTGATAAAGCAGTTGAACTGGATTGTTCTATCTAATGTAGGAGAGGTGGATAGATGGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165360 187 + 636262 CAGGTAGAATGTAGCTTCATCTAATATTGGCTAATTAACGACTCAGTACGGAATTTCCAGATGTTGGATCTGTTTAGAGAAAGTATGCATGAGAATTTCAGTGCCAAGCGATGATTCCAGTACTTGACTGATAAAACAGTTGTACTGGATTGTTCTATCTAATGTAGGAGAGGTGGATAGGTGGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 162954 149 + 647215 -------------------------------------AAGACCCAGTACGGAATTTCCAGATGTTGGATCTGTTTAGAGGAAATATGCACCACAATTTTAGTTCGGAGCGATAATTTCAGTATTTGACTGATAAAGCAG-TGAACTAAATTGTTCTATCTGATGTAGGGGAGGTGGATAGATGCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 28228 86 + 294542 ATGAGCACTCTAATAGGGCTAAGTTCAAATTATCCCTAGTTAGGTCAAAAGCCCAATTCTCACACTGTTGGAGTGACCACTCCCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165553 83 + 636262 ATGAGCACTC---TAGGGCTAAGTTCAAATTATACCTAGTTAGGTCAAAAGCCCAATTCTCACACTGTTGGAGTGACCACTCCCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 163103 86 + 647215 GTGAGCACTCTAATAGGGCTAGGTGCCAATTATCGCTAGTTATGTCAAAAGCCCAATTCTCACACCGTTCGAGTGACCACTCCTGT - -a -s mr.mrrefChr5 28314 63 + 294542 GGATTGGTATGTTGAATCAGCCAAGGTGAAATCAAAGTGCTTGAACTTAGTTCCTTGCGGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165636 63 + 636262 GGATTGGTATGTTGAATCAGCCAAGGTGAAATCAAAGTGCTTGAACTTAGTTCCTTGCGGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 163190 63 + 647215 GGATTGGTATGTTGAATCAGCCAATGTGTGATCAGAGTGCTTGAACTTAGTTCCTTGCAGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 28377 44 + 294542 TAAGGGCCGCGCATAAGTTGGTCCCACCTCAATCAATGATAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165700 44 + 636262 TAAGGGCCGCGCATAAGTTGGTCCCACCTCAATCAATGATAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 163253 44 + 647215 TAAGAGTAGCCCATGAGATGGTCCCACCTCAAGCAAGTAAAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 28421 23 + 294542 CTATTGTGGTCGCGATTGAGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165744 23 + 636262 CTATTGTGGTCGCGATTGAGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 163299 23 + 647215 CTATTGTGGTTGCAATTGGGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 28444 90 + 294542 GATGAGCTCAGTTGTGTACCTTTACCCCATGCTAGATGTGGTCAGCAGTTACTGGCCCTTGCAAGTCCGCCCAACAGTGCACAAGTGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165777 88 + 636262 GATGAGCTCAGTTGTGTACCTTTACCCCATGCTAGATGTGGTCAGCAGACAC--ACCCTTATAAGTCTGCCTAACAGTGCACAAGCGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 163322 90 + 647215 AATGAGCTCAGTTGTGTACTTTGTCCTCATGGTAGATATAGTCAGCAGTTACTGGCCCTTGCTAGTCCCCCCAACAGTGGACAAGTGCTG - -a -s mr.mrrefChr5 28534 78 + 294542 AGCTCATAGGATTAGAATAGTGGTGGCCTGATATGATTGTATTTCTGAACACGTTCCTGTGGCTGCTAAAATGTCCCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165882 77 + 636262 AGCTCATAGGATTTGAATAGGCATGGCCTGATATGATTGTA-TTCTGAACACGTTCCTGTGGCTGCTAAAATGTCCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 163412 78 + 647215 AGCATATAGGATTACAACAGTGGTTGCCTGATCTGATTGTATTTCTGAACTTGTTCCTGTGGCTGCTAAAAAGTCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 28612 286 + 294542 CCTCTACTAGAACAATTTCTCCCAGAAATTGCTGGTAACAAGGGGTTCCTTGAGAGATAAGCTAGTTTCTGAAAGCCCAAAGTTCACACTAATCAATTGAGACGTATTCAAACTTGATAATTGTAGTCGCCAGGATTAGAATGACTCACATGTGAAGCAACATGTAGATTTACAGGCTCTTTTATGGAGGGTAATTCAGAGATTAATACTGCTTCTTACGTAAACCACTTGCCCCATAGAGAAACCAACTGAACACCATGTGTAAAGTCAGTATTCACCTCAAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165960 280 + 636262 CCTCTACTAGAACAATTTCTCCCAGTAATTGCTGGTAACAAG-----CCCTGAGAGATGGGCTAGTTTCTGAAAGCCCAAAGTTCACACTAATCAATTGTGAAGCTTTCAAACTTGATGATTGTAGTCACCAGGATTAGAATGACTCACATGTGAAGCTACAAGTAGATTTACAGGCTCTTCTATGGAGGGTTATTCAGAGATTAATACTGCTTCCTACGTAAACCACTTGCCCCATAGAGAAACC-ACTGAACACCATGTGTAAAGTCAGCATGCACCTCAAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 163490 284 + 647215 CCTCTATTAGAACATTTTTTCCCAGAAAGTGCTGGTAATAAGGGGTTCCTAT-GAAATAAGCTAGTTTCTGAAAACCCAAAGTTCACACGAATCAATTAACGCCTAGGTAGACTTGATAATTGTAGTCGCGACGATTAGGTTGACTCACATATGAAGCAACATGTGGATTTACAGGCTCTTTTATGAAGGGTAATTAAGAGATTAATACTGCTACTTACGTAAACCACTTGC-CTATAGAGAAACTAATTGAACACCATGTGTAAAGTCTGTATTCATCTCAAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 28898 287 + 294542 AACACAAGGTAGGATTTGCTTTTTCTTTATCATATAAGATTAATGTTTGGTCTAACCAGAGGACCACCAATCATTTCCACAAACTTTTACAATTTGGAATTGCCTGGAGTCTACAATTTATGGTTAGTCTCTCCCTGATTTTCTCCAAGAGTATCTATAAATAAGACATGATTATCGAGCTGCTGCACAGCATTGTAGTCTGGCGGTACATCATCTTTGAGGTTTTCAGTGTAACAGCAGTGTCTGTTTGTCTACCACATCAAATTCAATTATAGAAGCCAATAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166243 269 + 636262 AACACAGGGTAGGATTCGCTTTTTTTTTATCATATAAGATTAATGTTTGGTC---CCAGAGGACCACCAATCATTTCCACAAACTTTTACAATTTGGAATTGCCTGG-----ACAATTTATGGTTGGTTTTGACCTGATGTTCCCCAAGAGTATCTATAAATAAGACATGTTTATTGAGC----------CATTGTAGTCTGGCGGTACATCATCCTTGAGGTTTTTGATGTAACAGCGGTGTCTGTTTGTCTACCACATCAAATTCCATTATAGAAGCCAATAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 163774 287 + 647215 GACACAAGGTAGGATTTGCTTTTTCTTTATCATATAAGATTAATGTTTGGTCTAAGCAGATGACAACCAAGCATTTCCACCAACTTTTACAATTTGGGATGGCTTGGAGTCTACAATTTATGGCTAATCTCTCCCTGATTTTCTCCTAGAGTATCTATAAATAAGACATAATTATCAAGCTGCTGCACAGCATTGTAGTTTGGGGGTACATCATGTTTGAGGTGTTCAGTGTAGCAGCAGTGTCTGTTTGTCTACTGCAACAAATGCAATTATAGGAGCCAATAGTC - -a -s mr.mrrefChr5 29185 183 + 294542 ACAATTCATACCTTTAATATATTCATTAATCACCTTTAAGCCACTATAGTAGCAAGAAATAATTTCTGCTGCTCACAGGTCTATGTCCCCCCATGGGACTGGGTCCAGGGCATATCACCCACCATTGTCTTGAGGGACTAACCATATATAATGACATGGATAATTCAATTGTATGTCACAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166515 181 + 636262 ACAATTCATACTTTTAATACATTCATTAATCACCCTTAAGCCACTATAGTAGCAAGAAGTAATTTCTGCTGCT--CAGGTCTATGTCCCCCCATGGGACTGGGTCCAGGGTATAGCACCCACCATTGTCTCGAGGGACTAACCATATATAATGACATGGATAATTCATTTGTATGTCACAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 164061 183 + 647215 ACAATTCATACCTTTAATTTATTCATTAATCACCTTTAAGCCACTATAGCAGCAGGAAATAATTTCTGCTGCTCACAGGTCTATTTCCCCCCAGGGGACTGGGTCCAGTGCATATCACCCGCCATTGTCTTGAGGGATTAACCTTATATAACGTCATGGTTAATTCAATTGTGTGTCACAACA - -a -s mr.mrrefChr5 29368 15 + 294542 ATTTAAATTGTCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166696 15 + 636262 ATTTAAAGTGTCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 164246 11 + 647215 ATTTACATTG-A--- - -a -s mr.mrrefChr5 29383 23 + 294542 TACACTGAATGACATAGAATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166713 23 + 636262 TACACTGAATGACATAGAATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 164257 19 + 647215 ----CTGAATGACATAGTATGTT - -a -s mr.mrrefChr5 29406 162 + 294542 CAACATGAAGTTTCTCCAATGTAGGAAGATGTAATTATGTGGGGTATAGGCACGATGTAAAACAATCAAGGAGTAAAACTCGGCCATGTGGATGGGAAATAAGGAGGGTATCTCTGATAGCAGACATAGCCTATTCTGTCATTCAGCACATAAAGGGGATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166737 161 + 636262 CAACATGAAGTTTCTCCAATGTACGAAGATGTAATTATGTGGGGTATAGGCACGATGTAAAACCATCAAGGA-TAAAACTCGGCTGTGTGCATGGGATATAAGGAGGGTATCTCTGATTGCAGACATAGCCTATTCTGCCATTCAGCACATAAAGAGGATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 164276 162 + 647215 CAACATGAAGTTTCTCCAATGTTGGAAGATGTAATTATGTGGGGTATAGGTATGATGTAAAACAATCAAGGAGTGAAACTAGGCCATGTGGATGGGAATTAAGGAGGGTATTTTTGATAGCAGACATAGCCTATTCTGTCCTTCAGCACATAAAGGGGATAA - -a -s mr.mrrefChr5 29568 208 + 294542 ATCCCCCTGCTAATTTTAGGACATGTTGGATACTTGCCAGACCCCTACAGACCCACTGGTCCCCTGTGTACACTTTTGCTATCTAACATGCAGTCTTAATGAGGACGTGAAAGCTAAAGCATATCTCACATGACAGTGTACTTGGTCTGGTTGAACAAATTGACCAGTTGTGCGCCATTGGAGTTCACCACCTACAAGATATACCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166898 205 + 636262 ATCCCCCTGCTAGTTTTAGGACATGTTGGAAACTTGCCGGACCCCTACAGACCCACTGGTCCCCTGTGTACACTTTTGTCATCTAACATGCAGTCTTAATGAGGACGTGAAAGCTAAAGCATACCTCACATGACAGTGTACTTGGTCTGATTGAACAAATTGACCAGTTGTGCGTCATTGGAGTT---CACCTACATGATAGACCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 164440 203 + 647215 ATCCCCCTGCCAATTTTAGGACATATTGGATACTTGCAAGACCCCTACAGACCTAATGGTCCTCTGTGTACACTCTTGCTATCTAACCCGCAGGCTTAAACAGGACATGAAAGCTAAGGCATATCCCACATGATAGTGTACTTGGTTTGGCTGAACAGATT-----GTCGTACCCCATTGGTGTTCACCACCTACAAGATATACCCCT - -a -s mr.mrrefChr5 29776 17 + 294542 TCACCATATCTTTTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167103 17 + 636262 TCACCATATCTTTTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 164644 17 + 647215 TCATCATATCTTTTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 29793 27 + 294542 TAACTATCAATTCTGAATACATCCGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167120 27 + 636262 TAACTATCAATTCTGAATACAGCCGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 164664 27 + 647215 TAACTATCAATTCCAAATACATCCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 29820 41 + 294542 TGCATAACAAATATGATTCTACAACCTCGACATCCAAGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167147 41 + 636262 TGCATAACAAATATGATTCTACAACCTCGACATCCAAGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 164706 41 + 647215 TGCATAACAAATATGATTCTATAACCTCGACATCCAAGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 29861 98 + 294542 AACACCAACATCATAATTCCTGAAGTGAACTCACATTCTCCAGGTGAACTCAGTCCATTGCCATATAAATGAATGTCAGGTGAAGATAGGATGGCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167188 98 + 636262 AACACCAACATCTTAATTCTTGAAGTGAACTCACATTCTCCAAGTGAACTCAGTCCATTGCCATATAAATGAATGTCAGGTGGAGATAGGATGACTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 164749 96 + 647215 AACACCAACAGCATAAATCCTGAAGTGAACTCACACTCTCCAGTTAAACTCAGTCCATTGCCATATAGATGAATGTTA--TGAAGGTAGTAAGGCACC - -a -s mr.mrrefChr5 29959 24 + 294542 AAAACTAATATTTACACAGGCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167286 24 + 636262 AAAACTAATATTTACACAGGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 164980 24 + 647215 AAAACTAATATTTATACAGGCTGG - -a -s mr.mrrefChr5 29983 163 + 294542 TCCCTTCCCCTACACAACCATGGGGTAACAACATGAAACACTTACCAACGGAACTCACAGGAGTTGAACTCTATCAAAGTGCACCTAAAAACACCTAAGAACAGGTCTGGTCTAGCTGCATAAGTGGGTTACAGAAGCCAACGTGGCGGCTTGCTTCTGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167310 163 + 636262 TCCCTTCCCCTATACAACCATGGGGTAACACCATGAAACACTTACCCACGGAACTCACAGGCATTGAACTCTATCAAAGTGCACCTAAAAACACCTAAGAACGGGTCTGGTCTAGCTGCATAAGTGGGTTACCGAAGCCAACGTGGTAGCTTGCTTCTGTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 165009 163 + 647215 TCCCTTCCTCTACACAACCATGGGGTGACAACATGAAACACTTACCAATGGAACTCACACGAGTTGAACTCTATCAAAGTGCACCTCAAAACACCTAAGAACAGGTCTGTACTAGCTGCATAAGTGGGATACAGAGGCCAACGTGGCGGCATGCCTCTGTACG - -a -s mr.mrrefChr5 30146 67 + 294542 TTTCTGGACCAAGAGTGCAGCAGTCACATCGCCACATGTGTTTATTTAAATCTACATACGGTGTAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167473 67 + 636262 TTTCTGGACCAAGAGTGCAGCAGTCACATCACCACATGTGTTTATTTAAATCTACATACGGTGTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 165179 67 + 647215 TTTCTGGACTAAGAGTGTAGCAGTCACATCGCCACATGTGTTTATTTAAATCTACATATGGCGTAGC - -a -s mr.mrrefChr5 30213 154 + 294542 GGCAAGTATGCCCTAGACATGGTTTGGATCGCATGATGTACATTTTTATTCTTTATACACGGCGTTTATACACAGCGTACGGTCATCCGAGTCACACGCCAGATAAAGGACGTTCTCTCGGTGGCATTTAGATGTTTGACAACATATGGAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167544 154 + 636262 AGTAAGTATGCCCTAGACATGGTTTGGATCGCATGATGTACATTTTTATTCTTTATACACGGCGTTTATACACAGCGTACGGTCATCCGAGTCACACGCCAGATAAAGGACGTTCTCTCAGTGGCATTTATATGTTTGACAACATATGGAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 165246 154 + 647215 GGCAAGTATGCCCTAGACATATTTTGGATCGCACGATGTACAGTTTTATTCTTTATACACGGCGTGTATACACGGCGTACGGTCATCCCAGTCACACGCCAGATAAAGGACGTTCTCTCGGTCGTATTTAGATGTTTGACAACATATGGAACAT - -a -s mr.mrrefChr5 30367 13 + 294542 AAGGCTGGCTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167698 13 + 636262 AAGGCTGGCTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 165401 13 + 647215 AGGGATGACTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 30380 68 + 294542 ATGGCATTTTCTCTGTGGAAAGTACAACATAATGATGTGGGCAGGAGTGCGTCGCTTCATTCTTTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167711 68 + 636262 AAGGCATTTTCTCTGTGGAAAGTACAACATAATGATGTGGGCAGGAGTGTGTCGCTTCGTTCTTTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 165417 68 + 647215 ATGGCATTTTCTCTGTGGAAATTACAACATAATGATGTGGGCAGGAGTGCATCGCTTCATTCTTTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 30448 261 + 294542 CTTTCACACACTGCCTCACTAGCCCTGGTAAAATTGTGTAAAACTTAAATTATACTCACTCCAAAAATGTCAAAGTTGTCAAGCTAGGGGTTCTAACATTCCAAAGGCATCCTCCCATGGCAAGTTGTATGTAAACTAGATAAGGCAGCATTTTAAAAACTATTCCTACCTTAAATTTTCATTCAAAGACCTACTCGTCCTCCCCTTTCCTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTGAGCCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167785 261 + 636262 CTTTCACACACTGCTTCACTAGCCCTGGTAAAATTGTGTAACACTTAGATTATACTCACTCCGAAAGTGTAAAAGTTGTCAAGCTAGGGGTTCTAACATTCCAAAGGCATCCTCGCACGGCAAGTTATATGTAAACTAGATAAGGCAGCATTTTAAAAACTATTCCTACCTTAAATTTTCATTTAAAGACCTATTTGTCCTCCCCTTTCCTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTGAGCCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 165485 256 + 647215 CTTTCACACACTGCCTCACTACCCCTTGTCAAATTGTGTAAACCTTAAATTATACTCACTCCAAAAATGTCAAAGTTGTTAAGCTAGGGGTTCTAACATGCCAA----ATCCTCCCATGGCAAGTTGTATGTAAACTAGATTGGGCAGTGTTTTAAAAACCATACCTACCTTAAATTTACATCCAAAGACCTACACGTCCTCCCCTTT-CTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTAAGCCTGT - -a -s mr.mrrefChr5 30709 64 + 294542 GTCCTAGGGCAAGATGTATTATGAGTACTAAGTACTGACAGGATATAGGGAATAAGGAACACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168046 64 + 636262 GTCCTAGGGCAAGATGTATTATGAGTACTAAGTACTGACAGGATATAGGGAATAAGGAACACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 165742 64 + 647215 GTCCTAGGGCAATATGTATTATGGGTACTGAGCACTGATAGGATATTGTGTATAAAGAACATAC - -a -s mr.mrrefChr5 30773 13 + 294542 TTGTTAATTACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168111 13 + 636262 TTGTTAATTACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 165806 13 + 647215 TTGTTAATTAATA - -a -s mr.mrrefChr5 30786 18 + 294542 CCTGCCAACTCATCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168124 18 + 636262 CCTGCCAACTCATCATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 165822 18 + 647215 CCTGTCAACTCACCATTA - -a -s mr.mrrefChr5 30804 75 + 294542 TGTTATTGTATGTAATGTACCAAACGATAGGCTATCTATTCAAAGCAACCTAGCATAAAGTTGAGGGTGGACCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168142 75 + 636262 TGTTATTGTATGTAATGTACCAAACGATAGGCTATCTATTCAAAGCAACCTAGCATAAAGTTGAGGGTGGACCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 165909 75 + 647215 CGTAATTGTATGTATTGTACCAAATGATGGGCTATCTGTTCCAAGCAACCTAATATAAAGTTAAGGGCAAACCTA - -a -s mr.mrrefChr5 30879 82 + 294542 AAACTTCCAGTCTAGCTATGCTGCACTGGCACATAAGCCACCTCTGCTGTACTGGATTACATCCCCTTACATGTCCTGGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168217 82 + 636262 AAACTTCCAGTCTAGCTATGCTGCACTGGCACATAAGCCACCTCTGCTGTACTGGATTACATCCCCTTACATGTCCTGGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 165985 82 + 647215 AAACTTCCAGTCTAGCTGCACTGCACTGGCATGTAAGCTAACTACGCTGTGCTGCTTAACATCCCCTTACATGTTTTGAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 30961 38 + 294542 ACCTGATTTTCCTTTTAAACTCAAGAAGTTTGGTGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168300 38 + 636262 ACCTGATTTTCCTTTTAAACTCAAGAAGTTTGGTGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 166067 38 + 647215 ACCTGGTTTTCCTTTTAAACTCAAGGAGTTTGGTGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 30999 135 + 294542 AGCTTGCTACAGAGCGCACCACATGGAGACTTATGAGAATATTTACAGCTTGAGCAGATATTAAATAGTAGCCTCTGGTATCATTGCCAGTATTGGATAATGACTCTGTCACACAAAATGATGACTCCAGATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168339 135 + 636262 AGCTTGCTACAGAGCGCACCACATGGAGACTTATGAGAATATTTACAGCTTGCACTGATATTAAATAGTGGCCTCTGGTACCATTGCCAGTATTGGATAATGACTCTGTCACACAGAATGATGACTCCAGGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 166105 93 + 647215 ------------------------------------------TTACAACTTGAGCAGACATTAAATAATAGCCTCTGGTATCATTGCCAGTATTGGATTATGACTCTGTTACACAAAATGATGACTCCAGAGTAG - -a -s mr.mrrefChr5 31134 146 + 294542 AAGTGTAGCCCAAGAGACAGATGTTGCCTTGGAACACTACAAAAGCCAGAGTCATTCCTTCTATTGGATTGGGGAAGATTGAGGAATCTTAGGAGTACCAAGGGCTGAGCATACATATTCATCTGGAAAAGAAAGTTAGGTGGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168474 146 + 636262 AATTGTAGCCCAAGAGACAGATGTTGCCTTGAAACACTACAAAAGCCAGAGTCATTCCTTCTATTGGATTGGGGAAGATTGAGGAATCTTAGGAGTACCAAGGGCTAGGCATACAAATTCATCTGGAAAAGAGAGTTAGGTGGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 166200 146 + 647215 AAGGGTTGCACAGGGGCCAGATGTTGTGTAGGCGGTCTATGAAGGGCAGAGTCACTCCTTCTATTGGATTGAGGAAGATCAAGGATTCTTAGGAGTACGAATGGCTGATCATACATATTCATCTGCAAAAGAAAGTTAGGTGGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 31280 143 + 294542 GGTAAAGTCAGGTGAAATGCTGATAGATCCCTTCAGTGTGGTGCTCTTGTTCTACTAACTGACAATGTAGCTCCAAGGGTAACTGAGACGGGGTTAGCCAATAGGGGAAGCCCACAAGTGGCCCTCACAGACAAATATCCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168621 143 + 636262 GGTAAAGTCCGGTGAAATGCCAATAGATCCCTTCAGTGTGGTGCTCTTGCTCTACCAACTGGCCATGTAGCTCCAAGGGTAACTGAGACGGGGTTAGCCAATAGGGGAAGCCCACAAGTGGCCCTCACAGACAAATATCCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 166346 114 + 647215 GGTGAAGCCAGGTGAAAAGCTGATAGATCCCTTCGGATT--TGCTCTTGTGCTAGTAACTGAGAATGTAGCTGC---------------------------TAGGGGAAGCCCTCAAATGGCTCTCACAGGAAAACATCCTCT - -a -s mr.mrrefChr5 31423 32 + 294542 GGGGAGGTCTAGAACTTCAGCAGGCACCGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168784 32 + 636262 GTGGAGGTCTAGAACTTCAGCAGGCACCGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 166460 32 + 647215 GGGGAGGTCTAGAATTTTAGCAGGCACTGGCC - -a -s mr.mrrefChr5 31455 47 + 294542 CATTAAGTGTCAAGCTTATTAGCTAGTTTTGACCAACTTGATAATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168819 47 + 636262 CATTAAGTGTCAAGCTTATTAGCTAGTTTTGACCAACTCGGCAATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 166492 47 + 647215 CATTAAGTACCAAGCCTATTAGTTAGTTTTGATCAACTTGATAATTA - -a -s mr.mrrefChr5 31502 227 + 294542 TATCTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAGATAACAGGATTTAAAATCAGTTCAATGTTATGGTGGTGAACTGGAGGCCACCATTCAAGGTTCTTAAATTCATACTTGTTTTATTACTTCTTGTGGCAGCTCACATATTGCCTCAAAGACATTCTTTCACATAAAAATTAGAACTTCATCATCCTGTCCCCCCCGAGTAGAGATATGTACAATAAGTGGCGATGCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168874 227 + 636262 TATCTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAGATAACAGGATTTAAAATCAGTTCAATGTTATAGTGGTGAACTGGAGGCCACCATTCAAGGTTCTTAAATTCATACTTGTTTTATTACTTCTTGTGGCAGCTCACATATTGCCTCAAAGATATTCTTTCACATAAAAATTAGAACTTCATCATTCTGACAGCCCCGAGTAGAAATATGAACAATGAGTGGCGATGCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 166539 224 + 647215 TAACTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAAATACCAGCATTTAAATTCAGTTCAGCGTTATGGTGGTGAACTGGAGGCCACCTTTCTAGGTTCTTA---TCATATTTGTTTTATTACTTCTTATGGTATATCACATATTGTCTCAAAGACATTCTTTCATATAAAGATTAGAACTTCATCATCCTGTCCCCTCCGAGTGGAGGTCCGTACAATAAGTGGAGATGCACC - -a -s mr.mrrefChr5 31729 19 + 294542 AAAGATTTCCAGGTGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169101 19 + 636262 AGAGATTTCCAGGTGGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 166764 19 + 647215 AAAGATTTCCAGGTGGACT - -a -s mr.mrrefChr5 31748 306 + 294542 AGTTACAATATTCCTGTTGACCCATTACTAACCCCCAAGAGTGCTGCCAGTCATTGAAATTTCCATTCTTTTCATTGACATATGTGCAATTGTCACCACTTCCTTGATCCTTTTAAGTCTGCAGTTTAAGAGAGACTAGGTGCAAAGATGCTACTTATTATAGGTAATGCTGAGTTAGTGGTGAGTTCATTTGATAGTGGCTATCTTGACAAAGCAATATTAATCATTCTTTGTAACTAGGTGGCTATGCTAAATAATCCTCATTATATTATTATAGGTTGAGTTACCCTTTTGAGCAGTCTCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169121 306 + 636262 AGTTACAATATTCCTGTTGACCCATTACTAACCCCCAAAAGTGCTTCCAGTCATTGCAATTTCCATTCTTTTCATTGACATATGTGCAATTGTCACCACTTCCCTGATCCTTTTAAGTCTGCAGTTTAAGAGAGACTAGGTGCAAAGATGCTACTTATCACAGGTAATGCTGAGTTAGTGGTGAGTTCATTTGATAGTGGCTATCTTGACAAAGCAATATTAATCCTTCTTTGTAACTAGGTTGCCATGCTAAATAATTCTCATTATATTATTATAGATTGAGTTACCCTTTTGAGCAGTCTCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 166783 305 + 647215 AGTTACAATATTCCTGTTGGCCCATTGCTAACCCCCAAGAGTTTTGCCAGTCATTGAGATTTCCATTCTTTTCATTGACATATATGCAAATGTAGCCACTTCCTTGATCCTTTTAAGACTGCAGTTTAATGGAGACTAGGAGAAAAGCTGCTACTTATTATAGGTAATGCCAAGTTATTCGTGAGTTCATCTTATAGTGGATATCTCAACAAAGCAATACTTATCATT-TTTGCAACTAGGTGGATATGCTAAATAATCCTCATCATATTATTATAGGTTGAGTTACCCTTTTGAGCATTCTCACA - -a -s mr.mrrefChr5 32054 137 + 294542 AGCTTATATATATGGCCTATTAACCAATGTTAATAGTGTATCATAATACGTATATATTATGAGGTTATTTCTATAAATCTATAGGTACAACTAGAGAACTACCTACAAAGTCAGTACTCAAATATTGTGTCAAAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169427 133 + 636262 AGCTTATATATATGGCCTATTAACAAATGTTAATAGTGTATCATA----GTATATATTATGAGGTTATTTCTATAAATCTATAGGTACAACTAGAAAACTACCTACAAAGTCAATACTTAAATGTTGTGCCAAAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 167095 136 + 647215 AGCTTATATATATGACCTAGTAACCAATGTTGGTAATGTATCATAATACGTACATATTATGAGTTTTTGTCTATAAATCAAT-GGTACAACTACAGAACTACCCACAAAGTCAGTACTCAAATATTGTGTCTAAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 32191 140 + 294542 AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTAGAAGTACTACACTTAGTTGAAAACTGACAGATAAGTCATACTGTATGCTGGTATAGTGCATTTTCGGCCATGCTGGGAAATTAGAGGTCATGGCCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169560 140 + 636262 AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTGGGAGTACTACACTTAGTTGAAAACTAACGGATAAGTCATACTGTATGCTGGTATAGTGCATTTTCGGCCATGCCAGGAATTTAGAGGTCATGGCCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 167235 140 + 647215 AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTAGAAGTACTACACTTAATTGAAAACTGACAGATAAGTCATACTGTATGCTTGTATAGTGCATCGTCTGCCATGCTGGAAAATTGGAGGTCATGGCCCG - -a -s mr.mrrefChr5 32331 15 + 294542 CTCTTTCTTTTGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169700 15 + 636262 CTTTTTCTTTTGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 167379 15 + 647215 CTCTTTCTTTTGTAG - -a -s mr.mrrefChr5 32346 198 + 294542 CATCTTGGGAAAAACAACAACTGCCAAGGGGGGGTAAATTATGAATCCCTTGAGCACCATACATAACCATCCAACCATTCCAGTTATTAGGTATCAACTTTGCCTTTGCTCATCTTGTATTCCTCTTGAACACTTTTACACCATCCTGACAGCCTTTGAATTTAACAGACAGGCAATCTAGACAGCCTCTTAACCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169715 198 + 636262 CATCTTGGGAAAAACAACAACTGCCAAGGGGGGGTAAATTATAAATCCCTTGAGCACCATACATAACCATCCCACCATTCCGGCTATTAGATATCAACTTTGCCTTTTCTCATCTTGTATTCCTCTTGAACACTTTTACACCATCCTGACAGCCTTTGAATTTAACAGACAGGCATTCTAGACAGCCTTTCGATCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 167396 197 + 647215 CATCCTGGGAAGAACAACAACTGCCAAGGGGGGCTGGATTATGAATCCCTTGAGCATCATAAATGACCATCCAAGCATTCCAGTGATTAGGTATCAACATTGTGCTCGCTCTTCTTGTATTCATCCTGAACACTTTTACACCATCCTGATCACCTTTGAATTGAA-AGACAGCCAATCTGGACAGACTCTTAACCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 32544 23 + 294542 ATGGAAACAATTTAAAGCAAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169913 23 + 636262 ATGGAAACAATTTAAAGCAAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 167601 23 + 647215 ATGGAAACAACTTAAAGCAAATA - -a -s mr.mrrefChr5 32567 86 + 294542 GATAGTTTGCTGTTGAGAGCTTTGACACCACAGAGCAAGAGGAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAGCCATTAGGGCAAGCTTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169936 86 + 636262 GATGGTTTGCTGTTGAGAGCTTTGACACCACAGAGCAAGAGGAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAACCATTAGGGCAAGCTTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 167628 67 + 647215 GATAGTTTTCTGTTGAAAGCTTTAACATCAGAAAGCAAGACAAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAGC------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 32653 97 + 294542 GGCAAGCTTAAAGGAATAGAGGCCCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTAAAGCAAGGAAGCAAGATATAGGTCCAAGTGAAAATTTATCTATCGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170026 97 + 636262 GGCAAGCTTAAAGGAATAGAGGCTCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTCAAGCACGGAAACAAGATATAGGTCCAAATGAAAATTTATCTATCGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 167695 97 + 647215 ACCAAGCTTAAAGCAATAGAGGTCCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTAAAGGAAGGAAGCAAAATTTAGGTCCAAGTGAAAATTTATCTAGTGAG - -a -s mr.mrrefChr5 32750 50 + 294542 TGATTACTAACCAGGGGAGATGTGAGAATCACTTCATATTATTGGACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170123 50 + 636262 TGATTACTAACCAGGGGAGATGTGAGCATAGCTTCATATCATAGGACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 167793 48 + 647215 TGA--ACCAACCAGGGGAGATGTGAGAATCACTTGGCATTATTGGACAGC - -a -s mr.mrrefChr5 32800 8 + 294542 TTGGGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170177 8 + 636262 CCGGGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 167841 8 + 647215 TTGAGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 32808 212 + 294542 CCACTTCATATTATGTGTCTGTATCTTTGATTTGCAAGAATAGTGTTTCCTAAGAGTGGCTGCCTTCTGAGAGCCCTCCTCAAATGGATGTTATACAGCAAGAGTGCATGAGTTGAAAACATTGTGCATCCTGAAGAGAAAAAGAATGGGATTATGGAAATTAAACTGTCAAATTGCAGTGTAGACATAGAAACTACTGCAAATCTTCAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170185 209 + 636262 CCACTTCATATTATGTGTCTGTATCTTTGATTTGCAAGAATAGTGTTTCCTAAGAGTGGCTGCCTTCTAAGAGCCCTCCTCAAATGGATGTTATCCAGCAAGAGCGAACGAATTGAGAACATTGTGCATCCTGAAGAGAAACAGAA---GATTATGGAAATTAAACTGTCAAATAGCAGTGTAGACACAGAAACTACTGCTAATCTTCAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 167854 212 + 647215 CCACTACATATTATGTGTCTGTACCTTTGATTTGCAAGAATAGCGTTTTCTAAGAATGGTTGCCTTCTGAGAGCCCTCCTGAAATGGATGTTATACAGAAAGACTGCATGAGTCGAAAACATTGTGCATCCCGAGTAGAAAAGGAATGGGATTATGGAAATTAAACAATCAAATTGTAGTGTAGACATAGAAACTGCTGCAAACCTTCAGAT - -a -s mr.mrrefChr5 33020 125 + 294542 CTGATGTGGTCCACTAATCAATACACCTACAATCTACTTCTCTAACTAATCCGGCCCCTTGCAGTGCACAAATACAAATTACTGCAATCTTAGATGAACCACTGGCTGTAGTCCACTAATTAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170394 125 + 636262 CTGATGTGGTCCACTAATCAATACACCTACAATCTACTTCTCTAACTAATCCGGCCCCTTGCAGTGCACAAATACAAATTACTGCAATCTTAGATGAACCACTGGCTACAGTCCACTGATTAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 168072 125 + 647215 CTGATGTTTTCCACTAATCGATACACCTACAACCAATTTCTCTAATTAATCTGGCCCCTTGCAGTACACAAATACAAACTACTGCAATTTCAGATGAACCACTGGCTGTAGTCCACTAATTAATG - -a -s mr.mrrefChr5 33145 8 + 294542 TGTCTACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170519 8 + 636262 TGTCTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 168198 8 + 647215 TATCTACG - -a -s mr.mrrefChr5 33153 108 + 294542 AGTTCTCTAATTGATCCTGCCTTAAAGAAGAAAAAGCACAGCCAATAGTAACAACCCCTAGTGATAACCATCACAAAATTTGGAGATGGAGTGCCCCCTTCTTGCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170531 108 + 636262 AATTCTCTAATTGATCCTGCTTTAAAGAAGAAAAAGCACGGCTAATAGTAACATCTCCTAGTGAGAACCACCACAAAGTTTGGGGATTGAGTGCCCCCTTCTTGCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 168206 108 + 647215 TGTTTCCTAATTGATCCTGCCTTAAAGAAGAAAAAGAACAGCCAATAGTAACAACCCCTAGTGATAACCATCACAAAATTTGGAGATGGTGTGCCCCCTTCTTGGATG - -a -s mr.mrrefChr5 33261 130 + 294542 GAGCCCCCTTCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTCATGCGGGCCCCGTCAGTTTGGGATGTGTCATGTCCAGCCATAGGCGATAAGGCCAAGTCTATAGAGCTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170640 130 + 636262 GAGCCCCCTTCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTTATGCGGGCCCCATCAGTTTGGGATGTGTCATGTCCAGCCATAGGCGATAAGGCCAAGTCTACAGAGCTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 168314 130 + 647215 GTACCCCCTCCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTCCTGCTGGCCCTGTCAGTTTGGGGTGTGTCATGTCCAGCCATAGGTGATAAGGCCAAGTCCATAGAACTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT - -a -s mr.mrrefChr5 33391 76 + 294542 ACTATCATGAGTGTACTGATGGGTCTAGACAATTTGCATGTCTCATAATGGATTGCTTACACCTAAATGTTGAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170771 76 + 636262 ACTATTACAAGTGTACTGATGGGCTTAGACAATTTGCGTGTCTCATAATGGATTGCTTACACCTAAATGTTGAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 168444 69 + 647215 GCTATCATGGGTGTACCGATGGGTCTCGACAATTGGCATGTCTCATAATG-------TACACCTAAATGTTGAATT - -a -s mr.mrrefChr5 33467 564 + 294542 TGACAGAGATGCAATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAACATACAGTCTTCGACATCTATGTGACTTCAACCAGTGATATCCCTATCCCGAAATCCCATTGGAACTAGGAGGGCTGACTGATTGTTCTTGTTCTATTGAATGCTCTCACTCTACAACTGTAATGATAGCTAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGAGAGTGTGAGCGCAGTGCCTCACCTTCCTGTTTCTGACTGAACTACTTAACCTAAAATAATGCCACAACTAGCTTTGCAAAACAAGTCAGTATCTCAAATATCCTAATAGACACAAAAGAAACAGCCATTAGCATTCCATATGTCCAACCAGCAATGTGCTCCATGAGAGGGAGTTTTTAAACTAAGTCATCTCCTTTACATCCATCCTCTATTTATCTAGTGGAATCCACTAGTAACTATTCTTCCCTTCAGGAGTAACAGTATCTTATGGATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTATATAAGTCACCCCCATTAGGCAGAAATATGTCCAGTTATTTGCAGGAAAGGTCTGAATAAGATACTAAATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170847 554 + 636262 TGACAGAGATGCAATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAACATATAGTCTTCGATATCTATGTGACTTCAATCAGTGATATCCCTATCCCAAAATCCCATTGGAACTAGGAGGGCTGACTGATTGTTCTTGTTCTA--GAATGCTCTCACTCCACAACTGTAATGAGAGAAAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGAGAGTGTGAGCG--------CACCTTCCTGTTTCTCACTGAATTACTTAACCTACAATAATGCCACAACTACCTTCGCAAAACAAGTCAGTATCTCAAATAACCTAATAGACACAAAAGAAACAGCTATTAGCATTCCATATGTCCAACCAGCAATGTGCTCCATGAGAGGGAGTTTTTAAACTAAGTCATCTCCTTTACATCCATCCTCTATTTATCTAGTGGAATCCACTAGTAACTATTCTTCCCTTCAGGAGTAACATTATCTTATGGATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTATATAAGTCACCCCCATTAGTCAGAAATATGTCCGGTTGTTTGTAAGAAAGGTCTGAATAAGATAGTAAATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 168514 544 + 647215 CGACAGAGATGCGATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAATGGACAGTCTTTGACATCTATGTGATTTCAACAAGCAATATCCCTATCCTGAAATCCCATTGGAACTGGGAGGACTGATTCATTGTTCTTGTTCTATTGA---CTATCCCTCTGCAATTGTAAGGATAACTAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGGGAGTGTATGTGCAGTGCCTCACATTCCTGTTTCTGACTGAACTACTTAACCTAAAATAATGGA------TGCTTTGCAAAACACCTCAGTATCTCAAAAATCCTAATAGACACAAAAGAAAAAGCCATTACCAGTCCATATGTCCAAGCAGCAGTGTGCT----------GAGTTTTTGAACGAAGTCATCTCCTTTACATTCATCCTCTATTTATCTAGTGGGATCCA-GAGTAACTATTCTTCCTTTCAGGAGTAACGGTATGGTATGAATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTGTATAAGTCACCCCCATTAGGTAGAAATATGTCCAGTTATTCGCAGGAAAAGTCTGAATAAGATACTAAATGTG - -a -s mr.mrrefChr5 34031 229 + 294542 CCTACAGTGCCATGTTGCGTAGTTCAAATAAGTCAGGAAAAAGCAGAGTTGTGGTTCGATGCAGACATGGGTATTACGGTGCATTTAATCTTCCCTCATTTTGAGACTAATAAGGTTAAGAGTGAAAGGTAAACCAGACAAATAACTCAGAATGGAAGGCAAATTTACATCCTAGCTTAGCCATAATACTTACAAAGTGGAAAGTTTAACGTCAAATTATGCATTTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171415 223 + 636262 CCTACAGTGCCATGTTGCGTAGTTCAAATAAGTCAGGAAAAAGCAGAGTTGTGGTTCCATGCAAACATGGTTATTACAGTGCATTTAATCTTCCG------TGAGACTAATAAGGTTAAGAGTGAAAGGTAAACCAGACTAATAACTCAGAATGGAAGGCAAGTTTACATCCTAGCTCAGCAGTAATACTTAAAAAGTGGAAAGTTTAACGTCAAATTATGCATTTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 169058 172 + 647215 -------------------------------------------------------TCGTTGCCGATATGGGTATTACGGTGCATTTAATCTTCCCTCATTTTGAGATTAACAAGATTAAGAGTAACAAGTAAATCAGACAAATA--TTAGAATGGAAGGCAAATTTACTTCCTAGCTTAGCCATAATACTTACAAAGTGAAAAGTTTAAATGCAAATTATGCATCTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 34260 74 + 294542 TGTCGACTGAGGAGATCCGAGTGGCCAATGGATGTGGAGACAGTTTTTTAGTGCCCACCTGTTTTCATAAGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171638 73 + 636262 TGTCGACTGAGGAGATCTGAGTGGTGAATGGATGTGGAGACTGTTTTTTAGGGCCCACCTGTTTTTATAgtta- -s simRat_chr6.simRat.chr6 169236 74 + 647215 TGTTGACTGAGGAGATCCAGGTGGCCAATGGATGTGGGGACAGTTTTTTGGTGCCTACCTGTATTCATAAGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 34334 36 + 294542 ATATCTTCTCTGCTGCAGTAGATCTCCTAAATTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179059 36 + 636262 GTGTCTTCCCTACTGCAGTAGATCTCCTAAATTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 169310 36 + 647215 ATATCTACTCTGCTGCAGTAGATCTCCTAAATTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 34370 27 + 294542 GATTACCTCCCCCTTTTCAATTACTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179095 27 + 636262 GATCACCTCACCCTTTTCAATTACTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 169347 26 + 647215 TACTACCTCCCCGTTTTCAATTACTT- - -a -s mr.mrrefChr5 34397 117 + 294542 CAGCCAAATAATATCATGAACATCTCAGAATTTACCACTTGGGTGCACATGCTCTACTAGTTCACTAGCTCCTGTGGCAGGTTACAAAAACAGCCAGCCCAGGATTTGGGGATATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179133 117 + 636262 CAGCCAAATAATATCATGAACATCTCAGAATTTACCACTTCGGTGCACGTGCTCTACTAGTTCACTAGCTCCTGTGGCAGGTTATAAAAACAGCCAACCCAGGATTTGGGGATATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 169373 112 + 647215 -----CAATAATATCATAAACATCTCCGAATTTGCCACTTGGGTGCACATGCTCTACTAGTTCATTAACTCCAGTAGAAGGTGACAAAAACAGCCAGCCCAGGATTTGGGGATATAC - -a -s mr.mrrefChr5 34514 99 + 294542 GTAAACCATTTCTTGCTGCATTTAGGGCAAGACTTTTGACCTCCTCCTGACACCATGATGCTACTGCAGAGACCTGGTATAATGCTACATTCTTATGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179251 99 + 636262 GTATACCATTTCTTGCTGCATTTAGGGCAAGACTTTCGACCTCCTCCTGACACCATGATGCTACTGCAGAGACCTGGTATAATGCTGCATTCTTATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 169485 98 + 647215 ATAAACCATTTCTTACTGCATTTAGGGCAAGATTTTTGACCTCCTCCTGACACCAGGAT-CAACTGCAGAGCCCTGATATAATGCTACGTTCTTATGGT - -a -s mr.mrrefChr5 34613 83 + 294542 CTTTATTTTCTTACTATGTCAGGTAACTCTATCAGGTGACTCACACTCCATTTATGAACCCACACATACTACTGAAAAGATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179350 83 + 636262 CTTGATTCTCTTACTATGTCAGATAACTCTATCAGGTGACTCACACTCCATCTATGAACTCACATATACTACTGAAAAGATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 169596 83 + 647215 CTTTATTTTCTTAATTTGTCAGGTAGCTCTATCAGGTGACTCACACTCCATTTATGAACCCAACCATACTAATGAAAAGATAC - -a -s mr.mrrefChr5 34696 321 + 294542 CACAAGCTTATACTGCTCTCCTTAGTGTTTTTATGGCCAGACACAGAACAAACTCTTCATGTTGTGCTTAATGTTGGATATGTGCTTCTGAGCATGCCTGTTTTTGAGTAGTTACTCAAGGATGTATTTTGGCTTAGGTAGAGTGGTAATAAGGTTGCATACATACACTGCCAACATTGTTTGACTTGTGCATTAAGCTGACCACAACTCAAATTTAACCTGGCTGTCCCATATACCTGTCCAATCTGCACTCTCTTATCCATTTACAGTTTCTTTCCTGAAGGCCTGAAACCCTAACTTGTCAGGCACACACTTAGACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179443 320 + 636262 TACAAGCTTATACTGCTCTCCTTAGTGTTTTTATGGCCAGACACAGAACAAACTCTTCATATTGTGCTTAATGTTGGATATGCGCATCTGAGCAAGCCTGTTTTTGAGTAGTTACTCAAGGATGTATTTGAGCTTAGGTAGAGTGGTAATAAGGGTGCATACATACGCTGCCAACATTGTTTGACTTATGCATTAAGCTGACCACAACTCAAATTTAGCCTGGCTGTCCCATTTACCTGTCTAATCTGCGCTCTCTCATCCATTTACAGTTTCTTTCCTGGAGGCCTGAAACCCTAACTT-TCAGGCACACACTTAGACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 169679 321 + 647215 CACAAACCTATACTGTTCTCCTCAGTGTTTTTATGGCCAGACACAAAACAAACTCTTCATGTTGTGCATAGTGTTGGATATGTGCTTCTGAACATGCCTGTTCTTGAGCATTTACTCAAGGATGTATTTTGGCCTAGGTGGACTGGTCATAAGGTTGCATACATACACAGCCAACATTGTTTGATTTGCACATTAAGCTAACCAGAACTTGAATTTAACCTGGCTGTCCCGTATACCTGTACAATCTGCACTCTCTTATCCATTTGCAGTTTCTTTCCTGAAGACCTGAAACCCCATCTTGTCAGGCACACACTTAGACCA - -a -s mr.mrrefChr5 35017 243 + 294542 GCTGACTCTCCATGCACTATTCTGCTTACTTCTAGCTCAAAAAGCAGGGGCATTGTCATAAACTGCCAGATCATGCAACTAGCCAGACCCTACAATCATGGAACAAGGCTAGATCATGCAATTTGTTAAACCCTACAACCATGGAACAAGGCTAATCTTAGTGCCATTCTAATCTTGGATTAACATGCTTTTACTTATCCATACTGGTATTGCTTAGAATGATGATTACAGTTACTCCCTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179763 243 + 636262 GCTGACTCTCCATGCACTATTCTGCTTACTTCTAGCTCAAAAAGCAGGGGCATTGTCATAAACTGCTAGATCATTCAACTAGCCAGACCCTACAATCATGGAACAAGGCTAGATCATGCAACTTGTTAAACCCTACAACCATGGAACAAGGCTAATCTTAGTGCCATTCTAATCTTGGATTAGGACGCTTTTACTTATCCATACTGGTATTGCTTGGAATGATGATTACAGTTACTCACTCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 170001 223 + 647215 GCTGACTCTCCATGCACTCTTCTGCTCATGTTTAGCTCAATAAGCAGGGGCATTGTCAAAGACTGCCAGATCATGCAACTAGCCAGACCCTACAATCACGGAACAAGGCTAGATCGTCCAATGTGTTAAACCCTACAACCATGGAATAAG--------------------AATCTTGGATTAACATACTTTTATTTATCCAAACTGGTATTGCTCAGAATGATGATTAGAGTTCCTCCCTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 35260 91 + 294542 TCCACTGTCCTTGATCGCTTTGTAGGAGAATTTGTGGGATTTAGACTACATATTTTGCTTTTCCATGGTGAGTCACTCTCACCATGTAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180006 91 + 636262 TCCACTGTTCCTGATCACTTTGTAGGAGAATTTGTGGGATTTAGACTATGTTATTTGCTTTGCCATGGTGAGTCACTCTCACCATGTAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 170226 76 + 647215 TCCACTGTCCTTGAAAGC-TTGTAGGAGAATCTATGTGTTTTAGACTACATATTTTGCTTTTCCATG--------------CCCTGTAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 35351 32 + 294542 CATGTTTTCTTTGCATGTATATGTCTACACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180099 32 + 636262 CATGTTTTCTTTGCATGTATATGTCTACACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 170302 32 + 647215 CATGTTTTCTTTGCATATATATGTCTAAACTC - -a -s mr.mrrefChr5 35383 196 + 294542 TCGGATCATCAAACACATATTTTGACTCTACGTATACAAAGAGAATTTGCAGAGTAAAAATCTCTCAACATGAAAGTGGAGCTCCCATGTTGTGCGTGGTGCACTGTGCATGGGCACAATGAACAGCTGCAGCGTAGTATCCCTCTGACTGTTTACGACTACAATGGCACATGCTTTGTTTCTACCTACAAACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180133 196 + 636262 TCTGATCATCAAACACATATTTTGACTCTACGCATACAAAGAGAATTTGCAGAGTAAAAATCTATAAACATGAAAGTGGAGCTCCCATGTTGTGCGTGGTGCACTGTGCATGGGCACAATGAACAGCTGCAGCGTAGTATCCCTCTGACTGTTCACGCCTACAATGGCACATGCTTTGTTTCTAGCTACAAACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 170334 174 + 647215 TCGGCTCACCAAACACATATTTTGATTCTATGTATACAAAGAGAATTTGCAGAGTAGAAATCTCTCAACATGAAAGTGGAGCTCCCACGTTGTGTGTGGTGCACTGTGCATGGACACGATGAACAG----------------------CAGTTTATGACTACAATGGGACATACTTTGATTCTACCTACGAGCAAC - -a -s mr.mrrefChr5 35579 6 + 294542 ATACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180329 6 + 636262 ATACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 170509 6 + 647215 ATACAG - -a -s mr.mrrefChr5 35585 66 + 294542 CAGAGCACAGTCCATCTTTAGAAAGTCAAAACTGCAAAATAGGGTAGGTCTCTAAATGCTCTGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180336 66 + 636262 AAGTGCACAGTCCATTTTTAGAAAGTCAAAATGGCAAAATAGGGTAGGTCTCTAAATGCTCTGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 170515 66 + 647215 CAGAGCACAGTCCATCTTTAGAAGGTCAAAACTGCAAACTGGGGTGGTTCTATACATGGTCTGCTA - -a -s mr.mrrefChr5 35651 146 + 294542 TGTTGAATTGCTACTATATGCAATTATCAATTGCTTCAACAAAGGCGTAGCATGTCCCCGGCCTCTGTTTAAAGTCCTAGTTGCTTAGAAAAGCACTAGAGTGTGCAAGTAACAGGTGAAATGGGCAGATTCAACACTTGCTGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180402 146 + 636262 TGTTGAATTGCTACTATATGCAATTATCAATTGCTTCAACAAAGGCGCAGCATGTCCCCGGCCTCTGTTTAAAGTCCTAGTTGCTTAGAAAAGCACTAGAGTGTGCAAGTAACAGGTGAAATGGGCAGATTCAACACTTGCTGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 170642 146 + 647215 TGTTGAGTTGCTACTTTATGCAATTATCAATTGCTTCAATAAAGGTGTAGCATGTCCTCAGCCTCATTATAAAGTCCTAGTTGCTTGGGAAAGCACTAGAGCATGCAAGTAAAAGGTGTAATAGGCAGATTTAACATTGGGTGGCT - -a -s mr.mrrefChr5 35797 11 + 294542 GTTGTGTTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180551 11 + 636262 GTTGTGTTCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 170788 11 + 647215 GTTGTCTTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 35808 51 + 294542 GGTTCCCTATCCCTTAATATGAATTACTCGTTACGACAATCTGCCTTGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180604 51 + 636262 GGTTCCCTATCCCTTAATATGAATTACTCGTTACGACAATCTGCCTTGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 170799 51 + 647215 GGTTCCCTATCCCTTAGTATGAACCACTAGTCACTGCAATCCGCCTTGCAA - -a -s mr.mrrefChr5 35859 314 + 294542 ATATTATTTTGGTCTCTCGAGCATAACACTCTCCTAATGTATTTGAGTAGCACATTCAAACCTTTCAAGACCAAATGTGAACTATTTTGGTTCCAGGCTAATTTTGGCTCACCTTTCTCAAGGGGGCAAATTCTTTCCAACAGCAGTGGTGCTATTGCCTTGTACCAATAAGTCCAATTAGCCAAATTTCCACTCAGGGGTAATTTTTAATGTGGGTTATTGATTGAGAGGTGTTGTCCCACAGTGCACAGGCTGACTGGATATCCTATGCAGAGGCCAGCTAGACACTTTGGAATCATGTCCTAAATGTCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180655 313 + 636262 ATATTATTTTGGTCTCTCGAGCATAACACTCTCCTAATGTATTTGAGTAGCACATTCAAACCTTTCAAGACCAAATGTGAACTATTTTGGTTCCAGGCTAATTTTGGCTCACCTTTCTCAAGGGGGCAAATATGTCCCAACAGCATTGGTGCTATAACCGTGTACCAAT-AGTCCAATTGGCCAAATTTCCATTCAGAGGTAATTTTTGATGTGGATTATTGATAGGGAGGTGTTGTCCCACAGTGCACAGGCTGACTGGATGTCCTATGCTGAGGCCAGCTAGACACTCTTGAATCATGTCCTAAATGTCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 170851 314 + 647215 AAATTATCTTGGTCTCTCATGCATAACACTCCACTAATGTATTTGAGTAGCACATTCAAACCTTACAAGATTGTATGAGAACTATTTTGGCTCCAGTATAATTTTGGCTCACCTTTGTCAAGGGGGCAAATTCTTTCCAACAGCAGTGGTGCTATTGCCTTGTACCAATAAGTCCCATTAGCCAAATTTCCACTTGGGGGTAATTTTTAATGTGGGTTATTGATTGAGAGGCATCATACCACAGTGCATAGGCTGACTGGATATCCTATGCAGAGGCCAGCTAGCCATTTTGGAATCATGTCCTAAATGTCCTA - -a -s mr.mrrefChr5 36173 110 + 294542 TGTGGATTGTCATTACAAGTATTAGTCATGTACTGGTCCCATATTAAGGGCATTAATTCAATCACAAAATTTTAATGTGGCCAAACACTTACGTGGATAAACTCTGTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180970 108 + 636262 TGTGGATTGTTATAAC--GTATTAGTCATGTACTGGTCCCATATTAAGGGCGGCAATTCAATCACAAAATTTTAATGTGGCCAAACATTTACGTGGATAAACGCTGTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 171165 110 + 647215 TATGGATTGTCATTACAAGTATTAGTCATGTACTGGTCCCATCTTAAGGGAATTAATTCAATCACAAAATTTTAATGCGGCCAAAGACTTACATAGATAAGCTCTGTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 36283 324 + 294542 CTTATAAAATATTATCAACTGCACTTATATCTTCCATCACTGCTGTTCATGAGCATAATGACTGCTCCTGCTTAGGCTGAGCTTATCGCTTGTCATGTGCCATTTACTCACAGTTGATATATGATCAACATATAAATGCAACCACAATCTATCTTAGCTTAAGTATTTATCAATTATACCTCTATCTTGAACCTTTATCAGTGgtgtgtcttgtagctacaactgttttaggctgcctcccaattttagcatgtgtgtgcaacaagtgtgtgcctgccctgttgaaaaggtgacccttcctgtaatattgtgtagttagagagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181079 316 + 636262 CTTATAAATTATTATCTACTGCACTTATATCTTC-----CTGCTGTTCATGAGCATAATGACTGCTCCTGCTTAGGCTGAGCTTCTCGCTTGTCATGCGCCATTTACT--TAGTTGATGTATGATCAACAAACAAATGCAACCACAATCTATCCTAGCTTAAGTATTTATCAATCATACCTCTGTTTTCAACCTTTATCAGTGgtgtgttttgtggctacgactgttttaggctgcctcccaatattagcatgtgtgtgcaacaagtgtgtgcctgccctg-tgaaaaggtgacccttcgtgtaatatggtgtagttagagagt -s simRat_chr6.simRat.chr6 171275 324 + 647215 CTTGTGACATATTATCAACTGCACTTATATCTTCCATCACTACTGTTCATGAGCATAATGACTGCTCCTGCTTAGGCTGAGCTTATCCCTTGTCATGTGCCATTTACTCACAGTAGAGATATGATTGACATATGAATGCAACCACAACCTATCTTGGCTTAGGTATTTATCAATTACACCTCTATCTTGAACCTTTATCATTGgtgtgtcttgtagctacaactgtgttaggctgccttccaattttgccatgtgtgtgcaacaaatgtctgcctgccctgttgaaaaggtaacccttcctgtaatattgtgtagctagagagt - -a -s mr.mrrefChr5 36607 92 + 294542 attaggcggggaagaatggcaccaaatctaagggccccatggacaagttctgatgagaacttactacaaagttaatatgagcttccccacta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181396 92 + 636262 attaggcagggaaggatgacaccaaatctaaggaccccatggacaagctttgatgagaacttactacaaagttaatatgagctttcctacta -s simRat_chr6.simRat.chr6 171599 84 + 647215 attaggcggggcagaatggcatcaagtcta---gcactcTA-----GTTCAGATGAGAACTTACTACATAGTTAATATGAGCTCCCCCACTA - -a -s mr.mrrefChr5 36699 370 + 294542 cactaaggctcaacctgatggacaacccctctgggttgatttactgcaaaattttgaattgtgattctcttctgtccttccaaattcactaccacttccttactccaaggcttggactgactaggtggagttttgtaattctgacagcatgagttcttgatccagtatcaaattttagacattttagactcctgttagacctagagagtttgcacaaaaaacaattccttaaactggagaaggttgcactacaagcttcctctttgaatacacttcaaagagtcactcaaaatatgagctgctcttctaagttgaaagggtctgttgctgctatggcaacttaattagaaccctttttcctcattctcct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181488 368 + 636262 cactaaggctcaacctgttggacaacccctctgggttgatttactgcaaaattttgaattgtggttctcttctgtccttccaaattcactgctgcttccttactccaaggcttggactgcataagtggggttttgtaattctgacagcatgagttcttgatccagtaccaaatttttgacactttagactcctgttagacccagagagtttgcacaaaaaacaattccttaaactggagaaggttgtagtacaagcttcctccttgaatacacttcaaagagtcactcaaaatatgatctgctcttctaagttgaaagggtctgttgctactatggcaacttaattagaaccctttttcctcattctc-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 171761 357 + 647215 TACTAAGGCTCAACATGATGGACAACCTCTCTGGCTTGATTTGCTACAAAA--------AGTGACTctctcctgtccttcc-aattcactaccacttccttactccagggcttggactgaccaggtggagttttctaattctgacagcatgagttctggatccagtatcaaattttacacattttatactcctgttagacctagagagggtgcacaaaaaagaattccttaaactggagaaggttgcactacaagcctcctctttgaatacgcttaaaagagtcactaaaaatatgagctgc----ctaagctgaaagggcctgtggctgctatggcaacttaattagaaggctttttactcattctcct - -a -s mr.mrrefChr5 37069 47 + 294542 tgtgttgttctcttttatgtgtttacttatgtgcacatgccttcatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181856 47 + 636262 tgtgttgttctctactatgtgtttacttatgtgcacatgccatcatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 172121 47 + 647215 tgtgttgttctcttttatatgtttacttatgtgcacatgccttcatg - -a -s mr.mrrefChr5 37116 424 + 294542 tgtttacatactggcccctccctcaggttatgcgtaccctgagcagaataatatgagacagctgtgttaattctccaattaagtcaagttggacaggtgccgcaatcacactgcaccacttatttatggtcctaccccttagactgggagtaatgtgtactatcaaattggctggatttctctcaagtatggtcctcccaactgagtcatggttgaccctccacttgtatatccaagtgtggtccttctcccttaggtatttaaggtgaggctaagcttatcttttaagggggctacttaggtggtgctacaagacagtacacttttgtgagtgctttcctgcagtatttctaggttgattaaagcaaaaaccactagaaggctgataagaaggtaccctttcttatttaattactaccctggc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181905 410 + 636262 tgtatccataatggcccctctgtcaggttatgcatgccctgagcacagtaatatgagacagctgtgttaattctccaattaagtcaagttggacaggtgctgcaatcacactgcaccacttatttatggtcctaccccttagactgggagtgatgtgtactatcaagttggctggatt--tctcaagtatggtcctctcaactgag------------ctccacttgtatatccaagagcggtccttctcccttaggtatttaaggtgaggttaagcttatcttttaagggggctagttaggtagtgctacaagacagtacacttttgtgagtgctttcctgcagtatttctaggttgcttaaagtgaaaaccactagaaggctgataagaaggtaccctttcttatttaattactaccctggc -s simRat_chr6.simRat.chr6 172168 417 + 647215 tgtttacatactggcccctccctcaggttATGCGTACCCTGAGTGGAATAATataagacagctgtgttaattctccaattaagtcaagttgcacaggtgccgcaatcattctgcactacctatttatggtcctaccccttagactgagggtaatatgtaccttcaaagtggctggatttctctcaagtatggtcctcccaacagagtcatggttgaccctccacttatatatctaagtgtg--ccttctcctttaggtatttaaggtgaggctaagctgatcttttaagggggctgcttaggtgttgctacaatacagtacacttttgtga-----ttcctgcagtatttctaggttgatcaaagcaaaaaccactataaagataataagaaggtaccttttcctatttaattgccaccttggc - -a -s mr.mrrefChr5 37540 21 + 294542 cagagacatctgaccatgtaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182315 21 + 636262 cagagacatctgaccatgtaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 172586 21 + 647215 catagaaatctgactatgtag - -a -s mr.mrrefChr5 37561 199 + 294542 aaggtatccaggtcccttgctcatttattaaatcattcttatcaggtatctgtgaaattttgcctgcatagccagtctctttcagacaaataagtggcagatataacactcagtttgttggtcaggattggtcatggtcttttctttttttgtctttaccttccttcagccaattagggcccctaacttgatattagtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182336 199 + 636262 aaggtatccaggtcccttgctcatttattaaatcattcttatcaggtatctgtgaaattttgcctgcatagccagtctctttcagacaaataagtggcagatataacactcagtttgttggtcaggattggtcatggtcttttctttttttgtctttaccttccttcagccaattagggcccctaacttgatattagtg -s simRat_chr6.simRat.chr6 172608 199 + 647215 agggaatccaggtcctttgcccatttattaaaacattcttagcaggtatctgtaaaagtttgcctgcatagctagtctctttcaaatgaataagaggcaaatataacactcagtttgttagccaggtttggtcctggttttttccttttttgtctttacgttctttcagccagttaggaccttaaacctgatattagcc - -a -s mr.mrrefChr5 37760 14 + 294542 cgctctcactcaac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182537 14 + 636262 cgctctcactcaac -s simRat_chr6.simRat.chr6 172807 14 + 647215 cactctcactcaat - -a -s mr.mrrefChr5 37774 27 + 294542 ttgcatccattttaggccccttgagca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182551 27 + 636262 ttgcatccattttaggccccttgagca -s simRat_chr6.simRat.chr6 172825 27 + 647215 ttggctccattttgggcaccttaagca - -a -s mr.mrrefChr5 37801 8 + 294542 taggtccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182579 8 + 636262 taggtccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 172852 8 + 647215 taaatgcc - -a -s mr.mrrefChr5 37809 40 + 294542 ccaatatttcaaatcatactgtccaagttgccagaatctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182594 40 + 636262 ccaatatttcaaatcatactgtccaagttgccagaatctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 172860 40 + 647215 ccaacatttgaaatcatcctgtccaaattatttgaatctt - -a -s mr.mrrefChr5 37849 158 + 294542 aagctttcgcagctaagtttttaaatccccaacgcatcagtgtattgtccacacttcgggataaggagcgagaaggcagtcaagttccaggtcctggtagatagagtgccaatttcttctgcaatcttttggctgaaccataagtccttcttgattgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182636 158 + 636262 aagctttcgcagctaagtttttaaatccccaacgcatcagtgtattgtccacacttcgggataaggagcgagaaggcagtcaagttccaggtcctggtagatagagtgccaatttcttctgcaatcttttggctgaaccataagtccttcttgattgt -s simRat_chr6.simRat.chr6 172900 158 + 647215 aagcttttgcaactaaaacttcaaatccccaacccatcagcgttttgtccacactttggggtaaggagtgagaaagcagtcaagttccaggtcctggcggatggactgtgaatttcttcaccaatcttttagctgaaccataagtccttcttgattgt - -a -s mr.mrrefChr5 38007 7 + 294542 ctcatat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182797 7 + 636262 ctcatat -s simRat_chr6.simRat.chr6 173058 7 + 647215 ctcatat - -a -s mr.mrrefChr5 38014 18 + 294542 agcactcgagagcaaatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182822 18 + 636262 agcactcgagagcaaatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 173065 18 + 647215 aacactctagaacaaata - -a -s mr.mrrefChr5 38032 196 + 294542 ctcttcagcaagtctaactacaatgcatatttggtttatggtaccaattcactcagttgggatgctaatgataggttgctacagaatattggtaacactacttcatcttactgcaatggcccaaggacctgaggttctggtgcaagtagagacgagagtgttattttggttgagacaaaacttataacctggtgta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182843 196 + 636262 ctcttcagcaagtctaactacaatgcatatttggtttatggtaccaattcactcagttgggatgctaatgataggttgctacagaatattggtaacactacttcatcttactgcaatggcccaaggacctgaggttctggtgcaagtagagacgagagtgttattttggttgagacaaaacttataacctggtgta -s simRat_chr6.simRat.chr6 173083 196 + 647215 ctcttcagcaaattcaactacaaggcaagtttggcttatgagaccaatttacttggttgggatgctaatgataggttgctacacaatattggaagcactactttatcctactgctatggcctgaggacctgatgttctggtgcaagcagagactagagtgttcttttggttgagacacaacttacaacctggtgta - -a -s mr.mrrefChr5 38228 31 + 294542 ccaccagcttgatttgtctgacttatgggct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183039 31 + 636262 ccaccagcttgatttgtctgacttatgggct -s simRat_chr6.simRat.chr6 173282 31 + 647215 ccaccagcttgatttatctgacttgtgagct - -a -s mr.mrrefChr5 38259 57 + 294542 ctctttggtggtcttacacaaacttgacaattgtttttttgcactctgtaaccagag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183073 57 + 636262 ctctttggtggtcttacacaaacttgacaattgtttttttgcactctgtaaccagag -s simRat_chr6.simRat.chr6 173313 57 + 647215 ctctttggtggttccatgcagacttgacaattgttcttttgcactctctaaacagag - -a -s mr.mrrefChr5 38316 19 + 294542 gggttttttttacagagat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183130 19 + 636262 gggttttttttacagagat -s simRat_chr6.simRat.chr6 173377 19 + 647215 gggttttttttacagagag - -a -s mr.mrrefChr5 38335 76 + 294542 tcatcaaacttattagatctgtacatttaatttgcagaacaatatgttaatgtgtgtaggtttagcatcttcaggt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183149 76 + 636262 tcatcaaacttattagatctgtacatttaatttgcagaacaatatgttaatgtgtgtaggtttagcatcttcaggt -s simRat_chr6.simRat.chr6 173406 76 + 647215 taatcaaaggtattagatctgtacattttatttgcagaacaatatgtttatgtgcatgggtttaccatcttcaggt - -a -s mr.mrrefChr5 38411 34 + 294542 gaaaacattgagcctatagacccatgaacgacta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183226 34 + 636262 gaaaacattgagcctatagacccatgaacgacta -s simRat_chr6.simRat.chr6 173482 34 + 647215 gtaatcattgagcctattgatccatgaactaata - -a -s mr.mrrefChr5 38445 54 + 294542 aacatatataaagtcatatatcttgatcgtatgcacttgatgccttgggtaaac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183260 54 + 636262 aacatatataaagtcatatatcttgatcgtatgcacttgatgccttgggtaaac -s simRat_chr6.simRat.chr6 173540 54 + 647215 aacatatataaagttacatatcctgatcatatgtacttgatgtcttgggtaaac - -a -s mr.mrrefChr5 38499 22 + 294542 ggggggttcattcatctggaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183315 22 + 636262 ggggggttcattcatctggaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 173594 22 + 647215 ggggggttcattcatctggaat - -a -s mr.mrrefChr5 38521 85 + 294542 caatggtcagaggttactacactaggctctcgattgggctTGCCTGGGTGAAAGACTAAAGGAGACCTCAGAACTTGTGCTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183347 85 + 636262 caatggtcagaggttactacactAGGCTCTCGATTGGGCTTGCCTGGGTGAAAGACTAAAGGAGACCTCAGAACTTGTGCTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 173616 85 + 647215 cttctgtcagaggttactacactaggctcctgattggtctTGCCCATTTGGAGGACTAAAGGAAATCTCAGAACTAGTGCTGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 38606 9 + 294542 GTACCTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183436 9 + 636262 GTACCTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 173701 9 + 647215 GTACCCGCA - -a -s mr.mrrefChr5 38615 62 + 294542 ATTGATTAGAGTTCCAAAATCCAAGCAGGCATCTGCTTGATTTATCTATAGTTACTGAGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183452 62 + 636262 ATTGATTAGAGTTCCAAAATCCAAGCAGGCATCTGCTTGATTTATCTATAGTTACTGAGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 173710 62 + 647215 ATTAATTAGGGTTCCAAGATCCAAGCAGGCCTTTGCTTGATTTATCTATAGATACCAAGTAG - -a -s mr.mrrefChr5 38677 44 + 294542 TGTGCTATGAACACAATTGATCAACTCAAGGGCATGTAATGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183514 44 + 636262 TGTGCTATGAACACAATTGATCAACTCAAGGGCATGTAATGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 173773 44 + 647215 TCCAGAATGAACACAACTAATCAACTCAATGGTATGTAATGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 38721 35 + 294542 GGGGCCCATGTTCAGCATTCTATACGCAGACTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183558 35 + 636262 GGGGCCCATGTTCAGCATTCTATACGCAGACTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 173818 35 + 647215 AGGACCCATGTTCAGCAGTCCATACGCAGACTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 38756 59 + 294542 CTTCCACTGCTCCAAAATCCATGCTATGATAACTATCTTCTTAGCTTGGAAAACTACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183593 59 + 636262 CTTCCACTGCTCCAAAATCCATGCTATGATAACTATCTTCTTAGCTTGGAAAACTACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 173863 59 + 647215 CTTCCACTGGTCCATGCTCCATGCTTTGATAACTATGTTCTTGGCTAGGAGAACTACAT - -a -s mr.mrrefChr5 38815 46 + 294542 TCAGATATCTAAAGTCAGCACCTATTGATAATGTACTAACTTCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183656 46 + 636262 TCAGATATCTAAAGTCAGCACCTATTGATAATGTACTAACTTCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 173922 46 + 647215 TCAGATATCTAAAGTCAGCACTTATTGATCATGCACTAACTTCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 38861 138 + 294542 ATCATGTACTAACTTCAAAGTACTGAGTGGTCCCCAGAAGGGTCTATGTTCCTTCTACTAAGAGCTCTTGTAATAAGTAGTGTATCCATAGTGGTAAGGGAATGTATTACATTCCAGTCCTTCCGGCATTTTGAAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183703 135 + 636262 ATCATGTACTAACTTCAAAGTATTGAGTGGTCCCCAGAAGGGT---TGTTCCTTCCACTAAGAGCTCTTATAATAAGTAGTGTGCCCATAGTGGTAAGGGAATGTATTACATTTCAGTCCTTGCGGCATATTGAAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 173968 134 + 647215 ATCACATGCTAACTTCGAAGTACTGAGTGGTTCCCAGAAGGGTCTATGTTCCCTTTACTAAGA---CTTGTAATAAGTGGTCAATCC-TAGTGGTAAGAGAATGTATTACGTTCCACTCCTCCCAGCATTTTGAAAAC - -a -s mr.mrrefChr5 38999 223 + 294542 AATTTTAGATGGGTATAACTGCAAGCAAGCCTATATCCCCCTAGAAACTATAAACCATTTGATCAGCCATCCACTGGCACTTGAGCTGACTGAACCATAACTTTATTCATTAATCACATACTATTATCTACATATTTATTTAAGTATTATAACCACTCTACTCTCAAAAGCCATCCTCCTTGCTAACAGTGAGGTAGCAACAATCAGGCCACTAGATGGAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183838 223 + 636262 AATTTCAGATGGGTATAACTGCAAGCAAGCCTATAGCCCCCTAGAAACTATAAACCATTTGATCAGCCATCCACTGGCACTTGAGCTGACTGAACCATAACTTTATTCATTAATCACATACTATTATCTACATATTTATTTAAGTATTATAACCACTCTACTCTCAAAAGCCATCCTCCTTGCTAACAGTGAGGTAGCAACAATCAGGCCACTAGATGGAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 174103 223 + 647215 AATTTTATATGGGTATAACTGCCAGCAAACCTATATCACTCTAGAAACTATAAACCAGCTGATCAGCCACCCACTTGCACTTGAGCTGACTGAACCGTTGAGTTATCCAATAATCACAAACTATTGTCTACACATTTATTTAAGTACTATCACCACTCTGTTCTCAAAAGCCGTGATCCTTGCTAACAGTGTGGCAGCAAAAATCAGGTCACTTGAGGGGGTT - -a -s mr.mrrefChr5 39222 23 + 294542 GTGTTTGTGCTTTTCCCGACTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184061 23 + 636262 GTGTTTGTGCTTTTCCCGACTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 174327 23 + 647215 ATGTTCTTGCTTATCCTGACCAG - -a -s mr.mrrefChr5 39245 19 + 294542 CCCCTGAATCTCAGAAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184085 19 + 636262 CCCCTGAATCTCAGAAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 174350 19 + 647215 CCCATGAACCTCACAGACA - -a -s mr.mrrefChr5 39264 11 + 294542 ATCTGCCAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184104 11 + 636262 ATCTGCCAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 174371 11 + 647215 ACCTGCTGGGT - -a -s mr.mrrefChr5 39275 76 + 294542 CTGTGTATCTCAATGACACAAGAGTGTTGGCTCACCAACAGGCTTCCTGCCTGCAGGACTCCCTGTAATGGTCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451527 76 - 636262 CTGTGTATCTCAATGACACAAGAGTGTTGGCTCACCAACAGGCTTCCTGCCTGCAGGACTCCCTGTAATGGTCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 174399 76 + 647215 CTGTCTACCTCAATAACACAAGGGTGTTGGCTCACCAATAGGCTTCTTGCCTGCAGGACTCTCTGTAAGGGTCCAC - -a -s mr.mrrefChr5 39351 6 + 294542 AGCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451603 6 - 636262 AGCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 174476 6 + 647215 GGCTTA - -a -s mr.mrrefChr5 39357 21 + 294542 AATATATATTGGTGTATGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451609 21 - 636262 AATATATACTGGTGTATGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 174484 19 + 647215 AATATCTATTGGC-TAT-ACT - -a -s mr.mrrefChr5 39378 52 + 294542 TAGGCCCAAGGCATGAGCAATACAGAAGAATTGTTTTATCACTTTGGACCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451630 52 - 636262 TAGGCCCAAGGCGTGAGCAATACAGAAGAATGGCTTTATCGCTTTGGATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 174505 52 + 647215 TATGCCCCAGGAATGAGCAGTACAGATGAATTGTTTTATCACTTTGGACCTG - -a -s mr.mrrefChr5 39430 52 + 294542 CTGGATTTGCCATCCGATATGGTGAATATAAGATAAGATTTCATTGTTCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451683 48 - 636262 CTGGATTTGCCGTCCAATATGGTGAAT----GATAAGAGTTCATTGTTCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 174557 52 + 647215 CTGGATTTGCCATCCGATATGGTAAATATAAGATGAGATTTCATTGTTCAAA - -a -s mr.mrrefChr5 39482 26 + 294542 GCCATCTAGGTGAAGCTGCTGAAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451765 26 - 636262 GCCATCTAGCTGAAGCTGCTGAAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 174609 26 + 647215 GCCATCTAGGCGGACCCACTGAAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 39508 65 + 294542 GAGAAACTTTGCCTAGAACTATTACACTACCCCTTGATTGCTGTGACACCTATCTTAACCAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451791 65 - 636262 GAGAAACTTGGCCCAGAACTATTACACTACCCCTTGATTGCTGTGACACCTATCTTAACCAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 174636 65 + 647215 GAGAAACGTTGCCTAGAACTACTACACCTCCCCATCATTGCTGTGACACCTATCTTAGACAGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 39573 15 + 294542 CTGTGGCAAAACATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451856 15 - 636262 CTGTGGCAAAACATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 174702 15 + 647215 CTATTGCAAAACATA - -a -s mr.mrrefChr5 39588 28 + 294542 TTATCACAGGACTTGTCTGTCTGGTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451872 28 - 636262 TTATCACAGGACTTGTCTGTCTGGTGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 174717 28 + 647215 TTAGCACAGGACTTGTCTGTGTTGTGCC - -a -s mr.mrrefChr5 39616 96 + 294542 TCAGTAAATTGGCATACGTGAACATGTTCACAACAGTACCCACTTTCAGGTGCTGGGGATATGTGCATCAGTCAGGATGAGACATATGGTGTTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451900 95 - 636262 TCAGTAAATTGGCATACGTGAACATGTTCACAACAGTACCCATTTTCTGGTGCTGGGGAGATGGGCATCAGTCAGG-TGAGACATATGGTGTTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 174746 96 + 647215 TCAGCAAATTGGCATACATGAGCATGTTCACGACAGTAGCCACTTTCAGGTGCTCGTGATACATGCATCTGTCAGGATGAGACATATGGTGTTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 39712 152 + 294542 GGTCCACATTACAGGTGTAATATCGTCTCAACCTACAGTCGGGTACGTTAGTAGTATCAATATGGAACATTTGACAAGGCTTGGCCTTCACATGATAACCCTAGGTAGTTGAAGACCTATATTATTCCTATGCAATAGATAGTTACAAGCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451996 151 - 636262 GGTACATATTA-AGGTGTGATATCGTCTCAACCTACAGTCGGGTACGTTAGTACCATCAATACGGAACATTTGACAAGGCTTGGCCTTCACATGAAAACCCTAGGTAGTTGAAGACCTATATTATTCCTATGCAATAGATAGTTCCAGGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 174842 151 + 647215 GGTCCACATAACAGGTGTAATACCGTCTCAAC-TACAGTCGGGTACAGAAGTAGTGTCAATATGAAACATTTGACAACGCTTGGCTTTTACATGATACCTGTAGGCAGGGGAAGACCTCTATTATCCCTGTGCAATAGATAGTTACAAGCGA - -a -s mr.mrrefChr5 39864 54 + 294542 AGAGAGCTGCAATCTTGTCAAGTTTCCTCTCCTCCTTCTGTAGTCTTAGAGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184752 53 + 636262 AGAGAGCTGCCATCTTGTCAAGTC-CCTCTCCTCCTTCTGTAGCCTTAGAGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 174993 54 + 647215 AGAGAGCTGCAATCTTGTCAAATTTCCTCTCCTCCTTCTGTAGTTTTAGAGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 39918 71 + 294542 CTGCTTCTTGAGGCATTTATAAAATGAGGAGCAGGTCTACTCCAAATAATAGTATTATGGTAATGATGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184826 70 + 636262 CTGCTTCTTGAGGCATTTATAAGATAAGGAGCAGGTCAACTCCAAAT-GTTGTATGATGGTAATAATGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 175047 71 + 647215 CTGCTTCTTGAGGCATTTATAAAATGAGGAGCAGGTCTACTCCAAATAATAGTATTATGGTAATGATGACT - -a -s mr.mrrefChr5 39989 461 + 294542 GTTGATATGGGAATAGGTAAAATTATGGTACACATATTCCTGAAGAATATATGGATTTATAAATCTAACCGAGCATTGGCCAAAGCATATTATATCCCTATGTTCTACACTCTATGATCTTTTCAGGAGTCTACAAGAAGAAAGTTGTCTTTGCAGATTGACACATAAGAGAAAAAATGTCCACAGGTGAACTGCCAACATATTCTTATCTACTCTCAGAACCTCAAAACCAATCACACTGCTATCCATAGGATTTGAATACATTTTAGGGATGCAACACAAGGGCAGTGGAGATACTCTTCCCTTGTGTGGGGGGCAGGCTCCTTCTACAGGTGCCTGTAAATGGCTTGACATTGCGTCAAGTGGGACTGGCTCACAGCCAAGCACCAATCATGTGTACATAGCTGCTTTTGCTTTTTATTGGAGCTGCACGAGGCACTGTGTGGAATCTAAACAATGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184914 461 + 636262 GTTGATATGGGAATAGCTAAAATTATGGTACACATATTCCTGAAGAATATATGGATTTATAAATCTAACCGCGCAACACCCAAAGCATATTATATCCCTAGGTTCTACACTCTATGATCTCTTTAGGAGTCTACAAGCAGAAAGTTGTCTTTGCAGATTGACACACAAGAGAAAAAATGTCCACAGGTGAACTGCCAACACATTCTTATCTAATCTCAGAACCTCATAGCCACTCACACTGCTATTCATAGGTTTTGAATACATTTTAGGGATGCAACACAAGGGCAGTGGAGATACTCTTCCCTTGTGTGGGGGGCAGGCTCCTTCTACAGGTGCCTGTAAATGGCTTGACATTGCGTCAAGTGGGACTGGCTCACAGCCAAGCACCAATCATGTGTACATAGCTGCTTTTGCTTTTTATTGGAGCTGCACGAGGTACTGTGGGAAATCTAAACAATGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 175118 457 + 647215 GTTGTTATGGGAATAGGTAAAATTATGGTACACCAATTCCTGAAG-ATATATGGTTTAATAGAGCTAACCAAGCATTGGCCAAAACATATTATATCCATATGT--CCCACTCCATGAT-TTTTCAGGACTCTACAAAAAGGAAGTGGTCTTTGCAAATTGACACATTGGATAAAAACTGTCCTCAGGTGAACTGCCAACATATTCTTATCTACTCTCAGAACTTCAAGACCAATCACACTGCTAACCATTGGATTTGAACACATTTTAGGGATGCAACACAGGGGCAGTGGAGGTACTTTCCCCTTGTGTGGGGGGCGGGCTCCTTCTACAGGTGCCTGTAAATTGCTTTACATTGTGTCAAGCAGGACAGGCTTATAGCTAAGCACTAATCATGTGTGCGTGGCCATGTTTGCTTTTTATTGGAGCCGCAAAAGGCACTGTGTGGAATCTAAACAATGTG - -a -s mr.mrrefChr5 40450 51 + 294542 AGGCCCCATTTTGGTTTAGAAGTGGATATTGTGCTGCTTCTTCTCACCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185379 51 + 636262 AGGCCCCATTTTGGTTTAGAAGTGGATATTCTGTTGCTTCTTCTCACCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 175575 51 + 647215 AAGCCCCATTTTGATTTAGAAGTGGATATTGTGCTGCTTCTTATCACCAAT - -a -s mr.mrrefChr5 40501 68 + 294542 CCTCCGGATCTTGGTTGATTCATTTCCCTCTTGTGCAATGTAGGTCTCTCACAATCACCGCCAGTCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185431 68 + 636262 CCTCTGGATCCTGGCTGATTTATTTCCCTCTTTTGCAATGTAGCTCTCTCACAATCACCACCAGTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 175626 68 + 647215 CCTCCGGACCTTGATTTATTCATTTCCCTCTTGTGCAATGTAGGTCTCTTACAATCACCGCCAGTCCC - -a -s mr.mrrefChr5 40569 157 + 294542 GTTTGTTTAGTTTCTTCTAAGACAGCAAGTTCTCCTGTCAGTGTGCTTGCATACCCAGTTGAGTGAATAAGAAGTAAGGTCCTCCTTGAAGGGGAATCTTACATCCAGGGCCTCCAAGGTGCAAAGTGAAGGATTACGATAAAGAATCGTTAAATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185499 157 + 636262 GTTTGTTTAGGCTCTTCTAGGACAGCAAGTTCTCCTGTCAGTGTGCTTGCATACCCAGTTGAGTGAATAAGAAGCAAGGTCCTCCTTGAAGGGGAATCTTACATCCAGGGCCTCCAAGGTGCAAAGTGAAGGATTATGATAAAGAATTGTTAAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 175806 148 + 647215 GTTTATTTAGTTCCTTC-AAGAAAGCAATCTCTCCTGTCAGTG--------TACCCAGTTGAGTGACTAAGAGGTAAACTCCTTCTTGAAGGGGAACCTTACATCCAGGGCCTCCAGGGTGTAAAATGAAGGATTGCTATAAAGAATCGTTAAATCT - -a -s mr.mrrefChr5 40726 61 + 294542 GTTGAGACAGACCTCATGACCTCTCCACATGTGTGAACTGATGTAATCATTGTCAAGTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185656 61 + 636262 GTTAAGACAGACCTCATGACCTCTCCGCATGTGTGAACTGTTGTAATCATTGTCAAGTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 175958 61 + 647215 ATTGAGGCTGACCTCATGACCTCTCCACGTCCGAGAACCGATGTAATCAATATCAAGTACA - -a -s mr.mrrefChr5 40787 12 + 294542 TGCTATTGGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185718 12 + 636262 TGCTATTGGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 176019 12 + 647215 GGCTATTGGTGC - -a -s mr.mrrefChr5 40799 255 + 294542 CTGAGAGGAACAATGAAGTCAAGCTGCAAAGGGTCTACTGATTTGATGTACATTGATGTAAATATTTCTTGCATCATGACCTTCTCTTCTATGGTGAAATTATATACCACCCTTGATATTGGTTTCTCTACTTATTTAAGGCAATAATAGGCCTGAACTTCTTCTGTGCAATAGCAAGCCAAGTTGAATCAGTCCTTTTTGACTCTTCACAGTGTAGTGGCTAGTCACCAGAAATAACTAATGGCATTTCTACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185730 255 + 636262 CGGAGAGGAACAATGAAGTCAAGCTGCAAAGGGTCTACTGATTTGATGTACATTGATGTAAATATTTTCTTCATCATGACCTTCTCTTCTAGGGTGAAATTGTATACCACCCTTGATATTGGTTTCTCTACTTATTTAAGGCAATAGTAGGCCTGAACTTCTTCTGTGCAATAGCAAGCCAAGTTGAATCAGTCCTTTTTGACTCTTAACAGTGTAGTGGCTAGTCACCAGAAATAACTAATGGCATTTCTACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 176036 255 + 647215 CTAAGAGGAACAATGAAGTCAAGTTGTAAAGGGTCTACTGATTTGATGTACATTGATGTAAATATTTCTTGCATCATGACCTTCTCTTCTATGGTCAAATTATATAGCACCCTCGATAGTGGTTTCTCTACTTATTTAAGGCAATAATAGGCCTGAACTTCTTATGTGCAGCATCAAGCCAAGTTGAATCAGTCTTTTTTGAATCTTCACAGGGTAGAGGCTAGTCACCAGAAGTAACTAATGACATTTCTACCC - -a -s mr.mrrefChr5 41054 60 + 294542 TGAGAGCCAATTTGAAACTTACAAGACTGCATTATGCACATCTGACCATACACTTATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185985 60 + 636262 TGAGGGCCAATTTGGAACTCACAAGGCTGCATTATGCACATCTGACCATACACTTATTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 176294 60 + 647215 TGAGAGCCAATTTGACACTTACAAGACTGCCTGATGTACATTTGACCGTAGTCTTATTAA - -a -s mr.mrrefChr5 41114 151 + 294542 AACCTAACAGGGGCAATGGTGTGTACGACCAGCTTTCACTCCACAGCTTCCCTTTTAGAATTGCAGCCATTAGGATGGCCTGCAGCTCTGCCCATTCCAGCAAATGAAATACTCACAGTGTCTGATTAATGCAAGGAGGGTCAAGGTGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186046 151 + 636262 AACCTAACAGGGGCAATGGTGTGTATGACCAGCTTTCACTCCACAGCTTCCCTCGTAAAATTGCAGCCACGAGGATGGGCGGCAGCTCTGCCCATTCCAGCAAATGAAATACTCACAGTGTCTGGTTAATGCAAGGAGGGTCAAGGTGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 176354 143 + 647215 AACCTAACAAGGGCAATGGTGTGTACTACCAGCTTTCACTCCATGGCTTCCCTTTTAGAAGTGCAGTCATTAAGTTGGCCTGCTGTTCTGCCAAT--------ATGAAATACTCACAGTGTCTGACTAATACAAGGAGGGTCAAGGTGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 41265 344 + 294542 AGCCAGAGGATAATCTACAAGCTGAGCAAAAACAAAAACAGAATTCAAGATAGTACATTTTCCAGTAAAAGGCTTAGATGGACTGACAGGCTCAATTAGATATAATCTTCAAGAGTGTGCATCCTGAATCACTAAGATTTATAAGGAGAATATAGGTAACAACTCACAGGTACATGGTTAGCCTTACACGTGGTTAACAATTTAGTGATGTTGATACTGTTGATGTGACCAACAGGATAAGTTTACTTGTATAGGGAGGTGTAAAAGAGGCCTTTTATAGGAAACAACTATGCAAACCATGATCCCTAGTGACTATGTTAATAGTGACAACCAAAATGATAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186197 337 + 636262 AGCCAGAGGATAATCTACAAGCTGAGCACAAACAAAAACAGAATTCAAGATGGTACATTTTCCAGTAAAAGGCTTAGATGGACTAACAGGCTCATTTAGATATAATCTTCAAGAGTGTGCATCCTGAATCACTAAGATCTATAAGGAGAATACAGGTAGCAACTCACAGGTACATGGTTAGCCTTACCTGTGGTTAACAATTTAATGATGTTGATACTGTTGATGTGACCAACAGGATAAGATTACTTGTATAGGGAGGTGTACAAGAGGCCCTTGATAGGAAACAACTATGCAAATCATGA-------TGACTATGTTAATAGTGACAACCAAAATGATAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 176498 343 + 647215 AACACGAGGATAATCTACAAGCTGAGCAAGAAAAAAAACAGAATTCAACACAGTTCACTTTCCAGTAAAAGGCTTCGATTGACTGACAGGCACAATTAGATATAATCTTTAGGAGTGTGCTTCCCGAATCGCTAAGACTTATATGGAGAATATAGGTAAGAACTCACAGGTA-ATGATTAGCCTTGCACGTGGGTAACAATTTAGTGATGTTGATAACGTCAATGCAACAAGCAGAATAAGTTTACCTGTAGAGGGAGATTTAAAAGAGGCCTTTTATAGGAAACCATAACGCAAACCATGATCCCTAGAGACTATGTTAATAGTGACAGCCAAAATGATAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 41609 161 + 294542 GAGACCTGGAGTACAAAATCAGGGCCGAATAAAAGATTTTGAGATTCAAAACATTCTGGATTTTTCAAAGAGTCAGTTCTCCTTCATATTGGTAATGCTTGACCGAGTTTCCTGGTTTTTGTTCTACATACCAGTGAGATACTATATTATAGCTGCATTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186534 161 + 636262 GAGACCCGGAGTGCAAAATCAGGGCCGAATAAAAGATTTTGAGATTCAAAACATTCTGGATTTTTCAAAGAGTGAGTTCTCCTTCATATTGGTAAAGCTTGACTGAGTTTCCTGGTTTTTGTTCCACATACCAGTGAGATACTATATTATAGCTGCATTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 176846 161 + 647215 GAGTCTTGCAGCACAAAATCAGGGCTGAATAAAAGATTTTGAGGTGCATAACATTTTGGATTTTTCAAAGAGTCAGTTCTCCTTTATGTTGGTAGTGTTTGATCGAGTTTCATGGTTTTTGTTCTACATGCCAGTGAGATACTATGTTATAGCTGCATTGC - -a -s mr.mrrefChr5 41770 119 + 294542 TCTAGATCTAACTTACGTAGAGAGTTGAGGGTCAGATTTAGATTCATGTTCTAGAAAGAATTGAAAAGTTGGTTGGCTAGGAATACACTGTGAGCTATAGGCCTATATAAGAGATGGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186704 118 + 636262 TCTAGATCTAACTTACGTAGAGAGTTGAGAGT-AGATTAAGATTCATGTTTTAGAAAGAATTGAAAAGTTGGTTGGCTAGGAATACACTGTGAGCTATAGGCCCATACAAGAGATGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 177007 119 + 647215 TCTAGATCTAACATGTGTGGAGAGTTGAGGGTCAGATTTAGATTCATGTTCTAGAAAGAATTGAAAAGTTTGTTGGCTAGGAATACACTGTGAGCTATAGGACTATATGAGAGATGGGC - -a -s mr.mrrefChr5 41889 19 + 294542 CCACTATCACATAAGGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186822 19 + 636262 CCACTATCACATAAGGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 177132 19 + 647215 CCACAATTACATAAGGGAA - -a -s mr.mrrefChr5 41908 88 + 294542 AAAAGTTGCAAAGGAATCAGGCCAGACTCAGAATGAGGGTTGAGCACTGAATTCCATTTGGAAGTATAAGACTATATCTTGCCTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186842 73 + 636262 AAAAGTTGCAAAGGAATCCGGCCAGACTCAGAATGAGGGTTGAGT---------------GAAGTTTAAGACTACAGCTTGCCTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 177151 88 + 647215 AAAATTTGGAAAGCAATCAGGCCAGACTCAGAATGGGGGTTGAGCACTGAATTCCATTTGGAAGCATAGAACTATATCTTGCCTGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 41996 78 + 294542 GTAGCTTTAACTGGTGCTAAAAATGGTTACAGTATAAGCTAGCTGTCCAACCTTGTATTCACCTACATTTCCAGATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186915 77 + 636262 GTAGCTTTAACTGGTGCTAAAAATGGTTACAGTATAAGCTAGCTG-CCAACCTTGTATTCACCTACATTTCCAGATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 177240 78 + 647215 GTAGCTTTAAATGGTGCTAAAGATGGTTACAGTATAAGCTAGCTGTCCAACCTTGTATTCACCTACATTTCCAGATCC - -a -s mr.mrrefChr5 42074 14 + 294542 AATTGCACAACAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186992 14 + 636262 AATTGCACAACAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 177345 14 + 647215 AATTTCACAACAGG - -a -s mr.mrrefChr5 42088 202 + 294542 ACTCTCCAAATTTTTCAAATGCTATGTGTGGAACGAGGTAAATTTGAATTGTAAATTTTTGGTAGCAAGTCTCTTGATTGGTACAACTTCCCTGTTCATGTGATGCGGCAGAAAATAAATGGGGCCAGCACAATCTTTCAGTGTTTATGTAACATACCATTTCCATGTTCTAATAGCTTATATTCAGTAATTCAGACCCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187006 202 + 636262 ACTCTCCAAATTTATCAAATTCTATGTGGGGAACGAGGTAACTTTGAATTGTAAATTTTTGGTAGCGAGTCTCTTGATTGGTACAACTTCCCTGTTCATGTGATGCGGCAGAAAATAAATGGGGCCAGCACAATCTTTCAGTGTTTATGTAACATACCATTTCCATGGTCTAATAGCTTATATTCAATGATTCAGACCCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 177360 199 + 647215 GCTCTCCAAA-TTTTCAAATGCTATGTGTGGAACAAGGTAAATTTGAATTGTAAATATACAATGGAAAGTCTTTTGTTTGGTACAACTTCCCTGTTCATGTGATGCGTCAGAAAGTAAGTGGGGTCAGCACAATCTTTCA--GTTTATGTAACATACTGTTTTCAAGTTCTAATAGCTTATAATCAGTAATTCAGACCCCCA - -a -s mr.mrrefChr5 42290 16 + 294542 ATAATTACCAGCAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187208 16 + 636262 ATGATTACCAGCAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 177565 16 + 647215 ATAATTACCAGCAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 42306 61 + 294542 AGAAAGCCAGGCATCGTGGTTAGTCATCAAACCAACACAGGTCAGTGGGGAAGTTGGCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187232 61 + 636262 AGAAAGCCAGGCATCGTGGTTAGTCATCAAACCAACACAGGTCAGTGGGGAAGTTGGCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 177581 61 + 647215 AGAAAGCCAGGCATCTCGGCGAGCCATCAAACCAACACAGGTCAGTGGGGAAGTTGGCAGC - -a -s mr.mrrefChr5 42367 131 + 294542 GTTACATGTAATGGTACCATAACTTGCCATTTACCCTGTGATTTATTGTGAGAACTCGTGCTTCTAAAGAAAGCCAGGTACTATCAAATTGGTCACCTGATATAGAGCTGTACAACATTTTGAACGTCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187300 130 + 636262 GTTACATGTAATGGTACCATATCTTGCCATTTACCTTGTGATTTATTGTGAGAACCC-TACTTCTAAAGAAAGCCAGGTACTATCAAATTGGTCACCTGATATAGAGCTTTACAACATTCTGAACGTCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 177642 131 + 647215 GTTACATGTAATGATACCATAATTTGCCATTTACCCTGTCATTTATTGTGAGAATTTGTGCTTCTAAAGAAAATCAGGTACTATCAAATCGGTCACCTGATAGAGATCTGTACAACATTTCGAACATCATG - -a -s mr.mrrefChr5 42498 101 + 294542 ATAAGTATGTTAGTTTACTACATCTGGATAATGACGCTAAGGGTGAGACTTAATGATTGAAATGCAATTTTAGAGTCAACTAGATGGGAAATAACCCATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187430 101 + 636262 ATAAGTAGGTTAGTTTGCTACATCTGGATAATGACGCTAAGGGTGAGACTTAATGTTTGAAATGCAATTTTAGAGTCAACTAGATGGGAAATAACCCATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 177775 83 + 647215 ATAAGTATATTAATTTACTACATATGGATAATAACTCCAAGGGTGAGACTTAATGACTGA---------------TCCACTAGATGGGAAATA---CATGG - -a -s mr.mrrefChr5 42599 90 + 294542 CCCTAATCATAAAAAGTTTGTGCTTTATAAATGATTTGCAACACACAATAGTTGTAAGGCTGTAAAGAATTACCCTGGTAGAATCAAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187532 90 + 636262 CCCTAATCATAAAGAGTTTGTGCTTTATAAATGATTTGCAACACACAATAGTTGTAAGGCTGTAAAGAATTCCCCTGGTAGAATCAAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 177858 90 + 647215 CACTAATCATAAAAAGTTTGGGCTTTATACACGATCTGAAACACACAATAATTGTAAGGCTGTAAAAAACTACCCTGGTAGAATCAAGGC - -a -s mr.mrrefChr5 42689 72 + 294542 TGGGACAAAGTGCAACTTAGCACAGACCTTCACTGCTGTTTATAGTGAGGAGAAGATAGTAATATACTAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187622 72 + 636262 TGGGACAAAGTGCAACTTAGCACAGACCTTCACTGCTGTCTATAGTGAGGAGAAGATAGTAATATGCTAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 177981 72 + 647215 TGGGGCACAGTGCAATTCAGTGCAGACCTCCACTGGTGTTTATAGCGAGGAGAAGATAGTAATATACTAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 42761 82 + 294542 TTAATGTTGAGTTCAGTGTATAAATCTTTTAGTGTGTGAACTTATGACAACAGTTGTAACTAATGAATGTTAGTACTAATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187694 81 + 636262 TTAATGTTGAG-TCTGTGTGTAAATGTTTTAGTGTGTGAACTTATGACAACAGTTGTAACTAATGAATGTTAGTACTAATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 178057 82 + 647215 TTAATGTTGAGTTCAGTGTATAAATCTTCCAGCTTGTGAACTTATGACAACGGTTGTAACAAATGAATGTTAGTACTAATGT - -a -s mr.mrrefChr5 42843 127 + 294542 TAGTAGCAGAGCTTCAGGGGACAGGGGAAAAGCCATTGCAGGTGGCACAGTCAATCTACCTACAGGTCTTTCTATATGTTTACCCTGATAATTCAACTCAATGATAATCTCTCTATATTCTTGTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187775 127 + 636262 TAGTAGCAGAGCTTCAGAGGACAGGGAAAAAGCCATTGCAGGTGGCACAATCAATCAACCTACAGGTCTTTCTATATGTTTACCCTGATAATTCAACTCTATGATAATCTCTCTATATTCTTGTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 178175 94 + 647215 TAATAGATGAGCTTCAGGGAGCAGGAGAAAAGCCATTGCAGGTGGCACAGTCAATATAC---------------------TACCCTGATAATTCAACTCAATGATACTCTCTCTA------------ - -a -s mr.mrrefChr5 42970 239 + 294542 TGTTTGAAAATCATACTGGGCATTAAACCCCTTCATCTGATTTGGTTAACAATCACCAATCTCAAACAACTTTGCCTGTTGAACAGATAAATTCCAAGCAAAAATCTGAGGGTGATCATTAAATGATCTTACTTAGTATGCTAACTCTCATGGGACTGCACTCTTTCAGGATTAACTAGTCCCTATATTATGAAAAAATCTGGCTTATAACTGATTTTTATCCACTCAGAAGCAGAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187906 238 + 636262 TGTTTGAAAATCATACTGGGCATTAAACCTCTTCATCTGATTT-GTTAACAATCACCAATCTCAAACAGTTTTGCCTGTTGCACAGATAAATTCCAAGCAAAAATCTGGAGGTGATCATTAGATGATCTTACTTAGCATGCTAACTCTCATGGGACTGCACTCTTTCAGGATTAACTAGTCCCTATATTATGAAAAAATCTGGCTTATAACTGATTTTTATCCACTCAGAAGCAGAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 178269 234 + 647215 -----GAAAATTAAACCGGGCATTAAACCCCTTAATCTGATTTGGTTAACCATCACCAATCTCAAACAACTTTGCCTGTTGAACAGGTATATTCCAAACAAAAATCTGAGGGTGATCATTAAATGATCTTACTTAGTATGCTCATTCTCATTGGACTGCATTCTCTTCGGATTAACTTGTCCCTATATTATGACAAAATCTGGCTTATAACTGATGTTTATCCAGTCAGAAGCCAAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 43209 58 + 294542 TTGTAACCTAGTAAGATTGACATTGTCATTGTTGACATACCAGAAATTAGGGGCAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 188144 58 + 636262 TTGTAACCTAGTAACATTGACATTGTCATTGTTGACATACCAGAAATTAGTGACAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 178505 58 + 647215 TTGTCACCTAGTAAGATTGGCGTTGTCGTTGTTGACATACCAGAAATTAGGGGCAATT - -a -s mr.mrrefChr5 43267 281 + 294542 TGCAAAGTACATGGGTGCACATGGCTGCGTTTGCCTTTTTTTGGAGCTCTCCATGAGGCACTGTGCAAAATCTAAACAGTGCTAAGACCATGGGCCCTAAAAATTCTGGAGAAAATGAACTGTCATTTCTCCTCTTGCTGGGGGGTCCATTAGGTGCTGCTTGACGTATGTCAATAAATTTTTTGGTTACTCACAATGTCCATTTTTAAGTTGCACTTCATCATCTTCCATAACAACCAACACCAGTGTTACTGATCAGTTTGCCTGGGAGCTTAGTCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 188202 279 + 636262 TGCAAAGTACATGGGTGCACATGGCTGCGTTTGCCTTTTTTTGGAGCTCTCCATGAGGCACTGTGCAAAATCTAAACAGTGCTAAGACCATGGGCCCTAAAAATTCTGGTGGAAATGTACTTTCATTTCTCCTCTTGCTGGGGGGTCCATTAGG-GCTGCTTGATGTCTGTCAATAACCTTTTTGGTTCCTCACAGAGTCCATTTTTAAATTGCACTTCATCATCTTCCATA-TAACCAACACCAGCGTTACTGGTCAGTTCGCCTGGGAGCTTAGTCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 178565 281 + 647215 TGCAAAGTACATGGGTGAATGTGGCCGCATTTGCCTTTTATTGTAGCTTTGCATGAGGCACTGTGCAAAATCTAGTCAATGCTATGACCACGGTCCCTGAAAATTCTGGAGAAAATGAACTGTCATTTCTACTCTTGCTGAGGGGTCCATTAGGTGTTGCTTGACGTATGTCAAGGAATTTTTTGGTTACTCACAATGTCCATTTTTAAGTTGCACTTCATCATTTTCCATAACAACCAACAGCAGTTATACTGACCAGTTTACCCAGGAGCTTAGTCCAC - -a -s mr.mrrefChr5 43548 190 + 294542 AAGGAACTCCTTCTCCTCCACCTAAGTGATCCTTAAGTGCAACTACAAATTAACTGTTCTTAAAGTGCTGAGACTACACACTAGTGCAGTGCACTGCATGGTTTAGTTAGTGGCTACACTGATAACAATTAACTTCAATAAAAATTACCTTCTCACTCACAGTCTACTTTCCCTGATGCCTCCAAGATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 188527 189 + 636262 AAGGAACTCCTT-TCCTTCACACAAGTGACCCTTAAGTGCAACTACAAATTAACTGTTCTTAAAGTGGTGAGACTACACACTAGTGCAGTGCACTGCATGGTTTAGTTAGTGGCTACACTGATAACAATTAACTTCAATAAAAATTATGTTCTCACTCACAGTCTACTTTCCCTGATGCCTCCAAGATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 178846 190 + 647215 AAGGACCTCCTTCCCCTCCACCTAGGTGATCCTCAAATGCGGCTACAAATTAACTGTTCTTAAAATCCTGAGACTACACACCAGTGCATTGCACTGCATGCTTTAATTAGTGGCTCCACTGGTAACAATTAACTTCAATAAAAATTACCTCCTCACTCACAGTCTACTTTCCCTGATGTATCCAAGATAC - -a -s mr.mrrefChr5 43738 372 + 294542 TTCTTCACTCACATCCTTAACATCCTTATCTGGACCATGGTCCACGTCTTTCAATGGATTTTGAGCATCATATTTACTATCCTTCTTCTAGCTGCAATTTTCATGGATTGTTGGGATGAAGTCTAAGGCCAAAATAGTGCAAGTCTGGGTCTAGCAAGACTCTCATATAGCATGGGAGTTGTACATCTTTTACACACATATGGGCATCACCTTCTAAAGAAGCCCTCATTAACCCAGATTTCCAGTCCCTATGTGGGACAAATTAGTCTGTGTTTCCCAGGTTGACAGGTGACATCTATTCATGACGACTAAACTTTCTGGGTGGACCACATGGGTGTGGATGAGTCAACAGAACTATGAAGAATACTATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 188716 372 + 636262 TTCTTCACTCACATCCTTAACATCCTTATCTGGACCATGGTCCACGTCTTTCAATGGATTTTGAGCATCATATTTACCATTCTTCTTCTAGCTGGAATTTTCATGGATTGTTGGGATGAAGTCTAGGGCCAAAATAGTGCAAGTCTGGGTCTAGCAAGACTCTCATATAGCATGGGAGTTGTACATCTTTTACACACATATGGGCATCACCTTCTGAAGAAGCCCTCATTAACCCAGATCTCCAGTTCCTATGTGGGACAAATTAGTCTGTGTTTCCCAGTTTGACAGGTGACATCTATTCATGACGACTAAACTTTCTGGGTGGACCACTTGGGTGTGGATGAGTCAACAGGACCATGAAGAATACCGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 179037 372 + 647215 TTCTTAACTCACATCCTTAGCATCCTTATCTGAACCATAGACCACGACTTTCAATGGATTTTGAGCATCATAATCACTATCGTTCTTCTAGCTGCAATTTTCATGGATTGTTGGGATGAAGTCTAACGCCAAAATAGTGCAAGACTGGGTATGGCAAGACTCACATATAGCATGGGAGTTATACATCTTTAACACACATATGGGCACCCCCCCCTAAAGGAGACCTCATAAACCGGGACTTCCAGTCCTTATGTGAGACAAATTAGTCTGTGTTTCCCAGGTTGACATGTGCCATCTGATCACAATGACTAAACTTTCTAGGTGGACCACATGGGAGTGGATGCGTCAACAGAAGTATGAAGATTACTATAT - -a -s mr.mrrefChr5 44110 138 + 294542 ACATCTTTACTATACTATGCATATCGCAAATGACCAATCACAGTGTTGAACCAAGATTTATTGTGTTAAACGAGTCAGTAACAGTTAGCTTTGCACATAAATCCTCTATGTACTTTTAGACATGTTACCAAGTCCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189089 138 + 636262 ACATTTTCACTATACTATGCATATTGCAAATGACCAATCACAGTGTTGAACCATGATTCACTGTGTTAATCAAGTCAGTAACAATTAGCTTTGCACATAAGTCCTCTATGTACTTTTAGACATGTTACTAAGTCTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 179409 138 + 647215 ACATCTTTACTATACTATGCATATCGAAAATGACCAATCACAGTGTCAAACCAAGATTTATTGTGTTAAACGAGTCAGTAACAGTTAGCTTTGCACATAAATCCTCTACGTAATTTTAGACATGTTACCAAGTCCCCT - -a -s mr.mrrefChr5 44248 99 + 294542 TCATAACCTTGTATAGGTATACTATTGTCTTGTCTCTCGTTCCCTTGTTGAAATGCATTACTCATCACATGAAGAGGCTTAGGCACTGTGAACAGCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189232 99 + 636262 TCATAACCTTGTATAGGTATACTATTGTCTTGTCTCTCGTTCCGTTGTTGAAATGCATTACTCATCACATGAAGAAGCTTAGGCACTGTGAACAGCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 179547 99 + 647215 TCATAACCTTGTATAGGTATACTATTGTCTTGTCTCTTGTTCCCCTGTTGAAATGCATTACTCATCACATGAAAAGACTTAGGCACTATGAACAGCCTA - -a -s mr.mrrefChr5 44347 82 + 294542 CATTGTTGCAAAATCATATGCCAGTCCTCTGCCTTTTCCATATGTTTTCTTTCATCTTAACAAGGGTTTTGCATCCACATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189331 82 + 636262 CATTGTTGCAAAATCATATGCCAGTTCTCTGCCTTTTCCATATGTTTTCTTTCATCTTATCAAGGGTTTTGTGTCCACATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 179663 82 + 647215 CATTGTTGCAAAATCATATGGCAGTCCTCTGCTTTTTCCACAAATTTTCTTTCATCTTAACAAGGGTTTTGCATACACATGA - -a -s mr.mrrefChr5 44429 130 + 294542 TGGACCATTATACCATTTTTGTGATTGTTAGACTCTTTCATCCTATTTGGGTGTACCTGACTTGTTAGAGGTCATTTCTTAAGTTCTCTCAGGTTTTAATAGGTATGCCTAGAGTGATGGCTAGGATGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189413 130 + 636262 CGGACCATTATACCATTTTTGTGATTGTTAGACTCTTTCATCCTACTTGGGTGTACCTGACTTGTTAGAGGTCATTTCTTAAGTTGTCTCAGGTTTTAATAGGTATGCCTAGAGTGATGGCTAGGATCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 179746 130 + 647215 TGGACTATTGTACCACTATTGTGATTGTTGGATACTTTCAACCTATTTGTGTGGACCTGACTTGTTAGAGGTTATTTCTTAAGTTCTCTCAGGTTTTAATAGGTGTGCCTAGAGTGATGGCTAGAATGCC - -a -s mr.mrrefChr5 44559 57 + 294542 CCAGCATTAGGATGCTTTAAATTGCTATCTGTAGGTTCCACTGTATAACCTGACAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189545 57 + 636262 CCAGCTTTAGGTTGCTTAAAATTGCTATCAGTAGGCTCCACTATATAACCTAACAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 179876 57 + 647215 CTGTTATTAGGATGCTGTAAATTGCTATCTGTAGGTTCCACTGTATAACCTGACAGG - -a -s mr.mrrefChr5 44616 82 + 294542 CAAACTGACTTTTTAATTCTCTTAACTGTGGACTCACAGAAGAGGACAACAATATTCTGCAAGTCTACTTAGTTATCACTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189602 82 + 636262 CAAATTGACTTTTTAATTCTCGTAACTGTGGATGCACAGAAGAGGACAACAATATTTTGCAAATCTACTTAGTTACCACTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 179937 81 + 647215 CAAACTGACTGTCTAATTTTCTTAACTATGGACTCACAGAAGAGGACAAC-ATATTCTTCAAGTCTACTTAGTTATCACTCA - -a -s mr.mrrefChr5 44698 248 + 294542 TAACCTTGTAGAGGCAATTATTACTCTCTCTTCATTGCTCTTAAGAGTCTTATCAACTACCACTCATAAGGTCCGTGTCACTAACACTACTCTATCTTCATTACATCCTAACACCTGTACTAGTAGGTAGGCAAAAACATGGGACTGCCTGTGCTTGGCCACATACTAATTGACAATTTGAACATCCTATATAGACAAATTCCAGACAATGTACTGGGACTCCTCTGTTAGAGAGCAACAGCCTGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189685 246 + 636262 TAACCTTGTAGAGGCAATTATTACTCTCTCTTCATTGCTCTTAAGAGTCTTATCAACTACCACTCATAAGGTTCGTTTCACTAACACTACTCTATCTTCATTACATCCTAACACCTGTACTAGTAGGTAGGCAAAAACATAGGACTGCCTGTGCTTGGCCACATACTAATTGACGATCTGAACATCC--TATAGACAAATTCCAGACAATGTACTGGGACTCCTCTGTCAGAGAGCAAAAGCCTGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 180018 244 + 647215 TAACCTTGTATTGGCAATAATTACTCTCTGTCCATTGATCTTAACAGTCTTATCAACTACCACTCATAGGGGCGGTGTCACTAACATCACTCTGTCTTCATCACATCCTAACACCTGTACTA----ATAGGCAAAAAGTTGGGACTGCCTGTGCTGGGCCACATACTAGTTGACAATTTGAACATCCTATATAGACAAATTCCAGACGATGAACTGGTACTCCTCTGTTAGAGAGCTACAGCATAACA - -a -s mr.mrrefChr5 44946 73 + 294542 GGGTTGAGTATTCAAAATACATCAAGGCTTCCTGCTTCATTGGAATTCATTCCAGGCACTAATAGTTATGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189932 73 + 636262 GGGTTGAGTATTCAAAATCCATCAAGGCTTCCTGCTTCATTGGAATTCATTCCAGGCACTAATAGTTAGGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 180262 73 + 647215 GGGTTGCGTATTGAAAATACATCAAGGCTTCCTACTACATTGGAATTCATTCCAGGCACTAATAGTTATGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 45019 57 + 294542 TCAGATGATCAGTTGATTCCTCTGAGTGCCCTGATCTCAACTTTTGTTTGGAAGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190006 57 + 636262 CCAGATGATCAGTTGATTCCTCTGAGTGCCCTGAACTCAACTTTTGTTTGGAAGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 180335 57 + 647215 TCAGCTGATTAGTTGATTCCTCTGAGTGCCCTGATTTCAACTTGTATTTAGAAGGCC - -a -s mr.mrrefChr5 45076 42 + 294542 CAGACACAGCTCCATGCAGATGGGACATACCTCTACGGACGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190063 42 + 636262 CAGACACAGCTCCATGTGGATGGGACATACCTCTACGGACGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 180393 42 + 647215 CAGATACAGCTCCATGCAGATGGGACATACCTCCACAGACAG - -a -s mr.mrrefChr5 45118 49 + 294542 GGTTTGAGCAATGTAACGAATATTGCGCGTGATGATCTTCCCCTACTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190106 49 + 636262 TTTTTGAGCAATGTAACAAATATTACACGTGATGATTTTCCCCTATATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 180435 49 + 647215 GGTTTGAACAATGCAACGAAAATTGCGCCCGATGATCTTCCCCTACTTC - -a -s mr.mrrefChr5 45167 133 + 294542 TAACTGACAGTGCCATCATATAGAATATAATCTGTTACAACAGTTGAATCTTGTTGTTTCATTGCTCTGTATATTAGGTAGGTGCAAGGATTTCTTTTATGGTTTGGATGAGATGAGTAAGAGGTGCAAGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190156 133 + 636262 TAACTGACAGTGCCATCATATAGAATATAATCTGTTACAACAGTTGAATCTTGTTGTTTCATTGCTCTGCATGTTAGGTAGGTGCAGCAACTTCTTTTATGGTTAGGATACGATGACTAAGAGGTGCAAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 180484 133 + 647215 TAACTGACAGTGCCATCATATGGAATATAATCTGTTACAACAGTTGAATCTTGTTGTATCATTGCTCTGTATATTAGGTAGGTGCCAGGATTTCTTTTATGATTTGGACGAGATGAGTAAGAGGTGCAAGAAG - -a -s mr.mrrefChr5 45300 123 + 294542 AGGGGGTCCACAATTTCAAGGTCCATTGAATAAGCTACCTGAACTGCTTGCTGACCCACTAGAGGCAGTGTTGATTGCAAGATCATGAATGTTGCACCCATAAATCACAGGGGAATTGGGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190289 123 + 636262 AGGGTGTCCACAGTTTCAAGGTCCCTTGAATAAGCTACCAGAACTGCTTGATGAGCCACTAGAGGCAGTGTTCATTGCAAGATCATGAATGTTTCACCCATAAGTCACAGTAGAATTGGGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 180620 123 + 647215 AGGGGCTCCACAATTTCAAGGTCCAATCAATGAGCCACCTGAACTGCTTGCTGACCTACTAGAGGCAGCGTTGATTGCAAGATCATAAATGTTGCACCCATAAATCACAGGGGAATTTGAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 45423 192 + 294542 TGGAGTATGAATAGTCTAGACGATGGCTTGAGCCAGGCTGCATAGTCTCCCTAAAAATACTGTCCCTGACAAAAAAAGATAATTTATCTTTCTAGTTTGGCATCAAGAAAATAGCTCATCATGCCATCCCCCACACAATAGATTTGAGTTTGGTAAACCTTGAAACTGGAGTATTTGAGGTAATAAATCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190418 163 + 636262 TGGGGTAAGAATAGTCTAGATGATGGCTT-------GCTGTATAGTGTCCCTAAAAATAC--TCCCTGACAAAAAATGATAATTTATCTTTCTGGTTT------GAGAAGATAGCTCATCATGCCATCCCCCACACAATAGAATTGAGTTTGGT--------------GAGTATTTGAGGTAATAAATCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 180743 192 + 647215 TGGAGTATGAATAGTCTAGACCATGGCTTGAGCCAGGCGGCATAGTCTCCCTAAAAATACTGTCCCTGACAGACAGAGATAATTTATATTTCCAGCTAGGCATCAAGAAAATAGCTCATCAGGCCATCCCCCACACAATAGATTTGAACTTGGTAAACCTTGAAACTGGAGTATTTGAGGTAATAAATCTAT - -a -s mr.mrrefChr5 45615 146 + 294542 TAGAACTAGACATAATATGAGCGTGGTGCTGGTAGTAGGCTGGTAAGACAGGAGAATAAGGAGACCAGTGTGGAGTATAAAGATCTCAGAGTATGAAGTCTCGTTCGTTACTCCAGTTTGCCAAGTTAAGGAGAGTTTCAGACTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190582 145 + 636262 CAGGACTAGACATAATATGAGCGTGGTGCTGGTATTAAGC-AGCAAGACAGGAGAATGAGGAGACTCATGTGGAGTATAAAGATCTCAGAGTATGAAGTCTTGTTCATTACCCCAGTTTGCCAAGTTAAGGAGAGTTTCAGACTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 180935 140 + 647215 TAAAACTAGACACAAC------GTGGTGCTGGTAGTAGGCTGGTAAGACAGAAGAATAAGGAGACCAGTGTAGTGCATAAAGATCTTACAGTATGAAGTCTCGTTCGTTACTACAGTTTGCCAAGTTCAGTAGGGCTTCAGGCTAA - -a -s mr.mrrefChr5 45761 17 + 294542 GAGACTGTCCAATAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190728 17 + 636262 GAGGCTGTCCAATGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 181075 17 + 647215 GAGACTATCCAGTAGTC - -a -s mr.mrrefChr5 45778 9 + 294542 CTAACAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190746 9 + 636262 CTAACAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 181092 9 + 647215 CTAACAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 45787 72 + 294542 CAATCAAATATGCATGGCTCCCTAGCTTGAGCACTTGTGAAGGCTGAGGGTTTCCTTTCATGCTACTCCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190755 64 + 636262 CAAGCAAATATGCATGGCTCCCTAGCTTGACCTCATGTGA--------GGTTTCCTTTCAGCTAACAGCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 181103 72 + 647215 AAATCAAATATGCATGGCTCCCTAGCTTGAGCACTTGTGAAGGCTGAGGGTTTCTTTTCATGCTATTCCTAA - -a -s mr.mrrefChr5 45859 58 + 294542 ACACTAACACTTCTTGTTGGACTCAGCCATAGCACAGTATATCTATCACAATATGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190820 56 + 636262 ACCTAAACACTTCTTGTTGGACTCAGCCATAGCACAG--TATCTATCACAATATGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 181175 58 + 647215 ACACTAACACTTCATGTCAGACTCAGTCATAGCACAGTATATCTATCACAATAAGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 45917 289 + 294542 TATTTTGTGTGAGTAATCACAAGTACTAGATGATTGGAAGACCAAGTTTGTCTACTGGGAAAAGTTTGGGGTGTATCACAGTAGCCTCAAGAGGTGCCAAGCTCTGGTATGCACTCCCTCAATGAGCGAGATTACTGAATTAGGACACATGGGAGCCTTCAAATCCGGCTTCAATAATCTCCACTGTAACTAAATGATACAAGTACCGATTTGTGATGCTATAGATTTTAGAATATGAATTCGTGGGATTTCCATGGGTTAATTTATGGCTGCTTACCAATGACTTCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190880 255 + 636262 TATTTTGTGTGATTAATCACAAGTACTAGCTCATCGGGAGACCAAGTTTGTCTAGTAAGAAAAGTTTGGGGTGTATCACAGTAGCCTCAAGAGGTGCCAAGCTCTGATATGCACTCCCTCAATGCGCGAGACTACTGAATTAGGACACATGGGAGCCTTC--------------------------------AATGAAACAAGTACCGATTTGTGATGCTATAGATTTTAGAATATGAATCCGTGGGATTTTCATGGGTTAATTTATGGC--CTTACCAATGACTGCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 181233 289 + 647215 TATTTTGTGTGAGTAATCACAAGTACTAAATGATTGGAAGAGTAAGTTTGTCTACTGGGCAAAGTCTGGGGCGTTTCACAGTAGACTCAAGAGGTACCAAGGTCTGGTATGCACTCCCTCAATGAGCGAGATTACTGGATTAGGACACATTGGAGCCTACAAATCCGGCTTCAATAATCTCCACTGTAACTAAATGATTCAAGTACAGATTTGTGAAGCTATAGATTATATAATCTGAATTTGTCAGACTTCCATGGGTTGATTTATGGCTGCTTACCAATGACATCTT - -a -s mr.mrrefChr5 46206 6 + 294542 TCCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191136 6 + 636262 TCCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 181522 6 + 647215 TCAATT - -a -s mr.mrrefChr5 46212 200 + 294542 GCTTCAAATGCCACAAAGACATGAGACCTTGCTTTGTACTCATGTGCTTTCCTCAACCAGGAATAGAATCTCCTTCATGACATATGAGCCTACACCTGTAACCCACTAAATGATCAAACGATAGTTCTGTAACATTTTCTGTAACCTACTTGAAGCTGAGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGAAGTTGGATCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191145 184 + 636262 GTTTTAAATGCCACAAAGACATGAGAC----------ACTCATGTGCTTTCCTCAACCAGGAATAGAATCTCCTTCATGACATACGAGCCTACACCTGTAACCCACCAAATGATGAAAC------CCTGTAATATTTTCTGTAACTTACTTGAAGCAGAGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGAAGTTGGAGCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 181528 200 + 647215 GCTTCAACTGGCACAAAGACATGAGACCTTGCTTTGTGCTCATGTACTTACCTCGACCATGAATAGCATCTCCTTCATGTCATATGAGCCTATACCTGTAACCTAATAAGTGATCAAATGATAGTTCCGTAACCTTCTCTATAACCTAATTGAAGCTGGGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGACGTGAGCTCTTC - -a -s mr.mrrefChr5 46412 2 + 294542 AT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191329 2 + 636262 AT -s simRat_chr6.simRat.chr6 181730 2 + 647215 AT - -a -s mr.mrrefChr5 46414 7 + 294542 AATAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191332 7 + 636262 AATAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 181732 5 + 647215 AATAA-- - -a -s mr.mrrefChr5 46421 86 + 294542 ATGAAAGTATTTTGCAGATCTTTAGTAAACAGCCTTAGTTAAGTATCTGCTTCGTTGCCAATCTGTTTACAGATTCGTATGACTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191343 83 + 636262 ATGAAAGTATTTTGCAGATCT---GTAAACAGCCTTAGCTATATATCTGCTTCGTTGCCAATCTGTTTACAGTTTCGTATGACTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 181737 76 + 647215 ----------TTTGCAGATCTTTAGTAAACAGCCTAAGTTAAGTCTCTGCTTCGTTGCCAATCTGTTTACAGAGTCGTATGATTCT - -a -s mr.mrrefChr5 46507 57 + 294542 CAAAAGTGCCTTTTCTGCATCTACAGAACTAATGTATTATGGCTAATTCCACACCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191428 57 + 636262 CAAAAGTGCCTCCTCTGCACCCGCAGAACTAATGTATTATGGCTAATTCCACACCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 181813 57 + 647215 CAAAAGTACCTTTTCTGCATCTACAGAACTAATGTATTATGGCTAACTCCATCCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 46564 48 + 294542 CTGCCTCTGTCTAGCCTGTCTAGGCTATGGAAAACTGCCCCCTCTGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191489 48 + 636262 CTGCCTCTGTCTAGCCTGTCTAGGCTATGGAAAACTGCCCCCTTTGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 181870 48 + 647215 CCTCGTCTGTCTAGCTTGTTTAGGCTATGGAAAACTGCCCCCTCTGCA - -a -s mr.mrrefChr5 46612 205 + 294542 ACTCATTATAGTGCATTTCACCCTTGCCCCTTTGTCTAGTAGTATCACATTGCATCTTGACACTCATGAGATCTCCTGCATAAGTTGCCTTGGCAAGCATGCTCAGATCCTTTGACATTTAGATTAGATTGTCGAACAATGAAAAGTATGATTTGCTCTTCATTGCTCAACCCTACCAATGTACCAAGAGCTGAGTGATGTGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191543 205 + 636262 CCTCATTATAGTGCATTTCACCCTTGCCCCTTTGTCTAGTAGTATCACATTGCATCTTGACACCCATGAGATCTCCTGCATAAGTTGCCTTGGCAAGCATGCTCGGATCCTTTGACATTCAGATTAGATTGTCGAACAATGAAAAGTACGATTTGCTCTCGATTGTTCAACCCTACCAATGTACCAAGAGCTGAGTGATGTGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 181918 205 + 647215 ACTCGTTATAGTGCATTTTGCCCTTGCCCATTTGTATGGTAGTATCACCTTGCATCTTGACACTCATGAGATCTCCTGCACAAGTTGCCTTGGCAAGCTTGCTCAGATCCTTTGACATTTCGATTAGATTGTCTAATAATGAAAGGTATGATACGCTCTTCATTGCTCAACCCTACCAATGTACCAAGAGCTGAGTGATGTGGCG - -a -s mr.mrrefChr5 46817 21 + 294542 CATACAGCTCTGCGCTGGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191748 21 + 636262 CATATAGCTCTGCGCTGGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 182132 20 + 647215 TATACAGCTC-ACGCTGGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 46838 86 + 294542 TTGTCTCTTTCTACAAGACAAGCAGCATCTCTTGTATTTTTTATAGTAAAGATTGCTGTCATCTCAATGTGTTGAGACCATGGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191938 86 + 636262 TTGTCTCTTGCTACAAGACAAGCAGCATCTCTTGTATTTTTTATAGCAAAGATCACCGTCATCTCAATGTGTTGAAACCATGGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 182152 86 + 647215 TTGTCTGTATCTACAAGACAATCAGCATCTCTTGTATTTTTTATAGTAAGGATTGCTGTCATCTCAATGTGTTGAGACTATGGGTC - -a -s mr.mrrefChr5 46924 157 + 294542 TGTGGAATATAACAAATGTATCCTGAAGTCAAAGCTAGCTAGTTTAACAGGATCTGCCATGTTAGACTCTGGGCTACTAGTGAATGATTATTTCTGGCTAAATAATGTGCATATTTGTAAGCCAAAAGAGGTGCTTCAGTCTGACACAGCATGCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192025 154 + 636262 T--GGAATATAACAAATGTA-CCTGAAGTCAAAGCTTGCTAGTTTAACAGGATCTGCCATGTTAGACTCTGGGCTACTAGTGGGTGATTATTTCTGGCTAAATAATGTGCACATTTGTAAGCCAAAAGAGGTGCTTCAGTCTGACACAGCATGCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 182238 151 + 647215 TGTGGGATATAACAAATGTATCTTGAAGTCAAAGCTAGCTGGTGTAACAGGATCTGCCATGTTAGACTCGGGGC------TGAATCCTTATTTCTGCTTAAATAATGTGCATATTTGTAAGCCAAAAGAGGTGCTTTGGTCTGACACAGCACGAGAC - -a -s mr.mrrefChr5 47081 52 + 294542 AAAAAAAATTGAATCCAACTGGTTTCAATATGATAGATGCTACCAACTTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192182 52 + 636262 AAAAAAAATTGAATCCAACTGGTTTCAATATGATAGATGCTACCAACTTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 182389 52 + 647215 ACAAAAAATTGTATCCAACGAGTTTCAACATGATAGATGCTACCAACTTAGG - -a -s mr.mrrefChr5 47133 78 + 294542 ATAACACTATACACTTACCTTAGTTATTCACATCATTTAACCAGTCACAGTCACATGGGCCCTGTGGGGCCCTGTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192252 77 + 636262 ATAACACTATACACTTACCTTAGTTATTCACATCATTTAACCAGTTACAGTCACAT-GGCCCTGTGGCTCCCTGTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 182441 74 + 647215 ATAACACAATAAACTTACCTTAGTTATTCACA--ACTCAAACAGTCACAGTCACATGGGCCCTCTGGGGCCCCGTC-- - -a -s mr.mrrefChr5 47211 514 + 294542 TGAGATTGATCCTTTAAGACAGCATGCCCTGTTAACATGATGTTGGTCCTTTAAGACAGCACGTATAATGAACTCAGCACTTTATATCTCATGGACTGCTCACCGGATGTTATTGGCTAATCCAAATATACATGCAAAGCTTTGCCAGGCCCTTGAGCAGAAAAGAATGTGTTGCTGCATCCGTTGTGGGAGCAGATTTAAGCTGATGACCGCTCCTGTTATATACCAATTACAGTTACTCAGATTCAGGCACAGTCTGACTCTTTCAAGACTGCTTCTAGACAACATACCTCTCCTAAAGTCATAAGATGGGTAAATCGCTAAGATGGGTGTATGATGAAAGGACACAAAAGTATAGCCCTGCTGTAGCACATTAGGTGCAATCATGTGTAGGGAGATTGTTGGTAAGTGTCCTGGGGTACCACTGTAGCCCATAATGACTTGCCCAGTTGGCTGGCACACAGTGGATATTGTAGCTGTGAATTTAAGCGCGCGATGGACTGATCAATAATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192331 492 + 636262 TGAGATTGATCCTTTAAGACAGCATGCCCTGTTAACCTGATGTTGGTCCATTAAGACAGCACATATAATGAACTCAGCACTTTATATCTCGTGGACCGCTTACCGGATGTTATTGGCTAATCCAAGCATACATGCAAAGCTTTGCCAGGCCCTTGAGCAGAAAAGAATGTGTTGCTGCATCCGTTGTGGGAGCAGATTTAAGCTGATGACCGCTCCTGTTATATACCAATTACGGTTACCCAGATTCAGGCACAGTCTGACCCTTTCAAGACTTCTTCTAGACAACATACCTCTCCTAAAGTC-----------------CTAAGATGGGTGTATGATGAAAGGACACAGAAGTATAGCCCTGCCATAGCACATTAGGTGCAATCAGGTGTAGGGAGATTGTTGGTAAGTGTCCTGGGGCACCACTGTAGCCCGTAATGACTTGCCCAGTTGGCTGGCACACAGTGGATATTG-----GTTAATTTAAGCGCGCGACGGACTAATGAAGGGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 182515 504 + 647215 TGAGGTTGATCCTTTAAGATAGCAGGCCCTGTCAACATGATGTTGGTCCTTTAAGACAGCACGTATAACGAACTCAATACTTTATGTCTCATAGACTGTTCACCGGATGTTATTGGCTAGTCCAAATATACATGCAAAGCTTTGCTAGGCCCTGGAGCAGCAAAGAATGTGTTGCTGCATCTGTCCTGTGAGCAAATTTTAGCTGATGGCCACTCCTGTTATAAACCAATTAAAGTTACTCGGACTCAGGCACAGACTGACTCTTTCAAGACTGCTTCTAAAGAACATACATCTCCTAAAATCATAAGATGGGTAAATCGTTAAGATGGGTGTACGAAGAAAGGACACAAAAGTA--------CTGTACCACATTAGGTACAATCATGTGTAGGGAGATTATTGGTGAGTGTCCTGGGCTACCACTGTAGCCCATAATGACTTGCCCAGCTGGCTGACACACAGTGGATATTGTAGCTGTGAACATAAATGTTCTATG--CTGATCAATAATCA - -a -s mr.mrrefChr5 47725 10 + 294542 TGTGAACATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192825 10 + 636262 TGTGAACATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 183019 10 + 647215 TCCAGACACC - -a -s mr.mrrefChr5 47735 230 + 294542 AATGCAATCCAACCTACCAATCTACATATCCCAAGAGGAGTGCTGCCCAGTAAGTCTCCAGAAAACAATAGGAAAAATCCATGTATTATTCTGTTTATTTGGTTTCTCACACATAGGTGGCCCAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCTGCTCAGGTGCTCTTCAGGGATAGAAATATTCCCAGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTGATATCTCAGAGGCTGTATCAATGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192835 230 + 636262 AATGCAATCTAACCTACCAATCTACATATCCCAAGAGGAGTGCTGCCCAGAAAGTCTCCAAAAAACAATAGGAAAAATTCACGTATTGTTCTGTTTGTTTGGTCTGTCACACATAAGTGGCTCAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCGGCTCTGGTGCTCTTCAGGGATAGAAATATTCCCAGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTGATATCTCAGAGGCTGTATCAATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 183030 226 + 647215 AGTGCAATCCAATCTACAAATCTACATAT----AGAGGAGTGCTTCCGAGTAAGTCTCCAGAAAACAATAGGAAAAATCCGTATATTATTGCAATTATTTGGTTTCCCATACATGGGTGGCCTAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCTGCACAAGTGGCCTTCAGGAACAGAGATATTTCCGGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTTATATCTTAGAGGCTGTATCAATGCT - -a -s mr.mrrefChr5 47965 23 + 294542 TCACGGCTATGACTGTGGGTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193070 23 + 636262 TCACGGCTATGACTGTGGGTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 183256 23 + 647215 TCATGTCTATGACTATAGGTTCG - -a -s mr.mrrefChr5 47988 135 + 294542 GGAAAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTAAGCATAAGGACTCTATGAGAATGATTGCTTTTCTGATGTAGGAGTGGGGCCACCTCCCTACTAAGTCTGGAATGCAGCACATACATCCTCATCTATTAGGCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193093 135 + 636262 GGAAAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTAAGCATAAGGACTCTATGAGAATGATTGCTTTTCTGATGTAGGAGTGGGGCCACCTCCCTACTAAGTCTGGAATGCAGCACATACATCCTCATCTATTAGGCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 183290 135 + 647215 GGACAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTCAGCATGAAGAAACTATGAGAATGACTTCTTTTCAGATGTAGGAGTGGAGCCATCTCCCTTGTAAGTTTGGTACGCAGCACTTATGTCCTCCTCTATTAGGTATAA - -a -s mr.mrrefChr5 48123 63 + 294542 AAAGGGGGTGGTTCTGCATGACTAAGGGCAAATACTTCTAGCTCTTTATATTTGGTGAAGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193228 63 + 636262 AAAGGGGGTGGTTCTGCATGACTAAGGGCAAATACTTCTAGCTCTTTATATTTGGTGAAGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 183426 63 + 647215 AAAGGGGGTCTCTCTGCATGACTCAGGGCAGATACTTCTACCTCTTTATATTTGGTGAAGCAG - -a -s mr.mrrefChr5 48186 83 + 294542 AGACCTCTGTTTTATTTTATCAATCTACATTTGGTCTAAGCCTCAGCAGCCCTAATAACCCTTTGGGCTGGGGACATGGAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193291 83 + 636262 AGACCTCTGTTTTATTTTATCAATCTACATTTGGTCTAAGCCTCAGCAGCCCTAATAACCCTTTGGGCTGGGGACATGGAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 183492 83 + 647215 AGACCTCTTTTTTATTTTGTCAATCCACATTTGGTTAACGCCTCAGCAACCCCAATAACCCTTCAAGCTGGGGACATGGAACC - -a -s mr.mrrefChr5 48269 20 + 294542 TTATGTCATGGCTTCACGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193375 20 + 636262 TTATGTCATGGCTTCACGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 183575 20 + 647215 TTATGTCATGGCCTCATGCA - -a -s mr.mrrefChr5 48289 205 + 294542 TACGAATGAACCTTTCAGGTTAATGAAGTGGGAGTACAACTGCTTTACCATTGTAGGCTTCTGTTATTACGGGGTGGAATCTCAAGGGTTTCAAAAACCCCAGGCATTACTCGATCAACTTATATTGTGGGCTTCATCTACTTCAGTCATGACTTTAGCAGGTGTACAAATGCTTTAGGCTCGAGAAGTGGGAGAATAAACTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193413 205 + 636262 TACGAATGAACCTTTCAGGTTAATGAAGTGGGAGTACAACTGCTTTACCATTGTAGGCTTCTGTTATTACGGGGTGGAATCTCAAGGGTTTCAAAAACCCCAGGCATTACTCGATCAACTTATATTGTGGGCTTCATCTACTTCAGTCATGACTTTAGCAGGTGTACAAATGCTTTAGGCTCGAGAAGTGGGAGAATAAACTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 183595 205 + 647215 CATGTATGAACCTTTCAGGCTTACGAGGTGGGACCACAACTGCTTTACCATTGTAGGCTTCTGCTATTATGGGGTGGAATCTCAAAGGTTTGAAAAGCCCCAAGAATTACTTGATCAACTCATATTGTGGGCTTCATTTACTTCAGTCATGACTCCAGCAGGTGTACGAACTCTTTAGGCTAGAGAAGTGGGAGAGAAAACTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 48494 18 + 294542 AAACAAGAGGCTTTCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193624 18 + 636262 AAACAAGAGGCTTTCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 183800 18 + 647215 AAATAATAGGCTTTCAGT - -a -s mr.mrrefChr5 48512 12 + 294542 ATCATGGGATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193643 12 + 636262 ATCATGGGATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 183818 12 + 647215 ATTATGGGATCA - -a -s mr.mrrefChr5 48524 21 + 294542 ATCTCAAAAGCTGCAGGAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193655 21 + 636262 ATCTCAAAAGCTGCAGGAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 183835 21 + 647215 ATCTCAAAAGCTGCAGGTATT - -a -s mr.mrrefChr5 48545 13 + 294542 CTCGCTTGGCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193676 13 + 636262 CTCGCTTGGCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 183857 13 + 647215 CTTGCTTGGCTAA - -a -s mr.mrrefChr5 48558 45 + 294542 GTGTTGGCTTTTCGGGGTGCTATCTGAAAGCTTGCAGCATCAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193698 45 + 636262 GTGTTGGCTTTTCGGGGTGCTATCTGAAAGCTTGCAGCATCAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 183870 45 + 647215 GAGTGGGCTTTTCAGGGTGCTATCTGAAAGGTTGCAGCATCATGA - -a -s mr.mrrefChr5 48603 76 + 294542 TTGATGATGTCTTCCATGTGAATCAACATATTATGAACACTTTTGAAACTTGAGGTGAATATGCACACACCATTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193744 76 + 636262 TTGATGATGTCTTCCATGTGAATCAACATATTATGAACACTTTTGAAACTTGAGGTGAATATGCACACACCATTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 183915 76 + 647215 TTGATAAGGTCTTCCATGTGAATCAACATGTTATGCAGACTTTTCAAATATAATGTGGACATGCACACACCATTAC - -a -s mr.mrrefChr5 48679 193 + 294542 GAAGGTTCTCCTTACCTGGGAGAACAAGGTATCTTAGTTAAAGCAACCTGAGCTGAGCCTATCATTTCATATCTGCATAACACATCATGAATACTCATTTCTATAAACCTATTCTCTGCATGCAATGAACTTTCATACCCCTACCCTTGATGTGTCCAGCAAAGGGCTCACTCGTAGTCAAGTCCACCAAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193820 193 + 636262 GAAGGTTCTCCTTACCTGGGAGAACAAGGTATCTTAGTTAAAGCAACCTGAGCTGAGCCTATCATTTCATATCTGCATAACACATCATGAATACTCATTTCTATAAACCTATTCTCTGCATGCAATGAACTTTCATACCCCTACCCTTGATGTGTCCAGCAAAGGGCTCACTCGTAGTCAAGTCCACCAAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 183993 193 + 647215 GAAGGTTCTTCTTACCTGGGAGCACAAGGTATCTCTGTTAATGCAATGTGAGCTTAACCTGTCATTTCATGTCTGCATAACATGTCAGGAATACTCATTTATACAAACCTATTCTTCTCATGCAATCAACTTTCATACCCCTACTCTTGATATGTCCAGCAAAGGGCTCACTTCTAGTCAAGTTTAGCAAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 48872 207 + 294542 TTCACTCATAGTCAAGTCTAGAAGCATTTAGAATCAAGGTAAAAACTAGTGGACTGTTCAGTCAGGTGTCTCAAATATATCGCTCCCTAATATTGCAGCAGTCTTCTTGACTATAGCAAGAAACTGAAGTTAACTTCAGCTAAAGTAACCAAGGAAGTGAAAACACTACATTGAGCTGGACCTCTAAGGTCAAGCCAGCAACCTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194013 207 + 636262 TTCACTCATAGTCAAGTCTAGAAGCATTTAGAATCAAGGTAAAAACTAGTGGACTGTTCAGTCAGGTGTCTCAAATATATCGCTCCCTAATATTGCAGCAGTCTTCTTGACTATAGCAAGAAACTGAAGTTAACTTCAGCTAAAGTAACCAAGGAAGTGAAAACACTACATTGAGCTGGACCTCTAAGGTCAAGCCAGCAACCTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 184187 207 + 647215 CTCACTCATAATCAAGTCTAAAAGCATTTTGAATCAAGGTAAAAACCAGTGAACTGTTTAATCAGGTTTTTCAAAAATATTACTTCCTTATATTGCTGCAGTCTTCCTGACTATAATAAGTAGCTAAAGTTAACTGCAGCTAACGGACCCAAAGAAGTGAGAACACTACATTGAACTGGATCTCTATGGTCAAACCAGCAACGTATA - -a -s mr.mrrefChr5 49079 4 + 294542 ATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194220 4 + 636262 ATCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 184398 4 + 647215 ATCT - -a -s mr.mrrefChr5 49083 100 + 294542 CTTCCCTTGAAACCAAGATCCTGTTGGAACATCTCCTGTTGGATGGGGAATAGCAGATATGCAGACTGATAGTAGAGCGCAGCCTGAAGGTGTAGCTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194224 100 + 636262 CTTCCCTTGAAACCAAGACCCTGTTGCAACATCTCCTGTTGAATGGGGAATAGCAGATATGCAGACTGATAGTAGAGCGCAGTCTGGAGGTGTAGCTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 184405 100 + 647215 CTTCCCTTGAAACCAAGATCCTGTTGGAACATCTCCTGTTGGATGGGGAATAGCAGGTATGCAGACTGATAGTGGAGTGCAGCCTGAAGGTGTAGCTTTA - -a -s mr.mrrefChr5 49183 230 + 294542 CTGTTGTAAAGGAGCAAATCACATCGAGCAATCTTAATTATACCCCTCCCATCTATTGTTTTCCTCTAGCTGTTTGCTCGATGCTTTGTGTCTTCTACTTTCTTGATAGGGAGTTTGGACACATTTATCAAGCTGTGACCCTGGGCAACTGTCAGAAACTACTGTAACAGTACCTGCCAAACATTACCACTTTTCTGAACCCAAACCCAATGAATATAATAGAAAATTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194338 230 + 636262 CTGTTGTAAAGGAGCAAATCACATCGAGCAATCTTAATTATACCCCTCCCATCTATTGTTTCCCTCTAGCTGTTGGCTCGATGCTTTGTGTCTTCTACTTTCTTGATAGGGAGTTTGGACACATTTATCAAGCTGTGACCCTGGTCAGCTGTCAGAAACTACTGTAACAGTGCCTGCCAAACATTACCACTTTTCTGAACCCAAACCTAATTAATATAATAGAAAATTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 184679 229 + 647215 CTGTTATGAATGAGCAAGCCACAACGAGCAATCTTAAGTAT-CCCCTCCCTTCTATTGTTTTCCTCTAGTTGGTTGCTCAATGCTTTGTGTCTTCTACTTTCTTGATAGGGAGTTCAAACATATTTATCAAGCTCTCACCCTGGGCAACTGTCATAAACTACTGTAACAGTACATGCCAAATATTACCACTTTTCTGAACCCAAAGCCAATGAATATAATAGAAATTTGA - -a -s mr.mrrefChr5 49413 62 + 294542 GACTTCATACACAGAAAAATAATGGTGGCACCTAACCTGCCAACTTTATGTTCTGTGTCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194569 62 + 636262 GGCTTCATACACAGAAAAATAATGGTGGCACCTAACCTGCCAACTTTATGTTCTGTGTCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 184908 62 + 647215 GACTTTACACACAGCATGATAATGGAGGCACATAACCTGCCAACTTTATGATCCATGCCTAT - -a -s mr.mrrefChr5 49475 242 + 294542 AATAGACAATGTAGTAGACTTCATTCAGGTACAGTGTTTATATTTACCAATACATAATGACTCCAGTATACAGCTATAAATGGAAGCTTATTGTGTGGATAGCTAGTCCAAGTGTCTCACCTGAGTTATTCGGTAGTGTTCAGGCTGTTGGTTCAATGGGATGCATTGCAACATATGTTATCTCCTTGAATTTAGAGTAACATGAAGAAAAAGCCTGGTTTCTAGTATGCTTTTGTTATAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194632 241 + 636262 AATAGACAATGTAGTACACATCATTCAGGTACAGTGTTTATATTTACCAACACATAATGACTCCAGCATACTGCTATCAATGGAAGTTCATTGTG-GGATAGCTAGTCCAAGTGTCTCATCTGAGTTATTCGGCAGTGTTGAGGCTGTTGGCTCACTGGGATGCATTGCAACATATGTTATCTCCTTAAATTTAGTGTAACATGAAGAAAAAGCCTGGTTTCTAGTATGCTTTTGTTATAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 184970 212 + 647215 AATAGACAATGCAGTAGACTTCATTCAGGTACAGTGTTTATATTTACCAATACATAATGACTCCAGTCTACAGCTATAAATGGAAGCTTATTGTGTGGATAGCTAGTCCAAGTCTCTCACCTGAATTATTTGGTGGTGTTCAGTCTGTTGTTTCAAGGGGA--------AACATATGTCATCTCCTTGAATTTAGAGTAACATGAAAAAAAAGT----TTTCTA------------------ - -a -s mr.mrrefChr5 49717 642 + 294542 TCACAGTGACCACTCCTGTTGTAAGTACCTGTTACTAGAATTTCAACATATGGTTCACACTCACCCATTAAACCTTCTATTTCAGTCACTGGAAAGTCCTAATGTTGCTGTGATATTATATTCCATTTCACAGCATACTGAGCCAGATATTGCTTGCAGTACTCACTAAGATCTAAATTACTATAGTAAACCTCACCCTTATCTGCATAGGGATATAATGGACTCACTTCAAATCAACCCAGAAGGGTCCATCTCATTTGTACAAATTCTCTACCTTAGCACAAGGAGCAAAATCCCTCTGCAAGGTCAGGAAAAATTGCAAGGTCAGTGGTTTTAGCTGAGCTGGGGGAAAGAACAATCAATTAATATTGAAAATACCAAATTCATTGAGAAGACTTATATACTCTTATTAAACTGATCTTAGGATACATGCAGCCTCTACAATACTGAAGTACAGGTTATATGTGTTTGAAGGCAGGGTAGAAATAAAAAGTTTTCTCATGCAATGATGTACCAGTTAAGTACCCTCATTGACCTGGATCAAAATATTGAGGGTGACAAATCAGTCATATTTACTGGTTTAAGTTGCCACGCTGCTTATATAGAGAACATATCAACAACATAGCACTATGGCATGTACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194875 640 + 636262 TCACAGTGACCACGCCTGTTGTAAGTACCTGTTGTTAGAATTTCAACATATGGTTCACATCCACCCATTAAACCTTCCATTTCAGTAACTGGAAGGTCCTAATGTTGCTGTGATATTATAT-CCATTTCACAGCATACTGAGTCAGTTATTGCTTGCAGTACTCACTAAGATCTAAATTAC-ATAGTAAACCTGACCCTTATCTGCATAGGGATATAATGGACTCACTACAAATCAACTCAGAAGGGTCCATCTCAATTGTACAAATTCTCTACCTTAGCACATGGAGCAAAATCCATCTGCTAGGCCAGGAAAAATTGCAAGGTCAGTGGTTTTAGCTAAGCTGGGGGAAAGAACAATCAATTAATATTGAAAATACCAAATTCATGGAGAAGACTTATATACCCTCATTAAACTGATCTTAGGATACATTAAGCCTCTACAATACTGAAGTGCAGGTTATATGTGTTTGAAGGCAGGGGAGAAATAAAGAGTTTTCTCATGCAATGATGTACCAGTTAAGTACCCTCATTCACCTGCATCAAAATAATGAGGGAGTTAAATCACTCATATTTACTGGTTTAAGTTGCCACGCTGCTTATATAGAGAACATATCAACAACATAGCACTATGGCATGTACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 185182 577 + 647215 ---------CCACTCCTGTTG------CCTGTTACTAGAATTTCAAAATGTGGTTCACACTCACCCATTAAACATTCTGTTTCACTCACTGGAAAGTCCTAGTGTTGCCATGAAATTATATTCCATTTCACAGCATTCTGAGCCAGATATTGCTTGCAGTACTTACTAAGATCTAAATTACTATAGTAAACCTCACCCTTAATTGCATAGGGATATAGTGGACTCACTTCAAATCAACCCAGA--------TCTCATTTGTACAAATTCTCTACCTTGGCACAAGGGGGAAAATCCCTCTGCAAGGTCACTAAAAATTGCAAGGTCAGTGGTTTTAGCTGAGC---------------------------------------TTCATTGAAAACACTTATGTACTCTTAGTAAACTGATCTTAGGATACATGCAGCCTCTGTAATGCTGAAGCACAGACTATATGTGTTTGAAGGTAGGGTAAAAATAAAAGTTTTTCTCGT---ATGATGTGCCAATTAAATAACCTCATTGACCTGGATCAAAGTATTAAGGGTGACAAATTAGTCATATTTAATGGTTTAAGTTGCCATGCTATGTGTATGGAGAACATATCAACAGCATAGCCCTATGGCATGTACCA - -a -s mr.mrrefChr5 50359 25 + 294542 CAGCCACTTGAACCATTTGATCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195519 25 + 636262 CAGCCACTTGAACCATTTGATCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 185759 25 + 647215 CACCCACTTGAGCCATTCAATCTAT - -a -s mr.mrrefChr5 50384 49 + 294542 CATTCTGTCCACACAAGATGTCACAGCTAGTGCCCTTTGAGGGACATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195545 49 + 636262 CATTCTGTCCACACAAGATGTCACAGCTAGTGCCCTTTGAGGGACATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 185784 49 + 647215 CGTTCTGTGCACATAAGATGTTGTAGCTAGCACCCTGTAAGGGACATGA - -a -s mr.mrrefChr5 50433 19 + 294542 GATTGCACCCTTGTTTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195597 19 + 636262 GATTGCACCCTTGTTTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 185833 19 + 647215 GATTGGACCCATGTTTCTC - -a -s mr.mrrefChr5 50452 33 + 294542 CTGGTGAAGTTAGGTGGGATCAACTAAACTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195616 33 + 636262 CTGGTGAAGTTAGGTGGGATCAACTAAACTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 185855 33 + 647215 CTGGTGGAGTTAGATCGAATCACCTAAACCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 50485 60 + 294542 ACCACAGAGAATCTTTAGGGCCCTCATGAATCAAACTCGGGAGTAAGATGGACTTTACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195650 60 + 636262 ACCACAGAGAATCTTTAGGGCCCTCATGAATCAAACTCGGGAGTAAGATGGACTTTACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 185888 60 + 647215 ACCACAGAGAATCTTTAGGGCCCTCATTGATTAAACTGAGGAGTAAGATAGACTCTACCA - -a -s mr.mrrefChr5 50545 60 + 294542 CTAGGAGCCATACTGCATAAAAGCCCTTGCCAGACTTGTCATGTAGGGTTCATTAGTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195710 60 + 636262 CTAGGAGCCATACTGCATAAAAGCCCTTGCCAGACTTGTCATGTAGGGTTCATTAGTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 185949 60 + 647215 CAAGCAGCCATATGGCATAAGAGCCCTCGCCAGACTCATCATGCCTGGTTCATTAGTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 50605 159 + 294542 AGGTCCCATAAAACACACAATACTGCATAAGGTGCTATTACTGAAATTAGTCCCACCTCAGCACGGACTAACAGTATTCACTAACCTCCAAGGTTTACAACCTGAACCTCCTTGATGCCTAAACTCCCCTGTAGTGCTGTCTGAGGTGTCTTTATCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195771 159 + 636262 AGGTCCCATAAAACACACAATACTGCATAAGGTGCTATTACTGAAATTAGTCCCACCTCAGCACGGACTAACAGTATTCACTAACCTCCAAGGTTTACAACCTGAACCTCCTTGATGCCTAAACTCCCCTGTAGTGCTGTCTGAGGTGTCTTTATCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 186009 159 + 647215 AGGTCCTGTAAAACACACAATACTGCATAAGGTGTTCCCCCCAAAATTAGTTCCACCTCAGTGCGGACTAAAAGGATTCACTAGCCTCCAAGGTTTACAACCTGAGCTGACTTGATGGGTAAACTTCCCTATAGTGTTGTCTGAGGTGTTTTTTTCCCT - -a -s mr.mrrefChr5 50764 36 + 294542 CATATGCAGGATAAAACCAAGGGCTTGCCTGCTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195933 36 + 636262 CATATGCAGGATAAAACCAAGGGCTTGCCTGCTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 186168 36 + 647215 CATGTGCAGGGTAAAACTTAGGTCTTGCCCACTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 50800 7 + 294542 AATCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195971 7 + 636262 AATCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 186204 7 + 647215 AATCATC - -a -s mr.mrrefChr5 50807 54 + 294542 GAACTATGAAACAGCCTCCAAAAGGCATACTGCCCCAAATTCAGATGATCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196005 54 + 636262 GAACTATGAAACAGCCTCCAAAAGGCATACTGCCCCAAATTCAGATGATCTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 186211 54 + 647215 GAGCCATAAAACAGCCTTTAAAAGGCGAACTGCCCTAAATATGGATGGTCTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 50861 33 + 294542 TAATGCTGTCTgaggtgtcTTTAaccttcatat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196064 33 + 636262 TAATGCTGTCTgaggtgtctttaaccttcatat -s simRat_chr6.simRat.chr6 186265 33 + 647215 TATGGAGGTCTAAGCAACCTCCACCGGACAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 50894 14 + 294542 acaggataaaacca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196097 14 + 636262 gcaggataaaacca -s simRat_chr6.simRat.chr6 186299 14 + 647215 ACTTTATAAGGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 50908 5 + 294542 agggc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196111 5 + 636262 agggc -s simRat_chr6.simRat.chr6 186314 5 + 647215 AGGGC - -a -s mr.mrrefChr5 50913 50 + 294542 ttgcctgcttgaaatcatcagtaagccagtatcattgtatatgtggaacc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196116 50 + 636262 ttgcctgctggaaatcatcagtaagccagtatcattgtatacgtggaacc -s simRat_chr6.simRat.chr6 186322 46 + 647215 TCGCCT--TTCATAGTGTTGGTATCTGACTATC--TGAATATTTCTAACC - -a -s mr.mrrefChr5 50963 92 + 294542 atgaaacagccttcagaaagcaaactgccctaaatacggatggtctaagcaacctcaactggacagcttactttataaggccatagggccct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196166 92 + 636262 atgaaacagccttcaaaaggcaaactgccccaaatacggatgatctaagcaaccttcactggataacctactttataaggccataggccccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 186395 92 + 647215 ATTAAACAGGCTTTAGAAAGCAAACTGCCCTAAATGTGGACGGTCTAAGCAACCTCAAGTGGACAGCTTACTTTATAAGGCCATAGGGCCCT - -a -s mr.mrrefChr5 51055 22 + 294542 tCTGTAGTGTTGGTATCTGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196260 22 + 636262 tCTGTGGTTTTGGTATCTGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 186487 22 + 647215 TCATTAGTGTTGGTATCTGACT - -a -s mr.mrrefChr5 51077 97 + 294542 ATCTGAATATTTCTGACCTATGTGGTTCTTAGCTGTGGTTTTCCAATCAGTCACATTAATCACTTCAATTACACTTGTCCCCTCCTCAATAGTGCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196288 97 + 636262 ATCTGAATATTTCCGACCTATCTGGTTCTTAGCTGTGGTTTTTCAATTAGTCACATTAATCACTTCAATTACACTTGTCCCCTCCTCAATAGTGCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 186509 97 + 647215 ATCTGAATATTTCTAACCTATGTGGTTCTTAGCTGTGGTTTTCCAATCAGTCACATTACTCATTTGAATTACAATTGTCCCCTCCTCAATAGTGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 51174 96 + 294542 CAATACGATCACAACATTATCGCCTCCTGTGGATAGCTGTGCTGCTCTTCCAGTCCACATGCTTGAGGGGTTCTTGCTCACTGCCAATTTTAGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196386 96 + 636262 CAATACGATCACAACATTATCGCCTGCTGTGGATAGCTGTGCTGCTCTTTCAGTCCACACACTTGAGGGGTTCTTGCTCACTGCCAATTTTGGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 186606 96 + 647215 CAATACGTTCACAACACTATCGCCTCCTGTGGATAGCTGTGCTGCTCTTCCAGTCCACATGCTTGCAGGGGTATTGCTCACTGGCAGTTTTAGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 51270 297 + 294542 CTACAAAACAAAGAACATTATAGAGCTCCTATCTATATCAGCTCACCTCTTATCTAACCATCCTGAAACTAGCTCCTTTTATCCCAACCCCATAGTGATTTCGCCTTATATTCCTTAAATAATCACAATTGATACAAGCCCAAGTCCATTTTCTGTAACGGAGAGCCATAAGGGAAGTGTAGATGCCAACAGCCTATGTGTCCACAGGGTTGCTTTTAAGTGCATCCCAATAAATTAAGTCTAATTTAGAAACTAATTCTATCCACAATCCTAACTTCTGATTATTTTAAGTTCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196484 295 + 636262 CTACAAAACAAAGAACATTATTGAACTCCTATCTTCATCAGTTTTCCTCTTACCTAACCATCCTGAAACTAGCTCCTTTT--CCTAACCCCATAGTGATTTCGCCTTATATTCCTCAAATAATCGCAATTGATATAAGCCCAAGTCCATTTTCTGTAACGGAGAGCCATAAGGGAAGTGTAGATGCCAACAGCCTATGTGTCCACAGGGTTGCTTTTAAGTGCATCCCAATAAATTAAGTCTAATTTAGAAACTAATTCTGTTCACAATCCTAACTTCTTACTATTTTAAGTTCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 186702 284 + 647215 CTTCAAAGCAAAGAACGTTTTAGAGGTCCTATCTATATCAGCTCACCTCTTATCTAACCATCCTGAAACTAGCTCCTTTTATCCCAACCCCATAGTGATTTGCCCTCATATTCCTTAAATAATCACAATTGAAACAAGTCCAAGTCCATGTTCTGTGA-------------GGGAAGTGTAGATGCCAACTGCCTATGTGTCCGCAGGGTTGCTTTTAAGTACATCCCAATAAATTAAGTGTAATTTAGAAACTAATTCTATCCACAATGTTAACTTCTGATAATTTTAAGTTCTGG - -a -s mr.mrrefChr5 51567 36 + 294542 CAAAAGTTACATCTAAAAACCCAGTGCCCAGGGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196779 36 + 636262 CAAAAGTGACATCTAAAAACCCAGTGCCCAGGGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 186987 36 + 647215 CTAAACTTACATCTAAAAACCCAGTGCCCACGGGGA - -a -s mr.mrrefChr5 51603 227 + 294542 AGTGGAGTGAGTGACCAAAGGGAGGATTAGAGCACTATGTGATCAGTCCAAAACTTGGAACCTGCTTGGGGGCATACCTCCATGGTTTAGCCATTGAGGGGCTCAATGGAACTAAGACATAAAGGAATGACAGAATTGTCTGTGCCTGCATGAACTCAAGCCCTAATTCACTTGAATAGGGTAAGTTTAGTCAAGAGAACTCCAAATTAAACATGGAACCGAAGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196820 226 + 636262 AGTGGAGTGAGTGATCAAAGGGAGGACTGCAGCTCTA-GTGATCAGTCCAATACTTGGAACCTGCTTGGGGGCACACCTCCATGGTTTAGCCATTGAGGGGCTCAATGGAGCTAAGACATAAAGGAATGACAGAATTGTCTGTGCCTGCATGAACTCAAGCCCTAATTCACTTGAATAGGGTAAGTTTAGTCAGGAAAACTCTAAATTCAACATAGATCCGAAGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 187023 227 + 647215 AGTGGAGTGAGTGGCCTAAGGGTGGATTAGTGTACTATGTGATCAGTCCAAATCTTGGCACCTGCTCGGGGGCATACCTCTATGGTTTAGCCATCAAGGGGCTCAATGGAACTAAGACATAAAGGAATGACAAAATTATTGGTGCCCGGATGAACTCAATCCCTAATTCACTTGAATAGGGTAAGTTGAGACAAGAGAACTCCAAATTAAACATGGGACAAAAGATT - -a -s mr.mrrefChr5 51830 205 + 294542 AAAAACCCAAAACATGGTTCAGAAGAATAAGAAACACATGGCTACAGGGGAGCCCAAGGCTTGAAAAGATTTGTTAGAGTTTGCATGAGTGCATGAGTCAGGGTCTGTAAGAAGAAAGATGACTAGAAGGCATCTATATGTACTATAGAATGCAGGGACAACTACAGTGGAGTCTATCCTCAATCAGTCTGTCATTGGAAGCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197047 205 + 636262 AAAAACCCAAAACATGGTTCAGAAGAATAAGAAACACATGGCTACAGGGGAGCCCAAGGCTTGCAAAGATTTGTTAGAGTTAGCATGAGTGCATGAGTCCGGGTCTGTAAGAAGAGAGATGACTAGAAGGCATCTATATATGCTATAGAATGCAGGGACAACTACGGTGGAGTCTATCCGCAATCAGTCTGTTATTGGAAGCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 187250 205 + 647215 AAAAACCTAAAACATGGTTCGGAAGAACAAGAAGCACATGGCTACAGCGGAGCCCAAGACTTGAAAAGATTTGTTAGAGCTTGCATGAGTACATGAGTCATGGTCTGTGTGAAGAAAGATGATTAGAAGGCATCTATATGTACTATAGAATGTAGGAACAACCACAGTGGAGTCTATCCTCAATCAGCCTGTCATTGGAAGCAGT - -a -s mr.mrrefChr5 52035 187 + 294542 AGTCTCTTATCCACTTCAAGAGGAGCATGGGGTCATTGTGAGTTTGATGTATTAGACAATACTTCAGATTAACAAATTCAGTTAACGAGTTTTTGTGCCCCTATACCCTTTGGTTTCGGCAACATAGGGATCTATGAGCTGACTATGCACTCTTGATGACTGTCTATTTCTCGTAATGTTATTGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197253 186 + 636262 AGTACCATAACTACTTCAAGAGGA-CATCAGGTCATTGTGAGTTTGATGTGTTGGACCATACTTCAGATTAACAAATTCAGTTAACAGGTTTTTGCGCCCCTATACCCTTTGGCTTCGGCAACATAGGGATCTATGAGCTGACTATGCACTCTTGATGACTGTCTATTTCTCGTAATGTTATTGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 187455 180 + 647215 AGTCTCTTATCCACCTGAAGAGGAGCATGGGGTCATTGTAAGTTTG---TACTAGGCAATACTTCAGATTGACAAATTCAGTTAATGAGTTTTTGTGCCC----ACCCTTTGGTTTTGGCAACATAAGGATCTAGGAGCTGACTACGCACTCTTGATGACTGTCTATTTTTAATAATGTTGTTGATA - -a -s mr.mrrefChr5 52222 67 + 294542 ACTACAAGATGACTTAATACAAGTTTTTGAATTGTGCTGCAGGCTCTAAAGTTTGATGGCCTTTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197442 67 + 636262 ACTACAAGATGACTTAATACAAGTTTTTGAATTGTGCTGCAGGCTCTAAAGTTTGATGGCCTTTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 187635 67 + 647215 GCTAAAAGATGACTTAATACAAGTTTTGGGATTGTGCTGCAGGCATTAAAGTTCGATGGGCTTTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 52289 100 + 294542 GGTGGGCAATAGAGTGCTGATGGCTAGACTGCATAGCTGGGTGATACATGTGACAGACTTTAGTTTACCCTACCTGCCTTAGGAAAACCAGGCTCTTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197509 100 + 636262 GGTGGGCAATAGAGTGCTGATGGCTAGACTGCATAGCTGGGTGATACATGTGACAGACTTTAGTTTACCCTACCTGCCTTAGGAAAACCAGGCTCTTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 187709 100 + 647215 ACTGGGCAATAGAGTGCATATGGCTGAGCCGCATAGCTGGGTGCTGCATGTAACAGACTTTAGTTTACCCAACCTGCCTTAGGAAAACTAGGCTCACGCA - -a -s mr.mrrefChr5 52389 14 + 294542 CAGTGCCAACACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197631 14 + 636262 CAGTGCCAACACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 187809 14 + 647215 CAATGATAGCACAT - -a -s mr.mrrefChr5 52403 43 + 294542 tagtactcagttggtgtgcaaatcctaaaaatatttgaaaagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197652 43 + 636262 tagtactcagttggtgtgcaaatcctaaaaatatttgaaaagt -s simRat_chr6.simRat.chr6 187823 43 + 647215 TAACACACAGTGCCAACACAACCtttgatgatacttggttggt - -a -s mr.mrrefChr5 52446 5 + 294542 gagca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197718 5 + 636262 gagca -s simRat_chr6.simRat.chr6 187866 5 + 647215 gtgca - -a -s mr.mrrefChr5 52451 10 + 294542 tagcctataa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197725 10 + 636262 tagcctataa -s simRat_chr6.simRat.chr6 187871 10 + 647215 tatcctaaaa - -a -s mr.mrrefChr5 52461 8 + 294542 atattcta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197754 8 + 636262 atattcta -s simRat_chr6.simRat.chr6 187881 8 + 647215 atattcgA - -a -s mr.mrrefChr5 52469 25 + 294542 aaagtcttgaggctgctggggaccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197769 25 + 636262 aaagtcttgaggctgctggggaccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 187889 25 + 647215 AAAATCCTAAAACTATTTGAAAACT - -a -s mr.mrrefChr5 52494 4 + 294542 CCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197799 4 + 636262 CCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 187914 4 + 647215 CCCT - -a -s mr.mrrefChr5 52498 3 + 294542 AGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197806 3 + 636262 AGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 187918 3 + 647215 AGT - -a -s mr.mrrefChr5 52501 340 + 294542 AGGTCTTGCAGAAGACATCCTGTGGGTTGGCCGTTGGCTTGCACGACCTTagtctacaccctcattgattaaagcaaaggagtgatatcgagtacatctaacaagaagagagaaatAGCTCTCCTAATCAGCCTATGATTATGATATGTTTCTCAAGCATAGGGCCACCGTATTGGGGAGTGTGGTTTGAAATGAACATCTTGGATCCACACGGCAATGAAAAAAAATAATTCATTGCATTATTTTACACAAATCAAGAAGAGCCTGTTTTACATTTTCCTTTGCTCATTAGGAGACATGCAGGGTGATTAGATGCAAACATAAGAATTCCAGTGGACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197826 340 + 636262 AGGTCTTGCAGAAGACATCCTGTGGGTTGGCCGTTGGCTTGCACGACCTTAGTCTACACCCTCATTGATTAAAGCAAAGGAGTGATATCGAGTACATCTAACAAGAAGAGAGAAATAGCTCTCCTAATCAGCCTATGATTATGATATGTTTCTCAAGCATAGGGCCACAGTATTAGGGAGTCTGGTTTGAAATCAACATCTTGGATCCACACGGGAATGAAAAAAAATAATTCATTGCATTATTTTACACAAATCTAGAAGAGCCTGTTTTACATTTTCCTTTGCTCACTAGGAGACATGCAGGGTGATCAGATGCAACCATAAGGATTTCTGTGGACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 187921 340 + 647215 GGGTCTCGAAGCAGACATCCTGTGGGTTTGCCGTTGGTCTGCAGGACTGTaggttacaccctcattgattaaagtggaggagtgatatggaatccatctaacaagaagagccacatACCTCTCCTAATCAGCCTCTTATGATGATGTATTTCTCAAGCATAGGGCCACCGTACTGGAGACTGTGGTTTGAAATGAGCATCTTGGATCCACAAGGCAATGAAAAAAAACAATTCATTACATTATTTTACACAAATCAAGTAGAGCCTGTTTAACATTTTCCTTTGCTCATTAGGAGAAATGCAGGGTGGTTAGATGCAAACATAAGAATTCCAGTGGACAA - -a -s mr.mrrefChr5 52841 23 + 294542 GATTCTAGTACAAATGGCTGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198167 23 + 636262 GATTCTAGTACAAATGGTTGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 188261 22 + 647215 GATTGTAGTA-AAATGGCTATAA - -a -s mr.mrrefChr5 52864 100 + 294542 CTCATACATCATTGAGTTGTGAGAATTGTTGGCAAGGATAGCGAGCTAACAGCAGTATGATTCTTTTGATCGGATAGATTTAAAAGCAGACTACAATAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198215 99 + 636262 CTCATACATCATTGAGTTGTGAGAACTGTTGGCAAGGATAGCGAGC-AACAGCAGTATGATTCTTTTGATCGGATAGATTTAAAACTAGACTTCAATAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 188283 96 + 647215 CCCGTACATCATTGAGTTGTGAGAATTGTTGGCAAGGATAGCGAGCTAACAGCAGTATGGTTCTTTTGATCAGATAGATTTAAGGGCAGACTACAA---- - -a -s mr.mrrefChr5 52964 26 + 294542 GATGTATAGAAAAACATAACTGCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198316 26 + 636262 GATGTTTAGAAAAGCATAACTGCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 188379 22 + 647215 ----TAAAGAAAAACATAACTGCCCT - -a -s mr.mrrefChr5 52990 8 + 294542 CAATATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198343 8 + 636262 CAAAATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 188401 8 + 647215 CAATATAG - -a -s mr.mrrefChr5 52998 300 + 294542 GTATGTTTTTATGTAATAGAAGAATATCCATTGTCGCTATAGCAGGTCAGTTACAGATATTTGGCCAGTTTTCATCAGACTTCATTAATGTCTAGTAACCTGTCGTCAGGTACTACAGAAATTCCAGAGTATTTGAGTCTAAGAGATCACCTCAAATTTTAATTCCAGGGAGTTTGAGTTTAAGAGTCCACCTCAAATTTTGACTTGGCTTAGCCTCTCAACTATTTACCTGGCCAGACTAATTTTGCATGCAGGCTAATAGTGGGTATCTGCCTTGCTGATCAATGTCGAAGAGCTAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198354 299 + 636262 GTATGTCTTTATGTGATAGAAGAAT-TGCATTGTCGTTATAGCAGGTCAGTTACAGATATTTGGCCAGTTTTCATCAGACTTCATTAATGTCTTGTAACCTGTCGTCAGGTACCACAGAAATTCCAGAGTGTTTGAGTCTAAGAGATCACCTCAAATTTTAATTCCAGGGAGTTTGAGCTCAAGAGTCCACCTCAAATTTTGACTTGGCCTAGCCTCTCAACTATTTACCTGGCCAGACTAATTTTGCATGCAGGCTAATAGTGGGAATCTGCCTTACTGATCAATGTCGAAGAGCTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 188409 300 + 647215 GTATGTTTTTATGTAATAGAAGAATATCCATTGGTGCTATGGCAGGTCCGTTACAGATATTTGGCCAGTTTTCATCAGACTTCATTAATGTCCAGTAACCTGTCATCAGGTACTACAGTAATTCCAGAGTATTTGGGTCCAAGAGATCACCTCAAATTTTAATTCCAGGGTGTTTGAGTTTAAGAGTCCATCTCAAATTTTGACTTGGCTTAGCCCCTCAACTATTTACCCGGCAAGACTAATTTTGCATGCTGGCTAACAGTGGGTATCTGCCTTGCTGATCAATGTCGAAGAGCTGGC - -a -s mr.mrrefChr5 53298 146 + 294542 TCACTACCCATGTCCTATTCATATGAAAAGTATGTCTCCATAGTGCTATTGAATTGGTTGAGAGCACGTGAGGTGGGCAGGCTCTTCCCACAGGTGCCTGTGACTGCTTGATAGCGCATGAAGCGGGGCAGGTTCATCAGCTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198654 146 + 636262 TAACTACCCATGTCCTATTCATATGAGTAGTATGTCTCCATAGTGCTATTGAATTGGTTGAGAGCATGTGAGGTGGGCAGGCTCTTCCCACAGGTGCCTGTGACTGCTTGATAGCGCATGAAGCGGGGCAGGTTCATCAGCTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 188709 146 + 647215 TCACTAACCATGCCCTATTCAGATGAAAAGTATGTCTACATAGTGATATTGAATTGCTTGACAACACATGAGGTGGACAGGCTATTCCCACAAGTGCTTGTGATCACTTGATAGTGCATGAAGCAGGGCAGGTTCATCAGCTGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 53444 121 + 294542 CCTAATGTGTGCGCATGGACATTTACCTCCTAATGGAGCTTTGCACAAAGTACTCTGCAAAGTTTCAATAATGTTAAACTTTGCTGGCTGAAGTAAACCATTATAGCGCAGGGGAACAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198800 121 + 636262 CCTAATGTGTGCGCATGGACATTTACCTCCTAATGGAGCTTTGCACAAAGTACTCTGCAAAGTTTCAATAATGTTAAACTTTGCTGGCTGAAGTAAACCATTATAGCGCAGGGGAACAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 188856 121 + 647215 CTTAATGCGTATGCATGGACGCCTGCCTCCTATTGGAGCTTTTCACAAGGTACTCTGCAAAATCTCATTAATGTTAAAGTCTGCTGCCTGAAGGAAACCATTATAGCTCAGGGGAACAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 53565 142 + 294542 AAGTTGTAAAGTCTATACTTAACTACATTTTCCTGCTTCTGATATTGCTCTTTATACTGTATCTTTTGTGCAGTTTTGGGTCTTGCTGCATGGCAACTTATCTTTTAGGCAGTGCAAAGTTAAAAAATATGGGTTAAATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198923 142 + 636262 AAGTTGTAAAGTCTATACTTAACTACATTTTCCTACTTCTGATATTGCTCTTTATCCTGTATCATTTGTGCAGTTTTGGGTCTTGCTGCATTGCAACTTATCTTGTAGGCAGTGCAAAGTTAAAAAATATGGGTCAAGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 188977 142 + 647215 AAGTTGAGAAATCTATCCTTAACCACATTTTCCTGCTTCTGATGTTGCTCTTTATACTGTATCTTTTGTGCAGTTTTGGGTCTTGTTCACTGGCAACTTATCTTTAAGGCATTGCACAGATAAAGAATATTGGTTAAATTGA - -a -s mr.mrrefChr5 53707 100 + 294542 GTTCTAAGCCCACAGAAGCCGATTAGAATATAGTAACTTTTGACAAAAAAACATTCCTGCCCAGGTCCCACTTTCTGCACTCCAACAAAATGCCACTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199065 95 + 636262 GTTCTAAGCCCACAGAAGCCGATTAGCATATAGTAGCTTTTGA--AAAAAACATTCCTGCCCAGGTCCCACCTGTTGCACTCCAACAAAATGCC---CTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 189136 100 + 647215 GTTCTAATCACACAGAGGCCAATAAGAATATGGTAACTTTTGACAAAAAAACATTCCTGCCCGGGTCCCACTCTCTGCACCCCAACAAAATGCCACTTGA - -a -s mr.mrrefChr5 53807 389 + 294542 CTATGGATCTATTGGACATTCTTTAACCACAGACAACGCAAGGTCCTGTGATTGGTCAAATACAGTTGAGTATTATCATAATCCCACATTGCAAATAACACCTTATATGGAGCATATGGCTGGTGACTAGTGCTCTAAATGTGGCAAGAACTCTAAATGTGGGGAGAAGGACAAACATCTCGCAATTGTGGGGATTATCATACTGGAAGAGGGTGTCAGTTAGTCAGTTTTCTCTATTCTCTATTTAATCACTGGTAAGTGCTAGGTGAGCATATGCCACCTTTGATCTTAGATGGCTAAAGTTGTAATGGTACATAAACAGAGCAAGCATATAGTTCTTCCATTTGATCATCCAATCTTACAGACAGGTGACTTTGATGTACTTCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199160 388 + 636262 CTATGGATCTATTGGACATTCTTTTACCACAGACAATGCAAGGTTCTGTGATTGGTCAAATACAGTTGAGGATTATCATAATCCCACATTGCAAATAACACCTTATATGGAGCTTATGGCTGGTGACTAGTGCTCTAAATGTGGCAAGAACTCTAAAGGTGGGGCAAAGGACAAACATCTCGCAATTGTGGGGATTAT-ATACTGGAGGAGGGTGTCAGTTAGTCAGTTTTCTCTATTCTCTATTTAATTACTAGTAGGTGCTAAGTGAGCATATGCTACCTTTGATTTTAGATGGCCAAAGTTGTAATGGTACATAAACAGAGCAAGCATATAGTTCTTCTGTTTGGTCATCCCATCTTACAGACAGGTGACTTTGATGTACTTCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 189241 388 + 647215 CTATTGCACTATTGCACACTCTTTAACCACAGACAACATAAGGTCCTGTGATTGGTCAGATACGGATGAGTATTATCACAATCCCACGTTGCAAATAACACCTTGTATGGAGAATATGGCTGGTGACCAGTGCTCTAAACGTGGGGAGAAATCTAGATGTGAGGAGAAGGACAAACATCTTGAAATTGTGGGGAGTATCATACCGGAAGAGGGTGTTGGTTAGTTAGTTTTTTCTATTCTTGATTTAATCACTGGTAAGTGCTAGGTGATCATATGTCACCTTTAATCTTAGATGGCTAAAGCTGCAATGGTACATGGACAGAGTTAGCATA-AGTTCTGGCATTTGATCATCCAACCTTACAGACAGGTGACTTTGATGTACTTCTAC - -a -s mr.mrrefChr5 54196 28 + 294542 TAGTGTGCTGCTGAACTCAGTCCACAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199554 28 + 636262 TAGTGTGCTGCTGATCACAGTCCACAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 189629 28 + 647215 TAGTGTGCTGTTGAACTCCGTCCAGAAG - -a -s mr.mrrefChr5 54224 80 + 294542 ACAATTCTCAATAGGGCCATGGCGGCAATTAGTTATGAGTGATGGGTAATCTGTAGCAAATGTCAGCATTACAACTGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199582 75 + 636262 ACAATTCTCAAT-----CATGGCAGCAATTAGTTATGAGTCATGGGTAATCTGTAGCAAATGTCAGCATTACAACTGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 189659 80 + 647215 ACAATTCTCAACAGGGCCATGGTGGCAATTAGTTATGAGTGAAGGATAATCTGTCGCAATTGTCAGCCTTACAACTGGCA - -a -s mr.mrrefChr5 54304 8 + 294542 TGGACACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199657 8 + 636262 TGGACACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 189740 8 + 647215 TGGGCACT - -a -s mr.mrrefChr5 54312 191 + 294542 GACAATGACGGGATTTTGATTTATGAAGTCTGACCATTTGTAGGCAAGTCTCATTTGGAGAGGTGTTTGCTTATTTCTGCTTATTTGTACAAGCTGACTTCTTTATGTCCCCCAATCAGAATGTAGTTTGGAATTTTCCCAGTTGTTGAACCTTTAAACATGAAACCCTGAGGTTAAGTGTTGGTGGAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199665 190 + 636262 GACAATGACGGGGTTTTGATTTATGAAGTCTGACCATTTGTAGGCAAGTCTCATTTGGAGAGGTGTTTGCTTATTTCTGCTTATTTGTACAA-CCAACTTCTTTATGCCCCCTAATCAGAATGTAGTTTGGAATTTTCCCAGTGGTTGACCCTTTAAACATGAAACCCTGAGGTTAAGTGCTGGTAGAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 189749 174 + 647215 GACAATGACAGGATTATGTTTTATGAAGCCTGACCATGTGTATGCAAGTCTCATTTGG-----------------TTTGCTTATTTGTACAAGCTGAGTTCTTTATGTCCCCCAATCAAAATGTAGTTTGGAATTTTTCCAGTTGTTGAACCTCTAAACCTGAAACCCGGAGGTTAAGTGTTGCTGGAGAC - -a -s mr.mrrefChr5 54503 120 + 294542 AGGACTTCACTCTATAAAGTACACACTTAGCCTCGTTTATACAGTATACTATGTCTGGGTACTACCTGGAGGATCTTTACTCACTACCTAAGTATTCCCTATTGACTCTGATTGATCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199855 120 + 636262 AGGGCTTCACTCTACAAAAGACACACTTAGCCTCGTTTATACAGTATACTATTTTTGGGTACTACCTGGAGGATCTTTACTCACTACCTACATTTTCCCTATTGACTCAGATTGATCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 189927 120 + 647215 ATGACTTCAATGTATAAAGTACACACTTAGCTTTATTTATACAGTGCACTATGTCTGGGTACTACTTGGTGGATCTCTGCTCCCTACCTAAGTACTCCCTATTGACTTTGATTGTTCCAA - -a -s mr.mrrefChr5 54623 190 + 294542 CACCATCTCAGATTACACGCCTGAGAAAGAAGATAAGATGTAGTTACAGGGGCAGAGGAGTATCATGCAAACACTTTGTGGTCTAGACACAGTGACCGTAGTCTAGACACAGTGACCATGGTGTTTTCAAGTCAACACAGTGAAGATTATAGATTCTAATTGAGTATACAATAGTGAGTAGCAGAGAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199975 171 + 636262 CACCATCTCAGATTACACGCCTGAGAAAGAAGATAAGATGTAGTTACAGGGGCAGAG------------------TTGTAGTCTAGACACAGTGACCGTAGTCTAGACACAGTGACCATGGTGCCTTGAAGTCAACTCAGTCAGGAT-ATAGATTCTAATGGAGTATACTATAGTGAGTAGCAGAGAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 190054 190 + 647215 CACAATCTCAGATTCAAGGTGTGACGAAGGGGATAGGATGTAGTTACAGGGGCAGAGGAGTATCATGCAAACACTTTGTGGTCTAGGCACAGTGACCATAGTCTAGACACAGTGACCATGGTGTTTTCAAGTTGACACAGTGGAGATTATAGATTCTAATTGAGTATACAATATTGGTTAGCGGATCACA - -a -s mr.mrrefChr5 54813 45 + 294542 GAATGTCCATATTGTGTCACTCTCTCCATTATCTATGTATTTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200146 26 + 636262 -------------------CTCTCTCCATTATCTATGTATTTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 190317 45 + 647215 GAATGTCCATATTGTGTCACTGTCTCCATTATCTATGTATTTTAA - -a -s mr.mrrefChr5 54858 36 + 294542 GAGGGTTTGACAACAAAAGCAAAGTAACCCTTACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200172 36 + 636262 GAGAGTTTGACTACAAAAGCAAGGTAACACTTACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 190363 34 + 647215 GAGGGTTTGACAACAAAGGCAAA--AACCCTTACAC - -a -s mr.mrrefChr5 54894 67 + 294542 CTTGTGTCTCTTCCCATTCATGGTTGAATGCAGAGAACCTGTGACAGTCTCAAAACAGAGAAGTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200208 67 + 636262 CTTGTGTCTCTTCCCATTCATGGTTGAATGCAGAGAACCTGTGACAGACTCAAAACAGAGAGGTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 190399 67 + 647215 CTTGTGTCTCGTCACATTCATGGTTGAATGCAGAGAACCTGTGACAGTCTCAAAACAGAGAAGTGGA - -a -s mr.mrrefChr5 54961 19 + 294542 GTCAGAGCATGTACAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200275 15 + 636262 ----GAGCATGTACAGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 190467 19 + 647215 GTCAAAGCATGTACAGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 54980 77 + 294542 AGCATTCATCCTTTTACTTTATGAAAGACAATTTAGAAGGACACCAGTTTTCACTACTTGTCAGATTTAGGAGATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200292 75 + 636262 AGCATTCATCCTTTCACTTTATGAATGATGATTTAGTAGGACACCAGT--TCACTACTTGTCAGATTTAGGAGATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 190486 77 + 647215 AGCATTCATCCTTTTACTTTGTGAAAGACAATTTAGAAGGACACCAGTTTTCACTACCTGTTAGATTTAGGAGATTT - -a -s mr.mrrefChr5 55057 36 + 294542 TTACCAAGGTTTTTGGGTTTGCCATTACCCATGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200367 36 + 636262 TTACCAAGGTATTTGGGTTTGCCATTACCCATGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 190572 36 + 647215 CTACCAAGGTTTTTGGGTTTGCCATCACGCATGCAT - -a -s mr.mrrefChr5 55093 19 + 294542 ATTAGTAACCAGATTGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200405 19 + 636262 ATTAGTAACCAGATTGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 190608 19 + 647215 ACTATTTACCAGATTGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 55112 87 + 294542 TCTTCATTTGTTCCAGGTTTGCTATTATGTGAGTGTACAATGCTTGAGTAAGCAAAGTGTCACCAATCTGCATTTGTATTTACTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200428 87 + 636262 TCTTCATTTGTTCCAGGTTTCCCATTATGTGAGTGTACAATGCTTAATTCAGCAAAGTGTCACCAATCTGAATTTGTATTTACTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 190627 73 + 647215 TCCGCATCTGTTCCAGGGTTGCTATTATGTGGGTGTACGATGCTTGAGTAG--------------ATCTGCATTTGTATTTACTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 55199 783 + 294542 CACAGAGTAATCTATGACCCTTAATTCAAGCAATACTTCATCCACAGTCTGTTGATGCTCAATCCACATCGGTTGCAGAGCAGGTGCAACCTAAGTAAAGCTACCAAGAGCTGTCTGAACTCAGTTGAAGAGCAAGACATGGAATGTCTTAGGATCTGCCCTGATGAACTGTCTAGATGTTGGCAAAGACAACTGGGCTGCATACTATTACCTCACGGCAAGATGGGGACAGGAAAGGTCTGGTGTTGGTTCAGAAAGCCTGTGTCATGAGAGATGGTCTTTTCAAGAAATCCAGTTTGGAAATTGGGCTCATATGGAAACATATGACACCTAGTTAAAATAAATAAGAACCTGGTTCCCAGTCATCCGTGGGAATGGTAATGAGTGGACTTGACATTCTGAGGTGACACAACTGTGTTTTTTCTCAGGTTCCTTTTTACTCCTATTTGTATTATGGAATTTGACAGCAACACTTGATGCCTAAGTATAGTGGACCTAGTGTGTAGTTGAAGTCAGGTCTAAGGAACCTATATGAAATTAGCATTCTAGAGTTGGCCCTGCCTGTGTTGTTTGTGAGATCTTTCGTTATTAATTATAGACTGGTAGTTATGGGTGTCTTAATCTGGATTATTTCAGCTTGACACATCATGGATTTTAGCCTTATGCATCAGTTACCATTACCTTTCAAAAGATCTAAGGGAATAAGTGTTCCACGGAGGATTCTTCAAGCAAAAGATAACACTGAAGCACTTTACCCCCTATTGATCTTGTTACCCAGTCGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200517 760 + 636262 CACAGAGCAATCTATGAGCCTTAATTCAAGCAATACTTCATCCACAGTCTGTTGATGCTCAATCCATGTAGGTTGCAGAGGAGGTGCAACCTAAGTAAAGCTACCAAGAGCTGTCTGAACTCAGTTTAAGAGCAGGACATGGAATGTCTGAGGATCTGCTCTGATGAACTGTCTAGATGTTGGCAAAGACAACTGGGCTGCATACTATCACCTCACAGCAAGATGAGGACAGGAAAGGTCT--TGTTGGTTCAGA---------------------GTCTTTTCAAGAAATCCAGTTTGGAAATTGGGCTCATATGGAAACATATGACACCTAGTTAAAATAAATAAGAACCTGGTTCCCAGTCATCTGTGGGAATGGTAATGAGAGGACTTGACATTCTGAGGTGACACAATTGTGTTTTTTATCAGGTTCCTTTTTACTGTTATTTTTATTATGGAATTTGACAGCAACACTTGATCCCTAAGCATTCTGGACCTAGTGTGTAGTTGAAAGCAGGTCTAAGGGACTTATATGAAATTAGCATTCTAGAGATGGCCCTGCCTGTGTTGTTTGTGAGATCTTTCGTCATTAATTGTAGACTGGTAGTTATTAGTGTCTTAATCTGGACTATTTCAGCTTGACACATCATGGATTTCAGCCTTATGCATCAGTTCCCATTCCCTTTCAAAAGATCTAAGGGAATAAGTGTTCCACGGAGGATTCTTCAAGCAAAAGATAACACTGAAGCACTTTACCCCCTATTGATCTTGTTACCCAGTCGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 190700 761 + 647215 CACAGAGTAATCTACAACCCTTAATTCTAGCAATACCTCATTCACAGTCTGTTGATGCTCAATCCACATCGGTTGCAGAGCGGGTGCAACCTAAGTCAAGGTACAAAAAAGTGTCAGAACTGAGTTGGAGAGCAAGACATGGAATGTCTTAGGTACTGCCCTGATGAACTGTCTAGATGTTGGCAAAAACAACTGGGCTGCATTCTATTAACTCAGGGCAGGATGGGGACAGGAAAGGTCTGGTGTTGGTTCAGAAAGCCTGTGTCATGAGAGATGGTCTTTCCAACAAATACAGTTTGGAAACTGG-CTGATATGGAAA----TTACACCTAGTCAAAGTA-----GACCGTGGTTCCCAGTCACCC------AAGGTAATGGGTGGACTTGACATTCTCAGGTGACACAACGGTGTTTTTTCTCAGGTTCCTCTTTACTCCTATTTGTATTATGGGATTTGAGAGGA------GATGCCTAAGTATAGTGGTCCTAGTGTGTAGTAGGAGTCAGGTCTAAGGAAACTATATGAAATTAACATTCTAGAGTTGGCCTTGCCTGTGTTGTTTGTGAGATCCTTCATTATTAATTATAGACTGGTAGTTATGGATGCCTTAATCTGGATTATTTCAGCTTGACACATCATGAATTTTAGCCTTATGCATCAGTTACCATTACCTTTCAAAAGAACTAAGGGAACAAATTTTCAAGGGAGGATCCTTCAAGCAAAAGATAATACTGAAGCACTTTATCCCCTATTGATCTTGTTACCCACCCATC - -a -s mr.mrrefChr5 55982 113 + 294542 TGGTGTTACTCCCAGAAGACTACATTCAGATTCTTCAGGATGTAGTATAGCCTGGATAGTTGTAGCCCTTGAAGCAAAATGGACAAACACGGCAGCCTAGTTTGACTATAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201278 112 + 636262 TGGTGTTA-TCCCGGCAGACCACATTCAGATCCTTCAGGATGTAGTATAGTCTGGATAGTTGTAGCCCTTGAAGCAAAATGGATAAACACGGCAGCCTAGTTTGACTTTAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 191461 111 + 647215 TGCTGCTACTCCCAGAAGACTGCATTCAGATTCTTTGGGATGTAGTATAGCCTGGATAGTTGTAGCCCTTGAAGCAAAAAGGACAAACATGGC--CCTAGTTTGACTATAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 56095 15 + 294542 CATTTAATTTTAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201435 15 + 636262 CATTTAATTTTAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 191572 15 + 647215 CATTTAATTTTGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 56110 104 + 294542 CAAGAAAGTATGTGTTGTTAGTGTACATCTTATGGGTAGTGTACAATTAGGCAACTACATAGGCCCAGCTATGAAAAGGACAGGTAATTTGAAGAGTCTGTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201450 103 + 636262 CAAGAA-GTATGTGTTTTTAGTGTACATCTTATAGGTAGTGTACAATTATGCAACTACATAGCCCCAGCTATGAAAAGGACATGTAATTTGAAGAGTCTGTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 191588 104 + 647215 CAAGAAAGTATGTGTTGTCAGTGTGCATTTTATGGGGAGGGTACAAGTAGGCAAATACATAGGCCCAGCTATGAAACGGTCAGGTCATTTGAAGAGTCTGTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 56214 83 + 294542 CCGACCATTTCATCCACATGAAACTCACAAGGATCATAACACAGTGTTACTGCAGATTGGGGCCTGGTGCTATGGCAGAGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201554 82 + 636262 CCGATCATTACATCCACATGAAACTCATGAGGATCA-GACACAGTGTTACTGCAGATTGGGGCCTGGTGCTATGGCAGAGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 191692 83 + 647215 CCGACCGTTTCATCCACATGAAACTCACAAGGATCATAACACAGTATTAATGCAGATTGGGGCCTGGTGCTATGGCAGAGGGG - -a -s mr.mrrefChr5 56297 135 + 294542 TTCTGAGATCTCTGGACTTGTACGGAAGAGTTTAGATATTATGTGCATTTTCAAGTTAACAACTCTCTGTGTTGAGCTAGCAATTATCTTGGAGATAAAGGGAGCAGGTTTAGAAGAAACTGCCAGTTCTCAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201638 135 + 636262 TTCTAAGATCTCTGGACTTGTACGGAAGAGTTTGGATATTATGTGCATTTTCAAGTTAACAACTCTCTGTGTTGAGCTAGCAATTTTCTTGGAGATAAAGGGAGCAGGTTTAGAAGGAACTGCCAGTTCTCAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 191775 133 + 647215 TTCTGAGATCGCTGGACTTGTATGGAAGGGTTTAGATATTATGTGCATTTCCAAGTTAGCAACTC-CTGTGTT-CGCTAGCTATTATCTTGGAGAGAAAGGGAGCAGGTTTAGAAGAAACTGTCAGCTCTCAGCC - -a -s mr.mrrefChr5 56432 297 + 294542 TTGAAGAGCAAGCAGGTGGGGCTGTCTGTGGCCTTTGGCCTTTATAGCTTGCCTTACAGCTCAGTGCTAAACACTAGTCAAGATGAAATAAGGGCATGAATACAATGGTACCAGTCAAGCAAACTGGGAAAGAGCTGGACAGGGTTGCTGTATCTACCAAGGGCAAGAGCTTTACTAAATAGGACACTACTAATGAGGCAGATCCAAACCAACCCATTCATGACTTGTTTGGTATTACCCTATGAGTAGGTCATGGAGGGCTCAGTCATAGGCCACGGCAGGCTCAGCAAACACCCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201775 297 + 636262 TTGAAGAACAAGCTGGTGGGGTTGTCTGTGGCCTTTGGCTTTTATAGCTTGCCTTACAGCTCAGTGCTAAACACTAGTCAAGATGGAATAAGGGCATGAATACAATGGTATCAGCCAAGCAAACTGGGCAAGAGCTGGACAGGGTTGCTGTATCCACCAAGGGCAAGAGCTTCACTAAATAGGACACTAGTAATGAAGCAGATACAAACCAACCCATTCAAGACTTGTTTGGTATTGCCCTATGAGTAGGTCATGGAGGGCTCAGCCATAGGCCACGGCAGGCTCAGCAAACACCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 191908 296 + 647215 TGGAAGAGCAAGCAGGTGGGGCTGTCTGTGGCCTTTTGCCTTTATAGCTTGCCTTAAAGCTCAGTGTTAAACACTAGACAAGATGAAACAAGGGCATGAATAGAATGGTTCCAGTTAAGCATACTGGTAAAGAGCTGGACAGGATTGCTGTATCTACCAAGGGCAAGAGCTTTACTCAATAGGACATTACTAATGAGGCAAATCCAAACCAACCCATTCATGACTTGTTTGGTATTACCCTGTGAGTAGGTCATG-AGGGCTCAGTCAAAGGCCATGGCAGGCTCAGTGAACACCCA - -a -s mr.mrrefChr5 56729 250 + 294542 AAGTTCATATGACAGCGATGTATTGTTAATGAATAGTATCATTAGGGTGATAAGAGTTCACCAAACATCTGTATTTTTATGGACTAAAGTCCAATGGTAAACTGTATAAGTTCACTGCTATCACTGTGCAAACAAAGCTTATCTAACATTAAATTTGCCTTGTAATTTGTACAGCTTTGTCTCATAGGGCCACCAGGTCTTTCATCAAATCTGCAGATTCCTCAGTTTTTTAGCTTCATGAAACATACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 202072 250 + 636262 AAGTTCATATGACAGCGATGTATTGTTATTGAATAGTATCATTAGGGTGATAAAAGTTCACCAAACATCTGTATGTTTATGGACTAAAGTCCAATGGTAAACTGTATAAATTCACTGCTATCACCATTCAAACAAAGCTTTTCCAACATTAAATTTGCCTTGTGATTTGTACAGCTTTGTCTCATAGGGCCACCAGGTCTGTCATCAAATCTGCAGATTCCTCAGTTTTTTAGCTTCAGGAAACATACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 192205 248 + 647215 AAGTTCACATGACAGAGATATATTGTTAATTAATAATATCATCAGGGTGAAAGGAGTTCACCAAACATCTGTATTTTTAT--ACTAATGTCTAATGGTAACCCGTACATGTTCGCTGCTATCACTGAGCAAACAAAGCTTACTTAACATTAAATCTGCCTTGTAATTTCTGCAGCTTTGTCTTATAGGGTCACCAGGTCCTTCATCAAATCTGTAGGTTCCTCAGTTTTTTAACTCCGTGAATCGTACTA - -a -s mr.mrrefChr5 56979 469 + 294542 ACTTTGTCATTGACAAGAGGAACTTGCCTGAAGAATTGCACTTATAACTATAATTGGCATGTCACCAAGATTAAATTTTCTGAAAATTCAGTAGTTGGGGTGCGACATAAATAAACATGGACCACTGGCTTAACTAAGATTTGCAAAGGGGTCTACTAGTGTGAAAACTTATAGTGCTACATAAACAGTGAGTGGCTATAGGTTTACATAAGGTCTATTTACAGCGGGACCTACCTTCATGTTACACATGCTTGACCATGAGATTGTTTTTCTTTATAAGCGCAAGAGGAGATTTACCTCTGAAGAATTAGGGCTCTAGAAGCAGGCTAAACTCTCCCTCTATAGTCAAGTAATTTGTGTATGCTGTCCTATCTTACACCATGGGGAAGAGTGGAGTTTCTTGAAAAGTTAGGTGATATTACCAAATTATAAAACTACAGAATTATAAACAAGATTAATAAATGAGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 202323 459 + 636262 ACTTTGTCAGTGACAAGAGGAACTCGCCTGAAGAATTGCACTTATAACTGTAATTGGCATGTC-TCAAGATTAAATTTTCTGAAAATTTAGTAGTTGGGGTACGACATAAATAGACATGGACCACTGGCTTAACTAAGATTTGCAAAGGGGTTTACTAGTGTGAAAACTTGTAGTGCTACATAAACAGTGAGTGGCTATAGGTTTACTTAAGGTCTATTTACAGCGGGACCTACCTTCATGTTACACATGCTGGACCATGAGATTGTTTTTCTTTAT----GCAAGAGGAGATT-----CTAAAGAATTAGGGCTCTAGGAGCAGGATAAACTCTCCCTCTATAGTCAAATAATTTGTGTATGCTGTCCTATCTTACATCATGGTGAAGAGTGGAGTTTCTTGAAAACTTAGGTGGTATTACCGAATTATAAAACTACAGAATTATAAACAAGATTAATAAATGAGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 192453 464 + 647215 ACTTTGTGATTGATAAGATGAACTTGCCTGAAGAATTGCAGTTATTATTATAATTGGCATGTCACCCTGATTAAATTTTCTGAAAGTACTGTAGTTGGGGTGCAACATAACTAATCATGGACCACT--CTTAACTAGGATTTGCAAAGGGGTCTACTAGTGTGAAGACTTATAATGCTACATAAACAGTGAGTGGTAATAGGTTTGCATAAGGTTTATTTATAGGGGGATCTACCTTCATGTTACACATGCTTGACCATGAGATTGTTTTTCTTTATAAGCGCAAGGGGAAACTTACCTCTGAAGAATTAGGGCTCTAGAAGCAGACTAAACTCTCCCTCTATAGTCAAGTAATTTGTGGATGTTGTCCTATCTTACACCATGGGGAAGAG---AGTTTCTGGAAAAGTTAGATAATATTACAAAATTATAAAACTACAAAATTATGAACCAGACCAGCAAATGAGATT - -a -s mr.mrrefChr5 57448 27 + 294542 TTGTCAACTAATGATGGTGATGAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 202782 27 + 636262 TTATCACCTAATGATGGTAATGAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 192919 27 + 647215 TTGTCCACTAATGATGGTGATGAATTT - -a -s mr.mrrefChr5 57475 659 + 294542 GACAACTTAGTAAGCATCCAAATTCAAAACCAGCCAATTAGCTATGCCTGCACTGTTTGTACTCCCCTTGAGTCTCTAACAGATAACTTCTTATGTGCAGATGGTTGGGATGTTTCCTGAGGATGGGGGAAAGCTAATTAGTGGTCTTGGTTATCTCTACAGAAGTGGAATGGTCTCTTGGCACTAAGTTGTGATGTACATGAAGTCAAACTTGAAAATCTGCAAGCACAAACTATGTTGTATAACCCATCATTATGCTGATGCTGGACAATAAATCAAAACCAACTGCATACAACACTCTTTCGGCCTAGTGGGGTGTTTGTGTATAATCAGTATTAAGATGGGTTTGATATATTTAGTGGCCTGGTGACAGTCTGATATTTGAGAATCTCTTCTTAGTTCAATTTCTTAGTTCAACAAAAATGTAGATTTTCAATCTCACCAATAATTTCAATTGCAACCAATATCCTGGCAGTAGTTTGGGAAGGGTCCAATACATGTGATAACCTACCACTGACCCAGTATGTCTTATTTTAAGACTTGGAAGGGTGATGTCAGCTGTATGAAACGCCTGTGAGTAAAATGTTTCATCTTTGTATAATTTATGTCAGTCTGATAATGCTAGGCTTGAAGGCCTGAGCGCTTCCCCCGGCCTTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 202819 653 + 636262 GACAACTTAGTAAGCATCCAAATTCAAAACCAGCCAATTAGCTATGCCTGCACTGTTTGTACTCCCCCTGAGTCTCTGACAGATAACTCCTTACGCGCAGATGGTTGGGATGTTTCCTGAGGATGGCAGAAGGCTAATTAGTGGTCATGGTTAGCTCTACAGAAGTGGAGTGGTCCCTTGGCACTGAGTTGTCACGAACATGAAGCTAAACTTGAAAATCTGCAAGCACAAACTA------GTAACCCATCGATGTGCTGATGCTGGACAATAAATCAAAACCAACTGCATACAACACTCTTTCGGCCTAGTGGGGTGTTTGTGTATAATCAGTATTATGATGGGTTTGATATATTTAGTGGCCTGGTGACAGTCCGATATTTGAGAATCTCTTCTTAGTTCAATTTCTTAGTTCAACAAAAATGTAGATTTTCAATCTCACCAACAATTTCAATTGCAGCCAATAACCTGGCTGTAGTTTGGGAAGGGTCCAATACATGAGATAACCTACCACCGACCCAGCATGTCTTATTTTAAGACTTGGGAGGGTGATGTTAGCTGTATGAAACGTCTGTGAGTAAAATGTTTCATCTTTGTATAATTTATGTCAGCCTGATAATGCTAGGCTGGAAGGCCTGAGCGCTTCCCCCGGCCTTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 192946 645 + 647215 GACAATTTAGTAAGCATCAAAATTAAAAATCAGCCAATCAGTT--GCCTG---TGTTTGTACTCCCCTTGATTCTTTAATAGATAGCTTTTTATGTGCAGATGGTGATGATGTTTCTAGAGGGTGGGGGAAAGCTAATTAGTGGTCTTGGTTATGTCTACTGAAGTGGCACAGTCTCTTGGCACTAAGTTGTGATTTACATAAAGTCAAACTTGAAAATCTGCAAGCACAAACTATGTTGTATAACCCATCATTATGCTGATGCTGAACAATAAATCAAAACCAACTGCCCACAACACTTTTTCAGCCGAGTGGGGTGTTTGTGTATAATCAGTATTAAGATGGGTTTGATATATACGGTGGCCTGGTGAGAGCCTGATCTTTGAGAATCTCTTCTTAGTTCAACTCTTTAGTTCAACAAAAATGTAGATTTTCAATCTCACCAATAATTTCAATCACTACCAGTATCCTGGCAGTAGTTTGGGAAGGGCCCAATACATATGATAAGCTACCACTGTCCCCGTGTGTCTTATTT--AAGTTTTAATAGGTGATGTCAGC------AAAC-CCTGTCAGTAAAAATTTTCAACTTTGTATAATTTATGTCAGTCTGATTATGCTAGGCTTGAAAGCCTGAGGCCTTCCCCCAGCATTAGT - -a -s mr.mrrefChr5 58134 7 + 294542 GATCCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203472 7 + 636262 GATCCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 193592 7 + 647215 TATTCGT - -a -s mr.mrrefChr5 58141 37 + 294542 TTTATTATTACCTGGGGAGAAATTCAATGCGATTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203479 37 + 636262 TTTATTATTACCTAAGGATGAATTCAATGCGATTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 193650 37 + 647215 TTTATTAATACCTGGGGAGAAAGTCAATGCAATTTGG - -a -s mr.mrrefChr5 58178 13 + 294542 TTCATGCAGGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203517 13 + 636262 TTTATGCAGGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 193687 13 + 647215 TTCAGGCAGGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 58191 261 + 294542 GATCAGACCAGTCCCTCTAAACAACCTTATTGTTACCTAAAGGACATTGAGGTTTCTATCAAGATTGAATAACAATGGAAAGAAATGGGGAAGATGTACTTTATAAGTTAGTCTCAGACAGTTCTACACTTGATGTAGGTTGAATGAGATTTCAGATAATAAAAAGAGAAGGTCTGACAGTTCCTATCTTTAGGGTAAACAATTCTCTTGAAGTGAAGCATGTGTGTAATGACTGATGATTTGTTCAGTTATTCTGTGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203530 248 + 636262 GATCAGAACAG--------AACTACCTTATTGTTAACTAAAAGACATTGAGATCTCTATCCAGATTAAATAACAATGGAGAGAAATGGTGAAGATGTACTTTATAAGTTAGTC-CAAAGAGTTCTACACTTGATGTAGGTTGAATGACATTTCAGATAATAAAAAGAGAAGGTCTGACAGTTCTCATCTTTA----AAACAATTCTCTTGAAGTGAAGCATATGTGTAATGACTGATGATTTGCTCAGTTATTCTGTGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 193787 260 + 647215 TCATGGACCAATCCCTCTAAACAACCTTATCGTTACCTAAAGGACATTGAGGTTTCTGTCAAGATTGAATAACACTGGAA-GAAATGGGGAAGATCTACTTCATAAGTTAATCTCAGACCGTTCTACACTTGATGTAGGTTGAATGAGATTTCAGATAACCAAAAGAGAAGGTCTGACAGTTCCTATCTTTAGGGTAAACAACTCTTTTGAAGTGAAGCGTGTGTGTAATGGCTGATGATTCATTTGGATATTCTGTGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 58452 4 + 294542 ACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203778 3 + 636262 -CAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 194066 4 + 647215 ACAT - -a -s mr.mrrefChr5 58456 246 + 294542 TTTCTCCAGTACCTCACAAAATCATGCTATGTACTGGAGATTTGCCCAGTAAAGTTATGAGACATGAAGTGTCAATATGTCCAAGGACATATGATGTCCTCACTCGAAGGTATAATTGTATGATGTGTGAAGTGGTGCCTGCTCTAATAGAATCTCTTTATAGCTATAGCACTATGTAAATTATGACTTCATTGGAGGTACAATGACTGGCTAAAATTCCCATGTGATGACCATTGGAGCACATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203781 246 + 636262 ATTCTCTAGTACCTCACAAGGCCATGCTATGTATTCGAGATTTGCCCAGCAAAGTTATGAGACATGAAGTGTCAATATGTCCAAGGACATATGATGTCCTTACTCAAAAGTATAATTGCATGATGTGTGAAGTGGTGCCTGCTCTAATAGAATCTCTTTATAGCTATAGCACTATGTAAATTATGACTTCATCAGAGGTACAATGACTGGCTCAAATTCCCATGTGATGACCATTGGAGCACATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 194071 235 + 647215 TTTCTCCAGTACCACACAAAATCATGCTATGTACTGGAGATTTGACCAGTACAGTTATGGGTCATGAAGTGTCAATATGTCCAGGG-CATATGACGTCCTCACTCGAAGGTATATTTGTATGATGTGTGATG---------CCCTAACAGAATCTTTTTATAGCTATGACACTATGTAAATTATGACTTC-TTGAAGGGAAAATGACTGGCTAAAATTCCCATGTGTTGACCATTGGAGTGCATTG - -a -s mr.mrrefChr5 58702 39 + 294542 TGCTTTTGCAGACCATTGTTGCCACTACATCTATGGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204027 38 + 636262 GGCTTTC-CAGACCATTGTTGCCACTACATCTATGGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 194317 39 + 647215 TGCATTTGCAGCCCATTGTTGCCACTACATCTATGGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 58741 208 + 294542 AGTGATGGACCTGTGGCAGAACATATACTTCCTTTCTATAGGAGTCACATGTTTGAGGGCCTGAAGGATGTGTGGCTAACCCCTCCATTGAAGCTTTCATGGATCTAGTGATAAACTTTTATCTGGATGGCACTTCAGCAGACTTCACACACTGTAGCTATGCCACACATCAGGGGTGTCATAACTCTAATTACCAGTCAGTCATGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204180 197 + 636262 AGTGATGGACCTGTGGCAGAACATACACTTCCTGTCTATAAGAGTCACATGCTTGCGGGCCTGAAGG------GGCTAACCCCTCCATTGAAGCTTTCATGGATCAATAGATAAACTTTTACCTG-----CACTTCAGCAGACTTCACACACTGTAGCTATGCCACACATCAGGGGTGTCATAGCTCCAATTACCAGTCAGTCATGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 194356 208 + 647215 AGTTATGAACCTGTGGCAGAACATATACTTCCCTTCTATGGGAGTCACCTGTTTGAGGGCCTGAAAGATGTGTGGCTAACCCCTGCATTGAAGCTTTCATGGATCTAGTGATTAACTTTTATCTGGATGGCACTTCAGAGCACTTCACACACTGTAGTCATGTCACACATCAGGGGTGTCACAACTCTAATTACCAGTCAGTCATGGG - -a -s mr.mrrefChr5 58949 88 + 294542 ATACTATTACCTCCTACCTTAAAACGTCATCAGACGCCAGCATCACAGCCCTTAAAGTGCCTGTGATTTCCCAAACGCCAGTCCCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204382 83 + 636262 ATACTATTACCTCCTGCCTTAAAATGCCATCAGACGCCAGCATAACAGCCCTTAAAGTGCCTGTGATTTCCTAAACACCAGTC----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 194564 88 + 647215 ATACTATTACCTCCTACCCTAAAACGTCGTCAGATGCTAGCATCACAGCCCTTAAAGTGCCTGTGATTTCCCAAACGCCAGTCCCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 59037 386 + 294542 ATTGTGGCCCAATCATCCATTCTGTACATGAATGGTCCTCCAAACACAATGTATTAAACTATGCCAAATTTGGTGTTATGATGTATTAGATATATTAGGATGCCAATGGTCCTCCAAACACAATGTATTAATTCACACTGGATTTGGTTCTTAGGATGCAATAGGCCAGTTGATAGAAGAGTAATGCCTGCACTTTAAGATTGTCCTTAGGAATTATATTCAATGTGTATATTCTGTGGTGGGTACCTTGTTGTTCTATCCTATTCTTACCAAATATCCCCTCTTTTACTGTATTACTATGCTGTTGTGGTAAAATTGATCATGTGATATTTGACCATAGACTGTAATTGGCACAGGAATGTTCACAGATGTTTGCAATTATCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204465 364 + 636262 ATTGTGGCCCAATCATCAATACAGTACATAAATGGTCCTCCAAACACAATGTATTAAACTATGCCCAAATTGGTGTTATGATG---------CATTAGGATGCCAATGGTCCTCCAAACCCAATGTATTAAATCACACTGGATTCAGTTCTTAGGGTGCAATAGGCCAGTTGATAGAAGATTAATGCCTGCACTTTAAGATTGTCCTTAG------TATTCAAAGTGTATATTCTGTGGTGGGTACCTTGCTGTTCTATCCTATTCTTACCAAATATCCTCTCTTTCACTGTATTACTATGCTGTTGTGGTAAAATTGACCATGTGCTACTTGACCATATACTGTAATTGGCCCAGGTA-------AGATGTTTGCAATTATCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 194700 386 + 647215 ATTGCATCCCAATTATGCATTCTGTGCATGAATGGTCCTCTAAACACACTGTATCAAACTATGCTAAATTTGGTGTTATGATGTATTAGATATATTAGGATGCCAATGGTTCTCCAAACACAATCTATTAATCCACACCAAATTTGGTTCTTAGGATGCAATAGGCCAGTTGCTAGAAGAGTAATGCCTTCACTTTCATATTGTCACTAGGAATTATATTCAATGTGTACATTCTGTGGTGGGCACTTTGTTCTTATGTCCCAGTCTCACCAAATATCCCCTCTTTTACTGTCTTACTATGCTGTTATGGTCAAATTGATCATGTGATATTTGAGCGTAGGCTGTAATTGGCACAGGAATGTTCACAGATGTTTGCAATAATCATT - -a -s mr.mrrefChr5 59423 15 + 294542 ATCATCACAGTACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204832 15 + 636262 ATCATCACAGTACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 195086 15 + 647215 ATCATCATAGTACTG - -a -s mr.mrrefChr5 59438 357 + 294542 ATCTTTATAACTGAACATAACAAGATTATGCTGTTTGTTGGAACAACAATTAAGCAAGTGGAATATATAACTCCTGGTGCACCTAATAAAAGTAACGATTTTGTTAAACCAATCCAGAGCAATTGGTACATAGGGAAGAAGAGATCTCACCTCTGAGATCAGTGGAGCTATATGAGGATGAGTGTAACTGGTAAGGCTTTATGAGCACAAGAAACCCAATGTCATCTAGTAGCAAGTAAAAAGAAGGAGTAGCACATTATTCCCCAGATAAAGGGGCTTTAGTAACTCCAATGAATAAACGTATGAAGGTCAGGGCCTCCTATATGCTACAACTGATGTAGCACAAGGCATCTGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204849 327 + 636262 ATCTTTATAACTGAACATAACAAGATTATGCTGTTTGTTGGAACAGCAATTAAGCAAGTGGTATATATAACTCCTGGTGCAACTAATTAAAGTAACAATTTTGTTAAACCAATCCAGAGCAATTGGTACATAGGGAAGAAGAGATCTCACCTCTGAGATCAGTGAAGCTATATGAAGATGAGTGTAACTGGCAAGCCTTTATGAGC-------------------CTAGTAGCAAGTAAAAAGAGG------CATATTATTCCCCAGATAAAGGGGCTTCAGTAACTCCAATGGATAAACATATGAAGGTCAGGGCCTCCCATA-----CTACTGATGTAGCACAAGGCATCTGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 195101 352 + 647215 GTCTTTATAACTGCATGTAACAAGATTATGCTGTTTGTTGGTACAACAAATAAGTAAGTGGAATATA-----CCCAGCACACCTAATAAAATTAATGATTTTGTTAAGCCAATCCAGAGCAATCGATACATAGGGAAGAAGAGATCTCACCTCTGAGATCAGTGGAGCTATATGAGGATGAGTGTAACTGATAAGGCTTTATGAGCACAAGAAACCCAATGTCATCTAGTAGCAAGTAAAAAGAAGGAGTAGCACATTATACCCCAGATATAGGGTCGTTAGTTACTCCAATGAATAAAAGTATGAAGGTCAGGGCCTCCTATATGCTACATCTGGTGTAGCGCAGGGTATTGGATA - -a -s mr.mrrefChr5 59795 27 + 294542 CTGTAATCCTGGAAACTGAAGCATGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205176 27 + 636262 CTGTAATCCTGGATACTGAAGCATGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 195465 27 + 647215 CTGTAACCCTGGAAACTGAAGCATGCG - -a -s mr.mrrefChr5 59822 22 + 294542 TGTCTGAAATCAGACTGTGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205203 18 + 636262 ----TGAAATCAGACTGTGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 195495 22 + 647215 TGTCTGTAATCAGACTGTGTAA - -a -s mr.mrrefChr5 59844 92 + 294542 CCTGTGGTGCATTGCTACATAGAGGATTTACGATGCTTACAGCATACTTATCTACATAACACAGTACCCACATTCCCTATTGAATTGCTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205221 92 + 636262 CCTGTGTTGCATTGCTAGATAGAGGATTTATGATGCTTACAGCATACTTATCTACATAACACAGTACCCACATTCCCTATTGAATTGCTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 195518 92 + 647215 CTTGTGGTGCATTGCTACATAGAGGATTTACTATGCTTACACCATACTTATCTACATAACACAGTACCCACATTCCCTATTGAATTGCTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 59936 40 + 294542 TTGAGGCTACACACCATGATGTTGTGCCGCTTGAGCCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205313 40 + 636262 TTGAGGCTACATACCATGATGTTGTGCCGCTTGAGCCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 195615 23 + 647215 TTTAGGCTACACACCATGATATT----------------- - -a -s mr.mrrefChr5 59976 103 + 294542 GCTTTCATTCTTTAGGCATCCTTCGATAACCTTGTGGGGACGACACTGGCTGCCCTGAATTCTTTACTTCTTAGCCAGTTCACTGACTTCAGAGAGTCGGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205354 103 + 636262 GCTTTCATTCTTTAGGCATCCTTCAATAACCTTGTGAGGATGACACTGGCTGCCCTGAATTCTTTACTTCTTAGCCAGTTCACTGACTTCAGAGAGTCAGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 195638 95 + 647215 ----TCATTCTTTAGGCACCTTTCGATAACCTTGTGGGTACGACACTGGCTGTCCTAAATTCTTTACTTCTCAGCCAGCTTGCTGAC----GAGGATTGGAGG - -a -s mr.mrrefChr5 60079 38 + 294542 TTTTACAGGCTTGCTGTGATAACACCGCAGTATGTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205457 38 + 636262 TTTTACAGGCTTACTGTGATAACACTGCAGTATGTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 195734 38 + 647215 TTTTCCAGGCTTGCTGTGATAACACCGCAGTATGTTTA - -a -s mr.mrrefChr5 60117 355 + 294542 TGAGCATGTTGGTGGAGCAATATACTACTAGTCAAACAAGGAAGTAAGCTGGTTATTTCTAACCATACCCCTAGCCTTAGTGGTCTAGACCAAATCCTTTTCTAAACCGGATCCTTTTGGTTTGTCGCCAAAACTAAACAGGGCAGTGGAGTCTCACTTTCCTGCTCGGTGTGACCAGCCCTTGTAAGGAAACCACATGATGCAAAGTAAAAGCACTCTTCAAGTCCCCATCTTATATCTAAAAAGAAGAAAGAATGCATGAAGTTGGTTATGAAATCCGGCTGAGTCTTGTGCCTAGCTTGATATATTTTTTTCCCTTGGCTGTAATCATGTATTCATGCCTGCCTTTGCTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205495 355 + 636262 TGAGCATGTTGGTGGAGCTATATACTACTAGCCCAACAAGGAAGTAAGCTGGTTATTTCCAACCATACCCCTAGCCTTGGTGGTCCAGACCAAATCCTTTTCTAAACCGGATCCTTTTGGTTTGTCGCCAAAACTAAACAGGGCAGTGGAGTCTCACTTTCCTGCCCGGTGTGACCAGCCCTTGTAAGGAAACCACATGACGCAAAGTAAAAGTGCTCTTCAAGTCCCCATCCTATATCTAGAAAGGAGAAAGAATGCTTGAAGTTGGTTATGAAATCCAGCTGAGTCTTGTGTCTAGCTTGATATATTTTTTTCCCTTGGCTGTAATCATGTATTCATGCCTGCTTTTGCTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 195839 353 + 647215 TGAGCATGTTGGTGGAGCAACATATTACTAGTCAGACAAGGCAGTAAGCTGGTTATTTTTAACCATACCCTTAGCCTTAGTGGTCTAGACCAAATCCTCTTCTAGACCAAATCCTTTTGGTTTGTCCCCAAAACAAAACAGGGTAGTGGAGTCTCACTTTCCTGCTTGGTGTGACTATCCCTTGTAAC-AAACCTCAGGATGCAAAATAAAAGCAGTCTTCAAGTCCCCATCTTATATCTGAAAAGAAGAAAGGATGTATGAATTTGGTTATGATATCCGGCTGAGTTTTGTGCCTAGCTTGATATATTTTTTTCCCTTGGCTGCAATAATGT-TCCCTGCCTTCCTTTGCCAGC - -a -s mr.mrrefChr5 60472 694 + 294542 TCCCACTTAGCCTGCATAGCAGTAGCCAACTGGTTTGGCTTATGGAATATATTTCTTGTAATGTTGAGTACAATATTTGACTCATGGTTATAATGATTATTGTTTTACTTTAATGTAGGAGTACCATCTACACTGGGCTTGGGTCAGACAATTAGCTCTGTGCACACTTATTTCATTACCTGTTGACTCTGACTGATGCTTGTTCAACTAGCTGGAAATTAGCCAAGATTAAGCCTGAGGGACTGTCTGTGCTTGTCTCCAGCTAAATCAGGGAGCAATCCTGGAGAAGTTATCTTTACTAGATACAGATATTAGCAGAAATTAATAATACCACAGCAGGGTAAGGAGTCGAGCAGCATCGTAGATCAGGTTTCACAGAAATCTGTTTATTCCAGAATTACTTTGATCCTGATTGCTAATTGGGGTCTTTGTACATAGGCAAGTTAATCTTTTCTTTGAGAGTATCTTGTGCATACTGATTTTAACCAGGGGGGCCCTCCTTTTAGATAAATGATGGTCTGAGGGACTAAATATGACAAGATTCCCAAACAAAAGAACAGATGTAAGACATCATCAATGTTCTTCCTTACATTCATGACATTATAGGATGCTCCTTCAGTGCCCTCTATTACACAATGGACTCATGTATTTTCAACTTAGGCTGCAGCTCACCGTTACTTTAGGTCTCCTAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205870 605 + 636262 TCCCACTTAGTCTGCATAGCAGTAGCCAACTGATTTGGATTATGGAATATATTTCTTGTAATGTTGAGTACAATATTCGACTCATGGTTATAATGATTATTGTTTTGCTTTAATGTAGGAGTACCATCTACACTGGGCTAGGGTCAAACAATTAGCTCTGTGCACACTTATTTCATTACCTGTTGA------------------------------AATTAGCCAAGACTAAGCCTGAGGGACTGTCTGTGCTTGTCTCCTGCTAAATCAGGGAGCAAT-----------------------------ATAAAAGCCAAAATTAATAATACCACTGCA-----------CTAGCAGCA--GTAGACCAGGTTCCACAGAGATCTGTTTATTCCAGAATTACTTTGATCCTGATTGCTAATTGGGGTGTTGGTACATGGGCAAGTCAATCTTTTCTTTGAGAGTATCTTGTGCATACTGATTTTAACC--------------TCTAGATAAATGATGGTCTGAGGGACTAAATTTGACAAGAGTCCCAGACAAAAGAACAGATGAATGACA-CATCAATGTTCTTCCTTACACTCATGACATTATAGGAT--CCCTTCAGTGCCCTCTATTACACAATGGACTTATGTATTTTCAACTTAGGGTGGAGCTCACCGTTACTTTAGCTCTCCTAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 196192 691 + 647215 GCCCACTTAGCCTGGATAGCAGTAGCCAACTGGTTTGGCGTATGAAATATATTTATTGTAATGATGAGTGCAATATTTGACTCATGGTTATATTGATTGTTGTTTAACTTTAATGCAGCAGTACCCTCTACACTGGGCTTGGGTCAGACAAT-AGCTCTGTGCGCAGTTATTTC-TTACCTGTTGACTCTGACTGATGCTTGTTCAACTAGCTGGAAATTAGCAAAGATTAGGCATGAGGGACTGTCTGTGCTTGTCTCCAGCTAAATCAGGGAGCAATCCTGGAGAAGTTATCTTTACTAGATACAGATATTAGCAGGAATTAATAATACAACAGCAGGGTAAGGAGTTGAGCGGCATCGTAGATCAGGTTTCATAGAAAT-TGGTTATTCCAGAATTGATTTTATCCTGATTGCTAATTGGGGTCTTTGTACATAGGCAAGCTAATCTCTTGTAGGAGAGTATCTTGTGCATACTGATATTAACCAGGGGGGCCCTCCTTTTAGCTGAATGATAGACTGAGGGACTAAATATGATATGATTCCCAAACAAAAAAACAAATGTAAGATATTATCAATGTTATTCCCTACATTCATGACGTTATAGGGTGCTCCTTTTGTGCTCTCTATTACACAATTGACTCATGTATTTTCAACTTAGGCTGCAGCTCACTGTTACTTTAGGTCTCCTAACT - -a -s mr.mrrefChr5 61166 5 + 294542 TGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 206475 5 + 636262 TGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 196884 5 + 647215 TGATA - -a -s mr.mrrefChr5 61171 84 + 294542 TGTCAAATCTTAAGCTTATTCGGTGATTCTTTCTGTAATATGTTCAAGTTTTCCCCTAGTATGGCAGTACTAATAAGCTTTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 206482 84 + 636262 TGTCAAATCTTAACCTTATTCGGTGATTCTTTCTGTAATATGTTCAAGTTTTCCCCTAGTATGGCAGTACTAATACGCTTTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 196889 81 + 647215 TGTCAAATCTTAAGCTTTTTTGGTGATTATTTCTGTAATATGTTCAAGTTCTCC---AGTATGGCAGTACTAATAAGTTTTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 61255 76 + 294542 CCCAGTTATATCTACCATGCAATAACTCCTACCAAGCATGACATCACCACTACTAGCCAGCTGTGCTGAGGACCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 206567 76 + 636262 CCCAGTTATACCTACCCTGCAATAACTCCTACCAAGCATGACATCACCACTACTAGCCAGCTGTGCTGAAGACCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 196970 70 + 647215 CCCAGTTATATCTACCATGCAGTTACTCCTACCAAGCATGACATCACCACT------CAGCTGTGCAGAGGACCCA - -a -s mr.mrrefChr5 61331 162 + 294542 GTGTCAGGAGTGTCCATTCTAAGCATTGTAGAACACCCAATGTGGTGCATTGTTGTTTCTTGAATAACTACAATAGAGGTATTCCATCACATCTCTCATGTTTGGTATCATCTTAGACCTGTCAAGCTcaagctgtacAATTTGTCAATAGAAAGATGGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 206643 152 + 636262 GCGTCAGGAGTGTCCATTCTAAGCATTGTAGAACACCCAATGTGGTGCATTGTTATTTCTTGAATAACTACAATAGAGGTATTCCATCATATCTCTCATGTTTGGTATCATCTTAGACCTATCAAGCT----------AATTTGTCAATAGAAAGATGGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 197043 162 + 647215 GTGTCAGGAGTGTCCATTCTAAGCATTGTAGAACAACCAGTGTGGTGCATTGTTGTTTCTTGGATAACTAAAGTAGAGGTATTCGATCACATCTATCATGTTTGGTATCATCTTAGACCTGTTAAGGTCAAGCTGTACAATCTGTCAATAGAAAGATGGACA - -a -s mr.mrrefChr5 61493 220 + 294542 AGGCTTTTGACTGGATGAAAcagGATGCTGACCTGTCCATAATCaGGAATTATATATGTAGCTTACTTTTTTAATGGTGTGATTATCAGGTAAACCCTTGTCATTTATCTGAGAATTGTGCACAGCAAACACTATACCATACTTAATTAGCACCTTAACTAAGTTATCTAGTGACAATCAAAATGCTAGATTCCCTTTTTtttttaacaAGAATAACCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 206797 219 + 636262 AGGCTTTTGACTGGATGAAACAGGATGCTGACCTGTCCATAATC-GGAATTATATATGTAGTGTACTTTTTTAGTGGTGTGCTGATCAGGTAAACCCTTGTCATTTATCTGAGAATTGTGCACAGTAAACACTATACCATACTTAAATAGCACCTTAACTGAGTGACCTAGTAACAATGAAAATGCTAGATCCCCTTTTTTTTTTAACAAGAATAACCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 197205 208 + 647215 AGGCTTTTAACTCGATGACA---GATGCTGACCTGTCCATAATCAGGAATTATATATGTAGCTTACTTTTTTAATGGTGTGATTATCAGGTAGACCCTTGTCATTTATCTGAGAACTGTGTGCAGCAAACACTATACCATACTTAATTAGCAACTTAACTAAGTTATCTCGTGACAATCAAAATGGGAGAATCCCTCTCT---------AGAATAACCAA - -a -s mr.mrrefChr5 61713 130 + 294542 GGATTGGAGGGTGTTTAGATTCCAAATGCAATAACTGGAATCACACTTAATAAACATAGTAGAGGCCTAGTAACTGTGATACCTAATCAACTATTGTTTTAAGTAGACTGGCAGGGGGTTCCATGCGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207016 120 + 636262 GGATTGCAGG-TGTTTAA------AATGCAAT---TGGAATCACACTTGATAAACATAGGAGAAGCCTAGTAACTAAAATACCTAATCAACCGTTGTTTTAAGTAGACGGGCAGGGGGTTCCATGCGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 197413 130 + 647215 GGATTGGAGGGTGTTGAGATTCCAAGTGCAATAACTGGAGTCACACTTAATAAACATAGTAGACATCTAGTAACTGCGATACCTGATCAACTATTGTTTCAAGTAGACTGGCACGGGGTTCCATGCGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 355274 126 - 647215 AAAACTGTGGGTGTCTAGATTCCAAAT----TAACTGGAATCACACTTAATAAACCTAGTAGAGGCCTAGAAACCGTGATACCTAATCAACTATTGTTTTGAGTAGACTGGAAAGGGGATCCATGGGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 61843 1 + 294542 T -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207136 1 + 636262 T -s simRat_chr6.simRat.chr6 197548 1 + 647215 T -s simRat_chr6.simRat.chr6 355400 1 - 647215 T - -a -s mr.mrrefChr5 61844 36 + 294542 GCCCTGGTGTTACTTCAATTAATGAGGAGGCTACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207145 36 + 636262 GCCCTGGTGTTACTTCAATTAATGAGGAGGCTACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 197549 36 + 647215 GCCCTGGTGTTACCCTAATTAATGAGGAGGCTACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 355401 3 - 647215 TTT--------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 61880 89 + 294542 TTTGGTGGTTGGTGGATGCCACCTTAGTCCTCCATATGATGAATAATGTGGGATCTGTTAACCACCAGCAGGCTTGCAGAAGAACACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207181 89 + 636262 TTTGGTGGTTGGTGGATGCCACCTTAGTCCTCCATATGATGAATAATGTGGGATCTGCTAACCACCAGCAGGCTTGCAAAAGAACACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 197603 89 + 647215 TTTGGTGGTTGGTGGATGCCACCTTACTACTCCAGATGATGAATAATGTGGGATCTGTTAACCACCAGTAGGTTTGTGGAAGAACACCT - -a -s mr.mrrefChr5 61969 221 + 294542 AGGAATAAATTTGATATAGTGGTACGTGCAAGACTTGCTCTGGAACCTTGGTACTTGCAAGCATTGGCTTTATATATCAACAAAAATGATAACAAATTGGAGATGACAGTCAAAAATGATAAtaaagctggagctacattggctttagtaatatgacacgcCACTCATCTTTCTACAAGAGCACTCGTATACCAAGTCCACAATGAACTCATACTGTCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207270 182 + 636262 AGGAATAAATTTGATATAGTGGTACGTGCAGGACTTGCTCTGGAACCTTGGTGTTTGTAAGTATTGGCTTTATATATCAACAGAAATGATAACAAATTGGACAGAACAGTCAAAAATGATAG---------------------------------------CACTCATCTTTCTACAAGAGCACTCATATACCAAATCCGCAATGAAGGTATACTATCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 197694 221 + 647215 AGGAATAAATTTGACATAGTGGTACGTTCAAGACTTGCTTTGGGACCTTGGTACTTACAAGCAGTGGCCTTGTATATCACCAAAAATGATAACAAATTCAAGATGACAGTCCAAAAACAAAATAAAGCTGGAGCTACATTGGCTTTAGTAATATGACACGCCACTCATCTTTCTACAAGAGCATTCGTAATCCAAGTCCACAATGAACTCAGACTGTACCC - -a -s mr.mrrefChr5 62190 85 + 294542 TTTAATAAATAAAGATTCATTGTCCTAACACCTAACGATAAATTTAAGGGCCTCTACCAGACAAGGAAACCAGACACCAGGCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207452 85 + 636262 TTTAATAGATAAAGATTCATTGTCCTAACACCTAACGATCCATTTAAGGGCCTCTGCCAGACAAGGAAACCACACACCAGGCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 197976 85 + 647215 TTTAATAAAGAAAGACTCATTGTCCTAACACCTAAAGATAAATTTCAGGTCCTCTACCGGACAACGAAACCAGAGAGCAGGCCAC - -a -s mr.mrrefChr5 62275 84 + 294542 GGTGTGAAACAGGAATGCGGCACTCTAGTCAACCTGAGGCAGTCAGAGGCATGTTCTGATCAAGCCATTCCATGATTGTAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207553 81 + 636262 GGTGTGAAACAGGAATGCGGCACTCTAGTCAACCTGAGGCAGTTA---GCATGCTCTGATCAAGCCATTCCAGGATTGTAGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 198061 84 + 647215 GGTGTGAGACAGGAATGTGGCACTTTAATCAACCTGCGGCAATCAGAGGCATGTTCTGAGCAAGCCATTCCATGATTGTAAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 62359 31 + 294542 CTTGAATGGGTGATAAGTAAAGGAATATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207634 31 + 636262 CTTGAATGGGTGATAAGTAAAGGAATACTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 198151 31 + 647215 CTTGAATGGGTGATAAATAAAGGAATGTCCA - -a -s mr.mrrefChr5 62390 374 + 294542 CCATTCCATATAAGAGAAACTTCAGCCTTCCTTCAAAATCTAAGCATTTACTTCAGTCTCTCTAAAAGATATATGTTCATTCCAGTCATTCAGCCAATCAGCCAATGGCTGTAGGCCATAACTTAAATATTGAGTAAACAAATCATATCTCTAGGTCTAAACATATGACACCAAAAAAAGTGGGGCACTTTCATGAGTCTCTCAACCAGCTCAGAATGTAAGTTCAAGATCTGTAAGCTGGGTATTGATATTTCCATTGGCGTCCCCCTAGTAGGACTCCTCATACAACCTGTTTACCTCTTTAGTATGTCCCATTACATTATCAGTCACATGAGTTTTCACTTACCTTGCTATGATGTGCTCCTTGATGCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207665 364 + 636262 ------CATATAAGAGAAATTTCAGCCTTCCTTCAAAATCAAAGCATTTACTTCAGTCTCTCTAAAAGGTATATGTTCATCCCAGTCAG----CCAATCAGCCAATGGCAGTAGGCTATAACTTAAATTTTGAGTAAACAAATCATATCTGTAGGTCCAAACATATGACACCAAAAAAAGTGGGGCACTTTCATGAGTCTCTCAACCAGCTCAGAATGTAAGTTCGAGATCTGTAAGCTGGGTATTGATACTTGCATTCGCGTCCCCCTAGTAGGACTCCTCACACAACCTGTTTACCTCTTTAGTATGTCCCATTACATTATCAGTCGCATGAGTCTTCACTTACCTTGTTATGATGTGCTCCTTGATGCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 198186 374 + 647215 CCATTCCATAGAAGAGAAACTTCAGCCTTCCTTCAAAATCTAAGCATTTACTTCAATCTCACTAAAAGATATATGTTCATTTCAGTCATTCAGCCAATCAGCCAATGGCTATAGGCCATAACTTAATAATTGAGTAAACAAATCGTATCTCTAGGTCTAAACATACGACACCAAAAAAAGTGGGGCACTTTCATGCGTCTCTCAATCAGCTCAGAATGTAAGTTCAAGATCTGGAAGCTGGGTATTGATATTCCCAGTGGCATCCCCCTAGTAGGACTCCTCATACAACCTGTTAACCACTCTGGTATGTCCCATTGCATTATCAGTCAAATGAGTTTTTACTTACCTTGCTGTGCTGTGCTCCCTGATGTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 62764 51 + 294542 TGGTGCTCAATCTGACACAAAAAATGTGGCTCCCCACTGTGACTTAATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 208050 42 + 636262 TGGTGCTCAATCTGACGCAAA----GTGGCTCCCCACTGTGACTTA----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 198560 51 + 647215 TGGTGCTCAGTCTGACATAAAAAATGTGGCTCCCGACTGTGCCTTAATCAA - -a -s mr.mrrefChr5 62815 161 + 294542 ATAGCCTTGGGGGTGTGAGCATTATATCTCCTACAATCAGTATCCTCATCTAGATGATACTGTATTGTTGGGCTAGGGGGTCTACAAGAGTGGGTACTCTCTTGATTCACATGCAGCATGTCATAGCTAGGTCATGGAAATTCAAGTAAATAACTGCAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425888 161 - 636262 ATAGCCATGGGGGTGTGAGCATCATGTCTCCTACAATCAGTATCCTCATCTAGATGATATTGTATTGTTGAGCTAGGGGGTCTACAATAGTGGGTAATCTCTTGATTCACATGCAGCATGTCATAGCTAGGTCATGGAAATTCAAGTAAATAACTGCAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 198611 160 + 647215 ATAGCCTTGTGGGTGTGAGCATTACATCCCCTACAATCAGT-TCCTTATTTAAATGATACTGTATTATTGGGCTAGCAGGTCTACAAGAGTGGTTACCCTCTTGATTTACATGCAGCATGTCATAGCTAAGTTGTGGAGATTCAAGTAAATAACTGTAACA - -a -s mr.mrrefChr5 62976 176 + 294542 GCATTCTAGAATTAGAATAGGGCCTATCCCTGTATGAATCCATTGAACTAATACCCATGCTTGCTATTGAAATACTTATAATTCTGTATTGAAAGTTGAAATGTTCAACCTGAGGAAACAACAAAGGCTACACTACCATAGGGGGGGCTCAATGGTTAATGAGAAATTAATTTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426049 175 - 636262 GCATTCTAGAATAAGAATAGGGCCTATCCCTGTATGAATCCATTGAACTAATACCCATGCTTGCTATTGAAATACTTATAATTCTGTATTGAAAGTTGAAATGTTCAACCTGAGGAAACAACAAAGGCTACACTACCATA-GGAGGGCTCAATGGTTAATGAGAAATTAATTTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 198772 176 + 647215 GCTTTCTAGAATTAGAATAGGGCCTATCCCTGTATGAACCCATTAAGACAATACCCAGGCTTGCTATTGTGATACTTATAATTCTGTATTGAAAGTTGAAATGTTCAGCCTGAGGAGACAACAAAGGCTACACTATCACAGGGGGGGCTCACGGGTTTATGAGAAATTAGTTTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 63152 68 + 294542 TCATTAAGTTCAGTTCAGGTCAACTCAAGCAGTAGGCAAGTCTCTGGTAATACTGCCGATAAGTAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426225 68 - 636262 TCATTAAGTTCAGTTCAGGTCAACTCAGGCACTAGGCAAGTCTCTGGTAATACTGCCGATAAGTAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 198948 68 + 647215 TCATTAATTTCAGTTCAGGTCAACTTAAGCAGTAGGCAAGTCTCTGGCCCTGCAGCTCATAAGCAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 63220 243 + 294542 GGGCACCTGTGGACTATGCCCATTTGTGTGGAAATCATCTAGACAAATTTACAGCATAGAGTGCCCTACTGCACCTTCAATATGGCCGCAAGTGATCAGCTCAGTGAAAGTCTAAGGGATCTTTCCATACCTTATACAACTCCACATCTGCTAGTATCAGGTTGATCAATCCAGGTCACAACAAATACTGAGGTGATTGTAATGGGATATCAACGGCACAACACCATCTAACTGGCTGTATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426293 239 - 636262 GGGCACCTGTGGACTATGCCCATTTGTGTGGAAATCATCTAGACAAATTTAAAGCATAGAGTGCCTTACTGCACCTTCAATATGGCCGCAAGTGATCAGCTC----AAAGTCTAAGGGATCTTTCCATACCTCGTACAACTCCACATCTGCTAGTATCAGGTTGACCAATCCAGGTCAAAACAAATACTGAGGTGATTGCACTGGGATTTCAACGGCACAACACCATCAAACTGGGTGTATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 199017 243 + 647215 GGGTAGCTGTGGACTATGCCCATTTGAGTGGAAATCATCTAGACAAATTTACAGCAGAGAGTCCCCTACTGTACCTTCAATGTGGCCGCAAGTGATCAGCTCAGTGAAAGTCTAAATGATCTTTCCATACCTTATACAACTCCACATCTGCTAGTATCAGGTTGATCCATCCAGGTGACAACCAATACTGTGGTGATTGTAAGGGGATATCAAAGGCACAACACCATCTAACCAGCTGTATCA - -a -s mr.mrrefChr5 63463 48 + 294542 ACCACAGGAATACAAAGTGAGATATTCCCTTTAGTTGgtgggtggttt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426550 48 - 636262 GCTACAGGAATACAAAGTGAGGTATTCCCTTTAGTTGgtgggtggttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 199260 48 + 647215 ACCACAGGAATACAAGGTGAGATATTCTGTTTAGTTGGAGGGTGGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 63511 158 + 294542 acccagtgacctggcacatgcgaagtagtactgatgtaaagggagtgccatcttctgcatatgaagtgaatctgaggtcttgcccacttcctatcatgagccagcccatgactggttgtgctgtttcctggtgcctccaggagccttCTGGGTCTCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426620 158 - 636262 acccagtgacctggcacatgcgaagtagtactgatgtaaagggagtgccatcttctgcatatgaagtgaatctgaggtcttgcccacttcctatcatgagccagcccatgactggttgtgctgtttcctggtgcctccaggagCCTTCTGGGTCTCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 199308 158 + 647215 acccagtgacctgcctcatgtgaagtagtactgatgtacaggcagtgccatcttttgcaagtgaagttaatctgaggtcttgcccactcactatcatgagccagcccatgactggttgtgttgttttctggcgtctccgggagacttTTAGGTCTACC - -a -s mr.mrrefChr5 63669 32 + 294542 GGATTGAATCTGTAAATGATGCTGCCGTGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426778 32 - 636262 GGATTGAATCTGTAAATGATGCTGCCGTGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 199467 32 + 647215 GGGTTGAACCTGTAAATGATGATGCCCTGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 63701 49 + 294542 TGTCAATGGTCCATGTGATATCAATACTGGGAAGTGAATTAGCAGAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426810 49 - 636262 TGTCAATGGTCCATGTGATATCAATACTGGGAAGTGAATTAGCAGAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 199524 49 + 647215 TATCAATGGTCACTGTGATATGAATGCTGGGAAGTGAATTAGCAGAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 63750 87 + 294542 TGTTATTGAGTCTAGCTTTTATAAATCGAAGAGACCCAGAACCAATAGAAATAGGAAACTTATTGACTATGATTCAGATAGTGAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426859 87 - 636262 TGTTATTGAGTCTAGTTTTTATAAGTCAATGAGACACAGCACCAATAGAAATAGGAAACTTATTGACTATGATTCAGATAGTGGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 200095 87 + 647215 TGTTATTGAGTCTAGCTTTTAAAAATGGAAGAGACCCAGAACCAATAGAAATAGGAAACTTATTGACTATGATTCAGACAGTGAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 63837 120 + 294542 CTTGAACCTTTCCGCGTTGGGGTGGCATAATGCCGCAGATTGCATTCAAGAATCATGACCAGGAACTATTACAACAAATGGCTTAAATCTGAAAGGAGAAGAGGAACTGGTCTGGTGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426951 120 - 636262 CTTGAAGCTTTCCGCGTTGGGGCGGCATAGTGCCGCAGATTGCATTCAAGTATCATGACCAGGAACTATTACAACAAATAGCTTAAATCTGAAAGGTGAAGAGGATCTGGTCTGGTGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 200182 112 + 647215 CTTGAACTTCCCCAAGTTGGGGTAGAATAATGCTGCAGATTGCATTCAAGAATCATGACCAGGAACTATTATAACATATGCCT--------AAGGAAGGAGGGGAACTGGGCTGGTGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 63957 424 + 294542 ATGCATTCTATTTAAGAAGTGAGAAGCAGCATAATTTTACCCTTTGCACTGACAACAAATAAAGCAAGTAAAAATATTCAGATGTTCATATTGCTTTGAAATTAGTAAAACAGCACAATTGCTTAAGGGTTTAATAATATGTATTTTCATGCCCAGGCACCACAGTGATCAGCCTGCATAATCATAATATAATGGAATACAGTCCACACTTCCTATAGGTGCCCTAGAGCAGAATGGTTGAGTAATCCACTCTGGAAGTAAAAAGACTTGGATGTCTTTCATCATCTAGGTATACAGATTATATCTATGGATTGTACTTGCACCCTTTTCATTTAAACTTTTCTTAAAGTCAGGCTTCAGAAAAGCACAGATATGCCTATGTCTCGTAGTTGGGTAGTCTTTAGGATACTATACTCCAATGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427071 422 - 636262 ATACATTCTATTTAAGAAGTGAGAAGCAGCATAATTTTGCCCTTTGCACTGACTACAAATAAAGCAAGTAAAAATATTCAGATGATCATATTGTTTTG-AATTAGTAAGACAGCACAATTGCTTAAGGGGTTAATAATCTG-ATTTTCATGCCCAGGCACCACAGTGATCAGCCTGTATAAGCATAGTATAATGGATTGTGATCCACACTCCCTATAGGTGCCCTAGATCGTAATGGTTGAGTAATCCATTCTGGAAGTAAAAAGACTTGGATGTCTTTCATCATCAAGGTATACAGAATATATCTATGGATTGTACTTGCACCCTTTTCATGTAGACTTTTCTCAAAGTCAGGCTCCAGAAAAGCATAGATATGCCTATGTCTCAAAGTTGTGTAGTCTTTAAAATACTATACTCCAATGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 200295 418 + 647215 ATGCATTCCATTTAAGAAGTGAGAAGCAGCATACTTTTACCCTTTATGCTAACAAGAAATAAGGCATTCAAAAATATTCAGCTGTTGATATTGCTTTGAAATCAGTAAAATAGCACAATTGCTGAAGGGTTTAATAATATATATTATCATGCCCAGGTGCTATAGTGATCAGCCTGCATAATCATAATATATTGGAATACAGTCCAAACTTCCCATAGGTGCCCTAGAGCAGAATGGGTGAGTAATCCACTCTGGACATAAACAGACTTGAATGTCTTTCACCATCTAGGTATACAGATTACATCCATGGATTGTAGTTGCACCCTTTTCATTTAA--TTTGCTTAAAGTAAGGCTTCAGAAAGACACAGGTATGTCTATGTCTCGTACTTGGGTAGTTTTTAGGA----GTACTCCAATGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 64381 185 + 294542 GTATCTGACATAGATATTGCAGGACCTACTTCTTATCCACCTACCTCTTATTTTGTTGGATTCGGAGTAAAATTAGGCATAGTGGTGAATTTCCAAACCATGTTTGGGAAATGTTAGAGAATCACTGAACCTCTGCAGATAATTTCCAATTGTCCAGTCATGTTTTAATAGCAGATACATCATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427493 103 - 636262 GTATCGGACATAGATA-------ATCTACTTCTTATCCACCTACCTCTTATTTTGTTGGATTCGGAG---------------------------------------------------------------------------TCTCCAGTTGTCCAGTCATCTTTTAGTAGCAGATACATAATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 200714 185 + 647215 GTATCTGACATGGATATTGCAGGACCAATTTCTTATCCACCTACCTTTTATTTTGTTGGATTCAGAGTAAAATTAGGCATAGTGGTGAATTTCCAAACCATGTTTGGGAAATGTTAGAGAATCACTGAACCTCTGCAGATAATTCCGAATTGTCCAGTTACGTTTTAATAGCAGATACATCATTC - -a -s mr.mrrefChr5 64566 42 + 294542 TTTCCTCTCAGAAATAACATCTTGAATAACTTATTAGAAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427596 42 - 636262 TTTCCTTGCAGAAATAACATCTTGAATAACTTATTAGAAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 200900 42 + 647215 TTTCTTCTCAGAAATAACATTTTGGATAGCTTATTAGAAATA - -a -s mr.mrrefChr5 64608 96 + 294542 CGGTCCAACCAAACGGACTTGGATTTGTCAATAAGCCTGTCTGTAATCAATCCTTCTAACAGAGCCAAAGGACCCACTAAGAAAGACTGGAATCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427652 96 - 636262 CGGTCCAATCAAACAGACTTGGATTTGTGAATAAGCCTGTCTGTAATCAATCCTTCTAACAGTGCCAAGGGACACACTAAGAAAGACTGGAATCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 200942 90 + 647215 CGGTCCAACCAAATGGAC-----TTTGTCATTAAACCTGTCTGAAATCAATCCTTCTAACAGATCCAAAGG-CCCACTAAAAAGGGCTGGAATCCC - -a -s mr.mrrefChr5 64704 219 + 294542 ATTATTCAAACATAAAGGACAGCATAAGATGTTAAACAGTGAGATGGGGAGCCAGACTGTAATATCCTAGGAATGCACCCAATTAGTATTAATGAGGCAGGAGGACATTCAACATAATGTAGGGCTGTGTCAGGTAGAGCAGTAATTCTCTCGTACCTCCAGGTATCCAGGTGTAGGTTTACACTTGTAAGCCATTAATGTGCTAATCCTATCAAGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427751 218 - 636262 ATTATTCAAACATAAAGGACAGCATGAGATGTTAAACAGTGAGATGAGGAGCCAGACTGTAATATCCT-GGAATGCACCCAATTAGTATAAATGAGGCAGGAGGACATTCAACATAATGTAAGGCTGTGTCAGGTAGAGCAGTAATTCTCTCATACCTCCAGGTATCCTGGTGTAGGTTTACACTTGTAAGCCATTTATGTGCTAATCCTATCAAGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 201032 218 + 647215 ATTATTCAAACATAAAGGACAACATAAGATGTGAAACAGTGAGGTGGGGAACCAGACTGTAATATTCTAGGAATGCACCCAATTAGAATTAATGATGCAGGAGAACATTCAATATAATGCAGGGCTGTGTTGGGTAGAGCAGTAACTCTCTTGTACCTCCAGGTATCCAGGTGT-GGTTTACACTTGTAAGCCATTAATGTGCTAATCCTATCACTCTT - -a -s mr.mrrefChr5 64923 179 + 294542 TACACTGGTAGTTACACCCAATGGCAGCTCCCTAGGAAAGAAGTACTGTACTGTCATGCTCCATGTATTCTGATTGAAACACTGACCAAGGAAATGATAGAAATGACACTTAACCTTGTGCACTCTAAATGTTAGTAAAAAATACTACAACACTGAGAAACTTGAAGAGTAAAAAATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427972 179 - 636262 TACCCAGGTAGTTACACCCAATGGCAGCTCCCTAGGAAAGAAGTAATGGACTGTCATGCTGCATGTAATCTGATTGAAACGCTAACCAAGGAAATGATAGAAATGAGACTTAACCTTGTGCACTCTAAATGTTAGTAAAAAATACTACAACACTGAGAAACTTGAAGAGTAAAAAATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 201250 178 + 647215 TACACTGGTAGTAACACCCAATGGCATCTCCCTAGGATAGAAGTACCATACTGTCATGCCCCATGTATACTGATTGGAGCACTG-CCAAGGAAATGATGGAAATGGCATTTAAACTTGTGCACTCTAAGTGTTAGTAAAAAATACCACAACACTGAGAAAGTTGAAGAGTAAAAAATAC - -a -s mr.mrrefChr5 65102 33 + 294542 TTAAGACCTTTTTATGGCTGAACCCTGCCAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210377 32 + 636262 TTAAGACCT-TTTATGGCTGAACCCTGCCAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 201445 33 + 647215 TGAAGACCTTTTTTTGGCTGTACACTGCCAATT - -a -s mr.mrrefChr5 65135 41 + 294542 ATTACAAACACTGCCAATTTGTTACCCTGAAATAAGGTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210410 33 + 636262 ATTACAAACACAGCCAATATGTTACCCTGGAAT-------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 201478 41 + 647215 GTTACGAACGCTGCCAATTTGTTACCCTGAAATAAGGTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 65176 31 + 294542 TCCAGGCACTATACTGCCCACACAATATGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210443 7 + 636262 ------------------------CTATGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 201520 31 + 647215 TCCAGGCACTATACTGCCCACACAATATGGA - -a -s mr.mrrefChr5 65207 103 + 294542 GTCAAGGCAGGGCATTCATGATGTGGTACAAGTGCGTACCAGGATCTGCATAATCATTACCATTGCGGGATCTGTTTTAAGGAAGGCAAAATGAAATATTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210451 103 + 636262 GTCTAAGCAGGGCATTCATGATGTGGTACAAGTGTGTACCAGGATCTGCATAATCAGTACCTTTGCTGGACCTGTTTTAAGGAAGGCAAAATGAAGTTCTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 201551 103 + 647215 GTTAAGGCAGGGCATTCGCAATGTGGTACAAGTGCACACCAGGATCTGCATAACCATTACCATTGTGGAATTTGTTTTAAGGAAGGCAAAATGACATATTACA - -a -s mr.mrrefChr5 65310 277 + 294542 GCAGCACATGACATTCAAGGCTTTGCATTCCTTGTTGGCAATTTTTACTGTCTATCCATGAGCTTTAACCATAGTTTACTTTTAGTTTGTGTTGCTGGTGCTCTAATTTATTATGTGATCAATCCTAACCTTAGTACTCTTGGGCAACATTAACTTCTCCACTATGATGATCCTTGCTTGCCAGGTTGATAATGGACTCATCTTGCACATCTGTTCTTTATGAATCCCTCTTCACTGCCCTGCAATGTGAGATAGGAATAGCATTCAAGGGGGGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210573 270 + 636262 ACAGCACATGACATTCATGGCTTTGCATTGCTTCTTGGCAATTTTTAC--TCTATCCATGAGCTTTAAGCATGGTTCACTTTTAGTTTGTGGTGCTGGTGC-CTAACTTATTATGTGATCAATCCTAACCTTAGTACTCTTGGGCAGCATTCACTTCTCCACTATGAT----CTTGCTTGCCAGGTTGATAATGGACTCATCTTGCACATCTGTCCTTTATGAATCCCCCTTCATTGCCCTGCAATGTGAGACAGGAATAGCATTCAAGGGGGGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 201654 275 + 647215 GCAGCACATGACATCCAATGCTTTGCTTGCCTTGTTGGTGATTGCTCCTGTCCATCCGTGAGCTTTAACCATAGTTTGCTTTTAGTTTGTGTTGCTGGTGCTCTAATTTATCATGTGATCAATCCTAACCTTAGTACTCTTGGCTAACATCAACCTCTCGA-TATGATGATCCTTGCTTGCCAGATTGATAATGGATTCATCTTGCACATCTGTTCTTTAT-AATTCCTCTTCACTGCCCTGCAATATGAGATAGGAATAGCGTACAATAGGGGATA - -a -s mr.mrrefChr5 65587 35 + 294542 TTTAGATTTTTTTCCACTGACCCCTGTCAGTTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210845 35 + 636262 TTTAGATTTTTTTCCACTGACCCCTGTCAGTTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 201929 35 + 647215 TGCAGAGTTTTTTCCACTGAGCTCTGTCAGTTCAC - -a -s mr.mrrefChr5 65622 120 + 294542 TGGTGGACAACCTCTGGAGTCAGGGGCAAACAGACTGGATTAGGGGAACATGGCCAGGAGAGTAATACGCAGCACAAGCATGTGATATCCTACAGTCAAAGATGTAAGAACCATTGTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210880 120 + 636262 TGGTGGACAACCTCTGGAGTCAGGGGCAAACAGACTGGATTAGGGGAACATGGCCAGGAGAGTAATACGCAGCACAAGCATGTGATATCCTACAGTCAAAGATGTAAGAACCATTGTGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 201966 120 + 647215 TGGTGCACAACCTCTGGAGTTAGGGGCAAACAGACTGGATTAGGGGAACATGATCAGGAGAGTGATACGCAGTACAAGCATGTGGGATCCTACAGTCAAAGATGAAAGAACGATTGTGTC - -a -s mr.mrrefChr5 65742 78 + 294542 TACTGTGTTTACTACTCATCCATGTATACAATTCACATTGTACTTGTTGTGCTAGCAAATACAAGTAGAATTTGGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211006 78 + 636262 TACTGTGTTTACTACTCATCCATGTATACAATTCACATTGTACTTGTTGTGCTAGCAAATACAAGTAGAATTTGGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 202086 78 + 647215 TACTGTGTTTACTACTCATTCATATATCCAAATCACATTAAACTTGTTCTGCTAGGAAATACATGTAGAATTTTAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 65820 59 + 294542 ATGGTACAACAGATGTGTCTGTATGGTTCCAAATCTTGTTTGTAAGCATTTGTTAGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211085 59 + 636262 ATGGTACAACAGATGTGTCTGTATGGTTCCAAATCTTGTTTGTAAGCATTTGTTAGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 202164 59 + 647215 ATAGTACAAAAGGTGTGTTTGTATGGTTCCAACTCTTATCTGTAAGTGTTTGTTAGTGC - -a -s mr.mrrefChr5 65879 8 + 294542 GTGGCCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211147 8 + 636262 GTGGCCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 202223 8 + 647215 GAGGCCAC - -a -s mr.mrrefChr5 65887 25 + 294542 GTTATTTGCATCTAAGCACACACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211155 25 + 636262 GTTATTTGCATCTAAGCACACACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 202232 25 + 647215 ATTATTTGCATCTAAGCACAGATAG - -a -s mr.mrrefChr5 65912 57 + 294542 CATGGATTCTATAACCATCACTGTTACCAGTGTTGCTGTTGATAGGGACACCGTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211180 57 + 636262 CATGGATTCTATAACCATCACTGTTACCAGTGTTGCTGTTGATAGGGACACCGTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 202258 57 + 647215 CATGGGCTCCATAAGGATCACTGTTACCAGTGTTACTGTTCATAGGGGCACAGATTG - -a -s mr.mrrefChr5 65969 12 + 294542 ACTTGTCACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211258 12 + 636262 ACTTGTCACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 202315 12 + 647215 ACTCGTCACCAT - -a -s mr.mrrefChr5 65981 383 + 294542 TTGTGACATTTTGGTAGTCTCAATTCAGTTGCAGCACAAATGTACAGGGTAAGATTAACACATCTATAGTTTAACCCTGATGTCTGTTTTGTATTAGTCATTATGACTAGGTGTTCCTTAAGAAATTTACAATAGCTTATATTTCCCAGGGTTACCTAATGCTTATCATTATAGGCTTCTAAACAATGAAAACATGGATGATCACTAGATCCCAGAAATTGGGACATCTAGAGACCCAGAGGACATGCAAATTATAACCAGCAAATTAGACATGTGCAATAAAATAGTTTTATCATTTATTGTCCTGTCTGTTAGTTTTATTAAGCGCAGTTCATCATTCACTCTAACAATTTATTCCAAATATATTAGAGATAATACAGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211334 380 + 636262 TTGTGACATTTTGGTAGTCTCAATTCAGTTGCAGCACAAATGTACAGGGTAAGATTAACACATCTATAGTTTAACCCTGATGTCAGTTTTGTATTAGTCATTATGACTAGCAGTTCCTTAAGAAATTCACACTAGCTTGTATCTCCCAGGGTTACCTGATGCTTATCATTATAGGCTTCTAAACAATGAAAACATGGATGATCACTAGATCCCAGAAATTGTGACATCTAGAG---CAGAGGACATGCAAGTTATAACCAGCAAATTAGACATGTGCAATAAAATGGCGTTAACATTTATTGTCCTGTCTGTTGGTTTTATCAAGTGCAGGTTATGATTCACTCTAACAATTTATTCCAAATATATTAGAGATAATACAGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 202327 377 + 647215 TTGTGATTTTTTGGTGGTCTCAATTCAGTTGTAGCACACATGTACAAGGTAAGATTAATACATATATAAGTTAACCCCGAGGCCTGTAT-GTATTAGGCATTATGACTAGGTGTTCCTTAAGCAATTTACAATAGCTTATATTTGCCAGGGCTGCCTAATGCTTACCATTGTAG-----TACACAATGAAAACATAGATGATCACTAGATCCCAGACTTTGGAACATCTAGAGACCCGGGGGAAATGCAAATTATAAACAGCAAATTAGACATGGTTAATATAATAGTTTTGTGATTTATTGTCCTGTTTGTTAGTTTTACTTAGCGCTGTTCATCATTCATGCTAATAATTTATTCCAAATATATTAGAGATAATACAGGAG - -a -s mr.mrrefChr5 66364 209 + 294542 CCTAAGTTACTGGTGATTTCATGGTATCTTGATTTGACCTACATTACCGTTGTTACAACCAGTGGAGATCCATAGCAGCAACGAGGCAAGGAAAACAGTGGCGTACTTTAATGTTGCAGCTTTTTCCTTGTAGTGTTACAATTGTCCACTGCCAGGAAGCTAGGTCCCTTTGTGTTGTGGTCAAAGAGCTTTCTTTTAAAGATTCACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211714 209 + 636262 CCTAAGTTACTGGTGATTTCATGGTATCTTGATTTGCCCTACATTACCGTTGTTACAACCAGTGGCGATCCATAGCAGCAACAAGACAAGCAAAACAGTGGCGTACTTTAATGTTGCAGCTTTTTCCTTGTAGTGTTACAATTGTCCACTGCCAGGAAGCTAGGTTCCTTTATGTTGTGGTCAAAGAGCTTTCTTTTAAAGATTCACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 202708 199 + 647215 CCCAAGTT---------TTCATGGTATCTGGATTTGACCTACATTACCTATGTTACAATCAGTGGAGATCCATAGCATCAATGATGCAAGGAAAACGGTGGCATACGTTAATGTTGCAGGTTTTTCATTGCAATGCAACAATTGATCACTGCCAGGGAGCCAGTTCCATTGGTGTTGTG-TCAACGAGCTTTCTACTAAAGATTCACTA - -a -s mr.mrrefChr5 66573 76 + 294542 GAATTGTGTTGCTTAAAGACCCTGTTCTGGGTGAACAACACATCTGACTGATGAGGGTGCATACCACCAATGGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211923 76 + 636262 GAATTGTGTTGCTTAAAGACCCTGTTCTGGGTGGACAACACAACTGACTGATGAGGGTTCATACCACCAATGGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 202914 75 + 647215 GAATTGTGTTGTTTAAAGACCTCGTGCTGGGTGAACAACACATCTGACTGATGAAT-TGCATACCACCAATGGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 66649 49 + 294542 GGTAGGCCTAGTGACTCTGAGCAAGAGGTATACTCAGTAACTGTCACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211999 49 + 636262 GGTAGGCCTAGTGACTCTGAGCAAGAGGTATACTCAGTAACTGTCACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 203060 49 + 647215 GGTATGCTTAGTGACTCTGAGCAAATGGTATATTCAGTAAGTATCACAA - -a -s mr.mrrefChr5 66698 11 + 294542 CAGTCACTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212049 11 + 636262 CAGTCACTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 203109 11 + 647215 CAGTCACTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 66709 200 + 294542 ACATGTGAAACTTAAAAAGTAACTGAGTAAACTGAAACCACCATCAACATATATCATGTTGACCCTTCACATGGAGGAGATCATCCCCATGGAGGCATTGGTTCATAGATTTATTGCCTGTTGAGGCTTGGACCCCATGGAGACATTAGCCCAGAGATTTCGCACCTGTCTAGACTGGGGATGGAATGGCCTAATCTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212061 199 + 636262 ACATGTGAAACTTAAAAATTAACTGAGTAAACTGAAACCACCATCAACATATATCATGTTGACCCTTCACA-AGAGGAGATCATTCCCATGGAGGCATTGGTTTATAGATTTATCACCTGTTGAGGCTTGGACCCCATGGAGACATTAGCCCAGAGATTTCGCACCTGTCTAGACTGGGGATGGAATGGCCTAATCTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 203120 199 + 647215 ATATGAGAAACTTAATCAGTAGCTGAGTAAATTGAAGCCACCATCAACATATATCATGTTGACCCTTTACATGGATGAGATCATCCCCACAGAGGCATTGGTTCGTAGATT-ATTGCCTGTTGAAGCTAGGACCCTATGGAGGCATTAGTTCATAGATTTCTTACCTGTCTAAACTGGGGATGGAATGACCTAATCTGGA - -a -s mr.mrrefChr5 66909 27 + 294542 AGTGGCAAGGAAAGCTCCCTAGTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212261 27 + 636262 AGTGGCAAGGAAAGCTCCCTAGTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 203319 27 + 647215 AGTGGCAAGGAAAGCTCCTCAATGTAC - -a -s mr.mrrefChr5 66936 76 + 294542 CTCACCTTGAATAGGCTGAAGTAAAGTATCATTAGGCTCCATATGTCATTGCTCCTTGTCTTTGGTACTTGGAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212288 76 + 636262 CTCACCTTGAATAGGCTGAAGTAAAGTATCATTAGGCTCCATATGTCATTGCTCCTTGTCTTTGGTACTTGGAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 203349 76 + 647215 CTCACCTTGAATAGGCTGAAGTAGAGTGGAGTTAGGCTCCCTACGTCATTGCTACTTGTCTTTGGTACTTGGAGAC - -a -s mr.mrrefChr5 67012 129 + 294542 TTTGGTTGCATATAAGGACTTCTGGTCCAACTGAGCTTGACTTTTCATTTTCAGAAATAGAGTGATGCCCCCCTATTGAAAGGcatattactctctcttaattcagttaggaggcaggccaagtgatcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212374 128 + 636262 TTTGGTTGCATACAAGAACTTCTGGCCCAACTGAGCTTGACTTCTCA-TTTCAGAAATAGACTGATGCCCTCCTATTGAAAGGcatattactctattttaattcagttaggaggcaggccaggtgatcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 203425 129 + 647215 TCTGGTTGCACATATGGACTTCTGGTCCAACTGAGCTCGACTTTTCATTTTCAGAGGTAGAGTGAGGCCCCCCTATTGAAAGGCATAATACTctctcttaattcagttaggaggccgaccaagtgatcc - -a -s mr.mrrefChr5 67141 241 + 294542 caggtttagatttccaggtttcgattaggattaaatacagcttatggggtcccagttttaggaacaccatgtaatgagtgcagggaggtagcaaataaactggagacatgtacacTGCTATCTGGAGTCTTATCCCTACTGTTCCTTTTGTTATCCACTTCCATTCTGTACACTAGCTGTAGGCTCTTTTGGAGAGCTCCAGTGAGAGCACAATTATGCCACTTTACCATTCCTAGGGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212502 241 + 636262 taggtttagatttccaagtttcgattaggattaaatacagctcatggagtcagagctttaggaacaccatgcagtgagtgcagggaggtagcaaataaactggagacatgtacacTGCTATCTGGAGTCTTATCCCTACTGTTCCTTTTGTTATCCACTTCCATACTGTACACTGGCTGTAGGCTCTTTTTGAGAGCTCCAGTGAGAGCACAATTATGCTGCTTTACCAGCCCTAGGGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 203569 239 + 647215 caggtttagattcccaggtttcaattaggattaaatacagcttatgaggtccctgttttaggatcaccatgtaatgagcatggggaggtagcaaaaaaactggagacatgtacacTGCTATCTGGAGTCTTATCACTACTATTCTTTTTGTTTTCCACTTCTATTCTG--CACCAGTTGTAGGCTCTTTTGGAGAGCTCCAGTGGGAGCACAATCATGCCACTTTACCATTCCCAGGGTGC - -a -s mr.mrrefChr5 67382 7 + 294542 TTGCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212743 7 + 636262 TTGCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 203809 7 + 647215 TTGCATG - -a -s mr.mrrefChr5 67389 219 + 294542 TACATGTTTGACTTACCAATCCAGAGTGTTTCAGAGATCAGGGTCAATCATTACAGTCCAAGTATCTACTGAAGGCTGAGATGATTCTTTATACATAATCCAAAACTAAACCCTAGAGAGCATCTATTCTCTTCCATCACTTCACACCAGCACATTACCCACCTTGACATGCCCCAAGCCACCAGTATTAATGTACTGTTGTTTTCTCTTGATTATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212808 219 + 636262 TACATATTTGACTTACCAATCCAGAGTGTTTCAGAGATCAGGGTCAATCATTACAGTCCAAGTACCTACTGATGGCTGAGATGACTCTTTATACATAATGCAAAACTAAACCCTAGAGAGTTTCTATTCCCTTCCATCACTTCACACCATCACATCACCCACCTAGACATGCCCCAAGCCACCAGTATTAATGTACTACTGTTTTCTCTTGATTATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 203816 218 + 647215 TACCTGTTTTACTTGCACATCCAAAGTGTTTCTGAGATCAGGGTCAATCATTACAGGCCAAGTGTCTACTGAAGGCAAAGATTATTCTTTATCCATAATCCAAAACTAAACCCTGGAGAGCATTTATTCTCTTCCATTACTTCACCCCAGCACATTGCCCGTCTTGACTTGCCCCAAGCTGCCGGTATTAATGTGCTGTCGTTTTCTCTTG-TTATGGT - -a -s mr.mrrefChr5 67608 134 + 294542 TGACTGTACAATCCCATCAAATGGATGCCCATGGTCAACAATTAAATGCATGCCTCAATGACACTGTTGCCCCATGGATGAGTATGTTGCACCCCCATCACCATTTCAAGGATGCAGAGCACACATGACCTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213027 111 + 636262 TGACCATACAATCCCATCAAATGGATGCCCATGGTCAACAATCAAATGCGTCCCTCAATGACACCGTTGACCCATTGATTAGTATGTTACACCCCAATCACCATT-----------------------CCCGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 204035 134 + 647215 TGCCTGTACAATACCATCAAATGGATACCCGTGGTCAACAATTAGATGTATGCCTCAATGACCCTGTTGCCCCATGGATGAGTATGTTGCACCCCCAACACCCTTTCAAGGATGCAGAGCACACATGACCTGGT - -a -s mr.mrrefChr5 67742 111 + 294542 GAGTGCTGCCACCACTGCACTTCCCTTACCTACATGTTGTTTTCAAGATCTCACATAAAATTCCAGGTCTTACTGAATGATCATCATCTCTTTCATCTGGTGGAGGATTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213138 111 + 636262 GAGTGCTGCCACCACTGCACTTCCCTTACCTACATGTTGTTTTCAAGATTTCACATAAAATTCCAGGTCTTACTGAATGATCATTATCTCTTTCATCTGGTGTAGGATTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 204170 110 + 647215 GAATGCTGCCACCACTGCACTTCCCTTACCTACCTGTTGATTTCAAGATCTCACATAGAACTCCAGGTCTGACTGAATCAT-ATCATTTCTTTCATGTGGTAGAGGATTGG - -a -s mr.mrrefChr5 67853 334 + 294542 TGTTTGAGGAGTTTGCTCTAAAGAGAGTGTGGGTCCATGCATCTTTATAGAACACCAAGATAATTAGCCCTTTTTTGAAGGGCCCTTTTTTGAAGGAATGTACGTCAATGTACCTCAGTTACGGAGAGGACCAATAAGTGTGTGATCATGATTCTAAACAGGGAAACGAAATGAATAGAGTGGTGAACACATTGGTTGAGCTGCATAAGAGGTTAAAAGAAGTGAGGGCCAGAGACCCCCTCAGAATGAGGATGGTTCATCCTGTCACAAATTTTTTGAGCAAACCAAACCAATGAGTCTGCCTGGCAAGGAAATTCAAGGAGGGAGAAGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213249 334 + 636262 TGTTTGAGGAGTTTGCTCTAAAGAGAGTGTGGGTCCATGCATCTTTATAGAACAACAAGATAATTAGCCCTTTTTTGAAGGGCCCTTTTTTGAAGGAATGTACGTCAATGTACCTCAGTTACGGAGAGGACCAATAAGTGTGTGATCATGATTCTAAACAAGGAAATGAAATGAATAGAGTGGTGAACACATTGGTTTAGCTGCATAGGAGGTTAAAAGAAGTGAGGGCCAGAGACCCCCTCAGAATGAGGATGGTTCATCCTGTCGCAAATTTTTTGAGCAAACCAAACCAATAAGTCTGCCTGACAAGGAAATTCAAAGAGGGAGAAGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 204282 281 + 647215 TGCTGGTGGATTTT----TGAGAAG----------CGTACATCTTTATAGGATACCAAGATATTTAGCCCTATTTTGAAGGGCCCTT----------------------------------AGGAGAGGAACAATAAGTGTGTGATGATGATTCTAAACAGGGAAACAAAATGGATAGAGTGGTGAACACATTGGTTGAGCTGCATAAGA----AAAAGAAGTGGGAGCCATAGACCCTCTCAGAATGAGGATGGTTTATCCTGTCACAAATTTTTTGAGC-AACCAAACCAATGAGTCCACCTGGCAAGGAAATTCAAGGAAGGAGAAGATAT - -a -s mr.mrrefChr5 68187 66 + 294542 AGAAACCTAGTAGGAAGTGTTGCACATAAAGGAGGGCAAGAGTAAACTAGAGAGCACATTTCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213588 66 + 636262 AGAAACCTTGTAGGAAGTGTTGCACATAAAGGAGGGCAAGAGTAAACTAAAGAGCACATTTCCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 204563 66 + 647215 AGAAACCCAGCAGGAAGTCTTGCACATAACGGGGGGCAAGAGAAAACTAGAGAGCATAATTCCAAA - -a -s mr.mrrefChr5 68253 93 + 294542 CAAAGTCATAAGCTAAAGGGTATAGAATCTGAACCTAAAGTTGTAATATAGGAACCACAGTATGGCGTGAGTATTTGGTGCAAGAGCATTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213656 93 + 636262 CAAAGTCATAAGCTAAAGGGCATAGAATCTAAACCTAAAGTTGTAATATAGGAACCACAGTATGGCGTGAGTATTTGGTGCAAGAGCATTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 204629 93 + 647215 CAAAGTCATAAACTAAAGGGTATAGACTCCGAACCTAAAGTTGCAATATAGGAACCACAGTATGGGGTGAGTGTTTGCTGCGAGAGCATATAA - -a -s mr.mrrefChr5 68346 238 + 294542 GATGTTTCTTCATGATATTCTTAATGAAAAAATGTTGATTACAACCTAAAAACACGTTGATTAGGTAGATTACAAATTGAAGATATATGTTGGTCCCAACAGTCAACTGGAAGCACATTAACCAGATAAGTGTAGTATTGAAGTTTGGTGATCTGTACAATGATGTGAGGGAATGAACTCAACTATCCGGGCACATAGTGGAACCACTCAAGTTACTTCAGAATGCTTGACATTCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213749 237 + 636262 GATGTTTCTTCATGATACTCTTAATGAAAAAATGTTGATTACAACCTAAAAACACGTTGATTGGGTAGATTACAAATTGAAGATGTGTGT-GGTCCCAACAGTCAACTGGGAGCACACTAACTAGATAAGTGTAGTATTGAAGTTTGGTGATCTGTACAATTATGTGATGAAATGAACTCAACTATCCAGGCACATAGTGGAACCACTCAAGTTACTTCAGAGTGCTTAACATTCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 204723 232 + 647215 AATGTTTCTTCATGATATTCTTAATGAAAAAATTTTGGTTACGACCT---AGCACGTTGATTAGGTAGATTACAAATTGAGGATATATGTTGGTC---ACACTTAACTGAAAACACCTTAACCAGTTAAGTGTATTATTGAAGTTTGGTGATTTGTATAATGATGTGAGGGAATAATCTCAACTATCCGGGCGCATAGTGGTACCACTCAATCTACTTCAGAATGCTTGACATTCTAG - -a -s mr.mrrefChr5 68584 40 + 294542 GTGCATATGATATTATATCTCAGGTCTTACATTTACATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213986 40 + 636262 GTGCATATGATATTATATCTCAGGTCTTACGTTTACATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 204961 38 + 647215 GTGCATAAGGTATTACA--TCATGTCTTACATTTACCACA - -a -s mr.mrrefChr5 68624 157 + 294542 AATGCATCGATACTTTTTTAAGATGCAGCCTACTGATGCTTGACCTTGATTATGCCACATGTATAAAAATAGGGGCCTGCAGAGTTGCATGATGTGTTGATCTTGAAACCTTGATAAAAATAGCCCGGAATAATTCTGTGTATTTAAATACACTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 214027 157 + 636262 AATGCATCGATACTTTTTTAAGAGGGAGCCTACTGATGCTTGACCTTGATTACGCCACATGTATAAGAATAGGGGCCTGCAGAGTTGCATGATGTGTTGATCTTGAAACCTTGTTAAAAATAGCACGGAATAATTCTGGGTATTTAAATACACTCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 204999 157 + 647215 AATACATCGATATTTTTTTAAGATGCAGCCCACTGATGCTTGACCTTGATTGTGCCACATGTATAAAAATAGGGATTTGCAGAGTTGCATGATGTGTTGATCTTGGAACCTTGACAAAAAGAGCCAGGAACAATTCTATGTATTTGAATACACTCAT - -a -s mr.mrrefChr5 68781 846 + 294542 AAGATTATTAGTCAGGCAAGATCTAATAAGATCTAATGGGTCTGAACGAAATTGTTTGCCAGTGTGGGTCTAGCTTTGTTTTTTGGTTTAGTGTGTGCCTAGGATTCCGCTATACACTCCAGAGAGTTACTAACTTGTGAATATTCCAATGTGGTGTGCTAGTTGTTCCCATATATTGCACTGATACTTTACAGAGATATACTATCAGGATTATCTATTGATGATGGTGCAAGTTATCTCTTGCTCTCCTGCATAGAGGGTTTCTTCAGAAAACAGTGGTTCTCAACATTCAGTCTCAGCAATATGAATGATGCACAACTATACCTGAGTCCCAGCAAAGTGACAGTCAGTGCAGCAGCAGGAGCAACGGAATACCCTACAATATGGAGCACAATATAGAGAGGTTGATAGGCAACAAAGTGCTACGGAAAGGTTGGCATGGGGCCTGCAATTGAAGGGTAAAATCGCAGGTCCAATAGCAAAAAGAGAAGCGCGCTAGCAAGAGAAAATAGGGCCAAGACCTACATAAAGAAAAGCATTAATTGAGTATGTCATTGGCATTAGATGAGTGCTCTAGTAAACCCCTCTCAGGGAGAGTCTTTACCCATATCCTGGGAGGGTTGGGAATGATGGTTTAAACAGTAAAATGGACATATAAGTATTATATGTGATGGTTGTGGAAACACCAGTAAGCATATCAGGTTGGGAGAAGAATTTATCAAATCTTGTATGCCCATTGGTTGAGAGATGGAATGCCCACAATGCTCTGCTAGAGACTTGCAACATACTCTCTATCATGTGTACCAATGGCCCTGAAATCTTAGGAATGAAAACTTTTGTTTGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 214189 836 + 636262 AAGATTATTAGTCAGGCAAGATCTAATAAGATCTAATGGGTCTGGACGAAATTGTTTGCCAGTGTGGGTCTAGCTTTGTTTTTTGGTTTAGTGTGTGCCTAGGATTCTGCTATACACTCCAGAGAGTTACTAATTTGTGAAGATTCCAATGTGGTATGCTAGTT-TTTCCATATAATGCGCTGATACTTTACAGAGACATACTACCAGGATTGTCTATTGATGATGGTGCAAGTTATCTCTTGCTCTCCTGCATAGAGGGTTTCTTCAGAAAACAGTGGTTCTCAACATTCAGTCTC--------GAATGATGCACAACTATACCTGAGTCCCAGCAGAGTGACAGTCAGTGCAGCAGCAGGAGCAACGGAATACCCTACAATATGGAGCACAATATAGAGAGGTTGATAGGCAACAAAGTGCTACGGAAAGGTTGGCATAGGGCCTGCAATTGAAGGGTAAATTTGCAGATCCAATAGCAAAAAGAGAAGCACGCTAGTAAGAGAAGATAGGGCCAAGACCTAAATAAAGAAAAGCAATAGTTGAGTATGTCATTGGCATTAGATGAGTGCTCTAGT-AACCCCTCTCAAGGAGAGTCTCTACCCATATCATGGGAGGGTTGGTAATGTTGGTTTAAACAGTAAAATGGACATATAAGTATTATATGTGATGGTTGCAGAAACACGAGTAAGCAGATCAGGTTGGGAGAGAAGCTAATCAAATTTTGTATGCCCATTGGTTGAGAGATGGAATGCCCACAATGCTCTGCTAGGGACATACAACATACTCTCTATCACGTGTACCAATGGCCCTGAAATCTTAGGAATGAAAACTTTTGTTTGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 205156 836 + 647215 AAGATTATTATTCAGGCAAGATCTAAGAAAATCTAATGAGTCTGAACAAAATTGTTTACCAGTGTTGGTCTAGCTCTTTTTTTTGGTTTAGTATGTGCCTAGAATGCCACTATACACTTCAGTGAGTTGCTAACTTGTGAATATTTCAATGTGTAGTGTTAGTTGTTCCCATGTATTGCACTGACATTTTACAGGGATACACTATCAGGATTATCTATTGATGATAGTGCAAGATATCTCTTGCTCTTCTGCATAGAGGGTTTCTTCAGAAAACAGTGGTTCTCACCATTCAGTCTCAGCAATATGAATGATGCAAAACTAC-TCTGAGTCCCGGCAAAGTGACGATCAGTGCAGCAGCAGGAGCAATGGAATACACTACAATATGGAGTACAATATGGAGCGGTTGACAGGCAACAAAGTGTTACATAAAGGTTGGCATGGGGCCTGCAATTGAGGGGTAAAATCGCAGGTCCAATAGCAAAAAGAGAAGTGAG-CGGCAAGAGTAAAGAGGGACAAGACCTACATAACGGAAAGCATTGATTGGGTATAACA-------TAGGTAAGTGCTCTAGTAAACCCCTCTCAGAGAGAGTCTTTACCCTTATTCTGCGAGGGTTGGGAATGATGGTTTAAATGGTAAAATGGACATATAGCTATTATATGTGAT-GCTGTGGAAACACCAATATGCATATCAGGTTGGGAGGAGAATTTATCAAATCTTGTGTGCCCTGTGGTTGAGAGGTGGACTGTTCACAATGCTCTGCTAGAGACTTGCAACATACTCACTATCATGTGTACCAATGGCCCAAAAATCTTAGGAATAGAAACTTTTGTTTGCCT - -a -s mr.mrrefChr5 69627 117 + 294542 GTATCACATGAGCTAATCAGCCCATAACCCATGCTGTCAAATAAGATAGAGAAACTAAACAGCAACAAAGTCGTTTTGCTTTCCAGAATTGGTACAAAAAAAATTGAAGTCCTTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215025 117 + 636262 GTATCCCATGAGCTAATCAGCCCATAACCCATGCTGTCAAATAAGGTAGAGAAACTAAACAGCAACGAAGTCATTTTGCTCTCCAGAATTGGTGCAAAAAAAATTGAAATCCTTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 206042 117 + 647215 TTAACACATGAGATAATCACCCCATAAACTCTGCTGTTAAATTAGATAGAGAAACTAAACAGCAACAAAGTGGTTTTGCTTACCAGAATTGGTACAAAGACAATTGAAGTCCTTATA - -a -s mr.mrrefChr5 69744 43 + 294542 TAAGCAGGCCTTTAAGGCGAGTGTAGCTGGCATGTTACAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215142 43 + 636262 TAAGCAGGCCTTTAAGGCGAGTGTAGCTGGTATGTTACAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 206168 43 + 647215 TAAGCAGGCTTTAATGGGGAATGTAGATGGCGTGTTACAATTT - -a -s mr.mrrefChr5 69787 17 + 294542 GTGTAATAAGTGAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215186 17 + 636262 GTGTGATAAGTGAATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 206211 17 + 647215 ATGTATCAAGTGAATCA - -a -s mr.mrrefChr5 69804 93 + 294542 GTTTTGCTACAAGGCTGGCTAATTCTCATTTATCCCCATTTGGGACGCTTATTAGAGCCATTGTTTCTAGTCCTTACTTGCCTCTAGTGCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215204 93 + 636262 GTTTTGCTACAAGACTGGCTAATTCTCATCTAGCCCCATTTGGGACGCTTATTAGAGCCGTCCTTTCTAGTCCTTACTTGCCTCTAGTGCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 206228 93 + 647215 GTTTTGCTACAAGGCTGGCTAATTCTCTGTTATCCCCATTTGAGACGCTTATTAGAGCCATTGTTTCCAGTCCTTACTTGCCTCTAGTGCCAC - -a -s mr.mrrefChr5 69897 65 + 294542 TTTGATAAGGGTTGCAAGTATGAGTATCTTGAGTTGTTGTGAAGTCTGTTGTATGATGGTTATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215297 65 + 636262 TTTGATAATGGTTGCAGGTATGAGTATCTTGAGCTGTTGTGAAGTCTGTTGTATGATGGTTATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 206322 65 + 647215 GTTGATAAGGGACGCAAGTATGAGTATCTTAAGTTGCTGTGCAATCTGGTGTATGATGGTTCGCC - -a -s mr.mrrefChr5 69962 75 + 294542 TTAGATGTATCTTGGGCTGCTGTATAACCTGGTGTAGGATGGCCAGCCTCAAATGCAAAAACCCAATTCTCATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215363 75 + 636262 TTAGATATATCTTGGGCTGCTGTATAACCTGGTGTAGGATGGCTAGCCTCAGATGCAAAAACCCAATTCTCATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 206387 70 + 647215 TTATATGTATCTTGGGCGGCTGTATAACCTGCTGTAGGATGGTCAG-CTCTAATGC----ACCCGATTCTCATCT - -a -s mr.mrrefChr5 70037 126 + 294542 AATTAGTGGTGTTTGTGGAGGTTCACGGAACATACATATTCTAAATCTATGTTACCAGCAGTGAGTCATCAATATAGGGTCTAGAAGGGCATGTCTGATCTGTTCTGAGTAAACTGACTTTTATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215440 126 + 636262 AATTAGTGGTGTTTGTGGACAATCATGGAACATACATGTTCTAAATCTATGTTACCAGCAGTGAGTCATCAATATAGGGTCTAGAACGGCATGTCTGATCTGTTCTGAGTAAACTGACTTTTATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 206457 126 + 647215 AATTACTGGTGTTTGTGCAGGTTCACGGAATATACATATTCTAAATTTATGTTACCAGGAGTGAGTCATCAATACAGGGTCCAGAAGGGCATGTCTGATCTGTTCTCAGTAAATTGACTTTTATAA - -a -s mr.mrrefChr5 70163 513 + 294542 TTCCTTTCATAGCTGTCAGATGGTCATAGAAGCCAACCTACTCTAAAAAACAAATCCACATGTACTAGGTTGAACTCAATATACAGCCCTCCCGGTATTTCACGCTGGCTCAACATGGGTTATCACGTGCACTAGATAAATATTGTCTGGTTACTAGCTGTGGATATTAGGTTGTCTCATACGAGCCTCTTCTGGATAAGTGTATACATTATTGTGAGTAGGTACTAAAGATATTACTGTGAAGATAAAGCCTAGATTACAAAATCTCAAAGCCCTGACAGGGAAGTCCAGAATCAAGAGTCTCCATAATACAGTCCATGCTGAGATAATTGGCCTGACATAGAGAGTCATACAGTAATTTTGACATGCAGAATAATCTGCACTCATCAATCCTTCAATTGTAGCAAAATAAAACTGATTGTCTGTTATAAAAGAGAACTCATTTATTGTCTGCAATCAAGATAGACTACCCAATCTCCAACCACATTCAGTAATACTGCACCTAATGAGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215566 510 + 636262 TTCCTTTCATAGCAGTCAGTTGGTCATAGAAGCCAACCTACTCTAACAAACAAATCCACATGTACTAGGTTGAACTCAATATACAGCCCTCCCGGTATTTCACGCTGGCCAAACATGGGTTATCATGTGCACAAGATAAATATTCTCTGGTTATTAGCTGTGGATATTGAGTTGTCACATACGAGCCCCCTC---ATAAGCGTATACATTATTGTGATCAGGTACTAAAGATATTACTGTGAAGATAAGGCCTAGATTACAAAATCTCAAAGCCCTGACAGGGAAGTCCAGAATCAAGAGTCTCCCTAATACAGTCCATGCTGAGATAATTGGCATGACTTAGAGAGTCATACAGTAATTTTGACATGCAGAATAATCTGCACTCATCAATCCTTCAATTGTAGCAAAATAAAACTGACTGTCTGTTATAAAAGAGAACTCATTTATTGTCTGCAATCAAGATAGACTACCCAATCTCCAACCACATTCAGTAATACTGCACCTAATCAGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 206584 506 + 647215 TTTCTTTCATAGCTGTCAGATGGTCATAGAAGCCAACCTACTCTAAAAAACAAAGTCACATGCACGAGGTTGAACTCAATATACAGTCCTCCAG-------ATGCTGGCTCAACATGGGTTATCACGTGCACTAGATAAATATTGCCTGGTTACGATCTGTGGAGATTAGGCCGTCTCATATGAGCCTCTTCTGGATAAGTGTATACATTATTGTGAGTAGGAGCTAAAGATATCACTGTGAAGATGAAGGCTAGAGTACAAAATCTCAAAACCCTGACAGGGGAGTCCAGAATCAGGAGTCTTCATAATACAGTCCTTGCTGGGATAATCAGCCTGACACAGAGACTCACAGAGTAATTTTGACATGCAGAATAATCTGCACTCATTAATCCTTCAATTCTAACAAAATAAAACTTATTGTCTGGTATAAAAGAGAACTCATTTATTGTATGCAATCTACATAGACTACCCAATCTCCAACTACATTCAGTAATACTGCACCTAATGAGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 70676 45 + 294542 GCTGTCATGTATGACCAAAGTATCAACACCTGATAGATTCTACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216077 45 + 636262 GCTGTTATGTATGACCAAATTATCAACACCTGATAGATTCTCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 207090 42 + 647215 GCTGTCA--TATGA-CAAAGTACCAAGACCTGACAGAGTTTATTC - -a -s mr.mrrefChr5 70721 13 + 294542 TCCAACCAACCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216122 13 + 636262 TCCAACCTATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 207189 13 + 647215 TCCAAATAACGTG - -a -s mr.mrrefChr5 70734 115 + 294542 TAAGCTAAACAAAACTTATTAGATATGTATAATGAGCAGGGACTCAATCCTTTCTCACAATTGTTAATCAGGACTTGCTCTCCCACCCTGTGGCTGCCAATTTAAGGTGAAAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216139 115 + 636262 TAAACTAAACAAAACTTATTAGGTATGTATAACGAGCAGGGGCTCAGTCCTTTCTCACAGTTGTTAACCAGGACTTGCTCTCCCACCCTGTTGCTGCTAATTTAAGGTGAAAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 207202 115 + 647215 AAAGCTAAACAAAAACTACTAGATATGTATAATGAGCAAGGACTGAATACTATATCATAATTGTAAATCAGGACTTGCCCTCCTACCCTGTGGCTGCCAATCTAAGGTGAGCATT - -a -s mr.mrrefChr5 70849 266 + 294542 TCAGCATAGAAATGGAAGAAGCTCCCTATCTTTATGTCTTACTGGAAGAGACATAATAGATGAGGCTTTAGGGCCTGACTTGATCATCACCGACTGAGGCCCGTGCTGTTGTCATTCCTATGTCATGTCTTCTTATAAGACAAACTAGTCATTTCATCCTTCCTAGACTTCTTCTTGTCCATGTTAAGTGTTGTGCAGGGTGAGACCATGTAATTTATTTACTGTATCTAGTTTTATTTTTTATGATTATAATTTTACACATAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216255 266 + 636262 TCAGCATAGAAATGGAAGAAGCTCCCTATCTTTATGTCTTACTGGAAGAGACATAATAGATGAAGCTCTAGGGCCTGACTTGATCATTACCGACTGAGGCCCGTGCTGTTGTCATTTGTATGTCATGTCTTCTTATAAGATGAATTAGTCATTTCATCCTTCCTAGACTTCTTCTTGTCCGTGTTAAGTGTTGTGCAGGGTGTAACTATGTAATTTATTTACTGTCTCTAGTTTTATTTTTTATGATTATAATATTACACATAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 207317 266 + 647215 TACACATAGAAATGGAAGCAGCTCCCTATCTTTATGTCTTTCTGGAGGAGACATAATAGATGAGGCTTAAGGGCCTGACTTGATCATCACTGACTGAGGCTCGGGCTGTTGTCATTCCTATGTCATGTCTTCTTATAAGACAAACTTGTCATTTTATCCTTCCTAGACTTCTTCATATCCATGTTAAGTGTTGTGCAGGGTGAGACCATGTAATTTATTTACTGTATTTAGTTTTATTTTTTATGAATATAATTTTACACATAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 71115 106 + 294542 ATAGCTCTGATTGTGTTCTCTGTGTACCAAGTTAATCAGGATCAATGGTTAGTTGTGGCACTGAAATTATTGTACAACAGCCACCAGTGGGTGGCAGGTCCCTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216521 106 + 636262 ATAGCTCTGATTGTGTTCTCTGTGTACCAAGTAAATCAGGATCAATGGTTAGTTGTGGCACTTAAATTGTTGTACAACAGCCACCAGTGGGTGGCAGGTCCCTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 207584 106 + 647215 ATAGGTCTGATTGGGTTCTCTCTGTGCCGAGCTAATCAGGATCAATGGTTAGTGGTGGCACTGAAATTATTGTACAACAGTCACCGGTGGGCGGCAGGTCCCTGTC - -a -s mr.mrrefChr5 71221 459 + 294542 TTCCCTATCTAATAACTGTCACTTTTAGCATCAGGATTATAATTGATGCATGTGTTGAACAGCGTCCCTGGCAGAAAGCTGAGTTAGCACAGTCTTGGTTACTTCTAATTCAATGGGCACAACCAAGTGGCACATAGGATACACCTTTATGCGTGTTGTGGGCTTGTTCTATAGCATATGGTAGTAAATGACATGATTTGAACCAACAGATGCAGCTCAACCTACACAATTACCACACCTGTAAGTTTTAGTCAGTAGCAATCATGTTAGTTAATGAAAAAGTAAGTCCCTCCCACCTAAATTAACTATTAGATGCACCTGGATTACACCCAACTTGAGTATTGAAGTCTGCCTAGTGCACATATTGAATACCCTGATATTGCTTTAACTGAGGACATGACCCTCATGACCATACATATGAGTTGAGGTTACCATAATCCAGAATGCAGACCGATAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216628 455 + 636262 TTCCCTATCTAAACACTGTTGCTTTTAGCATCAGGATTATAATTGATGCAGGTGTTAAACAGCGTCCCTGGCAGAAAGATGAGTTAGCACAGTCTTGGATACTTCTCATTCAATGGGCACAACCAAGTGGCACATAGGATACACCTTTA----TGTTGTGGGCTTGTTCTGTAGCATATGGTAGTAAACAATGTGATTTGAACCAACAGATGGAGCTCAACCTACACAATTACCACACCTGTAAGTTTTAATCAGTAGCAATCATGTTAGTTAATGAAAAAGTAAGTCCCTCCCACCTAAATTAACGATTAGATGCACCTGGATTACACCCTACTTGAGTATTGAAGTCCGCCTTGTGCACATATTGCATGCCCTGATATTGCTATAACTGAAGACATGACCCTCATGACCATACATGTGAGTTGAGGTTACCATAATCCAGAATGCAGACTGATATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 207690 450 + 647215 TTCCCTATCTAATAACTGGCACTTTTGCCATCAGGACTATAATTAACACATGTGTTGGACATCATCCCTGGCAGAAAGCTGAGTTAGCACAGTCTTGGTTACTTCTAATTCAATGGGCGCCGCCAAGTGGCACATAGGATAACCCTTTATGCGTGTTATGGGCTTGTTCTATAGCAGATGGTAGCAAATGACATGATTTGAACCAACAAAGGCAGCTCAACCTCCATAATTACCATACCAGTAAGTTTTAGTCAGTAACAATCATGTTAGTTAATGAAAAAGTAAGTCCTTCCTGCCTTCATTAACTATT------ACCCGGATTGCACGCAACTTGAGTATGGAA---TGCCTAGTGCACATAATGAATACCCTGATATTGCTTTAACTAAGGACATGACCCTCATGACCATACACAAGAGTTGTGGTTACCATAATCCAGAATGCAGACCAATAACC - -a -s mr.mrrefChr5 71680 77 + 294542 TGGCAGCAATGCATATCTAATGATGTAGTCATGCTTGACAGTTAGAGGTTGGTTACATCTTGAAGTACTGAAGCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217083 77 + 636262 TGGCAGCAATGCATATCTAATGATGTAGTCATGCATGAAAGTTAGAGGTTGGTTACATCTTGAAGCACTGAAACCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 208141 77 + 647215 TGGCAGCAATGCGTATCTAATGATGTAGTCATTCTTGACAGTTTGAGGTTGGTTACATCTTGAGGTATTGAAGCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 71757 7 + 294542 ATCTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217196 7 + 636262 AGCTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 208218 7 + 647215 ATCTGGC - -a -s mr.mrrefChr5 71764 29 + 294542 ATAATGTGATGGGTATAGTTAGTAAATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217203 29 + 636262 ATAGTGTGGTGGGAATAGTTAGTAAATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 208291 20 + 647215 ATAACGTGAAAATTCTAGTT--------- - -a -s mr.mrrefChr5 71793 15 + 294542 TTTTGATTAAATGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217236 15 + 636262 TTTTGATTAAATGAA - -a -s mr.mrrefChr5 71808 157 + 294542 CATTTTCATAGCAAGGATGGACATTCAAACATGGGACTGGCTGCATACATGTCACTTTCTTGTTTCTTTCTCTATAACAGTTAACAAGCTACTAAACAGATTGAGACAGAGAGGGAGTCCCAGAGCACCCTATTTAGGTGCTCCTTCCAATGGAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217253 157 + 636262 CATTTTCATAGCAAGGATGGACATTCAAACATGGGACTGGCTGCATACATGTCACTTTCTGGTTTCTGTCTCTATAACAGTTAACAAGCTACTAAACAGATTGAGACTGAGAGGAATTCCCAAAGCATCCTATTTAAGTGCTCCTTCCAATGGAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 208311 102 + 647215 -------------------------------------------------------TCTCTTGTTTCTTTCTCTGTAACAGTTAACAAGCTACTAAACAGATTGAGACAGAGACGGAGTCCCAGAGCACCCTATTTAGGTGCTCCTTCCAGTGGAAGC - -a -s mr.mrrefChr5 71965 86 + 294542 CTTGACTTATAGGTTTCATGAATAAGAATGGATTATCTAAAAACAGGCTTTCCTTAACTCTTGTTGGTGTGTTCTGTTTCAGTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217419 86 + 636262 CTTGACTTATAGGTTTCATGAATAAGAATGGATTATCTAAAAACAGACTTTCCTTAACTCTTGTTGGTGTGTTCTGTTTCAGTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 208413 86 + 647215 GTTGACTTATAGGTTTCATGAATAAGAATGGATTGTCTAAAAGCAGGCTTTCATTAACTCTTGTTGGTCTGTTCTGCTTCAGTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 72051 254 + 294542 CCCAATGGTCCAGAACTTGCTGGGTCTTGGGTGGTTGTACTAGTGTGTCTGCTTGCTTGTTTGGTAAGTTCCTTAGGAGAAGAAAAAGGAGACCATGACTATTTGGGAGAAAAATGAACACTGTGAGAAGTTTTTAGCAGTTGGGCATGACACCAAATTAACCATTCAATGGATTCAGTAATTGCAGACATTAGATTGAAGCAACATTCTGCTATCCTATCGATAGATTTTGGACACCAAAGATATGCCAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217508 233 + 636262 CCCAATGGTCCAGAACTTGCTGGGTCTTGGGTGGTTGTACTAGTGTGTC----TGCTTCTTTGGTAAGTTCCTCAGGAAAAGAAAAAGGAGACCGTGACTATTTGGGAGAAAAATAAACACTGTGAGAAGTTTTTAGCAGTTGGGCATGACACCAAAATAACCATCCAGTGGATTCAGTAATTGCAGACATTAGATTGAAGCAA-----------------GATAGATGTTGGACACCAAAGATATGCCATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 208499 254 + 647215 CCCAATGGGCCAGAACTTGCTGGGTCATGAGTGGCTTTACTAGTGTGACTGCTTGCTTGTTTGGGACGTTCCTTAGGAGAAGAAAAAGGAGACCATGACTATTTGGTAAAAAAATGAACACTGTCTAAAGTTTTTAGTAGTTGGGCATGACACCAAATTGACCATTCAATGGATTTGGTAACTGCAGACATTAGATTGAAGAAACATTCTGCTATCCTATCCATAGAGTGTGTACTCCAAAGATATGCCAATTT - -a -s mr.mrrefChr5 72305 23 + 294542 ATAGTTGACCCACATTTGGTCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217775 23 + 636262 ATAGTTAAGCCACATTTGGTCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 208753 20 + 647215 ATAGTTGACCCACATTTGGT--- - -a -s mr.mrrefChr5 72328 118 + 294542 AACTACCCCCATGCAAGGCATCCCCAGATGATTCTGGTAGGCCAGTAGCCACCTTAGGTTTAAGAAAGCAAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTTGATGTACTCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217799 118 + 636262 AACTACCCCCATGCAAGGTATCCCTACATGATTCTGGTAGGCCAGTAGCCACCTTAGGTTAAAGAAAGCAAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTTGATGTACTCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 208773 102 + 647215 ----------------TGCATCCCCAGATGATTCTGGTAGACCAGTAGCTCACATAGACTTAAGAAAGCGAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTCGACATACTCTTG - -a -s mr.mrrefChr5 72446 47 + 294542 GTGCTGAGGAGGGGGGAGCACCTAGTGTGAGACTGTGAATATTTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217933 47 + 636262 GTGCCAAGGAGGGGCAAGCACCTAGTGTGAGACTGTGACTATTTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 208875 47 + 647215 GTGCTGAGGGGAGGGGAGCACCTAGTGTGAGACTGTGAATATTTCTC - -a -s mr.mrrefChr5 72493 92 + 294542 CTGCTTGGATTTGCTCTTTCACCCCAATAACTATCAGAATGGCAGATGCTCTAAGCCAAATGAGGAGAAACTGATTACCAGCAGGACCGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217983 92 + 636262 CTGCTTGGATTTGCTTTTTCACCCCAATAACTGTCAGAATGGCAAATGCTCTAAGCCAAATGAGGAGAAACTGATTACCAGCAGGGCCGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 208922 92 + 647215 CTGCTTGGATTTGCTCTATCACCCCAATAACTATCAGAATGGCAGATGCTACCTGCCAAAAGTGGAGAAACTGATTACCAGCAGGACCGGAC - -a -s mr.mrrefChr5 72585 304 + 294542 TGCTTGTGGTGGAGTGGTTAAGTACATGTATCAGGATGTCCCTTTTCACTTAGTTTCAACCTGATTTATCAAATCCTCTGTCGCTTCCCACATGAATGACATCAAAATGGGAATCCTTGAGTTGTATTACATCcaataaCTAAatcacaATAGTAATATTAAAAGTCTATGTTCCCATTGAGCAACTTGGAGTGATTACCATCACTAAGCAGTTTAACAGTCAAGGGATAATAACACCGCCCAAAGTGAATGCACAATTGAGGAAACACACTAAGTGGCAACCTGACAAGTGTGAGCATTCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218077 304 + 636262 TGCTTGTGGTGGAGTGGTTATGTACATGTATCTGGCTGTCCCTTTTCACTTAGTTTCATCCTGATTTAACAAATCCTCTGTCGCTTCCCACATGAATGACATTCAAATGGGAATCCTTGAGTTGCACTACATCCAATAACTAAATCACAATAGTAATATTAAAAGTCTATGTTCTCAGTCAGCAACTTGGAGTGATTATCATCACTAAGCAGTTTAACAGTCAAGGGAGAATAACACCGCCCAAAGCGAATGCACAATTGAGGAAACACACTAAGTCGCAACCCGACAAGTGTGAGCATTCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 209014 283 + 647215 TGCTTGTGGTGGGGTGGTTAAGTACATGTATCAGGACCTCCCATTTCACTTGATTTCAACCTGATTTATCAAATCCTCTGTCACTTCCCACATGAATGGCATCAAATTGGGAATCTTTGAGTTGTATTACATC------CTAA-----------GATATTAAAAGTCTATATTCCCATTGAGCAACTTGGAGTGATAACCATCACTAAGCAGTTTAACAGTTGAGGGATAATCCCACCAACCAAAGTGATTGCACAATTGAGGAAACACACCAAGTGGCAACCTAACAAATGCGAGCATT---- - -a -s mr.mrrefChr5 72889 32 + 294542 AGAATGTTTTAAATGTGGGTAGGCCACAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218386 32 + 636262 AGAATGTTTTAAATGTGAGTAGGCCACAACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 209297 32 + 647215 AGAATGTCCTAAACGTTGGTAGGGCCCAACCA - -a -s mr.mrrefChr5 72921 112 + 294542 TGTTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTCCATAGGCAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCGTATGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218425 111 + 636262 TGTTGATTGTAATTTTCAACAAGAACTTTAATCTTTCTCTAT-GGCAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCGTATGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 209329 109 + 647215 TGTTGATTG---TTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCATAAACAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGAAATTTTCAACAACAATTTTAATCTTTCTCCATAGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 73033 11 + 294542 CTTGGATTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218536 11 + 636262 CTTGGATTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 209480 11 + 647215 CTTGGATTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 73044 133 + 294542 GAATACTATCTCCTGGTATCCCTTTGCTGGTCGATACCTCATCCACTATTTAGACATATGTCAATCACACACCTATAAATCCCTTAACTACTACTTCTGGATACTCATGAGCTACTACTGGCTCCTCATGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218548 133 + 636262 GAATACTATCTCCTGGTATCCCTTTGCTGGCCGATACCTCATCCACTATTTGGCCATATGTCAATCACACACCTATAAATCCCTTAACTACTACTTCTGGATACTCCTGAGCTACTACTGGCTCCTCATGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 209491 129 + 647215 GAATACTATCTCCTGGCATCCCCTTGCTGGTCAA----TCATCCACTATTTAGACATATGTCAATCACACACCTATAAATCCCTTAACTACTACTTCTGGATACTCACCAGCTACTTCTGGTTACTCGTGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 73177 186 + 294542 TACAGTCATTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTCCCTTGGACCTTGGACCACCACGATCAAGGGCCCTCACTACCTATCTTTTACCTCATTTGCACTTGCAAGTATAGAGAAGCTAGGCTCTCTAAGGAGGTCAGTCTGAGACTCCAATGGTTTAGTTTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218682 186 + 636262 TACAGTCGTTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTCCCTTGGACCTTGGACCACCACGATCAAGGGCTGTCACTACCTATCTTTTACCTCATGTGCATTTGCAAGTATAGAGAAGCTAGGCTCTCTAAGGACGTCAGTCTGAGACTCCAATGGTTTAGTTTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 209620 146 + 647215 TACAGTCATTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTC-------ACTGGGATGACCACGATTAAAGGCCCTCACTACCTATCTTTTACCTCTTTTGCACTTGCAAGTATTGAGAAGC-AGGCT------GGAGGTCAGT-------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 73363 21 + 294542 AGAACCCATGACATTATATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218870 21 + 636262 AGAACCCATGACATTATATCT - -a -s mr.mrrefChr5 73384 59 + 294542 AGACTAACTGTGATGCTGGTAGAGGAACATACCCATGCATTTATCACCTTACAATTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218892 59 + 636262 AGACTAGCTTTGATGCTGGTAGAGGAACATACCCATGCATTTATCACCTTATCATAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 209766 56 + 647215 ---CTAACTGTGACGTTGGTAGAAGAACATACTGATGCATTTATCACCTTACAATTATG - -a -s mr.mrrefChr5 73443 45 + 294542 CAAGGTTAAATGACCAGGTATTAAGCTCTGGGTGGTGATTTGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218954 45 + 636262 CAAGGTCAAATGACCAGATATTAAGCTCTGGGTGGTGATTTGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 209822 44 + 647215 CAAGGTTAAATGGCCAGGTGACAAGCTCTGGG-AGTGATTTGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 73488 38 + 294542 ACAACCGAACTGACGAATTGGGCTAAGTTGCAAACTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219002 38 + 636262 ACAACCAAACTGACGAATTGGGCTAAGTTGCAAACTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 209866 38 + 647215 ACAACTGACCTAACAAATTGGGCTAAGTTGCACATTAA - -a -s mr.mrrefChr5 73526 494 + 294542 ATCACTTGAGAACGCCCATTAGTAAGCATTTTAGTCCATTCATTACGGGGTAAAATAGCTGGAGGATTCCTACGTTTTTTACATGAGATTGGAGATTTGCCGCCACCAGTAACATGCCACTTAATATAGTATGTTCATTTATCCATGGCTATATGCCTGTGAGACCACAACCTTATTTGAAGCCTCCCTTGTCCCATCAATGAGTGGAACTGGGTCTAAAACCACTTATACCCCTCCTCTATTTTCCACCCTATATCTAGATGGTGACACTAAAGCATGTGAACAATTTACCATCCCTTTTGTTGGCTGTTGTCAAGCCACAAGAATTTTGCTGTCTCAGGTGCCCAGCAATTAGATAATAATTTTGGCTCTTATTTATGTCCCCAACAGTCAGGATATCTATCTTCTCAGGTATCCTTAATAGAGGGCTCTGCAGATTTTCTTATGCCCTATTGAGTGGGTTTTAGGTTCACTCATCCAACCACCACAACCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219049 425 + 636262 ATCACTTGAGAACGCCCGTTATTAAGCATTTTAGTCCATTCATTACGGGGTAAAATAGCTGG---------ACATTTTTTACATGAGATTGGAGATTT---GCCACACGTATCATGCCGCTTAATATAGTATGTTCATTTATCCATGGCTATATGCCTGTGAGACCACAACCTAATTTGAAGCCTCCCTTGTCGCATCAGCA---------------------------ACCCTTCCTCTACTTTCCACCCTATATCTAGATGGTGACACTAA-----GTGAACAATTTACCATCCCTTTTGTTGGCTGTTGTCAAGC------GATTTTGCTGTCTCAGGTGCCCAGTGATTAGATAATGATTTTGGCTCTTATTTATGTCCC--------------TTTGTCTTCTCGCGTATCCTTAGTAGAGGGCTCT---GATTTTCTTATGCCCTATTGAGTGGGTTATAAGTTCTCTCATAC--CCACCACAACCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 209904 486 + 647215 ATCACTTGAGAACCCCCATTAG-----ATTTGAGTCCAGTCATTATGGGGTAAAATAGCTGGAGGATTCCTAGGTTCTCTATATGAGATTGGAGATTTGCCGCCACCAGTTACATGCCACTTACTACAGTATGTTCATTTATCCATGGCTATATGCCTGTGAGACCACAACCTTATTTGAAGCCTCCCTTGTGCCATCAATGAGTGGAACTGGGTCTAAAACCACTTATACCCCTCCTCTATTTTCTACCCTATATCTAGATGGTGACACTAAAGCATGTGAACAATTTACCCTCCTTTCTGTTGGCTGTTGTCAAGCCACAAGAATTTTGCTGTCTCAGGTGCT--GCAAGGAGATAATAATTATGGTTCTTGTTTATGTCCTCAACAGTCAGGATATCTATCTTCTCAGGTATCTTTAATAGAGGGCTCTGCAGATTTTCTTGTGCTCCATTGAGTGGGTGTTAGGTTCACCGATCCAACCACCA-AACCAC - -a -s mr.mrrefChr5 74020 268 + 294542 TAGTTGTCTTTGCTGTATAAAATAGACCACCCTGCATTATTGCATCCCAAGGTTTTCAGGTCCTTACTCTCATTTTTCTTGCATCTTGTGTGTGGTTCGTATTAGTTTTAATAGATGTGAATTGGTGTTATACTACTTTTCTTTCCTGAATCTGTGAGTCTGCTGAGGGTATTCTGTATGTCCATTATGGTGTTAGACTAGGATCAGTAGCATCTGATCTGAGAGGTAGTTTATGGCAGTATTGTTTGCCTTGCATCTATCAAAAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219474 263 + 636262 CAGTTGTCTTTGCTGTATAAAATATACGACCCTGCATTATTGCATCCCAAGGTTTCCAGGTCCTTACTCTCATTTTTCTTGCATCTTGTGTGTGGTTCGTATTAATTTTAATAGGTGTGAATTGGTGTTATACTACTTTTCTTTTCTAAATCTGTGAGTCTGCTGAGGGTATTCTGTATGTCCATTAT----TTAGACTAGGATCAGTAGCATCTGATCTGAGAGGTAGTTTATGGCAGTATTGTTTGCCTTGCAC-TATCAAAAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 210400 268 + 647215 TAGTTGTCTTTGCTGTATAAAATAGACCACCCTGCATTATCTCATCCCAAGATTTTCAGGTGCTTATTCTCATTTTTCTTGCACCTTGTATGTGGTTTGTAATAGTTATTATAGATGTAAATTGGTGTTATACTACTTTTCTTTCCTGAATCTGTGAGGCTGCTGAGGGTATTCTGTATGTCCATTATGGTGTTAGACTAGGATCAGTAGCATCTGGTCTGAGAGGTATTTCATGGCAGTATTGTTTGCCATGCATCTATCAAAAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 74288 48 + 294542 GCCTTGCTTAGTAAATCATGCCCAGTCTCTTAATGTAAAAGCTCTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219738 48 + 636262 CCCTTGCTTAGTAAATCATGCCCAGTCTCTTAATGTAAAAGCTCTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 210668 48 + 647215 GCCTTGCTTAGTAAATCATTCCCAGACTCTTAAGGTATAAGCTCCAGA - -a -s mr.mrrefChr5 74336 117 + 294542 AGCAGAGGAGGACATGGTAGAAGTACAACATAGATCTCCCTTTAGCAATTAATATGACAGACTTGGCACATTGTTAAGTGTTACACATTCAGATGTATAAGACAGTAGGCTACCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219806 96 + 636262 AGTAGAGGAGGACATGGTAGAAGTACAACATAGATCTCCCTTTAGCAATTAATATGACAGACTTGGCACATTGTCAA---------------------AAGACATTAGGCTACCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 210716 117 + 647215 AGCAGAGGAGGACATGGTACACGTACAACATAGGTCTCTCTTTATCAATTAATAGGACAGACTCGGCACATTGTTAAGTGTTACACATTCAGATGTATAAGGTCGTAGGCTACCCAA - -a -s mr.mrrefChr5 74453 73 + 294542 CCTTCAGCATGACTGATTGCACCAAACATTTAAATCCCTGGGTAAGGGTAGGAGGGTAAACAAAACGACATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219902 73 + 636262 TCTTCAGCATGACTGACTGCACCAAACATGTAAATCCCTGGGTAAAAGTAGGAGGGTAAACAAAACTACATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 210834 73 + 647215 CCTTCAGCATGGCTGATTGCACTAAACATTTAAATACCTGGGTAAGGGTAGGAGGGTAAACAAAACGACGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 74526 186 + 294542 CTGCCTTACACTGAAGCTAACAATATTTACTGCTACATGAGGTCAGCAACCAAAAGATTACAAGAAACGACTTGCATAAACAGATGGCAGTGAAATGCAGGACCATAATTGTTCCACTTCAATCACTATAAAAGCTATGATTGACCCTGTCCAGGGCATTGTGGCTCATGACTGTGGTCCTATCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219976 177 + 636262 CTGCTTTACACTAAAGCTAACAATAT---------CACGAGATCAGCAACCAAAAGATTACAAGAAGCGACTTGCATAAACGGATGGCAGTGAAATGCAGGACCATAATTGTTCTGCTTCAATCGCTATACAAGCTATGCTTGACACAGTCCAGCGCATTGTGGCTCATGACTATGCTCCTATCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 210907 186 + 647215 CTGCCTTACACTGAAGGTAATGATATTTACTGCTATATGAAGTCAGCAACCAAAAGATGACAAGAAACAACTTGCATAAAAAGATGGCAGTGGGATGCAGGACCATAATTGTTCCACTTCAATCACTATAAAAGCTATGATAGACCCTGTCCAGGTCATTGTGGCTCAAGACTGTGGTCCTATCTA - -a -s mr.mrrefChr5 74712 149 + 294542 TCGAGACCTTTTTTCAAGCTTCTTATACCAACAACCAAATGCAATGCCCCCCTGTACAAGGCAGTGCTCACTGTTAGGACCCACCATTTTGCAGAAAGCTGCACAGCCCTTGGCTGGCTATCTTGGGAAAGCTCTAGTGGGCTCTTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220159 148 + 636262 TCGAGACCTTTTTTCAAGCTTCTGATACCAACAACCAAATGCAATGCCCCCCTGTACAGGACAGTGCCCACAGTTAGGACCCACCATTTTTCAGAAAGCTCCACAG-CCTTAGCTGGCTATCTTGGGAAAGCTCAAGTGGGCTCTTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 211093 149 + 647215 TGGAGAGCTGTTTTCAAGCTCCTTATACCAGCAACCAAACACAATGACCCCCTGTACAAGGCAGTGCTCACTGTTACGACCCACCATTGTGCAGAAAGCTGCTCAACCCTTGGCTGACTAGCTGGGGAAGATTCTAGCAGGCTCTTTAG - -a -s mr.mrrefChr5 74861 42 + 294542 GTAGTTTGATGCTATGCCACCAGATGCCAATATCCAGTGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220307 42 + 636262 GTAGTTTGATGCTATGCCACCACATGCCAATATCGAGTGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 211323 42 + 647215 GTAGTTTGATGCTATGCCACTAGATGACGATATCCAATGATT - -a -s mr.mrrefChr5 74903 117 + 294542 GTGTCAACAAGTTTAAGCCTCCCTGATTGTCTCACACAGTTGTGCCTTGTGTAACTGAGAGATATGATGGAACTTACTGTTAGTCATTAAGTTCATGTATGCTTTAGTTCAAAGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220349 117 + 636262 GTGTCAACAAGTTTAAGCCTCCCTGATTGTCTCACACAGTTGTGCCTTGCGTAACTGAGAGATATCATGGAACTTACTGTTAGTCATTAACTTCATGGACGCTTTAGTTCAAAGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 211366 116 + 647215 GTCTCAACAAGTTTAAGCCT-GCTGATTGTCACACAAGGCTGTGGCTTGTGTAAATGAGGGATAAGATGGAACTTACTGTTAGTTGTTATGTTCATGTATGCTTTAGGTCAGAGGCC - -a -s mr.mrrefChr5 75020 18 + 294542 TGTTCCAGTCCCATGACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220466 18 + 636262 TGTTCCAGTCCAGTAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 211508 18 + 647215 GGTTCCAGTCCCATGACC - -a -s mr.mrrefChr5 75038 7 + 294542 TGTCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220484 7 + 636262 TGTACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 211527 7 + 647215 TGTCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 75045 17 + 294542 TTTACCCTACACACGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220643 17 + 636262 TTAACCCTACCCTCGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 211534 17 + 647215 TTTACCCGGCACACGGT - -a -s mr.mrrefChr5 75062 66 + 294542 TTATACATTACATAGATGTCACGGTTGTAGGTATTAGGAGCATCATTGGAACTGGTTGACCCAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220660 66 + 636262 TTATACATTACATAGATGTCACGGTTGTAGGTATTAGGAGCATCATTGGAACTGGTTGACCCAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 211579 66 + 647215 TCATAGATTACACAGATGTTGTTCTTGTAGGTATTAGGGTAATCATTGGAACTGGTTGATCCAATC - -a -s mr.mrrefChr5 75128 37 + 294542 AACCCCAGCTGATTCAGCAGATGGGACCACCATTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220727 37 + 636262 AACCCCAGCTGATTCAGCAGATGGGACCACCATTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 211645 37 + 647215 CACTCCAGGTGATTCAGCAGATGGGGCCACCATTATG - -a -s mr.mrrefChr5 75165 49 + 294542 AAGATGGTGATGCCTTATCAAAAACCCTGCCCTCCATGAGGAGGTTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220765 49 + 636262 AAGATGGTGATGCCTTATCAAAAACCCTGCCCTCCATGAGGAGGTTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 211682 49 + 647215 AAGATGGTGATGCCTTATCAAAAACCCTGTCCTCCATCAGGAAGTTTGG - -a -s mr.mrrefChr5 75214 42 + 294542 AGACTATGGCATTCCACCTCCTAGAATTCCACCCCCCTATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220835 42 + 636262 AGACTATGGCATTCCACCTCCTAGAATTCCACCCCCCTATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 211731 42 + 647215 AAGCTATGGCATTCCACCCCCCACCATTCCACCCCCTTATAC - -a -s mr.mrrefChr5 75256 18 + 294542 GCAGGTCTAAGTCACAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221045 18 + 636262 GCAGGTCTAAGTCACAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 211773 18 + 647215 TCAGATCTAAGTCACAGG - -a -s mr.mrrefChr5 75274 24 + 294542 CATGCATTACAGCCATCTTCTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221063 24 + 636262 CATGCATTACAGCCATCTTCTCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 211792 24 + 647215 TATGCATTACAGCCATCTCATCTA - -a -s mr.mrrefChr5 75298 74 + 294542 ACAGACGGTTATTGTGAGTATGTGCATCAATATGCCCTCCTTTCAATTATACCAAGCCAATGCGACTGTAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221087 74 + 636262 ACAGACGGTTATTGTGAGTATGTGCATCAATATGCCCTCCTTTCAATTATACCAAGCCAATGCGACTGTAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 211821 74 + 647215 ACAGATGGATGTTTTGAGTATGTGCAACAATATGCCCTCCCTTCAATTATGCCAGGCCAATGCAACCGTAGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 75372 138 + 294542 ACCCCTGGATCAGTCTTGCTTGCTCTCTTATTGCAGTGCAATGACCGTTAGTCTCTCAGTGTAAGACTTATCAAAGGGGTGAGTTCTCATATGTACTAACAGTACCCTGACATGTCATTAACTCCAATATTATTGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221163 138 + 636262 ACCCCTGGATCAGTCTTGCTTGCTCTCTTATTGCAGTGCAATGACCGTTAGTCTCTCAGTGTAAGACTTATCAAAGGGGTGAGTTCTCATATGTACTAACAGTACCCTGACATGTCATTAACTCCAATATTATTGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 211895 138 + 647215 ACCCCTAGATCAGTTATGCTTGTTCCTTTATTGCAGTGTAATCACTTTTAGTCTCCCGGTGTAAATCTTGTTAAAGGGGTGAGTTCTCATATGTACTAATAGTACCCTGTCAAGTTAGTAACTCCAATATTGTTGAAG - -a -s mr.mrrefChr5 75510 8 + 294542 AGTGGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221302 8 + 636262 AGTGGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 212033 8 + 647215 AGTGGGCT - -a -s mr.mrrefChr5 75518 10 + 294542 ATTGTGTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221328 10 + 636262 ATTGTGTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 212041 10 + 647215 ATTGTGTGGG - -a -s mr.mrrefChr5 75528 110 + 294542 ATTATAACCTCAGCATTAGACACATTGGTAGGTTGTTTGCAGCCCCCCAATATTCATCAACACACTATGCTTGGAGATTTGTGATCATCACTCAACAGACCTTATAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221338 110 + 636262 ATTATAACCTCAGCATTAGACACATTGGTAGGTTGTTTGCAGCCCCCCAATATTCATCAACACACTATGCTTGGAGATTTGTGATCATCACTCAACAGACCTTATAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 212076 110 + 647215 ATCATAACCTTGGCATTAGACACATCGATAGGATGTTTACAGCCCCCCACTATTCACCTACTCCCTATGCTTGGAGATTTGTGACCATCACTCAATTAGCCTTTTCATTT - -a -s mr.mrrefChr5 75638 62 + 294542 TCATTTAAGAATGGACTCCAAAGGCCCGGTTTTAGTTTAGCTCTCAAAGGAGCAGCACAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221455 62 + 636262 TCATTTAAGAATGGACTCCAAAGGCCCGGTTTTAGTTTAGCTCTCAAAGGAGCAGCACAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 212186 62 + 647215 TCATTTAAGAATGGACTCCAAAGGGCCGGTTTTAGTTTAGGTCTTAAAGGAGCAGCACAGCC - -a -s mr.mrrefChr5 75700 64 + 294542 CGAGGTAGAACACCATCGCCTCAGAAATTCCCCTGATCATATCCTCCATCTAGTAGAGGTACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221518 64 + 636262 CGAGGTAGAACACCATCGCCTCAGAAATTCCCCTGATCATATCCTCCATCTAGTAGAGGTACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 212248 64 + 647215 AGAGGTAGGACACCTTCACCACAGAAACTCCCCTGATCATAACCTCCATCTAGTAGAGGTATAT - -a -s mr.mrrefChr5 75764 193 + 294542 TAATCTTACCAACTCTTTTAGTAACAGAGATTTCAATAGATATACAGAAACTGGCTGGGAGGTTGGAATCAATTCAAAGCAACCTGATTGATCAATTGAGTGAAGACAAGGGCCAGTTAGTCCAGGAGTGAGCCCCATTCTTTTTACCACTGTATTTTAAAATGATACAATGGGTACGAGCGGACTGGTCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221583 193 + 636262 TAATCTTACCAACTCTTTTAGTAACAGAGATTTCAATAGATATACAGAAACTGGCTGGGAGGTTGGAATCAATTCAAAGCAACCTGATTGATCAATTGAGTGAAGACAAGGGCCAGTTAGTCCAGGAGTGAGCCCCATTCTTTTTACCACTGTATTTTAAAATGATACAATGGGTACGAGCGGACTGGTCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 212312 193 + 647215 TGATCTTACCAACTCTATTAGAAACCCACATTTCAATAGACCTACAGGAACTGGCTAGGTGATTGGAAACTATTCAAAGCAACCTGCTCGATTAATCGAGTGAAGACAAGGGCCATTCAGTGCAGGATGGAGCCCCATTCTTCTTACCACTGAATTTTAAAATGATACAATGGGCACAAGGGGATTGGTCTCT - -a -s mr.mrrefChr5 75957 129 + 294542 GGAGATATTTTTGCACAGGGGGGTTGGTCTCTGGAGATATTTTTACAGTATCTATGGAATTGATCAAGCACCCGACTGCTCCAGCATCAGCAATGTTTGCCAAAATGACCCGTGGAAGGTTGGAGCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221785 129 + 636262 GGAGATATTTTTGCACAGGGGGGTTGGTCTCTGGAGATATTTTTACAGTATCTATGGAATTGATCAAGCACCCGACTGCTCCAGCATCAGCAATGTTTGCCAAAATGACCCGTGGAAGGTTGGAGCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 212505 129 + 647215 GGAGATATCTTTGCACAAGGGGATTGGTCTCTGGAGATATTTTTACATATTCTGTGGAATTGATCAAGCACTTGACTGCTCCAGCAGTAGCAATGCTTGCTAAAACAACCCATGGAAGGTTGGATTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 76086 98 + 294542 CATTGTTCACAGAACCAGCACTTGACTGCCCCAACATTGACAATTTATGCTGAGTAATTTGTGCTTAGACTACCCATTGAAGGTTGGATTGGACATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221915 98 + 636262 CATTGTTCACAGAACCAGCACTTGACTGCCCCAACATTGACAATTTATGCTGAGTAATTTGTGCTTAGACTACCCATTGAAGGTTGGATTGGACATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 212634 98 + 647215 CATTGTTCACAGATCCAGCACTTGACTGCCCCAACATTGGCAGTTTATGCTGAGAAATTTGTGCCGAGACTACCCGTTGAAGGTTGGATTGAACATTG - -a -s mr.mrrefChr5 76184 190 + 294542 CCCAAAGAGTTCTGGCACTTTAACTTTTTAAATTTTGGGTTGGACGAAGAAAAGAAGGATTTTCCTATCAGCAGCTATGTGCTATGAAGTGATAGGAACTCACTTCTCATACTATCTGTGCTTCTAGCATGAAGTGATTTCAACCTAGCTCAATCATCACTTTTCTCCATTTAATACTGCTGAGAAAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222014 190 + 636262 CCCAAAGAGTTCTGGCACTTTAACTTTTTAAATTTTGGGTTGGACGAAGAAAAGAAGGATTTTCCCATCAGCAGCTATGTGCTATGAAGTGATAGGAACTCACTTCTCATACTATCTGTGCTTCTAACATGAAGTGATTTCAACCAAGCCCAATCATCACCTTTCCCCATTTAATACTGCTGCCAATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 212732 190 + 647215 CTCAAGGAGTTCTATCACTTTGACTTTTTAGATTTTGGGTTGGACAAGGGAAAGAAGGATTTTCCTATCAGCAGCTACGAGCTAGGAAGTGATAAGAACTCACTTCTCATGCTATTGGTGCTTTTGGCATGAAGTGATTTCAACCTAGCTCAATCATCACTTTTCTCCACTTAATACTGCTAAGAGAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 76374 31 + 294542 AAAGGTTGCAGACGGCACAAGCATGTTTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222206 31 + 636262 AAAGGTTGCAGACGGCACAAGCATGTGTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 212922 31 + 647215 AAAGGTTGCAGAGGCCACAAGCATGTTTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 76405 15 + 294542 TCCCCTAATATCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222237 15 + 636262 TCCCCTAATATCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 212957 15 + 647215 TCCTCTAATATCAGT - -a -s mr.mrrefChr5 76420 184 + 294542 TGTGAATTTCCTGGACAGGTTTGGGCCTACAGCCACTGGCTTTAGAATTATTGTGAATTCAATAGGATGAGGAGTAGTAATGACAGCAATATAATTTATATCAGTAACCCTGTAGCTTTATTAGCATATTCCAACTTAGATTGAAATCATTTTGATGGACAAAAGGTATATTTTGCCAGACCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222252 184 + 636262 TGTGAATTTCCTGGACAGGTTTGGGCTTACAGCCACTGGCTTTAGAATTACTGTGAATTCAATAGGATGAGGAGTAGTAATGACAGCAATATAATTTATCTCAGTAACCCTGTAGCTTTATTAGCATACTCCAACTTTGATTGAAATCATTTTGATGGACAAAAGGTATATTTTGCAAGACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 212982 184 + 647215 TGTGAATTCCCTGGACAGGTTTGGGCCTACAGCCACTGGCTTTAGAATTATTGTGGATTCAATAGGTTGGGGAATAGTAATGACAGCAATATAATATATATCAGTAACTCTGTAGCTCTATTAGCATCTTCAAACTTAGATTGAAATCATTTTGATGGACAAGAAGTATATTTTGCCAGACCAA - -a -s mr.mrrefChr5 76604 194 + 294542 GGGCCAACTTGATGATAGAATTAGGACAGTCTGAGTAGCAACCAGGAAGTAGAGTGTGTAGGGATCAGTGTCGTCAACCCCTTCAATTAGCCAGAATGGATGTGTCTTAGATTTTGAATTAATTAACTCCCTCAATAAACTTATACACAGTGGTGATGTAGGTGGTTGTCCAACTTGGGTTCTAAGGAGTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222437 170 + 636262 GGGCAAACTTGATGGTAGGATTAGGAGTGTCTGAGTAGCAACCAGGA-----AGTGTGCAGAGATCAGTGTCGTCAACCCCTTCTATTAGCCAGAATCGATGTGTCTTAGATTTTGAATTAATTAACTCCTTCGATAAACT-------------------GGTGGTTGTCCAACTTGGGTTCTAAGGAGTTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 213166 194 + 647215 GGGCCAACTTTCTGATAGAATTAGTCCAGACTGAAGAACAACTAGGAAGTAGAGTGTATGGGGATCAGTGTAGTAAACCCCTTCAATTAGTCAGAATGGATGCGTCTTAGTCTTCGAATTAATTAACTCCCTCAATGAACTTATACACAGTGGTGATGTAGATGGTTGTCCAATTTGGGAGTTAAGGAGTATCA - -a -s mr.mrrefChr5 76798 39 + 294542 TTTATGCCCATGTTGCTACTGGCATATAACAGTAAAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222607 39 + 636262 TTTATGCCCATCTTGCTACTGGCATATAACCGTAAAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 213361 39 + 647215 TTTATGGCCATGTTGCTACTGGCATATAGCAGTAAAAGC - -a -s mr.mrrefChr5 76837 157 + 294542 AAAGTCCAACAATGCCAGGGCATTCATGCAATCTAATTAATTGCTATATACTATTGCATCTACAAACAGTCCCTTACAATACATATCAAACTCATAAAATATTGCTCTCTTTGAAGCCAATTTGGACCTAGATGCCATCTATCGTTAAGCAATAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222648 157 + 636262 AAGGTCCAACAATGCCAGGGCATTCATGTAATCTAATTAATTGCTATATACTGTTGCATCCACAAACAGTCCCTTACAATACATATCAAACTCATAAAGTATTGCTCTCTCTGAAGCCAATTTGGACCTAGATGCCATCTATGGTTAAGCAATGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 213400 157 + 647215 AAAGTCCAACAATGCCAGGGCATTAATTCAATCTAATTAATTGCTATATACTATTGCATCTACAAACAGTCCCTTACAATACACATCAAATTCATAAAATATCGCTCTCTTTGAAGCCAATTTAGACCTAGATGCCATCTATCATTAAGCAATAATA - -a -s mr.mrrefChr5 76994 154 + 294542 TGTATCTCTAATACAATAGACCTTCTGCCTGGCTCAATAGAACCATGCCATCAGGTTTACCTATCCACACCAGAACGCACATAGACACACCCTCCTAGCATGATGTCATAAGAGTATGAAAGGTTTTGCACTGTATCGACCTCAGGAAACCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222805 154 + 636262 TGTATCTCTAATACAATAGACCTTCTGCCTGGCTCAATAGAACCATGCCATCAGGTTTACCTAACCATAACAGAACGCACATAGACACACCCTCCTAACATGATGTCATCAGAGTATGAAAGGTCTTGCACTGTATCGACCTCAGGAAACCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 213603 144 + 647215 TGTAGCTCTAATATGATAG-CCTTCCACCTGGATCAATAAAACCATGCCATGAGGCTTACCTATCCACACCAGAGTGCACATAGACATACCCTCCTAGCATGATGTCATAAGAGTATGAAAGGTTTTGCACT---------TCAGGAAACCACT - -a -s mr.mrrefChr5 77148 15 + 294542 CGAGACTCTGTAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222960 15 + 636262 CGGGACTCTTTAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 213747 15 + 647215 GGAGACTTTGCAGGT - -a -s mr.mrrefChr5 77163 164 + 294542 GGATATTACTGCCTTCCAGAATGACAATTAGTTATACAGTTGTGTCATCCATGCCATCCAAGTGTAAGCTCCAGAGTAAGGTAACTAGATGTGGTTGCATGTCCTACACTCTGATGCATGCTCGCGTATATTAGAATCTACCTCTGGTAAAGCTATGGCAGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222976 152 + 636262 GGATATTACTGCCTTCCAGAATGAGAATTAGTTATAC--TTG---------TGCCATCTGAGTGTAAGCTCCAGAGTGGGGTAACTAAATGTGGTTGCATGTCCTACACTCTGATGCATACTCACGTATATTAGAATCTACCTCTGGTAAAGCTA-GGCAGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 213762 164 + 647215 GGATATTACTTCCTTCTAGAATGACAATTTGCTATACAGTTGTGTCATCCATGTCATCCAAGTGAAAGCTCCAGAGTAAGACAAATAGACGTGGTTGCGTGTCCTACACTCTGATGCATGCTTGCATATACTAGAATCTACCTCTAGTAAAGCTATGGCAGCTA - -a -s mr.mrrefChr5 77327 165 + 294542 GTGAAGTAAGAACCCTGATTCCAACCATTTCTCATGACAAACCCCAGAACTATACAAACTAACTATTCCAACCGTTTCTAATAGCCAAACCTAGAATGATACACTCCTACAACAAGTAAGAAAGATAACACTATGCCAATGGTTTTAGATGACAAGTACTTCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223128 165 + 636262 GTGAAGTAAGAACCCTCATTCCAACCATTTCTCATGACAAACCCCAGAACTATACAAACCGACTATTCCAACCGTTTCTGATAGCCAAACTTAGAATGACACACCCCTACAACAAGTAAGAAAGATAACACAATGCCAATGGTTTTAGATAACAAGTACTTGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 213927 165 + 647215 GTGAAGTAGGAATCCTGATTCCAACCATTTCTCATGACAAGCCCCAGAATTATACAAACTAAGTATTCCAACCATTTCTAATAGTCAAGCCTAGAATGATATACTCCAACAACAAGTAAGAAACATAACACTATGCCAATGGTTTTAAATGACAAATACTTCTGG - -a -s mr.mrrefChr5 77492 206 + 294542 ACAACATGCCCCCAAATCAAACATAACCAGATGAGACGGGGAATAAAATAACTTGAGATTGTAGATGATAGCCTCATTTATCCATCATGAGGGTTCAATTGATGCTAGTACAGTGTACGGGACTAACGTAACCTCAGATGGCCAAGCATCCAAAAAGTATATTAATTGGCATGCAGTTCAATAGGGTAACAACATGTGCACATCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223296 205 + 636262 AAAACGTGCCCCCAAATCAAACATAATCAGATGAGGCGGGGAATAAAATAACTTGAGATTGTAGATGATAACCTCATTTATTCATCATGATGGTTC-ATTAATGCTAGCACAGTGTACGGGACTAACGTAACCTCAGATAGCCAAGCATCCAAAAAGTATATTAATTGGCATGCAGTTCAATAGGGTAACAACATGTGCACATCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 214092 206 + 647215 ACAACATGCCCCCAAATCAAACATAACCAGATGAGATGGGGAACGAAATAACTTGAGATCCTGGATGATAGCCTCATTTATCCGCCATGAGTGTTCAATTGATGCCAGTACAGTTTGCAGGACTAATATAACCTCAGATGGCCAAGCATCCAAAAAGTATATTAATTGGCATAGAGTTCAATAGGGTAACAACATGTGCACATCTC - -a -s mr.mrrefChr5 77698 149 + 294542 TGCTCAGGGCATGACAAGGAAATAATTGTTGCACTATGTGGCATTCATTGGTGCAAGGCATATTATGTTAAGGTGGCTTCCAAAAACTTAACACTCAGATAGGACTTGATTTCTAATTAGATTCAGTCCAGCTTAGTGTGGGAGTTCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223501 149 + 636262 TGCTCAGGGCATGACGAGGAAATAATTGTTGCACTATGTGGCATTCATTGGTGCGAGGCATATCATGTTAAGGTGGCTTCCAAAAACTTAACACGCAGATAGGACTTGATTTCTAATTAGATTCAGTCCAGCTTAACGTGGAAGTTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 214309 148 + 647215 TATTTGGAGCATGACAAGGAAATAATTGTTGCATTCTGTGGCATTCATTTGTGCAAGGCATATTATGTTAAGGTGGCTTCCAAAAAC-TAACACTCATATAGGACTTGATTTCTAATTTGATTTGGTCCAGCTCAGTGTGGGAGTTCTT - -a -s mr.mrrefChr5 77847 79 + 294542 GATTGATAGAGGCACAGGGACATGAAATGCTGTTCATTCAATTTAATCTACTGATTCAAGCATGTTTAGTCCAAGAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223657 79 + 636262 GATTGATAGAGGCACAGGGACATGAAATGCCATTCATTCAATTTAATCTACTGATTCAAGCATGTTTAGTCTGGGAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 214457 78 + 647215 GATTGACAGAGGCACAGGGACATGAAATGCTGTCCATTCAATCTGAG-TACTGATTCAAGCATGTTCAGTCCAAGGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 77926 202 + 294542 TTACAATAACCAATATAGATCTTTTTTTACTAACTATTCTAGTAAAAAGCATACTTACACATGTTGATGCTGCTTAACCATCTATATCCCCTGCACGCTTCAGCAGTCTAATACCCCTCCGAATTTCAATGTCCAAGGCACCTTGGGCTGACTGAATGAATTGTTAATCATCTAAATATTTATTGAACCTAATCCACTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223736 202 + 636262 TTACAATAACGAATATAGATCTTTTTTTACTAACTATTCTAGTGAAAAGCATACTTACACATGTTGGTGCTGCTTAACCATCTATATCCATTGCACGCTTCAGCAGTCTAATACCCCTCCGAATTTCAATGTCCAAGGCACCTCAGGCTGACTGAATGAGTTGTTAATCATCTAAATATTTATTGAACCTATTCCACTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 214544 198 + 647215 TTACAATACCCAATATAGATCTTTTTTGACTAACTATTCTAGTAAAAAGCATACTTACACATGGTGATACTGCATAACCATCTATGTCCCCTACATGCTCCATCAGTCTGAAACCCCTCCGAATTTCAATGTCCATGGCACCTTGGGCAGACTGAATGAATCATTAATCATCTCAATATTT----AACTTAATCCACTGTAC - -a -s mr.mrrefChr5 78128 77 + 294542 TTTTGAGCTTTAGCCATGTAAAGTTGGGTGTAGTGTCATTATAACACAGGGATACCAAGATGCATTTTGTCGTTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223953 77 + 636262 TTTTGAGCTTTAGCCATGTAAAGTTGGGTGTAGTGTCATTATAACACAGTGATACCAAGATGCATATTGCCGTTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 214742 77 + 647215 TTTTAAGCCTTAGCCATGTAAAGTTGGGTGTAGTGTCATTATAACGCAGGAACACCAAGGTGCATTTTGTTGTTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 78205 131 + 294542 GCATGATATCGGATGATCAAAATAAGGAGTAGTGCATGACAGACTACTAATCCTTAAGAGATGTTGTCTTATTGTTGTTTAGATTTCATCAAGTGCCTTTGAAAGATAATAACGGAAGAACCATGAAAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224033 131 + 636262 GCATGATGTGGGATGATCAAAATAAGGAGTAGTGCATGACAGACTACTAATCCTTAAGAGATGTTGTCTTATTGTTGTTTAGATTTCATCAAGTGCCTTTGAAAGGCAATAACGGTAGAGCAACGAAAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 214819 112 + 647215 GCATTATATCTGATGATC-AAATAAGGAGTAGTGC------------------TTGAGACATGTTGTCTTATCATTGTTTAGATTTTGCAAAGTGCTTTTGAAAGATAAACATGGAAGAACCATGAAAGAC - -a -s mr.mrrefChr5 78336 142 + 294542 ACCAGAGCACTTGGGGTAAATTAAGACAAGAATATGTGAACAATACAACTCACTATCTAGCTGGACCCCCCTATGGCCTGTGGCTTTTGTTAGTTTAGCTAGCAAAGATCTATACAAAGACAGCAATCACTAAACATATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224164 142 + 636262 ACCAGAGCACTTGGGGTAAATTAAGACAAGAATATGTGAACAATACAACTCGCTGTCTACCTGGACCCCCCTATGGCCTGTGGCTTTTGTTAGTTTAGCTAGCAAAGATCTATACAAAGACAGCAATCACTAAACTTATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 214958 142 + 647215 AACAGAGCACTTGGAGTAAATGAGAACAAGAACATGTGAACAATACAACTCACTATCTCGCTGGACCCCCCTATGCCCTGTGGCTTTTGTTAATTTAGCCAGCAGTGATCTATACAAAGATGGCAAACACTAAACATATGTT - -a -s mr.mrrefChr5 78478 48 + 294542 GGGAACCAGTTAGGATAAGCATAAGCTTTCTAGTTGATAATCTGCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224307 43 + 636262 GGGAACCAGTTAGGA-----ATGAGCTTTCTAATTGATAATCTGCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 215100 48 + 647215 GGGAACCAGTTAGGATAAGCTTAAGCTTTCTAGATTTTAATCTGCCGT - -a -s mr.mrrefChr5 78526 28 + 294542 TTTGCAGGGCAACTGTGAGTATCCTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224351 28 + 636262 TTTGCAGGGCAACTGTGAGTATCCTCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 215148 28 + 647215 TTTGCAGGGCAACTGTGAGTATCCTCTA - -a -s mr.mrrefChr5 78554 189 + 294542 CCAATCCTTGTTCTAAGTTTTATTCAAACATTGTCTTCTTGGAGAgcagggtgtgcaactgcgtgaggactcacactggcagggtaacagaatatgtactttggacaagtgctgcaactggacctacccccctcaaactattcagtactctgtgtgatgtttttgagaaattaatgtgctcaacaaaca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224379 189 + 636262 CCAATCCTTGTTCTAAGTTTTATCCAAGCATTGTCTTCTTGGAgagcagggtgtgcaactgcgtgaggactcacactggcagggtaacagaatatgtactttggacaagtgctgcaactggacctacccccctcaaactattcagtactctgtgtgatgtttttgagaaattaatgtgctcaacaaaca -s simRat_chr6.simRat.chr6 215182 189 + 647215 CCAATCCTTGTTCTAAGTTTTGTTCAAACATTGCCTTCTTGGAACGCAGGGTGTGCAACTGAGTGAGGAGCCACGCTGGCAGCATAACAGGATGCGTACGTTGAACAAGGGCTGCAAGAGGGTCTATccccctcaagctattcagtaatctgtgtgatgtttctatgaaatcaatgtgcccaactcaca - -a -s mr.mrrefChr5 78743 147 + 294542 acagaagaataaccaacaaatgattcaaagaatgactggatccccttctatggttgacctggtgtgcagtaggctcttaggaacacagtttgcacaatacaggtacctacataataggatttgcagccctgccttgaaactaataag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224568 147 + 636262 acagaagaataaccaacaaatgattcaaagaatgactggatccccttctatggttgacctggtgtgcagtaggctcttaggaacacagtttgcacaatacaggtacctacataataggatttgcagccctgccttgaaactaataag -s simRat_chr6.simRat.chr6 215380 147 + 647215 acaacagagtaaccaacaaatgattcaaagaatagatggatcaccttctatggttcacctagagggaagttagttcttaggaacacagcttgcacaatacagggaccaacatactaagatttgcaaccctctcttgagattaataag - -a -s mr.mrrefChr5 78890 38 + 294542 acacaagctaatatgcagatttagcaggaccaccaaca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224715 38 + 636262 acacaagctaatatgcagatttagcaggaccaccaaca -s simRat_chr6.simRat.chr6 215669 38 + 647215 acacaagctaatatgcagatttagcacgaccaccaaca - -a -s mr.mrrefChr5 78928 10 + 294542 acaccaatgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224753 10 + 636262 acaccaatgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 215709 10 + 647215 acactgatgg - -a -s mr.mrrefChr5 78938 100 + 294542 cgtaaaaaaaccactgtcaaattagcctggaatcaaaaaagagaacctatggcaaacttagttctaggtaaaaaaaattgagctggttggatcatgttgc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224763 100 + 636262 cgtaaaaaaaccactgtcaaattagcctggaatcaaaaaagagaacctatggcaaacttagttctaggtaaaaaaaattgagctggttggatcatgttgc -s simRat_chr6.simRat.chr6 215722 100 + 647215 tgcaaaaaagccactgtcaaatcagcctggaaacaaaaaagagaacccatggcaaaattaattctatgtaaaagaaattgagctggtgggaccatgttgc - -a -s mr.mrrefChr5 79038 15 + 294542 AGattacaatcaatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224863 15 + 636262 AGattacaatcaatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 215828 15 + 647215 ACATTACAATCAATG - -a -s mr.mrrefChr5 79053 77 + 294542 ttcatataggtaggggccaaggattcactagttgatagtggtgttggaggaactggttgtctatcttccaagagcta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224879 77 + 636262 ttcatataggtaggggccaaggattcactagttgatagtggtgttggaggaactggttgtctatcttccaagagcta -s simRat_chr6.simRat.chr6 215843 77 + 647215 TTCGTATAGGTGGgggccaagaattcactatttgatagcagtgttggaggaactggttgtctatctagcaagaggta - -a -s mr.mrrefChr5 79130 23 + 294542 ttcttagtgccttatacaggttt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224956 23 + 636262 ttcttagtgccttatacaggttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 215932 23 + 647215 ttcttaatgctttatacaggttt - -a -s mr.mrrefChr5 79153 112 + 294542 agaaaagggtctaaatgttagtggatgatcccagaaacactgtccaagatattggcatgggacaacatctatttagataccaaagtcaactgctgtgaattgcaaaatcgat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224979 112 + 636262 agaaaagggtctaaatgttagtggatgatcccagaaacactgtccaagatattggcatgggacaacatctatttagataccaaagtcaactgctgtgaattgcaaaatcgat -s simRat_chr6.simRat.chr6 215970 112 + 647215 AAAGAGAAGACTAAACCTTCGCGGATGATCtcagaaacaccatctgggatattggcatagaagaacatctgtttagtcaccaaagtcaactgcagctaaactcaaaatcgat - -a -s mr.mrrefChr5 79265 21 + 294542 gagcacaagtgagatatggac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225091 21 + 636262 gagcacaagtgagatatggac -s simRat_chr6.simRat.chr6 216089 21 + 647215 gagcacaactgagacataaac - -a -s mr.mrrefChr5 79286 24 + 294542 aagagcctgcatggattgaaagaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225118 24 + 636262 aagagcctgcatggattgaaagaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 216110 24 + 647215 aaaagcctgagtggattgatagaa - -a -s mr.mrrefChr5 79310 9 + 294542 tggttacaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225152 9 + 636262 tggttacaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 216134 9 + 647215 TGGTTAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 79319 116 + 294542 atttgaacttggcatgagatctttccaacttattcctctcacacagttacacaaaaggaaaaccaataacaggattaaatgataggttagggacatgaacaggtgctaactggcaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225172 116 + 636262 atttgaacttggcatgagatctttccaacttattcctctcacacagttacacaaaaggaaaaccaataacaggattaaatgataggttagggacatgaacaggtgctaactggcaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 216143 116 + 647215 ATTTAAATTTGGAATGAGAGCTTTGCAACTTATTCCTctcacacaattacccaagaagaagaccaataacatgaacaaatgatgggctcgggacatgaacaggcactaactggcaa - -a -s mr.mrrefChr5 79435 12 + 294542 ttgcagtgaaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225297 12 + 636262 ttgcagtgaaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 216259 12 + 647215 ttgtggcgaaaa - -a -s mr.mrrefChr5 79447 96 + 294542 agcaccagaggaaatgtaattttccttgaacagtttgtcacaggtctattgcatggggagtcatggtagaacaatgccactatgatgcACTACAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225309 96 + 636262 agcaccagaggaaatgtaattttccttgaacagtttgtcacaggtctattgcatggggagtcatggtagaacaatgccactatgatgcACTACAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 216276 96 + 647215 agcaccagaggaaatgtaatttttcttgaACAGTTCGTCACAGATCTATTGCATGGGGCGTCATGGTAGAACAATGCCACTATGATGCACTATAAT - -a -s mr.mrrefChr5 79543 15 + 294542 ATAAAGTAGACGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225405 15 + 636262 ATAAAGTAGACGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 216374 15 + 647215 GTAAAGTAGGCGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 79558 49 + 294542 GGGTGCACTCCAGGAAGGCGTTTTCCTGGTCCCAAAGCCACAAACAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225424 49 + 636262 GGGTGCACTCCAGGAAGGCGTTTTCCTGGTCCCAAAGCCACAAACAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 216389 49 + 647215 GGGCGTGCTGCAGGAAGGCCTTTTCCTGGTCCCGAGGCCACAAATAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 79607 90 + 294542 TTTTATGCAACAATACTGGACAACACTATTTTGAGACATAATAGAACGGGTGAACACACTAGGCTGTATATGCAGGAAGCCAACAGTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225473 90 + 636262 TTTTATGCAACAATACTGGACAACACTATTTTGAGACATAATAGAACGGGTGAACACACTAGGCTGTATATGCAGGAAGCCAACAGTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 216439 90 + 647215 TTTTATGCGACAATACTGGATAAGACTATTTTGAGACATAATAGAAGGGGTGAACAAATCAGGCTGTATTTGCGCAAAGCCAACAAACCA - -a -s mr.mrrefChr5 79697 59 + 294542 GCAGTACTTCCTAGGCTGCCAACCAACCGATGCCTGTTAGAAATCCGACTAGTCCCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225564 59 + 636262 GCAGTACTTCCTAGGCTGCCAACCAACCGATGCCTGTTAGAAATCCGACTAGTCCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 216529 59 + 647215 GTGGTACTTTCTAGGCTGCCAACTAACCAATGCCTGTGAGAAATCCAACTAGTCCCAGT - -a -s mr.mrrefChr5 79756 118 + 294542 GCTCAGGGAGGTAGGTGAGTATCTTCGCTCATAGTTGTGCTCAGCATGATGATGTAGGACTATAGTAAATAAGAAATCACATAAACCTTTTCATAATTCTAGTACATGAGAAGACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225624 118 + 636262 GCTCAGGGAGGTAGGTGAGTATCTTCGCTCATAGTTGTGCTCAGCATGATGATGTAGGACTATAGTAAATAAGAAATCACATAAACCTTTTCATAATTCTAGTACATGAGAAGACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 216588 118 + 647215 GCTCAGGGAGGCAGGCAAGAATTTTGGCTAATAGTTGTGCTCGGTATGATGATGCAGGACTATAGTAAATAAGATATCACATAAACCTTGCCATAATTCTAGTACATGAGAAGACACA - -a -s mr.mrrefChr5 79874 11 + 294542 AAGAGTGGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225748 11 + 636262 AAGAGTGGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 216706 11 + 647215 AAGAGTGTGAG - -a -s mr.mrrefChr5 79885 161 + 294542 ATGGAGCCCCAAAGAATGTTGGTTACAAATATCGTGCGATGGATGGCATCCCATTTGTTTTATCGGGTAATGTGTGTTGGTCCCATCAACAGGTGCCTGTGGTCACCTAACATTGTATGAGGCCAGCATGCTCTTTCTACAGGTGTCTCAGATTACTTGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225763 161 + 636262 ATGGAGCCCCAAAGAATGTTGGTTACAAATATCGTGCGATGGATGGCATCCCATTTGTTTTATCGGGTAATGTGTGTTGGTCCCATCAACAGGTGCCTGTGGTCACCTAACATTGTATGAGGCCAGCATGCTCTTTCTACAGGTGTCTCAGATTACTTGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 216717 161 + 647215 ATGGAGCCCCAAAAAATATTCGTTACAAGTGTCAAGTGATGGATAGCATACCACTTGTTTTATGGGGTAATGTGTTTTGGGCCTACCAACAGGTGACTGTGGTTGCCTGCCAGTGTGTGAGGCCAGCTTGCTCTTTCTACAGGTGTCTCCAATTGCTTGAC - -a -s mr.mrrefChr5 80046 52 + 294542 GGCATGGGAGGTCAGGCAAGCTCAGCAACTAATTGAGCACATAACACGTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225925 45 + 636262 GGCATGGGAGGTCAGGCAAGCTCAGCAACTAATTGAGCACAT-------TTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 216878 52 + 647215 AGTAAAAGGTGTCAGGCAAGCTCAGCAGCCAAATGAGCACATAACACGTTTG - -a -s mr.mrrefChr5 80098 238 + 294542 TATTAATGGAGCTTTCCACAAGGTGCTGTTTTAATTCTCAACATTGTTAAGCAAGTGATCCTGAGTGATACAGAATGGTCTCTATTATGGTTTTATCCTTGAGGAACCTGTTCCTGGATAAAACATTGATCCTGATCTTAAGTGCAAGCTCTGTTACGAGTTGCTAGAGTTGGGTAGCTAAGGAATCACCTCAATTTGGATTGGTTGGGAAAACGTCTTGGTTATGAAGATTGGTCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225970 238 + 636262 TATTATTGGAGATTTCCACAAGGTGCTGTTTGAAATCTCAACATTGTTAAGTGAGTGATCCTTAGTGATACAGAATGGGCTCAATTATGGTTTTATCCTTGAGGAACCTGTTCCTGGATAAAACATTGATCCTGATCTTAAGTGCAAGCTCTCTTACGAGTTGCTAGAGTTGGGTAGTTAAGGAATCACCTCAATTTGGATTGGTTGGGAAAATGTCTTGGTTATGAAGATGGGTCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 216932 238 + 647215 TTTTAATGGAGCTTTGCACAGGGTGCCGTTTTAATTCCCAACATTGTTACGCAATTGATCCTGCATGACACAGAAAGGTTTCTAATACGATTTTATTCTTGAGAAACCTGTTCCTGGATAGCACAGTGATCCGGATCTTGAGTACATGCTCTGTTTCAAGTTGCTAGAGTTGGATAGCTAAGGAATCACCTCAATTCGGATTGGTTGAGGAAACATCTTGGTTATGAAGCTTGGTCCC - -a -s mr.mrrefChr5 80336 90 + 294542 GCAGCATGTATGTATGAATTGTAGAAAACCATTAACAAATAAATGATCATAACTTTCTCAAGAATTTGCATAGTGCTAATTAGTGTAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 226209 84 + 636262 GCACCATGTATGTATGAATTGTAG-ATACCATTAACAAA-----AATCATGGCTTTCTCAAGAATTTGCATAGTGCCAATTAGTGTAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 217170 90 + 647215 TCAGTGCGGATGTATGAATTGTAGAAAACCATTAACAAGTAAATGATCATAACTTTCTCTAGATTTTGCATAGTGCTAATTAGTGCAGGT - -a -s mr.mrrefChr5 80426 73 + 294542 TAACTCAAGATATGACACATCTTTTTATTCATTTACTGTCAAAAAGTTGAGTTACTGCGGTCACACCTTTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 226293 73 + 636262 TAACCCAAGATATGACACGTCTTCTTATTCACTTACTGTCAAAAAGTTGAGTTACTGCGGTTACACCTTTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 217262 68 + 647215 TAACTCAGTATATGACACATCTTTCTATTCGTTTACC-----AAAGTTGAGCTACTGTGGTCACACCTTTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 80499 242 + 294542 TGTTTAACCCACAAATAGCTAAAGGAGACAAACATTTGCTACTTGCAAACAACAATTAGACAAATATGCTGGGAACCCAAAGAGGTAGGCCAAAAGGAGATAGAGCTGAGAAGTGGCTATCAGGAGCATCATTAAAACAGGATCTTGGTTGCAGGTCACTTACTTGCACTAAAGAACAGTGTGCATAATTTGCGCGTGCCTGTAGAGCTAAATTCCAATGTGTAGTATCAAATATGAAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 226366 170 + 636262 TGTCTAACCCACAAATAGCTGAAGGAGACAAACATTTGCTACTTGCAAACAACAATTAGACAAATATGCTGGGAACCCA-----GTAGGCCAAAAGGAGATAGATCTGAGAAGTGACTATCAGGAGCG-------------------------------------------------------------------GTGCCTGTAGAGCTAAATTCCAATTTGTAGTACCAAACATGAAGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 217333 242 + 647215 CATTTAATCCACAAATAGCTAAAGGAAACAAACATTTGCTACTTGCAAACAAGAGTTAGACAAATATGTTGGAAACCCAAAGAGGTAGGCTAAAAGGAGATAGAGCTGAGAAGTGGCTATCAGGGGCATCATTAAAACAGGATCTTGGTTGCAGGTCACTTACTTGCACTAAAGAACAGTGTGCATAATTTGCGCGTGCCTGTAGATCTAAATTACGATGTGTAGTATCAAATATGAAGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 80741 524 + 294542 TGTCAGCAATAGGAACTGAAAATACAAGAATTTTATTGGTTGCATTCATCACCATTAATCCTGTACTCATTATCAATGAGGCTTTAAGAGAAAATAATAGAGTGAAGCATGATATTACACTTGGGAGGAGTGACACTCTGTTGAAGATAGAGATAGATAGTTCTAATCTTGCAGCATTCTGTAATAGGCACATAGTATCCAGTACCCATCCCAACCATTGGGCCAATACACCCCAAAAACTGACAGAAGCTTGAAATTAGCAAGACCTACTGGACAAAGCTCCACTGGGGGGGCATAAGGTGGAGTGCGGTGCATCTTCAACCTGCTTGTTTTACAGTGTATTCACCAACATTTAGATGTGCTGAATATAGCCTACAGAGATTAATTTTAAGCTATACCATGGAGTAGCCAACTCTATTTTAGATGCCAAATTATAAATTAAGACTAACACTTGGTGGCCTGGAAGTGAACACAGGACGCTTTTAATGGTTCGCAAATATTATGGCCATCTTGTGCTTGTCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 226536 508 + 636262 TGTTCACAATAGGAACTGAAAATACAAGAATCTTATTGGTTGCATTCATTACCATTAATCCTGTACTCATTATCAATGAGGCTTTAAGGGAAAATAATAGAGTGAAGCATGATATTACACTTGGGAGGAGTGACACTCTGTTGAAGATAGAGATAGATAGTTCTAATCTTGCAGCATTCTGTAATAGGCACATAGTATCCATTACCCATCCCAACCTATGGGCCAATACACGGCAAAAACTGAAAGAAGCTTGAAGTTAGCAAGACCTACTGGACAAAGCTCCACTGAGGGGGCATAAGGTGGAGTGCGGTGCATCTACAACCTGCTTGTTTTACAGTGTA-----------TCAGATGTACTGAATATAGCCTACAGAGATTAATTTTAAGCTATACCATGGAGTACCCAACTCTATTTTAGATGCCAAATTAT--ATTAAGACTAACACTTGGTGGCCTGGAAGTGAACACAGGACGCTTGTAATAGTTCG---ATATTATGGCCATCTTGTGCTTGTCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 217582 524 + 647215 TGTCAGCAATAGGAACTGAAAATACAAGAATTTTATTGGTGGTATTGATCACCATTAATCCTGTACTCATTATCATTGAGGTTTTAAGAGAGGAGTATTAAGTGAAGCATGATATTTCACTTGGGCTGAGTGACACTCTGCTGAAGATAGAGATTGATAATTCGAATCTTGGAGCATTCTGTAATAGGCATGTAGTCTCCAGTTCCCATCCCAACCATCGGACCCATACACCCCAAAAACTGGCAGAAGCTTGAAATTAGCAAGACCTACTGGACAAAGCTCCACTGGGGGGATAGAAGGTGGAGTGTGGTGCATCTTAGACCTGCTCGTTTTACAGTATATTCACCAACATTTAGATGTGCTGAACATAGCCCACAGAGATTAATTTTAAGCTATGCCATGGAGTAGCCACCTCTATTTTAGATGCCAAATTATAAATTATGACTATTGTTTGGTAGCCTGGAATAGAACACAGGAGGCCTTTAGTGATTAGCAAACATTATGCACATCTTGTGCCAGTCACC - -a -s mr.mrrefChr5 81265 258 + 294542 AAAGTACCCGCATTTATACCTATGATCTAGTGTATATGTCATTGGAATCCTAAAAGAACACCACAGGAGTCAGTATATGTTGGTTAGAACAGATAGTAGTAATTAAATCAGTGACTGTCCTGCATAACCAATGCATCTCAATTCATAGTTTAAGGCAACAGTAGGTTAGTATCTTCACCTACACTGAAGAGAAAACAGACATGTACATGCACATGGCCCTGTCTAAGGTTCATGTCTCTATGGAGTAAGGAGAGACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227046 258 + 636262 AAAGTACCCACATTTATACCTATGATCTAGTGTATATGTCATTGGAATCCTAAAAGAACGCCACAAGAATCAGTATGTGTTGGTTAGAACAGATAGTAGTAATTGAATCAGTGACTGTCCTGCATAACCAATGCATCTCAATTCATATTTTAAGGCAACAGTAGGTTAGTATCTTTACCTACACTGAAGAGAAAACAGACATGTACATGCATATGGCCCTTTCTAAGATTCATGTCTCTATGTAGTAAGGATAGACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 218106 258 + 647215 AAAGGACCCGCATTTATACCTATGATCTAGTGTATATGTCACTGTAATCCTAAAAGAACACCACAGGAGTCAGTATATGTTGGTTAGAACAGATAGTAGTAATTAAATGAGTGATCATCCAGCATAACCAATGCATCTCAATTTATAGTCTAAGGTAATAGTAGGTTAGTATCGCCACCTACACTGAAGAGAAAACAGACATGTACATGCACATGGCCCTGTCTAAGGTTCATGTCTTTATGGAGTAAGGAGAGTCCT - -a -s mr.mrrefChr5 81523 51 + 294542 TGAAGTAGCAGAACAAGTCTGACTCTTTTGCTGTTCTATTGTGCATCTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227304 51 + 636262 TGAAGTAGCAGAACAAGTCTGACTCTTTTGCTGTTCTATTGTGCATCTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 218365 51 + 647215 TGAAGTATCAGAACAAGTCTGGCTCTTTTGCTGTTTCGTTGTGCATGCAAT - -a -s mr.mrrefChr5 81574 12 + 294542 TTAAATAGTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227385 12 + 636262 TTAAATAGTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 218416 12 + 647215 TAAACCAGTATT - -a -s mr.mrrefChr5 81586 16 + 294542 GGGCTGGGAGAAGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227398 16 + 636262 GGGCTGGGAGAAGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 218428 16 + 647215 GGGCTGGGAAAAGGCT - -a -s mr.mrrefChr5 81602 52 + 294542 GGTCAGCTAAAAAAGCGAACCAAGTAAGGGGGACCATTTACAGGGGTTGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227414 52 + 636262 GGTCAGCTAAAAAAGCGAACCAAGTAAGGGGGACCATTTACAGGGGTTGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 218451 52 + 647215 GGTCAGCTAAAAAAACCAACCAAGTAAGTGAGAGTATTTACGGGGATTGATG - -a -s mr.mrrefChr5 81654 18 + 294542 ACTATTGATATCATGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227466 18 + 636262 ACTATTGATATCATGGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 218505 18 + 647215 ACCATTGAGATTATGGAC - -a -s mr.mrrefChr5 81672 11 + 294542 TGGTGTCTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227507 11 + 636262 TGGTGTCTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 218523 11 + 647215 TGGTGTCTGAG - -a -s mr.mrrefChr5 81683 22 + 294542 AGGCAGGATTAGAAATTATCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227524 22 + 636262 AGGCAGGATTAGAAATTATCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 218534 22 + 647215 AGGCAGTATTAGCGAATATCCT - -a -s mr.mrrefChr5 81705 37 + 294542 TCACAATTGAGATCATGATGTCACTTTTGAATCCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227546 37 + 636262 TCACAATTGAGATCATGATGTCACTTTTGAATCCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 218561 37 + 647215 CCACCATTTACGTCATGGTGTAGCTTTTGAATCCTAA - -a -s mr.mrrefChr5 81742 57 + 294542 ATCCAGATGTCACCCTGTTAGTGAATATGGTATTACAATATGGTATTATGTAAGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227589 44 + 636262 ATCCAGATGCCACCCTGTTAGT-------------CAATATGGTATTATGTAAGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 218598 57 + 647215 ATCCAGATGTCACCCTGTTAGTGAATATGGTATTATAATATGGTATTATGTAAGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 81799 112 + 294542 GAGTCCCTGTTCAATCCCTCACACTCATTCTACCATGAGTGAAAGTATATACTATTGTAGCAACATGTGTAAACATTGGGGCACTATTGAGAGTATGGCAATGTCCATACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227633 112 + 636262 GAGTACTTGCTCAATCCCTCACACTCATTCTACCATGTGTGAAAGTATATACTATTGTAGCAACATGTGTAAACATTGGGGCACTATTGAGAGTATGGCAATGTCCATACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 218673 111 + 647215 GAGTCCCTGTTCAATCCCTCACACTCGTCCTACCATGAGCGAAAGTATATACTATTGTGGCAAAATGTATAAACATTGAGGCGC-ATTGTGAGTATGGCAATGTCCATACAG - -a -s mr.mrrefChr5 81911 177 + 294542 GTCATTATTTAGGGTCGCTTCAGGTTCAAAAATACATGGGGCTGAACATTGAAATTATAGTTCCATTATGGAGGGTCCATATGTTAATAATCCCCATACAGAAAATTAGAAATAATATTAGAAATGTCAAACTATGCTTATATACATTGCATGTGCTGTGTGGATAGATATTCCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227765 177 + 636262 GTCATTATTTAGGGTGGCTTCAGGTTCAGAAATACATGGGGCTGAACATTGAAATTATCGTTCCATTATGGAGGGTTCATATGTTAATAATCACCATACAGAAAATTAGAAATAATATTAGAAATGACAAACGGTGCCTATATATACTGCATGTGCTGTGTGGATAGATACTCCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 218784 177 + 647215 GTCACTATTGAGGGGCGCTTCAGGTTCAAAAATACATGGGGCTGTACATTGAAACTATAGTTTCATTGTGGAGGGTCCATATGTAGATAATCCCCATACAGAATATCATAGATGATATTAGCAATGTCAAATTATGCTGATGTACATTGCATATGATGTGTGGTTAGATCTTCCAGC - -a -s mr.mrrefChr5 82088 59 + 294542 CTTTATAATATTCTGTCTGTAGTGGAGTTATCAACATGTCAAGCATCTTCCTGGTGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227953 59 + 636262 CTTTATAATATTCTTTCTGTAGTGGAGTTATCAACACGTCAAGCATCTTCCTGGTGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 218961 57 + 647215 CCTTATAATATTCTGTCTGTAGTCGAGTTAT--ACATGTCAAGCATTTTCATGGTGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 82147 329 + 294542 TAGAGTAGCTTAGGTCTTGGTCATTTTGTGGGTCAATATGCTCTAGAGTGTATATGGATCCAATTTAGCTGGGTCCTAATTTGTGGGCAAGACAGCTGTTTTAACAGTCCTACTTACCGATGGCTATCTTTAGCAATGAGGTCATATTGAGTGTAGTCATAGCTCATGCTATTAGTTGTTGGCGATCACCTTAGACCCCATTGATCTAAACACAGTCAACCCCTACTAGGTTTCGTACTTTTTGAGAGTAGACCTTATGAGAGCAGAGGTAAGAATGACTATAACCAAGGGCCCTTATTTTTCCAGGAGGGAGTAGTATAACATAGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228012 325 + 636262 TAGAGTAGCTTAGGTCTTGGTCATTTTGCGGGTCAATATGCTCTAGAGTGTATATGGATCCAATTTAGCTGGGTCCTAATTTGT-GACAAGACAGCTGTTTTAACAGTCCTACTTACTGATGGCTATCTTTAGCAATGAGGTCATATTGAGTGTAGTCATAGCTCATGCTATTAGTTGTTCGTGATCATCTTAGAGCCCACTGATC-AAACACAATCAACCCCTACTAGGTTTCGTACTTTTTGAGAGTAGACCTTATGAGAGCTGAGGTAAGA--GACTATAACCAAGGGCCATTATTTTTCCAGGAGGGAGTAGCATAACATAGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 219058 329 + 647215 TAGAGTAGCTTAGGTCTTGGTTGTTTTGTGGGTCAATATGCTCTAGAGTGTATATGGATCCAACTTAGCTGGGTCCTAATGTGTGGGCAAGACAGCCGTTTTAAAAGTCCAACTTACCGAGGCTTATCTTTAGCAATGAGGCCATATTGCGTGTAGTCACGGCTCATGCTATCAGTTGTTGGCGACCACCTTAGACCCCATTGATCTAAACATGGTCAACCCGTACTAGGTTTCGTACTTTATGAGAGTAGACTTTATGGGAGCAGAAGCAACAATGATTCTGACCAAGGGCCCTTACTTTCCCAGGAGGGAGTAGTGTAACATAACTC - -a -s mr.mrrefChr5 82476 34 + 294542 AAAACCCAAGCTTAATCCAAGTCCCCAGGCTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228337 31 + 636262 AAAACACAAGCTTAATCTAAG---TCAGGCTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 219388 34 + 647215 AAAACCCAAACTTAACCCAAGTCCCAAGTCTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 82510 135 + 294542 CTCTGTTTGACAACATGCTATGCAGTCACACTGTTCAGCTGCTGCTATTTTCTGATTCAATACTCTTCTGAGTGTTTGTTTCATAAGCGCCACATTCTGCACACCACACAATCGAATAATAATTTACTTGCTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228368 131 + 636262 CTCTGTTTGACAACATGCTATGCAGGCACATTGTTCAGCTGCTGCTATTTTCTGATACAATATTGTTCTGAGTGCTAGTTTTAT----GCTACATTCTGCACACCACACAATCGAATCATAATATACTTGCTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 219426 135 + 647215 CTCTGTTTGACAACATGCTATGCAGTCACACTGTTCAGCTGCTGATATTTTCTGGTTCAAAACTCTTCTGAGTATTTGTTTCATAAGCGCCACATTCTGCACATCACACAATTGAATAATAATTGACTTGAACTC - -a -s mr.mrrefChr5 82645 94 + 294542 TGGAGCCGTCTTGATCCTCTGTGCCATATTTGTTTTAAACACTTCTGGTTTGGTCCAGTGTGGGATCTAGCCAACTAATTGTTGACTACATGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228499 94 + 636262 TGGAGCCGGCTTGATCCTCTGTGCTAAATTTGTTTTAAACACTTCTGGTTAGGTCCAGTGTGGGATCTAGCCAACTAATTGTTGACTACATGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 219782 94 + 647215 TGGAGACGTCTTCATCCTCTGTGCCATATTTGTTTTAAACACTTCCGGTTTGGTCTAGTATGGGATCTAGCCAGCTAATCATTGACTACATGGA - -a -s mr.mrrefChr5 82739 27 + 294542 CTTCCTATAACATAAACCACTGTCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228600 27 + 636262 CTTCCCATAACATAAACCACTGTCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 219876 27 + 647215 CTTCCTATAACATAAACCACAATCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 82766 529 + 294542 TCTCAACTTCACAGAAGACTTAGACAGGATATTCATCCTGGGCTTCTAATTTCCCCTAGACAGTTGTCTAGACAGTATTGGGTGAAACATATTGATGGATGTATGGTCTTAGGAATATACAATACGTTCATGTCCTCTTGTGACAGCACTGATAATATGTAGGACATATAAGAAAGAGATGATCATCACTGTACTTTTACTTGCACTTTCTTACTGTAGGACATGTAAGAAAGAGTTGATCAACATTGTACTTTTACTTGCACTTTCTTATAATAGGTCCAACCAACTGGACTCAACTGAATCTTGCATTTAGAAGTAAATGTTATAACACTGTATTACCATGATTCCGTTTCAACCCATGGAAGTTCCCATGGAGGTTCCAGTACCATTGCCCTCACACTAAATTGGCTTGGTAACATTTTATCACAAAAATTTAGGTAAAAGCAAGTCACTCGAAATGGCTAATGTGGATGAAGTTCCAGTACCATTGCCCTCACATTAAAATGACTTTGTAACATTTTACCGCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228627 458 + 636262 TCTCAACTTCATGGAAGATTTAGACAGGATATTCATATTGG--------------CTAGACTGTTGTCTAGACAGTCTTGGGTGAAACATATTGATGGATGTATGGTCTTAGGAATCTACAATACGTTCATGTCCTATTGTGACAGCAGTGATAATATGTAGGACATGTAAGAAAGAGATAATCATCA---------------------------------------------------------TTGTACTTTTACTTGCGCTTTCTTATAATAGGTCCAACCAACTGGACTCAACTGAATCTTGCCTTCAGAAAAAAATGTTATAACATGGTATTACCATGATTCCGTTTCAACCCATGGAAGATCCCATGGAGGTTCCAGTAACATTGCCCTCACGCTGAATTGGCTTGGTAACATTTTATCACAAAAATTTAGGTAAAAGCAAGTCACTCGAAATGGCTAATATGGATGAAATTCCAGAACCATTGCCCTCACATTAAAATGATTTTGTAACATTTTACTGCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 219908 518 + 647215 TCTCACCTTCACAGAAAACTTGGACAGGATACGCATCCTGGGCTTCTAATTTCCCCTAGACAGTTGTCTAGACAGTAATGGGTGAAACAAATTTGCAGATATATGGTATTAGGAATACACAATAGGTTCATGTCCTCTTGTGACAGCACTGATAATATGTAGGACATATAAGAAAGAGATGATCATCACTGTACTTTTACTTGCACTTTCTTACTGTAGGACATGTAAGAAAGAGTTGATCAACACTGTACTTTTACTTGCACTTTCTTATAATAGGTCCAACCAACTGG---CAACTGCATTTTGCATTTAGAAGTAAATGTTTTAACACTGTACTATCATGATTCC-TTTCAACCCATGGAAGTTCCCATGGAGGTTCCAGTACCATTGCCCTTGCACTAAATTG-------AACGTTTAATCACAAAAATATAGGTAAAAGCGGGTCACATTAAATGGCTAATGTGGATCAAGTTCCCGTACCATTGTCCTCACACTAAATTGACTTTATAATATTTTACCGAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 83295 57 + 294542 ATATAGGTAAAAGCAGGTCACTCTAAATGGCTAATGTGGAGAATTCTTTTCATTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229085 57 + 636262 ATATAGGTAAAAGCAGATCACTCTAACTGGCTAATGTAGAAAATTCTTTTCAATTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 220427 57 + 647215 ACATAGGTAAAGGCAGGTCAATCTAAATGGCTAATGTGGAGAATTCTTTTCATTTCC - -a -s mr.mrrefChr5 83352 92 + 294542 AGCCAATTAATTGGAACAGACATTTGTCAATCAGATTGGAAAAATGATGAACCCAAATTGACTCAGTTTGGCCAGGAGACTATGCTAGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229217 92 + 636262 AGCCAACTAATTGGAACAGACATTTGTCAATCAGATTGGAAAAATGATGAACCTAAATTGACTCAGTTTGGCCAAGAGACGATACTAGATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 220484 92 + 647215 AGCCAATAAATTGGATCAGACATTTGTCAATCAGATTGGAAAAATGATGAACCCACATTGACTCAGCTTGGCCAGGAGACTATGCTAGATTG - -a -s mr.mrrefChr5 83444 71 + 294542 ATGGCAGCAGTACCATCTAGTCAAAAACTCCGGCTATCTCTGTGCTGACTTGGAGCATATATAATTATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229383 71 + 636262 ATGGCAGCAGTACCATCTAGTCAAAAACTCCGGCTATCTCTGTGCTGACTTGGAGCATATATAATTATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 220576 71 + 647215 ATGGCAGCAGTACCATCTAGTCAAAAACTCTGGCTATCTCTGTGGTGTCTTGGGGTATATATATTTATTCA - -a -s mr.mrrefChr5 83515 139 + 294542 GCCATCAACAGCGTGTCTTCAAAACAATTGGTGGCACTACTGGTCTTACAAGGCATCATTCTCCTTCAGGCAATGGGGTATCCCAGTTAAAGTACTCGTTGCATCCTAAGCATAAGAGCTAGAATATGATATTAGAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229459 139 + 636262 GCCATCAACAGCGTGTCTTCAAAACAATTGGTGGCACTACTGGTCTTACAAGGCATCATTCTCCTTCAGGCAATGGGGTATCCCAGTTAAAGTACTCGTTGCATCCTAAGCATAAGAGCTAGAATATGATATTAGAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 220647 139 + 647215 GCCGTCAAGAAGGCACCTTCAAAAGGATCGGTGGCACTACTGGTCTTACAAGGCATCATTCTCCTTCAGGCAATGAGGTATCCCAGTTGAAGTCCTCTTTGCAACCTCTGCATGAGAGCTTGAATATGATATTAGAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 83654 57 + 294542 TTTGGCGGTATATCAACCCTCATTGCTGAAGTCAATTTTCATTTAGATTTGGCTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229598 57 + 636262 TTTGGCGGTATATCAACCCTCATTGCTGAAGTCAATTTTCATTTAGATTTGGCTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 220787 57 + 647215 TTTGGGGGTATATTAACCTTCGTCGCAGAAGTCAATTTTCATTTAGATTTGGCTGTG - -a -s mr.mrrefChr5 83711 46 + 294542 AAATGTACAGAGTCAGGTCCGGTGATAGACCTGACTTAGATAAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229656 46 + 636262 AAATGTACAGAGTCAGGTCCGGTGATAGACCTGACTTAGATAAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 220844 46 + 647215 CAATGTACAGAGTCAGGTCAGGTGATAGAACTGATTTACATAAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 83757 42 + 294542 AAAACATGCTTGTATCAACACTATGTACAGCATAAAGCTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229702 42 + 636262 AAAACATGCTTGTATCAACACTATGTACAGCATAAAGCTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 220893 42 + 647215 AAAACATGCTTGTATCAACACTATGTACGGTAGAAAGCTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 83799 29 + 294542 GCCTTTTCCTGTTTTATCCTTAAGCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229744 29 + 636262 GCCTTTTCCTGTTTTATCCTTAAGCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 220936 29 + 647215 GCCTTTTCCTGATTTATCCTCAAGCAACT - -a -s mr.mrrefChr5 83828 12 + 294542 CCTCTTGGGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229774 12 + 636262 CCTCTTGGGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 220965 12 + 647215 CCTCTTGGTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 83840 47 + 294542 ACACAGGGTGTCACATCATTAATTAAAGCACACTGATGTGATGCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229791 47 + 636262 ACACAGGGTGTCACATCATTAATTAAAGCACACTGATGTGATGCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 220977 47 + 647215 ACACAGGGTGTCACATCTTTAAATAAAGCATACTGGTGGGATGTATA - -a -s mr.mrrefChr5 83887 40 + 294542 ATCTATGCTCAGGTGCCACTTTAAACATCGAACAGTAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229838 40 + 636262 ATCTATGCTCAGGTGCCACTTTAAACATCGAACAGTAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 221025 40 + 647215 ATCTATGCACAGGTGCCACTTTAAAGATCAAATGGTAACT - -a -s mr.mrrefChr5 83927 19 + 294542 CCCTATGGATTTCATACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229887 19 + 636262 CCCTATGGATTTCATACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 221065 19 + 647215 CCCTATGAATTTCATACAA - -a -s mr.mrrefChr5 83946 35 + 294542 GAATTCACAGCTCCAACAGGTTTGTAAGTCCCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229906 35 + 636262 GAATTCACAGCTCCAACAGGTTTGTAAGTCCCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 221085 35 + 647215 GAATGCGCAGCTTCAACAGGTTTGCAAGTCCCCAG - -a -s mr.mrrefChr5 83981 4 + 294542 TGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229952 4 + 636262 TGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 221120 4 + 647215 TGAG - -a -s mr.mrrefChr5 83985 28 + 294542 GTATCCACACAGAACCAAATACTGTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229958 28 + 636262 GTATCCACACAGAACCAAATACTGTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 221124 28 + 647215 GTATCCACACAAAGCCAAATACTGTCTG - -a -s mr.mrrefChr5 84013 24 + 294542 ATATCAACTTTGGGGCATTGGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229987 24 + 636262 ATATCAACTTTGGGGCATTGGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 221152 24 + 647215 ACATCAGTGTGGACGCGTCAGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 84037 60 + 294542 cttaactaggaccctacaagtaatattacatccaaatatctacaccaagagacgatgtgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230011 60 + 636262 CTTAACTAGGACCCTACAAGTAATATTACATCCAAATATCTACACCAAGAGACGATGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 221185 60 + 647215 cttaactaggacaccacaagcaatattacatcctaatagttaaaccaagagacgatatgg - -a -s mr.mrrefChr5 84097 43 + 294542 CTCGAGTTTCAGTGTTTCAGAGAGGGCTATGTCTTGAAAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230071 43 + 636262 CTCGAGTTTCAGTGTTTCAGAGAGGGCTATGTCTTGAAAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 221257 43 + 647215 CTCAAGTTTAAGTGTTTCAGAGAGGGCCACACATTGAAAGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 84140 109 + 294542 GATCATCAGCACACAACATATTTCGGTAGGACAGTACCAGTTGTTAGGCAGGATAATTTGAGCTTGAGGAGGTGCAAGGAAGAATATGGATAAGAAATAAGTATGTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230127 109 + 636262 GATCATCAGCACACAACATATTTCGGTAGGACAGTACCAGTTGTTAGGCAGGATAATTTGAGCTTGAGGAGGTGCAAGGAAGAATATGGATAAGAAATAAGTATGTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 221300 109 + 647215 GATTACTAGGGCATAACATATTTTGATATGACAATACTAGTTGCTAGCCAGAATTATTTGAGTTTGAGGGGGTGCAAGGAATAATATGCATGAGAAAAAAATATGTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 84249 14 + 294542 TGGGTTATAACCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230241 14 + 636262 TGGGTTATAACCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 221409 14 + 647215 TGGGTTATAACCTG - -a -s mr.mrrefChr5 84263 9 + 294542 ATTATAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230255 9 + 636262 ATTATAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 221424 9 + 647215 ATTATAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 84272 76 + 294542 GAATCGTAATTGCACAAAAAGCAATGTTTAGTCTATGAAGTTTTATGTTTGACCATGGTTCTAGTATGTACTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230264 76 + 636262 GAATCGTAATTGCACAAAAAGCAATGTTTAGTCTATGAAGTTTTATGTTTGACCATGGTTCTAGTATGTACTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 221438 76 + 647215 TAGTCATAATAGCACAGAAAGCTATGTTTAGTCTATGCAATATTATGTTGCACCATGGTTCTAGTAAGTACTAACA - -a -s mr.mrrefChr5 84348 107 + 294542 CGGCAGCACTTCAGCACCTTAACTTGTCTTTTATTGATAGTTTATTTTAAACCTAGTCTGGATTTGTCACATAGTTGAGTTCTTGGTGTAAAATCGCAACTGCTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230340 107 + 636262 CGGCAGCACTTCAGCACCTTAACTTGTCTTTTATTGATAGTTTATTTTAAACCTAGTCTGGATTTGTCACATAGTTGAGTTCTTGGTGTAAAATCGCAACTGCTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 221517 107 + 647215 TGACAGCACTTCAGCATATTAACTTGTCTTTTATTGATAGCTTATTTTAAACCTAGTCTGTATTTGTCATATAGTTGGGTTCTTGATGTAAAATGGCAACTGCTATA - -a -s mr.mrrefChr5 84455 73 + 294542 GGGTCTTAAGAGCGACCGTGCAGGTTGCTCAGAACCATTGATCAACATCATTATGTGAGCTTCTGAGAGTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230447 73 + 636262 GGGTCTTAAGAGCGACCGTGCAGGTTGCTCAGAACCATTGATCAACATCATTATGTGAGCTTCTGAGAGTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 221645 73 + 647215 GGGTCTTAAAAGCGACCATCAGGGTTACTGAGAGTCATTAATCAACATCATTATGTGAGCTACTGAGAGTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 84528 15 + 294542 ACAATTGTGGACTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230521 15 + 636262 ACAATTGTGGACTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 221718 15 + 647215 ACAACAGTGAATCGT - -a -s mr.mrrefChr5 84543 37 + 294542 AATAGGTTAGGCACAGCCTACGGAACATGTAAGTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230538 37 + 636262 AATAGGTTAGGCACAGCCTACGGAACATGTAAGTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 221733 37 + 647215 AATGGGTTGGACACAGTCTGGGGAACGTGTAAGTACA - -a -s mr.mrrefChr5 84580 43 + 294542 CCATTCAAGTAGGCAATTGGCCTGAGGGAGATTGGATTGCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230590 43 + 636262 CCATTCAAGTAGGCAATTGGCCTGAGGGAGATTGGATTGCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 221770 43 + 647215 CCATTTGAGTTGGCAATTGGCCTGGGGGATATCAGGTTATACC - -a -s mr.mrrefChr5 84623 11 + 294542 GTTTACCAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230636 11 + 636262 GTTTACCAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 221813 11 + 647215 GTGTATCAAAC - -a -s mr.mrrefChr5 84634 89 + 294542 ACCCGACCAGTTGAACTAGGGGACTAAAATGGATTCAACTGAGAATGGAGGTATGTCACACACGGGTGTTTGCCAGCCTGTGAAGTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230647 89 + 636262 ACCCGACCAGTTGAACTAGGGGACTAAAATGGATTCAACTGAGAATGGAGGTATGTCACACACGGGTGTTTGCCAGCCTGTGAAGTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 221825 89 + 647215 CCCCAATCAGTTGAACTAGAGAACTAAGATGGATTCAACTGAGGATGGAGGTCTGTCACATAAGGGTGCCTGCCAGTCTGTGAAGTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 84723 11 + 294542 CAGGTTTGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230736 11 + 636262 CAGGTTTGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 221924 11 + 647215 CAGATTTGCCT - -a -s mr.mrrefChr5 84734 28 + 294542 GTTAGGATTGGTAAGAACAACTAAGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230747 28 + 636262 GTTAGGATTGGTAAGAACAACTAAGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 221943 28 + 647215 GTTAGGACTGGTAAGTACAACTAAGTGC - -a -s mr.mrrefChr5 84762 42 + 294542 AACATGAGGGGGGATGTAGGGGTATAGGTAAATAAATCTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230779 42 + 636262 AACATGAGGGGGGATGTAGGGGTATAGGTAAATAAATCTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 221971 42 + 647215 AACATGAGTGGGGATGTCAGGGTATAAGCATGTAGAGCAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 84804 8 + 294542 TCACAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231169 8 + 636262 TCACAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 222013 8 + 647215 TCACAATG - -a -s mr.mrrefChr5 84812 20 + 294542 CAGCACTCATTGGGAGCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231178 20 + 636262 CAGCACTCATTGGAAGCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 222021 20 + 647215 CGGCACTCATTGGGAGCTCT - -a -s mr.mrrefChr5 84832 54 + 294542 ATCATGATTCTTCCATTCTTCTCTGCTTCTTCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231200 54 + 636262 ATCATGATTCTTCCATTCTTCTCTGCCTCTTCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 222041 54 + 647215 ATCATGATTCTTCCATCCTGCTCGGCTTCATCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA - -a -s mr.mrrefChr5 84886 77 + 294542 TCACCAATGTGCTTCCAAGCAATTATCATGCTGCTGTGCTAAGTTAAGGGGTTGATAGTTCACAACTTTTACCTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231254 77 + 636262 ACACCAATGTGCTTCCTAGGAATTGTGGTGCTGCTGTGCTAAGTTAAGGGGTTGATAGTTCACAACTTTTACCTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 222105 77 + 647215 TCATCAATGTGCTTCCAAGCAATTATCATGTTGCTGCATTAAGTTAGGGGCTTGATAGTCCACAACTTTTACCTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 84963 673 + 294542 TGGGATAATTTCTATCACACATCAGAGATCGCTACCTATACATGACTATTATTCCCCCAAGGCGCATCTGGATGGGTGAATTCACAGCAAGTCATACAACCATCTGGAGAGAGTTATACAGAATGCGTAACTTGAAAACACAGCAAGCAGGTGTAAATGCAATAGTGAAAGGTTATGCCTACATGCATATCAACTTTAGAGCTCCAGAGTTGGCTATCACTTATGACATAGAGTGTGAGTCCCCAACTATTAGCATAAAGTGTAATCTTAGCATGACTGCAGTACTGGGATCACTTCAGCAATGATACGCAGTGTCACCAATCTGAGGCATATGCCTTACTAATTTTAGAACCTTAGATAGTAAACTCAAGTCACGGTAAACTCAAGTCAGCTAGAAGAGTTCCGCAATGTCCCAGAACCAGCCAAAAATGCGAATGAGTGTTCTACAGTTCATGTATCATGGAATACGTTCTAGCCAATTCAAAAGGATATATCTTAGTACCTCTTTGCATTGGGATGACCATGACCAGCTTCATGATTGCTGTGAGGCTCATGCATAATAATGTTTTGGTTAAACAGTAGATAGTCTGCCTCCTACTCATTCTGTCAATGTCTGATTGAGATGTGTAATTTTGAACTATTTTTTCCATTCATGACTCCATGAAGCCCCGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231450 658 + 636262 TGGGATAATTTCTAACACACATCAGAGATCGCAACCTATACAGGACTATTGTTCCCT-AAGGTGCATCTGCATGGGTAAATTCACAGCAAGTCATACAACCATCTGGAGAGAGTTATACAGAAGGCATAGCTTGAAAACACAGCAAGCGGGTGTAAATGCAATAGTGAAAGGTTATGCCTACATACATATCAACTTTAGAGCTCCAGAGTTGGCTGTCACTTATGACATAAAGTGTGAGTCCCCAACTATCAGCATAAAGTGTAATCTTAGCATGACTGCCGTACTGGGATCACTTCAGCCATGATACGCAATGTCACCAATCTGAGGCATATGCCTTACTAATTCTAGCACCATAGACAGTAAACTCGAGTCA------------GTCAGCTAGAAGAGTTCCGCAATGTCCCGGAACCAGCCAAAAATGCGAATGGGTGTTCTACGGCTCATGTATCATGGAATACGTTCTAGCCAATTCGAAAGGATATAGCTTAGTACCTCTTTGCATTGTGATGTCC--GACCAGCTTCATGATTGCTGTGAGGCTCATGCGTAATAATGTTTTGGTTAAACAGTAGATAGTCTGCCTCCTACTCATTCTGGCTATGTCTCATCAAGATGTGTAATTTAGAACTATTTTTTCCATTCATGACTCCATGAAGCCCCGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 222182 671 + 647215 TGGGATAACTTCTATCACATATCAGAGATCGCTACCTATAGATGACTATTATTCCCCCAAGGCGCATCTGGATGGGTGAATTCACACCAAGTCTTACAACCATCTGGCGAGTGTCGTACAGAATGTGTAACTTGAAAACACAGCAAGTAGTTGTAAATGCAACAGTGAAAGGTTTTGCCCACATGCATATCAACTTTAGCGCTCCAGAGTCAGCTATCACCTATGACATAGAGTGCGATTCCCCAAATATT-GCATAACGTGTAATGTTACCATGACTGCAGTACTGGGATCACTTCAGCAA-GATATGCTGCGTCACCAATCTGAGGCATATGCCTTACTAATTTTAGATCTTCAGATGGTAAACTCAAGTTACGGTAAACTCAAGTTAGCTGAAAGAGTTCTACAATGTCCCAGAACCAGCAAAAAGTGCAAATGAGTGTTCTACATTTCATGTATCATGGAATATGTTATAGCCAATACAAAAGGATATATCTTTGTACCTCCTTGCATTGGGATGACCATGACCAGCTTCATAATTGATGTGAGGCTTACTCATAATAATGTTTTGGTTAAACAGTAGGTAGCTTGCCTCCTGCTCATTCTGTCAGTGTATGATTGAGATGTTTAATTTTGAACTATTTTTTCCATTCGTGACTCCATTAAGCCCCTCA - -a -s mr.mrrefChr5 85636 358 + 294542 GACAACACCACTAAAATAACCATGTGTAAAGAGTATCAACTTGAAAATGAAAAGCATGTGGCCAAACCAGAACATGTGAATGCATAGTCTCTGAAGACTATGCACTTGTTATGCAATTTGTGCTCTGTTAGGAGTTGTGAACAAAATTAGAGTTGACCTTCCTCTCCTGTGTGACTTGCTGCTGGAGTGGTTGTAATTCCGGGCCTTGCAGGTCTAGAAATTGGCATTTCAACGTTATGGGAGGAGGAGCATGGGGCCTTAAGATAGGTATGTAATATCTGGAACTATAGGATTACAGGGCAAGTAAACATATTATGTGACCAGTCAGAAGACATATAGCAGCAGTCATATTATGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232110 243 + 636262 GATGATACCACTGAAACAACCATGTGTAAAAAGTATCAACTCGAAAATGAAAATCATGTGGCCAAACCAGAACATGTGAATGCATAGTCTCTGAAGACTATGCACTTGTTATGCAATTTGTGCTCTGTTAGAAGCTGTGAACAA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTAGATAGGTATGTAATATCTGGAACTATAGGATTACAGGGCAAGTAAACATATTATGTGACCAATTAGAAGACATGTAGCAGCAGTCATATTATGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 222853 357 + 647215 GACAACACCACTAAAATAACCATGTATAAAGAGCATCAACTTGAAGATGAAAAGCATGTGGCCAACCCAGAACATGTGAATGCATAGTCTCTGAAGACTATGCACTTGTTATGCAATTTGTGTTCCATTAGGCATTGTTAACAAAATTAGAGTTGACCTTCCTCTCCTGTGTGACTTGCTGCTGGAGTGGTTGTAATTCCGGGCCTTGCAGGTCTAGAAATTGGCATTTCAACGTTATGGGAGGAGGAGCATGGGGCCTTAAGCTAGGTATGTAGTATCTGGAACTCTAGGATTATAGGGCAAGTAG-CATCTTATTTGTGCTGACAGAAGACATACGGCAGCAGTCATATTGTGCAC - -a -s mr.mrrefChr5 85994 344 + 294542 ACCAGGTGACCTGTTTGTAAACCAAGTAAGCCAGAGGCAACCAGGCTGACTTACAAACTAAGGTTCCTTCACAACATATTAACTTCTGAATCTGATTTAACATCTAAATGAACAGGCCTTACATAAAGATAGTGAACCTAATCAATTTTTTGTTGGAATATGTGTGGTTCTTGTATGTCGCTAGCTAGATTAATTTATGATATCACCTTTCTGATTAGTTATAAGCTTACATGTGGTAATGTATACCGTCATGTATTTCCATATTAAGGTAACTATCCACATAATCCATCAAGCCTGGGATACTTAATGGGGATACTTAACCTAACTTGTCCTGCCTATGTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232365 344 + 636262 ACCAGGTGACCTGTGTGTAAACCAGGTAAGCCAGTGGCAACCATGCTGACTTACAAACTATGGTATCTTCACAATATCTTAATTTCTGAATTTGATTTAACATCTAAATGAACAGGCCTTACAGAAAGATAGTGTACCTAATCAATTTTTTGTTGGAATATGTGTGGTTCTTGTTTGTCGCTAGCTAGATTAATTCATGATATCACCTTTCTGGTTAGTTATAAGCTTACATGTGGTAATGTATATTGTCATCTATTTCCATTTTAAGGTAACTATCCACATAATCCATTAAGCCTGGGATACTTAATGGGGATACTTAACCTAACTTGTCTTGCCTATGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 223210 344 + 647215 ACCAAGTGACCTGTTTGTAAACCAAGTAAGCCAGAGGCAACCAGGCTGAGTTACAAACTAAGGTTCCTTCACAACATATTAACTTCTGAATCTGATTTAATATCTAAATGAACAGGGCTTACATGAAGAGAGTGAACCTAATCAATTTTTTGTTTGGATATATGTGCTTCTTGTATGTTGTTAACTAGATTAATTTAAAATATCACCTCCATGATAAAGCATAAGATGACATGTGGTAATGTATACCATCATGTATTGCCATATTAAGGTAACTATCCTCATGACTCATCAAGCCTGGGACACTTAATGGGAAATCTTAATCTAACTTGTCCTGCCTAAGATAA - -a -s mr.mrrefChr5 86338 64 + 294542 CTAATTGATATGTTTACATAAGTGCCAAATTTTGCTGGTGTTAAATGCTTATCACAGCTAGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232820 64 + 636262 CTAAATGATATGTTTACATAAGTGCCAAATTTTGCTGGTGTTAAATGCTTATCACAGCTGGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 223554 64 + 647215 CTAATTCATACGTTTACATAAGTGCCAAGTTTCGCCGGTGCTAAATGCTTATCACTGCTAGATT - -a -s mr.mrrefChr5 86402 16 + 294542 GCAATTCTGAACCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232885 16 + 636262 GCAATTCTGAACCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 223618 16 + 647215 GCAATTCTGAACCACA - -a -s mr.mrrefChr5 86418 11 + 294542 ATCCCTACAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232908 11 + 636262 AACCCTACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 223634 11 + 647215 ATCCCTACAAT - -a -s mr.mrrefChr5 86429 3 + 294542 ATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232919 3 + 636262 ATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 223648 3 + 647215 ATA - -a -s mr.mrrefChr5 86432 69 + 294542 AGGTATAATTTGCCTTATTATCTGTTGTGATAACATATACATAGGATTGAGCTAGAAGCTCCCCTAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232923 69 + 636262 AGGTATAATTTGACTTATTAACTGTTGTGATAACATATACATAGGACCTAGCATGAAGGTCCCCTAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 223651 63 + 647215 AGGCTTAATTTGCCTTATTATCT----TGATAACGCATGCATAGGATTGAGATAGAAGCTCCCATAA-- - -a -s mr.mrrefChr5 86501 33 + 294542 TTTCTTTACGCTGCATATGCAGATATAGATAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232994 33 + 636262 TTTCTTTACGCTGCATATGCAGATATAGATAAG - -a -s mr.mrrefChr5 86534 200 + 294542 GTAGATGGGTTTGCCGATTTTACACATGAGGGGCCTGAGTGATGCATTCTGAATAACCTTCAACTACTTGTATGGGAACCCTTTACCAGCTCGAGTTCTGAGTAGCTTGATGTGCCAGCCATGCACTTACTCCTGGTTGTGCTCCTTTCATCCACTCAAGTGGAGGCTAATATAACAATAATCTAATATCATTAATAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233029 200 + 636262 GTAGATGGGTTTGCCAATTTTACACATGAGGGGCCTGAGTGGTGCATTCTGAATAACCTTCAACTACTTGTATGGGAAGCCTTTACCAGCTCGAGTTCTGAGTAGCTTGATGTGCCAGCCATGCACCTATTCCTGGTTCTGCTCCTCTCATCCACTCAAGTGGAGGCTAATATAACAATAATCTAATATCATTAATAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 223714 166 + 647215 GTAAATGGGACAGCTGCATTTTCACATAAGAGGTCTGAGTCATGCATTCTGAATATCCTTCAACTACTTGTATGGGAACCTTTTACCAACTCAAGTTCTGAGTAACTCAATGTGCCGGCCTTGCACTTACTCCTGGTTGTGCTTCTTGCATTCACTCAAGTGGAGG---------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 86734 10 + 294542 CTAGAAACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233238 10 + 636262 CTAGAAACAG - -a -s mr.mrrefChr5 86744 19 + 294542 GATAAAGATTGATTCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233259 19 + 636262 GATAAAGATTGATTCTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 223880 19 + 647215 GATAAAGATGGATTCTACG - -a -s mr.mrrefChr5 86763 114 + 294542 ACTGAGACCTTGTCTTGGTTAGGATCCCAGTCATGCCTGTTCTTTAGTAATCAGAGTTTTCCTCCCTTTTCAGTGGCAGGTCTCAATAGGAAATTGATTAGTACATTATATGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233279 110 + 636262 ACTGAGACCTTGTCTTGGTTAGGATCCCAGTCCTGCCTGTTCTTTAGTAATCAGAGTTGTCTACCTTTTTC----GCAGGTCTCAATAGGAAATTGGTTAGTACATTATATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 223899 114 + 647215 ACTGGGACCTTGTCTTGGTTAGGATCCCAGTCATGCTTGTTCTTCAGTAATCAGAGTTTTCCTCCCTTTTTAGTGGCAGGTCTCTATAGGAAACTGATTAGCACATTATCTGGT - -a -s mr.mrrefChr5 86877 140 + 294542 AACAATTTGAACTAATTGAACTGACATCTCCTCAGCAGAACTCTTGTGAGTTGTGCTAGACAAATCATACTTAGGCTGCTCAAGCTTGTATTTAGTTCAATCATAGCAATACAGGTCATTCTTGACTGCATTAGAGCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233389 140 + 636262 ATCAATTCGAACTAATTGAACTGACATCTCCTCAGCAGAACTCTTGTGAGTGGTGCCAGACAAATCATACTTAGGTTGCTCAAGCTTGTATTTAGTTCAATCATAGGAATACAGGTCATTCTTGACTGCATTAGAGCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 224014 135 + 647215 AACAATTTGAACTAATTGACCTGACATCTCTTCAGCGGAACTCTTGTGAATTGTGTTGGGCAAATCATACTTAGGCCAACCAAATTTGTTTTAAGGCCAATCATAGCAACACAGGTCATTCTTGACTGCATTAGA----- - -a -s mr.mrrefChr5 87017 98 + 294542 AAAAATGGTATTTTTAGTACTAATATTAATAAGTATGGTTATCTGTTTTGTTGTCTGTGATTGCATGCTATCAGAACCTGTTCTAAGGGCTGTTCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233531 95 + 636262 AAAGATGGTATTTTAC---CTAATATTAAGAAGTATGGTTATCTGTTTTATTGTCTGTGATTGCATGTTTTCAGAACCTGTTCTAAGGGCTGTTCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 224149 96 + 647215 --AAATGGTATTTTTAGTACTAATATTAATAAGTATGGTTATCTGTTTTGTTGTCTGTGATTGCCTGCTATCAGAACCTGGTGTAAGGGCTGTTCATC - -a -s mr.mrrefChr5 87115 7 + 294542 AGTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233628 7 + 636262 AGTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 224245 7 + 647215 AGTTCGA - -a -s mr.mrrefChr5 87122 227 + 294542 TCTATGAGTGTGTAGGTTATTAAGTAACTGAGATCGGACTCTCCCACACTTTTAACCATTTTCTCATAAAGGATACAAAAACTAATTTCTTGAATGGTCACTTGATTGAGCATGGAGTGGAATCCTAATAGCTTAATGAGTTTGACCATCAATCTGGAAAATCTGAGTACACTATCGGGAGAGATTGAACTGGGGTTAAAAGGATGGAAGATACAATGCCCTTTGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233635 196 + 636262 TCTATGTGTGTGTAGGTTATTAAGTAACAGAGATCAGACTC-------------ACCTTTTTCT-------------AAAACTAATTTCTTGAATGGTTACTCAATTG--CATGGAGTGGAATCCTAATAGCTTAATGA---TGACCATCAATCTGGAAAATCTGAGTACACTATCGGGAGAGATTGAACTGGGGTTAAAGACATGGAAGATACAATGCCCTTTGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 224276 227 + 647215 TCTAAGAGTGTGTAGGTTATTAAGAAACTGAGATCGGACTCTCCCACACTTTTAACCATTTACTCATAAAGGATACAAAGACTAGTTTATTGAATGGCCACTTGATTGAGCTTGAAGTGGAAGCCTAATAGCTTAAAGAGTTTGAACATCAATCTGGAGGTTCTGAGTACACTATAGGGAGAGATTGAACTGGGGTTAAAAGGATCAAATACACAACACCCTTTGAC - -a -s mr.mrrefChr5 87349 206 + 294542 CTCAAAATGCAATAACTTTTGCTTGCTCTTGTCTTGGTGTGAACAAAATTGGTTGTGGATGTAAAGCCAAGTTTTGCAAACTAAACCTAGGGGCATAGGCATGCTAAGGTCAACAGGGTCTAAGAAAGGGCATTTGCCTTGAGTGAAGCAACCTTCTAGGTTCGTAGACCACATGATTCTGCCTGTTGTCTGCTCTGAATTAAACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233838 205 + 636262 CTCAAAATGCAATAACTTTTGCTTGCTCTTGTCTTGGTGTGAACAAAATTGGTTGTGGGTGTAAAGCCAAATTGTGCAAACTAATCCTAGGGGCATAGGC-TGCTAAGGTCAACAAGGGCTAAGAAAGGGCATTTGCTGCGAGTGAAGTGACCTTCTAGGTTCGTAGACCACATGATTCTGCCTGTTGTCTACTCTGAATTAAACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 224503 206 + 647215 TTCAAAATGCAATAACTTTTGCTTGCTCTATTCTTGGTGTGAACAAAATTGGCAGTGGATGTAAAGCTAGGTTTTGCAAACTAAACCTAGGGGCATAGGCATGCGATGGTCAACAGGGTCTAAGAATGGGCATTTGTCTTGAATGAAGCAACCTACTAGGTTTGTATACCACAAGGTTCTGCCTATTGTCTGCTATGAATTAAACG - -a -s mr.mrrefChr5 87555 130 + 294542 ATGTTTATGTAGCAACAAGAACATGCCCACTCAGAAAAGCTACATGGGTGTACCACCTGCATCATATGAAAGGAGGGTTCAAGTAGTCTTTAGAATTAGATCCATATTGGTATATCATTCCACCCCTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234048 130 + 636262 ATGTTTATGTAGCAACAAGAACATGCCCACTCAAAAAAGCTACATGGGTGCACCACCTGCATGATATGAAAGAAGGGTTCAAGTAGTCTTTAGAATTAGATCCATATTGGTATATCATGCCACTCCTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 224709 129 + 647215 AT-TTTATGTAGCAACAAGAACATGCTCACTCAGAAAAGCTACATGGGTCTACCACCTGCATCCTATAAACAGAGGGTTCAAGAAGTCTTTAGAATTAGATCCATATTGGTATATCATTCTACCCCTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 87685 162 + 294542 TTGAGTAGGTAGGCGAATCTAACTTTTTTATATCTGAGTAAATACAAGATCTATATAGGAAAGGTCTGGGCCTTACCATTTCCAGACTAGAAAATTTCCTGTATATACACAGGGATGTGTCCATGGGATTTACAGCTCTGCCTGGGGGCTTGATTGGGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234180 162 + 636262 TTGAGTAGGTAGGTGAATCTGACTTCTTTTTATCTGAGTAAATACAAGATCTATATAGGAAAGGTCTGGGCCTTACCATCTCCAGACTAGAAAATTTCCTGTATATACACAGGGATGTTTCCATAGGATTTACAGCTCTGCCTGGGGGCTTGATTGGGGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 224838 161 + 647215 TTGAGTAGGTAGGCGAATCTAACTTTTCTATATGTGAGTAAATACAAGATCTATGTAGGAAAGGTCTGGGCCTTACCATTTCCAGACTAGAGAATTTCCAGT-TATACACAGGGGTGTGGCCATGGGATATACAGCTCTGACAGGGGGCTCGACTGGGGACT - -a -s mr.mrrefChr5 87847 111 + 294542 TGTGCATGTCCAGGCATTACAGTCTGGAACCTTTGTGATTGAAAATAGTCCCTCACTACCAACAACGCAATCGGCTGATACCCTAGGGGCCTCGCATTTTACATAAAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234345 111 + 636262 TGTGCATGTCGAGGCATGACAGTCTGGGACCATTGTGATTGAAAATAGTCCCTCACTACCAACAACGCAGTCGGCTGATACCCTGGGGGCCTCACATTTTACATAAAGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 224999 108 + 647215 ---GCAAGTCCAGGCATTACAGTCTGGAACCTTTGTGATGGACAATAGTCCCTCACCACCAACAATGCAATTGGCTGATACGCTAGGGGCCTCGCATTTTACTTAAAGAGG - -a -s mr.mrrefChr5 87958 274 + 294542 AGTCTGATATTAAGTGAACCACAACTGAGGGGAGACACTGAAGGTTGGGAATAACCCCCTGGGCCTGGAATAAATGGAATAAAACATAAAGCCTGCTTGGAGTAACTGAGAGGACAAAATGCTCCCGCCCTTGACCCCTGCTAGGGAGAGGCAATTTTGTCAACAATGAGCAACAAATCGGCAAGTTCTTATCTAGGATGGGGATGATGTATGAGAGTACATCATGAATTAATAGTTGCAGGAAAGATAAGCTTGGGTCTCCAACCCAACCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234456 267 + 636262 AGTCTGATATTAAGTGAGCCACAACTGAGGGGAGACACTGAAGGTGAGGAATAACACCCTGGGCCTGGAACAAA------AAAACATAAGGCATGTTTGGAGTAACTGAGAGGACAAAATGCTCCCACCCATGACCCTTGCTAGGGGGAGGCAATT-TGTCAACAATGAGCAACAAATCGGCAAGTTCTTATCTAGGATGGGGATGATGTATGAGAGTACACCATGAATTAATAGTTGCAGGAAAGATAAGCTTGGGTCTCTGACCCAGCCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 225122 273 + 647215 AGTCTGATATCAAGTAAACCACTACAGAAGGGAGACACTAAGGGTTGGGAATAAGCCCCTCGGCCTGGAATAAATGGAATAAAACATAAAGCCTGCTTGGATTAACTGAGAGG-TGAAATGCTTCTGCCCTTGACCCCTGCTAGGGAGAGGCAATTTTGCTACCAATGAGCTACAGATTGACAAGTTCTTATCTGGGTTGGGGATGATGTATGAGAGTACGTCATAAGTTATTAGTTGCAGGAAAGCTAAGCTTGGGTCTCCAACCCAAACCCA - -a -s mr.mrrefChr5 88232 150 + 294542 CATGTTAATACCACATCCAATTTAGTGCAGCGAAGGTATATACGAAGTCATTTCAAGTAGAATTAACACAAAGAAGCCAATTCTGATGAATTTCCATAGGAAAACTGATTCTGACCATTCAGTAATGACGCTCACAATGACGCCCAGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234723 150 + 636262 CATGTTAATACCACCTCCCATTTAGTGCAGCGAAGGTGGATACGAAGTCATTTCAAGTAGAATTAACACAAAGAAGCCAATTCTGATGAATTTCCATAGGAAAACTGATTCTGACCATTCAGTAATGACGCTCACAATGACGCCCAGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 225401 146 + 647215 CATGTTA----TATATACAATTTAGTGCAGTGAAGGTATATATGAAGTCATTTCAAGTAGAATTAACACTAAGAAGCCAATTCTCATGAATTCCCACGTAAAAACCGATTCTTACCCTTCAGTGATGATGCTCACAATGATGCTCAGGAG - -a -s mr.mrrefChr5 88382 24 + 294542 TTCTATGTTAACTGGCTGTCCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234874 24 + 636262 TTCTATGTTAACTGGCTGTCCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 225547 24 + 647215 TCCTATGTTAACTGGCTGTGCAAC - -a -s mr.mrrefChr5 88406 29 + 294542 ATTAAGATATGGCTAGCAATCTCATGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234898 29 + 636262 ATTAAGATATGGCTAGCAATCTCATGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 225577 29 + 647215 ATAACAATATGACTAGCAATCTCAAGATC - -a -s mr.mrrefChr5 88435 171 + 294542 AATTTTGAGCTGAGCTTAACAACCCCATTGGCTCACACGATTATCATTCATGTGCTTTGTTTCCACTTTCCTATTAGGCATCCAGGGACTAATTAGAGGGCTATTAGCCGCTATTAACCTTGGGATTATTGCTGAAGACAATTCAGGCCAATCACCGACCTATGATATACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234927 171 + 636262 AATTTTGAGCTGAGCTTAACAACCCCATTAGGTCACACGATTATCATTCATGTGCTTCGTTTCCACTTTCCCATTAGGCATCCAGGGACTAATTAGAGGGCTATTAGCCGCTATTAACCTTGGGATTATAGCTAAAGACAATTCAGGCCAATCACCGACCTATGATATACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 225619 171 + 647215 AATTTCGAACTGGGCTTAACAACCCCATTGGCTCACACGATTATCATTCATCTGCTTTGTCTCCACTTTCCTATTTGGCATCCAGGGACTAATTAGGGGGCTAGTAGCAGCTATTAACCTTGGGATTATTGCTGAAGACAGTTGAGGCCAATCACCGACCTATGATATACC - -a -s mr.mrrefChr5 88606 38 + 294542 GTTAATAGGTTACCAATAATTAGTTTGAGGTATGTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235102 38 + 636262 GTTAATAGGTTACCAATAATTAGTTTGAGGTATGTCTG - -a -s mr.mrrefChr5 88644 166 + 294542 TAGAGGTATGTCTGTTTATGATTGGACTCCAGTTGTAAGGTCTGCCTTCCCCTATGTGAGTGTGTAGTGGGTGTTTTCCCCCCATTATCTATTGTGACCAATCTGGCTTTGCCCAGAGTTTTCAATACTGTACTCAAGTTATATTGGCAGAGACAACCATCTCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235142 166 + 636262 TAGAGGTATGTCTGTTTATGATTGGACTCCAGTTGTAAGGTCTGCCTTCCCCTATGTGAGTGTGTAGTGGGTGTTTTCCCCCCATTATCTATTGTGACCAATCTGGCTTTGCCCAGAGTTTTCAATACTGTACTCAAGTTATATTGGCAGAGACAACCATCTCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 225790 166 + 647215 TAGAGGTATGTCCATTTAAGATTGGACCCCAGTTGTAAGGTCTGCCTTCCCCTATGTGAGTGTATAGCGGGTGTTTTCCCCCCATTATCTATTGTGACCAATCCGGCTTTGCCCAGTGTTTTCAATACTGGACTTAAATTATATTGACACAGGCTACCACCTCAAA - -a -s mr.mrrefChr5 88810 80 + 294542 CTGTATTACTAGTTCACCAATTTACACCCACATCACATGGTCTTTATGTGTATTTTACTAATGGCCCCATGTGAACCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235310 80 + 636262 CTGTATTACTAGTTCACCAATTTACACCCACATCACATGGTCTTTATGTGTATTTTACTAATGGCCCCATGTGAACCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 225956 80 + 647215 CTGCATTACTAGTTCACCGATTTAGACCCACATTGCATAGTCTTTTTGTGTATTTTACTATTGGCCCCATGTGAACCTTG - -a -s mr.mrrefChr5 88890 66 + 294542 AACCAGTGGAGTTTACTCTGATCAGAGTGAAACCACAAGGATTCTGCTCCAAACCATAAAGTTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235390 66 + 636262 AACCAGTGGAGTTTACTCTGATCAGAGTGAAACCACAAGGATTCTGCTCCAAACCATAAAGTTCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 226037 66 + 647215 CACCAGTGGAGTTTACTCTAATCAAAGCAAAACCACAAGGATTCTGCTTCAAATGATAAAGTTCAT - -a -s mr.mrrefChr5 88956 82 + 294542 GGGATATTACAGCATGCTTAGATGTGAATCAACATCCTTAGATGTGAAGCACGGAATATATTTAAGTTCTCTGCCACACGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235456 82 + 636262 GGGATATTACAGCATGCTTAGATGTGAATCAACATCCTTAGATGTGAAGCACGGAATATATTTAAGTTCTCTGCCACACGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 226105 82 + 647215 GGGATATTACAACATTCTTAGATGTGGGGCAACGTCCTTAGATGTGGAGCACGGGATATATTTAAGTTCTCTGCCATACACT - -a -s mr.mrrefChr5 89038 7 + 294542 AAACTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235538 7 + 636262 AAACTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 226188 7 + 647215 AAACTTA - -a -s mr.mrrefChr5 89045 660 + 294542 ACAGTATGCCGCACTCCCCCATTTTGCTCTATCATGATATATGCTTTATCTCACAATAAGTGTTGGACCCTTGGGCTATAAGAATATTCAGAATTAATTTGCATTTTGTCTTCACTTTGTGTGTTTAATATTAAGTGATTTCCATCAGTGTGTGTGGATTTTTTATTACTCTTCCTATTGTGTATAAACATGTGATACCCCAGAACAGATCACTTTCACCAGTGAATAATAGAAATTAGCAGCAGAAGCAACACTTTGTCCACTACCTTAGGACAATATGGGTTGTGTAAGTACCCTGCCTTAAGATGAGGGATCTCCAACTTATTTACCTAGCAGGTTCAATAATGGTGTTCTTAGCCATGCCCATACACAGATGAGTTGGGCTTGATTTGATGCACTGTTGAATTGTTTGGTGTGAAGAGTTAACACCTTGGTGAAAGGTGATCTGTAATTTTGGCTAACAATATCCATTAAATCTGCAACTGTCCATTCTGCAATCAAGTCTGTGTGACAGGTAAACCTGAACACAGACTCTGCCATAGTAACCTTGTTTACCTTAACTGCAACCTATCACAACCCTATCAACATGTCATAGAAACCCATTCAATATTCTTTCACATTCTACAAACCTGGTACAGAAGTAGCCCTTGGACATAATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235545 660 + 636262 ACAGTATGCCGCACTCCCCCATTTTGCTCTATCATGATACATGCATTATCTCACAATGAGTGTTGGACCCTTGGGCTATAAGAATATTCAGCATTAACTTACATTTTGTCTTCACTTTGTGTGTTTAATATTAAGTGATTTCCATCAGTGTGTGTGGATTTTTTATCACTCTTCCTATTGTGTATAAATATGTGATACCCCAGAACAGATCACTTTCACCAGTGATGAATAGAAATTAGCGGCAGAAGCAACACTTTGTTTACTACCTTAGGACAATATGGGTTGTGTAAATGCCCTGCCTTAAGATGAGGGATCTCCAACTTATTTACCCAGCAGGTTCAATAATGGTGTTCTTAGCCATGCCCATGCACAGATGAGTTGGGTTTCATTTGATGCACTGTTGAATTGTTTGGTGTGAAGAGTTAGCACCTTGGTAAAAGGTGATTTGTAATTTTGGCTAAGAATATCCATTAAATTTGTAACTGTCCATTCTGCAATCAAGTCTGTATGACGGGTAAACCTGAACACAGACTCTGCCATAGTAACCTTGTTCACCTTAACTGTAACTGATCACAACCCTATCAATATGTCATAGAAAACCATTCAATATTCTTTCACATTCTACAAATCTGGTACAGGAGTAGCCCTTGGACATAATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 226268 641 + 647215 ATGGATTGCCGCACTCCCCCATCTTACTCTAGCCTGATAT-TGCTTTATCTCACAATAAGTGTTGGACCCT--GGCTATAAGAATCTTCAGAATTAATTTGCAT---------ACTTTGTGCATTTAATATTAAGCGATTTCCATCTGTGTGTGTGGATTTTTTATTAGTCTTCCTATTGTGTATAAACATGTGATACCCCAGAACAGACCACTTTCACGAGTGAATAATAGAAATTAGCAGGAGAAGCTACACTTTGTCCACTACCTTGTGAGAAGATG-----TGTAGGTACCCTGCCTTAAGATGACCGATTTCCAA-TTACTTGCCTAGCAGTATCAATAATGCTGTTTTTGGCCATGTCCATACACAAATGAGTTGGGCCTGATTTAATGCACTGTTAAATTGTCTGGTGTGAAGAGTTAACTCCTTGATGATAGGTGATCTGTAATTTTGGCTAACATTATCCATTAAATCTGCAACTCTCCATTAAGCAATCAAGTCTGTGTCACAGGTAAACCTGAACACAGACTTT-CCATAGTAACCTTGTTTATTTTACCTGCAACCTAACACAACCCTATCAACATGTCATAGCAACCCACTTAATATTCTTTCACATTCTACAAGCCTGGTACAGAAGTACCCCTTGGACATAATCC - -a -s mr.mrrefChr5 89705 84 + 294542 AGCTCACAGACTGGCTGTCAATCTGCAATGGAGACTCATTTATGGTAGTAACATAATGTTGATTGAGAATAAGCCCCATTGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236205 84 + 636262 AGCTCACAGACTGGCTGTCAATCTGCAATGGAGACTCATTTATGGTAGTAACATAATGTTGATTGAGAATAAGCCCCATTGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 227145 84 + 647215 AGTTCACATTCTCACTATCAAACTGCAATGGAGGCTCATTAATGCTAGCCACAAGATCTTGGCTGAGAATATGCCCCATTGATG - -a -s mr.mrrefChr5 89789 21 + 294542 TCCTGTTTCTCATCAGTAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236290 21 + 636262 TCCTGTTTCTCATCAGTAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 227229 21 + 647215 TCCTGCTTTTCATCAGAAATC - -a -s mr.mrrefChr5 89810 125 + 294542 CAATGCCAGTATGGTGCATTCCACCGGGTAAAGCAGATGGCCAGTATGGGTACACTGTGGGAAGGCCCTTTGTGCACTGTGGGAAGGCCCCTTCCTAATACCTAAGTTCACAAATATAGGTTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236319 125 + 636262 CAATGCCAGTATGGTGCATTCCACCGGGTAAAGCAGATGGCCAGTATGGGTACACTGTGGGAAGGCCCTTTGTGCACTGTGGGAAGGCCCCTTCCTAATACCTAAGTTCACAAATATAGGTTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 227250 125 + 647215 TAATGCTAGAGTGGTGCATTCCACTAGGTAAACCAGATGCCCAGTATGGGTGCATTATGGAAAGGCCCCTTGTGCACTGTGGGAAGGCCCTTTCCTAATACCTAAGTTCACATATAAAGGTTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 89935 76 + 294542 ATGTACAATTGAGCAATACTATAATAGAGGGAGCTGACAAATCAGGCTGTATTTCCAGGGACCCAATAAACCATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236445 76 + 636262 ATGTACAATTGAGCAATACTATAATAGAGGGAGCTGACAAATCAGGCTGTATTTCCAGGGACCCAATAAACCATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 227375 76 + 647215 AGGTACAATTGAGCAATACCATAATAGAGGGAGCCGACAAACCAGGCCGTATTTCCAGGGACCCAATAAACCATAC - -a -s mr.mrrefChr5 90011 45 + 294542 TGTGTCTCCAGGGCCCCTGTGTGCCGAGTCCATATATTGGTTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236526 45 + 636262 TGTGTCTCCAGGGCCCCTGTGTGCCGAGTCCATATATTGGTTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 227451 45 + 647215 TGTATCTCCTAGGTCCCCATGCGCTGAGTCCATATATTGGTTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 90056 17 + 294542 GCTTGTGGACCTAATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236571 17 + 636262 GCTTGTGGACCTAATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 227497 17 + 647215 GCGTGTGGACCTAATAA - -a -s mr.mrrefChr5 90073 140 + 294542 GGAGCCCAAGTTGGTGAAACTTGTGACCGCTTCACTACCAGTCGCCTGATGTAACATATAATTTTCCCGACTTTTTACTGATACCCTCTCCTCACAAATCTTATATTGGGATGATCACAGATTTGTCCCAAAATGATCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236588 140 + 636262 GGAGCCCAAGTTGGTGAAACTTGTGACCGCTTCACTACCAGTCGCCTGATGTAACATATAATTTTCCCGACTTTTTACTGATACCCTCTCCTCACAAATCTTATATTGGGATGATCACAGATTTGTCCCAAAATGATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 227571 140 + 647215 GGAGCCTAAGTTGGCAAAACTTGTGACTGCCTCCCTACCATTCACCAGATGTAACATGTAATTTTGGTGGTTTTTTACTAATATCCTCCCTTCACACATCTTATATCAGGATGATCACAGAATTGTCTCAAAATGGCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 90213 43 + 294542 CCCTCTATTGCCATCTCCTGCATCCTACATCTTTCATTATTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236728 43 + 636262 CCCTCTATTGCCATCTCCTGCATCCTACATCTTTCATTATTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 227713 43 + 647215 CCCTCTATCGCCATCTCCTACATCCTACATCTTTCATCATTCT - -a -s mr.mrrefChr5 90256 206 + 294542 GATATAAGGTATAACTAGAATTTGTAGAAACCAAGTACCTCAGTGATTCCCCCATATAAATTATGCATAGATGCTGCTCTCATAGGGCTACCTACTTAAATGCAATGCTCCTTTCAACCTAAGCTGCCTGATTAAAGATCATTCCATGGTTACATAAATATGGGTAGCTGTTGGTCACAGGTTTTATCAAAGAGCATGGCCCAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236872 206 + 636262 GATATAAGGTATAACTAGAATTTGTAGAAACCAAGTACCTCAGTGATTCCCCCATATAAATTATGCATAGATGCTGCTCTCATAGGGCTACCTACTTAAATGCAATGCTCCTTTCAACCTAAGCTGCCTGATTAAAGATCATTCCATGGTTACATAAATATGGGTAGCTGTTGGTCACAGGTTTTATCAAAGAGCATGGCCCAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 227756 206 + 647215 GATATACGGTATAACTAGAATACGTAGAAACCAAATACCTGAGTGATTCCGCCAGGTGAATTATGGATAGATGCTGCTCTCATTGGGCTACCCACTTAAATGCAATGCTCCTTTCAACTTCAACTGCCAAATTAAAGATCATTCCATGGTTCCATAAATGTGTGCAGCTGCTGGCCACAGGTTATATCAAAGAGAGCAGCCCAGAT - -a -s mr.mrrefChr5 90462 18 + 294542 GCTGAAGAGTCTAGTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237078 18 + 636262 GCTGAAGAGTCTAGTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 227973 18 + 647215 GCTGAAGAGACTAGTGGA - -a -s mr.mrrefChr5 90480 63 + 294542 ATTTTGTACCCTGGGTGGTTGCCATCCAGTGTGTTTCCTTCATTAAGCTTTGATTAATCACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237097 63 + 636262 ATTTTGTACCCTGGGTGGTTGCCATCCAGTGTGTTTCCTTCATTAAGCTTTGATTAATCACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 227991 63 + 647215 ATTTTGCCCCCGGGGTGGTTTCCATTAACTGCGTTTCCTTCATGAAGCTTTAATTAATCACCC - -a -s mr.mrrefChr5 90543 269 + 294542 GTTCATTGTGTCTGACACATATTATGATACTCCAACATGAAAGGCCAACTTCCATGTTTCTGATAGTGGTGGGTAGGAATAGTTTAAGCATAAAGTGTATGAATCAACAGCCCCCTTACCCTGAGCTGTAATTTATTGTGGATAGTTGCATTATGCAAGCATGAGAAACTAGTGTGCGATCTGGCATCGGCTTTACTGTCTGTTATCTGGGGCATTTTCCAGCAGTTACAGGCTCAGAATTGATAACTCACAAGTAAACCTTCTTACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237245 264 + 636262 GTTCATTGTGTCTGACACATATTATGATACTC----ATGAAAGGTCTACTTCCATGTTTCTAATAGTGATGGGTAGGAATAGTTAAAGCATCAAGTGTATGAATCAACAGCCCCCTTTCCTTGAGCTGCAATTTATTGTGGATAGTTGCATTATGCAAGTATGAGAAACTAGTGTGCGATCTGG-ATCGGTTTTACTGTCAGTTATCTGGGGCATTTTCCAGCAGTTACAGGCTGAGAATCGATAACTCACAAGTAAACCTTCTTACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 228054 269 + 647215 GCTCATTGCATCTGACACATATTATGAAACTCCAACATGAAAGGCCAACTTCCATATCTCTGATAGTGGTGGGTAGGAATAGTTTAAGCATAAAGTGTATGAATCTCCAGCCCCTTTACCCTGAGCTATGATTTATTGTGGACAGTCGCATTGTGCAAGCATGTGAAACTAGTGTTTGATCTGGCATCCGCCTTACTGTCTGTTATCTGGGGCATTTTCCAGCAGTTGCAGGCTCAGGATTGATTACTCACAAGTAAACCTTATTACAG - -a -s mr.mrrefChr5 90812 50 + 294542 TCCAGAACCATAAAAGGTTATCAAGTGGGTTGGGCCTGTTCAAGTAAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237509 22 + 636262 CCCAGAACCATAAAAGGTTATT---------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 228354 50 + 647215 TCCAGAACCATAAAAGCTTATCAAGTGGGTTGGGCCTGTTCAAGTAAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 90862 282 + 294542 TAAAGCAGTATTGCCATTTGGAAGAAATACTAATTTACACCCTCTTCTTTATTTCTAGCACACAACTATTCGAATCATATTCCAAGTGGTTGCCAGCTAACAAGTCATATTGCAAGTGTTTGAATGATATTGTGCCCATTCCCCTGAAACTCTTTGGCTACCCCCATACAAACTTAGGCAGCATACTTGACTGCTTCCCATGTGGCAAGTCCTAGTTCAGCTTTCATGAGAACCATCAAGTGTTTACCAGTGTTGCAAGCATTCACAAGGTCTTCTTAAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237531 274 + 636262 --------TATTGCCATTTGGAAGAAATACTAATTTACACCCTCTTCTTTATTTCTAGCACACAACTATTCGAATCATATTCCAAGTGGTTGCCAGCTAACAAGTCATATTGCAAGTGTTTGAATGATATTGTGCCCATTCCCCTCAAAATCTTTAGCAACCCTCATACAAGCTTAGGCAGCGTACTTGACTGCTTCCCATGTGGCAAGTCCTAGTTCAGCTTTCATAAGAACCATCAAGTGTTTACCAGTGTTGCAAGCATTCACAAGGTCTTCTTAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 228406 277 + 647215 TAAAGCAGTATTGCCACTTGGGAGAAATACTAATTTACACCCTCTTCTTGATCTCTAGTATACAACTATTTGAATCATATAGTAAGTGGTTGCCAGCTACCAAGTCATGTTACAAGTGTTTGAATGAACTTGTGGCCATTCCCCTGAAACTCTGTGACTACCCCCATACAAACCTAGGCAGCATAAC-----GCTTCCCATGTGGCAAGTCCTAGTTCAGCCCTCATGAGAACCATCAGCTGTTGACCAGTGTTGCAAGCATTCACAAGGTATTCTTAAACC - -a -s mr.mrrefChr5 91144 25 + 294542 TATTAGACTAACAGAAAGGTCAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237819 25 + 636262 TCTTAAACTAACAGATAGGTCAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 228683 25 + 647215 TATGAGAGTAACACAAAGGTCAGGA - -a -s mr.mrrefChr5 91169 331 + 294542 AGTTGTGAGAAGATAGGTGGCCCATGTAAAGCTAGGTCATAACATGGCACATCATATTCCACTTAGCTCTATGAGTAACCCTATCCCATGAAAATATTGCTGGTTGTTTCTATAAATAGGGTCCCACCTGTTCTGCATGATGAATACTTGGTTATCTTAATCTTGGTATGTATTTCCACATGTATGCACCTGTAACAGCCAGTGGCATAGTCCTTTGGGTTAGATACAATGACCGGAGTGAACATGTGATTAGCACAATTATCATGTTGTTGCGTTTATCCCAGGACAAATACACCAAAAATGGCCCTCTCATAAATATTATCCCTCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237845 313 + 636262 AGTTGTGAGAAGATAAGTGGCCCATGTAAAGCTAGGTCATAACATGGCACATCATATTCCACTTAGCTCCATGAGTATCTCTATCCCACATAAATCTTGCTGGTTGTTTCTATAAATAGGGTCCCACCTGTTCTGCATGATGAATACTTGGTTATCTTAATCGTGGTATGTACCTCCACATGTATGCACCTGTAAGAG------------------GAGTTAGATACAATGACCGGAGTGAACATGTGATTAGCACAATCATCATGTTGTTGTGTTTATCCCAGGACAGATACACCAAAAACAGCCCTCTCATAAATATTATCCCTGAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 228708 330 + 647215 AGTTGTGAGAAGATAGGTGGCCCATGTAAAGCTAGGTCATAATACGGCACATTGTATTCCACTTAGCTCTATGAGTAACCCTATCCCATGAGAATATTGTGGGTTGTTTCTATTAATAGAGTCCCACCTGTTTTGCATGATGAATACTTGGTTATTTCAATCTTGGTATGCATTGCCAGATGTATGCACCTGTAACAGCCAGTGGCATAGTCCTTTGGTTCGGATA-AATGACCAGAATGAACACCTGATTAGCACAGTTATCAGGTTGTTGCTATTATCCTGAGACAAATACACCAAAAATGGCCCTCTCGTAAATATTATCCCTCAGTT - -a -s mr.mrrefChr5 91500 43 + 294542 GAGACATCTACACCCTAAGATTCTGTCACACCCTATATAAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 238158 37 + 636262 GAGACATCTACACC------TTCTGTCAGACCCTATATAAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 229060 43 + 647215 GAGACATCTACACCCTAAGATTCTGTCACACCTTATATAAGGC - -a -s mr.mrrefChr5 91543 34 + 294542 AGTGGAGCTTCTTTCTGAGTTAGCTTTGGCAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 238200 34 + 636262 AGTGGAGCTTCTTTCTGAGTTAGCTTTGGCAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 229103 34 + 647215 AGTGGGGCGTCTTTCTGAGTTAGCTTTGGCATGA - -a -s mr.mrrefChr5 91577 208 + 294542 CCTAGTAGAATGACACTGAAATTTTATCAATATGCCAAATGACTGCGCATATATCCAATTTGAAGGGTGATTTGATGTTCAAGGGTATTTATTTTCCACAGATGGCATAGTCTCATCATGATGCTAACATGTTGCTACTATTGGATTAGGCTTCTCTAGTGGGATGTATGGTTGCATCTATAGTTGGATTCTGGATGCCGTTTATGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 238234 208 + 636262 CCTAGTAGAGTGTCCCTGAAATTCTATCAATTTGCCGAACGACTGCACATATATCCAATTTGAAGGGTGATTTGATGTTCAAGGGTATTTAATTTCCACAGATGGTGTAGTCGCATCATGATGCTAACATGTTGCTACTATTGGATTGGGCCTCTCTAGTGGGATGTTTGGTCACAGCTATAGTTGGATTCTGGATGCTGTTCATGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 229139 208 + 647215 CTTAGCAGAATGACACTGAAATTTTATCAATATGCCAAATGACTGCGCATATGTCCAATTTGAAGGTTGATTTGATGTTCAAGGGTCTTTATTTTCCATAGATTGCATAGTCTCACTATGATGCTAACATGTTGCTACTATTGGTTTAGGCTTCTCTAGCGGGATGTATGCTTGCATCTGTAGTTGGATTCTGGATGCCGTTTATGAA - -a -s mr.mrrefChr5 91785 446 + 294542 ACTTCTCACTTAAGGATAATACACTGTAATAATTCTTTAGGATAAATTTGGGAAAACTAGTATATTAAAAAGATGTCAGGTGAAACAATGCATGGGGTTGCAGTTCAAGTAAAAAGATTCCCACACCTAACCTACTCATACCTAGGAGTGAAGCAGAGACTGCCTATTGAGAGAAGGACTAGATACTTACTTCATACCCCAGCAGTACAGTATTATACACTATATTATGTACTATTACTCAATCTCATAGTCAGCCATAGGTAGGAATAGAAGTTAGTTGGGCAGAATAGTAAACTGATATGAGTACATACACTCTGTGTCAGTACCTGACCAGTTAAGCCACACGAGTGTCTGTTGATGCTACATGCTAATTGCTGGCTTTGATCTGAGGGTGAAAATAAAATGCTTTTCATCTTGACATATATGTGGATACAGAAATGATTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 238443 445 + 636262 ACTTCTCACTTAAGGATAATACACTGTAATAAATCTTTAGGATAACTTTGAGAAAACTATTATATTAAAAAGGTGTCAGGTGAAACAATGCATGGGGTTGCAGTCCAAATAAAAAGATTCCCACACCTAACCTACTCATATCTAGGAGTGAAGCAGAGACTGCCTATTGAGAGAAGGATT-GATACTTACTTCACATCCCAGCAGTACAGTATTATGCATTATATTATGTTCTATTACTCAATCTCATAGTCAGCCAGAAGTAGGAATAGAAGTTAGTTGGGCAGAATAGTAAACTGATATGAGTACATACACTCTGTGTCCGTACCTGACCAGTTAAGCCACACGAGTGTCTGTTGATGCTACATGCTAGTTGCTGGCTTTGATCTGAGAGTGAAAATAAAATGCTTTTTATCTTGACATATATGTGGACACAGAAATGATTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 229347 443 + 647215 ACTTTTCACTTAAGGATAATACACTGTAATAATTCTTTAGGATAAATTTAGGAAAACTAGTATATTAAAGAGATGTCTGGTGAAATAATGCATGGGGTTGCAGTTCAAGTTAAAAGATATTCACACCTAACCTACTCATACCTAGCAGTGAAGCAGAGACAGCCTCTTGAGAGAAGCACCAGATACTTACTTCATGCCCCAGCAGTACAGTATTATACACTATAA---GTACTATTACTCAATCTTATAATCAGGCATAGGTAGGAATAGCACTCATTTAGGAAGAATAGTAAACTGATATGAGTACATACACTCCGTGTGAGTACCTGACCCGTTAAGCCACACAATCATCTGTTGATGCTACATGCTAATTGCTGGTTTTGATCTAAAGGTGAAAATAAAATCCGTTTCATCTAGACATTTATGTGGATACAGAAATGATTAGT - -a -s mr.mrrefChr5 92231 100 + 294542 TTTTACCTGAACATGTTTGTGTAGAATATACAATGCAAAAACACATGTACATGCTGTTTCTATAACATACCTGTGAAGTATTACTTTCCATAAAAACACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 238892 100 + 636262 TCTCACCTGAACATGTTTGTTTAGAATGCACAATGCAAAAACACATGTACATGCTGTTTCTATGACATACCTGTGAAGTATTACTTTCCATAAAAACACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 229790 100 + 647215 TTTTACCTGAACATGTTTATGTGGAATATACAATGCAAAAACACATGTACATGACATTTCTAAAACATACCTGTGAAGCATTGCTTTCCACAAAAACACT - -a -s mr.mrrefChr5 92331 99 + 294542 GGCACAAGGAGACTATCGCCCCCTCATGCTTAAATATCACCATGTTTGCAACAGGTTTGCTCTGAACTTGGAAAAGAGAGCTATATGTTTGGTCATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239000 99 + 636262 GGCACAAGGAGACTATCGCCCCCCCATGCTTAAATATCACCATGTTTGCAGTAGGTTTGTTCTGAACTTGGAAAGGAGAGCTGTGTGTTAGGTCATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 229890 84 + 647215 GGCACAAGGAGACTAATTCCTCCTCATGCGTAAATAT----ATGTTTGCAACAGGTTTGCTCTGAGCTTGGGAAAG-AAG--AGAAGGTTG-------- - -a -s mr.mrrefChr5 92430 50 + 294542 TATCTTGGAAGATAGTGTGGAAGATCAGCATATGCCAAGTTTTGTCTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239307 50 + 636262 TATCTTGGAAGATAGTGTGGAAGATCAGCATATGCCAAGTTTTGTCTATT - -a -s mr.mrrefChr5 92480 143 + 294542 ACTTTCCCTACATGTGGGCAAAATAATTCCCCCAGTTATTGCCAAAGGAACTGCACTGTTAACTCAGATCCTCTGTCTTGGTGCCAAGAGGCAGGCTAGTATCTTTGCAGATTTGTTGCTCTAGGATTGGTATGCAGATAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239364 143 + 636262 ACTTTCCCTACATGTGGGTAAAATAATTCCCCCAGTTATTGCCAAAAGAACTGCACTGTTGACTTAGATCCTCTGTCTCAGTGCCAAGAGGCAGGCTACAATTTTTGCAGATTTGTTGCTCTATGATCAGTATGCAGATAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 229974 133 + 647215 ----------CAAGTGGGCAAAGTAATTCCCCCAGTTATTGCCAAAGGGCCTGTACTGTTATCTCAAATCCTCTGTCTTGGTGCCTAGAGGCAGGCTAGTATCTTTGCAGATTTGTCACTCTAGGATTGGTATGCAGATAGAG - -a -s mr.mrrefChr5 92623 265 + 294542 GACTCTTAAGGATTCCAACATCTGCTATGTGCAATTCAACCCTCCTGAGATTCTGGGTTGCAAAATTAGAAATATCATTGAGATATTCCTTAATTTAAGTGGACATGAATTAGCAAATGATATGACATCAGTGACCCTAACTACATGTGTCCACCAGATTAACTTCATTTTCTGTGATGACAAAATTGTTTGTCATCAGGGCTGATTGTAGATGGTCTATGGCCTGAAAAGATAGCCAAAGCAGAAAATGAACAACTACTTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239509 263 + 636262 GGCTCTTAAGGATCCCAACATCTGCTATGTGCAATTCAATCCTCCTGAGATTCTGGGTTGCAAAATTCGAAATATCATTGAGATATTCCTCAATTTATGTGGACATGAATTAGCAAATGATATGACATCAGTGATCCTAACTA--TGTGTCCACCAGATTAACTTCATTTTCTGTGAGGACTCAATTGTCTCTCATCAGGGCTGACTGTAGGTGGTCTATGACCCGAAAAGATAGCCAAGGCAGACAATGAACAACTACTTTGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 230108 262 + 647215 AACTCCTAAGGATTCCAACATC--CAATGTGCAATTTGCCCCCCCTGACATTCTGGTTTGCAAAATCAGAAATATCATTGAGATATTCCTTAATCTAAGTGGACATGTATTAGCAAATGATATCACATCAGTGACCCCAACTACATGTGTCCGCCAGATTAACTTCATTTTCTGTGATGACAAAATTGTTTGTCTTCAGGGCTGATTGTAGATGGT-TATGGCCTGAAAAGATACCCAGAGCAGAAAATGAACAACTACTTTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 92888 110 + 294542 TCAAAGGCCTCAACATTTCAAGCTGTACTGAGATGTTAGCCCAACTTCCAGTCCTAACCAGTAGTACTTCCAGGCCAGACAACAATAGTTTACTCCCATCAATTTGGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239772 110 + 636262 TCAAAGGCCTCAACATTTGAAGCTGTACTGAGATGTTAGCCCAACTTGCAATACTAACCAGTAGTACTTCCTGGCCAGACAACAATAGTTTACTCCCATCAATTTGGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 230372 110 + 647215 TCAAAGACCTCAACATTTCAACTTGTACTGAGATGTTAGCCCAACTTCCAGTCCTACATAGTAGTACTTCCAGACCAGACAACACTAGTTTACTCCCATCACTTTGGGGG - -a -s mr.mrrefChr5 92998 27 + 294542 TTATACAAAGTATTACAACTGGTGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239886 27 + 636262 TTATACAAAGTATTACAACTGGTGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 230482 27 + 647215 TTATACAAAGTATCACAACTGGTGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 93025 24 + 294542 TTAGCTATCAGCCTGGAGGATGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239919 24 + 636262 TTAGCTATCAGCCTGGAGGATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 230509 24 + 647215 TTAGCTATCAGTCTGAAGGATGCT - -a -s mr.mrrefChr5 93049 166 + 294542 GGATTGCACCCTCATATACTCATGTTACCTGTCTCCTGTTACCTGTTTGCAGTAGATGCTTGGGTAAAGTAGCAGCTAAAGGCTATGATCCACCATTCACTGCTCATAAGAGTGAACATGGATCCCAATGAAGCAGGCTAGTGAGGTTAGACTCCAAATTACTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239944 165 + 636262 GGATTGCACCCTCAGATACTCATGTTACCTGTCTCCTGTTACCTGTTTGCAGTAGATGCTTTGGTAAAATA-CAGCTAAAGGCTATGATCCGCCATTCACTGCTTATAAGAGTGAACATGGATCCCAGTGAAGCAGGCTAGTGAGGTTAGAATCTAAATTACTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 230533 152 + 647215 GGATTGCACCCTCATATATT--------------TGTGTAACCTGTGTGCAGTAGATGGTTGGGTAAAGTAGCAGCCAGAGGCCACAATCCACCATTCACTGCTCATAAGAGTGAATATGCATCCCAATGAAGCAGGCTAGTGAGGTTAGACTCCAAATTAATTTA - -a -s mr.mrrefChr5 93215 370 + 294542 GGGGTGCCACAACAATGGTGAATCGACTGCCCTCTGGGGCTATAATCTTCTCACATACCTCACCGCAACCATCAGTGAAGGACCAGGTTTAACTATGTCCACGTAGGTCTTGAGTATTACCCCTTCCCCATTGAGGGGATCTTATACGGGGAGAAAATTTCCTTATGGATACTTTTAGAGTATACTCTGATAATACGGTCAGCCCATTTATATATGCTTTGCCTTGCAACAACCTAGCAGAGTTCAAGCGCACTCAGCTGGCAGGATTATTGACCCTATGAGTGAATTAAGGGTCGCATTGTGGGTAATAATGATGTGTCCAAAATAGCATTCAGATTTAAAGTGGTCTCCAAGTCTCTCCTGTCAGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240109 353 + 636262 GGGGTGCCA-ATAAATGGTGAGCCGACTGCCCTCTTGGGCTATAATCTTCTCACCTATCTCACCGCAATCATC---------------TTGACTATGTCCACGTTGGTCTTGAGTATTACCCCTTCCCCATTGAGGGGATCTTATAC-AGGAGAAAATTTCCTTATGGATACTTTTAGAGTAAACTCTGATAATACGGTCAGCCCATTTATATATGCTTTGCCTTGCAACAACCCAGCAGAGTTCAAGCGCACTCAGCTGGCAGGATTATTGACCCTATGAGTGAATTAAAGGTCGCATTGTGGGTACTAATGATGTGTCCAAAATTGCATTCAGGTTTAAAGTGGTCTCCAAGTCTCTCCTGTCAGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 230687 356 + 647215 GGGCTGCCACAACAATGGTGAATCAACTGTCCTCTGGGGCTATAATCTTCTCACATACCTCACCGCAACCAACAGTGAAGGACCAGGTTTAACTATGTCCACGTAGGTGTTGAGTATTACCCCTTCCAGATTGAGGGGATCTTATACGGGGAGAAAATTTCCCTATAGACATTTTTAGAGTATACTCTGATAACACTGTCAGCCCATTTATATATGCTTTGCCCTGCAACAACCTAGCA-AATTCAAGGGCACTCAGCTGACAGGGTTATTGACCCTATGAGTGAATTAAGGGT-------------ATAATGATGCGTCCAGAATAGCATTCAGATTTAAAGTGGTCTCCAAGTCTCTCCTGTCAGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 93585 79 + 294542 TGTATAAATGATAATCAATGTGACTTCGGCCTTTTTTACAGTCCCGAGCACTTATAGAACTCAATCCAAATTGTACTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240491 78 + 636262 TGTATAAATAAAAATCAATGTGGCTTCAGCCTTTTTTA-AGTCCCAAGCACTTATAGAACTCGATCCAAATTGTACTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 231043 79 + 647215 TGTATAAATGGTAGTCAATATGACTTTGGCCTTTCTTACAGCCCCGAGCACTTATAGAGCTCAATCCAAATTGTACTTA - -a -s mr.mrrefChr5 93664 9 + 294542 GGGTCCTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240574 9 + 636262 GGGTCCTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 231122 9 + 647215 GGGTCCTTC - -a -s mr.mrrefChr5 93673 65 + 294542 TAGCCACCCCTTGTTCCTCTCTGACAGGGAAGATTACATCAACACTTTTTAATACATGATTATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240614 61 + 636262 TAGCCACCCCTTGTTCCTCTCTGACAGGGAAGATTACATCCACACTTT----TACATGATTATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 231131 65 + 647215 TAGCCACCCCTTGTTCCTCTCTGACAGGGAAGATTACATCAACACTTTTTAATCTATGATAATTC - -a -s mr.mrrefChr5 93738 49 + 294542 TAGTTCTTGGCGCATTTTTCTGTACTAGTCATATCATAACTAAGGTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240675 49 + 636262 TAGTTCTTGGCGCATTTTTCTGTACTAGCCATATCATAACTAAGGTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 231197 49 + 647215 TAGTCCCTGATCCATTTTTCTCTACTAGTCATATCATAACTAAGGTAAG - -a -s mr.mrrefChr5 93787 152 + 294542 CTAGAATGGAATCAGGACCTAGGAGACTGAACCATCTAAAACACACAAGGTATATCCCCATACTCTTACTGGTGATGTGATGAAGTATTCACATGCTTAAGTCTTGTGAGCATTTAGGTAATAATAAGCTACTGGAGTAATCAACTTGCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240725 151 + 636262 CTAGAATGGAATCAGGACCTAGGAGACTGGACCATCTAAAACACA-AAGGTATATACCCATACTCTGAGTGGTGATGCGATGAAGCATTCACATGCTTAAGTCTTGTGAGCATTTAGGTAATAATAAGCTACTGGAGTAATCAACTTGCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 231246 136 + 647215 CTAGAATGGAATCAGGATCTAGGAGACTGAACCATCTAAAGCACACAAGGTATAGCACCATACTATTACTGGTGATGTGAGGAAGTATACACATGTTTAAGTCTTGTGAGTATTTAGGTAATAATGAGCTACTGGA---------------- - -a -s mr.mrrefChr5 93939 161 + 294542 TACTTGTTAATAAGTGACATAGAGCCTAGAAATTAGTAGCTTTCTTAGAAGGACACCAGCCACATCATTACATGTCTACAAGAATTCAGGGCATCAAAAACATGAGAGAGTGGGGACTCTTCAAGGTCAGTGAAACGAGGAGATTTAGGATGTTGATAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240881 161 + 636262 TACTTGTTAATAAGTAACATAGAGCATAGAAATTAGTAGCTATCTTAGAAGGACACCAGCCACATCATTACATGTCTACAAGTATTGAGGGCATCAAAAGCATGAGTGAGTGGGGACTCTTCAAGGTCAGTGAAATGAGGAGATTTAGGATGTTGATAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 231382 160 + 647215 TCCTTCTTAATAAGTGACATAGAGCCTAGAAATTAGTAGCTTTCTTAGAA-GACACCAGCTACATCATTACATGTCTACAAGAATTCAGGGCATTAAAAACATGAGAGAGTGGGGGCTCTTCAGGGTCAGTGAAACAGGGAGATCTATGATGTTGATAGTT - -a -s mr.mrrefChr5 94100 63 + 294542 ATAATCACCTGTTATTCTTCCTACAGTATTTTGTCTCAGTGTGGCAAATGTTTGATACTTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241042 61 + 636262 ATAATCACCTGTTATTCTTCCTACAGTATTTTGTCTCAGTGTGGCAAATGTTTGATACTTT-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 231543 63 + 647215 ACAGTCACCCGTTATTCTTCTTAAAGGGTTTTGTCTCACTATGGCAAGTGTTTAATACTTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 94163 170 + 294542 TCTAATTCTATGAAGGAGTATTGTACTGTTGATCTACTCTAGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGCAATCACTATCATCCTTAATGATGTGGCTAACGGCATCTGGTTCATTGGTATTTCACTAACTCAACCTTGGGTAGATACTCTAGCTACTACATCTTTCCTCCCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241103 166 + 636262 TCTAATCCTATGAAGGAGTATTGTACCGTTGATCTA----GGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGAAATGACTAGCATCCTTAATGATGTGGTTAATGGAATTTGGTTCATTGGTATTTCACTAACTTAACCTTGGGTAGATACTCTAACTACTACATCTTTCCTCCCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 231607 170 + 647215 TCTAATTCTCCGGAGGAGTATTGTACTGTTGATCTACTCTAGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGCAATCACTATCGTCCTTAATGATATGGCTAACGGCTTCTAGTTCATTGGTATTTCACTAACTCAACCTTGGATAGATGCTCTAGCTACTACATCTTTCCTCCCCCC - -a -s mr.mrrefChr5 94333 28 + 294542 AGTAGAGGCCGTACACATTTGGGAACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241270 28 + 636262 AGTAGAGACCGTACACCTTTGGGAACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 231777 28 + 647215 AGTAGATGCGGTACACATTCGGGGAATG - -a -s mr.mrrefChr5 94361 83 + 294542 GGGACACTGGCAGATATGGCTCCAGAAAGATTGACTTTGGTTGACATAAGGGGTACATCAGAGCTGGGATCAGTGGTAATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241298 83 + 636262 AGGATACTGGCAGATATGGCTCCAGAAAGATCGACTTTGGTTGACATAAGGGGTACATCAGAGCTGGGCTCAGTGGTAATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 231812 83 + 647215 GGAACACTGGTAAATATGGCTCCAGATAACATGACTTTGGTTAACATTGGGGGTACATCAGACCTGGGATCAGTGGTAATCAA - -a -s mr.mrrefChr5 94444 125 + 294542 CCCTCACAACAAAAATTAAGGATGCAATGGCAATCGTGCCATCCATTGAGTGGGTAAGCTTTTGATGATACCATGACTGCCTTATTGAAAAGCTAAACACACTGATAGCAAAAACTGTAATCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241385 125 + 636262 TCTTCACAACAAAAATTAAGGATGCAATGGCAATCATGCCATCCATTGAGTGGGTAGGCTTTTGATGATACCATCACTGCCTTATTGGAAATCTAAACACATTGATAGTAAGAGCTGTAATCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 231895 119 + 647215 CCCTCACAACAAGAATTAAGGAGGCAATTGCAATTGTGCCATCC------TGAGCAAGCTTCTGGTGATTCCAGGGTGGCCTTATTGAAAAGCTAAACACACTGATAGCAAAAACTGTAATGCAA - -a -s mr.mrrefChr5 94569 82 + 294542 CCATGAGTAGGAAGCAGCACCTGTTTATTTGCACACCTGGATGCATTTGACTGCATTCTTCACCCCTTAATATCCTCACAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241512 82 + 636262 CCATGAGTAGGAAGCTGCACTTGTTTATTTGCACACCTGGATGCATTTGACTGCATTCTTCACCCCTTAATATCCTCACAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 232014 82 + 647215 CCATGAGTAGGAGGCAGCACCTCGTTATTTGCATGCCTGGATGGCTTTGACTGCATTCTTCACCCCTTAATATCTTCACAGA - -a -s mr.mrrefChr5 94651 50 + 294542 TCCAGGAGGTCACATCTTGATCCCCACTCAGAATGGAGAGCTTTGGTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241596 50 + 636262 TCCAGGAGGTCACATCTTGATCTCCACTCAGAATGGAGAGCTTTGGTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 232096 50 + 647215 TGCAGGCGGTCACATCTTGATCCACACTCAGAATGGAAAGCTTTGGTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 94701 96 + 294542 AGTTGAAGTCTTGGCTGGTCACTTACATATTGGGCAGCCAAGTTCTCAAGTGTGTCTCTCACATGTGGCTTATTGCAGGACAGTCTAATTGAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241646 88 + 636262 AGTTGAAGTCTTGGCTGGTCACTTACATATTGGGCAGCCAAGTTCTCAAGTTTGTCTCTCACATGTGGCATATTGGAGGACAGTCTAA-------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 232147 96 + 647215 AGTAGAAGTCACAGCTGGTCACTCACTTATTGGGCAGTTAAGTTCTCAATTGTGTCCCTCACATGTAGCTGATTGCAGGACAGTCTAATTGAGCAA - -a -s mr.mrrefChr5 94797 55 + 294542 CCGTTCCATAAAGTTTTAAAGGAACCTGTATCATGAAGTGGACCTCAATATGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241734 55 + 636262 CCGTTCCAAAAAGTTTTAAAGGAACCTGTATCGTGAAGTGGACCTCAGCATGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 232246 55 + 647215 CCGTTCCATAGAGTTTTAAATGAACCTGTATCATGATGCGAACCTCAATATGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 94852 103 + 294542 ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATAAATGTGGGAATGTACAAAGCCAGTAGAAAAACATGCCTCTGTAATGACATCGACTGTTACACTGTAAGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241789 101 + 636262 ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATAAATGTGGGAATGTACAAAGCCAGT--AAAAACATGCCTCTGTAATGACATCGACTGTTACACAGTACGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 232302 98 + 647215 ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATGAATGTGGGAATGTA-----CCAGTAGAAAAACATGTCTCTTTAATAACATCGACTGTTACACTGTTAGCAG - -a -s mr.mrrefChr5 94955 208 + 294542 TGAGCTACAGCAGGAGTAGACCTCAGAATGACCTAGGATAACATACGGTAATCGGCCCACGAAGTGAATCAGCTAACCATGTGAGTTGTGAGTTTAACTTAATACTTCTAGTACTCACACAATGCAAGGTATCATTTAGAGCCCCCAGCTGTAGTGAGGGTTCACTTCAGAAGACCCTGGGATTACACATGGAGACTCCTGGAGAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241917 200 + 636262 TGAGCTACAGCAGGAGTAGATCTCAGAATTATCTAGGATAACATGCAGTAATCTGCCCACGGAGTGAATCAGCTAACCTTGTCAGTCGTGATTTTAACTTAATACTTCCAGTACTCACACAATGCTAGGTATCATTTAAAGCCCCCAGCTGTGGTGAGGGTT--------AAGACCCTGGGATTACACATGGAGAGTCCTGGAGAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 232400 208 + 647215 TGGACTACAGCAGCATTAGGCCTCAGAATGCCCAAGGATAACATATGGTAAGCGGCCCAAGAAGTGACTCGGCTTACCACATGAGTTGTGAGTTTTACTTAATACTTCTAGTACTCTCACAATGCAAGGAATCGTTTGGAGCCCCCAGCTGTAGTGAGGGGTCACTTCAGAAGAGCCTGGGATTACATATGGAAACTACTGGAAAGGT - -a -s mr.mrrefChr5 95163 94 + 294542 GTCACAGGTAGTCACAGGGCTTGTGGGCATGTTTTGAACTTTACAGTGATGGATGGCACATGCCATGAATATACCGCAAATACCTCTTGAATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242117 66 + 636262 ----------------------------ATGTTTTGAATTTTACAGTGATGGATGGCACATGCCATGAATATACCGCAAATACCTCTCGAATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 232616 94 + 647215 GTCACAGGTAGTCACAGGGCTTGTGGGCATGTTTTGAACTTTACAGTGATAGGTGACACATGCCATGAATAGACCACAAATACCTATTAAATAA - -a -s mr.mrrefChr5 95257 97 + 294542 CTGTAGTCTACTTAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGTGAGGCCCATTTTCTAAGGTTCCCAGCACCATAAAGAAATCCAGCAGGGCGCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242194 97 + 636262 CTGTAATTTACTTAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGCGAGGCCCATTTTCTAAGGTTCCCAGCACCATAAAGAAATCCAGCAGGGTGCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 232710 97 + 647215 GTGTAGTCTACTCAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGTGAGGCCCATTTCCTAAGGTCCCCAGCATCATAGAGAAATCCAGCAGGGCGCAAT - -a -s mr.mrrefChr5 95354 77 + 294542 GTGAACAAGCCTATCAATTTGTGAATGTATGCTATTTCCTAAAATTGAGGTCAGAACAGGCATGTTCTGAGATCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242295 57 + 636262 GTGAACAAGCCTATCAATTTGTAGATAT--------------------GGTCAGAACACGCATGTTCTGAGATCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 232807 77 + 647215 GTCAATAAGCCTATCAATTTGTGAATGTATGCTATTTCCTAAAATTGAGGTCAGAAAAGGCATGTTCTGAGATCTGG - -a -s mr.mrrefChr5 95431 369 + 294542 GTTCTGAGATCTTGACCCAGAATACATTTAGTACGATTCTTTTGTGAGCTCTCAGTCAGATGAAACAAGAGACATGCAAGATTCTAAATGCCTTGTGAAGTAAGTCAGATTGTGAGGACCCAGATTAGGAGACATATATGGATTGACTGTCCCACTAAGCTTGCTGCACATCACTAAGCGAGCCTCCAGATGATTTACATCTTACCATAGTTTTTCCTTTGCCATTGTGAAAGGCTACAAAAAGTAATGCGTACTCTCTAACAATGATGTGAGTCAGTCTTGATAGGTTGTCAGGATTAAGTGATATATATCAGTAGATGATACACTAGATGATATGAAACGCTAGACCTCTTACAATCATGGGCTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242354 364 + 636262 GTTCTGAGATCTTGACCCAGAATACATTTAGTACGATTCTTCTGTGGGCTTTCAGCCAGATGAAACAAGAGACATGCAAGATTCTAAATGCCTTGAGGAGTAAGTCAGTTTGTGAGGACCCAGATTAGGAGACATGTATGGATTGACAGTCCCACCACGCTTGCTGCACATCACTAGGCGAGCCTCCAGATGATTTACATCTTACCATAGTTCTTCCTTTGACATTGCGAAAGGCTACAAAACATATTGCATACTTTCTAACAATGATGTGAGTCAGTCTCGACAGGTTGTCAGGATTAAGTGATGTATATCAGTAGATGATACACTAGATAATATGAAACACTAGACCTCTTATAATCATGGG----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 232884 326 + 647215 ------------------------------GTACACTTCTTTTGCGAGCTCCCAGTTAGATGAAACTGGATA-------------AAATGCCTTGTGAAGTGAGTCAGATTGTGAGGTCCCAGATTAGGAGACATATATGGATTGACTGTCTGATTAAGCTTGCTGCACATCGCTAAGCAAGCTGCCAAATGATTTATATATTACCATAGTTTTTCCTTCGCCATTGTGAAAGGCTACAAAAAGTAATGCGTACTCTCTAACAATGATGTGACTCAGTCTTGTTAGGTTGTCAGGATCAAGTGATACATCTCAGTTAATGATACATTAGATGATGTAAAACGCTAGACCTCTTCCAATCATGGGCTCAC - -a -s mr.mrrefChr5 95800 8 + 294542 AAtccAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 689 8 - 636262 AATCCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 352577 8 + 647215 ccaccTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 66880 3 - 647215 AA-----A - -a -s mr.mrrefChr5 95808 24 + 294542 GACTTCGAAGTCGCAAACAAAGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242718 24 + 636262 GACTTCAAATTCACAAACAAAGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 697 24 - 636262 GACTTCGAAGTCGTGAACAAAGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 352588 24 + 647215 GGCTTCTAAGTCGCAAACAATGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 66883 19 - 647215 GG-----AAGTCGCAAACGAAGCA - -a -s mr.mrrefChr5 95832 4 + 294542 TACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242742 4 + 636262 TACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 721 4 - 636262 TACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 66902 4 - 647215 TATG - -a -s mr.mrrefChr5 95836 61 + 294542 CAAGGCAGTCGCATACCAGAGTGCTCAGTTAGCAAATCGTCTCGAGCGAATCATGACCGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242746 61 + 636262 CGAGGCAGTCGTATACAAGAGTGTTCAGTTAGCAAATCGTCTCGAGCGAGTCATGACCGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 725 61 - 636262 CAAGGCGGTCGCATACCAGAGCGCTCAGTTAGCAAATCGTCTTGAGCGAATCATGACCGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 352612 61 + 647215 CAAGGCTATAGCAGACCAGAGGACTCAAATGGTGGATAATCCCGAGCCAATAATGGCTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 66906 61 - 647215 GGAGGCCATAGCATACCAGAGTGCTCAAGTGGCAGATAGTCCTGAGCTAATAATGACTGTG - -a -s mr.mrrefChr5 95897 19 + 294542 GGCCCAGACAGTACGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242807 19 + 636262 GGCCCAGACAGTATAATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 786 19 - 636262 GGCCCAGACAGTACGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 66967 19 - 647215 GGGCCACACAATTCGATGT - -a -s mr.mrrefChr5 95916 31 + 294542 AGCACTCACTGGTTATTAAGACTTTCGTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242826 31 + 636262 AGCACTCACTGGTTATTAAGACTTTCGTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 805 31 - 636262 AGCACTCACTGGTTATAACGACTTTCGTGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 67036 12 - 647215 AGCACTCATTAG------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 95947 25 + 294542 CATTATTACCAACGAATTTTGGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242877 25 + 636262 CATGGTTACCAACGAAGTTTGTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 836 25 - 636262 CACTATTTGCAAAGAATTTTAGATT - -a -s mr.mrrefChr5 95972 19 + 294542 TCTCCACACAAAACACAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242902 19 + 636262 TCCCCACACAAAGCACCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 958 19 - 636262 TCTCCAATCAAGAAACAAG - -a -s mr.mrrefChr5 95991 4 + 294542 GCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242921 4 + 636262 GCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 987 4 - 636262 GCCA - -a -s mr.mrrefChr5 95995 2 + 294542 CT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 994 2 - 636262 CT -s simRat_chr6.simRat.chr6 352673 2 + 647215 CT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67048 2 - 647215 CT - -a -s mr.mrrefChr5 95997 110 + 294542 CGTTTATCACGGCCACATGAGTCCCCCTATCCCAATTTGAAATGTGTcactcatgggctcgcttatgatggccagtggtcaaggcctcggattcacctcgcacatgaaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242925 97 + 636262 CGTTAGTCACCGCCACATGAGTCCTCCTTTC-------------TGTcagtcatgggctcgcttatgatggccagtggtcaaggcctcggattcaccttgcacatgaaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 996 7 - 636262 TGCTTTT------------------------------------------------------------------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 352675 110 + 647215 CGTTTATCACGGTGACATGAGTCCCTTTATCCTGATTTGAAATGTGgcacttagggggtcgtctatgatggcctgtggccaaggcctcggattcacctcgcacatgaaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 67050 110 - 647215 CGTTTATCACGGCCACGTGGGTCCCCCTATCCCAATTTGAAGTGTGAcactcatgggctcacttatgagggccagtggtcagggcttcggattcacctcacacacaaaag - -a -s mr.mrrefChr5 96107 103 + 294542 atggtacttcctgtacaacggttccaccgaacatgatgtcaggtcactgggtcagtacagatgccgagggcagagtcccccccacagaatcgcctaccccatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243022 103 + 636262 atggaacttcctgtacaatggttccagcgaatatgatgtcaggtcactgggtcagtactgatgccgagggcagagtcccccccacagaatcgcctaccccatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 353021 103 + 647215 atggtccttcgtgtacaacggtaccaccaaacatgatgtcaggtcactgcgtcagtacagatgccgagggtggcgtcccacccacaaagtcacccaccccact -s simRat_chr6.simRat.chr6 67160 65 - 647215 atggtacttcctgtacaacagtgccactgtacatgatgtcaggtcgctgggtcagtacagatacc-------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 96210 10 + 294542 TAGGTATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243131 7 + 636262 CAAGTAT--- -s simRat_chr6.simRat.chr6 233210 10 + 647215 TAGGTATAGC - -a -s mr.mrrefChr5 96220 42 + 294542 CAGTCTCAAGAAGAGTTAGGGTGCTTCGTGGTGAATTTCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243138 41 + 636262 -AGTTTCAAGAAGAGTTAGGGTGCTTCGTGGTGAATTTCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 233221 42 + 647215 CAGTCTGAAGAAGAGTTAGGGTGCTTTGTGGTGAATTCTTGG - -a -s mr.mrrefChr5 96262 148 + 294542 CTATCTTCCATTGTGAGACCCAACTGGGTTCTATCTGAAGCTTTACTGCATCAATCAGGCAGTGAACTATAGTCTTGTTTTGTCTTTTAACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAATAGGGGCTTTAAGCGTTTGCATGTATTAATACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243184 148 + 636262 CTATCTTCCATTAGGAGAACCAACTGGGTTCTATCTGAAGCTTTACTTCATCAATCAGGCAGTGAACTATAGTCTGGTTTTGTTCTTTAACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAATAGGGGCTTTAAGCGTTTGCATGTATTAATACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 233263 136 + 647215 CTATCTTCTGTTGTGAGACCCAACTGGGTTCTATTTGAGGCTTTACTGC---------GCAGTGAACTATAGTCTTGCTTTTTCTTTTGACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAACA---GCTTTAAGTGTTTGCATGTATTGATACA - -a -s mr.mrrefChr5 96410 255 + 294542 TTCCCTAGCACATACATTTAAGAGTCAGGATGAATAATTGAGAGAGAAGTGATGCTTGAACTCAAGAACGCAGAACTGGAATGTATGAATGACTTAACCATGAATTCAGACTGTAATGCACTCCTACGCTAGATATCCTAGACTCTGTATCAATGAGAGCTGCAGCCGAGTAGCTTCTTATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTTGCCCTGTTAAGCCTTACTTTGATATGTTTCCTTGAGACTATCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243333 243 + 636262 TTCCCTGGCACATACATTTAAGAGTCAAGAAGAATAATTGAGAGAGAAGTGATGCTTGAACTCAAGAACGCAGAACTGGAATGTATAAATGACTTAACCATGAAAACAGTC--TAATGCACTCCTACGCCAGATATCCTAGACTCT-TGTCAATGAGAGCTGCAACCTAG--------CATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTCGCCCTGTTAAGCCTTACGTTG-TATGTTTCCCTGGGACTATCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 233399 254 + 647215 TTCCCTAGCACATACCATTAGGAGCCAGGATGAATAACTGAGAGTGAAGTTATGCTTGAATTCAAGAA-ACAGAACTGGAATATATGAATGACTTAACCATAAATTCAAACTGTAATGCACTCCTTCTCTAGATATCCTAGACTCTGCATCAATGAGAGCTACAGTAGAGTAGCTTCTTATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTTGCCCTGTTAAGCCTTACTTTGATGTGTTTCCTTGAGACTATCG - -a -s mr.mrrefChr5 96665 319 + 294542 TGATCGCACACCATTATTGCATTACTGGTTGGGTTGGCCTTCTCTCATCACATATAATGTCTAATACGGAGTTGCACAAAGTTTTAGTACCTGCTGTTGGTCATTAGGGAAACATAATGTGATATTTAAAGTAGAAGATGATGGCCTTGTCCTGCCTCATTCTTGAGATCTACATTTTATTAGTAAAAATTGGGTTCACCTATCACCTGTATAGATAATTCATAGTTGTGGTAGATGCACCTTTACCCTAAACATGGAAATTCAACAGATTGAGTGACTTTAGTGACCACATGATGGGTCAGTCCTGCCCTTTAGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243592 309 + 636262 TGATCGCACACCCTTAT--CATTACT-GTTGGGTTGGCCTTCTCTTATCACAT-TATTGTCTAACACGGAGTTACACAAAGTTTTAGTA------GTTGGTTATTAGGGAAACATAAAGTGATATTTAAAGTAGAAGACGGTGGTCTTGTCCTGCCTCATTCTTGAGATCTACATTTTATTAGTAAAAATCGGGTTCACCTATCACCTGTAGATGAAATTCATAGTTGTGGTAGATGCACCACCACCCTAAACATGGAAATTCAACCGATTGAGTGACTTCAATGACCATACGATGGGTCAGTCCTGCCCTTTAGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 233653 318 + 647215 TGATCGCACACCATTATTGCATTACTGGTTGGGTTGGTCTTCTCTCATCACATATAATGTGTAATACAGAGTTGCACAAAGTTTTAGTACCTGCTGTTGGTCATTAGGGAAACATAATCTGATATTTAAAGTAGAAGATGATGGCCTTGTCCAACCTCATTCCTGAGATCTACATTTTAACACTAAAAATTGGGGGCACCTATCACCTGTATAGATAATTTATAGTT-TGGTAGATGCATCTTTACCCTAAACATGAAAATCCAACAGATTCAGTGACTTTGGTGACCGCATGATGGGTCTGTCCTGCCGTTTAGCACA - -a -s mr.mrrefChr5 96984 200 + 294542 CAAATGGAGGAAGGACATTCACTACAAGATATAATTATTCACATTACAGGATTTTTCGTTGTTTATCCTCCTTGGGTTGTGGTTCATCAAGATGAAAGTTCTTCTCCAGTTGTGGTATGTTGGAACTAAGATACCATTAAACAAAAATAGTGAACAATATATCACCTCCTCTCGTGACTTGATGGAAAGATAGCTAGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243902 199 + 636262 CAAGTGGAGGAAGGACATTCACTACAAGATATGATTACTCACACTACAGGATTTTTCGTTGTTTATACTCCTTGGCTTGTGGTTTATCAAGGTGAAAGTTCTTCTCCAGTTG-GGTATGTTGGAACTGAGATACCATTAAACAAGAATAGTGAACAATATATCACCCCGTTTCGTTACTTGATGGAAAGATAGCTAGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 233971 200 + 647215 CAAATGGAGGTAGGATATTCACTACAAGACATAATCATTCACATTACACGCCTCTTCATTGTGTATCCCCTTTGGGTTATGGTTCATCAAGATGAAGCTTCTTCTCCAGTTGTGGAATGTTGGAACTAAGATTCCATTAAACAAAAATATTGACCAACATATCACCTCCTCTCATGACTTGATGAAAAGATTGCTAGGGA - -a -s mr.mrrefChr5 97184 93 + 294542 TTATTATTGAGTAAACCAAGATATTTTTCAGCAAGAAAAGTGTAATAGTAGAAGCAGGAAATGAAACAAATCAGTTAAAGATTGGTGTTGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244102 93 + 636262 TTATTATTGACTAAACCAATATATTTTCCAGCAAGAAAAGTGTAATCATAGAAGCAGGAGAAGAAACAAATCAGTTAAAGATTGGTGTTAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 234171 93 + 647215 TTATTATTGCGTAAACAAAGATATTTTTCAGCAAGAAAAGTATAATAGCAGAAGCAGGAAATGAAACAAATCAGTTAAAGATTGGTGTTGGAT - -a -s mr.mrrefChr5 97277 68 + 294542 CTATCCTATGAATTTATTGGTGTTCATGAAACTTCACTGGGATGGATGAACTCGACTGTGGTTTATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244195 54 + 636262 --------------TATTGGTGTTCATGAAACTTCACTGGGATGGATGAACTTGACTGCATATTATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 234265 68 + 647215 CTATCCTATGAATTTATCCGTGTCCATGAAACTTCACTGGGGTGGATGAACTCGACTGTGGTTCATAA - -a -s mr.mrrefChr5 97345 380 + 294542 CCCACTGAATCAGATGAAAGGGGTATTGTCAAGTGCACATTGCCAATTCTCAGTGAAGTAGTGTAGTGATTGACCATCAGGCACTACTATCAGTGTGAACATCAGTGTGAACAGCATTCTTTAGTGATTAAGCTTTTGATAGAAGACAGCTTCATTGAGAGCACATGAGGTATCTTTTGCTTTCAATAGCAGATGTCCTACCAACTAGAGTCTTTCAATTTCTTTTGTGCACAAATTAATGAGTGCCACATTGCCACAATGTTCGTAGCCCCTATAAGGAGGTTGTTTGTCTTACAAGCATGGGAACCAGAGTGTACTCACTGCCGGTGCTTTCCAGCATCTAGAAAGAATACAGATCAGGATGTTAGAGAGCACTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244251 371 + 636262 CCCACTGAAACAGATGATAGGGGTATAGTCAAGTGCGCAATGCGAATTCTCAGT-----TGTGTCGTGATTGACCATTAGGCACTACTATAAGTGTGAACATCAGTGTGAACAG---TCATTAACAATTAAGCTTTTGATAGAAGACAGCTTGATTGAGAGCACATGAGGTATCTTTTGCTTTCAATAGCAGATGGCCTACAAGCTAAAGTATTTGAATTTCTTTTTTGCACAAATTAATGAGTGCCAGATTGCCACAACGTCAGTAGCCCCTACAAAGAGGATGTTTGTTTTACAAGTATGGGAACCAGAGTGTACTCACTGCCGGTGCGTTGCAGCATCTAATAAGAATACAGATCAGGATGTTA-AGATCACTCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 234333 377 + 647215 CCCACTGAATCTGATGAAAGGGGTAATGCCAAGTGCACATTGCCAATTTTCAGTGAAGTAATGTAGTGACTGAC---CATGCACTACTATCAGTGTGAACATCAGTGTCAGCAGCATTCTTTAGTGATTAAGCTTGTGATAGAAGACAGCTTCATTGAAAGCACATGAGGTATCTTTTGCTTTCAATAGCAGATGTCCTACCAACTAGAGTCTTTCAATTTCTTTTGTGCACAAATTAACGAGTGCCACATTGCCACAATGTTCGTAGCCCCTATAAGGAGGTTGTTTGTCTTACAAGCATGGGAACCAGAGTGTACTCACTGCGGGTGCTTTCCAGCATCTAGAAAGAATACAGATCAGGATGTTAGAAAGCACTCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 234876 189 + 647215 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GATGTCCTACCAACTAGAGTCTTTCAATTTCTTTTGTGCACAAATTAATGAGTGCCACATTGCCACAATGTTCGTAGCCCCTATAAGGAGGTTGTTTGTCTTACAAGCATGGGAACCAGGGTGTACTCACTACCGGTGCTTTCCGGCATCTAGAAAGAATACAGATCAGGATGTTAGAGAGCACTCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 97725 38 + 294542 GTAACACCTTTTCATGATATATTGAACATGAAGATCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244668 38 + 636262 GTAACACCTCTACTTGATATATTCACCATGAAAATCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 234710 38 + 647215 GTAACACCTTTTCATGATATATTAAACATGAAGATCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 235065 31 + 647215 GTAACACCTTTT-------TATTGAACATGAAGATCTT - -a -s mr.mrrefChr5 97763 128 + 294542 CATGAAGTTGAGACTGGTTAGCACTGGGATGATATGGCTTGCCACAGTCAAGTCCCCTGTGCGAAGCCTAAGGAAGTTAATAGATCAGATCATTCTGACTTTCTTCATAAAGTTGACTTTGAAAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244707 128 + 636262 CATGAAGCTGAGATTGGTTAGTGGTGGGATAATGTGGCTTGTCACAGTCAAGTCCCTTGCGCTAAGCCTAAGGAAGTTGACAGATCAGATCGTTCTGACTGTCTTCATAAAGTTGACTTTGAAAGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 234748 128 + 647215 CATGAAGTTGAGACTGGTTAGCACTGGGATGATATGGCTTGCCACAGTCAAGTCCCCTGTGTGAAGCCTAAGGAAGTTAATAGATCAGATCATACTGACTTTCTTCATAAAGTTGGCTTTCAATAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 235096 128 + 647215 CATGAAGTTGGGACTGGTTAGCACTGGGACGATATGGCTTGCCACAGTCAAGTCCCCTGTGCGAAGCCTAAGGAAGTTAATAGATCAGATCATTCTGACTTTCTTCATAAAGTTGACTTTGACAATCA - -a -s mr.mrrefChr5 97891 33 + 294542 TGTGTATTCAAACAAGCCTAGCAATCTCTACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244835 33 + 636262 TGTGTATTCAAACAAGCCTAGCAATCTATATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 235224 33 + 647215 TGAGAAGGCAAACATGACTAGCAATCTCTACTC - -a -s mr.mrrefChr5 97924 122 + 294542 ACCACATTGAGCCTCAGATTCAACTGTTATTCTAATCTCCTAATTTTGAAAGGGGCCTTAATGCACTGTGCCAGACTGGCAAGGAAGAAGCCCTTCATGAGACACTCGTTGCTCCCACTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244868 122 + 636262 ACCACATTGAGCCTCAGATTCAACTGTTATTCTAATCTCCTACTTTTGAAAGGGGCCTTAATGCATTGTCCCAGACCAGCAAGGAAGAAGCCCTTCTTGAGACACTTGTTGCTCCCACTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 235261 121 + 647215 ACCACATTGAGCCTCAGATTCAACTG-TACTCCAATCTCCTAATTTTGAAAGGGGCCTTAATGCACTGTGCTGGTTTGGCAAGGAAGAAGCCCTTCATGAGACGCTCATTGCTCCCACTCAC - -a -s mr.mrrefChr5 98046 78 + 294542 TATTTAAGTTGAGCTACATTGGGGACCTCTGAACAACAATTACCTGGGTCTTCCCCACCTGTTAGGTGAACATCCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244991 72 + 636262 TATTTAGGTTGAGCTACATTGGGGACCT-TGAACAACAACTGCCTAGGTCT-----ACCTGTTAGGTGAACATCCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 235382 78 + 647215 TATGTAAGTTGAGCTACATTGGGGACCTCTGAACAACAATTACCTGAGTCTTCCCCACCTGTTAGGTGAACATCCAGC - -a -s mr.mrrefChr5 98124 119 + 294542 ATAGCAGTTTTATTTTCCCCTGGCCTCTACTCACATACATGATGCATGCAGCTGCTAGAAACTGGAACAGTTGAACAAGCTAATCCCAATGATTGACTGTGCTCAACGAGATGAATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245063 107 + 636262 ATAGCAGTTTTATTTTCCCTTGGCCTCTACTCACATACATGATGCATGCAGCTGCTAGAAACTGGAACAGTTGAACATGCTAATCCCAATGATTGACTGTGCTCAAC------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 235474 119 + 647215 ATACCAGTTTTACTTTTCCCTGTCTTACACTCACATATATGACGCATTCAACTGCGAGAAACTGGAACAGTTGAATAAGCTAATCCCAATGATTGACTGTCCTCAACGAGATGAATCAA - -a -s mr.mrrefChr5 98243 18 + 294542 CAGTCATGACCTTAGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245170 14 + 636262 ----CACGACCTTAGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 235595 18 + 647215 CAGTCATGACCTTAGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 98261 374 + 294542 GACCATAAATAGAGAGTATACTGGGGCTTCAATACAGAATAAGCATTCCCCCACTGCAGATACTAGAAGTAGTCCATCCAAGTATCAGATATTTCTGAACATTGCTAATAATTTGTCCTTCTTCCCCAGCTGGTGAGGCAGGCACATAACTGCAGCACATTAGTGGTCTAACTGCTCCCATGGTAACTTTTTGTACAAGGAGTACCTTGCTGAATTGTGACTGGATAAGCTATTGCTAGAACAAGATTTGTCACACTTATGGCACCATTATTAACGTGGTATCTAATCTTTTGTACCTGAAACTTGATGTCTAGCTGACAACTGTTGGTGGATGTGTATGGAAGAACCATACCCATGAGGATTTGTTGGTATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245184 308 + 636262 GGCCATAAATTGACTATATACTGGGGCCTCAATACAGAACAAGCATTCCTC----------------------------------------------AACATTGCTGATAATTTGTCCTTCTTCCCCAGCCGGTGAGGCAGGCACATAACTGCAGCACATTAGTGGTCTAACTACTCCCAAGGTAACTTTTTGTACAAGGAGCACCTTGCAGAATTGT--------------------GAACAAGATTTGTCACACTTATGGCACCATTATTAACGTGGTATCTAATCTTTTGTACCTGAAACTTGATGTCTAGCTGACAACTGTTGGTGGATGTGTATGGAAGAACCATACCCATGAGGATTTGTTGGTATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 235614 373 + 647215 GACCATAAATAGCGAGTATACTGGGGCTTCAATACAGAATATGCATTCCCCCACTGCAGATACTAGAAGTAGTCCATCCAAGTATCAGATATTTCTGAACATTGCTAATAATTTGTCCTT-TTCCCCGGCTGGTAAGGCAGGCGCATAACTGGAGCGCATGAGTGGTCAAACTGCTTCCATGGTCACTTTTTGTACAAGAAGTCCCTTGATGAATTGTGACTGGATAAGCTATTGCTAGAACAAGACTTGTCACACTTATGGAACTATTATTAACATGGTATCTAACCTGTTACACTTGAAACCTGCCGTCTAGCTGACAACTGTTGGTGGATGTGTATGGAAGGACCATACACATTAGGGTTTGTTGGTATCA - -a -s mr.mrrefChr5 98635 106 + 294542 ACATCGCTTGTTTCCCTACATCCTAACCTTCTGAAGGTCAAAGATGAGATCCAATTTCAATAAGCTATGGCATTGCACACTCAAGGCCCCATTAAACCTTAGGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245496 106 + 636262 ACATCGCTTGTTTCCCTACATCCTAACCTTCTGAAGGTCAAAGATGAGATCCAATTTCAATAAGCTATGGCATTGCACACTCAAGGCCCCATTAAACCTTAGGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 235987 106 + 647215 GCATGACTTGTTTCCCCACATCCTAACCTTCTGAAGGTCAAAAATGGGATCCAATTTCGATAAGCTATGGTGTTGCACACTCAAGGGCCCATTAAACTCTAAGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 98741 58 + 294542 GCTGTTCCATGCATTGAGGGACTGATCCAGTTGTCAGAATTTTTGTTACGTGTGACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245607 58 + 636262 GCTGTTCCATGCATTGAGGGACTGATCCAGTTGTCAGAATTTTTGTTACGTGTGACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 236093 58 + 647215 GTTATTTCATGCATTGAGGGACTGTTCCCGTTGTCAGAATTTCTGTTATGTTTGACAC - -a -s mr.mrrefChr5 98799 20 + 294542 ATCACATTTGAGGTAAATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245666 20 + 636262 ATCACATTTGAGGTAAATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 236151 20 + 647215 ATCATGTCTGAGCCAAATAT - -a -s mr.mrrefChr5 98819 59 + 294542 GAGCTGCCACTACTTCGGTGGAATCCCATAGGATTATAACAACCTGGACAGTAGGTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245686 59 + 636262 GAGCTGCCACTACTTCGGTGGAATCCCATAGGATTATAACAACCTGGACAGTAGGTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 236173 59 + 647215 GAGCCGCCAGCATTCTGGTGGAATCTCATATGATTATAACAACACAGACAGTCGGTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 98878 27 + 294542 TCTTAACACAGCCATACCTACTATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245745 27 + 636262 TCTTAACACAGCCATACCTACTATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 236233 27 + 647215 TCTTGACACAGCTATACCTACTATTCA - -a -s mr.mrrefChr5 98905 42 + 294542 TTGGATTCTGACCGGTAATCTTCAAAAGTCTGTAAATAAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245782 42 + 636262 TTGGATTCTGACCGGTAATCTTCAAAAGTCTGTAAATAAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 236260 42 + 647215 ATGGACTCTGACCAGTAATCTTCACAAGTCTGTAATCAAGTC - -a -s mr.mrrefChr5 98947 94 + 294542 TATTGTTTTGTGCACTTCCAGTTCCCATTCTCAAAGTCACATTGTCTGGCTATACATGTTGGCAATATACCGAGGTCCATAAGCAGTTTGGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245824 94 + 636262 TATTGTTTTGTGCACTTCCAGTTCCCATTCTCAAAGTCACATTGTCTGGCTATACATGTTGGCAATATACCGAGGTCCATAAGCAGTTTGGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 236347 94 + 647215 TATGGTTCTGTGCACTCCCAGCTCCCATTCTCAAACTCACATTCTCCAACAATAAATCTTGGCAATATACTGAGGTCCATGAGCATTATGGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 99041 64 + 294542 TTCTTCAGCAATGGGCTGGGGACTACACTTTGGAGATGGGTTCATGACTTACACAAACTTCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245918 64 + 636262 TTCTTCAGCAATGGGCTGGGGACTACACTTTGGAGATGGGTTCATGACTTACACAAACTTCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 236442 64 + 647215 TTCTTCAGCAATGGACTGGCACCTGCAATCTGGGGATGGATTCATGACTTACACAAACTTCTTC - -a -s mr.mrrefChr5 99105 242 + 294542 GCATGGGAAGGCAGTTAAAGCTTGCATTTACTTAAGCAAGCTAGTGAATACCAGAAATGTTGTATGGTACTGCCACATGAAATGGTGTCCACAAAAAACAGACTATGCAGGATGACCAATGGTGATGATGGGAATTGTACACCACCATGGTGAAGTTATCAACAACAACTCTGTGCAAGATTATCATTTGCTGTATGTCCACACAAAGCGAAATATCAATCTGTAAGTAGTGAGTACAGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246317 242 + 636262 GCATGGGAAGGCAGTTAAAGCTTGCATTTACTTAAGCAAGCTAGTGAATACCAGAAATGTCGTATGGTACAGCCACATGAAATGGTGTCCACAAACAACAGACTATGCAGGATGACCAAAGGTGATGATGGGAATTGCACACCACCATGGTGAAGTTATCAACAACAACTCTGTGCAAGATTATCATTCGCTGTATGTCCACACAAAGCGAAATATCAATCTGTAAGTAGTGAGTACAGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 236506 189 + 647215 -----------------------------------------------------ATAATGTTGTATGGTAGTGCCACAGAAAATGGTCTCCACAAAATACAGACTATGCAGGATCACCAATGGTGATGAAGGGAATTGTACACCACCACGGTGAAGTTATCAACAACAACTCAGTGCAAGGTTATCATTTGCTGTATGTCCACACAAAGTGACATATCAATATGATAGTAGTGAGTACAGGTC - -a -s mr.mrrefChr5 99347 95 + 294542 TGGATGACTACAGTGCCTTCTGTCTTCTCACAGTCTCCACTGTAAGAGCCATACTGAGACATGGAGCACACCTTTTGTTTGTTATCAAAATAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246561 95 + 636262 TGAATGACTACAGTGCCTTCTGTCTGCTCAGAGTCTCCACTGTAAGGGCCTTACTGAGACATGTAGCACACCTCTTGTTTGTGATCAAAATAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 236695 93 + 647215 TGGATGGCTAGAGTGCCTCCTGTCTTCTCACAGTCTCCACTGCAAGAGCCATACT--GGCATGGAGCACACCTTTTGTCCATTATTAGAATAAAC - -a -s mr.mrrefChr5 99442 147 + 294542 ACCCTCTTCACCTCAGTTACCCACTAAGCTATCTTTACTTAATGGCAACGGACAGTGAAACTAGAGATTGTGGCAGGTTAGCTCATTAGAAGACTGACATATAACATGCTTGCTTGGTTTGGTAGATGTATTTAAGAATGCATAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246656 147 + 636262 ACCCTCTTCACCTCAGTTACCCACTAAGCTCTCTCTACTTAAAGGCAAAGGACAGTGAAACTAGAGATTGTGGCAGGTTAGCTCATTAGAAGGCTGACATATAACATGCTTGCTTGGTTTGGTAGATGTATTTAAGAATGCATAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 236790 132 + 647215 AACTCCTGCATC--------------AGCTATCTTTACTTAATGGTAACGGACAGTGAAACTAGAGAGTGTGG-AGATCAGCTCATTAGAGGACTGACATGTGACATGCTTGCTTGGTTTGGTAGATGTATTTGAGAATACATTAAT - -a -s mr.mrrefChr5 99589 79 + 294542 CTTGCCTCAAAGATGAGTGTCTGTAATTTTCGCCAGGCCACATCACTGGTATATTCCTTTATGTAACATTCATGTTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246807 69 + 636262 CTTGCCTCAAAGATGAGTGCCTGTAATTTTCGCCACGCCACATCACTATTATATTCCT----------TTCATGTTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 236922 79 + 647215 CTCACCTCAAAGATGAGTGTCTGTAATTTCAGCCAGGCTGCATTACTGGTATGTCCCTTTATGTAACATTCAGGTTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 99668 79 + 294542 TGTTCAATTGCTCAGAGCTTTACTAACTAAGAAGTGTGTGCAAGAAGCCCATAGACACAATTTGTGTAAGGCTCTTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246879 79 + 636262 TGTTCAATTGCTCAGAACTTTACTAACCAAGAAGTGTGTGCAAGAAGCCCATAGACACAATTTGTGTAAGGCTCTTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 237001 69 + 647215 TGTTCAATTGCTCAGAGCTTTGCTAATTAAGAAGTGTGTTCAAGAAGGC----------ACTTGTATTAGCTTGTCGTA - -a -s mr.mrrefChr5 99747 273 + 294542 TTACCTTGTGGTAAGGTAACTATAGATACATACCTCTATGTGTTCATGGCATTAACTTTGTCATAACTTCAATCTGCTTATAAGGGTTTACTGCAGTTACACTTCACAAGGAAATATGATGATTACAACAGGAGAAATCAAGATAACTTCAGTAAAATAAAGACATGGCAGCTTCATTTAGTGTAACCTTGAACTGCATATTCAATTAAATATAACCAGCTCCTGGAGACAGGTTAGAACCATTGCTAAGCTTCCTGTTCCTTTTTGAGGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246958 273 + 636262 TTACCTTGTGGGAAGGTAACTATAGATACATACCTCTATGTGTTCAAGGCCTTCACTTTGTCATAACTTCAATCTGCTTACAAAGGTTTAATGCAGTCACACTCCACAAGGAAATATGATAACTACTACAGGAGAAATCAAAATAACTTCAGTAAAATAAAGACATGGCAGCTTCATTTAGTGTAACCTTGAAGTGCATATTCAATTAAATATAACCAGCTCCTAGAGACAGGTTAGAACCATTGCTAAGCTTCCTGTTCCTTTTTGAGGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 237078 264 + 647215 TCAGCTTGTGCTAAGGTAATTATAGTTCCATACATCTATATGTTCATGGCATTAATTTTGTCATGACTTCAATCTGCTTATAAGGGTTTACTACAGTTACACTTCACAAAGAAATATGACGATTACAACAGGAGAAGTTGAGATAGCTTCAATCAAATAAAAACATGACAGCTTCACTTATCATAATCTTGAACAGCATAATCAATCAAACATAACCACCTACTGGAAACAGG---------TTGATAAGCTTTCTGTTCCTTTTTGAGGACA - -a -s mr.mrrefChr5 100020 122 + 294542 TAGGGACACTGGGGATCCCAGTTGGGTGTTGAGCTACAAGTATGCTGGCCAGTATACAGTAAGAGTTGGTTCCAATAGGGTTATAGCATTCTTTCCACTTGTGGGGTAGGAGCTGACATATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247232 121 + 636262 TAGGGACACTGGGGATCCCAGTTGGGTGTTGAGCTA-AAGTATGCTGGCCAGTATACAGTGAGAGTTGGTTCCAATAGGGTTATAGCATTCTTTCCACTTGTTGGGTAGGAGCTGTTGTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 237342 122 + 647215 TAGGGACACTGGGGATCCCAGTTGGGTGTTGAGCTACAAGTACGCTGGCCAGTATACAGTAAGACTAGGTTCCAGGAGGGTTAGAGCATTCTTTCCACCTGTGGGGTAGGAGCTGACATATT - -a -s mr.mrrefChr5 100142 5 + 294542 TTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247361 5 + 636262 TTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 237464 5 + 647215 TTCTG - -a -s mr.mrrefChr5 100147 15 + 294542 GGGTGACCTGATATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247368 15 + 636262 GGGTGACCTGATATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 237469 15 + 647215 GGGTGACCTGATATA - -a -s mr.mrrefChr5 100162 96 + 294542 AGACTTCATTCTTTGACATGTCAGCTGGGTAGCATTCAACTTATATCATTTTTGCTCAGTGTACTGAACAACTCTTTCAGACACCCCTATAGTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247393 96 + 636262 AGACTTCATTCTTTGACATGTCAGCTGGGTAGCATTCAACTTATATCATTTTTGCTCAGTGTACTGAACAACTCTTTCAGACACCCCTATAGTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 237484 96 + 647215 AGACTTTGTTCTTTGACAAGTCAGCCACATAGCCCTGAACTCATGACGTCTTAGCTAGGTGCACTGAACAACTCCTCTGGACACTGGTATAGTGGC - -a -s mr.mrrefChr5 100258 189 + 294542 CATATTTGCTTAATTCTATTAAGAAACTCACTCCCGACTATCTAGGTGCCTTTGAGACCCACTGCTCGCAGAAAAGATGAGCCCCCACATACCAGCTAGCTACTGAATGCACACAATGGAATATACTCAGTCACAAACTGAAGTTCTGCATCCAGTTGTCACACTGGTATGACCAAAATGCAAAAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247491 189 + 636262 CATATTTGCTTAATTCTATTAAGAAACTCACTCCCGACTATCTAGGTGCCTTTGAGACCCACTGCTCGCAGAAAAGATGAGCCCCCACATACCAGCTAGCTACTGAATGCACACAATGGAATATACTCAGTCACAAACTGAAGTTCTGCATCCAGTTGTCACACTGGTATGACCAAAATGCAAAAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 237580 189 + 647215 TCTATTTGTTTAATTCCATTAAGAATCCCACTCTTGACTATCTAGGTGCCTTCAAGACCCACCGCTGCCAGAAAAGATGAGCCCCCCTGTTCCAGCTAAATACTGAATGCACACAATAGAATATGCTTAGCCACGAGCTGTAGTTCTGCATCCAGTTGTGACACTGGTATGACCAAAAAGCAAAAGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 100447 20 + 294542 TGCATATTTTCTATGATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247680 20 + 636262 TGCATATTTTCTATGATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 237770 20 + 647215 TACATATTTTCTATGATTCA - -a -s mr.mrrefChr5 100467 60 + 294542 ATAAATAGCTACATACAACACTTGTTGACTATCATTCATTAAACATATGTATTGAAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247704 60 + 636262 ATAAATAGCTACATACAACACTTGTTGACTATCATTCATTAAACATATGTATTGAAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 237790 60 + 647215 ATAAATAGCTCCGTACAGCGTTGGTTGACTATCACTCATTAGACATGTGTATTGATAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 100527 5 + 294542 CTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247767 5 + 636262 CTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 237850 5 + 647215 CCTCA - -a -s mr.mrrefChr5 100532 117 + 294542 ACATAGCTGCTTTATTCTTGGCAAATCTTGGTAAGCAGGAATCATCAGAAACATGCAGTCCACATCTCAACTGTCCATTGGTGTATTTCTAGACCCTGCAAGAATGTATTATCACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247773 117 + 636262 ACATAGCTGCTTTATTCTTGGCAAATCTTGGTAAGCAGGAATCATCAGAAACATGCAGTCCACATCTCAACTGTCCATTGGTGTATTTCTAGACCCTGCAAGAATGTATTATCACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 237855 117 + 647215 GCATAGCCCTTTTAATCTTGGCAAATCTTGGTAGACAGAGGTCATCAGAGACTTGCAGTCAGCTTCTCACTTGTCCATTGGTATATTCCTATACCCTACAAGACTGTATTATCACAG - -a -s mr.mrrefChr5 100649 131 + 294542 GGAATGAAAGACAAAAAAAATGAAAGTCATTCTTAGTTTTGATTCCTTAGACTTCCACTGAAGCTACCAGAGGTGGGCGGTTAGATAGTCCATGTGTATTAACAAAGTAACTGATCAATGATACCCTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247890 131 + 636262 GGAATGAAAGACAAAAAAAATGAAAGTCATTCTTAGTTTTGATTCCTTAGACTTCCACTGAAGCTACCAGAGGTGGGCGGTTAGATAGTCCATGTGTATTAACAAAGTAACTGATCAATGATACCCTATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 238006 131 + 647215 GGAGTGAAAGACAAAAAAAACTAAAGTTATTCTTAGGTTAGATTCCTTACACTTCCACTGAAGCTACCAGAGCTGGGCAACTAGATAGTCCATGTATAATAACACAGTAACTGATCAATAACACCCTACTG - -a -s mr.mrrefChr5 100780 43 + 294542 CCTACCAGCATTGTGATCTGCTGAAACAACAGGTGATGAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248039 43 + 636262 CCTACCAGCATTGTGATCTGCTGAAACAACAGGTGATGAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 238137 43 + 647215 CCTACCCGAGTTGTGATCTGCTGAAACAATAGGTGATGACACT - -a -s mr.mrrefChr5 100823 18 + 294542 ATATAACCAATGTGTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248083 18 + 636262 ATATAACCAATGTGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 238180 18 + 647215 ATATAATCAATGTGTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 100841 124 + 294542 GGTCAAGAAGAATTGGTTTCAGATGTAACCTCATGACTGACTAACTGATTGGTTGAGGCAGGTGTTGCCTCATGACTCACTAACTGATTGTTTGGGGTTGGGCAGTCTTGGGGGGCACAAGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248104 124 + 636262 GGTCAAGAAGAATTGGTTTCAGATGTAACCTCATGACTGACTAACTGATTGGTTGAGGCAGGTGTTGCCTCATGACTCACTAACTGATTGTTTGGGGTTGGGCAGTCTTGGGGGGCACAAGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 238198 124 + 647215 GGTCAAGAAGAATCCTTTTCAGATGTAAACTCATAACTCACTAACTGATTGGTTGGGGCAGATGTAACCCTAAGACTCACTATCTGATTGGTTGGGGTTGGGCAGTCCTGGGTGGCACTAACTG - -a -s mr.mrrefChr5 100965 87 + 294542 TTTGGTTGGGGTTGGTCAGTCTTGGGAGGTTTGCCCCTCAGAGTTTGCCCCCACTGTTTAATGGTGAGTGAATTATGAGTACAGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248229 87 + 636262 TTTGGTTGGGGTTGGTCAGTCTTGGGAGGTTTGCCCCTCAGAGTTTGCCCCCACTGTTTAATGGTGAGTGAATTATGAGTACAGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 238322 87 + 647215 TTTGGGAGGGGTCGGGCAGTCTTGGGAAGATTGCCCTTCAGAGTTTGCCCCCACCGCTCAACAGTGAGTACATTATAAGTACAGATG - -a -s mr.mrrefChr5 101052 53 + 294542 GACGGGTTGAGTGAGGCAAAAAAGAAGGTAGGTGCGTGATAGTCATAAAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248317 53 + 636262 GACGGGTTGAGTGAGGCAAAAAAGAAGGTAGGTGCGTGATAGTCATAAAACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 238409 53 + 647215 GACAGGTTGAGTGAGGCAAAAAAGAAATTGGATGCATGGTAGTCATAAAACCA - -a -s mr.mrrefChr5 101105 116 + 294542 CCTCAAAATTTCATAGTAGTTTTAGAGAAGTAGCTACAAATTGGAAGGGTGAAAACACCGGTTCAAGGCTGTGAATACTAAGTCTATTTTTGCTAGCCACCATATTTTCAAGTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248378 116 + 636262 CCTCAAAATTTCATAGTAGTTTTAGAGAAGTAGCTACAAATTGGAAGGGTGAAAACACCGGTTCAAGGCTGTGAATACTAAGTCTATTTTTGCTAGCCACCATATTTTCAAGTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 238462 116 + 647215 CCTCAAAATCTCATAGTAGCTTTAGAGAAGTAGCTATGAGTTGGAAGGATGAAAGCACCAGTTCAATCCTGTGTATACTAAGTCTATCTTTGCTAGCCAACCTATTTTCAAGTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 101221 11 + 294542 GACATGTTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248494 11 + 636262 GACATGTTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 238585 11 + 647215 AACATGCTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 101232 50 + 294542 TTATCTATTGTCCCCCAGGCCAATAGCCGATTCAAATGGCAGTAGCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248505 50 + 636262 TTATCTATTGTCCCCCAGGCCAATAGCCGATTCAAATGGCAGTAGCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 238621 50 + 647215 TGATCTATTGTCCCCCAGACAAATAGCCAACTCACATGGCAGCAGCCATA - -a -s mr.mrrefChr5 101282 78 + 294542 ATGCTTTTTTAGGTCTGAATCCTCCAAGCTAGTAGTTAACTCACAAACAGTGCCAATGGAACAGTAAGGAACAATGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248561 78 + 636262 ATGCTTTTTTAGGTCTGAATCCTCCAAGCTAGTAGTTAACTCACAAACAGTGCCAATGGAACAGTAAGGAACAATGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 238671 78 + 647215 ATACTTTTTTAGGTATGGGTCCCTCAAGCTAGTAGCCAACTCACAAACGATGCCAATGAAGCAGTAAGGAACGATGTA - -a -s mr.mrrefChr5 101360 64 + 294542 TGAATCACAGTGTCTGCTTAAACTCTTTGTGCGCACTAGTATTTAATATGTGACTTGCCCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248639 64 + 636262 TGAATCACAGTGTCTGCTTAAACTCTTTGTGCGCACTAGTATTTAATATGTGACTTGCCCAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 238762 64 + 647215 TGAATCACAGTGTTAGCTTAAGCTTTTTCCAAGCACTAATATTCAATGTTTGACTTGCCCAGTT - -a -s mr.mrrefChr5 101424 39 + 294542 AGGGGGAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTggcac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248749 38 + 636262 AGGGGGAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTg-cac -s simRat_chr6.simRat.chr6 238826 39 + 647215 AGGGTTAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTGGCAC - -a -s mr.mrrefChr5 101463 126 + 294542 tctcttgctaggggagaggtcttgtccctagcatacatatcttgtcctgaaacaactgaacggaactgagctcagtgtcatcctacagatgttgcagataagcactcacaaaggtgggctgtctct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248787 126 + 636262 tctcttgctaggggagatgtcttgtccctagcgaacatgtcttgtcctgaaaggactgaacggaactgagttcagtgtcatcctacagatgttgcagataagcactcacaaaggtgggctgtctct -s simRat_chr6.simRat.chr6 238872 107 + 647215 TTCATTTCAAAGGGAGGGA--------ATAGCATAAGTAT-----------ACAACAAACTTACACAGATCCCACATACATTCAAACTatgttgcagatcagcacacacaaaggtgggctgactct - -a -s mr.mrrefChr5 101589 113 + 294542 cccctatagagtagcaccgcaccacatccctcctaagtagcaacagcctaaaagctagactcagccacatcttactaaccccaaaagcacatcttacccatcccagaggtatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248913 113 + 636262 cccctatagagtagcaccgcaccacatccctgctaagtagcaacagcctaaaagctagactcggccacatcttgctaaccccaaaagcacatcttacccatcccaaaggtatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 238981 113 + 647215 cccttatgaagtagcactgcaccacatccctcctaaatagcaaagacctaaaagctagacccagccacatcttactaatcccaaaagcacatcttacgcatcccagaggtatt - -a -s mr.mrrefChr5 101702 12 + 294542 gagaggaccata -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 249029 12 + 636262 gagaggaccata -s simRat_chr6.simRat.chr6 239094 12 + 647215 gtagggaccata - -a -s mr.mrrefChr5 101714 161 + 294542 gttaggatatacaatcaggcaacctatggcaacctaagcaggaggactactataggcgggaagacctcagtggaaagatatccactctgctactttagtggggacccactcctaacctgggggaggatttgcaaacatgaaatgggattgatatgccaatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 249043 157 + 636262 gttaagatatacaatcaggcaacctatggcaacctaagcaggaggactactataggcgggaagacctcagtggaaagatacccactctgctacctt----gggaccccctgctaacctgggggaggatctgcaaacatgaaatggagttgatatgccactc -s simRat_chr6.simRat.chr6 239106 161 + 647215 gctaggatatccaataagacaacctgtggcaacctgagcaggaagactaccattggtgagaagacctcagtggaaagatatccactctgcaactttagtggggaccaactcctaacctgggtgaggatttgcaagcatgaaatgggattgaTATGCTAATT - -a -s mr.mrrefChr5 101875 411 + 294542 ctagacaggaaacctggctcaatctgagggagaggctcatatgtaaacattcaaggggaaatgacatatgtaaacattcaaggggaaatgaagggatgcatgtttatgtaaacgcataagagaaagcaagagagagtcagtatgtaattatacccagtgcgtctgtgcaacacccattagaattagagtagtggctcatattgagtatgacaaaaaagtacagggccaaggcttgaactagaactttatcatcctcaaggctgacttagagcctttaaagcctcaaggtctaggaagaggtgtgaggtgaaacattcaccacctcaggacattcccccttagtcaattcaaggcctacattgggtggttaggatgaatttgaattacaggaaagttactttctggtcagtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 249205 399 + 636262 ctagacaggaaacctagctcagtcagagggagaggctcatatgtaaacattcaaggggaaatgacatatgtaaacattcaaggggaaatgaagggatgcatgtttatgtaaacgcataagaagaagcaagagagagtcagtatgtaatgatccccagtatgtctgtgcaacacccattagaattagagtagtggctcatattgagtatgacaaaaaggtacagggccaaggcttgaactagatttttatcatcctcaaggctgacttaaagcctttaaagcctcaaggtctaggaggaggtgtgaggtgaaacattcaccacctcaggacattcccccttagtgaattcgagacctacattgactggttaggataaattcaaattacaggaaagttacc------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 239267 373 + 647215 CTAGACAGGAcacctggctcaatttgagggagcggctcatatgtaaacatccaagggg---------------------------aaatgaagggatgcatgttcatgtaaatgcataacagaaagcaagagagaatcagtatgtcattgtacccagtgcgtctgtgcaagacccactagagttagagtagtggctcatattgagtatgaccaaaaagtacagggccaaggcttgcactagaactttatcatcctaaaaggtgacttag---------agcctcaaggtctaggcagag--gtgaggggaaacacttacctcctcaggacattccctcttagtcaattcaaggactaccatgggtggttatgatgaacttgaattacgggaaaattactttctggtcagtg - -a -s mr.mrrefChr5 102286 89 + 294542 atctatgtggtttcagagttaaaactcgatctacatgagaagctcatggtcttctgggaagtggagacagtatgacctgttgatggatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 249604 84 + 636262 -----tgtggtttcagagttataactcgatctacatgagaagcccatggtctcccgggaagtggagacagtatgatctgttgatggatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 239641 89 + 647215 atctatgtggtttcagagttgaaacttgatctacatgaggagctcaaggtcttctggggagtggagacagtatgacctgttggtggatt - -a -s mr.mrrefChr5 102375 314 + 294542 cctagacctgatgcagacttttcttacctacaacaaagttaaagcaagggttacctcctcaGACAGCTATGGTCAAAAGATAATTGTCTGACTCAACTAAGTGCACTGGTTCTACATACAATGTTCAACTCTTCTATTTTACTGTGGAACACGTAACAATGGCTAAAATTGCCTCTGCAAGTTTAAAAATTTTTATTCCCCAGTTGGAAGATTTTTACAGCTCTGAAAAACTGCTGGGTATATTAAGCATAAGTAGTAAAAGAAGTGCTAGTTGGATGCAAAAGCACAACTTTACAAATCTCTACAAGCTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 249689 312 + 636262 cctagacctgatatagacttttcttacctacaacaaagttaaagcaagggttacctcctcaGACAGCTATGGTCAAAAGATAATTGCCTGACTCAACTAAATGCACTGGTTCTACATACAATGTTCAACTCTTCTATTCTACTATGGAACACGTAACAATGGCTACAA-TGCCTCTGCAAGTTTAAAAATTTTTATTCCCCAGTT-GAAGATTTCTACAGCTCTGAAAAACTGCGTGGTATACTAAGCACCAGTAGTAAAAGAAGTGCTAGTTGGATGCAAAAGCACAACTTTACAAATCTCCACAAGCTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 239730 312 + 647215 actagacctgatgcagactttttttacctacaacaacgttaggg--aggattacctcctcaGACAGCTATGGTCATAAGATAATTGTCTGACTCAACTAAGTGCAATGGTTCTACATACAATGTTCAACAATTTTATTTTACTGTGGGACATATAACAATGGCTAAGATTGCCTCCGCCAGTTCAAAAATTTTTATTCCCCAGTTGGAATATTTTTACAGCTCTGAAAAACTGCTGGGTATATTACGCATAAGTATTAAAAGAAGTGCTAGTGGGATGCAAACATACAGCTTTACACATGCCTACAAGCTGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 102689 193 + 294542 TCCTGGCCATATTCGCCCCTTTACCCTGTGCACTGTAGTTCTGAAGACCCTAAGATTGAGTACTAGTTCATTCCAAAACAATTGTTTAACTACTTCCTTCTAAGTCTGATTTCCTCCTTAAGAGATCAGAGGGGTCTGAGATACTCAAGTAGCTCCAAACCTGTGAGGTTCTATTTCAATTGTGATATGGGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250003 193 + 636262 ACCTGGCCATATTCGCCCCTTTACCCTGTGCATTGCAGTTCTGAAGACCCTAAGATTGAGTACTAGTTCATTCCAAAACAATCACTTAACTACTTCCTTCTAAGTCTGATTTCCTCCTGAAGAGATCAGAGGGGTCTGAGATACTCAAGTAGCTCCAAACCTGTGAGGTTCTATTTCAATTGTGATATGGGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 240042 191 + 647215 TCGTGGCCCTCAGCCCCCCTGTACCTGCTGCACTGTAGTTCTGAGGACCCTAAGATTGAGTACAGGTTCATTCCAAAACAGTTGTTTAACTACTTCCTTCTAAGTCTGATTTCCTCCTTAAGAGATCAGAGGGGTCTGAGATACTCAAGTAGTTCCAAACCTGTGAGGTTCTATTTCAATTGTGATA--GGAC - -a -s mr.mrrefChr5 102882 88 + 294542 TTGAAACGAGGTCTAGGTATGAGAAAGTGCACCCTAAAAATTGTGACAGGAGTGGGGGCCCACTGTGATAACAAGCAGTGGGTCGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250199 88 + 636262 TTGAAACGAGGTCTAGGTATGAGAAAGTGCACCCTAAAAATTGTGACAGGAGTGGGGGCCCACTGTTATAACAAGGAGTCGGTCGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 240233 87 + 647215 TTGAAATGAGGTCTAGGT-TGAGAAAGTGCACCCTAAACATTGTGACAGGAGTGGGGGCCCCCTGTGACAACAAGCCCTGGGTCACGG - -a -s mr.mrrefChr5 102970 34 + 294542 AGACACTTAGATAGTTAAGAGTGGGTTTTTTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250287 34 + 636262 AGACACTTAGATAGTTAAGAGTGGGTTTCTTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 240325 34 + 647215 AGGCACTTAGATAGTTAAGAGTGGGTTTTTTAAT - -a -s mr.mrrefChr5 103004 7 + 294542 GATTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250321 7 + 636262 GGTTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 240360 2 + 647215 GA----- - -a -s mr.mrrefChr5 103011 352 + 294542 ATGGAATTCAACAAATATGCCGCCATTATACAGGTGTCTGAACGAGTTGTTTCAGGGCCATTAGCTAAAATGATACAAATATAAGGCTACCCAACTGACCTGTCAAACAACAAAGTCTATACCAGGTTGCAGGCCTATGACACATCTCCATTGAGCAACCCATAGACCCACCAGCGATTTGATTCTGCATTTTACAGGTTTGTGGCAAGTGTAGTTCTGCTCAATGGCCTCATAAGAAAGTGTTGTTGACTAACATCATAACTCTAACGTGAGTTGGAACTGAATATATATAAAGTGCCAGTCACTAATTTATTGGGGGGACTATATTACATAAGAGATTTGGTCTGCCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250330 319 + 636262 ATGGAATTCAACAAATATG---------TACAGGTGTCTGAACGAGTTGTTCC--------TAGCTAAAATGATACAAATATAAGGCTACCCAACTGACCTATCAAACAACGAAGTCTATATCAGGTTGCAGGCCTATGACATA--TCCATTGAGCAAGCCATAGACCCACCAGCGAATTGATTCCGCGTTTTACAGGTTTGTGGCAAGTGTAGTTCTGCTCAAAGGCCTCATAAGAAAGTGCTGTTGACTAACATCATA--------------TGGAACTGAATATATATAACGTGCCAGTAACTAATTTATTGGGGGGACTATATTACATAAAAGTTTTGGTCTGCCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 240362 340 + 647215 -----ATTCAACTAATATGCCGCCATTATATGGGTGTCTGAATAAGCTGTTTCAGGGCCATTAGCTAAAATGATACAAGT-CAAGGCTACCCAGCAGACCTGCCAAAGAACAGGGTCTATACCAGGTCGCAGGCCTATGACACATCTCCATTGTGCAACCGATAGTCCCACCAGTGATTTGATTCTGTATTTTACAGGTTTGTGGCAAGTGTAGT--TGCTCAATGGCCTCATACGAAAGTATTGTTGACTAACATCCTAACTCTAACGTGAGTTCGAACTGA----ACATAAAGTGGCAGTCACCAATTTATTGGGGGAACTATATTAGATAAGAGATTTGGTCTGCCCTA - -a -s mr.mrrefChr5 103363 184 + 294542 GGCTTAGTTTATTGAACCCATGGCAATCTTGGATGGATATTATAGACTAGGACACAACTGTCTAGGTATCATTAACTGACAATAGACACCCCAGCCTAACTGGAAGCTTCAAGCACATAAGTTATCAATACTTATGTACATCCAGCTAGGCAAACAGCAATGGTGGATGCTAGGCAAACAGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250649 184 + 636262 GGCTTAGTTTATTGAACCCATGGCAACCTTGGATGGATATTATAGACTAAGACACAACTGTCTAGGTATCATTAACTGACAATAGACACCCCAGTCTAACTGGAAGCTCCCAGCACATAAGTTATCAATACTTATGTACGTCCAGCTAGGCAAACAGCAATGGTGGATGCTAGGCAAACAGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 240703 184 + 647215 GGCTTAGTTTATTGAACCCATGGTTATCTTGGATGGATATTTAAGACTAGGACACAACTGTTTAGGTATCATTAACTGACAATAGACACCCCAGCCTAACTGGAAGCTTCAAGCACCTGAATTGTCAATACTTATGTATATCCATCTAGCCAAACGGCAATGGTGGATGCTAGGCAAACATCAT - -a -s mr.mrrefChr5 103547 46 + 294542 AGATGCTAGCTAAAGTCCATCCCAAACAACTACTGGTGTGGCCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250833 46 + 636262 AGATGCTAGCTAAAGTCCATCCCAAACTACTACTGGTGTGGCCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 240888 46 + 647215 GGATGCTAGGTAAAGTCCATCCCAAACAACTACTGGTGTGGCCATG - -a -s mr.mrrefChr5 103593 144 + 294542 CCCACTACACTCCCTAAGTACAAATGTTAACTATAAGAGACTCTGTCAACACTAAACTAAAATGTGGATGTAATTTGCCACAGTGGAACTTGTTTTGACCATGCCACCAGTTATAGAAACACTGAGAGCTATTAAGACCAATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250883 144 + 636262 CCCACTACACTCCATAAGAACAAATGTTAACTATAAGAGACCCTGTCAACACTAAACTAGAATGTGGATTTAATTTGCCACAGTGGAACTTGTTTTGAGCATGCCACCAGTTATAGAAACACTGAGAGCTATTAAGACCAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 240934 144 + 647215 CCCGCTATGCTCCCTAAGTACAGACGTTAACTATAAGAGACTCTGTCAACACTAAACTAAAATGTGGCTGTAATTTGCCACAGTGGAGCTTGTTTTGGCCATGCTACCAGCTGTAGAAACACTGAGAGTTGTTAAGACCAATCT - -a -s mr.mrrefChr5 103737 35 + 294542 AAGTATCTCCAAACACTACCCTTACTATTTGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251027 35 + 636262 AAGTATCTCCAAACGCTACCCTTATTATTTGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 241079 35 + 647215 AAGTATCTCCAAGCACTACCCTTACTATTTCCACA - -a -s mr.mrrefChr5 103772 252 + 294542 TCATAACATTGTTTTACATTAGGACATAAGATGGTTATAGTGACCATTGTTTGAGACTACCCAGTGAGTAATAGACATGATCTGGTGTTAGTTAACAGTATTAAAATAGACTGTGATCTGCTGCTAAGACATCTTATACCACTTCTGTCCTGGATGCAATGCTTCTTGTGACTCAAAGTTTGAACTACATATGCTACATGTTACTTAGTTGGAAAATGCACTAATTTTGCAGTATAACACCCCACACAAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251062 247 + 636262 TCACAACATTGTTTTACATAAGGACATAAGATGGTTATAGTGACCATTGTTTGAGACTACCCAGTGAGTAATAGACATGATCTGGTGTTAGTTAACAGTATTAAAATAGACTGTGATCTGCTGCTAAGACATCTTATACCACTTCTGTCCTGGGTGCAATGCTTCTTGTGACTCAAAGTTTGAACTACATATGCTACATGTTACTTAGTTGGAAAATGCACTAATTT-----TATAACACCCCACACAAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 241119 249 + 647215 TTATAACACCATTGTAAATTAGGGCAGAAGA---TTATAGTGACCATTGTTTGAGACTACTCAATATGTTATAGACATGATCTGGTGTTAGTTAACAGTATTAAAATAGATTGCAATCTGCTGTTTAGACATCCTATACCACTTCTGTACTGGATGCAATGCTTCTTGTGACTCAAAGTTTGAACGACATATTCTACATGTTATTTCGTCAAAAACTGCACTAATTTTGCAGTATAACACCCCACACAAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 104024 55 + 294542 CACAGGAGTTTCCAATGTTCCTGTACATGGGCAACTTAATTTTTTCACAAGTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251311 50 + 636262 CACAGGAGATTCCAATGTTCCTGTACAGGGGCAACTTAA-----TCACAAGTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 241368 55 + 647215 CACAAGAGTTTCCAATGTTCCTGTACATGGGCAATTTAATTTTTTCACAAGTATT - -a -s mr.mrrefChr5 104079 5 + 294542 ATTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251361 5 + 636262 ATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 241439 5 + 647215 ACTTA - -a -s mr.mrrefChr5 104084 47 + 294542 AACTTATGTTCTAGCAGTCTCAAATCATATCTTGCTCTCTGTTTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251366 47 + 636262 AACTTGTGCTCTAGCAGTCTCAAATCATATCTTGCTCTCTGTTTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 241449 16 + 647215 AACTTAAGTTCAAGCA------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 104131 114 + 294542 CAGATTTCTAGTTTAGATGACCCTAGTGTTTCAAGGATAAATGAAAAATGCTGTCAATAATCGGGACTTGAGTTGCTACATAGTCTCTGTGTGGTTTTGAGGCGAGGGTATACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251477 114 + 636262 CAGATTTCTAGTTTAGATGACCCTAGTGTTTCAAGGATAAATGAAAAATGCTGTCAATAATCGGGACTTGAGTTGCTACATAGTCTCTGTGTGGTTTTGAGGCGAGGGTATACA - -a -s mr.mrrefChr5 104245 16 + 294542 GTAGTGGTGCTAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251592 16 + 636262 GTAGTGGTGCTAGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 104261 9 + 294542 ACCAACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251610 9 + 636262 ACCAACAAC - -a -s mr.mrrefChr5 104270 20 + 294542 CTACTGTGTACCCTCTCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251620 20 + 636262 CTACTGTGTACCCTCTCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 241465 9 + 647215 -----------TCTATCACA - -a -s mr.mrrefChr5 104290 77 + 294542 TCTTTCTATTACTCATCCCTGAGAACACTCGGGTCATCTAACCCAGAAACTGGATAGCAAAGCAGAGAGAGCAAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251640 77 + 636262 TCTTTCTATTACTCATCCCTGAGAACACTCGGGTCATCTAACCCAGAAACTGGATAGCAAAGCAGAGAGAGCAAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 241475 77 + 647215 TGCATCTTTTACTCATCCTTGAGAACAGTTGGGTCATCTGAACTAGAAACTGGACAATAATGCAGAGAGAGCAAGAT - -a -s mr.mrrefChr5 104367 6 + 294542 TGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251717 6 + 636262 TGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 241553 6 + 647215 TGATGT - -a -s mr.mrrefChr5 104373 46 + 294542 ATAGACTGCTGGAAAACTTTCGACGAGACTTCTGAAAAAATTAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251723 46 + 636262 ATAGACTGCTGGAAAACTTTCGACGAGACTTCTGAAAAAATTAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 241560 46 + 647215 CTAGATTGCTGGAACACTGTGAACAAAACTTCTGGACAAATGAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 104419 14 + 294542 GGACCAGGCACAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251769 14 + 636262 GGACCAGGCACAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 241709 14 + 647215 GGAGCAGGCACAGG - -a -s mr.mrrefChr5 104433 59 + 294542 GCACTGGAAACCCATTTGTCCACCTGTGTTGGACGTTATGCTGCAAAATTAGTGAATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251784 59 + 636262 GCACTGGAAACCCATTTGTCCACCTGTGTTGGACGTTATGCTGCAAAATTAGTGAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 241723 59 + 647215 GCATTGGCAACTCATTTGTGCACCTGTGTTGGATGTTATACCGCAAAATTAGTTAATCT - -a -s mr.mrrefChr5 104492 65 + 294542 TCCTACTAGATAGCATGTGGAATCAGTAATTCAAACCCTTCAAAAGTAGCTACGAGCATCCAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251845 65 + 636262 TCCTACTAGATAGCATGTGGAATCAGTAATTCAAACCCTTCAAAAGTAGCTACGAGCATCCAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 241782 65 + 647215 TCCGACTACGTAACATGGGAAATAAGTAATTCAAACCCTTCAGAAATAGCTTAGAGTATCCAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 104557 53 + 294542 GGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATTGCAGAATTTTAGCTCTAAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251910 53 + 636262 GGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATTGCAGAATTTTAGCTCTAAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 241848 53 + 647215 AGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATCGCAGAATTTTAGCTCTAAAGT - -a -s mr.mrrefChr5 104610 40 + 294542 AATCAATTGTCACAACTGTAGGACAAACAGTTATCCCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251970 40 + 636262 AATCAATTGTCACAACTGTAGGACAAACAGTTATCCCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 241901 40 + 647215 AATCACTTGTCACAACTGTAGAGCAAACAGCTATTAATTA - -a -s mr.mrrefChr5 104650 376 + 294542 AGTACTTAGATATGTATTTTTAATTAATTTCATCATCCTTACACTTATAGAATGGTATGGATGGGCCTCTTGATATGTCACCCTAAGAAAACAATAGTAGAAACACTGTATGTTTACAAGCAATCTGATCACTATTCTTATGTGTGAATAGAAATAGAATTTCTATTGTACTAATGCCTGACAAGTTTTTGGGGTAAGATCCAGTACAAATGATGGGTCAAAGTAACGGAATGTTATCAGAATTATGAGAGACCGCCTGTAAGTATTGTCAAGTATTACATGAAATTCTTTCTGTTGGATCCTGATTTTTGAGGATGCAATTAAATTCTGAGCGAGTGCACATTGTCTCCATAGCACATACCTAGTAATGGATCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252010 376 + 636262 AGTACTAAGATATGTATTTTTAATTAATTTCACCATCCTTTCACTTATAGGATGGTATGGATGGGCCTCTTGATATGTCACCCTAGGAAAACGATAGTAGAAACACTGTACGTTTACAAGCAATCTGATCACTATTCTTATGTGTGAATAGAAATAGAATGTCCATTGTACTAATGCCTGACAAGTTTTTGGGGCAAGATCCAGTACAAATGATGGGTCAAAGGAACGGAATGTTATCAGAATTATGAGAGACCGCCCGTAAGTATTGTTGAGTATTATATGAAATTCTTTCTGTTAGATCCTTATTTTTGAGGATGCAATTAAATTCTGAGTAAGTGCACATTGTCTCCATAGGACATACCTAGTAATGGACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 241942 373 + 647215 AGTACTTAGTTATGTATCTTCAATTAATTTCATCATCCTTACACTGATCGAGTGGTATGGATGGGCCTCTTGAGATGCTACCCTAACAGAACAATGGTAGAAACATTGTATGGTTACAAGCAATCTAATCGCTACTCTTATGTGTGAATAGAAATAAAATTTGTATTGTATTTATGCATAACAAGTTTTTGGGGTAAGATCCAGTGCAATTGATGAGCCAAAGTAACAGAATGTTATGAGAATTATGAGAGACCGCCTGTAAGTGTTGTCAAGTATTACATGAA---CTTTCTGTTGGATCCTGCTTTTTGAGGATGTAACTAAATTCTGAGCGAGTCCATAATGTCTCAGTAGCACATACCTAGGAATGGATCCC - -a -s mr.mrrefChr5 105026 153 + 294542 TGTTGAGATGTGGTTATTGTTCAAAACTACCCTGTGTCAAATGGACAGTACCAAAGGGCTGTGACTCTTTTGTCTGGGGATAGCACTTGTATCATCCAAAACTAGGACTTAGAAAAGTACTCACGCAAAGGAGGGCAGTACAAGCTTAAATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252389 52 + 636262 TGTTGAGATGT----------------------------------------------------------------------------------------------------GAAGGGTACTCACGCAAAGGA-GGCAGTACAAGTTTAAATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 242315 153 + 647215 TGTCGAGATGTGGTTATTGTTCAAAACTACCCTGTGTCAAATGGACAGTACCAAAGGGCTGTGACTCTTTTGTCTGGGGATAGCACTTGTATCATCCAAAACTAGGACTTAGAAAAGTACTCATGCAAAGGAGGGCAGTACAAGCTTAAATGG - -a -s mr.mrrefChr5 105179 149 + 294542 AAAGGGTTCCAATGTCTATAATGCATAAGGCTGAATATACCACAACCTTATCTATTGGTTATTTCAGGCCACGTATGACGTTTCTCTGCACAATCATACTTCAGGGTCTAAGTTGGCATTGAGAGAAGTTGGAGTGTATTTTAGCTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252441 145 + 636262 AAAGGGTTCCAATGTCCATGATGCATAAGGCTGAATATACCACAACCTTATCTATTGGTTATTTCTGGCCACGTATGACATTTCTCTG----ATCATACTTCAGGGTCTAAGTTGGCATTGAGAGAAGTTGTAGTGTATTTTAGCTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 242507 142 + 647215 AAAGGGTTCCAATGTCTATAACACATAAGATTGAATATATCACAACTTTAGCTATCGGTTATTTCAGGCCACCTATGACGTTTCTCTGCACAATCATACTTCAGGGTCTGAGTTGGCATTGAGTGAAGTTGGAGTGGATTTT------- - -a -s mr.mrrefChr5 105328 169 + 294542 CACCAGCTAAGCAGGCCTGACAGAGTGACTATACAAACCTTGTAACTGCATAAACAAGACTAACCACTACCTTAGGACTTAGAACAGTTACATTGGGAATCTGGACACGGTTCATCTGGAAAATGCTTGGGAGTCAATTTCCCTTACTGAATTATCAGGTCTCTGAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252587 169 + 636262 CACCAGCTAAGCAGGCCTGACAGAGTGACTATACAAACCTTGTAACTGCATAAACAAGACTAACCACTACCTTAGGACTTAGAACAGTTACATTGGGAATCTGGACATGGTTCACCTGGAAAATGCTTGGGAGTCAATTTCCCTTACTGAATTATCAGGTCTCTGGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 242649 106 + 647215 ------------------------------------------------CATAAACAAGACTGACCACTACCTTAGGACTT-------TTACATTGGGAATCTAGAGACGGTTCATCT-----ATGC---GGAGTCAGTTTCCCTTACCAAATTATCAGGTCTCTGAGCC - -a -s mr.mrrefChr5 105497 177 + 294542 TTTCAGACACAATAGGGATGAACAGGCAGCAAGGAGTTGCTCTTCATAGGAATCCAGGGACCCAATATTCAGTAGGACTGTGGGTATAATATAACTCGTGTCTGTAGCTAAACAGTCAGTGACTCTAATTTGCTAAATATCTCTTATGAATCTCCGGGGTCTTCTAATGTCCAGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252769 175 + 636262 TTTCAG-CACAATAGAGATGAACAGGCAGGAAGGAGTTGCTCTATATAGGAATCCAGGGACCCAATGTTCAGTAGGAC-GTGTGCATAACGTAACTCTTCTCTGTAGCTAAACAGTCAGTGAATCTAATTTGCTAAATATCTCTTATGAATCTCCGGGGTCTTCTAACGTTCAGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 242755 177 + 647215 TTTCAGACACAATAGGGATGAACAGGTGGCAAGGAGTTGCTTTTCATAAGAATGCAGGGACCCAATATTCAGTAAGACTGTGGGTATAATATATCTCGTGTCTGTAGCTAAACAGTCAGTGACTGTAATTTGCTAAATATCTCTTATGAATCTCCTCGGTCTTCTAATGACCAGATA - -a -s mr.mrrefChr5 105674 8 + 294542 CAAGAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252944 8 + 636262 CAAGAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 242934 8 + 647215 CAAAAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 105682 10 + 294542 AGGAACTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252952 10 + 636262 AGGAACTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 242946 10 + 647215 AGGAACCCAA - -a -s mr.mrrefChr5 105692 59 + 294542 TGTTGAATGGGTGTGCACAGAGTGTTTTCAGGTCTATCACAAGTATTTCAAATAGATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252965 59 + 636262 TGTTGAATGGGTGTGCACAGAGTGTTTTCAGGTCTATCACAAGTATTTCAAATAGATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 242956 8 + 647215 TGTTAATT--------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 105751 14 + 294542 AGTAAAGGAGGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253030 14 + 636262 AGTAAAGGAGGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 105765 93 + 294542 AAGGTTGCCAGATTAGTGGTTTTATCTCCATGCCCTAAGAAGACTACTGAATTGTTAGGGTCTATTTTCACAGTCATGAGACTGCCATTGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253057 93 + 636262 AAGGTTGCCAGATTAGTGGTTTTATCTCCATGCCCTAAGAAGACTACTGAATTGTTAGGGTCTATTTTCACAGTCATGAGACTGCAATTGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 242964 17 + 647215 -----------------------------------------------------------------------AGTCTAGACAACGCCAT----- - -a -s mr.mrrefChr5 105858 71 + 294542 AAGTAGAACTTTCAGTGAGAATGATGAAGTCACTAACCAATCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGATCTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253151 71 + 636262 AAGTAGAACTTTCAGTGAGGACGATGAAGTCACTAACCAATCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGATATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 242981 70 + 647215 -GGTAAAACTTACAGTGAGAATGATGAACTCACTAACCAACCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGGCCTTC - -a -s mr.mrrefChr5 105929 26 + 294542 AAGTGTAGTCTAGTGTACAGTTATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253223 26 + 636262 AAGTGGGGTCTAGTGTACAGTTATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 243051 25 + 647215 AAGTGTAGTA-AGTGTACAGTTATTA - -a -s mr.mrrefChr5 105955 106 + 294542 CCTGCACGTCACTTATTTTAGTAACAGCTCAATACTGTAATAGTGGCTACAGATATTAGTATTACCTCCACTATTTTTTGCCCTTGTACCACATTGTAAATCATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253249 90 + 636262 CCTGCACGTCAC----TTCAGTAACAGCTCAATACTGTAATAGTGGCTACAGATATTAGTATTACCT--ACTATTTTTTGAC------CCACATTGT-AATCA--- -s simRat_chr6.simRat.chr6 243080 106 + 647215 CCTGCACATCACTTATTTTACCAATTGCCAGCTACTGCAACAGTCGTGATAGTTACTGGTACTACCTCCACTATCTTTTGCCCTTGTACCACAATGTAAATCATCC - -a -s mr.mrrefChr5 106061 52 + 294542 GGTGAGAATGAAGAATTGGCAAAAGCTGACCCCCAAACTGGAGGAGTGTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253339 52 + 636262 GGTGAGAATGAAGAATTGGCAAAAGCTGACCCCCAAACTGGAGGAGTGTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 243189 52 + 647215 GGTGAGAATGAAGAATTGGCAAAACCCGACACCAAAACTGGAGGAGTGTGAG - -a -s mr.mrrefChr5 106113 15 + 294542 CTATTGAGATTTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253428 15 + 636262 CTATTGAGATTTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 243241 15 + 647215 CAAGTGAGATTTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 106128 71 + 294542 CCCATCAAAAATTTGTGATCACACTCTGCATTATTTCAGGGGCCCTGGGTTTAAAGGCCGCTAAGGTGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253443 71 + 636262 CCCATCAAAAATTTGTGATCACACTCTGCATTATTTCAGGGGCCCTGGGTTTAAAGGCCGCTAAGGTGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 243261 71 + 647215 ACCATCAAAATTTTGTGATCACAATCTGCATTATTTCAGGGGTACTGGGTTTAAAGGTCATTAAGTTGTGG - -a -s mr.mrrefChr5 106199 27 + 294542 TAATAGTAACCACCAATCCAGTAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253514 27 + 636262 TAATAGTAACCACCAATCCAGTAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 243359 27 + 647215 TAACAGTAACCTCCAACCCAGTAAACC - -a -s mr.mrrefChr5 106226 88 + 294542 CAACAGACAGCATTTTTATTCTGATGTACCTGCCGTAGTAAGAAATAGCTCAACCAGCAAATCATGGTTTAACCGATTAATTTTGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253542 72 + 636262 CAACAGACAGCATTTTTATTCTAATGTACCTGCCGTAGTAAGAAATGGCTCAAT----------------AGCCGATTAATTTTGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 243386 88 + 647215 CAAAAGAGATTATTTTTATTCTGCTGTACCTGTCATAGTAAGAAATAGCTCAACCAGCAAATCATGGTTTAACCAATTAACTTTGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 106314 229 + 294542 TTTCGACTTGGAAGGCTTTGGGAAATTCTTTTAGCATAAACCAGGGTTGTCATTGTTTAGCCAATTATGACAAAAGAAGGTCAAACCAAGAAGATCCATATATTCATACATTTTGCATAGAAGCCCATAACACTCCGTGCCAGAGACATTTAATTACAGAACTCCTTGGTACTACCTTTGTTGTTTTTTATGTGCTATCAGAGGCAGGTTAATTACCAGGCCCAAACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253616 229 + 636262 TTTCGACTTGGAGGGCTTTGGCAAACTCTCTTAGCATAAACCAGGGTTGTCATTGTTTAGCCAATTATGACAAAAGAAGGTCAAACCAAGAAGATCCATATATTCATACACTTTGCATAGAAGCCCATAACACTCCGTGCCAGAGACATTTAATTACAGAACTCCTTGGTACTACCTTTATTCTTTTTTATGTGCTATCAGAGGCAGGTTAATTACCAGGCCCAACCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 243474 221 + 647215 --------TGGAAGGCTTTGGGAAATTCTTTTAGCATAAACCAGGGGTGTCATTGTTTAGCCAATGATGACAAAAGAAGGTGAAACCAAGAAGATTCATAAATTCATAAATTCTGCATAGAAGACGATAACACTCCATGCTAGAGACATTTGATTACAGAACTCCTCAGGACTGCCTTTGTTGTTTTTTCTGTGCTATCAGAGGCAGGTTCATTACCAGGCCCAGACAA - -a -s mr.mrrefChr5 106543 68 + 294542 ACCAATATAAGCGAGATAGTAATGTCACTTAGCTGTGGTCTACTAATAATCACCTGAGGAGAAATAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253845 68 + 636262 ACCTACATAAGCGAGATTGTATTGTCAATTAGCTGTGGTCTACTAATAATCACCTGAGGAGAAATAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 243701 68 + 647215 ACCAATACAAGGGAGATAGTAACATCACTTTGCTGTGGTCTCCTAATAATCACCTGATGAACGATCAG - -a -s mr.mrrefChr5 106611 121 + 294542 GCTAAAGAGTACAGCCGTGAGATTAGTAGGGCAACTAAGAGCAAGATATGAGTGTTAGAGAAAATGCTGATGGCAATAAACGCCCCCCATTGAGATTAAGCAAAGGAAATTTGACTTAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253914 121 + 636262 ACTAAAGAGTACAGCCGTCAGATTAGTAGGGCAACTAAGAGCAACATATGAGTGTTAGAGAAGATGCAGATGGCAATAAACGTCCCCCATTGAGATTAAGCAAAGGAAATTTGACTTAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 243769 121 + 647215 GCTAAAGAGTATAGCCGTGAGATTAGTAGGGTAACTAAGAGCAAGATACAAGTGTTAGAGAAAACGCTGATAGCAATCAAAGCCCCCTGTTGAGATTAAGCAAATGAAGTTTAACTTAGGA - -a -s mr.mrrefChr5 106732 193 + 294542 AATGACAATAGAAGTGGAATCTAAGTTTCTGCTATTAAAGTTTTCCACTATTGACTATGGTGCAAGCTGGCTACTTAAAAAGTGTTTATAAGGCTGTAGGAACATAATAGTCTGCAGTGGTCCTAAATGAATACTAAGCAATAGCGACCGTAAGAGATGTTTACTGGTCTAGTAAGTACAGGGTAGCCGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254068 193 + 636262 AATGACAATAGAAGTGGAATCTAAGTTTGTGCTATTAAAGTTTTCCGATATTGACTATTGCGCAAGCAAGCTACTTAAAAAGTGTTTATAGGGCCGTAGGAACATAATAGTCTGCAGTGGTCCTAGATCAATACTAAGCAATAATGACCGTAAGAGATGTTTACTGCTCTGGTAAGTACAGGGTAGTCCATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 243890 184 + 647215 AATGACAATAGAAGTGGAATCTAAGTTTCTGCTAT-----TTTTCTACTATTGACTATGGTGCAAGCTGGCTACTCAAAAAGTGTTTATAAGGCTCTAGGA----GATGGTCTGCATCGGTCTTAAATGAATACTAAGCAACAGCGACCATACGAGATGCTTACTGGTCTAGTAGCTACAAGGTGGCCGATCT - -a -s mr.mrrefChr5 106925 369 + 294542 GGATGCTGCAATTGTCTACCTATCTTACCCTTAAGTACCAACCATCATTCATGGCTTTTGCCAGGGACATACATGATCTAGCAACACACCCAAACAAACTCTGACATGCAGCTGAAGTCAACTGGCCAATAAAGCAGGTAGTTAGTTTGTGAGATATATGTTGTTGCATGTTTAATGGACAAGGTTCCACACTTACTACTCCGATCAGACATCATATATCCCCAGGTCACTTGGCTAAACTGAACAGTTGTCTACCCCAAAATTACCTTATTAGAATCTAGCTGACCATGGGAATATCACTTGATAGCTAAACAATGTACTTTGTATAGGTGTGGAATTAAAATATGACACACTACAACCCTGTGATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254263 347 + 636262 AGATGCTGCAAGTGTCTACCTA-------------TACCAACCATCATTCATGGCTTTTGCCAGGGACATACATGATCCAGCAATACACCCAAACAAACTCTGGGATGCAGTTGGAGTCAACTGGCCAATAAAGCGGGTAGTTGGTTAGTGAGATATATGTTATTGCATGTTTAATGGACAAGGTTCCAAACTTGCTACTCTGATCAGACATCATATATCCCCAGGTCACTTGGCTAAACTAAACAGTTGCCTACCCCAAAATTACCTTATTAGAATCTAGCTGACCATGGGAATATCATTTGATATCTAAACAATGTACTTTGAGTAGGCGGACAACCAATACACAAC---------CCCTGTGATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 244074 369 + 647215 GGATGCTGCAATTCTCTACCTATCTTACCCTTAAGTACCAACCATCCTTCATGGGTTTTGCCAGTGATATACATGATCTAGCAACACACCCAAACAAACTCCGACATGCAGCTTAACTCAAATGGCCAATAAAGCAGGTAATTAGATTGTGAGACTTATGTTGTTGCATGTTTAATGGACAAGGTTCCACACTTACTACTCCGATCAGACATCACATATCCCCAGGTCACTTGGTTAAACCGAACAGTTGTCTACCTCATAATTACCTTATTAGAATCTTATTGGCTATGGGAATATCACTTGCTAGCCAAACAACACACTTTGTATAGGTGTGGAATTAAAATATGACACACTACAACACTGTGATCT - -a -s mr.mrrefChr5 107294 16 + 294542 GCTGATCTACGTACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254664 16 + 636262 GCTAAACAATGTACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 244443 16 + 647215 GCTGGTCTACGTACAC - -a -s mr.mrrefChr5 107310 170 + 294542 ACAACCAATACACAACCCCTGTGATCTCATTAAACTAAGTTTCATGACTTTGTCCTATAAGTTGTAACTATTGGGTTAGGTATCTGTCAACCTACTGGTGTTTAAGGTCCTTGATAGAGTATGAAGTCCTCGTGCCATGTTGTAGGTGGAGATGTGCTGGCTGCAACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254691 167 + 636262 ACAACCAATACACAACCCCTGTGATCTCAGTAAACTAAGTTTCCTGACTTGGTCCTATAACTTGTAACTATTGGGTTAGGTATCTGTCAACCTGCTGGTATTTAAGGTCCTTGATAGAGTATGAAGTCCTCATGCCATGTTGTAGGTGGAGATGTGC---CTGCAACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 244459 156 + 647215 ACAACCAATACACAACCCCTGTGATCTCATTAAACTAAGTTTCATGACTTTGTCCTATAAGTTGTAACTATTGGCTT--------------CCACTGGAGTTCAAGATCCTTGATAGGGTATGAGGTGCTTGTGCCATGTTGTAGGTGGAGCTGTGCTGGCTGCAACGTC - -a -s mr.mrrefChr5 107480 17 + 294542 GTATGCCATTTTACCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254858 17 + 636262 GTATGCCATTTTACCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 244616 17 + 647215 GTATGGCATTTTACCAG - -a -s mr.mrrefChr5 107497 127 + 294542 CACATAGATTCTAGCTTTGTCCAAACAGTTGTAGTGGAGTCATTCTGTAGGCTGGCAAGATGATGATACAAGAACTTCTACCCACCAAAGAAAGGTCATATCCATCTTATGCAGTATATGAATATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254875 122 + 636262 CACATAGATTCTAGCTTTGCCCAAATAGTTGTAGTGAAATCATTCTGTTGGCTGGCAAGATGATGATACAAGAACTCTTACCCACCAAAGAAAGGTCATATCCTTCTT-----GTATATGAATATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 244634 127 + 647215 CACAGAGGTTCTAGCTTTCTCCTAACAACTGTAGTGGAGTCAAGCTGGAGGCTGGCAAGATGATGATAGAAGAGCTTCTACCCACCAAAGAAGGGTCGTCTCCATCTTATGCAGTATCAGAATATCA - -a -s mr.mrrefChr5 107624 15 + 294542 TTTGGAACAAGAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255014 15 + 636262 TTTGGAACAAGAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 244761 15 + 647215 CTTGGAACAGGGAAG - -a -s mr.mrrefChr5 107639 18 + 294542 GTCATATCCATCTTATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255029 18 + 636262 GTCATTTCCATTTTATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 244777 18 + 647215 GTCATATCTATCTTACGC - -a -s mr.mrrefChr5 107657 44 + 294542 AGTACATGAATATGACTTGGAACATCCTCCCATTTGGTAGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255048 44 + 636262 AGTACATGAATATGGCTTGGAACATCCTCCCATTTGGTAGCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 244795 44 + 647215 AGTCTATGAATATGACTTGGAACATTCCCCCATTTGGTAGCACT - -a -s mr.mrrefChr5 107701 135 + 294542 GTTAGGGCTAGACCTTTGGCTCTCAGCAACTGCTACTGAGTAAGATATTAATTTCCTTGATCAGAAGATATTCATGATATCACTTTCTTCATGCTTGATGGAGTCCGTTCAGGATATAGCTTCTTTGCTGCTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255098 135 + 636262 GTTAGGGCTAGACCTTTGGCTCTCAGCAACTGCTACTCAGCAAGGTATTAATTTCCTTAATCAGAATATATCCCGGATATGACTTTCTTCATGCTTGATGGAGTCCGTTCAGGATATAGCTTTTTCGCTGCTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 244839 134 + 647215 GTTAGGACTAGACCTTTGGCTTTCAGC-ACTGCTGCTGGGTAAGATATTAACTTGCTTGATTAGAAGATATTCATGATATCACTTCCTTCATGCTTGATGGAATCCGTTCAGGATATAGCTTCTTTGCTGCTGAG - -a -s mr.mrrefChr5 107836 116 + 294542 AGTGTTGTTCAAGGTTCCTCTAGGTATTTTAGCCACGCAGTCAAGACTCCACTCCAATCTCCCCAATTTAATAGTTGTAGGCCCAAGCTTCCTGCTACTGTTTAAGAGACCCATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255242 116 + 636262 AGTGTTGTTCAAGGTTCCTCTAGGTGTTTTAGCTACGCAGTCTAGACTCCACTCCAATCTCCCCAATTTAATAGTTGTAGGCCCAAGCTTCCTGCTACTGTTTAAGAGACCCATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 244973 116 + 647215 AGTGTTGTTCAAGGTTCCCCTAGGCATTTTGGCCACGCAGTCAAATCTCCACTCTGATCTCCCTAACCTAATAATTGTAGGCTCAAGCTTCCCAATACTGTTTGGGAGACCCATTT - -a -s mr.mrrefChr5 107952 122 + 294542 ATGTAGCTTCATTTATGGTTCTCGTAGGTGCTTTAGGTGCACAGTGAACACTCCTATCTCCACAGCTTGAAGAAAGCCCCAAGCTTGCTCCATGGTATGAAAAGTCCTATGCTTACTATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255358 122 + 636262 ATGTAGCTTCATTTATGGTTCTCGTAGGTGCTTTAGGTGCACAGTGAACACTCCTATCTCCACAGCTTGAAGAAAGCCCCAAGCTTGCTCCATGGTATGAAAAGTCCTATGCTTACTATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 245091 122 + 647215 ACGTAGCTTCATTTATGTTTCCCATAGGTGCTTTAGCTGCACAGTGAAGACTCCCATCTCCACAACTTGAAGAAAGCCCCAAGCTTGCTCCATGGTATGAAAAGTCCTATGCTTACTATTAA - -a -s mr.mrrefChr5 108074 8 + 294542 ATCCACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255480 8 + 636262 ATCCATCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 245266 8 + 647215 GTTCACTA - -a -s mr.mrrefChr5 108082 123 + 294542 TCATCATGGACTCTAATTAATAAGACATTAGCTTCATCATATACTGTTCCTCTGACTCTACTTTGCACTCAAGTGTAGTACACAAGCTATCTTATTATCTATCACAGCCTCATGGGGCTAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255488 114 + 636262 TCATCATGGAGTCTAATTA---------TAGCTTCATCATATACTGTTCCTGTGACTCTATTTTGCACTGAAGTGTAGTACACAAGCTATCTTATTATCTATCACAGCCTGATGGGGCCAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 245276 123 + 647215 TCATGATGGACTCTAACTAATAAGACATTGGCTCCATCACATACCGTTGCTCTGACCCTACTCTGCACTCAAGTGTAGTACACATGCTGTCCTATTATCTATCACAGTCTCATGGGGCTGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 108205 71 + 294542 TGATGTCATGTATTTAATTATGGGTAAGAGTAAGGGTGTCCTTACTTGGTCTCAGTAGTATAGGAAGATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255608 71 + 636262 CGATGTCATATATCTAGTTATGGGTAAGAGTAAGGGTGTCCTTACATGGTTTCGGTAGTTTAGGAAGATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 245399 67 + 647215 TGATGTCACGTATTTAATTAT----AAGGGTAAGGGTGTCCTTACTTGGTCTCAGTAGTATAGGATGATAA - -a -s mr.mrrefChr5 108276 156 + 294542 GTTTCAGCATTAGATGGCTTGACATCAGGCTCAGAACACAGGAGAGAAGTACCACGATACTGCGACAAAAGACACTACAACCCTCAGACTAGCAGCAGGGCGGACAAAACATAGAGACAGTAGGTGGTCCCTACTAACAGAGTTCAAACTAACTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255680 99 + 636262 GTTTCAGCATTAGATGGCTTGACATCAGGCTTGGAAGAGAAGAGAGAAGCACCATG---------------------------------------------------------GAGACAGTAGGTGGTCCCTACTAATAGAGTTCAAACTAACTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 245466 156 + 647215 GTCTCAGCATCAGATGGCTTGACATCAGGCTCAGAACACAGGAGAGAAGTACCACGATACTGCGACAAAAGACACTACAACCCTCAGACTAGCAGCAGGGCGGACAAAACATAGAGACAGTAGTTGGTCCCTACTAACAGAGTTCCAACTAACTGG - -a -s mr.mrrefChr5 108432 263 + 294542 GTTCAACTATAGGTCACCAGTACAATATTGTCTCATTCTCTGTAACAAACAAAACATCCTAGGAACTTAACCATTTAATGCACAAGATACAGCAGCCTGTACCTAAGCTGCAGGGGGGTACTGTATACAATGTTCCAGGACTCACAAGTTTACAAATTTCATGATCTAATATATGACAAGGCACCTAATGGACAAAAGCCTGCTGCATCAAGTGACCTTAGCCATTTTACATATCAAACTGCCATGAACCCAATGCCCTGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255812 259 + 636262 GTTCAACCATAGGTCACAAGCACAATATCGTCTTATTCTCTGCAACAGACAAAACATCCTAGGAATTTAACCATTTAATGCACTAGATACAGCAGCCTCTACCTCAACCGCAGGGGGGTACTGTATACAATGTTCCAGAACTCACAAGTTTACAAA--TCGTGATCTAATATATGACAAGGCACCTAATGG--AAAAGCCTGTTGCATCAAGTGACCTTAGCTATCTTACATAACAAACTGCCATGAACCCAATGCCCTGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 245622 256 + 647215 ATCTCACTATATGTCACCAGTAGAATATTGTCTCATTC-CTCTAACGAACAATACAT-GCAGGAACTTAGCCATTTAGTGCACAAGATACAGCAGCCGGTAGCTAAGCTGCA-GAGTGTACTGTATACAATGATCCAGGACTCACAAGTTTACAAATTTCATGATCTAGTATCTGACAAGGTGCTTAACGGACAAAAGCCTGCTGTGTCAAGTGACCTTTACCACTTTACATATCAAACTGCCATGAAC----TGCCCAGGAT - -a -s mr.mrrefChr5 108695 52 + 294542 TATACAGACTCCCATTGATTAGAATTAGGCTGAAGTGAAATACGCTCTAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256072 52 + 636262 CATACAGACTCCCATTGATTAGAATTAGGCTGAAGTGAAATATGCTCTAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 245878 51 + 647215 TATACAGGC-CTCTGTGATTAGAACTGGGCTGCAGTGAAATACGCTCTAGCT - -a -s mr.mrrefChr5 108747 184 + 294542 TTTCACCTTCTAGTGTAGATTACATTGTGATTTATAGTACAACAGAGTAGCTCATGGTTCTAAATATCATCACACTGAGCAAAGAGAACCCCTACTTCAATACAATCAGCAGAATGGTAATTAAGACCTAATAGTTGTAACCTCGGTCCCTGGAAGAGGTTAGAGTGTTGCTTCAAAGTGTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256127 180 + 636262 T-TCACCTTCTAGTGTAGATTACATTGTGATTTATAGTACAACAGAGTAGCTCATGGTACTAACTATCATCACACTGAGC---GGGAACCCCTACTTCAATACAATCAGCAGAATGGTAATTAAGACCTAATAGTTGTTACCTCAGTCCCTGGAAGAGATTAGAGCGTTGCTTCAAAGTGTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 245929 184 + 647215 CTTCACCTTCTAGTGTAGATTATACTGTGATTTATCATACAGCAGAGTAGCTCATGGTTCTAAATATGATTACACTGAGCAAAGAGCACCCTTACTTCAACACAATCAGCAGAATGTTAATTAAGACCTAATAGTTGCAACCTCGGTCCTTGGGAGAGGTTAGAGTGTTTCTTCAAAGTGTTAA - -a -s mr.mrrefChr5 108931 101 + 294542 CCATGATAGGATGCCTGTGGTCAACAAACGATGTACTTGTTATTTAAATAACAGAGTAGTTGCTGAGGTGTGCCACACTAGAGCTCACTTATGCATGTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256307 101 + 636262 CCATGATAGGATGCCTGTGGTCAACAAACGATGCACTTGTTATTTAAATAACAGAGTAGTTGCTGAGTTGTGCCACACTAGAGCTCACTTATGCATGTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 246151 101 + 647215 CCATGATAGGATGCCTGTGGTGAACAAACGAAGTACTTGTTATTTAAATATCAGAGTAGTTGCTGAGGTGTGCCCCACTAGAGCTTGCTCATGCCTGTGGT - -a -s mr.mrrefChr5 109032 263 + 294542 AGCAAATAAGCTACCCATTATATAAATAACAAACTTTATGCTTAAGGTGTGCTCCACTAAAGATCCTTTGATTCATAAACCCTTACTTTATGGCCCAGAATAACAAAGAACAACAAATGTGAATACATAAATGTCAGAGTCTCAGAGGAGTCCCCGACTAGCTTAAGCCCTGAGGATACATCTCCCAGTTAGGATCTAAGAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAGACTTTGTCACCTTTGCATTGCTCCGCCTGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256408 263 + 636262 AGCAAATAAGCTACCCATTATATAAATAACAAACTTTATGCTTAAGGTGTGCTCCAGTAAAGATCCTTTGATTTGTAAACCCTTACTTTATGGCCCAGAATAACAAAGAACAACAAATGTGAATAAATAAATGTTAGAGTCTCAGAGGAGTCCCTGACTAGCTTAAGCCCTGGGGATACATCACCCAGTTAGGATCTAAGAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAGACTTTGTCACCTTTGAATTGCTTCGCCTGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 246253 253 + 647215 AGCAAGCAATATACCCATAATTTAAATAACAAACTTGTTGTTTAAGGTGTGCTCTGCTAAAGATCCTCTGATTCATAAACCCTTACTTTATGGACCAGAGT----------AACAAACGTGAATGCATAAATGTCAGAGTCTCAAAGGAGGCCCCGACTAGCTTAGGCCCTGAGGATACATCTCCCACTTAGGATCTAGAAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAAACTTTGTCACCTTAGCATTGCTCCGCCTGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 109295 104 + 294542 TTTGGATTTGGTACAATTCTATCTACAAAAAGAAGTTGTTTTTATAAAGGGTCCACCTGAAGGCCACCCAGTTATAGATGACTCATGAGTTCACTGATACAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256673 101 + 636262 TTTAGATTTGGTGTAATTCTATCTACAAAAAGAACTTGTTTTTATTAGAGGTCCACCTGAAAGCCACCCA---ATAGATCACTCATGAGTTCACTGATACGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 246506 104 + 647215 TTTGGATTTGGTACAATTCTATCTAGAAAAAGAAGTTGTTTTTAGAAAGGTTCCACATGAAGGCCACCCAGTTATAGATGACTCACGGGTTCACTGATATAGAC - -a -s mr.mrrefChr5 109399 8 + 294542 ATACACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256775 8 + 636262 ACACACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 400048 8 - 647215 TTTTTCTG - -a -s mr.mrrefChr5 109407 115 + 294542 CAACAGCTCTACTGTTTACAGCAGGTATACAACTAAAATGACTATATTTTCCAGGATATTTAACAAGTTACTAGACTAAAGCCAAGAAAATAGTAAGTTCAAATGAATATGGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256783 115 + 636262 CAACAGCTCTACTGTCTGCAGCAGGTATACAACTAAAACGACTATATTTTCCAGGATATTTAACGAGTTACTAGATTGAAGCCAAGAAAATAGTAAGTTCAAATGAATATGGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 400057 115 - 647215 CGTCATCTCTACTGTTTACAGCAGGTATACAATTGCGGTGACAATATTTCTCAGGATATTTAGCAAGCTGCTAGACTAATGCCAAGAAAATAGTAAGTTCAAATGAATATGGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 109522 78 + 294542 AGTCAAGTATGGGACCTATCAGTCAATGTGTTGACCAAAATACATGCCAAGGGGCCAGGAGACTTTGCAAGAGTGGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256902 78 + 636262 AGTCAAGTATGGGACCTATCAGTCAATGTGTTGACCAAAATACATGCCAAGGGGCCAGGAGACTTTGCAAGAGTGGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 400172 78 - 647215 AGGTAAGTGTGGGAACTTTCAGTCAATGTGTTGACCAAAATCCATCCGAGGGGGCCTGGAGACTATGCAAGGGTGGAC - -a -s mr.mrrefChr5 109600 68 + 294542 TGCTGGCTTTTACTGATACAAATTGCTCTATGGCCTATGGACGACCAAGACATGAGACTAAAATTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256980 68 + 636262 TGCTGGCTTTTACTGATACAAATTGCTCTATGGCCTATGGACGACCAAGACATGAGACTAAAATTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 400251 68 - 647215 CACGGGTGTTTACTGATACAGATTGCTCTTTGGCCAATGGACAACCAAGACATGAGACTGGAATTATG - -a -s mr.mrrefChr5 109668 82 + 294542 TGGAACTCTATGCGGTGCTGCATGTCCACAATTAGCTTCTACCTTTGAATATGGTTATGATTATGGTAGTGAGATTTGTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257048 82 + 636262 TGGAACTCTATGCGGTGCTGCATGTCCACAATTAGCTTCTACCTTTGAATATGGTTATGATTATGGTAGTGAGATTTGTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 400322 82 - 647215 GGGAACTCTATGGTCTGCTGCAAGTCCATAATTAGCTTCCACCTTGGAGCATGGTTATGATTTTGGTAGTGAGATTTGATTT - -a -s mr.mrrefChr5 109750 15 + 294542 CTATTAGCTTTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257130 15 + 636262 CTATCAGCTTTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 400408 15 - 647215 CTATTACCTTTGTAC - -a -s mr.mrrefChr5 109765 80 + 294542 AAAGTGAACTTTATCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGATCAGAGATGTGATGTGCAACTACAGTTGAGTTGCCCATGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257156 79 + 636262 AAAGTGAACTTTATCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGAT-AGAGATGTGATGTGCAGCTACAGTTGAGTTGCCCATGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 400423 80 - 647215 AACATAAACTTTGTCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGATCATAGATGTGATGTATGACTACAGTTGAGTTGCCCATGCA - -a -s mr.mrrefChr5 109845 21 + 294542 CTGCATTCAAGATACCTATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257235 21 + 636262 CTGCATTCAAGATACCTATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 400504 21 - 647215 TTGCATCCAAGATACCTATGG - -a -s mr.mrrefChr5 109866 80 + 294542 CTTGTTCAGGGGCATGAGTTATGTGATGAGGTGGTCCCAAGCCCAGCCAACAATGTGACATGCTGGATAGTCAGAACAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257256 80 + 636262 CTTGTTCAGGGGCAAGAGTTATGTGATGAGGTGGTCCCAAGCCCAGCCAACAATGTTACAGGTTGGATAGTCAGAACAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 400526 79 - 647215 CTTGTTCAGGGGCATGAATAATGTGATGAGGTGGTTCCAAGCCCAGCCAACAATGTGAAATGCTGCATGG-CAGTGTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 109946 37 + 294542 TGCAAGTTTCAACCAACAGAGTGACAACTATAATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257336 37 + 636262 TGCAAGTCTCAACCAACAGAGTGACAACTATAATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 247168 37 + 647215 TGCAAGCTTCAACAAACCTAGTGACAACTATAATCAT - -a -s mr.mrrefChr5 109983 8 + 294542 GTCTAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257373 8 + 636262 GTCTCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 247206 8 + 647215 GTCTAAGT - -a -s mr.mrrefChr5 109991 387 + 294542 GGTGATAGGTTCCTCCCAGGAAAGTAGCACAGGGGGCTGATAGAAGAGCTCCCTGTACCTATGATTGTCAGCATATGCCAGACCTCCTGTTTGGGATGTATGCACTGCCAAACTGGCTATAGATTACATTGGCAAATTAATTCCTTGAGCCCATTAATGCAGCAGCCTGGTATTGATTGGACTAGAGTTGGGCCTCTAAACACCAAGAGAAAGGAGAGAACATTTGTTAAGAAGGATTCTACATGCTACCGACCACACTAGTTAATCTTCTGTATCAAAATAACCCAGTCTACAACATTAAAATCTAACTTAGCCTGTTACTCGTGACACACCACTAAGTCATTGCTTTGAAGGCCATAACTTCTGTAGAAGCTACACTAGAAAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257381 383 + 636262 GGTGATAGGTTCCTCCCAGGAAAGTAGTACAGGG-GCTGATAGCAGAGCTCTTTGTACCTATGATTGTCAGCTTATGCCAGACCTCCTGTTTGGGATGTACGTACTGCCCAACTGTCTATAGATTACATTG---AATTAATTCCTTGAGCCCATTAATGCAGCAGCCAGGTATTGATTGGACTAGAGTTGGTCTTCTAAACACCAAGATAAAGGAGAGTACATTTGTTAAGAAGGATTCTACATACTACCGACCACACTAGTTAATCTGCTGTATCAAAATGACCCAGTCTACAACATTAAAATCTAACTTAGCCTGTTACTCATGACACACCACTAAGTCATTGCTTTGAAGGCCATAACTTCTGTAGAAGCTACAGTAGAAAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 247215 379 + 647215 GGTGATAGGTTCCTTCAAGGAAAGTAGCACAGGGGGCTGACAGAGGAGCTCCCTGTACCTATGACTGTCTGCATATGCCAGACCTCCTGTTTGGGATGTATGCCCTGCCAAACTGGCTATAAATAACATTGGCAAAATAATTCCTTGAGCCCATCAATGCAGCAGCCTAGTATTGATTGGACTAGCATTGGGCCTCTAAACACCAGAAGAGAGGAGAGAACATTTGTTAAGGAGGATCATACATGCTATCAACCACACTAGTTAATCTTCTGTATCAAAATAACTCAGTCTACAATATTGAAGACTAGCTTACCCTGTTCCCTGTGAC--------AAGTCATCGCTTTGAAGACCATAACTTCTGTAGAAGCTATACTAGAAAGAT - -a -s mr.mrrefChr5 110378 17 + 294542 GATAAGGAGCTAGATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257764 17 + 636262 GATAAGGAGCTAGATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 247616 17 + 647215 GATAAGGAGCTAGGTGG - -a -s mr.mrrefChr5 110395 145 + 294542 GAGAGATCAGGGTGATCTTCCTTAGCCAGGCTGGTTCTTTCACAAGTAGGGAGACGAAAAGGTTAACAGCTGTGGTAATGTGTGTTGTTGTTTAAAAGGGAAGGTTGAAGCTCAACTGTAAGCTCACACACTGTTTTGCTAGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257781 143 + 636262 GAGAGATCAGGGTGATCTTCCTTAGCCAGGCTGGTTCTTTCACAAGTGGGGAGACGAAAAGGTTAACAGCTGTGGTAATATGTG--GTTGTCTAAAAGGGAAGATTGAAGCTCAACTGTAAGCTCACACACTGTTTTGCTAGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 247645 135 + 647215 AAGAAATCAGTGTGGTCCTCCTTAGCCAGGCTGGTCCTTTCAGAAGTAGGGAGACAAAAAGGTT--CAGCTGTGATAATGCGTGTTGTTGTTTCAAAGGGAAGGTTGAAGCT--------AGCTCACACATTGTTTTGCCAGATT - -a -s mr.mrrefChr5 110540 308 + 294542 CTCCTGCCTTGGAACCTTGTACTAACACTGGAGATATCAGGTTTCCAACCCTTATTAAACCCTTAGTAAGACCACGGCTCATGGTTTTTACTTCAATATCATGATCAATACCCTACATCAGATTCTTGTGCTGTAAGAAATGGGTGAATTAGTAAAAATGCTTGTAATGGATAAAGATCTAGGCTTTTTATAGAGGAAGCAGCAAGCAAGCACCTAAAATTTAATTTTGCGGGGCTATCTACACTCCAAAAACACTCCAGCAAGTTCAAGTGACAGAATGGTTTTTTTATTTTGCAACTATCATGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257924 303 + 636262 CTTCCGCCTTGATACCTTGTACT-----TGGAGATATCAGGTTTCCAACCCTTATTAAACCCTTAATAAGATCACAGCTCATGGTTTTTACTTCAATATCATGATCAATACCCTACATCAGGTTCTTGTGCTGTAAGAAATGGGTGAATTAGGAAAAATGCTTGTAATGGATAGAGATCTAGGCTTTTTAGAGAGGAAGCAGCAAGTGAGCACCTAAAATTTAATTTTGCGGGGCTATCTACACTCAAAAAACACTCCAGCAAGTTCAAGTGACAGAATGGTTTTTTCATCTTGCAACTATCATGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 247795 306 + 647215 CTCCTGCCTTGGAACCTTCTACTAACACTGGAGATATCAGATTTCCAACCCTTATTAAGCCCTTAGTAAGACCACGGCTCTTGGTTTTTACTTCAATATCATGATCAATACTCTACATCAGATTCTTCTGCTGTAAGAAATTGGG-AATTAGTAAAAAGGCTTGTATTGGATAAAGATCTAGGCTTTTTATAG-GGAAGCCGCAAGCAAGCACTTAAAATTCAATTTTGTTGGGCTATCTACACTCCAAAAACACTCCAGAAAGTTCAAGTAACAGAATGGTTTTTTTAGTTTGCAACTATCGTGTGG - -a -s mr.mrrefChr5 110848 409 + 294542 TGCTATCAAAAGATTGAATTCTCAAATTCCTCCTTAGTGCAAGATTATCAGTATGTGGTGCAGTAGCCAGGTCTATTAATCTTTTAAGAGTCCGGTGCTAAAGCACCCACCAATGCGGTGACTTCCATGAGTTTGAAATGATTGCAGGCAACAGGCTCACAGGAGCAATAGACCGATCTAGGAGATTGAGATTATCAGTGGAAAGAGTTCATGTTCTGGAGATATTGTACTATAATTGTGTCAGGGATTAGCTGTTCTTCCTTTCTTCAGAGTATGACAGAATTTGGTTATAGAATAATTGCCCAAGGAAGTATGAGTATAGTAGGCCCTGTGCCTCTACCTGAATTTATATTGTCTATAGGGTAGTCTTCTGTGTAATTCTGCAAAGCTGCAACAAGCAAACACCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 258228 409 + 636262 TGCTATCAAAAGATTGAATCCTCAAATTCCCCCTTAGTGCAAGAGTATCTGTATGTGGTGCAGTAGCCAAGTCTATTAATCTTTTAAGAGTCCGGTGCTAAAGCACCCAACAATGTGGTGACTTCCCTGAGTCTAAAATGATTGCAGGCAATAGACTTAAAAGAGCAATAGACCGATCTAGGAGATTGAGATTATCAGTGGAAAGAGTTCATGTTCTGGAGATACTCTACTATAATTGTGTCAGGAATTAGCTGTTCTTCCTTCCTTCAGAGTATGACAGAATTTGGTTATAGAGTAATCGCTCAAGGAAGTATGAGTACAGTAGGCCCTGTGCCTTTACTTGAATCTGTATTGTCTATAGGGTAGTCTTCTGTGTAATTCTGCAAAGCTGTGAGGAGCAAACACCCGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 248101 391 + 647215 TGCTATCAAAAGATTCAGTTCGCAAATTCCTCCTTAGTGCAAGATTATCAGTATATGGTGCAGCAGTCAGGTCCAGTAATCTTTTAAC------------AAGCATCCACCAATACGAAGAGTTCCATGAGTTTGAAATGATTGCAGGCAGCAGGCTCACAGGGGCAATAGACTGATCTAGGAGATTGAGATTATTAGTGGAAAGAGTTCATGC------AATCTTGTACTATAATTTTGTCAGGGATTAGCTGTTCTTCCTTTCTTCAGGATATGACAGAACTTGGTTATAGAATAATTGCCCATGGAAGTATGAATATGGTAGTCCCTGTGCTTCTACCTAAATTTATTTTGTTGATATGGTAGTCTTCTGTGTAATGCTGCTAAGCTGCAACAAATGAACACCAGC - -a -s mr.mrrefChr5 111257 148 + 294542 GCTTTTAACTAATCTGCCTGTTTAGAACAGCTATGTTTATACAGGATGGTCCATCTGGCCCCAGACTTCTATGACCAATTGGAGTCACAATTCTGTGGTGTGTTGGTCCCCTAGCACACAGGTGGACTAGCAGTCCAAGATAATTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 258637 145 + 636262 GCTTTTAACTAATCTGCCTGTTTAGAACAGCTATGTTTATATAGGCTGGTCCATCTGGCCCCAGACTTCTATGACCTATTGGGGTCAGAATTCTGTGGT-TGTTGGGCCTCTAGCACACAGGTGGACAAGCAGTCCAAGATAATTG-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 248493 148 + 647215 ACTTTTAACTGATCTGTCTGTTTAGAACAGGTATGTTTATACAGGATGGTCCATCTGGCCCCAGACTTCCATGACTAATTGGAGTCACAATTCTGTGGTGTGCTGGTCCCCTAGTACACAGGTGGACTAGCAGTCCAAGATAATTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 111405 27 + 294542 GCCAGGTTTTGATCGTCACTTGTAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 248644 27 + 647215 GCCAGGTTTTGATCGTCACTTGTAATG - -a -s mr.mrrefChr5 111432 269 + 294542 TTCTGCTGGCACAGAGAAGAGTTACTGAGCTACAGATCTAGATAGCCCCTTCAGTAGTGCTCATTCTAGGATGGAACTCCTCTTGCACAGCTAGCTGGGGGGTGATACACAGATACATCAGTTACCCAGTTAAAAGAATATTACTAGTAGTCTTCTGGTGTTCTGATTGACCTTGGGAGTGGGGGATTCAACAGCACTGCACAAATGATGGAGTACATAGTGCACCTTCTGCAGCATTTGTATAACAAGAGCATTTATAATTGGGCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 258782 217 + 636262 ----------------------------------------------------AGTAGTCCTCATTCTAGAATGGAACTCCTCTTGCACAGCTAGCTGGGGGGTCATACACAGATACATCAGTTACCCAGTTAAAAGAATACTACTAATAGTCTTCTAGTGTTCTGAGTGACCTTGGGAGTGGGGGATTCAACAGTACTGCACAAATGATGGAGTACATAGTGCACCTTCTGCAGCATTTTTACAGCAAGAGCATTTATAATCGGGTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 248673 248 + 647215 TTCTGCTGGCACAGAGAAGAGTTACTGAGCTACAGATCTAGATAGCCCCTTCAGTAATGCTCATTCTAGGATGCAACTCCT-----------------GCGGTGATACACAGATACATCAGTTACCTGTTTAAAATAATATTACTAGTAGTCTTCTGGTGTTCTCATTGACCTTTGGAGTGGGGGATTCAACAGCACTGC----ATGATGGAGTACATAGTGCACCCTCTGCAGCATTTGTATAACAAGAGCATTTATATTTGGGCTCA - -a -s mr.mrrefChr5 111701 86 + 294542 TGTTACCCAAGCCAGATATTCACCAGGCTTGTGGTGTATAAGGGACGAGGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259001 86 + 636262 TCTTGCCCAAGCCAGATATTCACCAGGCTTGTGGTGTATAAGTGACGCGGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 248921 83 + 647215 TGTTACCCAAGCCAAATATGCACAGG--TTGTGGTGTATAAGGGATGAAGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTG- - -a -s mr.mrrefChr5 111787 91 + 294542 CAAAAGCAGAATCCTTCTGATCTACACATTTGGACTATTGACATTTTACTTCCTTACTCCTAAAGCTTCGCTTTTCACTTTTGGCTTGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259088 91 + 636262 CAAAAGCAGAATCTTTCTGATCTATGCATTTGGACTAATGACATTTTACTTCCTTACTCCCAGAGCTTCGCATTTCACTTTTGGCTTGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 249004 80 + 647215 -----------TCCTTCTAATCTACACATCAGGACTATTGACATTTTACTTCACTACTCCTAAAGCTTTGCTTTTCAGTTTTGGCTTGGAT - -a -s mr.mrrefChr5 111878 221 + 294542 TTTCATCTGATCTGTGGCAAATGTTGAGGGCTCTCCAGACTTGTTTCTAATATGGCCACGATAGATTACAGTTGGTTGCCATTTATTCTCTTTGCTTTTATCTTCCCTTCCAAACTTATGTCCTTAATACAAACAATCGCTGTCCTGACATCCAATATTCCCAACATGCTCCCACTGACAGTAACCACATGACCAAACGGAAGTTAGAACCATCATGCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259180 210 + 636262 TTTCATCAGATCCATGGCAAATGTTGAGGGCTCTCCAGACTTGTTT---ATATGGCCACGATAGATTACAGTTGGTTGCCATTTATTTCTCTTGCTTT--------CTTCCAAACTTATGTCCTTAATACAAACAATCGCTGTCCAGACATCCAATATTCCCAACATGCTCCCACTGACAGTAACCACATGACCAAACAGGAGTTGGAACCATCATGCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 249084 215 + 647215 ----ATCTGTTCTGTGGTAAATGTTGAGGGCCCTCTTG--TTGATTCTAATATGGCCACAATAGATTACAATTGGTTGCCATCTCTTCTCTTTGCATTTATCTTCCCTTCCAAACTAATGTCCTTAATACAAACAATCGCTGCCCTGACATCCAGTATTCCCAACATGCTCCCACTGACAGTAACCATGTGACCAAACGGAAGGTAGAACCATCACACAAC - -a -s mr.mrrefChr5 112099 16 + 294542 TTAAGCATTACAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259390 16 + 636262 TCAAGCATTACAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 249300 16 + 647215 TTAAGCATTACAACTT - -a -s mr.mrrefChr5 112115 25 + 294542 AGCACTCTTGTGTTATTGCTAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259406 25 + 636262 AGCACTCTTGTGTTATTGCTAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 249317 25 + 647215 AGCATTTTTGTGTCATCATTGATTT - -a -s mr.mrrefChr5 112140 50 + 294542 TTGGTCATTTTGGGTAGGCCAATCTTTGGGTTGGTCATTTCTAATCTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259452 50 + 636262 TTGGTCATTTTGGGTAGGCCAATCTTTAGGTTGGTCATTTCTAATCTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 249342 50 + 647215 TTCACCGCTTTGGGCAGACCAATTTTTGGGTTGGTCATTTCTAATCTTGG - -a -s mr.mrrefChr5 112190 15 + 294542 CCAATCTTTGGGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259502 15 + 636262 CCAATCTTTGGGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 249397 15 + 647215 CCAATCTTTGGGTTG - -a -s mr.mrrefChr5 112205 318 + 294542 ATTCCTTACTCTGGGGTCAATAGCTTCCCTATTGGAAATATAGACATATTTATGCATAGCAATCTCCTACACAAGCGTGCCCTCAAACAGCTTCTAGAAAAAATGTATACATGTCCCCTCTGGATCACAAAAACTGATCATATAACTCATATCAATTACCCTACACTTCTTATTCAGCTTTGGATTTTCTAAACTGATTGACCGATTCAAACATACCATCGACCATAGACATACTTAATGACCCCTTACTAAGTACCTATCTCAATGTGAGGCATTAGACTAGCGGATGCCTCATAAGATTGCATATGTTCTTAGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259520 311 + 636262 ATTCCTTACTATGGGGTCAATAGC-------TTGGGAATATAGACATATTTATGCATAGCAATCTCCTACACAAGCGTGCCCACAAACAGCTTCTAGAAAAGATGTATACATGTCCCCTCTGGACCACAAAAACTGATCATATAACTCATATCAATTACCCTACACTTCTTATTCAGCTTCGTATTTTCTAAACTGATTGACCAATCCAAACATAACATTGACCATAGACATACTTAATGACCCCTTACTAAGCACCTATCTCAATGTGAGGCATTAGGCAAGCAGATGCCTCATGAGATTGCATATGTTCTTAGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 249412 312 + 647215 ATTCCTTACTCGGAGGTCAATAGCTTCCCTATTGGAAATATAAACATACTTATGCATAGCAATCTCCTACACAATTGTGCTTTCAAACAGCTTCTATAAAAAATGTATACGTGTCCCCTCTGGATGACAAAAACTGATCATATAACTCATATCAATTACCTTACACTTCTTATTTAGCTTTGGCTTTTCCAAATTGATTGACTGATTCAAACATACCCTCAACCATAGACATACCTGATGACCACTTACTAAATACCTATCTCAATGTTAGTCATTGGACTAGCGGGTGCATCATAAG------TATGTACTTAGCAT - -a -s mr.mrrefChr5 112523 4 + 294542 GATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259831 4 + 636262 GTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 249726 4 + 647215 GATC - -a -s mr.mrrefChr5 112527 4 + 294542 TTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259840 4 + 636262 TACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 249730 4 + 647215 TTCT - -a -s mr.mrrefChr5 112531 42 + 294542 TGGAGTTCATGGAAGTCACTTCTTACCCTAGCACCCACATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259951 42 + 636262 TGGAGTTCATGGAAGTCCCTTCTTACCCTAGCACCCACATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 249734 42 + 647215 TGGAGTTCATGGAAGTCATTTCTTACCCTAGCACCCACATAG - -a -s mr.mrrefChr5 112573 162 + 294542 GATCTTCATGCTGCATGTCAATGGGAGTTAGGATCTTGCACTTATGCCTTTCTCATTGCCTGAGTGAAGACCACAGAGCACTAATGATAATCTGTAAATTAAGAAATACTAAAAGAGTGGAAACATCTGTAAGGTATGTATTTCTTTCTAATAGTGGAATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259993 160 + 636262 GATCTTCATGCTGCATGTCAATGGGAGTCAGGAACTTGTACTTATGCCTGTCTCATTGCCTGAGTG-AGACCACATAGCAC-AATGATAATCTGTAAATTAAGAAATACTAGAAGAGTGGAAACATCTGTAAGGTATGTATTTCTTTCTAATAGTGGAATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 249797 162 + 647215 GGTCTTCATGCTGCATGTAAATAGGAATTAGGATTTTGCACTTATGCCTTTCTCATCCCCTGAGTGAAGAGCACAGATCACTGATGATAATCGGTAAATTAAGAAAAACTAAAAGAGTGGAAACACCCGTAAGGTATGTATCTCTTTGTAATACTGTAATAC - -a -s mr.mrrefChr5 112735 138 + 294542 CATCCATTTCACAGAGTCAAGTAACTATTGAAAACACAATCTTACACCACCTCCAAGCCCCATAATATTCTGTTCTTGCCTTTAGGTGAAGTGGACATAGTCACAACGATTTATCTCATACATGAATAAGGTTATGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 260154 138 + 636262 CGTCCATTGCACAGAGTCAAGTAACTAGTGAAAACACAATCTTACACTACCTCCAAGCCCCATAATATTCTGTTCTTGCCTTTAGGTGAGGTGGACCTAGTCACAAGGATTTATCTCATGCATGAATAAGGGTATGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 249959 133 + 647215 CATCCATTTCACAGAGTCAAGTGACTATCGGAAACACAATCATACACCATCTCCGAGCCCCATATGTTTCTTTTCTTACCT-----TGCAGCGGACATAGTCACAACCATTTATCTCCTACATGAGTGGGGTTATGCC - -a -s mr.mrrefChr5 112873 71 + 294542 ACAGGAGTAGTTGCGTCATGATTGTTCAGGTTCACAGTCACGTTTATTCCTATTTATGACAATACCTAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 260300 71 + 636262 ACAGGAGTAGCTGCGTCATGATTATCCAGGTTCACGGTCAAGTTTATTCCTATTTATGACAATACCTAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 250092 71 + 647215 ACAGGAGTAGTTGCATCATGATTGTTCAGGTTCACAGTCACGTTTATTCCAATTTATGACAATACTTGATA - -a -s mr.mrrefChr5 112944 95 + 294542 ATCATTGATGGCAGATACACTGAGCGTTGGGTTGTATGTGGCAGTAAATATTTCCACAACCTCAGGAGGAGTAAGACCTACTACATTTTGAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 260378 92 + 636262 ATCATTTATGGCAAATACACTGAGCGCTTGGTTGTATGTGCCAGTGAATATTTCCATG---TCAGGAGGAATAAGACCTACTACATCTTGAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 250163 92 + 647215 ATCATTGATGGCAGATACACTGAGTGTTGGCCTGT---TGGCAGTAAATATTTCCACAACCTCAGGAGGAGCAAGACCTACCACATTTTGAATTT - -a -s mr.mrrefChr5 113039 113 + 294542 GAAGGTTTTCATAAAACCAGTGCAACTAATGGTAAATATCTTCTCTAGTTCGTCTGAGAAAAGTGATCGCATAACCTTATGCATTTGTGTGATAATGAGTGGTGGAATTCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 260470 113 + 636262 GAAGGTCTTCATAAAACCTGTGCAACTAATGGTAAATATCTTCTCTAGTTCGCTTGAGAAAAGTGATCGCATGACCTTAGGCATATGTGTGATATTGAGTGGTGGAATTCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 250256 113 + 647215 GAAGGTTTTTATAAAACCAGTGTAATTAATTGTAAATATCTTCTCTAGTAAGTCTGAGAAAAGTGATCTCATAACCTTATGCATTTGTGTGATAATGAGTGATGGAATTCATT - -a -s mr.mrrefChr5 113152 34 + 294542 GAATACTCATGGACCAATGGGCACTGTTGTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374493 34 - 636262 GAATATTCCTTTGCCAATGGGCACTGTTGTCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 250369 34 + 647215 GTTTACTCATGGACCAATGGGCACTGTTCTCCGG - -a -s mr.mrrefChr5 113186 57 + 294542 ACTGCTCTATGTCTAATGTTGTGTCAATGAGTAAAACCTGTACTGAGGAGCTTGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374527 57 - 636262 ACTGCTCTATGTCTAATGTTGTGTCAATGAGTAAAACCTGTACTGAGGAGCTTGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 250404 57 + 647215 AATGCTCTATGTCTAACGTTGTTTCAATGAGTGAAACCTATACTGAGGAGCTTGGAA - -a -s mr.mrrefChr5 113243 180 + 294542 AAAGAGTGCAGATAGTACAGGGGTAAGTTTATCAGTGCTAGCCCTCAGAAAATGTGCAGTATACCCTAATTACACCTACGTCTTAGAGAGTTGTAGGTGGATTTAAAAATCCATTTACTGACATCTGGTTGCCCACATTCACACTCCAGAACCAAGCTCTTTATGGTGATAGTAAAGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374585 180 - 636262 AAAGAGTGCAGATAGTACAGGGGTAAGTTTATCAGTGCTAGCCCTCAGAAAATGTGCAGTATACCCTAATTACACCTACTTTTTAGAGAGTTGTAGGTGGATTTAAAAATCCATGTACTGACATCTAGTTGCCCACATTCACACTCCAGAACCAAGCTCTTTATGGTGATAGTAAAGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 250461 180 + 647215 AAAGAGTGCAGATAGTACGGGGGTCAGTTTATCAGTGCTAGCCCTGAGAAAATGTGCCGTATACCCCAATTACACCTCCGTCTAAGAGAGTCTTAGTTGGATTTAAAAATCCATTTATTGACATCCGGCTGCCCACATTCACATTCCAGACCCAAGCTTTTTATGGTGATAGTAAAGTTG - -a -s mr.mrrefChr5 113423 28 + 294542 CAAATCGAATATAAGTGAGGTCTAATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374765 28 - 636262 CAAATCGAATATAAGTGAGGTCTAATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 250645 28 + 647215 CAAATTGAGTATAAGTGAGGTCTCATAG - -a -s mr.mrrefChr5 113451 17 + 294542 CTTGCATTATTCTCGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374794 17 - 636262 CTTGCATTATTCTCGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 250673 17 + 647215 CTTGCATTTTTCTTGGG - -a -s mr.mrrefChr5 113468 145 + 294542 GAGGTCTGGGGTAGAAATACTGCATGGCAGGCAGTTGGATGAGTATTAGCACCAAATGAAATGTTGTCTGTATTTCCATCAGTCATGTGTCCCTAGTACAGATCTGTTATGGCAGCGTCCTGGACAAGATAGTTGAGATAGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374897 144 - 636262 GAGGTCTGGGGTAGAAATACCGCATGGCAGGCAGTTGGATGAGTATTAGCACCAAATAAAATGTTGTCTGTATTTCCATCAGCCATATGTCCCTAGCCCAG-ACTGTTATAGTAGCGTCCTGGACAAGATAGTTGAGATAGCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 250690 142 + 647215 GAGGTGTGGGGTTGGAATAGTGCATTGGCAGCAGTTGGATGAG---TAACACCTAATGAAATGTTGTCCATATTTCCACCAGTCATGTGTCCCTAGTACAGATCTGTTGTGGCAGCATCTTGGACAAGATGATTGAAATAGCACT - -a -s mr.mrrefChr5 113613 9 + 294542 AGGATTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375043 9 - 636262 AGGATTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 250832 9 + 647215 AGGATTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 113622 146 + 294542 CCTTGAGCACTTCTTCCTAGTTAATCTACATGTTTTCAACAGCAGAATGGAGATACAGTGAAGTCCGTGATGAAGCTAGGAAACTTAGCAGATTGAGCAGATATCCACTCTCAGGGCAGCACTTCCCAATGTCAACAATCTGTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375055 146 - 636262 CCTTGAGCACTCCATCCTAGTGAATCTACATGTTTTCAACTACAGAATGGAGATACAGTGAAGTCCGTGATGAAGCTAGGTACCTTAGCAGATTGAGCAGATAACCACTCTCAGGGCAGCAATTCTCAATGTCAACAATCTGTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 250841 146 + 647215 CCTTGAGCAATTCTTCCTAGTTAATCTACGTGGCTTCAGCAGTGGAATGGAGATACAGTGAAGTCCATGATGAAGCTAGGAGACTTAGATGGTTGAGCAGATATCCACTTGCAGGGCAGCACTTCCCAATGTCAACAAGCTGTTGA - -a -s mr.mrrefChr5 113768 53 + 294542 TGCTCATCAAATTGCAGGAACAGTAGTCAATCTCATATTTGTTACCGAAAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375203 53 - 636262 TGCTCATCAAATTGCAGGAACAGTAGTCAATCTCATATTTGTTACCGAAAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 250987 52 + 647215 TGCTCAT-AAAGTGCAGGAACAGTAGTCCATCTAATATTTGTTACTGGAAGAG - -a -s mr.mrrefChr5 113821 324 + 294542 CGGGGATTCGGATGAACACTTGGACCACTGGCCAGTACTTGTACATACCCTTGGTCACTTATTTAGTCTATTGGGCTTGCTGCTCAGGAATCCATTGGAATTGTTTGTATATGATAGAGTAGACAATTTCTTAATACCCAGTGATGTTCTAATATATGCACACAATCTGACTGGGAGTTAGAAAGATTCTCCTCTAGTTCACTAATGGAGAGGGTTGAAAGAGGGGGTTAGGGAGTCTTGATGGATATTGGCAACATCATTTTGTAAGCTGTAAATGGAACTTGATGCAACCTGTAGCTGTAGCACCACTTGCTTTGTATAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375257 321 - 636262 CATGGGTTTGGATGAACACTTGGACCACTGGTCAGTACTTGTACATACCCTTCGTTACGTATTTAGTCTA-TGGGCTTGCTG--CAGGAATCTACTGGAATTGTTTGTATATGATATAGTAAACAATTTTTCAATACCCAGTGATGTTATAATATATGCACACAATCTGACTGGGAGTTAGAAAGAGTCTCCTCTAGTTCACTAATGGAGAGGGTCGAAAGAGGGGGTTAGGGAGTCTTGATGGATATTGGCAACATCATTTTGTAAGCTGTGGATGGAACTTGATGCAACCTGTAGCTGTGGCACCACTTGCTTTGTATAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 251039 324 + 647215 CGGGGATTCGGATGAATACTTGGACCACTGGCCAGTACTTGTATATACCCTTGGTCACTTATTTAGTCTATTGGGCTTGCTGCTCAGGAATCCATTGAAATTGTTTGTAAATGATCGAGTAGACAGTTTCTTAATACCCAGTGATTTCCTAATATAGGCTCACAATCTGACTGGGAGTTAGAAAGATTCTCCTCTAGTTCACTAATAGATAGAGTTGAAAGAGGGGGTTAGGGAGTCTTGATGGATTTTGGCAACATCAGTTTGTAAGCTGTAAACAGAACATGATGCAGTCTGTAACTGTAGCAACACTTGCTCTGTATAATT - -a -s mr.mrrefChr5 114145 54 + 294542 ATAAGTATTGGCGCCATAATAATAGCATAGGCAAAGCACGATGAAGGTTGTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375580 54 - 636262 ATAAGTATTGGCGCCATAATAATAGCATAGGCAAAGCACCATGAAGGTTGTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 251363 54 + 647215 ATAAGTATTAGCGCCATAATGATAAAATAGGCAAAGCACGATGAAGATTCTCCT - -a -s mr.mrrefChr5 114199 16 + 294542 CTGGCTAGCACAGCGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375634 16 - 636262 CTGGCTAGCACAGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 251425 16 + 647215 CTGGCTAGCACAGCAC - -a -s mr.mrrefChr5 114215 83 + 294542 TAAGATGATAAGATGGGTGATACACTGTGGAGGTGATGCCTGGCCAGCACAGCATAGGCCTAATTATCGTTAAAGGCATATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375650 16 - 636262 -------------------------------------------------------GGGCCTAATTATCGTC------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 251456 83 + 647215 TAAGATGATAAGATGGGTGATACACTGTGGAGGTGATGCCTGGCCAGCACAGCATAGGCCTAATTGTCATTAAAGGCATATTC - -a -s mr.mrrefChr5 114298 53 + 294542 TTCACCACCAGGACAAATAAACCCATCATTGAGTCAGACAGGGAATGGTCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261769 47 + 636262 TTCACCACCAAGGCAAATAAACCCATCATTGAGTCA------GAATGGTCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 251539 53 + 647215 TGCACCACCAGGACAAATAAACCCATCATTGAGTCAGACAGGGAATGGTCATC - -a -s mr.mrrefChr5 114351 60 + 294542 AAGCCTATCTTTCACTGACTACAACATATTTAACTTGTAGGAACAGTCATATATGCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261816 49 + 636262 -----------TCACTGACTACAACATATTTAACTTTTAGGAACAGTCATATATGCCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 251594 59 + 647215 AAGCCTATCTTTCACTAACTTCAACATATTTAACTTGTAGG-ACAGTCATATATGCCGAA - -a -s mr.mrrefChr5 114411 45 + 294542 CTTGGCTTGTTGTATTCAAGACTAGAGACAGCAACCAATTCAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261865 45 + 636262 CTTGACTTGTTGTATCCAACACTAGAGACAGCAACCAATTCAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 251654 45 + 647215 CTCGGCTTGTTGTATTCATGACTAGAGACAGTAACTAATACAGGC - -a -s mr.mrrefChr5 114456 252 + 294542 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCATCAAGCAGTATCCACAACGTTGCTAAGATTGATCATGCAAGGAATATGAAGTTTCATCATGGAGAATGGAGAATGGACACAGGAGAAGTGAGGAAACTTCTTGGACTACTACATTTGACTGTGTAGCGGTGGCTGAGTCTACATCAACGGTATGTACCTCTGTTCAGCAAATATGTTTTGTCTTTTAAGATGTTCCAGTATGGGAATAGATTTGCTAAGATGTCATGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261915 251 + 636262 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCACCAAGCAGTATCCACAACATTGCTAAGATTGATTGTG-AAGGAATATGAAGTTTCATCATGGCGAATGCAAAATGGACAAAGGAGAAGTGAGGAAACTTCTTGGACTTCTACATTTGACTGTGTAGCAGTGGCTGAGTCTACATTAACGGTATGTACCTCTGTTCGGAAAATATGTTTTGTATTTTAAGATGTTCCAGTATGGGAATAGATTTGCTAAGATGTCATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 251699 252 + 647215 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCATCAAGCTGTATCCACAACGTTGCTAAGATTGATCATGCAAGGGATGTGAAGTTTCATCATGGAGAATGGAGGATGGACACTGGAGAAGTGGGGAAACTTCTTGGACTACTACCTTTGATTGTGTAATGCTGGCTAAGTTTACACCAATGGTATGTACCTCTGTGCAGCAAATATGTTTTGTCTTCAACGATGTTCCAGTAGGGGAATAGATTTGCTAAGACAGCAGGCC - -a -s mr.mrrefChr5 114708 351 + 294542 AAGTCATAGTGGGTATTCAATACTTGCACCTCCAATCCAATTGATTGCCTGCATGTTTCTATTTCTAGGGTTCCCACATAGTTTGTTTTTGGTCTGATAAACAATCTCCAACTTGGTTACACCCAACTAAATGAGCCTGGCACTCCCAAACCTCAAGAAGTTTGAATAACAGACAATGAAGATCATTCTAGAACCACTATGGATAATAGCTAACCAGACTTTCAGATTCACATATTGGGGGTACTCATTTTATTTACAGAGTATTACCAAATATTAGTGGCATCATAATGGCTTCTTAGTTTCAAAGACATGTGCAATCCACAGGAGAAAAGGGTCTAATGTCCTAACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 262169 350 + 636262 AAGTCATAGTGGGTATTCAATACTTGCACCTCTAATCCAATTGATTGCCTGCATGTTTCTATTTCTAGGGTTCCCACATAGTTTGTTTTTGTTTTGACTAACTATTTCCAACTTGGTTACACCCAACTAAATGAGCCTGGCACTCCCAGACGTCAAGAGGATTGATTAACAGACAATGAAGATCATTCTGGAACCACTATGGATAATAGCTAACCAGACTTTCAGATTCACAAATTGGGGGTACTCATTTGATTTAGAGAGTATTACTAAATATT-ATGGCATCATAATGGCTATTTAGCATCAAAGACATGTGCAATCCACAGGAGAAAAGGGTCTAATGTCCTAACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 251951 332 + 647215 AAGTCATCATGGGTATGCGATCCTTGCAACTCCATTCCAATTGATTGCCCACATGTTTCTATTTGCAGGATTCTCAGATAGTTTGTTTTTGGTCTGATAAATAATCTCCAACTTGGTG-CACCCACCTAAATGAGCCTGGCACTTCCAAACCTCATGAAGTTTGAATAACAGGCAATGGA-ATCATTCTAG------------TAATAGCTAGCCAGAATTCCAGATTCACATAATGGGG--ACTCGTTTTATATACATAGTATCACCAATTATTAGT---ACCACAATGGCTTCTTAGTTTCAAAGACATGTGCAATCCACAGGGGAAAAGGGTCTAATGTCCTAACACA - -a -s mr.mrrefChr5 115059 120 + 294542 CAGATTGTTGTTTGTAGGTCATTTTTGACTCGACATCCCTTCAGAGACTTTTGAAGCTAAGTTCATCAACTTGGAGACTAGTGCACACCTCAGACCTGTCCATCATATAGACAGTTAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 262520 120 + 636262 CAGATTGTTGTTTGTAGGTCATTTTTAACTCGACATCCCTTCAGAGACTTTTGAAGCTAAGTTCATCAACTTGGAGACCAGTGCACACCTCAGAGCTGTCCATCATGTAGACAGTTAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 252283 120 + 647215 CAGGGGTTCATTTGTAGGTCATTTTTGACTTGATAATACTTTAGAGACTTTGGGGGCCAAGTTTATCAACTTACAGCCTAGTGCACACCTCAGACCTGTTCATCACATAGACAGTGAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 115179 437 + 294542 AAATATTATGTTAAAGCAGGGTAACACAATTGTCGTGGGAACTGACCAAAAGTCAGGGTGATGAGGGTTCAGCCAGTTATCCAAGAGGCTAAATCTTTGCAGTGGATTCTCCCATTTTAGTATTCTTAGGAAGTTGCACCCTAATGTTATACCAAAGGGCTAACACATGCAGGACTCAGGTAAAAGAACCATGGGTACTCTGTTGTGAGCACAAGGGAGAGCAACTAACTGGCTTGGATTTTAGCAGGATATTAAAACCTTAGAGTAATAGCTCATAGCAGAGATCAGTGACTATCATGTTTCAGAATATGAATCCAACAGGCATATCATCCCAGCACAAGGGTCAGGATAAATGAAGGCACCCTGTGCTTTTCATTGCAAACACACCCTTATCTATATACTTATGCTACCACTTCTTTGTATTGACACTTAGTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 262640 410 + 636262 AGATGTTATGTTAAAGCAGGGTAACACAATTGTCGTGGGAACTGACCAAAATCCAGGGTGATGAGGGTTCAGCGAGTTATCCAAGAGGCTAAATCTTTGCAGTGGATTCTCCCATCTTAGTATTCTTAAGAAATTGCACCCTAGTGTTACACCAGAGGGCCAACACATGCAG--CTCAGGTAAAAGAACCATCGGTACTCCGTTGTGAGCACAAGGGAGAGCAACTAACTGGCTTGG-TTTTAGCAGGATATTAAAACCTTAGAGGAATAGCTCATAGCAGAGATGAGTGACTATCATGTTCCAGAATATGAATCCAACTGGCATATCATCCCAGCACAAGGGTCAGGATAAATGAAGGCACCCTGTACTATTCATTGCAAACACCCC------------------------CTTCTTTGTATTGACACTTAGTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 252404 427 + 647215 AAGTATTATGTTAAAGCAGGGTAACACAATTGTCATGGGAAATGACCAAAAGTCAGGGCGATGAGGGTTCTGCCAGTTATCCAAGCGGCTAATTCTTTGCAGCTGTTTCTCATATTTTACTACTCTTAGGAGGATGCACCCTAAAGTTATACTAAAGAACTATCACATGCAGGACTC------AAGAACGATGGGTACTCTGTTGTGAGCACAAGGGGGAGTGAATAACGGGCTGGGATTCTAGCAGGATATT-AAGCCTTGGAGTACTACTTCATAGCAGAGATCAGTGACTATCGTGTTTCAGAATATGAAACCAACAGGCATATCATCCCAGCAGAAGGGATAGGAGAAATGAAGGCATCCTGTGCTTTTC---GCAAACACACCCTTATCTATATACTTATGCTACCACTTCTTCGTATTGACACTAAGTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 115616 109 + 294542 GAAAAGTAATTTAGAAATTCACCAGGAGCTATTCACTCTGTCAATAGGATGATTAGGTTCACACAATTTATTTTAATGTAGCTTGATTATGCCGGGAACATCAGGTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263055 109 + 636262 GAAAAGTAATTTAGAAATTCACCAGGAGCTATTCACTCTGTCAATAGGGTGATTAGGTTCACACAATTTATTTTAATGTAGCTTGATTATGCCGGGAACATCAGGTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 252831 109 + 647215 AAAAAATCATTTAGGAATTCACCAAGAGCTATTCTCTCTGTCGCTAGGATTATTAGGTTCACACGATTTATTTTAATGTAGATTGATTATGCCGGGAACATTAGGTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 115725 117 + 294542 AATGTATGCCCACACTAACTAAGCTTTTAGAGCTAAGCATCCTCACTCACGCAAAATGGCTTGAGGAAATGGTTGAGCAGGGTAGGCCCACCATCAATATTGAGTTGATTTGAACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263164 117 + 636262 AAAGTATGCCCACACTAACTAAGCTTTTAAAGCTAAGCATCCTCACTCACGCAAAATGGCTTGAGGAAATGGTTGAGCAGGGTAGGCCCACCATCAATATTGAGTTGATTTGAACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 252941 117 + 647215 AATGTACGCCCACACTAACTAAGGTATTGGACCTAAGCATCCTCATTCAGGCAAAATGGCTTGAAGAGATGGTTGGGCAGGGTAGACCCGCCGTCAATATTGAGTTGATTTCAACTG - -a -s mr.mrrefChr5 115842 18 + 294542 TGTGCTTCATGCCACTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263282 18 + 636262 TGTGCTTCATGCCACTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 253058 18 + 647215 TGTGCTTCATGCCACTCC - -a -s mr.mrrefChr5 115860 32 + 294542 AAGGCCCAAAATACAAGGGATTTTAGTTAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263300 32 + 636262 AAGGCCCAAAATACAAGGGATTTTAGTTAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 253077 32 + 647215 AAGGCCCAAATTATAAGGGATTTTAGTGAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 115892 107 + 294542 CATTTGGTATTCAACAAAGAAAGAATTAAGCTTTTATGTGCAGCTTAATATGACGTGTGGAGTGATTTATAGAGTACATTTCCTTAGAACATCTTCACATAGTATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263335 107 + 636262 CATTTGGTATTCAACAAAGAAAGAATTAAGCTTTTATGTGCAGCTTAATATGACGTGTGGAGTGATTTATAGAGTACATTTCCTTAGAACATCTTCACATAGTATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 253109 107 + 647215 CATTTGGTATTCAATAAAGAAGGAAGTAAGCTTTGATGTACAGTTAAATATGGTATATCAAGTGGTTTATAGAGTACATTTTCCTAGAACATCTTGATATAGTATTA - -a -s mr.mrrefChr5 115999 170 + 294542 CAATGAACACGAGGAATAGGTAGAATGCCTAAGAAATGGAGTTTTCACAGGATAAAGGTGATAATAGAATTACTGGAGATTACACCCCAGATAACTTTGGCACTGATTCACTAGTCAACAGTATCAACATGCAAGGCAGCTGATCACCAGTCAGCTCAGGTTTGGGCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263442 170 + 636262 CAATGAACACGAGGAATAGGTAGAATGCCTAAGAAATGGAGTTTTCACAGGATAAAGGTGATAATAGAATTACTGGAGATTACACCCCAGATAACTTTGGCACTGATTCACTAGTCAATAGTACCAACATGTAAGGCAGCTGATCACCTGTCAGCTCAGGTTTGGGGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 253224 170 + 647215 CAATTAGCATGAGGAATAGGTAGAATGCCCAAAAAATGAAGATTCCACAGGATAAAGGTGATAGTGGAATTATCGGAGATTACACCCCAGATAACTTTGGCACTGATTCACTAGTCAACAGTATCAACATGCAAGGCAACTGATCACCAGTCAGCTCAGGTCTGGGCATT - -a -s mr.mrrefChr5 116169 113 + 294542 TGACTCCATACCCTGAAGTAATTACAACAGGGTATTCCTTATAAGCTTGATACTAGCATTGGGGAAGTAGTAGGCGCTAGGGAGAATGTAGTGGTAATAACTTCATGTAGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263613 104 + 636262 TGACTCCATTCCCTGAAGTAATTACAACAGGGTATTCC---------TGATGCTAGCATTGGGGGAGTAGGAGGCGCTAGGGAGAATGTAGTGGTAATAAGTTCATGTAGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 253394 97 + 647215 TAACTGTACACCCTGAAGTAATTACAGCAGGGTGATCCTTATAAGCTTGATACTGGCATTGGGTAAGTAGTAGG---------GAATGT-------ATAACTTCATGTAGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 116282 30 + 294542 CAATCTTTGAACAAAACAAACCCTGTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263717 30 + 636262 CAATCTTTGAACAAGACAAACCCTGTTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 253493 30 + 647215 CAATCTACGAACCAAACAAACCCTGTCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 116312 95 + 294542 TGAGTGCAGGGAAATGGCCCACATCACTCTGAGTCTGCACCTGCACATGTGCTTAAGCCTCCAAGCTAACACCCAAACGAGCCTATTAGCTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263766 93 + 636262 TGATTGCAGGGAAATGGCCCACATCACTCTGAGTCTGCACCTGCACATATGCTTAAGCCT--AAGCTAACACCCAAACGAGCCTGTTAGCTTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 253523 95 + 647215 TGAGTGCAGGGGGATGGCCCACATCACTCTGAATCTGCATCTGCACATGTGCTTAAGCCTCCGAGCTAACACCCAGACATAGCTATCAGCTTGAC - -a -s mr.mrrefChr5 116407 348 + 294542 ATACTATTCTTCAGTAGCCCTCATGTTAGGACTGGTACTCTAGTAGTGTTTTCTAAATGCATGTGATTGTTGTGAGGGTTTGAATGAATGTAGCCAAGTGTGGAACCATGATGATACAGTGTAATCCAATAGTGACATgcaggtacagcctgttcccaaggcgcagtacaaagcgtatagcatacccatcatctatgtatttatggcaagtccccatggattgatgctggtcccctgatgatataattgtagaacttagaacCACATCTATGTGGTTAACGGAGTGCATGATCCTAGTGTatgacggtggtaacataatagtctgatatagtatgcatggattgttag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263859 348 + 636262 ATACTATTCTTCAGTAGCCCTCAAGTTAGGGATGGTACTCTAGTAGTGTTTTCTAAATGCATGTGATTGTTGTTAGGGTTTGAATGAATGTAGCCAAGTGTGGAACCATGATGATACAGTGTAATCCAATAGTGACATGCAGGTACAGCCTGttcccaaggcgcagtacaaagcgtatagcatacccatcatctatgtatttatggcaagtccccatggattgatgctggtcccctgatgatataattgtagaacttagaacCACATCTATGTGGTTAACGGAGTGCATGATCCTAGTGTATGACGGTGGTAacataatagtctgatatagtatgcatggattgttag -s simRat_chr6.simRat.chr6 253637 348 + 647215 ATACTATTCTTCAGTAGCCCTTGTGTTAGGACTGACACTCTGGTGGTGTTTTCTAAATACATATGATTGTTGTGAGAGTTTCAATGAATGTAGCCAAGTGTGGAACTGTGACGATATAGTGTAATCcaacagtgacatgcaggtacaaccagttcccaaagtgcggtacaaagtgtatagaatatccatcatccgtgtgttttcagcaagtccccatgggttgatgctggttcccttatgatataattgtaaaacCTCGAGCCACACCTATGTGATTAAGCGAGTGCATGATTCCAGTGTgtgacgctggcaacataatagtctgatatagcatgcatggattgttat - -a -s mr.mrrefChr5 116755 11 + 294542 aaatctcctaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264211 11 + 636262 aaatctcctaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 253985 11 + 647215 aagtcccctaa - -a -s mr.mrrefChr5 116766 107 + 294542 actgaactgcttacaattgacactgtggagactgaaacactgataccatgcactcagatgatatttggctgttagcagggtccatacaggcaactttccagtgactg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264223 107 + 636262 actgaactgcttacaattgacactgtggagactgaaacactgataccatgcactcagatgatatttggctgttagcagggtccatacaggcaactttccagtgactg -s simRat_chr6.simRat.chr6 253996 107 + 647215 attgaactgctcacaattgacactgtgcggactaaaataccactatcatgcactctaacagtgttatgctcctaacggggtccatacaggcgacttcacagtgactg - -a -s mr.mrrefChr5 116873 70 + 294542 gaggtactggcaaagctgtgacagaaaactgtgggggcacaaaatgctcaattgttgggatttgccgcga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264330 70 + 636262 gaggtactggcaaagctgtgacagaaaactgtgggggcacaaaatgctcaattgttgggatttgccgcga -s simRat_chr6.simRat.chr6 254119 70 + 647215 gaggtactgccaaagctatgacagaacaccgtgggggcacaaaatgcgtactttttggaatcatccgtga - -a -s mr.mrrefChr5 116943 95 + 294542 gtaggctgtagaaaagggaaaaaattattcctaaaacaaaaggttgtaaaaacctctgataaactagcttgctgtcccaACAAACACCTGGATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264401 95 + 636262 gtaggctgtagaaaagggaaaaaattattcctaaaacaaaaggttgtaaaaacctctgataaactagcttgctgtcccaACAAACACCTGGATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 254189 95 + 647215 gtaggctgtaaaaaagggaaaaagttattcctaaaacagaagattatcaaaacctctgataaaccagcttgctgtcccaAAAGACCCATGGATGA - -a -s mr.mrrefChr5 117038 66 + 294542 CTGGGTAGTGCTAGAATTTGAGGACTTCGGTGACTATCACCAAGCACATGTACTAGAGTTTACTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264501 66 + 636262 CTGGGTAGTGCTAGAATTTGAGGACTTCGGTGACTATCACCAAGCACATGTACTAGAGTTTACTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 254284 66 + 647215 CTGGGTTATGCTAGAACTTGAGGCTTTTGGCAACTATCACCAAGTACATATACTAAAGTTTACTTT - -a -s mr.mrrefChr5 117104 19 + 294542 GCTCAACGAATAATTGGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264567 19 + 636262 GCTCAACGAATAATTGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 254351 19 + 647215 GCTCAACGAATAATTAGGC - -a -s mr.mrrefChr5 117123 23 + 294542 GAGACTGCCATCACAAGAGTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264619 23 + 636262 GAGACTGCCATCACAAGAGTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 254370 23 + 647215 GCGGCTGCCACCACAAGAGTTGA - -a -s mr.mrrefChr5 117146 59 + 294542 ACCCTAAGTGTTGGTGTCTCATGGTGGTGTCCTCAATAGCTGCTTAAGAATGGAAAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264806 59 + 636262 ACCCTAAGTGTTGGTGTCTCATGGTGGTGTCCTCAATAGCTGCTTAAGAATGGAAAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 254393 59 + 647215 ACTCTAAGTGTTGGTGTCTCATGGTGGTGTCCTCAATAGCTTGCTAAGAGTGGAAGATG - -a -s mr.mrrefChr5 117205 66 + 294542 TATATATCCCCACAGACTTGAGGAAAAAAACCTGCTCATATTATGGCATATAGAGTGATGTCTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264865 66 + 636262 TATATATCCCTACAGACTTGAGGAAAAAAACCTGCTCATATTATGGCATATAGAGTGATGTCTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 254458 14 + 647215 CATATATCCCCACA---------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 117271 238 + 294542 AGGAAGCCTTGCCACAATACAATAGGGCTCTGTCTGTTTGGATGATATTGCTCAATAGAATTACTTTCTAACAAAATTCCAAAAGCTCCTCATGTTTGGACAGACCCATCTCAAGTATACCCTCCCAGGTTTATCGACGAAAGCCTTACCTAGCACTCTATTAAATCACTGATGCTGTACAAGGTTCTACCACAGTAAGCTGTCACTTTCAAAGTCTGGGTTTAAACATTCATTGGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264932 231 + 636262 AGGAAGCCTTGCCACAATACAATAGGGCTCTGTCTGTTTGGATGATATTGCTCAATAGAATTACTTTCTAACAAAATTCCAAAAGCTCCT-------GGACAGACCCATCCCAAGTATGCCCTCCCAGGTTTATCGACGAAGACCTTACCTAGCACTCTATTAAATTACTGATGCTGTACAAGGTTCTAGCACAGTAATCTGTCACTTTCAAAGTCTGGGTTTAAACATTCATTAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 254472 224 + 647215 --------------CAGTACAATAGGGCTCTGTCTGTTCAGATGATATTGCTCAATAGAATTACTTTCAAACAAAATTCCAAAAGCTTCTCATGTTTGGATAGACCCACCTCAAGCATATCCACTGAGGTTTATTGACAAAAGCCTTACATAGCATTCTATTAAATCACTGATCCTGTATAAGGTTCTACCACAGAAAGCTGTCACTTTCAAAGGCTGGGTTTAAACATTCATTGGAC - -a -s mr.mrrefChr5 117509 104 + 294542 AGTATCAATTGGtgactggttgactggatcctggcatgtagcaggtgtattcagtgtccttacagagacaacattcttgggttatctctagcagccagcttcct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265164 104 + 636262 AGTAGCAATTGAtgactggttgactggatcctggcatgtagcaggtgtattcagtgtccttacagagacaacattcttgggttatctctagcagccagcttcct -s simRat_chr6.simRat.chr6 254696 104 + 647215 AGTATCAATTGGTGCCTGGTTGACTGgtgcctggcatgtagcaggtgtatttagtgtctttccagagatggccttcttgggttatctctagcagctggcttcCC - -a -s mr.mrrefChr5 117613 8 + 294542 aaggattg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265279 8 + 636262 aaggattg -s simRat_chr6.simRat.chr6 254800 8 + 647215 AAGGattg - -a -s mr.mrrefChr5 117621 291 + 294542 taaaagcagtctattaaaataataatgatgaatgttgcatccctcaagggatcattttgggagctagaagtctgggctgcagtactgctggcaccatcagcatcacatctccattttttaaaagcactctatcaggaacttgcaattctcgtaatgtaatGAAggtcattatggtaccccagtatttctgctatcgggaaggcttggtgtatgaccaaaccagacttggcatgcacccatgtatgTCCCCTGCACTTGCTCACCACAGATTAACAAAGGTGACCACGAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265288 291 + 636262 taaaagcagtctattaaaataataatgatgaatgttgcatccctcaagggatcattttgggagctagaagtctgggctgcagtactgctggcaccatcagcatcacatctccattttttaaaagcactctatcaggaacttgcaattctcgtaaTGTAATGAAggtcattatggtaccccagtatttctgctatcgggaaggcttggtgtatgaccaaaccagacttggcatgcacccatgtatgTCCCCTGCACTTGCTCACCACAGATTAACAAAGGTGACCACGAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 254808 291 + 647215 tataagcagtctattaaaataataacaaagaatgttgaatctctcaagggatcattttgcgagccagaagtctgggctgcagtattactgacaccatcagcatcacatttccatcttttaaaagcaccctatcaggaacttgcaattttcataatataatGAAGATCATTATGGTAtgccagtatttctgctatctggaaggcttggtatatgaccagaccagacttggcatacacccaagtgtgCCCTCTGCACTTGCTTACCACAGGTTAAAAAGGGTGACCACATGTC - -a -s mr.mrrefChr5 117912 67 + 294542 CTATACAGACGGCTGAACACGGTGGATTCATAGGCCTGTGCTACTCTTTTACTCTGGAGTCATTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265579 67 + 636262 CTATACAGACGGCTGAACACGGTGGATTCATAGGCCTGTGCTACTCTTTTACTCTGGAGTCATTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 255101 67 + 647215 CTATACTGACAGCTGAACATAATGGATTCATAGGCCTGTGCTACACTTTTAATCGGGAGTCATCATT - -a -s mr.mrrefChr5 117979 6 + 294542 AACCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266364 6 + 636262 AACCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 255168 6 + 647215 GACCCT - -a -s mr.mrrefChr5 117985 54 + 294542 GATATTGTTTCATTTCCCGGCTGCCCTCTAGATAAATGGAACTTGATGACCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266381 54 + 636262 GATATTGTTTCATTTCCCGGCTGCCCTCTAGATAAATGGAACTTGATGACCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 391942 54 - 647215 AAGATTGTTTCATTTCCTGGTTGCCCTCTAGTCAAATGGAACTTGATGACCATT - -a -s mr.mrrefChr5 118039 45 + 294542 TGTCATTCTGTATGATTTATTGTGTTTGAAGTGAGTCTATTGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266436 45 + 636262 TGTCATTCTGTATGATTTATTGTGTTTGAAGTGAGTCTATTGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 391996 45 - 647215 TGTCATTCTGTATGATTTATTGTATTTGAAGTGAGTCTATACTGC - -a -s mr.mrrefChr5 118084 26 + 294542 GCCCTTCAGAGATATGCTGTGAAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266482 26 + 636262 GCCCTTCAGAGATATGCTGTGAAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 255285 26 + 647215 GCCTTTCAGAGATTTGCTGTGAAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 118110 98 + 294542 TCACTGAGAGAAAAACTCCTAGATGCAAATGTATTGCAAGGTCGGGTATTGTGGGGTGGATACATTTTGCCCACTAATGAATAAGCCAAGGATGGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266508 98 + 636262 TCACTGAGAGAAAAACTCCTAGATGCAAATGTATTGCAAGGTCGGGTATTGTGGGGTGGATACATTTTGCCCACTAATGAATAAGCCAAGGATGGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 255312 98 + 647215 TCACTGAGAAAAGAATTCCTATATGTAAATGTATTGCAATGCCATGTATTGTGGGGCGAATACGTGTTGTCCACTAATAAAGACACCAAGGATGGGTT - -a -s mr.mrrefChr5 118208 41 + 294542 CCCTCTAATCAATCCCTTTGTAACACATGGAGCTCTTCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266606 41 + 636262 CCCTCTAATCAATCCCTTTGTAACACATGGAGCTCTTCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 255413 41 + 647215 CCCTCTAATCAATCCCATTGTAACACATGGAGCCCTTGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 118249 26 + 294542 GCTTCCAATTTGAATGCAATGTGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266654 26 + 636262 GCTTCCAATTTGAATGCAATGTGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 255454 26 + 647215 GCTTCCAATTTGAGTGCAATGTGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 118275 9 + 294542 CTTGCATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266681 9 + 636262 CTTGCATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 255480 9 + 647215 CTTGCATGG - -a -s mr.mrrefChr5 118284 38 + 294542 ATTGACCTGAAGTGTTTCCCAGTGGTCATTGACTTACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266690 38 + 636262 ATTGACCTGAAGTGTTTCCCAGTGGTCATTGACTTACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 255497 38 + 647215 GTTGACCTGAAGTGTTTCCCCGTGGCTATTGACTTACC - -a -s mr.mrrefChr5 118322 8 + 294542 TATGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266729 8 + 636262 TATGATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 255535 8 + 647215 TACGATTG - -a -s mr.mrrefChr5 118330 69 + 294542 CCCAACATAATTCCAGAATGCTATAGAGTATGAAACCTCCACAACAGTGCGTTGGGGTAGTGAACTTCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266738 69 + 636262 CCCAACATAATTCCAGAATGCTATAGAGTATGAAACCTCCACAACAGTGCGTTGGGGTAGTGAACTTCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 255543 69 + 647215 CCCAACATAACTCCAGAATGCTTTAGAGTATGAAACCTCCCCAATAGTGGGTTAGGGTAGTGTACTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 118399 26 + 294542 TATTAGCACCTCTGCCAGAAGATTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266807 26 + 636262 TATTAGCACCTCTGCCAGAAGATTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 255613 26 + 647215 TATTAGCATCACTGCCAGAAGATGGG - -a -s mr.mrrefChr5 118425 53 + 294542 AGACACTGTAATACACGAACTGGCTTTATGAAATAACAATAGTGTTTAACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266837 53 + 636262 AGACACTGTAATACACGAACTGGCTTTATGAAATAACAATAGTGTTTAACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 255639 53 + 647215 AGACCCTGTAATACATAAACTGATGTTATGAAACAACAATAGTGTTTAACAAC - -a -s mr.mrrefChr5 118478 18 + 294542 TGGCTTGATGGCCTCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266891 18 + 636262 TGGCTTGATGGCCTCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 255692 18 + 647215 CAGCTTGACAGTCTCTTT - -a -s mr.mrrefChr5 118496 130 + 294542 GCTGGCAAGTTGCAAAGTGGGGAGATCCTCTTCTGTTGTCCATTATCTTTGAGCAATGTCTAGAACCCTCTATTCAGATACCTGCAACCCTTGCTCTTTTGCCTCATTTGTAACACAGTCAGGACATCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266909 130 + 636262 GCTGGCAAGTTGCAAAGTGGGGAGATCCTCTTCTGTTGTCCATTATCTTTGAGCAATGTCTAGAACCCTCTATTCAGATACCTGCAACCCTTGCTCTTTTGCCTCATTTGTAACACAGTCAGGACATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 255711 130 + 647215 GCTGTCAAGTTACAAAGTGGGGGGACCCTGTTCTGTTGTCGGCAATCTTTGGGCAATGTCTAGAACCCTCTATTCAGATACCTACGACCCTTGCCCCTGTGTCTTATTTGTAATATGGCCTGGACATCCA - -a -s mr.mrrefChr5 118626 104 + 294542 CTTCCGCATTGACTGTTAGCTTTTAACTGTCTCTATAATCTGTTGGGACTGGGCTCATGCAGGAAGCGTAATGTGATTACTGTTCTGAATTAGCAAAGTCACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267039 104 + 636262 CTTCCGCATTGACTGTTAGCTTTTAACTGTCTCTATAATCTGTTGGGACTGGGCTCATGCAGGAAGCGTAATGTGATTACTGTTCTGAATTAGCAAAGTCACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 255878 104 + 647215 CTTCTGCATTGACTATAAGCTTTTAACAATCTTTATAATCTGTTGAGGCAGGGCTCATGCAGGAAGCATAATGTGGTTACTGTTTTGAATAAGCAGAGTTATAT - -a -s mr.mrrefChr5 118730 78 + 294542 GAGTCTCTCCCGAGCCTAAGTGCCATGTGGAATTTGCTTGGAAGATTATGGTTCAACAATTCATATAGTTCccctgat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267143 78 + 636262 GAGTCTCTCCCGAGCCTAAGTGCCATGTGGAATTTGCTTGGAAGATTATGGTTCAACAATTCATATAGTTCccctgat -s simRat_chr6.simRat.chr6 256011 78 + 647215 GAGTCTCAGGCAAGCCTCAGTGCCATCGGGAATTTGGTTAGAAAATTATGGTGTAACAATTCATATAGTTCTCCTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 118808 57 + 294542 gtttgacaacctttttacacaatcagttccatagcatcaccatgtttgtctcctgtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267221 57 + 636262 gtttgacaacctttttacacaatcagttccatagcatcaccatgtttgtctcctgtt -s simRat_chr6.simRat.chr6 256095 57 + 647215 GTTTGACAACCTATTTGCACAATCAGTTCAATAGGGTCACCATGCTTGTCTCTTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 118865 14 + 294542 tactcagcAgagaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267278 14 + 636262 tactcagcAgagaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 256176 14 + 647215 TAATCACCAGagaa - -a -s mr.mrrefChr5 118879 162 + 294542 gtaggttcctatctcctccacagttaaagtaaattcctacccttgctgaggctagtagggcttcaggtggaagTCTATAGGTGCCTCTGATAGCTTGACAGCACAACAAGCGGGGCCTGCTCACAGCCAAGTTACTAACTGCATGCACATGGCTACATTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267295 162 + 636262 gtaggttcctatctcctccacagttaaagtaaattcctacccttgctgaggctagtagggcttcaggtggaagTCTATAGGTGCCTCTGATAGCTTGACAGCACAACAAGCGGGGCCTGCTCACAGCCAAGTTACTAACTGCATGCACATGGCTACATTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 256190 162 + 647215 attagttcctatcccccccactgttggagtaaactcctacctttgctggggttagtaggacttcaggttgaagTCTATAGGTGCCTGTGATTACTTGACAGCACATCAAGCGGGGCAGGCTCAGAGCCAAATTACTAACTGCATGCACATGGTTTCATTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 119041 55 + 294542 ATTAGAGCTTTGCACAGTGCGCTGTGCTAAATCTAAACAaggttaagcattgctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267462 55 + 636262 ATTAGAGCTTTGCACAGTGCGCTGTGCTAAATCTAAACAaggttaagcattgctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 256352 55 + 647215 ATTAGGGCTCTGCACAAAGTGCTGTACTAAGACCAAACAAGGTTAAGCATTGCTC - -a -s mr.mrrefChr5 119096 96 + 294542 ctgtccctcaactgcaaaacacagtagtgcatggacactttagaaacttctcaaccaagaagcAAGACAAGGTGTATAAGGGAACTCTGTGTAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267518 96 + 636262 ctgtccctcaactgcaaaacacagtagtgcatggacactttagaaacttctcaaccaagaagcAAGACAAGGTGTATAAGGGAACTCTGTGTAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 256407 96 + 647215 CTGCCCCTTAATCCCAAAACACAGTAGTGCATGGACACTTTAGAAACTTCTCAACCAGGAAGCAAGACAGGGTGTATGAGGGAACTCTATGTAGAA - -a -s mr.mrrefChr5 119192 15 + 294542 TTGAAGCGGGTAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267614 15 + 636262 TTGAAGCGGGTAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 256505 15 + 647215 TCAAAATCGATAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 119207 28 + 294542 GATGGCCATTGATGCTTCACTAAATTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267630 28 + 636262 GATGGCCATTGATGCTTCACTAAATTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 256520 28 + 647215 GATGCCAATTGATAGTTCAACAAATTTA - -a -s mr.mrrefChr5 119235 17 + 294542 AAAGTTAGGTGCCAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267658 17 + 636262 AAAGTTAGGTGCCAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 256552 17 + 647215 AAAGTCAGGTGCCAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 119252 12 + 294542 TGATGCTATCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267675 12 + 636262 TGATGCTATCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 256576 12 + 647215 TGATGCTATCAT - -a -s mr.mrrefChr5 119264 43 + 294542 CCTTTCTTTAGAAGAGTTATTTTAGAACACGCCCTGAAAAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267687 43 + 636262 CCTTTCTTTAGAAGAGTTATTTTAGAACACGCCCTGAAAAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 256612 43 + 647215 TTTTGCTTGAGAAGAATTATTTTAGAACAGGCCCTGACAAGAT - -a -s mr.mrrefChr5 119307 100 + 294542 ATATAGATTTAGCTGGTATAATCTATGGTAGCTGCTGATTCCGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAGTCTGACCATGGAACATAATCAACAATGCTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267730 100 + 636262 ATATAGATTTAGCTGGTATAATCTATGGTAGCTGCTGATTCCGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAGTCTGACCATGGAACATAATCAACAATGCTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 256658 100 + 647215 ATATATATTTAGCTGGTATGACCTATGGCAGCTGCTGATTCTGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAATCTGACAGTAGAACATAATCAACAATGCTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 119407 11 + 294542 CGCTTGACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267830 11 + 636262 CGCTTGACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 256759 11 + 647215 TGCTTGACATG - -a -s mr.mrrefChr5 119418 3 + 294542 TGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267846 3 + 636262 TGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 256770 3 + 647215 TGC - -a -s mr.mrrefChr5 119421 6 + 294542 TCCGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267849 6 + 636262 TCCGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 256775 6 + 647215 TCCACG - -a -s mr.mrrefChr5 119427 38 + 294542 CAATGGGCATAACATTTGACAGAGCTATCGTCTGCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267855 38 + 636262 CAATGGGCATAACATTTGACAGAGCTATCGTCTGCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 256787 38 + 647215 CAGAGGGGATAACATTTGAAAGAGCTATCGTCTGCACT - -a -s mr.mrrefChr5 119465 92 + 294542 ATCATCTGCAGCTATTATAAGTGTTTATTGTAATGGGCCAAGCTCCACAGTAGAACTAGCCACAGGGGGGACATTTGGTATCAAGCCAATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267898 92 + 636262 ATCATCTGCAGCTATTATAAGTGTTTATTGTAATGGGCCAAGCTCCACAGTAGAACTAGCCACAGGGGGGACATTTGGTATCAAGCCAATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 256825 92 + 647215 ATCATCTGCAGCTATTATAAGTTTCTATTGTAATGGGCCACGTTGCACAGGAGGGCCAGCCACAGAGAGGACATCTGGTGTCAATCCAATCC - -a -s mr.mrrefChr5 119557 41 + 294542 AGAGTCTTATCACCCTAGTGGTTTACTTTTGGTGGGTATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267991 41 + 636262 AGAGTCTTATCACCCTAGTGGTTTACTTTTGGTGGGTATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 256917 41 + 647215 AGAGTCCTACCCCCCTTGTGGTTTATTTTTGGTGGGTACTC - -a -s mr.mrrefChr5 119598 52 + 294542 AAATTAGAGAAGCTGCCTCACTTGGATGAGCAACTGAGGTGAGCAATTTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268039 52 + 636262 AAATTAGAGAAGCTGCCTCACTTGGATGAGCAACTGAGGTGAGCAATTTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 256958 52 + 647215 AAGTTAGAGATGCTGACTCATTTGGGTGAGCAACTGAGACAAGCAATTTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 119650 132 + 294542 TGTCCTACCTCCATGGGGCGCATTCTTCATAGATGACTAGAGAACCACAAAAGGCAAATCATATAGCCTGCATCTCCACCTCCACTTATTACACAGACTGACCCCCTAGTCATGCCCCTGTTTTAGCTGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268094 132 + 636262 TGTCCTACCTCCATGGGGCGCATTCTTCATAGATGACTAGAGAACCACAAAAGGCAAATCATATAGCCTGCATCTCCACCTCCACTTATTACACAGACTGACCCCCTAGTCATGCCCCTGTTTTAGCTGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 257010 132 + 647215 TGTCCTACCTCCGTGGGGTGCATTCATCACAGATGACTAATGAACCACAAAAGGCAAGTCATGTAGCCTGCATCACCATCTCCACTTATTACACAGAGTGATCCCCTAGTCATACCCCTGGTTTAGCTTGGG - -a -s mr.mrrefChr5 119782 16 + 294542 AATCTTGGCGTAGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268226 16 + 636262 AATCTTGGCGTAGCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 257144 16 + 647215 AATCCATGTGGAACTT - -a -s mr.mrrefChr5 119798 14 + 294542 CGACACAATGCGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268242 14 + 636262 CGACACAATGCGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 257171 14 + 647215 CGCTACAACATTCG - -a -s mr.mrrefChr5 119812 14 + 294542 GAGGCATGGGATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268256 14 + 636262 GAGGCATGGGATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 257188 14 + 647215 GTGCCATCAAGTAA - -a -s mr.mrrefChr5 119826 19 + 294542 AATGTCTTTAGTCCAGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268270 19 + 636262 AATGTCTTTAGTCCAGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 257204 19 + 647215 CAGGTCTATAGTCCAGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 119845 135 + 294542 ATAGTTTCATGACAACCACATGTGACAAACATAGTAGCCCAGACAGGACTAGAAATGATAAGTATGCCAACCATTCTGCAGTGGACATTTAATTTCAATCGAGAGACTATTCGATGAGTATTTCATATGGCTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268292 135 + 636262 ATAGTTTCATGACAACCACATGTGACAAACATAGTAGCCCAGACAGGACTAGAAATGATAAGTATGCCAACCATTCTGCAGTGGACATTTAATTTCAATCGAGAGACTATTCGATGAGTATTTCATATGGCTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 257223 135 + 647215 ATAGTTTCATGACAACTACATGTGACAAACATAATAGCCCAGATAGGGATAGAAATGATAAGTATGACAACCATAGAGCAGTGGACATTTGATTTCAGACAAGAGGCTATTCAATGAGTATTTCATATGGCTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 119980 20 + 294542 CTGATACTTCCAGTGGGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268427 20 + 636262 CTGATACTTCCAGTGGGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 257380 20 + 647215 TTGATATTTCCAGTGGTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 120000 42 + 294542 TAAATTTCTAGACAGCAGCGAAAGCTAGTCAGCATTAAATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268447 42 + 636262 TAAATTTCTAGACAGCAGCGAAAGCTAGTCAGCATTAAATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 257404 42 + 647215 TAAATTTCTTGACATCAAGATAAGTTAGTCAGCATTACGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 120042 37 + 294542 TCATCACTTATTTTGTGCCTGACTGGAAATGTCCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268494 37 + 636262 TCATCACTTATTTTGTGCCTGACTGGAAATGTCCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 257446 37 + 647215 TCATCACATATTTCGAGCCTGTCTGTACATGTCCTCT - -a -s mr.mrrefChr5 120079 12 + 294542 GACTTAGACAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268531 12 + 636262 GACTTAGACAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 257484 12 + 647215 GATTTAAACTGG - -a -s mr.mrrefChr5 120091 25 + 294542 CATTTAGAAACTTTCTGGCTCCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268543 25 + 636262 CATTTAGAAACTTTCTGGCTCCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 257500 25 + 647215 CATTCAGAGACTTTCTGGCACCACT - -a -s mr.mrrefChr5 120116 131 + 294542 GCATAGATTTGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAAGCTCAAATGGTGAGCAACTTCAACATAGATATGTGATACATTAGTGGAAGATATTTGGCTCATCAGACACACGATTTTACTTTACCCTGAGTGATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268570 131 + 636262 GCATAGATTTGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAAGCCCACATGGTGAGCAACTTCAACATAGATATGTGATACATTAGTGGAAGATATTTGGCTCATCAGACACATGATTTTACTTTACCCTGAGTGATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 257525 129 + 647215 GCATAGATTGGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAGGCTCAAATGGTGAGCGACTTCAACATAGATATGTGGTACGTTAGTGCAAGATATTTGGCTTATCAGACACACA--TTTACTTTACCCTTAGTGCTTA - -a -s mr.mrrefChr5 120247 23 + 294542 TTGTAACAATGCGTGGTTATCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268703 23 + 636262 TTGTGACAATGCGTGGTTATCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 257654 23 + 647215 TTGTAACAATGTGTGATTATCAG - -a -s mr.mrrefChr5 120270 100 + 294542 CTTAGTCCAACATTGCTCTATGTCCAGAACTATATTGTGATGCTCATGTGATATTTTTATTATCCTATAGGTGCACCTGGCCCCCGTACTATAAAGTAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268726 100 + 636262 CTTAGTCCAACACTGCTCTATGTCCAGAACTATATCATAATGCTCATGTGATATTTTTATCATCCTATAGGTGCACCTGGCCCCCGTACTATAAAGTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 257679 100 + 647215 CTTAGTCCAACATTCCTCTACGTCCAGGACTATATTGTGATGCTCATGTGATATTTTTATTATCCTATAGGTGCACCTGACCCCCATACTATAATGTAGC - -a -s mr.mrrefChr5 120370 3 + 294542 CTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268828 3 + 636262 CTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 257779 3 + 647215 CTG - -a -s mr.mrrefChr5 120373 185 + 294542 TGTATCTAGTTTTTGTTCTCTCCTAACCTGATGCTTCCCAAAGGTTTACCTTCTTCGATACTATTTCTAAGAAAAAATGGTGGATATTAGGCACACTTCAACATCCTCAATGTAACAAAGGTAGTTATCTGGGCAATTGTCATCTAGTTTACCGTTGGTAAGATCAATCTATTGTTGCCATTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268832 184 + 636262 TGTACCTAGTTTTTGTTCTCTCCTAACCTGATGCTCCACAAAGGTTTACCTCCTTCGATACTATTTCT-AGAAAAAATGGTGGATATTGGGCACACTTCAACATCCTCAATGTAACAAAGGTAGTTATCTGGGCAATTGTCATCTAGTTTACCGTTGGTAAGATCAATCTATTATTCCCATTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 257782 180 + 647215 TGTGTCTAGTTTTTATTCTCTCCTAACCTGATGCTTTCCAAAGGTTTACCTTCTTTGATACTATTTTTAAGAAAAAATAGTGGATATTAAGCACACTTCA-----TTCAATGTAGCAAAGGTAGCTATCTGGGCAATTGTCATATATTTTACCATTGGTAAGATCGATCTATTGATGCCAGTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 120558 84 + 294542 TTTCTACTACTAGAGAGTGCACTGAAGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTTCCAGTGTTGTTAATTTGGTACGAAGACATGAAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269024 84 + 636262 TTTCTACTACTAGAGAGTGCACTGAAGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTTCCAGTGTTGTTAATTTGGTACGAAGACATGAAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 257962 84 + 647215 TTTCTGCTATTAGAGAGTGAACTGGGGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTAAATGCATAGGTAATTTGGTACAGAAACATGAAATG - -a -s mr.mrrefChr5 120642 10 + 294542 AACATTGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269108 10 + 636262 AACATTGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 258047 10 + 647215 AACATTGTGG - -a -s mr.mrrefChr5 120652 45 + 294542 CAACTTGACAGCTCGGGGAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269119 45 + 636262 CAACTTGACAGCTCGGGGAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 258057 45 + 647215 CTACCCGACAGCTAGGGCAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGACAG - -a -s mr.mrrefChr5 120697 105 + 294542 GCAATCACTCTTAGATCAAGGATTCAACACAATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCGAAAAAGATATGTTACTTGTTGTTAGGTAGTGCAAGATCAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269164 105 + 636262 GCAATCACTCTTAGATCAAGGATTCAACACAATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCGAAAAAGATATGTTACTTGTTGTTAGGTAGTGCAAGATCAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 258138 105 + 647215 GCAATGACACTTAGGTCAAGGATACAACACTATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCAAAAAAGAAATGTTACTTGTAGTTAGGCAGTGTGATATCAGGT - -a -s mr.mrrefChr5 120802 15 + 294542 TTTGTTTTGTTCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269296 15 + 636262 TTTGTTTTGTTCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 258243 15 + 647215 TTTGTTTTGTTCCAT - -a -s mr.mrrefChr5 120817 41 + 294542 GTATAGCTTACTTACGTCGGGAGGCCTTCCCATTTACTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269312 41 + 636262 GTATAGCTTACTTACGTCGGGAGGCCTTCCCATTTACTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 258258 41 + 647215 GTACAGCTTACTTGCATCAGAAGGCTTTCCCATTTACTATT - -a -s mr.mrrefChr5 120858 213 + 294542 TGTGGGATCCAAAAAGCAGGTTGAAGAGCTAGGTGAGGCAAGAAGCCCAGGCTGCTTCTAGAAAAAACAGTTCTGGATTGTGTAGCAAGGCTTCAACTTTAATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTAGGTTAGGAATTTACTGTGTACTCAGCAACACATGAAGTAGCAACACAAGAAGTATTTAATTGTCTGTCTTGGTACTATGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269353 213 + 636262 TATGGGATCCAAAAAGCAGGTTGAAGAGTTAGGTGAGGCAAGAAGCCCAGGCGGATGCTAGAAGATACAGTTCAGGATTGTGTAGCAAGGCTCCGGCTTTAATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTAGGTTAGGAATTTACTGTGTACTCAGCAACACATGAAGTAGCAACACAAGAAGTATTTAATTGTCTGTCTTGGTACTATGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 258336 212 + 647215 TGTGGGTTCCCAAAAGCAGGTTGAAAAGCTAGGAGAGGCAGCAAGCCCAGGCTGCTTCAGGAAATAACAGTCCTGGCATGTGCAGTAAGGCTTCAACTTTTATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTGAGTTAGAAGTTTGTTGTGTACTCTGCAACACAAGAAGTAGCAACACAAGAAGTATATACTTGTCTGTCTTGGTACTATGTA- - -a -s mr.mrrefChr5 121071 45 + 294542 TCCTATCTCATTTAATATCAAGTAGCATTTATTGTCAAAGACATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269581 45 + 636262 TCCTATCTCATTTAATATCAAGTAGCATTTATTGTCAAAGACATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 258548 45 + 647215 TCCTATCTCATTTAAAATCAAGTAGTATTTATTGTCAAAGACATC - -a -s mr.mrrefChr5 121116 150 + 294542 AAGGCAGAAACACACTCTTTAACTAGAGATGTACTTAAAGTTGGAAATTTGTTGTATACGTTGCAACAGAAAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATTAACTTTTTGAAAATTGGGAGCATTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269631 149 + 636262 AAGGCAGAAACACACTCTTTAACTAGAGATGTACTTAAAGTTGAAAATTTGTTGTATACGTTGCAACAGAGAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATCAACTTTTTTAAAGTTGGGAGTACTT- -s simRat_chr6.simRat.chr6 258593 150 + 647215 AAGGTAGAAATAAACTCTTTAACTGGAGATGTACCTAATATTGGAAATTTGTTGTGTACATTGCAGCAGAAAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATTAACTTTTTGAAAATTGGGAGCATCTA - -a -s mr.mrrefChr5 121266 192 + 294542 TTGTCAAAGACATTAAGACAGAAACAAACTCCTCAACCAATTCCTGAACTAATTCAAGGAAAGCCTCTTTTTAAGACTAATATTCAGTATAAAGGCCAAGCAATTGACCCAGCTCTTCCAGATGCACAATCATCAGCTTGACATATGAGCTATTTGTCAATCCTGCCATGCACTTCCCCTTTTGCTTTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269780 184 + 636262 ---TCTAAGACACTCAGACAGAAACAAACTCCTCAACCAATTCCTGAACTAATTCAAGGAAAGCCTCCTTTTAAGACTAATATTCAGTTTAAAGAGCAAGCAATTGACCCAGCTCTTCCACA-----AATTATCAGCTTGACACATGAGCTATTTTTCAATCCTGCCATGCGCTTCCCCTTTTGCTTTTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 258744 191 + 647215 TTGTCAAAGACATTAAGACAGAAACAAACTCCTCAAGTAGTTCCTCAACTA-TTCAAGGAAAGCCTCTCTTTAAGACTAAAATTCAGTATAAAGGCCAAGCAGTTGACCCAGCTCTCCTAGGTGCACAATCATCAGTTTGACATATGAGCTATTTGTCAATCATGCCATGCACTTCCCCTTTCGCTTTTTTA - -a -s mr.mrrefChr5 121458 74 + 294542 ATGATAGTCTGAATCCCAATGTGTGACACCTAAAATTTTGATTGAGGCAATGAAATACAGTTCGATATGAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269965 44 + 636262 ATGATAGTCCGA------------------------------TGTGGCAATGAAATACAGTTTAATATGAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 258935 74 + 647215 ATGACAGTCTGAATCCCAATGTGTGACACCTAAAATTTTGATTGAGGCAACGAATTACAGTTCGATATGAAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 121532 701 + 294542 TGAAACCTCTTGTGAGCCAGGCCTAGTTTCTTATGCTGCTTTGGTTAAGAGGTCTACTATATTTGCTTTTTGACATGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTACTGGCTTGATTGCCTACACAGAAAAGAACCTCCATCATCATATAGGTAAATGTACAGGGATGCCTTCAAACACTCAGCCAATATATAATATGGAATAGTCTTGCTAGACTCAATTGAGGGCACAAGCCCAATTAGTTACTCATGGCACAAGGTCAATGAAATACTTGAGGCCCGCAAGATAAATGAGTTGAGCACTGCAATTACAACATTATCATTGTTACTCTTGGGTTAATAACATGCCACCAGGTACCAATCTATCATTCCATTCAGAGAGTGGCTGATTCATGTTGGAAAGTAAACAAAGTGTTCAGGATTCTAACTAATGATCATAAATTGGGACTGGTCTTATGCAAAGTACTGTGGTTCAATACTTCAATTAGTAGCAGCATTTGTAATTATCTGTGACACTACCCAGCCCCACCATAGCAGGGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTGGCTACAAAACCTTCTAGGAGCTGGCCATTCACTCATTGAGGCTTGGATGAGGTTGAGATGAAGTGTAGGCAGCAGAGATTTACTTACTGTTAAAAAGGCACATTTGTTAAATAAACCTATTAGGTCAGGTGATGCACCCACTTTACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270009 691 + 636262 TGAAACCTCTTGTGAGCCAGGCCT-GTTTCTTATACTGCTTTGGTTAAGAGGTCTACTATGTTTGCTTTTTGACATGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTATTGGTTTGATTACCTACACAGAAAAGAACCTCCATCATTGTATAGGTAAATGTACAGGGAAGCCTTCTAACACTCACCCAATATGTAGTATGGAATGGTCTTGCTAGACTCAATTGAGGACACAAGCCCAATTAGTTACTCATGGCACAAGGTCAATGAAATACTTGAGGCCCGCAAGATAAATGAGTTGAGCACTACAATTACAACCTGATCATTATTACTCTTGGGTTAGTAACATGCCACCAGGTACCGATCTATCATTCCATTCAGA---------ATTCATGTAGGAAAGTAAACAAAGTGTTCAAGATTCTAACTAATGATAATAAATTGGGACTGGTCTTATGCAAGGTATTGTGGTTCAATACTTCAATTAGCAGCAGCATTTGTAATTATCTGTGACACCACCCAGCTCCACCATAGCAGGGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTAGCTACAAAGCCTTCTAGGAGCTGGTCATTCACTCATTGAGGCTTAAATGCGGTTGAGATGTAGTGTAGGCAGCAGAGATTTACTTACTGTTAAAAAGGCACATTTGTTAAATAAACCCATTAGGTCAGGTGATGCACCCATTTTACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 259010 694 + 647215 TGATACTTCTTGTGAGCCAGGGCCAGTTTCTTATGCTGCTTTCGTTACCAGGTCTACTATATTCACTTTTTGACACGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTACTACCTTGATTGCCTACACAGAAAAGAACCTCCGACATCATACAGGTAGATGTACAGGGATGCCTTCAAACACTCAGCCAATATATGATATC-AACAGCCTTGCTAGACTCAATTGAGGGCACAAGGCCAATTAGTGATTGTTGGCACAAGGCCAATGCAATACTTGACCACTGCAATATAAATTAGTTGAGCACTGCAATTAGAACATTAACATTGTTACTCTTGGGTCAATAACAAGTCACAAGGTACCAATCTATCATTTTATGCTGAGAGTGGCTGATTCATGTTGGAAAGTAGACAAAGTATTCTGAACTCTAACTCACGATCATAGATTGAGACGGGTCTTATGCGAAGTACTGTGGCTCAATACTTCCATTAGTGGCAGCATCTGTAATTATCTGTGACACTACGCAGCCCCACCATGGCAGAGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTGGTTACAAAAGCTTCTAGAAGCTGGCCATGCACTTATCAAGGCTTGGATGAGGTTGAGATGAAGTGCAAGCAGCAGAGAATCACTTAC------AAAGACACATTTGTTAAAAAGACATATTAGGTCAGGTGATGCACCCACTTTACTG - -a -s mr.mrrefChr5 122233 68 + 294542 CTACAGATCTCCAGACCAATTATTAGTTAATTAGTTGGTGTGGCATGTATCTGTGAGGAGGTGATGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270702 66 + 636262 CTACAGATCCCCAGACCAATTAT--GTTAATTAGTTGGTATGGCATGTGTCTGTGCGGAGGTGATGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 259704 68 + 647215 CTATAAATCTGCAGAGCAATTATTAGTTAATTAGTTGACGCGGTATGAATCTGTGAGGAGGTGGTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 122301 430 + 294542 GTTGCTACCTACTGCACTTTTCATTCTACATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAACAGGAGCCTCAGCAATATCTCCAGTTTGACAGCATAAATAACTGTATTGAGTGTGGGTATGTGTAGAACTTACTGATTTATGCACTGATGCTGGTGTGACTAGGGGAGATGTACCCAGCTCTGCCTTCCTGTCCATCTAATTGCAACTACATATTTTCGTCTGGTTACAGTAAAGTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGACATCACTCACAGACTAGGTAAAAGTTCCAACATGAGGTAGGAGACCTGTGTTCCACTGCCTAGATGTTGGTACAGATCCATACAACTAAATGGTGACACCATTCCTGTCTAGACATCTATCTCATGCATGATGCATAAGAACGGTGCCATGTGAAAGGTCCCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270768 429 + 636262 GGTGCTACCCACTGCACTCTTCATTCTAAATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAACAGGGGCCTCAGCAGTATCTCCAGTTTGACAGCATAAATAACTGTATTGAGTGTGGGTATGTGTAGAACTTACTGATTTATGCACGGATGCTGGTGTGATTAGGGGAGATGTACCCAGATCTGCCTTCCTGTCCATCTAATCACAACTACATATTTTTGTCTGGTTTCAGTAAAGTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGGCATCACCCACAGACTATGTAAAAGTACCAACGTAAGGTAGGAGACCTGTGTTCT-CTGCCTAGATGTTGGTACAGATCCATACAACTAAATGTTGCCACCATTCCTGTCTAGACATCTAGCTCATGCATGTTACATAAGAACTGTGCCATGTGAAAGGTCCCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 259777 424 + 647215 GTTGCTACCTACTGCACTTTTCATTCTACATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAATGGGAGCCTCAGCAATACCTCCCGTTTGACAGCATAAATAACTATATTGAGTGTGGGTATGCGTAGAAGTTACTGATTTATGTGCTGATGCTGGTGTGACTAGGGGAGATGTACCCTGCTCTGTCTTCCTGTCCGCCTAATTGCAACTA------GTCGTCTGGTTACAGTAAATTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGACATCACTCATAGACTAGGTAAAAGGTACAACATGAGGTAGGAGACCTGTGTTCCACTGACTAGATGTTCGTACAGATCCATACAACTAAATGGTGACACCCTTCCTGTCTAGATATCTATCTCATGCATGATGCATAACACCGGTGCCATGTGAAAAGTCCCTTG - -a -s mr.mrrefChr5 122731 109 + 294542 AGATCCCCTTCAAAACAGTGATCCTATATAGTCTTCCAGCCCTTACAATGTCCACAGAAGAATCATGACGGTTGAATTGTTGACTTTATCAAAGGTTGCAGCTGTCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271204 108 + 636262 AGATCCCCTTCAAAACAGT-ATCCTATATAGTCTTCCAGCCCTTACAATGTCCACAGAAGAATCATGACGGTTGAATTGTTGACTTTACCAAAGGTTGCAACTGTCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 260201 108 + 647215 AGATCCCCTTCAAAACAGCGATCCTATATAGTCTTCCAACC-TTACAATGTCTACAGAGGAATCATGATGGTTGAATTGTTGACTTTTTCAAAGGTTGCAGCTGTCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 122840 30 + 294542 GAGTGTATTATTTTACTCTAGACATACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271312 30 + 636262 GAGTGCATTATTTTACTCTAGACATACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 260310 30 + 647215 GTGTGTATTATTTTACACTAGACATACATG - -a -s mr.mrrefChr5 122870 83 + 294542 TGTTAAACAGATTCTCTGCAAATGTGAGTAACTGTCACATTTTAGGACCAGTTGGATTAAAGATCCTAATGCCTACAATTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271342 82 + 636262 TGTTAAACAGATTCTCTGCAAATGTGAGTGCCTTTCACATTTTAGGACCAGTTGGATTAAAGA-CCTAATGCCTACAATTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 260343 83 + 647215 TGTTAAACAGATCCTCTGCACATGTGAGTAACTGTCACATTTTAGGACCAGTTGGACTAAAGATCCTAATGCCTAAAATTGGT - -a -s mr.mrrefChr5 122953 11 + 294542 AGGATGGTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271424 11 + 636262 AGGATAGTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 260427 11 + 647215 AGGATGGTATA - -a -s mr.mrrefChr5 122964 142 + 294542 AACTCTCTGCTAGAGTTTATGAATCCCAAATACATGGTGACAGTGAATATTACCCACATCAATTAGATGTCCCTCAGAACAGGCTTGGAGAGAGTTGATATTCATAAGACCTGTATTAGTATTCAAGATTTATATATACTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271435 135 + 636262 AACTCTTTGCTAGAGTTTATGAATCCCAAGTACATGGTGACAGTGAACATTACCCACATCAATTAGATGTCTGTCAGAAAAGGCCTGGAGAGAGTTGATATTCATAAGACCTGTATTAGTATTCAAGATT-------ACTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 260440 142 + 647215 AACTCTCTGCTAGAGTTTATAAATCCCAAATACATGGTGACATTGAATATTACCCACATCCATTAGATGTCCCTTAGAACAGGCTTGGAGAGAGGTGATATTTATAGGACCCATATTAGTATTCTAGATTTATATATACTTC - -a -s mr.mrrefChr5 123106 25 + 294542 GATTCTTCACTCCCCATTGAGCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271570 25 + 636262 GGTTCTTCACTCCCCATTGAGCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 260583 25 + 647215 GATTCTTCACTCCCCATTGAGCTTG - -a -s mr.mrrefChr5 123131 112 + 294542 CCTCCAAGTATTGCAACTTAATACATTGCCTCTAGGAAATAGCGACTTTACTCTGCCAAGCATGTGGCGTTGTATCCACACAAGCAGGTTTAGTTAAGGCAAAACTAGCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271596 112 + 636262 CCTCCAAGTATTGCAACTTAAAACATTGCCCCTAGGAAATAGCGACTCTACTCTGTCAAGCATGTGGCGTTGTATCCACACAAGCAGGTTTAGTTAAGGCAAAACTAGCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 260608 112 + 647215 CCGCCAAGTATTGCAACTTGATACATTGCCTCTAGGAAGTAGCAACTTTACTTTGCCAAGCATGTGGTGTCACATCCACACAAATAGGTTTTGTCAAAGCAAAACTAGCTGT - -a -s mr.mrrefChr5 123243 5 + 294542 TCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271708 5 + 636262 TCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 260742 5 + 647215 TCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 123248 337 + 294542 ATGGTGCATCTTAATGTTGACTACTATCAAGAACCAAGGTGGTCACATTAGAGGCATGGACACTCCTATGGTAGGCACTTTGTAGGGATAGCTAAAGAAGAAAACCAAAGACAAAACAAGCACAAATAAATAACTTTTTACTTAGGTGAATTCCATAAAGAAGTCTCTTACATCCTATCAACTACTAACCTTCAACTCTTTATATACCAAATCAAATGGACTCTAGGAAGCATACTGGCTCCATTCAAGTTTCCCATCATTCTGACTCATACAGAATCTTCTGATGTTTCCTATATGTTTTTTAGTGCTAACATTCAACTAGGGCCAACTCAGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271713 331 + 636262 ATGATGCATCTTAATGTTGACTACTATCAAGAACAAAGGTGGTCACGTTAGAGGCATGGACATTCCTATGGTAGGCAATTTGTAGGGATAGCTAAAGTAGAAAACCAAAGACAAAACAAGCACAAATAAATAACTTTTTACTTAGGAGAATCCCATAAAGAAGTCTCTTACATCCTATCAGCTACTAACCTTTAACTCTTTATGTACCAAATCAAATGGACTCCAGGAAGCATACTGGCTCCATTCAAGTTTCCCATCATTCTGACTCATACAGAATCTACTGATGTTTCTTATATGTTTTCTAGTGCTAACATTCA-G-----CCTATTCAGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 260748 335 + 647215 ATGGTGCATCTTAATTTTGACTACTATTGAGAACCAAGGTGGTCTCATTAGAGGCATGCACACTCCTATCGTAGGCACATTGTAGGGATAGCTAAAGAGGAAAACCAGAGACAAGACTAGCACAAACCAATCA--TTTTATTCAGGTGAATTGCATAAAGAAGTCTATTACATCCCATTAACTACTATCCTTCAACTCTTTATATACCAAATCAAATAGACTTTAGGAAGCATACTGGATTCATTCAAATATCCCATCATTCTGACTCATACAGAATCTTCTTATGTTTCCCACTTATTTTTTAGTGCCAAGCTTCAACTAGGGCCAACTCAGCACA - -a -s mr.mrrefChr5 123585 72 + 294542 GCAAAGCCAACCATTGTTTACAACATTTACACTTCCCATCCCTGCAACATTAGTAGCAAATGCTTCTTGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272046 72 + 636262 GCAAAGCCGACCAGTGTTCACAACATTTCCACTTCTGATCCCTGCAACATTAGTAGCAAATGCTTCTTGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 261083 72 + 647215 GCAAAGCCAACCCTTGTATGCAAAATTTACACTTCCCATCCCTGTAACATTGCAAGCAGATGCTACTTGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 123657 52 + 294542 TAGTCTAATCTTAGGAAACTACTGTACCTCTGTTAGATTACACAGAATTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272118 52 + 636262 TAGTCTAATCTTAGGAAACTACTGTACCTCTGTTAGATTACACAGAATTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 261159 52 + 647215 TAGTCTAATTTTAGAAAACTACTGTATCTCTGTTAGCTTACACAGAATTCTA - -a -s mr.mrrefChr5 123709 43 + 294542 GTGTGGACCAGCAACTCTCACCAAATCAGCAAATCAATGTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272179 43 + 636262 GTGTGGACCAGCAACTCTCACCAAATCAGCAAATCAATGTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 261211 43 + 647215 GTGTGGACCAACAACTTTGACCAAATCAGCAAATCAATGTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 123752 195 + 294542 GAGTCCCGTCCCTTAGATATTGGTAGCAAATGCTACTCCCACAACCTAATCTCATTTCAAAAAACCATTACATCTAGAGTGTAGACAATATGAATCTGATGTCTACCAACCAATTTCTATTGAGATGTTGCTACAAATAGTCAGATGATCAATAGACATAGGTCTTTCTGGACCCCAATGACCCATTTGGCAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272222 193 + 636262 GAGTCCCGTCCCTTAGATATTGGTAGCAAATGTTACTCCCACAACCTAATCTCATTTCAAAAAACCATTACATCTAGAGTGTAGTCGATATGAATCTGATGTCTACCAACCAATTTCTATTGAGATGT--CTACAAATAGTCAGATGATCAATAGACATAGGTCTTTCTGGACCCCAATGTCCCACTTGGCAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 261274 183 + 647215 AAGTCCCATTACTTAGATATAGGTAGCAAAGGCTACTCCCACAACCTAATCCCAT--------AACATGACATCTAGAGTGTAGACAATAT----CTCATTTTTGCCAACCAATGTCTATTGAGATATTGCTATAAATAGTCAGTTTATCAATAGATATAGGCCTTTCTGGACCCCAATGACCCATATGGCAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 123947 23 + 294542 GCAAGATGTGACGTTTCAATTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272415 23 + 636262 GCAAGATGTGATGTTTCAGTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 261459 23 + 647215 GCAAGATGCAACATTTCAATTGG - -a -s mr.mrrefChr5 123970 98 + 294542 ACTAGCATAACTTAGACTTACGTAATAAATGCAATTAATGGAAGAAATTAAAAATACTTTAAATTAAGAGGATGTGGATACTACATAAGGTGGGGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272441 98 + 636262 ACTAGCATAACTTAGATTTACGTAATAAATGCAATTAATGGAAGAAATTAAAAGTACTTTAAATTAAGAGGATGTGGATACTACATAAGGTGGGGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 261482 98 + 647215 ACCAGCATAACTCAGACTTACGTAATAAATACAATTGATGGGAGAAATTAAAAATACTTTAAATTAAGAAGATGTGCATACTACATTAGGTGGGGGCT - -a -s mr.mrrefChr5 124068 313 + 294542 GACTTGGGTTATGTATTCAATTCCAGTTCTTTTGATTCACTTACACTGGGGGCCTCATCCTAAGTATAGTTTTATCTTGTACTGTATGTTGCCAATTCGCTTCCACCATATGATAGTGGAAGCAGATCAGCTATTTCTATGTTGTATCCCTCTCTCCTAATCCCCTAGACTATCATATTAGTTATACTATATGGAAGATTTATAACTTTTCATCTCATTCCACCAGAGAATGACTAGGCCAGATAGCTCTGCAACTCTTCATGCAACCCCATAAGTGGTTGAGGCATTTGTATCATTGGCAACACAAAACCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272539 271 + 636262 GACTTGGGTTATGAATTCAATTCCAGTTCCT------------------GGGCCTCATCCTAAGTATAGTTTTACTTTGTACTGCATGTTGCCAATTTGCTTCCACCATATGATAGCAGAAGCCAGGCAGCTATTTCTATGTTGTATCCCTCTCTCCTAATCCCCTAGACTGTCATATTAGTTATATTATATGGAAGGTTTATGACTCTTCATCTCATTCCACCAGAAAAT------------------------TCTTCATGCAACCCCATAAGTGGTTGAGGCATTTGTCTCATTGTCAACACAGAACCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 261582 313 + 647215 GACTTGGGTTAAGTATTCAATTCCAGTTCTTTTGATTCACTTACACTGGGGGCCTCATCCTGAGTATAGTTTTATCTTGTACTGTATGTAGCCAGTTCGCTCCCACCATATGGCAGTGGAAGAAGATCAGCTATTACTCTGTTGTATCCCTCTCCCCTAATCCCCTAGACCATCATATTAGTTATACTATATGGAAGAATTATAACTTTTCATCTCACTCCACCAGAGAATGACTAGGCCAGATAGCTCTGCAACTCTTCATACAACCCCTTAAGTGGCTGAGGCATTTGTATCGTAGGCAACACAAAACCAA - -a -s mr.mrrefChr5 124381 203 + 294542 CTTCAATTGCTATTTGTCTATTTCAAGCATCCTTTCCAAGCAAGAGATTATGGTAAGGAACTGACACTAATTGAGACGAGCAAGGTGTCAGGAGGAGGCATAGAAATACATGGAATCGAAAATATTCTCCCAGGTGGCATTTATATAGCAACTCTTGTATGAAACAAGTTCTCAATTGGCAATTTCAATTTATGTATAACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272832 203 + 636262 CTTCAATTGCTATTTGTCTATTTCAAGCATCTTTTCCAAGCAAGAGATTCTGGTAAGGAATCGACACTAATTGAGACGAGCAAGGTGTCAGGAGGAGGCATAGACATACATGGAATCGAAAATATTCTCCCAGGTGGCATTTATATAGCATCTCTTGTATGAAACGAGTTCTCAATTGGCAATTTCAATTTATGTATAACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 261895 192 + 647215 CTTCAGTTGCTATTTGTCTATTTCAAGCATCCTTGCAAAGCAAGAGATTATGGTAAGGAACTGACACTAATTGAGACAAGCAAGATGTTAGGAGTAGGCATTGAAATACATGGAATC-----------CCCTGGTGGCATTTCATTAGCAACTCGTGTATGAAACAAGTTCTCTATTGGCAATTCCAATTTATGTATAAGACA - -a -s mr.mrrefChr5 124584 58 + 294542 AATCTTCATGAAAATGTTTGAAAGAACAGATATTCCTGTATGTAGAAGATATAGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 273036 58 + 636262 AAACTTCGAGAAGATGGTTGAAAGAACAGATATTCCTGTATGTAGAAGATATAGTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 262087 58 + 647215 AATCTTTATGAAAATGTTTGAATGAACAGAAAGTCCTGTATCCAGAAGAGATAGTATG - -a -s mr.mrrefChr5 124642 68 + 294542 GTCATTAGTAGTAATTTTGAGTCGAATAATTAATGAGCTATGGGTAATGTTAACCACAGCAGTATGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 273094 68 + 636262 GTCATTAGTAGTAATTTTGAGTCGAATAATTAATGAGCTATGGGTAATGTTAACCACAGTGGTTTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 262163 68 + 647215 GTCATTGGTAGTAATGTGGAATTGAATAATTAATGACCTATGGTTAATGTTAGCCACAGCAGCACTAA - -a -s mr.mrrefChr5 124710 500 + 294542 CAGGTCTAATGGTTTGAATGACAAATCTATCCAAAGAAAGAAAACACATAAAAGCTTATTATTGATCAAAATTGTGTATGAAGACTAAATTCACTCTGCAGTAGCCCAGAATATTTTGGCCCTACACTTAATACAACTAAGCCATTCTGCTGGTATTGCAAAACAAGTGACAAACTGCACACTTGAGTAGGTAACTTACCCAGCAGCAGCTCCCCTGGTCATGAATCAAGATTGGTTCTAATTATTTATATGCAGCTCAGTTCATTAAACAATGAGATTGCTGCAGGGCCCAGCTGAGGTTGTGTTCTTAAGTAGCTGCTGATACTCTGGCATTGTAAGTTGAATCTTTATTGCCCCAGCTTAGGACAATATAATGTGATACAAGGTACCTAATAGATCAATTGATATTAAACGGTAGAACCTGCCAAAAGAGCAACTCCCCTACTAAGAGTTAAGAGGATGGCCAATTTGAGGCTAAAAGTAGGGATCTTTGACCGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 273165 478 + 636262 CAAATCTA----------TGACAAATCTATCCAAAGAAAGAAAACACATAAAAACTTATTATTGATCCAAATTGCGTATGAGGACTAAATTCACTCTGCAGTAGCCTAGAATATTTTGGCCCTACGCTTAATACAACTAAGCCATGCTGCTGGCATTGCAAAACAAGTGGCAAACAGCACACTTGAGTAGGGAAATCACCCAGCA---GCTCCCCTGGTCATGAATCAAGATTGGTTCTAATCATTTATATGCAGCTCAGCTCATTAAACATTCAGATTGCTGCAGGGCCAAGCTGAGGTTGTGTTCTTGAGTAGCTG--GATACTCTGGCATTGTAAGTTGAATCTTTATTGCTCCAGCTTAGGACAATAGAATGTGATACAAGGTACCTAGTAGATCAATTGATAATAAACGGTAGAACGTGCCAAAAGACTGACTCCCCTACTA-------AGAGGATGGCCAATTTGAGGCTAAATGTAGGGATCTTTGACTGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 262231 488 + 647215 GGGGTCTAATGGTTTGAACGACAGATCTACCCAAGGAAAGAAAACACACAAAAGCTTATCATCGATCAAAATTGTGTATGAAGACCAAATTTACTCGTCAGTAGCCCAGAA---------CTTACATTTAATACAACTAAGCCATTCCGCTGGTATTACAAAATAAGTGACAGACTGCACACTTTAGAAGGTAGCTTACCCAGCAGCAGCTCCCCTGGTCATGAATCAAGATTGGTTCTGACTATTTATATGCAGCTTAGTTCATTAAACAATGAGATTGTTACAGGGCCCAGCTGAGGTTGTGTTCTTAAGTAGCAGCTGATACTTTGGCATTGTAAGTTAAATCTTTATGACCCAAGCTTAGGATAAAATAATGTGATACATGG---CTAATAGATCAATTGATATGAAACGGTAGAACCTGCCAAAAGAGCAACTCCCCTATTAAGAGTTAAGAGGATGGCCAATTTGAGGCTAAAATGAGGGATCTTTGACCACAG - -a -s mr.mrrefChr5 125210 175 + 294542 TGTCTGAGTGGTCACAATACCTATGCTGACAATCAGCCAAATGGTGGCGCAGGAAGCACTGTCTCGGTAAGGCACCTTAGAATTGCAAACATTCAGGCAGTCACTCAGTACATTGCAATTGTATTCATCAACCCATTTTTAGAAGAGCAGCATGTAGCTAATGTGCCCCAGGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 273643 175 + 636262 TGTCTGAGTGGTCACAATACCTATGCTGACAATCAACCAAATGGTGGCGCAGGAAGCATTGTCTCGGTAAGGCACCTTGGAATTGCAAACATTCAGGCAGTCACTCAGTACATTGCAATTGTATTCACCAACCCATTTTTAGAAGAGAAGCATGTTGCTAATGTGCCCCAGGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 262726 163 + 647215 TGTATGAACAGTTACAATACCTATGCTGAGAATCAGCC-----------CAGGAAACACTCTCTCGGTTAGTCACCTTAGAAT-GCAAACATTCAGGGAGTCACTCAGTACGTTGTAATTGTATTCATCAACCCATTTTTAGAAGAGCTGCATGTAGCTAATGTGCCCAAGGTCC - -a -s mr.mrrefChr5 125385 196 + 294542 CACATAACCTTATGATCCTATTGACCTGGATCCACCACAGCTACTTGGCAGAGAGCTCCTTTGTAAGAATGAAAATTGGTCATAGCTAGAAAGAGCTCAGTGTGTAGTCACCAATATGCAGCTTACTTCTAAATCAACTGTAAAAATAGAATAGAAGTGGGAATCTTTGGGGAATAGACACTTGTCCATAGGTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 273818 168 + 636262 CACATAACCTTATGATCCTAGTGACCTGGATCCACCACAGCTACTTGGCAGAGAGCTCCTTTGTAAAAATGAAAATTGGTCATAGCTAGAAAGAGCTTTGTGTGTA----------------------------CAACTGTAAAAATGGAATAGAAGTAGGAATCTTTGGGGAATAGACACTTGACCATAGGTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 262901 196 + 647215 CACATAACCTTATGATCCTATTGACCTAGTTCCATCACAGCTACTTGGCAGAGAGCTCCTTTGCAAGAATGAAAATTGGTCATAGCTAGAAAGAGCTCAGTGTGTAGTCACCAATATGCAGCTTACTTCTAAATCAACTGTAAATATAGAATAGAAGTGGGAATTTTTGGGGAATAGACACTTGTCTATAGATCTG - -a -s mr.mrrefChr5 125581 221 + 294542 GACTCATTATGGGGTAGCTAGGAAGCCATGTCTTGTGGATGATATGGATACAGCAGGCCACTTGGGTATAAAATCAGCCAACTTGTGCAAGGTTTAATGTAAGGGACAACAGCCGCACTATTTCTTATTCTACCTGATTGAAAAGGATAGTTCTTGGAATAATGTGGGACAAAGTTGAACTGGATCTATGATTTAGCAGCATCCCCCAAAAAAAGTGGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274011 221 + 636262 GATTCATTATGGGGTACCTAGGAAGCCATGTCTTGTGGATGATATGGATACAGCAGGCCACTTGGGTATAAAATCAGCCAACCTCTGCCATGCTTAATGTAAGGCACAACAGCCGCACTATTTCTTATTCTACCTGATTGAGAAGGATAGTTCTTGGAATAATGTGGGACAAAGTTGAACTGGATATATGATTTAGCAGCATCCCCCAAAAAAAGTGGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 263097 212 + 647215 GACTCATTATGGCGTTGCTAGAAAGCTATGGCTTGTGGGT---------ACAGCAGGCCACTTAGGTATAAAATCAGACAACTTGTGCAAGGTTCAATGTAAGGGACAACAGCTGCACTATTTCTTATTTTACCTGATACAAAAGGATGGATCTTGGAGTAATGTGGGACGAAGTTGAACTGGACCTACGATTTAGCAGCTTCCCCCAAAGAAAGTGGTAA - -a -s mr.mrrefChr5 125802 186 + 294542 TAAATACCCAATGGACTTGTTGAGTAAGTAAACCCATAATAGAGACTCTTCTTTAATGAACACTTATGGAAAAGACATAAGGTACTTTGAATTTAGGATTGATGCCTCCCCATCCCCTGTTACCAAAACTAATATCATCAAAAGCTGCATGAAAAGTTTAACAAACTCAACATTAACAGAGTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274252 186 + 636262 TTAATACCCAATGGACTTGTTGAGTAAGTAAACCCATAATAGAGACTCTTCTTTGATGAACACTTATGGAAAAGACATAAGGTACTTAGAATTTAGGGTTGATGCCTCCTCATCCCCTGTTACCAAAACTAATTTCATCAAAAGCTGCATGACAAATGTAACAAACTCAACATTAACAGAGTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 263309 185 + 647215 TAAGTATCCAATGGACTTGTTGAGTAAGTAAACCCATAATAGAGACTCTTCTTTAATGGACACCTATGGAAAAGACATAAGGTACTTTGAATTTAGGATTGATGCCTGCCCATCCCCTGTCACCAAA-CTCATATCATCAAAAGCTGCATAAAAAGTTTAACAAACTCAACAATAACAGAGTGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 125988 213 + 294542 AGTGGATGCCCTTCTTTGTGCAGTATGATGGATTCCAGCCCTCAATACAGCCTGACAGGAGGCAGCAGCTCAACACATAAATTGCAGTCAAATTGTCAATAGGTGGAATAGAAGCTTAGTGCTGTTATGGTGCAAGAAAATTCAAACATAACAACATTAGGCAGCTTATGAGATGAGATGCGGACCTAGCCTAAAAAAGGTATGTGCTGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274440 212 + 636262 AATGGGTGCCCTTCTTTGTGCAGTATGATGGATTCCCGCCCTCAATACAGCCTGACAGGAGGCAGCAGCT-AACACATAAATTGCAGTCAAATTGTCAATAGGTGGAATAGAAGCTTAGTGCTGTCATGGTGCAAGAAAATTCAAACATAGCAATATTAGGCAGCTTATGAGACAAGATGTGAACCTAGCCTAAAAAAGATATGTGCTGATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 263494 213 + 647215 GGTGGATGCCCTTCTTTGTGCAGTATGATGGACTCCAGCCCTCAATACAGACTAACAAAAGGCTGCAACTCAACACGTAAATTGCAGTTAAATTGTCAATAGGTGGACAAGAAGCTTAGTGCTGTTATGGTGCATGAAGATTCAAACATAACAACATTAAGCAGCTTATGAGATGAGATGCGGACCTAGCCTAAAAAAGGTATGTGCTGATGT - -a -s mr.mrrefChr5 126201 96 + 294542 ATATCATGTTCCACCCTTTGTAGAGGGCCCCTACATCCTCTGTGATATGGGATTTATTGAAGATCATCATAGTATGTAAAACACAATGGCAATCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274652 96 + 636262 ATATCATGTTCCACCCTTTGTAGAGGGGCCCTACATCCCCTGTGGTATGGGATCTATTGAAGATCATCATAGTATGTAAAACACAGTGGCAATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 263713 96 + 647215 ATATCATGTTCCACCCTTTGTAGCAGGCCCCTACATCCTCTGTGATATAGGATTTATTGAAGATCATCATGGTATATAAAACGCAATGGCAATCGG - -a -s mr.mrrefChr5 126297 32 + 294542 AATCTGTATAAGAAGGGCACCAATAGTGAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274749 32 + 636262 AATCTGTATAAGAAGGGCACCAATAGTGAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 263809 32 + 647215 AATCTGTATAAGAAGAGCATCAATAGTGAATA - -a -s mr.mrrefChr5 126329 49 + 294542 ATGTATGTATGACCTGGGATTATCTTGGCACGCCTTAAGGCTAATATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274788 49 + 636262 ATGTATGTATGACCTAGGATTATCTTGGCACGCCTTAAGGCTAATCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 263841 49 + 647215 ATGTATATATGACCTGTGATTATATTGGCACACCTTAAGGCTAATATGT - -a -s mr.mrrefChr5 126378 18 + 294542 TACCGAAAGTAAGGTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274837 18 + 636262 TACCGAAAGTAAGGTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 263894 18 + 647215 TACCGAAAGTAAGGTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 126396 477 + 294542 GTATCCTTGACATAAGTGGCCCCATGTCTAGGGGGGGTGACACCCACAGTATTTCAGGTAGTAAGCATTGCCTTGATGGCCTATAAGTAATGTCACCACTGAATACCACGGCATTTTGGCTGTGAACTTGAACATGATGATAATGCTGGATGTAAAAAGTGGATCCAACATTGATTGAGTGAGTATAAGGAAACATACCAACCAGATGGGAGTTGGTTCATTTGACAGGACTAAAGCATGTCTTATATTCTCCTACATCACTGACAAGTAGACCCCCACAGCAAGGAATTGATTGAATTTACAAGATGGTTTTTTCATGAAGTATAGCAAGCTATAAACCGGATAATGGTGAAACATGAGATATTTTAAGAAAATATACTAAGTGCTTTAGTTACCGTCTGAACATATCCTAAAGGTCATTTGCTAATCtCCAAGCCTCACAACCTtGCagtattgcagctagctcccctcaagtaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274855 474 + 636262 GTAGCCTTGACATAAGGGGCCCCACTTCTAGGGGGGGTGATACCTGCAGTATTTCAGGTAGAAAGCATTGCCTAGATGGCCCATATGTAATGTCACCACTGAATATCACGGCATTTTGGCTGGGAACTTGAACATTATGATGATGCTGGATGTAAAAAGTGGATCCAACATTGATTGAGTGAGTATAAGGAAACATACCAACCAGATGAGAATTGGTTCATTTGGCA--ACTAAAGCATGTCTTATATTCTCCTACATCACTGACAAGTAGACCCCCACAGCAAGGACTTGATCGAATTCACAAGATGGTCTTCTCATGAAGTATAGCAAGCTACAAACCGGATAATGGTGAAACATGAGATATTTTAAGAAAATATACTAAGTGCTTTAGTTACCGTCTGAACATATCCTAAAGGTCATATGCTAATC-CCAAGCCTCACAACCTTACCGTATTGCAGCTAGCTCCCCTCAAGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 263913 461 + 647215 GTATCCTTTACATAAGTGGCCCCATGTCTAGGGGG--TGACACCCACA----------TAGTAAGTCTTGCCCTGATGGCCTATAAGTAATGTCACCACTGAATACCATGGCATTTTGGCTGTGAACTTGAACGTGATGGTAATGCTGGATGTAAAGAGTGGATCCAACATTGATTGAGTGACTATAGGGGATATTACCAACCAGATGGGAGTTGGATCATGCGACAGGACTGGAGCATGCCTTATA----CTTCCATCTCTGAGATGTACACCCCCGCAGCAAGGAAGTGTTTTAATTTAAAAGATGGTTTTTTTATGAAGTATAGCAAATTATGAACCAGATAATGGTCAAACATGAGCCATCTTAAGAAAATATACTAAGGGCTTTAGTTGCTGCCtgaacatatgctaaaggtcatttgctaatctccaaggctttcagccttgcagaattgcagctcgctcccctcaagtaa - -a -s mr.mrrefChr5 126873 254 + 294542 tatttggtctacacattctaaagGTACTTGCTATGCCTATTTAGATTAAGACATGGTGTCAAAACCTTTAACCACTTAGTGTGAATGACTGGACATATTTTGGATTTCTTCTAGTGTGACACTGCGCCATAGAGGTCATTATGTAGTGAACTGGAATAGGTTTTAACCATAACCATCAAGCTGGCCCTGAGGCATCACTTGACCAAGCATATCTTCTACTAAATGGTAGCAGAGGGTTGTACCATAATTGCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 275330 250 + 636262 TTTTTGGTCTATCCATTCTAAAGGTACTTGCTATGCCTATTTACATTAAGACATGGTGTCAAAACTTTTAACCACTTAGTGTGAATGACTGGACATATTTTGGATTTCTTCTAGTGTGACACTGCGCCATAGAGGTCATTGTGTAG----CTGGAATAGGTTTTAACCATAACCATCAAGCTGACCCTGAGGCATTGCTTGACCAAGCATATCTCCTACTAAATGGTAACAGAGGGTTGTACCATAATTGCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 264374 253 + 647215 tatttggtctacacattttaaagGTACTTGCTATGCCTATTTAGATTAATATGTGGTGTCAGAACCTTTAACTACTTAGTGTGGATGACTGAACATATTTTGGATTCATTCCAGCATGAGACTGTACAATTGGAGTCATCATGTAGTGAACTGGAATATGTTTAAACTATAACTGGCAAGCTGGCCCTGAGGCATCACTTGACTAGGCATATCTTCTGCTAAACGGTCGCAGAGCGTTGTAACATAAGTGCT-C - -a -s mr.mrrefChr5 127127 23 + 294542 GGATATTCCATAACAGAGTCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 275582 23 + 636262 GGATCTTCCATAACAGAGTCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 264627 23 + 647215 GGATATTGCATAGCAGAGTTATC - -a -s mr.mrrefChr5 127150 127 + 294542 AAACTGTGGTAGCCTAATGCACATAAGGGTAGCACAAGCATTTGACGGCATATCTAGGGGGGGCAGCTTCTACAAACTACAAGAACAATAACAGTAGAGGGCTAGATTGGGTGCAAGGCAAATATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 275606 118 + 636262 AAACTGTGGTAGCCTAATGCACATAAGGGTAGCACGAGCATTTGACGGCATGTCTAGGGGGGGCAGCTTCTACAAATTACAATAACAATAACAGTAGAGGGCTAAGTTGGGTGCAAG---------A -s simRat_chr6.simRat.chr6 264650 127 + 647215 GAACTGTGGTAGCCTAATGCACTTAAGGGTAGCACAAGCATTTGACAGCATATTTAGGGGGGGCAGCTTCTAAAAACTACAAGAACCCTAACAATAGAGGGTTAGATTGGGTGCAAGGCAAATATGG - -a -s mr.mrrefChr5 127277 72 + 294542 CAAACATGTCACATCACACCTTGGCATGTAAGGGCTCCAGTTAGCGAATTCTCTTGTTACTCCCTTATGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 275724 71 + 636262 CAACCATATCACAT-ACACCTTGGCATGTAAGGGCTCCAGTTAGCGAATTATCTTGTTTCTCCCTAATGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 264799 72 + 647215 CAAACATGTCACATCACACCTTGGCATGTAAAGGCTCCAGTTAGTGAATTCTCTTGTTACTCCCTTATGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 127349 612 + 294542 TTGACCAAAGATAACATTTAATGGGTGAAGTACAGCCTCGGATTAGTAATATTTCATTTCTATATGACTCTATGTAACTCTGTTCCATGTAACTCTAGGTTTTCATAGAATGGCTTCTTCATTTACTCTCAGATAAACTACTGATGTTCTTATCTTGATCATGAGCACCCATCGGAAAGAGTTGTTTGACTAGTGGTCATTTAAAATATATTTTAAGAGAACTTGTCTATTGTTAAAGCTGAGGTATGGACCACTATAGGCTCTCAGCAGAAGAGAAGGGATCAGAAAGGGCTAGGTAGGATTAGGGATATCGCACCCTCTAAAGAGGTGGATACCAATCTGAAACATGGAGATGAGTAATCCGGGCCAACATAGCACAACGGGTTCGTCCTAGTTGCAGTGAGCATCAGAGGGACACTTGCCACGAGCTCCATCATACCTGCTGGGAACAAAAGTCAAGGCTTCTTTCTGAGCCAGGACCATAAATGGCAGGACAAGACACTGCAGATTGCCCTCAAACACCATTTTGGGTAACAAATTATAGCTTAATTTCAAGTCAAACTTAGTATACAAGGTAGTGGTGGGTTAATCATAAGGTAGGTACATACATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 275795 586 + 636262 CCAACCAAAGATAACATTTAATGGGTGAAGTACACCGTCGGATTAGTAATATTTCATCTCTATATGACTCTATGTAACTCTGTTCCATGTAACTCTAGTTTT--------------CTTCATTTACTCTCAGATAAACTACCGATGTTCCTATCTTGATCATGAGCACCCATCGGAAAGAGTTGTTTGACTAGTGGTCATTTAAAACTTATTTTAAGAGAACTTGTCTATTGTTAAAGCTGAGGTCTGGACCACTATAGGCTCTCAGCAGGAGAGAAGGGATCAGAAAGGGCTAGATAGGATTAGGGATATCGCACCCTCTAAAGAGGTGGATATCAATCTGAAACATGGAGATGAGTAATCCGGGCCAACATAGCACAACAGGTTCGTCCTAGTTGCAGTGAGTGTCAGTGGGACACTTGCCACGAGCTCCATCAT--------GGAACAAAAATCAAGGCTTCTTTCTGAGCCAGGACCAT--ATGGCGGGACAAG--ACTGCAGATCGCCCTCAAACACCATTTTGGGTAACACATTACAGCTTAATTTCAAGTCGAACTTAGTATACGAGGTAGTGGTGGGTTAATCATAAGGTAGGTACATACATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 264998 608 + 647215 TTGGCCAAAGATAACATTTAATAGGTGAAGTGCAGCCCTCGATTAGTAGTATTTCATTTCTAGATAACCCTATGTAACTCTGTTCCATGTAACTCTAGGTTTTCATAGAATGGCTTCTTCATTTGACG----ATAACCTACTGATGTTCTTATCTTGATCATGAGCATCCATTTGAAAGAGTTGTTTGACTAGTGGTCATCTAAAATAAATTTTAAGTGAACTTGGCTATTGTAAAAACTGAGGTATGGACCACTATAGGCTCTCAACAGAAGAGAAGGGATAAGAAAGGGCTAGGCAGTTTTAGGGGTATCGCACCCTCTACAGAGGTGGATACTCACCTGAAACATGGAGATCAGTAATCTGGGCCAACATGGCACAACGGGTTCATCCTAGTTGCAGTGAGCATTAGAGGGACACTTGCCAGGAGCCCCATCATACCTGCTGGGAACAAAAGCCAAGGCCTCCTTGTGAGCCAGGACCATAAATGGCAGGATAAGACACTGCAGATTGCCCTCAAAAACCATTTTGGGTAACAAATTATAACTTAATTTCAAGTCAAACATAGCAAACAAGGTAGAGGTGGGTTGATCATGAGGTAGGTACATACATTG - -a -s mr.mrrefChr5 127961 154 + 294542 TGTAACTTACTGCATCCTGATTCGGGTACCGTCCAATATATCAGTGTTTGGTAACTTCTGTGTCCAATATAACCATGGAAATATGTGCAAGGGGTACTACCTGATACGTTGGTGTTTGGTGACTTCTGTGTCCAATATAACCATGGAAATATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276408 154 + 636262 TGTAACTTACTGCATCCTGATTCGGGTACCGTCCAATATATCAGTGTTTGGTAACTTCTGTGTCCAATATAACCATGGAAATATGTGCAAGGGGTACTACCTGATACGTTGGTGTTTGGTGACTTCTGTGTCCAATATAACCATGGAAATATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 265606 154 + 647215 TGCAACTTACCGCATCCTGATTGGGATGCTGTCCAATACATCAGCATTTGGTGACTTCTGCATCCAATATAACCATGGAAATATGCACAAGGGGTACCACCTGATACATCAGTGTTTGGTGATTTTTGTGTCCAATATAGCCAAGGAAATATGT - -a -s mr.mrrefChr5 128115 20 + 294542 GCAGTGCATTGACAATTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276562 20 + 636262 GCAGTGCATTGACAATTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 265776 20 + 647215 GCAGTGCACTGACAATTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 128135 142 + 294542 ATTGAACTAGATATGTTTTACTCTTTAGACCCTGCAAATTATAGTGACTTGTCCACAATTAAGGGGCATTAACCATATTGTTTTGTAACATCCTCACAGGTATCACAACTTGGAAATTGGGGAATCCCCGTAGATCAATCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276582 142 + 636262 ATTGAACTAGATATGTTTTACTCTTTAGACCCTGCAAATTATAGTGACTTGTCCACAATTAAGGGGCATTAACCATATTGTTTTGTAACATCCTCACAGGTATCACAACTTGGAAATTGGGGAATCCCCGTAGATCAATCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 265804 142 + 647215 ATGGACCTAGATATGATTTGCTCTTTAGACTCTGCAAATTATAGTGACTTGTCCACAATTAAGGGGAATTGACCAAATCATTTTCTCATATCCTCACAGGTATCACAACATGGAGATTGGGGAATCCACATAGATCAATTAG - -a -s mr.mrrefChr5 128277 33 + 294542 TGTATTAATGTGAATATGCTTAGACTGTCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276724 33 + 636262 TGTATTAATGTGAATATGCTTAGACTGTCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 265947 33 + 647215 CATATTAATGTGAACATGCTAGGACTATCATAA - -a -s mr.mrrefChr5 128310 95 + 294542 TTGAGCACTACAAACTGGTGACAGGGCCTGTAAAAAAATTGTTACAACAAGCATCCTGACCGACTAGATAGATGGATTTGATCTTAACTGACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276757 95 + 636262 TTGAGCACTACAAACTGGTGACAGGGCCTGTAAAAAAATTGTTACAACAAGCATCCTGACCGACTAGATAGATGGATTTGATCTTAACTGACATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 266033 95 + 647215 TTGAGCAGTCCAATCTGATGACAGTGCCTGTAAAAAGATTGTAACAACAAGCATCCTGACAGATTAAATAAATGTATTTGATCCTATCTGACTTT - -a -s mr.mrrefChr5 128405 61 + 294542 TTCCCTTTTGATTTAGGAACACAGTTCATAATTCCACATTTTTAATTATATAAAAACAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276860 61 + 636262 TTCCCTTTTGATTTAGGAACACAGTTCATAATTCCACATTTTTAATTATATAAAAACAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 266128 61 + 647215 TTCAATTATGTTCTTGGCTCACAGTTCATAATTCAGCATCTCTAGTTATCTAAAAACAGTC - -a -s mr.mrrefChr5 128466 3 + 294542 TAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276964 3 + 636262 TAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 266189 3 + 647215 TAA - -a -s mr.mrrefChr5 128469 80 + 294542 CCTACTGACTTGTGGTGACATTGTATTGGTTTGTGTACAACACTTAAGTCGATGAATTCACGGCTACAGGCTTGCCTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276967 80 + 636262 CCTACTGACTTGTGGTGACATTGTATTGGTTTGTGTACAACACTTAAGTCGATGAATTCACGGCTACAGGCTTGCCTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 266199 80 + 647215 CCCACCGAAGTGTAGGGACATTGTACTGGGTTGTATACAACACATAAATCAGTGAATTGACAGCTACAAGCTTGCCTGTG - -a -s mr.mrrefChr5 128549 96 + 294542 CAGATATTTATTGTTCTGTGCCTTATTGGATCTGTAGCCAGTGCTGGCCAGCTTTTGGAGCACAAAAGGCCTCAGCCCTGGCTGCGGCCATGAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277052 96 + 636262 CAGATATTTATTGTTCTGTGCCTTATTGGATCTGTAGCCAGTGCTGGCCAGCTTTTGGAGCACAAAAGGCCTCAGCCCTGGCTGCGGCCATGAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 266279 96 + 647215 CAGATCTCTCTTGTACTATGCCTTGTTGGAACTGTGGGGAGTGCTAGCCAGCTTTTAGACCATAAAAGGCCTGACCCCTGGCTGCAGCCATAAAGC - -a -s mr.mrrefChr5 128645 54 + 294542 AATCACTGTCAATCCTGTCTCATGAGCAGCTTTTAAATTGTAAAAGACCTGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277151 54 + 636262 AATCACTGTCAATCCTGTCTCATGAGCAGCTTTTAAATTGTAAAAGACCTGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 266375 54 + 647215 AATCACTGTCATTCCTGTATCTTGCCCAGCTTTTAAATCGTAAAAGACCTGACA - -a -s mr.mrrefChr5 128699 6 + 294542 CTGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277206 6 + 636262 CTGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 266429 6 + 647215 TTGGCT - -a -s mr.mrrefChr5 128705 27 + 294542 TGCAATAAAGCAACTACCACTGTCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277212 27 + 636262 TGCAATAAAGCAACTACCACTGTCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 266437 27 + 647215 GGCAACAAAGCAACTACCACTTCCGAT - -a -s mr.mrrefChr5 128732 64 + 294542 TCAGAATCATGCTGTATAAAGTTATGAAGATTAACGAAGTACAGCATATGAATTATTGATGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277245 64 + 636262 TCAGAATCATGCTGTATAAAGTTATGAAGATTAACGAAGTACAGCATATGAATTATTGATGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 266464 64 + 647215 TCTGAATCATGCTGTATAAAGCTGTAAAGATTAGCGAAATACAGCAAATGAATTATTGATGTCT - -a -s mr.mrrefChr5 128796 43 + 294542 CCATAAGTAGGGGGGGGTGCCTGTTAATTGTGCAATCTAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277316 43 + 636262 CCATAAGTAGGGGGGGGTGCCTGTTAATTGTGCAATCTAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 266528 43 + 647215 CCATCAGTAGGGGGGGGTGCCTGTTAAGTGTACAATCTAAATT - -a -s mr.mrrefChr5 128839 64 + 294542 ATACTGATGGATCACAGTTGTGCTCTTTAATATGTTCTGAGACACATGTCATGAGCATCAGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277361 64 + 636262 ATACTGATGGATCACAGTTGTGCTCTTTAATATGTTCTGAGACACATGTCATGAGCATCAGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 266571 64 + 647215 ATACTGATGGATCATAGTAGTGTTCTTTAATATGTTCTGACACACATTTCATGAGCATTAAGTC - -a -s mr.mrrefChr5 128903 18 + 294542 ACAGTCAATTGTTCTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277425 18 + 636262 ACAGTCAATTGTTCTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 266636 18 + 647215 ATAGTCAATTGTTGTAAC - -a -s mr.mrrefChr5 128921 81 + 294542 TTTGTCACCTTTTAAAATATATCTAAGGCTACTAAAGAGTTAAGCTGACCTCCTCATTATTATCTACTTTGCTCATTTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277443 81 + 636262 TTTGTCACCTTTTAAAATATATCTAAGGCTACTAAAGAGTTAAGCTGACCTCCTCATTATTATCTACTTTGCTCATTTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 266666 81 + 647215 TTTGACACTATCTAAGATAGAGCTAAGGCTATTAAAGAATGAAGTTGATCTCCTCTTTACTGTCTCCTTTGCTCATTTCCT - -a -s mr.mrrefChr5 129002 102 + 294542 TTAGGCCTGCACAGCCTGGTTATGAGGGAAGCAAAATAGCTGTGTGTTTGTGCATGAATGTTTTGAATACTTAGAGTGCTAAAGAGAATGGTCTATGCCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277524 102 + 636262 TTAGGCCTGCACAGCCTGGTTATGAGGGAAGCAAAATAGCTGTGTGTTTGTGCATGAATGTTTTGAATACTTAGAGTGCTAAAGAGAATGGTCTATGCCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 266748 102 + 647215 GTAGGCCTGCATAGCCTGGTTATCAGGCAAGCAAAATAACAGCATGATTGTGCATGAACTTTTTGAATAGTTAGAGTGTTAAAGAGAATGGTTTGTGTCTCT - -a -s mr.mrrefChr5 129104 37 + 294542 CTAGTGGTTTAGATAGTGGTTTAGAAGAGATCCTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277628 37 + 636262 CTAGTGGTTTAGATAGTGGTTTAGAAGAGATCCTGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 266850 37 + 647215 TTAGTGATTTAGATAGTGGTTCACGAGAGATCTTGTC - -a -s mr.mrrefChr5 129141 26 + 294542 ATGTATATTTAATGGAAACTGACCGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277667 26 + 636262 ATGTATATTTAATGGAAACTGACCGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 266887 26 + 647215 ATCTAGTGTGAACAGATACCGACCAG - -a -s mr.mrrefChr5 129167 39 + 294542 TTAAGTCAGGTTGAGATACTGTGGGATCTACAACTTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277693 39 + 636262 TTAAGTCAGGTTGAGATACTGTGGGATCTACAACTTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 266915 39 + 647215 TTAAATCAGCTTGAGATACTGTGGGATCTACAACTTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 129206 22 + 294542 ACTGGCATTAGTGGGCACTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277732 22 + 636262 ACTGGCATTAGTGGGCACTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 266958 22 + 647215 GCTGGCCTTATTGGGCACTACT - -a -s mr.mrrefChr5 129228 101 + 294542 AGGTAGGTTGCTCCACCTTTTAGTCTAAGTTGTTTCTGACTTCTAGATAAAGTCTCCGCACTATTACGACTGGTACATCCAGTTAAAATGATGGGTCATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277755 101 + 636262 AGGTAGGTTGCTCCACCTTTTAGTCTAAGTTGTTTCTGACTTCTAGATAAAGTCTCCGCACTATTACGACTGGTACATCCAGTTAAAATGATGGGTCATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 266980 101 + 647215 AAGTAGGTTGCTCCACCTTTTAGTCAAAGCTGTTTCTGACTTCTAGATAATATTTCTGCACCGTCACAACTGGTACATCCAGTTATAATGATGGATTATAG - -a -s mr.mrrefChr5 129329 7 + 294542 CCTCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277856 7 + 636262 CCTCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 267112 7 + 647215 CCATTCC - -a -s mr.mrrefChr5 129336 135 + 294542 TGGTGGTATTGTAAGGAGATTATCTAGTACCAACATTTAGCTATAGAGAGACCCCTTACATATATAGTTAATTGCGTCTCACTGTTTGTGGAATTAATGCTTGGCTCTGTCAATCTCAAGCTTCACATTCAATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277863 135 + 636262 TGGTGGTATTGTAAGGAGATTATCTAGTACCAACATTTAGCTATAGAGAGACCCCTTACATATATAGTTAATTGCGTCTCACTGTTTGTGGAATTAATGCTTGGCTCTGTCAATCTCAAGCTTCACATTCAATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 267123 135 + 647215 TGGTGGTATCGTATGGGGATCATCTAGTACCATCATTTATCTATAGAGCTACCTCTCACATGTATAGTTAACTTCGTCACACCGTTTGTAGAATTAACGCTTTGCTCTGTCAATGTCAAGCTTCAAGATCAATGA - -a -s mr.mrrefChr5 129471 57 + 294542 CCCATTATTACATGGGTTTCATTAAGATTTTTAATAGTAGGCCCACAACTGCCTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277999 57 + 636262 CCCATTATTACATGGGTTTCATTAAGATTTTTAATAGTAGGCCCACAACTGCCTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 267258 57 + 647215 ACCATTATTATATGGGATTCATTTAGATTTTTAATAGTAGACCCATAAGTGCCTCCT - -a -s mr.mrrefChr5 129528 58 + 294542 TCTTCTGTCTATGCTGGGAAGCAGAGCATTTGAGTTAAGTTTACCTGAAGAAATACGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278064 58 + 636262 TCTTCTGTCTATGCTGGGAAGCAGAGCATTTGAGTTAAGTTTACCTGAAGAAATACGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 267315 58 + 647215 TCTTCTGTCTACGATGGGGAGCGGAGCATTTGAGTTTAGTTTACCTGAAGAAATACAC - -a -s mr.mrrefChr5 129586 32 + 294542 TGGCTTCACACCTTGTATCCGGGTTTACACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278123 32 + 636262 TGGCTTCACACCTTGTATCCGGGTTTACACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 267373 32 + 647215 TGGCTTCATACCGTGTACCTGGGTTTACACCT - -a -s mr.mrrefChr5 129618 146 + 294542 ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAAAAGTGTAGATTTTAGGATTGGCATTTAAGCTGAGATGGGACAAGTATCTCGTTTCCATGCCCAATAACAGTCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCCTGCCATCCTAGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278174 146 + 636262 ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAAAAGTGTAGATTTTAGGATTGGCATTTAAGCTGAGATGGGACAAGTATCTCGTTTCCATGCCCAATAACAGTCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCCTGCCATCCTAGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 267405 146 + 647215 ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAGAAGTGTAGCTTTTAGGATTGGCATTGAAGCTGGTATGGGCCAAATATCTTGTTTCCATGCCTAATAACAATCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCTTGCCATTCTAGTTC - -a -s mr.mrrefChr5 129764 6 + 294542 CAGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278320 6 + 636262 CAGGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 267552 6 + 647215 CAGGGT - -a -s mr.mrrefChr5 129770 261 + 294542 TTCCCTTAAGAGGCTTGCTGCATAGAGTCCTGTATTTTGCCCTTCTAGTTCTCTCTGCCCGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGCATTTTGAATATCACTTGACCTGGACATCTGGCTATTGCCATAAGAATGGACTAGCAGAGGAGGTCTATATTACTGTAAGTTGCTGCTCACATGAAGCAATACCTTATTATAACAAGCAGGTGGTCTATATGGTACCCTACAATTCAAGATAGTCTCCAAGCATTTCGTCGGCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278326 261 + 636262 TTCCCTTAAGAGGCTTGCTGCATAGAGTCCTGTATTTTGCCCTTCTAGTTCTCTCTGCCCGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGCATTTTGAATATCACTTGACCTGGACATCTGGCTATTGCCATAAGAATGGACTAGCAGAGGAGGTCTATATTACTGTAAGTTGCTGCTCACATGAAGCAATACCTTATTATAACAAGCAGGCGGTCTCTATGGTACCCTACAATTCAAGATAGTCTCCAAGCATTTCGTCGGCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 267559 231 + 647215 TTCCCTTAAGAGATTTGCTGCCTCAAGTCTGTGATTTTACCCTTCTAGTTCTCTCTGTCGGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGTGATTTGAATATCATTTGACCCGGGCTTCTAGCTCTCACTATAAGAATGGACTAGGAGAGGATGTCTAGAATACTGTAGGTTGTTATTCACATGAAACAATACTTTCTTATAACAAGCAGGTGGTCTATAAGGGACCCTACAATT------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr5 130031 161 + 294542 GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCGGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTACCATGAGAGGAAGTCTAGAACACTGTAAGTGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278590 161 + 636262 GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCAGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTAGTGTGAGAGGAAGTCTGGCACACTGTAAGTGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 267790 86 + 647215 ---------------------------------------------------------------------------AGACCCGGGCTTTTGGCTCTCACCCTAAGAATGGTCTGGGAGAGGAAGTCAACCATGAGAGGAAGTCTAGAACCCTGTAGGTGCTA - -a -s mr.mrrefChr5 130192 291 + 294542 AACACATGGAACTATAATTTCTTATAACAAGCAGGCAGTCCATAATGTGGCCTACAATCCTCCATACTCTCCAATCATTTGGTTGGCACTAAGCAGCAACTGGATTCATTGTACCACAGTAGGGGTTATTGGAAGTGATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTCCAGGTGGATGGTATATATACCAAGCTGGTGAAAATATTTTTCAAGTCATCTGGTGTGGTTGCTCTTATAGCTTCATTCTTAGTATGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGATCTGAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278751 291 + 636262 AACACATGGAACTATAATTTCTTGTAACAAGCAAGTAGTCCATAATGTGGCCTACAATCCTCCATACCCTCCAATCATTTGGTTGGCATTAAGCGGCAACTGGATTCATTGTACCACAGGGGGGGTTATTGGAAGTAATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTGCAGGTGGATGGTGTATATACCAAGCTGGTGCAAATATTTTTCAAGTAATCTGGTGTGGTTGCTCCTATAGCTTCATTTTTAGTACGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGATCTGAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 267881 285 + 647215 AACACATGGAACTATAATTTCTCATACTACGCAGGCAGTC-----TGTGGTCTATGATCCACCATACTCTCCAATCATTTGGTTGGCACTAAGCAGCAATTGAATTCATTATACCAGAATAGGGGCTATTCGAAGTGATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTCCAGGTGGATGATATATGTGCTAAGCCGGTGAAAATATTTCTCAAGCCAACTGGTGT-GTTCCTCTTATAGCTTCATTCTCAGTATGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGTTCTGAGGT - -a -s mr.mrrefChr5 130483 49 + 294542 GGTTAACATATGTAGGACCTAAAACACTGAAAAGTAGCAAGTCCAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279286 49 + 636262 GGTTAACATATGAAGGACCTAAAATAATGAAAGCTAGCATGTCCAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 268166 49 + 647215 GGTCAACATATGTAGGACCTAAAACACTGAAAAGCAGCAAGATAAGCAG - -a -s mr.mrrefChr5 130532 66 + 294542 GGGCTTGGGGCTCCTGTAGTCCAGTGTCTCTCAAAGATGGAATAAACTATGTACCAAGTCAATAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279335 66 + 636262 GGGCCTGGGGCTCCTGTAGTCCAGTGTCTCTCAAAGATGGAATAAACTATGTACCAAGTCAATAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 268216 6 + 647215 AAGATC------------------------------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr5 130598 98 + 294542 CTGAGTTGGTAGGGTTCAATATCTCAATTATGCTCTGTGACAAACAAAATTGTCTGCATTGGGTTGTTCACATGGAGCCCTACCAAGTTGGAGCCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279406 98 + 636262 CTGAGTTGGTAGGGTTCAATATCTCAATTAAGCTCTGTGACAAACAAAATTGTCTGCAGTGGGTTGTTCACATGGAGCCCTACCAAGTTGGAGCCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 268222 97 + 647215 -TGAGTTGGTAAGGTTCAATGTCTCAATTATGCTCTGTGACAAACAAAATTGCCTGGATTCGGTTGTTCACATGGAGCCCTACCAAGTTGGAGCCTCA - -a -s mr.mrrefChr5 130696 38 + 294542 CAAGTGTATGACAAAAAACTTGAAGACAGGGTGACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279504 38 + 636262 CAAGTGTATGACAAAAAACTTGAAGACAGGGTGACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 268320 38 + 647215 CAAGTGTATGACAAAAAACCTGTAGACAGGGTGACACA - -a -s mr.mrrefChr5 130734 126 + 294542 CTAGCTGTCCAGATCAAAACTAGTGGTATGGTCCAAATTACAGTCTAGCCCAGGGCAGCATGGTGCAGACCAAGAGGACAGTATAATGGAGGAAGCCTAAAAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279637 124 + 636262 CTAGCTGTCCAGGTCAGAACTAGTGGTATGGTCCAAATTACA-TCTAGCCCAGGGCAGCATGGTGCAGACCAAGAGGACAGTATAAT-GAAGAAACCTAAAAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 268358 126 + 647215 CCAGCTGTCCAGATCAAAACTAGCGGTATGGTCCAAATTACAGTCTATCCCATGGGAGCATAGTACAGACCAAGAGGACAGTATTATGGAGGAAGCCTAAGAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 130860 171 + 294542 TACATGCCTAATGGAGTTTAACTTGGAGTACTCATGGTCAGTATCAAAGATACTATTGATCCCAGTCCCTCAGCTTCAGGAGGCAGGTTAGGATAACAATGCACTTTGTCAAAAATTTTCTTACAATTATGTCATCAAAAAATGTGTTCCATTCCGCCTTCATCTTGAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279761 171 + 636262 TAAATGCCTAATGGAGTTTAACTTGGAGTACTCACTATCAGTATCAAAGGTACTATGGATCCCAGTCCCTCAGCTTCAGGAGGCAGGTTAGCATAACAATGCACTTTGTCAAAAATTTTCTTACAATTGTGTCATCAAAAAATGTGTCCCATTCCGCCTTCATCTTGAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 268485 171 + 647215 TACATGTCTAATGGAGTTTAACTTGAAATACTCATGGTCAGTATGAAAGATACTATTGATCCCAGTCCCTCAGCTCCAGGATGCAGGTTAGGATAACAATGCACTTTGTCAGAAATTTTCTTACAATTATGTCATCAAAAAATGTGTTCCATTCTGCCTTCATCTTAAACC - -a -s mr.mrrefChr5 131031 79 + 294542 AAAAAACTATATCATTCTACTGTCATATACTTGATGACTATTTGTTTGTGACCAAAACAGTCAATCAACACACATGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279933 79 + 636262 AAAAAACTATATCATTCTACTGTCATATACATAATGACTATTTGTTTGTGACCAAAACAGTCAATTGACACACACGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 268656 79 + 647215 AAAAAATTTTATCATTCTGGTTTCATACACTTGATGACTATTTGTTGGTGAACAAAAGAGACAATCAACACGCATGACA - -a -s mr.mrrefChr5 131110 277 + 294542 TTCCACCCATTATTAGTTGACTTCAGTAGGTCTGTCTTGTAAACATAAAAGCATTTTCTTTTTCTCTCATGGTAATGGTGGAAGATAGAAGTTCCAAACCATCTATATTTCTATACCACCGTCACCACACATCATTAATTTGCGGGCCAGCTTTTAGTATTGAGTTCTCCAATTCTAATTGTCCAAACATTCTCCTGCTGTCACTGTTCGTCCAGCTTGGGAGCCAGACTGCTGTATTTTGGTCAGGGCATGGCAGAGACATGGCCCTCTGTGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280058 275 + 636262 TCCCACCCATTATTGGTTGACTTCAGTAGGTCTGTCTTGTAAACATAAAAGCATTTTGTTTTTCTCTCATGACAATGGTGGGAGATGGAAGTTCCAAACCATCTATATTTCTATACCACTGTCACCACAAATCATTAATTTACAGGCCAGCTTTTAGTATTGAGTTCTCCAATCCTAATTGTCCTAACATTCTCCTGCTGTCACTGTTCGGCCAGCTT--GAGCCAAACTGCTATAATTTGGTCAGGGCATGGCAAAGACATGGCCCTCTGTGATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 268735 263 + 647215 TTCCACGCCTTATTAG---------AAAGGTATGTCTTGTAAACATAGGAGCAGTTTCTTTTTCTCTCATGGTAATGGTGGAGGATAGAAATTCCAAACCATTTATATTTCTAAACCTCCGTCACCAAACAT-----ATTTGTGTACCAGTTTTTTGTATTGAGTTCTTCAATTCAAATTGTCCAAACTTTCTCCTGTTGTCACTGTTTGTCTGGGTTGGGAGCCAGACTGCTGTATTTTAGTCAGGGCATAGCAGAGACATGGCCTGCTTTGATTG - -a -s mr.mrrefChr5 131387 94 + 294542 TCCATCAATTCAATCTAGAGCACAGAACAAGAATTACAGTTTGCCAAGGCGGCAAAGTTGGTCATAGATTAACCCTTCCACTACCCATGCCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280333 83 + 636262 TCCATCAATTCAATCTAGAC---ACAACAACAATTAC--TTTGCCAAGGCGGCAAAGTTG--TATAGATTAACCCTTCCACTACTCCTG----G -s simRat_chr6.simRat.chr6 269003 92 + 647215 TCCATAAATTCGATCTAGAGCACAGAACAAGTATCACAGCTTGCCAAGGCAGCAAGGTTGGTCACAGATTAACCCCTCCACTACCCA--CCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 131481 148 + 294542 CTGGGGATTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAACTAGGAACATGAATTGTAAAATTTGACACTATTGGGTTCATGAGCACCCGTCAGATGTGGTCCAAGAGTGCTATAACAATCAATTCAGTGGGGCGAGAGTTAGATCCCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280416 147 + 636262 TAGGGGACTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAA-TAGCAACCTAAATTGTAAAATTTGACACTATTGGGTTCATGAGAACCCGTCAGATGTGGTCCAAGAGTGCTATAACAATCAATTCAGTGGGGCGAGAGTTAGATCCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 269101 91 + 647215 CTGGGGATTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAACTTGGAGCATGAATAGGAAAATTTGACACTATTGAGTTCATGAGCAC---------------------------------------------------------TCCCAGT - -a -s mr.mrrefChr5 131629 146 + 294542 AGACTGACCTTGAAGAATTGTGAGGTCTCATGAAGTCAGACTGAGCATCAATTACAGTGAGGGATACATACTGTTTACCACACCCCATGGAGGGAAGGAGCAAAGTATTATTAGTAGCAGGTCTATGTGTTCTGAAATGAGGAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280564 138 + 636262 AGACTGACCTTGAAGA-------GGTCTCATGAAGTCAGACTGAGCATCGATT-CAGTGAGGGATACATACTGTTTACCACACCCCATGGAGGGAAGGAGCAAAGTATTATTAGTAGCAGGTCTATGTGTTCTGAAATGAGGAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 269192 146 + 647215 AGACTGACTTTGAAGGATTGTGAGGTCTCATGAATTCAGACTGAGCATCAATTATAGTGAGGGATACATACTGTTTACCACATCCCATGAAGGGAAGGAGCAAAGTATTGTTAGGAGCAGGTCTATGTGTTCTGAAATGAGGAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 131775 209 + 294542 GAAAGATGGTGCAAAGCGATTGGGAAACATTCACATGTATTAAGGCATTATGTCAACATACACATCAGTCACAATTGTACTAAGAGTCTGGAATAGGGACTCCAGTTTAATATCTGTAAGAATCTACCCGTGAAAACCACAACTAGAGCATGATAAAATGAGTGGCTGACCAATTAGGATGTTTGCCAGTAGAAACTCAAAAGAGCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280702 203 + 636262 GAAAGATGGTG------GGTTGGGAAACCTTCACATGTATTATTGCATTATGTCAACATACACATAAGTCACAGTTGTACCAAAAGTCAGGAGTAGGGACTCCAGTTTAATATCCGTATGAATCTACCCATGAAATGCACAACTAGGGCATAATAAGATGAGTGGCTGACCAATTAGGATGTTTGCCAGTAGAAATTCAAAAGAGCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 269342 200 + 647215 GAAAGGTAGTGCAAAGCAATTGGGAAACATTCACATGTATTAAGGCATTATGTCAACATACAAATCTGTTACAACTGTACTAAGAGTCTGGAACAGGGACTCTAGTTTCATATCTGTAAGAATCTACCCGTGAAAACTCCAACTAGAGCATGATAAAA---------GGCCAACTAGGATGTTTGCCAGTAGAATCTCAAAAGAACAAC - -a -s mr.mrrefChr5 131984 8 + 294542 CAGAGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280944 8 + 636262 CAGAATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 269542 8 + 647215 CAGAGTGC - -a -s mr.mrrefChr5 131992 61 + 294542 TCTATGTAAGATGAAAGTGGCAGCAGCACAACGCCTCCATCTGATGCTAAATAATCTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280954 61 + 636262 TCTATGCAAGATGAAAGTGGTAGCAGCACAATGCCTCCACCTGATGCTAGATAATCTGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 269550 60 + 647215 TTTATGTAAGATGAAAGGAGCAGCAGTAC-ACGCCTCCATCTGATGGTAAATAATCCGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 132053 133 + 294542 GCTGTTTAACATTGAATTAATGCACTACATTTGTTCAGGGGTCCACTGGTGGTACAAGATTCTCTTATCATGATGTTTGTGCACACCTAGTGGTGTCCTACTTTATTTTTTATAAAGGTAATCTAACATCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281015 133 + 636262 GCTGTTGAACATTGAATTAGTGCACTACATTTGTTTAGGGGTCCACTGGTGGTACACGATTCTCTTATCATGATGTTTGTGCACACCTCGTGGTGTCCTACTTTATTTTTTATAAAGGTAATCTAACATCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 269611 123 + 647215 ACTGTTTAACATTGAATTAATGCACTACATTTGTTCAGGGGTCCACTGGTGGTACAAGATTCTCTTATCATGATGTTTGTACACACCTAGTGGTGTCC----------TTTATAAAGGTAAGCTAACCTCTCA - -a -s mr.mrrefChr5 132186 9 + 294542 TGACTCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281148 9 + 636262 TGACTCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 269736 9 + 647215 TGACTCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 132195 178 + 294542 ACTTTATCTTAGTACTCTCCCCCACTTTCCTTCATTTAAAGGCTTGCTGATGGAATGGAATGCAGTACATCAAAGTAGGTGTTTTATTATCCAACCAGCTCTGTTTGCTTAAAGATAACTCACCTTGTTCATCCTCTCTCACTTTGGGGGTATAGAAGATGTTCATCAGATTCCTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281160 178 + 636262 ACTTTATCTTAGTACTCTCCCCCACTTTCCTTCATTTAAAGGCTTGCTCATTGAATGGAATGCAGTACATCAAAGTAGGTGTTTTATTATCCAACCAGTTCTGTTTGCTTAAAGATAACTCACCTTGTTCATCCTCTCTCACTTTGGGGGTATAGAAGATGTTCATCATATTCCTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 269745 170 + 647215 ACTTTATCTTAGTACTCGCCCCCACTTTCCTTCGTTTAAAGGCTTGATGATGGAATGGAATGCAGTTCATCAAATCAGGTGTTTTCTTATCCAACCAGCT--------TTAAAGATAACTCTCATTGTTCTTCCTCTCTCATTTTGGGGGTATAGAAGCTGTTTGTCAGACTCCTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 132373 21 + 294542 ACAAGAGGCGGGCAACTCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281339 21 + 636262 ACAAGAGGTGGGCAACTCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 269915 21 + 647215 ACAAGAGGCGAGCAACTCATC - -a -s mr.mrrefChr5 132394 103 + 294542 CACCTAGAGCTGTCAGTTGTTCACTTCTCCCCATCAGCAGAGGGTGTCATCCATCATCCTTGGTAACAGTGGCGGCAGCAACAATCATGTCACTAGAGGATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281360 103 + 636262 CACCTAGAGCTGTCAGTTGTTCACTTCTCCCCATCAGCAGAGGGTGTCATCCATCATCCTTCTTAACAGTGGCGGCAGCAACAATCATGTCAGTAGAGGATCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 269942 103 + 647215 CACCTCAAGCTGTCAGTTTTCAGGCTCTCACCTTCGGCAGAGGGTGCCATCCATCATCCTTGGTAATAGTGATGGCAGCAACAATCATGTCACTAGAGCATCA - -a -s mr.mrrefChr5 132497 21 + 294542 TTTCCTTATTATCATATGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281463 21 + 636262 TTTCCTTATTATCATATGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 270052 21 + 647215 TTTCCTTATTATCATATGCCT - -a -s mr.mrrefChr5 132518 95 + 294542 GAGTTGTGGTAAGCACTAACCCCAGACTTCAGACTGAAGATATCAGAATTTGTAGCTCAGGTTTTTCACAATCACAAACTGCCATCGAAAAGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281497 95 + 636262 GAGTTGTGGTAAGCAGTAAGCCCAGACTTCGGAATGAAGATATCAGAATTTGCAACTCAGGTTTTTCACAATCACAAACTGCCATTGAAAAGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 270073 95 + 647215 GATTTGTGACAAGCACTAACCCCAGACTTCAGACTGAAGATATCAGAATTTGTAGCTCAGGCTGTTCACGATCACAAACTGCCATCGAAAAGTGG - -a -s mr.mrrefChr5 132613 20 + 294542 GACTGAATTCATGGTCCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281596 20 + 636262 GACTAAATTCATGGTCCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 270168 20 + 647215 GGCTGAATTAATGGTCCCTT - -a -s mr.mrrefChr5 132633 108 + 294542 CAACAGACAATACATATTATAAGGTGAGTGGCCCAAATAATTTGGTAAATGAGCAGCAAGAACAGAAGCATAACCCATGGAGTATGTACTGTGTTGGTAATTAAGGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281631 108 + 636262 CTACAGACAATACATATTATAAGGTCAGTGGCCCAAATACTTTGGTAAATGAGCAGCAAGAACAGAAGCATAACCCATGGAGTATGTACTGTGTTGGTAATAAAGGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 270188 106 + 647215 CAACAAACAATACATATTATAAGGTGAGTGGCCCAAATGATTTGGTAAATGAGCAGCTAGAACAGAAGCATAATCAATGGAGTACAAAT--TGTTGGTAACTAAGGAC - -a -s mr.mrrefChr5 132741 218 + 294542 AAGCAAATCATAATTTGCTGCTCCAGTATGATAGGGGATATAGAAGTGTTTAAGGGCCCTGGAGTCCTGTAATCAACATCTAACTTAAAAGTCCCTATAGCCCTATGTTATAGCTTTAGTACCCAACCCACTAAATACTCTTGGTATCTTGAAACATAAGTATTTCATAAGCTTATCATCTTTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGGTAATACCCTGTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281742 218 + 636262 AAGCAAATCATAATTTGCTGCTCCAGTATGATAGGGGATATAGAAGCGTTTAGGGGCCCCGGAGTCCTGTAATCAACATCTTATTTAAAAGTCCCTATAGCCCGATGTTATTGCTTTAGTACCCAACCCACTAAATACTCTTGGCATCTTGAAACATAGGTACTTCATAAGCTTATCATCTCTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGGTAATACCCTGTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 270294 218 + 647215 AAGCAGCTCATAATTTGCTGGCCTAGTATGATAGGGGATATAGTAGTGCTTAAGGGCCCTGGAGGCCTCTAATCAACATCTAACCTAAAAGTCCCTATAGTCTTATGTTATAGCTTTAGTACCCAACCCATTAAATACTCTTGGTATCTTGAAACATTAGTATTTCATAAGCTTATCATCTTTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGATAATACTCTGTACT - -a -s mr.mrrefChr5 132959 69 + 294542 TATGATACACTTGAAGGAAAATAGTTCTGTGATCATAAATTGCAGGAGACTGCCCAGGAATAATAGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281962 69 + 636262 TATGATACACTTGAAGGAAAATAGTTCTTTAATCATAAATTGCAGGAGACTGCCCAGGAATATTAGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 270512 69 + 647215 TATGATAAACTTGAAGGAAAATAGTTCTGTGATCATAAATTGCAGTACACTGGCCAGGAAGAACAGGGG - -a -s mr.mrrefChr5 133028 347 + 294542 AAGGAAGATCTTTATGAATGGTAGGTATGCTTACATACCCAGATTGCCCCCATTCACCCTCAGCATCTTAGGGATATGCACAATAAGGCTTGTTGGAGCTCTTAACACGATAAGCTTTCCTGTTCTTGTCCACCAGTTATTGGGTAACTGTTACAATGATGTATTAGCAGGATGGGACCAGCCTCTGGTGAAAGTATTAGGGCATTAATATTCATTTTTAAGCCTGTACCTTCCATGACTCACCTAAGTAGCTCTCCCATCACCTTTATGACTAGATGGCCCTATGTCAGCTCATATCTGCCATTAGATCCAATTAATAAGACCATGAAACAGCTAATGGTCAAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282042 347 + 636262 AAGGAAGATCTTTATGAATGGTAGGTATGCTTACATACCCAGATTGCCCCCTTTCACCCTCAGCATCTTGGGGATATGTACAATAAGGCTTGGAGGAGTTCTTAACACAATAAGCTTTTCTGTTCTTGTCCACCAGTTATAGGGTTACTAGTATAATCTTGTAATAGCAGGATGGGACCAGCCTCTGGTGAAAGTATTAGGGCATTAATATTCATTTTTAAGCCTGTACCTTCCATGACTCACCTAAGTAGCTCTCCCATCACCTTTATGGCTAGATGGCCCTACGTCAACTCATATCTGCTGTTAGAGCCAATTAATAAGACCATGAAACAGCTAATGGTCAAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 270581 254 + 647215 AAGTAAGATCTTTATGTATGGTAGGTATGCTTACATACCCGGATTGCCCCCATTCACCCTCAGCATCTTAGGGGTATGCACAATCAGGCTTGTTGGAGCTCTTAACACGATAAGCTTTCCTGTTCTTGTTCCCCAGTTATTGGGTAGATGTTACAATGATGTATTAGCAGGATGGGACCAGTTTC----------------------------------------------------------------------------------ATTACTAGACTGCCCTATGTCAGCTCATATCTGCCATTAGATCCAATTAATAAAACC-----ACAGCTACTGGT------ - -a -s mr.mrrefChr5 133375 88 + 294542 GAGAGTGAGCCAATGATACAACATGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGCCCGTCAAATTTATTCCTGAGGCTGAAGTTTAACAGTGACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282408 88 + 636262 GAGAGTGAGCCAATGATACAACATGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGCCCATCAAATTTATTCCTCAGGCTGGAGTTTTACAGTAACACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 270835 70 + 647215 ------------------CAACGTGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGTGTGTCAAATGTATTCCTGAGGCTAAAGTTGAACAATGATATT - -a -s mr.mrrefChr5 133463 28 + 294542 CTAAATAGTGCATGGAAGTTCCAGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282497 16 + 636262 CTAAATAGTGCATGGA------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 270905 18 + 647215 ----------CATGGAAGTTCCAGCACA - -a -s mr.mrrefChr5 133491 56 + 294542 CCACTAGATACCTAACCTTGGTTGGGTTCTAAACAAACACAAAGAATAACCAACGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 270927 56 + 647215 CCACTAGATACCTAACCTTGGTTGGGTTCTAAACAAACACAAAGAATAACCAACGA - -a -s mr.mrrefChr5 133547 20 + 294542 GATTTCCTGTGCTGACTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282513 20 + 636262 GATTTCCTGTGCTGACTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 270986 20 + 647215 GACTTCCTGTGCTGCCTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 133567 22 + 294542 ATGAATTGCTCTGCATTGTGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282533 22 + 636262 ATGAGTTGCTCTGCATTGTGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 271009 22 + 647215 ATGAATTGCTCTGCATAGTGAC - -a -s mr.mrrefChr5 133589 138 + 294542 TCTTACTTGTGCCATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAATCTTTGCAGCTAAACCCACCTCTCAATTTTTAGTGATCGTGCTTTGAGCTAGAAATACAGTAATATTTCTTGGACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282555 133 + 636262 -----CTTACGCCATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAATCTTTGCAGCTATACCCACCTCTCAGTTTTTAGTGATCATGCTTTGAGCTATAAATACAGTAATATGTCTCGGACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 271032 138 + 647215 TCTTACTTGTGCGATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAACCTTTGCAACTAAACCCACCTCTCAATTTTCAGTGATCGCACTTTGAGCTGGAAATACAGTAATATTTCTTGGACAG - -a -s mr.mrrefChr5 133727 79 + 294542 CTGTGTTCTGGATAGGATAGTGCCACTAGCTCTAGTGTTATGAGAGGTTGTATCAATTAACATAGATAGAATCTTGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282692 79 + 636262 CTGTGTTCTGGATAGGATAGCACCACTAGCTCTAGTGTTATGAGAGGCTGTATCAATTAACATATATAGAATCTTGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 271170 74 + 647215 CCGGGCTGT-----GGATAGTGCCACTAGCTCTAATGTTATGAGAGGTTGTAGAAATTAACATAGATAGAGTCCTGATA - -a -s mr.mrrefChr5 133806 32 + 294542 TGAATATCATTGTTCTGCTAGCATTGTGTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282771 32 + 636262 TGAATATCATTGTTCTGCTAGCATTGTGTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 271248 32 + 647215 TGGATATCAATGTTTTGCTAACATTGTGCAAC - -a -s mr.mrrefChr5 133838 55 + 294542 CTCACTCTCTACCTCGCAATCATTATAATTATATCATTCCAATGACTCATCTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282803 55 + 636262 CTCACTCTCTACCTCACAATCATTATAATTACATCATTCCAAAGACTCATCTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 271283 55 + 647215 CCCACTCACTACCTCGCAATCATTATAATTATATCATTCCAATGACTCATCTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 133893 26 + 294542 ACTTGTACAGGTAAACCTAAAGTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282864 26 + 636262 ACTTGTACAGGCAAACGTAAAGTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 271338 26 + 647215 ACTTGTGCAGGTAAAACTAAGGTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 133919 32 + 294542 GTCAGGGAAGATGGAAAGAAGGCAGAGAGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282890 32 + 636262 GTCAGGGAAGATGGAAAGAAGGCAGAGAGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 271392 32 + 647215 GTGAGGGAACATGGAGATGAGGCAGAAAGGAA - -a -s mr.mrrefChr5 133951 422 + 294542 TCCTGTCTACCGATGCCAAGGAGCGGTCATGATATCAGTGAAAGTTCACTCTGTGTCTGTTGAGTGGTGTTATAGAATGCCAGTGAAGGCCAAACTCTTGCTTAACTCAAGGCAAGAAGGAAATCTAGACATGGGCACAATAGAGCGGCTTCCAATGTACCTGTAGGAGAGTTTTGGATGAACTACCCTATATACCTCTATGCCAAGAAGGAGGCAATCAGTGCACACAGTACGGAGTGTTCCTGAGTTGGAATAACTTCATGGACAGATGGATAAATTAGGAAGGGGAGAGAGTAGAGACAACCAGTTCTTATTCTCCTGAAGACAGAATGTAGGCCAGAAATAGTACCAGGTTAGGCAGGCATTAGCTCAACATATTGCATCCAATGATCGGTGTGGTATTGCATAGGCTGCCCATTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282925 420 + 636262 TCCTGTCCAAAGATGCCAGGGAGTGGTCATGATATCGGTGAAAGTTCACTCTGTGTCTGTTGAGTGGTGTTATAGAATGCCAATGAAGGTCAAACTCTTGCTTAACTCAAGGCAAGAAGGAAATCTAGACATAG--ACAATAGAGTGGCTTCCAATTTACCTGTAGGAGAGTTTTGGATGAACTGCCCTCTGTACCTCTATGCCAAGCAGGAAGCAATCAGTGCACACAGTACGGAGTGTTCCTGGGTTGGGATAGCTTCATGGACAAATGGATAAATTAAAAAGGGGAGAGAGTAGAGTCAACCAGTTCTCATTCTCCCGGAGACAGAATGTAGGCTAGACATAGTACCAGGTTAGGCAGGCAGTAGCTCAACATATTGGATCCAATGATTGATGTAGTATTCCATAGGCTGCCCATTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 271424 422 + 647215 TCCTCTCTACCGATGCCAAAGAGCGGTCATGATCTCAGTGAAAGTTGGCTCTGTGTCTGTTCAGTGGTGTTGTAGCATGCCAGTGGAGGCCAAACTATTGTTTAACTCAAGGCAAGAAGAGAATCTGGACATGGGCACGATAGAGCAGCTTCCAATGTACCTGGAAGAGAGTTTTGGATGAACTACCCTATATACCTCTATGCCATGAAGGAGGCAATCAGTGCACACAGTAAGAAGTGTTCCTGAGTTGGAATAACTTCATGGACAGATGGATAAATTAGGAAGGGGAGAGAGTAAAGACAACCAGTTCCTATTCTCCTGAAGACAGAATGTGAGCCAGGAGTAATACCAGGTTAGGCAGGGATGAGCTCAACACATTGCATCCAATGATCGGTGTGGTATTGCATGGGCATCCCATTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 134373 71 + 294542 GTCATACTTTGGTACCCAGCAGTCTTTATGGTTGTCATAGGTTACCTTATATAGGAATGCCTGAAAGTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283345 71 + 636262 GTCTTACTTTTGTACCCAGCAGTCATTATGGTTGTCATGGGTTACCTTATATAGGAATGCCTGCAAGTGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 271847 71 + 647215 GTCATATCTTGGTACCTAGCAGTCTTTATGGTTGTCATAGGTTACCCTCTCTAGGAATGCCTGAAAGTGCC - -a -s mr.mrrefChr5 134444 148 + 294542 TGAGGATAGAAATAGACTGGAATGTCCACTCAAATATGATGGCTAATAATCATAAAAGTTTGTAGAATTTGTCCCACCCCTCTCAGAAGGCTGTGCAACTTCTGTGTAAATGGATGAGAAGTGGCCTCCATATCAACAACCACATGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283418 64 + 636262 TGAGGATAGAAATTGACTGGAATGTCCACTCA------ATGGCTAATAATCATAAAAGTCTGTAGAATTT------------------------------------------------------------------------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 271918 148 + 647215 TGAGGATAGAAATAGACTGGATTGTCCACTCAAATATGATGGCTAATAATCATAAGCATTTGTAGAATTTGTCCCACCCCTCTCAGAAGGCTGTGCAACTTCTGTGTAAATGGATGAGAAGTGGCCTCCATATCAACAACCACATGAT - -a -s mr.mrrefChr5 134592 74 + 294542 TGTATGACCTTAACCCAAAACTAAGATCAATATTCTACTGTCTAGATGGTGTTAAGTTAAGAAGTGCGTAAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283482 32 + 636262 ------------------------------------------TGGATGGTGTTAAGTTAAGAAGTGCGTAGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 272068 74 + 647215 TGTATGACCTTAACCCAAAACTAAGATCAATATTCTACTGTCTAAATGGTGTTAAGTTAAGAAGTTCATAAATC - -a -s mr.mrrefChr5 134666 78 + 294542 ATACTAGTATATAGGCAGCATTTTGGTGTGAAGCTTCAGCATGCTTACATGGATAGATGGGTGATACTGATTACCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283711 7 + 636262 ATACTAG----------------------------------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 272142 78 + 647215 ATACTAGTATATAGGCAGCATTTTGGTGTGAAGCTTCAGCATGCTTACATGGATAGATGGGTGATACTGATTACCATG - -a -s mr.mrrefChr5 134744 116 + 294542 GCTACTTTGTCATCAAGCCTTTGCTCTTAAAACTAAGGCTGGGCTTTTACTGTTAAGTAATCCTGAGTCGTTGATAAGCCATGGGAAATGGAACTAAGCCTATCTGGTAATTACGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 272221 116 + 647215 GCTACTTTGTCATCAAGCCTTTGCTCTTAAAACTAAGGCTGGGCTTTTACTGTTAAGTAATCCTGAGTCGTTGATAAGCCATGGGAAATGGAACTAAGCCTATCTGGTAATTACGA - -a -s mr.mrrefChr5 134860 19 + 294542 ACAAACCAGACCACTACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283718 18 + 636262 -CAAACCAAACCACTACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 272342 19 + 647215 ACAAACCAGGCCACTCCAA - -a -s mr.mrrefChr5 134879 214 + 294542 ATGCCAGTCACTATGTTGGCTACAGATGACGTTATTAATTTGGCTAAAGATGACCTTAGTCATGATCTGAGCCCTGAACAGCTGGAAATGTGGGTATTCTTCATCTGTCCTCAAAGAATGGAATGTTTTTATGGGTTTACCTGATTGCTGCATATTTGGAGACTGACCTCTAAACTCTTGTCCATCTTTATGTCTTGATTCACAGCATCTAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283738 213 + 636262 ATGCCAGTCTCTAATTTGACAATAGATGACATCATTAGTTTGGCTAAACATGACCTTAGCCATGGTCTGAGGCCTGAGCAGCTGGAATTGTGGGTATTCTTCATCTGTCCTCAAAAAATGGAATATTTTGATGGGTTTACCTGATTGCTGCATA-TTGGAGACTGACCTCTAAACTCTTGTCCATCTTTATGTCTTGATTCACAGCATCTAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 272361 214 + 647215 ATGCTGGTCACTATGTTGGCTACAGATGACGTTACTAATTTGGCTAGAGATGACCATAGTCATCATCTGAGCCCTGAACAACTGGAAAAGTGGATATTCTGCCTCCGTTCTCTAAGAATGGAATGTTTTTGTGGGTTTACCTGATTGCTGCATATTTGGAGACTGACCTCCAAACACTAGTCCATCTTTATGTCTTGATTCATAGCATCTAGGA - -a -s mr.mrrefChr5 135093 83 + 294542 GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCCAGACTCAAATAATGCCTGCATTTCATAGCTGATGCCTACACAGGGGAAAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283952 83 + 636262 GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCCAGACTCAAATAATGCCTGCACTCCATACCTGATGCCTACACAGGGGAAAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 272575 77 + 647215 GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCAAGACTTAAATAATGCCTGCTTTTCACAGCTGATGCCTTCACAGGGG------ - -a -s mr.mrrefChr5 135176 42 + 294542 AGGCACAGGAATAGATGAGGGCTGGGATCTTAGAAACAGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284048 42 + 636262 AGGCACAGGAATAGATGAGGGCTGGGATCTTAGAAACAGGAT - -a -s mr.mrrefChr5 135218 21 + 294542 GAGAATGAATTCGAAACAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284156 21 + 636262 GAGAATGAATTCGAAACAATG - -a -s mr.mrrefChr5 135239 28 + 294542 AATGAGTTTAAGGAAGAATAGTCTCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284178 28 + 636262 AATGAGTTTAAGGAAGAATAGTCTCTTA - -a -s mr.mrrefChr5 135267 16 + 294542 CAGTACCATTGTATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284207 16 + 636262 CAGTACCATTGTATCT - -a -s mr.mrrefChr5 135283 346 + 294542 TGTGGCTGAAGTAACTTGCACAGTTAACATGGTAAAGGATGCCACCTACAGGCATTAAGCTAATCCTAACATCTGAGGCACTATCTGAGAACTGTGTAATGGAGGGAGAGTAATCATGTCAAGTTGGAGATTAGTTGGAATATACAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGTTAGTATATACAAGAATCTCTCTCTTTGATTTTCTGGTACATGTTGCTTACAAAACCTTTGCCCTGACAGGAGTCAAAAAAGGACCACTGGAATACTACATGGAAGTTTTCAGGATTGCAATATACTACTATCAGACAGATGGAAAGAATGGGGGTTTGATGCTTGGGTACTTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284235 342 + 636262 TGTGGCTGAAGTAACTTGCACAGTTAATATGGTAAAGGATGCCACCTACAGGCATTAAGCTAACCCTAACATCTGAGGCACTATCTGAGAATTGTGTAATGGAGGGAGAGTAATCATGTCAAATTGGAGATTGGTTGGAATATGCAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGTTAGTATATACAAGAATCTCTCTCT----TTTTCCGGTACATGTTGCTTGTGGAACCTTTGCCCCAACAGGAGTCAAAAAAGGACCACTGGAGTACTACATGGTACTTTTCAGGATTGCAATATACTACTATCAGACAGATGGGAAGAGTGGGGGTTTGATGCTTGGGTAATTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 272652 320 + 647215 ------------------------CAACATGGTAAAGAATGCCACCTACAGGCATTAAACTAATCATAATGTCTGAGGCACTATCTCAGAACTGTGTAATGGAGAGGGAGTAATCATGTCAAGTTGGAGGTTAGTTGGAATACACAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGGTAATATATACAAGAATCCTTCTCTTTGATTTTCTGGTACATGTTGCTTACAAAACCTTTGCCTTGACAGCAGTCTATAAAGAACCACTGGAATATTACTTGGAAGTTTTTAGAATTGCAATATATTACTACCAGAAAGATGGAAAGGAG--GGGTATGATGCTAGGGTACTTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 135629 73 + 294542 ATGTGCAGTGGTTCTACCACTTGTGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284577 62 + 636262 ATGTGC------TTTACC-----TGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 272977 73 + 647215 CTTTGCAGTGGTTCTTCCACTTGTGCCACTGTATTAGTCTTGCAAACTCAGTCGCTGCAAGGTGAATCTCTGT - -a -s mr.mrrefChr5 135702 55 + 294542 ACCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284639 55 + 636262 GCCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 273051 55 + 647215 ACCCTTTACAGCCATGAGTACTATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAGCTCTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 135757 68 + 294542 CCTACTTACTCGAACAGAGCTCATTTTGCAACTGTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284694 63 + 636262 CTTACATACTTGAACAGAGCTCATTTTGCAGCTGTACTTGATCGACCTAGGTAGCCAGAGCTA----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 273107 68 + 647215 CCTACTTTCTCGAGCAGAGCTCATTTTGCAACTTTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG - -a -s mr.mrrefChr5 135825 348 + 294542 CTTTATGCATGACTTGGGGTTGCTATAAAGGAAAATAGTGACAGATTTATTGATTCCATGTCTTGGATAATTGGAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGACGGAAGGCCATGAACATACCTCTCCAGCATTGTTTCTGAACATTTTGGGTGGCCCAGGGCAGTGTAGAATGTGTGATCATATCTTGAGGAAGTGCTTCCATGTTAGTAGAAGAAGATAGCCAATTATTGCCAAAAACATACGGTTCCAGTTCAGGTCCTCTTTTTAAGCAGATGGGGGGTGCCATAAACCATAAGTTATGTCAGAATGACATTAAGGGCCCTAGGTTGACTTTTATTCTCCTCTAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284757 337 + 636262 ----------GACTTGGGGTTGTTATAAAGGAAGATAGTGACAGATTTACTGATTCCAGGTCTTGGCTAATTGAAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGACGGAAGGCCATGAACATACCTCTTCAGCAGTGTTTCTGAACATTTTAGGTGGCCTAGGGCAGTA-AGAATGTGTGATCATATCTTGAGGAAGTGCTTCCATGTTAGTGGAAGAAGATAGCCAATTATTGCCAAAAACATACGGTTCCAGCTCAGGTCCTCTTTTTAAACAGATGGGGGGTGCCATAAACCATAAGTTATGTCAGAATGACAGTAAGGGCCCTAGGTTGACCTTTATTCTCCTCTAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 273181 339 + 647215 CTTTATGCATGACTTGGGTTCACTATAAAGGAAAATAGTGACAGATTTATTGAGTCCATGTCTTGGAAAATTGGAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGAAAGAAGGCCATGAACATACCTCTCCAGCATTGTCTCTGAACACTTTGGGTGGCCCAGGGCAGTGTAGATCGTGTGATCATATCTTACAGAAGTGCTCCCATGCTAGTAAAAGAAGATAGCTGATTATTGCCACAAACATACAGTTCCTGTTCAGGCCCTTTTTTTAAGCAGATGGGAGTTGCTATAAACCATAAGTTATGTCAGACTGACATTAAGGGCCCTAGGTTGACTTTTGTTCT--------- - -a -s mr.mrrefChr5 136173 27 + 294542 AACATTGACTTTTATTCTACTCTAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285095 27 + 636262 AACATTGACTTTTATTCTACTCTAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 273520 24 + 647215 ---ATTCACTTTTATTCTACTCTACGG - -a -s mr.mrrefChr5 136200 257 + 294542 AACTTCTTCCAAGTGCCACTGCTATCAGCTAGTGCCTTACCTTGTGATTGCCAGAACATCAGTCTACACTCACAGAATGTCTCCTGTAACCAAATTAACAAAATTAACCTTAACAAAACTAACCTTACTGAAGGTCCTTAGTCTCTTTTATGTGTTTAACATGCAGTTAACAACTTGTTAGCTTACAATTGTTGGACACAATAATATTGCCAGTGTAACCCATTCAAGTCATATAATTTGTTGTCTCATCAGCCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285122 242 + 636262 AGCTTCTTCCAAGGGCCACTGCTATTAGCTAGTGCCTTACCTTGAGATTGCCAGAACATCAGTCTACACTCACAGAATGTCTCCTGTAGCCAAA---------------TTAACAAAACTAACCTTACTGAAGGTCCTTGGTCTCTTTTATGTGTTTAACATGCAGGTAACAACTTGTAAGCTTACAACTGTTGGATACAATGATATTGCCAATGTAACCCATTCAAGTCGTATAATTTGTTGTCTCATCAGCCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 273549 252 + 647215 AACTTCTTCCTAGTGCCACTGCAATCAGCTAGTGCCTTACTTTGTGACTGCCAGAACATCTGTCT---CTCACACAATGTCTCCTGTAACTAAATTAACAAAATTAACCTTAACAAAATTAACCTTACTGAAGGTCCTTAGTCTGTTTTATGCGTTTAACATGCAATTAACAGCTTGTTA--TTACAATTGTTGGACACAACAATATTGCCAGTGTAACCCATTCAAGTCATATAGTTTGTTGTCTAATCAGCCAAC - -a -s mr.mrrefChr5 136457 4 + 294542 TACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285364 4 + 636262 TACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 273802 4 + 647215 TACT - -a -s mr.mrrefChr5 136461 13 + 294542 AACTGATGTAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285373 13 + 636262 AACTGATGTAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 273806 13 + 647215 AACTGATGTAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 136474 212 + 294542 AATTGACCATTCTAGCTAACTTGATGGTTTCAATCCGGGTAAGGTCATAGGTCAACAGTAGTGGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGGTGGGAAATGCAACTGAGAATGTTAGACGCAACCTAGCCCTAGAAATAAATGGATGAATGAACGGGCAATCTAGAAGTTAACGGATGAACAAACGGACGAAATCATCTCACTATCACCAGGGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285386 212 + 636262 AATTGACCATTCTGGCTAACTTGATGGTTTCAATCCGGGTAAGGTAATAGGTCTACAGTAGTGGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGATGGGAAATGCAGCTGAGAATGTTAGACGCAACCTAGCCCTAGAAATAAGTGGATGAATGAACGGGCAATCTAGAAGTTAACGGATGAACAAACGGACGAAATCATCTCACTATCACCAGGGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 273832 212 + 647215 AGCTGACCATTCTAGCTAACTTGATGGATTCAATCAGCGTAAGGTCATAGGTCAACAGTACTAGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGGTGGGAGATGCAACTGAGAATGTAAGATGCAACCTAGGCCTAAGAATAAATAGATGAGTAAACAGGCACTCTAGTAGTTAGTGGATGAACAAATGGACAAAATCTTCTGATGATGGACAGTGGGA - -a -s mr.mrrefChr5 136686 81 + 294542 CCAACATCCAAGTATCTGGAGTTTGGTAATTATGGAGACTTGCAGGGCCTTTTAGTAGTCTTACATCAAACTATTAGGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285600 81 + 636262 CCAACATCCAAGTATCTGGAGTTTGGTAATTATGGAGACTTGCAGGGCCTTTTAGTAGTCTTACATCAAACTATTAGGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 274044 81 + 647215 CCAACATTCAGGCATCTGGAGTATGGTAACTATGGACACTTGCAGGGCCTTTTAAATGTCCTATGTCGAGCTATTGGGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 136767 9 + 294542 GTACAGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285682 9 + 636262 GTACAGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 274125 9 + 647215 GTACAGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 136776 43 + 294542 TCCAAAGGATGACAAGAGTAGACCAATACCTTTTAATTGTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285691 43 + 636262 TCCAAAGGATGACAAGAGTAGACCAATACCTTTTAATTGTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 274145 43 + 647215 TTCAAAGGATGGCAAGAGTAGACCAATACCTTTTAATCGTCCT - -a -s mr.mrrefChr5 136819 147 + 294542 ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAGTGCGCAGACCCAAAGGATGTCAAGAGTAGACCAATGCAATAGATTGCGTAGTTAGCAACAGGCAGCTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGAAGGTTGTGTCATCCTGACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285734 147 + 636262 ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAGTGCGCAGACCCAAAGGATGTCAAGAGTAGACCAATGCAATAGATTGCGTAGTTAGCAACAGGCAGCTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGAAGGTTGTGTCATCCTGACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 274190 147 + 647215 ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAATACACAGATCCAAAGGATAGTAAGAATAGACCAATGCAATAGACCACACAGATAGCAACTGGCAACTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGACTGTTACAGCAGCCTGACCTT - -a -s mr.mrrefChr5 136966 133 + 294542 GTCTTCTGAATCAGGCAATATATTAATTTTAATAGAAAGATTTTAAGGTCAGGGGCATCTTATCTTTGCCAAAATGAAGGTTAATGATACATTACAATTTTCAAGTTGCTCAGCTGAGAAGGTTAAGACCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285881 133 + 636262 GTCTTCTGAATCAGGCAATATATTAATTTTAATAGAAAGATTTTAAGGTCAGGGGCATCTTATCTTTGCCAAAATGAAGGTTAATGATACATTACAATTTTCAAGTTGCTCAGCTGAGAAGGTTAAGACCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 274341 133 + 647215 GTCTTCTGAATCAGCCAATATATTAATATTCACAGAAAGATTATAAGGTCAGGAGTATCTTACTTTTGCCAAACTGAAGATTTACTGAACATTACAAGTTACAAGGTGCTCAGCTGAGAAGGCTAAGACGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 137099 170 + 294542 CAAGTCCAGCACTTTATTTTGTTTAGGCACTGGACTCTTCATAGCCACTAGAGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAACTCCTCCGCTATCAGTATCTTCATCTACAGGTCCAGTCCTTCAATCGTCTTTCCATCAGGACCCTCATTGTGGACACAGGCGCAGATTCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286031 170 + 636262 CAAGTCCAGCACTTTATTTTGTTTAGGCACTGGACTCTTCATAGCCACTAGAGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAACTCCTCCGCTATCAGTATCTTCATCTACAGGTCCAGTCCTTCAATCGTCTTTCCATCAGGACCCTCATTGTGGACACAGGCGCAGCTGCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 274474 170 + 647215 CAAGCCTAGCATTTTGTTTCATTTGGGCAGTGGGCTCTTCATAGCCACCTGTGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAATTCCTGCTCTATCAGTATCTTCACCTACTGGATCAGTCCTTGAATTTTTTCTCCATCAGGGCCCTCATTGTGGACTCAGGCCCAGAGTCCCC - -a -s mr.mrrefChr5 137269 32 + 294542 TAAATTCCAGATGCTTAAGGATCAGGTCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286204 32 + 636262 TAAATTCCGGATGCTTAAGGATCAGGTCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 274644 32 + 647215 TAAATTCCAGATGCTTAAGGATCAGGTCTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 137301 97 + 294542 GATATCTGATGCACAATAATTTTCTATCAACCTAATTTCCTATCCACTGTCTCAATGATCTCTTTAGATCTGGATATGTGAAATCTTAGTTACAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286264 97 + 636262 GATATCTGATGCACAATAATTTTCTATCAACCTAATTTCCTATCCACTGTCTCAATGATCTCTTTAGATCTGGATATGTGGAATCTTAGTTACGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 274676 29 + 647215 GAAATCCT--------------------------------------------------------------------TGTGAAATCTTTGTTACAACG - -a -s mr.mrrefChr5 137398 15 + 294542 CAAAGGGATCACTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286362 15 + 636262 CAAAGGGATCACTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 274705 15 + 647215 TAAAAGGATCACTAA - -a -s mr.mrrefChr5 137413 256 + 294542 TAGGTTACTATCCTCCAAGTGACTGTATGGACTTCAAATAACCAATTAGTTAACGGGTCAAGTGTTCAAAATTTTCAGACTCCAACTGCCATGGCAATTCTGCTGACATACCTCCATGCACATTCAAGGAACTCAAGGCGTCTGATGGCCATACAATTAAATCATGGCTTGGAAAATTCTACTTCCTGCAACTTCAAGAAAGGCCTTGAACCCGATTAATAAGTACCCCACAAACCCACCTTTACTTGCCACTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286396 254 + 636262 TAGGTTACTATCCTCCAAGTGACTGTATGGACTTCAAATAACCAATTAGCTAACAGGTCAAGTGTTCAGAATTTTCAGATTCCAACTGCCATGGCAATTCTGCTGGCAAACCTCCATGCACATTCAA--AACTCAAGGCATCTGATCGCCATACATTTGAATCATGGCTTGGAAAATTCTACTTCCTGCAACTTCAAGAAAGGCCTTGAACCCGATTAATAAGTATCCCACAAACCCACCTTTACTTGCCACTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 274720 224 + 647215 TAGGT--------------------------------ATAACCAATTAGTTAACGGGTCAAATGTTCAAAGTTTACAGACTCCCACTGCCATGCAAATTCCGCTGACATACCTCAATGCACACTGAAGGAACTCAAGGCGTATGATGGCCATACAATTAAATCACGGCATGGAAAATTCTTCTTCCTGCAACAGCAAGAAAGGCCTTGAACCCATTTAGGAAATACCCCACAAACTCGCCTTTACTCACCACTATC - -a -s mr.mrrefChr5 137669 58 + 294542 TTCCCTTACTTGGTTCCCTTACAATCACCCCTATGTAATGCAATCAATCAAAGTGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286650 58 + 636262 TTCCCTTGCTTGGTTCCCTTACAATCACTCCTATGTAATGCAACCAATCAAAGTGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 274948 56 + 647215 TTCCTTTACTTGGTTCCGTTACAATCACC--TATATAATGCAATCGATCAAGATGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 137727 13 + 294542 AGGGACATCACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286710 13 + 636262 AGGGACATCACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 275004 13 + 647215 AGGGACATCACTG - -a -s mr.mrrefChr5 137740 357 + 294542 TGTCTGAGTTGAGCATTGCAACTTGATAACAATTTCTTACAGTACATACTCTCCTAGACATCAAACATAAGACAAGACTGCCACACACATTCACTATACAGTACCTGTTCTGCTCCCAAAACAAGGGTTATGGTTACCAGAGGTTTTTATAAAAAATTGTCTTCTGAATCTGGAATTTATGCCCTGCTCCACATACCTATTTACTAGATGGTACCAGGCTTCACCAGTAATCCCTGTTGTAGGCTCCCAGTGAAATATCTAGTCTTGGTATTTTATAACTGTCTAATAAGGGATAGTTCAACCCAGAGTCGCAGCTTATTACAGTCATTTCGAGAAGCCATCCACTGGTAAATTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286724 328 + 636262 TGTTTGAGTTGAGCATTGCAACTTGATA--------------------------TAGACACCAAACACAAGACAAGACTGCCACACACATTCACTATACAGTACCTGTTCTGCTCACAGAACAAGGGTTATGGTTACCAGACATTTTTATAAAAAATTGTCTTCTGGATCTGATATTTATGCCCTGCTCCACATACCTATTTACTAGATGGCACCAGGCTTCACCAGTAATCCCTGTTGTAGG-TCCCAGTGAAATCCCTAGACTTGGTATTTTATAACCGTCTAATAAGGGATAATTTAACCCAGAGTCGCAGCTTATTACAGTCA--TCGAGAAGCAGTTCACAGGCAAATTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 275017 357 + 647215 TGTCTGAGTTGAGCATTGCAACCTGATAACAATTTCTTACAGTACATACTCTCCTAGACATCAAGCATAAGACCAGACTGCAACACAAGTTCACTAAACAGTACCTGTTCGGCTCCCAAAACAAGGGTGATGGATACTAGAGGTGTCCATAAAAAATTGTCTGCTGAATCTGGAATTTATGCCCTGCTCCACATCCCTATTTACTAGATGGTACCAGGCTTTGCCAGTAATCTCTGTTGTAAGCTCCCACTGAAATATCTAGTCTTGGTATTTTATCACTGTCAAATGAGGGATAGTTCAAACCAGAGTTGCAGCTTAGTACAGTTCTTTTGAGAAGCCACCCACTGGTAAATTGCA - -a -s mr.mrrefChr5 138097 119 + 294542 TAGAATACTAAGCTCACAGACCTGAAGAAGTTCATAGTACTTGGTAGAGATAATAGGCTGCTTCTATAACTAACATATAGCTTACGGTTAGCATACCAAGGGTATTCCTGAGTCCTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287053 118 + 636262 TAGAATACTAAGCTCACAGACTTGAAGAAGTTCATAGTACTTGGTAGAGATAATAGGCTGC-TCTGTAACTAGCACATAGCTTACAGTTAGCATACTAAAGGTATTCCTGATTCCTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 275374 119 + 647215 TAGAATACTAAGCTCACAGACCTGAAGAGGTTAATAGTACTTGGTAGAGATAATGGGCTACTTCTATAACTAACATATAGCTTACGGTTAGCATACCAAGGGTATTCCTGAGTCCCAGT - -a -s mr.mrrefChr5 138216 104 + 294542 AAAGAAGTGGAATATGACATCCAACTGATCTTATCTGTCAAGTGAGATGAGATCACTTGGATGTCATGTTCTACTTCTTTACTAAGACTGAGGGATACCCTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287174 104 + 636262 AAAGAAGTGGAATATGACATCCAAGTGATTTTATCTGTCAAGTGAGATGAGATCACTTGGATGTCATGTTCTACTTCTTTACTAAGACTGAGGGATACCCTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 275493 104 + 647215 AAAGAACTTGAATATGACATTCAACTGATCTTATCTGTCAAGTCAGATGAGATCACTTGGATGTTCTACTCTGCTTCTTTACTGAGACTCAGGAATACCCTTAG - -a -s mr.mrrefChr5 138320 25 + 294542 ATGCTAAGGCTAAAAGCTTATGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287278 25 + 636262 ATGCTAAGGCTAAAAGCTTATGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 275598 25 + 647215 ATGCTAACTCTAGAAGCTCAACCCA - -a -s mr.mrrefChr5 138345 118 + 294542 CACGCCAACCTCCCTAATGGAGGGGCTTGTGTTATTGTGGTGGCTCTGCACTGACTAAACATGAGCACAACTATGTGCCAGTTATAGAAGCCTATTATCTCTAACAAATGCTATTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287303 118 + 636262 CACGCCAACCTCCCTAATGGAGGGGCTTGTGTTATTGTGGTGGCTCTGCACTGACTAAACATGAGCACAACTATGTGCCAGTTATAGAAGCCTATTATCTCTAACAAATGCTATTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 275627 118 + 647215 CGTGCCAAACTCCCAAATGGGGGGGCTTGTGTTATTGTGATGGCTCAGCACTGGCTAAACTTGAGCCCAGCTATGTGCCAGTTACAGAAGCCTCTTTTCTCTACCAAACGCTGTTAAC - -a -s mr.mrrefChr5 138463 14 + 294542 AAGTTTCTACCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287441 14 + 636262 AAGTTTCTACCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 275745 14 + 647215 GAGTTTATACCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 138477 60 + 294542 CGCGTCCCACAGCAACATGAGTATTATACCCAACATCTATCTGGGTGAGTTATGGTTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287462 60 + 636262 CGCGTCCCACAGCAACATGAGTATTATACCCAACATCTATCTGGGTGAGTTATGGTTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 275759 60 + 647215 CATGTTCCACAGCTATATGAGTATTACACACGACGCTTATTGGGGTGAGTTATGATAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 138537 69 + 294542 AAGGATTTGGAGTGTAAGTTTTCAGCAACACAGACGACGTAGGCCTATTTCACTCATAATCAAGCAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287522 69 + 636262 AAGGATTTGGAGTGTAAGTTTTCAGCAACACAGACGACGTAGGCCTATTTCACTCATAATCAAGCAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 275821 69 + 647215 AAGCATTTGGAGTCTAGGTCTTCAGCAACACAGGAGATGTAGGCTTATTTCACTTGTAATCAAGCAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 138606 28 + 294542 ATAATGTAGGTCGAAATCATTAGGACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287591 28 + 636262 ATAATGTAGGTCGAAATCATTAGGACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 275987 28 + 647215 ATAATGTAGGTTGAAATTATTAGAACAC - -a -s mr.mrrefChr5 138634 66 + 294542 AAAATAGTCATATATATTTAGTACCATGAAAATATCCCCATGATGATGACCAAGCTTGTTTTTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287621 66 + 636262 AAAATAGTCATATATATTTAGTACCATGAAAATATCCCCATGATGATGACCAAGCTTGTTTTTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 276015 66 + 647215 AAGATAGTTATACATATCTAGTACAATGAAAGTATCACCATGATGGTGACCGAGCCTGGTTTTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 138700 124 + 294542 CTTGTGGGGAGAATAATTAGCACATACTTGTGGACAATTAAGGTATGCCCTACCCATTATCGCATATTTTCTGGCTGGGGGATGGAGACTCTACTCATCTTATTCATCCTCTCTGTGACTCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287692 124 + 636262 CTTGTGGGGAGAATAATTAGCACATACTTGTGGACAATTAAGGTATGCCCTACCCATTATCGCATATTTTCTGGCTTGGGGTTGAAGACACTACTCATCTTATTCAACCTCTCTGTGACTCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 276081 124 + 647215 CTTGTGAAGAGAATAATTAGCTCATACTCATGAACAATCAAGGTATGCCCCACCCATTATTGCATATTTTCTGGCTGGGAGATGGAGACTCTACGCATCTTATTCATCCTCTTTATGACTCCCT - -a -s mr.mrrefChr5 138824 430 + 294542 CCTTCATGATAGTTCCCATTACCTAACAGCTTTGCAGCATAGTAAGTTTAAAACTTTCATGCTCTTTACCACCTCTACTAGCTCCATCCAGCATATTTTGAGGGCAGCAGATCATGGAGGGACAAGTACATTAGGTGATCAAGTGGTGACTTCAAACAAGATCAGTTGGGTTGGAAATTTTCTGAGGGCAAGGTGCTTCTGTCATCTGCATCCTAGTCCCTTGGCCCCACATGTGAGTAAGGTGCCCACAATCATCTGATCTAGGAGTCTGTCTTCTGGATCTGAAGAGGATAGCCTAAAGTATATCATAGAGAAAGGGTCACTGTGGAGGGGAAATGTAAGCACTTCTGGTTGCTGCAGATGGTGTGCATAGGAACAGCAAACTTCAATAATGCTCTTGCTTTTTCCTTGTCATCTATAAAGAAGATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287816 430 + 636262 CCTTCATGATAGTTCCCATTACCTGACAGCTTTGCAGCATAGCAAGTTTAAAACATTCATGCTCTTTACCACCTCTACTAGCTCCATCCAGCATATTTTGAGAGCAGCAGATCATGGAGGGACAAGCTCATTAGGTGATCAAGCGGTGACTTCAAACAAGATCAGTTGGGTTGGAAATTCTCTGAAGGCAAGGTGCTTCTGTCATCTGCACCCTAGTCCCTTGGCCCCACATGTGAGTAGGGTGCCCACAATCATCTGATCTAGGAGTCTGTCTTTTGGATCTGAAGAGGTTAGCCTAAAGTATATCATAGAGAAAGGGTCACTGTGGAGGGGAAATGTAAGCACTTGTGGTTGCTGAAGATGATGTGGATAGGAACAGCAAACTTCAATAATGCCCCTACTTTTTCTTTGCCATCTATAAAGAAGATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 276206 428 + 647215 CCTTCATGATAGTTCCCACTACCCAACAGCTTTGCAGCATAGTAAGTCTAAAACTTTCATTCTCTTAACCACCTCTACTAGCTCCATCCAGCATATTTTGAGGGC--CAGATCATGGAGGGATAAGTACATTAGGTGATCAAGTGGTGACTTCAAACAAGATCTGCTGGGTTGGAAAGTTTCTGAGGGCATGGTGCTTCTGTCATCTGCATCATGCTCCCTTGGCCCCATGTATGAGTAAGGTGCCCACAATTATCTGATCTAGGAGTCTGTCTTCTGGATCTGAAAAAGATAGCCTACAGTATATCATAGAGAAACGGTCAATATGGAGGGGAAATATAAGCACTTCTGGTGGCTGCAGATGGTGTGCATAGGAACAGCAAACTTCAATAAAGCTCTTGCTTTTTCCTTGTCATCTAAAAAGAAGATAC - -a -s mr.mrrefChr5 139254 104 + 294542 AGAGACATTTTATGTAGTTAAGGTAAGGCATGTCAGAGCCCCTTTGAAGGAATATCCTCTGCGATTTATTTTCACTTGTAGACCACCCATGTTTAACTATCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 288246 104 + 636262 AGAAACATTTTATGTAGTTAAGGTAAGGCATGTCAGAGCCCCTTTGAAGGAATATCCTCTGCGATTTATTTTCACTTGTAGACCACCCATGTTTAACTATCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 276668 104 + 647215 AGGGAGATTTTATGTAGCTAAGGTAAGGTATGTCAAAGCCTCTTCTGAGGAATATCTTCAGCAATTTATTGTCACTTGCAGTCCACCCTTGTTTAATTATCACT - -a -s mr.mrrefChr5 139358 22 + 294542 AAAGTGGGCCTTGTTACCAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 288394 22 + 636262 AAAGTGGGCCTTGTTACCAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 276772 22 + 647215 AAAGTGGGCCTTGTTTTCAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 139380 98 + 294542 ATTCCAGCCTCGGAATTCTGGAGTTAAAACCTGGCTAGGGTTCATCAACCAATGAAGTACCCAATCTAGGTCCTTTGCTACAATAGTACTCTAGGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 288543 15 + 636262 ATTCCAGCATCATAA----------------------------------------------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 277062 97 + 647215 -TTACAGCCTGGGAATTCTGGAGTTAAAACCTGGCTAGGGTTCATCAACCAATGAAGTACCCAATCTAGGTCCTTTGCTACAATAGTACTCTAGGATG - -a -s mr.mrrefChr5 139478 186 + 294542 TGGTTTAAGTGGCTGTTGGCATTTCCTCCAATCAACTAATATATTGAGTACTATGTGTTGTCAAGCGTGTCATAGTGCCGGGCCTTTCTGATTAATGCGATTCTCTTGACAAGAATACAAAGAAGTCTGAATCCTGAATACCAGGTGCTTGGTGACTATCAGATTTTAGCTGCCACAATTACAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 288558 163 + 636262 -------------------CGTTTCCCCCAATCAA--AATATGTTGTGTACTATGTGTTGTCAAGCGTGTCATAGTGCCGG-CCTTTCTGATTAATGCGATCCTCTTGACAAGAATACAAAGAAGTCTGAATCCTGA-TACCAGGTGCTTGGTGACTATCAGATTTTAGCTGTCATGATTACAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 277165 186 + 647215 TGGTTTAAGTGGCTGTTGGCATTTCCTCCAGTCAACTAATATACTGAGTACTATGTGTTGTGAAGCGTGTCATAGCACAGGGCCTTTCTGATTAATGTAATTTTCTTGACAAGATCACAAAGAAGTCTAAATCCTGAATACCAGGTCCTTGGTGACTATGAGATTTTAGCTGCCACAATTACAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 139664 358 + 294542 GGGTGGAATTGGACAGGGGATCTACAATGTACATCGGGGGTTCCGGTCACATCTCATCAAGTAGGGGTGAGGAAGAATGATAAACTAGGGGCCCTTTGTAGTGGGTTTTTTCATAGAACCTGATACTTGTTAGGTATTCCGAGAGAGTAGCAAAGTGAATGGTTCAAACCCTGTAGAACTTTCAAAACCATGGAGAGTGTCACTTTACAAACATGGCCCGAGTAATTTTAACATGTCAGTACACACCTACATTTGGTTCATTATGTTTTATTGGGGAACCCTTCTAAGGGACTCTCAGGGCCAGGGAAACAATTCAGGAAATATGTTCTAACCCCACCTCGATGCTCCGACATACCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 288721 342 + 636262 GGGTGGAATTGGACAGGGGATCTACAATGTACATCGGGGGTTCCGGTCACATCTCATCAAGTAGGGGTGAGGAAGAATGATAAACTAGGGGCCCTTTGTAGTGGGTTTTTTCATAGAACCTGATACTTGTTAAGTATTCCATGAGAGTATCAAAGTGAATGGTTCAAACCCTGTAGAACTTT----------------GTCACTTTACAAACATGGCCTGAGTAATCTTAAGATGTCAGTACACACCTTCATGTGGTTCATCATGTTCTATTGGGGAACCCTTCTAAGGGACTCTCAGGGCCAGGGAAACAATTCAGGAAATATGTTCTAACCCCACCTCGATGCTCCGACATACCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 277363 358 + 647215 GAGTGGAAACAGACAGGAGATCTATAATGGACATGGGGGGTCTCCTTGACATCATGTCAAGTCGGGGTGAGGAAAAGTGATGAACTAAGAGCCTATTGTAGTGAGTTTTTTCACAGACCCTGATACTTGTTCGGTATTCCGAGAGAGTAGCAAAGTGAATGGTTCAAACGCTGTAGAAGGTTCAAAACCATGGAGAGTGTCACTTTACAAACATGGCCCAAGTTATTCTGACATCTCAGTACACACCTACATTTGGTTCATTATGTTTTATTGGGGAACCCTTTCAAGGTAGTCTCAGGACCAGGGAAACAAATCAAGGAATGTGCTCTAATCACACCTCAACGCGCTGCCACATCTA - -a -s mr.mrrefChr5 140022 405 + 294542 ATATTCAACAAATCCCAACCAGAAAGGTGATGCCTGAAAGATACCCTCATCCTTTAGATCACAGATGAACTCTCTATCAATCTAAGTCCATTTTCTAATCAATGAAGATCTCAGGTCACAGAAGTGAGCATAGAATTGCTACTTTGCCCTCAAAAGTTGGTCTGGACCCTTAGATTCCTGTTTCAATACATAGCATCTATCAAGTGTCTCAACACAATTTGCCACCATCGAATCCATCAACCAGGCAACAACATTCTGAAGGTCACGACTAGTCTTTGAACTCATCCACCCAAGGGAGCACCCTACATTTCCACTGTCTTATGGCACCTGAGTTGAGAGCTGGACAATAGCCACAGAATTTAGCTAGCATGCTCTGTTAAGTTGTGAATGAGATTAAAGTAGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 289064 366 + 636262 ATATTCAACAAATCCCAACCAGAAAGGTGATGCCTGAAAGATACCCTCATCCTTTAGATCACAGATGAACTCTCTATCAATCCAAGTCCATTTTCTAGTCAATGAAGATCTCAGGTCACAGAAGTGAGCATAGAATTGCCACTTTGCCCTCAAAAGTTGGTCTGGACCCTTAGATTCCTATTTCAATGCATAACGTCTATCAAGTGTCTCATCACAATTTGCCACCATCGAATCCATCAACCAGGCAACAACATTCTGAAGGTCACGACTAGTCATTGAACTCATCCACCCAAGTGAGCACCCTACATTTCCACTGTCTTATGGCACCTGA---------------------------------------GCTCTGTTAAGTTGTGAATGAGATTAAAGTAGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 277721 405 + 647215 ATATTCAATGAATCCCAGCTGGAAAGGTGATACCTGAAAAGACCCCTCATGCTTTAGATCACAGATGAACTCTCTATCAATCTAAGTCCATTTTCTAATCAAAGAAGATTTGTAGTCACAGAAGTGAGCATAGAATTGCTACTGTGCCCTCGTAAGTTGGTCTGGACCCTTAGATTCCTGTTTCAACACATAGCATCTATCAAGTGTCTCAACACAATTTGCCTCCATCAAATTCATCTACTAGGCAACAACACTCTGGAGGCCAAGACTAGTCTTTGAACTCACCAACCCCAGGGAGCATCCTACATTTTCGCTGTCTTATGGCACTTGAGTTGAGAGCTGGACAATAGCCACAGAATTTAGCTAGCATGCTCCATTAAGTTGAGAATGAGTTTAAAGTAGTCT - -a -s mr.mrrefChr5 140427 104 + 294542 TATCTGTATAATTTGGTTAGATAGAATGGAGTAGGAAGTGTGTCAGATAAGTAACATTGCCAGTTGTGTATATAAAATTCTGTCAAATAGGGTAGGCTCATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 289430 104 + 636262 TATCTGTATAACTTGGTTAGATAGAATGGAGTAGGAAGTGTGTCAGATAAGTAACATTGCCAGTTGTGCATATAAAATTCTGTCAAATAGGGTAGGCTCATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 278128 104 + 647215 GATCTGTATAATTTGGTTAGAGGGAATGGAGTCGGAAATGTGTTGAATAAGTAACTTAGCCAGTTGTGTATATAAAATTCTATCAAATAGGGTAGGCTCATTCA - -a -s mr.mrrefChr5 140531 252 + 294542 ATAATTGAATTTCTGTTCCTGATTTGCAAGAGAGGAAGTTTAATATCATCCCATACACTGTTAGGAATCTCCCTAATAGGAGGATGCTGTACCTTTATTGATTGATGTCATCCATGCTTTCTTTGCTTTTAGCTTGTATCCTTGTTGAAAATTGCTGATTGTTTATAGAACTCTCCTTTATCAAGTCACCAGTGGCCACCAGAAGTTAACAGGTAAGCTATGAGTGTCTGATTTTAGTACCATACCCCTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 289680 252 + 636262 ATAATTGAATTTCTGTTCCTGATTTGCAAGAGAGGAAATTTAATATCATCCCATACCTTGTTAGGAATCTCCCTAATAGGAGGATTCTGTACCTTTAGTGATTGATGTCATCCATGCTTTGTTTGCTTTTAGCTTGTATCCTTGTTGAAGATTGCTGATTGTTTATAGAACTCTCCTTTATCAAGTCACCAGTAGCCACCAGAGGTCAACAGGTAAGCTATGAGTGTCTGATTTTAGTACCATACTCCTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 278232 250 + 647215 ATAATTAAATTTCTGTTCCCGATTTGCAAGAAAAGAAGTTTAATATCATCCCATACACTGTTAGGAATTTCCCTAATGGCAGGATGCTGTACC--CATTGATCGATGTCATCCATGCTTTCATCGCTTTTAGTGTGTATCCTTGTTGAAAATTGCTGATTGTTCATAGAACTCTCCTTGATCAAATCACCAGTGGCCACTAGAAGTTAACAGGTAACCTATGAGTGACTCATTTTAGCGCCATACCCTTCCT - -a -s mr.mrrefChr5 140783 163 + 294542 TTTATCTCTTCGTTGTGTGAGGAAGATCTGACCCCAATACTAATATAGCAAAAAGGATATTGGACAGCTATATAATGATCTGGTTCTGTTTAATGGAGCACACTTTTAGTATGCACACAAGTGGAATTAGGGTTTATCAGATGATGCTAGGCCAACACTGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 289933 162 + 636262 TTTTTCTCTTTGTTGTGCAAGGAAGATCGGACCCCAATACTAATATAGCAGAAAGGATATTGGAAAGCAATATAATGATCTGGTCCTGCGTAATGGAGCACACTCTTAGTATGCACACAAGTGGAATTAGGG-TTATTAGATGATGCCAGGCCAACACTGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 278482 156 + 647215 TTTATCTCTTCATTGTGTGAGGAAGATTT-------AGACTAATATAGCCAAAAAGATATTGGACGGCTACATATTGGTCTGGTTTTGTTTAATGGGGCACACTTTTAGTATACACACAAGTGGAATTAGGGTTTATCAGATGATGCTATGCCAGTACTCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 140946 199 + 294542 TAAATTCTTCCCAATACCCAATTCATAAAGGTCACCCCCATATAATGCTCTTCCCTTGCCTCGGTGGGCTAATTGCACAAAGATATAGAATCATCTAGATTTCTCAGCTTTAAGTTTACTCAACCATCTGGACATTCACACTTAACAGCAAACTCATAGGTAATCCCCAGTCTCATTTAGATGCTTTAACTGATGAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290095 190 + 636262 TAAATTCTTCCCAA---------CATAAAGGTCACCCCCATATGATGCTCTTCCCTTGCTTGGGTGGGCTAATTGCACAAAGATATAGAATCATCTAGATTTCTCAGCTTTAAGTTTACTCAACCATCTGGACATTCACACTTAACAGCAAACTCATAGGTAATCCCCAGTCTCATTTAGATGCTTTAACTGATGAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 278645 199 + 647215 TAAATTCTTCCCAATACCCAATTCATAGAGGTCCCCCCCATATAACGCTCTTCCCTTGTCCCGGTGGGCCAATTGCACAAAGATATAGAATCATCTAGATTTCCCAGTTCTAAGTCTACTCAACCACCTGGACATTGACACTCAACAGCCAACTCATGGTTAAACACCAATCTCTTTCAGATGCTTTAACTGGCAAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 141145 25 + 294542 TTCATCGGAACTATTCAACATATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290286 25 + 636262 TTCATCGGAACTATTCAACATATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 278844 25 + 647215 TTCATTTGAGCTATTCAACATATTA - -a -s mr.mrrefChr5 141170 20 + 294542 TCGGGTATGCATATTATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290312 20 + 636262 TCGGGTATGCATATTATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 278869 20 + 647215 TCAGTTATGCTTATTATTCA - -a -s mr.mrrefChr5 141190 96 + 294542 ACTTAAAGGTGGTATTGTTCTTGGGCTGAGGTGTTTATGCAGTTGCCCTTGCGTATGGATAAGTAAACCAATTTCTAAAGAGAGGAAGTTTGCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290342 96 + 636262 ACTTAAAGGTGGTATTGTTCTTGGGCTGAGGTGTTTATGCAGTTGCCCTTGCGTATGGATAAGTAAACCAATTTCTAAAGAGAGGAAGTTTGCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 278889 96 + 647215 ACTTAAAGGCAGTATTGTCCTTGAGGTGAGGTGTTTATGCAGTAGCCCTTGGGTATACATAAGTTGACCAATTTCTAAAGTGGGAAAATTTGTCAT - -a -s mr.mrrefChr5 141286 11 + 294542 CTCTTCTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290444 11 + 636262 CTCTTCTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 278985 11 + 647215 CCCTTCTGTAC - -a -s mr.mrrefChr5 141297 6 + 294542 AAGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290459 6 + 636262 AAGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 278996 6 + 647215 AAGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 141303 34 + 294542 AATAGAGAAATCAGGTTAATCCCTTGTTAAACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290465 34 + 636262 AATAGAGAAATCAGGTTAATCCCTTGTTAAACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 279009 34 + 647215 AGTAGAGAATTCAGGTTAATCCCTTGCTAAATCC - -a -s mr.mrrefChr5 141337 8 + 294542 TTAAAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290500 8 + 636262 TTAAAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 279043 8 + 647215 TTAAAGAT - -a -s mr.mrrefChr5 141345 24 + 294542 TGCCCTAAATTTACTATCTTCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290508 24 + 636262 TGCCCTAAATTTACTATCTTCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 279052 24 + 647215 TGCCCTAAATTTACCATCTTCACA - -a -s mr.mrrefChr5 141369 14 + 294542 TGTCCCATTAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290532 14 + 636262 TGTCCCATTAGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 279077 14 + 647215 TGTGCCATTGGTAA - -a -s mr.mrrefChr5 141383 16 + 294542 TTAATTGAGAATAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290546 16 + 636262 TTAATTGAGAATAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 279177 16 + 647215 TTAACTGAGATTCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 141399 35 + 294542 ACTGATGGATTGTCTATTAAATGATGCCCATCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290562 35 + 636262 ACTGATGGATTGTCTATTAAATGATGCCCATCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 279196 35 + 647215 ACTGATGGATTGTCTATTAATTGACACTCTTACTG - -a -s mr.mrrefChr5 141434 52 + 294542 ATTGAACTTTGGTAGTGTTAATAGGTCTGACCCTACAGTTCGCACCCTAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290597 52 + 636262 ATTGAACTTTGGTAGTGTTAATAGGTCTGACCCTACAGTTCGCACCCTAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 279236 52 + 647215 ATTCGACTGTGGTAGTGTTAATAAGTCTGACCCTACAATTCACACCCTAATA - -a -s mr.mrrefChr5 141486 4 + 294542 TCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290650 4 + 636262 TCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 279288 4 + 647215 TCAA - -a -s mr.mrrefChr5 141490 38 + 294542 ACTACAAGAGCTCTAGTCTAAGAGCTAAAGTGAATCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290654 38 + 636262 ACTACAAGAGCTCTAGTCTAAGAGCTAAAGTGAATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 279317 38 + 647215 ACTAGAAGAGCTATAGTCTAAGAGCTAAAGTGAATCCA - -a -s mr.mrrefChr5 141528 45 + 294542 TGGGCTAGATATTCTGGATTCAGTGGTTTTACCAAAGATTTAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290692 45 + 636262 TGGGCTAGATATTCTGGATTCAGTGGTTTTACCAAAGATTTAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 279356 45 + 647215 TGAGCTAGATATTCTGGATTCATTTATTTTACCAAGGATTCTACT - -a -s mr.mrrefChr5 141573 101 + 294542 AAATTAGTCTTTGCTTTTTCGATTTATAGTACTAGACCATTTGGCTAACCTGACATGAGGTAGACATCCTTATATAGGGTCAACCCAGGTGTGCATGGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290740 101 + 636262 AAATTAGTCTTTGCTTTTTCGATTTATAGTACTAGACCATTTGGCTAACCTGACATGAGGTAGACATCCTTATATAGGGTCAACCCAGGTGTGCATGGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 279401 101 + 647215 AAATTAATCTTTCATTTGTCAATTTTTAGTACTAGACCATCTGGCCAACTTGACATGAGGTGCACAGCCATATATAGGATCAACCTATGAGTGTGTGAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 141674 7 + 294542 CAGAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290842 7 + 636262 CAGAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 279502 7 + 647215 CAGAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 141681 57 + 294542 TTCTCCTCAGATTTTAGCATCTTCCACAAAGCTTGCATTTTATTAATTTCATGCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290850 57 + 636262 TTCTCCTCAGATTTTAGCATCTACCACAAAGCTTGCATTTTATTAATCTCATGCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 279509 53 + 647215 TCCCCCTCAGAGTTTGGGACCTTCC----AGCTTGCATTTTATTAATTTCATTATGT - -a -s mr.mrrefChr5 141738 620 + 294542 TTAACTACAGCTATGTCTAGGAGAATGTGTAAATACCTATCCTCGTGGTTTGGGCAATCTCTGCAACATGACCCAATTGGCTTTGCTGTGGCTGTTTATGGGCATTAGTTGAATAGGTCTAACTAGACACACCCAAATGGACCTGAGTATGATCTGAGGGCTGGGGTTGATTTCGCATGTCCGCATATGCCGTGTCAAATTGCACCTTCATCTTTGGTTTTTTAATTTATTATGGACCCATTATTCCGCCTTGAGTCTTAAAATGCTAAAATGGAGTGTACTTAGCTTTGTGACTGATTTGTGATGGCTCCTGTGGTTTTTTAAAATTATAAAGGAAGGCATCATTGTAACAACATGCCATGGCCTTAGAATAAGGATCCCGCTGGTTAACAAAAATGAACCCAGACCCTCTTTTTCTGCTCAAATGAAAAAATTAGCATTAGAAGAGGATCACATAAGCAAGCATCTGATTGAGTCTAATTTTTTTCATTTGCTTTGCATATCCTCTCTTTTCTATGGTTTGCATCACCTTGGGGAATTTTTGTTAACTCAGGGCCTCATTAATATATGATACTCAGGACATCCTATGCTTCTGCCATATTATGCCCTAATCTGCTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290907 594 + 636262 -----------------TGGGAGAATGTGTAAGTACCTATCCTTGTGGTTTGGGCAATCCCTGCAACACGACCCAATTGGCTTTGCTGTGGCTGGTTATAGGCATGACTTGAATAGGTCTAACCAGACACGCCCAAATGGACCTGAGTATGATCTGAGGGCTTGGGTTGATTTCGCATGTCCGCACATGCCGTGTCAAATTGCCTCTTCATCTTTGGTTTTTTAATTCATTATGGACCCATTATTCCGCCTTGAGTCTTAAAATGCTAAAATGGAGTGTAATTAGCTTTGTGACAGATTTGTGATGGCTCCAGTGGTTTTTTAAAATTATAAAGCAAGGCATCATTGTAACAACATGCCATGGCCTTAGGATGAAGATCCCGCTGGTTATCAA--------TCAGATCCTCTTTTGCTGCTCAAATGAAAAAATTAGCAACAGCAGAGGATCACATAAGCAAGCATCTGATTGAGTCTAAT-TTTTTCATTTGCTTTGCATATCCTCTCTACTCTATGGTTTGCATCACCTTGGGGAATTTTTGTTAACTCAGGGCCTCATTAATATATGATACTCAGGACATCCTATGTTTCTGCCATATTATGCCCTAATCTGCTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 279566 619 + 647215 TTAACTACAGCTATGTCTAGGAGAATGTGTAAATACCTATTCTCATGGTTTGGGCAATCTCTGCAACATGACCCAATCGGCTTTGCTGTGGCTGTTGATGGGCATTAGTTGAATAGGTCTAATTAGACACACCAAAATGGACCTGAATTTGT-CTGAGGGCTGGGGTTGATTTCGTATGTCCACATATGCTGTGCCAAATTGCACCTTCATCTTTGGTTTTTTAATTTATTATGGACCCATTATTCGACCTTGAGTCTTAAAATACTACAATGGAGTGTACTGAGCTTTGTGACTGATTTGTGATGGCTCCTGTGATTTTTTAAAATTATAAAGGCAGGCATCATTGCAACAACATGCGTGGGCCTTAGAATAAGGTTTGCCCTGGTTAACAAAAATGAACCCAGACCCTCTTTTTCTGCTCAAATGAAAAAATTAGCATTAGAGGAGGATCACATAAGCAAGCATTTGATTGAGTCTAATTTTTTTCATTTGCTTTGCGTATCCTCTCTTTTCTATGGTTTGCATTGACTTGGGAAATTTTTGTTAACTCAGGGCCTCATTAATATATAATACTAAGGACATCCAATGCTCTAACCATATTATGCCCTAATCTGATTAC - -a -s mr.mrrefChr5 142358 8 + 294542 CATTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291501 8 + 636262 CATAATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 280190 8 + 647215 CATTATTG - -a -s mr.mrrefChr5 142366 236 + 294542 ACCGTCCTTTCTGTTGAAGAGTGTTTTCCATCTGAATATCATTCTTGTTCTGACTTGATGTCGTTACATCTTCTCAGACTCCACGAGGGCAATGCTAGAATTGAACATCTCAGGTCCACAAAAGAAGTTGCAACCATCCTTTGTCTCACCTTCAACCCATTTGTGAGGTAGTGTTCTTGCCTGCCTAATATTCTAGGTTAAATACTCTCCTGGTATGTCAGTGAGGGAGATGGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291510 236 + 636262 ACAGTGATTTCTGTTGAAGAGTGTTTTCCATCAGAATATCATTCTTGTTGTGACCTGATGTCGTTACATCTTCGCAGACTCCACGAGGGCAATGCAAGAATTGAACATCTCAGGTCCACAAAATAAGTTGCAACCATCCTTTGCCTTACCTTCAACCCATTTGTGAGGTAGTGTTCTGGCCAGCCTAATATTCTAGGTTAAATACTCTCCTGGTATGTCAGTGAGGGAGATAGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 280198 233 + 647215 ACCGTCCTTTC---TGAAGAGTGTTCTCCATCTGAATACCATTCTCAATCTGACTTGATGTCGTCACATCTTCTCAAGCTCCACCAGAGCAACGTTAGAATACAAGATATCAGGTCCACAACAGCAGTTGGAACCATCCTTTGTCTCATCTACAGCCCATTTATTGGGTAGTGTTCTTGCCTGCCTGATATTCAAGGTTAAATGATCTCCAGGTATGTCAGTGAGTGAGATGGCAG - -a -s mr.mrrefChr5 142602 16 + 294542 AGAGAATCAAAAGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291750 16 + 636262 AGAGAATCAAAGGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 280431 16 + 647215 AGAGAATCACAAGAGA - -a -s mr.mrrefChr5 142618 131 + 294542 GAATCATGTACATTATTTGTTGCTTTGCACTCAAGGAGAAGGACGACATGTGGTCCAAGATATAATGATAATGAATCTGGGCAAATCATGACAGGTTGCATGTTTGTGTTGTGGTTAATTGCAGTAGAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291766 131 + 636262 GAATCATGTACATTATTTGTGGCTTTGCACTCGAGGAAAAGGACAGCATGTGGTCAAAGATATAATGACAATGGATCTGGACAGATCATGACAGGTTGCATGTTTGTGTTGTGGTTAATTGCAGTAAAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 280456 131 + 647215 GAATCATGTACACTATTTGTTGCTTTGCACTCAAGGAGAAGGAAGACATGTGCCCCAAGATATAATGATAATGAATCTGGGCAAGTCATGATAGATTGCATGTTTGTGTTGTGGTTAATTGCAATAGAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 142749 49 + 294542 TCCAGCAACTATTGATCTATGAGGCTCTTAGGTTCCTCTGGTAGCTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291897 49 + 636262 TCCAAAAACTATTGATCTATGAGGCTCTTTGGTTCCTCTGGCAACTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 280588 49 + 647215 TCCTGCAACTATTGATCTTTGAGGCTCTTAGGTTCCTCTGGTAGCTCTT - -a -s mr.mrrefChr5 142798 6 + 294542 GTCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569456 5 - 636262 TAACT- -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291946 5 + 636262 GTCCT- -s simRat_chr6.simRat.chr6 280637 6 + 647215 GTCATA - -a -s mr.mrrefChr5 142804 8 + 294542 TGTCCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291951 8 + 636262 TGGCCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 280643 8 + 647215 TGTCCTGA - -a -s mr.mrrefChr5 142812 462 + 294542 AGTCTTGGTCTGAATTACAGTCCACTCAGATATTGATGTGTTTGCAAATATAATTAATAAGCATGTGCATTTGATATTCATATTGTTATGTTCAACTTTAAAGTGGCATGCCACTGGCAGTATGAATCATGTTCAACACATCTTGGGGGATAAGTTGCATTGATGTAATAACGTTTTATAGGGGGCCATAGCATCACCCATTCCTCACCTAGGACTCTTCTGGGATAAGTGGGCATCTTGCACAGGGGGAATTGTGCTTAAGGCAGAGGAGTTCTGAGGCTGTTTCATCCCACATCATGATCATTCTGAGGGGCAGCATTCCTCTTGAACTGTATGGTTGTTGCTGAAGTGTTGCACATAATACAAGCACAATTGTTCATCTCAGAAATCCCTACTCAGTAGTTTCCAGCACACCCAATATAGGATTGCATAACAGATAATCCTTTGTTTACTTTCAGTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569461 440 - 636262 AGTCTTGAGCTGAATTACAGTCGACTCAGATATTGATGTGTTTGCAAATATAATTAATAAGCATGTGCATTTGATATTCATATTGTTATGTCCAACTTTAAAGTG----------------------CATGTTCAACACATCTTGGGGGATAAGTTGCATTGATGTAATAACGTTTTATAGGGGGCCATAGCATCACCCATTCCTCACCTAGGACTCTTCTGGGATAAGTGGGCATCTTGCACAGGGGGAATTGTGCTTAAGGCAGAGGAGTTCTGAGGCTGTTTCATCCCACATCATGATCATTCTGAGGGGCAGCATTCCTCTTGAACTGTATGGTTGTTGCTGAAGTGTTGCACATAATACAAGCACAATTGTTCATCTCAGAAATCCCTACTCAGTAGTTTCCAGCACACCCAATATAGGATTGCATAACAGATAATCCTTTGTTTACTCTCACTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291959 415 + 636262 AGTCT-----------------------GAGATTGATGTGTTTGCAGATATAATTAGTGAGCATGTGCATTTGATATTCATATTGTTGTGTTTAACTTTAAAGTG----------------------CACGTTCAACACATCTTGGGGGATAAGTTGCATTGATGTAATAACGTTTTATAGGGGGCCATGGCATCACCCATTCCTCATCTAGGACTCTTCTGGGATAAGTGGGCATCTTGCACAGGCGGAATTGTGCTTAAGGCAGAGGAGTTCTGAGGCTGTTTCATCCCGCATCATGATCATTCTGAGGGGCAGCATTCCTCTTGAACTGTATGGTTGTTGCTGAAGTGTTGCACATAATACAAGCACAATTGTTCATCTCAGAAATCCCTACTCAGTAGTTTCCAGCACACCCAATATAGGATTGCATAACAGATAATCCTTTGTTTACTTT--GTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 280651 444 + 647215 AGTCTTGGTCTGACTTGCAGTCCACTCAGATAATAATGTGTTTGCAAAGATAATTAACAAACGTACGCATTTGATATTCATATTCTTATGTTCAACTTTCAAGTGGCATGCCACTGGCAGTATGAATCGTGTTCAACACATCTTGAGG-ATAAATTGCATTGATGTGATAATGTTTTATAGGGGGCCACAGCATCTCCCATTCCCCGCCTGGGGCTACTCTGGTACAAGTGGGCATCTTGCACAAAGAGTATTGTGCCTAAGGCCGAGGACTTCCGAGGCTGTTTCATCCCATGTCATGATCATCCTGAGAGGCAGCACACATCTTGAACTGCATAATTGTTGCTGAAGTGTTGCAAAT-------------CAA--TATTCCAGAAACCCCTACTCAGTAGTTTCCAGCATACCCAATATAGAATTGTGCAACAGACGATCCTTGATTTGCCTT--GTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 143274 88 + 294542 GCAAAATGATCTGACCATCTAATGTGAAGAATCAGGTGAGAAGAAGTTAGAAATCTCATTGTACATCTAAACCTATGGGCAATCTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292374 88 + 636262 GTGAAATGATCCAACCATTTGAAGTGAAGAATCAGGTGAGAAGAAGTTAGTAACCTCATTGTACATCTTAACCTATGGGCAATCTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 281095 88 + 647215 ACAAAATGATCTGACCATCTAATATGAAGAATCAGGTGAGAAGGAATTAGAAATCTCATAGTACATCTAAACCTATCAGCAATCTACT - -a -s mr.mrrefChr5 143362 81 + 294542 CGTGTGATCTGTGGCTATAGGGTGTTATAGAGAGCCTGATATTCTGGTCAATGTACCATGATTGTGTTACAGTTGAATCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292463 74 + 636262 CATGTGACCTGTGGCTATAGGGTGTTGTAGAGAGCCTGATTTTCTGGTCAATGTACC-------TGTTACTGTTGAATCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 281183 81 + 647215 CGTATGATCTGTAGCTATGGGGTGTTATACAGAGCCCTGTATTCTGGTCAATGTACCATGATTGTGTTACAGTAGAATCCT - -a -s mr.mrrefChr5 143443 47 + 294542 ATAAAAAATTTGTCACTAGGATATGAAGCCTTAACTGTGGACAAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292537 47 + 636262 ATAAAAAATTTGTCACTAGGATATGAAGCCTTAACTGTGGACAAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 281265 47 + 647215 ATCAAAAGTTTGTCACTAGGATATGAAGCCTTAACTGTGGATAAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 143490 38 + 294542 GTAGCTGAGCGCTACCTAGCTTAGCAAGAGAATGAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292584 38 + 636262 GTAGCTGAGCGCTACCTAGCTTAGCAAGAGAATGAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 281348 38 + 647215 GGAGCTGAACACTTCCTAGCTTAGCAGGTGAATGAATC - -a -s mr.mrrefChr5 143528 382 + 294542 GTGTGCCAGATGAATGTCCAACCACAGTCCCATTCCATTGTATAATAAACTATTTCATTTAGTCAGAGCACAATTGTAATCTTACACACATCCAAGCAATCAGGGCTGTTATTGCCACTGTAGTAAGGCAGATCCATTAGAAACAGCAGGTGTATGCAGGGAACATATGGCTATGTGGGTCTTAATCCAGAAGAGTTCTGCCTCACATGTGATAACAGAATAAACATTGAAAACCTTCTAGCTTTGCTCTCTCTGAGCAGAAACCCCAATGTCAGAATGTCATAAGTAAGAGATAATTGCCATTGGTTGGTTATACTTTTACCGACACTTGTGCCGTGACCTCGGCAATTGATAATGCCCATAATTATTTTACTGGCAGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292622 355 + 636262 GTGTGCCAGATGAATGTCCAACCACAGTCCCATTCCATTGTATAATAAACTATTTCATTTAGTCAGAGCACAATTGTAATCTTACACACATCCAAGCAATCAGGGCTGTTATTGCCATTGAAGTGAGGCAGATCCATTAGAAACAGCAGGTGTAT--------CATATGGCTATGTGGGTCTTAATCCAGAAGAGTTCTACCTCACATCTGATAACAGGATAAACATTGAAAACCTCCTAGCTTTGCTCCTTC-------------------CTGAATGTCATAGGTAAGAGATAATTGCCATTAGTTGGTGGTACTTTTACCGACACTTGTGCTGTGACCTCGGCAATTGATAACACCCATAATTATTCTATTGGCAGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 281387 382 + 647215 GTGTGCCAGATGAATGTCCAACCACAGTCCTATTCCATAATATACTAAACTATTTCATTTAGTCAGAGCACTATGGTAAGCTTGCACATAACCAAGCAATCAAAGCTGATATTGCCACTGTAGTAAGGCAGATCCATTAGAAACAGCAAGTGTAAGCAGGGAACATGTGTCTATGTGGGTCTTAATCCAGAACAGTTCTGCCTAACATGTGATAGCAGAATACACATTGAAAATCTTCTAGCTTTGCACTCTCTGAGCAGAAACCCCAATGTCAGAATGTCATAAGTAAGATATCATTGTCATTGATTGGTTACACTTGTACCCACACCTGCGCCGTGACTTAGGCAATTGATAATGCCCATAATTATTTTACTTGCAGGGG - -a -s mr.mrrefChr5 143910 30 + 294542 ATTGGCTTTGGGTCAGCGAGTCAGGTATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292979 30 + 636262 ATTGGCTTTGGGTCAGCGAGTCAGGTATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 281769 30 + 647215 ATTGGGTAAGGGTCAGCGAGTCAGGTATAA - -a -s mr.mrrefChr5 143940 86 + 294542 CCTTCTTCAATACACTAAATTGGTGTAACCCCAAGATCAAGAAGTGCAGTGTGATAAGGTAGCAAAGTTGAGGCCAGAGTTTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293010 86 + 636262 CCTTCTTCAACACACTAAATTGGTGTAACCCCAAGATCAAGAAGTGCAGTGTGATAAGGTAGCCAAGTTGAGGCCAGAGTTTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 281799 86 + 647215 CCTTCTACAATACACTAATTTCACGTAAACCAACGATCAAGAAGTGAAGTGTGATATGGTAGCAAAGTTGAGGCCAGAGATTTTGG - -a -s mr.mrrefChr5 144026 95 + 294542 TCCCTTTCCTGGATCTCATATCATGGACTTCGTTAGGCTAATTTGGTCAGGTAGCATCTATGTTGTTTCCTGATCCACACCTGTCGAGTTCATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293096 95 + 636262 TCCCTTTCCTGGATCTCATATCATGGACTTCGTTAGGCTAATTTGGTCAGGTAGCATCTATGTTGTTTCCTGATCCACACCTGTCGAGTTCATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 281895 95 + 647215 TCCCTTCCCTGAATCTCAAATATTGGACTCCAATAGGTTAACTTGGTCAGATAACATCTAGGTTGTTTCCTGACCCACACCTGTGGAGTTCACAG - -a -s mr.mrrefChr5 144121 273 + 294542 GAAGATAGTTTTTGAGACAAAGGGAACTCCTCTGTACTAGTGGCATGGACTGAGTTGCAAAGTGGGACAATGCCAGCCAGAATGAAAAACCCTAGAAGGCATTGAAAAATCTGACACTATTGTGTCGACGTATAACTACCTCCAAACATGATGTAAGTGCACTAAAACCACAAATTTGAATTTGACAAGAGCCATATCTCTGTACACTCACTAACCCATATGTCAGCTGGTGTGACTCTTCCATGGATTCAGTTAAACATGAGAGCTCTGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293192 250 + 636262 GAAGATAGTTTTTGAGACAAAGGGAACTCCTCTGTACTAGTGGCATGGACTGAGTTGCAAAGTGGGACAATGTCAGCCAGACTGAAAAACCCTAGAAGGCATTGAAAAATCTGACACTATAGTATTGACGTATAAGTACCTCCAAACATGATGTAAGTGCACTAAAACC-------------------GAGCCATGTCTCTGTACACTCACTAACCCATATGTCAGCTG-TGTGACTGTTCCATGGATTCAT---AACATGAGAGCTCTGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 281990 271 + 647215 GAGGGTAGTTTATAGTAGCAAGGGAACTCCTCCGCACTAGTGGCATGGACTGAGTTGCAAACTGGGACAATGCCAGCAAGAAAAAAAAACCCCAGAAGGCATTGAAAAATCTGACACTATTGTGTCAATGTATAACTACCTCCAAACAGGATGTAAGTGCACCAAAACCACAAATTTGAATTTGACAAGAGCCATATCTCTGTACACTCACTAACCCATATGTCAGCTGGTGTGACTCTCC--TGGACTCAGTTAAACATGAGAGCTCTGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 144394 169 + 294542 GGACCTTTTTTAATGAATTGTATACTGTATATGTGTTTTCTTAAATAGCAAAAAACATTATTGTTGTGTACAGCTACATAAATACAAGACAGGGAAGAGTTGTACCAGTTTCCAGGCTCTTGACACAAAGTAAGCTCATCAGGAGTTGTACATTTGGGCAGTAGAACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293443 169 + 636262 GGACCTTTTTTAATGAATTGTATACTGTATATGTGTTTACTTAAATAGCAAAAAACATTATTGTTGTATACAGCTACATAAATACAGGATGGAGAAGAGTTGTACCAGTTCCCAGGCTCTCGACACAAAGTATGCTCATCAGGAGTTGTACATTTGGGCAGTAGAACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 282261 169 + 647215 GGACCTTTTTTAATGAATTGTATACTGCATATGCGTTTTCTCAAATAGCAAGAAACATAATTGTTGTGTACAGCTATATAAATACAAGGCAGGGAAAAGGTATGCCAGTTTCCAGGCACTTGACACTAAGTGAGCTCATCAGGAGTTGCACACTTGGGCACTAGAAATG - -a -s mr.mrrefChr5 144563 253 + 294542 TATCAGATGAGTTCCACCTATTTGCAAAAAAAGATGGATGAAGAATAACCCTCTATTTGCAGTTTAGATCGCCAGGGATTCTCTAGGATTTAAAATCTTTTTTGGTACCTGCAATAGAGTTTGATACATGGTGGCTGTAACAGGTGTTACCTATTAAGGGTCCTATTGCAAAGTCATTCTGATCAGTAGATGTTACTTTTGTGAATTAGGTTGAATTAAGATTAATATGTGGCTCTACCTTAATTCATCTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293612 250 + 636262 TATCAGACGAGTTGCACCTATTTGCAAAAAAAGATGG-TGGAGAATAACCCTATTTTTGCAGTCTAGATCGCCAGGGAATCTCTAGGATTTAAAATCTTTATTGGTACCTGCAATAGAGTTTGATACATGGTGGCTGTAACAGGTGTTACCTATTAAGGGTCCTGTTGCAAAGTCATTCTGATCAGTAGAGGTTACTTTTGTGAATTAGGTTGAATTAAGATTAACATGTGGCTCTACCTTAATTCATCTT-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 282431 245 + 647215 TCTCAGGTGAGTTCCACCTATTTGCATAAAAAGCTGGATGAAGAACAACCCTCTATTTACAGTTTAGATCAT----GATTCTCTAGGAGATAAAATCTTTTTCGGTACCTGCAATAGAGTTTTATGCATGGAGGCTGTAAAAGGTGTTAGCGATT----GTTCTATCTTGATGTCAGACTGATCAGTAGATGTTACTTTTGTGAATTAGGTTAAATTAAATTTAATATGTGGCTCTGCCTTAATTCATCTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 144816 93 + 294542 GATTATAGCTGTATGTGTGTTGGGCTGCTGCCTCTTTTGACAGTTAACTCAGAAATGGAGTTCATTTATTGACTCTTACTCTCAAATCTAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293862 89 + 636262 ----ATAGCTGTATGTGTGTTTGGCTGCTGCCTCTTTTGACAGTTAACTCAGAAATGGAGTTCATTTATTGACTCTTACTCTCAAATCTAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 282678 92 + 647215 GATTATAGCTGTATGTGTGTTGGTCTGCTGCCTCTTTTGACAGTAAACTCATAAATGGGGAGCATTTATTTACACTTAC-CTCAAATCTGAAG - -a -s mr.mrrefChr5 144909 112 + 294542 TGTAGGTCAGTATAGGTAGGACGGATAACAACAGTCTTGTCCCCTGTGACCAGGCAGTGTTCTCATATTGTCATTTTAAAACTTCAGTACACAATATATTCCAATGTGATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293951 112 + 636262 TGTAGGTCAGTATAGGTAGGACGGATAACAACAGTCTTGTCCCCTGTGACCAGGCAGTGTTCTCATATCGTCATTTTAAAACTTCAGTACACAATATATTCCAATGTGATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 282773 112 + 647215 TGTGGGACAGTATGTGTAGGGCAGATAACAACAGTCTTGTCCTCTGTAACCATGCAGTGTTCTCATATTATCATTTTAAAACTTCAGTACACTAGATATTCCAGGGTGATAA - -a -s mr.mrrefChr5 145021 10 + 294542 TATAAGCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294067 10 + 636262 TATAGGCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 282885 10 + 647215 TAAAAGCTCT - -a -s mr.mrrefChr5 145031 63 + 294542 GGGAATCTGACCAGTATCCATGGTTAGCAATATGACATTGGAGTGTGTACAGCTGATAACTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294078 63 + 636262 GGGAATCTGACCAGCATCCTTGGTTAGCAATATGACTTTGGAGTGTGTACAGCTGATAACTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 282895 63 + 647215 TGGAATCTGGCCAGTATCCATGGTTAGCAATATGACATTGAAGTCTGTACAGCTTATAACTAG - -a -s mr.mrrefChr5 145094 25 + 294542 AGATAAGTACTAGGTCAAGGCAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294141 25 + 636262 AGATAAGTACTAGGTCAAGGCAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 282959 25 + 647215 AGATAAGTACTAGGCCAAGGCGATT - -a -s mr.mrrefChr5 145119 581 + 294542 GGGCTGGCAAAACATGAGTGCAGGTAAGGTTCACCCAAAAAGTATCTAAAACTGCTACCCTTATCATTATAGGAACAATAGTAGTGTCTGTCCCTGTCTGTGATCCAACCTGACATGCATCTTGTGTTGTCCTGTGTGAAGACTGTGATTAGGCAATATGGTAGCCCCCTCATAGCCATTGACCTTTCCGAAGGCAGACTCCAACCTAGGGTGCTTGTAGTATACCTAACAATGTGACTCTCTGTGCTAGCATGCCCTTACATAAGGCGCTGAATGAGAGAAATATAGTGAAGAGTCATTGCCTTACGTCATTAAGTCCAAAATCGTTAATACGGAAACAACTGACAACCTCCAGCTGAGCATTTTGATGCAAGAAAGTGAGAAGTACCATATCAATATGTTTTAACAACCATGGAAGTACATGCCAACTGGTTAGTGGATGCCAACTGGTCTAGTGGATCCTCCAACAAGTGCTAAATGATACAATCTACACTTCATGGCAAAGAATCCAACTTAGATGTTTGATCTCCTTTGACTTACCCTGACGTAAcatttaatattaggctagcaaaccagttagc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294166 581 + 636262 GGGCTGGCGAAACATAAGTACAGGTAAGGTTCACCCAAAAAGTATCTAAAACTGCTACCCTTATCATTATAGGAACAATAGTAGTGTCTGTCCCTGTCTGTGATCCAACCTGACATGCATCTTGTGTTGTCCTGTGTGAAGACTGTGATTAGCCAATATGGTCGCCCCCTCATAGACGTTGATTTTCCCAAAGGCAGACTCCAACCTAGGGTGCTGGTAGTATAACTAACAATATGATTCTCTGTGCTAACATACTCTTACATAAGGCGCTGAATGAGAGAAATATAGTGAAGAGTCATTGCCTTACGTCATTAAGTCCAAAATCATTAATACGGAAACAACTGACAACCTCCAGCTGAGCAATTTGATGCAAGAAAGTGAGAAGTACCATATCAATATGTTTTAAAAACCATGGCAGTACATGCCACCTGGTTAGTGGATGCCAACTGGTCTAGTGGATCCTCCAGCAAGTGTTAAATGATACAATCTACACTTCCGGGCAAAGAATCCAACTTAAATGTTTGATCTCCTTTAACTTTCCATGACGTAACATTTAATATTATGCTAGCAAACCAGTTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 283005 581 + 647215 AAGCTGGCAAAACATGAGTGCAGATAAGAGACTCCCAAAAAGTATCCAAAACTGCTACCCTTATCGTTATAGGGACGTTAGTAGTGTCTGTCCTTATCTGTGATCCAACCTGACTTACATCTTGTGTTGTCCTGTGTAATGACTGTGATTCGGCAATATGGTAGCCCCCACATAGCCATTGACCTTTGAGAAGGCAGACTCCAACCTAGGGTGATTGTAGTATACCTAACAATGTGACTCTCTGTGTTGGCATGCCCCTACATAAGGCGCTGAATGAGAGAAATAGAGCAAAGAGTCCTTGACTTATGTCATTTAGACCAAAATCGTTAATATGGATACAACTGACAACCTCCAGCTGAGCATTTTGATGCAAGAAAATGAGAGGTACGATATCAATATGTTGTAGCAACAATGGAAGGACATACTAACTCGTTAGTGGGTGCCAACTGGTGCCGTAGATCCTTCAACAAGTACAAAATGATACAATCTACACCGCATGTCAAAGAATCCTACTTAGATGTTGGATCTCCTTTGACTTACACTGATGTAAcatttaatattagaataacaaaccagttagc - -a -s mr.mrrefChr5 145700 61 + 294542 ttatttaacagtgtgattctttaaggtgatgtaaatagaagtcggtcttattctgcttaga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294755 61 + 636262 TTATCTAACAGTGTGATTCTTTAAGGTGATGTAAATAGAAGTCGGTCTTATTCTGCTTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 283586 61 + 647215 gtatttaacagtgtgactctctaaggtgatgtaagtagtagtcagtcttatgctgcttgga - -a -s mr.mrrefChr5 145761 57 + 294542 ctacaatctattgaaactgagggagttgaaggaggcatttcgccaatttggaaaaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294832 57 + 636262 CTACAATCTATTGAAACTAAGAGAGTTGAAGGAGGCATTTCGCCAATTTGGAAAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 283647 57 + 647215 ctgcaatctattgaaactgagggagttgaagtagacatttcaccgatttggaacaag - -a -s mr.mrrefChr5 145818 94 + 294542 ctgtgtgttgtactgatttccaaaGCACGCCATAGGATAAAGTGATGGTTGTAACCAGGATCTGGTGGCCTAGAAAAGATGTCACGGGTGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294890 94 + 636262 CTGTGTGTTGTACTGATTTCCAAAGCACGCCATAGGATAAAGTGATGGTTGTAACCAGGATCTGGTGGCCTAGAAAAGATGTCACGGGTGATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 283704 94 + 647215 ttgtgtgttgtgctgatttccaaaGCATGGCATACGACAAAGTGATGTAGGTAACCAGGATCTGGTGGCCTAGAAAAGACGACAAAGTTGATTA - -a -s mr.mrrefChr5 145912 27 + 294542 TTGTGAATACAGCCTGACTTGTCCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294984 27 + 636262 TTGTGAATACAGCCTGACTTGTCCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 283803 27 + 647215 TCGTGAACCCAGCCTGAGTCGTTGGCT - -a -s mr.mrrefChr5 145939 302 + 294542 TGCACCAAAATAGTGCCATTCAATAATGTCTCACAAAGCTtaaccactgacttgttctttttagatccacacaggctctttaacttgtgtacatccacacatgcttgttgattttgggtttaactgcagttgacttcggattcttcagcattgactttggcatcttcagcgtgtatgcttcttctgtgctaatgtctagaatggtgcttccaagattatcctgtaaacttttcctgctctttgggcgatgagaatctaaaactttattatactgaccttgtttcttcgaaactgcacctggt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295011 302 + 636262 TGCACCAAAATAGTGCCATTCAATAATGTCTCACAAAGCTtaaccactgacttgttctttttagatccacacaggctctttaacttgtgtacatccacacatgcttgttgattttgggtttaactgcagttgacttcggattcttcagcattgactttggcatcttcagcgtgtatgcttcttctgtgctaatgtctagaatggtgcttccaagattatcctgtaaacttttcctgctctttgggcgatgagaatctaaaactttattatactgaccttgtttcttcgaaactgcacctggt -s simRat_chr6.simRat.chr6 283840 302 + 647215 TGCACCAAAATAGTTCTGTTCAATAATGTCTCATGAAGCTtagctactgactcgtattctttagatccacacgggctctttaacttgtgtaagtccacacatccttgttgattttgggttgaggtgcagttgactttggcatctccaacattgactttggagtcttcagcatgtacgcttcttctgtgcaaatacctagaatgatgttttcaagattatcctgtaaggttttcatgctctttgggggatgagaatttagaactttagtatactcacattgtttcttccaaactgcacctggt - -a -s mr.mrrefChr5 146241 104 + 294542 attaagaaaggctcaagttttaacccttggcagattgataaccagttcctccaacatcacctacttattgagtagcgaatcgttggcccccttaaggcttcgct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295329 104 + 636262 attaagaaaggctcaagttttaacccttggcagattgataaccagttcctccaacatcacctacttattgagtagcgaatcgttggcccccttaaggcttcgct -s simRat_chr6.simRat.chr6 284142 104 + 647215 attaagaaaggcccaagttttaacccttggcggattgataaccagttcctcctacatcacctacttattgaatagtgaatccttggcccacttagggtttcact - -a -s mr.mrrefChr5 146345 16 + 294542 acaaaacgtgatccag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295433 16 + 636262 acaaaacgtgatccag -s simRat_chr6.simRat.chr6 284247 16 + 647215 accaaatgtgacacag - -a -s mr.mrrefChr5 146361 77 + 294542 tagtagatggatagttggacgatagaaccagccttagacagctccattttatttccacgtaaagtaatgattttcag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295449 77 + 636262 tagtagatggatagttggacgatagaaccagccttagacagctccattttatttccacgtaaagtaatgattttcag -s simRat_chr6.simRat.chr6 284264 77 + 647215 tagtaaatgggtagttggaggatagaaccaaccttagacggctccatttgatttctacataaagtaatgattttCAG - -a -s mr.mrrefChr5 146438 5 + 294542 atacc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295526 5 + 636262 atacc -s simRat_chr6.simRat.chr6 284775 5 + 647215 ATACC - -a -s mr.mrrefChr5 146443 11 + 294542 aggatactttc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295531 11 + 636262 aggatactttc -s simRat_chr6.simRat.chr6 284784 11 + 647215 AGGATGCTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 146454 80 + 294542 gcagtaaaaattgaaagcaggaagcatgatctggccgtcttgatttttttcatttagaatcaactttgacatgggccctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295555 80 + 636262 gcagtaaaaattgaaagcaggaagcatgatctggccgtcttgatttttttcatttagaatcaactttgacatgggccctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 284795 80 + 647215 gcagtaaagcttgacatgaagaagcatgatcctgccagctcaatttttttcatttagaatcaaatttgacacgggttcgc - -a -s mr.mrrefChr5 146534 12 + 294542 tttttgatttgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295636 12 + 636262 tttttgatttgt -s simRat_chr6.simRat.chr6 284875 12 + 647215 tctttgatctgt - -a -s mr.mrrefChr5 146546 79 + 294542 caccaacggtttttttacccaatggtttttttacaagcagtgaacaagcagggccatcgttgtcttgataggatgtcct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295648 79 + 636262 caccaacggtttttttacccaatggtttttttacaagcagtgaacaagcagggccatcgttgtcttgataggatgtcct -s simRat_chr6.simRat.chr6 284888 79 + 647215 caaaaacggtttttttacccagtggtttttttacaagcagtgaacaagctgggccatcactgtcttgataggatgtcct - -a -s mr.mrrefChr5 146625 12 + 294542 atcaaatctgta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295732 12 + 636262 atcaaatctgta -s simRat_chr6.simRat.chr6 284967 12 + 647215 atcaaatctgaa - -a -s mr.mrrefChr5 146637 34 + 294542 aagactaggtttctcagattcaaaatgttcacct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295757 34 + 636262 aagactaggtttctcagattcaaaatgttcacct -s simRat_chr6.simRat.chr6 284979 34 + 647215 aggactagatttctcagattcaaaacattcacct - -a -s mr.mrrefChr5 146671 13 + 294542 aagatttaataat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295802 13 + 636262 aagatttaataat -s simRat_chr6.simRat.chr6 285013 13 + 647215 aagatttgataat - -a -s mr.mrrefChr5 146684 27 + 294542 ttgacattaatattggtttcccctatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295816 27 + 636262 ttgacattaatattggtttcccctatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 285026 27 + 647215 ttggcatgaatattggtttcccctatt - -a -s mr.mrrefChr5 146711 15 + 294542 aatttcaagaaaagg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295845 15 + 636262 aatttcaagaaaagg -s simRat_chr6.simRat.chr6 285053 15 + 647215 aatttttagaaaggg - -a -s mr.mrrefChr5 146726 22 + 294542 ttgcaaatcctagtaggctctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295861 22 + 636262 ttgcaaatcctagtaggctctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 285068 22 + 647215 ttgcaaatcctagtaggatcct - -a -s mr.mrrefChr5 146748 13 + 294542 tgatgtcttgtac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295883 13 + 636262 tgatgtcttgtac -s simRat_chr6.simRat.chr6 285103 13 + 647215 tgatgtcttgtac - -a -s mr.mrrefChr5 146761 8 + 294542 aattcact -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295896 8 + 636262 aattcact -s simRat_chr6.simRat.chr6 285136 8 + 647215 aattcact - -a -s mr.mrrefChr5 146769 11 + 294542 tgggttaatca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295904 11 + 636262 tgggttaatca -s simRat_chr6.simRat.chr6 285145 11 + 647215 cgggtcagtca - -a -s mr.mrrefChr5 146780 18 + 294542 tcgagggcaattcactca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295915 18 + 636262 tcgagggcaattcactca -s simRat_chr6.simRat.chr6 285195 18 + 647215 ttgaaggccattcactca - -a -s mr.mrrefChr5 146798 102 + 294542 tgctgtaaactacctgttggttattcttgtatatagaagtatgtgacttgggcacattaactttatcactggcaacttcactcagagtactagtagtttgag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295933 102 + 636262 tgctgtaaactacctgttggttattcttgtatatagaagtatgtgacttgggcacattaactttatcactggcaacttcactcagagtactagtagtttgag -s simRat_chr6.simRat.chr6 285216 102 + 647215 cactgtgaactgtctgttggatattcttgtatataaatgtatgtgactcgagcacattgactttatcaccagaaacatcactcagagtactagtagttctag - -a -s mr.mrrefChr5 146900 88 + 294542 aaggttactgctcaacagtgtaggccttccttagtatacaatcatggaacctgcaaatacagaaagcataaccctctcctcgcccaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296035 88 + 636262 aaggttactgctcaacagtgtaggccttccttagtatacaatcatggaacctgcaaatacagaaagcataaccctctcctcgcccaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 285373 88 + 647215 Aaggttactggtcaacagtgtcagcctccctaagtatacaaccatgtcatctgcaaatacagaaagtataaccttcacctcacccaat - -a -s mr.mrrefChr5 146988 9 + 294542 cacactgca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296126 9 + 636262 cacactgca -s simRat_chr6.simRat.chr6 285461 9 + 647215 cacacagcc - -a -s mr.mrrefChr5 146997 17 + 294542 ctcatctctcccctggc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296135 17 + 636262 ctcatctctcccctggc -s simRat_chr6.simRat.chr6 285474 17 + 647215 ctcatctttcccctggc - -a -s mr.mrrefChr5 147014 191 + 294542 attgtcctgtggctctggctgattgagaatggtcaacatgtaatcatttttgatttgcttaatcagttggacatatctaggaatggatatcatcatatgcttgttctgattgctgcggtttttgggttgtatcacatttataggcctgcgtgattttagctaacccagctctccagttgtgaaccaaacga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296273 191 + 636262 attgtcctgtggctctggctgattgagaatggtcaacatgtaatcatttttgatttgcttaatcagttggacatatctaggaatggatatcatcatatgcttgttctgattgctgcggtttttgggttgtatcacatttataggcctgcgtgattttagctaacccagctctccagttgtgaaccaaacga -s simRat_chr6.simRat.chr6 285491 191 + 647215 attgccctgcggttctggctgattgagaatgatcagcatgtaatcattgttgatttgcttaattagttggacatatctatgaatggatataatcatatggttgttctgatcgctacagtttttgagttgtatcacagttacaggcttgcgtgattttggctaccccagcactccagttgtggacaagacaa - -a -s mr.mrrefChr5 147205 18 + 294542 ttggtacctagtgcaggg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296464 18 + 636262 ttgGTACCTAGTGCAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 285978 18 + 647215 tcagtacttagttcaggg - -a -s mr.mrrefChr5 147223 25 + 294542 ggacaagaacatagcaaatacattg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296482 25 + 636262 GGACAAGAACATAGCAAATACATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 285997 25 + 647215 ggacaagataaaagcagataggttg - -a -s mr.mrrefChr5 147248 102 + 294542 agcttggaatccacagtgcgaggccgatgatgtttttgctttgtgatgatttaaacatcagctgggttggtggttatcaccccatttttcaaacctatataa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296541 102 + 636262 agcttggaatccacagtgcgaggccgatgatgtttttgctttgtgatgatttaaacatcagctgggttggtggttatcaccccatttttcaaacctatataa -s simRat_chr6.simRat.chr6 286022 102 + 647215 agcttggaattcatagtttgatgccattgatgattttactctgtgatggtttacatgtcagctgggttggaagttatcaccccacttttcaagcctatatga - -a -s mr.mrrefChr5 147350 153 + 294542 ttgtcactgttagcaaaggtctatctgttttgttaatttagtcaaaagacccgggctttcgactcgttgaccttactcaaagtctccagcattttagtgctctttaaattaaattttatcgtggccattttatgctatctgccctttaatgcg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296643 153 + 636262 ttgtcactgttagcaaaggtctatctgttttgttaatttagtcaaaagacccgggctttcgactcgttgaccttactcaaagtctccagcattttagtgctctttaaattaaattttatcgtggccattttatgctatctgccctttaatgcg -s simRat_chr6.simRat.chr6 286146 153 + 647215 ttgtcactgttagcaaaggcctatccattttgttagtttagtcacaaagccagggttttggactcattgaccttactccaggtctcccgcattctagtgccctttaaatcaaattttatcttagccattttctgctagctgctcataaaggta - -a -s mr.mrrefChr5 147503 32 + 294542 aaactcctcagttctttcagtctgaacttcta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296796 32 + 636262 aaactcctcagttctttcagtctgaacttcta -s simRat_chr6.simRat.chr6 286300 32 + 647215 aaactccgaagttctttccatcagaactacca - -a -s mr.mrrefChr5 147535 62 + 294542 tactatgtgtaatatccctcatcccgtctgcccggcatcacacaactgttccaacacccccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296831 62 + 636262 tactatgtgtaatatccctcatcccgtctgcccggcatcacacaactgttccaacacccccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 286332 62 + 647215 taccatgtgtaatgtccctcatcccttccgcatggcatcgcacaactgttctaacacccctc - -a -s mr.mrrefChr5 147597 104 + 294542 taatccagtactaaatagctcccagatgttctgatatgtggggggttgtggttctcattacctttaagagacatcctgatctctggcttaatttcattatgaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296894 104 + 636262 taatccagtactaaatagctcccagatgttctgatatgtggggggttgtggttctcattacctttaagagacatcctgatctctggcttaatttcattatgaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 286394 104 + 647215 cgatccagttctaaagagctcccagatgttctgatatgtgggcagtcgtggttctcattactctcaaaggacatcttgatctctggctaaatctcaGTATAAgg - -a -s mr.mrrefChr5 147701 39 + 294542 cttaatattcttttttttccgctccgtattgtggttact -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297006 39 + 636262 cTTAatattcttttttttccgctccgtattgtggttact -s simRat_chr6.simRat.chr6 286498 39 + 647215 cttaatttccttttttttctgctctgtatcgtgcttact - -a -s mr.mrrefChr5 147740 29 + 294542 ctgaaattggccccactatagtgagcaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297046 29 + 636262 ctgaaattggccccactatagtgagcaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 286537 29 + 647215 ctaccattggccccagggtagtgagcaag - -a -s mr.mrrefChr5 147769 22 + 294542 catctacaaggagaaatgttca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297075 22 + 636262 catctacaaggagaaatgttca -s simRat_chr6.simRat.chr6 286570 22 + 647215 catctacaagtataaatgttca - -a -s mr.mrrefChr5 147791 65 + 294542 gttatcattgctaactgtttgttggaccatagtgaaataatcagcttaggtctggaacacaggtc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297097 65 + 636262 gttatcattgctaactgtttgttggaccatagtgaaataatcagcttaggtctggaacacaggtc -s simRat_chr6.simRat.chr6 286593 65 + 647215 gttatcatcaccaactgtatgctggaccagagtgaaataatcagcttaggtccggaaaggaggtc - -a -s mr.mrrefChr5 147856 14 + 294542 actgatagaaatca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297162 14 + 636262 actgatagaaatca -s simRat_chr6.simRat.chr6 286659 14 + 647215 acagctagaaacca - -a -s mr.mrrefChr5 147870 139 + 294542 ggcaggacacttaccccgaataacctcacactgatggctctcctacagcctgaattggatgcaaagtctcgtgaatattaatctagtcaagtggacttggtcagaaggtgagttcaatcattgggtgttctcattCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297177 139 + 636262 ggcaggacacttaccccgaataacctcacactgatggCTCTCCTAcagcctgaattggatgcaaagtctcgtgaatattaatctagtcaagtggacttggtcagaaggtgagttcaatcattgggtgttctcattCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 286673 139 + 647215 ggcagggcacttacgcagaataacctcgcgccagtagctctcctacaatcagcattggacgcaaagtctggtaaatattaacctagtcaagtggacttggtggggaagtcagtatgatcattgggtgttctcattTATG - -a -s mr.mrrefChr5 148009 52 + 294542 TGTAGGTGGTGTACACCTGTCACATACTACCAGGTCTCATGCCTGTTGTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297317 52 + 636262 TGTAGGTGGTGTACACCTGTCACATACTACCAGGTCTCATGCCTGTTGTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 286812 52 + 647215 TATAGGTGGCGTACATCTGTCACACACTACTAGGTCTCATGCCAGTTGTCGC - -a -s mr.mrrefChr5 148061 31 + 294542 ACTAACTTATCCAGAATTGTAACAGAATTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297376 31 + 636262 ACTAACTTATCCAGAATTGTAACAGAATTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 286864 31 + 647215 GCTACCTTATCCAGAGTTGTAACATAATTGC - -a -s mr.mrrefChr5 148092 71 + 294542 aaagaaaaccaggatgccagtcattacttgaccatgagtgcacccattgtctccaacttacagccatacat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297407 71 + 636262 AAAGAAAACCAGGATGCCAGTCATTACTTGACCATGAGTGCACCCATTGTCTCCAACTTACAGCCATACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 288277 71 + 647215 atagagaaccagtgggccagtcatcgcttgattgggagtggactgatcatctcaaacttacaaccatacat - -a -s mr.mrrefChr5 148163 4 + 294542 tgat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297485 4 + 636262 TGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 288348 4 + 647215 tgct - -a -s mr.mrrefChr5 148167 36 + 294542 atcaaattacattcttaggaacaGTGTAAGAGTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297490 36 + 636262 ATCAAATTACATTCTTAGGAACAGTGTAAGAGTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 288352 36 + 647215 atcaaattaaataactaggaaccATACAAGGCCTAT - -a -s mr.mrrefChr5 148203 190 + 294542 ACTTAAGTATGTGGTCCACCTGCTAAAATTAAAGATGGAAGCTACTTAAGAATCAGACAAATGTTTTATGGGTTGTCAGACTTAGTTGGAAAGACATGAAAGTACAAATTTACAACATACATCTAGCCTTAACAGGTAGATGAGAAGCCATCTGAGTCCGAACAGTTGGACAGTACTACTCCACCTAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297526 190 + 636262 ACTTAAGTATGTGGTCCACCTGCTAAAATTAAAGATGGAAGCTACTTAAGAATCAGACAAATGTTTTATGGGTTGTCAGACTTAGTTGGAAAGACATGAAAGTACAAATTTACAACATACATCTAGCCTTAACAGGTAGATGAGAAGCCATCTGAGTCCGAACAGTTGGACAGTACTACTCCACCTAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 288390 190 + 647215 ACTTAAGTACACAGTCCACCTGCTAAAATTAAAGATGGTAGCTACTTAAGAATCAAACACATGTTTTATAGGTTGTCAGACTTAGTTGGAAAGACATGAAAGTACTAATTTACACCAAACATCCAGCTATAACAGGTAGGTGAGAACCTGCCTGAGTCTGAAAAGTTGGATGGTAATACACTACATAATT - -a -s mr.mrrefChr5 148393 62 + 294542 CTTAGTACTAGAAGATAAGAAACATCAACAATACCAGAATTTATTGAGAATAAGGTTTATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297716 62 + 636262 CTTAGTACTAGAAGATAAGAAACATCAACAATACCAGAATTTATTGAGAATAAGGTTTATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 288586 62 + 647215 CTTAGTATAGCAAGATCAGAAACATAAATAATACCAAAATTTGTCAAGAGTAAGATTTATCC - -a -s mr.mrrefChr5 148455 49 + 294542 CACAATGAAGCCAAACAGAAGGGCACTACATATTAGAACAGAAATAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297794 49 + 636262 CACAATGAAGCCAAACAGAAGGGCACTACATATTAGAACAGAAATAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 288648 49 + 647215 CACAATGACGCCAAACAGAAGGCAGCTACATATTAGAATAGAAAAAATA - -a -s mr.mrrefChr5 148504 101 + 294542 AATGGAGGCCAAGAAGGCATAAGACTCCAAAAATCTGCCTCCACAGTCAACAAGGAGCTTAGGAGTTAGGTCAAAACCAGCTGTTCACTCCTAAGAGGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297843 101 + 636262 AATGGAGGCCAAGAAGGCATAAGACTCCAAAAATCTGCCTCCACAGTCAACAAGGAGCTTAGGAGTTAGGTCAAAACCAGCTGTTCACTCCTAAGAGGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 288699 101 + 647215 AGTGGAGGCCAAGAAGGCATAAGACTCCAGAAATCAGCCTCCACAGTCAACGAGGAGCTTAGGAGTTACATCCAAGCCAGTTGTCCACTCCTTAGAGGGTT - -a -s mr.mrrefChr5 148605 71 + 294542 AGTCACCCAAGTCACCTAGGTCTATGATGCACCCTTGCACACATACCACAAGACGGCCAAAGATAGAAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297944 71 + 636262 AGTCACCCAAGTCACCTAGGTCTATGATGCACCCTTGCACACATACCACAAGACGGCCAAAGATAGAAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 288802 71 + 647215 AGTCACTCAAGTCACCTAGCTCTATGATGCACTCTTGTAGATAGAGCACAAGACAGCCAAAGATGGAAATA - -a -s mr.mrrefChr5 148676 18 + 294542 CTAAGCAAGAGGCATGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298019 18 + 636262 CTAAGCAAGAGGCATGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 288873 18 + 647215 CTAAACAAGAGGTATGAA - -a -s mr.mrrefChr5 148694 97 + 294542 CAAAACTGCTACAAAGGCAAAGATGTCCATGCCTCAGAGCTAAAACAGCATACATTTCCCTTCTTTATTTCAATAAGTTGATATCTCCTCAACTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298037 97 + 636262 CAAAACTGCTACAAAGGCAAAGATGTCCATGCCTCAGAGCTAAAACAGCATACATTTCCCTTCTTTATTTCAATAAGTTGATATCTCCTCAACTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 288894 97 + 647215 CAAACCTGCTATATGGGCTAAGATGTCTGTGCCTCAGAGCTAGAACAGGATACATTTTCCTTCCTTGTTTCAATAAGTTGATATCTCCTTAACTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 148791 18 + 294542 CAGGAGGTCCTTATGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298134 18 + 636262 CAGGAGGTCCTTATGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 288992 18 + 647215 CAAGAGGCCCTTATGTCT - -a -s mr.mrrefChr5 148809 56 + 294542 ACACATAAAGAGCCAGCTCATACTTCAGAACTTGGAGTGAAATGCATACTCATTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298175 56 + 636262 ACACATAAAGAGCCAGCTCATACTTCAGAACTTGGAGTGAAATGCATACTCATTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 289010 56 + 647215 ACACGTAAAGAGCCAACTCATACTTCAGAACTTGGAGTAAAATGCATACTCATTTA - -a -s mr.mrrefChr5 148865 61 + 294542 AGCATTCTGGGGGGCTTGACCTCAAAAAATGAACACACTAAGTCCATTTTAAGCCTCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298231 61 + 636262 AGCATTCTGGGGGGCTTGACCTCAAAAAATGAACACACTAAGTCCATTTTAAGCCTCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 289067 61 + 647215 GGCATTGCAGGGGGCTTAAGCTTAAAAAATGAACACATTAAGTCCATCCTAAGCCCCATAG - -a -s mr.mrrefChr5 148926 69 + 294542 GAATGCATTAAGTCCATTTCCAACCTCATACCATGAGTGTAAAAAAGACTAGTTAGTGGTTCTGTGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298292 69 + 636262 GAATGCATTAAGTCCATTTCCAACCTCATACCATGAGTGTAAAAAAGACTAGTTAGTGGTTCTGTGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 289165 69 + 647215 GAATGCATTAATTCCATTGCAAACCTCATAGGATAAGAGTAAAAAAGGCCAGTTTGGGGTCCTGTGCTG - -a -s mr.mrrefChr5 148995 20 + 294542 CCTTTCATGTGTGGTAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298361 20 + 636262 CCTTTCATGTGTGGTAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 289235 20 + 647215 CCCTTCATGTGTGGTATCTT - -a -s mr.mrrefChr5 149015 27 + 294542 TGTCCTCTCAGGTCAACTGGGGATTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298397 27 + 636262 TGTCCTCTCAGGTCAACTGGGGATTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 289255 27 + 647215 TGTATGCTTAGGTCAACTGGGGATTAG - -a -s mr.mrrefChr5 149042 10 + 294542 AAAATAGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298424 10 + 636262 AAAATAGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 289286 10 + 647215 AAAACAGTCT - -a -s mr.mrrefChr5 149052 53 + 294542 ATTTGCACACGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAACATTTTGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298434 44 + 636262 ATTTGCACACGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAAC--------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 289300 53 + 647215 ATTTGCACATGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAACATTTTGAGG - -a -s mr.mrrefChr5 149105 52 + 294542 AGCTACATTACTCTATTCATGGCCTAGGGCAATTTAAGGAAAGGGTGAACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298478 39 + 636262 -----CATTACTCTGTTCATGG--------AATTAAAGGAGAGGGCGTACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 289354 52 + 647215 AGCTACATTACTCTATTCATGGCCTAGGGCAAATTAAGGAAAGGGTGAACTG - -a -s mr.mrrefChr5 149157 197 + 294542 AGACATGAGACATGCATCGCCACCTAATTATCTCATAAGGCAACATAAAATAGTTAAGAGTATGATGTGTGGTGATGGCATAAGGCTGCACTTTGAGAAAATCTAAAAACAGAGAGTTACCTCTAGCCACAGCAATGTGCTCGCACAAGCAGTCTAACAGCACAGCGATGGGCTTGTTCAAAGCATGGAATAAGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298517 193 + 636262 AGACATGAGACATGCATCGCCACCTGATTATCTCATAAGGCAACATAAAGTAGTTAAGAGTATT---TGTGGTGATGGCATAAGGATGCACTTTGAGAAAATCTAGAAACAGAGGGA-ACCTCTAGCCACGGCAATGTGCTCGCACAAGCAGTCTAACAGCACAGCAATGGGCTTGTTGAAAGCATGGAATAAGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 289409 197 + 647215 AAATATGAGACATGCATCACCACCCAATTATCTCATAAGGCAACATAAAAAAGTTAAGAGTATGATGTGTGGTGATGACATAAGGCTTCACTTTGAGATAATGTTAAAACAGAGAGTTACCATTAGCCACAGCAATGCGCTTACACAAGCAGTCTAACACCACAGCGATGGGCTTGTACAAAGCATGGAATACCATA - -a -s mr.mrrefChr5 149354 68 + 294542 GTGTGAACTTGCCATAAGTAGGGTTTTCACTGACGAACAACTCATCAGTAGCTGAATAATACCCCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298722 64 + 636262 GTGTGAACTTGCAATAGGTAGGGTTTTCACTGAC----AACTCATCAGTAGCTGAATAATCCCCCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 289606 63 + 647215 -----CACTTGCCATAAGAAAGGTTTTTACTAACGAACAACTCATCAGTAGCTGAATAATACCCCTAA - -a -s mr.mrrefChr5 149422 78 + 294542 TAGGGGGTGCACACTAAAGGAACAACGCAACATATCCCTACCTTGTGAGCCTGAGCTCACCGTCCGCATTGTAAGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298786 78 + 636262 TAGGGGGTGCACACTAAAGGAACAACGCAACATATCCCTACCTTGTAAGCCTGAAGTCACCGTCCGCATTGTGAGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 289676 78 + 647215 TAGGAGGTGCATGCTAAAGGAACAACACGACATATCCCTACCTTAAGAGCCTGAGCGCGCCTTCTGCATTGTAGGTCT - -a -s mr.mrrefChr5 149500 22 + 294542 TGTCACTTTGGGAAAGCAAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298865 18 + 636262 TCTCACTTTGGAAAAGCA---- -s simRat_chr6.simRat.chr6 289754 22 + 647215 TGTCACTTTAGGAAAGAAAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 149522 36 + 294542 GAATGGTGGTGGATCATTAGAAATACCAGTTTGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298883 36 + 636262 GAATGGTGGTGGATCATTAGAAATACCAGTTTGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 289777 36 + 647215 GGATGGTAGTGGATCATTAAAAATAACAGTTTGGGT - -a -s mr.mrrefChr5 149558 8 + 294542 GAGGTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298942 8 + 636262 GAGGTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 289813 8 + 647215 GAAATCTA - -a -s mr.mrrefChr5 149566 138 + 294542 CTGCCCTACAGCTCAATCCAGGATTAAGTGGTGTAGCGAAAAATGGTAAAAAATACTATGGTCCCATAGCATAGTAGATGTCTGCTTGCTACACCAGCAAGTCCTAGGTCTTGGGATTAGGTACTCCAACTGCCGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298950 138 + 636262 CTGCCCTACAGCTCAATCCAGGATCAAGTGGTGTAGCGAAAATCGGTAAAAAATACTATGGTCCCATAGCATTGAAGATGTCTGCTTGCTACAGCAGCAAGTCCTAGGTCTTGGGGTTAGGTACTCCAACTGCCAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 289822 138 + 647215 CTGCTGTGTAGCTCAATCCAGGATTAAGTGGTGTATCGAAAAATGGTGAAAAAAACTATGGTCCCATAGCATAGTGGATGTCTGCTTGCTACACCAACAAGTCCTAGGTCTTGGGATCAGGTACTCCAACTGCCGACT - -a -s mr.mrrefChr5 149704 258 + 294542 GGCCTGGAGCCTGTGTGGCAGGTTAGATCTAAAGTGGTACATAACAGCCCCCTGATCAAATCTGTATCTTGTGATGGAGGTTTTCATGCCCAAAGATATAAGGACTAAGACACCATCTATATCAGTACTGACAATCACATTCCATGCATTTCATTTTCACTAGACCTACAGTCAACTGTATCACATGACACAGGACAGGCCACAGCCCATTCTGAGGCATTCAGAGCTTTAGTGAAGAAGTAGCTGAAGTCCACTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299088 254 + 636262 GGCCTGGAGGCTGTGTGGCAGGTTAGATCTAAAGTGGTATGTAACAGCCCCTTGATCAAATCTGTATCTTGTGATGGAGGTCTTCATGCCCAAAGATATAAGGGCTGAGACACCATCTACATCAGTACTGACAATCACATTCCATGCATCTCATTTTCACCAGATCTACAGTCAACTGT----CATTACATGGGACAGGCCACAGCCCATTCTGAGGCATTCAGAGCTTTAGTGGAGAAGTAGCCGAAGTCCACTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 289965 258 + 647215 GGCCTGGAGCCTGTGTGGCAGGTTAAATCTAAAATGGTACATAACAGCCTCCTGATCAAGTCTGTATCTTGTGATGGAGGTTCTCATGCCCAAAGATATAAGGACTAAGACACCATCTATATCAGTACTGACAAGCACATTCCATGCATTTCATTTTCACTAGACCTGCAGTTGACTGAATCACATGACACAGGACAGGCCATAGTGCATTCTGAGGCATTCAGAGCTTTAGTGAAGAAGTAGTTGAAGTTCACTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 149962 114 + 294542 GCAGGTTGAAAACAGAGATCAATTCTATGAGTCCTGTCAAAGTGGTTGTAATTATGTTAGGCACATAGCAAGATGGCTGTACAGTTGGGATAATAATTCCTCCTTTGATACAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299345 114 + 636262 GCAGGTTGAAAACAGAGATCAATTCTATGAGTCCTGTCAAAGTGGTAGAAATTATGTTAGGCACATAGCAAGATGGCTGTACAGTTGGGATAATAACTCCTCCTTTGATACACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 290223 112 + 647215 GCGGGTTGAAAACAGAGATCAATTCTAAGAGTCCTGTCAACGTGGTTGTAGTTATGTTAGGCACATAGT--GATGGCTGTACAGTTGGGACAATAATTCCTCCTGTGATACAGG - -a -s mr.mrrefChr5 150076 100 + 294542 CCCATCCAGAAATAGCAAATAATTCACAATCGTATTCCCCTCATGAAGTACATTTACTACATCAAATGTTTGTAGTCCCCATACTTCATGGAGCGGTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299459 100 + 636262 CCCATCCAGAAATAGCAAATAATTCACAAACGTCTTCCCCTCATGAAGTACATTTACTACATCAAATGTTTGTAGTCCCCCTACTTCATGGAGTGGTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 290397 100 + 647215 CTCATCCAGAAATATGAAATAACTCACCATTTTATTTGCTTCATGAAGTACATTTACTACATTAAATGTTTGCGATCCCCAAACTTCATGGAGCGGGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 150176 90 + 294542 GGTGGCAATTCTTCAGTGTAACATGAAGGAGGGCTGCATTTTACTGCCATTCAAATATCTTCCCAAGATGTATGTCAATTCTTACCTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299562 76 + 636262 GGTTGCAATTCTTCAGTGTAACATGAAGGAGGGCTGCATTTTACTGCCATTTAAATATCTTCCCAAGATATATGTC-------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 290497 90 + 647215 GGTGGCAATTATGCTGTCGAATATGAAGGAGGGCTGCCTTTTACTGCCATTCAAATATCTTCCCAAGATGTATGTCAATTCTTACCTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 150266 166 + 294542 CACTGACTCTTGTCTTAATATTTCTTACATGACTTTGTATAAAATCATTCATAGTCAGAATACAAAACCCCCGTCTGCAAGATGCACAGTCTGCAGATGATAGTCTCACTCGACTAGTAGTCTATGTCCCCTGACACATCTTTAGTTGTTAATTTAAATCACCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299638 166 + 636262 CACTGACTCTTGTCTTAATCTTTCTTATACGACTTTCTATAGAATCATTCATAGTCAGAATACAAAACCCCTGTCTGCAAGATGCACAGTCTGCGGATGATAGTCTCACTTGACTACTGGCCTATGTCCCCTGACACATCTTTAGTTGTTAATTTAAATCCCCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 290589 166 + 647215 CACTAACTCTTGTCTTAATATTTCTTACATGACTTTGTATAAAATCATTCATAGTCATAATCCAAAATCCCCATCTGCAAGATGCACACTCCACAGATAGTAGTCTCACTCAATTAGTAGTGTATGTCCCCTAACAAACCTTTAGTTGTTAAGATAAACCACCATC - -a -s mr.mrrefChr5 150432 59 + 294542 GACAATTGAGTTTAACCTGGTTATCACCATAATCAGATTGGGTTACACATCAGCCTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299804 38 + 636262 GACAATTG---------------------TAATCAGATTGGGTTACACATCAGCCTGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 290762 59 + 647215 CACACTTGAGTTTAACCTGGTTATCACCACAATCAGATTGGGTTACAGATCAGTCTTCC - -a -s mr.mrrefChr5 150491 15 + 294542 AGAACACTCCTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299850 15 + 636262 AGAACACTCCTTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 290821 15 + 647215 AGTACGCTCCTTCTA - -a -s mr.mrrefChr5 150506 116 + 294542 GCAAGTTGCTTGTTTAGTCCCCACAGCTGTGGATGCCACAACAATTTGAAATACAAGCTGTCTGCTTGTGAACCAGCACACATGGCAAGGGACCAATTTCAGAGCTCACATAGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299866 116 + 636262 GCAAGTTGCTTGTTTAGTCCCCACAGCTGTGGATGCCACAACAATTTGAAATACAAGCTGTCTGCTTGTGAACCAGCACACATGGCAAGGGACCAATTTCAGAGCTCACATAGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 290836 116 + 647215 GCGAGTTGCTTGTTTAGTCCCCACAGCCATGGATACTACAACAATTCAAAATCCTAGCTGTCTGCTCGAGAACCAGCACACATGACATGGAACCAATTTCAGAGTTCATATAGGCC - -a -s mr.mrrefChr5 150622 13 + 294542 GGTTACCAAGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299982 13 + 636262 GGTTACCAAGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 290987 13 + 647215 TGTTACCAAGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 150635 76 + 294542 TGGGATAAGGGGATTCGTCATTCTTCGTGATTACAACCAAGGTTCAATATATCTTCAGATGGATGATCTACATCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299995 76 + 636262 TGGGATAAGGGGATTCGTCATTCTTCGTGATTACAACCAAGGTTCAATATATCTTCAGATGGATGATCTACATCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 291036 76 + 647215 TGGCATAAGGGGGTTTGTCATTTGTCATGATTATTACCAAGGTTCATTATATCTTGAGATGGATGATCTACGGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 150711 91 + 294542 TTTGAGTACCAGGGTTGTTGAGTACCAAGGGTCCAGTATTTACTTACTTGGCTAATAGGAGCCCAATACTCCTGAATGTGGGGGATGAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300071 91 + 636262 TTTGAGTACCAGGGTTGTTGAGTACCAAGGGTCCAGTATTTACTTACTTGGCTAATAGGAGCCCAATACTCCTGAATGTGGGGGATGAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 291116 91 + 647215 TTTGAGTACCAGGGTTTTTGAGTACTAGGGGCTCAGTATTTGTTTACTTGGCTCATAGGGACCCAGTACTGCTTAATGTGGGGGATGTGAC - -a -s mr.mrrefChr5 150802 82 + 294542 TATTTTTAGAACTTGTGGAAAGGACCCTTGGGTGTGGGTGTATACCATAATCTCTAGCAGGTACCTGGATCTTGGTTACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300162 82 + 636262 TATTTTTAGAACTTGTGGAAAGGACCCTTGGGTGTGGGTGTATACCATAATCTCTAGCAGGTACCTGGATCTTGGTTACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 291210 82 + 647215 TATTTTTGAAACTTGTGGAAAGTACCCTTGGGTGTGGGTGTATTCTATAATCTTTAGTTCATACATGGATCTAGGTTACCCT - -a -s mr.mrrefChr5 150884 45 + 294542 TTGAATTGACTTTTGTAGATTTACGCCGGTATACTCCAAGTAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300244 45 + 636262 TTGAATTGACTTTTGTAGATTTACGCCGGTATACTCCAAGTAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 291326 45 + 647215 TCGAATTGACTGTCATAGATTTGTGCCAGTACACTTTGAGAAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 150929 52 + 294542 AGGTGATATAGGATAGGTGACTCTTCTGCCACTTCACAGTTCAATACCCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300290 52 + 636262 AGGTGATATAGGATAGGTGACTCTTCTGCCACTTCACAGTTCAATACCCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 291371 52 + 647215 AGGTGATACAGGATAGTTGACTCTTCTGCCACTTCACAGTTCACTACCCCCC - -a -s mr.mrrefChr5 150981 62 + 294542 CACCATCCACATGTCCAATATTTCAAGGCCTTTGCGTAGGACTTTGAACATAGTCAATGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300345 62 + 636262 CACCATCCACATGTCCAATATTTCAAGGCCTTTGCGTAGGACTTTGAACATAGTCAATGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 291423 62 + 647215 CACCATCCACATGTCCAATATTCCAAGCTTTTTGTGTAGGACTTTGCACATAGTCAATGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 151043 10 + 294542 TAACCTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300408 10 + 636262 TAACCTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 291485 10 + 647215 TAACCTGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 151053 130 + 294542 TCCTTGACACTGAATAATTAATTTCATGCTGAGAGCAAATTACAACTACAATTAATGGTAAGTTTCCAAGAAATACTATTGTTCGAACAGCTATAAGTTTATTAAATGTTTTTCCTTTCAAACTAGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300419 130 + 636262 TCCTTGACACTGAATAATTAATTTCATGCTGAGAGCAAATTACAACTACAATTAATGGTAAGTTTCCAAGAAATACTATTGTTCGAACAGCTATAAGTTTATTAAATGTTTTTCCTTTCAAACTAGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 291495 130 + 647215 TTCTTGACACTGAATCATTAATTTCATGCTGAGGGCAAAATATAACTACAATTAATGGTAAGTTTCCAAGAAATACTATTGTATGGATAGCTATAAATCTGCTAATTGTGCTTCCTTTAAAACTAGATAT - -a -s mr.mrrefChr5 151183 27 + 294542 GAATTCATGTGCCATAGGCTTCTCACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300549 27 + 636262 GAATTCATGTGCCATAGGCTTCTCACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 291629 27 + 647215 GAATTTATGTGACATAGGTGTCTCACA - -a -s mr.mrrefChr5 151210 82 + 294542 AGTGCCCCTTTGACTCTTGGATACATGGAGTATGACTGACACTGTTTGAGCTAGCTTTTGGCTTCAGGGATGTACACAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300657 82 + 636262 AGTGCCCCTTTGACTCTTGGATACATGGAGTATGACTGACACTGTTTGAGCTAGCTTTTGGCTTCAGGGATGTACACAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 291656 82 + 647215 AGTGCCCCTTTGACTTTTGGATACATGAAGTATGACTGACACTGTTTGAGATGGCTATGGGCGTCAGAGATGTACACATCGA - -a -s mr.mrrefChr5 151292 9 + 294542 TGCTACAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300739 9 + 636262 TGCTACAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 291739 9 + 647215 TATTACAGC - -a -s mr.mrrefChr5 151301 9 + 294542 TGCTGCCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300748 9 + 636262 TGCTGCCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 291749 9 + 647215 TGGTGCCAG - -a -s mr.mrrefChr5 151310 53 + 294542 TTGAATTGGCAATCAGTCTCTGGGAAAATATGGGTCCCCCTGCTACACTTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300778 53 + 636262 TTGAATTGGCAATCAGTCTCTGGGAAAATATGGGTCCCCCTGCTACACTTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 291758 53 + 647215 TTGAGTTGGCAATGAGTCTGTGGGAAAGTCTGTGTCCACCTCCTACCCTTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 151363 107 + 294542 AAGAAGTTCATTCAAGAAGTGGTATCTACATCCCTACTTTAACAGACAATCTTACATGTCTACCACCCTCCTCAACAGCCTGTGGGGACCAAAGTTCTTGATTCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300836 107 + 636262 AAGAAGTTCATTCAAGAAGTGGTATCTACATCCCTACTTTAACAGACAATCTTACATGTCTACCACCCTCCTCAACAGCCTGTGGGGACCAAAGTTCTTGATTCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 291941 107 + 647215 AAGCAGTTCATTTAAGAAGTGGTATCTGCATCCTTACTTTACAAAACAATCTAACTTGCCTGCTGCCCTCCTCTACACCTTGTGGAGACCAAAGTTCTTGATTCACT - -a -s mr.mrrefChr5 151470 116 + 294542 TTGGGATTATCATTGGCTGGAGTCTACCTAACTTTTGGCTTCAAGTGATTGTTTTTACAAGATAGACCCAAGGAATCTAAGATTGCTAACTTCTTCCTCACTGGTGACTTGGTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300943 116 + 636262 TTGGGATTATCATTGGCTGGAGTCTACCTAACTTTTGGCTTCAAGTGATTGTTTTTACAAGATAGACCCAAGGAATCTAAGATTGCTAACTTCTTCCTCACTGGTGACTTGGTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 292056 116 + 647215 TCAGGATTATCATTGGTTGAAGTCTGCCTGACTTCTGGCTCCAAGTAATTGTTCTTAGAAGGTAGACTCAAGGAATCTAAGATTGTTGACTTCTTCCTCACTGGTGACGTGATAAA - -a -s mr.mrrefChr5 151586 69 + 294542 GATGTATAGCCAATCTCCCCCCTCATGTGCTTTATTGTGGATCAGTCCTACCCTGTACTACCTATTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301059 69 + 636262 GATGTATAGCCAATCTCCCCCCTCATGTGCTTTATTGTGGATCAGTCCTACCCTGTACTACCTATTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 292301 69 + 647215 ATTAGATAGCCAACCTCCCCCCTCCTGTGCTTTATTGAGGATCACTCCTACCCTGTGTTACCTATTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 151655 62 + 294542 GAAGTTGTGTTAGTCCAGTGTGTGTAGGTGTGCCCCCAATCCATAGATGAGGGTTTTCACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301130 62 + 636262 GAAGTTGTGTTAGTCCAGTGTGTGTAGGTGTGCCCCCAATCCATAGATGAGGGTTTTCACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 292370 62 + 647215 GAAGGTGTGTTAAACCAGTATGTACAGGTGTGTCCCCAATCCATAGATGAGGGTTTTCATCA - -a -s mr.mrrefChr5 151717 158 + 294542 TGCCATGATATACTATTAACTCTATCTACTACAAAGAGGTATGATCAGCAGTAGAGTGGTGGTTCAGGTAGAGTCATGGTTTAGTTGGTACCACTGATTAGTGTAAAGAATTTGATCTAAGTGTATCCTGAGCTTACCCCAGTTCCTTGCTTCAGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301192 158 + 636262 TGCCATGATATACTATTAACTCTATCTACTACAAAGAGGTATGATCAGCAGTAGAGTGGTGGTTCAGGTAGAGTCATGGTTTAGTTGGTACCACTGATTAGTGTAAAGAATTTGATCTAAGTGTATCCTGAGCTTACCCCAGTTCCTTGCTTCAGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 292446 158 + 647215 TGCCATGCTATACAGTTGACTCTTTCTACCACAAGGAGGTGTGATCAATAGTAGAGCAATGGTTTGGGTAGAGTCATGGTTTAGTTGGTTTCACCGATTAGCAAAAAGAATTCGATCTAAGTGCATCCTGAGTTTAATCCATTTCCTTGCTTTGGCTA - -a -s mr.mrrefChr5 151875 24 + 294542 TTTGCTCGAAGATTTGCTTTGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301350 24 + 636262 TTTGCTCGAAGATTTGCTTTGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 292607 24 + 647215 CCTGCTGTTAGACTTGCTTTGCAA - -a -s mr.mrrefChr5 151899 97 + 294542 ATTAATGAGTGATGGCTTAATTACACCTAATCTTGTTGCTATTGTTACATTAGATGAACTACTCAGGTGTAATCCATTATTTCAATAGCTGTATCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301374 97 + 636262 ATTAATGAGTGATGGCTTAATTACACCTAATCTTGTTGCTATTGTTACATTAGATGAACTACTCAGGTGTAATCCATTATTTCAATAGCTGTATCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 292648 97 + 647215 ATTAATGAGCGATGGCTTGATTACACCTAATCTTGTTACTGTCCTTACATTAACTGAGCTACTCGGGAGTAATCTATTATTTCAAGAGCTGTATCTA - -a -s mr.mrrefChr5 151996 25 + 294542 GGCACACAACAGATGGTTTTGACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301471 25 + 636262 GGCACACAACAGATGGTTTTGACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 292746 25 + 647215 GGCACACAATAGATGGTTTCAACAC - -a -s mr.mrrefChr5 152021 53 + 294542 CTTATCTCAGAACCTTACCCCAGGACAAGCTATATCTCAGCACAATTTAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301507 53 + 636262 CTTATCTCAGAACCTTACCCCAGGACAAGCTATATCTCAGCACAATTTAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 292771 53 + 647215 CTTATCTCAGTATCTTACCCCAGGACAAGCTATATCCCAGCACAAATTAAATT - -a -s mr.mrrefChr5 152074 62 + 294542 TATTTAATCATTTAATCTCATAAGCCCCGGTAACATATTCTTGCCAGAAACCACTTTCAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301560 62 + 636262 TATTTAATCATTTAATCTCATAAGCCCCGGTAACATATTCTTGCCAGAAACCACTTTCAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 292831 62 + 647215 TATTTAATTATTTAATCTCATAAGCCCAGGTAAAATACTCTTGCCACAAACCAACAACAATA - -a -s mr.mrrefChr5 152136 104 + 294542 TTAGAGTTAGAGGCCTAAGCCACTGTCAGCCTAAACCATTGATTTCTAGACTCTTGACCATGTGCCCCCCTGTTTATCAATTTATATGAACTTGGCCCTCTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301628 104 + 636262 TTAGAGTTAGAGGCCTAAGCCACTGTCAGCCTAAACCATTGATTTCTAGACTCTTGACCATGTGCCCCCCTGTTTATCAATTTATATGAACTTGGCCCTCTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 292893 104 + 647215 TCAGAGTTAAAGGCCTAAGCCACTGTTTGCTTAAACCATTGATTTCTGGACTCTCAACCATGTTCCCCCCTGTTTATCAGTATATATGAACTTGCCCTGCCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 152240 84 + 294542 CTTTCTCATGACTTGCTTGAGGTTTATTCAGGGCTATGTTGCAGTTCCTCAATACCTCTTCCAGATATTCCAGATTTCTAGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301732 84 + 636262 CTTTCTCATGACTTGCTTGAGGTTTATTCAGGGCTATGTTGCAGTTCCTCAATACCTCTTCCAGATATTCCAGATTTCTAGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 292998 84 + 647215 CTTTATCATGATTCGCTGGAGATTTATTCAGGGCTATGTTGCAATCCCTCAATGCCTCTTCCATGTGTACCAGTTTTCTAGATA - -a -s mr.mrrefChr5 152324 67 + 294542 CCACAAAGTTTATGATCCCTGGAGTGGATATAAGTTGTTTTGCAATTGCTGGCGCCTTGGTTGGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301816 67 + 636262 CCACAAAGTTTATGATCCCTGGAGTGGATATAAGTTGTTTTGCAATTGCTGGCGCCTTGGTTGGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 293083 67 + 647215 CCACAAAGCCTATGATCCCTGGAGTGGCTATGAGTTGTTTTGCAATTGCGGGTGCCTTAGTTGGGCA - -a -s mr.mrrefChr5 152391 26 + 294542 CATTATCGTGTGTTGCATAATAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301894 26 + 636262 CATTATCGTGTGTTGCATAATAGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 293150 26 + 647215 CTTTTTACTGTTTAGTGTCATGTGCA - -a -s mr.mrrefChr5 152417 120 + 294542 GCAAGTGACTTCTTACTGTTAGTGTCATATGCATACTGTGCAAACTAGCACATATAAGGCTTGCTATGTCAAAAGCTCCAGAAAGCTAGGCAGAATCGATTAAGATGCTCTGAGAGGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301920 120 + 636262 GCAAGTGACTTCTTACTGTTAGTGTCATATGCATACTGTGCAAACTAGCACATATAAGGCTTGCTATGTCAAAAGCTCCAGAAAGCTAGGCAGAATCGATTAAGATGCTCTGAGAGGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 293222 120 + 647215 GTTGGGCACTTTTTAATGTTAGTGTCATACGCTTACTGTGGAAACTAGCAGATATAAAGCTTGCCATGTCAAAAGCTCCAGTAAGCTAGACAAAATTGATTAAAACAATCTGAGAGGCAA - -a -s mr.mrrefChr5 152537 29 + 294542 CTGTTCCTTTAAGGTTTAAAGTAGAAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302040 29 + 636262 CTGTTCCTTTAAGGTTTAAAGTAGAAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 293355 29 + 647215 CTGTTCCTTTCAGGTTTAAAGTAGAAATA - -a -s mr.mrrefChr5 152566 67 + 294542 GATATGAATAGGATTTATGATACTTCTGTATCCCTGTACTCATTAGGAGAGCCTCACTTGAGAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302080 67 + 636262 GATATGAATAGGATTTATGATACTTCTGTATCCCTGTACTCATTAGGAGAGCCTCACTTGAGAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 293384 67 + 647215 GATATGAATAGGATTTGTGATATTTCTGGATCCCTGTACTCATCAGGAGAACATCATTCGAGACAAA - -a -s mr.mrrefChr5 152633 41 + 294542 TGGATGATGATAGTTGAATGGAATCTTCAACCATAGAGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302149 41 + 636262 TGGATGATGATAGTTGAATGGAATCTTCAACCATAGAGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 293451 41 + 647215 TGGATGATGATAGTTAAAAGGAATTGTCAACCATGGAGATA - -a -s mr.mrrefChr5 152674 143 + 294542 TACGCAGGCTATATCTATTTGGGCGCACTAGAGCTTCCTGAAAATAATCTTGGAGTAAGTTTGAACACGCAGTACATGGGATATAAGGGGGTAAACCCATTCATAGCTGCATGTACAAGTCATCATGATTCAGGGCAGCGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302192 143 + 636262 TACGCAGGCTATATCTATTTGGGCGCACTAGAGCTTCCTGAAAATAATCTTGGAGTAAGTTTGAACACGCAGTACATGGGATATAAGGGGGTAAACCCATTCATAGCTGCATGTACAAGTCATCATGATTCAGGGCAGCGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 293492 143 + 647215 TATTCAGGCTAGTTCTATTTGGGCCCACTAGAACTTCTTGAAAACAATCTTGGAGTATATTTGAATAGGAAATACATGGGCCATAAGGGGGTAAAGCCATACATAGCATCATATACCAGTCATTGTGATTCGGGGCAGGGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 152817 24 + 294542 AATCCGATATATAGGAAGTTCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302335 24 + 636262 AATCCGATATATAGGAAGTTCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 293637 24 + 647215 AATCCAATATACAGGAAGTTCATA - -a -s mr.mrrefChr5 152841 56 + 294542 GATATGCTAGTGTTCACCTTTTGGGGTGGCTTGAATTTTCTGTGGGGAGGACGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302360 56 + 636262 GATATGCTAGTGTTCACCTTTTGGGGTGGCTTGAATTTTCTGTGGGGAGGACGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 293661 56 + 647215 AATATGCTAGTGTTCACCTTGTGGGGCGGGTTGAATTTCTTGTAGAGAGACCAATT - -a -s mr.mrrefChr5 152897 27 + 294542 GGGCATGACCCTTGGGCATGACAACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302417 27 + 636262 GGGCATGACCCTTGGGCATGACAACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 293717 27 + 647215 GGACATGACCATTGGGCATGACAACAG - -a -s mr.mrrefChr5 152924 80 + 294542 ATACTCCCATTACAGTGGTGACTTATTAAACTTATATCTGTCATGCCCACTGGCTTCAGGAGTGAAGCCCATCTCTACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302450 80 + 636262 ATACTCCCATTACAGTGGTGACTTATTAAACTTATATCTGTCATGCCCACTGGCTTCAGGAGTGAAGCCCATCTCTACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 293744 80 + 647215 ATACTCCCATCACAGTGGTGATTTATTATACTCATATTTATTCATCCCCATGGCTTCGGGAGTGAGGCCCATCTCTACTA - -a -s mr.mrrefChr5 153004 6 + 294542 ACAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302530 6 + 636262 ACAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 293825 6 + 647215 ACAGTT - -a -s mr.mrrefChr5 153010 42 + 294542 ACACATCACACCTCCCTCATCAGCATAAAAGGAGTTACTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302536 42 + 636262 ACACATCACACCTCCCTCATCAGCATAAAAGGAGTTACTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 293833 42 + 647215 ACACACCACACCCTCTTTGTCAGCATTAATGGAGTTACTTTG - -a -s mr.mrrefChr5 153052 18 + 294542 CAGTTGTTCAGTTATGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302578 18 + 636262 CAGTTGTTCAGTTATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 293876 18 + 647215 CAGTTGCTCAGTTATGCT - -a -s mr.mrrefChr5 153070 19 + 294542 TGAATAATTCCCTTATTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302596 19 + 636262 TGAATAATTCCCTTATTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 293898 19 + 647215 TGAATAGTTCCCTTATGGC - -a -s mr.mrrefChr5 153089 157 + 294542 CAGGTGCTTCTTCATGCACTCACATTCATGACAACTGGGTCGTGATGCCAGTCCTTATACACAGACTCATTAACTTTTGACTGGGTGTGAGTAGCCAATCTTCTGAAGGTTGGAGACAACTCCACATCCTGCTGACAGAGTTGATCACCTTCATCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302615 157 + 636262 CAGGTGCTTCTTCATGCACTCACATTCATGACAACTGGGTCGTGATGCCAGTCCTTATACACAGACTCATTAACTTTTGACTGGGTGTGAGTAGCCAATCTTCTGAAGGTTGGAGACAACTCCACATCCTGCTGACAGAGTTGATCACCTTCATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 293920 157 + 647215 CAGGTGCTTCCTCATGTGCTCACTTTCATAACACCTGGGTATTGATGCCAGTCCATCTACTCAGACTAATTAATTTTTGAGTGTGTGTGAACTGGCAGTCTTCTGAGGCTTGGAGACGACTTAAAATCCACCTGACAGAGGTGAGCACGTTCATCCG - -a -s mr.mrrefChr5 153246 9 + 294542 TTATATGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302772 9 + 636262 TTATATGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 294078 9 + 647215 TTATATGTC - -a -s mr.mrrefChr5 153255 16 + 294542 TCTCTCTGAATAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302781 16 + 636262 TCTCTCTGAATAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 294354 16 + 647215 TCTCTGTCAATGAAGT - -a -s mr.mrrefChr5 153271 46 + 294542 AAGCTAGTAATGTCTCCAGTATATCTAACCTACAACCAGATACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302797 46 + 636262 AAGCTAGTAATGTCTCCAGTATATCTAACCTACAACCAGATACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 294372 46 + 647215 ACACAAGTAATGCTTCCAGTATATCTGACCTACAGCCAGATACAAC - -a -s mr.mrrefChr5 153317 242 + 294542 AACGGGTCACTCTTTGAAATACAGGTACAATTATCTTTATATACCTCATTCTTTAGATGGCTTTATTATACTAGGTGCCTCTGTGCCATACACTTGGGACTTATTTTCCCTACTGACCACTCTATTGAGTGGAATTTGTTAAATAGAAGGAGTAATGGGCGAAAACTCAAAACTTGGCCTACAACTTGAATACACAGAAGGCCTTAAATGGGAATGCCTTAGATGAATAAACTAATTCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302843 206 + 636262 AATGGGTCAC------------------------------------CATTCTTTAGGTGACTTTATTATACTCGGTGCCTCTGTGCCATACACCAGGTACTCATTTTCCCTACTTACCTCTCTATTGAGTGGAATTTGTTAAAGAGAAGGCGTAATGGGTGAAAACTCAAACTTTGGCCTACAACTCGAATAAACAGAAGGCCTTAGATGGGAATGCCTTAGACAAATAAACTACTTCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 294422 242 + 647215 GACGGGTCATTCTTTGAAATACAGGTACAATTATCTTTATATACCTCATTCTTTAGATGGCCTTGTTATACTAGGTGCCTCTGTGGCATGCACTTGGGAATTGTTTTCCCAACTGACCACTCTATTGAGTGGAGATTGTAAAATAAAAGGAGTAATGGGCGAAAGCTCAAAACTTGGCGTACAACTTGAATGCACAAAAGGCCTTAAATGGGAAAGCCTTAGATGAATGAAATAATTCTATG - -a -s mr.mrrefChr5 153559 69 + 294542 ATGGTCCGGTTACTATAACAAGAGGTACAAGAATGTGAGCCACACTTCCCAAATATTATAGGTCAGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303050 69 + 636262 ATGGTCTGGTTACTACAAAAAGAAGTACAAGGATGTGAGCCACACTTCCCAAATCTTATAGGTCAGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 294664 68 + 647215 ATGGTCCAGTTATTATAACAAGAGGGACAAGAATGTGAGCCACACTTCCC-AATATTATAGGTCAGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 153628 222 + 294542 GTACTATACAATATATAATCCATTCTGACAACAATTGAAGGGGAGAATAGTATTGGACTCTACCCCTGGATTTTGAAAGGGCTTGATTTAACACTTAGCACACAGACAGCACATATGGATCAGTGTAACAGCACTTCATGAAAATAAGTTGGCTGATGAGGGATAGGGATGTAGGATGAATGAAGAAGTTCATAGAATAAAGTACCGTCACCAGTTTGTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303124 222 + 636262 GTATCATACAAAATATAATCCATTATGACAACAGTTGAAGGGGAGAATAGTATTGGACTCTACCCACGGATTTTGAAAGGGCTTGATTTAACACTTAGCACACAGACAGCACATATGGATCAGTGTAACAGCACTTCATGAAAATAAGTTGGCTGATGAGGGATAGGGATGTAGGCTGAATGAAGAAGTTCATAGAACAAAGTACTGTCACCAGTTTTTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 294732 221 + 647215 GTACTGCACAATATATAATCCATTCTGACAACAATTATAGGAGTGTATAGTATTGGACTCTACCCCTGGATCTTGAAAGGGCTTGAATTACCAGTTAGCCCACAAACAGAACATATGGATTAGTATAACAGCACTTCATGAGAATAAATTGGCCGATGAGGGATAGGGATGTAGGAT-GATGAAGAAGTTCATAAAATAAAGTACCGTCACCAGTTTGTCAG - -a -s mr.mrrefChr5 153850 40 + 294542 CCACCTCTGTCTTCAATAGTTGTCATCCATTTCTTTGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303350 40 + 636262 CCACCTCTGTCTTCAATAGTTGTCATCCATTTCTTCGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 294953 40 + 647215 CCACCTCTCTCTTCAATAGTTGTCATCTATTTCCTTGCTA - -a -s mr.mrrefChr5 153890 39 + 294542 ATAGTATGTAGATCAATTCATCAGTTTGTCACTTTGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303390 39 + 636262 ATAGTATGTAGATCAATTCATCAGTTCGTCACTTTGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 294994 39 + 647215 ATAGTGTGTAGATCAATTCTTTAGTTTGTCACTTTGTCC - -a -s mr.mrrefChr5 153929 68 + 294542 CCAAGCACATGCTCTGTGCCAATTGGTCAACCTTGGTGGTTAAAAGAGCTAAGGTTAACTCAGGAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303430 66 + 636262 CCAAGCACATGCC--ATGCCAATTGGTCGACCTTGGTGGTTAAAAGAGCTAAGGTTAACTCAGGAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 295033 68 + 647215 CCAAGCACATGCTCTGGGCCAATTGGTCAACCTTGGTGGTTAAAAGAGCTAAGGCTAACTCAGGAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 153997 5 + 294542 CTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303496 5 + 636262 CCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 295104 5 + 647215 CTATT - -a -s mr.mrrefChr5 154002 12 + 294542 TGTGGTAGCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303563 11 + 636262 TATGG-AGCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 295296 12 + 647215 TGGGGTAGCCTT - -a -s mr.mrrefChr5 154014 128 + 294542 GTCCCTGCTATCTGATCTAGCGTGTGAATCAATCCTAGGCCCACATATGTTGCTTGGATAGCATGAGTTATGGGTGTTGTCATCCTTCAGCAATATGGAATTGACTGCTTAAAACTCATGAGTTATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303574 122 + 636262 ---CCTGCTATCTGATCTAGCGTGTGAATCAATCCTAGGCCCACAAATGTTGCTTTGATAGCATGCGTTATGGGTGCTGTCAT---TCAGCAATATAGAATTGACTGTCTAAAACTCATGAGTTATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 295312 128 + 647215 GTCCCTGCTACCTGATCTAGTGGGTGAATCAATCCTATGCCTGCATATGTTGCTTGGCAAGCATGAGTTATGGGTGTTGTTACCCTTCAGCAATGTGGAATTGAATGCTTAATGCTCATGAGTTATGG - -a -s mr.mrrefChr5 154142 18 + 294542 GTGCCATCGGTTGGCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303696 18 + 636262 GTGCCATCGGTTGGCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 295441 18 + 647215 GTGTCATTCTTTGGCAAT - -a -s mr.mrrefChr5 154160 149 + 294542 ACTGCTTAAAACTAGGCATTGCTAGAACCCCTGCTCACAGTGCATCAAGATGCAAGATACATGAGAAAGGTGCAGATTCTAGCTGTGCATGCCTCCCAGCTTTGGGTTCCAACTTTAACCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303723 149 + 636262 ACTGCTTACAGCTAGGCATTGCTAGAACCCCTACTCAAAGTGCATCAAGATGCAAGATACATGAGAAAGGTGCAGATTCTAGCTGTGTGTGCCTCCCAGCTTTGGGTTCCAACTTTCACCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 295459 149 + 647215 ACTGCTTAAAACTAGGCACTGCTAAAACCCTTGCTCACAGTGGATCAAGATGCAAGATACAGGAAAAAGGTGCTGATTCTAACTGTGCATGCCTCCCAGCTATGGGTTCCAATCTTAAGCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG - -a -s mr.mrrefChr5 154309 57 + 294542 CAAGATTAGGTTGGTTTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACATTGTCCCAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303873 57 + 636262 CAAGATTAGGTTGATGTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACACTGTCCCAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 295608 53 + 647215 CAAGATTAAGTTGGTTTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACATTGTCCC---- - -a -s mr.mrrefChr5 154366 316 + 294542 GAAACCCAAGCTTCACCAATGTAGTAATGACTATCTTGGATCTATAAGATCTTCCTCTAATAACTGGGGAAGGGCAGAATATTGATGAGTTGACTCTAGAGGTGCTAAAATGCTAATATAAATGAATTGTGATACTGAGCCACATGAGTAGTGAAACAAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCTGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCTAGAGCATTCTCTAAGGCTGACAGACATACTTGAGTTTTTACTCCGATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACATAGGGGGAGGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303931 306 + 636262 GAAACTTAAGCTTCACCAATGTAGTATTGACTATCTTGGACCTACAAGATCTTCCCCTAATAACTAGGGAAGGGCAGAATATTGATGAGTTGACTCTTGAGGTGCTAAAGTGCTAATATAAAGGGATTGTGATACTGAGCCACATGAGTAGTCAAACAAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCTGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCT----------CTAAGGCTGACAGACATATTTGAGTTTTTACTCCGATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACATAGGGGGAGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 295661 312 + 647215 ----CCCAAGCTTCACCAATGTAGTGATGACTATCTAGGGTCTATAAGATCTTCCTCTAATAACTGGGGAAGGGTAGAATATTTATGAGTTGACTCTAGAGGTGTTAAAATGCTAATATGAATGAATTGCAATACTGAGTCACATGAGTAGTGAACCCAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCCGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCTAGAGCATTCTTTAAGACTGACAGACATACTTAAGCTCTTACTCCCATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACACAGGGGGAGGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 154682 14 + 294542 TAGTGAACAACCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304237 14 + 636262 TAGTGGACAACCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 296021 14 + 647215 TAGTGAACAACCAC - -a -s mr.mrrefChr5 154696 364 + 294542 TACGGGATGACTCTGTGTGGTTAGTTAATTAAGCACCCTTGCCCTAACTTGGGTTCAGTCACGCTTCTCATCTTACTGTTTAACATCAGATCTTTGAAGCCATATCAAAGCTCCCCTATTGTATAACCCTCACAACAGCTCAAGGAACATTTTGCATTCAATCATGGAGGTGAGATTGCTGATGATTCATTTCTACCAGCCTAGGATACCACAAGACCCATGGTGATGAGTGGTTGTGTTAAGGACACACATCTAAGTGTGATCAAGGCACCCAGGGGCCTATGGTTCCTTGAATATCCTAAGAAGTAATTGTAGACTGTCATGATAAGACTGTGATTTGCTTGCAATTTAGTCAGTGTCAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304251 357 + 636262 TATGGGATGACTCTGTGTGGTTAGTTAATTAAGCACCCTTGTCCTAACTTGGATTCAGTCACGCTTCACATCTTACTGTTCAACATCAGATCTTTGAAGCCATATCAAAGCTCCCCTATTGTATAACCCTCACAATAGCTCAAGGAACATTTTGCATTCAATCATGGAGGTGAGATTGCTGATGATTCATTTCTACCAACCTAGGATAACACAAGACCCATAGTGCTGAGTGGTTGTGTTAAGAACACACATTTAGGTATGATCAAGGCAACCAGGGGGCTATGTTTCCTGGAATATCCTAAGAAGTGATTGTAGACTG-----ATAAGACTGTGATTTGCTTGCAATTTCGTCAGTGTCAG-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 296038 342 + 647215 TACTGGATGACTCTCTGTGGTTAGGTAATTAAGCACCCTTGCCCTGACTTGGGTTCAGTCAAGCTTCTCATTTTACTGTTTAGCATCAGATCTTTGAAGCCACATCAAAGC-------------------CACAACAGCTCAAGGAACATTTTACATTCAATCACAGATGAGAGATGGCTGCTGATTCATTTCTACTGGCCAAGGATACCACAATACCCATGGGGATGAGTGGTTGTGTCAAGGACACACATCTAAGTGTGAACAAGGCACCCAGAGGCCTATAGTTCCTTGATTATCCTAAGAAGCAATTGCAGACTGTCATGGTAAGACTGTGA---GCTTGCAATCTAGCCAGTGTCAGGT - -a -s mr.mrrefChr5 155060 54 + 294542 TAGACAGGGTGTCTAACACTGTGAGTATACTAGGTTTGTGGGAGTTATTATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304608 41 + 636262 -------------TGACATCGTGAGTATACTAGGTTTGTGGTAGTTATTATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 296381 54 + 647215 TAGACAGGGTGTCTAACACTGTGAGTATACTAGGCTGGTGAGAGTTACTATTTG - -a -s mr.mrrefChr5 155114 38 + 294542 TCCTATCAACCCAATGGGGTTATGAAATGCCAACTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304650 38 + 636262 TCCTATCAACCCAATGGGGTTATGAAATGCCAACTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 296435 37 + 647215 TCCTATCAACCCAATGGGATTATGAAGTGTCAACTCA- - -a -s mr.mrrefChr5 155152 390 + 294542 TTTTCAGCGGCATTTTTTCAGTGAGTATAGCATGAATTAGATGTACAGGGAGGACAAATTTATTGGCATACACTGATAAAACTTAGGGCAATTTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATGTTACAAGGCAACTGTTCATGCCCTGTTAGATTGCTTTAACACACCATGATCATTCCTACTATTGCTACTGTATACTTGCCTCGGGCATGTGGGCACATGTGTTTGGTATTAATATGCCATGAACCTGCTGTTAATCCTCTAACAATGCTGATTACAATCTTCTTACCTAGGAAAACCAGATAGGCTAACCACATTATTAGGACCTGTATTGGAGGTGTTCGTTTACCCACGTCATGCTCCCAAGTGTGATCCCCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304690 390 + 636262 TTTTCAGCAGCATTTTTTCAATGCGTATAGCATGAATTAGGTGTGCAGGGAGGACAAATTTAATGGCATACACTGATAAAACTTAGGGCAATTTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATATTACAAGGCAACTGTTCATGCTCTGTTAGATTGTTTTAACACACCATGATCATTCCTACTATTGCTACTGTATACTTGCCTCGGGCATGTGGGCACGTGTGTTTGGTATTAATATGCCATGAACTTGTTATTAATCCTCTAACAATGTGGTTTGCAATCTTCTTACGTAGGAAAACCAGATAGGCTAACCACGTTATTAGGACCTGCATTGGAGGTGTTTGTTTACCCACGTCATGCTCCCAAGAGTGATTCCTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 296472 373 + 647215 ---TCAGCGGCATTTTTTCAGTGAGTATAGCATGAATTAGATGTACAAGGAGGACAAATTTATTGGCAAACACTGATAAAACTTAGGGAAATCTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATGTCACAAGGCAACTGCACATGTCCTGTGAGATTACTTTAACACACAATGCTCATT--TACTATTGCTATTGTATACGTGCCTCGGGCATGTGGGCTCATATGTTTGGTATTAATATGCCAGGAGCCTACTGTTAATC----------GCTGATTACAATATTCTTCCCTAGGGAAACCAGATAGGCCAACTACATTATTAGGACCTGTATTGGAGATGTTCTTTTACCCACGTCA--CTCCCAATTGTGATCCCCAGA - -a -s mr.mrrefChr5 155542 247 + 294542 ACCCTTTGCATTAGTCTCAAGGTTATACATATTAGGCTGGATCTCATGTTATCTGAATACATCTGTAGTTGCATCATCACTAAGCTTAATTTGTAATAGTCCATTTTAAAGTCCAATTGATTTTAAGTTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGAGGCCTAAACTATGTGGCATCATCTACCTAACGTTTGGGTAACAATGAGAGTGAAAAAATTTTTCTTTGATGGAGATGTGTAGACAGGGCTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305082 197 + 636262 ACCCTTTGCATTAGTCTCAAGGTTGTACATATTAGGCTGGATCTCACGTTATCTGATTATATGTGTTGTTGCATCATCACTAAGCTTAATTTGTAATAGTCCATATTAAAGTCCAATTGATTTTAAGTTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGACGCCTAAACT--------------------------------------------------TTTCTTTGATTGAGACGTGTAGACAGGGCTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 296845 240 + 647215 ACCCTTTGCATTAGCCTCAAGCTTATACATATTAGGCTGGATCTCATGTTATCTGGATACATCTGTAGTTGCATCATCGCTAAGCTTAATTGGTAATAGTCCATTTTCAAGTCCAATTGATGTTGAGGTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGAGGCCTAAGCTATGTGGCATCATCTACCTAACGTTTGGGTAACAATGAGAGTGAAAAAATTTTTCTTTGATGGAGATGTGTAGACAGG------- - -a -s mr.mrrefChr5 155789 91 + 294542 AACTTATATATCAGCTAAATGACTATGTAAAAAAAATAATATTCCTCTGAGAGATGACGTACACCATATATTACCCTAGGGGATGTAACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305281 91 + 636262 AACTTATATATCAGCTAAATGACTAAATAAAAAAAATAATATTCCTCTGAGAGATGACGTACACCATATATTACCCTAGGGGATGTAACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 297085 60 + 647215 AACTTATAGATCACCTACATGACTATGTTAAAAAAATAAAAT-CCTCTGAGAGATGACGTA------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr5 155880 128 + 294542 TTGCATAACAGCCATGCCCCCATAACCCAGGTCTTTGTTCCTAATCTGTGTGACATCATTGGAGAGAACAACTGGCATCCAGGTCATCTACTCCTCCAAAGTTATGGCATGAACTCTTAAGCTGTAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305373 128 + 636262 TTGCATAACAGCCATGCCCCCATAACCCAAGTCTTTGTTCCTAATCTGTGTAACATCATTGGAGAGAACAACTGGCATCCAGGTCATCTACTCCTCCAAAGCTATGGCATGAACTCTTAAGCTGTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 297145 118 + 647215 ----------GCAATGCCCCCATAACCCAGGTTTTTGTTTCAAAGCTGTGTGACATCATTGGGGAGAACAACTTCCATCTAGGTCATCTGCTCGTCCAAAGTTGTGGCATGAGCTCTTAAACAGTAGT - -a -s mr.mrrefChr5 156008 12 + 294542 GGAAGTGTTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305503 12 + 636262 GGAAGTGTTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 297263 12 + 647215 GGAAGTGTTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 156020 252 + 294542 TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTCTGCTCTATTACATTTATCTATGGAGACTAACGTTCCCTTAAAGTTCTGGTGCTTATCCCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCATATAAGGCCAATCTGTCTACTGCCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCATGATATAACTGAGCTGAGGTTTTTGAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305515 252 + 636262 TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTGTGCTCTATTACATTTATCTATAGAGACTAACGTTCCCCAAAAGTTCTGGTGCTTATCTCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGGACAGCTGGGTCATATAAGGACAATCTGTCTACTGGCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCACGATATAACTGAGCAGAGGTTTTTGAAAATAGAGGATTAAGGTTTAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 297277 252 + 647215 TGAAGCTGTAATTGCTATAATACCCTGGGAAGTTCATGCCTCTTCTGTTCTATTACATTTGTCTATGGAGACTAATGTACTCTTAATGTTCTGGTCCTTATCCCCGAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCACATAAGGCCAATCTGTCTGCTGCCATAACTTTGAAGCATACCTTTTGCCCATCTCCATGATATAACTGAGCTAAGGTTTTTTAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA - -a -s mr.mrrefChr5 156272 72 + 294542 CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAGAAGGTGAGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACAGGGTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305769 68 + 636262 CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAG----TGGGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACTGGGTGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 297529 72 + 647215 CCTGAAGCAATGGGTTTGTGTAGAAGGTGAGTGAGCCCGATTCACATTGAGCTCTATCTGGACAGGATGTAC - -a -s mr.mrrefChr5 156344 64 + 294542 ATTTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACTTAGAATGGCTAACCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305910 64 + 636262 ATCTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACCTAGAATAGCTGGCCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 297601 64 + 647215 ATTGAGGGGGTTAGCCTGCTCATCAGCACTTACTAATCCGCCGTACTTAGAATGACTAACCAAT - -a -s mr.mrrefChr5 156408 477 + 294542 CAGTCTGGTGGTTGATGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGGATTGGTATTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATGCCTTTATGTTTCTTTTATCTTAGGCATACTTCCGTCATAAACAGAGTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTCAACCTTATGCTTACACAAGTAAGAACTTAGGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGACAGTCTTGTTAGCACCATTCCTTGTACAGGAACCTCTGATTCGCATTCACAATTCTGCACTACCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACTAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCATACACAAGCTTTTCTCACAGCATGGGTGAGGTGTGGTATAGTGGCTTAATATTTTGGGCACTTTTTCTCTCTGGAAAATCAGTTCAAAGAAGAGCTACATCCAGCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306031 473 + 636262 CAGTCTGGTGGTTGATGATTGAAAATTATAAGGTGTGTGTTCTAGTGGATTGGTGTTACAAGGTACGCAT-GCAAGTGTTATGCCTTTATGTCTCTTTTATCCTAGGCATGCTTCCGTCATAGACAGAGTTTGATGTGATG---TTGGGTGACCTCAACCTTATGCTTACACAAGTAAGAACTTAGGTATAGTGTGATAGTCCCATCCAGTTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGACAGTCTTGTTAGCGCCATTTCTTGTACTGGAATCTCTGATTCGCCTTCACAATTCTGCACTACCTGATGAAAGTAGGTACTCACAAAACTAACACATGATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATATATCATACACAAGCTTTTCTCACAGCATGAGTGAGGTGTGGCATAGTGGCTTAATATTTTGGGCACTTTTTCTCTCTGAAAAGTTAGTTCAAAGAAGAACTACATCCAGCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 297665 457 + 647215 CAGTCTGGTGGTTGGTGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGG-----TAGTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATCC------GTTCCTTTTATCTTAGTCATACTTCTGTCATAAAAAGATTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTTAACCTTATGCTTAGACAAGTGAGAACTTAAGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGATAGTCTTGTTAGCACCACTCCTTATACAGGAACCTCTGCTTCACATTCACAATTCTGCACTGCCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACGAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCACGCAAAAGCT--------TGCATGGGTGAGGTGTAGTATAGTGGCTTAGTATTTTGGGCACTTTTTCTCTGTGGAAAATCAG-TCAAAGAGGAGGTACATCCAGCACC - -a -s mr.mrrefChr5 156885 208 + 294542 ATGTAGGATGTCACCCTTGAGTGGCATGGGCAGTGAAACAGCTGGTTTATTAATGTACAACTTCAAGCAGTGTCCCAATGGGTGTAGTCAACATATAATATCAGACCTTCACTACAGAAGGCTCCATACAGAGGTTACACTCACATGCTCTGTCAATCAGAAAGACCCTACATCTATAGGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTATGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306505 208 + 636262 AGGTAAGATGTCACCCTTGAGTGGCACGGGCAGTAAAACAGCTGATTTATAAATGTACGACTTCAAGCAGCGTCCCAATGGGTGTAGTCAACATATAATATCAGACCTTCACTACAGAAGGCTCCATACAGAGGTTACACTCACATGCTCTGTCAATCAGAAAGACCCTACATCTATAGGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTATGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 298122 208 + 647215 ATGTAGGATGTAACCCTTGGGTGGCATGGGCAGTGAAACAGCTGGTTTATTAATGTACAACTTCGAGCAGTGTCCTAATGCGTGTAGCCAATATATAATGTCAGACTTTCACTAGAGAAGGCTCCATACGGAGATTACACTCGCATGCTGTGTCAATCAGAAAGACGCTACATCTATAAGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTGAGCA - -a -s mr.mrrefChr5 157093 196 + 294542 CTTGCTGATAATTTTCCTGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTTACAATCATGTAACAGTGGCTACTTCAATTCCATATGTGAAAGCCAATGCTAGTTGATGATAAAGGTATAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTTAAGTGGCAGACTTGCTGATGCACCAATAAGTTACACACATACTCTAGTCTACAGTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306720 196 + 636262 CTTGCTGATAATTTTCCCGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTTACAATCATGTAACAGTAGCTACTTCAACTCCGTATGTGAAAGCCAATGCTAGTTGATGATAAAGGTATAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTCAAGTGGCAGACTTGTCGATGCACCAATAAATTACACACATACTCTAGTCTACAGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 298330 196 + 647215 CTTGCTGATAATTTTTCTGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTCAAAATCACGTAACAGTGGCTACTTCAATTCCATATATGAAAGCCAATGCTACTTGATAACAAAAGTGTAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTTAAGTGGCAGACTTGCTGATGCACCAATAAGTTACACACATACTCTAGACTACAATTGT - -a -s mr.mrrefChr5 157289 182 + 294542 TGCTGCTCTCATGACAGGTAAAAGTGTCTAGGGTTATTCATGTAAATTTCTAGGAACCAACAATTAACCATGACTACAAGGAGCTTGATTTTCACATGTTTCAACATTAAATATCTTTAATCCACATAAGCTGCACCTCAAGACTAACCCTTCTACTATACGACCCTACGCATAGTCCATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306918 181 + 636262 TGCTG-TCTCATGACAGATAAAAGTGTCTAGGGTTATCCATGTAAACTTCTAGGAACCAACAATTAACCATGACTACAAAGAGCTTGGTTTTCACATGTTTCAACATTAAATATCGTCAATCCACATAAGCTGCACCTCAAGACTAACCCTTCTACTATACGACCCTACGCATAGTCCATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 298526 182 + 647215 TGCTGCTTTCATGACAGGTAAAAGTGTCGAGGGTTATTCATGTAAATTTCTAGGAACCCACAATTAACCATGACTACAAGGAGCTTGATTTTCACTTGTTTCAACACTTAATGTCTTTAATCCACACAAGCTGTACCTCTAGACTAGCTCTCCTACTATATGACCCTATCCATAGTCAATGT - -a -s mr.mrrefChr5 157471 86 + 294542 CATGGTCATCTCTATTTGTAACTTAGCCAGTGAATGGCTTCTTGTGGTGCCCTTGAAACACTAGTACCAGATGATGTGGATTCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307099 86 + 636262 CATGGTCATCTCTATTTGTAACTTAGCCAGTGAATGGCTTCTTGTGGTGCCCTTGAAACACTAGTACCAGATGATGTGGATTCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 298709 86 + 647215 CATGGTCGTCTGTAGTTGTAACTTAGTCAGTGAATGGCTTCCTGTGATACCCTTGGAACACCAGTACCAGATGATGTGGATTGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 157557 27 + 294542 ACACTGGTTAACAAGATGCTAATGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307185 27 + 636262 ACACTGGTTAACAAGATGCTAATGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 298799 27 + 647215 AAACTGGTTAACTAGATGCTAATGCCT - -a -s mr.mrrefChr5 157584 28 + 294542 TCTCTTCCTGCTCTGAAACTAAGGTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307212 26 + 636262 TCTCTTCCTGCTC--AAACTAAGGTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 298827 28 + 647215 TCTCCTCCCACTCTGACACTAAGGTGAG - -a -s mr.mrrefChr5 157612 11 + 294542 TTTTGAGTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307240 11 + 636262 TTTTGAGTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 298855 11 + 647215 TTTTGAGTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 157623 366 + 294542 TATTTGCTTGCTCATCTACTCTTCCGCTGTGCTGTTAATCTTATTTTGGGTTGAGTCTATGATTGATATAATGATAAGATTAGTAGGATGAATTGGGGGAAACAAACGCTGGCATGTAAAGACACTCCACCTTACAGTTGATTCCTTATTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGTATAGTAGTGCCATTAAGTGGTGTCTATTGTCAAAGACAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTTACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGTTTTTTCTGTTGCTGCTGCCCATAGGTTCCCAGTAAACCAAATTGATCTGAAGATTGATTGGTCTGACACTCCAGGCATGCAACTAGAAGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307252 366 + 636262 TATTTGCTTGCTCATCTACTCTTCCGCTGTGCTGTTAATCTTATTTTGGGTTAAGTCTATGATTGGTATGATGATAAGATTAGTAGGATGAATTGGGGGAAACAGATGCTGGCATGTAAAGACACTCCACTTTACAGTTTATGCCTTAGTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGCATAGTGGTGCCATCAAGTGGTGTCTTTTGTCAGAGACAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTTACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGCTTTTTTTGTTGCTGCTGCCCATAGGTTCCCAGCAAACCTAATTGATCTGAACATTGATTGGTCTGACACTCCAGGCATGCAACTAGAAGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 298866 362 + 647215 TATTTGCTTGCTCATCTGCTCTTCTG-TGTGCCATTAATCTTATTTTGGGTTGAATCTATGATTGATATAATGATAAGATCAGTACGATTAATTGGGGGAAACAAACACTGGTGTCTAGAGACACTCCACCTTACAGTTGATTCCTTATTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGTATAGTAGTGCCATTAAGTGGTGTCTATTGTCAAAGGCAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTGACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGTTTTTTCTGTTGCCACTGCCCGTACGTTCCCAGTAAACCAAATTGACCTGAAGATTAATTGCTCTGTCACTCCAGGCATGC---TAGAAGATGT - -a -s mr.mrrefChr5 157989 157 + 294542 AGATCTGTCGGAAATTGTACATTGCTGGAGCAGCAGCACCACACAACCGTATGAGCAGTAAAAAATTGAGGATACCTGTTGAAGAAGAAGTACACTTAGTTGGTGAGAACTATCTGATTGTACCTGATATGTAATTAAGCCAGTTAAAAAAACATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307625 156 + 636262 AGATCTGTCGGAAATTGTACATTGCTGGAGCAGCAGCACCACACAACTGTATGAGCAGTAAAAAATTGAGGATATCTGCTGGAGA-GAAGTACACTTGGTTGGTGAGAACTATCTGATTGTACCTTACATGTAATTAAGCCAGTTAAAAAAACATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 299228 157 + 647215 AGATCTGTCAAAAATTGTACATTGCTGGAGCAGCAGCACCACACAGCCATATGAGCAGTAAAAAATTGAGGATACCTGTTGAAGAAGAAGTACACTTAGGTGGTGAGAAATATCTGATTCTACCTGATATGTAATTAAGCCAGTTAGAAAAACATAC - -a -s mr.mrrefChr5 158146 167 + 294542 TGAATTTTGGTAAGAGGAAACTATCAAGTGTCAGGGAAGCCCACAATCCGAATGTAGTCAGAGAGTGTGTATTGGGAAGTGCCTATATGATCCCTCGCATGCCACTATGGGTTTGAGGGCCAGAGTCTATATCTAAAGAAATCGACCAAAATAGCATAAAGTTCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307781 167 + 636262 TGAATTTTGGTAAGAGGAAGACATCCAGTGTCAGGGAATCCCACAATCCGAATGTGGTCAGAGAGTGTGTATTGGGAAGTGCCTATATAATCCCTTGCATGCCACTATGGGTTTGAGGGCCAGAGTCTATATCTAAAGAAATCGACCAAAATAGCATAAGTTTCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 299386 167 + 647215 TAAATTTTGGTAAGAGGAAACTATCAAGTGTCAGGGAAGCCCACAATGCCAATGTAATCAGAGAGTTTGTATTGGGAAGAAGCTATATGATCCCTCACATGCTACTATGGGTTTAAGGGCAAGAGTCTATATCTAAAGAAAAGGACCAAAATAGCACAAAGTTGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 158313 86 + 294542 TACTACTACAGCTATACTAAGTATTTGAGATGGCCAATTGGAATTGCCTTTCATCTTCGCAGTTTAAAAAACTGTGACCTTACATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307950 81 + 636262 TACTACTACAGCTATACTAAGTATTTGAGATGGCCAATTGGAATTGCCTTTCATCTTCGCAGTTTAAAAAACTGTGACCTT----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 299553 86 + 647215 TACTACTGCAGCTATACTGAGTATTTGAGATGGCCAATTGGAATTCCCTTTCATCTTCACAGTTCAAAAATCTGTGACCTTACATC - -a -s mr.mrrefChr5 158399 6 + 294542 AGGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 299641 6 + 647215 AGGCAA - -a -s mr.mrrefChr5 158405 17 + 294542 AAGTCAAAACCAACAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 299654 17 + 647215 AAGTCAAAACCAACAGA - -a -s mr.mrrefChr5 158422 27 + 294542 GAAGGTTTGGTATTTTGGGAACAAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 299676 27 + 647215 GAAGGTTTGGTATTTTGGGAACAAGCT - -a -s mr.mrrefChr5 158449 52 + 294542 GTATCTTATAACTGAAGCCAGTCTATCAAGACAGGCAGTGTATTATAAGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 299704 52 + 647215 GTATCTTATAACTGAAGCCAGTCTATCAAGACAGGCAGTGTATTATAAGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 158501 15 + 294542 TATGTTTAAACTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 299777 15 + 647215 TATGTTTAAACTGTG - -a -s mr.mrrefChr5 158516 208 + 294542 GGTTAAGAAAAGGAGAGGTATTACAGAACGTGAAACACAGATTATTTTACACATGCCAAATAATGCATAATCACAAATGAATGGGTAAAACTATTAATAGTAACAATGCAACTTGGCACATGATCATCCTGCACTCTAAGTGTACCCAGTATTGTTCAACTAGCAAACCTTCCCCAGAGAGGCAATAACATACAAGCCCATTCTCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308031 98 + 636262 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACTTGGCACATAGTCATCCTGCACTCTAATTGTACCCAGTATTGTTCAACCAGCAAACCTCCCCCAGAGAGGCAATGACATACAAGCCCAGTCTCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 299794 208 + 647215 GGTTAAGAAAAGGAGAGGTATTACAGAACGTGAAACACAGATTATTTTACACATGCCAAATAATGCATAATCACAAATGAATGGGTAAAACTATTAATAGTAACAATGCAACTTGGCTCATGATCATCCTGCATTCTAAGTGTACACAGTATTCTTCAACTTCCAAACCTTCCCCAGAGAGGCAATAACATACAAGCCCATGGTCTAT - -a -s mr.mrrefChr5 158724 54 + 294542 AACATACTAGCATACTACTAGAATTTCTAGTCTGTTATCAAAAATGTATCCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308129 54 + 636262 AACATACTAGCATAATACTAGAATTCCTAGCATGTGATCAAAGATGTATCCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 608840 54 - 647215 AGCATACAAGCATACTACTAGAATTTCAAGTCTGTTATCTAAAATGTATGTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 300005 54 + 647215 ATCATACTAGCATACTACCAGAATTTCTATTCTTTTATCAAAAATGTATCCCGG - -a -s mr.mrrefChr5 158778 6 + 294542 TATACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308183 6 + 636262 TATACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 300059 6 + 647215 TACACA - -a -s mr.mrrefChr5 158784 93 + 294542 GAAGGAAATGTCAGCAAGGAGATGTCATACTTCAGCGCTTCTATGTGTATGCCATTTCAAAACAGCACTAAGGGCATATGATATGAACCTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308189 81 + 636262 GAAGG------------GGAAATATCAGACTTCAGCGTTTCTTTGTGTATGCGATTTCAAAACAGCACTAAGGGCATATGATATGAACCTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 608894 93 - 647215 GAAGGAAATGCCAGGAAGGCGATGTGATACTTCAGTGCTTCTATGTGTGTGCCATTTCAACCCAACACCACGGGCATATGTTATGAATCTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 300065 93 + 647215 GAAGGAAATGTCAGCAAGATGATGTCGTACCTCAGCGCTTCTATGTGTATGCCATTTCAAAACAGCACTAAGGACACAAGATATGAGCCTACC - -a -s mr.mrrefChr5 158877 21 + 294542 AGAGAGTGGTTCATTGTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308270 21 + 636262 AGGGAGTGGTTCATTATTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 608990 21 - 647215 CAATAGTGGTTAACTGGCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 300158 21 + 647215 AGAGCGTGGTTCATTGTTCCA - -a -s mr.mrrefChr5 158898 168 + 294542 GGGTTTTGTCCTTATCAGACCGATGTAAGCATTGGTTGTTCTAGTGGTATTACGGCAGTCTTTTCATAACCCCAATCATAAGTAGATTTGTATCCGCCTGATCTGTCTATGTTGAATGGTATTGCATCATTTCAAAGGACGATGCATTTAAATGACAATGTATTGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308291 165 + 636262 GGGTTTTGTCTTTATCCGAC--ATGTAAGCATTGGTTGTTCTAGTGGTATTACGGCAGTCTTTTCATAACCC-AATCATAAGTATATTTGTATCCGCCTGATCTGTCTATGTTGAATGGCCTTGCATAATTTCAAAGGACGATGCATTCATATGACAATGCATATGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 300179 168 + 647215 GTATTTTATCCTTATCAGACCGATGTAAGCATTGGATGTTCTGGTGATATTACGGCAGTCTTTTCATAACCCCAATCATAAGTAGATTTGTGTCTGCCTGATCTATCTATACTGAATGGTATTGCATCATTTCAAAGGACAATGCATTTAAATGACAGTGTACTGCAT - -a -s mr.mrrefChr5 159066 218 + 294542 AAAGGACAATGCATTCAGATGACAATGCATGTGAAAAGACCTGAACTTGATCAATATCTTGATGAAATTAGCCACACTGTCCCTATACCTCTGAGACTGGCTCTGGCACACTGGTAAGTACCATGGCACTTATGGTTGTAGTATTAGCAAGAGGACTAGAACAGGATCCGCTAGGCAGAGCTGTAAAGCCTATAAAGCTTAGGGTCAAAATTCAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308461 216 + 636262 AAAGGACAATGCATTCAGATGAGAATGCATGTGAAAAGACCTGAACTTAATTAATGTCTTGATAAAATTAGCCACACTGTCCCTATACATGGGAGACTGACTCTGGCACACTGGTAAGTACCACTGCACTTATGGTTGTGATGTTAGCAAGAG--TTAGAATAGGATCCGCTAGGCAGAGCTGTAAATCCTATAAAGCTTAGGGTCAAAATTCAATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 300347 211 + 647215 ATAGGACAATGAATTCAGATGACAATGCATGTGAAAAGACCTCAACATGATCAATATCTTGACGAAATAGGGCACACTGTCCCTATACCTCTGAGAATGGCTCTGGAACACAGTTGAGTACCATGGCA-------TTGCAGTACTAGCGAGAGGACTAGAACAGGATGCCCTAGGCAGAGCTGTAAAGTCTATATAGCTTGGGGTCAAAAATCAATCA - -a -s mr.mrrefChr5 159284 112 + 294542 ATGTAGATTTGTACATGAAAATGCTGGTCAAAACAAATATTATGCCCTATAAGAAGTGAATGATAGCTTTTCACATTGGTACAAGGTGGCCAGCAATTTGACATGTTGTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308694 112 + 636262 ATGTAGATTTGTACATGAAAATACTGGTCAAGACAAATATTATACCCTGTAAGAAGTGAATGTTAGCTTTTCACTTTGGCACAAGGTGGCCAACAATTTGACATGTTGTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 300558 111 + 647215 ATGTACATATGTACATGAAAATGCTGGGCACAACAAATATTATGACCTATAAGAAGTGAATCATAGCTTTCCACATTGATACAAGGTGGCCAGCA-TTTGACGTGTTGTTTA - -a -s mr.mrrefChr5 159396 26 + 294542 TCCTCTGATAAGATTTCTCTTGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308808 26 + 636262 TCCTCTGACAAGATTTCTCTTGCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 300669 26 + 647215 TTCCCTAATAAGATTTTTCTTGCACT - -a -s mr.mrrefChr5 159422 78 + 294542 CCTGATGTTCTTCTACCTCTAGCCTGTGAACTCAGAATAAAATGAGGGTGGCCCATTGGCCCTTTGTAATCATGACGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308835 75 + 636262 CCTGATGTTCATCTAACTCTAGCCTGCGAACTTAGAATAACATGAGGGTGGCCCCTTG---CTTCGTAACCATGACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 300695 76 + 647215 CCTGATGTTCTTCTACATCTAGCATATGAACTCAGAATAAAATGAGGGTGGCCCATTGGCCCTTTGTAATCA--GCGT - -a -s mr.mrrefChr5 159500 274 + 294542 TGTCCTTATTTACCTGTAGGACAAAGGTCTGACCTTGGTTTCCACTGAAATCAACTAGTTtcaatattgctcttgtagtttggtcctaacagtgcaacacagcttgagtggtcccactttcaaggcctccaggttgagaattaagatgtgctgcagcaactagagggttcccagttttaggacttacagTTTGGATGATCAAATAAAGCTGGGTGATGTAGACATATGATGTACCATTTAGGATTCTCTAACTTGCAAACACACAGTTGAGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308911 274 + 636262 TGACCTTATTTACCTGTAGAACAAAGGTTTGACCTTGGTTTCCACTGAATTCAGCCAGTTTTAATATTGCTCTTGTAGTTTGTTCCTAACAGtgcaacacagcttgagtggtcccactttcaaggcctccaggttgagaATTAAGATGTGATGCACCAACTAGAGGGTTCCCTGTTTTAGGACTTACAGTCTGGATGATCAAATAGAGCTGTGTGATGCAGACATATGATGTACCAAGTAGGATTCTCTAACTTGCAAACACACAGTTGAGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 300771 273 + 647215 TGTCCTTATTTACCTGTAGGACAAAAGTCTGACCTTGGTTGCTGCCGAAATCAActagtttcaatat-gttcttgtagtctggtcctaacaatgcaacacagcttaagaggtcccactttcaaggcctccagtttgtgaatcaggatgtcctgcagtagttggagggttcccagttttaggacttccagTTTGGATCATCAAATAAAACTGGGTGATGTAGACATATGACATACAATTCAGGATTCACTAACTAGGAAGCACACAGTGGAGCGG - -a -s mr.mrrefChr5 159774 34 + 294542 ATCAGTACCTGCAGTTCTGTGACTGTCTTATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309185 34 + 636262 ATCAGTACCTGCAGTTCTGTGACTGTCTTATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 301079 34 + 647215 ATCAGTACCTGCAGTTCCGTGGCCGTTTAATCAA - -a -s mr.mrrefChr5 159808 24 + 294542 ATTTTTTCATAAACACTTGTCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309221 24 + 636262 ATTTTTTCATAAACACTTGTCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 301113 24 + 647215 ATGTTTTCATAAGCACTGGTCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 159832 81 + 294542 CTTACTAGCGGCTCTCCTTGGCATTTAATATATTGACTTTGCCATTTCACTGGCAGCTACACATGTTCTCACTGGCAGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309245 81 + 636262 CTTACTAGCGGCTCTCCTTGGCATTTAATATATTGACTTTGCCATTTCACTGGCAGCTACACATGTTCTCACTGGCAGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 301141 81 + 647215 CTTACCCGCTGCTCTCCTTGGCACTTAATGCATTGACTTCGTCATTTCACTGGCAGCTACACATGTCCCCACTGACAGCTA - -a -s mr.mrrefChr5 159913 3 + 294542 AGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309337 3 + 636262 AGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 301222 3 + 647215 AGC - -a -s mr.mrrefChr5 159916 40 + 294542 AAATGTATCGGACACCTGCATGAAGTCTGGAGCTACAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309340 40 + 636262 AAATGTATCGGACACCTGCATGAAGTCTGGAGCTACAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 301227 40 + 647215 AAATGGATTGAACACATGTATAAAGTCTTCAGCTAAAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 159956 31 + 294542 CATGGTTAATGTATTGTACTAATGGAGTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309380 31 + 636262 CATGGTTAATGTATTGTACTAATGGAGTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 345812 31 - 647215 CCTCATTTTAGGATTGTACTAATGGAGTAAG - -a -s mr.mrrefChr5 159987 93 + 294542 GTTGGACCATTAGGCAGTGCACCCACCAGGTTTATAATTGGATTCATATGGCTCTGGCCACTTCATGTATATGTCTGATGCACTTTTTCCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309415 93 + 636262 GTTGGACCATTAGGCAGTGCACCCACCAGGTTTATAATTGGATTCATATGGCTCTGGCCACTTCATGTATATGTCTGATGCACTTTTTCCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 345843 93 - 647215 ATTGGACCATTAAGCAGTGCACCCACCAGGTTTATAATGGGGTTCATATGGCTTTGGCTACTTCATGTATATGTCTGATGCACTTCTGCCCAC - -a -s mr.mrrefChr5 160080 12 + 294542 ATCATACTAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309692 12 + 636262 ATCATACTAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 345936 12 - 647215 AACATTACCATG - -a -s mr.mrrefChr5 160092 10 + 294542 GGCTTAATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309704 10 + 636262 GGCTTAATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 301403 10 + 647215 TGCCTAGAGG - -a -s mr.mrrefChr5 160102 64 + 294542 ACTCGGCTGATGCAGGGTAGCCAGGGCTCATTATGTAAATCCTGATTAGTACTGGATTGGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309714 64 + 636262 ACTCGGCTGATGCAGGGTAGCCAGGGCTCATTATGTAAATCCTGATTAGTACTGGATTGGATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 301414 64 + 647215 ACTCAGTTGATGCTGGGTAGCCAGGGCTCATCATGCTAATCCTGATTAGTGATGAATTGGATTG - -a -s mr.mrrefChr5 160166 18 + 294542 GAGGGTGTCTCAGGGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309784 18 + 636262 GAGGGTGTCTCAGGGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 301478 18 + 647215 GAGGGTGTCTCAGGGGCA - -a -s mr.mrrefChr5 160184 136 + 294542 AAGGAGGGTGTCGTACTTTAGAATCAGAGATTACCTCCTGGAGTTGGTTATCAAGATTTGTATCCAGGCAAACTTGATCGTGGGGACCACCTACCTATCACCACTGTGGTTAATATTGATTGGTCTTGCACATATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309804 136 + 636262 AAGGAGGGTGTCGTACTTTAGAATCAGAGATTACCTCCTGGAGTTGGTTATCAAGATTTGTATCCAGGCAAACTTGATCGTGGGGACCACCTACCTATCACCACTGTGGTTAATATTGATTGGTCTTGCACATATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 301496 136 + 647215 AAGGAGCATGTCGTACTGTAGAATCAGAGATGACCCCCTGAAATTGGTTCACAAGAATTCTATCCAGGCAGACTTGTTCATAGAGACTGCCTACATGCCACCGCTGTGATTAAAATTGATTGGTTATGCATATATT - -a -s mr.mrrefChr5 160320 29 + 294542 GTGGGCTTAGGTGTAGTTGATGCACAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309940 29 + 636262 GTGGGCTTAGGTGTAGTTGATGCACAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 301643 29 + 647215 GTGGGCATAGGTGAGCTTGATGCACAGAG - -a -s mr.mrrefChr5 160349 41 + 294542 CTCAGATTCGATCTAGCAAGAGATGTTATTAATGACACTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309969 41 + 636262 CTCAGATTCGATCTAGCAAGAGATGTTATTAATGACACTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 301673 41 + 647215 CTCAGATTCTTTCTAACAAAAGATGTTATTAATTATGCCAT - -a -s mr.mrrefChr5 160390 207 + 294542 AAGCAAAGTCTATAGGTGCAATGTGTGGGTAACTAAACTCAGCTTGGACAGGTGACAAAAACGTGTAGTCATTTGCATGGGGATACAGGTGTAGCTCAATTGTTGCGATGCCTTGGGATACATGCTGCTGCTGCCACTCCAGACAGAAGAGGACACTCGCAATCACTTCAGTCTTGTGTGGCCATAGACAGGTGTTCACAGCCTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310013 207 + 636262 AAGCAAAGTCTATAGGTGCAATGTGTGGGTAACTAAACTCAGCTTGGACAGGTGACAAAAACGTGTAGTCATTTGCATGGGGATACAGGTGTAGCTCAATTGTTGCGATGCCTTGGGATACATGCTGCTGCTGCCACTCCAGACAGAAGAGGACACTCGCAATCACTTCAGTCTTGTGTGGCCATAGACAGGTGTTCACAGCCTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 301714 207 + 647215 AAGAAGGGTTTATAGGTGCTATGTGCGGCTAACTAAACTCAGCTTGGACAGGTGACATATACACATAGTTACATGCATGCAGATGCAGGTGCAGCTCAATTTTTGTGATGCCTCGGGATACATGCTGTTGCTGTCACTCCAGACAGAAGAGGGCACTTGCAATCACTTTGATTCTGTGCAGCCACAGACAGGTTTTCACAGCATTTC - -a -s mr.mrrefChr5 160597 18 + 294542 ACAGCCTCCCTGGGTCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310221 18 + 636262 ACAGCCTCCCTGGGTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 301921 18 + 647215 ACGACCTCCCTGGATCAT - -a -s mr.mrrefChr5 160615 79 + 294542 CCAGTGGGCATTAAATATGTTGGACCATGCTTGACCAAGTCTTCTCACTGCTAATTGTGTGTATGAGTAGACTTGCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310241 79 + 636262 CCAGTGGGCATTAAATATGTTGGACCATGCTTGACCAAGTCTTCTCACTGCTAATTGTGTGTATGAGTAGACTTGCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 301939 79 + 647215 CCGTGGGGGACCAAATATGTTGGACCATGCATGACCAAGTCTTCTCAATGCTCATTGTGTGCATGAGCAGACTTGCTTG - -a -s mr.mrrefChr5 160694 32 + 294542 CGGGTCACTGAGATGCTCCAAACCCTGCTAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310328 32 + 636262 CGGGTCACTGAGATGCTCCAAACCCTGCTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 302018 32 + 647215 CTCGTCACTGAGATGCTCAGAACACTGCTAGC - -a -s mr.mrrefChr5 160726 87 + 294542 TGCACCTGGATTGTGTCTGGCTGAATTTCTTACCACCCTATCCCCCTTTGCAGTAGCCATACTTTGGGTTGGGCCTCTCATGGGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310360 87 + 636262 TGCACCTGGATTGTGTCTGGCTGAATTTCTTACCACCCTATCCCCCTTTGCAGTAGCCATACTTTGGGTTGGGCCTCTCATGGGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 302051 87 + 647215 TGCACCTAGATCATGCCTGGCTGAATTTCTTACTATTCTATCCCCCTGTGCAGTAACCATACTTTGAGTTAGGCCTTTTATGGATAT - -a -s mr.mrrefChr5 160813 188 + 294542 AATGCCGAGATCTGTGAGATTGAGTCAAGGCAAAAAACATTACCACATGAAACTGCACAATCTACTAGATGATTCATCATTCTTTTTCCCCTGTTAGTGTAGGACTGTTCTTTTTCTCTGCCGTCTGCAGTTGAGGTGAAGTTTACCTAAAAAATAGGCCTATTTCTGCCCATCCATACTGAGAAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310461 188 + 636262 AATGCCGAGATCTGTGAGATTGAGTCAAGGCAAAAAACATTACCACATGAAACTGCACAATCTACTAGATGATTCATCATTCTTTTTCCCCTGTTAGTGTAGGACTGTTCTTTTTCTCTGCCGTCTGCAGTTGAGGTGAAGTTTACCTAAAAAATAGGCCTATTTCTGCCCATCCATACTGAGAAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 302138 188 + 647215 AATGGTGAGAACTGTGAGATTGAGTCAAAGTAAACAACACTGGCACATGAAACTGCACAACCTAAGGGATTATTCATCATTCTTCTTCCCCTGTTAGTGTAGAACTGTTCTTTTTCTCTACAGTCTGCAGTTGAGATGAAGTTTACCTATGAAATAGGCCCATTTTTGCTAAACCATGCGGAGAAATA - -a -s mr.mrrefChr5 161001 29 + 294542 TTGTGTTGTTGACAGGTTCTCAAGGAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310694 29 + 636262 TTGTGTTGTTGACAGGTTCTCAAGGAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 302326 29 + 647215 TTATGTTGCTGACAGGTTCTCAGGGAATC - -a -s mr.mrrefChr5 161030 102 + 294542 GAGGTAAAGGATTGAATGTGTAACAAGTAGAAATCTATGGTTGTCCTCATCGCACTGGTCATATATATTTTGATCCTCAGGCAGCAAGTATCCTGAACTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310757 102 + 636262 GAGGTAAAGGATTGAATGTGTAACAAGTAGAAATCTATGGTTGTCCTCATCGCACTGGTCATATATATTTTGATCCTCAGGCAGCAAGTATCCTGAACTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 302355 102 + 647215 TGGGTAGAGGATTGAAGGTGCAATGAATAGGAAGTTAAGGTTGTCCTTGTTGCACGGGTCACATAAATTCTGATCCTCAGGAAGCACATACCCTGGACTGGC - -a -s mr.mrrefChr5 161132 57 + 294542 GCAAATTAGAAATTTAATGAATAGGGAAAGCAGTTTTTCCGAAAAAAAAGAAGAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310859 57 + 636262 GCAAATTAGAAATTTAATGAATAGGGAAAGCAGTTTTTCCGAAAAAAAAGAAGAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 302500 57 + 647215 GCAGGTTAAAAATCTAATGAATTGGGTAAGTGGTTCTTCAGAAGCCAAAGGACACGA - -a -s mr.mrrefChr5 161189 53 + 294542 TAGTCCATAGTTTGTTTTCTTTATAACTATAGGTATATGAAGTATTTCATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310916 53 + 636262 TAGTCCATAGTTTGTTTTCTTTATAACTATAGGTATATGAAGTATTTCATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 302558 53 + 647215 CAGTATATAGTTTTTTTTTTTTGTTACTACAGTTATATGAAGTATTTCATATG - -a -s mr.mrrefChr5 161242 79 + 294542 ACTTGTGTGGATTGCTTTCATGTTGTAAGTATTCAGACTATGTAACCTTGTATCAGGCGTAGGCATATCAGGCAAGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310969 79 + 636262 ACTTGTGTGGATTGCTTTCATGTTGTAAGTATTCAGACTATGTAACCTTGTATCAGGCGTAGGCATATCAGGCAAGGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 302612 79 + 647215 ACTCGTGTGAATTTCTTCCTTGTTGTAAGTATTCAGGCTATGTAACCCCACATCAGACGTAGGCATATCAGGCAAGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 161321 22 + 294542 CTTAGACAGGGTTGCAACCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311050 22 + 636262 CTTAGACAGGGTTGCAACCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 302691 22 + 647215 CGTAGACAGGGTTACAATAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 161343 12 + 294542 TTGTTCCTATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311074 12 + 636262 TTGTTCCTATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 302713 12 + 647215 TTGGTCCTATTA - -a -s mr.mrrefChr5 161355 29 + 294542 ATGCACTGTTATCCTAAAGTTTAAGTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311086 29 + 636262 ATGCACTGTTATCCTAAAGTTTAAGTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 302727 29 + 647215 ATGGGCTGGTATCCTGGAAGTTAAGTTAG - -a -s mr.mrrefChr5 161384 76 + 294542 TAATTAAGCCAAAAAGAGTATGGGTGTGATAGCATGCATTTGCATGAAATTGGATTTTGCCTTTCTATTGGGCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311115 76 + 636262 TAATTAAGCCAAAAAGAGTATGGGTGTGATAGCATGCATTTGCATGAAATTGGATTTTGCCTTTCTATTGGGCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 302757 76 + 647215 TAATTAAGCGGAAGAGGGTATGGGTATGATAGCATGCTTTTGCATGAATTTAGACCTTGCCCTTATAATGGGCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 161460 13 + 294542 AAATGTGCATAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311192 13 + 636262 AAATGTGCATAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 302833 13 + 647215 GAATAAGCTGAGG - -a -s mr.mrrefChr5 161473 52 + 294542 GTAACATAGGATAGCCTATATACCACTGAACTCAAATGTCTGCAGTTTTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311205 52 + 636262 GTAACATAGGATAGCCTATATACCACTGAACTCAAATGTCTGCAGTTTTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 302852 52 + 647215 AAAACATAGAATAGTCAATATACCACTGAACTCAAATGTCTGCAGTTTTATG - -a -s mr.mrrefChr5 161525 8 + 294542 AAAAATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311257 8 + 636262 AAAAATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 302908 8 + 647215 AAAAATGC - -a -s mr.mrrefChr5 161533 88 + 294542 GATTACTTTTAAGGTGAGAAGCAATGCGTAATCATACATAGTGTTGATGATTTGTATATACATTGTGGTTAAACCCATTTATACTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311266 88 + 636262 GATTACTTTTAAGGTGAGAAGCAATGCGTAATCATACATAGTGTTGATGATTTGTATATACATTGTGGTTAAACCCATTTATACTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 302916 88 + 647215 GATTACTTTCAAAGTGAGAAGCAATGCATAATCATACATAGTGATGATGGTATGTATATACATTGTGGGTAAACCCATTTACACTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 161621 13 + 294542 GTCCTGTGCCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311370 13 + 636262 GTCCTGTGCCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 303004 13 + 647215 GTCCTGTGCCCCA - -a -s mr.mrrefChr5 161634 51 + 294542 ATTTGAATGGGCAATTTCCTTTAACTAATGAACTAGTCCTTTCCCAGAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311383 51 + 636262 ATTTGAATGGGCAATTTCCTTTAACTAATGAACTAGTCCTTTCCCAGAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 303029 51 + 647215 ATTTGAATGGGCAGTGTCCTTTAACTAATGAACTACTTCTTCCCCAGAATA - -a -s mr.mrrefChr5 161685 46 + 294542 GGAACAATATGTAGTCCCCTTCTCCATAATGCATCAATGAGATCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311439 46 + 636262 GGAACAATATGTAGTCCCCTTCTCCATAATGCATCAATGAGATCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 303080 46 + 647215 GGACTAATATGTAGTCCCCTTCTCCATAATGCATCATTGAAATTCC - -a -s mr.mrrefChr5 161731 27 + 294542 GTTTGGTGTACTCCATCTCAGGACAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311487 27 + 636262 GTTTGGTGTACTCCATCTCAGGACAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 303126 27 + 647215 ATTTGGTGTACTTCAGCACAAGGTGGT - -a -s mr.mrrefChr5 161758 51 + 294542 TGACATAGACCTATAAGATAGTTGGTTATTATTTCTGTCTTCTGTCCTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311528 51 + 636262 TGACATAGACCTATAAGATAGTTGGTTATTATTTCTGTCTTCTGTCCTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 303153 51 + 647215 TGGCATAGACCTATAAGGTAGTTGGTTATTATTTCTGTCTTCTGTCCCTTG - -a -s mr.mrrefChr5 161809 40 + 294542 TATATAAACAGCCATTGCTCTGGTTACCTGGTTATACCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311583 40 + 636262 TATATAAACAGCCATTGCTCTGGTTACCTGGTTATACCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 303204 40 + 647215 TATATAGACAGGCATTGCTCCGGTTAATTGGTTATTCCAA - -a -s mr.mrrefChr5 161849 196 + 294542 AGCTGGTTCATACCAGCAACTTATCCTCTCTTCCTCCTGAACATAAGTAGATTTGATAGCCCCTTGCACCTTTTCATCAGGTCACATGACCTTATACCCCTGAAAGTAGGTCTGACACTGGTAAGTACAATGGCACATATGATCATGATAAAACAGATTGGGACCTAGGACAAGACCAGCTAAGTTGATTGATAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311623 196 + 636262 AGCTGGTTCATACCAGCAACTTATCCTCTCTTCCTCCTGAACATAAGTAGATTTGATAGCCCCTTGCACCTTTTCATCAGGTCACATGACCTTATACCCCTGAAAGTAGGTCTGACACTGGTAAGTACAATGGCACATATGATCATGATAAAACAGATTGGGACCTAGGACAAGACCAGCTAAGTTGATTGATAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 303245 196 + 647215 AGCTGGTTCCTACAAGCAACTTACCCTCTCTTCTTCTTGAACATAAGTACATTAGACAGCCCCTTGCACCTTTCCATCAAGTCACATGACCTTATACCCCTGAGATAAGGTCTAATACTGGTGAGTACAATGGCACAAATGATCATGATAAAATGGAATGGGAACTAGGACAAGACCAGCTAAGTAGATCTATAAG - -a -s mr.mrrefChr5 162045 55 + 294542 CAACCAGGATTAGGTCCAAAGCTGAACTAAGGCATGTCTAACTACTGGGCAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311819 55 + 636262 CAACCAGGATTAGGTCCAAAGCTGAACTAAGGCATGTCTAACTACTGGGCAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 303442 55 + 647215 CAACCAGTAATAGGTCCAGGGCTGAACCAATGTTTGTCTAACTACTGGGCAAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 162100 20 + 294542 CAAAACCATTGTTTTATCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311874 20 + 636262 CAAAACCATTGTTTTATCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 303503 20 + 647215 CAAAACCATCACGTTAGCTA - -a -s mr.mrrefChr5 162120 46 + 294542 GATAATAACTTTATAAATCAGCACAAAATGCTCAGCAACTTGGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311895 46 + 636262 GATAATAACTTTATAAATCAGCACAAAATGCTCAGCAACTTGGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 303523 46 + 647215 GACGCTAACTTTATAGATCAGCACAAAATGTCCAGCAATTTGGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 162166 34 + 294542 CTCTTTCTTCTACTGCCATGATTTTATCTTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311942 34 + 636262 CTCTTTCTTCTACTGCCATGATTTTATCTTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 303569 34 + 647215 CTCTTTTTTCTACAGCCATGATTTTATCTTGTAC - -a -s mr.mrrefChr5 162200 45 + 294542 ATCCCCTGGCACACTTTAACCTCTAGCCCTGTATCAGAGTGAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311976 45 + 636262 ATCCCCTGGCACACTTTAACCTCTAGCCCTGTATCAGAGTGAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 303604 45 + 647215 ACCCCCTGACATCCTTTAACCTCTGGCCCTGTATCAGAATAAAGT - -a -s mr.mrrefChr5 162245 21 + 294542 AGCATTTGCCTGGCTGTTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312023 21 + 636262 AGCATTTGCCTGGCTGTTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 303649 21 + 647215 AGCATTTGCCTTGCTGTTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 162266 36 + 294542 TTCAAAAATATACTCGTAATAATCAAAACTTTTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312044 36 + 636262 TTCAAAAATATACTCGTAATAATCAAAACTTTTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 303674 36 + 647215 TTCAAAAATATAGTCATTATAATTAAAACTTCTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 162302 50 + 294542 TCTAGTTTGACTGCAGGAGGAACAACAATAGTTTATAGTTACTCACCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312080 50 + 636262 TCTAGTTTGACTGCAGGAGGAACAACAATAGTTTATAGTTACTCACCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 303712 50 + 647215 TCTGGCTTAAATGCAGTTTGAACAGCAATAATTTATAGTTACCCACCCTC - -a -s mr.mrrefChr5 162352 114 + 294542 TAATGCAGAGGGCGGTAATGTGGACTGCACTAGGTACTCCATGTTTCTACTTGAAGGAAAAAGGTCTGACCCCTACTCCCATTTATGTCAACTCAGATTCAGTACCACTTTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312139 114 + 636262 TAATGCAGAGGGCGGTAATGTGGACTGCACTAGGTACTCCATGTTTCTACTTGAAGGAAAAAGGTCTGACCCCTACTCCCATTTATGTCAACTCAGATTCAGTACCACTTTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 303762 114 + 647215 TGATGTGGAGGCAGGTAATGTGGACTACACTAGGTACTCCACATTTCCACCTGAAGGAAAAAGGTCTAACCCCAACTCCCATTTATGTCAGCACAGATTCTATATCACTTTCCT - -a -s mr.mrrefChr5 162466 65 + 294542 GTCTGTCATCTTAGTTCCTTATTCACAAGAGACAGTCATGACAGTGTGAGACACCTTATTTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312253 65 + 636262 GTCTGTCATCTTAGTTCCTTATTCACAAGAGACAGTCATGACAGTGTGAGACACCTTATTTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 303877 65 + 647215 GTTTATCGTCTCCATTCCTATTATACAAGAGACAGTCATGGCAGTGTGAGATACCTTATCTAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 162531 90 + 294542 TGGGcagtcatgacagtgcaagatagttgcaggagtcccatgttgacaggattctggttctgagtatgatgtgatacagcttaagagatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312318 90 + 636262 TGGGCAGTCATGACAGTGCAAGATAGTTGCAGGAGTCCCATGTTGACAGGATTCTGGTTCTGAGTATGATGTGATACAGCTTAAGAGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 303977 90 + 647215 CGGGcagtcatgacagtgcaagatagctgcaagggtcccattttgacaggattctggttctgattataatgtgagacagcttaatggatt - -a -s mr.mrrefChr5 162621 27 + 294542 gtactaagatttccagaggtggcaagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312411 27 + 636262 GTACTAAGATTTCCAGAGGTGGCAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 304067 27 + 647215 gtacttaggctgccaggggtggcaagc - -a -s mr.mrrefChr5 162648 25 + 294542 ctggaggattatcaaacaTACCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312439 25 + 636262 CTGGAGGATTATCAAACATACCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 304094 25 + 647215 ctggaggattggcaaataTATCCCA - -a -s mr.mrrefChr5 162673 84 + 294542 AGTTGGGAGGGACTGATCGCAGTATGTAGCCCTAAGGCAGGAATGAAACTTCTAATTGTACAAGGAAGTGTGCCATCACTCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312464 84 + 636262 AGTTGGGAGGGACTGATCGCAGTATGTAGCTCTAAGGCAGGAATGAAACTTCTAATTCTATAAGGAAGTGTGCCATCACTCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 304202 84 + 647215 AGTTGGGAAGGACTGAATGCAGTATGTAGCCCTAAGGCAGGAACAAAACTTCTAATAGCACAACGAAGTGTGGCATCACTCCTA - -a -s mr.mrrefChr5 162757 217 + 294542 CTGGAATATATGCCATTTTTGACAGGTGAGTAAGCAGAGGTGGCTAGGGGTATTGTACCAGTGAGTAAGGTTATCAACAAAGCACATTAAAGAGAGGCTAACATGGAATGTCACTTGTCTCATACCATGTCTGTACCTGCTAAGACAAATCAACTTCAGTGCCTGTAGCTCCTTGAGAATGATACAGCAAATTTTTTACTGACATCAGTGGAGGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312548 217 + 636262 CTGGAATGTATGCCATTTTTGACAGGTGAGTAAGCAGAGGTGGCTAGGGGTATTGTGCCTGTGAGTAAGGTTATCAACAAAGCACATTAAAGAGAGGCTAACATGGAATGTCACTTGTCTCACACCATGTCTGTACCTGCTAACACAAATCAACTTCAGTGCCTGTAGCTCCTTGAGAATGATACAGCAAATTTTTTGCTGACATCAGAGGAGGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 304311 217 + 647215 CTGGAATATGTGCCATTTTTGACAGGTGAGTAAGCAGAGGTGGCTAAGGGTATTGTACCAACGAGTAAGGTTAACAACAAAGCGCATCACAGATAGGCTAACATGGAATGTCACCAGTCTGATACGATGTCTCTACTTGCTAAGACAAGTCAATCTCAGTGCCTGTAGGTCCTTGCGAATGATACAGCAAGTTTTTTACTGACATCAGTGGTGACAA - -a -s mr.mrrefChr5 162974 181 + 294542 AATACTTGCAGCTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAACTAGAGAGATGTTGGTGTGGTGCGCCAGAATGAATCAGACACATGTATGAAATCCTCGCTCCATCATAGGCCAGGTGGACCCACCATTAAGAGGTCAAATATACCTTTCTCATGCTTAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312768 180 + 636262 AATACTTGCAGCTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAACTAGAGAGACATTGGTGTG-TGCACCAGAATGAATCGGGCACATGTATGAAATCCTCGCTCCATCATAGGCCAGGTGGACCCACCATTAAAAGATCAAATATAACTTTCTCATGCTTAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 304528 169 + 647215 AAGCCTTGTAGTTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAGCTAGAGAGATGTTGGTGTGGTGCGCCAGAATGAATCAGACACATGTATGAAATCCTTGCTCCATCATAGG------------AACATTTAGAGGTCAAATATACCTTTCTCATATATAACGT - -a -s mr.mrrefChr5 163155 16 + 294542 GCTTAGATTTTGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312949 16 + 636262 GCTTAGATTTTGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 304697 16 + 647215 GCTTAGATTTCACACA - -a -s mr.mrrefChr5 163171 102 + 294542 GTGCCTCGTGCAAAGCTTCATTAAATGGCAAACATGGACACGTACAAGCGGTTAGTGCTTCACCCTGCCCTGCTTGATGTGATGTAAAACAGTCACAGGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312975 102 + 636262 GTGCCTCGTGCAAAGCTTCATTAAATGGCAAACATGGACACGTACAAGCGGTTAGTGCTTCACCCTGCCCTGCTTGATGTGATGTAAAACAGTCACAGGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 304713 102 + 647215 GTGCCTCGTGCAAAGCTCCATTAAATGGCAAATGTGGCCATGTATATGCAGCTAGTGCTTCACCCTGCCTTGCTTGATGCAATGTTAAACAGCCACAGGCAC - -a -s mr.mrrefChr5 163273 46 + 294542 TGTAGAGGGAGCCTGTTCACCTCACACAAGAGGTTTGACATGTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313078 46 + 636262 TGTAGAGGGAGCCTGTTCACCTCACACAAGAGGTTTGACATGTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 304815 46 + 647215 TGCAAAGGGAGCCTGTTCACCTCACGCATGATGTTTGTCATGTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 163319 182 + 294542 TATTAGCTAGTTGAAGACCTTTTATCTCTTTTAAAAGCCAATCCTAGATAGAGATGGGTTAAAACCTTTTAAGTTCACTGGCTTAGTCAGGTTTTGATTATTGCATTGGTTTGTAGCTGCACTTTGAAGGAAGCTATTCACTTAGCCCACTTAATCATTGGAGCATAAACTGACAAGTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313138 182 + 636262 TATTAGCTAGTTGAAGACCTTTTATCTCTTTTAATAGCCAATCCTTGAATAGAATGGGTTAAAACCTTTTAAGTTCATTGGCTTAGTCAGGTTTTGATTATTTCATTGGTTTGTAGCTGCACTTCGAAGGAAGCTATCCACTTAGCCCACTTAATCATTGGAGCATAAACTGACAAGTTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 304861 159 + 647215 ----------------------TATCTCTTTTAAAAGCCAATCCTAGATAGAGATGGGTTAAAACCTTATG-GTTGACTGGCCTACTCAGGTTTTGATCATTGCGTTGGTTCGTAGCTGTACTTTAGAGGAAGCTATTTACTTAGCCTGCTTCATCATTGAAGAATGAACTGACAGGTTTTA - -a -s mr.mrrefChr5 163501 36 + 294542 AACAACCTCCTCAATAATAAACTGCTGCATAAGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313342 36 + 636262 AACAACCTCCTCAATGATAAACTGCTGCAAAAGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 305020 36 + 647215 AACAGCTTCCTCAACAAGAAATTGTTGCATAAGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 163537 93 + 294542 ATGAGGCATCCATGCTAAACAGCCAGGGAGATCAGATTGAGACTGGACAGCCAGAACTTAGCTCTTCTGTATTGATTAATGATCAAATCGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313378 93 + 636262 ATGATGCATCCATACTAAACAACCAGGGAGATCAAATTAAGACTGGAGTGCCAGAATTTAGCTCTTCTGTATTGATTAATGATCAAATCGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 305059 93 + 647215 ATGAGGCATCCATGATAAACAGCCAGGGAGATCAGATTGAGACAGGACAGCCAGAACTTAACTCACCTGTTTTGATTAATAATCAAATCGGCT - -a -s mr.mrrefChr5 163630 57 + 294542 GAAGTTTGTTGGGACATCAAGAAGAGTGTCTTGCTGTAGGATCATTTAATCTGGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313471 57 + 636262 GAAGTTTGTTGGGACATCAAGAAGAGTGTCTTGCTGTAGGATCATTTAATCTGGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 305157 57 + 647215 GAAGACTGTTGGGATATCAAGAATAGTGTCTTGCTGTAGGATCACTTAATCTGGTGG - -a -s mr.mrrefChr5 163687 55 + 294542 TTAATTGTTATATCTAGGCAGATTGGTTAATATAAACCTATTAGAGGTTGCACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313528 55 + 636262 TTAATTGTTATATCTAGGAACGTTTGTTCATATGAACCTATTAGAGGTTGCACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 305215 39 + 647215 TTAATTGTTATATTTAGGCAGATTGGTTAATGTAAATCT---------------- - -a -s mr.mrrefChr5 163742 142 + 294542 CGTTGAACCCTCCTTGGGTAGCTGGCTTGATATGTGTATACTAGACATGATGTGAAGCTGATGCAGTTACAGTCTCATTGTGACAAGCTATTATTAGTGTACTTATTTCAGGTATGTTTAGGTGCTATATGTAGGTAGCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313591 142 + 636262 CGTCTAACCCTCCTTGGGTAGCTGGCTTGATATGTGTATACTGGACACAATGTGAAGCTGATGCAGTTACAGTCACATTGTGACAAGCCATTATTAGCGTACTTGATTCAGGTATGTTTAGGTGCTATGTGTAGGTAGCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 305254 140 + 647215 CATTGAACCCTCCTTGGGCAGCTGGCTGGAT--TTGTAGACTAGACATGATGTGAAGCTGATGCAGTCACAGTCTCATTGTGACAGACTGTTATTAGTGTACTTATTTCTGGTATCTGTAGGTGCTATATGAAGATAGCCAA - -a -s mr.mrrefChr5 163884 256 + 294542 AGCCACAGAAATGAATATGTGTTCATGTTAACAGGTGTAGCTCATATTGATGTGATGCCTTGGGATGCATGCTGCCATGACTTCAAACGCATAGCAGCTTTCTTTGTTTTGAAGATGGTGTATATATAAATATGTATTCACCAGCTCTCTAGGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATAATGAACCTTGCATGACCAATTAATCTTACTACTCAATGAGTGTTGATGTGGCATTGGGATGATGAATGATTTTACTTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313733 248 + 636262 AGGCACAGAAATGAATACATGTACATGTTAACAGGTGTGGCTCATCTTGATGTGATGCCTTGGAATGCACACTGCCATGACTCCAAATGCATGGCAGCTTTCTTTGTTTTGAAGATGGTGTATATATAAGTATGTATTCACCAGCTCTCTAGGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATA-----CCTTGCATGACCAATCAATTTTACTATTCAATGAGTATTGGTGTGGCATTGGGATGA---ATGATTTTACTTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 305413 243 + 647215 ATCCACAGAAATGAATATGTGTTC----------TTGTAGCTCATATTGATGTG---CCCTGGGATGCATGCTGCCATAACTTCAAACACATAGTAGCTTTCTTTGTTTTGAAGGTGGTGTATATATAGATGTGCATTCACTAGCTTTCTAAGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATAATGAACCTTGCATGACCAATTGATCTCACTACTCAGTGAGTGTTGATGTAGCATTGGGATGATGAATAATTTTACTTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 164140 49 + 294542 ACCTAGACCGTGCCTGACTCAATTTCATGGAGATAATGAGACTGAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313981 46 + 636262 ACCTAGACCATGCCTAACTCAATTT---GGAGATAATGAGACTGAATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 305663 49 + 647215 ATCTAGACTGTGCCTGACTCAATTTCATGGAGATAATAAGACTGAACCA - -a -s mr.mrrefChr5 164189 367 + 294542 AAACTAAAGTGCAGAAGTTCAGATTTGGATAAatgataagacCTTGGTGATAACATTCAGTACCCCAGAATGAAGCTTCATGACTAAAGTGCTTGTTACAGTGGTAGATAAAACTAAGGTTGAAACAAATGAATACCATTTTATAATATATCGAAGACTGTAGATATGACGACAGACCAAGTACCACGAGTGTTGGTGTATGAGATCATATAAACGAGCATGAATGAGCTCAAGAACAAGTTAATTGCCCCTGCAGCATAGTCATCAAATAGGGCTCTTGTATCTAGGGTTTCAAATGAGTCAATACAAACCCTTGAGGAAAAGATTAGTAACCCATGAAATGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314028 357 + 636262 AAACTGAAGTGCAGAAGCTCAGACTTGGATAA----------CTTGGTGGTAACATTCAGTGCCCCAGAATGAAGCTTCATGACTAAAGTGCTTGTTACAGTGATAGATAAATCTAAGGTTGGAACACATGCATACCATTTTATAATATATCGAAGACTGTAGATATGACGACAGACCAAGTACTGCGAGTGTTGTTGTATGAGATCATATAAACGAGCATGAGTGAGCTCAAGAACAAGTTGATAGCCCCTGCAGCATAGTCATCAAATAGGGCCCATGTATCTATGGATTCAAGTGAGTCAATACAAACCCTTGCAGAAAAGATTAGTAACCCATGAAATGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 305712 367 + 647215 AAACTAGAGTGCAGAAGTTCGGGTTTGGATAAATGATAAGACATTGATGACAACATCCAGTACCCCAGAATGAAGCTTCACGACTAAAGCACTTTTTACAGTGGCAGATAAAACTAAGTTTGAATCAAATGAATACCAAGTTACAATATATCGAAGACTGTAGATATGACAACAGACCAAGTACCACAAGTGTTGGTGTATGAAGCCATATAAGAGAGCATTCATGAGCTCAAGAAGAAGTTAATTGCCCCTGCAACATGGTCATCAAATAGGGCTCTTGTATCTAGGCTTTCAAATGAGTCAATACAAACCCTTGAGGAAAAGATTAGTAACTCATTAAGTGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 164556 13 + 294542 ATATCTTGATGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314499 8 + 636262 ATATCTTG----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 306079 13 + 647215 ACATTTTGATGGG - -a -s mr.mrrefChr5 164569 68 + 294542 GATCACAAGATATGTTCAAAAGTGACAAAGTTTTATAGGAAGCACCTGTAAAAATGAATGGTTAGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314507 6 + 636262 --------------------------------------------------------------TAGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 306147 68 + 647215 GATCACAAGATATGTTCAAAAGTGACAAAGTTTTATAGGAAGCACCTGTAAAAATGAATGGTTAGACT - -a -s mr.mrrefChr5 164637 10 + 294542 ATGAAGATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314516 10 + 636262 ATCAAGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 306215 10 + 647215 ACGAAGATAT - -a -s mr.mrrefChr5 164647 178 + 294542 CACACTTGGTATCCCTATCTGTGGCAAGAGAGTGGATTAAATGATTTATTTTAGCTATATGACCTTAGATTCACTGCCTTTCCTATAGTTCAGAGGTTGTGGACACACCACCACATATATAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCACACATAGGTGACTTACAGGAATCTGATAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314530 176 + 636262 CACACTTGTTATCCCTATCTATGGCCAGAGAGTGGATTAAATGATTTATTTTAGCTATGTGACCTTAGATTCACTGACTTTCTTAT-GTTCAGAGGTTGTGGACACACCACCACATATATAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCACACATAGGT-ACTTACAGGAATCTGATAACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 306225 166 + 647215 CACACTTGGGATCCCTATCTGTGGCAAGAGAGTGG------------ATTTTTGGTGCATGACCTTAGATTCATTGCCTTTCCTTTAGTTCGGAGGTTGTAGACACACCACCAAATATAGAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCCCACATAGGTGACTTTCTGGAATCTGATAACCA - -a -s mr.mrrefChr5 164825 163 + 294542 TTGCATAACTGACTGGGTTTCACACCTTCTTTCCCATCAGGACACTCTGTGCATGGAATCTGACAACATGGCTTCCCATATATGAAGAGCATCTCACTTGCTGTGAGAATTGGAGCCAGCAGATGTGGAAAATACCCTACTTGATAGTCTTATGTCTGGCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314706 163 + 636262 TTGCATAACTGACTGGGTTTCACACCTTCTTTCCCATCAGGACACTCTGTGCATGGAATCTGACAACATGGCTTCCCATATATGAAGAGCATCTCACTTGCTGTGAGAATTGGAGCCAGCAGATGTGGAAAATACCCTACTTGATAGTCTTATGTCTGGCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 306400 163 + 647215 TCGCATTAATGACAAGGTTTGGCCCCTTCTTTTTCATCAGGACACTCTGTGCATTGAATCTCATAACATGGCTTCCTGTGTATGAAGAGAAGCTCACTTTCTGTGAGAATAGGAGCCAGTAGACGCCAAATATATCCCACTTGATAGCCTTATGTCTGGCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 164988 38 + 294542 TGGATTAAATGATTTATTTCGACTGCCTTACCTTAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314869 38 + 636262 TGGATTAAATGATTTATTTCGACTGCCTTACCTTAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 306567 38 + 647215 TGGAGTAAATGATTCAATTCAACTCCCTTACCTTAGAC - -a -s mr.mrrefChr5 165026 405 + 294542 TCACTGGTCTACCTAATATTCAGAGATTATGCTGTGCATCAAAACTGGAAGATTGTCCCCCCATTATATGAACAGCATATCACTGGCCAAAAGGGTTTGATCACCCTCATATTCACAAGAGATCACTCCAGTTCAGAGAGCATCAGATTCTATTTACACATTTCAACCCATTGAATAATCACCTGCTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGGAATATGGCATACCAGTAACCATTAGCATTATATTTTTCCAACCTCATGTGCATCACTCAGCATTATTTTTTTCTGACCTTGTGTGCCTCAGCCCTAACTCAGACCAGAAGTTAGACCCCCATTATGTTAGGGTGGCTTCCATATTATTCTTCCAATTTGATGGCACACAATATAGCTCCCAGAGTTATCTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314907 405 + 636262 TCACTGGTCTACCTAATATTCAGAGATTATGCTGTGCATCAAAACTGGAAGATTGTCCCCCCATTATATGAACAGCATATCACTGGCCAAAAGTGTTAAATCACCCTCATAATCACAAGAGAACACTTCAGTTCAGAGAACATCAGATTCTATTGACAAATTTCAACCCATTGAATAATCACCTGCTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGGAATATGGCATAGCAGTAACCATTAGCATTACATTTTTCCAACCTCATGTGCATCACTCAGCATTATTTTTTTCTGGCCTTGTGTGCCTCAGCGCTAACTCAGACCAGAAGTTAGACCCCCATTATGTTAGGGTGGCTTCCATATTATTCTTCCAATTTGATGGCACACAATATAGCTCCCAGAGTTATCTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 306606 403 + 647215 TCTCTGACTTACCTAATAATCAGAGATTACGCTGTGCATTAAAACTGAAAGATTTACCCCCCAT-ATATGAACAGCACATGACTGGC-ATAGGGGTTTGATGACCCTCATATTCACAAGAGATCACTCCAGTTAAGAGAGCATCAGATTCTGCTTACACATTTCAACTCCTTGAATAATCACCTGTTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGAAATATGGCATACCAGGAACCATAAGCATCATATGCTTCCAACCTTTTGTGCATCATTAAGCATTGTTTTTTTCTGACCTTGTGTGCATCAGCCCTAACTCTGTCCAGAAGCTAGATCCAGATTATGTTGGGGTTGCTTCCATATTATTCTTCCAATTCAATAGCACTGAATATAGCTCCAAGAGTTATTTTAC - -a -s mr.mrrefChr5 165431 52 + 294542 AATTTAAAGGTCCTGAGCTTGGGGGGTATTTAAACATTTCCAGGACACTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315324 52 + 636262 AATTTAAAGGTCCTGAGCTTGGGGGGTATTTAAACATTTCCAGGACACTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 307009 52 + 647215 GACTTTAAGGTCCTGAGCTTGGGGGGTATTTAATCATTTCCAGGACATAGAA - -a -s mr.mrrefChr5 165483 9 + 294542 TGTGTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315380 9 + 636262 TGTGTTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 307061 9 + 647215 TCTGTTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 165492 37 + 294542 GAGACCCTAGAGGTCATATTGTGCAAGATGGTTCGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315412 37 + 636262 GAGACCCTAGAGGTCATATTGTGCAAGATGGTTCGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 307070 37 + 647215 GAGACCCAGATGGTCATACTATGCGAGATGGTTCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 165529 5 + 294542 GTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315451 5 + 636262 GTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 307108 5 + 647215 GTTTG - -a -s mr.mrrefChr5 165534 77 + 294542 ATAGTGTTCAAAAACTAGAACTATCTCTTTCAGAGTCCCACTACCTAGGTGTCATTCATGAACCATTGTTCCTTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315467 77 + 636262 ATAGTGTTCTAAAACTAGAACTATCTCTTTCAGAGTCCCACTACCTAGGTGTCATTCATGAACCATTGTTCCTTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 307113 77 + 647215 ATAGGGTTCAAAAACTGGACCTATCTCTTCCAGAGTCCCACTACCTAGGCGTCATTCATAGACCCTTGTTCCTTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 165611 21 + 294542 CAAAATGCAGGGGAGATGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315545 21 + 636262 CAAAATGCAGGGAAGATGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 307190 21 + 647215 CATAATGCAGGGGAGATGCAT - -a -s mr.mrrefChr5 165632 63 + 294542 TTATGCAGGTCTATGACTATTATCTGGTAGAGGAATGGGGGATTGGGATTACACATGATTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315566 63 + 636262 TCATGTAGGTCTATGACTATTATCTGGTAGAGGAATGGGGGATTGGGATTACACATGATTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 307213 25 + 647215 TTATGCAGGTCTATGTGTATTATTT-------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 165695 249 + 294542 CATCCAGCACCAACCACCCTAATGTTAGCTCCAAAATGATGTGCCAGAACTCCAGATATGTGGAAAATTAGGTAAGCTTCACCTGACCGAGCTTTGGAATTTGTGGAGGTAAGCCCTAGTATTAATCCTGACTGGATAGCAACTGAAATAAGCTACATTTCACCCAGATGAGTTTAGTGTTTATCAATCATGCAACCAGGAAGGGTTAAACTGGGGCAATCTGGACTTGTACAGCTATATGAGTATCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315635 242 + 636262 CATCCAGCACCAACCACCCTAATGTTAGCTCCAAAATGATGTGCCAGAACTCTAGATATGCGGAAAATTAGGTAAGCTTCATCTGACTGAGCTTTCAAATTT-------CAAGCCCTAGTATTAATCCTGACTGGACAGCAACTGAAATAAGGTACATTTCACCCAGATGAGTTTAGTGCTTATCAATCATGCAACCAGGAGGGGTTAATCTGGGGCAACCTGGACTTGTACAGCGATATGAGTATCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 307238 206 + 647215 -------------------------------------------CTAGAAATTCAGATATGTGGAAAATAAGGTAGGCTTCACCTGACCAAGCTTTGGAAATTGTGGAGGTAAACCCTAGCATTAATCATGCCTGTATAGGGACTAGAAATTGCTACAATTCACCCAAATGAGTTTAGTGTCTATCAATCATGCAACTAGGAAGGGTTAAACTGGGGCAATCTGGACTAGTACAGCTATATGAGTATCCC - -a -s mr.mrrefChr5 165944 170 + 294542 ATCCTCCTCACCCCATGTACTGACAGACATTAGCAATTACATGTATAGAAGAGCTTGGAATCTAAGCAAACACAGAATCATAATCATTTTCAATTTACTAGCATTGTACTGTCTCCCCTTGCCCAAAGATATGCATCGCCAAATAACGGAAGACTGCCTAAAGTGATGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315877 170 + 636262 ATCCTCCTCACCCCATGTACTGACAGGTATTAGCAAATTCATGTATAGAGGCGCTTGGAATCTAAGCAAACACAGAATCATAATCATTTTCAATCTACTAGCATTGTACTGTCTCCCCTTACCCAAAGATATGCATCGCCAAATAACGGAAGACTGCCTAAAGTGATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 307445 170 + 647215 ATCCTCTTCATGCCATGTACTAACAGACATTAGCAATTACATGTATAGAAGAGCTTGAAATTTAAGCAAACACAGATTCAAAATCATTTATAATTTACTAGAATTGTACTGTCTCCCCTTGCCCAAAGACATGCATCACCAAATAAGGGATAACTGCCTAAAGGGATCGC - -a -s mr.mrrefChr5 166114 101 + 294542 ACTCTAGAAAAAAAGTCCTTAAAGTGCCATTACTTTTAAATTACGTCCCAAAGACATTGTTGGGTGGTACCTGCTTGGTACTTGGTACCAGTGGCTTAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316047 101 + 636262 ACTCTAGAAGAAAAGTCCTTAAAGTTCCATTACTTTTAAATTACGTCCCATAGACATTGTTGGGTGGTACCTGCTTGGTACTTGGTACCAGTGGCTTAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 307616 101 + 647215 ACTTTAAACAAAAAGTCCTTAGTGTGCCATTACTTTTAAATTACATCCCAAAGACATTGTTGGGTGGCACCTGCTCGATACTTGGCACCAGTTGCTTAACG - -a -s mr.mrrefChr5 166215 30 + 294542 TTGTGCAAAGTTCCAATAAAAGGCAAATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316171 30 + 636262 TTGTGCAAAGTTCCAATAAAAGGCAAATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 307717 30 + 647215 TTGTGTAAAGTTCCAATAAAAGGCAAATGT - -a -s mr.mrrefChr5 166245 35 + 294542 GCTGTGTGCATGTGGTTAGTAGTTGGCTGCTGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316202 35 + 636262 GCTGTGTGCATGTGGTTAGTAGTTGGCTGCTGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 307747 35 + 647215 GCCATGTGCATGCGGCAAGCACTCGGCTGCAGAGC - -a -s mr.mrrefChr5 166280 109 + 294542 AGCTGTCAAGCAGCTGCAGACACCAGGAGAAGAAGTCTGCCTGCCTCATGCACTGCCAAGTGATCACAGGGACATGTAGAAGGACCCAACACCCTCCACCCCATAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316252 109 + 636262 AGCTGTCAAGCAGCTGCAGACACCAGGAGAAGAAGTCTGCCTGCCTCATGCACTGCCAAGTGATCACAGGGACATGTAGAAGGACCCAACACCCTCCACCCCATAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 307782 109 + 647215 AGCTATCCAGCAACTGCAGGCACCAGGTGAAGAAGCCTGCCTGCCTCATGCACTGTCATGTGATTGCAGACACCTGCGGAAGGACCCAACACCCTCCACGCCATAAACC - -a -s mr.mrrefChr5 166389 42 + 294542 CATGAGATGCTATTTATTGCACAATACTCATAACCAAGATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316362 42 + 636262 CATGAGATGCTATTTATTGCACAATACTCATAACCAAGATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 307891 42 + 647215 CGTAAGATGCTATTTATTGCACAATACTCATAATCAACATTC - -a -s mr.mrrefChr5 166431 326 + 294542 TTCCAGCTTCATGATGTTCACAACTCTTGGCTCTTGGGGGCAGGGGTCTGCAAATACTGCCTCTGACTATCTCTTGTAGCATTGAAGAAGTTTATGTATTCCATGCCTAACATCCAAAACTTTAGTGGCTCTTAAAGCACAAGCACACTGCCTTAACACTGAGGATTGCCCCTGTTCTGTCACACTAAAGTATGTGCAGTACATTATGCTGCAGACACAGAGGGATCAATAAAATGAGTCGACAATAATACAACATTAAGAATAGCTTTCTAGTCCCCTCTGGGGTTTGTTCGTTGGACAGGGCATCTATAATGTACTCGGGGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316405 326 + 636262 TTCCAGCTTCATGATGTTCACAACTCTTGGCTCTTGGGGGCAGGGGTCTGTAAATACTGCCTCTGACTATCTCTTGTAGCATTGAAGAAGTTTACGTATTTCATGCCTAACATCCAAAACTTTAGTGACTCTTAAAGCAGAAGCACGCTGGCTTAACACTGAGGATTGCCTCTGTTCTGTCACACTAAAGTATGTACAGTACATTATGCTGCAGACACAGAGGGATCAATAAAATGAGTCGACGATAACACAACGTTAAAAATAGCTTTCTAGTCCCCTCTGGGGTTTGTTCGTTGGACAGGGCATCTATAATGTACTCGGGGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 307933 303 + 647215 TTCCGTCTTCATGGTGTTCATGACTCCTGGCTATTGGGGGCTGGGGTCTGCGAACAATGCCTCTG-----------------------AGATTATGTATTCCATGCCTAACATCAAAAACTTTAGTGGATTTTAAAGCACAAGCAAACTGCCTTAGCGCTGAGGAGTGCCCCTGTTCTGGCACAATAAAGTATGGGCAGTACAATATGTTGCAGACACAGTGGGATCAATAAAATGAGTCAACAATAATATAACATTCAGAAAATCTTTTTAGTCACCACTGGGGTTTTTTTGTAGGGCAGGGGATCTACAATGTATGCGGGGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 166757 80 + 294542 CACATGACAAGCCTCTTGTTAGAGGCACCACACTCACAAATTATGAGTTTATTTCTAGTGAGTGATTTGCCTATGCAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316733 80 + 636262 CACATGACAAGCCTCTTGTTAGAGGCACCACACTCACAAATTATGAGTTTATTTCTAGTGAGTGATTTGCCTATGCAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 308236 80 + 647215 CACATGACAAACCTCTTGCACGATGCGTTGCACTCATAAATTATGAATTTGTATCCAGTGAATGATTTGCCTATGCGTCT - -a -s mr.mrrefChr5 166837 10 + 294542 CTTCTGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316813 10 + 636262 CTTCTGGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 308373 10 + 647215 CTTTTGGATT - -a -s mr.mrrefChr5 166847 70 + 294542 TGGAGTATTTACAAGTTGTGGGCCATCTCGTGTGCCATGCACAGACTATAAGTTCTCAACTGACTGAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316823 70 + 636262 TGGAGTATTTACAAGTTGTGGGCCATCTCGTGTGCCATGCACAGACTATAAGTTCTCAACTGACTGAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 308388 70 + 647215 TGGAGAATTTACAAGTTGTGGGCCAGCTCATGTGGCATGCACAGACTTCAAGTTCTGAACTGACTGGACC - -a -s mr.mrrefChr5 166917 71 + 294542 AGATTAATGAAGAGGGGATGCGATCAAAAGGATGGGAAGCAGTGACCTAAAAAATGATTACTCTCTAGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316893 71 + 636262 AGATTAATGAAGAGGGGATGCGATCAAAAGGATGGGAAGCAGTGACCTAAAAAATGATTACTCTCTAGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 308459 71 + 647215 AGATTAGTGAAGAGCAAATACGATCAGAAGTATGGAAAGTAGTGACTCAAGATATGATTACTCTCTTAACC - -a -s mr.mrrefChr5 166988 11 + 294542 CAATGAATTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316970 11 + 636262 CAATGAATTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 308530 11 + 647215 CAATGAATTCT - -a -s mr.mrrefChr5 166999 88 + 294542 GGATCATCCCTACAAATATCATCAGATGTGGAAACTCAAGTGGACCTAACTAAAGTTCAGTTTTACACAATTTGCCAAGCTAATTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316984 88 + 636262 GGATCATCCCTACAAATATCATCAGATGTGGAAACTCAAGTGGACCTAACTAAAGTTCAGTTTTACACAATTTGCCAAGCTAATTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 308541 88 + 647215 GGATCATCCCTACAAATACCATCAGATGCGGAAACTCCAGTGGATCCGGCTAAAATTCAGTTTTACACAATTTGCCAAGCTAATTTAA - -a -s mr.mrrefChr5 167087 3 + 294542 GAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317072 3 + 636262 GAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 308640 3 + 647215 GAA - -a -s mr.mrrefChr5 167090 61 + 294542 ATTCTTTCTACACAGTTTATGAAGTTTGCCTCTTACTGGAGCTTTGCATGAGGCATTGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317075 61 + 636262 ATTCTTTCTACACAGTTTATGAAGTTTGCCTCTTACTGGAGCTTTGCATGAGGCATTGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 308646 61 + 647215 ATTCTGTCTACTCAGTTCATGAAGTTTGCCTCTTATTGAAGCTTTACATGATGCATTATGT - -a -s mr.mrrefChr5 167151 39 + 294542 AAATATAATCCATGTTAAGGTGCAACTCAGATGTAGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317136 39 + 636262 AAATATAATCCATGTTAAGGTGCAACTCAGATGTAGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 308708 39 + 647215 AAATACAACCAATGTTAAGGTGCAACTCAGGTCGAGATT - -a -s mr.mrrefChr5 167190 19 + 294542 GCCAATGCAGGTTCCCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317175 19 + 636262 GCCAATGCAGGTTCCCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 308750 19 + 647215 GCAAAATCAGGTTCCCAGA - -a -s mr.mrrefChr5 167209 23 + 294542 TTGGTCTGGCTTACTTCACAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317197 23 + 636262 TTGGTCTGGCTTACTTCACAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 308769 23 + 647215 TTGGCTTGGCCTACTTCACAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 167232 131 + 294542 CATTCCCAGCAAGAGGTTTCCTGTTCTAGCTGCTTTCCCAGCAAGAGGTATCCCAGGCTACATGTCAACTTCATGAGACTTCTCACAGAACCTAATCAGGCACTGCGGTACTGCACAATGTATGCATTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317222 131 + 636262 CATTCCCAGCAAGAGGTTTCCTGTTCTAGCTGCTTTCCCAGCAAGAGGTATCCCAGGCTACATGTCAACTTCATGAGACTTCTCACAGAACCTAATCAGGCACTGCGGTACTGCACAATGTATGCATTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 308792 131 + 647215 CATTCCCAGCAAGAGGTTTCCTGTTCTAGCCAGATTCCCAGCAACAGGAATCATGTTCTACATATCAACTTCAAGAGACACCTCACAGAACCTATTCAGGTTGTGGGGTGTTGTACAATGTATGCACTTCC - -a -s mr.mrrefChr5 167363 101 + 294542 AAAATATCGTGCATTATATGCATTTCCAAACTTTTCTGGTATAACTCACCCTTCTACCTAAGAGCTTGTTGGATCGCTTGAGTCCTTCTAGGATAAGACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317353 101 + 636262 AAAATATCGTGCATTATATGCATTTCCAAACTTTTCTGGTATAACTCACCCTTCTACCTAAGAGCTTGTTGGATCGCTTGAGTCCTTCTAGGATAAGACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 308924 101 + 647215 AAAAGATCGTGCATTATATGCATTTTCAAACTTTGCTTGTACAACTCGTCCTTCCACCTAAGAGCTTGTTGGATTGCTTGAATCCTTTTAGGATAAAACAA - -a -s mr.mrrefChr5 167464 21 + 294542 ACTATGCACACTGAATTACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317455 21 + 636262 ACTATGCACACTGAATTACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 309025 21 + 647215 ACTGTGTGCGCCAAACAACTT - -a -s mr.mrrefChr5 167485 16 + 294542 AAGACTTGCATAACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317476 16 + 636262 AAGACTTGCATAACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 309047 16 + 647215 AAAACTTGCATAACAG - -a -s mr.mrrefChr5 167501 15 + 294542 TCCAGACAATGATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317492 15 + 636262 TCCAGACAATGATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 309065 15 + 647215 TCCAGACAATGCTAT - -a -s mr.mrrefChr5 167516 25 + 294542 ACTGGAATCGTACTGTATCATCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317541 25 + 636262 ACTGGAATCGTACTGTATCATCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 309080 25 + 647215 ATTTGAATCATACTGTATCAGCCAA - -a -s mr.mrrefChr5 167541 25 + 294542 CCCGACTCACAATGCTTCTCTCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317581 25 + 636262 CCCGACTCACAATGCTTCTCTCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 309105 25 + 647215 CCTGACTCACAATGCTTCTCTCAAA - -a -s mr.mrrefChr5 167566 177 + 294542 TTACAAACTAATGGACAATTCCATCCCTATACCATTCATAAATTCCCAACTAACCTTGTTCAGCCTTTGAAGAGACCATTGCATTCAATACATAGGCCATTGGCCCTAGTACTATTCCAATTCCATAGACTGGTGAGATTGGTGCAAAATTCAAATTATTCCTACATTGCTTTTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317610 144 + 636262 TTACAAACTAATGGACAGTTCCATCCCTTTATCACTCATAAATTCCCAACTAACCTTGTTCAGCCCTTGAACAGACCATTGCATTCAATACATAGGCCATTTACCCTAGAACTATTCCAATTCC---------------------------------ATTCCTACATTGCTTTTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 309130 177 + 647215 TTGCAAACTTACGTACAAGTCCATCCCTATACCATGCATAGATTCCTGACTAACCTTGTTCAGCCTTTGAAGAGACCATTGCATTCAATACATAGGCCATTGGCCCTAGTACTATTTAAATTCCATAGACTGGTGAGATTGGTGCAAAATTCAAATTATGCCTACATTGCTATTTTG - -a -s mr.mrrefChr5 167743 237 + 294542 CTTTTGGCATATAATAGGTTGTTTATCCATGAGATGTATAGGAAACTTATCTCACCCAATAAGTAAACAAAACTTATTATCTGGGTTCAGGCACATTAGAGTGCTGTGGCACAGTACAAGTGTGAGTTTGCTGCCCTCATTCTCAGGAACCTGTCAGGCACTCAAACTGTACAAAATAGAACAGTCTACACACTCATGTGTGGGATCCTGTCAGATTTCATATTCTGACTGAAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317754 232 + 636262 CCTTTGGCATATAATAGGTTGTTTATCCATGAGATGTATAGGAAACTTATCTCACCCAATGAGTAAACAAAACTTATTATCTGGGT-----CACATTAGAGTGTTGTGGCCCAGTACAAGTGTGAGTTTGCTGTCCTCATGCTCAGGAACCTGTCAGGCACTCAAACTGTACAAAATAGGACAGTCTACACACTCATGTGTGGGATCCCGTCAGATTTCATATTCTGACTCAAGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 309308 230 + 647215 CTTTTGGCATATATTAGGTTATTTATCCATGAGGTATATAGGAAACTTATCTCACCGAATAGGTAAACAAAACTTATTATCTGGGTTCAGGCATAT-------CTGTGGCACAGTACAAGTGTGAGTTTGCTGCCCTCATTCTCAGGGACCTGTCTGGCACTCAAAATGTACAAAATAGAACAGTCTACACACTAATGTGTGGGGTCCTGCAAGATTTCATATTCAGACTGAAGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 167980 9 + 294542 CTCAGGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317986 9 + 636262 CTCAGGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 309606 9 + 647215 CTCAGGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 167989 98 + 294542 TTGCCTGGATAGCTCTACCTCTGTTCCAATTTGTCCTTCTTGCTCCTGGGAATAGTTTCTTGAGAATAGTCTCTTTTTGTAGCCCGAAACCCACAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317996 98 + 636262 TTGCTTGGATAGCTCTACCTCTGTTCCAATTTATCCTTCTTGCTCCTGGGAATAGTTTCTTGAGAATAGTCTCTTTTTGTAGCCCGAAACCCACAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 309615 98 + 647215 TTGCCTGGATAGCTCTACCTCTGTCCCAATTTGTCCTTCTGTCCCCTGGGAATAGTTTCTTGAGAATGGTCTCTTTTTGTGGACCACAACCCAGAACA - -a -s mr.mrrefChr5 168087 31 + 294542 CTTGTTCCACTTAGTTCCATCCATTGCCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318094 31 + 636262 CTTGTTCCACTTAGTTCCATCCATTGCCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 309718 31 + 647215 CTTGTCCCACTGAGTTTCATCCATTGCCAAT - -a -s mr.mrrefChr5 168118 90 + 294542 GTATCCTATTTTCTATATACTTGGTAAGCCTCTGATATGTGTTTCTTGCTCTTGAGAACAGTTTCTTTAGAATAGTCTTTTTTTGTGGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318125 90 + 636262 GTATCCTATTTTCTATATACTTGGTAAGCCTCTGATATGTGTTTCTTGCTCTTGAGAACAGTTTCTTTAGAATAGTCTTTTTTTGTGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 309750 90 + 647215 GTATTCTATTTTCTATATACTTGGTAAGCCTCTGATTTTTCTCTCTCGCTCCTGGGAACATTTTCTTGAAAATAGTCTCTTTTTGTGGGC - -a -s mr.mrrefChr5 168208 26 + 294542 CCATTTGGTTTAGTCCATTGCCAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318215 26 + 636262 CCATTTGGTTTAGTCCATTGCCAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 309860 26 + 647215 CCACTTAGTTTAGTCCATTGCCAATT - -a -s mr.mrrefChr5 168234 119 + 294542 GAATTCTATTTTCTATGTACTTGAAAAGCCTGCCTAGGTGTACTCCTTTCCTGAGTTAACAGCTCCAACTACAGACTTCATGAGCTGGGGCAGCCTAAACACCTAGTATTCATCATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318241 119 + 636262 GAATTCTATTTTCTATGTACTTGAAAAGCCTGCCTAGGTGTACTCCTTTCCTGAGTTAACAGCTCCAACTACAGACTTCATGAGCTGGGGCAGCCTAAACACCTAGTATTCATCATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 309887 119 + 647215 AAACTCGATTTTCTATGTATTTGGTAAGCCTGCCTGGGTTTACACCTTTCCTGAGTTGACAGCTACAACTATAAACTTTATGAGCTGGGGCAACCTAAACATCTAGGATTCATCAGCAA - -a -s mr.mrrefChr5 168353 72 + 294542 GTTGGAAACTGGCCTCTCTCCCTTCATTGGTCAAAGCTCACGTCAGCCTTCTATAGTGACTATAAACAATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318363 72 + 636262 GTTGGAAACTGGCCTCTCTCCCTTCATTGGTCAAAGCTCACGTCAGCCTTCTATAGTGACTATAAACAATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 310006 72 + 647215 ATTAAAAACTGGCCTCTCTCCCTTCTTTGGCTAGAACACACATCAGCTTCCTATAGTGACTGCAAACGATGG - -a -s mr.mrrefChr5 168425 43 + 294542 CTGCTCCACAGCACTGAGATACATGCTAATGATATCCAGGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318437 43 + 636262 CTGCTCCACAGCACTGAGATACATGCTAATGATATCCAGGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 310078 43 + 647215 CTGCTCCAAAGCAATGAGATACATGTTAATGATATCCAGGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 168468 103 + 294542 AATTCATTTTCTCTCATAGGACAACCTCTTCTTGTCTTAGAGGACAGACTTCTTGACTAGAAGCTTTCCTGCATTGGTTTATGGATGCGTTTACAGGACAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318480 103 + 636262 AATTCATTTTCTCTCATAGGACAACCTCTTCTTGTCTTAGAGGACAGACTTCTTGACTAGAAGCTTTCCTGCATTGGTTTATGGATGCGTTTACAGGACAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 310137 103 + 647215 AATTCATTTTCTCTCATAGGTCAACCTCTTCTAGTCTTAGGGAGCAGACTCCTAGACCTGAAGCCCTCCTGTATTGGTTTATGGATTTGTTGACAGGACAGAA - -a -s mr.mrrefChr5 168571 20 + 294542 CTGACTACTTATATGTGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318583 20 + 636262 CTGACTACTTATATGTGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 310253 20 + 647215 CTAAACATTTATACGTGTAG - -a -s mr.mrrefChr5 168591 11 + 294542 CATGTAAGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318603 11 + 636262 CATGTAAGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 310274 11 + 647215 CATATAAGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 168602 61 + 294542 ATATTTCAAAGCTTATATAAAGTGAAACAGCAAATTAACTTACTGGACTGTTATGTGAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318628 61 + 636262 ATATTTCAAAGCTTATATAAAGTGAAACAGCAAATTAACTTACTGGACTGTTATGTGAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 310285 61 + 647215 ATATTTGGAAGTTTATACAAAGTGATAAAGTAAATTAACTGACTAGAGTGTTATGTGAGCC - -a -s mr.mrrefChr5 168663 46 + 294542 ACAAGCGCAATCATGAACAATCTGCTGTTGGCAGCGAGTCTGCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318691 46 + 636262 AAAAGCGCAATCATGAACAATCTGCTGTTGGCGGCGAGTCTGCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 310346 46 + 647215 ACAAGCGTAATCATGAACAATCTGCCTTTGGCAACTAATCTGCATT - -a -s mr.mrrefChr5 168709 139 + 294542 CATATCTGCCTGTGTAACTGACCTAGATTTTATGGATTGAAATTATTGTGCAATAAACTGATTCTTGCCCATTGACCATATGGTCTAATGATGTTTCTACACCACAGCTGGAAGAAAACTAGTGGTAATGCCAGCTGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318746 139 + 636262 CATATCTGCCTGTGTACCTGACCTGGATTGAATGGATTGAAATTACTGTGCAATAAACTGATTCTTGCCCATTGACCATATGGTCTAATGATGTTTCTACACCACAGCTGGAAGAAAACTAGTGGTAATGCCAGCTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 310392 134 + 647215 CATATCTGCCTGTGTAATTGACGTAGATTTTATGGATTGAAATCATTGTGCAATAAACTGCTTC-TGCCCATTGACCATA-GGTCTAACAATGTTTCTACGCCACAACTGGAAG---ACTAGTGGTTATGCCAGTTGGC - -a -s mr.mrrefChr5 168848 111 + 294542 TATTCTCAGCCAGTACCAGAAGCATTTGGCAAGATAATTAACCTCGCTATGAGCTTTGATGTGAGGATAAAAAGTTATAAAGACATGGTCTACACTGTGGATTGCCACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318885 109 + 636262 TATTCTCAGCCAGTACCAGAAGCATTTGGCCAGATAATTAACCCTGCTATGAGCTTTGATATGAGGAT--AAAGTTATCAAGACATGGTCTACACTGTGGATTGCCACATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 310539 111 + 647215 TATTCTCAGCCAGTACCAGAAGCATTTGGCAAGATAATTAACCTCGCTATGAGCTCTGACGTGAGGATAAAAAGTTATAAAGACAAGGTTTATGCTGTGGATTGCCATGTT - -a -s mr.mrrefChr5 168959 14 + 294542 TGGGTGTGGTGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318997 14 + 636262 GGGGTGTGGTGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 310650 14 + 647215 TGGGTGTGGTGAGA - -a -s mr.mrrefChr5 168973 432 + 294542 ATATGGAATATGTGTGATTCTCTGTTACAGCAAGATGGGTCAAGACTACAAGCTCAGTATGTGTAATTCCCATTAGGTAATACCTTGATTTTTAAGCCTACAAATGTCCAAGTATCTGCACCACTCTTGGTATGCTTTACAGGGCTGAAATCGTGGCCCAGTTCATGAACATACAGGCTGGGAGACTGGCCTCAAACCATGTCTATCATTTTATTAAACTTTCTAACTCCAGCATTCTTAAAACCTAAGTCCTCTGACCCTAAAGTGTGACTTTAAGTATCATTCGGGCTCCACTTTAGAATCACACAGTTATTAATAACTTTGGTATCTTGATGGAATGTATGCAGGAAAAAACCATGAATCAAGTTCTCCTTGGGGCATATATTGCCCCACACAATTAATTTTGAGGATAAAATAGAAAGGACATAGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319011 431 + 636262 ATATGGAATATGTGTGATGCTCTGTTACTGCAAGATGGGTCAAGACTACAAGCTCAGTATGTGTAGTTCCCATTAGGTAATACCTTGATTTTTAAGCCTACAAATGTCCAAGTATCTGCACCACTCTTGGTATGCTTTAGAGGGCTGAAAGTGT-GCACAATTCATGAACATACAGGCTGGGAGACTGGCCTCAAACCATGTCCATCATTTTATTAAACTTTCTAACTCCAGCATTCTTAAAACCTAAGTCCTCTGACCCTAAAGTGTGACTTTAAGTATCATTCGGGCTCCACTTTAGAATCACACAGTTATTAATAACTTTGGTATCTTGACGGAATGTATGCAGGAAAAAACCATGAATTGAGTTCTCCTTGAGGCATATATTGCCCCACACAATTGATTTTGAGGATAAAATGGAAAGGACATAGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 310717 429 + 647215 ATATGGAATGTATGTGATTCTCCATTACAACAAGATGGATCAAGACTGCTAGCTCAGTATGTGTCATTCCCATTAGGTAATACCCTGATTTTTGAGACTACAAATATCCAAGTATCTCCATCGCTCTTGGCATTCATTACAGGGGTGAAATCGTGGCCCAGTTCATGAACATACAGGTAGGGAGACCGGCCTCAAACCATTAGTATCATTTTATTAAACTCTGTAACCCCAGCATTCTTAAATCCTAAGTCCTCTGACCTTACAGTGTGACTTTAAGTATCATTCGGGCTCCACTTTAGACCCACGCAG---TTAACAATTTTGGTATCTTGATGAAATGTATGCCGGAAAAAACCATGAATCAAGTTCTCCTTGGGGCATATATCGCCCCACACAATTAATTTTGAGGATAAAATAGAAAGGACATAGACA - -a -s mr.mrrefChr5 169405 21 + 294542 ATATGGATAGATCACATTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319442 21 + 636262 ATGTAGATAGATCACCTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 311183 21 + 647215 ATATGGATAGATCTCATTCGA - -a -s mr.mrrefChr5 169426 64 + 294542 ATAACACAGTACGCTGGTTGCAAGTTGTTTCCTTCTACTATAGTACAGGGATTTTGTGAGGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319465 64 + 636262 ATAACACAGTACGCTGGTTGCAAGTTGTTTCCTTCTACTATAGTACAGGGATTTTGTGAGGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 311204 64 + 647215 ATAGCATAGTACACTGGTTGCAAGTTGTTTCCTACTACTATAGCACATGAATTTTATGAGGCAT - -a -s mr.mrrefChr5 169490 248 + 294542 ATAGAGGAGCACAGCATTGTATCTTTAGGGTGAATTGTATTGCAGTATTGGTTTGCTCATAATTGGCCCACCAAAGGATTGTTGAGGTGACTGTACCCCACACCTCCAGGCCTCCCATCCAGTACAGCTATTTCAATTGTATGATGGGCGACTAGGCAACAATGGCTGCAGTCTAGGCAGTTGAAACATTTTTTACTTTGGTACCTGCATATATTCTCTGGCTATTAATTCGGTTGCATGGTGTACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319535 239 + 636262 ATAGAGGAGCACAGCATTGTATCTTTAGGGTGAAT--TACTGCAGTATTGGGTTGCTCATAATTGGCCTACCAGAGGCTTGTTGAGG-------ACCCCACACCCACAGGCCTCCCATCCAGCATAGCTATTTCAATTGTATGAAGGGCGACTAGGCAACAATGGCTGCAGTCTAGGCAGTTGAAACATTTTTTACTTTGGTACCTGCATATATTCTCTGGTTATTGATTCAGTTGCATGGTGAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 311268 246 + 647215 ATAGAGGAGCACAGCATTGCACCTTTAGCATGACTTGTGTTGCAGTATTGGTTTGCTCATAATTGTCCCACCAACGTATTGTTGAGGTGACTGTACCCCACATTTCCAGAGCTCCCATCCAGTGCAGCCATCTCAATTGTATGATGGGAGACTCGGCAGTGATGGCTGCAGTCTAGGCAG--GAAATATTTTGTACTTGGGTACCTGCATATATTCCCTGGCTATTAATTCGGTTGCATGGTGTACTT - -a -s mr.mrrefChr5 169738 129 + 294542 AGCTACTCTCCTTATTCGTCAGGAGGGTGCGAAGGTGTTTATGGATAGATCATGTGGTCTACACACATCTTGTATTCACAGAATTCTGAAATTAAAACATTTAGTCTTCCCAAATCTACTTATGATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319809 129 + 636262 AGCTACTCTCCTTATTCGTCAGGAGGGTGCGAAGGTGTTTCTGGATAGATCTTGTGGTCTACAAACATCTTGTATTCACAGAATTCTGAAATTAAAACATTTGGTCTTCCCAAATCAACTTATGATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 311514 127 + 647215 GGCTACT-TCCTCATATATCAGAAGGGTGAGAAGGTGTTTATGGATAGGTCATGTGGTCTACACG-ATCTTGTAATCACAGAATTTTGAAATTAGAACATTTAGTCTTGCTAAATCTACTTCTGACATG - -a -s mr.mrrefChr5 169867 95 + 294542 TACCGTTCAAGATTGAGTGGTGCTTGTCCCCAACCAAGATAGAAAAAATACTTTACCTTCTCCAGGGAAGTAATATTCAGCTGAGTAGTAAGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319938 95 + 636262 TGCTGTTCAAGATTGAGTGGTGCTTGTCCCCAACCAAGATAGAAAAAATGCTTTACTTTCTCTGGGGAAGTAATATTCAGCTGAGTAGCAAGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 311695 93 + 647215 TACCGGTCAAGATTGAGTGGTGGTTGTCCCCAACCAAGATAGAAGAAATACTTTACCTTCTACAGGGAAGTAATATTCAGCCAAGTTGTAAGG-- - -a -s mr.mrrefChr5 169962 171 + 294542 ACACACCAGCAGCCTCATGTTAAATAGATCCCCCATGGTGCTCAGGTTCAAAAAGGAGAGGGAAGAGTTTACAAAACTAGATCAGAAGTTTGATATTCAAAAGGTTGGGTCGGACAAGGTTGCTATTAGGATTCTATAGCATACCCCTAGTCAGTCTCCTGACAGGAACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320035 171 + 636262 ACACACCAGCAGCCTCGTGTTAAATAGATCCCCCATGGTGCTCAGGTTCAAAAAGGAGAAGGAAGAGTTTACAAAACTAGATCAGAAGTTTGATATTCAAACGGTTGGGTTGGACAAGGTTGTTATTAGAATTCTATAGCATACCCCTAGTCAGTCTCCTGACAGGAACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 311788 145 + 647215 --ACCCCAGCAGACTCATGTTAAATAGATCCCCCATGGTGCTCAGGTTCAAAAAAGAGAGGGAAGAGTTTACAAAACTAGATCAGATGTTTGATATTTGAAAAGTTGGGTCAGACAAGGTTGCTATAAGGATTCTATAGCACACCCC------------------------ - -a -s mr.mrrefChr5 170133 35 + 294542 AGAAAATAGGTAGCAACCACCAGTCAATGCAGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320213 35 + 636262 AGAAAATAGGTAGCAACCACCAGTCAATGCAGGAG - -a -s mr.mrrefChr5 170168 4 + 294542 ACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320342 4 + 636262 ACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 311933 4 + 647215 ACCC - -a -s mr.mrrefChr5 170172 30 + 294542 AGACCAGACCTTATCAAGGAGTGTGGGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320346 30 + 636262 AGACCAGACCTTATCAAGGAGTGTGGGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 311939 30 + 647215 GGACCAGACCTTATCAAGGACTGTGGTCCC - -a -s mr.mrrefChr5 170202 20 + 294542 ACCCATTACGATGTAGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320383 20 + 636262 ACCCATTACGATGTAGCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 311969 20 + 647215 ACCCATTACGATGTAGCACT - -a -s mr.mrrefChr5 170222 102 + 294542 TGACGCGTGTCATACCTGGACCAGATTTATTAATGACTATGGGTCCACCTACCTCAATGTAGGTCTCACTGGGGGAAATGAATTTCACTTCTACAGCAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320403 101 + 636262 TGACGCGTGTCATACCTGGACCAGATTTATTAATGACTATGGGTCCACCTACCTCAATGTAGGTCTCACT-GGGGAAATGAATTTCACTTCTACAGCAGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 311999 102 + 647215 TAATGACTGGCATACTTGGACCAGACTTATTAATGACTGTGGGTCCACCCATCTCAGTGTAGCACTCATTGGGGGAAATGAATTTCACATCTACAGCAGGCA - -a -s mr.mrrefChr5 170324 21 + 294542 AGGTCAGATTGCTTATCATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320504 21 + 636262 AGGTCAGATTGCTTATCATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 312106 21 + 647215 AGGTCAGATTGCTTATTATCA - -a -s mr.mrrefChr5 170345 120 + 294542 ATTGCACTTGTCACACTATCTCCGCTATATATGGGGTTTGATCAATGAAGATTCAACTTTCCATGAGTCCTTTTTGTTTATATTGTTAAATCACCCGTGATATCCTAGCAAATTTCCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320525 119 + 636262 ATTGCCCTTGTCACACAATCTCCGCTATATATGGGGTTTGATCAATGAAGATTCAACTTTCCATGAGTCCTTTTTGTTCATATTGGTAAATCA-CCGTGATATCCTAACAAATTTCCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 312135 114 + 647215 ATTGCACTTG-----CTATCT-TGCTATATATGGGGTTTAATCAATGAACATGCAACTTTCCATGAGGCCTTTTTGTGTATCTTGTTAAATCACCCGTGATATCCTAGCAAGTTTCCTTA - -a -s mr.mrrefChr5 170465 148 + 294542 ATGAGGCAGAACAGCAACCACTATCTGAAGAGTTGGGAATGGTACTATGCATAAGTAAATCCGCTTGATGAAAACCAACTCAAAAACTGCTTCTGGAGGCTCCAGAGTCTAGATGCTCTAAACACCCAAGTATTTGGAGGCTTCTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320694 122 + 636262 ATGAGGCAGAACAGCAACCACTATCTGGGGAGTTGGGAATGGTACTATGCATAAGTGAATTCGC---ATGTAAACCAACTCAAAAACTGC-----------------------TGCTCTAAACACCCAAGTATTTAGAGGCTTCTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 312249 148 + 647215 ATGAGGCAGAACAGAAACCACTATCTGAAGATTTGGTAATTGTACTGTGCATATGTAAATCAGCTTGATGAAAACCAACTCCAAAACAGCTTCTGGAGGCTCCAGAGTCTAGATGCTCTAAACACTCAAGTATATGGAGGCTTCTGGA - -a -s mr.mrrefChr5 170613 122 + 294542 TGATGTATGGATCCTCAGTCAATGGCTTTCCTCTCCTACAGCTCTTTGAAATACCCCATATCATTAGAAACAAACTTACTTTATGTTTACTTTGCTAACCTTCCAGGCCTTATGACCTTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320816 122 + 636262 TGATGTATTGATCCTCAGTCAATGGCTTTTCTCTCCTACTGCTCTTTGACATGTCCCATATCATTAGACACAAACTTACTTTATGTTTACTTTGCTAACCTTCTTGGCTTTAAAATCCTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 312420 122 + 647215 TGCTGTATGGATCCTCAGTCAATGGCTTTCCTATCCTACAGCCCTTTGAAATACCCCATATCATTAGAAACAAACTCACTATATGTTGATTATAGTGGCCTTCCAGTGCTTGTGGCTTCAAT - -a -s mr.mrrefChr5 170735 196 + 294542 TCTTAACATTATTTCGGAAGATGTAATACCTCAACTCAATATGTATGATATTAAATGACATCAGAGATGGCTATGCCTACTGCACTAACCTAGTAGGTCTTATGATTATAGTCAATTAGAGCATAACATATGTCTGCCTGAAGAGTGCGTCCTTTCTGTGTACATAACAGGTCCAATGGTCACATTATGCAAGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320940 196 + 636262 TCTTAACATTATTTCGGAAGATGTAATACCTCAACTCAATATGTATGATGTCAAATGACACCAGAGATAGCTATGCCTACTGCACTAACCTAGCAAGTCTTATAATTATAGTCAATTAGAGCATAACATATGTCTGCCTGAAGAGTGCGTCCTTTCTGTGTATATAACAGGTTCAATGGTCACATTATGCAAGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 312542 196 + 647215 CCTTAACATTATTTCGCAAGATATAATACCTCAACCCAATATGTATGATATTAAATGACATCAGATGCGGCTATGCCTGTTGCACTAACCTAGTAGGTCTTGTGATTATGGTCAATTAGGGCATAGCTTATGTCTGCCTGAAGAGTGCATCCTTTCTGTGTACATAAGAGGTCTGATGGTCACATTATGCAAGGTC - -a -s mr.mrrefChr5 170931 167 + 294542 AATGTATTACAATCATCACAATGTCAATTAATGCCCACCCCAGGCTGCTCCTAACTTAACACTTTTAACCATGATAAGTACAATAATAGCCCAGATATTTAGGGGACCTGGTAGTGGGGAACACCTGAAAATGCAAGCCCATACTAATATGATCCCACACTATCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321136 167 + 636262 AATGTATTGCAATCATCACAATGTCAATTAATGCCCACCCCAGGCTGCTCCTAACTTTACACTTTCAACCATGTTAAGTACAATAATAGCCCAGATGTTTAGGGGACCTGGTAGCGGGGAACACCTGAAAATGTCAGCCCATGCTAATATGATCCCATGATATCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 312740 167 + 647215 ATTGTATGACAATCATCAAAATGTCAATTGAAGCCCACCCCAGGCTGATCCTAACTTAACACTTTTAACCATGAGAAGAACAATCATATTACAGACATGTAGGGAACCTGAGAGTGGGGAACACCTGAAAGTGCAAGTCCATACTAATATGATTCCACACCATCAGC - -a -s mr.mrrefChr5 171098 166 + 294542 AGGCAAAGAGATGTGGCACATTTGACAACAAGATGCATCAAAATGCCTCATGTCTCGGGAAGTCCCACTTCATGATTAAGGTCCAGGAGGCAAGGTCTCAAGAAAACAGGCTGCTGTGCTTGAGCACCCCTCCATGTGGGGATTATAACCCTTGTCTATGTCCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321303 166 + 636262 AGGCAAAGGGATGTGGCACATGTGACAACAAGATGCATCAAAATGCCTCATGTCTCTGGAAGTTCCACTTTATGATTAAGGTCCAGGGGGCAAGGTCACAAGAAAACAGGCTGCTGTGCTTGGGCACCCCTCCATGTCGGGATTATAACCCCTGTCTATGTCTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 312946 165 + 647215 AGGAAAAGAGATGTGGCACCTTTGACAACAAGATGCATCAACATGCCTCATGTCTTGAAGAGTCCCCCTTCATGATTAAGGTCCAGAAGGCAAGGTCTTAAGAAAAAAGGCTGATGGGCTTGAGCACCCCTCCATGTGGGGATTATAACACTTGTCTATG-CCAGA - -a -s mr.mrrefChr5 171264 157 + 294542 ATGTCGAGACAAAACCTGGCCAATGTCAATGTCCTGAAAGACCATACAGCCTCATGCTGAGGTATCACTGGCAAGATGAGGTTGGGCAATCTTCACTTTGCACTGTGGTTGGGTATCTTTTTATGACTTAGCCCTCAATCTTGACAACCCTAGTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321470 155 + 636262 AAGTCTAGACAAAACCTGGCCAATGTCAATGTCCTGAAAGACCATACAGCCTCATG-TGAGGTATCACTGGCATGATGAGGTT-GGCAATCTTCACTTTGGACTGTGATTGGGTACCTTTTTATGACTTAGCCCTCAATCTTGACAACCCTAGTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 313111 157 + 647215 ATGTAGAAACAAAACCTGGCCAATGTCAATGTCCTGAAAAACCCTACTGCCTCATGCTGAGATATCACTAGCAAGATGAGGTCGGGCAATCTTCACTGTGCACTGTGGTTACGTATGTCTTTATGACCTAACCCTCAATCTTTACAACCCTAGTTAC - -a -s mr.mrrefChr5 171421 63 + 294542 TGCACCACCTTAACTATAATCCTTTATCCCGCTATGATTGCATTAAAGCTGAACCCTTCAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321625 61 + 636262 TGCACTGCCTTAACTATAACCCTTTACCCCGCTAGGATTGCATTAAAGCTGAACCCTTCAG-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 313279 59 + 647215 TGCCCCACCCTAACTAGAATGCTTTATCC--CTATGATTGCA-TAAAACTGAA-CCTTCAGGT - -a -s mr.mrrefChr5 171484 113 + 294542 ACCCAATATGTAGTAGCCCTCACCTTGATTTGGCAAGGAGAATGCATATAAGCCCTTAGTACCATGATTCTCCAATGAATAGGAGAGTAATAAGTCAAGAACCTGAACATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321686 113 + 636262 ACCCAATATGTAACAGCCCTCACCTTGATTTGGCAAGGAGAGTGCATATAAGCCCTTAGTACCATGATTCTCCAATGAATGGGAGAGTAATAAGTCAAGAACCTGAAGATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 313339 112 + 647215 ACCCAACATGTAGTAAAACTCACCTTGACTTGGC-AGTAGAATGCATATAATCCCTTAGTGCCATGATTCTCCAATGAATAGGACAGTAATAAGTCAGGAACCTGAACATTCA - -a -s mr.mrrefChr5 171597 80 + 294542 TATATGGCTTTTGGGAACCCCAGGGTCTAAGTTCATTGAGCTACAGGGTCACAATAGAGACTATTGAGTCCTCAGAAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321799 80 + 636262 TATATGGCTTTTGGGAACTCCAGGGTCTAAGCTCATCGAGTTACAGGATCACAATAGAGGATATTGAGTCCTCACAAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 313463 80 + 647215 TATATGGCTTTCGTGAACCCCAGGGTCTAAGTTCATTAAGCTACAGGGTCACAATAGAGACTATTGAGTCCTCAGAAGTT - -a -s mr.mrrefChr5 171677 34 + 294542 AGTGCCCTGCTGGAAATATTCCTATTTGCAATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321896 34 + 636262 AGTGCCCTGTTGGAAATATTCCTATTTGCAGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 313543 34 + 647215 AGTGCCCTGCTGGAAATGTTCCTATTAGCAATAA - -a -s mr.mrrefChr5 171711 122 + 294542 cctcgacaaacaactcatagaggattgttagcatgtgatcctgctctgcctgctcgatcggcccgtcatctcttaggtgattctcttgatcagcccagttaataggttgtattatgctaata -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323656 122 + 636262 cctcgacaaacaactcatagaggattgttagcatgtgatcctgctctgcctgctcgatcggcccgtcatctcttaggtgattctcttgatcagcccagttaataggttgtattatgctaata -s simRat_chr6.simRat.chr6 315210 122 + 647215 cctctatacacaactcattgaggatcattagcatgtgattgtgctctgttggttcaatcagcccatcatctcttatgtgattctcctgattggccttgttaatgggttgtatagtgttaata - -a -s mr.mrrefChr5 171833 227 + 294542 aggtcttcatatcttgcacactcctgggatccctggggtgagttgcaagtgattgtaatgtattggctttccgaccatttgctggtagtttcggttggcaagtatctggttcaagttcctgtcttgcaagatcaaaaccacaggtctaactctctgtcctctcactatggctttacttggtttggataccagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323797 227 + 636262 aggtcttcatatcttgcacactcctgggatccctggggtgagttgcaagtgattgtaatgtattggctttccgaccatttgctggtagtttcggttggcaagtatctggttcaagttcctgtcttgcaagatcaaaaccacaggtctaactctctgtcctctcactatggctttacttggtttggataccagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta -s simRat_chr6.simRat.chr6 315332 227 + 647215 atgtcttcatttcttgcaccatcctggcattcctggggcgaattctgagtggttgtaatgaattaactgtctggccatttgctggtagtttcgcttggcaagtgtctgggtcaggttcccatctttcaagatcaaaaacaaaggtctaactctctgttctctcactgtggctttactcgatttggatatcagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta - -a -s mr.mrrefChr5 172060 95 + 294542 tccccttaatttcaatggactgtggatcaagaaCTTTAGCAGCTGTGTGGAATGACCTGGAACCATAGCATAGGTAGTCAAAACCAAAAATGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324025 95 + 636262 tccccttaatttcaatggactgtggatcaagaaCTTTAGCAGCTGTGTGGAATGCCCTGGAACCATAGCATAGGTAGTCAAAACCAAAAATGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 315559 95 + 647215 tccccttgctttcaatgaattgtggctcgggAACTTTACCAGCTGTGTGGAATGACCTGTAACCATAGTGTGGGTAGACAAAATCAAAAATGTTC - -a -s mr.mrrefChr5 172155 104 + 294542 AAGCTTGTCTTCAAATTGCATGAAGTCACACCTTGATGGCATGATCCTTGCCTCTTTGTAGAAAACAATCATGTTCCCTGCTTCTTAGAAGTAAACAGTGGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324120 102 + 636262 AATCACACCTTCAAAT--CATGCACATAGATCTGGGTAGGATGATCCTTGCCTCTTTGCAGAAAATAATCATGTTCCCTGCTTCTTAGAAGTAAACAGTGGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 315655 104 + 647215 AAGATTGTCTTCCATTTGCATGAAGTCACACCTTCAAGGCATGATCCCTGCTTCCCTGTAGAAAACAGTTGTGTGCCCTGCTTCCTAGAAGAAAACAGTTGCAC - -a -s mr.mrrefChr5 172259 153 + 294542 TATGATTCTGTGGAATTCTCAGAGATAAGATCACTTACACTCTTACATCCCATATATATGTTTATAGTATCCTCAAGTGGTTATTATGGTCATGGCATCAAACCAGTCCGCAAGTAGATCGGTAGATCTAGGATAGTGTGAACTGGCTGCACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324222 153 + 636262 TATGATTTTGGAGAATCCTCAGGGATAAGATCACTTACACTTTTACATCCCATATGTACGTTTATAATATCCTCAAGTGGTTATTATGGTCATGGTATCAGACCAGTCCGCAGGTAGATTGGTAGATCTAGGATAGTGTGAATTGGCTGCACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 315761 144 + 647215 TATGATTCTGTGGAATTGTCAGAAATAAGATGACTTACATTCTTGCATGTCATCTATATGTTTATAGTATCCTCAAGTGGTTGTTATGTTCACGGCACCAAATCAGTTGGCAAGTAGATCGGTAGATCTAGGATAGTGAGAACT--------- - -a -s mr.mrrefChr5 172412 111 + 294542 TACTTGAATGATAATAATAAGTTAAGAGGTCAATAATTTGCCAGAGATCTTGAATCAGAACATAGCCAAATTACAACAGCCAGGTAATCCCAGTTTGTGTCTGCACGTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324376 109 + 636262 TACTTGAATGATAATAGTAGGTTAAGAGCTCAATAATTTGCCAGAGATCTTGA--CAGAACATGACCAAATTATAACAGCCAGCAAATCCCAGCTTGCGTCTGCATGCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 315905 107 + 647215 --CTGGAATGCTAATAATAAGCCAAGAGGTCAATAAT--GCCAGAGACCTTGAATCAGAACATAGCCAAATTACAACAGCCAGGTAATCCCAGTTTGTGTCTGCCCGTTGA - -a -s mr.mrrefChr5 172523 15 + 294542 CCCCACCTAGAGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324486 15 + 636262 CCCCGCTTAGAGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 316012 15 + 647215 CCCCACCTAGAAAAC - -a -s mr.mrrefChr5 172538 114 + 294542 GCCTGGTAGTTGTTGTTTTTTAGGGCATACTTTGTTACTGTTTGCGTGACTTTCACTCTCCCAGAGATTAGGTTGTTGGACTCCAGAAGGGACAGAGCTAAAGAGCGGCTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324505 114 + 636262 GCCTGGTAGTCTTCGTTTTTTAGGGCATACTTTGTTACTGTTTGGGTGACTTTCTCGCTTCCAGAGATTAGGTTGTTGGACCCCAGAAGGGACAGAGCTAAAGAGCGGCTTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 316027 87 + 647215 GCCTGGTAGTTGTTGTTTTTTAGGGTGTACTTTGTTACTGTTTCCGCGACTTTCACTCACCCAGAGTTTAGGTTGTTGGACTCCAGA--------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 172652 176 + 294542 TGATGGTCTGTCATGGTATTCATTAGTGTACATGAGCTTAGCAAAACAATCTCGTATGCCCAAATGCTGCCTGTATTTGCTTTGCTTGTGTAGAGTGATGTAAACGAAAAATCTGGATATTACACTCAAAAAGTTCATTAAGGCAGTCCTCCCAATTCTGATCCGTAAGTAACCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324620 175 + 636262 TGATGGTCTGTCATGGTATTCATTAGTGTACATGAGCTTAGCAAAACAATCTCGTATGCTTAAATGCTGCCTGTATTTGCTTTGCTTGTGTAGGGTGATGCAAACGAAAAATCTGGATATTACACTCAAAAA-TTCATTAAGGCAGTCCTCCCATTTCTGATCTGTAAGTAACCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 316114 113 + 647215 ----------------------------------------------------CATATGCCCAAACGCTGCCT----TTGCTTTGTTTGTGTAGAGTGATGTAAACGAAAAATCTGGATATTACACTCAAAAAGTACATTAAGGCAGTCCTCCTAATTCTGACACGTAAG------- - -a -s mr.mrrefChr5 172828 289 + 294542 TACTAACTTACTCATTATTTAAACAGCGGTCAAGATTGTGGTCTTATTAGTTTGAGCTTCATGTATAGGCATGTGAAGCTGTGCGCCCTGTATTTAACACCCTCTCCTTTGTATTCCCCCCAGGTCTGCTTCCCTCAGAGGCTTTTCTGCACGGATCTTCTGCAGGTGAGGCTGTTCTATTTTGAATTGCTGGTCAAATCAAGACTCAATTACAGTGGATAAGTAATCAACTGAAAACAATCTGCTCCTTCTGGTCCTCTGCTCCTGAATCTTGAGTGATGACTAATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324797 289 + 636262 TACTAACTCACTTACTATTTAAAAAGCGGTCAAGCTTGCAGTCTTATTGGTTTGAGCTTCATGTATAGGCATGTGAAGCTGTGCGCCCTGTATTTAACACACTCTCCTTTGTATTCCCCCCAGGTCTGCTTCCCTCAGCGGCATTTCCGCACGGATCTTCTGCAGGTGAGGCTGTTCTATTTTGAATTGCTGGTCAAATCAAGACTCAATTACAGTGGATAAGTAATCAACTGAAAACAATCTGCTCCTTCTGGTCCTCTGCTCCTGAATCTTGAGTGATGACTAATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 316227 285 + 647215 ---TAACTTACTCATTATCTAAGCACCGGTCG-GATTGTGGTCTTATTAGGTTGAGCTTCATGTCCAGGTACGTGAAGTTGTCTGCCCTGTATGTAACACCCTTTCCTTTGTTTTCCCCCCAAGTCAGTTGCGCTCAGAAGCTTTTCTGCACGGATGTTCTGAAGCTGAGGCTGTTCTACATGGAATTGCTGGTCAAACAAAGACTCAATCACAGTGGATAAGTAATAGACTTAAAACAATCGGCTCCTTCTGGTGCTCCGCTTTTGAATCTTGAGTGATGACTGATGT - -a -s mr.mrrefChr5 173117 10 + 294542 ACCACACCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325089 10 + 636262 ACCACACCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 316512 10 + 647215 ACCACACCTC - -a -s mr.mrrefChr5 173127 80 + 294542 TGAACTCCTGCAATCCATACAAGTCCAATGTATAGTTTTTGACCCTTCATATCGAATTGTTGTGACAGGTCCTAAACTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325112 80 + 636262 TGAACTCCTGCAATCCATACAAGTCCAATGTATAGTTTTTGACCCTTCATATCGAATTGTTGTGACAGGTCCTAAACTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 316522 80 + 647215 TGAAGTCCTGCAATCTGTACAAGTTCAATGGATAGTTTTCTACCCTCCATATCGAATTGTTATGACAGGCCATAGACTTA - -a -s mr.mrrefChr5 173207 117 + 294542 TTTTAAGACAACCTCAAACAACATGAGGTAAGGCCCTGTAATGATAATATTTGCTGTCATGGCAACTTGTGGGAAAAGACATACAGCTTGTGTATGAGCTTGAATGCTAATTATGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325193 117 + 636262 TTTTAGGACAACCTCAAACAACACGAGGTACAGCCCTGTAATGATAACATTTGCTGTCATGGCAACTTGCGGGAAAAGACATACAGTTTGTATATGAGCTTGAATGCTAATTATGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 316602 106 + 647215 CTTTAAGACAACCTCAGACAGCATGAGTTAAGGCCATGTATTGACAATATTTGTGGTTATGGCAACTTGTGAGAAAAGAGATACAGCTTGTGTAT-----------TTAATTATGAA - -a -s mr.mrrefChr5 173324 84 + 294542 TCAATTGGCATCTAATACTATAATCAATCTGTATTCAATGCTACTTATTGCACTAAGTTCTGCGGGCACACTTCCAAAAAATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325310 84 + 636262 TAAATTGGCATCTAATACTATAATCAATCTGTATTTAATGCTACTTATTGCACTAAGTTCTGCGGGCACACTTTCAAAAAATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 316709 84 + 647215 TCAATTGGCATCTAATACTAAAACCAATCTGTATTCAATGCTACTTTTTCAACTTAGTTCTAGGGACACACTTCCAAAAAATGG - -a -s mr.mrrefChr5 173408 166 + 294542 GTCATTGTCCTTCTTCCCTATCCAATAATGAACTCACAACAACTCTCTTGATGCATATTGGGGTTAAGGTTCAAACACTTGGGTGTTTCTTAGTGCTTGGGGATCTAGGCCTTGACCCCAGAGGCCTCACTGATTACACATTGTGGTAAGTCACCCAGGTTTTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325396 158 + 636262 GTAATTGTCCCTCTTCCCTATCCAATAATGAACTCACAACAACTCTCTAGACG-----TGGGGTTGAGGTTCAAACACTTGGGTGTTTCTTAGTGCTTGGGGATCTAGGCTTTG---CCAGAGGCCTCATTGATTACACGTTGTAGTAAGTCACCCAGGTTTTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 316793 160 + 647215 ATC----TCTTTCTTCCTTATT--ATAATGAACTCACAACAACTCCCATCGTGCATATTGGGGTTAAGGCTCACACACCTGGGTGCTTCTTGGTGCTTGAGGCTCTAGTCCTTGACCCCAGAAGTCTCACTGATTACACATTGTGGTAAGTCACGCAGGTTTTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 173574 183 + 294542 CATAATAGTGATTCTTTAGTTTAATCTCTGCTTTATGGCTGTCATAACTGTGAGTGTAGACAATATGGACGCTAAAGGATCATGGCCCTACTTGCACTTACATTTTATCTGAAGCGTGTGATCTATTGCAGTACTTGGTGATAAACTCAACTAAAAACAATGCTTCTAGTAATAGTCTGTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325571 183 + 636262 CATAATAGTGATTCTTTAGTTTAATGTCTGCTTTATGGCTGTCATAACTGTGAGTGTAGACAATATGGACGCTAAAGGATCATGGCCCTGCTTGCACATACATTTTATCTAAAGCGTGTGATCTATTGCAGTACTTGGTGATAAACTCAACTAAAAACAGTGCTTTTATTAATAGGCTGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 316953 181 + 647215 CATAATGGTGATTCTTGAGTTTAACCTCTGCTTTATGGCTGCCATAACTGAGAGTGTAGACAATGTGGATACTAAAGGCCCATGGCCCTACTTGCACTTACATTTTATCTGAAGCGTG--ATCTCTTGCAGTACTTGGTGATAAATTGACCTGAAAACAATACTTCTAGTAATACTCTGTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 173757 44 + 294542 ACAGGTCCAAGGAGAGTCAATTGAGATGGCTACCAACTTTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325754 35 + 636262 ACAGGTC---------TCAAATGAGATGGCTACCAACTTTTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 317135 44 + 647215 ACAGGGCCAAGGAGAGTCCATTAAGATCGCTAGCAACTTTTTTA - -a -s mr.mrrefChr5 173801 63 + 294542 CAAAAGCTTCAAATTTGTTGACAATGTCTAACTCCTAGTATTGATTGCATTAATCTGCTCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325791 63 + 636262 CAAAAGCTTCAAATTTGTTGACAATGTCTAACTCCTAGTATTGATAGCATTAATCTGCTCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 317179 63 + 647215 GAAGAGCTTCAAATTTGTTGACAATGTCTAACTCCTGGTATCCACTGCATTAATCTGCCCTGT - -a -s mr.mrrefChr5 173864 121 + 294542 AACCTAGCCTGGTGTTTATACACCTTGAGTGATGGTCTGAACCTAAATAGGCGTGATATGACTAGAATGCATGATATCACTGCAATCATTTACATCTCAAAGACACCTAATTGATGGGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325855 121 + 636262 AACCTATCCTGGTGTTTATACACCTTGATTGATGGGCTGAACCCAAATAGGCGTGATATGAATAGAATGCATGATATCACTACAATCATCTGCATCTCAAAGACACCTAATTGATGGGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 317242 120 + 647215 AACCTAGCCTG-TGTTTATACACCTTGAGTGATGGTCTGAACCTGAGTTGACACGACATGTCTAGAATGCATGATATCACTGCAATAAATTACATCTCAAAGACACCTAATTGAGGGGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 173985 162 + 294542 TATGATTTCCCTCAGTTTGAGACAGTGTATGCCCATGTAGGGACAATACCCACTTTTTATATCAAAAAATACGGACTATCAGTCAATAAAGGTCTGTACTGAGAATACTGCATCTAATTACCAACACTATGAAGTTTAGTTGACTCCTGCTATCCTTTGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325977 162 + 636262 TATTATTTCCCTCAGTTGGAGACAGTGTATGCCCATGTAGGGACAATACCCATTTCTAATATCAAAAAATACGGACTATCAGTCAATAAAGGTCTGTACTGAGAATACCGCATCTAATTACCAACACTATGAAGTTTAGTTGACTCCTGCTATCCTTTGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 317362 145 + 647215 TATGATTTCCCTCAGTCTGAGACAGTGTATGCCCATGCAGGGACAATGCACACTTTTTTCAATACAAAA-----ACTATCCTTCAATAAAGGTCTGTACTGAGAATAGTGCATCTAATTA------------AGTTTAATGGACTGGTGCTATCCTTTGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 174147 60 + 294542 TATGGCCATGGCCAGGGTGATATGGAGTATCCATATCACACCTTATGTCAAACACTTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326139 60 + 636262 TATGGCCATGGCCAGGGTGATATGGAGTATCCATATCACACCTTATGTCAAACACTTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 317509 60 + 647215 TATGGCCACGGCCAGGGTGATACGGAGTATCCATGTCACACCTTATGTCAAACACTTGGA - -a -s mr.mrrefChr5 174207 210 + 294542 ATCTGGTTAGGTTCAGCATCAACAATGAGTAGATATTCTATCCCATGTGTCTGACTACCATAGTTGCATGATATTTTGTTGTCCATGCCACACCCAACCTCCTTTTGTCAATTGGTATCCTGACTGTTCATTATAACAATATTTAGTCTTTAAAGCTACACAATAGTGGTTTCATTGTGTAAATGTGGCACCTTCAACAATTCAACCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326199 206 + 636262 ACCTGGTTAGGTTTAGCATCAACAATGAGTAGATATCCTCTCCCATGTGTC--ACTCGCATAGTTGCATGTTATCATGTTGTCCATGCCACACCCAACCTCCTTTTGTCAATTG-TATTCTGACTGTTCATGATAACAATATTTAGTCTTTAAAGCT-CACAATAATGGTTTCATTGTGTAAACATGGCGCCTTCAACCATTCAACCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 317572 210 + 647215 ATCTGGTTAGGTTCAGCATTGACAATGAGTAGAAATTCTATCCCATGTGTCTGACTACTATAGTTGCATGACATTTCGTTGTCCATGCCCCACCCAACCTCCTTTTGTCAATTGGTATCCTGACTCTCCATTATAACAATATTTAGTCTTTAAAGCTACACAATAGTGGTTTCAGTGTGTAAGTGTGGCACCTTCAACAATTCAACCCCA - -a -s mr.mrrefChr5 174417 108 + 294542 GGAATTCTCTTGTAATACAATCAGGGATCTGCTGAGACTCAGTTGCAATATGTCTAGGGCTTCAAAACCTTAGTACAATGTAGGATGAAAAGTGATTACAGCGGGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326405 108 + 636262 GAAATGCTAGTGTAATACAATCAGGGATCTGCTGAGACTCAGTTGCAATATGTCTAGGGCTTCAAAACCTTAGTACAATGTAGGATGAAAAGTGATTACAGCGGCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 317784 88 + 647215 AGAATTCTCTTGTGGTATGATCAGGGATCTGCTGAGACTCAGTTGCAATGTGCTT--------------------CAATGTAGGATGAAAAGCAATTACAGCAGGTCC - -a -s mr.mrrefChr5 174525 59 + 294542 AACCAGAACAGACTACTATCACCCAACAAATTAGCATGTTTAGCATGTTGGAATTGGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326514 59 + 636262 AACCAGAACAGACTACTATCCCCCAACTAATTAGCATGTTTAGCATGTTGGAATTGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 317872 59 + 647215 AACCAGAACAGACTACTATCACCCAACAAATTAGCATGTTTCGCATGTTGGAATTGGGC - -a -s mr.mrrefChr5 174584 34 + 294542 GACAGTTTCCCCACTATTCTTACATTAAGCACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326576 34 + 636262 GACCGTTTACCCACTATCCTTACCTTAAGCAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 317931 33 + 647215 GACAGTTTCCAC-CTGTTCTGACATTAAGCACAG - -a -s mr.mrrefChr5 174618 85 + 294542 CTTCTCTCTTTGCTTCAGGAGTGGGCATGCAGTCATATTGTTCTGGAGCCTCAGAGTATTACTGATGGTATGCATATGCAGCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326610 85 + 636262 CTTCCCTCTGTGCTTCAGGAGTGGGCATGCAGTCATATTGTTCTGGAGCCTCAGAGTATTACTGATGGTATGCGTATTCAGCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 318000 85 + 647215 CTTCTGTCTTCACTTCAGGAGTGAGCTTGCAGTCATATTGTTCTGGAGCCTGAGAGTATTACTGATGGTATGCATATGCAGCCCA - -a -s mr.mrrefChr5 174703 59 + 294542 GGAAATTGGCCATTGCCCATACTAGCTCCCCAAAATACATAGGTAGACTCATTGGTCCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326695 59 + 636262 GGAAATTGGCCATTGCCCATACTGGCTCCCCAAAATACATAGGTAGACTCGTTGGTCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 318086 59 + 647215 GGAAATTGGCCATTGCCCATACTAGCTCCCCCAAATACATAAGTAGATTCATCCATCTT - -a -s mr.mrrefChr5 174762 142 + 294542 GTTCCAGATTGCACCCACTTAACCAGCTTTTCCTCCAGTAGTATCTTCTTTATACATTTTTCAAACTTAGTTTATTCTTCATAAATTTTTCAATGTAAGTTTATGGGCAGGTCTTTAGAGTGTTTGGGGTACCTGAATGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326767 142 + 636262 GTTCCAGATTGCACCCACTTAACCAGCTTTTCCTCCAGTAGTATCTTCTTTATACATTTTTCAACCTTAGTTTATTCTTCATAAATTTTTCAATGTAAGTTTACGGGCAGGTCTTTAGAGCGTTTGGGGTACCTGTATGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 318145 135 + 647215 GTTCCAG-------CGACTTAACTAGCCTTCCCTCCAGTAGTATCTTCTTTATAAATTTTTCTAACTTAGTCTATTCCTTATACATTTTTCAAAGTAAGTTTATAGGCAGGTCTTTAGAGTGTTCAGGGTACCTGAATGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 174904 7 + 294542 CTGCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326912 7 + 636262 CTGTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 318280 7 + 647215 CTGCATA - -a -s mr.mrrefChr5 174911 451 + 294542 AGTGAAATGCCTTGCTTGAACAGCAATTTAATTTTGCATAAGTGAAATGCTTTGCTTGAATAGCAGTTTAATTGATTTACCAGGAGATAGCAAGTGTTCAATATGACTGGCAATAAACACCCAAGTTGAACTCCCAGAATTTCAGCGTGTGACTCGTAAATCATGAGTACGTTAGCACCTATTAACAATTGGATGTTCCATCCTTTTTAATTTAACCTTTTCCCTTTTTGTTATGCTGGATATCTCACATTGTGCTTTCTTAATCTCCAATTTCCAAGTGAGTGGCAACAACCTTCCTGTTCTCTCCAGGCTCCCTCGTAGCCCAATTGACTGGGAGCCCCTATCCTTGAGGTCTATCCTACTTAGGGGTGGTAGCTGGCTTGTAAGATTGACTGCAACCAATTATTATAGACTGGCCAAACCAGACATCTTTGCATGTTGGTTCAACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326924 451 + 636262 AGTGAAACGCCTTGCTTGAACAGCAATTTAATTTTGCATAAGTGAAATGCTTTGCTTGAATAGCAGTTTAATTGATTTACCAGGATATCACAAGTGTTCAATATGACTGGCAATAAACACCCAAGTTGAACTCTCAGAATTTCAGCATGTGACTCGTAAATCATGAGTACGTTAGCACCTATTAACAATTGGATGTTCCATCCTTTTTAGTTTAATCTTTTCCCTTTTTGTTATGCTGTGTATCTCACATTGTGCTTTCTTAATCTCCCATTTCCAAGTGAGTGGCAACAACCTTCCTGTTCTCTACAGGCTGCCTCGTAGCCCAATTGACTGGGAGCCCCTATCCTTGAGGTTTATCCTACTTAGGGGTGGTAGCTGGCTTGTAAGATTGACTGCAACCAATTATTATAGACTAGCCAAACCAGACATCTTTGCATGTTGGTTCAACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 318287 443 + 647215 AGTGAAATGCCTTGCTCGAATAGCGACTTAATTTTGCATAAGTTAAATGCCTTGCTTGACTAGCAGTTTAATTAATTTACCAGGAGATAGTGAGTGGTCAATATGACGGG-AATAAACACCCATGTTGAACTCCCAGAATTTCAGTGTGTAACTTGTAAACAATGAGTATGTTAGGACGTATTAACAACTGGATGTTACATCCTT---AATTTAACCTTTTCCCTTTTTGTTATA---GATCTCTCACATTGTGCTGTCTTAATCTCCAATTTCCAAGTGTGTGGCAACAACCTTCCTGTTCTCTCCAGGCTCCCTCGTAGCCCAATTGACTGGGGGCCCCTACCCTTGAGGTCTATCC-ACTTAGGGGCAGTAGCTGGCTTGTAAGATGGACCGCAACCAATTATTATAGAATGGCCAAATGAGAAGTCTTTGCATGTTGGTTCAACACA - -a -s mr.mrrefChr5 175362 33 + 294542 CAGCACATCATATCAATTGGTAAGCAATCAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327375 33 + 636262 CAGCACATTATATCAATTGGTAAGCAATCAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 318733 33 + 647215 CAGAACATCATCTCAATTGGAAAGGCAACAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 175395 66 + 294542 TGTATTCTGCCACAAATGCCCTAGATTCTGAAGTGCTGATGTTCGTGTTGATACATGCCTTTTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327409 66 + 636262 TGTATCCTGCCACAAATGCCCTAGATTCTGAAGTGCTGATGTTCGTGTTATTACATGCCTTTTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 318766 66 + 647215 AATATTCTGCCACAAATGCCCTAGATTCTGAAGTGCTGAAGTTCGCATTGATACATGCCTTTTAGT - -a -s mr.mrrefChr5 175461 8 + 294542 CATATGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327476 8 + 636262 CATATGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 318832 8 + 647215 CATATGTA - -a -s mr.mrrefChr5 175469 125 + 294542 ACTGTGGATGAAAAAAACCTCTGACTGATAGTCTAGATGTTTCATGGACCTGTTCCGTCCCTCATGGCCCAGGTAATGATTTGGCTAACTACGTCCAACAAGATTCTGGAGGAAAATGAAGAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327485 69 + 636262 ACTGTGGATGAAAAGAACCTCTGACTAATAGTCTGGATGT--------------------------------------------------------CACAAAATTCTGGAGGAAAATGAAGAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 318840 125 + 647215 ACTGTGGAGGAAGTAAACCTCTGACTGATAGTTAAGAGGTTTCATGGACCTGTTCCGTCCCTCATGGCCCAGGTAATGATTTGGCTAACTACGTCCAACAAGATTCTGGGGGAAAATGAAGAATA - -a -s mr.mrrefChr5 175594 43 + 294542 CAATAAATTGACGTGTTCAGGATTGGCAAGAACATAATCTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327557 39 + 636262 CAATAAATC----TGTTCAGGATTGGCATAAACATAATCTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 318965 43 + 647215 CAATAAATTGACGTGTTGAGGATTGTCAAGAACATAATCTGGA - -a -s mr.mrrefChr5 175637 46 + 294542 GTCCAGTCTGCAGCCTCACCCTTATAGAAGGACAAGGGATTCAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327596 46 + 636262 GTCCAGTCTGCAGCGTCACCCTTATAGGAGGACAAGCGATTCACGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 319020 46 + 647215 GTCCAGTCTGCAGCCTCACGCTTGTGAAAGGACAAGGGATTCAGGA - -a -s mr.mrrefChr5 175683 33 + 294542 GGGGTTGGGACACTTTGAGTGATACTTTTGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327655 33 + 636262 GGGGTTGGGACACTTTGAGTGATACTTTTGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 319066 33 + 647215 GGGGTTGGGACACTTTGAGTGACGCTTATGGCA - -a -s mr.mrrefChr5 175716 339 + 294542 ACTGATAAAAAAGCAACTGGCAACACACATAGCCTAAACCAGGAATAAGTTCCATAAGAGATAGCCAATTGCCATGTGTATTTGATGAAGTTACAACACTGGAAGACCAACTTTTGGCAGAGGTTGCTATAATGTTTGAAAAATTTACATTTTGCACAAGTTGTTTTCTTACAGGGCAGTGCTGTGTGCTCTTATCAAGAGACTTGCCTGCAAGTGATGCATAACTTTGACAGTGCTTCTGTATATTATAATACCAAAATTACCCTACCAGTGTTATCTTCCTCTGCTTGACAAAAAAGTGAATTAAGTATCCCAATTTTAGAGTATAAGCTTTCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327688 316 + 636262 ACTGATAAAAAAGCAATTGGCAACACACATAGCCTAATCCAGGAATAAGTTCCA-AATAGATAGCCAATTGCCATG-GTATTTGATGAAGTTACAACACTGGAAGACCAACTTTTGGCAGAGGTTGCTATAATGTTTGAAAAATTTACATTTTGCACAAGTTGTTTTCTTACAGGGCAGTGTTGTGTGCTCTTATCAA---------------------CATAACTTTTACAGTGTTTCTGTATATTATAATACTGAAATTACCCTACCTGTGTTATCCTCCTCTGCTTAACAAAAAAGTGAATTAAGTATCCCAATTTTAGAGTATAAGCTTTCACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 319105 324 + 647215 ACTGATAAAAAAACAACTGAAAACTGGTATAGCCAAAATTGGGAATAAGTTCCATAAGAGATAGCCAATTGCTATGTGTATTTTATGAGGCTACAACACTGGGAAACTAATTTTTGGGAGAGGTTGCCATAATGTTTGAAAAATCTAC---------------TATTATTACAGGGCAATGCTGTGTGCTCTTATCAAGAGACTTGCCTGCAAGTGATGCATAACTTTGACAGTGCTTCTGTATAGTATAATACCAAAATTACCCTACCAGTGTTATCTTCCTCTACTTGACAGAAAAGTGAATTAAGTATCCCACTTTTAGAGTATAAGCTTTCATGA - -a -s mr.mrrefChr5 176055 279 + 294542 CTCAACATATGATTAGACTAAACTGTCTATTGGAATGCAAGTCTCCTCACTAGATGCAACTTACAATGAACTGTGCTGCACTGAAAGCTACCCTGAGAGGGTTTCCCCATCCAAACCTTAATGTAACTGTCTCTGCGCCAATCTCCACAGATTCCAGTTCCGTCCACTAGTGGAACAACATCCCATTAACTCCAAATTACTATCTGTATTGCGCAGAAATTAATTCTCCAGTTTATTCCTCTGACCAGAATACTATTCAGTGTCCCCTACTTATTCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328018 279 + 636262 CTCACCATATGATTAGACTAAACTGTCTATTGGGATACAAGCCTCCTCACTAGATGTAACTAACAATGAACTATGCTGCACTGAAAGCTACCCTGAGAGGGTTTCCACCTCCCAACCTTAATGTAACTGTCTCTGTGCCAATCTCCACAAGTCCCAGTTCCGTCCACTAGTGGAACAACATCCCATTAACTCCAAATTACTATCTGTATTGCGCAGAAACTAACTCTCCAGTTTTTTCCTCTAGCCGGAATACTATTCAGTGTCCCCTACTTATTCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 319429 272 + 647215 TTAAACATATGGTCAAACTAAACGGTCTGTTGGAATGCAAGTCTCCTCTCTAGATGCGACTTTCAATGAACCGTGCTCCACTGAAGGCTAGCCTGAGAGGATGTCCCCATCCAAGCCTTAACATAACTGTCTCTGCGCCAATCTCCACAGATTCCAGTTC-------TAGTGGAACAACATCCTGTTCACTCCAACTTACTATCTGTATTGTACAGAAATTAATTCTCGAGTTTATTCCTCTGACCAGAATACTATTCGGTGTCCCCTACTTATTCCTA - -a -s mr.mrrefChr5 176334 155 + 294542 TCATGCATAAGATAGGACATACGTTTGGCTCAGACCATAGACACTATAGATTGCAGATCTTTCAGCAGTATGTCTTCAACATGGACTTATAATGAATGGGACCTCTGGCCAAGGCGCATCATTGACTTAAACTATTGGCCAGCTGCTACCATTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328298 155 + 636262 TCATGCATAAGGTAGGACATACGTTTGGCTTAGACCATAGACACTATAGATTGCAGATCTTTCAGCAGTATGTCTTCAACATGGACTTATAGTGAATGGGACCTCTGGCCAAGGCGCATCATTGACTTAAACTATTGGCCAGCTGCTACCATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 319701 155 + 647215 TCATGCGCAAGATAGGACATACATTTGGTTCAGACCATAGACACTATAGATTGTGGATCTTTCAGTAGTATGTTTTCAACATGGACTTATAATGAATGAGACCTCTGGCCGGCGGACATCATTGATTTAAACTACTGGCCATCTGCTATTATTTT - -a -s mr.mrrefChr5 176489 86 + 294542 TTTGATACCCCCCTATCAGCACACAATCATGTTAGAGCTCCTATCTGATGAGACATATGAACAGGTAATTATAAGGAACTAGCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328453 86 + 636262 TTTGATACCCCCCTATCAGCACACAATCATGTTAGAGCTCCTATCTGATGAGACATATGAACAGGTAATTATAAGGAACTAGCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 319902 86 + 647215 TTTAATACCACTCCATAAGCACACAATCATGTTAGAGCTTCTAATTGATGAGACATATGGACAGGTAATTACAAAGAACTAGCTCA - -a -s mr.mrrefChr5 176575 87 + 294542 GAAAGGCAGACACTTTATCTCCAGGAAAGAAGTAGCGGCTCATAGTGGATGGGATAGGTTCGAGTCACTGGGCTAGTTCAGTGTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328540 87 + 636262 GAAAGGCAGACACTTTATCTCCAGGAAAGAAGTAGCGGCTCATAGTGGATGGGATAGGTTTGAGTCACTGGGTTGGTTCAGTGTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 319988 87 + 647215 GGTAGGCGGACACTTTATCTCCAGGAAAGAGGTAGCAGCTCATAGTGAATGGGATAGGTTCGAGTCACTGGGCTAGATCAGTGTCTC - -a -s mr.mrrefChr5 176662 222 + 294542 ACCCAGATGTTATATTGTCCTGCTTTAAATTTGAAGGTGTTTGAAGTCCAGGGGGGGAATGGTATATGACACAGATAGGTTGGCAAACATTGTAGCATGGGGCTAAGAACCAGTCAGGTCAAATGGATAGGTCAGTATGTGTAGCATAGGATCAAAAACTAGCTTTATGGCCTATAAGAGGAGCTCAACATCTTTTAAAGCTACCATTCTGTCCTAATTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328628 222 + 636262 ACCCAGATGTTAGATTGTCCTGCTTTAGAATTGAAGGTGTTTGAAGTCCAGGGGGGCAATGGTATATGACGCAGATAGGTTGGCAAACATTGTAACGTGGGGCTAAGAACCGTTCAGGTCAAATGGATAGGTCAGTATGTGTAGCATAGGATCAAAAACTAGCTTTATAGCCTATAAGAGGAGCCCAACATCTTTTAAAGCCACCATTCTGTCATTATTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 320075 216 + 647215 ACCCAGATGTTATCTTGT------TTAAATTTGAAGGTGTTTGAAGTTCAGGGGGGGAATGGTAGATGACACAGATAGGTTGGCAAATCTTGTAGCATGGGGCTAAGAACCAGCCAGATCAAATGGATAGGTCAGTATGTGTAACATGAGGTCACAAACCAGCTCTATGGTCTATAAGATGAGTTCAACATCTTTTAAAACTACCATTCTGTCCTAATTTAC - -a -s mr.mrrefChr5 176884 120 + 294542 ATAAGGTAGAGGAGTGACCAGGATTAGAACTCTAGAGACCCATATGTTCCAAGAGTTCGCTGAAGCCCATATGTGCACAGAGTTTGCTTTTGAACAATTATACGGGCTCACAGACAGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328850 120 + 636262 ATAAGGTAGAGGAGGGACAAGGATTAGAACTCTAGAGACCCATATGTTCCAAGAGTTCGCTGAAGCCCATATGTGCACAGAGTTTGCTTTTGAACAATTATATGGGATCCTGGACAGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 320298 120 + 647215 ATAAGGTAGAAGAGTGACCAGGATCAGAACTCTAGAAACCCATATGTTCTCAGAGTTTGCTGAAGCCCACCTGTACCCAGAGCTTGCTTTTGAACAATTATACGGGCTCACAGACAGCGA - -a -s mr.mrrefChr5 177004 66 + 294542 TTTAAATATTATGCATCCTGACCTTGACCTTTAGCTCCCTGCTCTGAAACAACAATACATTAGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328970 66 + 636262 TTTAACTATTATGCATCCTGACCTTGACCTTTAGCTCCCTGCTCTGAAACAACAATCCATTAGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 320424 65 + 647215 TTTAAAT-TTATGGATCGTGACCTTGACCTTTACCTCCCTGCTCTGAAACAACGACACATTAGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 177070 40 + 294542 GCTTACTACTCAGATAATGCTCAATTATTCATAGGAGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329036 40 + 636262 GCTTACTACTCAGATAATGCTCAATTATTCATAGGAGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 320490 40 + 647215 GATTACTCCTCAGATAATGCTGAATTATTCATGGTAGCTA - -a -s mr.mrrefChr5 177110 40 + 294542 CTACAACTCAGTTGAAATCATGAAAGAAAGAAAGGCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329076 37 + 636262 ---CTGCTCAGTTGAAATCATGAAAGAAAGAAAAGCATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 320531 40 + 647215 CTACAATTCAGTTGAAATCATGAAAGAAAGAGAGGCATTA - -a -s mr.mrrefChr5 177150 123 + 294542 CTTTAAATCCAGCTGATGATTCCAACCACCTGCACACAAGGGATGGGTACTATTGAAACTCTGGGACCCATACACACCCTTTTCCTTGGTTGGGTAGGCTTATGCAGATTTACACACCCTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329113 123 + 636262 CTTTAAATCCAGCTGATGATTCCAACCACCTGCGCACAAGGGATGGGTACTATTGAAACTCTGGGACCCATGCACACCCTTTTCCTTGGCTGGGTAGGCTTATGCAGATTTACACACCCTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 320581 122 + 647215 CTTCAAATCCAGCTGAGGATTCCAACCACCTGCACACAGGGGATGGGTACTACTGAAA-TCTGCGACCCATACGCGCCCTTTTCCTTGGTTGAAGAGGCTTATGCATATTCACAGACTCCTAG - -a -s mr.mrrefChr5 177273 176 + 294542 CAGGGTTAACACCTATTAGCTAAGACTGCTCTCGATTGGCATCCAAATATGTTTGCCATTCTAACACCCTTCCATACCCTTTCACTCTAATTTGTTTGTGTTATAAGTGTCTACCTCCTTATCTTGCTTACAATAGTTGTCATCACCAATGGCCCAATTCCCTCGTTATGCAATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329236 166 + 636262 CAGGGCT--CACCTCTTAGCTAAGACTGCTCTTGATTGGCATCCAAATATTT--------CTCACACCCTTCCATACTCTTTCACTCTAATTTGTTTGTGTTATAAGTGTCTACCTCCTTATCTTGCTTACAATAGTTGTCATCACCAATGGCCCGTTTCCCTCGGTATGCAATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 320709 174 + 647215 CAGGGTTAACACCCATTGCCTAAGACTACTTTCGATTGGCATCCAAATATGTTTGCCATTCTAGCACCCTTCCATACCCTTTCACTCTCATTTGTTCTTGTTATAAGGGTCTACCTCCTTATATTGCT--CAATAGTTGTCATCACCAGTGGCCCAATTCCTTGGTTATTCAATAG - -a -s mr.mrrefChr5 177449 151 + 294542 GTTTTGACAAGCTTTTTCCTGGTCATGCCTGCATATCCAAACCTTATGACTTGGGGAGACATGTGCCTTATTGTCAGACATGTATTGTTATGCCAATTTCAGAGTTTCAATAACACACCAGATGTCTTTGACACAAGTAAACTGCAAAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329502 142 + 636262 GTTTTGACAATCTTTTTTCTGATCATGCCTCCATATCCAAACTTTATGACTTGGGGAGACAT---------TGTCAGACATGTAATGTTATGCCAATTTCAGAGTTTCAATAAGACACCAGATGTCTCTGACACAAGTAAACTGCAAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 320883 151 + 647215 GTTTTGACAAGCTTTTTCCTGGTTGTTCCTGCATATCCAAAACTTATGACTTGGGGAGACATGTGCCTTATTGTCAGACATGTATTGTTATGCCAACTTCAGAGTTTCAATAACACACCAGATGTCTTTGACACAAGTAAACTGCAAAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 177600 68 + 294542 AATCAGAATAAACATCATCTTCCACATCTATCTATGAGAGTGATCTTGCAGGAATCACAGTCAGCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329672 67 + 636262 AATCAGAATAAACATCTTCTTCCACATCTATCTGTGAGAGTGATCTTGCAGGAAACACA-TCAGCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 321034 68 + 647215 AATCAGAATAAACATCATCTTCCACACCTATCTATGAGGCTGATCTTGCAGGAATCACAGTCAGCTGG - -a -s mr.mrrefChr5 177668 63 + 294542 TCTTTCTCAGGCAAGAATCCAGCCTACTCTAGTGCACTTAACCAGATCTGTGCCAAGGTTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329768 63 + 636262 TCTTTCTCGGGCAGGAATCCAGCCTACTCTAGTGCACTTAACCAGATCTGTGCCAAGGTTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 321102 63 + 647215 TCTTTCTCAGACAAGAATCCAGCCTGCTCTAGTGCACTTAACCAGATCTGTGCCAAGGTACAG - -a -s mr.mrrefChr5 177731 253 + 294542 TTGTCCTTAAGAGTTCAAGTTTGAATTGAACCATTTAACGCAGGTAACACCATAAGCAAGCAGATAATAATGTATTGATAAGGCACAACCAGTTTAGTAACTTGTATGGGGATGTGTAATGGTTGGCAACCCATCCTGTTAGTTATCCCATAGATGCCATGATATTCTTGACATACTGTGCCACGGGAACTCCCCATTTTGTAGTGGGTCCTTAGTTGTCACATGATTACACTCTGCCTTCAGAGGTCACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329831 253 + 636262 TTGTCCTTAAGAGTTCAAGTTTGAATTGGACCATACAACGCAAATAATACCATAAGGAATCAGATATTAATGTATTGACAAGACACAACCAGTTTGGTAACTTGTATGGGGATGTGTAATGGTTGGCAACCCATCCTGTTAGTTATCCCATAGATGCCATGATATTCTTGACATACTGCGCCACAGGAACTCCCCATTTTGTAGTGGGTCCTTAGTTGTCACATGATCACACTCTACCTTCAGAAGTCACTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 321171 253 + 647215 TTGTCCTTAAGAATTCAACTTTGAATTGAAGCATTTAACGCAGGTAACACCCTAAGCAAGCAGATAATAATTTATCGATAAGGTACAACCAGTTTAGTAACTTGTATGGGGATGTGTAATGGCTGGCAACGCACCCTGTTAGTTATTCCATAGATGCCATGATATTCTTGACATACTGTGCCACGAGAACTCCCCATTCTGCAGTGGGTCCTTAGTTGTCACATGATTGCACTCTGCCTTCAGAGGTCACCTT - -a -s mr.mrrefChr5 177984 35 + 294542 CCTGAGTGGATATTTGGATGGGGCACCTAAGATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330085 35 + 636262 CCTGAGTGGATATTTGGATGGGGCACCTAAGATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 321424 35 + 647215 CCTGAGTGGATATTCGGATAGGGCATTTAAGATCA - -a -s mr.mrrefChr5 178019 35 + 294542 GTACTCAAAATCCATTACCTGAACCATTCTGGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330120 35 + 636262 GTACTCAAAATCCATTACCTGAACCATTCTGGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 321464 35 + 647215 GTAATCAAAATCTATTGCCTGAACCATTCTGGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 178054 84 + 294542 CTGAACCGTACTGCCTGGAGACAATTGGCCCTATCCAAACGCGTTGAAAGTGGTGGTGAACCATGACAGATTATTTTCTAGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330156 84 + 636262 CTGAACCGTACTGCCTGGAGACAATTGGCCCTATCCAAACGCGTTGAAAGTGGTGGTGAACCATGACAGATTATTTTCTAGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 321499 84 + 647215 CTGAACCCCACCGCCTGGAGACAATTGCCCTTATCAAAATATGTTGCAAATGGTGTTGACCCATGCCAGATTATTTTTTAGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 178138 116 + 294542 AACTAACATGGCATAAGACCTCCAATCACTAAGTTTGGATACTTCATATCTTAATTTTTGGCAGGTCATCCTGTTAGCTACTCAGCCTCTCCTTAGTGACACACCTGGTGTCCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330240 116 + 636262 AACTAACATGGCATAAGACCTCCAATCACTAAGTTTGGATACTTCATATCTTAATTTTTGGCAGGTCATCCTGTTAGCTACTCAGCCTCTCCTTAGTGACACACCTGGTGTCCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 321584 116 + 647215 AACTAGCACAGCATAAGACCTCCAGGTATGTATTTTAGATACTCCATATCTTATTTTTTGGCAGGTTGTCCTGTTAGCTAGCAAGCTTCTCCTTAGTGACAAACCTGGTGTTCGTG - -a -s mr.mrrefChr5 178254 147 + 294542 ATTTCTCCATCTCAAAGTTCACACTGTTTTACAGTCAGGTTCTCTTCAACTCAATTGGGATGTGAAGTTCATATAACAGGGATTGGTGAGCTGACTTGATAGCCTGTTAATATTGTCACAGAATAAAACTGGGACTATATGATTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330356 147 + 636262 ATTTCTCCATCTCAAAGTTCACACTGTTTTACAGTCAGGTTCTCTTCAACTCAATTGGGATGTGAAGTTCATATAACAGGGATTGGTGAGCTGACTTGATAGCCTGTTAATATTGTCACAGAATAAAACTGGGACTATATGATTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 321703 147 + 647215 ATTTCTTCATTTAACAGTTCACATTATTTTACAGTCAGGTACTCTTCAACTCAATTAGGATGAGAAGTTAATATAACAAGGATTGGTGAGCTGACCAGATAAGCTGTTAATGTAGTCACAGAGTAAAACTGGGACTATATGATTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 178401 6 + 294542 CAGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330503 6 + 636262 CAGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 321852 6 + 647215 CAGGTT - -a -s mr.mrrefChr5 178407 16 + 294542 CATTAGATTGTGTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330509 16 + 636262 CATTAGATTGTGTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 321865 16 + 647215 TATTTAATGGTGTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 178423 62 + 294542 TGGTGTAGTTTGAGCATCACTGTGAGGATTAATTGGATGTTTCGGAATCCCAGATGTTTCGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330537 62 + 636262 TGGTGTAGTTTGAGCATCACTGTGAGGATTAATTGGATGTTTCGGAATCCCAGATGTTTCGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 321881 62 + 647215 TGGTGTAGTTCGAGCATCACTGTGAGAACTAATTGGATGTTTCGGAATCTCAGATGTTTCGG - -a -s mr.mrrefChr5 178485 61 + 294542 AATCCCGGCAGCTATCCTGAGGTAACCGACCTTACTCGGGCTCAATTGGAATCGTTCCGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330600 61 + 636262 AATCCCGGCAGCTATCCTGAGGTAACCGACCTTACTCGGGCTCAATTGGAATCGTTCCGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 321943 61 + 647215 AATCCCAGCAGCTAACGTGAGGTAACCGACCTCTGTTGGGCTACATTGGAATCGTTCCGGG - -a -s mr.mrrefChr5 178546 35 + 294542 TAAACACATTGGGCAGGCTCATTCTAGATGCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330661 35 + 636262 TAAACACATTGGGCAGGCTCATTCTAGATGCCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 322016 35 + 647215 TAAACATATCAGGCAGGCTCATTCTAGATGCGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 178581 134 + 294542 AGTGCCGGTCATTGCTTGACAGTGTTTGAATCGGACAGGGGATCTACAATGTACACAGGGGCCTGTCATTGCTTGACAGTGCATGAATCGGACAGGGGATCTACAATGTATGTGAGGAGATCATTTGATGTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330698 132 + 636262 AGTGCCGGTCATTGCTTGACAGTGTATGAATCAGACAGG--ATCTACAATGTACACAGGGGCCTGTCATTGCTTGACAGTGCATGAATCGGACAGGGGATCTACAATGTATGTGAGGAGATCATTTGATGTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 322051 134 + 647215 GGTGCCTGTCATCTCTCAACAGTGGTTGAATCGGACAGGGGATCTACAATGTACACAGGTGCCCGTCTTTCCTTGACAGTGCACGAATCAGACAAGGGATCTACAATATATGCAGGAAGATCCATTGACATCTC - -a -s mr.mrrefChr5 178715 89 + 294542 ATCAAGCGGAGCAGGCTTGTAGCCAAGTACTGAGCGTGTGTACATGGCTGTGCAGGGCAGGCTCATAGCCAAGCACTGACTGTGTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331145 89 + 636262 ATCAAGCGGAGCAGGCTTGTAGCCAAGTACTGAGCGTGTGTACATGGCTGTGCAGGGCAGGCTCATAGCCAAGCACTGACTGTGTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 322185 89 + 647215 ATCAAGCAGGGCAGGCTCGTAGCCAAGCACCAACCATGTGTACATGGCCGCGTGGGGCAGGCTCATAGCCAAGCACTAACCGTGTGTAC - -a -s mr.mrrefChr5 178804 57 + 294542 ATGGCTGGATTTGCTTTTTTTTGAAGATTTGCATGAGGCACTGTGCGAAGTCTAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331235 57 + 636262 ATGGCTGGATTTGCTTTTTTTTGAAGATTTGCATGAGGCACTGTGCGAAGTCTAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 322274 57 + 647215 ATGGCTGCATTTGCCTTTTTTTGGAAATTTGCACGAGGCACTGTGCAAAGTCTAACC - -a -s mr.mrrefChr5 178861 7 + 294542 AGTGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331293 7 + 636262 AGGGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 322331 7 + 647215 AGTGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 178868 55 + 294542 GCCGGTCGCTGACGTGCCCAACTAGTTAGGATAGACAGGAGCAGCACGCGTTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331303 55 + 636262 GCCGGTCGCTGACGTGCCCAACTAGTTCGGATAGACAGGAGCAGCACGCGTTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 322338 55 + 647215 GCCGGTCGCTGACGTGCCCAACTGGTTAGGATAGACAGGAGCAACACGCGTTGGG - -a -s mr.mrrefChr5 178923 18 + 294542 CCTAATTGTGTTACTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331364 18 + 636262 CCTAATTGTGTTACTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 322393 18 + 647215 CCTAATCGCGTTACTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 178941 55 + 294542 CAGATAACAAAACAAAAAGTCTTGGAAATTGAATGCGGCTGTTTCCAAACTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331387 55 + 636262 CAAGTAACAAAGCAAAAAGTCTTGGAAATTGGATGAGGCTGTTTCCAAGCTTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 322411 55 + 647215 CAGAGAACAAAACAAAAAGTTTTGGAAATTGAACGCGGCTGTTTCCAAACTTTTA - -a -s mr.mrrefChr5 178996 71 + 294542 CCATCCTCATTAATTCCAGTTACTAGTTGAATTGTCAGTTCTGTGATTTCCAGTATGATAATCCAACCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331443 61 + 636262 CCATCCTCATTAATTCCAGTTACCAGTTGAATTGTCAGT----------CCAGTATGATAATCCAACCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 322466 71 + 647215 CCATCCTCATTAATTCCAGTTACTAGTCAAATTGTCAGTTCTGTGATTTCCAATATAATAATCTGACCTAT - -a -s mr.mrrefChr5 179067 168 + 294542 CTATGGAGTATCCAAACAACTTTTAAGTCTTTTTGCTAAGTTAAGAAATGACACTACGTCTCAAGAGAAACCACTCTCTCTTTGACATAAGGGTTAGACTCCCTCGACTAGTTCCACAATGCACAGCTCTCAGAAGAGCCCACCACAGCCAGTTCTCAGACCAGGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331505 167 + 636262 CTATGGAGTATCCAAACAACTTTTAAGTCATTCTGCTAAGTTAAGAAATGACACTACGTCTCAAGAGAAACCACTGTTTCTTTGACATAAGGGTTAGACTCCCTCGACTAGTTCCACAATGCACAGCTCACAGAA-AGACAACCACAGTGAGTTCTCAGACCAGGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 322537 144 + 647215 CTATGGTGTATCCAAACAACTTTTAAATCTTTTTGCTAAGTTATGAAATGACCCTACATCTCAAGAGGATACACTCTCTCTTTGACATAAG-------------------GGTCCACAATGCACAGCTCT-----GAGCCCACCACAGCCAGTTCTCAGTCCAGGATA - -a -s mr.mrrefChr5 179235 137 + 294542 CCTTATAAGGAGCATGCTCCAGTGATGTCAGGCACATGTTTGGGGTAGTCTGTCTCAATGTTCAGACAAGAACTAGCCCAACACTGGGATGGCGGAAGGGAGCCCTACTCAACCCTCCAGGACAGCAAAATGAAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331675 137 + 636262 CCTAATAAGGAGCATGCTCCAGTGATGTCAGGCACATGTTTGGGGTAGTCTGTCTCAATGTTCAGACAAGAACTAGCCCAACACTGGGATGGCGGAGGGGAGCCCTGTTCAACCTTCCAGGACAGCAAAATGAAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 322681 124 + 647215 CCTTATATGGAGCATGCTCCAGTGATGTCAGGCACATGTTTGGGGTAGCCTGTCTCAATGCTCAGACAAGAACTAGCCCA-------------GGTAGGGAGCCCTACTCAACCCTCCAGGCCAGCAAACTGAATCC - -a -s mr.mrrefChr5 179372 40 + 294542 CTGCTCAACCTTTCAGATAAGAAACTATCACCAACTAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331816 36 + 636262 CTGCTCAACCTTTCAGATAAGAA----TCACCAACTAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 322805 40 + 647215 CTACCCAACCTTTCAGATAAGAAACTATCACCAACTAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 179412 57 + 294542 TTTGTTCTACCTGTACGAGTATAAAGCATCAAAAACAACTCCTGAACACCCACTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331852 57 + 636262 TTTATTTTACTTGTACAAGTGTAAAGCATCGAAAACAACTCCTGAACACCCACTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 322851 57 + 647215 CTGGTTCTACCTGTACGAGTATAAAGCAACAAGAACAACTCCTGAGCACCCACTACC - -a -s mr.mrrefChr5 179469 214 + 294542 ATCCAATTGATCTATGCTCCCCTCCTGAGCACCGACTCCAATCCAATTGAGCTATGTGCCCACAATTCGCTCATAGACACCAACAATCTCTTTTTAGATAAACAGCTGGGTGCTTCAAATTACTCTAGGTGATATCAGATTTTGGTAATAAACCACCAGACTGTTTTGAATCTGAAACAATGGTTTCCTTCCACAGTATATGTAATCCATTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331909 211 + 636262 ATCCAATTGCACTATGCTCCCCTCCTGACCACCCACTCCAATCCACTTGAGTTATGCGCCCGCAACTCGCTCATAGACACCAACAATCCCTTTTTAGATAAAAAGCCGGGTGTTTCAAATTAGTCTTGGTGATATCAGATTTTGGTAATA---CACCAGACTGTTTTGAATCTGATACAAATGTTTCCTTCCACGGTATATGTAATCTGTTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 322915 214 + 647215 ATCCAATTAATCTATGTGCCCCTCCTGAGCACGGACTCCAATCCAATTGAGCTATGTGCCCACAATTCGCTCATAGACACCAACAATCTCTTTTTAGATGAACAGCTGGGTGCTTCAAATTACTCTAGGTGATATCAGATTTTGGCAATAAACCACCAGACTGTTTTGAATCTGAAACAATGGTTTCCTTTCACAATATATGTAATCCATTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 179683 5 + 294542 AATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332120 5 + 636262 AATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 323135 5 + 647215 CATGT - -a -s mr.mrrefChr5 179688 20 + 294542 TCCATTCACAGTAGGGCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332171 20 + 636262 TCCATTCACAGTAGGGCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 323140 20 + 647215 TCCATTCACAACAGGACAAT - -a -s mr.mrrefChr5 179708 119 + 294542 TATGCCAGATTATTGGCTGATAGTTCATGAGGATTAAAGGATTTAGTGACACTAGGCTAAATAAAACTTCTTGCAAACCACTCAGTCTCAATCCCCAAGATGCTAGCTTCCATTTCCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332191 119 + 636262 TATGCCAGATTATTGGCTGATAGTTCATGAGGATTAAAGGATTTAGTGACACTAGGCTAAATAAAACTTCTTGCAAACCACTCAGTCTCAATCCCCAAGATGCTAGCTTCCATTTCCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 323161 119 + 647215 TATACCAGATTATTGGCAGATAGCTCACAGGGCTTAAAGGACTGAATAACATTAGACTAAGTGAAACTTCTTGCAGACCACTCAGTCTCAATCCAGAAACTACTAGCTTCCATTTCCTA - -a -s mr.mrrefChr5 179827 60 + 294542 TTATGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATCTAAAGGGGTGTACTCATGTCAAACACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332312 60 + 636262 TTATGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATCTAAAGGGGTGTACTCATGTCAAACACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 323280 60 + 647215 TTGTGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATTTAAAGGGGTGTACCCCACTCAAATACC - -a -s mr.mrrefChr5 179887 31 + 294542 ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332373 31 + 636262 ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 323340 31 + 647215 ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAGATTT - -a -s mr.mrrefChr5 179918 9 + 294542 CCGGACAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332404 9 + 636262 CCGGACAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 323383 9 + 647215 CCTTACTGC - -a -s mr.mrrefChr5 179927 129 + 294542 GAGTAGCTTGCTGAGTGAGGAGATAGCTGTAGGCCCGGAGTCCTCTTAGAAGAGAGCCAGGAATGCTAGCCAAGAATCTATGTCAGATTGCTCACTTAGGTCATGCAAGGATGGTTGACCAGATACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332413 129 + 636262 GAGTAGCTTGCTGAGTGAGGAGATAGCTGTAGGCCCGGAGTCCTCTTAGAAGAGAGCCAGGAATGCTAGCCAAGAATCTATGTCAGATTGCTCACTTAGGTCATGCAAGGATGGTTGACCAGATACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 323399 129 + 647215 GGGAAGTCATCTGAGTGGGGAGTTAGTTGTAGGTCCTGAGTCCTCTTAGAAGAAAGCCTGGAATGCTAGCCAAGAATTCAAGTCAGATTCCTCACTTAAGTCACACAAGAAGGGTGGACCAGCTACCTT - -a -s mr.mrrefChr5 180056 50 + 294542 CAAAATATACCAGGTACATGTGATGGCTTCTCTTCTGCCACACTATTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332543 50 + 636262 CAAAATATACCAGGTACATGTGATGGCTTCTCTTCTGCCACACTATTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 323528 50 + 647215 CTAAATATACCAGCTACATGTGATGGCTTCCCTTCTACCATACTATTATT - -a -s mr.mrrefChr5 180106 95 + 294542 TTTTTTTGTTATCTGCTACAGGCAAACCGAACCATTGGTTCACAACGCAGTATTTATGATGTGATACTAAATGACATGGAGATTGTTGCACAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332600 95 + 636262 TTTTTTTGTTATCTGCTACAGGCAAACCGAACCATTGGTTCACAACGCAGTATTTATGATGTGATACTAAATGACATGGAGATTGTTGCACAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 323578 95 + 647215 TTTTTTTGCTTTCTGCTACAGGCTCAAAAAACAATTGGTCCACAAAGCAGTATTTATAATCTGCTACTAAATTACATGGAAATTGTTGCAAAGAG - -a -s mr.mrrefChr5 180201 20 + 294542 TGTCCATATGAGGGGGCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332698 20 + 636262 TGTCCATATGAGGGGGCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 323673 20 + 647215 TGTCCATATGAGGGTGCTCC - -a -s mr.mrrefChr5 180221 18 + 294542 CAACCATTTTTTGACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332721 18 + 636262 CAACCATTTTTTGACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 323693 18 + 647215 CAACCATACTTTGACATG - -a -s mr.mrrefChr5 180239 58 + 294542 CATAGCGTTAACCTACATTGAAAAACAATGAATATTGAGTATGATTCCAGAAAACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332740 58 + 636262 CATAGCGTTAACCTACATTGAAAAACAATGAATATTGAGTATGATTCCAGAAAACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 323711 58 + 647215 CATATCATTGACCTACTTTAAACAACAATGGATATTGAGTGTGATTTCAGAAAACACA - -a -s mr.mrrefChr5 180297 94 + 294542 TGTCTCTGTGTCATTTTAAAAATGTAGATACAGCTCCCAGCATCACTTTGACTAACTGCATTGCTATGGCCACAGTGTGTTAGACCCCAAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332804 94 + 636262 TGTCTCTGTGTCATTTTAAAAATGTAGATACAGCTCCCAGCATCACTTTGACTAACTGCATTGTTATGGCCCCAGTGTGTTGGACTCCAAACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 323769 94 + 647215 TGTCTCTGTTTCATTTTAAAAAAGTAGATCCAGCTCCCAACATCACTTTGACTAACTGCACTGCTGTGGCTACAGTGGGTTAGACCCTGAACCA - -a -s mr.mrrefChr5 180391 5 + 294542 TGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332898 5 + 636262 TGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 323878 5 + 647215 TGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 180396 21 + 294542 GCTCCCACACGTGACTATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332903 21 + 636262 GCTCCCACACGTGACTATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 323889 21 + 647215 ACTCCAACACTTGACTATTTG - -a -s mr.mrrefChr5 180417 187 + 294542 ATAGCACAGACTCCATTGTAACTACAGATAGCAGCTGAAGTAGCAGTTAGTGAGTGGGACATATGTTGCTGAGCAGTATAACTTTTATAAAATCTGTTTCATCTATACTGGTAAGTATAGATGATGTCGTGTACACAAATGTGGACTGGTATAACAACCAAGGGATGAAGACAAGGCTAGAGATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332929 178 + 636262 ACAGCACAGAACCCATCATAACTACGGATAGCAGCTGTAGTAGCAGTCAGTGAGTGGG---------GCTGAGTAGTAGAACTTTTATAAGATCTGTTTCATCTATACTGCTAAGTATAGATGATGTCGTGTACATAAATGTGGACTGGTATAACGACCAAGGGATGAAGACAAGGCTAGAGATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 323910 186 + 647215 ATGGCACTGACTCCATTGTAACTATAAATAGCAGCTGAAGTAGCAGTT-GTGAGTGGGACATATGTTGCTTAGCAGTATAACTTTTATAAAATCTGGTTCATCTCTACTGGTAAGTATTGATGATGTTGTGTACACAAATGTGGACTGGTATAACAACCAAGGGATGAAGAGAAGGTTAGAGATGTT - -a -s mr.mrrefChr5 180604 611 + 294542 AAAATTGGACTGGTGCCAGTGGTCTGGGCCTTTGCCCCACAGGGGGCAGTCATGGTCCATGACACAACAGAATGTGTAAGCAGACTCGGAAGTATATGTCTTTTCCTTTTTGAGCCCACTTTCTATTAGGAATCTCATCTATATTCTTTTAAAACACATGAACAATCGTCAAATTAGGATTTGATACTATAGAAACCACCAGGTGTTGTGATATGCAATaaagtcttgtagctgtgattcttcaagtctattttgcgtacataaagtcttgCGTCTGCCACATTTGAAATAATGAATGGATATTGCATATAATGGGCGACTATCATACCATAAGATGCTTTCTTAGCGGAGCCAGGACAGGATGCAGCATAGGTATGAATTGCGGTTTGCAAGTTATTGAAATATTGCAGCAATTCTGAGCTGTCAGTAGGGATGAATAAAATTGAAACTTAGAATACATGAGGACAACCTAATTGTCATAAACAAACCATAGTAGACATGTTAAATCACAATGccccacAGCTTATGTGGTAATATAGCATGATTGGTATGGATAGGCCATAAACAGGCCATAAAAAAAACTCTGACTGTATTACTCATACTGAGTTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 333108 604 + 636262 AAAATTGTACTGGTTCCAGTGGTCTGGGCCTTTGCCCCACAGGGGGCAGTCATGGTCCATGGCACAACAGAATGTGTAAGCAGACTCGGATGTATATGTCTTTTCCTTTTTGGGCCCACTTTCTATTAGGAATCTCATCTATATTCTTTTAAAACACATAAACAATCGTCAAATCAGGATTTGATATTATAGAAACCACCAGGTGTTGTAATATGCAATaaagtcttgtagctgtgattcttcaagtctattttgtgtacataaagccttgCGTCTGCCACATCTTAAATACTGAATGGATATTACATTTAATGGGCGGCTATCATACCATAAGAGGCTTCCTTAGAGGAGCAAGGACAGGATGCAGCATAGGTATGAATTGTGATTTGCAAGCTATTGAAATATTGCAGCAATTTTGAGCTGTCAGTAGGGAAGAATAAAATTGAAA-TTAGAATACATGAGGACGACCTAATTGTCATAGACAACCTATAGTAGACATGTTAAATCACAATG------GGCTTATGTGGTAATATAGCATGATTGGTATGGGTAGGCCATAAACAGGCCATAAAAGAGACCCCAACTATACTACTCATACTGAGTTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 324096 611 + 647215 AAAATTGGACTGGTGCCAGTGGTCTAGGCCTTTGCCCCACAGGGGGCAGTCATGGACCATGACACAACAGAATGTGTGAGCAGGCTCGGAAGTATATGTCTTTTCCTTTTCCAGTCCACTTTCTATTTGGAATCTCATCGATATTCTTTTAAAACACATGAGGAATCATCAAATTGAGATTTGATACTATAGAAACCGCCAGGTGTTATGATATGCAATaaagtcttgtagttgtgattcttcaagtctattttgcgcatataaagtcttgtatctgCCACATTTGACATAATGAATGGATCTTGCATATAATGGGTGACTATCATACTATAAGATGCTTTCTTAGCGGAGCCAGGACAGGCTGCAGCATAGGTATGAATTGCTGTTTGCAAGTTATTGAAATATTGATGCAACTCTGAGCTGTTAGTAGGGATGAATAAAATTGAAACTTAGCATACATGAGGACAACCTAATTGGGATAAACAAACCATAGCAGACATGTTAGGTCATAATGCCCCACAGCTTCTGTGTTAATCTATCAAGATTGGAAAGGATAGGCCATAAACAGGCCATAAAAAAAACTCTGACTGTATCACTCATACTGAATTACA - -a -s mr.mrrefChr5 181215 492 + 294542 CAGTACCAGAGGCTGTCTCACAAGAGAGTAGACTTTTGACTAATATTTGTTCTTCTTTTCAGTGTGGGTAAGAACACTTGTATGGGCTGAGCATCACACCAATAAATCGACACTCCATGTCAGAATACATGCTAGTTAAGCATGAAGGAATGAGTGCCTCAATATACATCCCTTATCTCAGTTTGTATCGTTCTGACTTTTAGGGTATGCTAGTTTTCAGATAGAGTCTTGTACACTTTTAAGGCATTGGTTTGAATTCTGACTTTGGATGGCTACTGAGTAGCACTAGAGCACCACAAACCCTAAGCATAAGTGTGAAATTGTAACAAGTTAATTCCCAAGTGCTTGTGCCCAAGAAGACAGCATTGCTACGTAAAACAGCCTACACCACTTAATCTCTTCACGTATTTAGTGTAGCAAATTTGCTAAGTTTTTGGATGGTGCTTCAGTGCATAGTTGTCAGCATCTAACCTTGTCACTATAGGGGACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 333712 474 + 636262 CAGTACCAGAGGCTGTCTCACAAGAGAGTAGACTTTTAACTAATATTTATTGTTCTTTTCAGTGTGGGTAGGAG-ACTTGTGTGGGCTGAGCATCACACCAATAAA-------TCCATGTCA-AATACATGCTAGTCAAACATGTAGGAGTGAGTGCCTCAATATACATCCCTTATCTCAGTTTGTATCGTTCTGACTTTTAGGGTATGCTAGTTTTCAGATAGAGTCTTATACACGTTTAGGGCGTTGG------CTCTGACTTTGGATGGCTACTGA-TATCACTAGGGCACCACAAACCATAAGCATAAGTGTGAAATTGTAACAAGTTAATTCTGAA--GCTTCTGCCCAAGAAGACAGCATTTCTACGTTAAACAGCCTACACCACTTAATCCCTACACGTATTTAGTGTAGCAAATTTGCTAAGTTGTTGGATGGAGCTTCAGTGCAGAGTTGTCAGCATCTAACCTTGTCACTATAGGGGACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 324775 492 + 647215 CAGTACAAGAGGTTTTCTCACAAGAGTGTAGACTTTTGACTAGTATTTGTTCTTTTTTTCGGTGTGGGTAAAAACACTTGTATGGGCTGAGCATCACACCAATAAATCGACACTCCATGTCAGAATTTACACTAGTTAAGCATGAAGGAATGAGTGCCTCAGCACACATCCCTTAGCTCAGGTTTTATAGTTCTGACTTTTGGAGTATGCTTGTTTTCAGATAGAATATTGTACATTTTTAAGGCATTGGTTTGAATTCTGACTTTGGATGGCTACTGAGTTGCACTAGAGTACCACAAACTCCAAGCATAAGTGTGAAATTGTAACAAGTTAATTCCCAAGTGCCTGTGCCTAAGAAGACAGCATTGCTACGTAAAACAGCCTACACCATTTGATCTCTTCAAGGATTTAGTGTAGCAAATTTGCTAAATTTTTGGATGGTGCTTCAATACATGGTCGTCAGCACTTAACCTTCTCACTATAGGGGACATG - -a -s mr.mrrefChr5 181707 26 + 294542 CTCACTACTTCTCACATGAACCTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334186 25 + 636262 -TTACTACTTCTCACATGGACCTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 325270 26 + 647215 CTCACTACTTTTTACATGAACCTAGG - -a -s mr.mrrefChr5 181733 98 + 294542 ATGCTAATAAACCATTGCATGGAAAGCTTTTGGGCTCCGAGACAACCAGCTGATTTGGAGATCTTAACTTTGGAATGTCATTAACAAGCCCAGCTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334240 98 + 636262 ATGCTAATAAACCATTGTATGGAAAGCTTTTGGGCTCCGAGACTACCAGCTGATTTGGAGATCTTAACTTTGGAATGTCATTAACAAGCCCAGCTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 325296 98 + 647215 ATGTTATTAAATGGTGACATAGAAAGCTTTAGGGCTCTGAGACAGCCAGCTGATTTGGAGGTCTTGCCTTTGGAATGTCATTAACAAGCCCAGCTACA - -a -s mr.mrrefChr5 181831 60 + 294542 GGCTTGCCCTAGCAAGGTCACTTTGGATCCTGCCAGTGTATGCCTGAATTGCACCCGCCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334339 60 + 636262 GGCTTGCCCTAGCAAGGTCACTTTGGGTTCTGCCGGTGTATGCCTGAATTGCACCAGCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 325394 60 + 647215 GGCTTGCTCTAGCAAGGTCACTTTGGATCCTGCCAGTGTATGCCTGAATTGCCCCCACCA - -a -s mr.mrrefChr5 181891 52 + 294542 TTTGGGAGGACTCAAGCTTGGAACCCAGCTGGCGTTGCTGCCTGCAGGCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334402 21 + 636262 TTTGGGAGGAATTGAGCTTGG------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 325454 52 + 647215 TCTAGGAGGGCTCAAGCTTTGAACCCAGCTGGCGTTGCTGCCTGCAGGCCAC - -a -s mr.mrrefChr5 181943 36 + 294542 CACACCATCAACCTCAACAGATATGTCATCAATGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 325545 36 + 647215 CACACCATCAACCTCAACAGATATGTCATCAATGAT - -a -s mr.mrrefChr5 181979 9 + 294542 CAATATTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 325583 9 + 647215 CAATATTTT - -a -s mr.mrrefChr5 181988 23 + 294542 GAATCCAGCACTCTGAGGCCGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334423 9 + 636262 --------------GGGGCCGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 325593 23 + 647215 GAATCCAGCACTCTGAGGCGGCA - -a -s mr.mrrefChr5 182011 40 + 294542 TAGAATTAGTCTGGGGATAATTCCATAAAAATCTGCTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334447 35 + 636262 TAGAATTATCCTCGGACTAATTCTATG-----CTGCCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 325616 40 + 647215 TAGAATTAGTCTGAGGATAATTCCATAAAAATCTACTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 182051 25 + 294542 GAAAGAACCCTTAACATAGAATCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334605 25 + 636262 GAAAGAACCCTTAACAAAGACTCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 325656 25 + 647215 GAAAGAACCCTTAACGTAGAATCAC - -a -s mr.mrrefChr5 182076 101 + 294542 ACCTCTTGTTTTTTTTATACCTACCCATTGATTTCTAAGTGTGGATAGCCATAAGTCATCTTTGTTGTTGGATTTGCAGTTTTAGTAGTTGCTTAGTAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334640 100 + 636262 ACCTCTTGTTTTTTTTATACCCACCCATTGATATCTCAGTGTGGATAGCCATAAGTCATCTTTGTTGTTGGATTTGCAGTTTTAGTAGTAGCTT-GTAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 325681 101 + 647215 ACTTCTTGATTTTTTTATATTTACCCATTCCTTTCTAAGGGTGGATAGCTATAAGTCATCTTTGTCGGTGGATTTGCAGTTTTAGTAGTTGCTTAGTAGTC - -a -s mr.mrrefChr5 182177 203 + 294542 TTCTGCTAAACAGAGCTATTATCTCTCACTAAGGTATGTATCACTTCCCCCATTCTGATCATAATAGTGGTTGTGCTGAGATGTGGTCACTTCTCACTGTTCTATACATAGAAGATTGTAGGCATTCTAGGGGCTTGGCCCCATCACTAGTCTTGCAAGGCTAGAACGACACTTATGTGATCCAGTAAAGAGTCATGCATGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334741 183 + 636262 ATCTGCTAAACAGGGCTATCCTCTCTCA--------------------CCCATTTTGATCATAATAGTGGTTGTGCTGAGATGTGGTCATTTCTCACTGTTCTATACATAGAAGATTGTAGGCATTCTAGGGGCTTGGCCCCATCACTAGTCCTGCAAGTCTAGAACGACACTTATGTCATCCAGTAAAGAGTTATGCATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 325782 162 + 647215 TTCTGCTAAATAGAGACATTATCTCTCACTAAGGTATGTATCACTTCCCCCATTCTGCTCATAATAGTGGTTGTGCTAAGATGAGGTCACTTCTCACTGTTTTATACATTG-----------------------------------------TTGCAAGGCTAGAAAGAGACTTATATGATCCAGTAAAGAGTCATGCATGCT - -a -s mr.mrrefChr5 182380 66 + 294542 CCCAAAGTGCATAGGTTCATGTGCACTCAGGACACTGCTTTGAACTTTTCATTCTCTCACATATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334924 66 + 636262 CCCAAAATGCATAGGTTCATGTGCATTCTGGACACTGCTTTGAACTTTTCATTCTCTCACATATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 325945 66 + 647215 CCCAAAGTGCTCAGGTTCATGTACACTCAGGACACTGCTTTGAACTTCTCATTCTCACACATACTC - -a -s mr.mrrefChr5 182446 81 + 294542 GCAATGTTAGGTAGCTCCTACCTGCAAAACTGTGCAACAGCACTAGCACTTCACCATGTCACCACTTATGAGTCTGAACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334990 81 + 636262 GCAATGCTAGGTAGCTCCTACCTGCAAAACTGTGCAACAGCACTAGCACTTCACCATGTCACCACTTATGAGTCTGAACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 326014 81 + 647215 GCAATGTTAATTTGCTCTTACCTGCAAGTCTGTGTAACAGCACTAGCATTTGATCATGTTATCATTTAGAAGTCTCAACTC - -a -s mr.mrrefChr5 182527 139 + 294542 CGCTACTCACTTGTGTGTGTGCTATTGTTCTGGTCAATACTGATTCATGGTGGTAAGAGAGGCAAAGTCAATTAAAAAATAATCTTCAGTGGCAACACAAAAACAAACTTCAGTGACAATCCATTGTATGACAGTGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335071 139 + 636262 CCCTACTCATTTGTGTGTGTGCGTTTGTGTTGGTCAATACAGATTCATGGTGATAAGAGAGGCAAACTCAATTAAAAAATAAACTTTAGTGGCAACACAAAAACAAACTTCAGTGACAGTGCATTGTATGACAGTGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 219561 139 + 647215 CGCTACTCACTTGTGTGTGTGCTATTGTTCTGGTCAATACTGATTCATGCTGGTAAGAGAGGCAAGGTCAATTAAAAGATAATCTTCAGTAGCAACACAAAAACAAACCTCAATGACAATCCATTGTATGAAAGTGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 326095 137 + 647215 CGCTACTCACTTGTGTGTGTGCTATTGTTCTGGTCAATACTGATTCATGGTGGTACGAGAGGCAAAGTCAATTAAAAAATAATCTTCAGTGCCAACACAAAAACAAACTTCAGTGACAATCCAT--TATGACAGTGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 182666 72 + 294542 CACCTGTGCATGAAATGGTCCCCCCCTGTTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATAGGAAAGTTATTACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335211 72 + 636262 TGCATGTGCATGAAATTATCTCCCCCTATTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATATGAAAGTTATTCCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 219700 72 + 647215 CACCTGTGCATGAAATGGTCCCCCCCTGTTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATAGGAAGGTTATTACATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 326232 72 + 647215 CACCTGTGCATGAGATGGTCCCCCCCTGTTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATAGGAAAGTTATTACATT - -a -s mr.mrrefChr5 182738 1 + 294542 G -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335283 1 + 636262 G -s simRat_chr6.simRat.chr6 326304 1 + 647215 G - -a -s mr.mrrefChr5 182739 50 + 294542 AAGTAATATCCCACGACCCAAGCACAACTAGTAAGAGTGGCACCTATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335284 50 + 636262 AAGTAATATCCCATGATCCAAGCACAACAAGCAAGAGTGGCACCTATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 193706 50 + 647215 AACAGATATCCCACAACCCAAGCACAACTAGTGAGAGTGGCACCTATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 326305 50 + 647215 AAGTAATATCCCACGACCCAAGCACAACTAGTTAGGGTGGAACCTATCAT - -a -s mr.mrrefChr5 182789 9 + 294542 CTTAAACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335345 9 + 636262 CTTAAACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 193756 9 + 647215 CTTAAACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 326355 9 + 647215 CTTAAATAG - -a -s mr.mrrefChr5 182798 1 + 294542 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335354 1 + 636262 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 326364 1 + 647215 A - -a -s mr.mrrefChr5 182799 22 + 294542 ATTTTTTATTAGGAAGGTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335355 22 + 636262 ATTTTGTATTAGGAAGGTAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 193765 22 + 647215 ATTTTTTATTAGGAAGGTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 326365 22 + 647215 ATTTTTTATTAGGAAGGTGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 182821 259 + 294542 TCATGGACTAACCAATCCCTCTACACCAAGGGACTGCCTTAAGAAGATAGCCCTTGTACCCAGATCATCTAAGAGCCACTAGAAGTAGGGCACAGTATTAACCTTTCCAGGCACGTGGAGGGAATGTGTCATATTGAGATACCTGCTATATTAATTAATGAAGAGGCCGTGTCAGTAGCACATTTGCCTTAATAATATGGGCTTCCAGCCCTGCCCTCAATTCTCTTATGTTCTAGACATATCCATGAGGCTATGTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335377 259 + 636262 TCATGGACTAACCAATCGCTCTACACCAAGGGACTGCCTTAAGAAGATAGCCCTTGTATCCAGATCATCTAAGAGCCACTTGAAGTAGGGCACAGTATTAACCTTTCCAGGTACGTGTAGGTAATGTGCCATATTGAGAAACCTACTATATTAATTGATGAAAAAGCTGTGTCAATAGCACATTTGCCCTAATAAGATGGGCTTCCAGCCCTGGCCTCAATTCTCTTAGGTACTATACATGTCCATGAGGCTATGTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 326387 254 + 647215 CCATG----CACCAATCCCTCTACACCAAGGGATTGCCTTAAGAAGACAGCCCTTGTACCTAGATCATCTAAGAGCCACTAGAAGTAGGGTCTAGTATTAACCTTTCCAGGCACACGGAGGGAACGTGTCAT-TTGAGATACCTGCTATATTAATTAATGAAGAGGTCGAGTCAGTAGAACATTTGCCTTAAGAATATGGGCTTCCAGCCCTGCCCTCGATTCTCTTATGTTCTAGATATATCCATGAGGCTATAGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 183080 130 + 294542 AGCTAGGCTATGCCTACGTATCTGATCCCTTTAGAGTCATATCCACCCCCAGCTTCGACACGACTAAGACAGTGGATACCTAAGCTGGGCCTGCTATACAGTGGTCGGTAGCACCTATTTGACATTTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335636 105 + 636262 ------------------------ATCCCTTTGGCGTCATATCCACCCCCAGCCTCGGCACGACTAAGACAGTGGATACCTAAGATGGGCCTGC-ATACAGTGGTCGGTAGCACCTATTTTACATTTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 326725 130 + 647215 AGCTAGGCTATGCCTACGTATCTGATCCCTTTAGAGTCATATACGCCCCCGGCTTGGACGCTGCTAAGACACTGGATACCTAAGCTGGGCCTGCTGTACTGTGGTCAGTAGCACCAATTTGACATTTATA - -a -s mr.mrrefChr5 183210 94 + 294542 TTGAAAGGGATAGCATACATATGGCCATTGCAGGAGAGTGTCTTAGTGCCCATATAGTCTTACACTCACTTGGTGACAGACAGGATGCAGTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335741 92 + 636262 TTGAAAGGGATAGGATACATGTGGCCATTGCAGAAGA--GTCTTAGTGCCCATATAGTCTTACACTCACTTGATGACAGACAGGAGGCAGTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 326900 94 + 647215 TTGAAAGGGATAGCATACATATGGCCAGTGCAGGAGAGTGTCTCAGTGCCCATACAGTCTTAACCCCACTTGGTGACAGATAGGATGCAGCAGA - -a -s mr.mrrefChr5 183304 80 + 294542 ATAAATCATAACCAATAACTAAAAAATTGATGGAGACATCAATCCTGTGGTGTGCAGACTGTGATGACCACATGACACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335833 80 + 636262 ATAAATCATAACCAATAACTAAAAAATTGATGGAGACATCAACCCTGTGGTATGCAGACTGTAATGACCACAGGACACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 326998 80 + 647215 ATAAATCATAACCAATAACTAAAAACTTGATGGAGGCATCAATCCTGTGGTGTGCAGAGTGGGATGACCACATGAGCCAT - -a -s mr.mrrefChr5 183384 35 + 294542 ATTGTTCGGGGTACACAAAGCATCACAAGGCATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335937 35 + 636262 ATTGTTCGGGGTACACAATGCATCACAAGGCTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 327078 35 + 647215 ATTGTTTGGGGCACACTAAGCATCACAGGGCATGT - -a -s mr.mrrefChr5 183419 62 + 294542 AGGAATTTTGCTGAAGTTATTTCATGTTGCGGGCCTATGGCAATTAGCTTGCTGAAAGCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335972 62 + 636262 AGGAATTTTGCTGAAGTTATTCCATGTTGCGGGTCTATGGCAATTAGCTTGCTGAAAGCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 327126 62 + 647215 AGAAATTTTGTTGAAGTTATTTCATGTTGCGGACCTGGGGGAATTGGCTTGCTAAATGCTTT - -a -s mr.mrrefChr5 183481 272 + 294542 CAGCAGTTTGGAATTTAGGAGACAATGCAACAAAGACTTGGAGAATAACAGTATCTAAGTGTGCACACCAATCGGGGACATTACACACAGTCAAGAGGCCAGTAAATTCTCTGGTACTTCCACCATCAAAAACATGCTTCACATCAGCTCTCTCTCTGGGTGTAGTGAAGATTCATTGGATAGGTAATAGTCACCATTTAGATCACAGCCTTGTTCCATTGGCATCGGTCATATATTAAGACACAAGATAATAAGATAATCTTTATTCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336034 248 + 636262 CAGGAGTTTGGAATTTAGGAGTCAATGCACCAGAGACTTGGAGAATAACAGTATCTAAGTGTCCACACCAATCAGAGACATTACACACAGTCAAGAGGCCAGTGAATTCTCTGGTACTTCCACCATCAAAAACATGCTTCACATCAGCTCTCTCT------------------------ATAGTTAATAGTTATCATTTAGATCACAGCCTTGTTCCATTAGCATCGGTCATATATTAAGACACAAGATGATAAGATAATCGTTATTCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 327190 271 + 647215 CAGCAGTTTGGAATTTAGGAGACGGTGCAACAAAGTCTTGGAG-ATAAAAATATATAAGTGTGCACATCAATTGGGGACATTTCACATAATCAAGAGGCAGGTAAATTCTCTGGTCCATCCACCAGCAAAATCATGCTTAAAATTAGCTTTCTCTCTGGGTGTAGTGAAGATTCATTGGCTAGGTAATAGTCACCATTTAGGTCTCAGCCTTGTTCCATTGGCATCGGTCATATATTAAGACACAAAAGAATAAAATAATCTTTGTTCAATG - -a -s mr.mrrefChr5 183753 10 + 294542 CAGGCGAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336282 10 + 636262 CAGGCGAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 327466 10 + 647215 CAGTTCAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 183763 122 + 294542 GCTAGACTAATGTGATGAATTTTCCCAACAGTGGGCTAACTTTGTAAATTCTGACTGATCCCACCTATTTAACATTCTACGGATATACGGGTAAGACCTACCCTGAGTTTCAGCTGATGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336292 121 + 636262 GCTAGACTAATGTGATGCA-TTTCCCAACAGTGGGCTAACTTTGTAAACTCTGACTGATTCCACTTCTTTACCATTCTACGGATATACGGCTAAGACCTACCCTGAGTTTCAGCTGATGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 327478 122 + 647215 GTTAGACTAATGCGATGAATTTTCCCAGCACTGGGTTAACTTTGTAAATTCTGATTGACCCCACCCATTTAACATTCTATGGATATATGGGTAAGACCTACTCTGAGTTCCAGCTGATGATG - -a -s mr.mrrefChr5 183885 379 + 294542 GGTCCTTGGTGTCAGCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCGTTTTTGACAGTGCCTAGCTAACCAAAACCTACAATCTGTAAGGTTAGTGAACTAATGGGATCAACCCTCTATCGTGACCAGTCCCGGAGGACATTGGCACTCTTGCTATTGAATATCCTAAGTCAGGCAATAAATTAGATCATTGCTCTGTACCTCGAGTCTCAACTAGGTAGCTAGGTACCACACAGCAATCAATCATAATAGATTGACTTCCCTACTAACTAAATCTAGGAATTCATTTTTAGATCCAATAATATCTATGCTGTTAACTAAAGCATTAAGGGTCTTGGGGGGGTGAGTTTCTAGGGGATGGGTTTTGGAAGTAGCCAATGAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336413 378 + 636262 GGTCCTTGGTGTCAGCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCATTCTTGACAGTGCCTAGCTAGCCAAAACCTACAATCTGTAAGGTTAGTGATCTAATGGGATCAACCCTCTATCGTGACCAGTCTTGGAGGACATTGGCACTCTTGCTATTGAATGTCCTAAGACAGGCAATAAATTAGATCATTGCTCCATACCTCGAGTCTCAACTAGGTACCCAGGTACCACACGGCAAACAATCTTAATAGATTGACTTCCCTACTAACTAGATCTAGGAATTCATATTTAGATCCAATAATCTCTATGCCGTTAACTAAAGCATTAAGGGTC-TGGGGGGGTGAGTTTCTAGGGGATGGGTTTTGGACGTAGCCAATGAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 327601 354 + 647215 CATCCTTGGTGTCTTCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCGTTTTTTACAATGCTTAGCTAAGCAAAGCCTACAATCAGTAAAGTTAGTGAACTAATGGGATGAACCCTCTATAGTGACCAGGCCCGGAA---------------------GCATATCTTAAGTCAGGCAATAAAATG----ACTGCTCTGTATCTCAAGTCTCAACTAGTTAGCTAGGTACCACACAGCAATCAATCATAGTAGATTGACTTCCCTACTAACTAAATCTATGAGGTCATTTTCTGATCCAATAATATCCGCCCTCTGTACTAAAGCATTAAGGGTCTTGGGGGGGTGAGTCTCGTGGGGATGGGTTTTGGAAGTAGACAATGAGAT - -a -s mr.mrrefChr5 184264 115 + 294542 AGGCAATGAGAAATGACAGTGACCAACATATGGCAAGCCCTGTGGAGACCTATTGTGATAGAGGAACCCTCACATATTGTTTCCATTGCTTGTAGAGGGCAATGGGTAATGGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336829 115 + 636262 AGGCAATGAGGAATGACAGTGACCAACATATGGCAAGCCCTGCACAGACCTATTGTGATAGATGAACCCTCACATATTGCTTCCATTGATTGTAGAGGGCAATGGGTAGTGGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 327955 114 + 647215 AGGCAATGAGATATGACAGTGACCAACATATGGTAGGCCCTGTGGAGACTTTTTGTGATGGAGGAGCCCTC-CATATTGTTTCCATTGCTTGTAGAGGGCAATGGGTAATAGGGA - -a -s mr.mrrefChr5 184379 232 + 294542 AAGTACTTATATAACCACACTCCCCAGACTTACATTTAGGACATAGTTATTAAGCTTATAGCTTTACCAATAACTCCCTCCTAATGAGATGTATGACCTCAATGGCTTGTATTTACCCCTACACCACAGATGTAGTGTCTAATCATACAGGCAAGTTGGGCAAGTGATTGCTAAGATGAGATTTTTAACTAAGAAGGGGAATAGTGGCAGACATAGTGCCCAAATAGCAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336944 232 + 636262 AAGTACTTATATAACCGCACTCCCCAGACTTACATTTAGGACATAGTTATTAAGCTTATAGCTTTACCAATAACTCCCTCCTAATGAGATGTATGACCTCACTGGCTTGTATTTACCCCTACACCACAGATGTAGTGTCTAATCATACAGGCAAGTTGGGCAAGTGATTGCTAAGATGAGATTTTTAACTAAAAAGGGGAGTAGTGGAAGGCATAGCGCCCAAATAGCAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489949 116 + 636262 AAGTACTTATATAACCACACTCCCCAGACTTACATTTAGGACATAGTTATTAAGCTTATAGCTTTTCCAATAACTCCCTCCTTATGAGATGTATGACCTCAATGGCTTGTATTTAT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 328069 223 + 647215 AAGTCCTTATCTAACCATACTCCAAAGACTTACATTTAGGACATAG---TTAGGCTCATATACTTACCCATGAGTCCCACCTAATGAGATGTATGAACTCAATCGCTTATATTTACCCCTACACCACAGATTTAGCATCTAATAATACAGGCAAGTTGTGCAAGTGATCGCTAGGCTGAGATTGTTAACTATGAAGGGGAATAGTGGCAGACATAGTGCCCAAATA------ - -a -s mr.mrrefChr5 184611 208 + 294542 CACACATACCAGCCAGTGATCTCTCAAGGGTGATAGCATTATTCAAGGCATGGACAGTGCCTTGGTCTCAAATCATACTGCCCCAGTTGTAACCATTATTCTTCTGAGAGGGTCATACCATTGATGGTTTGTCTCTGTTTGCCTATTTATGTCCAGTTATATATATCCATCTATATTCATGTGGTATACTTGAGATTAGACGTTGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337178 208 + 636262 CACACATACCAGCCAGTGATCTCTCAAGGGTGATAGCATTATTCAAGGCATGGACTGTGACTTGGTATTAAATCATACTGCCCCAGTTGTAACCATTATTCTTCTGAGAGGGTCATACCATTGATGGTTTGTCTCTGTTTGCCTATTTATGTCCAGTTATATATAGCCATCTATATTCATGTGGTACATATGCGCTTAGCCGTTGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 328292 191 + 647215 ----CATA-------------TCTAAAGGGTGATAGTGATATTCAAGGCATGGGTACTGCCTTGGTCTCAAATCATACTGCCCCAGTTGTAACCATTATTCTTCTGAGAGGGCCATACCATTGATGGTTTGTCTCTGTTTGCCTATTTATGTCCAGTTATATATATCCATCTATATTCATGTGGTATACTGGAGATCAGATGTTGCCT - -a -s mr.mrrefChr5 184819 77 + 294542 GTTGTACCGTGTGACTATTAAGAGTGAGGTGACTCATAGAGAACATAAAGAATTCATAAGGTCACTTTATAATGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337386 77 + 636262 GTTGTACCGTGTGACTATTAAATGTGAGGTGATTCCTAGAGAACCTAAAGAATTCATAAGGTCACTTTGCAATGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 328492 77 + 647215 GTTATATCATGGGACTATTAAGAGTGAGGTGACTCATAGAGAACATCTAGCTTTCATAAGGTCACTTTATAATGATA - -a -s mr.mrrefChr5 184896 13 + 294542 CTCACATTATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337463 13 + 636262 CTCACATTATTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 328572 13 + 647215 CTCACCTTGTTAA - -a -s mr.mrrefChr5 184909 73 + 294542 TTTGCCAAGCTAGTACCTGCTCATTTGCAAACCAAGAAATCCCAGCATAAATATTTAATGATGTTTAGATTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337476 73 + 636262 TGTGCCAATCTAGTACCAGCTCATTTGCAAACCAAAAAATCTCAGCATAAATATTTAATGATGTTTAGATTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 328586 73 + 647215 TTTGCCCAGATAGTGCCTGCTCATTTCCAAACCAAGAAATCCCAGCATAAATACTTAATATTGTTTGGATTTC - -a -s mr.mrrefChr5 184982 135 + 294542 GCACAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAACACAAACGTGGCCAAGTATATGCAGTAAATGATTGGCTGTGAGCCTGCCCCACATGGCCAAGTACATACAGTTAGTACATGGCTATGAGTAATATCAAGCCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337550 135 + 636262 GCACAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAACACAAACGTGGCCAAGTATATGCAGTAAATGATTGGCTGTGAGCCTGCCCCACATGGCCAAGTACATACAGTTAGTACATGGCTATGAGTAATATCAAGCCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 328659 135 + 647215 ACTCAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAATGCAAACGTGGCCATGTACGAACAGTTAATGATTGTCTTTGAGCCTGCCCTGCGCAGCTGCATACATACAGTTAATGCTTGACTATATGTAATAACAAGCCCAT - -a -s mr.mrrefChr5 185117 8 + 294542 TACTGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337685 8 + 636262 TACTGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 328795 8 + 647215 TACTGCAG - -a -s mr.mrrefChr5 185125 35 + 294542 ACACTAGACATTGCATGGAATGTACACCTGTAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337693 35 + 636262 ACACTAGACATTGCATGGAATGTACACCTGCAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 328804 35 + 647215 ACACTAGATATTGCATGGAATGTACATCTGTAGGT - -a -s mr.mrrefChr5 185160 28 + 294542 GCAGACTTCAGATTCATCATCAATATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337728 28 + 636262 GCAGACTTCCGATTCATCATCAATATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 328863 28 + 647215 ACGGACTTCAACTTCATCATTAATATAT - -a -s mr.mrrefChr5 185188 213 + 294542 AGATTTAAGGCTAGCGTGGGGGTGGGGAGAGGATGAGAGGGAGGACAATATTAGAAAATAAGTGTTCATCCTGGTATGCTTGCAGATATACGACATCCAGACAATGAGGTGAGCTTACTGTTCAGAGGATCACTCAATTGACTTTCCTAGACCAAAAGGCTTGTACAAAATCATTGAATCAACAACTTGTTTTTCCATCTCAATAAATTGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337756 213 + 636262 AGATTTAAGGCTAGCGTGGAGGTGGGGAGAGTATGAGAGGGAGGACAACATTAGAAAACAAGCGTTCATGCTGGTATGCTTGCAGACATACGACATCCAGACAATGAGGTGAGCTTACAGTTCAGAGGATCACTCAATTGACTTTCCTAGACCAAAAGGCTTGTACAAAATCATTGAATCAACAACTTGTTTTTCCATCTCAATAAATTGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 328892 189 + 647215 GGATTCAAGGCTAGCATGGGGGTGGGGAGAGGATTAGAAGGAGAAAAATATTAGAAAATAAGTATTCATCCTGGTATGCTTGCAGATATATCACATCCAGACAATGATGAGAGTTTACTGTTCAG------------------------GACCAAAAGGCTTGCACAAAATCATTGAATCAATAACTTGTTCTTCCATCTCAATTAATTGACA - -a -s mr.mrrefChr5 185401 70 + 294542 TTCAACCAAAGGGGGCCAGATTTAGGTTTCAAAGAGAAAAGAAAAACTGTCTAGAACAAGATAACATCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337969 70 + 636262 TTCAACCAAAGGGGACCAGATTTAGGCTTCAAAGAGAAAAGAAAAACTGTCTAGAACAAGATAACATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 329082 70 + 647215 TTCAATCTAAGGGGGGCAGATTTAGGTTTCAAAGAGAAAAGAAAAACTGTCTAGAACAATATAACATCCG - -a -s mr.mrrefChr5 185471 59 + 294542 GCCACAAATTGATTTGGTGCATGGAGAAGCATGGGGGGACCAAATAGTAggtccaataa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338039 59 + 636262 GCCACTAATTGATTTGGTGCATGGAGAAGCATGGGGGGACCAAATAGTAGGTCCAATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 329198 59 + 647215 GCCACAAATTGATTTGGTGCATGGAGAAGCATGGGGGGACCAGATAGTAggttcaatga - -a -s mr.mrrefChr5 185530 75 + 294542 tggaagaaactgtgtcccagcatggcagggtttatgatccaccctaagaaggaaaccttgatagaggtggtggac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338098 75 + 636262 tggaagaaactgtgtcccagcatggcagggtttatgatccaccctaagaaggaaaccttgatagaggtggtggac -s simRat_chr6.simRat.chr6 329265 75 + 647215 tggaagaaactgtgtcccagcatggcagggtttatgatccagcctaagaaggaaaccttaatagagctggtggac - -a -s mr.mrrefChr5 185605 58 + 294542 tctaagaaatcagaggagagggctttcatggattggattcaggccaggttcaaggaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338173 58 + 636262 tctaagaaatcagaggagagggctttcatggattggattcaggccaggttcaaggaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 329344 58 + 647215 tcaaactaatcataggagagggctctcagggattgaattcaggccaggttcaagcaat - -a -s mr.mrrefChr5 185663 97 + 294542 aattgacacaacacttaacactttaatgcaagtatttatgagtattggcttagaccgtgcaatcatcttcctcctgacgatgatggataatggatca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338231 97 + 636262 aattgacacaacacttaacactttaatgcaagtatttatgagtattggcttagaccgtgcaatcatcttcctcctgacgatgatggataatggatca -s simRat_chr6.simRat.chr6 329403 97 + 647215 aatggatacaacacttaacattttagtgcaggtattggtgagtattggcttagatcgtacatctatcttccttccgatgatgatggatgatggattg - -a -s mr.mrrefChr5 185760 100 + 294542 ccttcagtaccgagcaagtggttgcaatgaatgtgactgggtatttgtaggggcattatgatgtttgatgtacttaacttgcccaggcctgcccacttcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338328 100 + 636262 ccttcagtaccgagcaagtggttgcaatgaatgtgactgggtatttgtaggggcattatgatgtttgatgtacttaacttgcccaggcctgcccacttcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 329501 100 + 647215 ccttcagtactgagcaagtggttgtgatgaatatgatggtgcatttgtaggggtgtaacgatgttcaatgtacttaattcgtccaggcctgcccattttc - -a -s mr.mrrefChr5 185860 141 + 294542 acttttcagaagtttacctgccttttgtgagatggatcataccatgattagtttagtctgattgacccctattgatgaagtgctctatggaaatatcttaagagaaatgaatacataagaaaaatcaccaagtattgtctg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338429 141 + 636262 acttttcagaagtttacctgccttttgtgagatggatcataccatgattagtttagtctgattgacccctattgatgaagtgctctatggaaatatcttaagagaaatgaatacataagaaaaatcaccaagtattgtctg -s simRat_chr6.simRat.chr6 329601 141 + 647215 actattcaggattttccctgctttttgtcagatggatcaaaccatggttagtgtagtctgattgaaactaattgatgaagtgccctatgaaactatcttgagagaaatgaaaactttaggaagatcaccaagtgttgtttg - -a -s mr.mrrefChr5 186001 35 + 294542 aggcccgcatcagcccaactagctgtgcagggact -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338570 35 + 636262 aggcccgcatcagcccaactagctgtgcagggact -s simRat_chr6.simRat.chr6 329743 35 + 647215 aggcccctgtcagcccagctacctctgcggggatt - -a -s mr.mrrefChr5 186036 54 + 294542 tcactggttgctgccagtacacctggtgcaagctccattcctactcctctccta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338605 54 + 636262 tcactggttgctgccagtacacctggtgcaagctccattcctactcctctccta -s simRat_chr6.simRat.chr6 329787 54 + 647215 tcacctgctgttgcccgtacacctgatacaagctccattccaactcctcttcaa - -a -s mr.mrrefChr5 186090 151 + 294542 tgctaagttgtcaagatgagtcatggcatactcccctcttatgtactctgctaaacgccctgatggtggagtgccatgatgatccactagtgcctgactaccagtaagtactaatcttatccctctgatgtaTTTCTGGTGATCCAGTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338659 151 + 636262 tgctaagttgtcaagatgagtcatggcatactcccctcttatgtactctgctaaacgccctgatggtggagtgccatgatgatccactagtgcctgactaccagtaagtactaatcttatccctctgatgtaTTTCTGGTGATCCAGTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 329848 151 + 647215 tactaagttgtcaagatgagatatgacttgctcccctcttatgtagtctgctgaatcccctgatggaggactgctaggatgattcactaccacctgattaccagtaagtacTAATCTTATCCCTATGATTGATGTCTGCGGAACCAGTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 186241 52 + 294542 TGATTAACAGTTGGTATCCATCTGCGTCGTCTTGTGTCTTTGTCTCAGGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338810 52 + 636262 TGATTAACAGTTGGTATCCATCTGCGTCGTCTTGTGTCTTTGTCTCAGGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 330002 52 + 647215 TGATTAACAGTTGGTATCCATCTTCGTTGTCTTCTGTTGGTGTCTCAGGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 186293 29 + 294542 CACTAAAGCACACCCAACCATACTAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338862 29 + 636262 CACTAAAGCACACCCAACCATACTAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 330055 29 + 647215 TACTAAAGCACACCCAACCAGACCATCAG - -a -s mr.mrrefChr5 186322 8 + 294542 ATGCTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338891 8 + 636262 ATGCTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 330085 8 + 647215 ATGCTAGT - -a -s mr.mrrefChr5 186330 14 + 294542 AGTTGGAAATTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338899 14 + 636262 AGTTGGAAATTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 330141 14 + 647215 AGTTGAAAATTAGC - -a -s mr.mrrefChr5 186344 34 + 294542 ACCATTTTCTTATCTCAGTAGCATATTTTACTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338917 34 + 636262 ACCATTTTCTTATCTCAGTAGCATATTTTACTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 330155 34 + 647215 ACCATTCTCTTCTCTAAGTAGCATATTGTACTAC - -a -s mr.mrrefChr5 186378 5 + 294542 AGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338952 5 + 636262 AGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 330189 5 + 647215 AGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 186383 209 + 294542 GCATCTGCGAGGTTCTGAAAGTGTCATCttcttatgttgaacctagaagcatacaaagttgtttcccagtcccacacctgcacaatatctacacacctgatcgctctttctcagtatttaatgactgtgttggagggtgcTTGGTACACCAGTAAGTACATCGCTGTCTTATCTGCACTTGATTTACGGTATGCTCAGGTGGAATGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338957 209 + 636262 GCATCTGCGAGGTTCTGAAAGTGTCATCTTCTTATGTTgaacctagaagcatacaaagttgtttcccagtcccacacctgcacaatatctacacacctgatcgctctttctcagtatttaatgactgtgttggagggtgcTTGGTACACCAGTAAGTACATCGCTGTCTTATCTGCACTTGATTTACGGTATGCTCAGGTGGAATGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 330195 209 + 647215 GAATCTGTTTTGTGTTGAAAGTGCCATCttcttgtcttgagccttgaagcatacaatgttgtttaccagtcccacatctgcacagtatctacacacatgattggtctttctcagtttttaatgactgtgttagagggTTCTTTGTGCACCAGTAAGTGCATCACTGTCTTATCTGCACTTGATTTAGGGTATGCTCAGGTAGAATGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 186592 37 + 294542 GAATTAAGTTAGACTTGCTCTGAGACTTGCTATGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339171 37 + 636262 GAATTAAGTTAGACTTGCTCTGAGACTTGCTATGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 330404 37 + 647215 GAATCATGTTAGACTTGCTATGAGATTGGCTATGAGA - -a -s mr.mrrefChr5 186629 447 + 294542 CCTGTCAGGCCTGATCTTGTTTCTTTTAACAACATCTGGTATGCAGGCCTGTCTGTAAACTTAAATTAAAAATGGTTAGACTTACTTTTTTTTATCACTGTCATACTTGATTGACCTAGTGGTGATGGAGGTGCCACTAAGGAGCAGTGAAACAATTGCTACAAATTAAACTATAGCTCTGTTATCCTAGGTATGACTGGGAGACTAAATCATGTGCTGCAAATTAATAGTCTACAAAATAAAAAAGCTTTGCAAGCACCGTCAACAAACTTTTTGGCTAAGGAGATGAGTATTAACAAAAAATTGTGAACTTGGAAGATGGGCCTACATATTTGCTGTGGTACCATCTGCTTCTTGAACCGAGGTGACCAGCCTGCAAAAGTCCACCCTGGTCTACTTGCCCATTTCATTGCATTTGCCTGTGAAGTTTACTTGGCCACGAGCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339208 430 + 636262 CCTGTCAGGCCTGATCTAGTTTCTTTTAACAATATCTGGTATGCA----------TAAACTTAAATTAAAAATGGTTAGACTTACTTTTTTTTATCACTGTCATACTTGATTGACCTAGTGGTGATGGAGGTGCCACTAAGGAGCAGTGAAACAATTGCTACAAATTAAACTATAGCTCTGTTATACTAGGTATGACTGGGACACTAAATCATGTGCTGCAAATTAATAATCTAGAAAATAAAAAAGCTCTGCAAGCACCGTCAACAGACTTTTTGGTTAAGGAGATGATTATTAACAAAAAATTGTGACCTCGGAAGATGGGCCTACATATTTGCAG-------ATCTGCTTCTTGAGCCCAGGTGACCAGCCTGCAGAGGTCCACCCCGGTCTACTTGCCCATTTCATTGCATTTGCCTGTGAATTTTACTTAGCTACGAGCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 330472 443 + 647215 TTTGTCAGGCCTGATATTGTTTCTTTTAACAACATTGGATATGCAGGCCTGTCTGTAAACTTAAATTAAAAATGGTTAGACTTACTTTTTTGTAGCACTGTCATGTTTGACTGACCTAGTGGCGATGGAGGTGCCACTAAGGAGTAGTG-AACAACTGCTACAAGTTAAACTATAGCTTTGTTATCCTGGGTATAACTGGGTGACTAAATCATGTGCCGCAGGGTACTAGTTTACAAAATAAAAAAGCTTTGCAAGCACCATCAACAAACTATTTGACTAATGAGATGAGTAC---CGAAAAGGGGTGAACTTAGAAGATGGGCCTACATATTTGCTGTGGTACCATCTGCTTCTTGAACCGAGGTGACTAGGCTGCAAAAGACTACCCTGGTCTACTTGCCCATTTCATTGTATTTGCCTGCCGAGTCTACTTGACCATGAGCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 187076 49 + 294542 CCCGCTTGATGAGATGTCAAGCAATCTCCCCGTGTACATTGTAGATCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339638 49 + 636262 CCCGCTTGATGAGATGTCAAGCAATCTCCCCGTGTACATTGTAGATCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 330916 49 + 647215 CCTGCTTGGTGAGATGTCAGGTGCTCTCCCCACGTACATTGTAGATCCC - -a -s mr.mrrefChr5 187125 52 + 294542 TGTCCGATTTATGCACTATCAAGCGATGACAGGCCCTCTTGTACATTGAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339687 52 + 636262 TGTCCGATTTATGCACTATCAAGCGATGACAGGCCCTCTTGTACATTGAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 330966 52 + 647215 TACCCAATTCACGCACTATCAAGCAATGACAAGCCCTCACATACATTGCAGA - -a -s mr.mrrefChr5 187177 45 + 294542 CCCCTGTCTGATTCACGGACTGTCAAGCGATGTTGTATTCAACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339740 45 + 636262 CCCCTGTCTGATTCACGGACTGTCAAGCGATGTTGTATTCAACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 331018 45 + 647215 TCCCTGTCTGATTCATGCGCTGGCAAGTGATGTTGTATTGAACAT - -a -s mr.mrrefChr5 187222 81 + 294542 GCCCTTGGTCTACTTGCGCCTTCTGTTGTATTTAACATCTACTCTTTAACAAGTTAGGGTGAGCACACAGTTGTAACTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339839 81 + 636262 GCCCTTGGTCTACTTGCGCCTTCTGTTGTATTTAACATCTACTCTTTAATAAGTTAGGGTGAGCACACAGTTGTTACTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 331063 81 + 647215 GCCCTTGGTCTACTTGCACCTTCTGTTCTATTTAACATCTACTCTGTAGCAAGTTAGGGTGAGCACACATTTGTACCTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 187303 22 + 294542 AGCAGCTCATCTAGATCCTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339922 22 + 636262 AGCATCTCATTAAGATCCTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 331144 22 + 647215 AGCAGCCCATCTAGATCCTCTG - -a -s mr.mrrefChr5 187325 14 + 294542 AAGAAATTTATAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339945 14 + 636262 AAGAAATTTATAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 331166 14 + 647215 AAGAAATTTATAAA - -a -s mr.mrrefChr5 187339 64 + 294542 TAGAATGTTATGGTGTGCATCAATTTGAAAGCATAATTTCTAATTTCATACAAGGAAGATATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339961 64 + 636262 TAGAATGTTATGGTGCACATCATTTTGAAAGCATAATTTCTAATTTCATACAAGGAAGATATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 331180 64 + 647215 TAGAATATTAAGGTGTGCATCAATTTGAAAGCATGATTTCTAATCTCATACAAAGAAGATATGA - -a -s mr.mrrefChr5 187403 56 + 294542 TTTTATTTAAAGACCAGTGTCCTAATTGGAAGTTAATGGAGTTTGAGACAAATTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 331252 56 + 647215 TTTTATTTAAAGACCAGTGTCCTAATTGGAAGTTAATGGAGTTTGAGACAAATTAC - -a -s mr.mrrefChr5 187459 94 + 294542 AAGCAGGGTGTTGTGCCATAGGCTGTGTATTCAAATCAATTCTACTGTTGTTGGCCAATAGAATGATCCACACCAGGGCTAAGTATGTGTGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 331311 94 + 647215 AAGCAGGGTGTTGTGCCATAGGCTGTGTATTCAAATCAATTCTACTGTTGTTGGCCAATAGAATGATCCACACCAGGGCTAAGTATGTGTGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 187553 16 + 294542 GTCCAATCAGCAATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 331629 16 + 647215 GTCCAATCAGCAATTC - -a -s mr.mrrefChr5 187569 55 + 294542 AATCGAAGGCGTAAGACCACTAGCTTATTTAAGAATAGATACAATAGGGAATGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 331646 55 + 647215 AATCGAAGGCGTAAGACCACTAGCTTATTTAAGAATAGATACAATAGGGAATGAG - -a -s mr.mrrefChr5 187624 116 + 294542 TAAAGTATTTTAGACTCTGTTGGATTGGATGATTACTTAATTCAGGCTGTTGACCACACTAACTAAAGCTCTCATTGGTGTTCAACCAGGTAAGTATATTAATGCTGGATTGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340025 73 + 636262 -------------------------------------------AGGTAGTTGACCACACTAACTAAAAGTCTCATTGGTGTTCAACCAGGTAAGTATATTAGTGCTGGATTGGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 331703 116 + 647215 TAAAGTATTTTAGACTCTGTTGGATTGGATGATTACTTAATTCAGACTGTTGACCACACTGACCAAAGCTCTCATTGGTGTTCAACTAGGTAAGGATATTCATGCAGGATTGAATG - -a -s mr.mrrefChr5 187740 175 + 294542 CACAGTTCTATTTTCTGTGTTAAGACAGACAAGAGTGATTGCCTTGGAGCTGTGTGGTACATGGTACAAGTCAGCCCTTCCAAAAAGCAGGCAGCCTGTTCAACAACAGGAGTTCTTATGTCACAAGAGAAGTACAGATGGGTAGCTGTTATTGGGATTTGGATATGTTGCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340099 175 + 636262 CACAGTTATATTTTCTGTGTTAAGACAGACAGGAGTGATTGCCTTGGAGCTGTGTGGTACATGGGACAAGTCAGCCCTTCCACAAAGCAGGCAGTCTGTTCAACAACAGGAGTTCTTATGTCACAAGAGAAGTACAGATGGGTAGCTGTTATTGGGATTTGGATATGTTGCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 331819 127 + 647215 CACAGTTCT--TTTTGGCGTTAAGACAGGCAAGAGTGATTGCTTTGAAGCTGTGTGGTACATGGTACAAGTCAGCCCTTAGAAAAAACAGGCAGCCTGGTCAACAACAGGAGTTCTTATGTCACGAGGG---------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 187915 144 + 294542 AACTGTTCATGAAAGTTATGGTCCAGGGTAGTGAAATAGTCTGTGGACCATTTTACTATATAATCCTCTCTGAACACTTTATACTTCCAGGGTATTGGAAGCTAGTGATGGCACCTCATCAGGACACAGACTTGTCACGTTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340275 127 + 636262 AACTGTTCATGAAAGTTATGGTCAAGGGTAATGAAATAGTCTGTGGACCATTTTACTATATAAT-----------------TACTTCCAGGGTATTGGAAGCTAGTGATGGCACCTCATCAGGACAAAGACTTGTCACGTTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 331946 131 + 647215 ----GTTCATGCAAGT------CCAGGATAGTGAAATAGTCGGTGGACCATTCCACTATATAATCCTCTCTGAACACTTTATACTTCCAGGGTATTGGAAACTAGTGATGGCACCTCATCAGAACACA---TTGTCATGTTAAC - -a -s mr.mrrefChr5 188059 81 + 294542 TACAGTCTGTCCCATGCCCACTATCAGTCCATATAAAACATCTTGAAATCAGAAAAAATGAGCTCTAGTAACTCAAGACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340408 81 + 636262 TACAGTCTGTCCCATGCCCACTATAAGTCCATATAAAACATTTTGAAATCAGAAAAAATGAGCTCTAGTAACTCAAGACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 332077 78 + 647215 CAAAGTCTGTCTTATGTCCTCTATCATTCCATAACAAATATCTTGGAATCGGAAAAAACAAGCTCTGGTAAC---AAGCTG - -a -s mr.mrrefChr5 188140 107 + 294542 TAGAATAATTGGAGAAAATAAGTGCACTGTGCAAACAAATATCAATGTGTATGGTCTCAAAGGTGGGCCCTAGAAAAGTCCATGGATCATCATAGAGCTAATGGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340549 107 + 636262 TAGAGTAATTGATGAAAATAAGTGCACTGTGCAGACAAATATCAATGTGTATGATCTCAAAGGTGGGCCCTAGAACAGTCCATGGATCATCATAGAGCTAATGGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 332155 103 + 647215 TAGAATAATTGGAGAGAGTAAGTGCACTGTGCAAACC----TCGATGTGTATGGTCTAAAAGGTGGGCCCTAGAAAAGTCCATGGACCATCTTAGATCTAATGGATG - -a -s mr.mrrefChr5 188247 74 + 294542 TAACTATCCTACATAGGAACTTGATTGTGGATCATGTGCCTATAGCCCATTACCAATTCAAATGTATGTAGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340656 73 + 636262 TAACTATCCTA-ATAGGAACTTGATTGTGGATCATGTGCCTATAGCCCATTACCAATTCAAATGTATGTAGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 332262 74 + 647215 TAACTATCCTACACAGGAACTTGCTTGTGGACCATGTGCCTATAGCCCATTACCAGTTTAAATGTATGTAGGTC - -a -s mr.mrrefChr5 188321 169 + 294542 TTGTCTAGGAGCAGCTCTTATTATATGAGTGCAGGGGATCAATGGCTACAGTTGGGAGTCAACAATCATTTACATGTTCTATATAATCATGGCATCTCTGTTCAGTAAATTTCTAGGTAGGTACTGTTTTTGTCTTTTGGATCCAAAGATGGAATAACAAGCAAGGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340745 164 + 636262 TTGTCTAGGAACAGCTCTTATTATATGAGTGCAGGGGATCAATGGCTACAGTTGGGAGTCAACAAT-----ACACGTTCTAGATAATCAAGGCATCTCTGTTCAGTAAATTTCTAGGTAGGCAGTGTTTTTGTCTCTTGGATGCAAAGATGAAATAACAAGCAAGGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 332336 168 + 647215 TTGTTTAGAAGCAGCTCTTATAATATGAAAGCAGGGGATCAATG-CTATAGCTGGGAACCAACAATCATTTACATGTTTTATATAATCATGGCATCTCTGTTCAGTAATTTTCTAGGTAGGTACTGTCTTTGTCTTTTGGATCCAAAGATGGAATAATAAGCAAGAGCA - -a -s mr.mrrefChr5 188490 145 + 294542 GGTTATTGGAACTAACTTCACTAGATATATAAAAGGAAAACAATAATTGGTTGGAAGGTGAAAGACTGAAAAGGCGGTCTACCACCTCTACTAATAGTCGTGGTGGGAAAAGACTGAGAAGGCTGCACACTGCTCTACTAGCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340909 145 + 636262 GGTTATTGGAACTAACTTCACTAGATATATACAAGGAAATCAATAATTGGTTGGAAGGTGAAAGATTGAAAAGGTGGTCTACCACCTCTACTTATAGTCGTGGTGGGAAAAGACTGAGAAGGCTGCACACTGCTCTACTAGCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 332505 145 + 647215 GGTTATTGGAACTACCTTCACTGGATATAGGAAAGGAAAACAATAATAGTCTTGAAGGTGAAAAACTGGGAAGGCAGTCTACCACCTCTACTAATAGTCTTGGTGGTCAAAGATTGAGAAGGCTGCACAATGCTCTACGAGCTTA - -a -s mr.mrrefChr5 188635 106 + 294542 CCTCTGTAATTCTGCTAAATTTCCACAAAAAGACAAGACAAGAGAAGGCAAGACCTTTATAGCAATAAGAGAAGACAATGATGGAAAGTAGCTTGAATCCGTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341054 105 + 636262 CCTCTGTAATTCTGCTAACTTTCCACAAAAAGACAAGACAAGAGAAGGCAAGACCTTTATAGCAATAAGAGAAGACAATGATGGTAAGTAGCTTGAATCTGTCAG- -s simRat_chr6.simRat.chr6 332652 106 + 647215 CCTCTGTAATTTCGCTAAATGTCCACAAAAAGACAAGTCAAGAGACGGCAAAACCTTTATAGCAATAAGAGAAGACAATGATGGAAAGTAAATCGAATCCATCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 188741 91 + 294542 TACAGGGATAAAAGGACCCACTCGTGCTCTCTTAAAAATGTGGGACAACTTTGGTTAACCAATCTGATAATGTAGCCTTGGGCGTATGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341159 91 + 636262 TACAGGGATAAAAGGACCCACTCGTGCTCTCTTAAAAATGTGGGACAACTTTGGTTAACCAATCTGATAATGTAGCCTTGGGCGTATGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 332763 91 + 647215 CGCAGGGATAAAGGGACCCACTCCTGATATGTTATAAATGTGTGATAACTGTGGTTAATCAGTGTGATATTGTAGCCTTGGGTGTATGTAA - -a -s mr.mrrefChr5 188832 192 + 294542 AATTGGAACAAAGCATTCATGTTGTTTAGGTGTTGATTTCAACAGAAGATTGTGCACTCTGGGCATTAAAAAAGGCAGTAAGTTAAGCTGGCACATCGGTAAGTTCAAAGTTTGCCACCTTTCCCAATGCAAGATGCAGAGCATCTGAGCCTACCCCCTTCTCTATGTATAATTGTCATGTGGGAGTTAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341251 192 + 636262 AATTGGAACAAAGCATTCATGTTGTTTAGGTGTTGATTTCAACAGAAGATTGTGCACTCTGGGCATTAAAAAAGGCAGTAAGTTAAGCTGGCACATCGGTAAGTTCAAAGTTTGCCACCTTTCCCAATGCAAGATGCAGAGCATCTGAGCCTACCCCCTTCTCTATGTATAATTGTCATGTGGGAGTTAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 332854 192 + 647215 AATTGCAACTAAGCATTTATTTTGTTTAGGTGTTGATATCCACACAAGCCTGTCCACTCCAGTCATTAAAAAAGGCAGTAATTTGAGCTGGCACATCGATAAGTTCAAAATTAGCCATCTTGCACTATGCAAGATGCATAACATCTCAACCTATCCCCTTACCTATGTACAATTGTGGTGTGGGGGTCAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 189024 30 + 294542 CAAAGTTGTTACTCATATTTTCAGACACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341444 30 + 636262 CAAAGTTGTTACTCATATTTTCAGACACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 333046 30 + 647215 CAAAGTTGTTGCTCATATTTTCAGACACAA - -a -s mr.mrrefChr5 189054 266 + 294542 GCCTGGAGTCCTCAATAACCATGGCATAAACAGCAGCTGGAAGGAGGCCTTAGCCCCATTGTGCAGTGAACTGGAGGGGCAAATTGGACTTCAGTGAACAAGCTGGGGGGGGCTTGGCCACCTCTAAGGACCCATCACAAATAGCCACTTGGGGACCGCCTGAATTCCACCCATCACTACTCAATGTCTGCACCGAACAAATTTCTCCAGTTCAGTATGTTTATTTCTCCTTCTATGATTCAACTGTGCGTGTAGTTTGATTGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341479 266 + 636262 GCCTGGAGTCCTCAATAACCATGGCATAAACAGCAGCTGGAAGGAGGCCTTAGCCCCATTGTGCAGTGAACTGGAGGGGCAAATTGGACTTCAGTGAACAAGCTGGGGGGGGCTTGGCCACCTCTAAGGACCCATCACAAATAGCCACTTGGGGACCGCCTGAATTCCACCCATCACTACTCAATGTCTGCACCGAACAAATTTCTCCAGTTCAGTATGTTTATTTCTCCTTCTATGATTCAACTGTGCGTGTAGTTTGATTGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 333076 266 + 647215 GTATGGAGTCCTCTATATCCGTGGCATGAGCCGCAGCTGCAAGGAATCCCTAGCCCCATTGTTCAGCTAACTGGAGTAGCAAATTGGATTTCAGTGAACAAGCTGGGGGGAGCTAGGCTGCCTCTAAGAACACATTGTTAATGACCACTAGGTACCACCCTGAATTGCATCCATTACTATTCAATGTCTGTACCACACCAATTTCTCCAGTTCAGTATGTTTATTTCTATTTGCATGATTCCACTGTGCATGTAGTTTGATGGTGG - -a -s mr.mrrefChr5 189320 52 + 294542 TTCCTGTCGAGGTGGACCCTACATATAAGACTTGGACTCACCTAGGGTCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341746 52 + 636262 TTCCTGTCGAGGTGGACCCTACATATAAGACTTGGACTCACCTAGGGTCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 333342 52 + 647215 TTCCTGTAGTTGAGGACCCTATAAATAAGACCTGGACCCACCCAGGGTCTTT - -a -s mr.mrrefChr5 189372 109 + 294542 ATTGCCCTGTTATATGGACTGTCTGTTTTAAAGTGGATGGTTATGACCAGGGATCTTACTAGACACTCAGGTAAGAATTATATGAGAATAAATTGTGGCATTGCTGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341798 109 + 636262 ATTGCCCTGTTATATGGACTGTCTGTTTTAAAGTGGATGGTTATGACCAGGGATCTTACTAGACACTCAGGTAAGAATTATATGAGAATAAATTGTGGCATTGCTGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 333395 109 + 647215 ATTTCCCCGTTATATGGAATGTCTGTTTTAAAGTGGATGATTATGACCAGGGATCGTAATAGACACTCAAGTAAGAATTATATGAGAATCAATTGTGGTGTTGCTGCTA - -a -s mr.mrrefChr5 189481 58 + 294542 CTGCCTATGCCATTTTTGACAGATATAGCTACAACTGTTTTAACAGGCTAGGGAGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341907 58 + 636262 CTGCCTATGCCATTTTTGACAGATATAGCTACAACTGTTTTAACAGGCTAGGGAGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 333525 58 + 647215 CTCCAAATGCCATTTTTGAAAGATATAGCTCCAACTGTTTTAACAGGCAAGGGAGTAA - -a -s mr.mrrefChr5 189539 55 + 294542 CAGAATTATGCAGAAAGAATTATTGGTTTGCCAGGTGCAGAAAATTGATAACATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341965 55 + 636262 CAGAATTATGCAGAAAGGATTATTGGTTTGCCAGGTGCAGAAAATTGATAACATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 333584 55 + 647215 GAGCATTATGCAGAAAGAATTGTTGGTTTGCCAGGTGCAGAAAATTGATAACATA - -a -s mr.mrrefChr5 189594 124 + 294542 TTGAATAGTATGGTCCAGAGGCAGATAGTGATTCATAACCTTCATGCCTGCCTTTCTCAGCATCCCCAATCTCCCACACCACACAAGGTATATAATACTTGTAAACACTTCTCTGGGTTGTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342020 124 + 636262 TTGAATAGTATCGTCCAGAGGCAGATAGTGATCCATAACCTTCATGCCTGCCTTTCTCAGGGTCCCCAATGCCCCACACCACACAAGGTATATAATACTAGTAAACACTTCTCTGAGTTGTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 333640 119 + 647215 TTAAATAATATGGTCC-----CACATAGTGATTCATTACCTTCATGCCTGCCTTTCCCAGCACTCCCAATCTCACACACCACACAAAGTATATAATGCTTGTAACCACTTCTCTGGGGTGTCTT - -a -s mr.mrrefChr5 189718 43 + 294542 TCAAGGCACAACAGGTAAGTATGAGTGACCAACTTTGCTGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342144 43 + 636262 TCAAGGCACAACAGGTAAGTATGAGTGACCAACTTTGCTGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 333764 43 + 647215 TCAAGGCATAACAGATAAGTATGAGTGACCAACTTTGCTGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 189761 18 + 294542 TTCTTTGTTTTACAGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342187 18 + 636262 TTCTTTGTTTTACAGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 333815 18 + 647215 TTCATGGTTTTACAGTCC - -a -s mr.mrrefChr5 189779 66 + 294542 AGTTGTTAAAGGTGGTCTATGATTGTCCAACCCCCAAAATAACAATATAAGGTAACCCCCAAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342220 66 + 636262 AGTTATTAAAGCTGGTCTATGATTGTCCAACCTCCAAAATAACAATATAAGGTAACCCCCAAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 333833 66 + 647215 AGTTGTTAAAAGTGGTCTATGTCTATCCAACCCCCAAAATAACACTAATAGGTAACCCCCAAAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 189845 24 + 294542 GTCAGTGACAAAACATTCACCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342297 24 + 636262 GTCAGTGACAAAACATTCTCCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 333899 24 + 647215 GTCACTGACAAGACATTCACTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 189869 38 + 294542 ACTTGGAGTAGTAGTGCTTTACTTCCACTGTGAGTGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342321 38 + 636262 ACTTGGACTAGTAGTGCTTTACTTCCACTGTGAGTGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 333924 38 + 647215 GCTTGGAGTAGTCATGCTTTACTTTCACTGTGAATGAC - -a -s mr.mrrefChr5 189907 144 + 294542 TAATGAAGCCCCCCCATGGCATATTAACAACCAGGAAGTGTCATGTACAATATAATCCCTGCAATCTACTGAGGTGTGAGTCTAATGTTGAAGGATCTCTTCATAAAGATAACTTTTACACTGTAAATTGTCTCTATTAAAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342359 144 + 636262 TAATGAAGCCACCCCATGGCATATTGACAACCAGGAAGTGTCATGTACAATATAATCCCTGCAATCTACTGAGGTATGAGTCTAATGTTGAAGGATCTCTTCATGAAAATAACTTTTACACTGTCAATTGTCTCTATTAAAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 333969 132 + 647215 TAATGAAGCCCCCCCATGGCATAATAACAACCGGGAAGTGTCATGCACAAT------------ACCTACTGAGGTGTGAGTCTAATGATGAAGGATCTCTTCATAAAGATAACTTTTACGCTGTAAATTGTCTCTATTAAAGAA - -a -s mr.mrrefChr5 190051 4 + 294542 TCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342506 4 + 636262 TCTA - -a -s mr.mrrefChr5 190055 4 + 294542 GAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342516 4 + 636262 GAGA - -a -s mr.mrrefChr5 190059 86 + 294542 CCTTGTGACCATAGACATTGGACTAATGAAGCTGAAAAAAGGCCAAATGAATCAAGCAAGTAAAAGAGGTTCCTAGTAATAGTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342523 85 + 636262 CCTTGTGACCATAGACATTGGACTAATGAAGCTGAAAAAAGGCCAAAT-AATCAAGCAAGTAAAAGAGGTTCCTAGTAATAGTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 334101 67 + 647215 -------------------GGACTAAGGAAGCTGAAAAAAGGCCAAGTGAATCACGCAAGTGACAGAGGTCCCGAGTAATATTCCA - -a -s mr.mrrefChr5 190145 67 + 294542 CTATAAATAGAAAAATCATAGTTGACAGGATACAGTAGATGTCAATTGATATTATATGCTGTATCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342608 67 + 636262 CTATAAATAGAAAAATCATAGTTAACAGGATACAGCAGATGTCAATTCATATTATATGCTGTATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 334173 67 + 647215 CTATAAATAGAAAAATCATAGTTGACAGAATACAATAGATGTCAATTGATATTACATTCTGTATCTG - -a -s mr.mrrefChr5 190212 27 + 294542 ATAATTAGACTTTCGTTGATCACAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342675 22 + 636262 -----TAGACTTTCGTTGATCACAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 334241 13 + 647215 ATAATTAAACTTT-------------- - -a -s mr.mrrefChr5 190239 267 + 294542 TGGGGCCATGGTCTGAAAGCTGGCCTATCAGTGTCTTAGCCCCCCAGATATTGTATACAACTAATCAGAGTGATCACTACAGGACATTAGCTTTGAGTCAAAGCAGTCCTCTGATGTTAGGCCATTGTGACTTGAGCTGCATTACATTCATCTCATTAAATCATGGGGTTCTGACACTTGTTATTGTTGACACATTATTTaaactctatgcacatgcaatacacctcaaagggtgaaagtctcaggaatttaaggtgttcagagcaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342706 253 + 636262 TGGGGCCATGGCCTGAAAGCTGGCCT--------------CCCCCAGATATTGTATACAACTAGTCAGAGTGATCACTACAGGACATTATCTTTGAGCCAAAGCAGTCCTCTGATGTTAGGCCATTGTGACTTGAGCTGCATTACATTCATCTCATTAAATCATGGGGTTCTGACACTTGTTATTGTTGACACATTATTTaaactctatgcacatgcaatacacctcaaagggtgaaagtctcaggaatttaaggtgttcagagcaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 334254 245 + 647215 -----CCATGGTCTGCGAGCTGGCCTATCAGTGTCTTAGCCCCCAAGATATTGTATACAATTAACCAGAGTGATCACTACAGGATATTAGTTTTGAGTCAAAGCAATGCCCTT-TGCTAGCAGAT---------------ATTTCATTCATCTCATT-AATCATGGGGTGCTGACACTTGTTATTGTTGACACATTATTTaaactccatgctcatgcaatacacctaagggggtgtaaatttcaggaattttaggtgatctgagcag - -a -s mr.mrrefChr5 190506 36 + 294542 ggtagcgaaataaatttgggatatgtacaccaacca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342963 36 + 636262 ggtagcgaaataaatttgggatatgtacaccaacca -s simRat_chr6.simRat.chr6 334499 36 + 647215 cgtaggaaaatgattttgggatatgtacaccaacca - -a -s mr.mrrefChr5 190542 111 + 294542 cctatcgagctctttatgaaggATCGAACCAACATGTGACCCAAACTTAGTAATTCACCTTCCACCTTACTAGATATAATTGACATGTAACAAGGGCCTACACTAAAATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343000 79 + 636262 cctatcgagctctttaTGAAGGATCGAACCAACATGTGACCCAAATTTAGTAATTCACCTT-------ACTAGATAT-------------------------CTAAAATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 334535 111 + 647215 cttatcgagctctttatgtagaATCAGGCCAGCATGTGACCCAAACTTAGTAATCCACCTTCCACCTTACTTGATATAATTGACATGTAACAAGGGCCTACACTAAAATGA - -a -s mr.mrrefChr5 190653 54 + 294542 GTTATCCCTACCAAGCCTGCACGTGAGCCGGCCACTGATGACATTGGCAAGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343080 52 + 636262 GTTATCCCTACCAAGCCCACTCGTG-GCCGGCCACTGATGACATTGGCAAGGT- -s simRat_chr6.simRat.chr6 334646 54 + 647215 GTTATCCCTACCAAGCCTGCACATGAGCCGGCCACTGATGACATTGGCAAGGTT - -a -s mr.mrrefChr5 190707 221 + 294542 CAGGTGTTTAAGCAAGGACGATCACTCTCAATTATGAGACCAAAAGTTGAGTCTTAATTTTTGTGGAGGGAGATTCAGCCATCTCTGAAATGAAAAGAGGTCTCACACTACTGATTACAACCTTAGAGTAGTGTAATGCCCAGGTGAATGCTTAGTTTAAACACTCTGGTTTATATCAAAAAGCGGTGCAAGTGGCACTGTAAGTCAATAAACATACACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343132 221 + 636262 CAGGTGTTTAAGTAAGGACACTTACTCTCAATTATGAGACCAAAAGTTGGGTCTTAATTTTTGTGGAGGGAGATTCAGCCATATCTGAAATGAAAAGAGGTCTCACACTACTGATAACAACCTTAGAGTAGTGTAATGCCCAGGTGAATGCTTATTTTGAACATTCTGGTTTATATCTAAAAGTGGTGTAAGTGGCACTGTGAATTGATAAACATACACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 334705 221 + 647215 CAGGTGTTTGAGCAAGGAGGATCACTCTCAATTATGAGACCAAAAGTTAAGGCTCAATTTTTGTGGAGGGAGATTAAGCTATCTCTGAAATGAAAAGAAGCCTCACACTTCTGATTACACCCTTAGACTACTGTAATGCCCAGGTGAGTGAGTAGTTTAAGCACTCTGGTTTATAACAAAAAGCGGTGCAAATGGCACTGCAAGTCAATAAACATATACCA - -a -s mr.mrrefChr5 190928 8 + 294542 AATGGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343360 8 + 636262 AATGGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 334926 8 + 647215 AATGGGTT - -a -s mr.mrrefChr5 190936 119 + 294542 AATCAACCTCATATTCATTGTCATTTCTTACTTGCCAATTAAGGTTGACACTTGGTGGCACACTGCAAGTAAGGATACCAACCTTAGAAGCCAAAACCAACCTACAAGTACCAGAGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343412 119 + 636262 AATCAACCTCATATTCATTGTCATTTCTTACTTGCCAATTAAGGTTGACACTTGGTGGCACACTGCAAGTAAGGATACCAACCTTAGAAGCCAAAACCAACCTACAAGTACCAGAGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 334934 119 + 647215 AATCAACCTCATATTCACTGTCATTACTTACTGGTCAATTAAGGCTGACAATTGGTGGCACACTGCAAGCAAAGATATCAACCTTAGAGGCCAAAACTGACTTACAAGTACCAGAGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 191055 408 + 294542 GTAAAAGAACTGTTACAGTGGCTTAATACTTTTTTAGATGGTTATTTTACATATGGCATTATCTACCGTGGTGGACTAGTTTCTCCAAGAAACATTTTAGTTATAATCTAGTCAAGCTACAATTAAACTCAATGGTGTAAAAAAGCCTTTACTAATGAACTAAACCCTAGACAGGTTTCATTACATGAGGTGGTGGACATACCGGCCACTCAGATTATGGAGATTAAAATGGGTAACAACAAATCGCTAGATTGACTTTCTCCTGGACACAAAGTACTTATGTTAATTTCCCAGGCTCAAATGCTAAGGTCCCTCTTTGTAGATCTGACATGGATTTTTAAGGCAGGGTGCTGGGTATTCAGGGTTTAATATTGTTAATACTGGTGGGGCCTGTATGTGCATTAAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343531 408 + 636262 GTAAAAGAACTGTTACAGTGGCTTAATATTTTTTTAGATGGTTATTTTACATATGGCATTATCTTCTGTGGTGGACTAGATTCTCCAAGAAACATTTTGGTTACGATCTGGTCAAGCTACAATTAAACTCATTGGTGTAAAAAAGCCTTTACTAATGAAGTAAGCCCTGGACAGGTTTCGTTACATGAGGTAGTGGACATGCTGGCCACTCAGATTATGGAGATTGAAGTGGGTAATAATGAATCACTAGATTGACTTTCTCCTGGACACAAAGTACTTATGTTGATTTTCCAGGCTAAAGTACTAAGGTCCCTCTTTGTAGATCTGACATGGATTTTTAAGGTAGGGTGCTGGTTATTCAGGGTTTAATATTGTCAATACTGATGGGACCTGTATGTACATTAAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 335055 393 + 647215 GTAAAAGACCTGTTACAGCAGCTTAATACTTTTTTATATGGTTATTTTACATAT------AACTACCGTGGTGGTCTAGTTTCTCCATGGAACGTTTTAGTTATAATCTAGTCAAGCTACAATTAAACTATACAGTGTAAAAAACCATTTACTAACGAACTAAACCCTAAACAGGTTTCATAACATGAGGTGGAGGACATACCAGCCCCTCAGAATATGGACAATAAGATGACTAACAACAAATTGCTAGATTGACTTTCTCCTGGTCACAAACTACTTATGTTAATTTCCC---CTCCAATGCTAAGGTCCCTCTTTGTAGATCTGACCTGAATTTTTAAGACAGGCTGCTGGGTATTCAGGATTTAATATTGTTGATATTGGTGGGGCCTGTATGTGCAT------ - -a -s mr.mrrefChr5 191463 97 + 294542 TAATGTGGCGGGGTCCTTGTACTAAGGCTGTTAGGTCTCATACTGTAACAGCTAAAATTGGCCAGATTTTCTATTATAAAGCTAATGCTGTAACTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343940 97 + 636262 TAATGTGGCGGGGTCCTTGTACTAAGGCTGTTAGGTCTCGTACTGTAACGGCTAAAATTGGCCAGATTTTCTATTATAAAGCTAATGCTGTAACTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 335448 82 + 647215 ---------------CTTGTACTATGGCCATTAGGTCTCATACTGTAACAGCTAAAATTGGCCAGATTTTTTATTATAAAGCTAATGTTTTAACTTC - -a -s mr.mrrefChr5 191560 128 + 294542 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACTGTGGCCCTTGATAATTATGTGGTAAATGGGATAATACAGGTTAAGATGCATTCCATGGTAGTGATCAGAGCTACAAATACTAAACCAGAATTTTTTGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344037 121 + 636262 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACTGTGGCCCTTGATAATTCTGTGGTAAATGGGATAATACAGGTTAAGATGCA-------GTAGTGATCTGAGCTACGAATACTAAACCAGAATGTTTTGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 335535 128 + 647215 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACCGTGGCGCTTGATAACTATGTGGTAAATGTGATAATACAGGTTAAGATGCATTCCATGGTAGTGATCAGAGCTACAAATACTAAACCAGAATTTTTTGATT - -a -s mr.mrrefChr5 191688 135 + 294542 ATTTGTTTCCTGCTACCTACCATTAGTGCATATCAGCAGCCCTCAAACTACCCTGACCTTTGTGTATCGCACAGTCAACCCTTTGGCTTCTTTCTATAGCAATTTCAGAAAGTGTTATTCAATGTACTAATCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344159 135 + 636262 ATTTGTTTCCTGCTACCTACCATTAGTGCATATCAGCAGCCCTCAAACTACCGTGACCTTTGTGTATCGCACAGTCAACCCTTTGGCTTCTTTCTATAGCAATTTCAGAAAGTGTTATTCAATGTACTGATCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 335663 129 + 647215 ATTTGTTTCCTGGTACCTACTATTAGTGCATATCGG------TCAAACTACCCTGACCTTTATGTACCACACAGTCAACCCTTCGGACTCTTTCTAGAACAATTTCAGAAATAGTTATTCAATGTACTAATCCTC - -a -s mr.mrrefChr5 191823 20 + 294542 ATCTCAGGCAGCATGAATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344356 20 + 636262 ATCCCAGGCAGCATGAATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 335792 20 + 647215 ATCTCAGGCAACACGAATTC - -a -s mr.mrrefChr5 191843 47 + 294542 GTCACTCTTGGTTACAATGTTTTATACTGATTTTAGTGTGTAACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344380 47 + 636262 GTCACTCTTGGTTACAATGTTTTATACTGATTTTGGTGTGTAACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 335812 47 + 647215 GCCACTCTTGGTTACAATGTTTCATGCTCATTTTAGTGTGTAATGTA - -a -s mr.mrrefChr5 191890 203 + 294542 TTAGATCATACTCTTAACAAGCTTTCCCATGACTTGTGTGTTGTGTGATATGCCCCATCTATGGTCAAGTTCAAGCAAGCTGCCTGTGGGATCTATACCAAGCATTGCCACCGTGGGTCTCTATATGCATCTTGCATGTGCAACATAACATGGGACTACATACAAGTACATAAAATTGGTATCTCTGAGGTATTCCATGCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344427 203 + 636262 TTAGATCATACTCTTAACAAACTTCCCCATGACCTGTGTGTTGTGTGAGGCGCCCCATGTATGGAGAAATTCAAGCAATCTGCCTATGGGATCTATACCAAGCATTGCCACCGTGGGTCTCTATATGCATTTTGCATGTGCAACATAACATGGCACCATATACAAGTACGTAAAATTGCTATCTCTGAGGTATTCCATGCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 335864 203 + 647215 TCAATTCATACTCTTAACAAGCTTTCCCATGACTTGTGTGTTGTGTGATATGCCCCATCTATGGTCAAGACCAAGCAAGCTGCCTGTGGGATCTATACCAAGCACTGCTGCCGTGGGTCTCTATACACATCTTGCATGTGCACCATAACATGGGACTCCATACAAGTACATAAAATTGGTATCTCTGAGGTATTACAGGTAGG - -a -s mr.mrrefChr5 192093 42 + 294542 ACTCACTGGAGTTAAAGACCAAAGGAGCCAGGAATGGCACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344631 42 + 636262 ACTCACTGGATTTAAAGACCAAAGGAACCAGGAATAGCACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 336067 42 + 647215 ACTTTCTGGAGTTAAAAACCAAATGAGCAAGGAATGGCACGC - -a -s mr.mrrefChr5 192135 279 + 294542 TAGCTTTCCATACACTACTGGATTATTGTTCAGAAAGCAGGGTATCTCAAGGAAAACCTAGTAGCACACCTTTTCTATGTGTTCACCAAATGTGAATAGATCATGGCAATCAGAAGTCAAAATGTATGGACCAGTTCTTGACACATGACCAGGGATACAATCATTCTGCATGCAGAACATCTGGTGAGCTAAGGGCCTCCTGTATGAACAGTCCTTTGCTGGTTAGGATAGCATGGTTCACTCCCATATGAGGACATGCCAGGATTCATCAAAGATCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344675 279 + 636262 TAGCTTTCTATACAGTACTGGATTATTGTTCAGGAAGCAGGGTATCTCAAGGGAAACCTAGTAGCACACCTTTTCTACGCATTGACCAAATATGAACAAATCATGGCATTCAGAAGTCAAAGTGTATGGGCCAGTTCTTGACACATGACCAGGGATACACTCATTCTGCGTGCAGAAGATCTGGTGAGCTAAAGGCCTCATGTATGAACGGTCCTTTGCTGGTTAGGATAGCATGGTTCACTCCTATATTAGGACATGCCAGGATTCATCAAGGATCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 336109 279 + 647215 TAGCCTTCCATACACTACTAGGCTATTGTTCAGAAAACAGGGTATCTCGAGGAAAACCTCGTAGTACAACTTTTCTATGTGCTCACCAAATGTGGATAGATCATGGCAATCAGAAGTCGAAATGTATGGATCAGTTCTTGACACATGGCCAGGGATACAATCATTCTGCATGCAGAACATCTGGTGAGCTAAGGGCCTCCTGTATGAACAATCCTTTGCTGGTTAGGACAGCATGGTTCACTCCCATATGAGGACATACCAGGATTCATCACAGATCCT - -a -s mr.mrrefChr5 192414 128 + 294542 AAGGAACTTTTATAATGCCAATTTAATTCAACCAGTTCCAGATGCAATCATGCCCCATGGGTGTTTTGGGTCAGTCTGAGGCCAGAATATATCAAACCTGTCTGGGTTCTATAACACTTCCATCATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344954 128 + 636262 AAGGAACTTTTATAATGCCAATTTAATTCAACCAGTTCCAGATGTAATTGTGCCCCATGGGTGTTTTGGGCCAGTCTGGGGCCAGAATATATCAAACCTGTCTGAGTTCTATAACACTTCTATCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 336395 128 + 647215 AAGGAACTCTCATATTGCCAATATAGTCCAACCAGTTCTAAATGCAATCATGCCCCATGGGCATTTTGGGTCAGTGTGAGGCCAGAATATATCAATCCCATGTGGATCCTAGAACACTTCCCTCGCAT - -a -s mr.mrrefChr5 192542 272 + 294542 GCTGGAGTATGGGAATAATAATGGGATCTAGTTGGATAGAGTATGCTTATATTACTATTTGGGTCCTGCATTAGTTTAGCCACCACCATGAATGATAAGTAGTGGTGGACCCAGGGACTTCTGTGGCTGGCAGGCCCAGTGTAAAGTGCCTATGCCTAGGATCCGCTCCCAAAGGCTCGCAAGTACCTCAAATGTACTAGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGACATATCCCCTTACACTTATACAATTTTTCGGTGCATCAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345087 270 + 636262 GCTGGAGTATGGGGATAATAATTGGACCTAGTTGGATAGAGTATGCTTATGTTGCT-TTTGGGTCCTGCACTAGTTTA-CCACCACCATGAATGATAAGTGGTGGTGGACCCAGGGACTTCTGTGGCTGACAGGCCCAGTGTAAAGTGCCTATGCCTAGGATCCACTACCAAAGGCTCGTAAGTACCTCAAATGTACTAGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGAGATATCCCCTTATACTTATACAATTTTTCGGTGCATCAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 336523 268 + 647215 GTTGGAGAATGGGAATAATAATGGGATCTAGTTGGATAGTGTGTGCTTATATTACTATTTGGGTCCTGCATTAGTTTAGCCGCCACAATTATTGATAAACATTGATGGACCCGGGGACTTCTGTGGCTGGTAGGCCCAGTGCAAAGTGCCTATGTCTGAGATCTGCTCCCTGAGGCTCGCAAGTACCTTAAATGTACTGGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGACACATCCCTTTACACTTACAAAATTTTTTGGTGTATC---- - -a -s mr.mrrefChr5 192814 185 + 294542 TCCTAAAATCCATTGATTCTCAGACATGGTGGATATGGAGCTCAGTAGATTAGAGGCCTGACTGGAGGTGACAGCTTCATAATGTGAAGAAGTCTGAGGCATAATGGCAGATCCCTGTATTTTTATTAGAAAAAATGGAAACAAGGCTCACGAAAGAACAGGGCTAACTTCGCTCTAGGCATACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345358 181 + 636262 TCCTAAAATCCATTGATTCTCAGACATTGTGGAGATCGAATTCAGT----TAGAGGCCTGACTGGAGGTGACAGGTTCATAATGTAAAGAAGTCTGAGGCATAATGGCAGATCCCTGTATTTTTATTAGAAAAAATGGAAATGACGCTAACGAAAGAACAGGGCTAACTTCGCTCTAGGCATACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 336791 183 + 647215 TCCTAGAATCCATTGATTCTCAGACATGGTGTATATGGAGCTCAGTAGATTAGAGGCCTGACTGGAGGCAACAGCTGCATAATGTGAAGGAGTCTGAGACAT--TGGCAGATCCCTGTATTTTTGTTAAAAAAAATGGAATCAAGGCTCACAAAAGAACAGGGCTAACTTGGCTGTAGGCATACT - -a -s mr.mrrefChr5 192999 150 + 294542 AGGCTAACTTGGCTGTAGTCATACTTTCATAGATCAGACATAGACATCAAGTGGAAACTGATGCTTGAGGGCCCTTACTGCAGGAGCTGGATGGTAGAGAGGATAAGGCCACCTTTGTTATGATTTTTCACTGGGGTCATTTGTAACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345539 150 + 636262 AGGCTAACTTGGCTGTAGGCGTACTTTCATAGATCAGACATAGAGATCAAGTGGAAACTGATGCTTGAGGGCCCTTACTCCAGGAGCTGGATGGTAGAGAGGATAAGGCCACCTTTGTTATGATTTTTCACTGGGGTCATTTGTAACATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 336979 150 + 647215 AGGCTAACTTGGATGTAGTCATACTTTCATAGATCAGACAGTGACATCAACTTGAAACTTATGCTTGGGAGCCCTTACTGCAGGAGCTGGATGGTAGAGAGGATAATGCCATCCTTGTTATGATTTTTCACTGGGGTCACTTGTAACATT - -a -s mr.mrrefChr5 193149 9 + 294542 GAACAGCCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345689 9 + 636262 GAACAGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 337138 9 + 647215 GAAAAGACA - -a -s mr.mrrefChr5 193158 147 + 294542 ATGAATCCTGGAAAGGCTAATGATGCTGGATAGTGTATGCTTGGATTTGGTTGTGAATGTCTGCCATGCTTCAACATGAGTCTTTCCACTTTTGCATTGGTAAAGATAATAAGTTTTAATACAAAACTCATTGAAGATGTAATCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345698 146 + 636262 ATGAATCCTGGAAAGGCTAATGATGCTGGATAGTATATGCTTGGATTTGGTTGTGAATGTCTGCCATGCTTCAACATAAGTCTTTCCACTTTTG-ATTGGTAAAGATAATAAGTTTTAATACAAAACTCATTGAAGATGTAATCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 337149 147 + 647215 ATGAATCCTGGAAAGGTTAATGATGCTGGATAGTGTATGCTTTGATTTGGTTGTGCATTTCTGCCTTGCTTCAACATGAGTCTTTTCGGTTTTGCATTAGTGAAGGTAATAAGTTTTAATATAGAACTCATTGAGGGTATAATCGGT - -a -s mr.mrrefChr5 193305 29 + 294542 GTCACAAGGTTAGGTGAAGCTTAGTAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345844 29 + 636262 GTCACAAGGTTAGGTGAAGCTTAGTAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 337297 29 + 647215 GTCACAAGATTAGGCAAAGCCTAGTAACA - -a -s mr.mrrefChr5 193334 17 + 294542 CTTCCCCCTAAAACTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345873 17 + 636262 CTTCCCCCTAAAACTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 337333 17 + 647215 CTTCCCTGCAAGACTGT - -a -s mr.mrrefChr5 193351 203 + 294542 GATGTGCTAACCCATTGGTGGCTAGATTCCACAACATAGAGACGCTACAATTGTGTTATGGACAAACATCAGGCAGGTCGGCTGTGCACTTGAGAGTTTTCATGTTTAATTGCTTCAATTTTGGAATTTTGTTTTCCTGATAACTTTCAAGGCACAAATACCAACCCAGCCAAAGATAATAGCGTTTGGTGGTTCAACTTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345890 203 + 636262 GATGTGCTAACCCATTGGTGGCTAGACTCCACAACATAGAGACGCTGCAATCATGTTATGGACAAACATCAGGCAGGTCGGCTGTGCACTTGAGAGTTTTCATGTTTAATTGCTTCAATTTTGGAATTTTGTTTTCCTGATAACTTTCAAGGCACAAATACCAACCCAGCCAAAGAAAATAGCGTTTGGTGGTTCAAGTTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 337356 152 + 647215 AATACACTGACCCATTGGTGGCTAGATTTCACAACAGAGAGACACTACAGTTGTCTTATGGACACACATCAGGCA---------------------------------------------------TTTTGTTTTCCTGATAACTTTCAAGGAACAAATACCAACCCAGACAAAGATGATAGCGTTTGGTGGTTCAACTTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 193554 45 + 294542 TGATTGTTACCTGTTCACCTGCATACTTGATATTACAGTTTTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346095 40 + 636262 TGATT-----CTGTTCACCTGCATACTTGATATTACAGTTTTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 337611 40 + 647215 -----GTTACCTGTTCACCTGCATACTTGATATTACAGTTTTACA - -a -s mr.mrrefChr5 193599 101 + 294542 TGCCATCTGAAGAGGGATGGAATTATACACACCATCTTAGCTGGGGAGTGTCATAAGGTTCTGAAAGGCAGATGTTCCTACACTCAAAAGAAGTGCAGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346137 101 + 636262 TGCCATCTGAAGAGGGATGGAATTTTGCACACCATCTTAGCTGGGGAGTGTCATAAGGTTCTGAAACGCAGATGTTCCTGCACTCAAAGGAAGTGCAGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 337651 95 + 647215 TGCTGTCTGGAGAGGGGTGGAATTATACACACCATCTTAGCT------TGTCATAAGGTTCTGAAGGGCAGAAGCCCCTACGCTCAAAAGAAGTGCAGAAG - -a -s mr.mrrefChr5 193700 180 + 294542 CTATTATCAAGGGCCAAAAATTTGCCTACATTCTAGTAGTGAAGCCCATATGGTAATCTAATGTAGGGCTATATTACCTGGATCTATCCCAACTTTTATCATGCTTCAAAATTTCAGAGCTACATTTATGGACACCCTATGGGATGCATCAATCAATTAAAGACACAAAAGTAAGATGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346238 180 + 636262 CCATTATCAAGGGCCATAAATTTGCCTACATTCTAATAGTGAAGCCCATATGGTAATCTAATGTAGGGCTATATTACCTGGATCTATCCCAACTTTTATCATGCTTCAAAATTTCAGAGCTACATTTATGGACACCCTATGGGATGCGTCAATCAATTAAAGACACAAAAGTAAGATGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 337749 179 + 647215 ATACTATCAAGGGACAAAAATTTGTCTACATTCTCGTAGT-AAGCCCATGTGGTAATCTAATATAGAGGTAGACTACCGGGCTCTATCCCAACTTGTATCACGCTTCAAAATTCCAGAGCTACATTGATTGACACCCTATGGGATGTATCGATCAATTAAAGACGCGAAAGTAAGATGCG - -a -s mr.mrrefChr5 193880 94 + 294542 GATCTAGTGAGTTATGTTGCCAATTAAGCATATTGAAGTAGCATCAGTAATAACAGGTGTCAATCTGCATCTATTAACAGGGGTTGTAACTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346418 94 + 636262 GATCTAGTGAGTTATGTTGCCAATCAAGCATATTGAAATAGCATCAGTAATAACAGATATCAATCTGCATCTATTAACAGGGGTTGTAACTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 337930 82 + 647215 GATTTAGTGAGTTATGTTGCCAGTTGAGCATATTAAAGTAGCATC----ATGACAGGTG------TGGATCTATCAACAGGGGT--TCACTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 193974 289 + 294542 AATTGAACTGAAGTGGAAGATTTCGGAAATGTAATGAACATATTACTGACCATCAAAACCCAGCTTTCTGAAGACATTGATAAACTTCTAGTTAAAGCTTGTAAGAACAAGGCAAAGACACATGATTGTTAAAATATTACATGTAACATCAGAAATTAGACTAGATCCAAAATACTTGAGAAAAGGATGTAGTATACCTCACCAAGTCTCATGTTTTATATGATGACATTACATCAAGGTGATAACAGAAGCAGCAAGCCCAAGTCATTTGCTTAGCTGGTTTAGGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346512 281 + 636262 AATTGAACGGAAGTGGAAGATTTCGGAAATGTAATGAACATATTACTGACCATCAAAAACCAGCTTTCTGAAGACATTGATAAACTTCTAGTTAAACCTTGTAAG---AAGGCAAAGACATGTGATTGTTAAAATATTACATGTGATATCAGAAATTAGGTTAGATCCAAAATACTTGAGAAAAGGATGTAGTATACCTCATCAAGTCTCATGTTTTATATGATG-----AGATCAAGGTGATAACAGAAGCAGCAAGCCCAAGTCATTTGCTTAGCTGGTTTAGGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 338023 286 + 647215 AATTGAACTGAACTGGAAGA-TTCAGAAATGTAATGAACATATCACTGACCATCAAAACCTAGCTTTC--AAGACATTGATATACTTCTAGTTACAGCTTATAAAAACAAAGCAAAGACACATGATTGTCAAAATATCACATGTAACATCAGAAATTAGACTAGATCCAATATACTCGAGAAAAGGATGTAGTATACCTCACCAATCCTCATGTTTTACATAATGACATTACATCAAGGCGATAACAGCGACAGCGAGTCCAAGTTATTTGCTTAACTGACTTGAGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 194263 46 + 294542 GGGCTCTTGAATAATACTTAACTCACTGACCAAAAACAAAAAACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346798 46 + 636262 GGGCTCTTGAATAATACTTAACTCACTGACCAAAAACAAAAAACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 338309 46 + 647215 TGACTCTTGATTAATACTTAACTCACTGACCCATTAAAAATATCCA - -a -s mr.mrrefChr5 194309 24 + 294542 TCCAGGCAGCACACATACACTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346844 24 + 636262 TCCAGGCAGCACACATACACTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 338371 24 + 647215 TGCAGAGAGTATACACATAATCTT - -a -s mr.mrrefChr5 194333 7 + 294542 GAGTCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346872 7 + 636262 GAGTCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 338395 7 + 647215 GAGTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 194340 8 + 294542 GTACCCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346880 8 + 636262 GTACCCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 338402 8 + 647215 GTATCGAG - -a -s mr.mrrefChr5 194348 11 + 294542 GGACTCACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346888 11 + 636262 GGACTCACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 338411 11 + 647215 AGACCCTGATA - -a -s mr.mrrefChr5 194359 28 + 294542 ATTCATATGCGCAACATAATGAATATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346903 28 + 636262 ATTCATATGCGCAACATAATGAATATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 338422 28 + 647215 ACTCAAATAGTCCAGGTAACACACATAA - -a -s mr.mrrefChr5 194387 39 + 294542 CCATGGTGGCCCTATAAAAATGGTCTAAAGTGAAGTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346933 39 + 636262 CCATGGTGGCCCTATAAAAATGGTCTAAAGTGAAGTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 338450 39 + 647215 CCATGGTGGCCCTATAAAAGGGGGTCCAAGTGAAGTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 194426 9 + 294542 ACCCCTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346972 9 + 636262 ACCCCTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 338491 9 + 647215 AACCCATTG - -a -s mr.mrrefChr5 194435 38 + 294542 TGCTGGGTTATTTATGGGGGACAAGACCCTGGTGTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347143 38 + 636262 TGCTGGGTTATTTATGGGGGACAAGACCCTGGTGTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 338500 38 + 647215 TGCTGCGTTATTTATGGGGAACAAGACGCTTGTAGGCA - -a -s mr.mrrefChr5 194473 175 + 294542 GAAAACATTGAAATAACCGCATTGATCACTGCCAAACTCCATTTCAAAGGGCTATTGGAAAACCGTTCAATCGGAAAAGGTGGTTTTAAGTAATGGTGATGCAGGATTACTGGGATGAATCCAGGTGCTGGGCAGTAGAAAAGTCACTATCTTTAAAAAATAGTAAAAACAGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347181 175 + 636262 GAAAACATTGAAATAACCGCATTGATCACTGCCAAACTCCATTTCAAAGGGCTATTGGAAAACCGTTCAATCGGAAAAGGTGGTTTTAAGTAATGGTGATGCAGGATTACTGGGATGAATCCAGGTGCTGGGCAGTAGAAAAGTCACTATCTTTAAAAAATAGTAAAAACAGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 338543 175 + 647215 GAAAACATTGAAATAACCACATTGACCAATACCAAACTCCATTTCGAGGGGCTATTGGAAAACTGTTAGATCAGAAAAGGATATTTTTAGTAATGGAGATGTAGGATCACTGAGATGAATCCAGCTGCAAGGCAGTAAAAAAGCCACTATCTTTGAAAAATAGTAAAAATGGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 194648 87 + 294542 CTTCCAGAAAGTCACTGGCTGATAACTTGGGAAACATCTTTGCCATGTACTGGGCCATTAGGTCGGGCTCATTCACAAGCACATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347360 87 + 636262 CTTCCAGAAAGTCACTGGCTGATAACTTGGGAAACATCTTTGCCATGTACTGGGCCATTAGGTCGGGCTCATTCACAAGCACATTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 338718 87 + 647215 CTTCCAGAAAGTCATTGGTTGATGACTGGGGAAACATCTTTGCCAAGTACTGGGCCATTAGATTGCGCTCATCCACAAGCACATTAA - -a -s mr.mrrefChr5 194735 32 + 294542 AAAAATTCCTAGTCAGAGTACTAAATTAAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347447 32 + 636262 AAAAATTCCTAGTCAGAGTACTAAATTAAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 338830 32 + 647215 AAAAATTCCTAGTCATACTACTAAATTAAGAT - -a -s mr.mrrefChr5 194767 63 + 294542 GAGAATTATAATGCGGTGTCCTGCTTGTAGGTCGTCTAAGAGTATAGCTAACAATGTTCTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347479 63 + 636262 GAGAATTATAATGCGGTGTCCTGCTTGTAGGTCGTCTAAGAGTATAGCTAACAATGTTCTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 338883 63 + 647215 AAGAACTATAACGTGGTGGCCTGTTAGTAGGTTGTTTAAGAGCACAGCTAAAGATGTTCTACT - -a -s mr.mrrefChr5 194830 82 + 294542 GTGGTTGGGTTTTCCCTCAAGCATACCACTAGCATGAACTCAATTTTGGATACCAAAATTATTCCAAGGTCCTTTCTAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347542 81 + 636262 GTGGTTGGGTTTTCC-TGAAGCATACTACTAGCACGAACCCAATTGCGGATACCAAAATTATTCCAAGGTCCTTTCTAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 338954 82 + 647215 GTGGTTGAGTTTTCCCTCAAACATACCACTAGCATTAACTCATTTTTGGGTACCAAAATCATTCCAAGGTCCTTTCTAGCAA - -a -s mr.mrrefChr5 194912 205 + 294542 GCTTCAACCATTGTCTCACTACCTTTGTACTTAGGGACAAACTTGGTGTAACTTCTGGTGCAACTTCATTGGTGAAGTTTCTCATATTCCTGTGTGTGTAACCACATATTTAAAATCAAACTATAAAGAAACAGCTCTACATTCACGCTCTTCCGTGGTAGATTAGTTAACTAGCTGTCACCAGTAATTAATTTTAAACTAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347623 205 + 636262 GCTTAAACTATTGTCTCACTACCTTTGTACTTAGGGACAAACTTGATGTGACTTCTGGTGCAACTTCATCAGTGAAGTTCCTCATATTCCTGTGTGTGTAACCACATATTTAAAATCAAACTATAAAGAAACAGCTCTACATTCACCCTCTTCCAGGGTAGTTTAGTTAACTAGCTGTCACCAGTAATTAATTTTAAACTAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 339037 205 + 647215 GCTTCAACCATTGTCTCACCACCTTTGTACTTAGGGACAAATTTGGTGCAACTTCTGATGCAACTTCACTGGTGAGGTTTCTTATATTCCGTTATGTGTAACCACACATCTAAAATCAAACTATGAAAAAACAGCACTACATGCATGCTCATCTGTGTTAGATTAATTAACTAGCTGTCACTAGTAATTAATTTTAAACTAGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 195117 236 + 294542 CTAATAATTCAAGAGAGCTAGGAAGTCATAATGTTTAGTTGCATATAGATCGTAACGTTCTGGTTTACTCTTTAGATGGCTGGAACTGTTTTTTGCTGGTATATTTCAGGTACATATGGTATACCAGCCATTTGTGTATTGGGTATAACAGACATCAAGGGCATGGTGTTAGGATCAACTGGACATTATAAATTCTATCAGGGCACAGCAGCGTTTACAACTGGTCTGGGCCTGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347828 235 + 636262 CTAATAATTCAAGAGAGCTAGGAAGTC-TAATGTTTAGTTGCATATAGATCGTAACGTTCTGGTTTACTCTTTAGATGGCTGGAACTGTTTTTTGTTGGTATATTTCAGGTACATATGGTATACCAGCCATTTGTGTATTGGGTATAACAGACATCAAGGGCATGGTGTTAGGATCAACTGGACATTATAAATTCTATCAGGGCACAGCAGCGTTTACAACTGGTCTGGGCCTGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 339250 233 + 647215 TTAATAATTCAAGAG--CCAGGAAGTCATAATGTTTAGTGGGATATAGATCATAACATTTTGGTTTACTCTTTAGATGACTGGAACTGTTTTTTGCTGGTTAAGTTCAGGTACATATGCTATACCAACCATTTGTGTATTGGTTATAACAGACATCAAGGGCATAGTGTTAGGA-CAACTGGACATTATAGATTCTATACGGGCATTACAATGTGTACAACAGGTCTGGGCCTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 195353 258 + 294542 CAGCATTACCAATGTTATGATAATAACTCAGGATTGAGCCTGGTGCCTTTGCTACTGATGGACAAACAGGTGCGACTTCTGGTGCACCTACTATGGTAATCATTTTGTGTTGCTTTCAGTATAACGATGATGACACAACTCTCAGTTCAGGTTCCTTGGTGGTAGTTTAGTCAACTAACCCTGTTATTCACCAATTGATGTATAATGATGCAAGAAAGTGGTTGTAATGCTCAGGCATTGCTAGGATACAAGAGAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348063 258 + 636262 CAGCATTACCAATGTTATGATAATAACTCAGGATTGAGCCTGGTGCCTTTGCTACTGATGGACAAACAGGTGCGACTTCTGGTGCACTTACTGTGGTAATCATTTTGTGTTGCTTTCAGTATAACGATGATAACATAACTCTCAGTTCCAGTTCCTTCGTGGTAGTCTAGTCTACTAACCCGGTTATTCACCAATTGATGTATAATGATGCAAGAAAGTGGTTGTAATGCTCAGGCATTGCTGGGATACAAGAGAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 339490 243 + 647215 CAGCATTACCAGTGTTATGATAAGAACCCAGGATTAAGTCTGGTGCCTTTTCTACTGATGGACAAACACGTGCAACTTCTGGGGCACCTACTATGGTAATCCT------TTGTTATCAGTATAAATATGATGACACAACTCTGAGTTCAGGTCCCTTGGTGGTAGCTTAGTCAACTAACCCTGTTATT---------ATGTATATCGATGGAAAAAAGAAGTTGTAGTGCTCAGGCGTTGCTAGGATACAAGAGAGCT - -a -s mr.mrrefChr5 195611 59 + 294542 GAGAGGTTATAATGCTAATGCCCAGTGGTGTTTCCCTAAGACACTGGCACAGCCTGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348321 59 + 636262 GAGAGGTTATAATGCTAATGCCCAGTGGTGTTTCCCTAAGACACTGGCACAGCCTGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 339737 59 + 647215 GAGAGGTTATAACACTAATGCTCACTGGTGTTTCCCTAAGGCATTGCTAATGCCTACAA - -a -s mr.mrrefChr5 195670 33 + 294542 TCCAGATTGTTTTTTGCTGTTCTATTCCTGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348382 33 + 636262 TCCAGATTGTTTTTTGCTGTTCTATTCCCGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 339796 33 + 647215 ATCAGATTGTTTTTTGCTGTTCTATTCCTGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 195703 145 + 294542 TCGGACACCTATTGGCCTTTGGTCCATTGGAAGTACCACAAGTCAAGATATAGGATAAAGAGTTAGGATCAACTGGGCATTAAAGATAACATTGGGGCTGCAACAGTGTGAACAGTTGGTCTGGACCTGTACCATTTACTGCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348415 145 + 636262 TCGGACACCTATTGGCCTTTGGTCCATTGCAAGTACCACAAGTCAAGACATACAATAAAGGGTTAGGATCAACTGGGCATTAAAGATAACATTGGGGCTGCAACAGTGTGAACAGATGCTCTGGCCCTGTACCATTTACTGCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 339833 145 + 647215 TTGGACATTCATTGGTGTTTGATCCATTGGAATTACCACAAGTCGAGGTATGGGACAGAGAGTTGGGATCAACTGGGTATTACAGATTACATTGGGGCTGCAACAGTGTGAACACTGTGTCTGGACCTGTACCATTCACTGCACC - -a -s mr.mrrefChr5 195848 30 + 294542 AGGTGTGTTAGGTGTCTCAGAGGTATCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348635 30 + 636262 AGGTGTGTTAGGTGGCTCAGAGGTATCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 339978 16 + 647215 AGGTGTGTTAGGTATC-------------- - -a -s mr.mrrefChr5 195878 32 + 294542 AGAGAGGAGCTCATGAAATTGGGATTAGTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348668 32 + 636262 AGAGAGGAGCTCATGAAATTGGGATTAGTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 339994 5 + 647215 -------------------T--------TGTA - -a -s mr.mrrefChr5 195910 84 + 294542 AAAGTGAAACAGTTAACTGGGGAATAATGGCTACACATGTGAACCATCTTCTTGTCCCATCCCAACATTATCCTCAATATCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348700 84 + 636262 AAAGTGAAACAGTTAACTTTGAAATAATGGCTACACACATGAACCATCTTCTTGTCCCATCCCAACATTATCCTCAATATCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 340005 84 + 647215 AAAGCAAAACAGTTAACTGGGGAATAATAACTACACATGTGAACCATCTTCTTGCCATATCCCATCATTGCCCTAAATATCATC - -a -s mr.mrrefChr5 195994 183 + 294542 AGAGAATTACAAAAGTAAGGCTTCACTAGACTACACCTGAACAAATGTGGAATCATCGGTCAGGCACATTGAAAAACTGATGTTGTGTTCAAGGCAGACCTACTATTATTCTTGTTTCTCTTAAAATATCACCTTTAACCAACCTCTCAAGAAAACCATCAAATGTCAAAAAATTCTGACTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348784 182 + 636262 AGAGAATTACCAAAGTAAGGCTTCACTAGACTACACCTG-ATAAATGTGGAATCATTGTTCATGCACATTGAAAAGCTGATGTTGTGTTCAAGGTTGACCTACTCTTATTCTTGTTCCTCTTAAAATATCACCTTTAACCAACCTCTCAGGAAAACCATCAAATGTCAAAAAATTCTGACTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 340090 182 + 647215 AGAGAATTACAAAAGCAAGGCTTCACTAGACTACACCTGAACAAGTCTGGAATCATCGGTCAGGCACATTGAAAAA-TGATATTGTGCTCAAGGCAGACTTACTATTATTCTTGTTTCTCTTAAAATATCACCTTCAACCATCCTCTCAAGAAAAACATAAACTGTCAAAAAGCCCTGACTTT - -a -s mr.mrrefChr5 196177 279 + 294542 CCCCGTGTGCCAGTAATCACCCTACTCTGTCTCACTGCCACCAAGAATGTATACAACCATGCGGATGTCACACAATAAAACTGCTTCTTATTCTCTTGGGCAATTCTCAATTTTAGTACTTATATTGCCATTCTGTACCGTCTGAATATGATCCATTTGACTAGTAGATGTGTCAACTACATTATTACTCTGGATGCTTCAAAGTGAGTATCTTACAGACTCACATCTATTGAGCTTGTTAAAGGTGCAAAGGTTCCCATGGGAGAGGTGGTAGAATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348971 277 + 636262 CCCTGTGTGCCAGTAATCACCCTACTCTGTCTCACTGCCACCAAGAATGTATACAACC--GCGGAAGTCACACAATAAAACTGCTTCTTATTCTCTTGGGCAATTCTCAACTTTAGTACTTATATTGCCATACTGAACCGTCTGAATATGATCCATTTGACTAGTCGATGTGTCAACTACATTATTACTCTGGATGCTTCTAAGTGAGTGTCTTACAGACAGACATCTATTGAGCTCGTTAAAGGTGCAAACGTTCCCATGGGAGAGGTGGTAGAATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 340272 276 + 647215 CTCCTCATACCAGTAATCACCTTACTCTGTCTCACTGCCACCAAGAATGTCTACAACCATGCAGATGGCACACAATAAAACTGCTTCTTGTGCTCTTGGGCAATTCTCAATTTTAGTGCTTATATTTCCATTCTGTA---TCTGAATACGATCCATTTGACTAGTAGATGTATCAACTATATTATTACTCTGGTTGCTTCAAAGTGAGTATCTTACAAACTCATGTCTATTGAGCTTGTTATAGCTGTGAAGGTTCCCATGGGAGAGGTGGTAGAATGT - -a -s mr.mrrefChr5 196456 188 + 294542 AGATCTCACTCCTAGCAGTACCGTCAATAGTCTAGGGTGCTGTCCCATATATACATTTTTGACCCATCGGGACTCTGTCTGTTATAACCTGGTGACATCTGGGATGACTCTCAGTCACCAATCCTGGATCCATACATGTTCATCGATCATTAAGGACCACTAGATTGCTAAGCAGATGTAACTCACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349248 188 + 636262 AGATCCCACTCCTAGCAGTATCGTCAATAGTCTAGGGTGCTGTCCCATATATACATTTTTAACCCATCAGGACTCTGTCTGTTCTAACCTGGTGACATCTGGGATGACTCTCAGTCACCAATCCTGGATCCATACATGTTCATCAATCATTAAGGACCACCAGATTGCTAAACAAATGCAACTCACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 340549 174 + 647215 AGATCTCACTCCTAGCATCACTGTCAATAGTCTAGGGTGCTGTCGCATACATACATTTTTGACCCATCGGGACTCTCCCTGCTATAACCTGGTGACAACTAGGA--------------CCATCCTGGATCCACATAGGTTCATGGATCATTAAAAACCACTAGATTGCTAAGCAGATGTAACTCACAC - -a -s mr.mrrefChr5 196644 82 + 294542 CTTCTTCTTGTTGGGGATGAGGAGTCCGTGCCCTATGTTGCTGGATTCCAAATTCTTTTTTCCCTTCTTGTCAACCCTCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349439 82 + 636262 TTTCTTCTTGTTGGGGATGAGGAGTCTGTGCCCTATGTTGCTGGATTCCAAATTCTTTTTTCCCTTCTTGTCAACCCTCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 340723 82 + 647215 CTCATTATTGTTGGGGATGAAGATTCCATGCCCTATGTTGCTGGATTTAAAATTCTTTTTTCCCTTCTTGTCAACCCTCTTG - -a -s mr.mrrefChr5 196726 43 + 294542 GCCCAGCTAATGTAGACATATACTGGTCCCAGTGTCTGGAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349521 43 + 636262 GTCCAGCTAATGTAGACGTATACTGGTCCCAGTGTCTGGAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 340815 43 + 647215 GCCCAGCTAATGTGGAGATACGCTGGTCCCTGTGTCTGGAGAC - -a -s mr.mrrefChr5 196769 25 + 294542 AGGCAACCCTAGCCATTAGGTGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349564 25 + 636262 AGGCAACCCTAGCCATTAGGTGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 340864 25 + 647215 AGGTAACCCTAGTCATTAGGTGCAG - -a -s mr.mrrefChr5 196794 65 + 294542 ACCTTCATTGGAACCTTTTCCTTAAACTTGACTCATATCTTTGTAAAGATTACCTGACACACAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349589 65 + 636262 ACCTTCATTGGAACCTTTTCCTTAAACTTGACTCACATCTTTGTAAAGATTACCTGACACACAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 340899 65 + 647215 ACCTTCGTTGAAACCTTTTTCTTACATTTGACTCATATCTTAGAAAAGCTTACCTGACACATGGG - -a -s mr.mrrefChr5 196859 147 + 294542 CCTGCAGACTCAGATAAAATACCGACGTAATGTACAATACTACTAGTTCTGAAGCATCCCTGTGGGAGGCATGGGAAGTAGAGTAGGATTATGTAACTTGGTTCCTACCCAGACTGACACCCACACATAGTCCAGGCCCTGAGTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349663 147 + 636262 CCTGCAGACTCAGATGAAATACCGACGTAATGTACAATACTACTAGCTCTGAAGCATCCCTGTGGGAGGCATGGGAAGTGGAGTGGGATTATGTAGCTTGGTTCCTACTCAGACTGACACCCACACAAAGTCCAGGCCCTGAGTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 340964 147 + 647215 CCTCGAGACTCAGATAAGATACCGACGTAATGTACAATACTACTAGTTCTGAAGCATCCCTGTGGGAGGGATGGGAAACAGAGTAGGATTATGTAACTTAGTTCCTACCCAGACTGACACCCTCACATAGTCCAGGCCCCGAGCAAA - -a -s mr.mrrefChr5 197006 46 + 294542 AGATAGTCCATTGCCTAGCCTAGTTCACTTCCATCAAGGATCACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349810 46 + 636262 AGATAGTCAATTGCTTAGCTTAGTTCACTTCCATCAAGGATCACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 341114 46 + 647215 AGATAGTACATTGCCTAGCCTAGTGTACTTCCTTCAAGGATCACTT - -a -s mr.mrrefChr5 197052 177 + 294542 TCAAGGTATAGTTCTTGACTCATCTGTCGATTTCTTAGTGAACACTCTTCTCTTTGGAAGTTTAAAGGAAACCTTGTCATGGGTCCTTTGCTCGGTGGTAACCAGATAGAGGGATCCTAGCCGTATGTACACTATGCTTGGGGTGTACTTGAAGATAAGCTCACTACCATCATAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349856 176 + 636262 TCAAGGTATAGTTCTTGACTTGTCCATCGATTTCTTAGTGGA-ACTCTCCTCTTTGGAAGTTTAAAGGAAACCTTGTCCTGGGTCCTTTGCTCGGTGGCAACCAGATATAAGGATCCTAGCCGTATGTGCACTATGCTTGAGGTGTACTTGAAGATACGCTCACTACTATCATAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 341162 174 + 647215 TCAAGGCAGAGCTCTTGACTCATCTGTCAATTTCTTAGTGAACCCTCTTCTCTTTGGAGATTTAAAGGAAACCTTGTCATGGGTCCTTTGCTCAGTGGTAACC--ATAGAGGCATCCTAGCCACATGTACACGAG-CTCAGGGTATACTTGAAGATAAGCTCACTACCATCATAAAC - -a -s mr.mrrefChr5 197229 79 + 294542 ATCTCTTGTCTGAGATGCACTCAAAAGGGGAGCCTATGGAACCATAACAAAGGTATTTTTGGTATGGCAGGTTTGAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350032 79 + 636262 ATCTCTTGTCTGATATGCACTCAAAAGGGGAGCCTACAGAACAATAACAAAGGTATTTTTGGTATGGCAGGGCTGAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 341337 79 + 647215 ATCTATTGTCTGAGATGCACTCAAAAGGGGAGCCTATGGAACCATAACAGAGGTAGTTTTGGTATGCCAGGTTTGAGCT - -a -s mr.mrrefChr5 197308 131 + 294542 CCATACCTACTTCACACCAAAAGAAGTCAGGCATCCCACAATGAAAAATTGTAACAACTCTGGTCTGCCCATAAGAATCTCAGATTACTGCACAGAAGCTGCCACTGGCTTGATCTCTGGTCCAAGGTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350116 131 + 636262 CCATACCTACTTCACACCAAAAGAATTCAGGCATCCCACAATGAAAAATTGTAACAACTCTGGTCTGCCCATAAGAATCTCAGTGTACTGCACAGAAGCTGCCACTGGTTTGATCTCTGGTCCAAGGTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 341416 131 + 647215 CCCTACCTACTTCACAGCAAAAGAAGTTAGGCTGCCCACAATGAAAAATTGTAACAACTCTGGTCAGCCCATAAGAATCTCAGATTATTGCACAGAAGCTGCTACTGGCTTAATTTCTGGTCCAAGATAGT - -a -s mr.mrrefChr5 197439 23 + 294542 TGGATTTCATAAGATCACTGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350247 23 + 636262 TGGATTTCATAAGATCACTGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 341548 23 + 647215 TGGATTTCCTAAGATCAGTGGTC - -a -s mr.mrrefChr5 197462 22 + 294542 TGTGTATTCAAACGAGATTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350270 22 + 636262 TGTGTATTCAAACGAGATTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 341576 22 + 647215 TATGTCTGCAAACAAGATCGGT - -a -s mr.mrrefChr5 197484 118 + 294542 TTCTTGCAAACATAACAACCCACCATGGCATGTAGATGGTGTACTATTTGTTTCCAATGTCTTGAGAATGGGGGATGCACTTATCTTAAGTGTAGGTTAGCCTGTTGTGTATTACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350302 118 + 636262 TTCTTGCAAACATAACAACCCACCATGGCATGTAGATGGTGTACTATTTGTTTCCAATGTCTTGAGAATGGGGGATGCACTTATCTTAAGTGTAGGTTAGCCTGTTGTGTATTACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 341598 118 + 647215 TTCTAGCACACAAAATAACTCACCATGGTATGTAGATGGTGTTCTATTTGTCTCCAATGTCTTGACCACTGGGGATGCACTTATCTTAAGTGTAGGTCAACCTGCTGTGTATTATCTT - -a -s mr.mrrefChr5 197602 286 + 294542 AAACACTCTGCACTATAACAAGATCTACACGTCAGATCACTTACCTGAATTACCGCACTTACTTTGGCATGACAGTGTAGGAACAAACTGTAGGATTGAGACGGATAGACTGAGTGCAGATATTTGGCACTCTAAAGTATCTTTTGGTAGCCTAATCAACAGACAATGGGCTCTCAGAGGAGTGCTTGTTTGTGCCAGTTAGGCTGTACTCCTTTCCTTTGGTAAGCCTATAGATAAGTTTGGCTTAGGAGCGTCATAAACCTATCCAATATATCGATATATTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350421 286 + 636262 AAACACTCTGCACTATAACAAGATCTACACGTCAGATCACTTACCTGAATTACCGCACTTACTTTGGCATGACAGTGTAGGAACAAACTGTAGGATTGAGACGGATAGACTGAGTGCAGATATTTGGCACTCTAAAGTATCTTTTGGTAGCCTAATCAACAGACAATGGGCTCTCAGAGGAGTGCTTGTTTGTGCCAGTTAGGCTGTACTCCTTTCCTTTGGTAAGCCTATAGATAAGTTTGGCTTAGGAGCGTCATAAACCTATCCAATATATCGATATATTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 341716 286 + 647215 AATCACTCCACACTATTATAAAATGCACACCTCAGATCGCTTGCTTGAATTACCCCACCTATTTTGGCATGACAGTGGAGGAACAAACTGTAGGATTGAGAGGGACAGACTGTGCACAGATATTTCATACTCTAAAGCATCCTTTGGTACCCTAATCAACAGATAATGGGCTTTCAGGTGAGTGCTTGTTTGTGCCAGTTAGACTGTACTCTTTCCCTTTGGTAAGCCTATAGATAGGTTTGGCTTAGTAGCATCATAAACCTATCCAATATATCAATATATGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 197888 95 + 294542 CTCAAATCACAATCAGTTTCTGTATTTCTCCATATCCTGATTCACAAGTTAGGCTAGTCCCTTACTGTGATTGTAATTTCATGACTCCTATACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350712 95 + 636262 CTCAAATCACAATCAGTTTCTGTATTTCTCCATATCCTGATTCACAAGTTAGGCTAGTCCCTTACTGTGATTGTAATTTCATGACTCCTATACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 342002 95 + 647215 CTCAAACCACAATCAGTTTCTATATCTCTCCATATCTTGATCCATTGGTCAGGCTAATCCTTTACTGAGATTGTAATTGCATGACTGCTATAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 197983 11 + 294542 TGCCTCTTGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350807 11 + 636262 TGCCTCTTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 342100 11 + 647215 TGCATCTTGCA - -a -s mr.mrrefChr5 197994 10 + 294542 CCTGAGGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350818 10 + 636262 CCTGAGGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 342154 10 + 647215 CCTTAGTCAC - -a -s mr.mrrefChr5 198004 131 + 294542 TTTTGTTAACAGAGTTCACATATGGATATGTTGTGACAGTGCATTCTCACTTATCTGTTAAAGCAGTTTTGGCTGGATTGGTTTAAACATGGCGCAAACTGCAAATGCAGTGACTCCACCAGTGTCCCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350837 131 + 636262 TTTTGTTAACAGAGTTCACATATGGATATGTTGTGACAGTGCATTCTCACTTATCTGTTAAAGCAGTTTTGGCTGGATTGGTTTAAACATGGCGCAAACTGCAAATGCAGTGACTCCACCAGTGTCCCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 342164 131 + 647215 TTTTGTTAACAGACATTGCATATGGTTATGTTGTAATAGTGCACTCTCACTTACCTGTTAAAACAGTTTTAGCTAGATTGGTCGAAATGTGGCGCACAGTCCAAGCACAATGACTCACCAAGCATTCCCTC - -a -s mr.mrrefChr5 198135 107 + 294542 ACTCGCAGTCTTAATCTGTCACAACATCCACACTGATAAGCCTAAATTTGATGAATCAGAGAACAATGGCCCTCAGGCAAAAGTTTGATCCCAGAATGGATCACAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350969 107 + 636262 ACTCGCAGTCTTAATCTGTCACAACATCCACACTGATAAGCCTAAATTTGATGAATCAGAGAACAATGGCCCTCAGGCAAAAGTTTGATCCCAGAATGGATCACAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 342295 107 + 647215 ACACACAGTCTAAGACTGTCACAATATCCAACCTGATAAGGCTAAACTTGACGAATCAGACAACAACAGTCCACGGTCAAAAGTTGGATCCCAGAATGGATCCTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 198242 36 + 294542 CAGGGGTTTTCATCACATCTAGGTTGTACTTTACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351076 36 + 636262 CAGGGGTTTTCATCACATCTAGGTTGTACTTTACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 342403 36 + 647215 CAGGGATGTTCATCAAACCTAGGTTGTACTCAACCT - -a -s mr.mrrefChr5 198278 13 + 294542 TTAAATGAGTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351112 13 + 636262 TTAAATGAGTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 342462 13 + 647215 TTCAATGGGTTGG - -a -s mr.mrrefChr5 198291 119 + 294542 AAGGTTTGTCCCTGTGGTGGAATCATAGACTTTATGGAATCAAGGTGTGGTGAAAACAGTCACTATCATCATTTTGGTTGACTGCACATGGATATGATTTGCCTTTGATAAGCGGCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351130 119 + 636262 AAGGTTTGTCCCTGTGGTGGAATCATAGACTTTATGGAATCAAGGTGTGGTGAAAACAGTCACTATCATCATTTTGGTTGACTGCACATGGATATGATTTGCCTTTGATAAGCGGCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 342475 119 + 647215 AAGGTTTGTCCCTGTGGTGGAATCATAGACTTTATGGAACCAGGAAGTGGAGGAAACAGTTATTGTCATCATTTTGGTTAACTGCACTTGGGTATGGTTGATTTTTGATAATTGGCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 198410 33 + 294542 TAAAGGGCCATTAAGTATCCTTATTGTAGAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351251 33 + 636262 TAAAGGGCCATTAAGTATCCTTATTGTAGAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 342594 33 + 647215 TAAAGGACCACTAAGTATCCTTATCGTAGAGAC - -a -s mr.mrrefChr5 198443 8 + 294542 TTCTCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351287 8 + 636262 TTCTCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 342627 8 + 647215 TTCTAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 198451 7 + 294542 TCTGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351295 7 + 636262 TCTGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 342638 7 + 647215 ACTAAGT - -a -s mr.mrrefChr5 198458 25 + 294542 AGCCTCTGTGTAGAGACTGTTTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351303 25 + 636262 AGCCTCTGTGTAGAGACTGTTTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 342645 25 + 647215 ATCCTTATTGTAGAGACTTCTTCTC - -a -s mr.mrrefChr5 198483 53 + 294542 AGATCTGTGTGAGCCTCTGCGTTAATGTCTGAGGGGGATGCTCAGAGGGTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351328 53 + 636262 AGATCTGTGTGAGCCTCTGCGTTAATGTTTGAGGGGGATGCTTAGAGGGTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 342672 47 + 647215 AGATCTGTGTGAGCCCCTGGGTTAGTGTCTCAGGGGGATGCTCAGAG------ - -a -s mr.mrrefChr5 198536 32 + 294542 TGCTTAGAGGGTTGGGGGTGTTGTATGTGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351384 32 + 636262 TGCTTAGAGGGTTGGGGGTGTTGTATGTGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 342719 23 + 647215 ---------GGATGGGGGTCTTGTATGTGACA - -a -s mr.mrrefChr5 198568 3 + 294542 TAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351416 3 + 636262 TAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 342748 3 + 647215 TAT - -a -s mr.mrrefChr5 198571 222 + 294542 CACCTAACTCAATTGCTACAAGAGGATAGAATGCTTAAGTGACCCTATTATGAATAGCTATGGCAACTGTATCTTACTCACATGAGCTCAAATTCCCATTCTCAATTTTATGCCTAACCAACAATGGGTATACTGCAGAATACCATGGAATTTCAGATTGTTGCCCTAAAGGTTGCTTGCAAGGCTAGTCAATCAGATTCAAAGTATAAGAACATACAGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351419 219 + 636262 CACCTAACTCAGTTGCTACAAGAGGATAGAATGCTCAA-TGACCCTATTATGACTAGCTATGGAAACTGTATCTTGCTCACATGTGCTCAAACTCCCATTCTCACTTTTATGCGTAACCAACAATGGGTATAGTGCAGAATACCATGGAATTTCAGAATGTTACCCTAAAACTTG--TGCATGGCTAGTCAATCAGATTCAAAGTATAATAACATACAGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 342753 222 + 647215 CACTTAACTCAATCGCTACAAGAGAATAGAATGCTTAAGTGACCCTACTATGGATAGCTATGGCAACTGTATCTTACTCACATGAGCTCAAATTCCCATTGTCAATTTTATGCCTAACCAAAGATGGGTATACTGCGGAATACCATAGAAGCTCAGATTGTTGTCCCAAAGGTTGCTTGGAAAACTAGTCAATCAGAGTCAATGTATAAGAACATACAGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 198793 56 + 294542 AATGTTGCAGATGGTCCCTTTAGAGTCATCCAGGGTAACTTGAGTCAGCGTTGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351639 56 + 636262 CATGTTGCAGATGGTCCCTTTAGACTCATCCAGGGTAACTTGAGTCAGCGTTGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 342975 33 + 647215 AATGTTGTAGATGGTCCCTTGAGAGTCATCCAA----------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 198849 14 + 294542 ATCTCAAACCTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351696 14 + 636262 ATCTCAAACCTTGA - -a -s mr.mrrefChr5 198863 408 + 294542 CAAGTGCTCTTTCACAGGTATCAGGTATAGGTGGGATTCAACACCCCAAAGTTATAAACAAAAAAGTTACATTTTACAAAGGTGTGTGCTACAACCATAATTGAGCTTATAGTAAGCCAAGCTTCTCAAAGGTTAACTCATTTGGGAATACAACCCTTATATATCCATGGGGATGACAGAACAGTCCTAAATGTGGACACTCCTAACTAGCCCATTCCTAGTTATTGAGGCCACACTTGTGCTTGTCTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGACTATGAGTGGGGTGCGGCCATTGGCAAGGTTCTGTAGGAGTTGCTGTGAGGTTTGAATGGCCACCCTATTTTATGAAGCTTGAAACTAAGGGGTCAATGTTTTTTTCTGTGTTGATGCTATCCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351713 407 + 636262 CAAGTGCTCTTTCACAGGTATCAGGTATAGGTGGGATTCAAAACCCCAAAGTTATAAACAAACAAATTACATTTTGCAAGGCTGTGTGCTACAACCATAATTGCACTTATAGAGAGCCAAGCTTCTCAAAGATTAACTCATATGGGAATACAACCCTTATATATCTATGGAGCTGACAGAATGGTCCTAAATGTGGACACT-CTAACTAGCTCATTCCTAGTTATTGGGGCCACACTTGTGCTTGCGTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGAGTATGAGTGGGGTGCGGCCACTGGCAGTGTTCTGTAGGAGTTGCTGTGGGGTTTGAATGGCCACCCTATTCTATGAAGCTTGAAACTATGGGGTCAATGTTTTTTTCTGTGTTGATGCTATCCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 343008 389 + 647215 -------------ACAGGTATCA-GTATAGCTGGGATTCAACACCCAAAAGTTATAAGCAAAAAAGTTCCATTTTACAAAGGTGTGGGCTACAGCCATAATTGAGCTTATGGTATG-CAAGGTTCTCAAAGGTAAACTCATTTGGGAATACAACCTTTCAATGCCCATGGGGATGACAGAACAGTCCTGAATGTGGACACTCCTAGCTACCCCATTCCTAGTTATTAAGGCCACATTTGCGCTTGTCTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGACTATGAGTGGGGTGAGGGCATTGGCAAGGTTCTATAGGAGTTGCTGTGAG----GAATGGACACCCAATTTTATGAAACTTGAAACTAAGGGGCCAATGTTTTTTTCCTTCTTGATGCTATCCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 199271 46 + 294542 CCTATAGACAGAGAACCAAATGAATTGTGCTACAGTGGCTGGTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352120 46 + 636262 CCTATAGACAGAGAACCAAATGAATAGTGCTACAGTGCCTGGTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 343429 46 + 647215 CCTATAGACAGATAACCAAATGAATTGTGCTACAGTGGCGGGTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 199317 83 + 294542 GAAGCTTCTTGTTGCATATTTCTGGCACTCATTATAAAGTGGTCAGTGTCTCCAGCCAACCATGCTCAACAGGCTTTAATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352167 83 + 636262 GAAGCTTCTTGTTGCATATTTCTGGCACTCATTACAAAGTGGTTAGTGTCTCCAGCCAACCATGCTCAACGGGCTTTAATATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 343475 76 + 647215 GAAGGTTCTTGTTGCATAATTCTGGCACTCATTATAAAGCGGCCAGTGTC-------AACCATTCTCAACAGGCTTTAATGTT - -a -s mr.mrrefChr5 199400 347 + 294542 CAGGGCCCAGATCTAACACATAATGAACCCAATTCTTTGTAGGTAGGAGGTTTGTGGAACAACAAGTTACTGTGTATAAACTGTTTTTACCAGTTTTGATGCCTTAGCTCCCCGACAAGCAAGCTACTGTTCTATCTGTATTATGTTAGTAGCAAAGAGCATAATAATTCAGTGGGCAACATTTGGCTGATCTATCTTTTATTGCTAACTGATTATCTGAAGGGCACCTAGAAGTGCTTTGTGCCATCACCATTAATCTATGTGCACTAGTTGGCTTTCACGTCCCCGTACTGGCATCCAAATAGTGAACAAGGCCTGCTGGACACTCTGTAAATAGGAACTAACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352251 342 + 636262 CAGGACCCAGATCTAACACAT-ATGAACCCAATTTTTTGTAGGTAGG----TTCAGGAACAACAAGTTACTGTGTATAAACTTTTTTTACCAGTAGTCATGCCTTAGGTCCCCGCCAAACAAGCTACTGTTCTATCCGTATTATGTTAGTAGCAGAGAGCATAATAATTCAGTGGGCAACATTTGGCTGATCTATCTTTTATTGCTATCTGATTATCTGAAGGGTACCTAGAAGTTCTTTGTGGTATTACCATTAATCTAAGTGCACTCCCTGGCTTTCACGGCCCTGTACTGGCATCCAAATATTGAACAAGGCCTGCTGGACACTCTGTAAATAGGGGCTAACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 343551 346 + 647215 CAGGGTCCAGAACTAACACATAATGAAACCCGTTCTTTGTAGGGAGGAGGTTTGTGGAAGAACAAGTTAGTGCGTATAAACCGTGTTTACCAGTTTTGATGTCTTAGCTCCCCAACAAGAAAGCTACTGTTCTGTCTGTATTATACTGGTAGCAAAGAACCCAATAATTCAGTCAGCAACATTTGGCTGATCTATCTTTTATTGCTAACTGATTATCTGAAGGGCACCTAGAAGTGCTTTGTGCCCTCACCTTTAATGTATGTGCACTAGTTGGCTTTCACCTCCCCGT-CTGGCATCCAAATAGTGACCAAGGCCTGCTAGACACTCTGTAAAAAAGAACTAACCC - -a -s mr.mrrefChr5 199747 50 + 294542 ATGCCAAAGAGATGCACTCTACAATAACCCCTTGATAACCTTAAGAGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352596 50 + 636262 GTGCCAAAGAGATGAACTCTACAATAACCCCTTGACAGCCTTAAGAGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 343897 49 + 647215 ATGCCAAGGAGATGCATTCAACAATAACCCCCT-ATAACCTTAAGAGAGA - -a -s mr.mrrefChr5 199797 151 + 294542 GCATGTGAAAATTACCTCATGTTTAGGCCAAAATAACCCTTAGGTCCATGTAACTCAGGGCAATTGTTGCCAGAGAGATAGGAAGTTGATTTGAACTTCAGTGTTGCAAATACCTCATTCAATAAGTTCCTTCTGTTCCAGGTACCAGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352646 139 + 636262 GCATGTGAAAATTACCTCATGTTTAGGCCAAAATAACCCTTAGGTCCACGTAACTTACGGCAATTGTTGCCAGGGAGATAGGAAGTTCATTTGAACTTC------------ACCTCATTCAATAAGTTCCTTCTGTTCCAGGTACCAGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 343978 151 + 647215 GCATGTGAAAATTACCTCATGTTTAGGCCAACATAACCTCAAGGGCCATGTAACTCAGGACAATTATTGCCGGACAGATAGGAAGCTGATTTGAACTTCAGTGTTGCAAATACCTCATTCAATAAGTTCCTTCCATTCCAGGTGCCAGTAA - -a -s mr.mrrefChr5 199948 6 + 294542 TTTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352785 6 + 636262 TTGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 344137 6 + 647215 TTTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 199954 126 + 294542 GAATGTAGCTCTGTTTGAGACTAAGCTCCAATGTTGCCTCTCCTCATGAGAGCTCTGTAGCGATGTAGTAAGCAGGTTATTTTCGCTCATATTCTAGCTCAAGAACAGGCTCTAAGAGAATCAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352791 123 + 636262 AAATGTAGC---ATTTGAGACTAAGCTCCAATGTTGCCTCTCCTCATGAGAGCTCTGTAGCGATGTAGTAAGCAGGTTATTTTCGCTCATATTCTAGCTCAAGAACAGGCTCTAAGAGAATCAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 344151 126 + 647215 GAGTGTACCTCTGTTTGAGACTAAGCTCCAAAGCTGTCTTTCCTCAGGAGAGCTCTGTAGCGATGTAGTGAACGGACTATTTTCACTCATATTCTAGCTCAATAACTGGATCTATGGGAATCAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 200080 30 + 294542 CCAGGGAGGCAGTAGTGTAAAACAGATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352915 30 + 636262 CCAGGGAGGCAGTAGTGTAAAACAGATAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 344277 30 + 647215 CCAGAAAGGCAGGAGTGTAAAACAGATAGT - -a -s mr.mrrefChr5 200110 72 + 294542 AAAAATCTTGAGGCCCTATGAGAGGTATATTGATTGTCTAGATAAAATGTAGCCTGTCAAGAGCTATGTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245997 72 + 636262 AAAAATCTTGAGGCCCTATGAGAGGTATATTGATTGTCTAGATAAAATGTAGCCTGTCAAGAGCTATGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 344322 72 + 647215 AAAAATCTTGAGGCCCTATGAGAGGTAAATTGATTGCCTAGATAAAATGAAGCCTGTCAAGAGCTATGTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 200182 37 + 294542 CCTCAAACCTCATAGCTGCAACCCTTTGACTTATTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246069 37 + 636262 CCTCAAACCTCATAGCTGCAACCCTTTGACTTATTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 344396 37 + 647215 ACTTAAACCTCATAGCTACAACCATCTGACTTATTTT - -a -s mr.mrrefChr5 200219 48 + 294542 GGCACCCTTTGAGTTAGCTATCAGTCAGGGAGACATGAGGTTGCTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246106 48 + 636262 GGCACCCTTTGAGTTAGCTATCAGTCAGGGAGACATGAGGTTGCTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 344455 48 + 647215 GGCACCCTTTGATTTGGCTATCAGTCCGGGGGACATGAGGTTGATCCT - -a -s mr.mrrefChr5 200267 23 + 294542 AATGTAGGAGTGGGACAGAATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246165 23 + 636262 AATGTAGGAGTGGGACAGAATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 344503 23 + 647215 GATGTAGGAGTGCGACAGAATTG - -a -s mr.mrrefChr5 200290 77 + 294542 CTGAATTGGAAGCCTTGTGCACATACCTGGCCTCCTTGTTAATCAGACTGGACTAGTTAGACGGATTCTGTTGAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246189 77 + 636262 CTGAATTGGAAGCCTTGTGCACATACCTGGCCTCCTTGTTAATCAGACTGGACTAGTTAGACGGATTCTGTTGAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 344526 77 + 647215 CTGAATTGAAAGCCTTGTGCACAGACCTGGCCCCCTCGTCAAGTGCTCTGGAGTAGTTAGATGGATTACATTGAGCC - -a -s mr.mrrefChr5 200367 50 + 294542 GGGGCTTCATTCATGAGATCCTTTACCCACCTTGTCACCAAACTTGTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246267 50 + 636262 GGGGCTTCATTCATGAGATCCTTTACCCACCTTGTCACCAAACTTGTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 344603 50 + 647215 GGGCCTTTATTGAAGAGATCCTTCACCAGACTTGTCACCAAACTTGTAGT - -a -s mr.mrrefChr5 200417 123 + 294542 TGACAATAGTGGGAGTCAACTAGAGTTCCTCAGTGGCAAGAATATTTGAAACAGGAGCATGGGTACGTCAGGTTTACTCCTTTTGACATATTATTGCTAGCACTGACAGGTCATTGATCACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352952 123 + 636262 TGACAATAGTGGGAGTCAACTAGAGTTCCTCAGTGGCAAGAATATTTGAAACAGGAGCATGGGTACGTCAGGTTTACTCCTTTTGACATATTATTGCTAGCACTGACAGGTCATTGATCACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 344713 123 + 647215 TAACAATGACAGGAGTCAACTAGAGTTCCTCTCTGGCAAGAATGTATGAAACATGAGGATGTGTACATTAGGTTTATTCCTTTTGACATATTATTGCTAGCAATGACAGGTCATTGATCACAC - -a -s mr.mrrefChr5 200540 127 + 294542 CCTGAAGTAAACAACTTCATGTATACATCACATGCTGCTTCACGTGTACTGCTGCGTCCTCTCAGTGAGACTCATCTCATGGCCATTGGGTATTTGCCCATAAGCTGGCATATTCCCAAGTATGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353077 127 + 636262 CCTGAAGTAAACAACTTCATGTATACATCACATGCTGCTTCACGTGTACTGCTGCGTCCTCTCAGTGAGACTCATCTTATGGCCATTGGGTATTTGCCCATAAGCTGGTATATTCCCAAGTATGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 344836 127 + 647215 CATGAAGTAAACAACTTCATGTATACATCACACGCTGGTTCACCTTTACTGCTGCATCCTCTCAGGGAGATTCTCCTCATGGCCATTGGGTATCTGCCCATAAGCTGGCATATTCCCAGGTATGTAG - -a -s mr.mrrefChr5 200667 31 + 294542 CCAGGCTGGTATAGCCCTTGAGAAGTGACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353205 29 + 636262 CCA--CTGGTACAGCCCTTGAGAAGTGACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 344963 31 + 647215 CCAGGCTGGTATAGCCCTTGAGAAGTGACCA - -a -s mr.mrrefChr5 200698 64 + 294542 ATCAAACTGGTTTAGACATTTTAGATGAATCTAACGGGTTCTTAAGATTGCGACATAATAGGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353236 63 + 636262 ATCAAACTGGTTTAGACATTTT-GATGGATCTAACGGGTTCTTAAGATTGCGACATAATAGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 344994 64 + 647215 ATCAAGCTGGTCTATACATTTTAGATGAATCTTTCAGGTTTTTAAGATTGCAACATAATAGGGC - -a -s mr.mrrefChr5 200762 105 + 294542 CTTATTTAGttctaattagatgaacttcatgtaattcttctagttcaggtacaagggtgcgaccccaggtaactttagagtgtgtatgcaaaatatacctcaagg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353300 90 + 636262 CTTATTTAGttctaattagatgaacttcatgtaattcttctagttcaggtacaa---------------taactttagagtgtgtatgcaaaatatacctcaagg -s simRat_chr6.simRat.chr6 345058 104 + 647215 CTTATTTAGttccaattggatgatcttcatataattcttctagtttaggtactagggtgcgaccccaggtgctgctggagattggttggttaata-acttcagag - -a -s mr.mrrefChr5 200867 60 + 294542 ggtcccaactttaagactctcctgtttcaagtgctaggTATCAAGTGACATTGAATGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353390 60 + 636262 ggtcccaactttgagattctcctgtttcaagtactaggTATCAGGTGACACTGAATGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 345164 60 + 647215 GGTCCTAACTCTAAGACTCTACTGTCTCAAGTGCTAGTTATCAAGTGACATTATTTGGGG - -a -s mr.mrrefChr5 200927 86 + 294542 TCTGGGACAAGTCTCAGCTGAATGCAAACAAGTCTCACCTCAGTGTAAACTATTGCTGCAAACTGGACTAATAGTGCACAGTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353450 86 + 636262 TCTGGGACAAGTCTCAGCTGAATGCAAACAAGTCTCACCTCAGTGTAAACTATTGCTGCAAACTGGACTAATAGTGCACAGTGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 345232 86 + 647215 TCTGATACAAGTCTCACCTGAGTGCAAACAAGTCTCACCTTAATGTAAATTATTGCCGCAAACTGAACTAATAATGCACAGTGTAC - -a -s mr.mrrefChr5 201013 130 + 294542 AGAAAGAGGTGGTATAAATAGTGGATTTAGTTAGCTCTCATAGTAGGCAGCATAATCCTCACCAATGTTGTTAAAAGGGCACTGACAGCGCAATTCCTATGCATAATCATTTGAACAAGACATTGTCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353537 130 + 636262 AGAAAGAGGTGGTATAAATAGTGGACTTAGTTAGCTCTCATAGTAGGCAGCATAATCCTCACCAATGTTGTTAAAAGGGCACTGACAGCGCAATTCCTATGCATAATCATTTGAACAAACCATTGTCAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 345318 122 + 647215 AGAAAGAGGTAAGATA-------GATTTAGTTAGCTCTCATAGTAGGCAGCATAATCCTCTCCAATGT-GTTAAAAAGGCATTAACATCCCAATTCCTAGACATAATCATTTGAACAAGACACAGCAGAC - -a -s mr.mrrefChr5 201143 8 + 294542 CTGATTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353667 8 + 636262 CTGATTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 345458 8 + 647215 CTGATTCA - -a -s mr.mrrefChr5 201151 55 + 294542 TACAGCCTCATATGTATGACCCTGACTTCCTTCATTCTCGAAAGGGGTATATGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353677 34 + 636262 TACAGC---------------------TCCTTCATTCTCGAAAGGGGTATATGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 345466 49 + 647215 TACAGCCTCATATGTATGACCCTGACTTCCTTCATTCTCG------GTATATGCC - -a -s mr.mrrefChr5 201206 80 + 294542 TTAAACCAGTATATGCCTTAAACCACTAAACTGGCCAAGGGGTTGCTTAACAGCTAAGACATGTGGTGTGTCATATCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353713 80 + 636262 TTAAACCAGTATATGCCTTAAACCACTAAGCTGGCCAAGGGGTTGCTTAACAACTAAGACATGTGGTGTGTCATATCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 345515 80 + 647215 TTAAACCAGTATATGCCTTAAACCATTAAACTGGCCAAGGAATTGTTTAACAGCTAAGACATGTGGTGTGTCACATCACA - -a -s mr.mrrefChr5 201286 698 + 294542 TGCCAGCTTAGAGTACGTTAGAATCTTGCAATATAGACTCTCGTTACAGACATGACAGATGGATATGGAATCAAGTTACTACTATGACAATTTAGACTGTATTTGCTTTGCTGCAAGGTGTGTCTTCCACCCTCAGGCTGTCTGATCGGACCAGTTGAGACCCCCACAGAAGCGTATATCACAGTCTATAGCACTGAGAGGAGGCCATGGGTGGGGGTAGCTGTCAGACATGTTGCTGATACACAGTCAATGGGAGTCAGACTACAGACTCCATAACCCTGTACTAGGACTCAACACAAGAGCAAGACGCAATTTTTCTTGGACCCATTTCCTTTTCCTATTAAGAATTAGAACAGGAAGGGAAGGGGGGTTGCCAGTAGGGGAGAAAATATAGTGAAAAGAGTAATCATAAGTGATCTGTAGACATAATCACACAGGAGGATGTAGCCTCTAGAGCAAGGCTTGCAACAGCTTTCCGTCATTGGGGCTTCACAAAGGCTACGTGGTGGCACACAGTATGATATCATGATGTAATGTGTTGGGAAGGATTGGTGGACCTACCTTGATCCACAAATTGAGGCTAAGCTGTAAGGTAGTCTTTTATCCCCCTTGCCTCAAACTTTCTTAGGGCCAGGTATGGACCACTGAAATCACTAAAAGAAAATCAGGCCTATATATTTTCTAACTGATAGTTGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353793 691 + 636262 TGCCAGCTTAGAGTACGTTAGAATCTTGCAATATAGACTCTCGTTACAGACATGACAGATGGATATGGAATCAAGTTACTACTATGACAATTTAGACTGTATTTGCTTTGGTGCAAGGTGTGTCTTCCACCCTCAGGCTGTCTGATCGGACCCGTTGAGACCCCCACAGAAGCGTATATCACAGTCTATAGCTCTGAGAGGAGGCCATGGGTGGGGGTA-----CAGACATGTTGCTGA--CACAGTCAAAGGGGGTCAGACTACAGACTCTATAATCCTGTACTAGGACTCAACACAAGAGCAAGACGCAATTTTTCTTGGACCCATTTCCTTTTCTTATTAAGAATTAGACCAGGAAGGGGAGGGGGGTTGCCAGTAGGGGAGAAAATATAGTGAAAAGAGTATTTACAAGTGATCTGTAGACATAATCACACAGGAGGATGTAGCCTCTAGAGCAAGGCTTGCAACGGCTTTCCGTCATTGGCGCATCACAAAGGCTATGTGGTGGCACACAGTATGATATCATGATGTAATGTGTTGGGAAGGTTTGGTGGACTCACCTTGATCCACAAATTGAGGCTAAGCTGTAAGGTAGTCTTTTATCCCCCTGGCCTCAAACTTTCTTAGGGCCAGGTATGGACCACTGAAATCACTAAAAGAAAATCAGGCCTATATATTTTCTAACTGATAGTTGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 345597 697 + 647215 TGACTGCTTAGAGTTCATAAGGATCTTACAATATAGACTCTCTTCACAGACATGACAGAATGATATGGAATCAAGTTACTACAATGAGAATTTAGACTGTATCTGCTATGCTGCAAGGTGTGTCTTCCACCCTCAGGCTGTCTGATTGGACCAGTTGAGACCCCCACAGAAGCCTATATCACATTCTACAGCACTGAGAGCAGGCCATGGGTAGGGGTAGCTGTCAGACATGTTGCTGATACACAGCCAATGGGAGTCAAACTTCAGACTCCATAACCCTGTGCTAGGACTCAACACAAGAGCAAGACACAATTTTTCTTGGACCCATTTCTTTTTCCTATTAAGAATTAGAACAGCAAGGGAAAGGGCGTTGCCAGTAGGGAAGAAAATATGGTGAAAAGAGTAATCATAAGTGATCTGTAGACATAACCTCACAGGAGGATATAGCCTCTAAAGCGAGGCTTGCAACAGCTTTCCATCATTGGGACTTCACACAGGCTACATTGTGGCACAGAGTATGATATCATGATTCAATGTGTTGGTAAGGATTGGTTGACCTACCTTGATCCACAA-TTGAGGCTAAGCTGTAAGGCAGTCTTTTACCCCCCTTGCTTCAAACTTTCATAGGGCCAGGTATGGACCACTAATATCACTAAAGGAAAGTGAGGCCAATATACTATATACATGATAGTTGATC - -a -s mr.mrrefChr5 201984 32 + 294542 CATTGCTAAATTGAAGTAGCATAGGATGCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354484 32 + 636262 CATTGCTAAATTGAAGTAGCATAGGATGCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 346298 32 + 647215 CATTGCCAAATTGGAGTAGCATAGGGTGCAGT - -a -s mr.mrrefChr5 202016 72 + 294542 ACTTCATCCTAAAGGATCACCCTGATCAAAGTCTGCTTAGTCATGGATGTGTAGATCAGTCTGAACAAGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354516 72 + 636262 ACTTCATCCTAAAGGATCACCCTGATCAAAGTCTGCTTAGTCATGGATGTGTAGATCAGTCTGAACAAGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 346331 72 + 647215 ACTTCACCCTAAAGGATCACCCTGATTAAAGTCTGCTTAGTGACAGATGTGTAGATCAGTCTGAACAAGCGC - -a -s mr.mrrefChr5 202088 17 + 294542 AGAGATTCAATTGGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354599 17 + 636262 AGAGATTCAATTGGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 346403 17 + 647215 AGAGATTCAATGGGCCT - -a -s mr.mrrefChr5 202105 8 + 294542 tgtcagga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354616 8 + 636262 TGTCAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 346425 8 + 647215 tttaagga - -a -s mr.mrrefChr5 202113 90 + 294542 cagaagaaaagaagtttgtggatatagggcaccaaaagcttaggccttgggacaaattcttcaatacttatttggctgaaaaggtacagg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354624 90 + 636262 CAGaagaaaagaagtttgtggatatagggcaccaaaagcttaggccttgggacaaattcttcaatacttatttggctgaaaaggtacagg -s simRat_chr6.simRat.chr6 346434 90 + 647215 caaaagaaaagaagtttgtggatatagtgaactaccagcttaggacttggaacaaatttttcaacacttatttggctgaaaagggacagg - -a -s mr.mrrefChr5 202203 66 + 294542 ctgggttaagaaacaaaaaggagtacagatgaccttttcagaacaagcgtacaatacacaaaaaga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354714 66 + 636262 ctgggttaagaaacaaaaaggagtacagatgaccttttcagaacaagcgtacaatacacaaaaaga -s simRat_chr6.simRat.chr6 346528 66 + 647215 ctggcttaagaactgagatggattacgaatggcctgttcacaacaagtgcgcaatacacaaaaaca - -a -s mr.mrrefChr5 202269 34 + 294542 gaataacatgattaaaaaatgaactagacatcaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354784 34 + 636262 gaataacatgattaaaaaatgaactagacatcaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 346594 34 + 647215 gaatggcatgattaaaaattgaagtacaaaccag - -a -s mr.mrrefChr5 202303 93 + 294542 gcacccaattgcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacgagaagaactgtgtttattcatggtcagcctattgcactcgtctagaccaggg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354821 93 + 636262 gcacccaattgcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacgagaagaactgtgtttattcatggtcAGCCTATTGCACTCGTCTAGACCAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 346628 93 + 647215 gcacccaatggcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacaagagtaagtttgttgagtcatgatcggcctattgcaccagtaagcatcaggg - -a -s mr.mrrefChr5 202396 44 + 294542 aactttaccttttcctGATTGGTCCATCATACAAATGTGCTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354921 44 + 636262 AACTTTACCTTTTCCTGATTGGTCCATCATACAAATATGCTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 346721 44 + 647215 aactttaccttttcctGATTAGTCCAGCATACAAATGTGCTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 202440 137 + 294542 GTGTGATAATACAGTGTAGAGAACAAGGTGTTATGGTTCCATGTAACACCTATCTAATAGTCCTATAACAAGATTGAAGGGACAAAAGAATAAATAAAATACAAGAGGATACTGTCATTTCAAATTTAGTTAGGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354970 137 + 636262 GTGTGATAATACGGTGTAGAGAACAAGGTGTTATGGTTCCATGTAACACCTATCTAATGGTCCTATAACGAGATTGAAGTGACAAAAGAATAAATAAAATACAAAAGGATACTGTCATCTCATATTTAGTTAGGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 346765 134 + 647215 GTGTGATAA-ACAGTGTGTAGGACAAGCTGCTATGGTTCCATGAATCACCCATCTAATAGTCCTGTAACAAGATTGAAGGGACAAAAGAATAAATGAAAGACAAGAGGGTACTGGCACTTCAAATTTAGT--GGTGG - -a -s mr.mrrefChr5 202577 77 + 294542 GTTTGATATTTGGTTAGACAATTAATGAGCAGTTAAGCAGTGAATCAACCCCACCCTACCATCCTAGGTAGAGGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355118 77 + 636262 ATCTCATATTTAGTTAGACAATCAATGAGCAGTTAAGCAGTGAATCAACCCCACCCTACCATCCTAGGTAGAGGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 346899 77 + 647215 GTTTGTGAGATGTTTAGGCAAATAATGAGCAGTTACGTAGCGAATGAACCCTACCCTACCATCCCAAGTAAAGGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 202654 39 + 294542 ATGTGATTGGGTTTGTGGTAGCTGAGTGGCTAGTACCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355198 39 + 636262 ATGTGATTGGGTTTGTGGTAGATGAGTGGCTAGTACCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 346976 39 + 647215 ATGTGATTAGCTTTGTGGTAGCTGAGCGGCTAGTGCTAT - -a -s mr.mrrefChr5 202693 237 + 294542 TCTTAGACCATAATGAAAAGTAACTAAATAATCAGTCCTAGGAATAATTACTCAAATATTGTTATGTTGCATATATATAACTATCCAATGACAGATCCATATTCCTGCTTGTATATTATAGATACCGTAAGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGTAGTTCCCCTGAATTAGTAATGAAATTGTAGCAACCTGCAGCTGGTCTCATCCACATTGTAAGGACATGTGTTGGGGCTAGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355237 237 + 636262 TCTTAGACCATAATGAAAAGTGACTAAATAATCAGTCCTAGGAATAATTACTCAGATATTGTTATGTTGCATGTATATAACTATCCAATGACAGATCCAGATTCCTGCTTGTATATTATAGACACCATAGGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGTAGTTCCCCTAAATTAGTAATGAAATTGTAGCAACCTGCAGCTGGTCTCATCCACATTGTAAGGACATGTGTTGGGGCTAGTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 347061 235 + 647215 TCTTGGACCGTAATGAAAAGGAAATACATCCTCAGTCCTGGGAATAATTACTCAAATGTTGTTATGTTGCTTATATATAACTATCCAATGACAGATTCATATTACTACTCGTATATTATAGATACCGTAAGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGCAGTTCCCCTGAATTAGTAATCGAATTGTAACAACCTGCAGCTGGTCTAATCCACATTGTGAGGACATGAGT--AGTCCAGTATG - -a -s mr.mrrefChr5 202930 120 + 294542 AGTAGAGATGGAGTACACTGGATAAGAGTACTAGTCCACGCTAAGCAACAACACCTGTCTTGAGACTCAAATATTAGCAGAGTCAAGGATGGTGTTACAGTGTATGATAGTCCATCATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355474 119 + 636262 AGTAGAGATGGAGTACACTGGATGAGAGTACTGGACCACGCTAGGCAACAACGACTGTCTTGAGACTCAAATATGAGCAGAGTCAAGGATAGTGCTAC-GTATATGATAGTCCATCATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 347296 120 + 647215 AGTAGAGATAGAGCACACTGGATAAGAGTGCTAGTCCACGCTTAGCAACATCACCTGTCTTGAGACTGAAATATTAGCAGAGTCAAGGATGGTGTTACAGAGTATGATAGTCCATCATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 347416 97 + 647215 CAT----------------------GTGTACTAGTCCACGCTAAGCAACAACACCTGTCTTG-GACTCAAATATTAGCAGAGTCAAAGATGGTGTCACAGGGTATGATAGTCCATCATGG - -a -s mr.mrrefChr5 203050 554 + 294542 CATGTCATCTTGACCACAATTTGACCAATGCAGATAACACGATTGTAATGTTGGGTCCCTGTTGCAAGCAGCTCAAGGTTAGGATGATGTTTATATCTGATCACAGTGCAAAGTTGTGCAAATTCTGTGGCCTTTAACTTTTACATGAGTGCTGGTAGTGTATCAAGACACCGGAATTTCTAAAGTGCAGGGAACTCAGTATTGTGGAACATGGGAGTTATGCATGGTGACTTTTGAATAGGATATTAAAAGTTGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAATAATTTCAGATCCTCCTATAAGTTCCTGTGAGGCTGCTTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGACACTCCTTGTTGATCATTTTACTGTCTAGTTCCTATGTATTATTATGCCTTCTGTGAGTTTCCCTTCTGCTCCACTATAACAGTTTGGATGCTGCAGAGGGACTGGATAAACATGAATGAACGTGAATTCTATTATTGCATCAAATCACTGGATAAACACATCATTAGACCCTCTAATGATTATCACACTGTTTATAGCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355593 544 + 636262 CATGTCATCTTGACCACAATTCGACCAATGCAGATAATAGGATTGTAATGTTGGGTCCATGTTGCAAGCAGCTCAAGGTTAGGATGATGTTTATATCTGATCACAGTGCAAAGTTGTGCAA----TGTGGCCTTTAACTTCTACATGAGTGCTGGTAGTGTACCAAAACACCGGAGTTTCTAAAGTGTAGGGAACTCAGTATTGTGGAAGATAGAAGTTATGCATGGTGACTTTTGAATATAATATTAAAAGTGGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAATAATTTCAGATCCTCTTAT-CGTCCCTCTGAGGCTGCTTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGATGCTCCTAGTTGATCATTTTACTGTCTAGTTCCTATGTATTACCATGCCTTCTGTGAGTTTCCCC-----TCCACTATAACAGTTTGGATGCTGCAGAGGGACTGGACAAACATGAATGAACGTGAATTCTATTATTGCATCAGATCACTGGATAAACACATCATTAGAGCCTCTAATGATTACCACACTGTTTATAGCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 347513 536 + 647215 CATGTCATCTTGACCATAATTTGACCAATCCAGATAACACCAGCAT-ATGTTGGGTGTCGGTTGCAACCAGTTTAATGCTAGGATGGTGTTTATATCTGATGACGATGCAAAGTTGTGCAAATTCTGTGGCCTTTTACTTTTACATGATTGCTGGTAGTGTATCAAGACACGTGAATTTCTAAAGTGCAGGGAACTCAGCATTGTGGAACATGGGAGTGATCTGTGGTGAGTCTTGAATAGGATATTAAAAGTTGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAGTAATTTCAAATCCTCCTAGAAGTTCCTGTGAGGCTGCCTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGACACTTGTTGATGATCATTTTAC----------------ATTATTATGCCTTCTGTGAGTTTCCCTTCTGCTCCACTATAACAGTTTGGATGTTGCAGAGGGACTGGATAGACATGAATGAACATGAATTCTATTATTGCATCAAATCATTTGATAAACAC-TCATTGGACCCTCTAATGATTATCTCACTGTTTCTAGCTCA - -a -s mr.mrrefChr5 203604 27 + 294542 AGTCATTATGAAAAAATCTAGGATGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356137 27 + 636262 AGTCATTATGATAAAATCTAGGATGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 348052 22 + 647215 AGTCATTATGAAAAAATCTATG----- - -a -s mr.mrrefChr5 203631 389 + 294542 AAGGGCAGACTAAGGTGAGTCTTGCCATTGGGTGGTTCCCACTAAGTACTGATTGCAAGGCATCCTCAGAGCTGGTCAAACACACATACTTGCCGCACAGATTGTAGTGACATATTACTAACTTGATTCACTCAGTTGTACAATTGTTAAATTCTACAAAGGAGGTGAATAAAGTCTGTTGTGCCAGATTTACTGGTCATGACGCATACTGAATGAGAATCATGATTCAATTGTGTTAATAAGGTCATGCCCTGTGCTTTTGGGTAAGAAGACAGTAGCAAGCTAAGTTGCTGTACCACCAGATGTGGCAGTCAATTTTTGTCCTCACCATAGGGGATCTTGTGTGATACATAGCACATATAAATTCACAGCTGCACTTTATTTACAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356170 372 + 636262 AAGGACAGACT--GGTAAGTCTTGCCATTG------TCCCACTAAATACTGATTGCAAGGCATCCTCAGAGCTGGTCAAACATACAT--------CACAGACTGTAGCGACATATTATTAACTTGATTCATTCAGTTGTACAATTGTTAAATTCTACAAAGGAGGTGAATAAAGTTTGTTGTGCCAGATTTACTGGTCATGATGCATACTGAACAAGAATCATGATTCAATTATGTTAATAAGGTCATGCCCTGTGCTTTTGG-TAGGAAGACAGTAGCAAGCTAAGTTGCTGTACCACCAGATGCGGCAGTCAATTTTTGTCCTCACCACAGGGGATCCTGTGTGATACACAGCACATATAAATTCACAGCTGCACTCTATTTACAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 348074 381 + 647215 -AGGGCAGACTAAGGTGTGTCTTGCCACTGGGTGGTTCACAGTAAGTACTAGTTGTAAGGCATCCACAGAGCTGGTCAAACCCACATACTTGCCGTACAGATTGAAGTGACATATTACTAACTTGATTCACTCAGTTGTACAATTGTTACATTCTACAAA--AGGTGAATAAAGTCCGTTGTCCCACATCCACTGATCACGACGCATACTGAATGAGAATGACGATTCAATTGTGTTAATAAGGTCGTGACCTGCGCTTTTGGGCCAGAAGACTATAGCAAGTTATGTTACTGTACCGCCAGATGTGGCAGTCAATTCTTGTCCTCCCCATAGGGGATCTTGTTTGATGCTTAGCACATATACATTCA-----GCATTTTATTTTAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 204020 341 + 294542 ATACGGTTCCCCAAGGCAGCCTATATCAAACTACAGAAAGTATGTCAGCTTAGACTGGTTAATTGAAACTAAACCAACATATTAAGTCGATCTGGCAGCCCTTCGAAAGGAATCCCTTAGCACGGACTTCAGTCCACCAGCGCTTTTATGGCCCGCTGGTCCGCGACAATAACGGAGATGAAGGTGAAAAAAAAGACGTACGAAGTTCGTGGTTGGATCATGTCCGACCTTGCCCGAAGAACCTAACTGGCCTACTGCACTCATCAATCACAGAACTTTCTTTCAGTATCATGCTGGTCTATCCATAGATATGCCACATCATAGAGACCCTATGGTTATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356543 337 + 636262 ATACGGTTCCCCAAGGCAGCCTATATCAAACTACAGAAAGTATGTCAGCTTAGATTGGTTAATTGAAACTAAACCAACATATTAAGTCGATCTGGCAGCCCATCAGAAAGAATTCCCTAGCACGGACTGCAGTCCACCAGCGGTTTCATGGCCCGCTGGTCCGCGATAATAACGGAGATCAAGGTGAAAAAAAAGACGTACGAAGTTCATTGTTGGATCATGTCCGAC----CCTGAAGAACCTAACTGGCCTACTGCACTCATCAATCACAGAACTTTCTTTCAGTATCATGCTGGTCTATCCATAGATATGCCACATCATAGAGACCCTATGGTTATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 348455 328 + 647215 ATACAGTTCCCCAAAGCTGCCTATATCTAACTACAGAAAGAATGCCAACTTAGACTGGTTAATTGAGACTAAGCCAACATACTAAGACGATCTGGCAGCCCTTCGAAAGAAATCTCTTAGCACGGACTTCAGTCTACCAGCGCTATTATGGCCTCCAGGTCCGCGACAATAACGGAAATGAAGGTG-------------ACGGAGTTCGTGGTTGGATCATGTTCGACCTTGCCCGAAGAACCTAACTGGCATATTGCACTCATCAACCACAGAACTTTCTTTCAATATCATGCTGGTCTATCCATAGATGTGCCACATCATAGAGAGCCTATGATTATCC - -a -s mr.mrrefChr5 204361 254 + 294542 CCACCATTTATTGCTGAGACAAGATTTAGCTATCTTAATATATGGCTCTATTTAGACATACCTATGTCCTACCATATTGCCCGTTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTGTCCTTGACCTCAGAGAACTCCTGGATAAAGTATCAACACTAAAGAGTGAACTGTCATTGCCTATGAGCATGTGCCCTTTTCATTGATCCAGCCCTTTGGCTGCTCTTTACAAGCTAGGTTAGTTGCAATGTGTTGGATCAAATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356881 252 + 636262 CCACCATTTATTGCTAAGACAAGATTTAGCTATCTTAATATATGGCTCTATTTAGACATACCTGTGTCCTACCATATTGCCCGTTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTGTCCTTGACCTCAGAGAACTCCTGGATAAAGTATCAACACTAAAGAGTGAACTGTCATTGCCTAT--GCATGTGACCTTTTCATTGATCCAGCCCTTAGGCTGCTCTTTGCAAGCTAAGTTAGTTGCAATGTGTTGAATCAAATACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 348783 228 + 647215 CCACCATATATTGCTGAGACAA-------------------------CCCTTTAGACATACCTA-GTGCTACCATATTGCCCATTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTATTGTTGACCTCAGAGAACACCTGGGTAAAGTATCAACTCAAAAGAGTGAACTGTCATCGCCTATGAGTGTGTGCGCATTTCATTGATCCAGCCCATTGGCTGCTCTTCACGAGCTAGGTTATTTGTAATGTGTTAGATTGAATATT - -a -s mr.mrrefChr5 204615 15 + 294542 CGTCAATTGGTAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357133 15 + 636262 CGTCAATTGGTAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 349096 15 + 647215 CATCAATTGGTAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 204630 54 + 294542 CTGAGGCATCTACAGCTAGGTTACTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357148 54 + 636262 CAGAGGCATCTACAGCTAGGTTACTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 349117 54 + 647215 CTGATACATCTGCAGCTAGGTCATTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCGTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 204684 180 + 294542 TTGGTAGTACAGAGCCCGAGGCATCTACAGCCCTATCTTGCCCCAGCTAGTACTTGATCAGCAGAGGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTATATTTCCTCTATTGGACACTAGTGAATTGTGCACTCAAATTCAATATGACCAAACGTACAAGAGGTACATTCTACGCCTCCTCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357206 180 + 636262 TTGGTAGTACAGAGCCCGAGGCATCTACAGCCCTATCTTGCCCCAGCTAGTACTTGGTCAGCAGACGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTAGATTTCCTCTATTGGACACTAGTGAATTGTGCACTCAAATTCAATATGACCAAACGTACAAGATGTCCATTCTATGCCTCCTCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 349171 169 + 647215 TTGGTAGTGTAGAGTCAGAGACATCTACAGCCTTATCTGG-CCCAGCTAGTACTCAATCAGCAGAGGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTATATTTCCTCTTTTGGACACTAGTGGATTGTGCACTGAAATTCAATATGACCAAACGGACAAGAGGTACATTCTACG---------- - -a -s mr.mrrefChr5 204864 222 + 294542 GAGTCTAGACTTGACATGGTTTAATAAAATTATACAGGAAAAGATGAAGTGATGTGACTGAGCCAATTGATAAATCAGTTTCCCTAACTATATGTCTAGCATTTGGTGCTACAAAAGGGTACCGGCCCTCTACAATCCACTTTCAAAAGATTGCATCTCCTGTATGTTATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTAAGTCTGCACAGCTTTATAGGCATGCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357392 209 + 636262 GAGTCTAGACTTGACATGGTTTAATAAAATTATACAGGAAAAGATGAAGTGATGTGACTGAGCCAATTGATAAAGCAGTTTCCCTAACTACATGTCTAGCATTTGGTGCTACAAAAGGGTACCGGC-------------CTTTCAAAAAACTGCATCTCCTGTATGATATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTAAGTCTGCACAGCTTTATAGACATGTGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 349340 199 + 647215 -----------TGACATGGTCTAATAAGATTATACAGG-AAAGATGAAGTGATGTGACT-----------TAAATCAGTTTCCATAACTATATGTCTAGCACTTGGTGCTACAAAATGGTACTGGCCCTCTACAATCCACTTTCAAATGATTGCATCTCCTATATGTTATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTCAGTCTGCACAGCTTTATAGGCATGCAGTT - -a -s mr.mrrefChr5 205086 254 + 294542 TATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTACAGCTAGTTAACCTTGTTTTGATACTCTTGTCTAGAGTTATTGTTTGATACCTAGTTAAACAAAAAACGGAGTAATGTATATACTCTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGTGGAACAGTTCTCATAGACAAAAATTGTCATTTATTGTTGAAGATAGTAGTACAAGAATCCATTCTCAATTTATCCCCTATGCATCATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357611 251 + 636262 TATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTACAGCTAGTTAAGCTTGTTTTGATACTCTTGTCTAGAGTTAGTCTTTGATACCTAGTTAAACAAAAAACGGAGTAGTGTAT-TACTCTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGTGGAGCAGATCTCATAGACAGAA--TGTCATTTCTTGTTGAAGATAGTAGTACAAGAATCCATTCTCAATTTATCCCCTATGCATCATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 349539 253 + 647215 GATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTCCAGCTAGTTAGCCTTGTATTGATACTCTTGTCTAGAGTTATTGTTTCATACCTAATTAAATGAAAAACAGAGTCATGTATATACTTTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGCAGAACAGTTCTCATAGACAAAAATGGTCACTTATTA-TGAAAATAGTAATACAAGAATTCATTCTCCATCTATCCCCTATGCATTATTTA - -a -s mr.mrrefChr5 205340 55 + 294542 TCTTTCTTTGTTCTCATGCCAAAGTGCCCTGGGTGTGGTCCGTTTATAGTTTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357862 55 + 636262 TCTTTCTTTGTTCTCATGCCAAAGTGCCCTGGGTGTGGTCCGTTTATAGTTTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 349815 55 + 647215 TCTTCCTCCGTTCTCGTGCCAAAGTGCCCTGGGCTTGGACCATCTATAATCTAAC - -a -s mr.mrrefChr5 205395 28 + 294542 TTCACAATTCCAACCAATGAGTACCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357917 28 + 636262 TTCACAATTCCAACCAATGAGTACCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 349880 28 + 647215 TTCACAATTCTTACCAATCAGTACCACA - -a -s mr.mrrefChr5 205423 147 + 294542 ACATGAAACTCTCTAATCTTTAAAGGCTAACATTCTATTGCAACCTAGTACGGCTCCAACAGGATTATTTCCATTATTGTAACAGTCCAAGGAAAGGATGGTGAGAAGAATAAGATGACCAGGGGGTCACGGGCTCTGTTTCAAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357948 147 + 636262 ACATGAAACTCTCTAATCTTTAAAGGCTAACATTCTATTGCAACCTAGTACGGCTCCAACAGGATTATTTCCATTATTGTAACAGTCCAAGGAAAGGATGGTGAGAAGAATAAGATGACCAGGGGGTCACGGGCTCTGTTTCAAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 349908 147 + 647215 GCATGAAACCCTTTAGTCTTTAAAGGCCAACATTATATTGAAACTTATTAAGGCTCGAAAAGGATTCTTTCCATCATTGTTACATTCCAAGGAGAGAGAGATGAGAAGGTTAAGGTGACCAGCGGGTCACAGGCTCAGTTTCAAAGT - -a -s mr.mrrefChr5 205570 162 + 294542 TAGCCCTCCTAGCAGACTGGTTTATCTCTGAACTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGTGACAGGATTTGCAGAGAGAGTCAGAGGCATCAGTAGGGAATTTTTATTGAAATAGGCAATGTCTTGTTTTATGCACTGATGTAATTATTTAGATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358095 161 + 636262 TAGCCCTCCTAGCAGACTGGTTTATCTCTGAACTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGCGACAAGATTTGCAGAGAGGGTCAGAGGAATCAGTAGGGAATCTTTATTGAAATAGGC-ACGTCTTGTTTTATGCACTGATGTAATTATTTAGATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 350072 162 + 647215 TAGCCCCCTTGGCAGGCTGGTAGATCTCTGAGCTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGTAACAGGATTTGCAGAGAGAGTCAGAGGCATCAGTAGGGAATTTTTATTGAAATAGGCAATGTCTTGTTTTATGCCCTGGTGTATTCATTTAGATCA - -a -s mr.mrrefChr5 205732 73 + 294542 AATTTGAGCTTAAGATCAGAACAGGGTGACCGTATGATGGTGCTTCATGACAACTATCTCTTTATTATCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358274 73 + 636262 AATTTGAGCTTAAGATCAGAACAGGGTGACCGTATGATGGTGCTTCATGACAACTATCTCTTTATTATCATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 350234 73 + 647215 AATTTGAGATTAAGATCAGAACAGAGTGACTATATGGTAATGCATCATGACAACTATCTCTTTATTATCACTG - -a -s mr.mrrefChr5 205805 9 + 294542 gcagctcTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358347 9 + 636262 GCAGCTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 350497 9 + 647215 gcagcccTT - -a -s mr.mrrefChr5 205814 11 + 294542 GAGTGACTTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358357 11 + 636262 GAGTGACTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 350506 11 + 647215 GAGTGGCTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 205825 108 + 294542 TTTGGCTCCTGAGGGGATGAGCATGCAATCAGGgatcacttctttgtttcaccattaattccctttcatttcttggattgcaattagttaatgccattttttcacctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358369 108 + 636262 TTTGGCTCCTGAGGGGATGAGCATGCAATCAGGGATCACTTCTTTGTTTCACCATTAATTCCCTTTCATTTCTTGGATTGCAATTAGTTAATGCCATTTTTTCACCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 350517 108 + 647215 TTTGGCTCCTGGGGGGATAAGTATGCAATCAGGgcttccatctttgtttcactgttaattccctttcatttcttggattgcaattagttaatgacctcatctcacctc - -a -s mr.mrrefChr5 205933 57 + 294542 ctccttgtgacacaagtctcactatacagacccctaacttcagttcaatctcaagtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358477 57 + 636262 CTCCTTGTGACACAAGTCTCACTATACAGACCCCTAACTTCAGTTCAATCTCAAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 350626 57 + 647215 ctccttgtaacactatactcactacatagacccctgacttcatatcaatctcaagtt - -a -s mr.mrrefChr5 205990 8 + 294542 cttcagtc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358545 8 + 636262 CTTCAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 350683 8 + 647215 ctttggtc - -a -s mr.mrrefChr5 205998 95 + 294542 cattcttcaaggcacttatgttcttaacttcttctgtgcttgtgccttatctgcctgtcagtttagtttcatgtgatggaggaacaagttccggt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358553 95 + 636262 CATTCTTCAAGGCACTTATGTTCTTAACTTCTTCTGTGCTTGTGCCTTATCTGCCTGTCAGTTTAGTTTCATGTGATGGAGGAACAAGTTCCGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 350693 95 + 647215 caatcttcaaggcacttatgtatttaactacttctgtccttgtgcgttatctgactgttagcttagttccaggtgatgggggaaaaaattacagt - -a -s mr.mrrefChr5 206093 14 + 294542 ccttgtcactaggt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358663 14 + 636262 CCTTGTCACTAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 350788 14 + 647215 tctggtcaatcagc - -a -s mr.mrrefChr5 206107 67 + 294542 gaggcaggatcctagctacacgtgaaccccaagggtgcatgtttaattggtaccccattgactcaac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358682 67 + 636262 GAGGCAGGATCCTAGCTACACGTGAACCCCAAGGGTGCATGTTTAATTGGTACCCCATTGACTCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 350802 67 + 647215 aaggtagcatcctacccacacgtgaaccccatgggtgtgtttttaattggcatcccactgttacaac - -a -s mr.mrrefChr5 206174 6 + 294542 ctgtta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358749 6 + 636262 CTGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 350870 6 + 647215 ttgtca - -a -s mr.mrrefChr5 206180 49 + 294542 ttggtaccatgtcaaggccagcctaccacacacatatttcgttgtctct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358755 49 + 636262 TTGGTACCATGTCAAGGCCAGCCTACCACACACATATTTCGTTGTCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 350877 49 + 647215 ccagtactatgttaaggtcagcctaccacccacatatttcgttgtctct - -a -s mr.mrrefChr5 206229 11 + 294542 ccagctgcctg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358805 11 + 636262 CCAGCTGCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 350926 11 + 647215 ccagctgtctg - -a -s mr.mrrefChr5 206240 51 + 294542 cactctatgagaaggcccttaaagctcatgtattcgTTTAGATACATGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358816 51 + 636262 CACTCTATGAGAAGGCCCTTAAAGCTCATGTATTCGTTTAGATACATGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 350939 51 + 647215 ccctctgtataaaggcccttaaagcccatgtattcaTTTAGATATGTACAT - -a -s mr.mrrefChr5 206291 130 + 294542 CTGCTCATTCAGCCTGAATCCTCATTCTAGTGCCGTTGTCACCATTACTACCGATGTATAtattgtggtcccttgtagtggcttgataacctttatgatgggaggtgctgtgaagtgtgcatgtacagca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358868 130 + 636262 CTGCTCATTCAGCCTGAATCCTCATTCTAGTGCCGTTGTCACCATTACTACCGATGTATATATTGTGGTcccttgtagtggcttgataacctttatgatgggaggtgctgtgaagtgtgcatgtacagca -s simRat_chr6.simRat.chr6 350990 130 + 647215 CTGCTGATTCTGCTTGAATCCTCATCCTAGCTCCATTGTCACCATTGCTACTGCTGTATAcattgtaagcccttgcaatgccttgataacctttatagtaggaggtgctgtggagtgtgcatgtatagca - -a -s mr.mrrefChr5 206421 36 + 294542 aaccatctgtacctcgcactgtctatctcatgtgag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358998 36 + 636262 aaccatctgtacctcgcactgtctatctcatgtgag -s simRat_chr6.simRat.chr6 351121 36 + 647215 gaccatctgtacctcccactgtctatctcatatgag - -a -s mr.mrrefChr5 206457 99 + 294542 cctactgttacattgcaggagcagtgatgccacactcacactgtgtaacttgtgattatcaaattctttccattcccattaattcattatgactatagc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359052 99 + 636262 cctactgttacattgcaggagcagtgatgccacactcacactgtgtaacttgtgattatcaaattctttccattcccattaattcattatgactatagc -s simRat_chr6.simRat.chr6 351157 99 + 647215 cctattgttacattgcaggcagagtgatgccatactcacactgtatgacttgtgattatcaaattcgttccatttgcattaattcatcatgaatatagc - -a -s mr.mrrefChr5 206556 16 + 294542 cgaaagtcagtaccaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359151 16 + 636262 cgaaagtcagtaccaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 351257 16 + 647215 tgaaggtcaatactaa - -a -s mr.mrrefChr5 206572 11 + 294542 tgtagtcgaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359177 11 + 636262 tgtagtcgaAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 351273 11 + 647215 tgtaatcgagt - -a -s mr.mrrefChr5 206583 60 + 294542 cctgtaagcaaatccagcccTTTTAGGGTAGCTAGGGATTCCAGGCCATTCATTTTCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359189 60 + 636262 CCTGTAAGCAAATCCAGCCCTTTTAGGGTAGCTAGGGATTCCAGGCCATTCATTTTCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 351284 60 + 647215 cctgtaatcaaatccaccccTTTTAGGGTAGCTAGGGATTCCAGGCCCTTCATTTTCAAT - -a -s mr.mrrefChr5 206643 85 + 294542 AATTACATTTATATTCTTCCAGTTCAGTTAAGAAGAGTGTGCCTGACTGATATGAGTAcatccatgcagagtaggtcatatcaga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359249 85 + 636262 AATTACATTTATATTCTTCCAGTTCAGTTAAGAAGAGTGTGCCTGACTGATATGAGTAcatccatgcagagtaggtcatatcaga -s simRat_chr6.simRat.chr6 351345 85 + 647215 GATTACATATATGTTCTTCCAGTTCAGTTAAGAAGAGTGCAACTGGCTGATGTGAGGCCACCCATGCAATGTGGGTCATAACAGA - -a -s mr.mrrefChr5 206728 39 + 294542 catctgtttgtgtgctataaatttttttggtattgtgtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359334 39 + 636262 catctgtttgtgtgctataaatttttttggtattgtgtg -s simRat_chr6.simRat.chr6 351433 39 + 647215 CAGCTGTTTGGGTGTTATGAATTTATTCGGTATGGTTTG - -a -s mr.mrrefChr5 206767 72 + 294542 cctagtgaagtccttgtggttggggcaaacatgtgtgttAATTGTAGATACTTGTGCAGGGAAGATCAAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359395 72 + 636262 cctagtgaagtccttgtggttggggcaaacatgtgtgttAATTGTAGATACTTGTGCAGGGAAGATCAAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 351472 72 + 647215 CCTAGCAAAGTGCTTGTGGTTGTGGCAAACTTGTGTGTTCATTGTAGATACTGGTGCGGGGGAGATCAAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 206839 9 + 294542 CTAAGTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359467 9 + 636262 CTAAGTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 351545 9 + 647215 CTAAGTATT - -a -s mr.mrrefChr5 206848 58 + 294542 TATAACTGGCTGAGTCCCCACTCACAATTATAATTGTAATGTGAGCATGAGCCAAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359476 58 + 636262 TATAACTGGCTGAGTCCCCACTCACAATTATAATTGTAATGTGAGCATGAGCCAAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 351555 58 + 647215 AATAACTAGCTGCGTCCCCACTCTCAATTGTAATTATAATGTGAGCACAAGCCAAGAC - -a -s mr.mrrefChr5 206906 58 + 294542 TTGACTGACAGAATCCCCAAATCTGCATAGagctaagacctgattgagagatttacca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359538 58 + 636262 TTGACTGACAGAATCCCCAAATCTGCATAGAGCTAAGACCTGATTGAGAGATTTACCa -s simRat_chr6.simRat.chr6 351613 58 + 647215 TTGATTAGCAGAATCACCAAATCAGCAAGGagccaggatttgattgacagacttacta - -a -s mr.mrrefChr5 206964 46 + 294542 caggatgtatggttcatagtaccagtaccaaaggtggagatagatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359596 46 + 636262 caggatgtatggttcatagtaccagtaccaaaggtggagatagatc -s simRat_chr6.simRat.chr6 351695 46 + 647215 cagagtgtatgattcatattaccagtatagaaggtggtgataactc - -a -s mr.mrrefChr5 207010 105 + 294542 tgtttttcctgtgctgcaggggatgaaagtgtgaggctttcataagtttcattgccccagTGCACAGTTGGTGCCAAATTAACCCTAGAAGCTAAGGCCTACTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359642 105 + 636262 tgtttttcctgtgctgcaggggatgaaagtgtgaggctttcataagtttcattgccccagTGCACAGTTGGTGCCAAATTAACCCTAGAAGCTAAGGCCTACTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 351742 105 + 647215 tgtttttgctgtgctggaggggatgaaggtgataggccttcatatgtttcattactcaagTGCACAGTCAGTGCCAAATTAACCCTCGAGGCTAAGGCCTACTGC - -a -s mr.mrrefChr5 207115 33 + 294542 TGGAACATGTTGATCAGACTAGacaaccctttt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359750 33 + 636262 TGGAACATGTTGATCAGACTAGacaaccctttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 351847 33 + 647215 TGGAACATGGTAACCAGGCTAGacaaccttttt - -a -s mr.mrrefChr5 207148 75 + 294542 gggcccaggcagttgcataggaagtgaaactgatcttacttaggtgctcctctatgtacctcaattatctctgct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359784 75 + 636262 gggcccaggcagttgcataggaagtgaaactgatcttacttaggtgctcctctatgtacctcaattatctctgct -s simRat_chr6.simRat.chr6 351880 75 + 647215 ggtcccaggcatttgcataggaagtgtaaccgatcttacccaggtgctcctctatgtacctcaattatctctact - -a -s mr.mrrefChr5 207223 40 + 294542 ttttcttgttgcagttttgtggacagaagtgcttgattgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359859 40 + 636262 ttttcttgttgcagttttgtggacagaagtgcttgattgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 351956 40 + 647215 tcttctggttgtagttaggtagactgaagtgcttgttcgg - -a -s mr.mrrefChr5 207263 69 + 294542 attggatgtggttgtcctgggagttgcaagatgcagtttcagaccgactccagaataaaccagtaaatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359906 69 + 636262 attggatgtggttgtcctgggagttgcaagatgcagtttcagaccgactccagaataaaccagtaaatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 351996 69 + 647215 attggatatggttgtcctgggggttacaaaatgcagtgccagagctacttcagaacaaaccagtagatg - -a -s mr.mrrefChr5 207332 16 + 294542 aaccccgcctgtgacc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359977 16 + 636262 aaccccgcctgtgacc -s simRat_chr6.simRat.chr6 352065 16 + 647215 aaccctgcctgtgacc - -a -s mr.mrrefChr5 207348 6 + 294542 tcagcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359993 6 + 636262 tcagcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 352083 6 + 647215 ccagcc - -a -s mr.mrrefChr5 207354 107 + 294542 taaactgaagtcacaattgattttccaatgagtacaaaagggttatctccctttataatggaatggtagggttgcattccagattctggcagttaatcaggttgtga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360008 107 + 636262 taaactgaagtcacaattgattttccaatgagtacaaaagggttatctccctttataatggaatggtagggttgcattccagattctggcagttaatcaggttgtga -s simRat_chr6.simRat.chr6 352089 107 + 647215 taaactgaagtcacaattgattttccaatgagtacaagagggttatctccctttataatagaatcagatggttgcataccagattttgacagttgattgggttgtga - -a -s mr.mrrefChr5 207461 32 + 294542 tttttggctgaggtgcctcgattcttgagctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360115 32 + 636262 tttttggctgaggtgcctcgattcttgagctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 352198 32 + 647215 ttttcggctgaggtgcattgcttctcaagctt - -a -s mr.mrrefChr5 207493 15 + 294542 ccaggtgtacacccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360155 15 + 636262 ccaggtgtacacccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 352230 15 + 647215 cccagtgaacacttc - -a -s mr.mrrefChr5 207508 36 + 294542 tgtgaagtaacctatctcatattgaccctccaaccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360173 36 + 636262 tgtgaagtaacctatctcatattgaccctccaaccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 352245 36 + 647215 tgtgaaattacctatctcatgttgacccttataccc - -a -s mr.mrrefChr5 207544 11 + 294542 tctgtgatgtc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360213 11 + 636262 tctgtgatgtc -s simRat_chr6.simRat.chr6 352281 11 + 647215 tctgtgatgtc - -a -s mr.mrrefChr5 207555 186 + 294542 cccaactagtgcatcctgggagtatttgctgctgATTTCTCGAGGATTTCCATGAGGAGTCTCTTTGCTAGTATTGGTCTCTATTATTTGTGCCCCTACCACTTTACAAGCATTACGATGAGGGTGGCAAAGGGTGTCATGCAATGCAGCTGTATGCTCAGTAGAATCCACACTACTCCTGCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360237 186 + 636262 cccaactagtgcatcctgggagtatttgctgctgATTTCTCGAGGATTTCCATGAGGAGTCTCTTTGCTAGTATTGGTCTCTATTATTTGTGCCCCTACCACTTTACAAGCATTACGATGAGGGTGGCAAAGGGTGTCATGCAATGCAGCTGTATGCTCAGTAGAATCCACACTACTCCTGCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 508881 186 + 647215 CCCAACTAGTGCACCCTGGGAGAATTTGTTGCTGATATCTCCAGCATTTTCATAGGGAGTCTCTTTACTAGTATTGGTCTCTATTATTTGTGCCCCTACCACTTTGCAAGCATTGTAATAAGGGTGGCAAAGGATGTCATGCGACGAAGTTCTGTATTCAGTAGGATCCACCCTATTCTTGCAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 207741 10 + 294542 ccatatgatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360530 10 + 636262 ccatatgatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 509067 10 + 647215 CCATCGGATT - -a -s mr.mrrefChr5 207751 60 + 294542 GTATGGGCTAACTGTGCAGGATGGTGAAGCATTCCCAATGTCTTCAAGCCTCTCATTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360636 60 + 636262 GTATGGGCTAACTGTGCAGGATGGTGAAGCATTCCCAATGTCTTCAAGCCTCTCATTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 352303 60 + 647215 CTATAAGTCAACCATGCATGATGGTGAAGCACTCCCAATGTCTTCAAGCCTCTCGTTACT - -a -s mr.mrrefChr5 207811 44 + 294542 GAACCAGAGGAGTTATATGGCATCTCAAGTATatctaatgtctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360696 44 + 636262 GAACCAGAGGAGTTATATGGCATCTCAAGTATatctaatgtctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 352368 44 + 647215 GAACCAGAACAGTTATATGGCATCTCAAGTATATCTAATGTCTC - -a -s mr.mrrefChr5 207855 40 + 294542 ccccttgttgctgaaccagggaagttatatggcatccggt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360740 40 + 636262 ccccttgttgctgaaccagggaagttatatggcatccggt -s simRat_chr6.simRat.chr6 352416 40 + 647215 TCTCTTGTTGCTTAACCAGGGAAGTTACATGGCATCCCGT - -a -s mr.mrrefChr5 207895 20 + 294542 TAAACCAGGGAAGTTATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360815 20 + 636262 TAAACCAGGGAAGTTATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 352456 20 + 647215 TAAACTAGAAGAATCATATG - -a -s mr.mrrefChr5 207915 79 + 294542 AAGAATCCAAGTGTTGACTGACCTGTTTATCAaatcagttggccagaattagtattacagttaggagtactttgttttt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360851 79 + 636262 AAGAATCCAAGTGTTGACTGACCTGTTTATCAaatcagttggccagaattagtattacagttaggagtactttgttttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 352476 79 + 647215 AAGAGTCCAAGCATTAACTGCTTTGTTTATCAaatcagttggccagaattagtgttacagcaaggagtactttgctttt - -a -s mr.mrrefChr5 207994 22 + 294542 gcctctaatgcactcctactaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360931 22 + 636262 gcctctaatgcactcctactaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 352555 22 + 647215 gcctctaatgcacccctactaa - -a -s mr.mrrefChr5 208016 148 + 294542 atatgattatgtgtgtgctgaactccctatataactgatgttataagggcccagtccctgctggtgatgattccattaatgcagtgcctttaggtactataattagcctctacattgggctgactctcccccagtcccaccatgaccc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360969 148 + 636262 atatgattatgtgtgtgctgaactccctatataactgatgttataagggcccagtccctgctggtgatgattccattaatgcagtgcctttaggtactataattagcctctacattgggctgactctcccccagtcccaccatgaccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 353215 148 + 647215 ATATAATTACGTGTGTGCCGAACTCCGTATAAAACTGAGGctataaggacccagctcctgctggtgatggttccatcaatgcggtgcttttaagtactatgattagtctccacattgggctgactctcccccagtcccaccatgactc - -a -s mr.mrrefChr5 208164 89 + 294542 ctatctgatacttcaggtagagatctctcactgttcatttcataatacaccactgatctctccactgaactacggtcttcaatctgaac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361136 89 + 636262 CTATCTGATACTTCAGGTAGAGATCTCTCACTGTTCATTTCATAATACACCACTGATCTCTCCACTGAACTACGGTCTTCAATCTGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 353363 89 + 647215 ccatctggtacttcaggtagagatatctgaccgttgatttcttagtacaaccctagtctttactctgaactactgtgtttaatgggaaa - -a -s mr.mrrefChr5 208253 8 + 294542 tactgtgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361225 8 + 636262 TACTGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 353454 8 + 647215 tactgagt - -a -s mr.mrrefChr5 208261 15 + 294542 aatgggatattgtga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361235 15 + 636262 AATGGGATATTGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 353462 15 + 647215 aatgtagtattttga - -a -s mr.mrrefChr5 208276 19 + 294542 tccctcaatacattgttcg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361250 19 + 636262 TCCCTCAATACATTGTTCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 353501 19 + 647215 tccctccatacactgttca - -a -s mr.mrrefChr5 208295 118 + 294542 ttcagAGCATGATGTGGTAGTTGGTAGAAACTTACTCATAGAGTGACTCAGTTCAAAAGTCACTCAGTTTAAACAACGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361269 118 + 636262 TTCAGAGCATGATGTGGTAGTTGGTAGAAACTTACTCATAGAGTGACTCAGTTCAAAAGTCACTCAGTTTAAACAACGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 353529 118 + 647215 gtgggAGCATAATGTGGTAGTTGGTAGAAATTTACTCATAGAGTGATTCAGCTCAAGACTCACCCAGTTTATACAATGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 208413 119 + 294542 AGAAGCCGTCATTTCCAGCAAGACAGCAATGGGGTAAAACTTGAGGACCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAAGAATACAGCTTGAGGGGGGCCCGAGATTTAAGATCATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361387 119 + 636262 AGAAGCCGTCATTTCCAGCAAGACAGCAATGGGGTAAAACTTGAGGACCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAAGAATACAGCTTGAGGGGGGCCCGAGATTTAAGATCATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 353648 119 + 647215 AGAGGTCTTCATCTCCAACAAAACAGCAATGGGGTAAAACTTGATGTCCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAGGATTACAGCTTGAGGGGGGCCCCAGATTTAAGATCATGG - -a -s mr.mrrefChr5 208532 50 + 294542 CCATGATTCTAATGCATGTCAACACTAGCCCCTTGGCACTTAATTCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361508 50 + 636262 CCATGATTCTAATGCATGTCAACACTAGCCCCTTGGCACTTAATTCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 353767 50 + 647215 CCATGAATCTAATGCATGTCAATACTAGCCCCTTAGCACTCAATTCAATG - -a -s mr.mrrefChr5 208582 116 + 294542 ATACCTAATCTAAGGGTTCATGATGACTCAAGACAGGTTCTAATCATGAGAGTTGATTGGACCCATGCTAAGCCCATATAGCAGCTCTTAATAATAGCCACAATGGAAATGGAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361562 116 + 636262 ATACCTAATCTAAGGGTTCATGATGACTCAAGACAGGTTCTAATCATGAGAGTTGATTGGACCCATGCTAAGCCCATATAGCAGCTCTTAATAATAGCCACAATGGAAATGGAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 353817 116 + 647215 ATACCTAAACCAAGGTATCTTGATGCCTCAATACAGGTTCTAATGATGATAGGTTATTGGATGCATGCTGAGCCCCTATAGCAGCTCTTATAGATAGCAACAATGGAAACGGAATG - -a -s mr.mrrefChr5 208698 49 + 294542 ATCCTGGGAATTAGTGAAAAGCattgatcttctaacccggtggttaaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361679 49 + 636262 ATCCTGGGAATTAGTGAAAAGCATTGATCTTCTAACCCGGTGGTTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 353933 49 + 647215 ATCCTGGGAACTAGTGAAAAGCattgatcttctaacctagtggatacca - -a -s mr.mrrefChr5 208747 18 + 294542 CTTGTGAGAGACCCACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361728 18 + 636262 CTTGTGAGAGACCCACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 354042 18 + 647215 CTTCTGATTGCCTCAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 208765 72 + 294542 GGAATCCTTGCAGCTCCTTGTTTAGAGGCTCCATGGGAAGCTGTGGCAAGCAATCCCAAGTGACTCCCTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361746 72 + 636262 GGAATCCTTGCAGCTCCTTGTTTAGAGGCTCCATGGGAAGCTGTGGCAAGCAATCCCAAGTGACTCCCTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 354068 72 + 647215 GAGATCCTCACAGCTACTTGTTTAGGGGTTCCACGGGAAGCTGGATCCAGGAATGCCAAGTGACTCCCTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 208837 193 + 294542 TGGTAGATTCAATCCTACTCCACTAGTTCCCCCACAAGTTCTACTAACGATGCCCATATGCCCCCCAGAGTGGTAACCAACCCAAAAGCCAGCTGTATGACTCTATGTGTGCCATATAGATTGAAGGGCCGCAGCTTCCAGATGGTATGCCGACAATCTCCAGAGGTGTTAAAACTTTCTGGATGTGAGGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361821 193 + 636262 TGGTAGATTCAATCCTACTCCACTAGTTCCCCCACAAGTTCTACTAACGATGCCCATATGCCCCCCAGAGTGGTAACCAACCCAAAAGCCAGCTGTATGACTCTATGTGTGCCATATAGATTGAAGGGCCGCAGCTTCCAGATGGTATGCCGACAATCTCCAGAGGTGTTAAAACTTTCTGGATGTGAGGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 354140 193 + 647215 TGGTAGATTCGGTCCTACTCCACTAGCTCCTCCACTAGTTCAATTAATAATGCCACTATGCCCCCCAGAGTGGTAGCCAACTCAAAAGCCAGCTGCGTCACCTTATGTATGCAATATAGGTTGAAGGGCTGCAGCTTCTAGATGGTATGCCAACAGTCTGCAGGGGTGTTATAACTTTCTGGTTGTGTGGGAT - -a -s mr.mrrefChr5 209030 10 + 294542 AATAATCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362015 10 + 636262 AATAATCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 354333 10 + 647215 AATAATTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 209040 398 + 294542 CAGAATTTGCACACCAACCAGGTACTCAAATAGGATTTGCCCATTGACTAAGTGCTATCAGGCCAGTATGGTTAACATTATAATATTTGAGCCAATGGTGATCACTCTGTTTCTAATCATAAATGCACCAGGTAACCCAGATTACTCGTTTCCTTCTTAGTACATTTCTTGGGGTTTCCTTATAGAAGGCAACTGTTCATGCAGCACCTGACAAGTAGAGGCATTCTCAATTCACCCCTGTGTACCTCTTATGTGACCGGGAATTCAACATGCAAGCTATACAAATAATTTGACCAGAGAAACACTAGTTCATTACACTAGGTTGATTGCTTGTTCAGTATCTTCATTTTCCCAGCGTGGCTCTCCAGGCTCCAGCAGGTACGTATAACAAAGGCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362025 398 + 636262 CAGAATTTGCACACCAACCAGGTACTCAAATAGGATTTGCCCATTGACTAAGTGCTATCAGGCCAGTATGGTTAACATTATAATATTTGAGCCAATGGTGATCACTCTGTTTCTAATTATAAATGCACCAGGTAACCCAGATTACTCGCTTTCTTCTTAGTACATTCCTTGGGGTTTCCTTTTAGAAGGCAACTGTTCATGCAGCACCTGACAGGTAGAGGCATTCTCAATTCACCCCTGTGTACCTCTTATGTGACCGGGAATTCAACATGCAAGCTATACAAATAATTTGACCAGAGGAACACTAGTTCATTACACTAGGTTGATTGCTTGTTCAGTATCTTCATTTTCCCAGCGTGGCTCTCCAGGCTCCAGCAGGTACGTATAACAAAGGCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 354359 392 + 647215 TAGAATTTGCACACCATCCAGGCACTCAAATAGGATGTGCCCATTAACCAAATGCTATCAGACCGGTTTGATTAAAATTATAACATTCGAGCCATTAGTGATGTCTCTGCTGCTAATCATAAATGCACCACGTAACCCAGATTACTCGTTTCCTTCTTAGTACATTTCTTGAGGTTTCCTCATAGAAGGCAACTGTTCATACAGCACCTGACAAGTAGAGGCCATCTCAATTCACCCCCGTGTACGCCTAATGTAACCTGGAA-TCAACATGCAAGCTG---AAATAATACGACCGGGGAAACACTAGTTTATTACACTAGCTTGATTGCT--TTCAATATCTTCATTTTCACAGCATGTTTCACCAGGCTCCAGCAGGTAGGTATAACAAGAGCCAG - -a -s mr.mrrefChr5 209438 7 + 294542 TACTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362423 7 + 636262 TACTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 354752 7 + 647215 TACTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 209445 42 + 294542 GAGCGAAGCCCTCACCACTTGGAGGAACTCCTGTGCCCATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362430 41 + 636262 GAGCGAAGCCCTCACCACTTGGAGGAACTCCTGTGCA-ATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 354762 42 + 647215 GGGAGAAGCCCTCACCACTTGGGGGAACCACTGTGCCCATAT - -a -s mr.mrrefChr5 209487 283 + 294542 CAGTATTATAACTTCCTAACTATGGTAGTGTATAGTAGTGATTTCTAGCCCTATTAGCATGTGACAGACTGTCCTTATCCTCTAGCCTCTGTTATCCATGTCACAGGCCTGTGGGTCTGTACCAAAACTAGTAACAAGTGTGGAACTCTGTTCCTATATTGTTTGTACTGAAGTCTGTCTGATTGTTGCTTCAACTGGAAGTCATCATCAGCAACCTACTGCTTTATCACCTGCGTCACTTTTTAGAGGTCTTAACCTATTAACTTGACACAATCTGGAGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362471 283 + 636262 CAGTATTATAACCTCCTAACTATGGTAGTGTATGGTAGCGATTTCTTGCCCTATTAGCGTGTGACAGACTGTCCTTATCCTCTAGCCTCTGGTACCCATATCACAGGCCTGTGGGTCTGTACCAAAACTAGTAACAAGTGTGGAACTCTGTTCCTATATTGTTTGTACTGAAGTCTGTCTGATTGTTGCTTCAACTGGAAGTCATCATCAGCAACCTACTGCTTTATCACCTGCGTGACTTTTTAGAGGTCTTAACCTATTAACTTGACACAATCTGGAGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 354808 279 + 647215 CAAAATTACAACTTCCTAAGTATAGTAGCGTATAGTAGTGATTTCTAGCCCAATTAGCATGTGACAGATTGTCCTTATCCTCTTGCCTCTGTTATCCACGTCACAGGCCTGTGGGTCTGTGCCGAAACAAGTAACAACTGTGGAACCGTGTTCCGATATTATTTGTACTG-AGACTGTCTGATTCTTGTATCAAT---GAGTCATCATCAGCAACCTCCTGTTTTATCACCTGCGTCACTTTTTGGTGGTCTTAGCGCACTAGCTTAGCAAAGTCTAGAGATC - -a -s mr.mrrefChr5 209770 83 + 294542 AACCTATCCATCAGGAGGCCATGGGTTGGGGATGGCCCTGTTATACAACTTGTAATCACTTGCATCAATGACCTACTGAATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362754 73 + 636262 ----------TCAGGAGGCCATGGGTTGGGGATGGCCCTGTTATACAACTCATAATCACTTGCATCAATGACCTACTGAATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 355089 83 + 647215 AACCTATCCATCAGGAGGTCATGCGTTGGGGACAGCCCCATTACACAACTTGTAACCACTTGCATCAATGACCTACTGAATGG - -a -s mr.mrrefChr5 209853 11 + 294542 ATGAAAAATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362827 11 + 636262 ATGAAAAATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 355173 11 + 647215 ATCAATGACCT - -a -s mr.mrrefChr5 209864 11 + 294542 TTGATGAAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362838 11 + 636262 TTGATGAAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 355190 11 + 647215 CGGATGAAAAC - -a -s mr.mrrefChr5 209875 112 + 294542 TAGTCAGTCTTATAATCGCATGTGTCAGAGAATGCAGCAGTACCTCTCATATCCTGGACAACCTCTCTAAAACATGAGGTATCACTACCATTTAAAGTTGAATTACATGGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362849 111 + 636262 TAGTCAGTCTCATAATCGCATGTGTCAGAGAATACAGCAGTACCTCTCATATCCTGGACGATCTCTCTAAAACATGAGGTAT-ACTACCATTTAAAGTTGAATTACATGGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 355203 112 + 647215 TATCTAGTTTTATAATCACATGTGTCGCAGACTGCAGCAGTACCTCTCATATACTAGGCAACCTCTCTAAAACATTGGGTTTCACCACCATTTAAAGTTGAATTGCATAGAT - -a -s mr.mrrefChr5 209987 323 + 294542 TAGCTTGATGTCCTATTCTGCAGACTTCAAGCCACTGAGCCCAACGTAGCATCACCTAATGGGATCAGTGTTGTCTTTTGGTGACAATTTATAACCATCACTGATAAATGGTTGGCTTGCATAGATGTTAGAACTTGGTCACATGCCTACGATAGCCATATCCTGCCCTGTGCCATCCTTCTGGGTTTGGGTCTGGGTTTGAAGCAAGCCTCATGACGCTGTTAGTCACCATCACTGTTGATGAAAGTTATTAATTAGTGGAAACTCTGTGGTAGGTACATAACAGCAAAAGGTCTAATTTCATCCTAATCCTATCTTTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362960 323 + 636262 TAGCTTGATGTTGTATTCTGCAGACTTCAAGCCACTGAGCCCAACGTGGCATCACCTAATGGGATCAGTGTTGTCTTTTGGTGACAATTTATAACCATCACTGATAAATGATTGACTTGCATAGATGTTAGAACTTGGTCACATGCCTACGATAGCCATATCCTGCCCTGTGCCATCCTTCTGTGTTTGGGTTTGGGTTTGAAGCAAGCCTCATGACCCTGCTAGTCACCATCACTGTTGATGAAAGTTATTAATTAATGGAAACTCTGTGGTAGGCCCATAACAGCAAAAGGTCTAATTTCATCCTAATACTATCTTATCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 355338 320 + 647215 TAGCTTGATGTCCTATTCTATGGACTTCCAGTCACTCAGCCCAACGTAGGATCACCAAGTGGGATCAGTGTTGTCTTCTGGTAACAATTTACAACCATCACTGATATATGGCTGGC-TGCATAGAAGTTAGCACTTGGTCACATGCCAAGGATAGCCATGTCCTCCAATGTGCCATCCTTCTGGGTTTGGGTCTGGGTTTGAAGCAAGCCTTATGACGCTGTTAGTTACCATCTTTGTTAATGAAAGTTATTAATTAGTTGAAACTCTGTGGTAGTTACATA--AGCAAAAGGTCTAATCTCATCCTAACCCTATCTTTTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 210310 48 + 294542 TGTTCTGCCACTTGGATGTTTTGTAATTTGATAATAGGGGGAAAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363290 48 + 636262 TCTTTTGCCACTTGGATGTTTTGTAATTTGATAATAGGGGGAGAGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 355658 47 + 647215 TGTGCTGCCAC-TGGATTTTCTGTAACTTGATAATAGGGGGAATGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 210358 32 + 294542 TACTATTACTGGAGCATTATCTTGAGATCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363338 32 + 636262 TACTATTACTGGAGCATTATCCTGAGATCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 355717 32 + 647215 TACTCTTACTGGAGCATAATCTTGAGGTCTGT - -a -s mr.mrrefChr5 210390 37 + 294542 AGCCTGCCACTGGTGTAAGAGGGTTGAGGACCTAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363370 29 + 636262 AGCCTGCCACTGGTGTAAGAGGGTTGAGG-------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 355750 37 + 647215 AGCATGCCACTGGTGTAACAGGATTGAGGACCTAGTC - -a -s mr.mrrefChr5 210427 86 + 294542 TTTCAATCTCTCTTGTTCATATTCTACTTACATGCACTAAGAGTTGTAAATTCCTATATAGAAGCTCTAACTGAGTCAGTCCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363399 65 + 636262 ---------------------TTCTACTTATGCGCACTAAGAGTTGTAAATTCCTATATCGAAGCTCTAACTGAGTCAATCCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 355794 85 + 647215 TTTCAATCTCTCTTGTTCATATACTAGTTACATGCACTAAACAATG-AAATTCCTATATAGAAGCTCTAACTGAGTCAGTCCATAA - -a -s mr.mrrefChr5 210513 88 + 294542 CTATGGTCAATTCTTTGAGAGGTGGTGGGGAACAATGTCATTGTCAGCATCTGTCAGATCCAGGTTGGAGAGCTGATTCACAATGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363464 86 + 636262 CTATGGTCAATTCTTTGAGAGGCGGTGGGGAACAATGTCATTGTCAGCATCTGTC--ACTCAGGTTGGTGAGTGGATCCACAATGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 355880 88 + 647215 CTATGGTCCATTCCTTGGGCGGTGGTTGGGAACAATGTTGTTGTCAGCATCTGTCAGATCCAGGTTGGAAAGCTGATTTGAAATGAGA - -a -s mr.mrrefChr5 210601 213 + 294542 GCTCAATGGCTGCCTGGTTGATTGATACATAAATTAGAATCCGGGTGGGCATGATTTCTGGGTGACACCAGGACACAGCTGAAACTGATTGAGAAGTGCTACAATCTTTGAATTATACATGTAGAATCAGATTCTGGTTGATTCTAGACATAGACTCTATGTTTGGCACCCCGTTGAGACAGAGTAAGTACTGGGTCTTCCTACTGTTCTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363550 213 + 636262 GCTCAACGGCTGCCTGGTTGATTGATACATAAATTAGAATCCGCGTGGGCATGATTTCTGGGTGACACCAGGACACAGCCAAAACTGATTGAGAGGTGCTACAATCTTTGAATTATACATGTAGAATCAGATTCTGGTTGATTCTAGAGATAGACTCTATGTTTGGCACCCCGTTGAGACAGAGTAAGTACTGGGTCATCCTACTGTTCTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 355971 212 + 647215 GCTCAATGGCTGCCTGGTTGATTGACACAT-AATTAGATTCTGGCTGGGCATGATTCCCGGGCAATACCAGGACACAGCTGAGACTGATCAAGAAGTGCTAAAATCTTTGAATTATACATGTACAATCAGATTGTGGTTGATTCTAGACGTAGACTCTATGGTTGGCATCTAGTAGAGACAGAGTAAGTACCTGGTCTTCCTACTGTTCTAGG - -a -s mr.mrrefChr5 210814 123 + 294542 ATGCCCCTGTACCCTAGGATATATTCTCTCTGCCCATGGTAAAGTGTTGAAACAGTTTCCCGTACAGAGTAGTACACTGTAACTAAGATCACTTACATTTCACCTAAGTAGGTACTCGTATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363763 123 + 636262 ATGCCCCTGTACACTAGGATACATTCTCTCTGCCCTTGGTAAAGTGTTGAAGCAGTTTTCCGTACAGAGTAATACACTGTAACCAAGATCACCTACGTTTCACCTAAGTAGGTACTCGTAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 356187 123 + 647215 ATGCCCCTGTACCCTAAAATATATCCTGTCTGCCCATGGTAAAGTGTTGCAACATTTTCTAGTACAGAGTAGTACACTGTAACTAAGATCACTTACATTCCACCTAAGTATGTATTGGTATCT - -a -s mr.mrrefChr5 210937 123 + 294542 AAGATCACTTACATTTCACCTAAGTACTCAGAAGGGCAGTCCATACTTAAGTTCAATGGACCTTTTAACCTGGCCATGAGTCATCCAAAATTATGTGTATCCATACACCCACACATTTTTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363888 123 + 636262 AAGATCACTTACATTTCACCTAAGTGCTCAGAAGTACAGTCCATACTTAAGTTCAATGGACCTTTTAACCTGGCCATGAGCCATCCAAAATTATGTGTATCCATACATCCACACACTTGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 356310 121 + 647215 GAGATCACTTACACTCCACCTAAGTACTTAGA--GGTAGCCCACAAGTAACTTCAATGGATCTTTTAACTTGGCCATGAGTCATCCAAAATTATGTGTATCCATACACCCACACATTTTTTAA - -a -s mr.mrrefChr5 211060 104 + 294542 GTAGTTTTGAGGCTGCATTGCTGTCATTCATAATGTTTGAGTCCAGCAATAAACTTGTACATCACAATTATGGCATTAAGCCCACCGCCAGCTGTACCCATATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364012 97 + 636262 GTGCTTCTGATGCTGCATTGCT----TCCCTAATGTTTGAGTCCAGCAATAAACTTGTACATCACAATTATGGCATTAAGCCCACCGC---CTGTTCCCAGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 356431 104 + 647215 GTAGTTTTGTGGCTGCATTGCTGTCAGTCACAATGTTTGAGTCCAGCAATAAACTTGTACATCACAATTATGGCATTAAGCCCACCTCCAGCTGTACCCTTGTC - -a -s mr.mrrefChr5 211164 1 + 294542 C -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364109 1 + 636262 C -s simRat_chr6.simRat.chr6 356539 1 + 647215 C - -a -s mr.mrrefChr5 211165 131 + 294542 ACCCTAAACTAGGCATGCATTACACCTTTTGATGATGAACCCAATAAAACCATTGAAACAACTGAAAAAATAAAATTGGATGCATTGGCATTCCATGCCCAATGACACACACAACCACTGTGTAGGTCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364111 131 + 636262 ACCCTAAACTAGGCATGCATTACGCCTTTTCATGATAAACCCAATAAAATCATTGAAACAAAAGGAAAAATAAAACTGGATGCATTAGCATTCCATGTCCAATGACACACACCACCACTGTGTAGGTCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 356540 131 + 647215 ACCCTAAGCTATGCATGCATAACACCTTTTGATGATGAACCCAATGAAACCATTGAAACAACTGAAAACATAAAATTGGATGCATTGGCAGTTCATACCCAATGACACACACAACCACTGTGAAGGTCGAT - -a -s mr.mrrefChr5 211296 49 + 294542 ATAAAGGCAAAATTATTAACATTAAAGTCTAGGTCAACCATGTTGTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364242 49 + 636262 ATAAAGGCAAAATTATTAACATTAAAGTCTAAGCCAACCATGTTGTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 356703 46 + 647215 ATAAAGGCAAAATTATTAAGATTAAAGTCTGGATCCAC---ATTGCCAG - -a -s mr.mrrefChr5 211345 52 + 294542 CTTAAGATTAAGAGGAGTGAGTAGCCTACAGTACAATTTTATGCATTTGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364295 52 + 636262 CTTAAGATTAAGAGGAGTGAGTAGCCTACAGTACAATTTTATGCATTTGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 356749 52 + 647215 CTTAAGATCAAGATGAGTGAGTGGCTCACAGCACAATTTTATGCATTTTGCA - -a -s mr.mrrefChr5 211397 87 + 294542 TCCCAAGCGACCCTAGGTGTCCTCATTGCCTAGTTTATGAGAGTGTTGGCCAAACACAGCTTTGGTGATGGGATTTTCACTAGCGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364348 87 + 636262 TCCCAAGCGACCCTAGGTGTCCTCATTGCCTAGTTTATGAGAGTGTTGGCCAAACACAGCTTTGGTGATGGGATTTTCACTAGCGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 356801 87 + 647215 CCCCAAGCAACCTTAGGTGTCTTCATTGCTTAGTTTATGAGAGTGTTGTCCAAACACAGGTTTAGTGATGGGATTTTCACTGGTGGT - -a -s mr.mrrefChr5 211484 42 + 294542 TAAGAATACATCTGTATTTTAAACAAGAATTTGGGTGCTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364435 42 + 636262 TAAGAATACATCTGTATTTTAAACAAGAATTTGGGTGCTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 356894 42 + 647215 TAAAAAGAAGTCTGTATCTTTAGCGAAAATTTGGGTGCTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 211526 19 + 294542 CTGACTCTGCTAGTGGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364479 19 + 636262 CTGACTCTGCTAGTGGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 356936 19 + 647215 TTGACTCTACCAGTGGTAA - -a -s mr.mrrefChr5 211545 204 + 294542 AGTCCAGTAGGTTTGGCATTTTTAGGTCACAAGGTGATATTATTAGTACATGCCAAGTATATTACTATCAGAGTCTGAGAGGGGGAATTGGGCTAATTTACCTTGAAGTGGCTTTACTGTGCAAATTGTATGGTCCCATTACAAATCTTTGTTGCATTCTTTATTGAACCTGGCCTGTCCCAGAAAGAAGGGATTTTCATCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364499 204 + 636262 AGTCCAGTAGGTTTGGCATTTTTAGGTCACAAGGTGATATTATTAGTACATGCCAAGTATATTACTATCAGAGTTTGAGAGGGGGAATTAGGCTAATTTACTTTGAAGTGGCTTTACTGTGCATATTGTATGGTCCCATTACAAATCTTCATTGCATCCTTTATTGAACCTGGCCTGTCCCAAAAAGAAGGGATTTTCATCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 356955 204 + 647215 AGTCTGGTTGGTTTAGTATTTTTCGGTCAGAAGGTGATATTATTATTACATGCGAAGTATGTTACCATCAGAGCCTGAGAGGTGGAATTGGGTTAATTTACCTTGAAGTGGCTTTTCTTTGCTAGTTGTATGGTCCCATTACAAATCTTTGTTGCATTCTTGTTTGGGCCTGGCCTGTTTCAGAAAGAAGGTATTTTCATCCCT - -a -s mr.mrrefChr5 211749 81 + 294542 ATTCATCACTTTTGGAAGAAGTTAAACAGAAAACAAGTATCATTCCCCAGTGTTGAGCTATTTGTGTCCAATAAACTTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364703 81 + 636262 TTTCATCACTTTTGTAAGAAGTTAAACAGAAAACAAGTATCATCCTCCAGTGTTGAGTTATCTGTGTCCAATAAACTTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 357161 81 + 647215 ATTCATAACTTTTGGAAGAAGTTAAACAGAAAATGAGCGTTAGTCCACAATGTTGAGCTATTTGTGTCCAATAAACTTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 211830 302 + 294542 TCCTAACACTTTTGAAACTAAATGTACTAAATGTAGCAAGGCTGGAATAATTGTGATATTTCCTAAGGTATGTCTGTTCCACCCAGCGTCATGTGGTCTAGATTATGCTATGGAGAGTGCTACATCACACTTTATATGAGAGAATAAGCATAGTCATCCATGGCAGGCCTTGCCTCTTTAGCCATACTGGTACCTACTATGTATGGAAAATTTTTGTGCTAGACCAGTATTTAGCCTTTCCCATCCCAACTTGAAATTGTCCTTCTGTTTGAACAACCTCCATTCTCCCAATGCTCTTCGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364801 293 + 636262 TCCTAACACTTCTGAAACTAAATGTAGTTAATGTAGCAAGGCTGGAATAATTGTGATATTTCCTAAGGTACGTCTGTTCCACCCAGCGTTATGTGGTCTAGATTGTACTATGGAGAGTGCTACATCACACTTTA----AGAGAATAAGCATAGTCATCCAGGGCAGGCCTTGCCTCTTTAGCCATGCTGGTGCCTACTATGTATGGAAAATTTTTGTGCTAGACCAGTATTTAGCCTTTCCCATCCCAACTTGAAATTGTCCTTCTGTTTGAACAACCTCGATTCTCCCAATGCTCT----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 357242 296 + 647215 TACTAACACCTTTGAAACTGAATGTACTAAATGTAGCCAGGCTGGAATAATTATGATATTTCCTGGGGTATGTCCATCCCACTCGGCGTCAGG----CTAGATCATGCTACGGAGACTGCTACATCACACTCTATATGAGAGAGTAAGCATAGTCATCTATGGCAGG--TTGCCTCTTTAGCCATACTGGTACCTAACATGTATGGATAATTTTTGTGCTGGACCAGTATTTAGCCTTTCCCATCCCGACTTGACATTGTCCTACTGTTTGTACAACCTCCATTCTCTTGATGCTCTTCGTA - -a -s mr.mrrefChr5 212132 332 + 294542 GGGGTCCCCTTAATTTTATTTAATGGAATTGGATGCAAACAATGTTTGATTATTGACAATCAGGCCATGACACATTCCAAATTGTGGATTCTCAAAGTTACAAAAGTAATGGTATGAAGCTTTTTTAGACACTGATATTTTTAGAGGTTGCTGCAATGACGCTTCCACACCTTATTCCCGCAGGTAGATGAAGTTTCAATTCCCTTGGGTTTTGTCCGACTGGTAGAGCACAGTTAACTAGGGGAGTCATCCTACACTGCCAACAGAGGTCACTGTTGGCCGTATATGGTGACTCCCCTGGTTCACTGCACTCTTGACCAATTAAGGAAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365094 332 + 636262 GGGGTCCCCTTAATTGTATTTAATGGAATTGGATGCAAACAATGTTTGATTATTGACAATCAGGCCATGAGACATTCCAAATCGTGGATTCTCAGAGTTACAGAAGTAATGGTGTGAAGCTTTTTTAAACATTGATACTGTTAGAGGTTGCTGCAATGACGCTTCCACGCCTTATGCCCGCAGGTAGAAGAGATTTCAATTCCCTTGGGTCTTGGCCTACTGGAAGAGCACAGTTAACTAGGGGAGTCATCCTACACTGCCAACAGAGCTCACTGTTGGCCGTATATGGTGACTCCCCTGGTTCACTGCACTCTTGACCAATTAAGGAAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 357539 331 + 647215 GGGGCCTCCTTAATTTTATTTAATGGAATTGGACATAAACAATGTTTGATTACTGACAATCAGGC-ATGACACACTCCAAATTGTGGATGTTCAAACTTACAAAAGTAATGGTATGAAGCGCTGCTAGACACTGATATTTTTAGAGGTAGCTGCAACAGGGCTTCCACACCTTATTCCCGTAGGTAGATGAAGCTTCAATTCCCTTGGGTTTTGTCCGACTGGTAGAGCACAGTTAACTAGGGAAGTCATCCTACACTGCCAACAGAGGTCACTGTTGGCCTTATATGGTGACTCCCCTGGCTCACTGCACTCTTGACCAGCTTAGGAAACC - -a -s mr.mrrefChr5 212464 68 + 294542 GATTGGGACTTACACCTACTTGGGGTTATCATAGTGGGTGTGGCTGCCTAAAAATATACATGTCTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365432 68 + 636262 GATTGGGACTTACACCTACTTGGGGTTATCATAGTGGGTGTGGCTGCCTAAAAATATACATGTCTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 357870 68 + 647215 AATTGAGACTTGCACCTGCTTCAGGTAGTAATAGTGGGTGTGGCTGCCTAAGAATATATGTGTCTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 212532 12 + 294542 TAGCTATGTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365500 12 + 636262 TAGCTATGTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 357939 12 + 647215 TAGCCATATATT - -a -s mr.mrrefChr5 212544 212 + 294542 CTGTTGCTTTGAAAACATGTAATTCAAAGCATGTCAGTGGCATTGGTCTCACAAATAATTCCACTGCACAGCAGGAGTATGAGCAATGAGCATCATTGACATCCTCGTTGACTTCCACTTGGTTTAGTCTTATAATTGTTTACAACCAATTTGTGCAGTGTATATTATTTAGGTGGCACCTGCCCACAACACTCTCTGTCAGATGGTAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365512 212 + 636262 CTGTTGCTTTGAAAACATGTAATTCAAAGCATGTCAGTGGCATTGGTCTCACAAATAATTCCACTGCATAGCTGGAGTATGAGCAATGAGCATCATTGACATCCTCGCTGACTTCCACTTGGTTTAGTCTTATAATTATTTACAACCAGTATGTGCAGTGTATATTATTTAGGTGGCACCTGCCCACAACACTCTCTGTCAGATGGTAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 357958 212 + 647215 CTGTTGCTTTGAAAACCTATAATTCAAAGCATGTCAGTGGCATTGGTCTAACAAATAATTCCACTGCACAGCAGGAATATGAGCAATGAGCATCATTGACATCCTCTTTAACTTCCACTTAGTTTAGTCTTATAGTAGTTTACAACTAATTTGTGCAGTGTATATCATGTAGGTGGCACCTGCCCGTGACCCACTTGGTCAGATGGCAAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 212756 24 + 294542 CCGTGCTAAGCAATGTGCTTTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365724 24 + 636262 CCGTGCTAAGCAATGTGCTTTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 358176 24 + 647215 CCATGTTAAGCGATGTGCTTTTTA - -a -s mr.mrrefChr5 212780 13 + 294542 GAGTGCTTAACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365748 13 + 636262 GAGTGCTTAACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 358201 13 + 647215 GAGTGCTTAACAG - -a -s mr.mrrefChr5 212793 43 + 294542 TGAGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365761 43 + 636262 CAAGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 358215 43 + 647215 TGTGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCG - -a -s mr.mrrefChr5 212836 224 + 294542 AGGAATTGACCTGCCACTCCCGTTTGGCTGGGTGATTTTGTTGGCACCTAAGAAGACCATGCTGCAGGAGACCCAAAGACTGAGGCAGAATACTCTTCATCCGATTGCAGCATATTACCTGGTCATATGGTCCTCCTTTCTGCCTGATGAATGGCTCCTGGACAAGTGTGAGCATATCTCTTAATATCTTATTTACATACACATATAAGGTTTGATCACTTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365804 221 + 636262 ---AATCGACCTGCCACTCCCGTTTGGCTGGGTGATTTTGTTGGCACCTAAGAAAACCATGCTGCATGAGACCCAAAGACTGGGGCAGCATACTCTTCATCCGATTGTAGCATATTACCTGGTCATATGGTCCTCCTTTCTGCCTGATGAATGGCTCCTGGACAAGTGTGAGCATATCTCTTAAGATCTTATTTACATACACATATAAGGTTTGATCACTTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 358260 223 + 647215 AGGAATTGACCGTGCACTCCCATCTGGCTAGGTGATTTTGTTG-CACCTAAGCAGATCATGCTGCAGGAGACCCAAAAACTGAGGCGGAATACTCATCATCCAATTGCAGCATATTACCTGGTACTATGGTCCTACTTTCTGCCTGATGAATGGTTCCTGGACAAGTGTGAGCATATCTCTTAATATCATATTTGTATACACATATGAGTTTTGATCACTAGGT - -a -s mr.mrrefChr5 213060 383 + 294542 AGATAGATATGTTAGTTAATGAAACAGTTATACAAAGAGTGGTTAAGGTAGCAGAAACCTCCAACCATGAAAGCAGTGCTTTCAGATGTGTCATGGCTGAGAGGACCACCCAACCTAACTCCCTCTAGAACATACAAATAAGCTCTCCAAAGCAACCGATGACAGGTGTGCTTATGCAACAGCTAATGGGACTGCAACTTCATGGTCACTCAAGCTCTACACCTAATGTAGTGTTCAAATGGTATACACTCCAGCGATTGCTAAGCCACCATTAAGTAGGAGCAATTTAAGATTAATCATTGTTCGTTGATAGCAGCACTAAGAAGAACTTCATGCATGACTTATATCTATAGGAGGTCTCAAAGCACCAAAGCCAAAGGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 366027 383 + 636262 AGATAGATATGTTAGTTAATGAAACAGTTATACAAAGAGTGGTTAAGGTAACAGAAACCTCCAACCATGAAAGCAGTGCTTTCAGATGTGTCAGGGCTGAGAGGACCACCCAACCTAACTCCCTCTAGAACATACAAATAAGCTCTCCAAAGCAACCGATGACAGGTGTGCTTATGCAACAGCTAATGGGACTGCAACTTCATGGTCACTCAAGCTCTACACCTAATGTAGTGTTCAAATGGTATACACTCCAGCGATTGCTAAGCCACCATTAAGTAGGAACAATTTAAGGTTAATCATTGTTCATTGATAGCAGCACTAATAAGAACTTCATGCATGACTTATATCTATAGGAGGTCTCAAAGCATCAAGGCCAGATGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 358483 380 + 647215 AGATAGATACCTCAGTTAGTGAAA--GGTATACAAAGAGTGAGTAAGATGGCAGAAACCTCCAATCATGAAAGCAGCGCTTTCCAGTCTGTCATGGCCAGGAGGACCACCCAACCCTATTCACACTAGAACATACAAATAAGCTCCCTGAAGCAACCAATCACGGGTGTGCTTATGCAACAGCCGATGGGTCTTCGACTTCATGGTCGCTCAAGCCCTACACCTGATGTAGTGTTCAAATCGCCTGCATTCCAGCCATTGCAAAGCCATCATTAAGTATGAGCAATTTAAGATTAATTATTGTTCGTTGATAGCAGCACTAAGAAGAACTTCATGCATGACTGATATCTATAGGAGGTCTCAAAGCACCAAAACCAAAG-CCT - -a -s mr.mrrefChr5 213443 32 + 294542 GACATTGTGCCAACCTTAGTAAGTTTTGAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 366412 32 + 636262 GCTATTGTGCCAACCTTAGTAAGTTTTGAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 358863 32 + 647215 GACATTGTGTGAACCTTAATAGGTTTTGAACG - -a -s mr.mrrefChr5 213475 468 + 294542 AGTCCTCATGGCCTATTTATTGAACCTGGAGATCAGATGATTAGAATTTATTATATAGGGATTCTCAAAAGCCTGACTCAATGAATTAGAAATATGAGGGGGAAGCAAGTTTGCATACTTTATGCAGATACTGGGAGATAGAAGTAACACTATCAGTTAGGAGATTACCCAAAACCCGCACTGGAAAAATACTGCTCGTCATGAGTATTAGAATGGTGTCACTGATAAATGTTATTGAAGGGCCATGTCCTACAATTCATCCTACACTTAAAAATCTTGTCCACTTACATACCAATCCACTTACAGGTGTTGTTGAGTGGTAAAAGTGACCATGTAAGGCTGGCAACAGATCTCATGGGAAGCGCTTCCTTGTTTGGTGGAGTCCATCTCAGTCCTCCAGTTCAATTAATAGAGGACTTGAATGAATAAGGGTGTGATCCAATTGCATACCATTAGTCACCAATGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 366444 468 + 636262 AGTCCTCATGGCCTGTTTATTGAACCTGGAGATCAGATGATTAGAATTTATTATATAGTGATTCCCAAAAGCCTGACTGAATGAATTAGAAATATGAGAGGGAAGCAAGTTTGCATACTTTATGCAGACACTGGGAGATAGAAGTAACACTATGAGTTAGGAGATTACCCAAAACCCGCACTGGAAAAGTGCTGCTCGTCAAGAGTATTAGAATAGTGTCACTGATCAATGTTATTGAAGGGCCATGTCCTACAATTCATCCTACACTTCAAAATCTTGTCCACTTACATACCAATCCACTTACAGGTGTTGTTGAGTGGTGAAAGTGACCACATAAGGCTGGCAACAGATCTCATGGGAAGCGCTTCCTTGTTTGGTGGAGTCCATCTCAGTCCTCCAGTTCAATTAACAGAGGACTTGAATGGATAAGGGTGTGATCCAATTGCATACCATTAGTCACCAATGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 358896 440 + 647215 AGTCCTCATGGCCTAATTGTTGAATCCGCAGATCA---------AATTTATTATATAGGGATTCTCAAGAGCCTGACTCAATGAATTAGAAATATGAGGGGGAAGCAAGTTTGCATACTTTATGCAGATACTGGGAGATAGAAGTAATGCTGTCAGGTAGGAGATAACCCAAAACCACTACAAGAAAAACACTGCTCGTCATGAG---TAGAATG--GTCACTGATAAGTGTTATTGAAGGGCCAGGTCCTACAATCCATCCTACACGTAAACATCTTGTC-------------ATCCACTTAGAGGTGTCGTAGAGTGGTACAAGTGACCATGAAAGGCTGGCAACAGATCTCATGGGATGCGCTTCCTTGTTTGGTGG-GTCGATCTCAGTCCTCCAGTTCAATTAATAGAGGGGTTCAATGAATAAGAGTGTGATGAGGTTGCATAACATTAGTCACCAATGGGT - -a -s mr.mrrefChr5 213943 80 + 294542 GATGGAAAAAGGAACACCTTCAACATTAAGCTTACACCTGCACATAAACGTGGCACTGACACATAAACATGCTAAAGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 366912 80 + 636262 GATAGAAAAAGGAGCACCTTCAGCATTAAGCTTACACCTGCACATAAACGTGGCACTGACACATAAACATGCTAAAGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 359421 80 + 647215 GATGGAAAAAGGAACACCTTCAACATTAAGCTTACATGTACACATAGACATGACACCTAGGCATAAACATGCTACAGTTG - -a -s mr.mrrefChr5 214023 252 + 294542 CAAACAGACTGCTAGACCGTATGTCTCATCCCAGATTGATACATGTACCCAAGCAGAACTTTGAGGGGCCACTGCCCTACAACGTCATTGTATACAATGGAAAAAAAGAATAGTTAGCTGGCCAGAAATCCTAGCTCTGAAAGATGAAGAAAGTGGCCTTCCTGGTATGATGGAAGACACTGTTATACTTTTAAAGCAATTAGTCAATTCAATGCAAATCCCAAATCCCACAAAAGGCTACAATCTTTACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 367005 250 + 636262 CAAACAGACTGCTTGACCGTATGGCTCA-CCCTGATTGATACATGTACCCAAGCAGAACTTTGAGGGGCCACTGCCCTACAACGTCATTGTATACAATGGAAAAAAAGAATAGTTAGCTGGCAAGAAATCCTAGCTCTGAAAGATGAAGAAAGTGGCCTTCCCGGTATGATGGGAGACACTGTTATACTTTTAAAGCAATTAGCCAATGCAATGCAAATCCCAAATCCCAC-AGAGGCTACAATCTTTACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 359501 245 + 647215 CAAACAGACTGCCATACCTTATGTCTCATCCCAAATTGATACATGTATCCAGGCAAAACTTTGAGGGGCCACTGCCCTACAACGTC----TATACAATGGAAAAAAAGAATAGTTCGCTGGCCAGAAATCCTAGCT---AAAAGTGAAGAAAGTGGCCTTCTTGGTATGATGGAGGACACTATTATACTTTTAGAACAATTAGTCAATTCAATGCAAATCCCAAATCCCACAAAAGGCTACAATCTTTACTC - -a -s mr.mrrefChr5 214275 159 + 294542 AGGCCACAAGGAAGACTAATATGACTGTTCTTTGATATGAATCTCTCCAATCTGGAGGAAGGCGCATGCTCTAGAACTGCATTGGCAAACTGGGTATAAAAAAGAGAGGATTTCAAGTGTTACAGGCAGTAGGTAACACCCCTTTATTTACCTTCTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 367255 158 + 636262 AGGCCACAAGGAAGACTAATATGACTGTTCTTTGATATTAATTTCTGCAATCTGGAGGGAGGCGCATGCTCTAGAACTGCATTGGCAAACTGGGTATAAAAAAGAAAGGTTTTCAGGTGTTACA-GCAGTAGGTAACACCCCTCTATTTACCTTCTCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 359752 153 + 647215 AGGCCACAAGGAAGGCTAATATGGCTGTTCTTTGATATGAAACTCTCCAATCTGGAGGAAGGCATATGCCCTAGAACTGCATTGGCAAACTGG--ACAAAAAAGGGACGATTTCAAGTGTTACAGGCAGTAGGTAACACCCCTTTATTTACCTTC---- - -a -s mr.mrrefChr5 214434 267 + 294542 GATTTTTTCAGCTAATCTGACTATCTGGTGGTAGCCATCTTTTGCAGAGGTTGGCTCATGCCAGGACTCATTAAATAGAGATTGAAGCAGGGTACAGGAAATGACTATTCCACCAATTATAACAGGACTTCCACATCTGGGCAGATTAGGAAAGTGTGATTTGCCTGACTAATGGTCTGTATGAGACAGTCTGAGTTGTGGCTACAGTGTTTCTGGACCCAGCATCGCAGAGCACCCCCAGACCTAGGATTCCTGATATGAGCATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 367415 266 + 636262 GATTTTTTCAGCAAATCTGACTATCTGGTGGTAGCCATCTTTTGCAGAGGTTGGCTCATGCCAGGACTCATTAAATAGAGATTGAAGCAGGGTACAGGAAATGACTATTCCACCAATTATAACAGGACTTCCACATCTGGGCAGATTAGGAAAGTGTGATTTGCCTGACTAATGGTCTGTATGAGACAGTCTGAGTTGTGGCTACTGTGTTCCTGGACCCAGCATCACAGAGCGCCCCCAGACCTAGGATT-CTGATAGGAGCATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 359905 155 + 647215 AATTTTTTCAGCTAATCTGACTACCTGGTGGCAGCAATTTTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTGATTTGCCTGATTAATGGTCAGTATGCGACAGTCTGCGTTGTGGCTACAGTGTTTCTGGACCCAGCATCGCAGAGCACCCCCACACCTATGATTCCTGACATGAGCATGT - -a -s mr.mrrefChr5 214701 387 + 294542 ATGAGAAGAAATGCTATTACATAGAAACACAAAGATGGGACTAATGAGAGACAAAAACAAACTTCAAAGACTATAACTGGGAACCAGGAGGACAAGTTATAGAATAAACACTGAAAATTATGAACTCATTGGCTAGGAGGGACAGGAACAGTAACTTGAGCCTTCATGGAAAACACGCTTTAAGTACAACAGGAGTATAGTAGGAATGGGGACACTTAACTGCTAGCCCAGTTGACCCCTTGATACTAACTATGCTATGGCTAAACCTCAGGTAACCATTATTATCTAGGTCATCAAGGTCATACTCACAAAGAGTCATGCTTATACCAACTACTCTGTAAGGCACCCTGGATATTATGTGCCTAGTCATCCAACCAGACAGTTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 367682 358 + 636262 ATGAGTAGAAATCCTATTACATAGGAACACAAAGATGGGACTAATGAGAGACAAAAACAAACTCC----------ACTAGGAACCAGGAGGAGAAGTCATGGAATAAACACTGAAA---ATGAACTCATTAGCTGGGAGGGACAGGAACAGTAACTTGAGCCTTCATGGAAAACACGCTTCAAGTACAACAGGAGTATAGACAGAATGGGGACGCATAACTGGTGGCCCAG-TGACCCCTTGATACTAACTATGCTATGGCTAAACCTCAGGTGATCATTATTATCTAGGGCATC---------------AAGAGTCATGCTTATACCAACTACTCTGTAAGGCACCCTGGATATTATGTGCCTAGTCATCCAGCCAGACAGTTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 360060 383 + 647215 ATGAGAAGGAATGCTATTACATAGAATCACAAAGATGGGACTAATGAGA---CAAAACAAACTTCAAAGACTATAACTGGGAACCAGGAGGCCAAGTTATACAATAAACACTGAAGATTATGAACTCAATGGCTAGGCGGGACAGGAACGTTAACTTGCGCCTTCATGAAAAACACACTTTAAGTACAACAAGAATATAGTAGGAATGGGGACACTTAACTGCTATCTCAGTTGACCCCTCAATACCAATTATGTTATGGATAAACCT-GGGTAACCATTATTATCTAGGTCATCAAGGTCATACTCACAAAGAGTCATGCTTATATCAACCACTCAGTAAGGCTCCCCCAATATTATTTGACTAGTGATCCAACCAGACAGTGGGA - -a -s mr.mrrefChr5 215088 23 + 294542 GAATACTTTGGTTGTATAAACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368044 23 + 636262 AGATACTTTGATTGTATAAACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 360443 23 + 647215 GAATACTCTGGTTGTATAAATTC - -a -s mr.mrrefChr5 215111 18 + 294542 TTCCTGAATTAGACAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368068 18 + 636262 TTCCTGAACTAGACAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 360466 18 + 647215 TTCCTGCATTAGACGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 215129 161 + 294542 GAAGGCTTTGAGCTGAGGGTCATTTAACATCTTATTAGTACTAGGTGCAGTGCCTGAGACCCACTAGTCTTTCTATGTCTGACATCCCATATAATAGAAGAAGTTCTCACTAACTATTGTCAAAAGTTCTTGCTGATTATTGTCAAGGCACCCATCTTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368086 161 + 636262 GAAGGCTTTGAGCTGAGGGTCATTTAACACCTTATTAGTACCAGGTACAGTGCCTGAGACCCACTAGTCTTTCTATGTCCGACATCTCATATAATAGAAGAAGTTCTCACTAATTATTGTCAAAAGTTCTAGCTGATTATTGTCAAGGCACCCATCTTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 360500 161 + 647215 GAGGGTTTTGAGCTGAGGGTCATTTAAGATCCTATTAGTACTGGGTGCAGTGCCTGATACCAACTGGTCCTTCCATGTATGATGTTCCATATAATAGAAGAAGTTCTCGCTAACTATTGTCAAGAGTTCTTGCCAATTAGTGTTAATGCGCCCATCTTGAG - -a -s mr.mrrefChr5 215290 34 + 294542 GACATATCGCCCTTCATGACAGGCCCTGGAATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368247 34 + 636262 GACATATCGCCCTTCAAGACAGGCCCTGGAATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 360665 34 + 647215 GACATATCGCTCTTCATGACAGGCTCTGGAATCC - -a -s mr.mrrefChr5 215324 28 + 294542 TAGACCCATATCTTTGAAGGCAACAGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368282 28 + 636262 TAGTCCCATATCTCTGAAGGCAACAGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 360699 20 + 647215 AAGACCCATATCTTTCAAGG-------- - -a -s mr.mrrefChr5 215352 102 + 294542 TTTTTGTAGTATCAGCACAGACATGTTGAAGTACCATGACCCAGGTCTGGTAGGCATGGTTCAGGTCAAGGTGAGAGAAGAAAGATTACAATGCCTGAACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368311 102 + 636262 TTTTCGTAGCATAAGCACAGACATGCTGAAGTACCATGACCCAGGTCTGGTAGGCATGGTTCAGGTCCCGGTGAGAGAAGAAAGATTACAATGTCTGAACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 360719 101 + 647215 -TTTTGTAGTATCAGCAAAGATATGTTAGAGTAACATGACCCAGTTCTGGTCAGCATGATTCAGGTTAAGGTGAGAGAAGAGAGATTACAATCCCTGAACAC - -a -s mr.mrrefChr5 215454 97 + 294542 CCACTTTAGTGACTTCTATAGGGTATTCTTAATGTGAATCTGACAAGCCTGCACATCAGTGTATTCTGTATTCCTGGTACCATAGTTCTAAAATCGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368413 97 + 636262 CCACTTTAGTGACTTCTATAGGGTATTCTTAATGTGAATCTGACAAGCCTGCACATCAGTGTATTTGGTATTCCTGGTACCATAGTTCTAAAATCGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 360824 97 + 647215 CCAATTTAGTGCCTTCTATATGTTACTCTTAATGTGAATCTGACAAGCCTGCACATCAGTGTATTCTGTATTCCTGGGACCATAGTTCTTAACATGC - -a -s mr.mrrefChr5 215551 121 + 294542 TTTGGATGCACTGCAATTATTCTCAGGCATATCCGTAAATAAAGTATTAAATCAGTGTCTGTACTTTTCTGTATTAAAAGGTGTCTAATTGCTTTTGCCTAGCCTACATGGATGGTATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368525 92 + 636262 TATGGATGCACTGCAATTATTCTCAGGCATATCTGTAAATAAAGTATT-AATCAGTGTATGTACCTTCCTGTATTAAAAGGTATCTATTTGCT---------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 360921 121 + 647215 TTTGGATGCACTGCCATTATTCACAGGCATATCCGTAAATAAAGTATTAAATCAGTGTCTGTTCTTTTCTGGATTAAAAGGTGTCTAATTGCCTTTGCCTAGCCTACATGGATGGTATGTT - -a -s mr.mrrefChr5 215672 99 + 294542 CAGTATCCGCTCAATGCCCACTTATCCCCCTTTTGGAAAGGAAATATTCAATCAACTCTTAGGAGTAATTGTCAGGCTGTATGGTACAGGACCCCAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368617 92 + 636262 --GTATCCGCTCAATGCCCACTTATCCCCCTTTTGGAAAGTAAATATTCAATCAACTCTTAGGAGTAATTGTCA-----GATGGTACTGGACCCCAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 361043 92 + 647215 CAGTAACTGCTCAATGTCCACTTATCCAC-------AAAGGAAATATTCAATCAACTCTTAGGAGTCATTGTCAGGCTGTATGGTACAGGTCCCCAAGC - -a -s mr.mrrefChr5 215771 29 + 294542 CTCTGATTTCATACACTGAGTCTCTTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368711 29 + 636262 CTCTGATTTCATACACTGAGTCTCTTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 361135 28 + 647215 CTCTGATTTTA-ACACTGAGTCTCTTTAG - -a -s mr.mrrefChr5 215800 59 + 294542 TGCCATCACACACAGTCTTAAAGAATCTGTTGGGATAAACCAGAAAGAAAGAAATCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368740 50 + 636262 --------CACACAGTCTTAAAGAATCTGTTGGGATAAACCAGAAA-AAAGAAATCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 361165 57 + 647215 TGCCATCACACACAGTCTTAAAGAATCTGTT--GATAAACCAGAAAGAAAAAAATCAGC - -a -s mr.mrrefChr5 215859 206 + 294542 GGTTTGCCTCAACATCAGGTAAGCGTGGTCCCAACTGTTATTACAGGGCATTGGCCTGCGTGAATGGGTGATACATTGATGACACGAAACTGTGATCACCCAAATTATGTCACCCTTGGCAGCCTATACAGTAGCTATGGATTTATGGACACCTATATTGCAGCTGTTCATTTATGGAGGAGCCTATCCGGCAGCTATTGTGTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368791 206 + 636262 GGTTTGCCTCAACATCAGGTAAGCGTGGTCCCAACTGTTATTACAGGGCATTGGCCTGCGTGAATGGGTGATACATTGATGACACGAAACTGTGATCACCCAAATTATGTCACCCTTGGCAGCCTATACAGTAGCTATGGATTTATTGACACCTATATTGCAGCTGTTCATTTATGGAGGAGCCTATCCGGCAGCCAGTGTGTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 361222 197 + 647215 GGATTACCTCAACATCAGGTAAGAGTGATCCCTATTCTTATTACAGGGGATTGGCCTGTGTGAATGCGTAATACGTTGGTGACAGGAAGCTGTGATCACCCAAATTTTGTCACCCTTGGTTGCCTAGACAGTAGCTATGGATTTGTGGATGCCTTTATTGCAGCTGT---------GAGGAGCTTATCCGGCAGCTATTGTGTTAC - -a -s mr.mrrefChr5 216065 199 + 294542 CAATGTAACACCAGTATACATCAGATATTAAGGAGCTGTATCATACTATTGAGGGATCACCATCCTGCTATTAACTACCATTAAAGAGAGGTCCAGTCTTCCTGCAGTGGCTGACAAAATTAAACCTTTCAAAAATTAACTCAGCCTGTAGCCTACAAATTGGTGTGTGTTGGATACTTGTTATGATATCACTAGCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368997 186 + 636262 CAATGTAACACCAGTATACATCAGATATTAAGGAGCTGTATCATGCTATTGAGGTATCACCAT-CTGCTATTGACTACCATTAATGAGAGGTCTGGTCTTCCTGCAGTGGCTGACAATATTTAACCTTTCAAAA--TAACTCAGCCTGTAGCCTACAAATTGGTGTGTGTTGGATACTTGTTAT----------GCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 361424 199 + 647215 GAATGTAACATTTGTAGACACCAGCTAGCATGGTGCCGTATCATACCATTGAGGGATCACCATCCTGCTATTAACCACCATTGAAGAGATGTCCAGTCTTCCTACAGTGGCTAACAAAATTAAACCTTTCAAAAATTAACTCAGCCTGTAGCCTATGAATTGGTGTGTGTTGGATCCTTGTTATGATATCACTAGCCAC - -a -s mr.mrrefChr5 216264 129 + 294542 CCTGTGATTAAGTGAGAGGCAATTGCATGTGTCCAGTGCCTGTTCTAATCCTATTTGGCTCGGACAAATTAGTATAAATCATTAACTAATGGCTTTGAGCGATTTCGACATTCGTATGAGTAACAGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369183 121 + 636262 CCTGTGATTAAGAAAGAGGCAATTGCTTGTGTCCAGTGCCTGTTCTAATCCTATTTGGCTCGGATAAATTAGTAAAACTCATTAACTAATGGCTTTCAGCGATTTCGACATTCGTG--------AGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 361628 129 + 647215 CCTGCAAATAAGTGAGAGGCAATTGCATGTGTCCGGTGCCTGTTCTAACCCTACTTGGCTCGGACAAATTAGTATAAATCATTAACTAATGGCTTTGAGTGATTTCTACATTCATATGAGTAACAGCAC - -a -s mr.mrrefChr5 216393 36 + 294542 CGGCCTGATCTCTTCCTTCTCCTTGGGCGGCAATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369304 36 + 636262 CGGCCTGATCTCTTCCTTCTCCTTGGGCGGCAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 361760 36 + 647215 CGGCCTGGTCTCTTCCTGCTCCTTGGGCGGCAATCT - -a -s mr.mrrefChr5 216429 98 + 294542 ACATGCATCTGTCATGAATAACTTGTCAAAAGACCCACTGGGGCACACATTTGTAGTGCCACTCCGAGTAACTTTGAGATGAGTGAATGACTTCTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369343 98 + 636262 ACATGCATCTGTCATGAATAACTTGTCAAAAGACCCACTGGGGCACACATTTGTAGTGCCACTTCGAGTAACTTTGAGATGAGTGAATGACTTCTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 361796 93 + 647215 ACACGCATCGGTCGTGAATAACTTGTCAAAAGACTGACGGGGGCACACACTTGTAGTGACCCTCCGAGTAACT-----ATGACTGAATGACTTCTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 216527 56 + 294542 ATAGGTAGGCCTTGCGGCCAGGTACTTTTCCAAAGCGATCAAACCTGGGTTCAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369441 56 + 636262 ATAGGTAGGCCTTGCGGCCAGGTACTTTTCCAAAAAGATCAAACCTGGGTTCAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 361925 56 + 647215 ATAGGTCGGCCTTGTGGCCAGGTACTTATCCAAAGCGATCAAACCTGGGTTCAGGA - -a -s mr.mrrefChr5 216583 151 + 294542 CACCTGGTCTGGCGCATTGACCTTCAATCTCATTGGCGATCATGCATCCTCGAGGTGTCTGGGAACGTTAATGGTCTGCAATGAGCGCCACGTATCTTGGGCCTATAGTGGTCCGAAAATGGTGAAAGGTGAGAAGACAAGCATTTATGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369497 151 + 636262 CACCAGGTCTGGCGCATTGACCTTCAATCTCATTGGCGATCATGCATCCTAGAGGTGTCTGGGGACGTTAAGGGTCTACAATGAGCGCCACGTACCTAGGGCATATAGTGGTTCGAAAATGGTGAAAGGTGAAAAGAAAAGCACCTATGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 361986 151 + 647215 CACCTGGTCACGCGCATTGACCTTCAATCTCATTGGCGATCATCCATCCTCGAGGTGTCTGGGAACGTTAATGGTCTGCAATGAGCGCCACGTATCTTGGGCCTATAGTGACCCAAAGATGGTGAAAAATGAGAAGACAAGCATTTATGGC - -a -s mr.mrrefChr5 216734 38 + 294542 TGACCACCTTCCTGGTGTTAGGCAGTAGGTTTACAGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369660 38 + 636262 TGATAACCATCCTGGTGTTAGGCAGTAGGTTTACAGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 362137 12 + 647215 TGACCCCCTTCC-------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 216772 48 + 294542 GTAGTCTAATCTCAAATAGTCATGGTAAACCCGCCTTATATAGTGACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369711 48 + 636262 GTAGTCTAATCCCACATAGTCATGGTAAGCTCGCCTTATATAGTGACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 362149 35 + 647215 ---GTGGAGTATCAAATAATCATGGTAAACCCGCCTTA---------- - -a -s mr.mrrefChr5 216820 20 + 294542 CTCCCCCAATCACCCTCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369760 20 + 636262 CTCCCCCAATCACCCTCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 362184 20 + 647215 CTCCCCCAATCATCTTCCTT - -a -s mr.mrrefChr5 216840 48 + 294542 ATACACACTTCCTTATGTAGCCCTGCTACATTAGCATCTCATGTATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369780 48 + 636262 ATACACACTTCCTTATGTAGCCCTGCTACATTAGCATCTCATGTCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 362205 48 + 647215 ATACACACTTTCCTTTGTAGCCCTACTACATTAGCATCGCATGTATGT - -a -s mr.mrrefChr5 216888 40 + 294542 GAGTCAGACAGGCCCATGGTTACTATATGCTAGAAGAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369870 40 + 636262 GAGTCAGACAGGCCCATGGTTACTATATGCTAGAAGAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 362253 40 + 647215 GAGACAGACAGGCCCATGGTTACTATATTCTAGAAGCATA - -a -s mr.mrrefChr5 216928 309 + 294542 ATCTATCTGGTATCACCTGTGTATTCTCATGGCTACATAGACAAGAGGTTGCAAACAATGCATATCAATTTCCAAAATTTCCAAAATAGAGACAAATTTGAGGACTTCATAGGATGTAGGAACAATGAAATCTTTCAAAGTGTTTGGCTGTCTGTAGTACTCCCAGTGTTTGTGGCTCTATGTCATTTTAATTTGGGAAGTTGCAGGAGATGAGACCACTAGGACCCAATCCTAATTTGTGTCAAGGTCCATGATTCAGCTAATTCTATAATGCCATTGCCTTAAAGACATCTGTCACTTAATACAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369910 306 + 636262 ATCTATCTGGTATCACCTGTGTATTCTCATGGTT---TAGACAAGAGGTTGCAAACAATGCATATCAATCTTCATAATTTCCAAAATAGAGACAAATTTGAGGACCTCATAGGATGTAGGAATAATGCAATCTTTCAAAGTGTTTGGCTGTCTGTAGTTCTCCCAGTGTTTGTGGTTCTATGTCATTTTAATTTGGGAAGTTGTAGGAGATGAGACCACTAGGACCTAATCCTAATTGGTGTCAAGATCCATGATTCAACTAATTCTATAATCCCATTGCCTTAAAGACATCTGTTACTTGACACAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 362317 309 + 647215 ATCTATCTGGTATCACCTGTGTATTCTCATGGCGACATAGATGAGGGGTTGCAAACAATGCATATCAGTTTCCAAAATTTCCAAAATAGACACAAATTTGAGGAGTTCATAGGATGTTGTAACAATGAAATCTTTCAAAGTGTTTGACTGTCTGTAGTACTCCCAGTGTTTGTGGCACTACGTTATTTTAATTTGGGAAATTGCAGGAGATGAGACTACTAGGACCCAATCCTAATTTGTGTCGAGGGCCACGGTTCAGCTAATTCAATAATGCCATTGCCTTAAACACATCTGTCACTTAATACAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 217237 62 + 294542 GCTTCTTATCTTAATCAGGGGGTCATTATCTAGTCAAAGCAATCCTGCCCTTGGGGGTGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370216 62 + 636262 GCTTCTTATCTTAATCAGGGGACCATCATCTAGTCAAAGCAATCCTGCCCTTGGGGGGGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 362630 62 + 647215 CCTTCTTATCTTAATCAGGGGGTCATTATCTAGTTAATGTGATCCCGCCCTTGGGGGTGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 217299 10 + 294542 TGTGTGCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370278 10 + 636262 TGTGTGCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 362702 10 + 647215 TGTGTGCCAA - -a -s mr.mrrefChr5 217309 131 + 294542 CCCAACTGTCCCCAGATGATGTAGTGGCAATTGAGGGTGGGTTAGGCTGATGGGGGTGAGTTCAAACAAGACTTCAGTAAATGCCCTGGCAAAAGCATATAGCCATTCTTTTTCCATAAAAGTGATGGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370288 131 + 636262 CCCAGCTGTCCCCGGATGATGCAGTGGCACTTGAGAGTGGGTTAGGCTGATGGGGGTGAGTTCAAACAAGACTTCAGTAAATGCCTTTGAAAAGGCACATAGCCATTCTTTTCCCATAAAAGTGATAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 362714 118 + 647215 CCCAACGGCCCCAAAATAATGTGGTGGCAATTGATGGTGGGTTAGAACAATGGGGGCTAGTTCAAACAAGACTT----------CCTGGCAAAAGTATGTACCCATTCTTTTTCCATAAAAGTGCTGG--- - -a -s mr.mrrefChr5 217440 133 + 294542 TAGACAACAAGACTTATATACCAATCAAGCCAGCACAGCACAGCTCACTTGAAATTGTCAATCTGACAGACAGTTCAACAGTATACTAAACTCATGTCAAAACTATTCAGCATTGACCAACCCTGCCGGCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370422 133 + 636262 TAGACAACAAGACTTATATACCAATCAAGCCAGCACAGCACAGCTCACTTGAAATTGTCAATCTGACAGACAGTTCAACAGTATACTAAACTCATGTCAAAACTATTCAGCATTGACCAACCCTGCCGGCATT - -a -s mr.mrrefChr5 217573 20 + 294542 GGATCTAGATGAGCTCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370558 20 + 636262 GGATCTAGATGAGCTCAGTT - -a -s mr.mrrefChr5 217593 22 + 294542 CATGTCACGGTCTCTCAGGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370579 22 + 636262 CATGTCACGGTCTCTCAGGTTC - -a -s mr.mrrefChr5 217615 25 + 294542 GAGCGCTCTAGTATGTGGATACAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370618 25 + 636262 GAGCGCTCTAGTATGTGGATACAAA - -a -s mr.mrrefChr5 217640 17 + 294542 ATCCTGGGTTTTGCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370645 17 + 636262 ATCCTGGGTTTTGCATC - -a -s mr.mrrefChr5 217657 20 + 294542 GTGTACTTTCAGGTAGCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370668 20 + 636262 GTGTACTTTCAGGTAGCATT - -a -s mr.mrrefChr5 217677 12 + 294542 AACGTATAGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370693 12 + 636262 AACGTATAGCCC - -a -s mr.mrrefChr5 217689 56 + 294542 GGTTATCTTTGATGCTGCATCAGGTGTGGTATATCTAGAGGGGCTGTATTACCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370707 56 + 636262 GGTTATCTTTGATGCTGCATCAGGTGTGGTATATCTAGAGGGGCTGTATTACCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 362832 35 + 647215 ---------------------AGGTGTGGTAGACCTAGAGGTGCAGTATTACGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 217745 70 + 294542 AAAGGCATTTGTGGCTATTATCTGTAATGGCGATTATCACCATCTTACGTTGACTCCATCTAGGCTTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370763 70 + 636262 AAAGGCATTTGTGGCTATTATCTGTAATGGCGATTATCACCATCTTACGTTGACTCCATCTAGGCTTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 362871 70 + 647215 GAAGCCATCTGTGGGGTATTTCTGAATTGGTGATTATCACTATCTTACACTGTCTCCATCTAGGCTTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 217815 26 + 294542 GTCTAGTTAGCTAATGAGTGTCACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370839 26 + 636262 GTCTAGTTAGCTAATGAGTGTCACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 362941 26 + 647215 GTCCAGTTGGCTAAAGAGTGTCACAA - -a -s mr.mrrefChr5 217841 28 + 294542 TTTGTTTGATAAATTTCACTGTACCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370865 28 + 636262 TTTGTTTGATAAATTTCACTGTACCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 363212 28 + 647215 ATTGTTTGATAAATTGCACTAAACCATC - -a -s mr.mrrefChr5 217869 45 + 294542 CTCAGTGACAAGTAAATCTGGAGATTGGCTGCAGCACTTGATAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370977 45 + 636262 CTCAGTGACAAGTAAATCTGGAGATTGGCTGCAGCACTTGATAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 363240 45 + 647215 CTCAGTAACAAGTAAATTTGGAGATTGGCTCTAATGCTGGATAGA - -a -s mr.mrrefChr5 217914 57 + 294542 TGGTAGGAGCTAGTTTAAGAAAAGTAACAACTAGTTTGAGGACCATTTATGCCTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371022 57 + 636262 TGGTAGGAGCTAGTTTAAGAAAAGCAACAACTAGTTTGAGGACCATTTATGCCTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 363286 57 + 647215 TGTTAGGAGTTAGGCTAATAAAAATAGCAACTAGTTTGAGGACCATGTATGCCTATG - -a -s mr.mrrefChr5 217971 68 + 294542 TGCCCCTGGAACTCATTTGTTTTTGCTTGCTTGTGGTATACAGAGTGCGGTGGTATACAGAATGCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371079 68 + 636262 TGCCCCTGGAACTCATTTGTTTTTGCTTGCTTGTGATATACAGAGTGCGGTGGTATACAGAATGCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 363432 68 + 647215 TGCCCCTGGAACTCATTTGTTTTTGCTTGCTGGTGGTTTACAGAGTGCTGTGGTGTACAGAATCCCAT - -a -s mr.mrrefChr5 218039 153 + 294542 GCATGGCAGCAGGAAGCATCAGCCCTGGGATAGAATGCTGTGTTGGTGTTCACTGCCATCAGGAGGGGAGAAAGAGGCTGCCTGTTGTCAACTTATACTCCACCATCTAATGGCATTTATGAGTGCTAGGAAATGAGGGAACTGCTTGAACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371165 152 + 636262 GCATGGCAGCAGGAAGCATCAGTCCTGGGATAGAATGCTGTGTTGGTGTTCACTGCCATCACAAGGGGAG-AAGAGGCTGCCTGTTGTCAACTTATACTCCACCATCTAATGGCATTTATGAGTGCTAGGAAATGAGGGAACTGCTAGAACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 363500 152 + 647215 GCATGACAGCAGGAAGCATCAGCCCTGGGATAGAATGCTGTGTTGGTGTG-GTTGCGATCAGGAGAGAAGAAAGAGGCTGCCTGTTGTCAACTTATACTTTGCCATCTAATGGCATTTGTGAGTGCTGGGAAACAAGGGAACTGCTTGAACTG - -a -s mr.mrrefChr5 218192 323 + 294542 CCTATGAATGGATCCATCCCTGCAATCTGAGACAGGATTTGAATTATTGAACTTATGGTTCTGCATGGTGAATGGAACACATGACTGCACTGGGATTCCAGCAATATATGAGTACACTTCTCCCATAAGATATCTAACTGAGACAGTCATGTAAATAATGTGATAAGTATTAGGATGAATTTTATGTTGGATACAGTTGTTGGTGCTCAAACCCATATTACTGTCATGACAATTCAAATCAATCATAAACACTTACCACTGAGCATCAATTGGGCCTAGACATGGAATGGAGACCATATGATTAAAAAGGTTACTGCAGGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371317 316 + 636262 CCTATGAATGGATCCATCCCTGCAATATGAGACAGGATTGGAATTATTGAACTTATGGTTCTGCATGGTGGATGGAACACATGACT-CACTGGGATTCCAGCAATATATGAGTACACTTCTCCCATAAGATATCTAACTAAGACAATCATGTAAATAATGTGGTAAGTATCAGGATGACTTTTATGTTGGATGCAGTTGTTGATGCTCAAACCCATATTACTGACATAACAATTCACATCAATCATAAACACTTACCA------ATCAATTGGGCCTAGATATGGAATGGAGACGATATGATTAAGAAAATTACTGCAGTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 363731 323 + 647215 CCTATGAATGGATCCATCCCTGCAATCTGAGACAGGATTTGAATTATTGAACTTATGGTTCTGCACAGTGAATGGAACACATGGCTGCACTGGGATTCCAGCAATATGTGAGTACTCTTATGTTATAAGTTATTTAACTGAGACGGTCATGTAAACAATCTGATAAGTATTGGGATGGATTTTATGTTAGATACAGTTGTTGGTGGTCAAACCCATACCACTGTCAGGTCGATCCAAATCAATCCTAAATACTTACCACTGAGCATCAATTGGGTCTAGACATGGAACGGAGACCATATGGTTAAAAAGGTTACTGCAGGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 218515 30 + 294542 GTGAGAGAACCTGGATGCAGCAAACAAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371653 30 + 636262 GTGAAAGAACCTGGATGCAGCAAACAAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 364054 30 + 647215 GTAAGAGAACTTGAACGCAGCAAACAGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 218545 75 + 294542 AATGGTGCAGCAATGCTACTCATGCCAATGTGAAGGAACCTGTGATGCTGAGGACAAAGTGAGTTTGTGATTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371683 75 + 636262 AATGGTGCAGCAATGCTACTCATGCAAATGTGAAAGAAGCTGTGATGCTGAGGACAAAGTGAGTTTGTGGTTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 364086 75 + 647215 AATGGAGCAGCAATGGTACTCATGCCAATGTGAAGGAACCTGGGATGCTGAAAACAAAGTGAATTTGTGATTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 218620 9 + 294542 GGTTGACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371759 9 + 636262 GGTTGACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 364161 9 + 647215 GGTTGACAC - -a -s mr.mrrefChr5 218629 22 + 294542 ACAACCTGGTGGAGGTTTTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371769 22 + 636262 ACAACCTGGTGGAGGTTTTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 364170 22 + 647215 ACAACATGGTATAAGCTTTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 218651 635 + 294542 GAGGTTTACATCCTGGTAGGTGCCTCTAGAGGCCTATTCGAATAATGAATACTTTTGGAATGGCAAACCAACTTTGCTACATTGCCCCTCACCCAATTTGAAGAAAAGTGCCTGGATCCTGGATGTAAGACAAGAAGGGCCCCAGAGGATGGCATATATGAGAGGAAGCAGAAACCACTCAATATAATACTATCCCAGTGTATAGATCAACTAATCTGCCAATGCCTTACTGGATGCTTATGGAGCAATTTTCAGGAGTGGAGTGACTTGGTCAAATAGCATGGGGTGTGGGAAGAACCTGATTCAGTGGCATACAGTGGATGCAGATAAGATCATAGACTACAAGGACAAAAACTGCGATAAGATTGCCCACTACACAATGCAAGGGACAGTGTTATCTGGCCTATCTAATAGGCCGGTGATGCGCAGGTGCTGGGGGACACTGTGATGGAGATCCAGGCTAGGAGAGTATTCCCACAAGAGACATTTAAACTACAGTTAGTACATCAATGTCATGTTAGTGGGCCCCAAGCTTTGTAGGGGGTTCCTAAACCAAGTAGCCATGATTATACAGTATTTATGGTATACAGTAATGGTCCAATGGCATGTTTCTGCAGCTCTTACTACTCCTTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371794 628 + 636262 GAGGTTTACGTCCTGGTAGGTGCCTCTAGAGGCCTATTCGAATAATGAATACTTTTGGAATGGTAAACCAACTTTACTACATTGCCCTTCACCCAATATGAAGAAAAGTGCCTGGATCCTGGATGTAAGACAAGAAGGGCCCCAGAGGATGGCCTATATGAGAGAAAGCAGAAACCACTCAATATAATACTATCCCAGTGTATAGGTCAACTAATCTGCCAATGCCTTACTGGATGCTTATAGAGCATTTTTCAGGGGTGGAGTGACTTGGTTAAATAGCATGGGATGTGGGAAGAACCTGATTCAGTGGTATACAGTGGATGCAGATAAGATCATAGACTATAAGGAC-AAAACTGCAATAAGATTGCTCACTACACAAGGCAAGGGACAGTGTTATC------ATCTAATAAGCCGGTGATGCGCAGATGCTGGGGGACACTGTGGTGGAACTCCAGGCTAGGAGAGTATTCCCATATGAGACATTCAAACTACAGTTGGTACATCAATGTGATGTTAGTGGGCCCCAAGCTTTGTAAGGGGTTCCTAAACCAAATAGCCATGATTACGCAGTAATTATGGTATACCGTAATGGTCCAATGGCATGTTTCTGCAGCTCTTACTACTCCTTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 364192 622 + 647215 CAGGTTTATATCCTGGTAGGTGCCCCTAGAGGCCTATTTGATTAATGAATACTTGTGGAATGCCAAACCAGTTTTGCTACATTGCCCCTCACCCAATTTGAAGAAAAGTGCCTGGATCCTGGATGTAAGACAGGAAGGGCCCCAGAGGATGACATATATTGGAGGAAGCTGAAACCACTCAATATAATACTATCCTAGTCTATAGATCAACTCATCTGCCAATGCCTTACTGGATGCTTATGGAGTGATTTTCAGGAGTGGCGTGACT----CAAATAGCATGGGGTGTGGGAAGAGCCTAATTCAGTGGCATACATTGGATGCGGATAGGATCATAGACTTCAAGGACAAAAACTGCGATAAAATTGCCCACTACACAATCCAAGGGACAGTGTTGTCTGGCCTATCTAATAGGCCAGTGATGGGCAGGTGCTGGGGGACACTGTGATGGAGATCCAGGCCAGTCAAGTATCCCCACAAGAGACATTTAAACCACAGTTAG---------GTCATGTCAGTGGGCCCCAAGCTTTGTCGGGAGTTCCTAAACCAAGTAGCCATGATTATACAGTATTCGTGGTACACAGCAATAGTCCAATGGCATGTTTCTGCAGTTCTTACCACTTTTGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 219286 49 + 294542 TTGCTACTACAATTGAGCTCAGACTCACAGCTGGCTGGCCCCAGATCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 372436 49 + 636262 TTGCTACTACAATTGAGCTCAGACTCACAGCTGACTGGCCCCAAATCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 364814 49 + 647215 TAGCTGCTATGATTGAGCTCACACTCACAGCTGGCTGGCCCCAGATCTA - -a -s mr.mrrefChr5 219335 160 + 294542 AGGTATTTGCAAAACTGTTAAGCCCAGTTTACCAGCATACTACACATTGGTGTGGGTAGTTTATGGGACAAAGATGTTGTGTAAGCATATTGTCATGACGACACTGCTCTTCTCTTAGCATTACAGGACCAGGTCAGGCACTGCCAACCCTTGAGTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 372486 156 + 636262 AGGTATTTGCAAAACTGTTAAGCCCAGTTTACCAGCATACTACACAATGGTGTGGGTAATTTATGGGACAAAGATGTTGTGTAAGCATATTGTCATGACGACATTGCTCTTTTCTTAGCACTACAGGACCAGGTCAGCCACTG-TAACCC---AGTATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 364863 151 + 647215 AGGTATTTGCAAAACTGTTCAACCCAGTTTACCAGCATGTTCCACATTGGTGTGGGTAGTTTATGGGACAA---------GTTAGCAAGTTGTCATAACAACACTGTTCCTCTCTTAGCCTTGCCAGTCCAGATCAGGCCCCGCCAACCCTTGAGGATTG - -a -s mr.mrrefChr5 219495 79 + 294542 CGGTTGCAGAGCAATGCAGACCAGCCCTTAAAAAATCAGGTTTGGCATAAAAAACCGGGTTTAGCATAATGATGTGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 372642 60 + 636262 CGGTTGCAGAGCAATGTAGACCAGCT-------------------GATAAAAAACCGGGTTTAGCATAATGATGTGCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 365015 79 + 647215 AGGTTGCAGAGTAATGCAGACCAGCCCTTAAAAAATCAGGTTTGGCATGAAAAACCAGGTTTGGCATGACCATCTTCTC - -a -s mr.mrrefChr5 219574 190 + 294542 TAAATGCCAGGCTTGGACCCACCAGATCTAGCCAAGGTGAACAGCATCACACTGAAAGACATTGCTTGACTTTTTTTTTCGACTGCATTGTTCTAATTAGATGGAGTTCTCTGTCAAACAACTTAGCTAGTTTGTGCAAGGAAAATTCACACAATCAAACAATTGGCTGAAACCTCCTTCTTTAAAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 372702 190 + 636262 TAAATGCCAGGCTTGGACCCACCAGATCTAGCCAAGGTGAGCAGCATCACACTGAAAGGCATTGCTCGGCTTGTTTTATCACCTACATTGTTCTAATTAGATGGAGTTCTCTGTCAAACAACTCAGCTAGCTTGTGCAAGGAAAATTCATACAATCAAACAATTGGCTCAAACCTCCTTCTTTAAAAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 365095 190 + 647215 GGAATGCCAGGCTTGCGCCCACCAGATCCAGCCAAGGTGAACAACATCACAGTGAAAGACATTGCTTGACTTTTTTTTTCGACTGCATTGTTTTAATTAGATGGAGTCCTCTGTCAAACAACTTGGCTAGTTTGTACAGGGAAAATTCACACAATCAACGAGTTGGATGAGACATCCTTCGCGAACACTT - -a -s mr.mrrefChr5 219764 51 + 294542 TGACACTCAGGTATTGTAGACTGGCCCTATTGAAAACCTCCCTTGGTAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 372897 51 + 636262 TGACACTCAGGTATTATAGACTCCCTCTATTGAAAATCTCCCTTGGTAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 365285 51 + 647215 TGAGACTCAGGAGTTGGAGACTGGCCCTATCAGATTCCTCCCTTGGTAACG - -a -s mr.mrrefChr5 219815 116 + 294542 CCAATGATAGCCCAGCTCTTTCTACTGTCCAGTTCTGTAACTTAGTAAATTCATCTCTTTCCACGTTCTGCATGCTATTGAGTCAGCCTTGTGAAAAGGAAGGTGTACTGACTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373074 116 + 636262 CCGGGGATAGCCCAGCTCTTTCTACTGTCCAGTTCTGTAACGTGGTAAATTCAGCTCTTTCCACGTTCTGTATGCTATTGAGTCAGCCTTGTGAAAAGGAAGGTGTACTGACTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 365336 116 + 647215 CGAATGGTAGCCCAGCTCTTTCCACTGTCCAGTTCTGTAACTTAGTAAATTCATCCCTTTCCATGTTCCGCGTGCTGTTGACTGGGCCTTGTGAAAAGGAAGGTGTACTTACTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 219931 6 + 294542 GGATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373190 6 + 636262 GGGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373349 6 + 636262 GTATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 365452 6 + 647215 GGATGA - -a -s mr.mrrefChr5 219937 1 + 294542 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373196 1 + 636262 G -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373359 1 + 636262 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 365458 1 + 647215 A - -a -s mr.mrrefChr5 219938 6 + 294542 GGCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373267 6 + 636262 GGCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373360 6 + 636262 GGCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 365459 6 + 647215 GGCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 219944 1 + 294542 T -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373366 1 + 636262 T -s simRat_chr6.simRat.chr6 365465 1 + 647215 T - -a -s mr.mrrefChr5 219945 45 + 294542 AACATTCTGACTCATTATTAGATGTTTGATTTTGATGTCCACTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373273 45 + 636262 AACATTCTGTCTCATTATTTGATGTTTGAGTTTGATGTCCACTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373367 45 + 636262 AAGATTCTGACTCATTATTAGAGGTTTGATGCTCATTGTTACTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 365466 45 + 647215 AAAATTCTGACTCATTATTAGATGTTTGATTTTTGTGTCCCTTTA - -a -s mr.mrrefChr5 219990 1 + 294542 C -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373412 1 + 636262 C -s simRat_chr6.simRat.chr6 365511 1 + 647215 C - -a -s mr.mrrefChr5 219991 31 + 294542 CAAATTGTACTCCTGTGGGTCATGTTCTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373318 31 + 636262 CAAATTGTACTCCTGTGGGTCATGTTCTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373413 31 + 636262 CAAATTGTACCCCGGTGGGTCATGTCCTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 365512 31 + 647215 AAAATAGTACTCCTGTGGGTCATGTTCCCCA - -a -s mr.mrrefChr5 220022 77 + 294542 GAAGAGCCAGTACATGATCCAACCCAGTTCTGGAGCAGATCCAATCTACCCTTTCTCAGCTATATGAATCATTCTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373445 77 + 636262 GAAGAGCCAGTACATGATCCAACCCAGTTCTGGAGCAGATCCAATCTACCCTTTCTCAGCTATATGAATCATTCTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 365543 77 + 647215 AATTAACCTGTACATGATCCAACCCAGTGCTGGAGCAGATGCAATCTGCCCTTTATCAGGTATATGATTCCTTTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 220099 38 + 294542 TATTAGCAAATTTCCTTTTCTATTAGGCTGTTATTACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373522 38 + 636262 TATTAGCAAATTTCCTTTTCTATTAGGCTGTTATTACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 365627 38 + 647215 TATTAGGTAATTTCCTTTTCCATTAGGCTGTTATTAAC - -a -s mr.mrrefChr5 220137 77 + 294542 TAATACAACATTCTGAGCTGACAGCCTTAACCACTGGCAAACATGCTGGCATGGATGAAATACAGATCCTTACCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373561 77 + 636262 TAATACAACATTCTGAGCTGACAGCCTTAACCACTGGCAAACATGCTGGCATGGATGAAATACAGATCCTTACCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 365665 77 + 647215 TAATACAACATTCTGAGCTGCCAGCCTTAACCACTGGCAAACATGCTGGCATAGAAAAGATAAAGAATCTCACCTTT - -a -s mr.mrrefChr5 220214 231 + 294542 TGCTAGGATCTCAAGCCCATCAGAAAGCCTATAAAGAGGGGTCCAGTATTATCATGGAATGTTGACCGAGTCTTGAACAGATCTTTATTATCTGGGAATGTTCTTTCTAGTGACCTGTTAGGCAGGGCCCTTTGCTCAATACCATTTTCATGGTGAAGATTTATGTTGGTGTGTTAGCTAGTAGTGGCACTACCTGAATATAGTACTCCTGTGGTTGAGCATTCTTTGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373643 231 + 636262 TGCTAGGATCTCAAGCCCATCAGAAAGCCTATAAAGAGGGGTCCAGTATTATCATGGAATGTTGACCGAGTCTTGAACAGATCTTTATTATCTGGGAATGTTCTTTCTAGTGACCTGTTAGGCAGGGCCCTTTGCTCAATACCATTTTCATGGTGAAGATTTATGTTGGTGTGTTAGCTAGTAGTGGCACTACCTGAATATAGTACTCCTGTGGTTGAGCATTCTTTGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 365742 231 + 647215 TGCTAGGATCTCAAGACTATCAGAAAGCCAATAAAGAGAGATCCAATATGAACATGGAGTGCTGACTGTATCTTGAACAGATCTTTATTATCTGGGAATGTTCTCTCTAGTGACCTGTTAGGCAGTGCCATTTGCTCAGTTCCATTTTCATGTTGAAGACCTTCGCCAGTGCGTTAGCTAGTAGGAGCAATACCTGAATATAGGACTCCTGTGGTTGAACATTCTTTACGG - -a -s mr.mrrefChr5 220445 83 + 294542 CACCTGTTTTGCTCTATGAGTTGCAATAAAGCCCGCAGAACTGGTAAGAGCCTGCTAACTGGACTAACCCAGATAATAGCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373876 83 + 636262 CACCTGTTTTGCTCTATGAGTTGCAATAAAGCCCGCAGAACTGGTAAGAGCCTGCTAACTGGACTAACCCAGATAATAGCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 365973 83 + 647215 CGCCTGTTTTGTTCTATGAGCTGCAATAAAGCCCACAGAACTGGTAAAAGCTTGCTAACTGAACCAACCCAGATAATAACCTG - -a -s mr.mrrefChr5 220528 13 + 294542 TTTTAACCCATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373959 13 + 636262 TTTTAACCCATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 366060 13 + 647215 TTCTAGACCATTC - -a -s mr.mrrefChr5 220541 26 + 294542 TAGACCAACCTATTCTAGACCCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373996 26 + 636262 TAGACCAACCTATTCTAGACCCCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 366073 26 + 647215 TAGACCAACCTATTCTAGACCCCAAA - -a -s mr.mrrefChr5 220567 24 + 294542 TATGATGTAGCATGGTCTTGCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374023 24 + 636262 TATGATGTAGCATGGTCTTGCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 366099 24 + 647215 TGTAATGTAGCACGGTCTTGTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 220591 268 + 294542 GAGTGAGTGGCTGGAGCAACAATGTGAACAATCACTCTCTCATAGGATATTGTTAGTTCATGTAGGCAAACTTAGGTATCATTCTCAGGGCTCGAGGGTGTGAAAATTTATTTGGAATCTATATGTAGTAGAAAGCAAAACTACTACGACAGTTGTTGAGTTGCTGTGTAGAGAAAAGATATAGGTGTCAAATTGTTAGCATATCATGGCCCACATGTAATACTAATCATGCAATACTAATCATGCTGATTGATGTTGCATACtatct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374047 230 + 636262 GAGTGAGTGG-------------------------------ATAAGATATTGTTAGTTCATGGGGGCAAACATAGGTATCATTCTCAGGGCTCGAGGGTGTGAAAATTTATT-------TATATGTAGTAAAAAGCAAAACTACTACGACAGTTGTTGCGTTGCTGTGTAGACAAAAGATATAGGTGTCAGATTGTTAGCATATCATGGCCCACATGTAATACTAATCATGCAATACTAATCATGCTGATTGATGTTGCATACTATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 366125 266 + 647215 GAGTCAGTGGCTGGAGCAACAATGTGAACAATCACTCTCTCATCGGATATT--TAGTTCATGTAGGCAAACTTAGGTGCCACTCTAAGGGCTGAAGGGTGTGGAAATTTATTTGGAATCTAGATGTAGTAGAAAGCAAAACTCCTACGACAGTCGTTGAGTTGCTGTGTAGAGAAAAGATATAGGTGTCAAATTCTTAGCATATCATGGCCCACATGTTATACTAATCATGCAATACCAATCATGCTGATTGATGTTGCATTGactct - -a -s mr.mrrefChr5 220859 26 + 294542 actgccgtcagtgttgagagtatcgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171716 26 + 636262 actgccgtcagtgttgagagtatcgt -s simRat_chr6.simRat.chr6 366392 26 + 647215 actactgtcggtgttgagagtaccat - -a -s mr.mrrefChr5 220885 190 + 294542 gggtagggaccttcccaatgggtatccagcaatggaggatgtgacggaagcgaagctagttaactgataccatattgcctggatgaaataactcttttccttctcgatgcagacaagtcccgaggagtgctttgaggatttgctgaaacttagccagggagataatatctgtaaccaaaattgcagtctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171743 190 + 636262 gggtagggaccttcccaatgggtatccagcaatggaggatgtgacggaagcgaagctagttaactgataccatattgcctggatgaaataactcttttccttctcgatgcagacaagtcccgaggagtgctttgaggatttgctgaaacttagccagggagataatatctgtaaccaaaattgcagtctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 366418 190 + 647215 gggtggggactttcccgaggggtaactagcaatggagaatgcgatggaaaagaagcaatttaactagtatcatattggctggatgcaataactgctttccttctcagtgtggacaagtcccgggaagtgctttgagaatttgctgaaacttacccaatgagataatatccgtgaccaaatttgcagtctc - -a -s mr.mrrefChr5 221075 6 + 294542 tgacaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171933 6 + 636262 tgacaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 366612 6 + 647215 tgccaa - -a -s mr.mrrefChr5 221081 157 + 294542 agataatatctgtgaccaaattcgcagcctcatggtcgagaatcaaattttgtcttaggaagggctgtctgtacaacatcttgtataggctaagtcccaccttttgcagtgaatttatggtgcatcgaagagcaattggtaacagcaccagccatgc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171939 157 + 636262 agataatatctgtgaccaaattcgcagcctcatggtcgagaatcaaattttgtcttaggaagggctgtctgtacaacatcttgtataggctaagtcccaccttttgcagtgaatttatggtgcatcgaagagcaattggtaacagcaccagccatgc -s simRat_chr6.simRat.chr6 366620 157 + 647215 agataacatctgtgaccaaattcgcagcctcatggtcaagaactgaatcattcactaggaaggtctgtccctacagcatctcatataggttaagtcccacttctttcggtgaatttctggttcatagaagagcaagtggtaacagcaacagccatgc - -a -s mr.mrrefChr5 221238 17 + 294542 tagatgggtctgttgtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172096 17 + 636262 tagatgggtctgttgtg -s simRat_chr6.simRat.chr6 366778 17 + 647215 tatatgaatctgttgtg - -a -s mr.mrrefChr5 221255 25 + 294542 ttaaggtgacacttcagtgtttcat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172113 25 + 636262 ttaaggtgacacttcagtgtttcat -s simRat_chr6.simRat.chr6 366803 25 + 647215 ttaaggtgacatttcagtgtttcat - -a -s mr.mrrefChr5 221280 95 + 294542 gccttacctgaagattgcggcctccatgtacaatgagagtaatcttgtattctaagtgctcgaaacgcaccatgagtgacagcccccttaagtgc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172149 95 + 636262 gccttacctgaagattgcggcctccatgtacaatgagagtaatcttgtattctaagtgctcgaaacgcaccatgagtgacagcccccttaagtgc -s simRat_chr6.simRat.chr6 366828 95 + 647215 gtgtttcatgaagattgtggcctccatgcacaatgagagtaatattgtattccaagcgcttgagacacacctgcagtgacagcccccttgagtgc - -a -s mr.mrrefChr5 221375 93 + 294542 attgctctgaaaaccgtgaggtaaccgaagtgaagtataatgtcatgcacaagtgccttaattacctccttggccttctctatgcgtcaggag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172253 93 + 636262 attgctctgaaaaccgtgaggtaaccgaagtgaagtataatgtcatgcacaagtgccttaattacctccttggccttctctatgcgtcaggag -s simRat_chr6.simRat.chr6 366923 93 + 647215 atctctctgtaaaccatgaggtaactggaccaaggtataattttgtgcacaagtgcctggattacctcctgggccttctctgtgtgccggagg - -a -s mr.mrrefChr5 221468 72 + 294542 gcctcagcccaactgataaacatgttgacccaccctaataggtattagaatccttgagacttgggcatatgc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172346 72 + 636262 gcctcagcccaactgataaacatgttgacccaccctaataggtattagaatccttgagacttgggcatatgc -s simRat_chr6.simRat.chr6 367019 72 + 647215 gcctcagctcaagcgataagcatgtcgacccacccttataggtattggcatccttgagactttggcatatgt - -a -s mr.mrrefChr5 221540 132 + 294542 taaagcctaactcccaatcctccctcaggttatggtcaagcctctgctctcgcaacaatgcctgacactaaggtaacaggtcatttctttgggaacaatccaggtccaataaatagttacttagccatccga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172418 132 + 636262 taaagcctaactcccaatcctccctcaggttatggtcaagcctctgctctcgcaacaatgcctgacactaaggtaacaggtcatttctttgggaacaatccaggtccaataaatagttacttagccatccga -s simRat_chr6.simRat.chr6 367092 132 + 647215 taaagcctaactgccaatcctctctcaggtaatagtcgggcctctgctctttcaacggttcctgacactaaggtaacaggtcatttctttgcgaacaatccaggtccagtaaatagatacttggtcatctga - -a -s mr.mrrefChr5 221672 14 + 294542 gcctaagtcaaatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172550 14 + 636262 gcctaagtcaaatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 367237 14 + 647215 gcctaagtgaaatg - -a -s mr.mrrefChr5 221686 41 + 294542 tttggttaagagcctttaccaatttccactggttggctgca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172566 41 + 636262 tttggttaagagcctttaccaatttccactggttggctgca -s simRat_chr6.simRat.chr6 367251 41 + 647215 tttggtaaagagcctttaacaatttccactggttggatgca - -a -s mr.mrrefChr5 221727 71 + 294542 agcagcaaaattttcccctcctcagtcgcggaacagttacagggcaagaaactgtgcccataagatttgcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172618 71 + 636262 agcagcaaaattttcccctcctcagtcgcggaacagttacagggcaagaaactgtgcccataagatttgcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 367292 71 + 647215 cacagccaaattttcccctcctcagtcactgaccagcctcaggttaagaaactatccccatgagatttgtc - -a -s mr.mrrefChr5 221798 11 + 294542 caatttcctcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172694 11 + 636262 caatttcctcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 367363 11 + 647215 caatttcctcc - -a -s mr.mrrefChr5 221809 24 + 294542 ccaaatattgtggtttcacctctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172705 24 + 636262 ccaaatattgtggtttcacctctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 367375 24 + 647215 ccaaatattgtggttatgtctctt - -a -s mr.mrrefChr5 221833 18 + 294542 tctccccagaccagtgga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172737 18 + 636262 tctccccagaccagtgga -s simRat_chr6.simRat.chr6 367399 18 + 647215 cccccccagaccagtaga - -a -s mr.mrrefChr5 221851 28 + 294542 acaagcctcttgagaggagggtcctgtc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172755 28 + 636262 acaagcctcttgagaggagggtcctgtc -s simRat_chr6.simRat.chr6 367423 28 + 647215 ataagcatctctagatgagggtcctgtc - -a -s mr.mrrefChr5 221879 26 + 294542 aagcagcatgtttggcatcaacatct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172783 26 + 636262 aagcagcatgtttggcatcaacatct -s simRat_chr6.simRat.chr6 367453 26 + 647215 aagaggcttgttaggcttcaacatct - -a -s mr.mrrefChr5 221905 17 + 294542 cttgagagttgccttcg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172809 17 + 636262 cttgagagttgccttcg -s simRat_chr6.simRat.chr6 367480 17 + 647215 cttgacagtttccttca - -a -s mr.mrrefChr5 221922 16 + 294542 atctcatgctctttct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172826 16 + 636262 atctcatgctctttct -s simRat_chr6.simRat.chr6 367499 16 + 647215 atttcacgctctttcc - -a -s mr.mrrefChr5 221938 11 + 294542 tccccaacagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172852 11 + 636262 tccccaacagt -s simRat_chr6.simRat.chr6 367515 11 + 647215 tatacagcagt - -a -s mr.mrrefChr5 221949 37 + 294542 cactgtcatctgttttggcttctggatggctaacaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172867 37 + 636262 cactgtcatctgttttggcttctggatggctaacaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 367526 37 + 647215 tattgttacccatcaagaagccaaaagaggtcacagt - -a -s mr.mrrefChr5 221986 91 + 294542 aactgccatatagcttcctgaggttttattggtgtaccttaggaggtcagaaactctctctcgtgccagatagccacatgtgcatgtagcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172904 91 + 636262 aactgccatatagcttcctgaggttttattggtgtaccttaggaggtcagaaactctctctcgtgccagatagccacatgtgcatgtagcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 367578 91 + 647215 accagcagtaaggcttcctgatgtcttattggtgtaccttaggaagtcagaaatccttcctcatgccagataggcgcatgtgcatggagca - -a -s mr.mrrefChr5 222077 17 + 294542 agtatgtggagtctctg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172995 17 + 636262 agtatgtggagtctctg -s simRat_chr6.simRat.chr6 367678 17 + 647215 tgtatttggagtctgcg - -a -s mr.mrrefChr5 222094 35 + 294542 cctcgcatagtttgcgtgcctctgtgagtgtgatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173012 35 + 636262 cctcgcatagtttgcgtgcctctgtgagtgtgatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 367714 35 + 647215 cctcacctagttcaagtgcctgtgtaagtgtggtg - -a -s mr.mrrefChr5 222129 93 + 294542 aaatgaattcagccagctgagtaccagtgcctggcatcagggggttacttccttgaaaaccattctcgctaataacagcatactttgctttgc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173047 93 + 636262 aaatgaattcagccagctgagtaccagtgcctggcatcagggggttacttccttgaaaaccattctcgctaataacagcatactttgctttgc -s simRat_chr6.simRat.chr6 367781 93 + 647215 aagtgaattcagccagctgaccactagtccccggcataaaggggtttctttctagaatgccattatcactaacaacagcatactctgtcttgc - -a -s mr.mrrefChr5 222222 18 + 294542 gaagacccttttctacaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173140 18 + 636262 gaagacccttttctacaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 367877 18 + 647215 aaagacccttttctacaa - -a -s mr.mrrefChr5 222240 83 + 294542 acgagcaaatgtcagcatatacattgaggtcagggtcagtcactggaacctccagtagatcagcgcaagctgcatgcattcaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173158 83 + 636262 acgagcaaatgtcagcatatacattgaggtcagggtcagtcactggaacctccagtagatcagcgcaagctgcatgcattcaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 367896 83 + 647215 acgagctactgtcagtatataccttgaggtcagggtcagactgtggaacctccagtagatcagcgtgagctgcaaacatttga - -a -s mr.mrrefChr5 222323 60 + 294542 ACTCTCACCCATCGGTTCAATTACATACCCCATTATTTTAAGTCTATGTCATACCATAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173241 60 + 636262 actctcacTCGTCAGTTCAATTACATACCCCATTATTTTAAGTCTATGTCATACCATAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 368000 60 + 647215 ACTCTCACCGATTGGTTCAATTACATACCCCATTATTTTAATTCTATGTCATGCCATAGA - -a -s mr.mrrefChr5 222383 264 + 294542 CTCTGAATATACTCTATCAATTTACACAGACAACAACATTCGCCTCATCCCCTTCTTTCCAAGATGTCCATGATACATCAGGGTAATAGATCCCCAGAGTGGTTTTTTAGTTGTCATCACTGTTGGTGGTTAGTTTCGTAATTTAGTAGCAGTGCCAGTTTGATAGCATGGAGTTTATCTGTGATCCAGCTGAGCTTAGCAGTTAGGCATAAGGATTTAAGCTGGTCTCGGTGAACTATAACAAGCACAAAAAGTATAAAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173303 264 + 636262 CTCTGAACATACTCTGTCAATTTACACAGACAACAACATTCGCCTCATCCCTTTCTTTCCAAGATGTCCATGATACATCTGGGTAATAGATCCCCAGAGTGGTTTCCTAGTTGCCATCACTGTTTGTGGTTAGTTTCGTAATTTAGTAGCAGTGCCAGTTTGATAGCATGGAGTTTATCTGTAATCCAGCTGAGCTTAGCAGTTAGGCATAAGGATTTAAAATGGTCTCGGTGCACTATAACAAGCCCAAAAAGTATAAAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 368060 248 + 647215 GTCTGAATATCCTCTATCAATTTACACAGA---------------CATCCCCTTCTTTGCGAGGTGTCCATGATGCAACAGGGTAATGGATCCCCAGAGTGGTTTTTTAGTTGTCATCACTGTTGGTGGTTAGTTTAGTATTTTAATAGCAGTGCCAGTTTGATAGCATGGAGTTTATCTGTGATCCAGCTAAGCTTTGCA-TTAGGCCTAGGGATTTAAGCTGGTCTTGGTGATCTATAATAAAGACAGAAAGTAAAAAAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 222647 71 + 294542 CCATTTGACATTGCGGGATCAGTCACAGAGGGTAAACTTCAGTATTTGCCATTTGTGGGGTACATTGTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173567 71 + 636262 CCATTTGACATTGCGGGATCAGTCACAGAGGGTAAACTTCAGTATTTGCCATTTGTGGGGTACATTGTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 368312 69 + 647215 CCACTGG--ATTGCAGGATCAGTCACAGAGGGCAGACTTTGGTGTTTGCCATTTGTGGGGTACATTGTTTG - -a -s mr.mrrefChr5 222718 177 + 294542 CACGTGTTAATTACAAGTCTCATGAATCCTACTAGAGTATACCTTGCATGTCCCTTTACTCTTTGAAAAACCCTAACCTAGCTCATGCTTCATAATATACTTTAGCTGTATACTTTGTGTGGGAAAGATAGAATATAGACTTAGCTTGAATAGGATGCACTGGAAACCTTTCACCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173638 172 + 636262 CACAAGTTAATTACAAGTCTCATGAATCCTACTAGAGTATACCTTGCATGTCCCCTTACTCTTTGAAAAACCCCAACCTAGCTCATACTTC-----CAACTTTAGCTGTATACTTTGTGTGGGAAAGATAGAATATGGACTTAGCTTGAATAGGATGTGCTGGAAACCTTTCACCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 368382 176 + 647215 CATGTGTTAATGACAAATCTCATGAGTCCTACTAGAGTATACCTTGCGTGTCCCTTTTTTCTTTGGAACACCCT-ACCTAGCTCATGCTTCATAATATACTTTGGCTGGATACTTTGTGTGGGCAAGATATAATATAGACTTAGCTTGGATAGAATGCACTGGACGAATTTCACCCT - -a -s mr.mrrefChr5 222895 86 + 294542 ACAAAGGTTGGTCATAGGTTAAAGGCCAATTGGTTATTGCTTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATCAATCATCTCCTCCAAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173815 78 + 636262 ACAAAGGTTGTTCATAGG-TAAAGGCCAATTGGT------TTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATC-ATCATTTCCTCCCAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 368558 86 + 647215 ACAAAGGTTGGTCATGGGTTAAAGGCCGACGGGTTATTGCTTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATCAATCATCTCCTCCAAGAG - -a -s mr.mrrefChr5 222981 116 + 294542 TCACTTCTGAGCTTTGGAAGTATTTCCATCACTAGGCACAACACTTGGTCATATTACTGGGGGAATGGGAGTGGAACATGGGGTTGAATGAAAGTGGGGCTACCAGGCTTCACATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173898 116 + 636262 TCACTTCTGAGCTTTGGAAGTCCTTCCGTCTCAAGGTACAACACTTGATCATATTACTGGGGGAATGGGAGTCGAAGATGGGGATGAATGAAAATGGAGCTACCAGGCTTCACATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 368644 115 + 647215 TCACTTCTGAACTTTGGAAGTATGTCCATGAGTAAGCACAACACTTGGTCATATTACTGGGGGAA-GGGAGTGGAACATGGGGTTGAATGAAAGTGGGGCTAATGGGCTTGACATA - -a -s mr.mrrefChr5 223097 42 + 294542 TAAAGATGCTTGAAACCAACAACACCCCTCCCTTCTGCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 174014 42 + 636262 TAAAGATGCTTGAAATCAACGACACTCCTCCCTTCTGCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 368800 41 + 647215 TAAGGATGCTTG-AACCAACAACACCCCTCCCTTTTGCTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 223139 271 + 294542 GAAATATTGACGCTTCCACCTAGATTATACCCAAACCTACAACTATACAAACTGACAAACCCTAAAACAGAGACCTGCCTGTACACTGGCTCTCCATTCTGTAACCTAAAAAATGACTGAGATAGTTTGTACTGAGGAATGGCCAATTCTCTTTCTCAATAAAGGGGATAGGCCAGATGCATCTGCTGGAGGCTTGTAATAAGCCTGCATCTACGGCAGCATAACTAGTAAGTGATAACAAAAAATATGGTCACACAGCAGACCAGGAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 174194 271 + 636262 GAAATATTGACGCTTCCACCTAGATTATACCCAAACCTACAACTATACAAACTGACAAACCCTAAAACAGAGACCTGCCTGTACACTGGCTCTCCACTCTGTAACCTACAAAATGACTGAGATAGTTTGTAACGAGGAATGGCCAATTCCCTTTGTCTATAAAGGGGATAGGCCAGATGCATCTCCTGGAGGCATGTAATAAGCCTGCATCTACGGCAGCATAACTTGCAAGTGATAACAAAAAATATGGTCACACAGCAGACCAGGAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 368841 239 + 647215 GCAATAATGACGCTTCCACCTAGCTGAGGCAAACACCTAC----CTGCAAAATGGCAA----------------------------TGGCTCTCCATTCTGCAACCTAAAAAATGACTGTGATAGTTTGCACTGAGAGGTGTCCACTGCTCTTTCTAAATAAAGGGGATAGGCCAGATGCATTTGCTGGAGGCTTGTACTAAGCCTGCGTTTACGGCAACATAACTAGTAAATGATAACAAAAAACATGGTCGTGTGGTAGACCAGCAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 223410 596 + 294542 CCCACACTAATATATATCAGGTAATAACACATCCAGGCTGTATGTATATATGGTCTTTATGGGTGGTCATAAGCTTCTTCAGTGTCCTCTTGATAGAGCTGGATGCAGTCTGCTGGTCTCTTTAGAGTTAGAATGGTTAAATGCACATGCTTTTTCTTAATGTCTGTTTTAGTAATTTGTCTTATGAGTAGGCAGCTTTGTAGAACTTACCTCAGGTCATGGCACTGGCACTACAGCAGGTAAGGCTTACCAGTAAGCTGTCATATGATATCAGTAACAAGATGAGAGGTGTCAGTTGTTCATGGTACAGAGATGTGCAAGGAAAAAGATCATTATGGTTCTCCCAGTAGCCATGAAAGCTGGGAATAATTGAATGGGGCCAGAGTTCATTATGGTTTTCCCAGTAGCCATGACAGTTGGGAATAATTGAATGGGGCCAAAGCAGCTACAACCAATTAGCTCCCACATTTTGTTCACTCAAAAGTGGTAGGTGTAAAACACTGTGATATGCATACCATGGTTGAGCTTAGATTTGAGAGGCAGAGGGAATAACAATTTATGTCATACTAGATTCACCTGCTGTAGAGATGGGGCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 174465 595 + 636262 CCCACACTAATATATATCAGGTAATAACACATCCAGGCTGTATGTACATATGGTCTTTATGGGAGGTCATAAGCTTCTTCATTGTCTTCTTGATAGAACTGGATGCAGTCTGCCGGTCTCTTTAGTGTTAGAATGGTTAAATGCACATGCTCTTTCTTAATGTCTGTTTTAATAATTTGTCTTATGAGTAGGCAGCTTTGTAGAATTTACCTCAGGTCATAGCACTAGCACTCCAGTAGGTAAGGCTTACCGGTAAGCTATCATATGATAACAGTAACAAGATGAGAAGTGTCAGTTGTTCATGGTTCAGAGCTGTGCAAAGAAAAAGATCATTATGGTTCTCCCAGTAGCCATGAAAGCTGGGAATAATTGAATGGGGCCAGAGTTCATTATGGTTTTCCCAGTAGCCATGACAGTTGGGAATAATTGAATGGGGCCAAAGCAGCTACAACCAATTAGCTCCCACATTTTGTTCACTCAAAAGTGGTAGGTGTAAAACACTGTGATATGCATACCATGGCAGAGCTCAGATTTGAGAGGCAGAAGGAATAACAATTTATGTCATACTAGA-TCACTTGCTGTTGAGATGGGGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 369081 569 + 647215 CCCGCACTAGTATACATCAAGTAATAGCAAATCCAGGCTGTATTTATATATGGTC-TTATCAGTGGTCATAAGCTCCTTCAGTGTCCTCCTGATAGAGCTGGATGCAGTCTGCTGGTCTCTTTAGAGTCAGAACGGTTAAATGCAGATGTCTTTTCTTAATGTCTGTTCTAGTTACTTGTCTTATGAGTAGGCAACTTTGTAGTACTTACCTCAGGTCATGGCACTGGTACTACAGCAGGTAAGGCTTACCAGTAAGTTGTTGTATGATATCCGAAACAAGATGAGAGGTGACAGTCATTCATTGTACAGAGATGTGCAGGGAAAAAGATCATTATGATACTCCCAGTAGCCATGATAGTTGGGAATAATTGAATAGGGCCAAAGTTCATTATGGTTTCCCCAGTAGCCATGGTAGTTGGGAACAATTGAATGGGGCCAAAGCAGCTACAACCAATAAGCTCCTAC--------------------------GTAAAACATTGTGATATGCATACCGTGGTTGAACTTAGATTTGAGAGGGAGAGGGAATAACAATTTATGTCATACTAGATTCACCTGCTGTAGGGAGGGGGCTA - -a -s mr.mrrefChr5 224006 182 + 294542 TGTATGCATGGTTATAGACCTCTTATGTCTCCTTTACAAATTGTTTAAGTGTCTCGCTTAGTGTTGGTATTTATAAGTTTCCATTACAACCACCCGTATAATATTATCCTAATGGAAAAACCAAACTGTTCTAAGCACAGAATGATGTGTTTATGTCTTGCCTTAATGTCAGAACATTTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 175065 182 + 636262 TGTATGCATGGTTATAAACCTCTTATGTCTCCTTTACAAATTGTTTAAGTGTCTCGCTTAGTGTTGGTATTTATAAGTTTCCATCACAACCACCCGTATATTGTTATTCAAATGGAAAAACCAAGCTGTTCTAAGACCAGAACAATATGTTTGTTTCTTGCCTTTATGTCAGAACACTTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 369650 182 + 647215 TGCATGCATGGGTATAGACCTATTATGTATTCTTTGTGTATTGTTTAAGTGTCTCACTTAGTGTTGGTATTTATAAGTTCCCATTACAACCACCCGTATAATATTATCCTAATGGAAAAACCAAACTGTTCTAAACACAGAATGATGTGTTTAAGTCTTACATTAATGTCAGAACATTTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 224188 715 + 294542 CACCCATGTGAAAAAAGTGTTTCTTAGAGGAATGTAATGATGTGGACATAACATGATAGGTGTGTAACTGTGCATTTCTCTTGTGCTTTATCTAGATACAATCTCTAATTTTTGTAAGGATGAAAGACAAAATCCCCCATGGACTCCAGTACTACTCTTGGTGTAAGAAATATGGCTTTAGTCCCAGTGCCAGTTGAATTAAATCTTGCTAAACATAGATATTGTATATTCTGCTTTACTGGGTCTTTCTCTAGCAACTCACCCAAAGGCTCCGCCCCCTTTCTGATGCTCTTGTAAGTCCATAACTTATGATGCCAATAATGAAGCTGAACTGCCTTTCATGTCATGTTAACTAAGTAACAGGTGATGGGCTGTGGCATCCTTATTACTGCTCTAGACAACTAGCACCTTGGGAGTGCACACCAGGTTGCTGTGAGCATGTGTCAGCACTGTAAAAGTTCCACTGCACTAGGATACATGGTCTAAAAGTTAGGATTTAACAGTAACAAAGGTCTGGCGTTCTACCCCCCTCCCAGTGCTAATGTGAAACATCTCTTTTTCTACTGGAATAGGCTGAGCATAAAGACTTAAAGTTGCTGTTACATGCTATGTGCAAAGAGGTGGCACGCTAAATGTAAGGCCAACGAATTAGCAGAGATGATATGATGAGTTCAGTTCTTCAATTCTGTCCTACACAGGGGAATATAGTTCCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 175249 711 + 636262 CACCCATGTGAAAAAAGTGTTTCTTAGAGGAATGTAATGATGTGGACATAACATGATAGGTGTGTAACTGTGCATTTCTCTTGTGCTTT-TCTAGATACAATCGCTAATTTTTGTAAGGATGAAAGACAAAATCCCCCATGGACTCCAGTACCTCTCTTGGTGTAAGAAATATGGCTTTAGCCCCAGTG-CAGTTGAATTAAATCTTGCTAAAGATAGATATTGTATGTTCTGCTTAACTGGGTCTTTCTCTAGCAACTCACCCAAAGGCTCTGCTCCCTTTCGAGTGCTCTTGTAGGTCCATAACTTATGATGCCAATAACGAAGCTGAACTGCCTTTCATGTCATGTTAACTAAGTAACAGGTGAT-GGCTGTGGCATCCAAATTACTGCTCTAGACAACTAGCACCTTGGGAGTACACACCAGGTTGATGTGAGCATGTGTCAG-ACTGTAAAAGTTCCACTGCTCTAGGATACATGGTCTAAAAGTTAGGATTTAACAGTAACGAGGGTCTGGCGTTCTACCCCCCTCCCAGTGCTAATGTGAAAGATCTCTTTTTCTACTGGAATAGGCTGAACATAAAGACTTAAAGTTGCTGTTACATGCTATGTGCAAAGAGGTGGCACTCTAAATGTAAGGCCAACGGATTAACAGAGATGATATGATGAGTTCAGCTCTTCAATTCTGTCCTACACAGGGGAATATGCTTCCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 369832 702 + 647215 CACCCAAGTGAAAAGAGTGTTTCTGAGAGGAACGTAATGATGTGGACAT---------GGTGTGTAACTGTGCATTCCTCTTGTGCTTTATCTAGATATAATCTCTAATCCTTGCAAGGGTGTCGGACAAAATGCCCCATGGTCTCCAGTACTACTCTTGATTTAAGAAATATGACTTTAGTCCCAGTGCCAGTTGAATTAAATCTTGCTAGACATAGATATTGTATATTCTGATCTACTGGGTTCTTCTCTAGCAACTCGTCCAGAGGCTCCGCCCTCTTTCTGATACTCTTGTAAGTCCATAACTTGCGATACCGATAATGTAGGTGAACTACCTTTCATGTCACGTTTACTAAGTAACAGGTGATGGGCTGTGGGATCCTTATTACTGCCCCATACAACAAGCACCTTGGGAGTGCA---CAGGTTGCTGAG-GCATGTGTCAGCACTATAAAAGGTCCACTGCACTAGCATACATAGTCTAGAAGTTAGGATTTAACGGTAACAAAGGTCTGGCGTTCTACCTCCCTCCTAGTGCTAATGTGAAACATCTTTTTTTCTACTGAGACAGGCTGAGCATAATGACTTAAATTCCCTGTTACGTGCCAAGTGCAAAGAGGTGGCACGCTGAATGTAAGGCCAACAAATTAGCAGAGATGATATGATGAGTGCAGTTCTTCAGTCCTGTCCTGCACAGGGGAATATAGCTCCTAA - -a -s mr.mrrefChr5 224903 14 + 294542 TAACAGTCCAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 175960 14 + 636262 TAACAGTCCAACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 370536 14 + 647215 TAACAGTCCAATCA - -a -s mr.mrrefChr5 224917 185 + 294542 CCCTGCTGTTAAATCCTTCCACTACATTAATGGCAGTGGTTGTAAGTGAAACAAATGTTTATCAGAATTAAAGACTACCTAAAGTGAATGGCTGTAGTTGGTTAGATGTTAGCTGCcactgtttttgtttaagtggatggtcatataactcttccagttaactttacaaagatgcacccttaagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 175992 184 + 636262 CCCTGCTGTTAAATCCTTCCACTACATTAATGACAGTGGTT-CAAGTGAAACAAATGTTTATCAGAATTAAAGACTACCTAAGGTGAATGGCTGTAGTTGGTTAGATGTTAGCTGCcactgtttttgtttaagtggatggtcatataactcttccagttaactttacaaagatgcacccttaagt -s simRat_chr6.simRat.chr6 370550 168 + 647215 CCCTGCTGTCAAGTCCTTCCACTACATTAATGGCAGTGGTTGTGAGTGAAACAGATATTT-----------------CCTAGAATGAATGGGTGTAGTTGGTTAGATGTTACCTGCCGCTCTTTCTGTTTAAGTGGATGGTCATATAGCTCTTCAAGCTTACTTTACAAGGATGTACCTTCGGGT - -a -s mr.mrrefChr5 225102 85 + 294542 ccccagactagtgctgaggtcccagcaattcctttgatgtacagtaaatataacttgaggactcccagtctaaaaaccttatata -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176177 85 + 636262 ccccagactagtgctgaggtcccagcaattcctttgatgtacagtaaatataacttgaggactcccagtctaaaaaccttatata -s simRat_chr6.simRat.chr6 370718 85 + 647215 CAAAATGCTAGTGCTGAGGTCCCAACAAATCCTTTGATGTATATAGAATATAACTTGAGGACTCCCAACCTACAAACTTTATATA - -a -s mr.mrrefChr5 225187 75 + 294542 gacgacatCTGGTAGACTCCACCTAAGAAGCAGCCCTAAGTGCATCCCAATTGATATATGTGTGTGTACTACCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176262 75 + 636262 gacgacatCTGGTAGACTCCACCTAAGAAGCAGCCCTAAGTGCATCCCAATTGATATATGTGTGTGTACTACCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 370807 75 + 647215 GACAGAATGCAGTCGCCTCCACCCAAGAACCAGCCTTAAGTGCATACAAATATATATATGTTTGTGTACTACCCG - -a -s mr.mrrefChr5 225262 41 + 294542 TTTTTCAACATTTAAAATAAGACCCAATTTCATTGCAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176337 41 + 636262 TTTTTCAACATTTAAAATAAGACCCAATTTAATTGCAGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 370883 41 + 647215 TTTTTCAACATTTAAGAGAAGACCCAATTTCATTGCTTAGG - -a -s mr.mrrefChr5 225303 278 + 294542 AGTTCAATGGTTCTATGACTGAGACAGCAGAATTGAGGCCTGGGACGAGCATAATTGAGGCCTTGATGGGGATGATTGCAGTATGAAGCATGAGCAATGGTGGATACTGAATCCAGATTATAACTCACAGGGTTACAATGACCATTCTCAGCTGTCTTTGTGTCCCTCTTTACCATCACCTTAAGCAGGTACCTTGGAATCGCCAGGGCTGGTGTCCCAAACTATTATAGAAATAATTATAGAGAAAGTTGGGGACACCAGGGCCTTGAGCCATTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176378 160 + 636262 AGTCCAATGCTTCTATGACTGAGACAACAGAAGTGAGGACTGGGACCCGCATAATTGAGGCCTTGATGGTGATGTTTGAAGTATGAAGCATGAGCAATGGTGGATCCTGAATCCAGATCATAACTCACAGGGTTACAATGACCATCCTCAGCTGTCTTTG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 370926 278 + 647215 AGTTCAATGGTTCTATGTCTGAGACAGCAGAATTGAGGCCTGGTACGAGCATAACTGAGGCCTCCATGGGGATGATTGCAGTACGAAGAATGGGCAATGGTGGATACTGACTTCAGGGTATATCTCACAGGGTTACAATTACCATTCTCAACTCGCTTTGTGTCCCTCTTTACCATCACCTTAAGCAGGTACCTTGGAATCGCCAGGGCTGGTGTCCCAAACTATTATAGAAATAATTATAGAGAAAGTTGGGGACACCAGGGCCTTGAGCCATTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 225581 39 + 294542 TCATTTTGATGGGCGCAATTTGGTACATTGGACTTTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 371206 39 + 647215 TCATTTTGATGGGCGCAATTTGGTACATTGGACTTTATA - -a -s mr.mrrefChr5 225620 9 + 294542 ACATTCGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 371248 9 + 647215 ACATTCGAA - -a -s mr.mrrefChr5 225629 248 + 294542 CTATATAGATGAAATGAAACAGAGTTGCCAAGTTAAATGTCCTAGTGGTTTTCACATGAATCATTATGCTTTTTTGAGCCCAGCTGGAGCCAGAGTTGTGTAAAGGCTTTCCTACTCAAGCTACTGAAAACTCATTCTGGTTCTTGTGCATCTGGTAATGTTATTATTATCTCTAAGTCACATAAATATCAGAACCTGAGCTACACAAGCAAAATCAGAACATCTGACATCTTTTTGTAGCTCATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176538 231 + 636262 ----------GAAATGAAACAGAGTTGCCAAGTTGAATGCCCTAGTGGTCTTCACATGATTCATTATGCTCTTTTGAACCCAGCTGGAGCCAGAGTTGTGTAAAGGCTTTCCTACTCAAACTACTGAAAACTCATTCTGGTTCTTGTGCATCTGGTAGTGTTATTAGTATTTCTAAGTCACACAAATA--AGAACGCGAGCTACACAAGCAAAATCAGAACATCTGACATCTTTTTGTAGCTC----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 371319 245 + 647215 CTATATAGATGAAATGAAACAGAGTTGC---GCTAAATGTCCTAGTGGTTTTCACATGAATCATTATGCATGTTTAAGATCAGCTGGAACAAGAGTTGAGTAAAGGCTTTGCTACTCAAGCTACTGTAATCTCATTCTGGTTCTTGCACATCTGGTAATTTTATCATTATCTCTAAGTCACATAAATATCAGAACCTGAGCTACACAAACAAAATCAGAACATCTGACATCTTTCTGTGGCTCATGTG - -a -s mr.mrrefChr5 225877 239 + 294542 GCACTTATAGAAAAAGGCAAGGATGTGAGCAAAATACCTTCTGAGACATTGATCTATAGCCCATGTACGAGACCTTAATTACTGTACTGTGTCCATATGCCCAGGTGAACTTGCTTCTACAGAAGGTATCCCCTATAATATAGCTGAATGCAGCAGTTGGTGCACAATCTAAAATTAAAAGCTTGAGACTCTATACTCACTTAGAATACACAGCAAATGGTTTGATATTGGCAAGTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176769 231 + 636262 ------GTAGAGAAAAGCAAGCATGTGAGCAACATGCCTTCTGAGACATTGATCTATAGCCCATGTA-GAAACCTTAATTGCTGTACTGTGTCCATATGCCCAGGTGAACTTGCTTCTACAGAAGGTATCCCCTATAATATAGCTGAATGCGGCAGTTGGTGCACAATCTAAAATTGAAAGCTTGAGACTC-ATACTCACTTAGAATACACAGCAAATGGTTTGATATTGGCAAGTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 371565 220 + 647215 GCACTTATAGAAAGAGGCAAGGATGTGAGCAAAAGACCTTCTGAGACACTGATCTATAGCCCATGTACTAGACTTCAATTACTGTACTGTGGCCATAGGCCCAGGTAAACTTGCTTCTACAGAAGTTATCCCCTATAATATAGCTGAATGAAGCAGTTGGTGCACTATCTAAAATTAAAAGCTTACGACTCTATACTCACTTTGAATACAC-------------------GCAAATGAT - -a -s mr.mrrefChr5 226116 605 + 294542 AGTAATAGTAATAAAACAGATTCACTTCTTAGGATTGATGGAATCCTAACTTTTTAATTGAGGGTACTATCTGGTCTGACTCTTTCAAGTATAAGGGGCTATGGTACAGTTGCATCAGAACCCAGCCAGCTTTATATCTTCCAACAAATTTAATGCAGTCAGTTTGCTTTTGATCTTCAGCAATTCTCAAACCAAGTAATTCTAGAACTTGGCTATGGTATCTCATATTATACACTTGACTTTGTAAAATATGTGCTGAGAGTTAAGGGCTCCCCAAAACATTAATAAAGCCTTAACATTTAGATCTTGTCTGAGCAAAGCTTTGTATGACTTCAAGTATAGTTaggtagtatcactgaggcttgtacttcttcactggattcattcagtctatttcctgtctacttggaaagttgaacagcccatcaGATCCTCATAATTGAACTAAAAGAGTTACATAGCATCCAACGAAATAGAGGATAAGGGAATTGTGATGATTGTTGCTACATGTATTGCCTCTCCCTATGCAATTAAGGTTCAAAGGTTGTTTCATGTATTTTATTAATATAGTACGTCTCTTGCCATCTCAAATTCCAGCATCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177007 595 + 636262 AGTAATAGTAATAAAACAGATTCACTTCTTAGGATTGGTGGAATCCTAACCTTTTGATTGTGGGTACTATCTGATCTGACTCTTTCAAGTATAAGGGGCTATGGTACAGTTGCATCAGAACCCAGCCAGCTTTATCTCTTCCAATAAATTTAATGCAGTCAGTTTGCTTTTGATCTTCAGTAATTCTCAAACCAAGTGATTCTAGAA-----CTATGGTATCTCATATTATGCACTTGACTTTGTAAAATATGTGCTGAGAGTTAAGAGCTCCCCAAAACGTTAATAAAGATTTAACGTTTAGATCTTGTCTGAGTAAAGCTTTGTATGACTTCAATTATAGTTaggcagtatcactgtggcttgtacttcttcactggattcattcagtctatttcctgtctacttggaaagctgaacagcCCATCAGATCATCATAATTGAGCTAAAAGAGTTACATAGCATCAAATGAAATAGAGGATAGGGGAATTATGATGATTGTTGCTACATGTATTGCCTCTCCCTATGCAATTAATGTTCAAAGGTCGTTTCATGTGTTCTATTAATATA-----TCTCTTGCCATCTCAAACTCCAGCATCTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 371785 600 + 647215 AGTAATAGCAATAAAACAGATTGACTTCTTAGGATTTATGAAATCCTAACTTTTTAATTGAGGGTACTATCTGGTCTGACTCTTCCAAGTATAAGGTGCTACGGTACGGTTGCATCAGAATCCAGCTAGCTTTATATCTTCCAACATATTTAATGCAGTCAGTTTGCTTTTGTTCTTTAGCAATTTTGAAACCAAGTAATTCTAGAACTTGGCTATGGTATCTCATATTATACACATGACTTTGTAAAATATGTGCTGAGAGTCAAGGGCTCTCCAAAACATCAACAAAGCCTTAACATTTAGACCTTGTCAGAGCAAAGCTTTGTGTGACTTCAAGTATAGTTaggtagtatgactgaggcttgtctgtctacactgaattcattcagtctatttcctgtctactcagaatgtcgaatggcccatgaGATCCTCATAATCAAACTAAAAGAGTTACATAGCATCCAACAAAATAGAGGATCAGGGAATTGTGATGATTGTTGCTACATGTATTGCCTCTCC-----CAATTGAGGTACAAAGGTTGTTTCATGTATTTTATTAATATAGTACGTCTCTTGCCATCTCAAATTCCACCATCTAAG - -a -s mr.mrrefChr5 226721 63 + 294542 GCACCAGTCTTTTTGGAGGCCAAAACATTGCAACATGGCCAAGACACTAGAAGAAAAGACCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177622 63 + 636262 GCACCAGTCCTTTTGGAGGCCAAAACATTGCAACATGGCCAAGACACTAGAAGAAAAGACCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 372385 63 + 647215 GCAAAAGTCTTTTTGGGGGCCAAAACATTGGAAGATGGTCAAGACACTAGAAGAAAAGACCAG - -a -s mr.mrrefChr5 226784 7 + 294542 AATGACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177696 7 + 636262 AATGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 372448 7 + 647215 AAAGACT - -a -s mr.mrrefChr5 226791 32 + 294542 GATTTTTAATGTAGTTCCTACCTTGCAGAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177704 32 + 636262 GATTTTTAATGTAGTTCCTACCTTGCAGAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 372455 32 + 647215 GATTTTTAATGTAGTTCCTACCTCGCAGAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 226823 153 + 294542 AGATTTTATTTTCAATGTAGTTCCTCTGTTGCCAAAGAGTAGACAGGGGTGGTTTTTATCTCAAGATTGCACAGATATTATAGACGTGTATGTGTAGATACTGTTAGAGTCTGGTCATGGCTGTGGACCTGGAGAGTAAAACAATAGGTCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177736 137 + 636262 AGATTTTATTTTCAATGTAGTTCCACTG----------------AGGGGTGGTTTTTATCTCAAGATTGCACAGACATTATATACGTGTATATGTAGATACTGTTAGGGTCTGGTAATGGCTGGGGGCCTGGAGAGTAAAACAATAGGTCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 372491 153 + 647215 AGCTTTCATTTTCAAAGTAGTTCCTCTGTTGCCAAAGAGTAGACACAGGTGGTTTTTATCTCAAGATTGCACAGATAATATAGATGTCTATGTGTAGATACTGTTAGAGTCTGGTCATAGCTGTGGACCTGGTGAGTTAAACAACAGGTCTTG - -a -s mr.mrrefChr5 226976 345 + 294542 GGGGGGAAACATAGTGTCTACATCCTAACGCATTCTTATTTTTTAGTCTCCTATAAGTGGACAATGGAGTTAGTTTTAGTGCCATACCCTGTAAGATCTAGAGGGAATCATTTACACTTGGCCTCTCAAATATTACCTCTATCCCATGTGTCACAGCTTCCTAGGGCTGACAGAATGCTTAAAACAGCATCCTATTGTCCTGCCATCCCTCTAGCCTGTACTCTATATGCCACCATTCTGTACTACCTAAGTATCCCCCCGTATCCCCTCAATTTGTAGCAGCTGCACAGCATGCCCAATTCACTTCTTAGCATCACGTTACCCTTCTTAGCATCACATTACCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177873 322 + 636262 GTGGGGAAACATAGTGTCTACATCCTAACGCACTCTTATTTTTTAGTCTCCTATAAGCGGATAATGAAGTCAGTTTTAGCGCCATACCCTGTAAGATCTAGAGGGAATCATTTAC-------------AATGTTACCTCTATCCCATGTGTCACAGCTTCCTAGGGCTAACACAATGCTTAAAACAGCATCCTATTGTCCTGCCATCCCTCTAGCCTGTACTCTATATGCCACCATTCTATACTACCTAAGTATCCCCC----------CGATTTGTAGCAGCTGCAGAGCATACCCGATTCATTTTTTAGCATCACACTACCCTTCTTAGCATCACGTTACCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 372646 345 + 647215 GGAGGAAAACATAGTGTCTACAACATAACACATTCTTATTTTTTAGCCTCCTATAAGTGGTCAATGGAGTTAGTTTTAGTGCCATACCCTGTAAGATCTAGAGGGGATCATTTACACTTGGCCTCTCAAATATTACCTCTATCCCATGTGTCACAGCTTCCTAGGGCTGACAGTGTGCTTAAAACAGCATGCTATTGTCCTGCCATCCCTCTAGCCTGTACTCCATATGCCACCAGTCTGTACTACCTAAGTGTCCCCCCGTATCCCCTCAATTTGTAGCATCTGCACAGCTTGCCTAATTCACTTCTTAGCATCACGTTACCCTTTTTAGCATCACATTACCCT - -a -s mr.mrrefChr5 227321 144 + 294542 TTTAATTACCACTTCGTTTTGCCATCAGTTCCATGCCATCATTTGCAGTAACTATTTGACATTTGTATCAACTTGTTTGTTGTGCTATGCCTGCAGACAGGATAATTCATGAAAAGATAGGTAGAATCCCCCACCCTGGAGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178196 144 + 636262 TTTAATTACCACTTCGTTTTGCTATCAGTTCCATGCCATCATTTGCAGTAACCATTTGACATTTGTGTCAACTTGTTTGTTTTGCTATGCCTGCAGACAGGATGACTCATGAAAAGATAAGTAGAATCCCCCACCCTGGAGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 372991 144 + 647215 TTTCTTTACAACTGCATTTTCTCATCTGTTCCATGCCATCATTTGCAGTTACTATTTGACATTTGTATCAACTTGTTTGTTGTGCTAGGCCTGCACACAGGATAATTGATGAAGAGATAGATAGAATTCCTCACCCTTGAGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 227465 154 + 294542 CAGTCAAGTTGCTATAGTTAAGGAGCTCTTGTCGCTGGATGGAATATTCCAGTAATATTGAGGATATCGCAGCAACAGCAGGGAGGGAATTATATCAATCATGTTATATAGTTTACACTAAATTGCACCAATAAGCAGCAAAGGGGTCTGATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178346 143 + 636262 CACT-AAGTTGCTATAGTTATGGAGATCTTGTCGCTGGATGGAATATTCCAGTAATCTTGAGGATATCGCA-------CAGGGAGGAAATTATATCAATTATGTCATATAG---ACACTAAATTGCACCAATGAGCAGCAAAGGAGTCTGATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 373135 154 + 647215 CAGTCAAGTTGCTATAGGTAAGGAGCTCATGTCACTGGATGGAATATTCCAGCAACATTGAGGATATGGCAGCAACAGAAGGGAGGGAATTATATCAATCATGTTCTATAGTTTACACTAAATCGCACCAATAAGCAGCAAAGGGGCCTTATGG - -a -s mr.mrrefChr5 227619 51 + 294542 AAAGCCTTTAGTTTAAAAACCACTAGTTTACTATGACAAGCAGAGTAAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178495 51 + 636262 AAAGCCTTTAGTTTAAAAACGATTAGTCTATTATGACAAGCAGAGTAAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 373289 51 + 647215 AAAACCTTTAGTTTAAGAACCACTAGTTTACTATAACAAGCAGATTAAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 227670 34 + 294542 CTCAACAAAGTGGTCAGTTACTGTGTGTTTGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178546 34 + 636262 CTCGACAAAGTGGTCAGTTACTGTGTGGTTGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 373345 34 + 647215 CTCAACAAAGTGGTGAGTTATTGTGTGTACGGGA - -a -s mr.mrrefChr5 227704 78 + 294542 CACCTTGCCCTGGCTAGGTTAATGTGGTCTTGTCCCTTCGAGGGAAACTAATAATTTCGTATTGGCCTGGTGACTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178580 68 + 636262 CACCTTGCCCTGGCTAGGTTCATGTGGTCTCGTCCCTTCGAGGGAGACTAATAATT----------CTGGTGACTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178753 68 + 636262 AACCTTGCCCTAGCTAGGTTAACATGGTCTTTTCCCTTCGAGGAAAACTAATAATT----------CTGGTGACTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 373379 74 + 647215 CACCCTGCCCTGGCTATTTT----CCATCTTGTCCCAGCTAGGGAAACTAATAATTTCGTATTGGCCTGGTGACTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 227782 105 + 294542 TGTGGTAGGTCTAGGTCCTGGGTAGATACATAATTTAGTTCCATACATTAATGTGAGGCAGCCAAAGGTGTGGCCACACCTCTAAGGCTAGCCTGGCGAGACAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178648 105 + 636262 TGTGGTAGGTCTAGGTCCTGGGTAGATACATGATTTAATTCCATACATTAATGTGAGGCAGCCAAAGGTGTGGCCACACCTCTAAGTCTAGCCTGGCTAGACAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178823 99 + 636262 TGTGGTAGGTCTAGGTCCTGGGTAGTTACATAATTTAGTTCCATACATTAATGTGAG------AAAGGTGTGTCCACACCTCTAAGGCTAGCCTGGCGAGACAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 373453 69 + 647215 TGCGGTAGGCCTGGGTTTTGGGTAGATACATAATTTAGTTCCATACATTCGTGTGAGGCAGCCAAAGGT------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr5 227887 60 + 294542 CCGCCAGGCTCTGACTAGAATAGATATGTATGTAGCTTTGACCACTTGATGAGACCATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179004 55 + 636262 CCGCCAGGCTCTGAGTAGAATAGATATGTATGTAGTTTTGA-CAATTGACGAGA----AA -s simRat_chr6.simRat.chr6 373522 60 + 647215 CTGCCAGGCTCTGACTAGAATAGATGTGTATGTAGCTTTGACCACTTGATGAGACCATCC - -a -s mr.mrrefChr5 227947 112 + 294542 CTACCCTAAAGGTATGCTGTCATAGTAGGTTCCCAGACTATGGAGATTAAACACTGTCTCATTGTATGTCACTATTACATTACCCCTTCCTCAATGTATCTTAACAAGTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374277 112 + 636262 CTACCCTAAAGGTGTGCAGTCATAGTAGGTCTGCAGACTATAGAGATTAAATACTGTCTCATTTTGGGTCACTATTACATTCCCTCCTCCTCAATGCATCTTAACAAGTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 373582 112 + 647215 CTACCCTGAAGGCATACTATCATAGTAAGTTCCCAGAATTTGGAGATTAAACACTGTCTCATTGTATGTTGCTATTACATTAACCCTCCCTCAATGTATCTCAACAAGTTGA - -a -s mr.mrrefChr5 228059 73 + 294542 TTGATTTATATGAGCCTCTACAAAGTCTTATGAATATGCAAGCTACAAGATGCCTTTTTTAGGCTCACAGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374390 73 + 636262 TTGATTTAGATGAGGCTCTACAAAGTCTTATGAATATGCAGGTTACAAGACACCTTTTTTAGGCTCACAGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 373694 73 + 647215 TTGATTGATATGAGCCTCCACGAAGTTTTATGAGTTTGCAAGCTACAAGATGCCTTTTTTAGTTTCACAGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 228132 321 + 294542 GAAAAGTGAGGATCTAAGTAAAGGTAAACCGTAAGGAACAAAAAGAACAAAGTCTAGGATAGAGGACACAAGAGTTAACTTTGCTCTTACCAAAGACAATTTTTAGATACTTTCACTCACTCAAGACGCCACTAAGTATACTGAGCTTTAAGTTACTTAGAAATGCATGGATAGTTTTGTATTCCCCTCAATTCCAGGTCTCTCAGGACCTCACTTTGGGCAAAAGACCAGAATCACACAGGTATAATCAGCTGTGTTGTGCATGTCAGCGATGGTGCAACTCTTATTATGCAATCCTGAATGGCTATTACATACCATTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374463 321 + 636262 GAAAAGTGAGGATCTAAGTAGAGGTAAACCATAAGGAACAAAAAGAATAAAATCTAGGATAGAGGACACAAGAGTCAACTTTGTTCTTACCAAGGACAATTTTTAGATACTTTCACTCACTCAAGACGCCCCTAAGAATACTGAGCTTTAAGCTACATAGAAATGCATGGATCGTCTTGTATTCCCATCAATTCCAGCTCTCTTAGGACCCCACTATGGGCAAAAGACCAGAATCACACAGGTATAATCAGCTGTGTTATGCATGTCAGGGATGGTGCAACTGTTAATATGCAATCCTGAATGGCTATTACATACCATTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 373768 321 + 647215 GAAAAGTGAGGATCTAAGTAAAGGGAAACCGTAAAGAACAAAAAGAACAACGACTAGGAGAGAGCACACAAGAGTTGACTTTGCACTTACCAAAGACAATTTTTAGAGCCTTTCGCTCGCTCAAGACACCACTAAGTATACTGGGCTTAAAGTTACTTAGAAATGCATGGATAGCTTTGTATTCCCCTCAATTCCAGGTCTCACATGACCTAACTTTGGGCAAAAGACCAGAATCACACAGGTATAATCAGCTGTGTTGTGCATGTCAGCTATGGTGAACCTCTTATTACACAATCCTGTATAACACTCATGTAACAGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 228453 133 + 294542 ATTTTTTGGCATGCTTCATTGTCTTTCAACAGCTGTGGAATTCGTGTCTATAACATCCCCTGGACCCAGTCTTCTTTTACCTTTACTCCCATGTTTGACTGGCATGTTCAAAGGGAGTGAGAAAATTCCTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374800 133 + 636262 ATTTTTTGGCATGCTTCATTGTCTTTCAACAGCTGTGGAATTCGTGTCTATAACATCCCCTGGACCCAGTCTTCTTTTACCTTTACTCCTACGTTTGACTGGCATGTTCAAAGGGAGTGAGAAAATTCCCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 374089 133 + 647215 ATCTTTTGGCATGCTTCAGTGTCTTTCAACAGCTGCAGAATTGGTGTCTATAAAATTCTGTGAACCCAGTCATCTTCTATCTTTACTCCCATGTTTAAGTGGCATGTTCAAAGCGAGTGAGTCAACTCCTATA - -a -s mr.mrrefChr5 228586 41 + 294542 TCTCAAGTGTGGGACCAACCTGTGACATGTTCACTGAAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374935 41 + 636262 TCTCAAGTGTGGGACCAACCTGTGACATATTCACTGAAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 374222 41 + 647215 TCTCAAGTATGGGACCAACCTGTGACATGTTCACTGAAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 228627 258 + 294542 GTTAAGCAACTATGTCTATTCTTTCATCTTGAGACATCTAGTTTCTGCTATGGTGTGAATCAAGTGTTCATTTGGAGACTGGCTTTATTAGCTGTGAAGTTTATACTATTGAATGTGCCTTCAGCCCAGCAGTGTGGGAACTCCAAGATTTTCAACTGGATATCCCTACTAACATCCTCTACCTGCATAGTTCTCTCAGGATTTAGACAAGAGTTACATTATTCAAGTGGAGGTATTGGTCTAGCGTATTCAATTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374978 250 + 636262 GTTAAGCAACTATGTCTATTCTTCCATCTTGAGACATCCAGTTTCTGCTATGGTGTGAATCAAGTGTTC--------ACTGGCTTTATTAGCTGTCAAGTTTTTATAATTGAATGTGCCTTCAGCCCAGCAAACTGGGAACTCCAAGATTTTCAACTGGGTATACCTACTAACATCCTCTACCTGCATAGTTCTCTCAGGATTTAGACAAGAGTTACATTATTCAAGGGGAGGTATTAGTCAAGCGTATTCAATTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 374263 256 + 647215 GTTAAGCAAGTATGTCTTTTCTTTCATCTTGAGACATCTAGTTTCTGCTATGATGTGAATCAA-TGTTTATTTGGAGACTGGCTTTCATAGCTGTGAAGTTTACACTATCAGATGTGCCTTCAGCTCAGCAGTGTGGGAACTCCAAGATCTTCAACTGGATGTCCCTACTAACATCCTCTACCTGCACAGTTTTCTCAGGGTTTAGACAATAGTTACATTATTCAAGTGG-GGTATTGTTCTAGTGTATTCAATTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 228885 35 + 294542 CTAGTGTATTCAATCGAAGATAAGTGTCTATCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375228 21 + 636262 -------GATCAATC-------AGTGTCTATCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 374520 35 + 647215 CTAGTGTATTCAATTGAAGATAAGGGTCTATCAAC - -a -s mr.mrrefChr5 228920 28 + 294542 ACCATGCTCACTATACATTTCAGTGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375249 28 + 636262 ACCATGCTCACTATACATTTCAGTGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 374556 25 + 647215 ACCATGGTCACAATACATTTTAGTG--- - -a -s mr.mrrefChr5 228948 210 + 294542 AAGTAATGTATAATCTAGTTGGGAACAAACCCGTTTATTGATAGTTTGTGATTCCTTGACCTCAGTGGCACATAAATTAAGAATATGTCTGGCTTCAACGGAGGATGCTGTTACTACTATATATTATTACTGTACATATTACTAATGTAGTCAGAGGGGTAAGCTAACTCCATGATCATTTTTTCAAGTGAGAAAAGACCAATCCTGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375279 208 + 636262 AAGTAATGTATAATCTAGTTAGGAACAAACCTGTTTATTGATAGTTTGTGACTCATAGACCTCAGTGGCAC--AAATTAAGAATATGTCTGGCTTCAACGGAGGATGCTGTTACTACTATATATTATTATTGTACATATTACTACTGTAGTCAAAGGGGTAAGCTAACTCCATGATCATTTTTTCAAGTGAGAAAAGACCAATCCTGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 374581 210 + 647215 AAGTAATGTATAATCTAGTTGGGAAGAAACCCGTTTATTGATAGTTTGTGTTTCCTTGACCTCAGTGGCACATAAATTAAGAATATGTCTGTCTTCAATGCAGGATGCTGTCACTGCTATATATTGTTACTCTACATTTTACCAATGTAATCAGAGGGGTGAGCTAACTCCATTATCATCTTGTCGAGTGAGCAAAAACCAATCCTGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 229158 218 + 294542 TGTCCTATTGTTGGAGGTGTCAATCTGGTTTGTTTGATGGTACAAGGGTCCTATGATCTCTTTAAATGCATCTTGACTTTTCTAGTTTCAGACTTGAGCTTATAGGGGCCATCCAGTCTACATAATGGCTGCCATATTCCTAAGTTGGCCAAGCAAAGTGAGTAAGAGTAGGTAGTACTAAATTGGTTTAAGACTCCTGCTTGTGTACTCGCACCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375580 218 + 636262 TGTCCTATTGTTGGAGGTGTCAATCTGGTTTGTTTAATGGTACAAGGGTGCTATGATCTCTTTAAATGCATCTTGACTTTTCTAGTCTCAGACTTGAGCTTATAGGGGCCATCCAGACTACATAATGGTTGCCCTATTTCTAAGTTGGCCAAGCAAAGTGAGTAAGAGTAGGTAGTACTAAACTTGTTTAAGACTCCTGCTTATATACTCGTACTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 374791 216 + 647215 TGTCCTATTTTTGGAGGTGTCAGTCTGGGTTGTTTGATGGTAC-CGGGTCCTGTGATCTCTTTAAATGCATCTTGCCTTTTCTAGTTTCGGACTGGATC-TATAGGGACCATGAAGTCTGCATAATGGCTTCCATATGCCTAAGTTTGCCAAGCAAAGTGAGTAAGAGTAGGTAGTCCTAAATTGGCTTAAGACTCCTACTTGTGTACTCGCACCTAA - -a -s mr.mrrefChr5 229376 51 + 294542 TGTTATTTAGATTTCAGAACAGTGCCTGGTGCAAAGCTGTAATAAAGGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375798 51 + 636262 TGTTATTTAGATTTCAGAACAGTGCCTGGTGCAAAGCTGTAATAAAGGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 375008 51 + 647215 TGTTGTTTAGATTTCAGCACAGTGCCTGATGCAATGCTATAATAAAAGGCA - -a -s mr.mrrefChr5 229427 222 + 294542 AACACAGCCATGTACTTTTGGTTATTGCTTGGCCATGAGCCTGCCCACTTTAGGAGATGTTAAGCGATCACAGAAGGAGTCTGCCCACATCATGCAAGAGGTTAGTCATGCACAGCTCCCTACGTACATTCTATATCCCCTGTCCACCTCATGCTAATGCATCTTCATTGTGGTGGCAGAAACAAGGAAAGAGAGAAGGAAAGCCTTCAATGGTAATTTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375862 218 + 636262 AACACAGCCATGTACTTTTGGTTATTGCTTGGCCATGAGCCTGCCCACTTTAGGAGATGTTAAGCGATCACAGAAGGAGTCTGCCCACATCATGCAAGAGGTTAGTCATGCACAGCTCCCTACGTACATTCTATATCCCCTGTCCACCTCATGCTAATGCATCTTCATTGTGGTGGCAGAAGCAGG----GAGAGAAGGAAAGCCTTCAATGGTAATTTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 375059 220 + 647215 AACACAGCCATGTACTCATGGTTATTGCATGGCTATCAGTCTGCCCTCTTGAGAAGATGTTTAGCGATCACAGAAGAAGTCTGCCTGCCTCATGCAAGAGGTTTGTCATGCAGAGCTGCCCACGTACATTTGAGATCCCCTGCCCACCTCATGCTTATGCACCTTTATTGTGGTGGCAGAAACAAGGAAAGAAAGAAGGAAAGCCTTCAATGG--GTTTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 229649 156 + 294542 GAAACTCTTCAGTTCCTTAAAGGAGACTAGAAATAGTTGCATCCCACAGCATACACAGAAAGGTAACTGGTGTAGTTTATACTCAGCCCTCACTTTGCAGCGCTGACTGATTCTCTCACAAACTGATTAAACATCAAACTATATTGAGTCCATCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376080 154 + 636262 GAAACTTTTCAGTTCCTTC-AGGAGACTGGAACTAGTTGCATCCCACAGCATACACAGAAAGGTAACTGGTGTAGTTTGTACTCAGCCCTCACTTTGCAGCCCTGACTTACTCTCTCACAAACTGA-TAAACATTAAACTATATTGTGTCCATCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 375336 156 + 647215 GAAATTCTTCACTTACTTAAAGAAAACTATAAATAGTTGCACTGCACAGCATGCACAGTGAGGTGACTGGGGTAGTTTATGCTCAGCCCTCACATTGCAGCGCCAACTGGTTCTCTCACAAACTGATTAAATATCAAACTATATTGAGTCCATCAC - -a -s mr.mrrefChr5 229805 110 + 294542 AGACAGCAGTAACATAAGAAAAGCTAAAGTTTTCAGTGTAATTTCCATGCAAAAGAATTTGATTGACAAACATTCAGTGGTCCCATGCTGACTGAAAGTGTATACAAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376236 110 + 636262 GGACAGCAGTAACATAAGAAAAGCTAAAGTTTTCAGTGTAATGTACAAGCAAAAAAAATCACTTGACAAACATTCAGTGGTCCCATGCTGACTGAAAGTGTATACAAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 375492 110 + 647215 AGACGGCAGTACCATAAGAAAAGGTAAAGTTTTCAGTGTAATTTCCATGCAAAAGACTTTGATTGACAAGCATTCAGTAGTCCAATGCTGCCTGAAATTGTATACAAAGC - -a -s mr.mrrefChr5 229915 59 + 294542 GACAAAGCTTGCATAATAGGAGGAGGCCTTCCCACCCCTTGTGTAGTAGACTTGTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376346 51 + 636262 --------TTACATAATAGAAGGAGGCCTTCCCACCCCTTCTGTAGTAGACTTGTTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 375604 59 + 647215 GACAAAGCATGCATAATAGGACGAGGCCTTCCCACCTCTTGTGTAGTAGAATTGTTTGA - -a -s mr.mrrefChr5 229974 232 + 294542 GATCACATGCACAGGTGACTCATGGGAACTACTGTCTGTATCCTTTTGATTGTACAATCCAAAATATACTGAAAATACAAACACTATAAAGGTGCCATGGAGATGGGAAGTCATAACAAAAACTCTTAACAATACCCTACCATTCCTATATTTTGGTTCATAAAAAAATCCATTTTATCCCCTTTATCCACACACCTTGCCAGCATAACTATAGAATCTTGCTCTCTAAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376398 230 + 636262 GATCACATGCACAGGTGACCCATGGGAACTACTGTCTGTGTCCTCTTGATTGTACAATCCAAAACATACTGAAAATACAAACACTATAAAGGTGCCATGGAGATGGGAAGTCGTAACAAAAATTCTTAACAGTGCCCTACCATTCCTATATTTTGGGTCATAAAAAAACCCATCTTAT--CCTTTATCCGCACACCTTGCCAGCATAAATATAGAATCTTTCTCTCTAAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 375663 230 + 647215 GATCACATGAGTGGGTGACTCATGAGGACTACTGTCTG-ATCCTTTTGATTGTACAATACAAAGTATACTGAAAATACAAATGCCATAAAGCTGCCATGG-TATGGTCAGTCATAACAATAACTCTAAACAATACCCTACCATTCCTATATTTTGGTTCAAAAAACAATCCATTTTATCCCCTTTATCCACACACCTTGCCAGCATGACTATAGAACCTTGCTCTCTAAGAG - -a -s mr.mrrefChr5 230206 261 + 294542 AAATGCACGCATTGTACAACACTGACCCTATGCATGTGAAACTTGCACCTTATTATCCTTTGACCAGCAATATTTTTGGTAATTGTGTGTACCTAGTGTTAGACAGTGATTTCTCCATAGATACATGGTGACCACCAGGCTTTTCATAATTGGGAGTATGGAACCCTAGTAGCTACGAGCAAACCCATCAGTCATTTGCATGGGAGAGTATATTCTTCTCAGCATGATGATACCTTCCTTTTTCCAGAATAGACCAGCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376628 261 + 636262 AAATGCATGCATTGTACAACACTGACCCTATGCATGTGAAACTAGCAGCTTATTATCCTTTGTCCAGCAATATTTTTGGTAATTGTGTGTACCTAGCATCAGACAGTGATATCTCCATAGACACATGGTGACCACCAGGCTTTTGATAATTGGGAGTATGGAACCCTAGTAGCTACGAGCAAACCCATCTGTCATTTGCATGGGAGAGTATATTCTTCTCAGCATGATGATACCTTCCTTTTTCCAGAATACACCAGCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 375894 259 + 647215 AAATGGACGCAATGCAAAACGCTGACCCTATGCATGTGAAATGTGCACCTTAGTATTCTTTGACCAGCAATATTTTTAGTAATTGTGTGTACCTAATGCTGAACAGTCATTTCTCCATATGTACATGGTGACCACCAGGCTTCTCATAATTGGGAGTATAAGACCCTAGTAGC--CGAGCAAACCCTTCAGTCATTTGAGTGGGTGGGTGTATTCTTCTCAGCATGATGATAGCCTTCTTTTTCCAGAATAGACCAGCTGA - -a -s mr.mrrefChr5 230467 15 + 294542 GCAGACCCACACAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376889 15 + 636262 GCAGACCCACACGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 376166 15 + 647215 GCAGACCCACACAAT - -a -s mr.mrrefChr5 230482 158 + 294542 CAATGTTTATACCCAGCACTGGATTTGGTATTTATAGGGGATAGGGGCTCAGGGCAACAATAGGAGACCATTGACATAAAAAAATTGTTGTGGGGGTATGCATGTGGACAGACTAAAAGAGAGGTGAGTATTTTTGAACATTCCAATTGCAGTCTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376904 158 + 636262 CAATGTTTATACCTAGTACTGGATTTGGTATTTATGGGGGATAGGGGCTCACAGCAACAATAGGAGACTATTGACATAAAAAAATCGTTGTAGGGGTATGCACGTGGACAGACTAAAAGAGAGGTGAGTATTTTTGAACATTCCAATTGCAGTCTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 376182 158 + 647215 CAATGTTGATGCCCAACACTTCATTTGGTATTTATAGGGGATAGGGGCTCAGGGCAACAACAGGAGACCATTGACATCGAAAAATTGCGGTGGGGGCATGCATGTGGGCAGACTGAAAGAAAGGTGAGTATTTCTGAACACTCCGATTGCAGTCTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 230640 11 + 294542 AGGAAGGTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377062 11 + 636262 AGGAAGGTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 376341 11 + 647215 AGGGAGGTTTG - -a -s mr.mrrefChr5 230651 20 + 294542 TTACAGTATCAAGAGATGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377074 20 + 636262 TTACAGTATCAAGAGATGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 376352 20 + 647215 TTACAGTATTAAGAGATGAA - -a -s mr.mrrefChr5 230671 225 + 294542 ATGAATAAGGTTCCGCTATGGATGATATACAGCATTTAATAACAACTACCTGAGCGTTATGGTGATCAACTTTTGAAATTAAAAATGACAGTAAGGGAAATCTGGCATGCAGCAACATCATAAGCCTTAATTCTATAGTTAATGGGCAGCAAAGTGGGTGTGGACATCCCAGAAGGAGGGGACTCCAAGAGACTATGCCTGCAGATAGTACTAGCAAGTTAGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377094 225 + 636262 ATGAATCAGGTTCCACTATGGATGATATACAGCATTTAATAACAACTATCTGAGCGACATGGTGATCAACTTTTGAAATCAAAAATGACAGTAAGGGAAATCTGGCATGCAGCAACATCATAAGCCTTAATTCTATAGTTAATCGGCAGCAAAGTGGGTGTGGACATCTCAGAAGGAGGGGACTCCAAGAGACTATGCCTGCAGATAGTACTAGCAAGTTAGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 376373 225 + 647215 ATGAGTAAGGTTCCGCTATGGATGATCTACAGTGTTCAATAACGACTACCTGAGGGTTACAGCGAACAACTTTTGAAATTAAAAATGCCAGTATGGCAAATCTGGCATGCAGCAACATCTTAGGCCTTAGATCTATAGTGAATGGGCAGCAAAGTGGGTGTGGACATCCCACAAGGAGGGGTCTGCAAGAGACCATGCCTGCAGATAGAACTAGCAAGTTAGGAG - -a -s mr.mrrefChr5 230896 270 + 294542 GGGGAGGAACCCAAGAGGCTATGCCTGCAGATTGTTTGAGGGTTAAATTCTGAAAAGTGGATTTCCAGATGGTTTGTAGAAGTCAGCATGGATGCCCTGATTCTGATATACCACAAGGGCATACTTAACACCAAGGCAGAGTGCTCCCAAGATACTATCGGACCATTCTAAGGGAGTGACCGATAAGCAATGTTGTGACAAAGATAGAAATGTGTGTTACTTGTGCAAGAGTCAACATTATAAGAAGTATATAGGTAGGGTTGAGTTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377336 270 + 636262 GGGGGAGAACCCAAGAGGCTATGCCTACAGATTGTTTGAGAGTTAAATTCTGAAAAGTGGATTTCCAGATGGTTTGCAGAAGTTAGCATGGATGCCATGATCCTGATGTACCACAAGGGCATACTTAACACCAAGGCAGAGTGCTCCTGAGATACTGTTGGCCCAATCTAAGGAACTGACCGATAAGCAATGTTGTGACAAAGATAGAAATGTGTGTTACTTGTACAAGAGTCAACATTATAAGAAGTATGTAGGTAGGGTTGAGTTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 376598 266 + 647215 GGGGAGGATTCCAAGGTGTTATGCCTGCAGATTATTTAAGGGTTAAATACTGAAAAGTGGATTTCCAGATTGTTTATAGGAGTCAGCATGGATGCACTGATTTTGATATACC----GGGCATACTTAATGTCAAGGCAGAGTGCTCCCAAGGTATTATCAGACCATTCCAAGGGAGTGACCAATAACCAATGTTGTGACGAAGATAGAAACTTGTGTTGCTTTTGCAAGAGTCAACATTATAAGAAGTATATAGGTAGGGTTGAGTCATT - -a -s mr.mrrefChr5 231166 178 + 294542 TACTTATAGTGACTGTAAATGATATCAATATTGAATGCTACTATAACATGAGGGGGTTTCTTTTTCCTCAAGGCTGTATGGATATATGTATGCCCTTCTTCCATACTTAATTATTTATTGAGGTTGGCTAAGGTTTTTGTGATCCTGGCTTAACCAGTGGACCATTGTTTGAGGAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377606 178 + 636262 TACTTATAGTGACTGTAAATGATATCAATATTGAATGCTACTATAACATGACGGGGTTTCTTTTTCCTCAGGGCTGTATGGATATATGTATGCCCTTCTTCCATACTTAACTATTTATTGAGGTTGGCTAAGGTTTTTGTGATCCTGGCTTAACCAGTGGACGATTGTTTGAGGAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 376902 178 + 647215 TACTTATAGTGACTGTAAATGATATCATGATTGAATGCTACTATAACATGAGGAGGTTTCTTTTTCCCCAAGCCTATATGGATATATGTATGCCCTTCTTCCATCCTTAATTATTTATTGAGGTTGGCTAAGGTTTCTGTGATCCAGGGTTAACTAGTGGACCATTGTTTAAGGAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 231344 103 + 294542 CCTGGTATGCCTAGATGTGATTCCATCCAATCCTTTAATGGCATTAGCTTGCCCTCAATTGAAATGAGCATCGGAGTTCTACAGTCAACCTTTCCTACCTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377784 103 + 636262 TCTGTTATGCCTAGATGTGATTCCATCCAATCCTTTAATGGCATTAGCTTGCCCTCAATTGAGATGAGCATCGGAGTTCTACGGTCAACCTTTCCTACCTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 377090 103 + 647215 CCTGGTGTGCTTAGATGTGATTCCATCCAATCCACTAATGGCACTAGCTTGCCCTCAACTGAAAGATGCATAGTAGCTCTACAGTCAACCTCACCTATCTAAC - -a -s mr.mrrefChr5 231447 273 + 294542 TATTCAGGGAGTATCTTCTGTGTTTTTTTGAAGAGACTATTTTCCGCTGGGATCGACTGTTGTAATGGACACTCAAGTAACTGGTAAACCTGAGCAGTAGTCAGGCATGCATGAAACGGTCTTACTAAGTTGTTGCAGGGCATTCTAGCCATGAAAATGCACCAATTAGTGGGGAGACCATTTTTTTAGGCAGAAACTTGTGTCTGGTTTTTTAGGCTGAAACTCATGTTGGTTTGCTGTACAAGAGTAAATATCTAATATCAGCATAGAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377887 261 + 636262 TATTCAGGGAGTATCTTCTGTGTTTTTTTGAAGAGACTATTTTCCGCTG------------GTAATGGACACTCAAGTAACTGGTGAACCTGAGCAGTAGTCAGGCATGCATGAAACGGTCTTACTAAGTTGTTGCAGGGCATTCTAGCCATGGAAATGCACCAATTAGTGGGGAGACCATTATTTTAGGCAGAAACTTGTGTATGGTTTTTTAGGCTGAAACTCATGTTGGTTTGCTGTACAAAAGTAAATATCTAATATCAGCACAGAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 377199 262 + 647215 TATCTAGAGAGTATCTTCTGTGTTGTTTTGAAGAGACTATCTACCAATGGGATCGACTGTTGTAATGGACACTCAAGTCGCTGGTAGACCTGAGCAGTAATCAGGCATGCATGAAACAGGCTTACTAAGTTG----------TTCTTGCCATGAAAATGTACCAATTAGTGAGAAGACCATTTTTCTAGGCCGAAA-TTGTGTCTGGTCTTCTAGGTAGAAACTTGTGTTGAGTTGCTGTACAAGGATAAATATCTAATATCAGAATACAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 231720 18 + 294542 CTATAATATGAGATTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378148 18 + 636262 CTATAATATGAGATTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 377467 18 + 647215 CTATTATATGAGACTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 231738 253 + 294542 ATGTCTTTGTACAGGCTGTGTTCTTAATTGATTTATCATAGTGCAGTGTGACTGCACAGAGGAATACCAGGTTACTCCAAGTCAAGGATTTTCCCCAGCAAGTGTTTAGTGTACAAAGGGTACATGCGTAATGTTGTTATCATATTAAGTAGTGCAAGCAGTTGGGGTAATACAAGTAGTATGTCCTACACACATTTAACAGTTGGGCAGGTGAGTATTTAACAGTTGGGCAATCGAGTGGGTGCAACCATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378166 253 + 636262 ACGTCTTTGTACAGGTTGTGTTCTTAATTGATTTATCATAGTGCAGTGTGACTGCACAGAGGAATACCAGGTCGCTCCAAGTCAAGGATTTTCCCCAGTAAGTGTTTAATGTATAAAGGGTACATGCGAAATGTTGATATCATATTAAGTAGTGCAAGCAGTGGGAGTAATACAAGTAGTATGTCCTACACACATTTAACAGTTGGGCAGGTGAGTATTTAACAGTTGGGCAATCGAGTGAGTGCAACCATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 377487 253 + 647215 ATGTCTTTGTACCGGCTGTGTTCTAAGTGGATCTATCATAGTGCAGTGTGGCTGCACAGAGGAACACAAAGCTACTCCAAGTCAAGGATCTTCCCCAGCAAGTGTTTAGTGTACAAAGGGTACATGCGTAATGTTGTTATCATATTAAGTGGTGCAAGCAGTTAGGGTAATACAAGTAAGATGTTCTACACACATTAAACAGTTGGGCACATGAGTATTTAACAGTTGGGCAGGTGGGTGGGGGCAACCATTC - -a -s mr.mrrefChr5 231991 16 + 294542 AACGCCCAAATAAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378419 16 + 636262 AACGCCTAAATAAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 377746 16 + 647215 AACACCCAAATAAGGC - -a -s mr.mrrefChr5 232007 207 + 294542 AGATAATGTGTTCCAGAATAATGGGTTAAAATTAAGGGATGAGGACAGTCCCTGAATAGGCTGCAAGGATTTTGGGGAAGTAGTACCAAAGCTGATGTGTGGTTCATAACATAGAAGCTATGAAACTTGGAATAATGAGCAAGTGATTGTTCTTGTAAGATCCGAAGGCTGGGGAAGAGGAACATCTATGAGGGATTGAACATCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378435 206 + 636262 AGATAATGTGTTCCAGATTAATGGGGTAAAATCAAGGTATGGGAACAGTCCCTGAATAGGCTGCAAGGATTCCGGGGAAGTAGTACCAAAGCGGATGTGTGGTTC-TGAAATAGAAGCTATGAAACTTGGAATAATGAGCAAGTCATTGTTCTTGTAAGATCCGAGGGCTGGGGAAGAGGAACATCTGTGAGGGATTGAACATCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 377764 206 + 647215 AGATAATGTATTCAAGAATAATGGGTTAAAATTAGGGGATCAGGCTAGTCACTGAATAGGCTGCAAGGATTTTGGGGAGGTAGTTCCAAAGCTG-TGTGTGGTTCATAACATAGAAGCTACAGAGCTGGGAATAATGAGCAAATGATTGTTCTTGTAAGATCCGAAGGCTGGGGAATAGGAACATCTATGAAGGACTGAACATCTGG - -a -s mr.mrrefChr5 232214 142 + 294542 GGGTAACGAAAAGTCCTCATACTTTGGCGAGATTAGTCTTTGGGACCACTACAGGACAATACAACAAGTGGAAGTGTATCCAGTAATGTTGGGGGGTTGGCACACCACCTGACAGTGTTAGGAGACAAGTATGTTTAGTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378641 139 + 636262 GGGTTACGATAAG-CCCCATACTTTGG-GAGATTGGCCTTTGGGACCACTACAGGACAATACAACAA-TGGAAGAGGATCCAGTGATGTTGGGGGGTTGGTACACCACCTGACAGTGTTAGGAGACAAGTATGGTTAGTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 377972 142 + 647215 GGGTATCGAAATGTCCTCATACTTTTGCGAGATTAGTCTTTGGTACCACTACAGGACAATACAACAAGTGGAAGTGTATCCAGTAATGATGGGGGGTTGCCACACCACCTGACAGTGTAAGGAGAGAAATATGTTTAGTTTA - -a -s mr.mrrefChr5 232356 85 + 294542 CAATGATATTGATTAATGACCCTAGCTAAAATTCTCAGATGTCTTTATCCAGCAGGTAGATAATATTAGGTGGGTCAATCAGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378780 85 + 636262 CAATGATGTTGATTAATGACCCTAGCTAAAATTCTCAGACGTCTTTATCCACTGTGTAGATAATATTAGGTGGGTCAATTGGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 378218 81 + 647215 CAATGATATTGATCACTGACCCTAGCTAAAGTTCTTATATGTCTTTAACCAGCAGGTAGATAATATTAGGTGGG----TCAATTA - -a -s mr.mrrefChr5 232441 43 + 294542 GAAAGAATGGCGTGTTTTCTCAACTACTAATATAGCAATTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378865 42 + 636262 GAAAGACTGGCGTGTTTTCTCAACTACTAGTAT-GTCATTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 378303 35 + 647215 GAAGGAATGG---AGT-----GACTACTAATATATCAATTTGC - -a -s mr.mrrefChr5 232484 40 + 294542 TCCTTGTTGCCTAGCTCGCTATCTTTAGCTCTCTTATACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378908 40 + 636262 TCCTTGTTGCCTAGCTCGCTATCTTTAGCTCTCTTATACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 378338 40 + 647215 TCCTTGTTTCCTAGCTAGCTACCTTTAACTCTCCCGTACT - -a -s mr.mrrefChr5 232524 111 + 294542 GTCATACGGCCGATCTCATCCACTGCACGGCTCGTTGCTGGTGCACCGAGCGTGAACCCGACTCAAGAAATTGCAGCGAGCGGCCCTCGTCCGAAGCCCTGGCGAGCACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378948 111 + 636262 GTCATGCGGCCGATCTCAACCACCGCACGGCTCGTGGCCGGTGCAACGAGCATGAACCCGACTCAAGAAATTGCACTGAGTAGCACTCGTCCGAAGCCCTGGCGAGCACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 378388 109 + 647215 GTCATACGGCCGATGTCATCCACTGCACGGCTCGTTGCTAGTGCACC--GCGTGAACACGACTCAAGGTATTGCAGCGAGCGGCCCTCGTCCGAAGGCGTGTCGAGCACAA - -a -s mr.mrrefChr5 232635 104 + 294542 AATCCCAAATTAGCCCCCATGAGCCGCATTGTCCTAGTGGCATAGGATCTCTAGGTCCCCAAACCCCCTCTCGATCACCAACTGGTGCCGAAGACTGCACCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379063 104 + 636262 AATCCCAAATTCGCCCCCATTAGCCGCATTGTCCTAGTGGCATAAGATCTCTAGGTCCCCAAACCCCCTCTCGAGCACCAACTGGTGCCTAAGGCTGCAGCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 378497 104 + 647215 AATCCCAAATTAGCCTCCATGAGCCGCATTGTCCAATTGGCACAGGATCACTAGGTCTCCAAGTCCCCTCTTGATCACCAACTGATGCCGAAAACTGGACCCTC - -a -s mr.mrrefChr5 232739 65 + 294542 GGTACTCTTCACAGGTCGCCCTACTCAAGCGCCCAAGGTCAATCGTTGGCCGCACATACTGGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379222 65 + 636262 GGTACTCTTCACAGGTCGCCCTACTCAAGCGCCCAAGGTCAATCCTGGGCCGCACATACTGGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 378601 65 + 647215 GGTACTCTTCACAGGTCGCCCTACTCACGCGCCCAACGGCAATCGTTGGCCGCACAGACTGGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 232804 35 + 294542 TGTTACCAGAGTAACTGATCGCACAAGTTATTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321930 35 + 636262 TGTTACCAGAGTAACTGATCACACAAGTTATTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379414 35 + 636262 CGTTGCCGAAGTAACTGATTGCACAAGCTATATAG - -a -s mr.mrrefChr5 232839 13 + 294542 AATGTTATTGCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379472 13 + 636262 AATGTTATTGCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 378666 13 + 647215 AACATTACTGCGA - -a -s mr.mrrefChr5 232852 15 + 294542 AAAAAAATAATATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379485 15 + 636262 AAAAAAATAATATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 378679 15 + 647215 AAAAGAATAATATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 193946 15 - 647215 ACGATCATAAGATTT - -a -s mr.mrrefChr5 232867 9 + 294542 CCAAAAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379500 9 + 636262 CCAAAAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 378694 9 + 647215 CCAACAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 193964 9 - 647215 CTTAAAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 232876 40 + 294542 TGTTGTACAACATACTGTTTTGTTTTGATCCCACGGGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379509 40 + 636262 TGTTGTACAACATACCATTTTGTTTTGATTCCATGGGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 378703 40 + 647215 TGCTTTACAACAAACTGCTTTGTCTCAATCCCACGGACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 193976 30 - 647215 TGTTGTTGGAGACACTG----------ATCACACAAGCAT - -a -s mr.mrrefChr5 232916 4 + 294542 TTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321965 4 + 636262 TACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379549 4 + 636262 TTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 378743 4 + 647215 TTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 194006 4 - 647215 TTCA - -a -s mr.mrrefChr5 232920 75 + 294542 TAGGCACCTGCCCCTATAATACAATCTGTTTCGTATGCTCCTTCACACTGTATGAGGTTTACCTGACTAATTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321969 75 + 636262 TAGGCTCCTCCCACTATAATACAATTTCTTTTGTGTGCTCCTTCACACTGTATGAGGTTTACTTGACTGATTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379553 72 + 636262 TAGGCACCTGCCCCTATAATACAACCTGTTTCGTATGCTCCTTCAAACTGTGTGAGGTTCACCTG---AATTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 378747 75 + 647215 TATGCACCTGCCCCTATAATACAATCTGTTCCGTATGCTCCTTCCCACTGTATGAGGTTTACCTGACTAACTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 194017 71 - 647215 TAGGACTCTGACTCTA--ATACAATCAATTTCTTACGCTCCTTCATACCGA--GAGGTTTACCTGGCCGGTTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 232995 27 + 294542 TCCTTTTACTTGAATGTTCCTGTCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322044 27 + 636262 TCCTTTTACGTGAATGTTCTTGTCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379625 27 + 636262 TCCTCTTACTTGAATGTTCCTGTCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 378822 27 + 647215 TCCTTTTATTTGAATGTTCCAGTCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 194095 27 - 647215 TCCTTTTACTCAAATGTCCCTGTGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 233022 6 + 294542 CATACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322075 6 + 636262 CATACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379652 6 + 636262 CATGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 378849 6 + 647215 CAACCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 194122 6 - 647215 CAAACA - -a -s mr.mrrefChr5 233028 1 + 294542 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322081 1 + 636262 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379658 1 + 636262 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 194128 1 - 647215 A - -a -s mr.mrrefChr5 233029 35 + 294542 TACAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCCTCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322082 35 + 636262 TATGAGATTTACTGGACTGTTTTTATTCCCTCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379659 35 + 636262 TACAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCCTCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 378855 35 + 647215 TACAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCCTCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 194129 35 - 647215 TATAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCATCACC - -a -s mr.mrrefChr5 233064 8 + 294542 ATATTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322117 8 + 636262 ATCTTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379694 8 + 636262 ATATTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 378890 8 + 647215 ATATTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 194237 8 - 647215 ATATTAGG - -a -s mr.mrrefChr5 233072 7 + 294542 TGTATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322125 7 + 636262 TGTATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 194245 7 - 647215 TGTACTT - -a -s mr.mrrefChr5 233079 27 + 294542 GAAGGTGGCACTTCTGAGTATGGCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322132 27 + 636262 GACTGTCGCACTTCTGATTATTTCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379702 27 + 636262 GAAGGTGGCACTTCTGAGTATGGCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 378898 27 + 647215 GAGGGTGGCACTTCTGAGTATGGCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 194252 27 - 647215 GAAGGTGGCACTTTTGAGTATGGCCGT - -a -s mr.mrrefChr5 233106 6 + 294542 TTTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379729 6 + 636262 TTATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 378925 6 + 647215 TTTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 194279 6 - 647215 TTTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 233112 28 + 294542 ATGCTTCTCCACAATATTAGATTTTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322159 28 + 636262 ATTCTTCTCCACAATATTAGATTTCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379735 28 + 636262 ATGCTTCTCCACGACATTAGATTTTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 378931 28 + 647215 ATGCTTCTCCACAATATTAGATTTGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 194285 15 - 647215 GTGCTTCCCCACTAT------------- - -a -s mr.mrrefChr5 233140 44 + 294542 ATTGTCTGTCTTATGGCTCTTCAGAGTATCACTGCTGGCCCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322203 44 + 636262 ATTGTGTGTCTTATGTCTCCTCAGAGTATCACCGCCGGCTCTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379763 34 + 636262 ACTT----------GGCTCACCAGAGTATCACTACTGGACCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 378959 44 + 647215 ATTTTCCATCTTATGGCTCTTCAGAATATCAGTGCTGGCTCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 194300 29 - 647215 -TCGTCTGTGTTATGGCTTTTCAGA--------------CCTTT - -a -s mr.mrrefChr5 233184 14 + 294542 ACTGCTGGCCTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379797 14 + 636262 ACTGCTGGCCTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 379003 14 + 647215 ACTGCAGGCTTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 194329 14 - 647215 ACCACTGTTCCTTT - -a -s mr.mrrefChr5 233198 22 + 294542 TCGTATGCTTCTCCACTATATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322247 20 + 636262 CCGTATGCTTCTCCACTGTA-- -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379811 18 + 636262 TCGTACACTTATCCAGTA---- -s simRat_chr6.simRat.chr6 379017 22 + 647215 ACATACGTTTCTCCGGTTTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 194343 22 - 647215 TCGTGTGCTTTTCCCCTATATC - -a -s mr.mrrefChr5 233220 35 + 294542 AGGTTTTTTAATCGTCCTTCTTATGGCTCTTCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379829 35 + 636262 AGGTTTTTTAATCGTCCTTCTTATGGCTCTTCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 379039 35 + 647215 AAGTTTTTTAATTGCTCTTCTTATGGCTCTTCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 194365 26 - 647215 GGGTCTC---------CTTCTTATGGCTCTTCAGA - -a -s mr.mrrefChr5 233255 37 + 294542 GTATCACCCCCACTCACAGTTCAGATATCAACCGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379864 37 + 636262 GTATCACCTCTCCTCACAGTTCAGATATCAACCGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 379074 37 + 647215 GTATCACCCCCACTTTCAGTCCAGAAATCAACCACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 194392 14 - 647215 GTATCGGCCCCACT----------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 233292 11 + 294542 ATCCCTTACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322267 11 + 636262 ACCACTTAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379901 11 + 636262 CTCCATTGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 379111 11 + 647215 CTCCATTACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 194406 11 - 647215 ATCCCTTGCAC - -a -s mr.mrrefChr5 233303 5 + 294542 GCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379912 5 + 636262 GCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 379122 5 + 647215 GCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 194417 5 - 647215 GTGTG - -a -s mr.mrrefChr5 233308 18 + 294542 ACCCATCCCCCCCTACaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322278 18 + 636262 ACCCATCCCCCCCTAAaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379917 18 + 636262 ACCCATCCCCCCCTAcaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 379127 18 + 647215 GCCCATCCCCCCCTACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 194422 10 - 647215 --------TCCCTTACAA - -a -s mr.mrrefChr5 233326 19 + 294542 tcttattgggacgagctga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322296 19 + 636262 tcttattggaatgagctac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379935 19 + 636262 tcttattgggacaagctga -s simRat_chr6.simRat.chr6 379145 19 + 647215 Tcttattgggacgagctga -s simRat_chr6.simRat.chr6 194433 19 - 647215 TCTCAAGAGGACAGGTAGa - -a -s mr.mrrefChr5 233345 1 + 294542 a -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322315 1 + 636262 a -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379954 1 + 636262 a -s simRat_chr6.simRat.chr6 379164 1 + 647215 a -s simRat_chr6.simRat.chr6 194467 1 - 647215 a - -a -s mr.mrrefChr5 233346 1 + 294542 t -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379955 1 + 636262 t -s simRat_chr6.simRat.chr6 379165 1 + 647215 t -s simRat_chr6.simRat.chr6 194468 1 - 647215 t - -a -s mr.mrrefChr5 233347 21 + 294542 gtacacttttgtaaatgcttc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322316 21 + 636262 aaacacttttgtaaatgcttc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379956 21 + 636262 gtatacttttgtaagtgcttc -s simRat_chr6.simRat.chr6 379166 21 + 647215 ggatacttttgtaaatgcttc -s simRat_chr6.simRat.chr6 194469 21 - 647215 gtacacttttgtaaatgcttc - -a -s mr.mrrefChr5 233368 1 + 294542 t -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322337 1 + 636262 t -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379977 1 + 636262 t -s simRat_chr6.simRat.chr6 194490 1 - 647215 t - -a -s mr.mrrefChr5 233369 47 + 294542 ttgaagtgtagacttcttgtgtagtaagagaatgtctattcatgtct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322338 47 + 636262 ttggagtgtagacttcttctccagcaagagaatgcctatccatgact -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379978 47 + 636262 ttgaaatgtagacttcttgtgtagtaagaggatgtctatttatgtct -s simRat_chr6.simRat.chr6 379187 47 + 647215 ttaaaatgtagacttcttgtgtagtgagagaacgtctatttgtgtct -s simRat_chr6.simRat.chr6 194491 44 - 647215 ttggagcgtaaacttctcttgca---agggaatgtctattcatgtct - -a -s mr.mrrefChr5 233416 6 + 294542 ctagcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380025 6 + 636262 ccagcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 379234 6 + 647215 ctagcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 194535 6 - 647215 ctagcc - -a -s mr.mrrefChr5 233422 18 + 294542 catcttttaatggtgtcg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322385 18 + 636262 cgtctcttaatggtgttg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380031 18 + 636262 catcttttattgttgtcg -s simRat_chr6.simRat.chr6 379240 18 + 647215 catcttattatgttgtca -s simRat_chr6.simRat.chr6 194541 18 - 647215 catctcttaatagtgttg - -a -s mr.mrrefChr5 233440 2 + 294542 tt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322405 2 + 636262 tt -s simRat_chr6.simRat.chr6 194559 2 - 647215 tt - -a -s mr.mrrefChr5 233442 13 + 294542 ggttttcgttttg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322407 13 + 636262 ggtgactgttttg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380049 13 + 636262 gtttttcatgttg -s simRat_chr6.simRat.chr6 379258 13 + 647215 aattataattttg -s simRat_chr6.simRat.chr6 194561 13 - 647215 ggttttcgttttg - -a -s mr.mrrefChr5 233455 2 + 294542 tg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380062 2 + 636262 tg -s simRat_chr6.simRat.chr6 379271 2 + 647215 tg -s simRat_chr6.simRat.chr6 194574 2 - 647215 tg - -a -s mr.mrrefChr5 233457 5 + 294542 atctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380064 5 + 636262 atttc -s simRat_chr6.simRat.chr6 379273 5 + 647215 atctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 194577 5 - 647215 atctc - -a -s mr.mrrefChr5 233462 17 + 294542 tgtaattctgttatgga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322420 17 + 636262 tgtatatctgttaagga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380069 17 + 636262 tgtaattctgttataga -s simRat_chr6.simRat.chr6 379278 17 + 647215 tgtgattctattatgga -s simRat_chr6.simRat.chr6 194582 17 - 647215 tgtaagtatgttatgga - -a -s mr.mrrefChr5 233479 1 + 294542 c -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322445 1 + 636262 t -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380086 1 + 636262 c -s simRat_chr6.simRat.chr6 379295 1 + 647215 c -s simRat_chr6.simRat.chr6 194599 1 - 647215 c - -a -s mr.mrrefChr5 233480 7 + 294542 ctgtgca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380087 7 + 636262 ctgtgca -s simRat_chr6.simRat.chr6 379296 7 + 647215 ccatgaa - -a -s mr.mrrefChr5 233487 38 + 294542 ggcaaaatgttactcttaattggtatattcacagttgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380120 38 + 636262 ggcaaaatgttactcttaattggtatattcacagttgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 379303 38 + 647215 ggcgacattcctgtcttaattggtaggtacacacctgg - -a -s mr.mrrefChr5 233525 49 + 294542 gtggcaacagtcttttgttcctatgacccacacagcatgttatggacca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380160 49 + 636262 gtggcaacagtcttttgttcctatgacccacacagcatgttatggacca -s simRat_chr6.simRat.chr6 379341 49 + 647215 gtggtaacgggcttttgatcctttggcccacacaGCAcattatggacct - -a -s mr.mrrefChr5 233574 43 + 294542 gtgaaaccaggcccctcttagatgaataagtggcagaattttt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322446 43 + 636262 gtgataccaggctcctctcaaatgagtaagtggcaaaATTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380209 43 + 636262 gtggaaccaggcccctcttagacgattaagtggcagaatcttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 379390 43 + 647215 gagaaaccaggcacctcttacatgaataagtggcagaatcttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 194600 43 - 647215 gtgaaaccaggcccctctcagatgaataagtggcaaaattttt - -a -s mr.mrrefChr5 233617 6 + 294542 gtccca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380252 6 + 636262 gtccca -s simRat_chr6.simRat.chr6 379433 6 + 647215 gtccca -s simRat_chr6.simRat.chr6 194643 6 - 647215 gtccca - -a -s mr.mrrefChr5 233623 2 + 294542 ag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380258 2 + 636262 ag -s simRat_chr6.simRat.chr6 194649 2 - 647215 at - -a -s mr.mrrefChr5 233625 14 + 294542 tggcaggtttgcag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380260 14 + 636262 tggcaggtttgcag -s simRat_chr6.simRat.chr6 379439 14 + 647215 tggtatgtttggtt -s simRat_chr6.simRat.chr6 194651 14 - 647215 tggcaggtttgcgg - -a -s mr.mrrefChr5 233639 4 + 294542 gtgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380280 4 + 636262 gtgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 379453 4 + 647215 gtgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 194665 4 - 647215 gtgg - -a -s mr.mrrefChr5 233643 83 + 294542 taatagtctcttgctcctttgccccacacaatgcctttgacttaataatatcccactcccgtttgttgattcgcagcctcgca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380284 77 + 636262 taacaatctcttgctcctttgccccacactatgctttttacttaataatatcccactcccctttgttgattcacagc------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 379457 83 + 647215 taatggtctattgctcctttgccctacacaatgccattgacttaataatatcccactcctgtttgctgattcgcagcccctca -s simRat_chr6.simRat.chr6 194697 82 - 647215 ttat-gtttgttgctgctttgacccacacagtgtctttgacttaatgatatcaaactcacgtttgtcaattcgtggttttgca - -a -s mr.mrrefChr5 233726 16 + 294542 ttcgcatctttttttg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380361 16 + 636262 ttcacatcttttctgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 379540 16 + 647215 ttcgcagctgtttttg -s simRat_chr6.simRat.chr6 194792 16 - 647215 tttgcaactttttttg - -a -s mr.mrrefChr5 233742 25 + 294542 gagtgttaagcatcaagggctcttc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322489 25 + 636262 CAATGTCAAACATCAAGGCCCTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380377 22 + 636262 gagtg---ggcatcaagggttcttc -s simRat_chr6.simRat.chr6 379556 25 + 647215 gtgtgttgagcattataggttcttc -s simRat_chr6.simRat.chr6 194808 25 - 647215 gcatgttaagcataaaaggctcttc - -a -s mr.mrrefChr5 233767 4 + 294542 agta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380399 4 + 636262 agta -s simRat_chr6.simRat.chr6 379581 4 + 647215 agta -s simRat_chr6.simRat.chr6 194833 4 - 647215 agtt - -a -s mr.mrrefChr5 233771 10 + 294542 cctatatctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322514 10 + 636262 CATGTAACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380403 10 + 636262 gctatatctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 379585 10 + 647215 gctatatctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 194837 10 - 647215 cctatatctt - -a -s mr.mrrefChr5 233781 3 + 294542 gga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380413 3 + 636262 gga -s simRat_chr6.simRat.chr6 194847 3 - 647215 gga - -a -s mr.mrrefChr5 233784 59 + 294542 tgttggtgatccctaagttgtcctctataatcttaacgctccttggcagctgagagtgc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322524 44 + 636262 TG----------ctaatctgtcctctaaaatcttaacgtcccttggcggctgag----- -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380416 1 + 636262 t---------------------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 379595 59 + 647215 tgtttgtgatccctcagttgtccgctattatcttaacgctctttagcagctgagagttc -s simRat_chr6.simRat.chr6 194850 59 - 647215 tagtggtgttccctaagttgtcctctatgatcttaacactccttggcagctgacagtgt - -a -s mr.mrrefChr5 233843 53 + 294542 atggcacctggcatttacttcagtgtagggagtgagaaatggggtaagtgttc -s simRat_chr6.simRat.chr6 379668 53 + 647215 atggcatgtggggtttacttcattgtagggagtgagaaattggttgagtggtc -s simRat_chr6.simRat.chr6 194909 53 - 647215 agggcacctggcattcacttcagtgtagggagtgagaaagggggcaagtgtcc - -a -s mr.mrrefChr5 233896 68 + 294542 tcctggcagatagaaggccaattcccctagcaccaggtattgaagagggactcctgtggccattgatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380417 58 + 636262 ----------tagaaggtcaatttccctagcaccagttattgaagagggactcctgtggccattgatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 379724 68 + 647215 tccaggcagatgaatggccaattcccctggcatcacgtattgaagaggggcttctggggctattgatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 194962 68 - 647215 tcctggcaggtagaaggccaattcctccagtaccatgtattgaaaaaggaatcctgtgcccattgatt - -a -s mr.mrrefChr5 233964 97 + 294542 tcttcctgatgtatggaagatagagcaattggaaagttgagggatgaacttgattttcagcaagtccatcttattgccatgggctatgggccgaatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322568 97 + 636262 ctttcctgatgtatggaagatggagcaattagaaagttgaaggatgaacttgaatttcagcaagaccatcttattgccatggcatatgggccaaatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380475 90 + 636262 tcttcctgatgtatggaagatagagcaatggggaag--gagggatagccagga-----ggggtagccatcttactgccaagggctatgggccgaatc -s simRat_chr6.simRat.chr6 379792 97 + 647215 tcttcctgatgtatggaagatagagcaatgggaaagtttagggatgaacttgattttcaacaagtccatcttaccgccatgagctaagggctgaatc -s simRat_chr6.simRat.chr6 195030 92 - 647215 tcttcctgacgtgtggaagatagagcaattggaaagttgagggatgaacttgatttttgacaagtccatcttattgccatggtcta-----tgattc - -a -s mr.mrrefChr5 234061 34 + 294542 tcgtggtaccagtatggtgttgttttactgagag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322665 34 + 636262 ttgtagtatcagaatggtgttgttccagtgagtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380565 34 + 636262 tcgtggcaccagtatagtgctgttttgctaagag -s simRat_chr6.simRat.chr6 379889 34 + 647215 tcgtggtaccagtatagtgtagttttactgagag -s simRat_chr6.simRat.chr6 195123 34 - 647215 ttgtgggaccagaatggtgttgttttaatgagag - -a -s mr.mrrefChr5 234095 7 + 294542 tcactca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322699 7 + 636262 ttgctta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380599 7 + 636262 tcactca -s simRat_chr6.simRat.chr6 379929 7 + 647215 tcactca -s simRat_chr6.simRat.chr6 195157 7 - 647215 tcgctcg - -a -s mr.mrrefChr5 234102 18 + 294542 atagtagaatttgttatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322706 18 + 636262 atagtagaatttgtgatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380628 18 + 636262 atggcaaagtccattcca -s simRat_chr6.simRat.chr6 379936 18 + 647215 atagtagaatttgttata -s simRat_chr6.simRat.chr6 195164 18 - 647215 atagtggaatttgtggtc - -a -s mr.mrrefChr5 234120 28 + 294542 cgggaggattatgccgccagctcaattc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322724 28 + 636262 tgggaggattatgccaccggcccgatgc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380649 28 + 636262 cagaagaatcaagcaggcagcataaccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 379954 28 + 647215 cgggagggttatgctgccagctcaattc -s simRat_chr6.simRat.chr6 195182 28 - 647215 tgggagggttatgccgctggcttgattc - -a -s mr.mrrefChr5 234148 25 + 294542 ttctggcttggaacggactttgcca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322764 25 + 636262 ttctggcttggaacagacttcgctg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380677 13 + 636262 tcctggatcacaa------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 379982 25 + 647215 ttttggcctggaatggactttgcca -s simRat_chr6.simRat.chr6 195210 25 - 647215 ttctggcttggaacggactttgcca - -a -s mr.mrrefChr5 234173 89 + 294542 ggctcgcttttttggttccaattaaacctaacgattgtttttttacactcagtgaacagggccatagggcttttaatagtagtcctatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322821 89 + 636262 ggctcgctttttcggttccaagtaaacctaactcttgtctctttatactcagggaacagggccatagggcttttaatagtagtcctatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380690 64 + 636262 --------gttcta---ctatttgaacttgacaat--tttttttacactcagtaaacagggccacagggcttttgat------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 380007 89 + 647215 ggctcccttttttggttccaattaaacctgacgattttttttttacactcagtaaacagggccacagttcttttaatagtagttctttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 195235 83 - 647215 ------cttttctggttccaagtaaacttaatgatggtttttttacattcagtgaacagggccatcagacttttgatcgtagtcctgtt - -a -s mr.mrrefChr5 234262 24 + 294542 agacctacaggtgagtttgtgtaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322910 23 + 636262 agacctacagttgagattggata- -s simRat_chr6.simRat.chr6 380111 24 + 647215 agacttataggtgagtttgtgtaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 195318 24 - 647215 agctctacaggtaagtttgtgtaa - -a -s mr.mrrefChr5 234286 43 + 294542 taacatcttcaagttcacgttaagtcgatcgactcacgagcat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322933 42 + 636262 -aacatcttcgagttcacattaagttgatcgactcatgagcat -s simRat_chr6.simRat.chr6 380135 43 + 647215 taacatctctaagttcatgttaagccagtcaacccacaagcat -s simRat_chr6.simRat.chr6 195345 43 - 647215 taacatcttcaagttcacgttcagtcgatcgactcacgagcat - -a -s mr.mrrefChr5 234329 10 + 294542 tcaatattct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322975 10 + 636262 tcaatactct -s simRat_chr6.simRat.chr6 380178 10 + 647215 tcaatattct -s simRat_chr6.simRat.chr6 195402 10 - 647215 ttaatattct - -a -s mr.mrrefChr5 234339 50 + 294542 tgggattaattatcgtttctctgattagctttaatagtgggttttatatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322985 50 + 636262 tgggattaattatcgtttctctgattagctttaatagtgggttttatatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 195412 50 - 647215 ttggattatttattgtttctctgataagcttttatagtggattatgtatt - -a -s mr.mrrefChr5 234389 6 + 294542 taataa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323035 6 + 636262 taataa -s simRat_chr6.simRat.chr6 195463 6 - 647215 taataa - -a -s mr.mrrefChr5 234395 17 + 294542 gcagatcctttatgtct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323041 17 + 636262 gcagatcctttatgtct -s simRat_chr6.simRat.chr6 380188 17 + 647215 gcagatcatttatgtct -s simRat_chr6.simRat.chr6 195469 17 - 647215 gcagatcctttatgtct - -a -s mr.mrrefChr5 234412 2 + 294542 tg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323058 2 + 636262 tg -s simRat_chr6.simRat.chr6 195486 2 - 647215 tg - -a -s mr.mrrefChr5 234414 38 + 294542 aatcaactgtgtctctagaaatttgattcgtttagaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323060 22 + 636262 agtcaactgtgtctctataaat---------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 380205 38 + 647215 aatcaactgggtctttagaaatttcatccgcttagcat -s simRat_chr6.simRat.chr6 195488 38 - 647215 aatcaactgcgttcctagaaatttgattcgtttagaat - -a -s mr.mrrefChr5 234452 43 + 294542 tgattgttgaaggtgattcactcatgctctgactgctttgctg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380754 22 + 636262 ---------------------tcatgctctcagtgccttgttg -s simRat_chr6.simRat.chr6 380243 43 + 647215 tgattgttgaaggtgattcacgcatgctctgactgctttgctg -s simRat_chr6.simRat.chr6 195543 43 - 647215 tgattgtcgaaggtgattcactcatgctctgactggtttgctg - -a -s mr.mrrefChr5 234495 17 + 294542 attcttctacaagaaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380776 17 + 636262 attcttctacaagaaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 380286 17 + 647215 attctactacaagaaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 195589 17 - 647215 atttttatacaaaaaag - -a -s mr.mrrefChr5 234512 14 + 294542 tctcagattttaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323082 14 + 636262 tttcagattttaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380793 14 + 636262 tctcagattttaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 380303 14 + 647215 tctcagattttaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 195606 14 - 647215 tttcacattttaat - -a -s mr.mrrefChr5 234526 1 + 294542 a -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323096 1 + 636262 a -s simRat_chr6.simRat.chr6 195620 1 - 647215 a - -a -s mr.mrrefChr5 234527 32 + 294542 ccttaattttgtaactagagacttcagctaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323097 32 + 636262 cattaattatgtaatcagagacttcagttaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380807 32 + 636262 ccttaattttgtaactagagacttcagctata -s simRat_chr6.simRat.chr6 380317 32 + 647215 ccttaattttgtaactggggactccagctaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 195621 32 - 647215 cattaattttgtagccggaaacttcagctaaa - -a -s mr.mrrefChr5 234559 45 + 294542 ttgcttatcagcttaagcaagtttccagctgctgccattggatta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323129 45 + 636262 ttgtttatcagcttaagcaagtctacagctcctgccattggatta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380839 45 + 636262 tcgcttatcagcttatgtaagtttccagctgccgccatcagatta -s simRat_chr6.simRat.chr6 380349 45 + 647215 ttgcttatcagcttaagtaaggttccagcagccaccattgaatga -s simRat_chr6.simRat.chr6 195679 45 - 647215 ttgcttatcagcttaagcaagtttccagctactgccattgggtta - -a -s mr.mrrefChr5 234604 28 + 294542 ctgaggtatactatcatatcatccgcaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323174 28 + 636262 ctgaggtaaacagacatatcatccctga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380884 27 + 636262 c-gaggtatactatcatatcatctgcaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 380394 28 + 647215 ctgaggtgtactatcgtaccatcagcaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 195725 27 - 647215 cctgggtatact-tcatatcgtccacaa - -a -s mr.mrrefChr5 234632 34 + 294542 atattgaaggttttatttcttcttcatccaattg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323290 34 + 636262 atattgaaagctttacttcttcttcatccaattg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380911 34 + 636262 atattgaaggttttatttcttcttcatccaattg -s simRat_chr6.simRat.chr6 380422 34 + 647215 atattgaaggctctatttcttcttcatccaattt -s simRat_chr6.simRat.chr6 195752 34 - 647215 atattgaaagtttcatctccccttcttccaatag - -a -s mr.mrrefChr5 234666 5 + 294542 gatac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380945 5 + 636262 tatac -s simRat_chr6.simRat.chr6 380456 5 + 647215 gatac -s simRat_chr6.simRat.chr6 195786 5 - 647215 gatac - -a -s mr.mrrefChr5 234671 100 + 294542 actgtttatctttatcctgtcgggttgtctgcaccaatagttccaggactttgttaaacagcagtggtgatatggaacagccctgccgccttttcgtgcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323324 100 + 636262 cctgcttatcttgatcctgttgggttgtctgcaccaatagctccaggattttgttgaagagcagtggtgatatggaacagccctgcctcctttttgtgcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380950 100 + 636262 accgtttatctttatcctgtctggttgtctgtgccaatagttccaggactttgttaaacagcagcgatgatatggaacagccctgctggcttttcgtgtc -s simRat_chr6.simRat.chr6 380461 100 + 647215 attgtttatctttaacctgtctggttgtctgcgccaatagttccaggactttgttaaacagcagtaatgatatagaacaaccctgctggcttttcacacc -s simRat_chr6.simRat.chr6 195791 100 - 647215 cctatttatctttatcctgtcgggctgtccacaccaatagttccaggattctgttgaacagcagcggtgatatggaaccgccctgccaccttgtcatgcc - -a -s mr.mrrefChr5 234771 73 + 294542 ctttaaagggaagacttcaagcctgcatccatttactattagattgcaaatcagtttatcgtaaattgctcta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323424 73 + 636262 ctttaaaagaaagacttcaatcctgcacccatttactattagattgcaagccggtttatcgtaaattgccctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381050 72 + 636262 ctttaaagggaagac-tcaagcctgcatccatttattattagattgcaaatcagtttgtagtaaattactcta -s simRat_chr6.simRat.chr6 380561 73 + 647215 ctttaaagggaaggcttcaagcctgcatacatttactctgagatcgcagatcagttaattgtatattgctcta -s simRat_chr6.simRat.chr6 195903 73 - 647215 ttttaaagggaagacttcaagcctgcatccatttactattagattgcacgtgggtttatcgtaaattgcccta - -a -s mr.mrrefChr5 234844 18 + 294542 acaacattgacgtagttg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323497 18 + 636262 acaacattgacgtagttg -s simRat_chr6.simRat.chr6 195976 18 - 647215 acaacattgatgtagttg - -a -s mr.mrrefChr5 234862 32 + 294542 ccctcgatgcacaactcattgaggatcattag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323515 32 + 636262 ccctcgacacacaactcattgaggatcattag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381122 32 + 636262 cccttgatgcaccatgcattgaggatcgttgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 380634 32 + 647215 ccctcaatgcacaactcattgaggatcattag -s simRat_chr6.simRat.chr6 195994 32 - 647215 cccttgatgcataactcattaagaatccttag - -a -s mr.mrrefChr5 234894 27 + 294542 catgcaatcctgcttagtctgttcgat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323547 27 + 636262 catgtgatcctgctctgcctgtacggc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381155 27 + 636262 catgcaatcctgcttagtctgtttgat -s simRat_chr6.simRat.chr6 380666 27 + 647215 catgcagtcctgtttagtctgtttgat -s simRat_chr6.simRat.chr6 196026 27 - 647215 catgtaatcctgctccacctgttcgat - -a -s mr.mrrefChr5 234921 2 + 294542 tg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323574 2 + 636262 cg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381182 2 + 636262 tg -s simRat_chr6.simRat.chr6 196053 2 - 647215 gg - -a -s mr.mrrefChr5 234923 14 + 294542 gcccgacatctctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323576 14 + 636262 gcccgtcatctctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381184 14 + 636262 gcctgacctctctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 380693 14 + 647215 gtcaaacctctctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 196055 14 - 647215 gcccattatctctt - -a -s mr.mrrefChr5 234937 15 + 294542 tccaatgttaagatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381198 15 + 636262 tccaatgttaagaca -s simRat_chr6.simRat.chr6 380707 15 + 647215 tccaacgttaagatc -s simRat_chr6.simRat.chr6 196069 15 - 647215 tccaatgtcagaatc - -a -s mr.mrrefChr5 234952 34 + 294542 atgtgattctcctgattggcccggttaaccggtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323590 34 + 636262 atgtgattcttctgattggcccggttaataggtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381213 34 + 636262 ctgtgattctcctgattggccaggttatctgttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 380722 34 + 647215 ctgtgattctcctgattgccccagttagccattt -s simRat_chr6.simRat.chr6 196084 34 - 647215 atgtgcttctcccgattagcccagttaaccagtt - -a -s mr.mrrefChr5 234986 6 + 294542 gtatta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323624 6 + 636262 gtatta -s simRat_chr6.simRat.chr6 196118 6 - 647215 gtatta - -a -s mr.mrrefChr5 234992 4 + 294542 catt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323630 4 + 636262 tgct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381247 4 + 636262 cata -s simRat_chr6.simRat.chr6 380756 4 + 647215 catt -s simRat_chr6.simRat.chr6 196124 4 - 647215 catt - -a -s mr.mrrefChr5 234996 14 + 294542 agcaggttttcata -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323634 14 + 636262 agcaggttttcata -s simRat_chr6.simRat.chr6 196128 14 - 647215 aataggtatttgta - -a -s mr.mrrefChr5 235010 3 + 294542 tct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323648 3 + 636262 tct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381251 3 + 636262 tcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 380760 3 + 647215 tct -s simRat_chr6.simRat.chr6 196142 3 - 647215 tct - -a -s mr.mrrefChr5 235013 20 + 294542 tgggccatcctggcattcct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381254 20 + 636262 tgggccatgctggcattccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 380763 20 + 647215 tgtgccatcctggcagtact -s simRat_chr6.simRat.chr6 196145 20 - 647215 tgagccaccctggcattcct - -a -s mr.mrrefChr5 235033 6 + 294542 agggtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381274 6 + 636262 agggtg -s simRat_chr6.simRat.chr6 196165 6 - 647215 ggggtg - -a -s mr.mrrefChr5 235039 28 + 294542 aattctaagtgatcataatgtattagct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381280 28 + 636262 aagtctaagtcatcataatgtattaact -s simRat_chr6.simRat.chr6 380783 28 + 647215 aattctaagtgatcataatgttttggct -s simRat_chr6.simRat.chr6 196171 28 - 647215 aattctaagtgatcataaggtatcagct - -a -s mr.mrrefChr5 235067 5 + 294542 cactg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381308 5 + 636262 ttctg -s simRat_chr6.simRat.chr6 380811 5 + 647215 cactg -s simRat_chr6.simRat.chr6 196202 5 - 647215 caatg - -a -s mr.mrrefChr5 235072 14 + 294542 atgatttgttggta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381313 14 + 636262 atgatttgttggta -s simRat_chr6.simRat.chr6 380816 14 + 647215 acaatttgatggtg -s simRat_chr6.simRat.chr6 196218 14 - 647215 atgatttgctggta - -a -s mr.mrrefChr5 235086 88 + 294542 atttcgattggcaagtatttggttcaaattaccgtcttggcgaatcaaaagcccaggtctagctgtctgttgtatcatcatggcttta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381329 78 + 636262 atttt-attgac-----ttta--tcaaaagacagactttccgactcatagacccagg--ggagtgttttttgaacctttataccttta -s simRat_chr6.simRat.chr6 380830 88 + 647215 gtttcagctggcaagtatttggttcaaattctcgtcttggcaaattgaaagcccaggtctagctcgctgtcgtatcatcgtggcttta -s simRat_chr6.simRat.chr6 196232 88 - 647215 atttcgattggcaagtattcggttcaggttgccatcttgggcaatcaaaagcacaggtctagctttctgttgtctcatcatggcctta - -a -s mr.mrrefChr5 235174 25 + 294542 ctcgaattggatatcagtactatgc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381409 25 + 636262 ctcaaattttattttagtaatttgc -s simRat_chr6.simRat.chr6 380918 25 + 647215 cttgacttggatatcagtacgatgc -s simRat_chr6.simRat.chr6 196320 25 - 647215 ctcgatttggatatcagtacaatgc - -a -s mr.mrrefChr5 235199 4 + 294542 agct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381434 4 + 636262 tgct -s simRat_chr6.simRat.chr6 380993 4 + 647215 agct -s simRat_chr6.simRat.chr6 196345 4 - 647215 agct - -a -s mr.mrrefChr5 235203 35 + 294542 cttgcagaaatgacactagcttctcttcgtgtagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381449 30 + 636262 cttgcatgagta-----agctcttactcatgtagc -s simRat_chr6.simRat.chr6 380997 35 + 647215 cttgcagatatgacactaacttctctttgtgtagt -s simRat_chr6.simRat.chr6 196349 35 - 647215 ctagcagaaatgacaccagcatctcttcgtatcgt - -a -s mr.mrrefChr5 235238 12 + 294542 ttgaataaaatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381652 12 + 636262 ttgaatgaattg -s simRat_chr6.simRat.chr6 381032 12 + 647215 ttagagaaaatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 196384 12 - 647215 ttgtaaaatatt - -a -s mr.mrrefChr5 235250 2 + 294542 aa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381664 2 + 636262 aa -s simRat_chr6.simRat.chr6 196396 2 - 647215 ac - -a -s mr.mrrefChr5 235252 4 + 294542 tggt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381666 4 + 636262 tggt -s simRat_chr6.simRat.chr6 381044 4 + 647215 cagt -s simRat_chr6.simRat.chr6 196398 4 - 647215 tggt - -a -s mr.mrrefChr5 235256 29 + 294542 aggccaggtagtttcttcgttggcctgtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381673 13 + 636262 gggccagatgatt---------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 381048 29 + 647215 aggccaggtagtttcttcatcggcccgtt -s simRat_chr6.simRat.chr6 196402 29 - 647215 aagctgggtagtttcttagttggcctgtt - -a -s mr.mrrefChr5 235285 45 + 294542 aataaatgcctttacttcaggaccaattacgggtctgttgaggga -s simRat_chr6.simRat.chr6 381077 45 + 647215 aataagtgcctttacttcagggccaattatgggtctgtttaggga -s simRat_chr6.simRat.chr6 196432 45 - 647215 aataaatgcctttacttcaggaccaattacgggtctattgaggga - -a -s mr.mrrefChr5 235330 36 + 294542 tcaataccttctttattagaacagggcagagcgccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 381122 36 + 647215 tcaataacttctttattagcacagggcagagcgccc -s simRat_chr6.simRat.chr6 196478 36 - 647215 tctataccttctttattgaaacggggtagaggacac - -a -s mr.mrrefChr5 235366 37 + 294542 gaatcaaagaagtcattatctaccaagttaatgtcct -s simRat_chr6.simRat.chr6 381161 37 + 647215 gaatcagagaaatcattatctactaagttaatgtcct -s simRat_chr6.simRat.chr6 196514 37 - 647215 gaatcaaagaagtcaatatctaccaagttaaaattct - -a -s mr.mrrefChr5 235403 64 + 294542 tagcgtgaaggggatggtggtggtgcttaataatcatttggacatctgcggggtcggttgtttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 381214 64 + 647215 tagcgtgcaggggatggtggtgttgcttaataatcatttgaacatctgcagggtaagttgtttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 196551 64 - 647215 tagcatgaaggggttggtgatggggcttaatactcatttggacgtctgcggggtcggttgttat - -a -s mr.mrrefChr5 235467 84 + 294542 ccctggttgagttctcaagacatcaatatgattcttcttgcatatctctttaacgatgctcaataaaggccggtcaattgtatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 381281 84 + 647215 ccctggatgatttctcaagacatcagtataattgttcttcaatatttcttttactatgctcaacaaaggctgatcgattgtatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 196615 84 - 647215 ccctggttgagttcttaagacatcaatatgaatctttttgcaattctctttaacgatgctcaataaaggccggtcaattctatt - -a -s mr.mrrefChr5 235551 46 + 294542 gactttatcaaaaaactcgctctttgatttgttgaccttggggaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 381366 46 + 647215 gactttatcaaaagaccgactcttggactcattgagcttggggaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 196699 46 - 647215 gactttatcgaaaaactcgctctttgatttgttgaccttgggtaat - -a -s mr.mrrefChr5 235597 98 + 294542 gttttctgagtctttatacctttaagctcaaaatttattttagttatttgctgctgccaactcacccttgaatgagtgagctcttgctcatgcagctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 381418 98 + 647215 attttctgagtctttatacctttaagctcaaattttaatctagttatttgctgctgccaactcacccttgcatgagtaagctcttgctcaggcagctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 196745 98 - 647215 gttttctgggtctttatacccttaagctcaaaatgtattttagtcacttgctgttggcgagtcgcccttgagtgagtgagctcttgcttgtgtagctc - -a -s mr.mrrefChr5 235695 45 + 294542 ctgtgtcgcagccatatcatccaggcgtaattttatagagctctg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381686 45 + 636262 ctgtgtcgcagccatatcatccaggcgtaattttatagagctctg -s simRat_chr6.simRat.chr6 381674 45 + 647215 ctgtgtcacagccctggcctccaggctttactttatagagctctg - -a -s mr.mrrefChr5 235740 21 + 294542 tctgcaaggcaattagagatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381731 21 + 636262 tctgcaaggcaattagagatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 381720 21 + 647215 tctccaaggcaattagtgatg - -a -s mr.mrrefChr5 235761 104 + 294542 tcagagttcttacgtttgtgcaccagggctttgctccctgcgatgtagccacttcttaaatatgcacgatgtggagcagcaaagaataagtacccagcataaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381752 104 + 636262 tcagagttcttacgtttgtgcaccagggctttgctccctgcgatgtagccacttcttaaatatgcacgatgtggagcagcaaagaataagtacccagcataaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 381744 104 + 647215 tcagagttcttacattcacgcactagagctttgctcactacgatgtagctaatttttaagtatgcatgatatggagcaccaaagaatgagtacccagattaaat - -a -s mr.mrrefChr5 235865 73 + 294542 ggggtgaaaagtctcattgatctcaatcaactcagcttggtgaaaacctgtattcagctcagggtatgtagtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381862 73 + 636262 ggggtgaaaagtctcattgatctcaatcaactcagcttggtgaaaacctgtattcagctcagggtatgtagtg -s simRat_chr6.simRat.chr6 381848 73 + 647215 ggggtgaaaagtctcattgatcgcaatcaagtcagtttggtgtaaaactgcaatcagctcgtggtatgtattg - -a -s mr.mrrefChr5 235938 75 + 294542 cttcatgttgatctatccacagtcgatagtggcgtgttgacatcacccttgacccactgtatgtgagtgtgggcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381935 75 + 636262 cttcatgttgatctatccacagtcgatagtggcgtgttgacatcacccttgacccactgtatgtgagtgtgggcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 381927 75 + 647215 ctttgtgttgatctattcacagtcgatagtggcgagttgacatcacccttgactcactgtatgtgagtgtgggcc - -a -s mr.mrrefChr5 236013 5 + 294542 gtttc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323651 5 + 636262 Gttac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382010 4 + 636262 tttt- -s simRat_chr6.simRat.chr6 382002 5 + 647215 gtttt - -a -s mr.mrrefChr5 236018 143 + 294542 tgaggttacatcccaggcctcaaaagccttcacacacctgtgttgggtttatgcacattcaatacagttgatttttctgattgtatagaaccttctagcgttatggattgcccttcccggtcccttctcacactagcagattt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382014 143 + 636262 tgaggttacatcccaggcctcaaaagccttcacacacctgtgttgggtttatgcacattcaatacagttgatttttctgattgtatagaaccttctagcgttatggattgcccttcccggtcccttctcacactagcagattt -s simRat_chr6.simRat.chr6 263299 143 - 647215 tgaagttagatcccatgcctcaaaagcctttgcacacctgcgttgggtttgtgcatgttcaatacagttgttttttctgattgtgtagaatcttcaaccattattgttcgcccctctcggtcccctctcgcactagcagattt - -a -s mr.mrrefChr5 236161 21 + 294542 aacctaaagtctgccttgtcg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382157 21 + 636262 aacctaaagtctgccttgtcg -s simRat_chr6.simRat.chr6 263443 21 - 647215 aacccaaagtctaacttgtca - -a -s mr.mrrefChr5 236182 100 + 294542 tttttcttttctcctttcccaataatctggtgttccttctcctagcccttcacctcgagcttacgagtgtgcctgcatgcaaggtgcatcttatggatgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382178 100 + 636262 tttttcttttctcctttcccaataatctggtgttccttctcctagcccttcacctcgagcttacgagtgtgcctgcatgcaaggtgcatcttatggatgt -s simRat_chr6.simRat.chr6 263488 100 - 647215 ttcttcttttctccttttccatgaatctggtggttgttctcccaaaccttcaccttgagtttacagatttgccggcatgtaaggtgcatcttttggatgt - -a -s mr.mrrefChr5 236282 37 + 294542 tgagcaatactgacttctatagctaatctgtgtggct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382278 37 + 636262 tgagcaatactgacttctatagctaatctgtgtggct -s simRat_chr6.simRat.chr6 263617 37 - 647215 tcagcatccctgatttttatagctactctgtgtctct - -a -s mr.mrrefChr5 236319 97 + 294542 caaagattttattcccatgaccttttgctcaacgaatttactcatatgactggggcgaatatggtgacatatgggtgggattagctcatggcacatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382319 97 + 636262 caaagattttattcccatgaccttttgctcaacgaatttactcatatgactggggcgaatatggtgacatatgggtgggattagctcatggcacatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 263654 97 - 647215 caaagagttcaatcctatgacctcttgatcaaagaggttaatcctatgaccagggtgaatttggtcacatacacgtggggttcattcatggcacatg - -a -s mr.mrrefChr5 236416 19 + 294542 gtctgggttctgttggatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382452 19 + 636262 gtctgggttctgttggatc -s simRat_chr6.simRat.chr6 263751 19 - 647215 gtctgggtttagttgtacc - -a -s mr.mrrefChr5 236435 107 + 294542 ttgtcttgcaataagtggttacaatctagaaacatagactgaatgtaaaaagcctcatgtaggcataaaaagtccctgcctaatgaacaataccaacccctaattac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382477 107 + 636262 ttgtcttgcaataagtggttacaatctagaaacatagactgaatgtaaaaagcctcatgtaggcataaaaagtccctgcctaatgaacaataccaacccctaattac -s simRat_chr6.simRat.chr6 263770 107 - 647215 ttgtcttgccataagtggttacaatccagaaacattgacagaatgtaaagtgccccatgtaggcacagagaatccccgtctaataaatgataccaacccctagttag - -a -s mr.mrrefChr5 236542 50 + 294542 atttggcacattgatgcaatagatgatagggactcctttgtgtgttcaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382585 50 + 636262 atttggcacattgatgcaatagatgatagggactcctttgtgtgttcaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 263877 50 - 647215 atttggcatattgatgcaataaatgatagggattcttatgtatatttaag - -a -s mr.mrrefChr5 236592 67 + 294542 ttatttctccaagagtaggcctgcccagaacaaaatcccacaaaccttactcgtcagtgaaatattt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382645 67 + 636262 ttatttctccaagagtaggcctgcccagaacaaaatcccacaaaccttactcgtcagtgaaatattt -s simRat_chr6.simRat.chr6 263927 67 - 647215 ttatttctccaagagtaggcctgcctggtacaaagtcctacaaggcttgcttatctgtgaaatattt - -a -s mr.mrrefChr5 236659 49 + 294542 gatattcccttcactaacaaagctgagcttacctggttatggaattttg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382712 49 + 636262 gatattcccttcactaacaaagctgagcttacctggttatggaattttg -s simRat_chr6.simRat.chr6 263995 49 - 647215 gatatttccttcactaacaaagctgagccaacctggctgtggaattttg - -a -s mr.mrrefChr5 236708 18 + 294542 ggtctgacatttttttcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382763 18 + 636262 ggtctgacatttttttcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 264044 18 - 647215 ggtctgacatttttttcc - -a -s mr.mrrefChr5 236726 248 + 294542 tcaagatattgaagaagggtccccattttgccttttgatcaatgggatctgttaagtggtctgttactcacagtttccctttccttgtcatctagtcctcttctgttggagcacttagcacaccctgcacctatacctggacattggctcctttgattatcgtacaaaaattctgttgtataatgtcacggagctcttcctccaattttgcaccattccacctttcttgatccggcacccctaagagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382782 248 + 636262 tcaagatattgaagaagggtccccattttgccttttgatcaatgggatctgttaagtggtctgttactcacagtttccctttccttgtcatctagtcctcttctgttggagcacttagcacaccctgcacctatacctggacattggctcctttgattatcgtacaaaaattctgttgtataatgtcacggagctcttcctccaattttgcaccattccacctttcttgatccggcacccctaagagt -s simRat_chr6.simRat.chr6 264062 248 - 647215 taacgatattgaagatgggtccccattttggctttcaattgacggtatctgttaaatagtctgatactcattgtttccctttagtggtcatctagtcctcttccgttggagcgcttaacatagcctgcacttttgcctggttacagggtcctttaattatcgcagaagaattcttttgtataatgtcctggagctcattctccaatttcatgctgttctgcctttctttatccggcacctctgagagt - -a -s mr.mrrefChr5 236974 47 + 294542 cacaagttgggcctctggtagtcccaaatctcttggggcccatgctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383038 47 + 636262 cacaagttgggcctctggtagtcccaaatctcttggggcccatgctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 264310 47 - 647215 cacaagttgggcctttgatagtcccagctctcttgagacccatgctt - -a -s mr.mrrefChr5 237021 14 + 294542 atcctgtgttaggg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383085 14 + 636262 atcctgtgttaggg -s simRat_chr6.simRat.chr6 264358 14 - 647215 attccgttttaggg - -a -s mr.mrrefChr5 237035 22 + 294542 ctatttccttagaatctctctc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383099 22 + 636262 ctatttccttagaatctctctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 264377 22 - 647215 ctttctccttgaaaactctctc - -a -s mr.mrrefChr5 237057 71 + 294542 agttcattttggtttccccgtccctggtaatcagatcctccctctgttcaaaatggtcaaaaaggctactg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383123 71 + 636262 agttcattttggtttccccgtccctggtaatcagatcctccctctgttcaaaatggtcaaaaaggctactg -s simRat_chr6.simRat.chr6 264399 71 - 647215 agctcgttttcatctccccatccccagtaaccagatcctccctgctgtcaaaatggtcagaatagctactg - -a -s mr.mrrefChr5 237128 40 + 294542 aaactcctgcaatcataatgtgtcttaggcaagcttgtct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383194 40 + 636262 aaactcctgcaatcataatgtgtcttaggcaagcttgtct -s simRat_chr6.simRat.chr6 264639 40 - 647215 AAactcctgcaagcataatgtgtcttaagcagccttgtct - -a -s mr.mrrefChr5 237168 40 + 294542 gtttagttagctcttgagataatctttagtcttcttaact -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383237 40 + 636262 gtttagttagctcttgagataatctttagtcttcttaact -s simRat_chr6.simRat.chr6 264679 40 - 647215 gtatagttatctcttgagaggatctttagtgttcttactt - -a -s mr.mrrefChr5 237208 44 + 294542 tttgttgaagctgtggaggtgcctagcattcgctcatatctctt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383297 44 + 636262 tttgttgaagctgtggaggtgcctagcattcgctcatatctctt -s simRat_chr6.simRat.chr6 264719 44 - 647215 tttgtcgaagctgtggaggtatctgtcattcgctcgcatctctt - -a -s mr.mrrefChr5 237252 19 + 294542 caaagcttgacgtagtatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383343 19 + 636262 caaagcttgacgtagtatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 264763 19 - 647215 caaagcttggcgtagttca - -a -s mr.mrrefChr5 237271 73 + 294542 gaatggttagagtctttctccctcaatttgtcagagtcattaccggtcttggtcatgtctactaagggtgcgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383365 73 + 636262 gaatggttagagtctttctccctcaatttgtcagagtcattaccggtcttggtcatgtctactaagggtgcgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 264782 73 - 647215 gagtagctaaagtctttctccctcaatttgtcaaagtcattaccagccttggtcttgtctactaaaggtgggg - -a -s mr.mrrefChr5 237344 65 + 294542 gcaaaggcacagcgccattgatctatgaattgttacagtagtgtgctcagcccatgtgctcattc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383438 65 + 636262 gcaaaggcacagcgccattgatctatgaattgttacagtagtgtgctcagcccatgtgctcattc -s simRat_chr6.simRat.chr6 264871 65 - 647215 ccaaaggtgaagcaccattgttgtttgaattgtcacagttgtgtcctcagcccatTTGCCCATCC - -a -s mr.mrrefChr5 237409 13 + 294542 acaagttacagtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383505 13 + 636262 acaagttacagtg -s simRat_chr6.simRat.chr6 264936 13 - 647215 ACAAGTTACAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 237422 37 + 294542 tgacTGTGCATAGTGGACATGATGTGGCCATGCATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383545 37 + 636262 tgacTGTGCATAGTGGACATGATGTGGCCATGCATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 264949 37 - 647215 TGACTGTGCATAGTGGCCATGGTGGGGCCATACATAG - -a -s mr.mrrefChr5 237459 39 + 294542 CAGTCATGGAGGGGGGGTGGAGCAGGTTGGATAAGGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383583 39 + 636262 CAGTCATGGAGGGGGGGTGGAGCAGGTTGGATAAGGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 264986 39 - 647215 CGGCCGTGGTGGGGGGGTGGAGCAGGTTGGATAAGGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 237498 48 + 294542 CACATTATTAATCCCATCTTAATCCCCATGCATACATATCGTTAGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383622 48 + 636262 CACATTATTAATCCCATCTTAATCCCCATGCATACATATCGTTAGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 265027 48 - 647215 CCCACTCTTAATCCCACCTTAATCTCTATGTATACATATCCTTAGATA - -a -s mr.mrrefChr5 237546 102 + 294542 TGTGGTTCCTGAATTGCGACATGTCACTCTACACTCTCATAGAGAACAACAGTCACGATGTCTGTGATAGTTCCTCGGCCTACGATTGCGGGGCTTACGCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383670 102 + 636262 TGTGGTTCCTGAATTGCGACATGTCACTCTACACTCTCATAGAGAACAACAGTCACGATGTCTGTGATAGTTCCTCGGCCTACGATTGCGGGGCTTACGCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 265076 102 - 647215 TGTGGTGCCTGCATATTGTCAGGTCGCTCTACACTCTCACAAAAAGCAACTGTTACAGTGTCCACGATCATTTCTCAGCCTACAATTCCGGGGCTCACCCGT - -a -s mr.mrrefChr5 237648 30 + 294542 AGATTTTTCAGTGGTCAAATACTCTAGctg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383773 30 + 636262 AGATTTTTCAGTGGTCAAATACTCTAGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 265178 30 - 647215 AGATTTTTCAGTGGTCAAATACTCTAGctg - -a -s mr.mrrefChr5 237678 362 + 294542 aACTTGTAGTGGGGCTTCACTATCTCCTCTGAGAGCCGTTGAGGTTGGTAAGAACATCTTCATTTCTTGATATTGAGACATAGCAGCAAAAAAAGCTATGCTTACTTTTAAAGGCACCAGTACGTCCATATCCAGTAGTCTATTAGTGTTAGTCCATGATAGGTCAGACATGTTTACTTGAGGGATTGGGATGAGGGGATCTTCATTTCCATAACTTATAGAAGTGTGACATTTTTATAAGAGAGGGGTGTAGGGCTCACTCACATTCGAGTGAAATCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTCCTAACCTTGTAGGGGCCTTTTTTGCAACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383805 362 + 636262 AACTTGTCGTGGGGCTTCACTATCTCCTCTGAGAGCCGTTGAGGTTGTTGAGAACATCGTCATTTCTTGAGATTGGGACATAGCATCAAAGAAAGCTATGCTTACTTTTAAGGGCACCAATACGTCCATATCCAGTAGTCTATTAATGTTAGTCCATGAGAGGTCAGACATGTTAACTTGAGGGATTGGGATGAGGGGATATTCATTTCCATAACTTATAGAAGTGTGACATATTTACAAGAGGGGGGTGTAGGGCTGACTCACATCCGAGTGAAATCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTCCTTACCTTGTAGGGGCCTTTTTTGCGACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 383917 362 + 647215 aACTTGCAGTGGGGCTTCACGCTCTCCTCTGAGAGCCGTTCAGGCTGGCAAGAATATCTTCATTTCTTGATATAGAGACATAGTAGCAAAAAAAACTATGCTTACTTTTAAAGGCACTAGTGTGTCCATATCCAGTAGTCTATTAGCTTTAGTCCATGATAGGTCAGACATGTTTACCTCAGGGATTGGGATGAGGGGATCTTCGTTTCCATAATTTTTAGAACTGTAACATTTTTATAAAAGAAGGGTGTAGGGATCACTCACATTCGAGTGAAGTCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTGTTATCCTTTTAGGGGCCTTATTTACAACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTTTAA - -a -s mr.mrrefChr5 238040 34 + 294542 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGATGTGACATTACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384167 33 + 636262 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGATGCAACATTGCC- -s simRat_chr6.simRat.chr6 384280 34 + 647215 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGACGTGAACTTATTT - -a -s mr.mrrefChr5 238074 306 + 294542 ATTATGAGCCCTTGTTCTGTTCCACTTAGGAAGATTCCTGAATATGTTACAGATTGTATCCATGTTGTAGCACCTACTTACCATCCAGCCACTAGTGAAGCAGATAAGCGAGTGTCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTTTTGTGGATGCTGTATGCAGACTTTGACTCTTTTGGCTCTTATATAATCTAGGCCCTATCCTTGTTAGAACCTATTGCAAGTGTTTTTGCGAAAAGGATTCCACCATTAGTATTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAATCTGATAGAATCAGTTTTGATCTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384200 303 + 636262 ---ATGAGCCCTTGTTTTGTTCCATTTAGGAGGATTGCTAAGTTTATTACAGACTGTATCCATGTTGTAGCACCTACTTACCATCCAGCTACTAGTGAAGCAGATAAGCGAGTGTCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTCTTGTGGATGCTACATGCAGACTTTGACTCTTTTGGCTCTTATATAATCCAGGCCCTATCCTTGTTAGAACCTATCGCAAGTGTTTTTGTGAAAGGGATTCCACCATTAGTGTTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAACCTGATAGAATCAGTTTTGATCTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 384318 301 + 647215 ATTGTACGCCCTTGTTCTTTTCCACCTAGGAAGATTCCAGAATATGTTACAGATTGTATCCATATTGTAGCACCTACTTCCCATCTAGCCCCTAATGCAGCAGATAAGCGAGTTCCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTTTTGTGG-TGCTGTATGT----TTTGACTCTTTTGACTCTTGTATAATCTAGGCCCTATCCTTACTGGAACCTCTTGCAAGTGTTTCTGCGTAAAAGGTTCCACCATTAGTATTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAATCTGATAGAATCAGTTTTGATGTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 238380 81 + 294542 AGCATTGTAATTTGACAGTTCCTCATTCACTGAGAGGACTGATGAGTGCAAACTATGTATAACCATTACTAAATTATAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384568 81 + 636262 AGCATTGTAATTTGACAGTTCCTCATACACTGAGAAGACTGATGAGTGCAAACTATGTATAACCATTACTAAATTATAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 384619 76 + 647215 AGCATTGTAATTTGACAGTTTTTTATTCACTGAGAGGACTG-----TGCAGACTATGTACAACCACTACTAAACTATAGCC - -a -s mr.mrrefChr5 238461 67 + 294542 GCCTTATTGATGGTATTGTATCTGGTTCATATCCTTGTCAGTTAGCTTGGGCTCTCAGTAGTGGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384650 67 + 636262 GCCTTATTGATGGTATTGTATCTGGTTCATATCATTTTCAGTTAGCTTGGGCACTCAGTAGTGGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 384695 67 + 647215 GTCTTATTGATGATATTGTATCTAGTGCACATCCTTGTCAGTTAGTTTAGGCTCCCAGTAGTGGCGT - -a -s mr.mrrefChr5 238528 35 + 294542 ATATTTCCTACATCATCAATAGAGGCATTTGTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384719 35 + 636262 ATAGTTCCTACTTCATCAACAGAGGCATTTGTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 384762 35 + 647215 TTATTCTCCACATCATCAATAGAGGCATTTCTGTG - -a -s mr.mrrefChr5 238563 156 + 294542 ATAGTTATTCTGACAGGCTCCCCCATGTCTTTTGAGAATTGCCCCAGTAGTTTAAGGATTACATAGTCACAATGAGAAAAAGAAGAAAGGTTGGTAAGGCCATGTTGGGAGGTTCCACGAAACCAGCTATGACATTACCTTACCTATATCAACAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384754 156 + 636262 AAAGTTATTCTGACATGCTCCCCCATGTCTTTTGAGAATTGCCCCAGTAGTTTAAGGATTACATAGTCACAATGAGAAAAAGAAGAAAGGTTGGTAAGGCCATATTGGGAGGTTCCGCGAAACCAGCTATGAGTATATCTTACCTATATCAACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 384801 145 + 647215 ATAGTTATCCTGACAG------CAATGTCTCTTGAGAATTGCCACAGTGGTTTA-GGATTACATAGTTACAATGAGAAAAAGAAGAAAGGTTGGCAAGGCCATGCTGGGAGATTCCACAACAGCAGCTATGACATTACCTTACCT----CAACAAA - -a -s mr.mrrefChr5 238719 57 + 294542 CTGGTGTACCATTGTGAACCAAACACCCTCATTAGGAGTGGTCAAGGAATGCATACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384910 57 + 636262 GTGGTGTACCATTGTGAACCAAACACCCTCATTAGGAGTGGTCAAGGAATGCATACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 384947 57 + 647215 CTGGTGTACCCTCATGAACCAAACTCCCTCATTAGGCATGGTCAAGGAATGCATCCA - -a -s mr.mrrefChr5 238776 290 + 294542 TGCCTAACAAATGCTGGCATCCTTATCACCTGGCATTCTTGTCACCACTTGAATCACAGCATTTATTCTAGCCTATCAGTATGAGTAGCTGGATGGGAATATAAGCCCCCCATAGATTTCGCGTCCTGCTGCTGGCTATATGACCATGAACCAAGTTTTGCCTCCTCAGTCAGATAGCATCTTTGACTGCGCAGTCATTTATCTATCATCTGCTTGGTGCAGAGTGGCACAAACTTAACACACGGCAGAGTCTTGTCCTTATAGAGCTGTTGGAAGGACTAGCTCATAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384967 286 + 636262 TGCCTAACAAATGCCGGCATCTTTGTCACCTGGCATTCTTGTCACCACGTGAATCACAGCATTTATTCTAGCCTATCAGTATGAGTAGCTGGATGGGAATATAAGTCCCACACAGATTTTGAGTCTTGCTGCTGGCTATAT---CATGAACCAAGTTTTGCCTCCTCAGTCAGATAGCATCTTTGACTGCGCAGTCATTTATCTATTATCTGCTTGGTGCAGAGTGGTGCAAACTTAACACACGGCAGAGTCCTGTCCTTATAGAGCTGATGGAAGGACTAGCTGATAA- -s simRat_chr6.simRat.chr6 385005 267 + 647215 TGTCTAACAAGTGCTTGCATCCTCATCACCTGGCATTCTTTTCACCACTTGAGACGTAGCAT--------------------GAGTAGCTGGATGGGAATATGAGCCCTCCATGGATTTCGCTTCCTGTTATTG-CTATATGACCATGAACCAAGTTTTTCATTCTCAGTCTGATAGCATCTATGGCTTCGCAGTCATTTATCTATCATCTGCTTGGTCCAGAATGGCACAAACTTAACACAG--CAGAGTCTTGTCCTTATAGAGCTGTTGGAAGGACTAGCTCATAAA - -a -s mr.mrrefChr5 239066 68 + 294542 CATAAAAAATCAAGCTATGTTATATGTCAAGGTTAGTGCCCCATTCTACCTAGCAACATGCCTATAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 385253 63 + 636262 -----AAAATCAAGCTATGTTAGATGTCAAGGCTAGTGCCCCTTTCTACCTAGCAACATGCCTATAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 385273 68 + 647215 CATAAAAAATTGAGCTATGTTATATGTCAATGTTAATGCCCCATTCTACCTAGTATCTTGCCTATAAA - -a -s mr.mrrefChr5 239134 459 + 294542 CTAACTGTGGTAAGCACAGGGTCACACATTAACATCATGATATCAGCAATTGGGCATGAAAAAGGATGAAAAAGAACCTTACATTTAAACATGGAGTGGAGGGAACTAGTGTATGTGTTAAAATTTCAATTTATGTGTTAGTATCGCTTTTATGCATTTTAGGACTTGACATAGTTGATTGTTAATGATAACACCTGCATTATATCTGAGGTCCCAGGTTGCAAAGCCCTTAAGTATCTGGCTTTCTACCCAGTACTCCAGTATGTGGTGTCTTCAAAGCTAATCACAAGTGTGGGTTCAAGTGACATGGGTGCTAAGCCATGGACACTAGGATAGCACAGGAGGTATCTCTGCGCCACAACAGATTCATGCATCTATGTCACCCCCCAAAAGTTAGATAATGGCCCTGTTTGGTTGGTGAACCTAGCAAAGATGAAGTTACTTACTGTGGAAGTGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 385316 451 + 636262 CTAATTGCGGTAAGCACAGGGTCAAACATTAACATCATGATATCAGCAATTGGGCATGAAAA-GGATTAAAAAGAACCTTACATTTAAACATGGAGTGGAGGGATCTAGTGTATGTGTTAAAATATCAATTTATGTGTTAGTATCGCTTTTATGCATTTTAGGACTTGACATAGTTGATTGCTAATGATAACACCTGCGTTATACCTGATGTCCCAGGTTGCAAAGCCCTTAAGTATCTGGCTTTCTACCCAGTACTCCAGTATGTGGTGACTTCAAAGCTGATCACAAGTGTGGGTTCAAGTGACATGGGTGCTAAGCCATGGACACTAGGATAGCACAGGAGGTATCGT-------CAACAGATTCATGCATCTATGTCACCCCCCAAAAGTTAGATAATGGCCCTGTTTGGTTGGTGAACCGAGCAAAGATGACGTTACTTACTGTGGAAGTGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 385342 410 + 647215 CTAACTGTGGTAAGCACACGGTCACACATTAACATCATGATATCAGCAATTGGGCATGAAAAAGGATGAAAAGGAACCTTACATTTAAACATGGAGTGGAGGGAACTAGTCTGTGTGTTAAAGTTTCAATCTATGTGTTAGTATGGTTTTTGTGTATTTTAGGACTTGTCATAGTTGATTGTTCATGATAACACCAGCATTAAATCTGAGGTCCCAGGTTTCAAGAACCTTAAGTATCTGGCTTTCCACCCAGTACTCCAGTATGTGGGGTCTTCAAAGCTACTCACA-GTGTGGGTTCAAGTGACGCGGGCGTAACGCCATGGACACTGGGATAGTACAGGAGGTACCTCTGCGCCACAACAGATTCATGCATC------------------------------------------------CTCACAAAGATGAAGCTACTTATGGGGGAAGAGTGC - -a -s mr.mrrefChr5 239593 249 + 294542 AAAGAAATACAAAAACTGTCTCCAGGGGTATCGTTAAAAAATAAAAAAAATGGTCATAAGAGACTTACATTTAAGTATGATGCAAATAGTTCACCTCAGGCATGTTAACCCCCCAGATTGGTTTTTAAGATTTAGTTTGGGACTCTTGGTGAATTACCACAGTAAGTGACGGTTGATTAGACTAAGTTCCATACCTCTACTATTACAAGTTGAGACCCCTAGTGCATGTGGATGTATTATTGACCCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 385778 249 + 636262 AAAGAAATACAAAAACTGTCTCCAGGGGTATCGTTAAAAAACAAAGAGAATGGTCATAAGAGACTTACATCTAAGTATGATGCAAATAGTTCACCTCAAGCATGTTAACCCCCCGGATTGGTTTTTAAGATTTAGTTTGAGACTCACAGTGCATTCCCACAGTAAGTGACGCTTGATTAGACTAAGTTCCATACCTCTACTATTACAATTTGAGACCCCTAGTGCATGAGGACTTATTATTGACTCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 385752 249 + 647215 AAGGAAATACAAAAACTGTCTCTAGGGGTATTGTTAGGAAATAAAAAAAATTGTCATAAGAGACTAACATTTAAGTATAGTGCAGGTGGATTGCCTGAGGCATGTCTACCCCCGAGATTGATTTTTAGGATTTAGTTTAGGACTCTTGGTGAATTACCACAGCAAGTGACGGTTGATTAGACTAAGATCTATACCTCTACTATTACAAGTTGAGACCCCAAGTGCATATGGATGCACTATTGACCCATT - -a -s mr.mrrefChr5 239842 94 + 294542 GAAACCTGTGAAGATGCATTTTGGTGATGGTAGTGTAGTACATGTCCAATTCTCTAGTGGGTTTGCAAGATAAGGGGATATGTGCTGGTGCTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386027 93 + 636262 GAAGCCTGTGAAGAACCATTTTGGTGATGGTAGTGTAGTACATGTCCAATTCTCAAGTGGGTTTGCAAGATAAGGGGATATGTGCTGGTGTGG- -s simRat_chr6.simRat.chr6 386002 82 + 647215 GAAACCTGTGAAGATGCATTTTGGTGGTGGTAGAGTAGTACATGTCCAACTCTCTAGT------------CAAGGGGATATCTGCTGCTGCTGC - -a -s mr.mrrefChr5 239936 268 + 294542 GACTTGGCCAACTATGGATGGATGGTACCCCCACATAATCGATGGAGTAACAGCTTTCTTTATCATCAAGCTCAGGTTGGCCCTCGGCCCCTATCAAAGTTATCATGGCAGTTTTTGTGAATATAAGTGCTGTTATCTTCTTATTGGTGGTTCCATGGTGTGGAATGCCTTACAACCAGAGTTGTCTTTGTCCTGGTTGTTGCCTCAAAATGGCTGCTTCATGGACTCACCAATACAGACAAAGTGTGCAGAACTGTTTGGCGTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386120 257 + 636262 GACTTGGCCAACTATGGAATGATGGTACCT-------ATCGATGGAGCAAGAGCTTTCTTTATCGTCAAGCTCAGGTTGGCCCTCGGCCCCTATCAAAGATATCATGGCAGTTTTTGTGAAACTGA----GGTTATCTTCTTATCGGTGGTTCCAGGATGTGGAATGCCTTCCAACCAGAGATGTCTCTGTCCTGGTTGTTGCCTCAAAATGGCTGCTTCATGGACTCACCAATACAGACAAAGTGTGCAGAACTGTTTGGCGTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 386089 267 + 647215 GACTTGACCAACTATGGATGGATGCTACCCCCACATAATCGATGGAGTAACAGATTTCTTTATCATCAAGCTCAGGTTGGCCCTTG-CCCCTATCAAAGTTATCATAGCAGTTTTTGTGAATATAAGTGCTGATGTCTTCTGATTGGTGGTTCCATGGTGTACAATGCCTTACAACCAGAGTTGTCATTGTCCTGGTTGTTGATTCAAAATGGCTGCATCATGGACTCACTAATACAAACCAAGGGTGCAGAACTGTTTGGCATAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 240204 273 + 294542 TTGTTCTGGATTTGGGACCATCATTCTGTGCCCTGCATATCAAAACAATTCAAGTCGGCTACCCCATGCATTGAATGTTAAACCGGGCCCTTGCCAAATGAGCACTAGATGTATAAGTTGGGGTCATCCATCTCCTCCCGATAGCTAATGCCAACGCCCATTCAGCAGTCCCAAACCATATATGATTCAAAAATTTGCCCTCACCATTCATTCAAATAATGGTCAGTCTGGTGGTTCAATGTCTCCTGATTCACTGTCCAGGATGGTAGTACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386377 269 + 636262 TTGTTCTGGGTTTGGGACCATC----TGTGCCCTGCATATCAAAGCAATTCAAGTCGGCTACCCAATGCATTGAAAGTTAAACCGGGCCCTTGCCAAATGGGCACTAGATGTATAAGTTCGGGTCACCCATCTCCTCCCGATAGCTAATGCCAACGTCCATTCAGCAGTCCCAAACCCTATATGATTCAAAAATTTGCCCTCACCATTCATTCAAATAATTGTCAGTCTGGTGGTTCAATGTCTCCTGATTCACTGTGCAGGATGGTAGTACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 386357 271 + 647215 TTGTTCTGTACTTGGGACCATCATTCTGTGCCTCGTATATCAAAACAATTCAAGTCACCTACCACACGCATTGAATGGTGAACCGGGCCCTTACCAAATGAACCCTAGATGTATAAGTTGGGGTCATCCATGTCCTCCAAATAGCTAATGCCAATGCCCATCCTGCAGTTCCAAAACATACATGATTCGAAAATTTGTCCTCACAATATCTTCGAATAATGGTCAGTCTGGTGGTTCAATGTCTCCTGATTCAGAGTCCAGGATGGTAGTA-- - -a -s mr.mrrefChr5 240477 26 + 294542 TAATAGGTTATAGACGACATGCCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386647 26 + 636262 TAATAGGTTATAGATGACATGCCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 386628 20 + 647215 ------GTAATACACGACATGCCCTT - -a -s mr.mrrefChr5 240503 68 + 294542 CCACGAACAGATAGTATAGCCCTAAGCCCTAACTAAGACCTACCACATTCTTCCTGAAAATGACATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386673 68 + 636262 CCACGAACAGATAGTATAGCCCTAAGCCCTAACTACGACCTACTACATTCTTCCTGAGAATGACATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 386650 68 + 647215 CCACAAACAGATAGTATAGCCCTAAGCCCTAACTAAGATCTACCACATTGTCCCTAAAAAGGACATGT - -a -s mr.mrrefChr5 240571 493 + 294542 TATGCAGGTGGGAATTTAGCTGAGACAGACCTCCTATCAGTTTGAAGTGATGTCAAGCCTAGTAATGCCTTGCACACCTTTCGATTCTGTACTTTGCTCTTTGAGGAGGTTCTACACCTGAAGAATTCCTTCAACATGCATGGGTTGGTTGGTAGCGCAATAGAAGCAATTGTTCTCACATTAATCAAGAATTGAGGAGGAAAGTGGAACATCACAATATCATCTGCTGGCCTATTGTGACTAATGGTTGTATTTCTCCTAGCCTGCCTCACAAACACTTATCAATGGGTAGAGACCAAGAACCCATACATAGAGACCAAGAATCCATACCAAGGCTTAACAGTACGACATCTGAAGAGGCATGACTAGTAGGGTGGAATACTTATCTTCCAAAAGGCACAAATTTTTCTGTAGAACACAAGATGAATTCAGGTGGTTAAATACCAGGGGCTGCCACTAATACTAATCAGGTGGTAAAACCTGACTGCTGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386741 493 + 636262 TATGCAGGAGAGAATTTAGCTGAGACAGCTCTCCTTTCAGTCTGAAGTGATGTCAAGCCTAGTAATGCCTTGCACACCTTTCGATTCTGTACTTTGCTCTTTGTGGAGGTTCTACACTTGAAGAATTCCTCCAACATGCATGGGTTGGTTGGTAGCGCAATAGATGCAATTGTTCTCACATTAATCAAGAATTGAGGAGGAAAGAGGGACATCACAGTATCATCTGCTGGCCTATTGTGACTAATGGTTGTATTTCTCCTAGCTTGCCTCACAAACACTTATCAATGGGTAGAGACCAAGAACCCATACATAGAGACCAAGAATCCTTACAAAGGCTTAACAGGACGACATCTGAAGAGGCATGACTAGTAGGGTGGAATACTTATCTTCCAAAAGGCACAAATTTTTCTGTAGAACACAAGATGAATTCAGGTGGTTAAATACCAGGGGCTGCCACTAATACTAATCAGGTGGTAAAACCTGACTGCTGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 386720 488 + 647215 TATGCTGGTAGGAA----GCTGAGACAGACCTCCTATCAGTTTGAATTAATGTCAAGCCTAGTAAGGCCTTACATACATTTAGATTGTATACATTGCTCTTCGAGGAGGCACTACACCTGAAGAATTCCTTCAA-ATGCATGGGTTGCTGAGTTACACAATAAAAGTAATTGTTCTCACATTAACCAAGAATTGAGTAGGAAAGTGGAGCATCACCATATCATCTGCTGGCCTATTGTGACTAATGGTTGTGTTTCTACTATCCTGCCTCACAAACACTTATCCATGGGTAGAGACCAAGAATCAACACATTGGGACTGAGAATCCATACCAGGACTGAACAGTACGACAACTGAAGAGGCGTGACTAGTAGGGTGGAATACTTAGCTTTAAAGAGGCACTAACATTTCTGGAGAATACAAGGTGGATTCAAATGGTTAAATACCAGGGGCTACCACTAATACCAGTCAGGTGGTTAAACCTGCCTGCTGAGC - -a -s mr.mrrefChr5 241064 335 + 294542 CATCTCTAACATTCATGCATTATACTATGATTGCGATTAGCAGTTATTACTAGTCCATTCCAAAATGAATTTGGCAATTCCATCTACACTGCCCCCTTATTGTGTTCCAGGCTAATCGGTTCAATTCTCTGCAGAAAATTTCTCAAAAACTTATAAAATTAACCATCCTTACAAAGAATGACCTTTAAAGCCTGGCTTAAACTCCCATTGCCAGAGGCTCAGCTTCAACTATTGGAAGAACACCTAAATAATTGAACAATTGGTATATATACCTATTTGTGCCCACTATATTTAATCAGCAGTGATCAGTTGATTCACTATAGAAGGTGAGAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387234 332 + 636262 CATCTCTAACATTCATGCATTATACTATGATTGCGATTAGCAGTTATTACTAGTCCACTCCAAAATGAATTTAGCAATTCCATCTACACTGCCCCCTTATTGT---CAAGGCAAGTTGGTCCAATTCTCTGCAGAAAATTTCTCAAAAACTTATAAAATTAATCATCCTTACAAAATACAACATTCAAAGCCTGGCTTAAACTCCCGTTGCCAGAGGCTCAGCTTCAACTATTGGAAGAACATCTAAATAATTGAACAATTGCTATATATACCTATTTGTGCCCACTATGTTTAATCAGCATTGATCAGTTGATTTGCTATAGAAGATGAGAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 387209 335 + 647215 CGTTCCTTACATTCATGCATTATATTATGATTACAAGAAGGAGGTATTACTAGTCCATTCCAAAATGAATGTGGCTATTCCATCTACACTGCCCCCTTACTGTGTTACAGGCTTATCGGTTCAATTCTCTGCAGAAAATTTCTCAGAGACTTATTAAATTACCCACCTTTACAAAGAATGATCTTTAGAGCCTGGCCTAAACTCCCATTGCCAGAGGCTCAGCTTTAACTATTGGAAGAACACCTAATTAATTGAACAATTGGTATATATACCTATTTGTGCCCACTATATTTCATCAGCAGTGATCAGTTGCTTCACTATAGAATGTGAGAGCC - -a -s mr.mrrefChr5 241399 9 + 294542 CCAGAAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387568 9 + 636262 CCAGAAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 387544 9 + 647215 CCAGAAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 241408 94 + 294542 TCAACAATCAAAAAGCATAAGGACAACTTGCAGATTTGCACATACCTATCAACCCAAAGGCTGCTGCTTTAATATTTTATGTATATAATATGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387579 94 + 636262 TCAGCAGTCAAAAAGCATAAGGACAACCTGCAGATTTTCAAATACCTGTCAACCCAAAGGCTGCTGCTTTAATATTTTATGTATATAATATGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 387553 94 + 647215 TCAACAACCAAAAAGCATAAGTATAACTTGCAGATTTGCACATACCTATCACCTCAAAGGCTGCTGCTACAATACTTTATGTAGATATTATGAC - -a -s mr.mrrefChr5 241502 128 + 294542 CTTCATAACATATTTTGACATCTCAGGTGTAAGATGGTAGAAAGTGTGACAATGGCACCTATGATATTAATATGATTCATATAAGCAGGTTGAATTGTCCCATTGGTTGTAGAAGTTTTGCTGTCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387703 128 + 636262 CTTCATGACATGTTTCGACATCTCAGGTGTAAGATGGTACAAAGTGTGACAATGGCACCTATGATATTAATACGATTCATATAAGCCGGCTGAATTGTCCCATTGTTTGTAGAAGCTTTGTTGTCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 387647 128 + 647215 CTTCATAACATATTTTGACATCACAGATGTAAGATGGTAGAAAGTGTGACAATGGCACCTATGATATTAATATGATTCATATAAGCAGGTTGAATTGTCTCATGGGTTGTAGAAGTTTTGCTGTCAAT - -a -s mr.mrrefChr5 241630 120 + 294542 CATTTTGTTTGTGCTGCACCATCAGTGCCATTCACCTTAACCAAGTACCCTCCAATAGAACTACAACCATGTAGCCATAATGAACCATGACTACTGGCCTAAATTAGCGAGTCTGATTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387831 118 + 636262 CATTTTGTTTGTGCTGCACCAACAGTGCCATTCACCCTAACTAAGTACCCTCCAATAGAACTACACCCA-GTAGCCATGATGAACCATGACT-CTGGCCTAAATTAGCGAGTCTGATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 387776 120 + 647215 CGTTTTGATTGTGCTGCACCATCAGTGCCATTCACCTTAACCAAGTACCTTCCAATAGAATTACAAACATGTATTCATAATGATCCATGACCATGGGCCTAAGTTAGTGAGTCTCATCAT - -a -s mr.mrrefChr5 241750 275 + 294542 CCACATAAATAACACATAGTGGTCATGATTCATTATTACAGATTGCAAATTTGGTTCAAATTCTCAATAGTGTAAACATTTTCCTGTGAGATTTAGTAATGCTATGCATGAATTGTTGCTCAGAAGGACCAGTTTAACCCTAACTGTGCTTGTTGACAGCTGGTCCATCCTATTAGTCTCCAATGTATTCCACCATACCCTTAAGGCTGTTTCTGATGGTGTTGATGACTATGGATAATTTGATTGTGTATTTAATACATATAGAGGCTTAAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387949 242 + 636262 ---------------------------------TATTACAGATTGCAAATTTGGTTCAAATTCTCAATAGTGTAAACATTCTCCTGTGAGATTTAGTAATGCTATGCATGAATTGTTGCTCAGAAGGACCACTTTAACCCTAATTGTGCTTGTTGACAGCTGGTCCATCCTATTAGCCTCCAATGTATTCCACCATACCCTTAAGGCTGTTTCTAATGGGGTTGATGACTATGGATAATTTGATTGTGTATTTAATACATATAGAGACTGAAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 387901 271 + 647215 CCACATAAATAACACATAGTGGTCATGATTCATCATTACAGATTGCAAGTTTGGTTCAAATTCTCCATAGTGTAAACATTTTTCTGTGAGATTTGGTAATGCTATGCATGAATTGTTGC--ATCAGGACCAGGTTAACCCTAACTTTGCTTGTTGATAGCTGGTCCATCCTATTAGTCTCCAATGTATTCCACCATATCCCT--GGCTGTTTCTGACGGTGCTGATGACTATTGATAAGCTGAGTGTGAATTGAATACATATAGAGGCTTAAAGC - -a -s mr.mrrefChr5 242025 65 + 294542 TTAGGCAAAATTGATTACTTGGTTAGCTCACCATCATAACAGTGGGGGAATAATAGGACCACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 388192 65 + 636262 TTAGGCAAAATTGATTACTTGGTTAGCTCACCATCATAACAGTGGGGAAATCATAGGACCACATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 388172 65 + 647215 GTAAGCAAAATTGATTACTTGGCTATCTCAGCATTATAACAGTGGGAGAATAATGTAACCATATT - -a -s mr.mrrefChr5 242090 40 + 294542 GCACGCTGTAACAGTTTTATGCTGATTTCCATCCTACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 388266 40 + 636262 GCACGCTGTAACAGTTTTATGCTGATTTCCATCCTACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 388237 40 + 647215 GCACACAGTAACAGTTTTAGGCTGATTTCCATCCTACACA - -a -s mr.mrrefChr5 242130 557 + 294542 TGGCTTATGATGATAGCTCAAGTTATTGAGTGCTCCATAAAATCAAGTTGATGTACTTGGGAGGAATAGTTATGGCCCAACTCAGTAATTGTCACCTAATTGGCATGAATTTGTTGAATTGGTTTGTTCATGGATTGTATTTTTATGGGTGCTGGTGCATAATGTACAGCAACACTTGCCTATACATATACATTGGTCTAATAGCACAAAGTTGTTGTTACTAATAACATCCCTGAATAAGCTGTGCTTCCTGCTGTGTATCAATTTATCAAGGGAATGATAGTTTAACAATGATCCATAGAGATTCAGATTTTTTGCAGGTCCCCTGGAAGGTGTGTTACTATTTCTAATGACAGTCAGTAATCCCAGATGTTGATGGAATTGAAACTCGCATGGATGGCACCCTGTACTATAGTTTATGTACCACCATCCCATTGTAGGTCCACCACCTACATAAAAAACTGATACATTCGTTTGTCTGTTTATCACCATGTTTCAGTCATTCACTCCACTATGTCCAACAGGAGAATATTCTGTTTAACATGAGTGATATTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 388307 554 + 636262 TGACTTATAAAGACAGCTCAAGTTATTGGGTGTTCCATAAAATCAAGTTGATGTATTTAGGAGGAATAGTTATGGCCCAACTCAGTAATTGTCACCTAATTGGCATGAATTTGTTGAATTGGTTTGTTCATGGATTGTGTGTTTATGTGTGTTGGTGCATAATATACAGCAACACTTGCCTATACATATAAATTGGTCTCATAGCACAAAAGTATTGTTACTGATAATATCCCTGAATAGGCTGTGCTTCCTGCTGTGTATCAATATATCAAGGGAATGATAGTTTTACAATGATCCG--AAGATTCAGATTTTTTGCAGGTCCCTTGAAAGGAGTCTGACTATTTCTAATGACAATCAGTAATCCCAGATGTTGATGGAATTGAAACTCGCATGGATAGCACCCTGTACTATAGTCTATGAGCCACCATCCCATTGTATGTCCACCACTTACGTAAAAAGCTGATACATTCGTTTGTCTGTTTATCACCTTGTTTCAGTCATTTACTCCACTATGTCCTACAG-AGAATATTCTGTGTAACATGAGTGATATTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 388277 555 + 647215 TGGTTTAAGATGGTGGCTCAAGTTATTGAGTGCTCCATAAAATCAAGGTAATGCACTTGGGAGGAACATTTGTGGCCCAACTCAGTAATTGCCACCTAATTGGCATGAATTCGTTGAATGGGTTTGTTCATGGATCGTATTTTCATGGATGCTTGTGCATAATGTACAGCAACATTTTCCTATACATATACATTGGTCTAATAGCAAAAGGTTGTTATTACTAATAACATACCTAAATAAGCTGTGCTTCCTGCTGTGTAACAATTTATTGAGGGAGGAATAGTTTAACAATGATCCATAGAGATTCAGATTTTT-GCAGGTCCCCTGGAGGATGTGTTGCTATTTCTAATGACAGTCAGTAATCCTAGATGTTGATGGAATTGAACCTCACATGGATGGCACCCTGTACTATATTTTATGTACCACCATCCCATAATAGGTCGACCACCTACATAAAAAACTGACACATTCATTTGACTGTTC-TCACCATGTTTCAGTCATTCACTCCACTATGTTCAACAGGAGAGTATTCTGTTTAACACGAGTGATATTTAC - -a -s mr.mrrefChr5 242687 129 + 294542 TCCATGCTAGCAAAAGGGTGACATTCATGGACTCAGATCAGGGATTTTGATGCCATATCCCCTGTTTGGGTCTCTCCCATCTTGGGTCAAGCCCACATCCACTTGGCCCTTTTAGAGCTCAGTTTATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 388864 129 + 636262 TCCATGCTACTAAAAGGGTGACATTCATGGAGTCAGATCAGGGATTTTGACGCCATATCGCCTGTTTGTGTCTCTCCCATCTTGGGTCAAGCCCACATCCACTTGGCCCTTTTAGAGCTTAGTGTATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 388832 129 + 647215 TCCATGCTAGCAAAATGGTGACATACATGGACTCAGATCAGGGATTTTGATGCCATATCCCATGCTTGGGTCTCTCCCATCTTGGGTCGAACCCGCATCCATTTGGCCCTTTTAGAGCTCAGTTTATCA - -a -s mr.mrrefChr5 242816 9 + 294542 AGGTTCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 388994 9 + 636262 AGGTTCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 388961 9 + 647215 AAGTTCACC - -a -s mr.mrrefChr5 242825 116 + 294542 TCCCACTAAAGAAATTCTACTACCTAGTGAGTATGTAAGGCAAGGGCTATAGCTAATGTTCTGTTCCGCCTTCCATGCAATGTTTAACTGAATTCACAACTGGGAACTCAACTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389005 116 + 636262 TCCCACTAAAGAGATTCTACTACCTAGAGAACATGTAAAGCAAGGGCCATAGCTAATGTTCTGTTCTGCCTCCCATGCAATGTTTAACTGAATTCACAATTGGGAATGCAACTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 388970 111 + 647215 TCCCACTAAAGAAATTCTACTACCAAGTGAGTGTGTAAGGCAAGGTCTATAGCTAATATTC-----CGCCTTCCTTGCAATGTTTAACTGACTTCACAACTGGGAACTCAACTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 242941 55 + 294542 CTAATACCTACAACGCCAACATAATCATCAGCTGCTAGGTATGTCTTTGAGTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389121 55 + 636262 CTAATACCTACAACACCAACATAATCATCAGCTGCTAGGTATGTCTTTGAGTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 389083 52 + 647215 CTAATACCTCCAACGCCTACATAGTCATCAACT---AGGTATATCTTTGAGTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 242996 40 + 294542 GTCCTTGATCAGCTCCCTGGTGAATGCTCCCTGGTGAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389176 40 + 636262 GTCCTTGATCAGCTCCCTGGTGAATGCTCCCTGGTGAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 389137 40 + 647215 GTCCTTGATCAGCTCCCTGGTGAATGCTCCCTGGTGAACT - -a -s mr.mrrefChr5 243036 40 + 294542 TGAGTATGTCCGGGAGGACTATTCAGCAGTTCAATCATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389224 40 + 636262 TGAGTATGTCCGGGAGGACTATTTAGCAGTTCAATCATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 389177 40 + 647215 TGCGTACGTCCCGGAGGACTATTCAACAGTTCAAACAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 243076 29 + 294542 CTCAGTATTGCACACCTGTAAGTTCAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389264 29 + 636262 CTCAGTATTGCACACCTGTAAGTTCAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 389218 29 + 647215 CTTAGTATTGCACACCTCTATATTCAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 243105 27 + 294542 ATCCATTTTTTTTCTGCCACTCAGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389293 27 + 636262 ATCCATTTTTTTTCTGCCACTCGGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 389340 27 + 647215 ATCCATTTTTTTTCTGCCACTCAGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 243132 271 + 294542 TCTTCTGCCATTTAGATAAGACCAACCTGGCATGCAAAGAGTGACTGGTATGTGATTTGAGATCTAGGACTGTGCTACCTTGTCTGTCTGCTTCCACCTTGCTTGTAGTTGTCATGACGACGTCACCCCTTGATATACTTCAATAATAGATTTAATATTCACTTCAGTCTTTCCCTTCAGCCTAAAAGCTTCTCAGAGTTCAACACTGTTTTCTCTACTGTAAATACCCTGCCACCTATTTGTTTGGCTCTGGCTACCATGTGTTCAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389320 271 + 636262 TCTTCTGCCATTTAGATAAGACCAACCCAGCATGCAAAGAGTGACTGGTACGTGATTTGAGATCAAGGACTGTGCTACCTTGACTGTCTGCTTCCACCTTGTTTGTAGTTGTCATGACGACGTCACCCCTTGATATACTTCAAGAATAGATTTAATATTCACTTTAGTCTTCCCCTTCAGCCTAAAAGCTTCTTAGAGTTCAACACTGTTTACTCTACTGTAAATACCCTGCCACCTGTTTGTTTGGCTCTGGCTACCATGTGTTCAAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 389381 250 + 647215 TCTTTTGCTGTTTAAATAAGATCAGCCTGGCATGCAAAGAGTCACAGATATGTGAATTGGGATCTAGGACTGTACCACCTCTTCTGTCTGGTTTCACCTTGCTCGTAGTTGTCATTATGATGTCACCCCTTGATATACTTCAATAATAGATTTAATATTGACTTCAGTCTTTCCCTTCTGCCTAAAAGCTTCTCAGAGTTCAACTCTGTTTTCTCTACTTTAGATACCCTGCCACCTATTTGTTTAGCTT--------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 243403 181 + 294542 AGTTGAGTCTGAGAAGTCATTCTAAGATACTATTTATTGAACATGGGTGAATTCTCCAAAAGTCAGTTTAATTCTCTGTCACTCATGTGCTCCTGCTGTGAAATGATGGTGCTGATGGTGATCCATGCTGTGGAACAATGGGGCTCATGGTGTGCTACATCCAGAACTGCCCAATGCTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389594 181 + 636262 AGTTGAGTCTGAGAAGTCATTCTAAGATACTATTTATACAACATGGGCGAATTCTCCAAAAGTAAGTTTAATTCTCTGTCACTCATGTGCTCCTGCTGTGAAATGATGGTGCTGATGGTGATCCATGCTGTGGAACAATGGGGCTCATGGTGTGCTACATCCAGAACCGCCCAATGCTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 389631 181 + 647215 AGTTGAGTCTGAGAAGTCATTCTAAGATATTATTTATTGGATTTGGGTGAATTCTCCAAAGGTCAGTTTAATTCTCTGTCACTCATGTGCTCCTGCTGTGAAATGATGGTGCTGATGGTGATCCACGCTGCAAAACAGTGGTGTTCGTGGTGAACTACATCCAAGACTGCCCAACGCTCTC - -a -s mr.mrrefChr5 243584 325 + 294542 AGTTCTTGGTCGTAGGTGCACTCAATTCTTGTTTGTGACTTCCCTTTTTTGGTGGAGTTACTGCACTTTGTAATTCTAACATATGTTAAGAGCTGGCAGGCTATGACAATATGTACTGGCCATTTGGAAAAGGTCTGTCAACGATCCTCTAGCTACAATGATTTCTGATCCTAATTAACCCAACAATGACATTACTTTTATTAAGATGACATAACAAGAGAGGAGACTGCAATTCCTTGGATGGTTTGATAGAGATCACGAATTGTTCAGCGGTCCAGCTCACCAGCTTCAACCACCATCTGAGTGATGTACACATGAGAGATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389775 325 + 636262 AGTTCTTGGTCGTAGGTGCACTCAATTCTTGTTTGTGACTTCCCTTTTTTGGTGGAGTTACTGCACTTTGTAATTCTAACATATGGTAAGAGCAGGCAGACTATGACAATATGTACTGGCCATTTGGAAAAGGTCTGTGAACGATCCTCTAGCTACAATGATTTCTGATCCTAATGAACCCAACAATGACATTACTTTTATTAAGATGACATAACAAGAGAGGAGACTGCAGTTCCTTGGATGGTTAGATAAGGATCACGAATTGTTCAGCGGTCCAGCTCACCAGCTTCAACCACCATCTGAGTGATGTACACATGAGAGATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 389813 301 + 647215 AGTTCTTGCCCTTAGGTGCAC-AAATTCTTGTTTGTGACTTCCCTTTTTTGGTGG--------------GTAATTCTAATATGTGTTAAGAGCTGTCAGGCTATGAGAATATGTACTGGACATTTGCAAAAGGTCTGTCAATGATCCTCTAGCCTCAATGATTTC----CCTAATTAATCCAACAATGACATTACATTTATCAAGATGACATAACAATAGA-----CTGCAATTCCTTGGGTGGTTTGATTGATGTCACAAACTGATCAGCAGTCCAGCTCACCTGCCTAAACCACCATCTGAGTGATGTACACATGAGGGACAG - -a -s mr.mrrefChr5 243909 265 + 294542 AGTAAGTCCTTTGGACTATAACTTCATTCTACATGTATGCTGTAGGTGGCATATAATCCTTGGTGCTCTGAGGCATTGTATTTCCTGCCTATGGCTAGATTATTGGTACTTCCAGTATATTTCCATTCTATGGCTAGATTCTTGGTACTTCCAGTACTAGGAGGCTAATATTATTGGTCCATATGGGTAGCTAGATGAGGCACAAGTGGGCAGGCTGATGAGCCACAATGTGTGAAGCTCAAGATTATGCACTGATGCCCTCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 390100 265 + 636262 AGTAAGTCCTTTGGACTATCACTTCATTCTACATGTATGCTGCAGGTAGCTTATAATCCTTGGTGCTCTGAGGCATTGTATTTCCCGCCTATGGCTAGATTATTGGTACTTCCAGTATATTTCCATTCTATGGCTAGATTCTTGGTACTTCCAGTACTAGGAGGCTAATATTATTGGTCCATATGGGTCGCTAGAAGAGGCACAAGTGGGCAGGCTGATGAGCCACAATGTGTGAAGCTCAAGATTATGCACTGATGTCCTCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 390118 262 + 647215 AATAAGTCCTTTGGATTATAACTTCACTCAACACGTAT-CTGTAAGTGGCATATAATTCTTGGCACTCTCAGGCATTGTATTTCCTGC--ATGGCTAGATTCATTGTACTTCCAGTATATTTCCTTCCTATGGTTAGATTATTGGTACTTCCAGTACTAGGATACTAATATTATTGGTCCATATGGGTAGCTAAATGAGGCATAGGTGGGCAGGCTGATGGGCCACAGTGTGTTGAGCTCAAGATTGTACACTGATGCCCTCAGT - -a -s mr.mrrefChr5 244174 249 + 294542 ATTAGGTGTAGAAGTTAAATCACATAATTCAATTACCATACTGCTAGGGCACTGAAGTATGCCCAGAAAACCCATTACATGTGCTTTTTCTAGGGATGGCTCTACATACACAAGAGTATGTTTGGCTTGTTTCAACCCTAGAAATGTAATAATTAATGAATGCCCACATGTACCCAAGACTGAAATCAGTACCAATTCTTTCCTGTAAAGCTGTAATAATCTTTTTGGATAGGAAGGTCTGAAAAGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 390369 247 + 636262 ATTAGGTGTAGAAGTTGAATCACATAGTTCAATTACTATACTGCTAAGGCACTGATGTATGCCCAGAAAACCCAATACATGTGCTTT--CTGGGGCTGGCTCTATATACACAAGAATATGTTTGGCTTGTTTCAACCCTAGAAATGTAACAATTAACGAATGCCCACATGCACCCAAGGCTAAAATCAGTACCAATTCTTTCCTGTAAAGCTGTAATAATCTTTTTGGATAGGAAGGTCTGAAAAGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 390380 248 + 647215 GTCAGGCGTAGAAGTTAAGTCACGTAATTCAATTACCATACTGCCAGAGTACTGAAGCATGCTGGGAAAACCCATT-CATGTGATTATTCTACGGATGGCTCTACATACACAAGAGTATGTTTGGCTTGTTTCAACCCTTCAAACGTAATAATTCATGAAAGCCCAGATATACCCAAGATGGAAATCAGTATCAATTCTTCCCTGTAAAGCTGAAATAATCATCTTGGATAGGAAGGCCTAAAAAGTCT - -a -s mr.mrrefChr5 244423 25 + 294542 GTGTACCCCAACTCATAAACCTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 390707 25 + 636262 GTGTACCCCAACTCATAAACCTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 390628 24 + 647215 GGGAATGCCAACTGATAAACCTTG- - -a -s mr.mrrefChr5 244448 356 + 294542 ATTCCACTGGACTCATAGGGAACATGTAAAATGCAGGCAAAATATGGGTAAGTTACATGCTAGGTTTCCAACTACTAGCATCTGTGCATCAATACTATGTGTTCCTACTATCTCCCCAGATATGATGGAAAACTCTAAAGCAGAGAACTTGCTGGAGACCAAATACCAATACAACCCTTCTGCAGACCATAGGTGTTCACTTCTATGCAAGGGCAAGCTGGTCCAGAATGATTTTTAGGACTATGGGACATCTGTAATATGTTTATGCGTGAGGGGGACTTAGGCTTCTTTGTAGTAGTCATTAGGATGGAGATGATTCTAGTGTACAATGTATATTGCGCCAACACAGGCTCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 390733 356 + 636262 ATGCTGCTGGACTCATAGGAAACATGTAAAATACAGGCAAAATATGGGTAAGTTACATGCTAGGTTTCCAACTACTAGCATCTGTGCGTCAATACTATGTGCTCCTACCATTTCCCCACATATGATGGAACACTCTAAAGCAGAAAACTTGCTGGAGACCAAATACCAATACAACCCTTCTGCAGACCATAGGTGTTCACTCCCATGCAAGGGCAAGCTGGTCCAGAATGATTTTTAGGACTATGGGACATCTGTAATATGTTTATGCGTGTGGGGGACTTAGAGTTCTTTGTAGTAGTCATTAGGATGGAGATGATTCTAATGTACAATGTATATTGCGCCAACACAGGCTCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 390652 354 + 647215 ATTCCACTGGACTCATAGGGAACATGTAAAATGCAGGCAACATGTGGGTAAGTTACAAGCTAGGCTTCCAATTAGTAGCATCTGTGCATCAATACTATGTGTTCCTACTATCTCTCCAGATATGATGGAAAAATCTAAAGCAGAGAACTTGGTGGAGACCAAACACCAATCCAACTCTTCTGCAGACCATAGGTGTTCATTTGTATGCAAGGGTGAGGTGGTCCAGAATAATTTTTATGACTATAGGACATCTATAGTATTTTTATGTATGAGAGGGACTTAGGCTTCTCTGTAGCAGTCATTAGGATGAAGATGATTCTAGTGTCCAATGTATGTTGCATCAACACAGGC--TCC - -a -s mr.mrrefChr5 244804 179 + 294542 AACCAGTGCTCTGCAACTTCTGTGCTTGACATTGACTAGACTTGAACAGTTCACTTGTTGCTGCCCAAGAGCAACTTACTACTACACACTATAACTTGTTAATGAGAGCCAGTCAATCTCTACTTCCAAGCTCAGTATATAAATAAATGTTTCTCATAGGGCCTGCATGAAAAATCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391089 177 + 636262 AACCAGTGCTCTGCAACTTCTGTGCATGACATTGAATAAACTTGAACAGTTCACTTGTTGCTACCCAAGAGCAACTTACTACTACACACTACAACTTTTTAATGAGAGCCAGTCA-TCTCTACTTCCAAGCTCAGTATATAAATAAATGTTTC-CATAGGGCCAGCATGAAAAATCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 391007 178 + 647215 AACCAATGCTCTGCAACTTTCGTGTTTACCATTGACTAGGCTTGAACAGTTCACTTGTTACTGCCCAAGAGCAACTTACAACTACACACTATGACTTGTTAACGAGAGCCAGTCAATCTCTCCTACCAAGCCCAGTATATAAA-AAATGTTTCTCATAAGGCCTGCATGAAACACCACA - -a -s mr.mrrefChr5 244983 134 + 294542 CGCAATGCCAGCTTTCCTATGTGTTTCCCCTATTAATTGCCTCTTTTCCTCATTCTTTATTAAATGTATGATTAAGCAACACATATGCATGAGAATAAGACTTTGTTTCCTAATAGCACGTCATTGGCTGTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391266 117 + 636262 CGCGATGATGCCTTTCCTATGTGTTTCCCCTATTAATCGCCTTTTTCCCTCATGCTTTACTAAATATATGATTCAGCAACACATATGCATGAGAGTAAGATTTTGTTTCTTAATAGA----------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 391186 134 + 647215 TGCAATGCCAGCTTTCCTATGTGTTCCCCCTATTAATTGCCTCTTTTGCTCATTCTATATTGAATGTATGATCAAACAACGCATATGCATGAGAATAAGACTTTGTTTCCTAATAGCACGTCATTGGCTGTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 245117 34 + 294542 TGGTGGTATCTAGGCAAAATTAACCTTGGCTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 391322 34 + 647215 TGGTGGTATCTAGGCAAAATTAACCTTGGCTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 245151 10 + 294542 TCTGGGAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391383 9 + 636262 -CTGGGGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 391357 10 + 647215 TCTGGGAACT - -a -s mr.mrrefChr5 245161 108 + 294542 AAGTTGACCCTGGGAATGATCTTGAGCATCATGATCTAGTACGTGTGGCCACACTGTAGGTACTAATTAGCTATTACTGCACTTAATTTATTAAGCCTGGCAAGGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391394 108 + 636262 TAGTTGACCCTGGGAATGATCTTGAGCATCATGATCTAGTACGTGTGGCCACACTGTAGGTACTAATTAGCTATTACTGCACTTAATTTATTAAGCCCGGCAAGGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 391367 108 + 647215 AGGTTGACCCTAGGACTGAACTTGAGTATCATGATCTAGTACGTGTGACCAGACTGTAGGTACTAATTAGCTATCACTGCACTTAATTTATTAAGCTTGGCAGGGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 245269 195 + 294542 TGTCATACACTTTTATGGCATACTAGTTACAGACTAGAACCACTCCTCGTGGCTTACTTGGGGTTAGTTGGGGGTGATTCACTTGACATTATCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACATATTTGCTCCACACGCGACTTGCCTGAAAATGTAAGGAATACAATTAAAACAATATAGCTACCAATGGGCACTTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391511 191 + 636262 TGTCATACAC----ATGGCATACTGGTTACAGACTGGAACCACTCCTCATGGCTTACTTGGGATTAGGTGGGGGTAATTCACTTGACATTACCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACGTATTTGCTCCACACACGACTTGCCTGAAAATGTAAGGAATACAATTAAAACGATATGGCTACCAATGGGCACTTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 391475 195 + 647215 TGTCTTACGCTTTTATGGCTTACTAGTTACAGACTAGAACCACTCCTGGTGGGATACTAGGGGTTAGTTGGGGGTGACTCACTTGTCATTATCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACACACTTGTTCCACACGCTACTTGCCAGAATGTGTAAGGAATACAATTAAAACACTATAGCTACCAATGGGCACCTtgc - -a -s mr.mrrefChr5 245464 54 + 294542 TGAGGGTGTCTAGGCCATTTGCATTGGGATCTATTGCTTATATCCTGCTTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391702 54 + 636262 TGAGGATGTGTAGGCCGTTTGCATTGGGATCTATGGCTTATATCCTGCTTACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 391875 54 + 647215 TGGGGGTGTCTAGGCCATTTGAGTTGGGATCTATTGCTTATATCATGCTTCAAA - -a -s mr.mrrefChr5 245518 284 + 294542 TAATAAGAAAGCATCATGCATGCAGTAAGGGATCATACTACATTACACATAGCAAGATGGAGTATTGACTCCCTTTATTTGATTAGGCCATCTGAAGTCAACACACCAGACAGGCAGTACTTGAACTAGAAGCTTTACAAATTCTGCTTCTTAGTGCACGGTGACGGGTCTGGCAAGCGAGACACTCCTGATCTTGGTTGCTACATGATAGCGCTTACCCACGACTCCGTCTCATACAACGACGAAAAGTAATGGGCGTTCGGTCTAGGAATTTTTCCAGGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391756 284 + 636262 TAATAAGAAAGCATCATGCATGCAGTAAGGGATCATACTACATTACACATAGCAAGATGGAGTATTGACTCCCTTTATTTGATTAGGCCATCTGAATTCAACACGCCAGACAGGCAGCACTTGAACTAAAAGCTTTACAGATTCTGCTTTTTAGTGCCCGGTGACGGGTCTGGCAAGCGAGACACTCCTGATCTTGGTTGATACAGGATAGCGCTTACCTACGACTCCGTCTCATACAACGACGAAAAGTAATGGGCGTTCGGTCTAGGAATTTTTCTAGCGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 391931 282 + 647215 TAGTAGGAAATCATCATAAATGCAGTAAGTGATCATACTACATTGCACATAGCGAGATGGAGTACTGTCTCCCTTTGTTTGATT-GGCCATCTGAAGTCAACACACCAGACGGGCAGTACTTGAACTAGAAGCTTTAAAAATTCTGCTACTTAGTGCACGGTGAGGGGTCTGGCAAG-GAGACACTTCTGATCTTGGTTGCTACATGACAGAACCTATCCACGATTTCGTCTCATACAACGACGAAAAGTCATGGGCGTTCGGTCTAGGAGTTTTTCCGGGAGC - -a -s mr.mrrefChr5 245802 51 + 294542 GAATACTTCAACCAAAAAGAGCTGAAGGCGCGGAGGTTATAGACAGCAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392040 51 + 636262 GAATACATCAACCAAAAAGAGCTGATGGCGCGGAGGTTATAGACAACAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 392227 51 + 647215 AGATACTTCAATCAAAAGGAGCTGAAGGCGCGGGGGTCATAGACAGCAGAG - -a -s mr.mrrefChr5 245853 129 + 294542 CACAGACATGACCACTGGGTCACAGCTGCTAGGGTTCAACCATTTCAACACATAGTCCCCATCACAGATTATCTGCATCTCAAATCGTCGACACCTAATTTCCGGGTGGCACTCCTTCTTGGAGCACTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392092 129 + 636262 CACAGACATGACCACTGTGTCACAGTTGCTAGGGTTCAACCATTTCAACACATAGTCCCCGTCACAGATTATCTGCATCTCAAATTGACGACACCCAATTTCTGGGTGGCACTCCTTCTTGGAGCACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 392278 129 + 647215 CACGGACATGACTGCTGGGTCACAACTGCTTGGGTTCAACCATTTCAACACATAGTCCCCATCACAGATTATTTGCATCTCAAATCGTCGACACCTAATTTCCGGGTGGCACTCCCTCCTGGGGCACTC - -a -s mr.mrrefChr5 245982 100 + 294542 GAACCCTCCGAGTCAGCCATGCCGATTTTCTGATGACGCAATACACCCGGTGTCCAAGGCTTCGTGTGCGTGAATTGGCTCACCGTGGGGATTGCCCCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392221 100 + 636262 GAACCCTCCGAGTCAGCCATGCCGATTTTCTGATGACGCAATACACCCGGTGTCCAAGGCTTCGTGTGCGTGAATTGGCTCACCGTGGGGATTGCCCCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 392415 100 + 647215 GCGCCCTCCAAGTCTACCGGGCCGATTTTCTGACGACGCGACACATTTGGGGTCCAAGGCTTCGTACGAGTGAGTTGGCTCACCGTGGGGCTCGCCCCCC - -a -s mr.mrrefChr5 246082 8 + 294542 CCCTTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392321 8 + 636262 CCCTTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 392516 8 + 647215 CCCCTAGT - -a -s mr.mrrefChr5 246090 184 + 294542 AAAAGCAAGCTCTGGTAAGGTCTGTAAATTACCCTTGAGTGAACTAGAACAGGTAGAATGAACAGGTAGTATAGAACTGTGCAATGAAAAAAGAATTTTTGAGTGCCAATTGTTGTCCTTCAGTCTTGAAAGACATGCATTAGTAAGGATACTCCTCTTCCTCTGTGTTCTACATCCAGAGGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392348 184 + 636262 AAAAGCAAGCTCTGGTAAGGTCTGTAAATTACCCTTGAGTGAACTAGAACAGGTAGAATGAACAGGTAGTATAGAACTGTGCAATGAAAAAAGAATTTTTGAGTGCCAATTGTTGTCCTTCAGTCTTGAAAGACATGCATTAGTAAGGATACTCCTCTTCCTCTGTGTTCTACATCCAGAGGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 392524 184 + 647215 AAAAGGATTCTGTGGTAAACACTGTATATTATCCTTGGGTAGAATAGAACAGGTAGAATGAACAGGTAGTATAGGACTGTACAATGAAAACAGAATTTCTCAGTGCCAAATGTGGTCCATCAATTTAGGAAGACATGCATTAGATAAGATACTATTGCGCCTCTGTGTCCTATATCCAGATGGG - -a -s mr.mrrefChr5 246274 129 + 294542 ATGAAGTGAGGAGCAAAGCCAAACACATAGTACTTTGATTCTGTGGACCTTGTTGATTCCAAATTAGCATGGCTAATCACATTGTCCCCAATCCCATTGTTCCCATTGAGTGTTTGTATCATACATCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392532 129 + 636262 ATGAAGTGAGGAGCAAAGCCAAACACATAGTACTTTGATTCTGTGGACCTTGTTGATTCCAAATTAGCATGGCTAATCACATTGTCCCCAATCCCATTGTTCCCATTGAGTGTTTGTATCATACATCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 392709 129 + 647215 ATGAAGCAAGGAGCCGAGGCAAACACATAGTACTGTGATTCTTTGGGCCTTGTTGCTTCCAGACTAGGATGGCTAATCACATTGTCCCCAACCACATTGTTCCCATTGAGTGTTTGTATAATACACCCC - -a -s mr.mrrefChr5 246403 274 + 294542 ACATTTAGCAGCCTGATTGAAAAGATGACTAACACAACTCCGAGCTTACTAAAACTTAGTAGGAGCTCCAATATTGTTAGTAGACAAGTAGGAGATTGATGTGATTGAGACTGTCAACTAATAAATAGTCATAAAATTGATGGGATGACATCCGCAGGGATTCTAGAAGAAGGATTATTGCATTCTCTCCACATTTATTGAAGTGCAAGAGGCACCATCACTAGGTGATACACTCTTTATACCCTACAATGGCTTCCTAAAATGGTTGTGGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392726 274 + 636262 ACATTTAGCAGCCTGATTGAAAAGATGACTAACACAACTCCGAGCTTACTAAAACTTAGTAGGAGCTCCAATATTGTTAGTAGACAAGTAGGAGATTGATGTGATTGAGACTGTCAACTAATAAATAGTCATAAAATTGATGGGATGACATCCGCAGGGATTCTAGAAGAAGGATTATTGCATTCTCTCCACATTTATTGAAGTGCAAGAGGCACCATCACTAGGTGATACACTCTTTATACCCTACAATGGCTTCCTAAAATGGTTGTGGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 392838 274 + 647215 ACATTTAGCAGCCTGATTGAAAGGATGACTAACACAACTCTAAGCTTACTAAAACTTAGTAGGAGCTCCAATATTGTGAGTAGATATGTAGGAGATTGATGTGATTGAGACTGTTACCTAATAAATAGCCATAAAGTTGATGGGTTGACATCTGCTGGGATTCTAGAAATAGCATGCATGCATCCTCTCCACATGTATTCAACTGCAACTGGCACCATCACTAGGTGGTACACACTTTATACCCTTCAATGGCTTTCTGAAATGGTTGTGGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 246677 9 + 294542 TCATAGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393000 9 + 636262 TCATAGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 393113 9 + 647215 TCATATGTG - -a -s mr.mrrefChr5 246686 67 + 294542 CACTATGTTAACCCTGAGCATAGCAGTAAATCCTGTTTTAGATACTATTTCACTAAGGCAAGCTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393009 67 + 636262 CACTATGTTAACCCTGAGCATAGCAGTAAATCCTGTTTTAGATACTATTTCACTAAGGCAAGCTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 393123 67 + 647215 CACTATGTTAACTCTGAGCATAGCAATAAAACCTGTTTTAAGTAATCTTGCACTGAAGCAAGCTGGA - -a -s mr.mrrefChr5 246753 59 + 294542 GACAGACAGAATAGAAAATCATGTGGCGCCATTGCATGCAGTCATACAATGTGCGCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393077 59 + 636262 GACAGACAGAATAGAAAATCATGTGGCGCCATTGCATGCAGTCATACAATGTGCGCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 393190 59 + 647215 GACAGACAGGGTGGAAAATCATGAGGTGCCATTGTATGCAGTCACACAATATGAGCAAC - -a -s mr.mrrefChr5 246812 284 + 294542 CAATGTGATGTTGCCAGTGATAGAATCACTCATAATCTCACTCACTAGCTTAGTAGTGCAATGTTTGCCTGCATAATGGGAAAAAATTATTAGAAATAGCAAAGTATAAGTTAAGTTTTATGTAGTGAAAAGGCACTGGAGTGCTACTCTCTCTTTTTGTGGATTCTCCAGTTTTTTGGGTTATTTGTTGGTTTTGTCACTGTTAGGTGGGCAGAATGCCCAGTTTACAATGTTGTGTGTATCTTAACCTAGTGATTAAGAATGGGTATGCTGGTAGGGCATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393151 272 + 636262 CAATGTGATGTTGCCAGTGATAGAATCACTCATAATCTCACTCACTAGCTTAGTAGTGCAATGTTTGCCTGCATAATGGGAAAAAATTATTAGAAATAGCAAAGTATAAGTTAAGTTTTATGTAGTGAAAAGGCACTGGAGTGCTACTCTCTCTTTTTGTGGATTCTCCAGTTTCTTGGGTTATTTGTTGGTTTTGTCACTGCTGGGTGGACAGAATGCCCAGTTTACAATGTTGTGTGTGTCTTAACCTAGTGATGAAGAATGGGTATGCT------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 393249 284 + 647215 CAATATGGTGTTGCCAGTGATAGGATCACTCATTATCTCACTCATTAGCTAAGTAGTGCAATGTTAGCCTGCATAATGGGTGTAAATTAGTAGACATGGCAAAATATAAGTTAAGTTTTATGTAATGAAAAGGTACTAAAGTCCTACTGGCTCTTTTTGTGGACTCTCCTGTTTTTTGGGTTATTTATTGGTTTTGTCACTGTCAAGTGGGCAGAATGCCCAGTTTACAATGTTGTGCATATCTCAAACTCGTGACTAAGAATGGGGATGCTGGTAGGGCATAT - -a -s mr.mrrefChr5 247096 305 + 294542 CAACTAATCTTATCCATGGACCACATTCTGCTAAGCTCATGTCACCTCGTGTGCATGCAGCTCCTTTCTTTACCTATGGGGAATTCTAGCCCAACCAATTTCTACTTACCCCATTCTGTTGTGAATTTGGTCACATGGGATGGGTACATGTGCTTACTTCATACCTTAATTAATAATGCCACCGGTAACACTTAAGAATGCCTCTGGCAAAATTTAGCATCCAGCACAATTCATCTTAAGGCCCAATCATAGGGAGAGAAAGAAACTAGCATGGTCTATCTTAACATTGTGATCTATTCAGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393423 277 + 636262 --------CTTATCCATGGACCACATACTGCTAAGCTCATGTCACCTCGTGTGCATGCAGCTCCCTTCTTTACCTATGGGGAATTCTAGCCCAATCAATTTCTACTTACCCCATTCTGTGGTGAATTTGGTCACATGGGATGGGTACATGTGCTTACTTCA------------------TACC--TAACACTTAAGAATGCCTCTGGCAAAATTTAGCATCTAGCACAATTCATCTTAAGGCCCAATCATAGGAAGAGAAAGAAACTAGCATGGTCTATGTTAACGTTGTGATCTATTCATCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 393534 302 + 647215 CAACTAATCTTATCCATGGAGCACATTCAACTAATCTCATGTCAGCTCATGGGCATGCAGGTAGTTTCTTGACCTATGGGGAATTCTAGCTCAACCAATTCCTACTTACCTCATTCTGTTGTGAATTTGTTCACATGGGATGGGTTCATGTGCTTACTTCATACCTTAATTAATAATGCCACTGGTGACACTTAAGAACGCCTCTGGCAATGCTTAGCATCCAGCACAATTC---TTAAGGCCCAATCATAGGGAGAGAAAGAATCTAGCATGGTCTGTCTTAAGATTGTGATTTATGCAGCACT - -a -s mr.mrrefChr5 247401 228 + 294542 ATCTCTTAGGGGAAATACAACTGGACAGAGACAATATGCATATTGTTATTTTCTTATGACTATTTTTACATATCAGGCTCAACAGGAAAGAATGCCTGGGAGATGGCTGGTGCCCAATAATTGAAGATATTGTGATTAGAGAGTTAAGATTCAGATTAAGCTAGAATCTCGATCACACATAAAAATTAGAGTTACAACATCTGTACACTTCCTGCTGTTTATGTATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393736 228 + 636262 ATCTCTTAGGGGAAGTACAACTGGACAGAGACAATATGCCTATTATTATTTTCTTATGACTATTTTTTAATATTAGGCTCAACAGGAAATAATGCCTGGGAGATGGTAGGTGCCCAATAGTTGAAGATATTGTGATTAGAGAGTTAAGATTCAGATTAAGCTAGAATCTCGATCACACATAGAAATTAGAGTTACAACATCTGTACACTTTCTGCTGTTTAGGTATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 393836 228 + 647215 GTCTCTTAGGGGAAATGCAACTGGATATAGACAATATGCATATCGTTATTTTCTTATGACTATTTTTACATATCAGGCTCAATGGGAAAGAATTCCTGGGAGATGGCTGGTGCTGAATAATCGAAGATATTGTTATTTGTGGGTTAAGATGCAGATTAAGCTAGAATCTTGATCACACATAAAACTTAGAGTTACTACATCTGTACCCTTCCTGCTGTTAATGTGTTC - -a -s mr.mrrefChr5 247629 51 + 294542 CCTGCTCTGGAGTTAACTTATTAGATGTGATTGGGAACACAATTTATTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393968 51 + 636262 CCTACTCGGGAGTTAACTTATTAGTTGTGATTGGGAACACAATTTATTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 394064 49 + 647215 CCTGCTCTGGAGCTAACTTATTAGATGTGATTGGGCACACAATTTATCA-- - -a -s mr.mrrefChr5 247680 77 + 294542 TTCATACTGTCTAGTATGGATGCCTCTGGATGATTAAACCCAGTATTTAGAATTAACAGCTGGTTGTGCCAAAGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394022 77 + 636262 TTCATACTGTCTAGTATGGATGCCTCTCGATGATTAAACCCAGTATTTAGAATTAACAGCTGGTTGTGCCAAAGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 394113 77 + 647215 TTCATACGGTCTAGCATGGATACATCTGGATGATTAAACGCAGTATTGAGGATTAACAACTGATTGTGATAAAACCT - -a -s mr.mrrefChr5 247757 98 + 294542 GAGTGCTAAACAATGTTGTTGTCAATAAACCTGGGACAGCATACTCAGAATGGTTGTCTGTAAACTTAAAGAGTTCTTGGAATTTTCTCTGAAAGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394099 98 + 636262 GAGTGCTAAACAATGTTGGTGTCAATAAACCTGGGACAGCATACTCAGAATGGTTGTCTGTAAACTTAAAGAGTTCTTGGGGTTTTCTCTGAAAGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 394214 98 + 647215 GAGTGCTACACAATGTTATTGTTAATAAACCTGGGATAACACACTCAGAATGGTTGTCTGTAAACTCTAAGAGTTCTTGGAATTTCCTCTGAAAGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 247855 70 + 294542 CTCAAATGAGCAATATCATTCGGCAGAAGGAGCCCTCTTGTATTCATGGTAAAGCTTCCTTGAGAGCTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394207 70 + 636262 CTCAAATGAGCAGTATCATTCAGCAGAAGGAGCCCTCTTGTATTCATATTGAAGCTTCCTTGAGAGCTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 394312 70 + 647215 CTCAATTGAGCAATATCATTTGGCAGAAGGAGCCCTCTTGTATTCATGGCAATGTTTCCTTGTGAGTCCA - -a -s mr.mrrefChr5 247925 11 + 294542 CCACTATTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 394383 11 + 647215 CCACTATTTAC - -a -s mr.mrrefChr5 247936 27 + 294542 GTCCACACTATCTGTTGCTATCAATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83810 27 + 636262 GTCCACACTATCTGTTGCTATCAATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 394395 27 + 647215 GTCCACACCGTCTGGTACTATTGATAA - -a -s mr.mrrefChr5 247963 15 + 294542 GTAACCAGGGTATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83837 15 + 636262 GTAACCAGGGTATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 394448 15 + 647215 ATAACCAGGGTAGAT - -a -s mr.mrrefChr5 247978 14 + 294542 CACTGGTTCATCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83852 14 + 636262 CACTGGTTCATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 394464 14 + 647215 CACTAGTTCATCTA - -a -s mr.mrrefChr5 247992 25 + 294542 CTAGGGCATTTACTTGTTGTAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83867 25 + 636262 CTAGGGCATTTACTTGTTGTAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 394478 25 + 647215 CTAGGGTATTTATTTGTTGTGAATA - -a -s mr.mrrefChr5 248017 5 + 294542 CCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394277 5 + 636262 CCCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 394541 5 + 647215 TCCAT - -a -s mr.mrrefChr5 248022 20 + 294542 AGGATTATGTACAATTGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394282 20 + 636262 AGGATTACGTACAATTGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 394553 13 + 647215 AGGATTATGTACA------- - -a -s mr.mrrefChr5 248042 152 + 294542 CTGCAATCATAAAATTAGTTCTCCTGTTTTCAACTTCCCAACCTTGACAGTCAGGGTAGGGCTTAGAAATTTTATGTCCCAACTGCCCCCAGGGTAAGTGTGCCATCGCTGGCATATGGTTGTGACTCTGTCCAACACTTGCAGTGTCATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394305 128 + 636262 CTGCAATCATAAAATTAGTTTCCCTGTTTTGAACTTCCCAATCTTG-----CAGGGTAGGGCTTAGAAATTTTATGTCCCAACTGCCCCCAGGTAAAGTGTGCCATCACTAGCATATGGTTGTGACTATGTCC------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 394566 130 + 647215 -------CATAAAATTATTTCTCCTGTTTTCAAGTTCCCAACTTTGACAGTCAGGGTAGGGCTTAGAAATTT---------------CCCAGGGTAAGTGTGCCATCGCTGGCATATGGTTGTGACTCTGTCCAACACTTGCAGTGTCATCA - -a -s mr.mrrefChr5 248194 119 + 294542 GTAATTGGCTTGCTGAAAGAAGGTGTTTAATTACTTGTAAGAGATAAACTTGATTACATGTTCTTGGTTGGCACATAACTGAAACTCTGGCATAATCCAGTGTGATCCAAGGTTCCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394433 94 + 636262 -------------------------TTTATTTACTTGTAAGAGATAGACTTGATACCATGTTCTTGGTTGGCACATAACTGAAACTCTGGCATAATTCAGTGTGATCCAAGGTTCCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 394699 105 + 647215 GTAATTGGCTTGCTGAAAGAAGGTGTTTAATAACTTGTAAGAGATAAACTTGATTACATGTACTTGGTTGGCATATCACTGAAACTCAGGCATAATCCAGTGTGA-------------- - -a -s mr.mrrefChr5 248313 32 + 294542 GGATAAGACACGCAACTGCCCTTAGCCAGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394533 32 + 636262 GGATAAGACACACAACTGCCCTAAGCCAGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 394804 32 + 647215 GAATAAGACATGCAACTGCCCTTAGCCATGTC - -a -s mr.mrrefChr5 248345 138 + 294542 CAAGTTATCAGGCAGTGGGCCCCACAAGGGTCCGTTGATCCACATTTCGATTGGAGCATCTCCTGGGTGTCTGGGAGTGGGCAGGAAGCAGGCTTGAAGGACCCTGTTATACTGGAGGTCTTACTGCTGGGTGTCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394571 138 + 636262 CAAGTGATCAGGCAGTGGGCCCCAGAAGGGTCAGTTGATCCACATTTCGATTGGAGCATCTCTTGGGTGTCTGGGAGTGGACAGGGAGCAGGCTTGAAGGACTCTGTTATACTGGAGGTCTTACCGCTGGGTGTCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 394836 138 + 647215 CAAGCTATCAGGCAGTGGGCCCCACGAGGGTCCGTTGATCCACATTCCTATTGGAGCATCTCCCGGGTGTCTGGGAGTGGGCAGGAAGCAGGCTTGAAGGACCCTGTTATACTGTAGGTCGTACTATTGGGTGTAATT - -a -s mr.mrrefChr5 248483 3 + 294542 ACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394709 3 + 636262 ACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 394980 3 + 647215 GCT - -a -s mr.mrrefChr5 248486 242 + 294542 GGTGTCCTCTAACCACCATGATTTGTACTTTGTTTTTCATGTAAAGACTGGTTGCTTAACATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTTGACCCCTAAAGGATGACTGGCTAGAGCCCAACCTGAGATTTTCCTGCAGAACTCCTTTAATCAATACCACTCTACACCAGGAGGACTCTCCAGTGAAGCTACAGCCTAACATGCAGAGTACTCTCATGATGAACTTTCTCCATGAGAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394712 240 + 636262 GGTGTCCTCTAACCACCATGATTTGTACTTTGTTT--CATGTAAAGAGCGGTTGCTTAACATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTTGACCCCTAAAGGATGACTGACTAGAGCCCAATCTGAGATTTTCCTGCGGAACTCCTTTAATCAATACCACTCTACACCAGGAGTACTCCCCAGTGAAGCTACAGCCTAACATGCAGAGTACTCTCATGATGGACTTTCTCCATGAAAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 394985 232 + 647215 GGTGTCCTTTATACACCATGATTTGAGCTTTTTGGTTCATGTAATGACTG----------ATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTCCGTTGCTAAAGGATGACATGCTAGAGCCCTACCTGAGGTTTTCCTGCAGAACTCCTTTAATCAAGACCACTCTACACCAGATGGACTCTCCAGTGAAGCCACAGCCTAAGATGCAGAGTACTTTCATGATGAACCTTCTCCATGAGAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 248728 68 + 294542 ACCGTCCAGAGGGGTACAGACTCATATTCCCCACCCTCTTTTGAGTCCCTATTCTATCTTTCTCTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394954 68 + 636262 ATCCTCCAGAGGGGTACAGACTCATATTCCCCACCCTCTTTTGAGTCCCTACCCTATCTTTCTCCTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 395217 66 + 647215 ACCGTACAGAGGGGTACAGACTCATA--CCCCGCCCTCTTTTGAATCCCTATTCTATCTTTCTCTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 248796 192 + 294542 GTCTCCCTTGTTTATCTTTTAGTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATCATCTCCAACAACATTCAGCATTCATCTCTACCTTTTAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGCCAATAAAAGGCTCACGCATCATGTAGGCACTCGAGAAATTAAATACAGACATAAAGACCGAATCACACAATACTAGCTCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395023 191 + 636262 GTCTCCCTTGTTTATCTTTTACTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATAATCTACAACAACATTCAGCAGCCA-CTCTACCTTTTAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGCCAATAGAAGGCTCACGCATCATGTAGGCACTTGAGAAATTAAATACAGACATGAAGACTGAATCACCCAATACTAGCTCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 395283 192 + 647215 GTCTCCCTTGCTTATCTTTTAGTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATCATCCCCAACCACATTCAGCATTCATCTCTACTTCTAAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGAAAATAAAAAGCTCACATATCATGCAGGCACTCGAGAAATCAAATACAGCCATAAAGACCGAATCACACAATACTAGCTCATA - -a -s mr.mrrefChr5 248988 46 + 294542 TGGAGTGACTCTGCAACATCTTCCTGCATCGGCCATGTCCAAATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395293 46 + 636262 TGGATTGACTCTGCAACACCTTCCTGCATCAGCCATGTCCAAATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 395475 46 + 647215 TGAAGTGTCTCTGCAATATCTTCCTGCATCGGCCATGTCCAGATTT - -a -s mr.mrrefChr5 249034 7 + 294542 ACCTACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395339 7 + 636262 ACCTACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 395526 7 + 647215 ACTCACT - -a -s mr.mrrefChr5 249041 20 + 294542 CACACATATACACATAGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395346 20 + 636262 CACAAATATACACATAGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 395534 20 + 647215 CACACATACACACATTGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 249061 449 + 294542 AAACCCAATTACTTGTTGATGAACAGTAGTTACTGTAGTACCTTGGAAAGGGCCTACTTTAATTATAACTATGAGCTTGTCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCATTCCATGAAAGATGTAGAAGTGAAGAGAAAACATCTTTTTCAGAGCCGCAGATGAGATTATTATTTAAAAGCAAGACTATGCAAGACACTCATGTGATTGACATGGTACTGAATAAGGACAATGCTGTATTTTTGTTCTCTAGCATGTACAATACAGCCCAAGGTACTCCTTATAAAAAACCCCCATCGGTTGTTGAACCACAATTCTTTGTTCCAGTTCTACTTCCACTACTGAGAGTTAGGTTCACCACAACATAGGAGCATTGCAGAGTTCTCAGTTCTTGGCGCAATAGACAATTTGCAATAGATTTAGACTCTTGAATAAAAGAATCCATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395366 449 + 636262 AAACCCAATTACTTGTTGATGGAGAGTAGTCAATGTAGTGCCTTGGAAAGGGCCTACTTTAACTATAACTATGAGCTTGGCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCATTTCATGAAAGATGTAGAAGTGAAGAGAAAACATCTTTTTCAGACCCACAGATGAGATTATTACTTAAAAACAAGTCTACACTAGACAGTCATGTGATTGACATCGTACTGAATAAGGACAATGCTGTATTTTTGCTCTCTAGCATGTACAATACAGCCCAAGGTACTCCTTATAAAAAACCCCCATCGGTTGTTGAACCACAATTCTTTGTTCCAGTTCTACTTCCACTACTGAGAGTTAGGTTCACCACAACATAGGAGCATTGCAGAGTTCTCAGTACTTGGCGCAATAGCCAATTTGCAATAGATTTAGACTCCTGAATAAAAGAATCCATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 395622 445 + 647215 AAACCCAATTACTTGTTGATGAACAGTAGTTACTGTAGTACCTTGGAAAGGGCCTACTTTAATTATAACTATGACCTTCTCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCACTCCA----AGAGGTAGAAGTGAAGGGAAAACATCCCTTTCAGAGCAGCAGATGAGATTATTTTTCAAAGGCAAGACTATGCAAGACACTCATGTGCTTAACAAGGTACTGAATAAGTATAACGCTGTATTTTAATTCTCTAATGTGTACAATACAGTCCAAGCTACTCCTTATAAAAGGGCCCCATCAGTTCTTCAACCACAATTCTTTACTCGAACTCTAATACAACTACTGAGAGTTAGGTTCATCACAAGCGAGGAGAATTGCAGAGTTCTTGGTTCTTGGTGCAATAAATAATTTACAATAGATTTGGACTCTTGAATAAAAGAATCCTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 249510 48 + 294542 GTGATCACCCCCAACATGTGCCCCCGTCTGATATTTCATTAAATGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395823 48 + 636262 GTGAGCACCCCCAACATGTGCCCCCGTCTGATATTTCATTAAACATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 396067 48 + 647215 GTGATCACCTCCAACATGTGCCCCCGTCAGAAAGTTGATCAACTGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 249558 276 + 294542 GTCCTGACTCTATCAGCAGGGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACCACAGATTAGATGAGGAAAAATGGTTTGAGCTGGTGCTTGCAATCCAACAAAAAGGACCTGCTAAATGCATGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAACATGGACCAACCAGTATCTGATACAGGTGTGGCAGAAGTAGGTCCCTACATTATGAGCAGCTATCAGCAACAGAGAAAGTCATGCATTGGATTTCACTATAGTATCCGGCCTCAAGTAATCCTCAAGTTGTTGCTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395871 274 + 636262 GTACTGACCCTATCAACAAGGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACAATAGATTGGATGAGGAAAAATGGTTGGAGCTGGTGGTTGCAATTCGAGAAAAAGGACCTGCTAAATGCGTGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAGCATAGACAACCCAATATCTGATACGAGTGTGGCAAAATCAGGTTGCTATATTATGAGCAACTATCAGCAACAGGTGAAGTCATGTACTGGATTTCACTATAGTATCAAGCCTCATATAATCTTCAAGTTGTTGCTG-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 396115 272 + 647215 GTCCTGACTCTATCAGCAGAGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACCACAGATTAGATGAGGAAAAATGGTTTGAGCTGGTGCTTGCAATCCAACAAAAAGGACCTGCTAAATGCCTGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAACATGGACCAACCAGTCTCT----CAGGTGTGGCCGAAGTAGGTCCCTACATTATGAGCAGCTATCAGCAACAGAGAAAGTCATGCATTGGATTTCACTATAGTATCCGGCCTCAAGTAATCCTCAATTTGTTGGTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 396397 263 + 647215 GTCCTGACTCTATCAGCAGGGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACCACAGATTAGATGAGGAAAAATGGTTTGAGCTGGTGCTTGCAATCCAACAAAAAGCACCTGCTAAATGCATGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAACATGGACCAACCAGTATCT----CAGGTGTGGCAGAAGTAGGTCCCTACATTATGAGCAGCTATC---------GAAAGTCATGCATTGGATTTCACTATAGTATCCGGCCTCAAGTAATCCTCAACTTGTTGCTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 249834 8 + 294542 TCCTACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396145 8 + 636262 TCCTACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 396660 8 + 647215 TCCTATCT - -a -s mr.mrrefChr5 249842 10 + 294542 TCAAGTATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396153 10 + 636262 TCACATATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 396387 10 + 647215 TCAACTGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 396668 10 + 647215 TCGAGTATTT - -a -s mr.mrrefChr5 249852 77 + 294542 CTGAGTCCTATTAGGTTTTGTTTTAGTGAAAAGGAGTGAGGTGTAGTCATTTAGGTTCACTTTATGAGCTTAATGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396163 77 + 636262 CTGAGTCCTATTAGGTTTTGTTTTAGTGAAAAGGAGTGAGGTGCAGTCATTTAGGTTCACTTCGTGAGCTTAACAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 396678 77 + 647215 CTGAATCCTATTACGTTTTGTCTGAGTGAAAAGGGGTGAGGTGTAGTCATATATCTTAACTTTATGAGCTTAATGGG - -a -s mr.mrrefChr5 249929 54 + 294542 CTTGGGCCATTTCCTTTATGTTGGTACTATAGGCAACCATTAGTTTGTCAATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396240 54 + 636262 CTTCAGCCATTTCCTTTATGTTGGTATTGTAGGCAACCATTAGTTTGTCAATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 396757 54 + 647215 AGTGGGCCGTTTACTTTATGTTGGTACTATAGACAACCACTAGTTTGTTAATGT - -a -s mr.mrrefChr5 249983 64 + 294542 TTACATCATCTACTCCAGTCTGATCCTTAGTAATTATGTAATTCTTCAACACCTAAGCTTTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396294 64 + 636262 TTACATCATCTACTCCAGTCTGATCCTTAGTAATTATGTAATTCTTCAACACCTAAGCTTTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 396815 64 + 647215 TTACATCCTCTACCCCGGTCTGATCCTTCATAATAACTTAATTGTTTAGCACCTCAGCTTTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 250047 146 + 294542 TGGGTGAGTGAGATAGTATGAGTAATATGAGCATTTATTTGTTGCTCCCTGCTTATACTGTATGGTTTACCCTTGGGACAGGATCTATCAAAGAGGCACGTGTCAGGGCGCATATGCTGTTTCACTCAAACTCCACTGTAAGCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396369 146 + 636262 TGGGTGAGTGAGATAGTATGAGTAATATGAGCATTTATTTGTTGCTCCCTGCTTATACTGTATGGTTTACCCTTGGGACAGGATCTATCAAAGAGGCACGTGTCAGGGCGCATATGCTGTTTCACTCAAACTCCACTGTAAGCCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 396879 146 + 647215 TGAGTGAGTGAAATCGTATGAGTAGTATGAACATTTCTTTGTTGCTCCAGGCTTATACTGTATGGGTCACCCTTATGACATGATAAATCAAGGGGGTGCTCATCAGAGCGCATGTGCTCTTTCACTCAAACTTTACTGTAAACCAA - -a -s mr.mrrefChr5 250193 19 + 294542 TGACTATATCTTTTCTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396516 19 + 636262 TGACTATATCTTTTCTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 397025 19 + 647215 TATCAGTATCTTTTCTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 250212 22 + 294542 AGTCAGGACCCATTTACCTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396536 22 + 636262 AGTCAGGACCCATTTACCTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 397044 22 + 647215 AGTCAGGACCCATTTACCTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 250234 126 + 294542 CACTACCCACTGCCAGCAGGACAATGGATAGTAGTCAATTTCCTTCCAGGTTGAGAGCATAAGAATTGCACCTGAATCTTGTCTCAAAATCCATGACATGTTAAATAATCAGGTAATGCACCTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396558 125 + 636262 CACTACCCACTGCCAGCAGGACAATGGATAGTAGTCAATTTCCTCCCAGGTTGAGAGTATAAGAGTTGCACCCGAATCTTGTCTCAAAATCCATGACATGTTAT-TAATCAGGTAATGCACCCTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 397072 126 + 647215 TACTACCCACTCCTAGCGGGACAATGGATAGTGCTCAATTACCTTCCAGGTTGAGAGCCCAAGAAGTGCACCTGAATCATGTCTCAAAATTCATGACGTGTTAAATAATCAGGTAATGCACCTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 250360 479 + 294542 CAGCATCAAGTACTTAACTCAAGACTAGGCGCTAATAAGGACTCTAAGGGTGTCTAACAACTGTTCCCATTCAATTGAGGCTTGAGCCAGTGTCAATGCATTAAGCTGTTTCGTATACTCAGCACTTGGACCAACTCAATGTCATGTTAAGTAGTACAGGTGCACTTGAGCTTAGGCATTTATTAATGCTATAAAGACTCATATGACGCTACTCCATGGAGGTTGACAGATCACAGCATATACCACTAGTTCTGGGGGGATAGTAGATGTAAATTCTTGACTCTGACTGATTGACTCGACAATTGTGTCCAGCTTGGATTTCTTGTTATGTAAATGTCTGGATAGTGATTAAGGCCTTCAATGGGGTAGTACCATCCTTTTCAGGTAAACAAGGCAGTGGACATGGGGTCCAATAAATATGGTGTGGGTTGGTGGACTTACCTCAGGATGTTGCCAAAATATAATTTTTGTTTGCTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396792 468 + 636262 CACCATCAAGTACTTAACTCAAG--TAGGCACTAATAGGGACTCTAAGGGTGTCTAACAACTGTTCCCATTCAACCGAGGTTTGTGCCAGTGTCAATGCATTAAGCTGTCTCGTATACTCAGCACGCAGACCAACTCAATGTCATGTTAAGTAGTACAGATGC---------TAGGCATTTATTAATGCTAAAAAGACTCATATGACGCTACTCCATGGAGGCTGACAGATCACAGCATATACCACTAGTTTTGGGGGGATATTAGATGTAAATTCCTGACTCTGATTGATTGGCTCGACAATTGTGTCCTGCTTGGATTTCTTGTTATCTAAATGTCTGGATGGTGATTAAGGCTTTCAATGGGGTAGTAACATCCTTTTCAGGTAAACAAGGCAGTGGACATGGGGTCCAATGAATATGGTGTGGGTTGATGGACTTACCTCAGGATGTTGCCAAAATATGATTTTTGTTTGCTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 397198 472 + 647215 CAGCATCAAGCAATTAACTCAAGACTAGGCGCTAATCAGGGTTCAAAGAGGGTCTAACTACTGTTCCCAATCAATTGAGGCTTGAGCCAGTGTTAATGCATTAAGCTGCTT-----ATCCAGCACTTGGATTAACTCAATGTCATGTTGAGTAGGACAGGTGCACTTGAGCTTAGGCATTCAATAAT--TATAAAGACTCATATGATGCTACTCCATAGAGGTTGACGGATCATGGCATATACCATTGGCTCTGGGGCGATGGTAGATGTAAATCCTTGACTCTGCCTGATTGACTCAACAATTGACTCCAGCTTGGATTTCTCATTATGTAAATATCTGGACAGTTATTAAGGCCTTCACGGGGGTAGTACCATCCTTATCAGGTAAATAAGGCAGAGAAGATGGGGTCTGATAAATATGGTGGGGGTTGGACGAATTACCTCAGGATGCTGACAAAATATAATTTTGGCTTGCTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 250839 21 + 294542 GTCACAGGTCACCCCACTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397262 21 + 636262 GTCACAGGTCACCCCACTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 397670 21 + 647215 GTCACAGGTCACTTCTCTGGT - -a -s mr.mrrefChr5 250860 204 + 294542 TTTGTGGCAGCAATTGACTTGGTACAGTGGTGCAATGATGATAGAACCTTTGTTGTGGGCTCAACATCACCCCCGCTTACTGTTCAGTTCAACAGGAAATGTTTATTAATTCATTTCCTTACAAAGTCATAATGCCAGTTAAGTCAGGCTCACAGGGTAGGTAGGTTGCATTTTGCTGTTCtaGTTCAGCTATTAGGGTGCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397287 202 + 636262 TTTGTGGCAGCAATTGACTTGGTACAGTGGTGCAATGATGATAGAACCTTTGTTGTGGGCTCAACATCATCCACGCTTACTGTTCGGTTCAACAGGAAATGTTTATTGATTCATTTCCTTACAAGGTCATAAGGCCAGTTAAGTCAGGCTCACAGGGTAGGTAGGTTGCATTTTGCTGTTC--GTTCAGCTATTGGGGTGCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 397691 204 + 647215 TTGGTGGCAACAATTGACTTGATGCAGGTGGGCAATGATGATAGAACCTTTGTTGTGGGCACAACATCACCGCCGCTTACTGTTCAGTTCAACAGGAAACATTTATTAATTCATTTCTTTACAAAGTCCTAATGCAAGTAAAGTCAGGCTCACAGAGTAGGTAGGTTGCATTTTGCTGTTCTAGTAGAGCTATTAGAGTGCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 251064 137 + 294542 GCGGCTTGGAGGTCATAGCTTTCAGACTTTTAGCTCATGAGCTCTGGAGGGTTGGCAGGGATAATGGGGGTATAAACATGGGGAGCAGAGGAAATGATGTCAGCAACACAACCAAACAACTGAAGTATAAGGTCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397489 137 + 636262 GCAGCTTGAAGGTCATAGCTTTCAGACTCTTAGCTCATGAGCTCTGTAGGGTTGGCAGGGATAACGGGGGTATAAACATGGAGAGCAGAGGAAATGATGTCTGCAACACAACCGAACAACTGAAGTGTAAGGTCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 397907 137 + 647215 GCGGCTTTGAGGTCATAGCTTTCTGACTTTTACCTTATGAGTTCTGGAGGGTTGGCAGGGATAATGGTGGTATTAACATGGGGAGTAGAGGAAATGATGTCAGTAACACAACCAAACAACTGAAGTATAAGGTCTAA - -a -s mr.mrrefChr5 251201 225 + 294542 ATGAATTCTCATATTACAGTTGAGCCCCAACCTGCATCACCGAGTATAAGAGTTTGGTGTCAAATACTATGCAGCTGATCTGCTCCAAACATACTTCCAATCAGTTCACTAGGTTAAGAATAATGGATAAGCTCTACTTGAGTTGTCTGGGAGCTTAAGTTGAACCTGAGCTAACAGTGAACCTGCATAAAATTAGGACTAAAGAGCTGTAGAGAAGGGATACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397738 218 + 636262 CCAAATTCTCATATTACAGTTGAGCCCCAACCAGCATCACCGAGTATAAGAGTTTGGTGTCAAATACTATGCAGCTGATCTGCTCCAAACATACTTCCAGTTAGTTCACTATGTTAAGAATAATGGATAAGCTCTACTTAAGTTGTCTGGGAGCTTAAGTTGAACCTGAGCTGACAGTGAACCTGCATAAAATTAGGACTAAAGAGCTGTAGAGAAGG------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 398044 225 + 647215 ATGAATTCTCATCTTACAGTTGAGCCCCAACATGCATCATTGAGTATAAGAGTTTGGTGGTAAATACTATGCAGCTGATCTGCTCCAAACACACTTCCAATCAGTTCCCTAGGGTAAGAATGATGGATAAGCTCTACTTGAGTTCTCTTGGAGCTCAAGTTGAACCTGAGCTAACTGTGAACCTGCATAAAATTGGGACTAAAGAGCTGTATAGAAAGGATACAG - -a -s mr.mrrefChr5 251426 101 + 294542 AGGGGATACTCAATTTGCAATTATCTCAGAAATCTTAGAAGGGAGTTACAGCAATATATCCATCTTCAATCCTTGAGACACTAGGGGTTGGGACTAGATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397956 97 + 636262 ----GATACTCAATCTGCAATTATCTCAGAAATCTTAGAAGGGAGTTACAGCAATACAACGATCTTCAATTCTTGAGACACCAGGGGTTGGGACTAGATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 398277 101 + 647215 AGGGGATACTCAATTTGCAATTATCTCAGACATCTCAGACGGGAGTTACAGCACCATATCCATCTTGAATCCTTGAGACACTAGGGGTTGGGACTACATAT - -a -s mr.mrrefChr5 251527 155 + 294542 ATATTGGAGGCAAAAAGGGGTGCATTCAAGAACAAAAAAATTCTTGCATTAAAATATACTGAATTGCACAGTACTTACCTCTTTTGATATCATTGCTATCAGCCAATATAGCAAATGAATAAAGAGCTAAGATAAGGTTGCAAAAGTGCCGATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398053 155 + 636262 ACATTGGAGGCTAAAAGGGGTGCATTCAAGAACAGAAAAATTCTTGCACTAAAATATACTGAATTGCACAGTACTTACCTCTTTTGATATCATTGCTATCAGCCGAGATGGCAAATGAATGAAGAGCTAAGATAAGGTTGCAAAAGTACCAATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 398379 155 + 647215 ATATTGGAAGCAAAAAGGGATGCCCTCAAGAACAAAAAAATTCTTGCATTAAAATATATTGAATTGCAGAGCACTTACCTATCCTGACATCATTGCTATCAACCAATACAGCAAATAAATAAAGAGCTTAGATAAGGTTGCAAACATGCCGATAC - -a -s mr.mrrefChr5 251682 46 + 294542 AAGCCCGCAGTGGGAGGCTGCTGCATTTACAACCATTTCAGGAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398208 45 + 636262 AAGCCCGCCGTGGGAGGCTGCTGCATTTACAACCATTTCAGG-GCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 398538 46 + 647215 AAGTCAACAGTGGGAGGCTGCTGTGTTTACAACCATTTCAGGAGCT - -a -s mr.mrrefChr5 251728 4 + 294542 TGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398253 4 + 636262 TGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 398585 4 + 647215 TGGC - -a -s mr.mrrefChr5 251732 189 + 294542 TGGTGGCTAGTAGTGATATATACAATTTTGGTAGGCAGCAGAGTATTCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTGGCAATGACTACCATATGAGAAATGCAGGCAGTGTATTTCCCTTCAATATTCATGAGACAATAGTGCAAGTAATAATTTGTAGCCAGCAGGGCATTCAAGGAACATAGGAAGCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398257 189 + 636262 TGGTGGCTAGTAGTGATATAGACAATTTTGGTAGGGAGCAGAGTATCCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTGGCAATGACTACCATATGAGAAATGCAGGGAGTGTATTTCCCTTCAATATTCATGGAACAATAGTGCAAGTAATAATTTGTAGCCACCAGGGTATTCAAGGAACATAGGAAGTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398505 183 + 636262 TGGTGGCTAGTAGTGATATATATGATTTTGGTGGGTAGGAGAGTATGCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTG-CAATGACTACCATATGAGAATTGCAGGCTGTGTATTTC-----AATATTCATGAGACAATAGTGCAAGTCATAATTTGTAGCCAGCAGGACATTCAGGGAACATAGGAAGCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 398589 181 + 647215 TAATGGCTAGTACTGATCTATACAATTTTGGTAGGCAGCAGAGCATTCAAGACCCTCGAAAGTAGATTACATTGGCAACCACTACCAT--GAGAAACGCAGGCAGTG-ACGCA-----AATGTCCATGAGACAATAGTACAAGTAGTAATTCGTAGCCAGCAGGGCATTCAAGAAACACAGGAAGCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 251921 7 + 294542 CATTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398446 7 + 636262 CATTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398688 7 + 636262 CATTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 398771 7 + 647215 CATTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 251928 52 + 294542 GTATATGTAAACAGCTGATTAAAGGTGGACCACACTAGACAGGATGCCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398453 52 + 636262 GTATATGTAAACAGCTGATTAAAGGTGGACCACACCAGACAGGATGCCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398695 52 + 636262 GTATATGTAAACAGCTGATTAAAGATGGACCACACTAGACAGAATGCCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 398779 51 + 647215 GTATAT-TAAACAGCTGATTAAAGGTGGATCACACTAAACAGGATGACATAA - -a -s mr.mrrefChr5 251980 16 + 294542 TGACTTTTCAATATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398747 16 + 636262 TGACTTTTCAATATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 398830 16 + 647215 TGAATATGCAGTACCC - -a -s mr.mrrefChr5 251996 72 + 294542 GGGGCATGTTTACTCATTGGTATTAGCTTAGTAATCTGGATCAGAGTAATGACATGAATGAGCCACTCACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398767 72 + 636262 GGGGCATGTTTACTCATTGGTATTAGCTGAGTAATCTGAAACGGAGTAATGACATGAATGAGCCACTCACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 398846 52 + 647215 --------------------TATTAGCTTAGTAATCTGGATCAGAGTAATGACATGAATGAGCTACTCACAT - -a -s mr.mrrefChr5 252068 37 + 294542 TTGACCACAGCTACAGGTTAGGCATATAGCTGCTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398885 37 + 636262 TTGACCACAGCTACAGGTTAGGCATGTAACTGCTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 398898 37 + 647215 TTGAGCAGAGCTACAGGTTGGGCATATAGCCGCTACT - -a -s mr.mrrefChr5 252105 108 + 294542 GAAGTGATAGACCATTCTGTTTTTACTGCAGAGCCAAGAATAAAACTGAAGGGAGTAGGGTCTTCTTCAGCGTCAACTGGTAATCAAGAGGGCAAAGTGGTGTAGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398922 107 + 636262 GAAGTCATTGACCATTCTGTTTTTACT-CAGAGCCAAGAATAAAACTGAAGGGAGTAGGGTCTTCTTCAGCGTCAACTGGTAATCAAGAGGGTAAAGTGGTGTAGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 398936 108 + 647215 GAAGTGATAGACCATTCTGTTCTTACTGCAGAGCCAACACAAAAACTGAAGGGAGTAAGGTCTTCTTCAGCATCAACGGGTAATCCAGAGCGCAAAGCGGTGTCGACT - -a -s mr.mrrefChr5 252213 140 + 294542 GCTCATTGGAGTGAAGATGTGGTTAATGGACTACACCACCCCCTGACCCACCACTCCCAGATGAGGATTGTTATAGTCTTGTGTGCTAAGAGAATCCCCAGAATTTTACCCATATTGCATAATCCCCAGGTAAATTCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399029 140 + 636262 GCTCATTGGAGTGAAGATGTGGTTAATGGGCTACACCACCCTCTGACCCACCACTCCCAGATGAGAATTGCTATAGTCTTGTGTGCTAAGAGAATCCCCAGAATTTTACCCATATTGCATAATTCCCAGGTAAATTCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 399045 138 + 647215 GCCTATTGGAATAAAGATGTGCTTAATGTACTACACCACCCCCTGACCCACCACTCCCAGATGAGGGTTGTTAAAGTCATG-GTGCTAAGAGA-TTCCCAGAATTTTACCCATATTGCATAATCTCCAGGTAATTTCAAC - -a -s mr.mrrefChr5 252353 82 + 294542 ACCCTTCAGGATTTCATCACCAAAATTAGCACTCCTTACTTCACAATTGTATAGTGTCATAAGGTGAAGTAGAAAAGGAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399169 82 + 636262 ACCCTTCAGGATTTCATCACCAAATTTAGCACTCCTTACTTCTCAATTGTATAGTGTCATAAGGTGAAGTAGAAAAGGAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 399184 82 + 647215 ACCCTGCAGGATTTCATCACCAAAATTAGCTCTACTTACTTCACAATTGTACAGTGTCATAAGGAGAAGTAGAAAAGTAAGT - -a -s mr.mrrefChr5 252435 38 + 294542 TAGACCTTGGTCAGCATTCTTGTCTCATAAATGTTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399255 38 + 636262 TAGACCTTGGTCAGCATTCTTGTCTCATAAATGTTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 399266 38 + 647215 TAAACCTAGGTCAGCATTCTTCTCTTATAAATGTTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 252473 271 + 294542 TTTTTCACTAAGGGGCAATCTTCCATGGTGCTCTCAGGGATTAGTATGTGAGTCACATTGCCTTCTCATACCTCTTTATACTCTTTGCTAACTTTTCATGCAAAAACCATGTTGATATCTGGACTCTAATTATTCACATTCACAGACTAGAGATCTAATTAGTGAATACCCATGGCTCAATGTAATAGAGGAGAAGACAAACTCCAACCAGACTGTCAAAGAATACTGGTAGGAAAGACAGCTACACCAATTTGATGGCAGGTGTGGCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399333 271 + 636262 TTTTTCATTGAGAAGCAATTTTCCATGGTGCTCTCAGGGATTAGTATTTGAGTCACATTGCCTTCTCATACCTCTTTATACTCTTTGCTAACTTTTCATGCAAAACCCATGTGGTTATCTGGACTCTAATTATTCACATTGACAGACTAGAGATCTAATTAGTGAATTCCCATGGCTCAATGTAATAGAGGAGAAGACAAACTCCATCCAGACTGTCAAAGAAAACTGGTAGGAAAGACAGCTACACCAATTTGATGGCAGATGTGGCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 399304 268 + 647215 TTTTTCACTAAGGGGCAATCTTCCATGGTGCCCTCAGGGACTAGTATGTTGGTCAAATTGCCTTCTCATACCTCTTTATACTCTTTACTAACTTTTTGTGCAAAAACCATGTTGATATT--GTCTCTAATTATTCACATTCCCAGACTAGAGATCTAATTAGTGAATACCTATGGCCCA-TGTAATAGAGGAGAAGACAAACTCCAACCGGACTGTCAAAGAATACTGGTAGGAAAGACAGCTACACCAATTTAATAGCAGGTGTGGCGAA - -a -s mr.mrrefChr5 252744 268 + 294542 ATGAATTCTGCTAGATTATCTGAGAACTTATCAGGTGAGAGTGAGAGATGACAGATTGGGTTATTCGAGAGGCTCATGTGAGAGACAGCTGCTTGCTAACACATGATACTGGCAGTTCACAGTCACTGTAGCCTGAGGTTAGAAATCTAATAGGATCAATCTCCTCATGCAAGTTATTGATACAAACAACAAGAAGGCCTTCCATTGGATAGAAATGATGATGTCAACATACAGATAAATTTAGATTGGTTCCACTTCTAAGCCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399608 268 + 636262 ATGAATTCTGCTAGATTATCTGAGAACTTATCAGGTGAGAGTGAGAGATGGCAGATTGGGTTATCTGAGAGGCCCATGTGAGAGACAGCGGCTTGCTAACACATGTTACTGGCAGTTCACAGTCACTGTAGCCTGAGGTTAGAAATCTAATAGGATCGTTCTCTTCATGCAAGTTATTGATACCAACAACAAGAAGGCCTTCCATTGGATACAAATGATGATGTCAACATACAGATAAATTTAGACTGGTTCCACTTCTAAGCCCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 399572 268 + 647215 ATGAATTGTGCTAGATTATCTGAGAACTTATCAGGTGAGAGTGAGAGATGACAGATTAGGTTACTCGAAAGGCTCATGTGAGAGACAGCTGTTTGCTGACACAAGATACTGGCAGGTCACAGTCACTGTAGCCTGGGGTTACAGATCTAATAGGATCAATCTCCTCTTGCAATTTGTTGATACAACCAACAAGAAGGCCTTCCATTAGATAGAAATGATGAGATCAAAATACAGATAAATTTAGATTCATTCCACTTCTACGCCCAAA - -a -s mr.mrrefChr5 253012 154 + 294542 TCAGTTGCAAGACTTCACCAGTGGCCCTTGTCTATGTCTCAGTACTGGGGTCCACGGCTATCACACTATGGAGGTTATAGGATCTCAACAAGATACAGAACCTTTCTCAATTTAAAATAGGAGAGCACAAACAACAAACAAAGAGATAACAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399879 154 + 636262 TCAGTTGCAAGACTTCACCAGTGGCCCTTGCCTATGTCTCACTACCGGGGCCCACGGCTGTCACACTATGGAGGTTATAGGATCGCGACAAGATAGAGAGCCTTTCTCAATTTAAAGTAGGAGAGCACAAACAACAAACAAAGAGATAACAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 399840 145 + 647215 TCAGTTGCAAGACTTGACTGCTAGCACTTGTCTATGTCTCAGTACTGGGGTCCATGGCCATC-CATGACGGAGGTTGTAGGATCTCAACAAGATACGGAACCTTTCTCAATTTAAAATCGGAGAGCGCAAATAATAAACAAAGAG--------A - -a -s mr.mrrefChr5 253166 19 + 294542 CCTCTCAGATTGGGTGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400033 19 + 636262 CCTCTCAGATTGGGTGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 399986 19 + 647215 CCTCTCAGATTGGGTGATG - -a -s mr.mrrefChr5 253185 51 + 294542 CTGAAGGGTATCAAAACTTTTATCTTGTGAATGCTTATAAATTTGTTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400052 51 + 636262 CTGAAGGGTATCAAAACTTTTATCTTGTGAATGCTTATAAATTTGTTTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 400018 51 + 647215 CTGAAGGGTCTCAAGACTTTTATCTTGTGAATGCTTATAAATTTGTTTTAA - -a -s mr.mrrefChr5 253236 15 + 294542 TAAGATAGAACACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400163 15 + 636262 TAAGATAGAACACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 400069 15 + 647215 TAAGATAAAAGTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 253251 30 + 294542 ATTCCATTTCCATCTTGAGTCATAAATCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400178 30 + 636262 ATTCCATTTCCATCTTGAGTCATAAATCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 400085 30 + 647215 ATCCCATTTCCATCTTGAGTCATAAATATC - -a -s mr.mrrefChr5 253281 265 + 294542 GGGCTCTGTTACCTAGACAGAAACTGGGGTCTAGTTCTGGCTTAGGGGGGGTGCACCCAGGCAAAATCTATAGTGGTGCATTATCAGTCAGCGAGAAAATGAACACAGACCAGGGAGTAATTGTGCTGCATAACAGGGACAGGGGATACATCTCTGAATGCATACTTCCGACCTAAAAGGAGGTGGGGGATGCTAGTCCACAGAAGCTGCCAACCCCCAACCCCCTAGGGGAAAAGCCCTGATAATATGATACAGGACACTAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400212 265 + 636262 GGGCTCTGTTACCTAGACAGAAACTGGGGTCTAGTTCTGGCTTAGGGGGGGTGCACCCAGGCAAAATCTATAGTGGTGCATTATCAGTCAGCGAGAAAATGAACACAGATCATGGAGTAATTGTGCTGCATAACAGGGACAGGGGATACATCTCTGAATGCATACTTCCGACCTAAAAGAAGGTGGGGGATGCTAGTTCACAGAAGCTGCCAACCCCCAACCCCCTAGGGGAAAAGCCCTGATAATATGATACAGGACACTATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 400115 265 + 647215 GGGCTCCACTACCTTGTCAGAAACTGGGATCAAGTTCTGGCTTAGGGTGGATGCACCCAGGCGAAATCTATAGTGGTGCATTACCAGTCAGAGAGAAAATGAACACAGACCAGGGAGCAATTGTGCTACATAACAGGGATAGGGGATACATCTCAGAATGCATACTTCCAAACTAAAAGGAGGTGGGGGATGCTAGTCCACTGAAGCTGCCAACCCCCCATCCCTTAGGGTAACAGCCTTGATCATATGATACAGGACACTAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 253546 89 + 294542 GATGGAGAGATGATTCTTTACAGGCCTACACAAAGTGTCTTTTCTGGGGACAGATCACAGTTCATTCAACAGCCTAAGGATATGTGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400477 88 + 636262 GATAGAGAGAGGATTCTTTA-AGGCCCACACAATGTGTCTTTTCTGGGGACAGAAGACAGTTGATTCAACAGGCTAAGGATATGTGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 400387 89 + 647215 GATGGAGAGATGATTCCTTACAGGCCTACACAAAGTGTCATTTCGGGGAACGCATCACAGTTCATTCAACAGCCTAAGGATATGTGGAT - -a -s mr.mrrefChr5 253635 74 + 294542 TGACAGTGTATTTCAGCTGTATAATGATTGTTATTAGATTAATGAGAATCAAGGTATTAAATTTGATGCAAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400567 74 + 636262 TGACAGTGTAATTCAGCTGTACAATGATTGTTATTAGATTAATGAGGATCAAGGTATTAAATTTGATGCAAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 400476 74 + 647215 TGACAGTGTATTTCAGCCGTATAATGATTGTCATTAGATTAATGGGAGTCTAGGTATTGAACTTGATGCAAAGC - -a -s mr.mrrefChr5 253709 97 + 294542 ATACATTGACTCATGGTAGTCAttgcttggtgtacatatcctaaagttaatgactgactgccgtcatgacctgaatgttttgaggatggggcccttc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400642 97 + 636262 AGACATTGACTCATGGTAGTCAttgcttggtgtacatattctaaagttaatgactgactgccgtcttgacttgaaggttttcaggatggggcccttc -s simRat_chr6.simRat.chr6 400550 96 + 647215 ATAGTTTGACTCAGGGTAGTCAttgtttggtgtacatatcctaaagtta-tgactgactgtcatcaagacctgaatgttttgaggatggggcccttc - -a -s mr.mrrefChr5 253806 347 + 294542 aaagcttctttcacatacatatgctcacattttttgttaacccctcaagtagttgaagttgcacctttgtaaccaaactagggtagttatatgcaatccactgaaagagaacaatgacatggGTTtGCCAGCCTGCTAAGTGGAATGGGCCAAGGTTATGAATAGGATTCAGAGAAATATGTGCAAAGAACACTAAAAAAGATACAAAGAACAAAGAAACATATGCTGTGCTTCCTAATAAGCACCTTGGCTCCAGTACAGATATTTGTGATAGCTGTGAGGTGGAAATATCATCATATGTCTGAGACTTTAGTAAGTGGTGAGCTTGTTCTGGTAAGGGGAAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400754 347 + 636262 gaaacttcttcctcatacctatgctcacactttttgttagcccctcaagtggttgaagttgcacctttgtaaccaaactagggtaattatatgcaatccaCTGAAAGAGAACAATGACGTGTGTTTGCCAGCCTGCTAAGTGGAATGGGCCAAGGTTGTGAATAGGATTAAGAGAAATATGTGCAAAGAACACTAAAAAAGGTACAAAGAACAAAGAAACATATGCTGTGCTTCCTAATAAGCACCTTTGCTCCAGTACAGATGTTTGTGATAGCTGTGAGGTGGAAATATCATGATATGTCTGAGACTTTAGTAAGTAGTGAGCTCGTTCTGGTAAGGGGAAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 400646 346 + 647215 aaagcttctttcatgtacatatgctcacattttttgttaacccctcaagtagttgaagttgcacctttgtaaccatactagggtagttatatgcagtccactgaatgagaacaataacatggGTT-GCCTGCCTCTTAAGTGGAGTGGGCCAATGTTATGAATAGGATTCAAAGAATTATGGGCAAAGAATACTAAAAAAGATACAAAGAACGATGAAACATATGCTGTGCCTTCTAATAAGCACTTTGGCTCCAGTACAGGTATTTGTGATAGCTGTGAGGTGGGAATATCATCATATGTCTGAGACTTAAGTAAGTGGTGAGCTTGTTCTGGTAAGGGGAAAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 254153 6 + 294542 GTTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401101 6 + 636262 GTTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 400993 6 + 647215 GTTGGA - -a -s mr.mrrefChr5 254159 180 + 294542 TAGCCAACCAAGATAATCAAGAAACACTAAGGGAGTTTGATTAGATTATTAACAGTGAAAGAGTAACATCACCTGGTGACAACAATGGAACATGGATACCCACTGAGGTACCTAGCATGCATCATACATACTAATAGTACGATATTGCACTTAGTATAAAAGGGTGACATAGGATCAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401113 157 + 636262 TAGCCAACCAAGATAATCAAGAAACACTAAGGGAGTTTGATTACATTATCAACAGTCAAA-----------------GA------TGGAACATGGGTACCCACTGAGGTACCTAGCATGCGTCATACATACTAATAGTATGATACTGCACTTAGTTTAAAAGAGTGACATAGGATCAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 400999 180 + 647215 CAACCAACCAAGGTAATCAACAAACACTAAGAGAGTTTGATCAGAACATTAACAGTGAAAGAGTAACATCACCTGGTGACAACAATGGAACATGCATGCCCACTGAGGTACCTAACATGCATTGTACATACTAACAGTACGATATTGCGGTTAGCATAAAAGGGTGACATAGGATCAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 254339 8 + 294542 TGCAAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401272 8 + 636262 TTCAAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 401179 8 + 647215 TGCAAGTG - -a -s mr.mrrefChr5 254347 213 + 294542 AACCATGATTGCCATTAAGGCTCCTATTGCTCTGTCTTAAGTAATAAGGGGTTAACCCTCCTCAACTGGGGTGTTATGTAATTGCACTTCATCCTTTCTACTGTGCTCTAACATATGTTACACTAAAGTGCTATTTGAGTGACCTGGAGTCACCTGACATTATAACTATAAAAAATTACCTGGAAGTAGAATGTCCTTAAGGAAACTCTGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401308 211 + 636262 AACCATGATTGCCATTAAGGCTCCTATTGCTCTGTCTTAAATAATAAAGGGATACCCCTCCTCACCTGGGGTGTTATGTAATTGCATTTCATCCTTTCTACTGTGCTCTAACATATGTTACACTAAAGTGCTATT--AGTGACCTGGAGTTACCTTACATTATAATTATAAAAAGTTACCTGGAAGCAGAATGTCCTTAAGGAAACTCTGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 401187 213 + 647215 AACTATGATTGCCATTAAGGCTCCTATTGCGCTGTCTTATGTCATAAGTGGTTAACCCACCTCAACTGGGGTGTTATGTAATTGCACTTCATCCTTTCTACTGTGCTCTAACATATGTTACACTAAAGTACTATTTGAGTGACCTGGAGTCACCTGATATTATTACTTTAAGAAATTACCTGGAAGTAAGATGACCTTAGGGAAACGCTGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 254560 209 + 294542 CATGACAGGACAGCTGCAATCTCAACAAAGGGAGTTGTACAATGCTTAAGTCTTGAACCTTGGGGAAGAGCTAGTTGTGTGTGCACTTCACCAGTAACCAAGCACCTGCTGAGTGGAGTTCTGGATTTCTGTAAGGAAACTGGAATAAATGTGTGCATATTAGTACAATGATTCGTAATTTAGAAGGCATTAGACATGAGAGGATACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401519 209 + 636262 CATGACAGGACAGCTGCAATCTCAAGAAAGGGAGTTATACAATGCTTAAGTATTGAACCTTGGGGAAGAGCTACTTGTGTGTGCACTTCACCAGTAACCAAGCACCTGCTGAGTGGAGTTCTGGATTTCTGTAAGGCAACTGGAATAAATGTGTGCATATTAGTACAATGATTCGTAATTTAGAAGGCAGTAGACATAAGAGGATACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 401401 209 + 647215 CATGACAGAACAGCTCCAATCTCAACAAAGGGAGTTGTAAAATGCCTAACCCTTGAACCTTCAGGAAGAGCAAGTTGTGTTTGCACTTCATCGATAACCAAGCACCTGCTGAGTGGAGTTCTGGGTTTCTGTAGGGAAACTGGAATAAATGTGTACATATTAGTACAATAACTCATAATTTCGAAGGCATTAGACATGAGAGGGTACCC - -a -s mr.mrrefChr5 254769 106 + 294542 ATGAATAAGCAAGAGGTGGGAGCTACATACATCTTAACCCCCCTCTCTGCCTAAGCATAATAGTCCCTGTGGTTGTTCCGGGTAATTAGAGGGAGTAGTATAGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401744 106 + 636262 ATGAATGAGCAAGAGGTGGGAGCCACATGCTTCTTAACCCCCCTCTCTGCCTAAGCATAGTAGTCCCTGTGGTTGTTACAGGTAATTAGAGGCAGTGGTATAGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 401610 106 + 647215 ATGAATAAGCTAGAGGTGGGAGCTACATACATCTTAACCCCCCTCTTTTCCTAAGCATAATACTTCCTGTGGTAGTTCCGGGTTATTAGAGGGAGAAGTAGAGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 254875 293 + 294542 TGATTGTTTTTGAAATGAGGATTGCCCTTAAACATCTCCTTGCAAAGTTTTTGGCAACCTAAATGCACTTCAGAACCTAGACTTCTTCACAGACTGAAAATTTTTGGGTCATGGGTCTGGCTTGCAATGCCCAACTACAAATATGCAGCCAGCAGTATTAAATGCAGACTGGGAAAGATTAGATATTGATTCCCAATCATTGTCCTTCATCTTGCTATTACCCAGGATGGAAATAAACAAATACGACTTATAAATGTAGGGGCTTAATGATACTCAAGTTAGGAACCTCAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401850 289 + 636262 TGATTGTTTTTGAACTGAAGATTGCCCTTAAACATCTCCTTGCAAAGTTTTTGGCAACCTAAATGCACT----AACCTAGACTTCTTCACAGACTGAAATTTTTTGGGTCATGGGTCTGGCTTGCTATGCCAAACTACAAATATGCAGCCAGCTGTACTAAATGCAGACTGAGAAAGATTAGATATTGTTTTTTAATCATTGTCCTTCATCTTGCTATTACCCAGGATGGAAATAAACAAATACGACTTATAAATGTAGGGGCCTAATGATACTCAAGTTGGGAACCTCAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 401717 290 + 647215 TGATTGTTTTTGAAACGAGGATTGCCCACAAACATCTCCTTGCAAAGTTTA---CAACCTGAGTGCCCTTCAGAACCCAGACTTCTTCACAGACTGAAAATTTTTGGGTCATGGGTCTGGGTTGCAATGCCCAACTACAAATATGCAGCCAGCAGTATTAAATGCAGACTGGGCAAGATTAGATATTGATTCCCAATCATTGTCCTTCATCTTGCTAGTACCCAGGATGGGAATAAATAAATACGACTTACAAATGTAGGAGCTTAATGCTACTCAAGTTAGGAACCTAAAAC - -a -s mr.mrrefChr5 255168 17 + 294542 ATCCCTGCCAGCATCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402140 17 + 636262 ATCCCTGCCAGCATCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 402007 17 + 647215 ATCCCTGCCAGCATCCC - -a -s mr.mrrefChr5 255185 32 + 294542 TGCCAGTACAATAATAGAGATTAACACTTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402161 32 + 636262 TGCCAGTACAATAATAGAGATTAACACTTGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 402024 23 + 647215 TGCGAGCACAATAA---------GCACTTGGG - -a -s mr.mrrefChr5 255217 83 + 294542 ATTCCCTGAGGAAGTCTCCAATTTGCATCTGACTTTCTGACTTCATAAGGAGACAGAATTGGAAGGTGAGGGTAGGGGTGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402193 83 + 636262 CTTTCCTGAGGAAGTCTCTAATTTGCATCTGACTTTCTGACTTCAAAAGGAGACAGGATTGAAAGGTGTGGGTTGGGGTGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 402048 83 + 647215 ATTCCCTGAGGAAGTCTCCAATTTGCATCTGACTTTCTGACTTCGTAAGAAGACAGAATTGGAAGGCGAGGGTAGGTGTGGAA - -a -s mr.mrrefChr5 255300 104 + 294542 AGTTGCACAACCTGAAAAAATCATAGCTCTCATCTTGGGATCTTGTGTCACTATTGAATATCAAACACTTTCTTCTGACTATCCTGCTATGGCAAAATTTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402276 103 + 636262 AGTTGCACAACCCGAAAAATTCACAACCCTCATCTTGG-CTCTTGTCTCACTATTGAATATCAAACACTTTCTTCTGACTAGCCTGCTATGGCAAAATTTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 402148 102 + 647215 AGTTGCACAACTTGAAAAAATTATAGCTCTCATCTTGGGATCTTGTGTCACTATTGACC--CAAACACTTTCTATTGACTGTCCTGCCATGGCAAAATGTAATT - -a -s mr.mrrefChr5 255404 76 + 294542 CCACACATGTAGTCCTACAACCTGGCGATCTTCAAAGGATGCAGTTCTTTGATATGGGAGTTGATAGTTGATGCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402380 71 + 636262 CCACACATGTAG-----CAACCTGGCAATCTTCAAAGGATGCAGTTCTTTGATATGGGGGTTGATAGTTGATGCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 402250 64 + 647215 CCAATGATGTAGTCCTACAACCTGGTGATCTTCAAAGGATTCAGCTCCTTGATATGGAAGTTAA------------ - -a -s mr.mrrefChr5 255480 19 + 294542 GCGTCAGGCCTAAATAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402452 19 + 636262 GCGTCAGGCCTAAACAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 402314 19 + 647215 GCATCAGGCCTAACTAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 255499 403 + 294542 AAGCTATGACACTAAGTTGGGAATTGTGTATAACACCTGGCATTCCTCAGTTGATTTGGGAGCAAATCTGAATGGTGTAAGCTGGCTCTAGTATCGGATCCTCTTACCTATAGTGTAATCTTTGGAAAATCAGATGAACTTTGAGATCTGGAATACATAAATCCTGCCAAATAAGCAGCTGCTAACATAGCTAGTTATGTTGTTATACACCATAAATTAACCCAGTATGTGAAAGATAAGCCAATGAGGGTGGAATGAGGGTGGAATCAACTAATGAGCAGTTATGACTGTCTTGTAAGTAGAGGACATAGAATTTGGCCCAGGTGGTGTGTCCCTAGCTATCTCCCCTGCCAACCATCTCTTGATTTGTTGACCTACCTCCTAAAGTTACAGAACTCTAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402471 397 + 636262 AAGCTATGACACTAAGTTGGGAATTGTGTATAACGCCTGGCATTCCTCAGTTGATTTGGGACCAAGTCCGAATGGTGTAAGCTGGCTCTAGTATCGGATCCTCTTAGCCAT------ATCTTTGGAAAATCAGATGACCTTTGAGGTCTGGAATACATAGATCCTGCCAAATGAGGAGCTGCTAACATAGCTAGTTATGTTGTTATACACCATAAATTAACCTGGTATGTGAAAGATGAGCCAATGAGGGTGGAATGAGGGTGGAATCAACTAATCAGCAGTCACGACTGTCTTGTAAGTAGAGGACATAGAATTTGGCCCAGGGGGTGTGTCCCTAGCTAGCTCCCCTGCCAACCATCTCTTGATTTGTTGACCTACCCCCTAAAGTTACAGAACTCTAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 402334 402 + 647215 AAGCTGTGATGTTAAGTTGAGAATTGTGTATAACACCTGGCCTTCCTCAGTTGATCTGGGAGCAAATCTGATTAGTGAAAGCTGGCTCTAGTATTCAATCCTGGTACCTGTAGTGTAATCTTTGGAAAATCGGATGAAATTTGAGATCCAGAATACATAAATCCTGCCTAATAACCAACTACTAACAAAGCAAGTTATGTTGTTATACACCATAAATTAAGCCAGTATGTGAAAGATAAGCCAATGAGGGCAGAATGAGGGTGTGATCATC-AATGAGCAGTTATGACTGTCTTGCAAGTGGAGGATATAGAATTTGGCCCAGGTGGTGTGCCCCTAGCTATCTCCCCTGCCAGCCATCTCTTGATTTGTTGACCTACTTGCTAAAGTTACAGAACTCTCAGT - -a -s mr.mrrefChr5 255902 161 + 294542 ATGGAACTCTCCCATGATATTGTTGCTCAAGACTTAGTACATCTTTCTCACCAAAAAGATAAAGTGTAGTTTGTCTATGAGGTCCTGGACTTGATAGCTATTAAATGTGGCTCTGGGGAGTGATCAAGAGCTGGGACATATATTAGCATTTTAACCACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402869 157 + 636262 ATGGCCCTCTCCCATGATATAGTTGCTCAAGACTTAGTACATTTTTCTCAGCAACAAGATAACGTGTAGTTTGTCTATGAGGCCCTGGACTTGACAGCCATTAAATGTGGCTCTGGGGAGTGATCAAG----GAGACATATATTAGCATTCTAACCACATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 402736 157 + 647215 ATGGAACTCTTCCATGATATTGTTGCTCAAGACTCAGTATATCTTTCTCACCAAAAAGATAGAGTGTAGTTTGTCTATGAGGTCCTGGACTTGATAGCTATCAAATGTAGCTCTGAGGAGCGATCAAGAGCTGGGAGATATATTAGCATTT----AGCATT - -a -s mr.mrrefChr5 256063 25 + 294542 GGACACTCTTTCCCCATTTCCAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403026 25 + 636262 GGACACTCCTTCCCCATTTCCAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 402894 25 + 647215 TGACACTCTTTCCCCATTACCAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 256088 11 + 294542 AAGACAAGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403052 11 + 636262 AAGACAATGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 402919 7 + 647215 ----CAAGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 256099 199 + 294542 TGAGGCTGGTCATGATACATGATAAACGTTTGTGAGTGAGTCATTGCTAGACAAGGCAGCATTAATTATCCATGATTCAAGGGTTATAGGAGTTGTCAGTTGAGTGTGTATTTATAGGCCTTTCTAGTAAATTGAAATACTAACTCCCCTGTACAGGCACACCCAGACTAGCCCTATCGAGTGGATGAAATTTAACTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403340 199 + 636262 TGGGGCTGGTCATGATACATGATAAACGTTTGTGAGTGAGTCATTGCTAAACAAGGCAGCATTACTTATCCAAGATTCAAGGGTTATAAGAGTTGTCAGTTGTGTGTGTATTTATAGGCCTTTCTAGTAAATTGAAATGCTAACTCCCCTGTACAGGCACATCCAGACTAGCCCTATCGAGTGGATGAAATTTAACTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 402926 198 + 647215 TGAGGCTGATCATGATACATGTTAAACATTTGTGAGTGAGTCATTACTAGACAAGGCAGCAT-AATTATCCATGATTTAAGGGTTATAGGAGCTGTCAGTTGAGTGTGTATTTATAGTCTTTTCTAATAATTTGGAACACTAACTCCCCTGTACAGACACACCCAGACTAACGCTATCGAACAGGCTAAATTTAACTGC - -a -s mr.mrrefChr5 256298 77 + 294542 AAAGATAGCATAATATTCAGGGAATGTGGGCATGGACTATATATATTCTACCCTACTTTCATCTCGCCGAGCATCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403540 76 + 636262 AAAGATAGCA-AATATTCAGGGGATGTGGGCATGGACCATCTATATTCTACCCTACTTTCATCTCGCCGAGCATCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 403124 66 + 647215 AGAGATAGCATAATACTCGGGGAAAGTGGGGACGGACTATATATATGCTACCCTACTTTCAGC-------GCA---- - -a -s mr.mrrefChr5 256375 425 + 294542 GCTGAGCAGAGATAATTATGTATAAACATAGTAAGACTATTGCCCAACTATTGAGTATCACATGTGGTCTCTCAAGGATGCAGGATCCTGATCAGTCCAACTGAGAGCTGGGAGGAACTTTAGCTTTTATGAGTATGAGAAACTAGTTAGGGTTGTTAATATGGTTTGAAAACCAGACTATTAGTGAGGTTTTTGGTCAGTGGTGACACCTGTAATGCACAGCAGCACAGTGGGATTCAGTTGTGGCTAATATTCTATCATTGTACAGGTGTAATCTTCTTAAGCAAAGTAGGGTTCTTTCAGTAGCCCCAGTGGTGACTCCTAACCTTAAAGCCAGCTTACAAGCATAGTTAGCAGATTAGCTTTGAGCAAGGTAACACCATACATCTTATAACACCCTCATTCAGGATGCTGATAGGATGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403617 403 + 636262 GCTGAGCAGAGATAATTATGTATAAACATGGTAAGACTATTGCCCAACTATTGAGCATCACATGTGGTCTCTCAAGGATGCAGGATCCTGG--------ACTGAGGGCTGGGAAGAACTTTAGCTTTTATGAGTATGAGAAACTAGTTTGGGTT----------TTTGAAAACCAGACTATTAGTGAGCTTTTTGGTCAGTGGTGACACCTGTAATGCACAGCAGCACAGTGGGATTCAGTTCTGGCTAATATTCTACCATTGTACAGGTGTAATCTTCTTAAGCAAAGTAGGGTTCTTTCAGTAGCCCCAGTGGTGACTCCTAACCTTAAAGCCAACTTGCAAGCATAATCAGCAGATTAGCTTTGAGCAAGGTAACACCGTACATCTT----CACCCTCATTCAGGATACTTATAGGATGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 403190 379 + 647215 -----GCAGAGATAGTTATGTAGAAACAGAGTAAGGATATTACCCAACTATTAAGTGTCATAGACGGTCTCTCAAGGATGCAGGATCCTGATCAGTCCAACTGTGAGTTGGGCGGAACCTTAGCTTTAATGAGTATGAGAAACTACTTAGGCTGGTTAATATGGTTTGAAAACTAGACTATCAGTGGGGTTTATGGTCAGTGGTGACACATGTAATGCACGGCAGCACAGTGAGATTCAATCGTGGCTAATATTCTATCATTG--CAGGTGTA---------------------------------------TGGTGACTCCTAACCTTAAAGCCAGCTTACAAGCATAGTTAGCAGATTAGCTTAGTGTAAGGTAACACCATATATATTATAACTCCCTCATTCATGATGCTGATAGGATGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 256800 98 + 294542 ACTATTTATAGCCATCCAGATAGTTCTAACAGTTTTTATGTTCGTCCTTTGGCCTCAATGGTGAATGCAGAGAAAATGGCGATTCCACAGATAACACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404021 98 + 636262 ACTATTTATAGCCATCCAGATATTTCTAACAGTTTTTATGTTCATCCTTTGGCCTGCATGGTGATTGCAGAGAAAATGGTGATTCCACAGATAAGACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 403569 98 + 647215 ACAATTTATAGCCATCCAGATAGTTCTAAGAGTTTTTATGTTGGTTCTTTGGCCTCAATAGTGAATGAAGAGAAGATGGCGATTCCACACATAACATG - -a -s mr.mrrefChr5 256898 132 + 294542 GATAAATTTCGTCCTCAATCAGCGCCCCTGGTACAATATAGTTGGCTGCAGAGTTACCAACAGTGGTTTTGGGAGAGCTGATATGTTGGAACAATCCCTTAACCTATTCTGTAGGGGAATTCAGCAAGAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404119 132 + 636262 GATAAATTTCGTTCCCAGTCAGCGCCCCTGGTACAATATGGTTGTCTGCAGAGTTACCAACAGTGGTTTTGGGAGGGCTGATATGTTGGAACAATCCCTCAACCTATTCTGTAGGGGGAGTCAGCAAGACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 403682 132 + 647215 GATAAATTTCCTCCTCAATCAGCTCTCCTTGTAGAATATAGTTGGCTGCAGTGTTAGCAACAGTGTTTCTGGAACAGCCATTGTGTTGGAACAATCTCTTAACCTATTCTGCAGAGGACTTCAGCAAGAGCA - -a -s mr.mrrefChr5 257030 106 + 294542 GTACGCAGTATGTGGATATTCAAGTAGTTGGAGTCTAGAAGCAGCATCCTTCACAGTTCTTGGCTTTGGCTGCAATAACAGTCAGTACGATCAAGAACGTTTGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404251 106 + 636262 GTACGCAGTATGTGGATATTCAAGTAGTTGGAGTCTGGAAGCAGCATCCTTCACAGTTCTTGGCCTTGGCTGCAATAATGGTCAGTACGATCAAGAATGTTTGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 403817 98 + 647215 GTACGTACTACGTGAATATTCAAGAAGTTAGAGTCTAAAAGAAGCCTCCTTCAC--------GCTTTGGCCGCAATAACAGTCAGTATGACCAAGAACATTTGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 257136 254 + 294542 GCTCTAATTGTACCTCATGCTGATTTATCTCCAGACTACTCACTCTGCCGTACTCGCTTGTAGTTGTGGAGCTGAGCACATCCATAGGTATACCCTACAATAATCCGAGGGTGAAAGCACCATCCCTAGCTCTATGTGTCAGTCATGCTAGTGCTCACTAAACTCACACTGGCAAAACTTATGGAAAGATAGCTTGGTGGGGACACCAAAGCATATCAGTGACACAACACCCAGCAGATCAAATAGCCCAGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404358 254 + 636262 GCTCTAATTGTGCCTCATGCTGATTTGTCTCCAGATTACTCACTCTGCCATACCCATTTGTAGTTGTGGGGCTGACCACATCCATAGGTACACCCTACAATAATCCGAGGCTGAAAGTGCCATCACTAGCTCTATGTGTCAGTCATGCTAGTGCTCACTAAACTAGCACTGGCAAAACTTATGGAAAGATAGCTCGGTGGGGACACCAAAGCATATCAGTGACACAACACCCAGCAAATCAAATAGCCCAGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 403915 254 + 647215 GCTCTAATTGTACCTCATGCTGATTTATCTCCAGTCTACTCACTCTGCCGTACTCGCCTGTAGTTGTGGAGCTGAGTGCACCCATAGGTATAGCCTACAATAGTCCGAGGGTGAAAGCACCATCCCTGGCTCGATGTGTCAGTCATGCTAGTGCTCGCTTAAATCACACTGGCAAAACATATCCAAAGATAGCTTGGTGGGGACACCTATGCATATCAGTGACACAACACCCAGCAGATCAAATAGCCCAGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 257390 121 + 294542 TAAAAAAAATGGCAATATATGCTGTAAGGGTGTTAGTGAGCCGAAGAATAACCTGAGAACATCAGTAAGTGTCAACAGCTAGTGATAATAAAATCACAACCCAGCCAGTTCCAGAAGAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404619 108 + 636262 TAAAAAAAATGGCCACATATGCTGTAACGGTGCTAGTGAGCCGAAGAATAACCTGAGAACTTCACTAAGTGTCACC------------TAAGTTCACAACCCAGCCAGTTC-AGAAGAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 404169 121 + 647215 CAAAAGAAATGGCAGTATATGTTGTAAGGGGGTTAGTGACTCAAAGAATAACCTGAGAACATCAGTAAATGTCAACAGCTAGTGATAATAAAAGTACAACCCAGCCAGTTCCAGAAGAACC - -a -s mr.mrrefChr5 257511 82 + 294542 CCCAAGATACATTGATACACTGGAAGGGAGCATCGTGTTTGGGACTATGCTGATTTAGTTGAGAGCCAGCTGTTAAAGTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404734 82 + 636262 CCCAACATGCATTGATACACTGGAGGGGAGCATTGTGTTTGGGACCATGCTGATTTAGTTGAGAGCCAGCTGTTAAAGTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 404290 82 + 647215 CCTATGATACATTGATACCTTCATAGGGAGCATCATATGTGGGACTATGCTGATTTAGTTGAGAGCCAGCTGTTAAAGATAG - -a -s mr.mrrefChr5 257593 19 + 294542 CAAATGTAGACGACTGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404816 19 + 636262 CAAATGTAGACGAGTGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 404374 19 + 647215 CAAATATAGTCAACTGCCC - -a -s mr.mrrefChr5 257612 363 + 294542 TGAATTTGGCCTAGACAATTAATACATTGTTTGATTGGCAATTAACCCAGTGATTATTTGATAATGTGACAATAATCCAGCCCACAGGAGATTACATGCCTTCCCCATGAGAGTGGGTGACTGACAGTCCAGCCTACTAGTGCACTATTGATTGTGTAGGGTACCCTTACCTGGTTGCTATCTGTTCTAATTAAAACCTTCTAATTGATGCTAAGATGGCATGGAACGCAGTGAAAGAATCTGGTTCAAATATGTGTGATACTATTAAGAGTTGAACTCTCTAGCCAGCCACCCTAATTTGTACCTTCTGCTTTTTGATAGTTTTCCATTTATATTCCCCTGCTTTTTCTGTTAATACTGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404837 361 + 636262 CGAATTTGGCCTAGACAATTAATACATTGTTTGATTGGCAACTAACCCAGTGAGTATTTGATAACGTTATAATAATCCAGCCCACAGGAGATTACATGCCTTCCCCATGAGAGTGGGTGACTGACAGTCCAGCCTACTAGTGCACTATTGAT-GTGTAGGGTACCCTTACCTGGTTGCTATCTGTTCTAATTAAAACCTTCTAATTAATGCTGAGATGGCATG-AACGCACTCAAAGAATCTGGTTCAAATATGTGTGATAATATTAAGGGTTGGACTCTCTAGCCAGCCAACCTAGTTTGTACCTTCTGCTTTTTGATAGTTTTCCATTTATATTCCCCTGCTTTTTCTGTTAATACTGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 404393 312 + 647215 TGAATTTGGCCTAGACAATTAATACATT------TTGGTAATTAACCCAGTGATTCCGTGATAATGTGACAATAATCCAGCCAACGAGAGACTACATCCCTTCTCCATGGGAGTGTGTGACTGACAATACAGCCTACTAGTGCACTATTGATTGTGTGGGGTACCCATACCTGGTTGCCCTCTGTTCTAATTAAAACCTTCTAATTGATGCTAAGATGGCATGGAATGCAGTGAAAGAATCCAGTTCAAACATGTGTGATACCATAAAGAGTTGAACTCTCTAGCCAAGCACCCTAATTGCTACCTTATACTATCTGA--------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 257975 8 + 294542 AGTTGGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405203 8 + 636262 AGTTGGAA - -a -s mr.mrrefChr5 257983 6 + 294542 ACCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405213 6 + 636262 ACCCAT - -a -s mr.mrrefChr5 257989 34 + 294542 GTAGGGCCTTCAAAGGTCAGGACCACCTATCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405222 34 + 636262 GTAGGGCCTTCAAAGGTCAGGACCACCTATCTCT - -a -s mr.mrrefChr5 258023 3 + 294542 GCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405258 3 + 636262 GCT - -a -s mr.mrrefChr5 258026 152 + 294542 TCTGCTCCTTGTGTCCCTATATGTCACTTCATCATCAACACTTTCATGAGATCATGTAAAACCCCTTAAATTGGTGGGAATAAGGGCACAATCCTAAAAGTATCAATATTGCCACATTTTTGTCTTTCATATTCAAAGGTCCATTTATCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405262 152 + 636262 TCTGCTCCTTGTGTCCCTATATGTCACTTCATCATCAACACTTTCATGAGATCATGTAAAACCCCTTAAATTGGTGGGAATAAGGGCACAATCCTAAAAGTATCAATATTGCCACATTTTTGTCTTTCATATTCAAAGGTCCATTTATCATT - -a -s mr.mrrefChr5 258178 11 + 294542 AACATATTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405415 11 + 636262 AACATATTGCC - -a -s mr.mrrefChr5 258189 191 + 294542 CAATGATTCATTCAATTTAACACCCCTATTAAGTAAGGATGAATCCCCTTATTATGGATTATGATCACCCTAATCATGCTGTGTTTATGCCCTGTCTTTCTCATTACTAGGTGCAAACAGGAGTGCTGGGAGTTCTTGATCCCTTTGATAGACAGGTCCCATACATCTTTTCTTAGTGAGATTTACAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405443 191 + 636262 CAATGATTCATTCAATTTAACACCCCTATTAAGTAAGGATGAATCCCCTTATTATGGATTAAGATCACCCTAAACATACTGTGTTTATGCCCTGTCTTTCTCATTACCAGGTGCAAACGGGAGTGCTGGGGGTTCTTGATCCCTTTAAGAGACAGCTCCCATACATCTTTTCTTAGTGAGATTTACAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 404705 138 + 647215 -----------------------------------------------------ATGGATTATGATCACTCTAATCAAGCTGTGTTTATGCCCTGTGTTTCTCACTACTAGTGGCAAACAATAGTGCTGGGAGCTCTTGATCTCTTTGATAGACAGGTCCCATACATCATTCCTTAGTGAAATTTACAACAT - -a -s mr.mrrefChr5 258380 8 + 294542 CCTGTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405634 8 + 636262 CCTGTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 404861 8 + 647215 CCTGTATA - -a -s mr.mrrefChr5 258388 101 + 294542 ACCCCTTAAGTATTGGTTTGTATGCAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTAAATGAAATAGAGGTAATTCCTCGCCTAGTGACTAATACGGTGAGGCTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405642 101 + 636262 ACCCCTTAAGTATTGGTTTGCATACAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTCAATGAAATAGAGGTAATTCCTCGCCTAGTGACTAATACGCTGGGGCTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 404871 76 + 647215 ACCCCTTAAGTAT-GGTCTGTATGCAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTAAATA------------------------AGACTAATACGGTCAGGCTCCA - -a -s mr.mrrefChr5 258489 127 + 294542 TGTAATCCATGCCACTACGCATCTCCTTAGTGATCATCTCTACAATGTAGATTTCATGTAGTTGCAAAATTCTACCAATTATGTGGTGTCTTTATCTTACATTAATTAATTCGAGCAAATATAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405747 120 + 636262 TGTAAACCATGCCACC-------TCTTAGGTGATTGTCTCTACAATGTAGATTTCATGTAGTTGCAAAATTCTACCAATTATGTGGTGTATTTATCTTACATTAATTTATTCGAGCAAATATAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 404947 127 + 647215 TGTAATCCATGCCACTACGCATCTCCTTAGTGATCATCTCTACAACGGAGATTTCATGTAGTTACAAAATTCTACCAATTATGTGGCGTCCGTATCTTACATTAATTAATTCATGCAAATATAAACA - -a -s mr.mrrefChr5 258616 396 + 294542 CATTTCTCTGGTCTACTAATTAGTATTTGAGATTAATAGTCTGTCAGCAATCCTGGCTGGCTGATATCTATGTCTATGCTGGCATAATTATGGTATACAGCTTCATCACTTCAGCAAACCAATAACAACTTTATTTAGGTGAGCAGGGAGGTAGAAGTGACAATCTTTTGGTGTGACTCTAACACGACTGACATGATCTTTTAGAATATGCCCATCAGATTCCATTCCACCTTGCATATGTACTGATGACCAATGCATTACCTGAGAGGAGTCAAGCTCTACTACATTAACTCTTAATAAGGCTCAATAAGTCCAGGGATTTGGACCATATATATAACCACTTCATAGTATCAAGGCTAGTACATCTCCATCACCACTAACTACTGGTATAGAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405868 383 + 636262 CATTTCTCTTGTCTACTAATTAGTATTCG-------------GTCAGCAATCCTGGCTGGCTGATATCTATGTCTATGCTGGCATAATTATGGTATGCAGCTTCCTCACGTCAGAAAACCAATAACAACTTTATTTAGGTGAGCAGAGAGGTTGAAGTGACAATCTTTTGGTGTGACTCTAACATGACTGACATGATCTACTAGAATATGCCCATCAGATTCCATTTCATCTTGCATATGTACTGATGACCAATGCATTACCTGAGAAGAGTCAAGCTCTACCACATTAACTCTTAATAAGGCTCAATAGGTCCAGGGACTTGGATCATATATATAACCACTTCATAGTATCAAGGCTAGTACATCTCCATCACCACTAACTATTGGTATAGAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 405074 388 + 647215 CATTTCTCTGGTGTGCTAATTGGTATTTGAGATTAATAGTCTGCTAGCAATCCTGGCTGGCTGATATCTATGTCTATGCTGGCATAATTATGGTATACAGCTTTATTACTTCAGCAAACCAAAGACAACTTTATTTAAGTCAGCAGGGAGGTAGAAGTGACGATCTTATAGTGTGACTCTAACACGACTGACATAATCTTTTAGAATGTCCCGATCAGATTCCATCCCACCTTGCATATGTGCTCATAGCCAATGCATTACCTGTGAGGAGTCAAGTTCTACTGCATTAGCTCTCAATAAGGCTCTATAAGTCCAGGGATTTGGACTATATATATAATCGCTTCATGATATC--------TATATCTCCATCACCACTTATTACAGGTATAGAGGA - -a -s mr.mrrefChr5 259012 83 + 294542 TCAGAATGAATCTAAGTACTGACATCGCTGATAGTCAGACACTACTCACTCTTTCACTAATTAAGGCCATTCTTTGTAATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406252 81 + 636262 TCAGTATGAATCTAAGTACTGACATCGCTGATAGTCAGACACTACTCACTCTTTCACTAATTAAGACCG--CTTCGTAATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 405462 83 + 647215 TCAGAATGAATCTAAGTGCTGACACCGCTGATAGTCAGACACTACTCAGTCTTTCACTAATTAAGGCCATTCTTTGTAATCAA - -a -s mr.mrrefChr5 259095 24 + 294542 GCATAGACCTCATACCAGCCATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406333 24 + 636262 GCATACACCTCATACCAGCCATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 405547 24 + 647215 GCATAGACCTCATACCAACCATAC - -a -s mr.mrrefChr5 259119 220 + 294542 CTTTAGTGACTATTATCTATACTTCCTAGAGTCAACATCTGTGATGTCTAAATCATACTGTGCATGCACATTGACTTCACCTCAGTATATACAATCCATTGTGCTGGTGTGCACAGTAGATTAAGTGCTTGTCTTATTTCAGGTAATTGTTAGCATGTTGTTGAAATATAGCATCCTAAACCTGGATCCCCTTTCTCTATAGCATAAACAGTTGGTTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406361 220 + 636262 CTTTAGTGACTATTATCTATACTTCCTAGTGTCAACATCTGTGATGACTAAATCATACTGTGTATCCACATTGACTTCACCTCAGTATATACAACCCATTGTGCTGGTGTGCACAGTAGATTAGGTGTTTGTCTTATTTCAGGTAATTGTTAGCATGTTGTTGGAATATAGCATCCTGAACCTGGATCCCCTTTCTCTATAGCATAAACAGTTGGTTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 405571 212 + 647215 CTTTAGTGAATATTATCTACACTTCTTAGAGTCAAGATCTGTGATCTCTAAATCATACTGTGCATGCACATTGCCTTCACCTCAGTATAAACAATCCATTGTGCTGGTGTTC------GATTCAGTGCTAGTCTTATTTCACTTAATTGTTAACACGTCG--GAAATATACCATCCTAAACCTGGATGCGCTTACTCTATAGGATAAACAGTTAGTTTCG - -a -s mr.mrrefChr5 259339 22 + 294542 ACCAGTTTGCTGCACCTGATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406581 22 + 636262 ACCAGTTTGCTGCACCTGATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 405785 22 + 647215 GCCGGTCTGCTGCACCTAATAG - -a -s mr.mrrefChr5 259361 137 + 294542 ATATCCTGACTTACTTAAACTTTTATTTTAGGGCTTAGCAGCAGCTCAACCACTATGTGATGTAATCTGCTGAGGGCAATGCAAAGAGCCTATTAGACTAGATATGTGTAATGTTGAGGTATACAGGTGGGAAACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406604 137 + 636262 ATATCCTGACTTACTTAAACTTTTATTTTAGGGCTTAGCAGCAGCTCAACCACTATGTGATATAACCTGCTGAGGGCGATGCAAAGAGCCTATTAAACTAGATATGTGTAATGCTGAGGTATACTGGTGGGAAACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 405807 136 + 647215 GTATCCTGACCTATTTAAACCTTAACTGTAGGGTTTAGCAGCAGCTCAGCTAGTAAGTGATGTAATCTGCTAAGGGCAATGCAATGAGTCTTTTAGACTACATATGTGTGCTGTTGAGGTATGCAGGT-GGAAACAC - -a -s mr.mrrefChr5 259498 193 + 294542 ATACATGATAGTATACCGATATCATCCTGGTGAAAACTTCCTGGCATAACCCCTAAGAGTGTTGGTAACACTTGTTTCTGCAACATAGTTTGGTGGCCTAACACACTTGAATGATCTACATATGTTTAGAAGTTCTAAATTGTTATCTCAAAAATGGAACATGTACATCCTGTGGCTGTGCAGTATGCGAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406741 192 + 636262 ATATATGATAGTATACCGATATCATCCTGGTGAAAACTTCCTGGCATAACCCATAGATGTGTTGGTAACTCTTGTTCCTGCAACATAGTTTAGTGGCCAATCACACTTGAATGAGCTACATATGTTCAGAAGTTCTAAATTGTTATCTCGAAAATGGAACATGTACAT-CTGTGGCTGTGCAGTATGCAAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 405944 178 + 647215 ATACATGATAG-ATACCGAAATC--------------TTCCTGGCATAAAGCCTAAGAATCTTGGTAACACTTGCTTCTGCAACATAGTTTGGTGGCCTAACACACTTGAATGATCTACATATGTTTAGATGTTCTAAATTGTTATCTCAAAAATGGAACATGTACATCCTGTCACTGTGCAGTATCTGAGGC - -a -s mr.mrrefChr5 259691 191 + 294542 ACAGTGATTCAGATTGCCATGTATCTCATGTATGAGTACCCTACCCACTAAAACATCTAGTGTCTTATCTGGAGTATAACTCCAGTTGGGCAGGAACTAGTTGAGTCTGGGCTCCAGATACTGCAGCTGATCCATATAACCATTGCACAAGCATCATAGCCAAAGATTACCATGAAATGACAAGATGAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406933 191 + 636262 ACAGTGATTCAGATTGCCATGTATCTCATGTATGAGTACCCTACCCACTAAAACATCTAGTGTCTTATCTGGGATATAACTCCAGTTGAGCAGGAACTAGTTGAGTCTGGGCTCCAGATACTGCAGCTGATCCATATTACCATTGCACAATCATCATTGCCAAACATTACCATGAAATGACAAGATGAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 413216 190 + 647215 ACAGCGATGCCAATTGGCATGTATCCCATGTATGAGTATCCTACCCACTAAAACATGTAGTGCCTCATCTGGAGTATAACTCCATTTAGGCAGGAACTAGTTGAGTCTGGGCTTCA-CTACTGCAGCTGGTGCATGTAACCATTGTACAAGCATCATAGCCAAAGATTGCCATTACATAACAAGATTGACA - -a -s mr.mrrefChr5 259882 202 + 294542 AGACAAGAACACTGGGGTTGCATGCCATATGGGACAGGGGAAGAGGCATGTAATTTCTACAAATTTCAGGTTATACCATGTCTGATAGTATGATCGGACTAAGGACTAAGATTAGAGATAAAGCCAGAATGGCCATTCAAGGATCCCTGACTATTTGAAAATACCACATTTTCACAGTCACAAAACTATTATGGAGAAAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407124 200 + 636262 AGACAAGAACACTGGGGTTGGATGCCATACAGGACAGGGGAAGAGGCATGTAATTTCTACAAAGTTCAGGTTATACCATGTCTGACAGCATGATCGGACTAAGGACTAAGATTAGAGATAAAGCCAGAACGGCCATTCAAGGATTCCTGACTATTTGAAG-CACCACATTTTCACCGTCACAAA-CTATTATGGAGAAAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 413589 196 + 647215 GGACAAGGACGCTGGGGTTGCATGCCATATGCAACCGGGGAAGAGGCATGTAATTTCTACAAATTTCAGGTTATACCATGTCTGCTAGTATGATCAGAGTAAGTACTAAGATTTGGAGTGAAGACAGCATGGCCATTCAAGGATCCCCAACTATTTGAAAATACCAC----TCACAGCCACAAAACTATTATGGAGAAAG-- - -a -s mr.mrrefChr5 260084 23 + 294542 GATGGGTTTGTGTTGTCTTGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407325 23 + 636262 GATGGGTTTGTGTTGTCTTGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 413785 23 + 647215 AAGGAGATTGTGTTGTCTTGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 260107 60 + 294542 GGATCCTATGGATGATTGGTTATCAAGATTTAAGCAAAAATAAAATACTAATTATTTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407348 59 + 636262 GGATCCTATGGATGATTGATTATCAA-ATTTAAGCAGTAATAAAATACTCATTATTTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 413809 60 + 647215 GGTTCCTATGGATGACTGGTTATCAAGATTTAACCAAAAATAAACTAGTAATTATTTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 260167 70 + 294542 GGGGTAATTCACTTTATGGAAGTATATAGTTACATTACTAGAGTTCTAGTAGAATAACCAGCAGAATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407407 61 + 636262 GGGGTAATTCACTTTATGGAAG-ATATGGTTACATTACTAGAGTTCTAGTAGAATAACCAAC-------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 413870 69 + 647215 GAGGTAATTCACTTTATGGAAGTATATAGTCAC-TTACTAGCGTTCTAGTGGAATATCCAGCAGAATCAT - -a -s mr.mrrefChr5 260237 196 + 294542 CACCTATTCCCTTTATAACAAAATCAATTTTATCTCCCAAATATGACATGTCTAAATTGTAAACTTCTAAATTATTTCTATTTTTCAAGCAGCCAGCCTGGATAAGAGGATTGCAAACCTCAATTGTTAGTATTCCACAGTCTGTTACCCAAGATGATTGTTGCCTCAAGGGCAATGGGAAGCTCCTACACTCAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407468 150 + 636262 -----------------------TCAATTTTATCTCCCAAATGTGACACGCCTAAATTGTAAACTTCTAAATTATTTCTATTTTTCAAGCAGCCAGCCTGGATAAGAGGATTGCTGACCTCAATTGTTAGTATTCCACAGTCTGTTACCCAAGATGATTGTTGTCTCAAGGGC----------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 413940 196 + 647215 CACCTATTCCCTTTATAACAAAACAAATTTTAGTTCCCAAATATGACATGTCTAAATAGTAAACATCGAAATTATTTTTATGTTTCAAGCAGCCAGCCTAGATAAAAGGATTGCAAATCTCAATTGTTAGTATTACCCAGTCTGTTACCCAAGATGATTGTTGCCTCATGGGCAATGGGAAGCTCCTACACTCAGC - -a -s mr.mrrefChr5 260433 11 + 294542 TACTATGTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 414137 11 + 647215 TACTATGTGGT - -a -s mr.mrrefChr5 260444 110 + 294542 AGTGATATTTAGCAATACGTTACATGAATTAGATCTACCAATACAGAGATTTCTTGTCTTCATGAGTAGTCATTTCACTTCTTTTTCTAAGCCCCCCACAGTCGCTGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407618 86 + 636262 ----------------------TGTGAATTAGATCTA--AATACAGAGATTTCTTGTCTTCATGAGTAGTCATTTCACTTATTTTTCTAAGCACCCCACAGTCGCTGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 414149 110 + 647215 AGTGATATTTAGCAATACGTTACATGAATTAGATCTACCAATACAGAAATTGTTTGTTTTCGTGAGTAGTCATTTCAGTTCTCTTTCTAAGCCATGCACAATCTCTGTCC - -a -s mr.mrrefChr5 260554 160 + 294542 TATCTTAGGTGCCTCCAAAATATAAAGCAGAACAGAAGCAATAGGTGAGCAGATATGAGGAATGGTTCTAGCCTTCTTTCACATCCCCAGGATTGACAATCCAGGTGGTGGATGCAGGAGAAGGGGTTCAGAGGTTTCCCAACCCCATAGACATGGTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407717 160 + 636262 TACCCTAGGTGCCTCCAAAATTTAAAGCGGAATAGAAGCAATAGGTGAGCAGATATGAGGAATGGCTCTAGCCTTCTTTTACATCCCCAGGGTTGATAATCCAGGTGGTGGATGCAAGACAAGGGGTTCAGAGGTCTCCCAACCCCATAGACACGGTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 414259 160 + 647215 TGTCTTAGGTGCCGCTGAAATATTAAATAGAACAGAAGCAATAGGTGAGTGGATATGAAGAAAGGTTCTAGTCTTCTTTCACATCCCCAGGATTGACAATCCAAGTGGTAGATGCAGTAGAAGGGTTTCAGAGGTTTCCCAACCCCATAGACATGGTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 260714 29 + 294542 GACCACCTCATTTACGCAGCAGGGGTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407877 29 + 636262 GACCACCTCATTTACGCAGCAGGGGTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 414420 25 + 647215 GACACCCTCAATTGCACAGCAGGGA---- - -a -s mr.mrrefChr5 260743 46 + 294542 ACGTTTATGAGCAAGCAAGTCGAATTTGCCTAGCTATGCTGTGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407909 46 + 636262 ACGTTTATGAGCAAGCAAGTCGAGTTTGCCTAGCTATGCTGTGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 414445 34 + 647215 -----------CAGGCAAGTGGAATTTGCCTAGCT-TGCTGTGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 260789 39 + 294542 GACATTCTCTGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGATTTCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407955 39 + 636262 GACATTCTCTGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGATTTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 414480 32 + 647215 GA-------TGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGACTTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 260828 160 + 294542 TGGAGAAGGTGTATTTGATTATGATCACCCTGCACCCCTGGTGTTTCCTCAAGAGCAAAGTAAGAGTGTTCCTGTACCAACAGACAGAACCTGTTGCAACAAATAGATCCTCACGGTTTTTGAGAGGTAAGGAAGCCTGTGGAGAGAGCCAATATACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 408001 157 + 636262 TGGAGAAGGTGTATTTGATTACGATCACCTTGCACCCCTGGTGTTTCCTTAAGAGCAGAGTAAGAGTGTTCCTGTACCAACAGACAGAACCTGTTGCACCAAATAGATC---ACGGTTCTTGAGAGGTAAGGAAGCCTGTGGAGAGAGCCAATATACATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 414512 156 + 647215 TGGAGAAGATGTATTTGATTATGCTCACTCTGCACCCCTCGTGCTTCCTCAAGAGCAAAGTGAGAGTATTCCAGTGCCAACAGA----ACCTGTTGCAACAAATAGAACCTCACTGTTTTTGAGAGGTATGTCAGCCTGTGGAGAGAGCTAATATACATT - -a -s mr.mrrefChr5 260988 606 + 294542 TAAGGTGAAAGGATGATTGAAGTGATTCTATGGCAAGTGATGCTATGGGCAGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTTCCCACACTACTAATGAATCATTGTCAGACATCCAATATAGCAGTTTATGGCATAATAGGTTGTACACACTATTGAGATCTGCTTGGTAAAGGGGCTAATGTGTGAAGTTAGCATAGAACAAGAATATTTATGATGGTATCTGAATTATTAACCTACTTTTGTGGTATTGGTCAATTATTTCACACTACAACTAAGCCTATACAAATATATTTATTATCGGATTACAGGGCAAGAACATTATTCAGAGAGTGGATTGTAGACTGAATTTCATTATAATAAGTCATAGAATAGTACTGGGGGTGAACAATTACAGCCCAAGATCTGAAATTGAGATCGTAATTGTGACTAGAGGTTTAAATTTACATTTTATTGTACACACATCACCTGCCCACTCTCATACCTTGGGCATTTTCAATAGACTACAATAAGTTTGTAAGTGGTTATTAATATGGTAGTCACTGCTAGAACTTGTGTTTCTATCCAAGCAGTTATGCAACTATGCAACTTCTGGTGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 408158 600 + 636262 TAAGGTGAAAGGATGATTGAAGTGATTCTATGGCAAGTGATACTATAGCCAGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTCCCCACACTACTAATGAGTTCACGTCAGACATCCAATATA-TAGTTTATGGCATAATAGGTGGTAC----TGTTGAGATCTGCTTGGTAAAGGTGC-AATGTGTGGAGTTAGCATAGAACAAGAATTATTATGATGGTATCTGAATTATTAAGCTACTCTTATGGTATTGGGCAATTATTTCACACTACAACTAAGCCTATACAAATATATTTATTATGGGATTACAGGCCAGGAACATTATCCAGAGAGTGGATTGTAGACTGAATTTCATTATATTAAGTCATAGAATAGTACTGGGCGCGAACAGTTACAGCCCAAGATCTGAAATTGGGATCGTAATTGTGACTAGAGGTTTAAATTTGCATTTTATTGTACATACATCACCTGCCCACCCTCATATCTTGGGCATTTTCAACAGACTATAATAAGTTTGTGAGTGGTTATCAATATGGTAGTCACTGCTAGAACTCGTGTTTCTATCCAAGCAGTTATGCAACTATGCAACTTTTGGTGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 414673 605 + 647215 TAAGGTAAAAGGATGATTGAGGTGATGCTATGGCAAGTGATGCTATGGGCGGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTTCCCACACCACTAATGGATCATTGTCAGACATCCAATATAGCAGTTTATGGCATAATAGGTTGTACACACTACTGAGATCTGCTTGGTGAAGGGGCTAATGTGTGAAGTTAGCATAGAACAAGAATATTTATGATGCAATCTGAAGTATTAACCTACTTTGGTGGTATTGCTCAAGTATCTCACACCGCAACTAAGCCTATACAA-TATATTTTTTGTCGGATTACAGGGAAAGAACATTAGTCAGAGACTGGATTGTAAACTGCATTTCATTACAATAAGTCATAGCATAGTACTGGGGGTGAACAATTACAGCCCAAGATCTAAAATTGAGATCCTACTGTTGGCTAAAGGTTTAAATTTACATTTTATTCTAGACACATCACCTGCCCATTCTCATACCTTGGGGATTTACAATAAACTGCAATAAGGTTGTAAGTGGTTATTAATATGGCAGTCACTGCTAGAACTTGTATTTCTATCCAAGCAATTATGCAACTATGCAACCTCTGGTGACC - -a -s mr.mrrefChr5 261594 61 + 294542 TTAAGGCAACATAACGCTGGGGTCACGTACTTATGACACCAGTCCCAGTATCTGAAAGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 408758 61 + 636262 TTAAGGCAATATAATGCTAGGGTCACATACTTATGACACTAGTCCCAGTATCTGAAAGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 415280 61 + 647215 TTATGGCAACATAACACTGGGGTCACGTACTTATGAAACCAGTCCCAGTATCTAAAAGTCT - -a -s mr.mrrefChr5 261655 313 + 294542 AGAGGCGATATTTTTTGCATGGTTGTCACAATATCAGCTTCTACATTGATACCAGATCAACCCTTGAAATGATCCAATTCTTACCACAGTTCTGGCATACTGCACAGAACTTGTGAGCTTAGTGAGTATTCCAACAATGTTGTAGGTCATAACTTGACATGCTAATGTGAGCTATAGTCATAGAATTGTCCGAAGAGTAAGCCCATTTTTCCATAATTTAATCTCCAGTACTGCGTCCCCTATCTATGGGTCTGGTGCAGTTTGCCCATTGGGATGAGATTAGTCTCTTAAACTGTTTAAGGCCTAGAATGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 408819 275 + 636262 AGAGGCTATATTTTTTGCATTGTTGTCACAATGTCAGCTTCTACATTGATACCAGATCAGCTCTTGAAATGATCCAATTCTTACCACAGTTCTGGCATACTGCACAGAACTTGTGAGCTTAGTGAGTATTCCAACAATGTTGTAGGTCATAATT--------------------------------------AAGAGTAAGCCCATTTTTCTATAATTTAATCTCCAGTACTGTGTCCCCCATCTATGGATCTGGTGCAGTTCGCCCATTGGAATGAGATTAGTCTCTTAAACTGTTTAAGGCTTATAATATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 415343 307 + 647215 AGAGGCGATATTTTTTGCGTG-----CACAAAATCAGCTTAGACCTTGGTACCAGATCAACCCATGAAATGCTCCATTTCTTACCACAGTTCTGGCATACTGCACAAAACTTGTGAGGTTAGTGAGTATTCCAA-AATGTTGTAGGTCATAACTTGACATGCTAATGTGAGCTATAGTCATAGAATTGTCCGAAGAGTGAGCCCATTTTACCATAATTTAATCTCCAGTACTGCGTCCCCTATCCTTTGGTCTGGTGCAGTTTGCCCATTGGGATGAGATTAGTCTCATAAGATGTTTAAGGCCTAGAAGGAT - -a -s mr.mrrefChr5 261968 63 + 294542 GTCATTGTGAGGACTCCTCAACAAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATGTTGATGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409095 63 + 636262 GTCATTGTGAGGACTCCTCAACAAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATGTTGATGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 415650 59 + 647215 GTCGTTGAGAGGACT----ATCTAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATATTGATGGG - -a -s mr.mrrefChr5 262031 117 + 294542 TGGCTATATGTCATGGGCTTTCCATTGGTCCCCAGTCATCAGATTAAATCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCATTACGTCTGATTATTTCCTTGAATAAAATACTGATTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409158 117 + 636262 TGGCTATATGTCATGGACTTTCAATTGGTCCCCATTCATCAGATCAAATCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCATTACGTCTGGTTATTTCCTGGAATAAAATACTGATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 415731 115 + 647215 TATCTGCATCTCATGGGCTTTCCATTGGTCTCCAGTCAT--GGTTGAACCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCACTATGTCTGATTATTTTCTTGAATAAAATACTGATTAT - -a -s mr.mrrefChr5 262148 19 + 294542 ATAGTGTGAAGCTTCCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 415849 19 + 647215 ATAGTGTGAAGCTTCCATT - -a -s mr.mrrefChr5 262167 90 + 294542 ATTTATATATGATTTGTTTTCAGATCTGCAGTTGAGCTACCTAAAGTCTTCAGGTTACACCATATAAAAACTCAGCTATGTGTCTCTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409275 86 + 636262 ----ATATACGATTTGTTTTCAGATCTGCAGTTGAGCTACCTAAAGTCTTCAGGTTACACCATATAAAAACTCAGCTATGTGTCTCTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 415870 82 + 647215 ATTTATATATGATTTGGTTTCAGATCTCCAG--------CCTACAGTCTTCAGGTTACACCATATAAAAACTCAGCTATGTGTTTCTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 262257 27 + 294542 GACTGCATAATGTGACACTGGAATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409361 27 + 636262 GCCTGCATAATGTGACACTGGAGTTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 415954 27 + 647215 GACTGCATAATGTGATAGTGGAATTCA - -a -s mr.mrrefChr5 262284 93 + 294542 TATCCAGTCCTGAGCTCTAGACCATAAATAACAGTTCTCATATAATGGTTACAAAGATGAGAGTCACCAGGATACACCTTGATATTGTGTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409389 93 + 636262 TATCCAGTCCTGAGCTCTTGACCAGAAATAACAGTTCTGATATAATGGTTACAAAGATGAGAGTTACCAGGATACACCGTGATATTGTGTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 415981 93 + 647215 TATCCAGTCCTGAGCTCTAGACCATAAATAACAGTTCCCATATAACGATTACAAAGGTGAGAGTCACCTGGATACACCTTGACATTGTGTGTC - -a -s mr.mrrefChr5 262377 188 + 294542 AGATAGATGGTGTCCCAAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACGTGACAATCACCTTCTGGTTTTTCCAGGAGTGTATCCTATTGATGATTGGTCCATGGGTCAGTCCTTAGTCATTTGTGTCAGTTGCTAGTCATTAGGACGTTTAGTAGATGATCAAGGGTTTAACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409482 184 + 636262 AGATAGATAGTGTCCCCAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACGTGACAATCACCTTCTGGTTTTTCCAGGAGTGTATCCTATTGATGATTGCTCTATGGGTCAGTCCTTAGTCATTTGTGTCAGTTGCTC----CTAGGACGTTTAGTAGATGATCTAGAGTTTAACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 416075 188 + 647215 AGATAGATGGTGTCCCAAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACATGACAGTCACCTTCCATTTTTTCGAGGAGTGTATCCCATTGATGATTGGTCCATGAGCCAGTCACGAGTCATCAGTGTCAGTTGCTAGTCATTAGGACGTTTTGTAAATGATCAAAGCTTTCACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG - -a -s mr.mrrefChr5 262565 7 + 294542 CCAATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409667 7 + 636262 CCAATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 416263 7 + 647215 TCAATTT - -a -s mr.mrrefChr5 262572 5 + 294542 TGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409714 5 + 636262 TGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 230251 5 - 647215 TGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 262577 21 + 294542 CTCCTCATTTACCATTACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409719 21 + 636262 CACCTCATTTACCTTTACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 230268 21 - 647215 CTATACATTTACCATTACAAC - -a -s mr.mrrefChr5 262598 357 + 294542 CTGGTATAGGAGATGTTTCACTTACTCTATTAGGGTGATGATGAATCAAGACTTAGGTCAGCCTAAACACATGTACAATGTTTTTGCTTCTATTTAGTTCAGTCCAGTCGTTGTGCATGTGTGTGCACTGTACAGTTTCCCTTCCTTCAAATTCATATGATTACAATGCCACTAACAATCTTAAATCTTTCCTATTATAACAAACTGAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTGGATGAGGTCTCACCACCTCACTCCATTGTCCATAACAGATTTGTCAGCATTGTCCAAGAAGCTCCAAAGAGAAATACCACATGACAGATGGCTCTACTGACCCATGGTATTCCAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409740 341 + 636262 CTGGTACAGGAGGTGTTTCACTTACTCTATTAGGGTGATGTTGTATC--------TGTCAGCCTAAACACATGTAGAATGTTTTTGCTTCTATTTAGTTAGGTCCAGTCATCATGCAAGTGTGTGTACTGTACAGTTACTCTCCCTTCTGATTCATATGATGACAATGCCACTAACAATCTTAAATCTTTTCTATTATAACAAACTGAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTGAATGAGGACACACCACCTCTCTCCATTGTCCATAACAGATTTGTCAGCATTGTCCAAGAAGCTTCAAAGAGATATATCTCATGACAGATGGCT--------CCATGGTATTCCAGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 230292 357 - 647215 CTGGTATAGGAGATGTTTTGCTTACTCTATTAGGTTCATCATTAACCAAGACTTAGGTGAGCCCTAACACATGCACACTGTTTTTGCTTCTATTTAGTTCAGTCCATTTGTTGAGCATGTGTGTGCACTGTACAGTTTTCCATCCTTCAAATTCATATGAGTACAATGCCACTAACAGCCTTCAATCTTTCCTATTATAACAAACTAAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTAGATGAGGTCTCACCACCTCACTCCAATGCCCATAACAGATTAGTCAGTATTGTCCAGGAAACTCCAAAGAGAAATACTACATGACATATGGCTCTACTGACCCATGGTATTCAAGAAG - -a -s mr.mrrefChr5 262955 4 + 294542 CTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410090 4 + 636262 CTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 230649 4 - 647215 CTTG - -a -s mr.mrrefChr5 262959 14 + 294542 GCAAATGTTTGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410096 14 + 636262 GCACATGGTTGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 230653 14 - 647215 GCAAAAGTTTAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 262973 7 + 294542 TACAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410259 7 + 636262 CACAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 230667 7 - 647215 TACAAAA - -a -s mr.mrrefChr5 262980 7 + 294542 ATTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410267 7 + 636262 ATTCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 230674 7 - 647215 ATACAGG - -a -s mr.mrrefChr5 262987 7 + 294542 AAAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410274 7 + 636262 AAAGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 230684 7 - 647215 ACAGGCA - -a -s mr.mrrefChr5 262994 125 + 294542 TTCTCTAGTGCACCATGATGTTCACAACTCTTGAGAAATATGTTTATGGCATTGTACATTGAAGTGGGATGCTATTTGCATCTTACTAGACTCTTACCACCCCAATTTGCCTGCTCATTGTCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410282 119 + 636262 TTCTTTTGTGCACCATGATGTTCACAACTCTTGAGGAATATGTTTATGGCATTGCATATTAAAGTAGGGTGCT------ATCCTACTAGACTATTACCACCCCAACTTGCCTGCTCATCGTCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 230691 121 - 647215 TTCTCTAGTGCACCATGATGTTCACAACTCTTGAGAAATATGTTTATGGTATTGTACATTGGAGTGGGATGCTATTTGCATCTCACTAG-CTCCTACCACCCCAATTTGCCTGC-CGTTGCCA-- - -a -s mr.mrrefChr5 263119 148 + 294542 TGGTTCTAGTGTTTCTTAGTGTCTAGGATTATGCCTGTCACTTACTTGTCTCTCTTCACAATAAGTTAGTTACTGACTGTGTGGCTATGTTATCACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTAACACAAAAACCTTGCAAGTAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410408 148 + 636262 TGGTTCTAGTGTTTCTTAGTGTCTGGGATTATGCCTGTCACTTACCTGTCTCTCTTCACAATAAGTTAGTTACTGACAGTGTGGCTATGTGATCACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTAACACAAAAACCTTGCAAGTAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 230812 133 - 647215 ---------------TTAGTGTCAAGGATTATGCCTGTCACCTACTTATCTCTCTTCACAATAAGTCTGTTACTGGCTGTGTGGCTATGTTATAACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTCGCACAAAAATTTTGTAAGTGATT - -a -s mr.mrrefChr5 263267 64 + 294542 ATCATGTGCTCCTGGTCACCAGTCATATTGATCTAGCTTAGGGGCCCCCTACAATTTTATTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410557 64 + 636262 ATCATGTGCTCCTGGTCACCAGTCATATTGATCTAGCTTAGGGGCCCCACACAATTTTATTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 416976 51 + 647215 -------------GGTCACCAGTTATATTGATCTAGCTTAGGGGCCCCCTGCAAATTTATTTAA - -a -s mr.mrrefChr5 263331 14 + 294542 ACTAGTATAAAAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410622 14 + 636262 ACTAGTATAAAAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 417027 14 + 647215 ACTAGAATAAAAAC - -a -s mr.mrrefChr5 263345 647 + 294542 TCTTCCTTGTTCACTATTACCCAAGCATGATATTTTCAAATGTTCTGTCACCATTTGCACCCCAACCTCTCCAGGTATTTAAACTTTCTTGAGAATCTTCACCATATCTGAGACACCATATGGACGGGGGGTGGTGCAATATGACCAGTACCAAATATATGTCTGGTGCTTGGGGGTGAAAAGGGTGCTTGGGGGTCAAAAGGACTATGACATAGGACCTTGATAACAATGATTAGTTGACCAATAATTGAAGGAGGTCAAAGTGTGGTGTTAAGGATTGGCCTTTTGTCTTAAGGACATGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGAATAAAAAGTCATCTGGTAAGGATACTGGAGTAAGGGGTCAAAAAGGAGTACTGGATGCTATCCCCCATATGTAAGCTCCCTCTTAAGACTTTGCTGAGTAAAGGACCACCACATTGTTAGCCTCACTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTTACCATGGGATGGTTTCTTGGGACCTGAGTGAGGAGTGCAATGATCCATAGATGGAACACAATGATCTAAGGGTAAGAGATCCTTGTTGTAATGGTATCACCTAATAGGCAGTTTTACCTTCTATGAGCATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410639 644 + 636262 TCTTCCCTGTTCACTATCACCCAAGCATGATATTTTCAAATGTTCTGTCACCATGTGCACCCCAACCTCTCCAGGTATTTAAACTTTCTTGAGAATCCTCACCATATCTGAGACACCATATAGACGGGGGG-AGTGCAATATTACCAGTACCACATATATGTCTGGTGCTTGGGGGTGAAAAGGGTGCTTGGGGGTCAAGAGGACTATGACATAGGACCTTGATAACAATGATTAGTTGACCAATAATTGAAG-AGGTCAAAGTGTGGAGTTGAGGATTGGCCTTTTGTGCCAAGGACATGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGCATGAAAAGTCATTTGGTAAGGATACTGGAGTAAGGGGTCACAGAGGAGTGCTGGGTGCTATCCCGCATATGTAAGCTCCCTCTTATGACTTTGCTGAGAAAAAAACCAC-ACATTGTTAGCCTCACTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTAACCGTGGGATGGTTTCTTGAGACCTGAGTGAGGAGTGCAATGATCCATAGATGGAACACAATGATCTAAGGGTAATAGATCCTTGTTGTAATGGTATCACCTAATAGGCAGTTTTACCTTCTATGAGCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 417041 623 + 647215 TCTTCATTGTTCACTAATACTCAACCATAATATTTTCAAATGTTCTGGCACCATTTGCACCCCAACCTCTCCAGGTAT--AGACTTTCTTGAGAATCTTCACTGTATCTGAGCCACCATATGGACGGGGAGTGGTGCAATATGACCAGTACCAAATATGTGTGTAGTGCTTGGGGGT-------------------CAAAAAGACCATGACATATGACCTTGATAACAATGGTTAGTTGACCAATAATTGAGGGAGGTCAAAGTGTGGTCTTAAGGATTCGCCTTTTGTCTTAAAGACTTGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGAATAAAAAGTCATCTGGTAAGGATACTGGAATAAGGGGGCAAAAAGCAGTACTGGATGCTACCCCCCATATGTA---TCCCTCTTAAGACTTAGCTGAGTAAAGGACCACCACATTGTTAGCCTCGCTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTTACCATAGGATGGTTTTTTGGGACCTGAGTGAGGAGTGCAGTGATCCATAGATGGAGCATAAAGATCTAATGGTAAGAGATCCTTGATGTATTGGTATCAGCTAATAGGCAGTGTCACCTTCTATGGGTCTCT - -a -s mr.mrrefChr5 263992 80 + 294542 ACCAAAAAAGCATAGAACTGTGTATTAACTGTAAGTTGACCATTCAGAATCTATTGCTCTAAACATATGGCAAATTGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411288 80 + 636262 ACCAAAAAAGCATAGAACTGTGTATAAACTGTAAGTTGACCGTTCAGAATCTATCGCTCTAAACATATGGCAAATTGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 417664 64 + 647215 ----AAGAAGCATAGAACTGTGTATTA-CTGTAAGTTTCCCATTCAGAATCTATTGCCCTAAACATATG----------- - -a -s mr.mrrefChr5 264072 12 + 294542 ATTGTGGACAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411369 12 + 636262 ATTGTGGACAAA - -a -s mr.mrrefChr5 264084 18 + 294542 GCATGCAAGCTCACTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411392 18 + 636262 GCATGCAAGCTCACTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 264102 58 + 294542 AATATGAACTACGTCAGATGAGATGCCACCTTAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411421 58 + 636262 AATATGAACTACGTCAGATGAGATGCCACCTTAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 417728 51 + 647215 -------ACTACATCAGATGAGATGCTACCCCAACATGAGTTTTAGAAAAGGAACCTG - -a -s mr.mrrefChr5 264160 253 + 294542 TTGCACCACACGGCCAAAGTGTAAGCTCACTTCTGATACCCACAGAATTCGAATTACAATAAATGAGATGCCACCTCAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTGGTAGTCTGTTGCACCACACAGCTAAACAAAGTGAAGTCATTCCACACTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGCAATGCACCCAACTATACAAAGCCTAATTGCTAGGCAAGTTACTATAACACAGGATCATAGTGAGGTTCTTCGGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411487 244 + 636262 TTGCACCACACGGCCAAAGTGTAAGCTCACTTCTGATACCCACAGAATTCAAATTACAACAAATGAGATGCCACCGCAACATGGG----AGGAATGGAACTTGGTA-----TTACGCCACACAGCTAAACAAACTGAAGTCATTCCACACTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGAAATGCACCCAACTATACAAAGCCTAATTGCTAGGCAAGTTACTATAACACAGGATCATAGTGAGGTTCTTCTGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 417779 252 + 647215 TTGCACCACACAGCCATAATGCAAGCTCACTTCTGATTTCCAGAGAATTTGAATTACAATAAACGAGATGCTACCTCAGCAAGAGTTTTAGGAATTGAAGTTGGTAGTCTGTTGCACCACACAGTGAAACAAAGTGAAGATATTCCAC-CTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGCAATGCACCCAACTATACAAAGCTTAATGGCTAGGCAAGTTACTACAACCCAGGAGAATAATGGGGTTCTTTGGAAG - -a -s mr.mrrefChr5 264413 44 + 294542 CTAGCTGGCAAAGGTAAATACATGACATGGAAGAAATAAGACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411740 44 + 636262 CTAGCTGGCAAAGGTAAATACATGACATGGAAGGAATAAGACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 418031 44 + 647215 CTAGCTGGCACAGGTAGATACATGACATGGAAGAAATAAGACAG - -a -s mr.mrrefChr5 264457 287 + 294542 TACAGTTGAAGTCAGCACTGCCTTTTCACTTCAGTCCCTGTGTCTAAATCATGATTCACACCCGGTGTGTAATGTGTGGAAAGAGGTCAGACAATGACTACCATTTTAAGACAACCAACTATGTTGTTTTACATAGCTGTTGCAAGCGGTTAGCTGCACTTTCTAGGCTTCAGGGTCATAGAAAAGAAACAATGGGAATGTGGGCCACCTTACACTTACATTAATACATGCAATAATAGTGAGAGTTGAATACATTGCTGGCCAACTGATGGGTGGGGAAAACGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411784 279 + 636262 TACAGCTGAAGTCAGCACTGCCTTTTCACTTCAGGCCCTGTGCCTAAATCATGATTCACACCCGGTGTGGAATTTGTGGAAAGAGGTAGGACAATGCCTACCATTTTAAGACAACCAACTATGTTGTTTTACACAGCTGTTGCAAGCGATTAGCTGCACTTTCTAGGCTCCAGGGTCATAGAAAAGAAACA--------GTGGACCTACTTACACTTACATTAATACATGCAACAATAGTGAGAGTTGAATACATTGCTGGACAACTGATGGGTGGGGAAAGCGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 418077 285 + 647215 TACAGTTCAAGTCAGCAATGCCTTTTTACTTTGGTTCCTATGTCTAAATTATGATTCAAATCCCGTATGTAATGTATGGAAGGAGGTCAGACAATGACTACCATTTTAAGACAACCAGCTATGTTGTTCTGCATAGCTGTTGCAAGCAGTTAGCTGCACTTTCTAGGCTTCAGGGTCATAGAAATGAAATAATGGGAATGTGGGCCACCTTATACTTACATTAA--CATGCAATAATAGTGAGAGTAGAATACATTGTTGGCCACCTCACGGGTGGGGAAAACACCA - -a -s mr.mrrefChr5 264744 58 + 294542 GGGGAACAGAATAATAGTCTTGGTTATAAGCACTTATAGATCTGTGCACAGCCTGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412063 58 + 636262 GGGGAACAGATTAATAGTCTTGGTTGTTAGCGCTTATAGATCTGTGTACAGCCTGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 418367 58 + 647215 GGGGAATAGAATAACGGTCTTAGTTATAAGCACTTATAGGTCTGTGCACAGCCTGAGG - -a -s mr.mrrefChr5 264802 48 + 294542 TCAAAAAGCATAACTGGAAACCTGTCAATAAATAATCATATAAATCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412122 48 + 636262 TCAAAAAGCAGAACTGCAAACCTGTCAATAAATAATCATATAAATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 418425 48 + 647215 TCAAAAAACATAACTGGAAACCTGTCAGTAAATAATCATATAAATCTG - -a -s mr.mrrefChr5 264850 35 + 294542 TCTAATTGCAATAAACTTACATGGAAGAATCACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412170 30 + 636262 -----CTGCAATAAACTTACATGGAAGAATCACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 418474 19 + 647215 TCTAATTGCAAGATACTTA---------------- - -a -s mr.mrrefChr5 264885 147 + 294542 ATATGGGGTCTTATTATATTTTATTTTTTTCAGAGTTTATCCATAAAGTTGTATCATTTGATAATGCCTAGAAAAAAGCACTAAACCACAAAATATAGGAAAGAAACCTGATTTGCCTCAACAACAGAGCTAGCCAAGAAGAAGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412201 147 + 636262 ATATGGGGTCTTATTATATTTTATTTTTTTCAGAGTTTATCTATAAAGTTGTATCATTTGATAATGCCTAGAAAAAAGCACTAAACCACAAAATATAGGAAAGAAACCTGATTTGCCTCAACAACAGAGCTAGCCAAGAAGAAAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 418493 105 + 647215 ---------------------------------------TCCATAAAGTCATATCATTGGATAATGCCTAGGACAAAGCACTAAACCACAAAATATAGGAAAGAAACCTGACTTACCTGAACAACAGAGCTAACCAAGTAGATG--- - -a -s mr.mrrefChr5 265032 18 + 294542 TGGGTGCACTGAGCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412351 16 + 636262 TGGGTGCACTGAG--ATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 418598 18 + 647215 TGGGTGCACTGAGCAATG - -a -s mr.mrrefChr5 265050 119 + 294542 CATGTAAATATTGCTATGGCACAATAACTCAACTATTAGGCCTTAAAGTCTAATAACTCTAATCTTTGTGAGTATAAAATCATGGGGCTGAGGCTCTGAAAGTGCTGAGCAATGTCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412368 119 + 636262 CATGTAAATCTTGCTATGGCACAATAACTCAACTATTAGGCCTTAAAGTCTAATAACTCCAATCTTTGTGAGTATAAAATCATGGGGCTGGGGCTCTGAAAGTGCTGAGCAATGTCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 418616 119 + 647215 CCAGTAAGTATTGCTATGGCACAATACTTTAACTATTAGGCCTTAAAGTCTAATAACTCTAATGTTTGTGAGTCTAAAATCATGGGGCTAAGGCTCTGAAAGTGCTGAGCAATGTCCTC - -a -s mr.mrrefChr5 265169 50 + 294542 CAATAGATGTAAGATTTGTATCATTCTTATTGGAAGGTTTATATGTAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412487 48 + 636262 CAATAAATGTAAGATTT-TATCACTCTCATTGGAAGGTT-ATATGTAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 418739 50 + 647215 CACTAGACGTAAGATTTGTATCATTCTTATTGGAAGGTTTATATGTAATC - -a -s mr.mrrefChr5 265219 41 + 294542 CCACGCACAGGCCTAAAATTTTTGTGACTTCTGCAACAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412544 41 + 636262 CCACGCACAGGCCTATAGTTTTTGTGACTACTGCAACAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 418789 41 + 647215 ATATGCACAGGCCTAAGATTTTTGTAACTTCTGCAACACTG - -a -s mr.mrrefChr5 265260 37 + 294542 AGTCTCTTTTCACGTGACACTCTACTCTGTTTTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412585 37 + 636262 AGTCTCTTTTCACGTGACACTCTACTCTGTTTTTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 418832 37 + 647215 GGTCTCTTTCCACATGACACTCTACTTTGTTTTTAGG - -a -s mr.mrrefChr5 265297 42 + 294542 TTATAGTGAGATGCTGGGCCCTTTATTAGCACCCCTAGAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412622 42 + 636262 TTATAGTGAGATGCTGGGCCCTTTATTAGCACCCCTAGAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 418896 42 + 647215 TTATAGTGAGATGCTGGGCTGTTTATAAGCACCCTTAGAGAG - -a -s mr.mrrefChr5 265339 33 + 294542 CCCGGCAGTAGCTATCAATGAGGCAGTAGCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412664 33 + 636262 CCCGGCAGTAGCTATCAATGAGGCAGTAGCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 418939 33 + 647215 TTTGGCAGCAGCTGCTAATGGGGCAGCAGCTAT - -a -s mr.mrrefChr5 265372 102 + 294542 CAAGGCCACCCCCATAATGTATCTCCTTGCTCTTTTTTGTTTACATTAAGTATAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGACCATTAGTGTGGAGGATGACCATTGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412698 102 + 636262 CAAGGCCACCCCCATAATGTATCTCCTTGCTCTTTTTTGTTTACATTAAGTATAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGACCATTAGTGTGGAGGATGACCATTGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 418972 102 + 647215 CAACACACCCCCAATAATGCGTCTCTTCGAGCTTCTTTGTCTACATTAAGCATAGCTGGCGCCCTTTGAGTCAACCATTGGTGTGGGGGATGACTATAGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 265474 94 + 294542 AGGGGATATGTACATGAAGTATTGCAGCTAGTGACAGTGGGGACTGAGTTCTGACAATATTTAGCGGTGTCTCACGCCAAGTGATTAGATATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412800 94 + 636262 AGGGGATATGTACATGAAGTATTGCAGCTAGTGACAGTGGGGACTGAGTTCTGACAATATTTAGCGGTGTCTCACGCCAAGTGATTAGATATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 419075 94 + 647215 GGGGGACGTGTACATGAAGTATTGCAACTGGCACCAGTGGGCACTGGGTCCTGAAAATATTTAGCGGTGCCGCACACCAAATGATTAGATGTTC - -a -s mr.mrrefChr5 265568 18 + 294542 TGGATTGACTATCAGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412902 18 + 636262 TGGATTGACTATCAGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 419169 18 + 647215 TAGATTGACTATGCGTTT - -a -s mr.mrrefChr5 265586 84 + 294542 CTAGGCCACACCCTAGTTTGTTGAACCGCCCTGTTAATTTAACTGGGGGATGAGGTTTATGGAACTATGGGCCTAATTCCCCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412921 84 + 636262 CTAGGCCACACCCTAGTTTGTTGAACCGCCCTGTTAATTTAACTGGGGGATGAGGTTTATGGAACTATGGGCCTAATTCCCCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 419187 84 + 647215 CTAGACCACACCCTAGCTTGTTGAACCCCCCTGTTAATTAAACTGGGGGATAAAGTTTATGGAACTATGGGTCTAATTCCTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 265670 22 + 294542 GTTGCTGACACTCATTTGAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413005 22 + 636262 GTTGCTGACACTCATTTGAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 419272 22 + 647215 GTTGTTGACATTCTTTTGAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 265692 61 + 294542 CCATGATTGGTTGATCTGCCATAAGCATAGGCTAAGATGAATTCCACTGACTGCAGAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413027 61 + 636262 CCATGATTGGTTGATCTGCCATAAGCATAGGCTAAGATGAATTCCACTGACTGCAGAGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 419295 61 + 647215 CCGTGATTGACTGATCTGCCATGAGCACAGGCCAAGATGAATTCCACTCAATGAAGAGATA - -a -s mr.mrrefChr5 265753 12 + 294542 CAATTTAACCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413093 12 + 636262 CAATTTAACCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 419356 12 + 647215 CAATTTAACCCA - -a -s mr.mrrefChr5 265765 187 + 294542 TACCTAATATATGTGTGGTGCTTGGGGCTCATAATTAAGGAATGTGACATGCAGACCCCGACATCACTGATTCATTGACCAATAATTCAAGTAAGGTGAAAGTGTGGAGTTAAGATTGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACCTCTTGAAACTAGATAGGGAATACACTCCCACATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413105 179 + 636262 TACCTAACATGTGTGTGGTGCTTGGGGCTCATGATTAAGGAATGTGACATGCAGACCCCGACATCACTGATTCATTGACCAATAA-----GGAGGGTGGAAATGTGGAGTTAG---TGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACCTCTTGAAACTAGATAGGGAATACACTCCCACATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 419370 187 + 647215 TACCTAATATATGTGTGGTGCGCGGGGCTCATAACTTAGGTATATGACATGCAGACCCCAACAGCCCTAATCCATGGACCAATAATTCAAGTAAGGTGAATGTGTGGAGTTAAGATTGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACGTCTTGAGACTATATAGGGAACACACTCCCACATAA - -a -s mr.mrrefChr5 265952 132 + 294542 AGAGATACAGGTGCACTTGATGCTACTCCCCATCTATCACCTCCCTCTTTTTACTTTGCTCAGTGAAGGGCCACATCACACATTGTTAGTCTTACTCAACCTATAGCACAGTCTGTGCTACAATGAGGGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413284 132 + 636262 AGAGATCCGGTTGCACCTGAAACTACTCCCCATCTATCACCTCCCGATTTTTACTTTGCTCAGTAAAGGACCACATCACACATTGCTAGTCTTACTCGACCTATAGCACAGCCTATGCCACAATGAGGGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 419614 123 + 647215 AGACAGACAGGGGAACTCAATGCTACTCCC------TCACCTCTTTCTTTTCATTTTGCTCAGTGAAGGGC---ATCACACATTGTTAGGGTTACTCAACCTATAGCACAGTCTGTGCTACAATGAGGACCT - -a -s mr.mrrefChr5 266084 178 + 294542 GATGGGATGCTTTCTTGAGACCTGAGTAAGGAGTGCAACAATCTACAGATGAACCGCAGTGACCTAATGATAAATAATCCATAGACAGAACACCAGGATGTAACAGTATTAGCTAACAGTTAGGTTCACATTCTATGGGACGGGTACATGATAAATTAAGGGGGCATCATGTGTCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413416 178 + 636262 GATGGGATGCTTTCTTAAGACCTGGACAAGGAGTACAACAATCTACAGATGAACCGCAGTGACCTAATGATAAATAATCCATAGACAGAACACCAGGATGTAACAGTATCAGCTAACATTTAGGTTCACATTCTATGGGATGGGTATATGATAAATTAAGGGGGCATCATGTATCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 419740 177 + 647215 GATGGGATGCTTTCTTGAGACCTGAGTGAGGAGTGCAGCAATCTACAGATGAACCACGATGACCTAATGGCAAATGATCCATAGACAGAGCACCAGGATGTAACAGTATTAGCTAATAGTCAAGTTCACATTCTATGGGACGGGT-CATGACAAACTAAGGAGGCATCATGTGTCAAC - -a -s mr.mrrefChr5 266262 121 + 294542 TGTAAGGTGAACACTCAGAATCTATTGCTCTACACAAATGGTATAGATCCCATCATGGACAAATTTAGGAGGCCATATGCGAGCTTACTACTAATACCCTTATAATTAGAATTATAACAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413594 121 + 636262 TGTAAGGTGAATACTCAAAATCTGCTGCTCTACACAAATGGTGGAGACCATATCATTGACAAACTTAAGAGGCCAAATGTGAGCTTACTACTGATACCCTTATAATTAGAATTATAACAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 419920 121 + 647215 TGTAAGGTGAACACTCAGAATCTATTGCTCTACACAAATGGGATAGATCCCATCATGGACAAATTTAGGAGGCCATATGCCAGCTTGCTACCAATACCCTTACAATTAAAATTGTAACAGA - -a -s mr.mrrefChr5 266383 14 + 294542 TGAGATCACACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413720 14 + 636262 TGCTATGACACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 420041 14 + 647215 TGAGATCACACCTT - -a -s mr.mrrefChr5 266397 71 + 294542 TTATGAAAGGAACTCAGTAGTCTACTGAGTGAAACAGCTAAACAGGGTGAACTCATCCTGCACTAGCTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413743 69 + 636262 TTATGAAAGGAACTCAGTAGTCTACTGAGTGAAACAGCTAAACAGGGT-AGCTCATCCTGCAC-AGCTGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 420055 71 + 647215 TTATGAAAGGGTCTAAGTAGTCTATTGAGTGAAATAGCTAAACAAGTTGAACTCATTCTGCACTAGCTATC - -a -s mr.mrrefChr5 266468 255 + 294542 AAATTCCATACTAAGCTGCACACCCAACCGCACAAAGCCTGATTGCTAAGCAAGTTGCTATAACTCAAGCACGTGTGATGAGGTGCTTTGGAAGCCAGGTAGATACATACCATGGAAGAAATGACACATCACATAATCGTTACAGTTCAAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGCCCCTGAGTCTAAACTGTGATTCACACCAGCTGTGTAATTAAAGCAACAAGAGTGAGAGTTGAATGTTGGTCTGGGGGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413812 201 + 636262 ---------------------------------------------------AAGTTGCTATAACTCAAGCACATGTGACGAGGTGCGTTGGAAGCCAGGTAGATACATACCAGGGAAGAAGCGACACATCACATAATCGCTACAGTTCAAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGC---TGAGTCAAAGCTGTGATTCACACCAGCTATGTAATACATGCAACAAGAGTGAGAGTTGAATGTTGGTCTGGGGGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 420129 253 + 647215 AAATTCCATACTAAGCTGCACACCCAACCGCACAAAGCCTGATTGCTAAGCAAGTTGCTATAACTCAGG-GTGTTTGATGAGGTGCTTTGGAAGCCAGGTAGATACATAACATGGAAGAAATGACACATCACATAAGCATTACAGTCAGAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGCCCCTGAGTCTAAACTGTGCTTCACACCAG-GGTGTAATTAAAGCAACAAGAGTGAGAGTTGAGTTCTTGGATGGCTATTG - -a -s mr.mrrefChr5 266723 6 + 294542 AGCTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414030 6 + 636262 AGCTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 420382 6 + 647215 GGCCGG - -a -s mr.mrrefChr5 266729 116 + 294542 GGCTCTCAGTCTGAGAGTTATCACACTCTTATTTGCGACCTTTCCCATTAGCTGATCCATAAGACTAACATGAAATTCTGCTAAATGATATGGTGTGCCACATGAGATCCCCCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414049 116 + 636262 GGCTCTCAGTCTGAGAGTTATCACACTCTTATTTGCGACCTTTCCCATTAGCTGATCCATAAGACTAACATGAAATTCTGCTAAATGATATGGTGTGCCACATGAGATCCCCCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 420388 116 + 647215 GGGGCTCAGTCTGAGGGTCATCACACTCTCATTTGTAAACTCTCCCATTAGCTAATCTGTAAGACTGAGATGGAATTCTTCTTAACAATAAGGTGCACAACGTGAGGTCCCTCTCC - -a -s mr.mrrefChr5 266845 104 + 294542 ACCCTTGTAATCACCAGGTTCTGTGTACTTGTCAGGTAATCATGTATGGCTCATAAATTGCTAGGGAAGTTGGACCAGCTGGTAGGAAATATGGTGGTAGCTCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414176 104 + 636262 ACCCTTGTAATCACCAGGTTCTGTGTACTTGTCAGGTAATCACGTATGTATCATAAATTGCTAGGGAAGTTGGACCAGCTGGTAAGAAATATGGTGGTAATCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 420504 101 + 647215 ACCCTTGTAATCACCAGGTTCTGTGTACTTGTCAGGTAATCATGTATGGCTTGTAAATTGCT---GAAGCTGTACCAGATGGTAGGAAATATGGTGGTAGCTCG - -a -s mr.mrrefChr5 266949 378 + 294542 TTAGGAAGGCCACAATCATGAGGATGCTTGCCCCCTAGATACTTTTTGACTTGAGCTTGAATAGCAAAAACAGCATGACATGTGGTGAGTTTGTGATCTAAGCTAGTCACCTGTGCACAAACTGGTGAATTTCAGCCCATGATTTTGTTATCCCTAATATTGATTAAACATATACATTATATAACCCCATAATTTCCACTGGCCAACTGCTAGGAGTGTTTGTGGTGATTTCTATCACTGTCCAATTGATTAAGGGAATACAAAGAGCTTATGAGCTTCTCCCTTTAAATCACTATTATGTCACAATGGCTCAACTCCTAATGTGAAACTGTAGGAATATCTTGTTAAACAAAACTTTTCAAAATCCAGACCCATGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414281 362 + 636262 TTAGGGAGGTCACAATCATGAGGATGCTGGCCCCCTAAATACTTTTTGATTTGGGCTAGAA---CAAAAACACCATGACATGTGGTGAG------GTCTAAGCTAGTCACGTGTGCAAAAACTGCTGAATTTCAGTCTATGATTTTGTTATCCCTAATATTGATTAAACATATACACTATATAACCCCATA-------CTGGCCAACTGCTAGGAGTGTTTGTTGCGATTTCCATCACTGTCCAATTGATTAAGGGAATACAAAGAGCTTATGAGCTTCTCCCTTTAAATCACAATTATGTCACAATTGCTCAACTCCTACTCTGAAACTGTAGGAATATCTTACTAAACAAAACTTTTCAAAATCCAGACCCATGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 420605 339 + 647215 TTAGGAAGACCATAATCATGTGGATGCTTGCCCCCTGGGTATTTTTTGACTTAAGCTTGGATAGCAAATTCAGCATGACATGTTGTGAGTTTGTGATCTAAGCTAGTCACCTGTGCACAAACTGGTGAAGTTCAGCCCATGATTAT------------ATTGATTAAATATACACATTATATAACCCCATAATTTCCACTGACCAACTCCTAAGAGTGTTCATGGTGTTTTCTATAACTGTCCAATCGATTGAGAGAATGCAAAAAGCTTATGAGCTTCTCCATTATATTCACTATTATGACAGAATGGCTCAACTCCTAATGTAAAACC-CAGGATTATCTTGTCACATAA-------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 267327 164 + 294542 GCAGCACAGTTTTAGGTGGTCTCCCAATGCTTAAGGGCAATGCATCCATGGAGGGTGCAGATGATTGCAAGCCAATGTGCCACACTCCAGTGCATTTTGTGATTTGAATCCATATCGTCAACTTGCAGGACATAGTTGCAATGTCCAACCTGCAGTCAACTACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414644 128 + 636262 GCAGCACAGTTTTTGGTGGTCTGCCACTGCTTAAGGGCAATGCAACCATGG---------------------CAATGTG------TCGAGTGCATTTTGTGATTTGAATCCATATCCTGGACTTGCGGGACATAG----AATGTCCAACCTGCAGTCAA----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 420944 164 + 647215 GCAGCACAGTTTTAGGTGGTCCCCAAATGCTTAAGGGCAATGCATCCATGGAGGGTGCAGATGATTGCAAGCCAATGTGCCACACTCCAGTGCATTTTGTGATTTGAATCCATATCGTCAACTTGTAGGACATAGTTGCAATGTCCAACCTGCAGTCAACTACC - -a -s mr.mrrefChr5 267491 95 + 294542 ATTTTGTTATTCTCTTCTCTCTAATAGTGGAATGATAAAGAGCAGCGTAGGATTGCAAAAACTAGGATGGAAAAAATGTACTAATGTAGGAAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414772 94 + 636262 -TTTTGTTATTCTCTCCTCTCTAATAGTGGAGTGATAAAGAGCAGCGTAGGATTGCAAAAATTAGGATGGAAAAAATGTACTAATGTAGGAAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 421110 95 + 647215 ATTGTGTTATCTTCTTCTCTCTAATAGTTGAATGATAAAGAGCAGAGTAGGATTGCAAGGTCTAGGATTCAAAAAATGTACTAATGTAGGAAACT - -a -s mr.mrrefChr5 267586 117 + 294542 AATCCTGGTGTCCGTATTATTCCACATGTCCTCTACATGCAGTTGGGTGGCTACATATTGAGCTTTGAGTTGAATACATTTGCAAGAGAGTAGCTATGAATTATCATGGGGCAATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414872 114 + 636262 AACCCTGGTGTCCGTAATATTCCACATGTCCTCC---TGCAGTTGGGTGGCTACATATTGAGCTTTGAGTTGAATACATTTGCTAGAGAGTAGTTATGAATTATCATGGGGCAATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 421205 117 + 647215 AATCCTGGTGTCCGTATTATTCCACATGTCCTCTACATGCAGTTGGGTGGCTACATATTGAGCTTTGAGTTGAAAATGTTTGCAAGAGAGTGGCTATGACTTATCACAGGGCAATTG - -a -s mr.mrrefChr5 267703 14 + 294542 CATGCTGAGTTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414996 14 + 636262 CATGCTGAGTTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 421322 14 + 647215 CATGCTGAGTTTTG - -a -s mr.mrrefChr5 267717 12 + 294542 ATTGAATATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415011 12 + 636262 GTTGAATATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 421336 12 + 647215 ATTGAATATGTT - -a -s mr.mrrefChr5 267729 81 + 294542 GAGGGTAGCTATGCATTCTCTTACACATCCAGGGCATTGGGTCAGTATCACAAAATGGTTGTTACTATGGCAGAGGAAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415023 81 + 636262 GAGGGTAGCTATGCATTCTCTCACACAGCCAGGGCATTGAGTCAGTACCACAAAGTGGTTGTTACTATGGCAGAGGAAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 421353 81 + 647215 GAGGGTAGCTATAAATTCTCTTACACATCCAAGTCATTGGGTCAATATCCGAAAATGGTTGTTATTATAGCATAGGAAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 267810 71 + 294542 TGGAATCCACAAGAGTAGTTGTATAAATGAGAGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAACGTGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415109 71 + 636262 TCGAATCCACAGGAGTAGTTGTTTAAATGAGAGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAATGTGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 421434 71 + 647215 TGGAATCCACAAGAGTAGTTGTATAAAAGAGGGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAACATGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 267881 19 + 294542 CCTGTAAAAGCTATATGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415180 19 + 636262 CCTGGAAAAGCTATATGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 421507 19 + 647215 CCTGTAAAAGCTATGCGCA - -a -s mr.mrrefChr5 267900 369 + 294542 GATTGAGAAGACCAAGTGTGTACTATCTAGGAGATTGATGTTACCATTATGGTAGTAGCCTAGGGCCACTGAAAGGGGACTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATTGAGCAGCTAGTTATTTGTACTTCTTTGTAGTGGTACAGAACTATTATGTCAGCAGGGCATGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCTTGAACTGGTGTCATTCAGGAGTTCTGTGCAGCAGATCCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAATGAAGTCTTCTGCGGCTGGGACCTACGCATGGGCACTGGCCAAAGAGCATTGAAACTTTTACATGGAGTGTTAGATGCTTTATCAGGCACATTATTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415199 369 + 636262 GATTGAGAAGACCAAGTGTGTACTATCTGGGAGATTAATGTTACCATTATGGTAGTAGCCTAGGGCCACCGAAAGGGAACTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATTGTGCAGCTAGTTCTTTGTACTTCTTTGCAGTGGTACAGAATTATTATGTCAGCAGGGTGTGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCTTGAACTGGTTTCATGTAGGAGTTCTGTGCAGCAGACTCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAATGAAGTCTTCTGCGGCTAGGACCTATGCATGGGCATTGGCCAAAGAGCGTTGAAACTTTTACATGGAGCGTTAGATGCTTTATCAGGCACATTGCTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 421527 368 + 647215 GACTGAGAAGACCAAGTGTGTACTGTCTAGGAAATTGATGTTACCATTATGATAGTAGCCTAGGGCCACTGAAAGGGGATTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATAGAGCAGCTAGTTATTTG-ACTTCTTTGTAGTGGTACAGAACTATTATGTCAGCAGGGCATGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCACAAACTGGGGTCATTCAGGAGTTCAGTGCAGTAGATCCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAAGGAAGTCTTCTGCGGCTGGGACCTGCGCATGGGCACTGGCCAGAGATCACTGAAACTTTTACATGGAGTGTTAGATGTGTTATCAGGCATATTATTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 268269 382 + 294542 GATGTCTGGGCAATCAAAAGTGGGCAGATTCCTGCTCAAATACAGTTTATCATCACGCACTGGGCAGGGTATAAGCCAGTTATTTGATTGCTCGTAGGGGACCCAGAGCACAACTTCTGCTTAAACAAGATCCATACTTCCACTTAAGAAAGCCCAATTTGATTTTCCCTTGAATTTTGGCAGATCTTTTGATAGACACCCACATTCGTACGTCATGACAAGTTTGTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAATGAAAGGCTTGCTGGTCACCAACCCAAGACAGATGTTCAAAGCTGTCATTACACAGTGTGCTTTGGCCACTGTACACTATGGACAAATATGCAAACCAGAGAACACCTCATTAATGGTATGACTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415570 382 + 636262 GATGTCTGGCCAATCAAGAGTGGGCAGATTCCTGCTCAAACACAGTTTATCATCATGCACTGGGCAGGGTATAAGCCAATTATCCGATTGCTCGTAGGGAACCCAGAGCACAACTTCTGCTTAAACAAGATCCATACTTCCACTTAAGAAAGCCCAATTTGATTTTCCCCTGGAGTTTGGCAGATCTTTTGATAGACAACCACATTCGTACATCATGACCAGTTTGTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAATGAAAGGCTTGCTGATCACCAACCCAAGACAGATGTTCAAAGCTGTCATTACACAGTGTGCTTTGGCCAGTGTGCACTATGGACAAATATGCAAACCAGAGAACACCTCATTAATGGTATGACTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 421895 382 + 647215 GATGTCTGGGCAATCAAAAGTGGGTGGATTCCTGCTCAACTACAGTTTTTCATCACGCACTGGGCAGGGTATAAACCAGTTATTTGGGTGCTTGTAGGAGACCCAGAACACAACTTCTGCTTAAAAAAGATCCATACTCCCACCTAAAAAACCTCCATTTGATTTTACCTTGAATTTTGGCAGAGCTTTTGATAGCCACCCGCACTTGTCTGTCATGGCAAATTTTTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAAAGAAAGGCTTGCTGGTCACCGACCCAAGACAGATGTTCAAGGCTGTCATTACACAGTGTACTTTGACCACTGTACACTACAGACAGAAATGCAAACCAGAGAATACCTAATTAATGATGTGACTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 268651 268 + 294542 ATCTGGCTGGAGCATGTCTATTCCCCAGTAGCAATAAAGGGCCCTGCTTAAGGCTGCAAGCTTAATCAGCCTCCAAACAAGGGGTTAATTTTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTAGGACCTGTGGTCTCCCTGGCCTTTAATGAATCACAAAGAGCTTCCAACTCCTGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACATCAGTAAACAGACTGTTATGCAGAGTTTCCCTTCCCCAAGTTCATCCCCACCATTAGGCTTACAACTGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415952 268 + 636262 ATCTGGCTGGAGCACGTCTATTCTCCAGTAGCAATGAAGGGCCCTGCTTAAGGCCGCAAGCTTAATCAGCCCCCAAACAAGGGGTTAATTGTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTAGGACCTGTGGTCTCCCTGGCCTTTAATGAATTGCAAAGAGCTTCCAACCCTCGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACATCAGTAAACAGACTGTTATGCAGAGTTTCCTTTCCCCAAGTTCATCCCCACTGTTAGGCTTACAACTGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 422278 266 + 647215 ATCTGGCTAGAGCATGTCTATTTCCCAGTAGCAATAAATGGCCCTTTTTGAGGCTGCAAGCTTGATCAGACTCCACACATGGGGTTAATTTTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTATAGCCTGTAGTCTCCTTGGCCTTTAAAGATGCACAAAGAGCTGCCAACTCCTGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACACCAG--TACAGACTATTATGCTGAGTTTCCCTACTCCAAGTTCATCCCCACCACTAGGCGTGCGACTGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 268919 137 + 294542 TCCCAAGAATACAGAGTGTTTTTAGTCTCTTATTCCAAGTACCATAATTTGCTGAGGGCCTGTACACCTAGTTAGACAAAATTACAGCCAAAACAGTAGTTTTTTTAATCCATTCCCACCCTCCATAGCACAATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 416518 137 + 636262 TCCCAAGAACACAGAGTGTTTTTAGTCTCTTATTCCCAGTACCATCGTTTGCTGAGGGCCTGTGAACATAGTTAGACAAAATAACACCCAAAGCAGTAGTTTTTTTAATCCATTCCCACCCTCCATAGCACCATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 422544 136 + 647215 TCCCAAGAGTATAGAGTGTCTTTAGTCTCTTATTGCAAGTACCATAATTAGCTGAGGGC-TGTACACCTAGTTAGACAAAACTACAGCAAACACTTTAGTTTTTTTAATGCATACCCACCCTCCATAGCACAACCAA - -a -s mr.mrrefChr5 269056 450 + 294542 TGTTGAATTGAACTTTCCCATTTAATGAGTCATAGGTAACTTATTCCTGTTTTCCTCTTACTTATAAACAAACCCTGCCACCACATATTGACAACTTGACATGCATTCAGGATATGCATTATGATTTGTCATTTTTGGCATGTACTAGTTGCTAGGGGGGCTGATGGCGGAAACCTTTTTTGTCACAGCTTGATAGTCAGTGGTTCACTAAAGTATGTATTTAGATGCCCTCACGTCTATTCCAGATGCAAGTATCAATCCCAGCTACCAGCTCACTTCCAAACAAAAGAGCATATTTGCAATCATGCTGAGGCATTGGACTACAAAAGTCAAGTCACTGATAAACTCTGCGCAATCTTAAGGTATTTAATAAAGAGAGTTGGTCTCCTAAGGTATCACTAGTCTGAATGCTATCATGTTGCTATTGGATTTCTCATCAGCAGGATTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 416655 446 + 636262 TGTTG--TTGAACTTTCTCATTTAATGAACCATAGGTAACTTATTCCTGTTTTCCTCTTACTTATAAACAAACCCTGCCACCACATATTGACAACTTGACATGCATTCAGGATGTGCATTATGATTTGTCATTTTTGGCATGTACTAGATGCTAGGGGGGCTGATGGCGGGAACCTTTTTTGCCACAGCTTGATAGTCAGTGGTTCATTAGAGTATGTATTTAGATGCACTCACGTCTATTCCCGATGCAAGTACCAATCCCAGCTGCCAGCTCACCACCAAACAAAAGAGCATATTTGCAATCATGCTGAGGCATTGGACTACGAAAGTCAAGTCACAGATAAACTCTGCGCATTCTTAAGGTATTCAATAAGGAGAGTTGATCT--TAAGGTATCACTAGTCTGAATGCTATCATGTTGCTATTGGATTTCTCATAAGCAGGATTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 422683 438 + 647215 TGTTGAATTGAACTTTCCCATAAAATGAGTCATTGCTAACTCATTCCCGTTTTCCCCTCACTTATAAACAAACCCTGCCACTATGTATTGACAACTTGACATGCATTCAGGATATGCATTACGATTTGTTCTTTTTGGCATGCACTAGTTGCTAGGGGGGCTGTTGGCGGAAACCCTTTTTGTCATAGCTTCATAGTCAGTAGTTCACCCAAGTATGTATCTAGATGCCCTCATGTCTATTCCAGATGCAAGTATCAATCTGAGCTACTGGCTCCCTTCCAAACCAAACAGGATATTTGCAATCATGCTGAGGCGTTAGACTACAAAAGTAAAGTCACTGATAACCTCTACATAATCTTAAGGTACTTAACAAAGAGAGTTGGCCTCCTAAGGTATCACTAATCTGG------------TGCTATTGGATTTCTCCTCAGCGGGATTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 269506 126 + 294542 CCAGTTGAGCTGGACTGGGGTATCACAAAGTCATTATTTCTCTGTTACCTCCGTATATGTCCAAAGTGACTATCTTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACTCACCATATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417101 126 + 636262 CCAGTTGAGCTGGACTGGGGTATCACAAAGTCATTATTTCTCTGTTACCTCCCTATATGTCCAAAGTCACCATCTTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACCCAGCATATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 423136 126 + 647215 CCGGTTGAGCTGGACCAGGTTATCACAAAGTCTTTATTTATCTCTTACCTCCGTATATGTCCAAGGTGACTATCCTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACTCACCATATTG - -a -s mr.mrrefChr5 269632 47 + 294542 CCTACTCAATAATTGTCTAGTCATTGGTCAGGTTGCTATTTTGAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417228 47 + 636262 TCAACTCCATAATTGTCTAGTCATTGGTCAGGTTGCTATTTTGAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 423262 47 + 647215 CCTGCTCAATAATTGTCTAGTCATTGGTCATGTTGCTATATAGAAAC - -a -s mr.mrrefChr5 269679 88 + 294542 ACACCCAGTAATGGGCCCTCTAATCATGGAAGCAAGGCAGGGCAACTACTAAAAAGAGCGATCCATGTCAACTATGTTGGGGTGCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417277 88 + 636262 ACACCCAGTAATGGGCCCTCTAATCATGGAAGCAAGGCAGGGCAACTATTCAAAAGAGCGATCCATGTCAACTATGTAAGGGGGCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 423309 88 + 647215 ACACGCAATAATGGGCCATCCAATCATGGAAGCAAGGTAGGGCAATTACTAAAAATAGTGTCCCATGTTAACCATGTTGGGGTGCCAG - -a -s mr.mrrefChr5 269767 38 + 294542 CATACTAAAGTTAATATGGGTTCCATTAATATGGGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417366 38 + 636262 TATACTAAAGTTAGTATGGGTTCCATTAATATGGGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 423397 38 + 647215 CATACTAAAGTTAATATGGGTTCCATTAATATGGGCCC - -a -s mr.mrrefChr5 269805 33 + 294542 AAAGCATCTGGTGATGGTTGGGATAAAACGACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417404 32 + 636262 -AAGGATCTGGTGATGATTGGGATAAAACGACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 423436 33 + 647215 AAAGCATCTGGTGATGGTTGGAATAAAACAACC - -a -s mr.mrrefChr5 269838 90 + 294542 ATGTGCTACTCTGCCTGTGGTCAACCAAGGGGGAGCCAGTATCAAGGCTTCGCATTCTCTCCTGCAACCCTCATCACTTTCACAGTATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417437 90 + 636262 ATGCGCTACTCTGCCTGTGGTTGACCAAGGGGAATCCAGTATCAAGGCTTCACATTCTCTCCTGCAACCCTCATCACTTTCACAGTATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 423469 90 + 647215 ATGTGCTACTCTGCCTGTGGTCAACCAAGGGGGAGCCAGTATCAAGGCTTCGCATTCTCTCCTGGAACCCTCATCACTTTCACAGTATGT - -a -s mr.mrrefChr5 269928 108 + 294542 CTGCCCACTCTCGTGTCTAATGGACCTTCCCATGAATGTTTGCATCAATCCTTGGCCAACAGATATGACCAGTTCTGGTGGGGCATACACGAAAGGGATGGAACTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417528 108 + 636262 CTGCCCACTCTCGTGTCTATCAAACCTTCCCATGAATGTTTGCATCACTTCTTGGCCAACAGATATGACCAGTTCTGGTGGGGCATACATGAAAGGGATGGAACTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 423559 108 + 647215 CTGTCCACCCTCTTATCTAATGGACCTTCCCATGGATGTTTGGATCAATCTTTTGCCAACAGATATGACCAGTTCTGGTGTCTCATACACGAAACGGATGGAACTGAA - -a -s mr.mrrefChr5 270036 90 + 294542 CATGGTGCATATTCCCAAAAGGATGGGAATGTCTCAAAAACCATCATCCAGGTGAATGGAGGGGGGTTGACAGGGTGTCTGTTGCATTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417637 90 + 636262 CATGGTGCATGTTCCCGAAAGGATGGGAATGTCTCAATAACCATCATCCAGGTGAATGGAGGGGGGTTGACAGGGTGTCTGTTGCATTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 423667 90 + 647215 CATGGTGTATATTCCCATAAGGTTGGGAATGTCTCAAAAACCATCATCCAGGTGTATGGATGGGGGGTAACAGGGTGCCTGTTGTGTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 270126 193 + 294542 ATGTAGATCCTGCTGTGACACTACTAATGATAGCTGACATGATTTTAAGTGGAAACGTGAAGTGTCTCTAGGAATGTAAACCAAAAAATCCTCATGGGTGATCAAGGTCAGCAAACCATCATGAGTGGTTGGATGACTGGAAGGCATAAATGTATCATGTTAATTTCTTACCCCACTGATTTCATGTCTTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417727 193 + 636262 ATGTAGATCCTGTTGTGACACTACTAATAATAGCTGACATAATTTTAAGTGGAAACGTGAAGTGTCTCTAGGAATGTAAACCAAACATTCCTCATGGGTGATCAAGGTCAGCAAACCATTATGAGTGGTTGGATCACCAGAAGTCATAAATGTATCATGTTGATTTCTTATCCCACTGATTTCACATCATTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 423759 190 + 647215 ATTTAGGTCCTGCTGGGACCCT---AATGATAGCTGACATGATTTTAAGTGGAAATATGATGTGTCTCTAGGAATGTAAACCAAGAAATCCTCATGGGTTATCAAGGTAAGCAAACCATCATGACAGGTTGAATGACTGGAAGGCCTAACTGTCTCATGCCAATTTCTTACCTAACTGATTTCATGTCTTTAG - -a -s mr.mrrefChr5 270319 31 + 294542 CTGAAGTTCGTCTCCATGTGGTTGCCAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417920 31 + 636262 CTGAAGTTCGTCTCCATGCAGTTGCCAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 423966 31 + 647215 CTGAAGTTCATCTCCATGTGGTTGCAAGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 270350 61 + 294542 TACCAGAAATCTGATGTACACTGATAGGCCTACTAAGCTCCACTGCCTCGTCTTAGTAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417951 61 + 636262 TACGAGAAATCTGATGTACACTGATAGGGCTACTAGGCTCCACTGCCTCGCCTTAGTAGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 423999 61 + 647215 TACCAGAAATCCAATGTACACTGGTAGGCCTACTGAGCTCCACTGCCTTGTCTTGGTTGAC - -a -s mr.mrrefChr5 270411 54 + 294542 ACCACACTTTGTAAGTTAAGTTGTGGTAGGACATAGAACCCTACTAACATGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418012 44 + 636262 ACCACACTTTGTAAACTATGTTGTGGT--------GAACCCTACTAACATGG-- -s simRat_chr6.simRat.chr6 424061 54 + 647215 ACCACACTCTGTAAGTTAAGATGTGGTAGGACATAGAACCCTACTAACATGGGA - -a -s mr.mrrefChr5 270465 265 + 294542 ACATCAATGTCACTACCTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCCCTGGATATGAGATCTTCGTTTCATATAAAATAGTCAGAACTTCCTAGTTTGGTTACAGACACAGGCATCCCTATTAACCTAGTAGTTCCTGCTCTGCCACCGGCAGTTTGAGGACCCTTGACTGTTCGTTCTTTCTACACTTGGTGCCATCTTTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATTCATCTTTTTCTCTATCAATTGCACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418056 262 + 636262 ---CTAATGTCACTACTTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCCCTGGGTATGAGATCTTTGTTTCACGTAAAATAGTCAGAGCTCCCTAATTTGGTTCCAGAAACAGGCATCCCTATTAACCTAGTAGTTCCTGCTCTGCCACCAGCAGTTTGAGGACCCTCGACTGTTCGTTCTTTTTACACTTGGTGCCATCATTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATTCATCTTTTTCTCTATCAGTTGCACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 424116 259 + 647215 ACATCAACGCCACTACCTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCTCTGGATATGAGATCTTCGTTTCATATAAAATAGTCAGAACTTCCTAGTTTGGTCACAGACACAGGCATCCCTATGAGCCTAGTAGTGCCTGCTTTTACACCGG------GAGGACCCTTGACTGTTCGTGTTTTCTACAATTGGTGCCATCTTTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATACATCTTTATCTCTATCAATTGCACT - -a -s mr.mrrefChr5 270730 282 + 294542 CCAATACTTGTATAGACCTCTACAGCATTGAGATAATGAGCAGACCATGTATCCTTTCTTGATGCCCATGCTATTGCAGTATTTGCTTGGAACTTTTACAGGGCTAGAATGCACAAAAGTGCCCAAACAATTTATTTATATCCTGAGCCATAACTTAGTTTAGGGAGATCTACAGGATTTCATGTTCACATGTTTCACTAGAGTTCTCATGTTGTGCCCTAACCATTCCTCCCAACTGCATGGATAACTCTACGTTTTAGAAATATCTGGTGTAGGATGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418318 273 + 636262 CAAATACT---------CTCTACAGCATTGAGATAATGAGCAGACCATGTATCCTTTCTTGATGACCATGCTATTGTAGTATTTGCTGGGAAGTTTTACAGGGCTAGAATGCACAAAGGTGCCCAAACAATTTATTTATATCCTGAGCCATAAATTAGTTTAGTGAGATCTACAGGATTTCATGTTCACATGTTTCACTAGAGTTCTCATGTTGTGCCCTAACCATTCCTCCCAACTGCATGGATAACTCTACGTTTTAGAAATATCTGGTGTAGGATGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 424382 282 + 647215 CCAATACCTGTATAGACCTCTACAGCATTGAGATAATGAGCAGACCATGTATCCTTTCCTGATGCTCATGCTATTGCAGTATGTGTTTGGAACTTTCACTAGGCTAGGATGCACAAAAGTGCCCAAACAATTTATTTATATCCTGAATCATAACTTAATTAAGGGAGATCTACAGGGTTTCATGTTCACATGTCCCACTAGAGTTCCCATCTTTTGCTATAATCATTCCTCCCAAATGCATTGATGACTCAACATTGTAGAAATATCTGGTGTATGTTGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 271012 180 + 294542 GTGTGGTACTTTCCCTTTCTCTTGGCACTATGAAGGCTTTTCTAATCTGTTGAGAACATCTGAAGGTTAACTGACTATTGGCATGACTGGATCCTCTGAGGTGACAGCAAAACATAAACACTTAAATCACCTCTGGCTGTTCCTTGGATGTGAAAGAAATGATTGCTGAGAGCAATTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418591 175 + 636262 GTGTGGTACTTTCCCTTTCTCTTGGCACTATGAAGGCTTTTCTAATCTGGTGAGAACATCTGAAGGTTAACTGACTATTGGCATGACTGGATCCTCTGAGGTGACAGCAAAACATAAACACTTAAACCACCTCAGGCTGTTCCTTGGAGGTGAAAGAAGTTATTGCTGTGAGCAA----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 424666 178 + 647215 GTGTGGTCCTTTCCCTTTCTCTCGGCA--ACTAGGGCTTTCCTGGTCGGTTGAGAACATCTGAAGGTTAACTGACTATTGGCAGGTTTGGATCCCTTGAGGTGACAGCAAAACATTCACACTTAAATCACCTCTGGCTGTTCCTTGGATGTGAGAGAAATGATTGCAGAGAGCAATTCAG - -a -s mr.mrrefChr5 271192 5 + 294542 GAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 424850 5 + 647215 GAGCA - -a -s mr.mrrefChr5 271197 243 + 294542 CAGAGACAACTACCTAAAATTTCACATTGGCAGCTATGATGTGGAAGAGTCTCCAGTTACAAAGGAGGATCCCATCCAGGACATCAGGACCCATAAAGGAGAGACAACTGACAAAGCAATTCTATACTCAACCAGAGGGCAAGATACAGTGCAACATGCATCACAGGAAGCATAATCAGAGTCATGATGGTACGCAACCACTAATGATAGCATCACAGGACCACATGCTCTAGTTTAGAGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418766 205 + 636262 ------------------------CATTGGCAGCTATGATGTGGAAGAATCTCCAATTCCAAAGGAGGATCCCATCCAGGACATCAGGACCCATAAAGGAGAGACAACTGACCAAGCAATTCTATACTTAACCAGAGGGCAAGATACAGTGCAACATGCATCACAGGAAGCATATTCAGAGTCATGATGGTGCGCA--------------CATCACAGGACCACATGCTCTAGTTTAGAGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 424857 243 + 647215 CAGAGACAACTACCTAAAATTTCACATTGGCGGCTATAATGTGGAAGAGTCTCCAGTTACAAAGCAAGATACCATCCAGCACATCAGGACCCATAAAGGAGAGACAACTGACAAAGTGATTCTATACTCAACCAGAGGGCAAGATATAGTGCACTATACATCACAGACAACGAGATCAGAGTCATGAGGGTATCCAACCACTAATGATAGCATCACAGGGCCACGGGCTCTAGTTTAGAGAGA - -a -s mr.mrrefChr5 271440 56 + 294542 TTTGCCCTGCTGTGTGAGAGAATCACCATAAGTGTCGTCCGCCCTAATCGACAACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418973 56 + 636262 TTTGCCCTGCTGCGTGAGACAATCACCATAAGTGTCGTCCGCCCTAATCGACAACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 425100 33 + 647215 TTTGCCCTGCTGTGTGAGAGAATCACCATAAGC----------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 271496 114 + 294542 GGCCACGTGGTACAGACAGTGTGTAAGTAAGAATGATATCGATTTTGCATTAAGTCACTATACATACACCAGCCTAGATAGGAGGAGAAAAATTAAATGAAAATTGACGGTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419034 114 + 636262 GGCCACGTGGTACAGACAGAGTGTAAGTAAGAATGATATCGATTCTGCATTAAGTCACTATACATACACCAGCCTAGATAGGAGGAGAAAAATCAAATGAAAATTGACGGTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 425133 98 + 647215 ---------------ACAGTGTGTAAGTAAGAATGATATCAATTTTGCATTAAGTCACTATACATGCACCAGC-TAGATAGGAGGACAAAAATTGAATGAAAATTGACAGTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 271610 11 + 294542 CGTACAAGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419148 11 + 636262 CGTACAAGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 425250 11 + 647215 CGTGCAAGGCT - -a -s mr.mrrefChr5 271621 48 + 294542 TTTTTCTACTTGATAGAAAAGTTGAAAAGTTCTAATTGACTAGTGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419279 48 + 636262 TATCTCTACTTGATAGAAAAGTTGGAAAGTTCTAATTGACCAGTGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 425261 48 + 647215 TTTTTCTACTTGATAGAAAAGTTTAAAAGTTCTAATTGTCTAGTGCAC - -a -s mr.mrrefChr5 271669 216 + 294542 TATAAGTATCCAAACTCAGGTGGCTGCTGAGGCCAAAAATGTGTTCATTATATACGTGTAACTTCTATGCAAAATTACATTTAATATTCCTGATGACAGGTTGTCTGTCCAGATTGTGTTTCCAGATGCTGTACACAGGGATATAGACTTTAATTAATGAAGGCTCGTGCCTACATCTGACACTGAGCTGATGCAACTTAAATCAATCGAGCAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419327 216 + 636262 TATAAGTATCCAAACTCAGGTGGCTGCTGAGGCCAAGAATGTGATCATTATATACGTGTAACTTCTATGCAAAACTACATTTAATATTCCTGATGACAGGTTGTCTGTCCAGATTGTGTTTCCAGACACTGTACACAGGGATATAGACTTTAATTAATGAAAGCTCGTGCCTACATCTGACACTGAGCTGATATAACTTAAATCAATCGAGCAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 425378 216 + 647215 TATAAGTATCAAAACTCAGGTGGCTTTTGAGGCAAAAAATGTATTCATTATATACGTGTAACTTCTATGCAAAATTACATTTAATATTCCTTATGACAAGTTGTCTTTCCAGATTGTGTCTCCAGATGCTGTATACAGGGACTTAAACTTTAATTAATGAAGGCTTGTGCTTACATCTAACACTGAGCTGATGCAACTTAAATCAATTGAGCAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 271885 118 + 294542 CTAACTTGCTAGTAGTGAACTGTAGAGATAGAAAATTTATGTCTCCAAGTCAGTACACTTGATACAGTATGTGGAAGAGGCACAACTAGGCACTAGGCATATGGATTGTGGGTCACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419543 118 + 636262 CTAACCTGCTAGTAGTGAACGGTAGAGATAGAAAATTTATGTCTCCAAGTCAGTACACTTGATACAGTATCTGGAAGAGGCACAACCAGGCACTAGGCATATGGATTGTGGGTCACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 425598 118 + 647215 TTAGCTTGCTAGTAGTGAACTGTAGATATAGAAAATTTATGTCTCCAAGTCAGTACACGTGATACAGCATGTGGAAGCGACACAACTAGGCACTAGGCACATGGATTGTTGTTCACAT - -a -s mr.mrrefChr5 272003 184 + 294542 ACCTTTTGATGCTCTTAGACAGGGGTGCTTAGTGGCTACCTCAAATTTTCAAACCAACCAGGATGTCTTAACCTATCTAGTAAGTTACAGTAGCCTGAACACCAGGCTAACCATCTCTCTGATTTTAGACTAGCCACCTAGATTCCAGCTCATTCACAACTGGAAGAATTGTGATCCATACTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419661 181 + 636262 ACCTTTTGATGCTCTTAGGCAGGGGTGCTTAGTGGCTACCTCGAATTCTCGAATCAACCAGGATGTCTTAACCTATCTGGTAAGTTACAGTAGCCTGAACACCAGGCTGACCATCTCTCTGATT---GACTAGCAACCCAGATTCCAGCTCATTCACAACTGGAAGAATTGTGATCCATACTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 425732 184 + 647215 ACCTATAGAAGCTCTTAGACAGGGGTGCTTAGTGGGTACCTCATATCTTCAAACCAACCAGGATGTCTTGACCTATATAGTGAGTTACAGTACCCTGAACACTAACCCAAACAGCTCTCTGATTTTAGACTAGCCACATAGATTCAAGCTTACACACATCTGGAAGAATTGTGAGTGATACATA - -a -s mr.mrrefChr5 272187 7 + 294542 AGGATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419845 7 + 636262 AGGATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 425916 7 + 647215 AGGATTA - -a -s mr.mrrefChr5 272194 94 + 294542 GAAGACCAAAGCTATATTTTGTTTCAGAGTAGCACCTTAGTCGCAAACTCAGTACACTAGATTAGTGATCTGTTCCCAACTAAGGTACTTTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419853 94 + 636262 GAAGACCAAAGTTATACTCTGTTTCAGAATAGCACCTTAGTTGCAAACTCAGTACACTAGATTAGTGATCTGTTCCTAACTAAGGTACTTTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 425923 94 + 647215 GAAGACCAAAGCTCTATTTGGCTTTAGAGTAGCACCCTAGTCACAAACTCAGTACGCTAGATTAGTAATATGTTCCCAACTAAAGTACATTATG - -a -s mr.mrrefChr5 272288 57 + 294542 CTGAGAACTTAGACACATCCAGCAGCACAGCCCCCCAGTCTCTGTCAAAGGAGCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419947 57 + 636262 CTGGAAACTTAGACACATCCAGCAGCACAGCCCCCCAGTCTCTGTCAAAGGAGCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 426167 57 + 647215 CTGAGAACTTAGATGCGTCCAGCCGCCCAGCCCACCAGCCTCTGGCAAAGGAGCAAA - -a -s mr.mrrefChr5 272345 70 + 294542 GGAGCTAAGAAATATATTATAGTTTACTCTTGTAATCACCAGATTCTTAGGGACCTCTCAGAATGGGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420007 70 + 636262 GGAGCTAAGAAATATATTATAGTTTACTCTTGTAATCACCAGATTCTTAGGGACCTCTCAGAATGGGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 426224 70 + 647215 GGAGCTCATAAATGTAATATAGTTTACTCTTTTAACCACCAGATTCTTGGGGATCTCTCTAAATGAGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 272415 203 + 294542 TATTGTCAGTATAGACATCTGCTCTCAGTACTCTGCTTGAGTTATCTTATCACTTGAGCATGAAGACATATGTTCTGGGCTTCTTGAGCGATAATGTAAGGTTAGGAGATGCCCATTCTATATGCATGCATGGGCTATACACCTTTATCCCCTGGTATGCCAAGGTCCCTGTGATAAACTGCGCTTGACCAAACTGGCTCTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420077 196 + 636262 TATTGTCAGTATAGACATCTGCTCTCAGTACTCTGCTTAAGTTATCTTATCACTT-AGCATGAAGAGATATG------GCTTCTTGAGCGATAATGTAAGGTTAGGAGGTGCCCATTCTATATGCATGCATGGGCTATACACCTTTATCCCCTGGTATGCTAAGGTCCCCGTGACAAACTGCGCTTGACCAACCTAGCTCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 426295 203 + 647215 TGTTGGCATTATAGGCGTCTACTCTCAGTACTCTGCTGGAGTTATGTCATCACTTGAGCATGAAGACATATGTTCTGGGCATCTTTAGCAATAATGTAAGGTTAGGAGATGCCCATTCTATATGTATGCATGGGCTATACACCTTAATCCCCTGGTATGCCAAGGTCCCTGTGATAAACTGGGCCTGACCAAACTGACTCTCT - -a -s mr.mrrefChr5 272618 29 + 294542 TGGAACAGAGGCAACAATCAGAGTAAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420274 29 + 636262 TGGAACAGAGGCAGCAATCAGAGTAAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 426498 29 + 647215 TGGAACACAGGCAATTATTAGAGTAAAAT - -a -s mr.mrrefChr5 272647 14 + 294542 ATCAGTAAGATACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420308 14 + 636262 ATCAGTAAGATACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 426527 14 + 647215 ATCCATAAAATACA - -a -s mr.mrrefChr5 272661 203 + 294542 AATTTTCTACACTTTAGGAGAGTTTTGTCATATGAGGAATCAGGCATGCCGGGTGTATATCCATATCACCAATAATCATAAAAGGTTCACCAGCCTTAGGTAGGTAAGTATCAGGTCAATTGTTCTGCCATTCTAATGTCAAAGTTGGCAGCATAAACACTTGCCATGTGCCTTGAGGGACATTGTGTAGCGACCCTGGACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420326 192 + 636262 AATTTTCTACACT------GAGTTTTGTCATATGAGGAACCAGGCATGCCGGGTGAATA-----ATCACCAATAATCATAAAAGGTTCACCAGCCTTAGGTTGATAAGTATCTGGTCAATTGTTCAGCCATTCTAATGTCAAAGTTGGCAGCATACACACTTGCCATGTGCCTTGAGGGTCATTGTGTAGCGACCCTGGACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 426541 197 + 647215 AATTTTCTACACTTTAGGAGAGTTTTGTCATACGAGAAATCAGGCAAGCCAGGTGTATATCCATATCACCAGTAATCATAAAAGGGTCACCAGCCTTAGGTAGGTAAGTATCAGGTCAACTCTTCTGCCATTCT---GTTAAAGTGTGCAGCATAAACACTTGCCATGTGCCTTG--GGACATTGTGAGGAGATCCTGGACG- - -a -s mr.mrrefChr5 272864 41 + 294542 GGATAACACAGAGAATTCCTTGGAAACAATACACTTTCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420519 41 + 636262 GTACAACACAGAGAATTCCTTGGAAACAATACACTTTCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 426738 41 + 647215 GGATAACACAGAGAATTCCTTGAAAACTATACATTTTCATC - -a -s mr.mrrefChr5 272905 123 + 294542 TGTGTTCCTTGCAAGTAACATGTTACAAGAACTTAGGTCTTGATAATGTACATTTAATTTTAGATGTCAACTTGACCACACTTAAGAAAGTCCTGATGATCATCTGTTATTTTCAATTTTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420560 123 + 636262 TGTGTCCCTTGCAAGTTACATGTTACAAGAACTTAGGTCTTGATAATGTACATTTAATTTTAGATGTCAACTTGACCACACTTAAGAAAGTCCCGATGATCATCTGTTATTTTCAATTTTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 426783 123 + 647215 TGTGTTCCCTTCAAGCAGCATTTTGCAAGAACTTAGGTCTTGGTAATGTACATTTAATTTTAGTTGTCAGCTAGACCACACTTAAGAGAGTCCTGATGATCATCTGTTATCTTCAATTTTTCC - -a -s mr.mrrefChr5 273028 45 + 294542 TCTCATATATCCACATTGTATGATTCTGCTTAAACAAGGTCTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420683 45 + 636262 TCTCATATATCCACATTGTATGATTCTGCTTAAACAAGGTCTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 426913 45 + 647215 TCTCATATACACACATTGTATGATTCTGCTCAAACAAGATCTCCT - -a -s mr.mrrefChr5 273073 18 + 294542 GACCCATAATTGTCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420729 18 + 636262 GACCCATAATTGTCTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 426958 18 + 647215 AACTAGTAACTGTTGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 273091 16 + 294542 TGCAGCCTTAATTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420747 16 + 636262 TGCAGCCTTAATTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 426977 16 + 647215 TGCAGCCTTAATTGAG - -a -s mr.mrrefChr5 273107 37 + 294542 CTAGCATTGGCAACTTGAGCTATTTGGTCTGTAGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420766 37 + 636262 CTAGCATTGGCAACTTGAGCTATTTGGTCTGTAGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 426993 37 + 647215 CTAGCATTGGCAACTTGAGCTATTAGGCGTGTGGTAC - -a -s mr.mrrefChr5 273144 276 + 294542 GTTCAGAACTAAGACATATGAGACACTTCACACAATCTGAATAACTAGTATGTCTAATAGACAACTGGGATGTAGGGAATTGGCTACTAGATTAGTTGGCGTCACCTAATATAATAAGTATATATTATTGGTTATGTGAGCTATATAGTTTATATCTGTAAGTATATGTATTTAGGCTAGAGCCCTTGTCATGACCATACATAGAATCCAGAACAATTGCAGCTTTACAAACTGGTATTATCTGTATATGCCTATAGTATGTAGCTTGACCCTAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420803 254 + 636262 GTTCAGAACTAAGACATATGAGACACTTCACACAATCTGAATAACTAGTATGTCTAATAGACAACTGGGATGCAGGGAAT----------------------CATCTAACATAATAAGTATATATTATTGGTTATGTGAGCTATATAGTTTATATCTGTAAGTATATGTATTTGGGCTAGAGCCCTTGTCATGACCATACATAGGATCCAGAACAATCACAGCTTTTCAAACCGGTATTATCTGTATATGCCTATAGTATGTAGCTTGACCCTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 427031 276 + 647215 GTCCCATACTAAGACAGATGAGGCACTTCGTGCAATTTGAATAACTAGTCTGTATAATAGACAACTGGGATGTAGGGAATTGGCTACTAGATTAGTTGGCGTCACTTAATATATTAAGTAAATATTATCGGTTATGTGAGCTACCTAATTAATACCTGTAAGCATATGTTTTTAGGCTACAGTCCCTGTCATAACCATAGATAGAATCCAGAACAATTGCAGCTTTACAAACTGGTATTACCTGAATATGCCTATAGTATGTAGCTTGACCCTAGT - -a -s mr.mrrefChr5 273420 66 + 294542 ATTCCTCCACACATATCTGTCTGACCTTTTCCTGGCCTCATGATGCTTTGTTGTTCTGATTGTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421063 66 + 636262 ATTCCTCCACACATATCTGTCTGACCTTTTCCTGGCCTCATGATGCTTTGTTGTTATGATTGTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 427307 66 + 647215 ATTCCTTTACACATGACTGTCTGACCTTCTCCTAGACTCATGATGCTTTGTTGTTCTGATTGTGTG - -a -s mr.mrrefChr5 273486 343 + 294542 GCTACCCTTTGATCTGAAGTAGAACTTCAGTGTGTGAGGTGTGGCCAAGCCAATCACAAGATATGACAGGCTCATGGGCATTTCCTAAGCACCACTGGGTTTTGGTGCTAAGATTACCATATCATGTTGGAATAGTTTATGTGATACTAGTAAGGACTGAAATTGATACAGTTATGGAGGCTGACTGTTCCCCCTGGCTAGGACCTATGAGACATGCCCCAGAAGGCTTTTAGAGAGCACTGCTTTAGCCTGGATAATCATAACTATTGCCCTGTCTTTTTCCAAAGTTAGCATCATGTTTGCCAGGCAGTCCATTGGACAAACAGAATGTTTACCTCCTCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421130 343 + 636262 GCTACCCTTTGAACTGAAGTAGAACTTCAGTGTGTGAGGTGTGGCCAAGCCAATCACAAGATATGACAGGCTCATGGGCATTTCCTAAGCACCACTGGGTTTTGGTGCTAAGATTACCATATCATGTTTGAATAATTTATGTGATACTAGTAAGGACTGAAATTGATACAGTTATGGAGGCTGACTGTTCCCCCCAGCTAGGACCTCTGAGACATACCCCAGAAGGCTTTTAGAGAGCACTGCTTTAGCATGGATAATCATAACTATTGCCCTATCGTTTTCCAAAGTTAGCATCATGTTTGCCAGGCAGCCCATGGGACAAACAGAATGTCTACCTCCTCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 427373 342 + 647215 ACCACCCTTTGATCTGAAGTGGAACTTCAGTGTGTAAAGTGTGGCCAAGCCAATCACAAGATATGACAGCCTCATGGGCATTTCCCAAGAACCACTGGGTTTTGGTGCTAAGATTGCCATATCATGGAGGAATAGTTTATG-GCTATTAGTAGGGACTGAAATTGATACACTTATGGAGGCTGACTGTTCCCCCTGGCTAGGACCTATGAGATATGACCCAGAAGGCTTTTAGAGAGCACTGGTTTAGCCTGGATAATCATAACTATTGCAATGTATTTTTCCAAAGTTAACATCAGGTTTGTCGGGCAGTCCATTGGACAAACAGAATGTTAACCTCTTCGC - -a -s mr.mrrefChr5 273829 148 + 294542 CAACCATCTGCATGCTGATAGATAAGCTGTATGAGTCAATCCTATCTTCAGTTTTTGAGCACCAGAAAACTAGGAGGAGTACCAGGCCATTCACATCAACATGCTTGTTACCTAGTGTTGTTTAGATTTTGCATAGCAAATCGTGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421473 148 + 636262 CAACCATCTGCATGATAATAGATGAGCCATATGAGTCAGTCCTATCTTCAGTTTTTGAGTACCAGAATGCTAGGAGGAGTACCAGGCCATTCACATCTACATGCTCGTTACCTAGTGTTGTTTAGATTTTGCATAGCAAATCGTGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 427718 148 + 647215 CAACCATCTGTATGCTGATACATAAGCTGCATGAGTCAATCCTATCGTCAGTGTTTGAGCACCAGAAAACTAGCAGGAGTACCAGACCATTCACATCAACATGCTTGTTACCTAATGTTGTTTAGATTTTGCATAGCAAATCGTGCAA - -a -s mr.mrrefChr5 273977 95 + 294542 AGCACACATATCAGGGGATTTTTTGCATCAAGAGGTATACTAATTAACTTCCTAGTTATCCGAGCACCGAAACCTGGAAATGAGGTTCCTCAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421634 95 + 636262 AGCACACATATCGGGGGATTTCATGCCTCAAGAGGTATACTAATTAACTTCCTAATTATCCAAGCACCGAGACCTGGAAATGAGGTTCCTCAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 427866 95 + 647215 AGCACACATATCAGGGAATTTTTTGCATTGAGAAGTGTACTAATTAAATTCCTAGTTATCAGAGTACCGAAACCTGGAAATGAAGTTCCTCAATA - -a -s mr.mrrefChr5 274072 143 + 294542 TGCCTGTTAACGTCAAATGGATGAATACTTCCATTTGTGATTTCCACAGGCAAGTCGCTAACTTCCAAAATACCAATTATGTTTTGCCTTCATGATCCTCTAAACTGGTTGGATCATCGCTTAAACTGGTTGGGCTGTTAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421731 143 + 636262 TGCCTGTTAATGTCAAATGGATGAATACTTCCATTTGTAATTTCCACAGGTAAGTCGCTAACTTCCAGAATACCAATTAAGTTTCGCCCTCATGATCTTCTAAATTGGTTGGATCATCGCTTAAACTGGTTGGGCTGTTGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 427961 127 + 647215 -----TTGAGCTTCACA-------ATAC----ATTTGTGATTTCTGCAGGCAAGTCGCTAACTTCCAAAATACCAATTATGTTTTGCCTTCATGATCCTCTAAACTGGTTAGATCATCCTCTAAACTGGTTGGGCTGTTAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 274215 54 + 294542 ATAGCCCAGTGTACTGCACCACTTCTGGAGTGTGGGGCTTTCAGACTTGATATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421874 40 + 636262 ATAGCTCAGTGTGCTG--------------TGTGGGGCCTTCAGACTTGATATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 428089 54 + 647215 ATAGCCCAGTGTATTGCACCACTTCTGGAGTGTGGGGCTTTTAGACTTGATGTA - -a -s mr.mrrefChr5 274269 78 + 294542 TGGTCCTAACCTCGGCAACATCATAAAGTATATAATCTAACAACTCAATATTAACTCTACACACTATTGAGTGACCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421915 78 + 636262 GGGTCCTAACCTTGGCAATATCATGGAGTATATAATCTAACAACTCAATATGAAAGCTACACACCATTGAGTGACCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 428143 78 + 647215 TGGTCCTATCCTCGGCAACATCATAAAGTACATAATCTAACAACTCATTATTAACTCTGCACACTATTGAGTGACCAT - -a -s mr.mrrefChr5 274347 77 + 294542 GCCTGCAGCATTGGTAACCAGCTGAGGTATGTGATCAAAATGCTTGAACTTAGTGCCTTGTGGTTTCTAAGAGTAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421993 77 + 636262 GCCTGCAGCATTGGTAACCAGCTGAGGTCTGTGATCAAACTGCTTGAACTTAGTGCCTTGTGGTTTCTAAGAGTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 428224 77 + 647215 GCCTGCAGCATTGGTAACCACCTGAGTTACATGATCAAAATGCTTGAAGTTAGTGCCTTGTGGTTTCTAAGAGCAGC - -a -s mr.mrrefChr5 274424 118 + 294542 ATATGAAATAGTCATTTATCAATCAGTTAAAGGCCATTGTGGCCACAATTGAGGTGGCCATGCAGATGAGCTAAGGGGTATACTTTTACTCCTAAATAATATTGAATGTCTGCCTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422070 118 + 636262 ATATGAAATAGACATTTATCAATCAGTTAAAGGCCATTGTGGCCATAATTGAGGTGGCCATGCAGATGAGCTAAGGGGAATGCTTTTACTCCTAAATAATAATGAATGTCTGCCTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 428314 118 + 647215 ATATGAAATAGTCATTTATCAATGAGTTAAAGGCTATTGTGGCCACAATTGAGGTGGCCATGCAGATGAGCCGAGGGGTACACTTGTACTCTGGAATAACATAGAATGTCTGCCTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 274542 50 + 294542 AAGTCTGTCAATTAGATGTCGATGTTACACAAACACACGCATACCTACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422188 50 + 636262 AGGTCTGTCAATTAGATGTCTATGTTACACAAACACACGCATACCTACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 428433 50 + 647215 AAGTCTACCAATAAGATGTCGATGTCACACAAACACACACATACCTACCC - -a -s mr.mrrefChr5 274592 125 + 294542 CTACATCATACCTACCCTAATCTGCATAGGGACATGAGAAATAGTATGCAATATATGTCCTGTAGCATGCTTATGACCATGCTGTCAATCTTTAATTACACTGCAGAGTAAACCTGCCCCCGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422242 125 + 636262 CTACATCATACCTACCCTAATCTGCATAGGGACATGAGAAATAGTATGCAATATATGTCCTGTAGCATGCTTATGACCACGCTGTCAAACTTTAATTACACTGCAGAGTAAACCTGCCCCTGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 428483 125 + 647215 CCGAATCATACCTACCTTAATCTGCATAGGGACATGAGAAATAGTATGCAATATATGTCCTGTAGTATGCTTATGATCATGCTGTCAATCTTTAATTACACTGCAAAGTAAACCTGCCCCCCCCC - -a -s mr.mrrefChr5 274717 175 + 294542 AGAATTAATATCATACTGGTTACAAGTGGGATGAGAGGTAGGCACCCTTCATTGCAGGATGCACACACCCAGCCAACAAAATGTGCGATTTTTTCATTTTGCCTATCTTGGCTGTGCATCATTGTGAAAGGTGATCTTTCAATCGGGTTGTGGATTTAGGCATGTGCCATGTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422367 175 + 636262 AGAATTAATATCATACTGGTTACAAGTGGGGTGAGAGGTAGGCACCCTTCTTTGCAGGATGCACACACCCAGCCAACAAAATGTGCGATTTTTTCATTTTGCCTATCTTGGCTGTGCATCATCGTGAAAGGTGATCTTTCAATCGGGTTGTGGATTTAGGCATGTGCTAGGTGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 428613 141 + 647215 AGAGCTAATATCATACTGGTTACAAGTGGGATCAGAGATAGGCACCCTTCATTACAGGATGCACACACCCAGCCAGCAAAATGTGC---------------------------------CATTGTGAAAGATGATCTTT-AATTGACTTGTGCATTTAGGCATGTGCCATGTGTC - -a -s mr.mrrefChr5 274892 12 + 294542 TTAGATTAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422542 12 + 636262 TTAGATTAGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 428782 12 + 647215 TTAGATTAAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 274904 114 + 294542 GAGATGTGACTAACACACAAGTCAAATCAGGCTCAAGATTCCAATGAGAGTGGCTTGTATATAAACACAAAGGCAAAACAGAGCACACCTGTCAGTGGGGTACATGTATCAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422554 114 + 636262 GAGATGTGACTAACACACAAGTCAAATCAGGCTTAAGATTCCAATGAGAGTGGCTTGTATGTAAACACAAAGGCAAAACAGAGCACACCTGTCAGTGGAGTACATGTATCAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 428798 114 + 647215 GAGATAGGACTAACACACAAGTCAAATCAAGATCAAGCTGCTAATGAGATTGGCCTGTATATAAACACAAAAGCAAAACAGAGCACACCTGTTAGCAGGGTACATGTATCAAGC - -a -s mr.mrrefChr5 275018 89 + 294542 TTAGCTCGGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATGTCTTTACAATTGTCCCACCTAGCAAATTTTTAGGAAACAACTTGTGGCCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422674 89 + 636262 TTAGCTCGGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATGTCTCTACAACTGTTCCACCTAGCAAATTTTTAGGAAACAACTTGTGGCCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 428912 87 + 647215 TTAGCCTCGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATCTCTTTACAATTGTCCCACCTATCAAATTTTTAGAAAACAA--TATGCCCATAA - -a -s mr.mrrefChr5 275107 22 + 294542 TTATTGTAACAGAGTACCGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422765 22 + 636262 CCATTGTAACAGAGTACCGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 428999 21 + 647215 TTGTTGTAACAGAG-ACTGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 275129 87 + 294542 ATAGCTAGGAGCTAGCTAGTATTGGGACACTGGGCCATTTATTATTTACTAGGAACAGGTGAGTAGCTGAGCTTTTCTATATTTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422787 87 + 636262 ATAACTAGGAGCTAGCTAGTATTGGGACACTGGGCCATTTATTATTTAATAGGAACAGTTGAGTAGCTGAGCTTTTCTATATTTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 429024 86 + 647215 ATAGCTTGGAGCCAGCTCGTATTGGGACAC-GGGCCATTTATTTTTTACTTGGAATAGGTGAGTAGCTGAGTTTTACTATATTTGTT - -a -s mr.mrrefChr5 275216 148 + 294542 TGCATTTAGTATTACAACATCTGGTTTGATCTCTACCACAGTTCACCCGGTAAATTTGCAGTGCTGCATAAAATACTAAAGTCTTCAACATTAGCCTGCCAAACTTAATATCCCACACAGTCTCCAGTGGGATCTAGAGACATTGTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422874 148 + 636262 TGCATTTAGTATCATAACCTCTGGTTTGATCTCTCCCACAGTTCACCCGGGAAAATTGCAGTGCTGCATAAAACACTAAAGTCTGCAACATCAGCCTGCCAAACTTATTATCCCACACAGTCTCCAGTGTGATCTAGAGACACTGTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 429114 139 + 647215 TGCAATTAGTATTACAACATCTAGTTTGATCTCTACCACAGTTTACCCAGTAAGTTTGCAGTGCTGCATAAAATACTAAAGTCTTCGACATTAGC---------TTAATATCCCATACAGTCTCTAGTGGGATCTAGAGACATTGTTG - -a -s mr.mrrefChr5 275364 6 + 294542 TCTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423028 6 + 636262 TCTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 429253 6 + 647215 TCTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 275370 30 + 294542 CATCAGTACAGATAAACAATAAAATGCTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423038 30 + 636262 CATCAGTACAGATAAACAATAAAATGCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 429259 30 + 647215 CATCAGTACAGATGAACAATAAAATTCTGC - -a -s mr.mrrefChr5 275400 11 + 294542 TTAAGCAAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423070 11 + 636262 TTAAGCAAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 429289 11 + 647215 TTAAGCAAGTC - -a -s mr.mrrefChr5 275411 15 + 294542 TCTGTGACTGGTGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423082 15 + 636262 TCTGTGACTGGTGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 429300 15 + 647215 TCTGTGACTGGTGGA - -a -s mr.mrrefChr5 275426 9 + 294542 TCGCCATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423097 6 + 636262 ---CCATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 429316 9 + 647215 TCGCCGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 275435 278 + 294542 TCTATTGACTCATGCCAGTGCAACACACATAGTCCCTGTGATTTGCACTAAGTGAGCTGATTGTACATGAAATCTCTCATAATCTCTCTGGTACCAAAATAACTCCTACTACCAAGTGTGATCTGTGCATACACCAGTACCTTATAGATTCCAACAATTGGGATCACCTACAGAGAGACAAAAAACGTACAGACCTGTTTTGTCCCCTCTTCTATGTCGTAGGTTCATAAAGACTAGACACATGAGGACATAGAAGATGAGTACTGTACATTTCCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423104 273 + 636262 TCTATTGACTCATCCCAGTGCAACACACATAGTCCCTGTAATTTGCACTAAGTGAGTTGATTGTACATGAAACCTCTCATAATCTCTCTGGTAACAAAATAATTCCTACTACTAAGTGTGATCTGTGCATACACTAGTACCTTATAGATGCCAACAATTGTGATCACCCATAGAAAGACAAAAGACTTAC----CTGTTATGTCCCCTCTTCTATATCGTGGGTTCATAAAGACTAG-CACATGAGGACATAGAAGATGAGTACTGTACATTTCCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 429325 271 + 647215 TTTATTGACTCATGCCAGTGAAGCACATTTAGTCTCTGTGATTTGCACTAGGTGAGCTAATTGTGCATGAACTCTCTTATAATCACTCTGGTACCAAAATAACTCACACTACCAAGTGTGATCTGTGCATACACCAGTACCTTATAGATTCCAACAATCGGGATCACCTACAGAGAGACAAAAAACGTACAGACCTGTTTTGTCCACTCTTCTAGGTCATAGG-------GGACTAGACGGGTGAAGACATAGAAGATGAGTATTGTACATTTCCCAT - -a -s mr.mrrefChr5 275713 118 + 294542 ACATACCCAGCGAAGGAAGTCTGGTATAGGATTACAATTCCATTCATCCACCACGGGCCATCAGTCAACTCAACTCATCTGGTCTCAAATTAAACATAACTTCGCACCCTCTAAGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423382 118 + 636262 ACATACCCAGCGAAGGAAGTCTGGTATAGGATTACAATCCCATTCATCCACCATGGGCCATCAGTCAACTCAACTGATCTGGTCTCAAATTAAACATAACTTGGCAGCCTCTAAGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 429596 111 + 647215 ACAAACTCAGTGAAGGAAGTTTGGTATAGGATTACAAGTCCGTTCATCCACCACAGGCCA-------ACTCAAATCAACTGATCTCAAATTAAATATATCTTCGCACCCTCTAAGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 275831 9 + 294542 CCTTTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423500 9 + 636262 CCTTTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 429762 9 + 647215 CCTTCTTAC - -a -s mr.mrrefChr5 275840 149 + 294542 CAACCATTTGAAAGCTATAAAGCATGAACATTGCCAAAACTTTAAGAGAGACCTTAGACTTAGGATGAGAGGCATCTGAACTGTGCTGTGACTCCACTTGGGGCTGTTTAAGCATTACAATCAAGGATGGTAGATGGTGAAGTAAGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423509 149 + 636262 CAACCATTTGAAAGCTATAAAGCATGAACATTGCCAAAACTTTAAGAGAGACCTTAGACTTAGGATGAGAGGCATCTGAACTGTGCTGTGACTCCACTTGGGGCTGTTTAAGCATTACAATCAAGGATGGTAGATGGTGAAGTAAGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 429779 12 + 647215 CTACCATCTGAG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 275989 17 + 294542 GATGTTATTAATCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423668 17 + 636262 GATGTTATTAATCTAAG - -a -s mr.mrrefChr5 276006 87 + 294542 GGGGCAATGGTTGTGTAGATATAGGATGAACATCCTCTACCCAGTATTGTATTGTGGTTATCATGTGGACTCACCATGATGCACAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423686 87 + 636262 GGGGCAATGGTTGTGTAGATATAGGATGAACATCCTCTACCCAGTATTGTGTCGTGGTCATCATGTGGACTCACCATGATGCATAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 429791 60 + 647215 ---------------------------GAACATCCTCTACACAGTATTGTATTATGGTTATCATGTGGACTCACTATGATGCACAGT - -a -s mr.mrrefChr5 276093 215 + 294542 ACATCAAAGCCAGTCATGTGCAACAGTAAAATTGTCTAATCTTACTCCTTGTCTGCAAGAACACTCCTCTAACATCCTGATAGATTTAAATTCCTTACGAGACATCATGTTGTGTTGTATTCTCCTTTAGGAACAATGTATGACTGAACCTGCACACCCTGCAAGTGGCAATGCTACAAGTTGATTGATCACCTTACACCATTAGTGAAATGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423773 215 + 636262 ACATCAAAGCCAGTCATCTCCAACAGTCAAATTGCCTAATCTTACTCCTTGTCTGCAAGAACATTCCTCTAACATCCTGATAGATTTAAATTCCTTACGAGACATCACGTTGTGTTGTATTCTCCTTTTGGAACAATGTATGACTGAACCTGCACACCCTGCATGTGGCAATGCTACAAGCTGATTGAGTACCTTACATCTTTAGTGAAGTGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 429861 215 + 647215 AAATCAAAGCCAGTCATGTGCTACAGTAATATTGTCTAATCTTACTCCTTGTCTGCCAGACCACTCCTCTAACATCCTGATAGGTTTAACTTCCTTCCGAGACAGCATATTGTGGTGTATTCCCCTTTAGGAACAATGTATGGCTGAACCTACAAGCTCTGCAAGTGTTAATGCTGCAAGTTGATTGATCATCTTACACCATGAGTGAAATGTGG - -a -s mr.mrrefChr5 276308 13 + 294542 CTTTTTTTAGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423989 13 + 636262 CTTTTTTTAGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 430076 13 + 647215 CTTTTTTTAGTCC - -a -s mr.mrrefChr5 276321 126 + 294542 CATGCTGAAAACCCTCACTATAAAGTCTTTACTAGACACAGTACATATATAAGATGAACCACATAAACAAAGCACCAACTAATGGACGGTCTCGTATCATGGCCTGCATGCCATCCCCAAAAATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424003 120 + 636262 CATGCTGAAAACCATCACTATAAAGTTTTTACTAGACACAGTACATATATAAGATGAACAACATAAACAAAGCACCAACTAA-----GGTCTCGCATCATGACCTGCATAC-ATTCCCAAAAATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 430089 126 + 647215 CATACTGACAACCCTCACTATAAAGTCTTTAATAGACACAGTAAATATACAAGCTGGACCACATAAACAAAGGACCGAGTACTGGACGGTCTGGTGTCATGGCCTGCATGCCATCCCCACAAATAG - -a -s mr.mrrefChr5 276447 336 + 294542 TGATGTTGGCTATTGCTTTTTTGTGTCTTCTCTGCCCTCTTCTTATTCTTGTTCCACACTCAAGTTAAACAAGTGTAGCTTGTCAACCAATTCTTTCACAGGTATTGTCAACTTCCAACGGTTAGTCAATGGAACACTGGTCAAAATAGCACTCTAATAGCAGTTCAAAGCATAATACTACATTTTTTAACAAAGTCAAGTACTATGTCTTTGAACATCTAGGGCTTTGAACATTGAACTGGCCTAAGCCCTGACATCTGTGATAGCCCTAGCCATGCAAAATAATCCAAGCTTGTGGTACATGGCAGTGGGATCCTCATCTGTGACACTCTGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424124 324 + 636262 TGATGTTGGCTATTGCCTTCTTGTGTCTATTCTGCCCTCATCTTATTCTTGGTCCACACTCAA------------TAGCTTGCCAACCAATTCTTTCACAGGTATTGTCAACTTCCAACGGTTAGTCAATGGAACACTGGTCAAAATAGCACTTTAATAGCAGTTCAAAGCACAATACTATATTTTTTAACAAAGTCAAATACTATGTCTTTGAACATCTAGGGCTTTGAACATTGAACTGGCCTAAGCCCTGACATCTGTGATAGCCCTAGCCATGCAAAATAATCCAAGCTTGTGGTGCATGGCAATAGGATCCTCATCTGTGATACTCTGATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 430215 325 + 647215 TGATGTTGGCTATTGCTTTTTGGCGTCTTCTCTGCCCTCTTCTTATTCTTGTTCCACACTCAAGTTAAACAAGTGTAGTGTGTCAACCAATTCTTTCACAGGTGTTGTCAACATCCAACAGTAAGTCCATGGAACACTGAGCAAAAAAGCAGTCCAACAG-----------ATAATACTACATTTTTTAACAAAGTCGGGTCCTATGCCTTTGAACATCTATGGCTTTGAACATTGAACTGGCCAGAGCCCTGGCATCTGTGATAGCCTTTGCCACACAAAATAATCCAAGTTTGGGGTACATGGCAGTGGGATCCTTATCTGTGACACTCTAATC - -a -s mr.mrrefChr5 276783 189 + 294542 AGTGACCCCTTTGGACCTGGGATGAAGGGTGTCGTGTCCTTCTAAAGGTGCTTGCAATCAGATGACAGCATGTGAAGTGGGCACATGAGCCAGGCAGGGTCCTCCTACAGGTGCCTGTAATCACTTGAGAGCGCATAAGTGGGGCCGGCTCAGAGCCACGCACTAACCATGTGCACATGGCCACATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424448 189 + 636262 AGTGACCCCTTTGGACCTGGGATGAAGGGTGTCGTGTCCTTCTAAAGGTGCTTGCAATCAGATGACAGCATGTGAAGTGGGCACATGAGCCAGGCAGGGTCCTCCTACAGGTGCCTGTAATCACTTGAGAGCGCATAAGTGGGGCCGGCTCAGAGCCACGCACTAACCATGTGCACATGGCCACATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 430542 189 + 647215 AGTGAACCCTTTCGACTTGGGATGAATGACGTTGTGTCCCTCTAAAGGTGCTTGCAATCACTTGACAGCATGTGACATGGGCACGTGAGGCAGGCAGGGTCCTCCTACAAGAGCTTGTAATCATTCGAGAGTGCATAAGTGGGGCAGGCTCAGAGCTACATGCTAACCACGTGTATGTGGCCACATTTG - -a -s mr.mrrefChr5 276972 16 + 294542 CCTTTCATTGGAGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424637 16 + 636262 CCTTTCATTGGAGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 430740 16 + 647215 TCATACAGTTCAACTA - -a -s mr.mrrefChr5 276988 9 + 294542 TACATGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424653 9 + 636262 TACATGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 430759 9 + 647215 CACTTGTAG - -a -s mr.mrrefChr5 276997 9 + 294542 GCTGTGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424663 9 + 636262 GCTGTGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 430768 9 + 647215 GCGGTGTAA - -a -s mr.mrrefChr5 277006 97 + 294542 TTAAGATTGTTTCTTCTATAGGCTTCTAAGGTGCCTGTTGGAATGATGACTCAACAACACCTCCTAAAAGTTTAGTTGACCTGTAGGGTAAATGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424685 97 + 636262 TTAAGATTGTTTCTTCTATAGGCTTCTAAGGTGCCTGTTGGAATGAAGACTCGACAACACCTCCTAAAAGTTTAGTTGACCTGTATGATAAATGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 430777 93 + 647215 TTGAGTCTTTCACTGCAACAGGCACCTAAGAAGCCTATAGGAAACATGATTTAACA----TTGTTGAGAATTTGCACAGCACCTTGTGTAAAGCTCC - -a -s mr.mrrefChr5 277103 14 + 294542 CTGGGCCACACAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424782 14 + 636262 CTGGGCCACACAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 430879 14 + 647215 CTGGTCCACAAAGT - -a -s mr.mrrefChr5 277117 27 + 294542 ATGTAGTCTGAAGTATCAGTTAGAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424796 27 + 636262 ATGTAGTCTGAAGTATCAGTTAGAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 430894 27 + 647215 ACATAGTCTGAAGTATTGGTTAGAGTC - -a -s mr.mrrefChr5 277144 30 + 294542 CAGTTACCTAGGGATGAGTGGCTGTGGGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424823 30 + 636262 CAGTTACCTAGGGATGAGTGGCTGTGGGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 430922 30 + 647215 CAGTTACCTGGGGATGAGTGGCTATTGGGT - -a -s mr.mrrefChr5 277174 92 + 294542 AGGTCCCTGTCTAAACTCAGTGGATCAGTGGTTTGAGCGCTGATGAATGGGTGCAGATAAACCTGATGCATGAAGGGTGCAGCCCTATGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424853 88 + 636262 ATATCCCTGTCTAAATGCAGTGGATCAGTGGTCTGAGCGCTGATGAATGGGCACAGATAAACCTGATGCATAAAAGGTGCAGCCTTAT---- -s simRat_chr6.simRat.chr6 430989 91 + 647215 AGGTCCCTGTCGAAACTCAGTGTCTCAGTGGCTTGA-GGCTGATGAATAGGTGCAGATAAATCAGATGCATGGAGAGTGGAGCCCTATGTCA - -a -s mr.mrrefChr5 277266 23 + 294542 CAATCCAGCCCTCCATTATGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424941 22 + 636262 -AATCCAGCCCTCCATTATGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 431084 23 + 647215 CAACCCAGCCCTCCATTATTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 277289 452 + 294542 CTTGCCAGTTATATAAGTCATCTTTGTTAGTGCTTATGGGTGCCTTCTGTCTTTTGGGCTGACAGTCAAAGCAAGAACCAGGCTAAGTAGTAGGCAGGGAGAGTAGGTGAGTGGAATCTTAACTATGTCTAATCCCTGATAGCCAACAACAGGCTAGTTTAATCAGCAACATATTTTTATTGCTGGGTCCCCTTGGATCTACTACTTAGAGTGGCTCTTGTATCTTAATCTGTAAGTAAACATCTGGCTGCAGACATTCAAGGCATGTTATCAAATCCATGCCATATAATGAACATATCCGATATCTCATGGCCATGTGACAGGTACAGTGTACGACACAGCATTCCCCATGAGGCAAGTTCCCTTCAGTGGTCTTACTAATTCCAGCTATACATGCCCTTTACTGTGACCTTATGCCCCTACTTACCAGCAGTATTGTCAATCCTAGAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424963 414 + 636262 CTTGCGAGCTATATAAGTCGTCTTTGTTACTGCTTCTGGGTGCCTTCTGTCTTTTGGGCTGACAGTCAAAGCAACAACAAGGCTAAGTAGTAGGCAGA---AGTAGGTGAGTGGAATCTTAACTATGTCTAACCCCTGATAGCCAACAACAGGTTAGTTTAATCAGCAACATATTTTTATTGCTGGGTCCCCTTGGATCTACTATTTAGAGTGGCTCTTGTATCTTAATCTGTAGGTAAACATCTGGCTGCAGACATTCAAGGCGTGTTA-----------------------------------CTCATGGCCATGTGACGGGTACAGTGTACGACACAGCATTCCCCATGAGGCAAATTCCCCTCAGTGGTCTTATTAATTCCAGCTATGCATACCCTTTACTGTGACCTTATGCCCCTACTTAACAGCAGTATTGTCAATCCTAGAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 431108 429 + 647215 CTTGGCAGTTATTTGAGTCATCTTTGTTAGTGCCTA-------CCTCTGTCTTTTG-A------GTCAAAGCAAGAACCAGGCTAAGTTGTAAGCAGGGAGAGTAGGTTAGTGGAATTTTAACTATGTCTAATCTCTGATAGCCAACAACAGGCCAGTTTAATCAGCAACCTATTTTTATTGCTATGCCCCCTTGGGTCTACTGCCTAGACCGGCTCTTGTATCTTACTCTGTAAGTC---------CTGCATACATTCAAGGCACGTTATCAAATCCATGCCATATAATGAACATATCCGATATCTCACGGCCATGTGACAGGTACAGTGTACGACACTGCATTCCCCATGAGGTAAGTTCCCTTCAGTGGTCTTACTGATTCCAGCTATACATGCCCTTTACTGTAACCTTATGCACCTACTTACCAGCAGTATTGGCAATCATAGAACT - -a -s mr.mrrefChr5 277741 11 + 294542 CTATTAACGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425377 11 + 636262 CTATTAACGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 431541 11 + 647215 CTATTAACGCT - -a -s mr.mrrefChr5 277752 36 + 294542 GGTGCAGTGCTTGAAATTGTACCTTATTATAATCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425388 33 + 636262 GGT---GTGCTTGAAATTGTTCCTTATCATAATCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 431554 36 + 647215 GGTGCAGTGCTTAAAATTGTACCTTATTATAATCTT - -a -s mr.mrrefChr5 277788 47 + 294542 ATCTGCCTAGTCTAAAGGCTTGTCAGATAAATTAGCTTAGTTCCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425421 47 + 636262 ATCTTCCTAGTCTAAAGGGTTGTCAGATAAATGAGCCTAGTTCCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 431591 40 + 647215 CTCTGCCTAGTCAAGGGGCTTGTCAGTTAAATTAGCTTAG------- - -a -s mr.mrrefChr5 277835 7 + 294542 GTCTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425528 7 + 636262 GTCTGTG - -a -s mr.mrrefChr5 277842 19 + 294542 TAACTATTGCATCCCCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425536 19 + 636262 TAACTATTGCATCCCCCTT - -a -s mr.mrrefChr5 277861 16 + 294542 AGTTTAACATGGATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425556 16 + 636262 AGTTTAACATGGATAC - -a -s mr.mrrefChr5 277877 333 + 294542 TGATTGCCCAAGTGTCACTCTTATAGTTCTGACTTTTATATTATCCAGAGGACATGCATGTCAGGAGACATGACATACTCAAAATGGAGTGGCATGTGCTGTTTGACTAGTCTGTCTTTCCTGGCCCATGTAGATTATGGGAGGGAGCATCTAGCAGAAGGGTTTTCAGCCACAAATTAGTTGCTTGCCAGAAACTTGTAGCAGGTGTAGGGAGCGTCCCTGTAATTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTCACCATCTCAAATGTAGGGCTGGTGATGTATTCCAGGATTCTGCAAGATAAGATTGAAAGTGGCTAGTCATAGCTGTTGAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425574 327 + 636262 TGATCACCCAAGTCTCACTCTTATAGTACTGACTTCTATATTATCCAGTGGACATGCATGTCAGGAGACATGACATACTCAAAATGGAGTGACATCTGCTGTT------GTCTGTCTTTCCTGGCCCATGTAGATTATGGGAGGGAGCATCTAGCAGAAAGGTTTTCAGTCACAAATTAGTTGCTTACCAGAAACTTGTAGCAGGTGCAGGGAGCGTCCCTGTAATTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTCACCATCTCAGATGTAGGGCTGGTGATGTATTCCAGGATTCTGCAAGATAAGATTGAAAGTGGCTAGTCATACCTGTTGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 431631 324 + 647215 --ATTGCCCAAGTGTCACGCCTATAGTTCTGTCTTTTATATTATCCAGAGAACATGCATTTCAGGAGACATGACATGCCCAAAATGGAGTGGCATGT-CTATTTGACTAGTCTGTCT------ACCCATGTAGATTATGGAAGGGAGCATCTAGAAGAAGGGTTTTTGGCCACAAATTAGTTGCTTGTCAAAAACTTGTAAAAGGTGTAGAGAGCATCCCTGTAACTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTTACCATCTCAAATGTAGGGCTGATGGTGTATTCTAGGATTCTGCAAGATGAGATTGAAAGTGGCTAGCCAGAGCTGTTGAGC - -a -s mr.mrrefChr5 278210 69 + 294542 AGCCGCTGTACTTTCCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCCCTATTTTACTATATCTGTGTAGTAGTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425905 69 + 636262 AGATGCTGAACTTTTCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCCCTATTTTACTATATATGTGTAGTAGTTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 431955 69 + 647215 AGCCGCTGTTCTTTCCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCGCTATTTTACTGTATCTGTGTAGTAGTTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 278279 15 + 294542 CCTGTTAGCCAGCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425999 15 + 636262 CCTGTTAGCCAGCCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 432024 15 + 647215 TCTGTTAGCCAGCCA - -a -s mr.mrrefChr5 278294 120 + 294542 TGCTGCTATGCGGGACAGAAGACCAAGCCAAACAAGGAAAAGAACTTATGGAGATTTGGGTATACCATAAGAGCAGTGGTCTGGGTTTGCTGTGCACCTGTGACTGGACTGAGGGTCTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426014 120 + 636262 TGCTGCTATGCAGGACAGAAGACCTAGCCAAACAAGGAAAAGAACTTATGGAGATTTGGGTATACCATAAGAGCAGTGGTCTGGGTTTGCTGTGCACCAGTGACTGGACTGAGGGTCTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 432040 118 + 647215 TACTGCTATGCGGGACAG--GACCAAGTCGAACAAGGAAAAGAACTTATGGAGATTTGCATATACCATAAGAGCAGTGGTCTGGTTTTGCTGTGCACCTGTGACTGGACTGAGGGTCTTC - -a -s mr.mrrefChr5 278414 532 + 294542 ACCACTGGCTCCTTATAATGACACAGACCCAGAAAGCAGAGAAGGGAGGAGTTGCTGGAGTACCTGGAAATTGCTGATACATATTTTGCATATGAAACAGTAGAATCATTCTTCAGTTGCATAGGTGCTAGATCAGCTTTTAACATTGAGCTTACTTAGGGATGATTCCTCAAGATGGTGTGAACAGATGTGTGTTATACTTGGGGTCCACAGTGACAATCCTGGTTGCTCTCTGAGGGTACAGTGATTATAACTTCTCAAGAGAAATTCTGATTAAGCCATGATATGGTATAGCAATCATACCTGTTCCTTGGTATCTTGGGTGGAAGGGAATCAAACACAGTTTCAATACTAGTACCTGCTGATCGACATCTCCTGTTGTGATAATAAGCAAGCTCAGGAAATGGCCTAAAAAGTTGGTTTTCAATTGGATACTGTTATGTGCAAATAGTAATAGAATCACGTCATGACAAGAAGAAGCTATTCAAAGCAGCTTAATGGATGATTTGTGCAAATAGTTTGTGTCTTAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426134 486 + 636262 ACCACTGGCTCCTTATAATGAC-------CAGGAAGCAGAGAAGGGAGGAGTTTCTGGAGTACCTGGAAATTGCTGACACATGCTTTGCATATGAA-CAAAAGATTCATTCTTCAGCTTCATAGGTGCTAGATCAGCTTTTAACATTGAACTTAATTAAGGAGGATTCCTCAAGATGGTGTGAACAGATGTGTGTTATACTTGGGGCCCCC---------------TGCT---TGAGGGTACAGTGATTATAACTTCTCAAGAGAAATTCTGATTAAGCCATGATATGGTATAGCAATCATACCTGTCCCTTGGTATCTTGGGTGAAAGGGAATCAAACACAGTTTCAATACTAGTACCACCTGATAAACATCTCCTGTTGTGATAATAAGCAAGCTCGGGAAATGGCATAATCAGCTGGTTTTCAATTGGATACTGTTATGTGCAGATA--------------------CAAGAAGAAGCTATCCAAAGCAGCTTAATTGATGATTTGTGCAAATAGTTTGTGTCTTAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 432161 522 + 647215 GCCACTGGCTCCTTATGATGACACAGACCCAGACAGCAGAAAAGAGAGGACTTGCTTGAGTACCTGGAAATTGCCAATATACATTTTGCATATGAAACAGTAGAATCATCCTTCAGTTGCATAGGCGCTAGATCATCTTTTAACATTGAGCTTACTTAGGGATAATTCCTCAAGATGGTGTGAACAGATGTGTGTTATACTTGGGGTCCACAGTGACAATCCTGGTTGCTCTCTTAGTGTACAGTGATTATAACTTCTCAAGAGTAATTCTGACTAAGCCATGATATGGTATAGCAATCATACCAATTCCTTGGTATCTTGGGTGGA-TGGAATCAAACACAGTTTCAATACTAGTACCTGAAGTTCGGCATCTCATGTTGTGATGATCAGC----TCAGGAAATAGCCTAGAAAGTTG-TTTTTAATTGAATACTGTTATGTGCAAATAGTAATAGAATCACGTCATGACAAAAAGAAGCTATTCAAAGC----TTGTGCAAATTTTGTGCAACTAGTTTGTGTCTTAATC - -a -s mr.mrrefChr5 278946 21 + 294542 TCATGTCACCAACAGTTAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426620 21 + 636262 TCGTGCCACCAACAGTTAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 432684 21 + 647215 TCATGTCATCAGCAGTTAGAG - -a -s mr.mrrefChr5 278967 88 + 294542 CCCCAGGATTCAACTATTCAGCCTTTTTCCGAAAAACCACAAAATAGAACCAACAGCTTGTATTAATAAGCAAATAAACTGACTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426641 88 + 636262 CCCCAGGATTCAACTATTCAGCCTTTTTCTGAAAAACCACAAAATAGAACCAACAGCTTATATTAATAAGCAAATAAACTGACTCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 432711 88 + 647215 CCCCAGAATTCAACTATTCAGCCTATTTCCGAAAAACCACCAAATAGAACCAACAGCTTGTATTAATAAGCCAATAAACTGACTCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 279055 203 + 294542 TCCTGCAACTCTTCATGGTACTCAAAAATAGCTGCCCATTTGCAAGCTTGGATTACCTGACTTGTCTCAGCTTAAATTGCAAAGAAGATTTTGTATGTAGGGTAGATGCTTTCCAAAAGATGGTTTAAGTCGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGACAACACTCATAAGATTCACATCCGCCAATGTTTTATAAGGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426737 203 + 636262 TCCTGCAACTCTTCATGGTACTCAAAAATAGCTGTCCATATGCAAGCTTGGATTAACTGACTTGTCTCAGCTTAAATTGCTAAGAAGATTTTGTACATAGGGTAGATGCTTTCCAAAAGATGGTTTAAGTCGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGACAACACTCATAAGATTCACATCCGCCAATGTTTTATATGGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 432799 198 + 647215 TCCTGCAACTCT-----GTACTCAAAAATAGCTGCCCATTTGCAAGCTTGGATAACCTGACTTATCTGAGCTTGAATTGCAAAGAAGATCTTGTATGCAGGGTACATGCTTTCCAATCGATGGTTTAAATTGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGAAAACACTCATGGGATTCATATCCGCCAATGATTTATAAGGTTC - -a -s mr.mrrefChr5 279258 28 + 294542 AGTAGCCTGGTTGCCTTTTTTCATGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426941 28 + 636262 AGTAGCCTGCTTGCCTTTATTCATGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 432997 28 + 647215 AGTAGCCTGGTTGCCTTTTTTCATGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 279286 237 + 294542 CAGTGTGTCGTCACACTCCAGACTCAGGTGTAATATTGCTGCAACAAGAAACTCACTCATGTAGGATTTAGACTTTCATTACCCATAAAGCTGGAGCAAGCAGCCAAGTGAATGTAGTAGGCTATGAGCCACAAATGAGTCTTCATCAATAGCCCAGAAATTCATAGCCCTCAGTTATCCTGAACCATGATTCCATTGGGGAAGGAGTTTATAGTCATCAAAGTGGGTACACTCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426969 235 + 636262 CAATGT-TCGTCACACTCCAGACTCAGGTGTGATATTGCTGCTACAAGAAACTCACTCATGTAGGATTTAGACTTTCATGACCCATAAAGCTGGAGCAAGCAGC-AAGTCAATGTAGTAGGCTATGAGCCACAAATGAGTCTTCGTCAATAGCCTAGAAATTCATAGCTCTCAGTTATCCTGAAGCATGATTCCATTGGGGAAGGCGTTTATAGTAATCAAAGTGGGTACACTCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 433026 237 + 647215 CAGTGTGTTGGCACACTCCAGACTCAGGTGCAATGTTGTTGCAACAAGAAACCCACTCATGTAGGATTTAGACTATCATTACTCTCAAAGTTGGAGCAGGCTGCCAAGTGAATGTATAAGGCCATGAGCCACAAATGAGTCTTCATCAATAGCCCAGACATTCATAGCCCTCAGTTAGCCTGAACCATGATCCCATTGGGGAACGAGTTTATAGCCATCAAAGTGGGTGCATTACTG - -a -s mr.mrrefChr5 279523 35 + 294542 TCCCCTGTGATGTCACATGGCCCAAACAAGTGATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427217 35 + 636262 TCCCCTGTGATGTCACATGGCCCAAACAAGTGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 433263 35 + 647215 TCCCCTGTGGTGTCACATGGCACAAACTAGTGATT - -a -s mr.mrrefChr5 279558 197 + 294542 AAGATGTCTATGCAAACTGTGTCTATTTTGATCCAATACCTTAGCCCTGACTGAACCCTAAACAAGACACATAGTAGTAGGATGATTTCTGCAGGTGCACAATCCATCCTCATAGGGGTAATCTCAGGAATGCTTACTCCATATCAACCTCTTTGCTGCCCTTCTGTGCATTCGCTGTTGGTATTAATATCAGTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427252 188 + 636262 AAGATGTCTATGCGAATCGTGTCTATTTTGATCCAATACCTTAGCCCTAA--GCACCCTAAACAGGACACATAGTAGTAGGGTGATTTCTGCAGGTGCACAATCCATCCCCATAGGGATAATCTCAGGAATGCTTACTCCATATCAACCTTTTTGCTGCCTTTCTGTGCATTCGCTGTTGGTATTAATAC------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 433299 197 + 647215 AAAACGTCCTTGCAAACTGTGGCTATTCTTATTGCATATCTTAGCCCTGACTGAGCCCTGAACAAGAGACATAGTAGTAGGATGTTTTCTGCGGGTGCACAATCCATCCTCATAAGAGTAATCTCAGGAATACTCACTCCATATCAACCTCTTTGCTGCCCCTCTATGCATTCACTGTTGGTAATAATATCAGTCAG - -a -s mr.mrrefChr5 279755 20 + 294542 AGGTGTAGCATAAATTGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427440 20 + 636262 AGGTGTTTCATAAATTGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 433502 20 + 647215 AGGTGTAGCATAAATTGATG - -a -s mr.mrrefChr5 279775 603 + 294542 CAGTAGACTATGGGATTAGTATGCTATCTTCTACACCTATAGCAGTCCATTCACATCATCCTGAGGTAAGAATACGACTGGAGCGTATTGCAATTTTCACTGGCCATACTAAGTCTATTAGAGTTGTTTAAGTAGTCATGTTTGCTACCATTTGGATAACTTATTATTAATGTTGTTTAACTGGACTTGGACGCATCCTCTCAATGAGAGAGGTACCCTGTTCCCAATTTGAATGAGTGTTTTGGCACTCACATATAGTGCATCTGATCATAATATAAGCCCCATGATGAGCATTTGCAGGGCAAGATCTGTAAAAGAATGATTCTTCTGACGGAAAATATAGGTTGGGCTAGCTGGTAATGAAAAATCTCATGTCAGTGGATGTGAAGGTATAATAGACTTCATTGTATTATCAACTTTGTTTAGGCTTGGAACTTGGGCAACATACTATACTGTATTTGCTTGCATAAGATTGTTGGTTAACATGGCATTAGTATGACCTTGCTGGCCATGTTTCCAGATATGTATCCTGTTTTCTATTAAGTCTGATCTTCCAATAATAGTGAACCTGACCCAACTGTTCCAGTGATCTGCTGGGCATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427460 524 + 636262 CAGTAGACTATGGGATTAGTTTGCTGTCTTCTAAACCTAAAGCATTCCATTCACATCATCCTGAGGTATGAACACGACCGGAGCGTATTGCAATTTTCACTGGCCATACTAAGTCTATTAGAGTTGTCTAAGTAGTCATGTTTGCTACCATTTGGATAACCTATTATTAATGTTGTTTGACAGGACTTGGACGCATCCTCTCAATGAGAGAGGTACCCTGTTCCCAATCTGAATGAG--------CACTACTATATAGT--------------------------------------CTTGGCAAGATCTGTAAAAGAATGATTCTTCTGATGGAAAATATAGGTTGGGCTAACTGCTAATGATAAATTTCATGTCAGTGGATGTGAAGATATAATAGACTTCATTGTATTATCAACTTTGTTTAGGCTTGGAACTTGGGCAACATACTATACTGTATCTGCTTGCATAAGATTGTTGGTTAATGTGGCATTAGTATGACCTTGCTGGCCATGTTTCCAGATATGTATCCTGTTTTCTATTAAGTCTGATCTTATAATAATAGTGAACCT--------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 433523 588 + 647215 CAGTAGATCATGG-ATTAGTATGCCATCTTCTACACCTATAGCAGTCCATTCACATCATCCTGATGCTAGACTACAACTGGAGCCTGTTTCAGTATTCACTGGCCGTACTAAGTCTATTAGAGTTGTTTATGTAGTGATGTTTGCTACCATTTAGATAACTTATTGTTAAAGTTATCTAATTAGACTTAGACGCATCCTCTCAATGAGAGAGGTACCCTATTTCCAATTTGAATGAGTGTTTTGGCACTCACATATAGTGCATCTGATCATAATATAAGCCCCATGATGAGCATTTGCAGGGCAAGATCTGTAAAAGAAC-ATTCTTTTGACGGAGGATATAGGTTTGGCTGGCTGGTAATGAAAAATCTCATGTCAGTGGAGGTGAGGGTATAACAGACTACATTGTATCATCAGCTTTGTACAGG-TTGGACCTTGGGCAGCACTATATCCTCCATTTGCTTGCATAAGGTTGTTGGTTAACATGGCATGAGTATGACCT------CAATGTTTCGAAATATGTATCCTGTTTTCGATTAAGT------TTCCAACAATAGTGGACCTGACCCAACTGTTCCAGTGATCTGCTGGGCATTT - -a -s mr.mrrefChr5 280378 10 + 294542 TGCTATTCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 434118 10 + 647215 TGCTATTCAA - -a -s mr.mrrefChr5 280388 30 + 294542 TTGCTTTATTCACTACATACTTGGCTGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427984 18 + 636262 ------------CTACATACTTGGCTGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 434154 30 + 647215 TTGCTTTATTCACTATATACCTGGCTGTAC - -a -s mr.mrrefChr5 280418 161 + 294542 TCTAGAAGTATTCCACTCCTGAGACGACTGACCTTGGCCCATCTTCAAGTACACACCAAGGGGCAGTCCAGGCAGGTACCCTGGGAAGCTGACCAGGATTCTCCAATTTTTCATCCTAATGCCAAGGACATTGCATATGAGCTTTGTAGGCTCACTATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428002 161 + 636262 TCCAGGAGTATTCCACTCCTGAGACGACTGACGTTGGCTCATCTTCAAGTACACACCAAGGGGCAGTCCAGGCAGGTACCCTGGGAAGCTGACCAGGATTCTCCAATTTTTCATCTTAATGCCAAGGACATTGCATATGAGCTTTGCAGGCTTACTATGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 434192 161 + 647215 TCTACAAGTATTCCACTCCTGAGATGATTAACCTTGGCCCAACTTCAAGTACACACCAAGGGGCAGTCGAGGCAGGTACCCCGGGAAGCTGACCAGGATTCTCCAATTTGTCATCCTAATGCCAAGGACATTGCATATGAGCTTTGTAGGCTCACTATGTG - -a -s mr.mrrefChr5 280579 29 + 294542 CAGTGTCCAGAGGTTAACTTGTTATACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428163 29 + 636262 CAGTGTCCAGAGGTTAACTTGTTATACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 434358 20 + 647215 CCATGTGCAGAGGTTGACTT--------- - -a -s mr.mrrefChr5 280608 65 + 294542 GTCCTATCTTTGACAATGGCTAATCTAGTCCATTGTTCTATTTCTGAACAGAAGAAAGCAGATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428193 65 + 636262 GTCCTATCTTTGACAATGGCTAATCTAGTCTATGGTTCTATTTCTGAACAGAAGAAAGCAGATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 434378 39 + 647215 --------------------------AGTCCTATGTTCTATTTCTGCATAGAAGAAAACAAATTC - -a -s mr.mrrefChr5 280673 47 + 294542 TAGTTTACATTGGTTAAAACATTAAGTGCTCTAAGATGACATGTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428258 47 + 636262 TATTTTACATTGATTAAAACATTAAGTACTATAAGATGACATGTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 434421 47 + 647215 TAGTTTACATTGGTTTAAACATTAAGTGCTCTAATATGACACGTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 280720 170 + 294542 CACCCATGGAGTAATTCCAGAGTGACAAAGACCTGGGTATTGTATTATTTGTAGTCTTTCATGCTATCTGGAGGCTTTTGGTGTAGCCTCAAATTGCATCTTGGCTGGTGATTTTCAATACCTCACATGTATGGCAAACTAAAGAATCCACTAAAAGAGGAGAGTAGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428306 170 + 636262 CATCCATGGAGTAATTCCAGAGTGACAAAGACCTGGGTATTGTACCATTTGTAGTCTTTCATGCTATCTGAAGGCTTTTGGTGTAGCCTCAAATTGCATCTTGGCTGGTGATTTTCAATACCTCACATGTATGGCAAGCTAAGGAATCCACTAAAAGAGGAGAGTAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 434468 170 + 647215 CACCCATGGAGTAATTCCAGGGTGACAGAGAGCTGGGTATTGTATTATTTGTAGTCTTTCATGCTACATGGTGACTTGTGGTGTAGCCTCACATTGCATCTTAGCTCATGATTTTCAATACCTCACATGTATGGCAAACTTAAGAATCCACTAAAAGAGGAGAGTAGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 280890 192 + 294542 ATCTCTAGCCTGGTGGATGTACATATGTGCAGTCCACCCACTTTCTGAAACACAGAGCTTTAGGTCCAGACTCCACCACTGGGTCTTGAAATGTGGTTCTTGTCAAAAACAGGCAGTAGACTCTAACAAAGTCCGAGTTAGCTGAAGGTTCAAACCGTAAGTGACTAAGCTTGCAATGCTTTTAGCCTTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428479 178 + 636262 ATCTCTAGTCTGGTGGATGTACATATGTGCAGTCCACCCACCTTTTGAAACACAGAGCTGTAGGT--------------TGGGTCTTGAAATGTGGCTCTTGTCACAAGCAGGCTGTATACTCTAACGAAGTCCGAGTTAGCTGAAGGTTCAAACCGTAAGTGACTAAGCTTGCAATGCTTTTAGCCTTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 434638 185 + 647215 ATCTCTAGCCTGATGTGTGTACCTATGGACAGTCCACCGACTTTCTGAAACACAGAGCTTTAGGTCCAGACTCCACCACTGGGTCTGGAAATGTGGTTCTTGTCAAAAACAGACAGTAGACACTAACAA-------GTTATCTGAAGGCTCAAACCCTAAGTGACTGAGCTTGCAATGATTTTAGCCCTTAC - -a -s mr.mrrefChr5 281082 167 + 294542 AAGAACGCTCTATGTCAAGGCTGAAAATCTCCAGGTGTTAGCTTTTAGTGCTTACAAGGACACTTCCATGTCAAGGCTGAAAATCTCCAGGTGTTAGCCATATCAAAAGTAAATATGAAGGGTTAGGTATACCTTGACTGGAGATCTTGTCAATTGCCGAATTGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428657 167 + 636262 AAGAACGCTCTATGTCAAGGCTGAAAATCTCCAGCTGTTAGCTTTTAGTGCTTACAAGGACACTTCCATGTCATGGCTGAAAATCTCCAGGTATCCGCCTTATCAAAAGTAAATGCAAAGGGTTAGGTATACCTTGACTGGAGATCTTGCCAATTGCCAAGTTGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 434829 167 + 647215 AAGGACACTCCATGTCAAGGCTGAAAATCTCCAGGTGTTATCCTTTAGTGCTGACAAGGACACTTCCATGTCAAGACTGAAAATCTCCAGGTGTTAGCCATATCAAAAGTGAATATGAAGGGATAGGTATACCTTGAGGGGAGATCTAGTCAATCACTGAATTCGCA - -a -s mr.mrrefChr5 281249 178 + 294542 ACATTCCCATCGGCACCGCCCAGGAGGAACAATGGCCAGCATTAGGGAATAGTCATAATTCCATGGTTATGGTATGTAGGGAGTACTGCATGAACACACCACTCAAAAACACAATAGTGGATAGACTAAAACTAGTAAGGATGTGCAACAATGTACAACACTGTTATTTCATTATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428824 171 + 636262 GCATTCCAATCGGCACTGCCCAGGATGAACGATGGCTGGCATTAGGGAATAGTCATAATTCCATGGTTATGGTATCTCGGGAGTACTGCATGGACACACCACTCAAAAACACAATAGTGGATAGACTAGAACTAG-------ATGCAACAACATACAACACTGATATTTCACTATGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 435001 178 + 647215 ACACTCCCATCGGCACCCTCCAGGAGGAACAATGGCCAGCATTAGGGAATAGTCATAATTCCATGGTAGTGGTTCGTAGGGAGTGCTGCATGAACACACCACTCACAAACACAACAGTGGATAGACTAAAACTAGTAAGGATGTGCAACAATGTACCGTGCTGTTATTTGATTATGTG - -a -s mr.mrrefChr5 281427 303 + 294542 TGATACAAAGGATCACTGGAACTCACTAAGCCACATGTTTGACAATCTTTCCAAAGAGGTAGGTCACCTAATATGGCACTGGCAGGCAAAGACTTGCCTTTACAGTGAAGTCAAAATATTTGTTGTACACTTGATGGTCACTCAAGGAAATTTGTTGGTTGTTTTAACTCTTTTATCTGAAATCTGCATGAAGTGTGAAATTTGAAAGAGAAAAGACAGGACCTTGAACAGCTAGTTATGGTCTTCAACCAAAGAGGCCTGACTCACTGGATATGTGTATGTGTCTACCCATAACGTTATATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429004 286 + 636262 TGATACAGAGGATCACTGGAACTCAATATGCCACATGTTTGACAATCTTTCCAAAGAGGTAGGTCACCCAATATGGCACTGGCAGGCAAAGACTTGCCTTTACAGTGAGGTCAAAATATTTGTTGTACACTTCTTGGTCACCCAAGGAAATTTGTTGGTTGTTCTAACTCTTTTATCTGAAATTTGCATGAAGAATGAAATTTGAAAGAGAAAAGAC---A--------------TTATAGTCTTCAACCAAAGAGGCCTGACCCACTGGATATGTGTATGTGTCTACCCATGACATTATATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 435179 270 + 647215 TGATACAAAGCATCACTGGAACTAACTAAGCCACATGTTTAACAATCTTTCTAAAGAGGTAGGTCACCTAATATGCCACTGGCA---------------------GGAAGTCAAAATATCTGTTGCACACTTGATGGTCACTCAAGT-------TCAGCTGTTTTGACTCTTTTATCTGAAATCTGCATGAAGTGTGAAATTTGAAAGAGAAAATACAGGTCCTTGAACAGCTAGTTATGGGCTTCAACCAAAGAG-CCTGACTCACTG----TGGATATGTGTCTACCTATAACGTTATATT - -a -s mr.mrrefChr5 281730 210 + 294542 GTGTAACCCTTCACAGCACCCATGACAGCTCTTCTATCTAAATTTGGCATGTACACAAATACGCAGTGACCAGGCAATGCAGAATCAATGCAGAAAAATTGTTTCAGTATGTTGCCGGGGTCATTATCTGGTGTCTGGTGGACTGGTTAAGAAGCCTTGCAGGGGCCCATGTATATACACTGAGGATGCACATGGTGTAAGTTATTAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429290 191 + 636262 GTGTAAGCCTTCA------------------TTCAATCTAAATTTGGCATGTACACAAATACGCAGT-ACCAGGCAATGCAGAATCAATACAGAGAAATTGTTTCAGTATGTTGCCAGGGTCATTATCTGGTGTCTGGTGGACTGGTTAAGAAGCCTTGCAGGGGCCCATGTATATACACTGAGAATGCACATGGTGTAAGTTATTAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 435450 208 + 647215 GTGTAGCCCTTCACAGCACCCATGACAGCTCTTCTATCTAAATTTGGCGTGTACACAAATACACAGTGACCAGGCAATGCAGGAGCAATGCAGAATAATTGTTTCAGTATGTTACCGGGGTCATTATGTGGTGCCTGGTCGACTGGTTAAG--GCCTTACAGGGGCCCATGTATATACACTGAGGATGCACATGGTGTAAGTTATTAAGC - -a -s mr.mrrefChr5 281940 173 + 294542 ATTTCCCCAGAATCAGACAAACAAACTGCATCTCACAACACTGTAGGAACTTCAAAGAATGACTTGGACTGTGCGACACCTTGTGAACTTTTTGATGGCACTTGAGACTTCCCCACCAGAGCCAAGTATCAAACTGTTTCCACCAGTACCCAGTACCAAACTTATTTTTGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429485 173 + 636262 ATTTCCCCAGAATCAGACAAATAAACTGCATCCCGCAACACTGTAGGAACTTCAAAGAATGACTTGGACTGTGCGACACCTTGTGAACTTTTTGATGATACTTGAGACCTCTCCACCAGAGCCAAGTTTCAGACTGTTTGCACCAGTACCCAGTACCAAACTTATTTTTGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 435658 162 + 647215 AGTTTCCCAGTATCAGACAAACAAACTGCATCTAACAACACTCTAG-AACTTCAAAGAATGACTCAGACTGTG----------TGAACTTTTCGACGGCCCTTGAGACTTCCCCAACAGAGCCAAGTATCAAACTGTTTCCACCAGTACCCAGTACCAAACTTATTTTTGACC - -a -s mr.mrrefChr5 282113 56 + 294542 AAGAAACGACATACAGCAGCAAACAATGTACAGCAGCCAAAAGAAGACATACAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429658 56 + 636262 AAGAAACGACATACAGCAGCAAACAATGTACAGCAGCCAGAAGAAGACATACAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 435822 56 + 647215 AAAAGACAACATATAGCAGCAAACAACATACAGCAGCCAAAAGAAGACATACAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 282169 74 + 294542 CCATGGCCAAGGTATAAAAAGTTCAGATTCACCTACAGCAAAATTTGGTTTCGGCAATTACTATATGTTTCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429716 74 + 636262 CAAGGGCCAAGGTATGAAGAGTTCAGATTCACCTACAGCAAAATTTGCTCTCGGCAATTACTATATCTTCCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 435878 74 + 647215 CCATGGCCAAGGTATAACAAGTTCAAATTCACATACAGCAAAATTTAGTTTCCGCAATTAATAAATGTTTGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 282243 28 + 294542 TACAGATGGACAACCATTGTTGTTTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429792 27 + 636262 TACATATGGTCAAAC-TTGATGCTCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 435952 28 + 647215 TATAGATGAACAACCATTGTTGTTTTGA - -a -s mr.mrrefChr5 282271 437 + 294542 AATCTCTAGCATTGCGAGGCAATGCCAAAAATTTGAACACCAATGATGATAATCTATAGGTAAGAAACATATGCATACATGGAATAAGAAAAGTATATATAATGTTTGGATTTAAGCAGACACATGAGCCTAAGCACATGTGGCTGCTATTCATCAGTTTAAATACTGATAGGCCACAGGAAGTACTAACTAAATAGCAAAAAATTGCTGTCTAAATGTCTTATCATATTTACTTTACAGACTACCAATTACTAGCATAATTTTCTGCTGGAGCAGCTTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACATGCAACTTATCTTCACCACGAGCAATTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTAATTAAACACTGAAGTGAATGGAAACACATTTAATTTGAATTCAAGATTAGTTTTGTAGCATGCCATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429820 419 + 636262 AAT---TAGCATTGCCTCACAATACTAAAAATTTGAA-ACCAATGATGGTTGTCTA--------AAACATATGCATACATGGAATAAGAGAAGTATATATAATGTTTGGTTTTAAGCAGACACATGAGCCTAAGCGCATGTGGCTGCTATTCATTAGTTTAAATACTGATAGGCCACAGGAAGTACTAACTAAAGAGCAAAAAATTGCTGTCTGAATGTCTTATCATATTTACTTTACAGAGTACCAATTACTAGCATAATTTTCTGCTGGAGCAG-TTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACACGCAACTTATCTTCACCACGAGCAAGTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTAATTAAACACTGAAGTGAATGGAAACACATTTAATTTGAAT-----ATTAGTTTTGTAGCATGCCATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 435980 429 + 647215 AATCTCTAGAAATGCGAGGCAATGTCAATTGTATGAGCATCAAGGTTGATAATTTGTAGGTAAGGAAGATATGCAGACATGGAATAAGAAAAGTGTATATAATGTTTGGATTTAACCAGACACACGAGCCTAAGGACATGTGGCTGCTATTCATCAGTTTAAATAC----AGGCCTCAAGAA----TCACTAAATAGCAAAAATTTGCTGTCTAAATATCTCATCGTATTTACTTTAGAGACTACCAATTAATAGCGTAATTTTCTGCTGGAGCAGCTTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACATGCAACTTATCTTCACCAGGAGCAATTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTATTTAAACGCTGAAGTGAATTGAAATGCATTTGACTTGACTTCAAGAGTAGTTTTATAGTGTGCCATA - -a -s mr.mrrefChr5 282708 56 + 294542 TTATTCACATACAGTAATCATTGTTTTAGAGTGCACTTTTGTTATTAATGAACAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430239 56 + 636262 TTATTCACATACACTAATCATTGTTTTAGAGTGCACTTCTGTTGTTAATGAACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 436416 56 + 647215 TTATTCACATACAGTAATCATTGTTTTAGAGTGCACTTTTTCCATTAATGAGCAGA - -a -s mr.mrrefChr5 282764 171 + 294542 CTGTGGAATCCTGTCTCACACTCTTATTTGTGTGAGCTAAGCTTGCAAAGGACTTGATCCAAGGCAGGATGTGCTGCACAGATCTTAGACTTTGTCTAATCTGGCTCTAAAGACAGGAATAGATTAGATGGGATTGCTTAAATATCTGTACAAAAGAAATAATCTACTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430298 171 + 636262 CCGTGCAATCCTGGCTCACACTCCTATTTGTGTGAGCTTAGTTGGCAGAGGACTTGATCCAAGGCAGGATGTGCTGCACATATCTTAGACTTCATCTAATGTGGCTCTAAAGACAGGAACAGATCAGATGGGATTGCTTAAATATCTGTACAAACGAAATAATCTATTACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 436472 171 + 647215 TTGTGGAATCCTGTCTCACACTCTTATTTGTGTGGGCTAGGCTTGGCATGGACTTGATCCAGGGCAGGATGTGCTGCACAGATCTTAGACTTTGTCTAATCTGGCTAAAAAGACAGGAATAGATTAGATGGGATTGCTTAAATATCTGTACAAAAGAGATAATCTACTACA - -a -s mr.mrrefChr5 282935 392 + 294542 CAACCCAGGGTTTTGGATACAACTGTGGCTTTACAAATAGGTTGAAGCCCTTCTCTTCCTATTTTGCCACTGGACTCCCAAGGCAGCATGCCATGATAGTCACCCTAAATGACCACACACCATGAGAGTTGTAAATCCTTTCTTTACTCTATTTGCTATATATAATATATGCCTATCATGACAGCACCTGACAGCAATAATAAGAGGTAGAGACAATGGATAACCTGTGGGCTAGAAAGATCAATCTTGGTGGGCCTCCTGCACAAGCAGGATCCCAAGCACATTCTTAAGTGCCCATAATTTGCCCCTTTTGGAGCCAACTATACTAAAGTGAAAACAGCTTGAGAAAAACCATAGGATGGAGGAGCGTAATGACAGTGTTGCAGGGAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430480 354 + 636262 CAACCTAGGGTTTTGGATACAACTGTGGCTTTACAAATAGTTTGAAGCCCTTCTCTTCCTATTTTGCCTCTGGACTCCTAATGCAGCATGCTATGATAGTCACCCTAAATGACC--------TGAGAGTTGTAAATCCTTTCTTTACTCTATTTGCTATATATAATAGATGCCTATCATGACAGCACCTCACAGCTATAATAAGGGGTAGAGACAATGGATAACCTGGTGGCTA------------------------------AAGCAGGATCCCAAGCACATTCTTAAGTGCCTATACTTTGCCCCTTTTGGAGCCAACTATACTACAATGAAAACAGCTTGTGAAAAACCATAGAATGGAGGAGCATAATGGCAGTGTTGCAGGGAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 436643 391 + 647215 CAACTCAGGGTTTTGGCTACAACTGTGGCTTTACATATAGGTTGGAGCCCTTCTCTTCCTACTTTGCCATTGGACTCCCAAGGCAGCATGCCATGATAGTCACCGTAAATGATCACACACCATGAGAGTTGTAAATCCTTTCTTTACTCTATTTGCTATATATAATATGTGCCTAACATGCCAGC-CCTGACAGCAATAATAAGAAGTAGAGACAATAGATAACCTGTGGGCTAGAAAGATCAATCTTGGTGGGCCTCCTGCACAACCAGGATCCGAAGCACATTGTTAAGTGCCCATAATTTGCCCCATTTGGAGCCAACTATACTAAAGTGAAAAGAGCTTGAGAAAAATCATAGGATGGAAGAGCGTAATGACAGTGTTGCAGGGCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 283327 29 + 294542 CAAATGCAGGATGCATAGGTGAGTGGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430836 29 + 636262 CAAATGCAGGATCCATGGGTGAGTGGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 437034 29 + 647215 CAAATGCAGAATGCATAGGTGAGTGGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 283356 26 + 294542 GGTCCCATCTGCCAAACGGCCATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177774 26 - 636262 GGTCCCATCTGCCAAACGGCCATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 437063 24 + 647215 GGTATC--CTGCCAAAAGTTCATGTT - -a -s mr.mrrefChr5 283382 496 + 294542 AATGTACAGGTGTATACCTCTATGGTGTTAGCTCAGCCACCGCATGGGAGAGCCCTAGATGGCAGAAGCAATAATTGTGACAGAGTTGAGTTTCATTGGAAGGATTCTGGCATTTTTAGCACAGGTTAATTCAAACCACCTCCTTACTTGCCCCAATGCCCGGAGCCTGTTGGCACATCCTATATGTAGCCATACCAGGATCGGGTTTGTTTCTATCTATGGGCATAGACATCACTATAAAAGATTGCCTAACATGAGTAAAATGCCAATGGGCCTGGTAAGAGAACAAGACTAGTGCACTCTGAGTATGAAAGAAGTGAATTGTGTGTGGCCCCTGAATGTCTCAGTGTGCACATTTATGCTCTTTCACTAGGTGAAGTTCTCCAGAACACCTGCCCCAAGGTGGTCTCTTGTTTTAAGTTGAGCTAGTTGCAGAAGGTGGCACACAAAGTTCAGATCCTTACTAATGGATATTCTTTGTTCATAGATGTATGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177800 483 - 636262 AATGTACAGGTGTATACCTCTATGGTGTTAGTTCAGCGACCGCATAGGAGAG-------------AAGCAATAATTGTGATAGAGTTGAGTTTCATTGGAAGGATTCTGGCATTTTTAGCATAGGTTAATTCAAACCATCTCCTTACTTGCCTCAATGCCCGGAGCCTGTTGGCACATCCTATATGTAGCCATACCAGGATCGGGTTTGCTTCTATCTATGGGCATAGACATCACTATAAAAGATTGTCTAACATGAGTTAAATGTCAATGGGCACAGTAACAGGACAAGACTAGTGCACTTAGAGTCTGAAAGAAGTGAAGTGTGTGTGGCCCCTGAATGTCTCAGTGTGCACATCTATGCTCTTCCACTAGGTGAAGTTCTCCAGAACGCCTGCCCCAAGGTGGTCTCTTGTTTTAAGTTGAGCTAGTTGGAGAGGGTGGCACACAAAATTCAGACCCTTACTAAAGGATATTCTTCGTTCATTGATGTATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 437088 491 + 647215 AGTGTACAGGTGTATACTTCTATGGTCTTAGCTCAGCCACCGCATGGGAGATCCCTAGATGGCAGCAGCAATAATCGCGACAGAATTGAGTTTAACAGGAGGGATGCTGGCATTTTTAGCACAGGTTAATTCAAACCACCTCCTTACATGCCCCAATGCCAGGAGCCTGTTAGCACATCCCATATGTAGCCCTACCAGGATTGGGTTTGTTTCTATCTATGGTCATAGACGTCACTGTAAAAGATTGCTTAGCATGAGTAAAATGCTAACGGGCCTGGTAGGAGAATAAGACTAGTGCACTCTGAGTATGAAAGAAATGAATTTTGTGTGCCCCCTGAAGGTCT-----TGCACACTTATGCCCTCTCACTAGGTGAAGTTTTCCAGAACACTTGACCCAGGGTGGTCTCTAGTTTTAAGTTGAGCTAGTTGCAGAAGGTGGCACACAAAGTTCAGATTCATACTAATGGAAATTCTTTGCTCATAGAGGTATGGT - -a -s mr.mrrefChr5 283878 214 + 294542 TACATAGATTGACAGACAGCTAGTGACAGATGTAACTAAATATGAATTAGTAGGTATTAATAGTAATCTTTTTCCTAATAAGTGTATAAGGATGTGTCAGTTCCTGATACTTTAGGTAGTGGAATGACTAACAGATCTTATTTATTGATAGGCTATTGAATTTTATTGAGTACACCAGGGCCAAGCCCCATTTGTGTGAGAATTTGTGTGAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178284 212 - 636262 TACATAGATTGACAGACAGCTAGTGACAGAGGTAACTAGATATGAATTAGTAGGTATCAACAGTCATCTTTTCCCTAATAAGTGTATAAGGATGTGTCAGTTCCTGATACTTTAGGTAATGTAATGACTAACGGATCTTACTTTTTGATAGGCTATTGAATTTTATTCAGTACACAAGGG--AAGTCCCATTTATGTGAGAATTTGTGTGAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 437579 204 + 647215 TACATAGATTGACAGACAGCTAGTGATAGATGTAACCAAACATGAATTAGTAGGTATTAATAGCAATCTTTTTCCTAATAAGTGTATAC-GATGTATCAGTTCCTGC---------TGGCGGAATGACTAACAGATCTCATCTATTGATAGGCTCTTGAATTTTATTGAGTACAACAGGGCCAAGCCCCATTTGTGTGAGAATTTGTGTGAGAA - -a -s mr.mrrefChr5 284092 35 + 294542 ACATGGTAGACTCAGGGTTTGAACCATTCTCTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178496 35 - 636262 ACATGGTAGACTCAGGGTTTGAACCATTCTCTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 437845 35 + 647215 ACATGGTAAACTCAGGGTGTGAACCATTCTCAGAA - -a -s mr.mrrefChr5 284127 58 + 294542 CCATTCACAGAGATTCTGTTGAAAATGGAACTAGTTCATGCTCTGTTGTATTAAAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178544 58 - 636262 CCATTCACAGAGATTCTGTTGAAAATGGAACTAGTTCATGCTTTGTGGTATTAAAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 437880 20 + 647215 -------------------------------------ATGCTCTGTTGTATTAAAAC- - -a -s mr.mrrefChr5 284185 15 + 294542 ATGAGGTTTGTTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178603 15 - 636262 ATGAGGTTTGTTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 437900 14 + 647215 -TGAAGTTTGTTTCC - -a -s mr.mrrefChr5 284200 184 + 294542 TTAGGTGGTGATTTATATTTTACATTTCTCTATTGACAGGACTGCCTTGTTCTTTGTTATGTTGTCAGTAAGCTTTCCATGTAATTACAGCACAGTTTAAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTTTAAAGTTTGCAGACAGCCATATGGTCCATGATCTATCTGTGTCATCCCGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178618 184 - 636262 TTAGATGGTGATTTATATTTTACATTTCTCTATTGTCAGGACTGTCTTGTTCTTTGGTATGTTGTCAGTAAGCTTTCCATGTAATTACAGCACAGTTTCAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTATAAAGTTTGCAGACAGCCATCTGGTCCATGACCTATCTGTGTCATCCTGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 437915 184 + 647215 TTAGGTGGTGATTTATATTTTACATTCCTCAAATGACAGGACTGCCTTGTTCTTTGTTATGATGCCAGTAGGCTTTCCATGTAATTATAGTACAGTTTAAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTTTAAAGTTTGCAGGCAGCCATATGGTCCATGATCTATCTGTGTCACCCCATAA - -a -s mr.mrrefChr5 284384 132 + 294542 AGACTATAAAGTTCTTACACTTATATAAGGGTTAGAAATAATTATGCTGTGGTGTTAGATCATGGGTAGTCCCCAGTTGAAGTAGCTACATGTTGAGTGGATTGTAAGAAGAGCGTAGTATGGGTGTCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178802 127 - 636262 AGACTATAAAGTTCTTACACTTATATAAGAGTTAGAAATAATTATGCTGTGGTGTTAGATCATGGGTAGTCCCCAGTTGAAGTAGCTACATGTTGAGTGGATTGTAAGAAGAGCGTAATATGGGTCT----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 438101 132 + 647215 TGACTATAAGGATGGTACACTTATACAAGGGTTAGAAATAACTATGCCCTGGTGTTAGATCATGGGTAGGCCCCAATTGGAGTAGTCACGTGTTGATTGGATTGTAAGAAGAGCTTAGTATGGGTGTCAGTT - -a -s mr.mrrefChr5 284516 36 + 294542 GAGCAATGACTACAATGCTGTTCAATTAAATACCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179160 36 - 636262 GAGCAATGACTACAATGCTGTTCAATTAAATACCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 438233 36 + 647215 GAGCAATGACTAAAATGTTGTTCCATTAAGTAACCA - -a -s mr.mrrefChr5 284552 218 + 294542 TGCACAATGGAACATCTGGCCCCTGTCACGCATGCAGCAGCTGAAATTCACCGTGTGCACCGAGGAGGCAAATTATTGTTTAAAACTTCTGTAGACTTCTTGTTTAACCTCTCTGACAAGATTCTTAGGAGGGGTTGTGTACTCACCAGTCGTAATAGCTTCAAAAGGCCAAGCAGGCAAAGTTCCTGATCATTTGTCACCTACCACACTCAGTAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179196 218 - 636262 TGCACAATGGAACATCTGGCCCCTGTCACGCATGCAGCAGCTGAACTTCACCATGTGCACCAAGGAGGCAAATTAGTGTCTACAACTTCTGTAGACTGCTTGTTGAACCTCTCTGACAAGATTCTTTGGAGGGGTTGTGTTTTCACCAGTTGTGATAGCTTCAAAAGGCCAAGCAGGCAAAGTTCCTGATCATTAGGTTCCTACCACACTCAGTAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 438280 188 + 647215 TGAATAATGGAACATCTGGCCTCTGTGACAAATGCAGCAGCCGAAATTCACTGCATGCACCGAGGAGGCAAACTATTGCTGAAAATTTCTGTAGACTTCTTGTCTAACCTCTCTGACATGATTCTCAGGAGGGGTTGTGTACTCACCAGTCACAATAGCTTCAAAAGGACAAGCTGGCA-----------AGGTTGTCA------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 284770 53 + 294542 TGAATGCACTAGTTCGTTGTGTCTGGTTTGGAAATGATCTGGGGTCTTGACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179418 53 - 636262 TGAATGCACTAGTTCGTTGTGTCTGGTTTGGAAATGATCTGGGGTCTTCACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 438468 50 + 647215 ---ACATACTAATTCATTGTTTCTGGTTTAGAAATGACCTGGGGTCTTGACTA - -a -s mr.mrrefChr5 284823 216 + 294542 ATGTCTTGCATGTGTCCAGTTTTGATTGAGTGGCTTTAGTGAGTGGTTTTATTGTTGACTGAGATTCGAATAGACTTTGACCAAGATTCCAAGAGGATTTGAATCTTTGAACAGGGCACCAGCTGATTCATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATATGGATAAGGTCCTTGATAAGGAGCATTTCATATGATAGGGCAGTGAATAGAGAACAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179481 216 - 636262 ATGTCTAGCATGTGTCCAGTTTTGACTGAGTAGCTTTAGTGAGTGGCTTTATTGTTGACTGAGTTTTGAGCAGACTTTGACCAAGATTCCAAGAGGATTTGAACCTTAGAACAGGGCACCAGCTGTTTTATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATGTGGATAAGGTCCTTGATAAGGAGCATTTCATATGATAGGGCAGTGAATAGAGAACAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 438518 216 + 647215 ATGTCTTGCATGTGTCCATTTTTGGTTGAGTGGCTTTCGTGAGTAGTCTTATTGTTGATTGAGATTCGAATAGACCTAGAACAAGATTACAAGAGGATTCAAATCTTTGAACAGGTTACCAGCTGACTCATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATATGGCTAAGGCCCTTGATAAGGAGCATTTCGTATGATAGGACAGAGAATGGAAAACAGG - -a -s mr.mrrefChr5 285039 87 + 294542 CGTAGGCAAAGGGTGAACAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGATAAACTCAAGACAAATACTCACCCTTAGATAAGATATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179697 87 - 636262 CGTAGGCAAAGGGTGAACAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGATAAACTCAAGACAAATACTCACCTTTAAATGAGATATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 438735 86 + 647215 AACAGTCAAAGGGTGAGCAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGAGGGCCACAAGACAAATACTGAGTCTTTGGTAGAATACT- - -a -s mr.mrrefChr5 285126 94 + 294542 AAATGGCATAGCAGCATGAATTTGATTAATAATAAATGATGCACTATTAACACTGTTGTACAAATTATCGTTACCCAAGTTATGGAGCACTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179784 94 - 636262 AAATGGCATAGCAGCATGAATTCGATTTATAATAAATGATGCACTATTAACACTGTTGTACAAGTTGTCGTTACCCAGGTTATGGAGCACTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 439032 94 + 647215 AAGTGGCATAGCAGCATGGACTTGATTAATATTATATGATGCACTATTAACACTGTGACACAAATTATTGTTACACAAGTTATGGAACACTGTC - -a -s mr.mrrefChr5 285220 129 + 294542 CACAAGTTAAATCTTTGTGGGCCCTAGGGTGAGCAAAGTTTTTACAGAGATTTTTGAGACAAGGTACAGCTGTTTGAAATCTTCTGTCATCCTGGGATGATAGGCATTCTGGGATGACACATTAGGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179878 129 - 636262 CACAAGTTAAATCTTTGTGGGCCCTAGGGTGAGCAAAGTTTTTACAGAGATTTTTGGGACAAGGTACAGCTGTTTGAAAACTTCTGTCATCCTGGGATGATAGGCATTCTGGAATGACACATTAGGCGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 439127 128 + 647215 CAAAAGTTAAGTTTACACGAGCCCTAGGGTTGGCAAAGTTTTTACAGAGATTTTTGAGACAAGGTACAGCTGCTTGAAATCTTCTGTCATCCTGCAATCATATGCAGTCTGGGATGACACATTAGGTG- - -a -s mr.mrrefChr5 285349 112 + 294542 CGGAGAAACTAAACCCATGTTAGGTACTATGCTCTTGTTTGCTGGCCATTTCACAAATACTCCACCATATTGTGTCTTTTTATTAGGTTGAGAAAAGACGCTATATGAATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180008 112 - 636262 CGGAGAAACTAAACCCATGTTAGGTACTATGCTCTTGTTTGCTGGCCATCTCACAAATATTCCACCATGTTGTGTCTTTTTATTAGATTGAGAAAAGACGGTATAGGAATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 439255 111 + 647215 -GGAGAAATTAGACCCATGTTAGGTTCTATGCTCTTGTTTGCTGGCCATTTCACGAATACTCCACCGTATTGTGTCTTTTTATTAGGTTCAGAAAAGTCACTATGTGAATCC - -a -s mr.mrrefChr5 285461 88 + 294542 AAAAACATAATGTATTCAGCTGACCCCAAACAGTAACTAAGTGTGGTATATGACTCAATACAATCCTTACTTTCTCTGGTGGATGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180120 88 - 636262 AAAAACATAATGTATTCAGCTGACCCCAAACAGTCACCAAGTGTGGTATATGACACAATACAATCCTTGCTTTCTCTGGTGGATGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 439377 87 + 647215 AGAAACATTATG-ATTCAGCTCACCCCAAACAGTAACTAAGTGTGGCATAGGACTCAACACAATCCTTACTTTCTTTGGAGGTTAACG - -a -s mr.mrrefChr5 285549 30 + 294542 TTTCTGGGCTTCTTGTTATGAGTAATGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180222 29 - 636262 TTTCTGGGCTTCTT-TTATGAGTAATGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 439464 30 + 647215 TTTCTGGGCTTCTTGTTATGAGTAATGGTT - -a -s mr.mrrefChr5 285579 45 + 294542 TATCTTGCACTATTTCAGCTGGTATATCATGATTGTATCGCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180257 25 - 636262 TATCTGGTACTATTTCAGCTGGTAT-------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 439494 45 + 647215 TATCTTGCACGATTTCAGTTAGTATATCATGATTGTATCGCAGTT - -a -s mr.mrrefChr5 285624 390 + 294542 GATAGCTTAGGTATAGCATCCATGATATTAGCACAGACGAGCATGCCCCTCAATATATGGTCAATATGGGGATAGCAATATTGCTGCTGTAATACTGAAATGATGAATCATATTGTTGTTTCAAGATAGCACCTCAAAATGTTTTAAAAGATTCAATGGGCTAGAACTGTGTTTGCATTGGTGTTTACATCTAATAATGCCAGTTGTTGCGTTGTTGCTGGAATGCTTTATGATGTAGATTTTTCAACGGTGGCAGTGGTTTGAATAGTTCAGCCAAATAGGTTGGCCCAAGATTAGTAAGATAGTCTAGCATGTGAGCTTCATTTAGGTCTCATAACACATATAGGAGGGACAGGTGGTAGCTGTAGAGAATGTAGGAAACCACATTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430999 379 + 636262 GATAGGTTAGGTATAGCATCCATGATGTTAGCACAGACAGGCATA-CTCGCTATATATGGTAAATATGGGGATAGCAATATTGCTGCTGTAATACTGAAATGATGAAGCATATTGTTGTTTCAGGACAGCAC-------TGTTTTAAAAGATTCAATGGGCTAGAACTGTGTTTGCATTGGTGTTCACATCTAATGATGCCAATTGTTGCGTTGTTGTTGG---GCTTTATGATGTAGATTTTTCAACGGTGGCGGTGGTTTGAATAGTTCAGTCAAATAGATTGGCCCAAGATTAGTAAGATAATCTAGCATGAAAGCTTCATTTAGGTCTCATAACACATATAGGAGGGATAGGTGGTAGCTGTAGAGAATGTAGGAAACCACATTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 439539 390 + 647215 GATAGCTAAGGTATAGCAGCCATGATATTAGCACAGACGAGCATGCCCCTCAATATATGGGCGATATGGGCATAGCAATCTTGTTGTTGTAATACTGAAATAATGAATCATATTGTAGTTTCGAGATAACACCTCAAAATGTTTTAAAAGATTCAATGGGCTACGTGGGTGTTTGGATTTTCGTTTACATGTAATACTGCCAGTTGTTGTGTTGTTGCTGGAATGCTTTATGATGTAGATGTCTCAAGGGTGGCAGTGGTTTGAAAAATTCAGCTAAATGGGTGGGCCCAAGGTTAGTAAGGTAGTCTAGCATGTGAGATTTGTTTAACTCTCATAACACACATTGGAGGGACCGGTGGTAGCTGTAGAGAGTGTAGGAAACCACATTAA - -a -s mr.mrrefChr5 286014 144 + 294542 GGTTATTGGTAGTTTGTTAGCAGGATGACCCATTTTGTTTCGTCTTAAAGCCTTACCTCAAAGTCACAGTTCATTATAGTTTTCAAAAATCTGCTTTGCAACACCTGTGACTGCCCTTTGAGCTAGGCCAAACATTGTCTTCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431378 144 + 636262 GGTTATTGGTAGTCTGTTAGCAGGATGACCCATTTTGTTTCGTTTTAAAGCCTTACCTCAAAGTCACAGTTCATTATAGTTTTCAAAAATCTGCTTTGCCACACCTGTGACCGCCCTTTGAGCTAGGCCAAACACTGTCTTCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 439931 144 + 647215 GGTTATTGGTAGTTTGTTAGCAGGATGACCCATCTTGTGTCATCTAAAAGCCTTACCTCAAAGTCACAGTTCATTATAGTGTTCAGAAATCTGGTTTGCAACACCTGTGACTGCCTGTTGAGCTGGGCCAAACATTGTCTTCTT - -a -s mr.mrrefChr5 286158 158 + 294542 GGTAAAAAGATTCGAGCTAGGCCAAACATTGTCATCTGGAGTAAAAAGAGTTTCCCTCACCACCATCTGAGCTATAAGACTATTGCTGGGAAGCTCTACTGGGCTCACATAAGCTTATCCGATCAATGGAATGCCAGGGTATTTTGTAGTAACCCTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431523 156 + 636262 GGTAAAAAGATTCGAGCTAGGCCAAACATTGTCATCTGGAGTAAAAAG-GTTTCCCTCACCACCATCTGAGCTATAAGACTATTGCTGGGGATCTCTAATGGGCTCACATAAGGTCATCTG-TCAATGGAATGCCAAGGTCTTTTGTAGTAACCCTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 440075 158 + 647215 GGTAAATAGATTTGAGCTAGGCCAAACATTGTCTTCTGCAGTAAAAAGAGTTTCCCTCACAACCATCTGGGCCATAAGACAGTATTTGGGAAGCTCTACTGGGCTCACATAAGCCTATCCGATCAATGGAATGCCCGGGTATTTTGTAGTAACCCTTG - -a -s mr.mrrefChr5 286316 37 + 294542 TATGGACCTGTCAGGCCGCCTTACAATACTTAGCCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431681 37 + 636262 TATGGACCTGTCAGGCCGCCTTACAATACTTAGCCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 440233 37 + 647215 TATGGACCTATCAGGCCGCCTTACAGTACTTAGCTCA - -a -s mr.mrrefChr5 286353 51 + 294542 TTTACAGAAGCCTCATAGTCACTTCAAAGAGCATCCTTAAATAAAAGATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431718 51 + 636262 TTTACAGAAGCCTCATAGTCACTTCAAAGAGCATCCTTACATAAAAGATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 440282 51 + 647215 CTTACTGAAGCCTGATAGTTACGTCAAGGAGCATCCTTAAATAAAAGATAT - -a -s mr.mrrefChr5 286404 82 + 294542 TGGTTGTCCCACAGGAAATCTACTCAGTGCCTCGTTTTCGATGGAAATAACTAAGATAAGAGTTACATGAAAGGTTGCTACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431769 82 + 636262 TGGTTGTCCCACAGGAAATCTACTCAGTGCCTCTTTTTCGATGGACATAACTAAGATAAGAGTTACATGAAAGGTTGCTGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 440343 82 + 647215 TGGTTGTCCCACAGGAAGTTTACTCAGTGCCTCGTTTTCGATGGGAATAGCTAAGATAAGAGTGACATGAAAGGTTGCTACA - -a -s mr.mrrefChr5 286486 50 + 294542 TTTGAAATAGTCCATCCAAGTAGTTGTGTGTCCCTTATGACCACATGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431851 50 + 636262 TTTGAAATAGTCCATCCAAGTAGTTGTGTGTCCCTTATGACCACGTGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 440426 50 + 647215 TTTGAAAAAGTCCACCTGATTAGTTGTGTGTCCCCTATGACCACATGTTG - -a -s mr.mrrefChr5 286536 258 + 294542 AATAATATCTCTATCTCTCCTCACTATCATGGCACACATTCTTGATAGGAACCTCTTCATAAGATTTCAGGTGCAATCTAAAGCACCTGTAGCATGGGAAATGTACATTATTTTCATGAATCGGGAATAGGGCACTAATAACCAGTCCCTGGTACTTTCATGTCATCTCATCTCAGTGTACAATGAAGTTAGATGCAAATAAATGTTCCAGGCAATATTAGATTTGATAACAAACGCATTCAGGACACGATTACACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431901 255 + 636262 AATAATAGCTCTATCTCTCCTCATCATTATGGCACACATTCTTGATAGGAACCTCTTCCTAGGATTTCA-GTTCAATCTAAAGCACCTGTAGCGTGGGAAATGTACATTATTATCGTGAATCAGGAATAGGGCACTGATAACCAGTCCCTGGTATTTTCATCTCATCTCATCTCATTGCACGATGAAGTTAGACGCAAATAAATGTTCCAGGCAATATTAGATTTGAT-ACGGACGCATTCAGGACGC-ATTACACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 440477 257 + 647215 AATAATATCTCTATCTCTCCTCACTATCATGACACACACTCTT-ATAGGAACCTCTTCATAAGATTGCAGGTGCAATCTAAAGCACCTGTAGCATGGGAAATGTACATTATTTTCAAGAATCGGGAATAGGGCACTAATAACCAGTCCCTGGTACTCTCAAGTCATCCCGTCTCGGTGTGCAATGAAGTTAGATGCAAATAAATTTTCCAGGCAGTTTTAGATTTGATAACAAACGCATCCAGGACACGATTACATTT - -a -s mr.mrrefChr5 286794 28 + 294542 CTGCTGCTGCTACAGGTTTTCTCTACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432157 28 + 636262 TTGCTGCTGGTACAGGTTTTCTCTACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 440734 28 + 647215 CTGCTGCTGCTACAGGTGTTCTCTACTA - -a -s mr.mrrefChr5 286822 19 + 294542 TTGGGGTGTTCATTCCCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432268 19 + 636262 TTTGGGTGTTCATTCCCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 440762 19 + 647215 CTGTGGTGGTCATTCCCAT - -a -s mr.mrrefChr5 286841 138 + 294542 AGCGGCAGAACCAGCTAATATGCACTCAGAATCTTCCATTAGTGTTCATGTTGAACCTTCCAATTATTGTCTAAGGTGAGTTATGAGTTGCATTAAAACTAAGTCCTAACACTGCAAGGAATAGATCTCTCAGGAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432295 131 + 636262 AGTGGCAGGACCAGCCAACATGTACTCAGA-------ACTAGTGTCCTTATTGAACCTTCCAATTATTGTGTGAGCTGGGTTATGAGTTGCATTAAAACTAAGTCCTAACACTGCAAGGAATAGATCTCTCAGGAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 440781 138 + 647215 AGCGGCAGAACTAGCTAATGTGCACTCAGAATCTTCCATTAGTGTTCATGATGAACCTTCCGACTATTGTCCAAGGTGAGGTATGAGTTGCATTAAAACTAAGTCCTAACACTACGACGAATAGATGTCTCAAGAGGA - -a -s mr.mrrefChr5 286979 11 + 294542 ATAGTGGCTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432426 11 + 636262 ATAGTGGCTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 440920 11 + 647215 ATAGGAGCTGC - -a -s mr.mrrefChr5 286990 23 + 294542 TTGAGACTATGCTCTGCCACTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432442 23 + 636262 TTGAGACTATGCTCTGCCACTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 440931 23 + 647215 TTGAGACTGTGCTCTGCCACTCA - -a -s mr.mrrefChr5 287013 25 + 294542 CAGCAACAATACTCATCCATCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432466 25 + 636262 CAGCAACAATACTCATCCATCAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 440954 25 + 647215 CATCAACAATACTTAACCCTTGATT - -a -s mr.mrrefChr5 287038 175 + 294542 GACATAGGGCTCATATCTCATGATATAGACTGTTTAGTCTCCACAAGGCTTAGAGCTACAAACCTGCTGATGTAAATTCTGTCGCTAGTACATACATTTAGCCTAGTCACAACCCACAGGGGCATGTAAGAATCAAGAGTGTTTTTTATAAGAGGTTGATAATGAGTTTATCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432492 175 + 636262 GACATAGGGCTCATATCTCATGATATAGACTGTTTAGTCTCCACAAGGCTTAGAGCTACAAACCTGCTGATGTAAATTCTGTCGCTAGTACATACATTTAGCCTAGTCACAACCCACAGGGGCATGTAAGAATCAAGAGTGTTTTTTATAAGAGGTTGATAATGAGTTTATCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 440979 175 + 647215 GACATAGGGCTCATATCCCAGGAAATAGACTGTCTAGTCTGCACAAGGCTTGGAGCTGCAAACCTATGGATGTAAATTCTGTAGCCAACACATACATCTAGCCTAGTAGCAAACCAGAGGGGTGTGTAAGAATCAAGAGTGTTTTTTATAAGAGGCTGATAATGAGTTGATCAAC - -a -s mr.mrrefChr5 287213 106 + 294542 CACTGTGATAGATAAACAACCCCCATAACTAGAGCAATGAAACACTTTTATAAGAGATTGACAATGGGTTAGTCAATATGCTATGATTGACATGCCAACGATATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432668 106 + 636262 CACTGTGATAGATAAACAACCCCCATAACTAGAGCAATGAAACACTTTTATAAGAGATTGACAATGGGTTAGTCAATATGCTATGATTGACATGCCAACGATATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 441154 106 + 647215 CACTGTGATAGATAAGCAACCCCCATAACTAGAGCAAGGAAGTGCCTTTATAAGACCTGGACAATGGATTAGTCAGTACGCTATGATTGATATGCCAGTGATATGC - -a -s mr.mrrefChr5 287319 169 + 294542 GGGGCCTCATAACTAGAGTAAGGACACGCCTTAATAAAAGTCTTATAATGGATTGATCAAAATGCTATGGTAGACTTGCAGGCCCACCTACTAGAGTAATGACACACTGGTTTGACTAGTTGATACCAGACTGTTAGACAACATCAATGAATAGTTTCTAGGCCATGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432774 169 + 636262 GGGGCCTCATAACTAGAGTAAGGACACGCCTTAATAAAAGTCTTATAATGGATTGATCCAAATGCTAAGGTAGACTTGCAGGCCCACCTACTAGAGTAATGACACACTGGTTTGACTAGTTGATACCAGACTGTTAGACAACATCAATGAATAGTTTCTAGGCCATGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 441261 152 + 647215 AGGGCCCCATAGGTAGAGTAATGATACACCTTAATAAAA-----------------TCAAAATGCTGTGGTAGTCTTATAGGCTCACTTACTAGAGTAACGAAACACTGGTTTGACTAGTTGATACCAGACTGTTAGACAACAGCAATGAACAGTTTCTAGGCCATGAG - -a -s mr.mrrefChr5 287488 75 + 294542 TATTCATAATTATTGTGAACTACAGCAAAGAAAAATGCAATGGGGACGTCTGAGAAGAATCGATGCCAAAGACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432952 75 + 636262 TATTCATAATTATTGTGAACTACAGCAAAGAAAAATGCAATGGGGACATCTGAGAAGAATCGATGCCAAAGACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 441413 75 + 647215 TATTCATAATTAGTTTGAACTACAGTAAAGAAAAATGCAATGGGGACGTCTGAGAAGAATCAATGCCAAAGACAG - -a -s mr.mrrefChr5 287563 82 + 294542 AAACAACTCCAACCTGGCATAAATGAAATAAATATTAGCTAGAATCTTTCTCTTGGTAGAAAGGGAGCAAGATGCTCCACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433028 82 + 636262 AAACAACTCCAACCTGGCATAAATGAAATAAATATTAGCTAGAATCTTTCTCTTGGTAGAAAGGGAGCAAGATGCTCCACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 441488 82 + 647215 CAACAAATCAAACCTGGCGTAAATGAAATAAATAGTACCTAGAATCTTTTTCTGGGTACAGAGGAAGCAAGATGCTCCACAT - -a -s mr.mrrefChr5 287645 387 + 294542 TCAGCTTTTCTTTTGAGGTCATCTTTATCAGCAAGCAAAATTACATGATACTGCTACAATGACTGTTTTTACTTTCAACATGGTTTATGGAAGTATATTCTTGTGCCTTAGACAAACCGATAAATTCCAAGAGTGACCAGCACACAGGAGTAGCCACCTTGCACATTTTTCCATATAGTGTTGTGTCACAGATATTCAGTTACTGTATAGTTGCTGTAAGAAATCAAAAAGTTAGGTATCAAAAATTGGCATAGGTCCAAACAGGAATAACTGCCAGGGAGATAGATACATCCTTACTGGATAAACCATAATTCTCAGTATTATGTCTTGATCTCTAGAGTTATCCAGCAGCGGTACATAACCCATGACTTCTACTATCTTAGACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433110 284 + 636262 ----------------------------------------------------------------------------------ATTCCTGGA--TATATTCTTGTGCCTTATACAAACAGATTAATTCCAAGAGTGACCAGCACACGGGAGCAGCCACCTTTCACATTTTTCCATATGGTGTTGTGCCCCAGATATTCAGTTACTGTATAGTTGCTGTAAGAAATTAAAAAGTTAGGTATTAAAAATGGGCATAGGTCCAAACAGGAATAACTGCCAGGGAGATAGATACA-------------------AATTCTCAGTATTATGTCTTGGTCTCTAGAGTTATCCAGCAGTGGTACATAACCCATGACTTGTACTGGCTAAGACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 441663 387 + 647215 TCAGCTTTTCTTTTGAGGTCATCTTTATCAGCAAGCAAAATTACATGATACTGCTACAATGACTGTTTTTACTTTCAACATGGTTTATGGAAGTATAATCTTGTGCCTTAGACAAACCGATAAACTCCAAGAGTGACCAGCACACAGGAGTGGCCACCTTGTACATTCTTCCATACAGTGTTGTGTTACAGATATTCAGTTACTGTGTAGTTGCTGTAATAAATCAAAAAGTTGGGTAACAAAAATTGGCACAGGTCTAAACAGAAATAACATACAAGGAGATAGAGACATCCTTACTGGATAAACCATAAATCTGAGTATTATGACTAGATCTTGAAGCTTATCCAGTGGCAGCACATAACCCATGACTACTACCATCTTAGACAT - -a -s mr.mrrefChr5 288032 78 + 294542 TTTTATTAGCTGACATGCTGAAGGTTGTCTTGTCCAATGCTCTTCATAACAATTTCAGCTCCGTATTCAACCAATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433395 78 + 636262 TTTTATTAGCTGACATGCTGAAGGTTGTCTTGTCCAATGCTCTTCATAACAATTTAAGCTCCGTATCCAACCAATAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 442050 72 + 647215 TTCTATTAGCCGACATGCTGAAGGTTGTCTTGTCCAATGCTCTT------GTTTTCAGCTCCGTAGTCAACTTACAGC - -a -s mr.mrrefChr5 288110 262 + 294542 AACCTAGTGCAAATGACTGTGTTGTTCATTGAAAGTGTGTGACTTTGTTGACTCAAGGTATATCCACAGGAGAGGAAGTTAAGGGCTTTAGATAATAGAGAATTGCAGCGGCAAATTTTATTTCATATCAGGACAATGAGAAAACAACACAGTTGTGGGTGTGCAGCCTTATGATCCTATGTCTGGCTATTGATCTTCGGGTGATAGACCTTCTTGTTCAGCGTACTTAGTCTGCAAGTTCAGTTGATGTATGGGTTCAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433479 262 + 636262 AACCTAGTGCAAATGATTATGTTGTTCATTTAAATTATGTGACTTTGGTGACTCAAGGTACAGCCACCGGAAAGGAAGTTAAGGGCTTGAGATAACAGACAATTGCATCAGCAAATTTTATTTCATATCAGGACAATGAGAAAACAACACAGTTGTGGGTGAGCAGCCTTATGATCCTATGTCTGGCTATTGATCTTCGGGTGATAGACCTTCTTGTTCAGCGTACTTAGTCTGCAAGTTCAGTTGATGTATGGGTTCAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 442122 260 + 647215 AACCTAGTGCAACTGACTGTGTTGTTCATTGAAAGTGTGTGACTTTGTTGACTCA--GTATGTCTCCAGGAGAGGAAGTTAAGGGTTTTAGATAATAGAGAACCGCAGTGGCAAGTTTTGTTTCATATCAGGACAGTGAGAAAACGACACAGTTGTGGGTGTGCAGCCTTATGGTCCTAGGTCTAACTATTAATCTTCAGGTAACAGACCTTCTTGTTCAGCAGACTTAGACTGCAAGTTTTGTTGAGGTAGGGGTTCAATA - -a -s mr.mrrefChr5 288372 14 + 294542 AACGTGGGTGCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433809 14 + 636262 AACGTGGGTGCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 442382 14 + 647215 AACATGGGCACAAG - -a -s mr.mrrefChr5 288386 99 + 294542 CCTAGTCCAACAGAAAACTCTAATGGTCCCAGTTGTATTACTTTATGTATATGTCCCCCAGGCCAATAACCAGCTCAGTGCCAGTTCAACTTTATGTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433832 99 + 636262 CCTAGTCCAACAGAAAACTCTAATGGTCCCAGTTGTATTACTTTATGTATATGTCCCCCAGGCCAATAACCAGCTCAGTGCCAGTTCAACTTTATGTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 442396 99 + 647215 CCTAGTCCAACAACCAACTCTAATGGATCCAGTTGTATTACTTCATATATATGTCCCCCAGGCCAATAGGCAACTTAGTGCCAGTTCTACTTTATGTCT - -a -s mr.mrrefChr5 288485 52 + 294542 AAAGATTGAAGAGGCATGCCCACGGTTCTTTAAGGCTGTTGGTAGTATTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433936 52 + 636262 AAAGATTGAAGAGGCATGCCCACGGTTCTTTAAGGCTGTTGGTAGTATTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 442495 52 + 647215 AAAGATTGAAGAGGCATGCTCACAGTTCTTTTAGGTTGTTGGTAGTATTAGT - -a -s mr.mrrefChr5 288537 5 + 294542 ACTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433989 5 + 636262 ACTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 442547 5 + 647215 ACTGT - -a -s mr.mrrefChr5 288542 113 + 294542 CAGAGGGTAAAGTGGTTCTACCTAATATCTTCCTCTAGGACAGGATTACTTTGCTCAGTACTCTGACATTATACTATTAATTCGGTTAAAACCtgattagggtgtgccacagc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433994 113 + 636262 CAGAGGGTAAAGTGGTTCTACCTAATATCTTCCTCTAGGACAGGATTATTTAGCTCAGTACTCTGatattatactatcaattcggttaaaacctgagtagggtgtgccacagc -s simRat_chr6.simRat.chr6 442554 113 + 647215 TAGAGGGTAGAGTGGCTCTACCTAATATTTTCTTCTCGAAAAGGATTACATTGCTCAGTGGTCTGACATTATATTATTAGTTCAGTTAGAACCTGATTAGTGTTTGCCACAGC - -a -s mr.mrrefChr5 288655 47 + 294542 ctaagagtttaagtctttcaggacatagttatgaaattagatacagc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434107 47 + 636262 ctaagatttcaagtcttttaggacatagttatagtattagatacagc -s simRat_chr6.simRat.chr6 442669 47 + 647215 CTAACAGTTTCAGCCTATCAGGACACAGTTAAGAAATTAGATACAGC - -a -s mr.mrrefChr5 288702 87 + 294542 gggtcccagtttaaagactttgggcacacaactgctgtgggtttagtaaatgagttcaggattgtaaggtagacatacggcagtgat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434159 87 + 636262 gggtcccagtttaaagactttggacacacaactgctgtgggtttagtaaatgagttcaggattgtaaggtaggcatacggcagtgat -s simRat_chr6.simRat.chr6 442716 86 + 647215 GGGTCTCAG-TTAAAGACTTCAGGCACACGACTGCTGGGGGTTTAGTAAATGGCTTCAGGATTTTAAGGTAGACACACTGCAGTGGT - -a -s mr.mrrefChr5 288789 7 + 294542 tggCTCa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434248 7 + 636262 gggctca -s simRat_chr6.simRat.chr6 442802 7 + 647215 TGGCTCA - -a -s mr.mrrefChr5 288796 53 + 294542 TTGGCATCacatcattatggcggaaatgtaatttTGTCTGAAGATGGCATGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434257 53 + 636262 ttggcatcacatcattatggcggaaatgtaatttTGTCTGAAGATGGCATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 442809 49 + 647215 TTGGCAACACATCACTATGGTGGAAATG----TTTGTCTGAGGCTGACAAGGT - -a -s mr.mrrefChr5 288849 265 + 294542 TGGCTCTGCCTCTGGACAGGAGCTGTTTGCAGGCCCCTCAATGAGATGTCAAAAATATGGAACATAGGACAAGGTAGCTTCCAATCAGGATCTTACCAAACAACAAGAGCCACATAAAAGAAACCCGTGGTCCCTGGGGGTGTGCTGATTGTGAGTCCGTGCCCCTCCTTCGCTGAGCTGCACCGGAGGTACCAACCCTAACTTTGTGCTTATCATTAATCCCTGCCCCTCCTACACTGGGCTGTGCCAGGGGTACCAACGTGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434310 262 + 636262 TGGCTCGGCCTCTGGACAGGAGCTGTTTGCAGGCCCCTGAATGAGATGTCAAAAGAGTGGAATGTAAGACAAGGTAGCTTGCAATCAGGATCT---CAAACAACAAGAGTCACCTAAAAGAAACCCGTGGTCTCTGGGGTTGTGGTGATTGTGAGTCCGTGCCCCTCCTTCGCTGAGCTGCACCGGAGGTACCAACCCTAACTTTGTGCTTATCATTAATCCCTGCCCCTCCTACACTGGGCTGTGCCAGGGGTACCAACGTGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 442860 265 + 647215 TGGCTCTGCCTCAGGATAGGAACTGTTTGCAGGCCCCTCAATGAGATGTCAAAAATATGGGACATAGAACAAGGTAGCCTCCAATCAGGATCTTACCAAACAACAAGAGCCACATAACGCGAGCCAGTGGTCCCTGGGGGTGTGCTGTCCGTGAGTCCGTGCCCCTCCTATACTGGGCCAGGCCAGGGGTCCCCACCCTAACTTTGTGTTGATCGTTAATCTGTGCCCCTCCTATGCCGGGCTGTGCCAGAGGAATCAACGTGTC - -a -s mr.mrrefChr5 289114 61 + 294542 CCAGAGGCACTGTCGGAATGCACCAGGGATACCAACATGTCCCAGAATTTAGAGGTCCGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434573 61 + 636262 CCAGAGGCACTGTCGGAATGCACCAGGGATACCAACATGTCCCAGAATTTAGAGGTCCGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 443125 61 + 647215 CCAGAAGCACCATTGGGCTGCGCCAGGGGTACCAACATGGCCCAGAATTTAGTGGTGCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 289175 27 + 294542 CGACACATGGTACCCAAATGCCAAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434637 27 + 636262 CGACACATGGTACCCAAATGCCAAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 202249 27 - 647215 CTACACATGGTACCCAAAAGCCGAAGT - -a -s mr.mrrefChr5 289202 15 + 294542 GGGATGTCCACGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434664 15 + 636262 GGGATGTCCACGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 202278 15 - 647215 GGGATATCTACGCGT - -a -s mr.mrrefChr5 289217 47 + 294542 TGCAATACACTGCAGAAAACACACCAGTGTCGGTGCCACCACCAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434697 47 + 636262 TGCAATACACTGCAGAAAACACACCAGTGTCGGTGCCACCACCAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 202293 47 - 647215 TGCAATACAACGCAGAAAACACACCAGCGTCGGTGCCACTACCTGGG - -a -s mr.mrrefChr5 289264 49 + 294542 TGCCACCACCAGGCACTTTGTGTGgtcgaaaagagggtggtgtaaaatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434744 49 + 636262 TGCCACCACCAGGCACTTTGTGTGgtcgaaaagagggtggtgtaaaatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 202351 49 - 647215 TGCCACTACCTGGGACATGGAGTGCtcaaaaagagggtgaggtacaatt - -a -s mr.mrrefChr5 289313 21 + 294542 gtcattgtttactagatgaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434794 21 + 636262 gtcattgtttactagatgaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 202400 21 - 647215 gtcactgtttactagatgcaa - -a -s mr.mrrefChr5 289334 28 + 294542 atgcacagttatcatagttgacctcatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434826 28 + 636262 atgcacagttatcatagttgacctcatc -s simRat_chr6.simRat.chr6 202421 28 - 647215 atgtatggtcgtcatagctaaccccatc - -a -s mr.mrrefChr5 289362 103 + 294542 tgaagcattatcagaagactatatattaagagcagtgttaacaagacttcatcccatctcctaagcgttaaggatgccactggaatagacgtagagggaggtg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434860 103 + 636262 tgaagcattatcagaagactatatattaagagcagtgttaacaagacttcatcccatctcctaagcgttaaggatgccactggaatagacgtagagggaggtg -s simRat_chr6.simRat.chr6 202449 103 - 647215 cgaagcattatccaaagagtatatagcaggagcagtgtcaacatgacttcatcccatcacctaggtgttaaagatgccactggaatagatgtagaggcgggtg - -a -s mr.mrrefChr5 289465 19 + 294542 tccgggtgccagctgacga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434963 19 + 636262 tccgggtgccagctgacga -s simRat_chr6.simRat.chr6 202553 19 - 647215 tccaggcactggctgatga - -a -s mr.mrrefChr5 289484 294 + 294542 ctggggagataaacggagttgccacagaggcggtcgagttgggctcctgatgacagtacgttatgctccttcttgtttcctgtttctccttctctctaatattgcagtacggcacctcatctattgattatgataatcgaagcaaactaatcatggtttgctcaatctcgcaaaaagctgttatgattttaaatgattggaaggtatttatatcgtctagcatcataagtcctcaacaaatgtccaaataaagcttatttccctgcactgaggccagattatcaggtggcaaac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434984 294 + 636262 ctggggagataaacggagttgccacagaggcggtcgagttgggctcctgatgacagtacgttatgctccttcttgtttcctgtttctccttctctctaatattgcagtacggcacctcatctattgattatgataatcgaagcaaactaatcatggtttgctcaatctcgcaaaaagctgttatgattttaaatgattggaaggtatttatatcgtctagcatcataagtcctcaacaaatgtccaaataaagcttatttccctgcactgaggccagattatcaggtggcaaac -s simRat_chr6.simRat.chr6 202572 294 - 647215 ctggggagataaacggagtcaccgtagaagcagtcaggctggggtcgtaatgacagtacgttgtattacctcctgtttcctgtttttccacctctctaatattgcagtattgcccctcatctattgattgttttaattgaagcaaacaaatcatggtttgctctttattgccaaaagatgttatgattttaaataaccagaaggtaattatattatctagcatcataagtcctcagcaaatgtctgaagaagggttatttcctcacactaatgtcagattgttgggtgggaaat - -a -s mr.mrrefChr5 289778 97 + 294542 ttctagtggtaaatgtttgcttggcactgaggcttctccctcatcctaaccgtcatctgggtgcagatgatcacatcccctgatcccaatgctcatc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435279 97 + 636262 ttctagtggtaaatgtttgcttggcactgaggcttctccctcatcctaaccgtcatctgggtgcagatgatcacatcccctgatcccaatgctcatc -s simRat_chr6.simRat.chr6 202866 97 - 647215 ttctagtggtaaatgtttgcttggcactgaggcttcaccctcctcctaattgtcatcggggggtagatgatcgcatgccctgaccccaatgctcatc - -a -s mr.mrrefChr5 289875 40 + 294542 gtacctcttgcaccaagcgttttaaggttgtatcaattag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435377 40 + 636262 gtacctcttgcaccaagcgttttaaggttgtatcaattag -s simRat_chr6.simRat.chr6 202963 40 - 647215 gtacctcttgtgccgaccgttttaacgtcatatcaattag - -a -s mr.mrrefChr5 289915 44 + 294542 gtatgtattatgcgcttcattatgtccttaataggggggatcat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435417 44 + 636262 gtatgtattatgcgcttcattatgtccttaataggggggatcat -s simRat_chr6.simRat.chr6 203017 44 - 647215 gtatctactatgcacttcattatgaccttaaagggtgggatcat - -a -s mr.mrrefChr5 289959 5 + 294542 tatgc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435462 5 + 636262 tatgc -s simRat_chr6.simRat.chr6 203061 5 - 647215 tatcc - -a -s mr.mrrefChr5 289964 131 + 294542 cgtctcaggacacagtcttctccaacatcagttcatggcacctggttcattttgtttggcaggctgatcagtgatgttgattgcatcgctgattgaatccttccaaaggctgataatgttacccttaatgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435470 131 + 636262 cgtctcaggacacagtcttctccaacatcagttcatggcacctggttcattttgtttggcaggctgatcagtgatgttgattgcatcgctgattgaatccttccaaaggctgataatgttacccttaatgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 203066 131 - 647215 catcccaggacgcagtcttttccaacaccaactcatggtacctggttcattttgcctggtgggctgatcagtgacttggatggggttgtcgatcgaatccttccaaagcctgataatgttaccctaaatga - -a -s mr.mrrefChr5 290095 25 + 294542 gattctcttcagtcatgttcacacc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435605 25 + 636262 gattctcttcagtcatgttcacacc -s simRat_chr6.simRat.chr6 203197 25 - 647215 gatgcacttcagtcatgttcacacc - -a -s mr.mrrefChr5 290120 38 + 294542 atagcgtgtcaaatatagagaacatcattaaatgttct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435630 38 + 636262 atagcgtgtcaaatatagagaacatcattaaatgttct -s simRat_chr6.simRat.chr6 203229 38 - 647215 atggcgtgtcaaacatagagaacatcattaaatgtcct - -a -s mr.mrrefChr5 290158 11 + 294542 gtgactcttgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435669 11 + 636262 gtgactcttgt -s simRat_chr6.simRat.chr6 203267 11 - 647215 gtgactcttgg - -a -s mr.mrrefChr5 290169 34 + 294542 aatcaaggggtctgatgtattgggagatacatag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435682 34 + 636262 aatcaaggggtctgatgtattgggagatacatag -s simRat_chr6.simRat.chr6 203278 34 - 647215 aggcctgagcgctaatgtattagtcgatatgtag - -a -s mr.mrrefChr5 290203 41 + 294542 tctacacctacaaatgtaaatccatgagaatctgcatagct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435722 41 + 636262 tctacacctacaaatgtaaatccatgagaatctgcatagct -s simRat_chr6.simRat.chr6 203312 41 - 647215 tctacacctacaaacgtaaatccatgagaatctgcatagct - -a -s mr.mrrefChr5 290244 78 + 294542 agcattgtccaggacctgaagtaccagtaggggcctacaattgttcctccctgagaatatgcaaacgtgaaggtagcc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435766 78 + 636262 agcattgtccaggacctgaagtaccagtaggggcctacaattgttcctccctgagaatatgcaaacgtgaaggtagcc -s simRat_chr6.simRat.chr6 203353 78 - 647215 gacattgtccaggacctgaagtacctgtaggggcctatagtagttcccccccgagaatatgtgaatgtcaaggaaacc - -a -s mr.mrrefChr5 290322 10 + 294542 ttgaaaccag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435844 10 + 636262 ttgaaaccag -s simRat_chr6.simRat.chr6 203432 10 - 647215 ttgaaaccag - -a -s mr.mrrefChr5 290332 15 + 294542 gtcaaccaagcagtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435875 15 + 636262 gtcaaccaagcagtt -s simRat_chr6.simRat.chr6 203442 15 - 647215 gacgactaagtggtt - -a -s mr.mrrefChr5 290347 52 + 294542 tttttgtacgtgtaaatccgaagtactggagtgatttcatgcctatatttag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435890 52 + 636262 tttttgtacgtgtaaatccgaagtactggagtgatttcatgcctatatttag -s simRat_chr6.simRat.chr6 203460 52 - 647215 ttattgtacatgtaaatccagagaattgtagcaatttcatgcctatatttag - -a -s mr.mrrefChr5 290399 38 + 294542 cctttaaatgtcaagggttggtagtctggcatactaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435949 38 + 636262 cctttaaatgtcaagggttggtagtctggcatactaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 203512 38 - 647215 cctttaggtgttgagtgttggtagtatggcatactaaa - -a -s mr.mrrefChr5 290437 10 + 294542 tattttttag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435987 10 + 636262 tattttttag -s simRat_chr6.simRat.chr6 203551 10 - 647215 tgttttttag - -a -s mr.mrrefChr5 290447 33 + 294542 atcagatgaaccgaatgcttgcaatatagcgac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435998 33 + 636262 atcagatgaaccgaatgcttgcaatatagcgac -s simRat_chr6.simRat.chr6 203561 33 - 647215 atcagttgagctgaattcttgcaatatagtgac - -a -s mr.mrrefChr5 290480 7 + 294542 ataagct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436031 7 + 636262 ataagct -s simRat_chr6.simRat.chr6 203599 7 - 647215 gtaagct - -a -s mr.mrrefChr5 290487 21 + 294542 gtagcttgccccacggtaaat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436038 21 + 636262 gtagcttgccccacggtaaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 203608 21 - 647215 gtagttctccccccagtaact - -a -s mr.mrrefChr5 290508 74 + 294542 ccagggtcttgcatttcctctttgctagttgaagttctcaagggggtcttctgcctccagaataatgagactct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436059 74 + 636262 ccagggtcttgcatttcctctttgctagttgaagttctcaagggggtcttctgcctccagaataatgagactct -s simRat_chr6.simRat.chr6 203630 74 - 647215 ccaggggcttgcatttcttctttgctagttggagttctcaagggggtcttctgcctccaggacaatgagattct - -a -s mr.mrrefChr5 290582 4 + 294542 attg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436136 4 + 636262 attg -s simRat_chr6.simRat.chr6 443187 4 + 647215 ATTG - -a -s mr.mrrefChr5 290586 28 + 294542 GAGTGAGCTCTACACATATACTGGTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436845 28 + 636262 GAGTGAGCTCTACACATATACTGGTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 443191 28 + 647215 GACTGAGCTCTACACAAATACTGGTGTC - -a -s mr.mrrefChr5 290614 50 + 294542 GGCAGAGCATCACCTTAATGACTGACTTAGCTCTACACAAGTATGTTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436873 50 + 636262 GGCAGAGCATCACCTTAATGACTGACTTAGCTCTACACAAGTATGTTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 443222 50 + 647215 GACATAGTGTCACTTTAATAACTTCCTGAGCTCCATGCAAATATGTTATG - -a -s mr.mrrefChr5 290664 2 + 294542 GT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436925 2 + 636262 GT -s simRat_chr6.simRat.chr6 443272 2 + 647215 GT - -a -s mr.mrrefChr5 290666 30 + 294542 GTGAGAAGCATACCACATACTGTGGGCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436927 30 + 636262 GTGAGAAGCATACCACATACTGTGGGCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 443275 30 + 647215 ATGACAAATATACCACATACCGTGAACATA - -a -s mr.mrrefChr5 290696 8 + 294542 CATGATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436957 8 + 636262 CATGATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 443307 8 + 647215 AACAATAA - -a -s mr.mrrefChr5 290704 11 + 294542 GTTAAGGGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436965 11 + 636262 GTTAAGGGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 443316 11 + 647215 GTTAAGGGTAT - -a -s mr.mrrefChr5 290715 9 + 294542 GGCAACTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436979 9 + 636262 GGCAACTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 443327 9 + 647215 GGCAACTTG - -a -s mr.mrrefChr5 290724 157 + 294542 GGGCAGATAGCAACACCACCGTTCCATTTCATACTATATAAATGAGGGAAACAGGGGGTAACATGACGTCAAAATCTAGAAGTAGTTCTTTGTCTCTTCATCCCTATATTGGTAAGAGGTGCCTTCCATTGGGTTTTAAGCTGAATCTCTGTTATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436988 157 + 636262 GGGCAGATAGCAACACCACCGTTCCATTTCATACTATATAAATGAGGGAAACAGGGGGTAACATGACGTCAAAATCTAGAAGTAGTTCTTTGTCTCTTCATCCCTATATTGGTAAGAGGTGCCTTCCATTGGGTTTTAAGCTGAATCTCTGTTATTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 443337 157 + 647215 GGGCATATAGCAACACCACTGTTCCATTGCTCACTATGTGAATGAACACAACAGGGGGTAACACAACATCAAAATTTAGAAGTAGCTCTTTGTCACTTCATCCCTATAATGGTCAGAGGTGCCTTCTGTTGGGTTTTAAGCTGAATGTCTGTCATTA - -a -s mr.mrrefChr5 290881 17 + 294542 AACCTAAGGCTggagta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437152 17 + 636262 AACCTAAGGCTGGAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 443494 17 + 647215 GATCCAAGGCTaccgga - -a -s mr.mrrefChr5 290898 60 + 294542 GACCCAGTTATATGGTATTTAGACGCTGGTAGTGCATTGCAGGGGATGAGTTCCTCATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437169 60 + 636262 GACCCAGTTATATGGTATTTAGACGCTGGTAGTGCATTGCAGGGGATGAGTTCCTCATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 445709 60 + 647215 GACTCAGTTATAAGGTTTTTGGATGCTGGTAGTGCATTGCAAGGGATGGATTCCTCACCC - -a -s mr.mrrefChr5 290958 28 + 294542 CACACATATGTCCTGAGGGCCTGGTAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437229 28 + 636262 CACACATATGTCCTGAGGGCCTGGTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 445773 28 + 647215 CCCACATATGTCCTGGGGGCCTGATAGT - -a -s mr.mrrefChr5 290986 6 + 294542 AGAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437260 6 + 636262 AGAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 445801 6 + 647215 AGAGGT - -a -s mr.mrrefChr5 290992 12 + 294542 AGTTTATTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437267 12 + 636262 AGTTTATTCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 445807 12 + 647215 AATTTATTCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 291004 146 + 294542 GAGGCTGCTATAATATGGCTCACGCTCTCAGAATCCAGGCGTTTAGTACTAGTAATGCACAAGAAACCATTAGTTCAACTTTCTTCAGTGTTCTTCTACACGAACTGTTTTCAGCAAGTGCTGCATCCATGGTTGGGTATTGGTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437287 146 + 636262 GAGGCTGCTATAATATGGCTCACGCTCTCAGAATCCAGGCGTTTAGTACTAGTAATGCACAAGAAACCATTAGTTCAACTTTCTTCAGTGTTCTTCTACACGAACTGTTTTCAGCAAGTGCTGCATCCATGGTTGGGTATTGGTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 445819 146 + 647215 GAGGCTGCCATAATATGACTCAAGCTCTCAGAAACCAGGAGTTTAGTACTAGTGATGCGCAAGAAACTGTTAGTTCAACTTTCTTCAGTGTTCTTCAACACGAATTGTTTTCAGCAACTGCTGCATCCATGGTTAGGTATTGAATT - -a -s mr.mrrefChr5 291150 21 + 294542 CATTTTGCCTTCCCCCAGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437440 21 + 636262 CATTTTGCCTTCCCCCAGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 445965 21 + 647215 CATTTTGCCTTCCTCCTGATC - -a -s mr.mrrefChr5 291171 42 + 294542 GGGGTTCGATTTTAGAGTATTGTCTATGAGAAATTCAGAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437461 42 + 636262 GGGGTTCGATTTTAGAGTATTGTCTATGAGAAATTCAGAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 446000 42 + 647215 AGCGTTTGATTCTTAAGAATTGTCTATGGGAAATTCAGGGCC - -a -s mr.mrrefChr5 291213 234 + 294542 TCTAAGTAAAGTCCAGTGATGGCCACCATGCCACCTATAGTGTTTTGATCAGCCAACATGGGCAACAGGCATTTACTCACAGCCAGTCAATATGGAGAACTTGAGTGTGATCTCAGGAAGGTCTCGAACATCGAGGGATGACCAGTCCATGCCCTACCTTAGATCCTGTGTATACACAAGCTACCCTTCTTGCTAACAACACATTTCTTTGCTCGAAGAGTAGAAAGAAGTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437503 234 + 636262 TCTAAGTAAAGTCCAGTGATGGCCACCATGCCACCTATAGTGTTTTGATCAGCCAACATGGGCAACAGGCATTTACTCACAGCCAGTCAATATGGAGAACTTGAGTGTGATCTCAGGAAGGTCTCGAACATCGAGGGATGACCAGTCCATGCCCTACCTTAGATCCTGTGTATACACAAGCTACCCTTCTTGCTAACAACACATTTCTTTGCTCGAAGAGTAGAAAGAAGTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 446044 234 + 647215 TCTCAGTAAAGTCCAGTGACAGCCACCACAGCACCTCTAGTGTTTTGACCAGCCCGCATAGGCAATAGGCGTTTGTCCACAGACAGTTAATATGGGGAACTTGAGCATGATCTCAGCAAGGCCTAGGACATTGAGGGATGAACAGTCCATGCCCTGCCTTAGATCCCATGTATAAGCAAGCTACCCTTCTTGCTAACAACACATTTCTTTACTTGAAGAGTAGAAAGAAGTCCA - -a -s mr.mrrefChr5 291447 17 + 294542 TAGATGTCTCTAAGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437737 17 + 636262 TAGATGTCTCTAAGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 446292 17 + 647215 TAGATGTCTCTAAGCCT - -a -s mr.mrrefChr5 291464 22 + 294542 GCTACTGCATATAATAGGGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437754 22 + 636262 GCTACTGCATATAATAGGGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 446311 22 + 647215 GATACTGCTTATACTAGAGTAA - -a -s mr.mrrefChr5 291486 6 + 294542 TATCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437777 6 + 636262 TATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 446333 6 + 647215 TATCTG - -a -s mr.mrrefChr5 291492 17 + 294542 TCTTTTGTACTATGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437783 17 + 636262 TCTTTTGTACTATGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 446340 17 + 647215 TCTTTTGTGCTATGGAG - -a -s mr.mrrefChr5 291509 28 + 294542 TGCCCTCCTGCCATCAAGCAATGTATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437800 28 + 636262 TGCCCTCCTGCCATCAAGCAATGTATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 446358 28 + 647215 TGTCATTTTTCCTTCAAGCTATATGTAG - -a -s mr.mrrefChr5 291537 177 + 294542 TGGTCTAAGTAGTCACTTGATAATTGGTTCTGTCAAAGTGATCATGCCATGGTTATATGAATCCCCATGGATATCCCTACAATTCACTCTGTTAGGAACCCTGATAACAATCCCTAGAATTCAGCTTCTATCCACAGACTGGTGACTATTCCCAGAGCTCATCTTTTATCCAGGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437836 177 + 636262 TGGTCTAAGTAGTCACTTGATAATTGGTTCTGTCAAAGTGATCATGCCATGGTTATATGAATCCCCATGGATATCCCTACAATTCACTCTGTTAGGAACCCTGATAACAATCCCTAGAATTCAGCTTCTATCCACAGACTGGTGACTATTCCCAGAGCTCATCTTTTATCCAGGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 446386 177 + 647215 CGGTCTAAGCATTCACTTGATAATGGGTTATGTCAGAGAGATTATGCCATGGTTATATGAATCCCCATGGATATCCCTACAATTCACTCTGTGAGGAACCCTGATAGTTGCCCCTAGATTTCATTTTCTATCCACAGACTGGTGACTATCTCCAGAGCTCATCTTTTATCCAGGCAC - -a -s mr.mrrefChr5 291714 96 + 294542 ACCCTTGCTATGGTGAGTGAGAACTTTTTACCATGCCCATGGAGTCAAATTCTGAGGTGGAGCCTCTAACAGATCATGTGCCTATTGCCTCAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438013 96 + 636262 ACCCTTGCTATGGTGAGTGAGAACTTTTTACCATGCCCATGGAGTCAAATTCTGAGGTGGAGCCTCTAACAGATCATGTGCCTATTGCCTCAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 446570 96 + 647215 GCCGTTGCTGTTGTGGGTGAGAACTTTTTACCATGCCTATGGAGTCGAATTCTGAGGTAGAGCCACTAATAGATTATGTGGCTATTGTCTCAAACA - -a -s mr.mrrefChr5 291810 119 + 294542 CTAAATTTTGGGGTCGAGCAGAGAGGCTTTTTTCAGGAAGTAGAGAAGTAAGGCCCTCACCAGTTATGCTGTTGATTGTTCCAATCACTGACCTACCTCTTGTTATGCTTCTTCTGAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438109 107 + 636262 CTAAATTTTGGGGTCGAGCAGAGAGGCTTTTTTCAGGAAGTAAAGAAG------------CAGTTATGCTGTTGATTGTTCCAATCACTGACTTACCTCTTGTAATACCTCTTCTGAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 446667 119 + 647215 CTAAATCTTGTGGTAGTGAAGTGAGGCTCCTTTCAGGATGTAGAGAAATAAGGCCCTCACCAGTTATGCCATGGATTGTTCCAATCAATGACCTACCCCTTGTTATGCTCCTTCTGAGA - -a -s mr.mrrefChr5 291929 7 + 294542 TTTTATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438219 7 + 636262 TTTTATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 446786 7 + 647215 TTCCATT - -a -s mr.mrrefChr5 291936 224 + 294542 ATTTTTCTTCTCCTGAGATACTGGAAAATCCCCTCCTCAACCCTCCAATGGCATCTCTGTGGTAACTGTTTGTCTTGAACATTCTTTCATACCTCTGTTATAAGAAGCATGTTGATTGCAGATATCGGTATTTGAAGGTAAATAGGCACTCACAATGCAGTCTGCAGGGCCTTTGGGTCAGCCCCTATGTAAGTTGGTATGTAGGATTTATTTCTCTTGGGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438227 224 + 636262 ATTTTTCTTTTTCTGAGATGCTGAAAAATCCCCTCCTCAACCCTCCAATGGCATCTCTATGCTAACTGTTTGTCTTGAACATTCCTTCATACCTCTGTTATAAGGAGTATGTTGACTGCAGATATCGGTATTTGAAGGTAAATAGGCACCCACATTGTAGTCTGCAGGGCCTTTTGGTCAGCTCCTATGTAAGTTGGTTTGTAGGATTTATTTCTCTTGGCCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 446793 215 + 647215 -TTTTTTTTCTCCTGAGATAACGGAAAATCC------CAACTCTCCAATGGCATCTGTGTGGTAAGTGTTTGTCTTGAACATTCTTTCATACCTCTGTGATAAGAAGCAGATTGATTGCAGATCTCAGTATTTGAAGGC-AATAGGCACTCACAATGCAAACTGCAGGGCTTTTGGGTTAGTCCCTATTTAAG-TGGTATGTACAATTTATTTCTCTTGGGCTG - -a -s mr.mrrefChr5 292160 23 + 294542 ACTACCCTATACTAATATTTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438460 23 + 636262 ACTACCCTATACTGATATTTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 447008 23 + 647215 ACTACCCTATACTAATATTGTCC - -a -s mr.mrrefChr5 292183 75 + 294542 ATACTTCTAAAATCATACTCCATCAATTTCAGTGGTTCTGTTGCCTATGTGTACTCAGGTACATAACTGGGTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438486 75 + 636262 ATACTTCTAAAATCATACTCCATCAATTTCAGTGGTTCTGTTGCCTATGTGTACTCAGGTTTGTAACCAGGTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 447031 65 + 647215 GTACTTGTAAAA-------CCATCAATTTGAGTGGTTCTGTTGCCC---TACACCTGGATACAAACCTGAGTATA - -a -s mr.mrrefChr5 292258 151 + 294542 GGTTGTCTAGCAGTATCCTTTATGATAGGGGAAGGGAAAATTATGTATTTTGCGGTTTCAGAAATGTTACTACAGGCCTTTGCAGTGAATGAAGCCAGCCCAAAGATTGAAATGAGGTTACAACATTAAAGCAGTCATTATAGCAGTTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438561 151 + 636262 GGTTGTTTAGCAGTATCCATTATGATAGGGGAGGGGCAAATTATGTATTTTGCGGTTTCGCAATTGTTACTACAGGCCTTTGCAGTGAATGAAGCCAGCCCAAAGATTGAAATGGGGTTACAACATTAAAGCAGTCATTATAGCAGTTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 447099 151 + 647215 AGTTGTCTAGCAGTATCCTTCATGATACAGGAAGGGAAAATTATGTATTTTGCTGTTTTAGAAATGTTACTACAGGCCCTTGCAGTGAATGAAACCATCCCAAAGAGTGAAATGAGGTTACAACATCAAAGCAGTCATTATTGCAGTTAAA - -a -s mr.mrrefChr5 292409 46 + 294542 TTACAGGACAGGAGACATCAACAAACATTAATATCCAAAAAGTAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438739 46 + 636262 TTACAGGACAGGAGACATCAACAAACATTAATATCCAAAAAGTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 447250 46 + 647215 TTACAGGATGGGAGACATAAACAAACATTTCTATCCTAACAGTAGG - -a -s mr.mrrefChr5 292455 274 + 294542 TTGATATTGTTTGTTTAAGCTAGCAACTTACTAAACTTACTAAATTGGATTGCATAAAATAGGGACACCAGTCAGGTTTTTGGTGTGTTTCTCTCTACAACCATTCTGGGAGATTTTAACTCCAAGGAATCTGGAGGTGGAAAGCAGTCCACACATGTCTGGAAAAGCAAATCTATAAATATTGTGAGGTATGGGCATATCTCGCAACTTTCTAGTTGATGCCAAAACGCTTAAACACACAGGCTATCAGCAGTCTATGGCATCTTGGCTCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438789 274 + 636262 TTGATATTCTTTGTTTAAGCTAGCAACTTACTAAACTCACTAAATTGGATTGCATAAAATAGGGACACCAGTCAGGTTTTTGGTGTGTTTCTCTCTACAACCATTTTGGGAGATTTTAACTCCAAGGAATCTGGGGGTGGAAAGCAGTCCACACCTGTCTGGAAAAGCAAATCTATAAATATTGTGAGGTACGGGCATATCTCGCAACTTTTAAGTTGATGCCTAAACGCTTAAACACACAGGCTATCAGCAGTCTATGGCGTCTTGGCTCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 447296 273 + 647215 TTGTGATTGTGTGTTTAAGCTAGCAACTTGCTAAACTTACTAAATTGGATTGCATAAAATAAGGACACCAGTTAGGTTTTTAGTGTGTTTCTCCCC-CAACCATTCTGGGAGATTTTAACTCCAAGGGGTCTGGAGGTGGAAAGCAGTCCACACATACCTGGAAAAGCAAAGCTATACATGTTGTGAGGTATGGGCATATCTGGCAACTTTCTAGTTGACGCTAAAAGGCATAGACATACAGGCTATCCGCTGTCTATGGCATCTTGGCTCTAA - -a -s mr.mrrefChr5 292729 359 + 294542 TAAATCAGTTGAAGTACAATGGCCGTTACATAATGGCAATTACATAGACAGATTCTATGAGACATAATGACTGGAGACTAAGTCTGCATAGAATAACTAGTGCATATAGCCCTTTAATGAAATGATCCACTTGTGGCTAGCCTAGATAACTTGACCACTCTTTCAGTGCCATGCCAATATTGACCAGTTGGAAGGGTACCATTCAGTCCGGATTACCATTCAGTTCAGACGAGTAGCTTACCATCACAACATAGATCATCTTTCTATTAACCCCACTAGTGCAATGGAGAGACACATATTCGCCTTAAGATCCTACGTTGTAGTACTTACTCAGAAACAAACTGAGACAGTATAGTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439063 359 + 636262 TAAATCAGTTGAGCTATGATGGCCGTTACATAATGGCAATTACATAGACAGATCCCATGACACATAATGACTGGAGACTAAGTCTGCATAGAATAACTAGTGCATATAGCCATTTGATGAAATGATCCACTTGTGGCTAGCCTAGATAACTTTACTACTCTTTCAGTGCCATGCCAATATTGACCAGTTGGAAGGGTACCATTCAGTCCAGATTACCATTCAGTTCAGACGAGTAGCTTACCATCACAACATAGATCATCTTTCTATTAACCCCACTAGTGCAATGGAGAGACACATATTCGCCTTAAGATCCTACGTTGTAGTACTTACTAAGAAACAAACTGAGACAGTGTAGTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 447577 352 + 647215 TAAATCAGTTGAAGTACAATGGCCATCACATAATGGCAATTACATAGACACAATCTATGAGACATAATGACTGGAGACTAAGTTTGAATATAATAACTAGTGCATACAGTCCTTTAATGAGATGATCCACTTGTGGCTAGCCTGCATAACTTGACCACTCTTTTGGTGCCATGCCAATATTGACCAGTTGGAAGTGTACCATTCAGCCTGGATTACCATTCAGTTCAAAAGAGTAGCTTACCATCACAACATAGATCATCTTTCTATTAA-------AGTGCAGTGGAGGGACGTGTATTCGTCTTAAGATCCTATGTTGTACTACTTACTCAGAAACAATCTGAGACAGTATAGTCTC - -a -s mr.mrrefChr5 293088 838 + 294542 TAGGACATACCGAGCAGCCCATAAGAACCAACATGAATGTACAAACTACACAAGATTCCCACATAACCAGCAGCACAGACAATACAGGTTCCACCTGTTATAGTATCCTGGTTATTAGGAACTAGATGAAATGCCCAGGGGATATATGGTATCTTAGCAAACAACAATACTACAAAGGCTACAAGAAGTGGATTGCCCAATGCTAAAACATCCAGGTTTGTTTCATCTGTTCTCCCTATTTGAATCAAGTCCACAAAAGGAAAAATGGAAAGAGAAGACACTAACTTTAACGAAAAGACTATTACACTACTGTGCCAGTTTATGTGAAGGACACTTTGTATAAGCTATTGGAGATACTACTCTGTTCCACATTTTCATGACAGCACAGGGTCCCAACTCACCTCTTCATTCTCCTCTTTATTTATGAATGCATATATGTGTTTCGCGAAGCTGTTGATTTGTTGTACTTGCAGTACTCATATTGTTACTTTGCCTCATGTTTTAATTGTATGTGTTAGTTTGATACTTAAACTGTTGAATGTTATGATCATAAACTTAACTGTTACCTCTCTCAAGAAGGGATCATATGGTGAAGTTTTCAATTTCAGGCTACATCTAGGTTGGTTCAGCAGCTCCAATTGAGGTGTTTCCCAAGTATCAGGTGGTGCTTTTGACAAAGCTAGTACTTTTGATATGATACAGATGTCCTGCCAGTGGACTAAGCACAATTTAAGTGTAAACAACTCAGTCATAGATAATTTAGACCAGTACAAAAATAAGTCATGTAAGCCATTTTTAATATTCCAACGCACACAAACTTTACAATTGTAATGTCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439618 819 + 636262 TAGGATATACAGATCAGCCCATAAGAACCAACATGAATATACAGACTACACATGATTCCCACATGACCAGCGGCATAGACAACACAGGTTCCACCTGTTATAGTATCCTGGATATTAGGAACTAGATGAAATGCCCAGGGGATATATGGTATCTTAGCAAACAACAATACTACAAAGGCTACAAGAAGTGGGTTGCCCAATACTAAAATATCCAGATTTGTTTTATCTGTTCTCCCTATTTGAGTCAAGTCCATGAAAGGAAAAATGGAAAGGGGAGACACTAACTTTAACATAGAGACTATTAC---ACTGTGCTAGTTTATGTGAAGGACGCTTTGTATAAGCTATTGGAGATACTACTCTGTTCCACATTTTCATGACAGCACAGGGTCCCAACTCACCTCTTCATTCTCCTCTTTATTTACTAGCGCATATACATGTTTCGCGAAGCTGTTAATTTGTTGTACTTGTAGTACTCATATTGTTACTTTGCCTCATGTTTTAATTGTATGTGTTAGTTTGATATTTAAACTGTTGAATGTTATGATCATAAACTTAACTGTTACCTCTCACTAGATGGGATCATATGGTCTAGTTTTCAATTTCAGGCTACATTTAGGTTGGTTCAGCAGCTCCAATTGAGGTGTTTCCCGAGTGTCAGGTGGTGCTTTTGACAAAG-----------GATATGATACAGATGTCCTGCCAGTGGGCTAAGCACAATTTAAGTGTAAAC----CAGTCATA-ATATTTTAGACCAGTACAAAAATAAGTCATGTAAGCCATTTTTAATATTCCAACACACACAAACTTTACAACTGTAATGTCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 447929 832 + 647215 TAGTCCATATCCAGCAGCCCATAACAACCAAAATGAATGTACAAAGTACACAAGATTCCT-TAAAACCAGCAGCACAGACAGTACAGGTTCCACCTGCTGCAGTGTGCTGGTTATTTGGAACTAGATGAAATGCCCAGGGGATGAATGGTTTCTTAGCGAACAACAATACTACAAAGGTTACCAGAAGTGGATTGCCTAATGCTAAAACATTCATGTTTGTTTCATCTGTTCTCTCTATTTGAATCAAGCCCACAAAAGGAAAAATGGAAAGAGAAGACACTAACTTTAAGGAAAGGACTATTGCACTACTGTGCCAGTTTATGTGAAGGACACTTTGTATCAGTTATTGGAGATACTATTCTGTTCCTCATTGTCATGACACCAAAGGCCCCCAACTCACTTCTTCATTCTCCTCTTCATTTGTGAATGCATATATGTGTTTCAAGAAGCTGTTGCTTTGCTGTACTTGCAGCACTCATATTGTTA-TTTGCCACATGAATTAATTGTATGTTTAAGTTTAATACTTAACCTGTTGAAGGTTCTGATGCTTAACTGATCTGTTACCTCTCTCAAGAAGGGATCATATGGTGACGTCTTCAATTTCAGGCTCCATCTAGG-TGGTTCCGCAGCTCCAATTGA---GTTTCCCAAGTATCTGGCGGTGCTTTTGACACAGCTAGTACTTTTGGTAGGATAGAGTTGTCCTGCCAGTGAACTAACCACATTTTAAGTATCAACAACTCAGTCATAGGTAATTTAGACCAGTGTAAAAATGAGTCATGTAAGCCGTTTTTAATATTCCAACGCACACAGACTATACAATTGTAATATCTCT - -a -s mr.mrrefChr5 293926 271 + 294542 CAAAAAACCAAGTTTTAAGGTTTCGTCAAGTGAACAGGGACACTTATCATACATGCAATCAGATTGTCTGTATTTTAAGAATACCAGTGTTTTTGGTGGATTCATCCAAACCTCAGGTTGACTAGGTATTTGCTGTGGAGTAAGTACATGCATATGACATTAATATCATATTAAGGACTTCTGTAGTATAATGTGTAACCATTGACTTGACTAATATGTAGTGCAAGCTTGTTTACTATCCACATTACCTTCCATCAACTGGGAATTCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440437 271 + 636262 CAAAAAACCAAGTTTTAAGGTTTCGTCAAGTTAACAGGGACACTTATCATACATGCAATCAGATTGTCTGTATTTTAAGAATACCAGTGTTTTTGGTGGATTCATCCAAACCTCAGGTTGACTAGGTATTTGCTGTGGAGTAAGTACATGCATATGACATTAATATCATATTAAGGACTTCTGTAGTATAATGTGTAACCATTGACTTGACTAATATGTAGTGCAAGCTTGTTTACTATCCACATTACCTTCCATCAACTGGGAATTCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 448779 271 + 647215 CAAAAAACTAAGTTTTACGGTTTCGTCAGGTGAACAGGGAGACTTATCAGACATGCAGTCAGATTCACTGTATTTTGAAAGTATCAGTGCTTTTGCTGGATTCATCCAATTCTCAGGTTGACAAGGAATTTGCAGTGAAGTCAGTACAGGCACATAACACTAATGTCATATTAGGGACTTCTGTAATAAAATGTGTAACCATTCACTTGACTGACATGTAGTGCAAGCTTGTTTACTATCTACACTACCTTCCATCAACTAGGAATGCGTT - -a -s mr.mrrefChr5 294197 5 + 294542 ATGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440708 5 + 636262 ATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 449051 5 + 647215 ATGCT - -a -s mr.mrrefChr5 294202 6 + 294542 ATGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440713 6 + 636262 ATGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 449058 6 + 647215 ATGACG - -a -s mr.mrrefChr5 294208 58 + 294542 TGCTGTTCAAGGTGCTGATGATTTTAGGGAGTGCCTTAACCCTGAAAGTTCCCAATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440719 58 + 636262 TGCTGTTCAAGGTGCTGATGATTTTAGGGAGTGCCTTAACCCTGAAAGTTCCCAATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 449136 58 + 647215 TGCTGTTCGAAGTGCTGCTGACTTTAAGAAGTGCCTTAACCCCCAGAGCTCCCAATAG - -a -s mr.mrrefChr5 294266 49 + 294542 GTTGGAGGGAATCAGCATTGTCTTCTTGCCTTAACAGACTATCAAACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440777 49 + 636262 GTTGGAGGGAATCAGCATTGTCTTCTTGCCTTAACAGACTATCAAACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 449197 49 + 647215 GGAGGGGGGAATCAGCATTGTCTTCTTATCTTAACAGACTATCAAACAA - -a -s mr.mrrefChr5 294315 153 + 294542 ACTTAACCTGTGGGCATCCAAATCTTTAAATCTGGGATTGAATGATATTCATTGAAACTTGTCCTTCAAGAGCCCTCATCTCACTCCAACACCGCTAGTGTCGTTTGGGTCAACTCTCACATGTTGAGGATCCAGAGCCACCTGCTCAGAGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440826 153 + 636262 ACTTAACCTGTGGGCATCCAAATCTTTAAATCTGGGATTGAATGATATTCATTGAAACTTGTCCTTCAAGAGCCCTCATCTCACTCCAACACCGCTAGTGTCGTTTGGGTCAACTCTCACATGTTGAGGATCCAGAGCCACCTGCTCAGAGCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 449310 153 + 647215 GCTTAACCTGTGGGCATGCAACTCTTTAAATCTGGGGCTGAGTGGTTTTCATCAAAACTTGTCTTGCAAGAGCCAGTATCTGACTCCAACAGTGCTAGTATCATTTGGGTGGACTCTCACATGTTGAAAATCCGAAGCCATCCGCTCTGGGCA - -a -s mr.mrrefChr5 294468 74 + 294542 TTTCTGTCAGTGCATTTGCATGTATGATGGTGACAGTAACAAAGAAAATCTGATACATGTGCTGAAGAATGGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440979 74 + 636262 TTTCTGTCAGTGCATTTGCATGTATGATGGTGACAGTAACAAAGAAAATCTGATACATGTGCTGAAGAATGGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 449482 74 + 647215 TTTCTATCAGTGCATTTGCATATATTGTCCTAACAGAAACAAAGAGGATCAGATACAATTGCTGAAGAGTGGTG -