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GTGTTTGGTAGGCTCAGAGGCATAGTTAGCAATAGTTGCTACTGCACTGCAAGGATCCCAAAGGCATGCACCATGATTTGCTCATCCCAATGAATAAGAATCATGAACCCACCCTAACTTTGTGGGCCCAGATGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4421 135 + 636262 GTGTTTGGTGGGCTCGGAGGCACAGTTAGCAATAGTTGCTACTCCATTGCAAGGATCCCAAAGGCTTGCACCGTGATTTGCTCATCCCAATGAATAAGAATCATGAACCCACCTT-ACTTTGTAGGCCCAGATGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 4210 136 + 647215 GTGTTTGGTAGACCCAGATGCATAGGTAGCAGTAGTTGCTACTGCACTGCGAGGATCCCAAAGGCATGCACCATGATTTGCTCATGCTGATGCCTAAGAAGCACAAACCCACCCTAACTTTGTGGGTCCAAATGCT a s mr.mrrefChr0 4347 14 + 130230 TGACAACGGGAATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4564 14 + 636262 TGACAACGGGAATT s simRat_chr6.simRat.chr6 4346 14 + 647215 TGACAAAGGGAATT a s mr.mrrefChr0 4361 37 + 130230 TTATTAATAGGCTAGGGGTGTTGTTCACAGTACCTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4578 37 + 636262 TCATTAATAGGCTAGGGATGTTGTTCACAGTACCTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 642057 18 - 647215 TTGCTATTCGTCCAGGGG------------------- a s mr.mrrefChr0 4398 23 + 130230 CATCGTACACCAAGGTATAACCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4616 23 + 636262 CATCGTACACCAAGGTATAACCA a s mr.mrrefChr0 4421 255 + 130230 ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATAGTGAAGATTGCAAGACAAAGAATGTGCTGATCTAAATTTTTTGATTAGTGGATGCAGCTGGTTGCACCATCAACACAGACGGCAGCAGCATTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCACTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGTGGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4650 255 + 636262 ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATACTGAAGATTGCAAAACAAAGAATGTACTGATCTAAATTCTTTAATTAGTGGATGTGGCTGGTTGCACCATCAACACAGACAGCAGCATCACTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCGCTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGCAGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA s simRat_chr6.simRat.chr6 642075 254 - 647215 ACCTTAGCTTGCACCCATGTATATCAAGCCCCCCTGTTAGTCACAGTGAAGATTGCAAGACAAAGAAAGTGCTGATCTAAATTTTTTGATTAGTGGATACAGCTGGTTGCTCCATCAGCACAGATGGCAGCAGCATTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATGCCACTGCAGACCTTATTGCAGCTTATTA-GGAAAGTGCTGTGGACAGTGGCAGCTTCCATGGGGTGATACCCGATGCCAGTGGCAACTG a s mr.mrrefChr0 4676 108 + 130230 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AGGCTATGCCTTTGTCACTAGAAATGCACACCACGTTTCTAATTTGAATCAACGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTATAATAAGTTGCAGCCCATGCTTTTATCACTAGAAACGCACACCACGTATCTAATCTGAATCAATGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTAGATCATGTCTCTACACTTAAATGTTCTGATTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 5192 116 + 647215 ----------------------------------------------------------------------------------------TGAAGGCTACGCTTTTGTCACTAGAAACTCACACCACATATCTAATTTAACTCAACATTACAATAAGTGTTGAAAGTTAGATATGTCATGTCCCTACACTTAAGTGTTCTGGTTTC a s mr.mrrefChr0 5521 169 + 130230 AACTCCAAAGAACCTGGCAACCCTCTACCTTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGCATTATATACTTAATGCATAAACAATTGAAGGGGATGCAAGTGCCACCACTAGAACATGCAAAGGTATAAAGGGAACTCACATAAGAGAGCAGTTGAGTTTATCTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5807 169 + 636262 AACTCCAAAGAACCTGGCAACACTCTACCGTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGCACTATATACTTAAGGGATAAACAATTGAAGGGGAAGCAAGTACCACCACTAGAACATGTATAAGTACAACGGGAACTCACATAAAAGAACAGTTGAGTTTATCTA s simRat_chr6.simRat.chr6 5309 169 + 647215 AACTCAAAAGAAACTGGTGACCCTCTACCTTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGAATTATATACTTAATGCATAAACAATTGAAGGGGCTGCAAGTGCCACCACTAGAACATGCAAAGATATAAAGGGAGCTCACACAAGAGAGCAGTTGAGCTTATCTA a s mr.mrrefChr0 5690 128 + 130230 CTTGCATGTTACTAGAGAGTCCATGAGCTCTTTAGTTAGATGACTTGTGGGTGTCATAAGGTTAATGTGGACAAGTAAGCTAGGGGCTTTCATAAGGTAGGGGCTTTCAAACTGCTGGAAGTTCAGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5976 128 + 636262 CTTGAATGTTATTAGAGAGTCCATGAGCTTTTTAGTTAGATGACTTGTGGGTGCCATAAGATTAATGTAGACAAGTAAGCTAGGGGCTTTCATAAGGTAGGGGCTTTCAAACTGCTGGAAGTTCAGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 5479 111 + 647215 CTTGCATGTTACTAGAGAGTCCATAAGCTCTTTAGGTAGATGACTTGTGGGTGTCATAAGGTTAATGTGGACAAGTA----------------GAGGTAGGGGCTTTCACCCTG-TGGAATTTCAGGA a s mr.mrrefChr0 5818 327 + 130230 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TATTAATGCACCAAAGCATTATGATCTTAAGTAGCACTAGCACTGAATTTCAATCTAGACCGTCTGGCCCAAAAGCAATCTGAGATGGAAAGGAATCACACAGAGAGAAGGGTAGTATTGATGAAGCCAGGCTACAGCTTGAAACCAACTAGCAAGTTTTAATTCAATAGCCATAAAGAACTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6674 182 + 636262 TATTAATGCACCAAAGCATTAGGATCTTAAGTAGCACTAGCACTGAATTTCAATCTAGACCGTTTGGCCCAAAAGCAATCTGATATGGAA--GAATCACACAGAGAGAAGGGTAGTATTGATGAAGCCAGGCTACAGCTTGAAATCAACTAGCAAGTTTTAATTCAATACCCATAAAGAACTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 6147 180 + 647215 TATTAATGCATCAGTGCATTATGATATTAAGTAGCATTAGCACTGAATGTCAATCTA----GTCTGGCCCAAAAGCAATCTGAGATGGAAAGGAATCACAAAGAGGGAAGGGTAGTATTGGTGGGGCCAGGCTATGGCTCGGAACCAACCAGCAAGTTTTAATCCAATAGCCATATAGAACTAA a s mr.mrrefChr0 6551 178 + 130230 AACCAAGCGCAGTAATGTAACAGGCAGCATGGAGTGGCAAGTGACCAGAGCAGTGCAGTATTGGTCATTTATGTATTAGCAATTCTAAGCACAATTGGTGTCATACTATGTAAAACAGTTTTGGTGAAACCATCACAGATCAGCAATGTGTCTTTGAATGGAGCCCAATGATAAGATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6856 178 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 7112 73 + 636262 AATTTCCATTGGAGCTGAATCAGGGGATAGACTGCTGACATCCAACAAAGGTGATGAAGTTACACAAAATTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 6630 73 + 647215 AATTTCCATTTTAGGTGAATCAGGGGATACACTGCTGATATCAAACAAAAGTCGTGAAGTTGCACAAAATTAC a s mr.mrrefChr0 6879 58 + 130230 ACTAAATCATAGTCATGGCTAAAAGGTATGGACAACTACATACAGTTTATTTAGGTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7185 58 + 636262 ACTAAATCATAGTCATGGCTAAAAGGTATGGACAACTACATACAGTTTATTTAGGTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 6704 58 + 647215 ACTAAATCACTGTCATGGCTAGGAGGTGTAGACAAATACATACAGTTCAATTATATTG a s mr.mrrefChr0 6937 31 + 130230 TACTCTGCTTTGCTATTTGCTGAGTGGCTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7243 31 + 636262 TACTCTGCTTTGCTATTTGCTGAGTGGCTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 6764 31 + 647215 TATTCTACTTTGCTATTTGCAGGGTGACTTC a s mr.mrrefChr0 6968 4 + 130230 TAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7281 4 + 636262 TAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 6795 4 + 647215 TAAT a s mr.mrrefChr0 6972 57 + 130230 ATCAATCCATTTTTGGGATGTCATGACCCTTGTAGAAGGTGACCTGCCTTAGCTGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7290 57 + 636262 ATCAATCCATTTTTGGGATGTCATGACCCTTGTAGAAGGTGACGTGCCTTAGCTGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 6799 57 + 647215 CTTGATCCATTTTTGGGATGTCATCACCTTTGGAGGAGGTGACCCACCTTAGCTGCT a s mr.mrrefChr0 7029 53 + 130230 GTATTTACCGATCAGCATTGCTGTCACCAAGTGCCGGGAAGTTGTCTTCTTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7347 53 + 636262 GTATTTACCGACCAGCATTGCTGTCACCAAGTGCCGAGAAATTGTCTTCTTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 6857 53 + 647215 GTATTTACCAATCGACATTGCTGTTGCCAAGCACCGGGAAGTTGTCTTCTTGG a s mr.mrrefChr0 7082 10 + 130230 ATGACTCTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7409 10 + 636262 ATGACTCAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 6910 10 + 647215 ATGACTCTAA a s mr.mrrefChr0 7092 13 + 130230 GTCCACATGCATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7420 13 + 636262 GTCCACATGCATG s simRat_chr6.simRat.chr6 6920 13 + 647215 GTCCATATGCATG a s mr.mrrefChr0 7105 42 + 130230 ATACCACAAGCCTTTGGGAGCTGGTACTGACTCAAATGGTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7467 42 + 636262 ATACCACAAGCCTTTGGGAGCTGGTACTGACTCAAATGGTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 6933 42 + 647215 ATACCACAGGTCTTGGGAAGCTTGTACTGTCTCAGATGATCA a s mr.mrrefChr0 7147 58 + 130230 AGTGATCATCAACAGAACGAGACAGCTGAGCAGTCATGAGCCTACTTTCTCTTGGATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7926 58 + 636262 AGTGATCATCAACAGAACGAGACAGCTGAGCAGTCATGAGCCTACTTTCTCTTGGATG s simRat_chr6.simRat.chr6 6975 58 + 647215 AGTGCTCATCAATAGAACAAGCCAGCTGAGCAGTCATGAGTCTATCTTCTCTTGGATG a s mr.mrrefChr0 7205 61 + 130230 CTGGGATGGGACTAGCAATCATTCATACCTGAGAGAAGTAATAGAGTAAGCCTCTTATACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7984 61 + 636262 CTGGGATGGGACTAGCAATCATTCATACCTGAGAGAAGTAATAGAGTAAGCCTCTTATACA s simRat_chr6.simRat.chr6 7041 61 + 647215 CTGGGATGGGACTAGCAACCACTGGCACCTGAGAGAAGCACTAGAGTAAGCCTCGTACATA a s mr.mrrefChr0 7266 9 + 130230 CCTATGTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8048 9 + 636262 CCTATGTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 7102 9 + 647215 CCTATGTTG a s mr.mrrefChr0 7275 38 + 130230 GCTACAGACTTGATAGCGAGGTACAAAAGGAAGCTATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8057 38 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 8913 46 + 636262 TATTGTCAGTGAGGAGTACCTCAAATGGTGCCAGACAGACTTTGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 7971 46 + 647215 TTCTGTCAGTGAGGAGTAGCCCAAATGGTGCCAGACAGAATTTGGC a s mr.mrrefChr0 8166 76 + 130230 AATAGGTTATGAACACTCCTCCTACCAATCACAGTAGTGATACATGACTTCCCCCAGGATAGATCATGTGGGTTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8960 76 + 636262 AATAGGTTATGAACACTCCTCCTACCAATCACAGTAGTGATACATGACTTCCCCCAGGATAGATCATGTGGGTTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 8017 76 + 647215 GGTAGGTTATAAACCCTCCTCCTACCAATCATAGTAGTGCTACATAGCATCCCCCAGGATAGGTCATGTGGGTTAC a s mr.mrrefChr0 8242 102 + 130230 TACATGGGGCCTGTTCACCCCACCCGCCAAACTAACAAGGCCAAGAAAGGAAGGAGCTTTAGCCTGAGTTTCTCTAACTCCAGGTGTAATTCCCTTAGGGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9036 102 + 636262 TACATGGGGCCTGTTCACCCCACCCGCCAAACTAACAAGGCCAAGAAAGGAAGGAGCTTTAGCCTGAGTTTCTCTAACTCCAGGTGTAATTCCCTTAGGGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 8132 102 + 647215 TGTATGGGGCCTGTTCACCCCACCTGCCAAACTAACAAGGCCAAGAAAGGAAGGAGTTTGAGCCTGAATGTCTCTAACTCCACTTGTAAGTCCCTTAGGGCT a s mr.mrrefChr0 8344 14 + 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+ 647215 Aaggataaaagcgggataaaaaaggtcatccaagtgaagtccaaaggcacaaaccctcctcaaacgttaacccattctaagtgtttgccagcttaatatatggggattat a s mr.mrrefChr0 8752 150 + 130230 aatacacatcatgtgtgaatctcagatagGGCCTGAAATATGCTTGTACTGGAAATTCAAGCTGGTTGTCAACTTCTTCACGTACAGAATCTAGTGAATGTCAATTCAACAGTATCAACCAATCTAAGATTCAATTGAAACTGCCTAGGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9590 150 + 636262 aatacacatcatgtgtgaatctcagatagGGCCTGAAATATGCTTGTACTGGAAATTCAAGCTGGTTGTCAACTTCTTCACGTACAGAATCTAGTGAATGTCAATTCAACAGTATCAACCAATCTAAGATTCAATTGAAACTGCCTAGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 8677 150 + 647215 aatatgcagcatgtgtgaatctcagaCGTGGTCTGAAATATGCTTGTTCTGGAAAACCTGCCTGGTTGCCAGCATCTTCACACACAGAGTCTAGTGAATGTCAATCCAACAGTGTTAACCAATCTAAGATTCAATTGACACTGCCTGGAC a s mr.mrrefChr0 8902 13 + 130230 AGGTAGctgctta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9740 13 + 636262 AGGTAGCTGCTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 8854 13 + 647215 AGGTACctgctta a s mr.mrrefChr0 8915 71 + 130230 ttttctctgctctacctatgcccactcaaaccaggcactcaagtgaggaccaaagactttgttggtattgt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9754 71 + 636262 TTTTCTCTGCTCTACCTATGCCCACTCAAACCAGGCACTCAAGTGAGGACCAAAGACTTTGTTGGTATTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 8867 71 + 647215 ttttctctgctctacttatgcccactcaaaccaagcattcaagtgaggaccaaagattgcgttggtattgt a s mr.mrrefChr0 8986 4 + 130230 gccc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9825 4 + 636262 GCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 8946 4 + 647215 gccc a s mr.mrrefChr0 8990 17 + 130230 tgtgcaaggctatgttt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9829 17 + 636262 TGTGCAAGGCTATGTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 8964 17 + 647215 tctgcaaggccgtgtct a s mr.mrrefChr0 9007 41 + 130230 acaatacaagtaacagcaaaaaacggctgctgacaacatgt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9846 41 + 636262 acaatacaagtaacagcaaaaaacggctgctgacaacatgt s simRat_chr6.simRat.chr6 9203 41 + 647215 acaatataACTACCAGTAAAAATGGGCTGCTGACACCAGGT a s mr.mrrefChr0 9048 21 + 130230 caacagtgatccaaagattat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9887 21 + 636262 caacagtgatccaaagattat s simRat_chr6.simRat.chr6 9245 21 + 647215 CAGTAGTGCTCCAAAGATCAT a s mr.mrrefChr0 9069 12 + 130230 gaatggaaaagc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9908 12 + 636262 gaatggaaaagc s simRat_chr6.simRat.chr6 9284 12 + 647215 GAATCGAAAACC a s mr.mrrefChr0 9081 16 + 130230 gtgagagctcacacct s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9927 16 + 636262 gtgagagctcacacct s simRat_chr6.simRat.chr6 9296 16 + 647215 GTGGGCCTCTACTCGT a s mr.mrrefChr0 9097 18 + 130230 ccaaggatgattagactg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9943 18 + 636262 ccaaggatgattagactg s simRat_chr6.simRat.chr6 9313 18 + 647215 CCGAACATGGTTAAACTG a s mr.mrrefChr0 9115 15 + 130230 ggtcatcaaggtaaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9961 15 + 636262 ggtcatcaaggtaaa s simRat_chr6.simRat.chr6 9334 15 + 647215 GGTCATCAGAGTTAA a s mr.mrrefChr0 9130 41 + 130230 tttgagctaagagagatcaagaggcaaaggataatgtctaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9976 41 + 636262 tttgagctaagagagatcaagaggcaaaggataatgtctaa s simRat_chr6.simRat.chr6 9352 41 + 647215 TCTGAACTAAAAGAAATCAAGAGGTTAAGGATAATGTCTAA a s mr.mrrefChr0 9171 20 + 130230 tcggccagtgagagagtcgg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10017 20 + 636262 tcggccagtgagagagtcgg s simRat_chr6.simRat.chr6 9395 20 + 647215 TCAACTGGTGTGATAGTAGG a s mr.mrrefChr0 9191 53 + 130230 ttttgctggtcttgaggttagattaatgaaattcacaggcctcaactggacat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10037 53 + 636262 ttttgctggtcttgaggttagattaatgaaattcacaggcctcaactggacat s simRat_chr6.simRat.chr6 9418 53 + 647215 TTCTGCTGGTCTATAGACTAGATTAATGAAATTTGCAGGCCTCTGCTGGACAT a s mr.mrrefChr0 9244 22 + 130230 gcatgtagagtaacaaAGGTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10090 22 + 636262 gcatgtagagtaacaaAGGTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 9473 22 + 647215 TCATGTTGAGTAACAAAGGATG a s mr.mrrefChr0 9266 49 + 130230 ATATCTTCAAATATACACCAATCAGTTGCACTAACTTCTTTCTGCTAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10112 49 + 636262 ATATCTTCAAATATACACCAATCAGTTGCACTAACTTCTTTCTGCTAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 9498 49 + 647215 ACATCTTCAAATACACTTCAATCTGTTGAACTAATTTCTTTGTGCTAAT a s mr.mrrefChr0 9315 20 + 130230 AAGACAGCTTGGTGGTAATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10165 20 + 636262 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69 + 647215 AGTACTTCTTGAATGTCTGAGTCTGTCAAAGATATGATGAAAGGAGCACAGAGCTACTATGTCAAAAGC a s mr.mrrefChr0 9613 303 + 130230 Catagggaagcccacgcattgacaatcacttgagattcagtctggagaagctgggatggcttgggatgtataaacttataaatttcacaagactcatggtatgtaatggaatatattaacagaatcacatgattagatcattggataatggtggtgcacagattgaattaaacaaacaggatcacatcacaggttagccataatgaatgagttagaaagtgaccgataacagtgcctgaatgttgcctgcacaagcataaagctgctttccagtggttatggttggacacttgtgtaatccct s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10547 303 + 636262 Catagggaagcccacgcattgacaatcacttgagattcagtctggagaagctgggatggcttgggatgtataaacttataaatttcacaagactcatggtatgtaatggaatatattaacagaatcacatgattagatcattggataatggtggtgcacagattgaattaaacaaacaggatcacatcacaggttagccataatgaatgagttagaaagtgaccgataacagtgcctgaatgttgcctgcacaagcataaagctgctttccagtggttatggttggacacttgtgtaatccct s simRat_chr6.simRat.chr6 9879 303 + 647215 CACAgggaagcttgtacatttacaattacttgagactcattctggagaagctgggatggcttgggatatatagacttgtaaatgtcacaagactcatgctatataatggagtatattaatggaattagatcaggagatcaatggataatggtgatggacaaattgaattaaacaaacaggatcacatcacagggtaaccacaatgaacaagttaagaattgacgcatgaccgcacctgaatgttggcagCATAAGCACAAAGCTGCTTTCCAGTGATTATGGTTGGACACTTGTGTAATCACT a s mr.mrrefChr0 9916 47 + 130230 ttgagtgtcactagagggcaccaaggacgttccataatcatcGAGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10850 47 + 636262 ttgagtgtcactagagggcaccaaggacgttccataatcatcGAGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 10226 47 + 647215 TTGACTGGCACTAGAGGACAACGAGGATGTTGCATAACCATTACGTA a s mr.mrrefChr0 9963 84 + 130230 CCCAATTGTTAAAGGATCTCAAATATTCCCAGATCAGATTACAGGATCACAATCTGTCAATGCTAGAAGAATAGTGGTCTAGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10897 84 + 636262 CCCAATTGTTAAAGGATCTCAAATATTCCCAGATCAGATTACAGGATCACAATCTGTCAATGCTAGAAGAATAGTGGTCTAGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 10298 84 + 647215 CCCAATTGTTACAGGATTTCGAATACTCCCGAATCAAATTACAAGATCACAACCTGCTAGTGATAGAAGCCTAGTGTTCTAGCA a s mr.mrrefChr0 10047 160 + 130230 GTAATTACCGATTGCTTTCTTAAGTCATTAGGGTAGGTTGTCAAAGAGGTGTGAATAAACATGCCCGCACACTTGAGCTTTGACCTACTCTAGGGGATTGACCATCTCTGAAGCTACTGTAGCCTAAGTAGGATGCTGCTGAAGTCAGATTCTTGCATTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10981 160 + 636262 GTAATTACCGATTGCTTTCTTAAGTCATTAGGGTAGGTTGTCAAAGAGGTGTGAATAAACATGCCCGCACACTTGAGCTTTGACCTACTCTAGGGGATTGACCATCTCTGAAGCTACTGTAGCCTAAGTAGGATGCTGCTGAAGTCAGATTCTTGCATTA s simRat_chr6.simRat.chr6 10384 160 + 647215 GTAATAACCTATTGCTTTCTTGAGTCTCTAAGAAAGGTTGCCAAAGAGGCATGAACAAACAAGCCCACACAATTGAACTTTGACTTACTCCTGGGGCTGAACCATCTCTGAAGCTACTGTAGCCTGAATGGGACCCTGCTGAAGTCAGGTTCTGGCATTA a s mr.mrrefChr0 10207 64 + 130230 ACACTTAAACAAGTCATCGGTTACCTGTTTGGGGCATGTCTTTATATTTGAAGCCAGCAAGCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11142 64 + 636262 ACACTTAAACAAGTCATCGGTTACCTGTTTGGGGCATGTCTTTATATTTGAAGCCAGCAAGCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 10544 64 + 647215 ACACTTAAACAGGTCATCGGTGACCTGTTTGGGGCATGTCTTTATATTTGAAGACAGCAAACTA a s mr.mrrefChr0 10271 19 + 130230 CATCTTGATATTAGCCTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11208 19 + 636262 CATCTTGATATTAGCCTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 10608 19 + 647215 CATCTTGATATTAGCCTCA a s mr.mrrefChr0 10290 29 + 130230 TGTTAATTCCCATATGTATCAGGGGTGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11227 29 + 636262 TGTTAATTCCCATATGTATCAGGGGTGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 10630 29 + 647215 TGTTACCTCCCATATGTATCTGGGGAGTT a s mr.mrrefChr0 10319 17 + 130230 GCTTCTTCTGTCACTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11257 17 + 636262 GCTTCTTCTGTCACTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 10659 17 + 647215 GCTTCTTGTGTCGCTGT a s mr.mrrefChr0 10336 68 + 130230 CTGTAACACCCAATACAGACACTACAAAGAACATTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGCAGTGCTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11274 68 + 636262 CTGTAACACCCAATACAGACACTACAAAGAACATTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGCAGTGCTC s simRat_chr6.simRat.chr6 10677 68 + 647215 CTGCAATATCCAATACAGACACTATAAAGAATGTTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGTAGTGCCT a s mr.mrrefChr0 10404 47 + 130230 ACGAAGGTTTTTACCATGAAAATGGTATTGAGCAAATGACCCTGTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11342 47 + 636262 ACGAAGGTTTTTACCATGAAAATGGTATTGAGCAAATGACCCTGTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 10763 47 + 647215 ACAAAGGCCCTCACCATGAAAATGGTATTGAGCAAATGGCTCTGCCT a s mr.mrrefChr0 10451 59 + 130230 TCACTAGAAGGAACATTCCCAGATAATAAAGGTCTGTTCAAGACTGAGACAACTTTCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11395 59 + 636262 TCACTAGAAGGAACATTCCCAGATAATAAAGGTCTGTTCAAGACTGAGACAACTTTCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 10810 59 + 647215 TCACTAGAAAGAACATTCCCAGATAATAAAGGTCTGTTCAAGACTTAATCAACATTCCA a s mr.mrrefChr0 10510 9 + 130230 TGTTAATAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11454 9 + 636262 TGTTAATAC s simRat_chr6.simRat.chr6 10871 9 + 647215 TGTTAATAC a s mr.mrrefChr0 10519 146 + 130230 GCGTATTGAACCTGGGATTGAAAGACTGTGGTCATCTGGTGTGGCTCTATTAACTACCACACTGATATAACATTGATGTTCGTCAATGTTACACTAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACAGCATATAACCACAGTCTCTTAATCCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11463 146 + 636262 GCGTATTGAACCTGGGATTGAAAGACTGTGGTCATCTGGTGTGGCTCTATTAACTACCACACTGATATAACATTGATGTTCGTCAATGTTACACTAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACAGCATATAACCACAGTCTCTTAATCCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 10910 146 + 647215 GCGTGTTGAGCCTGGGAGTAAGAGACTATGGTTATCTGGTGTGTCTCTGCTAATTACCACACTAATGTAACATTGATGTGTATCAGTGTTACACCAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACACCAGATGGCCACAATCTCTTAACCCCA a s mr.mrrefChr0 10665 3 + 130230 ACC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11609 3 + 636262 ACC s simRat_chr6.simRat.chr6 11058 3 + 647215 ATC a s mr.mrrefChr0 10668 19 + 130230 TCAGTCAGAAGAAAAATAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11612 19 + 636262 TCAGTCAGAAGAAAAATAC s simRat_chr6.simRat.chr6 11067 19 + 647215 TCAGTTAGAGTAAGGATAC a s mr.mrrefChr0 10687 16 + 130230 TTTCAGTATTAGCATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11632 16 + 636262 TTTCAGTATTAGCATG s simRat_chr6.simRat.chr6 11086 16 + 647215 TTTCAGTATTAGTATG a s mr.mrrefChr0 10703 9 + 130230 AATGCTAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11648 9 + 636262 AATGCTAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 11157 9 + 647215 AATTATACA a s mr.mrrefChr0 10712 124 + 130230 CTCAGTCTTGGACCAATTCTGATTGTCTAGGAATTTTCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTCGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACGTTTGTTGGTCTATTCACTGGTTAGAAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11657 124 + 636262 CTCAGTCTTGGACCAATTCTGATTGTCTAGGAATTTTCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTCGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACGTTTGTTGGTCTATTCACTGGTTAGAAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 234007 124 - 647215 CTCAGTCTTGGACAGATTTTGATTGTCTAGGAATATGCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTTGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACTTTTGTTGGTTTATTCACTGATTGGACTG a s mr.mrrefChr0 10836 65 + 130230 CTACCTGAATATAGTACTCCTGTAGTGGCACATACTTTGTAGTGTCTGTATTGGATATTGCAGGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11783 65 + 636262 CTACCTGAATATAGTACTCCTGTAGTGGCACATACTTTGTAGTGTCTGTATTGGATATTGCAGGG s simRat_chr6.simRat.chr6 234131 65 - 647215 CTACCCGAATACAGTACTCCTGTAGTGGAACATTCTTTGTATTGTCTGTATTAGATATTGCAAGA a s mr.mrrefChr0 10901 51 + 130230 CAGGTTAAGTACACATTTAAGGTATAGTACTTCTTGCAATTTATGATGATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11849 51 + 636262 CAGGTTAAGTACACATTTAAGGTATAGTACTTCTTGCAATTTATGATGATC s simRat_chr6.simRat.chr6 234196 51 - 647215 CAGATCAAGTTCACATTTAGGGTATAGTACTTCTTGCAACTTATGATGATA a s mr.mrrefChr0 10952 45 + 130230 ACTGTAATTATTGATTTGGTCTTTAGCAACCTCAGGTAAAATGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11900 45 + 636262 ACTGTAATTATTGATTTGGTCTTTAGCAACCTCAGGTAAAATGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 234250 45 - 647215 ACTGTAATTATTAATTTGGTGTCTAGAAACCTCAGATAAAATGTT a s mr.mrrefChr0 10997 44 + 130230 AGTGATCCAGGCACAGCTTACTCCCAGCCTAACAAAGTCAAATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11945 44 + 636262 AGTGATCCAGGCACAGCTTACTCCCAGCCTAACAAAGTCAAATT s simRat_chr6.simRat.chr6 234296 44 - 647215 AATGATCCAGGCACAGTTTGCTCCCAACCTCACAAAGTCAAATT a s mr.mrrefChr0 11041 23 + 130230 TTAAGCACAAACCTGTACTCATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12022 23 + 636262 TTAAGCACAAACCTGTACTCATG s simRat_chr6.simRat.chr6 234340 23 - 647215 TTAAGCACGAACCTGTACTCATG a s mr.mrrefChr0 11064 69 + 130230 CCTATTCCGACACCCCCATTTTAATACCCTTATGCATATTCCATTATTGAGTGACCCCGTGTTTGTCAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12045 69 + 636262 CCTATTCCGACACCCCCATTTTAATACCCTTATGCATATTCCATTATTGAGTGACCCCGTGTTTGTCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 234364 69 - 647215 CCTATTTCCACACCCCCATTTTAATACCCTTAGGCATAATCTATTATGGGGGGACCCTATGATTGTCAT a s mr.mrrefChr0 11133 66 + 130230 TGAACCCTTGGTAGGGGGACCCACAGTTCTTGAAAGTCTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12114 66 + 636262 TGAACCCTTGGTAGGGGGACCCACAGTTCTTGAAAGTCTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 234436 66 - 647215 TGACCCCATGGTGGGGGGACCCAGAGTTGCTGAAGGTTTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA a s mr.mrrefChr0 11199 5 + 130230 TATGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12180 5 + 636262 TATGC s simRat_chr6.simRat.chr6 234506 5 - 647215 TATGC a s mr.mrrefChr0 11204 116 + 130230 GAGGTGCTTCCTTGTTTGGATTGAATTGTTATCTATTTTCCTTTTCTGACATGATCTCCTTTCTTGTGTCTATCTTTTAGGACACTTATCTCAGTTGACTCCTAGGTAAATCCCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12392 116 + 636262 GAGGTGCTTCCTTGTTTGGATTGAATTGTTATCTATTTTCCTTTTCTGACATGATCTCCTTTCTTGTGCCTATCTTCTAGGACACTTATCTCAGTTGAGTCCTAGGTAAATCCCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 234511 116 - 647215 GAGATTCTTCCTTGTCAGGATCGATTTGTTACCTATTTTCCTCTCATCACCTGAGCTCCTTTTTTGTGTCTATCTTTTAGGACACTTATATCAGTTGACTCCTAGGTACCTCCCTT a s mr.mrrefChr0 11320 92 + 130230 AGCACTTAGTGAAAAAATTACTCCTATATTTTGGCACTGGGCACCTACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATATGTGAGCAGGAGAAGTTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12509 92 + 636262 AGCACTTAGGGAAAGAGTTACTCCTACATTTTGGCACTGGGCTCCTACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATATGTGAACAGGAGAAGTTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 234627 92 - 647215 AGGACTTAGTGAAAAAATTACTCCTCTTTTTTGGCACTGGGCACCCACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATACGTGAGCAGGAGAGGTCTC a s mr.mrrefChr0 11412 49 + 130230 TGGCTACTGATCCCGCTCCTACTTCTATCTCTCACCAAAACTCATTGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12618 49 + 636262 TGACTACTGATCCCACTCCTACTTCTATCTCTCACCAAAACTCATTGCC s simRat_chr6.simRat.chr6 234719 49 - 647215 TGGTTACTGATCCTGCTCTTTCTTGTGTCTCTGACCAAAACTCATTGCA a s mr.mrrefChr0 11461 142 + 130230 ACTCCTCCAAGTGATGTTATACAAATACGTTGTCTATTAATATATCCACACAAAGTTGTTATCCTAGCACTAATGCATGAGCTACACATGGGTGAGTACCATACACTGAAGGGTCATTAAACCATTGATAGCTTTTGGGAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12669 142 + 636262 ACTCCTCCAAGTGATGTTATACAAATATGTTGTCTATTAATATATCCACACAAAGTTGTTGTCCTAGCACTAATGCATGGGCTACACATGGGTGAGTACCATACTCTGAAGGGTCACTGAACCATTGATAACTTCTGGGAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 234768 142 - 647215 ACTCCTCCAAATGATGTTGTAAAAATACGTGGTCTATTAATATATACACACGAAGTTGTTATCTTAGCACTAATGCATGAACTACACATGGGTGAGTACCATACACTGAAGGGTCATTAAACCATTGATAGCTTTTGGAAAA a s mr.mrrefChr0 11603 195 + 130230 GTCCTCAATGTGTTACAATGGCTTTTTATCCCTCTAAATTCAGAATTGGGTATGATATGAGTGAAGCTATTTTCAGATGGACCACTCTAATGTCCGATGGACCTCTCATTCATCAGTCATTCCTCCATCCTAAACAGAAGATAGCTTGTATTGATAAAGGACACTGGTACTCTTCACAACAGATTTTCAAACTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12811 168 + 636262 GTCCTCAATGTGTTA--------------------AAATTCAGAATTGGGCATGATATGATTGAAGCTGTTTTCAGATGGACCACCCTAATGTCCGATGGACCTCTCATTCAT-------TCCTCCATCCCAAACAAAAGATAGGTTGTATTGATAAAGGACACTGGTACCTTGCACAACAGGTTTTCAAACTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 234917 187 - 647215 GTCCTCAATGTGTTACAATGGCTTTTTATCCCTCTAAATTCAGAATTGGGTATGATATGAGTGAAGCTATTTTTAGATGGACCACTCTACTATCCAATGGACCTCTCAGTCATCAGTCATTCCCCCCTCCTGAACAGAAGATATCTT--------AAAGGGCACTGGTACTCTTCACAACATACTTCCAAACTAA a s mr.mrrefChr0 11798 42 + 130230 CTATGACTGGTTGGTCTCTGTTATTAATCATATACTAGAGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13004 42 + 636262 CTATGACTGGTTGGTCTCGGTTGTTAATCATATACTAGAGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 235104 41 - 647215 CGATGACTGGATGGTCTCTGTCAT-AATCAAATACTAGAGAC a s mr.mrrefChr0 11840 169 + 130230 TAAGGCCATGTAACTTGATTCTTGTAGAGCTTAATATTCTCATCTGTATCCTGTCAAGCATTGAATGGCATTTACTGATAACCTATAATGTTGGTAATATGGAGATGGTAATAAAGAGTACAATGGACTGATAAAGATTAGTTAGTTTTGTATCTACAACCACCCTAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13050 164 + 636262 TAAGGTCATATAACTTGATTCTTGTAGGGCTTAATATTCTCATCTGTATCCTGTCAAGCATTGAGTTGCATTTACTAATAACCTATAATGTTGGTAATATGGAGATGGTAATAGAGA-----ATGGACTGGCAAAGGTTAGTTAGTTTTGTATCCAAAACCACCCTGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 235145 163 - 647215 TAAGGCCATGTGACTTGACTCTTGTAGAGCTTAATATTCTCACA---ATGCTGCCAAGCATTGAATGGCATTTACTGATAAGCTATAATGTTA--AATA-GGAGATGGTAATAAAGAGTACAATGGACTGATGAAGATTGGTTAGTTTTGTATCTGCAAGCGCCCTAAA a s mr.mrrefChr0 12009 111 + 130230 TTGCTTTTCACAATTCTTTATCCTAATGGGCTTGGAGCACATGGCAAGAACCTTACAGCAATTTTTCAAGCTTGTTTCTATTCCTTGGTGTCCTTTCACTTCTAAACAGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13214 97 + 636262 TTGCTT--CACAATTC------------AGCTTGGAGCACATCGCAAGAACCTCTCAGCAACTTTTCATGCTTGTTTCTATTCCTTGGTGTCCTTTCACTTCTAAACAGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 235309 105 - 647215 TTGCTTTTCACAATTCTTTATCCTAATGGGCTTGGAGCACATGGCAAGGTCTTTACAGCGATTTTTGAAGCTTGTTTCTATTTCTTGGTATGCTTTCACTTTCAC------ a s mr.mrrefChr0 12120 70 + 130230 TTCTGGAGCAAATCAAGGTACTCCAATAGACCATTGTCAACTACTCTACCAACTGCCAGATGAAGGACCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13318 70 + 636262 TTCTGGAGCAAATCAAGGTACTCCAATAGACCATTGTCAACTACTCTATCAACTGCTAGATGAAGGACCC s simRat_chr6.simRat.chr6 235414 68 - 647215 TTTTAAAAAAAATAAAGGTACTCCAATAAACCATTGTCAACTACTCAACCAACTGCCAGC--AAGAATCC a s mr.mrrefChr0 12190 161 + 130230 AGGCCTAGCTTAGTCTCCAAAAGCGAATCCTTTTTTAGCCACAATTACCCTGTATGATGACTTAGGAGGCTCATACCTCCATCAGAAACTGGCTTCATTCCTCCATCAGAAAACAAGCCTTATAGGTCAACATACACTCATCATTAATTAGCCTTCTCAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13388 140 + 636262 ---------------------AGCGAATCCTTTTTTTAACACAATTACCCTGTATGATGACTTAGGAGGCTCATACCTCCATCACAAACTGGCTTCATTCCTCCATTAGAAAACAAGCCTTATAGGTCAATATACAATCATCATTAATTAGCCTTCTCAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 235514 149 - 647215 AGGCCTAGCTTAGTCTCCAAAAATGAATTCTCTTTTAGCCACAATTACCCTGTATGATGACTGAGGATGCTCATATCTCAATCAGACACTGGCTTCATTTCTCCATCAGAAAACAAGTCTTATAGGTCAACATACACTCATCAATAATT------------ a s mr.mrrefChr0 12351 104 + 130230 AGCTCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTGGGCTCAAAGGCCAGGAGGCACCTTAGTCGTGACTGACTTTAGATACATGCTGTTAGAAACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13532 104 + 636262 AGCTCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTGGGCTCAAAGGCCAGGAGGCACCTTAGTCGTGACTGACTTTAGATACATGCTGTTAGAAACT s simRat_chr6.simRat.chr6 235663 104 - 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 13765 81 + 636262 TGCAGAGATGTACCATGCTTCAGAAATGGTTCAACTGCACCCAATGTTATCGTGGTCGTATGATGTCCAATATTTGAGTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 235916 81 - 647215 TGCAGGGATGTACCATGCTCCAGATCTGGCTCAACTACACCCAATGTTATTGTGGTCGTATAATGTCCAATACTTGAAGTT a s mr.mrrefChr0 12661 28 + 130230 TGAATTATGAGTAGACTTTTGAAACGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13847 28 + 636262 TATATTATGAGTAGACTTTTGAAACGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 235997 28 - 647215 TGAATTATGAGTAGACTTTTGAAATGAG a s mr.mrrefChr0 12689 136 + 130230 ATTATCCACAGGAGTCAGGTGTAGTCATGTTCCCCCTCTGTAGCATTTTACTCATTGAGTAGCTTAGCTTTTAAGATTTTAAGACTCCCTTGAAGTGGGCTGGAATTTGCAATGAAGATATATGGTGGTGAGTCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13876 136 + 636262 ATTATCCACGGGAGTCAGGTGGAGTCATGTTCCCCCTCTGTAGCGTTTTAATCATTGAGTAGCTTAGCTTTTAAGCTTTTAAGACTCCCTTGAAGTGGGCTGGAATTTGCAATGAAGATATGTGGTGGTGAGCACA s simRat_chr6.simRat.chr6 236025 136 - 647215 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AATGAAAGAATTATCATAGCCACTTTCTTTCTGGAGGTATTTACTTTACATCATCAAGGTGGCTTCTTCTCTGACACAGTCTTCTCATCCAGTGTAGCTGTCAG--------------------GTATACATCAAAA a s mr.mrrefChr0 13038 14 + 130230 GTTGCACTAAAGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14252 14 + 636262 GTTGCACCAAAGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 236354 14 - 647215 GTTGCACTAAAGTT a s mr.mrrefChr0 13052 201 + 130230 CATCGTATTGTGCCCATATATTTGAGGGTTGGCCTTGTCAATTCAGGGTTGCCCTGAGGATCACCACTAGGCCACTCACTGGCTTACTATCATTGAGCATTGCTGCCTTTGATGTCTTATGTCTTCGATGGATGTTACAGCTGCAGGTGCACCCCACAAACGCTAGATTGTGGGCGAAATCACTACTCAACAGAAGTGTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14266 201 + 636262 CATCGTATTGTGCCCATATATTTGAGGGTTGGCCTTGTCAATTCAGGGTTGCCCTCAGGATCACCACTAGGCCACTCACTGGATTACTATCATTGAGCATTGCTGCCTTTGATGTCTTATGTCTTTGATGGATGTTACAGCTGCAGGTGCACCCCACAAATGCTAGATTGTGGGTGGAGTCACTACTCAACAGAAGTGTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 236369 200 - 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 16768 54 + 636262 ATCCCAGTTAGGAATTAGCCTAACTTATGGATGAAAATATGAAGGGGTGTAAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 238812 54 - 647215 ATCCCAGTTAGGAATTAACCTAACTTGTGGATGAAAATATGAAGGGGTGTTAGG a s mr.mrrefChr0 15475 3 + 130230 CTA s simRat_chr6.simRat.chr6 238876 3 - 647215 CTA a s mr.mrrefChr0 15478 93 + 130230 GCCAGATGGGAGAAGGTAGAGATGAGAACCTCTCCTTTAGAGAAGTAATTAATGCACTACATGGAGGAACTTGTCACATCACCCAGAATGGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16822 84 + 636262 ---------GAGAAGGTGGAGATGAGAGCCTCTCCTTTAGAGAAGTAATTAATGCACTACATGGAGGAACTTGTCACATCATCATGAGTGGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 238880 92 - 647215 GCCAGATGGGAGAAGGTAGAGATGCGAACCTCTCC-TTAGATAAGTAATTACTGCACTACATGGAGGAACTTATCACATCACCCAAAACGGAA a s mr.mrrefChr0 15571 90 + 130230 AATATCTTGAGTGAGAGTAGTGAATCAAGCAGGGTGAGGAACCTGCGTTGCTGAAACTACATTAGTACCTTGACCTAGGAGATTGGTAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16910 90 + 636262 AATATCTTAAGTGAGAGTAGTGAATCAAGCAGGGTGAGGAGCCTGCGTTGCTGAAATTACATGAATACCTTGACCTAGGAGATTGGTAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 238972 90 - 647215 AATATCTTGAGTGTGAGTAGTGAATTAAGCAGGGTGAGGAACCTGTGTTGCTGAAACTACACTAGCACCTTCACCTGTGGGATTGGTAAT a s mr.mrrefChr0 15661 54 + 130230 CTAATTGATCAACTTAGACACATTTAGCAGAGTGTCCTATTCGTGGAAATGAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17000 54 + 636262 CTAATTGATCAACTTAGACACATTTAGCAAAGTGTCCTATTCGTGGAAATGAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 239064 54 - 647215 CTAATTGATCAACTTAAACACATTCAGCAGAGTGTCCTACTCATGGAAATAAGT a s mr.mrrefChr0 15715 253 + 130230 GACTCAATTTGACCTACTCATGTAAATGGCTCGAAATAGCTTAAGGCTAGGATTTGTATTGTCCCAAGGCCTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGCATCAATCTACAACTGTGCCTGTGTTTAGATCACACTCTAGCACTAGAAGCAAAGTGCCATTTTCTAGAAATTTCTGGGATCAGAACTATTAAAAAGTGAAGATTTACATGCTAGCTACCACTAGGGGCCACCAGGACTGCAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17055 253 + 636262 GGCTCAATTTGAGCTACTCATGTAAATGGCTCGAAATAGATTAAGGCCAAGATTTGTATTGTCCCAATAACTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGCATCAATCTACAACTGTGCCAGTGTTTAGATCACACTCTAGCACTAGAAGCAAAGTGCCATTTTCTTGAAATTTCTGGGACCAGAACTATTAAAAAGTGAAGATTTACATGGTAACTACCACTAGGGGCCACCAAGACTGCAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 239118 253 - 647215 GACACAATTTGACCTACTCATGGAAATGGCTCGAAATAGCTTAAGGTTAGGATTTGTGTTGTCCCAAGGCCTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGAATCAGCCTACAGCTGTACCTGGGGTTAGATCACACTATAGCACTGGAAGCAAAGTGCCATTTTCTAGAAATTTTTGGGATCGGAACTATTAAAATGTGAAGATTTACAAGCTAGCTACCAGTGAGGACCACCAGGATTGCAGG a s mr.mrrefChr0 15968 229 + 130230 CTCTTTCACCCTGGACTCATGCCCTAAATATTATAAATCTAAGCCATAAAATAACCTCTGAGGACAGCTTATAGCTGGATACCTGTTGTGGCATTATGTGGAGCAGGTGGAGGTTACAAGCATCCTCAATTCTCAGGCTCTGACACCATATCCCTCCCCCTACCCCTAGCTTAGACATTCTATTCAAACAGGCACTTGGTAAGCTTTGGTGAATCAACACAGATTGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17308 229 + 636262 CTCTTTCACCCTGGACGCATGCCCTAAATATTATAAATCAAAGCCATAAAATGACCCCTGAGGACAGCTTATAGCTGGACACCTGTTGTACCATTATGTGGAGCAGGTGGAGGTTACAAGCATATTCAATTCTCAGGCTCTGACACCATATCCCTCCCCCTACCCCTAGCTTAGACATTCTATTCAAACAGGCACTTGGTAAGCTCTGGTGAATCAACACAGATTGCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 239379 228 - 647215 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mr.mrrefChr0 16405 111 + 130230 GAAAAGTTTGATGTGTACAAGTCACGCCCTTCACGCCATTAGTGAACTCATGGATAACAGCAATCACACAGCTGTCGGTCTTTCCATAGTAGAAAGCCAAGGAGGGTAACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17754 111 + 636262 GAAAAGTCTGATGTGCACAAGCCACGCCCTTCACGCCATTATTGGATTCATGGATAACAGCAATTGCACAGCTGCCGGTCTTTCCATGGTAGCAAGCCAAGGAGGGTAACT s simRat_chr6.simRat.chr6 239813 111 - 647215 GAAAAGTTTGATGTGTACAGGTCACACCCTTGACATCATTAGTGAACTCATGGATAACATCAATCACACAGCTGTCGGTCTTTCCATAGTAGAAAGCCAAGGAGGGTAACT a s mr.mrrefChr0 16516 118 + 130230 CTATAAGCTGGGAGAGCCTGTTACCCCTAACAAGTAGAATTGTAATTCATTAAAATTAAGTATAATGAAGGGTAAAGTGTAATGAGGTGTATGCTGTTGCTATGTGCAATAGCGGAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17868 117 + 636262 CTATAAGCTGGGAGAGCCTGTTACCCCTAA-AAGTGGAATTGTAAAATGTTAAGATTAAGTATAGCAAAGGGTAAAGTGTAATGAGGTGTGTGCTGTTGCTATGTGCAATATCAGAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 239924 118 - 647215 CTATAAGCTGGGATAGCCTGTTACCCCGAACAAGTAGAACTGTAATTCATTAAAATTAAGTATAATGAAGGGTAACATGTAATGAAGCGTATGCTGTTGCTATGTGCATTAGTGGAAA a s mr.mrrefChr0 16634 46 + 130230 CATCAAGGGAGTTTCTGTCATGAATTAGTGAACCTGAACACAAGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17986 46 + 636262 CATCGAGGGTATGTCTGTCATGAATTAGTGAACCTGAACACACGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 240042 46 - 647215 CATCAAGGGAGTTTCTGTCATGAATTAGTGAACCTGAACACAAGCC a s mr.mrrefChr0 16680 82 + 130230 TTAAGTTTAATACTATGATTATGGTATGCTGACTCAATTGCAATTGGGGTAAGATTAAGGCCAGGTCAGGGTAAATTACAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18033 82 + 636262 TTAAGTTTAATACTGTGATTATGGTATGCTGACTCAATTCCAATTGGGGTAAAATAAAGCCCAGATCAGGGTGAATTACAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 240088 82 - 647215 TTAAATAGAATACCATGATGATTGTATGCTGACTCAATTGCAATTGGGGTATGATTAAGGCCAGGTCAGGGTAAATTGCAAC a s mr.mrrefChr0 16762 95 + 130230 ACTAAACACACACTATTTCCATGTGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGTCACCCTGTTGTCCGTAGTGCATGAATTGATACAGTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18115 95 + 636262 ACTAAACACACAGCATTTCCATGCGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGTCATCCTGTTGTCCGTAGTGCATGAATTGATACAGTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 240174 71 - 647215 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GATGCTCTAATGCTCTGGGTTGCCTGATAGTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 240716 33 - 647215 GATGCTCTAATGCTCTGGATTGCCTGATAGCAA a s mr.mrrefChr0 17350 139 + 130230 TAACAAGGTAGTTGGTGCTACATCTTTAAGCAATAGCTCACACAAGCAAACAAGATAATGCACAGCCACGTATTTGCACTGACCAGCATCAACTATGTGATGGACCCGCCATAATGGGGCAGCATTATTCAGTCCAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18702 138 + 636262 TAACAAGCTAGTTGGTGCTACATCTTTAAACAATAGCTCACACAAGCAAACTAGACAATGCACAGCCACATATTTGCACTGATCAGGATCAACTATGTGATGGACCCGCCATCATGGAGCAGCATTATTCAGTCCAGG- s simRat_chr6.simRat.chr6 240749 139 - 647215 TAGCGAGGCAGTTGGTGCTACATCTTACAGCAATACCTCACACAAACAAACAAGATAATGCACAGTCCTGTATTTGGACAGACCAGCATCAGCTATGTGATGGACCCGTCACAATGGGGCAGTGTTATTCAGACCAGGT a s mr.mrrefChr0 17489 18 + 130230 TAACATTGATGAGGCTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18840 18 + 636262 TAACATTGATGAGGCTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 11458 10 + 647215 TAATATTGAC-------- a s mr.mrrefChr0 17507 189 + 130230 CTCCCAAACCCAGCGGCAGCGCATGTTGACAGCCCAACTATAGTTCTATTATACTTATTTATAGTTGTATACATATCAAGTATATTCATTATCCCAAACTACAATTCCCCTACTTTTGTTGTAAAAGTTGATTTTCTTCCCCCTGATGGGAGGATCTTTTGGCTCTTTTTTAGCTGCTGTGTACCAACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18861 189 + 636262 CTCCCAAACCCAGCGGCAGCGCATGTTGACAGCCCAACTATAGTTCTATTATACTTATTTATAGTTGTATACATATCAAGTATATTCATTATCCCAAACTACAATTCCCCTACTTTTGTTGTAAAAGTTGATTTTCTTCCCCCTGATGGGAGGATCTTTTGGCTCTTTTTTAGCTGCTGTGTACCAACT a s mr.mrrefChr0 17696 162 + 130230 ATGTAATTGAGTATACATTCCGAACTGCCTAATGTGCCTGCAATCTATCAGTAGTGAAGCCTTGCCCATGCCTGAGGTAGCTCACAGGTCAGAGGAATATGCCCAGCACTTTAGGACATTATAGGATTCCCCAGCAAATCAACAATCATCCACTGGTGGACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19051 162 + 636262 ATGTAATTGAGTATACATTCCGAACTGCCTAATGTGCCTGCAATCTATCAGTAGTGAAGCCTTGCCCATGCCTGAGGTAGCTCACAGGTCAGAGGAATATGCCCAGCACTTTAGGACATTATAGGATTCCCCAGCAAATCAACAATCATCCACTGGTGGACT a s mr.mrrefChr0 17858 21 + 130230 CTACAGAGAGAATTATGTTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19352 21 + 636262 CTACAGAGAGAATTATGTTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 11468 11 + 647215 ----------ACATATGTTCA a s mr.mrrefChr0 17879 13 + 130230 GTACTTAGTGCAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19373 13 + 636262 GTACTTAGTGCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 11482 13 + 647215 GTACCAGCTGCAC a s mr.mrrefChr0 17892 9 + 130230 TGCCACCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19391 9 + 636262 TGCCATTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 11495 9 + 647215 TGCCACCTT a s mr.mrrefChr0 17901 178 + 130230 ACTTAGGCTTGATGAGGAAGTCCTTTAATTCCTGGTGTGTCCCTCTTTCACTACCTCAGCTCTTCTGTCGTCTGCCAGACAGACTTTTTATGCTGAGTATAATGACTCATCAAGCCTGGCAATACTCACTGTTTTTTTGACTTGTTTTCAATGTAAGTTTCAGGTGCTCTGTTAGAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19400 178 + 636262 ATATAGACTTGAGGAGGAAGTCCTTTGATCCCTGGTGTGTCCCTCTTTCACTACCTCAGCTCTTCTGTCATCTGCCAGACAGACTTTTTATGCTGAGTATAATGACTCGTCAAGCCTGGCAATACTCACTGTTTTTTTGACTTGTTTTCAATGTAAGTTTCAGGTGCTCCATTAGAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 11511 178 + 647215 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TATTATGATT-ATGCTAGTTGAGGAGTTGTAATGGTAACTTAGTTCTGAACCTTAAGAGAAAGACTTGCTCCACTATAGTACATGGTAAAGTGACATAACTCAATTGGGGGCGGTAAGGACTTAGTCATCCATATC a s mr.mrrefChr0 18306 15 + 130230 CTTAGAGATAACCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19830 15 + 636262 CTTAGAAATAACCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 11915 15 + 647215 CTTAGAGATAACCCC a s mr.mrrefChr0 18321 146 + 130230 TCTCCCCCACCAGGATGTGGCATAGACTGGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGTGTGACAGTAGGCCAACAAGAGCATATAATGCACCAAGCAGCTTGGATGTTTGGCCATTGGCACATCAGCAACTGGTGGCTCACCCAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19845 146 + 636262 TCTCCCCCACCGGGATGTGACATAGACTGGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGTGTGAATGCAGGCCGACAAGAGCATATAATGCACCAAGCAGCTTGGTTGTTTGGCCATTGACATATCAGCAACTAGTGGCTCATCCAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 11931 146 + 647215 TCTCCCCCACCAGGATTTGGCATAGAGTAGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGCATAACAGTAGGCCAGCAAGAGCTTATAATGCACCAAGCAGCTTGCATGTTTGGCCATGAGCACATCAGTAACTGGTGGCTCACCCAAT a s mr.mrrefChr0 18467 167 + 130230 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 21930 38 + 636262 GGGATTTATATTCTAATAAGGGGTTCTTGGCTGGCATG s simRat_chr6.simRat.chr6 13844 38 + 647215 GAGCTTTGTATTCTAATGGGGACTTCTTGGCTGGCATG a s mr.mrrefChr0 20254 75 + 130230 ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTTTATTATTATGATTACTATAGGTCTGACACTGCTATAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21968 75 + 636262 ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTTTATTATTATGATTGCTATAGGTCTGACACTGCTATAGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 13892 75 + 647215 ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTCCTTTATTACACTTAACGTAGGCCTGACATTGCTGTAGGT a s mr.mrrefChr0 20329 238 + 130230 TGTAGACTGTATTAGCTTCAATGGGAAACCCTCTCATTACTACAACTGCTGGCATCCTAAAAAAATGAGCCCCTCTAACATAATACAGGCTACCTCCCTGCTGAATGCTGGGCATTTTTAACTTTAGAATAGACCATGTAGTCAGCTACAGAGAGATAATGCATGTTGTAGCCTGGATCAGCTACAGTGGGACAATGAACTATATAGCCTGGCAAAGGCAAAATGCCACAGACTTTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22044 231 + 636262 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CAATTCTCAACTTGACAGTACCCCAGACACACAATCTTATATTGAGTCACCAGTTATCTTTCTTACATACTGCCATCATTTCTGTATCCCATGC-TTTTGTAAGTCAATACTTATATTTCTGTATCTGGATGGATTGGTATTGGTGTAAACTTCAAAAACTAGTGTGTGGCCTCTCTATGGTTTGGTTGCCAGCA a s mr.mrrefChr0 23918 18 + 130230 GAAATTTCCCCTGGGGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25445 18 + 636262 GTGATTTCTCCTGGGGCC s simRat_chr6.simRat.chr6 17595 18 + 647215 GAAATTCCCCCCAGGGCC a s mr.mrrefChr0 23936 357 + 130230 AATACGTTAACTGGCTTAGTGTACAAATGCTGCTAAAGAACATATGAATATCCAAATTGCTCCATGTTGACATCCCATGTGATTTAACCCACATACTTACCATCTCTTCCACTTAATGTTCAACCTCTGAACCCAATGTGGTCCCCTTGTGAGGGATTCCATGAGAATTCCTTTTAAAAGGAGTGTCAATCTTGCCAGTGGTTATGCCTTAATCCCTCCACCTGAGAGTTGCCCATGCAGCCAGTGTCAGTTAGTGTTTTGGTTGATGCCCCAGATTGATGCCCCACAGTATAGCAACCACAGTTTGCCAGCAACCATCTGAATAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGCCTTGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25465 357 + 636262 AATACGTTAACTGGCTTAGTGTACAAACACTGCTATAGAACATATGAATATCCGAATTGCTCCATGTTGACATCCCATGTGATTCTACCCACATACTTACCATCTCTTCCACTTAATGTTCAACATCTGAACCCAATGTAGCCCCCTTGTGAGGGATTCCATGAGAACTCCTTTCAAATGGGGTGTCAATCTTGCCAGTGGTAATGCCTTAATCCCTCCACCTAAGAGTTGCCCATGCAGCCAGTGTCAGTTAGTGTTTTGGTTGATGCCCCAGATTGATGCCCCACAGTATAGCAACCACAGTTTGCCAGCAATAATCTGAGTAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGCCTTGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 17613 342 + 647215 AATACGTTTACTAGCTTAGTGTACAAATGCTACTAAAGAACATATCAATCTCCAAATTGCTCCATGTTGACATCCCATTTGATTTAACCCACATACCTACCATCC----------ATGTGTGACCTATAAACCCAATGTGGTCCCCTTATGAGGGATTCCTTGAGAATTCCTTTTGAAAGGAGTGTCCATCTTGCCAGTGGTTGTGCCTTAATTCCTCCACCTGAGG-----CTATGCAGCCAGTATTGGTTTTTGTTTTGATTGATGCCCCAGATTGATGCCCAACAGTATAGTAACCACAGTTCACCAGCGACCATCTGAATAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGGCTTGCA a s mr.mrrefChr0 24293 82 + 130230 CACAGGTGAGTCAATTAGAATTGAAGGACTCTGAGGTGAGATGAGCTTTTTGGGGGACACTTGCCATTTTGAGTTATATAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25823 82 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 19082 66 + 647215 ACCTGCTGCCTTAAACAAACCCTTTCCAAGAAGGCCCTGCTCTCTAAACTGTTAGTCAGTTTAATG a s mr.mrrefChr0 25493 391 + 130230 TACTTACTGAGTTGATCCCACTTCCACTAGAGGTAGTTACAATCATATGGAAGTTTAGTAGTTATGGTCCTTTAAGATTTATAATGTTTCTCCCTTTTCCCCCATACTATCTGTCCAAGGTTGATTGGGGTCCTTTCCTTTGCCAAGACTCTTACCGAATAACTTAGCTAGTGGGCATACAACCAAGCTGGTTTTTTTGGATTTCAGAGGGAATCTCGTCCTGTGGGCTTTGAGTTGCGTTCCTTCAACTTCAGTACAGTTCTTTGGGCTATCTGTACATATAAGTCTGAACTCCTGCCCACATATAAGGTACAGATTAAATCTAATCTCATGACATTACTTCCTTTCCAATCTAAGTAGCAGTCACACTTATGTGAACTCACTCGCTTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27027 388 + 636262 TACTTACTGAGTTGATCCCACTTCCACTAGAGGGAGTTACAATCATTTGAAAGTTTAGTAGTTATGGTCCTTTAAGATTTATAATGTTTCTCCCCTTTCCCCCATACTATCTGTCT---GTTGATTGGGGTCCTTTCCTTGGCAAAGACTCTTACCGAATAACTTAGCGAGTGGGCATACAACCAAGCTGGTTTCTTTGGGTTTCAGAGGGAATCTCGTCCTGTGGGCTTTGAGTTGCGTTCCTTCAACTTCAGTACAGTTTTTTGGGCTATCTGTACATATAAGTCTGAACTCCTGCCCTCATATAAGGTAGAGATTAAATCTAATCTCATGACATTACTTCCTTTCCACTCTAAGTAGCAGTCACACTTATGTGAACTCACTCGCTTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 19151 369 + 647215 TACTTACTTGGTTGATCCCACTTTCACTAGAGGTAGTTATAATAATATGGAAATTTAGTGGTTATGGTCCTTTACGACTTATAATGTTTCTCCCTTTTCCCCCATATTATGTGTTCAAGGTTAATTGGGGTCCTTTCCTTTGACAA---TCTTACCAGATAACTTAGCTAGTGGGCATACAACCAAGCTGGTTTTGTTGCATTTCAGA---------GTCCTGTTGGCTTTGAG----GTTCCTACAACTTCAGTACAGTTCTCTGGACTATCTG------TAAGTCTGAACTCCTACCCAGATATAAGGTACACATTAAATCCAATCTCATGAACTTACTTCCTTTCCAATCTAAGTAGCAGGCACGGTTATGTAAGTTCAATTGCTTTC a s mr.mrrefChr0 25884 79 + 130230 CAATTTAAGTTGCAGTCTCACTTATAAGAATTTTAATGTGTTTCAGCCTTCATAATCAGCGTGATATAATCATAAGCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27415 79 + 636262 CAATTTAAGTTGCAGTCTCACTTATAAGAATTTCAATGTCTTTCAGCCTTCATAATCAGTGTGATATAATCATAAGCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 19522 79 + 647215 CAATCTAAGTAGCAGTCACACTTATATGAATTTTGATGTGTCTCATCTTTCATAATCAGCATGATGTAATCATAAGCCC a s mr.mrrefChr0 25963 161 + 130230 TCACAAGCACATGATTCCCCCCTCAGCACAGCCTGGACAAATGAACAGCCTGGAGTAGACACATGATTCTCTTTAGAATGAAATCATAAGGTTATTCCTGCGCACAGTTATATGCCTTGCTTGTAATTATCATGGGCCTAGCCCTTCACAAGAACATTAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27498 160 + 636262 TCACAAGCACATGATTCCTCCCTCAGCACAGTCTGGAAGAACGAACAGCCTGGAGTGGACACATGATTCTCCTTAGAATGAAATCATAAGGTAATTCCTGTGCACAGTTATATGTCTTGCTTGTAATTATCATGGGCCTGGCCC-TCACAAGAACATTAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 19601 159 + 647215 TCACAAGCACAAGACTCCCCCCTCAGCACAACCTGGACAAATGAACAACCTGGAGTAG-CACATGATTCTCTCTATAATGACATCATAATGGTATT-CTGCGCACAGTTGCATGCCTTGCATGTAATTATCATAGGCCTAGCCCTTCACAAGGACATTAAG a s mr.mrrefChr0 26124 227 + 130230 CATTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAATTAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTAAATGAATAGTCGTATTAGTTTACATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGTCTCCCAATCATCCTACTGCAATGTGTTGGGATTAGATGTTGACAGATCATTTTGAAGAGCCCTCAAGGGCTCTGCATCTCAAATAGAACTACTAAAGTAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27659 221 + 636262 CATTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAATTAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTAAATGAATAGTCATATTAGTTTACATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGTCTCCCAATCATCCTGCTGCAA-----TGGGATTAGATGTTGACAGATCATGTTGAAGAG-CCTCAAGGGCTCTGCAGCTCAGATAAAACTACTAAAGTAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 19760 221 + 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mr.mrrefChr0 26473 22 + 130230 TGTTGGGATCAGGTGTGGACAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28004 22 + 636262 TGTTGGGATCAGGTGTGGACAG s simRat_chr6.simRat.chr6 20113 22 + 647215 TGTTGGGGTCAGATGTGGACAG a s mr.mrrefChr0 26495 6 + 130230 CTTACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28026 6 + 636262 CTTACT s simRat_chr6.simRat.chr6 20137 6 + 647215 TTTATT a s mr.mrrefChr0 26501 89 + 130230 ATTTTATTGAAGAGCCCGCAAGGGCCTCGCAGCCCAAATAAAACAACTAAAGTAGTAAGCTTAGGCTTATTATGAACATGTTATGTGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28032 83 + 636262 ------TTGAAGAGCCCTCAAGGGCTCCTCAGCCCAAATAAAACAACTATAGTGGTAAGCTTAGGCTTATTATGAACATGTTATGTGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 20162 89 + 647215 ATTTTATTGAAGAGCCCGCAAGGGCCTGGCAGCCCAAATAAAACAACTAAAGTAGTAAGCTTAGGGTCATTATGAATATGTTATGTGCA a s mr.mrrefChr0 26590 71 + 130230 CACAGAATAATATTTAGTTTGCTAGCAGTGGTAAGACTATCACCAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28116 69 + 636262 CACAGAATAATATTTAGTTTGCTAGTAGT--TAAGACTATCACCAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 20251 71 + 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 28633 30 + 636262 ACTTTTAGGGCACTTGTTTGGGG----GTCCACA s simRat_chr6.simRat.chr6 20772 34 + 647215 ACATTTAGGGCACTTGTTACGGGGCTTGTCCACA a s mr.mrrefChr0 27149 206 + 130230 TAGTTAATAAGCTGTGTTGTGGAGCTATGGAGCAGGCATGAATTGTGGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCGGTTCCTCATAACCAGTTATGTAGATATGAGTGCATGCATTTTTCTCTTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCCCCAGATCCAGTGGGTGTGCTTTGTCATGAGTGAGAGACCTACTGGCTATTTAAATTGTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28678 206 + 636262 TAGTTAATAAGCTGTGTTGTGGAGCTATGGAGCAGGCATGAATTGTGGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCGGTTCCTCATAACCAGTTATGTAGATATGAGTGCATGCAGTTTTTTCTTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCCGCAGATCCAGTGGGTGTGCTTTGTCATGAGTGAGAGACCTACTGGCTATTGAAATTGTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 20806 206 + 647215 TAGTTAATAAGCTGTGTTGGGCAGCTATGGAGCAGGCATGAATTATAGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCAGTACCTCATAACCAGCTATGTTGGCACAATTGCACGCATTGTTCTCCTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCTCCAGATCCAGTGGGTGTACTTTGTCATGAGTGAGAGACCTAGTGGATATTTGAATTGTAG a s mr.mrrefChr0 27355 42 + 130230 ACTGCGCATTATGGTATTTGTTTACTTCTAGTCCCTGCATAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28891 42 + 636262 ATTGCGCATTATGGTATTTGTTTACTTCTAGTCCCTATATAG s simRat_chr6.simRat.chr6 21012 42 + 647215 ACTGCACGTTAAGGTATTTATTTACTCCTAGTCCCTGCATAG a s mr.mrrefChr0 27397 160 + 130230 CTACCACTGTTGTGTACCTGGAGTCATGTTCCAATACATATAGCGATGTCAGGCACCGCAGTGAGCCAAAGTGGGATGTAGTGAGAGAGTATCCAGAATTAGGATATGCAAAACTGTATTGACTAAAGCTAGGTAGAACAAGGGACCCTTAAGTGTTAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28934 160 + 636262 CTACCACTGTTGTGTACCTGGAGTCGTGTTCCAGTTTATATAGCGATGTCAGGCACCGCAGTGAGCCAAAGTGGGATGTAGTGAAAGAGTATACAGAATTAGGATATGCAAAACTGTATTGACTAAAGCTAGGTAGAACAAGGGGCCCTTAAGTGTTAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 21054 157 + 647215 CTACCTCTGCTGTGTACATGGAGTCATGTTCCAATACATATAGTGATATCCGGAACTGCAGTGAGTC-AAGTAGGATGTAGTGAGAGAGTATCCAAAAGTAG--TATCCAAAACTATATTGACTAACACTAGGTAGACCAAGGGACCCTTGAGTGTTAAG a s mr.mrrefChr0 27557 176 + 130230 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+ 130230 TATTAAGCAGGCTTTGTTAAGGAGCATCAACAGGTACTAGATACCTCCTTGCCACCTGCCTCCTTGCACAGGGCTGCGGAGAGAAGATATGATGTGGTAATGGTGTTGGGGTAGTGAGATTGAGATAGTAGTGTGCATGGTATATCACCTTACTGGACTGTTTCTTACATTGGTATAATGGAGTAGTCCAAGGGAACAAGGACAAGTTCCAGGAGGAATGGTGGACATTCCAATTTTCCCTAGATTAGTTAAGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39046 255 + 636262 TACTAAGCAGGCTTTGTTGAGGAGCATGAACAGGTACTAGATACCTCCTTGCCACCTGCCTCCTCGCACAGGGTTGCGGAGAGAAGATATGATGTGGTAACGGTGTAGGGGTAGTGAGATTGGGATAGTAGTGTGCATGGTATATCACCTTACTGGACTGTTTCTTACATTGGTATAATGGAGTAGTCCAAAGGAACAACGACAAGTTCCAGGAGCAATGGTGGACATTCTAATTTTCCCTAGATTAGTTAAGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 31311 255 + 647215 CATTTGTCACTTATTGTTAAGGAGGAACAGCAGGTACTAGCTACCTGCCTGCTGCCTGCTTCCTTGCACAGGGCTGAGGAGAGAAGATGTGATGGGGTAATGGTGGTGGGGTAGCAAGATTGAGCTAGTAGTGTGCATCGTATATGACCTTACTAAACTGTTTCTGACATTGGTATAATGGAGTAGTCCACGGGAACAAGGAAAAGTTCCAGAGGGAATGGTGGACGGTCCAATTTTCCCTAGATTAGTTAACAC a s mr.mrrefChr0 37106 51 + 130230 TACAAAGAGATACGAATGTGTTGATGTTAAAAAGTTCCAACTTCTGCCTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39301 51 + 636262 TACAAAGAGATACGAATGTGTTGATGTTAAAAAGTTCCAACTTCTGCCTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 31567 51 + 647215 TACAAAGAGATAGAAATGCACTGTTGTTAAAAAGTTCCAACTTCTGCCTGA a s mr.mrrefChr0 37157 367 + 130230 TATCTATTAGAGGAGTTATTACATTACCATAACTAGAGAAGCCTTGTATGAAGCGGAAGGCACAGACTCCACACACCCTATTGGCAGACCAGAACTTTTATCTGGTTGGTTGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTATATTGAAACAGGTAGAACCCAGATCGCAGTTAGGCGCATGAATCTGTGAGAGCAGCAGGGCCTTTGCTATCCCTTCGCAATTCAGATGGAATAGTACCATACAGTACCATTAATTGAGCCATTGGATGAGGTGATCTCCTGTCAGATGCTCCCAAAGTAGGCAGGTAACAATGAAGGCTGATTGCAGCATATCTAATGGAATAGATAACACTTGATGCCGGTCATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39360 364 + 636262 TATCTATTAGAGGAGTTATTACATTACCATAACTAGAGAAGCCTTGTACGAAGTGGAAGGCACAGACTCCACACACC---TTGACAGACCAGAACTTTTACCTGGTTGGATGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTATATTGGAACAGGTATAACCCAGATCGCAGTTAGGCGCATGAATCTGTGAGAGCAGCAGGGCCTTTGCTATCCCTTCGCAATTCAGATGGAATAGTACCATACAGTACCATTAATTGAGCCATTGGATGAGGTGATCTCCTGTCAGATGCTCCCAAAGTAGGCAGGTAACAATGAAGGCTGATTGCAGCATATCTAATGGAATAGATAACACTTGATGCCGGTCATA s simRat_chr6.simRat.chr6 31618 367 + 647215 TGTCTATTGGAGGAGTTACTGCATTACCATATCTAGAGAAGCCTTGTGTGAAGCGGAAGGCACAGACTCCACACACCCTATTGGTAGACCAAAGCTTTTATCTGGGTGATTGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTGTATTGAAACAGATAGAACCCAGATCACAGCTAGGCACATAAGTCAGTATGATTAGCAGGGCCTTTGCTGCCCCTTAACAATTCAAATGAAACCGTGCCATATAGTACCATTAATTAGGCCATCAAATGAGACGATCTCCTGTCTGATGCTCCCAAAGTAGGTGGGGAACAATGAAGGCTGATCACAGAATATCTGATGGCATGGGTAACAATTAAGCTCGATCATA a s mr.mrrefChr0 37524 552 + 130230 CAGGGAAGCTTCGGCTTCTTCCTTCTTCCTCAGCTGGCTAATAGAAAGAGGACTCCTAAGTAATGGCTCTTAAGTGACTCCTAATTTACTAGTTACCTCCTTTTATACCTGACCAGCTAATATTAGTCCTACTTGTTGATGGTTGAAGGCCCCACCCTTGACTCCTCTGCTTTAGTAGGTGGATAGGCTTCTACTTAACTAAGTCAATAGGTTCACCATTTGTACTTCATGCAATGAATGAATACAAGCATATTTTACTTCTAAACACAAGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGTTAGAGGAATCAGCTAGGGTCAACTTTCTTGTAGGTGATACATACAATTTGGATAAGCATTAGCGTAAACTGGAGTTTAGATCTTGACAGGTGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTCATGAGATTTCGTTAGTGGCTTTTCAGGTTCAGTGTGTCCTGGCACCCTCAACCTTAAGAGAATGAGTTAAAATGGGATACTTCATAGCTGCAAATATTTCCAGGTATCTAGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39725 552 + 636262 CAGGGAAGCTTCGGCTTCTTCCTTCTTCCTCAGCTGGCTAATGGAAGTAGGACTCCTAAGTAATGACTCTTAAGTGACTCCTAATTTACTACTTACCTCCTTTTATACCTGACCAGCTAATATTAGTGCTACTTGTTGATGGTTGAAGGCCCCATCCTTGACTCCCCTGCTTTAGTAGGTGGATAGGCTTCTACTTAACTAAGTCAATAGGCCCACCATTTGTACTTCATACAATGAATGAATACAAGCATATTTGATCTCCAAACACAGGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGGGAGAGGAATCATCTAGGGTCCATTTTCTTTTAAGTGATACATAAAATTTGGATAAGCATTAGCGTAGACTGGAGTTTAGATCTTGACAGGTGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTCATGAGATTTCGTTAGCGGTTTTTCAGGTTCAGTGTGTCCTGGCACCCTAAACCTTAAGAGAATGAGTTAAATTGGGATACTTCATAGCTGCAAATATTTCCAGGTATCTAGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 31985 520 + 647215 CAGGAAAGCTTTGCCTTCTTCCTTCTTCCTCACCTGGCTAATAGAAAGAGGACTACTAAGTGATCGCTCCTAAGTGACTCCTAATTTACTAGTTACCTGCTTTTATTCCTGACCAGCTAATATTAGTCCTACTTGTTGATGGTTGAAAGCCCCACCCTTGACTGCTCTGCTTTAATAGGTGGATAGGCTTTTAATTAACTAAGTCAATAAGTTTGAAATTTGTACTTCATGCAATGAATGAATACAAGCACATTTTACTTCTAAGCACAAGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGTTAAAGGAATCAGCTAGGGTCAGCTTGCTTGTAGGTGATACATAC-----------GCATTAGTGTAAACTGGAGTTTGGATCTTAGCAGGGGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTTATGAGATTTCATTAGTGGCTT---------------------CACCCTCAACCTTAAGAGAATGAGTTAAAATGGGATACTTCATAGGTGCAAATATTTCCAGATATCTAGAT a s mr.mrrefChr0 38076 329 + 130230 GTACAGGTATGCCTAAATATGATGCCAATCCATTATAGCAAGTGACTACAGTAGAGAATGTATAACAATTGTGAGCAGCCCATCCCTCCTAGATTACACACCTATATTAGGTATAGTTACTTAGATAAATTAACCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTACTTCAGAGGGTGTCTTCTTCTCATAGGTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCATATGGGTTCACATTTGGGGTCCTATCTCTTGATGGTGTGCTAGATGGAGGAAGCTAATTTGATATTTGTAATGGATCACCAGTCACTTAATGTGTCAGAAACAAACATTGCTTCCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40289 329 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 32834 94 + 647215 AAGGCTAGAAAGCAGAGAGTGCTTGCACAAACACCTTATACTGTTG-GAGCCATATAttgtgttcctgaagtaagtctctcaaaactgcctttct a s mr.mrrefChr0 38500 139 + 130230 tggacattctgtttacttaaagagcttgttagcatatggtcaatgtgcagaccctgaaattgctgcttaactccttagtgTACTTGACTgtaccttgtctgcatctacaaaagttgtttgctgatgcccctgttcctaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40717 139 + 636262 tggacattctgtttacttaaagagcttgttagcatatggtcaatgtgcagaccctgaaattgctgcttaactccttagtgTACTTGACTgtaccttgtctgcatctacaaaagttgtttgctgatgcccctgttcctaa s simRat_chr6.simRat.chr6 32929 139 + 647215 tctacattctgtttgtttaatgagcttgttagcgtatggtcggtgtgcagatcccaaaaatgttgctcaactccatagtgTACTTGACTgtaccttgtgaacatcttcacaaattgtttgctgataccccttttctcaa a s mr.mrrefChr0 38639 43 + 130230 gttacaccatcattactgaagaaaagagttatacagggtccag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40858 43 + 636262 gttacaccatcattactgaagaaaagagttatacagggtccag s simRat_chr6.simRat.chr6 33068 43 + 647215 attgcaccaccattactggagaaaagagttatacagagtcaag a s mr.mrrefChr0 38682 67 + 130230 gaggactgacttggatcttcagcctCGACCAGTGGGCCCGTGACCAAACACTGTTGTCTGTGCCCTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40901 67 + 636262 gaggactgacttggatcttcagcctCGACCAGTGGGCCCGTGACCAAACACTGTTGTCTGTGCCCTC s simRat_chr6.simRat.chr6 33113 67 + 647215 gaggagtgacctggatttctagcctTGACCAGTGGCTCCTTGGCTAAACACTGTTGTCTGTGCCCTC a s mr.mrrefChr0 38749 97 + 130230 CCTTTCATTCCTAGTCTCATGCACCTCCCTGTAACAACTGCGGGCTCCCTGGAGTGTCCTCTTTGAGTGACCTCTTTGAGAGGGAGGTTTGTACTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40968 97 + 636262 CCTTTCATTCCTAGTCTCATGCACCTCCCTGTAACAACTGCGGGCTCCCTGGAGTGTCCTCTTTGAGTGACCTCTTTGAGAGGGAGGTTTGTACTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 33202 97 + 647215 CCTCTCATTTCCAGTCTTATACACTGCCCTGTACCAACTGTGGGCTCCCTGGAGTATCCTCTTCGTGTGACCTCTTTGAGAGGGAGGTTTATACTGA a s mr.mrrefChr0 38846 26 + 130230 CATGTGTGAGTATGTTCCAATTCTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41066 26 + 636262 CATGTGTGAGTATGTTCCAATTCTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 33299 26 + 647215 CATATGTACGTATGTTATAATCTGGT a s mr.mrrefChr0 38872 8 + 130230 CAGCTTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41092 8 + 636262 CAGCTTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 33326 8 + 647215 CAGCTTCA a s mr.mrrefChr0 38880 3 + 130230 CAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41101 3 + 636262 CAC s simRat_chr6.simRat.chr6 33334 3 + 647215 CAC a s mr.mrrefChr0 38883 86 + 130230 CCATAGTAAACCTGTCTTGCCCAACCCACACCATCTGCCCCGGCTTCAATTTGTCAAGATGGTGCAAAGGCAGTCCTGGACACATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41107 86 + 636262 CCATAGTAAACCTGTCTTGCCCAACCCACACCATCTGCCCCGGCTTCAATTTGTCAAGATGGTGCAAAGGCAGTCCTGGACACATG s simRat_chr6.simRat.chr6 33337 86 + 647215 CCATAGTCAACTGGTCTTGCCTAAGCCACACCATCTGCTCTGTCTTCAACATGTCAAGATGGTGTAAAGGTAACCCTGAACACATG a s mr.mrrefChr0 38969 365 + 130230 TCAGGAGCTGGATCCCTTATCTTTTTTAACTTATCAACGTGTCTTTGCCCTATCACTCCCACAGTTATGCGCCAGTCACTCTGAGTAGCACAGACAACTCTATTTCGACATTCAACATTCGAATTTGTATCTAGAACACAACACGTGGAATTGTTTTCAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAAGCAGCATATTTTGTCTTGAAAGGGCTGAGTGTGGAACCAACAGTGACTTGTTCCTCTACTCTAGTGTGGGGGTGTCACAGGACAGATTATACATATAGCAGGAATAGAAATTTAGACAGATGTTTGGCAGGATGTTATCTACAGATAATATTATCTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41193 364 + 636262 TCAGGAGCTGGATCCCTTATCTTTTTTAACTTATCAACGTGTCTTTGCCCTATCACTCCCACAGTTATGCGCCAGTCACTCTGAGTAGCACAGACAACTCTATTTCGACATTCAACATTCGAATTTGTATCTAGAACACAACACGTGGAATTGTTTTCAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAAGCAGCATATTTTGTCTTGAAAGGGCTGAGTGTGGAACCAACAGTGTCTTGTTCCTCTACTCTAGCGTGGGGGTGTCACAGGACAGATTGTACATATAGCAGGAATAGAA-TTTAGACAGATGTTTGGCAGAATGTTATCTACAGATAACATTATCTG s simRat_chr6.simRat.chr6 33425 365 + 647215 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TGAACTTACATACGTGGAGTTCGTGAGTCTTTAAAGGAAT a s mr.mrrefChr0 39460 39 + 130230 CTGGTAGAAAAGCCAAAATGGACCTACCACAGGGCCACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41699 39 + 636262 CTGGTAGAAAAGCTAAAATGAACCTACCACAGGGCCACT s simRat_chr6.simRat.chr6 612973 39 - 647215 CTGGTAGAAAAGCCAAAATGGACCTACCACAGGGCTACT a s mr.mrrefChr0 39499 18 + 130230 TTACTATAGGAGTAAAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41738 18 + 636262 TTACTATAGGAGTGGAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 613017 18 - 647215 TTACTATAGGAACAAAGG a s mr.mrrefChr0 39517 16 + 130230 CAGAAATAAGCTATTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41756 16 + 636262 CAGAAATAAGCTATTA s simRat_chr6.simRat.chr6 613038 16 - 647215 CTGAGATAAGCTATTA a s mr.mrrefChr0 39533 57 + 130230 GGAAAGCAAATAGACAATAAACTGTGGAAACCACACATCTACAAGATGACTGCTAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41773 57 + 636262 GGAAAGCAAATAAACAAGAAACTGTGGAAACCACACATCTACAAGATGACTGCTAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 613054 57 - 647215 GGAAAGCAAATAGATAATAAACTGTGGAAACCCCCCATCTACAAGACAACTGCTAAG a s mr.mrrefChr0 39590 70 + 130230 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simRat_chr6.simRat.chr6 34404 245 + 647215 TGATTGTGCTAGTTGATGATATAGTAGTATCAGACAGAAAGAACGATTCACTTCATT-CATCACTTTGGAGTAAGGGTATTCCTGTCCATGC-----ATTTTCAGACCAT--------AAAGGCTCATTATACACTCCGTAACTGCTGTCAGGTCAGGTGTA---------GGCTGTACTGCAAAGCTCATAGTTGTCAGCTGATGCTTAATTGGGCGCCAATCAACTGCATCCAATGAACTGTAGTCTTGCATTTGGTGCTGCACGA a s mr.mrrefChr0 40080 165 + 130230 TCCACGAGAACATTATTCCATTGGGAATACTAGATGATTTACTAACACTTAAGGGGTTGGAGACAATATCACAGTACTGGCAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGTTGGGAGTTTGATGTAGTGGCAAAGGACTGGGAACTCTTTACAGCTAGAAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42336 165 + 636262 TCCACGAGAACATTATTCCATTGGGAATACTAGATGATTTACTAACACTTAAGGAGTTGGAGACAATATCACAGTGCTGACAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGTTGGAAGTTTGATTTAGTGGCAAAGGACTGGGAATGCTTTACAGCCAGAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 34649 165 + 647215 TCCACGAGAACGTCATTCCATTGGGAGTACTAGATGAACTGCTAACACTTGAGGGGTTGGAGACAATATCTCAGTACTGGCAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGATGGGAGTTTGATGTAGTGGCAAAGGACTGGGAACTCTCTACAGCTATTAAA a s mr.mrrefChr0 40245 115 + 130230 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AAAGCTTCAGGTGACCACATTAAGATTTAAAGCAGGACATCTGATTGCAGGCTTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGCACTTCAGATGTACGTCCCTAAAGAACAGCTAAGACTGTCCACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42745 145 + 636262 AAAGCTTCAGGTGACCACATTAAGATTTAGAGCAGGACATCTGATTGCAAGCCTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGAATTCCCGATGTATGTCCCTAAAGAACAGCTGAGACTGT----- s simRat_chr6.simRat.chr6 35056 150 + 647215 AGAGCTTCAGGTGACCAAATTAAGATTTAAAGGAGAACATCTGATTGCAGGCTTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGCACTTCAGATGTACGTCCCTAAAGAACAGCTAAGTCTGTCCACA a s mr.mrrefChr0 40634 475 + 130230 AATGTAAACCAATAGTCCATCTATATCCTTGCAAGTTCAATCTCCTTTTCACATAGTTGGTAACTTGTATATACCCTCAGGGTCAAACAGATCGAGTGTAAGAAAACACTTGGGGAATGACTTGGCACATTGATTTTAATTCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAATCCTCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGGGCATATCATGCTATTACCTCAATGCAGACTAACTACCTTGTACATGTACAATCTGTCATATTTGGTACAATGGTTTTCAGGTTCACAAGAAGTGTCAAGGAAATAACATGGTGTTTATGCCAATTGCCAAAAACTATCAAGAAAATAACCTGAGTACAATTACTTAATTTCATGGGGAAGCTGGTTGTCACCTTTATAGTTCAAGGTGGGTGGCCACGGCAAACCCATTGTAAGTATGATCCATTCATCCTGATGACACTCATAATTACACAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42890 457 + 636262 AATGTAAGCCAATAGTCCATCTACATCCTTAGAAGTTCAATCTCCTTTTCACATAGTTGGTAACTTGTATATACCCTCAGGGTCAAACAGATT-----------AACACTTTGGGAATAACTTGGCACATTGATTTTAATTCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAAGCATCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGAGCATATC--GCTATTACCTCAATGCAGACTAACTACCTTGTACATGTACAATCTGTCATATGTGGTACA-----TTTTAGGTTCGCAAGAAGTGTCAAGGATATGACATGGTGTTTATGCCAATTGCCAAAAACTATCAAGAAAATAACCTGAGTACAATTACTTAATTCTATGGGGAAGCTGCCTGTCACCTTTATAGTTCAAGGTGGGTGGCTACGCCAGACCCATTGTAAGTATGATCCATTCCTTCTGATGACACTCATAATTACCCAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 35208 470 + 647215 AATGTAAACCAATAGTCCATTTATATCCTTGCTAGTTCAATCTCCTTTTCACACAGTTGAT----TGTATATACCCTCAGAGTCAAACAGATCGAGTGTAAGAAAACACTTGGAGAATGACTTGGCAGGTTGATTTTAAACCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAATCCTCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGGGCATATCATGCTATGACCTCAATGCAGACTATCTATCTTGTACATATACAATATGTCATACTTGCTACAATGGTTTTCAGGTTCACAAGAAGTGTCAAGCAAATAACATGGTATGTATGCCAATTGCCAAA-ACTATCAAGATCATAACCTGAGTACAGTTACTTCATCTCATGGGGAAGCTGGTTGTCACTTTTGTAGTTCAAGGTGAATGGCCATGGCAAACCCATTGTAAGTATCATCTATTCATCTTGATGACAATCATAATTACAAGTG a s mr.mrrefChr0 41109 130 + 130230 TGTAAAGAATTTATTTTGTCATTTGCTTTTTTGACATTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGGACTATGTCCTGGGTTGGTTGCTCTAGCACAGGCTAATGTTCCTCAGTTATATTGGACTTAGATTCAAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43347 130 + 636262 TGTAAAGAATTTTTTTTGTCACTTGCTTTTTTAACATTGGATGGATCAATCCATTTTAAGGAATATGTCCTGGGTTGGCTACTCTAGCATAGGCTAATGTTTCTCAGTTATATTGGACTTAGATTCAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 35678 130 + 647215 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CATATCCTCATGGTTGATCACAGCTATCCCTTGGGCAGGAAAGTAAACTTTATTTTTCTTTCATATAATGAATTACTAATAGATTTTCTGCCTTCTTTCTTGGTTGAGTAACACAATGCATAAAAGTAGACTCAGACTCAAGCAGATCGAACACCATACAAACTCAATCTGATGGAACATCATCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43642 186 + 636262 CATATCCTTATGGTTGATCACATCTATCCCTTGGGCATGAAAGTAAACTTCATTTTTCTTTCATATAATGAATTACTAATAGATTTTCTGCCCTCTTTCTTGGTTGAGTAAGACAATGCATAAAAGGAGACTCAGGCTCAAGCAGATCGAACACCATACAAACTCAATCTGACGGAACATCATCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 36109 186 + 647215 CATACCCTCACGGTTGATCACAGCTATCCCTTGGGCAGGAAAGTAAACTTTATTTTTCTTTTCTATCATGAATTACTAATAGATTTCCTGTCTTCTTTCTTGGTTGAGTAACACAATGCATAAAAGTAGACTCAAACTCAAGCAGATCGAACACCATACTAACACAATCTAATGGAACATTATCCA a s mr.mrrefChr0 41596 129 + 130230 TACCCATGGCCTTAAAGCACATTGATTTAAAGTGAATTGTCCCAAATGGCATTACAAGTTGTTGTCCATTGGCTGACTAATTAATtcgtTGGCTGACTAATTGATTCTTTCTACTGAGACTCCATCTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43829 129 + 636262 TGCCTATGGCCATAAAGCACATTGATTTAAAGTGAACTGTCCCGAATGGCATTACAAGTTGTTGTCCATTGGCTGGCTAATCAATTCGTTGGCTGACTAATTGATTCTTTCTACTGAGATGCCATCTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 36295 129 + 647215 TACCCATGGCCTTAGAGCACGTTGATTTAAAGAGAATTGTCGCAGATGGCATTACAAATTGTTGTCCATCGGCCTACTAattgattgattggctgactgattgattCTTTCTACTGAGACTCCAGCTAG a s mr.mrrefChr0 41725 10 + 130230 GGCCTGTCTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43958 10 + 636262 GGGCGGTCTA s simRat_chr6.simRat.chr6 36442 10 + 647215 GGCCTGTCTC a s mr.mrrefChr0 41735 68 + 130230 ATTTGAACAATCCTCTGCATTTAAGCAATCCACCAGCCATTACCCTGCTTAGCTCCGAATATATATGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43969 68 + 636262 ATTTGAACAATCCTCTGCATTTAAGCAATCCACCAGCCATTACCCTGCTTAGCTCCGAATATATATGT s simRat_chr6.simRat.chr6 36452 68 + 647215 ATTAGAGCAACCCTTTGCATTTAAGCAATCCACCAGCCATTACCCTGCTCAACTCGGAATATATATAT a s mr.mrrefChr0 41803 55 + 130230 GTTGATTAATCCCACACCCAGCACCATGGTGTCAGTGTGCATTAGGAACACAGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44041 55 + 636262 GTTGATTAATCCCACACCCAGCACCATGGTGTCAGTGTGCATTAGGAACACAGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 36520 55 + 647215 ATTGGTTACTCTGACACCCAGCACCATGGTGTAAGTGTCCATTTGGAACACAGAC a s mr.mrrefChr0 41858 226 + 130230 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simRat_chr6.simRat.chr6 38809 23 + 647215 ACCCTGTAGTGAGTGGATAGTGT a s mr.mrrefChr0 43855 346 + 130230 TAGGTAGCCAATACCTATGGACGTGACTGATATCCAGAAAGCTAAAATAAATATAGGATGATTGGCAGGAACCAAGTTTTAGAGCCGTCTTAAGGTCCCTGAGGCATAGCAAAGCAACAGCTGCTAATTGCAGTCTTAGGACTCCTCCCCATCAAGACTCCATCTGCAAGTTGCATGAGTACCCTGGTGAAAGTGTTGTGTGGCTCAGCATCAAAAGGTAGGTAGTATAATTCACCTTTTGCTAGACTTGTTTATGCATATTTATAAAGCTTGATTATTGCTTCTTGAGAGGATGTGTTCTTAACATGTTTATAGCACAAAATAATTTATAATTGATTTGGAACTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46061 346 + 636262 TACGTAGGCAATACCTATGGACATGACTGATATCCATGAAGTTAAAATAAATATAGGATGATTGGTAGGAACCAAGTTTTAGAGCCGTCTTAAGGTCCCTGAAGCATAGCAAACCAACAGCTGCTAATTGCAGCCTTAGGACTCCTCCCCATCAAGACTCCATCTGCAAGTTGCATGAGTACTCTGGTGGAAGTGTTGTGTGGCTTAGTATCAAACGGTAAGTAGTATAGTTCACCTTTTGCTAGACTTGTTTATGCATATTTAGAAAGCCTGATTTTTGTTTATTGAGAGGATGTGTTCTTAACATATTTATATCACATAATAATTTATTATTGATTTGGAACTT s simRat_chr6.simRat.chr6 38832 346 + 647215 TAGATAGCCAATACATATGGGCGTGACTGATATCCAGAAAGCTAAAATAAATATAGAAAGATTGGCAGGAACCAAGTTTTAGAGCCATCTTAAGGTCCCTGAGACATGGCAAGGCAACAGCTGCTAACTGTAGTCATAGGACTCCTCCCCATCAAGACTCCAGCTGCAAGTAGCATGAGCGCCCTAGTGAGAGTGTTGTGTGGCACAGCATCAAAAAGTAGGTAATATAATTCACCTTTTTCTAGACTTGTTTATGCATATTTATAAAACTTAATTACTACATCTTGAGAAGATGTGTTCTTAACATGTTTATAGCACAAAATAATTTAAAATTGATTTGGAACTT a s mr.mrrefChr0 44201 262 + 130230 CTAAACTTCTCACTCCTACAATGGTGCAGTGCGTAGAAGGCACCAGAGATTTTAGAGGCAAGACAAAAAACCAATATTGCTAGACTTGTGATATATTCACAATTTGAACAAAGCCTGTATCGCCTATGTTAACCTATGGTATTCTTCCAACCTTGAAAAAGCAGAGTGGAAAACACATGTTGGAATTGCAAATGTGAAGCATACACATCAAATCACACATTCTAACAAACCCAACTGATTTAATACATCAACATCACAATAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46407 260 + 636262 CTAGACTTCTCACTCCTACAATGGTGCAGTGTGTAAAAGGCACTAGAGATTTTAGATGTAAGACAAAAAACCAATATTGCTAGA--TGTGAAATATTCACAATGTGAACATAGACTTTATTGCCTATGTTAACCTATGGTATTCTTCCAACCTCGAAAAAGTAGAGTGGAAAACACATGTTGGAATTGCAAACGTGAAGCATACACATCGGATCACACATTCTAACAAACCTAACTGATTTAATACACCAACATCATAATAT s simRat_chr6.simRat.chr6 39179 262 + 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simRat_chr6.simRat.chr6 40279 102 + 647215 ATACGCGTTAAGATCCATGGCTAGCATTAGCCCACTAGGATAGTCATAGTCTGAGGGGGTGGCAGACTTAATCCTTCAAGAAAGAACAATAGAGAATAAGTA a s mr.mrrefChr0 45400 20 + 130230 TGCCAGGCTATCTTACCTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47621 20 + 636262 TACCAGGCTATCTTACCTAT s simRat_chr6.simRat.chr6 40384 17 + 647215 TGCCAGG---TCTTACCTAT a s mr.mrrefChr0 45420 203 + 130230 ATGTATAGAACAATAGAGCAGGTACATAAAACAATATTTTAGTTGATAATTCTTAGATCTTTGCTAATTCTTCGTTCTTTGCCCATGCACTGCTCCATGTTAAAGTGCTTGAAGAGGGCAAGAACCTCTTTCTAATCACACTTTAGGACCCATGATGTTATAATGATCTTCAAGTGAAGCAGAAATTCCATTCATATTTATGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47641 186 + 636262 ATGTATGGAACAATAGAGCAGGTAGACAAAACAATATTTTAGTTGATAATTCTTATATCTTTG------------TCTTTGCCCATGCACTGCTCCATGTTAAAGTGCTTGAAGAGGGCAGGAACCTCTTTCTAATCA-----TAGGACCCATGATGTTATAATGGTTTTTAAGTGAAGCAGAAATTCCATTCATATTTATGC s simRat_chr6.simRat.chr6 40404 203 + 647215 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mr.mrrefChr0 46495 69 + 130230 AGCTGTTTGTGTATGGAACATTCTTGTTTGTATTATTCTCACAGGTTGTGACACAAAAATCTTGAAGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48755 69 + 636262 AGCTGTTTGTGTATGGAACATTCTTGTTTGTATTATTCTCACAGGTTGTGACATAAAAATCTTGAAGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 41474 69 + 647215 AACTGTTTTTGTATGGAACATTCTTGTCTGTATTATTGACATAAGTTGTAACACAAAAGTCTTGGAGTG a s mr.mrrefChr0 46564 259 + 130230 CTATGTGCACATCTCCCAGATTGATTGACTGACACTCCAGAAACTGTTTAGGAAGGAATTGCCCTGGTTGATTCTGTTTATAAGTCAGAACCACCTATTATACACATGAACAGTCTTGTATTTTTCAAACCTTCGTGATGACAAAAATACAATAGTAGGACAGTGCAAGCATCTATTAGTATCATCATTAAGTTTCTCCAGATATCTTGATGTTTCAACAAGCTGGCTTTAACTTGTATTCGAAAAATTAGTCCGTCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48824 258 + 636262 CTATGTGCACATCTCCCAGATTGATTGACTGACACTCCAGAAACTGTTCAGGAAGGAATTGCCCTGGTTGATTCTGTTTATAAGTCCGACCCACCTATTATGCACATGAACAGTCT-GTATTTATCAAACCTTCGTGATGACAAAAATACAATAGTAGGACAGTGCAAGCATCTATTAGTGTCATCATTAAGTTTCTCCAGATATCTTGATGTTTCAACAAGCTGGCTTTAACTCGTATTCGAAAAATTAGTCCGTCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 41560 251 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 52793 85 + 636262 GCCTCTTTCGAGGGACCTAAGAAGGGTTCGGCATTTTAGGATTCCGTTCCATAATCTCCTAGTACTCCACTCCCAGCTCAACTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 45596 66 + 647215 GC-------------------AAGGGTAAGGCATTTTAGGATTCTGTTCTATAATCTCTTAGTACACTGTTCCTGGCTCAACTAA a s mr.mrrefChr0 50612 109 + 130230 AAGTGCATACATCTTCCAGCAAGTGGAAGCTCACAGGTCTCAGGATAATGTGTAGCGTCATTATTGACTTGTTTCATGGCTTTTGCATCTAAATTGTGCTTTACCTGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52878 57 + 636262 ----------------------------------------------------TAGCGTCATTATTGACTTGTTTCATGGCTTTTGCATCTAAATTGTGCTTTACCTGCC s simRat_chr6.simRat.chr6 45881 109 + 647215 AAGTGCATACATCTTCCAGCAAGTGGAAGCTCACAGGTCTCAGGATAATGTGTAGCATCACTATTGACTCATTTTACTATTGACTCACTCATTTTATGTCTTTCATACC a s mr.mrrefChr0 50721 9 + 130230 TATATAGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52947 9 + 636262 TATATAGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 45990 9 + 647215 TAAACACTG a s mr.mrrefChr0 50730 24 + 130230 CACAACTGAATTTCAGCCAATGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52973 24 + 636262 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TGGAGAAAGATTAGATATGTAGGCTTCCCTATTTGTGAATCAAGAATGCATCATACTACTTGCACCATGTC a s mr.mrrefChr0 50948 111 + 130230 ATAACCTGACCTACTGGTTGCAAAATAATTGTGATCCTTATCACATTTCTTATTGACACATGTCTCTGGTAGACAAGACACATAGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTGTGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53229 111 + 636262 ATAACCTGACCTACTGGTTGCAAAATAATTGTGATCCTTATCACATTTCTTATTGACACATGTCTCTGGTAGACAAGACACATAGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTGTGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 46348 111 + 647215 ATAACCTGACCTATTGGTTGCACGATATTTGTGATCCATACCACATCTCTTATTTCCACATGTCTTTGGTAGACAAGACACGTGGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTATGGG a s mr.mrrefChr0 51059 13 + 130230 TGATGACTGTAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53340 13 + 636262 TGATGACTGTAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 46502 13 + 647215 TGATAACTGTGAA a s mr.mrrefChr0 51072 34 + 130230 ACCTACTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATGACGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53353 34 + 636262 ACCTACTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATGACGG s simRat_chr6.simRat.chr6 46516 34 + 647215 ACCTGCTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATTACGG a s mr.mrrefChr0 51106 8 + 130230 ACTTCCAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53387 8 + 636262 ACTTCCAC s simRat_chr6.simRat.chr6 46551 8 + 647215 AATTCTAC a s mr.mrrefChr0 51114 13 + 130230 ACATAGTGGTTGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53411 13 + 636262 ACATAGTGGTTGG s simRat_chr6.simRat.chr6 46559 13 + 647215 ACATCATGGTTGG a s mr.mrrefChr0 51127 41 + 130230 CTAAAGGTGGCCTtcactgggagggacctcctgtatgatag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53444 41 + 636262 CTAAAGGTGGCCTtcactgggagggacctcctgtatgatag s simRat_chr6.simRat.chr6 46572 41 + 647215 CTAAAGGTGGCCTTCACTGGAAGGGATCTCCTGTATGTTGG a s mr.mrrefChr0 51168 24 + 130230 cttgaggtggcctagcccccactc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53527 24 + 636262 cttgaggtggcctagcccccactc s simRat_chr6.simRat.chr6 46613 24 + 647215 CTAGaggtggcctaccccccactt a s mr.mrrefChr0 51192 65 + 130230 agtccctttgtttgttaccaggtgcactagcgttttctttggaaagtttccagtAGCTCATAAGt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53551 65 + 636262 agtccctttgtttgttaccaggtgcactagcgttttctttggaaagtttccggtAGCTCATAAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 46638 65 + 647215 ggtccctgactttgctaccaggggcactagcgttttctttggaaagtttccagtagctcataagt a s mr.mrrefChr0 51257 10 + 130230 gaggcccagt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53618 10 + 636262 GAGGCCCAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 46703 10 + 647215 gagacccagt a s mr.mrrefChr0 51267 38 + 130230 AAGGGTGATCACACAAATTAGCTCTCTATCTGGTCAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53628 38 + 636262 AAAGGTGATCACTCAAATTAGCTCTCTATCTGGTCAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 46763 38 + 647215 AAGGGTGATCACACAAATTAGCTTGCTATCGGGTCAAT a s mr.mrrefChr0 51305 353 + 130230 TTTTATCAAGTACCCAGTGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCCCTAATCATGCATTCATAGAGGTCACCAAAGAGTATGCATACTAAGTTGACACTGCTTAGCTCTAGAGGTAGTTAAGGGCGCTCAAATTTTATACAAAATAAGACTATCAGAACTCCAATTCAGTTGACAAGCCACCAACTGAGTTTGGCTACCTCTAGCAATGCCCTTAAGGCTCTTATGTCCAATGTGATCCTAATCTAATCATCATAATGTTCATTGACCTCCAGGAGTTTATTGTTTAATGATTAACTATTTAAACTTCCTATCTCGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53685 350 + 636262 TTTTATCAAGTACCCAGTGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCACTAATCATGTATTCATAGAGGTCACCAAA-AGTATGCACACTGAGTTGCCATAGTTCAGCTCCAGAGGTAGTTAAGGGCGCTCAAATTTTATACAAAATAAGACTATCAGAACTCCAATTTAGTTGATGTGCCAGCAACTGAGTTTGGCTACCTCTAGCAGTGCCCTTAAGGCACTTAAGTCCAGTGTGAT--TAATCTAATCATCATAATTTTCATTGACCTCCAGGAGTTTATTGTTTAATGATTAACTATTGAAATTTCCTATCTCGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 46801 353 + 647215 GTTTATCAAGTACCCAGCGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCCCTAATCATGCATTTATAGAGATCACCAAAGAGTATTCATACTAAGTTGACACTGCTTAGCTCTAGAGGTATTTGATGGATTTCAAATTTTCTATAAAATAAGACTCTCAGAACTCCAATTCAGTTGACAAGCAACCAATCAAGTTTGGCTACCTCTAGCAATGTCCTTGAGGCTCTTATATTCAATGTGATCCTAATCTAAACATCATAGAGTTCATTGAGCTCCAGGAGTTTATTGCTTGATGATTAAATATTTAAGCTTCCTACCTTGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT a s mr.mrrefChr0 51658 347 + 130230 ATAAGACAGACCCCCCACACTCTAGGAGCTTATTAAATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACTCAAGGGAGTGATGCTGGCAAGAAGGCAATAAGCCAATAAGAAAAGTCCCCAGAGGTCCCAGAAGAGTTCCAACTGCCCAGCAGTGCAATGGCTGTGACCATTTCACAGGTTAAGAGCTATCGAGGGAGATCATGATGGGGTCTTGACATATTGTATTTCAACAATCATTAAATTAGCTGGGGTTGGGGAGTTTGTGGGTTCATAAACCATTAGTTAAGTCCTTAAATGGGTCAGATGAATGAGATTAGCTGTGCCGGCTGAGTGATAAATGATCATGATGCATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54037 335 + 636262 ATAAGACAGACCCCCCACACTCTAGGAGCTTATTAAATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACTCAAGGGAGTG----TGGCAAGAAGGGAACAAGCCAATAAGAAAAGTACCCAGAGGTCACAGAAGAGT--------CCCAGCAGTGCAATGGCTGTGACCATTTCACAGGTTAAGAGCTATCAAGGGAGATCATGATGGGGTCTTGACATATTGTATTTCAACAATCATTAAATTAGCAGGGGTTCGGGAGTCTGTGGGTTCATAAACCATTAGTTAAGTCCTTAAATGGGTCAGGTGAATGAGATAGGCTGCGCCGGCTGAGTAATAAATGATCATGATGCATG s simRat_chr6.simRat.chr6 47154 341 + 647215 ATAAGACACACCCCCCATACTCTAGGAGCTTATTAGATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACCCAAGGGAGTGATGCTGGCAAGAATGCTGTAACCCAATAAGAAAAGTCCCCAGTGGTCCCAGAAGAGTTCCAACTGCCCAGCAGTGCAATT------ACCATTTCACAGGTTAAGAGCCATCGAGGGAGATTATGATGGGATCCTGATATACTTTATTTCAACAATCATTAGGTTAGCTGAGGTTGGGGAATTCGTGGGTCCATAGACCATCATTTAAGTTCTGAAATGGATCAGATGAACAAAATTAGCCGTGCCGGCTGAGTGATAAATGATCAGGATGCATG a s mr.mrrefChr0 52005 11 + 130230 TAAGTTGCTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54376 8 + 636262 TAAGTTTT--- s simRat_chr6.simRat.chr6 47495 11 + 647215 TAAGTTGCTAG a s mr.mrrefChr0 52016 77 + 130230 GGCAATGAAAAATGCTTAGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTACATCCTTCTTTTTGGGGTTTAAAAGGACTGCTGACATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54384 77 + 636262 GGCAATAAAAAGTGCTTAGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTAAATCCTTCTTTTTGAGGTTTAAAAGGACTGCTGACATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54578 77 + 636262 GGCAACGAAACATACTTAGTGTCCCAAGAGTTTTGTTTACATCCCTCTTTTTGGGGTTGAAAAGGAATGCTGACATC s simRat_chr6.simRat.chr6 47506 62 + 647215 GGCAATGAGAAATGCTTCGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTACATCCTTCTTTTGGGGGAGT---------------ATC a s mr.mrrefChr0 52093 6 + 130230 CTAAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54461 6 + 636262 CTAAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54656 6 + 636262 TTAAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 47568 6 + 647215 CTGAAC a s mr.mrrefChr0 52099 1 + 130230 A s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54662 1 + 636262 A s simRat_chr6.simRat.chr6 47574 1 + 647215 A a s mr.mrrefChr0 52100 24 + 130230 TATTGTTGGAGATATGAGATGCTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54467 24 + 636262 TATTGTTGGAGATATGAGGTGCTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54663 24 + 636262 TATTGTTGGAGATATGAGATGCTG s simRat_chr6.simRat.chr6 47575 24 + 647215 TATTATTGTAGATATGAGATGCTG a s mr.mrrefChr0 52124 1 + 130230 T s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54687 1 + 636262 T s simRat_chr6.simRat.chr6 47599 1 + 647215 T a s mr.mrrefChr0 52125 82 + 130230 TCCTAAAGACTTTCCTCTAGGTAACCGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATACCATACTGGACCAAGGCACAGTTTGATTATTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54491 82 + 636262 TCCTAAAGACTTTCCTCGAGGTAACAGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATATCATACTGGACCTAGGCACAGTTTGATTATTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54688 82 + 636262 TCCTAAAGAATATCCTCTAGGTAACCATTATGTTGTTTGCTTTGCATGTACCATACTGGACCAAGGCACAGTTTGATTAGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 47600 79 + 647215 TCCTAAAGACTTTCCTCTAGGTAACCGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATGCTATACTGGACTAAGGCACAGTTTGATAA--- a s mr.mrrefChr0 52207 29 + 130230 TCACACTTTGGTTATCACACAAATTTGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54789 29 + 636262 TCACACTTTGGTTATCACACAAATTTGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 47679 29 + 647215 TCACACTTTGATTATCACATAAGTTTGAT a s mr.mrrefChr0 52236 5 + 130230 TATTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54573 5 + 636262 CATAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54818 5 + 636262 TATTG s simRat_chr6.simRat.chr6 47708 5 + 647215 TATTG a s mr.mrrefChr0 52241 80 + 130230 CACAGCATCTTGTCATTGTCTAGATTATGCTTCCAAGGACCCATAGGCATAAAATATAACAACCAATAGGCAATGTGAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54823 78 + 636262 CACAGCATCTTGTCATTGTCTAGAATATG--TCCAAGGACCCATAGGCATAAAATATAACAACCAATAGGCAATGTGAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 47713 80 + 647215 CACACCACCTTGTCATTGTTGAGATTATGCTTCCAAGGACCCATAGGCATGAAATATAACAACCAATAGGCAATGTCAGA a s mr.mrrefChr0 52321 55 + 130230 ACAGGACAGTAGTGAATCACCTGGCACTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54901 55 + 636262 ACAGGACAGTAGTGAGTCACCTGGCACTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 47824 55 + 647215 ACAGGACAGTAGTGAATCACCTGGTATTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG a s mr.mrrefChr0 52376 23 + 130230 AAATTCGAGGACTATCATCATTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54956 23 + 636262 AAATTCGAGGACTATCATCATTA s simRat_chr6.simRat.chr6 48100 23 + 647215 AAATCTGAGGACTATCGTCATTA a s mr.mrrefChr0 52399 224 + 130230 TTTACTTCCTACTGAGTATGTGCCAGGCCTACATATTTTTCCACTGAGTATGTACCAGGTGTGCAACTGTTCCTTCATTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCCTGAAATTTTTGCCTGCCTGTATCAGGCCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTCGGCATACCTATCTTTTGCATTCATTAGGTAGAATTGGCACAATGTCCACTGAAGCTCCATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54979 224 + 636262 TTTACTTCCTACTGAGTATGTGCCAGGCCTACATATTTTTCCACTGAGTATGTACCAGGTGTGCAACTGTTCCTTCATTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCCTGAAATTTTTGCCTGCCTGTATCAGGCCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTCGGCATACCTATCTTTTGCATTCATTAGGTAGAATTGGCACAATGTCCACTGAAGCTCCATA s simRat_chr6.simRat.chr6 48124 224 + 647215 TTTGCTTCACACTTAGTATGTGCCAGGTCTAAATCTGATTTCACTGAGTATGTGCTAGGCCTGCAACCATTTCTTCGTTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCTTGAAATTATTGCATTGATGTATCAGACCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTGGGCATACGTGTCTCTTGCATTCAGTAGGTATAATTAGAGTAATATGCACTGAGGCTCCATG a s mr.mrrefChr0 52623 99 + 130230 TGACATCTAACACAGTATGCCCCTTGTGATTGGCTCACCAGAAGATTGAGTTTAAATGCAATTGTGTGTCTATATACATTGAGCGGCCAACGTTGTATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55203 99 + 636262 TGACATCTAACACAGTATGCCCCTTGTGATTGGCTCACCAGAAGATTGAGTTTAAATGCAATTGTGTGTCTATATACATTGAGCGGCCAACGTTGTATG s simRat_chr6.simRat.chr6 48349 99 + 647215 TGACAACTAACACAGTATCTCCCGTGTGAATGGCCCACAAGAGGATTCAGTCGAAGAGCAATTGTGTGGCTGTATACAATGAATGGCCAACATTGAATG a s mr.mrrefChr0 52722 111 + 130230 CCATGAGTGCCTATTGGATCTCTTAACTTGGCGCGGGCAGGTTGCACCCCATGTAAGCTGAAACTACACTATTGCAATTATGGCAGAGCCTGATAGACAACCTGCTGTAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55302 109 + 636262 CCATGAGTGCCTATTGGATCTCTTAACTTGGCGCGGGCAGGTTGCACCCCATGTAAGCTGAAACTACACTATTGCAATCA-GGCAGAGCCTG-TAGATAACCTGCTGTAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 48487 111 + 647215 ACATAGGTGCCTATTGGATCTCTTAACTCGGCACGGGCAGGTTGTGCCCCATGTAAACCGAAGGCACATTATTGCAATTATGGCAGGGCCTGATAAACAACCTGCTGTAAT a s mr.mrrefChr0 52833 50 + 130230 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACATTGACCTTGCAACTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55411 50 + 636262 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACAATGAACTTGCAACTA s simRat_chr6.simRat.chr6 48601 50 + 647215 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACATTGACCTTGCAACTA a s mr.mrrefChr0 52883 110 + 130230 TAAACTTTTGAGAGCATTGGATAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAATGTTTTCATAAGCATAAATTATTGGTTTTTCTGGCTTTTCAAGATCATGGGTCTTAATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55473 103 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 51457 168 + 647215 ACATACCCACACAATCTGTCTCCATGCCACATATTACACATTCA-------GATTAGATAATTTAGACAATCCTTGCAGCCACTGGATCACCTCATGCTTACCATGCATGTGCCATGCATGTGACTATAATTGATGGGGTAAAGATATTAAAATGATGGCCTTTATCATACTGCG a s mr.mrrefChr0 55621 101 + 130230 TGTAACTACACAGTTTAATGAGCATTCCAAGTGTCACACATATTCAGTTTGTTATGTTTGATATTCAATCATTGTGTGTCTTACAGAAACCCTTGTAAGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58322 101 + 636262 TGCAACTACACAGTTTGTTGAGCATTGCAAGTGTCACACATATTCAGGTTGTTATGTTTGATATTCAATCATTATATGTCTTACAGAAACCCTTGTAAGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 51626 96 + 647215 TATAACTACACAGTTCAATGGGCATCCCAGGTGTCACACATATTCAGTTTGCTA-----GATATTCATTCATTGTGTATCTTACAGAAACCTCTGTAAGAT a s mr.mrrefChr0 55722 89 + 130230 ATGTAAACTACAATGATGCGCTCTGACTCAATACTTGTATAACTGAGTCAAGACAAATATTAACATCTGCATGTGTTCACATCACAAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58482 89 + 636262 ATGTAAACTACAATGATGCACTCTGACTCAATGCTTAAATAACTGAGTCAAGACAAATATTAGTGTCTGCATGTATTCACATCACAAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 51722 89 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 60493 35 + 647215 CCCACACCCTTAAGGAAATCGACTCCTCAGGGTTT a s mr.mrrefChr0 64865 169 + 130230 AGAAAGCTGTTGTCATGTATACAGCAGCAAGAAGACCACACCTgcttcaggttcaccccattgaaggtaactcatgcatgcaattgtcaattggtattgtccattggtcctccttgtcctgtgacttgagcatattaattttataaccagacacattctacaaccctca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68780 169 + 636262 AGAAAGCTGTTGTCATGTATACAGCAGCAAGAAGACCACACCTgcttcaggttcaccccattgaaggtaactcatgcatgcaattgtcaattggtattgtccattggtcctccttgtcctgtgacttgagcatattaattttataaccagacacattctacaaccctca s simRat_chr6.simRat.chr6 60529 169 + 647215 ATAAAGCCGTTGTCATGTATACAGCAGCAAGAGGGCCACACCTGCTCGAGATTCACCCCACTGAGTGTgactcatgcatgcaattgtccattggtattgtccattggtcatccttatcttacaacttgagcacattaattttacaaccagatacatttgacaaccctca a s mr.mrrefChr0 65034 47 + 130230 ctgaggaatttgaggaggttactggattcctggatggtataggctta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68949 47 + 636262 ctgaggaatttgaggaggttactggattcctggatggtataggctta s simRat_chr6.simRat.chr6 60703 47 + 647215 ctgatgaatttgacaaggttactggattcctggatggtataggctca a s mr.mrrefChr0 65081 32 + 130230 tttgggtgtacgataatgtcatctgcaaatcc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68997 32 + 636262 tttgggtgtacgataatgtcatctgcaaatcc s simRat_chr6.simRat.chr6 60750 32 + 647215 tttgggtgtacaatcctttcatctgcaaatcc a s mr.mrrefChr0 65113 20 + 130230 aaccttaatctcctcttcat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69029 20 + 636262 aaccttaatctcctcttcat s simRat_chr6.simRat.chr6 60785 20 + 647215 aagattaatctcctcttcat a s mr.mrrefChr0 65133 278 + 130230 gtcacgcatcttgcacctttcccctagcatattgTAACTTAAATTATACGACACCCTATCAGGATACCATACAATGTAGTGTTGTGGCTTGTTTGACATCCTATTTCAATGAGGTCATTCCTGTGTAAGAGAGAAATACTTGAAAGTGTCTGCATAGTTCCTCTAGAACATGCATTTCCCCTCAAGTTGGTACAGGTGCAGCTCAGAACTTGACACTTGGGATAACTGGTTTCTGGAAGGCTTCTACCAGGGTGGATCACAACCCAACAGTAAACGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69052 278 + 636262 gtcacgcatcttgcacctttcccctagcatattgTAACTTAAATTATATGACACCCTATCAGGATACCATACAATGTAGTGTTGTGGCTTGATTGACATCCTATTCCAGTGAGGTCACTTCTGTGTATGAGAGAAATACTTGAAAGTGTCTACATGGTCTCTCTAGGACATGCATTTCCCCCCAAGTTGGTCCAGGTGCAGCTCAGAACTTGACACTTGGGATAGCTAGTTTCTGGAAGGTTTCTACCAAGGTGGAACACGACCCAACAGTAAATGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 60805 276 + 647215 gacacacagcttgcaccttttccctagtatattgTAACTTGAATTATACGACACCCCATCAGGATACCACACAATGTAGTATTGTGGC-TGTTTGACCTCCTATTTCAATGAGGTCTTTCCTGTGTAAGAGAGAAATACTTGAAAGTGTCTGCATAGTTCCTCTAGAACA-GCATTTTCCCTCAAGTTGATACAGGAGCAGCTCAGAACTTGACACTTGCGATAACTGGTTTCTGGAAGGCTTCTACCAGGGTGGATCACAACTTAAAAGTAAACGTG a s mr.mrrefChr0 65411 78 + 130230 AAGAGACACAGAGTAGTTTGCATTTGCTCTGAGATGCACCTCCGTTAGCATGAAGAAGTTCAAGCATTCCAGGCATAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69334 78 + 636262 AAGAGACACATGGTAGTCCGCATTTGCTCTGACATGCACCTCCGTTAACGTGAAGAAGTTCAAGCATTGCAGGCATAT s simRat_chr6.simRat.chr6 61081 78 + 647215 AGGAGACACCGAGTAGTTTGGTTTTGCTCTGAGATGCACCTCTGTTAGCATGAAGAAGTTCACACATCCCAGGCACAT a s mr.mrrefChr0 65489 83 + 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AGAGTGGTGACACTGTCCCCATCCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAATTAAATGAAACACATTTTATGTCAGCGGACTCCAATTTAACTAAGGAGTATAAAAGTGACATTTCTCACACACTTGCCAATGCCCTGCTACAAATTTCCCTATGCAGGTACTCACACCAGTATACTTCTTCTTGCACCTGAAAACAGCTGGATGAATGTACACCCACCACAATAGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69576 243 + 636262 AGAGTGGTGACACTGTCTCCATCCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAATTAAATGAAACACATTTTATGTCAACGGACTCCAGTTTAACTATGGAGTATAAAAGTGACATTTCTCACAC-CTTGCCAATCCCCTGGTACAAAGTTCCCGATGCAGGTACTCACACCAGTATACTTCTTCTTGCACCTGAAAACAGCTGGATGCATGTACACCTACCACAATCGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 61349 229 + 647215 AGAGTGGT---TCTGTCCCCAACCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAT--AAATGCAACACGTCTTATGTCAGCTGACTCCAATTTAACTAAGGA----------GATGTTTTTCACACACTTGCCAATGCCCTGCTACAAATTTCCCTATGCAGGTACTCACACCAGTAGACTTCTTGTTGCGACTAAAAATGGCTAGATGAAACTATACCCACCACAATAGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG a s mr.mrrefChr0 65898 143 + 130230 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mr.mrrefChr0 67601 174 + 130230 CTTGCCACATCCTTATACAATGTGTGGTTATGTGCACATGTGCCATGGTAATGACATCAATATAGTTGCCCAGTTTTGTTGCAGCCCAATAGGTACATAACTAGAGAATCACTTGGACGTGGAGGATCACCTGGGAATATAAGACTAAGGCACTCAGATTTATAGGATGGCTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71626 174 + 636262 CCTGCCACATCCTTATACAATGTGTGGTTATGTGCACATGTGCCATGGTAATGACATCAATATAGCTGCCCAGTTTTGTGGCAGCCCAATAGGTACATAACTGGAGAATCACTTGGACGTGGAGGATCACCTGGGAATATAAGACTAAGGCACTCAGATTTATAGGATGGCTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 63267 174 + 647215 CTTGCCACATCCTTATACAATAAGTACTTATGTGCACATGAGCCATGGTAATGTCATCATCATAGTTGCCCAGTTTTGTTGCAGCCCATTAGGTACATAAGTAGAGAATCCCCTGGGAGTGGAGACTTACCTGGGAATCTAAGACTAAGGCACTCAAATTTATACGATGGCTTT a s mr.mrrefChr0 67775 745 + 130230 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simRat_chr6.simRat.chr6 64431 28 + 647215 GTATACTAATCAAAATATCCCAACATAG a s mr.mrrefChr0 68800 209 + 130230 CATCAAATGCAATGTCTATTGTCCACTCCTAATTTCTTCTTACTGCAATGAACATGTACAGCTTTCTGACTGAATGGATCCCTACATGTTACAGTGACCACATTTGACTGTATTGTAAGTTGTCAAACATATACCACTCAGAGAACGGGTTAATTAACCTCATATTAATTTTTATCACCTATCCTTGTCAACTGAGGCTAATAATCGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 72840 209 + 636262 TCTCAAATGCAACGGCTATTGTCCACTCCCAATTTCTTCTTACTGCGATGAACATGTACAGCCTTCTGACTGAATGGACCCCTACATGTTACAGTGACCACATTCGACTGTATTGTAAGTCATCAAACATATACCACTCAGAGAACGGGTTAATTAACCTCATATTAATTTTTATCACCTATCCTTGTCAACTGAGGCTAATAATCGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 64459 209 + 647215 CATAAAATGCAATGTCTATTGTCCAGGCCTAATTTCTTTTTGCTGCAGTGAACATGTACAGCTTTCTGACTGGATGGATCCCTACATGTTATAACGACCACATTTCGTTGTACTGTAAGTTGTCAAACATATACTGCTCAGAGAATGTATTAATTAACCTCATAGTAATTTTTATCACTCGTCGATGTCAACTGAGACTAATGAGCAGT a s mr.mrrefChr0 69009 35 + 130230 GACATACTGCAAGTCAGGATACCAACCTTAGATTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73049 35 + 636262 GACATACTGCAAGTCAGGATACCAACCTTAGATTC s simRat_chr6.simRat.chr6 64669 35 + 647215 GACACACTGCAACTCAGGATACCAACTGTAAATTC a s mr.mrrefChr0 69044 14 + 130230 AAGATTTATTAATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73089 11 + 636262 AAGATTTATTA--- s simRat_chr6.simRat.chr6 64704 14 + 647215 AAGATTTATTAATA a s mr.mrrefChr0 69058 30 + 130230 CAGATGCAGGTGCTACACATACTGAAGAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73100 13 + 636262 -----------------CATACTGAAGAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 64719 30 + 647215 CAGATGCAGGTGCTACACATCCGGAAGAAC a s mr.mrrefChr0 69088 477 + 130230 CCAGGACTTCCTTTACATATTTCATAGGAATGTGGAGTGAGTTGAATCAATCCTCCAAGCTGCATCCTGACTTACTTAAGAACTGGAAGCAAGTATAATATGTGTAGTCCTATCCAGGCATATATATGGTGAACTAACTGAGATCTGATATTAACCTGAAGTTGTTTTTACCAAACCATTTGTGCAACAGACTTTATAAGGTTTACTTGATTATTCAACATAGGGATACTTTCTTGTTTCTCTGCATGTAAGGAACCCAATACTGCTGACCAACTAGTCTTCCCTGACTGGTAATTTCATGATTGTATATTGGGAAGGGAAGACTAATCATTGCCCTATGTTTCTCTTAGGGGTTGCCTAACATCAAAATCCACCCATCTAAATACACCAGGTCTTTATCTACCTCAAATGAATTTATAAGCAAAGTACTGTGCTCAGGTAATTTCACCCCCCCTCATAGCATCCACTGAGCACAGG s 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 562491 44 - 636262 AATGAATCTTGCCATGATCGACATAAGCATTCTAAAGCATGGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 65529 44 + 647215 AATGAATCTTTCCATAATTGACACAACCATCTTAAAGAATGGTA a s mr.mrrefChr0 69908 96 + 130230 CAATAAATATTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATATCTAGTGGTTGTGATAACAGTCCAGGGGGAGGCACCCATCTACTTTATCTAACATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562535 96 - 636262 CAATAAATGTTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATACCTAGTGGTTGTGATAACAGTCCAGGGGGAGGCATCCATCTACTTTATCTAACATT s simRat_chr6.simRat.chr6 65581 96 + 647215 TAATAAATATTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATATCTAGTGGTTGTGAGGACACTCAAGGGAGATGCACCCATCTACTTTATCTAGCATT a s mr.mrrefChr0 70004 23 + 130230 TATTTGGTAAGACTCCAGGCTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74007 10 + 636262 T-TTGGGTA----AC-------- s simRat_chr6.simRat.chr6 65677 23 + 647215 TATTTGGTAAGACTCCAGGCTTA a s mr.mrrefChr0 70027 308 + 130230 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 74873 2 + 636262 TG----- s simRat_chr6.simRat.chr6 66338 7 + 647215 TGAAACA a s mr.mrrefChr0 70674 21 + 130230 GATGAGCTCATGCAAGTTGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74875 20 + 636262 -ATAGGCCCCTGCAAGTTGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 66359 21 + 647215 GATGAGCTCAGGCAAGTTGTT a s mr.mrrefChr0 70695 279 + 130230 CAATGCAAAGTAGGATTCTTATTTCTCCTATTGCCAGCAGCCTCCCAGGTGTCTGGCCTAGTTAGGGATATTTATGGGGATGGGTTCACCTGAAAATTTGTAGCCCAAGCACTGCATACACCTCCTTCTAGACCCATAAACTCACCATTAACCCTACCCCCCAAATTGGTTCAGTTGCTCAACCGAACTCAGCTGAACTACAAAAGGTTAAAGCTGATTGAATGATGATAACCTGTGGGTGAGTCCTTTCTTGTTATTCCTCTCTATTTTGATTACAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74895 279 + 636262 CAATGCAAAGTAGGATTCTTACTTCTCCTATTGCCAGCAGCCACCCAGGCGTGTGGCCTAGTTAGGGATACTTTTGGGGATGGGTTCACCTGAAAATTTGTAGCCCAAGCTTTGCATACACCCCCTTCTAGACCCATAAACTCGCCATTACCCCTACCCCCCAAGTTGGTTTGGTTGCTCAACCAAACCCAGCTGAACTACAAAAGGCTAAAGCTGCTTGAATGATGATGACCTGTGGGTGAGTCCTTTCATGTTATTCCTCTCTATTTTGATTACAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 66400 279 + 647215 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TATCAAGACATGGATCAAAGGGGACGAGTGTCCCTTACAGGGCTGTATGAGGCTCTCTTACTCTGGAGAGAATCCCCTCATTATCTGACCAAAATTGGGACATTTGGCTATATTGAGGGACACAATAATCTTGGTTGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 67460 138 + 647215 TATTAAGACACGGATCAAAGGGGATGGGTGTCCCTTACACAGATGTATTAAGCTGTTTTACTCTGGAG-GAATCCCCTCATTATCTGGCCAAAATTGGTACATGTGGCTATATTGTGGCACACAATAATCTTGGTTGAT a s mr.mrrefChr0 71615 43 + 130230 GGGCTTATATACATCAATTATGGAATGATTGTGCTGCTGATGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75828 43 + 636262 GGGCTTAAATACATCAATTATGGAATGATTGTACTGCTGATGT s simRat_chr6.simRat.chr6 67761 43 + 647215 GGGCTTATATACATCAATTATGGAATGATTGTGTTGCTGATGT a s mr.mrrefChr0 71658 72 + 130230 TGAGTTTCCCTACAATTAGGGAGCAGGATTACTGAAATGTAGCAGTGCATAAGGCCAACAATTCACAGAAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75878 72 + 636262 TGAGTTTCCCTACAATTAGGGAGCAGGATTACTGAAATGTAACAGTGCATAAAGCCAACAATTCACAGAAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 67804 72 + 647215 GGAGTTTCCCCACAATTAGGAAGCAGGACTACTGAAATGTAGCAGTGTATAAGGTCAACAATCCCCAGAGAG a s mr.mrrefChr0 71730 116 + 130230 AAAATCCTGTCTCCTAGAACAACAGTAACATTGAGCGTTGCAAATCAAGACAGATGTAAATCAACTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGAAGAACCACAAAGATCCAAGAGAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75950 116 + 636262 AAAATCCTGTCTCCTAGAACAACAGTAATATTGACCGTTGCAAATAGAGATAGATGTAAATCTTCTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGAAGAACCACAAAGATCCAAGAGAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 67884 116 + 647215 AAAATCCTGTCCCCTAGAACATCAGTAACATTGAGCATTGCAAAGCAAGACAGATGTAAATCAACTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGATGAACCATAAAGATCAAAGAGGCT a s mr.mrrefChr0 71846 162 + 130230 TTCCCATACTGCCAAAATTATTGATTCCCTTCCTGGTCTCCTGGCAGGGGAGGGATTGAATCTTGCACTGAACAGTTTACAGACCTTTACACTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGAGAAAAGATGAAAGATGGATAGCACAACCGAGTTCTCCTGATAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76066 161 + 636262 TTCCCATACTGCCAAAATTATTTATTCCCCTCCTGGTCCCCTGGCAGGGGAGGGATTGA-TCTTGCACTGAACAGTCTGCAGACCTTTACTCTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGAGAAAAGATGAAAGATGGATTGCACAACCGAATTCTCCTGATACC s simRat_chr6.simRat.chr6 68001 162 + 647215 TTACTATACTGCCAAAATTAATGATTCCCTTCCTGGTCTTCTGGCAGGGGAGGGGTTGAATCTTGCACTCAACTGTTGATGGACCTTTACACTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGTGAAAAGATGAAAGATGAATAGCACAACCGAGTTCTCCTGATAGC a s mr.mrrefChr0 72008 17 + 130230 TGGCATATCTAGGGGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76227 17 + 636262 TGGCATATCTAGGGGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 68172 17 + 647215 TGCAAACTGCAGGGTGG a s mr.mrrefChr0 72025 4 + 130230 TATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76244 4 + 636262 CTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 68249 4 + 647215 TACA a s mr.mrrefChr0 72029 15 + 130230 GCTCTAATCCAAAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76248 15 + 636262 GGTCCAATCCTAAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 68257 15 + 647215 GCGATAATTCAAAAA a s mr.mrrefChr0 72044 7 + 130230 GGCAGCC s simRat_chr6.simRat.chr6 68286 7 + 647215 GGCAGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 184505 7 + 647215 GGCTACC a s mr.mrrefChr0 72051 174 + 130230 TGACATGAGGAACCAATGACTACTTCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAAACACCATGGACCCAGGAAGATTTTGGCCACTATGAACCCATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76263 174 + 636262 TGACATGAGGAACCAATGACTACTTCTGAGAGACTGTTAAATGCAGCTGGTCAGTTTGACAGCCACACTATTTAATGGGCACACCCTAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTTAAACTTTAGGGAGATGTCAAACACCATGAACCCTGGAGGATTTTAGTCACTATGAACCCATA s simRat_chr6.simRat.chr6 68334 172 + 647215 TGACATGAGGAATTGATGAC--CTTCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTTCTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAAACACGATGGACCCAGGAAGATTTTGGCCACTATGAACCCATA s simRat_chr6.simRat.chr6 184512 155 + 647215 -----------------TGC--GTCCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAGACACTATGGGCCCAGGAAGATTTTGACCACTACGAACCCATA a s mr.mrrefChr0 72225 59 + 130230 GGTAGGCACCCTATCAGTCTAGGAGGCAAGTCCTTCTGCCCTTTGCAGTTGTGCTTATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76437 59 + 636262 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gcattctttaagtagactgactatagacagaatgcagtggtgt s simRat_chr6.simRat.chr6 69975 43 + 647215 gtattctttaagtagactgattatagacaagatgcagtgatgt a s mr.mrrefChr0 73481 31 + 130230 aacttcacaaacacaaTGTCCCCTCCAAGTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77675 31 + 636262 aacttcacaaacacaaTGTCCCCTCCAAGTC s simRat_chr6.simRat.chr6 70024 31 + 647215 aacttcacaaacacgaTGTCCCCTCCAAGTC a s mr.mrrefChr0 73512 19 + 130230 TGGAAAGTTGCTTGAATCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77751 19 + 636262 TGGAAAGTTGCTTGAATCA s simRat_chr6.simRat.chr6 70055 19 + 647215 TGGAAAGTTAGTTGAATCA a s mr.mrrefChr0 73531 108 + 130230 CCTGCTTGGTTCTCAAATAGTACTGTAAGGTTGCCTGCTATTATTCGGTCTTACAATGCTGTGGAATTGTTACCCTACTGGGGATTGCTTTTTTAGATTCTATTGCTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77770 108 + 636262 CCTGCTTGGTTCTCAAATAGTACTGTAAGGTTGCCTGCTATTATTCGGTCTTACAATGCTGTGGAATTGTTACCCTACTGGGGATTGCTTTTTTAGATTCTATTGCTA s simRat_chr6.simRat.chr6 70075 108 + 647215 CCAGTATGATTCTAAAACAGTAATGTAAGGGTGCCTTCTACTATTTTGTTCTACAATGCTATGGAATTGCTACCCTAGTGGGGATTGCTTTTTTAAGTTCTCAGGCTA a 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s mr.mrrefChr0 73799 20 + 130230 TCTATGCACTATCAGCAATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78045 20 + 636262 TCTATGCACTATCAGCAATC s simRat_chr6.simRat.chr6 70391 20 + 647215 TCTACCCAATGACAGTAAGC a s mr.mrrefChr0 73819 135 + 130230 CATCTACCCAATGATAATAAATAAGCTGCAACAGGCAGGAAGGTGGCCTGTCCAAATAACAAATAAGCCTTCACACAATCCATCATGCTCAGCTCCAATATAAGGCAGATGTGGCCATGTACATGTGGTAGGTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78065 135 + 636262 CATCTACCCAATGATAATAAATAAGCTGCAACAGGCAGGAAGGTGGCCTGTCCAAATAACAAATAAGCCTTCACACAATCCATCATGCTCAGCTCCAATATAAGGCAGATGTGGCCATGTACATGTGGTAGGTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 70415 135 + 647215 CATCTACCCAATGACAATAAATAAACTGCAACAGGCCGGAAGGTGGCCTGTCTAAATAACAAGCAAGCTTTCACACAATGCATCATGCCAAGCTCCATTACAAGGCAAACATGGTCATGTACATGTGGTAAGTAC a s mr.mrrefChr0 73954 62 + 130230 TCGGCTCTGAGCTCCTCAGGTGGCCAATCACCATCTAGCTTCAGTGCAAATTCTAGTTGAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78201 62 + 636262 TCGGCTCTGAGCTCCTCAGGTGGCCAATCACCATCTAGCTTCAGTGCAAATTCTAGTTGAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 70550 62 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 73653 3 + 647215 ACT a s mr.mrrefChr0 77052 56 + 130230 CTAACCATGTTCCTTAACCTAACCTGGAACAGTTGAATTTTACTTATAGTGGACTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81383 56 + 636262 CTAACCATGTTCCTTAACCTAACCTGGAACAGTTGAATTTTACTTATAGTGGACTA s simRat_chr6.simRat.chr6 73656 56 + 647215 CTAACCATGTTGTTCAACTTAACCTGGGACCGTTGAATTGTATGCATAATGCACTG a s mr.mrrefChr0 77108 73 + 130230 TAATCGTTGAACGGGTTACTATGAGGTGCTCTTTCTTCCTCTTGAGTATTATGTGGTCCATATCCAACTGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81444 73 + 636262 TAATCGTTGAACGGGTTACTATGAGGTGCTCTTTCTTCCTCTTGAGTATTATGTGGTCCATATCCAACTGCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 73712 73 + 647215 TAATCATTGATCAGATTACTCCAAAGCGCTCCCTCTTCCTGTTGATTAAAATGTGGACCATATCGAATTGCTT a s mr.mrrefChr0 77181 146 + 130230 CTGTAGTCAAGAGCGGATTATGAATTTGTGGGGCCAGCCACACTCCCCTAAAATAAACTCTTATCTACTATAGACTTGTGCACCTATTAAGACTTGTGCCATTATTATTTACCATTTAAGGATGTTATAACCTAAGCGCTGTGGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81605 143 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 82054 110 + 636262 ACAATCCTCCCATACAATCTGTTGAATTTCCACTAGCATTAGTGGTGACTTTAAGGCTGCTGAGTTTAATACCTAACGTTAATTTTAGAAGCGTTTTAATTACAGTAACT s simRat_chr6.simRat.chr6 74214 110 + 647215 ATACTCCTCCCATACAATCTGTTGAATTTTCACTTACATTAGTACTGACTCTAAGGCCACTGAGTTTAATACCTCAAGTTAATTTTAGAGGCATTTTAATTATAGTAACT a s mr.mrrefChr0 77717 158 + 130230 AGCTACAGAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCTGACACAATTTTGATAATTGTAAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATAGATGGCAATGGTGGGGTATAACCATGTCTTGTTAATATGGGTTTGTCCAGCCCATTAAGTATAGTCAATGTAAGGGGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82164 158 + 636262 AACTATAGAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCTGATACAATTTTGATAATTGTCAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATAGATGGCAATGTTGGGGTATAACCATGTCTTGTTAATATGGGTTTGTCAAGCCCATTAAGTATAGTCAATGTAAGGGGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 74387 158 + 647215 AGCTACAAAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCGGACTCAATTCTGAGAATCGTAAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATATATGACAATGGTGGGGTATAACCATGTCTTGATAATATAGGTTTGTCCAGCCTGTCAAGTATAGTCAATGTAAGGGGGC a s mr.mrrefChr0 77875 301 + 130230 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a s mr.mrrefChr0 78176 177 + 130230 TCCTGCTTTCATACACCCTACTAAATGTCATTACAGCATAAGGTTATGTTGTTGATATTACTCCCTTTCCACTGCACATTTTTAATTCTCAGTTTaTTGACTGACTCCCTAATGACtacACATGcttcaataatatactgctcaagaacTATCACATCCTAGTGACTGAACCCAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82622 176 + 636262 TCCTGATTTCATACACCCTATTGAATGTCATTACTGTATAAGGTTATGTTGTTGATACTACTCCCTTTCCACTGCACATTTTTAATTCTCAGTTT-TCAACTGACTCCCTAATGACTACACATGCTTCAATAATATACTGCTCAAGAACTATCACATCCTAGTGATTGAACCCAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 74844 149 + 647215 TCCTGCTTCCATACACCCTACTAAGTGTCATTACAGCATGAGGCTATGCTGTTGAGATTACTCCCTTCCCACTGCGCATTTTTAATTCTCTGTTTATTGACTGACTCCCTAATGAC---ACATG-------------------------TATCACATCTTAGTGACTGAACCCAATG a s mr.mrrefChr0 78353 130 + 130230 GGGGAAAGGAAAGTAAATCGCAGAGTTAACATCTCCAGACCATTTTTCTATAGATCATCACCTATGCAAGTGGAGGCTGGGTCTACTTGGTTAGATCCCAACTGACATCAGTTGGCATACCCAGCACGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82798 126 + 636262 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tgaatgatcacttcaactatgtggttaacaaaggtgcacatcaggatctccaaacccattaaggtgtcagcaaataattatg a s mr.mrrefChr0 81994 37 + 130230 atgcaagcacaacttgaatggtcacagcttcaaaact s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86879 37 + 636262 atgcaagcacaacttgaatggtcacagcttcaaaact s simRat_chr6.simRat.chr6 78893 37 + 647215 atgtaattacaatttgaatggtctcagcttgaaaact a s mr.mrrefChr0 82031 21 + 130230 ccatacacaaagtatgtcttg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86918 21 + 636262 ccatacacaaagtatgtcttg s simRat_chr6.simRat.chr6 78930 21 + 647215 ccatacacaaagtatgtcttg a s mr.mrrefChr0 82052 67 + 130230 ttggtcctagcttctggactaggactcttatgttctgagaacttggcgaatagcaaatagttctaga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86939 67 + 636262 ttggtcctagcttctggactaggactcttatgttctgagaacttggcgaatagcaaatagttctaga s simRat_chr6.simRat.chr6 78952 67 + 647215 ttggtcatagtttcaggagtaggactcttatgttctgagtactgggggaatagcaaatagttctaga a s mr.mrrefChr0 82119 19 + 130230 cggtcgggtacctgagcac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87006 19 + 636262 cggtcgggtacctgagcac s simRat_chr6.simRat.chr6 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 548981 37 - 636262 TTACCAGCCTGATCATAAGGAAATATTAACACCGGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 79571 37 + 647215 TTACCAGCCTGAACATAAGGAAACATTAACACAGGTT a s mr.mrrefChr0 82703 2 + 130230 CA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549018 2 - 636262 CA s simRat_chr6.simRat.chr6 79609 2 + 647215 CA a s mr.mrrefChr0 82705 28 + 130230 TAGTGCCAGCCTTCATATGGCTTTAACC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87633 28 + 636262 TAGTGCCAGCCTTCATATGGCTTTAACC s simRat_chr6.simRat.chr6 79622 28 + 647215 TCACGATGGCCTTCATCTGGCTGTAACC a s mr.mrrefChr0 82733 33 + 130230 GGAGCATCCAAGAGTCAAAAAGTAAAACTGTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87668 33 + 636262 GGGGCATCCAAGAGTCAAAAAGTAATACTGTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 79650 33 + 647215 GAAGCATCCAAGAGTCAAAAAGTAGAACTGTAG a s mr.mrrefChr0 82766 11 + 130230 TACACAGGTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87705 11 + 636262 TCTGCAGGTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 79683 11 + 647215 TACACAACCAC a s mr.mrrefChr0 82777 68 + 130230 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---AATTATAGCAGCATCAAACAAATAAGCTTATGGATGTAAGCCTAAGCTGAAAGAGAATTGAAAATTACCTCTCACCAAAAAGGTGAAAGTACTTTGTCGGAACACAATATCAGACTTTGGCTAATTCCAGAGAAAATTGGAATATGAATATCAGCGTGAATAGTAGAAGGGGATTGAATGCACAGAGGGTATAGGGCTCCACTGGGGTCAGACAAACACCAAGCTGACTTGTAGCTTAGGACAGTTGTAGCCTCAAAAGACAAATTGTCATGTATCTGATACACTGGACCTGTCTTCATGGTCCCTGTCCTCATGAAGCAAATCTCAATACGGCAATTAATCCTGAGAAGCACAGTATTAATAAGCAAAGCATTACTTGGCAAG a s mr.mrrefChr0 83692 39 + 130230 TGATAGTTAACACATTGTCTGAGCCTTCTGGTTGGCAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88435 39 + 636262 TGATAGTTAACACATTGTCTGAGCCTTCTGGTTGGCAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 80613 39 + 647215 TGATAGTTAACACATTGTCTGAGCCCTCTAGTTGTCAGA a s mr.mrrefChr0 83731 44 + 130230 CCAGACAATTCACCTTTTAGTGGTTGCATAATGCAAACCATCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88476 44 + 636262 CTAGACAAGTCACCTTTTAGTGGTTGCATAATGCAAACCATCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 80652 44 + 647215 CCAGACAATTGACCTTTTAGTGGTTGCATAATGCAAACTATCAA a s mr.mrrefChr0 83775 22 + 130230 CTCCATCATTTACTATTGGAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88520 22 + 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ATGAAATCCCAACCTATGGGATGCAGACCAGGCAGAATGGTAACAACAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 80836 50 + 647215 ATGAAATCTCAACCAATGGGGTGCAGATCTGGCAGATAGGTAACAACATA a s mr.mrrefChr0 83963 59 + 130230 CCACTCACTTTAATAACACAAAAAAGCAATTGAATCACTGTGTCCTCTACTGAATTCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88713 59 + 636262 CTACTCACTTTAATAACACAAAAAAGCAATTGAATCACTGTGACCTCTACTGTATTCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 80886 59 + 647215 CCCCTTATTTTAATAACACAGAAAAACAATCAAATCACTGTGTCCTCTACTGACTTCGC a s mr.mrrefChr0 84022 18 + 130230 AATGGTATCCCACCATGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88780 18 + 636262 AATGGTATCTCACCATGG s simRat_chr6.simRat.chr6 80945 13 + 647215 AATGGTATCCCAC----- a s mr.mrrefChr0 84040 50 + 130230 TCAAATTACCATCATGAGTTCATTAATGGAGGGATAGGGAATTTAACAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88800 44 + 636262 TCAAATTA------TGAGTTCATTAATGGAAGGACAGGGAACTTAACAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 80958 50 + 647215 TCAAATTACCATCATGAGGTCATTAATGGAGGAATAGAGAATTTAAGAAG a s mr.mrrefChr0 84090 230 + 130230 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AAATAGACAGAAGGAATATTATAATATATTTTGCTTAAGGTACCAATGCAGAGGTCCCTGTCCCCACACTATAGACTTTTTGCTGCTGCCAAACCACATCCTGGTGGGTGATAATAGCCCATCAAGACATTAGTAGCATGGTGTGTTTCTGTAAGTTCTCCCATACTAAAACATAACTGCTAGTTGCCAGTGATGTGTCATACAATGCTCCTGTGGCACATGCTTGCGGCTAGAGCCATGCCTAACTCCCAATGAAAGCCCTTAGGTGGGCAAAATTGTCATCACAATATTTAAAAAGCCATCTTCCTTGCCTCAACAGTGATGAGCTAAAAACTTTAAGAATAAGTAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89081 340 + 636262 AAATAGATAGAAGGAATATTATAATATATTCTGCTTAAGGTACCAATGCAGAGGTTTCTGTCCCCACACTATAGACTTTTTGCTTCTGCCAAACCAC-TCCTG-TGGGTGATAGTAGCCCATCAAGACATTAGTAGCATGGTGTGTTCTTATAAGTTCTCCCATACTAAA--------GTTAGTTGCCAGTGATGTGTCATGTAATGCTCCTGTGGCACATGCTTCCGGCTAGAGCCATGCCTAATTCCCAATGAGAGCCCTTAGGTGTGCGAAATTGTCATCACAATATTTAAAAAGCCATCTTCCTTGCCTCAACAGTGATGAGCTAAAAACTTTGAGAATAAGTAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 81388 348 + 647215 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a s mr.mrrefChr0 85045 60 + 130230 AATCTTTTAGAGACCCCCCAAGATGCATTCTGTGAACGTCAAGATTTGGTGCTTTATCTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89788 60 + 636262 AATCTTTTAGAGACCCCCCAAGATGCATTCTGTGAACGTCAAGATTTGGTGCTTTATCTA s simRat_chr6.simRat.chr6 82118 60 + 647215 AATCTTTTAAAGACCCCCCAAGATGCATTTTGTGAACATTGAGATTTGGTACTTTATCTA a s mr.mrrefChr0 85105 20 + 130230 ACCCAGAGCTGTGACCCCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89849 20 + 636262 ACCCAGAGCTGTGACCCCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 82178 20 + 647215 ACATAAAGTTCTGAGGCTGT a s mr.mrrefChr0 85125 59 + 130230 CAATCAGCCATTGGTCTGAGGCACCTGGGGTTACGCTCTCATTAAGTAAACTATGAAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89869 59 + 636262 CAATCAGCCATTGGTCTGAGGCACCTGGGGTTACGCTCTCATTAAGTAAACTATGAAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 82200 59 + 647215 CAATCAACCATTGGTGTGGGGGACCTGAGGTCACACTCCCATTAAGCAAACTATAAAAG a s mr.mrrefChr0 85184 17 + 130230 TATAGGAGTCCACTGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89928 17 + 636262 TATAGGAGTCCACTGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 82260 17 + 647215 TATAGGAGTCCACTCAA a s 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simRat_chr6.simRat.chr6 103548 42 + 647215 aagaggggactagtcccccggtttcagaaggaacccacaaag a s mr.mrrefChr0 106110 68 + 130230 tccaaaaagaatgccaatgcactaatcagaagatggactagaaacattaacagtctgtcagtgtttgg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111312 68 + 636262 tccaaaaagaatgccaatgcactaatcagaagatggactagaaacattaacagtctgtcagtgtttgg s simRat_chr6.simRat.chr6 103590 68 + 647215 tccaaaaagagaaccaatgccacaatcagaagatggactagagacattaatagtcggtcagtgttttg a s mr.mrrefChr0 106178 50 + 130230 attgccagaggaagtgtgcttcttccccatcagctcattggatgggcaag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111387 50 + 636262 attgccagaggaagtgtgcttcttccccatcAGCTCATTGGATGGGCAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 103658 50 + 647215 agtgccagaggaagtctgcttcttcctcatcagcccattgcacagccaag a s mr.mrrefChr0 106228 77 + 130230 caccaggggaagtaagacttttcctgaggcctatcgtgcaggtattggtggtaggacaacactatgttgtgtcaggc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111438 77 + 636262 caccaggggaagtaagacttttcctgaggcctatcgtgcaggtattggtggtaggacaacactatgttgtgtcaggc s simRat_chr6.simRat.chr6 103708 77 + 647215 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s mr.mrrefChr0 107788 174 + 130230 AAATTGAAGCACCTGTAGTAAGACTATAGTGGCTGGTTGACCAGTAAACCATTGTGGGTCTCCCTCTAGGAGGGGAATTGGGGCATACATGGTTGCCAAGGAAAGGGGCAGAGCAGGGTGAAGGGGCAGAGCAGAGTATAGTTGGGCAGGTAAACAAATAGTCCCACACATGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113064 174 + 636262 AAATTGAAGCAACTGTAGTAAGACTATAGTGGCTGGATAAGCAGCAAACCATTGTGGGTCTCCCTCTAGGAGGGGAATTGGGGCACACATGGTTGCCAAGGAAAGGGGCAGAGCAGGGTGAAGGGGCAGAGCAGAGTATAGTTGGGCAGGTAAACAAATAGTCCCACACATGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 105367 174 + 647215 AAATTGAAGCACCTGCAGCAAGAATATAGGGGCTGGTGGACCAGTACACCAATGTGGGTCTCCCTCTAGGGGGGGAATTGGGGCATACATGGTTGCCATGGAAAGGGGCAGAGCAGGGGAAAGGGGCACAGCAAGGTATAGTTGGGCAGGTAAACAAATAGTCCCACACATGTG a s mr.mrrefChr0 107962 34 + 130230 TCTAAACTGTGGTGAGGGTAGTACAGAGCCGGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113238 33 + 636262 TCTAAACTGTGGTGAGGGAAGTACAGA-CCTCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 105543 34 + 647215 TCTAACCTGTGGTGAGGGTAGTACAGAGCAGGGT a s mr.mrrefChr0 107996 158 + 130230 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 119537 9 + 636262 ACA-GAACAC s simRat_chr6.simRat.chr6 112328 10 + 647215 ACATGAACAC a s mr.mrrefChr0 114183 8 + 130230 AGCTATCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119547 8 + 636262 AGCCATCA s simRat_chr6.simRat.chr6 112338 8 + 647215 AGCTGTCA a s mr.mrrefChr0 114191 174 + 130230 GGTGCTTTAATTCATTTAGAACCCCTAATCTATAAATGCAGCGATTGCAATGTATGTATAAATTAACTAGGTCCTGGCCACATGGGTATTGATCTTTGAAGACATCTGTTTGTATCTTGAAGAAATGATTTTGTGGCTGAGTATTAGTGTGCACGAGCAAATAGTGGGTTCAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119638 172 + 636262 AGTGCTTTAATTCATTTAGTACCCCTAATCTATAGATGT-GCGATTGCAATGTATGTATAAATTAGCTAGGTCCTGGACCCATGGGTATTGATCTTTGAAGATGTCTGTTTGTATTTT-AAGAAATGATTTGGTGGCTGAGTATGAGTGCGCATGGGCAAATAGTGTGTTCAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 112346 170 + 647215 GGTGCTTTAATTCATTTAGAATGTCTAATCCATAAATGCAGAGGTTGCAATGTATATATAAATTAACTAGG----GGCCACATGGGTATTGATCTTTGAAGACATCTATTTGTATCTTGAAGTAGTGATCTTGTGGCTGAGTACTAGTGTGCACGAGCAAATAGTGGGTACAAC a s mr.mrrefChr0 114365 56 + 130230 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 123547 20 + 636262 ATCAGACTATGATCTTAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 116039 20 + 647215 ACCAAACAATGATTTTAATT a s mr.mrrefChr0 118097 23 + 130230 AATGCAACATCAAAAATACAATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123567 23 + 636262 AATGCAACATCAAAAATACAATT s simRat_chr6.simRat.chr6 116060 23 + 647215 AATGCAACATCAAATATACAATT a s mr.mrrefChr0 118120 123 + 130230 CATCAAAAGACATATATATTGATGTTTCAACCTCCCATAAGCTCATATGTGTTCATACTGGATTCAAGAACATGACAAGACAGATTTTTATGCAGTTTTCAAAGGTGATTAATCCAATTCTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123592 123 + 636262 CATCAAAAGACATATATTTTGATGTCTTAACCTCCCATAAGCTCATAAGTGTTCCTACTGGATTTAAGGACATGACAAGACAGATTTTTATGCAGTTTTCAAAGGTGATTAATCCAATTTTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 116083 123 + 647215 CACCAAAAAACATATATATTGATGTTTCAACCTCCCATAAGCTCATATGTGTTTATACTGGATTCAAGAACATGACATGACAGGTTTTTATGTAGTTTTCAAAGGTGATTGACCCAATTCTCT a s mr.mrrefChr0 118243 161 + 130230 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simRat_chr6.simRat.chr6 119121 411 + 647215 GTCCGAGACCACGGTAAGGCCAGGCCTATGGACCAAGGAACATTGATCTAAATTGGACTATGAGCACAAGTCAAGCTTTTTTGGGTTAAGGTCACCCTTAAAGGATTGTATGCATTAATATCCAGAGGCCAATGGCAGTGTACGGATTAAAATCAGGATGGTTTGTAATTTTATTGCACTAACATGCAGAGGCCAATGGCAGTATTTTGGCTTATATCCAGATGATTCGCTTAGAGAGTTATCAGTTACAGGCCATTATTTGGATGGCCTGTGTAGTGAGAGAGCCACTTGATAACTGAATTATGCAGTTAGAATAGCACCAACCTCGAGTAAATTTGGAGGCTAGCCAAACCCCCCCCACCCCTGACTCAACCTCAGGTATAATCATACCAATACCAGCCATATTAGACT a s mr.mrrefChr0 119499 20 + 130230 GTGGAGGAAAGCAGGGGCCG s simRat_chr6.simRat.chr6 119101 20 + 647215 GTGCAAGAAAACAGGGGCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 119538 20 + 647215 GTGGAGAGAGGCACGAGCCG a s mr.mrrefChr0 119519 55 + 130230 CAGGAATCATGGACCAGGGGGTGTAACTTGTTCTGCAGATAAAAGAACAATCATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124580 55 + 636262 CAGGAATCATGGACCAGAGGGTGTAGCTTGTTCTGCAGATAAAGGAACAATCATG s simRat_chr6.simRat.chr6 123093 55 + 647215 caggaatcattgaCCAGGGAGAGTTACTTGTTTTGCAGATGAAAGAACAATATTG a s mr.mrrefChr0 119574 20 + 130230 AGTGGAGGAATTAACAGAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124636 20 + 636262 AGTGGAGGAATTAACAGAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 123148 20 + 647215 GGCGGAGGAATGAACAGAAT a s mr.mrrefChr0 119594 250 + 130230 AAACAAGCCCCAAAATAACACCTGAGCAGCTATTGTGAGACCTATGTCAGATTGTGACTGATGCAATGTTTGATCAGCAGAACAATAGCAGGGAGCCGAGAAGTGTATGAATGTATGGTGATGAGCCCGAAGTGTTCTGGGTTTTCAGTATAGCACCATTGCCCTGCTCAAGAGGGTTCAGTATTGTTGCCCAATGTTGCGATGTGATCCTCTTAGAAGGAAATGCAAATAGCTGGTAGACATCAGCAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124663 250 + 636262 AAACAAGACCCAAAATAACACCTAAGCAGCTATTGTGAGACCCATGTCAGATTTTGACTGATGCAATGTTTGATCAGCAGAACAATAGCAGGGAGCTGAGAAGTGTATGAATGCAGGGTGATGAGCCCGAATTGTTCTGGGTTTTCAGTATAGCACCATTGCCCTGCTCAAGAGGGTTTAGTATTGTTGCCCAATGTTGTGGTGTGATCCTCTTAGAAGGAAAAGCAAATAGCCGGTAGACATTATCAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 123168 245 + 647215 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AATATGTAGTGGCATTGCCTGCAAGTAGGTGCAAATTAATACCTTCTTCAGTGCACCAGCTGTATAGGAGGACCTCACACACTTGCAGACTCGCACTAGAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126703 102 + 636262 AATATGTAGTGGCATTGCCTGCAAGTAGGTGCAAATTAATACCTTCTCCAGTGCACCAGCTGTATAGAAGGACCTCACACACTTGCAGACTTGCACTAGAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 125141 87 + 647215 AATATGTAGTGACATTGCCTGCCTGCA-----------ATACCTTCTTCAGTGTACCAGCTGCATAGGAGGACCTCACATAC----AGATGCTTACTAGAAC a s mr.mrrefChr0 121702 46 + 130230 AATTTATTTGTGATATCCCATAGCAGATGTACCAGAGGATGCACAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126809 46 + 636262 AATTTATTTGTGATATCCCATAGCAGATGTACCAGAGGATGCACAA s simRat_chr6.simRat.chr6 125228 46 + 647215 AATTATTTTGCAATATCCCGTAGCAGATGTACCAGGGGATCCCCAA a s mr.mrrefChr0 121748 321 + 130230 GACCACTTTGAGTTACAATCTAACACTAATGCTGAGAAAATAAAATAAGCACAGCTCCAAATCACCACAGTTGATTGATACAAGCAAAACTAACACTGCTCTGTGTCTTCTGGTACTCATCAGAAACACCATAAGTTGTATTAACATCCATTCTGGGGCCAAGCCATGAGGGATCACTTATGGGATTCAAGGCTTTGGAGAGAGGTAACTTCATTACCTCCTCTAGAATAGCCATGACCATTCAGTGTTCTTATGTCCAAACTACACTTACTGTATCTCATAACACAAACTGGATGAATCAATGATGTCATCCTGTGTATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126855 320 + 636262 GACAACTTTGAGTTATAATCTAACACTAATGCTGAGAAAATAAAATAAGCACAGCTTCAAATCACCACAGTTCATTGATACA-GCAATACTGACACTGCTCTGTGTCTTCTGGTACTCATCAGAAACACCATAAGTTGTATTAACATCCATTCTGGGGCCAAGCCATGAGGGATCACTTATGGCATTCAAGGCTTTGGAGACAGGTAACTTCATTACCTCCTCTAGAATAGCCATGACCATTCAGTGTTCTTATGTCCAAACTACACTTACTGTATCTCATAACACAAACTGGATGAATCAATGATGTCATCCTGTGTATA s simRat_chr6.simRat.chr6 125275 319 + 647215 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mr.mrrefChr0 123742 209 + 130230 GTTTACAATCCACTAACCCTCTCAGATCACTCAATGTGTTGAATCCGCTGGAATATTACATCAGAAGTGAATCCCCAGTATATAGGTATTTGTAAGTGTTGACATCTGAATGTTAATATTTCGAGATGCAAGGTGTCACATGAGGTTTCTCGCCAGTCCCAGGAGGTTAGGTTTCTCACCAACATCACATGATGAGGTGTATGAGGTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128841 209 + 636262 GTTTACAGTCCACTGACCCTCTCAGATCACTCAATGTGTTGAATCCGCTTGAATATTACATCAGAAGTGAATCCCCAGTATATAGTTATTTGTAAGTGTTGACATCTGAATGTTAATATTTCGAGATGCAAGGTGTCACATGAGGTTTCTCGCCAGTCACAGGAGGTTAGGTTTCTCACCAGCATCACATGATGAGGTGTATGAGGTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 127297 138 + 647215 GTTTACAATCCACTAACT---TCAGATCACTCCATGTGTTGAATCCACAGGAATATTACAGCAGAAGTGATTCCCCAGTATACAAGTGT---------------------------------------------------------------CCAGTCCCATGAAGTT-----TCTTGCCAACATCACGTGATGAGGTGCATGAGGTGT a s mr.mrrefChr0 123951 195 + 130230 CTTCATATAACATGGGTCCACAAAAGTTCTGTGTCCAGGGGCACTGGGGTCTTGCCTAAGCAATAGAGAATGTACAGTATCTTATGACTTATAATGTGAGGACTTGACTTTGGTACTGACTTTGACCTACTTATGTGGCTCTAGAAGTGCTGACAACTCTTATATGGTAGATGTTACTGAGATCACTATATAAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129056 194 + 636262 CTTCATATAACATGG-TCCACAAAAGTTCTGTTTCCAGGGGCACTGGTGTCTTGCCTAAGCAATAGAGAATGTACAGTATCTTATGACTTATAATGTGAGGACTTAACTTTGGTACTGATTTTGACCTACTTATGTGGCTCTAGAAGTGCTGACAACTCTTATATGGTAGATGTTACTGAGATCACTATATAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 127435 125 + 647215 CTTTACAAAACATGGGTTCACAAAAGTTCTGGGTCCAGGGGCACTGGGGTCTTGTCTAAGCAA----GAATGTACAGTATCTTATGACTTACAATGTGAGGACTTGAATTTGGTACTGACTTTGACCTA------------------------------------------------------------------ a s mr.mrrefChr0 124146 88 + 130230 TATTATGACAGTCCTTTGTGATTATAGGAAAACTTTAAAAACTCTTTGATCTATCATGCAGAACATGGTCTCAAGTCGATGAAATTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129262 88 + 636262 TATTATGACAGTCCTTTGTGACTATAGGAAATCTTTAAAAACTCTTTGATCTATCATGCAGAACATGGTCTCAAGTCGATGAAATTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 127560 88 + 647215 TATTATGACAGTCCATTGTGATTATAAGAAAACTTTCGAAACTATTTGATCTATCATGCAGAACATGGTCTCAAGTTGATGAGATGGT a s mr.mrrefChr0 124234 2 + 130230 AT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129350 2 + 636262 AT s simRat_chr6.simRat.chr6 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CTGAACAATTGATCTCCTATAGTACATCCTAAACTCACTCCCAGGCATAGTAAGCAACTATATCTGGCAAGGCCTTCTGCCATTTTCTACTGTGTTCTTTAATTAGACCTGAAGTTTTCTGAGGATCTGTCACATTTGGCTTGGCTGAATTCTCAGGTTCTCAAGTTGAAATTGTTCTGATTAATTTTCACTCTTCTTATGGTAACCCTCAATACATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTACATACATGCATGGCTGGGGGTCTACCTTTATGCATCACACTGGGTGGGCTGATTGGGTTTTGCTGTAGAAGGGGCCCAGGATAGTTGGGAATGTTATGATCACTTTGTCCTTGTTAGAAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 134910 359 + 636262 CTGAACAATTGAACCCCTATAGTACATCCTAAACTCACTCCTAGGCATAGTCAGCAACTATATCTGGCAAAGCCTTCTGCCATTTTCTACTGTGTTCTCTAATTAGACCTGAAGTTTTCTGAGGATCTGTCACATTTGGCTTGGCTGAATTCTCAGGTTCTCAAGTTGAAATTGTTCTGATGAATTTTTACTCTTATTATGGTAACCCTCAATGCATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTCCATACATGCATGGGTGGAGGTCTACCTCTATGCTTCACACTGAGTGGGCTGATTGGGTTTTGCTGTAGAAGGGGCCCAGGATAGTTGGGAATGTTATGAGCACTTTGTCCTTGTTAGAAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 513663 359 - 647215 CTGAACAGTTGATCTCCTATAGTACCTCCTAAGCTTACTCCCAGGCATAGTAAGCAACTATATCTGGCTAGCCCTTCCGCCATGATCTAATGTGTTCTTTTAATAGACCTGAAGTGTTCTGAGGATCTGTCATGTTTGGCTTGGCTGAATTGTTAGTTTCTCAGGTTGAGATTGTTCTGACTAATTCTCACCCCTCTTATGGTAACCCTCAGCACATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTACATACATGCATGGCTGAGGGTCTGCTTTTATGCATCACACTGGATGAGCTAATTGGCTTTTGCTGTAGAAGTGACCCAGGATAGTTGGGAAAATAATCATCACTTTGTCTCTGTTACAAAG a s mr.mrrefChr0 129598 125 + 130230 CCTTCTCAGGCTCTGACAATCAGGCATAACACAGCTAGTTAATCAATCCTTGATGTGCTCAGCTGTGAATGGGAGTGGGATCTTGAAGGAAGTTGGTTAATAAAAAGTATATCAACTCAATTAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135275 125 + 636262 CCGTCTCAGGCTCTAACAATCAGGCATAACACAGCTAGTTAATCAATCCTTGATGTGCTCAGGCGTGAACGGGAGTGGGATCTTGAGGGAAGTTGGTTAATAGAAAGTATGTCAACTCAGTTAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 514022 125 - 647215 ACTTCTCAGTCTCTGACACTTGGGCATAACTCAGCTAGTTAATCAATCCTTGATATGCTCTGCTGTTAATGGGAGGGGGATCTTGAAGGAAGTTAGTTAATAAAGAGTAAATCAACTGAATTAAT a s mr.mrrefChr0 129723 87 + 130230 GTGCCAAAATAATGTTTGCTTGTCTATAGCACAAATACAACGGAAAAGTAACAGAATGTATAAAGCACCCTGCAAGATTTAAAAGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135400 87 + 636262 GTGCCAAAATAATGTTTGCTTGTCTATAGCACAAATACAATGGAAAAGTGACAGAATGGATAAAGCACGCTGCAATCTTTAAAAGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 514150 87 - 647215 GTACCAAGATAATGTTCCCTTGTTTGTAGCATGAATACATCTGAAAAGTAACAGTATGTATAAATCACCCTGTGAGATTTAAATGCG a s mr.mrrefChr0 129810 62 + 130230 GGGGTTTTGACATTAGATGTACGCACCCTGCAATCACCCTGGGGTGTTGTTATATATATCTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135487 62 + 636262 TGGGTTTTGACATTAGATGTACGCACCTTGCAATCACCCTGGGGTGTTGTTATATATATGTC s simRat_chr6.simRat.chr6 514253 62 - 647215 GGCGTTTCGAAATTAGATGTACGCACCCTGCAATCACCCCGGGGTGTTGTTATATATATCTC a s mr.mrrefChr0 129872 104 + 130230 AGGATGTCTCAACCTGCTCACATCTCTCAACTTGGGGTCTAAGGGCCTGTCTTCATATAAATAACTAGGACTACTTAATTTGAACAAATGAAAAACAGACAGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135550 102 + 636262 AGGATATCTCAACCTGCTCACATCTCTCAACTTGGGGTCCAAGGGCCCA--TTCATATAAATAGCTAGGACTACCCAATTTGAATAAACAAAAAACAGACAGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 514315 104 - 647215 AGGATGTCTCAACCTGCTCACATCTCTCACCTTGGGGTCTAAGGGTCTGTCTTCATATAAATAACTAGGATTACTTGATTTGAACAAATGAAAAACAGACAGAT a s mr.mrrefChr0 129976 105 + 130230 GGATAATTTTCTAGAGGGTAACAACCATCTGCCATACAATTAGCATTCTCCTAACGTAGGAGGGACAGGAGAAAGTGTAGGCCTACAGATTTTCAGTACAGGGGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135652 105 + 636262 GGATAATTTGTTAGAGGGTTACAACCATCTGCCATATAATTAGCATTCTCCTAACGTACAAGGGACGGGAAAAAGTGTAGACCTACAGATTTTCAGCACAGGGGG s simRat_chr6.simRat.chr6 514426 105 - 647215 GGATAACTTTCTAGAGGGTAACAACCAACTGCCATACAATCAGCACTCTCCTAATGTAGGACAGACAGGGGAGAGTGTAGGCCTACAGATTTCCAGTACAGGGGG a s mr.mrrefChr0 130081 11 + 130230 CATTCTTATCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135757 11 + 636262 CATTCTTATCA s simRat_chr6.simRat.chr6 514535 11 - 647215 CATTCTTATAA a s mr.mrrefChr0 130092 80 + 130230 TCCCACTCTTTGGTTTCTCAGGAGTTGCCTCTTGGGCTAGGTTAGGTGAAACCTTTAAGGTCAGCTAGCCTGTTCAGGGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135771 80 + 636262 TCCCACTCTTTGGTTTCTCAGGAGTTGCCTCTTGGGCTAGGTTAGGTGAAACCTTTAAGGTCAGCTAGCCTGTTCAGGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 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CTATTCTTACTGCGACCCACTTGAGTAGTATTGATGTGCTCTATTAGCCATCCTGATAACAGACAAGATGCCAAGGGTTAGAAGCAAAAAATTTAGAACTAATTTGAATACAAGACGAGAACCTATAAGTTGGCCAAAGACAGTGAGAAATGCCCTGCACCAACCTAGGCGCCAACAATCTCTACAGTTTAGTGCCTGAGGTTCACAAGTGGCACAGA a s mr.mrrefChr1 391 101 + 670 CTCTTTTGACCCCTTTGCTAGCTGTAACTACGATATTATGACATTTGGCAGTATGACCCTCACACTGAGACTTTAGAACTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635943 101 + 636262 CCGTTTTGACCCCTTTGCTAGCTGTAACTACGATATTGTGATGTTTGGCAGTATCACCCTCACACTGAGACTTTAGATCTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 1007 101 - 647215 CTCTCTTGACCCCTTTGCTAGCAGTAAATACAATACTATGACATTTGGCAGTATGACCCTCACACTGAGACTTTAGAACTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA a s mr.mrrefChr1 492 62 + 670 ATGAACCACTCAAGAACATTATGAGCCTTATAGGGACAACATATTATTAACCTCATGGAGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 636055 62 + 636262 ATGAACCACTCAAGAACATTATGAGCGTTATAGGGACAACATATTATTAACCTCATGGAGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 647041 62 + 647215 CAGTACCACTCAAGAACATTATGAGCCTTATAAGGACAACACATTGTTAGCCTCATGGAGAC a s mr.mrrefChr1 554 116 + 670 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ACTGTCCTTATACAGCTTTTTGTGTCTATCCTGGTGAAAAAATTAAGCTGATTGGAGCTCTAGTGGCGTAAAAGAAATCAGAATGGGAATCATACATACAGGGGGGCTTGGTTGCACTCCCCGCAACTACTTTAGA-AAATTTAAGAAGGAAAGATAGGACTTGAGGGCTAGGATGCTCCACACTGTTGTGTTTTAACCTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 453762 202 + 647215 GCTGTCCCTATACAGCTTTTTTTGTTTATCCTGTTTAAAAAATTAAACTGGTTGGAGCTTTAGTGGCATCCAGGAAACCAGAATGGGAGTCATACATACAAGGGGGCTTGGGCTCACTGCCTGCAACTACTTTAGATACAGCTAAGAAGGAAAGATAGGACTGGAGGGCTAGCATGCTCAACACTTTTGTGTTTTAACCTGC a s mr.mrrefChr3 202 47 + 181019 AACACCCAATCCATCACCTACCTCACCTTATCAATACGTTTTACTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 441880 47 + 636262 AACACCCAATCCATCACCTACCTCACCTTATCAATACGTTTTACTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 453965 47 + 647215 AACACCCAATCCATCACCTCCCTCACCTTGTCGATTTGTTTTACTGT a s mr.mrrefChr3 249 74 + 181019 CTGGTAGGAGTGCACACTTTTTGCCTTATTTGACAGGACACTGACTTTTTCTCTTTGTTGTCAGTAATGTTTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 441929 74 + 636262 CCGGTAGGAGTGCACACTTTTTGCCGCATTTGACAGGACACTGACTTTTTCTCTTTGTTGTCAGTAATGTTTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 454012 74 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 442164 274 + 636262 CCTTCCCTATATTTCCATCCTAGTGGCACAGTAGCTTTTGTGGAGCCATCTGCTGGGGGCCCAGGACTCAGTTGCAGCAGCT----AAATCTCAACAACC-TAGACCCCCTAGCCTTAGATAGTGTATAAAGTGATGCTTGTTTCCAAAAATAACTTAGAACAACAAGGGTGATTAACATTACTCATGTTAGGTTCTGTTGGGTACTATACTGGGTAGAGTGCATATAGTCAGTACATTCATACGCTGAAAACCTGGGCAGGAAAGGATCCATCTTGAA------------------------ s simRat_chr6.simRat.chr6 454233 303 + 647215 CCTTCCCTATATTTCCATCCTAATGGCATAGTAGCCTTCATAGAGCCATCTGCTGGGGGCCAAGGACTCAGTTGCAGCAGCTTAAGAAATCTCCACAACCTTAGACTCCCAAGCCTTAAATAGTGTATCAAGTGATGTATGCATCCAGAAATAACTTAGAACAATAAGGGTGATTAACATTACTCATGGAAGGTACTGTTGGGTACTATACTGGGAAGAATGCATATAGTCAGTACATTGATGTCATGAATACCTGGACAGGATGGGATCCATCTTTGAAGAAGATCTGCCTTAAAGAACAGG a s mr.mrrefChr3 777 123 + 181019 ATCGTTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442438 119 + 636262 ----TTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 454537 123 + 647215 ATCGTTGTGATAAGGACCTGTAGTGTACCCACAGCACAGCATTAAAAGTCAGAGGTTAATGGGGTTGATAATTTTTTCTGTGGTGTGGGGCAGTTTTATAATACAGTTAGTGAGCCGCAGGTT a s mr.mrrefChr3 900 63 + 181019 AATAAAAGGATCACACATTAATGTTGCACCAATGGCACCAACCAGTGATACAGATCCAGCATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442559 63 + 636262 AATAAAAGGATCACACATTAATGTTGCACCAATGGCACCAACCAGTGATACAGATCCAGCATG s simRat_chr6.simRat.chr6 454660 63 + 647215 AATAAAAAGATTGCACATTAATGTTGCACCAACGGCACCGGCCAGGGATACAGATCCAGCATG a s mr.mrrefChr3 963 27 + 181019 GTTCAACTCTCTATTACACATCAAACC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442625 27 + 636262 GTTCAACTCTCTATTACACATCAAACC s simRat_chr6.simRat.chr6 454723 27 + 647215 GTTCATCTCTCTATTACACATCAAACC a s mr.mrrefChr3 990 19 + 181019 CAGTAATGAAAGAGTCTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442654 19 + 636262 CAGTAATGAAAGAGTCTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 454750 19 + 647215 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GCTTCTTACAAGGGGTGCCTTG-------CTGGGTAGAGGCCCACACACATATACCCCACGGAAACCATGACCGTCCAAATGACCTTAATAAGACTGGCAAATGTTTCTTCAAAGGGCAAAATAGGCAGCCTACTATAACAGC-AAGGGGCTCACGCATTAATCAGTATCCATGTGCTGTATGCACATAGAATTCTTACTTAAGGAAGGATATGATAGCTTAGTTTGGATGCAATAGCCTCACATGATCAAATCGTACTTTCAGGTGAGGTTCCACAGCAATAAAATGGAGTAGACTGACCTTTGGAAAGTCACTTTACACTCTGTCAGGTCAATACTGTCTTAAGTAACATCTCAG--CAGCCCTTTTCCCACTCAAGCCAGAGTTATAACCACACT---TGGACCATGAAAA-------CCATTAGTATCAACACACCAACGCGGCGGTAAAGTGCATG---TTGCGGGTGCTCCGCCTCCACGTTTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 454925 480 + 647215 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GGACGGGCGGAAACTGAACGTTGCATTTTCCGCGCAATGGACACGTGTTATATCAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 455548 53 + 647215 ----GGGTCGAAACTGAATGTTGCACTTTCCGCGCAATGGAGATTTGCTACATCAGA a s mr.mrrefChr3 1792 146 + 181019 TGTCATAGGTCAAAATATTCCGGTCGATGGGGCGGCTAAAGCAATTCATGCGTTGGCCTTTTAAATAACCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATCTACTGATTGGTTGACTTGCAACAGTCCCATAGTGATTTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443435 146 + 636262 TGACATAGGTCAAAATATTCCGGCCGCTGGGGCGGCTAAAGCAATTCATGCGTTAGCCTTTTAAATAGCCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATGTACTGACTGGTTGACTTGCAACAGTCCCATAGTGATTTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 455602 146 + 647215 TGTCAAAGGTCGAAATACTCCGGTCGATGGGGCGGCTAAAACAATTCATGCGTTGACCTTTTGAATAACCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATCTACAGATTGGTCAACTTGCAACAGTCCCATAGTGGTTTGA a s mr.mrrefChr3 1938 30 + 181019 AACAAGCCACAGTTCCATAGTGGTTTAACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443589 30 + 636262 AACAAGCATCAGTCCCATAGTGGTTTAACA s simRat_chr6.simRat.chr6 455748 30 + 647215 AACAAGCCACAGTTCCATAGTGGTTTGACA a s mr.mrrefChr3 1968 417 + 181019 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AGAAAGAATGTGCTGACCTATCTGGTCTGTACCAACTCTGTGATCTACGGACAACTAAGA-GCAATACATTAATGGAC-TAAATTGAGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGACAGCCTAGCACTGCAGTGAGGAACATGTGCCTAATGTTTTCATACCATGTCTTTATCACTTCGTATCTAATCTGGCTATGAAGATATAGTGTTAATATGACCCAGCGAAAGAATTGGAAGTCTGATTACTAGGCTCACCAGTGGACGGTGTTGCATGTTCCGTCCATATAGCTGCATGCCTCAGAACTAGGCATGTCTGCAAGCCCAACCAAGGCTACAAGAAAGAAGGCAATGCAGGAGGATTACTGGGCTATATTAACATAGTACTACATGACCAGGTGAAGTATTGCAAAATTTTTGCATGCCT a s mr.mrrefChr3 2385 489 + 181019 GTGTTAGCTGGTCCAGACAAGCCTTAAGTTTAGATTATGAATACTGGATCTAACCTAACAGAGATACCTGGAGATAGTACTAGGGTCCGTAATTGAAGTTAATTTCAGTAGCTAACAATAATGCCTGCATGATGGCATGAAAACATTGTTGGCTTTATGTTCACATTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCACAGCTTGCATTACCTCCTTTATATTGGCTGGAATCTTACAACAAACAATATGCGGACCTCATTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGACACTAATACTTCGACATCAAGCATAGGCCTCAGGGAATGCTGTTTCCCAGTGTGCACAAAAAAATTCTTAACACTCCTTTAATCATGGGTGCATGGTAGACGAATTTCTTAAATAAACTGTTGTGTTGTCTCAGTATCTGATGTTGGGTGTGGGAATGATAAGTTTAAGCCTCGCACTCTTAGTCCCATTGTCAGCCTGACTTATATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444050 446 + 636262 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GTGTTGGCTGGTCCAGACAAGCCTTAACTTTAGATCATGAATACTGGATTTAACCTTACAGAGATACCTTGAGATAGTACTTGTGTCTGTAATTGAAGTTAACTTCAGTAGTTAACAATAATGCCTGCATGATGGCATGAAAACATTCTTGGCTTTATGTTTACACTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCCCAGCTTGCATAACCTCCTTTATATCGGCTGGAATCTTACAACAAACAACATGTGGACCTCATTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGCCACTAATACTTTGACATCAAGCATAAGCCTCAGGGAATGCTGTTTACCTGTGTGCACAAAAAAATTGTTAAGACTCCTTTAATCATGGCTTCATGGTAGACAAATTTCTTGAATAAACTGTTGTGTTGTCTCAGCATCTGATGTTGGGTGTGGGTATGATAAGTTTAAGCCTCGCACTCTTAGTCCCATTGTCAGCCTGACTTATATG a s mr.mrrefChr3 2874 386 + 181019 AGAGTGATAGCCCACCATGATCCTTCAATGCTCCTTATTTGTGATCTGGTGGATTGGTAAATGTGTATATCATATCCTGGGAGAGGGTTGGTTGCAGGCTTTTCTTCAGTGCCAGGGCAATAGAAATTTTAGCAGTTTAGTATCTACGTTAAATTATCTTTAACATCACAAATTATAACAGTGAGGTGTACTGTACATGGTACTCTTATCACAGCAGTAATAAGAAATCTAGGGACAGTGTATGGTAATTCTCAGTACTGTATGCTTGTGGTGAACATGTGCTACTCCTGTCTACCCCTTTTCCAAGTGCTGAATCGAGTTAACCAAGATTCTATATATAGTCCTTATTTTTGCCATCCTATGTACAGGATGTAGCATGCATGGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444496 335 + 636262 -------------------------------------------ACCTGGTGGATTGGTAAATGTGCATATCAACTACTGGGAGATGGTTGGTTGCAGGCTTTTCTTCAGTGCTAGGGCAATAGAAATTTTAGCAGCTTAGTATCTACGATAAGTTATCTTTAACATCACAAATTATAACAGTCAGGTGTACTGT-CATGGTACTC-TATCACAGCAGTAATAAGAAGTCTAGGAACAGTGTATGAGAATTCTCAGTACTGTAAGCTTGTGGTGAACATATGCTACTCCTGTCTACCCCTTTTCCAAGTGCTGAATCAAGTTAGCCAAGATCCTATATGTAGTCCCTATTTTTGCCATCCTATGTACAGGATGTAGCATGC------ s simRat_chr6.simRat.chr6 456688 363 + 647215 AGAGTGATAGCCCACCATGATCCTTCAATGCTCCTTATTTGTGATCTGTTGGATTGGTAAATGTGTATATCATATCCTTGGAGAGGGTTG----CAGGCTTTTCTTCAGGGCCAGGGCGAGCAAAATTTTGGTGGTTTAGT-------TTAGATTATCTTTAACATCACAAATTCTGACCGTGAGGTGTACTGTACATGGTACTTTTATCA---CAGTAATAAGAAATCTAGAGACAGTGTATGGTAATTCTCAGTACTGTATGCTAGTGGTGAACATGTGCTACTCCTG--------TTATCCAA-TGCTGAATGGAGTTAACTGAGATTCTATATATAGTCCTTATCGTTGACATCCTATGTACAAGGTGTAGCATGCATGGCA a s mr.mrrefChr3 3260 112 + 181019 GGAGCAACTGGAAATTCCTGGAATGTGTTTCAATCTTGATCCACTTAACCTGTATGACATTTTGCTGAGTACATCTCGGGATATATTCACAGACTGAAGTCGGCAATTCACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 446325 24 + 636262 TAGTACTTGGCTATGAGCCCACCC s simRat_chr6.simRat.chr6 458525 24 + 647215 TAGTGTTTGACTATGAGCCTGCCC a s mr.mrrefChr3 4645 75 + 181019 actaGGGGATTAGCAAATATCAGCTGCTTTGATAATAGGGAGTGATATTCTTCAAAAAAGACTTTTGGGTAGATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446355 74 + 636262 ACTAGGGGATTAGCAAATACCAGCTGCTTTGATAATAGGGAGTG-TATTCATCAAAAAAGACTTTTGGGTAGATT s simRat_chr6.simRat.chr6 458549 71 + 647215 ----GGGGATTAGCAAATATCAGCTGCTTTGATGATAAGGAGTGATTTTCTTCAAATAAGACTTGTGGGTGACTT a s mr.mrrefChr3 4720 74 + 181019 AAACTTCTGGCATGGATCTCGGCTGCTGCATCAGGTGTCAACCCTGCAGCCTTGACAGCATACAGAGAGACCAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446429 74 + 636262 AAACTTCTGGCATGGATCTCGGCTGCAGCATCAGGTGTCAACCCTGCAGTCTTGACAGTATGCAGAGAGACCAG s simRat_chr6.simRat.chr6 458632 71 + 647215 AAATTTCTGGCATGGATCTCGGCTGCTGCATGAGGTGTCAGCCC---AGCCTTGACAGCCTACAGAGAGATCAG a s mr.mrrefChr3 4794 221 + 181019 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simRat_chr6.simRat.chr6 463271 9 + 647215 CAGCTCATA a s mr.mrrefChr3 9446 193 + 181019 CTCGGATTCTGTACTATGAATTTACAGAACCCTGGTATAGGTCTGTGAAAATGTTGTCATGTTAATTTCATTACTGTCATATCATGATGAATTAATCCCTGTGCTGTCCATAGAAGTTAATAGGCTAGGCATAAATACACAGATCTTGTTTTGGGTCTTAAGATGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451193 193 + 636262 CTCGGAGTCTGTACTATGCAATTACAGAACCCTGGTATAGGGCTGTGAAGATACTGTCATGTTAATTTCATTATTGTCATATCATGATGAACTAATCCCTGTGCTATCCATAGAAGTTAATAGGCTAGGCATAAATAAACAGATCTTGTTTTGGGTCTTAAGGTGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT s simRat_chr6.simRat.chr6 463280 190 + 647215 CTCGGATTCTGTACTATGAATTTAAAGAACCCTGGTATAGGTCTGTGAAAATGTTGTCATGTTAAGTTTATTACTGTTGTATCATGATGAATCAATTCCTGTGCTGTCCATCGAAGTTAATAG---GGGCATAAATACACAGATCTTGTTCTGGGTCTTAGGATGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT a s mr.mrrefChr3 9639 36 + 181019 CTACTTACCTTGGTGTTTTCCCTCAAGACAAGCGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451388 36 + 636262 CTACTTACCATGGTGTTTTCCCTCAAGACAAGCGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 463470 35 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 453847 16 + 636262 CTATCAGACAATCACA a s mr.mrrefChr3 12194 22 + 181019 GGGCTGACAGGCTGCAATGAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453867 22 + 636262 AGGCTGACAGGCTGCAATGAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 465783 22 + 647215 GGGCTGACAGGCTGCAATGAAT a s mr.mrrefChr3 12216 344 + 181019 AGTAAAATTTACTCCATGGAAGAATGGAAGATATGATTTGGATTCTCCTGGCTTGGCCTATTTTCTTGTTCTTGCTATGTGGTTTGTGAGATATATGGTGTCCATCAGAAATTATTCTAGTAATCTGATTAGTAGAAAGGGATAAGAAGAATAAGGTTCAACAGTGAGACAAGTTAGGTCCACTAACTAGTTGTTCAGATCACATCCCATGGTTGGAACTCTCTTTCATCTGCCTCTGGGGTCTCTTATTAATAGTTCGATGCTCAGTCAGAGTTGTTTTGGCCTGGTGTCTTTAATGTTTCAATGCATTAAACCCTTAATGCCCCCATCATTGGTACACCCAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453897 344 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 459193 57 + 636262 ATGCGTCCACTTTAAGGTTGTGTCTTATCTAGGAGTCAAATTTGTCGACTTGTAAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 468456 55 + 647215 ATAGGGTCACTTTAAGGT--TGTCTAATCTAGGAGTCAAATTTGTCGATTTGTAAGT a s mr.mrrefChr3 14838 25 + 181019 TGTACAGATGCTATTGGTGCTGCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459122 25 + 636262 TGTACAGATGCTATTGGTGCTGTCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459250 25 + 636262 TGTACAGATGCTATTGGCGCTGCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 468535 24 + 647215 AGTATAAATGATATTGGTG-GACTC a s mr.mrrefChr3 14863 41 + 181019 AACGCACAAGCCTGAGATCACATTTTACAAGCATTACTCAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459152 41 + 636262 CACACACAAGCCTGAGATCACATTTTGCAAGCATGTTTGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459275 41 + 636262 AACGCACAAGCTTGAGATCTCATTTTACAAGCATTACTCAG s simRat_chr6.simRat.chr6 468559 40 + 647215 AATGC-CAAGCCTGAGTGCACATGTCTCAAGCATTACCCAA a s mr.mrrefChr3 14904 35 + 181019 TACACCTTGATTTCTAAACTATGCAGCATCCAGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459316 35 + 636262 TACACCTTGATTTCTAAACTATGCAGCATCCAGAC s 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 463513 41 + 636262 TCAGAGATGAAAACAGCATTTACAT---------------------TTTGTCTCACAAAACT s simRat_chr6.simRat.chr6 473261 60 + 647215 TGAGA--CGAAACCAGAATTCACGTCTACGCTAGACAAATGCAACATTTGTCTCACACAATT a s mr.mrrefChr3 19413 176 + 181019 GGACTTCTTAAGTTTGAGTTTGTAGAAATAAAAGGCAATTGCTGTGATCCCGTAGAGATAAATGTGAAAGGTAACATTATCAACTGCTAATAGTAAATGTTATCAAGGTTAGAGATGGAGTTACATACCTATTAGACATCAGACATATAAGTGACACCAAAATTTGATGTTGGGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463554 172 + 636262 GGACTTCCTAAGTTTGAGTTTGCAGAAATAAACGGCAATTGCTGTGATCCCGTAGAGGTAAATGTGAAAGGTAACATTATCAACTGCTAATAGTAAATGCTACCAAGGTTGGAGATGGAGTTACATACCGATTACATATCAGACATATAAATGACACCAAAATTTGATATTG---- s simRat_chr6.simRat.chr6 473331 176 + 647215 AAACTTCTTAAGTTTGAGTTTGTAGAAATAAAAGGCAATTGCTATGGTCCTGTAGAGATAAATGTGAAAGGTAACATTATCAACTGCTAATAGTAAATGTTGTCGAGGTTAGAGATGGAGCTACACACCTATTAGACATCAGGCATATAAGTGACCCCAAAATTTGGTGTTGGGTG a s mr.mrrefChr3 19589 11 + 181019 GCGTAAGGAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463726 10 + 636262 -CCTAAGGGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 473509 11 + 647215 GAGTAAGGAAA a s mr.mrrefChr3 19600 217 + 181019 CATATGGAGTTTGAGCCCCTGACACAGATCAGCATCAAATATCTCTGTGCCAAATTATACTAGGCACACCTGGATACTAAGACTGGCCTGGTTTAGATAGCTTGTCCCAATATTTATGCACACATTTATGAAGGGTGGGAAAGATGAGACAAGGGATCTAATAATATCAGTAGAGAGGTCTGCAAAAGTCCTAGTAGTTTTGGGTGTGTTGGGTGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463736 217 + 636262 CATATGGAGTTCGAGCCCCCAACACAGATCAGCATCAAACATCTCTGTGCGAAATTATGCTAGACACAGCTGGATACTGAGACTGGCCTGGTTTAAACAGCTTGTCCCAATATTTATGCACACATTTATGAAGGGTGGAAAAGATGAGACAAGGGATCTAATAATATCAGTAGAGAGGTCTGCAAAAGTCCTAGTGGTTTTGGGTGTGTTGGGTGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 473523 215 + 647215 CGTATGGAGTTTGAGCACCTGACACAGATCAGCATCAAATGCCTCTGTGTCAAATTACACTAGGCACACCTGGACACTAAGACAGGC--GGTGTAGATAGCTCGTCCCAATATTTATGCACACATTTATGAAGAGTGGGAAAGATGAGATGAGGGATCTGAGACTGTCCGTGGAGGGGTCTGCAAGAGGCCTAGTAGTTTCAGGTGTGTTGGGTATG a s mr.mrrefChr3 19817 132 + 181019 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simRat_chr6.simRat.chr6 474754 157 + 647215 AGTAGTTATTATATTAACAGGTGAGTTATCTTCCCAAGTAGTTGGTTCCTCTTAGTAACTGTGTTGTGAACAGTTATTTACTTCCAGTCAGTGGGATGAGCGTTTTGGTAGTGACAGTACAACTGATATGAGTTCTTGTGCCATTAACAATACATTC a s mr.mrrefChr3 20958 440 + 181019 ACTTGAGGTTGTGCAGCACTGTTTAATCTAATAGTGTTGTGTTGAAGTCAGTAGCATGCATTGGGCTAATGACATGTGATATTGCTACTTGCTTAAGGATGTCAGTAACAAGTTGCTACTTGTTAAGGACCACATAATAAAACAGCCTATCTGTTCACTAGCATCAAACTTTTTAACACCATGATTCTTGGAGAGCCCAAATTAATACTAATGTGAGGGATCCAATTGAAGATCCAACAGTCAATGGGACCTGAGGTGGCTCAGGTCCATACGGGAGAAATACATGTGGATTAGAGCCACATGCTCTTGGCATTTAATTTAACTATGTGCGGTGTGTAATGGTTGTCCACAATCCCTAATTGTGAAAGCGTTAGAACATTTGGTCCTATAAGGCCATACATGAGTTTTCTGTCATTATCATTAGGAGCTAGGAACCAGTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465235 412 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 477080 55 + 647215 CAGGTGTGAGTTAATATCACTTATATTGAAGGTTACTATCAGAAATACTACTGCC a s mr.mrrefChr3 22981 6 + 181019 CATAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467254 6 + 636262 CATAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 477135 6 + 647215 CATAAA a s mr.mrrefChr3 22987 39 + 181019 CTTAATAAAACATAGCTAATAATCCCAACTTTCTATCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467266 39 + 636262 CCTAATAAAACATAGCTAATAATCTCAACTTTCTATCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 477141 37 + 647215 CTTAA--AAACATAGCTAATAATCCCAACTGTCTATCCA a s mr.mrrefChr3 23026 96 + 181019 GAGGGGGTTCATTCATGCCACAAAGATGCTGTCAATAAGCCAGTTGAGCCCAGTGAAGGGCACAATAGCCATGGAGGGTCCCTAAAGAAATTGACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467305 96 + 636262 GAGGGAGTTCATTCATGCCGCAAAGATGCTGTTGATAAGCCAGTTGAGCCCAGTGAAGGGCACAATAGCCATGGAGGGTCCCTAAAGAAATTGACA s simRat_chr6.simRat.chr6 477180 96 + 647215 GAGGGGGTTCATTCAGGCCACAACAATGCTGTCAATAGGCCAGTTGAGTCCACTGGAGGTCTCAATGGCCACGGAGGGTCCCTCAGGAAACCATCA a s mr.mrrefChr3 23122 57 + 181019 TGCCGCTTGTATTTTAAAAGTGGGCAAACAAATTCTCTGCTGTTATCACTGGGGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467428 57 + 636262 TGCCGCTTGTATTTTAAAAGTGGGCAAACAAATTCTCTGCTGTTATCACTGGGGCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 477276 57 + 647215 TGCAGCTTCTATTTTAATAGTTAGCGAGCAAATTCTATGCTGTTATCACTGGCACTT a s mr.mrrefChr3 23179 18 + 181019 TGAACTGCTCTCAATGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467485 18 + 636262 TGAACTGCTCTCAATGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 477355 18 + 647215 TGAGCTGCTCTCAGTGGT a s mr.mrrefChr3 23197 337 + 181019 CAAGGAACCTATGCATTCCTTCCCCCCCTTGTTCACTCACTGTTACCAGGGGGCTGGAATGTATTGGTTATTAAGCATGCTACTGGTATCAAATTCCAGGGTGCTGTGGTGACACCCAGGGGAAACAAAAGTATAACCTGGCATAACTCATTTGCTTAAAAAGCACCAAAAGATGTGTCCTTAACTAATTATAATAACTTACTATGCAGGTTCTATGTATCAAGGAATTACCTCTGCCTAACTTATTAACCGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTACCCTGCCTGATGGCTAAGGGTCTTTAAGACTGGGCAACTACCCTTCACAATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467504 337 + 636262 CAAGGAACCTATGCATTCCTTCCCCCCCTTGTTCACTCACTGTTACCAGGGGGCTGGAATGTATTGGTTATTAAGCATGCTACTGGTATCAAATTCCAGGGTGCTGTGGTGACACCCAGGGGAAACAAAAGTATAACCTGGCATAACTCATTTGCTTAAAAAGCACCAAAAGATGTGTCCTTAACTAATTATAATAACTTACTATGCAGGTTCTATGTATCAAGGAATTACCTCTGCCTAACTTATTAACCGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTACCCTGCCTGATGGCTAAGGGTCTTTAAGACTGGGCAACTACCCTTCACAATT s simRat_chr6.simRat.chr6 477373 337 + 647215 CTAGGTACCTATGTATTCCTTCCCCCCCTTGCACACTCACTGTTAGCAGGGGGCTGGCATATATTCATTATTAAGCATGCTACTGATATCAAATCCTAGGGCGCTGTGGTGACATTCAGGGCAAACAAAAGTACAACCTGGCATAATTCATTTGCTTAAAAAGCACTAGAAGGTGTGTTCCTCACTAATTACAATAACTTACTATGAGGGTTTTATGTGTCAAGGATTAACTTCTGCCTAACTTATGAAGTGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTATACTGCCTGATGGCTGAGGGTCTTTGAGACTGGGCAACTACATTTCACTTTT a s mr.mrrefChr3 23534 24 + 181019 GGCTAATCATGTTTCCATGTGGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467841 24 + 636262 GGCTAATCATGTTTCCATGTGGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 477711 24 + 647215 GGCTAATCAGGGTTCCAAATTGTA a s mr.mrrefChr3 23558 30 + 181019 ATCAGGAATATTGGCTATGATCCTTTTTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467865 30 + 636262 ATCAGGAATATTGGCTATGATCCTTTTTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 477787 30 + 647215 ATCAGCAGTATTGGCTATGATCCTCTTTAC a s mr.mrrefChr3 23588 20 + 181019 CACCATAACTGCACCCCAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467902 20 + 636262 CACCATAACTGCACCCCAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 477817 20 + 647215 AGCCATAACTACACCCCAAG a s mr.mrrefChr3 23608 13 + 181019 AGTTAGCTAAGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467922 13 + 636262 AGTTAGCTAAGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 477840 13 + 647215 AGTTAGCTAAGCG a s mr.mrrefChr3 23621 104 + 181019 TGTAAAGAAACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGATTGTCTTAGTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTCCCTATGCTTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467938 104 + 636262 TGTAAAGAAACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGATTGTCTTAGTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTCCCTATGCTTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 477853 104 + 647215 CGGCAAGATACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGCTTGTCTTATTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTTCCTATGCTTAT a s mr.mrrefChr3 23725 98 + 181019 GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACTTGTTTTAAAGCACTTCACTGTCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468045 98 + 636262 GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGAATACCTTCCTTTGCAAGGTCTTGTTTTAAGGCACTTCACTGGCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA s simRat_chr6.simRat.chr6 477957 98 + 647215 GGATTGTATTAGCACTGTCTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACATGTTTAAAAGCACTTCACTCTCTGGGCTACTCAAGGGACATGTATTATCA a s mr.mrrefChr3 23823 58 + 181019 ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468168 32 + 636262 ACACAAGCCTCAGACAGCTTAATGCTCCAGGC-------------------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 478055 58 + 647215 ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA a s mr.mrrefChr3 23881 356 + 181019 ACAGCTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCTGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAAACTTCCAGCTTCACCTAACCCCACCATGACAGGATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATGTGCAACTGTTTACCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCATCAGGGCTCCGATGTGGGGTCAACCATCACTATCAAGGATCAACCAAAATTCCAGGCTGGGTGTCACATTGTCTTTCTTCACACTTCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGACATTCATATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468200 337 + 636262 ACAGTTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCCGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAA-------------------CCCACCATGACAGAATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATTTGCAGCTGTTTGCCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCAGCAGGGCTCTGATGTGGGGTCAAGCATCACTACCAAGGATCAACCATCATTCCAGGCTGGGTGTTGCATTGTCTTTCTTCACACTCCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGGCATTCATATT s simRat_chr6.simRat.chr6 478117 353 + 647215 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TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACTACAACACAGCTGTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAGTGGAACTCCTCTGCAGTGTGCTTTCCCGTGCTCTGTAATGACTTGTGGGATGATCCCATTGTATGAACTCAAGTACCGATGCCACTGACCACAACGGGTTAC-GAGTGGACATAAGACTCTCTCCTGCAACTTGGACAACATCT----TTAAGGATTGTTATTAATGCTCCAATCCATTTGCAATTTGGCTCTTTAATTGGATGCTTGATAACTAACATTGTCACCCTCCAAGGGG s simRat_chr6.simRat.chr6 478472 313 + 647215 TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACCACACCACAGCCTTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAATTGGACTCCTCTACATTGTACTTTGCTGTGCTCTGTAAGGGCTTGGGGGATAATCCCATTGTGTGAACTAAAGTACTTTTGCCATTGAACCTAAGGCATTACAGAATGGACATAAGACTGTGTCCTGCAACTTCAACCACGTCTCAGGTAAAGGACAGTTATTAACAGTGCAATCCATTTGCACTTTGGCCCTTTAACTAGATAATTCGTGACTAACATTGTCCCTCTCCAAAGGG a s mr.mrrefChr3 24550 131 + 181019 CTTCAAAGTTGCAAACAGAGCATACGCAAGTCAATTGCATACCGGAGCCCTCAAATGGCAATTAGTCCCAAGCCAACAATGATTGTGGGCCCACACGTTATGTTGTAGAATTCATTGGTTATAACGACTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468846 131 + 636262 CTTCAAAGTTGCAAACAGAGCATACGCAAGTCAATTGCATACCGGAGCCCTCAAATGGCAATTAGTCCCAAGCCAACAATGATTGTGGGCCCACACGTTATGTTGTAGAATTCATTGGTTATAACGACTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 478785 131 + 647215 CTTCAAAGTTGCAAGCAAAGTATACACAAAGCAATTGCATACTGGAGCACTCAAATGGCAGATAGCCCCAAGCCAATAATGACTGTGGGCCCACCCGTTATGATGTAGCACTGACTGGTTATAACGACTTG a s mr.mrrefChr3 24681 20 + 181019 GACCTGACTTATCACACCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468985 20 + 636262 GACCTGACTTATCACACCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 478916 20 + 647215 GACCTGGCTTATCACACTAT a s mr.mrrefChr3 24701 512 + 181019 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TGATTACCAATGAA-TGTGGATTTACTGATCACTATACAGCACTCATTGCCCTGTTTATCATGGCCAAAGCAGTAAGAATCTTTAACAGCGCTGTCTGCAAGGTAGGCCGAATACAA-TGAAGGCTTTGGTTTCATCACAGGATAGTCACATGCTAATGAATAGTGTTAGTGGCAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTG--GGCTTGTTTTAGCAATGTAAGTCTCCACAAGATATTGAGGTAATGGAAAATAAACAGTGTCAACGCGAGGTGATTGCTCAGCTTATAATGGAATGTATATATAAGCTCTAATATGCTTGACACACATTTGAGACATTTGATACCAAACTACAAGAAATGCTCACAATTGCTAGACTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTACGACTCATGTTGATTCTCAGTATATACTAGAACC--ACCTATAGTGGTCCATGAATACCTCCCTGTGCCTATCTTCTCGTATTTCAAGCATGTGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 478936 472 + 647215 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s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469515 435 + 636262 TGGA---------ATGGA----GATGTTACTATGACTGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAG-TGGCACCATATAAGGTAGGGAGACCCTTTATTTATAAT-CACAAATACGCATGTACCATTGAAACACACCAAAGCCCTGCGTACACAAGCTTGGTGATAGCTAATATTAACTTGCAAGATTGGAACACAGGATTGGCCAGGTTACCTGGCTGGCAGGAGAGACCCTTTAGCACTGGCATCCCTTGATAGCCTGAGTTGATGATGTAGGATTAATCTACAAAAAACAATAAATGTAAGAACCATCATTTTTCTCATACAGTTAATTGTCTCATACAGTTGAAGGTAGTGTAGAGGCTGCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTGACCTTGTTTTACAAAGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGT-ACCAGTCTTTAGGTAGAATAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 479408 426 + 647215 TGAAGCCAGTCACCTGGATGGAGATCTTACTATG--TGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAGGTGGCACCATATAAGGTAGGGGGTCCCTTTGTTTATAATTCACAAATACACACATACCATTGAAACACACCAAAACTCTGCGTACAC----CTGATAATAGCTAATATTAACTTGAAAGATTGGAACACAGGATTGGCAAGGTCACCTGGCTGACAGTAGAGACCCTTTAGCATTGGCATCC--TGGCAGCCTGAATTGATGATTTACGGTCAGTCTATGAAAACCAATAAATGTAAGAACCACCATTT-----------------GCCTCATTCAGGTAAAGGTAGTCCAATGGCTCCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTCATCTTGTTTTACAAGGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGTTACCAGTCTTTAGGTAGAATACT 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AATGAGTTTGTAAAATCGATGGATTAATAGTGATTGGGTTGTATATGTGACTCCCGTCACTTTGCATGCTAATCTTGTTCAGAATCTATTTTTGTAGGTGACTATTCTTGTTATGACTGGAGTATCAATTGGCTTGGGCCATCAGAAAAATGTTCATCCCTGAATAGCTTGTGCACTTGGAGACAGCTATGACCTCTGAGTGAGCTTTATAGACAAGATTGCTACATAAACCTTGATAGTACACCCAAGTTCTTTTTGCACCACCCCTCGGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCACAGATCCTAAATTACTTAAACTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTGTGTTCAAGTCCACCCAGTACTCTGAATCATTATTTTATCAAAACCACTACACACCTCCAGGTGTTTCGCATTAGGCA a s mr.mrrefChr3 26300 55 + 181019 TATGGGCACTTGCTATGACCACTACCTGAGGAGTGGTAGGTAGAGCGAGGAGTGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470536 55 + 636262 TGTGGGCGCTTGCTATGACCACTACTTGAGGAATGGTAGGTAGAGCGAGGAGTGG s simRat_chr6.simRat.chr6 480466 55 + 647215 TATGGGCACTTGCTATGACTACTACCTGAGGAGTGGTAGGTAGATTGAGGAGTAG a s mr.mrrefChr3 26355 8 + 181019 AGGTAGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470591 8 + 636262 AGGTAGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 480522 8 + 647215 AGGTAGAA a s mr.mrrefChr3 26363 38 + 181019 TAAATATACAAATACATACGACTGAGCACTAATTAGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470599 38 + 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CAAAAGACATTCACTGCATGGCCTTAAAGACAGAAATCAATTTTGCCCCTGTATTTTCCTGTCTTGGCAGGTAATGACTCTCACATTCTTCACGAGTATGTTGTCCAGGAGACCTTAGTAAATCTTTGCTCATTAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 480894 136 + 647215 -GAAAGCCATTTACTGCATCACCTTAGAGTAAGATATCCATTTTGCCCCTTTACCTACTTGTCTTGGCATGTAATTACTCTCATATTCTTCAGGAGTCTGTTGACCGGGAGGCCTTATTAACTCTTCGCTCATTAGA a s mr.mrrefChr3 26856 144 + 181019 TATGCTAACCCTCATCTGCCATCACCATTATTTAAGAACATTGGTCTATGAGCTTATGCTTAAGAGGACCCCTGGCTGTGTCCGTGTTTGGTATTGTTTGGCTTTTGTCTGCATCCATCCTTAGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471113 144 + 636262 TATACTAACCCTCATCTGCCATCACCATTATTTAAGAACATTGGTCTATGAGTTTATGCTTAAGATGAACCCTGGCCGTGTCCGCGTTCCATATTGTTTGGCTTTTGTCTGCATCCATCCTTGGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 481032 144 + 647215 TGTGCTAACCCTCAACTGCCATCCCCATTGTTTAAAAACACTGGTCTATGAGCTTGTGGTTAAGAGGACCCCTGGATGTGTCCATGTTTGGTATTGTTTAGCTTTTGTCACCAACCATCCTCAGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC a s mr.mrrefChr3 27000 52 + 181019 ATAGGCTGACAATCAAATCATTCCACCTGTTATTATCATCAATTCATAGAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471257 52 + 636262 ATCGGCTGACAATCAAATCATTCCACATATTATTATCATCAATTCATAGAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 481184 52 + 647215 ATAGGCTAACAACCAAACCATTCCGACCGTTATCATCATTAATTCATAGAGA a s mr.mrrefChr3 27052 23 + 181019 ACAGGGTTAGGATACTTGATTGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471313 21 + 636262 ACAGGG--TGGATGCTTGATTGG s simRat_chr6.simRat.chr6 481236 23 + 647215 ACAGGGTTAGGATACTTGATTGG a s mr.mrrefChr3 27075 132 + 181019 AAGAAATGCTAACATTGCAAATTGGCATTGGGATTTGTCTAAATCTGCTTAGAGTATCTAGTTGAACAGCCCCCAGAAGGTGACCAAACGTTGGAGAAAGCAGATAACACTCAATACAATAAAGCTGGGGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471334 131 + 636262 AAGAAATGCTAACATTGCAAATTGGCATTGGAATTTGTCTAAATCTGCTTAGGGTATCTAGTTGAATAGCCCCCAGAAGGTGACC-TACATTGGAGAAAGCAGATAACACTCAATACAATAAAGCTGGGGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 481261 132 + 647215 CAGTAGTGCAAACATTGCAAATTGGCGTTGGGATTTGTCTAAATCCGCTTAGAGTATCTAGTTGATCAGCCCTGGGAAGGTGACCAAATGTTGGAGAAAGCAGAAAACACTCAAGACACTAAAGCTGGGGGA a s mr.mrrefChr3 27207 204 + 181019 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GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTT-------------------------ATGGGGAAGCCTTCTGGACCATGCAAGGCTGAGGAGTAGACCACTAGATGGAATTGCTAGTATAAGAATTAAATAGATCGTCATGATTGTAGCACTATAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 481570 156 + 647215 GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTTACTGATATCATTGGACCTACCTGTAATGGGCAAGCCCTTTGGTCCATGCAAGGCTGAGGAGTGGACCACTAGATGGAATTGCCAGTACAAGAATTAAATAGATCATTATGATTGTAGCACTATGAA a s mr.mrrefChr3 27567 11 + 181019 AAAGGGTAAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471797 11 + 636262 AAAGGGTAAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 481730 11 + 647215 AAAGATTAAAT a s mr.mrrefChr3 27578 192 + 181019 CCTGCTCATATCAATGATTAAAAGGAAAAACCAAGGATGTTCAAGTGAGAAAACAAGAAAATGGATGATCCTACTAGTAAGGAGGTGTAAATTATTCAATTAGCATCTATGGTCAGTTACATTAATGGTACAGAAGCAGGGGTACTCAGATGCTTAATAATTTTGACCTTGAGCTATTCCAGATCTAATGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471808 192 + 636262 CCTGCTCATGTCAATGACTAAAAGGAAAGACCAAGGATGTTCAAGTGAGAAAATAGGAAAATGGATGATCTTACTAGTGAGGAGGTGTAAGTTATTCAATTAGCATCTATTGTCAGTTACATTAATGGTAAAGAAGCAGGGGTCCTCAGATGCTTAATAATTTTGACTTTGAGCCATTCCAGATCTAACGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 481830 191 + 647215 ACTATGAATATCAAAGATTAAATGGAAAAAGCAAGGATGTTTAA-TCAGAAAACAAGAAAATGGATCATCCTACTAGTAAGGAGGTGTAAAGTATTCAATTAGCATTTATGGTCAGTTACATTAATCGTACAGAAGCATAGGTACTCAGATGCTTAATAATTTTGACCTTGAGCTGTTCCCAATCTAGTGTA a s mr.mrrefChr3 27770 94 + 181019 ACTTACTACACTTCACCCTGCCTTAGTGCATGGTCCTGGCCTGAGCTCTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAACTCTGATTGCAGACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472004 94 + 636262 ACTTACTACACTTCACCCTGCCTTAGTGCATGGTCCTGGCTTGAGCTCTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAGCTCTGATTACAGACA s simRat_chr6.simRat.chr6 482021 94 + 647215 ACATACTACACTTCACCCTGCCTTACTGCATGGTCCTGGCCTGAGCTTTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAAATCTGATTGCAGACA a s mr.mrrefChr3 27864 32 + 181019 GCAGTTGCATGACTATGATGATCCTTGTACTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472098 32 + 636262 GCAGTTGCATGACTATGATGATCCTTGTACTC s simRat_chr6.simRat.chr6 482123 30 + 647215 GCAGTTACATGATTATGATGATCCTTTCAT-- a s mr.mrrefChr3 27896 27 + 181019 TTGGCCAGACAAAGTCTTAATGTTTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472133 27 + 636262 TTGGCCAGACAAAGTCTTAATGTTTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 163578 27 - 647215 TTGGCCAGATAAAGTCTTAAAGTTTTT a s mr.mrrefChr3 27923 41 + 181019 AGGGGGAGTTATCGTCACTTTCTATTGTCTGGTGTCCTTCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472161 41 + 636262 AGGGGGAGTTATCGTCACTTTCTATTGTCTGGTGTCCTTCC s simRat_chr6.simRat.chr6 163605 41 - 647215 AGGGGGAGTTACCTTCCCTTTCTATTATCTGGTGTCCTTTT a s mr.mrrefChr3 27964 219 + 181019 AAGCAAGCGACCAACAAAAACAGGTGACTAACTGCAGAATTGTACGATTATGACTCTGCTCATTTGGAGGACCATATCTAATGCAGGTACCAGCACCCCTAGCCACCCTATCCAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCAATGCACCTCCTTGTTGATTGGAATCCATCATCTAATGTACCCCAGACTGAGAGCCAACTCAAATGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472203 219 + 636262 AAGCAAGCGACCAACAAAAACAGGTGACTAACTGCAGAATTGTACGATTATGACTCTGCTCATTTGGAGGACCATATCTAATGCAGGTACCAGCACCCCTAGCCACCCTATCCAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCAATGCACCTCCTTGTTGATTGGAATCCATCATCTAATGTACCCCAGACTGAGAGCCAACTCAAATGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 163646 219 - 647215 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ATCTAAGCTTAGCCCAAATAGTCAGGATATTGTAATGTAGTGCCTGGAAGTGTGCAT a s mr.mrrefChr3 28618 10 + 181019 TCAATTCCAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472857 10 + 636262 TCAATTCCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 164302 10 - 647215 TCAATTCCAT a s mr.mrrefChr3 28628 17 + 181019 CCTATATTCCCACAGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472867 17 + 636262 CCTATACTTCCACAGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 164313 17 - 647215 CCTGTATTCCCACAGTA a s mr.mrrefChr3 28645 24 + 181019 CTGGAATTGAATTGGAAGTTAGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472896 24 + 636262 CTCGTATTGAATTGGAAGTTAGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 164330 24 - 647215 TTGAAATCGAATTGCAAGTTAGCA a s mr.mrrefChr3 28669 261 + 181019 TTCTTTTCCTTGTTTGGTTTGTCTGCTAGAAGGATTAGTACGTCATGTTTTGTCTTCTACAATGGCAGTGTAGCTGACCTGAAAACTAAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTCTTATGGAGCTTTCTATGGTGTGACCTTGAGGGGGAGATCTAGAGGAACTTATCTTATAAGTGAAGATAGTAGCTCTGACATGATGGATGAGGAATCCCTCTTGAGTATACAGTGCCACCCAGGATGAAATCTCAAGGAACTCCAAAGACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472920 251 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 483837 232 + 647215 TACTAAAGGCATGCGGATGTGTTGCCAGCTCTCATTCAAGAGTCAAGCGTCCATTTAATATGTAGCTTAATAAAGTTGCTGTCCAGTGATCATTCAGTAACTTTCTGCCTTGAATTG-TCTGATGTCCATCCATTAATAACTCTAATCACTTGAGAGCAGGACTGTCCACAGGTTGTACACCTCTGTTGAAAGGTGCTAGACTGGCCCTTAGTCCATATTCAGAAGAGATCCT a s mr.mrrefChr3 29760 22 + 181019 GCACCATTGTCACTTCTTTGGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474000 22 + 636262 GCACCATTGTCACTTCTTTGGG s simRat_chr6.simRat.chr6 484070 14 + 647215 GTAACAAAATCAGT-------- a s mr.mrrefChr3 29782 179 + 181019 TGCCAGATACCAAATTGAAACCTCTGTATTAGTATAGCATGTGCATTATTTATAACAACAGCTCCTAATGGCCCTACCTAGAAGGGGCAAAAGGCAAGGCAGATTGAGGGAGCCTGACTTGTCATAATTCGCGCTTTTCCAAAGGGCCTTCCATGATGATGTTGGTCAAATCATTTATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474036 179 + 636262 TGCCAGATACCAAATTGAAACCTCTGTATTAGTATAGCATGTGCATTATTTATAACAACAGCTCCTAATGGCCCTACCTAGAAGGGGCAAAAGGCAAGGCAGGTTGAGGGAGCCTGACCTGTCATAATTGGCGCCTTACCAAAGGGCTCTCCAAAATGATGTTGGTCGAATCATCTATG s simRat_chr6.simRat.chr6 484084 106 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 484765 14 + 636262 CCATTTAAGGTTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 493084 14 + 647215 CTATTTAAGGTTAA a s mr.mrrefChr3 38900 415 + 181019 TAAACAAATTAGAATTTATGTCCCACAATTCTTGAAATGTTTCTATTTAAAAGTCATCTGTTACTATATCAAATTCCTTTAAAAGCTTCACTCTGCTTAATGAATGGTTTTCAGTGATGTCCCAGTCCTATTATGAACAATGCTCATTATTTAGCAACGCATGTTATCTGCCCTATCAAGTGTTAGTCCATAGAGAGATTCGAGTTGGAAGGTTAGAACAAATAAATTTATCAGTTTTTGGTTCTCCAGTATCTTCACTAATTAACCACTAACTGTGCTGACTAGTAAACCTATGATCCTGATTTGTTTTGCGATAGCAGACCTATTGTACTGAATCACTATTTATGCAGTTTTTATCACAGTTCCTGTCCTGTTCTGACTTGTATGCGTACAAACACCTTTGCTAAGTATGAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484779 404 + 636262 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mr.mrrefChr3 39696 15 + 181019 TTAGGACCTGGCCAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485573 15 + 636262 TTAGGACCTGACCAC s simRat_chr6.simRat.chr6 493921 15 + 647215 TAAGGACCAGGACGC a s mr.mrrefChr3 39711 158 + 181019 CCTGTTTGGCAATGAGAAGCCTTGAATATGACAACACAGAAACATTCAGTTCAAGATATAATCATCTTGCAAGACAAGTCAAGTAGTAAGATGTTTAAGGTACTGAGCATGCTGATCATTCTCAGTAGGCATAACATCAATAGGAGACTAATGACATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485588 158 + 636262 CCTGGTTGGCATTGAGAAGTATTGAATATGACAGCACAGAAACATTCAGTTCAAGATATAATCATCTTGCATGACAAGTGAAGTATAAAGATGTTTAAGGTACTGAGCATGCTGATCATCCTCAGTAGGCATAACATCAATAGGAGACTAATGACATA s simRat_chr6.simRat.chr6 493937 158 + 647215 CCTGTTTGGCAATGAGAAGCCTTGAATATGATAACACAGAAACATTCAGTTTAAGATATAATGACCTTGCAAGACAAGTCGAGTAGTAAGATGTTTAATGTACTGAGCATGCTGATCATTATCAGCAGAGATAACATCAATAGGAGAATAATGACACA a s mr.mrrefChr3 39869 52 + 181019 GACTTTCCACAACCCTCATACCATCTCTCATGCTATGGCAGGTACTCAAGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485746 50 + 636262 GGCTTTCCACAACCCTCATACCA--TCTCATGCTATGGCAGGTACTCAAGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 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TACCTGTATGAGAGCCTCCAAACTAGGAAGTTGAGGACTTCTTTAGCTTACTTCTACATGCATCTTAAAACTCACAATTGATTTAACATGGCCACTAAGGAACAAACCATTCCAGCCATGGCTTTATGTATAATGATCAGTACTACTCTTCTTTGCTCTATCCTTGGAATACATTCTACAGTAGATACATGGCAGGTAGGTGCCATTGATTTCTATGTTGAGAATTTAGTAGTGCCACTTACAATAGTACTATGTAGGATGA-CTTCATATCTTCATCTCAACATTACCAGTTGGTTGGGATTCCTTCTGGTAGTAAAGAGTGAGATCAGTTAATGTATTGGCCTAACATGTCAGTGCTGCTATTGTGGTGGTTGGATTTTGTTGGTAGTTGGAGTGTGTTTGGGTGCGAAGTGTTTTGGCCGATGTTACTTAGATGATGTTATCATTATTTGCGAGCTCATATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAGAATATACAAACTCCAACCAACACCACCATTCAGGTATGGTAGCTTCACATGTCTA------------- a s mr.mrrefChr3 41111 120 + 181019 ACAGCCCATAGCTGTACAGCCCATTGTCTGACCAACTTGGAATCTAAGTTTTTCCTTCTTTAGGGACAGACAAGCCTTAGGTAAAACCTCCATGATGAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486962 120 + 636262 ACAGCCCATAGCTGTACAGCCCATTGTCTGACCAACTTGGAATCTAAGTTTTTCCTTCTTTAGGGACAGACAAGCCTTAGGGAAAACGTGAATGATGAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 495332 68 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 487476 22 + 636262 TACCAATAGTCACTTGGGTGCC s simRat_chr6.simRat.chr6 495759 22 + 647215 TACCAATAGTCTCTTGTGTGCC a s mr.mrrefChr3 41612 59 + 181019 ATTTCAGTCCACTATACATGGCCACTTCAAGATTATTCTAATAATGCATAATGCCTAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487501 59 + 636262 ATTTCAGTCCACTATACATGGCCACTTCAAGATTATTCTAATAATGCATAATGCCTAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 495781 59 + 647215 ATTTCAGTCCACTATGCATGGCTACTCCAAGATTGTTCTAATAACCCATAATGCCTAGA a s mr.mrrefChr3 41671 147 + 181019 CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCACACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTGTCTATGTGAGATATTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487567 147 + 636262 CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCCCACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTATCTATGTGGGATGTTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT s simRat_chr6.simRat.chr6 495840 147 + 647215 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a s mr.mrrefChr3 41957 97 + 181019 GGTAAGGCTAGATGACATATGTACTTTCATATGGAGTAATCAAAGAGAGTTTCCAGGAATCACTCACCCCCATCCATCAGAGTGTCTAATCTGCCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487864 97 + 636262 GGTAAGGCTAGATGACATATGTACTTTCATATGGAGTAATCAAAGAGAGTTTCCAGGAATCACTCACCCCCATCCATCAGAGTGTCTAATCTGCCCC a s mr.mrrefChr3 42054 56 + 181019 AGGACTCACGGGAGACAGACATATAGCAGTAATTTTCCAGACAAGGCGATGTGCTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487962 56 + 636262 AGGACTCACGGGAGACAGACATATAGCAGTAATTTTCCAGACAAGGCGATGTGCTG a s mr.mrrefChr3 42110 50 + 181019 GAGGCTATCCTAGTTGGAAATCAAGTTTTCATTAAAGTACCCACACTTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488024 50 + 636262 GAGGCTATCCTAGTTGGAAGTCAAGTTTTCATTAAAGTACCCACACTTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 496078 36 + 647215 --------------TGGAAATCAAGTTTTCATTAAAGTGCCCACACTTAC a s mr.mrrefChr3 42160 40 + 181019 TTCAGAGGAAGGATACAGTCATGCAAAAGTGGAACCCTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488076 40 + 636262 TTCATAAGAAGGATACAGTCATGCAAAAGTGGAACCCTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 496114 40 + 647215 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TTGTGTTTTTTCCTGGAGTGAGGCCAAGGTATAAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTG--------CAGATT-----TTGTGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 496944 93 + 647215 TCGTATTTATTCCTGGACTGAAGCCAGGGTATTAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTGTTGCTGTGCAGATGATAAATTGTGAA a s mr.mrrefChr3 43208 217 + 181019 TGAGGCAAACTCTCCCCATGGGCACTGAGCCTCTATTGATTGTCATGCCTCCATCTTATCTACTTGCTTTTCAAACTTTGTAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGGGCATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCGCTCATTCAGGGTTTAGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTCTGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489202 214 + 636262 TCGGGTGAACTCTCCCCATGGGCACTAAGCTTCTATTGATTATCATGCCTCTATCTTATCTACTTCCTTCTCAAACCTTGCAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGG-CATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCACTCATTCAGGGGTTCGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTC--TT s simRat_chr6.simRat.chr6 497037 215 + 647215 TGAGACAAACTCTCCCCATGGGCACTGAGCCTCTACTGATTGTCATGCCTCCATCTTATCAACTTGCTTTTCAAACTTTGTAGGTTTGCC-ACATATAGCAGGGAGATATGTTTGAATGGGTATTGTAGAGATAGTCCCTCACCAGTGCCCGTTCATTCAAGGTCTAGCTTATGCACTTCAGACTGCATTAGATTTCTCC-TCTTGTCCCTTCTGTT a s mr.mrrefChr3 43425 118 + 181019 CCAATCACCAACAATCCCATTGCGTTTATCAATCAATCTTGTATCCTGATGACCAGGTAGCACATAATAAATAAAAATGGAGTGACAACAATACACCAGTTGCTATATGTTGTCTCTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489417 118 + 636262 CCAGTCACCAGCAGCCCCATTGCGTTTATCACCCAATCTTGTATCCTGATGACCAGGTGGCATCCAATAAATAAAAATTAAGTGACAACAGTATACCAGTTGCTATATGTTATCTCTC s simRat_chr6.simRat.chr6 497252 118 + 647215 CCAATCACCAACAATCAAATTGCGTTTATCAATCAATCTTGTATTCTGATGACCAAGTAGCACATAATAGATAAAAATGGAGTGACAACAATACACCAGTTGATATATGTTGTCTCCC a s mr.mrrefChr3 43543 368 + 181019 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TAGTTATCTAAAGGCTCCAGTGCTTGCTTAATGCCACAATATCATACCT a s mr.mrrefChr3 44006 41 + 181019 TACAGCACATCAGGGAAATGATAGTTCACTATATTATCCTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490065 41 + 636262 TACAGCACACCAGGGAAATGATTGTTCACTATATTACCTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 497850 40 + 647215 TACAGAACATGAGGGAAATGATAATTCACCATATGATCCT- a s mr.mrrefChr3 44047 119 + 181019 GAACCACTAAGCAATCACATCTACAAGATGAGAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCTGGAAGGTATGGCTCTAACCTGTGCAGTCTGTATCAATGGGTGGCTCAACTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490109 119 + 636262 GAACCACTAAGCAATCATATCTACAAGATGAGAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCGTGAAGGTAAGGCTCTAACTTGTGTGGTCTGTATCAGTGCGTGGCTCAACTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 497890 116 + 647215 GAACCACTAAGTAATCTCATCTGCAGTATGACAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCTGGTAGGTGTGGCTCT---CTGTGCAGTCTGCATCAATGGGTGGCTCAATTCA a s mr.mrrefChr3 44166 76 + 181019 TCTTGACATGATGAAGTTCTTACAGTGGTTCCTGGGGAGAAATAATGGAAAGGTGCAATAGATATCTGTAGTCCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490228 76 + 636262 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ACAGCCAGTGATAATAATAGACAGTTTAATGTCATGACAGCAG a s mr.mrrefChr3 47299 214 + 181019 TACAAAAATAATATGGATGGTTAAGAGTAGTGGGTACAGAATTGAAGGATGCAGCATAATACAAAGGCCCTTGACATTGGACCATCATTACTGTCGCTGACAACTTCATCTAGGCTTGATACTCTTCGCAACCCAATGGTAGAGCATTCAATAACTATGTTTGGCTTGGTTAACACCACCCTAAGCTCCTAGTACTGATTAATTAGCTTTAGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493039 208 + 636262 TACAAAAATAATATGGATGGTTAAGAGTAGTGGGTACAGAATTGAAGGATGCAGCATAATACAGAGGCCCTTGACATTGAACCATTATTACTGTCGCTGACAACTTCATCTAGGCTTGATACTCCTCGCAACCCAATGGTAGAGCATTCAATAACTATGTTTGGCTTGGTTAACAGCACCCTAAGCTC------CTGATTAAATAGCTTTAGCC s simRat_chr6.simRat.chr6 501290 207 + 647215 AACAAAAATAATATGGATGGTTAAGATTAGTGGGGAC------GAAGGATGCATTA-AATACAAAGGCACCTGAAACTGGACCGCCATTACTGTCGCTGACAACTTCATCAAGGCTTGATACTCTTTGCAACCCAATGGTAAAGCACTCAATAACCAAGTTGGGCTTGGCTAAGACCACCCTACGCTCCTAGTACTGATTAATTAGCTTTAGCC a s mr.mrrefChr3 47513 128 + 181019 AGCAGACCAGCAGAGATTGGTCTTTTTTATTTTGGAACCCTTGCCCTTGGCTTGCACAGGTTAAGGAAGATGACAACCTTAACTTGATGCCTGTAAGTTCATCAAGTTCAGCAGCTTTGTGAAATTTG s 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simRat_chr6.simRat.chr6 501639 12 + 647215 CTACTGGTCCAA a s mr.mrrefChr3 47695 16 + 181019 CTTACAACATTTTTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493522 16 + 636262 CTTACAACATTTTTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 501656 16 + 647215 CATACCTCATCTTCTC a s mr.mrrefChr3 47711 9 + 181019 GAAGAGCTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493542 9 + 636262 GAAGAGCTG s simRat_chr6.simRat.chr6 501672 9 + 647215 AAAGTCCTG a s mr.mrrefChr3 47720 331 + 181019 GTGCTGTGTCATTCAACCATAATGAAAAGAGATCCAAATGAATTGTTTCACCCTGTTATCATTGTTACCAAGCATGTGACCTCAGTGTAAGTTTCAGTCATAAGGATGAGTATCTTCCCCCAGACCTACCACCAATCAAGAAAAACTTTTATAAGGAGTCCACTGCAATGAGCACCATGACAAAAGTGCAAGCAGATAGTTGGAAGTATATCCCCATCCCACCATAGAGGGAAACAGAAATACTGTGCCACTGGACTGTGATAATGTATATGGACATATGTCAATGGGAGAATAATGTTAAGTCATAGCATCTGAGAATAATGTTAAGTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493552 327 + 636262 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------------GGGATGGAGTTTAGGCTCAGCATCATGGATGGTCAACTGGAGCCTAATGTCTAGCACAAGA a s mr.mrrefChr3 48124 52 + 181019 tttgtgtgtgtaaagtcacgatgttgggaccctttgaggggtattttgtata s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493955 52 + 636262 tttgtgtgtgtaaagtcacgatgttgggaccctttgaggggtattttgtata s simRat_chr6.simRat.chr6 502062 52 + 647215 TCTGTGTATATAAAGTCATGATGTTGGGCTCCTTTGGGGGGCATCTTATATA a s mr.mrrefChr3 48176 24 + 181019 acctgctaaagttagttgctcccc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494007 24 + 636262 acctgctaaagttagttgctcccc s simRat_chr6.simRat.chr6 502115 24 + 647215 ACCTGCGAGAGTGAGTTGCCCTCC a s mr.mrrefChr3 48200 18 + 181019 tcaagcatcaactgatgc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494031 18 + 636262 tcaagcatcaactgatgc s simRat_chr6.simRat.chr6 502158 18 + 647215 TCCAGCATCAGCTGATGC a s mr.mrrefChr3 48218 76 + 181019 agcatcctAGACCTACCTACATGAATGAACAATGTATAGTGAAGGGTGATGACATATCTCATGCAATGTGAGACTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494049 76 + 636262 agcatcctAGACCTACCTACATGAATGAACAATGTATAGTGAAGGGTGATGACATATCTCATGCAATGTGAGACTC s simRat_chr6.simRat.chr6 502177 76 + 647215 AGTATCCTAAACCTACCTACATGAATGAACAATGCATAGTGAAGAGTGATGACATGTCTGATGCAATATGAGACTC a s mr.mrrefChr3 48294 9 + 181019 TTTTTATGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494411 9 + 636262 TTTTTATGT s simRat_chr6.simRat.chr6 502253 9 + 647215 TTTTAAAGT a s mr.mrrefChr3 48303 64 + 181019 AAGTATGAGGGGGTGAGGACCCTAGTTCTAGATGTGGTAAAATAggagtggggggggaggaggg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494420 64 + 636262 GAGTAGGAGGGGGTGAGGACCTTAGTTCTGGATGTGGTAAAATAggagtggggggggaggaggg s simRat_chr6.simRat.chr6 502264 64 + 647215 AATGATGAGGGGGTGAGGACCCTAGTTCTAGAGGTGGTAAAATAGGGGCagggggggaggaggg a s mr.mrrefChr3 48367 232 + 181019 agggtgggggggggggaggggagggAAGTAAAGGAGGTAAAGTTTAAAGCATAACAGTGCTTTGTAAACAAATTTCACAAAATAGCATATTGCGCCAAGTTTTATAAATTGAATTCTGTTATGGTTAGGCACAGATAAGGGCTCACATTGGGTCATGACTGGTTATGTTAAAGGTAGACTCATTTTTTCTTCAATTAACAACTTGGCAAAGGCTTTTAGGTTTAAATATGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494485 210 + 636262 agagtggggggggggtaggggagggAAGTAAAGGAGGTAAGGTTTAAAGCATAACAGTGCTTAGTAAACAAATTTCACAAAATGGCATATTGCGCAAAGTTATGTAAATTGAATTCTGTTATGGTTAGGCACAGATAAAGGCTCACATTGAGTTATGACTGGTTATGTTAAAGGTAGACTCATTTTTTCTTTGATT----------------------GGATTAAATATGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 502328 230 + 647215 agggtgggggggagggaggggagggaggTAAAGGAGGTAAAGTTTAAAGCATAATAGTGCTCTGTAAACAAATTTCACAAAATAGCACATTGC-CCAAGTTTTATGAATCGTATTCTGTTCTGGTTAGGCACAGATAAGGGCCCACATTGGCGCATTACTCACTATGCTAAAGGTATACTCA-TTCTTCTTCAATTAACAACTTGGCAAAGGCTTTTAGGTTTAAATATGAC a s mr.mrrefChr3 48599 524 + 181019 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2 + 636262 AT s simRat_chr6.simRat.chr6 509235 2 + 647215 AT a s mr.mrrefChr3 50588 101 + 181019 TTGTTCTCTCCAGCATTACCTGTACCATTGTAGTACTCTGATAATTACGCCCTTTCATTCTTTACCTTTATTTTTTTGGGTACAAATTCTCCTCTCAGTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496589 100 + 636262 TTGTTCTCTCCAGCATTACATGTACCATTGCAGTACTCTGATAATTAAGCCCTTTCATTCTTTACTTTTATTTTTTTGGGTGCAA-ATCCACTCTCAGTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 197295 101 - 647215 CTGGTCTCTCAAGCATTACCTGTACCATTGTACTCCCCTGATACTTCCTCTCTTTCATACTTTATCTTCTTTTTTTTAGGTACAAATTCTCCTATCAGTCC s simRat_chr6.simRat.chr6 509237 100 + 647215 TTGTTCTCTCGAGCATTACCTGTACCCTTTTAGTACTCTGTGAATTATGCCCTTTCATTCTTTACCTTTACTTTTTTGGGTACAA-TTCTCCTCTTGGTTC a s mr.mrrefChr3 50689 14 + 181019 TACCTCCTTGCTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496689 14 + 636262 TACCTCCTTGCTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 509337 14 + 647215 TACCTCCTTACTTC a s mr.mrrefChr3 50703 1 + 181019 A s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496703 1 + 636262 A s simRat_chr6.simRat.chr6 197396 1 - 647215 A s simRat_chr6.simRat.chr6 509351 1 + 647215 A a s mr.mrrefChr3 50704 6 + 181019 GAAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496714 6 + 636262 GAAGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 197397 6 - 647215 GGAAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 509352 6 + 647215 GAAGAT a s mr.mrrefChr3 50710 259 + 181019 CTTTAGTAGTCATAGTTGTCTTGGCTATCCAGTTTGGTACCTCTGGGGCCGAGTGATATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAGTTGTTATCTCACTCCTACAACGCTAGTCCGTTTCAGGTGGACTCTCACATATTGAGGATCCAAAGCCACCTGCTATGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCTCTTCGTACTAGAGCATTTGTATATATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496720 259 + 636262 TTTTAGTAGTCATAGTTGTCTTGGCTATCCAGTTTGGTACCTCTGGGGCCGAGTGGTATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAGTTGTTGGCTCCTTCCTGCAACACTAGTCCATTTCAGGTGGGCTCTCACAAATTGAAGATCCAAAGCCACCTGCTATGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCTCTTCGTACTAGAGCATCTGTATACATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 509358 258 + 647215 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mr.mrrefChr3 51144 9 + 181019 GTCTGTTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497153 9 + 636262 GGCTGTAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 509778 9 + 647215 GTCTGTTAA a s mr.mrrefChr3 51153 21 + 181019 GATAGGAATATAACGCTGTCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497162 21 + 636262 GATAGGAATATAACGTGGTCC s simRat_chr6.simRat.chr6 509798 21 + 647215 GATAGGAATATAACACTGTCT a s mr.mrrefChr3 51174 78 + 181019 CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCATATAAGGCACTTCTAAAGTCAGAAGCCTGAACAAAGGAGACTCCTCATACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497183 78 + 636262 CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCTTATAAGGCACTTCTAAAGTCAGAAGCCTGAACAAAGGAGACTCCTCATACA s simRat_chr6.simRat.chr6 509838 78 + 647215 CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCATACAAGGCACTTCTAAAGTCAGCAGCCTGAGCATAGGTGACCCCTCGTACA a s mr.mrrefChr3 51252 28 + 181019 TCATATTGTATCCCACTAGTTTACAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497263 28 + 636262 TCATATTGTATCCCACTAGTTTACAGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 509916 28 + 647215 TCATATTGTAACCCACTAGTTTACAGGT a s mr.mrrefChr3 51280 365 + 181019 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TGTCATACTCAAGAAACAGAGCTTTTGAGATGAGATTTTTTGGAATTGGATCTGTAACTTCGTGCTACCTCATGACAACTCAGCAGCTCCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGATAGTTGATATAGACAGGAAACTAACTTGTATACCTGCAAAATGTATACACTTTCTTACACATTACTTTGATGTTCCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTACTCATTATAAAGCCCTTAATTTGAAGCTTTAGGCAATGTGAGGATTAGATAACACAATCAAAAagtgggcaagacctctgattcactctgcacatgagaaagatgTTACGCC a s mr.mrrefChr3 51645 85 + 181019 tgagggtggcgttccgcccacagactctactaccccactgctgggtgcccctgggttcttttttgaaggattCATAGTGGTAGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497712 85 + 636262 tgagggtggcgttccgcccacagactctactaccccactgctgggtgcccctgggttcttttttgaaggattCATAGTGGTAGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 510309 85 + 647215 TgagggtggcattccgcccacagagccacctaccccattgcttggtgtccctgggttctctttgAAGGGATCTATAGTGGTAGTT a s mr.mrrefChr3 51730 50 + 181019 GAAGATATGGTCAATGTGAATAAAAGGCAGTGGTCATGTACACGTGATTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497798 50 + 636262 GAAGATATGGTCAATGTGAATAAAAGGCAGTGGTCATGTACACGTGATTA s simRat_chr6.simRat.chr6 510394 50 + 647215 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TGACAGTCCACAGAAAGGTTGTATTGTTGATATGGGTTCTGGTGGAGGAGTCTAAACAATTGAAAGGAGGTTTTGGATGACGCGAAAAGGATGTTAGAGATGGGTTATAAACCCCAAGTAATGAGGATTCTACTAGATGTATGTCCAGACAAACAAGCATTGATGACCAGGTTGGAAATCACAGACCAGCATTGACATGACCAGGTTGGGAATTGCACTTCCCTAAGTGCTATG s simRat_chr6.simRat.chr6 511022 234 + 647215 TGACAGTCAGTAGATAGATTGTATTGTTGATATGGGTTCTGGTGGAGGAGACTAAGCAACTCAAAGGAGGTCTTGGAGGACGCAAAAAGAATGTTAGAGATGGGTTACAAACCCCAAGTAATGAGGATTCTATTAGACGTATGTCCAGACAAGCAAGCATTGATGACCAGGTTGGAAATCACAAGCAGACATCAGGATGATCAGACTGGGAATCGCACTTCCCTAACTGGTATG a s mr.mrrefChr3 52594 71 + 181019 ACTATGAAGATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTCGCCTTTTGCTTTGTTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498670 71 + 636262 ACTATGAAGATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTCGCCTTTTGCTTTGTTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 511256 71 + 647215 ACTGTGAACATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTTGCCTTTTGCTTTATTGA a s mr.mrrefChr3 52665 10 + 181019 AAAGTGTAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498743 10 + 636262 GCAGTGTAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 511327 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simRat_chr6.simRat.chr6 513019 26 + 647215 cactgaagatgccaaagtcaaaggca a s mr.mrrefChr3 54319 76 + 181019 gttaaacccacaatccacaagaatgtgaatgtacacatttaaagacgccatgtaggttacaagaagagaagtctTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500373 76 + 636262 gttaaacccacaatccacaagaatgtgaatgtacacatttaaagacgccatgtaggttacaagaagagaagtctTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501760 76 + 636262 gttaaacccacaatccacgagaatgtgaatgtacacatttaaagacgccatgtaggttacaagaagagaagtctTG s simRat_chr6.simRat.chr6 513046 76 + 647215 gttcaacccataatccacaagaatgtgaatgtacacaatcaaagaggccatgtgtattacaagaagagaagtctTG a s mr.mrrefChr3 54395 69 + 181019 AAAGCATATTGTAAGATAAGATGTGCCCAGTGCCCAATTATCTTTTGGGTTTTAATCACTGTGATGGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500449 69 + 636262 AAAGCATATTGTAAGATAAGATGTGCCCAGTGCCCAATTATCTTTTGGGTTTTAATCACTGTGATGGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501836 69 + 636262 AAAGCATATTGTAAGATAAGATGTGCCCAGTGCCCAATTATCTTTTGGGTTTTAATCACTGTGATGGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 513127 40 + 647215 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ATTTAATCAACTTGCGATGAAAAGCCATCTCTTAGTTACTATTGCTTGGTCTTATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGAACTCATTGTAACGTAAAGTTCAGTCATTTTGATTTTGTATAATAATAAGTGATTTCCTGTGCTGCTTTATCACTGTAGGGCCTGCAGAGGCCCGCCCTTACCCAGCAGTCTGGCGGAAGTACTCACAGGGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAATAACAATGTAGGTGGGATATGAGTTAAATGTCATTGAACG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503947 285 + 636262 ATTTAATCAACTTGCGATGAAAA-CCATCTCTTAGTTACTATAGCTTGGTCTTATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGAACTCGTTGTAACATAAAGTTCAGTCATTTTGATTTTGTATAGTAATAAGTGATTTCCTGTGCTGCTTTATCACCGTAGGGCCTTCAGGGGCCCGCCCTTACCCAGCAGTTTGGCGGAAGGACTCACAGTGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAAGAACCATGTAGGTGGGATTTGAATTAAATGTCATTGAACG s simRat_chr6.simRat.chr6 515244 283 + 647215 ATTTAGTCCA-GTGCGGTGAAAAGGCATCTCTTGGTTACTATTGCTTGGTCCCATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGACCTCATTGTAACGTAAAGGTCAGTCA--TTGATTTTGTATAATAGTAAGTGATTTCCAGTGCTGCTTTAAAACTGTAGGGCCGGCAGAGGCCCATCTTTACCCAGCAGTCTGGCAGAAGTACTCACAGGGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAATAACAATGTAGGTGCGATATGAGTTAAATGTCATTGGACT a s mr.mrrefChr3 56748 219 + 181019 CACAGCACCCAAAGCCTCCCACTTGGAACCATACTTGTAATCAATTTCTAGTCCATAAGTTCAGTGAAGCAAAATATAATTGTTACAACAGAAGAGGATAAATGGAGCCACATGCATAATTCCCTTCAGAGTGTCTCATCTTCAGACAAAGTTATTGTCTTTGTGCCCCGAAGGACTTTGTATAGAGACCATGTGAGGGCGGCAGAAACTAATAGAGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 504232 219 + 636262 CACAGCACCCAAAGCCTCCCACGTGGAACCATACTTACAATCAATTTCTAGTCCATAAGTTCAGTGAAGCAAAATATAATCGTTACAACAGAAGAGGATAAATGGAGCCACATGCGTAATTCCCTTCAGAGTGTCTCATCTTCAGACAAAGTTATTGTCTTTGTGCCCCGAAGGACTTTGTAGAGAGACCATGTGGGGGCTGCATAAATTACTAGAGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 515528 218 + 647215 CACAGCACCCAAAGCCGCCCACTTGGAACCCTACTTGTAATCAATTTCTAGTCCATAAGTTCAGTGAAGCAAAATATAATTGTTACAACAGAAGAGGATAAATGGAGCCACATGCATAATTCCCTTCAGAGTGTCTCATCTTCAGACAAAGTTATCGTCTTTGTGCCCCGAAGGACTTTGTATAGA-ACCATGTGAGGGCGGCAGAAACTAATAGAGAG a s mr.mrrefChr3 56967 226 + 181019 AAGCATTATTGACCCCCTGTAGGGAGACTTATCTGCCCAACTATTTACACAAACACTAAGTTGAAACTGTCTCCTGAAGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCAAGTGATTTAATACTTGGAACCAACTCAGTAGCTTTGCAAGCAGATAAGGAACAGCGGGATCAAGAGAAGCTAGAAAATTTTAAAACAGGTGTGTTCTCAGATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 504451 226 + 636262 AAGCATTATTGACCCCCTGTAGGGAGACTTATCTGCCCAACTATTTACACAAACACTAAGTTGAAACTGTCTCCTGAGGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCGAGTGATTTAATACTTGGAACCAACTCAGTAGCTTTGCAAGCAGATAAGGAGCAGCGGGATCAAGAAAAGCTGGAAAATTTTAAAACAGGTGTATTCTCAGATG s simRat_chr6.simRat.chr6 515762 226 + 647215 AAGCATGATTGACCCTTTGTAGGGAGGCTTATCTGCCCAACTATTTACATGAACACTAAGTTGAAGCTGTCACCTGAAGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCAAGTGATCTAATACTTGGTACCAACTCGGTAGCTTTGCAAGCAGATAAAGAACAGCAGGATCAAGAGAAGCTAGAAAATTTTAAAATGGGTCTGTTCTCAGATG a s mr.mrrefChr3 57193 571 + 181019 CAGGTACGTATTCCAGGTTGGATGCCTATTATTACCTGCTGATCAACTGTTTCCATCCTATGAGCTGACCTCGATCATGCATAGTCTAATTTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATGAAACCAATGATTGATAAGGAGATAAACTATGGTGAGTGCTTTAGTATGGGTCTGGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAAATAGTTGATGTAGGCTTACTAATAGATATGTATCGACATTGTCTAACTATTTCTTCTAGGACAGGACAGAATCCTGGTTGCAGCTGATCTTGGCACTCGAGGTGTCCATGATGTGTCTCACATTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTTGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCATGAATAGTAGGCCATCTCTGTTAGCTTTTCATACCTCTCACTGTAGACCACCATAATTGCCCTTCATGAGTGTACTGCATACTCACAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCCATCAGAATAAAATATCTTATCCATTGGAGTCCCAAATCTATGAATAAATTATCAAACACAAGTTAGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 504678 565 + 636262 CAGGTACGTTTTCTAGGTTGGGTGCCTATTACTACCTGCTGACCAACTGTTTCCATCCTATGAGCTGACCT--GTTATGCATAGTCTAATCTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATGAAACTGATGATTAATCAGGAGATAAACTATGGTGAA-GCTTTAGTATGGGTCTAGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAAATAGTTGATGTAGGCTTACCAATAGATATGCATCGACAGTGTCCAACTATTTCTTCTAGGACAGGACAGAATCCTGGTTGCAGCTGATCTTGGCACTCGAGGTGTCCATGAGGTGTCTCACACTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTAGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCTTGAATAGTAGGCCATC---GTTAGCTTTTCATACCTCTCACTGTAGACCACTATAATTGCCCTTCGTGAGTGTACTGCATACTCCTAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCCATTAGAATAAAATATCTTATCCATTTGAGTCCTAAATCTATGAATAAATTATCAAACACAAGTTAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 515988 571 + 647215 CAGACACGTATTCCAGGTTGCATGCGTATTATTACCTGCTGATCAACTGTTTCCGTCCTATCAGATGACCTCGATCATGCATAGTCTAATTTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATTAGACCAACCATTGCTAAGGAGATAAACTATGTTGAGTGCTATCGTATGGGTCTGGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAGATAGTTGATGTAGGCTTACTAATAGGTAAGTATCGACATTGTCTAACTACTTCTTCTAGGACAGGACAGAATGCTGGTTGTGGCTGATCTTGGGACTCGAGGTGTCCACGATGTGTCTCACATTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTTGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCATGAAAAGTAGGCCATCTCTGTTAGCTTTTCATACCTCTCGCTGTAGGCCACCATAATTGTCCCTCATGAGTGTAGTGAATGCTCACAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCTATCAGAATAAATTATCTTATCCATTGGAGTCCCAAGTCTAAGAGTAAATGATCAAACACAAGTTAGAA a s mr.mrrefChr3 57764 253 + 181019 CTGTATGCCATTGTCTCTTGTGCCACCTATTTGTAAGCAGAACTGGTGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATATTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCATCATTTCATGCACACTGTTAATTAGACGAAAACTCCTGCTAATTCATTCAGGCAACTGCACCAGAAAAGGAATATGGGATATACCAAGAGTGAAGGACATATCCATGGAGTCTGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505243 253 + 636262 CTGTATGTGATCGTGTCTTGTGCCACCTATTTGTAAGAAGAACTGGTGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATATTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCATCATTTCATGCACCCTGTTGGTTACACGAAAACTCCTGCTAATCCATTCAGGCAACTGCACCAGAAAAAGAGTATGGGATATACCAAGAGTGAAGGACATATCCATGGAGTTTGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 516563 252 + 647215 CTGTATGCCATTGTCTCTTGTGCCACCTATTTGGAAGCAGCACTGGCGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATGTTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCA-CATTTCATGCACACTGTTAATTAGACCAAAACTCCTGCTACTTCATTCAGGCAACTCCACCAGAAAAGGAATGTGCGATATACCTAGAGTGAATGACATATCCATGGAGTCTGGG a s mr.mrrefChr3 58017 95 + 181019 ATAACAAGGTATGGATATGGGTACCCACAACAGAGAGAGTCAACATATGGTTTATATGGTTTAAACTGTTTGAGCTTGTTTAATTGCTTCAGGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505501 42 + 636262 ATAACGAGGTAT-----------------------------------------------------CTGTTTGAGCTTGTTTAATTGCTTCAGGCC s simRat_chr6.simRat.chr6 516815 95 + 647215 ATAACAAGGTATGGATATGGGTACCCACAACAGAGAGAGTCAACATATGGTTTATATGGTTTAAACTGTATGAGCTTGTTTAATTGTTTGAGGTC a s mr.mrrefChr3 58112 23 + 181019 AACTGTGAATTTAGCTTAAAGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505545 23 + 636262 AACTGTGAATTTAGCTTAAAGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 516910 23 + 647215 AACTGTGCATTTAGTTTAAAGGG a s mr.mrrefChr3 58135 31 + 181019 CAGTTCTATGAACATGTAGGCGTTAACAGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505568 31 + 636262 CAGTTCTATGAACATGTAGGCGTTAACAGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 516934 31 + 647215 CAGTTCTCTGAACATGCAGGTGTTAATGGGA a s mr.mrrefChr3 58166 81 + 181019 CTAAAACTTATTACCCCTTAGCAGGTAAGAATGCCCCTGGCAACTTCATATCTGAACAGCTATATTGACAACCTGCTCTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505600 81 + 636262 CTAAAACTTATTACCCCTTAGCAGGTAAGAATGCCCCTGGCAACTTCATATCTGAACAGCTATATTGACAACCTGCTCTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 516965 81 + 647215 CTAAAACTTATTACCCTTTAGCAGGCAAGAATACCCCTGGTGTCTTTGTATCTGAACAGCTATATTCACAACCTGCTCTGC a s mr.mrrefChr3 58247 18 + 181019 AACTCATATCTCACAGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505696 18 + 636262 AACTCATATCTCACAGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 517046 18 + 647215 AACTCATATCTCACAGAG a s mr.mrrefChr3 58265 23 + 181019 ACACAATAATAAGAAGTTGGTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505715 23 + 636262 ACACAATCATAAGAAGTTGGTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 517064 23 + 647215 ACACAATACTAAGGATTGGGTCT a s mr.mrrefChr3 58288 232 + 181019 CAGAGCATCCCAGAAGAGCTAGTTTCAATGGTTGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGAGGAGTGAGATGGAGAGAAAGATGGAAAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCACCAATTTTTTCAGGGAGGCAGGTGTGGTACCTCCAACTATATTATTGGCTTTTAGCTACAAAACTGCTTACTCTAGATGCTAGTAGAAATGTTTTCAATTAGTTCCCATTACTTTGACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505739 226 + 636262 CAGAGCATCCCAGAAGAGCTAGTTTCAATGGTTGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGCGGACTGAGATGGAGAGAAAGATAGAGAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCACCAGTTTTTTCAAGGAGGCAGGTGTGGTACCTCCAACTATATTATTGGCTTTTAGCTACAAAGCTGCTTACTCTAAATGC------AAATGTCTTCAATTAGGTCCCATTACTTTGACT s simRat_chr6.simRat.chr6 517087 232 + 647215 CAGAGCATCCCGGAAGAGCTAGTTTCAATGGTCGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGAGGAGTGAGATGGAGAGAAAGATGGAAAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCATCAATTTTTTCAGGGAGGCAGGTGTGGTACCTTCAACTACACTATTGGCTTTTAGCTACAAAACTGCTCACTCAAGATGCTAGTAGGAATGTTTTCAATTATTTTCAATTACTTTGGCT a s mr.mrrefChr3 58520 262 + 181019 AGTATACAAGCAACTGTTCCCATCGTTTATTCAAAATTTTAAGGCTCTCAGGATGCATTGATGGTGCCAAAAGATGGGCCTCTGTTCTTGATAATGAGATATCTTACTCTGGGAAATCTAGATGTAAACCAACATTTCGGGGTTTTGTGGACTCACCAAGACTTGATTAATCCGAAAGGCAGGCCTATTCACATGATGCTGAGATATCTTATTCTGGGAGATGTAGATGTAAAAGCTCTACACAATGAAGGACCTTAGTGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505965 260 + 636262 AGTGTACAAGCAGCTGTTTCCATAGTTTATTCAAAATTTTAGGGCTCTCAGGATGAACTGATGGCACCAAAAGGTGGGCCT--GTTGTTGATACTGAGATATCTTACTCTGGGAGATCTAGATGTAAACCAACATTTCGGGGCTTTGTGGACTCACCAATACTTGATGAATCCGAAAGGCAGGCCTATTCACTTGATGCTGAGATTTCTTATTCTGGGAGATGTAGATGTAAAAGCTCTACACAACGAAGGACTTTAGCGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 517321 262 + 647215 AATATACAAGCAACTGTTCCCATCGTTTATTCACAATTTCAAGACTCTCAGGATGCCTTGATGGTGCCAAAAGATGGGCCCCTATTCCTGATAATGAAATATCTTACTCTGGGAAATCTTGATGTAAACCGACATTTTGGGGTTTTCTGGACTCACCAAGACTTGATTAAGCCAAAAGGCAGGCTTATTGACATGATACTGAAATATCTTACTCTGGGAGATGTCAATGTAAAAGCTCTAAACAATGAAAGACCTTAGTGGC a s mr.mrrefChr3 58782 53 + 181019 GGGTGAAAAATAATTGTAAACATATAATGTATAAGCCTTGGGAAGGTATAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506279 53 + 636262 GGGTGAAAAATAATTGGGAACATATAATGGATAGGCCTTGGGAAGGTATAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 517583 53 + 647215 GGTTCAAAAATAATCATAAATATATGATGTATAAGCCTTGGGAAGGTATAATG a s mr.mrrefChr3 58835 31 + 181019 GCATAATCCTACATACTAAGGCTATATAACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506334 31 + 636262 GAATAATCCTACATACTAAGGCTATATAACA s simRat_chr6.simRat.chr6 517636 31 + 647215 GCATAGTCCTACATGCTGAGGTTATATAACA a s mr.mrrefChr3 58866 160 + 181019 TAATGCCACTTGGCTTTTGATAAAGGTAGAGACAAGCGGTAACCCATTATACATAATGGGTATTTGGAAATCTGGGACCCAATGTAAAATATAATGTATGATCCTACATACTGAGACCACATTAATAATTGGTCAACTAGTCTTCCATTAGGGCAGAGGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506365 160 + 636262 TAATGCCACTTGGCTTTTGATAAAGGTAGAGATAAGCGGTAACCCATAATACATAATGGGTATTTGGGAATCCAGGACCCAATGTAAAATACAATGTATAATCTTACATACTGAGACCACATTAATAACTGGTCAACTAGTCTTCCATTAGGGCAGAGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 517681 160 + 647215 TAATTCCACTGGGCTATGAATAAAGGTAGAGACAAGCAGTAATCCATTATACAAAATGGGTACTTGGAAATCTGGGACCCTATGCAAAATATAATGTATGAGCCTACATACTGAGAACACATTAAAAATTGGTCTACTAGTCTTCCTCTAGGGCAGAGGC a s mr.mrrefChr3 59026 207 + 181019 CACATTTTAACTACTTGTACAGGGTCATGAAATGGGTACCTTGAAGACTTTGCTTGGAAGACCAATAATTTTTTGATTGTGCAGGTGCTTATCTTTTCCAGGGCACTGCTGATGATAAAGATTCTTCTAGTGTAATGTTAGAATAATTCACCTATTAGTAGCTCAGTAAAAAATGGTTTTGGTACTCTAGTAAGCCTGGAGACATGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506525 205 + 636262 CGCAGTTTAACTACTTGTACAGGGTCATGAAATGGGTACCTTGAAGACTTTGCTTGGAAGACCAATAATTTTTTGATTGTGCAGGTGCTTATCTTTCCCAGGTCACTGCTGATGATAAAGATTCTTCT-GTGTAATATTAGAATCATTCACCTATTAGTAGCTTAGTAAAAAATG-TTTTGGTACTCCAGTAAGTCTGGAGACATGT s simRat_chr6.simRat.chr6 517849 192 + 647215 CACATTTTAACTACTTGT---------------GGGTACCTTGACAACTGCGCATGGAAGACCAATATTTTTTTCATTGCACAGGTGCTTATCTTTTCCAGGGCACTGCTGATGATAAAGATTCTGCTAGTGTAATGTTAGAATAACATGCCTATTAGTAGCTCAGAAAAAAATGGTTTTGGTTCTCTTGTGAGCCTGGATATATGT a s mr.mrrefChr3 59233 51 + 181019 CTGGATGTATGCTTACTCACTTACCCACAACATACTTCACTCAAGAGTTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506738 51 + 636262 CTGGATGTATGCTTACTCACTTACCCACAACATACTTCCCTCAAGAGTTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 518041 51 + 647215 CTGGATGTATGCTTGCTCACCTACCCACAAGATACTTCACTCAAGTGTTAA a s mr.mrrefChr3 59284 37 + 181019 TTCAGCATTGAAAACGAACCAGAGATCTCTTGTTGGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506796 37 + 636262 TTCAGCATTGAAAAGGAACCAGAGATCTCTTGTTGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 518092 37 + 647215 TTCAGCATTGAAAACGAACCAGGGCTTTCTTGTTGGC a s mr.mrrefChr3 59321 50 + 181019 TCAAACAGAAAAGAATATTCTGAAGCAGCTAAAATGCTAACATATTCAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506833 50 + 636262 TCAAACTGAAAAGAATATTCTGAAGCAGCTAAAATGCTAACATATTCAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 518130 50 + 647215 TTAACCAGAAAAGAATATTCTGAAGCAGCTAAAATGCTAACATATTCAGG a s mr.mrrefChr3 59371 98 + 181019 CAGAAAAAACAAAGATCCATCAGTGGCTAGTACCCCATAAGGAATTTGTGTTTCCCCCAGTTGGTAATAATCCTATTGTGCAGAATTAAGGATAAAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506883 98 + 636262 CAGAAAAAACAAAGATGCAGCATCAGCAAGTACCCCATGAGGGATTTATGTTTCCCCTGGTTGGTAATAATCCTATTGTGCAGAATTGAGGATAAAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 518187 98 + 647215 CCGAAAAAACAAAGATCCATGAGTGGCTAGTAACCCACAAGGAATTTGTGTTTCCCCCAGTTGGTAATCATCCTATTGTGCAGAATTAAGGATAACAT a s mr.mrrefChr3 59469 123 + 181019 TTTTTGGCTTGGCTGATCAATTGAAAATGACTTGCCATGTCAGTATGGAATTGCATTATTCCTAATGTAAAGAAGGCTGGTATATCCAGACTTTCTTTGGTTCAATTTCACCAAGGAGAGAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506982 123 + 636262 TTTTTGGCTTGGCTCAGTAACTGAGAAAGGCTTGCCATGTCAATATGAAATTGCATTATTCCTAATGTAAAGAAGGCCGGTATATCCAGACTTCCTCTGGTTCAATTTCACCAAGGAGAGAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 518285 123 + 647215 TTTCTGGCTTGGCTGATCAATTGAAAATGACTTGCTATGTCAGTATGGAATTGCATTATTCCTAATGTATAGTAGGCTGCTATATCCAGACTTTCTTTGGCTTAATTCTACCAAGGAAAGAGG a s mr.mrrefChr3 59592 103 + 181019 TAATAGCAAAATTAGGGAGTCCTCTCTCTTAGTTGTATAAGTACCACCAAATTGAATGAGGGTCAATCTATCTCCCAGTTACATTCACATGAAGCTATCAAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507105 103 + 636262 TATTAGCAAAATTAGGGAGTCCTCTCTCATAGTTGTATAAATACCACCAAATTGAATGAGGGTCAATCTATCTCCCAGTTACATTCACGTGAAGCTATCAAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 518409 103 + 647215 TAATCTCAAAATTAGGTAGTTCTCCCTCTTAATTGTATAAGTACCACTAAATTAAATGAGGGCCTATCTCTCTCCCAGTTGCATTCACATGAAGCTATAAAAT a s mr.mrrefChr3 59695 180 + 181019 ATCCTCTCATCAAACGTAATGAAAGTTCACAGAACGTCACATGTCTTGCAATACTTTAAGAAGTTGGTTTCTGTGAAGAGTCTGACTCCCAAAAATGTTATGTTTCAAGGAAGTCTCCTTTGACCTATGGACACTATAACACTGCTTGTCCCAAATTTCCATGCCATTAGATTCCTTTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507208 180 + 636262 ATCCTCTCATCAAACGTAATGAAAGTTCACAGAACGTCACATGTCTTCCAGTACGTTAAGAAGTTGGTTTCTGTGAAGAGTCTGACTCCCAAAAATGTTATGTTGCAAGGAAGTTTCCTTTGGCCTATGGACTCTATAACACTGCTTGTCCCAAATTTCCATGCCATTAGAGTCCTTTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 518513 177 + 647215 ATCCTCTTGTCTAATTTCATGAGAGTTCACAGAAAGTCACATGTCTTGCAATACTTTAAGAAGTCGGATTTTGTGAACAGGCTGATTTCCTAAAATGTTATGCTTCAAGCAGGACTCCTTTGACCTATGGGCACTATAACACT---TTTCTCAAATTTTCACGCCATTAGGTTCCTTTGC a s mr.mrrefChr3 59875 28 + 181019 AAGGAGACAAGTGACACATTGGAACTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507389 26 + 636262 AAGGAAACAAGTGACACATTGGAGCT-- s simRat_chr6.simRat.chr6 518690 28 + 647215 AAGGAGACAGGCGACACATTGGAAATTT a s mr.mrrefChr3 59903 100 + 181019 TTTGAATCAGCCATGTCTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAGCCTCTGCATCTATCATCCAAGGCTGCTTTTTATTGAAAGTTGCCCGCTGGATTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507415 93 + 636262 -------CAGCCATATTTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAGCCTCTGCGTCTATTATCCAAGGCTGCTTTTTATTGAAAGTTGCCCGTGGGATTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 518750 97 + 647215 TTTGAATCACCCAAGTCTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAACCTCTGCATCTATCATCCAAGGCTGCTCTTTATTGAAAGTTGCCCGCTGGAC--- a s mr.mrrefChr3 60003 641 + 181019 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 509952 13 + 636262 AAGACATTTCTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 370160 13 - 647215 AAAAGTTCACTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 521248 13 + 647215 AAGACATTTCTAC a s mr.mrrefChr3 62409 2 + 181019 TT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509965 2 + 636262 TT s simRat_chr6.simRat.chr6 521261 2 + 647215 GT a s mr.mrrefChr3 62411 7 + 181019 TTAATAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509967 7 + 636262 TTAATAG s simRat_chr6.simRat.chr6 370173 7 - 647215 TCATCAG s simRat_chr6.simRat.chr6 521263 7 + 647215 TTAATAG a s mr.mrrefChr3 62418 4 + 181019 GCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509974 4 + 636262 GCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 521270 4 + 647215 GCTA a s mr.mrrefChr3 62422 146 + 181019 GTTGGGGATTAATGGCCTGCCAAATTGGTTTTATAGCATGTGTTACAGCATGGCTGTAGGAGTCCTAGTGTGCAGTGGATCTCTGTTTCTAAACTTGATGATATAATTATCATCCTTGTTTCATATATCTGGAACATGCCTGAGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509978 143 + 636262 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GTTGTTCTTGTACCCCATCATATTTTTATGATTTTGTTAACTATGAACATACTTAAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511089 57 + 636262 GTTGTTCTTGTACCCCATCATA-TTTTATGAGTTTGTTGACCATGACCATACTTAAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 522443 58 + 647215 GGTGTTCTAGTACCCTATCACATTTTTACAATTTTGTTAACTATGAACATACTTAAGA a s mr.mrrefChr3 63585 145 + 181019 AAGAATCAGCAAGGATGTGCAGAAAAAATACCTAGTAATTGGCGAATTTTGTTCACAATCTATTTACAAGTCATTAATTGGATGTTTTATTATTCTATTAACCTGTTATCTTGCCTCTGTTGTAAGGATACTCATAGGAACCCTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511146 135 + 636262 -------AGCAAGGATGTGCATAAAAAATACCTATTCGTTGGCGAATTCTGTTTAAAATCCATTTACAAGCCATTAATTGGATGTTTTG-TACTCTATTAACCTGTTATCTTGCCTCTGTTGGAAGGATA--CATAGGAACCCTC s simRat_chr6.simRat.chr6 522504 143 + 647215 AAGAATCAGTAAGGATGTGCAGAAAAAATATCTAGTAATTGGCCAATTTTGTTCCCAAACTATTT-CAAGTCATTAATTGGATGTTTTATTATTCTACTAACCTGTTATCTCATCTCT-TTGTGAGGATACTCCTAGGACCCCCC a s mr.mrrefChr3 63730 994 + 181019 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 511281 934 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 522649 974 + 647215 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mr.mrrefChr3 64724 45 + 181019 CTCACCTTatctttgaaCTCCTTATCACtAGCTgatctggaagtc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512215 28 + 636262 -----------------CTTATTATCACTAGCTgatctggaagtc s simRat_chr6.simRat.chr6 523624 44 + 647215 CTCACCTTATCTTTGAACGCCTTATCAC-AGCTGATGTGGAAGTC a s mr.mrrefChr3 64769 502 + 181019 tcttaaaaattgggaagccaagacctattgagctgtactgtgtcatagtaaccaaactagaaaagggatatggaatctaGGTCGACAGTATTGAATCACAGACTCTCTACAATTGATTGTCACTGTTCAATCTAACTATTTTTGGGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTTCAAGTGGAGTGGCTACTGCAGTAGGCTTGTCTATAGCAAACCTAAACAAGTTTCTGCCTAATGTATCGGAACACTAATACCTCTATAACACTAAACTAAGATCAAGGTTCACTTGCTCGGCCTTTTTATTGGCCTTTAAACAATATTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCAACATAACTAGGAGCATCAAATAACGGAATTGTCAAAAGGTCCTTTTAGTATGTAATGCATTCTAGAATTTTTGGGACTAGGAGTAAACATGCCCTAGAGTATCCCTCCAGGTTTATACAAAATGTGCTTAGGGTAGCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512244 476 + 636262 tcttaaaactgggcaagccaagacctattgagctgcactgtgtcatagtaaccaaactagaaaagggatatggattctagGTAGACAGTATTGAATCATAGACT---TACAATTTATTATCGCTGT------------------GGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTTCAAGTGGAGTGGCTATTGCTGTAGG-TTGGCTCTAGCAAACCTAAACAAGTTTCTCCCTAATGTATCAGAACACTAATACCTCTATAACACTAAACTAAGATCAAGGTTCACTTGCTCGGCCTTTTTATTGGCCTTTAAACAATACTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCAACACAACTAGGCACATCAAATAACGGAATTGTGGAAAGGTCCTTTTAGTATGTAATGCAGTCTAGAAATTTTGGGACTAGGAGTAAACATGCCCTAGAGTATCCCTT---ATTCATCCAAAATGT-CTTAGGGTAGCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 523668 502 + 647215 TCTTAAAAATTGGGAAACCAAgacctattgagctgtgctgtgccatagtaaccaaattagaaaagggatatggaatctaTGTCGACTGTATTGAATGACTGACTCTCTACTATTGATTGTCACTGTTCAATCTAACTATTTTTGGGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTCCCAGTGAAGCGGCTACTGCAGTAGGCTTGTATATAGTAAACCTAAACTAGTTTCTGCCTAATGAATGGGTACACTAATACCTCCATAACACTAAACTAAGATCTAGGTTCACTTTCTTGGCCTTTTTATTGGCCCTTAAACAATGTTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCGACATAATTAGGAGCATCAAATAACTGTGTTGCCAAAAGGTCCTTTTATTATGTAAACCATCCTAGAATTTTTGGGACTAGGAATAAACATGCCCTAGAGTAACCCCCCAGGTATGTACAAAATGTGCTTAGGGTAGCCC a s mr.mrrefChr3 65271 167 + 181019 TGTACACCCCGAATAAGTGATTTGTGTACTTCAAATAACCCCCATGAGCTTTGAGATTCCCCATACATGTCTCTTGTCTAGAATTAATAATTGACTGTCTAGATTGCCAGGACTTCTGGTCTAGACAGGAACTGTGTTGGCTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512721 167 + 636262 TGTACACCCCGAATAAGTGATTTGTGTACTTCAAATAACCCCCATGAGCGTTGAGATTCCCCATACATGTCTCTTGTCTAGAGTTAATAATTGACTGTTTTGATTGCCAGAACTTCTGGTCTAGACAGGAACAGTGTCGGCTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 524170 161 + 647215 AGTTCACCCAGGATAGGTAATTTGTGTACTCCGAATAACCCCCATAAGGTTTGAGATTCCCAACACATGTCTCTTGTCTGGAATTAA----TGGCTTGCTAGATTGCCAGG--TTCTGCTCTAAACAAGAGCTGTGTTGATTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA a s mr.mrrefChr3 65438 73 + 181019 TGTTAAATTCACATTCTTGTTATGCATAATTGCACCCAAATGTAAAAATTGAGTATAGCTGATAGCAAACTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512888 73 + 636262 TGTCAAATTCACATTTTTGCTATGCATAATTGGACTCAAATGTAAAAGGTGGGTATAGCTGATAGCAAACTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 524334 71 + 647215 TGTTAAATTCACAACCTTGTTATGCATAATGGCACCCAAATCTAAAAATAGAGTATA--TGATAGCAAACTTG a s mr.mrrefChr3 65511 146 + 181019 AACATTAGATTTTACATTCTACCCTACTTTCAAATAGGAAGGTATGTTAAATGGCAGTGACTAAGACCCAGTATAAGTAGTAAGAGCAGCCTAACCATGATGTAGATTCTTAAATGCAATGTGGTGAATATGACAACAGTATTGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512961 146 + 636262 AATATTAGATTTTACATTCTACCCCAGTTTGGGATAGGAAGGTATGTTATATGGCAGTGACTAAGGCCCAGTATAAGTAGTAAGAGCAGCCTAACCATGATGTAGATTCTTAAATGCAAAGTGGTGAATATAACAACAGTATTGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 524407 146 + 647215 AACATTAGATTTTACATTCTACCCTACTTTCAAATAGGTAGGTATGTTAAATGGCAGTGACCAAGACCCAGTATAAGTAGTAAGAGCAGCCTAACCATGATGCAGATTATTAAAAGCAATGTGGTGAACATGACAACAGTATTAAT a s mr.mrrefChr3 65657 69 + 181019 GGCAAGATAAGTATATCATTTGTCGATGATGTGGCCAATAATGACCATCCACACTACACCCATGGATAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513107 69 + 636262 AGCAAGATAAGTATATCATTTGTCGATGATGTGGCCACTAATGACCATCCACACCACACCCATGGATAG s simRat_chr6.simRat.chr6 524555 69 + 647215 GGCAAGATAATTATATCATTTGTCGATGATGTGGCGAATAATGACCATCCGCACTACACCCATGGATAG a s mr.mrrefChr3 65726 129 + 181019 GAAGAGGATAAGGAGCGGGTTTTCTGCTTAAAGAGAACCTGAGAATCAAGGGAATCAGGTAATAAGAAAAGTCATCTACTCTGAGCCAGTACAATGCTAATTTGAAGGAGAACCTATACTTGATATGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513176 65 + 636262 GAAGAGGATAAGGAGCGAGTTTTCTGATTAAAG----------------------------------------------------------------TAACTTGAAGGAGAACCTATACTTGATATGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 524626 129 + 647215 GAAGAGGATAAGGAGCGGGTTTTCTGCTTAAAGAGAACCTGAGAATCAAGGGAATCAGGTAATAAGAAAAGTCATCTACTCTGAGCCAGTACAATGCAAATTTTAAGGAGAACCTATACTCGATATGCT a s mr.mrrefChr3 65855 23 + 181019 TAATTGGTAACTAAGTCACAAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513241 23 + 636262 TAATTGGTAACTAAGTCATAAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 524756 23 + 647215 TAATTGGTAACTAAGTCACAAAT a s mr.mrrefChr3 65878 156 + 181019 AAGTGAATATTACCGATGCATGCTGAGATGGACAAGCAGTTAGATACCATTATGGAATCCAAGGTAGGGGTAGAAAGATAGGTGGTGGAATTTATGATCTATAAAAAACTGGGATAACACCAGCATTTAAGTACTTAATTTACCCCTCCAAAGAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513276 150 + 636262 AAGTGAATATTACCCATGCATGCTGAGATGGGCAAGCAGTTAGATACCATTATGCAATCTAAGGTAGGGGTACAAAGATAGGTAGTGGAATTTATGATCTATAGCAATAT------ACACCAGCATTTGAGTACTTAATTTCCCCCTCCAAAGAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 524779 145 + 647215 AGGGGAATATTAATGATGTATGCTAAGATGGAC-AGCAGTTAGATACCATTATGGAATCCAAGGTAGAGGTAGAAAGATAGGTGGTGGATTTTGTGAGCTATAAAAAACTGGGATAACACCAGCATTTAAGC-CTTAATTTACCCGT--------- a s mr.mrrefChr3 66034 201 + 181019 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181019 GGATGATGCGTTCTGTATAGTGAATGTGACTATTCAGGGTGGGGAGGGTCAAAATGGACTAGATACAACCTTAACTTTAAATATGAACTGTCCTTGAGTGTATTTGAAACGTTTCATTCTCTCAGTGCCCTAATGAACAGAAAATCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513624 124 + 636262 -----------------------ACATGACTATTCAGGGTGGGGAAGGTCAAAATGGACTAGATGTAACCTTAACTTTAAATATGAACTGTCCTTGAGTGTATTTGAAACGTTTCATTCTCTCAGTGCCCTAATGAACAGAAAATCA s simRat_chr6.simRat.chr6 525265 147 + 647215 GGATGATGCGTTCTGTATAGTGAATGTGACTATTCAGGGTGGGGAGGGTCAAAATGGACTAGATACAACCTTAACTTTAAATATGAATTGTCCTTGAGTGCATTTGAAACACTTCATTCTGTCAGTGCTCTACCGAACAGAAAATCA a s mr.mrrefChr3 66433 17 + 181019 CTATCATGTGGAATAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513749 17 + 636262 CTATCATGTGGAATAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 525412 17 + 647215 CTATCATGTGGAATAAA a s mr.mrrefChr3 66450 65 + 181019 TCCCCACAAGGCAGCGTGTATGGCTGTGTATGCCACCACTTGCTCAGAAATGGTGTCTTTATCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513767 65 + 636262 TCCCCACAAGGCAGCATGTATGCCTGTGTATGCCACCACTTGCTCAGAAATGGTGTCTTTATCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 525429 65 + 647215 TTCCTGCAAGGCAATGTGTATGGCTGTGTATGTCCCCACTTGCTGAGAAGTGGTGTCTTTAGCAA a s mr.mrrefChr3 66515 197 + 181019 CCCGACTGTTTGCTATGTAACTCCCTGTGGCCCTGCTTTGTGTATAAACACTCAATATCCTTGGTATTCTGTAGTATGTCTTGGTTCATTTCTTCGAATAGCTGCTCTGTTATATACCATCTCCTTGTGTAGATAAAATCTAATATGAATATAGTAGCATCTATGTGTTGTGCATATTATGTTGACTATATGTGTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513834 176 + 636262 CCCCACTGATTGCTATGTAATT-----------TGCTTTGTGTATAAACACTCAATATCCTTGGCATTCTGTAGTATGTCTTGGTTCATTTCTTCGAATAGCTGCTCTGTTATATACCATCTCA----------AATATCTAATATGAATATAGTAGCATCTATGTGTTGTGCATATTATGTTGACTGTATGTATTA s simRat_chr6.simRat.chr6 525494 185 + 647215 CCTGACTGTTTGCTACGTAGCTCCCTGTGGCCCTGTTTTGTGTATAAACACTCAATATCCTTGGTATTCTGTAGTATGTCTTGGTTCACT------------TGCTCTGTTATATACTATCTCCTTGTGTAGATAAAAATTAATATGAATATAGTAGCATCTATGTGTTGTGCATATTAGGTTGACTATATGTGTTA a s mr.mrrefChr3 66712 128 + 181019 ACATGCCCAGCCCATGTCCCAACTAGGATCAAAGGATGGAGCCTTAATGAAAGGACCGCTAGAGCCTTAATAAAGCCTTATTTGATAGAATAGGTATACCTGGCTTCCTATTTGCAGATAAATGAGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 514010 128 + 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s mr.mrrefChr3 71524 37 + 181019 GTGTTAGAGTATGAAGAGATTTTTTGTTACCCCCTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519175 37 + 636262 GTGTTAGAGTATGAAGAGATTTTTTGTTACCCCCTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 530540 21 + 647215 ----------------AGATTTTTTGTTAACCCCTTT a s mr.mrrefChr3 71561 60 + 181019 GACGACTTATGCAAATGATAACAGGATTATGTCTGAATTTAAACAAATATGTGACACAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519213 60 + 636262 GACGACTTATGCAAATGATAACAGGATTATGTCTGAATTTAAACAAATATGTGACACAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 530561 60 + 647215 GACGACTTATGCAAATGATACCAGAATTTTGCCTTAGTCTCAACGAAAGCCACCCACAAC a s mr.mrrefChr3 71621 8 + 181019 ATCGACAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519273 8 + 636262 ATCGACAT s simRat_chr6.simRat.chr6 530622 8 + 647215 ATAGACAT a s mr.mrrefChr3 71629 54 + 181019 TGTATATTTTTTATTTTTCTGCAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519283 54 + 636262 TGTATATTTTTTATTTTTCAACAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 530630 54 + 647215 TGTATATTTTTGATTTTTCTGCAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTCAA a s mr.mrrefChr3 71683 9 + 181019 TCAGCCATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519338 9 + 636262 TCAGCCATA s simRat_chr6.simRat.chr6 530684 9 + 647215 TCAGTCATA a s mr.mrrefChr3 71692 334 + 181019 TGCACCAGGACCACCATGTACTGTGATTTCTGTATCTCTTCTTCTCACAGAGGAAATTAGTCAGCAATGGAGTAGGGTGATGGTTTTAGTAAGCTAGTCCAAAAAACATTTCCCTGTGAATCAATCTCATGATATGGTAGGTTCTGATTGTGATATTCAGTGACACCAGCCAGATCTTGAGTGTTTAGTTGTCTAGTCGCAGCCAAGGCACCATTGAGTTTGATAGTCAAGTTTTGTAACTGTCCTGGGGTTTAATTGAATCCAGCATAGACTACTATGATGTGGAGAAGTTAGTGAACTTGTATATCTTGCCTAGCCATTATTAGGTAATATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519347 306 + 636262 TGCACCAGGATCACCATGTACTGTGATTTCTGTATCTCTTCTTCTCACAAAGGAAATTAGTCAACAATGGAGTAGGGTGATGGTTTTAGTAAGCTAGTCCAAAAAACATTTCCCTGTGAATCATTCTCATGATC----------------------------ATGCCAGCCAGATCTAGAGTGTTTAGTTGTCTTGTCGCAGCCAAGGCACCTTTGAGTTTAATAGTCAAGTTTTGTAACTGTCCTGGGGTTTAATTGAATCCAGCATAGACTACTATGATGTGGAGAAGTTAGTGAACTTGTATATCTTGCCTAGCCATTATTAGGTAATATA s simRat_chr6.simRat.chr6 530702 334 + 647215 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tctacgctccaaagaagcatctacaaaagtgtacatgctcataacccgtcCCATGAGGATTGTAAGGGATGTACGT a s mr.mrrefChr3 72178 65 + 181019 TGGTGAAGCCGCTGATATCTGCACTACAGTCTGCCCACTATAATTTCCCACACCCCACAACTGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519828 65 + 636262 TGGTGAAGCCGCTGATATCTGCACTACAGTCTGCCCACTATAATTTCCCACACCCCACAACTGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 531203 65 + 647215 TGGAGAAGCAGTCGATATGTGCACATAGGTCTGCCCACTATAAGTTCCCACACCTTTCTACTAAC a s mr.mrrefChr3 72243 141 + 181019 GTGGGAGCGATACTCTGAAGAGCCATTAGAAGGACTTAAGAAGCCTAATATATGAGAAGGACAGTACAGAAACCTATCATAGTGGAAAAGCACATGAAGAGGACCAGCACTCAAACTCTGAAGAGCCATAACGTGGACAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519893 141 + 636262 GTGGGAGCGATACTCTGAAGAGCCATTAGAAGGACTTAAGAAGCCTAATATATGAGAAGGACAGTACAGAAACCTATCATAGTGGAAAAGCACATGAAGAGGACCAGCACTCAAACTCTGAAGAGCCATAACGTGGACAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 531269 141 + 647215 GTGGGGGTGTTACTCTGAAGACCCATGAAAAGGACTTAAGAAACCTAAGATATAAGAAGGATGTTTCAGAAGCCTAATGCAGTGGAGAAGCACACGAAGAGGACCAGCAGTGAAACTCTGAAGAGTCATAACACGGACAAT a s mr.mrrefChr3 72384 23 + 181019 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simRat_chr6.simRat.chr6 532176 99 + 647215 TCCCCAAATAGCAACTTAATGGTCAACTATACAGGGCCATGTACTACCTGGAGGCTAGATTACGTAAGGAGATGCTGCCTTGGCTAAAGAAATAAGAGG a s mr.mrrefChr3 73184 734 + 181019 GACTTACACAGTATATAAATACACAGAAAGCACCTGGTGAGCAGCAGAACAGACAGATACACAGCTGCAGGCATTAGACTGCACGCAGGTATCTAACACTGGCATATAGGGAATCTCAAGGACTTTAGAATATTTCAAGCAAGAGTCTCCCAAAAATGGTGGCAACTAGAGTGGTCTTTAATATGAGGCATGTAAGGTTTTAGGAAATAGGTGAAATGCGGCCTTGTCACTGTAATGCTTTTTTGGCCTCAATTGAATTAATTGTATGCTCATTGGATAGAAGTCTTGCAACTTGAGAACTGGAGACTGGAGGTTGGTGCTAAGTTATGATCCTGCTAAATCAGATGGCACAGGAGGTTAAAGTCCATTGAGCCTCATGGTGAAAGGTTAAAGTCTATAATGAAAAATAAAGATAAGGGAGACCCATATGGTTTGTTGGTATGGAAGATATGGTAGGTGAGTAGGAGGCCCATACACTTTATCCCCCCACAGAATACAGGGCAAAACTGTTGTTATTATATTTTGTGGGTCACAAATGGAGCATAAAAGACACTTGTACAAGTGAACACCAGTACCTATCAGCATGCACATGACAAAATGACAAGGTCATTTTAAGTACTAACTAAACAAATATGGTATTTGTCTCAAAGGTACAATGTGGTGGTATCTGGCATTATCACAGCATAAACTATGACTGGTGCAAGTTAGTTATTAGCCGGGGGGACATGTACATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520846 719 + 636262 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GAATGGCAAAGATTAATGCCCCATGACTACATGTAAATATTTGACACTTATATTT a s mr.mrrefChr3 74203 251 + 181019 ACACAATAGCCTGTTCAAGATTTCTTCTTCAGTTAATGTGATGGTTGGGAACAACATGTTAGTTTTGATGAACATCTGGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATGGAACCAAGAAATTAAAAGAAGTAGAAGAAAACTTAACTGCACATGAGGGAAAGACATCCTTGTTCTTCTGAGAACAGTATTGATATGATTGGCAATTGTATTTAGTAGTTGTACATGACCTCACAAGTAAGCTGAATCCCAAGTCCAAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522166 242 + 636262 ACACAATAGCCTGTTCAAGATTTCTTCTTCAGTTAATGTGATGGTTGGGAACAACATGTTAGTTTTGATGAAAATCTGGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATGGAACCAAGGCAATAAAAGAAGT-GAAGAAGCCTTAACTGCACATGAGGGAAAGACATCCTTGTTCTTCTGAGAACAGTATTGATATGATTGGCAATTGTATATA--------ACATGACCTCACAAGTAAGCTGAATCCCAAGTCTAAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 533296 251 + 647215 ACTCAATAGTCTGATCAAGATGTCTTCTTCAGGTAATGTGATGGTTGGGTACAACATGTGAGCTTTGATGAACATCTAGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATTGTACCAAGAAATTAAAAGAAGTAAAAGAAAACTTAACTGCACATGAGGGGAAGACATCATTGTTCTTCTGAGAACTGTATTGATTTCATTGGCAGGTGTACTTAGTAGTTGTACATGACCTCACAAGTAAGCTGTATCCTAAGTCCAAGC a s mr.mrrefChr3 74454 14 + 181019 AGAAACAGAGCACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522408 14 + 636262 AGAAACAGTGTATC s simRat_chr6.simRat.chr6 533550 14 + 647215 ATAAACAAACCACT a s mr.mrrefChr3 74468 40 + 181019 ATAAACAGTGTGTGTAGGTGCAACATGCATTCAATCAATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522437 40 + 636262 AGAAACAGTGTATCTAGGTGCAACATGCATTCAATCAATA s simRat_chr6.simRat.chr6 533564 39 + 647215 ATAAACAGTGTGTGTAGGTGCAACATGCACTC-ATCAATA a s mr.mrrefChr3 74508 249 + 181019 AAATGTTAGTAGACAGATGAGGCTAATCAACTAGCTAACCTTTACAATGTCATACCTAAGTGCGAGTGGGAACAAACATACAGGATTTTGTCCATAATTGTGCCAGATACCTAAATCAGTGGCATTTTATCTGCCTACTTCCCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGGCTTACTAGCACGACCACATCATTGCAGCACACATCCAAATGGGGATCAACTCCCATGTGTTATATGGCATATTAGAAGGGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522481 249 + 636262 AAATGCTAGTAGGCAGATGACTCTAATCAACTAGCTAATCTTTACAATGTCATACCTAAGTGCGAGTGGGAACAAACATACAGGATTTTGGCCATAATTGCACCAGATACCTAAATCAGTGGCATTTTATCTGCCTACTTCCCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGGCTTACTAGCACGATCACATCATTGCAGCACACATCCAAAGGGGGATCAACTCCCATGTGTTATATGGCATATTAGAAGGGG s simRat_chr6.simRat.chr6 533603 249 + 647215 AAATGTTAGTAGATAGCTGAGGCTAATCAACTAGCTAACCTTTACAATGTCATACCTGAGTGCGAGTGGAAACCAACATACAGGATTTTCTCCATAGTTGTGCCAGATACCTAAATCAGTGGCACTTTATCTGCCTACTTCTCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGCCTTAATAGAACCACCACATCGTTGCAGCACGCATCCAAATGGGGATCAACTCCCATGTGTTAGATGGCATGTCAAAAGAAG a s mr.mrrefChr3 74757 66 + 181019 CAGCAAAAACTGAAATGGACGGGTGTGCAAATCTTTGATACAATGTAAGTCTATGACTCATGAGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522731 66 + 636262 CAGCAAAAACTGAAATGGACGGGTGTGCAAATCTTTGATACAATGTAAGTCTATGACTCATGAGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 533852 66 + 647215 TGGCAAAAACAGAAAGAGATGGGCGTGCAAATCTTCGATACAATGTAAGTATATGACTCATGAGTA a s mr.mrrefChr3 74823 159 + 181019 CTGGAAATTGGTTATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAGTTCTTTCTTGGGCAGGGCTATTCACACACTCACTTGCCAAAAGGAATGACCATTTACTACTTACCTTCCACCTAACCCATGAATAATTAAATAACAACCCTGCATTGGTACAAGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522998 159 + 636262 CTGGAAATTGGTTATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAATTCTTTCTTGCGCAGGGCTATTCACACACTCGTTTGCCAAAAGGAATGACCATTTACTACTTACCTTGCACCTAACCCATGAGTAATGAGATAACAACCCTGCATTGGTACAAGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 533918 158 + 647215 CTGTAAATTGGTGATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAGTTCTTTCTTGGGCATTTCCATTCACACACTCACTTGCCAACAGGAATGACTATTCACTATTTACCTTCCA-CTAACCCATGAATAGTTAAATCACAGCTGTACATTGGTACAAGAC a s mr.mrrefChr3 74982 65 + 181019 AATATCCATGAGAAGCTCTGAATGGCACAAGTGGCCCTATCATCAATAAATCAATGTTTCCCTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523157 63 + 636262 AATATCCATGAGAAGCCCTGAATGGCACAAGTGTCCCCATCATCAATGAATCA--GTTACCCTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 534119 65 + 647215 AATGTCCATGAGAAGCTCTGCATGGCACAAGTGGCCCTATCATCAACAAATCAATGTTTCCCTGA a s mr.mrrefChr3 75047 125 + 181019 CTGTCAGAATATTGTACTGATCACATTACATCAGGACACAATTTTTATTTTACTGTCAGCAGCAACTAGGGGATAATTGCGTTTAGTTTCCCTACTTAGAAATGAAGTGTCTTGAACAGGTGCAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523220 125 + 636262 CTGTCAGAATACTGTACCGATCACATTACATCAGGACACAATTTTTATTTTACTGTCAGCAGCAACCAGGGGATAATTGCGTTTAGTCTCCCTACTTAGAAATGTAGTGTCTTAAACAGGTGCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 534185 124 + 647215 CTGTCAGAATATTGTACTGAGCACACTACATCAGGACACAATTTTTA-TTTACTGGCAGCAGTAACTGGGAGATAATCACATTTAGTTTCCCTGCTTAGAATTGAATTGTCTTGAACTGGCACAT a s mr.mrrefChr3 75172 180 + 181019 GTACCCTCTAGCACCTATATGGTGAAATCCAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAACTAGTTTATTGTTTCTCCGTTGAGATTCACACTTAAGATCCACCTGACCTTAGGTGATCTCCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATGCCTACTAATTCAATGCATCCTTTGATGATACAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523346 173 + 636262 GTACCCTCTAG-------ATGGTGAAATCAAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAACTAGTTTATTGTTTCTCCGTTGAGATTCACACTTAAGATCCACCTGACCTGAGGTGATCTCCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATGCCTACTAATCCAATGCATCCTTTGATGATACAT s simRat_chr6.simRat.chr6 534309 175 + 647215 GTACCCTCTAGCACCTATATGATGAAATCCAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAGCTATTTTATTGCTTCTCTGTTGAGATTCACACTTAAGATCCG-----CCTTAGGTGATCTTCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATACCTACTAATTGAATGCATCCTTTGATGATACAT a s mr.mrrefChr3 75352 121 + 181019 TGCGGAGGGTAAATGCCCATGCCACTCGTTACTAGACTACCCTAAGCTTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTACTTAACTATATTGCTTTGTGACAAAGTTTTGACATTAGACTATTATAGGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523529 121 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ATCCTG-------GGGACCAGGTACAGTAATGGAAGAAATTATGGGGACACATTCTTGATAGTGCCAACAGGGTAACCATAGTCTTAGGAACTCCATATTGTAACAACTTTTGACACAGTAAGAGGACACCTTCACATGTCAGAGGACA a s mr.mrrefChr3 76156 162 + 181019 CGCTAAACTCCCCCAGATGCAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTTCAATGTGTTGTAATGCAGAAGTGAATGATGAGATATGGATGCATGCACATACTTCAAGCCTATCTTGGATGGTAAAATTTGTGAAACTTAACAGCTTCTATTGACTGGAAGGAAAAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524385 149 + 636262 -------------CAGACACAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTCTGATGTGTTGTAATTCAGAAGTGAATAATGAGATATGGATGCATGCACTTACCTCAAGCCTATCTTGGATGGTAAAATTTGTGAAACTTAACAGTATCTATTGACTGGAAGGAGAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 535324 161 + 647215 CGCTAAACTCCCCCAAATGCAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTTCAATGTGTTGTAATGCAGAAGTGAATGATCAGATATAG-TATGTGTGCATACTTCAATCCTATCTTGGATGGTACGATTTGTGGGACTTAACAGCTTCTATTGACTTGAAGGAAGAAG a s mr.mrrefChr3 76318 101 + 181019 TATTATAATTCTTTATAGCTACATTTGCATCACAGTTACAGGTGAGGTGATACATTAGCAGTTGGACAATGATGAAAGAGTCTATTGGGTTTAAGAACTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524535 96 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 536087 175 + 647215 TACCATTACCTGATAGTTAAATACTACCAGTTCATGGAAAACCCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTCCATTAAGCTGTTACAGGTGAGTTATAGCCCTACCTCCCTTTACTGGACTATACCCATGGAAAAAGCAAGGATCAATAGGAAGCTCTGGG--AGTACTATTGATATGTTGGG a s mr.mrrefChr3 77090 66 + 181019 CATTGCTATCAGAGGATAAGTGCACAGATGACAGGTGCACTCAGGGAGGCTAAGGAGGGAATGGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525281 45 + 636262 -------GGTAGAGGACAAGTGCACAGATGACAGGTGCACTCAGGGAGGCCA-------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 536265 66 + 647215 CATTGCTATCAGAGGATAAGTGCACAGTGGACAGGTGCACTCAGGGAGGCTAAGGAGGGAATGGCT a s mr.mrrefChr3 77156 12 + 181019 GTGCAGTTAATT s simRat_chr6.simRat.chr6 536365 12 + 647215 GTGCAGTTAATT a s mr.mrrefChr3 77168 224 + 181019 TAAGTGAATAAAAGAGAACATAGTGAACAAAGAGGGGCATATGTCTTGAAAAATTGTTTCCCTGAAGGACGATCAGAGAACTACCACATACAGCAGCAAGACTTTTGGAATTGCCCAAGATTATGCAACCACCCTGCTGCCTCTAGGGGCCTTCTTTTCTAATCAGAGTAATGACTTGGGGTAAGGGTCTACACCCTTAGAAAAAGGGCCGGAGTAATAAAAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525326 198 + 636262 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ACCTTATTGACATGACCCTCAAATGATTAAAGATTTCTGCAATCATAACACCAGTTTACCTCACTCCTAGCTAACCAATGGGCCCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTACATCCCAAAGCTAAGAATTGTCAGGTGTTAAGAACCCAAGATATAGTTTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGTCTATGTCACCTAACCCTACCTTCCTCTTATTTATCCACTTGTCTATCTGACATCTGAAATTGGAGGCATCTAAAGCTAGAAGGCAATTGGAGGAGAGCAATAATAGACCTCTGTCAATCTAGTCATGGAATGATAATTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526012 305 + 636262 ACCTTGTTGACATGACCCTCAAATGATTAACGATTTCTGCAATCATAACACCAATTTACCTCACTCCTGGTGAACCAATGGGCCCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTACATCCCAAAGCTAAGAATTGTCTGGTTATAACAACCCAAGATATAGTCTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGGCTA--------AACCCTACCTTCCTCTTATTTATCCACTTGTCTTTCTGACATCTGAAA-------CACCTGAAGCTAGAAGCCAACTGGAGGAGAGCAATACTAGACCTCTATCAATCTAGTCATGGAATAATAATTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 537164 319 + 647215 ACCTTATTGGCATGACCCTCTAATGATCAAAGATTTCTGGAATCATAACACCAGTTTACCTCACTCCGAACTAACCACTGGGTGCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTAGATCCCTAAGCTAAGAATTGTTAGATGTTAGGAACCCAAGATATAGTTTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGTCTGTGTCACCTAACCCT-CCTTCCTCTTATTTATCCACCTGTCTATCCGACCTCTGAAATTGGAGGCATCTAAAGCTAAAAGGCGATTGGAGGAGAGCAATAATAGACCTCTGTCAAGCTAGTCATGGAATGATAATTGT a s mr.mrrefChr3 78239 93 + 181019 ATCCCAGATTGTCTCCACCCATGAAGTGCACAGAAGAACACCTAAGTATTAAGAGAAGAGATTAAAGCAGGCTAAAGTCATAGGGGGTCTTGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526327 93 + 636262 ATCCCAGGTTGTCTCCACCCATGAAGTGCACAGAAGAACACCTAAGTATTAGGAGAAAGGATTAAAGCAGGCTAAAGTCATAGACGGTCTCGG s simRat_chr6.simRat.chr6 537483 92 + 647215 ATCCCGGATTG-CTCCACCCATGAAGTGCATAGAAGAACAGCTAAATATTAAGTGAAGAGATTAAAGCAGACTAAGGTAATAGGGGGTCTTGG a s mr.mrrefChr3 78332 58 + 181019 CGGATCAACAGGGTGTTAATGACAGCTATGTGTGGTAGATGGTGCTAGAAATGCTAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526420 58 + 636262 CGGATCAACAGGGTGTTAATGACAGCTATGTGTAGTACATGGTGCTAGAAGGGCAAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 537576 58 + 647215 TGGATCAACAGGGTGTTATTGACAGCTATGTGTGGTAGATGGTAGTAGAAATGCTAGT a s mr.mrrefChr3 78390 17 + 181019 CATCCATTCATGTGCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526484 17 + 636262 CGTCCATTCATGTGCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 537634 17 + 647215 CATTCATTCATGTGCCA a s mr.mrrefChr3 78407 159 + 181019 CAGCCTGCAGCCTGTCATGTGCCAAAGAGACCCTCAGTCTCGGAGACTTGAACAACATCTACAGCATATGACTAGCCTGTAGCCTTTCTGCTGCAGAAATCAAACAGCATAGGCAGTATGTGAACTGAAAGTCCCCTCAGGTTATATCTCACAAGGTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526592 158 + 636262 CAGCCTGCAGCCTGTCATGTGCCAAAGA-ACCCTCACTCTTGGAGACTTCAACAACATCTACAGCATATGACTGGCCTGTGGCCTTTCTGCTGCAGAAATCAAGCAGTATAAGCAGTATGCCAACTGAAAGTCCCCTCAGGTTATATCTCACAAGGTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 537651 159 + 647215 TAGCCTGCAGCCTTTCATGTGCCAAAGAGACCTTCGGTCTCGGAGACACGGACAACATCGACAACATATGACTAGCCTGCAGCCTTTCTGCACCAGAAATCAGACAGCAGAGGCAGTAAGTGAACTGAAAGTCCCCTCATGTTATATCTCACAACGTAG a s mr.mrrefChr3 78566 177 + 181019 CACACAAGAGAGACTAGAAGACAAATTGATTCTATATCACTCATTTTCTCTACTCTGGGTTCCTCTACAGAAAATAGTAAGCAGCAATACTTAGGTCCAATGTTTACTATGCCTGGACAACAGAAACCCAACTATCCACTATCCTTTTATCTGGGTTGCAACTCAGTTTCCCTAATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526751 174 + 636262 CACACAAGAGAGACTAGAAGACAAATTGATTCTACATCACTCATTTTCTCTACTCCGGGTTCCTCTACAGAAAATAGTAAGCAGCAATACTTAGGTCCAATGTTTGCT---CCTGGACAACAGAAACCCAACTATTCACTATCCCTTTATCTGGGTTGCAACTCAGTTTCCCTAATA s simRat_chr6.simRat.chr6 537810 174 + 647215 CACACAAGAGAGA-TAGAAGACAAACTGATCCTATATCACTCATCCTCTCTACTCTGGGTTCCTCTACAGAAGATAGCAAGCAGCAATACTTGGGTATGATGTTTACCATGCTTGGCCAACAGAAACCCCACTATCCACTATTCTTTTATCTGGGTTGTAACTCAGTTTCCCTAA-- a s mr.mrrefChr3 78743 183 + 181019 CACTTTTGTTTAGTTTGGAATAAGTCACATTGATCAACTGGGACCCTAATGTCATGACTTCAGTCCTGCCACCACAATCCTGTTTTGAAAGATGTATTGTGCTACCTCTTTCCTGGTGACAAAGTGTCTGCCTTTCCCGAGCTAGTTCCTTATGATTACCTGTTCATATGTCTCATCAGATAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526927 183 + 636262 CACTTTTGTCTAGTTTGGAATAAGTCACATTGATCAACTGGGACCCTAATGTCATGACTTAAGTCCTGCCACCACGATTCTGACTAGGAAGATGTATTGTGCTACCTCTTTCCTGGTGACAAAGTGTCTGCCTTTCCTGAGCTCTTTCCTTATGATTACCTGTTCATATGCCTCATCAGATAG s simRat_chr6.simRat.chr6 537984 172 + 647215 CACTTCTGTTCAGTTTAGAATCAGTCACATTGCTCAACTGCCACCCTAATGTCACGGCTTCAGTCCTTCCACTACAATCCCGTTTTGAAAGATGTACT---CCCGCTCTTTCA----GACAAAGTTTCTGCCTTTCCCGAGCCAGTTCCTTATGAT----TGTTCAGATGTCTCATCAGATAG a s mr.mrrefChr3 78926 200 + 181019 GAGCTCTAACATGATTGGATGTTGATAGAGTGATATTAAAATAATAGTAGCTGACGGCCCGTAGTTTAAGTCAATGATGCCCACTGGCTAGAAGTCCATGAAAACTTCTTAACTAATCATACGCAGAGATGACACTGTAACCTCAACAAGTTGCAGACTCGCTGAGGCGTCAGTAGAAATTTACAACAATTCACCCTGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527110 200 + 636262 GACCTCTAACATGATTGTGTGTTGATAGAGTGATATTAAAATACTAGTAGCTGACGGCCCGTAGTTTAAGTCAATGATGCCCACTGGCTAGAAGTCCATGAAAACTTTTTAACTAATCATATGCAGAGATGACACTGTAACCTCAACAAGTTGCAGACTCGCTGAGGCGTCAGTAGAAATTTAGAACAACTCACCCTGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 538158 131 + 647215 GAGTTGTAACATGATTGGATGCTGATAGAGTGGTATAAAAATAATTGT-------------TAGTTTAAGTCAATGATGTCTGCCGGCCAGAAGTCCATGAAAACTTCTTCACTAATCATAC--------------------------------------------------------ATTTACAACAATTCACCCTGGG a s mr.mrrefChr3 79126 126 + 181019 TAACTAACTCAAGTCTATTGCTCCCCTGTGGAATTAATTGTTATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGTTCATATAGGAATGCACTAGTTCCACTGTTGTTTGTAACTGAACCATATGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527310 75 + 636262 TAACTAACTCAAGTCTATTGCTCCCCTGTGAAATTAATTGTTATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGT--------------------------------------------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 538292 126 + 647215 TAACTAACTCAGGTCTATTGCTCCCCTGTGGAGTTAATTGTGATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGTTCATATAGGAATGCACTAGTTCCACTGTTGTTTGTAACTGAACCATATGCC a s mr.mrrefChr3 79252 37 + 181019 GTACTGGGACGTAAGCAACATGGACATGGATATGTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527385 34 + 636262 ---CTGGGACGTAAGCAACATGGACATGGATATGTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 538420 37 + 647215 GTATTGGGATGTAAGCAACCTGGACATGGGTATGTGA a s mr.mrrefChr3 79289 97 + 181019 TTTTGTTCTGAAtaaaagggctcaccaccacttgtagttgcagtccaaatcctagaactctttactaacccctgagtgcttgcaaccaaaaagtcac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527419 97 + 636262 TTTTGTTCTGAATAaaagggctcaccaccacttgtagttgcagtccaaatcctagaactctttactaacccctgagtgcttgcaaccaaaaagtcac s simRat_chr6.simRat.chr6 538459 97 + 647215 TTTTGTTCTGAAtaaatgagttcaacaccacttgtagtcgcagtccaaatcctaaaactatttactaacccccgaatgcttgcgaccgaaaagtctt a s mr.mrrefChr3 79386 130 + 181019 acaactccttgaaatgttttttgacatgttatttacatatggtccctaagctgggatgAATAGCGAATGGCCCACACTAATACTGCCCCTTTTCTCTATGGTTAATCTATTCTGTCCACATTAAGTCTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527516 130 + 636262 acaactccttgaaatgttttttgacatgttatttacatatggtccctaagctgggaTGAATAGCGAATGGCCCACACTAATACTGCCCCTTTTCTCTATGGTTAATCTATTCTGTCCACATTAAGTCTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 538558 130 + 647215 aaaaccccttggaatgttttttgacatgtcattcacatatggtccataagcagggaccAATAGCAAATTGCCCACTCGAATACATCCTCCTTTCTCTATGGTTAATTTATTCTGTCCACATTAAGACTTT a s mr.mrrefChr3 79516 20 + 181019 CAGCTGGGACTCCTAAAGTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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gtcacatggaatccccagAAAACTTCTGTTCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCTTATGCAGCTGTTGACATGTGCATATCTACCTGTGCATATCTACCAGGTATAACATAGATGGAAATGAAGTTCTTACAAGACACAAGTATACTCATCCCCCTTAAGCAAGGTTAAAAAAACATTATTCCACTTTATGCAATTAAAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGGAGTAAATCTTCTACAACTACAAATATATTAATGCCTACTTTGCATTTTGAATGGTCTGAGGTCACTATTTCAGTGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527735 198 + 636262 GTCACATGGAATCCCCAGAAAACTTCTGTTCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCTTATACAGCTGTTGGCATGTGCATATCTACCTGTGCATATC------------------------------------------------------------------------------------------------------AAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGGAGAAAATCTTCTACAACTACAAATATATTAATGCCTCCTTTGCGTTTTGAATGGTCTGAGGTCACTATTTCAGTGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 538788 279 + 647215 gtcacatggaatccctagGCACCTTCTGTGCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCCTATGCGGCTGCTGACATGTGCATATCTACCTGTGCATATCTACCAGGTATAACATAGATGGAAATGAAGTTCTTACAAGACACAAGTATACTCATCCCCCTTAAGCAAGGTTAAAAAAACATTATTCCACTTTATGCAATTAAAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGAAGTAGGTCTTCTAGAACTACAAATA----AATGTCTACTTTGCATTTTGAATAGTATGAG----------------- a s mr.mrrefChr3 79896 228 + 181019 GAGCTAGGGATAACTAACTAAGCTCCCTTGTCTCTTGGCTTCAGCAGACGTTTATGTCATTTATCTATCATTACATCTGATATCTGCTACTACTTGAGTGAACTGCACTGAGCTAACCAACATGTGGTCCAGATCAAGGGAGAAGCCACATATGCAAAGCACAATTCTGTATTGGTTTGTCAGGCTAGAGATTGTATTCACCCTACTTGATTAACATCCTTAATCCAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527935 210 + 636262 GAGCTAGGGATAACTAACTAAGCTCCCTTTTCACTTGGCTTCAGCAGACGTTTATGTCACTTATCTATCATTACATCTGATATC------------------CTGCACTGAGCTAACCAACAGGTGATCCAGATCAAGGGAGAAGCCACATATGCAAAGCACAATCTTGTATTGGCTTGTCAGGCTGGAGATTGTATTCACCCTACTTGATTAACATCCTTAATCTAT s simRat_chr6.simRat.chr6 539067 197 + 647215 ------------------------CTCTTGTCTCTTG------GCAAACGTTAATGTCATTTATTGATCATTACATCTGATATCTGCTACTACTTGAGTGAATCGCACTTAGCTAACAAACATATGGTCCAGCTCAAGGAAGAAGCCGCATATGCAACACACAATTCTCTATC-GTTGGCCAAGCTAGAGATTGTACTTCTCCAACTTGATCAACATCCTTAATCCAT a s mr.mrrefChr3 80124 21 + 181019 GCGTTTTGTGGATATTGACTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528175 21 + 636262 GCGCCTTGTGGATATTGACTA s simRat_chr6.simRat.chr6 539264 21 + 647215 GAGTTGTGTGGATATTGAGTA a s mr.mrrefChr3 80145 626 + 181019 CCACAAAGGAGTGACTGTGAGAACTATGTTAAACTATTCATCCTTGTTCATGTGTTCTAACTGGTTGGTGTCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAGATATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGTAGCATTTATGATTTAGGTTACAATCATGAATATAAAATACAGTAGCTTTTGGTACCAGCTATCAGTAACCGTGAAAACAGATGCTGTACATTCACTAAGTCCGGGCTGGAAGCACATGAATGATAAAGAACTTTCTGAATTACTCCCAAATATAAAATTTCATCAGCAGACTATGGCAAAGTGGCTTCAATTCTTTTTAAGGCATAGGCCTCTACCATGGCTGATGAGTTGTGTTCTGATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGATTTTGACAGTAAACTAGAGCATCACATGGGCTAATGACGAATCACAGCATAGGAATACTGCAACCTTCAGGGTTAATATTAGTCTAGTCAATCGGTACCAATTATGGTATCTCTGACTGTCATTTGCCAGACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTATCTGCATACACTACCACAAGAGGAATACTTGTTTGCACTCCTTTAACAGCTAATGCACAATGTATGACTTGACGACAAGTCAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528196 622 + 636262 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CCACAAAGGAGTGACTGTAAGAACTATGACAAACTACTCATACTTGTTCATGTGTTCTAA-TGGTTGATGTCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAACTATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGGGGCACTTATGATTTAGGTCACAATCATGAATTTAAAATTCAGTAGCTTTTAGTACCAGCTATCAGTAACTATGAAAATAGATGACATCCATTCACTATGTCCTGGCTGGAATCACCTGGATGATAAAGAACTTTCCTAATTACTCCCAAATATAAGTTTTCGTCAGCAGACTATGGCAAAGTGGCTTCAATTCTCTTTAAGGCATAGGCCTCTACCATGGCTGATGAGTTGTGTTCTGATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGGTTTTGACAGTAAACTGGAGCATCACATTGACTAACAAAGAATCACGTCATGTGAATACTGCAACGTTCAGGGTTAATATTAGCCTAGTCAATCAGTACCAATTATGGTATCTCCGACTGTCACTTGCCACACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTATCAGCATACACTAACACAAGAGGAATACTTGTTTGCACCCCTTTAACAGCTAGTGCACGATGCATGACTT-ACGAGGAATCTG a s mr.mrrefChr3 80771 13 + 181019 TTTGGTCAATAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528827 13 + 636262 TTGGGTCAATAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 539910 13 + 647215 TCTGATCTATATG a s mr.mrrefChr3 80784 8 + 181019 ATCTGACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528840 8 + 636262 ATCTGACA s simRat_chr6.simRat.chr6 539928 8 + 647215 GTCTGACA a s mr.mrrefChr3 80792 19 + 181019 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gtcagc s simRat_chr6.simRat.chr6 542767 6 + 647215 gacaac a s mr.mrrefChr3 82913 81 + 181019 cagtgggtggatgctctagatcatgtcaaatgaaaacaaactccagttcttacataaggagtatgaacttgataaatatgg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531665 81 + 636262 cagtgggtggatgctctagatcatgtcaaatgaaaacaaactccagttcttacataaggagtatgaacttgataaatatgg s simRat_chr6.simRat.chr6 542773 81 + 647215 CAGAgggtggacaatctacatcatgtcgaatgaaaacaaactacagttcttacatgaggaggatgaacttgataaatatgg a s mr.mrrefChr3 82994 71 + 181019 tcactcactgagtgaagatgtgcaggtagcacttcctaccgacagaatagggaatgacaaacttcaatttt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531752 71 + 636262 tcactcactgagtgaagatgtgcaggtagcacttcctaccgacagaatagggaatgacaaacttcaatttt s simRat_chr6.simRat.chr6 542854 71 + 647215 tcactcaataagtaaaggtgagcaggtagtacttcctacccacgaaacagagtatgacaaactaggttttt a s mr.mrrefChr3 83065 123 + 181019 cgcttagaataaagtaccacttagctggagtgaatctcaatgtagcttacagagtaggagctgtgatctattgtaccaagctctctatttaaagtgatctgtggcatctggggtagacacaaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531829 123 + 636262 cgcttagaataaagtaccacttagctggagtgaatctcaatgtagcttacagagtaggagctgtgatctattgtaccaagctctctatttaaagtgatctgtggcatctggggtagacacaaa s simRat_chr6.simRat.chr6 542925 123 + 647215 tgcttagaataaagtgccacttagctggagtgaatcttaatatatcttacacagtgggagatgtgctccaatgtactaagctctctatccagagtgatctgccacatctagggtaaacacaaa a s mr.mrrefChr3 83188 28 + 181019 aactgaaattactactctgtctacaccg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531957 28 + 636262 aactgaaattactactctgtctacaccg s simRat_chr6.simRat.chr6 543048 28 + 647215 aactgaaattactactccatctacactg a s mr.mrrefChr3 83216 57 + 181019 ttaaagcttgaaactaaagtcctctacctgatgcttttcagcttgatattcatcaca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531986 57 + 636262 ttaaagcttgaaactaaagtcctctacctgatgcttttcagcttgatattcatcaca s simRat_chr6.simRat.chr6 543076 57 + 647215 ttaaagcttgaaactaaagccctctaccttttgcttttcaccttaatattcatcaca a s mr.mrrefChr3 83273 72 + 181019 ttgcagttcctcacaaggttaagcttgctctgtgttactagctcttttagccattcgatatcacatgctggg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532043 72 + 636262 ttgcagttcctcacaaggttaagcttgctctgtgttactagctcttttagccattcgatatcacatgctggg s simRat_chr6.simRat.chr6 543135 72 + 647215 ttgcagttcctcacaaggttaagcttgttctgtgttactagctcttttagccactacatatcagatgttgga a s mr.mrrefChr3 83345 16 + 181019 attgacctttgatagg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532115 16 + 636262 attgacctttgatagg s simRat_chr6.simRat.chr6 543237 16 + 647215 attgattgatgatagg a s mr.mrrefChr3 83361 124 + 181019 cccttcatcttgcattagtgcctggccaacgagataggtaaataagaggaatacaatcttggggagagaaatcagatgcctatacttctctagtaataccacagtggttgcagtgtgtattgtt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532131 124 + 636262 cccttcatcttgcattagtgcctggccaacgagataggtaaataagaggaatacaatcttggggagagaaatcagatgcctatacttctctagtaataccacagtggttgcagtgtgtattgtt s simRat_chr6.simRat.chr6 543254 124 + 647215 ccctttatctcgtattagtgtctgaccaacaagatagggaaataagagaaatgcaattgcggggagagaagtcgcttggctatagttcgttggtgctaccatggtggttgctgtgtgtattgtt a s mr.mrrefChr3 83485 93 + 181019 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attagatccatggcatagccctccctataatagctagcacatgaactgcttacacaaggtgactctctctgaagtgcaccgttgacacatgagccccggactcaggtgtctattttggcttctgaactgttggcacctgaaatgcaacctggcaaacaactgacacaggacctacttaatgacgatgcaagcaacagcatacctgagcaccctaactgtgtgagtg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533286 226 + 636262 attagatccatggcatagccctccctataatagctagcacatgaactgcttacacaaggtgactctctctgaagtgcaccgttgacacatgagccccggactcaggtgtctattttggcttctgaactgttggcacctgaaatgcaacctggcaaacaactgacacaggacctacttaatgacgatgcaagcaacagcatacctgagcaccctaactgtgtgagtg s simRat_chr6.simRat.chr6 544199 226 + 647215 atcaaatcagtggcatagccctcccgatcatacctaacatttgaaccactcactcaaggtaactctatctggagtgcactgttagcacatgaactgctgactcaggtgcctattttggttttcggactgttggagcctggaatgccacttggctaacaactgacacaggacctacctaacgaggatgctagcaacagcgttcctgagcaccctaattttgcgagag a s mr.mrrefChr3 84381 166 + 181019 tgtctcagtttttgagcccaacgggctatgggcttggggatcagctgtacatggagacacatcactttgaaatacacgtccatgactcaaatcaacaactatctacccacccgcctacatgcggatcgtgttttgcctgcatccatatcaacaggatggtatacca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533523 166 + 636262 tgtctcagtttttgagcccaacgggctatgggcttggggatcagctgtacatggagacacatcactttgaaatacacgtccatgactcaaatcaacaactatctacccacccgcctacatgcggatcgtgttttgcctgcatccatatcaacaggatggtatacca s simRat_chr6.simRat.chr6 544425 166 + 647215 tgcctgagtatttgagcccagtgggctatgggcttggggctcagctgtacctggagacacatcacttcgaaatacacatccataactcaaatcaacaactatccaccaacccccctacatgtggatcatattttgcctgcatccatatcaacaggatggtatatca a s mr.mrrefChr3 84547 7 + 181019 cacagca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533689 7 + 636262 cacagca s simRat_chr6.simRat.chr6 544593 7 + 647215 cagagca a s mr.mrrefChr3 84554 111 + 181019 gatagatttgacatcggacggagaatacttgcttacaaatgtgctggggggataatacttacttatgtcgccagagagatgagcctacacattggagaaaaacacaggatg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533696 111 + 636262 gatagatttgacatcggacggagaatacttgcttacaaatgtgctggggggataatacttacttatgtcgccagagagatgagcctacacattggagaaaaacacaggatg s simRat_chr6.simRat.chr6 544603 111 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 544821 44 + 647215 agttccaagactgaggctcagtagagcacataaaattagtagag a s mr.mrrefChr3 84811 98 + 181019 tgatggtagaagaaatggctccccttcgtatgggtaacctctttagaaaggtttaatatactttgcgaaaggaatcatctaagaagaataacattgtt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534147 98 + 636262 tgatggtagaagaaatggctccccttcgtatgggtaacctctttagaaaggtttaatatactttgcgaaaggaatcatctaagaagaataacattgtt s simRat_chr6.simRat.chr6 544865 98 + 647215 tgatggtggaagaagtgcctccccttcatatgggtaacctctttagaaaggtttagtatactttgcctaaagaatcatctaaaaagactagcattgtt a s mr.mrrefChr3 84909 59 + 181019 gacaatatggtgagtatactaatgctgagtcattctgtgcttaggggcatagtggatac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534245 59 + 636262 gacaatatggtgagtatactaatgctgagtcattctgtgcttaggggcatagtggatac s simRat_chr6.simRat.chr6 544964 59 + 647215 gagattatggcaattagactaatgctgagtcattctgtgcttaggggcatagtggatac a s mr.mrrefChr3 84968 74 + 181019 gcttgacatcaactctgccatcaaacggagtcatttcagtgcctgtgacatagtggcctaactatttccctatt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534308 74 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 545265 11 + 647215 cactggaattt a s mr.mrrefChr3 85190 5 + 181019 ccatc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534530 5 + 636262 ccatc s simRat_chr6.simRat.chr6 545296 5 + 647215 ccgtc a s mr.mrrefChr3 85195 91 + 181019 atccacatgaaggtctttctaatagttaaatagagacccgacgctgtccactagaagcagtgtcctgcagacacagagttactataaaaat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534535 91 + 636262 atccacatgaaggtctttctaatagttaaatagagacccgacgctgtccactagaagcagtgtcctgcagacacagagttactataaaaat s simRat_chr6.simRat.chr6 545302 91 + 647215 atccataccaaggtctttcttatagttaagtagagagccagggttgtcaaccagaagcagtgtcctgcagacacagggttactatgaaaat a s mr.mrrefChr3 85286 40 + 181019 gtgacctctgatattgtctttatggtggactgtaaggctc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534627 40 + 636262 gtgacctctgatattgtctttatggtggactgtaaggctc s simRat_chr6.simRat.chr6 545393 40 + 647215 gtgacttctgatattgccatttcggttgactgtaaggctc a s mr.mrrefChr3 85326 63 + 181019 atattccccagtaactgcattcggcacttgaactgtaacttgacaggctgttcttttatagtc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534667 63 + 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 535298 12 + 636262 cccctgagaatg s simRat_chr6.simRat.chr6 546060 12 + 647215 cccctgacaatg a s mr.mrrefChr3 85921 214 + 181019 aagctggtgaagctgacagagttcaaaggtctatggatatccctaggtattgagatcggatagtaccagaacatcaatgggtgggcttagcttcaccatgcaagcttggattgggagcaattgctatgcatgtactggcctaagccaggaggtgtaatagaagtggacaatcggatatagcatatcacatgaatgttttagccttggctgcagg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535310 214 + 636262 aagctggtgaagctgacagagttcaaaggtctatggatatccctaggtattgagatcggatagtaccagaacatcaatgggtgggcttagcttcaccatgcaagcttggattgggagcaattgctatgcatgtactggcctaagccaggaggtgtaatagaagtggacaatcggatatagcatatcacatgaatgttttagccttggctgcagg s simRat_chr6.simRat.chr6 546077 214 + 647215 aagcacataaagctgatagagttcaaaggtctatggatatccctaggtattgggattgggtactaccaaaacatcaatgggtgggcttagattcaccaggcaagcttggaatgggaacaattgctatgcatgtacaggcctaagtctgggtgtgtaatgcaagtggacaatcggatatagcatatttcacaaacgtctgagccttggctgcagg a s mr.mrrefChr3 86135 72 + 181019 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atgctttccaactgaacaatttgctgtttctagaaacaaagctgaattcacacttaaatgaggatgagagtaaatgcattttagacgccttgaacatcaaaaggtcctaaatagaaatgagaaaaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536699 126 + 636262 atgctttccaactgaacaatttgctgtttctagaaacaaagctgaattcacacttaaatgaggatgagagtaaatgcattttagacgccttgaacatcaaaaggtcctaaatagaaatgagaaaaa s simRat_chr6.simRat.chr6 547502 126 + 647215 atgatttgcaactgaataatttgctggttctagaagcaaggctgagttcacacttaaatgaggatgcgagtaattgctttctagacactttgaacatcaaaaggtcctatatagaaataagacaaa a s mr.mrrefChr3 87395 11 + 181019 gacaacaaata s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536826 11 + 636262 gacaacaaata s simRat_chr6.simRat.chr6 547628 11 + 647215 ggtaccaaatT a s mr.mrrefChr3 87406 22 + 181019 attagcagttatgtagaaatgt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536837 22 + 636262 attagcagttatgtagaaatgt s simRat_chr6.simRat.chr6 547684 22 + 647215 GTTTACATTTCTACAGAACTGT a s mr.mrrefChr3 87428 15 + 181019 aatcacacacatctg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536859 15 + 636262 aatcacacacatctg s simRat_chr6.simRat.chr6 547710 15 + 647215 AATTACTTGCTGCTA a s mr.mrrefChr3 87443 17 + 181019 tacagccaagTCCGTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536879 17 + 636262 tacagccaagTCCGTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 547725 17 + 647215 TACAGCAAGGTTCCTCA a s mr.mrrefChr3 87460 25 + 181019 GCAAATCACTTCAGGAATAGAATTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537116 25 + 636262 GCAAATCACTTCAGGAATAGAATTT s simRat_chr6.simRat.chr6 547742 25 + 647215 GCAAATCACTTCAGGAATAGAATTT a s mr.mrrefChr3 87485 5 + 181019 CCCTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537141 5 + 636262 CCCTG s simRat_chr6.simRat.chr6 547771 5 + 647215 CCCTG a s mr.mrrefChr3 87490 89 + 181019 TCTGATTCATGTAACCATTCCCTTAACGAAATGTCGGAGATATCGTAGATTTTGGCCCCCATTCTGATGAAAGCAACCAGTTCCTATAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537146 89 + 636262 TCTGATTCATGTAACCATTCCCTTAACGAAATGTCGGAGATATCGTAGATTTTGGCCCCCATTCTGATGAAAGCAACCAGTTCCTATAA s simRat_chr6.simRat.chr6 547777 89 + 647215 TCTGATTCATGTCACGATTCCCTTGATGAAATGTCAGAGGTATGGTAGACTTGGGCCCCCATTCTGGTTTAAGTAACCAGTTCGTACAA a s mr.mrrefChr3 87579 48 + 181019 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simRat_chr6.simRat.chr6 550586 174 + 647215 GAGATCTTGTCTTTTCAAGCTACACAC-----------CTGTGTAGC------------------------------------TCCAAGTGCTTAAAACTCAGGTGCCCTAAGCCACTTATGAACCATTGGCAGGCCATAGCATGGTTATTTCCTAAGTGGACATCTCGTTTGTGAAATGAAGCTGACTTGCCATCTGCAAAGGGGCCTTAAATCTGTGCA a s mr.mrrefChr3 88994 139 + 181019 TCAATGGTCTTATATTGCTGCTATAATTTTTCTGGCCAATTTGGGTTGTATGTGGTCCTATGTACATACTTACTCCACAGACTTAACTATGCTACCCTGTCCACTTACTTAACAGAAGGGTATCATTGCCTTGATTATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538701 139 + 636262 TCAATGGTCTTATATTGCTGCTATAATTTTTCTGGCCAATTTGGGCTGTATGTGGTCCTATGTACATACTTACTCCACAGACTTAACTATGCTACCCTGTCCACTTACTTAACAGAAGGGTATCATTGCCTTGATTATT s simRat_chr6.simRat.chr6 550772 138 + 647215 TCAAGGGTGTTATATTGCCGCTATAATTTTTTTAGCCCAATTCGGTTGTATGTCGTCCTGTGTACATACTTACACCACAGACTTGA-TATGCCACCCTGTTCACTTACTTAACAGAAGGGTATCATAACCTGGATTATT a s mr.mrrefChr3 89133 118 + 181019 AACTAATACATACACTAGTCATTATATGCCTCAATTTACATAGATTTTAGCCTAGACATGGAAAAGTCTGTAGTGGACTCCTGGATGACTTGTGCCAACATACTACATGCCAGATTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538840 118 + 636262 AACTAATCCATACACAAGTCATTATATGCCCCAATTTACATAGATTTTAGCCTGGGCATGGAAAAGTCTGTAGTGGACTCCTGGATGCCTTGTGCCAACATACTACATGCCAGATTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 550913 110 + 647215 ACCTAATACATAAACTAGTTATTATATGCCTCCATTTTCATAGTTTTTAGCCTAGACATGGA-------GTAATGGACTC-TGGATGACTTGTGCCTACATACTACATGCCAGATTCA a s mr.mrrefChr3 89251 121 + 181019 ATAAAGATGGTCTCCGTGTCATATGATAAAACGAGCCAAATATAGACAATCAATAGGTTTATGTTACTATATGGTATACTACCAATGAATTGAATTTAATTAGTTTGTGTTCATTACATTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538959 121 + 636262 ATAAAAATGGTCTCCGTGTCATATGATAAAACGAGCCAAATATTGACAATCTACAGGTTTATGTTACTATATGGTATACTACCAATGAATTGAACTTAATTAGTTGGTGTTCATTACATTA s simRat_chr6.simRat.chr6 551023 99 + 647215 ATAAAGATGATCTCCGTGTTACATGATAAAACGAGCCGAATATAGACAATCAATAGGTT----------------------CCAATGAATTGAATTTAATTAGGTTGTGTTCATTACACTA a s mr.mrrefChr3 89372 86 + 181019 GCAAACCGAAAAACAGTGCAATATACTAGACCTGGAACCACAAGTTACTATACATCAAATAATTCGTTCTGTTTCTCTCAGGCCTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539146 86 + 636262 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mr.mrrefChr3 93933 43 + 181019 CCCCTGGTAAATATATTTAGAAGTATGAACCCCTCAAGGCTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543742 43 + 636262 CCCCTGGTAAATATATTTAGAAGTATGAACCCCTCAAGGCTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 555931 43 + 647215 CCCCTGGTGAATATTTACGGAAGTATGAACCCCTAAATGATAG a s mr.mrrefChr3 93976 39 + 181019 CATGCAACTATCCTTGCAGTCTCCAAAATGGCTTCTAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543785 32 + 636262 CATGCAACTATGCTTGCAGTCTCCAAA-------CAAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 555975 39 + 647215 CATGCAACTATCCTTGCAGTCTCCGGAATGGCTTCTAGG a s mr.mrrefChr3 94015 204 + 181019 ACCCCTCTGGCTGTGTGGAGACCGACACATTGATAGGATCCAACCACCGGCAGCACATTACTGTGGATTAACTTGCTGCCACACAGGGGAGTGTGGAAGAGGTGGATACTTGTTAACCCTACTGACCGCTGCAGCACATGAGGAGGGCTTGAACCAATGAAAGATCAGACCACCACACATTTCTGTACATGAACCGAAGGAGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543817 203 + 636262 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attaattatCCAAACCAATCAGTGGACACAGTGAAATAACAGAATCCTCAGAGATGGAAAGTCTGAACCCGATCACCTGGAGTGAAAAACTATCTGAAGCCAGGGTGCTAAGGTGTTGGACACCAGAATCCGAATTGAAGAGCCCTTTCATCTGCAGGCAGGTTACATTG a s mr.mrrefChr3 95189 33 + 181019 TTCAATATAGGGCACCCCTAAAAAACAGTCACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 544992 33 + 636262 TTCAATATGGGGCACCCCAAAAAAACAGTCACA s simRat_chr6.simRat.chr6 557212 33 + 647215 TTCAATATAGGGCACCCCTAAAAAACAGTCACA a s mr.mrrefChr3 95222 316 + 181019 ATGATAAGTAACAAAGTGGGTTTGCCTACCTTTTGAAACCTTTGAAGTGTAATTAACTTCTTATCTTAGGTGGAATTCAATCTGTGATCAAGTTGAAATGCATTTGCTTCTGGTTACCAAAACATATAATCTTGTGAGATTTAGGGTTCCTTTGAATCTGCATTCAACTGAGGATTAACAATTAACTAGGATAGAGTTGGGACAAAACTGCCATGGGGATCAGAGAGCCTCCAGAAATAAATTTGTTGTGTGATAAGCAAACCTGTGAGATTCAGAAAAGCACAACTGTTAGAAGGGAAGTGAAAAGCAGCATACC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545027 316 + 636262 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AGTCGAACATATGTGGATAACAGGCTCCCAGGTACAGTTGGCCTGGAATTAGATTAATGAGACCCAATATTTTGAGTGCTAAGATTACCTGGTCAGTTAGCCAGTATAACACAGATGTTTTTCAAGTGATACATGTTCATTAGCGACATTTCTGACCATAATGCACCACTAGTAGGGAGTGAATTAGAATGGAGTTCATCAGTATCTTAGCTACAGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545769 213 + 636262 AGCCGAATATATGTGGATAACAGGCTCCCAGGTACCGTTGGTCTGGAATTAGATTAATGAGACCCAATATTTTGAGTGCTAAGATTACCTGGTCAGTTAGCCAGTATAACACAGATGTTTTTCAAGTGATACACGTTCATTAGCGACGTTTCTGACCATAATGCACCACTAGTAGGGAG---ATTAGAATGGAGTTCATCAGTATCTTAGCTACAG-- s simRat_chr6.simRat.chr6 557996 195 + 647215 AGTCAAACATACTAGGATAACAGGCTCCCAGATACAGTTGGCCTGGAATTGGAGTAACTACACCCAATATTTTGGGTGCTAGGATCACCTGGTCGGTTAGTCAGTATGACACAGATGTTTTTCAAGTGGTACATGTTCATTAGCAACATTTCCGACTGTAATGCACTACCAGTAGGGAGTGAATTAGAATAGA-----------------------CC a s mr.mrrefChr3 96182 37 + 181019 CGAAGCGATCAAGATACCAAACTTGCCCTGATTAAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545982 37 + 636262 CGAAGCGATCAAGATACCAAACTTGCCCTGATTAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 20785 37 - 647215 CACAGGAATCAGGATACCAAGCTTGTCTAGATTAATA a s 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TTTCCACACAGGGCTTGTAGCATGCCCTCTGGTCAGTAAGCAAGCAACAATAAAGTGGAGTCAATTAATGAGAATAACATGGAACCATTTTGTGTACTGCCTGTGTATTGTGGATAATACTCATAGGTAGGCCAGTCGTCTACAACGGTTTGGACCCCTATGACTAGGGGCCCT s simRat_chr6.simRat.chr6 21027 106 - 647215 TTTCCACACAGGGGTTGTAGCATGCCCTCTGGCCAGTAAGCAAGCAACAATAAAGTGGAGTCAATTAATGAGAATAACATGGAACCATCTTGTGTACTGCCTGTGT-------------------------------------------------------------------- a s mr.mrrefChr3 96573 11 + 181019 ATTTCTGACCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546383 11 + 636262 ATTTCTGACCA s simRat_chr6.simRat.chr6 21308 11 - 647215 ATTTCATGCTA a s mr.mrrefChr3 96584 41 + 181019 GGGGACTGTATTACTAATAATTGGGTCTCAACAAGCAGCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546394 41 + 636262 GGGGACTGTATTACTAATAATTGGGTCTCAACAAGCAGCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 21324 41 - 647215 AGTGGTCAGATTACCAATAATTAGGTCTCAACAATCACCAA a s mr.mrrefChr3 96625 46 + 181019 CGTCAAAGAAGTTGGCAGTGGGTCATTTGAAACTTATGCAGTAGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546435 46 + 636262 CGTCAAAGAAGTTGGCAGTGGGTCATTTGAAACTTATGCAGTAGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 21374 46 - 647215 CGTTAAAGAGGTTGGCATTGATTCATTTGAAAGCTTTGCATTAGGA a s mr.mrrefChr3 96671 14 + 181019 ATGAGTCAACAGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546481 14 + 636262 ATGAGTCAACAGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 21421 14 - 647215 ATGACTCAACAGAA a s mr.mrrefChr3 96685 98 + 181019 TGCTCAAGGAATTGGAGCCTCTTAGTTGCCCTTTCTACTCCACCCAGTCCACCCAATCTGCTGCTTGAAAACTTGATTCTACATCCTTGAAAAGGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546495 98 + 636262 TGCTCAAGGAATTGGAGCCTCTTAGTTGCCCTTTCTACTCCACCCAGTCCACCCAATCTGCTGCTTGAAAACTTGATTCTACATCCTTGAAAAGGCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 21438 98 - 647215 TGCTCAAGGGACTGGAGTGCCTTAGGTGCCCTTTCTAGTCCACCTGGGCCACCGAAACTGCTGCTCAAAAACTTGAATCTACATCTTTGAGAAAGCTT a s mr.mrrefChr3 96783 88 + 181019 TAAGTTTTTCATTTGCCCCCCATCTTATGATCTTAGACACGTTTTCCTCCCACCTGTCTGTACAGGAGGTCTTACAAAAAACTCCATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546597 88 + 636262 TAAGTTTTTCATTTGCCCCCCATCTTATGATCTTAGACACGTTTTCCTCCCACCTGTCTGTACAGGAGGTCTTACAAAAAACTCCATG s simRat_chr6.simRat.chr6 21536 88 - 647215 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AACATCCCTTGTTGTAAAATCAATATGGCTGGTGATACAGTATACCCATTACCATTAGTAT-GCCAAATTCCTCCTGCCCTGGTGTACTATGCCTGTATACATAGTAGTAGTACATAACAGATACTTTTGTCAATGTCAGGGTCTATCACTGCTGGCCACATTATAAGTGTGTGCAGTGCTCTCAGCAGCCATTATGCCACATTGGTTTAGCCTAAT-TTCTAAACCCGTCTGGTTTGTATTAACCATCAGTGGCTAATTTTCACTTGCTGCCTTTTTTTTTGCATTGGTAGTTAGCGGTACTTATTGTTCCAGTAGCCGAAGGTCAGCGAAATAAAATCCCAGTGGCTGCAGGTCAGCAGAAGAAAGTAGACTCGGT a s mr.mrrefChr3 97570 2 + 181019 GT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547445 2 + 636262 GC s simRat_chr6.simRat.chr6 22334 2 - 647215 TT a s mr.mrrefChr3 97572 177 + 181019 AAGTTTTGTATTTCTAAGCTTGGGAGCTATGCTTGCCCAATTTGAATTTATGTGGAGATTCCATTGATGCTAACCAGGAAACCTTAGAAGGAGCCTTAATGGCCACAACACCTCAATCAACTCTAAAACCAAATTCATCATTGATGGGTCTTTCTGATGTTAGGTTTTATGATGTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547477 177 + 636262 AACTTTTGTGTTTCAAAGCTTGGGAGCTATGCTTGCCCAATTTAAAGTTGTGTGGAGATTCTATTGATGCTAACCAGGAAACCTTAGAAGGAGCCTTAATGGCCACAACACTGCAATCAACTCTAAAACCAAATTCATCATTGATGGGTCTTGCTGATGTTAGGTTTTATGATGTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 22336 148 - 647215 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mr.mrrefChr3 98990 51 + 181019 GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548888 51 + 636262 GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 23817 51 - 647215 GATCCAGCATGAAGTGGATGCGCTAAAAGAGAGACATCAAGCATTTTGGGA a s mr.mrrefChr3 99041 243 + 181019 CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCAAAGAGCTATTGATGTGCTACTAGGTATGAGAGGCTGGTCTAATGATAACCAGAATGTCCCTGCCAGCGGGTGTACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTGGCTGCTGTTGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATTTGGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548939 234 + 636262 CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCGAAGAGCTAT-GATGTGCTACTAGGTATGAGAGACTGGTCTAATGATAGCCAGAATGTCCTTGCCAGCGGGTGAACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTG--------TGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATCTAGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 23871 235 - 647215 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CATACCAGCCTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACAGTAACTTGTAGTTATCATACCCAAGTGAAAGGGCCATTGGCACCCAAGGTCCACAAAAGTAACAGTTTGTAACCACGCTAGAAGGCAGCTTATAGCCATCTACACATTTCTTCTTAAATCCCAGTGGCACTCTTCTTCTCCTTTTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCTCACAACTATAAACATTTCAGATTGAAAAGAGTAAGGGAGAGTGTACTGCAGACAC s simRat_chr6.simRat.chr6 25461 282 - 647215 CGTATCAGTTTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACGGTAACTTGTAGTCATCATACCCAAGTGAATAGGCCACTGGCACCAAAGGCCCACAAAGGTAAGAGTTTAGAACCACATTAGCAGGCAGTCTATGACCTTCTAAACATTTCTTCTTCAATTCCAGTACCTCTCTTCTTCTCCCTTTCTTTTCTCCTAGTCCTTTTCTCACAACTATAAACACTCTAGAGCGAGAAGAGTAAAGAAGGTTGTACTGTGGACAC a s mr.mrrefChr3 100802 176 + 181019 CATTTTGGAAGTTGACAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTGATATGATGGTGTAGCCTGGGGAAGAGCAACCTCCCACATCCAGTAATGTTAGCCCAGCCTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGAATAAACACAGTTTCTGTAGTTCAGTGTCTGTGATAAGTAAAAGTATCATGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550796 176 + 636262 CATTTTGGAAGTTGACAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTGATATGATGGTGTAGCCTGGGGAAGAGCAACCTCCCACATCCAGTAATGTTAGCCCAGCCTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGAATAAACACAGTTTCTGTAGTTCAGTGTCTGTGATAAGTAAAAGTATCATGT s simRat_chr6.simRat.chr6 25743 176 - 647215 CACTTTTGAAGTTCATAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTAGTATGATGGTGTAGCCCAGGGAAGAGCAGCCTCCCACATGCAGTGATGTTAGCCCAGCTTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGGACTGATACAATTTCTCTAGTTCAGTATCTGTGATAAGTAAAAGTATCCTAG a s mr.mrrefChr3 100978 111 + 181019 TCCTACAGTTTTGTCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGAAGTCAAGCTTTTTCTCATCCTAATGTTACTTTTTAACTATGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550972 111 + 636262 TCCTACAGTTTTGTCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGAAGTCAAGCTTTTTCTCATCCTAATGTTACTTTTTAACTATGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 25924 111 - 647215 TTCTGCCATTTTGCCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGATGTCAAGCTCTTTCTCATCCCAGTGTGGATTCTTAACTAGGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG a s mr.mrrefChr3 101089 59 + 181019 AATGAAGTATGTACTTAATCAACATATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551083 59 + 636262 AATGAAGTATGTACTTAATCAACATATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC s simRat_chr6.simRat.chr6 26039 59 - 647215 AATGAGGTATGTACTTAATCAATGCATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC a s mr.mrrefChr3 101148 154 + 181019 ATCATCTTCAAGTCAGGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGCTGCAAGGTAGTGTAACACTTAATGGATGACAAACGTTTAGGTATGTTTAGATAGGGGCACATGGAATTAGGGTTGTTTGTCTAAAAGTGCATACGTACATCAACTTATGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551142 154 + 636262 ATCATCTTCAAGTCAGGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGCTGCAAGGTAGTGTAACACTTAATGGATGACAAACGTTTAGGTATGTTTAGATAGGGGCACATGGAATTAGGGTTGTTTGTCTAAAAGTGCATACGTACATCAACTTATGG s simRat_chr6.simRat.chr6 26101 154 - 647215 ATTATCTTTAAGTCAAGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGTTGAGGAATAGTGTAACACTCAATGGACAGCAAATGTCTAGGTATGTTTAGATTGGGGTACATGGAATTAGGGTTGTTTCTCTAAAAATGCATACATACATCAGCTTGTGG a s mr.mrrefChr3 101302 91 + 181019 TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551297 91 + 636262 TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT s simRat_chr6.simRat.chr6 26255 91 - 647215 TACCCTACCAAAAATCAAGGAAGTTATTTTTCAAGCATAACATAGCAAACCTTGCAGGTTACAATGCCTTATCGATTCTTTGAACTTACAT a s mr.mrrefChr3 101393 13 + 181019 ATGTGAGAGATCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551397 13 + 636262 ATGTGAGAGATCA s simRat_chr6.simRat.chr6 26346 13 - 647215 ATGTAAGAAATTA a s mr.mrrefChr3 101406 7 + 181019 TGCTAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551412 7 + 636262 TGCTAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 26359 7 - 647215 TGCTAAT a s mr.mrrefChr3 101413 15 + 181019 CATCAGTGATATTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551421 15 + 636262 CATCAGTGATATTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 26366 15 - 647215 CATCAGTGATATTGA a s mr.mrrefChr3 101428 95 + 181019 TACAAGCAATTATTTAATGCTATGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCTCCTCTGTCCTTTGAAGAAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551437 92 + 636262 TGCAAGCAATTACTTGATGCTATGATAAAAGTGCAGGTGAACTTAAGTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCCCCTCTGTCCTTT---GAAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 26381 94 - 647215 TACAAGCAAT-ATTTAATGCTAGGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCATCCAGTTGTGGTCAGTGGTCTCCTCTGTCCGTTGAAGAGGT a s mr.mrrefChr3 101523 1 + 181019 A s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551574 1 + 636262 A s simRat_chr6.simRat.chr6 26475 1 - 647215 G a s mr.mrrefChr3 101524 15 + 181019 ACCTGTTACCCTCGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551575 11 + 636262 GTCTGT----CTCGC s simRat_chr6.simRat.chr6 26478 15 - 647215 ACTTATTACCCTTGT a s mr.mrrefChr3 101539 353 + 181019 ATAAGCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTACCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGTCGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTGATTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTTGGGCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTGCCAAGCCAGCCTAGACTAATCTAGGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAAATGCCACCTCACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551586 352 + 636262 ATGACCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTGCCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGCTGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTCCTTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTCAGCCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTACCAACCCAGCCTAGACTAATCTAGACTTAAGACACACAATAACCA-TGTTAAAATGCCGTCTAACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAGAGAAGCACCACTGACAATACT s simRat_chr6.simRat.chr6 26498 352 - 647215 AGAGGTGGCTTGCTTCTCGCTTGAGTTACCATTAGCCTACCCCCTCAACTCACTGAAGGATTAATATCGGCAGATGCATGTCGTGATGGGCCAGCACAGTCTTTATAAAGATTTGATTCAATTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCGAAGCTTGGGCCGAGAAGAATTTGGAAAAATCTTACATCCTAGCTGAGTGCCCACTACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGTA-GCCTGCCAAGCCAGCCTAAACTAACCTGAGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAGGTGCCACCTCACTGTTCTAGATGGACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT a s mr.mrrefChr3 101892 51 + 181019 TCCCCTACTTGCATTTATGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551938 51 + 636262 TCCCCTACTTGCATTTATAAGTACTAGCACCATAGTTTTTTCAGCTTTATA s simRat_chr6.simRat.chr6 26863 51 - 647215 TCCACTACTGACATTTGTGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA a s mr.mrrefChr3 101943 169 + 181019 TCAAATCACCGTAAGGGATCCTATCTGGTTAGCACTGGCATCTATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGTTGAGATTGCGACATGCAGCACTTAGGATTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551992 155 + 636262 TCAAATCACTGTAAGGGTTCCTATCTGGTTAGCACTGGCACCAATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCTATCAGACCCA--------------GCAGTTCTGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGCTGAGATTGCAACATGTAGCACTTAGGATTAT s simRat_chr6.simRat.chr6 26914 169 - 647215 TCAAACCACCGAAAGGGATCCTATCTTGTTAGCACTGGCATCTATTATCAAAGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTGGATAAAGTTGAGAAGATACAACTGTTGAGATTGTGACATGCAACACTTAGGATTAT a s mr.mrrefChr3 102112 113 + 181019 AATCAGAGTATATTCTGCAGCACCCCGATTGGGGACAAATACAGAACAATAGTGTCCTGAGCCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAGACCAAGAAATAACTGAATGGGATATGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552151 112 + 636262 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GTAAGTAGGCCTATCATATTGCTTTTTCAGAATTTAGCAGTCTTCACAGAGGCTGTTCATTTGTTGAGGACATCAGGAGATACTCTAGAATGAGTCCATTATGATGGCCAATGAAGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGACATGGATCATAGGCCATTCGGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGTGTGCTTAGAATTCAAAGACA a s mr.mrrefChr3 102430 54 + 181019 AGATGAATCTATGCTTAAATGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552465 54 + 636262 AGATGAGTCTATGCTTAACTGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 27499 54 - 647215 AGGTTAATTTATGCTTAAATGCCATTCTGATTTTAATAGACACTTTGTCTGGTT a s mr.mrrefChr3 102484 11 + 181019 AATCTCAAGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552519 11 + 636262 AATCTCAAGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 27557 11 - 647215 AATCCCAAGAG a s mr.mrrefChr3 102495 38 + 181019 CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552531 38 + 636262 CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC s simRat_chr6.simRat.chr6 27568 38 - 647215 CGCATGCACCAAAGTCATTAGTAGGACTAGGTCAAAGC a s mr.mrrefChr3 102533 494 + 181019 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AAGCGTTCTATATATGA-GATGCTGAGCTACAGAGCCTCAATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATAGAAGTAAAAACAGCCTTTCCCACTTATACATGTTCTGGTAGGGATTTCAACTTCAACTGCTGTACTTTTTCTTTAAGGCATGCACATCTTTTG-CTGGGGTCAGAGAGGCACTACGCTAACATATGAACTCGTCCACTTGTAAGCTAGGGTGACAAAACAATCTGCCCTCTTAAATGTGATTTTATGATTATGTTACTCCCTGCCTAGAAGTGACGTTACAGGCTGCATGAATAAGAAACTCCCTGTCTGGGTCTGTGCCTAGTCAATTGTGATCCTCCATAGAAATCCGGTTGTGAATATGCTTGGGCACCAAACTCTCCCTCTTGTACTGAGAGAGCTGACATTAGTTGATGATAGATTTATTATAGAGGGCTCTGAGTACTCCCTCATATAGTTATTTGTTTATGGGGGCTATGGGCAATAGGCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 27615 488 - 647215 AAGCATTCTATCTATGATGATGCTAAGCTACAGACCCTCTATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATGGTAGTAAAAACAGCCTTTCCCGCTTATACATGTGCTGGTAGGAATTTCAACTTTAACTGCTGTACTTTTCTTTTGAGGCATCCACATCTTTTGTCTGACGACAGAGAGGCACCACCCTAACATATGTACTCACTCACTTGTAAGCTAGCGCGACAAAACAATCTGGACTCTTAAATCTGTTC----AATTACTTTACTCTCTGCCCAGAAGTGACAT--CAGGCTGCTTGAATAAGAAAATCCCTGTGTGGGTCTGTGCCTAGTCCATTGTGATCCTCCATAGAAATCCAGTTGTGGATATTCTTGGGCACCAAACTCTCATTGTTGTACTGAGAGAACTGACATCAGTTAAAGACAGATTTAATATAGAGGGCTCTAGGTACTCCCTAATGTAGTTATTTATTTATAGGGGCTATGGGCAATGGGCCC a s mr.mrrefChr3 103027 319 + 181019 TGGACAAACTCTTGGAATAAGATAAGCAGCCAGACTCTATAATAGCACCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCAAAATTCAAGTTCTGTCATTGTTGAGTTTGTAAGTTTCTCCCCATCACTCTTACTATAATGTTGACCCCATATGGGGACGCATATCTTAAATGCCTACTGTTAGGTTAAAATAAACATCATGAGAGCACCTTATCTAATGCTGGTTTCACATGACCCTTGTCGGCCTTGAGTCATCTCTTTATCCAAGCTAATACCCATGTGATGTGCCTAATGGGAATGCTTTGGTGCAGCTATGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553062 314 + 636262 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mr.mrrefChr3 103403 32 + 181019 GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553433 32 + 636262 GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA s simRat_chr6.simRat.chr6 28481 30 - 647215 GAGACCAATAATCTCATAAACGGAAGGTAA-- a s mr.mrrefChr3 103435 167 + 181019 GGCAGTCCCTCCTGTATATTGTATCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGCATAGTGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553467 167 + 636262 GGCAGTCCCCCCTGTCTATTGTGTCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGTTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGGATAGAGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 28511 167 - 647215 GGCAGTCCTTTCCGTATATTGTATCAGAAGGATCAGGGAAAGATTTACAAGCCAATATAAGTATCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATATAATGTGACCACTGGAGGACCAGCTCAGTGGATGGGTGGCTGGACATCTGAGCAAATTCAACTTGGGCTAACTTATTCC a s mr.mrrefChr3 103602 217 + 181019 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simRat_chr6.simRat.chr6 29355 32 - 647215 TCACTCCAGGGGTTCGGGCACACACATTGTGT a s mr.mrrefChr3 104213 164 + 181019 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGTCCTGAAAGAATAAGCTCCAGTAATCAGGTTCATGTGGTTAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGTGGTGGAGCAAGTAACCTTAATTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474459 164 + 636262 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGCCTTGAAAGAATAGGCTCCAGTAATCAGGTTCATGTGGTTAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGTGGTGGAGCAAGTAACCATAAGTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554240 155 + 636262 AAATAAA------GGCAGGTGGTCCTGAAAGATTACGCTCCAGTAAACAGGTTCATGTGGTAAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGCAGTGGAGCAAGTAACC---ATTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 29387 164 - 647215 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGTCCTGAAAGAATAAGCTGCAGTGCTCAGTTTCCTGTGGCTAGCAGTTTCCCTAATCTCAAGGGAGTATATTTAACTGGTGGAGCATGTAACCTTAATTTTGCCAGTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATATATAAGTCCCC a s mr.mrrefChr3 104377 48 + 181019 AAAGCTGCTCATAGTATAACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474623 48 + 636262 AAAGCTGCTCATAGTATAACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554395 48 + 636262 AAAGCTGCTCATAGTATGACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 29552 48 - 647215 AAAGCTGTTCATGGTATAGCTGAATTCTAATGTCCATATCTGGAAATA a s mr.mrrefChr3 104425 51 + 181019 GGTTGTACCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATTACCAACCAGGGGGAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474671 51 + 636262 GGTTGTACCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATTACCGACCAGGGGGAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554443 51 + 636262 GGTTGTGCCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATCACCAACCAGGGGAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 29608 51 - 647215 GGTTGCACCATGATGACAGTGACCCTACCTTAATTAATAACCACGGGGAAA a s mr.mrrefChr3 104476 248 + 181019 AAGATGTACCTGTGCATATCGAGGTATAATTCTTGAGTTAATTCCTTGCAATGGGTGATGACAACCTCAGCCTATCCAAGAATTAGTGTGGTTTACATGTGACCTAAAACCCTCAGAGACTTCAAATTGCCTCCCCCTTTTCTGGGAGTTCCTGTATCGTTGATACTAAAACAAGCTGAACAATCATTTAGTAGAGAGGCCCTGGGAAGGTGGCCTCCTTACTAAGAAACTTGCTCAATGACTGAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554494 248 + 636262 AAGATGTAACTGTGCATATCGAGGTATAATTCTTGAGTTAATTCCTTGCAACGGGTGATGACAATCTTAGCCTATCCAAGAATTAGTGTGGTTTACATGTGACCTAAAACCCACAGAGACTTCAAATTGCCTCCCCCTTTTCTGGGAGTTCCTGTACCGTTGATACTAAAACAAGATGAATAATCATTTAGTAGAGAGGCCCTGGGAAGGTGGCCTCCTTACTAAGAAACTTGCTCAATGACTAAGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 29659 214 - 647215 AAGATGTACCTGTGCACATCAAGGTATGGTTTCTGAGGTAATCCCCTACAATGGG-GATGACAGCCTCAGTCTACCCAACAATTAGTGTGGTTTGCATGTGACCTAAAATCCTCAGACACTTCAAATTTCCTCCCCCTTTTGTGGGAGTTCCTGTATGGTTGAGACTAAAACAAGCTGAACAATTATTTAGTA---------------------------------AAACTTGCTCAATGGCTGAGGT a s mr.mrrefChr3 104724 142 + 181019 TTGAATTCTTTTGTCAAGGATTAATACATATTTCGAGTATGAGTCTTGTTAGGTTGAATGAAGAAAGGATGCTGGACTGAAGATCTGATCAACTGGTCTCCAACCAAGATTGGTGATGCTGGAGGACTATTTGCACCTAGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554749 142 + 636262 TTGAATCCTTTTGTCAAGGATTAGTACATATTTCGAGTATGAGTTTTGCTAGGTTGAAAGAAGAAAGGATGCTGGACTGAAAATCTGATCAACTGGTCTCCAACCAAGATTGGTGATGCTCGAGGAATATTTGCACCTAGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 29873 141 - 647215 TTGAATTCTTTTGTCAAGGATTAATATATATTTCTAGTATGAGGCTTGTTAGGTTGAATGA-GAAAGGATGCTGGACTGAAGGTCTGATAAATTGGTTTCCAAACAAGATTGGTGATGCTGGAGGACTATTTGGACCTAGGT a s mr.mrrefChr3 104866 33 + 181019 AGCTTAGATTTTAGGGCTATAAGCATAATTTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554891 33 + 636262 AGCTTAGAATTTAGGGCTATAAGCACAATTTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 30015 33 - 647215 AGCTTTAATTTTAGGGTTACAAGCATAATTTGT a s mr.mrrefChr3 104899 240 + 181019 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GTAACTGAAGACAACCAATGCAA-AGTACTAAGATAGGCCTGTGGATGGGTTTGCCCGTGCTTGAGCCTAAGGACAACAATTGAGAGGGGGATTAATGAGGATCTGAGCCTATAAGTTACAGGGTGCTGGCAATGAGCCTAGGTATGGTTTCTATTAGTACAC a s mr.mrrefChr3 107845 28 + 181019 CGCTTGCCCCACATATTAATCTATGTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557867 28 + 636262 CGCTTGCCCCACATATTAATCTATGTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 33102 28 - 647215 CCCTTGCCCCACATGTTAATCTATGTAG a s mr.mrrefChr3 107873 10 + 181019 GCCTCAGAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557896 10 + 636262 GCCTCAGAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 33130 10 - 647215 GCTTCAGAGG a s mr.mrrefChr3 107883 8 + 181019 ATGTGCAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557911 8 + 636262 ATGTGCAC s simRat_chr6.simRat.chr6 33140 8 - 647215 ATGTGCAG a s mr.mrrefChr3 107891 19 + 181019 ACAGTCTTAATATCTGTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557919 19 + 636262 ACAGTCTTAATATCTGTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 33150 19 - 647215 ACAATCTTTATAGCTCAAC a s mr.mrrefChr3 107910 79 + 181019 TGTCCTATCATTACCCCAGTGAATATCATGGAACCCTGAGGTATCTCTGATATGGATATCATGTGATAGACAGCATCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557938 79 + 636262 TGTCCTATCATTACCCCAGTGAATATCATGGAACCCTGAGGTATCTCTGATATGGATATCATGTGATAGACAGCATCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 33170 79 - 647215 TATCCTATCATTACCCCAGTGAACATCATGGTACCCTGAAGTATCTCAGATATGAATATCATGTGAAACACAGCATCCC a s mr.mrrefChr3 107989 45 + 181019 ACTCGTTTTATAGGGTAAAATGTGTTGGGCCCTTCTCCAGATGTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558090 45 + 636262 ACTCGTTTTATAGGGTAAAATGTGTTGGGCCCTTCTCCAGATGTC s simRat_chr6.simRat.chr6 33249 45 - 647215 ACTTGTTTTATGGCGTGAAATGTGTTGGGTCCTCCTACGGGTGCC a s mr.mrrefChr3 108034 17 + 181019 AATGATTGGTTGATAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558136 17 + 636262 AATGATTGGTTGATAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 33294 17 - 647215 AGTGGTTGCTTGACAAC a s mr.mrrefChr3 108051 68 + 181019 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTAGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439433 68 + 636262 ACATGAGGTGGATAGGTTCCTTCTTGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558153 68 + 636262 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTAGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 33311 68 - 647215 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTACAGATGCTGGTGATTATTTGGCAGCACATGAGGCAGGTGGGCT a s mr.mrrefChr3 108119 58 + 181019 CAGCAGCCAAGTAATGACTGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTAATGGGAGCTTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439501 58 + 636262 CAGCAGCCAAGTAATGACCGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTGATGGGAGCTTGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558222 58 + 636262 CAGCAGCCAAGTAATGACTACATGCACATGGCCGTGTTTGCCCTTAATGGGAGCTTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 33379 58 - 647215 CACCAGCCAAGTAATGACAGCACGCACATGGCCATGTTTTCCTTTAATGGGAGCTTTG a s mr.mrrefChr3 108177 58 + 181019 CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439559 58 + 636262 CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558280 58 + 636262 CACATGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 33438 58 - 647215 CACAAGGAGCACTTGAAATCTTGACAACATTAAGGAGGTCCAAAAAGAGTTTAAGAAT a s mr.mrrefChr3 108235 33 + 181019 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558338 33 + 636262 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT s simRat_chr6.simRat.chr6 33496 33 - 647215 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT a s mr.mrrefChr3 108268 21 + 181019 ATAGGCCAAATGTTTGATCAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558388 21 + 636262 ATAGGCCAAATGTTTGATCAC s simRat_chr6.simRat.chr6 33529 21 - 647215 ATAAGCCAAATGTTGGATATC a s mr.mrrefChr3 108289 29 + 181019 ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558409 29 + 636262 ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 33553 29 - 647215 ATTTATCAGGCTACAGCGATACAGAGACA a s mr.mrrefChr3 108318 35 + 181019 TGAGTTACAACCCTGGGGCAACACAATATGTGTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558450 35 + 636262 TGAGTTACAACCCTGGGGCAACACAATATGTGTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 33582 35 - 647215 TGAGTTGCAACCTTGGGGCAGCACAATATCTGAAC a s mr.mrrefChr3 108353 84 + 181019 TCTCTTCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGGGAGTGCAATGCAGGACCTTCCCTGGTACATGTTGGTTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558492 84 + 636262 TCTCTTCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGGGAGTGCAATGCAGGACCTTCCCTGGTACATGTTAATTAT s simRat_chr6.simRat.chr6 33617 84 - 647215 TGTCTCCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGTGAGTGCAGTGCAGGACCTTCCCTGGTAAATGTAGGTTAT a s mr.mrrefChr3 108437 422 + 181019 ATATAAGATTATTCACATAGTGCACATCAAGGTAAGCAACATTTAATAATGCCTGGTAGCTTCTCCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAATAGATAGTTGAACTGTTCCAATTATAAACTTGTATTCACAATTGCTATCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATTTAATAGCAAGGGAATTTGTTCTTCCAAACAACTGTTCTATGTTGACCTACTCAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTCCCCTTACTGGTGTTATGAATGCTAGTATAGTCTTCAGCTCAAATGCTAGTATAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCGTAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558576 370 + 636262 ATATAAGACTATTCACATAGTGCACATCAAGGCAAGCAACATTTAATAGTGCCTGGTAGCTTC-CCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAAGAGACATTAGAACTGTTCCAATTATAAACTTG--TTCACAATTGCTTTCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATCTAATAGCAAGGGAATATGTTGTTCCAAACAACTGTTCTA--CTGGCCTACTTAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTGCCTT-----------------------------------------------TAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCACAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 33703 413 - 647215 ATATAAGGTTATACTCATAGTGCACATCAATGTAAGCAACATTTAATAATGCCTGGAAGCTTCTCCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTCGTAAAATTGGGAAATAGATAGTTGAACTTTTCCAATTATAAATTTGTATTCACAATTGCTATCTCATTTCTTTCACTTAAGCAGCTACTTTTCCTCTGTTTGATTAAATAGCAAGGGAATTTGTTCTTCCAAACAACTGTTCTATGTTGACCTACTCAACTGTGTAGCACAGTAATTGTTGGCTTG---------GGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTCGCCTTACTGGTGTTATGAATGCTAGTATAGTCTTCAGCTCAAATGCTAGTATAGTCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTCGGACAGGTTTTAATATTTATGATCCCGTAGT a s mr.mrrefChr3 108859 57 + 181019 ATCCTGTCGTCGTGGACAATAGATTATAGGCCCAGACCAAAGCAACTGTCTACTGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558953 57 + 636262 ATCCTGTCGTCGTGGACAATAGATTATAGGCCCAAACCAAAGCAACTATCTACTGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 34116 57 - 647215 CGCCCGTAGTCGCGGACAATAGATTATAGGCCCAGACCAAAGCAACCGCCTATTGAA a s mr.mrrefChr3 108916 434 + 181019 ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCATATCTCCCAAGGCAGTGGACAGGGGCCACTAAACTCTCTTAGCTTCAGAGCCTCAAATGAGTAGGTCTTGTTGTGGTTGCAGGAGTCATACACTGTGGCCCTAATGACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCAGTGGCACTAATCTAGAGCTAAATTAGGCTTAAAAACCGCTCACTGGCTAGTGAATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACAGGAGACTATTACCTAGCACTCGTGCAATTAAGTGTGACCAAATCTCCTGAATTATAGAAATTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAAACGGTCGGACCTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559010 418 + 636262 ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCACGTCTTCCAAGGCAGTGGATGGGGGCCAATAAACTCTCTTAGCTTCAGAGGTTCAAATGAGTAGGTCCTGTTGTGGTTGCAGGACTCATACACTGTGGCCCTAATAACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCCGTGGCACTGATCTAGGGCTAAATAAGGCTTAAAAACC---------------CATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACTGGAGACTATTACCTAGCACTC-TGCAATTAAGTGTGCCCAAATCTCCTGAATCATATAAACTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAATCGGTCGGACCTA s simRat_chr6.simRat.chr6 34176 433 - 647215 ATGTACCCATCAGATACTCTAATCAATGACAGTTCAACCCATAAATCCCAAGGCAGTGGACAGGGGCCACTAAAATCTCTCAGCAC-AGAGCCTCAAATGAGTAGGTCTTGTTGTGGTTGCAGGCGCCATACACCACGGCTCTAATGAACATGCACCTTGGGGAGTGACTACTATGAATCTTTGACTCAGTGGTACTAATCTAGAGCTAAATTTGGCTTAAAAACCGCTCACTGGCTAGTGAATATCTGCTTTTCTCTCTTTGCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACAGGAGACTATTGCCTAGCACTCGTGCAATTAAGTGGGACCAAGTCTCCTGAATTATAGAAATTCACCTCCTTTCAGTAAACTGTACAGAATAAAAATAAAGGTAGGTTTACACAGAAGGAATCAGGGAATGAAACGGCCGGACCTA a s mr.mrrefChr3 109350 171 + 181019 GCGATGTTCCGGCCCTTCGCAAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCGACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCGCG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559429 171 + 636262 GCGATGTTCCGGCTCTTCGTAAACAGCTTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCACGACAAACATGTATCAGGCGGTCTTCGACCACTTCTGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCACG s simRat_chr6.simRat.chr6 34609 171 - 647215 GCGATGGTCCGGCCCTTCGCCAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGTCTCTAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCTACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTAATCCCTCTAACCAGATGGCAGTCTTAATTCAATTACTACGCGTGTCTTGCGCG a s mr.mrrefChr3 109521 365 + 181019 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13 + 636262 AGCATTCACTTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 35247 13 - 647215 AGCCTTCACTTTA a s mr.mrrefChr3 109993 153 + 181019 TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGAATTATAATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCAACTGGGATCATGGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560064 151 + 636262 TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAAT-GTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGGATTATGATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAACTACTGCAGCTGGGATGATGG- s simRat_chr6.simRat.chr6 35273 153 - 647215 TGATTATTGTCAATATATGTAATGGGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTTTATGATTTGGTGAGCTTATCAAAAAAAATAATGTGAATACTATTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCGACTGGGATCACGGG a s mr.mrrefChr3 110146 20 + 181019 TCTGTTTGTCACAGACTTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560215 17 + 636262 ---GTTTGCTACAGACTTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 35427 20 - 647215 TCTGTTTGTCACACACTTGA a s mr.mrrefChr3 110166 353 + 181019 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CATCTAATGCTGTTTGCTCATGAACTCACCACAACCTGCAACTAAGTCAGACCATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATAGCCCGGGTCTTACAATACAAGTTGTACACCACCAATAGAAGCTAGTTGTAGGCTGAAGTCTAAATAAGGGAAACTCTCAGGCGAGGCAATTTAAGTCTGAGGGACACCACTACAATTCTGTATGCAAGGTGTAGCAGTACAAAAAATTTGAGTGCCAGGAGAAGGAGTAACAATGTTAATATGCATTAAGTGGTGGCAGGAGTTGTCAGTACTCTGACATGTACTATCAATAGGCCCTATTCCCTTGCATGTTTAATATATGGCTCCTCAGACA a s mr.mrrefChr3 110519 78 + 181019 AACCAAGGGACGGACCTTATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGTTATGCCATTCTTATCAGCTTGAGTCTGGGTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560604 78 + 636262 AGCCAAGAGACGGACCTCATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGCTATGCCATTCTCATCAGCTCGAGCTTGGGTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 35801 76 - 647215 AAGCAGGGGATAGACCTTACT--TATTACATTTGCCTGCTGTTCATTGTGCCATCCTTATCAACTTGAGTCTGGGTAC a s mr.mrrefChr3 110597 168 + 181019 ATCTCAATGCCACCACCAAGGGATCCAACCTAAATTATATCTGGGATGAGTTTCCAGTAAGAAACCTCTCCTTTAGTTGAGCTCTGTCTTTCCATGCTGACTATGGTGAGCATGCTCTAATTAACACACTCACCTTATTGCTAGGTACCCTGCATGTTGCATTGCATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560682 168 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 563003 68 + 636262 ----CAGATAACAAAACTCTGACTTTGGTCCCCAGGACAATTATCTTCAATAAATTAGCTTACTGGTCGTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 38282 72 - 647215 GCATTTGATATCAAAGCTCTGATTATGGTCCCCAGGCCAATCATCTTCACTAAATTAGCTTAGTGGTAGTAA a s mr.mrrefChr3 112940 70 + 181019 TCATCTGACTATCAGATCTGACCTCTCTAGTGTAAAGTAAGAGATTGAGTAACACTCGACTTACAGACCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563072 70 + 636262 CCATCTGGCTATCAGATCTAACCCCCCTAGTGTAAAGTAAGAGATTGAGTAACACTCGACTAACAGACCT s simRat_chr6.simRat.chr6 38354 70 - 647215 TCATCTGACTATCAGATCTGACCTCTCTAGTGTTCACTGAGAGATAGAGTAACACTAACCCTAATCTTCT a s mr.mrrefChr3 113010 59 + 181019 TAGTCTACAAGGAGTAATGTTCTCAGGGAACTCTTATTATGGGGGGATAAATTGCAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563143 42 + 636262 TGGTCTACAAGGAGTGATGTTCTCAGGGAGCTCTTATT-----------------GATG s simRat_chr6.simRat.chr6 38424 58 - 647215 TAGTCTA-AAGGAGCAGTTTTCTCAGGGAACTCTTATTATGGGGGGATAAATTGCAATG a s mr.mrrefChr3 113069 155 + 181019 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 563352 217 + 636262 TCTTGAATTCCTTAGCCCCGCCAGGTTGATCTTAGTAAGATCCCCCTCAATGGTAATAATTTCAGGGGCTCCTACAAGTTCTCTCAAGTTGCGGCACTGTTTTTCATATTTTATGTCAGATGGGTCTGTGGGAAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGTTGATCACAACTCTAGCCAGACCCTTGCAATAGCGTGCAGCTCTGTAAGACAGTTCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 38650 211 - 647215 TCTTGAATTCCCTAACCACACCAGGTTGTTCTTCGTAGGATCCC---CTG---CAATAATTTCAGGGTCTTCCACAAGTTTTCTCAAGCTATGGCAATGTTTTTAATACTTTACATCAGATGGGTCTGTGGGGAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGCTGGTGGCAACTCTAGCCAGACCATTGAATTAGCGTCCAGCTCTGTAATACTGTTCCA a s mr.mrrefChr3 113451 109 + 181019 TTCATGCTGCAGATAAAATGGGACCATGGATCAAACTGGGAGAACCTGTAAGATAGTACAGATGTTTATGGAAGGGTCTTATAGTTACTACTACCTCTGCTAGTTCCAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563570 109 + 636262 TTCATGCTGCAAATAAAATGGGAGCATGGATCAAACTGGGAGAACCTGTAAGATAGTACAGATGTGTGTGGAAGGGTCTTATAGTAACTACTACCTCTGCTAGTTCCAG s simRat_chr6.simRat.chr6 38861 109 - 647215 TTCATGCTGCAGATAAAATGGGACGATGGATCCAACTGGGAAAACCTGTAACACAGTACGAATGTTTATGGAAAGGTATAATAATTAACACTACCTCTGTTAGTTCCAG a s 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AAGTGACATGAAATCACAGTAGCTGCTGGTAGGGTGCAACTTGTAGCAAGTTGCAAATAAAGCAAATATACAATTAACTCATTCAACCTGGAGGATAATGTTATAGACAAAAAACTGGACTAACTCTTATTACATTAACAAAGATTTCTCATATTATTTGTTTTAATAATGACCAGATTCATGTCATGTAATCCCTCCTTTGGGGGCATTGGAAAAGGACATCTAATGCGAGAAGTAGATGCACTGGATGGGTTGTGTTCTCATATCTGTGACCAGTCTGGTGCTCTTTATAAAGTCCTGAACCATCGTAGGGGGCCTGACGTGGTGGGGGGGCTGCGGGCACAGATCGATAGAAAGCTTTATAAGCAGAACATGCAAGTTACAAATATAAAGCGTTATTGTAGCAGATCCCAGCATTGCATTCCTAACTGTAAGTGTAGACTCCAGATTGAGAAAGAGATATTAAATACGCCATTGTTGACAGTTCAAGAAGGAGCAGTTGAAGAGCTTACTCTCCCTGAACCAGAGCCTGAACACACTGGTGAATGTCATGTCAGTGGTGTTGTCTTAGGTTTGTATTTAAAACCTGTGATACATGATACTCCAAGATGGTTGTGTTCACAGATTATCTCTCCAAGTTGGTTTGCTACAGGCTCACCAGGAAAGTGATTTGTACGTGAAACCCCCCGG a s mr.mrrefChr3 114722 34 + 181019 CTGGTGACTACAAAACACCATGATCTTTTGCGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564835 33 + 636262 CTGGTGGCTACAAAATACCATGA-CTTTTGCGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 40128 34 - 647215 TTGGTGACTACACAACACCATGATCTTTTGAGAT a s mr.mrrefChr3 114756 10 + 181019 AACTTTTATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564869 10 + 636262 AACTTTTATT s simRat_chr6.simRat.chr6 40162 10 - 647215 AACTTTTGTT a s mr.mrrefChr3 114766 25 + 181019 TTGTATTGCCCTCTTGCTCCATCAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564882 25 + 636262 TTGTATTGCCCTCTTGCTCCGATAC s simRat_chr6.simRat.chr6 40172 25 - 647215 TTGTGTTGCCCTCTTGCTCCATCAC a s mr.mrrefChr3 114791 51 + 181019 CATCTCATACGGTTCTCAGCTCTGGCGGACATCATAGATGGTAAATTGTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564907 51 + 636262 CATCTCCTACGGTTCTCAGCTCTGGCGGACATCATAGATGGTAAATTGTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 40202 51 - 647215 CATCTCATCCGGTTCTCATCTCTGGTTGACACCATAAATGATAAATTGTCA a s mr.mrrefChr3 114842 133 + 181019 TATATATCTACAATACAGCTTATAAGATAAAGCAAGATGCTTTCCACGCACTCAAAAGATAAGTCTGTTAATGAACCCATAACCTGTTTTTATGATGCTCTCATCTACTCAAAGTAATCCCCGCATGCTCCTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564958 133 + 636262 TATATATCTACAATACAGCTTACAAGACAAAGCAAGATGCTTTCCACGCACACAAGAGATAAGTCTGTTAATGAACCCATAACCTGTTTTTATGATGCTCTCATCTACTCATAGTAATCCCCACATGCTACTC s simRat_chr6.simRat.chr6 40254 133 - 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GATGAAGGTTGTGGG a s mr.mrrefChr3 115364 60 + 181019 ACTGGGTATTATCTGAGAAATCTGAGTTAATTAGCCACCCAAAACAAAACCACTTATAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565480 60 + 636262 ACTGGGTATTATCTGAGAAATCTGAGTTAATCAGCCACCCAAAACAAAACCACTTATAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 40798 60 - 647215 AACAGGTAATAGCGAAGAGATCTGAGCTAATTAGCCAACCAAAACAAAACCACTTGTAAT a s mr.mrrefChr3 115424 516 + 181019 GGTTGCTCTAAAGGTTCAACCAACTGAAGATCTTGGGATTAGACCTTAATGCCTGATCCTAGATCATAATCACCTTGGTGTCTCAGTTCAATGCCTGTCAGGTGGGGTGTCAAGGGGTATCCACATACAGTATGTAAGGTAAAGGGACTCTTGGTGGGAGAGGCTTTTCTTTGTCATACTTATGGTTCATTCAGCTGAAAAATTACTTTTCATGTCCTACATTCATCAGATGTCATCCATTAGCTAATGTGGCCATGATGGCCAAGCTCAAACTCTGTtgTTTtacaaatttaaccagatgaaataagcccctgttgtgaatggttaggaaaaaatgctcaaaaagtctcttggggaatcatccatagcacataaccactgaatctgctcttgttcaaatctgttgcaggaagtaagagaagtacaaacaaccaacctctttgtggcaagatatgtaactcagttaaagtagagcctttacattgtttaaccatatctattgttctccccacatca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565571 499 + 636262 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agatcgactcaacaaagaagctatggtgtcacaggggttgaattctaactggaccctcaatgccccaac-aaaagtcactcatcgacaagcagacatagagattacagggtctactgacgcaagctccactgacacacagtaaaacagaggagttggaaccatttctgcacaaaccacaatccattcaggttggctccattctatatgcactgaaacc--tgtaaagcaagtgagaggagaatacggattgcaaggcatgtttttgccaatgtcaaa s simRat_chr6.simRat.chr6 41367 263 - 647215 ------actcaacaaagaagctatgctgtcacaagggttgaatcctaaatagaccctcaatgccccaactaaaa-----ttatcaacaagcagacaaagagattacagggtctactgacataagctccactgacacgcactaaaacagaagagttggaatcatttctgcacaaaccacaatc--ttgaagatgaCTCAATCCTATATGCACTGAAACCCATATAAAGCAAATGAGAGAGGAATACAGAAT-CAAGGCATGTTTTTTCTCATGTCAGA a s mr.mrrefChr3 116217 276 + 181019 tgctggagatctgtgatcagtgtactagacatcatgcactggacatttgcaatcagaacactagtcaactgaataattgattagaaagcccatctactatgaaccagtatataagatgtgtggaactataagttatgtaacctattaactgaaccatcatgaatcacatgatattattgtgaggacacattgaatacaccaggccagtttacatattaagaatcctgaactgagggaaattaccaatgttgtttgggtgattaaagaataagcaag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566356 275 + 636262 tgctggaggtctgtgatcagtgtactagacatcatgtgctggacatttgcaatcagaacactagtcaactgaataattcattagaaagcccatctactatgaaccagtatataagatgtgtggaactatatgttatgtaa-ttattaacgtaaccatcatgaatcacacaatattactgtgaggacacattgaatacaccaggccagtttacatgttaagaatcctgaactgagggatattaccgatattgtttgggtgattaaagaataagcaag s simRat_chr6.simRat.chr6 41686 276 - 647215 TACTGGACATCTGTGACCAGGGTGCCTGACACTAAGCACTGGACATTTGCGATCGGAGTGCTAACCAATTGAATAATTGATTAGAAAACCCATCCACTATGAATTAGTATATaagatgtgtggaactgtaagttatgtaacctattaactgaaccatcatgaatcacatgatattattgtgaggacacattggatacaccaggccagtttacatattaagattcctgagatgagggaaattaccaacgttgtgtgggtgtttaaagaatgataaag a s mr.mrrefChr3 116493 82 + 181019 acatccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcctaagatgggcacaagaatgaaggaaacaaaatat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566631 82 + 636262 acatccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcccaagatgggcacaagaatgaaggaaacaaaatat s simRat_chr6.simRat.chr6 41971 81 - 647215 acaaccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcctgagatgggaacaagaaTGAAGGAAACAAAATC- a s mr.mrrefChr3 116575 103 + 181019 ttccacgttctcagatgatatgatgctctaccttggaaaccctAGCATGGCAAGTTGGGCACAGCTAGCCTAGATGTAATTGAGAGGTACGAGAACAAGAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566714 103 + 636262 ttccacgttctcagatgatatgatgctctacctaggaaaccctGGCATGGAAAGTTGAGCACAGCTAGCCTGGATGTAATTGAGAGGTACGAGAACAATAGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 42052 78 - 647215 -------------------------CTCTACCTTGGAAACTCTAGCATGGCAAGCAGGGCACTGCTAGCCTAGATATAATTAAGAGGTATGAGAACTAGAGGT a s mr.mrrefChr3 116678 165 + 181019 GGTAatactaaagaaacacccactggtaatactaaagaaacacccacctacagtttaggtaggaagatcatagttgggaaaggctaaagagacagccactccactcaattttatttttctcagtaggcacctccagcctcatcttaggcagggagacccttagcg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566818 165 + 636262 GGTAatactaaagaaacacccactggtaatactaaagaaacacccacctacagtttaggtaggaagatcatagttgggaaaggctaaagagacagctactccacccaattttatttttctcagtaggcacctccagcctcatcttaggcagggagacccttaggg s simRat_chr6.simRat.chr6 42130 163 - 647215 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atgaagcaaaagtgggccctcaactcaaattaagggaTGAATTCAC--------ACAAAAAGGAAACGAAAGTTAGAATGGTTTATGTCTGGCAGCAAAAtaggagcgagagtgaaacacccatccaattgaacagagtagctcttgcagaccttaagaagatatcaagggCT-----TCAGACCCTATATCTGAGGGGGAGTATTTAAGTAAAGAATTGACAGTGAGGCACACACTCCCACAGAGTGGTTCACATACGAAGAAATAAT a s mr.mrrefChr3 117112 20 + 181019 GGAGAAGCACCTTACTTTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567233 20 + 636262 GGAGAAGCACCTTACTTTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 42550 20 - 647215 GGAGAAACATGTTGCTTTAG a s mr.mrrefChr3 117132 127 + 181019 TTATCATGCTATGGCTGATTGGCCTCATTAGTCTAGTGTAATCTCCTTAATCAATTATAGTGGaCAATAGCGAGGAAATAGGTATGAAGCACTCATTCAGCTaaggggaGAGGGTTGTGTTTCAAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567263 127 + 636262 TTATCATGCTATGGCTGATTGGCCTCATTAGCCTTGTGTAATCTCCTCAATCAATTATAGTGGACAATAGCGAGGAAATAGGTACAAAGCACTCATTCGGCTAAGGGGAGAGGGTTGTGTTTCAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 42570 119 - 647215 TTATCACGCCATGGCTGCTTGGTCTTGTTAGTGTAGTGTAATTTCCTTAATCAATTATAGTGG-CAATAGCGACAAAATAGGTATGAAGTACTCATTCAGCA-------GTCAATCATGGTTCACAA a s mr.mrrefChr3 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simRat_chr6.simRat.chr6 42892 13 - 647215 TCAGTTATCACTC--------- a s mr.mrrefChr3 117484 356 + 181019 TGTTAGTCAAACATCAGGATCCACCCCATATGACCACTCTATTTGCCCTGCCCTATGAAATGTTGTGAGATATGGTGTATGGAATGTGAGTTCTAGGGAAGGGCGATCAAGGGCCCATAGGAATCAAGCATGTGGAATCCTGAGAGTAATCATATTTCAAGGGATAGCTGTCAAGGTATTTATTTTCTGACTAACCCCTCATCATGCCAACCTATTGTTCTTGCTTGTCTGATGTCTGTATTCTTGATTGTAAATCCATCTCTCCTGGCTTATCCAGTGTTTACACCAATAAAATGTGGGACTGAAAGGAATGTTAGGATTCAGTAGAACCAAGGGTTAAGGCAGCTGCATGTTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567631 355 + 636262 TGTTAGTCGAACATAAGGATCCACCCCATATGACCACTCTATATGCCCTGCCCAATGAAATGTTGTGAGATATGGAGTGTGGAATATGAGTTCTAGGGAAGGGCGAACAAGGGCCCATAGGGATCAAGCATGTAGAAGCCTGAGAGTAATAACATTTCAAGGGATAGCTGTCAAGG-ATTTATTTTTTGACTAACCCCTCATCATGCCAACCTATTGTCCTTGCTTGTCTGATGTCTGTATTCTTGATTGTAAATCTGTCTCTCCTGGCTTATCCAGTGTTTACACCAATAAAATGTGAGACTGAAAGGAATGTTAGAATTCAGTAGAACCAAGGGTTAAGGCAGCTGCATGTTAT s simRat_chr6.simRat.chr6 42905 354 - 647215 --TTAGTCAAGCATCAGTATCCACCCCATATGACCACTCTATTTTCCTTTCCCTATGAAATGTTGTGAGATACAGTGGATGGAATGTAGGTTCTAGGGAATGGCCATCAAGAGCCCATAGGAATCAAGCATGTGGAATCCTGGGAGTAACCATATTTCAAGGGATGGCTCTCAAAGTATTTGTTTCCTCACTAACCCCTCATCGCGCCAACCCACTGTTCTTGCTTGTCTGATGTCTTTATTCCTGATTGTAAATCCAACTCTCTTGGCTTATCCGGTGTTTACACCAATAAAGCGTGGGACTGAAAGGTATTATATGCCTCAGTAGAACCTAGGGTTAAGACAGCTGCCTGTTAT a s mr.mrrefChr3 117840 550 + 181019 TTTTGTGCATGGTGGGATGCATTGGATCTGCCCTTACCTACCAGACCAACACCTATTGATAGGAACTGTAAACATCTCACAGACCACTTGTAATATCTAATGATCAGACTAAAGAATATAATACTCTGTAGCATCTTGTCTGGGTACTGTGCACCAGTGCTGCTCTTGTTACCCTCCCATTAAGTAATGTGTCCACATTCCAAATTGGATGTAGTTTTGTATGGGTGATCTGAATTATTTAGTTTACAGTTGGAAAATAGTGCTGATGGGGGCCTACCATTTTGCACCTGGAATGTTTCCAACAGTGTTCAGTCCAGTGTGATAAGTGTCATCCTAATTTCTAAGCTCCCAGTGTTATTACAGTTAGAGTTCTCCAATGGAATAGGTGGATGCCAATTAATAAATGTATAATCACATTGAGGTCAGTAGAATAACTGGAAAAACAGCAGTAAGGTTGGTTACAGATATCTTGTGATGCACCTCCTGTACAAGAGCACCAACAGCACACCTAAACTTGCAGAATTCTGTGGACAACCATCCCGTTTTTCGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567986 549 + 636262 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181019 TAACATAAAACTTAAATTGAAGGGAGCTATAATTCTGACAAGGTGTTATTACCAAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572135 57 + 636262 TAACATAAAACCTAAATTGGAGAGAGCTATAGTTCTAACAAGGTGTTGTTACCTAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 47632 57 - 647215 TAACATAAGACTTAAATTGAAGGGAGCTTTAATTCTGACAAGATGCCATTGCCAAAA a s mr.mrrefChr3 122128 101 + 181019 TTCATGAGATTAGAATTCTAGATAATTGCATCATGAATTATTGGACAGAGATGAAATCCACATGTCATATGGATTAACTCATAGGTTGCCGGGTATCCCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572192 101 + 636262 TTCATGAGATTAGAATTCTAGATAATTGCATCATGAATTATTGGACAGAGATGAAATCCACATGTCATATGGATTAACTCATAGGTTGCCGGGTATCCCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 47690 101 - 647215 TTCATGGGATTAGAATTCTAGATAGTTGCATCATGAATTAATGGACGTTGATGAGATCCTCATGGCATATGGACTAACTCATAGATTGCCAGCTATACCTT a s mr.mrrefChr3 122229 19 + 181019 AGAAATTGTAGTGCTGACG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572304 19 + 636262 AGAAATTGTAGTGCTGACG s simRat_chr6.simRat.chr6 47791 19 - 647215 AGGAATTGTAGGGCTGACT a s mr.mrrefChr3 122248 45 + 181019 TCAAGTTCCTGTTTCCAATGTGACTATTGGTTTGGGGGAGAAGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572329 45 + 636262 TCAAGTTCCTGTTTCCAATGTGACTATTGGTTTGGGGGAGAAGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 47810 45 - 647215 TGAAGTTCCTGTTTCCAATCGGACTATTGGTCTAGGGGAAATGGA a s mr.mrrefChr3 122293 59 + 181019 ATAAACATTGCACCTGGCACCATAGGAGTTGGCTGTCAGTCGGGGGGACACTAGATCGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572374 59 + 636262 ATAAACATTGCACCTGGCACCATAGGAGTTGGCTGTCAGTCGGGGGGACACTAGATCGC s simRat_chr6.simRat.chr6 47856 59 - 647215 ATAAATATTGCACCAGGCACAATAGGTGTTGGCTGTCAGTCCGGGGGATACTAGATTGC a s mr.mrrefChr3 122352 40 + 181019 ACCCTCACTTATCAAACTCTTCTGTTGGTCAAACTGAAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572433 40 + 636262 ACCCTCACTTATCAAACTCTTCTGTTGGTCAAACTGAAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 47951 40 - 647215 ACCCTCGCTTATTAAACCCCTCTATTGATAAAACTGAAGG a s mr.mrrefChr3 122392 118 + 181019 TTAACATGGATTCCACTGAATAAGGGGGTACATCACACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGCATGAGCCAGCTGGGTTTAAGAGGGCCGTATCTATGGGGTCCTATCAAGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572473 118 + 636262 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AACACCAAAACATTAAATATTGAGTGTAACCAAAGTGACCAGGCCAATAGTTGAACGGCTTACAGGATCTCTAGTTTATCGTGTTTAAACAAATCTCTAGACCCGTTGAATCTCTAAGCAACCAAAAGTAAAGAAACTGTGTGCAGAGATGTTTTGGAGGTTATATTAGTTATTTTACCTACTTACTTCTGTACAAGTATTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGCGCTGGGAAGGTGCATTCTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572703 239 + 636262 AACATCAAAATATTAAATATTGAGTGTAACCACAGTGACCAGGCCAATAGTTGAACGGCTTACAGGA--TCTAGTTTACCGTGTCTAAACAAATCTTTAGACC--------CTCTAAGCAACCAAAAGTAAAGAAACTGTGTGCATGGATGTTTTGGAGGTTATATTAGTTATTTTACCTACTTACTTTTGTACAAGTATTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGCGCTGGGAAGGTGCATTCTG s simRat_chr6.simRat.chr6 48260 246 - 647215 AGACCCAAAACATTAGATATTGAGTGAGACCAAAGTGACCAGGCCAATAGTTGAAAGGCTTACAGGATCTCTAGTTGATTGTGTTTAAACAACTCACTAGACCCGTTGAATCTCTAAGCAACCAAAATTAAAGAAACAGTGCACAGAGAGGTATTGGAGGTTATATTAGTTATTTTGCTTACTTACTTCTACACAAGTACTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGAAC---AAAGGTGCATTCAG a s mr.mrrefChr3 122861 161 + 181019 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mr.mrrefChr3 129308 119 + 181019 TTCTTAGCCAGCCATTGGTAACGATTTAGCAATACACTTCAAGGATTATAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACAGATGCATGGTAACATTTCAGCTTTACAGTGGTTGGAGTGACAGTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579487 119 + 636262 TTCTTAGTCAGCCATTGGTAACGATTTAGCAATACACTTCAAGGATTATAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACAGATGCATGGTAACATTTCAGCTTTACAATGGTTGGAGTGACGGTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 55006 119 - 647215 TTCCTATCCAGCCATTGGTAACGATCTATCAATAAACTTCAAAGATTTCAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACCGACGCATGGTAACAGTTCAGCTTTACAGTGGTTGAAGTGACAGTTC a s mr.mrrefChr3 129427 76 + 181019 CCATCTTCTGCATGTTGACTACTCCCATACTAGAGAGTCCAGGGGAGATGATGACAGAGTGGCTAGAATTGTGGGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579609 76 + 636262 CCATCTTCTCCATGTTGACTACTCCTATACCAGGGAGTCCAGGGGAGTTGATGCCAGAGTGGCTAGAATTGTGGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 55125 76 - 647215 CCATATTCTGCATGTTGACTACTCCCATATTAGAGAGTCCAGGCAAGATGGTGACAGGGAGGATAGCATTGTAGGG a s mr.mrrefChr3 129503 128 + 181019 CACTATGGGTTGTTTTCGAGCCATAGTACTTTGTCTTTATAAGTTTTTTGGTGTAAACAAGAGAGTGTCAGATTGTGGGTACAGCGTAAAAGATAGTGCCCTGCTGGTTTATACTTGATGATAGAGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579686 128 + 636262 CACTATGGGTTGTTTTCAAGCCATAGTATTTTGTTTTTATAAGTTTTTTGGTGTAAACAAAAGAGTGTCAGACTGTGGGTACAGCGGAAAACATGGTGCCCTGCTGGTTTATACTTGATGATAGAGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 55201 124 - 647215 CACTATGGGTCGTTTTTGAGCAATAGCACTTTGTCTTAATAACTTTTTTGGTGTAAACCAGAGAGTGTCCAATTGTGGGTACAGGGTAAAAGATAGTGCC----TGGTTTATACTTGATGCCCACCCA a s mr.mrrefChr3 129631 107 + 181019 CCCTTTTATATCTAATCCTGTATTACTTCAGCCTGTTGAAAACCTAGCCCATTTATTAAGTTATGGTTCTGTCCATTGTATTATGGGGAACTACTTTTCTAATGCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579814 107 + 636262 CCCTTTTATATCTAATCCTGTATTACTTCAGCCTGATAAAAACCTAGCCTGTTTGTTAAGTTATGGTTCTGTCCATTGCATTGTGGGGAACTATTTTTCTAATGCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 55326 107 - 647215 CCCATTTATATCCAATCTAGTATTACCTCATCCTATTGAAAACCTAGCCCATTTATTCAGTTATGGTCCTGTCCATTGTGTGATGGGGAAATACTTTTCTAGTGCAA a s mr.mrrefChr3 129738 27 + 181019 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TATCTTGAGATTGCCCTTTTACACTTGGATAAACTTAGTAATTAGCAGTTACATGCCTAATATCCAGGCTGATCTAAGTTCTCTATAGAATCATCACTTGGTTGGGTGAATAACTATGACCTAGGTAGAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTGTTCTAGTCTGGAGATCAGCTACCATGTTACCTCACTCATACCAACCCAAGAGTTGAGGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGCGGACCAAGGTATAGGTAGCA a s mr.mrrefChr3 130050 98 + 181019 AATTTTAGAAATTCATTATGCCCTTTCGGCTTTTTATATCTGCTACTATTTCCCGAGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580228 98 + 636262 AATTTTAGAAATTCATTATGCCCTTTCGGCATTTTACATCTGCTACTATTTCCCGAGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 55804 95 - 647215 AATTATAGAAATTCATCATGTGCTTTCAGCTTTGTATACCTGCTA---TTTCCCGGGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT a s mr.mrrefChr3 130148 433 + 181019 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simRat_chr6.simRat.chr6 56928 28 - 647215 AACCACCTGGGCCAATTTTGTCCTAAGG a s mr.mrrefChr3 131205 51 + 181019 AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCATAGGAACTATTGTATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581383 51 + 636262 AAACAAACTACCCAACTGCTCTTATACCATGATCATAGGAACTATCATATG s simRat_chr6.simRat.chr6 56956 51 - 647215 AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCACTGGAACTATTGTGTG a s mr.mrrefChr3 131256 34 + 181019 TCGTATCTCTGCAGATCTAACTGTTCAGAACCTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581439 32 + 636262 TCGCATCTCTGCAGATCTAACTGTT--GAACTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 57007 34 - 647215 TCGTAGTTCTACAGATTTAACTGTTCAGTACCTG a s mr.mrrefChr3 131290 130 + 181019 CATTACATTCCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCTCCAGGCTTGAATGATCGGGTGGTAGCGAAGGATTGTTTGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581471 120 + 636262 CATTACATTCCCTTGCACTCTGTA----------ATCAACCACAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCTGAATAATCCTATATCGTATAGCTCCAGGCTTGAATCATTGGGTGGCAGCGAAGGATTGTTTGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 57044 130 - 647215 TATTACGTTTCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATTGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCGCCAGCCTTAAATGATCTGGTGGTGACTAAGGATTGTTTGAG a s mr.mrrefChr3 131420 157 + 181019 CTGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGGCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCTAGTGCCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGCGTAAGCTGGAAACATTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581637 157 + 636262 CCGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGCCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCCAGTGCCACTGAGGGGGTATCTTAACAGTATGCGTAAGCTGAAAACATTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 57174 155 - 647215 CTGAATTT-ACCACAACACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAATTGCCAATGCATGGCAGCCCC-TGCTAACGGTAGGGGGGAATGAATGCACAGGTACCTATTGTCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGTGGAAGCTGGAAACATTGG a s mr.mrrefChr3 131577 51 + 181019 AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTATTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581794 51 + 636262 AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTGTTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 57330 51 - 647215 AATCCCAATTCTAACACCACTGGATTAATTGGGTAAGTTTTAATGGGGAAG a s mr.mrrefChr3 131628 58 + 181019 ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCACTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581845 58 + 636262 ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCATTT s simRat_chr6.simRat.chr6 57382 57 - 647215 GGCTTCAAGACGTAATTCTGACTTCAT-GAGAAGAGATTATAGTCAACCTTCCCACTT a s mr.mrrefChr3 131686 104 + 181019 ACATAGAACTATTTCACACCCTCATGTACTTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACCCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581903 104 + 636262 ACATGGAATTATTTTACACCCTCATGTACCTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACGCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 57443 104 - 647215 ACATAGAACTATTTCACAAAATAATATACTTTGGATTCATGGAGGTATACATGACCCTCTTTAATACTGAGGGCACAAAAGCTTGTGAAAATTAGTACCACCCC a s mr.mrrefChr3 131790 231 + 181019 CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCAAGGCCGTGTATGCGCTCAGTAATACCTAACAGCTACCCTTATCCCAAATAAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582007 230 + 636262 CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTGACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCTAGGCCGTGTATGCGCTCCGCA-TACCTAACAGCTATCCTTATCCCCAATAAGGCAACCAGTCCCCATTGAGAGCACACCGGATACTCTGGAAAGCTCTCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 57548 228 - 647215 CTGAGAAGAGAGGTCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTACAGCCAGGGCACAACCAGGGTAGTGGAGGGAAATGCAAGGCCATGTATG---TCAGTAATGCCTAAAAGTTACCCTTAGCCGAAATGAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAAGCCCCCAAGAGACATCATGCAGGAAGATCAGCCCTTCTAAGGCCATATGAAAAT a s mr.mrrefChr3 132021 679 + 181019 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mr.mrrefChr3 135611 2 + 181019 AT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586002 2 + 636262 AT s simRat_chr6.simRat.chr6 61374 2 - 647215 AT a s mr.mrrefChr3 135613 12 + 181019 AGAGATTTGCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586005 12 + 636262 AGAGATTTGCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 61376 12 - 647215 AGAGATTTACTA a s mr.mrrefChr3 135625 28 + 181019 AGACAGGTTAAATTGCAGGACTAGTATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586017 28 + 636262 AGACAGGTTAAATTGCAGGACTAGTATG s simRat_chr6.simRat.chr6 61397 28 - 647215 AGACACGCTAAATCGCAGGACTAGTATG a s mr.mrrefChr3 135653 12 + 181019 GTCggaacacag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586045 12 + 636262 GTCggaacacag s simRat_chr6.simRat.chr6 61449 12 - 647215 GTAGGAACACAG a s mr.mrrefChr3 135665 6 + 181019 aacaca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586059 6 + 636262 aacaca s simRat_chr6.simRat.chr6 61461 6 - 647215 GACTCA a s mr.mrrefChr3 135671 22 + 181019 acccatcaaatacccacaaact s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586065 22 + 636262 acccatcaaatacccacaaact s simRat_chr6.simRat.chr6 61473 22 - 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actattattgtgaaaccagtggtcttgttcaccacacctaaaaagaccattgttgaat a s mr.mrrefChr3 135858 19 + 181019 tggcctggagtgagaaaag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586258 19 + 636262 tggcctggagtgagaaaag s simRat_chr6.simRat.chr6 61689 19 - 647215 ctgcctggaatgagaaaag a s mr.mrrefChr3 135877 171 + 181019 gaacccatggcagaatcctttcttagtgaaagaaatcaagggagtgcagtcatatccttgaactttaagtgttactatcaggtaactattgtgaaagcaacactatacttgcatcaaaagatcagtacaatacaccatggaattagaagtgatggagctaccacatttaag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586277 171 + 636262 gaacccatggcagaatcctttcttagtgaaagaaatcaagggagtgcagtcatatccttgaactttaagtgttactatcaggtaactattgtgaaagcaacactatacttgcatcaaaagatcagtacaatacaccatggaattagaagtgatggagctaccacatttaag s simRat_chr6.simRat.chr6 61709 171 - 647215 gaacccaaggcagaaccttttcttattgaaaaaaatcaggggagtgcgatcatatcctcgaactttaagtgttactcttgagtaacagtttggaaagcaacactatattagcatcaaaagatcattacaatacaccatgggattagtagtgatggagctaccacacttagg a s mr.mrrefChr3 136048 52 + 181019 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586448 52 + 636262 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat s simRat_chr6.simRat.chr6 61906 52 - 647215 aaacgcttcatattatgatgagaaattttaacaaggactcattattcaatct a s mr.mrrefChr3 136100 73 + 181019 gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586509 73 + 636262 gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt s simRat_chr6.simRat.chr6 61958 73 - 647215 gaatcagtttattaccttccaaaaattaaaacttgacatttccccattaccttataccatgattaatacaagc a s mr.mrrefChr3 136173 37 + 181019 tgtaactaatctaaagaattgaggttcggagctacca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586583 37 + 636262 tgtaactaatctaaagaattgaggttcggagctacca s simRat_chr6.simRat.chr6 62031 37 - 647215 tgttactggtctaatgaattgaggttctcatccccca a s mr.mrrefChr3 136210 44 + 181019 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586628 44 + 636262 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta s simRat_chr6.simRat.chr6 62068 44 - 647215 aaaagtgttaagggctgagtagattttctgagaaggacctttta a s mr.mrrefChr3 136254 24 + 181019 caatatgtacttagggaattggtt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586674 24 + 636262 caatatgtacttagggaattggtt s simRat_chr6.simRat.chr6 62112 24 - 647215 agatattggaacgggggaatggtt a s mr.mrrefChr3 136278 59 + 181019 atacaaaaaaaccacaaggatagagtggccataacatggacatatgtcttgcagaactc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586869 59 + 636262 atacaaaaaaaccacaaggatagagtggccataacatggacatatgtcttgcagaactc s simRat_chr6.simRat.chr6 62136 59 - 647215 atacaataccaccacaaggatagtgtgggcataacatgcaaatatgtcttgcaaagccc a s mr.mrrefChr3 136337 63 + 181019 aagataaatgatcaacaaacatgagtgggatgtaaacaagggaaagagcacacttacagtaaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586928 63 + 636262 aagataaatgatcaacaaacatgagtgggatgtaaacaagggaaagagcacacttacagtaaa s simRat_chr6.simRat.chr6 62215 63 - 647215 gagataaatgatcaagaaatatgaatggggtgtaaacaaggtaaagagcatacttagagtaga a s mr.mrrefChr3 136400 25 + 181019 ccaggagtttagcaaataggataga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586992 25 + 636262 ccaggagtttagcaaataggataga s simRat_chr6.simRat.chr6 62278 25 - 647215 ccatgaggttagtaaataggataga a s mr.mrrefChr3 136425 141 + 181019 acctttgtcacctatttgtccaaaaggggtccagtctctcaggtctcatagcaaactcacccaaatacacaaggagaagcccagtgacataatcaatagacagattggaaccataaacaggctctcactggtaaggggaga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587017 141 + 636262 acctttgtcacctatttgtccaaaaggggtccagtctctcaggtctcatagcaaactcacccaaatacacaaggagaagcccagtgacataatcaatagacagattggaaccataaacaggctctcactggtaaggggaga s simRat_chr6.simRat.chr6 62310 141 - 647215 accttcgacacctacttgtccaaaaggggcccagtatctaaggtgccacagcaaactcacacagatacgcaaagagaaacccggtaacacgaccaatagatggactgaaaccataaatgggctctcataggcaaggggaga a s mr.mrrefChr3 136566 28 + 181019 cccggtgcaaggaagcaccataggaagt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587158 28 + 636262 cccggtgcaaggaagcaccataggaagt s simRat_chr6.simRat.chr6 62452 28 - 647215 cccgttgcaaggaaccaccataggcagt a s mr.mrrefChr3 136594 21 + 181019 gtgctgaggtttttcaggacC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587186 21 + 636262 gtgctGAGGTTTTTCAGGACC s simRat_chr6.simRat.chr6 62481 21 - 647215 gcactgaggtttttctgatcC a s mr.mrrefChr3 136615 11 + 181019 CCTCCGTAAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587207 11 + 636262 CCTCCGTAAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 62504 11 - 647215 TCACAGTAAGC a s mr.mrrefChr3 136626 6 + 181019 GCCATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587520 6 + 636262 GCCATA s simRat_chr6.simRat.chr6 62515 6 - 647215 GCCATA a s mr.mrrefChr3 136632 168 + 181019 GCAGTTATCTATCTCTCAGTCGGCCTGTCAAAGAGGCCTCTGTGGCCACTGCAGTGCTACTCCAATGAGTAACTACAGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGCACAACTTAAACAGGACACTGCATAGCTTGTGATATTAAATGCTTAGCAGAAGGGCACAATCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587526 168 + 636262 GCAGTTATCTATCTCTCAGTCGGCCTGTCAAAGAGGCCTCTGTGGCCACTGCAGTGCTACTCCAATGAGTAACTACAGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGCACAACTTAAACAGGACACTGCATAGCTTGTGATATTAAATGCTTAGCAGAAGGGCACAATCA s simRat_chr6.simRat.chr6 62522 168 - 647215 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ggagccaggaaacaagactttttctccttgtcacaACCTGGAGGAATCCTAGTTTTATCCCTAATGCTGCACTTGTTTTCACAAATTGGCCTTCTTTTTCTTTCCCAAAGTTGGAAACAAAGCACCCATGCTCTCCTTGATAACGATCAATAGTATACAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587766 160 + 636262 GGAGCCAGGAAACAAGACTTTTTCTCCTTGTCACAACCTGGAGGAATCCTAGCTTTATCCCTAATGTTGCACTTGCTTTCACAACTTGGCCTTCTTATTCTTTCCCAAAGTTGGAGACAAAGCACCCATGCTCTCCTTGATAACGATCAATAGTATACAC s simRat_chr6.simRat.chr6 62765 118 - 647215 gaaaccaggaaacaaagctttctctactagtcacaACCGGGAGGAATCCTAGTTTCATCCCTAATGCTGCACTTGTTTACATAAATTCGCCTTCTTTTTCCTTCCCAAAGTTGGAAAC------------------------------------------ a s mr.mrrefChr3 137022 680 + 181019 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 589444 32 + 636262 CCAGCCCTGGGGAGATTACTAAGTATAGGGGG s simRat_chr6.simRat.chr6 64053 32 - 647215 CCAGCCCAGGGGAGATTACCAAGTATTAGGGG a s mr.mrrefChr3 138270 168 + 181019 GTTATGTACAATGATGTATTCAACAGCATGCCTGAACCTATAAAATAAAGTATCCTCCTATAAAATAAGGTATCCTGGATCTTGTAATGTTACCCTATTTTTATAATACATGATGGTATTCCTCTTATTGATCACACTGTGACCCCTTGTGTTAACATAATGAACCTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589476 166 + 636262 GTTATGTACAATGGTGTATTCAACAGCATGCCTGAACCTATAAAATAAAGTATCCTCCTATAAAATAAGGTATCTTGGATCTTGTAATGGTACCCTATTTTTATAATACATGATCGTATTCCTCTTATTAATCACACTGTGACCCCTTG--TTAACATAATGAGCCTA s simRat_chr6.simRat.chr6 64087 163 - 647215 GTTATGTACAATGATGTTTTCAACAGAATGCCTTAACCTATAAAATAAAGTATCCTCCTATACAATAAGGTATCCTGGATCTGGTA-TGTTACCCTATTTTGAAAGGACATGATGGTATCCCTCCTATTGATCACACTGTGACCT----TGTTAACATAATGAATCTA a s mr.mrrefChr3 138438 57 + 181019 AAGGTCTTGGGTAGTCCTCCCTAGGACATATAAGGGGAGATAACACTTTAGAACACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589642 56 + 636262 TAGGTCTTGGGTAGTCCCCCCTAGGACATCTAAGGGG-GATAACAGTTTAGCACACT s simRat_chr6.simRat.chr6 64251 57 - 647215 AAGGTCTTGGGTAGTCCTCCCTAGGACATACAAGGAGAGATAGCACTTTAGACCACT a s mr.mrrefChr3 138495 138 + 181019 TTCCCAACTAATAGATGGAGTCTTTATCTGTTATTATAGTTCCACACTAAGCACTCAATTTATAGTGGTAATATGTTATGTGGAGACCACATCACGTCTAAATTGTCTGCGAAACCTCAACCCCTAACCTCACTACAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589700 129 + 636262 TTCCTGACTAATAGATGGAGTCTTTACCTATTATTATAGTTCCACACTAAGCACTCTATTTATAGTGGTAATATGTTATGTGGGGACCACATCCTG--------ATCGGCGAAACCTCAACCTCTAACCTCACTACA- s simRat_chr6.simRat.chr6 64308 138 - 647215 CTCTCAACTAATAAGTGGAGTCTTTATCTGTTCTTATATCTTCATACTAAGCACTCAATGTATACTGGTAGTATGTTATGTGGAGACCACATCACGTCTAAATTGTCTGCGAAACCTCAATCCCTAACCTCACTACAG a s mr.mrrefChr3 138633 89 + 181019 GAGTTCACAGGTTTTTTTCTGCTTTTCACTCATAAGCATCTCTAATGGCATTGTGATGAAAGGTGAATCTATTGTGACAACTGTTAGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589829 86 + 636262 GAGTTCACAGGTTTTTTTCTGCTTTTCACTCATAAGCATCTCAAATGGCATTGTGATGAAAGGTAAATCTATTGTGACAATTGTTA--- s simRat_chr6.simRat.chr6 64447 85 - 647215 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GCTCCAAGATATATGTGTGATTGGAGGACCAGATTAGTA a s mr.mrrefChr3 139733 76 + 181019 TGCTATAGCCCCTAGTACATTGCAGACCCAGTCATTGGGAGTTTGTAACCTGAGTTTATATATCTTAATGCATGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590924 76 + 636262 TGCTATAGCCCCTAGTACATTGCAGACCCAGTCATTGGGAGTTTGTAACCTGAGTTTATATATCTTAATGCATGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 65571 76 - 647215 TGCTGTAGCCCCTAGTACATTGCAAACCCAGTCATTGAGAGTTTGTGACTTGAATTGGTATATCTGAATGCCTGAC a s mr.mrrefChr3 139809 13 + 181019 TGATCTATATCCG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591002 13 + 636262 TGATCTATATCCG s simRat_chr6.simRat.chr6 65647 13 - 647215 TGATCTATATCCT a s mr.mrrefChr3 139822 62 + 181019 AATAATTCAAGAAGACTGCACACAGCACTAGTACACTTCTGTGCCTAACTCTAGTGCTTGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591023 62 + 636262 AATAATTCAAGAAGACTGCACACAGCACTAGTACACTTCTGTGCCTAACTCTAGTGCTTGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 65660 62 - 647215 AATCATTCAGGGAGACTGTGCTCAGCATTGGTGCACTTCTGTGCCCAACTCCAGTGCTTGAT a s mr.mrrefChr3 139884 6 + 181019 TTAGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591086 6 + 636262 TTAGCC s simRat_chr6.simRat.chr6 65722 6 - 647215 TTCGCC a s mr.mrrefChr3 139890 62 + 181019 TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTTGACAACTTTATGAAAGAGGGATAGCACAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591145 62 + 636262 TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTTGACAACTTTATGAAAGAGGGATAGCACAG s simRat_chr6.simRat.chr6 65728 62 - 647215 TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTAAGCCCCTTTATGAAAGAGGGATAGCATGG a s mr.mrrefChr3 139952 68 + 181019 CAGGCATAAACTCTGAAAGGAACATATTCAATAGTCTGCAACTGCATATCCTCAATGACATTTTTGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591226 68 + 636262 CAGGCATAAACTCTGAAAGGAACATATTCAATAGTCTGCAACTGCATATCCTCAATGACATTTTTGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 65790 68 - 647215 TGTGCATAAACTCTGAAAAGGACATATTCAATAGCCTGTAGCTGCGTATCCTCAATGACATTTTTGCC a s mr.mrrefChr3 140020 120 + 181019 CATAGATATGGATGTGTATGAGTCCTTGATTGATGTCTGTATGAGTACTGTCTACTCAGTAACAATAGACTGGGCAAGTCTTGCCCTATGAGTTACCATAAAAATCGTTCCATAAGTTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591294 120 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 593428 235 + 636262 ATATGGGAGCCTTTGGGTGCTCTGCTTAGTCTTGATTCAATAAGCTGGATCTCATCCCAGCAAAGTTGTAACACTTCTCTACAGAGCTCTAGACATTCTGAGATATGAGGAAGTTGACATGGCTTCATTGTCCAAAGCAGTTCCTGAATCCTTGAAGAAATACACAAAGTGCAGGGAATTGGCAGAAAGACTAAAGATAGAAGGTCAGGGTCAAAAGTGCCTTTTAAACCACACA s simRat_chr6.simRat.chr6 68449 232 - 647215 ATATCAGAGCCTTTGGATGCTCTGCCTACCCTTAGTTCACTAAGCTGGATCTTAGCCCAGTGAAGTTGTAACATACTTCTACAGAACTCTAGACATTCTGAGATATGAGGAAGTTGACATGGCCTCATTGTCCAAAGCAGTTCCTGAATCCTTGAAGAAATACACTAAGTGCAGGGAATTGGCAGAAAGACTGAAAATAGAAGGTCAGGGTCAAAAAT---TTTTAAACCACACA a s mr.mrrefChr3 142263 180 + 181019 CTCTATTTAGAAGTGTGACCTAATTACACCCTACTGATGTCTTAGCTATCAAATATGCCCCTTCTCAAACATGTCACTCAGACTACCTGTTTAATTGGATATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGACTAGGTTAATGTCTCCATTACTGGAGTACATGTTACATGAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593663 180 + 636262 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TACCTTGCAGATCATCTGAACAGGAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAACAATACATAGTCTACTGAACCATCCAGAACATGTTCTCAGTGAGATGAGTAGGAGGCAAAATCTAGAAGTCCCTACTGTCGCATCATAGATCGTTTTACAGCAACACATAGAAG a s mr.mrrefChr3 142608 114 + 181019 TGATGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTATGGCAAATAACGCCTCTTTAGCAGTAAGTTAACTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594004 114 + 636262 TGATGAACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTCTGGCAAATAACGCTTCTTTGGCAGTAAGTTAATTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 69038 110 - 647215 CAAAGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGGTCCTCACCTATGGCAAA----ACCTTGTTACCTTTTAATGAACTGATGGATTTCAACTAGGCCTATT a s mr.mrrefChr3 142722 86 + 181019 GCTTTTTAATGGACTGATGGGCTTCGCCTATGCCTATTTGATGGCATATCTAACATGTACATAGGGTTTTATGTTATCCACTTTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594118 86 + 636262 GCTTTTTAATGGACTGATGGGCTTCGCTTATGCCTGTTTAATGGCATATCTAATATGTACATCGGGTTTTATGTTATCCACTTTGG s simRat_chr6.simRat.chr6 69175 84 - 647215 GTTTGATTATCCACTTTTGGGCTTCACCTATGCCTATTTGATAGCATATCTCACATGTACATAGGGTTTGA--TTATCCACTTTAG a s mr.mrrefChr3 142808 128 + 181019 AATTTCTTTTTATTGATGAATTACTGTTTATGCCAAAACTATAAGACTGTTTTCCATATTTGGAGTGAGTCCTGGGTGAGTTTCCCCAGCTGTGTTGCTATTATTTCTGCCCCTGTATGGGATACCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594204 128 + 636262 AATTTCTTTTTATTGATGAATTCCTGTTTATGCCATAACTATAAGACTGTTTTCCATATTTGGAGTGAGTCCTGGGTGATTTTCCCCGGTTGTGTTGCTATTATTTCTGCCCCTGTATGGGACATCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 69272 124 - 647215 AACTTCTTTTTATTCATGAGTTACTGTTTATGCCAAAACTTTAAGACTATTTTCCATGTTTGGGGTGAGTGCTGGGCAAGTTTCCCCAGCTGTCTTGCTATTATTTTT----CTGTATGGAATACGCA a s mr.mrrefChr3 142936 40 + 181019 TGGTGGGCCATGTACCATGGCACTTAGAAAATCAGTTGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594332 40 + 636262 TGATGGGCCATGTACCATGGCACCTAGAAAATCTGTTGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 69398 40 - 647215 TGGTGAGCCATGTACCATGGCACTTCGAAAATCAGTTGTG a s mr.mrrefChr3 142976 135 + 181019 GGCTATTTACTTTGGTCAATGGTACTCCTGAATAGAAAAAAAGTCTTGAGACTCCCCAAGTGGTGAGTTGTCCCCATAAAATGGCAAACTGGACCCTTTGATTTGTTTTCTGTACGTAAAGGACTGCAGCTGGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594372 135 + 636262 GGCTATTTACTTTAGTCAATGGTACTCCTGAATAGAAAAAAAGTCTTGAGACTCCCCAAGTGGTGAGTTGTCCCCATAAAATGGCAAACTGGACCCTTTGATTTGTTTTCTGTACGTAAAGGACTGCAGCTGGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 69583 135 - 647215 GGCTATTTACTTTGGTCAATGCCACTCCTGAATAGAAGAAGACTATAGAGACTCCCAAATTGGTGAGTTGTCTCCATAAAATGTCAAACTGGACCCTTTAGTCTGTTTTTTGTACATAAAATATTGCAGCAGGAG a s mr.mrrefChr3 143111 24 + 181019 TCCATTGAGTTGGCTATTAGTCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594509 24 + 636262 TCCATTGAGTTGGCTATTAGTCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 69718 24 - 647215 TCCGTTGAGTCGGCTATTAGCCCA a s mr.mrrefChr3 143135 31 + 181019 ATGGGAGTGCACAAACTGTGGCACTAAGACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594533 31 + 636262 ATGGGAGTGCACAAACTGTGGCACTAAGACA s simRat_chr6.simRat.chr6 69748 31 - 647215 ATGAGAGTGCACAAACTGCAGGAGTAAGACG a s mr.mrrefChr3 143166 36 + 181019 CCAGGAGATACATGGAATCCCTGGCCCCTCTGTAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594576 36 + 636262 CCAGGAGATACATGGAATCCCTGGCCCCTCTGTAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 69779 36 - 647215 CCTGGAGCTACATGGAATCACTAGCCCCTTCGTAAC a s mr.mrrefChr3 143202 134 + 181019 TGGATGCTATACCACGTGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCCCAGATATAGTGAACTAGTCATTCGTAAAGCCAAACTGCAGGCCCTGTTTATGTGCTTCTTGTGCATCTAGGCTTACGAGAGAGGTTTGTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594621 132 + 636262 TGGATGCTATACCACGTGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCCCAGATATAGTGAACTAGTCATC--TAAAACCAAACTGCAGGCCCTGTTTATGTGCTTCTTGTGCATCTGGGGTTACAAGAGAGGTTTGTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 69815 122 - 647215 TGGGTGCCTTACCACATGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCACAGGTATAGTGAACTAGTCATTCGTAAAGCCAAAGTACAGGTCCTGTTTATGAGCTTCCTGTGCACCTAGGCTTACGAG------------ a s mr.mrrefChr3 143336 9 + 181019 GCTCACTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594757 9 + 636262 GCTCACTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 69937 3 - 647215 ------TCT a s mr.mrrefChr3 143345 224 + 181019 CTTAGTCTCAGCTTGGGGTGGCATGATACATCCTATACCATATGTCTCCACTTGCCAGATTGTGTAATGGGTACTAAGCCAAGCAAGTCAGACAAGTTATGAGTCAGCAACCAGTTGCCTAAGTTACTAGGTCTAATCTGGTAAAGTATAGTTCATTTGAGGTATTTCAAATGACTTTGAGCTATGCAGACTGTACCTGAATGCAATGCAACGTGGTGCATTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594767 223 + 636262 CTTAGTCTCAGCTTGAGGTGCCATGATACATCCTATACCATATGTCTCCACTCGCCAGATTGTGTAATGGGTACTTAGCCAAGCAAGTCAGACAAGTTATGAGTCAGCAACGAATTGCCTAAGCTACTAGGTCTAATTTGGTAAAGTATAGTACATTTGAGGGATTTCAAATGACTTTGAGCTATGAATAC-ATACCTGAATGCAATGCAACGAGGCGCACTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 69940 220 - 647215 CTTAATCTCA-CTTGGGGTGGCA--ATGCATTCTATACCACATGTCTCCACTTGTCAGAGTGTGTAATGGGTACTAAGCCAAGCACGTCAGACAGGTTATGAGTCAGCAACCAGTTCCATAAGTTACTAGGTCTAA-CTGGTAAAATATATTTAATTTTAGGTACTTCAAATGACTTTGAGCTATGCAGACTGTACCTGAATGCAATGCAACATGGTGCATTGC a s mr.mrrefChr3 143569 18 + 181019 AAAAGCTCAGGTTTAGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594990 18 + 636262 AAAAGCTCAGGTTAAGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 70162 18 - 647215 AAAAGCTCAGGTTTAGCC a s mr.mrrefChr3 143587 105 + 181019 AAGTTCCCCCACAGTAACAAGCCTCGAATGCATATAAAAGCCCCTCTATCTTTAAATGAATAGCCAAGGAGTACAACACACCATGAAACACACATATCAATCAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595009 102 + 636262 AAGTTCCCCCACAG---CAAGCCTCGAATGCATATGAAAGTCCCTCTATCTTTAAATGAATAGCCATGGAGTATGACGCACCATGAAACACACATATCAATCAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 70180 93 - 647215 AAGTTCGCCCAGAGTAACAAGAC-----------TAAAAGCCCCTCTTTC-TTAAATGAATAGCTGAGGAGTACAACACACTGTAAAACACACATATCTACCAGT a s mr.mrrefChr3 143692 22 + 181019 GTGACATTTCCTTAGGCAAAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595112 22 + 636262 GTGACATTTCCTTAGGCAAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 70273 22 - 647215 ATGACATTCCCTTAGGCAAAAA a s mr.mrrefChr3 143714 210 + 181019 GGGCTCAGAGGTAATGCTCAGGAATAGACAGTGTCACTGGGGTCAATTCAATTACTGCTAAGCTATAAGAACAATTGTGGATATGCTTGAAAACTAACAGATTCATTCAACCAATGCATGCATTCCATCTCTCAGATCACAAACAACAAATTGCTAGGAATCCTTACATAAGTAGCAGTTCCTAGGAGTTGGCACACCAGACCATGCCTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595135 210 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 70891 311 - 647215 --------------------------CCCAACATGACCATTGCAGCATGGCAACCTTGTAACCAACACAGTTTACCTTGATTTTTAGCTTCAATACACACTCTGCATGGTCTTATGATTCTAAAGCATCATAGTTACTGACCTCTTGATCCGAACTGAACCTGGTTTCTTGATCACTATTGTATAGTTAATAGTCTTATAGAATAGAGAGTTCAATGGTTGAGGTAATGAAATATTGCATAATGGTAACAAAGACATGAGACTATTTATATCCTATATTACATAA-AATTATTGGTCCAAGTTACTGGCATAGGAAATTTTGCATGTCACCTTAGCTG a s mr.mrrefChr3 144696 292 + 181019 ATGAGAGCAACACTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGAGTATAATAATTGCTACATATGTAATCCTAGCTTTATGAAGTCCACAATTTGAACAATATATAGTGGAAAGAGAAAGAATTGCATACATGCAATACATGACACAAATGATAATCTGACAGTTATATTATCCCTATCTGTAGCAATTACATGGTGCATGATGGCCCCCTCACTTGGTTAGGCAGGACAAAGACTGAATGCCTTTAAGGAGGTTTATCCTCAATTTCTGTTGCCAATGACCAAACAGGAAAACC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596271 292 + 636262 ATGAGAGCAACATTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGAGTATAATAATTGCTACATATGTAAACCTAGCTTTATGAAATCCACAATTTGAACAATATATAGTGGAAAGAGAAAGAATTGCATACATGCAATACATGTCACAAGTGATATTCTGAAAGTTATATTATCCATATTTGTAGCAATTACATGATGCATGATGGCCCCCCCACTTGGTTGGGCAGGACAAAGACTGAATGCCTTTAAGGAGGTTTATCCTCAATTTCTGTTGCCAATGAACAAACAGGAAAACC s simRat_chr6.simRat.chr6 71202 279 - 647215 ATGAGAGCAACACTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGTGTATAATAATTGCTACATATGTAATCCTAGCTTTATGAAGTCTACAATTCGAACAATATATGGTGGAAAGCAAACGAATTGCATAGATGCAATACATGACACCAATGATAATCTGACAGTTATATTCTCCCTATCTGTAGCAATTACGTGGCGGAAGATGGTCCCCTCACTTGGTTAGGCAGGGCAAAGACTGAATGCCTTTAAGAAGGTTTATGCTC-------------AACAACCAAACAAAAAAACC a s mr.mrrefChr3 144988 40 + 181019 ATACATAATAATTGCAGAATTCCATTATTATGAATCAGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596574 40 + 636262 ATACATAATAATTGCAGAATTTCATTATTATGAATAAGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 71481 40 - 647215 ATACATAATAATTGCAGAATTCCATTATTATGAATCAGTT a s mr.mrrefChr3 145028 28 + 181019 CATTCTGAGGACAATCTAGCCAATCTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596614 28 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 71698 30 - 647215 CTCACTCTCCCCATGCAATTATACTATCAA a s mr.mrrefChr3 145246 149 + 181019 TGTAGTTTAATGAGGATAAGAAAATGGTGCCATATTTACATTTATGAATTAGGAAATGTAGTTGCTACTTTGAACAGACATTGACCAACATGCCTGAAAGAGAACTGAATCTTAATATCTTTAATGCAAGCCTCACTATCTATCATGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597261 149 + 636262 TGTAGTTTAATGGGGATAAGAAAATGGTGCCAGATTTACATTTATGAATTAGGAAATATAGTTGCTACTTTGAGCAGACATTGACCAACATGCCTGAAAGAGGACTGAATCTTAATATCTTAAATGCAAGCCTCACTATCTATCATGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 71728 138 - 647215 TGTAGTTTAATGAGGATAAGAAGATGGTGCCATATCTAGATTTATGAATTAGGAAATGTAGTTGCTACTTTGGACAGACACTGACC-----------AAGAAAAGTGAATCTTAATATCTTTAATGCAAGCATCCATATCTATCATGAG a s mr.mrrefChr3 145395 15 + 181019 AGCCAACAATGGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597410 15 + 636262 AGCCAATAATTGCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 71893 15 - 647215 GACCAACAATGGCTT a s mr.mrrefChr3 145410 97 + 181019 TTATCACACAAAGCCATGATGCTTGAGTAGAGTAACGGCATGTGATCATGCTTGTCAATGTTCACCTGTCTAAGTCTGTGCCAAGAAGTGTGCCTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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GAAGGAATAGCATGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTGGCCTGTAGAGACATGATAGGCATACAAAGTACAGCCATGAGGGAACACCTAATATGCAAATACCCATTATCTGTAGGCCCACTTCCTATGGTTCATCCCTGTGTTTAATCTAGCCCTCAAGGCATAATAGCCATAGTGGTTTGACCCTAGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597905 214 + 636262 GAAGGAATAGCATGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTAGCCCGTAGAGACATGATAGGTATACAAAGTACAGCCATGAGGGAACACCTAAGATGCAAATACCTATTATCTGTAGGCCCACTTCCTATGATTCATCCGTGTGTTAAATTTAGCCCTCAAGGCATAATAGCCATAGGGGTTTGACCCTAGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 72326 212 - 647215 GAAGGAATAGTCTGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTGGACTGCAGAGACATGATAGGCACACAAAGTACAGCTATGAGGGAACACCTAATATGCAAATACCCATTATCTGTAGGCCCAC--CCTATGGTTCATCCCTGTGTTTAATCTAGCCGTCAAGGCGTAATAGCCATAGTGGTTTGACCCTAGCA a s mr.mrrefChr3 146040 67 + 181019 GGCTTTCAGACCACAAAATCAAGAATATTCCCATAGTATAGTATATTGAGGAAGACATGGGATCTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598121 67 + 636262 GGCTTTCAGACCACAAATTCAAGAATATTCCCATAGCATAGTATATTGAGGAAGACATGGGATCTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 72538 67 - 647215 GGCATTCATACCTCAAAATCAAGAATAATCCCATAGTATAATATAGTGAGGAAGACGTGGAATCTTG a s mr.mrrefChr3 146107 84 + 181019 TTGGCTCCTTGTTCAGTGGAATCAATCCCTCCAGTTCAATCGACGAAGGGGCTATGGTGAAGGTGGATTCAGTGAGTCTAAGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598188 84 + 636262 TTGGCTCCTTGTTCAGTGGAATCAATCCCTCCAGTTCAATCGACGAAGGGGCTATGGTGGAAGTGGGTTCAGTGAGTCTAAGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 72613 84 - 647215 TTGACTCCTCATTCAGCGAAATCCATCCCTGCAGTTCAACCGATGAAGGGGCTATGGTGAAGGTGGATTTAGTGGGTCTAATGA a s mr.mrrefChr3 146191 35 + 181019 ATTCCAGTGCTTGCAGGAACTGCAGAGATACAACC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598273 35 + 636262 ATTCCAGTGCTTGCAGGAACTGCAGAGATACAACC s simRat_chr6.simRat.chr6 72697 35 - 647215 ATGCCAGTGCTTGCAGGAAATGCAGAGATCCATCC a s mr.mrrefChr3 146226 36 + 181019 TATATCATGTTCCACAGGTCCTATAAGCCCCAAGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598310 36 + 636262 TATATCATGTTCCACTGGTCCTGTAAGCCCCAAGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 72732 36 - 647215 TGTATCATATTCGACAGGTCCTATAAGTCCCAAGAC a s mr.mrrefChr3 146262 222 + 181019 TTAAGGGGTAATGACCACCCCAAGATTTCATCTTTGTTCAACCACTTTGACTCATCAACTCACAGGTTTTTCAAAGATTACTCCTGGAATACTACATTTGGATTCTAAACATTTACTTATGGTCATTTGTCATAGCTTTCACTTCCCTTGTCTATGATTTGCCTTGGCCATCATATGATTAGCACTTGTAGAATCAACCCCACCAATAAAGCACACTACAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598347 222 + 636262 TTAAGGGGTAATGACCATCCCAAGATTTCATCCTTGTTTAACCGCTTTGACACATCAATTCACAGGTTTTTCAGAGATTGCTCCTGGAATACTACATTTGGATTGCAACCATTTACTTATGGTCATTTGTGATAGCTTTCACTTCCCTTGACTATGATTTGCCTTGGCCATCATTTGATTAGCACTTGTAGAATCAACCCCACCAATAAAGCACACTACAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 72768 207 - 647215 TTAACAGGTAGTAATCACCCCAAGATTTCCTCTTTGTTCAACCACTTTAACTCATCAAC--------------AAGATTACTCCTGGAATACTACATTCAGATTCTGCACATTTACTTACAGTCATTTGTCATAGCTTTCAGTTCCCTTGTCTATGA-TTGCCTTGGCCATCATATGATCAGCACTTATAGAATCAACCCCACCAATAGAGCACACTACAAT a s mr.mrrefChr3 146484 65 + 181019 CAGATTCGGAAACTGAGGGCAACCTTCAGACATCTATCTTCCTACGGCAAAAGAATTTAGGTGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598584 65 + 636262 CAGGTTCAGAAACTGAGAACAACCTTCAGACACCTATCTTCCTACGGGCAAAGAATTTAGATGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 72975 65 - 647215 CAGATTCGGAGACTGAGGGCAACCTTCAGACATGTATCTTCCTATGGCAAAATAATTTAGGTGAA a s mr.mrrefChr3 146549 18 + 181019 CATATGGCTTGAAAATAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598649 18 + 636262 CATATGGCTTAAAAATAA s simRat_chr6.simRat.chr6 73041 18 - 647215 CATATGGCTTGAAAATAA a s mr.mrrefChr3 146567 93 + 181019 TGGCCTCGGAATGGGATTTGATTGTGCACAGTGTACTTCATACGTAAACATTGCCTGAGTAGCCATACTATAAGGATACAAAATATTCAGAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598668 93 + 636262 TGGCCTCGGAATGGGATTTGGTTACGCACAGTGTACTTCATACATAAACATTGTCTGAGTCGCCGTGCTATAAGTATACAAAATATTCAGAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 73059 92 - 647215 TGGCCTCAGAATGGGATTTGATTGTCCACAGTGTACTT-ATATGTAGACACGGCCTGAGTAGCCATACTATAAGGATACAAGATATTCTGAAG a s mr.mrrefChr3 146660 23 + 181019 AAATAATACATTTCTATTCCAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598762 23 + 636262 AAATAGTACATTTTTATTCCAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 73151 22 - 647215 -AATAATACATTTCTATCCCCAG a s mr.mrrefChr3 146683 295 + 181019 TAGTTCCTACATATAACTCCAGGGCGGTGTCCTGGGAACATACATCATACAAATGATTGTGCTCCATTTCTCCATTGTGTGGAGCTGCATCTGTGCCTCATGGATGGTCTTCATTATCATTTTCAGCCTCTTTAGTTCAGCATTTTAATGTAGGTTTTGTGTGGACACACATAGCAATTTTTTTAAGATAACATTCTAGTTCCATCGGGGGTCAACATTGGGAATTAGTCATTATATGGCTGCAATATGACCTGGTCTTAGCAGAGAGGCTTATGATCTTCATCATGTGTGTACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598785 287 + 636262 TAGTTGCTCCATATAACTCCAGGGCGGTGGCCTGGGAACATTCATCATACAAATGATTGTGCTCAATTTCTCCATTGTGTGGAGCTGCTTCTGTGCCTCAAGGATGGTCTTCATTATCATTTTCAGCCTGTTTAGTTCAGCATTTTAATGTAGGTTTTGTGTCGATACACATAGCAATTTTTTTGAGATAACATACTAGTTCCATTGGGGGTCAACATAGGGAATTAGTCATTATATGGCTGCAATATGACCTGGTCTTAGCAGGGAGACTTATAATCTTCATCATG-------- s simRat_chr6.simRat.chr6 73174 295 - 647215 TAGTTCCTACATATAACTGCAGGGCGGTCTCCTGGGAACATACATCATACAAATGATTGCACTCCATTTTTCCATAGTGTGGAGCTGCATTTGTGCCTCATGGATGGTCTTCGTTGTCACTTTCAGCCTCTTTAGTTCAGCATTTTAATGTTGGTTATATGTGGACACATATAGCAATTTTTTTAAGATAACATTCTAGTCCCATCGGGGTTCAAGATTGGGAATTAGTCATTATATGGTTGCAACATGACCTGGGCTTAGCAGAGGGGTTTATGATCCTCATCATGTGTGTACA a s mr.mrrefChr3 146978 71 + 181019 CTTGTGTTGTTCTGGCAAAAAACATACCCCTGTTCAGCTTGCTAAGAGTGGTTTGTGGTACTAATCTAATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599072 71 + 636262 CTTGTGTTGTTCTGGCACAAAGCATACCCCTGTTCAGGTTGCTAAGACTAGTTTGTGGTACTAATCTAATC s simRat_chr6.simRat.chr6 73489 71 - 647215 CTTGTGTTGTTCCAGCAAACTACATACCCCTGTTCATCTTGCTAGGAGTGATCTGGGGTACTAACCTAATT a s mr.mrrefChr3 147049 92 + 181019 AAATTACCTCAGACACCATTATTATTTCTCCTGCCCATCATCATGTTATACAGAATTATCTTTGGCTTCACTGCAAGTGGTCAACACTGTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599144 92 + 636262 AAATCACCTCAGACAGCATTTTTATTTCTTCTGCCCATTATCATGTTTTACAGACTTATCTTTGGCTTCAGTGCGGGTGGTCAACACTGTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 73560 89 - 647215 ---TTACCTCAGACACCATTATTATGTCTCCTGCCCATCATCATGTTATACACAATTATCTTTGGCTGCACTGCAAGTGGTCAACACCGTGC a s mr.mrrefChr3 147141 235 + 181019 ACTAAGTCTGTCATGCTAGATTACTGATGTTGGGTGGTGATACTCCATTCGGCACTTTTTTGTAAATATTATTGTTATCTAACTTCCACTCCCTCACTCCCCGGACCCTGGCAGTCATACATTGCTCTCACTTCATCGCACAAGCCACTTTGAACTAGGGGGACAAGTGGTATCTGGGTGGATGGTAACATCTTGAAGGGTAATTGTTGTCAGGTGTAACTGTCCAGTAGATTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599238 228 + 636262 GCTAAGTCTGTCATGCTGGATTGCTCATGTTGGGCGGTGATACCCCATTCGTCACTTTTTTGTAAATATTATTGTTGTCTAACTTTCACTCCCTCACTCCCCGGACCCTGGCAGTCATACATTGCTCTCACTTTGTC-------CCACTTTTACCTAGGGGGATGAGTGGTATCTGGGTGGATGGTAACATCTTGAAGGGTAATTGTTGTCAGGTGTAGCTGTCCAGTAGATTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 73649 235 - 647215 ACTAATTCTGTCATGCTAGATTACTGATGTTGGGTGGTGGTACTCCATCTGGCACTTTTTTGTAAATATTATTGTCACCTAACTTCCACTCCCTCACTCACTGGACCCTGGCAGTCATACATTGCTCTCATTTCATCGCACAAGACACTTTGAACTGGTGGGACAAGTGGTATCTTGGTGGATGGTAACATCTTGGAGGATATTTGTTCTCAGGTGTAACTGTCCAGTAGACTGT a s mr.mrrefChr3 147376 146 + 181019 ACCACCTCTACCTAAAGAGGCCCAAATATGAGCAGTCCTACAATGTGCCACCAGTACTGTGGAATTTACCCCCATGAGTCAACACAATAATAACATCTtatgtttttcagataagtagatatcttttttagcaggatgcttattaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599467 144 + 636262 GACACCTCTACCTAAAGAGGCCCAAATATGAAGAATCCTAAAATG--CCACCGGTACTGTGGAATTTCCCCCCATGAGTCAACACAATAATTACATTTtatgtttttcagataagtagatatcttttttagcaggatgcttattaa s simRat_chr6.simRat.chr6 73884 146 - 647215 ACCAGCTCTACCTAAAGATGCCCAGAAATGAGCAGCCCTACAATGTGACACCAGTACTGTGGAATTTACCCCCATGAGTCAACACAATAATAACAGCTtatgtttttcagataagtagatatcttctttagcaggatgcttatttg a s mr.mrrefChr3 147522 11 + 181019 aggtatttctt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599619 11 + 636262 aggtatttctt s simRat_chr6.simRat.chr6 74030 11 - 647215 aggtacttctt a s mr.mrrefChr3 147533 23 + 181019 ttgttggttttattcttgtaagc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599637 23 + 636262 ttgttggttttattcttgtaagc s simRat_chr6.simRat.chr6 74041 23 - 647215 ttgctggttttattctcgtgagc a s mr.mrrefChr3 147556 9 + 181019 cttgttgta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599660 9 + 636262 cttgttgta s simRat_chr6.simRat.chr6 74073 9 - 647215 cttgttgta a s mr.mrrefChr3 147565 17 + 181019 agttcacacatgaggag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599669 17 + 636262 agttcacacatgaggag s simRat_chr6.simRat.chr6 74091 17 - 647215 ggttcagacatgagggg a s mr.mrrefChr3 147582 40 + 181019 ttccaatgggtaagttcatgatgggcttcattgaagatga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599704 40 + 636262 ttccaatgggtaagttcatgatgggcttcattgaagatga s simRat_chr6.simRat.chr6 74108 40 - 647215 ttccaatgggttagtgcatgatgggcttcattgaagatga a s mr.mrrefChr3 147622 26 + 181019 agctgcattgagatttaagcttacac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599745 26 + 636262 agctgcattgagatttaagcttacac s simRat_chr6.simRat.chr6 74148 26 - 647215 acctgcattgagatttaggcttacac a s mr.mrrefChr3 147648 86 + 181019 tacatcttgtatctaatTTTCACTAGTAATAGCTTAATATCTTAAAGATGGCAATAAATGTACATTAGGTCTAGTGTATAGTTTCG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599771 85 + 636262 tacatcttgtatctaatTTTCACTAGTAATAGCTTAATAACTCAAAAATGG-AATAAATGTACATTAGGTCTAGCATATAGTTTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 74176 86 - 647215 tacatctcgaatctgatTTTCACTAGTAATAACTTCATATCTTAAAGATGGCAATAAATGTACATTAGGTCTAATGTATAGTTTCG a s mr.mrrefChr3 147734 76 + 181019 TGTGTCTTTCCCATTATCAGAGATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTAACAGTGAATCACATCTCACCTGCTTCCCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599856 75 + 636262 TGTGTCTTTCCCATTATCAAAGATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTAACAGTG-ATCACATCTCACCTGCTTCCCT s simRat_chr6.simRat.chr6 74273 76 - 647215 TGTGTATTTCCCATTATCAGAAATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTGACAGTGAATCATATCTCACCTGCTTTTCC a s mr.mrrefChr3 147810 47 + 181019 AATTCTAAATACTTTTGTCTATGATGTGATGTTCAAAAATTATTCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599939 47 + 636262 AATTCTAACTACTTTTGTCTATGATGTGATGCTCGAAAATTATTCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 74349 47 - 647215 AATTCTAAATACTTTTGTCTATGATGTGATGTTCAAAAATTATTCCA a s mr.mrrefChr3 147857 120 + 181019 TATGCCCAGTTTGCAAATCTGGGGATTAATTTTATGCCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCTGGGCTAGCACCTACCCTGCACCTTACATTGGCATAAGTGGAGATACAGTTGAACCCATCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600018 120 + 636262 TATGCCCAATTTGCAAATCTGGGGATTAATTTTATGTCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCAGGGCTAGCACCCACCTTGCACTTTACATTGGCATAAGTGGAGATACAGTTGAACCCATCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 74396 120 - 647215 TATGCCCAGGCTGCAAATCTGGGGATTGATTTTATGCCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCTGGGCTAGCACCTACCCTACACCTCACATTGGCATGAGTGGAAATACAGTTGAACCCGTCTT a s mr.mrrefChr3 147977 443 + 181019 TGACGTAATCTGCCCCATTGTCATGTCAAAATTCCTCTTGCTTGGTGCACACAGAATTTCTAGTTTCTGTGCACAAAGAACCATACTTTGTCCCTTAGGTAAATTTATGCGGTATGACGCACTTGCTAATTTTTAGATAAGACTTTCCAATTTTTAGATATTTGGATACACTCTGTGAAACTCTCAGTTCCTGTTTTGACTTTAATAGCCTTAAGCAGCCTCCCATAAATATCATGGTTGATTTGGATTCTTAATGCTGCTCTACACTTTCAGATTAGCCCAAGTGCCTCCCATAATGGTCCTGTGTTAGGATCCTCCTACACTGTCAATCCCTTTTATCTTGCTCCCTGAAATGGGGTGATTTCAAGGTGAGACCAAATATTTGGAAAAAATGAAATATGGATCATGATCACATGGTGCTGGAGCATGTTGAAGCTATCTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600156 431 + 636262 TGATGTAATCAGCCCCACTGTCATGTCAAAATT--TCTTGCTTGGTGCACACAGAATTTCTAGTTTCTGTGCACAAAGAACCATACGTTGTCCCTTAGATGAATTG----GGTATGACGCACTTGCTAATTTTTAGATAAGACTTTCCAATTTTTAGATATTTGGATACACTTTGTGAAACTCTCAGTTCCTGTTTTGACTTAAATAGTCTTAAGCAGCCTCCCATAAATATCATGGTTGATTTAGATTCTTAATGCTGCTCTACACTTCCAGATTAGCCCAAGTGCCTCCCATAATGGTCCTGTCTTAGGATGCCCCTACACTGACAATCCCTTTTATCTTGCTTCCTGAAATGGGGTGATTTCAAGGTGAGACCTAATATTTGGAAAAAATGAAATATGGATCATGATCACATGGTGCTGGAGCATGTTGAAGCT------ s simRat_chr6.simRat.chr6 74516 441 - 647215 TGACTTAATCTGTCCCATTGCCATCTTAAAATTCCTCTTGCTTGGTGCACACAGAATTTCTAGTTTCTGTACACAAAGAACCATACTTTGTCCCTTAGGCAAATTTATGCGGTATGATGCAATTGCAAACTTTTAGATAGCACTACTCAATTTCTAGATATTTGGATACACTCTGTGAATCTCTAATTTCCTGTTTTGACTTTCATAGCCTTAAGCAGCCTTCTATAAATATCATGGTTGACTTGGATTCTTAATGCTGCTCCACACTTTCACCTTAGCCCAAGTGCCTGCCATAATGGTCATGTGGTAGGATCCTCCTACACTGTCAATCGCTTTTATCTTGCTCCCTGAAAAGGGGTGATTCCAAGGTGAGACCAAATGTTTAGAAAAAATCAAATATGGATCGTGAACACATGGTGCTG--GCATGTTGAAGCTATCTAA a s mr.mrrefChr3 148420 296 + 181019 GGTTGATCTGTGCACTTGAATAAAAAAAACATCATTTTGATGTGATACCCCTGTATTATTTTGTATTAGCTACTTACGAGTCTGTCGTGATATATCAGCAGTTACAAGAAATCAAGGGAGTTCAGCAAGATGATGCCCTCCAGCTCCCAAAAGACCTCGATTATTTGACAATCAGGGATGTTACGCTAACACATGAACTAAGGGCAAAGTTACATTTTAGTCCTCCACAGACTGTTGTATATAGTAGTCCAAAGTGAGGAGTTGTCATACGGAAAAAAGTGTATCTTGAAGTTAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600587 282 + 636262 --------------CTTGAATAAAAAAAACATCATTTTGATGTGATACCCCTGTATTATTTTGTATTAGCCACTTACGAGTCTGTCGTGATATACCAGCAATTACAAGAAATCAAGGGAGTTCAACAAGATGATGCCCTCCAGCTCCCAAAAGACCTCGATTATTTAACAATCAGGGATGTTACGCTAACACATGAACTAAGGGCAAAGTTACATTTTAGTCCTCCACAGACTGTTGCATATAGTAGTCCTATATGAGGAGTTGTCATACGGAAAAAAGTGTATCTTGAAGTTAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 74975 296 - 647215 GGTTGATCTGTGCACTTGAATAAAAAAAACATCATTGTGATGTGATACCCCTGTATTATTTTGTTTTAGCTACTTACGAATCTGTCTTGATATATCAGCAGTTACAAGAAATCAAGGGAGTTCAGCAAGATGATGCCCTCCAGCTCCCAAAAGACCTGGATTATTTGATGATCAGGGATGTTACACTAACACATGAACTAAGGGCAAAGTTACATTTTAGTCCTCCACAAACTGTCGTATATCGTAGTCAAAAGCGAGGAGTTGTCATATGGAAGAAAGTATATCTTGGAGCTAAA a s 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636262 GTCACACCCATGATGATATCTCGTGGGGACATTCCAATTTCAGAGTTCCAAGAACAATATAGTTTTGGTAGTGGATTCTTATCTTGTCTACCACACACTGATTTGTTTCACATTAGGCTAATCACTTATTCAACTGAACCTAATTAGTC s simRat_chr6.simRat.chr6 75442 149 - 647215 CTCACTCCAACAATTATATCTCATGTGGATATTCCAATTTCACGGTTCCAGGAATAATATAGTTTTGGTAATGGATTCTTATCTTGTCTAACACACATTGAGTTTTATCACATTAGGCTAACCGCCTTATCAACTGAACCTAATCAGCC a s mr.mrrefChr3 149034 53 + 181019 TATGTCATGAATTGTAGAGTCCATTGCCATACGTATCACACCTGTTTAGGACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601214 53 + 636262 TATGTCATGAATTGTAGAGTCCATTGCCTTGCGTATCACACCTGTTTAGGTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 75591 53 - 647215 TATGTCATGAATTGTGGCATCCATTGGCATACATATCACAGCTGTTTAGGACT a s mr.mrrefChr3 149087 10 + 181019 AGCTGAGGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601267 10 + 636262 AGCTGAGGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 75645 10 - 647215 AGCTGCAGCA a s mr.mrrefChr3 149097 65 + 181019 TTTCTGAAAGCCTTCTAGAAGGAGCTTCTAATCATCCAAACAAGGTCCTAGGTCAAGCATTACTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601283 65 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 75845 37 - 647215 ATAAGACAACAATAGACAGGGAAGTGCTGACTCCCAC a s mr.mrrefChr3 149331 181 + 181019 AAGCCATGTACTGGCAATGTCTGTTGAACAATGGATTAACAAGAATAACGATACACAAACTAAATAAACCTCATATAAACACTAGCATCAGTACAGCTAGCAAGTCATTGCAAAGTCATACCTTAAGTTTGACTCTGATCTGTCACAATACATGTTACTTAAATAATTGGGCTCCTGCACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601498 179 + 636262 AAGCCATGTACAGGCAATGTCTGTTGAACAATGGATTACCAAGAATAAC--TACACAAACTAAATAAACCTCATATAAACACTAGCATCAGTACGGCTAGCAAGTCATTGCAAAGTCATACCTTAAGTTTGCCTCTGATCTGTCACAATACAGGCTACTTAAATAATGGGGCTCCTGCACT s simRat_chr6.simRat.chr6 75907 180 - 647215 ATGCCATGTACTGGCAATTTTTGTTAAACAATGTATTAACAAGAGTAGCGACACACATACTAAGTAAACTTCATACAAACACTCGCATCAGTACAGCCAGCGAGTCATTGCAAAGTCGTACCTTAACTTTGACTCTGATTTGTCACAATACATGTTACTTAAA-AACTGCGCTCCTGCACT a s mr.mrrefChr3 149512 221 + 181019 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mr.mrrefChr3 150572 74 + 181019 GTGATGGATTTGGCCCCCAAACAAGGGGTTACTGTGCATGAGGACCCTTACGAGCCCCACAGCCTGGTATTTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602782 71 + 636262 GTGATGGATTTGGCCCCCAAACAAGGGGCTACTGTGCATGATGTCCCTTACGAGCC---CAGCCTGGTATTTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 77150 71 - 647215 TTGATGA---TGCCCCCCAAACAAGGAGTTGCAATGCATGAGAACCCTTATTGGCCCCACAGCCTAGTATTTTG a s mr.mrrefChr3 150646 60 + 181019 GTGAATAAGAAATGCATGTAGAGAACATCCATGACAGCTGCCTACTCCACTTTAACATGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602855 60 + 636262 GTGAATAAGTAATGCATGTGGAGAATGTCCATGAAAGCTGCCTACTCCACTTTAACATGA s simRat_chr6.simRat.chr6 77221 60 - 647215 GTGAATAAGAAATGCATGCAGGAAACATCCATGACGGCTGCCTACTCCACTTTTACATGA a s mr.mrrefChr3 150706 145 + 181019 AATCACCAAGTTGACTTTTGCTTCGGGCTGCTTGTTACAGTGCATGGGCTGACACAGGAGCATCCTCACAATGTCTGATACAGAAGCATTCTCACTATAATGAACATCTTGTAAACACATGTATAGACATTTGTGGTATGGGGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602916 145 + 636262 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TGTGCCAAGGTCTCACAGAATCTGATAATAACCTTAAAGTTCGCTCAAAGGCTCATGCTGACATTGCAATAGGCCCCCAGTTTACTTGTGTCTCATGGGGGGTAAAGACTGAGGAGCCAATGGAGCCCTGAACTGTGTATGATACAGAGTGTAATGAAGGTGTTGCAACAAGAGATAGTGAAACCCTGCCAACATGCCATACTCACAATGACCTGTCCAATTCCAGCATACACTTGGTCTGGACTAGAACCATATGTGGCCAAATACTAACTTGATTCATTT a s mr.mrrefChr3 151489 663 + 181019 CCTCTTTACTGGATTGCTTGCACCGTTGCTTGTCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGCTTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATATTGGTGAATTCTACTCAACGACAGTCTGCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGCGGACCGTCTACAGGAAATAGAATTACAGCTACCCTGCTATAAAAACTGATGATGAAAAATCATGCATAGCAGCTATGTTAGACTGCAGGTAATGCTATAACCATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATTTGCTGCACTATAGGCAGATGAAGAAGAAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCACAATTGATGCTCCAATGTCCTAGGTCAATAATCCTGCTTTTATTTTCATTCTGGAGATTAGGGTTGAAAGCATGTTAATTTAGATTCAGACCAGACATCCTTCAAGTGTCATACCAGTGGATGGAATGACATGGTATGAACAGTATGTACAAACAGCAAATTAAGCAGCCATTTTACTAGCCATATATACTACAGGCATTGACCCAAAGACCCCTGAGCCTTCAGATGTGGCATAGTTTAGAACCCAAGCTTAATATTATGTCACTCAATGTGTGACAAACACTCTCCTGCTATTCACCAGTGTCACCTGGCTGAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603762 656 + 636262 -----TTCCTGGATTGCTTGCACCGCAGCTTGTCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGATTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATCTTGGTGAATTCTACTCAACGACAGTCTGCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGCGGACCGTCTACAGGAAATAGAATTACAGCCACCCTGCTATAAGAACTGATGATGAAAAATCATGCATAGCAGCTATGGCAGACTGCAGGTAATGCTATAACCATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATATGCTGCACTATAGGCAGATGTGGAAGGAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCGCAATTGATGCTCCAATGTCCTATGTCCATAATCATGCTTTTATTTTCATTCTGGAGATTAGGGTTGGAAGCATGTCAATTTAGA-TCAGACCAGACATCCTTCAAGTGTTATACCAGTAGATGGAATTACATGGTATGAACAGCATGTATAAACAGCAAATTAAACAGCCA-CTTACTGGCCATATATACTACAGGCATTGACCCAAAGACCCCTAAGCCTTCAGATTTGGCATAGTTTAGAACCCAAGCTTAATATTATGTTGCTCAATGTGTGACAAACACCCTGCTGCTATGCATCAGTGTCACCTGGCTGAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 78043 652 - 647215 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32 + 181019 ATAGGCACAGAACACTGGGCCCTGTGGCCTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604439 27 + 636262 -----CACAGCACACTGGGCCCTGTGACCTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 78738 32 - 647215 ATAGGTGTAGAACGCTGGGCCCTTTGGCCAAG a s mr.mrrefChr3 152223 272 + 181019 CCAAGTACCTTGTTAGGGGGAAGATTGATGAAGTTGTTAGGGGTTATGAGTTTATTATCAGCTACTTTATCAGGAAATACTTGTACATGGTTGCAGTCACCCCTGCACAGAACGCTGTGGGTTTCTTAAGGAAGCTGTGGATTTCTTCAAACTACAGTCCTGCAAAACTTCACAAACAGTACCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTTAACCTTCTTAAACTTCATTCAAAGGTTGTATGCCACGATCAAATAACCATCCGTACAGAGCGAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604467 272 + 636262 CCAGGTACCTTATTAGGGGGAAGATTGATGGAGTTGTTAGGGGTTATGAGTTTATTACCAGCTTCTCTATCAGGAAATACTTGTACATGGTTGCAGTCACCCCTGCACAGAACGCTGTGGGTTTCTTAAGGAAGCTGTGGATTTCTTCAAACTACAGTCCTGCAAAACTTCACAAACAGTATCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTTAACTTTTTTAAACTTCATTAAGAGGTTGTATGCCACGATTAAATGACCGTCCGTACAGAGCGAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 78770 272 - 647215 CCAAGTACCTTGTTCTTAGGAAGGTTGATGAAGTTGTTAGGGGCTAAGAGTTTATTATCAGCTACTTTATCAGGAGATATTCGTAGATGGTTGTGTTCACCCCTGCAAAGAAAGCTGTGCACTTCTTAAGGAAGTGGTGAATTTGCTCACACTACAGTTCTGGAAAACTTCTCAAACAGTACCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTAAACCTTCTTAAGCTTCATTCAAAGGTTGTATGCCACTATCAGATAACCATCTGTACAGAGTGAATG a s mr.mrrefChr3 152495 24 + 181019 ATGAAAAAAGTTCAAGAGGACCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604750 24 + 636262 ATGAAAAAAGTTCAAGAGGACCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 79042 24 - 647215 ATGAAAAAAGTTCAAGAGCGCCCC a s mr.mrrefChr3 152519 7 + 181019 TTAATGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604775 7 + 636262 TTAATGC s simRat_chr6.simRat.chr6 79066 7 - 647215 TTGATGC a s mr.mrrefChr3 152526 91 + 181019 TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604783 91 + 636262 TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 79073 91 - 647215 TTTTTGGCTCATAGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCTGGCTTTTGGACTGGGGGACGTGTACATAAAATATTGCAGCTGGCACCATTTGA a s mr.mrrefChr3 152617 20 + 181019 GGACATTAGATTACACCCTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604874 20 + 636262 GGACATTAGATTACACCCTC s simRat_chr6.simRat.chr6 79213 20 - 647215 GGATATTAGATTACACCCTC a s mr.mrrefChr3 152637 8 + 181019 TATACCCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604894 8 + 636262 TATACCCT s simRat_chr6.simRat.chr6 79239 8 - 647215 TGTACCCC a s mr.mrrefChr3 152645 157 + 181019 CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAACAAAGGACTTGGTACTCTCCCGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604915 157 + 636262 CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAATAAAGGACTTGGTATTCTCCCGT s simRat_chr6.simRat.chr6 79247 157 - 647215 CCCCCATTAGTTGAACTGGGGCACTAAGATAGATTCTGCTGAACAGGGAGGGACGTCACATATGATCCTTGGCCAACCTAATTTGCTTTAGCAAGCTTCTACAATTGTGTCTCTATTTATCACCTGTAAACTAACAAAGGACTTGGTACTCTGCCAT a s mr.mrrefChr3 152802 43 + 181019 ATCTCCCTTGGGTAGGTCTATTTTAGACAAGATAATGCAGTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605073 43 + 636262 ATCTCCCTTGGGTAGGTCTATTTTAGACAAGATAATGCAGTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 79404 43 - 647215 ATTTCCCTTGGATAGGTCTATTTCAGACAAGATAATGCAGTTA a s mr.mrrefChr3 152845 90 + 181019 TCACCATTGCCTGCCAGATTCTTTATAAAGGTGTCCTTACTCAGTCCTGGTGCAGAAAAATTACAGGCAATAGCATTAGACTCCCCCAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605116 90 + 636262 TCATCATAGCCTGCCAGATACTTCATAAAGGTGTCCTTATTCAGTCCCGGTGCAGAAAAATTACAGGCAATAGCATTAGACTCCCCAAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 79448 89 - 647215 TCACCATTGCCTTCCAGATTCCTTATAAAGGTGTCCTTACTCAGTCCTGGTGCAGAAGAATTAGAGG-AATAGCATTAGACTCCCCCAGA a s mr.mrrefChr3 152935 250 + 181019 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mr.mrrefChr3 154230 15 + 181019 AATGTTTTGTGTTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606490 15 + 636262 AATGTTTTGTGTTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 80859 15 - 647215 ATAGCATTCACCTGT a s mr.mrrefChr3 154245 58 + 181019 GCCTAGCCAACCCTTTTTATAAATTACTAATATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606505 58 + 636262 GCCTAGCCAACCCTTTTTATAAATTACTAATATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACAC s simRat_chr6.simRat.chr6 80881 58 - 647215 GCCTAACAAACCCTTTCTACATATTACTCAAATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACGT a s mr.mrrefChr3 154303 22 + 181019 AGTTCTGGTGGATTGCTCAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606563 22 + 636262 AGTTCTGGTGGATTGCTCAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 80940 22 - 647215 AGTTCTGGTGGACTGCTCAATG a s mr.mrrefChr3 154325 39 + 181019 CCCATAAGCTGTTGGGATTGCAGGACTATGATGGTAATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606585 39 + 636262 CCCATAAGCTGTTGGGATTGCAGGACTATGATGGTAATT s simRat_chr6.simRat.chr6 80977 39 - 647215 CCAATATGCTGTTGGGATTGCAAGACTTTCATGGTAATT a s mr.mrrefChr3 154364 26 + 181019 ATCATTGCCAATCTGTGAAGTCTTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606629 26 + 636262 ATCATTGCCAATCTGTGAAGTCTTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 81016 26 - 647215 ATTATCCCCAATCTGCGAAGTCTTTA a s mr.mrrefChr3 154390 14 + 181019 GTAGATGGTAACCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606663 8 + 636262 GTAGATGG------ s simRat_chr6.simRat.chr6 81042 14 - 647215 GTAGCTGGTAACCA a s mr.mrrefChr3 154404 94 + 181019 AATTATATCCCAAGTCATATCAATCCTGGTGGGCAGAGGGCAGAAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCAGGGGCCAGCAAAGAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606671 90 + 636262 ----ATATCCCAAGTCATATCAATCTTCGTGGGCAGAGGGCAGAAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCTGGGGCCAGCAAAGTGG s simRat_chr6.simRat.chr6 81059 94 - 647215 AATTATATCCCAAGTCTTATCAATCCTGGTGGGCAGAGGGCAGGAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCAAGGGCCCGCAAAGAGG a s mr.mrrefChr3 154498 85 + 181019 TAACTAAGATATTATACCAATCTGCAACATATGCAATCCAATACCCCAATCAAACTGAGCTTGCCAAATTGAGCCAAAATCAGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606776 76 + 636262 TAACTAAGATATTGTACCAATCTGTAACATATGCAATCCAATACCCCAATCAAACTGAGCTTGCCAAATTGAGCCA--------- s simRat_chr6.simRat.chr6 81153 85 - 647215 CAACTAAGATATTATACCAATCTACAGCATAAGCAATCCAATACACCAATCAAACCGAGCTTGCCAAGTTGGGCCAAAATCAGTA a s mr.mrrefChr3 154583 110 + 181019 AAAGGTGGATTGACTAAGTCTCGTATGCCTAAATTGACTATCTATTATGCTTTCCTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTGTGCCAGATGTCATGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606852 67 + 636262 --------------------------GCTTAAATTGACTACATATTAT-CTTTCCTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTG---------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 81244 110 - 647215 AAAGGTGGATTGACTAAGTCTCGTATGCCTAAATTGACTATCTATTATGCTTTCTTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTGTGCCAGATGTCATGCA a s mr.mrrefChr3 154693 66 + 181019 ACGACTTTACAATTTACAAGAAAGCCAGACGCAAAAGTAGTGCTCATGGCTTTGCTACTGCTACAA s simRat_chr6.simRat.chr6 81359 66 - 647215 ACGACTTTACAATTTACAAGAAAGCCAGACGCAAAAGTAGTGCTCATGGCTTTGCTACTGCTACAA a s mr.mrrefChr3 154759 22 + 181019 AAATAGGTACAAAAATAGTTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 81431 22 - 647215 AAATAGGTACAAAAATAGTTGC a s mr.mrrefChr3 154781 17 + 181019 TAGAGCCACAACGTGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 81456 17 - 647215 TAGAGCCACAACGTGAG a s mr.mrrefChr3 154798 123 + 181019 TTTATCATACAAGTCAATCCTGTTCTAATCACCTGGACAAGATCACTACAAGCTTGCTGCCACAGATCAAGCTCTTTCTGATAGGAGTCTTGTCTTTATGAAGTGTGTGGAGTGCCTACCTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606919 123 + 636262 TTTATCATACAGGTCAACCCTGTTCTAATCACCTGGACAAGATCACTACAAGCTTGCTGCCACAGAGAAAGCTCTTTCTGATAGGAGTCTTGTCTTTATGAAGTGACTGGAGTGCCTACCTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 81483 111 - 647215 TTAATCATAGAAGTGAATCCTGTTCAAGTCACCTTGATAAGATCGCTGCAAGCTTGCTGCCACAGATCAA------------ATGACTTTTGTCCTTATGAAGTGTGTGGGGTGCCTACTCAA a s mr.mrrefChr3 154921 84 + 181019 TGCCTATGCAAGCATGGATAAGGCAACTTGGAGTGTAGCATTATGCAAGCATGGTATAGACTATTTGGAGTTTGACATACTTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607042 84 + 636262 TGCCTATGCATGCATGGATAAGACAATTTGGAGTGTAGTGTTATGCAAGCATGGTATAGACTATTTGGAGTATGACATACTTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 81618 84 - 647215 TGCCTATCCAAGCATGGATAAGGCAACTTGGAGTGTAGCATTATGCAGGCATGGTATAGACTATTTGGAGTTTGACATACTTTT a s mr.mrrefChr3 155005 109 + 181019 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34 + 636262 TTGTTTGAGTGCTCCCTAAATGGGCCGCACTAAC------ s simRat_chr6.simRat.chr6 82622 40 - 647215 TAGTTCAAGTGCCCGCCAAATGAGCTGCACCAACTGAATA a s mr.mrrefChr3 156033 304 + 181019 CACTTACAGATATATTGCACGCATCCATAGGTCCTCAAAATTTTACCTGAAGAAAGTCAATAATATACAATGGATGCTAACCTTACCCAATTTTAATCCAGCAAGAACCTAGCTGTAAAAGGCACTTCAGAGGATGTCTGTTACCATCATATGTGATCTAGCTGACCTAGAATTTCAGGAAAAGGGGCAGTCAACATTTTATAGCCATAGTAATAGGAGAAATTAGGAATTGATTTCATCACTGCAGACTCAGATGCTTTTACCTGGGCCTGAACCTTGCTCAATCACCACTTAATCTTTCTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608120 304 + 636262 CACTTACAGATATACTGCACGCATCGATAGGTCCTCAAAATATTACCTGAAGAAAGTCAATGATATACATTGGATCCTAACCTTACCCAATTTTAATGCAGCAAGAACCTAGCTGTAAAAGGCATTTCAGAGGATGTCTGTTACCATCATATGTAATCTAGCTCAGCTAGAATTTCAGGAGAAGGGGCAGTCAACATCTCATAGCCATAGTAATAGGAGAACTTAGGAATTGATTTCATCACTGCAGATTCAGATGCTTTTACCTGGCCTTGAACCTTGCTCAATCACCACTTCATCTACCTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 82664 299 - 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 611092 9 + 636262 TGCGCCTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 85716 9 - 647215 TACCTCTAC a s mr.mrrefChr3 159032 21 + 181019 CGTGGTCTATACTTACAGAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611101 21 + 636262 CGTGGTCTATACTTACAGAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 85727 21 - 647215 CGTCGTCTGATCTTAATCTAC a s mr.mrrefChr3 159053 3 + 181019 TAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611123 3 + 636262 TAC s simRat_chr6.simRat.chr6 85748 3 - 647215 TAC a s mr.mrrefChr3 159056 12 + 181019 CAGGGTATCCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611127 12 + 636262 CAGGGTATCCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 85751 12 - 647215 CCGGGAACCCCA a s mr.mrrefChr3 159068 8 + 181019 GGATCATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611139 8 + 636262 GGATCATT s simRat_chr6.simRat.chr6 85768 8 - 647215 AGACCATT a s mr.mrrefChr3 159076 9 + 181019 CCAAGTGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611147 9 + 636262 CCAAGTGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 85780 9 - 647215 CCTACTATA a s mr.mrrefChr3 159085 32 + 181019 AGATCTCTGTATGTGACATGTGTTTAAGGCTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611159 32 + 636262 GGATCTCTGTATGTGACATATGTTTAAGGCTA s simRat_chr6.simRat.chr6 85789 32 - 647215 AGTCTTTTTTATGTGAGATGTGTTTAAGGCCA a s mr.mrrefChr3 159117 195 + 181019 AGGATGATATGCTCATTTGTCATGGAGTGATTTGACCATTTATGCAAATGCATCCTTTTAATGACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGATTCATAGGGATATGCAATTTGTGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGACTAGCAGTTATCTGTCACATAAGGCTCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611191 195 + 636262 AGGAGGATATGCTCATTTGTCATGGAGAAATTTGACCATTTATGCAAACGCATCCTTTTAATCACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGGCTCATAGGGATATGCAATTTATGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGATTAGCAGCTATCTGTCACATCAGGCTCC s simRat_chr6.simRat.chr6 85828 181 - 647215 AGGATGATATGCTCCTTGGTCATGGAGTGACTTGACCATTTATGTAAATACAT-CTATTAATGACATTTACTGCTCCCCGTGAGGT-------------AGACAAGATTCATAGGGATACGCAATTTGCAAATTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAGAAGGCTATTAGTTATCTGTCACATAAGGCCCC a s mr.mrrefChr3 159312 49 + 181019 ACAGCTGATCATATGGCTTTAATAACATAACTGGGTAGGACTTGATGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611386 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AATTATCAGGGCATTTGTATGTGATTGCTAATCAAAAAGTGTTGTAATCTGGAAAGCTGAGAATGTTTGTTTGTGGCCATCATGCAATCAGCACTGTACTTGGAGTAATTTGAGGGGTGGTGCAAGTGAATCTTGTTTATGTTTTATTTTTCATGACTGCTTTCTTCAACCATGTCCTCAATCAAGATAGAATCTCTTTTTATTACTCATTGTACAATTTCACTGTCTATAGTT a s mr.mrrefChr3 161376 62 + 181019 TTTCATTGGTGCAAACACATTGTGGCAGTTAGTATTACTGAGTCTAACAACCTGGAAGGTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613516 62 + 636262 TTTCATTGGTGCAAACACATTGTGGCAGTTAGTATTACTGAGTCTAACAACCTGGAAGGTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 88496 62 - 647215 TTTCATTGGTCCAAACACATCGTGGCAATAAGTATCACTGAGTTTAATAATTTGAACCGCCA a s mr.mrrefChr3 161438 110 + 181019 ATGATGCTCCTGACTTTAGTCGATGAGTCTACACTCAGTCTGTAAGGGGCTGTGTGGGACAAAATAGATTTGCCCCAGAAGATTTGAAGCAATACCAACaccactacatc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613579 110 + 636262 ATGATGCTCCTGACTTTAGTCGATGAGTCTACACTCAGTCTGTAAGGGGCTGTGTGGGACAAAATAGATTTGCCCCAGAAGATTTGAAGCAATACCAACaccactacatc s simRat_chr6.simRat.chr6 88558 110 - 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 615598 56 + 636262 TATCTAGTTTAATTAAACCAGAGGCTAGTCAAAAAGAAAGAAGGACCATATGGCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 627480 56 + 647215 TCTCTAGTTTAATCATATAAGAGGATAGCCGGAAAGAGAGAAAGACCATATGACAT a s mr.mrrefChr3 162924 76 + 181019 GTGGGACCTGTATTGACAGGTATTGGCAAGTGTGGACCCTGTGTTAGTCAATGGGCATGAGACTATTTGAGTGACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615658 76 + 636262 GTGGGAACTGTATTGACAGGTATTGGCAAGTGAGGTCCCTGTGTCAGTCAATGGGCATGAGACTATTTGAGTGACA s simRat_chr6.simRat.chr6 627536 76 + 647215 GTGGGACCTGTATTGACAGGTATTAGCAAGTGTGGACTCTGTGTTAGTCAATGAGCATGAGACTATTTGAGTGACA a s mr.mrrefChr3 163000 49 + 181019 GCTGTAAACCATCCCCTCACTACTAATACTAAGGGGGGACTACTCAAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615734 49 + 636262 GCTGTAAACCATCCCCTCACTACCAATACTAAGGGAGGACTACTCAAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 627619 49 + 647215 GCTGTAAACCATCCCCTCACTATTAATACTAAGAGGGGATTACTCAAAA a s mr.mrrefChr3 163049 82 + 181019 TAGACCTCCCCACAGTAATTGCTTCTTTGCCTGGGCCCTACGGCAATAGCATATGCAGATATGTTAGCATTAGAAATCATAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 622272 51 + 636262 AATGACTGCGACCAACACTATCTGCCCTTTGACTCAAACAGGGAAGATCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 634140 51 + 647215 AATGCCTGTGACTAACAGTATCTCCCCTTTGACTCAAAGGGTGAAGATCAA a s mr.mrrefChr3 169358 6 + 181019 GAGAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622324 6 + 636262 GAGAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 634191 6 + 647215 GAGAGA a s mr.mrrefChr3 169364 13 + 181019 GCCCAAATAACTC s simRat_chr6.simRat.chr6 634206 13 + 647215 GCCCAAATAACTC a s mr.mrrefChr3 169377 333 + 181019 CACCTGATACTATCTCCCCTTTGAGTAATTGCTAGCTGCAGCCCTTGTGTACCACATCTGACTTTACTTTGAATTCATACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGTAAAGGTAGTGTGCTGTCAGATCACTTATGCTCCATTGTCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGATCCCATGGCAATGTATTAAGCCAATACCTACCATGGGTAGGCATAAACTGTATCACCTGTAGGATAGATGGGGTGACAACTATGAACCTCCATATTCAGCCCAAATAAAGATATATTATATCAAGAACACAGACCACCAAAATTAGCACGCACTTGAATGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622633 324 + 636262 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mr.mrrefChr3 170842 103 + 181019 AGTATCACGCACGATAAGTGTCACACGCTCTGCTGCATTAAGTACATGCCATGTCCGATGACATCAAGACCTAACCTAGTATGTCCTGTATCTTGATTTCAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624133 103 + 636262 AGTATCACGCACGATAAGTATCACATGCTGTGCTGCATTAAGTTCATGCCATGTCGGATGACATCAAGATCTAACCTAGTATGTCCTGTATCTTGATTTCAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 635744 87 + 647215 ---------------AAGTGTCAGACGCTCTGCTGCATTAAGTACATGCCATGTCCTATGACATCAAGACCTAACATAGTATGTCCTGTA-CTAGATTTCGGA a s mr.mrrefChr3 170945 275 + 181019 TACCATTGTAATCATAATATAATGCATGAATGTTAGAAATGAGTTCAGCAGGCAGGTTTTCCCACCTGACTAGTATTAGTGGTAGCCTCTGGTATTTAACCGTCTGAATTCATCTTGTGTTCTAACACTCCAGGGCCCTACGGCAACATTTGTCAGAGCTGCAAATTAAGAACTTTCCTCAGCACTTAGGTGACCTACATGGTCTGTACTAATTCTTCCTTGATTTACTGGTCCAGTTGAGTATTAATTACAACAACCACATGCTATACCAAGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624239 275 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 637522 11 + 647215 CAAGCTACTGG a s mr.mrrefChr3 172677 38 + 181019 AAGCATGCTTGTACTCCTTCTAGGAATTACTTATAGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626020 36 + 636262 -ACCATGGTGGGATACCAT-TGGGAATACTGTAGAGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 637536 38 + 647215 AAGCAGGCTTGTACTCCTTCTATGAATTACTTATAGGA a s mr.mrrefChr3 172715 5 + 181019 GTGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626060 5 + 636262 GTGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 637574 5 + 647215 GTGAT a s mr.mrrefChr3 172720 225 + 181019 CAACAATACCTTATACATTAGGATGAGGGATGAGGGTACAATCAAAAATGTTCTGGGCACCTGGGATTCTTTTAATATAAATGATTAGCCCCATCACCACCCAATATCAAATAGGCAGGGGCTGGGGATCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCATGTGACTGCCAAGGACATGAGTTGCTAAAGAATCTGGTCCCATCAGCCCGACCAGCCCAGATTTGTTGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626071 225 + 636262 CAACAATACCTTATACATTAGGATGAGGGATGAGGGTACAATCATAGATGTTCTGGGCACCTGGGATTCTTTTAGTATAAGTGATTAGCCCCATCACCACCCAATATCAAATAGGCAGGGGCTGGGGATCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCATGTGACTGCCATGGACATGAGTTGCTAAGGAATCTGGTCCCATCAGCCCAACCAGCCCAGATTTGTTAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 637579 225 + 647215 CAGCAATACCTTATACATCAGGATGAGGGATGAGGGTCCAATCAAAAATATTATGGGCATCTGGGATTCTTTTAATATAAATGATTAGCCCCATAAGCACCCAAGATCGAATAGGCAGGGGCTGGGGACCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCAGGTGACCACCAAGGACGTGAGTTGCTAAAGATTCTGGTCCCATCAGCCCGACCAGCCCAGATTTTTTGGA a s mr.mrrefChr3 172945 166 + 181019 GCACAACTTAAATACTATCACTCAAACGAGACTCAAACAAATTCACTTCATGACCACATTCAGAATCAATAATTACGTTGCCTGGAGCATATTTTCAAACTTGGATATGTGCAGTATACTTGTAAATCTATACTTTTGAGTGCCTATTTTTTTGTTGGACCTGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626296 162 + 636262 GCACCACTTAAATACTATCACTCAAACAAGACTCAAGCAAATTCTTTTCATGACCACATTAAGAATCA----TTACATTGCCTGGAGTATATTTTCAAACTTGGATATGTGCAGTATATTGGTAAATCTATACTGTTGAGTGCCTATTTTTTTATTGGACCTGTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 637814 159 + 647215 GCAAAACTTAAATACTATCACTCAAATGAGACTCAAACAG-TTCACTTCATGACCACACCCAGTATCAATAAGGACGTTGCCTGGAGCTTATTTTCAAACTTAAATATGTGTA-TATACTTGT-----TATACTTTTGAGTGCCTATTTTTTTGTTGGAATGGCTT a s mr.mrrefChr3 173111 35 + 181019 ATTTGCTTTAGCAAATTGGTATGAAAACACTGATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626627 14 + 636262 ACTTGCTAAAGCAA--------------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 637973 35 + 647215 ATTCGCTTTAGCAAATTGGTATGAAAACACTGATA a s mr.mrrefChr3 173146 12 + 181019 ACATCTTGTCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 638009 12 + 647215 ACATCTTGTCAA a s mr.mrrefChr3 173158 28 + 181019 TGGATATTTGCCCGAGGCACTGTGTGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 638093 28 + 647215 TGGATATTTGCCCGAGGCACTGTGTGAA a s mr.mrrefChr3 173186 11 + 181019 TCTAAACAGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626641 7 + 636262 ----ATGAGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 638122 11 + 647215 TCTAAACAGCA a s mr.mrrefChr3 173197 40 + 181019 TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTCTCCTCCAGGGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626651 40 + 636262 TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTCTCCTACAGGGCC s simRat_chr6.simRat.chr6 638133 40 + 647215 TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTGTCCTCCAGGGCC a s mr.mrrefChr3 173237 10 + 181019 CACGGGGAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626704 10 + 636262 CATGGGGAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 638173 10 + 647215 CACGGGGAAT a s mr.mrrefChr3 173247 107 + 181019 GAACCTTGGGTAGAACCTAAAATCTGCATTTTTTTTGGAAGGTATGTTACTTTTTGCAGGTTAAGTTACTGCACTACACATACAACAGAATCATGCTGTATTCCCCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626714 106 + 636262 GAACCTTGGGCAGATCTTCAAA-CTGCGTTTTTTTTGGAAGGCATGTTACTTTTTGCAGGATAAGTTACTGCACTACACATGCAACAGAATCATACCGCATTCCCCT s simRat_chr6.simRat.chr6 638184 107 + 647215 AAACCTTGGGTAGAACCTAGAATCTGCATTTTTTTTGAAAGCTATGTTACTTTTCGCTGGTTAAGTTATTGCACTACATATATAACAGAATCATGCTGTATTGCCCT a s mr.mrrefChr3 173354 38 + 181019 CCTGTTCTAAAAAGCTTGCCCAGGTCTAGGTCCTATAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626842 34 + 636262 CCTGTTCTAAAAAGCTTGACCAGGTTTAGGTCCT---- s simRat_chr6.simRat.chr6 638291 38 + 647215 CCTGTTCTAAAAAACTTGCCCGGGTCTAGGTCCTATAT a s mr.mrrefChr3 173392 20 + 181019 TCATGTTTTCAATGTTATCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626876 20 + 636262 TCATGTTTTCAATGTTATCT s simRat_chr6.simRat.chr6 638339 20 + 647215 TCATGTTGCCAATGGTATTT a s mr.mrrefChr3 173412 41 + 181019 TTTGCAGATCTGATGTGTATGAAGGCTATTTTGATTTCTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 628571 4 + 636262 TGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 640111 4 + 647215 TAAC a s mr.mrrefChr3 174995 61 + 181019 ACCTCTCCTGATCCCCAGAGTGGGGTTGAGTGGTGATGATCCTTGTACATAGTCAGTTTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628575 61 + 636262 ACCTCTCCTGATCCCCAGAGTGGGGTTGAGTGGTGATGATCCTTGTACATAGTCAGTTTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 640122 61 + 647215 GGCTCTCTTGATCCCCAGGGTGATGTTCTGTTGTTATGATTCATGTGCATTGTCAGCTTCA a s mr.mrrefChr3 175056 145 + 181019 TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCACATCGATGGAATTAAAGCTGTATCCATCAACTAGACTTCTATTACAAGCAGTGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGTCTAGTATAATAACTGCGTTTAGCACATCCAGTCATTTGACATCCACTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628638 145 + 636262 TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCACATCGATGGAATTAAAGCTGTATCCATCAACTAGACTTCTATTACAAGCAGTGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGTCTAGTATAATAACTGCGTTTAGCACATCCAGTCATTTGACATCCACTAT s simRat_chr6.simRat.chr6 640183 145 + 647215 TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCAAATTGAAGGAATTAAAGATGTAACCATCAACTAGACTTGTATTACAAGCAATGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGCTTAGTCTAATAACTGTGTTTAGCACATCCAGCCATTGGACATCCTGTAT a s 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181019 ATTCATGGGAAGGATTGACCCTTTAGCAAGCGCATTGAGTAATTTTTGAAAATTTGCCTTCTATTTCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628980 69 + 636262 ATTCATGGGAAGGATTGACCCTTTAGCAAGCGCATTGAGTAATTTTTGAAAATTTGCCTTCTATTTCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 640522 69 + 647215 ATTTGTGGGAAGGACTGATCCTTTGGCAAGAACACTGGGTAATGTTTGAAAATTTGCCTTCTATCTCTT a s mr.mrrefChr3 175462 324 + 181019 AGTGGAGGTACAAATGCTAGAACCAGAATCGATCACATCCCAGCCAGAGCTGTGGACTCAATGCTTAAGTGGGAACCCAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTATGGTCACTCAAGGGCATGTGAGGTGAACAAGGGGTCTAGAATGTATGCAGGGGGGGCTGTGCATGACAAACCTCTCGTGTGGGGAGCAGGCTCCCTCTACAGCTGCCTGTGATCGCTCGATACCATGTCAAATGGCAGAGTCTTATAGCCAAGCACTATCCGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCATTTATTGGAGCTTTGCACGAGGCACTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629059 319 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 629670 276 + 636262 TAGTTGTTGAAGCTAGTAGCTACAAATTCTCCTATGTGAGAGAGCAGTCTAGACAGGTGGCAGTCTAAGCAGGCAAGGCATGGTGCCAGCTTATCCTTCTAGA--TTGAAAGTGTATGGAATTTGTTGGAACTCAGACAGGATGTTCTTATGTCCAACAACTGCTTGCCCAGTTGGTAAAAAAGTGCAGCTCACCCAAAAAGTATATTTAATATCATAGGTTGCAGCCTGTGGGGAGCCCTGGTGATTGCCAACTTCCCTGTTGGCCCCATGCACATC s simRat_chr6.simRat.chr6 641114 266 + 647215 TGGTTGTTGAAGCTAGTAGCTACAAATTCTCATAAGTGAGAGAGCAGTCTGGAAAGGTGGCAGTTTAAGCAGGCAAGGCACAATGCCAGCTTACCCTTCTAGAATTCTAAAGTGTATAGAATTTGTTGGAACTCAGAC------------CATCCAACAACTGCATGCCCAGTCAGTGAAAAAGTCCAGCTCACCCAAAAACCATATCTAACATCAAAGGTTGCAGTCTGGGGGAATCCCTGGTGATTGCAAACTTCCCTGACATCCCCATGAGCATG a s mr.mrrefChr3 176260 62 + 181019 TTGAGTTTCAATGGAATTATTAGCCTCATTGTCACACAGCTAGTCTTTCTGCCTTAATGTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629947 46 + 636262 TTGAGTTTCAATGGAATTATTAGCCTCATTCTCACACAGCTAGTTT---------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 641380 62 + 647215 TTGAGTTTCAATAGAATTATTAGGCTCATTGTCGCGCAGCTAAACTTTCTGCCTTAATGTTC a s mr.mrrefChr3 176322 69 + 181019 TGAATCATGACTGTGTGCATCCACTTTTATTGGTTCATTCAACTGCATTAGGAATTTACAGGTTCATTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629993 33 + 636262 ------------------------------------ATTCAACTGCATTAGGAATTTACAGGTTCATTA s simRat_chr6.simRat.chr6 641443 69 + 647215 TGAATCATGACTGTGTGCATCCACTTTTATTGGTTCATTCAACTGCATTAAGAATCTAAAGGTTCATTA a s mr.mrrefChr3 176391 16 + 181019 CCTCCCAAATTTTGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630026 16 + 636262 CCTCCCAAATTTTGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 641513 16 + 647215 CCTCCCAAATTTTGTA a s mr.mrrefChr3 176407 29 + 181019 TTTCTTAGTTGTTGTCAACCTATTATCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630043 29 + 636262 TTTCTTAGTTGTTGTCAACCTATTATCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 641529 29 + 647215 TTTTTTAGTTGTTGTAACCCTACTATAAA a s mr.mrrefChr3 176436 76 + 181019 CTGCATTAGGAATTTAAAGGTTCATTATCTTCCCAAATTTTATAGTTTCTTAGTTGTTGTCAACCAATTCTTCGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630072 75 + 636262 CTGCATTAGAAATTTAAAGGTTCATTATCTTCCCAAATCTTATGATTTCTT-GTTGTTGTCAACCAATTCTTCGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 641561 76 + 647215 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CTGACATGGGGATCATTAAACTACATATATACAAGTAAATATGTGGAACTTATCTTCTATGGGGAGAAACTAGTAACTCTCTCCCAGAGCAGGCTAACCTATTGTCTACAAATACAAAGTTGTACTCAAATCTGTGCTTACTCAAACCTGTGCTTTAGTTTAATCTTTTGAGATAACTGACACTTTCTCGATCATTTTACATCGAGATTCCCTGCTCCTCCCTCATATCAACTAAATAGAGCCGTGACCAAAGTAGGGTGAGTAGTCTG s simRat_chr6.simRat.chr6 645578 219 + 647215 --------------------------------------------------CATCTGTGATAGGGAGAAATTAGTAAGTCTCTTCCAAAACAGGCTTACCTATTGCTTATAAATACAAAGTTGTACTCAGATCTGTGCTAATTCAAACCAATGCTTTGGGTTGCTCTTTCCAGATAACTGACACTTCGTAGATCATTTTATAGTGAGATTCCCTGCTCCTCGCTCATATCAACTGAAAAGAGCCCTGGCCCGAGTAGGGTGAATAGTCTG a s mr.mrrefChr3 180697 65 + 181019 TGTTAAATTGTTGAGGAATGGACCCATTTTATGTACACTCCCCTCTAAGTGATCTTGCTTGATCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1293 63 - 636262 TGTTAAATTGTTGAGGAATGGACCCATTTTATGTACACTCCCCTCTAAGCGATCTTGTG--CTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 645797 65 + 647215 TGTTAAATTGTTGGGGAATGGAAACATTTTATGTATGCTCCCCTCTAAGTGATCTTGCTTGAGTA a s mr.mrrefChr3 180762 18 + 181019 GCTAACAGAACAGCCTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1358 18 - 636262 GCTAAAAGAACAGCCTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 645862 18 + 647215 GCTAACAGTACAGCTTAG a s mr.mrrefChr3 180780 46 + 181019 CCAACTATCAACCATTCATCGCCTCCTATGACATTGCTTGCTACAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1391 46 - 636262 CCAACTATGTGCCATTCATCGCCTGCTGTGACATTGCTTGCTACAT s simRat_chr6.simRat.chr6 645880 46 + 647215 CCAACTATCAACCATTTATTGCCTCCTATGACATTGCTTGCTACAT a s mr.mrrefChr3 180826 187 + 181019 ATAGGACCACATCCCATTCAAAAAATACAACCCACTCATGCAATACAACCAACCTATGCAACTGGCCTGGGTGTGTTATTGTGGATCTGCATAGCACTGATTTCTGCCAATTAGGTGGGGGGATCCAACACCTGATTGCCTTGAATCCCAGCTTGGCGTGGTCTCCTTTCTGACCAACAGGTGGGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1437 173 - 636262 ATGGGACCACATCCCAT-------------CCCAATCAGAAAAAACAACCAACCGATGCAACTGGCCTGGGTGTG-TAGTGTGGATCTGCATAGCACTGATCTTTGCCAATTAAGTGGGGGGATCCAACACCTGATTGCCTTGAATCCCAGCTTGGCGTGGTCTCCTTTCTGACCAACAGGTGGGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 645927 163 + 647215 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ATCAACCAGGATGGATCTACTCAGGAAGTTGAAATACAATATTGCAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATCTTTTTATGGAGCAATACAATCTGCAGGACAGAGAGTTCTGCTTACTAATCAAGCTATAAAGTTATTAAGGAGGGTGAGGATTAACAGAATGTAGTCTAAAGCTATTGAGGTCTGGCCTTATATCTTCACACTTATCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGTGGAGAACCCCACCATATGTTCTCATAAAAAAATATTCACATATGGCATTGGTAAAGGGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500017 296 - 636262 ATCAACCAGGATGGATCTACTCAGGAAGTTGAAATACAATATTGCAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATATTTTTATGGGGCAATACAATCTGTAGGACAGAGAGTTCTGCTTACT-ATCAAGCAATAAAGTTATTAAGGAGGGTCAGGATTAACAGAATGTAGTCTAAAGCCTTTGAGGTCTGGCCTTATGTCTTCACACTTATCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGTGGATAACCCCACTATATGTTCTCATAAAAAAATATTTACATATGGCATTGGTAAAGGGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 132197 294 + 647215 ATCAACCAGGATGGATCCACTCAGAAAGTCAAAATACTATATTGGAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATCTTATTATGGAACAATACAATCTGCAGAACAGAGAGTTCTGCTGACTAACCAAGCTATAAACTTATTAAGGAGGGTGAGGATTGGCAGAATGTAGTCTAAAGATATTGAGGTCAGGCCTTTTATCTTCACACTTGTCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGCGAAGAACCCCACCAT---TTCTCATAAGAAAACATTCACAAATGGCATTGATAAAGGGGT a s 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CTGTGCTCACTCCTTCTCACCTTCCAGACATGTATTATTGTCATACTACAACCCAAACTGTCTGGACTGGGGCTGGTACAACTTGTAGGCAGGAGCTATGAGCCTAAGGCATTACA a s mr.mrrefChr5 878 42 + 294542 ATATGCACTTGCTTGTGCATTTGGATGAGAGTAGATGTTGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137162 42 + 636262 ATATGCACTTGCTTGTGCATTTCGATGAGAGCAGATGTTGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 135035 42 + 647215 ATACGCACTTGCTTGTGCATTTGGATGAGAGTAGATGTTGCA a s mr.mrrefChr5 920 1 + 294542 G s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136958 1 + 636262 G s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137204 1 + 636262 G s simRat_chr6.simRat.chr6 135077 1 + 647215 G a s mr.mrrefChr5 921 12 + 294542 TATTACTGAGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137205 12 + 636262 TTTTACTGAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 135078 12 + 647215 TATTATTGAGTG a s mr.mrrefChr5 933 86 + 294542 ATACATCTAGAGCATGCTCTGTGTGCTCCTCTTCTAATGGAGTGCAcagctaccaagttGTGCTCCTgttctaaTGGAGTGCACAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136959 54 + 636262 ATACATCTAGAGCATGCTCTGTGTGCTCCTCTTCTAATGGGGTGCA-------------GTGCTCCT------------------- s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137217 54 + 636262 ATACTTCTCGAACATGCTCTGTGTACTCCTCTTCTAATGGAGTGCA-------------CTGCTCCT------------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 135090 86 + 647215 ATACAACTAGAGTGTGCTCTGTATGCTCCTGTTCTAATGGAGTGCACAGCTACCAAGTTATGCTCCTGTTCTAATGGAGTGCACAG a s mr.mrrefChr5 1019 80 + 294542 CTAAGTTGATGCAGCACATTTCTTGTAGATAAGAGGCGACTTTCTAGTAAGTCATCAAATGCAAACTAATGAACTCAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137013 79 + 636262 CTAAGTTGATGCAGCACATTCCTTGTAGATAAGAGGCGACTTTCTAGCAAGT-ATCAAATGCAAACCAATGAACTCAGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137271 79 + 636262 CTTAGTTGATGCAGCACATTTCTTGTGGATATGCGGCGACTTTCTAGTAAGT-ATCAAATGAGAACTAATGAACTCAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 135179 78 + 647215 CCAAGTTGAAGCAGCACATTTCTTGTAGATAAGAGGCAACTTTC--GGATGTCATCAAAGGCAAGTTGATGAACTCAATG a s mr.mrrefChr5 1099 9 + 294542 TTAGATTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137093 9 + 636262 TTAGATTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137350 9 + 636262 TTAAATTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 135257 9 + 647215 TTAGATTGT a s mr.mrrefChr5 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TCCTTCTGACACAAAGGTCTGTCACTTTTATGGGGTGGCCACACTTATCCACTAACACACCCAGTTTTCCTTCCCTACTTGTACAAGTATATTTGACTTTCATATTCGGATAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137552 113 + 636262 TCCTTCTGACACAAAGGTCTGTCACTTTTATGGGGTGGCCACACTTATCCACTAACACACCCAGTTTTCCTTCCCTACTTGTACAAGTATATTTGACTTTCATATTCGGATAG a s mr.mrrefChr5 1413 927 + 294542 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CCGAATGCAATGTATGGAGTATTCTCTATATATCCTCTGCATCGGGTGTCAAGGGCATTACAT-GTTTTGGTACTGCCTGTAGTCAGTGTAAATATTCATGGGATCAGGAGTA-GCACACAGTAGTATTTGATACAAACAAAGGTTCACCCCAGATGGAAGTAGAAGATGAAACAATTGACTATGATAGTTCAGTGAATGTTTGAGCTACTCAGTCTTAACATTCCTTACTTTAGTATATGGTAAACTTAGAGTATGAACCTAGCAAAACCCAAAAGAATCTAGATGTAACAGACATGCTACTTGGGTATCACACTGTGTACAGCTCTATCTAACTGCCCTCCAGATCCATGCCTTCTCAACACTACCTTACAACCAGCTGTACTTTAGTCTTGTTAAGAGGCCAACTGCAGCATGTCCACAGCTGTTATCACCCATATAGGTCCCACAATGATATGGATTTTTGGGTGGAATGCTTAATATTCTTCTTTGTCCTCAAAACGCCCACAGGGACCAACCATCATGATTTGACTGTCCCTCATAAAAGCACCTATAGACATTAACTCATGCAATTTAAGAATTCCACAGCATGGCGAGGATAAGCAGGTGGGGTACCAAACAAATATATTGTAGACAGTATGTTTGATGACTAAGATCTCAAAGGTATAGATACTTGATCACCACAACTAGCGATCAACACCAACTCAGAAGAGTAATGGGAAGTAGTGAGCTCTTTTTAGGGTGATTAATAACAGTGTCCAGAACCTAACACCAAATGCGCTAGAATCCTTTTGTGCTCCTGTTTCTTAGCGCATCAGTTCTAGCAAAGTCGCTAATTAGATTAGACTGAAGATAAACGGCTCCTTTTTACCATTCCTTTTAACATGACCTATACTGTGACAAGGACTCAGTCGACTTACCTGATAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 135317 878 + 647215 ---------------------------------------CACTAGGTGTCAGGGGCATTACCTTGTTTTGGTAATGCCTGTAATCAGC-TAAAGAGTCACAGGCTCATGAGTAAGTGCACAGTAGTATTTGATACAGACAAAGGCTCACCCCTGATGGAAGTAGAAGATTGGACAACTCTCGATGATAGTTCAGTGAATATTTCAGCTACTCGGTCTTAGTGTTCCTTACTTTAGTATACAGTACAATTAGAGTATGAACTTAGCCAAACCCAAAAGAAACTAGATGTAACAGACATGTTACTTGGGTATCAAGCTGTGTACATCTCCATCT--------TGCGGATCCATGCCTTCTCAGCACCACTTTGCACCTAGCTGTATTTTAGCCTTGTTAAGGGTCCACCTGCAGCATGTCCAGAGCTATTAGCACCCATATAGATCCCACAATGATATGGCTTTTTGGGTGAAATCCCTAATAGTCTTCGTTGTTCTCAAAACGACCACAGGGACAAAACATCATGATTTGACTGCCCCTCCTAAAAGTACCTATAGACATTAACTGATGCAACTCAAGAATTCCACAGCAGGGCAAGGATAAGCAGGTGGCATAACAGACAAAAGTATAGTAGACAGTATGTTTGATGACCAAGATCCCATAGGTGTAGATACTTGATCACCACAATTAGCAATCAACACCAACCCAGTAGAGTAATAGGAAGTAGTGAGAGCTTTTTAGGGTGATTAATAAGATTGTCCAGAATCTAGCACCAAAGGAACTAGAATCCGTTCGTGCTCCTGTTTCTGTGTGCATCAGCTCTGGCAAAGTAGCTGAT-AGACTAGATTGGAAGTAAACAGCCCCTTTTTACCATTCCTTTTAACATGACCTATACTGTGAGAAGGGCTCAGTAGACTTACCTTCTAGC a s mr.mrrefChr5 2340 22 + 294542 TCATTCTTTGAATATAACCTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138605 22 + 636262 TCATTCTTTGAATACCACCTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 136195 21 + 647215 TCATTCTT-GAATATAACCTAT a s mr.mrrefChr5 2362 23 + 294542 ACAATTGGTAGTTGGACAGCACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138627 23 + 636262 TCAATTGGTATTTGGACAACACT s simRat_chr6.simRat.chr6 136219 23 + 647215 ACAATTGGTAGTTGGACAGCAAT a s mr.mrrefChr5 2385 17 + 294542 CTACCAATAATCTAGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138651 15 + 636262 CTACCAATA--CTAGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 136242 17 + 647215 CTCCCAATAATCTAGAG a s mr.mrrefChr5 2402 122 + 294542 GGCAATTAGGACACAGTGAAAGTACAAGCGATATTTTATGTTCTATCTGCAATTGGTGCCAAGCTTGACTTGGTGACCCTTCTCTTGTTTAGTTAATCCTGGAGCCACCTTGGATAGCTGTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138667 122 + 636262 GGCAATTAGGACACAGTGAAAGTACAAGCGATATTTTATGTTCTATCTGCAATTGATGCCAAGCTTGACTTGGTGACCCTTCTCTTGTTTAGTTAATCCTGGAGCCACCTTGGATAGCTGTC s simRat_chr6.simRat.chr6 136259 114 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 136965 288 + 647215 ACTCTCTTTGATCCCAAAGGAGCCTGTACTGTTCAAGGTTAATTCCAACACAACAGATAAGACAGTTAAGAAAGAGATGGTTAAGATATTTGTAGTATATCTAGACCCCCTATGGGCACCATGGGGTGTGTATGGCGAGCTCGTTTCTCTAGGTTGATCTTCTATGCACAATTCAAGAAAGTTTGCTTTCATCATTCATATACAACAGCTCCCCCCCACAAAAGGAGGAGGACCTTCA--CTAGTTGACTGTGCCACCATCTATCAACGTCATGTCA--ACATTACCACATG a s mr.mrrefChr5 3082 148 + 294542 GGTGGTGGGTCCGACTGTTATCCAATTGGCCTATGACAATTGCTGCCAAGGCTAAAGCTATTAGAAAGAGTGTTAAGATGTTGGCCATGTGTAACCAGGATACTTAAGAGAGTAACAAGCTGCACCGAGTCAAAACATGCAGGACAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139401 148 + 636262 GGTGGTGGGTCCGACTGTTATCCAATTGGCCTATGACAATTGGTGCCAAGGCTAAAGCTATTAGAAAGAGTGTTAAAATGTTGGCCATGTGTAACCGGAATACTTAAGCGAGTAACAAGCTGCACCAAGTCAAAACATGCAGGACAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 137257 145 + 647215 GGTGGAGGGTCCAGCTGTTATCCAATTGGCCTATGGCAAACGCTACCAAGGCTACAGGTATCTGAAAGAGTGTTAAGATGTTGGCCATGTGGAACCAGGATACTTAAGATAATAACAAACTGCACCGAGTCA---CATGTGGGACAAT a s mr.mrrefChr5 3230 16 + 294542 GAGAGTCAACAAAAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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ACTGGCTCTTCTCTAGTGATGACTGAGATCAGGGGTTCCAGCTTCTGTGGTTGTCCTGAAGTATACTTGGCAACCACACAGACGAGGAGTGGAATGGTTTTCTTGTGGTATTCTTGTGCTGATTCTATAAAGGCCGTCC a s mr.mrrefChr5 13892 37 + 294542 TATTCTTGTATTTAATTGTAAGCATTCATGTTAGTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150805 30 + 636262 TATTCTTGTATTTAATTGTAA-CACTCATGT------ s simRat_chr6.simRat.chr6 148402 37 + 647215 TATTCATATATTTAATTTAAAGATTTCACATTAGTTA a s mr.mrrefChr5 13929 140 + 294542 TGCAACTGAGTGAACTGAATAATGTGGATTATGAACACAGATTAATTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAAGCAAGACAATTGAGGTGAGGACTAGTTGGTCACTGTTAGAAGGTAATAATCTATGAATACATGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150835 139 + 636262 TGCAACTGAGTGAACTGAAAAATGTGGATTATGAACACAGATTAATTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAAGCAAGACAATTATGGTGAGGACTAGTTGGTCACTGTTAGAAGGT-ATAATCTGTGAATACATGC s simRat_chr6.simRat.chr6 148440 140 + 647215 TGCAACTGAGCGAACTGAATAATGTGGTTTGTGAACACAGATTAACTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAATCAAGACAATTGAGCTGAAGGCTAGTTGGTCACTGTTAGTAGGTAATAATCTATGAAGACACAC a s mr.mrrefChr5 14069 183 + 294542 AATCTTGTAACTCATTGTTCAAAGCTAATTTGTATTAGTAGGCTTTGTACTCATAACTGCCAGCATTTATGGTAACTAGCCCTTGAATATCTGTCCAATTATGAACTGGGATAGGAATTATAAAAACTATGTAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCCATATATATAGAGACATTTTAATATATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150974 179 + 636262 AATCTT-TCACTCATTGTTCAAAGCTAATTACTATTGGTAGGCTTTG---TCATAACTGCCAGCATTTATGGTACCTAGCCCTTGGAGATCTGTCCAATTATGAACTGGGGTAGGAGATATAAGAACTATGTAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCCATATATACAAAGACATTTTAATATATG s simRat_chr6.simRat.chr6 148581 179 + 647215 AATCTTGTAACTCATTGTGCAAAACTAATTTGTATTAGTATGCTATGTACTTATAACTGCCAGCCCTTATGGTAACTAGCCCTTGAATATC-GTCCAATTATGAACTGGAATAGGAATTATAAAAACTACGCAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCTGTATATATAGAGAC---CTAATCTATG a s mr.mrrefChr5 14252 149 + 294542 TAAGTTGTTGTCCAGCCTCTATTCCCCATGTTCACATGGCATACACTATCAGTTTTACCAGATTTTAGTATTCTAAACCCTCTATATGGGATCTACCTGTGAGTGTAATTTACTAGTGGGCTGAATATTGGATGGGAACTGCCCATAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151153 149 + 636262 TAAGCTGTTATCCAGCCTCTATTCCCCGTATTCCAATGGCATACACTATCAGTTTTACCAGATCTTAGTATTCTAAACCCCCTATATGGGGTCTACCTGTGAGTGTAATTTATTAGTGGGCTGAATATTGGATGAGAACTGCCCATAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 148764 149 + 647215 TGAGTTGTCGTCCAGCCTCCATTCCCCATGTTCACATGTCATGCTCTATGAGTTTTACCAGATTTCAATATTCTAAGCCCTCCATATGGGATCTACCTGTGAGTGTAATTTACTAGTGGGCTGAATATTGGATGGGAACTGCCTATAGA a s mr.mrrefChr5 14401 7 + 294542 GGACTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151302 7 + 636262 GGACTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 148914 7 + 647215 GGATTGA a s mr.mrrefChr5 14408 7 + 294542 CTGGACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151309 7 + 636262 CTGGACA s simRat_chr6.simRat.chr6 148959 7 + 647215 CTGAGCA a s mr.mrrefChr5 14415 39 + 294542 CTAACCAATTCCTAATCCATAGATCATTTGTTGAGACCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151316 39 + 636262 CTAACCAATTCCTAATCCATAGATCATTTGTTGAGACCT s simRat_chr6.simRat.chr6 149027 38 + 647215 CTAACCAATTCCTAAT-CATAGATCATTTGTTGAGACAT a s mr.mrrefChr5 14454 42 + 294542 ACACTTGGGCCTACCATTTGGGCCAGATAGGATTAAGTGGTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151356 42 + 636262 ACACTTGGGCCTACCATTTGGGCCAGATAAGATTTAGTGGTC s simRat_chr6.simRat.chr6 149065 42 + 647215 ACAGTTGGGCCTGCCATTTGGGCCAGATAGGATTAAGTGGCC a s mr.mrrefChr5 14496 7 + 294542 ATAAATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151399 7 + 636262 ATAGATA s simRat_chr6.simRat.chr6 149107 7 + 647215 ATAAATA a s mr.mrrefChr5 14503 40 + 294542 GGAATACCATTGAGGTAGGATTTTGTGTTGTAGATCAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151406 14 + 636262 --------------------------GTTGCAGATCAGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 149119 40 + 647215 GGAATACCATTGAGGTAGGATTTTGTGTTGTTAACCAAGC a s mr.mrrefChr5 14543 19 + 294542 AGTAAAAATGAAGTGTTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151420 19 + 636262 GGTAAAAATGAAGTGTTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 149165 19 + 647215 AGTGACAGTGCAGTGATTT a s mr.mrrefChr5 14562 102 + 294542 GACCAGTAAATTAAGTTGCTGTCTCTTAGATAACATGTGTCCAAGATGTGTAACTTGCTAAGTTTCGTTAAAATAACTTAAATTTAAGGAAGTACCTGTCCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151439 102 + 636262 GACCAGTAAATTAAGTCGCTGTCTCTTAGATAACATGTGTCCAAGATCTATAACTTGCTAAGTTTCGTTAAAATAACTCAAATTTAAGGAAGTACCTATCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 149242 102 + 647215 GACCAGTAAATTAAGTTGCTGTCTCTTAGGTAACATGAGTCCAAAAGGTGTAACTGGCTAGGTCTCGTTAAAATTCCTTAAATTTAAGGAAGCACCTGTCCT a s mr.mrrefChr5 14664 339 + 294542 AACTCAAGTTATCATTAGCCATATGTTACCCAAATCCATGCAACTTAAGAACCTGAAATGGTTATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGATGAGGGCAGGCTCCTTGGATAAGTCCCAACACCATGGCGTGGGGGCTCACTGGACTGAGTCTAACTCTCACAGTTGGGAGTATCAATTTCTGATATGGAGCCCTTTTTAGCACAATAAGGTTACCTTACTACAGTCATTAGCAATATACCATAGGGCTCATGGCACGCTACTACAGTAAGCATGTAAGTGAACAACTGCAAGGATGTAAGAGATCATGATATGTGGGCTACCTGAGATAGAATTAATTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151541 335 + 636262 AACTAAAGTTATCATTAGCCATATGTTACCCAAATCTGTGCAACTTAAGAACCTGGAATGGTTATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGATGAGGGTAGGCTCCTTGGATAAGTCCCATTACCATGGCGTGGGGGCACACTGGACTGAGTCTAACTCTCACAGTTGGGAGTATCAATTTGTGA----GAGTCCTTTTTAGCACAATAAGGTTACCTTACTACACTCATTAGCAACATACCATAGGGCTCATGGCACGCTACCACAGTAGGCATGTAAATGAACAACTGCAAGGATGTAAGAGATCGTGATATGTGGGCTACCTGAGATAGAATTAATTT s simRat_chr6.simRat.chr6 149345 339 + 647215 AACTCAAGTTATGATTAACAATATGTTGCCCAAAGCCATGCACCTGAAGAGCCTTAAATAGTAATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGGTAAAGGCAGGCTCCTTGGATCTGTCACAACATCATGGTGTGGGGTCTCACTGGACTGAGTCTACCTATGCCAGTTGGAAGTGTCAAATTCTGATATGAAGCCCTTTTTAGCGCAATAAGGTTTACTTACTACAGACATTAGCAATATAGCATAGGGATCATGGCACACTGCTACAGGAAGTATGTAAGTAGACAATTGCAAGGATGTAAGAGATCATGATATGTGGGTTACCTGACATAAAATCAATTT a s mr.mrrefChr5 15003 678 + 294542 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AATCCTAAGCCTACCAAAGATTGATTCCTCTCAGCTAACAAGTCAGGTATAAGTACTGATAGCGGGTGGTGTGGAGTGCATGCCACTAAAAACAGTTGGTCTTGTTGGCAAAGTGGGGAAGAAGCTGAATAGAAGGCAGTTCTATTCTGGTGT-TGCATCAGTTGCTCTGACTAATATAGGGAAAGGAATGACAAGTTGCACTGGGTTAAAGAAGTTGCACTGGGTCATGAAACAACGAATACTAGATTGTCCTTCAATACTAAATGTACAGGTTCACTAAGTAGCCCCACCCAGGTTACCACTCAGAATTGCTGATAAAAGATCCCTAGTTACAATTGAAATAGGCTGGGTTCCACTGGGCTTCATGTCACTCTTTGAGTGGGAGTTAAGACTTAATGACACTATCACTACTTCACATTGAACACCATATTGACTTGCCAATCCTTTAAATCATGCAGCGTATAACTGGGTCTCCAGGCAAAATTCCTTAGGCTAAATCCAATAATGGCGATTCTTTCCATACCATCATGTCAGATTGGGAAGTAGAGGAACAAAAAAGAAACTTTAGACAATA-GATTTTAAACACAAAAATATTTAGTTATGTGTTCCATGGAAGAAAGGTGATTGTTTCATGTCCAAGAGTGGTCTTGGTTTTACACTTGAGGGGGTAAAGGTA a s mr.mrrefChr5 15681 116 + 294542 GGAGAATTAGCTCCTAATCACCTTGAGCCAGTGTGACACTCAAGACATAGTCAAAATGAAATCAATCACTGAGATTGCACCTATTAGAGGACACAACAACAAGCTATTCAGCCCTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152558 110 + 636262 GGAGAATTAGCTCCTAATCACCTTGAGTCAGTGTGACACTCAAGACTTAGTCAAAATGAAATCAATCACCGAGATTGCACCTATTAGAGGACATAACAATAAGCTATTCA------ s simRat_chr6.simRat.chr6 150360 111 + 647215 ----AACTAGCTTTTAATCACCTTGGGCAAATGTGACACCCAAGATATAGGCACATTGAAATCAATCACTGAGATTGCAC-TATTAGAGGGCACAATAACAAGCTATTTAGCCCTG a s mr.mrrefChr5 15797 177 + 294542 CCAATATTACTTGAATACAATGATTATGTCATAAGATGTCACTCATGTCTGATAACATGACTATGATTATGCTCTTACTGTTGCGTGCCCGAAGGGTATATAGAATCTCAAAAAGCTTGTTCACTTTAACCTAAAGTTTTAACGTTGTTCATTGTCTTTGTATCTATCAATGAAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152668 171 + 636262 CCAATATTACTTGAATACAATGATTATGTCATAGGATGTCACTCGCGTCTGATAACATGACTACGATTATGCCCTTACTGTTGCGTGCCCGAA------AAAGAATCTCAAAAAGCTCGTTCACTTTAACCTAAAGTTTTAACATTGTTCATTGTCTTTGTATCTATCAATTAAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 150473 176 + 647215 CCAATCTTACTTGTATACAATGATTATGTGATAAGATGTCACTTATGTCTGATAACATGGCTATGATTATACTCT-ACTGTTGCATGCCCTGAGGGTATATAGAATTTAAAAAAGCTTGTTCACTTTAACCTAAAGTTATGACGTTGTTCATTGTCTTTGTATCTATCAATGAATTG a s mr.mrrefChr5 15974 57 + 294542 TTTCCTCCTAGAGATTGCTCTCTTCTGGTGGCTTCTTTGAGGACTCATGCTTCTTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152839 46 + 636262 TTTCCTCCTAGAGATTGCTCCCTTCT------TTCTT-----ACTCATGCTTCTTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 150685 57 + 647215 TTTTCTCCTAGAGATTGCTCTCTTCTGGTGGCTTCTTTGAGGACTCATGCTTCTTAT a s mr.mrrefChr5 16031 86 + 294542 GGACCAGTTATTGGATCATATTGATATGATAGGATGTGGAGCGTATTCAAGTCTCTTCCAGCCTTGTCTCGGCACCCTATATAGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152886 86 + 636262 GGACCAGTTATTGGATCATATTGATATGATAGGATGTGGAGCGTATTCAAGTCTCTTCCAGCCTTGTCTCGGCACCCTATATAGCC a s mr.mrrefChr5 16117 28 + 294542 CTGCAAGATAATATCTTACTCTGCAACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152978 28 + 636262 CTGCAAGATAATATCTTACTCTGCAACT s simRat_chr6.simRat.chr6 150742 17 + 647215 -----------TATCTTTCTCTGTGAAT a s mr.mrrefChr5 16145 91 + 294542 GGTGTCTATCTTGGTGTTTAATCCATAATAGGGGAAGCAGGCATGTTAGCATCCCTGGTTTTAATAAGGAAAATGAGACTCAGGCTATTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153006 91 + 636262 GGTGTCTATCTTGGTGTTTAATCCATAATAGGGGAAGCAGGCATGTTAGCATCCCTGGTTTTAATAAGGAAAATGAGACTCAGGCTATTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 150761 91 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 153421 34 + 636262 TATCTTGTATGGGAGTGGGACCCTATGTCCTCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 151172 34 + 647215 TACTTTGTGTGGAAGTGGGACCCTGTGTCCTCCC a s mr.mrrefChr5 16563 31 + 294542 TCCTCAAGCGGCCCCTTTACCTGCTTAGAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153460 31 + 636262 TCCTCAAGCGGCCCCTTTACCTGGTTAGAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 151206 30 + 647215 TCCTCAAGCG-CCCCTTTACCTGCTTAGCAT a s mr.mrrefChr5 16594 77 + 294542 TGCTCACGCGGAGCAAGAAGTGCTGTTTTGCAGATACTTTTTATGAATTGATATCTTTTCAACTTTTATTAGAGTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153573 65 + 636262 TGATCACACGAAG--AGAGGTGCTGTTTTGCAGATATTTTTTATGAA----------TTCAACTTTTATTAGAGTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 151236 77 + 647215 TGCTCACGCCGAGCAAGAAGTGCTTTTTTGCAGATACTTTTTATGAATTGATATCTTTTCAATTTTTAATAGAGTTG a s mr.mrrefChr5 16671 462 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 151313 457 + 647215 TCTAGTGGTAGGTATCTCTGCTGACCTTGATGCTACTCATGTTCAGTTCCCCTAGTGTACTGCAGCCCTTTACTTTCTTATGCTGATCTTTTGGAGGCATGGACGTGGCATCTATGGTAATGACTATCACTGAGATTCTTATTAATTACCCTTCAATCTTATTATGATTATAGATTGTGCG---GCGACAGAAGGTTACTTTTTATCACTACAACCACTTTTTTTTTCTGATAGCCACAAGTGAGATGACAGTCCA-GGGCATCCCTC-GAATGCTTTGAGTTGTACCTTCACATGGTGATGAGAGTGACATACACAGAAAACCACTGTGTCTAATAGAATTGTTATACAAAGTCCTTCAGTCTTACCAAGAGCACATACCTTGGGGATATGTTACGTAAGTTATACTGTTGATTGGAAAAGGGAAAATCAGACTCTTCTGCATTTAAATTTTACCGGCCTG a s mr.mrrefChr5 17133 35 + 294542 GGCAGTCTAGCGGACTTGGCTTTGGCATTACTTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154110 35 + 636262 GGCAGTCTAGCGGACTTGGCTTTGGCATTACTTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 151770 35 + 647215 GGCAGTCTAGCAGACTTGGCTTTGGCATCACTTCT a s mr.mrrefChr5 17168 175 + 294542 ACATAAAATGTTCACTCATATGAATTTAGTGCTTCGGTGTAGTATTAATTAAGCTGGGCATGGCACATGTTTTCTATCATTACCTCTTATGGGACAGAACTAGCTTGTCTTAGGAAGTCTCAGTGTTCATTTCTTCAACCTCTCATTTTCCCACCTACTTCCCTCTGTCTGCACC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154145 175 + 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43 - 647215 GCGTAGTGTGATGACGGAGAGGAAGCATTCGCTATCTATCATT------------------------------------------------------------------------------------------ a s mr.mrrefChr5 17654 485 + 294542 ATGTCAATACTAAGCCCTTAATGATATCTAATGTCTTATTACCACATTGGATAGAAGGTTCATGGACTAAGACATTCAGAGTTGAGTGGAAAAGTTAGCCATAATCCAACCAAAATAGAGAAATTTTGTTAAATTAATACATAGAAGCCCATGTGTCATATTAATAGCAATGCAGGACATTTCAACTATCCAATGAATATATCAGATAAATATGTCTCAAGGACCAGCATAATATGACTTTCAGATCACCACTTGAGTGTCTTAAAATGAATAATAGTGGTCATCAGCTAAGCCAGAAAGATTGTGTAAGTTGTTATGCCAGGTTAGTATCACTCGATAAAGTTACATTTTCTTTTGGGCACTGTACAGTATTTTTGGACTTTTATTAGTACAAGTATAAAATAAATCTATGCAGTTGTTCTAGGGCCCTCAATGTTGTTCATTCATTGATAAGTTCAACATACTCTAAGATAGCTATTTCACAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154619 474 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 152851 28 + 647215 ATGTAGAGGCCTTTGAATAATGAACACT a s mr.mrrefChr5 18243 46 + 294542 ATGAGAACGAATGATGTGGGATGCTACTAACTGATTGTAATGATTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155217 46 + 636262 ATGAAAATGAATGATGTGGGACGCTACTGACTAATTGAAAGGATTG s simRat_chr6.simRat.chr6 152934 46 + 647215 ATGAGAACGAACGATGTGGGATGCTACTAACAGATCATGATGATTG a s mr.mrrefChr5 18289 116 + 294542 ATAGTATCCTCACTATTTTGACCCAGGAGTACAAATCTTAATGAAAAAGTAGCATCTTTTTACACTGCTTCTCATCTAGATAGCTCAGGATCGACCCATGCAATAAGTGTCCTTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155267 116 + 636262 ATAGTATCCTCACTATTTTGACCCAGGAGTACAAATCTTGATGAGACAGTAGCATCTTTTCCAACTGCTTCTCATCTAGATAGCTCAGGATCACCCCATGCAATAAGTGTCCTTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 152980 93 + 647215 ----------TGCTATTTTGACCCAGGAGT----ATCTTAATGAAAAAGTAACATCTTTTTACACTG---------TAGATAGCTCAGGATTGACCCATGCAATAAGTGTCCTTGG a s mr.mrrefChr5 18405 39 + 294542 TGGGAGAAGTGGTCTTGACTTAGTCTAGAGAATATGATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155385 39 + 636262 TGGGAGAAGTGGTCTTGACTTTGTCTAAAGAATGTGATT s simRat_chr6.simRat.chr6 153073 39 + 647215 TGTGATAAGTGGTCTTGACTTAGTCTAGAGAATATGATT a s mr.mrrefChr5 18444 36 + 294542 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAGGATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155425 36 + 636262 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAAGGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 153112 36 + 647215 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAGCATG a s mr.mrrefChr5 18480 10 + 294542 AGATAGGATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155523 10 + 636262 AGATAAGGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 153148 10 + 647215 AGATAGCATG a s mr.mrrefChr5 18490 498 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 159000 33 + 636262 AGGGTTGCCAATCCTATATTTCAATGAATGAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 156737 27 + 647215 GGGGTTGCCAATCCTATATTTCAATGA------ a s mr.mrrefChr5 21954 3 + 294542 CTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159034 3 + 636262 CTC a s mr.mrrefChr5 21957 198 + 294542 CAAACCCCTTAAGTTGTGTACCAACCATCTACTCCGTAATGCTTCGTACCATATGAAAGTGGGTGAGATTCTCTGCTAGCCATAAGTTGTATGTTCAGTATTTTTGGAATAGACACATTCTTGAAGGAGGACCAGCTCAATTGCAGTATGACTTGACAGGAATGATAGTCAGTAAGTTCTAGTAACTTCCATTATACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159038 196 + 636262 CAAACCCCCTAAGTTGGGTACCAACCATCTACTCTGTAATGCTTCGTACCATATCAAAGTGGGTGAGATTCTTTGCTAGCCATAAGGTGTGTGCTCAGTATTTTTGGCATAGACACATTCTTGAAGGAGGAACAGCTCAATTGCA-TATGACTTGACAGGAATGATAGTCAGTA-GTTCCAGTAACTTCCATCAAACT s simRat_chr6.simRat.chr6 156764 193 + 647215 CAAACCGATGAAGTTGTGTACCAGCCATCTACTCCGTAATGCTTCATACTATATGAAAATGGGGTA-----TCTGCTAGCTACAAGTGGTATGTTCAGTATTTTTGGAATAGGCACATTCTTGAAGGACGACTGGCTCAATTGCAGTATGACTTGACAGGAATGATAGTGAGTAAGTTCTAGTAACTGCCATTATGCT a s mr.mrrefChr5 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simRat_chr6.simRat.chr6 158477 28 + 647215 ATAAGAGAGGAGTAGCATCTGACTCTTT a s mr.mrrefChr5 23828 12 + 294542 CAGCAGTCAACC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473881 12 - 636262 CAGCAGTCAACC s simRat_chr6.simRat.chr6 158506 12 + 647215 CACCAGTCAACC a s mr.mrrefChr5 23840 32 + 294542 AAACCATCAGTTGAATCAGTTGAAGATTATGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473893 32 - 636262 AAACCATCAGTTGAATCAGTTGAAGATTATGA s simRat_chr6.simRat.chr6 158519 32 + 647215 AAACCATAAGTTGAATCAGCTGAAGGGTATGA a s mr.mrrefChr5 23872 21 + 294542 GATGTTGCACACGCTTATTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473925 21 - 636262 GATGTTGCACACGCTTATTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 158574 21 + 647215 GATGCTGCACACACTTATTGT a s mr.mrrefChr5 23893 37 + 294542 ACCGAACACATACAATCCAGTATCATCTAAGCTCGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473946 37 - 636262 ACCGAACACATACAATCCAGTATCATCTAAGCTCGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 158598 37 + 647215 ACCAAAGACATCTGATCCAGTATCATCTAAGCTTGCA a s mr.mrrefChr5 23930 13 + 294542 ACACTTATCGCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473984 13 - 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simRat_chr6.simRat.chr6 165417 68 + 647215 ATGGCATTTTCTCTGTGGAAATTACAACATAATGATGTGGGCAGGAGTGCATCGCTTCATTCTTTTTC a s mr.mrrefChr5 30448 261 + 294542 CTTTCACACACTGCCTCACTAGCCCTGGTAAAATTGTGTAAAACTTAAATTATACTCACTCCAAAAATGTCAAAGTTGTCAAGCTAGGGGTTCTAACATTCCAAAGGCATCCTCCCATGGCAAGTTGTATGTAAACTAGATAAGGCAGCATTTTAAAAACTATTCCTACCTTAAATTTTCATTCAAAGACCTACTCGTCCTCCCCTTTCCTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTGAGCCTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167785 261 + 636262 CTTTCACACACTGCTTCACTAGCCCTGGTAAAATTGTGTAACACTTAGATTATACTCACTCCGAAAGTGTAAAAGTTGTCAAGCTAGGGGTTCTAACATTCCAAAGGCATCCTCGCACGGCAAGTTATATGTAAACTAGATAAGGCAGCATTTTAAAAACTATTCCTACCTTAAATTTTCATTTAAAGACCTATTTGTCCTCCCCTTTCCTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTGAGCCTAT s simRat_chr6.simRat.chr6 165485 256 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 167379 15 + 647215 CTCTTTCTTTTGTAG a s mr.mrrefChr5 32346 198 + 294542 CATCTTGGGAAAAACAACAACTGCCAAGGGGGGGTAAATTATGAATCCCTTGAGCACCATACATAACCATCCAACCATTCCAGTTATTAGGTATCAACTTTGCCTTTGCTCATCTTGTATTCCTCTTGAACACTTTTACACCATCCTGACAGCCTTTGAATTTAACAGACAGGCAATCTAGACAGCCTCTTAACCAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169715 198 + 636262 CATCTTGGGAAAAACAACAACTGCCAAGGGGGGGTAAATTATAAATCCCTTGAGCACCATACATAACCATCCCACCATTCCGGCTATTAGATATCAACTTTGCCTTTTCTCATCTTGTATTCCTCTTGAACACTTTTACACCATCCTGACAGCCTTTGAATTTAACAGACAGGCATTCTAGACAGCCTTTCGATCAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 167396 197 + 647215 CATCCTGGGAAGAACAACAACTGCCAAGGGGGGCTGGATTATGAATCCCTTGAGCATCATAAATGACCATCCAAGCATTCCAGTGATTAGGTATCAACATTGTGCTCGCTCTTCTTGTATTCATCCTGAACACTTTTACACCATCCTGATCACCTTTGAATTGAA-AGACAGCCAATCTGGACAGACTCTTAACCAGG a s mr.mrrefChr5 32544 23 + 294542 ATGGAAACAATTTAAAGCAAGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169913 23 + 636262 ATGGAAACAATTTAAAGCAAGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 167601 23 + 647215 ATGGAAACAACTTAAAGCAAATA a s mr.mrrefChr5 32567 86 + 294542 GATAGTTTGCTGTTGAGAGCTTTGACACCACAGAGCAAGAGGAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAGCCATTAGGGCAAGCTTAAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169936 86 + 636262 GATGGTTTGCTGTTGAGAGCTTTGACACCACAGAGCAAGAGGAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAACCATTAGGGCAAGCTTAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 167628 67 + 647215 GATAGTTTTCTGTTGAAAGCTTTAACATCAGAAAGCAAGACAAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAGC------------------- a s mr.mrrefChr5 32653 97 + 294542 GGCAAGCTTAAAGGAATAGAGGCCCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTAAAGCAAGGAAGCAAGATATAGGTCCAAGTGAAAATTTATCTATCGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170026 97 + 636262 GGCAAGCTTAAAGGAATAGAGGCTCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTCAAGCACGGAAACAAGATATAGGTCCAAATGAAAATTTATCTATCGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 167695 97 + 647215 ACCAAGCTTAAAGCAATAGAGGTCCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTAAAGGAAGGAAGCAAAATTTAGGTCCAAGTGAAAATTTATCTAGTGAG a s mr.mrrefChr5 32750 50 + 294542 TGATTACTAACCAGGGGAGATGTGAGAATCACTTCATATTATTGGACAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170123 50 + 636262 TGATTACTAACCAGGGGAGATGTGAGCATAGCTTCATATCATAGGACAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 167793 48 + 647215 TGA--ACCAACCAGGGGAGATGTGAGAATCACTTGGCATTATTGGACAGC a s mr.mrrefChr5 32800 8 + 294542 TTGGGTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170177 8 + 636262 CCGGGTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 167841 8 + 647215 TTGAGTTA a s mr.mrrefChr5 32808 212 + 294542 CCACTTCATATTATGTGTCTGTATCTTTGATTTGCAAGAATAGTGTTTCCTAAGAGTGGCTGCCTTCTGAGAGCCCTCCTCAAATGGATGTTATACAGCAAGAGTGCATGAGTTGAAAACATTGTGCATCCTGAAGAGAAAAAGAATGGGATTATGGAAATTAAACTGTCAAATTGCAGTGTAGACATAGAAACTACTGCAAATCTTCAGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170185 209 + 636262 CCACTTCATATTATGTGTCTGTATCTTTGATTTGCAAGAATAGTGTTTCCTAAGAGTGGCTGCCTTCTAAGAGCCCTCCTCAAATGGATGTTATCCAGCAAGAGCGAACGAATTGAGAACATTGTGCATCCTGAAGAGAAACAGAA---GATTATGGAAATTAAACTGTCAAATAGCAGTGTAGACACAGAAACTACTGCTAATCTTCAGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 167854 212 + 647215 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ACTATCATGAGTGTACTGATGGGTCTAGACAATTTGCATGTCTCATAATGGATTGCTTACACCTAAATGTTGAATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170771 76 + 636262 ACTATTACAAGTGTACTGATGGGCTTAGACAATTTGCGTGTCTCATAATGGATTGCTTACACCTAAATGTTGAATT s simRat_chr6.simRat.chr6 168444 69 + 647215 GCTATCATGGGTGTACCGATGGGTCTCGACAATTGGCATGTCTCATAATG-------TACACCTAAATGTTGAATT a s mr.mrrefChr5 33467 564 + 294542 TGACAGAGATGCAATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAACATACAGTCTTCGACATCTATGTGACTTCAACCAGTGATATCCCTATCCCGAAATCCCATTGGAACTAGGAGGGCTGACTGATTGTTCTTGTTCTATTGAATGCTCTCACTCTACAACTGTAATGATAGCTAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGAGAGTGTGAGCGCAGTGCCTCACCTTCCTGTTTCTGACTGAACTACTTAACCTAAAATAATGCCACAACTAGCTTTGCAAAACAAGTCAGTATCTCAAATATCCTAATAGACACAAAAGAAACAGCCATTAGCATTCCATATGTCCAACCAGCAATGTGCTCCATGAGAGGGAGTTTTTAAACTAAGTCATCTCCTTTACATCCATCCTCTATTTATCTAGTGGAATCCACTAGTAACTATTCTTCCCTTCAGGAGTAACAGTATCTTATGGATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTATATAAGTCACCCCCATTAGGCAGAAATATGTCCAGTTATTTGCAGGAAAGGTCTGAATAAGATACTAAATGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170847 554 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 179443 320 + 636262 TACAAGCTTATACTGCTCTCCTTAGTGTTTTTATGGCCAGACACAGAACAAACTCTTCATATTGTGCTTAATGTTGGATATGCGCATCTGAGCAAGCCTGTTTTTGAGTAGTTACTCAAGGATGTATTTGAGCTTAGGTAGAGTGGTAATAAGGGTGCATACATACGCTGCCAACATTGTTTGACTTATGCATTAAGCTGACCACAACTCAAATTTAGCCTGGCTGTCCCATTTACCTGTCTAATCTGCGCTCTCTCATCCATTTACAGTTTCTTTCCTGGAGGCCTGAAACCCTAACTT-TCAGGCACACACTTAGACTG s simRat_chr6.simRat.chr6 169679 321 + 647215 CACAAACCTATACTGTTCTCCTCAGTGTTTTTATGGCCAGACACAAAACAAACTCTTCATGTTGTGCATAGTGTTGGATATGTGCTTCTGAACATGCCTGTTCTTGAGCATTTACTCAAGGATGTATTTTGGCCTAGGTGGACTGGTCATAAGGTTGCATACATACACAGCCAACATTGTTTGATTTGCACATTAAGCTAACCAGAACTTGAATTTAACCTGGCTGTCCCGTATACCTGTACAATCTGCACTCTCTTATCCATTTGCAGTTTCTTTCCTGAAGACCTGAAACCCCATCTTGTCAGGCACACACTTAGACCA a s mr.mrrefChr5 35017 243 + 294542 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TACTAAGGCTCAACATGATGGACAACCTCTCTGGCTTGATTTGCTACAAAA--------AGTGACTctctcctgtccttcc-aattcactaccacttccttactccagggcttggactgaccaggtggagttttctaattctgacagcatgagttctggatccagtatcaaattttacacattttatactcctgttagacctagagagggtgcacaaaaaagaattccttaaactggagaaggttgcactacaagcctcctctttgaatacgcttaaaagagtcactaaaaatatgagctgc----ctaagctgaaagggcctgtggctgctatggcaacttaattagaaggctttttactcattctcct a s mr.mrrefChr5 37069 47 + 294542 tgtgttgttctcttttatgtgtttacttatgtgcacatgccttcatg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181856 47 + 636262 tgtgttgttctctactatgtgtttacttatgtgcacatgccatcatg s simRat_chr6.simRat.chr6 172121 47 + 647215 tgtgttgttctcttttatatgtttacttatgtgcacatgccttcatg a s mr.mrrefChr5 37116 424 + 294542 tgtttacatactggcccctccctcaggttatgcgtaccctgagcagaataatatgagacagctgtgttaattctccaattaagtcaagttggacaggtgccgcaatcacactgcaccacttatttatggtcctaccccttagactgggagtaatgtgtactatcaaattggctggatttctctcaagtatggtcctcccaactgagtcatggttgaccctccacttgtatatccaagtgtggtccttctcccttaggtatttaaggtgaggctaagcttatcttttaagggggctacttaggtggtgctacaagacagtacacttttgtgagtgctttcctgcagtatttctaggttgattaaagcaaaaaccactagaaggctgataagaaggtaccctttcttatttaattactaccctggc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181905 410 + 636262 tgtatccataatggcccctctgtcaggttatgcatgccctgagcacagtaatatgagacagctgtgttaattctccaattaagtcaagttggacaggtgctgcaatcacactgcaccacttatttatggtcctaccccttagactgggagtgatgtgtactatcaagttggctggatt--tctcaagtatggtcctctcaactgag------------ctccacttgtatatccaagagcggtccttctcccttaggtatttaaggtgaggttaagcttatcttttaagggggctagttaggtagtgctacaagacagtacacttttgtgagtgctttcctgcagtatttctaggttgcttaaagtgaaaaccactagaaggctgataagaaggtaccctttcttatttaattactaccctggc s simRat_chr6.simRat.chr6 172168 417 + 647215 tgtttacatactggcccctccctcaggttATGCGTACCCTGAGTGGAATAATataagacagctgtgttaattctccaattaagtcaagttgcacaggtgccgcaatcattctgcactacctatttatggtcctaccccttagactgagggtaatatgtaccttcaaagtggctggatttctctcaagtatggtcctcccaacagagtcatggttgaccctccacttatatatctaagtgtg--ccttctcctttaggtatttaaggtgaggctaagctgatcttttaagggggctgcttaggtgttgctacaatacagtacacttttgtga-----ttcctgcagtatttctaggttgatcaaagcaaaaaccactataaagataataagaaggtaccttttcctatttaattgccaccttggc a s mr.mrrefChr5 37540 21 + 294542 cagagacatctgaccatgtaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182315 21 + 636262 cagagacatctgaccatgtaa s simRat_chr6.simRat.chr6 172586 21 + 647215 catagaaatctgactatgtag a s mr.mrrefChr5 37561 199 + 294542 aaggtatccaggtcccttgctcatttattaaatcattcttatcaggtatctgtgaaattttgcctgcatagccagtctctttcagacaaataagtggcagatataacactcagtttgttggtcaggattggtcatggtcttttctttttttgtctttaccttccttcagccaattagggcccctaacttgatattagtg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182336 199 + 636262 aaggtatccaggtcccttgctcatttattaaatcattcttatcaggtatctgtgaaattttgcctgcatagccagtctctttcagacaaataagtggcagatataacactcagtttgttggtcaggattggtcatggtcttttctttttttgtctttaccttccttcagccaattagggcccctaacttgatattagtg s simRat_chr6.simRat.chr6 172608 199 + 647215 agggaatccaggtcctttgcccatttattaaaacattcttagcaggtatctgtaaaagtttgcctgcatagctagtctctttcaaatgaataagaggcaaatataacactcagtttgttagccaggtttggtcctggttttttccttttttgtctttacgttctttcagccagttaggaccttaaacctgatattagcc a s mr.mrrefChr5 37760 14 + 294542 cgctctcactcaac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182537 14 + 636262 cgctctcactcaac s simRat_chr6.simRat.chr6 172807 14 + 647215 cactctcactcaat a s mr.mrrefChr5 37774 27 + 294542 ttgcatccattttaggccccttgagca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182551 27 + 636262 ttgcatccattttaggccccttgagca s simRat_chr6.simRat.chr6 172825 27 + 647215 ttggctccattttgggcaccttaagca a s mr.mrrefChr5 37801 8 + 294542 taggtccc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182579 8 + 636262 taggtccc s simRat_chr6.simRat.chr6 172852 8 + 647215 taaatgcc a s mr.mrrefChr5 37809 40 + 294542 ccaatatttcaaatcatactgtccaagttgccagaatctt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182594 40 + 636262 ccaatatttcaaatcatactgtccaagttgccagaatctt s simRat_chr6.simRat.chr6 172860 40 + 647215 ccaacatttgaaatcatcctgtccaaattatttgaatctt a s mr.mrrefChr5 37849 158 + 294542 aagctttcgcagctaagtttttaaatccccaacgcatcagtgtattgtccacacttcgggataaggagcgagaaggcagtcaagttccaggtcctggtagatagagtgccaatttcttctgcaatcttttggctgaaccataagtccttcttgattgt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182636 158 + 636262 aagctttcgcagctaagtttttaaatccccaacgcatcagtgtattgtccacacttcgggataaggagcgagaaggcagtcaagttccaggtcctggtagatagagtgccaatttcttctgcaatcttttggctgaaccataagtccttcttgattgt s simRat_chr6.simRat.chr6 172900 158 + 647215 aagcttttgcaactaaaacttcaaatccccaacccatcagcgttttgtccacactttggggtaaggagtgagaaagcagtcaagttccaggtcctggcggatggactgtgaatttcttcaccaatcttttagctgaaccataagtccttcttgattgt a s mr.mrrefChr5 38007 7 + 294542 ctcatat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182797 7 + 636262 ctcatat s simRat_chr6.simRat.chr6 173058 7 + 647215 ctcatat a s mr.mrrefChr5 38014 18 + 294542 agcactcgagagcaaatt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182822 18 + 636262 agcactcgagagcaaatt s simRat_chr6.simRat.chr6 173065 18 + 647215 aacactctagaacaaata a s mr.mrrefChr5 38032 196 + 294542 ctcttcagcaagtctaactacaatgcatatttggtttatggtaccaattcactcagttgggatgctaatgataggttgctacagaatattggtaacactacttcatcttactgcaatggcccaaggacctgaggttctggtgcaagtagagacgagagtgttattttggttgagacaaaacttataacctggtgta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182843 196 + 636262 ctcttcagcaagtctaactacaatgcatatttggtttatggtaccaattcactcagttgggatgctaatgataggttgctacagaatattggtaacactacttcatcttactgcaatggcccaaggacctgaggttctggtgcaagtagagacgagagtgttattttggttgagacaaaacttataacctggtgta s simRat_chr6.simRat.chr6 173083 196 + 647215 ctcttcagcaaattcaactacaaggcaagtttggcttatgagaccaatttacttggttgggatgctaatgataggttgctacacaatattggaagcactactttatcctactgctatggcctgaggacctgatgttctggtgcaagcagagactagagtgttcttttggttgagacacaacttacaacctggtgta a s mr.mrrefChr5 38228 31 + 294542 ccaccagcttgatttgtctgacttatgggct s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183039 31 + 636262 ccaccagcttgatttgtctgacttatgggct s simRat_chr6.simRat.chr6 173282 31 + 647215 ccaccagcttgatttatctgacttgtgagct a s mr.mrrefChr5 38259 57 + 294542 ctctttggtggtcttacacaaacttgacaattgtttttttgcactctgtaaccagag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183073 57 + 636262 ctctttggtggtcttacacaaacttgacaattgtttttttgcactctgtaaccagag s simRat_chr6.simRat.chr6 173313 57 + 647215 ctctttggtggttccatgcagacttgacaattgttcttttgcactctctaaacagag a s mr.mrrefChr5 38316 19 + 294542 gggttttttttacagagat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183130 19 + 636262 gggttttttttacagagat s simRat_chr6.simRat.chr6 173377 19 + 647215 gggttttttttacagagag a s mr.mrrefChr5 38335 76 + 294542 tcatcaaacttattagatctgtacatttaatttgcagaacaatatgttaatgtgtgtaggtttagcatcttcaggt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183149 76 + 636262 tcatcaaacttattagatctgtacatttaatttgcagaacaatatgttaatgtgtgtaggtttagcatcttcaggt s simRat_chr6.simRat.chr6 173406 76 + 647215 taatcaaaggtattagatctgtacattttatttgcagaacaatatgtttatgtgcatgggtttaccatcttcaggt a s mr.mrrefChr5 38411 34 + 294542 gaaaacattgagcctatagacccatgaacgacta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183226 34 + 636262 gaaaacattgagcctatagacccatgaacgacta s simRat_chr6.simRat.chr6 173482 34 + 647215 gtaatcattgagcctattgatccatgaactaata a s mr.mrrefChr5 38445 54 + 294542 aacatatataaagtcatatatcttgatcgtatgcacttgatgccttgggtaaac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183260 54 + 636262 aacatatataaagtcatatatcttgatcgtatgcacttgatgccttgggtaaac s simRat_chr6.simRat.chr6 173540 54 + 647215 aacatatataaagttacatatcctgatcatatgtacttgatgtcttgggtaaac a s mr.mrrefChr5 38499 22 + 294542 ggggggttcattcatctggaat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183315 22 + 636262 ggggggttcattcatctggaat s simRat_chr6.simRat.chr6 173594 22 + 647215 ggggggttcattcatctggaat a s mr.mrrefChr5 38521 85 + 294542 caatggtcagaggttactacactaggctctcgattgggctTGCCTGGGTGAAAGACTAAAGGAGACCTCAGAACTTGTGCTTTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183347 85 + 636262 caatggtcagaggttactacactAGGCTCTCGATTGGGCTTGCCTGGGTGAAAGACTAAAGGAGACCTCAGAACTTGTGCTTTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 173616 85 + 647215 cttctgtcagaggttactacactaggctcctgattggtctTGCCCATTTGGAGGACTAAAGGAAATCTCAGAACTAGTGCTGTGA a s mr.mrrefChr5 38606 9 + 294542 GTACCTGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183436 9 + 636262 GTACCTGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 173701 9 + 647215 GTACCCGCA a s mr.mrrefChr5 38615 62 + 294542 ATTGATTAGAGTTCCAAAATCCAAGCAGGCATCTGCTTGATTTATCTATAGTTACTGAGTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183452 62 + 636262 ATTGATTAGAGTTCCAAAATCCAAGCAGGCATCTGCTTGATTTATCTATAGTTACTGAGTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 173710 62 + 647215 ATTAATTAGGGTTCCAAGATCCAAGCAGGCCTTTGCTTGATTTATCTATAGATACCAAGTAG a s mr.mrrefChr5 38677 44 + 294542 TGTGCTATGAACACAATTGATCAACTCAAGGGCATGTAATGTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183514 44 + 636262 TGTGCTATGAACACAATTGATCAACTCAAGGGCATGTAATGTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 173773 44 + 647215 TCCAGAATGAACACAACTAATCAACTCAATGGTATGTAATGTTT a s mr.mrrefChr5 38721 35 + 294542 GGGGCCCATGTTCAGCATTCTATACGCAGACTGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183558 35 + 636262 GGGGCCCATGTTCAGCATTCTATACGCAGACTGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 173818 35 + 647215 AGGACCCATGTTCAGCAGTCCATACGCAGACTGAA a s mr.mrrefChr5 38756 59 + 294542 CTTCCACTGCTCCAAAATCCATGCTATGATAACTATCTTCTTAGCTTGGAAAACTACAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183593 59 + 636262 CTTCCACTGCTCCAAAATCCATGCTATGATAACTATCTTCTTAGCTTGGAAAACTACAT s simRat_chr6.simRat.chr6 173863 59 + 647215 CTTCCACTGGTCCATGCTCCATGCTTTGATAACTATGTTCTTGGCTAGGAGAACTACAT a s mr.mrrefChr5 38815 46 + 294542 TCAGATATCTAAAGTCAGCACCTATTGATAATGTACTAACTTCAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183656 46 + 636262 TCAGATATCTAAAGTCAGCACCTATTGATAATGTACTAACTTCAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 173922 46 + 647215 TCAGATATCTAAAGTCAGCACTTATTGATCATGCACTAACTTCAAG a s mr.mrrefChr5 38861 138 + 294542 ATCATGTACTAACTTCAAAGTACTGAGTGGTCCCCAGAAGGGTCTATGTTCCTTCTACTAAGAGCTCTTGTAATAAGTAGTGTATCCATAGTGGTAAGGGAATGTATTACATTCCAGTCCTTCCGGCATTTTGAAAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183703 135 + 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 190755 64 + 636262 CAAGCAAATATGCATGGCTCCCTAGCTTGACCTCATGTGA--------GGTTTCCTTTCAGCTAACAGCTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 181103 72 + 647215 AAATCAAATATGCATGGCTCCCTAGCTTGAGCACTTGTGAAGGCTGAGGGTTTCTTTTCATGCTATTCCTAA a s mr.mrrefChr5 45859 58 + 294542 ACACTAACACTTCTTGTTGGACTCAGCCATAGCACAGTATATCTATCACAATATGGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190820 56 + 636262 ACCTAAACACTTCTTGTTGGACTCAGCCATAGCACAG--TATCTATCACAATATGGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 181175 58 + 647215 ACACTAACACTTCATGTCAGACTCAGTCATAGCACAGTATATCTATCACAATAAGGTA a s mr.mrrefChr5 45917 289 + 294542 TATTTTGTGTGAGTAATCACAAGTACTAGATGATTGGAAGACCAAGTTTGTCTACTGGGAAAAGTTTGGGGTGTATCACAGTAGCCTCAAGAGGTGCCAAGCTCTGGTATGCACTCCCTCAATGAGCGAGATTACTGAATTAGGACACATGGGAGCCTTCAAATCCGGCTTCAATAATCTCCACTGTAACTAAATGATACAAGTACCGATTTGTGATGCTATAGATTTTAGAATATGAATTCGTGGGATTTCCATGGGTTAATTTATGGCTGCTTACCAATGACTTCGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190880 255 + 636262 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GCTTCAAATGCCACAAAGACATGAGACCTTGCTTTGTACTCATGTGCTTTCCTCAACCAGGAATAGAATCTCCTTCATGACATATGAGCCTACACCTGTAACCCACTAAATGATCAAACGATAGTTCTGTAACATTTTCTGTAACCTACTTGAAGCTGAGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGAAGTTGGATCTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191145 184 + 636262 GTTTTAAATGCCACAAAGACATGAGAC----------ACTCATGTGCTTTCCTCAACCAGGAATAGAATCTCCTTCATGACATACGAGCCTACACCTGTAACCCACCAAATGATGAAAC------CCTGTAATATTTTCTGTAACTTACTTGAAGCAGAGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGAAGTTGGAGCTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 181528 200 + 647215 GCTTCAACTGGCACAAAGACATGAGACCTTGCTTTGTGCTCATGTACTTACCTCGACCATGAATAGCATCTCCTTCATGTCATATGAGCCTATACCTGTAACCTAATAAGTGATCAAATGATAGTTCCGTAACCTTCTCTATAACCTAATTGAAGCTGGGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGACGTGAGCTCTTC a s mr.mrrefChr5 46412 2 + 294542 AT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191329 2 + 636262 AT s simRat_chr6.simRat.chr6 181730 2 + 647215 AT a s mr.mrrefChr5 46414 7 + 294542 AATAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191332 7 + 636262 AATAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 181732 5 + 647215 AATAA-- a s mr.mrrefChr5 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TGAGGTTGATCCTTTAAGATAGCAGGCCCTGTCAACATGATGTTGGTCCTTTAAGACAGCACGTATAACGAACTCAATACTTTATGTCTCATAGACTGTTCACCGGATGTTATTGGCTAGTCCAAATATACATGCAAAGCTTTGCTAGGCCCTGGAGCAGCAAAGAATGTGTTGCTGCATCTGTCCTGTGAGCAAATTTTAGCTGATGGCCACTCCTGTTATAAACCAATTAAAGTTACTCGGACTCAGGCACAGACTGACTCTTTCAAGACTGCTTCTAAAGAACATACATCTCCTAAAATCATAAGATGGGTAAATCGTTAAGATGGGTGTACGAAGAAAGGACACAAAAGTA--------CTGTACCACATTAGGTACAATCATGTGTAGGGAGATTATTGGTGAGTGTCCTGGGCTACCACTGTAGCCCATAATGACTTGCCCAGCTGGCTGACACACAGTGGATATTGTAGCTGTGAACATAAATGTTCTATG--CTGATCAATAATCA a s mr.mrrefChr5 47725 10 + 294542 TGTGAACATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192825 10 + 636262 TGTGAACATA s simRat_chr6.simRat.chr6 183019 10 + 647215 TCCAGACACC a s mr.mrrefChr5 47735 230 + 294542 AATGCAATCCAACCTACCAATCTACATATCCCAAGAGGAGTGCTGCCCAGTAAGTCTCCAGAAAACAATAGGAAAAATCCATGTATTATTCTGTTTATTTGGTTTCTCACACATAGGTGGCCCAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCTGCTCAGGTGCTCTTCAGGGATAGAAATATTCCCAGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTGATATCTCAGAGGCTGTATCAATGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192835 230 + 636262 AATGCAATCTAACCTACCAATCTACATATCCCAAGAGGAGTGCTGCCCAGAAAGTCTCCAAAAAACAATAGGAAAAATTCACGTATTGTTCTGTTTGTTTGGTCTGTCACACATAAGTGGCTCAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCGGCTCTGGTGCTCTTCAGGGATAGAAATATTCCCAGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTGATATCTCAGAGGCTGTATCAATGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 183030 226 + 647215 AGTGCAATCCAATCTACAAATCTACATAT----AGAGGAGTGCTTCCGAGTAAGTCTCCAGAAAACAATAGGAAAAATCCGTATATTATTGCAATTATTTGGTTTCCCATACATGGGTGGCCTAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCTGCACAAGTGGCCTTCAGGAACAGAGATATTTCCGGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTTATATCTTAGAGGCTGTATCAATGCT a s mr.mrrefChr5 47965 23 + 294542 TCACGGCTATGACTGTGGGTTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193070 23 + 636262 TCACGGCTATGACTGTGGGTTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 183256 23 + 647215 TCATGTCTATGACTATAGGTTCG a s mr.mrrefChr5 47988 135 + 294542 GGAAAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTAAGCATAAGGACTCTATGAGAATGATTGCTTTTCTGATGTAGGAGTGGGGCCACCTCCCTACTAAGTCTGGAATGCAGCACATACATCCTCATCTATTAGGCATAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193093 135 + 636262 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193650 37 + 647215 TTTATTAATACCTGGGGAGAAAGTCAATGCAATTTGG a s mr.mrrefChr5 58178 13 + 294542 TTCATGCAGGTGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203517 13 + 636262 TTTATGCAGGTGG s simRat_chr6.simRat.chr6 193687 13 + 647215 TTCAGGCAGGTGA a s mr.mrrefChr5 58191 261 + 294542 GATCAGACCAGTCCCTCTAAACAACCTTATTGTTACCTAAAGGACATTGAGGTTTCTATCAAGATTGAATAACAATGGAAAGAAATGGGGAAGATGTACTTTATAAGTTAGTCTCAGACAGTTCTACACTTGATGTAGGTTGAATGAGATTTCAGATAATAAAAAGAGAAGGTCTGACAGTTCCTATCTTTAGGGTAAACAATTCTCTTGAAGTGAAGCATGTGTGTAATGACTGATGATTTGTTCAGTTATTCTGTGTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203530 248 + 636262 GATCAGAACAG--------AACTACCTTATTGTTAACTAAAAGACATTGAGATCTCTATCCAGATTAAATAACAATGGAGAGAAATGGTGAAGATGTACTTTATAAGTTAGTC-CAAAGAGTTCTACACTTGATGTAGGTTGAATGACATTTCAGATAATAAAAAGAGAAGGTCTGACAGTTCTCATCTTTA----AAACAATTCTCTTGAAGTGAAGCATATGTGTAATGACTGATGATTTGCTCAGTTATTCTGTGTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 193787 260 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 194071 235 + 647215 TTTCTCCAGTACCACACAAAATCATGCTATGTACTGGAGATTTGACCAGTACAGTTATGGGTCATGAAGTGTCAATATGTCCAGGG-CATATGACGTCCTCACTCGAAGGTATATTTGTATGATGTGTGATG---------CCCTAACAGAATCTTTTTATAGCTATGACACTATGTAAATTATGACTTC-TTGAAGGGAAAATGACTGGCTAAAATTCCCATGTGTTGACCATTGGAGTGCATTG a s mr.mrrefChr5 58702 39 + 294542 TGCTTTTGCAGACCATTGTTGCCACTACATCTATGGTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204027 38 + 636262 GGCTTTC-CAGACCATTGTTGCCACTACATCTATGGTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 194317 39 + 647215 TGCATTTGCAGCCCATTGTTGCCACTACATCTATGGTAT a s mr.mrrefChr5 58741 208 + 294542 AGTGATGGACCTGTGGCAGAACATATACTTCCTTTCTATAGGAGTCACATGTTTGAGGGCCTGAAGGATGTGTGGCTAACCCCTCCATTGAAGCTTTCATGGATCTAGTGATAAACTTTTATCTGGATGGCACTTCAGCAGACTTCACACACTGTAGCTATGCCACACATCAGGGGTGTCATAACTCTAATTACCAGTCAGTCATGGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204180 197 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 205354 103 + 636262 GCTTTCATTCTTTAGGCATCCTTCAATAACCTTGTGAGGATGACACTGGCTGCCCTGAATTCTTTACTTCTTAGCCAGTTCACTGACTTCAGAGAGTCAGAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 195638 95 + 647215 ----TCATTCTTTAGGCACCTTTCGATAACCTTGTGGGTACGACACTGGCTGTCCTAAATTCTTTACTTCTCAGCCAGCTTGCTGAC----GAGGATTGGAGG a s mr.mrrefChr5 60079 38 + 294542 TTTTACAGGCTTGCTGTGATAACACCGCAGTATGTTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205457 38 + 636262 TTTTACAGGCTTACTGTGATAACACTGCAGTATGTTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 195734 38 + 647215 TTTTCCAGGCTTGCTGTGATAACACCGCAGTATGTTTA a s mr.mrrefChr5 60117 355 + 294542 TGAGCATGTTGGTGGAGCAATATACTACTAGTCAAACAAGGAAGTAAGCTGGTTATTTCTAACCATACCCCTAGCCTTAGTGGTCTAGACCAAATCCTTTTCTAAACCGGATCCTTTTGGTTTGTCGCCAAAACTAAACAGGGCAGTGGAGTCTCACTTTCCTGCTCGGTGTGACCAGCCCTTGTAAGGAAACCACATGATGCAAAGTAAAAGCACTCTTCAAGTCCCCATCTTATATCTAAAAAGAAGAAAGAATGCATGAAGTTGGTTATGAAATCCGGCTGAGTCTTGTGCCTAGCTTGATATATTTTTTTCCCTTGGCTGTAATCATGTATTCATGCCTGCCTTTGCTGGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205495 355 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 210880 120 + 636262 TGGTGGACAACCTCTGGAGTCAGGGGCAAACAGACTGGATTAGGGGAACATGGCCAGGAGAGTAATACGCAGCACAAGCATGTGATATCCTACAGTCAAAGATGTAAGAACCATTGTGTC s simRat_chr6.simRat.chr6 201966 120 + 647215 TGGTGCACAACCTCTGGAGTTAGGGGCAAACAGACTGGATTAGGGGAACATGATCAGGAGAGTGATACGCAGTACAAGCATGTGGGATCCTACAGTCAAAGATGAAAGAACGATTGTGTC a s mr.mrrefChr5 65742 78 + 294542 TACTGTGTTTACTACTCATCCATGTATACAATTCACATTGTACTTGTTGTGCTAGCAAATACAAGTAGAATTTGGAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211006 78 + 636262 TACTGTGTTTACTACTCATCCATGTATACAATTCACATTGTACTTGTTGTGCTAGCAAATACAAGTAGAATTTGGAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 202086 78 + 647215 TACTGTGTTTACTACTCATTCATATATCCAAATCACATTAAACTTGTTCTGCTAGGAAATACATGTAGAATTTTAAAT a s mr.mrrefChr5 65820 59 + 294542 ATGGTACAACAGATGTGTCTGTATGGTTCCAAATCTTGTTTGTAAGCATTTGTTAGTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211085 59 + 636262 ATGGTACAACAGATGTGTCTGTATGGTTCCAAATCTTGTTTGTAAGCATTTGTTAGTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 202164 59 + 647215 ATAGTACAAAAGGTGTGTTTGTATGGTTCCAACTCTTATCTGTAAGTGTTTGTTAGTGC a s mr.mrrefChr5 65879 8 + 294542 GTGGCCGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211147 8 + 636262 GTGGCCGT s simRat_chr6.simRat.chr6 202223 8 + 647215 GAGGCCAC a s mr.mrrefChr5 65887 25 + 294542 GTTATTTGCATCTAAGCACACACAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211155 25 + 636262 GTTATTTGCATCTAAGCACACACAG s simRat_chr6.simRat.chr6 202232 25 + 647215 ATTATTTGCATCTAAGCACAGATAG a s mr.mrrefChr5 65912 57 + 294542 CATGGATTCTATAACCATCACTGTTACCAGTGTTGCTGTTGATAGGGACACCGTTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211180 57 + 636262 CATGGATTCTATAACCATCACTGTTACCAGTGTTGCTGTTGATAGGGACACCGTTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 202258 57 + 647215 CATGGGCTCCATAAGGATCACTGTTACCAGTGTTACTGTTCATAGGGGCACAGATTG a s mr.mrrefChr5 65969 12 + 294542 ACTTGTCACCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211258 12 + 636262 ACTTGTCACCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 202315 12 + 647215 ACTCGTCACCAT a s mr.mrrefChr5 65981 383 + 294542 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caggtttagatttccaggtttcgattaggattaaatacagcttatggggtcccagttttaggaacaccatgtaatgagtgcagggaggtagcaaataaactggagacatgtacacTGCTATCTGGAGTCTTATCCCTACTGTTCCTTTTGTTATCCACTTCCATTCTGTACACTAGCTGTAGGCTCTTTTGGAGAGCTCCAGTGAGAGCACAATTATGCCACTTTACCATTCCTAGGGTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212502 241 + 636262 taggtttagatttccaagtttcgattaggattaaatacagctcatggagtcagagctttaggaacaccatgcagtgagtgcagggaggtagcaaataaactggagacatgtacacTGCTATCTGGAGTCTTATCCCTACTGTTCCTTTTGTTATCCACTTCCATACTGTACACTGGCTGTAGGCTCTTTTTGAGAGCTCCAGTGAGAGCACAATTATGCTGCTTTACCAGCCCTAGGGTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 203569 239 + 647215 caggtttagattcccaggtttcaattaggattaaatacagcttatgaggtccctgttttaggatcaccatgtaatgagcatggggaggtagcaaaaaaactggagacatgtacacTGCTATCTGGAGTCTTATCACTACTATTCTTTTTGTTTTCCACTTCTATTCTG--CACCAGTTGTAGGCTCTTTTGGAGAGCTCCAGTGGGAGCACAATCATGCCACTTTACCATTCCCAGGGTGC a s mr.mrrefChr5 67382 7 + 294542 TTGCATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212743 7 + 636262 TTGCATG s simRat_chr6.simRat.chr6 203809 7 + 647215 TTGCATG a s mr.mrrefChr5 67389 219 + 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TGCTGGTGGATTTT----TGAGAAG----------CGTACATCTTTATAGGATACCAAGATATTTAGCCCTATTTTGAAGGGCCCTT----------------------------------AGGAGAGGAACAATAAGTGTGTGATGATGATTCTAAACAGGGAAACAAAATGGATAGAGTGGTGAACACATTGGTTGAGCTGCATAAGA----AAAAGAAGTGGGAGCCATAGACCCTCTCAGAATGAGGATGGTTTATCCTGTCACAAATTTTTTGAGC-AACCAAACCAATGAGTCCACCTGGCAAGGAAATTCAAGGAAGGAGAAGATAT a s mr.mrrefChr5 68187 66 + 294542 AGAAACCTAGTAGGAAGTGTTGCACATAAAGGAGGGCAAGAGTAAACTAGAGAGCACATTTCCAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213588 66 + 636262 AGAAACCTTGTAGGAAGTGTTGCACATAAAGGAGGGCAAGAGTAAACTAAAGAGCACATTTCCAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 204563 66 + 647215 AGAAACCCAGCAGGAAGTCTTGCACATAACGGGGGGCAAGAGAAAACTAGAGAGCATAATTCCAAA a s mr.mrrefChr5 68253 93 + 294542 CAAAGTCATAAGCTAAAGGGTATAGAATCTGAACCTAAAGTTGTAATATAGGAACCACAGTATGGCGTGAGTATTTGGTGCAAGAGCATTTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213656 93 + 636262 CAAAGTCATAAGCTAAAGGGCATAGAATCTAAACCTAAAGTTGTAATATAGGAACCACAGTATGGCGTGAGTATTTGGTGCAAGAGCATTTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 204629 93 + 647215 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TGTTGATTG---TTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCATAAACAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGAAATTTTCAACAACAATTTTAATCTTTCTCCATAGGTG a s mr.mrrefChr5 73033 11 + 294542 CTTGGATTTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218536 11 + 636262 CTTGGATTTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 209480 11 + 647215 CTTGGATTTTC a s mr.mrrefChr5 73044 133 + 294542 GAATACTATCTCCTGGTATCCCTTTGCTGGTCGATACCTCATCCACTATTTAGACATATGTCAATCACACACCTATAAATCCCTTAACTACTACTTCTGGATACTCATGAGCTACTACTGGCTCCTCATGTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218548 133 + 636262 GAATACTATCTCCTGGTATCCCTTTGCTGGCCGATACCTCATCCACTATTTGGCCATATGTCAATCACACACCTATAAATCCCTTAACTACTACTTCTGGATACTCCTGAGCTACTACTGGCTCCTCATGTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 209491 129 + 647215 GAATACTATCTCCTGGCATCCCCTTGCTGGTCAA----TCATCCACTATTTAGACATATGTCAATCACACACCTATAAATCCCTTAACTACTACTTCTGGATACTCACCAGCTACTTCTGGTTACTCGTGTTA a s mr.mrrefChr5 73177 186 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 209766 56 + 647215 ---CTAACTGTGACGTTGGTAGAAGAACATACTGATGCATTTATCACCTTACAATTATG a s mr.mrrefChr5 73443 45 + 294542 CAAGGTTAAATGACCAGGTATTAAGCTCTGGGTGGTGATTTGTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218954 45 + 636262 CAAGGTCAAATGACCAGATATTAAGCTCTGGGTGGTGATTTGTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 209822 44 + 647215 CAAGGTTAAATGGCCAGGTGACAAGCTCTGGG-AGTGATTTGTGT a s mr.mrrefChr5 73488 38 + 294542 ACAACCGAACTGACGAATTGGGCTAAGTTGCAAACTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219002 38 + 636262 ACAACCAAACTGACGAATTGGGCTAAGTTGCAAACTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 209866 38 + 647215 ACAACTGACCTAACAAATTGGGCTAAGTTGCACATTAA a s mr.mrrefChr5 73526 494 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 221063 24 + 636262 CATGCATTACAGCCATCTTCTCTA s simRat_chr6.simRat.chr6 211792 24 + 647215 TATGCATTACAGCCATCTCATCTA a s mr.mrrefChr5 75298 74 + 294542 ACAGACGGTTATTGTGAGTATGTGCATCAATATGCCCTCCTTTCAATTATACCAAGCCAATGCGACTGTAGAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221087 74 + 636262 ACAGACGGTTATTGTGAGTATGTGCATCAATATGCCCTCCTTTCAATTATACCAAGCCAATGCGACTGTAGAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 211821 74 + 647215 ACAGATGGATGTTTTGAGTATGTGCAACAATATGCCCTCCCTTCAATTATGCCAGGCCAATGCAACCGTAGAAT a s mr.mrrefChr5 75372 138 + 294542 ACCCCTGGATCAGTCTTGCTTGCTCTCTTATTGCAGTGCAATGACCGTTAGTCTCTCAGTGTAAGACTTATCAAAGGGGTGAGTTCTCATATGTACTAACAGTACCCTGACATGTCATTAACTCCAATATTATTGAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221163 138 + 636262 ACCCCTGGATCAGTCTTGCTTGCTCTCTTATTGCAGTGCAATGACCGTTAGTCTCTCAGTGTAAGACTTATCAAAGGGGTGAGTTCTCATATGTACTAACAGTACCCTGACATGTCATTAACTCCAATATTATTGAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 211895 138 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 225547 24 + 647215 TCCTATGTTAACTGGCTGTGCAAC a s mr.mrrefChr5 88406 29 + 294542 ATTAAGATATGGCTAGCAATCTCATGATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234898 29 + 636262 ATTAAGATATGGCTAGCAATCTCATGATC s simRat_chr6.simRat.chr6 225577 29 + 647215 ATAACAATATGACTAGCAATCTCAAGATC a s mr.mrrefChr5 88435 171 + 294542 AATTTTGAGCTGAGCTTAACAACCCCATTGGCTCACACGATTATCATTCATGTGCTTTGTTTCCACTTTCCTATTAGGCATCCAGGGACTAATTAGAGGGCTATTAGCCGCTATTAACCTTGGGATTATTGCTGAAGACAATTCAGGCCAATCACCGACCTATGATATACC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234927 171 + 636262 AATTTTGAGCTGAGCTTAACAACCCCATTAGGTCACACGATTATCATTCATGTGCTTCGTTTCCACTTTCCCATTAGGCATCCAGGGACTAATTAGAGGGCTATTAGCCGCTATTAACCTTGGGATTATAGCTAAAGACAATTCAGGCCAATCACCGACCTATGATATACC s simRat_chr6.simRat.chr6 225619 171 + 647215 AATTTCGAACTGGGCTTAACAACCCCATTGGCTCACACGATTATCATTCATCTGCTTTGTCTCCACTTTCCTATTTGGCATCCAGGGACTAATTAGGGGGCTAGTAGCAGCTATTAACCTTGGGATTATTGCTGAAGACAGTTGAGGCCAATCACCGACCTATGATATACC a s mr.mrrefChr5 88606 38 + 294542 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----------CAAGTGGGCAAAGTAATTCCCCCAGTTATTGCCAAAGGGCCTGTACTGTTATCTCAAATCCTCTGTCTTGGTGCCTAGAGGCAGGCTAGTATCTTTGCAGATTTGTCACTCTAGGATTGGTATGCAGATAGAG a s mr.mrrefChr5 92623 265 + 294542 GACTCTTAAGGATTCCAACATCTGCTATGTGCAATTCAACCCTCCTGAGATTCTGGGTTGCAAAATTAGAAATATCATTGAGATATTCCTTAATTTAAGTGGACATGAATTAGCAAATGATATGACATCAGTGACCCTAACTACATGTGTCCACCAGATTAACTTCATTTTCTGTGATGACAAAATTGTTTGTCATCAGGGCTGATTGTAGATGGTCTATGGCCTGAAAAGATAGCCAAAGCAGAAAATGAACAACTACTTTGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239509 263 + 636262 GGCTCTTAAGGATCCCAACATCTGCTATGTGCAATTCAATCCTCCTGAGATTCTGGGTTGCAAAATTCGAAATATCATTGAGATATTCCTCAATTTATGTGGACATGAATTAGCAAATGATATGACATCAGTGATCCTAACTA--TGTGTCCACCAGATTAACTTCATTTTCTGTGAGGACTCAATTGTCTCTCATCAGGGCTGACTGTAGGTGGTCTATGACCCGAAAAGATAGCCAAGGCAGACAATGAACAACTACTTTGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 230108 262 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 231543 63 + 647215 ACAGTCACCCGTTATTCTTCTTAAAGGGTTTTGTCTCACTATGGCAAGTGTTTAATACTTTTC a s mr.mrrefChr5 94163 170 + 294542 TCTAATTCTATGAAGGAGTATTGTACTGTTGATCTACTCTAGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGCAATCACTATCATCCTTAATGATGTGGCTAACGGCATCTGGTTCATTGGTATTTCACTAACTCAACCTTGGGTAGATACTCTAGCTACTACATCTTTCCTCCCCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241103 166 + 636262 TCTAATCCTATGAAGGAGTATTGTACCGTTGATCTA----GGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGAAATGACTAGCATCCTTAATGATGTGGTTAATGGAATTTGGTTCATTGGTATTTCACTAACTTAACCTTGGGTAGATACTCTAACTACTACATCTTTCCTCCCCCC s simRat_chr6.simRat.chr6 231607 170 + 647215 TCTAATTCTCCGGAGGAGTATTGTACTGTTGATCTACTCTAGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGCAATCACTATCGTCCTTAATGATATGGCTAACGGCTTCTAGTTCATTGGTATTTCACTAACTCAACCTTGGATAGATGCTCTAGCTACTACATCTTTCCTCCCCCC a s mr.mrrefChr5 94333 28 + 294542 AGTAGAGGCCGTACACATTTGGGAACTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241270 28 + 636262 AGTAGAGACCGTACACCTTTGGGAACTG s simRat_chr6.simRat.chr6 231777 28 + 647215 AGTAGATGCGGTACACATTCGGGGAATG a s mr.mrrefChr5 94361 83 + 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TGAGCTACAGCAGGAGTAGATCTCAGAATTATCTAGGATAACATGCAGTAATCTGCCCACGGAGTGAATCAGCTAACCTTGTCAGTCGTGATTTTAACTTAATACTTCCAGTACTCACACAATGCTAGGTATCATTTAAAGCCCCCAGCTGTGGTGAGGGTT--------AAGACCCTGGGATTACACATGGAGAGTCCTGGAGAGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 232400 208 + 647215 TGGACTACAGCAGCATTAGGCCTCAGAATGCCCAAGGATAACATATGGTAAGCGGCCCAAGAAGTGACTCGGCTTACCACATGAGTTGTGAGTTTTACTTAATACTTCTAGTACTCTCACAATGCAAGGAATCGTTTGGAGCCCCCAGCTGTAGTGAGGGGTCACTTCAGAAGAGCCTGGGATTACATATGGAAACTACTGGAAAGGT a s mr.mrrefChr5 95163 94 + 294542 GTCACAGGTAGTCACAGGGCTTGTGGGCATGTTTTGAACTTTACAGTGATGGATGGCACATGCCATGAATATACCGCAAATACCTCTTGAATAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242117 66 + 636262 ----------------------------ATGTTTTGAATTTTACAGTGATGGATGGCACATGCCATGAATATACCGCAAATACCTCTCGAATAA s simRat_chr6.simRat.chr6 232616 94 + 647215 GTCACAGGTAGTCACAGGGCTTGTGGGCATGTTTTGAACTTTACAGTGATAGGTGACACATGCCATGAATAGACCACAAATACCTATTAAATAA a s mr.mrrefChr5 95257 97 + 294542 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------------------------------GTACACTTCTTTTGCGAGCTCCCAGTTAGATGAAACTGGATA-------------AAATGCCTTGTGAAGTGAGTCAGATTGTGAGGTCCCAGATTAGGAGACATATATGGATTGACTGTCTGATTAAGCTTGCTGCACATCGCTAAGCAAGCTGCCAAATGATTTATATATTACCATAGTTTTTCCTTCGCCATTGTGAAAGGCTACAAAAAGTAATGCGTACTCTCTAACAATGATGTGACTCAGTCTTGTTAGGTTGTCAGGATCAAGTGATACATCTCAGTTAATGATACATTAGATGATGTAAAACGCTAGACCTCTTCCAATCATGGGCTCAC a s mr.mrrefChr5 95800 8 + 294542 AAtccAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 689 8 - 636262 AATCCAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 352577 8 + 647215 ccaccTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 66880 3 - 647215 AA-----A a s mr.mrrefChr5 95808 24 + 294542 GACTTCGAAGTCGCAAACAAAGCG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242718 24 + 636262 GACTTCAAATTCACAAACAAAGCG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 697 24 - 636262 GACTTCGAAGTCGTGAACAAAGCG s simRat_chr6.simRat.chr6 352588 24 + 647215 GGCTTCTAAGTCGCAAACAATGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 66883 19 - 647215 GG-----AAGTCGCAAACGAAGCA a s mr.mrrefChr5 95832 4 + 294542 TACG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242742 4 + 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atggaacttcctgtacaatggttccagcgaatatgatgtcaggtcactgggtcagtactgatgccgagggcagagtcccccccacagaatcgcctaccccatt s simRat_chr6.simRat.chr6 353021 103 + 647215 atggtccttcgtgtacaacggtaccaccaaacatgatgtcaggtcactgcgtcagtacagatgccgagggtggcgtcccacccacaaagtcacccaccccact s simRat_chr6.simRat.chr6 67160 65 - 647215 atggtacttcctgtacaacagtgccactgtacatgatgtcaggtcgctgggtcagtacagatacc-------------------------------------- a s mr.mrrefChr5 96210 10 + 294542 TAGGTATAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243131 7 + 636262 CAAGTAT--- s simRat_chr6.simRat.chr6 233210 10 + 647215 TAGGTATAGC a s mr.mrrefChr5 96220 42 + 294542 CAGTCTCAAGAAGAGTTAGGGTGCTTCGTGGTGAATTTCTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243138 41 + 636262 -AGTTTCAAGAAGAGTTAGGGTGCTTCGTGGTGAATTTCTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 233221 42 + 647215 CAGTCTGAAGAAGAGTTAGGGTGCTTTGTGGTGAATTCTTGG a s mr.mrrefChr5 96262 148 + 294542 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TGTTCAATTGCTCAGAGCTTTGCTAATTAAGAAGTGTGTTCAAGAAGGC----------ACTTGTATTAGCTTGTCGTA a s mr.mrrefChr5 99747 273 + 294542 TTACCTTGTGGTAAGGTAACTATAGATACATACCTCTATGTGTTCATGGCATTAACTTTGTCATAACTTCAATCTGCTTATAAGGGTTTACTGCAGTTACACTTCACAAGGAAATATGATGATTACAACAGGAGAAATCAAGATAACTTCAGTAAAATAAAGACATGGCAGCTTCATTTAGTGTAACCTTGAACTGCATATTCAATTAAATATAACCAGCTCCTGGAGACAGGTTAGAACCATTGCTAAGCTTCCTGTTCCTTTTTGAGGACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246958 273 + 636262 TTACCTTGTGGGAAGGTAACTATAGATACATACCTCTATGTGTTCAAGGCCTTCACTTTGTCATAACTTCAATCTGCTTACAAAGGTTTAATGCAGTCACACTCCACAAGGAAATATGATAACTACTACAGGAGAAATCAAAATAACTTCAGTAAAATAAAGACATGGCAGCTTCATTTAGTGTAACCTTGAAGTGCATATTCAATTAAATATAACCAGCTCCTAGAGACAGGTTAGAACCATTGCTAAGCTTCCTGTTCCTTTTTGAGGACA s simRat_chr6.simRat.chr6 237078 264 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 247368 15 + 636262 GGGTGACCTGATATA s simRat_chr6.simRat.chr6 237469 15 + 647215 GGGTGACCTGATATA a s mr.mrrefChr5 100162 96 + 294542 AGACTTCATTCTTTGACATGTCAGCTGGGTAGCATTCAACTTATATCATTTTTGCTCAGTGTACTGAACAACTCTTTCAGACACCCCTATAGTGGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247393 96 + 636262 AGACTTCATTCTTTGACATGTCAGCTGGGTAGCATTCAACTTATATCATTTTTGCTCAGTGTACTGAACAACTCTTTCAGACACCCCTATAGTGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 237484 96 + 647215 AGACTTTGTTCTTTGACAAGTCAGCCACATAGCCCTGAACTCATGACGTCTTAGCTAGGTGCACTGAACAACTCCTCTGGACACTGGTATAGTGGC a s mr.mrrefChr5 100258 189 + 294542 CATATTTGCTTAATTCTATTAAGAAACTCACTCCCGACTATCTAGGTGCCTTTGAGACCCACTGCTCGCAGAAAAGATGAGCCCCCACATACCAGCTAGCTACTGAATGCACACAATGGAATATACTCAGTCACAAACTGAAGTTCTGCATCCAGTTGTCACACTGGTATGACCAAAATGCAAAAGAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247491 189 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 247767 5 + 636262 CTTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 237850 5 + 647215 CCTCA a s mr.mrrefChr5 100532 117 + 294542 ACATAGCTGCTTTATTCTTGGCAAATCTTGGTAAGCAGGAATCATCAGAAACATGCAGTCCACATCTCAACTGTCCATTGGTGTATTTCTAGACCCTGCAAGAATGTATTATCACAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247773 117 + 636262 ACATAGCTGCTTTATTCTTGGCAAATCTTGGTAAGCAGGAATCATCAGAAACATGCAGTCCACATCTCAACTGTCCATTGGTGTATTTCTAGACCCTGCAAGAATGTATTATCACAG s simRat_chr6.simRat.chr6 237855 117 + 647215 GCATAGCCCTTTTAATCTTGGCAAATCTTGGTAGACAGAGGTCATCAGAGACTTGCAGTCAGCTTCTCACTTGTCCATTGGTATATTCCTATACCCTACAAGACTGTATTATCACAG a s mr.mrrefChr5 100649 131 + 294542 GGAATGAAAGACAAAAAAAATGAAAGTCATTCTTAGTTTTGATTCCTTAGACTTCCACTGAAGCTACCAGAGGTGGGCGGTTAGATAGTCCATGTGTATTAACAAAGTAACTGATCAATGATACCCTATTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247890 131 + 636262 GGAATGAAAGACAAAAAAAATGAAAGTCATTCTTAGTTTTGATTCCTTAGACTTCCACTGAAGCTACCAGAGGTGGGCGGTTAGATAGTCCATGTGTATTAACAAAGTAACTGATCAATGATACCCTATTG s simRat_chr6.simRat.chr6 238006 131 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 238671 78 + 647215 ATACTTTTTTAGGTATGGGTCCCTCAAGCTAGTAGCCAACTCACAAACGATGCCAATGAAGCAGTAAGGAACGATGTA a s mr.mrrefChr5 101360 64 + 294542 TGAATCACAGTGTCTGCTTAAACTCTTTGTGCGCACTAGTATTTAATATGTGACTTGCCCAGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248639 64 + 636262 TGAATCACAGTGTCTGCTTAAACTCTTTGTGCGCACTAGTATTTAATATGTGACTTGCCCAGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 238762 64 + 647215 TGAATCACAGTGTTAGCTTAAGCTTTTTCCAAGCACTAATATTCAATGTTTGACTTGCCCAGTT a s mr.mrrefChr5 101424 39 + 294542 AGGGGGAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTggcac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248749 38 + 636262 AGGGGGAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTg-cac s simRat_chr6.simRat.chr6 238826 39 + 647215 AGGGTTAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTGGCAC a s mr.mrrefChr5 101463 126 + 294542 tctcttgctaggggagaggtcttgtccctagcatacatatcttgtcctgaaacaactgaacggaactgagctcagtgtcatcctacagatgttgcagataagcactcacaaaggtgggctgtctct s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248787 126 + 636262 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s simRat_chr6.simRat.chr6 241723 59 + 647215 GCATTGGCAACTCATTTGTGCACCTGTGTTGGATGTTATACCGCAAAATTAGTTAATCT a s mr.mrrefChr5 104492 65 + 294542 TCCTACTAGATAGCATGTGGAATCAGTAATTCAAACCCTTCAAAAGTAGCTACGAGCATCCAGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251845 65 + 636262 TCCTACTAGATAGCATGTGGAATCAGTAATTCAAACCCTTCAAAAGTAGCTACGAGCATCCAGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 241782 65 + 647215 TCCGACTACGTAACATGGGAAATAAGTAATTCAAACCCTTCAGAAATAGCTTAGAGTATCCAGTA a s mr.mrrefChr5 104557 53 + 294542 GGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATTGCAGAATTTTAGCTCTAAAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251910 53 + 636262 GGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATTGCAGAATTTTAGCTCTAAAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 241848 53 + 647215 AGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATCGCAGAATTTTAGCTCTAAAGT a s mr.mrrefChr5 104610 40 + 294542 AATCAATTGTCACAACTGTAGGACAAACAGTTATCCCTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251970 40 + 636262 AATCAATTGTCACAACTGTAGGACAAACAGTTATCCCTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 241901 40 + 647215 AATCACTTGTCACAACTGTAGAGCAAACAGCTATTAATTA a s mr.mrrefChr5 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-----------------------------------------------------------------------AGTCTAGACAACGCCAT----- a s mr.mrrefChr5 105858 71 + 294542 AAGTAGAACTTTCAGTGAGAATGATGAAGTCACTAACCAATCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGATCTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253151 71 + 636262 AAGTAGAACTTTCAGTGAGGACGATGAAGTCACTAACCAATCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGATATTC s simRat_chr6.simRat.chr6 242981 70 + 647215 -GGTAAAACTTACAGTGAGAATGATGAACTCACTAACCAACCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGGCCTTC a s mr.mrrefChr5 105929 26 + 294542 AAGTGTAGTCTAGTGTACAGTTATTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253223 26 + 636262 AAGTGGGGTCTAGTGTACAGTTATTA s simRat_chr6.simRat.chr6 243051 25 + 647215 AAGTGTAGTA-AGTGTACAGTTATTA a s mr.mrrefChr5 105955 106 + 294542 CCTGCACGTCACTTATTTTAGTAACAGCTCAATACTGTAATAGTGGCTACAGATATTAGTATTACCTCCACTATTTTTTGCCCTTGTACCACATTGTAAATCATCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253249 90 + 636262 CCTGCACGTCAC----TTCAGTAACAGCTCAATACTGTAATAGTGGCTACAGATATTAGTATTACCT--ACTATTTTTTGAC------CCACATTGT-AATCA--- s simRat_chr6.simRat.chr6 243080 106 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 253514 27 + 636262 TAATAGTAACCACCAATCCAGTAAACT s simRat_chr6.simRat.chr6 243359 27 + 647215 TAACAGTAACCTCCAACCCAGTAAACC a s mr.mrrefChr5 106226 88 + 294542 CAACAGACAGCATTTTTATTCTGATGTACCTGCCGTAGTAAGAAATAGCTCAACCAGCAAATCATGGTTTAACCGATTAATTTTGTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253542 72 + 636262 CAACAGACAGCATTTTTATTCTAATGTACCTGCCGTAGTAAGAAATGGCTCAAT----------------AGCCGATTAATTTTGTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 243386 88 + 647215 CAAAAGAGATTATTTTTATTCTGCTGTACCTGTCATAGTAAGAAATAGCTCAACCAGCAAATCATGGTTTAACCAATTAACTTTGTCA a s mr.mrrefChr5 106314 229 + 294542 TTTCGACTTGGAAGGCTTTGGGAAATTCTTTTAGCATAAACCAGGGTTGTCATTGTTTAGCCAATTATGACAAAAGAAGGTCAAACCAAGAAGATCCATATATTCATACATTTTGCATAGAAGCCCATAACACTCCGTGCCAGAGACATTTAATTACAGAACTCCTTGGTACTACCTTTGTTGTTTTTTATGTGCTATCAGAGGCAGGTTAATTACCAGGCCCAAACAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253616 229 + 636262 TTTCGACTTGGAGGGCTTTGGCAAACTCTCTTAGCATAAACCAGGGTTGTCATTGTTTAGCCAATTATGACAAAAGAAGGTCAAACCAAGAAGATCCATATATTCATACACTTTGCATAGAAGCCCATAACACTCCGTGCCAGAGACATTTAATTACAGAACTCCTTGGTACTACCTTTATTCTTTTTTATGTGCTATCAGAGGCAGGTTAATTACCAGGCCCAACCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 243474 221 + 647215 --------TGGAAGGCTTTGGGAAATTCTTTTAGCATAAACCAGGGGTGTCATTGTTTAGCCAATGATGACAAAAGAAGGTGAAACCAAGAAGATTCATAAATTCATAAATTCTGCATAGAAGACGATAACACTCCATGCTAGAGACATTTGATTACAGAACTCCTCAGGACTGCCTTTGTTGTTTTTTCTGTGCTATCAGAGGCAGGTTCATTACCAGGCCCAGACAA a s mr.mrrefChr5 106543 68 + 294542 ACCAATATAAGCGAGATAGTAATGTCACTTAGCTGTGGTCTACTAATAATCACCTGAGGAGAAATAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253845 68 + 636262 ACCTACATAAGCGAGATTGTATTGTCAATTAGCTGTGGTCTACTAATAATCACCTGAGGAGAAATAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 243701 68 + 647215 ACCAATACAAGGGAGATAGTAACATCACTTTGCTGTGGTCTCCTAATAATCACCTGATGAACGATCAG a s mr.mrrefChr5 106611 121 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 245276 123 + 647215 TCATGATGGACTCTAACTAATAAGACATTGGCTCCATCACATACCGTTGCTCTGACCCTACTCTGCACTCAAGTGTAGTACACATGCTGTCCTATTATCTATCACAGTCTCATGGGGCTGTCA a s mr.mrrefChr5 108205 71 + 294542 TGATGTCATGTATTTAATTATGGGTAAGAGTAAGGGTGTCCTTACTTGGTCTCAGTAGTATAGGAAGATAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255608 71 + 636262 CGATGTCATATATCTAGTTATGGGTAAGAGTAAGGGTGTCCTTACATGGTTTCGGTAGTTTAGGAAGATAA s simRat_chr6.simRat.chr6 245399 67 + 647215 TGATGTCACGTATTTAATTAT----AAGGGTAAGGGTGTCCTTACTTGGTCTCAGTAGTATAGGATGATAA a s mr.mrrefChr5 108276 156 + 294542 GTTTCAGCATTAGATGGCTTGACATCAGGCTCAGAACACAGGAGAGAAGTACCACGATACTGCGACAAAAGACACTACAACCCTCAGACTAGCAGCAGGGCGGACAAAACATAGAGACAGTAGGTGGTCCCTACTAACAGAGTTCAAACTAACTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255680 99 + 636262 GTTTCAGCATTAGATGGCTTGACATCAGGCTTGGAAGAGAAGAGAGAAGCACCATG---------------------------------------------------------GAGACAGTAGGTGGTCCCTACTAATAGAGTTCAAACTAACTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 245466 156 + 647215 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AGCAAATAAGCTACCCATTATATAAATAACAAACTTTATGCTTAAGGTGTGCTCCACTAAAGATCCTTTGATTCATAAACCCTTACTTTATGGCCCAGAATAACAAAGAACAACAAATGTGAATACATAAATGTCAGAGTCTCAGAGGAGTCCCCGACTAGCTTAAGCCCTGAGGATACATCTCCCAGTTAGGATCTAAGAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAGACTTTGTCACCTTTGCATTGCTCCGCCTGTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256408 263 + 636262 AGCAAATAAGCTACCCATTATATAAATAACAAACTTTATGCTTAAGGTGTGCTCCAGTAAAGATCCTTTGATTTGTAAACCCTTACTTTATGGCCCAGAATAACAAAGAACAACAAATGTGAATAAATAAATGTTAGAGTCTCAGAGGAGTCCCTGACTAGCTTAAGCCCTGGGGATACATCACCCAGTTAGGATCTAAGAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAGACTTTGTCACCTTTGAATTGCTTCGCCTGTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 246253 253 + 647215 AGCAAGCAATATACCCATAATTTAAATAACAAACTTGTTGTTTAAGGTGTGCTCTGCTAAAGATCCTCTGATTCATAAACCCTTACTTTATGGACCAGAGT----------AACAAACGTGAATGCATAAATGTCAGAGTCTCAAAGGAGGCCCCGACTAGCTTAGGCCCTGAGGATACATCTCCCACTTAGGATCTAGAAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAAACTTTGTCACCTTAGCATTGCTCCGCCTGTTA a s mr.mrrefChr5 109295 104 + 294542 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TGGAACTCTATGCGGTGCTGCATGTCCACAATTAGCTTCTACCTTTGAATATGGTTATGATTATGGTAGTGAGATTTGTAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 400322 82 - 647215 GGGAACTCTATGGTCTGCTGCAAGTCCATAATTAGCTTCCACCTTGGAGCATGGTTATGATTTTGGTAGTGAGATTTGATTT a s mr.mrrefChr5 109750 15 + 294542 CTATTAGCTTTGTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257130 15 + 636262 CTATCAGCTTTGTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 400408 15 - 647215 CTATTACCTTTGTAC a s mr.mrrefChr5 109765 80 + 294542 AAAGTGAACTTTATCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGATCAGAGATGTGATGTGCAACTACAGTTGAGTTGCCCATGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257156 79 + 636262 AAAGTGAACTTTATCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGAT-AGAGATGTGATGTGCAGCTACAGTTGAGTTGCCCATGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 400423 80 - 647215 AACATAAACTTTGTCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGATCATAGATGTGATGTATGACTACAGTTGAGTTGCCCATGCA a s mr.mrrefChr5 109845 21 + 294542 CTGCATTCAAGATACCTATGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257235 21 + 636262 CTGCATTCAAGATACCTATGG s simRat_chr6.simRat.chr6 400504 21 - 647215 TTGCATCCAAGATACCTATGG a s mr.mrrefChr5 109866 80 + 294542 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GGTGATAGGTTCCTCCCAGGAAAGTAGCACAGGGGGCTGATAGAAGAGCTCCCTGTACCTATGATTGTCAGCATATGCCAGACCTCCTGTTTGGGATGTATGCACTGCCAAACTGGCTATAGATTACATTGGCAAATTAATTCCTTGAGCCCATTAATGCAGCAGCCTGGTATTGATTGGACTAGAGTTGGGCCTCTAAACACCAAGAGAAAGGAGAGAACATTTGTTAAGAAGGATTCTACATGCTACCGACCACACTAGTTAATCTTCTGTATCAAAATAACCCAGTCTACAACATTAAAATCTAACTTAGCCTGTTACTCGTGACACACCACTAAGTCATTGCTTTGAAGGCCATAACTTCTGTAGAAGCTACACTAGAAAAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257381 383 + 636262 GGTGATAGGTTCCTCCCAGGAAAGTAGTACAGGG-GCTGATAGCAGAGCTCTTTGTACCTATGATTGTCAGCTTATGCCAGACCTCCTGTTTGGGATGTACGTACTGCCCAACTGTCTATAGATTACATTG---AATTAATTCCTTGAGCCCATTAATGCAGCAGCCAGGTATTGATTGGACTAGAGTTGGTCTTCTAAACACCAAGATAAAGGAGAGTACATTTGTTAAGAAGGATTCTACATACTACCGACCACACTAGTTAATCTGCTGTATCAAAATGACCCAGTCTACAACATTAAAATCTAACTTAGCCTGTTACTCATGACACACCACTAAGTCATTGCTTTGAAGGCCATAACTTCTGTAGAAGCTACAGTAGAAAAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 247215 379 + 647215 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TGCTATCAAAAGATTGAATCCTCAAATTCCCCCTTAGTGCAAGAGTATCTGTATGTGGTGCAGTAGCCAAGTCTATTAATCTTTTAAGAGTCCGGTGCTAAAGCACCCAACAATGTGGTGACTTCCCTGAGTCTAAAATGATTGCAGGCAATAGACTTAAAAGAGCAATAGACCGATCTAGGAGATTGAGATTATCAGTGGAAAGAGTTCATGTTCTGGAGATACTCTACTATAATTGTGTCAGGAATTAGCTGTTCTTCCTTCCTTCAGAGTATGACAGAATTTGGTTATAGAGTAATCGCTCAAGGAAGTATGAGTACAGTAGGCCCTGTGCCTTTACTTGAATCTGTATTGTCTATAGGGTAGTCTTCTGTGTAATTCTGCAAAGCTGTGAGGAGCAAACACCCGC s simRat_chr6.simRat.chr6 248101 391 + 647215 TGCTATCAAAAGATTCAGTTCGCAAATTCCTCCTTAGTGCAAGATTATCAGTATATGGTGCAGCAGTCAGGTCCAGTAATCTTTTAAC------------AAGCATCCACCAATACGAAGAGTTCCATGAGTTTGAAATGATTGCAGGCAGCAGGCTCACAGGGGCAATAGACTGATCTAGGAGATTGAGATTATTAGTGGAAAGAGTTCATGC------AATCTTGTACTATAATTTTGTCAGGGATTAGCTGTTCTTCCTTTCTTCAGGATATGACAGAACTTGGTTATAGAATAATTGCCCATGGAAGTATGAATATGGTAGTCCCTGTGCTTCTACCTAAATTTATTTTGTTGATATGGTAGTCTTCTGTGTAATGCTGCTAAGCTGCAACAAATGAACACCAGC a s mr.mrrefChr5 111257 148 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 258782 217 + 636262 ----------------------------------------------------AGTAGTCCTCATTCTAGAATGGAACTCCTCTTGCACAGCTAGCTGGGGGGTCATACACAGATACATCAGTTACCCAGTTAAAAGAATACTACTAATAGTCTTCTAGTGTTCTGAGTGACCTTGGGAGTGGGGGATTCAACAGTACTGCACAAATGATGGAGTACATAGTGCACCTTCTGCAGCATTTTTACAGCAAGAGCATTTATAATCGGGTTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 248673 248 + 647215 TTCTGCTGGCACAGAGAAGAGTTACTGAGCTACAGATCTAGATAGCCCCTTCAGTAATGCTCATTCTAGGATGCAACTCCT-----------------GCGGTGATACACAGATACATCAGTTACCTGTTTAAAATAATATTACTAGTAGTCTTCTGGTGTTCTCATTGACCTTTGGAGTGGGGGATTCAACAGCACTGC----ATGATGGAGTACATAGTGCACCCTCTGCAGCATTTGTATAACAAGAGCATTTATATTTGGGCTCA a s mr.mrrefChr5 111701 86 + 294542 TGTTACCCAAGCCAGATATTCACCAGGCTTGTGGTGTATAAGGGACGAGGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259001 86 + 636262 TCTTGCCCAAGCCAGATATTCACCAGGCTTGTGGTGTATAAGTGACGCGGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTGG s simRat_chr6.simRat.chr6 248921 83 + 647215 TGTTACCCAAGCCAAATATGCACAGG--TTGTGGTGTATAAGGGATGAAGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTG- a s mr.mrrefChr5 111787 91 + 294542 CAAAAGCAGAATCCTTCTGATCTACACATTTGGACTATTGACATTTTACTTCCTTACTCCTAAAGCTTCGCTTTTCACTTTTGGCTTGGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259088 91 + 636262 CAAAAGCAGAATCTTTCTGATCTATGCATTTGGACTAATGACATTTTACTTCCTTACTCCCAGAGCTTCGCATTTCACTTTTGGCTTGGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 249004 80 + 647215 -----------TCCTTCTAATCTACACATCAGGACTATTGACATTTTACTTCACTACTCCTAAAGCTTTGCTTTTCAGTTTTGGCTTGGAT a s mr.mrrefChr5 111878 221 + 294542 TTTCATCTGATCTGTGGCAAATGTTGAGGGCTCTCCAGACTTGTTTCTAATATGGCCACGATAGATTACAGTTGGTTGCCATTTATTCTCTTTGCTTTTATCTTCCCTTCCAAACTTATGTCCTTAATACAAACAATCGCTGTCCTGACATCCAATATTCCCAACATGCTCCCACTGACAGTAACCACATGACCAAACGGAAGTTAGAACCATCATGCAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259180 210 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 260378 92 + 636262 ATCATTTATGGCAAATACACTGAGCGCTTGGTTGTATGTGCCAGTGAATATTTCCATG---TCAGGAGGAATAAGACCTACTACATCTTGAATTT s simRat_chr6.simRat.chr6 250163 92 + 647215 ATCATTGATGGCAGATACACTGAGTGTTGGCCTGT---TGGCAGTAAATATTTCCACAACCTCAGGAGGAGCAAGACCTACCACATTTTGAATTT a s mr.mrrefChr5 113039 113 + 294542 GAAGGTTTTCATAAAACCAGTGCAACTAATGGTAAATATCTTCTCTAGTTCGTCTGAGAAAAGTGATCGCATAACCTTATGCATTTGTGTGATAATGAGTGGTGGAATTCATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 260470 113 + 636262 GAAGGTCTTCATAAAACCTGTGCAACTAATGGTAAATATCTTCTCTAGTTCGCTTGAGAAAAGTGATCGCATGACCTTAGGCATATGTGTGATATTGAGTGGTGGAATTCATC s simRat_chr6.simRat.chr6 250256 113 + 647215 GAAGGTTTTTATAAAACCAGTGTAATTAATTGTAAATATCTTCTCTAGTAAGTCTGAGAAAAGTGATCTCATAACCTTATGCATTTGTGTGATAATGAGTGATGGAATTCATT a s mr.mrrefChr5 113152 34 + 294542 GAATACTCATGGACCAATGGGCACTGTTGTCAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374493 34 - 636262 GAATATTCCTTTGCCAATGGGCACTGTTGTCAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 250369 34 + 647215 GTTTACTCATGGACCAATGGGCACTGTTCTCCGG a s mr.mrrefChr5 113186 57 + 294542 ACTGCTCTATGTCTAATGTTGTGTCAATGAGTAAAACCTGTACTGAGGAGCTTGGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374527 57 - 636262 ACTGCTCTATGTCTAATGTTGTGTCAATGAGTAAAACCTGTACTGAGGAGCTTGGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 250404 57 + 647215 AATGCTCTATGTCTAACGTTGTTTCAATGAGTGAAACCTATACTGAGGAGCTTGGAA a s mr.mrrefChr5 113243 180 + 294542 AAAGAGTGCAGATAGTACAGGGGTAAGTTTATCAGTGCTAGCCCTCAGAAAATGTGCAGTATACCCTAATTACACCTACGTCTTAGAGAGTTGTAGGTGGATTTAAAAATCCATTTACTGACATCTGGTTGCCCACATTCACACTCCAGAACCAAGCTCTTTATGGTGATAGTAAAGTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374585 180 - 636262 AAAGAGTGCAGATAGTACAGGGGTAAGTTTATCAGTGCTAGCCCTCAGAAAATGTGCAGTATACCCTAATTACACCTACTTTTTAGAGAGTTGTAGGTGGATTTAAAAATCCATGTACTGACATCTAGTTGCCCACATTCACACTCCAGAACCAAGCTCTTTATGGTGATAGTAAAGTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 250461 180 + 647215 AAAGAGTGCAGATAGTACGGGGGTCAGTTTATCAGTGCTAGCCCTGAGAAAATGTGCCGTATACCCCAATTACACCTCCGTCTAAGAGAGTCTTAGTTGGATTTAAAAATCCATTTATTGACATCCGGCTGCCCACATTCACATTCCAGACCCAAGCTTTTTATGGTGATAGTAAAGTTG a s mr.mrrefChr5 113423 28 + 294542 CAAATCGAATATAAGTGAGGTCTAATAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374765 28 - 636262 CAAATCGAATATAAGTGAGGTCTAATAG s simRat_chr6.simRat.chr6 250645 28 + 647215 CAAATTGAGTATAAGTGAGGTCTCATAG a s mr.mrrefChr5 113451 17 + 294542 CTTGCATTATTCTCGGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374794 17 - 636262 CTTGCATTATTCTCGGG s simRat_chr6.simRat.chr6 250673 17 + 647215 CTTGCATTTTTCTTGGG a s mr.mrrefChr5 113468 145 + 294542 GAGGTCTGGGGTAGAAATACTGCATGGCAGGCAGTTGGATGAGTATTAGCACCAAATGAAATGTTGTCTGTATTTCCATCAGTCATGTGTCCCTAGTACAGATCTGTTATGGCAGCGTCCTGGACAAGATAGTTGAGATAGCACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374897 144 - 636262 GAGGTCTGGGGTAGAAATACCGCATGGCAGGCAGTTGGATGAGTATTAGCACCAAATAAAATGTTGTCTGTATTTCCATCAGCCATATGTCCCTAGCCCAG-ACTGTTATAGTAGCGTCCTGGACAAGATAGTTGAGATAGCACT s simRat_chr6.simRat.chr6 250690 142 + 647215 GAGGTGTGGGGTTGGAATAGTGCATTGGCAGCAGTTGGATGAG---TAACACCTAATGAAATGTTGTCCATATTTCCACCAGTCATGTGTCCCTAGTACAGATCTGTTGTGGCAGCATCTTGGACAAGATGATTGAAATAGCACT a s mr.mrrefChr5 113613 9 + 294542 AGGATTGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375043 9 - 636262 AGGATTGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 250832 9 + 647215 AGGATTGAT a s mr.mrrefChr5 113622 146 + 294542 CCTTGAGCACTTCTTCCTAGTTAATCTACATGTTTTCAACAGCAGAATGGAGATACAGTGAAGTCCGTGATGAAGCTAGGAAACTTAGCAGATTGAGCAGATATCCACTCTCAGGGCAGCACTTCCCAATGTCAACAATCTGTTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375055 146 - 636262 CCTTGAGCACTCCATCCTAGTGAATCTACATGTTTTCAACTACAGAATGGAGATACAGTGAAGTCCGTGATGAAGCTAGGTACCTTAGCAGATTGAGCAGATAACCACTCTCAGGGCAGCAATTCTCAATGTCAACAATCTGTTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 250841 146 + 647215 CCTTGAGCAATTCTTCCTAGTTAATCTACGTGGCTTCAGCAGTGGAATGGAGATACAGTGAAGTCCATGATGAAGCTAGGAGACTTAGATGGTTGAGCAGATATCCACTTGCAGGGCAGCACTTCCCAATGTCAACAAGCTGTTGA a s mr.mrrefChr5 113768 53 + 294542 TGCTCATCAAATTGCAGGAACAGTAGTCAATCTCATATTTGTTACCGAAAGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375203 53 - 636262 TGCTCATCAAATTGCAGGAACAGTAGTCAATCTCATATTTGTTACCGAAAGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 250987 52 + 647215 TGCTCAT-AAAGTGCAGGAACAGTAGTCCATCTAATATTTGTTACTGGAAGAG a s mr.mrrefChr5 113821 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simRat_chr6.simRat.chr6 251654 45 + 647215 CTCGGCTTGTTGTATTCATGACTAGAGACAGTAACTAATACAGGC a s mr.mrrefChr5 114456 252 + 294542 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCATCAAGCAGTATCCACAACGTTGCTAAGATTGATCATGCAAGGAATATGAAGTTTCATCATGGAGAATGGAGAATGGACACAGGAGAAGTGAGGAAACTTCTTGGACTACTACATTTGACTGTGTAGCGGTGGCTGAGTCTACATCAACGGTATGTACCTCTGTTCAGCAAATATGTTTTGTCTTTTAAGATGTTCCAGTATGGGAATAGATTTGCTAAGATGTCATGCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261915 251 + 636262 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCACCAAGCAGTATCCACAACATTGCTAAGATTGATTGTG-AAGGAATATGAAGTTTCATCATGGCGAATGCAAAATGGACAAAGGAGAAGTGAGGAAACTTCTTGGACTTCTACATTTGACTGTGTAGCAGTGGCTGAGTCTACATTAACGGTATGTACCTCTGTTCGGAAAATATGTTTTGTATTTTAAGATGTTCCAGTATGGGAATAGATTTGCTAAGATGTCATGCT s simRat_chr6.simRat.chr6 251699 252 + 647215 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCATCAAGCTGTATCCACAACGTTGCTAAGATTGATCATGCAAGGGATGTGAAGTTTCATCATGGAGAATGGAGGATGGACACTGGAGAAGTGGGGAAACTTCTTGGACTACTACCTTTGATTGTGTAATGCTGGCTAAGTTTACACCAATGGTATGTACCTCTGTGCAGCAAATATGTTTTGTCTTCAACGATGTTCCAGTAGGGGAATAGATTTGCTAAGACAGCAGGCC a s mr.mrrefChr5 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ATACTATTCTTCAGTAGCCCTCAAGTTAGGGATGGTACTCTAGTAGTGTTTTCTAAATGCATGTGATTGTTGTTAGGGTTTGAATGAATGTAGCCAAGTGTGGAACCATGATGATACAGTGTAATCCAATAGTGACATGCAGGTACAGCCTGttcccaaggcgcagtacaaagcgtatagcatacccatcatctatgtatttatggcaagtccccatggattgatgctggtcccctgatgatataattgtagaacttagaacCACATCTATGTGGTTAACGGAGTGCATGATCCTAGTGTATGACGGTGGTAacataatagtctgatatagtatgcatggattgttag s simRat_chr6.simRat.chr6 253637 348 + 647215 ATACTATTCTTCAGTAGCCCTTGTGTTAGGACTGACACTCTGGTGGTGTTTTCTAAATACATATGATTGTTGTGAGAGTTTCAATGAATGTAGCCAAGTGTGGAACTGTGACGATATAGTGTAATCcaacagtgacatgcaggtacaaccagttcccaaagtgcggtacaaagtgtatagaatatccatcatccgtgtgttttcagcaagtccccatgggttgatgctggttcccttatgatataattgtaaaacCTCGAGCCACACCTATGTGATTAAGCGAGTGCATGATTCCAGTGTgtgacgctggcaacataatagtctgatatagcatgcatggattgttat a s mr.mrrefChr5 116755 11 + 294542 aaatctcctaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264211 11 + 636262 aaatctcctaa s simRat_chr6.simRat.chr6 253985 11 + 647215 aagtcccctaa a s mr.mrrefChr5 116766 107 + 294542 actgaactgcttacaattgacactgtggagactgaaacactgataccatgcactcagatgatatttggctgttagcagggtccatacaggcaactttccagtgactg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264223 107 + 636262 actgaactgcttacaattgacactgtggagactgaaacactgataccatgcactcagatgatatttggctgttagcagggtccatacaggcaactttccagtgactg s simRat_chr6.simRat.chr6 253996 107 + 647215 attgaactgctcacaattgacactgtgcggactaaaataccactatcatgcactctaacagtgttatgctcctaacggggtccatacaggcgacttcacagtgactg a s mr.mrrefChr5 116873 70 + 294542 gaggtactggcaaagctgtgacagaaaactgtgggggcacaaaatgctcaattgttgggatttgccgcga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264330 70 + 636262 gaggtactggcaaagctgtgacagaaaactgtgggggcacaaaatgctcaattgttgggatttgccgcga s simRat_chr6.simRat.chr6 254119 70 + 647215 gaggtactgccaaagctatgacagaacaccgtgggggcacaaaatgcgtactttttggaatcatccgtga a s mr.mrrefChr5 116943 95 + 294542 gtaggctgtagaaaagggaaaaaattattcctaaaacaaaaggttgtaaaaacctctgataaactagcttgctgtcccaACAAACACCTGGATGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264401 95 + 636262 gtaggctgtagaaaagggaaaaaattattcctaaaacaaaaggttgtaaaaacctctgataaactagcttgctgtcccaACAAACACCTGGATGA s simRat_chr6.simRat.chr6 254189 95 + 647215 gtaggctgtaaaaaagggaaaaagttattcctaaaacagaagattatcaaaacctctgataaaccagcttgctgtcccaAAAGACCCATGGATGA a s mr.mrrefChr5 117038 66 + 294542 CTGGGTAGTGCTAGAATTTGAGGACTTCGGTGACTATCACCAAGCACATGTACTAGAGTTTACTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264501 66 + 636262 CTGGGTAGTGCTAGAATTTGAGGACTTCGGTGACTATCACCAAGCACATGTACTAGAGTTTACTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 254284 66 + 647215 CTGGGTTATGCTAGAACTTGAGGCTTTTGGCAACTATCACCAAGTACATATACTAAAGTTTACTTT a s mr.mrrefChr5 117104 19 + 294542 GCTCAACGAATAATTGGGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264567 19 + 636262 GCTCAACGAATAATTGGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 254351 19 + 647215 GCTCAACGAATAATTAGGC a s mr.mrrefChr5 117123 23 + 294542 GAGACTGCCATCACAAGAGTTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264619 23 + 636262 GAGACTGCCATCACAAGAGTTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 254370 23 + 647215 GCGGCTGCCACCACAAGAGTTGA a s mr.mrrefChr5 117146 59 + 294542 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tataagcagtctattaaaataataacaaagaatgttgaatctctcaagggatcattttgcgagccagaagtctgggctgcagtattactgacaccatcagcatcacatttccatcttttaaaagcaccctatcaggaacttgcaattttcataatataatGAAGATCATTATGGTAtgccagtatttctgctatctggaaggcttggtatatgaccagaccagacttggcatacacccaagtgtgCCCTCTGCACTTGCTTACCACAGGTTAAAAAGGGTGACCACATGTC a s mr.mrrefChr5 117912 67 + 294542 CTATACAGACGGCTGAACACGGTGGATTCATAGGCCTGTGCTACTCTTTTACTCTGGAGTCATTATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265579 67 + 636262 CTATACAGACGGCTGAACACGGTGGATTCATAGGCCTGTGCTACTCTTTTACTCTGGAGTCATTATT s simRat_chr6.simRat.chr6 255101 67 + 647215 CTATACTGACAGCTGAACATAATGGATTCATAGGCCTGTGCTACACTTTTAATCGGGAGTCATCATT a s mr.mrrefChr5 117979 6 + 294542 AACCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266364 6 + 636262 AACCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 255168 6 + 647215 GACCCT a s mr.mrrefChr5 117985 54 + 294542 GATATTGTTTCATTTCCCGGCTGCCCTCTAGATAAATGGAACTTGATGACCATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266381 54 + 636262 GATATTGTTTCATTTCCCGGCTGCCCTCTAGATAAATGGAACTTGATGACCATT s simRat_chr6.simRat.chr6 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gtaggttcctatctcctccacagttaaagtaaattcctacccttgctgaggctagtagggcttcaggtggaagTCTATAGGTGCCTCTGATAGCTTGACAGCACAACAAGCGGGGCCTGCTCACAGCCAAGTTACTAACTGCATGCACATGGCTACATTTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267295 162 + 636262 gtaggttcctatctcctccacagttaaagtaaattcctacccttgctgaggctagtagggcttcaggtggaagTCTATAGGTGCCTCTGATAGCTTGACAGCACAACAAGCGGGGCCTGCTCACAGCCAAGTTACTAACTGCATGCACATGGCTACATTTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 256190 162 + 647215 attagttcctatcccccccactgttggagtaaactcctacctttgctggggttagtaggacttcaggttgaagTCTATAGGTGCCTGTGATTACTTGACAGCACATCAAGCGGGGCAGGCTCAGAGCCAAATTACTAACTGCATGCACATGGTTTCATTTGC a s mr.mrrefChr5 119041 55 + 294542 ATTAGAGCTTTGCACAGTGCGCTGTGCTAAATCTAAACAaggttaagcattgctc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267462 55 + 636262 ATTAGAGCTTTGCACAGTGCGCTGTGCTAAATCTAAACAaggttaagcattgctc s simRat_chr6.simRat.chr6 256352 55 + 647215 ATTAGGGCTCTGCACAAAGTGCTGTACTAAGACCAAACAAGGTTAAGCATTGCTC a s mr.mrrefChr5 119096 96 + 294542 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TGATGCTATCAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267675 12 + 636262 TGATGCTATCAC s simRat_chr6.simRat.chr6 256576 12 + 647215 TGATGCTATCAT a s mr.mrrefChr5 119264 43 + 294542 CCTTTCTTTAGAAGAGTTATTTTAGAACACGCCCTGAAAAGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267687 43 + 636262 CCTTTCTTTAGAAGAGTTATTTTAGAACACGCCCTGAAAAGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 256612 43 + 647215 TTTTGCTTGAGAAGAATTATTTTAGAACAGGCCCTGACAAGAT a s mr.mrrefChr5 119307 100 + 294542 ATATAGATTTAGCTGGTATAATCTATGGTAGCTGCTGATTCCGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAGTCTGACCATGGAACATAATCAACAATGCTGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267730 100 + 636262 ATATAGATTTAGCTGGTATAATCTATGGTAGCTGCTGATTCCGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAGTCTGACCATGGAACATAATCAACAATGCTGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 256658 100 + 647215 ATATATATTTAGCTGGTATGACCTATGGCAGCTGCTGATTCTGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAATCTGACAGTAGAACATAATCAACAATGCTTGT a s mr.mrrefChr5 119407 11 + 294542 CGCTTGACATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267830 11 + 636262 CGCTTGACATG s simRat_chr6.simRat.chr6 256759 11 + 647215 TGCTTGACATG a s mr.mrrefChr5 119418 3 + 294542 TGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267846 3 + 636262 TGC s simRat_chr6.simRat.chr6 256770 3 + 647215 TGC a s mr.mrrefChr5 119421 6 + 294542 TCCGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267849 6 + 636262 TCCGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 256775 6 + 647215 TCCACG a s mr.mrrefChr5 119427 38 + 294542 CAATGGGCATAACATTTGACAGAGCTATCGTCTGCATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267855 38 + 636262 CAATGGGCATAACATTTGACAGAGCTATCGTCTGCATT s simRat_chr6.simRat.chr6 256787 38 + 647215 CAGAGGGGATAACATTTGAAAGAGCTATCGTCTGCACT a s mr.mrrefChr5 119465 92 + 294542 ATCATCTGCAGCTATTATAAGTGTTTATTGTAATGGGCCAAGCTCCACAGTAGAACTAGCCACAGGGGGGACATTTGGTATCAAGCCAATCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267898 92 + 636262 ATCATCTGCAGCTATTATAAGTGTTTATTGTAATGGGCCAAGCTCCACAGTAGAACTAGCCACAGGGGGGACATTTGGTATCAAGCCAATCC s simRat_chr6.simRat.chr6 256825 92 + 647215 ATCATCTGCAGCTATTATAAGTTTCTATTGTAATGGGCCACGTTGCACAGGAGGGCCAGCCACAGAGAGGACATCTGGTGTCAATCCAATCC a s mr.mrrefChr5 119557 41 + 294542 AGAGTCTTATCACCCTAGTGGTTTACTTTTGGTGGGTATCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267991 41 + 636262 AGAGTCTTATCACCCTAGTGGTTTACTTTTGGTGGGTATCT s simRat_chr6.simRat.chr6 256917 41 + 647215 AGAGTCCTACCCCCCTTGTGGTTTATTTTTGGTGGGTACTC a s mr.mrrefChr5 119598 52 + 294542 AAATTAGAGAAGCTGCCTCACTTGGATGAGCAACTGAGGTGAGCAATTTTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268039 52 + 636262 AAATTAGAGAAGCTGCCTCACTTGGATGAGCAACTGAGGTGAGCAATTTTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 256958 52 + 647215 AAGTTAGAGATGCTGACTCATTTGGGTGAGCAACTGAGACAAGCAATTTTGC a s mr.mrrefChr5 119650 132 + 294542 TGTCCTACCTCCATGGGGCGCATTCTTCATAGATGACTAGAGAACCACAAAAGGCAAATCATATAGCCTGCATCTCCACCTCCACTTATTACACAGACTGACCCCCTAGTCATGCCCCTGTTTTAGCTGCAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268094 132 + 636262 TGTCCTACCTCCATGGGGCGCATTCTTCATAGATGACTAGAGAACCACAAAAGGCAAATCATATAGCCTGCATCTCCACCTCCACTTATTACACAGACTGACCCCCTAGTCATGCCCCTGTTTTAGCTGCAG s simRat_chr6.simRat.chr6 257010 132 + 647215 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ATAGTTTCATGACAACCACATGTGACAAACATAGTAGCCCAGACAGGACTAGAAATGATAAGTATGCCAACCATTCTGCAGTGGACATTTAATTTCAATCGAGAGACTATTCGATGAGTATTTCATATGGCTGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268292 135 + 636262 ATAGTTTCATGACAACCACATGTGACAAACATAGTAGCCCAGACAGGACTAGAAATGATAAGTATGCCAACCATTCTGCAGTGGACATTTAATTTCAATCGAGAGACTATTCGATGAGTATTTCATATGGCTGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 257223 135 + 647215 ATAGTTTCATGACAACTACATGTGACAAACATAATAGCCCAGATAGGGATAGAAATGATAAGTATGACAACCATAGAGCAGTGGACATTTGATTTCAGACAAGAGGCTATTCAATGAGTATTTCATATGGCTGTT a s mr.mrrefChr5 119980 20 + 294542 CTGATACTTCCAGTGGGGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268427 20 + 636262 CTGATACTTCCAGTGGGGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 257380 20 + 647215 TTGATATTTCCAGTGGTGAA a s mr.mrrefChr5 120000 42 + 294542 TAAATTTCTAGACAGCAGCGAAAGCTAGTCAGCATTAAATTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268447 42 + 636262 TAAATTTCTAGACAGCAGCGAAAGCTAGTCAGCATTAAATTA s simRat_chr6.simRat.chr6 257404 42 + 647215 TAAATTTCTTGACATCAAGATAAGTTAGTCAGCATTACGTTA a s mr.mrrefChr5 120042 37 + 294542 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TGTATCTAGTTTTTGTTCTCTCCTAACCTGATGCTTCCCAAAGGTTTACCTTCTTCGATACTATTTCTAAGAAAAAATGGTGGATATTAGGCACACTTCAACATCCTCAATGTAACAAAGGTAGTTATCTGGGCAATTGTCATCTAGTTTACCGTTGGTAAGATCAATCTATTGTTGCCATTTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268832 184 + 636262 TGTACCTAGTTTTTGTTCTCTCCTAACCTGATGCTCCACAAAGGTTTACCTCCTTCGATACTATTTCT-AGAAAAAATGGTGGATATTGGGCACACTTCAACATCCTCAATGTAACAAAGGTAGTTATCTGGGCAATTGTCATCTAGTTTACCGTTGGTAAGATCAATCTATTATTCCCATTTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 257782 180 + 647215 TGTGTCTAGTTTTTATTCTCTCCTAACCTGATGCTTTCCAAAGGTTTACCTTCTTTGATACTATTTTTAAGAAAAAATAGTGGATATTAAGCACACTTCA-----TTCAATGTAGCAAAGGTAGCTATCTGGGCAATTGTCATATATTTTACCATTGGTAAGATCGATCTATTGATGCCAGTTTC a s mr.mrrefChr5 120558 84 + 294542 TTTCTACTACTAGAGAGTGCACTGAAGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTTCCAGTGTTGTTAATTTGGTACGAAGACATGAAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269024 84 + 636262 TTTCTACTACTAGAGAGTGCACTGAAGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTTCCAGTGTTGTTAATTTGGTACGAAGACATGAAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 257962 84 + 647215 TTTCTGCTATTAGAGAGTGAACTGGGGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTAAATGCATAGGTAATTTGGTACAGAAACATGAAATG a s mr.mrrefChr5 120642 10 + 294542 AACATTGTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269108 10 + 636262 AACATTGTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 258047 10 + 647215 AACATTGTGG a s mr.mrrefChr5 120652 45 + 294542 CAACTTGACAGCTCGGGGAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGGCAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269119 45 + 636262 CAACTTGACAGCTCGGGGAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGGCAG s simRat_chr6.simRat.chr6 258057 45 + 647215 CTACCCGACAGCTAGGGCAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGACAG a s mr.mrrefChr5 120697 105 + 294542 GCAATCACTCTTAGATCAAGGATTCAACACAATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCGAAAAAGATATGTTACTTGTTGTTAGGTAGTGCAAGATCAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269164 105 + 636262 GCAATCACTCTTAGATCAAGGATTCAACACAATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCGAAAAAGATATGTTACTTGTTGTTAGGTAGTGCAAGATCAGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 258138 105 + 647215 GCAATGACACTTAGGTCAAGGATACAACACTATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCAAAAAAGAAATGTTACTTGTAGTTAGGCAGTGTGATATCAGGT a s mr.mrrefChr5 120802 15 + 294542 TTTGTTTTGTTCCAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269296 15 + 636262 TTTGTTTTGTTCCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 258243 15 + 647215 TTTGTTTTGTTCCAT a s mr.mrrefChr5 120817 41 + 294542 GTATAGCTTACTTACGTCGGGAGGCCTTCCCATTTACTATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269312 41 + 636262 GTATAGCTTACTTACGTCGGGAGGCCTTCCCATTTACTATT s simRat_chr6.simRat.chr6 258258 41 + 647215 GTACAGCTTACTTGCATCAGAAGGCTTTCCCATTTACTATT a s mr.mrrefChr5 120858 213 + 294542 TGTGGGATCCAAAAAGCAGGTTGAAGAGCTAGGTGAGGCAAGAAGCCCAGGCTGCTTCTAGAAAAAACAGTTCTGGATTGTGTAGCAAGGCTTCAACTTTAATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTAGGTTAGGAATTTACTGTGTACTCAGCAACACATGAAGTAGCAACACAAGAAGTATTTAATTGTCTGTCTTGGTACTATGTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269353 213 + 636262 TATGGGATCCAAAAAGCAGGTTGAAGAGTTAGGTGAGGCAAGAAGCCCAGGCGGATGCTAGAAGATACAGTTCAGGATTGTGTAGCAAGGCTCCGGCTTTAATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTAGGTTAGGAATTTACTGTGTACTCAGCAACACATGAAGTAGCAACACAAGAAGTATTTAATTGTCTGTCTTGGTACTATGTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 258336 212 + 647215 TGTGGGTTCCCAAAAGCAGGTTGAAAAGCTAGGAGAGGCAGCAAGCCCAGGCTGCTTCAGGAAATAACAGTCCTGGCATGTGCAGTAAGGCTTCAACTTTTATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTGAGTTAGAAGTTTGTTGTGTACTCTGCAACACAAGAAGTAGCAACACAAGAAGTATATACTTGTCTGTCTTGGTACTATGTA- a s mr.mrrefChr5 121071 45 + 294542 TCCTATCTCATTTAATATCAAGTAGCATTTATTGTCAAAGACATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269581 45 + 636262 TCCTATCTCATTTAATATCAAGTAGCATTTATTGTCAAAGACATC s simRat_chr6.simRat.chr6 258548 45 + 647215 TCCTATCTCATTTAAAATCAAGTAGTATTTATTGTCAAAGACATC a s mr.mrrefChr5 121116 150 + 294542 AAGGCAGAAACACACTCTTTAACTAGAGATGTACTTAAAGTTGGAAATTTGTTGTATACGTTGCAACAGAAAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATTAACTTTTTGAAAATTGGGAGCATTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269631 149 + 636262 AAGGCAGAAACACACTCTTTAACTAGAGATGTACTTAAAGTTGAAAATTTGTTGTATACGTTGCAACAGAGAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATCAACTTTTTTAAAGTTGGGAGTACTT- s simRat_chr6.simRat.chr6 258593 150 + 647215 AAGGTAGAAATAAACTCTTTAACTGGAGATGTACCTAATATTGGAAATTTGTTGTGTACATTGCAGCAGAAAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATTAACTTTTTGAAAATTGGGAGCATCTA a s mr.mrrefChr5 121266 192 + 294542 TTGTCAAAGACATTAAGACAGAAACAAACTCCTCAACCAATTCCTGAACTAATTCAAGGAAAGCCTCTTTTTAAGACTAATATTCAGTATAAAGGCCAAGCAATTGACCCAGCTCTTCCAGATGCACAATCATCAGCTTGACATATGAGCTATTTGTCAATCCTGCCATGCACTTCCCCTTTTGCTTTTTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269780 184 + 636262 ---TCTAAGACACTCAGACAGAAACAAACTCCTCAACCAATTCCTGAACTAATTCAAGGAAAGCCTCCTTTTAAGACTAATATTCAGTTTAAAGAGCAAGCAATTGACCCAGCTCTTCCACA-----AATTATCAGCTTGACACATGAGCTATTTTTCAATCCTGCCATGCGCTTCCCCTTTTGCTTTTTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 258744 191 + 647215 TTGTCAAAGACATTAAGACAGAAACAAACTCCTCAAGTAGTTCCTCAACTA-TTCAAGGAAAGCCTCTCTTTAAGACTAAAATTCAGTATAAAGGCCAAGCAGTTGACCCAGCTCTCCTAGGTGCACAATCATCAGTTTGACATATGAGCTATTTGTCAATCATGCCATGCACTTCCCCTTTCGCTTTTTTA a s mr.mrrefChr5 121458 74 + 294542 ATGATAGTCTGAATCCCAATGTGTGACACCTAAAATTTTGATTGAGGCAATGAAATACAGTTCGATATGAAAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269965 44 + 636262 ATGATAGTCCGA------------------------------TGTGGCAATGAAATACAGTTTAATATGAAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 258935 74 + 647215 ATGACAGTCTGAATCCCAATGTGTGACACCTAAAATTTTGATTGAGGCAACGAATTACAGTTCGATATGAAAAA a s mr.mrrefChr5 121532 701 + 294542 TGAAACCTCTTGTGAGCCAGGCCTAGTTTCTTATGCTGCTTTGGTTAAGAGGTCTACTATATTTGCTTTTTGACATGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTACTGGCTTGATTGCCTACACAGAAAAGAACCTCCATCATCATATAGGTAAATGTACAGGGATGCCTTCAAACACTCAGCCAATATATAATATGGAATAGTCTTGCTAGACTCAATTGAGGGCACAAGCCCAATTAGTTACTCATGGCACAAGGTCAATGAAATACTTGAGGCCCGCAAGATAAATGAGTTGAGCACTGCAATTACAACATTATCATTGTTACTCTTGGGTTAATAACATGCCACCAGGTACCAATCTATCATTCCATTCAGAGAGTGGCTGATTCATGTTGGAAAGTAAACAAAGTGTTCAGGATTCTAACTAATGATCATAAATTGGGACTGGTCTTATGCAAAGTACTGTGGTTCAATACTTCAATTAGTAGCAGCATTTGTAATTATCTGTGACACTACCCAGCCCCACCATAGCAGGGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTGGCTACAAAACCTTCTAGGAGCTGGCCATTCACTCATTGAGGCTTGGATGAGGTTGAGATGAAGTGTAGGCAGCAGAGATTTACTTACTGTTAAAAAGGCACATTTGTTAAATAAACCTATTAGGTCAGGTGATGCACCCACTTTACTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270009 691 + 636262 TGAAACCTCTTGTGAGCCAGGCCT-GTTTCTTATACTGCTTTGGTTAAGAGGTCTACTATGTTTGCTTTTTGACATGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTATTGGTTTGATTACCTACACAGAAAAGAACCTCCATCATTGTATAGGTAAATGTACAGGGAAGCCTTCTAACACTCACCCAATATGTAGTATGGAATGGTCTTGCTAGACTCAATTGAGGACACAAGCCCAATTAGTTACTCATGGCACAAGGTCAATGAAATACTTGAGGCCCGCAAGATAAATGAGTTGAGCACTACAATTACAACCTGATCATTATTACTCTTGGGTTAGTAACATGCCACCAGGTACCGATCTATCATTCCATTCAGA---------ATTCATGTAGGAAAGTAAACAAAGTGTTCAAGATTCTAACTAATGATAATAAATTGGGACTGGTCTTATGCAAGGTATTGTGGTTCAATACTTCAATTAGCAGCAGCATTTGTAATTATCTGTGACACCACCCAGCTCCACCATAGCAGGGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTAGCTACAAAGCCTTCTAGGAGCTGGTCATTCACTCATTGAGGCTTAAATGCGGTTGAGATGTAGTGTAGGCAGCAGAGATTTACTTACTGTTAAAAAGGCACATTTGTTAAATAAACCCATTAGGTCAGGTGATGCACCCATTTTACTG s simRat_chr6.simRat.chr6 259010 694 + 647215 TGATACTTCTTGTGAGCCAGGGCCAGTTTCTTATGCTGCTTTCGTTACCAGGTCTACTATATTCACTTTTTGACACGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTACTACCTTGATTGCCTACACAGAAAAGAACCTCCGACATCATACAGGTAGATGTACAGGGATGCCTTCAAACACTCAGCCAATATATGATATC-AACAGCCTTGCTAGACTCAATTGAGGGCACAAGGCCAATTAGTGATTGTTGGCACAAGGCCAATGCAATACTTGACCACTGCAATATAAATTAGTTGAGCACTGCAATTAGAACATTAACATTGTTACTCTTGGGTCAATAACAAGTCACAAGGTACCAATCTATCATTTTATGCTGAGAGTGGCTGATTCATGTTGGAAAGTAGACAAAGTATTCTGAACTCTAACTCACGATCATAGATTGAGACGGGTCTTATGCGAAGTACTGTGGCTCAATACTTCCATTAGTGGCAGCATCTGTAATTATCTGTGACACTACGCAGCCCCACCATGGCAGAGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTGGTTACAAAAGCTTCTAGAAGCTGGCCATGCACTTATCAAGGCTTGGATGAGGTTGAGATGAAGTGCAAGCAGCAGAGAATCACTTAC------AAAGACACATTTGTTAAAAAGACATATTAGGTCAGGTGATGCACCCACTTTACTG a s mr.mrrefChr5 122233 68 + 294542 CTACAGATCTCCAGACCAATTATTAGTTAATTAGTTGGTGTGGCATGTATCTGTGAGGAGGTGATGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270702 66 + 636262 CTACAGATCCCCAGACCAATTAT--GTTAATTAGTTGGTATGGCATGTGTCTGTGCGGAGGTGATGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 259704 68 + 647215 CTATAAATCTGCAGAGCAATTATTAGTTAATTAGTTGACGCGGTATGAATCTGTGAGGAGGTGGTGAT a s mr.mrrefChr5 122301 430 + 294542 GTTGCTACCTACTGCACTTTTCATTCTACATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAACAGGAGCCTCAGCAATATCTCCAGTTTGACAGCATAAATAACTGTATTGAGTGTGGGTATGTGTAGAACTTACTGATTTATGCACTGATGCTGGTGTGACTAGGGGAGATGTACCCAGCTCTGCCTTCCTGTCCATCTAATTGCAACTACATATTTTCGTCTGGTTACAGTAAAGTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGACATCACTCACAGACTAGGTAAAAGTTCCAACATGAGGTAGGAGACCTGTGTTCCACTGCCTAGATGTTGGTACAGATCCATACAACTAAATGGTGACACCATTCCTGTCTAGACATCTATCTCATGCATGATGCATAAGAACGGTGCCATGTGAAAGGTCCCTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270768 429 + 636262 GGTGCTACCCACTGCACTCTTCATTCTAAATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAACAGGGGCCTCAGCAGTATCTCCAGTTTGACAGCATAAATAACTGTATTGAGTGTGGGTATGTGTAGAACTTACTGATTTATGCACGGATGCTGGTGTGATTAGGGGAGATGTACCCAGATCTGCCTTCCTGTCCATCTAATCACAACTACATATTTTTGTCTGGTTTCAGTAAAGTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGGCATCACCCACAGACTATGTAAAAGTACCAACGTAAGGTAGGAGACCTGTGTTCT-CTGCCTAGATGTTGGTACAGATCCATACAACTAAATGTTGCCACCATTCCTGTCTAGACATCTAGCTCATGCATGTTACATAAGAACTGTGCCATGTGAAAGGTCCCTGG s simRat_chr6.simRat.chr6 259777 424 + 647215 GTTGCTACCTACTGCACTTTTCATTCTACATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAATGGGAGCCTCAGCAATACCTCCCGTTTGACAGCATAAATAACTATATTGAGTGTGGGTATGCGTAGAAGTTACTGATTTATGTGCTGATGCTGGTGTGACTAGGGGAGATGTACCCTGCTCTGTCTTCCTGTCCGCCTAATTGCAACTA------GTCGTCTGGTTACAGTAAATTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGACATCACTCATAGACTAGGTAAAAGGTACAACATGAGGTAGGAGACCTGTGTTCCACTGACTAGATGTTCGTACAGATCCATACAACTAAATGGTGACACCCTTCCTGTCTAGATATCTATCTCATGCATGATGCATAACACCGGTGCCATGTGAAAAGTCCCTTG a s mr.mrrefChr5 122731 109 + 294542 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TGTTAAACAGATCCTCTGCACATGTGAGTAACTGTCACATTTTAGGACCAGTTGGACTAAAGATCCTAATGCCTAAAATTGGT a s mr.mrrefChr5 122953 11 + 294542 AGGATGGTATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271424 11 + 636262 AGGATAGTATA s simRat_chr6.simRat.chr6 260427 11 + 647215 AGGATGGTATA a s mr.mrrefChr5 122964 142 + 294542 AACTCTCTGCTAGAGTTTATGAATCCCAAATACATGGTGACAGTGAATATTACCCACATCAATTAGATGTCCCTCAGAACAGGCTTGGAGAGAGTTGATATTCATAAGACCTGTATTAGTATTCAAGATTTATATATACTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271435 135 + 636262 AACTCTTTGCTAGAGTTTATGAATCCCAAGTACATGGTGACAGTGAACATTACCCACATCAATTAGATGTCTGTCAGAAAAGGCCTGGAGAGAGTTGATATTCATAAGACCTGTATTAGTATTCAAGATT-------ACTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 260440 142 + 647215 AACTCTCTGCTAGAGTTTATAAATCCCAAATACATGGTGACATTGAATATTACCCACATCCATTAGATGTCCCTTAGAACAGGCTTGGAGAGAGGTGATATTTATAGGACCCATATTAGTATTCTAGATTTATATATACTTC a s mr.mrrefChr5 123106 25 + 294542 GATTCTTCACTCCCCATTGAGCTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271570 25 + 636262 GGTTCTTCACTCCCCATTGAGCTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 260583 25 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 262163 68 + 647215 GTCATTGGTAGTAATGTGGAATTGAATAATTAATGACCTATGGTTAATGTTAGCCACAGCAGCACTAA a s mr.mrrefChr5 124710 500 + 294542 CAGGTCTAATGGTTTGAATGACAAATCTATCCAAAGAAAGAAAACACATAAAAGCTTATTATTGATCAAAATTGTGTATGAAGACTAAATTCACTCTGCAGTAGCCCAGAATATTTTGGCCCTACACTTAATACAACTAAGCCATTCTGCTGGTATTGCAAAACAAGTGACAAACTGCACACTTGAGTAGGTAACTTACCCAGCAGCAGCTCCCCTGGTCATGAATCAAGATTGGTTCTAATTATTTATATGCAGCTCAGTTCATTAAACAATGAGATTGCTGCAGGGCCCAGCTGAGGTTGTGTTCTTAAGTAGCTGCTGATACTCTGGCATTGTAAGTTGAATCTTTATTGCCCCAGCTTAGGACAATATAATGTGATACAAGGTACCTAATAGATCAATTGATATTAAACGGTAGAACCTGCCAAAAGAGCAACTCCCCTACTAAGAGTTAAGAGGATGGCCAATTTGAGGCTAAAAGTAGGGATCTTTGACCGCAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 273165 478 + 636262 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AAGTAGGTTGCTCCACCTTTTAGTCAAAGCTGTTTCTGACTTCTAGATAATATTTCTGCACCGTCACAACTGGTACATCCAGTTATAATGATGGATTATAG a s mr.mrrefChr5 129329 7 + 294542 CCTCTCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277856 7 + 636262 CCTCTCC s simRat_chr6.simRat.chr6 267112 7 + 647215 CCATTCC a s mr.mrrefChr5 129336 135 + 294542 TGGTGGTATTGTAAGGAGATTATCTAGTACCAACATTTAGCTATAGAGAGACCCCTTACATATATAGTTAATTGCGTCTCACTGTTTGTGGAATTAATGCTTGGCTCTGTCAATCTCAAGCTTCACATTCAATGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277863 135 + 636262 TGGTGGTATTGTAAGGAGATTATCTAGTACCAACATTTAGCTATAGAGAGACCCCTTACATATATAGTTAATTGCGTCTCACTGTTTGTGGAATTAATGCTTGGCTCTGTCAATCTCAAGCTTCACATTCAATGA s simRat_chr6.simRat.chr6 267123 135 + 647215 TGGTGGTATCGTATGGGGATCATCTAGTACCATCATTTATCTATAGAGCTACCTCTCACATGTATAGTTAACTTCGTCACACCGTTTGTAGAATTAACGCTTTGCTCTGTCAATGTCAAGCTTCAAGATCAATGA a s mr.mrrefChr5 129471 57 + 294542 CCCATTATTACATGGGTTTCATTAAGATTTTTAATAGTAGGCCCACAACTGCCTACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277999 57 + 636262 CCCATTATTACATGGGTTTCATTAAGATTTTTAATAGTAGGCCCACAACTGCCTACT s simRat_chr6.simRat.chr6 267258 57 + 647215 ACCATTATTATATGGGATTCATTTAGATTTTTAATAGTAGACCCATAAGTGCCTCCT a s mr.mrrefChr5 129528 58 + 294542 TCTTCTGTCTATGCTGGGAAGCAGAGCATTTGAGTTAAGTTTACCTGAAGAAATACGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278064 58 + 636262 TCTTCTGTCTATGCTGGGAAGCAGAGCATTTGAGTTAAGTTTACCTGAAGAAATACGC s simRat_chr6.simRat.chr6 267315 58 + 647215 TCTTCTGTCTACGATGGGGAGCGGAGCATTTGAGTTTAGTTTACCTGAAGAAATACAC a s mr.mrrefChr5 129586 32 + 294542 TGGCTTCACACCTTGTATCCGGGTTTACACCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278123 32 + 636262 TGGCTTCACACCTTGTATCCGGGTTTACACCT s simRat_chr6.simRat.chr6 267373 32 + 647215 TGGCTTCATACCGTGTACCTGGGTTTACACCT a s mr.mrrefChr5 129618 146 + 294542 ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAAAAGTGTAGATTTTAGGATTGGCATTTAAGCTGAGATGGGACAAGTATCTCGTTTCCATGCCCAATAACAGTCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCCTGCCATCCTAGTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278174 146 + 636262 ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAAAAGTGTAGATTTTAGGATTGGCATTTAAGCTGAGATGGGACAAGTATCTCGTTTCCATGCCCAATAACAGTCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCCTGCCATCCTAGTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 267405 146 + 647215 ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAGAAGTGTAGCTTTTAGGATTGGCATTGAAGCTGGTATGGGCCAAATATCTTGTTTCCATGCCTAATAACAATCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCTTGCCATTCTAGTTC a s mr.mrrefChr5 129764 6 + 294542 CAGGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278320 6 + 636262 CAGGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 267552 6 + 647215 CAGGGT a s mr.mrrefChr5 129770 261 + 294542 TTCCCTTAAGAGGCTTGCTGCATAGAGTCCTGTATTTTGCCCTTCTAGTTCTCTCTGCCCGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGCATTTTGAATATCACTTGACCTGGACATCTGGCTATTGCCATAAGAATGGACTAGCAGAGGAGGTCTATATTACTGTAAGTTGCTGCTCACATGAAGCAATACCTTATTATAACAAGCAGGTGGTCTATATGGTACCCTACAATTCAAGATAGTCTCCAAGCATTTCGTCGGCGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278326 261 + 636262 TTCCCTTAAGAGGCTTGCTGCATAGAGTCCTGTATTTTGCCCTTCTAGTTCTCTCTGCCCGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGCATTTTGAATATCACTTGACCTGGACATCTGGCTATTGCCATAAGAATGGACTAGCAGAGGAGGTCTATATTACTGTAAGTTGCTGCTCACATGAAGCAATACCTTATTATAACAAGCAGGCGGTCTCTATGGTACCCTACAATTCAAGATAGTCTCCAAGCATTTCGTCGGCGT s simRat_chr6.simRat.chr6 267559 231 + 647215 TTCCCTTAAGAGATTTGCTGCCTCAAGTCTGTGATTTTACCCTTCTAGTTCTCTCTGTCGGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGTGATTTGAATATCATTTGACCCGGGCTTCTAGCTCTCACTATAAGAATGGACTAGGAGAGGATGTCTAGAATACTGTAGGTTGTTATTCACATGAAACAATACTTTCTTATAACAAGCAGGTGGTCTATAAGGGACCCTACAATT------------------------------ a s mr.mrrefChr5 130031 161 + 294542 GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCGGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTACCATGAGAGGAAGTCTAGAACACTGTAAGTGCTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278590 161 + 636262 GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCAGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTAGTGTGAGAGGAAGTCTGGCACACTGTAAGTGCTG s simRat_chr6.simRat.chr6 267790 86 + 647215 ---------------------------------------------------------------------------AGACCCGGGCTTTTGGCTCTCACCCTAAGAATGGTCTGGGAGAGGAAGTCAACCATGAGAGGAAGTCTAGAACCCTGTAGGTGCTA a s mr.mrrefChr5 130192 291 + 294542 AACACATGGAACTATAATTTCTTATAACAAGCAGGCAGTCCATAATGTGGCCTACAATCCTCCATACTCTCCAATCATTTGGTTGGCACTAAGCAGCAACTGGATTCATTGTACCACAGTAGGGGTTATTGGAAGTGATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTCCAGGTGGATGGTATATATACCAAGCTGGTGAAAATATTTTTCAAGTCATCTGGTGTGGTTGCTCTTATAGCTTCATTCTTAGTATGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGATCTGAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278751 291 + 636262 AACACATGGAACTATAATTTCTTGTAACAAGCAAGTAGTCCATAATGTGGCCTACAATCCTCCATACCCTCCAATCATTTGGTTGGCATTAAGCGGCAACTGGATTCATTGTACCACAGGGGGGGTTATTGGAAGTAATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTGCAGGTGGATGGTGTATATACCAAGCTGGTGCAAATATTTTTCAAGTAATCTGGTGTGGTTGCTCCTATAGCTTCATTTTTAGTACGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGATCTGAGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 267881 285 + 647215 AACACATGGAACTATAATTTCTCATACTACGCAGGCAGTC-----TGTGGTCTATGATCCACCATACTCTCCAATCATTTGGTTGGCACTAAGCAGCAATTGAATTCATTATACCAGAATAGGGGCTATTCGAAGTGATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTCCAGGTGGATGATATATGTGCTAAGCCGGTGAAAATATTTCTCAAGCCAACTGGTGT-GTTCCTCTTATAGCTTCATTCTCAGTATGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGTTCTGAGGT a s mr.mrrefChr5 130483 49 + 294542 GGTTAACATATGTAGGACCTAAAACACTGAAAAGTAGCAAGTCCAGCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279286 49 + 636262 GGTTAACATATGAAGGACCTAAAATAATGAAAGCTAGCATGTCCAGCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 268166 49 + 647215 GGTCAACATATGTAGGACCTAAAACACTGAAAAGCAGCAAGATAAGCAG a s mr.mrrefChr5 130532 66 + 294542 GGGCTTGGGGCTCCTGTAGTCCAGTGTCTCTCAAAGATGGAATAAACTATGTACCAAGTCAATAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279335 66 + 636262 GGGCCTGGGGCTCCTGTAGTCCAGTGTCTCTCAAAGATGGAATAAACTATGTACCAAGTCAATAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 268216 6 + 647215 AAGATC------------------------------------------------------------ a s mr.mrrefChr5 130598 98 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 268358 126 + 647215 CCAGCTGTCCAGATCAAAACTAGCGGTATGGTCCAAATTACAGTCTATCCCATGGGAGCATAGTACAGACCAAGAGGACAGTATTATGGAGGAAGCCTAAGAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC a s mr.mrrefChr5 130860 171 + 294542 TACATGCCTAATGGAGTTTAACTTGGAGTACTCATGGTCAGTATCAAAGATACTATTGATCCCAGTCCCTCAGCTTCAGGAGGCAGGTTAGGATAACAATGCACTTTGTCAAAAATTTTCTTACAATTATGTCATCAAAAAATGTGTTCCATTCCGCCTTCATCTTGAGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279761 171 + 636262 TAAATGCCTAATGGAGTTTAACTTGGAGTACTCACTATCAGTATCAAAGGTACTATGGATCCCAGTCCCTCAGCTTCAGGAGGCAGGTTAGCATAACAATGCACTTTGTCAAAAATTTTCTTACAATTGTGTCATCAAAAAATGTGTCCCATTCCGCCTTCATCTTGAGCC s simRat_chr6.simRat.chr6 268485 171 + 647215 TACATGTCTAATGGAGTTTAACTTGAAATACTCATGGTCAGTATGAAAGATACTATTGATCCCAGTCCCTCAGCTCCAGGATGCAGGTTAGGATAACAATGCACTTTGTCAGAAATTTTCTTACAATTATGTCATCAAAAAATGTGTTCCATTCTGCCTTCATCTTAAACC a s mr.mrrefChr5 131031 79 + 294542 AAAAAACTATATCATTCTACTGTCATATACTTGATGACTATTTGTTTGTGACCAAAACAGTCAATCAACACACATGACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279933 79 + 636262 AAAAAACTATATCATTCTACTGTCATATACATAATGACTATTTGTTTGTGACCAAAACAGTCAATTGACACACACGACA s simRat_chr6.simRat.chr6 268656 79 + 647215 AAAAAATTTTATCATTCTGGTTTCATACACTTGATGACTATTTGTTGGTGAACAAAAGAGACAATCAACACGCATGACA a s mr.mrrefChr5 131110 277 + 294542 TTCCACCCATTATTAGTTGACTTCAGTAGGTCTGTCTTGTAAACATAAAAGCATTTTCTTTTTCTCTCATGGTAATGGTGGAAGATAGAAGTTCCAAACCATCTATATTTCTATACCACCGTCACCACACATCATTAATTTGCGGGCCAGCTTTTAGTATTGAGTTCTCCAATTCTAATTGTCCAAACATTCTCCTGCTGTCACTGTTCGTCCAGCTTGGGAGCCAGACTGCTGTATTTTGGTCAGGGCATGGCAGAGACATGGCCCTCTGTGATTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280058 275 + 636262 TCCCACCCATTATTGGTTGACTTCAGTAGGTCTGTCTTGTAAACATAAAAGCATTTTGTTTTTCTCTCATGACAATGGTGGGAGATGGAAGTTCCAAACCATCTATATTTCTATACCACTGTCACCACAAATCATTAATTTACAGGCCAGCTTTTAGTATTGAGTTCTCCAATCCTAATTGTCCTAACATTCTCCTGCTGTCACTGTTCGGCCAGCTT--GAGCCAAACTGCTATAATTTGGTCAGGGCATGGCAAAGACATGGCCCTCTGTGATTG s simRat_chr6.simRat.chr6 268735 263 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 280954 61 + 636262 TCTATGCAAGATGAAAGTGGTAGCAGCACAATGCCTCCACCTGATGCTAGATAATCTGAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 269550 60 + 647215 TTTATGTAAGATGAAAGGAGCAGCAGTAC-ACGCCTCCATCTGATGGTAAATAATCCGAGT a s mr.mrrefChr5 132053 133 + 294542 GCTGTTTAACATTGAATTAATGCACTACATTTGTTCAGGGGTCCACTGGTGGTACAAGATTCTCTTATCATGATGTTTGTGCACACCTAGTGGTGTCCTACTTTATTTTTTATAAAGGTAATCTAACATCTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281015 133 + 636262 GCTGTTGAACATTGAATTAGTGCACTACATTTGTTTAGGGGTCCACTGGTGGTACACGATTCTCTTATCATGATGTTTGTGCACACCTCGTGGTGTCCTACTTTATTTTTTATAAAGGTAATCTAACATCTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 269611 123 + 647215 ACTGTTTAACATTGAATTAATGCACTACATTTGTTCAGGGGTCCACTGGTGGTACAAGATTCTCTTATCATGATGTTTGTACACACCTAGTGGTGTCC----------TTTATAAAGGTAAGCTAACCTCTCA a s mr.mrrefChr5 132186 9 + 294542 TGACTCCCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281148 9 + 636262 TGACTCCCT s simRat_chr6.simRat.chr6 269736 9 + 647215 TGACTCCTG a s mr.mrrefChr5 132195 178 + 294542 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GACTAAATTCATGGTCCCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 270168 20 + 647215 GGCTGAATTAATGGTCCCTT a s mr.mrrefChr5 132633 108 + 294542 CAACAGACAATACATATTATAAGGTGAGTGGCCCAAATAATTTGGTAAATGAGCAGCAAGAACAGAAGCATAACCCATGGAGTATGTACTGTGTTGGTAATTAAGGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281631 108 + 636262 CTACAGACAATACATATTATAAGGTCAGTGGCCCAAATACTTTGGTAAATGAGCAGCAAGAACAGAAGCATAACCCATGGAGTATGTACTGTGTTGGTAATAAAGGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 270188 106 + 647215 CAACAAACAATACATATTATAAGGTGAGTGGCCCAAATGATTTGGTAAATGAGCAGCTAGAACAGAAGCATAATCAATGGAGTACAAAT--TGTTGGTAACTAAGGAC a s mr.mrrefChr5 132741 218 + 294542 AAGCAAATCATAATTTGCTGCTCCAGTATGATAGGGGATATAGAAGTGTTTAAGGGCCCTGGAGTCCTGTAATCAACATCTAACTTAAAAGTCCCTATAGCCCTATGTTATAGCTTTAGTACCCAACCCACTAAATACTCTTGGTATCTTGAAACATAAGTATTTCATAAGCTTATCATCTTTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGGTAATACCCTGTACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281742 218 + 636262 AAGCAAATCATAATTTGCTGCTCCAGTATGATAGGGGATATAGAAGCGTTTAGGGGCCCCGGAGTCCTGTAATCAACATCTTATTTAAAAGTCCCTATAGCCCGATGTTATTGCTTTAGTACCCAACCCACTAAATACTCTTGGCATCTTGAAACATAGGTACTTCATAAGCTTATCATCTCTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGGTAATACCCTGTACT s simRat_chr6.simRat.chr6 270294 218 + 647215 AAGCAGCTCATAATTTGCTGGCCTAGTATGATAGGGGATATAGTAGTGCTTAAGGGCCCTGGAGGCCTCTAATCAACATCTAACCTAAAAGTCCCTATAGTCTTATGTTATAGCTTTAGTACCCAACCCATTAAATACTCTTGGTATCTTGAAACATTAGTATTTCATAAGCTTATCATCTTTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGATAATACTCTGTACT a s mr.mrrefChr5 132959 69 + 294542 TATGATACACTTGAAGGAAAATAGTTCTGTGATCATAAATTGCAGGAGACTGCCCAGGAATAATAGGGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281962 69 + 636262 TATGATACACTTGAAGGAAAATAGTTCTTTAATCATAAATTGCAGGAGACTGCCCAGGAATATTAGGGG s simRat_chr6.simRat.chr6 270512 69 + 647215 TATGATAAACTTGAAGGAAAATAGTTCTGTGATCATAAATTGCAGTACACTGGCCAGGAAGAACAGGGG a s mr.mrrefChr5 133028 347 + 294542 AAGGAAGATCTTTATGAATGGTAGGTATGCTTACATACCCAGATTGCCCCCATTCACCCTCAGCATCTTAGGGATATGCACAATAAGGCTTGTTGGAGCTCTTAACACGATAAGCTTTCCTGTTCTTGTCCACCAGTTATTGGGTAACTGTTACAATGATGTATTAGCAGGATGGGACCAGCCTCTGGTGAAAGTATTAGGGCATTAATATTCATTTTTAAGCCTGTACCTTCCATGACTCACCTAAGTAGCTCTCCCATCACCTTTATGACTAGATGGCCCTATGTCAGCTCATATCTGCCATTAGATCCAATTAATAAGACCATGAAACAGCTAATGGTCAAGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282042 347 + 636262 AAGGAAGATCTTTATGAATGGTAGGTATGCTTACATACCCAGATTGCCCCCTTTCACCCTCAGCATCTTGGGGATATGTACAATAAGGCTTGGAGGAGTTCTTAACACAATAAGCTTTTCTGTTCTTGTCCACCAGTTATAGGGTTACTAGTATAATCTTGTAATAGCAGGATGGGACCAGCCTCTGGTGAAAGTATTAGGGCATTAATATTCATTTTTAAGCCTGTACCTTCCATGACTCACCTAAGTAGCTCTCCCATCACCTTTATGGCTAGATGGCCCTACGTCAACTCATATCTGCTGTTAGAGCCAATTAATAAGACCATGAAACAGCTAATGGTCAAGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 270581 254 + 647215 AAGTAAGATCTTTATGTATGGTAGGTATGCTTACATACCCGGATTGCCCCCATTCACCCTCAGCATCTTAGGGGTATGCACAATCAGGCTTGTTGGAGCTCTTAACACGATAAGCTTTCCTGTTCTTGTTCCCCAGTTATTGGGTAGATGTTACAATGATGTATTAGCAGGATGGGACCAGTTTC----------------------------------------------------------------------------------ATTACTAGACTGCCCTATGTCAGCTCATATCTGCCATTAGATCCAATTAATAAAACC-----ACAGCTACTGGT------ a s mr.mrrefChr5 133375 88 + 294542 GAGAGTGAGCCAATGATACAACATGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGCCCGTCAAATTTATTCCTGAGGCTGAAGTTTAACAGTGACATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282408 88 + 636262 GAGAGTGAGCCAATGATACAACATGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGCCCATCAAATTTATTCCTCAGGCTGGAGTTTTACAGTAACACT s simRat_chr6.simRat.chr6 270835 70 + 647215 ------------------CAACGTGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGTGTGTCAAATGTATTCCTGAGGCTAAAGTTGAACAATGATATT a s mr.mrrefChr5 133463 28 + 294542 CTAAATAGTGCATGGAAGTTCCAGCACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282497 16 + 636262 CTAAATAGTGCATGGA------------ s simRat_chr6.simRat.chr6 270905 18 + 647215 ----------CATGGAAGTTCCAGCACA a s mr.mrrefChr5 133491 56 + 294542 CCACTAGATACCTAACCTTGGTTGGGTTCTAAACAAACACAAAGAATAACCAACGA s simRat_chr6.simRat.chr6 270927 56 + 647215 CCACTAGATACCTAACCTTGGTTGGGTTCTAAACAAACACAAAGAATAACCAACGA a s mr.mrrefChr5 133547 20 + 294542 GATTTCCTGTGCTGACTTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282513 20 + 636262 GATTTCCTGTGCTGACTTAT s simRat_chr6.simRat.chr6 270986 20 + 647215 GACTTCCTGTGCTGCCTTAT a s mr.mrrefChr5 133567 22 + 294542 ATGAATTGCTCTGCATTGTGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282533 22 + 636262 ATGAGTTGCTCTGCATTGTGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 271009 22 + 647215 ATGAATTGCTCTGCATAGTGAC a s mr.mrrefChr5 133589 138 + 294542 TCTTACTTGTGCCATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAATCTTTGCAGCTAAACCCACCTCTCAATTTTTAGTGATCGTGCTTTGAGCTAGAAATACAGTAATATTTCTTGGACAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282555 133 + 636262 -----CTTACGCCATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAATCTTTGCAGCTATACCCACCTCTCAGTTTTTAGTGATCATGCTTTGAGCTATAAATACAGTAATATGTCTCGGACAG s simRat_chr6.simRat.chr6 271032 138 + 647215 TCTTACTTGTGCGATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAACCTTTGCAACTAAACCCACCTCTCAATTTTCAGTGATCGCACTTTGAGCTGGAAATACAGTAATATTTCTTGGACAG a s mr.mrrefChr5 133727 79 + 294542 CTGTGTTCTGGATAGGATAGTGCCACTAGCTCTAGTGTTATGAGAGGTTGTATCAATTAACATAGATAGAATCTTGATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282692 79 + 636262 CTGTGTTCTGGATAGGATAGCACCACTAGCTCTAGTGTTATGAGAGGCTGTATCAATTAACATATATAGAATCTTGATA s simRat_chr6.simRat.chr6 271170 74 + 647215 CCGGGCTGT-----GGATAGTGCCACTAGCTCTAATGTTATGAGAGGTTGTAGAAATTAACATAGATAGAGTCCTGATA a s mr.mrrefChr5 133806 32 + 294542 TGAATATCATTGTTCTGCTAGCATTGTGTAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282771 32 + 636262 TGAATATCATTGTTCTGCTAGCATTGTGTAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 271248 32 + 647215 TGGATATCAATGTTTTGCTAACATTGTGCAAC a s mr.mrrefChr5 133838 55 + 294542 CTCACTCTCTACCTCGCAATCATTATAATTATATCATTCCAATGACTCATCTGAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282803 55 + 636262 CTCACTCTCTACCTCACAATCATTATAATTACATCATTCCAAAGACTCATCTGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 271283 55 + 647215 CCCACTCACTACCTCGCAATCATTATAATTATATCATTCCAATGACTCATCTGAA a s mr.mrrefChr5 133893 26 + 294542 ACTTGTACAGGTAAACCTAAAGTAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282864 26 + 636262 ACTTGTACAGGCAAACGTAAAGTAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 271338 26 + 647215 ACTTGTGCAGGTAAAACTAAGGTAGA a s mr.mrrefChr5 133919 32 + 294542 GTCAGGGAAGATGGAAAGAAGGCAGAGAGGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282890 32 + 636262 GTCAGGGAAGATGGAAAGAAGGCAGAGAGAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 271392 32 + 647215 GTGAGGGAACATGGAGATGAGGCAGAAAGGAA a s mr.mrrefChr5 133951 422 + 294542 TCCTGTCTACCGATGCCAAGGAGCGGTCATGATATCAGTGAAAGTTCACTCTGTGTCTGTTGAGTGGTGTTATAGAATGCCAGTGAAGGCCAAACTCTTGCTTAACTCAAGGCAAGAAGGAAATCTAGACATGGGCACAATAGAGCGGCTTCCAATGTACCTGTAGGAGAGTTTTGGATGAACTACCCTATATACCTCTATGCCAAGAAGGAGGCAATCAGTGCACACAGTACGGAGTGTTCCTGAGTTGGAATAACTTCATGGACAGATGGATAAATTAGGAAGGGGAGAGAGTAGAGACAACCAGTTCTTATTCTCCTGAAGACAGAATGTAGGCCAGAAATAGTACCAGGTTAGGCAGGCATTAGCTCAACATATTGCATCCAATGATCGGTGTGGTATTGCATAGGCTGCCCATTTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282925 420 + 636262 TCCTGTCCAAAGATGCCAGGGAGTGGTCATGATATCGGTGAAAGTTCACTCTGTGTCTGTTGAGTGGTGTTATAGAATGCCAATGAAGGTCAAACTCTTGCTTAACTCAAGGCAAGAAGGAAATCTAGACATAG--ACAATAGAGTGGCTTCCAATTTACCTGTAGGAGAGTTTTGGATGAACTGCCCTCTGTACCTCTATGCCAAGCAGGAAGCAATCAGTGCACACAGTACGGAGTGTTCCTGGGTTGGGATAGCTTCATGGACAAATGGATAAATTAAAAAGGGGAGAGAGTAGAGTCAACCAGTTCTCATTCTCCCGGAGACAGAATGTAGGCTAGACATAGTACCAGGTTAGGCAGGCAGTAGCTCAACATATTGGATCCAATGATTGATGTAGTATTCCATAGGCTGCCCATTTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 271424 422 + 647215 TCCTCTCTACCGATGCCAAAGAGCGGTCATGATCTCAGTGAAAGTTGGCTCTGTGTCTGTTCAGTGGTGTTGTAGCATGCCAGTGGAGGCCAAACTATTGTTTAACTCAAGGCAAGAAGAGAATCTGGACATGGGCACGATAGAGCAGCTTCCAATGTACCTGGAAGAGAGTTTTGGATGAACTACCCTATATACCTCTATGCCATGAAGGAGGCAATCAGTGCACACAGTAAGAAGTGTTCCTGAGTTGGAATAACTTCATGGACAGATGGATAAATTAGGAAGGGGAGAGAGTAAAGACAACCAGTTCCTATTCTCCTGAAGACAGAATGTGAGCCAGGAGTAATACCAGGTTAGGCAGGGATGAGCTCAACACATTGCATCCAATGATCGGTGTGGTATTGCATGGGCATCCCATTTTT a s mr.mrrefChr5 134373 71 + 294542 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s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283482 32 + 636262 ------------------------------------------TGGATGGTGTTAAGTTAAGAAGTGCGTAGATC s simRat_chr6.simRat.chr6 272068 74 + 647215 TGTATGACCTTAACCCAAAACTAAGATCAATATTCTACTGTCTAAATGGTGTTAAGTTAAGAAGTTCATAAATC a s mr.mrrefChr5 134666 78 + 294542 ATACTAGTATATAGGCAGCATTTTGGTGTGAAGCTTCAGCATGCTTACATGGATAGATGGGTGATACTGATTACCATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283711 7 + 636262 ATACTAG----------------------------------------------------------------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 272142 78 + 647215 ATACTAGTATATAGGCAGCATTTTGGTGTGAAGCTTCAGCATGCTTACATGGATAGATGGGTGATACTGATTACCATG a s mr.mrrefChr5 134744 116 + 294542 GCTACTTTGTCATCAAGCCTTTGCTCTTAAAACTAAGGCTGGGCTTTTACTGTTAAGTAATCCTGAGTCGTTGATAAGCCATGGGAAATGGAACTAAGCCTATCTGGTAATTACGA s simRat_chr6.simRat.chr6 272221 116 + 647215 GCTACTTTGTCATCAAGCCTTTGCTCTTAAAACTAAGGCTGGGCTTTTACTGTTAAGTAATCCTGAGTCGTTGATAAGCCATGGGAAATGGAACTAAGCCTATCTGGTAATTACGA a s mr.mrrefChr5 134860 19 + 294542 ACAAACCAGACCACTACAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283718 18 + 636262 -CAAACCAAACCACTACAA s simRat_chr6.simRat.chr6 272342 19 + 647215 ACAAACCAGGCCACTCCAA a s mr.mrrefChr5 134879 214 + 294542 ATGCCAGTCACTATGTTGGCTACAGATGACGTTATTAATTTGGCTAAAGATGACCTTAGTCATGATCTGAGCCCTGAACAGCTGGAAATGTGGGTATTCTTCATCTGTCCTCAAAGAATGGAATGTTTTTATGGGTTTACCTGATTGCTGCATATTTGGAGACTGACCTCTAAACTCTTGTCCATCTTTATGTCTTGATTCACAGCATCTAGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283738 213 + 636262 ATGCCAGTCTCTAATTTGACAATAGATGACATCATTAGTTTGGCTAAACATGACCTTAGCCATGGTCTGAGGCCTGAGCAGCTGGAATTGTGGGTATTCTTCATCTGTCCTCAAAAAATGGAATATTTTGATGGGTTTACCTGATTGCTGCATA-TTGGAGACTGACCTCTAAACTCTTGTCCATCTTTATGTCTTGATTCACAGCATCTAGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 272361 214 + 647215 ATGCTGGTCACTATGTTGGCTACAGATGACGTTACTAATTTGGCTAGAGATGACCATAGTCATCATCTGAGCCCTGAACAACTGGAAAAGTGGATATTCTGCCTCCGTTCTCTAAGAATGGAATGTTTTTGTGGGTTTACCTGATTGCTGCATATTTGGAGACTGACCTCCAAACACTAGTCCATCTTTATGTCTTGATTCATAGCATCTAGGA a s mr.mrrefChr5 135093 83 + 294542 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TGTGGCTGAAGTAACTTGCACAGTTAACATGGTAAAGGATGCCACCTACAGGCATTAAGCTAATCCTAACATCTGAGGCACTATCTGAGAACTGTGTAATGGAGGGAGAGTAATCATGTCAAGTTGGAGATTAGTTGGAATATACAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGTTAGTATATACAAGAATCTCTCTCTTTGATTTTCTGGTACATGTTGCTTACAAAACCTTTGCCCTGACAGGAGTCAAAAAAGGACCACTGGAATACTACATGGAAGTTTTCAGGATTGCAATATACTACTATCAGACAGATGGAAAGAATGGGGGTTTGATGCTTGGGTACTTTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284235 342 + 636262 TGTGGCTGAAGTAACTTGCACAGTTAATATGGTAAAGGATGCCACCTACAGGCATTAAGCTAACCCTAACATCTGAGGCACTATCTGAGAATTGTGTAATGGAGGGAGAGTAATCATGTCAAATTGGAGATTGGTTGGAATATGCAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGTTAGTATATACAAGAATCTCTCTCT----TTTTCCGGTACATGTTGCTTGTGGAACCTTTGCCCCAACAGGAGTCAAAAAAGGACCACTGGAGTACTACATGGTACTTTTCAGGATTGCAATATACTACTATCAGACAGATGGGAAGAGTGGGGGTTTGATGCTTGGGTAATTTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 272652 320 + 647215 ------------------------CAACATGGTAAAGAATGCCACCTACAGGCATTAAACTAATCATAATGTCTGAGGCACTATCTCAGAACTGTGTAATGGAGAGGGAGTAATCATGTCAAGTTGGAGGTTAGTTGGAATACACAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGGTAATATATACAAGAATCCTTCTCTTTGATTTTCTGGTACATGTTGCTTACAAAACCTTTGCCTTGACAGCAGTCTATAAAGAACCACTGGAATATTACTTGGAAGTTTTTAGAATTGCAATATATTACTACCAGAAAGATGGAAAGGAG--GGGTATGATGCTAGGGTACTTTGT a s mr.mrrefChr5 135629 73 + 294542 ATGTGCAGTGGTTCTACCACTTGTGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284577 62 + 636262 ATGTGC------TTTACC-----TGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 272977 73 + 647215 CTTTGCAGTGGTTCTTCCACTTGTGCCACTGTATTAGTCTTGCAAACTCAGTCGCTGCAAGGTGAATCTCTGT a s mr.mrrefChr5 135702 55 + 294542 ACCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284639 55 + 636262 GCCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 273051 55 + 647215 ACCCTTTACAGCCATGAGTACTATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAGCTCTGTA a s mr.mrrefChr5 135757 68 + 294542 CCTACTTACTCGAACAGAGCTCATTTTGCAACTGTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284694 63 + 636262 CTTACATACTTGAACAGAGCTCATTTTGCAGCTGTACTTGATCGACCTAGGTAGCCAGAGCTA----- s simRat_chr6.simRat.chr6 273107 68 + 647215 CCTACTTTCTCGAGCAGAGCTCATTTTGCAACTTTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG a s mr.mrrefChr5 135825 348 + 294542 CTTTATGCATGACTTGGGGTTGCTATAAAGGAAAATAGTGACAGATTTATTGATTCCATGTCTTGGATAATTGGAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGACGGAAGGCCATGAACATACCTCTCCAGCATTGTTTCTGAACATTTTGGGTGGCCCAGGGCAGTGTAGAATGTGTGATCATATCTTGAGGAAGTGCTTCCATGTTAGTAGAAGAAGATAGCCAATTATTGCCAAAAACATACGGTTCCAGTTCAGGTCCTCTTTTTAAGCAGATGGGGGGTGCCATAAACCATAAGTTATGTCAGAATGACATTAAGGGCCCTAGGTTGACTTTTATTCTCCTCTAGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284757 337 + 636262 ----------GACTTGGGGTTGTTATAAAGGAAGATAGTGACAGATTTACTGATTCCAGGTCTTGGCTAATTGAAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGACGGAAGGCCATGAACATACCTCTTCAGCAGTGTTTCTGAACATTTTAGGTGGCCTAGGGCAGTA-AGAATGTGTGATCATATCTTGAGGAAGTGCTTCCATGTTAGTGGAAGAAGATAGCCAATTATTGCCAAAAACATACGGTTCCAGCTCAGGTCCTCTTTTTAAACAGATGGGGGGTGCCATAAACCATAAGTTATGTCAGAATGACAGTAAGGGCCCTAGGTTGACCTTTATTCTCCTCTAGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 273181 339 + 647215 CTTTATGCATGACTTGGGTTCACTATAAAGGAAAATAGTGACAGATTTATTGAGTCCATGTCTTGGAAAATTGGAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGAAAGAAGGCCATGAACATACCTCTCCAGCATTGTCTCTGAACACTTTGGGTGGCCCAGGGCAGTGTAGATCGTGTGATCATATCTTACAGAAGTGCTCCCATGCTAGTAAAAGAAGATAGCTGATTATTGCCACAAACATACAGTTCCTGTTCAGGCCCTTTTTTTAAGCAGATGGGAGTTGCTATAAACCATAAGTTATGTCAGACTGACATTAAGGGCCCTAGGTTGACTTTTGTTCT--------- a s mr.mrrefChr5 136173 27 + 294542 AACATTGACTTTTATTCTACTCTAAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285095 27 + 636262 AACATTGACTTTTATTCTACTCTAAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 273520 24 + 647215 ---ATTCACTTTTATTCTACTCTACGG a s mr.mrrefChr5 136200 257 + 294542 AACTTCTTCCAAGTGCCACTGCTATCAGCTAGTGCCTTACCTTGTGATTGCCAGAACATCAGTCTACACTCACAGAATGTCTCCTGTAACCAAATTAACAAAATTAACCTTAACAAAACTAACCTTACTGAAGGTCCTTAGTCTCTTTTATGTGTTTAACATGCAGTTAACAACTTGTTAGCTTACAATTGTTGGACACAATAATATTGCCAGTGTAACCCATTCAAGTCATATAATTTGTTGTCTCATCAGCCAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285122 242 + 636262 AGCTTCTTCCAAGGGCCACTGCTATTAGCTAGTGCCTTACCTTGAGATTGCCAGAACATCAGTCTACACTCACAGAATGTCTCCTGTAGCCAAA---------------TTAACAAAACTAACCTTACTGAAGGTCCTTGGTCTCTTTTATGTGTTTAACATGCAGGTAACAACTTGTAAGCTTACAACTGTTGGATACAATGATATTGCCAATGTAACCCATTCAAGTCGTATAATTTGTTGTCTCATCAGCCAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 273549 252 + 647215 AACTTCTTCCTAGTGCCACTGCAATCAGCTAGTGCCTTACTTTGTGACTGCCAGAACATCTGTCT---CTCACACAATGTCTCCTGTAACTAAATTAACAAAATTAACCTTAACAAAATTAACCTTACTGAAGGTCCTTAGTCTGTTTTATGCGTTTAACATGCAATTAACAGCTTGTTA--TTACAATTGTTGGACACAACAATATTGCCAGTGTAACCCATTCAAGTCATATAGTTTGTTGTCTAATCAGCCAAC a s mr.mrrefChr5 136457 4 + 294542 TACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285364 4 + 636262 TACT s simRat_chr6.simRat.chr6 273802 4 + 647215 TACT a s mr.mrrefChr5 136461 13 + 294542 AACTGATGTAAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285373 13 + 636262 AACTGATGTAAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 273806 13 + 647215 AACTGATGTAAGA a s mr.mrrefChr5 136474 212 + 294542 AATTGACCATTCTAGCTAACTTGATGGTTTCAATCCGGGTAAGGTCATAGGTCAACAGTAGTGGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGGTGGGAAATGCAACTGAGAATGTTAGACGCAACCTAGCCCTAGAAATAAATGGATGAATGAACGGGCAATCTAGAAGTTAACGGATGAACAAACGGACGAAATCATCTCACTATCACCAGGGGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285386 212 + 636262 AATTGACCATTCTGGCTAACTTGATGGTTTCAATCCGGGTAAGGTAATAGGTCTACAGTAGTGGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGATGGGAAATGCAGCTGAGAATGTTAGACGCAACCTAGCCCTAGAAATAAGTGGATGAATGAACGGGCAATCTAGAAGTTAACGGATGAACAAACGGACGAAATCATCTCACTATCACCAGGGGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 273832 212 + 647215 AGCTGACCATTCTAGCTAACTTGATGGATTCAATCAGCGTAAGGTCATAGGTCAACAGTACTAGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGGTGGGAGATGCAACTGAGAATGTAAGATGCAACCTAGGCCTAAGAATAAATAGATGAGTAAACAGGCACTCTAGTAGTTAGTGGATGAACAAATGGACAAAATCTTCTGATGATGGACAGTGGGA a s mr.mrrefChr5 136686 81 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 286264 97 + 636262 GATATCTGATGCACAATAATTTTCTATCAACCTAATTTCCTATCCACTGTCTCAATGATCTCTTTAGATCTGGATATGTGGAATCTTAGTTACGAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 274676 29 + 647215 GAAATCCT--------------------------------------------------------------------TGTGAAATCTTTGTTACAACG a s mr.mrrefChr5 137398 15 + 294542 CAAAGGGATCACTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286362 15 + 636262 CAAAGGGATCACTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 274705 15 + 647215 TAAAAGGATCACTAA a s mr.mrrefChr5 137413 256 + 294542 TAGGTTACTATCCTCCAAGTGACTGTATGGACTTCAAATAACCAATTAGTTAACGGGTCAAGTGTTCAAAATTTTCAGACTCCAACTGCCATGGCAATTCTGCTGACATACCTCCATGCACATTCAAGGAACTCAAGGCGTCTGATGGCCATACAATTAAATCATGGCTTGGAAAATTCTACTTCCTGCAACTTCAAGAAAGGCCTTGAACCCGATTAATAAGTACCCCACAAACCCACCTTTACTTGCCACTATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286396 254 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 275004 13 + 647215 AGGGACATCACTG a s mr.mrrefChr5 137740 357 + 294542 TGTCTGAGTTGAGCATTGCAACTTGATAACAATTTCTTACAGTACATACTCTCCTAGACATCAAACATAAGACAAGACTGCCACACACATTCACTATACAGTACCTGTTCTGCTCCCAAAACAAGGGTTATGGTTACCAGAGGTTTTTATAAAAAATTGTCTTCTGAATCTGGAATTTATGCCCTGCTCCACATACCTATTTACTAGATGGTACCAGGCTTCACCAGTAATCCCTGTTGTAGGCTCCCAGTGAAATATCTAGTCTTGGTATTTTATAACTGTCTAATAAGGGATAGTTCAACCCAGAGTCGCAGCTTATTACAGTCATTTCGAGAAGCCATCCACTGGTAAATTCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286724 328 + 636262 TGTTTGAGTTGAGCATTGCAACTTGATA--------------------------TAGACACCAAACACAAGACAAGACTGCCACACACATTCACTATACAGTACCTGTTCTGCTCACAGAACAAGGGTTATGGTTACCAGACATTTTTATAAAAAATTGTCTTCTGGATCTGATATTTATGCCCTGCTCCACATACCTATTTACTAGATGGCACCAGGCTTCACCAGTAATCCCTGTTGTAGG-TCCCAGTGAAATCCCTAGACTTGGTATTTTATAACCGTCTAATAAGGGATAATTTAACCCAGAGTCGCAGCTTATTACAGTCA--TCGAGAAGCAGTTCACAGGCAAATTCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 275017 357 + 647215 TGTCTGAGTTGAGCATTGCAACCTGATAACAATTTCTTACAGTACATACTCTCCTAGACATCAAGCATAAGACCAGACTGCAACACAAGTTCACTAAACAGTACCTGTTCGGCTCCCAAAACAAGGGTGATGGATACTAGAGGTGTCCATAAAAAATTGTCTGCTGAATCTGGAATTTATGCCCTGCTCCACATCCCTATTTACTAGATGGTACCAGGCTTTGCCAGTAATCTCTGTTGTAAGCTCCCACTGAAATATCTAGTCTTGGTATTTTATCACTGTCAAATGAGGGATAGTTCAAACCAGAGTTGCAGCTTAGTACAGTTCTTTTGAGAAGCCACCCACTGGTAAATTGCA a s mr.mrrefChr5 138097 119 + 294542 TAGAATACTAAGCTCACAGACCTGAAGAAGTTCATAGTACTTGGTAGAGATAATAGGCTGCTTCTATAACTAACATATAGCTTACGGTTAGCATACCAAGGGTATTCCTGAGTCCTAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287053 118 + 636262 TAGAATACTAAGCTCACAGACTTGAAGAAGTTCATAGTACTTGGTAGAGATAATAGGCTGC-TCTGTAACTAGCACATAGCTTACAGTTAGCATACTAAAGGTATTCCTGATTCCTAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 275374 119 + 647215 TAGAATACTAAGCTCACAGACCTGAAGAGGTTAATAGTACTTGGTAGAGATAATGGGCTACTTCTATAACTAACATATAGCTTACGGTTAGCATACCAAGGGTATTCCTGAGTCCCAGT a s mr.mrrefChr5 138216 104 + 294542 AAAGAAGTGGAATATGACATCCAACTGATCTTATCTGTCAAGTGAGATGAGATCACTTGGATGTCATGTTCTACTTCTTTACTAAGACTGAGGGATACCCTTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287174 104 + 636262 AAAGAAGTGGAATATGACATCCAAGTGATTTTATCTGTCAAGTGAGATGAGATCACTTGGATGTCATGTTCTACTTCTTTACTAAGACTGAGGGATACCCTTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 275493 104 + 647215 AAAGAACTTGAATATGACATTCAACTGATCTTATCTGTCAAGTCAGATGAGATCACTTGGATGTTCTACTCTGCTTCTTTACTGAGACTCAGGAATACCCTTAG a s mr.mrrefChr5 138320 25 + 294542 ATGCTAAGGCTAAAAGCTTATGCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287278 25 + 636262 ATGCTAAGGCTAAAAGCTTATGCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 275598 25 + 647215 ATGCTAACTCTAGAAGCTCAACCCA a s mr.mrrefChr5 138345 118 + 294542 CACGCCAACCTCCCTAATGGAGGGGCTTGTGTTATTGTGGTGGCTCTGCACTGACTAAACATGAGCACAACTATGTGCCAGTTATAGAAGCCTATTATCTCTAACAAATGCTATTAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287303 118 + 636262 CACGCCAACCTCCCTAATGGAGGGGCTTGTGTTATTGTGGTGGCTCTGCACTGACTAAACATGAGCACAACTATGTGCCAGTTATAGAAGCCTATTATCTCTAACAAATGCTATTAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 275627 118 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 280651 444 + 647215 AGTCTTGGTCTGACTTGCAGTCCACTCAGATAATAATGTGTTTGCAAAGATAATTAACAAACGTACGCATTTGATATTCATATTCTTATGTTCAACTTTCAAGTGGCATGCCACTGGCAGTATGAATCGTGTTCAACACATCTTGAGG-ATAAATTGCATTGATGTGATAATGTTTTATAGGGGGCCACAGCATCTCCCATTCCCCGCCTGGGGCTACTCTGGTACAAGTGGGCATCTTGCACAAAGAGTATTGTGCCTAAGGCCGAGGACTTCCGAGGCTGTTTCATCCCATGTCATGATCATCCTGAGAGGCAGCACACATCTTGAACTGCATAATTGTTGCTGAAGTGTTGCAAAT-------------CAA--TATTCCAGAAACCCCTACTCAGTAGTTTCCAGCATACCCAATATAGAATTGTGCAACAGACGATCCTTGATTTGCCTT--GTGAA a s mr.mrrefChr5 143274 88 + 294542 GCAAAATGATCTGACCATCTAATGTGAAGAATCAGGTGAGAAGAAGTTAGAAATCTCATTGTACATCTAAACCTATGGGCAATCTACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292374 88 + 636262 GTGAAATGATCCAACCATTTGAAGTGAAGAATCAGGTGAGAAGAAGTTAGTAACCTCATTGTACATCTTAACCTATGGGCAATCTACT s simRat_chr6.simRat.chr6 281095 88 + 647215 ACAAAATGATCTGACCATCTAATATGAAGAATCAGGTGAGAAGGAATTAGAAATCTCATAGTACATCTAAACCTATCAGCAATCTACT a s mr.mrrefChr5 143362 81 + 294542 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mr.mrrefChr5 144026 95 + 294542 TCCCTTTCCTGGATCTCATATCATGGACTTCGTTAGGCTAATTTGGTCAGGTAGCATCTATGTTGTTTCCTGATCCACACCTGTCGAGTTCATAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293096 95 + 636262 TCCCTTTCCTGGATCTCATATCATGGACTTCGTTAGGCTAATTTGGTCAGGTAGCATCTATGTTGTTTCCTGATCCACACCTGTCGAGTTCATAG s simRat_chr6.simRat.chr6 281895 95 + 647215 TCCCTTCCCTGAATCTCAAATATTGGACTCCAATAGGTTAACTTGGTCAGATAACATCTAGGTTGTTTCCTGACCCACACCTGTGGAGTTCACAG a s mr.mrrefChr5 144121 273 + 294542 GAAGATAGTTTTTGAGACAAAGGGAACTCCTCTGTACTAGTGGCATGGACTGAGTTGCAAAGTGGGACAATGCCAGCCAGAATGAAAAACCCTAGAAGGCATTGAAAAATCTGACACTATTGTGTCGACGTATAACTACCTCCAAACATGATGTAAGTGCACTAAAACCACAAATTTGAATTTGACAAGAGCCATATCTCTGTACACTCACTAACCCATATGTCAGCTGGTGTGACTCTTCCATGGATTCAGTTAAACATGAGAGCTCTGCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293192 250 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 282431 245 + 647215 TCTCAGGTGAGTTCCACCTATTTGCATAAAAAGCTGGATGAAGAACAACCCTCTATTTACAGTTTAGATCAT----GATTCTCTAGGAGATAAAATCTTTTTCGGTACCTGCAATAGAGTTTTATGCATGGAGGCTGTAAAAGGTGTTAGCGATT----GTTCTATCTTGATGTCAGACTGATCAGTAGATGTTACTTTTGTGAATTAGGTTAAATTAAATTTAATATGTGGCTCTGCCTTAATTCATCTTCA a s mr.mrrefChr5 144816 93 + 294542 GATTATAGCTGTATGTGTGTTGGGCTGCTGCCTCTTTTGACAGTTAACTCAGAAATGGAGTTCATTTATTGACTCTTACTCTCAAATCTAAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293862 89 + 636262 ----ATAGCTGTATGTGTGTTTGGCTGCTGCCTCTTTTGACAGTTAACTCAGAAATGGAGTTCATTTATTGACTCTTACTCTCAAATCTAAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 282678 92 + 647215 GATTATAGCTGTATGTGTGTTGGTCTGCTGCCTCTTTTGACAGTAAACTCATAAATGGGGAGCATTTATTTACACTTAC-CTCAAATCTGAAG a s mr.mrrefChr5 144909 112 + 294542 TGTAGGTCAGTATAGGTAGGACGGATAACAACAGTCTTGTCCCCTGTGACCAGGCAGTGTTCTCATATTGTCATTTTAAAACTTCAGTACACAATATATTCCAATGTGATAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293951 112 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 294832 57 + 636262 CTACAATCTATTGAAACTAAGAGAGTTGAAGGAGGCATTTCGCCAATTTGGAAAAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 283647 57 + 647215 ctgcaatctattgaaactgagggagttgaagtagacatttcaccgatttggaacaag a s mr.mrrefChr5 145818 94 + 294542 ctgtgtgttgtactgatttccaaaGCACGCCATAGGATAAAGTGATGGTTGTAACCAGGATCTGGTGGCCTAGAAAAGATGTCACGGGTGATTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294890 94 + 636262 CTGTGTGTTGTACTGATTTCCAAAGCACGCCATAGGATAAAGTGATGGTTGTAACCAGGATCTGGTGGCCTAGAAAAGATGTCACGGGTGATTG s simRat_chr6.simRat.chr6 283704 94 + 647215 ttgtgtgttgtgctgatttccaaaGCATGGCATACGACAAAGTGATGTAGGTAACCAGGATCTGGTGGCCTAGAAAAGACGACAAAGTTGATTA a s mr.mrrefChr5 145912 27 + 294542 TTGTGAATACAGCCTGACTTGTCCACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294984 27 + 636262 TTGTGAATACAGCCTGACTTGTCCACT s simRat_chr6.simRat.chr6 283803 27 + 647215 TCGTGAACCCAGCCTGAGTCGTTGGCT a s mr.mrrefChr5 145939 302 + 294542 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tagtagatggatagttggacgatagaaccagccttagacagctccattttatttccacgtaaagtaatgattttcag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295449 77 + 636262 tagtagatggatagttggacgatagaaccagccttagacagctccattttatttccacgtaaagtaatgattttcag s simRat_chr6.simRat.chr6 284264 77 + 647215 tagtaaatgggtagttggaggatagaaccaaccttagacggctccatttgatttctacataaagtaatgattttCAG a s mr.mrrefChr5 146438 5 + 294542 atacc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295526 5 + 636262 atacc s simRat_chr6.simRat.chr6 284775 5 + 647215 ATACC a s mr.mrrefChr5 146443 11 + 294542 aggatactttc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295531 11 + 636262 aggatactttc s simRat_chr6.simRat.chr6 284784 11 + 647215 AGGATGCTTTT a s mr.mrrefChr5 146454 80 + 294542 gcagtaaaaattgaaagcaggaagcatgatctggccgtcttgatttttttcatttagaatcaactttgacatgggccctc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295555 80 + 636262 gcagtaaaaattgaaagcaggaagcatgatctggccgtcttgatttttttcatttagaatcaactttgacatgggccctc s simRat_chr6.simRat.chr6 284795 80 + 647215 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aggactagatttctcagattcaaaacattcacct a s mr.mrrefChr5 146671 13 + 294542 aagatttaataat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295802 13 + 636262 aagatttaataat s simRat_chr6.simRat.chr6 285013 13 + 647215 aagatttgataat a s mr.mrrefChr5 146684 27 + 294542 ttgacattaatattggtttcccctatt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295816 27 + 636262 ttgacattaatattggtttcccctatt s simRat_chr6.simRat.chr6 285026 27 + 647215 ttggcatgaatattggtttcccctatt a s mr.mrrefChr5 146711 15 + 294542 aatttcaagaaaagg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295845 15 + 636262 aatttcaagaaaagg s simRat_chr6.simRat.chr6 285053 15 + 647215 aatttttagaaaggg a s mr.mrrefChr5 146726 22 + 294542 ttgcaaatcctagtaggctctt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295861 22 + 636262 ttgcaaatcctagtaggctctt s simRat_chr6.simRat.chr6 285068 22 + 647215 ttgcaaatcctagtaggatcct a s mr.mrrefChr5 146748 13 + 294542 tgatgtcttgtac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295883 13 + 636262 tgatgtcttgtac s simRat_chr6.simRat.chr6 285103 13 + 647215 tgatgtcttgtac a s mr.mrrefChr5 146761 8 + 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aaggttactgctcaacagtgtaggccttccttagtatacaatcatggaacctgcaaatacagaaagcataaccctctcctcgcccaat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296035 88 + 636262 aaggttactgctcaacagtgtaggccttccttagtatacaatcatggaacctgcaaatacagaaagcataaccctctcctcgcccaat s simRat_chr6.simRat.chr6 285373 88 + 647215 Aaggttactggtcaacagtgtcagcctccctaagtatacaaccatgtcatctgcaaatacagaaagtataaccttcacctcacccaat a s mr.mrrefChr5 146988 9 + 294542 cacactgca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296126 9 + 636262 cacactgca s simRat_chr6.simRat.chr6 285461 9 + 647215 cacacagcc a s mr.mrrefChr5 146997 17 + 294542 ctcatctctcccctggc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296135 17 + 636262 ctcatctctcccctggc s simRat_chr6.simRat.chr6 285474 17 + 647215 ctcatctttcccctggc a s mr.mrrefChr5 147014 191 + 294542 attgtcctgtggctctggctgattgagaatggtcaacatgtaatcatttttgatttgcttaatcagttggacatatctaggaatggatatcatcatatgcttgttctgattgctgcggtttttgggttgtatcacatttataggcctgcgtgattttagctaacccagctctccagttgtgaaccaaacga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296273 191 + 636262 attgtcctgtggctctggctgattgagaatggtcaacatgtaatcatttttgatttgcttaatcagttggacatatctaggaatggatatcatcatatgcttgttctgattgctgcggtttttgggttgtatcacatttataggcctgcgtgattttagctaacccagctctccagttgtgaaccaaacga s simRat_chr6.simRat.chr6 285491 191 + 647215 attgccctgcggttctggctgattgagaatgatcagcatgtaatcattgttgatttgcttaattagttggacatatctatgaatggatataatcatatggttgttctgatcgctacagtttttgagttgtatcacagttacaggcttgcgtgattttggctaccccagcactccagttgtggacaagacaa a s mr.mrrefChr5 147205 18 + 294542 ttggtacctagtgcaggg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296464 18 + 636262 ttgGTACCTAGTGCAGGG s simRat_chr6.simRat.chr6 285978 18 + 647215 tcagtacttagttcaggg a s mr.mrrefChr5 147223 25 + 294542 ggacaagaacatagcaaatacattg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296482 25 + 636262 GGACAAGAACATAGCAAATACATTG s simRat_chr6.simRat.chr6 285997 25 + 647215 ggacaagataaaagcagataggttg a s mr.mrrefChr5 147248 102 + 294542 agcttggaatccacagtgcgaggccgatgatgtttttgctttgtgatgatttaaacatcagctgggttggtggttatcaccccatttttcaaacctatataa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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simRat_chr6.simRat.chr6 286659 14 + 647215 acagctagaaacca a s mr.mrrefChr5 147870 139 + 294542 ggcaggacacttaccccgaataacctcacactgatggctctcctacagcctgaattggatgcaaagtctcgtgaatattaatctagtcaagtggacttggtcagaaggtgagttcaatcattgggtgttctcattCATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297177 139 + 636262 ggcaggacacttaccccgaataacctcacactgatggCTCTCCTAcagcctgaattggatgcaaagtctcgtgaatattaatctagtcaagtggacttggtcagaaggtgagttcaatcattgggtgttctcattCATG s simRat_chr6.simRat.chr6 286673 139 + 647215 ggcagggcacttacgcagaataacctcgcgccagtagctctcctacaatcagcattggacgcaaagtctggtaaatattaacctagtcaagtggacttggtggggaagtcagtatgatcattgggtgttctcattTATG a s mr.mrrefChr5 148009 52 + 294542 TGTAGGTGGTGTACACCTGTCACATACTACCAGGTCTCATGCCTGTTGTTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297317 52 + 636262 TGTAGGTGGTGTACACCTGTCACATACTACCAGGTCTCATGCCTGTTGTTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 286812 52 + 647215 TATAGGTGGCGTACATCTGTCACACACTACTAGGTCTCATGCCAGTTGTCGC a s mr.mrrefChr5 148061 31 + 294542 ACTAACTTATCCAGAATTGTAACAGAATTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 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GAAACCCAAGCTTCACCAATGTAGTAATGACTATCTTGGATCTATAAGATCTTCCTCTAATAACTGGGGAAGGGCAGAATATTGATGAGTTGACTCTAGAGGTGCTAAAATGCTAATATAAATGAATTGTGATACTGAGCCACATGAGTAGTGAAACAAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCTGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCTAGAGCATTCTCTAAGGCTGACAGACATACTTGAGTTTTTACTCCGATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACATAGGGGGAGGTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303931 306 + 636262 GAAACTTAAGCTTCACCAATGTAGTATTGACTATCTTGGACCTACAAGATCTTCCCCTAATAACTAGGGAAGGGCAGAATATTGATGAGTTGACTCTTGAGGTGCTAAAGTGCTAATATAAAGGGATTGTGATACTGAGCCACATGAGTAGTCAAACAAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCTGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCT----------CTAAGGCTGACAGACATATTTGAGTTTTTACTCCGATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACATAGGGGGAGATGT s simRat_chr6.simRat.chr6 295661 312 + 647215 ----CCCAAGCTTCACCAATGTAGTGATGACTATCTAGGGTCTATAAGATCTTCCTCTAATAACTGGGGAAGGGTAGAATATTTATGAGTTGACTCTAGAGGTGTTAAAATGCTAATATGAATGAATTGCAATACTGAGTCACATGAGTAGTGAACCCAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCCGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCTAGAGCATTCTTTAAGACTGACAGACATACTTAAGCTCTTACTCCCATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACACAGGGGGAGGTGT a s mr.mrrefChr5 154682 14 + 294542 TAGTGAACAACCAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304237 14 + 636262 TAGTGGACAACCAC s simRat_chr6.simRat.chr6 296021 14 + 647215 TAGTGAACAACCAC a s mr.mrrefChr5 154696 364 + 294542 TACGGGATGACTCTGTGTGGTTAGTTAATTAAGCACCCTTGCCCTAACTTGGGTTCAGTCACGCTTCTCATCTTACTGTTTAACATCAGATCTTTGAAGCCATATCAAAGCTCCCCTATTGTATAACCCTCACAACAGCTCAAGGAACATTTTGCATTCAATCATGGAGGTGAGATTGCTGATGATTCATTTCTACCAGCCTAGGATACCACAAGACCCATGGTGATGAGTGGTTGTGTTAAGGACACACATCTAAGTGTGATCAAGGCACCCAGGGGCCTATGGTTCCTTGAATATCCTAAGAAGTAATTGTAGACTGTCATGATAAGACTGTGATTTGCTTGCAATTTAGTCAGTGTCAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304251 357 + 636262 TATGGGATGACTCTGTGTGGTTAGTTAATTAAGCACCCTTGTCCTAACTTGGATTCAGTCACGCTTCACATCTTACTGTTCAACATCAGATCTTTGAAGCCATATCAAAGCTCCCCTATTGTATAACCCTCACAATAGCTCAAGGAACATTTTGCATTCAATCATGGAGGTGAGATTGCTGATGATTCATTTCTACCAACCTAGGATAACACAAGACCCATAGTGCTGAGTGGTTGTGTTAAGAACACACATTTAGGTATGATCAAGGCAACCAGGGGGCTATGTTTCCTGGAATATCCTAAGAAGTGATTGTAGACTG-----ATAAGACTGTGATTTGCTTGCAATTTCGTCAGTGTCAG-- s simRat_chr6.simRat.chr6 296038 342 + 647215 TACTGGATGACTCTCTGTGGTTAGGTAATTAAGCACCCTTGCCCTGACTTGGGTTCAGTCAAGCTTCTCATTTTACTGTTTAGCATCAGATCTTTGAAGCCACATCAAAGC-------------------CACAACAGCTCAAGGAACATTTTACATTCAATCACAGATGAGAGATGGCTGCTGATTCATTTCTACTGGCCAAGGATACCACAATACCCATGGGGATGAGTGGTTGTGTCAAGGACACACATCTAAGTGTGAACAAGGCACCCAGAGGCCTATAGTTCCTTGATTATCCTAAGAAGCAATTGCAGACTGTCATGGTAAGACTGTGA---GCTTGCAATCTAGCCAGTGTCAGGT a s mr.mrrefChr5 155060 54 + 294542 TAGACAGGGTGTCTAACACTGTGAGTATACTAGGTTTGTGGGAGTTATTATTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304608 41 + 636262 -------------TGACATCGTGAGTATACTAGGTTTGTGGTAGTTATTATTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 296381 54 + 647215 TAGACAGGGTGTCTAACACTGTGAGTATACTAGGCTGGTGAGAGTTACTATTTG a s mr.mrrefChr5 155114 38 + 294542 TCCTATCAACCCAATGGGGTTATGAAATGCCAACTCAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304650 38 + 636262 TCCTATCAACCCAATGGGGTTATGAAATGCCAACTCAC s simRat_chr6.simRat.chr6 296435 37 + 647215 TCCTATCAACCCAATGGGATTATGAAGTGTCAACTCA- a s mr.mrrefChr5 155152 390 + 294542 TTTTCAGCGGCATTTTTTCAGTGAGTATAGCATGAATTAGATGTACAGGGAGGACAAATTTATTGGCATACACTGATAAAACTTAGGGCAATTTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATGTTACAAGGCAACTGTTCATGCCCTGTTAGATTGCTTTAACACACCATGATCATTCCTACTATTGCTACTGTATACTTGCCTCGGGCATGTGGGCACATGTGTTTGGTATTAATATGCCATGAACCTGCTGTTAATCCTCTAACAATGCTGATTACAATCTTCTTACCTAGGAAAACCAGATAGGCTAACCACATTATTAGGACCTGTATTGGAGGTGTTCGTTTACCCACGTCATGCTCCCAAGTGTGATCCCCAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304690 390 + 636262 TTTTCAGCAGCATTTTTTCAATGCGTATAGCATGAATTAGGTGTGCAGGGAGGACAAATTTAATGGCATACACTGATAAAACTTAGGGCAATTTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATATTACAAGGCAACTGTTCATGCTCTGTTAGATTGTTTTAACACACCATGATCATTCCTACTATTGCTACTGTATACTTGCCTCGGGCATGTGGGCACGTGTGTTTGGTATTAATATGCCATGAACTTGTTATTAATCCTCTAACAATGTGGTTTGCAATCTTCTTACGTAGGAAAACCAGATAGGCTAACCACGTTATTAGGACCTGCATTGGAGGTGTTTGTTTACCCACGTCATGCTCCCAAGAGTGATTCCTGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 296472 373 + 647215 ---TCAGCGGCATTTTTTCAGTGAGTATAGCATGAATTAGATGTACAAGGAGGACAAATTTATTGGCAAACACTGATAAAACTTAGGGAAATCTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATGTCACAAGGCAACTGCACATGTCCTGTGAGATTACTTTAACACACAATGCTCATT--TACTATTGCTATTGTATACGTGCCTCGGGCATGTGGGCTCATATGTTTGGTATTAATATGCCAGGAGCCTACTGTTAATC----------GCTGATTACAATATTCTTCCCTAGGGAAACCAGATAGGCCAACTACATTATTAGGACCTGTATTGGAGATGTTCTTTTACCCACGTCA--CTCCCAATTGTGATCCCCAGA a s mr.mrrefChr5 155542 247 + 294542 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305281 91 + 636262 AACTTATATATCAGCTAAATGACTAAATAAAAAAAATAATATTCCTCTGAGAGATGACGTACACCATATATTACCCTAGGGGATGTAACCT s simRat_chr6.simRat.chr6 297085 60 + 647215 AACTTATAGATCACCTACATGACTATGTTAAAAAAATAAAAT-CCTCTGAGAGATGACGTA------------------------------ a s mr.mrrefChr5 155880 128 + 294542 TTGCATAACAGCCATGCCCCCATAACCCAGGTCTTTGTTCCTAATCTGTGTGACATCATTGGAGAGAACAACTGGCATCCAGGTCATCTACTCCTCCAAAGTTATGGCATGAACTCTTAAGCTGTAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305373 128 + 636262 TTGCATAACAGCCATGCCCCCATAACCCAAGTCTTTGTTCCTAATCTGTGTAACATCATTGGAGAGAACAACTGGCATCCAGGTCATCTACTCCTCCAAAGCTATGGCATGAACTCTTAAGCTGTAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 297145 118 + 647215 ----------GCAATGCCCCCATAACCCAGGTTTTTGTTTCAAAGCTGTGTGACATCATTGGGGAGAACAACTTCCATCTAGGTCATCTGCTCGTCCAAAGTTGTGGCATGAGCTCTTAAACAGTAGT a s mr.mrrefChr5 156008 12 + 294542 GGAAGTGTTTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305503 12 + 636262 GGAAGTGTTTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 297263 12 + 647215 GGAAGTGTTTAT a s mr.mrrefChr5 156020 252 + 294542 TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTCTGCTCTATTACATTTATCTATGGAGACTAACGTTCCCTTAAAGTTCTGGTGCTTATCCCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCATATAAGGCCAATCTGTCTACTGCCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCATGATATAACTGAGCTGAGGTTTTTGAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305515 252 + 636262 TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTGTGCTCTATTACATTTATCTATAGAGACTAACGTTCCCCAAAAGTTCTGGTGCTTATCTCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGGACAGCTGGGTCATATAAGGACAATCTGTCTACTGGCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCACGATATAACTGAGCAGAGGTTTTTGAAAATAGAGGATTAAGGTTTAACA s simRat_chr6.simRat.chr6 297277 252 + 647215 TGAAGCTGTAATTGCTATAATACCCTGGGAAGTTCATGCCTCTTCTGTTCTATTACATTTGTCTATGGAGACTAATGTACTCTTAATGTTCTGGTCCTTATCCCCGAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCACATAAGGCCAATCTGTCTGCTGCCATAACTTTGAAGCATACCTTTTGCCCATCTCCATGATATAACTGAGCTAAGGTTTTTTAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA a s mr.mrrefChr5 156272 72 + 294542 CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAGAAGGTGAGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACAGGGTGTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305769 68 + 636262 CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAG----TGGGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACTGGGTGTAT s simRat_chr6.simRat.chr6 297529 72 + 647215 CCTGAAGCAATGGGTTTGTGTAGAAGGTGAGTGAGCCCGATTCACATTGAGCTCTATCTGGACAGGATGTAC a s mr.mrrefChr5 156344 64 + 294542 ATTTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACTTAGAATGGCTAACCAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305910 64 + 636262 ATCTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACCTAGAATAGCTGGCCAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 297601 64 + 647215 ATTGAGGGGGTTAGCCTGCTCATCAGCACTTACTAATCCGCCGTACTTAGAATGACTAACCAAT a s mr.mrrefChr5 156408 477 + 294542 CAGTCTGGTGGTTGATGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGGATTGGTATTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATGCCTTTATGTTTCTTTTATCTTAGGCATACTTCCGTCATAAACAGAGTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTCAACCTTATGCTTACACAAGTAAGAACTTAGGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGACAGTCTTGTTAGCACCATTCCTTGTACAGGAACCTCTGATTCGCATTCACAATTCTGCACTACCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACTAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCATACACAAGCTTTTCTCACAGCATGGGTGAGGTGTGGTATAGTGGCTTAATATTTTGGGCACTTTTTCTCTCTGGAAAATCAGTTCAAAGAAGAGCTACATCCAGCACC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306031 473 + 636262 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CAGTCTGGTGGTTGGTGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGG-----TAGTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATCC------GTTCCTTTTATCTTAGTCATACTTCTGTCATAAAAAGATTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTTAACCTTATGCTTAGACAAGTGAGAACTTAAGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGATAGTCTTGTTAGCACCACTCCTTATACAGGAACCTCTGCTTCACATTCACAATTCTGCACTGCCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACGAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCACGCAAAAGCT--------TGCATGGGTGAGGTGTAGTATAGTGGCTTAGTATTTTGGGCACTTTTTCTCTGTGGAAAATCAG-TCAAAGAGGAGGTACATCCAGCACC a s mr.mrrefChr5 156885 208 + 294542 ATGTAGGATGTCACCCTTGAGTGGCATGGGCAGTGAAACAGCTGGTTTATTAATGTACAACTTCAAGCAGTGTCCCAATGGGTGTAGTCAACATATAATATCAGACCTTCACTACAGAAGGCTCCATACAGAGGTTACACTCACATGCTCTGTCAATCAGAAAGACCCTACATCTATAGGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTATGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306505 208 + 636262 AGGTAAGATGTCACCCTTGAGTGGCACGGGCAGTAAAACAGCTGATTTATAAATGTACGACTTCAAGCAGCGTCCCAATGGGTGTAGTCAACATATAATATCAGACCTTCACTACAGAAGGCTCCATACAGAGGTTACACTCACATGCTCTGTCAATCAGAAAGACCCTACATCTATAGGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTATGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 298122 208 + 647215 ATGTAGGATGTAACCCTTGGGTGGCATGGGCAGTGAAACAGCTGGTTTATTAATGTACAACTTCGAGCAGTGTCCTAATGCGTGTAGCCAATATATAATGTCAGACTTTCACTAGAGAAGGCTCCATACGGAGATTACACTCGCATGCTGTGTCAATCAGAAAGACGCTACATCTATAAGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTGAGCA a s mr.mrrefChr5 157093 196 + 294542 CTTGCTGATAATTTTCCTGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTTACAATCATGTAACAGTGGCTACTTCAATTCCATATGTGAAAGCCAATGCTAGTTGATGATAAAGGTATAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTTAAGTGGCAGACTTGCTGATGCACCAATAAGTTACACACATACTCTAGTCTACAGTTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306720 196 + 636262 CTTGCTGATAATTTTCCCGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTTACAATCATGTAACAGTAGCTACTTCAACTCCGTATGTGAAAGCCAATGCTAGTTGATGATAAAGGTATAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTCAAGTGGCAGACTTGTCGATGCACCAATAAATTACACACATACTCTAGTCTACAGTTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 298330 196 + 647215 CTTGCTGATAATTTTTCTGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTCAAAATCACGTAACAGTGGCTACTTCAATTCCATATATGAAAGCCAATGCTACTTGATAACAAAAGTGTAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTTAAGTGGCAGACTTGCTGATGCACCAATAAGTTACACACATACTCTAGACTACAATTGT a s mr.mrrefChr5 157289 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TATTTGCTTGCTCATCTACTCTTCCGCTGTGCTGTTAATCTTATTTTGGGTTGAGTCTATGATTGATATAATGATAAGATTAGTAGGATGAATTGGGGGAAACAAACGCTGGCATGTAAAGACACTCCACCTTACAGTTGATTCCTTATTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGTATAGTAGTGCCATTAAGTGGTGTCTATTGTCAAAGACAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTTACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGTTTTTTCTGTTGCTGCTGCCCATAGGTTCCCAGTAAACCAAATTGATCTGAAGATTGATTGGTCTGACACTCCAGGCATGCAACTAGAAGATGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307252 366 + 636262 TATTTGCTTGCTCATCTACTCTTCCGCTGTGCTGTTAATCTTATTTTGGGTTAAGTCTATGATTGGTATGATGATAAGATTAGTAGGATGAATTGGGGGAAACAGATGCTGGCATGTAAAGACACTCCACTTTACAGTTTATGCCTTAGTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGCATAGTGGTGCCATCAAGTGGTGTCTTTTGTCAGAGACAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTTACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGCTTTTTTTGTTGCTGCTGCCCATAGGTTCCCAGCAAACCTAATTGATCTGAACATTGATTGGTCTGACACTCCAGGCATGCAACTAGAAGATGT s simRat_chr6.simRat.chr6 298866 362 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 312080 50 + 636262 TCTAGTTTGACTGCAGGAGGAACAACAATAGTTTATAGTTACTCACCCTA s simRat_chr6.simRat.chr6 303712 50 + 647215 TCTGGCTTAAATGCAGTTTGAACAGCAATAATTTATAGTTACCCACCCTC a s mr.mrrefChr5 162352 114 + 294542 TAATGCAGAGGGCGGTAATGTGGACTGCACTAGGTACTCCATGTTTCTACTTGAAGGAAAAAGGTCTGACCCCTACTCCCATTTATGTCAACTCAGATTCAGTACCACTTTCCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312139 114 + 636262 TAATGCAGAGGGCGGTAATGTGGACTGCACTAGGTACTCCATGTTTCTACTTGAAGGAAAAAGGTCTGACCCCTACTCCCATTTATGTCAACTCAGATTCAGTACCACTTTCCT s simRat_chr6.simRat.chr6 303762 114 + 647215 TGATGTGGAGGCAGGTAATGTGGACTACACTAGGTACTCCACATTTCCACCTGAAGGAAAAAGGTCTAACCCCAACTCCCATTTATGTCAGCACAGATTCTATATCACTTTCCT a s mr.mrrefChr5 162466 65 + 294542 GTCTGTCATCTTAGTTCCTTATTCACAAGAGACAGTCATGACAGTGTGAGACACCTTATTTAAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312253 65 + 636262 GTCTGTCATCTTAGTTCCTTATTCACAAGAGACAGTCATGACAGTGTGAGACACCTTATTTAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 303877 65 + 647215 GTTTATCGTCTCCATTCCTATTATACAAGAGACAGTCATGGCAGTGTGAGATACCTTATCTAAAA 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simRat_chr6.simRat.chr6 306215 10 + 647215 ACGAAGATAT a s mr.mrrefChr5 164647 178 + 294542 CACACTTGGTATCCCTATCTGTGGCAAGAGAGTGGATTAAATGATTTATTTTAGCTATATGACCTTAGATTCACTGCCTTTCCTATAGTTCAGAGGTTGTGGACACACCACCACATATATAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCACACATAGGTGACTTACAGGAATCTGATAACCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314530 176 + 636262 CACACTTGTTATCCCTATCTATGGCCAGAGAGTGGATTAAATGATTTATTTTAGCTATGTGACCTTAGATTCACTGACTTTCTTAT-GTTCAGAGGTTGTGGACACACCACCACATATATAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCACACATAGGT-ACTTACAGGAATCTGATAACCA s simRat_chr6.simRat.chr6 306225 166 + 647215 CACACTTGGGATCCCTATCTGTGGCAAGAGAGTGG------------ATTTTTGGTGCATGACCTTAGATTCATTGCCTTTCCTTTAGTTCGGAGGTTGTAGACACACCACCAAATATAGAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCCCACATAGGTGACTTTCTGGAATCTGATAACCA a s mr.mrrefChr5 164825 163 + 294542 TTGCATAACTGACTGGGTTTCACACCTTCTTTCCCATCAGGACACTCTGTGCATGGAATCTGACAACATGGCTTCCCATATATGAAGAGCATCTCACTTGCTGTGAGAATTGGAGCCAGCAGATGTGGAAAATACCCTACTTGATAGTCTTATGTCTGGCAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314706 163 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 311788 145 + 647215 --ACCCCAGCAGACTCATGTTAAATAGATCCCCCATGGTGCTCAGGTTCAAAAAAGAGAGGGAAGAGTTTACAAAACTAGATCAGATGTTTGATATTTGAAAAGTTGGGTCAGACAAGGTTGCTATAAGGATTCTATAGCACACCCC------------------------ a s mr.mrrefChr5 170133 35 + 294542 AGAAAATAGGTAGCAACCACCAGTCAATGCAGGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320213 35 + 636262 AGAAAATAGGTAGCAACCACCAGTCAATGCAGGAG a s mr.mrrefChr5 170168 4 + 294542 ACCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320342 4 + 636262 ACCC s simRat_chr6.simRat.chr6 311933 4 + 647215 ACCC a s mr.mrrefChr5 170172 30 + 294542 AGACCAGACCTTATCAAGGAGTGTGGGTCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320346 30 + 636262 AGACCAGACCTTATCAAGGAGTGTGGGTCC s simRat_chr6.simRat.chr6 311939 30 + 647215 GGACCAGACCTTATCAAGGACTGTGGTCCC a s mr.mrrefChr5 170202 20 + 294542 ACCCATTACGATGTAGCACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320383 20 + 636262 ACCCATTACGATGTAGCACT s simRat_chr6.simRat.chr6 311969 20 + 647215 ACCCATTACGATGTAGCACT a s mr.mrrefChr5 170222 102 + 294542 TGACGCGTGTCATACCTGGACCAGATTTATTAATGACTATGGGTCCACCTACCTCAATGTAGGTCTCACTGGGGGAAATGAATTTCACTTCTACAGCAGGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320403 101 + 636262 TGACGCGTGTCATACCTGGACCAGATTTATTAATGACTATGGGTCCACCTACCTCAATGTAGGTCTCACT-GGGGAAATGAATTTCACTTCTACAGCAGGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 311999 102 + 647215 TAATGACTGGCATACTTGGACCAGACTTATTAATGACTGTGGGTCCACCCATCTCAGTGTAGCACTCATTGGGGGAAATGAATTTCACATCTACAGCAGGCA a s mr.mrrefChr5 170324 21 + 294542 AGGTCAGATTGCTTATCATCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320504 21 + 636262 AGGTCAGATTGCTTATCATCA s simRat_chr6.simRat.chr6 312106 21 + 647215 AGGTCAGATTGCTTATTATCA a s mr.mrrefChr5 170345 120 + 294542 ATTGCACTTGTCACACTATCTCCGCTATATATGGGGTTTGATCAATGAAGATTCAACTTTCCATGAGTCCTTTTTGTTTATATTGTTAAATCACCCGTGATATCCTAGCAAATTTCCTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320525 119 + 636262 ATTGCCCTTGTCACACAATCTCCGCTATATATGGGGTTTGATCAATGAAGATTCAACTTTCCATGAGTCCTTTTTGTTCATATTGGTAAATCA-CCGTGATATCCTAACAAATTTCCTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 312135 114 + 647215 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s simRat_chr6.simRat.chr6 313111 157 + 647215 ATGTAGAAACAAAACCTGGCCAATGTCAATGTCCTGAAAAACCCTACTGCCTCATGCTGAGATATCACTAGCAAGATGAGGTCGGGCAATCTTCACTGTGCACTGTGGTTACGTATGTCTTTATGACCTAACCCTCAATCTTTACAACCCTAGTTAC a s mr.mrrefChr5 171421 63 + 294542 TGCACCACCTTAACTATAATCCTTTATCCCGCTATGATTGCATTAAAGCTGAACCCTTCAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321625 61 + 636262 TGCACTGCCTTAACTATAACCCTTTACCCCGCTAGGATTGCATTAAAGCTGAACCCTTCAG-- s simRat_chr6.simRat.chr6 313279 59 + 647215 TGCCCCACCCTAACTAGAATGCTTTATCC--CTATGATTGCA-TAAAACTGAA-CCTTCAGGT a s mr.mrrefChr5 171484 113 + 294542 ACCCAATATGTAGTAGCCCTCACCTTGATTTGGCAAGGAGAATGCATATAAGCCCTTAGTACCATGATTCTCCAATGAATAGGAGAGTAATAAGTCAAGAACCTGAACATTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321686 113 + 636262 ACCCAATATGTAACAGCCCTCACCTTGATTTGGCAAGGAGAGTGCATATAAGCCCTTAGTACCATGATTCTCCAATGAATGGGAGAGTAATAAGTCAAGAACCTGAAGATTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 313339 112 + 647215 ACCCAACATGTAGTAAAACTCACCTTGACTTGGC-AGTAGAATGCATATAATCCCTTAGTGCCATGATTCTCCAATGAATAGGACAGTAATAAGTCAGGAACCTGAACATTCA a s mr.mrrefChr5 171597 80 + 294542 TATATGGCTTTTGGGAACCCCAGGGTCTAAGTTCATTGAGCTACAGGGTCACAATAGAGACTATTGAGTCCTCAGAAAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321799 80 + 636262 TATATGGCTTTTGGGAACTCCAGGGTCTAAGCTCATCGAGTTACAGGATCACAATAGAGGATATTGAGTCCTCACAAAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 313463 80 + 647215 TATATGGCTTTCGTGAACCCCAGGGTCTAAGTTCATTAAGCTACAGGGTCACAATAGAGACTATTGAGTCCTCAGAAGTT a s mr.mrrefChr5 171677 34 + 294542 AGTGCCCTGCTGGAAATATTCCTATTTGCAATAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321896 34 + 636262 AGTGCCCTGTTGGAAATATTCCTATTTGCAGTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 313543 34 + 647215 AGTGCCCTGCTGGAAATGTTCCTATTAGCAATAA a s mr.mrrefChr5 171711 122 + 294542 cctcgacaaacaactcatagaggattgttagcatgtgatcctgctctgcctgctcgatcggcccgtcatctcttaggtgattctcttgatcagcccagttaataggttgtattatgctaata s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323656 122 + 636262 cctcgacaaacaactcatagaggattgttagcatgtgatcctgctctgcctgctcgatcggcccgtcatctcttaggtgattctcttgatcagcccagttaataggttgtattatgctaata s simRat_chr6.simRat.chr6 315210 122 + 647215 cctctatacacaactcattgaggatcattagcatgtgattgtgctctgttggttcaatcagcccatcatctcttatgtgattctcctgattggccttgttaatgggttgtatagtgttaata a s mr.mrrefChr5 171833 227 + 294542 aggtcttcatatcttgcacactcctgggatccctggggtgagttgcaagtgattgtaatgtattggctttccgaccatttgctggtagtttcggttggcaagtatctggttcaagttcctgtcttgcaagatcaaaaccacaggtctaactctctgtcctctcactatggctttacttggtttggataccagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323797 227 + 636262 aggtcttcatatcttgcacactcctgggatccctggggtgagttgcaagtgattgtaatgtattggctttccgaccatttgctggtagtttcggttggcaagtatctggttcaagttcctgtcttgcaagatcaaaaccacaggtctaactctctgtcctctcactatggctttacttggtttggataccagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta s simRat_chr6.simRat.chr6 315332 227 + 647215 atgtcttcatttcttgcaccatcctggcattcctggggcgaattctgagtggttgtaatgaattaactgtctggccatttgctggtagtttcgcttggcaagtgtctgggtcaggttcccatctttcaagatcaaaaacaaaggtctaactctctgttctctcactgtggctttactcgatttggatatcagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta a s mr.mrrefChr5 172060 95 + 294542 tccccttaatttcaatggactgtggatcaagaaCTTTAGCAGCTGTGTGGAATGACCTGGAACCATAGCATAGGTAGTCAAAACCAAAAATGTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324025 95 + 636262 tccccttaatttcaatggactgtggatcaagaaCTTTAGCAGCTGTGTGGAATGCCCTGGAACCATAGCATAGGTAGTCAAAACCAAAAATGTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 315559 95 + 647215 tccccttgctttcaatgaattgtggctcgggAACTTTACCAGCTGTGTGGAATGACCTGTAACCATAGTGTGGGTAGACAAAATCAAAAATGTTC a s mr.mrrefChr5 172155 104 + 294542 AAGCTTGTCTTCAAATTGCATGAAGTCACACCTTGATGGCATGATCCTTGCCTCTTTGTAGAAAACAATCATGTTCCCTGCTTCTTAGAAGTAAACAGTGGCAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324120 102 + 636262 AATCACACCTTCAAAT--CATGCACATAGATCTGGGTAGGATGATCCTTGCCTCTTTGCAGAAAATAATCATGTTCCCTGCTTCTTAGAAGTAAACAGTGGCAC s simRat_chr6.simRat.chr6 315655 104 + 647215 AAGATTGTCTTCCATTTGCATGAAGTCACACCTTCAAGGCATGATCCCTGCTTCCCTGTAGAAAACAGTTGTGTGCCCTGCTTCCTAGAAGAAAACAGTTGCAC a s mr.mrrefChr5 172259 153 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 324620 175 + 636262 TGATGGTCTGTCATGGTATTCATTAGTGTACATGAGCTTAGCAAAACAATCTCGTATGCTTAAATGCTGCCTGTATTTGCTTTGCTTGTGTAGGGTGATGCAAACGAAAAATCTGGATATTACACTCAAAAA-TTCATTAAGGCAGTCCTCCCATTTCTGATCTGTAAGTAACCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 316114 113 + 647215 ----------------------------------------------------CATATGCCCAAACGCTGCCT----TTGCTTTGTTTGTGTAGAGTGATGTAAACGAAAAATCTGGATATTACACTCAAAAAGTACATTAAGGCAGTCCTCCTAATTCTGACACGTAAG------- a s mr.mrrefChr5 172828 289 + 294542 TACTAACTTACTCATTATTTAAACAGCGGTCAAGATTGTGGTCTTATTAGTTTGAGCTTCATGTATAGGCATGTGAAGCTGTGCGCCCTGTATTTAACACCCTCTCCTTTGTATTCCCCCCAGGTCTGCTTCCCTCAGAGGCTTTTCTGCACGGATCTTCTGCAGGTGAGGCTGTTCTATTTTGAATTGCTGGTCAAATCAAGACTCAATTACAGTGGATAAGTAATCAACTGAAAACAATCTGCTCCTTCTGGTCCTCTGCTCCTGAATCTTGAGTGATGACTAATGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324797 289 + 636262 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a s mr.mrrefChr5 173864 121 + 294542 AACCTAGCCTGGTGTTTATACACCTTGAGTGATGGTCTGAACCTAAATAGGCGTGATATGACTAGAATGCATGATATCACTGCAATCATTTACATCTCAAAGACACCTAATTGATGGGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325855 121 + 636262 AACCTATCCTGGTGTTTATACACCTTGATTGATGGGCTGAACCCAAATAGGCGTGATATGAATAGAATGCATGATATCACTACAATCATCTGCATCTCAAAGACACCTAATTGATGGGCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 317242 120 + 647215 AACCTAGCCTG-TGTTTATACACCTTGAGTGATGGTCTGAACCTGAGTTGACACGACATGTCTAGAATGCATGATATCACTGCAATAAATTACATCTCAAAGACACCTAATTGAGGGGCTT a s mr.mrrefChr5 173985 162 + 294542 TATGATTTCCCTCAGTTTGAGACAGTGTATGCCCATGTAGGGACAATACCCACTTTTTATATCAAAAAATACGGACTATCAGTCAATAAAGGTCTGTACTGAGAATACTGCATCTAATTACCAACACTATGAAGTTTAGTTGACTCCTGCTATCCTTTGTGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325977 162 + 636262 TATTATTTCCCTCAGTTGGAGACAGTGTATGCCCATGTAGGGACAATACCCATTTCTAATATCAAAAAATACGGACTATCAGTCAATAAAGGTCTGTACTGAGAATACCGCATCTAATTACCAACACTATGAAGTTTAGTTGACTCCTGCTATCCTTTGTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 317362 145 + 647215 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AGCTAGGCTATGCCTACGTATCTGATCCCTTTAGAGTCATATCCACCCCCAGCTTCGACACGACTAAGACAGTGGATACCTAAGCTGGGCCTGCTATACAGTGGTCGGTAGCACCTATTTGACATTTATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335636 105 + 636262 ------------------------ATCCCTTTGGCGTCATATCCACCCCCAGCCTCGGCACGACTAAGACAGTGGATACCTAAGATGGGCCTGC-ATACAGTGGTCGGTAGCACCTATTTTACATTTATG s simRat_chr6.simRat.chr6 326725 130 + 647215 AGCTAGGCTATGCCTACGTATCTGATCCCTTTAGAGTCATATACGCCCCCGGCTTGGACGCTGCTAAGACACTGGATACCTAAGCTGGGCCTGCTGTACTGTGGTCAGTAGCACCAATTTGACATTTATA a s mr.mrrefChr5 183210 94 + 294542 TTGAAAGGGATAGCATACATATGGCCATTGCAGGAGAGTGTCTTAGTGCCCATATAGTCTTACACTCACTTGGTGACAGACAGGATGCAGTAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335741 92 + 636262 TTGAAAGGGATAGGATACATGTGGCCATTGCAGAAGA--GTCTTAGTGCCCATATAGTCTTACACTCACTTGATGACAGACAGGAGGCAGTAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 326900 94 + 647215 TTGAAAGGGATAGCATACATATGGCCAGTGCAGGAGAGTGTCTCAGTGCCCATACAGTCTTAACCCCACTTGGTGACAGATAGGATGCAGCAGA a s mr.mrrefChr5 183304 80 + 294542 ATAAATCATAACCAATAACTAAAAAATTGATGGAGACATCAATCCTGTGGTGTGCAGACTGTGATGACCACATGACACAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335833 80 + 636262 ATAAATCATAACCAATAACTAAAAAATTGATGGAGACATCAACCCTGTGGTATGCAGACTGTAATGACCACAGGACACAT s simRat_chr6.simRat.chr6 326998 80 + 647215 ATAAATCATAACCAATAACTAAAAACTTGATGGAGGCATCAATCCTGTGGTGTGCAGAGTGGGATGACCACATGAGCCAT a s mr.mrrefChr5 183384 35 + 294542 ATTGTTCGGGGTACACAAAGCATCACAAGGCATGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335937 35 + 636262 ATTGTTCGGGGTACACAATGCATCACAAGGCTTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 327078 35 + 647215 ATTGTTTGGGGCACACTAAGCATCACAGGGCATGT a s mr.mrrefChr5 183419 62 + 294542 AGGAATTTTGCTGAAGTTATTTCATGTTGCGGGCCTATGGCAATTAGCTTGCTGAAAGCTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335972 62 + 636262 AGGAATTTTGCTGAAGTTATTCCATGTTGCGGGTCTATGGCAATTAGCTTGCTGAAAGCTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 327126 62 + 647215 AGAAATTTTGTTGAAGTTATTTCATGTTGCGGACCTGGGGGAATTGGCTTGCTAAATGCTTT a s mr.mrrefChr5 183481 272 + 294542 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10 + 636262 CAGGCGAAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 327466 10 + 647215 CAGTTCAAGA a s mr.mrrefChr5 183763 122 + 294542 GCTAGACTAATGTGATGAATTTTCCCAACAGTGGGCTAACTTTGTAAATTCTGACTGATCCCACCTATTTAACATTCTACGGATATACGGGTAAGACCTACCCTGAGTTTCAGCTGATGATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336292 121 + 636262 GCTAGACTAATGTGATGCA-TTTCCCAACAGTGGGCTAACTTTGTAAACTCTGACTGATTCCACTTCTTTACCATTCTACGGATATACGGCTAAGACCTACCCTGAGTTTCAGCTGATGATG s simRat_chr6.simRat.chr6 327478 122 + 647215 GTTAGACTAATGCGATGAATTTTCCCAGCACTGGGTTAACTTTGTAAATTCTGATTGACCCCACCCATTTAACATTCTATGGATATATGGGTAAGACCTACTCTGAGTTCCAGCTGATGATG a s mr.mrrefChr5 183885 379 + 294542 GGTCCTTGGTGTCAGCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCGTTTTTGACAGTGCCTAGCTAACCAAAACCTACAATCTGTAAGGTTAGTGAACTAATGGGATCAACCCTCTATCGTGACCAGTCCCGGAGGACATTGGCACTCTTGCTATTGAATATCCTAAGTCAGGCAATAAATTAGATCATTGCTCTGTACCTCGAGTCTCAACTAGGTAGCTAGGTACCACACAGCAATCAATCATAATAGATTGACTTCCCTACTAACTAAATCTAGGAATTCATTTTTAGATCCAATAATATCTATGCTGTTAACTAAAGCATTAAGGGTCTTGGGGGGGTGAGTTTCTAGGGGATGGGTTTTGGAAGTAGCCAATGAGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336413 378 + 636262 GGTCCTTGGTGTCAGCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCATTCTTGACAGTGCCTAGCTAGCCAAAACCTACAATCTGTAAGGTTAGTGATCTAATGGGATCAACCCTCTATCGTGACCAGTCTTGGAGGACATTGGCACTCTTGCTATTGAATGTCCTAAGACAGGCAATAAATTAGATCATTGCTCCATACCTCGAGTCTCAACTAGGTACCCAGGTACCACACGGCAAACAATCTTAATAGATTGACTTCCCTACTAACTAGATCTAGGAATTCATATTTAGATCCAATAATCTCTATGCCGTTAACTAAAGCATTAAGGGTC-TGGGGGGGTGAGTTTCTAGGGGATGGGTTTTGGACGTAGCCAATGAGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 327601 354 + 647215 CATCCTTGGTGTCTTCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCGTTTTTTACAATGCTTAGCTAAGCAAAGCCTACAATCAGTAAAGTTAGTGAACTAATGGGATGAACCCTCTATAGTGACCAGGCCCGGAA---------------------GCATATCTTAAGTCAGGCAATAAAATG----ACTGCTCTGTATCTCAAGTCTCAACTAGTTAGCTAGGTACCACACAGCAATCAATCATAGTAGATTGACTTCCCTACTAACTAAATCTATGAGGTCATTTTCTGATCCAATAATATCCGCCCTCTGTACTAAAGCATTAAGGGTCTTGGGGGGGTGAGTCTCGTGGGGATGGGTTTTGGAAGTAGACAATGAGAT a s mr.mrrefChr5 184264 115 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 489949 116 + 636262 AAGTACTTATATAACCACACTCCCCAGACTTACATTTAGGACATAGTTATTAAGCTTATAGCTTTTCCAATAACTCCCTCCTTATGAGATGTATGACCTCAATGGCTTGTATTTAT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 328069 223 + 647215 AAGTCCTTATCTAACCATACTCCAAAGACTTACATTTAGGACATAG---TTAGGCTCATATACTTACCCATGAGTCCCACCTAATGAGATGTATGAACTCAATCGCTTATATTTACCCCTACACCACAGATTTAGCATCTAATAATACAGGCAAGTTGTGCAAGTGATCGCTAGGCTGAGATTGTTAACTATGAAGGGGAATAGTGGCAGACATAGTGCCCAAATA------ a s mr.mrrefChr5 184611 208 + 294542 CACACATACCAGCCAGTGATCTCTCAAGGGTGATAGCATTATTCAAGGCATGGACAGTGCCTTGGTCTCAAATCATACTGCCCCAGTTGTAACCATTATTCTTCTGAGAGGGTCATACCATTGATGGTTTGTCTCTGTTTGCCTATTTATGTCCAGTTATATATATCCATCTATATTCATGTGGTATACTTGAGATTAGACGTTGACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337178 208 + 636262 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a s mr.mrrefChr5 184909 73 + 294542 TTTGCCAAGCTAGTACCTGCTCATTTGCAAACCAAGAAATCCCAGCATAAATATTTAATGATGTTTAGATTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337476 73 + 636262 TGTGCCAATCTAGTACCAGCTCATTTGCAAACCAAAAAATCTCAGCATAAATATTTAATGATGTTTAGATTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 328586 73 + 647215 TTTGCCCAGATAGTGCCTGCTCATTTCCAAACCAAGAAATCCCAGCATAAATACTTAATATTGTTTGGATTTC a s mr.mrrefChr5 184982 135 + 294542 GCACAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAACACAAACGTGGCCAAGTATATGCAGTAAATGATTGGCTGTGAGCCTGCCCCACATGGCCAAGTACATACAGTTAGTACATGGCTATGAGTAATATCAAGCCCAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337550 135 + 636262 GCACAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAACACAAACGTGGCCAAGTATATGCAGTAAATGATTGGCTGTGAGCCTGCCCCACATGGCCAAGTACATACAGTTAGTACATGGCTATGAGTAATATCAAGCCCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 328659 135 + 647215 ACTCAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAATGCAAACGTGGCCATGTACGAACAGTTAATGATTGTCTTTGAGCCTGCCCTGCGCAGCTGCATACATACAGTTAATGCTTGACTATATGTAATAACAAGCCCAT a s mr.mrrefChr5 185117 8 + 294542 TACTGCAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337685 8 + 636262 TACTGCAG s simRat_chr6.simRat.chr6 328795 8 + 647215 TACTGCAG a s mr.mrrefChr5 185125 35 + 294542 ACACTAGACATTGCATGGAATGTACACCTGTAGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337693 35 + 636262 ACACTAGACATTGCATGGAATGTACACCTGCAGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 328804 35 + 647215 ACACTAGATATTGCATGGAATGTACATCTGTAGGT a s mr.mrrefChr5 185160 28 + 294542 GCAGACTTCAGATTCATCATCAATATAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337728 28 + 636262 GCAGACTTCCGATTCATCATCAATATAT s simRat_chr6.simRat.chr6 328863 28 + 647215 ACGGACTTCAACTTCATCATTAATATAT a s mr.mrrefChr5 185188 213 + 294542 AGATTTAAGGCTAGCGTGGGGGTGGGGAGAGGATGAGAGGGAGGACAATATTAGAAAATAAGTGTTCATCCTGGTATGCTTGCAGATATACGACATCCAGACAATGAGGTGAGCTTACTGTTCAGAGGATCACTCAATTGACTTTCCTAGACCAAAAGGCTTGTACAAAATCATTGAATCAACAACTTGTTTTTCCATCTCAATAAATTGACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337756 213 + 636262 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GAGCATTATGCAGAAAGAATTGTTGGTTTGCCAGGTGCAGAAAATTGATAACATA a s mr.mrrefChr5 189594 124 + 294542 TTGAATAGTATGGTCCAGAGGCAGATAGTGATTCATAACCTTCATGCCTGCCTTTCTCAGCATCCCCAATCTCCCACACCACACAAGGTATATAATACTTGTAAACACTTCTCTGGGTTGTCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342020 124 + 636262 TTGAATAGTATCGTCCAGAGGCAGATAGTGATCCATAACCTTCATGCCTGCCTTTCTCAGGGTCCCCAATGCCCCACACCACACAAGGTATATAATACTAGTAAACACTTCTCTGAGTTGTCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 333640 119 + 647215 TTAAATAATATGGTCC-----CACATAGTGATTCATTACCTTCATGCCTGCCTTTCCCAGCACTCCCAATCTCACACACCACACAAAGTATATAATGCTTGTAACCACTTCTCTGGGGTGTCTT a s mr.mrrefChr5 189718 43 + 294542 TCAAGGCACAACAGGTAAGTATGAGTGACCAACTTTGCTGAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342144 43 + 636262 TCAAGGCACAACAGGTAAGTATGAGTGACCAACTTTGCTGAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 333764 43 + 647215 TCAAGGCATAACAGATAAGTATGAGTGACCAACTTTGCTGAAA a s mr.mrrefChr5 189761 18 + 294542 TTCTTTGTTTTACAGTCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342187 18 + 636262 TTCTTTGTTTTACAGTCC s simRat_chr6.simRat.chr6 333815 18 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 343940 97 + 636262 TAATGTGGCGGGGTCCTTGTACTAAGGCTGTTAGGTCTCGTACTGTAACGGCTAAAATTGGCCAGATTTTCTATTATAAAGCTAATGCTGTAACTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 335448 82 + 647215 ---------------CTTGTACTATGGCCATTAGGTCTCATACTGTAACAGCTAAAATTGGCCAGATTTTTTATTATAAAGCTAATGTTTTAACTTC a s mr.mrrefChr5 191560 128 + 294542 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACTGTGGCCCTTGATAATTATGTGGTAAATGGGATAATACAGGTTAAGATGCATTCCATGGTAGTGATCAGAGCTACAAATACTAAACCAGAATTTTTTGATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344037 121 + 636262 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACTGTGGCCCTTGATAATTCTGTGGTAAATGGGATAATACAGGTTAAGATGCA-------GTAGTGATCTGAGCTACGAATACTAAACCAGAATGTTTTGTTC s simRat_chr6.simRat.chr6 335535 128 + 647215 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACCGTGGCGCTTGATAACTATGTGGTAAATGTGATAATACAGGTTAAGATGCATTCCATGGTAGTGATCAGAGCTACAAATACTAAACCAGAATTTTTTGATT a s mr.mrrefChr5 191688 135 + 294542 ATTTGTTTCCTGCTACCTACCATTAGTGCATATCAGCAGCCCTCAAACTACCCTGACCTTTGTGTATCGCACAGTCAACCCTTTGGCTTCTTTCTATAGCAATTTCAGAAAGTGTTATTCAATGTACTAATCCTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344159 135 + 636262 ATTTGTTTCCTGCTACCTACCATTAGTGCATATCAGCAGCCCTCAAACTACCGTGACCTTTGTGTATCGCACAGTCAACCCTTTGGCTTCTTTCTATAGCAATTTCAGAAAGTGTTATTCAATGTACTGATCCTC s simRat_chr6.simRat.chr6 335663 129 + 647215 ATTTGTTTCCTGGTACCTACTATTAGTGCATATCGG------TCAAACTACCCTGACCTTTATGTACCACACAGTCAACCCTTCGGACTCTTTCTAGAACAATTTCAGAAATAGTTATTCAATGTACTAATCCTC a s mr.mrrefChr5 191823 20 + 294542 ATCTCAGGCAGCATGAATTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344356 20 + 636262 ATCCCAGGCAGCATGAATTC s simRat_chr6.simRat.chr6 335792 20 + 647215 ATCTCAGGCAACACGAATTC a s mr.mrrefChr5 191843 47 + 294542 GTCACTCTTGGTTACAATGTTTTATACTGATTTTAGTGTGTAACATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344380 47 + 636262 GTCACTCTTGGTTACAATGTTTTATACTGATTTTGGTGTGTAACATG s simRat_chr6.simRat.chr6 335812 47 + 647215 GCCACTCTTGGTTACAATGTTTCATGCTCATTTTAGTGTGTAATGTA a s mr.mrrefChr5 191890 203 + 294542 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AGGCTAACTTGGATGTAGTCATACTTTCATAGATCAGACAGTGACATCAACTTGAAACTTATGCTTGGGAGCCCTTACTGCAGGAGCTGGATGGTAGAGAGGATAATGCCATCCTTGTTATGATTTTTCACTGGGGTCACTTGTAACATT a s mr.mrrefChr5 193149 9 + 294542 GAACAGCCG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345689 9 + 636262 GAACAGCAG s simRat_chr6.simRat.chr6 337138 9 + 647215 GAAAAGACA a s mr.mrrefChr5 193158 147 + 294542 ATGAATCCTGGAAAGGCTAATGATGCTGGATAGTGTATGCTTGGATTTGGTTGTGAATGTCTGCCATGCTTCAACATGAGTCTTTCCACTTTTGCATTGGTAAAGATAATAAGTTTTAATACAAAACTCATTGAAGATGTAATCTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345698 146 + 636262 ATGAATCCTGGAAAGGCTAATGATGCTGGATAGTATATGCTTGGATTTGGTTGTGAATGTCTGCCATGCTTCAACATAAGTCTTTCCACTTTTG-ATTGGTAAAGATAATAAGTTTTAATACAAAACTCATTGAAGATGTAATCTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 337149 147 + 647215 ATGAATCCTGGAAAGGTTAATGATGCTGGATAGTGTATGCTTTGATTTGGTTGTGCATTTCTGCCTTGCTTCAACATGAGTCTTTTCGGTTTTGCATTAGTGAAGGTAATAAGTTTTAATATAGAACTCATTGAGGGTATAATCGGT a s mr.mrrefChr5 193305 29 + 294542 GTCACAAGGTTAGGTGAAGCTTAGTAACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345844 29 + 636262 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CAGGGTCCAGAACTAACACATAATGAAACCCGTTCTTTGTAGGGAGGAGGTTTGTGGAAGAACAAGTTAGTGCGTATAAACCGTGTTTACCAGTTTTGATGTCTTAGCTCCCCAACAAGAAAGCTACTGTTCTGTCTGTATTATACTGGTAGCAAAGAACCCAATAATTCAGTCAGCAACATTTGGCTGATCTATCTTTTATTGCTAACTGATTATCTGAAGGGCACCTAGAAGTGCTTTGTGCCCTCACCTTTAATGTATGTGCACTAGTTGGCTTTCACCTCCCCGT-CTGGCATCCAAATAGTGACCAAGGCCTGCTAGACACTCTGTAAAAAAGAACTAACCC a s mr.mrrefChr5 199747 50 + 294542 ATGCCAAAGAGATGCACTCTACAATAACCCCTTGATAACCTTAAGAGAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352596 50 + 636262 GTGCCAAAGAGATGAACTCTACAATAACCCCTTGACAGCCTTAAGAGAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 343897 49 + 647215 ATGCCAAGGAGATGCATTCAACAATAACCCCCT-ATAACCTTAAGAGAGA a s mr.mrrefChr5 199797 151 + 294542 GCATGTGAAAATTACCTCATGTTTAGGCCAAAATAACCCTTAGGTCCATGTAACTCAGGGCAATTGTTGCCAGAGAGATAGGAAGTTGATTTGAACTTCAGTGTTGCAAATACCTCATTCAATAAGTTCCTTCTGTTCCAGGTACCAGTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352646 139 + 636262 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caaaagaaaagaagtttgtggatatagtgaactaccagcttaggacttggaacaaatttttcaacacttatttggctgaaaagggacagg a s mr.mrrefChr5 202203 66 + 294542 ctgggttaagaaacaaaaaggagtacagatgaccttttcagaacaagcgtacaatacacaaaaaga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354714 66 + 636262 ctgggttaagaaacaaaaaggagtacagatgaccttttcagaacaagcgtacaatacacaaaaaga s simRat_chr6.simRat.chr6 346528 66 + 647215 ctggcttaagaactgagatggattacgaatggcctgttcacaacaagtgcgcaatacacaaaaaca a s mr.mrrefChr5 202269 34 + 294542 gaataacatgattaaaaaatgaactagacatcaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354784 34 + 636262 gaataacatgattaaaaaatgaactagacatcaa s simRat_chr6.simRat.chr6 346594 34 + 647215 gaatggcatgattaaaaattgaagtacaaaccag a s mr.mrrefChr5 202303 93 + 294542 gcacccaattgcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacgagaagaactgtgtttattcatggtcagcctattgcactcgtctagaccaggg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354821 93 + 636262 gcacccaattgcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacgagaagaactgtgtttattcatggtcAGCCTATTGCACTCGTCTAGACCAGGG s simRat_chr6.simRat.chr6 346628 93 + 647215 gcacccaatggcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacaagagtaagtttgttgagtcatgatcggcctattgcaccagtaagcatcaggg a s mr.mrrefChr5 202396 44 + 294542 aactttaccttttcctGATTGGTCCATCATACAAATGTGCTCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354921 44 + 636262 AACTTTACCTTTTCCTGATTGGTCCATCATACAAATATGCTCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 346721 44 + 647215 aactttaccttttcctGATTAGTCCAGCATACAAATGTGCTTCA a s mr.mrrefChr5 202440 137 + 294542 GTGTGATAATACAGTGTAGAGAACAAGGTGTTATGGTTCCATGTAACACCTATCTAATAGTCCTATAACAAGATTGAAGGGACAAAAGAATAAATAAAATACAAGAGGATACTGTCATTTCAAATTTAGTTAGGTAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354970 137 + 636262 GTGTGATAATACGGTGTAGAGAACAAGGTGTTATGGTTCCATGTAACACCTATCTAATGGTCCTATAACGAGATTGAAGTGACAAAAGAATAAATAAAATACAAAAGGATACTGTCATCTCATATTTAGTTAGGTAG s simRat_chr6.simRat.chr6 346765 134 + 647215 GTGTGATAA-ACAGTGTGTAGGACAAGCTGCTATGGTTCCATGAATCACCCATCTAATAGTCCTGTAACAAGATTGAAGGGACAAAAGAATAAATGAAAGACAAGAGGGTACTGGCACTTCAAATTTAGT--GGTGG a s mr.mrrefChr5 202577 77 + 294542 GTTTGATATTTGGTTAGACAATTAATGAGCAGTTAAGCAGTGAATCAACCCCACCCTACCATCCTAGGTAGAGGTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355118 77 + 636262 ATCTCATATTTAGTTAGACAATCAATGAGCAGTTAAGCAGTGAATCAACCCCACCCTACCATCCTAGGTAGAGGTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 346899 77 + 647215 GTTTGTGAGATGTTTAGGCAAATAATGAGCAGTTACGTAGCGAATGAACCCTACCCTACCATCCCAAGTAAAGGTGT a s mr.mrrefChr5 202654 39 + 294542 ATGTGATTGGGTTTGTGGTAGCTGAGTGGCTAGTACCAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355198 39 + 636262 ATGTGATTGGGTTTGTGGTAGATGAGTGGCTAGTACCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 346976 39 + 647215 ATGTGATTAGCTTTGTGGTAGCTGAGCGGCTAGTGCTAT a s mr.mrrefChr5 202693 237 + 294542 TCTTAGACCATAATGAAAAGTAACTAAATAATCAGTCCTAGGAATAATTACTCAAATATTGTTATGTTGCATATATATAACTATCCAATGACAGATCCATATTCCTGCTTGTATATTATAGATACCGTAAGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGTAGTTCCCCTGAATTAGTAATGAAATTGTAGCAACCTGCAGCTGGTCTCATCCACATTGTAAGGACATGTGTTGGGGCTAGTATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355237 237 + 636262 TCTTAGACCATAATGAAAAGTGACTAAATAATCAGTCCTAGGAATAATTACTCAGATATTGTTATGTTGCATGTATATAACTATCCAATGACAGATCCAGATTCCTGCTTGTATATTATAGACACCATAGGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGTAGTTCCCCTAAATTAGTAATGAAATTGTAGCAACCTGCAGCTGGTCTCATCCACATTGTAAGGACATGTGTTGGGGCTAGTATG s simRat_chr6.simRat.chr6 347061 235 + 647215 TCTTGGACCGTAATGAAAAGGAAATACATCCTCAGTCCTGGGAATAATTACTCAAATGTTGTTATGTTGCTTATATATAACTATCCAATGACAGATTCATATTACTACTCGTATATTATAGATACCGTAAGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGCAGTTCCCCTGAATTAGTAATCGAATTGTAACAACCTGCAGCTGGTCTAATCCACATTGTGAGGACATGAGT--AGTCCAGTATG a s mr.mrrefChr5 202930 120 + 294542 AGTAGAGATGGAGTACACTGGATAAGAGTACTAGTCCACGCTAAGCAACAACACCTGTCTTGAGACTCAAATATTAGCAGAGTCAAGGATGGTGTTACAGTGTATGATAGTCCATCATGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355474 119 + 636262 AGTAGAGATGGAGTACACTGGATGAGAGTACTGGACCACGCTAGGCAACAACGACTGTCTTGAGACTCAAATATGAGCAGAGTCAAGGATAGTGCTAC-GTATATGATAGTCCATCATGG s simRat_chr6.simRat.chr6 347296 120 + 647215 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CATGTCATCTTGACCACAATTCGACCAATGCAGATAATAGGATTGTAATGTTGGGTCCATGTTGCAAGCAGCTCAAGGTTAGGATGATGTTTATATCTGATCACAGTGCAAAGTTGTGCAA----TGTGGCCTTTAACTTCTACATGAGTGCTGGTAGTGTACCAAAACACCGGAGTTTCTAAAGTGTAGGGAACTCAGTATTGTGGAAGATAGAAGTTATGCATGGTGACTTTTGAATATAATATTAAAAGTGGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAATAATTTCAGATCCTCTTAT-CGTCCCTCTGAGGCTGCTTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGATGCTCCTAGTTGATCATTTTACTGTCTAGTTCCTATGTATTACCATGCCTTCTGTGAGTTTCCCC-----TCCACTATAACAGTTTGGATGCTGCAGAGGGACTGGACAAACATGAATGAACGTGAATTCTATTATTGCATCAGATCACTGGATAAACACATCATTAGAGCCTCTAATGATTACCACACTGTTTATAGCTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 347513 536 + 647215 CATGTCATCTTGACCATAATTTGACCAATCCAGATAACACCAGCAT-ATGTTGGGTGTCGGTTGCAACCAGTTTAATGCTAGGATGGTGTTTATATCTGATGACGATGCAAAGTTGTGCAAATTCTGTGGCCTTTTACTTTTACATGATTGCTGGTAGTGTATCAAGACACGTGAATTTCTAAAGTGCAGGGAACTCAGCATTGTGGAACATGGGAGTGATCTGTGGTGAGTCTTGAATAGGATATTAAAAGTTGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAGTAATTTCAAATCCTCCTAGAAGTTCCTGTGAGGCTGCCTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGACACTTGTTGATGATCATTTTAC----------------ATTATTATGCCTTCTGTGAGTTTCCCTTCTGCTCCACTATAACAGTTTGGATGTTGCAGAGGGACTGGATAGACATGAATGAACATGAATTCTATTATTGCATCAAATCATTTGATAAACAC-TCATTGGACCCTCTAATGATTATCTCACTGTTTCTAGCTCA a s mr.mrrefChr5 203604 27 + 294542 AGTCATTATGAAAAAATCTAGGATGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356137 27 + 636262 AGTCATTATGATAAAATCTAGGATGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 348052 22 + 647215 AGTCATTATGAAAAAATCTATG----- a s mr.mrrefChr5 203631 389 + 294542 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-AGGGCAGACTAAGGTGTGTCTTGCCACTGGGTGGTTCACAGTAAGTACTAGTTGTAAGGCATCCACAGAGCTGGTCAAACCCACATACTTGCCGTACAGATTGAAGTGACATATTACTAACTTGATTCACTCAGTTGTACAATTGTTACATTCTACAAA--AGGTGAATAAAGTCCGTTGTCCCACATCCACTGATCACGACGCATACTGAATGAGAATGACGATTCAATTGTGTTAATAAGGTCGTGACCTGCGCTTTTGGGCCAGAAGACTATAGCAAGTTATGTTACTGTACCGCCAGATGTGGCAGTCAATTCTTGTCCTCCCCATAGGGGATCTTGTTTGATGCTTAGCACATATACATTCA-----GCATTTTATTTTAAAT a s mr.mrrefChr5 204020 341 + 294542 ATACGGTTCCCCAAGGCAGCCTATATCAAACTACAGAAAGTATGTCAGCTTAGACTGGTTAATTGAAACTAAACCAACATATTAAGTCGATCTGGCAGCCCTTCGAAAGGAATCCCTTAGCACGGACTTCAGTCCACCAGCGCTTTTATGGCCCGCTGGTCCGCGACAATAACGGAGATGAAGGTGAAAAAAAAGACGTACGAAGTTCGTGGTTGGATCATGTCCGACCTTGCCCGAAGAACCTAACTGGCCTACTGCACTCATCAATCACAGAACTTTCTTTCAGTATCATGCTGGTCTATCCATAGATATGCCACATCATAGAGACCCTATGGTTATCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356543 337 + 636262 ATACGGTTCCCCAAGGCAGCCTATATCAAACTACAGAAAGTATGTCAGCTTAGATTGGTTAATTGAAACTAAACCAACATATTAAGTCGATCTGGCAGCCCATCAGAAAGAATTCCCTAGCACGGACTGCAGTCCACCAGCGGTTTCATGGCCCGCTGGTCCGCGATAATAACGGAGATCAAGGTGAAAAAAAAGACGTACGAAGTTCATTGTTGGATCATGTCCGAC----CCTGAAGAACCTAACTGGCCTACTGCACTCATCAATCACAGAACTTTCTTTCAGTATCATGCTGGTCTATCCATAGATATGCCACATCATAGAGACCCTATGGTTATCC s simRat_chr6.simRat.chr6 348455 328 + 647215 ATACAGTTCCCCAAAGCTGCCTATATCTAACTACAGAAAGAATGCCAACTTAGACTGGTTAATTGAGACTAAGCCAACATACTAAGACGATCTGGCAGCCCTTCGAAAGAAATCTCTTAGCACGGACTTCAGTCTACCAGCGCTATTATGGCCTCCAGGTCCGCGACAATAACGGAAATGAAGGTG-------------ACGGAGTTCGTGGTTGGATCATGTTCGACCTTGCCCGAAGAACCTAACTGGCATATTGCACTCATCAACCACAGAACTTTCTTTCAATATCATGCTGGTCTATCCATAGATGTGCCACATCATAGAGAGCCTATGATTATCC a s mr.mrrefChr5 204361 254 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 349096 15 + 647215 CATCAATTGGTAGTG a s mr.mrrefChr5 204630 54 + 294542 CTGAGGCATCTACAGCTAGGTTACTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCATCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357148 54 + 636262 CAGAGGCATCTACAGCTAGGTTACTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCATCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 349117 54 + 647215 CTGATACATCTGCAGCTAGGTCATTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCGTCAA a s mr.mrrefChr5 204684 180 + 294542 TTGGTAGTACAGAGCCCGAGGCATCTACAGCCCTATCTTGCCCCAGCTAGTACTTGATCAGCAGAGGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTATATTTCCTCTATTGGACACTAGTGAATTGTGCACTCAAATTCAATATGACCAAACGTACAAGAGGTACATTCTACGCCTCCTCTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357206 180 + 636262 TTGGTAGTACAGAGCCCGAGGCATCTACAGCCCTATCTTGCCCCAGCTAGTACTTGGTCAGCAGACGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTAGATTTCCTCTATTGGACACTAGTGAATTGTGCACTCAAATTCAATATGACCAAACGTACAAGATGTCCATTCTATGCCTCCTCTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 349171 169 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 357862 55 + 636262 TCTTTCTTTGTTCTCATGCCAAAGTGCCCTGGGTGTGGTCCGTTTATAGTTTAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 349815 55 + 647215 TCTTCCTCCGTTCTCGTGCCAAAGTGCCCTGGGCTTGGACCATCTATAATCTAAC a s mr.mrrefChr5 205395 28 + 294542 TTCACAATTCCAACCAATGAGTACCACA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357917 28 + 636262 TTCACAATTCCAACCAATGAGTACCACA s simRat_chr6.simRat.chr6 349880 28 + 647215 TTCACAATTCTTACCAATCAGTACCACA a s mr.mrrefChr5 205423 147 + 294542 ACATGAAACTCTCTAATCTTTAAAGGCTAACATTCTATTGCAACCTAGTACGGCTCCAACAGGATTATTTCCATTATTGTAACAGTCCAAGGAAAGGATGGTGAGAAGAATAAGATGACCAGGGGGTCACGGGCTCTGTTTCAAAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357948 147 + 636262 ACATGAAACTCTCTAATCTTTAAAGGCTAACATTCTATTGCAACCTAGTACGGCTCCAACAGGATTATTTCCATTATTGTAACAGTCCAAGGAAAGGATGGTGAGAAGAATAAGATGACCAGGGGGTCACGGGCTCTGTTTCAAAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 349908 147 + 647215 GCATGAAACCCTTTAGTCTTTAAAGGCCAACATTATATTGAAACTTATTAAGGCTCGAAAAGGATTCTTTCCATCATTGTTACATTCCAAGGAGAGAGAGATGAGAAGGTTAAGGTGACCAGCGGGTCACAGGCTCAGTTTCAAAGT a s mr.mrrefChr5 205570 162 + 294542 TAGCCCTCCTAGCAGACTGGTTTATCTCTGAACTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGTGACAGGATTTGCAGAGAGAGTCAGAGGCATCAGTAGGGAATTTTTATTGAAATAGGCAATGTCTTGTTTTATGCACTGATGTAATTATTTAGATCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358095 161 + 636262 TAGCCCTCCTAGCAGACTGGTTTATCTCTGAACTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGCGACAAGATTTGCAGAGAGGGTCAGAGGAATCAGTAGGGAATCTTTATTGAAATAGGC-ACGTCTTGTTTTATGCACTGATGTAATTATTTAGATCA s simRat_chr6.simRat.chr6 350072 162 + 647215 TAGCCCCCTTGGCAGGCTGGTAGATCTCTGAGCTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGTAACAGGATTTGCAGAGAGAGTCAGAGGCATCAGTAGGGAATTTTTATTGAAATAGGCAATGTCTTGTTTTATGCCCTGGTGTATTCATTTAGATCA a s mr.mrrefChr5 205732 73 + 294542 AATTTGAGCTTAAGATCAGAACAGGGTGACCGTATGATGGTGCTTCATGACAACTATCTCTTTATTATCATTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358274 73 + 636262 AATTTGAGCTTAAGATCAGAACAGGGTGACCGTATGATGGTGCTTCATGACAACTATCTCTTTATTATCATTA s simRat_chr6.simRat.chr6 350234 73 + 647215 AATTTGAGATTAAGATCAGAACAGAGTGACTATATGGTAATGCATCATGACAACTATCTCTTTATTATCACTG a s mr.mrrefChr5 205805 9 + 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ctccttgtaacactatactcactacatagacccctgacttcatatcaatctcaagtt a s mr.mrrefChr5 205990 8 + 294542 cttcagtc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358545 8 + 636262 CTTCAGTC s simRat_chr6.simRat.chr6 350683 8 + 647215 ctttggtc a s mr.mrrefChr5 205998 95 + 294542 cattcttcaaggcacttatgttcttaacttcttctgtgcttgtgccttatctgcctgtcagtttagtttcatgtgatggaggaacaagttccggt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358553 95 + 636262 CATTCTTCAAGGCACTTATGTTCTTAACTTCTTCTGTGCTTGTGCCTTATCTGCCTGTCAGTTTAGTTTCATGTGATGGAGGAACAAGTTCCGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 350693 95 + 647215 caatcttcaaggcacttatgtatttaactacttctgtccttgtgcgttatctgactgttagcttagttccaggtgatgggggaaaaaattacagt a s mr.mrrefChr5 206093 14 + 294542 ccttgtcactaggt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358663 14 + 636262 CCTTGTCACTAGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 350788 14 + 647215 tctggtcaatcagc a s mr.mrrefChr5 206107 67 + 294542 gaggcaggatcctagctacacgtgaaccccaagggtgcatgtttaattggtaccccattgactcaac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358682 67 + 636262 GAGGCAGGATCCTAGCTACACGTGAACCCCAAGGGTGCATGTTTAATTGGTACCCCATTGACTCAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 350802 67 + 647215 aaggtagcatcctacccacacgtgaaccccatgggtgtgtttttaattggcatcccactgttacaac a s mr.mrrefChr5 206174 6 + 294542 ctgtta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358749 6 + 636262 CTGTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 350870 6 + 647215 ttgtca a s mr.mrrefChr5 206180 49 + 294542 ttggtaccatgtcaaggccagcctaccacacacatatttcgttgtctct s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358755 49 + 636262 TTGGTACCATGTCAAGGCCAGCCTACCACACACATATTTCGTTGTCTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 350877 49 + 647215 ccagtactatgttaaggtcagcctaccacccacatatttcgttgtctct a s mr.mrrefChr5 206229 11 + 294542 ccagctgcctg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358805 11 + 636262 CCAGCTGCCTG s simRat_chr6.simRat.chr6 350926 11 + 647215 ccagctgtctg a s mr.mrrefChr5 206240 51 + 294542 cactctatgagaaggcccttaaagctcatgtattcgTTTAGATACATGCAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358816 51 + 636262 CACTCTATGAGAAGGCCCTTAAAGCTCATGTATTCGTTTAGATACATGCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 350939 51 + 647215 ccctctgtataaaggcccttaaagcccatgtattcaTTTAGATATGTACAT a s mr.mrrefChr5 206291 130 + 294542 CTGCTCATTCAGCCTGAATCCTCATTCTAGTGCCGTTGTCACCATTACTACCGATGTATAtattgtggtcccttgtagtggcttgataacctttatgatgggaggtgctgtgaagtgtgcatgtacagca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358868 130 + 636262 CTGCTCATTCAGCCTGAATCCTCATTCTAGTGCCGTTGTCACCATTACTACCGATGTATATATTGTGGTcccttgtagtggcttgataacctttatgatgggaggtgctgtgaagtgtgcatgtacagca s simRat_chr6.simRat.chr6 350990 130 + 647215 CTGCTGATTCTGCTTGAATCCTCATCCTAGCTCCATTGTCACCATTGCTACTGCTGTATAcattgtaagcccttgcaatgccttgataacctttatagtaggaggtgctgtggagtgtgcatgtatagca a s mr.mrrefChr5 206421 36 + 294542 aaccatctgtacctcgcactgtctatctcatgtgag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358998 36 + 636262 aaccatctgtacctcgcactgtctatctcatgtgag s simRat_chr6.simRat.chr6 351121 36 + 647215 gaccatctgtacctcccactgtctatctcatatgag a s mr.mrrefChr5 206457 99 + 294542 cctactgttacattgcaggagcagtgatgccacactcacactgtgtaacttgtgattatcaaattctttccattcccattaattcattatgactatagc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359052 99 + 636262 cctactgttacattgcaggagcagtgatgccacactcacactgtgtaacttgtgattatcaaattctttccattcccattaattcattatgactatagc s simRat_chr6.simRat.chr6 351157 99 + 647215 cctattgttacattgcaggcagagtgatgccatactcacactgtatgacttgtgattatcaaattcgttccatttgcattaattcatcatgaatatagc a s mr.mrrefChr5 206556 16 + 294542 cgaaagtcagtaccaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359151 16 + 636262 cgaaagtcagtaccaa s simRat_chr6.simRat.chr6 351257 16 + 647215 tgaaggtcaatactaa a s mr.mrrefChr5 206572 11 + 294542 tgtagtcgaat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359177 11 + 636262 tgtagtcgaAT s simRat_chr6.simRat.chr6 351273 11 + 647215 tgtaatcgagt a s mr.mrrefChr5 206583 60 + 294542 cctgtaagcaaatccagcccTTTTAGGGTAGCTAGGGATTCCAGGCCATTCATTTTCAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359189 60 + 636262 CCTGTAAGCAAATCCAGCCCTTTTAGGGTAGCTAGGGATTCCAGGCCATTCATTTTCAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 351284 60 + 647215 cctgtaatcaaatccaccccTTTTAGGGTAGCTAGGGATTCCAGGCCCTTCATTTTCAAT a s mr.mrrefChr5 206643 85 + 294542 AATTACATTTATATTCTTCCAGTTCAGTTAAGAAGAGTGTGCCTGACTGATATGAGTAcatccatgcagagtaggtcatatcaga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359249 85 + 636262 AATTACATTTATATTCTTCCAGTTCAGTTAAGAAGAGTGTGCCTGACTGATATGAGTAcatccatgcagagtaggtcatatcaga s simRat_chr6.simRat.chr6 351345 85 + 647215 GATTACATATATGTTCTTCCAGTTCAGTTAAGAAGAGTGCAACTGGCTGATGTGAGGCCACCCATGCAATGTGGGTCATAACAGA a s mr.mrrefChr5 206728 39 + 294542 catctgtttgtgtgctataaatttttttggtattgtgtg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359334 39 + 636262 catctgtttgtgtgctataaatttttttggtattgtgtg s simRat_chr6.simRat.chr6 351433 39 + 647215 CAGCTGTTTGGGTGTTATGAATTTATTCGGTATGGTTTG a s mr.mrrefChr5 206767 72 + 294542 cctagtgaagtccttgtggttggggcaaacatgtgtgttAATTGTAGATACTTGTGCAGGGAAGATCAAGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359395 72 + 636262 cctagtgaagtccttgtggttggggcaaacatgtgtgttAATTGTAGATACTTGTGCAGGGAAGATCAAGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 351472 72 + 647215 CCTAGCAAAGTGCTTGTGGTTGTGGCAAACTTGTGTGTTCATTGTAGATACTGGTGCGGGGGAGATCAAGTG a s mr.mrrefChr5 206839 9 + 294542 CTAAGTATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359467 9 + 636262 CTAAGTATT s simRat_chr6.simRat.chr6 351545 9 + 647215 CTAAGTATT a s mr.mrrefChr5 206848 58 + 294542 TATAACTGGCTGAGTCCCCACTCACAATTATAATTGTAATGTGAGCATGAGCCAAGAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359476 58 + 636262 TATAACTGGCTGAGTCCCCACTCACAATTATAATTGTAATGTGAGCATGAGCCAAGAC s simRat_chr6.simRat.chr6 351555 58 + 647215 AATAACTAGCTGCGTCCCCACTCTCAATTGTAATTATAATGTGAGCACAAGCCAAGAC a s mr.mrrefChr5 206906 58 + 294542 TTGACTGACAGAATCCCCAAATCTGCATAGagctaagacctgattgagagatttacca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359538 58 + 636262 TTGACTGACAGAATCCCCAAATCTGCATAGAGCTAAGACCTGATTGAGAGATTTACCa s simRat_chr6.simRat.chr6 351613 58 + 647215 TTGATTAGCAGAATCACCAAATCAGCAAGGagccaggatttgattgacagacttacta a s mr.mrrefChr5 206964 46 + 294542 caggatgtatggttcatagtaccagtaccaaaggtggagatagatc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359596 46 + 636262 caggatgtatggttcatagtaccagtaccaaaggtggagatagatc s simRat_chr6.simRat.chr6 351695 46 + 647215 cagagtgtatgattcatattaccagtatagaaggtggtgataactc a s mr.mrrefChr5 207010 105 + 294542 tgtttttcctgtgctgcaggggatgaaagtgtgaggctttcataagtttcattgccccagTGCACAGTTGGTGCCAAATTAACCCTAGAAGCTAAGGCCTACTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359642 105 + 636262 tgtttttcctgtgctgcaggggatgaaagtgtgaggctttcataagtttcattgccccagTGCACAGTTGGTGCCAAATTAACCCTAGAAGCTAAGGCCTACTGC s simRat_chr6.simRat.chr6 351742 105 + 647215 tgtttttgctgtgctggaggggatgaaggtgataggccttcatatgtttcattactcaagTGCACAGTCAGTGCCAAATTAACCCTCGAGGCTAAGGCCTACTGC a s mr.mrrefChr5 207115 33 + 294542 TGGAACATGTTGATCAGACTAGacaaccctttt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359750 33 + 636262 TGGAACATGTTGATCAGACTAGacaaccctttt s simRat_chr6.simRat.chr6 351847 33 + 647215 TGGAACATGGTAACCAGGCTAGacaaccttttt a s mr.mrrefChr5 207148 75 + 294542 gggcccaggcagttgcataggaagtgaaactgatcttacttaggtgctcctctatgtacctcaattatctctgct s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359784 75 + 636262 gggcccaggcagttgcataggaagtgaaactgatcttacttaggtgctcctctatgtacctcaattatctctgct s simRat_chr6.simRat.chr6 351880 75 + 647215 ggtcccaggcatttgcataggaagtgtaaccgatcttacccaggtgctcctctatgtacctcaattatctctact a s mr.mrrefChr5 207223 40 + 294542 ttttcttgttgcagttttgtggacagaagtgcttgattgg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359859 40 + 636262 ttttcttgttgcagttttgtggacagaagtgcttgattgg s simRat_chr6.simRat.chr6 351956 40 + 647215 tcttctggttgtagttaggtagactgaagtgcttgttcgg a s mr.mrrefChr5 207263 69 + 294542 attggatgtggttgtcctgggagttgcaagatgcagtttcagaccgactccagaataaaccagtaaatt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359906 69 + 636262 attggatgtggttgtcctgggagttgcaagatgcagtttcagaccgactccagaataaaccagtaaatt s simRat_chr6.simRat.chr6 351996 69 + 647215 attggatatggttgtcctgggggttacaaaatgcagtgccagagctacttcagaacaaaccagtagatg a s mr.mrrefChr5 207332 16 + 294542 aaccccgcctgtgacc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359977 16 + 636262 aaccccgcctgtgacc s simRat_chr6.simRat.chr6 352065 16 + 647215 aaccctgcctgtgacc a s mr.mrrefChr5 207348 6 + 294542 tcagcc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359993 6 + 636262 tcagcc s simRat_chr6.simRat.chr6 352083 6 + 647215 ccagcc a s mr.mrrefChr5 207354 107 + 294542 taaactgaagtcacaattgattttccaatgagtacaaaagggttatctccctttataatggaatggtagggttgcattccagattctggcagttaatcaggttgtga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360008 107 + 636262 taaactgaagtcacaattgattttccaatgagtacaaaagggttatctccctttataatggaatggtagggttgcattccagattctggcagttaatcaggttgtga s simRat_chr6.simRat.chr6 352089 107 + 647215 taaactgaagtcacaattgattttccaatgagtacaagagggttatctccctttataatagaatcagatggttgcataccagattttgacagttgattgggttgtga a s mr.mrrefChr5 207461 32 + 294542 tttttggctgaggtgcctcgattcttgagctt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360115 32 + 636262 tttttggctgaggtgcctcgattcttgagctt s simRat_chr6.simRat.chr6 352198 32 + 647215 ttttcggctgaggtgcattgcttctcaagctt a s mr.mrrefChr5 207493 15 + 294542 ccaggtgtacacccc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360155 15 + 636262 ccaggtgtacacccc s simRat_chr6.simRat.chr6 352230 15 + 647215 cccagtgaacacttc a s mr.mrrefChr5 207508 36 + 294542 tgtgaagtaacctatctcatattgaccctccaaccc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360173 36 + 636262 tgtgaagtaacctatctcatattgaccctccaaccc s simRat_chr6.simRat.chr6 352245 36 + 647215 tgtgaaattacctatctcatgttgacccttataccc a s mr.mrrefChr5 207544 11 + 294542 tctgtgatgtc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360213 11 + 636262 tctgtgatgtc s simRat_chr6.simRat.chr6 352281 11 + 647215 tctgtgatgtc a s mr.mrrefChr5 207555 186 + 294542 cccaactagtgcatcctgggagtatttgctgctgATTTCTCGAGGATTTCCATGAGGAGTCTCTTTGCTAGTATTGGTCTCTATTATTTGTGCCCCTACCACTTTACAAGCATTACGATGAGGGTGGCAAAGGGTGTCATGCAATGCAGCTGTATGCTCAGTAGAATCCACACTACTCCTGCAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360237 186 + 636262 cccaactagtgcatcctgggagtatttgctgctgATTTCTCGAGGATTTCCATGAGGAGTCTCTTTGCTAGTATTGGTCTCTATTATTTGTGCCCCTACCACTTTACAAGCATTACGATGAGGGTGGCAAAGGGTGTCATGCAATGCAGCTGTATGCTCAGTAGAATCCACACTACTCCTGCAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 508881 186 + 647215 CCCAACTAGTGCACCCTGGGAGAATTTGTTGCTGATATCTCCAGCATTTTCATAGGGAGTCTCTTTACTAGTATTGGTCTCTATTATTTGTGCCCCTACCACTTTGCAAGCATTGTAATAAGGGTGGCAAAGGATGTCATGCGACGAAGTTCTGTATTCAGTAGGATCCACCCTATTCTTGCAGTG a s mr.mrrefChr5 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atatgattatgtgtgtgctgaactccctatataactgatgttataagggcccagtccctgctggtgatgattccattaatgcagtgcctttaggtactataattagcctctacattgggctgactctcccccagtcccaccatgaccc s simRat_chr6.simRat.chr6 353215 148 + 647215 ATATAATTACGTGTGTGCCGAACTCCGTATAAAACTGAGGctataaggacccagctcctgctggtgatggttccatcaatgcggtgcttttaagtactatgattagtctccacattgggctgactctcccccagtcccaccatgactc a s mr.mrrefChr5 208164 89 + 294542 ctatctgatacttcaggtagagatctctcactgttcatttcataatacaccactgatctctccactgaactacggtcttcaatctgaac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361136 89 + 636262 CTATCTGATACTTCAGGTAGAGATCTCTCACTGTTCATTTCATAATACACCACTGATCTCTCCACTGAACTACGGTCTTCAATCTGAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 353363 89 + 647215 ccatctggtacttcaggtagagatatctgaccgttgatttcttagtacaaccctagtctttactctgaactactgtgtttaatgggaaa a s mr.mrrefChr5 208253 8 + 294542 tactgtgt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361225 8 + 636262 TACTGTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 353454 8 + 647215 tactgagt a s mr.mrrefChr5 208261 15 + 294542 aatgggatattgtga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361235 15 + 636262 AATGGGATATTGTGA s simRat_chr6.simRat.chr6 353462 15 + 647215 aatgtagtattttga a s mr.mrrefChr5 208276 19 + 294542 tccctcaatacattgttcg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361250 19 + 636262 TCCCTCAATACATTGTTCG s simRat_chr6.simRat.chr6 353501 19 + 647215 tccctccatacactgttca a s mr.mrrefChr5 208295 118 + 294542 ttcagAGCATGATGTGGTAGTTGGTAGAAACTTACTCATAGAGTGACTCAGTTCAAAAGTCACTCAGTTTAAACAACGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361269 118 + 636262 TTCAGAGCATGATGTGGTAGTTGGTAGAAACTTACTCATAGAGTGACTCAGTTCAAAAGTCACTCAGTTTAAACAACGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 353529 118 + 647215 gtgggAGCATAATGTGGTAGTTGGTAGAAATTTACTCATAGAGTGATTCAGCTCAAGACTCACCCAGTTTATACAATGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT a s mr.mrrefChr5 208413 119 + 294542 AGAAGCCGTCATTTCCAGCAAGACAGCAATGGGGTAAAACTTGAGGACCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAAGAATACAGCTTGAGGGGGGCCCGAGATTTAAGATCATGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361387 119 + 636262 AGAAGCCGTCATTTCCAGCAAGACAGCAATGGGGTAAAACTTGAGGACCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAAGAATACAGCTTGAGGGGGGCCCGAGATTTAAGATCATGG s simRat_chr6.simRat.chr6 353648 119 + 647215 AGAGGTCTTCATCTCCAACAAAACAGCAATGGGGTAAAACTTGATGTCCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAGGATTACAGCTTGAGGGGGGCCCCAGATTTAAGATCATGG a s mr.mrrefChr5 208532 50 + 294542 CCATGATTCTAATGCATGTCAACACTAGCCCCTTGGCACTTAATTCAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361508 50 + 636262 CCATGATTCTAATGCATGTCAACACTAGCCCCTTGGCACTTAATTCAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 353767 50 + 647215 CCATGAATCTAATGCATGTCAATACTAGCCCCTTAGCACTCAATTCAATG a s mr.mrrefChr5 208582 116 + 294542 ATACCTAATCTAAGGGTTCATGATGACTCAAGACAGGTTCTAATCATGAGAGTTGATTGGACCCATGCTAAGCCCATATAGCAGCTCTTAATAATAGCCACAATGGAAATGGAATG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361562 116 + 636262 ATACCTAATCTAAGGGTTCATGATGACTCAAGACAGGTTCTAATCATGAGAGTTGATTGGACCCATGCTAAGCCCATATAGCAGCTCTTAATAATAGCCACAATGGAAATGGAATG s simRat_chr6.simRat.chr6 353817 116 + 647215 ATACCTAAACCAAGGTATCTTGATGCCTCAATACAGGTTCTAATGATGATAGGTTATTGGATGCATGCTGAGCCCCTATAGCAGCTCTTATAGATAGCAACAATGGAAACGGAATG a s mr.mrrefChr5 208698 49 + 294542 ATCCTGGGAATTAGTGAAAAGCattgatcttctaacccggtggttaaaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361679 49 + 636262 ATCCTGGGAATTAGTGAAAAGCATTGATCTTCTAACCCGGTGGTTAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 353933 49 + 647215 ATCCTGGGAACTAGTGAAAAGCattgatcttctaacctagtggatacca a s mr.mrrefChr5 208747 18 + 294542 CTTGTGAGAGACCCACTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361728 18 + 636262 CTTGTGAGAGACCCACTA s simRat_chr6.simRat.chr6 354042 18 + 647215 CTTCTGATTGCCTCAGTA a s mr.mrrefChr5 208765 72 + 294542 GGAATCCTTGCAGCTCCTTGTTTAGAGGCTCCATGGGAAGCTGTGGCAAGCAATCCCAAGTGACTCCCTGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361746 72 + 636262 GGAATCCTTGCAGCTCCTTGTTTAGAGGCTCCATGGGAAGCTGTGGCAAGCAATCCCAAGTGACTCCCTGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 354068 72 + 647215 GAGATCCTCACAGCTACTTGTTTAGGGGTTCCACGGGAAGCTGGATCCAGGAATGCCAAGTGACTCCCTGTT a s mr.mrrefChr5 208837 193 + 294542 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CAGAATTTGCACACCAACCAGGTACTCAAATAGGATTTGCCCATTGACTAAGTGCTATCAGGCCAGTATGGTTAACATTATAATATTTGAGCCAATGGTGATCACTCTGTTTCTAATCATAAATGCACCAGGTAACCCAGATTACTCGTTTCCTTCTTAGTACATTTCTTGGGGTTTCCTTATAGAAGGCAACTGTTCATGCAGCACCTGACAAGTAGAGGCATTCTCAATTCACCCCTGTGTACCTCTTATGTGACCGGGAATTCAACATGCAAGCTATACAAATAATTTGACCAGAGAAACACTAGTTCATTACACTAGGTTGATTGCTTGTTCAGTATCTTCATTTTCCCAGCGTGGCTCTCCAGGCTCCAGCAGGTACGTATAACAAAGGCCTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362025 398 + 636262 CAGAATTTGCACACCAACCAGGTACTCAAATAGGATTTGCCCATTGACTAAGTGCTATCAGGCCAGTATGGTTAACATTATAATATTTGAGCCAATGGTGATCACTCTGTTTCTAATTATAAATGCACCAGGTAACCCAGATTACTCGCTTTCTTCTTAGTACATTCCTTGGGGTTTCCTTTTAGAAGGCAACTGTTCATGCAGCACCTGACAGGTAGAGGCATTCTCAATTCACCCCTGTGTACCTCTTATGTGACCGGGAATTCAACATGCAAGCTATACAAATAATTTGACCAGAGGAACACTAGTTCATTACACTAGGTTGATTGCTTGTTCAGTATCTTCATTTTCCCAGCGTGGCTCTCCAGGCTCCAGCAGGTACGTATAACAAAGGCCTG s simRat_chr6.simRat.chr6 354359 392 + 647215 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CAGTATTATAACTTCCTAACTATGGTAGTGTATAGTAGTGATTTCTAGCCCTATTAGCATGTGACAGACTGTCCTTATCCTCTAGCCTCTGTTATCCATGTCACAGGCCTGTGGGTCTGTACCAAAACTAGTAACAAGTGTGGAACTCTGTTCCTATATTGTTTGTACTGAAGTCTGTCTGATTGTTGCTTCAACTGGAAGTCATCATCAGCAACCTACTGCTTTATCACCTGCGTCACTTTTTAGAGGTCTTAACCTATTAACTTGACACAATCTGGAGATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362471 283 + 636262 CAGTATTATAACCTCCTAACTATGGTAGTGTATGGTAGCGATTTCTTGCCCTATTAGCGTGTGACAGACTGTCCTTATCCTCTAGCCTCTGGTACCCATATCACAGGCCTGTGGGTCTGTACCAAAACTAGTAACAAGTGTGGAACTCTGTTCCTATATTGTTTGTACTGAAGTCTGTCTGATTGTTGCTTCAACTGGAAGTCATCATCAGCAACCTACTGCTTTATCACCTGCGTGACTTTTTAGAGGTCTTAACCTATTAACTTGACACAATCTGGAGATC s simRat_chr6.simRat.chr6 354808 279 + 647215 CAAAATTACAACTTCCTAAGTATAGTAGCGTATAGTAGTGATTTCTAGCCCAATTAGCATGTGACAGATTGTCCTTATCCTCTTGCCTCTGTTATCCACGTCACAGGCCTGTGGGTCTGTGCCGAAACAAGTAACAACTGTGGAACCGTGTTCCGATATTATTTGTACTG-AGACTGTCTGATTCTTGTATCAAT---GAGTCATCATCAGCAACCTCCTGTTTTATCACCTGCGTCACTTTTTGGTGGTCTTAGCGCACTAGCTTAGCAAAGTCTAGAGATC a s mr.mrrefChr5 209770 83 + 294542 AACCTATCCATCAGGAGGCCATGGGTTGGGGATGGCCCTGTTATACAACTTGTAATCACTTGCATCAATGACCTACTGAATGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362754 73 + 636262 ----------TCAGGAGGCCATGGGTTGGGGATGGCCCTGTTATACAACTCATAATCACTTGCATCAATGACCTACTGAATGG s simRat_chr6.simRat.chr6 355089 83 + 647215 AACCTATCCATCAGGAGGTCATGCGTTGGGGACAGCCCCATTACACAACTTGTAACCACTTGCATCAATGACCTACTGAATGG a s mr.mrrefChr5 209853 11 + 294542 ATGAAAAATAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362827 11 + 636262 ATGAAAAATAT s simRat_chr6.simRat.chr6 355173 11 + 647215 ATCAATGACCT a s mr.mrrefChr5 209864 11 + 294542 TTGATGAAAAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362838 11 + 636262 TTGATGAAAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 355190 11 + 647215 CGGATGAAAAC a s mr.mrrefChr5 209875 112 + 294542 TAGTCAGTCTTATAATCGCATGTGTCAGAGAATGCAGCAGTACCTCTCATATCCTGGACAACCTCTCTAAAACATGAGGTATCACTACCATTTAAAGTTGAATTACATGGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362849 111 + 636262 TAGTCAGTCTCATAATCGCATGTGTCAGAGAATACAGCAGTACCTCTCATATCCTGGACGATCTCTCTAAAACATGAGGTAT-ACTACCATTTAAAGTTGAATTACATGGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 355203 112 + 647215 TATCTAGTTTTATAATCACATGTGTCGCAGACTGCAGCAGTACCTCTCATATACTAGGCAACCTCTCTAAAACATTGGGTTTCACCACCATTTAAAGTTGAATTGCATAGAT a s mr.mrrefChr5 209987 323 + 294542 TAGCTTGATGTCCTATTCTGCAGACTTCAAGCCACTGAGCCCAACGTAGCATCACCTAATGGGATCAGTGTTGTCTTTTGGTGACAATTTATAACCATCACTGATAAATGGTTGGCTTGCATAGATGTTAGAACTTGGTCACATGCCTACGATAGCCATATCCTGCCCTGTGCCATCCTTCTGGGTTTGGGTCTGGGTTTGAAGCAAGCCTCATGACGCTGTTAGTCACCATCACTGTTGATGAAAGTTATTAATTAGTGGAAACTCTGTGGTAGGTACATAACAGCAAAAGGTCTAATTTCATCCTAATCCTATCTTTTGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362960 323 + 636262 TAGCTTGATGTTGTATTCTGCAGACTTCAAGCCACTGAGCCCAACGTGGCATCACCTAATGGGATCAGTGTTGTCTTTTGGTGACAATTTATAACCATCACTGATAAATGATTGACTTGCATAGATGTTAGAACTTGGTCACATGCCTACGATAGCCATATCCTGCCCTGTGCCATCCTTCTGTGTTTGGGTTTGGGTTTGAAGCAAGCCTCATGACCCTGCTAGTCACCATCACTGTTGATGAAAGTTATTAATTAATGGAAACTCTGTGGTAGGCCCATAACAGCAAAAGGTCTAATTTCATCCTAATACTATCTTATCCT s simRat_chr6.simRat.chr6 355338 320 + 647215 TAGCTTGATGTCCTATTCTATGGACTTCCAGTCACTCAGCCCAACGTAGGATCACCAAGTGGGATCAGTGTTGTCTTCTGGTAACAATTTACAACCATCACTGATATATGGCTGGC-TGCATAGAAGTTAGCACTTGGTCACATGCCAAGGATAGCCATGTCCTCCAATGTGCCATCCTTCTGGGTTTGGGTCTGGGTTTGAAGCAAGCCTTATGACGCTGTTAGTTACCATCTTTGTTAATGAAAGTTATTAATTAGTTGAAACTCTGTGGTAGTTACATA--AGCAAAAGGTCTAATCTCATCCTAACCCTATCTTTTGAT a s mr.mrrefChr5 210310 48 + 294542 TGTTCTGCCACTTGGATGTTTTGTAATTTGATAATAGGGGGAAAGTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363290 48 + 636262 TCTTTTGCCACTTGGATGTTTTGTAATTTGATAATAGGGGGAGAGTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 355658 47 + 647215 TGTGCTGCCAC-TGGATTTTCTGTAACTTGATAATAGGGGGAATGTGT a s mr.mrrefChr5 210358 32 + 294542 TACTATTACTGGAGCATTATCTTGAGATCTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363338 32 + 636262 TACTATTACTGGAGCATTATCCTGAGATCTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 355717 32 + 647215 TACTCTTACTGGAGCATAATCTTGAGGTCTGT a s mr.mrrefChr5 210390 37 + 294542 AGCCTGCCACTGGTGTAAGAGGGTTGAGGACCTAGTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363370 29 + 636262 AGCCTGCCACTGGTGTAAGAGGGTTGAGG-------- s simRat_chr6.simRat.chr6 355750 37 + 647215 AGCATGCCACTGGTGTAACAGGATTGAGGACCTAGTC a s mr.mrrefChr5 210427 86 + 294542 TTTCAATCTCTCTTGTTCATATTCTACTTACATGCACTAAGAGTTGTAAATTCCTATATAGAAGCTCTAACTGAGTCAGTCCATAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363399 65 + 636262 ---------------------TTCTACTTATGCGCACTAAGAGTTGTAAATTCCTATATCGAAGCTCTAACTGAGTCAATCCATAA s simRat_chr6.simRat.chr6 355794 85 + 647215 TTTCAATCTCTCTTGTTCATATACTAGTTACATGCACTAAACAATG-AAATTCCTATATAGAAGCTCTAACTGAGTCAGTCCATAA a s mr.mrrefChr5 210513 88 + 294542 CTATGGTCAATTCTTTGAGAGGTGGTGGGGAACAATGTCATTGTCAGCATCTGTCAGATCCAGGTTGGAGAGCTGATTCACAATGAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363464 86 + 636262 CTATGGTCAATTCTTTGAGAGGCGGTGGGGAACAATGTCATTGTCAGCATCTGTC--ACTCAGGTTGGTGAGTGGATCCACAATGAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 355880 88 + 647215 CTATGGTCCATTCCTTGGGCGGTGGTTGGGAACAATGTTGTTGTCAGCATCTGTCAGATCCAGGTTGGAAAGCTGATTTGAAATGAGA a s mr.mrrefChr5 210601 213 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 365748 13 + 636262 GAGTGCTTAACAG s simRat_chr6.simRat.chr6 358201 13 + 647215 GAGTGCTTAACAG a s mr.mrrefChr5 212793 43 + 294542 TGAGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365761 43 + 636262 CAAGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 358215 43 + 647215 TGTGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCG a s mr.mrrefChr5 212836 224 + 294542 AGGAATTGACCTGCCACTCCCGTTTGGCTGGGTGATTTTGTTGGCACCTAAGAAGACCATGCTGCAGGAGACCCAAAGACTGAGGCAGAATACTCTTCATCCGATTGCAGCATATTACCTGGTCATATGGTCCTCCTTTCTGCCTGATGAATGGCTCCTGGACAAGTGTGAGCATATCTCTTAATATCTTATTTACATACACATATAAGGTTTGATCACTTGGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365804 221 + 636262 ---AATCGACCTGCCACTCCCGTTTGGCTGGGTGATTTTGTTGGCACCTAAGAAAACCATGCTGCATGAGACCCAAAGACTGGGGCAGCATACTCTTCATCCGATTGTAGCATATTACCTGGTCATATGGTCCTCCTTTCTGCCTGATGAATGGCTCCTGGACAAGTGTGAGCATATCTCTTAAGATCTTATTTACATACACATATAAGGTTTGATCACTTGGT s simRat_chr6.simRat.chr6 358260 223 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 368525 92 + 636262 TATGGATGCACTGCAATTATTCTCAGGCATATCTGTAAATAAAGTATT-AATCAGTGTATGTACCTTCCTGTATTAAAAGGTATCTATTTGCT---------------------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 360921 121 + 647215 TTTGGATGCACTGCCATTATTCACAGGCATATCCGTAAATAAAGTATTAAATCAGTGTCTGTTCTTTTCTGGATTAAAAGGTGTCTAATTGCCTTTGCCTAGCCTACATGGATGGTATGTT a s mr.mrrefChr5 215672 99 + 294542 CAGTATCCGCTCAATGCCCACTTATCCCCCTTTTGGAAAGGAAATATTCAATCAACTCTTAGGAGTAATTGTCAGGCTGTATGGTACAGGACCCCAAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368617 92 + 636262 --GTATCCGCTCAATGCCCACTTATCCCCCTTTTGGAAAGTAAATATTCAATCAACTCTTAGGAGTAATTGTCA-----GATGGTACTGGACCCCAAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 361043 92 + 647215 CAGTAACTGCTCAATGTCCACTTATCCAC-------AAAGGAAATATTCAATCAACTCTTAGGAGTCATTGTCAGGCTGTATGGTACAGGTCCCCAAGC a s mr.mrrefChr5 215771 29 + 294542 CTCTGATTTCATACACTGAGTCTCTTAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368711 29 + 636262 CTCTGATTTCATACACTGAGTCTCTTAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 361135 28 + 647215 CTCTGATTTTA-ACACTGAGTCTCTTTAG a s mr.mrrefChr5 215800 59 + 294542 TGCCATCACACACAGTCTTAAAGAATCTGTTGGGATAAACCAGAAAGAAAGAAATCATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368740 50 + 636262 --------CACACAGTCTTAAAGAATCTGTTGGGATAAACCAGAAA-AAAGAAATCATC s simRat_chr6.simRat.chr6 361165 57 + 647215 TGCCATCACACACAGTCTTAAAGAATCTGTT--GATAAACCAGAAAGAAAAAAATCAGC a s mr.mrrefChr5 215859 206 + 294542 GGTTTGCCTCAACATCAGGTAAGCGTGGTCCCAACTGTTATTACAGGGCATTGGCCTGCGTGAATGGGTGATACATTGATGACACGAAACTGTGATCACCCAAATTATGTCACCCTTGGCAGCCTATACAGTAGCTATGGATTTATGGACACCTATATTGCAGCTGTTCATTTATGGAGGAGCCTATCCGGCAGCTATTGTGTTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368791 206 + 636262 GGTTTGCCTCAACATCAGGTAAGCGTGGTCCCAACTGTTATTACAGGGCATTGGCCTGCGTGAATGGGTGATACATTGATGACACGAAACTGTGATCACCCAAATTATGTCACCCTTGGCAGCCTATACAGTAGCTATGGATTTATTGACACCTATATTGCAGCTGTTCATTTATGGAGGAGCCTATCCGGCAGCCAGTGTGTTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 361222 197 + 647215 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mr.mrrefChr5 217299 10 + 294542 TGTGTGCCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370278 10 + 636262 TGTGTGCCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 362702 10 + 647215 TGTGTGCCAA a s mr.mrrefChr5 217309 131 + 294542 CCCAACTGTCCCCAGATGATGTAGTGGCAATTGAGGGTGGGTTAGGCTGATGGGGGTGAGTTCAAACAAGACTTCAGTAAATGCCCTGGCAAAAGCATATAGCCATTCTTTTTCCATAAAAGTGATGGAAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370288 131 + 636262 CCCAGCTGTCCCCGGATGATGCAGTGGCACTTGAGAGTGGGTTAGGCTGATGGGGGTGAGTTCAAACAAGACTTCAGTAAATGCCTTTGAAAAGGCACATAGCCATTCTTTTCCCATAAAAGTGATAGAAT s simRat_chr6.simRat.chr6 362714 118 + 647215 CCCAACGGCCCCAAAATAATGTGGTGGCAATTGATGGTGGGTTAGAACAATGGGGGCTAGTTCAAACAAGACTT----------CCTGGCAAAAGTATGTACCCATTCTTTTTCCATAAAAGTGCTGG--- a s mr.mrrefChr5 217440 133 + 294542 TAGACAACAAGACTTATATACCAATCAAGCCAGCACAGCACAGCTCACTTGAAATTGTCAATCTGACAGACAGTTCAACAGTATACTAAACTCATGTCAAAACTATTCAGCATTGACCAACCCTGCCGGCATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370422 133 + 636262 TAGACAACAAGACTTATATACCAATCAAGCCAGCACAGCACAGCTCACTTGAAATTGTCAATCTGACAGACAGTTCAACAGTATACTAAACTCATGTCAAAACTATTCAGCATTGACCAACCCTGCCGGCATT a s mr.mrrefChr5 217573 20 + 294542 GGATCTAGATGAGCTCAGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370558 20 + 636262 GGATCTAGATGAGCTCAGTT a s mr.mrrefChr5 217593 22 + 294542 CATGTCACGGTCTCTCAGGTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370579 22 + 636262 CATGTCACGGTCTCTCAGGTTC a s mr.mrrefChr5 217615 25 + 294542 GAGCGCTCTAGTATGTGGATACAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370618 25 + 636262 GAGCGCTCTAGTATGTGGATACAAA a s mr.mrrefChr5 217640 17 + 294542 ATCCTGGGTTTTGCATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370645 17 + 636262 ATCCTGGGTTTTGCATC a s mr.mrrefChr5 217657 20 + 294542 GTGTACTTTCAGGTAGCATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370668 20 + 636262 GTGTACTTTCAGGTAGCATT a s mr.mrrefChr5 217677 12 + 294542 AACGTATAGCCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370693 12 + 636262 AACGTATAGCCC a s mr.mrrefChr5 217689 56 + 294542 GGTTATCTTTGATGCTGCATCAGGTGTGGTATATCTAGAGGGGCTGTATTACCTAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370707 56 + 636262 GGTTATCTTTGATGCTGCATCAGGTGTGGTATATCTAGAGGGGCTGTATTACCTAA s simRat_chr6.simRat.chr6 362832 35 + 647215 ---------------------AGGTGTGGTAGACCTAGAGGTGCAGTATTACGTGA a s mr.mrrefChr5 217745 70 + 294542 AAAGGCATTTGTGGCTATTATCTGTAATGGCGATTATCACCATCTTACGTTGACTCCATCTAGGCTTAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370763 70 + 636262 AAAGGCATTTGTGGCTATTATCTGTAATGGCGATTATCACCATCTTACGTTGACTCCATCTAGGCTTAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 362871 70 + 647215 GAAGCCATCTGTGGGGTATTTCTGAATTGGTGATTATCACTATCTTACACTGTCTCCATCTAGGCTTAGA a s mr.mrrefChr5 217815 26 + 294542 GTCTAGTTAGCTAATGAGTGTCACAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370839 26 + 636262 GTCTAGTTAGCTAATGAGTGTCACAA s simRat_chr6.simRat.chr6 362941 26 + 647215 GTCCAGTTGGCTAAAGAGTGTCACAA a s mr.mrrefChr5 217841 28 + 294542 TTTGTTTGATAAATTTCACTGTACCATC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370865 28 + 636262 TTTGTTTGATAAATTTCACTGTACCATC s simRat_chr6.simRat.chr6 363212 28 + 647215 ATTGTTTGATAAATTGCACTAAACCATC a s mr.mrrefChr5 217869 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simRat_chr6.simRat.chr6 365459 6 + 647215 GGCCTG a s mr.mrrefChr5 219944 1 + 294542 T s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373366 1 + 636262 T s simRat_chr6.simRat.chr6 365465 1 + 647215 T a s mr.mrrefChr5 219945 45 + 294542 AACATTCTGACTCATTATTAGATGTTTGATTTTGATGTCCACTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373273 45 + 636262 AACATTCTGTCTCATTATTTGATGTTTGAGTTTGATGTCCACTTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373367 45 + 636262 AAGATTCTGACTCATTATTAGAGGTTTGATGCTCATTGTTACTTA s simRat_chr6.simRat.chr6 365466 45 + 647215 AAAATTCTGACTCATTATTAGATGTTTGATTTTTGTGTCCCTTTA a s mr.mrrefChr5 219990 1 + 294542 C s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373412 1 + 636262 C s simRat_chr6.simRat.chr6 365511 1 + 647215 C a s mr.mrrefChr5 219991 31 + 294542 CAAATTGTACTCCTGTGGGTCATGTTCTCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373318 31 + 636262 CAAATTGTACTCCTGTGGGTCATGTTCTCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373413 31 + 636262 CAAATTGTACCCCGGTGGGTCATGTCCTCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 365512 31 + 647215 AAAATAGTACTCCTGTGGGTCATGTTCCCCA a s 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gcctcagcccaactgataaacatgttgacccaccctaataggtattagaatccttgagacttgggcatatgc s simRat_chr6.simRat.chr6 367019 72 + 647215 gcctcagctcaagcgataagcatgtcgacccacccttataggtattggcatccttgagactttggcatatgt a s mr.mrrefChr5 221540 132 + 294542 taaagcctaactcccaatcctccctcaggttatggtcaagcctctgctctcgcaacaatgcctgacactaaggtaacaggtcatttctttgggaacaatccaggtccaataaatagttacttagccatccga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172418 132 + 636262 taaagcctaactcccaatcctccctcaggttatggtcaagcctctgctctcgcaacaatgcctgacactaaggtaacaggtcatttctttgggaacaatccaggtccaataaatagttacttagccatccga s simRat_chr6.simRat.chr6 367092 132 + 647215 taaagcctaactgccaatcctctctcaggtaatagtcgggcctctgctctttcaacggttcctgacactaaggtaacaggtcatttctttgcgaacaatccaggtccagtaaatagatacttggtcatctga a s mr.mrrefChr5 221672 14 + 294542 gcctaagtcaaatg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172550 14 + 636262 gcctaagtcaaatg s simRat_chr6.simRat.chr6 367237 14 + 647215 gcctaagtgaaatg a s mr.mrrefChr5 221686 41 + 294542 tttggttaagagcctttaccaatttccactggttggctgca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172566 41 + 636262 tttggttaagagcctttaccaatttccactggttggctgca s simRat_chr6.simRat.chr6 367251 41 + 647215 tttggtaaagagcctttaacaatttccactggttggatgca a s mr.mrrefChr5 221727 71 + 294542 agcagcaaaattttcccctcctcagtcgcggaacagttacagggcaagaaactgtgcccataagatttgcc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172618 71 + 636262 agcagcaaaattttcccctcctcagtcgcggaacagttacagggcaagaaactgtgcccataagatttgcc s simRat_chr6.simRat.chr6 367292 71 + 647215 cacagccaaattttcccctcctcagtcactgaccagcctcaggttaagaaactatccccatgagatttgtc a s mr.mrrefChr5 221798 11 + 294542 caatttcctcc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172694 11 + 636262 caatttcctcc s simRat_chr6.simRat.chr6 367363 11 + 647215 caatttcctcc a s mr.mrrefChr5 221809 24 + 294542 ccaaatattgtggtttcacctctc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172705 24 + 636262 ccaaatattgtggtttcacctctc s simRat_chr6.simRat.chr6 367375 24 + 647215 ccaaatattgtggttatgtctctt a s mr.mrrefChr5 221833 18 + 294542 tctccccagaccagtgga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172737 18 + 636262 tctccccagaccagtgga s simRat_chr6.simRat.chr6 367399 18 + 647215 cccccccagaccagtaga a s mr.mrrefChr5 221851 28 + 294542 acaagcctcttgagaggagggtcctgtc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172755 28 + 636262 acaagcctcttgagaggagggtcctgtc s simRat_chr6.simRat.chr6 367423 28 + 647215 ataagcatctctagatgagggtcctgtc a s mr.mrrefChr5 221879 26 + 294542 aagcagcatgtttggcatcaacatct s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172783 26 + 636262 aagcagcatgtttggcatcaacatct s simRat_chr6.simRat.chr6 367453 26 + 647215 aagaggcttgttaggcttcaacatct a s mr.mrrefChr5 221905 17 + 294542 cttgagagttgccttcg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172809 17 + 636262 cttgagagttgccttcg s simRat_chr6.simRat.chr6 367480 17 + 647215 cttgacagtttccttca a s mr.mrrefChr5 221922 16 + 294542 atctcatgctctttct s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172826 16 + 636262 atctcatgctctttct s simRat_chr6.simRat.chr6 367499 16 + 647215 atttcacgctctttcc a s mr.mrrefChr5 221938 11 + 294542 tccccaacagt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172852 11 + 636262 tccccaacagt s simRat_chr6.simRat.chr6 367515 11 + 647215 tatacagcagt a s mr.mrrefChr5 221949 37 + 294542 cactgtcatctgttttggcttctggatggctaacaat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172867 37 + 636262 cactgtcatctgttttggcttctggatggctaacaat s simRat_chr6.simRat.chr6 367526 37 + 647215 tattgttacccatcaagaagccaaaagaggtcacagt a s mr.mrrefChr5 221986 91 + 294542 aactgccatatagcttcctgaggttttattggtgtaccttaggaggtcagaaactctctctcgtgccagatagccacatgtgcatgtagcc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172904 91 + 636262 aactgccatatagcttcctgaggttttattggtgtaccttaggaggtcagaaactctctctcgtgccagatagccacatgtgcatgtagcc s simRat_chr6.simRat.chr6 367578 91 + 647215 accagcagtaaggcttcctgatgtcttattggtgtaccttaggaagtcagaaatccttcctcatgccagataggcgcatgtgcatggagca a s mr.mrrefChr5 222077 17 + 294542 agtatgtggagtctctg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172995 17 + 636262 agtatgtggagtctctg s simRat_chr6.simRat.chr6 367678 17 + 647215 tgtatttggagtctgcg a s mr.mrrefChr5 222094 35 + 294542 cctcgcatagtttgcgtgcctctgtgagtgtgatg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173012 35 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simRat_chr6.simRat.chr6 367896 83 + 647215 acgagctactgtcagtatataccttgaggtcagggtcagactgtggaacctccagtagatcagcgtgagctgcaaacatttga a s mr.mrrefChr5 222323 60 + 294542 ACTCTCACCCATCGGTTCAATTACATACCCCATTATTTTAAGTCTATGTCATACCATAGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173241 60 + 636262 actctcacTCGTCAGTTCAATTACATACCCCATTATTTTAAGTCTATGTCATACCATAGA s simRat_chr6.simRat.chr6 368000 60 + 647215 ACTCTCACCGATTGGTTCAATTACATACCCCATTATTTTAATTCTATGTCATGCCATAGA a s mr.mrrefChr5 222383 264 + 294542 CTCTGAATATACTCTATCAATTTACACAGACAACAACATTCGCCTCATCCCCTTCTTTCCAAGATGTCCATGATACATCAGGGTAATAGATCCCCAGAGTGGTTTTTTAGTTGTCATCACTGTTGGTGGTTAGTTTCGTAATTTAGTAGCAGTGCCAGTTTGATAGCATGGAGTTTATCTGTGATCCAGCTGAGCTTAGCAGTTAGGCATAAGGATTTAAGCTGGTCTCGGTGAACTATAACAAGCACAAAAAGTATAAAAAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173303 264 + 636262 CTCTGAACATACTCTGTCAATTTACACAGACAACAACATTCGCCTCATCCCTTTCTTTCCAAGATGTCCATGATACATCTGGGTAATAGATCCCCAGAGTGGTTTCCTAGTTGCCATCACTGTTTGTGGTTAGTTTCGTAATTTAGTAGCAGTGCCAGTTTGATAGCATGGAGTTTATCTGTAATCCAGCTGAGCTTAGCAGTTAGGCATAAGGATTTAAAATGGTCTCGGTGCACTATAACAAGCCCAAAAAGTATAAAAAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 368060 248 + 647215 GTCTGAATATCCTCTATCAATTTACACAGA---------------CATCCCCTTCTTTGCGAGGTGTCCATGATGCAACAGGGTAATGGATCCCCAGAGTGGTTTTTTAGTTGTCATCACTGTTGGTGGTTAGTTTAGTATTTTAATAGCAGTGCCAGTTTGATAGCATGGAGTTTATCTGTGATCCAGCTAAGCTTTGCA-TTAGGCCTAGGGATTTAAGCTGGTCTTGGTGATCTATAATAAAGACAGAAAGTAAAAAAAAA a s mr.mrrefChr5 222647 71 + 294542 CCATTTGACATTGCGGGATCAGTCACAGAGGGTAAACTTCAGTATTTGCCATTTGTGGGGTACATTGTTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173567 71 + 636262 CCATTTGACATTGCGGGATCAGTCACAGAGGGTAAACTTCAGTATTTGCCATTTGTGGGGTACATTGTTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 368312 69 + 647215 CCACTGG--ATTGCAGGATCAGTCACAGAGGGCAGACTTTGGTGTTTGCCATTTGTGGGGTACATTGTTTG a s mr.mrrefChr5 222718 177 + 294542 CACGTGTTAATTACAAGTCTCATGAATCCTACTAGAGTATACCTTGCATGTCCCTTTACTCTTTGAAAAACCCTAACCTAGCTCATGCTTCATAATATACTTTAGCTGTATACTTTGTGTGGGAAAGATAGAATATAGACTTAGCTTGAATAGGATGCACTGGAAACCTTTCACCCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173638 172 + 636262 CACAAGTTAATTACAAGTCTCATGAATCCTACTAGAGTATACCTTGCATGTCCCCTTACTCTTTGAAAAACCCCAACCTAGCTCATACTTC-----CAACTTTAGCTGTATACTTTGTGTGGGAAAGATAGAATATGGACTTAGCTTGAATAGGATGTGCTGGAAACCTTTCACCCT s simRat_chr6.simRat.chr6 368382 176 + 647215 CATGTGTTAATGACAAATCTCATGAGTCCTACTAGAGTATACCTTGCGTGTCCCTTTTTTCTTTGGAACACCCT-ACCTAGCTCATGCTTCATAATATACTTTGGCTGGATACTTTGTGTGGGCAAGATATAATATAGACTTAGCTTGGATAGAATGCACTGGACGAATTTCACCCT a s mr.mrrefChr5 222895 86 + 294542 ACAAAGGTTGGTCATAGGTTAAAGGCCAATTGGTTATTGCTTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATCAATCATCTCCTCCAAGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173815 78 + 636262 ACAAAGGTTGTTCATAGG-TAAAGGCCAATTGGT------TTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATC-ATCATTTCCTCCCAGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 368558 86 + 647215 ACAAAGGTTGGTCATGGGTTAAAGGCCGACGGGTTATTGCTTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATCAATCATCTCCTCCAAGAG a s mr.mrrefChr5 222981 116 + 294542 TCACTTCTGAGCTTTGGAAGTATTTCCATCACTAGGCACAACACTTGGTCATATTACTGGGGGAATGGGAGTGGAACATGGGGTTGAATGAAAGTGGGGCTACCAGGCTTCACATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173898 116 + 636262 TCACTTCTGAGCTTTGGAAGTCCTTCCGTCTCAAGGTACAACACTTGATCATATTACTGGGGGAATGGGAGTCGAAGATGGGGATGAATGAAAATGGAGCTACCAGGCTTCACATA s simRat_chr6.simRat.chr6 368644 115 + 647215 TCACTTCTGAACTTTGGAAGTATGTCCATGAGTAAGCACAACACTTGGTCATATTACTGGGGGAA-GGGAGTGGAACATGGGGTTGAATGAAAGTGGGGCTAATGGGCTTGACATA a s mr.mrrefChr5 223097 42 + 294542 TAAAGATGCTTGAAACCAACAACACCCCTCCCTTCTGCTGTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 174014 42 + 636262 TAAAGATGCTTGAAATCAACGACACTCCTCCCTTCTGCTGTA s simRat_chr6.simRat.chr6 368800 41 + 647215 TAAGGATGCTTG-AACCAACAACACCCCTCCCTTTTGCTGTA a s mr.mrrefChr5 223139 271 + 294542 GAAATATTGACGCTTCCACCTAGATTATACCCAAACCTACAACTATACAAACTGACAAACCCTAAAACAGAGACCTGCCTGTACACTGGCTCTCCATTCTGTAACCTAAAAAATGACTGAGATAGTTTGTACTGAGGAATGGCCAATTCTCTTTCTCAATAAAGGGGATAGGCCAGATGCATCTGCTGGAGGCTTGTAATAAGCCTGCATCTACGGCAGCATAACTAGTAAGTGATAACAAAAAATATGGTCACACAGCAGACCAGGAAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 174194 271 + 636262 GAAATATTGACGCTTCCACCTAGATTATACCCAAACCTACAACTATACAAACTGACAAACCCTAAAACAGAGACCTGCCTGTACACTGGCTCTCCACTCTGTAACCTACAAAATGACTGAGATAGTTTGTAACGAGGAATGGCCAATTCCCTTTGTCTATAAAGGGGATAGGCCAGATGCATCTCCTGGAGGCATGTAATAAGCCTGCATCTACGGCAGCATAACTTGCAAGTGATAACAAAAAATATGGTCACACAGCAGACCAGGAAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 368841 239 + 647215 GCAATAATGACGCTTCCACCTAGCTGAGGCAAACACCTAC----CTGCAAAATGGCAA----------------------------TGGCTCTCCATTCTGCAACCTAAAAAATGACTGTGATAGTTTGCACTGAGAGGTGTCCACTGCTCTTTCTAAATAAAGGGGATAGGCCAGATGCATTTGCTGGAGGCTTGTACTAAGCCTGCGTTTACGGCAACATAACTAGTAAATGATAACAAAAAACATGGTCGTGTGGTAGACCAGCAAAT a s mr.mrrefChr5 223410 596 + 294542 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TGTATGCATGGTTATAAACCTCTTATGTCTCCTTTACAAATTGTTTAAGTGTCTCGCTTAGTGTTGGTATTTATAAGTTTCCATCACAACCACCCGTATATTGTTATTCAAATGGAAAAACCAAGCTGTTCTAAGACCAGAACAATATGTTTGTTTCTTGCCTTTATGTCAGAACACTTGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 369650 182 + 647215 TGCATGCATGGGTATAGACCTATTATGTATTCTTTGTGTATTGTTTAAGTGTCTCACTTAGTGTTGGTATTTATAAGTTCCCATTACAACCACCCGTATAATATTATCCTAATGGAAAAACCAAACTGTTCTAAACACAGAATGATGTGTTTAAGTCTTACATTAATGTCAGAACATTTGTT a s mr.mrrefChr5 224188 715 + 294542 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TCATTTTGATGGGCGCAATTTGGTACATTGGACTTTATA s simRat_chr6.simRat.chr6 371206 39 + 647215 TCATTTTGATGGGCGCAATTTGGTACATTGGACTTTATA a s mr.mrrefChr5 225620 9 + 294542 ACATTCGAA s simRat_chr6.simRat.chr6 371248 9 + 647215 ACATTCGAA a s mr.mrrefChr5 225629 248 + 294542 CTATATAGATGAAATGAAACAGAGTTGCCAAGTTAAATGTCCTAGTGGTTTTCACATGAATCATTATGCTTTTTTGAGCCCAGCTGGAGCCAGAGTTGTGTAAAGGCTTTCCTACTCAAGCTACTGAAAACTCATTCTGGTTCTTGTGCATCTGGTAATGTTATTATTATCTCTAAGTCACATAAATATCAGAACCTGAGCTACACAAGCAAAATCAGAACATCTGACATCTTTTTGTAGCTCATGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176538 231 + 636262 ----------GAAATGAAACAGAGTTGCCAAGTTGAATGCCCTAGTGGTCTTCACATGATTCATTATGCTCTTTTGAACCCAGCTGGAGCCAGAGTTGTGTAAAGGCTTTCCTACTCAAACTACTGAAAACTCATTCTGGTTCTTGTGCATCTGGTAGTGTTATTAGTATTTCTAAGTCACACAAATA--AGAACGCGAGCTACACAAGCAAAATCAGAACATCTGACATCTTTTTGTAGCTC----- s simRat_chr6.simRat.chr6 371319 245 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 378148 18 + 636262 CTATAATATGAGATTAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 377467 18 + 647215 CTATTATATGAGACTAAA a s mr.mrrefChr5 231738 253 + 294542 ATGTCTTTGTACAGGCTGTGTTCTTAATTGATTTATCATAGTGCAGTGTGACTGCACAGAGGAATACCAGGTTACTCCAAGTCAAGGATTTTCCCCAGCAAGTGTTTAGTGTACAAAGGGTACATGCGTAATGTTGTTATCATATTAAGTAGTGCAAGCAGTTGGGGTAATACAAGTAGTATGTCCTACACACATTTAACAGTTGGGCAGGTGAGTATTTAACAGTTGGGCAATCGAGTGGGTGCAACCATTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378166 253 + 636262 ACGTCTTTGTACAGGTTGTGTTCTTAATTGATTTATCATAGTGCAGTGTGACTGCACAGAGGAATACCAGGTCGCTCCAAGTCAAGGATTTTCCCCAGTAAGTGTTTAATGTATAAAGGGTACATGCGAAATGTTGATATCATATTAAGTAGTGCAAGCAGTGGGAGTAATACAAGTAGTATGTCCTACACACATTTAACAGTTGGGCAGGTGAGTATTTAACAGTTGGGCAATCGAGTGAGTGCAACCATTC s simRat_chr6.simRat.chr6 377487 253 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 322278 18 + 636262 ACCCATCCCCCCCTAAaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379917 18 + 636262 ACCCATCCCCCCCTAcaa s simRat_chr6.simRat.chr6 379127 18 + 647215 GCCCATCCCCCCCTACTA s simRat_chr6.simRat.chr6 194422 10 - 647215 --------TCCCTTACAA a s mr.mrrefChr5 233326 19 + 294542 tcttattgggacgagctga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322296 19 + 636262 tcttattggaatgagctac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379935 19 + 636262 tcttattgggacaagctga s simRat_chr6.simRat.chr6 379145 19 + 647215 Tcttattgggacgagctga s simRat_chr6.simRat.chr6 194433 19 - 647215 TCTCAAGAGGACAGGTAGa a s mr.mrrefChr5 233345 1 + 294542 a s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322315 1 + 636262 a s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379954 1 + 636262 a s simRat_chr6.simRat.chr6 379164 1 + 647215 a s simRat_chr6.simRat.chr6 194467 1 - 647215 a a s mr.mrrefChr5 233346 1 + 294542 t s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379955 1 + 636262 t s simRat_chr6.simRat.chr6 379165 1 + 647215 t s simRat_chr6.simRat.chr6 194468 1 - 647215 t a s 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mr.mrrefChr5 233487 38 + 294542 ggcaaaatgttactcttaattggtatattcacagttgg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380120 38 + 636262 ggcaaaatgttactcttaattggtatattcacagttgg s simRat_chr6.simRat.chr6 379303 38 + 647215 ggcgacattcctgtcttaattggtaggtacacacctgg a s mr.mrrefChr5 233525 49 + 294542 gtggcaacagtcttttgttcctatgacccacacagcatgttatggacca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380160 49 + 636262 gtggcaacagtcttttgttcctatgacccacacagcatgttatggacca s simRat_chr6.simRat.chr6 379341 49 + 647215 gtggtaacgggcttttgatcctttggcccacacaGCAcattatggacct a s mr.mrrefChr5 233574 43 + 294542 gtgaaaccaggcccctcttagatgaataagtggcagaattttt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322446 43 + 636262 gtgataccaggctcctctcaaatgagtaagtggcaaaATTTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380209 43 + 636262 gtggaaccaggcccctcttagacgattaagtggcagaatcttt s simRat_chr6.simRat.chr6 379390 43 + 647215 gagaaaccaggcacctcttacatgaataagtggcagaatcttt s simRat_chr6.simRat.chr6 194600 43 - 647215 gtgaaaccaggcccctctcagatgaataagtggcaaaattttt a s mr.mrrefChr5 233617 6 + 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simRat_chr6.simRat.chr6 379457 83 + 647215 taatggtctattgctcctttgccctacacaatgccattgacttaataatatcccactcctgtttgctgattcgcagcccctca s simRat_chr6.simRat.chr6 194697 82 - 647215 ttat-gtttgttgctgctttgacccacacagtgtctttgacttaatgatatcaaactcacgtttgtcaattcgtggttttgca a s mr.mrrefChr5 233726 16 + 294542 ttcgcatctttttttg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380361 16 + 636262 ttcacatcttttctgg s simRat_chr6.simRat.chr6 379540 16 + 647215 ttcgcagctgtttttg s simRat_chr6.simRat.chr6 194792 16 - 647215 tttgcaactttttttg a s mr.mrrefChr5 233742 25 + 294542 gagtgttaagcatcaagggctcttc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322489 25 + 636262 CAATGTCAAACATCAAGGCCCTTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380377 22 + 636262 gagtg---ggcatcaagggttcttc s simRat_chr6.simRat.chr6 379556 25 + 647215 gtgtgttgagcattataggttcttc s simRat_chr6.simRat.chr6 194808 25 - 647215 gcatgttaagcataaaaggctcttc a s mr.mrrefChr5 233767 4 + 294542 agta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380399 4 + 636262 agta s simRat_chr6.simRat.chr6 379581 4 + 647215 agta s simRat_chr6.simRat.chr6 194833 4 - 647215 agtt a s mr.mrrefChr5 233771 10 + 294542 cctatatctt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322514 10 + 636262 CATGTAACTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380403 10 + 636262 gctatatctt s simRat_chr6.simRat.chr6 379585 10 + 647215 gctatatctt s simRat_chr6.simRat.chr6 194837 10 - 647215 cctatatctt a s mr.mrrefChr5 233781 3 + 294542 gga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380413 3 + 636262 gga s simRat_chr6.simRat.chr6 194847 3 - 647215 gga a s mr.mrrefChr5 233784 59 + 294542 tgttggtgatccctaagttgtcctctataatcttaacgctccttggcagctgagagtgc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322524 44 + 636262 TG----------ctaatctgtcctctaaaatcttaacgtcccttggcggctgag----- s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380416 1 + 636262 t---------------------------------------------------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 379595 59 + 647215 tgtttgtgatccctcagttgtccgctattatcttaacgctctttagcagctgagagttc s simRat_chr6.simRat.chr6 194850 59 - 647215 tagtggtgttccctaagttgtcctctatgatcttaacactccttggcagctgacagtgt a s mr.mrrefChr5 233843 53 + 294542 atggcacctggcatttacttcagtgtagggagtgagaaatggggtaagtgttc s simRat_chr6.simRat.chr6 379668 53 + 647215 atggcatgtggggtttacttcattgtagggagtgagaaattggttgagtggtc s simRat_chr6.simRat.chr6 194909 53 - 647215 agggcacctggcattcacttcagtgtagggagtgagaaagggggcaagtgtcc a s mr.mrrefChr5 233896 68 + 294542 tcctggcagatagaaggccaattcccctagcaccaggtattgaagagggactcctgtggccattgatt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380417 58 + 636262 ----------tagaaggtcaatttccctagcaccagttattgaagagggactcctgtggccattgatt s simRat_chr6.simRat.chr6 379724 68 + 647215 tccaggcagatgaatggccaattcccctggcatcacgtattgaagaggggcttctggggctattgatt s simRat_chr6.simRat.chr6 194962 68 - 647215 tcctggcaggtagaaggccaattcctccagtaccatgtattgaaaaaggaatcctgtgcccattgatt a s mr.mrrefChr5 233964 97 + 294542 tcttcctgatgtatggaagatagagcaattggaaagttgagggatgaacttgattttcagcaagtccatcttattgccatgggctatgggccgaatc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322568 97 + 636262 ctttcctgatgtatggaagatggagcaattagaaagttgaaggatgaacttgaatttcagcaagaccatcttattgccatggcatatgggccaaatc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380475 90 + 636262 tcttcctgatgtatggaagatagagcaatggggaag--gagggatagccagga-----ggggtagccatcttactgccaagggctatgggccgaatc s simRat_chr6.simRat.chr6 379792 97 + 647215 tcttcctgatgtatggaagatagagcaatgggaaagtttagggatgaacttgattttcaacaagtccatcttaccgccatgagctaagggctgaatc s simRat_chr6.simRat.chr6 195030 92 - 647215 tcttcctgacgtgtggaagatagagcaattggaaagttgagggatgaacttgatttttgacaagtccatcttattgccatggtcta-----tgattc a s mr.mrrefChr5 234061 34 + 294542 tcgtggtaccagtatggtgttgttttactgagag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322665 34 + 636262 ttgtagtatcagaatggtgttgttccagtgagtg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380565 34 + 636262 tcgtggcaccagtatagtgctgttttgctaagag s simRat_chr6.simRat.chr6 379889 34 + 647215 tcgtggtaccagtatagtgtagttttactgagag s simRat_chr6.simRat.chr6 195123 34 - 647215 ttgtgggaccagaatggtgttgttttaatgagag a s mr.mrrefChr5 234095 7 + 294542 tcactca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322699 7 + 636262 ttgctta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380599 7 + 636262 tcactca s simRat_chr6.simRat.chr6 379929 7 + 647215 tcactca s simRat_chr6.simRat.chr6 195157 7 - 647215 tcgctcg a s mr.mrrefChr5 234102 18 + 294542 atagtagaatttgttatc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322706 18 + 636262 atagtagaatttgtgatc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380628 18 + 636262 atggcaaagtccattcca s simRat_chr6.simRat.chr6 379936 18 + 647215 atagtagaatttgttata s simRat_chr6.simRat.chr6 195164 18 - 647215 atagtggaatttgtggtc a s mr.mrrefChr5 234120 28 + 294542 cgggaggattatgccgccagctcaattc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322724 28 + 636262 tgggaggattatgccaccggcccgatgc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380649 28 + 636262 cagaagaatcaagcaggcagcataaccc s simRat_chr6.simRat.chr6 379954 28 + 647215 cgggagggttatgctgccagctcaattc s simRat_chr6.simRat.chr6 195182 28 - 647215 tgggagggttatgccgctggcttgattc a s mr.mrrefChr5 234148 25 + 294542 ttctggcttggaacggactttgcca s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322764 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 322910 23 + 636262 agacctacagttgagattggata- s simRat_chr6.simRat.chr6 380111 24 + 647215 agacttataggtgagtttgtgtaa s simRat_chr6.simRat.chr6 195318 24 - 647215 agctctacaggtaagtttgtgtaa a s mr.mrrefChr5 234286 43 + 294542 taacatcttcaagttcacgttaagtcgatcgactcacgagcat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322933 42 + 636262 -aacatcttcgagttcacattaagttgatcgactcatgagcat s simRat_chr6.simRat.chr6 380135 43 + 647215 taacatctctaagttcatgttaagccagtcaacccacaagcat s simRat_chr6.simRat.chr6 195345 43 - 647215 taacatcttcaagttcacgttcagtcgatcgactcacgagcat a s mr.mrrefChr5 234329 10 + 294542 tcaatattct s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322975 10 + 636262 tcaatactct s simRat_chr6.simRat.chr6 380178 10 + 647215 tcaatattct s simRat_chr6.simRat.chr6 195402 10 - 647215 ttaatattct a s mr.mrrefChr5 234339 50 + 294542 tgggattaattatcgtttctctgattagctttaatagtgggttttatatt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322985 50 + 636262 tgggattaattatcgtttctctgattagctttaatagtgggttttatatt s simRat_chr6.simRat.chr6 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mr.mrrefChr5 234527 32 + 294542 ccttaattttgtaactagagacttcagctaaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323097 32 + 636262 cattaattatgtaatcagagacttcagttaaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380807 32 + 636262 ccttaattttgtaactagagacttcagctata s simRat_chr6.simRat.chr6 380317 32 + 647215 ccttaattttgtaactggggactccagctaaa s simRat_chr6.simRat.chr6 195621 32 - 647215 cattaattttgtagccggaaacttcagctaaa a s mr.mrrefChr5 234559 45 + 294542 ttgcttatcagcttaagcaagtttccagctgctgccattggatta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323129 45 + 636262 ttgtttatcagcttaagcaagtctacagctcctgccattggatta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380839 45 + 636262 tcgcttatcagcttatgtaagtttccagctgccgccatcagatta s simRat_chr6.simRat.chr6 380349 45 + 647215 ttgcttatcagcttaagtaaggttccagcagccaccattgaatga s simRat_chr6.simRat.chr6 195679 45 - 647215 ttgcttatcagcttaagcaagtttccagctactgccattgggtta a s mr.mrrefChr5 234604 28 + 294542 ctgaggtatactatcatatcatccgcaa s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323174 28 + 636262 ctgaggtaaacagacatatcatccctga s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380884 27 + 636262 c-gaggtatactatcatatcatctgcaa s simRat_chr6.simRat.chr6 380394 28 + 647215 ctgaggtgtactatcgtaccatcagcaa s simRat_chr6.simRat.chr6 195725 27 - 647215 cctgggtatact-tcatatcgtccacaa a s mr.mrrefChr5 234632 34 + 294542 atattgaaggttttatttcttcttcatccaattg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323290 34 + 636262 atattgaaagctttacttcttcttcatccaattg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380911 34 + 636262 atattgaaggttttatttcttcttcatccaattg s simRat_chr6.simRat.chr6 380422 34 + 647215 atattgaaggctctatttcttcttcatccaattt s simRat_chr6.simRat.chr6 195752 34 - 647215 atattgaaagtttcatctccccttcttccaatag a s mr.mrrefChr5 234666 5 + 294542 gatac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380945 5 + 636262 tatac s simRat_chr6.simRat.chr6 380456 5 + 647215 gatac s simRat_chr6.simRat.chr6 195786 5 - 647215 gatac a s mr.mrrefChr5 234671 100 + 294542 actgtttatctttatcctgtcgggttgtctgcaccaatagttccaggactttgttaaacagcagtggtgatatggaacagccctgccgccttttcgtgcc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323324 100 + 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ctttaaagggaaggcttcaagcctgcatacatttactctgagatcgcagatcagttaattgtatattgctcta s simRat_chr6.simRat.chr6 195903 73 - 647215 ttttaaagggaagacttcaagcctgcatccatttactattagattgcacgtgggtttatcgtaaattgcccta a s mr.mrrefChr5 234844 18 + 294542 acaacattgacgtagttg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323497 18 + 636262 acaacattgacgtagttg s simRat_chr6.simRat.chr6 195976 18 - 647215 acaacattgatgtagttg a s mr.mrrefChr5 234862 32 + 294542 ccctcgatgcacaactcattgaggatcattag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323515 32 + 636262 ccctcgacacacaactcattgaggatcattag s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381122 32 + 636262 cccttgatgcaccatgcattgaggatcgttgg s simRat_chr6.simRat.chr6 380634 32 + 647215 ccctcaatgcacaactcattgaggatcattag s simRat_chr6.simRat.chr6 195994 32 - 647215 cccttgatgcataactcattaagaatccttag a s mr.mrrefChr5 234894 27 + 294542 catgcaatcctgcttagtctgttcgat s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323547 27 + 636262 catgtgatcctgctctgcctgtacggc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381155 27 + 636262 catgcaatcctgcttagtctgtttgat s simRat_chr6.simRat.chr6 380666 27 + 647215 catgcagtcctgtttagtctgtttgat s simRat_chr6.simRat.chr6 196026 27 - 647215 catgtaatcctgctccacctgttcgat a s mr.mrrefChr5 234921 2 + 294542 tg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323574 2 + 636262 cg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381182 2 + 636262 tg s simRat_chr6.simRat.chr6 196053 2 - 647215 gg a s mr.mrrefChr5 234923 14 + 294542 gcccgacatctctt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323576 14 + 636262 gcccgtcatctctt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381184 14 + 636262 gcctgacctctctt s simRat_chr6.simRat.chr6 380693 14 + 647215 gtcaaacctctctt s simRat_chr6.simRat.chr6 196055 14 - 647215 gcccattatctctt a s mr.mrrefChr5 234937 15 + 294542 tccaatgttaagatc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381198 15 + 636262 tccaatgttaagaca s simRat_chr6.simRat.chr6 380707 15 + 647215 tccaacgttaagatc s simRat_chr6.simRat.chr6 196069 15 - 647215 tccaatgtcagaatc a s mr.mrrefChr5 234952 34 + 294542 atgtgattctcctgattggcccggttaaccggtt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323590 34 + 636262 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simRat_chr6.simRat.chr6 380760 3 + 647215 tct s simRat_chr6.simRat.chr6 196142 3 - 647215 tct a s mr.mrrefChr5 235013 20 + 294542 tgggccatcctggcattcct s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381254 20 + 636262 tgggccatgctggcattccc s simRat_chr6.simRat.chr6 380763 20 + 647215 tgtgccatcctggcagtact s simRat_chr6.simRat.chr6 196145 20 - 647215 tgagccaccctggcattcct a s mr.mrrefChr5 235033 6 + 294542 agggtg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381274 6 + 636262 agggtg s simRat_chr6.simRat.chr6 196165 6 - 647215 ggggtg a s mr.mrrefChr5 235039 28 + 294542 aattctaagtgatcataatgtattagct s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381280 28 + 636262 aagtctaagtcatcataatgtattaact s simRat_chr6.simRat.chr6 380783 28 + 647215 aattctaagtgatcataatgttttggct s simRat_chr6.simRat.chr6 196171 28 - 647215 aattctaagtgatcataaggtatcagct a s mr.mrrefChr5 235067 5 + 294542 cactg s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381308 5 + 636262 ttctg s simRat_chr6.simRat.chr6 380811 5 + 647215 cactg s simRat_chr6.simRat.chr6 196202 5 - 647215 caatg a s mr.mrrefChr5 235072 14 + 294542 atgatttgttggta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381313 14 + 636262 atgatttgttggta s simRat_chr6.simRat.chr6 380816 14 + 647215 acaatttgatggtg s simRat_chr6.simRat.chr6 196218 14 - 647215 atgatttgctggta a s mr.mrrefChr5 235086 88 + 294542 atttcgattggcaagtatttggttcaaattaccgtcttggcgaatcaaaagcccaggtctagctgtctgttgtatcatcatggcttta s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381329 78 + 636262 atttt-attgac-----ttta--tcaaaagacagactttccgactcatagacccagg--ggagtgttttttgaacctttataccttta s simRat_chr6.simRat.chr6 380830 88 + 647215 gtttcagctggcaagtatttggttcaaattctcgtcttggcaaattgaaagcccaggtctagctcgctgtcgtatcatcgtggcttta s simRat_chr6.simRat.chr6 196232 88 - 647215 atttcgattggcaagtattcggttcaggttgccatcttgggcaatcaaaagcacaggtctagctttctgttgtctcatcatggcctta a s mr.mrrefChr5 235174 25 + 294542 ctcgaattggatatcagtactatgc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381409 25 + 636262 ctcaaattttattttagtaatttgc s simRat_chr6.simRat.chr6 380918 25 + 647215 cttgacttggatatcagtacgatgc s simRat_chr6.simRat.chr6 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636262 tggt s simRat_chr6.simRat.chr6 381044 4 + 647215 cagt s simRat_chr6.simRat.chr6 196398 4 - 647215 tggt a s mr.mrrefChr5 235256 29 + 294542 aggccaggtagtttcttcgttggcctgtt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381673 13 + 636262 gggccagatgatt---------------- s simRat_chr6.simRat.chr6 381048 29 + 647215 aggccaggtagtttcttcatcggcccgtt s simRat_chr6.simRat.chr6 196402 29 - 647215 aagctgggtagtttcttagttggcctgtt a s mr.mrrefChr5 235285 45 + 294542 aataaatgcctttacttcaggaccaattacgggtctgttgaggga s simRat_chr6.simRat.chr6 381077 45 + 647215 aataagtgcctttacttcagggccaattatgggtctgtttaggga s simRat_chr6.simRat.chr6 196432 45 - 647215 aataaatgcctttacttcaggaccaattacgggtctattgaggga a s mr.mrrefChr5 235330 36 + 294542 tcaataccttctttattagaacagggcagagcgccc s simRat_chr6.simRat.chr6 381122 36 + 647215 tcaataacttctttattagcacagggcagagcgccc s simRat_chr6.simRat.chr6 196478 36 - 647215 tctataccttctttattgaaacggggtagaggacac a s mr.mrrefChr5 235366 37 + 294542 gaatcaaagaagtcattatctaccaagttaatgtcct s simRat_chr6.simRat.chr6 381161 37 + 647215 gaatcagagaaatcattatctactaagttaatgtcct s simRat_chr6.simRat.chr6 196514 37 - 647215 gaatcaaagaagtcaatatctaccaagttaaaattct a s mr.mrrefChr5 235403 64 + 294542 tagcgtgaaggggatggtggtggtgcttaataatcatttggacatctgcggggtcggttgtttt s simRat_chr6.simRat.chr6 381214 64 + 647215 tagcgtgcaggggatggtggtgttgcttaataatcatttgaacatctgcagggtaagttgtttt s simRat_chr6.simRat.chr6 196551 64 - 647215 tagcatgaaggggttggtgatggggcttaatactcatttggacgtctgcggggtcggttgttat a s mr.mrrefChr5 235467 84 + 294542 ccctggttgagttctcaagacatcaatatgattcttcttgcatatctctttaacgatgctcaataaaggccggtcaattgtatt s simRat_chr6.simRat.chr6 381281 84 + 647215 ccctggatgatttctcaagacatcagtataattgttcttcaatatttcttttactatgctcaacaaaggctgatcgattgtatt s simRat_chr6.simRat.chr6 196615 84 - 647215 ccctggttgagttcttaagacatcaatatgaatctttttgcaattctctttaacgatgctcaataaaggccggtcaattctatt a s mr.mrrefChr5 235551 46 + 294542 gactttatcaaaaaactcgctctttgatttgttgaccttggggaat s simRat_chr6.simRat.chr6 381366 46 + 647215 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 382319 97 + 636262 caaagattttattcccatgaccttttgctcaacgaatttactcatatgactggggcgaatatggtgacatatgggtgggattagctcatggcacatg s simRat_chr6.simRat.chr6 263654 97 - 647215 caaagagttcaatcctatgacctcttgatcaaagaggttaatcctatgaccagggtgaatttggtcacatacacgtggggttcattcatggcacatg a s mr.mrrefChr5 236416 19 + 294542 gtctgggttctgttggatc s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382452 19 + 636262 gtctgggttctgttggatc s simRat_chr6.simRat.chr6 263751 19 - 647215 gtctgggtttagttgtacc a s mr.mrrefChr5 236435 107 + 294542 ttgtcttgcaataagtggttacaatctagaaacatagactgaatgtaaaaagcctcatgtaggcataaaaagtccctgcctaatgaacaataccaacccctaattac s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382477 107 + 636262 ttgtcttgcaataagtggttacaatctagaaacatagactgaatgtaaaaagcctcatgtaggcataaaaagtccctgcctaatgaacaataccaacccctaattac s simRat_chr6.simRat.chr6 263770 107 - 647215 ttgtcttgccataagtggttacaatccagaaacattgacagaatgtaaagtgccccatgtaggcacagagaatccccgtctaataaatgataccaacccctagttag a s mr.mrrefChr5 236542 50 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 264044 18 - 647215 ggtctgacatttttttcc a s mr.mrrefChr5 236726 248 + 294542 tcaagatattgaagaagggtccccattttgccttttgatcaatgggatctgttaagtggtctgttactcacagtttccctttccttgtcatctagtcctcttctgttggagcacttagcacaccctgcacctatacctggacattggctcctttgattatcgtacaaaaattctgttgtataatgtcacggagctcttcctccaattttgcaccattccacctttcttgatccggcacccctaagagt s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382782 248 + 636262 tcaagatattgaagaagggtccccattttgccttttgatcaatgggatctgttaagtggtctgttactcacagtttccctttccttgtcatctagtcctcttctgttggagcacttagcacaccctgcacctatacctggacattggctcctttgattatcgtacaaaaattctgttgtataatgtcacggagctcttcctccaattttgcaccattccacctttcttgatccggcacccctaagagt s simRat_chr6.simRat.chr6 264062 248 - 647215 taacgatattgaagatgggtccccattttggctttcaattgacggtatctgttaaatagtctgatactcattgtttccctttagtggtcatctagtcctcttccgttggagcgcttaacatagcctgcacttttgcctggttacagggtcctttaattatcgcagaagaattcttttgtataatgtcctggagctcattctccaatttcatgctgttctgcctttctttatccggcacctctgagagt a s mr.mrrefChr5 236974 47 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 264949 37 - 647215 TGACTGTGCATAGTGGCCATGGTGGGGCCATACATAG a s mr.mrrefChr5 237459 39 + 294542 CAGTCATGGAGGGGGGGTGGAGCAGGTTGGATAAGGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383583 39 + 636262 CAGTCATGGAGGGGGGGTGGAGCAGGTTGGATAAGGCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 264986 39 - 647215 CGGCCGTGGTGGGGGGGTGGAGCAGGTTGGATAAGGCTT a s mr.mrrefChr5 237498 48 + 294542 CACATTATTAATCCCATCTTAATCCCCATGCATACATATCGTTAGATA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383622 48 + 636262 CACATTATTAATCCCATCTTAATCCCCATGCATACATATCGTTAGATA s simRat_chr6.simRat.chr6 265027 48 - 647215 CCCACTCTTAATCCCACCTTAATCTCTATGTATACATATCCTTAGATA a s mr.mrrefChr5 237546 102 + 294542 TGTGGTTCCTGAATTGCGACATGTCACTCTACACTCTCATAGAGAACAACAGTCACGATGTCTGTGATAGTTCCTCGGCCTACGATTGCGGGGCTTACGCGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383670 102 + 636262 TGTGGTTCCTGAATTGCGACATGTCACTCTACACTCTCATAGAGAACAACAGTCACGATGTCTGTGATAGTTCCTCGGCCTACGATTGCGGGGCTTACGCGT s simRat_chr6.simRat.chr6 265076 102 - 647215 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CTGGTGTACCATTGTGAACCAAACACCCTCATTAGGAGTGGTCAAGGAATGCATACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384910 57 + 636262 GTGGTGTACCATTGTGAACCAAACACCCTCATTAGGAGTGGTCAAGGAATGCATACT s simRat_chr6.simRat.chr6 384947 57 + 647215 CTGGTGTACCCTCATGAACCAAACTCCCTCATTAGGCATGGTCAAGGAATGCATCCA a s mr.mrrefChr5 238776 290 + 294542 TGCCTAACAAATGCTGGCATCCTTATCACCTGGCATTCTTGTCACCACTTGAATCACAGCATTTATTCTAGCCTATCAGTATGAGTAGCTGGATGGGAATATAAGCCCCCCATAGATTTCGCGTCCTGCTGCTGGCTATATGACCATGAACCAAGTTTTGCCTCCTCAGTCAGATAGCATCTTTGACTGCGCAGTCATTTATCTATCATCTGCTTGGTGCAGAGTGGCACAAACTTAACACACGGCAGAGTCTTGTCCTTATAGAGCTGTTGGAAGGACTAGCTCATAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384967 286 + 636262 TGCCTAACAAATGCCGGCATCTTTGTCACCTGGCATTCTTGTCACCACGTGAATCACAGCATTTATTCTAGCCTATCAGTATGAGTAGCTGGATGGGAATATAAGTCCCACACAGATTTTGAGTCTTGCTGCTGGCTATAT---CATGAACCAAGTTTTGCCTCCTCAGTCAGATAGCATCTTTGACTGCGCAGTCATTTATCTATTATCTGCTTGGTGCAGAGTGGTGCAAACTTAACACACGGCAGAGTCCTGTCCTTATAGAGCTGATGGAAGGACTAGCTGATAA- s simRat_chr6.simRat.chr6 385005 267 + 647215 TGTCTAACAAGTGCTTGCATCCTCATCACCTGGCATTCTTTTCACCACTTGAGACGTAGCAT--------------------GAGTAGCTGGATGGGAATATGAGCCCTCCATGGATTTCGCTTCCTGTTATTG-CTATATGACCATGAACCAAGTTTTTCATTCTCAGTCTGATAGCATCTATGGCTTCGCAGTCATTTATCTATCATCTGCTTGGTCCAGAATGGCACAAACTTAACACAG--CAGAGTCTTGTCCTTATAGAGCTGTTGGAAGGACTAGCTCATAAA a s mr.mrrefChr5 239066 68 + 294542 CATAAAAAATCAAGCTATGTTATATGTCAAGGTTAGTGCCCCATTCTACCTAGCAACATGCCTATAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 385253 63 + 636262 -----AAAATCAAGCTATGTTAGATGTCAAGGCTAGTGCCCCTTTCTACCTAGCAACATGCCTATAAA s simRat_chr6.simRat.chr6 385273 68 + 647215 CATAAAAAATTGAGCTATGTTATATGTCAATGTTAATGCCCCATTCTACCTAGTATCTTGCCTATAAA a s mr.mrrefChr5 239134 459 + 294542 CTAACTGTGGTAAGCACAGGGTCACACATTAACATCATGATATCAGCAATTGGGCATGAAAAAGGATGAAAAAGAACCTTACATTTAAACATGGAGTGGAGGGAACTAGTGTATGTGTTAAAATTTCAATTTATGTGTTAGTATCGCTTTTATGCATTTTAGGACTTGACATAGTTGATTGTTAATGATAACACCTGCATTATATCTGAGGTCCCAGGTTGCAAAGCCCTTAAGTATCTGGCTTTCTACCCAGTACTCCAGTATGTGGTGTCTTCAAAGCTAATCACAAGTGTGGGTTCAAGTGACATGGGTGCTAAGCCATGGACACTAGGATAGCACAGGAGGTATCTCTGCGCCACAACAGATTCATGCATCTATGTCACCCCCCAAAAGTTAGATAATGGCCCTGTTTGGTTGGTGAACCTAGCAAAGATGAAGTTACTTACTGTGGAAGTGTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 385316 451 + 636262 CTAATTGCGGTAAGCACAGGGTCAAACATTAACATCATGATATCAGCAATTGGGCATGAAAA-GGATTAAAAAGAACCTTACATTTAAACATGGAGTGGAGGGATCTAGTGTATGTGTTAAAATATCAATTTATGTGTTAGTATCGCTTTTATGCATTTTAGGACTTGACATAGTTGATTGCTAATGATAACACCTGCGTTATACCTGATGTCCCAGGTTGCAAAGCCCTTAAGTATCTGGCTTTCTACCCAGTACTCCAGTATGTGGTGACTTCAAAGCTGATCACAAGTGTGGGTTCAAGTGACATGGGTGCTAAGCCATGGACACTAGGATAGCACAGGAGGTATCGT-------CAACAGATTCATGCATCTATGTCACCCCCCAAAAGTTAGATAATGGCCCTGTTTGGTTGGTGAACCGAGCAAAGATGACGTTACTTACTGTGGAAGTGCAC s simRat_chr6.simRat.chr6 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AAAGAAATACAAAAACTGTCTCCAGGGGTATCGTTAAAAAACAAAGAGAATGGTCATAAGAGACTTACATCTAAGTATGATGCAAATAGTTCACCTCAAGCATGTTAACCCCCCGGATTGGTTTTTAAGATTTAGTTTGAGACTCACAGTGCATTCCCACAGTAAGTGACGCTTGATTAGACTAAGTTCCATACCTCTACTATTACAATTTGAGACCCCTAGTGCATGAGGACTTATTATTGACTCATT s simRat_chr6.simRat.chr6 385752 249 + 647215 AAGGAAATACAAAAACTGTCTCTAGGGGTATTGTTAGGAAATAAAAAAAATTGTCATAAGAGACTAACATTTAAGTATAGTGCAGGTGGATTGCCTGAGGCATGTCTACCCCCGAGATTGATTTTTAGGATTTAGTTTAGGACTCTTGGTGAATTACCACAGCAAGTGACGGTTGATTAGACTAAGATCTATACCTCTACTATTACAAGTTGAGACCCCAAGTGCATATGGATGCACTATTGACCCATT a s mr.mrrefChr5 239842 94 + 294542 GAAACCTGTGAAGATGCATTTTGGTGATGGTAGTGTAGTACATGTCCAATTCTCTAGTGGGTTTGCAAGATAAGGGGATATGTGCTGGTGCTGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386027 93 + 636262 GAAGCCTGTGAAGAACCATTTTGGTGATGGTAGTGTAGTACATGTCCAATTCTCAAGTGGGTTTGCAAGATAAGGGGATATGTGCTGGTGTGG- s simRat_chr6.simRat.chr6 386002 82 + 647215 GAAACCTGTGAAGATGCATTTTGGTGGTGGTAGAGTAGTACATGTCCAACTCTCTAGT------------CAAGGGGATATCTGCTGCTGCTGC a s mr.mrrefChr5 239936 268 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 386647 26 + 636262 TAATAGGTTATAGATGACATGCCCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 386628 20 + 647215 ------GTAATACACGACATGCCCTT a s mr.mrrefChr5 240503 68 + 294542 CCACGAACAGATAGTATAGCCCTAAGCCCTAACTAAGACCTACCACATTCTTCCTGAAAATGACATGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386673 68 + 636262 CCACGAACAGATAGTATAGCCCTAAGCCCTAACTACGACCTACTACATTCTTCCTGAGAATGACATGA s simRat_chr6.simRat.chr6 386650 68 + 647215 CCACAAACAGATAGTATAGCCCTAAGCCCTAACTAAGATCTACCACATTGTCCCTAAAAAGGACATGT a s mr.mrrefChr5 240571 493 + 294542 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TGTCTTAGGTGCCGCTGAAATATTAAATAGAACAGAAGCAATAGGTGAGTGGATATGAAGAAAGGTTCTAGTCTTCTTTCACATCCCCAGGATTGACAATCCAAGTGGTAGATGCAGTAGAAGGGTTTCAGAGGTTTCCCAACCCCATAGACATGGTCAA a s mr.mrrefChr5 260714 29 + 294542 GACCACCTCATTTACGCAGCAGGGGTCAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407877 29 + 636262 GACCACCTCATTTACGCAGCAGGGGTCAG s simRat_chr6.simRat.chr6 414420 25 + 647215 GACACCCTCAATTGCACAGCAGGGA---- a s mr.mrrefChr5 260743 46 + 294542 ACGTTTATGAGCAAGCAAGTCGAATTTGCCTAGCTATGCTGTGTCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407909 46 + 636262 ACGTTTATGAGCAAGCAAGTCGAGTTTGCCTAGCTATGCTGTGTCA s simRat_chr6.simRat.chr6 414445 34 + 647215 -----------CAGGCAAGTGGAATTTGCCTAGCT-TGCTGTGTCA a s mr.mrrefChr5 260789 39 + 294542 GACATTCTCTGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGATTTCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407955 39 + 636262 GACATTCTCTGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGATTTCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 414480 32 + 647215 GA-------TGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGACTTCAA a s mr.mrrefChr5 260828 160 + 294542 TGGAGAAGGTGTATTTGATTATGATCACCCTGCACCCCTGGTGTTTCCTCAAGAGCAAAGTAAGAGTGTTCCTGTACCAACAGACAGAACCTGTTGCAACAAATAGATCCTCACGGTTTTTGAGAGGTAAGGAAGCCTGTGGAGAGAGCCAATATACATT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 408001 157 + 636262 TGGAGAAGGTGTATTTGATTACGATCACCTTGCACCCCTGGTGTTTCCTTAAGAGCAGAGTAAGAGTGTTCCTGTACCAACAGACAGAACCTGTTGCACCAAATAGATC---ACGGTTCTTGAGAGGTAAGGAAGCCTGTGGAGAGAGCCAATATACATT s simRat_chr6.simRat.chr6 414512 156 + 647215 TGGAGAAGATGTATTTGATTATGCTCACTCTGCACCCCTCGTGCTTCCTCAAGAGCAAAGTGAGAGTATTCCAGTGCCAACAGA----ACCTGTTGCAACAAATAGAACCTCACTGTTTTTGAGAGGTATGTCAGCCTGTGGAGAGAGCTAATATACATT a s mr.mrrefChr5 260988 606 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 409389 93 + 636262 TATCCAGTCCTGAGCTCTTGACCAGAAATAACAGTTCTGATATAATGGTTACAAAGATGAGAGTTACCAGGATACACCGTGATATTGTGTGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 415981 93 + 647215 TATCCAGTCCTGAGCTCTAGACCATAAATAACAGTTCCCATATAACGATTACAAAGGTGAGAGTCACCTGGATACACCTTGACATTGTGTGTC a s mr.mrrefChr5 262377 188 + 294542 AGATAGATGGTGTCCCAAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACGTGACAATCACCTTCTGGTTTTTCCAGGAGTGTATCCTATTGATGATTGGTCCATGGGTCAGTCCTTAGTCATTTGTGTCAGTTGCTAGTCATTAGGACGTTTAGTAGATGATCAAGGGTTTAACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409482 184 + 636262 AGATAGATAGTGTCCCCAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACGTGACAATCACCTTCTGGTTTTTCCAGGAGTGTATCCTATTGATGATTGCTCTATGGGTCAGTCCTTAGTCATTTGTGTCAGTTGCTC----CTAGGACGTTTAGTAGATGATCTAGAGTTTAACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG s simRat_chr6.simRat.chr6 416075 188 + 647215 AGATAGATGGTGTCCCAAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACATGACAGTCACCTTCCATTTTTTCGAGGAGTGTATCCCATTGATGATTGGTCCATGAGCCAGTCACGAGTCATCAGTGTCAGTTGCTAGTCATTAGGACGTTTTGTAAATGATCAAAGCTTTCACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG a s mr.mrrefChr5 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----AAGAAGCATAGAACTGTGTATTA-CTGTAAGTTTCCCATTCAGAATCTATTGCCCTAAACATATG----------- a s mr.mrrefChr5 264072 12 + 294542 ATTGTGGACAAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411369 12 + 636262 ATTGTGGACAAA a s mr.mrrefChr5 264084 18 + 294542 GCATGCAAGCTCACTTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411392 18 + 636262 GCATGCAAGCTCACTTCT a s mr.mrrefChr5 264102 58 + 294542 AATATGAACTACGTCAGATGAGATGCCACCTTAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411421 58 + 636262 AATATGAACTACGTCAGATGAGATGCCACCTTAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 417728 51 + 647215 -------ACTACATCAGATGAGATGCTACCCCAACATGAGTTTTAGAAAAGGAACCTG a s mr.mrrefChr5 264160 253 + 294542 TTGCACCACACGGCCAAAGTGTAAGCTCACTTCTGATACCCACAGAATTCGAATTACAATAAATGAGATGCCACCTCAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTGGTAGTCTGTTGCACCACACAGCTAAACAAAGTGAAGTCATTCCACACTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGCAATGCACCCAACTATACAAAGCCTAATTGCTAGGCAAGTTACTATAACACAGGATCATAGTGAGGTTCTTCGGAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411487 244 + 636262 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TACAGTTGAAGTCAGCACTGCCTTTTCACTTCAGTCCCTGTGTCTAAATCATGATTCACACCCGGTGTGTAATGTGTGGAAAGAGGTCAGACAATGACTACCATTTTAAGACAACCAACTATGTTGTTTTACATAGCTGTTGCAAGCGGTTAGCTGCACTTTCTAGGCTTCAGGGTCATAGAAAAGAAACAATGGGAATGTGGGCCACCTTACACTTACATTAATACATGCAATAATAGTGAGAGTTGAATACATTGCTGGCCAACTGATGGGTGGGGAAAACGCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411784 279 + 636262 TACAGCTGAAGTCAGCACTGCCTTTTCACTTCAGGCCCTGTGCCTAAATCATGATTCACACCCGGTGTGGAATTTGTGGAAAGAGGTAGGACAATGCCTACCATTTTAAGACAACCAACTATGTTGTTTTACACAGCTGTTGCAAGCGATTAGCTGCACTTTCTAGGCTCCAGGGTCATAGAAAAGAAACA--------GTGGACCTACTTACACTTACATTAATACATGCAACAATAGTGAGAGTTGAATACATTGCTGGACAACTGATGGGTGGGGAAAGCGCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 418077 285 + 647215 TACAGTTCAAGTCAGCAATGCCTTTTTACTTTGGTTCCTATGTCTAAATTATGATTCAAATCCCGTATGTAATGTATGGAAGGAGGTCAGACAATGACTACCATTTTAAGACAACCAGCTATGTTGTTCTGCATAGCTGTTGCAAGCAGTTAGCTGCACTTTCTAGGCTTCAGGGTCATAGAAATGAAATAATGGGAATGTGGGCCACCTTATACTTACATTAA--CATGCAATAATAGTGAGAGTAGAATACATTGTTGGCCACCTCACGGGTGGGGAAAACACCA a s mr.mrrefChr5 264744 58 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 412622 42 + 636262 TTATAGTGAGATGCTGGGCCCTTTATTAGCACCCCTAGAGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 418896 42 + 647215 TTATAGTGAGATGCTGGGCTGTTTATAAGCACCCTTAGAGAG a s mr.mrrefChr5 265339 33 + 294542 CCCGGCAGTAGCTATCAATGAGGCAGTAGCTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412664 33 + 636262 CCCGGCAGTAGCTATCAATGAGGCAGTAGCTAT s simRat_chr6.simRat.chr6 418939 33 + 647215 TTTGGCAGCAGCTGCTAATGGGGCAGCAGCTAT a s mr.mrrefChr5 265372 102 + 294542 CAAGGCCACCCCCATAATGTATCTCCTTGCTCTTTTTTGTTTACATTAAGTATAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGACCATTAGTGTGGAGGATGACCATTGGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412698 102 + 636262 CAAGGCCACCCCCATAATGTATCTCCTTGCTCTTTTTTGTTTACATTAAGTATAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGACCATTAGTGTGGAGGATGACCATTGGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 418972 102 + 647215 CAACACACCCCCAATAATGCGTCTCTTCGAGCTTCTTTGTCTACATTAAGCATAGCTGGCGCCCTTTGAGTCAACCATTGGTGTGGGGGATGACTATAGGTG a s mr.mrrefChr5 265474 94 + 294542 AGGGGATATGTACATGAAGTATTGCAGCTAGTGACAGTGGGGACTGAGTTCTGACAATATTTAGCGGTGTCTCACGCCAAGTGATTAGATATTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412800 94 + 636262 AGGGGATATGTACATGAAGTATTGCAGCTAGTGACAGTGGGGACTGAGTTCTGACAATATTTAGCGGTGTCTCACGCCAAGTGATTAGATATTC s simRat_chr6.simRat.chr6 419075 94 + 647215 GGGGGACGTGTACATGAAGTATTGCAACTGGCACCAGTGGGCACTGGGTCCTGAAAATATTTAGCGGTGCCGCACACCAAATGATTAGATGTTC a s mr.mrrefChr5 265568 18 + 294542 TGGATTGACTATCAGTTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412902 18 + 636262 TGGATTGACTATCAGTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 419169 18 + 647215 TAGATTGACTATGCGTTT a s mr.mrrefChr5 265586 84 + 294542 CTAGGCCACACCCTAGTTTGTTGAACCGCCCTGTTAATTTAACTGGGGGATGAGGTTTATGGAACTATGGGCCTAATTCCCCGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412921 84 + 636262 CTAGGCCACACCCTAGTTTGTTGAACCGCCCTGTTAATTTAACTGGGGGATGAGGTTTATGGAACTATGGGCCTAATTCCCCGA s simRat_chr6.simRat.chr6 419187 84 + 647215 CTAGACCACACCCTAGCTTGTTGAACCCCCCTGTTAATTAAACTGGGGGATAAAGTTTATGGAACTATGGGTCTAATTCCTCAA a s mr.mrrefChr5 265670 22 + 294542 GTTGCTGACACTCATTTGAGGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413005 22 + 636262 GTTGCTGACACTCATTTGAGGC s simRat_chr6.simRat.chr6 419272 22 + 647215 GTTGTTGACATTCTTTTGAGGG a s mr.mrrefChr5 265692 61 + 294542 CCATGATTGGTTGATCTGCCATAAGCATAGGCTAAGATGAATTCCACTGACTGCAGAGGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413027 61 + 636262 CCATGATTGGTTGATCTGCCATAAGCATAGGCTAAGATGAATTCCACTGACTGCAGAGGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 419295 61 + 647215 CCGTGATTGACTGATCTGCCATGAGCACAGGCCAAGATGAATTCCACTCAATGAAGAGATA a s mr.mrrefChr5 265753 12 + 294542 CAATTTAACCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413093 12 + 636262 CAATTTAACCCA s simRat_chr6.simRat.chr6 419356 12 + 647215 CAATTTAACCCA a s mr.mrrefChr5 265765 187 + 294542 TACCTAATATATGTGTGGTGCTTGGGGCTCATAATTAAGGAATGTGACATGCAGACCCCGACATCACTGATTCATTGACCAATAATTCAAGTAAGGTGAAAGTGTGGAGTTAAGATTGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACCTCTTGAAACTAGATAGGGAATACACTCCCACATAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413105 179 + 636262 TACCTAACATGTGTGTGGTGCTTGGGGCTCATGATTAAGGAATGTGACATGCAGACCCCGACATCACTGATTCATTGACCAATAA-----GGAGGGTGGAAATGTGGAGTTAG---TGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACCTCTTGAAACTAGATAGGGAATACACTCCCACATAA s simRat_chr6.simRat.chr6 419370 187 + 647215 TACCTAATATATGTGTGGTGCGCGGGGCTCATAACTTAGGTATATGACATGCAGACCCCAACAGCCCTAATCCATGGACCAATAATTCAAGTAAGGTGAATGTGTGGAGTTAAGATTGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACGTCTTGAGACTATATAGGGAACACACTCCCACATAA a s mr.mrrefChr5 265952 132 + 294542 AGAGATACAGGTGCACTTGATGCTACTCCCCATCTATCACCTCCCTCTTTTTACTTTGCTCAGTGAAGGGCCACATCACACATTGTTAGTCTTACTCAACCTATAGCACAGTCTGTGCTACAATGAGGGCCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413284 132 + 636262 AGAGATCCGGTTGCACCTGAAACTACTCCCCATCTATCACCTCCCGATTTTTACTTTGCTCAGTAAAGGACCACATCACACATTGCTAGTCTTACTCGACCTATAGCACAGCCTATGCCACAATGAGGGCCT s simRat_chr6.simRat.chr6 419614 123 + 647215 AGACAGACAGGGGAACTCAATGCTACTCCC------TCACCTCTTTCTTTTCATTTTGCTCAGTGAAGGGC---ATCACACATTGTTAGGGTTACTCAACCTATAGCACAGTCTGTGCTACAATGAGGACCT a s mr.mrrefChr5 266084 178 + 294542 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---------------------------------------------------AAGTTGCTATAACTCAAGCACATGTGACGAGGTGCGTTGGAAGCCAGGTAGATACATACCAGGGAAGAAGCGACACATCACATAATCGCTACAGTTCAAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGC---TGAGTCAAAGCTGTGATTCACACCAGCTATGTAATACATGCAACAAGAGTGAGAGTTGAATGTTGGTCTGGGGGATG s simRat_chr6.simRat.chr6 420129 253 + 647215 AAATTCCATACTAAGCTGCACACCCAACCGCACAAAGCCTGATTGCTAAGCAAGTTGCTATAACTCAGG-GTGTTTGATGAGGTGCTTTGGAAGCCAGGTAGATACATAACATGGAAGAAATGACACATCACATAAGCATTACAGTCAGAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGCCCCTGAGTCTAAACTGTGCTTCACACCAG-GGTGTAATTAAAGCAACAAGAGTGAGAGTTGAGTTCTTGGATGGCTATTG a s mr.mrrefChr5 266723 6 + 294542 AGCTGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414030 6 + 636262 AGCTGG s simRat_chr6.simRat.chr6 420382 6 + 647215 GGCCGG a s mr.mrrefChr5 266729 116 + 294542 GGCTCTCAGTCTGAGAGTTATCACACTCTTATTTGCGACCTTTCCCATTAGCTGATCCATAAGACTAACATGAAATTCTGCTAAATGATATGGTGTGCCACATGAGATCCCCCTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414049 116 + 636262 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AATCCTGGTGTCCGTATTATTCCACATGTCCTCTACATGCAGTTGGGTGGCTACATATTGAGCTTTGAGTTGAAAATGTTTGCAAGAGAGTGGCTATGACTTATCACAGGGCAATTG a s mr.mrrefChr5 267703 14 + 294542 CATGCTGAGTTTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414996 14 + 636262 CATGCTGAGTTTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 421322 14 + 647215 CATGCTGAGTTTTG a s mr.mrrefChr5 267717 12 + 294542 ATTGAATATGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415011 12 + 636262 GTTGAATATGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 421336 12 + 647215 ATTGAATATGTT a s mr.mrrefChr5 267729 81 + 294542 GAGGGTAGCTATGCATTCTCTTACACATCCAGGGCATTGGGTCAGTATCACAAAATGGTTGTTACTATGGCAGAGGAAGGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415023 81 + 636262 GAGGGTAGCTATGCATTCTCTCACACAGCCAGGGCATTGAGTCAGTACCACAAAGTGGTTGTTACTATGGCAGAGGAAGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 421353 81 + 647215 GAGGGTAGCTATAAATTCTCTTACACATCCAAGTCATTGGGTCAATATCCGAAAATGGTTGTTATTATAGCATAGGAAGGG a s mr.mrrefChr5 267810 71 + 294542 TGGAATCCACAAGAGTAGTTGTATAAATGAGAGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAACGTGGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415109 71 + 636262 TCGAATCCACAGGAGTAGTTGTTTAAATGAGAGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAATGTGGTG s simRat_chr6.simRat.chr6 421434 71 + 647215 TGGAATCCACAAGAGTAGTTGTATAAAAGAGGGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAACATGGTG a s mr.mrrefChr5 267881 19 + 294542 CCTGTAAAAGCTATATGCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415180 19 + 636262 CCTGGAAAAGCTATATGCA s simRat_chr6.simRat.chr6 421507 19 + 647215 CCTGTAAAAGCTATGCGCA a s mr.mrrefChr5 267900 369 + 294542 GATTGAGAAGACCAAGTGTGTACTATCTAGGAGATTGATGTTACCATTATGGTAGTAGCCTAGGGCCACTGAAAGGGGACTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATTGAGCAGCTAGTTATTTGTACTTCTTTGTAGTGGTACAGAACTATTATGTCAGCAGGGCATGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCTTGAACTGGTGTCATTCAGGAGTTCTGTGCAGCAGATCCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAATGAAGTCTTCTGCGGCTGGGACCTACGCATGGGCACTGGCCAAAGAGCATTGAAACTTTTACATGGAGTGTTAGATGCTTTATCAGGCACATTATTTGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415199 369 + 636262 GATTGAGAAGACCAAGTGTGTACTATCTGGGAGATTAATGTTACCATTATGGTAGTAGCCTAGGGCCACCGAAAGGGAACTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATTGTGCAGCTAGTTCTTTGTACTTCTTTGCAGTGGTACAGAATTATTATGTCAGCAGGGTGTGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCTTGAACTGGTTTCATGTAGGAGTTCTGTGCAGCAGACTCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAATGAAGTCTTCTGCGGCTAGGACCTATGCATGGGCATTGGCCAAAGAGCGTTGAAACTTTTACATGGAGCGTTAGATGCTTTATCAGGCACATTGCTTGT s simRat_chr6.simRat.chr6 421527 368 + 647215 GACTGAGAAGACCAAGTGTGTACTGTCTAGGAAATTGATGTTACCATTATGATAGTAGCCTAGGGCCACTGAAAGGGGATTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATAGAGCAGCTAGTTATTTG-ACTTCTTTGTAGTGGTACAGAACTATTATGTCAGCAGGGCATGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCACAAACTGGGGTCATTCAGGAGTTCAGTGCAGTAGATCCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAAGGAAGTCTTCTGCGGCTGGGACCTGCGCATGGGCACTGGCCAGAGATCACTGAAACTTTTACATGGAGTGTTAGATGTGTTATCAGGCATATTATTTGT a s mr.mrrefChr5 268269 382 + 294542 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GATGTCTGGGCAATCAAAAGTGGGTGGATTCCTGCTCAACTACAGTTTTTCATCACGCACTGGGCAGGGTATAAACCAGTTATTTGGGTGCTTGTAGGAGACCCAGAACACAACTTCTGCTTAAAAAAGATCCATACTCCCACCTAAAAAACCTCCATTTGATTTTACCTTGAATTTTGGCAGAGCTTTTGATAGCCACCCGCACTTGTCTGTCATGGCAAATTTTTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAAAGAAAGGCTTGCTGGTCACCGACCCAAGACAGATGTTCAAGGCTGTCATTACACAGTGTACTTTGACCACTGTACACTACAGACAGAAATGCAAACCAGAGAATACCTAATTAATGATGTGACTTAT a s mr.mrrefChr5 268651 268 + 294542 ATCTGGCTGGAGCATGTCTATTCCCCAGTAGCAATAAAGGGCCCTGCTTAAGGCTGCAAGCTTAATCAGCCTCCAAACAAGGGGTTAATTTTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTAGGACCTGTGGTCTCCCTGGCCTTTAATGAATCACAAAGAGCTTCCAACTCCTGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACATCAGTAAACAGACTGTTATGCAGAGTTTCCCTTCCCCAAGTTCATCCCCACCATTAGGCTTACAACTGAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415952 268 + 636262 ATCTGGCTGGAGCACGTCTATTCTCCAGTAGCAATGAAGGGCCCTGCTTAAGGCCGCAAGCTTAATCAGCCCCCAAACAAGGGGTTAATTGTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTAGGACCTGTGGTCTCCCTGGCCTTTAATGAATTGCAAAGAGCTTCCAACCCTCGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACATCAGTAAACAGACTGTTATGCAGAGTTTCCTTTCCCCAAGTTCATCCCCACTGTTAGGCTTACAACTGAAC s simRat_chr6.simRat.chr6 422278 266 + 647215 ATCTGGCTAGAGCATGTCTATTTCCCAGTAGCAATAAATGGCCCTTTTTGAGGCTGCAAGCTTGATCAGACTCCACACATGGGGTTAATTTTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTATAGCCTGTAGTCTCCTTGGCCTTTAAAGATGCACAAAGAGCTGCCAACTCCTGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACACCAG--TACAGACTATTATGCTGAGTTTCCCTACTCCAAGTTCATCCCCACCACTAGGCGTGCGACTGAGT a s mr.mrrefChr5 268919 137 + 294542 TCCCAAGAATACAGAGTGTTTTTAGTCTCTTATTCCAAGTACCATAATTTGCTGAGGGCCTGTACACCTAGTTAGACAAAATTACAGCCAAAACAGTAGTTTTTTTAATCCATTCCCACCCTCCATAGCACAATCAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 416518 137 + 636262 TCCCAAGAACACAGAGTGTTTTTAGTCTCTTATTCCCAGTACCATCGTTTGCTGAGGGCCTGTGAACATAGTTAGACAAAATAACACCCAAAGCAGTAGTTTTTTTAATCCATTCCCACCCTCCATAGCACCATCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 422544 136 + 647215 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---CTAATGTCACTACTTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCCCTGGGTATGAGATCTTTGTTTCACGTAAAATAGTCAGAGCTCCCTAATTTGGTTCCAGAAACAGGCATCCCTATTAACCTAGTAGTTCCTGCTCTGCCACCAGCAGTTTGAGGACCCTCGACTGTTCGTTCTTTTTACACTTGGTGCCATCATTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATTCATCTTTTTCTCTATCAGTTGCACT s simRat_chr6.simRat.chr6 424116 259 + 647215 ACATCAACGCCACTACCTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCTCTGGATATGAGATCTTCGTTTCATATAAAATAGTCAGAACTTCCTAGTTTGGTCACAGACACAGGCATCCCTATGAGCCTAGTAGTGCCTGCTTTTACACCGG------GAGGACCCTTGACTGTTCGTGTTTTCTACAATTGGTGCCATCTTTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATACATCTTTATCTCTATCAATTGCACT a s mr.mrrefChr5 270730 282 + 294542 CCAATACTTGTATAGACCTCTACAGCATTGAGATAATGAGCAGACCATGTATCCTTTCTTGATGCCCATGCTATTGCAGTATTTGCTTGGAACTTTTACAGGGCTAGAATGCACAAAAGTGCCCAAACAATTTATTTATATCCTGAGCCATAACTTAGTTTAGGGAGATCTACAGGATTTCATGTTCACATGTTTCACTAGAGTTCTCATGTTGTGCCCTAACCATTCCTCCCAACTGCATGGATAACTCTACGTTTTAGAAATATCTGGTGTAGGATGGTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418318 273 + 636262 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AGAATTAATATCATACTGGTTACAAGTGGGGTGAGAGGTAGGCACCCTTCTTTGCAGGATGCACACACCCAGCCAACAAAATGTGCGATTTTTTCATTTTGCCTATCTTGGCTGTGCATCATCGTGAAAGGTGATCTTTCAATCGGGTTGTGGATTTAGGCATGTGCTAGGTGTC s simRat_chr6.simRat.chr6 428613 141 + 647215 AGAGCTAATATCATACTGGTTACAAGTGGGATCAGAGATAGGCACCCTTCATTACAGGATGCACACACCCAGCCAGCAAAATGTGC---------------------------------CATTGTGAAAGATGATCTTT-AATTGACTTGTGCATTTAGGCATGTGCCATGTGTC a s mr.mrrefChr5 274892 12 + 294542 TTAGATTAGAGG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422542 12 + 636262 TTAGATTAGAGG s simRat_chr6.simRat.chr6 428782 12 + 647215 TTAGATTAAAGG a s mr.mrrefChr5 274904 114 + 294542 GAGATGTGACTAACACACAAGTCAAATCAGGCTCAAGATTCCAATGAGAGTGGCTTGTATATAAACACAAAGGCAAAACAGAGCACACCTGTCAGTGGGGTACATGTATCAAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422554 114 + 636262 GAGATGTGACTAACACACAAGTCAAATCAGGCTTAAGATTCCAATGAGAGTGGCTTGTATGTAAACACAAAGGCAAAACAGAGCACACCTGTCAGTGGAGTACATGTATCAAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 428798 114 + 647215 GAGATAGGACTAACACACAAGTCAAATCAAGATCAAGCTGCTAATGAGATTGGCCTGTATATAAACACAAAAGCAAAACAGAGCACACCTGTTAGCAGGGTACATGTATCAAGC a s mr.mrrefChr5 275018 89 + 294542 TTAGCTCGGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATGTCTTTACAATTGTCCCACCTAGCAAATTTTTAGGAAACAACTTGTGGCCATAA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422674 89 + 636262 TTAGCTCGGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATGTCTCTACAACTGTTCCACCTAGCAAATTTTTAGGAAACAACTTGTGGCCATAA s simRat_chr6.simRat.chr6 428912 87 + 647215 TTAGCCTCGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATCTCTTTACAATTGTCCCACCTATCAAATTTTTAGAAAACAA--TATGCCCATAA a s mr.mrrefChr5 275107 22 + 294542 TTATTGTAACAGAGTACCGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422765 22 + 636262 CCATTGTAACAGAGTACCGCTT s simRat_chr6.simRat.chr6 428999 21 + 647215 TTGTTGTAACAGAG-ACTGCTT a s mr.mrrefChr5 275129 87 + 294542 ATAGCTAGGAGCTAGCTAGTATTGGGACACTGGGCCATTTATTATTTACTAGGAACAGGTGAGTAGCTGAGCTTTTCTATATTTGTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422787 87 + 636262 ATAACTAGGAGCTAGCTAGTATTGGGACACTGGGCCATTTATTATTTAATAGGAACAGTTGAGTAGCTGAGCTTTTCTATATTTGTT s simRat_chr6.simRat.chr6 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simRat_chr6.simRat.chr6 429259 30 + 647215 CATCAGTACAGATGAACAATAAAATTCTGC a s mr.mrrefChr5 275400 11 + 294542 TTAAGCAAGTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423070 11 + 636262 TTAAGCAAGTC s simRat_chr6.simRat.chr6 429289 11 + 647215 TTAAGCAAGTC a s mr.mrrefChr5 275411 15 + 294542 TCTGTGACTGGTGGA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423082 15 + 636262 TCTGTGACTGGTGGA s simRat_chr6.simRat.chr6 429300 15 + 647215 TCTGTGACTGGTGGA a s mr.mrrefChr5 275426 9 + 294542 TCGCCATTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423097 6 + 636262 ---CCATTA s simRat_chr6.simRat.chr6 429316 9 + 647215 TCGCCGTTA a s mr.mrrefChr5 275435 278 + 294542 TCTATTGACTCATGCCAGTGCAACACACATAGTCCCTGTGATTTGCACTAAGTGAGCTGATTGTACATGAAATCTCTCATAATCTCTCTGGTACCAAAATAACTCCTACTACCAAGTGTGATCTGTGCATACACCAGTACCTTATAGATTCCAACAATTGGGATCACCTACAGAGAGACAAAAAACGTACAGACCTGTTTTGTCCCCTCTTCTATGTCGTAGGTTCATAAAGACTAGACACATGAGGACATAGAAGATGAGTACTGTACATTTCCCAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423104 273 + 636262 TCTATTGACTCATCCCAGTGCAACACACATAGTCCCTGTAATTTGCACTAAGTGAGTTGATTGTACATGAAACCTCTCATAATCTCTCTGGTAACAAAATAATTCCTACTACTAAGTGTGATCTGTGCATACACTAGTACCTTATAGATGCCAACAATTGTGATCACCCATAGAAAGACAAAAGACTTAC----CTGTTATGTCCCCTCTTCTATATCGTGGGTTCATAAAGACTAG-CACATGAGGACATAGAAGATGAGTACTGTACATTTCCCAT s simRat_chr6.simRat.chr6 429325 271 + 647215 TTTATTGACTCATGCCAGTGAAGCACATTTAGTCTCTGTGATTTGCACTAGGTGAGCTAATTGTGCATGAACTCTCTTATAATCACTCTGGTACCAAAATAACTCACACTACCAAGTGTGATCTGTGCATACACCAGTACCTTATAGATTCCAACAATCGGGATCACCTACAGAGAGACAAAAAACGTACAGACCTGTTTTGTCCACTCTTCTAGGTCATAGG-------GGACTAGACGGGTGAAGACATAGAAGATGAGTATTGTACATTTCCCAT a s mr.mrrefChr5 275713 118 + 294542 ACATACCCAGCGAAGGAAGTCTGGTATAGGATTACAATTCCATTCATCCACCACGGGCCATCAGTCAACTCAACTCATCTGGTCTCAAATTAAACATAACTTCGCACCCTCTAAGTAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423382 118 + 636262 ACATACCCAGCGAAGGAAGTCTGGTATAGGATTACAATCCCATTCATCCACCATGGGCCATCAGTCAACTCAACTGATCTGGTCTCAAATTAAACATAACTTGGCAGCCTCTAAGTAT s simRat_chr6.simRat.chr6 429596 111 + 647215 ACAAACTCAGTGAAGGAAGTTTGGTATAGGATTACAAGTCCGTTCATCCACCACAGGCCA-------ACTCAAATCAACTGATCTCAAATTAAATATATCTTCGCACCCTCTAAGTAT a s mr.mrrefChr5 275831 9 + 294542 CCTTTGTAC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423500 9 + 636262 CCTTTGTAC s simRat_chr6.simRat.chr6 429762 9 + 647215 CCTTCTTAC a s mr.mrrefChr5 275840 149 + 294542 CAACCATTTGAAAGCTATAAAGCATGAACATTGCCAAAACTTTAAGAGAGACCTTAGACTTAGGATGAGAGGCATCTGAACTGTGCTGTGACTCCACTTGGGGCTGTTTAAGCATTACAATCAAGGATGGTAGATGGTGAAGTAAGGAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423509 149 + 636262 CAACCATTTGAAAGCTATAAAGCATGAACATTGCCAAAACTTTAAGAGAGACCTTAGACTTAGGATGAGAGGCATCTGAACTGTGCTGTGACTCCACTTGGGGCTGTTTAAGCATTACAATCAAGGATGGTAGATGGTGAAGTAAGGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 429779 12 + 647215 CTACCATCTGAG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- a s mr.mrrefChr5 275989 17 + 294542 GATGTTATTAATCTAAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423668 17 + 636262 GATGTTATTAATCTAAG a s mr.mrrefChr5 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AAATCAAAGCCAGTCATGTGCTACAGTAATATTGTCTAATCTTACTCCTTGTCTGCCAGACCACTCCTCTAACATCCTGATAGGTTTAACTTCCTTCCGAGACAGCATATTGTGGTGTATTCCCCTTTAGGAACAATGTATGGCTGAACCTACAAGCTCTGCAAGTGTTAATGCTGCAAGTTGATTGATCATCTTACACCATGAGTGAAATGTGG a s mr.mrrefChr5 276308 13 + 294542 CTTTTTTTAGTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423989 13 + 636262 CTTTTTTTAGTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 430076 13 + 647215 CTTTTTTTAGTCC a s mr.mrrefChr5 276321 126 + 294542 CATGCTGAAAACCCTCACTATAAAGTCTTTACTAGACACAGTACATATATAAGATGAACCACATAAACAAAGCACCAACTAATGGACGGTCTCGTATCATGGCCTGCATGCCATCCCCAAAAATAG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424003 120 + 636262 CATGCTGAAAACCATCACTATAAAGTTTTTACTAGACACAGTACATATATAAGATGAACAACATAAACAAAGCACCAACTAA-----GGTCTCGCATCATGACCTGCATAC-ATTCCCAAAAATAG s simRat_chr6.simRat.chr6 430089 126 + 647215 CATACTGACAACCCTCACTATAAAGTCTTTAATAGACACAGTAAATATACAAGCTGGACCACATAAACAAAGGACCGAGTACTGGACGGTCTGGTGTCATGGCCTGCATGCCATCCCCACAAATAG a s mr.mrrefChr5 276447 336 + 294542 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TGATGTTGGCTATTGCTTTTTGGCGTCTTCTCTGCCCTCTTCTTATTCTTGTTCCACACTCAAGTTAAACAAGTGTAGTGTGTCAACCAATTCTTTCACAGGTGTTGTCAACATCCAACAGTAAGTCCATGGAACACTGAGCAAAAAAGCAGTCCAACAG-----------ATAATACTACATTTTTTAACAAAGTCGGGTCCTATGCCTTTGAACATCTATGGCTTTGAACATTGAACTGGCCAGAGCCCTGGCATCTGTGATAGCCTTTGCCACACAAAATAATCCAAGTTTGGGGTACATGGCAGTGGGATCCTTATCTGTGACACTCTAATC a s mr.mrrefChr5 276783 189 + 294542 AGTGACCCCTTTGGACCTGGGATGAAGGGTGTCGTGTCCTTCTAAAGGTGCTTGCAATCAGATGACAGCATGTGAAGTGGGCACATGAGCCAGGCAGGGTCCTCCTACAGGTGCCTGTAATCACTTGAGAGCGCATAAGTGGGGCCGGCTCAGAGCCACGCACTAACCATGTGCACATGGCCACATTTG s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424448 189 + 636262 AGTGACCCCTTTGGACCTGGGATGAAGGGTGTCGTGTCCTTCTAAAGGTGCTTGCAATCAGATGACAGCATGTGAAGTGGGCACATGAGCCAGGCAGGGTCCTCCTACAGGTGCCTGTAATCACTTGAGAGCGCATAAGTGGGGCCGGCTCAGAGCCACGCACTAACCATGTGCACATGGCCACATTTG s simRat_chr6.simRat.chr6 430542 189 + 647215 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simRat_chr6.simRat.chr6 430989 91 + 647215 AGGTCCCTGTCGAAACTCAGTGTCTCAGTGGCTTGA-GGCTGATGAATAGGTGCAGATAAATCAGATGCATGGAGAGTGGAGCCCTATGTCA a s mr.mrrefChr5 277266 23 + 294542 CAATCCAGCCCTCCATTATGTCT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424941 22 + 636262 -AATCCAGCCCTCCATTATGTCT s simRat_chr6.simRat.chr6 431084 23 + 647215 CAACCCAGCCCTCCATTATTTCT a s mr.mrrefChr5 277289 452 + 294542 CTTGCCAGTTATATAAGTCATCTTTGTTAGTGCTTATGGGTGCCTTCTGTCTTTTGGGCTGACAGTCAAAGCAAGAACCAGGCTAAGTAGTAGGCAGGGAGAGTAGGTGAGTGGAATCTTAACTATGTCTAATCCCTGATAGCCAACAACAGGCTAGTTTAATCAGCAACATATTTTTATTGCTGGGTCCCCTTGGATCTACTACTTAGAGTGGCTCTTGTATCTTAATCTGTAAGTAAACATCTGGCTGCAGACATTCAAGGCATGTTATCAAATCCATGCCATATAATGAACATATCCGATATCTCATGGCCATGTGACAGGTACAGTGTACGACACAGCATTCCCCATGAGGCAAGTTCCCTTCAGTGGTCTTACTAATTCCAGCTATACATGCCCTTTACTGTGACCTTATGCCCCTACTTACCAGCAGTATTGTCAATCCTAGAACT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424963 414 + 636262 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333 + 294542 TGATTGCCCAAGTGTCACTCTTATAGTTCTGACTTTTATATTATCCAGAGGACATGCATGTCAGGAGACATGACATACTCAAAATGGAGTGGCATGTGCTGTTTGACTAGTCTGTCTTTCCTGGCCCATGTAGATTATGGGAGGGAGCATCTAGCAGAAGGGTTTTCAGCCACAAATTAGTTGCTTGCCAGAAACTTGTAGCAGGTGTAGGGAGCGTCCCTGTAATTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTCACCATCTCAAATGTAGGGCTGGTGATGTATTCCAGGATTCTGCAAGATAAGATTGAAAGTGGCTAGTCATAGCTGTTGAGT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425574 327 + 636262 TGATCACCCAAGTCTCACTCTTATAGTACTGACTTCTATATTATCCAGTGGACATGCATGTCAGGAGACATGACATACTCAAAATGGAGTGACATCTGCTGTT------GTCTGTCTTTCCTGGCCCATGTAGATTATGGGAGGGAGCATCTAGCAGAAAGGTTTTCAGTCACAAATTAGTTGCTTACCAGAAACTTGTAGCAGGTGCAGGGAGCGTCCCTGTAATTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTCACCATCTCAGATGTAGGGCTGGTGATGTATTCCAGGATTCTGCAAGATAAGATTGAAAGTGGCTAGTCATACCTGTTGAGT s simRat_chr6.simRat.chr6 431631 324 + 647215 --ATTGCCCAAGTGTCACGCCTATAGTTCTGTCTTTTATATTATCCAGAGAACATGCATTTCAGGAGACATGACATGCCCAAAATGGAGTGGCATGT-CTATTTGACTAGTCTGTCT------ACCCATGTAGATTATGGAAGGGAGCATCTAGAAGAAGGGTTTTTGGCCACAAATTAGTTGCTTGTCAAAAACTTGTAAAAGGTGTAGAGAGCATCCCTGTAACTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTTACCATCTCAAATGTAGGGCTGATGGTGTATTCTAGGATTCTGCAAGATGAGATTGAAAGTGGCTAGCCAGAGCTGTTGAGC a s mr.mrrefChr5 278210 69 + 294542 AGCCGCTGTACTTTCCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCCCTATTTTACTATATCTGTGTAGTAGTTGAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425905 69 + 636262 AGATGCTGAACTTTTCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCCCTATTTTACTATATATGTGTAGTAGTTGAT s simRat_chr6.simRat.chr6 431955 69 + 647215 AGCCGCTGTTCTTTCCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCGCTATTTTACTGTATCTGTGTAGTAGTTGAT a s mr.mrrefChr5 278279 15 + 294542 CCTGTTAGCCAGCCA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425999 15 + 636262 CCTGTTAGCCAGCCG s simRat_chr6.simRat.chr6 432024 15 + 647215 TCTGTTAGCCAGCCA a s mr.mrrefChr5 278294 120 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 432711 88 + 647215 CCCCAGAATTCAACTATTCAGCCTATTTCCGAAAAACCACCAAATAGAACCAACAGCTTGTATTAATAAGCCAATAAACTGACTCAGG a s mr.mrrefChr5 279055 203 + 294542 TCCTGCAACTCTTCATGGTACTCAAAAATAGCTGCCCATTTGCAAGCTTGGATTACCTGACTTGTCTCAGCTTAAATTGCAAAGAAGATTTTGTATGTAGGGTAGATGCTTTCCAAAAGATGGTTTAAGTCGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGACAACACTCATAAGATTCACATCCGCCAATGTTTTATAAGGTTC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426737 203 + 636262 TCCTGCAACTCTTCATGGTACTCAAAAATAGCTGTCCATATGCAAGCTTGGATTAACTGACTTGTCTCAGCTTAAATTGCTAAGAAGATTTTGTACATAGGGTAGATGCTTTCCAAAAGATGGTTTAAGTCGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGACAACACTCATAAGATTCACATCCGCCAATGTTTTATATGGTTT s simRat_chr6.simRat.chr6 432799 198 + 647215 TCCTGCAACTCT-----GTACTCAAAAATAGCTGCCCATTTGCAAGCTTGGATAACCTGACTTATCTGAGCTTGAATTGCAAAGAAGATCTTGTATGCAGGGTACATGCTTTCCAATCGATGGTTTAAATTGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGAAAACACTCATGGGATTCATATCCGCCAATGATTTATAAGGTTC a s mr.mrrefChr5 279258 28 + 294542 AGTAGCCTGGTTGCCTTTTTTCATGCTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426941 28 + 636262 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 427440 20 + 636262 AGGTGTTTCATAAATTGATG s simRat_chr6.simRat.chr6 433502 20 + 647215 AGGTGTAGCATAAATTGATG a s mr.mrrefChr5 279775 603 + 294542 CAGTAGACTATGGGATTAGTATGCTATCTTCTACACCTATAGCAGTCCATTCACATCATCCTGAGGTAAGAATACGACTGGAGCGTATTGCAATTTTCACTGGCCATACTAAGTCTATTAGAGTTGTTTAAGTAGTCATGTTTGCTACCATTTGGATAACTTATTATTAATGTTGTTTAACTGGACTTGGACGCATCCTCTCAATGAGAGAGGTACCCTGTTCCCAATTTGAATGAGTGTTTTGGCACTCACATATAGTGCATCTGATCATAATATAAGCCCCATGATGAGCATTTGCAGGGCAAGATCTGTAAAAGAATGATTCTTCTGACGGAAAATATAGGTTGGGCTAGCTGGTAATGAAAAATCTCATGTCAGTGGATGTGAAGGTATAATAGACTTCATTGTATTATCAACTTTGTTTAGGCTTGGAACTTGGGCAACATACTATACTGTATTTGCTTGCATAAGATTGTTGGTTAACATGGCATTAGTATGACCTTGCTGGCCATGTTTCCAGATATGTATCCTGTTTTCTATTAAGTCTGATCTTCCAATAATAGTGAACCTGACCCAACTGTTCCAGTGATCTGCTGGGCATTT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427460 524 + 636262 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CAGTAGATCATGG-ATTAGTATGCCATCTTCTACACCTATAGCAGTCCATTCACATCATCCTGATGCTAGACTACAACTGGAGCCTGTTTCAGTATTCACTGGCCGTACTAAGTCTATTAGAGTTGTTTATGTAGTGATGTTTGCTACCATTTAGATAACTTATTGTTAAAGTTATCTAATTAGACTTAGACGCATCCTCTCAATGAGAGAGGTACCCTATTTCCAATTTGAATGAGTGTTTTGGCACTCACATATAGTGCATCTGATCATAATATAAGCCCCATGATGAGCATTTGCAGGGCAAGATCTGTAAAAGAAC-ATTCTTTTGACGGAGGATATAGGTTTGGCTGGCTGGTAATGAAAAATCTCATGTCAGTGGAGGTGAGGGTATAACAGACTACATTGTATCATCAGCTTTGTACAGG-TTGGACCTTGGGCAGCACTATATCCTCCATTTGCTTGCATAAGGTTGTTGGTTAACATGGCATGAGTATGACCT------CAATGTTTCGAAATATGTATCCTGTTTTCGATTAAGT------TTCCAACAATAGTGGACCTGACCCAACTGTTCCAGTGATCTGCTGGGCATTT a s mr.mrrefChr5 280378 10 + 294542 TGCTATTCAA s simRat_chr6.simRat.chr6 434118 10 + 647215 TGCTATTCAA a s mr.mrrefChr5 280388 30 + 294542 TTGCTTTATTCACTACATACTTGGCTGGCC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427984 18 + 636262 ------------CTACATACTTGGCTGGCC s simRat_chr6.simRat.chr6 434154 30 + 647215 TTGCTTTATTCACTATATACCTGGCTGTAC a s mr.mrrefChr5 280418 161 + 294542 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simMouse_chr6.simMouse.chr6 179196 218 - 636262 TGCACAATGGAACATCTGGCCCCTGTCACGCATGCAGCAGCTGAACTTCACCATGTGCACCAAGGAGGCAAATTAGTGTCTACAACTTCTGTAGACTGCTTGTTGAACCTCTCTGACAAGATTCTTTGGAGGGGTTGTGTTTTCACCAGTTGTGATAGCTTCAAAAGGCCAAGCAGGCAAAGTTCCTGATCATTAGGTTCCTACCACACTCAGTAGAG s simRat_chr6.simRat.chr6 438280 188 + 647215 TGAATAATGGAACATCTGGCCTCTGTGACAAATGCAGCAGCCGAAATTCACTGCATGCACCGAGGAGGCAAACTATTGCTGAAAATTTCTGTAGACTTCTTGTCTAACCTCTCTGACATGATTCTCAGGAGGGGTTGTGTACTCACCAGTCACAATAGCTTCAAAAGGACAAGCTGGCA-----------AGGTTGTCA------------------- a s mr.mrrefChr5 284770 53 + 294542 TGAATGCACTAGTTCGTTGTGTCTGGTTTGGAAATGATCTGGGGTCTTGACTA s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179418 53 - 636262 TGAATGCACTAGTTCGTTGTGTCTGGTTTGGAAATGATCTGGGGTCTTCACTA s simRat_chr6.simRat.chr6 438468 50 + 647215 ---ACATACTAATTCATTGTTTCTGGTTTAGAAATGACCTGGGGTCTTGACTA a s mr.mrrefChr5 284823 216 + 294542 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simRat_chr6.simRat.chr6 441488 82 + 647215 CAACAAATCAAACCTGGCGTAAATGAAATAAATAGTACCTAGAATCTTTTTCTGGGTACAGAGGAAGCAAGATGCTCCACAT a s mr.mrrefChr5 287645 387 + 294542 TCAGCTTTTCTTTTGAGGTCATCTTTATCAGCAAGCAAAATTACATGATACTGCTACAATGACTGTTTTTACTTTCAACATGGTTTATGGAAGTATATTCTTGTGCCTTAGACAAACCGATAAATTCCAAGAGTGACCAGCACACAGGAGTAGCCACCTTGCACATTTTTCCATATAGTGTTGTGTCACAGATATTCAGTTACTGTATAGTTGCTGTAAGAAATCAAAAAGTTAGGTATCAAAAATTGGCATAGGTCCAAACAGGAATAACTGCCAGGGAGATAGATACATCCTTACTGGATAAACCATAATTCTCAGTATTATGTCTTGATCTCTAGAGTTATCCAGCAGCGGTACATAACCCATGACTTCTACTATCTTAGACAT s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433110 284 + 636262 ----------------------------------------------------------------------------------ATTCCTGGA--TATATTCTTGTGCCTTATACAAACAGATTAATTCCAAGAGTGACCAGCACACGGGAGCAGCCACCTTTCACATTTTTCCATATGGTGTTGTGCCCCAGATATTCAGTTACTGTATAGTTGCTGTAAGAAATTAAAAAGTTAGGTATTAAAAATGGGCATAGGTCCAAACAGGAATAACTGCCAGGGAGATAGATACA-------------------AATTCTCAGTATTATGTCTTGGTCTCTAGAGTTATCCAGCAGTGGTACATAACCCATGACTTGTACTGGCTAAGACAT s simRat_chr6.simRat.chr6 441663 387 + 647215 TCAGCTTTTCTTTTGAGGTCATCTTTATCAGCAAGCAAAATTACATGATACTGCTACAATGACTGTTTTTACTTTCAACATGGTTTATGGAAGTATAATCTTGTGCCTTAGACAAACCGATAAACTCCAAGAGTGACCAGCACACAGGAGTGGCCACCTTGTACATTCTTCCATACAGTGTTGTGTTACAGATATTCAGTTACTGTGTAGTTGCTGTAATAAATCAAAAAGTTGGGTAACAAAAATTGGCACAGGTCTAAACAGAAATAACATACAAGGAGATAGAGACATCCTTACTGGATAAACCATAAATCTGAGTATTATGACTAGATCTTGAAGCTTATCCAGTGGCAGCACATAACCCATGACTACTACCATCTTAGACAT a s mr.mrrefChr5 288032 78 + 294542 TTTTATTAGCTGACATGCTGAAGGTTGTCTTGTCCAATGCTCTTCATAACAATTTCAGCTCCGTATTCAACCAATAGC s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433395 78 + 636262 TTTTATTAGCTGACATGCTGAAGGTTGTCTTGTCCAATGCTCTTCATAACAATTTAAGCTCCGTATCCAACCAATAGC s simRat_chr6.simRat.chr6 442050 72 + 647215 TTCTATTAGCCGACATGCTGAAGGTTGTCTTGTCCAATGCTCTT------GTTTTCAGCTCCGTAGTCAACTTACAGC a s mr.mrrefChr5 288110 262 + 294542 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