Mercurial > repos > galaxy-australia > cactus_export
diff test-data/hal2maf.maf @ 0:c18157c68134 draft
"planemo upload for repository https://github.com/usegalaxy-au/tools-au commit 8f8363625623f2ff3f04d12d227673ac134eba24"
| author | galaxy-australia |
|---|---|
| date | Mon, 04 Apr 2022 06:26:16 +0000 |
| parents | |
| children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/hal2maf.maf Mon Apr 04 06:26:16 2022 +0000 @@ -0,0 +1,30423 @@ +##maf version=1 scoring=N/A +# hal (simMouse_chr6:0.084509,simRat_chr6:0.091589)mr; + +a +s mr.mrrefChr0 0 143 + 130230 TTTTCTCAGTTGCAATACCCAACCTGGAGACACTTTCAGTGAGCACACCTCAGGTTCCTATATCAAGCAGACAGTCTTGCATAGCAAATGGTCTCTGATAGACGGTGCACTCAATCTATGTGAGGGATAGAAAACAAAGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 0 142 + 636262 TTTT-TCAGTTGCAATACCCAACCGGGAGAAACTTTCAGTGAGCACACCTCAGGTTCCTATATCAAGCAGGCAGTCTTGCATAGCAAATGGTCTCTGGTAGACGGTGCACTCAATCTATGTGAGGTATAGAAAATAAAGGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 0 141 + 647215 TTTTC--GGCTGCAATACCCAACCTGAAGACATTTTCAGTGGGCCCACCTCAGGTTCTTATATCAAGCAGACAGTCTTGCGCAACAGATGGTCTCTGATAGACAGTGCACTCAATCTATGTGAAGGATAGAAAACAAAGGACT + +a +s mr.mrrefChr0 143 277 + 130230 ACACATCTCATCAAGTATCCTGTCGTATTTGTGCTTTAGACTCAGCAAAACACGCGTACAAATGCACACCTGATGGTACTTGCCTGGAATATGACTCTAGGTTGATCCCTGGCACACAGGCAGGTCAATTCCCGAATGATGGTCTGCTTGTCCAGTTCTAGATAATCATTACATTGGTGAACTCACTAAAACACAGTTAAAATTACAAATCCTTTTTAACCAAGCCTAAAGTACAGAAAGTGAATGTTACCCTTGTGATATGAACCAGTATATAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144 259 + 636262 ACACATCTCATCAAGTATCCCGTCATATTTGTG-----------GCAAAACACACGTACAAATGCACACTTGATGGTACTTGCCTGGAATATGACTCTAGGTTGATCCCTGGCACACAGGCACATTAATTCCCGAATGATGGTCTGCCTGTCCAGTTCTAGATAAT-GTTACATTGGTGAACT---TAAAACACAG---AAATGACACATCCTTTTTAACCAAGCCTAAAGTACAGAAAGTGAATGTCACCCTTGTTATATAAACCAGTATATAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 141 275 + 647215 ACTCATCTCATCAAGTATCCTGTCGTATTTGTGCTTTAGACTCAGCAAAACAAGTGTGCAAGTGCACACCTGATTGTACTTGTCTGGAATATGACTCTAGGTTGAGCCCTGGCACACACTCAGGTCAACTCC--AATGATGGTCTGCTTGTCCAATTCTAGATAAACATTACATTGGTGAACTCACTAAAACACAGTTAAAATTACTAATCCTTTTTAGCACAGCCTAAAGTACAGAGAGTGAATGTTACCCTTTTGATATGCATCAGTATATAGGG + +a +s mr.mrrefChr0 420 89 + 130230 AGCCACTGCCCTCTTAGCATTTATTTGCTGTAAGGTAACTGATGAGCTAAAGTCGTCTAGAATGTATAAGTAAAAGTCTGTAAGCATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404 89 + 636262 AGCCACTGCTCTCTTAGCATTTATTTGCTGTAAAGGAACTGATGAGCTAAAGTCGTCCAGAATGTATAAGCAGAAATTTGTAACCAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 416 88 + 647215 AGCCACTGGCCTCTTAGCATTCATTTGCTGTAAGGTAA-TGATGCGCTAAAGTCATCTAGAATGTATAGGTAAAAGTCTGTAAGCATTG + +a +s mr.mrrefChr0 509 89 + 130230 TAAAGGCAGCAGCTTTGGTTATGACGCACAATTCAAGACCACCTGCTGGATCCAGCTACATTTAGCAATATTACTGATCTGTTGCACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494 89 + 636262 TAAAGGCAGCAGCTTTGGTTATAACGCACAATTCAAGACCACCTGCTGGATCCAGCTACATTTAGCAATATTACTGATCTGTTGCACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 504 46 + 647215 TAAAGGCACCGGCTTTGGTTATGATGCACAATTCAAGACCATCTGC------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 598 192 + 130230 ATCCATCAGGGTGATAGAAATGCAACACACATAACTTGTTGTCCAAGAGGTTAATTAGTGTGACCGGATCTACATCCACCTATCAGTGGTCCTCTCTATTCAAGGCTCAAAAACTAGTAGAGTAATAGGGTCTCCAATAAACTATAAGGGCGATAGGGAACTCTAGCTTTTACTTAGCACAACAGCCTACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585 192 + 636262 ATCCATCAGGGTGATAGAAATGCAACACACATAACTTGTTGTCCAAGAGGTTAATTATTGTAAGCGCATCTACATCCATCTATCAGTGGTCCTCTCTATTCAAGGCTCAAAAACTCGTAGACTATTAGGGTCTCCAATAAACTATAAGGGCGATAGGGAACTCTAGCTTTTACTTAGCACAACAGTCTATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 550 146 + 647215 ------------------------------------------CCA----GTTAATTAGTGTGACTGGATCCACATCCACCTATCAGTGGTCCTCTCTATTCAAAGCTCAAAAACTAGTAGAGTAATAGGGGATCCAATAAACTTTAAGGGCGATAGGGAACTCTAGTTTTTACTTAGCAAAACAGCCTACAG + +a +s mr.mrrefChr0 790 120 + 130230 CCTGCATCTGGTCACCAGTCACCTTTCTTCTAGCAACAAGGTACAGAGTAGGGCTGTGTGGTGGTGAGTGATGTGTACCTTGGCATGAACCCACTGTAGGTAGCAATACTCCAATTGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 777 120 + 636262 CCTACAACTGGTCACCAGTCACTTTTCTTCTAGCAACAAGGTACAGAGGAGGGCTGTGTGGTGGTGAGTGATGTACACCTTGGCATGAACCCACTGTAGGTAGCAATACTCCAACTGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 703 120 + 647215 CCTGGATCTGGTCATCTGTCACCTTTCTTCCAGCAACAAGATACAGAGTAGAGCTGTGGGGTGGTTAGTCATGCGTACCTTAGCATGAGCCCACTGTAGGTAGCAATCCTCCAATTGAAG + +a +s mr.mrrefChr0 910 506 + 130230 GTTAACCCAAGGAGAAATGCAAATGGGAGTCCGTGCTATTGCAAAATTGTTATATATTCAATTTACTGGCCTTAACTGCATTCCCCGCAGTATTACATACCAATAACCCACATGGTCTCTAAAGACTCTGTTTCGCTTTGGATATTGACTCTAATCTATGTGGCGAAGCACACCCTTAAACTAATCTTCACCTTTCAAGTAATCTTGTGTCTCTATTTGCACAGAGTATGATTATTGTGGGATTGACAGGAGCACTTGTTGGTAATTACAATCagattggattccatattgctcattcagttatcaggatgcaatatgactcaagtagtcccaggttttaagccatcaGAGCTCACTGATGGGGGTTTGCTGGTAACCTATATAGATCCAGGGAAGAGGCCACCCGCAACATGTGCGCCTTGTCTACCTTATGTAAGATTAAAGTTGTCAAGATGGAATCTTGCAGAGAATCGGATACTTTGTATAGTTATCTCATTCTCTCCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 898 505 + 636262 ATTAGCCCGAGGAGAAATGCAAGTGCGAGTCCGTGCTATTGCAAAATTGGTATATATTCAATTTACTGGCCTTAGCTGCATTCCCCACAGTATTACATACCAATAACCCACATGGTCTCTAAAGACTCTGTTTCGCTTTGGATGTTGACTCTCATCTATG-GGCCAAACACACCTTTAAACTAATCTTCACCTTTCAAGTGATCTTGTGTCTCTATTTGCACAGAGTAAGATTATTGTGCGATTGATAGGAGCACTTGTTGGTAATTACTATCagactggattccatattgctcactcagttatcaggatgcaatatgactcaagtagtcccaggttttaaaccatcagAGCTCACTGATAGGGGTTTGCTGGGAACCTATATTGATCCAGGGAAGAGGCCACCTGCAACATGTGCGCCTTGTCTACTACATGTAGGATTGAAGTTGTCAAGATCGAATCTTGCAGAGAATCGGATACTTTGTATAGTTATCTCATTCTCTCCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 823 504 + 647215 GTTAACCCAAGGAGAAATGCAAATGGGAGTCCATGCTATTGT-ATATTGTTATATATTCAATTTGCTGGCCTTAACTGTATCCCCTGCAGTGTTACATACCAACAACCCACATGGTCTCTAAAGACTTTGTTTTGTTTTGGATATTGGCTTTACCCTATGTGGTGAAGCAAACCCTTAAACTGATGTTCACCTTTCAAATAGTCTGGTGTCTCCATTTATACAGAGTATGGTTATTGTGGGATTGTCAGGAGCACTTGTTGGTAATTGCAACCAGATCGGATTCCATATTGCTCATTCAATGATCAGGATGCAATATGACACAAGTAGTCCCAGGTTTTAAGCCATTAGAGCTCACTGATGGAGGTTTGCTGGTAACCTA-ATAGACCCTAGGAAGAAGCCACCCACAACATGTGCACCTTGTCTACCTTATGAAAGATTAAAGTTGTCAAGATGCAATCTTGCAGATAATTAGATACTTTGTACAGTTATCTCATTCTCTCCTCC + +a +s mr.mrrefChr0 1416 131 + 130230 AACACTACCTCTCAAATAGCACCTTCTGAATGCCAACTAGTACTCATATTTTGCTTTTTCAGGTCTACAATTACATGTCTTAGGTGCTCCCATATAGGGACTGCTCCACCATGAAAGAGACTAAACACCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1420 131 + 636262 ACCACTACCTCTCAAATAGCACCTTCTGAATGCCAACTAGTACTCTTATTTTGCTTTTTCAGATCTACAATTAGATGTGTTAGGTGCTCCCATATAGGGACTGCTCCACCATGAAAAAGACTGAACACCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 1327 130 + 647215 AACACTACCTCTCAAATAGCACCTTCTCAAT-CCAACTAGTATTCATATTTTCCTTTTTCCGGTCTACAATTACACCTCTTAGATGCTCCCATATAGGGACTGCTCCCCCATGAAAGAGACCAAAAACCAT + +a +s mr.mrrefChr0 1547 345 + 130230 GTGTATAGCATCCTTTGACTGATGTTGTACAGTATTGTTTAAACATTAGCTGTTCTAGTACACTCCATGGTACCTTGACTACATTCTGAGGGATTCCTTCTGAGATGTTAACACTGTTCCTAATAACTTATAATATAGTTTACTAGATAGTATAGTTTACTAGGTGAGGAGTCATGTTGCTTCCACAGACAAAATTAATTCAACAGGAAGTCTGTAACCCAATACAATGCTGGCAGTGAAGTATAATTAGTGCTGTCAATTAATCATGATTAAATGGCCTCCTTGAAAGGGCTAGATGTTTTGGAGCTGTAGTATACCTCCTAGTTCTTTAATATGTTAGCTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1552 345 + 636262 GTGTATAGCATCCTTTGACTGATGTTCTACAGTATTGTTTAAACATTACCTGTTCTAGTACACTCCATGGTACCTTGACTACATTCTGAGGGATTCCTTCTGTAATGTTAACACTGTTCCTAATGACTTATAATATAGTTTACTAGATAGTATAATTTACTAGGTGAGGAGTCATGTTGCTCCCACAGACAAAATTAATTCAACAGGAAGTCTGTAACCCAATACAATGCTGGCAGTGAAGTATGATTAGTGCTGTCAATTAATCATGATTAAATGGCCTCCTTGAACGGGCTAGACGTTTTGGAGCTGTAGTATACCTTCTAGTTCTTTAATGTTTTAGCTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 1457 342 + 647215 GTGTATAGCATCCTTTGACTGATGTTGTACAGTATTGTTTAAACTTTAGCTGTTCTAGTTCGCTCCATGAAACCTTGACTACATTCTGAGATATTACTTCTGAGCTGTTAACACTGTTCCTAATAGCCTATAATATTGTTTACTAGATA-TATAGTTTACTAGGTTAGGAGTCATGTTGCTTTCACAGACAAACTTAATTCAACAGGAAGTCTGTAACCCAATACTATGAAGGGAGTCAATTATAATTAGTGCTGTCAATTACTCAGGATTAAATTGCCT--TTGAAAGGGCTAGATCTTTTGGAGCTGTAGTCTACCTCCTAGTACTTTAATATGTTAACTTAA + +a +s mr.mrrefChr0 1892 229 + 130230 TTAAACATATGCTATTGTGATTCACACTTTTCTTTGGCCTATCTGCATTATACATTGAGGTTGAGAGTACAATAACACTTCTGTTGTGTGAACTGTACTGATAGTAATATATCACCCTAATGCATGCATGTGATTGAGCACGGTGAAATTGAGAGTCCAGAAAGGGGTAGTTCCTCAGCTCATCATAACTCGATCTGATACACCTTTAATACTGAGTACGGTGAAATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1897 229 + 636262 TTAAACATATGCTATTGTGATTCACACTTTTCTTTGGCCTATCTGCATTATACATTGAGGTTGAGAGTACAATAACACTTCTGTTGTGTGAATTGTACTGATAGTAATATATCACCCTAATGCATGCATGTGATTGAGCACTGTGAAATTGAGAGTCTAGAAAGGGGTAGTTCCTCAGCTCATCATAACTCGATCTGATACACATTTGATACTGAGTACGGTGAAATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 1825 227 + 647215 TTAAACATATGCTACTGTCAGTCACACTTTTCTTTGGGCTAGCTGCATTATATGTTGAGGTTAAGAGTAGAATAAAACTTCTGTTGTGTGAACTGAACTGACAGAAATGTATCACCCCAATGCAAGCTTGTGATTGAGCAAGGTGAGATT-AGACTCCAG-AAGAGGTCATATGGCAGCCCATCATAGCTCAACCGGATACACCCTCAGGAATGATTAGGGTGAAATTG + +a +s mr.mrrefChr0 2121 92 + 130230 ACTCTAGAAAGGGGTAATTCTTCAGCTCATCATCATCCTTTGTGAACCACCTCTTTGGTCCCAACTGAGATGTTCACAATTAGCCTAAAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2128 92 + 636262 ACTCTAGAAATGGGTAATTCTTCAGTGCATCATCATCCTTTGTGAACCACCTATTTGGTCCCAACTGAGATGTTCACAATTAGCATAAAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 2052 88 + 647215 ----TAGAAAGGGGTAACTCTTCAGCTCATCATCATCCTTCATGAACCACGTCTTTGGTCCCAACCGAGATGTTCACAATTTGCCTAAAGGC + +a +s mr.mrrefChr0 2213 299 + 130230 GTATACACTAGCTGGATTATGGATGTGTAATATAAATTGCAGTGCTTCCATAGGACAGAGAACAGAAGTTGGTGACCCTTTTATTTGTTTGTTCTTATCCCCTGAGCTGTAAAGCAAGGAGGTCAGCTTAATTCATGGGACAGGCAGGCCCGTGAAATTTTTCTTGAAAAAGTGCACTTGTCATCAGTTGTGTAGGAGCCACACTATAGGACTGTTAATGAACGAAATGGGGGGTAGAGTCTCACATACACGAGATCAGTGTGATCCTTCTTAGCCCAGCTAATCCTAATGGGGAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2220 290 + 636262 GTACACACTAGCTGGATTATAGATGTATAATATAAATTGCAGTGCTTCCATAGGACAGAG-ACAGAAGTTGGTGACCCTTTTATTTGTTTGTTCTCATCCCCTG--------AGCAAGGAGGTCAGCTTAATTCATGGAACAGGCAGGCCCGTGAAATTTTTCTTGAAAAAGTGCACCGGTCATTAGTTGCATAGGAGCCACACTATAGGACTGTTAATGAACGAAATGGGGGGTAGAGTCTCACATACACGAGATCAGTGTGATCCTTCTTAGCCTAGCTAAACCTAATGGGGAGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 2144 294 + 647215 GGTTACACTGACTGGCTTAAGGATGTGCAATATAAATTGCTGTGCTTCCATAGGACAGAGAACAAAAGTTGGTGACTCTTTTTTTTGTTCATTCTTGTTCCCTGAGCTGTAAAGCAAGGAGGTC-----GATTCATGGGACAGGCAGGCCTGTGAAATTTTTCTTGATAAAGTGCCTTTGTCATCAATTGTGTAGAAGCCACACTAAAAGAGTGTTAATGGACTAAATGGGGGGTAGAGTCTCACATACATAAGATCAGTGTGAACCTTCTTAGCCCAGCTAATCCTAATGGGGAGTTG + +a +s mr.mrrefChr0 2512 95 + 130230 CTATTACAGGTTGCTTGTTGAGTTGCATGCTGGAAACCATAGGTTAAGTGTAACTTGCTTTGGCAATTTGGGAAATACCACCCTTGGTTAAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2512 95 + 636262 CTATTACAGGCTGCTTGTTGAGTTGCATGCTGGAAACCATAGGTTAAGTGTGACTTGCTTTGGCAATTTGAGAAATACCACCCTCGGTTAAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 2438 93 + 647215 CCATTACAGTTTGCTTGTTGAGCTGTGTGCTGGAAACCTTAGGTTAAGTGAAACTTGCTTTAGCTATTTGGGAAATACCACCCTTGGTTAAGT-- + +a +s mr.mrrefChr0 2607 27 + 130230 TTTTGAGGGATGCCAGTTTTGACAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2623 27 + 636262 TTTTGAGGGATGCCAGTTTTGACAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 2531 15 + 647215 ------------CTCATTTTGCAAAGT + +a +s mr.mrrefChr0 2634 40 + 130230 TCAGGTTGATAGAATGACCTTTCTTTATGCATAGTGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2659 38 + 636262 TCAGGTTGATAGAGTGACCTTTCTT--TGCATAGTGGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 2546 40 + 647215 TCAGGTTGATAGAATGACCTTTCTTTATGCATAGTAGACT + +a +s mr.mrrefChr0 2674 22 + 130230 TCCAGACCTTATCAGCCTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2697 22 + 636262 TCCAGACCTTATCAGCCTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 2607 22 + 647215 TCCAGACCTTATCGACCCAAAT + +a +s mr.mrrefChr0 2696 341 + 130230 TGACCCTGCCCCATGTGGCCATGTACACATGGCCAGTGCATGGCTACATTTGCTCCATGTGGCCATGTACACACGGTCAGTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCTACATGATGAAATGTTGGGTGATCTCCCCGCATACATTGTGCATTCCCCTGTCCGATTCAGGCACTGTGAAGCGATGACAGACCCCCGCGTACATTGTCGCCAGGATTAAAAGTTCACCTCATGATTTTACAACTCCATTCCCCTAACTGAGAGGATATTACTTATATAATAATACTTGTGACTGATACAGAGAATCACATCTATCTTGCCTTGTACAGACTAGAAACTTAAATAGGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 2719 340 + 636262 TGACCCTGCCCCATGTGGCCATGTACACATGGCCAGTGCATGGCTACATTTGCTCCATGTGGCCATGTACACACGGTCAGTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCACTTGATGAAATGTCAAATGATCTCCCCGCATACATTCTGCA-TCCCTTGTCCGATTCAGGCACTGTGAAGCGATGACAGACCCCCGCGTACATTGTCGCCAGGATTAAAAGTTCACCTCATGATTTTACAACTCCATTCCCCTAACTGAGAGGATATTACTTATATAATAATACTTGTGACTGATACAGAGAATCACATCTATCTTGCCTTGTACCGACTAGAAACTTAAATAGGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 2703 339 + 647215 TGACCCTGCCCTGCATGGCCATGTACACATGGTCAGTGCTTGGCTATGCCTGCCCTGCGTGGCCATGCACACACAGTCAGTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCTGCATGACAAAATGTTGGGTGATCTCCCCGTGAACATTGTAGATTCCCCTGTCCTTTTCACGCACTGTCAAACAATGACAGTCCCCTGCGTACATTGTTGCCATGATTAAAAGTTCACCTCATGATTGTACAACTCCGTTCCCCTAACTGAGGAGATGCCACTTA-ATAATAATACTGGTGACTGATACAGAGAATTGCAT-TATCTCTCCTTGTACAGATTAGAAACTTAAATAGGACT + +a +s mr.mrrefChr0 3037 23 + 130230 ACAGGATAATTAGTGGATTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3059 23 + 636262 ACAGGATAATTAGTGGATTTCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 3047 23 + 647215 ACAGGATATTTAGCCGATTTCCA + +a +s mr.mrrefChr0 3060 177 + 130230 AACTGGAACTAACCAATGTAATGAAGGTTATCTCCACAATACTAATTATAGCTTTTTAAGACTAAGATCTATTACACCTGTGAGCATGAAATGTGCTTGACCTTGAAGAGATAAAACCCTATTAGCATACAACTAGTGCTGGTGAAGTTAACACATGTGTCAACAAACTATTAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3084 172 + 636262 A-CTGGTACTAATCAATGTAATGAAGGTTATCTCCACAATACGAATTATAGCTTTTCAAGACAAAG---TATTACACCTG-GAGCATGAAATGTGCTTGACCTTGAAGAGATAAAACCCTATTAGCATACAGCTAGTGCTGGTCAGGTCAGCACATGTCTCAACAAACTATTAGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 3070 177 + 647215 CACTGTAACTATCCAATGTGATGAAGGTTATGTCCACGATACTAATTATAGCTTTTTAAGACTAAGATCTATTACACCTGTGAGCAGGCAATGTGCTTGCCCTTGGAGAGATAAAACCCTAATAGGATACAACTAGTACTGTTGAAGTTAACACATGTGACAACACACGATTAGTAG + +a +s mr.mrrefChr0 3237 56 + 130230 AATTATCACTATTAGTGGAAATTATATATTCCTAGGAAGGCTCCTCAATTCCAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3256 55 + 636262 AATTATCACTATCAGTGGAAATTATATA-TCCTAGGGAGGTTCCTCAATTCCAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 3248 56 + 647215 AATTATCACTATTAGTAGAAATTATGTATTCCTGGGAAGGCTCCTCAATTCCAACC + +a +s mr.mrrefChr0 3293 82 + 130230 GGTTGAATCTTTGGCATAAAAGCATTGAGGATCTGTTCTTCATCGTGAGCCCAGTGGTTAGTTGACATATAGATCTAACCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3315 76 + 636262 GGTTGAATCTTTGGCATAAAAGCATTGAGGATCTGTTCTTCATCGTGAGTCCAATGG------GACATATAGATCTAATCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 3304 74 + 647215 --------CTTTGGCATAAAAGCATTGAGGATCTGTTCTTCATGGTGAGCCCAGTGGTTAGTTGACATATAGATCTAACCAG + +a +s mr.mrrefChr0 3375 44 + 130230 ATCTGCAATACCTAGCATGATAAAAGTTAACCATGGAACTTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3391 44 + 636262 ATCTGCAATACCTAGCATGATAAAGGTTGACCATGGAACTTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 3390 44 + 647215 ATCTGCAATACCTAGCATGATAAAAGTCAACCATGGAACTTGGC + +a +s mr.mrrefChr0 3419 47 + 130230 CATAAAAAGAAACCATCCGATCTCCCAAATCCCTGAGATCTGTAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3435 47 + 636262 CATAAAAAGAAACCATCCGATCTCCCAAATCCCTGAGTTCAGTAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 3436 40 + 647215 TATAAGAGGAAATCATCCGATC-------TCCCTGAGATCTGTAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 3466 6 + 130230 AGTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3485 6 + 636262 AGTGGG + +a +s mr.mrrefChr0 3472 149 + 130230 ACAGGCATTATGTCTTCACTAGCAATAGATACAGCAGCTACGATAGTTGTGCTGTCTGCATTGCCCATTTTACATTTGCATCCCTGACCACCAATCCCCTACCAAATCAATGATTGATATATGGTGTCAATGCTGTTCAATACAAAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3492 149 + 636262 ACAGGCATTATGTATTCACTAGCAATAGATACAGCAGCTACGATAGTTGTGCTGTCTGCATTGCCCATTTTACATTTGCATACCTGACCATCAATCCCCTACCAAATCAACGATTGATATATGCTCCCAATGCTGTTCAATACAAAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 3476 144 + 647215 --AGACATTATGTCTTCATTAGCAATAGATACAGCAGCTACTATAGTTGTGCTGTCTGCATTGCCCATTTTACATTTGCCTCCCTGACCACCAATCCCCTACCAAGTCTATGATTGATAA---GTGTGAACACTGTTCGATGCAAAGGT + +a +s mr.mrrefChr0 3621 94 + 130230 ACCCAAAGTACATTCCCTAGAGAATCCAAATAGAAGGTGTGCTGTGTATTTAGGTTTGCTGATGATAAGCATGCTGCCATCACCTCACTCCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3641 90 + 636262 --CCAAAGTACATTCCCTAGAGAATCTAAATAGAAGGTGTGCTGTGTATTTAGGTTTGCT--TGAGAAGCACGCTGCTATCACCTCACTCCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 3621 94 + 647215 ACCCAAAATACATGCTCTAGAGAATCCAAATAGAACGTGTGCTGTGTGGATAGGTTTGCTGATGGTAAGCATGCTGCCATAACCTCATGCCTCT + +a +s mr.mrrefChr0 3715 176 + 130230 GTAAGGTCAATAGACTGAGGTTCATTTCCTCACAAAACATCACAAATCAAGGTCTAGATCCTATTACTGGTGGAACATCTTGTGTGCAAAGCTTGCGGAAACTTGTTTTACTGTTGTTAGAGCCCTCTTCAATTCCACTGCACATGAATATCAAGAGATAGAGAGCATCTCACTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3795 176 + 636262 GTAAGGTCAATAGACTGAGGTTCATTTCCTCACAAAACATTACAAATCAAGGTCTAGATCCTATTACTGGTGGGAGATCTTGTATGCAAAGCTTGCGGAAACTTGTTTTACTGTTGTTAGAGACCTTTTCAATTCCACTGCACATGAATATCAAGAGATAGAGAGCATCTCACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 3715 168 + 647215 ATAAGGTCAATAGACTGAGGATTATTTCCTAACAAAACATCGCAGCTCAAGGTCTCAATTCTATCACTGGTGGAACACCTTGTGTGAAAAGTTTGTGAAAACTAGTTTTTCT--------CGCCCCCTGCAATTCCAGTGCACATGAATATCAAGTGATAGAGAACATCTCACCAG + +a +s mr.mrrefChr0 3891 39 + 130230 CTTTGTGAGGTGAAGAGTCTTGGGTCCTTTGTGTGCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 3971 39 + 636262 CTTTGTGAGGTGAAGAGTCTTGGGTCCTATGTGTGCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 3884 39 + 647215 TTTTGTGGGGTAAAGAGTCTTGGGTCCTTTGTGTGTGTG + +a +s mr.mrrefChr0 3930 182 + 130230 AAGCCTAGTTATCCCACTCAATATGCGGGTGTAATGTTCAATTTTGCTATGTGCTTAGCATATCCTAATCTCAGTATTTTCTAGCTCCTGAATTCATCAGGTCTATTTTTATCAAGGTGTACGCTATCAATCAATACATCTTACAATGCATTCTCTCTAAAGGGTCATTTAGTCACAATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4091 181 + 636262 AAGCCTAGTT-TCCCACTCAATATGTGGGTGTAATGTTCAATTATGCTAGGTGCTTAGCATATCTCAATCTCAGTATTCCCTAGCTCCTGAATTCATCAGGTCTATTTTTATCAAGGTGTACCCTATCAATCAATACATCTTAGAATGCATTCTCACTAGAGGGTTAGTTAGTCACAACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 3923 180 + 647215 AAGGCTAGTTATGCCACTCA--ATGCGGGTGGAATGTTGAATTTTGTTATGTTCTTAGCATATCCTAATATCAGTATTTTCTAATTCTTGAATACATCAGGTCTATTTTTATCAAGGTGTAAGCTATCAATCAATACATTGAACAATGCAATCTCTCTAAAGGGACATTTAGTCACAATTTG + +a +s mr.mrrefChr0 4112 63 + 130230 TACATCCTGCAACATAAAACTTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTATGTAGTGGCATAGTAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4322 60 + 636262 TACATCCTGCAACATAAAACTTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTATGTAGTGGCATA---GCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 4103 63 + 647215 TAAATCTAGCAACATAAAACCTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTTTGTAGTGGCATAGTAGTGG + +a +s mr.mrrefChr0 4175 17 + 130230 CACACCCTATTCTACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4382 17 + 636262 CACACCCTATTCTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 4174 17 + 647215 CACACCCTATTCTACAA + +a +s mr.mrrefChr0 4192 19 + 130230 TACTCTTATCCTCAAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4401 19 + 636262 TACTCTTATCCTCAAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 4191 19 + 647215 TACTCTTTCCCTCCAGGGA + +a +s mr.mrrefChr0 4211 136 + 130230 GTGTTTGGTAGGCTCAGAGGCATAGTTAGCAATAGTTGCTACTGCACTGCAAGGATCCCAAAGGCATGCACCATGATTTGCTCATCCCAATGAATAAGAATCATGAACCCACCCTAACTTTGTGGGCCCAGATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4421 135 + 636262 GTGTTTGGTGGGCTCGGAGGCACAGTTAGCAATAGTTGCTACTCCATTGCAAGGATCCCAAAGGCTTGCACCGTGATTTGCTCATCCCAATGAATAAGAATCATGAACCCACCTT-ACTTTGTAGGCCCAGATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 4210 136 + 647215 GTGTTTGGTAGACCCAGATGCATAGGTAGCAGTAGTTGCTACTGCACTGCGAGGATCCCAAAGGCATGCACCATGATTTGCTCATGCTGATGCCTAAGAAGCACAAACCCACCCTAACTTTGTGGGTCCAAATGCT + +a +s mr.mrrefChr0 4347 14 + 130230 TGACAACGGGAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4564 14 + 636262 TGACAACGGGAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 4346 14 + 647215 TGACAAAGGGAATT + +a +s mr.mrrefChr0 4361 37 + 130230 TTATTAATAGGCTAGGGGTGTTGTTCACAGTACCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4578 37 + 636262 TCATTAATAGGCTAGGGATGTTGTTCACAGTACCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 642057 18 - 647215 TTGCTATTCGTCCAGGGG------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 4398 23 + 130230 CATCGTACACCAAGGTATAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4616 23 + 636262 CATCGTACACCAAGGTATAACCA + +a +s mr.mrrefChr0 4421 255 + 130230 ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATAGTGAAGATTGCAAGACAAAGAATGTGCTGATCTAAATTTTTTGATTAGTGGATGCAGCTGGTTGCACCATCAACACAGACGGCAGCAGCATTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCACTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGTGGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4650 255 + 636262 ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATACTGAAGATTGCAAAACAAAGAATGTACTGATCTAAATTCTTTAATTAGTGGATGTGGCTGGTTGCACCATCAACACAGACAGCAGCATCACTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCGCTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGCAGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 642075 254 - 647215 ACCTTAGCTTGCACCCATGTATATCAAGCCCCCCTGTTAGTCACAGTGAAGATTGCAAGACAAAGAAAGTGCTGATCTAAATTTTTTGATTAGTGGATACAGCTGGTTGCTCCATCAGCACAGATGGCAGCAGCATTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATGCCACTGCAGACCTTATTGCAGCTTATTA-GGAAAGTGCTGTGGACAGTGGCAGCTTCCATGGGGTGATACCCGATGCCAGTGGCAACTG + +a +s mr.mrrefChr0 4676 108 + 130230 CTGTGCTGCAACTCTTGAAAGTATGAGAGATGAGCTACAGAGAGTACACAGTAGCCAGGGAGGTATTTTACCAATGTAGTAGGATCTTGCTAACATGGGATTGCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4905 108 + 636262 CTGTGCTGCAACTCTCGAAAGTATGAGAGATGAGCTACAGACAGTACACAGCAACCAGCGGGGTATTTTACCAGTATAGTAGGATCCTGCTAACATGGGATTGCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 642397 108 - 647215 CTATGGTGCAGCTCTTGAAAGTATAAGAGATGGGCTGCACAGGGTACGCAGTAGCCAGGTAGGTATTTTACCAATGTAGTAGGATCTTCCTAAGATGGGATTGTTAAG + +a +s mr.mrrefChr0 4784 151 + 130230 GATATGCTGTACTGAGAAGGGTGGAGGAACATATAGATTCAACTAGTGATCACAAGAAAAAAGCATTTATGGTGAATTGTTATAGGGCTATATTTGATGACAATATAGTATAAGCTGTTAAAATGGAAAAATGATGAGCAGCATAATATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5013 135 + 636262 GATATGCTGTACTGAGAA-----GAGGAACATATAGATTCAACCAGTGACCACAAAAAAAAAGAATTTATGGTGAATAGCTATAGGGCTATATTTGATGACAATATAGTATAAGCTGTTAAAATGGA-----------CATCATAATATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 642515 151 - 647215 GTTATACTGTACTGAGAAGGGTGGAGGAACATATAGATTCAACTAGGGATCACAAGAAAAAAACATTTATGGTGAATTGTTATAGGGCTATATTTGAGGACAATATAGTATAAGCTGTTGAAATGGAAAAATGATGAGCAGCGTAATATGC + +a +s mr.mrrefChr0 4935 32 + 130230 AGGCTTCTTTAATGTATATAACAACAGAGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5149 32 + 636262 AGGCTTCTTTAATGTATATAACAACAGAGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 642666 32 - 647215 AGGCTTCTTAAATGTATTTAACAACAGAGTAC + +a +s mr.mrrefChr0 4967 209 + 130230 CATGGTTAGACTTAGCACAGAATGGATAATTCAGACAGTATGGATAATTCAGAGAGCTACCTTGAACCTTGAAATATGAGTAGTGGGAAGGAAAGGTTCAAGAAAAGTACCTATTTCATGAATCTGTCTTATGATATGCTATGTTTTGCTTAACATCACCTTGAGGGGTGGGGCCCTGGCAGCTGTTAAAATCTGATAATTCTAGCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5182 209 + 636262 CATGGTTAGACTTGGCACAGAATGGATAATTCAGACAGTATGGATAATTCAGAGAGCTACCTTGAACCTTGAAATATGAGTAGTGGGAAGGAAAGGTTCAAGAAAAGTACCTAGCTCATGAATCTGTCTCATGATATGCTATGTTTTGCTTAACATCACCTTGAGGGGTGGGGCCCTGGCAGCTGTTAAAATCTGATAATTCTAGCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 642698 152 - 647215 CATGGTTAGATTTAGCACGGTATAGATAATTCAGACAGTATTGATAATTCAGAGAACTACCTTGTATCTTGAAATAGGATTAGTAGGAGAGAAAAT----AAAAAAGTACCTATTTCATGGATCTGTCTTGTGGTATGCTATGTTTTGCTTAACAT----------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 5176 100 + 130230 TGAGATGTTGAGACCATTTCTAGTGTAGATTTAACAGGAAATTTCAGTATTTTTTAAGAGTTGAGCAGGACTTCACACCACTGAACACTTATCATGAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5449 100 + 636262 TGAGATGTTGAGACCATTTCTAGTGTAGATTTAACAGGAAATTTCAGTATTTTTTAAGAGTTGAGCAGGACTTCACACCACTGAACACTTATCATGAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 5276 41 + 130230 TCATAAGAGCATGTAGAGTAAAATTCAGCACAGGACTAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5551 41 + 636262 TCATAAGAGCATGTAGAGTAAAATTCAGCACAGGACTAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 5317 204 + 130230 AGGCTATGCCTTTGTCACTAGAAATGCACACCACGTTTCTAATTTGAATCAACGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTATAATAAGTTGCAGCCTATGCTTTTATCACTAGAAACGCACACCACATATCTAATCTGAATCAATATTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGATAGGTCATGTCTCTACACTTAAATGTTCTGGTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5603 204 + 636262 AGGCTATGCCTTTGTCACTAGAAATGCACACCACGTTTCTAATTTGAATCAACGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTATAATAAGTTGCAGCCCATGCTTTTATCACTAGAAACGCACACCACGTATCTAATCTGAATCAATGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTAGATCATGTCTCTACACTTAAATGTTCTGATTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 5192 116 + 647215 ----------------------------------------------------------------------------------------TGAAGGCTACGCTTTTGTCACTAGAAACTCACACCACATATCTAATTTAACTCAACATTACAATAAGTGTTGAAAGTTAGATATGTCATGTCCCTACACTTAAGTGTTCTGGTTTC + +a +s mr.mrrefChr0 5521 169 + 130230 AACTCCAAAGAACCTGGCAACCCTCTACCTTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGCATTATATACTTAATGCATAAACAATTGAAGGGGATGCAAGTGCCACCACTAGAACATGCAAAGGTATAAAGGGAACTCACATAAGAGAGCAGTTGAGTTTATCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5807 169 + 636262 AACTCCAAAGAACCTGGCAACACTCTACCGTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGCACTATATACTTAAGGGATAAACAATTGAAGGGGAAGCAAGTACCACCACTAGAACATGTATAAGTACAACGGGAACTCACATAAAAGAACAGTTGAGTTTATCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 5309 169 + 647215 AACTCAAAAGAAACTGGTGACCCTCTACCTTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGAATTATATACTTAATGCATAAACAATTGAAGGGGCTGCAAGTGCCACCACTAGAACATGCAAAGATATAAAGGGAGCTCACACAAGAGAGCAGTTGAGCTTATCTA + +a +s mr.mrrefChr0 5690 128 + 130230 CTTGCATGTTACTAGAGAGTCCATGAGCTCTTTAGTTAGATGACTTGTGGGTGTCATAAGGTTAATGTGGACAAGTAAGCTAGGGGCTTTCATAAGGTAGGGGCTTTCAAACTGCTGGAAGTTCAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 5976 128 + 636262 CTTGAATGTTATTAGAGAGTCCATGAGCTTTTTAGTTAGATGACTTGTGGGTGCCATAAGATTAATGTAGACAAGTAAGCTAGGGGCTTTCATAAGGTAGGGGCTTTCAAACTGCTGGAAGTTCAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 5479 111 + 647215 CTTGCATGTTACTAGAGAGTCCATAAGCTCTTTAGGTAGATGACTTGTGGGTGTCATAAGGTTAATGTGGACAAGTA----------------GAGGTAGGGGCTTTCACCCTG-TGGAATTTCAGGA + +a +s mr.mrrefChr0 5818 327 + 130230 TGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTCTCATACATTCCAGGCATTGGCATAGACATCCGAACTTCAGACAGCTCTTCAATTAAAATCCTCTCCTCCTAATTGTTGAGAGAGTGATGGCTAAGCAACATGGGCTTCATTTAGTCCAGTCCACTGCTCCCGGCATCCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAGTGCAGGCAGCAATTGCCTTACAATCTTCGAGAGGGTGACGGCTAAGCACCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAATGCAGGCATAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAACACTCACAATCTGATGTACTTATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6110 327 + 636262 TGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTCTCATACATTCCAGGCACTGGCATAGACATCCGAACTTCAGACAGCTCTTCAATTAAAATCCTCTCCTCCCAATTGTTGAGAGAGTGCTGGATAAGCAACATGGGCTTCATTTAGTCCAGTCCACTGCTCCCGGCATCCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAGTGCAGGCAGCAATTGCCTTACAATCTTCGAGAGAGTGATGGCTAAGCACCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAATGCAGGCACAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAATACTCACAATCTGATGTACTTATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 5590 327 + 647215 CGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTATCATACCGTACTGGCATCGGCATGGACCTCCGAACTGCAGCCAGTTCTTCAAGTAAAATCAACTTCTCCTAATTGTTGAGAGAATGATGACTAAGCAACATGGGCTTCAATTTGTCCAGTCCAATGCTCCCAGCATCCTGTAGATGCAGCAATACAGGCTTTAGTGCAGACAGCAAATGCCTTACAATCCTTGAGAGGGTGACGGCTAAGCACCTGTGGATGCAGCAGTACAGCCTGTAATGCAGGCATAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAACACTCACAATCTGATGTACTTATCA + +a +s mr.mrrefChr0 6145 52 + 130230 CAATTTATTAATGTATATGAGGGCTAACAACCGGTGGTCAGTAGATTCAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6437 52 + 636262 CAATTTATTAATGTATATAAGGGCTAACATCCAGCGGTCAGTAGATTCAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 5918 52 + 647215 AAATTTATTAATGTATATGAGGGCTATCAATGGGTGGTCAGCAGATTCAAAG + +a +s mr.mrrefChr0 6197 9 + 130230 TGCATTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6489 9 + 636262 TGCATTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 5975 9 + 647215 TGCATTTGT + +a +s mr.mrrefChr0 6206 90 + 130230 ATTTGTAGTAACTAAAATAACCAATAGACAATTAGTACACAGAAGGTGTTATTGAGCTATCAGCCCCACAAGCTTCACCTTAGTTAGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6498 89 + 636262 ATCTGTAA-AACTAAAATAACCAACAGACAATTAGTACACAAAAGGTGTTACTGAGCTATCAGTCCCACAAGCTTCACCTTAGTTGGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 5985 90 + 647215 ATTTGTAGTAACTAAAATAACTGATAGACAGTTAGTGCTCAGAAGGTGTTATTGGGCTATCAGCCCCATGAGCTTCACCTTAGTTAGGAA + +a +s mr.mrrefChr0 6296 12 + 130230 TAACGTGAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6592 12 + 636262 TAACGTGAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 6075 12 + 647215 TAACGCTAACCA + +a +s mr.mrrefChr0 6308 52 + 130230 CAGGTTCAGATAGCTTCCTGTGCCCATGTCTGCATGACTCCCAGAGCCTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6604 52 + 636262 CAGGTTCAGATAGGTTCCTGTGCCCATGTCTGCATGACTCCCAGCGCATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6088 52 + 647215 CAGGTTCAGATAGCTTCCCGTGCCCATAAATGCATGACTCCCAGAGCCTGTG + +a +s mr.mrrefChr0 6360 7 + 130230 CACCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6658 7 + 636262 CACCGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 6140 7 + 647215 CACCACT + +a +s mr.mrrefChr0 6367 184 + 130230 TATTAATGCACCAAAGCATTATGATCTTAAGTAGCACTAGCACTGAATTTCAATCTAGACCGTCTGGCCCAAAAGCAATCTGAGATGGAAAGGAATCACACAGAGAGAAGGGTAGTATTGATGAAGCCAGGCTACAGCTTGAAACCAACTAGCAAGTTTTAATTCAATAGCCATAAAGAACTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6674 182 + 636262 TATTAATGCACCAAAGCATTAGGATCTTAAGTAGCACTAGCACTGAATTTCAATCTAGACCGTTTGGCCCAAAAGCAATCTGATATGGAA--GAATCACACAGAGAGAAGGGTAGTATTGATGAAGCCAGGCTACAGCTTGAAATCAACTAGCAAGTTTTAATTCAATACCCATAAAGAACTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 6147 180 + 647215 TATTAATGCATCAGTGCATTATGATATTAAGTAGCATTAGCACTGAATGTCAATCTA----GTCTGGCCCAAAAGCAATCTGAGATGGAAAGGAATCACAAAGAGGGAAGGGTAGTATTGGTGGGGCCAGGCTATGGCTCGGAACCAACCAGCAAGTTTTAATCCAATAGCCATATAGAACTAA + +a +s mr.mrrefChr0 6551 178 + 130230 AACCAAGCGCAGTAATGTAACAGGCAGCATGGAGTGGCAAGTGACCAGAGCAGTGCAGTATTGGTCATTTATGTATTAGCAATTCTAAGCACAATTGGTGTCATACTATGTAAAACAGTTTTGGTGAAACCATCACAGATCAGCAATGTGTCTTTGAATGGAGCCCAATGATAAGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 6856 178 + 636262 AACCAAGCACAGTAATGTAACAGGCAGCATGGAGTGGCAAGTGACCAAAGCAGTGCAGTATTGGTCATTTATGTGTTAGCAATTCTAGATGCAATTGGTGTCAAACTATGTAGAACAGTTTTGGTTAAACCATCACAGATCAGCAATGGGTTTTTGAATGGAGCCCAATGATAAGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 6375 174 + 647215 AACCAAGCGCAGTCATGTAATAGGCA----GGAGTGGCAAGTGACTAGCGCAGTTCAGTATTGGTCATTTATGCAGTAGCAATTCTAAGCACAACCAGTGTCATACTATGTAAAACAGTTTTGGTGAAACCATCACAGATCAGCAATGTGTCTTTGAATGGAACCCAATGAAAAGATT + +a +s mr.mrrefChr0 6729 63 + 130230 CAATGCCCTATTGCTAGAGGGAAATTGACCACCCAGCTACTACACATGATGATGGAGTACCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7034 63 + 636262 CAATGCCCTATTGCTAGAGGGAAATTGACCACCCAGCTACTACACATGATGATGGAGTACCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 6550 63 + 647215 CAATTCCCTATTGTTAGAGGGAGATTGACTACCCAGTGACTACTCATAATGACAGTGCATCAA + +a +s mr.mrrefChr0 6792 14 + 130230 TCCTGAGGATATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7098 14 + 636262 TCCTGAGGATATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 6613 14 + 647215 CCCTGAGGATATGA + +a +s mr.mrrefChr0 6806 73 + 130230 AATTTCCATTGGAGCTGAATCAGGGGATAGACTGCTGACATCCAACAAAGGTGATGAAGTTACACAAAATTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7112 73 + 636262 AATTTCCATTGGAGCTGAATCAGGGGATAGACTGCTGACATCCAACAAAGGTGATGAAGTTACACAAAATTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 6630 73 + 647215 AATTTCCATTTTAGGTGAATCAGGGGATACACTGCTGATATCAAACAAAAGTCGTGAAGTTGCACAAAATTAC + +a +s mr.mrrefChr0 6879 58 + 130230 ACTAAATCATAGTCATGGCTAAAAGGTATGGACAACTACATACAGTTTATTTAGGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7185 58 + 636262 ACTAAATCATAGTCATGGCTAAAAGGTATGGACAACTACATACAGTTTATTTAGGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6704 58 + 647215 ACTAAATCACTGTCATGGCTAGGAGGTGTAGACAAATACATACAGTTCAATTATATTG + +a +s mr.mrrefChr0 6937 31 + 130230 TACTCTGCTTTGCTATTTGCTGAGTGGCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7243 31 + 636262 TACTCTGCTTTGCTATTTGCTGAGTGGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 6764 31 + 647215 TATTCTACTTTGCTATTTGCAGGGTGACTTC + +a +s mr.mrrefChr0 6968 4 + 130230 TAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7281 4 + 636262 TAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 6795 4 + 647215 TAAT + +a +s mr.mrrefChr0 6972 57 + 130230 ATCAATCCATTTTTGGGATGTCATGACCCTTGTAGAAGGTGACCTGCCTTAGCTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7290 57 + 636262 ATCAATCCATTTTTGGGATGTCATGACCCTTGTAGAAGGTGACGTGCCTTAGCTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 6799 57 + 647215 CTTGATCCATTTTTGGGATGTCATCACCTTTGGAGGAGGTGACCCACCTTAGCTGCT + +a +s mr.mrrefChr0 7029 53 + 130230 GTATTTACCGATCAGCATTGCTGTCACCAAGTGCCGGGAAGTTGTCTTCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7347 53 + 636262 GTATTTACCGACCAGCATTGCTGTCACCAAGTGCCGAGAAATTGTCTTCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6857 53 + 647215 GTATTTACCAATCGACATTGCTGTTGCCAAGCACCGGGAAGTTGTCTTCTTGG + +a +s mr.mrrefChr0 7082 10 + 130230 ATGACTCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7409 10 + 636262 ATGACTCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6910 10 + 647215 ATGACTCTAA + +a +s mr.mrrefChr0 7092 13 + 130230 GTCCACATGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7420 13 + 636262 GTCCACATGCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6920 13 + 647215 GTCCATATGCATG + +a +s mr.mrrefChr0 7105 42 + 130230 ATACCACAAGCCTTTGGGAGCTGGTACTGACTCAAATGGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7467 42 + 636262 ATACCACAAGCCTTTGGGAGCTGGTACTGACTCAAATGGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 6933 42 + 647215 ATACCACAGGTCTTGGGAAGCTTGTACTGTCTCAGATGATCA + +a +s mr.mrrefChr0 7147 58 + 130230 AGTGATCATCAACAGAACGAGACAGCTGAGCAGTCATGAGCCTACTTTCTCTTGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7926 58 + 636262 AGTGATCATCAACAGAACGAGACAGCTGAGCAGTCATGAGCCTACTTTCTCTTGGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 6975 58 + 647215 AGTGCTCATCAATAGAACAAGCCAGCTGAGCAGTCATGAGTCTATCTTCTCTTGGATG + +a +s mr.mrrefChr0 7205 61 + 130230 CTGGGATGGGACTAGCAATCATTCATACCTGAGAGAAGTAATAGAGTAAGCCTCTTATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 7984 61 + 636262 CTGGGATGGGACTAGCAATCATTCATACCTGAGAGAAGTAATAGAGTAAGCCTCTTATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 7041 61 + 647215 CTGGGATGGGACTAGCAACCACTGGCACCTGAGAGAAGCACTAGAGTAAGCCTCGTACATA + +a +s mr.mrrefChr0 7266 9 + 130230 CCTATGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8048 9 + 636262 CCTATGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 7102 9 + 647215 CCTATGTTG + +a +s mr.mrrefChr0 7275 38 + 130230 GCTACAGACTTGATAGCGAGGTACAAAAGGAAGCTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8057 38 + 636262 GCTACAGACTTGATAGCGAGGTACAAAAGGAAGCTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 7112 38 + 647215 GCTTCAGACTTCACAGCAAGTTCCGAAAGGAAGCTATA + +a +s mr.mrrefChr0 7313 24 + 130230 TTTGGTTCATATCTATGAAGTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8096 24 + 636262 TTTGGTTCATATCTATGAAGTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 7150 24 + 647215 TTTGGTTCATGTCTACAAAGTGTG + +a +s mr.mrrefChr0 7337 18 + 130230 AGTGTGTGGGGCAGTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8129 18 + 636262 AGTGTGTGGGGCAGTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 7174 18 + 647215 GGGGGCAAGGGCAGCATT + +a +s mr.mrrefChr0 7355 480 + 130230 ATCCAGGACAGAAAGATCAGATATTACTGACTTCTTAAAAATTTTTTTCACTTTTTGAGGTATATTGGGACAACCACACCATCAATGGATAGGAAAAACAATACATGGAAATGACAAGCCTTTCAATCCTGATATGCTGCAAAATTGATTCGCACCAGAGGTGATACACAAAGTCTCTACACCTGGACCACCTGGTCACAGGTTTCAGGAGTGCTTAATTTTTTGTGCAGAGTATTAAAAAGAAGGTGCACTTCAGTTTGCTTCTGACAGGGGTTAGGTTGTCAGGCATACTAACCTCGTTATCTAGTCCATCAGGGATAGAATGCAGGAAAAAATGCATTATTATGAGATTCAGGGCACCGCTGGCATACTGCTCGGACCCAACATCCCTCACCATCACCATTGGCTGAGAGTGGTCAAGTATCGAGTGATGCTGCACAACTTAAGGGGGGAAGGTTGTAGTCTTTGGAGCTATTGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8148 480 + 636262 ATCCAGGACAGAAAGATCAGATATTACTGACTTCTTAAAAATTTTTTTCACTTTTTGAGGTATATTGGGACAACCACACCATCAATGGATAGGAAAAACAATACATGGAAATGACAAGCCTTTCAATCCTGATATGCTGCAAAATTGATTCGCACCAGAGGTGATACACAAAGTCTCTACACCTGGACCACCTGGTCACAGGTTTCAGGAGTGCTTAATTTTTTGTGCAGAGTATTAAAAAGAAGGTGCACTTCAGTTTGCTTCTGACAGGGGTTAGGTTGTCAGGCATACTAACCTCGTTATCTAGTCCATCAGGGATAGAATGCAGGAAAAAATGCATTATTATGAGATTCAGGGCACCGCTGGCATACTGCTCGGACCCAACATCCCTCACCATCACCATTGGCTGAGAGTGGTCAAGTATCGAGTGATGCTGCACAACTTAAGGGGGGAAGGTTGTAGTCTTTGGAGCTATTGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 7192 480 + 647215 ATCCAGGACAGAAAGATCAGATTTTACTGGGTTCTTAATAATTTTTTTCACTTTTTGAGATATTTTGGGACAATCACTCCATCAATGCGTGGAAACGACAATACATGGAAATGACAAGCCTCTTAACCCTGATGTGCCCCGGAACAGAGTCACACCAGAGGTGATACACAAAGTTTCTAAACCAAGATCACCTGGTTGCAGGTTGCAGGATTGCTTACTTTTTTATGCAGAGTATTAAAAAGAAGGTGTCCCTCCAGTTGCTTCTGATGCAGGTCAGCTTGACAGGCATACCAACCTCTTTATCTAGTCCATCAGGGATGGCATGCAGGAAAAAATGCATTGTTATGAGGTTTAGGTCACCGCTAGCACACTGCTAGGACCCAGTGTCCCGCACTATCCCTATTGGCTGGGAGTGGTCAAGTATCAAGTGGTGCTGGACTACTTAAGGGGGGAAGGTTGCAGTCTTTGGAGCTATTGAGA + +a +s mr.mrrefChr0 7835 98 + 130230 GCTTTGGTTAGACTGTGACTGATAGCCTAACGTTAGCGATAGAACAATGGCTACTAATTTGGTTCCAATTGTGGGTGCTGATAGCCCCAAGCctaaac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8628 98 + 636262 GCTTTGGTTAGACTGTGGCTGACAGTCTAACGTTAGTTATTGAACAACGGCTATTAATTTAGTTCCAATTGTGGGTGCAGATTGCCccaaccctaaac +s simRat_chr6.simRat.chr6 7672 98 + 647215 GCTTTGGTTAGACTGTGACTGATAGCCTAACGTTAGCGATAGAACAATGGCTACTAATTTGGTTCCAATTGTGGGTGCTGATAGCCCCAAGCCTAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 337508 92 + 647215 GCTTTGGTTAGACTGTGACTGATAGCCTAACGTTAGCGATAGAACAATGGCTACTAATTTGGTTCCAATTGTGGGTGCTGATAGCCCCAAGC------ + +a +s mr.mrrefChr0 7933 49 + 130230 aaagttttgacaaatagttcgagactggattgtaatgctgaaagatggc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8726 49 + 636262 aaagttttgacaaatagttcgagactggattgtaatgctgaaagatggc +s simRat_chr6.simRat.chr6 7776 49 + 647215 ATAACTTTAACAAATAGTTCAAGAGTGAATTATAATCTTGAAAGATTGC + +a +s mr.mrrefChr0 7982 138 + 130230 acctcctagagtcaacagatcccaagctgaatccacttcaagcacattatgaagtcagtggccgttGTAGATCACTCAACCTGTACTATATACAGAAGACTAGAACGTCAACTCTTAAGTTACTATGTCAGCTAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8775 138 + 636262 acctcctagagtcaacagatcccaagctgaatccacttcaagcacattatgaagtcagtggccgttGTAGATCACTCAACCTGTACTATATACAGAAGACTAGAACGTCAACTCTTAAGTTACTATGTCAGCTAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 7830 138 + 647215 ACCTCCTAGAGTCAACAGATCCTAAGCTGAATTCAATGCAATTACATTATGAAGTCAGTGGTTGTTGTAGGTCACTCAACCTGTGCTATATACAGAAGACTAGAACGATAACTGTTAAGGCACCATGTCAGCTAAACA + +a +s mr.mrrefChr0 8120 46 + 130230 TATTGTCAGTGAGGAGTACCTCAAATGGTGCCAGACAGACTTTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8913 46 + 636262 TATTGTCAGTGAGGAGTACCTCAAATGGTGCCAGACAGACTTTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 7971 46 + 647215 TTCTGTCAGTGAGGAGTAGCCCAAATGGTGCCAGACAGAATTTGGC + +a +s mr.mrrefChr0 8166 76 + 130230 AATAGGTTATGAACACTCCTCCTACCAATCACAGTAGTGATACATGACTTCCCCCAGGATAGATCATGTGGGTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 8960 76 + 636262 AATAGGTTATGAACACTCCTCCTACCAATCACAGTAGTGATACATGACTTCCCCCAGGATAGATCATGTGGGTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 8017 76 + 647215 GGTAGGTTATAAACCCTCCTCCTACCAATCATAGTAGTGCTACATAGCATCCCCCAGGATAGGTCATGTGGGTTAC + +a +s mr.mrrefChr0 8242 102 + 130230 TACATGGGGCCTGTTCACCCCACCCGCCAAACTAACAAGGCCAAGAAAGGAAGGAGCTTTAGCCTGAGTTTCTCTAACTCCAGGTGTAATTCCCTTAGGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9036 102 + 636262 TACATGGGGCCTGTTCACCCCACCCGCCAAACTAACAAGGCCAAGAAAGGAAGGAGCTTTAGCCTGAGTTTCTCTAACTCCAGGTGTAATTCCCTTAGGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 8132 102 + 647215 TGTATGGGGCCTGTTCACCCCACCTGCCAAACTAACAAGGCCAAGAAAGGAAGGAGTTTGAGCCTGAATGTCTCTAACTCCACTTGTAAGTCCCTTAGGGCT + +a +s mr.mrrefChr0 8344 14 + 130230 TTTCCGGCCCTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9138 14 + 636262 TTTCCGGCCCTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 8235 14 + 647215 TTTCTAGCCCTATG + +a +s mr.mrrefChr0 8358 37 + 130230 GCAACAATAAATTTGGTTCTGAATATGAGGTGCCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9152 37 + 636262 GCAACAATAAATTTGGTTCTGAATATGAGGTGCCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 8282 37 + 647215 GCAAAAATGAATTTAGTTCCAACTCGGAGGTGCCCAT + +a +s mr.mrrefChr0 8395 32 + 130230 ACAAACCACTCTAATTGGATTCTACTATTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9189 32 + 636262 ACAAACCACTCTAATTGGATTCTACTATTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 8320 32 + 647215 ACAAACCATTCTGATTGGACTCTACTATTCAA + +a +s mr.mrrefChr0 8427 68 + 130230 CAAACATTTCTAAGAGAGTTACTAAATATGGCGTAAGGAGAAACTTTTTAAAAACTCTTATCATGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9225 68 + 636262 CAAACATTTCTAAGAGAGTTACTAAATATGGCGTAAGGAGAAACTTTTTAAAAACTCTTATCATGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 8352 68 + 647215 CAAACACAGGTAAGCGAGTTACTAAATATGGTGTAAGGAGAAATTTTTTAAAAACTCTTATCAACCCA + +a +s mr.mrrefChr0 8495 91 + 130230 AAGGGGAATAACAGgcatccataaaatccacctctcatgcttgcctggtacattggtgcacttgagattaaggggtgacaataggaccatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9294 91 + 636262 AAGGGGAATAACAGgcatccataaaatccacctctcatgcttgcctggtacattggtgcacttgagattaaggggtgacaataggaccatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 8420 91 + 647215 AAAGGAAATAACTGGCATCCATACAATCCACCTCCCTTGCTTGCCTGGCATGTTGGTGCGCTCAAGATTAAGGGCTGACAATGAGACCATC + +a +s mr.mrrefChr0 8586 56 + 130230 atcagaagtggacaaagaaaaagggtgggaatttagttccaaccaacaagtcagac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9391 56 + 636262 atcagaagtggacaaagaaaaagggtgggaatttagttccaaccaacaagtcagac +s simRat_chr6.simRat.chr6 8511 56 + 647215 ACCAGAAGGGTATATAGAAAAGGGTTGGGAATTTAGTTCCAACGCACAAGTCAGAC + +a +s mr.mrrefChr0 8642 110 + 130230 aaggataaaagggggataataaagggcattcaagtgaagtccaaaggcactaacccatctcaaaggtcaaaccattctaagtgtttgcccgctttatatatgggcattat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9473 110 + 636262 aaggataaaagggggataataaagggcattcaagtgaagtccaaaggcactaacccatctcaaaggtcaaaccattctaagtgtttgcccgctttatatatgggcattat +s simRat_chr6.simRat.chr6 8567 110 + 647215 Aaggataaaagcgggataaaaaaggtcatccaagtgaagtccaaaggcacaaaccctcctcaaacgttaacccattctaagtgtttgccagcttaatatatggggattat + +a +s mr.mrrefChr0 8752 150 + 130230 aatacacatcatgtgtgaatctcagatagGGCCTGAAATATGCTTGTACTGGAAATTCAAGCTGGTTGTCAACTTCTTCACGTACAGAATCTAGTGAATGTCAATTCAACAGTATCAACCAATCTAAGATTCAATTGAAACTGCCTAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9590 150 + 636262 aatacacatcatgtgtgaatctcagatagGGCCTGAAATATGCTTGTACTGGAAATTCAAGCTGGTTGTCAACTTCTTCACGTACAGAATCTAGTGAATGTCAATTCAACAGTATCAACCAATCTAAGATTCAATTGAAACTGCCTAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 8677 150 + 647215 aatatgcagcatgtgtgaatctcagaCGTGGTCTGAAATATGCTTGTTCTGGAAAACCTGCCTGGTTGCCAGCATCTTCACACACAGAGTCTAGTGAATGTCAATCCAACAGTGTTAACCAATCTAAGATTCAATTGACACTGCCTGGAC + +a +s mr.mrrefChr0 8902 13 + 130230 AGGTAGctgctta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9740 13 + 636262 AGGTAGCTGCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 8854 13 + 647215 AGGTACctgctta + +a +s mr.mrrefChr0 8915 71 + 130230 ttttctctgctctacctatgcccactcaaaccaggcactcaagtgaggaccaaagactttgttggtattgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9754 71 + 636262 TTTTCTCTGCTCTACCTATGCCCACTCAAACCAGGCACTCAAGTGAGGACCAAAGACTTTGTTGGTATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 8867 71 + 647215 ttttctctgctctacttatgcccactcaaaccaagcattcaagtgaggaccaaagattgcgttggtattgt + +a +s mr.mrrefChr0 8986 4 + 130230 gccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9825 4 + 636262 GCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 8946 4 + 647215 gccc + +a +s mr.mrrefChr0 8990 17 + 130230 tgtgcaaggctatgttt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9829 17 + 636262 TGTGCAAGGCTATGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 8964 17 + 647215 tctgcaaggccgtgtct + +a +s mr.mrrefChr0 9007 41 + 130230 acaatacaagtaacagcaaaaaacggctgctgacaacatgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9846 41 + 636262 acaatacaagtaacagcaaaaaacggctgctgacaacatgt +s simRat_chr6.simRat.chr6 9203 41 + 647215 acaatataACTACCAGTAAAAATGGGCTGCTGACACCAGGT + +a +s mr.mrrefChr0 9048 21 + 130230 caacagtgatccaaagattat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9887 21 + 636262 caacagtgatccaaagattat +s simRat_chr6.simRat.chr6 9245 21 + 647215 CAGTAGTGCTCCAAAGATCAT + +a +s mr.mrrefChr0 9069 12 + 130230 gaatggaaaagc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9908 12 + 636262 gaatggaaaagc +s simRat_chr6.simRat.chr6 9284 12 + 647215 GAATCGAAAACC + +a +s mr.mrrefChr0 9081 16 + 130230 gtgagagctcacacct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9927 16 + 636262 gtgagagctcacacct +s simRat_chr6.simRat.chr6 9296 16 + 647215 GTGGGCCTCTACTCGT + +a +s mr.mrrefChr0 9097 18 + 130230 ccaaggatgattagactg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9943 18 + 636262 ccaaggatgattagactg +s simRat_chr6.simRat.chr6 9313 18 + 647215 CCGAACATGGTTAAACTG + +a +s mr.mrrefChr0 9115 15 + 130230 ggtcatcaaggtaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9961 15 + 636262 ggtcatcaaggtaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 9334 15 + 647215 GGTCATCAGAGTTAA + +a +s mr.mrrefChr0 9130 41 + 130230 tttgagctaagagagatcaagaggcaaaggataatgtctaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 9976 41 + 636262 tttgagctaagagagatcaagaggcaaaggataatgtctaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 9352 41 + 647215 TCTGAACTAAAAGAAATCAAGAGGTTAAGGATAATGTCTAA + +a +s mr.mrrefChr0 9171 20 + 130230 tcggccagtgagagagtcgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10017 20 + 636262 tcggccagtgagagagtcgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 9395 20 + 647215 TCAACTGGTGTGATAGTAGG + +a +s mr.mrrefChr0 9191 53 + 130230 ttttgctggtcttgaggttagattaatgaaattcacaggcctcaactggacat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10037 53 + 636262 ttttgctggtcttgaggttagattaatgaaattcacaggcctcaactggacat +s simRat_chr6.simRat.chr6 9418 53 + 647215 TTCTGCTGGTCTATAGACTAGATTAATGAAATTTGCAGGCCTCTGCTGGACAT + +a +s mr.mrrefChr0 9244 22 + 130230 gcatgtagagtaacaaAGGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10090 22 + 636262 gcatgtagagtaacaaAGGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 9473 22 + 647215 TCATGTTGAGTAACAAAGGATG + +a +s mr.mrrefChr0 9266 49 + 130230 ATATCTTCAAATATACACCAATCAGTTGCACTAACTTCTTTCTGCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10112 49 + 636262 ATATCTTCAAATATACACCAATCAGTTGCACTAACTTCTTTCTGCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 9498 49 + 647215 ACATCTTCAAATACACTTCAATCTGTTGAACTAATTTCTTTGTGCTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 9315 20 + 130230 AAGACAGCTTGGTGGTAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10165 20 + 636262 AAGACAGCTTGGTGGTAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 9547 20 + 647215 AAGACAACTTGGGGGTATTT + +a +s mr.mrrefChr0 9335 47 + 130230 CACAATGAGACCCCTGGGGAAAACTTAGTTGTGATTGAGGATTTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10187 47 + 636262 CACAATGAGACCCCTGGGGAAAACTTAGTTGTGATTGAGGATTTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 9567 47 + 647215 CACAATGAGTCACCTAGGCAAAACTTAGTTGTGGTTGAGGATAATCG + +a +s mr.mrrefChr0 9382 46 + 130230 GACCCCTGGGGAGGGGGGGAAGGGGAGCACCTGAGAGTCGGAGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10235 46 + 636262 GACCCCTGGGGAGGGGGGGAAGGGGAGCACCTGAGAGTCGGAGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 9614 46 + 647215 GACCCCTGGGGAGAGGGGTAGGGAGGGCAGCTGAGAGCTGGAGACC + +a +s mr.mrrefChr0 9428 16 + 130230 ATTTCTATAAAATGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10281 16 + 636262 ATTTCTATAAAATGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 9692 16 + 647215 GTTTCTATGGCTTGAA + +a +s mr.mrrefChr0 9444 30 + 130230 TTGACTATCATGACTCAGTGCATGTTGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10297 30 + 636262 TTGACTATCATGACTCAGTGCATGTTGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 9710 30 + 647215 TTGACTATCATGAATCAGTGTGTGTTGTAA + +a +s mr.mrrefChr0 9474 8 + 130230 GTGGTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10340 8 + 636262 GTGGTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 9740 8 + 647215 GTGGTCAA + +a +s mr.mrrefChr0 9482 37 + 130230 TTTATTACTAGTGAAGTTCTACAGGCAGTATAGAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10389 37 + 636262 TTTATTACTAGTGAAGTTCTACAGGCAGTATAGAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 9748 37 + 647215 CTTGCTACCACTGAAGTTCTACAAGCAGCATAGAGGC + +a +s mr.mrrefChr0 9519 22 + 130230 ATATGTCAGTTTCACTTGCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10433 22 + 636262 ATATGTCAGTTTCACTTGCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 9785 22 + 647215 ATATGTCAGTTTCACATCTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 9541 3 + 130230 ATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10458 3 + 636262 ATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 9807 3 + 647215 ATG + +a +s mr.mrrefChr0 9544 69 + 130230 ACTACTTCTTCAATGTCTGAATCTAGCAAAGGTATGATAAAAGGAACACAGAGCTACCAGGTGAAAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10468 69 + 636262 ACTACTTCTTCAATGTCTGAATCTAGCAAAGGTATGATAAAAGGAACACAGAGCTACCAGGTGAAAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 9810 69 + 647215 AGTACTTCTTGAATGTCTGAGTCTGTCAAAGATATGATGAAAGGAGCACAGAGCTACTATGTCAAAAGC + +a +s mr.mrrefChr0 9613 303 + 130230 Catagggaagcccacgcattgacaatcacttgagattcagtctggagaagctgggatggcttgggatgtataaacttataaatttcacaagactcatggtatgtaatggaatatattaacagaatcacatgattagatcattggataatggtggtgcacagattgaattaaacaaacaggatcacatcacaggttagccataatgaatgagttagaaagtgaccgataacagtgcctgaatgttgcctgcacaagcataaagctgctttccagtggttatggttggacacttgtgtaatccct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10547 303 + 636262 Catagggaagcccacgcattgacaatcacttgagattcagtctggagaagctgggatggcttgggatgtataaacttataaatttcacaagactcatggtatgtaatggaatatattaacagaatcacatgattagatcattggataatggtggtgcacagattgaattaaacaaacaggatcacatcacaggttagccataatgaatgagttagaaagtgaccgataacagtgcctgaatgttgcctgcacaagcataaagctgctttccagtggttatggttggacacttgtgtaatccct +s simRat_chr6.simRat.chr6 9879 303 + 647215 CACAgggaagcttgtacatttacaattacttgagactcattctggagaagctgggatggcttgggatatatagacttgtaaatgtcacaagactcatgctatataatggagtatattaatggaattagatcaggagatcaatggataatggtgatggacaaattgaattaaacaaacaggatcacatcacagggtaaccacaatgaacaagttaagaattgacgcatgaccgcacctgaatgttggcagCATAAGCACAAAGCTGCTTTCCAGTGATTATGGTTGGACACTTGTGTAATCACT + +a +s mr.mrrefChr0 9916 47 + 130230 ttgagtgtcactagagggcaccaaggacgttccataatcatcGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10850 47 + 636262 ttgagtgtcactagagggcaccaaggacgttccataatcatcGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 10226 47 + 647215 TTGACTGGCACTAGAGGACAACGAGGATGTTGCATAACCATTACGTA + +a +s mr.mrrefChr0 9963 84 + 130230 CCCAATTGTTAAAGGATCTCAAATATTCCCAGATCAGATTACAGGATCACAATCTGTCAATGCTAGAAGAATAGTGGTCTAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10897 84 + 636262 CCCAATTGTTAAAGGATCTCAAATATTCCCAGATCAGATTACAGGATCACAATCTGTCAATGCTAGAAGAATAGTGGTCTAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 10298 84 + 647215 CCCAATTGTTACAGGATTTCGAATACTCCCGAATCAAATTACAAGATCACAACCTGCTAGTGATAGAAGCCTAGTGTTCTAGCA + +a +s mr.mrrefChr0 10047 160 + 130230 GTAATTACCGATTGCTTTCTTAAGTCATTAGGGTAGGTTGTCAAAGAGGTGTGAATAAACATGCCCGCACACTTGAGCTTTGACCTACTCTAGGGGATTGACCATCTCTGAAGCTACTGTAGCCTAAGTAGGATGCTGCTGAAGTCAGATTCTTGCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 10981 160 + 636262 GTAATTACCGATTGCTTTCTTAAGTCATTAGGGTAGGTTGTCAAAGAGGTGTGAATAAACATGCCCGCACACTTGAGCTTTGACCTACTCTAGGGGATTGACCATCTCTGAAGCTACTGTAGCCTAAGTAGGATGCTGCTGAAGTCAGATTCTTGCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 10384 160 + 647215 GTAATAACCTATTGCTTTCTTGAGTCTCTAAGAAAGGTTGCCAAAGAGGCATGAACAAACAAGCCCACACAATTGAACTTTGACTTACTCCTGGGGCTGAACCATCTCTGAAGCTACTGTAGCCTGAATGGGACCCTGCTGAAGTCAGGTTCTGGCATTA + +a +s mr.mrrefChr0 10207 64 + 130230 ACACTTAAACAAGTCATCGGTTACCTGTTTGGGGCATGTCTTTATATTTGAAGCCAGCAAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11142 64 + 636262 ACACTTAAACAAGTCATCGGTTACCTGTTTGGGGCATGTCTTTATATTTGAAGCCAGCAAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 10544 64 + 647215 ACACTTAAACAGGTCATCGGTGACCTGTTTGGGGCATGTCTTTATATTTGAAGACAGCAAACTA + +a +s mr.mrrefChr0 10271 19 + 130230 CATCTTGATATTAGCCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11208 19 + 636262 CATCTTGATATTAGCCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 10608 19 + 647215 CATCTTGATATTAGCCTCA + +a +s mr.mrrefChr0 10290 29 + 130230 TGTTAATTCCCATATGTATCAGGGGTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11227 29 + 636262 TGTTAATTCCCATATGTATCAGGGGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 10630 29 + 647215 TGTTACCTCCCATATGTATCTGGGGAGTT + +a +s mr.mrrefChr0 10319 17 + 130230 GCTTCTTCTGTCACTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11257 17 + 636262 GCTTCTTCTGTCACTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 10659 17 + 647215 GCTTCTTGTGTCGCTGT + +a +s mr.mrrefChr0 10336 68 + 130230 CTGTAACACCCAATACAGACACTACAAAGAACATTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGCAGTGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11274 68 + 636262 CTGTAACACCCAATACAGACACTACAAAGAACATTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGCAGTGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 10677 68 + 647215 CTGCAATATCCAATACAGACACTATAAAGAATGTTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGTAGTGCCT + +a +s mr.mrrefChr0 10404 47 + 130230 ACGAAGGTTTTTACCATGAAAATGGTATTGAGCAAATGACCCTGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11342 47 + 636262 ACGAAGGTTTTTACCATGAAAATGGTATTGAGCAAATGACCCTGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 10763 47 + 647215 ACAAAGGCCCTCACCATGAAAATGGTATTGAGCAAATGGCTCTGCCT + +a +s mr.mrrefChr0 10451 59 + 130230 TCACTAGAAGGAACATTCCCAGATAATAAAGGTCTGTTCAAGACTGAGACAACTTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11395 59 + 636262 TCACTAGAAGGAACATTCCCAGATAATAAAGGTCTGTTCAAGACTGAGACAACTTTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 10810 59 + 647215 TCACTAGAAAGAACATTCCCAGATAATAAAGGTCTGTTCAAGACTTAATCAACATTCCA + +a +s mr.mrrefChr0 10510 9 + 130230 TGTTAATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11454 9 + 636262 TGTTAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 10871 9 + 647215 TGTTAATAC + +a +s mr.mrrefChr0 10519 146 + 130230 GCGTATTGAACCTGGGATTGAAAGACTGTGGTCATCTGGTGTGGCTCTATTAACTACCACACTGATATAACATTGATGTTCGTCAATGTTACACTAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACAGCATATAACCACAGTCTCTTAATCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11463 146 + 636262 GCGTATTGAACCTGGGATTGAAAGACTGTGGTCATCTGGTGTGGCTCTATTAACTACCACACTGATATAACATTGATGTTCGTCAATGTTACACTAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACAGCATATAACCACAGTCTCTTAATCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 10910 146 + 647215 GCGTGTTGAGCCTGGGAGTAAGAGACTATGGTTATCTGGTGTGTCTCTGCTAATTACCACACTAATGTAACATTGATGTGTATCAGTGTTACACCAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACACCAGATGGCCACAATCTCTTAACCCCA + +a +s mr.mrrefChr0 10665 3 + 130230 ACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11609 3 + 636262 ACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 11058 3 + 647215 ATC + +a +s mr.mrrefChr0 10668 19 + 130230 TCAGTCAGAAGAAAAATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11612 19 + 636262 TCAGTCAGAAGAAAAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 11067 19 + 647215 TCAGTTAGAGTAAGGATAC + +a +s mr.mrrefChr0 10687 16 + 130230 TTTCAGTATTAGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11632 16 + 636262 TTTCAGTATTAGCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 11086 16 + 647215 TTTCAGTATTAGTATG + +a +s mr.mrrefChr0 10703 9 + 130230 AATGCTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11648 9 + 636262 AATGCTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 11157 9 + 647215 AATTATACA + +a +s mr.mrrefChr0 10712 124 + 130230 CTCAGTCTTGGACCAATTCTGATTGTCTAGGAATTTTCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTCGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACGTTTGTTGGTCTATTCACTGGTTAGAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11657 124 + 636262 CTCAGTCTTGGACCAATTCTGATTGTCTAGGAATTTTCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTCGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACGTTTGTTGGTCTATTCACTGGTTAGAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 234007 124 - 647215 CTCAGTCTTGGACAGATTTTGATTGTCTAGGAATATGCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTTGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACTTTTGTTGGTTTATTCACTGATTGGACTG + +a +s mr.mrrefChr0 10836 65 + 130230 CTACCTGAATATAGTACTCCTGTAGTGGCACATACTTTGTAGTGTCTGTATTGGATATTGCAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11783 65 + 636262 CTACCTGAATATAGTACTCCTGTAGTGGCACATACTTTGTAGTGTCTGTATTGGATATTGCAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 234131 65 - 647215 CTACCCGAATACAGTACTCCTGTAGTGGAACATTCTTTGTATTGTCTGTATTAGATATTGCAAGA + +a +s mr.mrrefChr0 10901 51 + 130230 CAGGTTAAGTACACATTTAAGGTATAGTACTTCTTGCAATTTATGATGATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11849 51 + 636262 CAGGTTAAGTACACATTTAAGGTATAGTACTTCTTGCAATTTATGATGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 234196 51 - 647215 CAGATCAAGTTCACATTTAGGGTATAGTACTTCTTGCAACTTATGATGATA + +a +s mr.mrrefChr0 10952 45 + 130230 ACTGTAATTATTGATTTGGTCTTTAGCAACCTCAGGTAAAATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11900 45 + 636262 ACTGTAATTATTGATTTGGTCTTTAGCAACCTCAGGTAAAATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 234250 45 - 647215 ACTGTAATTATTAATTTGGTGTCTAGAAACCTCAGATAAAATGTT + +a +s mr.mrrefChr0 10997 44 + 130230 AGTGATCCAGGCACAGCTTACTCCCAGCCTAACAAAGTCAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 11945 44 + 636262 AGTGATCCAGGCACAGCTTACTCCCAGCCTAACAAAGTCAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 234296 44 - 647215 AATGATCCAGGCACAGTTTGCTCCCAACCTCACAAAGTCAAATT + +a +s mr.mrrefChr0 11041 23 + 130230 TTAAGCACAAACCTGTACTCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12022 23 + 636262 TTAAGCACAAACCTGTACTCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 234340 23 - 647215 TTAAGCACGAACCTGTACTCATG + +a +s mr.mrrefChr0 11064 69 + 130230 CCTATTCCGACACCCCCATTTTAATACCCTTATGCATATTCCATTATTGAGTGACCCCGTGTTTGTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12045 69 + 636262 CCTATTCCGACACCCCCATTTTAATACCCTTATGCATATTCCATTATTGAGTGACCCCGTGTTTGTCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 234364 69 - 647215 CCTATTTCCACACCCCCATTTTAATACCCTTAGGCATAATCTATTATGGGGGGACCCTATGATTGTCAT + +a +s mr.mrrefChr0 11133 66 + 130230 TGAACCCTTGGTAGGGGGACCCACAGTTCTTGAAAGTCTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12114 66 + 636262 TGAACCCTTGGTAGGGGGACCCACAGTTCTTGAAAGTCTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 234436 66 - 647215 TGACCCCATGGTGGGGGGACCCAGAGTTGCTGAAGGTTTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA + +a +s mr.mrrefChr0 11199 5 + 130230 TATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12180 5 + 636262 TATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 234506 5 - 647215 TATGC + +a +s mr.mrrefChr0 11204 116 + 130230 GAGGTGCTTCCTTGTTTGGATTGAATTGTTATCTATTTTCCTTTTCTGACATGATCTCCTTTCTTGTGTCTATCTTTTAGGACACTTATCTCAGTTGACTCCTAGGTAAATCCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12392 116 + 636262 GAGGTGCTTCCTTGTTTGGATTGAATTGTTATCTATTTTCCTTTTCTGACATGATCTCCTTTCTTGTGCCTATCTTCTAGGACACTTATCTCAGTTGAGTCCTAGGTAAATCCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 234511 116 - 647215 GAGATTCTTCCTTGTCAGGATCGATTTGTTACCTATTTTCCTCTCATCACCTGAGCTCCTTTTTTGTGTCTATCTTTTAGGACACTTATATCAGTTGACTCCTAGGTACCTCCCTT + +a +s mr.mrrefChr0 11320 92 + 130230 AGCACTTAGTGAAAAAATTACTCCTATATTTTGGCACTGGGCACCTACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATATGTGAGCAGGAGAAGTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12509 92 + 636262 AGCACTTAGGGAAAGAGTTACTCCTACATTTTGGCACTGGGCTCCTACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATATGTGAACAGGAGAAGTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 234627 92 - 647215 AGGACTTAGTGAAAAAATTACTCCTCTTTTTTGGCACTGGGCACCCACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATACGTGAGCAGGAGAGGTCTC + +a +s mr.mrrefChr0 11412 49 + 130230 TGGCTACTGATCCCGCTCCTACTTCTATCTCTCACCAAAACTCATTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12618 49 + 636262 TGACTACTGATCCCACTCCTACTTCTATCTCTCACCAAAACTCATTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 234719 49 - 647215 TGGTTACTGATCCTGCTCTTTCTTGTGTCTCTGACCAAAACTCATTGCA + +a +s mr.mrrefChr0 11461 142 + 130230 ACTCCTCCAAGTGATGTTATACAAATACGTTGTCTATTAATATATCCACACAAAGTTGTTATCCTAGCACTAATGCATGAGCTACACATGGGTGAGTACCATACACTGAAGGGTCATTAAACCATTGATAGCTTTTGGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12669 142 + 636262 ACTCCTCCAAGTGATGTTATACAAATATGTTGTCTATTAATATATCCACACAAAGTTGTTGTCCTAGCACTAATGCATGGGCTACACATGGGTGAGTACCATACTCTGAAGGGTCACTGAACCATTGATAACTTCTGGGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 234768 142 - 647215 ACTCCTCCAAATGATGTTGTAAAAATACGTGGTCTATTAATATATACACACGAAGTTGTTATCTTAGCACTAATGCATGAACTACACATGGGTGAGTACCATACACTGAAGGGTCATTAAACCATTGATAGCTTTTGGAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 11603 195 + 130230 GTCCTCAATGTGTTACAATGGCTTTTTATCCCTCTAAATTCAGAATTGGGTATGATATGAGTGAAGCTATTTTCAGATGGACCACTCTAATGTCCGATGGACCTCTCATTCATCAGTCATTCCTCCATCCTAAACAGAAGATAGCTTGTATTGATAAAGGACACTGGTACTCTTCACAACAGATTTTCAAACTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 12811 168 + 636262 GTCCTCAATGTGTTA--------------------AAATTCAGAATTGGGCATGATATGATTGAAGCTGTTTTCAGATGGACCACCCTAATGTCCGATGGACCTCTCATTCAT-------TCCTCCATCCCAAACAAAAGATAGGTTGTATTGATAAAGGACACTGGTACCTTGCACAACAGGTTTTCAAACTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 234917 187 - 647215 GTCCTCAATGTGTTACAATGGCTTTTTATCCCTCTAAATTCAGAATTGGGTATGATATGAGTGAAGCTATTTTTAGATGGACCACTCTACTATCCAATGGACCTCTCAGTCATCAGTCATTCCCCCCTCCTGAACAGAAGATATCTT--------AAAGGGCACTGGTACTCTTCACAACATACTTCCAAACTAA + +a +s mr.mrrefChr0 11798 42 + 130230 CTATGACTGGTTGGTCTCTGTTATTAATCATATACTAGAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13004 42 + 636262 CTATGACTGGTTGGTCTCGGTTGTTAATCATATACTAGAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 235104 41 - 647215 CGATGACTGGATGGTCTCTGTCAT-AATCAAATACTAGAGAC + +a +s mr.mrrefChr0 11840 169 + 130230 TAAGGCCATGTAACTTGATTCTTGTAGAGCTTAATATTCTCATCTGTATCCTGTCAAGCATTGAATGGCATTTACTGATAACCTATAATGTTGGTAATATGGAGATGGTAATAAAGAGTACAATGGACTGATAAAGATTAGTTAGTTTTGTATCTACAACCACCCTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13050 164 + 636262 TAAGGTCATATAACTTGATTCTTGTAGGGCTTAATATTCTCATCTGTATCCTGTCAAGCATTGAGTTGCATTTACTAATAACCTATAATGTTGGTAATATGGAGATGGTAATAGAGA-----ATGGACTGGCAAAGGTTAGTTAGTTTTGTATCCAAAACCACCCTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 235145 163 - 647215 TAAGGCCATGTGACTTGACTCTTGTAGAGCTTAATATTCTCACA---ATGCTGCCAAGCATTGAATGGCATTTACTGATAAGCTATAATGTTA--AATA-GGAGATGGTAATAAAGAGTACAATGGACTGATGAAGATTGGTTAGTTTTGTATCTGCAAGCGCCCTAAA + +a +s mr.mrrefChr0 12009 111 + 130230 TTGCTTTTCACAATTCTTTATCCTAATGGGCTTGGAGCACATGGCAAGAACCTTACAGCAATTTTTCAAGCTTGTTTCTATTCCTTGGTGTCCTTTCACTTCTAAACAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13214 97 + 636262 TTGCTT--CACAATTC------------AGCTTGGAGCACATCGCAAGAACCTCTCAGCAACTTTTCATGCTTGTTTCTATTCCTTGGTGTCCTTTCACTTCTAAACAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 235309 105 - 647215 TTGCTTTTCACAATTCTTTATCCTAATGGGCTTGGAGCACATGGCAAGGTCTTTACAGCGATTTTTGAAGCTTGTTTCTATTTCTTGGTATGCTTTCACTTTCAC------ + +a +s mr.mrrefChr0 12120 70 + 130230 TTCTGGAGCAAATCAAGGTACTCCAATAGACCATTGTCAACTACTCTACCAACTGCCAGATGAAGGACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13318 70 + 636262 TTCTGGAGCAAATCAAGGTACTCCAATAGACCATTGTCAACTACTCTATCAACTGCTAGATGAAGGACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 235414 68 - 647215 TTTTAAAAAAAATAAAGGTACTCCAATAAACCATTGTCAACTACTCAACCAACTGCCAGC--AAGAATCC + +a +s mr.mrrefChr0 12190 161 + 130230 AGGCCTAGCTTAGTCTCCAAAAGCGAATCCTTTTTTAGCCACAATTACCCTGTATGATGACTTAGGAGGCTCATACCTCCATCAGAAACTGGCTTCATTCCTCCATCAGAAAACAAGCCTTATAGGTCAACATACACTCATCATTAATTAGCCTTCTCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13388 140 + 636262 ---------------------AGCGAATCCTTTTTTTAACACAATTACCCTGTATGATGACTTAGGAGGCTCATACCTCCATCACAAACTGGCTTCATTCCTCCATTAGAAAACAAGCCTTATAGGTCAATATACAATCATCATTAATTAGCCTTCTCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 235514 149 - 647215 AGGCCTAGCTTAGTCTCCAAAAATGAATTCTCTTTTAGCCACAATTACCCTGTATGATGACTGAGGATGCTCATATCTCAATCAGACACTGGCTTCATTTCTCCATCAGAAAACAAGTCTTATAGGTCAACATACACTCATCAATAATT------------ + +a +s mr.mrrefChr0 12351 104 + 130230 AGCTCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTGGGCTCAAAGGCCAGGAGGCACCTTAGTCGTGACTGACTTTAGATACATGCTGTTAGAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13532 104 + 636262 AGCTCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTGGGCTCAAAGGCCAGGAGGCACCTTAGTCGTGACTGACTTTAGATACATGCTGTTAGAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 235663 104 - 647215 GGATCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTTGGCTGGAACGCTAGGGGAAACCCAAGTCATGACTGACTTTAGGTACATGCTGTTAGAAACT + +a +s mr.mrrefChr0 12455 19 + 130230 GTGTGAATTGTAATGAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13636 19 + 636262 GTGTGAATTGTAATGAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 235786 19 - 647215 GTGGGAATTGTAATGAAAG + +a +s mr.mrrefChr0 12474 50 + 130230 TAGGACTCATACTATCATTAGTAAAGACCTGTGATTAAAAGGCAGTTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13659 50 + 636262 TAGGACTCATACTATCATTAGTAAAGACCTGTGATTAAAAGGCAGTTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 235805 50 - 647215 TAGGACTCACACTGTCCTTAGTAAACACTCATGATTAAAAGGCAGTTATA + +a +s mr.mrrefChr0 12524 56 + 130230 CGCATGCCAAATGTTGGTCATTTGCACTGTTAGTGTGCACTGGATGCATGGTAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13709 56 + 636262 CGCATGCCAAATGTTGGTCATTTGCACTGTTAGTGTGCACTGGATGCATGGTAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 235859 56 - 647215 CTCATGCTAAACGTTGGTCATTTTCACTGATTCTATGCACTGGGTGCGTGGTAGGC + +a +s mr.mrrefChr0 12580 81 + 130230 TGCAGAGATGTACCATGCTTCAGAAATGGTTCAACTGCACCCAATGTTATCGTGGTCGTATGATGTCCAATACTTGAGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13765 81 + 636262 TGCAGAGATGTACCATGCTTCAGAAATGGTTCAACTGCACCCAATGTTATCGTGGTCGTATGATGTCCAATATTTGAGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 235916 81 - 647215 TGCAGGGATGTACCATGCTCCAGATCTGGCTCAACTACACCCAATGTTATTGTGGTCGTATAATGTCCAATACTTGAAGTT + +a +s mr.mrrefChr0 12661 28 + 130230 TGAATTATGAGTAGACTTTTGAAACGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13847 28 + 636262 TATATTATGAGTAGACTTTTGAAACGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 235997 28 - 647215 TGAATTATGAGTAGACTTTTGAAATGAG + +a +s mr.mrrefChr0 12689 136 + 130230 ATTATCCACAGGAGTCAGGTGTAGTCATGTTCCCCCTCTGTAGCATTTTACTCATTGAGTAGCTTAGCTTTTAAGATTTTAAGACTCCCTTGAAGTGGGCTGGAATTTGCAATGAAGATATATGGTGGTGAGTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13876 136 + 636262 ATTATCCACGGGAGTCAGGTGGAGTCATGTTCCCCCTCTGTAGCGTTTTAATCATTGAGTAGCTTAGCTTTTAAGCTTTTAAGACTCCCTTGAAGTGGGCTGGAATTTGCAATGAAGATATGTGGTGGTGAGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 236025 136 - 647215 ATTACCCACAGGAGTCAGGTGTATTGATGTTCCCCCTCTCAAGCATTTAACTCATTGAGCAGCTTAGCTTTTAAGATTTTAAAACCCCCTTGAAGTGGGCTGGAATTTGCAATGAAAACATATGGTGGTGATTCCA + +a +s mr.mrrefChr0 12825 76 + 130230 GAGCATATCTGTATTAGACTATGTATCACTGTACAGAAGAATGTAGCTTAGTTTGCAAAGGTTGTTAGATAGCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14039 76 + 636262 GAGCACATCTGTATTAGACTATGTACCACTGTACAGAAGAATGAAGCTTAGTTTGCAGAGGGTGTTCGATGGCCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 236161 72 - 647215 GAGCATATCTGTATTAGACTATGTATCACTGTGCAGGAGAATATA----AGTTTGCAAAGTTTGTTAGATAGCCGT + +a +s mr.mrrefChr0 12901 137 + 130230 AATGAAAGAATTATCATTACCACTTTCTTTCAGGAGGTATTTACTTTACATCATGAAGGTGACTTTTTCTCTGATACAGCCTTCTCATCCAGTGAAGCTGTCCACATGAGCTCTAATACCGGGTATATACATCAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14115 136 + 636262 AATGAAAGAATTATCATTACTACTTTCTTTCAGTAGGTATTTACTTTACATCATGAATGTGACTTTTCCTCTGATA-AGCCTTCTCATCCAGTGAAGCTGTCCACATGAGCTCTAATACCGGGTATATACATCAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 236237 117 - 647215 AATGAAAGAATTATCATAGCCACTTTCTTTCTGGAGGTATTTACTTTACATCATCAAGGTGGCTTCTTCTCTGACACAGTCTTCTCATCCAGTGTAGCTGTCAG--------------------GTATACATCAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 13038 14 + 130230 GTTGCACTAAAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14252 14 + 636262 GTTGCACCAAAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 236354 14 - 647215 GTTGCACTAAAGTT + +a +s mr.mrrefChr0 13052 201 + 130230 CATCGTATTGTGCCCATATATTTGAGGGTTGGCCTTGTCAATTCAGGGTTGCCCTGAGGATCACCACTAGGCCACTCACTGGCTTACTATCATTGAGCATTGCTGCCTTTGATGTCTTATGTCTTCGATGGATGTTACAGCTGCAGGTGCACCCCACAAACGCTAGATTGTGGGCGAAATCACTACTCAACAGAAGTGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14266 201 + 636262 CATCGTATTGTGCCCATATATTTGAGGGTTGGCCTTGTCAATTCAGGGTTGCCCTCAGGATCACCACTAGGCCACTCACTGGATTACTATCATTGAGCATTGCTGCCTTTGATGTCTTATGTCTTTGATGGATGTTACAGCTGCAGGTGCACCCCACAAATGCTAGATTGTGGGTGGAGTCACTACTCAACAGAAGTGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 236369 200 - 647215 TACCATATTGTGCCT-TGTATGTGCAGGTTGGGCTTGTTAATTCAGGGTTGCCATGAGGATCACCACTAGGCCACTCGCTGGCTTACTATCATGGAGCATTGCTCCCTTTGATGTCTCATGTCTTCGATGAATGTTATAGCTGCAGGTGCACCCCATAAACACTAGATTGTGGGCGACATCACTACTCAACAGAAGTGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 13253 132 + 130230 TAGCACTGGACCACAGAGATTGCCTCCAATTCTCCTACAGCAGAACCTGGTGCATGAACATGTCTTGTTGTCTGCTGACCTCTCTACAGTCATTGACCATGGTTTGGCATCTGGAGAAGTTACCTTGCCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14467 125 + 636262 TAGCATTGGACCACAGAGATCGCCTCCAATTCTCC---AGCAGAACCTGGTGCATGAACATG----GTTGTCTGCTGACCTCTCTACAGTCATTGACCATGGTTTGGCATCTGGAGAAGTTACCTTGCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 236571 132 - 647215 TGGCACCAGACCACAGTGATTGCCTCCAATTCTCCTACAACAGACCCTGCGGCATGAACATGTCTTGTTGTCTGCTGACCTCTCTACAGTCATGGACCATGCTTTGGCATCTTGATAGGTTACCTTGCCAGC + +a +s mr.mrrefChr0 13385 465 + 130230 AAAACCCTAACTTGTAATAGTCAAATCCTCCAACCATTGGTAACCTGTATTTTCTTAAAACACTACAAACTGACCACACAGGTTGAATTAATACCTATTACAATTAAGGATGTTGTTCCTACTCTACTTTATGTTTGGCCATTCACAATCACAGCTCAAACTATGAATGACACAAGTAAATGATATAGAGATATTTAGTCCGATGAGTTCTAAGTCACTAGTTTGAGCTGTAGGTAGTAGAAGAGTGCTATTTCAATTCTATGTTCTACAATTTAAGAAGCTAGCAGAATGTAACACGACCTGCATAGGATAACCCTCCAGAGGCCCCCTGATAGATAGTTAAGGTAGGTACAATGTCATGATTACTAACCACTTTGTTATCCAGATAAGAAAACGGACTCTATGGGTAGTGATTAAGCTATTCTAATATTAAGTCCTATATTATGACCCTAATGGGTACTATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 14599 460 + 636262 AAAACCCTTACTTGTAATAGTCA--TCCGCCAACCATTGGTAACTTGTATTTTCTTAAAACACTACAAACTGACCACACAGATTGAATTAATACCTATGG-AATTAAGGATGTTGTCCCTACTCTACTTTATGTTCGGCCATTCACAATCACAGCTCAAACACTGAATGACACAAGGAAATGATATAGAGATATTTAGTCCGATGAGTTCTAAGTCACTAGTTTGAGCTGTAGGGAGTAGAAGAGTGCTATTTCAATTCTATGTTCTATAATTTAGGAAGCTAGCAGAATGTAACACAACCTGCATAGGATAACCCTTTAGAGGCTCCCTGATAGATAGTTAAGGTAGGTACAATGTCATGACTACTAAACACTTTGTTATCCAGATAAGAAAAC--ACTCTATGGGTAGTGATTAAGCTATTCTAATATTAAGTCCAATATTATGACCCTAATGGGTACTATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 236703 465 - 647215 AAATCCCAAACTTGTAATACTCAAATCCTCCAGCCATTGATAACCTGTATTGTTTTAAACTACTACGAGCTGACCACACAGGTCAAATTAATACCTATTACAATTCAGGATGTTGTTCCAACTCTACTTTATGTCTGGCCATTCACAATCACTGTTCAAATTATGAATGACACAAGTAAATGATATACAGAAATTTAGTCCGATGTGTTCTAAGTCACTAGTTTGAGCTGTAGGTAGTAGAAGTGTGGTATTTCAATTCAATGTTCTACAATTCAAAAAGCTAGCAGAATGTAACACGACCTGCATAGGATAACCCTCCAGAGGCCCCCTGATATATAGTTAAGGTAAGTACAATGTCATGATTACTAACCATTTTGTTATCCAGATAAAAATACGGCCTCTATGGGTAGTGATTAAGCTATTCTAATATTAAATCCTACATTATGACCCTAATGGGTACTGTGT + +a +s mr.mrrefChr0 13850 20 + 130230 AAAACCATCCATGCTCGATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15118 20 + 636262 AACACCACCCATGCTGGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 237168 20 - 647215 ACAACCATCCATGCTCCATC + +a +s mr.mrrefChr0 13870 38 + 130230 CTACCATATACAAAAGGCTGTCGATACTTTCCAGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15142 38 + 636262 CTACCATATATGAGAGGCTGGCGAAACTTTCCAACCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 237188 38 - 647215 CTACCATATGCAAAAGGCTGTCGATACATTCTAGCCAC + +a +s mr.mrrefChr0 13908 90 + 130230 TCAGGGAATTGCTAAGGATAGACTAGTCAAGCTGCTGTACCAGTCCGGGTCAGATGTGGTGACCAACATCATTATCCCATGCATAGCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15186 90 + 636262 TCAGGGAATTGCTAAGGATAGACTAGTTAAGCTGCTGCACCAGCCCGGGTCAGATGTTGTGACCAACATCATTATCCCGTGCATAACCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 237226 90 - 647215 TCAGGCAATTGCTAAGGTTAGACTAGTCAAGCTGCTGTACCAGTTGAGGTCAGATGTGGTGACCAACATCATTATCCCATGAATAGCCAT + +a +s mr.mrrefChr0 13998 130 + 130230 CTATGGGGGAGTAAATTCAACTTATAGGACTTGATACATATTAGGACTGTCTTATGTAATGCTACTTAGGACTTTGTGCTAGTTGGCTGAAAGTTGAAACAGATTGGCAACTTACCCCCACACAGTAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15276 130 + 636262 CTATGGGGGAGTAAATTCAACTTATAGGACCTGATACATGTTAGGACTGTCTTATGTAATGCTACTTGGGACTTTGTGCTAGTTGGCAGACAGTTGAAACAGATTGGCAACTTACCTCCACACAGTAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 237354 130 - 647215 CTGTGGGGGAGTAAATTCAACTTATAGCATTTGATACATATTAGGACTGTCTTATGTAATGCTACTTAAGACTTTGCGCTAGTTGGCTGAAAGTTGAAGCAGATTGCCAGCTTATCCCCTAGCAGTAATA + +a +s mr.mrrefChr0 14128 21 + 130230 GTATATGTGATGCAAGACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15406 19 + 636262 GTATATGTGAT--AAGACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 237489 21 - 647215 GTATATGTGATGCTAGACATT + +a +s mr.mrrefChr0 14149 167 + 130230 CTTTTGTTCTACTTCCACCAGCCGCTTCAGACATTAAGTGGGCAGGCACGTTCTAGACTCAAAACAGGTGCCTGACATCACTTGACAGTGTGTGAATTGGACCCTGACAAACCTCTTGTGTGAGACAGACAGGCTCTGTGGTTGCTTGACATCTTGTCAAGCCGGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15425 167 + 636262 CTTTTGTTCTACTTCCATCAGCCGCTTCAGCCATTAAGTGGGCAGGCACGTTCTAGACTCAAAACAGGTGCCTGACATCACTTGACAGTGTGTGAATTGGACCCTGACAAACCTCTTGTGTGAGACAGACAGGCTCTGTGGTTGCTTGACATCTTGTCAAGCCGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 237515 167 - 647215 TGTTTGTTCTACTTCCACCGGCAGTTTTAGAGATTAAATGGACAGGCTCATTCTAGCCTCAAAATAGGTGCCTGTCATCACTTGACAGTGCGTGTATCAGGCCCTGACAAAACTCTTGTGTGAGCCGAACAGACTCTGTGACTGCTTGACATCTCGTCAAGCCGGGC + +a +s mr.mrrefChr0 14316 33 + 130230 AGGCTCATAGCAAGGCACTAACCATGTGTACGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15592 33 + 636262 AGGCTCATAGCAAGGCACTAACCATGTGTACGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 237683 33 - 647215 AGGCTCATAGCCATACACTAACCATGTGAACAC + +a +s mr.mrrefChr0 14349 95 + 130230 AGCACTAACCATGTGTACATAGCCGCATTTGCCTTTTTTTGGAGCTTTGCACGAGGCACTATGAGAAATCTAAACAACGTTAAGGTACTCTCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15651 95 + 636262 AGCACTAACCATGTGTACATAGCCGCATTTGCCTTTTTTTGGAGCTTTGCACGAGGCACTATGAGAAATCTAAACAACGTTAAGGTACTCTCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 237716 95 - 647215 GGCACTAATCATGTGTATGTGGCTGCATTTGCCTTTTTTTGGAGCCTTGCATGAGGCACTGTGCGAAATCTAAACAATGTTAAGCTACTCTCTAC + +a +s mr.mrrefChr0 14444 147 + 130230 ATCTCTTCAGATTCTATAAGTGACACTAATAAAAGTTGTTGTCGCTGTTTTCATAAAACGCGCATCAGGCACATCATGAAGACCTGAAAACTTTGGAAATGTGACTTTGGGGTAGTTTGGTGTAGTTTTTGTCAGATTCCATGCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15747 147 + 636262 ATCTCTTCAGATTCTATAAGTAACACTAATAAAAGTTGTTGTCGCTGTTTTCATAAAACGCGCATCAGGCACATCATGAAGACCTGAAAACTTTGGAAATGTGACTTTGGGGTAGTTTGGTGTAGTTTTTGTCAGATTCCATGCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 237811 147 - 647215 ATCTGTTTAGATTTTATTAGTGACATTAATATAAGTTGTTGTCAGTGTTTTCATATGACTAAAATAAGCCACATCATGAAGAAGTGAAAATTTTGGAAATGTAATTTTGGGGTAGTGTGGTGTAGTCTTTGCCAGCTTGTACCCATA + +a +s mr.mrrefChr0 14591 29 + 130230 CTAGGCAGGCAACACATGACCAGTAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15896 29 + 636262 CTAGGCAGGCAACACATGACCAGTAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 237958 29 - 647215 CTACGCTGGCAATAAGTAACTATTTAACT + +a +s mr.mrrefChr0 14620 96 + 130230 TTTTCTACTTCTGGACTGCACCACATATTCTATTCATTCCAGTCCCTTGCTCTTTCATGGATACAAATTTAATCTCACCAACACATGTTGGGTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 15927 96 + 636262 TTTTCTACTTCTGGACTGCACCACATATTCTATTCATTCCAGTCCCTTGCTCTTTCATGGATACAAATTTAATCTCACCAACACATGTTGGGTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 237987 96 - 647215 TTTTCTCCTTTTGGACTGTGACACATATCCTGTCCATTCCAGTCCCTTGCTCTTTCACGGCTACAAATTTAATCTCACTAACACATGTTGGGTAGG + +a +s mr.mrrefChr0 14716 9 + 130230 CAAAGTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16076 9 + 636262 CAAAGTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 238083 9 - 647215 CAAAGTCAC + +a +s mr.mrrefChr0 14725 14 + 130230 TGAAATGGGCATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16086 14 + 636262 TGGAAAGGGCCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 238092 14 - 647215 TGAAATGGGCATCG + +a +s mr.mrrefChr0 14739 69 + 130230 TTGAGTCATCTTAGTCACCTTGCAGATGGGGCTTACACGCGAACCAGACAAATCAATTGGCTTGTGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16114 49 + 636262 TTGAGTCATCTTAGTCAC---------------TACCC-----CCAGACAAACCTATTGGCTTGTGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 238106 69 - 647215 TTGAGTCACCTTAGACACCTTGCAGATGGGGCTTACACGCGAACCATACAAATCAATAAGTTTGTCTGG + +a +s mr.mrrefChr0 14808 51 + 130230 GCGGGGTGACTAGGGTGCCCCAATCAATGTCAAGGATCAATGCCCTTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16183 37 + 636262 GCAAGGTGTCTAGGGTGACTCAAT--------------GATGCCCATTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 238175 51 - 647215 GGGGTGTGACTAAGGTGCCCCAATCAATGTCAAGGATCAAAGCCCTTTCCA + +a +s mr.mrrefChr0 14859 45 + 130230 GTGACTTTGTAATAGTCGTGAGTAGTATAGAGCACTGCTTGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16220 31 + 636262 GTGACTTTGCC--------------TATAGAGCACTGCTTGATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 238227 45 - 647215 ATGACTTTGTAATAGTCGTGAGTAGTATGGTTCAGGCCTTGCCAC + +a +s mr.mrrefChr0 14904 391 + 130230 AAACACATGATAGAAAGGGTTGACAGGGCTAAAGTGTTGGGTAAAAAGTGACAAGGCCTGGAAGCATACTTATTTCAGACTGCAGCTTCATGTCCAATTTGTGGGCCTAATAACTGCTAAAGAATTCCACAAGAATAGTGTTTAATATATTAACCATTAACCACTTGAAACAGACTACATTGTCTTGGAGGACGTGTCTTTTCACTGAGAGGTTGTTCATTTTTTGGAGGGTTTAATAGGCAAGTAGGTGAATCCATCTCTGATCTAAACAAAATAAGACACTGTATTCTACATTAGAGTGTCATTCACTAATTCACTGATGGATCAGGGCCCAGCACACAAATTGGGAAATTCGCAGTACTTTACTGTAGTGTGGCAGTGCCACCATTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16251 391 + 636262 AAACACATGATAGAAAGGGTTGACAGGGCTAAAGTGTTGGGTAAAAAGTGACAAGGCCTGGAAGCATACTTATTTCAGACTGCAGCTTCATGTTCAATTGCTGGGCCTAATAACTGCTAAAGTATTCCACAAGAATGATGTTTAATATATTAGCCATTAACCACTTGAAACAGACTACATTGTCTTGGAGGATGTGTCTTTTCACTGAGAGGTTGTTCATTTTTTGGAGGGTCTAATAGGCAAGTAGGCGAATCCATCTCTGATGTAAACAAAATAAGACACTGTATTCTACATTAGGGTGTCATTCACTAATTCACTGATGGATCAGGGCCCAGCCCACAAGTTGGGAAATTCGCAGTACTTTACTGTAGTGTGGCATCACCACCATTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 238291 384 - 647215 AAACACATGACAGAAAAAATTGACAGGGCTAAAGTGTTGGGTAAAAAGGGACAAAGCCTGGAAGCATACTTATTTCACACTGCAGCTTCATGGCTGATTTGTGGGCCTAATAGCTCCTAAAGAATTCCACAAGAATAGTGTTTAATATATTAACCATTATCCACTTGAAACAGACTACATTGCCTTAAAGGACGTGTCTTCCCACTGAGAGGTTGTTCATTTTTTGGAGGGTTTAATTGGCAAATAGATGAGTCCATATCTGAGCTAAACAAAATAAGGCACTGTTTTCTACATTACAGGCTCATTCATTAAGTCACTGACGGATCAGGGCCCAGCACACAAATTCGGAAATTAGC-------TACCGTAGTGTGGCAGTGCCACCATATT + +a +s mr.mrrefChr0 15295 126 + 130230 GATCTAACTAGAACTGTTTAACAGAATAGATAGTAAGCAAAAGTAGCTAAGGGTCTTGCAACTCAGATGAACATATTCTGGCAAGAACTATGGCAAGCAAGATACTATAGGAGTCAAGCAATTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16642 126 + 636262 GATCTAACTAGAACTGTTTAACAGAATAGATAGTAAGCAAAAGTAGCTAAGGGTCTTGCAACTCAGATGAACATATTCTGGCAAGAACTATGGCAAGCAAGATACTATAGGAGTCAAGCAATTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 238682 126 - 647215 GATCTAGCTAGAACTGTTTCAAAGACCAGATAGTGAGCAAAAGTAGCTAAGGGTCTTGCACCTCAGATGGACATATTCAGGCAGGAACTATGGTATTCAAGCTACTATAGGAGTCAAGCAATTACA + +a +s mr.mrrefChr0 15421 54 + 130230 ATCCCAGTTAGGAATTAGCCTAACTTATGGATGAAAATATGAAGGGGTGTAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16768 54 + 636262 ATCCCAGTTAGGAATTAGCCTAACTTATGGATGAAAATATGAAGGGGTGTAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 238812 54 - 647215 ATCCCAGTTAGGAATTAACCTAACTTGTGGATGAAAATATGAAGGGGTGTTAGG + +a +s mr.mrrefChr0 15475 3 + 130230 CTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 238876 3 - 647215 CTA + +a +s mr.mrrefChr0 15478 93 + 130230 GCCAGATGGGAGAAGGTAGAGATGAGAACCTCTCCTTTAGAGAAGTAATTAATGCACTACATGGAGGAACTTGTCACATCACCCAGAATGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16822 84 + 636262 ---------GAGAAGGTGGAGATGAGAGCCTCTCCTTTAGAGAAGTAATTAATGCACTACATGGAGGAACTTGTCACATCATCATGAGTGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 238880 92 - 647215 GCCAGATGGGAGAAGGTAGAGATGCGAACCTCTCC-TTAGATAAGTAATTACTGCACTACATGGAGGAACTTATCACATCACCCAAAACGGAA + +a +s mr.mrrefChr0 15571 90 + 130230 AATATCTTGAGTGAGAGTAGTGAATCAAGCAGGGTGAGGAACCTGCGTTGCTGAAACTACATTAGTACCTTGACCTAGGAGATTGGTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 16910 90 + 636262 AATATCTTAAGTGAGAGTAGTGAATCAAGCAGGGTGAGGAGCCTGCGTTGCTGAAATTACATGAATACCTTGACCTAGGAGATTGGTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 238972 90 - 647215 AATATCTTGAGTGTGAGTAGTGAATTAAGCAGGGTGAGGAACCTGTGTTGCTGAAACTACACTAGCACCTTCACCTGTGGGATTGGTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 15661 54 + 130230 CTAATTGATCAACTTAGACACATTTAGCAGAGTGTCCTATTCGTGGAAATGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17000 54 + 636262 CTAATTGATCAACTTAGACACATTTAGCAAAGTGTCCTATTCGTGGAAATGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 239064 54 - 647215 CTAATTGATCAACTTAAACACATTCAGCAGAGTGTCCTACTCATGGAAATAAGT + +a +s mr.mrrefChr0 15715 253 + 130230 GACTCAATTTGACCTACTCATGTAAATGGCTCGAAATAGCTTAAGGCTAGGATTTGTATTGTCCCAAGGCCTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGCATCAATCTACAACTGTGCCTGTGTTTAGATCACACTCTAGCACTAGAAGCAAAGTGCCATTTTCTAGAAATTTCTGGGATCAGAACTATTAAAAAGTGAAGATTTACATGCTAGCTACCACTAGGGGCCACCAGGACTGCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17055 253 + 636262 GGCTCAATTTGAGCTACTCATGTAAATGGCTCGAAATAGATTAAGGCCAAGATTTGTATTGTCCCAATAACTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGCATCAATCTACAACTGTGCCAGTGTTTAGATCACACTCTAGCACTAGAAGCAAAGTGCCATTTTCTTGAAATTTCTGGGACCAGAACTATTAAAAAGTGAAGATTTACATGGTAACTACCACTAGGGGCCACCAAGACTGCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 239118 253 - 647215 GACACAATTTGACCTACTCATGGAAATGGCTCGAAATAGCTTAAGGTTAGGATTTGTGTTGTCCCAAGGCCTTATAAAGTATTCATGCAACAAGAACAGGATTTGCTAGAATCAGCCTACAGCTGTACCTGGGGTTAGATCACACTATAGCACTGGAAGCAAAGTGCCATTTTCTAGAAATTTTTGGGATCGGAACTATTAAAATGTGAAGATTTACAAGCTAGCTACCAGTGAGGACCACCAGGATTGCAGG + +a +s mr.mrrefChr0 15968 229 + 130230 CTCTTTCACCCTGGACTCATGCCCTAAATATTATAAATCTAAGCCATAAAATAACCTCTGAGGACAGCTTATAGCTGGATACCTGTTGTGGCATTATGTGGAGCAGGTGGAGGTTACAAGCATCCTCAATTCTCAGGCTCTGACACCATATCCCTCCCCCTACCCCTAGCTTAGACATTCTATTCAAACAGGCACTTGGTAAGCTTTGGTGAATCAACACAGATTGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17308 229 + 636262 CTCTTTCACCCTGGACGCATGCCCTAAATATTATAAATCAAAGCCATAAAATGACCCCTGAGGACAGCTTATAGCTGGACACCTGTTGTACCATTATGTGGAGCAGGTGGAGGTTACAAGCATATTCAATTCTCAGGCTCTGACACCATATCCCTCCCCCTACCCCTAGCTTAGACATTCTATTCAAACAGGCACTTGGTAAGCTCTGGTGAATCAACACAGATTGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 239379 228 - 647215 CTTTTTCACCTTGGACTTATGCCCTAAATA-TATAAATCTAAGCCATAAAATAATCTAAGAGTACAGCTTAGAGCTGGATACCTGTTGTGGCAACGTGTGGAGCAGGTGGAGGTTACAAGCATCCTCAATTCTCAGGCACTGATAACACATCCCTTCCCCTACCCCTAGCTTAGACATTCTACTCAAACAGGCACTTGGAAAGCTTTGGTAAATCAACACAGATTACTT + +a +s mr.mrrefChr0 16197 208 + 130230 AGATGACTAAGAGTTAAATGAAGGGGTTCCCACCTTGTTGTTGTATATGATAGTTGATATTGGGCTCTGATTCAGAACTCCTCATTCATAAGGTATGGGATCTTACTCACAGCAAGCACAACTTCTGGACTACTTATGAGGGTTGAGTACTGATGTGATAGAGAATCATGGTGAAAAGTAGCAAACCAGGCTTAACCTTAAATCCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17541 207 + 636262 AGATGACTTATGATTAACTGAAGGGGTTCTCACCCTGTTGTTGTATATGATAGTTGATATTGGGCTCTGATTGAGGACTCAACATTCATAAGGTATTGGATCATACTCACAGCAAGCATGACTTCTGGACTACTTATG-GGGTTGAGTACTGATGTGATAGAGAATCATGGTGAAAAGTAGCAAACCAGGCTTACCCTTAAATCCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 239607 206 - 647215 --ATGAATAGGAGTTAAATGAAGGGGTTTCCACCTTATTGTTGTATATGATAGTTGATATTGGGCTCTGATTCGGAACTGCTCATTCATACGGTATGGGATCTTACTCACAGCAAGCACAACCTCTGGGCTACTTATGAGGGTTGAGTACTGATGTGATAGAGAATCATGGTGAAAAGTTGCAAACCAGGCTTAACCTTAAATCCATA + +a +s mr.mrrefChr0 16405 111 + 130230 GAAAAGTTTGATGTGTACAAGTCACGCCCTTCACGCCATTAGTGAACTCATGGATAACAGCAATCACACAGCTGTCGGTCTTTCCATAGTAGAAAGCCAAGGAGGGTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17754 111 + 636262 GAAAAGTCTGATGTGCACAAGCCACGCCCTTCACGCCATTATTGGATTCATGGATAACAGCAATTGCACAGCTGCCGGTCTTTCCATGGTAGCAAGCCAAGGAGGGTAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 239813 111 - 647215 GAAAAGTTTGATGTGTACAGGTCACACCCTTGACATCATTAGTGAACTCATGGATAACATCAATCACACAGCTGTCGGTCTTTCCATAGTAGAAAGCCAAGGAGGGTAACT + +a +s mr.mrrefChr0 16516 118 + 130230 CTATAAGCTGGGAGAGCCTGTTACCCCTAACAAGTAGAATTGTAATTCATTAAAATTAAGTATAATGAAGGGTAAAGTGTAATGAGGTGTATGCTGTTGCTATGTGCAATAGCGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17868 117 + 636262 CTATAAGCTGGGAGAGCCTGTTACCCCTAA-AAGTGGAATTGTAAAATGTTAAGATTAAGTATAGCAAAGGGTAAAGTGTAATGAGGTGTGTGCTGTTGCTATGTGCAATATCAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 239924 118 - 647215 CTATAAGCTGGGATAGCCTGTTACCCCGAACAAGTAGAACTGTAATTCATTAAAATTAAGTATAATGAAGGGTAACATGTAATGAAGCGTATGCTGTTGCTATGTGCATTAGTGGAAA + +a +s mr.mrrefChr0 16634 46 + 130230 CATCAAGGGAGTTTCTGTCATGAATTAGTGAACCTGAACACAAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 17986 46 + 636262 CATCGAGGGTATGTCTGTCATGAATTAGTGAACCTGAACACACGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 240042 46 - 647215 CATCAAGGGAGTTTCTGTCATGAATTAGTGAACCTGAACACAAGCC + +a +s mr.mrrefChr0 16680 82 + 130230 TTAAGTTTAATACTATGATTATGGTATGCTGACTCAATTGCAATTGGGGTAAGATTAAGGCCAGGTCAGGGTAAATTACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18033 82 + 636262 TTAAGTTTAATACTGTGATTATGGTATGCTGACTCAATTCCAATTGGGGTAAAATAAAGCCCAGATCAGGGTGAATTACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 240088 82 - 647215 TTAAATAGAATACCATGATGATTGTATGCTGACTCAATTGCAATTGGGGTATGATTAAGGCCAGGTCAGGGTAAATTGCAAC + +a +s mr.mrrefChr0 16762 95 + 130230 ACTAAACACACACTATTTCCATGTGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGTCACCCTGTTGTCCGTAGTGCATGAATTGATACAGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18115 95 + 636262 ACTAAACACACAGCATTTCCATGCGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGTCATCCTGTTGTCCGTAGTGCATGAATTGATACAGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 240174 71 - 647215 ACTAACCACACACTATTTCTATGTGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGCCACCCTGTTGTCA------------------------ + +a +s mr.mrrefChr0 16857 165 + 130230 TTTGAGTAACCGAACCCCTATAATAGCAGTTATACAGCACAATATTGAATGTGCTGAATATGCTCTTTTACCCTAATGACATGAACCTCTGTTCATTCTTGAATTTGGTGGGACTATTAATCTTGATGTTGTGTGTTTATGTCATCCCATGGTAAATGACAAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18211 164 + 636262 TTTGAATAACCGAACCCCTATAATAGCAGTTATACAGCACAATATTGAATGTGGTTAATATGCTCTTTTACCCTAATGACTTGAACCTCTGTTCATTCTTGAA-TTGGTGGAACTATTAATCTAGATGTTGTGTGTTTATGTCATCCCAAGGTAAATGACAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 240245 165 - 647215 TTTGAGTAACCGAACCCCTGTAATAGCAGTTACACTGCACAATATTCAAGATGCTGAATATTGTCTTTTTCCCTAACGCCATGAACCTCTGTTTATTCTTGAATTTGGTGGGACTATAAATCTTGATGTTGTGTGTTTATGTCATCCCGTGGTAAATGACAAGAC + +a +s mr.mrrefChr0 17022 195 + 130230 CCAAGGAGGTAGAAGCCAATACCTCTCCCCAGACGACCCCTAGTCTTTAGATCCATTCAGTGTTTAAAATCTAATAACATTGTGTCTGCAGGATCCATATATGCCTCTAATGCACCTGCTATAGAACTGTACAATGTGGTGTGATGATAAGTTGAATCTGGAGTCTTGCTAATGGAGAGCCAGATAGCTCAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18375 193 + 636262 CAAAGGAG--AGAGGCCAATACCTGTCCCAAGACAACCCTTAGCCTTTAGATCCATTCAGTGTTTAAAATCTAATAACATTGTGTCTGCAGAATCCATATATGCCTCTAATGTCCCTGCTATAGAACTGTACAATGTGTTGTGATGATAGGTTGAAACTGGGGTCTTGCTGATGGAGAGCCATATAGCCCAGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 240415 194 - 647215 CCAAGGAGGTAGAAGCCAAAACCTCTCCCCAGGCGACACCAAGTCTTTGGATTCATTCAGTGTTTAAAATCTTATAACATTGGGTCTGCAAGATCCATACA-GCCTCTAATGCACATGCTTTAGAACTGTACCATGTGGTGTGATGATAAGTTGAATCTGGAGTCTTGCTAATGGAGAGCCGGATAGCTCAGTAG + +a +s mr.mrrefChr0 17217 100 + 130230 CATTTGTCCAAAGGCAAGATCATTGTTGGTTTTTCCCTAACTGTTGCATAACAGTAATCAAATGTCTTTGAAACCAATATAATTTTTGATAACCTTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18568 100 + 636262 CAATTGTCCAAAGGCAAGATCATTGTTGGTTTTTCCCTAACTGTTGCCTAACGGTAATCAAATGTCTTTGAAACCAGTGTAACCTTCGATAACCTTGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 240614 100 - 647215 GATTTGTCCAAAGGCAAGATCATTTTTGGTTTTTCCCTAACTGTTGCATAACAACAATCAAATGTCTTTGAGATGAATATAATTTTTGATAACCTTAACT + +a +s mr.mrrefChr0 17317 33 + 130230 GATGCTCTAATGCTCTGGATTGCCTGATAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18668 33 + 636262 GATGCTCTAATGCTCTGGGTTGCCTGATAGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 240716 33 - 647215 GATGCTCTAATGCTCTGGATTGCCTGATAGCAA + +a +s mr.mrrefChr0 17350 139 + 130230 TAACAAGGTAGTTGGTGCTACATCTTTAAGCAATAGCTCACACAAGCAAACAAGATAATGCACAGCCACGTATTTGCACTGACCAGCATCAACTATGTGATGGACCCGCCATAATGGGGCAGCATTATTCAGTCCAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18702 138 + 636262 TAACAAGCTAGTTGGTGCTACATCTTTAAACAATAGCTCACACAAGCAAACTAGACAATGCACAGCCACATATTTGCACTGATCAGGATCAACTATGTGATGGACCCGCCATCATGGAGCAGCATTATTCAGTCCAGG- +s simRat_chr6.simRat.chr6 240749 139 - 647215 TAGCGAGGCAGTTGGTGCTACATCTTACAGCAATACCTCACACAAACAAACAAGATAATGCACAGTCCTGTATTTGGACAGACCAGCATCAGCTATGTGATGGACCCGTCACAATGGGGCAGTGTTATTCAGACCAGGT + +a +s mr.mrrefChr0 17489 18 + 130230 TAACATTGATGAGGCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18840 18 + 636262 TAACATTGATGAGGCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 11458 10 + 647215 TAATATTGAC-------- + +a +s mr.mrrefChr0 17507 189 + 130230 CTCCCAAACCCAGCGGCAGCGCATGTTGACAGCCCAACTATAGTTCTATTATACTTATTTATAGTTGTATACATATCAAGTATATTCATTATCCCAAACTACAATTCCCCTACTTTTGTTGTAAAAGTTGATTTTCTTCCCCCTGATGGGAGGATCTTTTGGCTCTTTTTTAGCTGCTGTGTACCAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 18861 189 + 636262 CTCCCAAACCCAGCGGCAGCGCATGTTGACAGCCCAACTATAGTTCTATTATACTTATTTATAGTTGTATACATATCAAGTATATTCATTATCCCAAACTACAATTCCCCTACTTTTGTTGTAAAAGTTGATTTTCTTCCCCCTGATGGGAGGATCTTTTGGCTCTTTTTTAGCTGCTGTGTACCAACT + +a +s mr.mrrefChr0 17696 162 + 130230 ATGTAATTGAGTATACATTCCGAACTGCCTAATGTGCCTGCAATCTATCAGTAGTGAAGCCTTGCCCATGCCTGAGGTAGCTCACAGGTCAGAGGAATATGCCCAGCACTTTAGGACATTATAGGATTCCCCAGCAAATCAACAATCATCCACTGGTGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19051 162 + 636262 ATGTAATTGAGTATACATTCCGAACTGCCTAATGTGCCTGCAATCTATCAGTAGTGAAGCCTTGCCCATGCCTGAGGTAGCTCACAGGTCAGAGGAATATGCCCAGCACTTTAGGACATTATAGGATTCCCCAGCAAATCAACAATCATCCACTGGTGGACT + +a +s mr.mrrefChr0 17858 21 + 130230 CTACAGAGAGAATTATGTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19352 21 + 636262 CTACAGAGAGAATTATGTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 11468 11 + 647215 ----------ACATATGTTCA + +a +s mr.mrrefChr0 17879 13 + 130230 GTACTTAGTGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19373 13 + 636262 GTACTTAGTGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 11482 13 + 647215 GTACCAGCTGCAC + +a +s mr.mrrefChr0 17892 9 + 130230 TGCCACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19391 9 + 636262 TGCCATTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 11495 9 + 647215 TGCCACCTT + +a +s mr.mrrefChr0 17901 178 + 130230 ACTTAGGCTTGATGAGGAAGTCCTTTAATTCCTGGTGTGTCCCTCTTTCACTACCTCAGCTCTTCTGTCGTCTGCCAGACAGACTTTTTATGCTGAGTATAATGACTCATCAAGCCTGGCAATACTCACTGTTTTTTTGACTTGTTTTCAATGTAAGTTTCAGGTGCTCTGTTAGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19400 178 + 636262 ATATAGACTTGAGGAGGAAGTCCTTTGATCCCTGGTGTGTCCCTCTTTCACTACCTCAGCTCTTCTGTCATCTGCCAGACAGACTTTTTATGCTGAGTATAATGACTCGTCAAGCCTGGCAATACTCACTGTTTTTTTGACTTGTTTTCAATGTAAGTTTCAGGTGCTCCATTAGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 11511 178 + 647215 ACTCAGGGCTAATGAGGAAGTCCTTTAATTCACCGTCTATCTCTCTTTCACTACCTCAGCTCTTCTGCCGTCTGCCACAGAGACTTTTTATGCTGAGTATAATGACACATCAAGCCTGGCAATACTCACTGTTTTTTTGACCTGTTTTCAATGTAAGTTTCAGGTCCTCTGTTAGAAG + +a +s mr.mrrefChr0 18079 91 + 130230 GACACTGTAATCCCTCTTAGGTAAGCCATGCTAGTGTAATTAATCAAGCTACGAGGCATAGACCCTATAGAATTGCTGCTTCATTACCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19581 91 + 636262 GACACTGTAATCCCTTTTAGGTAAGCTATGCTAGTGTAATTAATCAAGCTACGAGGCATAGACCCTATGGAATTGCTGCTTCATTACCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 11689 91 + 647215 GACACTGTGGTCCCTCTTTGGTAAGTCATGTTCGTATGATTAATCAAGCTACGAGGCCTAGACCCTACAGAATTGCTGCTTCATTACCATC + +a +s mr.mrrefChr0 18170 136 + 130230 TATTATGATTTATGCTAGGTGAAGAGTTGTAATGTTAACTTAGTTCTGAGCCTTAAGATAAAGACTTGCTCCACTATAGTACATGATAGAGTGACATAACTCAATTGGGGGCGGTAAGGACTTAGTCATCCATATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19678 128 + 636262 TATTATGATTTATGCTAGGTGAAGAGT------GTTGACTTAGTT--GAGCCTTAAGATAAAGACTTGCTCCACTATAGTACATGATAGAGTGACATAACTCAATTGGGGGCAGTAAGGACTCGGTCATCCATATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 11780 135 + 647215 TATTATGATT-ATGCTAGTTGAGGAGTTGTAATGGTAACTTAGTTCTGAACCTTAAGAGAAAGACTTGCTCCACTATAGTACATGGTAAAGTGACATAACTCAATTGGGGGCGGTAAGGACTTAGTCATCCATATC + +a +s mr.mrrefChr0 18306 15 + 130230 CTTAGAGATAACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19830 15 + 636262 CTTAGAAATAACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 11915 15 + 647215 CTTAGAGATAACCCC + +a +s mr.mrrefChr0 18321 146 + 130230 TCTCCCCCACCAGGATGTGGCATAGACTGGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGTGTGACAGTAGGCCAACAAGAGCATATAATGCACCAAGCAGCTTGGATGTTTGGCCATTGGCACATCAGCAACTGGTGGCTCACCCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19845 146 + 636262 TCTCCCCCACCGGGATGTGACATAGACTGGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGTGTGAATGCAGGCCGACAAGAGCATATAATGCACCAAGCAGCTTGGTTGTTTGGCCATTGACATATCAGCAACTAGTGGCTCATCCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 11931 146 + 647215 TCTCCCCCACCAGGATTTGGCATAGAGTAGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGCATAACAGTAGGCCAGCAAGAGCTTATAATGCACCAAGCAGCTTGCATGTTTGGCCATGAGCACATCAGTAACTGGTGGCTCACCCAAT + +a +s mr.mrrefChr0 18467 167 + 130230 GGTATTGACAGGTTCAGTAAACACTTGTAGGAACCAAGGTGAATGATTTTCCTTTATGAACCCAATATAGTAACTTTAATTCTTTGTTTAAGACCTAGTAACTATAGCCAATTGTTAAGGACCCACTTTGCAATCAGGATGGATGTTAAATGACTTATGTAATGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 19991 153 + 636262 GGTATTAACAGGTTCAGTAAACACCTGTAGGAACCAAG--------------TCTATGCACCCAATATAGTAACTTTAATTCTTTGTTTAAGACCTAGTAACTATAGCCAATTGTTAAAGACCCACTTTGCAATCAGGGTGGATGTTAAGTGACTTATGTAATGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 12082 167 + 647215 GGTACTGAAAGGTTCGGTAAACACTTGTAGGAACCAAGGTGAATGATTTTCCTTTATGAACCCAATATAGCAACTATAGTGCTTTGTTTAAGACCCAGTAACTATAGCCAATTGTTAAGGACCCAATTTGCGATCAGGATAGATGTTAAATGACTGATGTAATAGAG + +a +s mr.mrrefChr0 18634 190 + 130230 ACTGATGTAATGGAGCACATAATTATGCACTTTTGAAACCAAGGTTGTGAACATAATTGTGAGCTTATGAAGTCAAGCTAGCAAGACATAGGACTGGCTTGATGTTTTAAAGTTTAGTAAATGTAAATTGGTTGCTCTTTTTGTGGTTCCATCTATCATGTGATGTCTCAGCTTGGAATTAAGGCATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20284 185 + 636262 ACTGATGTAATTGAGCACATAATTTTGCACTTTTGAAACCATGGTTGTGAACATAATTGTGAGCTTATGAAGTCAAGCTAGCAAGACATAGGACTGGCTTGATGTTTTAAAGTTTAGTAAATGTAAATTG-----TTTTTTTGTGATTCTATGTATCATGTGATGTCTCAGCTTGGAATTAAGGCATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 12249 190 + 647215 ACAGATGTAATGGAGCACATAATTATGCACTTTTGAAACCAAGGTTGCTAACATAATCGTGATCATATAGAGTCAAGCTAACAAGACATAGGACTGGCTTGATGTTTTAACATTTAGTAAATGTAAATTGGTTGCTCTTTTTCTGGTTCCATCTACCATGTGATCTCTCAGCCTGGAGTTAAGGCATGGT + +a +s mr.mrrefChr0 18824 196 + 130230 AAACTAAATGAAGTTACACCATGACCATCCTACTGAGTGCCTAAACTGGCTAACACTGGTTTAGCCTACATGGCTACACAAATGTGGGCACCCTTCAGATGTCAAGAGCTTACTATAACTGCCAACCAGTGGGCCAGGATCTGCAGTGCAGCCCTCTCCATCCACCCACTGAATGGAATGAATGTTGATGTCACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20470 196 + 636262 AACCTAAATGAAGTTACACCACGACCATCCTACTGAGTGCCTAGACTGGCTAACTCCGGTTTAGCCTACCTGGCTACACAAATGTGGGCACCCTTTAGATGTCAAGAGCTTACTATAACTGCCAGCCAGCGGGCCAGAATCCACAGTGCAGCCCTCCCCATCCACCCACTAAATGGAATAAATGTTGATGTCACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 12439 195 + 647215 AAACTAAATAAAGTTACACCATGACCATCCTACTGAGTGCCTAAACTGGCTAACACTGGTTTAGC-TACATGGATACACAAATGTGGGCAACCTTCAGATGTCTACAGCTTCCTATAACTGCAAACCAGTGGGCCAGGATCTGCAGTGCAGCCCTCTCCATCCACTCACTGAATGGTATGAAAGTTGATGCCACCA + +a +s mr.mrrefChr0 19020 32 + 130230 TCACCCCTACTATTGGTACACATGTAGATGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20666 32 + 636262 TCACCCCTACTATTGGTACACATGTAGATGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 12638 32 + 647215 TCACCCCTACTATTGATACACACTCTGACAAA + +a +s mr.mrrefChr0 19052 23 + 130230 TTTTATGAGTATGTGCAATCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20703 23 + 636262 TTTTATGAGTATGTGCAATCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 12670 23 + 647215 TTTTGATAGGATATGCAATCCTG + +a +s mr.mrrefChr0 19075 70 + 130230 CCTGCATGTGGGCACACATTGACAAAATATTGTCAATCACCCCTCTTGTCAAACATCAGGCACTGGCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20772 70 + 636262 CCTGCATGTGGGCACACATTGACAAAATATTGTCAATCACCCCTCTTGTCAAACATCAGGCACTGGCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 12693 70 + 647215 CCTTCCTGGGCATCCGCATTGACAGTATATTGTCAATAACTCCTCTTTTCAAACATGAGGCGCAGGCTAG + +a +s mr.mrrefChr0 19145 7 + 130230 GATCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20842 7 + 636262 GATCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 12767 7 + 647215 GATCTTA + +a +s mr.mrrefChr0 19152 43 + 130230 AGCATTCTCTCTAGTCAGCAGTATAATTAGATTAGACTGACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20849 43 + 636262 AGCATTCTCTCTAGTCAGCAGTCTAATTAGATTAGACTAACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 12778 43 + 647215 AGCACTCCCTCTAGTCAGCAATATAATTAGATAGGACTGACAC + +a +s mr.mrrefChr0 19195 72 + 130230 ATTTGTAATCTTGTGCTTTATAACAAAGGTGTGTGACGTACATATAAATTGTGTAATGAGCTGCAGTGTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20893 72 + 636262 ATTTGTAATCTTGTGCTTTATAACAAAGGTGTGTGACATACATATAAATTGTGTAATGAGCTGCAGTATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 12821 72 + 647215 ATTTGTAATCTTGTGCCTAATAGCAAAGGTGTGTGACGTACATCTAGATTGTGTAATGACCTGTAGTGTCAA + +a +s mr.mrrefChr0 19267 190 + 130230 CCAATTGGGACCTTATAATGCTTCAGTTTAGAATCATCTTATAAACCATGTGAAATCAATAATGTCAGACACATTGGTCTATATATCTTAAAGTTATGTGCATGTGACCCCTCAAGTGTCTGCATTGCTGGATTAATATATATGTTAATCTTAGAATTTACACCTAAGAGGATCAGTGTACATCCCTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 20967 189 + 636262 CCAATTGGGACCTCGTAACGCTTCAGTCTAGAATCAACTTATAAACTATGTGAAATCAATAATGTCAGACACATTGGTCTGTATATCTTAAAGTTATGTGTATGTGACCCCTAAAGTGTCTACATTGCTGCATTAACATATATGTTAATCTTAGAATCTACACATAAGAGGATCAGTGTACATCCC-TTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 12893 190 + 647215 CCAATTGGGATCTTATAATGCTTCAGTTTAGAAACATCTTATAAACCATGTGAAATCAATAATGTCAGACATATTGGTCTATATATCGTAAAGTTATGTGCATGTGACCCCTCGAGTGTCTGCATTGCTAGATTAATATATATGTTAATCTTAGAACTTACTCCTAAAAGGATCAGTGTACATCCCTTTC + +a +s mr.mrrefChr0 19457 324 + 130230 AATGTCCCATGTATCTGCACTAGTCATTTATACGTAGTTCAATAGTTCCTATATCTTAGTATTTACTTGATATCGCAGATTTTGAGCATGAGGCTCACATCCAGTGGCTGTCCATCAACAAACCTATCCATAGGTCATGAGAATACATGTCTTTGCTTCCCTTGTCTTGAGAATGATCTCTGAATACCACATGTAAAAGGATATGGTTACAGCTAGTCCTTTTTTACCGAGCTTGTTTTCTGCAGTTTATCCAACACACTTCCAGTTATGCAAATACTTGCATTTCTTCACTATGTAGATGTGGAAGCCTTCTGAGGGCCAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21156 324 + 636262 AATGTCCCATGTATCTGCACTAGTCATTTATACAAAGTTCAATAGTTTCTATATCTTAGTATTTACTTGATATTGCAGGTTTTGAGCATGAGGCTCACATCCAGTGGCTGTCCATCAACCAACCCATCCATAGGTCATGAAAATACAGGTCTTTGCTTCCCTTGTCATGAGAATAATCTCTGAATACCACAGGTAAAAGGATATGGTTACAGCTAGGTCTTTTTTACCGAAATTGTTTTCTGCAGTTTATCCAACACACCTCCAGTTATGCAAATACTTGCATTTCTTCACTATGTAGACGTGGAAGCCTTCTGAGAGCCAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 13088 323 + 647215 AATGTCCCATGTATCTGTACTAGTCTTTTAGACGTAGTTCAATAGTTCTTATATCTTAGTATTTACTTGATACCGCAGATTTTGAGCATGAGGATCACATGCAGTGGCTGTCCATCAACAAATCTATCCATAGGTCATG-GAATACATGTCTTTGCTTCCCTTGTCTTTAAGATGATCTCTGAATACCACATGTAAAAGGATATGGTTACAGCTAGTCATTTTTTACCGAGCTTGATTTCTGTACTTTATCCAACACACTCCCAGCTATGCAAATACTTGCATTTCTTCATTATGTAGGTGTGGAAGCCTTCTGAGGACCAAGC + +a +s mr.mrrefChr0 19781 68 + 130230 TGTGCTGGCAAAATAGATGCAGGAAAATGAAACAAAGTTGTCTGAGGCATAACTTGATCATGCCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21481 66 + 636262 TGTGCTAGCAAAATGGATGCAGGAAAAT--AACAAAGTTGTCTGAGGCATAACTTCATCATGCCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 13411 67 + 647215 TGTGATGGCAAAG-AGATGCTGGAAAATGAAAGAAAGTTGTCTGAGGAACAACTTGATCATGCCATAT + +a +s mr.mrrefChr0 19849 285 + 130230 CATACATGGGTAGAAAAGTAGACTTATATGAATGTTCTTGTTTTAGTGGTATGACCTATTGGTTTTCTTAGACATTTCAGCCACTTAATATGGTGGGTCCTACAAAGTGCTTCTCCCCAGTATGCCTTCCTTAAGGGCTAAAGCATAGAGTGCTGGTGCTGATACAGAGCATGTATTGTATGTGAATAATGTGTATTTAATCCTCTTTCTCCACAAGTGTCTGTTATTACCTGGGATCTTCCCTTGTCATGTTTAACAAAAATGGTAAATTGCTACTAAGATGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21549 277 + 636262 CATACATGGGTAGAAAA-------TATATGAAGGTTCTTGTTTTAGTGGTATGACCTATTGGTTTTCTTAGGCATTTCAGCCATTTAATATGGTGGGTTCTAAAAAGTGC-TCTCCCCAGTATGCCTTCCTTAAGGGCTAAGGTATAGAGTACTGGTGCTGATACAGATCATGTATTGTATGTGAATAATGTGTATCTAATCCTCTTTCTCCACAAGTGTCTGTTATTACCTGAGAACTTCCCTTGTCATGTTTAACAAAAATGGTAAATTGCTACTAAAATGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 13478 284 + 647215 GATGCAGGGGTAGAATAGTAGACTTATATGAATGTCCTTGTTTTAGGGGTATGACCTATTGGTTTTCTTAGACATTTGAGCCACTTAATAGGGTGGGTCGTACACAGTGCTTCTCCCAAGAATGTCTCCCTTAAGGGCTAAATCATAGAGTGCT-GTGCTGATATAGAGCACGTATTGTATGTGAATAATGTGTATTTAATCCTCTTGCTCCACAAGTGTCTGTTGTTCCCTGGGATCTTCCCTTGTCATGTTTAACCGAGATGGTAAATTGCTACTAAGGTGTG + +a +s mr.mrrefChr0 20134 16 + 130230 GTATGCAATACACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21840 16 + 636262 GTATGCAATACACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 13762 16 + 647215 GTATACTGTACACATA + +a +s mr.mrrefChr0 20150 61 + 130230 TGCAATATACATGTGTAATGAGATATAATCACTAACTAGAACCCATTACATGCAGACACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21862 59 + 636262 TGCAATATACATGTGTAATGAGATATAA--ACTAACTAGAACCCATTACATACAGACACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 13778 61 + 647215 AGCAATAAACAAGCGCAATGAGATATAATCCCTAACAAGACACCATTACATGCAGACACTA + +a +s mr.mrrefChr0 20211 5 + 130230 ACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21922 5 + 636262 ACATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 13839 5 + 647215 ATATT + +a +s mr.mrrefChr0 20216 38 + 130230 GAGCTTTATATTCTAATAAGGAGTTCTTGGCTGGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21930 38 + 636262 GGGATTTATATTCTAATAAGGGGTTCTTGGCTGGCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 13844 38 + 647215 GAGCTTTGTATTCTAATGGGGACTTCTTGGCTGGCATG + +a +s mr.mrrefChr0 20254 75 + 130230 ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTTTATTATTATGATTACTATAGGTCTGACACTGCTATAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 21968 75 + 636262 ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTTTATTATTATGATTGCTATAGGTCTGACACTGCTATAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 13892 75 + 647215 ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTCCTTTATTACACTTAACGTAGGCCTGACATTGCTGTAGGT + +a +s mr.mrrefChr0 20329 238 + 130230 TGTAGACTGTATTAGCTTCAATGGGAAACCCTCTCATTACTACAACTGCTGGCATCCTAAAAAAATGAGCCCCTCTAACATAATACAGGCTACCTCCCTGCTGAATGCTGGGCATTTTTAACTTTAGAATAGACCATGTAGTCAGCTACAGAGAGATAATGCATGTTGTAGCCTGGATCAGCTACAGTGGGACAATGAACTATATAGCCTGGCAAAGGCAAAATGCCACAGACTTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22044 231 + 636262 TGTAAACTGTATTAGCTTCAAAGAGA------CTCATTACTACAACTGCTGGCATCCTAAAAAAATGAGCCCCTCTAACATAATACAGGATACCTCCGTGCTGAATGCTGGGCATCTTTAACTTTAGAAAAGACCATGTATTCAGCTACAGAGAGATAATGCATGTTGTAGCCTGGATCAGCTACAGTGGGACAATGAACTATATAGCCTGGCAAAGGTAAAA-ACCACAGACTTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 13967 238 + 647215 TGTAGCCTTTATTAGTTTCAATGGCAAACCCTCTCATTACTGCAACTGCTGGCATCCTAAAAAAATAAGCCCCTCTAACATAATACAGGCTACCTGACTGCTGAACACTGGGCACTTCTAATTTTGGAATAGACCATGTAGTCAGCTTCAGAAAGATAATGCATGGTGTAGCCCGGATCAGCTACAGAGGGACAATGCACTATATAGTCTGGCAGAGGCAAAATGGCACAGACTTTTT + +a +s mr.mrrefChr0 20567 77 + 130230 TTTTGCCCACATATTTTATCATGTACATCTCTTGTGATGCACTCGCCTCAACCTTGTAAAGCCTTTTATCATAGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22275 77 + 636262 TTTTGCTCACATATTTTATCATGTAAATCTCTTGTGATGCACTCGCCTCAACCTTGTAAAGCCTTCCACCACAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 14208 77 + 647215 TTTTGCCCACATATTTTATCATGTACATCCCTCATGATGCACTAGTCTCTTCCCTTTGAATCCTTTTATCATAGGTG + +a +s mr.mrrefChr0 20644 54 + 130230 GTGTGTATTTATCAGTATGTGAGGGCATAAAGGTGCCAGTTAGAATGATTGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22353 54 + 636262 GTGTGAATTTATCAGTGTGTGAGGACATAGAGGTGCTGGTTCGAATGATTGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 14285 54 + 647215 TTGTGTATTTACCATTATGTCAGGGCATAAAAGTGACAGTTAGAATCATTGAAA + +a +s mr.mrrefChr0 20698 13 + 130230 TTTGAACCATTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22407 13 + 636262 TTTGAACCATTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 14340 13 + 647215 TTGGAATCATTGG + +a +s mr.mrrefChr0 20711 29 + 130230 CGCTTCCTTGCTCATTTAAACACTGGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22434 29 + 636262 CGCTTCCTTGCTCATTTAAACACTGGCAT + +a +s mr.mrrefChr0 20740 11 + 130230 CACATCAGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22467 11 + 636262 CACATCAGGAT + +a +s mr.mrrefChr0 20751 40 + 130230 TAAGTGCCTAATATTGGGTGCAAATATTGTTACATGTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22479 31 + 636262 TAAGTGCCTGATATTGGGTGCAA----TGTTGGAT----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 14353 35 + 647215 -----GCGCATTGTCGGGTGCAAATATTGTTACATGTAGA + +a +s mr.mrrefChr0 20791 13 + 130230 CATGAACTTGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 14390 13 + 647215 CATGAACTTGTTG + +a +s mr.mrrefChr0 20804 32 + 130230 AATCTCAGATTACTTGCACAGCTATGATTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 14411 32 + 647215 AATCTCAGATTACTTGCACAGCTATGATTACT + +a +s mr.mrrefChr0 20836 19 + 130230 GGATGGAGCACAGGATAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 14449 19 + 647215 GGATGGAGCACAGGATAAC + +a +s mr.mrrefChr0 20855 54 + 130230 TCATGTAGCACCTTCAGGCCAGATCAAGTGTTTGGATGAAAATTCCTCTCAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 14469 54 + 647215 TCATGTAGCACCTTCAGGCCAGATCAAGTGTTTGGATGAAAATTCCTCTCAAAT + +a +s mr.mrrefChr0 20909 132 + 130230 TGGCAAAGTGACAGTAAGACATGACCAGTACTTTGCTGCTCTTATATTTTGTGCATCCATAGGAGCAGGTGTTCAGCATGACATCATAGGGAGGAGCAGGTAAGCTGTTGTATAACAGGTTTGTGCCAAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22510 97 + 636262 -----------------------------------CTGCTCTTATATTTTGTGCATCCATAGGAGCAGGTGATCAGCATGACATCATAGGGAGGAGCAGGTAAGCTGTTGTATAACAGGTTTGTTCCAAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 14525 132 + 647215 TGGCAAAGTGACAGTAAGACATGACCAGTACTTTGCTGCTCTTATATTTTGTGCACCTATAAGAGCAGGTGTTCAGCAGTACACCATAGGGAGGAGCAGGTACACTGTTGTATAACAGGTTTGTGCAAAAAC + +a +s mr.mrrefChr0 21041 104 + 130230 ACAGTGATTTAAAAGGGTACAGATACCTTTGATCTGGGGAAAGCACCTGGATATCATATCATGAGGAGCGAACAGCATGAGATTCAATTTATTGCATTGAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22607 103 + 636262 ACAGTGATTTAAAAGGGCACAGATACCTTTGATCT-TGGAAAGCACCTAGATATCACATCATGAGGAGCGAACAGCATGAGATTTAATTTAGTGTATTGAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 14662 103 + 647215 ACAGTGATTTAAAAGGGTACAGATACCTTTGATATGGGGAAAGCACCTGCATCTTATATC-TGAGGAGCGAACAGCATGAGATTCGGTTTATTGCATTGAAGTT + +a +s mr.mrrefChr0 21145 37 + 130230 GAAGACAGATATTGTAATGCATTTGGGGGGTTTCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22710 17 + 636262 GAAGACGGTTACTGTAA-------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 14834 37 + 647215 GAAGACAGATATTGTAATGCATTTGGGGGGTTTCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 21182 56 + 130230 GTATGGCAGATCAATTACACAAATCTGTTGTGATGATCCTACAAAGTAATTGAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22727 41 + 636262 ---------------CACACAAATCTGTTGTGATGATCCTACTGAGTAATTGAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 14872 56 + 647215 GTATGGCAGATCAATTGCACTAATCTCTTGTGCTGATCCTACAAAGTAATTGAGGT + +a +s mr.mrrefChr0 21238 25 + 130230 GACCCCCATCAATTAGCAAGTAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22768 25 + 636262 GACCCCCATCAATTAGCAAGTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 14967 25 + 647215 AACCCCCATTGATGAGCACGTAAGT + +a +s mr.mrrefChr0 21263 641 + 130230 CTTACCAGAAGCAGACCAGTTGTATTAGTGTAGAATATATGTAGGTGCTACTTGTCACTGACAACCACTTTTACCATTAAGAGCAGCTAAAATCTTCCTGTTTTACATCTAGCTATGAATGTTCTCTCTTGGCATCGATAACCATTTGCAGTACTAGACACACAAAGGGCATCGCTTAGCATGTGCCAACCTTCAACTTCAATTTCTTACTCTTTGACAAGTATATAACTTAATATACCTTACACTTCCAACCCTGTAACAGATAGCTGATTTATTTCCCTGCCAGGTTTCCTTTCCATAATGTCTAGTCCCTGCAGTGTTTCGTTTGCTGGGTAGCTAACTTAGCCTGCTATGATGCTGCCAATTTACAGTCTCCCAAACCTAACACATTGCCCCCTAGACTTTGCCCATACCCTCGTATAGAGACAGTCCAAGTGGTTTCGGTTTCTTTAATTTAGTAATCTCTACACTCTAGAGGTGTGCTATACTAACAGGATGAAGGGGTCTCACATACCAGGGGTTGCCCTTTGAGGTGATAAAACACTATGACTTTATATTTCATGGCAAAATTTGAGACAAAGCTGGTTGTCCCTATGGGCAGTAACTGACTTTGTTTGATCTGTATTGTATGTGATCTGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 22804 633 + 636262 CTTACCAGAAGCAGACCAGTTGTATTAGTGTAGAATATATGTAGGTGCTACTTGTCACTGACAACCACTTTTACCATTAAGAGCAGCTTAAATCTTCCAGTTTTACATCTAGCTATGAATGTTCTCTCTTGGCATCGATAACCATTTGCAGTACTAGACACACAAAGGGCATCGCTTAGCATGTGCCAACCTTCAACTTCAATTTCTTACTCTTTGACGAGTATATAACTTAATATACCTTACACTTCCAACCCTGTAACAGATAGCCGATTTGCTTCCCTGCCAGGTTTCCCTTCCATAATGTCTAGTCCCTGCAGTATTGCATTTGTTGGGTAGCTAACTTAGCCCGCTATGCTGCTGCCAATTAACAG-----CAAACCTACCACATTGCCCCCTGGACTTTGCTCATGCCCTCGCATAGAGACAGTCCAAGTGGTTTCGGTTTCTTGAATTTACTAATCTCTACACTCT---TGTGCACTATACTAACAGGATGAAGGGGTCTCACATACCAGGGGTTCCCCTTTGAGGTGATGAAACACTATGACTTTATATTTCATGGCAAAATTTGAGACAGAGCTGGTTGTCCCTATGGGCAGTAACTGACTTTGTTCAATCTGTATTGTATGTGATCTGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 14992 615 + 647215 CTTACCGGAAGCAGACCAGCTGTGTTAGTGAAGAATATATGTAGGTGCTACTTGTC-------ACCACTTGTA--ACTGACAGCAGCTAAAATCTTCCTGATTTACATCTAGCTATGAACGTTCGCCCTTGGCATCACCAACCATTTGTAGTACTGGAGATAGGTAAGGCACTGCTTAGCATGAGCCAACCTTCAACCT-GATTTCTTACTCTTCGACAAGTATATAGCTTAATATA-----------CAACCCTGTAACAGATAGCTGATTCATTTCCCTGTCAGATCTCCTTTCTGTAATGTCTAATCCCTGCAATGTTTCGTTTGCTGGGTAGCAAACTTAGCCTGCTATGATGCTGCCAATTTACAGTCTCCCAAACCTAACACATTGCTCCCTAGACTTTGCCCACACACTAGTAAAAAGACAGCCCAATTCGTTTCAGTTTCTTTAATTCAGTAGTCTCTACACTCTAGAGGTGTGCTAAACTAACAAGAAGAAGGGGTTTCACACACCAGGGGTTGCCCTTTGAGGTGATAAAACACTATGACTTTATATTTCATGGCAGAATTTGAGACAAAGCTGGTTGTCCCTATGGGCAGTAACTGACTTTGTCTGATCTGTATT-----TGATCTGTCT + +a +s mr.mrrefChr0 21904 53 + 130230 CAATAGTACTTTTTATGATTGTATGTGTTAATGATCATTCAGGAATCCGCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 23437 53 + 636262 CAATAGCACTTTTTATGAGTGTATGTGTTAATGATCATTCCAGAATCCGCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 15608 53 + 647215 CAGTAATGCTTTTTATGATTGTATGTGTTAATGATCATTTAGGAATCAGCTGA + +a +s mr.mrrefChr0 21957 42 + 130230 AAGACAAATTATCTGAGAGGTGGCGAACTAAAGCATAGACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 23490 37 + 636262 AAAA-----TACCTGAGAGGTGGCGAACTAAAGCATAGACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 15664 42 + 647215 TGGACAAATCATCTGAGAAGTGGCAAACTAATGCTTAGACAA + +a +s mr.mrrefChr0 21999 319 + 130230 AATACCTGAAGAGTGGTGAGTAGTTGAGTGTGATGTCTATCAATGAGGAAGCTCGCACTTCACTGTAAGAGAACCTACTAAAAGCTATGATGAGTACAACCAAGATTGACCACTGGGCATGGATTGGAGTCTGACTAGAGCATATCTTATCTTCAATTCTCACACATCTGTAGTGTGTTATTCCTGGAAGTTTTAAAGCTAGTTTATGTTTGACCTAATGCAGTTAAGGCCCCACTTATTTTAAAGCTAAGACATAACTAACAGTCTGGAGGCTAGGACTGATTTGGGGTTGCATAATCTTGCCACACTTTACCTGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 23535 304 + 636262 AATACCTGAAGAGTGGTGGGTAGT---------------TCAATGAGGAAGCTCGCACTTAGCTGCAAGAGAACCTACTAAAAGCTATGATTAGTACAACCAAGATTAACCACTGGGCATGGATTGGAGTCTGACTAGAGCATATCTTATCTTCAATTCTTACACATCTGTAGTATGTTATTCCTGGAAGTTTTAAAGCTAGTTTATGTTTGACCTAATGCAGTTAAAGCCTCACTTATTTCAAAGCTAAGACATACCTGACAGTCTGGAGGCTAGGACTGATTTGGGGTTGCATAATCTTGCCACAGTTTACCTGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 15706 316 + 647215 AATACCTGAAGACTGGTGAGTAGTTGAGTGTGATGTCTATCAATGAGGCAGCTGGCACTTCACTGTAAGAGAACCTACTAAAAGCTAT-ATGAGTACAATCAAGATTGACCACTGGGCATGGATTGGAGTCTGGCTAGAGCGTATCTTATCTTCAATTCTCACACCTCTGTTTTGTGTTATCCCTGGAAGTTTTAAAGCTAGCTTATGTTTAACCTAATCCAGTC-AGGCCCCACTTATTTTAGG-CCATGACATAACGAACAGTCTGGAGGCTAGTACTGATTTGTGGTTGCATAATCTTGCTACACTTTACCTGTTT + +a +s mr.mrrefChr0 22318 27 + 130230 CCTAACCTATCAAAAGATGCTTCATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 23839 27 + 636262 CCTAACCTATCAAAAGGTGCTTCATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 16024 27 + 647215 CCTAACCTATCAAAAGATGCTTCCTTG + +a +s mr.mrrefChr0 22345 223 + 130230 CAATTCCATGAGGACAGATAGGTAATTAAGGATATGAGAGCAGACACATATTTGTAATAAAGTACACATCTAACTGATCAAGGGCCAATTCTAATTTATTGCCTATTTAGATCCCCAATTTAAATCCCTATATAGCAACTAGTCTCATCCCAAACATGCATGATATAGCACCTCTGCGATTGTAGTAACCTCTACTAGACCTAAGGACCGTTTGTAGGCATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 23869 222 + 636262 CAATTCCATGAGGACAGATAGGTAATTAAGGATATGAGAGCAAACACCTATTTGTAATAAAGTACACATCTAACTGATGAAGAGTCAGTTCTAATTTATTGCCTATTTAGATCCCCAATTTAAATCCCTATATAGCAACTAGTCTCATCCCAAACATGCATGATATAGCACCTCTGCGATTTTAGTAACCTCTACTAGACCTAAGGACAATTTGTAGGTGTG- +s simRat_chr6.simRat.chr6 16051 222 + 647215 CAAGTCTGCAAGGACAGATAGGTAATTTA-GATATGAGAGCAGACACATATTTGTATTAAAGTACACATCTAACTAATCAAGGGCCAATTCTAGTTTATTGGCTATTTAGATCTCCGATGTAAATCCTTAGATATAATCTAGTCTCATCCCAAACATGCTTGATATAGCACCTAAGTGACTGTAGTCACCTCTGCTAGACCTGAGGACCGTTTGTAGTCATGT + +a +s mr.mrrefChr0 22568 367 + 130230 GGGAGCAAATACTCATACCCATACTCAGTTGCTATTATAGTGATACAGTTCTCTTGGCTAGCTTTCCATAATGTCAGCTGGTGAGGCCCACTTTAATGATACAGTGTTCACAACTGTAGCCCACACTCACTGGTGTAAGTTGCTTGTGAGACTGACCATGCTCACGAACTCTGTCTCAACCTAGTTAGCAAGCGTGTCATTAATTACCTTAGTAATATTAGTCAGAAGTAAGGGTTGTCACAGGTGGCCAGCATCACCTCCAAGAAGCAGTGTTCTGTGCACACAATGGATACTGGATCTACACGGAGCTAAACTTGCAGAAGAGGCCTCCAGTCCATGAGTTTCCAATTAAAGTGCCATTTTTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24091 367 + 636262 GGGAGCAAATACTCATACCCATACTCAGTTGCTATTATAGTGATACAGTTCTCTTGGATAGCTTTCCATAATGTCAGCTGATAAGGCCCACTTTAATGGTACAGTGTTCGCAACTGTAGCCTACACTCACCAGTGTATGTTGCTTGTGAGACTGACCATGCTCATGAACTCTGTCTCAACCTAGTCAGGAAGCCTGTCATTAATTACCTTGGTAATATTAGTCAGAAGTAAGGGTTGTCACAGGCAGCCAGCATCACCTCCAAGAAGCAGTGTTCTGTGCACAAAATGGGTACTGGATCTACAAGGAGCTAAACTTGCGGAAGAGGCCTCCAGTCCATGAGTTTCCTATTAAAGTGCCATTTTCGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 16277 365 + 647215 AGGAGCAAATACTTGTACCCACACCTGGTTGCTATTGTAGTGATACTGTACACTTGGCTAGCTTTACATAATGTCAGCTGGTGAGGCACACTCTAATGATGCAGTGTTCACAACTGTAGCCCACACTCATTGGTGTAAGTTGCCTATGAGACTGACCATGCTCACGAACTCTGTCTCGTCGTAGTTAGCAAGTGTGTCATCAATTATCTTAATAATATTAG--GGAAGTAAGAGTTGACACAGATGGCCACCAGCACCTCCAAGAAGCAGTATTCAGTGCACACAATGGATACTGGATCTACACGGAGGTAAACTTGCAGAAGAGGCCTCCAGTCCATTAGTTTCCAATCAAAGTGCCATTTCTGTG + +a +s mr.mrrefChr0 22935 79 + 130230 AATAACAACTCCAAGCAAAATCAGGGTGACAGTAATAAAGTGTGCTAGTGGACCAGAATAGTCAGGCGAGTTAGGCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24458 79 + 636262 AATAACAACTCCAAGCAAAATCAAGGTGACAGTAATAAAGTGTGCTAGTGGACCAGAATAGTCCGGGGAGCTAGGCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 16647 79 + 647215 GACAACCAGCTCAGGCACAGTCAGGGTGACAGCAATAAAGTGTCCTAGTGGATCAGAATAGTCAGGCTAGTTAGGCCAA + +a +s mr.mrrefChr0 23014 160 + 130230 TAAATTAGAGCTGCAAGCAACAAAATTACTGGAGTAGCAGAATTTGTGTCTGGCCCCTAATCCTGCTTAAATAACAACCTGGAAGTTTATAGCAGGGGGAGATTATGCTAGGCAAGAATTACAGGAGCTTCATAAATATAAATGGTTATACCGTAAAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24537 160 + 636262 TAAATTAGAGCTACAAGTAACAAGATTATTGGAGTAGCAGAATTTGTGTCTGGCCCCTAATCCTGCTTAAATAACAACGTGGAAGTTTATAGCAGGGGGAGATTCTGTTAGGCAAGAATTACAGAAGCTTCATAAATATAAATGGTTATACCGTGAAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 16727 159 + 647215 TGATTTAAAGCTGCAAGCAACAAAATTACTGGAGGAGCAGAATTCGTGT-TGGCCCCTAATCCTGCTTAAATGACAACCTGGAAGTTTATAGCAGGGGGAGATTATGCTGGGCTAGAATTACAGGAGCTTCATAAATATAAATGGTCATAGCATAAAATC + +a +s mr.mrrefChr0 23174 96 + 130230 CAACTTTTAGTTGTAGGTCCTATACCGGATACAACTGAGTGGAAAGACACAGACAAGGACAATAAATGTTATTATGTACAGATCCCCTGGCCCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24701 96 + 636262 CAACTTTTAGTTGTAGGTCCTATACCGGATACAACTGAGTGGAAAGACACAGACAAGGACAATAGATGTTATTATGTACAGATCCCCTGGCCCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 16886 49 + 647215 -----------------------------------------------CACAGACAAGGACAATAAATGTCATTCTGTACAGATTTCCTGACCCTCC + +a +s mr.mrrefChr0 23270 160 + 130230 CCTGCCCAGGATACATAAGCTTACTGCATTGGATTATTTGAGATATCGCAGCATAATATCTTGATGCACTCCATTTTTGGTCAATAATGTCAGGCTGGCATGAGATCCTATGTGATTCAGCTCCTTGTTCTAGTCAATTCCACCTTATTCCTGCAGTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24797 157 + 636262 CCTGCCCAGGATACATAAGTTTACTGCATTGGA-TATTTAAGATATCGCA-CACAGTATCTTGATGCACTCCATTTTTGGTCAATAAGGTCAGGCTGGCATGAGATTCTATGTGATTCAGCTCCTTGTTC-AGTCAATTCCACCTTATTCCTGCAGTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 16936 160 + 647215 CCTGCCCAGGAGGCATAGGCTTATTGCATTGGATTATTTGAGCTATCACAGCATAATATCTTCATGCACTCTATTTTGGGTCAATACTGTCAGGCTGGCATGAGATCCTGTGTGATTTAGCTCCTTGTTCTAGCCAACTCCACCATATCCTTGCAGTATA + +a +s mr.mrrefChr0 23430 12 + 130230 GGCTAAGGAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24955 12 + 636262 GGCTAAGGAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 17096 12 + 647215 GGCTAGGGAATC + +a +s mr.mrrefChr0 23442 196 + 130230 ATTAGTGCACATTAATTTTGATGATGCCATAGTGCATTTGAAATGTATTAATAGGTATATTCTTAACTCAGTGTGACGGGTTATAAATTATTTCTTATCATGGAAGTAAAATACATTTTGTTTGGTGTGAAATACAAACCCCATTCTAACCACCCCTAAAGGAGGGAGACTAACCTGTATTCCTCCCACTGCAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 24967 193 + 636262 -TTAGTGCACATTAATTTTG-TGATACCATAGTACATTTGAAATGTATTAATAGGTATATTCTTAACTCAATGTAACGGGTTATAAATTATTTCTTATCATGAAAGTGAAATACA-TATGTTTGGTGTGAAATACAAACCCCATTCTAACCACCTCTAAAGGAAGGAGACTAACTTGTATTCCTCCCACTGCAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 17113 196 + 647215 ATTAGTTCACATTAATTTTGAGGATGCCATAGTGCCATTGTAATGAATTAATAGGTATATTCTTACCTCAGTGTGACAGGTTATAAATTATTTCTTATCGTGGAAGTAAACTAGATTTTGTTTGGCATGAAACACAAACCCCATTCTAACTACCCCTAAAGGGGGCAGACTAACCTGCATTCCTCCCTCTGTAACC + +a +s mr.mrrefChr0 23638 34 + 130230 TGCAGACAGAGAAACATGCATCATCAACACCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25161 34 + 636262 TGCAGACAGAGAAACATGCATCATCAACACCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 17309 34 + 647215 TGCAGACAGAGACACATGCATCATCAAAACCTTT + +a +s mr.mrrefChr0 23672 11 + 130230 CTACAACACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25197 11 + 636262 CTACAACACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 17343 11 + 647215 CTACAACACTA + +a +s mr.mrrefChr0 23683 40 + 130230 ATTTGCACATCAAGACTATATTTACACATCAAAAATATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25209 40 + 636262 ATTTGCACATCAAGACTATATTTACACATCAAAAATATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 17354 40 + 647215 ATTCGCACATCCAGACTCTATTTGCAAATCAAAAATATGA + +a +s mr.mrrefChr0 23723 195 + 130230 CAATTCTAAACTTGTCAGTACCCCAGACACACAATCTTTTATTGAGTCACCAGTCATCTTTTTCACATACTGTCATGATTTCTGTATCCCATGCTTTTTGTAAGTCAATGCTTATATTTCTGTATATGGATGGATTGCTATTGGTGTAAACTTCAAAATCTAGTGTGTGGCTTCTCTATGGTGTGGTTACCAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25249 195 + 636262 CAATTCTAAACTTGTCAGTACCCCAGCCACACAATCTTTCAATGAGTCACCAGTCATCTTTTTCACATACTGTCATGATTTCTGTATCCCATGCTTTTTATAATTCAATGCTTATATTTCTGTATATGGATGGATTGCTAGTGCTGTAAACTTCAAACTCTAGTATGTGGCTTCTCTGTGGTGTGGTTACCAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 17401 194 + 647215 CAATTCTCAACTTGACAGTACCCCAGACACACAATCTTATATTGAGTCACCAGTTATCTTTCTTACATACTGCCATCATTTCTGTATCCCATGC-TTTTGTAAGTCAATACTTATATTTCTGTATCTGGATGGATTGGTATTGGTGTAAACTTCAAAAACTAGTGTGTGGCCTCTCTATGGTTTGGTTGCCAGCA + +a +s mr.mrrefChr0 23918 18 + 130230 GAAATTTCCCCTGGGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25445 18 + 636262 GTGATTTCTCCTGGGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 17595 18 + 647215 GAAATTCCCCCCAGGGCC + +a +s mr.mrrefChr0 23936 357 + 130230 AATACGTTAACTGGCTTAGTGTACAAATGCTGCTAAAGAACATATGAATATCCAAATTGCTCCATGTTGACATCCCATGTGATTTAACCCACATACTTACCATCTCTTCCACTTAATGTTCAACCTCTGAACCCAATGTGGTCCCCTTGTGAGGGATTCCATGAGAATTCCTTTTAAAAGGAGTGTCAATCTTGCCAGTGGTTATGCCTTAATCCCTCCACCTGAGAGTTGCCCATGCAGCCAGTGTCAGTTAGTGTTTTGGTTGATGCCCCAGATTGATGCCCCACAGTATAGCAACCACAGTTTGCCAGCAACCATCTGAATAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGCCTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25465 357 + 636262 AATACGTTAACTGGCTTAGTGTACAAACACTGCTATAGAACATATGAATATCCGAATTGCTCCATGTTGACATCCCATGTGATTCTACCCACATACTTACCATCTCTTCCACTTAATGTTCAACATCTGAACCCAATGTAGCCCCCTTGTGAGGGATTCCATGAGAACTCCTTTCAAATGGGGTGTCAATCTTGCCAGTGGTAATGCCTTAATCCCTCCACCTAAGAGTTGCCCATGCAGCCAGTGTCAGTTAGTGTTTTGGTTGATGCCCCAGATTGATGCCCCACAGTATAGCAACCACAGTTTGCCAGCAATAATCTGAGTAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGCCTTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 17613 342 + 647215 AATACGTTTACTAGCTTAGTGTACAAATGCTACTAAAGAACATATCAATCTCCAAATTGCTCCATGTTGACATCCCATTTGATTTAACCCACATACCTACCATCC----------ATGTGTGACCTATAAACCCAATGTGGTCCCCTTATGAGGGATTCCTTGAGAATTCCTTTTGAAAGGAGTGTCCATCTTGCCAGTGGTTGTGCCTTAATTCCTCCACCTGAGG-----CTATGCAGCCAGTATTGGTTTTTGTTTTGATTGATGCCCCAGATTGATGCCCAACAGTATAGTAACCACAGTTCACCAGCGACCATCTGAATAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGGCTTGCA + +a +s mr.mrrefChr0 24293 82 + 130230 CACAGGTGAGTCAATTAGAATTGAAGGACTCTGAGGTGAGATGAGCTTTTTGGGGGACACTTGCCATTTTGAGTTATATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25823 82 + 636262 CACAGGCAAGTCAATTAGAATTGAAGGACGCTGAGGTGAGATGAACTTTTGGGGGGACACTTGCCATTTTGAGTTATATAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 17955 78 + 647215 CACAGGTGAGTCAATTAGAATTGAAGGACTCTGAGGTGAGATGAGCTTTTTGGGGGACACT----ATTTCGAGTTATATAGC + +a +s mr.mrrefChr0 24375 15 + 130230 ATGTATCAATGACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25905 15 + 636262 ATGTATCAGTGACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 18034 15 + 647215 ATGTTTCAATGACCC + +a +s mr.mrrefChr0 24390 5 + 130230 ATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25924 5 + 636262 ATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 18049 5 + 647215 TCCAA + +a +s mr.mrrefChr0 24395 69 + 130230 AATTCCTTTGTAGTTAATCTTCAGAAATATAACACAAGGCACATAGCTCTGCTGACTGCTGGCAAAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 25929 69 + 636262 AATTCCTTTGTAGTTTACCTTCAGAAATATAACACAAGGCACATAGCTCTGCTGACTGCTGGCACACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 18058 67 + 647215 ATTTCCTTTGT-GTTAATTTTCGGAGATTTAACACAAGGCGCATA-CTCCAGTGACTGCTGGCAAGACC + +a +s mr.mrrefChr0 24464 166 + 130230 ATTGGTATATCTCCACATGTTGTAGGGGGACCAATGGCACAATGTGGATGTGGATGAGGGATCTATAATTCAAACTAATCCCCCACTTATCTTTTCTATTTTTATGCCAATCATGTTAGGCTTATGAGATAGGTTAGGTCATGTGATGGATCTAAAGAACTGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26010 145 + 636262 ATTGGTATATCTCCACATGTGGTAGGGGGTC--------CAATGTGGCTGTGGATGAGGGATCTATAA-----ACAAATCCTCCACTTATCTTTTCTATTTTTATG-----CATGTTAGGCTCCTGAGATAGGCTAGGTCATGTGATGGGTCTAAAGAACTGC--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 18125 166 + 647215 ATTGGTATATCTCCACATGTTGTAGGGGGACCAATGGCACAATGTGGATGTGGATGAGGGATCTATATTTCAAAGTAATCCCCCCCTTATCTTTATTATTTTTATGCCAATCATGTTAGGCTTATGATGTAGGTTAGGTAATGTGATGGATCTAAATAACTGCCAC + +a +s mr.mrrefChr0 24630 81 + 130230 CATCCAATGAGTCATCATTTTATGACACTGACTGACCTTCTTAATCACGGCTGTAGCCTCTTAGTTAGAAATGCAACAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26155 79 + 636262 --TCCAGTGAGGCACCGTTCTATGACACTGACTGACCTTCTTAAGCAGGGCTGTAGGCTCTTAGTTAGAAATGCAACAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 18292 81 + 647215 CATCCAATGAGTCATCATTTTATGACACTGAGAGTCCTTCTTAATCACGGCTATAGCCTCTTAGTTAGAAATGCAACAGAC + +a +s mr.mrrefChr0 24711 120 + 130230 TGTACTCAACCATTCATAAGGAAAGTTTCAAAACCATTTGACATCCAGAGCACCCGTTGTACAATCACCCATTGATAACAATGTGAGGTATGGTGGAGCCAGAACTCCATGGGTCAGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26242 118 + 636262 TGTACCCAACCATTCATGAGGAAAGTTTCAAAACCATTTGACATCCAGAGCATCCGTTGTACAATCACCCAT--ATAACAATGTGAGGTACGGTGGGGCCAGAACTCCATGGGTCAGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 18373 120 + 647215 TGCACTCAACAATTCGTAAGGAAGGTTTCAAAACCATTTGACATCCAGAGCACCCATTGTACAATCACTGATTGAACACAATGCGAGGTATGGTGGAGCCAGAACTCCATGGGTCAGCCC + +a +s mr.mrrefChr0 24831 94 + 130230 GGGTGTATTACCATTAGCCTCAATTCCTTGGACCTCATTTTAAAATATTATCTTTAACCCCTCCTGTAATTACGAAAAATTAGAGCAGAGAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26361 94 + 636262 GGGTGTATTATCATTAGCCTCAATTCCTTGAACCCCATTCTATGATATTATCTTTAACCCCTCCTGTAATTACGAAAAACTAGAGCAGAGAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 18493 84 + 647215 AGGTGTATTACCATTAGCCTCAATTCCTTGGTCATGATTTTAAAATATTGTCTCTAACCCCTCCTGTAATTAGGAAAAATTAGA---------- + +a +s mr.mrrefChr0 24925 144 + 130230 GGCAACCACTAGAATGTATAAGTGGGCAAGATTATTTAAGGGATCTAATCTCTTGCACTGGTGATAGGTTTACGGTTGGCTAATTGACTCACAGACAAACAAATGGTCACGACTTAGCTGAATTTCTCCATTGGCTCCTACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26457 140 + 636262 GGCAACCACAAGAATGTGTAAGTGGACAAG---ATTTAAGAGATCTAATCACTTGCACTGGTGACAGGTTT-CGGTTGGCTGATTGACTCACAGACAAACAAATTGTCCCGGCTTAGCTGAATGTCTCCATTGGCTCCTACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 18577 142 + 647215 -GAAACCACTGCAATGTATAAGTGGGCAAGATTATTTCAGGGATTTGATCTCTCACACTGGTGATAGGTTTACTGTTGGCTAATTGACTAATAGACAAAC-AATGGTCACGACTTAGCTGAATTTCTCCTTTGGCTCTTACATT + +a +s mr.mrrefChr0 25069 358 + 130230 TCCTCATATCACAAAAGAGGGTAAGCAGTGGCACTCAGAAGACACAGAGCTGTCACCTGGGAGAGCAGATGTGGCCTGAGAGACCAGACTCAGTCATTTGATGGTGTAATGGTTGGCCCTGATCATCAGGGACTGCAGTGTCAACAAGATAAGTATTTAGTAAGCATAAGTACCTGGATGTGGGGCTAGAGCCCCTAGGGTCCAGACAACTATGTAAGAGAGTTTGAGATCTGGCAAAAGTGTAATGTTCCCCATTGGCTGTCTTTGTTGTTATCATCTAGATTTTTTCTCATGGTGGGACATTGATCCTTTAACCAAAAACAAAGGTATCTACTGCCAATCAAGAGTACATACTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26597 358 + 636262 TCCTCATATCACAAAAGAGGGTAAGCAGTGGCGCTCAGAAGACACAGAGCTGTCACCTGGGAGAGCAGATGTGGCCTGAGAGACCAGACTCAGTCATTTGATGGTGTAATGGTTGGCCCTGATCATCAGGGACTGCATTGTCAACAAGATAAGTATTTAGTAAGCATAAGTACTTGGATGTGGGACTAGAGCCCCTAGGGTCCAGACAACCATGTAAGAGAGTTTGAATTCTGGCAAAAGTGTAATGTTCCCCATTGGCTGTCTTAGTTGTTATCATCTAGATTTTTTCCCAGGGTTGGACATTGATCCTTTAATCAAAAACAAAGGTGTCTACTGCCAATCAAGTGTACATACTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 18727 355 + 647215 TCCTCACGTTGCAAAGGAGGGTAAGCAGTGGCACTCAGAAGACTCAGAGGCAGCACCTGGGAGAGCAGATGTGACCTGAGAGACCAGACTTAGTCAATTGGTGGTGTAATGCTTGGCTCTGATCATCAGGGACTGCAGTGTCAACAAGATAAGTATTTAGTAAGCATAAGTACCCAGA---GGAGCTAGAACCCCTAGGGTCCAGACAACTATGTAAGAGAGTTTGGGACCTGGCAAATGTGTAATGCTCCCCATTGGCTGTCTGTGTTGTTATCATCTAGATTTTTTCTCATGGTGGGACATTGGTCCTTTAACTAAAAACAAAGGTATCTACTGCGAATCAAGAGCACATACTGCC + +a +s mr.mrrefChr0 25427 66 + 130230 ACTTACTGCCTTAAACAGACCCTTTCCAAGAAGGCCCTACTCACTAAAATGTTAGTCAAGTTAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 26961 66 + 636262 ACTTACTGCCTTAAACAGACCCTTTTCAAGAAGGCCCTATTCACTAAAATGTCAGTCAAGTTAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 19082 66 + 647215 ACCTGCTGCCTTAAACAAACCCTTTCCAAGAAGGCCCTGCTCTCTAAACTGTTAGTCAGTTTAATG + +a +s mr.mrrefChr0 25493 391 + 130230 TACTTACTGAGTTGATCCCACTTCCACTAGAGGTAGTTACAATCATATGGAAGTTTAGTAGTTATGGTCCTTTAAGATTTATAATGTTTCTCCCTTTTCCCCCATACTATCTGTCCAAGGTTGATTGGGGTCCTTTCCTTTGCCAAGACTCTTACCGAATAACTTAGCTAGTGGGCATACAACCAAGCTGGTTTTTTTGGATTTCAGAGGGAATCTCGTCCTGTGGGCTTTGAGTTGCGTTCCTTCAACTTCAGTACAGTTCTTTGGGCTATCTGTACATATAAGTCTGAACTCCTGCCCACATATAAGGTACAGATTAAATCTAATCTCATGACATTACTTCCTTTCCAATCTAAGTAGCAGTCACACTTATGTGAACTCACTCGCTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27027 388 + 636262 TACTTACTGAGTTGATCCCACTTCCACTAGAGGGAGTTACAATCATTTGAAAGTTTAGTAGTTATGGTCCTTTAAGATTTATAATGTTTCTCCCCTTTCCCCCATACTATCTGTCT---GTTGATTGGGGTCCTTTCCTTGGCAAAGACTCTTACCGAATAACTTAGCGAGTGGGCATACAACCAAGCTGGTTTCTTTGGGTTTCAGAGGGAATCTCGTCCTGTGGGCTTTGAGTTGCGTTCCTTCAACTTCAGTACAGTTTTTTGGGCTATCTGTACATATAAGTCTGAACTCCTGCCCTCATATAAGGTAGAGATTAAATCTAATCTCATGACATTACTTCCTTTCCACTCTAAGTAGCAGTCACACTTATGTGAACTCACTCGCTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 19151 369 + 647215 TACTTACTTGGTTGATCCCACTTTCACTAGAGGTAGTTATAATAATATGGAAATTTAGTGGTTATGGTCCTTTACGACTTATAATGTTTCTCCCTTTTCCCCCATATTATGTGTTCAAGGTTAATTGGGGTCCTTTCCTTTGACAA---TCTTACCAGATAACTTAGCTAGTGGGCATACAACCAAGCTGGTTTTGTTGCATTTCAGA---------GTCCTGTTGGCTTTGAG----GTTCCTACAACTTCAGTACAGTTCTCTGGACTATCTG------TAAGTCTGAACTCCTACCCAGATATAAGGTACACATTAAATCCAATCTCATGAACTTACTTCCTTTCCAATCTAAGTAGCAGGCACGGTTATGTAAGTTCAATTGCTTTC + +a +s mr.mrrefChr0 25884 79 + 130230 CAATTTAAGTTGCAGTCTCACTTATAAGAATTTTAATGTGTTTCAGCCTTCATAATCAGCGTGATATAATCATAAGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27415 79 + 636262 CAATTTAAGTTGCAGTCTCACTTATAAGAATTTCAATGTCTTTCAGCCTTCATAATCAGTGTGATATAATCATAAGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 19522 79 + 647215 CAATCTAAGTAGCAGTCACACTTATATGAATTTTGATGTGTCTCATCTTTCATAATCAGCATGATGTAATCATAAGCCC + +a +s mr.mrrefChr0 25963 161 + 130230 TCACAAGCACATGATTCCCCCCTCAGCACAGCCTGGACAAATGAACAGCCTGGAGTAGACACATGATTCTCTTTAGAATGAAATCATAAGGTTATTCCTGCGCACAGTTATATGCCTTGCTTGTAATTATCATGGGCCTAGCCCTTCACAAGAACATTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27498 160 + 636262 TCACAAGCACATGATTCCTCCCTCAGCACAGTCTGGAAGAACGAACAGCCTGGAGTGGACACATGATTCTCCTTAGAATGAAATCATAAGGTAATTCCTGTGCACAGTTATATGTCTTGCTTGTAATTATCATGGGCCTGGCCC-TCACAAGAACATTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 19601 159 + 647215 TCACAAGCACAAGACTCCCCCCTCAGCACAACCTGGACAAATGAACAACCTGGAGTAG-CACATGATTCTCTCTATAATGACATCATAATGGTATT-CTGCGCACAGTTGCATGCCTTGCATGTAATTATCATAGGCCTAGCCCTTCACAAGGACATTAAG + +a +s mr.mrrefChr0 26124 227 + 130230 CATTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAATTAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTAAATGAATAGTCGTATTAGTTTACATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGTCTCCCAATCATCCTACTGCAATGTGTTGGGATTAGATGTTGACAGATCATTTTGAAGAGCCCTCAAGGGCTCTGCATCTCAAATAGAACTACTAAAGTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27659 221 + 636262 CATTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAATTAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTAAATGAATAGTCATATTAGTTTACATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGTCTCCCAATCATCCTGCTGCAA-----TGGGATTAGATGTTGACAGATCATGTTGAAGAG-CCTCAAGGGCTCTGCAGCTCAGATAAAACTACTAAAGTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 19760 221 + 647215 CGTTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAAATAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTACATGAATAGACGTATCAGTTTAGATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGT------ATCACCCTACTGCAATGTGTTGGGATGAGATGTGGACAGATTACTTTGAAGAGCCCTCAAGGGCTTTGCATCCCAAAAAGAACAACTAAAGTAGT + +a +s mr.mrrefChr0 26351 26 + 130230 AACATAGGCCTATTATGAACATGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27881 26 + 636262 AACATAGGCCTATTATGAACATGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 19981 26 + 647215 ACCTTAGGCCTATTATGAACCTGTTA + +a +s mr.mrrefChr0 26377 37 + 130230 GTGTACATAGGATAATAGATAGTGCTCTAGCAGTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27907 37 + 636262 GTGTACATAGGATAATAGATAGTGCTCTAGCAGTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 20008 37 + 647215 GTGTATATGGAATAATAATTAGTTCTATAGTGGCAGT + +a +s mr.mrrefChr0 26414 59 + 130230 AAGACTATCATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGCCTCCCAATCATCCTACTGCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27945 59 + 636262 AAGACTATCATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGCCTCCCAATCATCCTACTGCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 20045 59 + 647215 AAGACTATCATTCTTTTAGCCATACTCTTTACTGGACTCCCAATCATCCTACTGCAATG + +a +s mr.mrrefChr0 26473 22 + 130230 TGTTGGGATCAGGTGTGGACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28004 22 + 636262 TGTTGGGATCAGGTGTGGACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 20113 22 + 647215 TGTTGGGGTCAGATGTGGACAG + +a +s mr.mrrefChr0 26495 6 + 130230 CTTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28026 6 + 636262 CTTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 20137 6 + 647215 TTTATT + +a +s mr.mrrefChr0 26501 89 + 130230 ATTTTATTGAAGAGCCCGCAAGGGCCTCGCAGCCCAAATAAAACAACTAAAGTAGTAAGCTTAGGCTTATTATGAACATGTTATGTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28032 83 + 636262 ------TTGAAGAGCCCTCAAGGGCTCCTCAGCCCAAATAAAACAACTATAGTGGTAAGCTTAGGCTTATTATGAACATGTTATGTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 20162 89 + 647215 ATTTTATTGAAGAGCCCGCAAGGGCCTGGCAGCCCAAATAAAACAACTAAAGTAGTAAGCTTAGGGTCATTATGAATATGTTATGTGCA + +a +s mr.mrrefChr0 26590 71 + 130230 CACAGAATAATATTTAGTTTGCTAGCAGTGGTAAGACTATCACCAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28116 69 + 636262 CACAGAATAATATTTAGTTTGCTAGTAGT--TAAGACTATCACCAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 20251 71 + 647215 CATAGGATAATAATTAGCTCTCTAGCAGTGGTAAGACTATCATTAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGG + +a +s mr.mrrefChr0 26661 216 + 130230 CTACCAATGGCACACGTCCACACAACATTGTCCAGATTGAATACTAAAACTGGACCTTGGGGGGAGCTGATGGTTCTCCTCTTTTTCTCTCATCCTGCCTGTCACATCTGAAGAATTTTGTGACTACACTGCTTGAAGAGAGCATCTATTCACCAGAGGTTGCTCTGCTCTAGTAAACCAGATGGGGGTGACTAACTAGATAAATTATTGCACTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28188 213 + 636262 CTACCAACGGCATGCGTCCACACAACATCCTCCAGATTGAATACTAAAACTGGACCTTGGGCGGAGCTGATAGTTCTCCTCTTTTTCT---ATCCTGCCCGTCATATCTGAAGAATTTTGTGACTACACTGCTTGAGGAGAACACCTATTCGCCAGAGGTTGCTCTGCTCTAGTAGACCAGGTGGGGGTGACCAACTACATAAATTATTGCACTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 20322 214 + 647215 CAACCAATGGCACACGTCCACACAACATTGTCCAGTTTGTATACGAGAACTGGACCTTGGGGGAAGCTGATGGGTCTCCTCTTTTTCTCTCATCCTACCTG--ACATCTGAAAAATTTTGTGATTACACTGCCTGAAGGGAGCATCTATTCACCAGAGGTTGCTCTGCACTAGTAAACCAGATGGGGGTGACTAACTAGTTAAATAATTGGGCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 26877 46 + 130230 TGGTCAAGAAAAGAGGTGCCCACATCAATCCTAACCAGAATAAGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28407 46 + 636262 TGGTCAAGAAAAGAGGTGCCCACATCAATCCTGACTAGAATAAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 20536 41 + 647215 -----ATGAAAAGAGGTGTCTACATCAATCCTAACCAGAATAAGCG + +a +s mr.mrrefChr0 26923 187 + 130230 GAGACCTGTGGCTTACTCTTAATAGCAATGTTTGTTTACTAATCTCTTACATGGGGCATTAACAGATTGCAAACTGTTAACTACCAACCTATTGAAATGTGTTCTATGGTTTCATGTTATACCTGGAGTTATGTCAATAGTATTGACTGTCAAGTTTATTTTATGGTAGTAGGGGTTGGTACTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28458 175 + 636262 GAGACCTGTGGCTTAGACTTAATAGCAATGTTTGTTTACTAACCTCTTACATGGGGCATTAACAGATTGCAAACTAGTAACTACCAACCCATTGAAATGTGTTCTATGGTCTCATGTTATACCTGGAGTTATGTTAATAGTATTGACTGTCAAGTTTATTTTATGGTAGTAGGGG------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 20577 187 + 647215 GAAACCTATGGCTTACTCTTAATAGCGATGTTTGTTTACTAATCTCTTACATGGGGCACTAACAGATTGCAAACTGTTAACTACCAACCTATTGAACTGTGTTCTATGGTTTCATGTTATACCTGGAGTTATGCCAATAGTAGTGACTATCAAGTTTATTTTATGGTTGTCGGGGTTGGTACTGTAC + +a +s mr.mrrefChr0 27110 5 + 130230 CCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 20765 5 + 647215 CCAGC + +a +s mr.mrrefChr0 27115 34 + 130230 ACTTTTAGGGCACTTGTTTGGGGGCTTGTCCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28633 30 + 636262 ACTTTTAGGGCACTTGTTTGGGG----GTCCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 20772 34 + 647215 ACATTTAGGGCACTTGTTACGGGGCTTGTCCACA + +a +s mr.mrrefChr0 27149 206 + 130230 TAGTTAATAAGCTGTGTTGTGGAGCTATGGAGCAGGCATGAATTGTGGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCGGTTCCTCATAACCAGTTATGTAGATATGAGTGCATGCATTTTTCTCTTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCCCCAGATCCAGTGGGTGTGCTTTGTCATGAGTGAGAGACCTACTGGCTATTTAAATTGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28678 206 + 636262 TAGTTAATAAGCTGTGTTGTGGAGCTATGGAGCAGGCATGAATTGTGGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCGGTTCCTCATAACCAGTTATGTAGATATGAGTGCATGCAGTTTTTTCTTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCCGCAGATCCAGTGGGTGTGCTTTGTCATGAGTGAGAGACCTACTGGCTATTGAAATTGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 20806 206 + 647215 TAGTTAATAAGCTGTGTTGGGCAGCTATGGAGCAGGCATGAATTATAGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCAGTACCTCATAACCAGCTATGTTGGCACAATTGCACGCATTGTTCTCCTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCTCCAGATCCAGTGGGTGTACTTTGTCATGAGTGAGAGACCTAGTGGATATTTGAATTGTAG + +a +s mr.mrrefChr0 27355 42 + 130230 ACTGCGCATTATGGTATTTGTTTACTTCTAGTCCCTGCATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28891 42 + 636262 ATTGCGCATTATGGTATTTGTTTACTTCTAGTCCCTATATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 21012 42 + 647215 ACTGCACGTTAAGGTATTTATTTACTCCTAGTCCCTGCATAG + +a +s mr.mrrefChr0 27397 160 + 130230 CTACCACTGTTGTGTACCTGGAGTCATGTTCCAATACATATAGCGATGTCAGGCACCGCAGTGAGCCAAAGTGGGATGTAGTGAGAGAGTATCCAGAATTAGGATATGCAAAACTGTATTGACTAAAGCTAGGTAGAACAAGGGACCCTTAAGTGTTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28934 160 + 636262 CTACCACTGTTGTGTACCTGGAGTCGTGTTCCAGTTTATATAGCGATGTCAGGCACCGCAGTGAGCCAAAGTGGGATGTAGTGAAAGAGTATACAGAATTAGGATATGCAAAACTGTATTGACTAAAGCTAGGTAGAACAAGGGGCCCTTAAGTGTTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 21054 157 + 647215 CTACCTCTGCTGTGTACATGGAGTCATGTTCCAATACATATAGTGATATCCGGAACTGCAGTGAGTC-AAGTAGGATGTAGTGAGAGAGTATCCAAAAGTAG--TATCCAAAACTATATTGACTAACACTAGGTAGACCAAGGGACCCTTGAGTGTTAAG + +a +s mr.mrrefChr0 27557 176 + 130230 ATGTCCACTAGTCTTACTCCTAACTTTTGGCCTTCTCTGTAACATTGTGCTTATCTTGAACGAGATCCATTTGATTTGTCCTCTTTCTAGAAGCCTGGCTCTATTCAATGATTGTTCTAGTCTGTTCATTTAGTTTCTTGTGTTGCATGTAGTTACACACACCCATCATTATGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29095 176 + 636262 ATGTCCACCAGTCTCACTCCTTACTTTTGGCCTTCTCTGTAACATTGTACTTATCTTGAACGAGATTCATTTGATGTGTCCTCTTTCTAGAAGCCTGGGTCTATTCATTGATTGTTCTGGTCTGTTTATTGAGTTTCTTGTGTTGCAAGTAGTTACACACATCCATCATTATGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 21211 168 + 647215 ATGTCCACTAGTCTTACTCCTATCTTTTGGCCTTGGATGTAACGCCGTGCTTATCTTGAACGACAGCTATTTGATTTGTCCTCTTT--------CTGGCCCATTTTAATGATTGTTCTAGTCTGTTCATCTAGTTTCTTGTGTTGCATGTAGTTACAAACACCCATCATTACAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 27733 68 + 130230 TAGAGTGAGGGACCCACCATCAGATAAGACCTTCTGGGGTAGAGGAAATAGAAGGCATTTGGACCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29271 68 + 636262 TAGAGTGAGGGACCCACCATCAGATAAGACCTTCTGGGGTAGAGTAAATAGAAGACATTTGAACCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 21395 68 + 647215 TAGAGTGGGGGACCCACCCTCAGATAAGACCTTCTGGGGTAGAGGAAATAGTGGGCATTTGGACCAAA + +a +s mr.mrrefChr0 27801 45 + 130230 CAATCCCTTCAGTTGCAAAAGAAGCTGGAAACCACAAGCTAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29340 45 + 636262 CAATCCCTTCAGTTGCAAAAGAAGCTGGAAACCATAAGCTAATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 21463 45 + 647215 CAATCCCTTCAGTTGCAAGAGAAGCTGGATATCACAAGGTAATTA + +a +s mr.mrrefChr0 27846 15 + 130230 GCCTTACCTAAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29385 15 + 636262 GCCTTGCCTAGATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 21509 15 + 647215 GCCTTACTTAAATAG + +a +s mr.mrrefChr0 27861 100 + 130230 ATAAACTATAATTATCATGACTTCAGGCATTTCAGCCTTTCTTGTATCCAACAATAGTTGACTATGGCACTTAGATTTTCCAGCTCCGATATGAGGTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29403 98 + 636262 ATAAACTATAGTTATCATGACTTCAGGCATTT-AGCCTTTCTTGTCTCCACCAATAGTTGACC-TGGCACTTAGATTTTCCAGCTCCGATATGAGGTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 21524 100 + 647215 ATAAACTATAATTATCATGACTTCAGGCGTTTCCGCCTCTCTTGTACCCAACAGTAGTTGACTACGGCACTTAGATTTTCCAGCTCTGATAAGAGATTCA + +a +s mr.mrrefChr0 27961 63 + 130230 AATATAGCCCAAGATTTGGCTTTACTAGAGAGATGCCAATGATTTCAAAGGGTGTTAAGAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29503 63 + 636262 AATATAGCCCAAGATTTGGTTGCACTAGAACAATGCCAATGATTTCAAAGGGTCTTAAGAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 21624 63 + 647215 AAAATACCCCAAGATTTGGCTTTACAAGAGAGATGCCAATGATTCCAAGGGTTGTTAAGAATA + +a +s mr.mrrefChr0 28024 5 + 130230 GGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29567 5 + 636262 GGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 21687 5 + 647215 GTATG + +a +s mr.mrrefChr0 28029 102 + 130230 TTGGGTGTTTATCTAATGTGAACAACCTAGACTGTCTGTTGGTCTTTGGCCTTACTGGGGCATAAGACTGGATCTCTTTTTTGATTTATTGGTAGCCAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29572 102 + 636262 TTGGGTGTTCATGTAATGTGAACAGCCTAGACTGTCTGTTGGTCTTTGGCCTTACTGGGGCATAAGACTGGATCTCTTTTTTGATTTATTGGTAGCCAAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 21807 102 + 647215 TTGGGTGTTTATCTAATGAGAACAACCTAGACTGTACATTTTCCTTTGACCTTACTGTAGCACAAGGCTGGGGCTCTTTTTTGAGTCATTGGTAGCCAAAGT + +a +s mr.mrrefChr0 28131 178 + 130230 GGCAGAGGTTCTTTTTGGACAAAACCAAAGAAAAAACTGAAAAAAGTAAAATCAGGTCCCTTCCAGAATTTTAGACCCGGTTGGTTTGTCACTAGGCTTGAAAGTAGGTCTAAGTGACTCCTTGCATCTAAGAAGTCAGATGAAGAACCACAGTGCTTGTGATTAAGGCACCACCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29674 178 + 636262 GGCAGAGGTTCTTTTTGGACAAAACCAAAGAAAAAACTGAACAAAGTAAAATCAGGTCCCTTCCAGAATTTTAGACCCGGTTGGTTTGTCACTAGGCTTGAAAGTAGGTCTAAGTGACTCCTTGCATCTAAGAAGTCAGATGAAGAACCACAGTGCTTGTGATTAAGGCACCACCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 21933 178 + 647215 GGTAAAGAATCTTTTTGGACAAAACCAAAGAAAAAAATGAAAAAAGTAAACTCAGGTCCCTTCCAGAATTTTAGACTGGGTTGGTTTGTCACTAGGCTTGAAAATACGTCTACGTGGCTCCTTACATCTAAGAGGTCAGATGAAGAACCACAATGCTTGTGATTAAGGCACCACCTGA + +a +s mr.mrrefChr0 28309 16 + 130230 TTTGGGAAGGCCCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29853 16 + 636262 TTTGGGAAGGCCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 22111 16 + 647215 TTTGGGAAGCCCCATT + +a +s mr.mrrefChr0 28325 26 + 130230 ACTGAGTTCCCACCTACTTTTGTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29873 26 + 636262 ACAGAGTTCCCACCTACTTTTGTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 22127 26 + 647215 ACTGAGTCCCCACCTACTTTTGTTCC + +a +s mr.mrrefChr0 28351 94 + 130230 ACTTTTTACCAGGCTGCTTGCTTTAGGAGAGTACCTATAAACTTGGTGCTTCCCCATGGTAAGTTTGTATGATAGTCATCAGGGTTACTAGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29904 94 + 636262 ACTTTTTACCAGGCTGCTTGCTTTAGGAGAGTACCTATAAACTAGGGGCTTCCCCATGGTAAGTTTATATGATAGTCATCAGGTTTACTAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 22153 94 + 647215 ACTTTAAACCAAGCTGATTGCTTTAGGAGAGGACCTACGAACTTAGTGCTTCCTCATGGTAAGTCTGTAGAATAGTCATCAGGGTTCCTAGAGA + +a +s mr.mrrefChr0 28445 12 + 130230 TTGTTATAAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 29998 12 + 636262 TTGTTATAAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 22255 12 + 647215 TGATTCCAAAGA + +a +s mr.mrrefChr0 28457 86 + 130230 GGATGTTGGGTGTTTATCTGTTAAATGTGAACAGGGTTGCATTATGTGCTTTGTCTTTACTCCTGCTACTGGGGCCTGAGGACTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30010 86 + 636262 GGATGTTGGGTGTTTATCTGTTAAATGTGAACAGGGTTGCATTATGTGCTTTGTCTTTACTCCTGCTACTGGGGCCTGAGGACTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 22274 86 + 647215 AGATGTTGGGTATTTATCTGTTAGATGTGAACAGGGTTGTAATATGTGCTTTCTCTTTAGTCTCACTACTGGGGCCTGAGGACTAG + +a +s mr.mrrefChr0 28543 160 + 130230 GTCTGACTCTTCATACACAGGTGGCCAAAGTGGCAGCAATTCTTTTTGGACAAAACCAAGGAAAAAACTGAAGAAAGTAAAATTGTGTCCTTTGCAGAATATTAGACCCAGTTAGTTAGTCACTAGGCTCAAAAACAGCTATAAGTGGACCTTCTTGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30096 160 + 636262 GTCTGACTCTTCATACACAGGTGGCCAAAGTGGCAGCAATTCTTTTTGGACAAAACCAAGGAAAAAACTGAAGAAAGTAAAATTGTGTCCTTTGCAGAATATTAGACCCAGTTAGTTAGTCACTAGGCTCAAAAACAGCTATAAGTGGACCTTCTTGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 22376 160 + 647215 GTCTGACTCTCCATACATGGGTGGCCAACGTGGCAGCAGTTCTTTTCAGACAAAACAAAGGGAAAAACTGAAGAAAGTAAGATCGTGTCCTTTTCAGAATTTTAGACCCAGCTAGTTAGTAACTAGGCTTGAAAACAGGTATAAGTGGACCTCCTGGCAT + +a +s mr.mrrefChr0 28703 103 + 130230 CTATGAAATCAGATCAAGTAGCATGGTGCTTGTGGTTAAGGCACTACTTGATTTGAGAAGTCCCACCACTAAGTTCCCACTTAATTTTTACTAGACAGGATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30376 103 + 636262 CTATGAAATCAGATCAAGTAGCATGGTGCTTGTGGTTAAGGCACTACTTGATTTGAGAAGTCCCACCACTAAGTTCCCACTTAATTTTTACTAGACAGGATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 22536 103 + 647215 CTATGCAATCAGATCAAGTAGCATTGTGCTTAAGATTAAGGCACAACTTGATCTGAGAAATCCCACCACTAAATTCCCACTTAATTTTTACTAGACAGAATTT + +a +s mr.mrrefChr0 28806 39 + 130230 CACCTTGGGAAAGTATTCACAAATTTGAGGCTTCCCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30479 39 + 636262 CACCTTGGGAAAGTATTCACAAATTTGAGGCTTCCCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 22641 39 + 647215 CACCTTAGGTAAGTATCCACAAACATGGGGCTCCCTTGT + +a +s mr.mrrefChr0 28845 33 + 130230 GTAAGTATGTATGTGAGCCATCAATCAGCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30519 33 + 636262 GTAAGTCTGTATGCTAGCCATCAATCAGCAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 22680 33 + 647215 GTAAGTATGTATGTGGGCCACCAATCAGCTGTA + +a +s mr.mrrefChr0 28878 180 + 130230 TTTAGTCTTCTTAAGGAACAGCTGGTAGTTTGGGGTGTAAGTTTACTCTAATCACTCACTATAAAATGACCAGTGTCCTGTCCCTATGGTTGGCTACTACTCTTGATATACGCAGGATTAACAGCCAAAGGTTAGCCGTTCCATTGGTATGCTATGTCTGTAGCTACAACCTGATACACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30552 179 + 636262 TTTAGTCTTCGTAAGG-ACAGCTGGCAGTTTAGGGTGTAAGTTCACTCTAATCACTCACTATAAAATGACCAGTGTTCTGTCCCTATGGTTGGCTACTACTCTTGACATACGCAGGATTAACAGCCAAAGGTTAGCCGTTTCATTGGTATGCTAAGTCTGTAGCTACAACCTGATACACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 22714 180 + 647215 TTTAGTGTTCTTAAGGAACAATTGGTAGCTCGGGGTGTAAGTTTACTCTAGTCACTCACTATAAAATTACCGGTGTCTTGTCCCTATGCTTGGCTACTACTTATTATATACACAGGATTAACAGCCACAGGTTAGCCCTCCCATTGGTATGCTATGTCTGTAGCTATAACCTGATACACC + +a +s mr.mrrefChr0 29058 26 + 130230 TGTATTATAGGGATATTAGACATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30732 26 + 636262 TGTATTATGGGGATATTAGACATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 22894 23 + 647215 TGTATTATAGGGATATTAGACAT--- + +a +s mr.mrrefChr0 29084 42 + 130230 CTTGCACCACAAGGTGGTGATGCACCATGAGTCTACTAATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30759 42 + 636262 CTTGCACTACATGATGGTGATGTACCATGAGTGTACTAATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 22917 42 + 647215 ACTGCACCACAAGGTGGGGGTGCACGATGAGTCTAGTAATGA + +a +s mr.mrrefChr0 29126 28 + 130230 CCAGAGAACTTGAGAAAATGTGGTAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30898 28 + 636262 CCTGAGAACTTGAGAAAATGTGGTAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 22959 27 + 647215 CCAAAGAACTAGAGAAAATGTGGTTGC- + +a +s mr.mrrefChr0 29154 9 + 130230 GTGCCCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 30927 9 + 636262 GTGCCCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 22986 9 + 647215 GTGCCCCTA + +a +s mr.mrrefChr0 29163 38 + 130230 CAGGCCTTCCCCAATTTCAATTTATATGCTGCTATCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31028 38 + 636262 CAGGCCTTCCCCAATTTCAATTTATATGCTGCTATTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 22995 38 + 647215 CAGGCCTTCCCCAATTTCTATTTATATGCTGCTATCCA + +a +s mr.mrrefChr0 29201 41 + 130230 AGGTTAACATTAAGTTAGTTAGATGTTGCTTGATTTTCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31098 41 + 636262 AGGTTAACATTAAGTTAGTTGGATGTTGCTTGATTTTCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 23033 41 + 647215 AGTTTAACACTGAGTTAGTTAGACGTTGCTTGATCCTTAAG + +a +s mr.mrrefChr0 29242 129 + 130230 CTTCTCTCTGCACTTGGATGTGCATATGATCGATGGAACATTTGCCAATCTGCATAAGAGTAATTCTTATATATTCCTGAATAGAGATCATCAGTAGATAAATAGCACCATCCTAGCATCATGGAGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31139 119 + 636262 ---------GCACCTGGATGTGCATATGATCAATGGAACATTTGCC-TTCTGGGTAAGGGTAATTCTTATATATTCCTGAATAGAGATCATCAGTAGATAAATAGCACCATCCTAGCATCATGGAGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 23090 129 + 647215 CTTCTCTCTGCACTTGGATGTGCATATGCGCGATGGCACAAACGTCAATCTGCATAAGAGTAATTCTTATATATTCATGGTTAGAGATCATCAGTAGATAATTAACAACATTCTAGCATGACAGAGGGC + +a +s mr.mrrefChr0 29371 77 + 130230 CATTAGTACTACGCTTTCTCCTTTTCTTCCCATAAGCTGTGTGTGAGTGCCTGACTTACTTAAGAGTTCTCCCCTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31258 77 + 636262 CATTAGTACTACGCTTTCTCCTTTTCTTCCCATAAGCTGTGTGTGAGTGCCTGACTTACTTAAGAGTTCTCCCCTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 23247 77 + 647215 CATTAGTAGTATGCTTTCTCCTTTTCTTGCCATAAGCTGTATGTCAGTGTTTGACTTACTTAAGAGTTCTCCCTTTC + +a +s mr.mrrefChr0 29448 69 + 130230 CCTGTACCATACCTGTGTGGTATGGGGGATGCCATCCTCTCTTATGAAAAGTAACTTAAAGTCCTGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31335 69 + 636262 CCTGTACCATACCTGTGTGGTATGGGGGATGCCATCCTCTCTTATGAAAAGTAACTTAAAGTCCTGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 23327 69 + 647215 CCTGCACCATACCAGTGTGGTATGAGAAATGCCATCCTCTCTAATCAAAAGTAACTTAAAGTCTTGTCA + +a +s mr.mrrefChr0 29517 7 + 130230 GATAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31518 7 + 636262 GATAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 23396 7 + 647215 GATATCA + +a +s mr.mrrefChr0 29524 24 + 130230 CACTCCCATAATATTACATTCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31526 24 + 636262 CACTCCCATAATATTGCATTCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 23403 24 + 647215 CACTCACATAATATTACATTCATT + +a +s mr.mrrefChr0 29548 42 + 130230 AAGGTGAATATTAATTATCTCTGTGCATTCATGATAGCACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31550 42 + 636262 AAGGTGAATATTAATTATCTCTGTGCATTTATGATAGCGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 23429 42 + 647215 AAGGTGAATATTAATTATCTCTGTGCATTCATGGTAGCAATG + +a +s mr.mrrefChr0 29590 44 + 130230 TGGAACTTTTTCTGTGTACCAGCAGGCAACTACACCTATATTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31592 44 + 636262 TGGAACCTTTTCTGTGTACCAGCAGTCAACTACACTTACATTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 23479 41 + 647215 TGCAACTTTTTCTGTGTACCAGCAGGCA---ACACCTATTTTTT + +a +s mr.mrrefChr0 29634 183 + 130230 GGACTCTGCTGCTCAACGGGTCCTTCTACCCATGAGTCGCTCTGTATGTTCCATTGTGGCCTTTACTGTTACACCTTGTGAGGACAAACCACTAGAGGCTTTTATTAAAGTGGTTGTTTGGATGGGTGTGGTCAGAATATTGGTGAAGTTACATTCTAGATATAGTCTTTGTAGGATACCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31639 173 + 636262 GGACTCTGCTGCTCAACGGGTCCTTCTACCCATGAGTCGCTCTGTATGTTCCATTGTGGCCTTTATTGATACACCT---------AAACTACTAGAGGCTTTTATTAAAGTGGTTGTTTGGATGGGT-TTGTCAGAATATTGGTGATGTTACATTCTAGATATAGTCTTTGTAGGATTCCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 23520 182 + 647215 GGG-TCTGCTGCTCAATTGATCCCTCTACCCATGACTCACTTTGTATGTTCGATTGTGCCCTTTACTGTTACACCTTGTGAGGACAAGCCACTAGAGGTGTTTATTAATGTTGCTGTTTGGTTGAGTGTGGCCAGAATATTGGTGAAGTTACATGCTAGATAGAGTCTATGTAGGTTACCCCT + +a +s mr.mrrefChr0 29817 93 + 130230 TCAACTAATCCTTTCTAAGAGGCCTACTGAACTCTCCAATGTCGCCATTCTTGTTTTGTTGATAGCCAGTTCCAACCCACTCTGATTTTGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31812 61 + 636262 TCAACTAATCCTTTCTCAGAGGCATACTGAACTCTCCAATGCCACCATTCTTGTTTTGTTG-------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 23703 93 + 647215 TCAACTAATCGTTTCTAAGGGGCCTACTGGACTCTCCGATGTTGCCATTCTTGTTTTGTTGATAGCCAGTTCCAACCCACTCTGATTTTGATG + +a +s mr.mrrefChr0 29910 19 + 130230 ACTATTCTTAGATGTTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31873 15 + 636262 ----TTCTTAGATGTTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 23798 19 + 647215 ACTACTCTTACATGTTGTA + +a +s mr.mrrefChr0 29929 234 + 130230 TTTTTAAACAGGCTTCTCTTGTACAGCTATACCAACCAGTCACTAACTTGTCAGGTGACTCCAGGGCTGCTAAGGGCTGCATGCCTTTCTAGGCCTGTATCAAGTTATTCAGCGTTACAGATAAAGTAGTATTCCAATTGGAATAGGGGTGGTGTCTGACTCATTTTAGGGGCGAAGAAGTTTGTAGCAAATTTTGAAAAAATGTTAACTTAACCACCAACTATCAATAGAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 31889 234 + 636262 TTTTTAAACAGGCTTCTCTTGTACAGCTATACCAACCAGTCACTAACTTGTCAGGTGACGCCAGGGCTGCTGAGGGCTGTATCCCTTTCTAGGCCTGTATCAAGTCATTTAGGGTTACAGATAAAGTAGTATTCCAATTGGAATAGGGGTGGTGTCTAACTCATTTTAGGGGCGAAGAAGTTTGTAGCAAATTTTGAAAAAATGTTAACTTAACCACCAACCATTAATAGAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 23817 220 + 647215 TTTTTAAATAGGCTCCTCTTATACAGCTATATTAATCAGTCACTAACTTGTCAGG-GGCTCAAGGGCTGCTAAGGGCTGCATGCCTTTCTAGGCCTGTATCAAGTTATTCAGCGTCAGAGATAAAGTAGTATACCACTTGGAT-AGAGGTGGAGTCTG---------AGGGGCGAGGAAGTTTGTAACAACTTTTGAAAAAATGTTA---TAACCTCCAACTATCAATAGAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 30163 130 + 130230 ATACTGATGTCCTGTCCTAGTCCAAGTCTTGATGCCTAGATAGTGGGTAAAGACAAAATATGGTCACCAAAGGGAACTATATAATGAACCAGTAAATACAGAACATTTGGTATCAGTGTGGAAGTCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32124 130 + 636262 ATACTGGTGTCCTGTCCTAGTCCAAGTCTTGATGCCTAGATAGTGGGTAAAAACAAAATATGGTCACCAAAGGGAACTATATAATGAACCAGTGAATACAGAACATTTGGTATCAGTGTGGAAGTCTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 24037 127 + 647215 ATACTGATACTCACTCTTAGTT---GTCTTGAAGTCTAGATTGTGGGTAAAGACAAAATATGGTCACCAAAGGGAACTATATAATGAACCAGTAAATACAGAACATTCGGTATCAGTGTGGAAGTCTGTA + +a +s mr.mrrefChr0 30293 81 + 130230 TCCCAGATTTCATGTATATGACTCAATAGATTATGTTGGGGCTCTTTCCCCATTCGTAGTAGTCAAGGGCTGAAGATCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32254 67 + 636262 TCCCAGATTTCATGTATA--------------ATGTTGGGGCTCTTTCCCCATTCGTAGTAGTCAAGGGCCGAAGATCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 24165 81 + 647215 TCCCAGATTTCATGCATATGACTCAATAGATTATGTTGGGGCTCTTTCCCCACTCGTAGTACATAAGGTCTGAAGATGATC + +a +s mr.mrrefChr0 30374 90 + 130230 CATCTCGCAACGATACTTGGAACATGACCTGGTAGTCAGCCCACCTTGAAACAGCAGAGTAAGTATGAGTTACTGACAAACATGACTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32321 89 + 636262 CATCTCGCAACGATACTTGGAACATGACCT-GTGGTCAGCCCACCTTGAAACAGCAGAGGAAGTATGAATTACTAACAAACATGACTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 24559 90 + 647215 TATCTCGCAAGTCTACTTGGAACACGACCTGGTAGTAACCCCACCTTGCAACAGCAGAGTAAGTCTGAGTTACTGACAAACATGACTCTG + +a +s mr.mrrefChr0 30464 373 + 130230 ATTGATATAACAAGGGCAATTAACGCCAAGCATCAATGAGAAGATGGTCGATGCGGATGATATAAGGCGTTTTTAAATTACAGTAACTGTCACATAGAACGTTAAATCAGGTTTTTCAGCAACACTCTCATATAATAATTCTATGGTGGACAAAAAATGGTTGAGGCCAGATCAGTTACTACAGGTTAATTAAATTCTTAGAATGTTTTAGTGCTCCAATGCTTCATCCTGATTGTTGATGAATACAGGAGCACTATAGGAAAACTTTCACGGAATGCTTAATAGGATATGATAGGCTCCTTTTGTTCCAATTTGAAAATTTACTACCAGTGATGCCTAGTACCATTCTACAGATCGCACAAGAACAAGGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32410 373 + 636262 ATTGATATAACAAGGGCAATTAACGCCAAGCATCAATGAGAAGATGGTCGATGCGGATGATATAAGGCGTTTTTAAATTACAGTAACTGTCACATAGAACGTTAAATCAGGTTTTTCAGCAACTCTCTCATATAATAATTCTATGGTGGACAAAAATTGGTTGAGGCCAGATCAGTTACTACAGGTTAATTAAATTCTAAGAATGTTTTAGTGCTCCAATGCTTTAGCCTGGTGGTTGGCAAATACAGGAGCACGCTAGGTAAACTTTCATGGAATGCTTAATAGGATATGATAGGCTCCTTTTGTTCCAATTTGAAAATTTACTACCAGTGATGCCTAGTACCATTCTACAGATCGCACAAGAACAAGGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 24650 372 + 647215 ATGGGTAGAACACAGGCAAATTAGGCCATGCATTGATGAGAAAATGGTAAACGCAGATGATATAAGATCTTGTTAAAAATCAGTCACTGTCACATAGAGTGTTAAATCAGGTTTCTCAGTCAGACTCTCACATAATAATTCTATGGTGGACAAAAAATGGTTGAGGCCACATCAATTAGTACAGGTTACTTAAATTCTTAGAATGTTTTAGTGCTCAAATGC-TCATCCTGATTATTGATGAATACAGGAGCACTATGGGAAAACTTTCACAGAATGCTTAATAGGATACGATCAGCTCCTTTTGTTCTAATTTGAAGATTTACTACCAGTGCTGCCAAGAACCACCCTACAGATCATACAAGAACAAAGCAC + +a +s mr.mrrefChr0 30837 74 + 130230 AGACATATGCTTAGGGCACTTCCAGGCTATGGCAATCTCTTTCTGTGGTAATTTGAAGCTTCACTACCAGTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32783 74 + 636262 AGACATATGCTTAGGGCACTTCCAGGCTATGGCAATCTCTTTCTGTGGTAATTTGAAGCTTCACTACCAGTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 25038 69 + 647215 AGAAATATGCCTAGGGCACTTCCAGGCTATGACAATCTCTTTCTGTGGGGACTTGAAG-----CTACCAGTGGT + +a +s mr.mrrefChr0 30911 79 + 130230 ATTTAATTACTACTCTATGAATAACCCAAGAGCTAAGCGCTCTTAAGTTTACTCCAGTCATATCATTAAAGGCAATTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32857 78 + 636262 ACTTAATTACTACTCTCTGAATAA-CCAAGAGCTAAGCGCTCTTATGCTGACTCCAGTCATATTATTAAAGGCAATTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 25114 79 + 647215 GTTTAATTACTACTCTATGAATAACCCAAGAGCTAAGCACTCTCAAGTTTACTTCATTCCTGTCATTAAAGGCAATTCC + +a +s mr.mrrefChr0 30990 339 + 130230 AGACTAAGTCACAACACAAATTTGAACAAGGTGGGGTACAAGGGACCTTTTGTTAATTGTCTGATATTGTGTGGATTATTTATATCGTCTTACATCGTTCCTGCTGCCCAATTGCATACCTTTCAGCATAGTAGTCCTTGCTCCCCACTCACATACAAACACACTGGGGCATATATAAATGTAAACTACACTCCACCAAACTAGAAGAGTAATGAGGTGTCTCCACCTTCAATGGGAGCAACTCTACATATGTATGGTATTGCCTATATGCTAGCCACACTACCCCAAAGCAAGGGCGAACTGGTTGTATGAAAGCCTCCTTTTAGTTTCAAGGACTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 32936 331 + 636262 AGACTAAGTCACAACACAAATTTGAACCAGGTGGGGTAGAAGGAACCCTTTGTTAATTGTCTGATATTGTG-GCATTATTTATAT--TCTCACATCGTTACTGCTGCCCAATTGCATACCTTTCAGCATAGCAGTCCTTGCCCACCACTCACATCCAAACACACTGGGGCATATATAAATGTAAACTGCACTCCACCAAACTAGAAGAGAAATGA-----CTCCACCTTTGATGGGAGCAACTCTACATATGTATGGTATTGCCTATAAGCTAGCCACACTACCTCAAAGCCAGGGCGAACTGGTTGTATGAAAGCTTCCTTTTAGTTTCAAGGACTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 25193 327 + 647215 AGACTAAGTCACAACATCAACTTGCACAGGGTGGCATACAAGGGACCTTTTGTTACTTGTCTGATATTGTGTGGGTTATCTGAATCGTCTTACATCATTCCGGCTGCCCAATTGCATATCTTTCAGCATAGTAGTCCCTATTCCCCACTCA-ATACAAACACACTGGGGCATTTAT---------TTACATTCCACCAATCTAGAAGAGTAATGCGGTGTCTCCACCTTCACTGGGAGCAAATCTACATGTGTATGGTATTGCCTATATGCTCTCCACACTGCCCCAAAGTAAGGGCTAACTTGTTGTACGAAAGCCTCCTTTTAGTT--GAGGACTGA + +a +s mr.mrrefChr0 31329 91 + 130230 CAAACATTAAGTAAAAGGGAGTCATTCTGCATTCTATGTACATGTATGTCTATGCACCTAAGTGTACATAGCTGGGCTGCTCCAATATAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33267 91 + 636262 CAAACATTAAGTATAAGGGAGTCATTCTGCATTCTATGTACAGGTATGTCTATGCACCTAAGTGTACATAGCTGGGTTGCTCCAATATAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 25521 86 + 647215 CAAACCTTAAGCAAAAG-----CACTTTGCATCCTCTCTACATGTATGAATCTGCACCTAGGTGTACATAGCTGGGCTGCTCCAATATAGC + +a +s mr.mrrefChr0 31420 34 + 130230 TCTACCGTTACTCCAATATATCAGTTTATCAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33360 34 + 636262 TCTACCGTTACTCCAATATATCAGTTTATTAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 25607 34 + 647215 TCTACCGTTACTCCAATATATCAGTATATCAAAT + +a +s mr.mrrefChr0 31454 156 + 130230 CATGCAAAGTGAAATAACACTAAATTGCTGGGTGATTTTCTCAAGACCTAGGGAGTCAAGAGTAAGCGCATTGTGTTTATTTGTAGAGTTCTAAGCCCTGAGTTTACTCTGATTTCCTTACTTTCTAATCTAACCAGCATGAATCCCCTTAGGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33394 156 + 636262 CATGCAAAGTGAAATAACACTAAATAGCTGGGTGATTTTCTCAAGACCTAGGGAGTCAAGAGTAAGCACATTGTGTTTATTTGTAGAGTTCTAAGCCCTAAGTTTACTCTGGTTTCCTTACTTTCTAATGTAACCAGTATGAATCCCCTTAGGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 25643 137 + 647215 CATG----------------TAAATTGCTGGGTGATTATCGCCAAACCTAAGGAGTTGAGAG--ATCGCATTATGTTTCTTTGTAGAGTTCTAAGCCCTGACTTTACTCTCATTTTCTTACTTTCTAATCTAA-CGGCATGAATCCCCTTAGGTCT + +a +s mr.mrrefChr0 31610 196 + 130230 CTCCCTTTTCTTTATTATCTCGTTATCTTTATTAGCTGCTTCCATTCATCCCAGCTGAACTGCACATCTCTTCAACTGACTTAAGACTCCTACTAACCTGTGGGCCCAGAAGTCACTCTAAGACTAGTGAACTTACTATCAGGATTATCCTCAAGACTTAATAACAGGCTCCTTTCCATAGCCCTCCAAATGGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33551 196 + 636262 CCCCCTTTTCTTTATTATCTCGTTATCTTTATTAGCTGCTTCCATTCATCCCAGTTGATCTGCACAGCTCTTCAACTGGCTTAAGACTCCTACTAACCTATGGGCCAAGAAGTCACTCTAAGACTAGTGAACTTACTATCAGGATTATCCTCAAGACTTAATAACAGGCTCCTTTATATAGCCCTCCAAATGGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 25780 186 + 647215 CTCCCTTTTCTTTGTTAACTAGTTATCTTTATTAGGTGGTTCCATTCATCCCAGCTCAACTGCAAATCTCTTCAACTGACTTAAGATTCCTACTAACCTGCGGGCCCAGAAGCCACTCTAAGACTAGTGAATTTATTACCAGGATTATCCTCAAGGCTGAATAACAGGCTCCTTTCCAT-GCCCTCC--------- + +a +s mr.mrrefChr0 31806 102 + 130230 GATGAACTACTGCCCAACCAGATCAAGACTCCTAGTGAAACCTTGCCTCTCATCTCAGTAGGGTTGCTGAAGACACCACCACAAGTGATACTATAGTTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33752 102 + 636262 GATGAACTACTGCCCAACCAGACCAAGACTCCTGGAGAAACCTTGCCTATCATCCCAGTAGGGTTGCTGAAGACACCACCATGAGTGTTACTATAGTTATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 25966 85 + 647215 ----------------ACCTGATCAAGACTCCCAATGGCACCTTGCCTCTTATCTCTGT-GGGTTGTTGAAAACACTACCACAAGTGATACTCTAGTTATTA + +a +s mr.mrrefChr0 31908 28 + 130230 AGATGTACTTTCAGATATGAACTGCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33855 28 + 636262 AGATGTATTTTTAGATATGAACTGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26051 28 + 647215 AGCCGTACTTTCCGATATGAAGTACTTT + +a +s mr.mrrefChr0 31936 43 + 130230 TTTGAATCTGGACTACTAGACCCTTCTTTAGTGCTTCATGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33888 43 + 636262 TTTGAATCTGGACTACTAGACCCTTCTTTAGCGCTTCATGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26079 33 + 647215 ----------GGCTACTACACCCTTCTTTAGTGCTTCatggac + +a +s mr.mrrefChr0 31979 158 + 130230 GTACATTCACTGTGATTAGCCTTAGGCTCTCATACATTGAGTGGTGGCACCCAGCTGGTTGAACATGATCACCTATGACACATTTCACTCTGTGAGATAGTGGTATGACATATCACAGGGGCTGGCTTGGGAGTCAATGTGGCTCCTTGTCCCGCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 33931 158 + 636262 GTACATTCACTATGATTAGCCTTAGGCTCTCATACATTGAGTGGTGGCACCCAGCTCGTTGAACATGATAACCTATGACACATTTCACCCTGTGAGATAGTGGTATGACATATCACAGGGGCTGGCTTGGGAGTCAATGTGGCTCCTTGTCCCGCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 156489 154 + 647215 GTACATTCACTGTGTTTAGCTTTAGGCTCTCATACATTGAGTGGTGGCACCCAGCTGGTTGAACATGGTCACCTATGACACATTTAACTCTGTGAGATAGTGGTATGAC----CACAGAGGCTAACCAGGGAGTCAATCTGGCTCCTTGTCCAGCAGA + +a +s mr.mrrefChr0 32137 2 + 130230 tc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34089 2 + 636262 TC +s simRat_chr6.simRat.chr6 26173 2 + 647215 cc + +a +s mr.mrrefChr0 32139 20 + 130230 aagcactaggggagtagcaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34091 20 + 636262 AAGCACTAGGGGAGTAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26192 20 + 647215 gagcactaggggggtaggaa + +a +s mr.mrrefChr0 32159 31 + 130230 ttttaacgtatggacactaatcagccactCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34115 31 + 636262 TTTTAACGTATGGACACTAATCAGCCACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26212 31 + 647215 ttttgatgtctggacactaatcaggtgctCA + +a +s mr.mrrefChr0 32190 9 + 130230 AATAGTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34146 9 + 636262 AATAGTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26244 9 + 647215 AATAGTTTA + +a +s mr.mrrefChr0 32199 27 + 130230 GGATTTGCAATCCAGTTGAGTGCTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34155 27 + 636262 GGATTTGCAATCCAGTTGAGTGCTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26254 27 + 647215 GGATTTGCAACCCAGCTGAGTACTATT + +a +s mr.mrrefChr0 32226 61 + 130230 AAACTTGTCTTGTCTCATGAGTCCCCTTGCATAATTTTTCCATGACAGAGTAAATATCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34182 61 + 636262 AAACTTGTCTTGTCTCATGAGTCCCGTTGCAGAATTTTTCCATGACAGAGTAAATATCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 26284 61 + 647215 AAACTTGTTTTGTCTTATGAGTCCCCTTGCATAATTTTCCCATGACAAAGTAAATATCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 32287 246 + 130230 ATTTTGTTGTAGGGAACCTACTTAATTGGAAAGTCATTATGGATAGTTAGTGTTGCTGTGTGTGTGGCTTACACCCTCATCTACTAATTATGATAGGTGGAGATACAATAATATAGAATCCAAGCTTGAGAGGAAAGGTTTCAATAGGTCAAGAGCAATACCAAATTGTCATACACTGTGATGTGGATTATCTCTGCTTTCATCATGTACATTTATAAACTCACTTGTCCTTTTGCAGTGCCCGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34259 245 + 636262 ATTTTGTTGTAGGGAACCTACTTGATTGGAAAGTCAATATGGG-AGCAAGTGTGGCTGTGTGTGTGGTTTACATCCCCATCTACTAATTATGACAGGTGGAGATACAATAATATAGAATCCAAGCTTTAGAGGAAATGCTTCAATAGGTCAAGAGCAATACCAAATTGTGATACACTGTGGTGTGGATTATCTCTGCTTTCATCATGTACATTTATAAACTCACTTGTCCTTTCGCAGTGCCCGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 26345 243 + 647215 ATTTTGTTGCAGTGAACCTACTTAATTCAAAAGTCATTATGGATAGTTAGTGTTACTGCGTGCGTGGCTTACACCCTCATCTACTAATTATGATAGGTGGAAAT---ATAATATAGAATCTGAGCTTGAGAGGGAAGGTTTCAATAGGTCAAGAGCAATATCAGATTGTCATACACTGTGATGTGGAATATCTCTGCTTTCATCATGTACATTTAAAAGCTCACTTGTCCGTTTGCAGTGCCCGTG + +a +s mr.mrrefChr0 32533 96 + 130230 CTACTCCTATTAACTTACATTCCTTATTTCCCTCTAATTTTTCACTCATTGCCCCCATCTCAGTCAAAATACTGCTGGACCCCTCTCCAATTCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34510 96 + 636262 CTACTCCTATTAACTTACATTCCTTATTTCCCTCTAATTTTTCACTCAGTGCCCTCATCTCAGTCAAGATACTGCTGGACCCCTCTCCAATTCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26588 96 + 647215 CTACTCCTATTACAGTACATTCCTTGTTCTCCCCTAATTTTTCACTCATTGCCCCCATCTCAGTCAAAATACTGCTGGACCCCTCTCCAAGTCCCT + +a +s mr.mrrefChr0 32629 66 + 130230 GAATTTGCAGAAAGTTGGCCCCAATATCGCTATTACATTGCAAATTGTTATGACAAAGATAGCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34630 66 + 636262 GAATTTGCACAAAGTTGGCCCCAATATCGCTATTACATTGCAAATTGTTATGACAAAGATAGCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 26684 63 + 647215 GAATTTGCAGAAAGTTGGCCCCAAGA---CTATTACAATGCAATTTGTTATGACAGAGATACCTCC + +a +s mr.mrrefChr0 32695 17 + 130230 CAGTCCTAGAGTAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34699 17 + 636262 CAGTCCTTGAGTAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26747 17 + 647215 CAGGCCTAAAGTAACAT + +a +s mr.mrrefChr0 32712 54 + 130230 GTTGTGGGCAATGCCTGCTGTCCAGTGATCTTGACATCAACAGTTCTTACGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34716 54 + 636262 GTTGTGGAGAACACCTCCTGTCCAGTGATCTCGACATCAACAGTTCTTACAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26765 54 + 647215 GTTGTGGGCCATGCCTGCTGCCGAGTGATCTTGACTTCAACAGTTATCACGGCA + +a +s mr.mrrefChr0 32766 81 + 130230 GCACTTGTTGCCATTGGGAGGAAGGTATCATCAGATTAACAAGTTAATTCCCCAGGGCCAGAGGCTATAAATGGTGGTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34770 81 + 636262 GCACTTGTTGCCAATGGGAGGAAGTTACCATCAGATTAACAAGTTAATTCCCCAGGGCCAGAGGCTATAAATGGTAGTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26820 64 + 647215 GCATTTGGTGCCATTGGGAGGGAGGTATAATCAGGTTAACAAGTT-----------------GGCTATGAATGGTGGTAGA + +a +s mr.mrrefChr0 32847 189 + 130230 CTGAAGAGAAGTTCATATGTTGCACATCATCTGTACCTATGCTCAACTGCACCTTTCCTGGAATTCCATTTTGAAGTGAAGTGCTGGATTTTTTGAAATGCTGCTCACTAATCAAGATTAACAATTCAGAATAAGTTTCTACTTGTATAATAGGTTTCTCAGCTAGCTCAGTATTTCATTTCCATCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 34851 185 + 636262 CTGAAGAGAAGTTCATGTGTTGCACATCATCTGTACCTATGCTCAAATGCACCTTTCCTGGAATTCCATTTTGAAGTGATGTGCTGGATTTTTTGAAATGCTG----CTAATAAAGATTAACAATTCAGAATAAGTTTCTACTCATATAATAGGTTTCTCAGCTAGCTCAGTATTTCATTTCCATCTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 26890 189 + 647215 ACAAAGAGAAGTTCATATGAAGCACATCATTTGAATCTATGTTCGACTGCATCTCTCCTGGGATCCCATTTTTAAGTGAAGTGTCGGATTTTTTGAAAACCTGCTCACTAATCAAGATGAACAACTCAGAATAAGTTTCTACTTGCATAATCGGTTTGTCAACTCGCTTAGTATCTCATTTCCATCTAG + +a +s mr.mrrefChr0 33036 237 + 130230 TAAATTTAGATTTTGTTAGAAAGGTCACTAAATCTTAATGGCAACAAGTGGCACTGTTGGACTCCCATGTGAATCTAGAACAAGCCACTCACCGCTAAACAAAGGGATCATAGGAGCAAAGAGGGTTTCCTTGAATGGGCTCAAACAGCATTTGCGTCAAATGATTCACTCACAAAATAGACTTTGAATGTGTCACGAGACTTTTAACTTGAAGTCCAATCAAGGATAACTGACAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35036 209 + 636262 TAAATCTAGATTTTGTTAGAAAGGTCACTAAATCTTAATGGCAACAAGTGGCACTGTTGGACTCCCATGTGAATCTAGAACAAGCCACTCACCGCTAAACAAAGGGATCATAGGAGCAAAGGGGGTTTCCTGGAATGGGCTCAAACAGCACTTGCGTCAAATGATTCACTCACAAAATAGACTTTGAATGTGTCATGAGACTTTTAACT---------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 27099 236 + 647215 TAAATTTAGATTTTGTCAGAAAGGTCACTAAACCTTAACGGCGACAAGTGGTAATGTTGCACTACTATATGACTCTAGAACAAGCCACTCACTCCTAAACAAAGGGACCATCGGTGCAAAGAGAGTTTCCTTGAATGTGATTAAACAGTATTTGTGTCAAATGA-TCACTCACAAAATAGACTTTGAATGTGTCACGAGACTTTTAACCTGAAGTCCAATCAAGGATAACTGACAGT + +a +s mr.mrrefChr0 33273 101 + 130230 CGTTGGTCTAGGGGACATTAGTTTGCAACCTTGTTTAACGAACCCCCAACTAATTGAACTGGAATACTAAGATGGATTCCTCTGAACAAGGAGACATGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35245 101 + 636262 CGTTGGTCTAGGGGACATTAGTTTGCAACCTTGTTTAACGAACCCCCAACTAATTGAACTGGAATACTAAGATGGATTCCTCTGAACAAGGAGACATGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 27556 101 + 647215 CGTTGGTCTGGGGGACATTAGATTGCAACCTTGTTTAATGAACCTCCAACTAATTGAACTGGAGCACTAAGATGGATTCCCCTGAACAAGGAGACATGCTA + +a +s mr.mrrefChr0 33374 81 + 130230 GATCCTTGCCAGCCTAACAAGAGGACAGTACCACACCCCCTGCTAATAATGGGACTGAATCAACTATAATCAACTATTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35346 81 + 636262 GATCCTTGCCAGCCTAACAAGAGGACAGTACCACACCCCCTCCCAATAATGGGACTGAATCAACTGTAATCAACTATTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 27662 81 + 647215 GATCCTTGCCAGCCCAACAAGAGGACAGTACCACACCCCCTGCTAATAACAGGACTGAATCAGCCATAGTCAACTATTGGC + +a +s mr.mrrefChr0 33455 150 + 130230 AATAAGTGATATCATAATTTTGTATAATTGATTAACAATCTTCTTACAGCTATAACAAGTTCCACAACACAATGATAGCAAAAGTACCCAGGGTAATAAGTAACCATATGATAAAGCTCAAGAACTTAACCATTGCACACTCTTCCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35429 148 + 636262 GATAAGTGATATCATAACTTTGTATAATTGATTAATAATCTTCTTACAGCCACAACAAGTTCCACAATACAATGATAGCAAAAGTACCCAGGGTGATAATTAGCCATATGATCAAG--CAAGAACTGTACCGTTGCACACTCTTCCAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 27743 150 + 647215 AATAAGTGATATCATAATTTTATATAATTGAGAAACAATCTTCTTACAGGTATAACAAGTTCCACAACACCATTATAGCAAAAGTACCCAGGGCAATAAGTAACCATATGATAAATCTCAAGAATCTAACCATTGCACACTCTTCCAGTT + +a +s mr.mrrefChr0 33605 211 + 130230 AAAGCCTGTGTATGATGAATTACAAATCCTACAAAGGACAAAAGATTCTCTCGCCTGTGAGAACAACCCCTACAGGGTTTTAGCCCCTGAAGCTTTAGACTGTGCCTACCCTTATTATGAACAGAAAGTGCACACTCTGTTCACCTTAACTTAGGGCAGCATGAGATCATGTTAATTGCTCATAAAAGATGTATTGACAATTTGAGGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35589 206 + 636262 AAAGCCTGTGTATGATGAATTACAAATCCTCCAAAGTACAAAAGATTCTCTCGCCTGTGAGAACAACCACTACAGGGTTTTAGCCCCTGAAGCTTTAGACTCTGTGTTCCCTTTTTATGAACAGAAAGTGCACACTCTG-----CTTGACTTAGGGCAACATGAAATTATGTTAATTGCTCGTAAAAGATGTATTGGCAATTTGAGGGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 27893 211 + 647215 AAAGCCTGTGTATGATGAGTTACAAATCCTACAAAGGACAAAAGATTCTCCTGCCTGTGAGAACAACCCCTGCAGGGTTTTAGCCCCTGGGTCATTAGGCTGTGCCAACCCTGATTATGAACAGAAAGTGCACACTCTGTTCACCTTAGTTTAGGGCAGCCTGAGATCATGTTAGTTGCTCATAAAAGATGTATTGACAATTTGAGGACGT + +a +s mr.mrrefChr0 33816 481 + 130230 ATTCTTGCTTTATGTGGTTGCCATCCATCTCAATGTCATACTTCCATCAGCATGTGGCCTGTCCTCAGCCCTTTATCTCTATGCCCAAAGCTCCAAACCCAATTTTTGCAGCTACACTACACCTACAAGCTACAACCTTAGTGAATACTCTGCATGGCCACTACATGTTATGTCACATTCACCAGCTATGGATACTTTACAGAGTGATCAAGAGCAATGGGGTACAAAGTGGAATGCACACTCAATTAAGACAAAGAATGTAAAGAGAATGTATACACAGGGTGTCTACATAGTCAATGATCTTGCTCTTGTTGCTTGGTCTTCGTTGCTTGCTCTTGTTGACAGTCACATTACATCTGAACAACGTATACTGGTGCTTCAAAGTACACTCCCCTAGGTAGATAAATAGGCTGCACACTGGAAGGCCATGAAAGTCCATGACAATTACTGCTAGTAGCTAGTAACTTTCTAGAGAAAGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 35796 467 + 636262 ATTCTTGCTTTATGTGGTTGCCATCCATCTCAATGTAATACTCCCATCAGCGTGTGGCCTGTCCTGAGCCCTTTATCTCTATGCCCAAGGCTCCAAACCCAATTTTTGCATCTACAC------------CTACAACCTTAGTGAATCCTCTACATGGCCACTACATGTTATGTAACAT--ACCAGCTATGGATACTTTACAAAGTGACCAAGAGCAATGGGGTACAAAGTGGAATGCACACTCAGTTAAGCCAAAGAATGTAAAGAGAATGTGTACACAGGATGTCTACATAGTCAATCATCTTGCTCTTTTTGCTTGGTCTTCGTTGCTTGCTCTTGTTGACAGTCACATTACATCTGAACAACGCATACCGGTACTTCAAGGCACACTCCCCTAGGTAGATAAACGGGCTGCAGACTGGAAGGCAATGAAAATCCATGACAATTTCTGCTAGTAGCTAGCAACTTTCTAGAGAAAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 28104 477 + 647215 ATTCTTGCTTTATGTGGTTGCCATCCATGTCAGTCTCATATCTACATCAGCATGTGGTCTGTCCTCAGCCCTTTCTCTCTATGCCCAAAGCTCAAAACCCAATTTTTGCAGCTACACTACACCTACAAGCTATAACCTTAGTGAATACTCTGCATGGCCACTACATGTTATGTCACATTCACCAGCTATGGATGGTTGGCTGAGTGGTCAAGAGTAATGGGGCAGAAAATGAAATGCACTCTAAATTAAAACAACGAATGTAAAGAGAATGTACACATAGGGTGTCTACATAGTCAATGTTTTTGCTCTTGTTGCTTGTTCTTTATTACTTGCTCTTGTTGACAGTCATATTAAATCTGAACAACGTATACTGATGCTTCAAAGTACACTTCTCTAGGTAGAT---TAGGCTGCACACTGGAAGG-CATGAAAGCCTGTGACAATTACTGCTCATTACTAGTAACTTTCTAGAGAAAGGTG + +a +s mr.mrrefChr0 34297 105 + 130230 TTGGAGGATTGGACACACTGGTGGTTATGACAAGCTATTGAGGCCAGCATTGAAACAGAAGCAATTGATAGTCCAAACATGTGACATTAACATTGTTTAGATTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36263 102 + 636262 TTGGAGGATTGGACACACTGGTGGTT---ACAAGCCATCGAGGCCAGCATTGAAACAGAAGCAATTGACAGTCTAAACATGTGACATTAACATTGTTTAGATTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 28589 105 + 647215 GTGGAGGATTGGACACACTGGTGGGCATGATAAGCTGTTGAGGCCAGCATTGAAACAGAAGAAATTGATGGTCCAAACATGTGACATTAACATTGTTTAGATTTT + +a +s mr.mrrefChr0 34402 37 + 130230 ATGACGCACTGTCAAGCAATCACATGCACCTGTAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36371 37 + 636262 ATGACGCACTGTCAAGCAATCACATGCACCTGTAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 28694 37 + 647215 GTGATGCACTGTCAAGCAATCACAGGCACCCTTAGAA + +a +s mr.mrrefChr0 34439 30 + 130230 GCGCCTGCTTGCCTCATGTAAGAGGTTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36408 30 + 636262 GCGCCTGCTTGCCTCATGTAAGAGGTTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 28732 30 + 647215 GAGCCTGCTTGCCTCATGCCAGAGATTTGT + +a +s mr.mrrefChr0 34469 77 + 130230 CATGTAACTCGCTGTGTATATTCTAGATCCCCTGTCCAACTCGCACACTGTTGAGTGATCATAGGCAGTTGTAGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36438 77 + 636262 CATGTAACTCGCTGTGTATATTCTAGATCCCCTGTCCAACTCGCACACTGTTGAGTGATCATAGGCAGTTGTAGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 28764 77 + 647215 CATGCAGCTCCCTGTGTATATTCTAGATCCCCTGTCTAACTTGCATGGTGTTGAGTGATCACAGGAAACTGTAGAAG + +a +s mr.mrrefChr0 34546 37 + 130230 ACTCAGTACCCTTCACCTGTGGAAGAAGCCTGGATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36515 37 + 636262 ACTCAGTACCCTTCACCTGTGGAAGAAGCCTGGATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 28842 37 + 647215 ACTCAGTGCCCTTCATCTGTGGCAGGAGCCTGCCTGA + +a +s mr.mrrefChr0 34583 143 + 130230 CCGAACAACCTTAATGTACCAATAGTAAAGGCACATAAAAAGCAAGCTAGTCGGCCTGTCTAACTAGCCAAGTTTTTAGACCAAACATGATGTCCCCTTATGACCAATCACTAATCTTTCATTCATATTAGGAGCAATTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36558 143 + 636262 CCGAACAACCTTAATGTACCAATAGTAAAGGCACATAAAAAGCAAGCTAGTCGGCCTGTCTAACTAGCCAAGTTTTTAGACCAAACATGATGTCCCCTTATGATCAATCACAAATCTTTCATTCATATTAGGAGCAATTAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 28879 143 + 647215 CCAAACAACCTTAATGTACCAATAGGAAAGGCACATAAAAAGCAAGCTAGTCAGCCTGTCTAACTAGCCAAGTTCTTAGGACAATCATGATGTCCCATCATGACCAATCACTAATCTTTAACTCATGTTAGGAGCAATTAACT + +a +s mr.mrrefChr0 34726 603 + 130230 ATGTTAGCAGCAATTTGGTGACTTATGAGGCTACTACTGGTGTCTCTGGACATGCAATATCACACTTTGCACACATGTCTTTATTTGCAGTAACAACAAACAATCTTGATATATTTCTAATTGGCCAGATCAGCACATGAATTATTCAAACCAATGGTGGTTTTGAAAAATGAATGCATCTCACATGCATTTGACATGAgattgatttctattaacatgccTGTACATCAGTGTCATCTACATATGGGGTGACGATGTTGTTAATGGTTATTCAAATAAAACTTCAAATCTGCAACTGACATAAAGTGCTTCCTCATTTCACACTACCATGTAGCCTGTTGATGTGTACCCCCCCAGGTTCACTCATTCAATATGTTCCCACACTCATCTAGCCCAATTTCCTGAGTTGGATTATACTTGAGGAAAGCCCTAGAAAATTTCCAACCTTCAATGACAAAATGGCATGATCCTTCTGGCAAAAAGTCTTAGTACACTCATAATAATTTCCCTAACCACCTCTGCAGTTCACTTCTAGGGGCTATGTGCACAGCCCAGTCGCAGGATCGATGGAGGATCTCATGATAGCTATTGTGTATCTAGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 36701 572 + 636262 ATGTTAGCAGCAACTTGGTGACTTATGAGGCTACTACTGGTGACTCTGGACATGCAATATCATACTTTGCACACATGTCTTTATTTGCAGTAACAACAAACAATCTTGACATATTTCTAATTGGCCAGATCAGCACATGAATTACTCACACCAATGGTGGTTTTGAAAAATGAATGCATCTCACATGCATTTGACATGA----------------------TGTACATCAGTGGTATCTACATACGGGGTGACGATGTTGTTAATGGTTATTCAAATAAAACTTTAAATCTACCACTGACATAAAGTGCTTCCTCATTTCACACTACCATATAGCCTGTTGACACGTACCCCCCCAGGTTCACTCATTCAATATGCTCCCTCAACCATCTAGCCCAATTTCCTGAGTTGGATTATACTTGAGGAAAGCCCTAGAAAATTTCCAACCTTCAATGACAAAATGGCATGATCCTTCTG-CAAAAAGTCTTAGTACACTCATAATAATTTCCCTAA--------GCAGTGCACTTATATGGGCTATGTGCACAGCCCAGTCACAGGATCGATAGAGGATCTCCTGGTAGTTATTGTGTATCTAGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29023 602 + 647215 AAGTTAGCAGCAATTTGGTGACTTATGAGGCTACTACTGGTGTCTCTAGACATGCAATGTCACACATTGCACACATGTCTTTATCTGCAGTAACAACAAACAATCTTTGTATATTTCTAATTGGCCAGATGAGCACATGAATTATTCAAAACAGTGGTGGTTTCCAACAATGAATGCACGTCACATACATTTGACATGAGATTGATTTCTATTAACATGCCTATACATCAGTGTCATCTACATATGCGGAGAGGATGTTGTTAA-GGTTATTCAGATGAAACTCCAAATCTGCAACTGACATAAAGTGCTTCGCCATTTCATACTACCATGTAGCCTGTTGATGTGTACCCCTCCAGGTTCAGTCATTCAATATGTTCCAATACTCATCTAGCCCAATTTCCTGAGTTGGATTATACTTGCGAAAAGCCCTAGAAAATTTCTGACCTTTAATGACAAAATGGCATGATCCTTCTGGCAAAAAGTCTCAGTACACTCACAATAATTTCCCTAGCCACCTCTGCAGTTCACTTCTAGGGGCTCTGTGCACAGCCAAGTCGCAGGATCCATGGAAGATCTCATGATAGCTATTGTCTATCTAGCAT + +a +s mr.mrrefChr0 35329 15 + 130230 TGAGCACCTTATTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37291 15 + 636262 TGAGCACCATATTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29625 15 + 647215 TGAGCACCTTGTTCT + +a +s mr.mrrefChr0 35344 63 + 130230 TTAGGAAAACCACAGCTCTGATAGGGGGTCAATTAGGAAAACGGCAGTTCCACTTGATTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37306 40 + 636262 -----------------------GGGGGTCAATTAGGAAAACGGCAGCTCCACTTGATTGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 29649 63 + 647215 TTAGGAAAACCACAGCTCTGATAGGGGGTCAATTAGGAAAACCGCAGTTCCGCTAGATTAGCA + +a +s mr.mrrefChr0 35407 34 + 130230 GTAAGAGTAAGTGGTGAAACTAATAGTGACATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37346 34 + 636262 GTAAGAGTAAGTGGTGAAACTAGTAGTGACATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 29718 34 + 647215 GTAAGAGTAAGTGGTGAAACTAATAGTGACAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 35441 69 + 130230 CAATTACATATTCGGTCATATGTAGCCCAAACTTTTTTAACAATCAATCTTTTGAAGAATATTTACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37553 69 + 636262 CAATTACATATTCGGTCATATGTAGCCCAAACTTTGTTAACAATCAATCTTTTGGAGAGTATTTACATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 29752 69 + 647215 CAATTACATATTCCGTCATATGTAGCCCAAACTTTTTCAACAATTAATCTTTTGAAGAATAATTACATG + +a +s mr.mrrefChr0 35510 83 + 130230 CCTCTATATTGCACTGTCTACTTTTCAGTTGATTTGCTGAGTGGCATTAGCATATGTAGTACCATTTACTTTGTAATCAATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37622 83 + 636262 CCTCTATATTGCACTGTCTACTTTTCAGTTGATTTGCTGAGTGGCATTAGCATATGTAGTACCATTTACTTTGTAATCAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 29823 83 + 647215 CCTCTATATTGCACCATCTACTTTTCAGTTGATTTGCTGAGCGGCATAGGCATATGTAGTACCATGTACTTTTTAATCAATAT + +a +s mr.mrrefChr0 35593 15 + 130230 GCTGAGTGGCCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37705 15 + 636262 GCTGAGTGGCCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 29907 15 + 647215 GCTGACTGGCGTAAG + +a +s mr.mrrefChr0 35608 16 + 130230 GCTTGAATATGAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37722 16 + 636262 GCTTGAATATGAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29922 16 + 647215 GGATGAATTTGAGCAT + +a +s mr.mrrefChr0 35624 19 + 130230 GGGTAATAAAATATTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37738 19 + 636262 GGGTAATAAAATATTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 29939 19 + 647215 GGGTAATAAAATATTGTTT + +a +s mr.mrrefChr0 35643 202 + 130230 ATGATGCATGAATGAGGTTCATATCTGCATATCATCTGCGTATTAATACAAAGGCTGATGTACACAACACCTTGAAAGTTGTGAACATCATGAAGCCTGAAAGGATGTCAGTCCAGTTTTGAGTATCAGGTGATAGATAGCCTGTTTTATGGGGTGAAGGGTGTTGAGTCCTTCTGCACGTGCCCGTGATCACTTGTCACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37766 202 + 636262 ATGATGCATGAATGAGGTTCATATCTGCATATCATCTGCGTATTAATACAAAGGCTGATGTACACAACACCTTGAAAGTTGTGAACATCATGAAGCCTGAAAGGATGTCAGTCCAGTTTTGAGTATCAGGTGATAGATAGCCTGTTTTATGGGGTGAAGGGTGTTGAGTCCTTCTGCACGTGCCCGTGATCACTTGTCACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 29958 202 + 647215 ACTATGCATTAAAGAGGTTCATATCTCCATAGGATCTGCGTATTAATACAGAGGTTGATGTACACGACACCCTGAAAGTTGTGAACATCATGAAGCCTGAATGGATGTTAGTCCAATTATGAATGTCAGGTGATAGATAGCATGTTTTGCAGGGTGAAGGGTGTTGGGTCGTTCTGCACATGCCTATGATCATTTGTCACCA + +a +s mr.mrrefChr0 35845 30 + 130230 TGAGGCGGGCAGACCCCTTCTAGAGGTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 37970 30 + 636262 TGAGGCGGGCAGACCCCTTCTAGAGGTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 30160 30 + 647215 TGAGTCAGGCATGACCCTTCTAGAGGTGCC + +a +s mr.mrrefChr0 35875 28 + 130230 TGATTGTTTCACATCATGTGAAGCAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38000 28 + 636262 TGATTGTTTCACATCATGTGAAGCAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 30192 28 + 647215 TGATTGTCCAACATCATGTGAAACAGGG + +a +s mr.mrrefChr0 35903 60 + 130230 AGGCTCAGCAGCCTGGTACTAACTGTGCCTGCATGACCATGCTTGCCTTTTAATGGAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38029 60 + 636262 AGGCTCAGCAGCCTGGTACTAACTGTGCCTGCATGACCATGCTTGCCTTTTAATGGAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 30220 60 + 647215 AGGCTCAGCAGCCTGGTCCTAACCGTGTGCACATGACCATGCTTGCTCTTGATTGGAGCT + +a +s mr.mrrefChr0 35963 5 + 130230 CATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38092 5 + 636262 CATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 30280 5 + 647215 CATGA + +a +s mr.mrrefChr0 35968 43 + 130230 TACTGTATGAAATCTGAACAAGGTAAAGCATAACCCATTTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38099 43 + 636262 TACTGTATGAAATCTGAACAAGGTAAAGCATAACCCATTTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 30285 43 + 647215 CACTGTATGAAATCTAAATAAGGTTAAGCATAACCCATTTCAA + +a +s mr.mrrefChr0 36011 60 + 130230 CATATTCTGATCCCCTCTGAGATACCTCAATATTTTCCACTTTTTGGTTTAATGGGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38143 60 + 636262 CATATTCTGATCCCCTCTGAGATACCTCAATATTTTCCACTTTTTGGTTTAATGGGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 30328 60 + 647215 CATAATTTGGTCTCCTCTGAGATACCTCAATATTTCCCACTTTTTTGTTTAATGGGTCTG + +a +s mr.mrrefChr0 36071 36 + 130230 TGGGAGGGTATCTTAGTCTAATAACTTGTCCTAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38204 36 + 636262 TGGGAGGGTATCTTAGTCTAATAACTTGTCCTAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 30388 36 + 647215 TGCAAGGGTAACCCAGTCTAATAACTTGTCCTGCTG + +a +s mr.mrrefChr0 36107 20 + 130230 ATTTTCAAGGTTATATATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38241 20 + 636262 ATTTTCAAGGTTATATATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 30424 20 + 647215 ATTTTCAAGGTTATAGATCC + +a +s mr.mrrefChr0 36127 23 + 130230 CACACTATCTGAGGTGCCCACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38265 23 + 636262 CACACTATCTGAGGTGCCCACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 30444 23 + 647215 CACACCATTTGAAGTTCCCACTT + +a +s mr.mrrefChr0 36150 15 + 130230 ATTACCACCAGCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38288 15 + 636262 ATTACCACCAGCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 30468 15 + 647215 GTTAGCGCCCGCTCC + +a +s mr.mrrefChr0 36165 236 + 130230 TAAAGTGTGAGTTTTAACTCTTCACTTTGCCTAATCAATAACTGAGTATGTTCCTTTCTTATCTCATCACAATCTTATCCTCTGGGTAGCATTCCTGAGGTCTATAACACATTATACCCAGACCAGAAACAATTCAAGTGAGAACATAGGCAACTGAACCAGTTAGTTCAGATAACCAGAACTTGCTAGCTTTAATGTACTTGATCCATTTTCTCATAAATGAAAGGATAACAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38303 236 + 636262 TAAAGTGTGAGTTTTAACTCTTCACTTTGCCTAATCAATAACTGAGTATGTTCCTTTCTTATCTCATCACAATCTTATCCTCTGGGTAGCATTCCTGAGGTCTATAACACATTATACCCAGACCAGAAACAATTCAAGTGAGAACATAGGCAACTGAACCAGTTAGTTCAGATAACCAGAACTTGCTAGCTTTAATGTACTTGATCCATTTTCTCATAAATGAAAGGATAACAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 30499 236 + 647215 TAAAGTGTGAGTTTCAACTCCACACTTTGTCTAATCAATAACTGAAAATGCTCCTTACTTTTCTCATTACAACCTTATCCTCTGGGTAGCACTCCTGAGGCCTATATCACATTATACACAGACCAGAAACCATTCAAGGGAGAACATAAGTGACTGAACCAGTGAGTTAAGATAATTAAAACTTGCTAGCTCTATTGTCCTTGATTCATTTTCTCGTAGTCGAAAGGATAACAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 36401 63 + 130230 ATTCATTTATGCTCAATTTGGTATGCACTTGCACAAACCACTTGAGATGAAAACAATTTACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38539 63 + 636262 ATTCATTTATGCTCAATTTGGTATGCACTTGCACAAACCACTTGAGATGAAAACAATTTACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 30738 63 + 647215 ATTCATTTATGTTCAATTTGGTGTGCAATGGTATAAACCACTTAAGATGAACACAATTTACAT + +a +s mr.mrrefChr0 36464 9 + 130230 CACCATTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38602 9 + 636262 CACCATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 30802 9 + 647215 CGCCATTGT + +a +s mr.mrrefChr0 36473 34 + 130230 TAAATATTGGGGCTCACACACCTCAAGGTCTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38616 34 + 636262 TAAATATTGGGGCTCACACACCTCAAGGTCTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 30811 34 + 647215 CAAATATCGGAGCTTATGCACCTTAATGGTTTCT + +a +s mr.mrrefChr0 36507 48 + 130230 GCAAGATGGCAGGTCCAGTCCTTTTATGAGCAGTATGATAGGCCCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38655 48 + 636262 GCAAGATGGCAGGTCCAGTCCTTTTATGAGCAGTATGATAGGCCCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 30845 48 + 647215 GCCAGATGGCAGGTCCAGTCCTCTTATGATCAGTCTGGCAGGCCCATT + +a +s mr.mrrefChr0 36555 56 + 130230 ATCTTAATCCTACACAAACCTGCATAGTTGACTTTTATGTTTAACTAGTCCTGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38738 56 + 636262 ATCTTAATCCTACACAAACCTGCATAGTTGACTTTTATGTTTAACTAGTCCTGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 30893 56 + 647215 ACATTAATCCTACAATGAACTGTGTAGTTGACTTTTATGTTTAACTACTCCTGAAC + +a +s mr.mrrefChr0 36611 63 + 130230 CAGTTCACAGCCTTTTGAGTTGGTATAAATGTCCATGGACATCATATGGCCTCTGGATGCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38808 63 + 636262 CAGTTCACAGCCTTTTGAGTTGGTATAAATGTCCATGGACATCATATGGCCTCTGGATGCCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 31062 63 + 647215 CAGTTTACAGCCTTTTGTGTTGGTATAAATGTCCTTGGACATCATATGGCCTCTGGATGCCCC + +a +s mr.mrrefChr0 36674 33 + 130230 CAGACAGTTGTGTGAGGACACAATATTGTGATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38872 33 + 636262 CAGACAGTTGTGTGAGGACACAATATTGTGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 31125 33 + 647215 CAGACAGTTGTGTGAGCACACATTATTGTGATC + +a +s mr.mrrefChr0 36707 144 + 130230 AAAAGCATTTGTCACACATGAACCCAGCCTGAATTGGATTGATTGTGTCAATCATACCCTGGCCAAGTATGGGAGGGAATTGGTGATCAGGTTGACATATACTCTGTTACCCAAAAGCAAGACATCAGTCCACCATTTGTCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 38905 141 + 636262 AAAAGCATTTGTCACACATGAACCCAGCCTGAATTGGATTGATTGTGTCAATCATACCCTGGCCAAGTATGGGAGGGAATTGGTGATCAGGTTGACATATACTCTGTTACCCAAAAGCAAGACA---GTCCACCATTTGTCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 31160 144 + 647215 AAGAGCATCTGTCACACATGGACCGAGCCTGAATTGGATTGATTGTGCCAATAATCCCCTGGCCAAGTACAAGAGGAAATTGTTGGTCAGGTTGACATATACTCTGTTACCCAAGAGCAAGACATCAGTCCACCATTTGTCATC + +a +s mr.mrrefChr0 36851 255 + 130230 TATTAAGCAGGCTTTGTTAAGGAGCATCAACAGGTACTAGATACCTCCTTGCCACCTGCCTCCTTGCACAGGGCTGCGGAGAGAAGATATGATGTGGTAATGGTGTTGGGGTAGTGAGATTGAGATAGTAGTGTGCATGGTATATCACCTTACTGGACTGTTTCTTACATTGGTATAATGGAGTAGTCCAAGGGAACAAGGACAAGTTCCAGGAGGAATGGTGGACATTCCAATTTTCCCTAGATTAGTTAAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39046 255 + 636262 TACTAAGCAGGCTTTGTTGAGGAGCATGAACAGGTACTAGATACCTCCTTGCCACCTGCCTCCTCGCACAGGGTTGCGGAGAGAAGATATGATGTGGTAACGGTGTAGGGGTAGTGAGATTGGGATAGTAGTGTGCATGGTATATCACCTTACTGGACTGTTTCTTACATTGGTATAATGGAGTAGTCCAAAGGAACAACGACAAGTTCCAGGAGCAATGGTGGACATTCTAATTTTCCCTAGATTAGTTAAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 31311 255 + 647215 CATTTGTCACTTATTGTTAAGGAGGAACAGCAGGTACTAGCTACCTGCCTGCTGCCTGCTTCCTTGCACAGGGCTGAGGAGAGAAGATGTGATGGGGTAATGGTGGTGGGGTAGCAAGATTGAGCTAGTAGTGTGCATCGTATATGACCTTACTAAACTGTTTCTGACATTGGTATAATGGAGTAGTCCACGGGAACAAGGAAAAGTTCCAGAGGGAATGGTGGACGGTCCAATTTTCCCTAGATTAGTTAACAC + +a +s mr.mrrefChr0 37106 51 + 130230 TACAAAGAGATACGAATGTGTTGATGTTAAAAAGTTCCAACTTCTGCCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39301 51 + 636262 TACAAAGAGATACGAATGTGTTGATGTTAAAAAGTTCCAACTTCTGCCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 31567 51 + 647215 TACAAAGAGATAGAAATGCACTGTTGTTAAAAAGTTCCAACTTCTGCCTGA + +a +s mr.mrrefChr0 37157 367 + 130230 TATCTATTAGAGGAGTTATTACATTACCATAACTAGAGAAGCCTTGTATGAAGCGGAAGGCACAGACTCCACACACCCTATTGGCAGACCAGAACTTTTATCTGGTTGGTTGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTATATTGAAACAGGTAGAACCCAGATCGCAGTTAGGCGCATGAATCTGTGAGAGCAGCAGGGCCTTTGCTATCCCTTCGCAATTCAGATGGAATAGTACCATACAGTACCATTAATTGAGCCATTGGATGAGGTGATCTCCTGTCAGATGCTCCCAAAGTAGGCAGGTAACAATGAAGGCTGATTGCAGCATATCTAATGGAATAGATAACACTTGATGCCGGTCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39360 364 + 636262 TATCTATTAGAGGAGTTATTACATTACCATAACTAGAGAAGCCTTGTACGAAGTGGAAGGCACAGACTCCACACACC---TTGACAGACCAGAACTTTTACCTGGTTGGATGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTATATTGGAACAGGTATAACCCAGATCGCAGTTAGGCGCATGAATCTGTGAGAGCAGCAGGGCCTTTGCTATCCCTTCGCAATTCAGATGGAATAGTACCATACAGTACCATTAATTGAGCCATTGGATGAGGTGATCTCCTGTCAGATGCTCCCAAAGTAGGCAGGTAACAATGAAGGCTGATTGCAGCATATCTAATGGAATAGATAACACTTGATGCCGGTCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 31618 367 + 647215 TGTCTATTGGAGGAGTTACTGCATTACCATATCTAGAGAAGCCTTGTGTGAAGCGGAAGGCACAGACTCCACACACCCTATTGGTAGACCAAAGCTTTTATCTGGGTGATTGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTGTATTGAAACAGATAGAACCCAGATCACAGCTAGGCACATAAGTCAGTATGATTAGCAGGGCCTTTGCTGCCCCTTAACAATTCAAATGAAACCGTGCCATATAGTACCATTAATTAGGCCATCAAATGAGACGATCTCCTGTCTGATGCTCCCAAAGTAGGTGGGGAACAATGAAGGCTGATCACAGAATATCTGATGGCATGGGTAACAATTAAGCTCGATCATA + +a +s mr.mrrefChr0 37524 552 + 130230 CAGGGAAGCTTCGGCTTCTTCCTTCTTCCTCAGCTGGCTAATAGAAAGAGGACTCCTAAGTAATGGCTCTTAAGTGACTCCTAATTTACTAGTTACCTCCTTTTATACCTGACCAGCTAATATTAGTCCTACTTGTTGATGGTTGAAGGCCCCACCCTTGACTCCTCTGCTTTAGTAGGTGGATAGGCTTCTACTTAACTAAGTCAATAGGTTCACCATTTGTACTTCATGCAATGAATGAATACAAGCATATTTTACTTCTAAACACAAGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGTTAGAGGAATCAGCTAGGGTCAACTTTCTTGTAGGTGATACATACAATTTGGATAAGCATTAGCGTAAACTGGAGTTTAGATCTTGACAGGTGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTCATGAGATTTCGTTAGTGGCTTTTCAGGTTCAGTGTGTCCTGGCACCCTCAACCTTAAGAGAATGAGTTAAAATGGGATACTTCATAGCTGCAAATATTTCCAGGTATCTAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 39725 552 + 636262 CAGGGAAGCTTCGGCTTCTTCCTTCTTCCTCAGCTGGCTAATGGAAGTAGGACTCCTAAGTAATGACTCTTAAGTGACTCCTAATTTACTACTTACCTCCTTTTATACCTGACCAGCTAATATTAGTGCTACTTGTTGATGGTTGAAGGCCCCATCCTTGACTCCCCTGCTTTAGTAGGTGGATAGGCTTCTACTTAACTAAGTCAATAGGCCCACCATTTGTACTTCATACAATGAATGAATACAAGCATATTTGATCTCCAAACACAGGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGGGAGAGGAATCATCTAGGGTCCATTTTCTTTTAAGTGATACATAAAATTTGGATAAGCATTAGCGTAGACTGGAGTTTAGATCTTGACAGGTGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTCATGAGATTTCGTTAGCGGTTTTTCAGGTTCAGTGTGTCCTGGCACCCTAAACCTTAAGAGAATGAGTTAAATTGGGATACTTCATAGCTGCAAATATTTCCAGGTATCTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 31985 520 + 647215 CAGGAAAGCTTTGCCTTCTTCCTTCTTCCTCACCTGGCTAATAGAAAGAGGACTACTAAGTGATCGCTCCTAAGTGACTCCTAATTTACTAGTTACCTGCTTTTATTCCTGACCAGCTAATATTAGTCCTACTTGTTGATGGTTGAAAGCCCCACCCTTGACTGCTCTGCTTTAATAGGTGGATAGGCTTTTAATTAACTAAGTCAATAAGTTTGAAATTTGTACTTCATGCAATGAATGAATACAAGCACATTTTACTTCTAAGCACAAGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGTTAAAGGAATCAGCTAGGGTCAGCTTGCTTGTAGGTGATACATAC-----------GCATTAGTGTAAACTGGAGTTTGGATCTTAGCAGGGGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTTATGAGATTTCATTAGTGGCTT---------------------CACCCTCAACCTTAAGAGAATGAGTTAAAATGGGATACTTCATAGGTGCAAATATTTCCAGATATCTAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 38076 329 + 130230 GTACAGGTATGCCTAAATATGATGCCAATCCATTATAGCAAGTGACTACAGTAGAGAATGTATAACAATTGTGAGCAGCCCATCCCTCCTAGATTACACACCTATATTAGGTATAGTTACTTAGATAAATTAACCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTACTTCAGAGGGTGTCTTCTTCTCATAGGTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCATATGGGTTCACATTTGGGGTCCTATCTCTTGATGGTGTGCTAGATGGAGGAAGCTAATTTGATATTTGTAATGGATCACCAGTCACTTAATGTGTCAGAAACAAACATTGCTTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40289 329 + 636262 GTACAGGTATGCCTAGATAGGATGCCAATCCATTATAGCAAGTGACTACAGTATAGAATGTATAACAATTGTGAGCAGCCCATCCCTCCTAGATTACACACCTATATTAGGTATAGTTACTTAGACTAATTGGCCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTGCTTCAGAGGATGTCTTCCTCTCATAGGTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCGTATGGGTTCACATTTGGGGTCCTGTCTCTTGATGGTGTGCTATACGGAGGAAGCTCATTTGATATTTGTAATGGATCACCACTCACTTAATGTGTTACAAACAAACATTGCTTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 32505 329 + 647215 GTCCAGGTATGCCTAAATCTGATGCCAATCCATTTTAGCAAGTTACTACAGTAGAGAATGTATGGCAATGGTGTGCAGTCCATCCCTCCGAGATTATACACCTATATTATATATAGCTATTTAGATAAATTAACCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTACTTCAGAGGGTTTCTTCTTTTCATAGTTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCATATGGGTTCACATTTGGGATCCTATCTGTTGATGGTACACTAGATGGAGGAAGCTAATTTGGTATCTGTAATGGATCACCAGTCAGTTAATGTGTCAGAAACAAACACTGGTTCCT + +a +s mr.mrrefChr0 38405 95 + 130230 AGGGCTAAGAAGCAGAGAGTGCTTGCACAAACACCTTAAACTGTTGTTAGCCATATAttgtgttcctgaagttagtctctcattactgcctttct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40622 95 + 636262 AGGGCAAAGAAGGAGAGAGTGCTTGTGCAAACACCTTAAACTGTTGTTAGCCATATAttgtgttcctgaagttagtctctcattactgcctttct +s simRat_chr6.simRat.chr6 32834 94 + 647215 AAGGCTAGAAAGCAGAGAGTGCTTGCACAAACACCTTATACTGTTG-GAGCCATATAttgtgttcctgaagtaagtctctcaaaactgcctttct + +a +s mr.mrrefChr0 38500 139 + 130230 tggacattctgtttacttaaagagcttgttagcatatggtcaatgtgcagaccctgaaattgctgcttaactccttagtgTACTTGACTgtaccttgtctgcatctacaaaagttgtttgctgatgcccctgttcctaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40717 139 + 636262 tggacattctgtttacttaaagagcttgttagcatatggtcaatgtgcagaccctgaaattgctgcttaactccttagtgTACTTGACTgtaccttgtctgcatctacaaaagttgtttgctgatgcccctgttcctaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 32929 139 + 647215 tctacattctgtttgtttaatgagcttgttagcgtatggtcggtgtgcagatcccaaaaatgttgctcaactccatagtgTACTTGACTgtaccttgtgaacatcttcacaaattgtttgctgataccccttttctcaa + +a +s mr.mrrefChr0 38639 43 + 130230 gttacaccatcattactgaagaaaagagttatacagggtccag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40858 43 + 636262 gttacaccatcattactgaagaaaagagttatacagggtccag +s simRat_chr6.simRat.chr6 33068 43 + 647215 attgcaccaccattactggagaaaagagttatacagagtcaag + +a +s mr.mrrefChr0 38682 67 + 130230 gaggactgacttggatcttcagcctCGACCAGTGGGCCCGTGACCAAACACTGTTGTCTGTGCCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40901 67 + 636262 gaggactgacttggatcttcagcctCGACCAGTGGGCCCGTGACCAAACACTGTTGTCTGTGCCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33113 67 + 647215 gaggagtgacctggatttctagcctTGACCAGTGGCTCCTTGGCTAAACACTGTTGTCTGTGCCCTC + +a +s mr.mrrefChr0 38749 97 + 130230 CCTTTCATTCCTAGTCTCATGCACCTCCCTGTAACAACTGCGGGCTCCCTGGAGTGTCCTCTTTGAGTGACCTCTTTGAGAGGGAGGTTTGTACTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40968 97 + 636262 CCTTTCATTCCTAGTCTCATGCACCTCCCTGTAACAACTGCGGGCTCCCTGGAGTGTCCTCTTTGAGTGACCTCTTTGAGAGGGAGGTTTGTACTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 33202 97 + 647215 CCTCTCATTTCCAGTCTTATACACTGCCCTGTACCAACTGTGGGCTCCCTGGAGTATCCTCTTCGTGTGACCTCTTTGAGAGGGAGGTTTATACTGA + +a +s mr.mrrefChr0 38846 26 + 130230 CATGTGTGAGTATGTTCCAATTCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41066 26 + 636262 CATGTGTGAGTATGTTCCAATTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33299 26 + 647215 CATATGTACGTATGTTATAATCTGGT + +a +s mr.mrrefChr0 38872 8 + 130230 CAGCTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41092 8 + 636262 CAGCTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 33326 8 + 647215 CAGCTTCA + +a +s mr.mrrefChr0 38880 3 + 130230 CAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41101 3 + 636262 CAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33334 3 + 647215 CAC + +a +s mr.mrrefChr0 38883 86 + 130230 CCATAGTAAACCTGTCTTGCCCAACCCACACCATCTGCCCCGGCTTCAATTTGTCAAGATGGTGCAAAGGCAGTCCTGGACACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41107 86 + 636262 CCATAGTAAACCTGTCTTGCCCAACCCACACCATCTGCCCCGGCTTCAATTTGTCAAGATGGTGCAAAGGCAGTCCTGGACACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 33337 86 + 647215 CCATAGTCAACTGGTCTTGCCTAAGCCACACCATCTGCTCTGTCTTCAACATGTCAAGATGGTGTAAAGGTAACCCTGAACACATG + +a +s mr.mrrefChr0 38969 365 + 130230 TCAGGAGCTGGATCCCTTATCTTTTTTAACTTATCAACGTGTCTTTGCCCTATCACTCCCACAGTTATGCGCCAGTCACTCTGAGTAGCACAGACAACTCTATTTCGACATTCAACATTCGAATTTGTATCTAGAACACAACACGTGGAATTGTTTTCAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAAGCAGCATATTTTGTCTTGAAAGGGCTGAGTGTGGAACCAACAGTGACTTGTTCCTCTACTCTAGTGTGGGGGTGTCACAGGACAGATTATACATATAGCAGGAATAGAAATTTAGACAGATGTTTGGCAGGATGTTATCTACAGATAATATTATCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41193 364 + 636262 TCAGGAGCTGGATCCCTTATCTTTTTTAACTTATCAACGTGTCTTTGCCCTATCACTCCCACAGTTATGCGCCAGTCACTCTGAGTAGCACAGACAACTCTATTTCGACATTCAACATTCGAATTTGTATCTAGAACACAACACGTGGAATTGTTTTCAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAAGCAGCATATTTTGTCTTGAAAGGGCTGAGTGTGGAACCAACAGTGTCTTGTTCCTCTACTCTAGCGTGGGGGTGTCACAGGACAGATTGTACATATAGCAGGAATAGAA-TTTAGACAGATGTTTGGCAGAATGTTATCTACAGATAACATTATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 33425 365 + 647215 TCTGGGGCTCAATCCCATCTCTTTTTTAACTTATCAGCGTGTCCTTGTCCCATCACCACCACAGTATTGTCACAGTTGCGCAGAGTAGCACAGACAACTCCATTTGGAAATCCAACAATCAAGCCTGTATTCAAAACACAACACTTTGAATTGTTTTGAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAGGCAGCATATTTTGTCTTGGAAGGGCTGAGTGTGGAGCCATCAGTGAGATGTTACTCTACTCTGGTGTGGGGGTGTCACAGGACAGAGTATACATATAGCAGGAATAGAAATTTACATAGATGTTTGGCAGGATGTTATCTACAGATTATATTATCTG + +a +s mr.mrrefChr0 39334 86 + 130230 TGCGGCAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTTTTCTCAAGCTAGATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCACCATATTAACAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41574 85 + 636262 TGCGGCAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTTTTCTCAAGC-AGATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCAGCATACTAACAATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 33790 86 + 647215 TGCAATAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTATTCTCAAGCTATATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCACCAGATCAACAATAA + +a +s mr.mrrefChr0 39420 40 + 130230 TGAACTTACATACTTAGGGTTCCTGAGTCTTTGAAGGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41659 40 + 636262 TGAACTTACATACTTAGGGCTCCTGAGTCTTTGAAGGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33946 40 + 647215 TGAACTTACATACGTGGAGTTCGTGAGTCTTTAAAGGAAT + +a +s mr.mrrefChr0 39460 39 + 130230 CTGGTAGAAAAGCCAAAATGGACCTACCACAGGGCCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41699 39 + 636262 CTGGTAGAAAAGCTAAAATGAACCTACCACAGGGCCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 612973 39 - 647215 CTGGTAGAAAAGCCAAAATGGACCTACCACAGGGCTACT + +a +s mr.mrrefChr0 39499 18 + 130230 TTACTATAGGAGTAAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41738 18 + 636262 TTACTATAGGAGTGGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 613017 18 - 647215 TTACTATAGGAACAAAGG + +a +s mr.mrrefChr0 39517 16 + 130230 CAGAAATAAGCTATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41756 16 + 636262 CAGAAATAAGCTATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 613038 16 - 647215 CTGAGATAAGCTATTA + +a +s mr.mrrefChr0 39533 57 + 130230 GGAAAGCAAATAGACAATAAACTGTGGAAACCACACATCTACAAGATGACTGCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41773 57 + 636262 GGAAAGCAAATAAACAAGAAACTGTGGAAACCACACATCTACAAGATGACTGCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 613054 57 - 647215 GGAAAGCAAATAGATAATAAACTGTGGAAACCCCCCATCTACAAGACAACTGCTAAG + +a +s mr.mrrefChr0 39590 70 + 130230 TGGAGTCTCTGAAATGATATGTGATATGTTTACCAATCACTTTTCCACATATGTGTGATGCACTATAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41830 70 + 636262 TGGAGTCTCTGATATGATATGTGATATGTTTATCAATCATTTTTCCACATATGTGTGATGCACTATAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 613146 70 - 647215 TGGAGTCCGTGAAATGATATGTGATATGTTTACCAATCACTTTTCTACAAACATATGATGCACTATAGGA + +a +s mr.mrrefChr0 39660 3 + 130230 TGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41900 2 + 636262 -GG +s simRat_chr6.simRat.chr6 34242 3 + 647215 TAA + +a +s mr.mrrefChr0 39663 13 + 130230 TACTGGGCCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41902 13 + 636262 TACTGTTCCTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 34246 13 + 647215 TGCTGGGTATGTA + +a +s mr.mrrefChr0 39676 87 + 130230 GTACTAACCACCAACATGTGAGACATGGTGAACATAAAAAGTCCTGTGGTCACAGTAAACTTTTGAAAACATAAGCTAAGGAAAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41923 86 + 636262 GTACTAACCACCAGCATGTGAGACATGGTGTGCATAAAAAG-CCTGCGGTCACATTAGACTTTTGAAAACATAACCTAAGGAAAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 34259 87 + 647215 GTAACAACCACCAACATGTGCGCCATGGTGAACATCAAAAGTCCTGTGGTCACTGTAAACTCTTGAAAACATAAGCTAAGGAAAGCT + +a +s mr.mrrefChr0 39763 49 + 130230 TTGCTCACACATGACTAGAGATATACCAACCATCCCAATAAGATAATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42009 49 + 636262 TTGCTCACACATGACTAAAGATCTACCAACCATCCCAATAGGAGAATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 34353 49 + 647215 TTGCTCACACATGACTAGAGACATACCAACCATCCCAATAAGATAATTG + +a +s mr.mrrefChr0 39812 268 + 130230 TGATTGTGCTAGTTGATGATAATGCAGTATCAGACAGAAAGAAGGATTAACTTCATTACATCACTTTGTAGTAAGGGTATTCCTGACCATGCTAGAGCGTTTTGGACCACCTCTGGTTAAAGGCTCATTATATAATCCATAACTGCTGTCAGGTCAGGTGTAAGTGGTTTAGACTCTACTGCATAGCTCATAGTTTTCAGCTGGTGCTTAATTGGGTGCCAATCAACTGTATCCAATGAACTGTAGTCTTGCACTTGGTGCTTCACGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42058 264 + 636262 CCAT----CTAGCTGATGATAATGCGGTATCAGACAAAAAGACGGATTAACTTCATTACATTGCTTTGTAGTAAGGGTAATCCTGACCATGCTAGAGCGTTTTGGACCACCTCTGGTTAAAGGCTCATTATATAATCCATAACTGCTGTCATGTCAGGTGTAAGTGGTTTAGACTCTACTGCATAGCTCATAGTTTTCAGCTGGTGCATAATTGGGTGCCAATCAACAGTATCCAATGAATTGTGGTCTTGCACTTGGTGCTTCACGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 34404 245 + 647215 TGATTGTGCTAGTTGATGATATAGTAGTATCAGACAGAAAGAACGATTCACTTCATT-CATCACTTTGGAGTAAGGGTATTCCTGTCCATGC-----ATTTTCAGACCAT--------AAAGGCTCATTATACACTCCGTAACTGCTGTCAGGTCAGGTGTA---------GGCTGTACTGCAAAGCTCATAGTTGTCAGCTGATGCTTAATTGGGCGCCAATCAACTGCATCCAATGAACTGTAGTCTTGCATTTGGTGCTGCACGA + +a +s mr.mrrefChr0 40080 165 + 130230 TCCACGAGAACATTATTCCATTGGGAATACTAGATGATTTACTAACACTTAAGGGGTTGGAGACAATATCACAGTACTGGCAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGTTGGGAGTTTGATGTAGTGGCAAAGGACTGGGAACTCTTTACAGCTAGAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42336 165 + 636262 TCCACGAGAACATTATTCCATTGGGAATACTAGATGATTTACTAACACTTAAGGAGTTGGAGACAATATCACAGTGCTGACAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGTTGGAAGTTTGATTTAGTGGCAAAGGACTGGGAATGCTTTACAGCCAGAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 34649 165 + 647215 TCCACGAGAACGTCATTCCATTGGGAGTACTAGATGAACTGCTAACACTTGAGGGGTTGGAGACAATATCTCAGTACTGGCAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGATGGGAGTTTGATGTAGTGGCAAAGGACTGGGAACTCTCTACAGCTATTAAA + +a +s mr.mrrefChr0 40245 115 + 130230 TAGTGGAAGGGGCCTGGAGAACATTTGGAGAACATTAACAGTAATGACTAGTAACAAATGGAAGAACTTAGCAAGAAGGATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42502 115 + 636262 TAGTGGAAGGCGCCTGGAGAACATTTGGAGAACATTAACAGTAATGAATAGTAGTGAATGGAACAACTTAGCAAGAAGGATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 34814 114 + 647215 TAGTGGAAGGGGTCTGGAGAACATTTGGATAACATCAACAGTAATGACTAGTAACAAA-GGAAGAACTTAGTGAGAAACATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATGCC + +a +s mr.mrrefChr0 40360 124 + 130230 TCTTGTTTGGTAGATTCCAGTATACGACTGTTAAGAGGCTGAGGACAAACTAGGTTTACTTTCTTAATAGACATCAAGCAGCTGAACTTAGAGAGGCTCTCTTACAGTGCACCATTTTGATCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42617 124 + 636262 TCTTGTTTGGTAGATTCCAGTATACAACTGTTAAGAGGCTGAGGACAAACTAGGTTTACCATCTTAATAGACATCAAGCAGTTGAACTTAGAGAGGCTCTCTCACAGTGCACCATTTTGATCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 34933 123 + 647215 TCTGGTTGGGTGAATTCCAGTATATGACTGTTAAGAGACGGAGGACAAACTAGGTT-CATTTCTTAATAGACATCAAGCAGCTGAACTTAGAGAGGCTCTCTTACAGTGCACCATTGCGACCTA + +a +s mr.mrrefChr0 40484 150 + 130230 AAAGCTTCAGGTGACCACATTAAGATTTAAAGCAGGACATCTGATTGCAGGCTTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGCACTTCAGATGTACGTCCCTAAAGAACAGCTAAGACTGTCCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42745 145 + 636262 AAAGCTTCAGGTGACCACATTAAGATTTAGAGCAGGACATCTGATTGCAAGCCTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGAATTCCCGATGTATGTCCCTAAAGAACAGCTGAGACTGT----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 35056 150 + 647215 AGAGCTTCAGGTGACCAAATTAAGATTTAAAGGAGAACATCTGATTGCAGGCTTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGCACTTCAGATGTACGTCCCTAAAGAACAGCTAAGTCTGTCCACA + +a +s mr.mrrefChr0 40634 475 + 130230 AATGTAAACCAATAGTCCATCTATATCCTTGCAAGTTCAATCTCCTTTTCACATAGTTGGTAACTTGTATATACCCTCAGGGTCAAACAGATCGAGTGTAAGAAAACACTTGGGGAATGACTTGGCACATTGATTTTAATTCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAATCCTCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGGGCATATCATGCTATTACCTCAATGCAGACTAACTACCTTGTACATGTACAATCTGTCATATTTGGTACAATGGTTTTCAGGTTCACAAGAAGTGTCAAGGAAATAACATGGTGTTTATGCCAATTGCCAAAAACTATCAAGAAAATAACCTGAGTACAATTACTTAATTTCATGGGGAAGCTGGTTGTCACCTTTATAGTTCAAGGTGGGTGGCCACGGCAAACCCATTGTAAGTATGATCCATTCATCCTGATGACACTCATAATTACACAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42890 457 + 636262 AATGTAAGCCAATAGTCCATCTACATCCTTAGAAGTTCAATCTCCTTTTCACATAGTTGGTAACTTGTATATACCCTCAGGGTCAAACAGATT-----------AACACTTTGGGAATAACTTGGCACATTGATTTTAATTCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAAGCATCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGAGCATATC--GCTATTACCTCAATGCAGACTAACTACCTTGTACATGTACAATCTGTCATATGTGGTACA-----TTTTAGGTTCGCAAGAAGTGTCAAGGATATGACATGGTGTTTATGCCAATTGCCAAAAACTATCAAGAAAATAACCTGAGTACAATTACTTAATTCTATGGGGAAGCTGCCTGTCACCTTTATAGTTCAAGGTGGGTGGCTACGCCAGACCCATTGTAAGTATGATCCATTCCTTCTGATGACACTCATAATTACCCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 35208 470 + 647215 AATGTAAACCAATAGTCCATTTATATCCTTGCTAGTTCAATCTCCTTTTCACACAGTTGAT----TGTATATACCCTCAGAGTCAAACAGATCGAGTGTAAGAAAACACTTGGAGAATGACTTGGCAGGTTGATTTTAAACCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAATCCTCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGGGCATATCATGCTATGACCTCAATGCAGACTATCTATCTTGTACATATACAATATGTCATACTTGCTACAATGGTTTTCAGGTTCACAAGAAGTGTCAAGCAAATAACATGGTATGTATGCCAATTGCCAAA-ACTATCAAGATCATAACCTGAGTACAGTTACTTCATCTCATGGGGAAGCTGGTTGTCACTTTTGTAGTTCAAGGTGAATGGCCATGGCAAACCCATTGTAAGTATCATCTATTCATCTTGATGACAATCATAATTACAAGTG + +a +s mr.mrrefChr0 41109 130 + 130230 TGTAAAGAATTTATTTTGTCATTTGCTTTTTTGACATTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGGACTATGTCCTGGGTTGGTTGCTCTAGCACAGGCTAATGTTCCTCAGTTATATTGGACTTAGATTCAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43347 130 + 636262 TGTAAAGAATTTTTTTTGTCACTTGCTTTTTTAACATTGGATGGATCAATCCATTTTAAGGAATATGTCCTGGGTTGGCTACTCTAGCATAGGCTAATGTTTCTCAGTTATATTGGACTTAGATTCAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 35678 130 + 647215 TGAGAAGAGTTTATTTTGTCATTTGCTATTCTGACGTTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGGACTATGTCCTGGGTTGGTTGCTCTAGCACAGGGTAATGTTCCTCAGTTATATTGGACTTAGAACACAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 35808 130 + 647215 TGTAAAGAATTTATTTTGTCATTTGCTCTTTTGACATTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGAACTATGTCATGGGTCGGTTGCTCTGGCACAGGTTAATGTTCCTCAGTTGTATTGGACTTAGATTCAAAG + +a +s mr.mrrefChr0 41239 171 + 130230 CCTGATAAATTGATCTATATTTGTTGGATTGATCACCTGCCATTTGTCATGTGAAACACAATCACAACTGTGGCTAGTTCCGATGTTTAGATATTTCCTTACTATAAGCGAGTGCATGTTTGGTGGGCACCCAGTCTTCTTGGCCCATATGTTAGATGAGAAGGACTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43477 165 + 636262 CCTGATAAATTGATCTATATTTGTTGGATTGATCACCTGCCATTTGTCATGTGAAACACAATCACAACTGTGGCTAGTTTTGATGTTTAGATACTTCCCTGCTCTAAGCGAGTGCATGTTTGGTGGGCACCCAGTCTTCTTGGCCCATATGTCAGA------GGACTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 35938 170 + 647215 CCTGATAAA-TGATCTACATTTGTTGGATTGATGCCCTGCTTTTTGTCATGTGAGACACAATCACAAGTGCGGCTCGTTCCTAAGATTAGATATTTCTTTACTATAAGTGAGTGCATGTTTTGTGGGCATCCAGTCTTCTTGGCCCATATGTTAGATGAGAAGGACTAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 41410 186 + 130230 CATATCCTCATGGTTGATCACAGCTATCCCTTGGGCAGGAAAGTAAACTTTATTTTTCTTTCATATAATGAATTACTAATAGATTTTCTGCCTTCTTTCTTGGTTGAGTAACACAATGCATAAAAGTAGACTCAGACTCAAGCAGATCGAACACCATACAAACTCAATCTGATGGAACATCATCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43642 186 + 636262 CATATCCTTATGGTTGATCACATCTATCCCTTGGGCATGAAAGTAAACTTCATTTTTCTTTCATATAATGAATTACTAATAGATTTTCTGCCCTCTTTCTTGGTTGAGTAAGACAATGCATAAAAGGAGACTCAGGCTCAAGCAGATCGAACACCATACAAACTCAATCTGACGGAACATCATCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 36109 186 + 647215 CATACCCTCACGGTTGATCACAGCTATCCCTTGGGCAGGAAAGTAAACTTTATTTTTCTTTTCTATCATGAATTACTAATAGATTTCCTGTCTTCTTTCTTGGTTGAGTAACACAATGCATAAAAGTAGACTCAAACTCAAGCAGATCGAACACCATACTAACACAATCTAATGGAACATTATCCA + +a +s mr.mrrefChr0 41596 129 + 130230 TACCCATGGCCTTAAAGCACATTGATTTAAAGTGAATTGTCCCAAATGGCATTACAAGTTGTTGTCCATTGGCTGACTAATTAATtcgtTGGCTGACTAATTGATTCTTTCTACTGAGACTCCATCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43829 129 + 636262 TGCCTATGGCCATAAAGCACATTGATTTAAAGTGAACTGTCCCGAATGGCATTACAAGTTGTTGTCCATTGGCTGGCTAATCAATTCGTTGGCTGACTAATTGATTCTTTCTACTGAGATGCCATCTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 36295 129 + 647215 TACCCATGGCCTTAGAGCACGTTGATTTAAAGAGAATTGTCGCAGATGGCATTACAAATTGTTGTCCATCGGCCTACTAattgattgattggctgactgattgattCTTTCTACTGAGACTCCAGCTAG + +a +s mr.mrrefChr0 41725 10 + 130230 GGCCTGTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43958 10 + 636262 GGGCGGTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 36442 10 + 647215 GGCCTGTCTC + +a +s mr.mrrefChr0 41735 68 + 130230 ATTTGAACAATCCTCTGCATTTAAGCAATCCACCAGCCATTACCCTGCTTAGCTCCGAATATATATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 43969 68 + 636262 ATTTGAACAATCCTCTGCATTTAAGCAATCCACCAGCCATTACCCTGCTTAGCTCCGAATATATATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36452 68 + 647215 ATTAGAGCAACCCTTTGCATTTAAGCAATCCACCAGCCATTACCCTGCTCAACTCGGAATATATATAT + +a +s mr.mrrefChr0 41803 55 + 130230 GTTGATTAATCCCACACCCAGCACCATGGTGTCAGTGTGCATTAGGAACACAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44041 55 + 636262 GTTGATTAATCCCACACCCAGCACCATGGTGTCAGTGTGCATTAGGAACACAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 36520 55 + 647215 ATTGGTTACTCTGACACCCAGCACCATGGTGTAAGTGTCCATTTGGAACACAGAC + +a +s mr.mrrefChr0 41858 226 + 130230 TAACAAAATGGTCTTGCAACCAGTTAAGCCACTGCCTATTTATGCAGCCAGTCCGTACCCCCACTTGCATACACTTTTGAAATTATGCATAGAATTCAGAGCTGTGAATTTGATCCAGTTGGGTCCTGTGCTATGATGCACTTGAACACCATGCAGAGCCAATTTTCCAATTGCCTTAGTGGGATGATTGTCTCAGAATTTCTCCTGATGTTCAACTAAGCCAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44096 221 + 636262 TAACAAAATGGTCTTGCAACCAGTTAAACCACTGCCTATTTATGCAGCC-GTCTGTACCT----TTGCATACACTTTTGAAATTATGTGTAGAATTCAGAACTGTGAATTTGATCCAGTTGGGGCCTGTGCTATGATGCATTTGAACACCGTACAGAGCCAATTTTCCAATTGCCTTTGTGGGATGATTGTCTCAGAATTTCCCCTGATGTTCGACTAAGCCAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 36576 219 + 647215 TAACGAGATG-------AACCAGTTTAGCCGCTGCCTATTTATGCAGCCAGTCCTAACCCCCACTCACATACACTTTTGAAATTGTACATAGAATTGAGAGCTGTGAATTTGGTCCAGTTGTGTCATGTGCTATGATGCACTTGAACACCATGCAGAGCAGATTTTCCAATTGCCTTAGTGGGATGATTGTCTCTGAATTTCTCCTAATGTTCAACTAAGCCAATC + +a +s mr.mrrefChr0 42084 227 + 130230 ACAGCTGAGTCAACAGCCAAAGAGTAAATATAAGAGAGTGCTAGTGATCAGAAATTATCTTGTTAATACCATCAGAGGATGTAATACATGGATAGGCTGGGAGCATCTTCAGTCAAGTAGCATATAGCTATGATAATTGGGATGAACCCTTCATATCACGCAGTGTGTATATGTAGTTGAAAGAAGTGCACAATCCAGTCATAAACACAGAGTAATGATTTGCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44317 222 + 636262 ACAGCTGATTCAACTGCCAGAGAGTAAATATGAGAGAGTGCTACTGATCAGAAATTAGCTTGTTAATACCATCAGAGGATGTAATACATGGATAGGCTGGGAGCATCATCAGTCAAGTGGCATAT-----TGATAATTGGGACGAACCCTCCATATCACGTAGTGTGTATATGTAGTTGAAAGAAGTGCACAATCTAGTCATAAACACAGAGTAATGATTTGCGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36870 227 + 647215 ACTGCTGAGTCAACAGCCAAAGAGTAAATATAAGAGAGTGCTAGTGATCAGAGATTTTCTTGTTAATACCATCAGAGGATGTAATACATGGATAGGCTGGGACCATCTTCTGTCAAGTAGCATATAGCTATGATAATTGCGATGAACCCTTCATTTCACACAGTGTGTATATGTGATGGAAAGAAGCGCCCAAACCAGTCACAAACGTAGAGTAATAATTTGCCATA + +a +s mr.mrrefChr0 42311 10 + 130230 GCTATTGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44540 10 + 636262 GCTATTGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 37097 10 + 647215 GCACTTTCAC + +a +s mr.mrrefChr0 42321 39 + 130230 TTTCACATCACTATGTATGTGTTGGCATGTGAGATATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44550 39 + 636262 TTCAACATGACTATGTTTGTGTTGGCATGTGAGATATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 37113 38 + 647215 CTTCACATCA-CATGCATAGGCTTACACGCGAGATATGG + +a +s mr.mrrefChr0 42360 327 + 130230 TCAGGCTGTCTGGTCTGCCACACTGGAGGGTGATATCCTAGGAGTCAATAGGAGGCAGCTGAGACACTATCAGGGGGCCAACTAGTTTTTTCAAAACCGTATAATAATTGGCATAACTCCAAGACAACAGAAAATTATAACAGTATAACTGGCCTCAGTCATTCAAGAACTGCAGCAACTGGGCCCACCTACCTGCTGTTTATCAATCTTTGATAGAGTACTGAATTTTACTAGATATAAAAAAACTATAGCCATTGAGCAAACTCATGCGATTCACTGATCAGAATCATATGGGTGAATGATACATTATACTGGCTGTGATACTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44589 327 + 636262 TCAGGCTGTCTGGTCTGGCACATTGGAGGGTGATATGCTAGGAGTCAATAAGAGTCAGCTGAGACACTATCAGGAGCCCAACTAGTTTTTTTAAAACCATATAATAATTGGCATAACTCCAAGGCAACAGGAAGTTATAACAGTATAACTGGCCTCACTCATTAAAGAACTGCAGCAACTGGGCCTGCCTACCTGCTGTTTATCAATCTTTGATAGAGTACTGAATTTTACTAGATATAAAAAAACTATAGCCATTAAGTAAACTCATGCTATTCACTGATAAGAATCATATGGGTGGATGATATATTGTACTGGCTGTGATAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 37152 317 + 647215 TCTACCAGTCTGGTCTGCCACACTGGAGGGTGATATCCTAGGAGGCCATAGGAGGCAGCTGAGACACTATCAGGGGGCTAACTAGCTTTTTCAAGACTGTATAATGAGTGGCATAACTCCAAGACAGCAGAAAATTATAATAGTATA---GACCTCAGTCATTCAAAAACTGCAGCAACTGGGCCCATGTACCTGCTGTTAATCAATCTTTGATAG-GTTCTGGACTTTAGTAGATGTAAAAAAACTAT------TGAGCAAACTCATGCGATTCACTGACCAGAATTATATGGGTGAATGATACGTTATACTGGCGGTGATACTCT + +a +s mr.mrrefChr0 42687 211 + 130230 GATCTAACATGTAATTTAACAAGAGACTTAAGCTACGCAACAGGCCTCTCATCAGGAGACTAGTAACTGGGGCAGCGAAGGATTAGAAAGCTGTTTCTGATTCTCTGGTACCTCTGAATGAGCATGCTTCTACTGAGGGTTTATCAAGGTCTATGGGTGAAGTATATTGGAGGGACCTTTGCACTGGGAACCAAAGTGTGGTCCTCCCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 44916 211 + 636262 GATCTAACATGTAATTTAACAAGAGACTTAAGCTATGCAACAGGCCTCTCATCAGGAGACCAGTAACTGGGGCAGCGAGGGATTAGAAAGCTGTTTCTGATTGTCTGGTACCTCTGAATGAGCATGCTTCTACTGAGGGTTTATCAAGGTCTATGGGTGAAGTATATTGGAGGGACCTTTGCACTGGGAACTAAAGTGTGGTCCTCCCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 37484 198 + 647215 GTTCTAATGTGTAATTTAACAAATAACTTAAGCTAC-------------TATCAGGCGACTGCTAACTTGAGCAGTGAAGGACTAGAAAGCTGTTTCTGATTCTCTGGTACCTCTGAATGAGCATACTTCTACTGAGGATTTACCAGGGTCTGTGGGTGAAGTGTATTGGAGGGACCTTTGCACTGGGAACCAGAGTATGGTCCTCCCAAT + +a +s mr.mrrefChr0 42898 48 + 130230 ATTTATAGTGATGCATGCCTGGGAGTCAATGCATTACAGAATCATATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45128 48 + 636262 ATTAATAGTGATGCATGCCTGGAAGTCAATGCATTACAGAATCATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 37682 48 + 647215 ATTTAGAGTGATGCATGCCTGGGGGTCAATGCACTACAGAATCATATA + +a +s mr.mrrefChr0 42946 16 + 130230 TGATCTTCAATAGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45177 16 + 636262 TGATCCTCAATAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 37730 16 + 647215 TGATCTTCAATAGGGA + +a +s mr.mrrefChr0 42962 20 + 130230 TTAGATGTAATATTGTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45193 20 + 636262 TTAGATGTAATATTGGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 37755 20 + 647215 TTAGATGTAATATTGTTGCA + +a +s mr.mrrefChr0 42982 35 + 130230 CAGCATCCACTGAAGAGGTAACTGGTTGTACTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45224 35 + 636262 CAGCATCCACTGAAGAGGTAACTGATTGCACTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 37775 35 + 647215 CAGCATCCACTGAAGATGTAACTGGTTGTACTATA + +a +s mr.mrrefChr0 43017 248 + 130230 TGACATTAGAGGACCATTGCTTATGCAAAGATCTTATGGTCCACTACCCTGTTGATTTAGATTTGACTGACTATGATGCAGGTAGTGTCTAGCAGTCCTAAGTCAACACATGGGTGTGTGTAAACTAATTGTTCTTTAGGTCCCTTGCATTCAGGCAATCACATGCCACACAATGGAGATGGCTGTAATGGGTGGAGACTATGTGGCACTTGATGAAGACACATCAGCTTTAAGAAGAGGACAGCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45261 248 + 636262 TGACATTAGAGGACCATTGCTTATGCAGAGATCTTATGGTCCACTACCCTGTTGATTTAGATTTGACTGACTATGATGCAGATAGTGTCTAGCAGTCCTAAGTCAACACATGGATACGTGTAAACTAATTGTTCTTTGGGTCCCTTGCATTCAGGCAATCACATGCCACACAATGGAGATGGCTGTAATGGGTGGAGACTATGTGGCACTTGATGAAGATACATCAGCTTTAAGAAGAGGACAGCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 37810 244 + 647215 TGACATCGGAGGACCATTGCTTATGCAAAGATCTTATGATCCACTACCCTGTTGGTTTAGATTTGACTGACTACGATGCATGTAGCGCCTAGCATTCCCAAGTCAACTCATGGGTGTGTGTAAACTAATTGTCCTGCAGGTCCCTTGCATTCAGGTAATCACATACCACACA---GAGATGGCTGTA-TGGATGGAGACTATGTGGTACTTGAAGAAGACACATCAGCTTCAAGAATAGCACAGCTGA + +a +s mr.mrrefChr0 43265 90 + 130230 CAGCAGTCTTTGTAACTAATGATGAACAAGCCTTGTGGTGAGGCCAGGCCCTATCCTGACAAACTAGTGTTCCCACTAAACTCACAACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45510 90 + 636262 CAGCAGTCTTTGTAACTAATGATGAACAAGCCTTGTGGTGCGGCTAGGCCCTATCCTGCCAAACTAGTGTTCCCACTAAACTCACTATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 38054 90 + 647215 CAGCAGTCTTTTTACCTAATGATAAACAAGCCTGGTGGTGAAGCCAGGCCCTATCCTGACAAACTGGTGTTCCCACTAAACTCATACCAG + +a +s mr.mrrefChr0 43355 31 + 130230 GATGATTGGACAATAATGACTGTTGAGGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45600 31 + 636262 GATGGTGGGACAATGATGACTGTTGAGGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 38152 31 + 647215 GATGATTGGACAATAATGACTGTTGAGGCCT + +a +s mr.mrrefChr0 43386 21 + 130230 ACTTGCTATTACCAGTTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45636 21 + 636262 ACTTGCTATTACCAGTTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 38183 21 + 647215 ATATACCATTATCAGTTAGTT + +a +s mr.mrrefChr0 43407 224 + 130230 GTCGGCTCTGTTGGGAAAGCCAACAATTGATCCACAGCTAAGTAAACAAATGGCAATTAGGAGCATAGCTTCAAATGCTAGAATGGTCTGTCTGTATGTTACAGGGCCCATATTGTCTTGTGTAATGACCCAAGGTCTGTAATGACCCAAGGTATGTGCTACATATGCCATGCCACCATGTCCTATATCCTGCACACCCCCCCTAGAACAGTATTCTAGAGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45660 220 + 636262 GTCGGCTCTGTTGGGAAAGCCAACAATTAATCCACAGCTAAGTAAACAAATGGCAATTAGGAACATAGCTTCAAATGCTAGAATGGTCTGT----AGGTTACAGGGCCCATATTGTCTTGTGTAATGACCCAAGGTCTGTAATGACCCAAGGTATGTGCTACATATGCCATGCCACCATGTCCTATGTTCTGCACACCCCCCCTAGAATAGTATTCTAGAGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 38379 204 + 647215 ---AGAACTGTTGGGAAAGCCATCGATTGATATACAGCTAAGTAAACAAATGGCAATTGGGAGCATAGCTTCAAATGCTAGAATGGTCTGTCTGTATGTTACAGGGCCCATTTTGTGTTGTATAATGACCCAAGGCTTT-----------------TGCTACATATGCCATGCCACCATGGCCTATATCCTGCACACCCCCCCTAGAACAGTATTCTAGAGCTA + +a +s mr.mrrefChr0 43631 40 + 130230 GAGCTCTTAATTTTATCCTTACTGTCATCTAGCTAGTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45880 40 + 636262 GAGTTCTTAGTTTTATCCTTACTGTCACCTAGCTAGTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 38599 40 + 647215 GAGCTCTTAATTTTATCCTTACTGGCATCTAGCTAGTCAG + +a +s mr.mrrefChr0 43671 7 + 130230 CACTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 38642 7 + 647215 CACTAGT + +a +s mr.mrrefChr0 43678 139 + 130230 GGACTTAGAAATTGGCATAAGGATGATTAGTTGCACCTTAAACTTTAATTGTTCAGTCTTAATAACCTTGCACAATCTGACTCAGGCTGAACATCCCCTAGTACAACCTATTGGAGTGGTGTGAATGTGTTATGTGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 45920 92 + 636262 -----------------------------------------------ATTGCTCAGTTTTATTAGCCATACACAATCTGAGCCAGGCTGAACATCCCCTAGTACAACCCATTGGAGTGGTGTGAATGTGTCATGTGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 38655 139 + 647215 GGACTTAGAAATTGGCATAAGGATGATTAGTTGCACCTTAAACTTTAATGGTATAGTCTTAACAATCTTGCACCATCTGACTGAGGCTGAATATCCCCTAGCACAACCTATTGGAGTGGTGTGAATGTGTTATGTGGTG + +a +s mr.mrrefChr0 43817 15 + 130230 GAATCTGCTATGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46013 15 + 636262 GAATCTGCTATGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 38794 15 + 647215 GAATCTGTTATGTGT + +a +s mr.mrrefChr0 43832 23 + 130230 ACTCTCTAGCAAATGGATAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46036 23 + 636262 ACTCGCTGGCAAATGGATAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 38809 23 + 647215 ACCCTGTAGTGAGTGGATAGTGT + +a +s mr.mrrefChr0 43855 346 + 130230 TAGGTAGCCAATACCTATGGACGTGACTGATATCCAGAAAGCTAAAATAAATATAGGATGATTGGCAGGAACCAAGTTTTAGAGCCGTCTTAAGGTCCCTGAGGCATAGCAAAGCAACAGCTGCTAATTGCAGTCTTAGGACTCCTCCCCATCAAGACTCCATCTGCAAGTTGCATGAGTACCCTGGTGAAAGTGTTGTGTGGCTCAGCATCAAAAGGTAGGTAGTATAATTCACCTTTTGCTAGACTTGTTTATGCATATTTATAAAGCTTGATTATTGCTTCTTGAGAGGATGTGTTCTTAACATGTTTATAGCACAAAATAATTTATAATTGATTTGGAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46061 346 + 636262 TACGTAGGCAATACCTATGGACATGACTGATATCCATGAAGTTAAAATAAATATAGGATGATTGGTAGGAACCAAGTTTTAGAGCCGTCTTAAGGTCCCTGAAGCATAGCAAACCAACAGCTGCTAATTGCAGCCTTAGGACTCCTCCCCATCAAGACTCCATCTGCAAGTTGCATGAGTACTCTGGTGGAAGTGTTGTGTGGCTTAGTATCAAACGGTAAGTAGTATAGTTCACCTTTTGCTAGACTTGTTTATGCATATTTAGAAAGCCTGATTTTTGTTTATTGAGAGGATGTGTTCTTAACATATTTATATCACATAATAATTTATTATTGATTTGGAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 38832 346 + 647215 TAGATAGCCAATACATATGGGCGTGACTGATATCCAGAAAGCTAAAATAAATATAGAAAGATTGGCAGGAACCAAGTTTTAGAGCCATCTTAAGGTCCCTGAGACATGGCAAGGCAACAGCTGCTAACTGTAGTCATAGGACTCCTCCCCATCAAGACTCCAGCTGCAAGTAGCATGAGCGCCCTAGTGAGAGTGTTGTGTGGCACAGCATCAAAAAGTAGGTAATATAATTCACCTTTTTCTAGACTTGTTTATGCATATTTATAAAACTTAATTACTACATCTTGAGAAGATGTGTTCTTAACATGTTTATAGCACAAAATAATTTAAAATTGATTTGGAACTT + +a +s mr.mrrefChr0 44201 262 + 130230 CTAAACTTCTCACTCCTACAATGGTGCAGTGCGTAGAAGGCACCAGAGATTTTAGAGGCAAGACAAAAAACCAATATTGCTAGACTTGTGATATATTCACAATTTGAACAAAGCCTGTATCGCCTATGTTAACCTATGGTATTCTTCCAACCTTGAAAAAGCAGAGTGGAAAACACATGTTGGAATTGCAAATGTGAAGCATACACATCAAATCACACATTCTAACAAACCCAACTGATTTAATACATCAACATCACAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46407 260 + 636262 CTAGACTTCTCACTCCTACAATGGTGCAGTGTGTAAAAGGCACTAGAGATTTTAGATGTAAGACAAAAAACCAATATTGCTAGA--TGTGAAATATTCACAATGTGAACATAGACTTTATTGCCTATGTTAACCTATGGTATTCTTCCAACCTCGAAAAAGTAGAGTGGAAAACACATGTTGGAATTGCAAACGTGAAGCATACACATCGGATCACACATTCTAACAAACCTAACTGATTTAATACACCAACATCATAATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 39179 262 + 647215 CTAAACTTCTCACTCCTGCAATAGTGCAATGCGTAGAAGGCACCAGAGATTTTAGAGGCAAGACAAAACACTAATATTGCTAGACTTGTGATATATTCACAATTTGAACAAAGCCTGTATCGCCTAAGTAGACCTATGGTATTCGTCCAACTATGGAAAAGCAGAGTGGTAAACACATGTTGGAATTGCAAGTCGGAAGCATACACAACAAATCACACATTCTAACAAACCCAACTGGTTTTATACATCAACATCACAATAT + +a +s mr.mrrefChr0 44463 260 + 130230 GAGACTATCATATTAGAATCCTGGTGGAGGATGCCAGGTGGATGTTTACACACAGGATAATTAGATGAATTAGACGATGGAAGCAACTGAGTCCTCTGCAGCTCTAACGCCTTATTCACAATTTCACCCTACTCTTCAGTGGTATACAGACTAAGCCGAGCTGGTATTACTGTGGACAACTAGGCACTACTGTTTAGATGAGCCTGACATTAGCAAGCATACACAAGGTTATTGATTGGAGCCTTCCAATGAGAATGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46692 255 + 636262 GAGGATGTCATATTAGAATCCTGTTGGAGGATGCCAGGTGGATGTTTGCACACAGGATAATTAGATGAATCAGACGATGGAAGCAACTAAGTCTTCTGCAGCTCTAACGCCTTATCCACAATTTCACCCTACTCTT-----GTATACAGACTAAGCCGAACTGGTATTACTGTGGCCAACTAGGCACTACTGTTTAGATGAGCCTGACATTTGCAAGCATACACAAGGTTAGTGATTGGAGCCTTCCAATAAGAATGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 39441 260 + 647215 AAGACCATCATATTAGAATCCTGGTGGAAGACGCCAGGTGGATGGTTACACACACGATAGTTAGATGAGTTAGAAGATGGAAACAACTGAGTCCTCTGGAGCTCTAACACCTTATTCACAATTTCACCCTACTCTCCAGTGGTATACAGACTAAGCCAAGCTGGTATTACTGTGGACAACTAGGCACCACTGTTAAGATGAGCCTGACACTAGCAAGCATGTACAAGGTTATTGATTGGAGCTTTCCAATGAGAATGGTG + +a +s mr.mrrefChr0 44723 161 + 130230 CAGTCACAGTGCATGCAAAAAAGTACATATGGACTTTAAGTGAGAGTGAGGCCCAAAATCTTACAAGGTGGACAATCAGCATAAGCTAAACTGCCTAACCACCCTGTTGTTGCAGGATTGCTAAACCTAGTGATTATGACCTAAGCTTCAGTGCTGAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 46947 161 + 636262 CAGTCACAGTGCATGCAAAAAAGTACATAAGGACTTTAAGTGAGAGTGAGGCCCAAAATCTTCCAAGGTGGACAATCAGCATAGGCTAAGCTGCCTAACCACCCTGTTGTTGCAGGATTGCTAAACCAAGTGATGATGACCTAAGCTTCAGTGCAGAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 39703 161 + 647215 CAGTCATGGTACATGCATAAAAGTACATATGGAATTTAAGTGAGAGTGAGGCCCAAAACCTTACATGCTGGACAATCAGCATAAGCTGAACTGCCTAACCTCCCTGTTGTTGCAGGGTTGCTAAATCTAATGATTGTGACCTAAGCTTCAGCACTGAGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 44884 105 + 130230 TATTCTAACACTAGCATTATATGGCAATTAGATTATATCCAACTGGATAGTAGATTGATGGGATACAGGAGGAGCACAAATCAAGACAATTCCAGTAGATGTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47108 103 + 636262 TATTCTAACCCTAGTATTATATGGCAATTAGATTATATCCAACTGGATAGCA-ACTGATGGGATATGGGAGAAGCACAAATCAAGACACTTCCAGT-GATGTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 39867 105 + 647215 TATTCTAACACTAGCATTACATGGCAATTAGATTTTATCCAACTGGATAGTAGATTGATGTGATACAGGAGGAGCACAAATCAATGCAATTCCAGCAGATGTGTG + +a +s mr.mrrefChr0 44989 188 + 130230 CCTTACACTTTAGTAGGGCTAGATGAGAGAGGGCATAGACATGCAGACTACAATCGATGATAACCCTTTGTCAGTCAGATTCAAGCACTTTGCAGCTGGGTTCGTGATTACCAGCTTTTGCTATGCCTAATGATGGTGTTTCAGGGCCTTCAGAAGTAGGCCAATCCTAGCAAGGTTAAATAGAAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47213 185 + 636262 CCTTACACTTTAGTAGGGCTAGATGAGAGAGGGCATAGACATGCAGACTACAAT---TGATAGCCCTTTGTCAGTCAGATTCAAGCACTTTGCAGCTGGGTCCATAATTACCAGCTGTTGCAATGCCTAATGATGGTGTTTCAGGGCCTTCAGAAGTAGGCCAATCCTAGCAAGGTTAAATAGAAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 39972 181 + 647215 GCTCAAACCTTAGTAGGGCTAGATGAGAGAAGGCATAGACATGCAAACTACAATCGATGATAACCCTTTGCCAGTCAGGTTCAAGCCCTTTGCAGTCAGGTTCGTGATTATCAGCCTTTGCTATGCCTAATGATGGTGTTTCAGGGCCTTCAGAAGTAGGCCAATC-------GTTTAAATCAAAGAA + +a +s mr.mrrefChr0 45177 121 + 130230 AGGCTTAAAGATTTTCTCACTCTAACACAGGTGTTAGATCACATGTACAGATTCTGTGGATTAAAAAGGAGCTACAGGTAGTGTATACACACAAATTGAGTCAAAAATAAAGATCATGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47398 121 + 636262 AGGCTTAAAGATTTTCTCACTCTAACACAGGTGTTAGATCACACGTACAGGTTCTGTGCGTTAATAAGGATCTCCAGGTAGTGTATGCACACAAATTGAGTCAAAGATAAAGGTCATGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 40157 121 + 647215 AGGCTTAAACATTTTCTAACCCTGACACAGGTGTTAGAACATATGTACAGATTATGTGGACTAAAAAGGAGCTACAGGTAGTGTATACACACAAATTCAGTCAAAAATAAAGAGCATGTGG + +a +s mr.mrrefChr0 45298 102 + 130230 ATATGTGTTAAGATCCATGGCTAGCATTGGCCCACTAGGATAGTCATAGTTTGAGGGGGTGGCAGACCTAAACCTTGGGGAAAGAACAATAGAGAATTAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47519 102 + 636262 ATATGTGTTAAGATCCATGGCTAACATTGGCCCACTAGGATAGTCATAGTTTGAGGGGGTGGCAGACCTAGACCTTGGGGAAAGAACCATACAGAATTAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 40279 102 + 647215 ATACGCGTTAAGATCCATGGCTAGCATTAGCCCACTAGGATAGTCATAGTCTGAGGGGGTGGCAGACTTAATCCTTCAAGAAAGAACAATAGAGAATAAGTA + +a +s mr.mrrefChr0 45400 20 + 130230 TGCCAGGCTATCTTACCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47621 20 + 636262 TACCAGGCTATCTTACCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 40384 17 + 647215 TGCCAGG---TCTTACCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 45420 203 + 130230 ATGTATAGAACAATAGAGCAGGTACATAAAACAATATTTTAGTTGATAATTCTTAGATCTTTGCTAATTCTTCGTTCTTTGCCCATGCACTGCTCCATGTTAAAGTGCTTGAAGAGGGCAAGAACCTCTTTCTAATCACACTTTAGGACCCATGATGTTATAATGATCTTCAAGTGAAGCAGAAATTCCATTCATATTTATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47641 186 + 636262 ATGTATGGAACAATAGAGCAGGTAGACAAAACAATATTTTAGTTGATAATTCTTATATCTTTG------------TCTTTGCCCATGCACTGCTCCATGTTAAAGTGCTTGAAGAGGGCAGGAACCTCTTTCTAATCA-----TAGGACCCATGATGTTATAATGGTTTTTAAGTGAAGCAGAAATTCCATTCATATTTATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 40404 203 + 647215 TTGTATAGAACAATACAGCAGGTACATATAACAATATTATAGTTGATAATTCTTCGTTCTTTGCTAATTCTTCGTTCTTTGCCCATGCACTGCACCATGTCATAGTGCTTGAAGAGCGCAAGAACCTCTTTCTAATCACACTTTAGAATCAATAACATTATAATGATCTTCAAGTCAATCCAAAATTCCATTCATATTTATGG + +a +s mr.mrrefChr0 45623 135 + 130230 ACTACCATGTACGCCCCAGAGAAATTCTCATATCTGACTAGGTTACATAGCTATCGTCTACTGGGTTTAGTTCAGGGCAACCTTTTAATAAACTGATTCAATTGCTATTGAGTGCAAGAATCACTGACAAACCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47831 135 + 636262 ACAACCATGTACGCCCCAGAGAAACTGTCATATCTGACTAGGTTACATCGTGGTCATCTACTGGGTTTAGTTCGGGGCAACCTTTTAATAAACTGATTCGATTACTATTGAGTGGAGAAATCACTGACAAACTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 40607 135 + 647215 ACTACCATGTACACCTCAGAGAAATCCTCATTTCTGACTAGGCTACATAGCTATTGACTAATGGGTTTAGTACAGGGCAACCTCTTAATACATTGATTTAATTGCTATTGAGTGCAAGAATCACTGACAAACCAT + +a +s mr.mrrefChr0 45758 58 + 130230 TGAATATTGAAGAAATCAGCTGTGGCTAGTTTGAGGGCAAACCCTAATATCTGGTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 47972 58 + 636262 TGAATATTGAAGAAATCAGCTGTGGCTAGTTTGAGGGCAAGCCCTAATATCTGGTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 40742 58 + 647215 TGAATGTTGAACAAATCAACTGTGGCTCGTTTGAGGGCAAACCCCAATTTCTGACAAA + +a +s mr.mrrefChr0 45816 65 + 130230 TGGTTAGTCCCCTCTGCTCATACAGGTATCCCCATCCCTATACACCACTAACACCACAGAACTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48031 64 + 636262 TGGTTAGCCCCCCCTACTCATACAGGTATCCCCATCCCTATACACCACTA-CACCACAGAACTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 40800 65 + 647215 TGGTCAGTCCTCTCTGCTCATACAGGTATCCCTATCCCTATACACCACTAACACCACAGAACTAC + +a +s mr.mrrefChr0 45881 180 + 130230 TCAGATATTATGAGTTACATCCATGTAGGCTAGCAATATTTTTTAGTACTCCTGCACTTGGTTGCAGACAAGGTGTCATACAGATTTCATACTGAACTGGACCCTCTGTTTAGACTACGGGGCTGACCTGTTAATATGTATCCTTAAAAAAATGGATTCAATCATTATTGGAGCAAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48097 179 + 636262 TCAGATATTA-GAGTTACATCCATGGGGGCTAGCAATGTTTTTTAGTGCACCTGCACTTGGTTGCAGACAAGGTGTCATGCAGATGTCATACTGACCTGGACCCTCTGTTTAGACTACGGGGCTGACCTGTTAATATGTATCCTTAAAAAAATGGATTCAATCATTATTGGAGCAAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 40865 173 + 647215 TAAGATATTATGAGTTACATTCATGTAGGGTAACAATATTTTTTAGCACTCCTGCACTTGGCTGCGGACAAGGTGTCATACAGATTTCATACTGGACTGGACCCTCTGTTTAGACTAGGGTGCTAACCTGTTAATATGTAGCCTTATAAA-------TCAATCATTATTGGGGCGAAGAA + +a +s mr.mrrefChr0 46061 131 + 130230 TGTACAAGTTCTTGATTGTAGAAGGTAGAAGCATCATACATCAGAGAGATTGTGTCATCCTAATTCCCAGAATATATTTCCAGTTTAACAGTTGGCTCCAGGAGGATTGAATGGAAATAGTGCTTTTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48277 131 + 636262 TGGGCAAAGTCTTGATTGTAGAAGTTAGAAGCATCATACATCGGAGAGATTGTGTCATCCTAATTCCCAGAATATATTTCCAGTTTAACAGTTGGCTCCAGGAGGATTGAATTGAAATAGTGCTTTTTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 41038 131 + 647215 TGTACAAGTTGTTGATTGTAGAAGGTAGAAGCATAGTACACGAAAGAGATTGTGTCATTCTAATTCCCAGAATATATTTCCAGTTTAACACTCGGCTCCAGGAGGACTCAATGGAACTCGTAATTTTTGAG + +a +s mr.mrrefChr0 46192 7 + 130230 CCTATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48408 7 + 636262 CCTATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 41171 7 + 647215 CCTATCA + +a +s mr.mrrefChr0 46199 296 + 130230 AATCATTATTTACCTACATATCCCCATATACTATGATGATAACGGTAGCAGAAAAAGTGTTGCTATTGGGAAGTAAGTATTGTCCACTTTTAGCCTCTTGTACTTAAACAGCAAGCTCAAGGTCACATTCACTGTAAGCACCTAAGATCAAATATATATTGCTGCCATGGCAACAAAATAAACACTCGAGGTTGATAGCAAAGAATGCTGACAGATCTGATGAACTGCATAACGGTCTTAGCAGGGCACTGATGCTACCTGGCTTCACATATCCAACTCTCCATCCATGCAACTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48422 294 + 636262 AAGTATTATGTACCTACATATCCCCATATACTATGATGATAACGGTATCAGAAAAAGGGTTGCTATTAGGAAGTAAGTATTGTCAACTTTTAGCCTCTTGTACTTAAACAGCAAGCTCAAG-TCACATTCACAGTAAGCACCTAAGATCAA-TGTATATTGTTGCCATGGCAACAATTTAACAACTCGAGGTTGGTAGCAAAGAATGCTTACAGATCTGATGAACTGAATAACAGTCTTAGCAGGGCACTGATGCTACCTGGCTTCACCTATACAACTCTTCATCTATGCAACTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 41178 296 + 647215 AATCATTGTTTACCTACAAATCCCCATTTACTATGATAATAATGCTAGCTCAAATAGTGTTGCTATTGGGAGGTAAGTATTGTCCACTTATAGGCTCTTGTACTTAAGCAGCGCACTCAAGGTCACGTTCACTGTAAGCACCTAAGATCAAATACATATTGCTACAATGGCAACAAAATAAACCCTGCAGGGTGAATGCAAAGAATGCTGAGAGATCTGATGAACTGCATAATGGTCTTAGCAGGGCACTGATGCTACCTGGCTTCACATATCCAACTCTCCAACCACACAATAAG + +a +s mr.mrrefChr0 46495 69 + 130230 AGCTGTTTGTGTATGGAACATTCTTGTTTGTATTATTCTCACAGGTTGTGACACAAAAATCTTGAAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48755 69 + 636262 AGCTGTTTGTGTATGGAACATTCTTGTTTGTATTATTCTCACAGGTTGTGACATAAAAATCTTGAAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 41474 69 + 647215 AACTGTTTTTGTATGGAACATTCTTGTCTGTATTATTGACATAAGTTGTAACACAAAAGTCTTGGAGTG + +a +s mr.mrrefChr0 46564 259 + 130230 CTATGTGCACATCTCCCAGATTGATTGACTGACACTCCAGAAACTGTTTAGGAAGGAATTGCCCTGGTTGATTCTGTTTATAAGTCAGAACCACCTATTATACACATGAACAGTCTTGTATTTTTCAAACCTTCGTGATGACAAAAATACAATAGTAGGACAGTGCAAGCATCTATTAGTATCATCATTAAGTTTCTCCAGATATCTTGATGTTTCAACAAGCTGGCTTTAACTTGTATTCGAAAAATTAGTCCGTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 48824 258 + 636262 CTATGTGCACATCTCCCAGATTGATTGACTGACACTCCAGAAACTGTTCAGGAAGGAATTGCCCTGGTTGATTCTGTTTATAAGTCCGACCCACCTATTATGCACATGAACAGTCT-GTATTTATCAAACCTTCGTGATGACAAAAATACAATAGTAGGACAGTGCAAGCATCTATTAGTGTCATCATTAAGTTTCTCCAGATATCTTGATGTTTCAACAAGCTGGCTTTAACTCGTATTCGAAAAATTAGTCCGTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 41560 251 + 647215 CTATGTGCACATCTCCAGGATTGATGGACTGTCACTCCAGAGTGTGTTTAGGAAGGAGTTGCCCTGGTTGATTC--------AGTCAGAACCACCTATTATATACATGAACAGTCTTATATTTTTCAAACCTCCGTCATGACAAAAATACAATAGTTGGACAGTGCACGCATCTATTAGTATCATCATTAGATTTCTCCACATATCTTGATGTTTCAACAAGCTGGCCTTGATTTGTATTCAAAAAATTAGTCCTTCCA + +a +s mr.mrrefChr0 46823 59 + 130230 GTTTAAAATGCGTGTTTTTTAGCAAGCATATGTCTTTATTGCTTCTAGGTTTGCAGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49083 59 + 636262 GTTTAAGATGCGTGTTTTTTGGCAAGCATATGTCCTTATTGCTTCTAGGCTTGCAGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 41811 57 + 647215 GTTTAAAATGCGT--TTTTCAGCAAGCATATGTCTTTGTTGCTTTTAGGTTTACAGAAG + +a +s mr.mrrefChr0 46882 241 + 130230 TTAAGCTGAGTCCTGACAATGCAGAGATAAATTCCCTGTCTAAGCACCCCAGAAGCAAACACCATCTATATTAGTTCCCTAGCCTCTATTCTGGTTGGGAACTCAAATCTATAAAATATAGTATCTCCACATGAAACAGAACCCCTTTATGACGAGGACTCAATTAGAATAATTAGAATGTTGCTCAAACAGTGGAGTATTTTATTGCCATTTTTATTGCCTTGAGATTATGCTCAAAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49143 241 + 636262 TTAAGCTGAGTCCTGACAATGCAGAGATCAATTCCCTGTCTAAGCACCCCAGAAGCAAACACCATCTATATTAGTTCCCTGGCCTCTATTCTGATTGGGAACTCAAATCTATAAAATATAGTATCTCCACATGAAACAGAACCCCTTTATGACGAGGACTCAATTAGAATAATTAGAATGTTGCTCCAACAGTGGAGTATTTTATTGCCATTTTTATTGCCTTGAGATTATGCTCAAAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 41868 240 + 647215 TTAAGGTGAGTCATGACAATGCAGAGATAAATTCTATGTCTAACCACCCCACAAGCAAACAA-ATCTGTATTGGTTCCCTAGCCTCTATTCTGGTTGGGGACTCAAAGCTATAAAATACACTATCTCCACACGAAACAGACCCCCTTTATGACAAGGACTTAATTGGAATAATTAGAATGTTGCTCAAACACTGGAGTTTTTTATTGCCCTTTTTATTGCCTTGAAATTATGTTCAAAGGT + +a +s mr.mrrefChr0 47123 59 + 130230 CATGTCAAGTGAATCTGATTCCATTTTGTTGCTGTATTAATGTATCATCTTTGCTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49389 59 + 636262 CACGTCAAGTTAATCCAATTCCATTTTGTTGCTGTATTAATGTATCACCTTTGCTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 42108 59 + 647215 CATGTTAAGAGAATCTGATTCCATTTTGTTGCTGTATTAATGTATCATCTTTGCTTTGA + +a +s mr.mrrefChr0 47182 21 + 130230 TATAGGGTATCTTTGACAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49455 21 + 636262 TATGGGGTATCTTTGACAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 42167 21 + 647215 TATAGGGTATCTTTGACAACT + +a +s mr.mrrefChr0 47203 44 + 130230 TAATGCCTCAAAATAACATATTAGCTGGTCCATATTAAAAAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49476 44 + 636262 GGATGCCTCAAAATAACATATTAGCTGGTCCATATTAAAAAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 42206 44 + 647215 TAATGCCTCAAAATAACATATTAGCTGGTCCATATTAAAAAGCA + +a +s mr.mrrefChr0 47247 28 + 130230 TCCTCATTTAACTTGTATCACCTGCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49544 28 + 636262 TCCTCATTTAACTTGTATCACCTGCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 42250 28 + 647215 TCCACATTCAACTTGTACCACCTACTTT + +a +s mr.mrrefChr0 47275 5 + 130230 TTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49646 5 + 636262 TTCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 42278 5 + 647215 TTAAG + +a +s mr.mrrefChr0 47280 94 + 130230 CAGAGGTTGCTAATTACTTATATTGGAGAATTTATATTAGTCACTTACGTAGTGGGTATGCTTTTTCTCAATTATACAGATCATTTCAAGAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178941 93 - 636262 CCGAGGTTGCTGATTACTTATATTGGAGAATGTATATT-GTCACTTACGTAGTGGGTATTCTTTTTCTCAATCATACAGATCATTTCAAGAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 42283 94 + 647215 CAAAGGTTGCTAATTACTTATGTTGGAGAATTTATATCAGTCACTTACATAGTGGGTACGCTTTCTCTCAATTATACAGATCATTTCAAGAGGA + +a +s mr.mrrefChr0 47374 140 + 130230 TAGGCCTATGGTTTGTAGGTATCTTACACACATGGTTCTATTAGTTTTGTGAATTGCACTTTGCAACTCATTATTCTATGATACTCCCACTTCACTTCCCTTTTCACTGCACTAGTCACCAAGTctactatagtccttct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179036 124 - 636262 TAGGCCTTTGGTTTGTAGGTATCTTACACACATAGTTCTATTAGTATTGTGAATTGCACTTTGCAACTCATTATTCTATGATACTCCCACTCTACTTCCCTTTTCACTGCACTAATCACCAAGT---------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 42377 140 + 647215 TAGGCCTAGTGTTTGTAGGTATCTTACACACATGGTTCTATCAGTTTTGTGAATTGCACCTTGCAACTCATTATTGTATGATGCTCCAACTTCACTTCCCTTTTCACTGCACTAGGCACCAAATCTACTATAGTCCTTCT + +a +s mr.mrrefChr0 47514 32 + 130230 TATACTTTGTTGACTTCAATACCTTATACTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49651 32 + 636262 TATACTTTGTTGACTTCAATACCTTATACTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 42530 32 + 647215 TGTACTTTGTTGACTTCAATACATTTTACTAA + +a +s mr.mrrefChr0 47546 59 + 130230 GATTATGTGTATATCTATACAACTGGTAGGCAGAGGTGTAGCAAATTGCATTTGCATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49683 59 + 636262 GATTATGTGTATATCTATACAACTGGTAGGCAGAGGTGTAGCAAATTGCATTTGCATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 42575 59 + 647215 GACCATGTGTATATCTGTACAACCGGTAGGCATAGGTGTAGCAAATTGCATTTGTATCA + +a +s mr.mrrefChr0 47605 51 + 130230 TGAAGTCCTTAAAGACCTCAATTCTAAATTCATTTGCCAACCGTGCATCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49748 51 + 636262 TGAAGTCCTTAAAGACCTCAATTCTAAATTCATTTGCCAACCGTGCATCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 42634 51 + 647215 TGAATTTCTTAAAGACTTCAAGCCTAAATTCATTTGCCGATTGTGCAGCAC + +a +s mr.mrrefChr0 47656 31 + 130230 TTTGCAATGATTGAGCTTTAAACTTCTAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49813 31 + 636262 TTTGCAATGATTGAGCTTTAAACTTCTAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 42685 31 + 647215 TTTGCAATGATTGCGCTTTAAAGCCGCAGCC + +a +s mr.mrrefChr0 47687 99 + 130230 AGAATAGATGAGCAATGTGGAACCTTGCCTTAGATCTTGGCCTTGCTCTTTCACTGTGCAAAATGCTGTTTCATGCTGTAATTTCAGGTGATACCTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49844 99 + 636262 AGAATAGATGAGCAATGTGGAACCTTGCCTTAGATCTTGGCCTTGCTCTTTCACTGTGCAAAATGCTGTTTCATGCTGTAATTTCAGGTGATACCTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 42731 99 + 647215 CAAATAGATGAGCAATGTGGAACCTTGCCCTGGATCTTGGTCTTGCTCTCTTGCTGCACAAAATGCAGTTTCATGCTGTACTTTCAGGTGTTACCTACT + +a +s mr.mrrefChr0 47786 9 + 130230 AGGTGATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49948 9 + 636262 AGGTGATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 42830 9 + 647215 GGGTTGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 47795 14 + 130230 TTGTGACACTCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49965 14 + 636262 TTGTGACACTCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 42839 14 + 647215 TTATGTCACTCTCA + +a +s mr.mrrefChr0 47809 126 + 130230 CTTAAAAATGACCAGTCACCCATGGTTTTGTAGCTTTGAATTAGATGTGTACAGAAGTAGATATTCTTCTTCCAGTAAATCAACTATAGCAGTATCGTCATTTCAGCCCTTGTGAGTCTCATAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 49979 126 + 636262 CTTAAAAATGACCAGTCACCCATGGTTTTGTAGCTTTGAATTAGATGTGTACAGAAGTAGATATTCTTCTTCCAGTAAATCAACTATAGCAGTATCGTCATTTCAGCCCTTGTGAGTCTCATAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 42856 126 + 647215 CTTAATAATGACTAGCTACCCATGGTATCGTAGCTCTGTATTAGATATGAACAGAAGTAGATATTCTTCTTCCAGGAAATCATCTATAGCAATATGGTCATTTTAGCCCTTGTGAGTCTCATAACT + +a +s mr.mrrefChr0 47935 31 + 130230 CATTGGTCTTGTAACCCTATAGCTTGTCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50106 31 + 636262 CATTGGTCTTGTAACCCTATAGCTTGTCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 42982 31 + 647215 CATTGGTCCTTAAGCCCTGTAGTTTGTGGAC + +a +s mr.mrrefChr0 47966 41 + 130230 AGGACAGAAATTACTTGTACACTCTTATACTTGCTGTAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50138 41 + 636262 AGGACAGAAATTACTTGTACACTCTTATACTTGCTGTAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 43013 41 + 647215 AGGACAGAAATGACTGGTAGGCTATTATACGTGCTGGGATA + +a +s mr.mrrefChr0 48007 9 + 130230 TGAGTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50180 9 + 636262 TGAGTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 43054 9 + 647215 TTAGTTTGA + +a +s mr.mrrefChr0 48016 18 + 130230 CTTGGCAGACTTATTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50192 18 + 636262 CTTGGCAGACTTATTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 43063 18 + 647215 TTTGGCATACTCATTCTG + +a +s mr.mrrefChr0 48034 14 + 130230 ATTGCCGGATGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50210 14 + 636262 ATTGCCGGATGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 43082 14 + 647215 ATTGCAGGACACCT + +a +s mr.mrrefChr0 48048 18 + 130230 ACTCAGTAGCATTAAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50224 18 + 636262 ACTCAGTAGCATTAAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 43097 18 + 647215 GCTCAGTAACATTAAGTT + +a +s mr.mrrefChr0 48066 126 + 130230 GTATTTGGTACATTGGCTTCCATCTTCAAAGTTACAATAGCTTACAGGTTCACTTTGTCTTTTTGCACCTTAGGCAAGTTGAAGTATCAAGACCTTCATTCTGATAATTCAAATTAAGTTGGTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50242 88 + 636262 GTATTTGGTACATTGGCT--------------------------------------GTCTTTTTGCACCTTAGGCAAGTTGAAGTATCAAGACCTTCGTTATGATAATTCAAATCAAGTTGGTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 43123 126 + 647215 TTATTTGATACATTGGCTTCCATCTTCAAAGTTACAATAGCTTACAGGTTCACTTTGTCTTTTTGCACCTTAGGCAAGTTGAAGTATCAAGACCTTCATTCTGATAATTTGAATTGAGTTGGGGTA + +a +s mr.mrrefChr0 48192 90 + 130230 GCCATAATCTGTATTGAGGGTAGATCATGGTCCTTGTCCTAGTATACAGTAAAAAGTGAGAAACTTCCAATCAATGACTTTAAGGTTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50330 72 + 636262 ------------------GGTAGATCATGGTCCTTGTCCTAGTATACAGTAAAAAGTGAAAAACTTCCAATCAATGACTTTAAGGTTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 43253 90 + 647215 GCCATAATCTGTATTGAGGGTAGATCATGGTCTTTGTCCTAGTATGCAGTAAAAAGTGCGAGACTGCAAATCAATGACTTTAAGGTTACA + +a +s mr.mrrefChr0 48282 150 + 130230 TTTTATCCTATCTTTTTTCTCAATAACTCCTCAAGTGAGTTAATTTGTCTGGACGATTATAAGTGCTCTATACCCTCACATTGCAATTTCAGCGTCTGCTGCAACATCTTAACTTACCAGTAAGGGTATTGACACCTCAGGCTGAGTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50402 150 + 636262 TTTTATCCTATTTTTTTTCTCAATAACTCCTCAAGTGAGTTAATTTGTCTGGATGATTATAAGTGCTCTATACCCTCACACTGCAATCTCAGCGTCTGGTGCAACATCTTAACTTATCAGTAAGGGTAATGACACCTCAGGCTGATTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 43350 150 + 647215 TTTCATCCTATCTTTTTTCTCAATAACTACTCAGGTGAGTTAATTTGTCTGGACGATGGTAAGTGCTTTACACCCTCACCTTACAATTTCAGTGTCTGCTGCAACATCTTAACTTACCAGTAAAGGTATTAACAACTCAAGCTGAGTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 48432 289 + 130230 ACAAACAATGACAGTGGGTCAAAGTAATCCTTACAACTTCCCCAATAGGTTGTTCAGCCACAATGCAATTAAGTAAACCAAAGTTCATGATCATTGATGATAGACCTTTCATTAATCATGACTACATTGCTATTATTATCCCTTTATTTCCTTGGTTTAGACCCTGACTTATTCCTTTCAGTGTAGGTCTACTCCTTTTACTGTATTCTAATTTTCTATGGCAGAGCATTCCTTATCAATGAACCCACCCATAGTCTATATTGCAGGAGTCACATGGAGATCCTGAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50600 287 + 636262 ACAAACGATCACAGTGGGTCAAAGTAATCCTTACAACTTCCCCAATAGGTTGTTCAGCCACAATGCAATTAAGTAAACCAAAGCTCATGATCATTGGTGATAGACCTTTCAATAATCAGAACCACATTGCCAT-ATTAACCCTTTATTAACTCAGCC-AGACCCTGACTTATTCCTTTCAGTGTAGGTCTACTCCTTTTACTGTATTTTAATTTTCTATGGCAGAACATTCCTTACCCATGAACCCATGCATAATCTATATTGCAGGAGTCACATGGAGATCCTGAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 43500 289 + 647215 ACAAACAATGTCAGTGGGTCAAAAAAACCCTTACAACTTATCCAATAAGTTGTTCAGCCACAATGCAATTGAGTAAGCCAAAGTTCAGGACCCTTGATGATAGACCTTCCATTAATCATGACTACACTGCTATTATTATCCCTTTTTTTCCTTGGTTTGGACCCTGATTTATTCCTTCCAGTGTAGGTCTACTCTTTTCACTGTGTTCTAATTTTGTCTGGCAGAGCATTGCTTATCAATGACCCCACCCATAGTCCGTATTCCTGGAGTTGCATGGTGATCTTGAGCT + +a +s mr.mrrefChr0 48721 12 + 130230 GTTGGTTAATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50888 12 + 636262 GTTGGTTAATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 43789 12 + 647215 GCTGGTTAGATG + +a +s mr.mrrefChr0 48733 3 + 130230 CTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50902 3 + 636262 CTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 43801 3 + 647215 CTG + +a +s mr.mrrefChr0 48736 4 + 130230 GTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50905 4 + 636262 GTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 43805 4 + 647215 GTGG + +a +s mr.mrrefChr0 48740 318 + 130230 CTCTAGCCAGTCTCTTCTATTAACATACGTGGTCACCTTATAGTACATGAATACCTTGTGCAATGATCACCTAATGCCATAAGGCCAGGAATCTATGTTAATCATGACTCAACCCTATGACTCAAGGGCTTAAATGATATATACACACCAGCCTTTTTACAAAACACCAGCCTTTTCATTGATTTACACATGTATTTAAGTATACCTGTTTATGGGATGTTATCAATAAAAGAAACTATAATATCTTATAATTTTGAGATGCATTATGTTAGATCAGAGATACAGCTGCTTCAATAATTAGGCCACCCTGTTCATTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 50953 314 + 636262 CTCTAGCCAGTCTCTTCTATGGACATATGTGGTCACCTTATAGTACATGAATACCTTGTGCAATGATCACCTAATGCCATAAGGCCAGGAATCTATGTTAATCATGACTCAACCCTATGACTCAAGGGCTTAAATGATATATACACACCAGCCTTTTTACAAAACACCAGCCTTTTCATAGATTTA----TGGATTTAAGTATACCTGTTTATGGGACGTTATCAATAAAAGAAACTGTAATATCTTATAAATTTGTGATGCATTATGTTAGATCAGAGATACAGTTGCCTCTATAATTAGGCTGCCCTGTTCATTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 43809 314 + 647215 CTCACTTCATTCTCCTCGATTAGCATGCGTGGTCACTATATAGTACATGAATCCCTTGTGCAATGATCACCTAATGCCATAAGGCCAGGAATCTATGTTAATCATGACTCAATCTTAT---TCAAGGGCTTGAATGATATATACACACAAGCCCTTCTACAAAACACCAGCCTTTTCATTGATTAACACATTTATTTAAGTATACCCATTTATGGAATGTTATCAATAAAAGAAACTATAATATCTTATAATTTTAAGATGCATTATGTTAGATCAGAGATACAGCTCCTTCAATAAT-AGCCCAACTTGTTTATTTC + +a +s mr.mrrefChr0 49058 19 + 130230 GCATTGTGTCAACTATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51268 19 + 636262 GCATTGTGCCAACTATTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 44123 19 + 647215 CCATTGTGTCAATGGTTAA + +a +s mr.mrrefChr0 49077 11 + 130230 TAATTTGTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51287 11 + 636262 TAATTAGTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 44144 11 + 647215 TGATTTGTAAC + +a +s mr.mrrefChr0 49088 90 + 130230 GAACAAGGCCTCTCCTGTGCCACATCCCAAGAACTGTAGGGCTTAGCAAAATTGAAAAGGTTGTTAGGACAAACTAGTATAGGTAATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51299 90 + 636262 GAACAAGGCCTATCCTATGCCACATCCCAACAATTGTAGGGCTTAGCAAAATTGAAAAGGTTGTTAGGACAAACTAGTATAGGTAATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 44155 90 + 647215 AAACAAGGTCTCTCCTGTGCCACATCACAAGAACTGTGGAGCTTAGTAAAATTAAAGAGGGTGTTAGGACAAGCTAGTATGGGTAATACA + +a +s mr.mrrefChr0 49178 140 + 130230 TGAATGAGTATCAGAGGCTAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGTTTCGTGTGGCATTAATGGGATTAAACAGCTGAGTTCACAAATCCACTGGTTGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCTGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51392 140 + 636262 CGAATGACTATCAGAGGCTAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGTTGCGTGTGGCATTAATGGAATTAAACAGCTGAGTTCACAAATCCCTTGGTCGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCTGGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 44245 140 + 647215 TGAACCAGTATCAGAGGATAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGCTTTGTGTGGCACTAATGGGATTAAACAGCTGAGTTCACACATACACTAGTTGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCCAGATG + +a +s mr.mrrefChr0 49318 108 + 130230 TTGTGAGTACAGTATCCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGATACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTATGCCTGCTAATCTTCATTATTGGTTGATTCATATGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51532 108 + 636262 TTGTGAGTACAGTATCCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGATACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTATGCCTGCTGATTTTCATTATTGGTTGATTCATATGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 44400 108 + 647215 TTATGATTGCAGTACTCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGTTACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTACACCTGCTAATCTTCATTATTGGTTGCTTCATATGAT + +a +s mr.mrrefChr0 49426 42 + 130230 GATCTCCACAGGTGAGCTAGTTTTAATACTGACTGATCATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51640 42 + 636262 GAGCTCCACAGGTGAGCTAGTTTGAATACTGACTAATCATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 44519 42 + 647215 GATCTCCATAGGTGAGCTAATTTTAATCCTGACTGATCATCA + +a +s mr.mrrefChr0 49468 31 + 130230 CCTTTCCAGGTTTCACCCTGTTCCCTCCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51682 27 + 636262 CCTTTC----TTTCACCCTGTCCTTTTCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 44562 31 + 647215 CCTTTCCAGGTTTCACCCTGTTCCCTCCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 49499 198 + 130230 ATAGAGGAACCTGGGTGTGTAGGAGCTTGATGTCAATTCTGCAGAGTAGTACATTGCTGCTTCTGAATCCACTCAGAGTTTAATCTCACCATCTAGGAACCGTGCTCCTTGCTACTATTAATTTACACACCTCTTTAAAATTTCTGTTATCACCCTTGTGGTCCATAACAATAATATCACCCTTTTACTTATAACTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51742 197 + 636262 ATAAAGGAACCTGGGTGAGTAGGAGTTTGATGTCAATTCTGCAGAGTGGCACATTGCTGCTTCTGAATCCACTCAGA-TTTAATCTCACCATCTAGGAACCACACTCCTTGCTACTATTAATTTACACACCTCTTTAAAATTTCTGTTATCACCCTTGTGGTCCATATCAATAATATCACCCTTTTACTTATAACTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 44593 198 + 647215 TTAGAGGAACCTGGGTGTGTAGGATCTTGATGTCAATCCTACAGAGTAATAGATTGCTGCTTCTGAATCCACGCAGAGTTTAATCTCAGCATCTAAGAACCGTGCTCCTTGGTACTACTAATTTACACACCTCTTTAAAGTTTCTGTCATCACCCTTGTGGCCCATAACAATCATATCACCCTTTTACTTATTACTGA + +a +s mr.mrrefChr0 49697 227 + 130230 TGGCCTGTGAGCTGGAGGTTCTCAAGGCAACATTTACTTATGGTTCTGGTGCAATATCCAACTTATGTCTTTAATGTATCTTGTCTGGGGTCGTGCCTTTGATTTACAATCACTTTTGTCAGTGTGCATAGTGCTATATGATGTCAGAACTCTTACTTGGAGAAACTCATCTCATCAAGTAAATGTATCTGTCACATGAAGGGGAGCAGCTAGGGGGATATGCTGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 51946 215 + 636262 CATCCTGTGAGCTGGAGGTTCTCAAGGCAACAATTACTTATGGTTCTGGTGCAATATCCAACTTGTATCTTTAATGTATTTTGTCTGGGGTCCTGCCCTTGATTTACACTCACTTTTGTCAGTGTGCATAGTGCTATATGATTTCAGAACTCTTATTTGGAGAAAATCAT-TCATCAAGTAAATTTATCTGTC---TGAAGGGGAG--------GGGATATGCTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 44791 227 + 647215 TGGCCTGTGAGCTTGAGGTTCTCAAGGCAACATTTACTTATGATTCTGGTGCAATATCCAATTCATGTCTTTAATGGATCTTGTCTGGCGTGGTGCCTTTGATTTCCAATCACTTTTATCAGAGTGCACAGTGCTATATGATGTCAGAACTCTTACTTGGAGAAACTCATCTCATCAACTAAATGTATCCGTCACATGAAGGGGAGCAGCTAGGGGGATACGTTGAC + +a +s mr.mrrefChr0 49924 167 + 130230 GACTACTCATCTGTCAATGGACCTAACCCAAACCTGGGGTACCATGAAATATTTTTTAATTCTTGCTATTTCTCACATTGCACCACATAGGGTTCAGATGACTGGTGGTAGAGCAAGATTAAGCCAGCTGAACAACTGTTCAGGATCTAAGTCTCCCATCACCAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52162 167 + 636262 AACTACTCATCCATCAATGGACCTAACCCAAACCCAGGGTACCATGAAATATTCTTTAATTCTTGCTATTTCTCACAATGCACCACATAGAGTTCAGATGACTGGTGCTAGAGCATGATTAAGCCAGCTGAACAACTGGTCAGGATCAAAGCCTCCCATCACCAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 45018 167 + 647215 GACTACTCATCTGTCAATGGACCAAACCCAGACCTGGGGCACCATGAAATATTTTTTAATTCTTGTTCTTTTTCATATTGCACCACATATGGTTCAGATGACTGGTGGTGGAGCAAGATTAAGCCATCTGAACAATTGTTCGGGATCTAAGTCTCCCATCACCAAGG + +a +s mr.mrrefChr0 50091 117 + 130230 GACCCTCTCAGACATTAACTGTCATTCACTGTAGGTGATCCAGTAGTGGATGTAAAGTAGTGCATGTTCATATACAAACTCTATATGCTATGTGAATGCTGCAACTGAGAGTCCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52330 117 + 636262 GACCCTCTCAGACATTAACTGTCATTCACTGTAGGTGATCCAGTAGTGGATGTAAAGTAGTGCATGTTCATATACAAGCTCTATATGCAATGTGAATGCTGCCACTGAGAGCCCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 45185 86 + 647215 GACCCTCTCAAATATTAACTGTCAATCACTGTAGTTA------------------------------TCTTATACAAACT-TATATGCTATTTGAATGCTGCAGCTGAGAATCCCTA + +a +s mr.mrrefChr0 50208 103 + 130230 AGGCATGGTTAACAATATCATTGATGTGACTGTCAAGTGTCCCTAAGTCCCAGCTGACAGTCCATATATTAATATGCTCAAATGACCCCATTGAAGTCCTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52447 103 + 636262 AGGCATGGTTAACAATATCATTGATGTGACTGTAAGGTGTCCCTAAGTCCCAGTTAACAGTCCATATATTAATATGCTCAAATGACCCCATTGAAGTCCTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 45274 103 + 647215 AGGCATGGTTAAGAATATCATTGATGTGACTGTCAAGTGTCCTTAAGTCCCAGCTGACAGTCCATGTATTAATATGCTTAAATGACCCCATTGAAGTCCTGAT + +a +s mr.mrrefChr0 50311 141 + 130230 CACACTGCATAGATTAGGGAGTGTAGTGGTGGGTGAAGAGAAGAATCTTCATTCCCAATTCCCATCCCAAAAGACTCAGCAACTGTTTGTAAGTAACAATTCCCTTTACTAATGAACATCAATGAAAATGCAGGATACGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52550 140 + 636262 CACACTGCGTGGGTTAGGGAGT-TAGTGGTGGGCGAACAGAAGAATCTTCATTCCCAATTCCCATCCCAAAAGACTCAGCAACTGTTTGTAAGTAATAATTCTCTTTACTAATGAACATCAATGGAAATGCAGGATACGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 45385 134 + 647215 CACCCTGCATATATTAGGGAGTGTAGTGGTTGATGAAGAGAAGAATCTT-------AATTCCTATTCCTAAAGACTCAGCAACCGTTTGTAAGTAACAATTCCCTTTACTAATGAACATCAATGAAAATGCAGGATTCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 50452 75 + 130230 CTGAGGAACTATATTCAGGAAAGATTAGTTAGATGACACTGACAAATGAAGCAAAAGCCTCCCATTTTAGTACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52718 75 + 636262 CTGAGGAACTATATTCAGGAAAGACTAGTTAAATGACACTGACAAATGAAGCATAAGCCTCCCATTTTAGTACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 45519 75 + 647215 CTTAAGCACTATATTGGGGAAGGATTAGCTAGATGACAGTGGTAAATGAAGCAAAAGCCTCCCAGTTTAATACAG + +a +s mr.mrrefChr0 50527 85 + 130230 GCCTCTTTCGAGGGACCTAAGAAGGGTTAGGCATTTTAGGATTCTGTTCCATAATCTCTTAGTACACCACTCCTGGCTCAACTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52793 85 + 636262 GCCTCTTTCGAGGGACCTAAGAAGGGTTCGGCATTTTAGGATTCCGTTCCATAATCTCCTAGTACTCCACTCCCAGCTCAACTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 45596 66 + 647215 GC-------------------AAGGGTAAGGCATTTTAGGATTCTGTTCTATAATCTCTTAGTACACTGTTCCTGGCTCAACTAA + +a +s mr.mrrefChr0 50612 109 + 130230 AAGTGCATACATCTTCCAGCAAGTGGAAGCTCACAGGTCTCAGGATAATGTGTAGCGTCATTATTGACTTGTTTCATGGCTTTTGCATCTAAATTGTGCTTTACCTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52878 57 + 636262 ----------------------------------------------------TAGCGTCATTATTGACTTGTTTCATGGCTTTTGCATCTAAATTGTGCTTTACCTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 45881 109 + 647215 AAGTGCATACATCTTCCAGCAAGTGGAAGCTCACAGGTCTCAGGATAATGTGTAGCATCACTATTGACTCATTTTACTATTGACTCACTCATTTTATGTCTTTCATACC + +a +s mr.mrrefChr0 50721 9 + 130230 TATATAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52947 9 + 636262 TATATAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 45990 9 + 647215 TAAACACTG + +a +s mr.mrrefChr0 50730 24 + 130230 CACAACTGAATTTCAGCCAATGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 52973 24 + 636262 CACAACTGAATTTCAGCCAATGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 45999 24 + 647215 TACAACCGATTATTATGCAATGAG + +a +s mr.mrrefChr0 50754 93 + 130230 CACAGATAACATATAAGAGCATGAGCCATGCAATATAGTCAGAAGACAGGTGGGAGTCATGAATTACTGGGATTCTCAATCAATCATTGGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53003 93 + 636262 CACAGATAACATATAAGAGCATGAGCCATGCAATATAGTCAGAAGACAGGTGGGAGTCATGAATTACTGGGATTCTCAATCAATCATTGGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 46023 93 + 647215 CACAGATAACATGTAGGAGCATGAGCCATGCAATATAGTATGGAGACAGGTGGGATACTCTAATTACTGGGATTCTCAACAACTCATCAGCTC + +a +s mr.mrrefChr0 50847 30 + 130230 GACACTGATGCAGGTCCAAGATGATATATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53102 30 + 636262 GACACTGATGCAGGTCCAAGATGATATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 46116 30 + 647215 GACACTGACACAGGTCCAATCTGATGCTTA + +a +s mr.mrrefChr0 50877 71 + 130230 TGGAGAAAGATGGGATAGGTAGGCTTTCCTAGTTGTGAATAGAGAACGCATCATACTACTTGCACCTTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53158 71 + 636262 TGGAGAAAGATGGGATAGGTAGGCTTTCCTAGTTGTGAATAGAGAACGCATCATACTACTTGCACCTTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 46146 71 + 647215 TGGAGAAAGATTAGATATGTAGGCTTCCCTATTTGTGAATCAAGAATGCATCATACTACTTGCACCATGTC + +a +s mr.mrrefChr0 50948 111 + 130230 ATAACCTGACCTACTGGTTGCAAAATAATTGTGATCCTTATCACATTTCTTATTGACACATGTCTCTGGTAGACAAGACACATAGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTGTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53229 111 + 636262 ATAACCTGACCTACTGGTTGCAAAATAATTGTGATCCTTATCACATTTCTTATTGACACATGTCTCTGGTAGACAAGACACATAGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTGTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 46348 111 + 647215 ATAACCTGACCTATTGGTTGCACGATATTTGTGATCCATACCACATCTCTTATTTCCACATGTCTTTGGTAGACAAGACACGTGGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTATGGG + +a +s mr.mrrefChr0 51059 13 + 130230 TGATGACTGTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53340 13 + 636262 TGATGACTGTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 46502 13 + 647215 TGATAACTGTGAA + +a +s mr.mrrefChr0 51072 34 + 130230 ACCTACTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATGACGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53353 34 + 636262 ACCTACTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATGACGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 46516 34 + 647215 ACCTGCTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATTACGG + +a +s mr.mrrefChr0 51106 8 + 130230 ACTTCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53387 8 + 636262 ACTTCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 46551 8 + 647215 AATTCTAC + +a +s mr.mrrefChr0 51114 13 + 130230 ACATAGTGGTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53411 13 + 636262 ACATAGTGGTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 46559 13 + 647215 ACATCATGGTTGG + +a +s mr.mrrefChr0 51127 41 + 130230 CTAAAGGTGGCCTtcactgggagggacctcctgtatgatag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53444 41 + 636262 CTAAAGGTGGCCTtcactgggagggacctcctgtatgatag +s simRat_chr6.simRat.chr6 46572 41 + 647215 CTAAAGGTGGCCTTCACTGGAAGGGATCTCCTGTATGTTGG + +a +s mr.mrrefChr0 51168 24 + 130230 cttgaggtggcctagcccccactc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53527 24 + 636262 cttgaggtggcctagcccccactc +s simRat_chr6.simRat.chr6 46613 24 + 647215 CTAGaggtggcctaccccccactt + +a +s mr.mrrefChr0 51192 65 + 130230 agtccctttgtttgttaccaggtgcactagcgttttctttggaaagtttccagtAGCTCATAAGt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53551 65 + 636262 agtccctttgtttgttaccaggtgcactagcgttttctttggaaagtttccggtAGCTCATAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 46638 65 + 647215 ggtccctgactttgctaccaggggcactagcgttttctttggaaagtttccagtagctcataagt + +a +s mr.mrrefChr0 51257 10 + 130230 gaggcccagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53618 10 + 636262 GAGGCCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 46703 10 + 647215 gagacccagt + +a +s mr.mrrefChr0 51267 38 + 130230 AAGGGTGATCACACAAATTAGCTCTCTATCTGGTCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53628 38 + 636262 AAAGGTGATCACTCAAATTAGCTCTCTATCTGGTCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 46763 38 + 647215 AAGGGTGATCACACAAATTAGCTTGCTATCGGGTCAAT + +a +s mr.mrrefChr0 51305 353 + 130230 TTTTATCAAGTACCCAGTGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCCCTAATCATGCATTCATAGAGGTCACCAAAGAGTATGCATACTAAGTTGACACTGCTTAGCTCTAGAGGTAGTTAAGGGCGCTCAAATTTTATACAAAATAAGACTATCAGAACTCCAATTCAGTTGACAAGCCACCAACTGAGTTTGGCTACCTCTAGCAATGCCCTTAAGGCTCTTATGTCCAATGTGATCCTAATCTAATCATCATAATGTTCATTGACCTCCAGGAGTTTATTGTTTAATGATTAACTATTTAAACTTCCTATCTCGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 53685 350 + 636262 TTTTATCAAGTACCCAGTGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCACTAATCATGTATTCATAGAGGTCACCAAA-AGTATGCACACTGAGTTGCCATAGTTCAGCTCCAGAGGTAGTTAAGGGCGCTCAAATTTTATACAAAATAAGACTATCAGAACTCCAATTTAGTTGATGTGCCAGCAACTGAGTTTGGCTACCTCTAGCAGTGCCCTTAAGGCACTTAAGTCCAGTGTGAT--TAATCTAATCATCATAATTTTCATTGACCTCCAGGAGTTTATTGTTTAATGATTAACTATTGAAATTTCCTATCTCGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 46801 353 + 647215 GTTTATCAAGTACCCAGCGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCCCTAATCATGCATTTATAGAGATCACCAAAGAGTATTCATACTAAGTTGACACTGCTTAGCTCTAGAGGTATTTGATGGATTTCAAATTTTCTATAAAATAAGACTCTCAGAACTCCAATTCAGTTGACAAGCAACCAATCAAGTTTGGCTACCTCTAGCAATGTCCTTGAGGCTCTTATATTCAATGTGATCCTAATCTAAACATCATAGAGTTCATTGAGCTCCAGGAGTTTATTGCTTGATGATTAAATATTTAAGCTTCCTACCTTGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT + +a +s mr.mrrefChr0 51658 347 + 130230 ATAAGACAGACCCCCCACACTCTAGGAGCTTATTAAATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACTCAAGGGAGTGATGCTGGCAAGAAGGCAATAAGCCAATAAGAAAAGTCCCCAGAGGTCCCAGAAGAGTTCCAACTGCCCAGCAGTGCAATGGCTGTGACCATTTCACAGGTTAAGAGCTATCGAGGGAGATCATGATGGGGTCTTGACATATTGTATTTCAACAATCATTAAATTAGCTGGGGTTGGGGAGTTTGTGGGTTCATAAACCATTAGTTAAGTCCTTAAATGGGTCAGATGAATGAGATTAGCTGTGCCGGCTGAGTGATAAATGATCATGATGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54037 335 + 636262 ATAAGACAGACCCCCCACACTCTAGGAGCTTATTAAATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACTCAAGGGAGTG----TGGCAAGAAGGGAACAAGCCAATAAGAAAAGTACCCAGAGGTCACAGAAGAGT--------CCCAGCAGTGCAATGGCTGTGACCATTTCACAGGTTAAGAGCTATCAAGGGAGATCATGATGGGGTCTTGACATATTGTATTTCAACAATCATTAAATTAGCAGGGGTTCGGGAGTCTGTGGGTTCATAAACCATTAGTTAAGTCCTTAAATGGGTCAGGTGAATGAGATAGGCTGCGCCGGCTGAGTAATAAATGATCATGATGCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 47154 341 + 647215 ATAAGACACACCCCCCATACTCTAGGAGCTTATTAGATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACCCAAGGGAGTGATGCTGGCAAGAATGCTGTAACCCAATAAGAAAAGTCCCCAGTGGTCCCAGAAGAGTTCCAACTGCCCAGCAGTGCAATT------ACCATTTCACAGGTTAAGAGCCATCGAGGGAGATTATGATGGGATCCTGATATACTTTATTTCAACAATCATTAGGTTAGCTGAGGTTGGGGAATTCGTGGGTCCATAGACCATCATTTAAGTTCTGAAATGGATCAGATGAACAAAATTAGCCGTGCCGGCTGAGTGATAAATGATCAGGATGCATG + +a +s mr.mrrefChr0 52005 11 + 130230 TAAGTTGCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54376 8 + 636262 TAAGTTTT--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 47495 11 + 647215 TAAGTTGCTAG + +a +s mr.mrrefChr0 52016 77 + 130230 GGCAATGAAAAATGCTTAGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTACATCCTTCTTTTTGGGGTTTAAAAGGACTGCTGACATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54384 77 + 636262 GGCAATAAAAAGTGCTTAGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTAAATCCTTCTTTTTGAGGTTTAAAAGGACTGCTGACATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54578 77 + 636262 GGCAACGAAACATACTTAGTGTCCCAAGAGTTTTGTTTACATCCCTCTTTTTGGGGTTGAAAAGGAATGCTGACATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 47506 62 + 647215 GGCAATGAGAAATGCTTCGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTACATCCTTCTTTTGGGGGAGT---------------ATC + +a +s mr.mrrefChr0 52093 6 + 130230 CTAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54461 6 + 636262 CTAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54656 6 + 636262 TTAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 47568 6 + 647215 CTGAAC + +a +s mr.mrrefChr0 52099 1 + 130230 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54662 1 + 636262 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 47574 1 + 647215 A + +a +s mr.mrrefChr0 52100 24 + 130230 TATTGTTGGAGATATGAGATGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54467 24 + 636262 TATTGTTGGAGATATGAGGTGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54663 24 + 636262 TATTGTTGGAGATATGAGATGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 47575 24 + 647215 TATTATTGTAGATATGAGATGCTG + +a +s mr.mrrefChr0 52124 1 + 130230 T +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54687 1 + 636262 T +s simRat_chr6.simRat.chr6 47599 1 + 647215 T + +a +s mr.mrrefChr0 52125 82 + 130230 TCCTAAAGACTTTCCTCTAGGTAACCGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATACCATACTGGACCAAGGCACAGTTTGATTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54491 82 + 636262 TCCTAAAGACTTTCCTCGAGGTAACAGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATATCATACTGGACCTAGGCACAGTTTGATTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54688 82 + 636262 TCCTAAAGAATATCCTCTAGGTAACCATTATGTTGTTTGCTTTGCATGTACCATACTGGACCAAGGCACAGTTTGATTAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 47600 79 + 647215 TCCTAAAGACTTTCCTCTAGGTAACCGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATGCTATACTGGACTAAGGCACAGTTTGATAA--- + +a +s mr.mrrefChr0 52207 29 + 130230 TCACACTTTGGTTATCACACAAATTTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54789 29 + 636262 TCACACTTTGGTTATCACACAAATTTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 47679 29 + 647215 TCACACTTTGATTATCACATAAGTTTGAT + +a +s mr.mrrefChr0 52236 5 + 130230 TATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54573 5 + 636262 CATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54818 5 + 636262 TATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 47708 5 + 647215 TATTG + +a +s mr.mrrefChr0 52241 80 + 130230 CACAGCATCTTGTCATTGTCTAGATTATGCTTCCAAGGACCCATAGGCATAAAATATAACAACCAATAGGCAATGTGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54823 78 + 636262 CACAGCATCTTGTCATTGTCTAGAATATG--TCCAAGGACCCATAGGCATAAAATATAACAACCAATAGGCAATGTGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 47713 80 + 647215 CACACCACCTTGTCATTGTTGAGATTATGCTTCCAAGGACCCATAGGCATGAAATATAACAACCAATAGGCAATGTCAGA + +a +s mr.mrrefChr0 52321 55 + 130230 ACAGGACAGTAGTGAATCACCTGGCACTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54901 55 + 636262 ACAGGACAGTAGTGAGTCACCTGGCACTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 47824 55 + 647215 ACAGGACAGTAGTGAATCACCTGGTATTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG + +a +s mr.mrrefChr0 52376 23 + 130230 AAATTCGAGGACTATCATCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54956 23 + 636262 AAATTCGAGGACTATCATCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 48100 23 + 647215 AAATCTGAGGACTATCGTCATTA + +a +s mr.mrrefChr0 52399 224 + 130230 TTTACTTCCTACTGAGTATGTGCCAGGCCTACATATTTTTCCACTGAGTATGTACCAGGTGTGCAACTGTTCCTTCATTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCCTGAAATTTTTGCCTGCCTGTATCAGGCCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTCGGCATACCTATCTTTTGCATTCATTAGGTAGAATTGGCACAATGTCCACTGAAGCTCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 54979 224 + 636262 TTTACTTCCTACTGAGTATGTGCCAGGCCTACATATTTTTCCACTGAGTATGTACCAGGTGTGCAACTGTTCCTTCATTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCCTGAAATTTTTGCCTGCCTGTATCAGGCCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTCGGCATACCTATCTTTTGCATTCATTAGGTAGAATTGGCACAATGTCCACTGAAGCTCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 48124 224 + 647215 TTTGCTTCACACTTAGTATGTGCCAGGTCTAAATCTGATTTCACTGAGTATGTGCTAGGCCTGCAACCATTTCTTCGTTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCTTGAAATTATTGCATTGATGTATCAGACCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTGGGCATACGTGTCTCTTGCATTCAGTAGGTATAATTAGAGTAATATGCACTGAGGCTCCATG + +a +s mr.mrrefChr0 52623 99 + 130230 TGACATCTAACACAGTATGCCCCTTGTGATTGGCTCACCAGAAGATTGAGTTTAAATGCAATTGTGTGTCTATATACATTGAGCGGCCAACGTTGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55203 99 + 636262 TGACATCTAACACAGTATGCCCCTTGTGATTGGCTCACCAGAAGATTGAGTTTAAATGCAATTGTGTGTCTATATACATTGAGCGGCCAACGTTGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48349 99 + 647215 TGACAACTAACACAGTATCTCCCGTGTGAATGGCCCACAAGAGGATTCAGTCGAAGAGCAATTGTGTGGCTGTATACAATGAATGGCCAACATTGAATG + +a +s mr.mrrefChr0 52722 111 + 130230 CCATGAGTGCCTATTGGATCTCTTAACTTGGCGCGGGCAGGTTGCACCCCATGTAAGCTGAAACTACACTATTGCAATTATGGCAGAGCCTGATAGACAACCTGCTGTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55302 109 + 636262 CCATGAGTGCCTATTGGATCTCTTAACTTGGCGCGGGCAGGTTGCACCCCATGTAAGCTGAAACTACACTATTGCAATCA-GGCAGAGCCTG-TAGATAACCTGCTGTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 48487 111 + 647215 ACATAGGTGCCTATTGGATCTCTTAACTCGGCACGGGCAGGTTGTGCCCCATGTAAACCGAAGGCACATTATTGCAATTATGGCAGGGCCTGATAAACAACCTGCTGTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 52833 50 + 130230 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACATTGACCTTGCAACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55411 50 + 636262 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACAATGAACTTGCAACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 48601 50 + 647215 GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACATTGACCTTGCAACTA + +a +s mr.mrrefChr0 52883 110 + 130230 TAAACTTTTGAGAGCATTGGATAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAATGTTTTCATAAGCATAAATTATTGGTTTTTCTGGCTTTTCAAGATCATGGGTCTTAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55473 103 + 636262 TAAACTTTTGAGAGCACTGGATAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAACGTTTTCATAAGCATGAATTATTGATTTTTCGGGCTTTTCAAGATCATGGGT------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 48651 110 + 647215 TAAATTTTTAAGAGCATTGGACAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAATGCTTGCACAAGCATAAATTATTGGTTTTTCTGGCTTTTCAAGATCATGGATCTTAATT + +a +s mr.mrrefChr0 52993 266 + 130230 TCTAATTAACTACACCACTTGTTCTGAGGAATTAATACTAAGGGGGATGACATTTCCCTAGCTATCAGAGCATTGCCGGATGACATTGGTTGGCTTCCCGGACCTGCAGAAGAACAAACCACCCAAACATGTTGCACTGAAGATGATTCTGTTGTCCTCCCACATGACAGCTTATGGTAACAAAACACTCATTGGAAGGAGTGAAAGGGTGACTCACAGTCCGCAGAGAGGGAAGGGGACACAAACCCACTATAGAGATGTTCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55576 265 + 636262 TCTAACTAACTACACCACTTGTTCTGAGGAATTAATACTAAGGGGGATGACATTTCCCTAGCTATCAGAGCATTGCCGGATGACATTGGTTGGCTTCCCGGGCCTGCAGAAGTACAAACCACCCAAGCATGTTGTGCCAAAGATGGTTCTGTTGTCCTTCCACATGACAGCTTAAGGTAACAAAACACTCATTGGAAGGAGTGAAAGGGTGACTCACAGTCCACAGAGAGCGAAAGGG-CACTAACCCATTATAGAGATGTTCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48765 263 + 647215 TTTAATTAACTACACCACTTGTTCTGAGGAATTCATACTAAGGGAGATGACATTTTCCTAGCTATAGGGGCATTGCTGGAGGGCATTGGTTGGCTTCCTGGACCTGCAGGAGAACAAAC-GCCCAAACATGTTGCACTGAAGATAATTCTGTTGCCCTCCCATATGACAGGTTATGGTAACAAAACACTCATTGGAATGAGTGAAACGGTGACTCACAATGCGCT--GGAGCGAGTGGACACAAACCCGCTATAGAGATGTTCTGG + +a +s mr.mrrefChr0 53259 205 + 130230 GCCCTCAATGATAAGGGCAAGGCCCCACCACTTAGGAGAGAGCAACTTCAGAGTAGTCAGTAGTCATAAAAAATTAGCTTAGCAAATGCAATTGGAAGTTATGAACAGGATGAAGTTGCTCACTACGAACATGCTTTATATAATATGAGACATGTTAAATCGATATGAGAAGTGGTGGACTGAATAGTAGTGCCTTCCCAATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 55842 204 + 636262 ACGCTCAATGATAAGGGCAAGGTCCCACCACTTAGGAGAGAGCAGCTTCAAAGTAGTCAGTAGTCATTAAAAATTAGCTTAGCAAATTCAATTGGAAGTTATGAACAAGATGAAGTTGCTCACTATGAACATGCTTTATATAATATGAGACATGTTAAATCGATATGAGAAGTGATGGACTGAATACTTGTGCCTTCCCAATAC- +s simRat_chr6.simRat.chr6 49028 189 + 647215 GCCCTCAATGCAAAGGGCAAGGCCCCACCACTTAGGAGAGAACAACTTCAGAGTAGTTAGTATTCATAAAA---TAGCTTAGCAAATG-----GGATGCTAAGGACAGGATGAAGTGGCTCAGTACGAACGTGCTTTATACAATATGAGTCGTGTTGAATCGATAT--------GTGGACGGAATTGTAGCGCCTTCATAATTCA + +a +s mr.mrrefChr0 53464 61 + 130230 TGTGGGTTCCTACCACAAGCAAACTTATAATTCTTGTAAAGTTAGAAAGTCTGCTTGGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56046 61 + 636262 TGTGGGTTCCTACCACAAGCAAACTTATAACTCTTGTAAAGTTAGAAAGTCTGCTTGGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 49221 61 + 647215 CGTGCGTTCCTGCCACAAACAAACTTAAAATTCTTGCAAAGTTAGAAGGTCTGCTTGGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 53525 8 + 130230 GGGATTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56111 8 + 636262 GGGATTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 49282 8 + 647215 GAGATTGC + +a +s mr.mrrefChr0 53533 3 + 130230 ATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56131 3 + 636262 ATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 49290 3 + 647215 ATA + +a +s mr.mrrefChr0 53536 271 + 130230 ATCACTGTATAATTTTGATAAACTGGTTCCCACTAAATAAGTTTAAAATTGGAGTGATCTATGAGTCTGCATTTTGGTATGGATTTGTGCCACATCCACAACCAGGGCTCAAGATGTAAGCAGTGGTGGTGGTATAGGGTATCCCACTTAGTTTCAGTGATCAACATTTCTTTGTTAATATGAGTGTTGTATATATAGCATCAGTTGTACAGGTAGCATCAGAACTGGCATTGATGATAAAGGGTAACGGATCAGCAAAGCTGTCAGGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56134 267 + 636262 ATCACTGTGTAATTTCAATAAACTGGTTCCCACTAAATGAGTTAAAAATTGGAGTGATCTATGAGTCTGCATTTTGGTATGGACTTGTGCCACATCCACAACCAGGGCTCAAGATGTAAGCAGTGGTGGTGGTATAGGGTACCCCAATTAGTTTCAGGGATCAACATTTCTGTGTTAATATGAGT-TTGTTCATATATCATC---TGTACAGGTAGCATCAGAATCGGCATTGATGATAAAGGGTAACGGATCACCAAAGCTGTCAGGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 49294 266 + 647215 ATCACTGAATAATTTTGATAAACTGGTTCCCACTAAATAAGTTTAAGATTGGAAAGATTTATGAGCCTGCATTTTGGTATGGATTTGTGCCAGATCCGCAACCAGGACGCAAGATGTAAGCAGTGGTGATGGTATTGGATATCCCACTTAGTTTCAGTGATCAAAATTTCTTTGTTAATATGAGTGTTGTATATATAGCATCAGTTGTACAGGTATCATCA--ACTGGCGTTGATGATAAAGGGTAACGGATCAGCAAAGCCG---GGCAA + +a +s mr.mrrefChr0 53807 29 + 130230 CCACATCTTCCATAACTGAATTCTATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56401 29 + 636262 CCACCACTTCCATAACTGAACTCTATTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 49561 29 + 647215 CCACATCTTCCATAACTGACTTATAGTAA + +a +s mr.mrrefChr0 53836 37 + 130230 TTGAATGTTTAAAGATACAGAAAGCACTTGGTATTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56430 37 + 636262 TTGAATGTTTAAAGATACAGAAAGCACTTGGTATTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 49856 37 + 647215 TTAAATGTTTAAGGATACAGAAAGCACTTGGTATTTC + +a +s mr.mrrefChr0 53873 94 + 130230 CATAGGATCAACATAGTCTTTACACCAACCCACTCAACTTTACTGTACAGATGTATTAAGACTGTCTAGCTGTTTCTTCTCAAGTGCATGTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56467 94 + 636262 CATGGGATCAACATAGTCTTTACAGCAACCCACTCAACTTTACTGTACAGGTGTATTAAGACTGTCTAGCTGTTCCGTCTCAAGTGCATGTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 49895 94 + 647215 CATAGGATCAACATAGTCTTTACACCAACCCACCCAACTCTACTGTACAGATGTATTAAGACTGACTAGTGGTTTCTTCTCAAGTCGTTGTGGT + +a +s mr.mrrefChr0 53967 133 + 130230 AATGTTAGATCAGTGTCCACTAAATGTATGTCTTAAGAATTGTTCATTGGAGAGAGTGCATAAAGCATCCTAGAATCTTAGCCCAATACATATATGAGATATTCAACTGGAGCCGTAATTACATGACTTGACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56562 133 + 636262 AATGTTAGATCAGTGTTCACTAAATGTATGTCTTAAGGATTGTTCATTGGAGAGAGTGCATAAAGCATCCTAGAACCTTAGCCCAATACATATACTAGATATTCAGCTGGAGCCATAATTACATGACTTGACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 49989 133 + 647215 AATGGAAGATCAATGTCCACTAAATGTATGTTTTAAGAATTGGTCACTGGGGAGGGTGCATAAAGCATCGTAGAATCTTAGCCCAATACATATATGAGATATTCAACTGGGGCTGCAACTACATGACTTTGCG + +a +s mr.mrrefChr0 54100 123 + 130230 AGAAATTCTTGGGGATCAATGGGTGTCATTGCCTGACTGACACTAGTTGATGGAGGTCTGCTGTCTAGGAAAGTTATGATATTTAAACTAGGTTGTAGCGGAAGACTTGCATATCCATTTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56794 120 + 636262 AGAAATTCTTGGAGATCAATGGGTGCCGTTACCTGACTGACACTAGTTGATGGAGGTCTGCTGTCTAGGAAAGTTATAATATTTAAACTAGCTAGTAGCGG---ACTTGCATATCCATTTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 50122 123 + 647215 ACAAATTCTAGGGGAGCAATTGATGTCATTGCCTGACTGACACTAGTTGATGGAGGTCTGCTATCTAGGAAAACTATGATATTTAAACTAGGTTGTAGTGGAAGACTTGCATTTCCATTTAGA + +a +s mr.mrrefChr0 54223 304 + 130230 GTATGTGCCTAATCCAGTCATTAAGAGTTTTGAATGTCATTTTGTCAATGGCACAGAGATAGGGGCACTAGCAACAACCCCTTGACCACTTCAGGGCATATTGCCAGTGATGGGGAATAAGGATAGGTAATCAATCTCCAAGGAGGTAAACTCAAGGAAGGGGCCACTGGTCTTGTAGATTAACTATCAATGTATTTATATATTTTACACCCACAGATGCTCAGCAATTCTTTAGTAGTCTTGGGTCAACAACCCCATTGCTGTTTCAAACTACTCAGAACCCTTCTGCTACATTAAAACACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 56917 295 + 636262 GTATGTGCATAATCCAGTCATTAAGAGTTTTGAATGTCATTTTGTCAATGACACAGGGATAGGGGCACTAGCAACAACCCCTTGACCACTCCAGGGCATATTGCCAGTGATGGTGAA---------GTAATCAATCTCCAAGGAGGTAAAATCAAGGAAGGGGCCACTCGTTTTGTAGATTAACCATCAATGTATTTATATATTTCACACCCACAGATGCTCAGCAAGTCTTTAGTAGTCTTGGGTCAACAATTCCATTGCTGTGTCAAACTACTCAGAAGCCTTCTGCTACATTAGAACACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 50245 297 + 647215 GTATGAGCCTAATCCAGTCATTAAGAGTTTTGAATGTCATTTTGTCAATGGCACAGAGATAGGGGCACTAGCAACAACCCCTTGAACACTTCAGCACGTATTGCCAGTAATAGGGAATAAGGATAGGTAATCAATTTACAAGGAGGTAAACTCAAGGAGGCGGCCACCGATCTTGTAGATTAACTATCAATGTGTTTATTCATTTTACACCCACAGATGCTCAGCAATTCTTTAGGAGTCTAGGGTCAACGACCCCATTGTTGTTTCAAACTACTCAGAACCATTCTGCTACATTAA------- + +a +s mr.mrrefChr0 54527 64 + 130230 CCTAGCCCTTCTTGATGACCCTAGGGTTTTCTCATTCATAAGACATCACACCAGGTCCATGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57215 64 + 636262 CCTAGCCCTTCTTGATGACTCTAGGGTTTTCTCATTCATAAGACATCACACCAGGTCCATGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 50542 45 + 647215 -------------------CCTAGGGTTTTCTTATTCATAAGACCTCATGCCAGGTCCATGACA + +a +s mr.mrrefChr0 54591 160 + 130230 CTGATGAGGCTCCCTACTTTTGAGGAATGAAGATGCATTACTTTCTATTCCATACGTTGTTTAGTGTCAGTCATGCCCTACAATCACACTGACACAAGTTCAGTTTAACAGGGGTTATAACTATATATCTACTTTCATTGTCCCAATAACTGACCTATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57279 160 + 636262 TTGATGAGCCTCCCTACTTTTGAGGAATGGCAATGCACTATTTTCTATTCCATACATTGTTTAGTATCAGTCATACCCTACAATCACAATGACACAAGTTCAGTTTAACAGGGGTTATAGCTATATATCTATTTTCATTGTCCCATCAACTGACCTATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 50591 160 + 647215 CTGAAGAGGCTCCCTATTCTTGTGGAACAAAGATGTGTTACTTTCTATTCCATGTGTTGTTTAGTGCCAGTTGTGCCCTACAATTACACTGACACAAGATCAGTTTAACAGGGGTTATAACTATATATCTACCTTCATTGTCTCAATAACTGACCTACTT + +a +s mr.mrrefChr0 54751 226 + 130230 CAACAGATTCCCCTGAAAAGTCTATCTTCTGGGTATTTTGGCCATGAACATCAAATCAATAGTGGATTCATAGTCATGTTCTGGGGGACATCAGTTTATGAGAATGGTCATGCAGGCCCAAGAAGGACCAAGAGTCATTCTGCCAATGTCATCAGTCTGGAGCATGTCCATGCTCTAGAGATACCCAATGACTGCCCTGCAGAAGCCAGCTTAACCAAAAATTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57439 226 + 636262 CAACAGATTCCCCTGAAAAGTCTATCTTCTGGGTATTTTGGCCATGAACATCAAATCAGTAGTGGATTCATAGTCATGTTCTGGGGGACATCAGTTTATGAGAGTGGTCATGCAGGCCCAAGAAGGACCAAGAGTCATTCTACCAGTGTCATCAGTCTGGAGAATGTCCATGCTCTAGGGATACCCAATGACTGCCCTGCAGAAGCCAGCTTAACCAAAAATCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 50759 225 + 647215 CATCAGATTTCCCTGGAACGTCTATGTTCTGGGGATTTTGGCCATGAATATCAAATCAATAGTGGATTCATAGTCATGTTCTGGAGGACATCAGTTTATGAGAATG-TGATGTAGGACCAAGAGGGACCAAGAGTGATTCTGCGAATTTCATCAGTCTATAGCATGTCCATGCTCCAGAGATACCCAATGACTGCCCTGCAGAAGCCAGCTTAAGCAAAAATTTAT + +a +s mr.mrrefChr0 54977 70 + 130230 GTGGTCCCTAGAGTGGTGCCTGAACCAGACTGTTAACACAAACAAACAAGATGTTCTCATTCAGCTAACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57672 70 + 636262 GTGGTCCCTAGGGTGGTGCTTGAACCAGACTGTTAACACAAACAAACAAGATGTTCTCATTCAGCTAACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 50984 70 + 647215 ATGGTCCCTAGAGTGGTGCCTGAACAAGACTGTTCACACAAGCAGACAAGATGTTCTCATTCAGTTAACA + +a +s mr.mrrefChr0 55047 42 + 130230 TGGATCATTGCAAAATTAGGGCACAGGATCATGCGTCACTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57748 42 + 636262 TGGATCATTGCAAAGTTAGGGCACAGGACCATGCGTCACTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 51054 42 + 647215 TGGATGATTGCCAAATTAGGACACAGGATCACGCGTCACTTT + +a +s mr.mrrefChr0 55089 50 + 130230 TGGACACCTCTCTCTTAGACATTCCTACATGTGAACAGGACAACATACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57791 50 + 636262 TGGACACCTCTCTCTTAGACATTCCTAGATTTGAATAGGACCACATACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 51096 50 + 647215 TAGATACCTCCCTTTTAAACATTGCTACGTGGGAACAGGACAACATACAT + +a +s mr.mrrefChr0 55139 45 + 130230 TCCATTGCACCTGTTTGTACCTGGCCTGGGTAAACTGTATACCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57843 45 + 636262 TCCATTGCACCTGTTTGTACCTGGCCTGGGTAAACTGTATACCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 51146 45 + 647215 TCCATTGCACCTGTTTGTACCTAGCCTGGGTAAACTTTATACCAC + +a +s mr.mrrefChr0 55184 178 + 130230 GGATAACAGATCACTAACTTTTGCAGCATCTATGTGATAAATCTGTTTGGGTGAAAGTCTGATTGGGTGTCTGGATGCAATGTCAGTATGCTAATGACCTATGGGTGTATTCTTGTTCAGTACTTCCTATGCACAAGACCATAGTGCACATCAAGCACTTCTTATAGACACTAATAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 57888 178 + 636262 GGATAACAGATCACTAACTTTTGCAGCATCTATGTGATAAATCTGTTTGGGTGAAAGTCTGATTGGGTGTCTGGATGCAATGTCAGTATGCTAATGACCTATGGGTGTATTCTTGTTCAGTACTTTGTATGCACAAGACTATAGTGCGCATCAAGCACTTCTTATAGACACTAATAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 51193 178 + 647215 GGATAACCGATCACCAACTTTTGAAGCATCTATGTAATAAATCTGGTTGAGTGCAAGTCTGGATGGGTGCATGGATGCAATGTCAGTGTGCTAACGACCTATGGGTGAATTCTTGGCCAACACTTCCTATGCACAGGATCATGGTGCACATCATGCACTCCTTATAGACACTGGCAAT + +a +s mr.mrrefChr0 55362 84 + 130230 GATGACAAGAGCATTATTTGATACTTGTTAAGGGTGGATCAACTTGTATCCTCTCTGTCAGTTTTGATCATCTGTGTCTATGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58066 84 + 636262 GATGACAAGAGCATTATTTGATACTTGTTAAGGGTGGATCAACTTGTATCCTCTCTGTTAGTTTTGGTCATCTGTGTCTATGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 51372 84 + 647215 GATGACAAGATCATTATTTGATACTTGTCAAGGACGGATCAACTTGTATCCTCTCTGTCAGCTTTGATCATCTGTGTTTATGCC + +a +s mr.mrrefChr0 55446 175 + 130230 ACATACCCACACAATCTGTGTCCATACCACATATTACACATTCATTATTTAGATTAGATAATTTAAACAATCCTTGCAGCCACTGGATCACCTGATGCTTACCATGCATGTGCCCTGCATGTGACTATAATTGATGGGGTAAAGATATTAAAATGATGGCCTTTATCATACTTCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58150 172 + 636262 ACATACCCAGACAATCTGTGTCCACACCACATATTACACATTCATTATTTAGATTAGATAATTTAAACAATCCTTGCCGCCACTGGG-CACCTGATGCACACCATGCATGTGCCCTGCATGTGACTATAACTGATGCG-TAAAGATATTAAAATG-TGGCCTTTATCATACTTCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 51457 168 + 647215 ACATACCCACACAATCTGTCTCCATGCCACATATTACACATTCA-------GATTAGATAATTTAGACAATCCTTGCAGCCACTGGATCACCTCATGCTTACCATGCATGTGCCATGCATGTGACTATAATTGATGGGGTAAAGATATTAAAATGATGGCCTTTATCATACTGCG + +a +s mr.mrrefChr0 55621 101 + 130230 TGTAACTACACAGTTTAATGAGCATTCCAAGTGTCACACATATTCAGTTTGTTATGTTTGATATTCAATCATTGTGTGTCTTACAGAAACCCTTGTAAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58322 101 + 636262 TGCAACTACACAGTTTGTTGAGCATTGCAAGTGTCACACATATTCAGGTTGTTATGTTTGATATTCAATCATTATATGTCTTACAGAAACCCTTGTAAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 51626 96 + 647215 TATAACTACACAGTTCAATGGGCATCCCAGGTGTCACACATATTCAGTTTGCTA-----GATATTCATTCATTGTGTATCTTACAGAAACCTCTGTAAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 55722 89 + 130230 ATGTAAACTACAATGATGCGCTCTGACTCAATACTTGTATAACTGAGTCAAGACAAATATTAACATCTGCATGTGTTCACATCACAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58482 89 + 636262 ATGTAAACTACAATGATGCACTCTGACTCAATGCTTAAATAACTGAGTCAAGACAAATATTAGTGTCTGCATGTATTCACATCACAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 51722 89 + 647215 ATGTAAACTACAATGATGCGCTTTGACTCAATACTTGTGTAGATGAGTCAAGACAAATATTAACATCTGCATGTGTTCACATCACAAGG + +a +s mr.mrrefChr0 55811 362 + 130230 ACTGTGAGTTTGCTAGGAGTGTGTCTTAGGGAAGACATCTGCATGAATCAATTTAGGGTATTTTGTGAATAGTCACTATACCGAGGTGAAGACATATTTTGAAAAAATTGTAGGTATCAAGCCCTTTAACATAAAGGGAAATATAAGAATAGGCCTTGTACGAGTTCTGACATGCCTGCACTGAGATGATGTCTTAAAATAACTTGCATTTGGTCTGGGGCCATTAATATTTAATTGCAAACAATGAGGTTGTCAACATGTTCTTATAAGTGAGGGTAGAAAGAGACTGGCTGATTCAGTAAGTGTTACAGTACATAGTCTCAATGTTATGGGTACTTCTGAGGTACTTACAGTGCTACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58572 341 + 636262 ACTGTGAGTTTGCTAGAAGTGTGTCTTGGGGAAGATGTCT------ATCAATTTAGGGTATTTTGTGAATAGTCACTATTCCGAAGTGAAGACAT-----CAAAAAATTGCAGGTATCAAGCTCTTTAACATAAAGGGCAATATAAGAATCAGCCTTGTACGGG-----ACATGCCGGCACTGAGATGATGTCTTAAAGTAACCTGGCTTTGGTCTAGAGCCATTAATATTTGATTGCCAACAATGAGGTTGTCAACATATTCTTATAAGTCTGGGTAGAAAGGGACTGACTGATTCAGTAA-TGTTACAGTCCATAGTCCCATTGTTATG----CTTCTGAGGTACTTACAGTGCTAAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 51811 361 + 647215 ACTGTGAGTTTGCTAGGAGTGTGTCTTAGGGAAGACATCTGCATGACTCAATTTAGGGTATTTTGTGAATAGTCACTTTACCGAGGTGAAGACATATTTTGAAAAAATTGTAGGTATAAAGCCCTTTAACATAAATGGAAATAGAAGAATAGGCCTTGTAGGAGTTCTGACATGCCTGCACTGAG-TGATGTCTTAAAAAAACTTGCATTTGGTTTGGGGCCATTAGTATTTAATTCCAGACAATGAGGTTGTCCACATGCTCTTATAAGTGAGGGTAGAAAGAGACTGGCTGACTCAGTAAGTGTTACAGTATATAGTCTCAACGTTATGGGTACTTCTGAGATACTTACAGTGCTACATA + +a +s mr.mrrefChr0 56173 89 + 130230 AAATTATTAAGTTAATTCAACCATAGTTAATCTTAATTCAACTATAGCCTTTTTTGTTCCTATCAAAAGGTTGTTGTAAAAAAACCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 58913 88 + 636262 AAATTATTAACTTAATTCAACCATAGTTAATCTTAATTCAACTATTGCCTTTTTTGTTCCTATCAAAAGGTCGTTGTAAAAAAACCT-T +s simRat_chr6.simRat.chr6 52179 89 + 647215 AAATTATCAAGATAATTCAACTATAGTTAATCTTAATTCAACTATAGCCTTTTTAATTCCTGTCATAAGATTGTTGTAAAAAAACCCAT + +a +s mr.mrrefChr0 56262 20 + 130230 GTCCAGCGTGCAATTCACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59001 20 + 636262 ATCCAGCGTGCAATTCACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 52321 20 + 647215 GTCCAGCATGCAATTTACCT + +a +s mr.mrrefChr0 56282 235 + 130230 TAACCATTGTAAATCAGTTGATTGCACTTAATGACTGACACTGTATGGGGCTGGTGCAAATCACTTAGCTTTTGTTCTTTTTGTATAGTTAAAAGAAAGTTGTGTGAAATGCAATTTTTAAAATTTGGTGAAATTTGCTGAGTTTAGAGCAATGATCCTCCATATTCATTTCAAGTATGAGAATTGACATTTGTTACATATCCTGCATCCTAAACATAGTTTGGATATGATATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59030 235 + 636262 TAACCATTGTAAATCAGTTGATTGCACTTAATGACTGACACTGTATGGGGCTGGAGCAAATCACTTAGCTTTCGTTCTTTTTGTATAGTTAAAGGAAAATTGTGTGAAATGCAATTTTGAAAATTTGGTGAAATTTGCTGAGGTTAGAGCAATGATCCTCCATGTGCATTTTAAGCATGAGAATTGACGTTTGTTACATATCCTGCGTCCTAAACATAGTTTGGATATGATATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 52341 232 + 647215 TAGCCATTGTAGATCAGTTGATTACACTTAATTACTGACACTGTATGGGGCTCGTGCAAATTACTTGGCTTTTGTTCTTTTTGTATAGTTAAAAGAAAGTTGTGTGAAATGCAATTTTTGAAATTTGGTGAAACTTGCTGAGTTTAGAGCAAAAATCC---ATATTCATCTCAAGTATGATAATTGACATTTGTTTCATATCCTGCATCCTAAACTTAGTTTGGGTATGATATGA + +a +s mr.mrrefChr0 56517 209 + 130230 TAAGCTAGTTCAACGAAGGCTATGGAACAATGCTGGCAACCCAAGACTTAACCAGTATTAATCACTTTTATTACTCCACAGGCTGTGCGTTCCAGTCATCAGTCAAGCTGTTCGGTCACACTCATGTCAGCAAGTATACAGCCAGGGACTTACAGTCTGTATAATTTGTCGTTGCTTTTTCTTGTGGCAACAGAAGTCATCTTATTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59265 156 + 636262 TAAGCTAGTTCAACGAAGGCTATGGAACAATCCTGGCAACCCAAGACTTAAC------TAATCACTTTTATTACTCCACAGGCTGTGCGATC--------------------------CACTCATGCCAGCAAGTATACAGCCAGGGATTTACAGTCTGTATAATTTGTCTGTATAATTTATTGTTGC--------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 52580 209 + 647215 GAAGCTAGTTTAAAGAAGGCTATGAAACAATGATGGTAATGCAAGATTTGACCAGTATTAATCACTTTTATTACTCCACAGGATGTGCATTCCAGTCATCAGTCAAGCTGTTCGGTCACACTCATGTCAGCAAGTATACAGCCAGGGACTTACAGTATGTATAATTTACCGTTGCTTTTGCGTGAGGAAACAGAAGTCATCTTATTACT + +a +s mr.mrrefChr0 56726 207 + 130230 TTTATCACAAGGCAACAGAAGTCATCTGGCCAGTTCTCTCCTATGTTATAACTTAGAGGTGCTAAAGACTGCATTCCCAAGGTAATTCTACCTACACTAGCAGATGGAATCAACTGCATCCTTTTCACTAAGTGAAATAATATTCTTTGAATTTGGCTATCTGGTTGATTGTCCATACTAACATAGATGCTATAAACTCTTTTTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59421 207 + 636262 TTTATCACAAGGCAACAGAAGTCATCTGGCCAGTTCTCTCCTATGTTATAACTTAGAGGTGCTAAAGACTGCATGCCCAAGGTCATTCTACCTACACTAGCAGATGGAATCAACTGCATCCTTTTCACTAAGTGTAATAATATTCTTTCAATTTGACTATCTGGTTGATTGTCCATACTAACATAGATGCCATAAGCTCTTTTTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 52878 207 + 647215 TTTATCATGAGGGAACAGAAGTCATCTTGCCAGTCCTCTCCTATGTTATAACTTAGAGGTGCTAAAGACTGCACTCCCAAGGCAATTCTACCTACACGAGCAGATGGAATCAACTGCATCCTTTTCACTAAGCGAAATAATATTCTTTGGATTTGGCTATCTGGGTGATTGACCATACTAATATAGATGCTATACACACTTTTTAGG + +a +s mr.mrrefChr0 56933 210 + 130230 CTTCATTCTGCTCTTGGTTACAATGTAATTCATCACAGATGTGAATTGGTCACAGAATGTACAGGGCAATGTGGTCCTGCTGCTTTTAACACCAAGTTACTCCCATGGGGAGAACTGCACCTGCTTGTACTGCTCTCACATATTCAAAGAGTATATACAACACTAATTGTATTAGGGGCCAATGTACCATCTAAAGAAAGGTTAACAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59638 204 + 636262 CTTCATTCTGCTCTTGGCCACAATGCAAACC-TCACAGATGTGAATTGGTCACAGCACGTACAGGGCAATGTGGTCCTGCCACTTTTAACAGCAAGTTACTCCCATGGGGAGAACTGCACCTGCTTGTACTGCTCTCACATATTCAAAGAGTA-----AACACTAATTGTATTAGGGGCTAATGTACTGTCTAAAGAAAGGTTAACAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 53085 207 + 647215 CTTCATTCTGCA---AGTTAAAGTATAGTTCACCACAGATGAGAGTTGGTCACAGAATGTACAGGACTATGTGGTCCTTCTGCTTTGAACACCGAGTTACTTCCATGGGGATAATTGCTCCTGCTTGGACTGGTCCCACATATTCGACGAGTATATACAATACTAATTGTATTGGGGGCCAATGTACCATCTATAGAAAGGTTAACAGCT + +a +s mr.mrrefChr0 57143 153 + 130230 CCATATATTCTTTAAGTTGCCAGTAACCCAGCTACGTGTCTGGTCACAGGGAAATTGTGTATGTTTGCATGTTTTGTGTATACATTATTAAACTGTCTATGATTTTTAGTGAACATTGTAAGAGCTGTGCTTTGATTTACGTGGGGTTTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59842 142 + 636262 -----------TTGAGTTGCCAGTAACCCAAATACGTGTCTGGTCACAGGGAAATTTTGTATGCTTGCATGTTTTGTGTGCACATTATTGAACTGTCTATGATTTCTAGTGAACATTGTAAGAGCTGTGCTTTGATTTACGTGGGGTTTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 53294 149 + 647215 CCATATATTCTTTAAGTTG---GTAACCCAGCTATGTATGTGACCACAGGGAAATTGTGTATGTTTGCATGTTGTATGTATACATTATCAGATTGTCTATCATTTTTAGTGAACATTATAAGAGCTAT-CTTTAATTTATGTGGGGCTTAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 57296 7 + 130230 GAGTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 59984 7 + 636262 GAGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 53444 7 + 647215 GAGTGCT + +a +s mr.mrrefChr0 57303 3 + 130230 AAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60022 3 + 636262 AAT + +a +s mr.mrrefChr0 57306 11 + 130230 TCTAGAGACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60027 11 + 636262 TCTAGAGACTA + +a +s mr.mrrefChr0 57317 55 + 130230 AGTAAGTACAAAGCTGTCAGATCCCCTTCCAAAAGTTAAATGTAATGTCCAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60042 55 + 636262 AGTAAGTACAAAGCTGTCAGATCCCCTTCCAAAAGTTAAATGTAATGTCCAAACA + +a +s mr.mrrefChr0 57372 133 + 130230 TTTAGAAATAACAGGTGTCTATGTGTAGGCCAGTAAAGGTCATTTTGTACTTTCTTGGATGTCCTCTAGAAAGAGGATATAGGTAGGCTGGCTGCAACATTACTAGAGATCCTTCGGTAAGGACTTTTAAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60098 133 + 636262 TTTAGAAATAACAGGTGTCTATGTGTAGGCCAGTAAAGGTCATTTTGTACTTTCTTGGATGTCCTCTAGAAAGAGGATATAGGTAGGCTGGCTGCAACATTACTAGAGATCCTTCGGTAAGGACTTTTAAGGA + +a +s mr.mrrefChr0 57505 48 + 130230 TATGATGGCCTGTGACCTGTGTGAATGCATGCGTGTTCTTTACTCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60235 48 + 636262 TATGATGGCCTGTGACCTGTGTGAATGCATGCGTGTTCTTTACTCTTG + +a +s mr.mrrefChr0 57553 11 + 130230 TAGGGTATACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60285 11 + 636262 TAGGGTATACT + +a +s mr.mrrefChr0 57564 25 + 130230 TTAGTGGAAATTTCTCAGGTACCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60299 25 + 636262 TTAGTGGAAATTTCTCAGGTACCCT + +a +s mr.mrrefChr0 57589 12 + 130230 GTGCCTCTCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60326 12 + 636262 GTGCCTCTCCAT + +a +s mr.mrrefChr0 57601 35 + 130230 GTCATCTAGGTCTATAACTTCACTAGACTTTTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60380 35 + 636262 GTCATCTAGGTCTATAACTTCACTAGACTTTTTCT + +a +s mr.mrrefChr0 57636 16 + 130230 TTCTATTAGTCAAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60419 16 + 636262 TTCTATTAGTCAAGTT + +a +s mr.mrrefChr0 57652 9 + 130230 GTGGTTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60436 9 + 636262 GTGGTTCAT + +a +s mr.mrrefChr0 57661 41 + 130230 TGATTGCCAGGTGGGTTGCATGCCATCTGTCATTGCACCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60477 41 + 636262 TGATTGCCAGGTGGGTTGCATGCCATCTGTCATTGCACCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 53469 41 + 647215 TGATTGCCAGGTGGGTTGCAAGCCATTTGTCATCACATCCT + +a +s mr.mrrefChr0 57702 173 + 130230 TAATACCCTGTAGGCATGGTTATGTCTCCCAAGAGAGCCTGCTAGATAGATGACAGTTCGATAGAATTGGTATCTAACTTGGAACCACTCTTGCCAATTTACTATTTGGTTCATGTTCCGCAGTATGCTCTTCGAGCTTTTATGCGTGTGGGTAAGAAGGGAGGGTTGAGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60518 173 + 636262 TAATACCCTGTAGGCATGGTTATGTCTCCCAAGAGAGCCTGCTAGATAGATGACAGTTCGATAGAATTGGTATCTAACTTGGAACCACTCTTGCCAATTTACTATTTGGTTCATGTTCCGCAGTATGCTCTTCGAGCTTTTATGCGTGTGGGTAAGAAGGGAGGGTTGAGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 53512 173 + 647215 CAATACCCTGTAGGCTGACCACTGTCTCCCAATAGGGCCTGATAGCTAGATGACAATTTGATAGAATTGGTATCTAACTTGGAACCAAATTTGGCAATTTACTATTTGGTTCATGTTCCACAGGATACTCCTCGAGCTTCTTCGCACGGGGGTAAGAAGGGAGGGTTGAGTTT + +a +s mr.mrrefChr0 57875 27 + 130230 GATCTAAGCGGGAACTTATACCCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60691 27 + 636262 GATCTAAGCGGGAACTTATACCCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 53690 27 + 647215 GATCTAGACAGGAACTTATACCCATAT + +a +s mr.mrrefChr0 57902 81 + 130230 ATCCTAGGTAGTGGGTAGGATTGGATTGAGCTAAAGGGTTACCAGTAAATTAATACAGTCTGTGCATGCAACATGACTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60718 81 + 636262 ATCCTAGGTAGTGGGTAGGATTGGATTGAGCTAAAGGGTTACCAGTAAATTAATACAGTCTGTGCATGCAACATGACTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 53718 81 + 647215 ATCCTAGGTAGTGGGTAGGATTGGATTAAGCTAAAGACTTACCAGTAAATTAATACAGTCTGTGGGATCAACATGACTTTT + +a +s mr.mrrefChr0 57983 54 + 130230 GCAAATAACCTATAGTATAAGGAATGGAAGTGTTAAAGGCCGAAATATCCTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60808 54 + 636262 GCAAATAACCTATAGTATAAGGAATGGAAGTGTTAAAGGCCGAAATATCCTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 53799 54 + 647215 GGAAATAACCGTTAGTATAGGGGGTGGAAGTGTTAAAGGCCGAAATATCTTTCA + +a +s mr.mrrefChr0 58037 42 + 130230 GTTCTCAGTTCAAAGAGGCATGGGTTAGATCCAGTGGTTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60862 42 + 636262 GTTCTCAGTTCAAAGAGGCATGGGTTAGATCCAGTGGTTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 53857 42 + 647215 GTTCTCAGTTCAAGATGGAATGGATTAGTTCCACTGGTTTCT + +a +s mr.mrrefChr0 58079 288 + 130230 ACTGGTAAAAGTAAAATTGAATAGGATTAGGATGTAACATTCATCTTTCTTAGTCTATGAATTCAACCATTATGGTAAATCTTTCCCCAAAGTTGCATTCCAGGGGTCTGGATTTCCTATTAACTTTTGAACATTTATCTATGCTTCTACTACCCCAACTATACAAGAGATAGACATCTACAATGGTGGTCAGGTCTGTAGACCCAATTGTGCTGGCTGTCCGATAGGCAGGGGTATCATTTTAACGACTACCAACCAGCCCCATAGACACTGTCAGCTTTCCTAGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 60916 280 + 636262 ACTGGTAAAAGTAAAATTGAATAGGATTAGGATGTAACATTCATCTTTCTTAGTCTATGGAATCACCCATTATGGTAAATCTTAGCCGAAAGTTGCATTCCAGGGGTCCAGACTTCCTATTAACTTTTGAA--------TATGCTTCTACTACCCCAACTATATGAGAGATAGGCATCTACAATGGTGGTCAGGTTTGTAGACCCAATTGTGCTGGCTGTCCAATAGGCAGGGGTATCACTTTAACGGCTACCAACCAGCCCCATAGACACTGTCAGCTTTCCTAGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 53899 287 + 647215 ACCGGTAAAAGTAAAATTGA-TAGGATTAGGATGTAACGTTCGATTTTCTTAGTGAATCAATTCAACCATTATGATAAATCTTTCCCCAAAGTTGCATTCCAAGTGTCTGGATTTCCTATTAACTTTTGAACATTTATCTATGCATCTACTACCCCAACTATACAAAAGATAGACGTCTAGAATTGTGGTCAGTTCTGTAGACCCAATTGTGCTGGCTGTCTGATAGGCAGGGGTATAATTTTAACGACTACTAATCAGCCCCCCAGACACTGCTATCTTTCCTAGGG + +a +s mr.mrrefChr0 58367 10 + 130230 AAAATAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61196 7 + 636262 ---ATAGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 54202 10 + 647215 AAAATAGTAG + +a +s mr.mrrefChr0 58377 247 + 130230 CATCTCATATATTACTGTGCCTAATTCTATGAACCACTTTTACTAAAAATTGTATGATTTTCCTTAGCTGTTACATTCAGACAATGGCTAAATTTTATAGAAAGTACTACTGGGAGCCACTAAAGGAACGCGAACCATTTCAGATGATAAGATGGCGTGCAACTCTTGCAGAATGCCCTGACCACTTTTTTCATTCATGCGGTAAGACCCTATGAAAAGCATTGAGTGCACTGATAACTACCAATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61205 247 + 636262 CATCTCATATATTACTGTGCCCAATTCTATGAACCACTTTTACTAAAAATTGTATGATTTTCCTTAGCTGCTACATTCAGACAATGGCTAAATTTTATAGAAAGTACTACTGGGGGCCACTAGAGGAACGCGAACCATTTCAGATGATAAGATGGCGTGCAACTCTGGCAGAATGCCCTGACCACTTTTTTCATTCATGCGGTCAGACCCTATAAAAAGCATTGAGTGCACTGATAATTACCAATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 54212 244 + 647215 CAACTCATATATTACTG-GCCTAATTCTATTAACCACTTTAACTAAAAATTGTATGATTTTCCCTAGCCGTTA--TTCAGACAATGGCTAAATTTTATAGAAAGTACTACTGGGAGCCACTAAAAGGACGTGAACCATTTCTGACGATAAGATGGCGTACAACTATTGCAGATTGCCCTGACCACTTTTTTCATTTATGTGGTAGGACCCTATGATAAGCATTGAGTACACTGATAACTACCAATCC + +a +s mr.mrrefChr0 58624 67 + 130230 ATGGCCTGACCTCTAATAGAGAGTATAAAACAATCTCAACACTTAGTTTTAAAACTTAATATACACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61458 67 + 636262 ATGGCCTGACCTCTAATAGAGAGTATAAAACAATCTCAACACTTAGTTTTAAAACTTAATATACACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 54456 67 + 647215 ACAGCCTGACCGCTAATAGAGAATATGAAACTATCTCAACACTTAGTTTTAAAACTTAATATACACT + +a +s mr.mrrefChr0 58691 37 + 130230 TAGTCTCTAAACTTAATATACACTCCATTGCTACTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61535 37 + 636262 TAGTTTCTAAACTTAATATACACTCCATTGCTACTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 54523 37 + 647215 TAATCTCAAAACATAACATACATCCCATTGATACTAT + +a +s mr.mrrefChr0 58728 29 + 130230 GTGACTTTGGAGCCTAAGGTAGGAGACGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61607 29 + 636262 GTGACTTTGGAGCCTAAGGTAGGAGACGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 54560 29 + 647215 GTGACTTTGGAGCCTAAGGTAGGAGATGT + +a +s mr.mrrefChr0 58757 525 + 130230 GGTTCCCAAAAAATTTTGCCTATATCTGTTGTGTGTAGAAGTTGAAAGTAAGATTGCAGGTCATATGCAATGATCATTGAGTTGAAATATATCTTGGCATTGTTGTGTCTGTCATCGAATAATGATCTTAGTAAACAGACATTGTGCAAAGTAGACAGACACAATGACTCTTTTGAATCTCCCAGCAGGGATGTCTTGACAAAGCTTGCAAGATTCTATGATGCACTGTTGCATCCATCACTGTTTTTCCATATCATTAAAAATATCATATGGTATTCATGGCCCTGTTCATACAACTAAAGTGCCTATAGTCTGTTATTGTAATAGATGCAAGTGTGAGGGTGATTTGACAGATCATGTACCCATCAGTCATTGCTAGTTTCGCAAGCTATTTGGAGCTACATTTTCCTGGTCCTGATGTCATGTGCTATGAGATCAGTTGACTAATTAAGAGAGTGTGTTGTTTATAAAGGATCGTTTCCTGCTGATAGTTCACATTCTGAGGTAACAAGATGGATAGCGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 61640 512 + 636262 GGTTCCCAAAAAATTTTGCCTATATCTGTTGTGTGTACAAGTTGAAAGTAAGGTTGCAAGTCATATGCAATGAGCACTGAGTTGAAATATATCCTGGCCTTGTTGTGTCTATCATCGATTAATGATCTTAGTAAACAGACATTGTGCAAAGTAGACAGACACAATGACTCTTTTGAATCTCCCAGCAGGGATGTCTTGACAAAGCTTTCAAGATTCTATGATGCACTGTTGCA-CCATTACTGTTTTTCCATATCATTAA--------TTTGGTATTTGTGGCCCTGTTCATACAACTAAAGTGC----AGTCTATCATTGTAATAGATGCCAGTGTGAGGGTGAATTGACAGATCATGTACCCATGAGTCATTGCTAGTTTCGCAAGCTATTTGGAGATACATCTTCATAGTCCTGATGTCATGTGCTATGGGATCAGTTGACTGATTAAGAGAGTGTGTTGTTTATAAAGGATCATTTCCTGCTGATAGTTCACATTCTGAGGTAACAAGATGGATAGTGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 54589 524 + 647215 GGTTCCCCAAAAATTTTGCCTATATCTGTGGTATGTAGAGGTTGACAGTAAGATTGCAGGTCATTTGCAATGATCATTGAGTT-AAATATATTTTTCCATTGTTGTGTCTGTCGTCGAATAATGGTCTTAGTAAACAGGCATTGTTCAAAGTAGACAGACACAATGACTATTTGGCATCTCCTAGCAGGGATGTCTTGACAAAGCTTGCAAGATTCAATGATGCACTGTTGCATCCATCACTATTTTTCCATATCATTAAAAATATCATATGGTATGCATGACCCTGTTAATACAACTAAAGTGCCTATGGTCTGTTATTGAAGCAGATGCAAGTGTAAGGGTCTTCTGACAGGTCGTGTACCCATCAGTCATTACTAGCTTTGCAGGCTATTGGGAGCTACAGTTTCCTGGTCATGATGTCATGTGCTATGAGATGAGCTGGCTAATTGAGAGAGTGTGTTGTTTATAAAGGAGCGTTCACTGCTGATAGTTCACATTCTGAGGTAACAAGATGCATAGCGAAA + +a +s mr.mrrefChr0 59282 24 + 130230 TAGTGCCGCAATTTAAGAAGCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62152 24 + 636262 TAGTGCCGCAATTTAAGAAGCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 55114 24 + 647215 TACTGTCGCAACTTAAGAAGCTGA + +a +s mr.mrrefChr0 59306 174 + 130230 TGTGTTATCATGTATTGTAACATTTTAAAAAAAGAGCAAAGGTGGAGAAAACCAAAATCTAGGGAGTGTAATGTCTTCTTTTAAGACACATTCAGATAACATGGTCAGAGCTTGCTTGTAGCATAAGATTAGTTGCCATGGGTTATCTGCCCAGCTTAGTAGATAAGATGCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62181 174 + 636262 TGTGTTATCATGTATTGTAACATTTTAAAAAAAGAGCAAAGGTGGAGTAAGCCAAAATCTAGGCAGTGTAATGTCTTCTTTTAAGACACATTCAGATAACATGGTCAGAGCTGACTTGTAGCATAAGATTTGTTGCAATGGGTTATCTGGCCAGTGTAGTAGATAAGATTCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 55138 173 + 647215 TGTGGTATCATGTATTGTAACATTTTAAAAAATGAGCAAAGGTGGAGAAAACCCAAATCCAGGGAGTGTAATGTCTTCTTTTAAGACAC-TTCAGAGAACATGGACAGAGCTTGCTAGTAGCATAAGATTACTTGCCATGGGTTATCTGCCCAGCTTAGTAGATAAGATGCAAA + +a +s mr.mrrefChr0 59480 210 + 130230 CTGTCAGCCTAAGCTTTTATTAAACTGCTGGGAGTTTAGGATAGCTTGATATGCCTGAACTCTGTGACAATAATCCCAGTGCAGAGAGACGCAGTTTTTAATGTTCTTTACTGATACTTAGACTTTGGTTGGATGCACCACGCCCTTTTATATTTCATAACCCTTATTCGTAGTGAATTGCAGCAATTGTCAGTGCAAATCAACTCAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62356 208 + 636262 CTGTTGGCCTAAGCTTTTAATAAA-TGCTGGGAGTTTAGGATAGCCTGATATGCCTGAACTCTATGACAATAATCCCAGTGCAGAGAGACACAGTTTTTAATGTCCCTTATTGATACTTAGACTTTGGTTGGATGCACCACGCCCTTTTATATTTCATAACCCTTGTCTGTAGTGAATCGCAGCAATTGTCAGTGCAAATCAAC-CAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 55311 210 + 647215 CTCTCAGCCTAAGCTGTTATTAAACTGCTGTGAGTTTAGGATAACTTGATATGCCTGCACTCTGTGACAATAATCCTAGTGCACAGAGGGGTGGGTTTTAGTGTTCTTAACTGATACTTATACTTTGGTTGGATGCACCAGGCCCTTTTATATTTCATAATCCTTATTCGTAGTGAATTGCAGCAATTGTCAGTACAAATCAACTCAAGG + +a +s mr.mrrefChr0 59690 54 + 130230 TTAGTGCATGCTGACAATAATGTACTTACTATATTAACCAGTCCTCCTCTCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62564 54 + 636262 TCAGGGCATGCTAACAATAATGTACTTGTTATATTAACCAGTCCTCCTCTCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 55523 53 + 647215 CTGGTGCACACTGACAATAATTTAATTACTAT-TTAACCAGTCTTCCTCTCTAC + +a +s mr.mrrefChr0 59744 292 + 130230 AGTAGTCAGACTAACACCATCCCCCAATATCCTCTTTTTGAACTATGGATGGCATCTTTACCTGGGACTTGGCCAGCACCTGTATACAACTGATCAGTGGATAGGTGAAAATACATATTGAAACTATTTGAAACTATAATGCTGTGGTTGGGCAGTGCACAGCAAAGGGTTCTTTAAGAACTCCTGAGCAGCACAACCTTGGGCCCTTGTACTAAATTAAACAAAGCTTTGACAGACAGCTAGCATGCTGTGGTGTCCCTCAGGGGATAAACCCTTCCACAATGCACTACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62619 279 + 636262 AGTAGTCAGACTAACACCATCCCCCAATATCCTCTTTTTGAACTATGGATGGCATCTTTACCTGGGACTTGGCCAGCGCCTGTATACAACTGATTAGTAGATAGGTGGAAATACATATTGAAACTA------------ATGATGTGGTTGGGCAGCGCACAGCAAAGGGTTCTTTAAGAACTCCTGAGCAGCACAACCGAGGGCCCTTGTACTAAATAAGACAAAGCTTTGACAGACAGCTAGC-TGTTGTGGTGTCCCTCAGGGGATAAACCCTTCCACAATGCACTACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 55576 287 + 647215 AGTAGTCAGACCAATACCATCCCCGAATATCCTCTTTTTGAACTATGGATGGCATCTTTACCTGGGACTTGGTCAGCACCTGTATACAACTAATCAGTGAATAGGTGAAGATACATATTGAACCTATTTGAAACTATAAGGCTGTGGTTGGGCAGTGGACAGCAACAGGTTCTTTAAGAACTCCTGAGCAGCACAATCTTGGGCCCTTATTCTAAATTAAACAAAGCTTCATCAGACAACTAGCATGCTGTGGTGTCCCTCAAGGGATAAACCCT-----AGTGCACTACCG + +a +s mr.mrrefChr0 60036 68 + 130230 GAAATTACCACCCTGCCTTTATCTCAGACATGTGGAGTGTGGCAGCTCAGGAGCTTCTGTGCAATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62899 68 + 636262 GAAATTACCACCCTGCCTTTATCTCAGACATGTGGAGTGTGGCAGCTCAGGAGCTACTGTGCAACAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 55863 68 + 647215 GAAATTACCACCCTGCCTTTGTCTTAGACATGTGGCGTGTGGCAGCTCAGGGGCTTCTGTGCAATGGC + +a +s mr.mrrefChr0 60104 29 + 130230 ATGAATTAGTCAAGAAATAATTGCACACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62968 29 + 636262 ATGAATTAGTCAAGAAATAATTGCACACT + +a +s mr.mrrefChr0 60133 6 + 130230 TCAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 62998 6 + 636262 TCAAAT + +a +s mr.mrrefChr0 60139 140 + 130230 TGCCTGCTCACCAGCTGTTACGGGTGCTAAGGACATTCCTCTCCTGTAGGCTGAGGGTCCACATCTTCACTTAACCCAAATGCCGCTTTATACTGGGTCTAATGGGATGATACAAGAACAACAGCAATGATGTGGCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63005 139 + 636262 TGCCTGCTCACCAGCTGTTACGGGTGCTAAGGACATTCCTCTCCTGTAGGCTGAGGGTCCACTTCTTCACCTAACCCAAATGCTGCTTTATACTGGGTCTAATGGGATGATACAAGA-CTACAGCAAAGATGTGGCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 55931 120 + 647215 -----------------GTATGGGTGCTAAGGACATTCCTCTCATGTAGGCTGAGGGTCCATATCTTCACTTAA---AAATACCACCTGATACTGGGTTTCATGGGTTTATACAAGAACAACAGCAATGATGTGGCATAA + +a +s mr.mrrefChr0 60279 136 + 130230 AAAATTAGTTAGGAGGAATAATGGAACATGAAAGTTAGAGATCCCATGCACTTACTTCTGATATACAAGAAATAAACTTTACATGTCTCAAATAGTCACATAGTCACAAATACTTGTGCAAACCACATGTCTCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63144 113 + 636262 AAAATTAGTTAG-AGGGATAATGGGACATGAAAGTTAGAGGTCCCATGCACTTACTTCTGATATACAAGAAATAAACTTGACATGTCTCAAATAGTCACATTGTCACGAATACT---------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 56054 131 + 647215 AAAATAAGTTAGGAGGAATAATGGAACATGAAAGTCAGAGATCCTGCGTACTTTCTTCTGATATA-AAGAAATAAACTTTACACATCTCAAATCTTC----AGTCACAAATACTTGTGCAAACCACATGTCTCTGG + +a +s mr.mrrefChr0 60415 168 + 130230 GGTTTAATGCACCCAGGCAGACATTAAAGACATCCTTGACTGACATAAGTGCATGTACACTCTTAAGCAACTAAGCCTTGATGGAGGCATGTTGGTGCCTTAGCAAGACAGCAAAACACAGTAGACAGTGGGTCATTTTTTGAACTAGTGTAAAATAAGTTCATACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63257 126 + 636262 ---------------------------AGACATCCTTGACTGACAT-------TGTACACTCTTAAGCAACTAGGGCTTGATGGAGGCATGTTGGTGCCTCAACAAGACA--------CAGTAGACAGTGAGTCATTTTTTGAACTAGTGTAAAATAGGTTCATACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 56197 167 + 647215 GGTTTAATGCACCCAGGCAGACATTAAAGACATCCTTGACTGATATAAGTGCATATGCACTCCTAAGCAATTGAGCCATGATGGAGGCA-GTTGGTGCCTTAGCAAGACAGCAAAACACATTAGACAGTGGGTCATATTTTGAACTAGTGTAAAATAAGTTCAAACTA + +a +s mr.mrrefChr0 60583 63 + 130230 CTTAATGTACCTGCAAATCATTTGCTTCTCACAAGATTCCCAATAGTGGTGTTACAAATATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63383 63 + 636262 CTTAATGTACCTGTACATCACTTGCTTGTCACAAGATATCCAATAGTGGTGTTGCAAATACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 56367 63 + 647215 TTTAATGTACCTGCAAATCATTTGCTTCTCACAAGATTCCCAATAGTGGTGTTACAAATATTG + +a +s mr.mrrefChr0 60646 101 + 130230 AGAACTGACACAGGATCATGAGTCGGTAACAACTTCATAAAGTTCGCACCCTAATTAGCTTAGCAGAAGTGCCAGGTATTGGCACCTGGGCAAGTGACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63446 101 + 636262 AGAACTGACATAGGATCATGAGTCGGTGATAGCTTCATAAAGTTCACACCCTAATTAGCTTAACAGAAGTACCAGGTATTGGCACCTGGGCAAGTGACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 56431 81 + 647215 AGAACTGACACAAGATCGTGAGTCAGTAACAACTTCATAAAATATGCTCTCTAATAAGCCGAGCAGAAGCGCCAGTTATTG-------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 60747 489 + 130230 CAGATCAAGTGACATTATAATTAACTCAGTATTCAACAATGGAGGTCCCTCCCCTCCACCACCACTTGATGAACTTTTGAGTTATGGTGGAGAATTTTCAGTTGCAGTTTCATTGTCAATTTAATGAATGAGTACTCAGTTACAAGCGAATGATTTGGAAAAGCTATATCCTCAAACGGATGATTTGAGAATTGCTGACCTTATCTTTACCTGTTGGCTATGATTATGACTTTGTTTGAAAGCCTATCATGATAGTGCTCACTAGGCTCATATCAAGCATTGATGTTGTGTAGATTTAATTAAATTCAGTAGCTGTGTATGAAAGCCTAACATGCTAGAGCTTCCCAGGCTCATATCAAAGATGGATGTATTACAGGCTTAAATAAATTCAGTACTGGGAGGGAAGGAAACCAGAAGAATCATTGTTAAATATTTGTGACCCCGACACCCCTCTAGAGCATTCTTAATGCTGGATACCATCCAGCTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 63549 489 + 636262 CAGATCAAGTGACATTATAATTGACTCAGTATTCAACAATGGAGGTCCCTCCCCTCCACCACCACCCGATGAACTTTTGAGTTATTGTGGAGAATTTGTAGTTGCAGTTTCATTGTCAATTTAATGAATGAGTACTCAGTTACAAGCGGGTGATTTGGAAAAGCTATATCCTCAAACAGATGATTTGAGAATTGCTGACCTTATCCTTTCCTGTTGGCTATCATTATGACTTTGTTTGAAAGCCTATCATGATAGTGCTCACTAGGCTTGTATCAAGCATTGATGTTGTGTAGGTTTAATTAAATTCAGTAGCTGTGTATGAAAGCCAAACATGCTAGAGCTTGCTAGGCTCATATCAAAAATGGATGTGTTACAGGCTTAATTAAATTCACTACTGGGAGGGAAGGAAACCAGAAGAATCATTGTTAAATATTTGTGACCCCGACACCCCTCTAGAGCATTCTTAATGCTGGATACCATCCAGCTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 56512 468 + 647215 --------------------TTAACTCAGTATTCGACAATGGAAGTCCCTCCCC-CCACGACCACTTGATGAACTTTTGAGTTATGGTGGAGGATTTTCAGTTGCAGCTTCATTGTCAATCTAATGAATGACTACTCAGTTACAAGGGAATGATTTGGAAAAGCTACATTCTCAAATGGATGATTTGAGAATTGCTAAGCTTGTTTTTACCTCCTGGCTATGATTATGATTTTGTTTGAAAGCCTATCATGGTAGTGCTCACCAGGCTCATATCAAGCATTGATGTTTTATAGAGTTAATGAAATTCAGCAGCTATGTATGAAAGCCTACCATGCTGGACCTTCCCAGGCTCATATCAAGGATTGATGCATTACAGGCTTAAATAAACTAAGTACTGGGAGGAAAGGAAATCAGAATAAACATCGTTTAATCTTTGTGACCCTCACACTCCTCTGGACCATTCTTAATACTGGATACCATCCAGCTTAC + +a +s mr.mrrefChr0 61236 48 + 130230 GATAATTACTTTAATACCTGTACAGGCTAGCTAGTCTATTGCAGTACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64038 48 + 636262 GATAATTACTTTAATACCTGTACAGGCTAGCTAGTCTATTGCAGTACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 56984 48 + 647215 GATTGGGACACTAATACCTGTACAAGCTAGCTATTCTACTGCAGTACT + +a +s mr.mrrefChr0 61284 137 + 130230 TGTGAGGGTTGGGTTATATAATCCTTAAGTACCCGATAAGTCACATCCGTGATTACTCTAAACAGTCGGAATGATCAAGTCTTTATTTGACACATTAATCGCTTAAAAGGTCCATTCAAAATGAGTACAAGATTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64151 137 + 636262 TGTGAGGGTTGGGTTATATAATCCTTAAGTACCCGATAAGTCACATCCGTGATTACTCTAAACAGTCGGAATGATCAAGTCTTTATTTGACACATTAATCGCTTAAAAGGTCCATTCAAAATGAGTACAAGATTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57032 137 + 647215 TGTGAGGGTTGGGTTGTATGGTCTTTAAGTTCCTGATAAGTCGCATCTGTGAGTACTTTACACAGTTGGAGTGATCACGTCTTTATTTGACACATTAATTACTTGAAAGGTCCACTCAGAATAAGTGCATGATTTAG + +a +s mr.mrrefChr0 61421 10 + 130230 GTTAGAGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64380 10 + 636262 GTTAGAGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 57169 10 + 647215 GTTAGAGGTT + +a +s mr.mrrefChr0 61431 42 + 130230 TGTTAATAAACAGTGTGTAGAGGATAAACAGCAGTTATACGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64390 42 + 636262 TTTTGATATTCAGTGTGTAGAGGATAAACAGCAGTTATACGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64700 21 + 636262 TGCTACTCAACTATACGTTGA--------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 57179 42 + 647215 TGTTAATAAACAGTGTGTAGAGGATAAACAGTAATTATAAAT + +a +s mr.mrrefChr0 61473 13 + 130230 ATGAGATTTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64435 13 + 636262 ATGAGATTTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64721 13 + 636262 ATGAGATTTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 57221 13 + 647215 ATGAGATTTGAGT + +a +s mr.mrrefChr0 61486 14 + 130230 TTGGCTGATAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64452 14 + 636262 TTGGCTGATAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64734 14 + 636262 TTGGCTGATAGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 57234 14 + 647215 TTGGCTGATAGCAT + +a +s mr.mrrefChr0 61500 12 + 130230 GTAAATCAAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64466 12 + 636262 GTAAATCAAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64748 12 + 636262 GTAAATCATAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57250 12 + 647215 GTATATCAAAGG + +a +s mr.mrrefChr0 61512 1 + 130230 G +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64760 1 + 636262 G +s simRat_chr6.simRat.chr6 57262 1 + 647215 G + +a +s mr.mrrefChr0 61513 151 + 130230 AGGGACCTTGCAGACACAATGGTATGTTGAGGGTAGACAATAATTGTATATTTAACATTTTAATCCAAGGTAGCAGGTTTTTGGGGGACAGGAGTGTGGCAATCGTAAAGAGGTTATTTGCGGAGACCTTCGTGTAACCAAAGGATGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64478 151 + 636262 AGGGACCTTGCAGATGCAATGGTATGTTGAGGGTAGACAATAATTGTATATTTAACATTTTAATCCAAGGTAGCGGGTTTTTGGGAGACAGGAGTGTGGCAACCGTAAAGAGGTTATTTGCGGAGACATGCGTGTAAACAAAGGATGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64761 151 + 636262 AGGGACCTTGCAGACACAATGGTATGTTGAGGGTAGACAATAATTGTATATCTAAAATTTTAATCCAAGGTAGCAGGTTTTTGGGGGACAGGAGTGTGGCAATCGTAAAGAGGTTATTTGCGGAGACCTTCGTGTAACCAAAGGATGCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 57263 150 + 647215 AGGGACCTTGCGGACACAATGGTATGCCGAGGGTAAACAATAACTATATATTAAACATTTTAATCCAAGGTAGCAGGTTTTTGGGGGACAG-AGTGTTACAATCATAAACAGGTTATTTGTGGAGACCTTTGTGTAACCAGAGGATGCACC + +a +s mr.mrrefChr0 61664 25 + 130230 TTTGAAACTGAGTTGGGAGAGATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64675 25 + 636262 TATGAAACTGAGTTGGGAGAGATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64912 25 + 636262 TTTGAAACTGGGTTGGGAGAGATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 57413 25 + 647215 TTTAAAACTGAGTTGGAAGAGTTTA + +a +s mr.mrrefChr0 61689 49 + 130230 TGCCACTCAACTAGAAGGGCTACAAGGTATTACCGCCAAATAAAATGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64937 49 + 636262 TGCCACTCAACTAGAAGGGCTACAAGGTATTACCGCCCAATAAAATGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57438 49 + 647215 TGCTGCTCAACTAGATGGGCTACAAGTTATTGCCACTATATAAAACGGG + +a +s mr.mrrefChr0 61738 244 + 130230 TAGCCAATTTCTTATTGCACTGGGACCAAATAGCAGAAAGTTATTTAGACAACTTAATCTTTTGATGATGAATGTGCATTGTCTGTTATTTGTCATGATCAAGTTGTGTCTGGTACCTGACAATGAAGCCCCATCTCGTAAGATATGTGGCTGACGATGGGGCAGAATCTGTGCTGTGACCCCCTGATAAGTATTCCTTTCCTAAACACCAAAAGAATCATTAAATTCTTAGCCTAATCTCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 64992 244 + 636262 TAGTCAATTTCTTATTGTACTGGGACCAAATAGCAGAAAGTTATTTAGACAACTTAAACTTTTGATGATGAATGCGCATTGTCTGTTATTTGTCATGATCAAGTTGTGTCTGGTACCTGACAATGAAGCCCCATCTCGTAAGATATGTGCCTGATGATGGGGCAGAATCTGTGCTGTGACCCCCTGATAAGTATTCCTTCCCTAAACACCGAAAGAATCATTAAATTCTTGGCCTAATCTCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 57487 244 + 647215 TAGCCTATTTCTTATTGCACCGGGACTAAACAGTGGAAAGTTATTTAGATAACTTAATCATGTGATGATGAGTGTGCATTGTCTGTTATTTGTCATGGTCAAGTTGTGTCTGGTACATGACAGTGAAGTCTCCTGTAGTAAGATATGTGGCTGACAATGGGGCAGAATCTCTGATGTGACCCCTTGATAAATATTCCTTTGCTAAACACCAAAAGAATCATTAAATTCTTAGCCTAATCTCACC + +a +s mr.mrrefChr0 61982 82 + 130230 GTCAAGAATCAATATAATTGCTCTAGGTCAATATGGTTCGTGGTGCCGTGTTGATTTGATATAATTGCTCTAGGTCAATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65244 82 + 636262 GTCAAGAATCAATATAATTGCTCTAGGTCACTATGGTTCGAGGTGCCGTGTTGATTTGATATAATTGCTCTAGGTCAATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57731 82 + 647215 GTCAAGAATCAATATAATTGCTCTAGGTCAATCTGGTTCGTGGTGCCAGGTTGAATCAGTATAATTGCTCTAGGTCAATATG + +a +s mr.mrrefChr0 62064 84 + 130230 TTCATGCTGCCATGCTGGGTCTGGCGTTAATGGTTTAACTTGTGTCCAATGCCTGACACTTTTGTACCATAGGTATCACAGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65327 80 + 636262 TTCATGCTGCCATGCTGGGTCTGGCATTAATGGTTTAACTTGTGTCAAATG----GCACTTCTGTACCATAGGTATCACAGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 57813 84 + 647215 GTCATGGTGCCATGTTGGGTCTGGTGTTAACGATTTAACTTGGGTCCAATGCCTGACACTTTTGTACCAAAGGTATCACAGCAC + +a +s mr.mrrefChr0 62148 117 + 130230 TTGCTGCTAAGAGCTGCTGTGGTACTTATTTAGTTAATGATAGTGCCTGAGCTAGCAGAAAACCATGATATGGGCGGGAGCTCAGTAACTAGGTTGGGTAACTAATAACTAAATATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65411 117 + 636262 TTGCTGCTAAGAGCTGCTGTGGTACTTATTTAGTTAATGATAGTGCCTGAGCTAGCAGAAAACCATGATATGGGCGGGAGCTCAGTAACTAGGTTGGGTAACTAATAACTAAATATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 57897 117 + 647215 TTGCCTCTAAGACATGATGTAGAACTTATTTAGTTAATGATGGCGACTAAGCTAGCAGAAAGCCATGATATGGGAGGGAGCTCAGTAACTAGGTTGGATAACTAACAACTAAATATT + +a +s mr.mrrefChr0 62265 136 + 130230 GACTTGCCTCTCAATATGACAAGCCTTTACAGTGAATAGACATGAAGGTTCAGTTTTCAAGCTAATCAGGGAGAAGATCCAGTTAAGTATGGACAAGTCTTTAATTGATTACTAGTTCCCTATTGGTTCATTTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65580 136 + 636262 GACTTGCCTCTCAATATGACTAGCCTTTACAATGAATAGACATGAAGGTTCAGTTTTCAAGCTAATCAGGGAGAGGATCCAGTTAAGTATGGACAAGTCTTTAAATGATTACTAGTTCCCTACTGGTTCATTGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 58014 136 + 647215 GAGTTGCCTCTCTATATGACAAACATTTACAGTGAATAAACATGAAGGTTCAGTTTTCAAGCTAAGCAGGGAGGAGATCCAGTTAAGTATGGACAAGTTTACAATTGATTACTGGTTCCCTATTGGTTCATTTTGG + +a +s mr.mrrefChr0 62401 77 + 130230 ATATGGGCAATAGCTAAGCCAGTGAAGAAAGATCTTCTAAATAGCCCTCATCTAACAGCTAAGTATCATACTGTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65741 63 + 636262 ATATAGGCAATAGCTAAGCCAGTGAAGAGAGAT--------------TCATCCAACAGCTAAGCATCATACTGTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 58150 77 + 647215 ATATGGGCAATAACTGAGCCAGTGAAGAAAGATCTTCTAAATAGCCCTTATATAACAGCTTAGTATCATACTGTAGT + +a +s mr.mrrefChr0 62478 238 + 130230 ACCCCTTATGATTCCAAAACCATAACACAGCCTGTTCAAAGAGTCACACAGAGAATAACTGGAGACATAGTAAAGACTGAGCGCCAATTGACAATGGGGACATTCAGGACTACATGCAAGCAATAGAACAAGTTTGACGCAGAATTATTGCACTGTAGGTTAATTTTTGATAGGATGATTTCCAATATTATGCACAAATGGACACTGAAGCATATACTGCTCAGAGGGGAGCGTAcga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 65808 238 + 636262 ACCCCTTATGATTCCAAAACCATAACACAGCCTGTCCAAAGAGTCCCACAGAGAAGAACTGTAGACATATTAAAGACTGAGCGCCAATTGACAATGGGGACATTCAGGACTACGTGCAAGCAATAGAACAAGTTCGACGCAGAATTATTGCACTTTAGATTAATTTTTGATGGGATGATTTACAATATTATGCACCAATGGACACTGAAGCATATACTGCTCAAAGGGGAGCGTACGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 58227 209 + 647215 --------------------------ACAGCCTGTTCAAAGAGTCACACAGAGAATGACTGGAGACGTAGTAAATACTGAGCGCCAATTGACAATTGACACATTCAGGACTACATGCAAGCAATAGAACAAGTTTGGTGCAGAATTATTGCACTGTAGGCTAATTTCTGAAAGGATGATTTCCAATATTATGCACAGATGGACACTGAAGCATATACTGCTCAGAGGAGATCATA--- + +a +s mr.mrrefChr0 62716 152 + 130230 gaatacaactaaatttctctgtcataaaTCTAGTGCTCTTGTTTGTCTGTGCAATGCAACAAGAGGACagTGATGAGTATTTTTGATTAGATcAAGAACAGgttcaaatATCCACCTTTTGCGGCTACATTATGGTTTATCTAAGGAACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 66048 151 + 636262 GAATACAACTAAATTTCTCTGTCATAAATCTAGTGCTCTTGTTTGTTTGTGCAATGCAACAAGAGGACAGTGATGAGTAATTTTGATTAGAT-AAGAACAGGTTCAAATATCCACCTTTTGCGGCTACATTGTGGTTTATCTAAGGATCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 58436 114 + 647215 ----------------------------TCTACTGCTCGCGTTGGTCTGGGCAATGCAACATGAGGAC--TGATGAGTATTTCTGATTAGATCAAGAACAA--------ATCCACCTTTTGCAGCTACATCATGGTTTATCTAAGGAACCTT + +a +s mr.mrrefChr0 62868 171 + 130230 TTATGAGCACCTACCCATACTGACTTGCTTTAAATGAaagcatgttaagtaaGATCTCTGGCTACAAACAACATGCTGCAACCCAGCTGCCTCAAATCACTTTCAACCATCAGTTCCAATCATAAAGTTACTAGGATATTACATACACTAGATACccaagtgagctcatta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 66206 155 + 636262 TTATGAGCACCTCCCCATACTGACTTGCTTTAAATGAAAGCATGTTAAGTAAGATCTCTGGCAACAAACAACATGCTGCAACCCAGCTACCTCAAATCACTTTCAAGCACAAGTTCCAATCATAAAGTTACTAGGATATTACATACACTAGATAC---------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 58550 156 + 647215 TTATGAGCACCTAACCATCATGATTTGCTCCGAATGA---------------AGTCTCTGGCTACAAACAACATGCTGCAACCCAGCTGACTCCAATCACTTTCAGCCATCAGTTCCAATCATAAAGCTGCTAGGATATGACATACACTAGATACCCAAGTGAGCTCATTA + +a +s mr.mrrefChr0 63039 86 + 130230 GCTAATTGGAGtatataATTTGTATTGCAACTAATAAGTAGCACTCAATCTGAGTAAGACATATTATCTGTGGATTATGGCCTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 66806 80 + 636262 GCTAATTGGAG------ATTTGTATTGCAACTAACAAGTAGCACTCAATCTGAGTAAGACATATTATCTGTGGATTATGGCCTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 58706 86 + 647215 GATAATTGGAGTATATAATTTTTATTGCAACTAATAAGTAGCATCCAATCTGAGTCCGACACATTATCTGTGGATTATGGTCTCAG + +a +s mr.mrrefChr0 63125 66 + 130230 TGTGTTAAACTTGAACTCACTAGCTTTACTCAAAGGAAGATAGTCAAACAAGATCCTTACACCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 66886 66 + 636262 TGTGTTAAGCTTGAACTCACTAGCTTCACTCAAAGGAGGATAGTCTAACAAGATCCTTACACCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 58795 66 + 647215 TGTGTTGAACTTGAATTCACTAGCTTTACTCAAGGGAAGATAGGCAAACCAGATCCTTACACCCCT + +a +s mr.mrrefChr0 63191 210 + 130230 CCCTTTCACCCCCTACATTATGGCTATGTACTAACCAGGAGATCTGAACCAAAGACAAGGGCAAAAGACCCGGGCCAATGAGTTCTCTGTACAACATTATGTGTCCTTACCTATCTATGTATTCCATTCTTAATGATTTGGCAAGAAACACTGAGTTAAgCCTTCACTCTGTCCCATAGGTGGTGCTGGTAATCAAGTTAACATGTTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 66952 209 + 636262 CCCTTTCACTCTCTACATCATGGGTATGTACTAACCAGGAGATCTGAACCAAAGACAAGAGCTAAGGACCCAGGCCAATGAGTTCTCTGTACAACATTACATATCCCTACCTATCTATGTATCCCATTCTTAATAATTTGGCAAAAAACACTGAGTTCA-CCTTCACTCTGTCCCATAAGTGGTACTGGTAATCAAGTTAACATGTTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 58876 207 + 647215 CCCTTCCATCCCCTACATTATGGCTATGTAGTAACCAGGAGATCTGAACCCAGGAC---GGCATAAGACCTGGTCCAATGAGTTCTCCGTACAACATTATGTGTCCTTAAGCATCTAAGCACTTGATTGCTAATGATTTGGAAAGAAACAGTGAGTTAAGCCTTCACTCTGTCCCATAGGTGGTGCTGGTTTTCAAGTTAACATGTTCTT + +a +s mr.mrrefChr0 63401 145 + 130230 ccttcctcctttgcccaagttaaacaccggatgctgatagaactctcaatcttcaaacagtgccagaaattaatagtaaaaactattctagtctatacccttcaaagtactggtgcttagaaaatgcttatgtaacagagacttc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67163 145 + 636262 CCTTCctcctttgcccaagttaaacaccggatgctggtagaactctcaatcttcaaacagtgccagaaattaatagtaaaaactattctagtctatacccttcaaagtactggtgcttagaaaatgcttatgtaacagagacttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 59083 71 + 647215 -----CTCCTTTGCCCAAGTTAAACACCAGGTGCTGACAGAAGTCTCAGTCTtc-aacagtgcaagaaaataatagt-------------------------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 63546 100 + 130230 attgcaaactgcaaggctataaattgggacaacatatatgccgtacttattcatacaaaggaggtgagacttccagttcaacaTGCAATCGATAAGAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67398 100 + 636262 attgcaaactgcaaggctataaattgggacaacatatatgccgtacttattcatacaaaggaggtgagacttccagttcaacaTGCAATCGATAAGAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 59154 100 + 647215 atagcaaaccacaaagctataaattgggacaacatatatgccgtacttattcctacaaaagaggTGAGACTTCCAGTTAAGCAAGAGATCAATAAGAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 63646 131 + 130230 CCCACACTGCACCTCACCCTTTTAGCATTGTACTGAAGAAACTGTGTCATGTCAGGCAATATAGCGCACACCCAAGACTAGCACATTAAACAACACCTGACAAAGTGTACTTTCACATAGTTCATCTTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67498 131 + 636262 CCCACACTGCACCTCACCCTTTTAGCATTGTACTGAAGAAACTGTGTCATGTCAGGCAATATAGCGCACACCCAAGACTAGCACATTAAACAACACCTGACAAAGTGTACTTTCACATAGTTCATCTTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 59260 131 + 647215 CCCACACTGTACCTCACCCTTTTAGTGTTGTACTCGAGAATCCATGTCATGTTAGGCAATATAGCGCACACCTAAGACTCGCACATAAAACAACACCTGAAATAGCGTACTTTCACATAGCTCATCTTAAC + +a +s mr.mrrefChr0 63777 9 + 130230 AAGTGAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67629 9 + 636262 AAGTGAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 59392 9 + 647215 AAGTGAGTA + +a +s mr.mrrefChr0 63786 17 + 130230 CTTCCCAGTCTCCTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67638 17 + 636262 CTTCCCAGTCTCCTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 59404 17 + 647215 CTTCCCAGTCTTCTTAG + +a +s mr.mrrefChr0 63803 32 + 130230 AAAGCACCGACTTGTCTTGAAAGAGAGCTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67655 32 + 636262 AAAGCACCGACTTGTCTTGAAAGAGAGCTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 59446 32 + 647215 AAAGCACCTACTTGTGTTGAAAGAGAGCTGAT + +a +s mr.mrrefChr0 63835 104 + 130230 ACACTAAAGAAGAGCTGGAAAGTCCAGAAGTAAAGCTGGTAAACACTGCATACTGTTAACTTGTAACTTAACACAGTTGACTTTTTAACTCAATCTAAGGGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67693 104 + 636262 ACACTAAAGAAGAGCTGGAAAGTCCAGAAGTAAAGCTGGTAAACACTGCATACTGTTAACTTGTAACTTAACACAGTTGACTTTTTAACTCAATCTAAGGGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 59478 104 + 647215 CCACTAAAGAAGAGCTGGAAAGGCCAGAAATAAACCTGGTAAACACTGCATACTATTGACTTTTAACTTAACACAATTGACATTTTAACACAATTTAAGTGAGC + +a +s mr.mrrefChr0 63939 45 + 130230 TACCAAGCATGAAAGCCATTCTGAAAATGAGGACCATACCTTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67797 45 + 636262 TACCAAGCATGAAAGCCATTCTGAAAATGAGGACCATACCTTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 59583 45 + 647215 AACCAAGTGTGAAGGCCATTTTGAAAATGAGAACTATACCTTTCC + +a +s mr.mrrefChr0 63984 98 + 130230 AATTCAACCTACAGATGGTCCTAATCAAGGCAGAAATGTCGTCAATGAGGAGGAGTATGTAATTGTTGCACATGTGTCTTCAACTTCAGCATGAAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67883 98 + 636262 AATTCAACCTACAGATGGTCCTAATCAAGGCAGAAATGTCGTCAATGAGGAGGAGTATGTAATTGTTGCACATGTGTCTTCAACTTCAGCATGAAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 59628 98 + 647215 AATTCAACCTACAGATGGTCCTAGTTGAGGCAGAAATGTTGTCAATGAGGAGGAGTATCTAATTATTGTACATGTGATTTCAACTTCACCATGAAAGC + +a +s mr.mrrefChr0 64082 19 + 130230 TTAAGAGAGTTATAAGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 67981 19 + 636262 TTAAGAGAGTTATAAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 59727 19 + 647215 TTAATAGAGTTATAAGAAC + +a +s mr.mrrefChr0 64101 60 + 130230 TTGAGTGATTTGTGTTAAATGCATGTATTAGTTTATGCTTTGAGTCCTAATCTCTGTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68001 60 + 636262 TTGAGTGATTTGTGTTAAATGCATGTATTAGTTTATGCTTTGAGTCCTAATCTCTGTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 59746 60 + 647215 TTGGATGATTTGTTTTAACCACATGTATTAGTTTATGCTTTGACTCCTAATCCCTGTATT + +a +s mr.mrrefChr0 64161 23 + 130230 GAACTTGTTGCCCTGTCTGTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68061 23 + 636262 GAACTTGTTGCCCTGTCTGTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 59808 23 + 647215 GAACTTGTTGCCCTGCCAGTCCA + +a +s mr.mrrefChr0 64184 50 + 130230 ACCATTGACTTCTAACAGATTCCTTGACTTCTAACAGATTCTGAGTTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68093 50 + 636262 ACCATTGACTTCTAACAGATTCCTTGACTTCTAACAGATTCTGAGTTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 59831 50 + 647215 GCTATTGACTGCTAATGGATTCCTTGACTTCTAACGGATTCCAAGTTTGA + +a +s mr.mrrefChr0 64234 84 + 130230 CCAAGGAGACACTCACACTATCTTCTAATCATTTACCTACAAGCACTTGGGGGCATTCAATGTGCTATGGCTGATTGAGGTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68144 84 + 636262 CCAAGGAGACACTCACACTATCTTCTAATCATTTACCTACAAGCACTTGGGGGCATTCAATGTGCTATGGCTGATTGAGGTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 59881 84 + 647215 CCAGGAAGAAGCTCACACTATCTTCTATCCACTTACCTACAACCACTTAGGGACATTCAATGTGCTATGAGTCATAGACAATCT + +a +s mr.mrrefChr0 64318 85 + 130230 CTTTAGATATGTCCCAATGATAGAATCAATTGTGCTTGCTTCCATGCATACAATATATcagcaacaattgacttgaagcaaatga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68228 85 + 636262 CTTTAGATATGTCCCAATGATAGAATCAATTGTGCTTGCTTCCATGCATACAATATATcagcaacaattgacttgaagcaaatga +s simRat_chr6.simRat.chr6 59967 85 + 647215 TTTTGGGTATGTCACAAGGATAGAATCAATTGTGCTTGCTTTCATGCATGCAATAGACCAGCAGCAATTAAGATGAAGCAAAGCA + +a +s mr.mrrefChr0 64403 36 + 130230 tttcctagtaatacaagtggtggcagtcatcaaggg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68313 36 + 636262 tttcctagtaatacaagtggtggcagtcatcaaggg +s simRat_chr6.simRat.chr6 60059 36 + 647215 Tttcataggcatacaagtggtggcagttgccaagga + +a +s mr.mrrefChr0 64439 246 + 130230 ccacaaattaaggatcacaatccttgctgatcttggcattttataatggaagccactaatagttcaaaggttattagatgttcttggggcacactgttgtgaattcatttgtggacctcgaatttacttaagctaatatacagctttagcaggactgccactgagacactgatggccctgttcaccacatgtaaaaaaacctctgtggaattcacctgtaacaggaaaaggggacttgtgatagag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68350 246 + 636262 ccacaaattaaggatcacaatccttgctgatcttggcattttataatggaagccactaatagttcaaaggttattagatgttcttggggcacactgttgtgaattcatttgtggacctcgaatttacttaagctaatatacagctttagcaggactgccactgagacactgatggccctgttcaccacatgtaaaaaaacctctgtggaattcacctgtaacaggaaaaggggacttgtgatagag +s simRat_chr6.simRat.chr6 60095 246 + 647215 ctataaattaaggttcacaacccttgcaattctcgacatttcataatagaagccactaatagttcaaagattattagaagttctcggggcttgatgttgtgaatttatttgtccacctcaaatttactttagcgaagatatagccttagcaggactgctactgaggtaccgatggccccaatcaccacatgtaaaaaaacctccgtggaattcacctctaaccaaaaaaggggacctgtggtaagg + +a +s mr.mrrefChr0 64685 41 + 130230 tgattccgagttaaaaaaattggccagccgaataacattac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68596 41 + 636262 tgattccgagttaaaaaaattggccagccgaataacattac +s simRat_chr6.simRat.chr6 60342 41 + 647215 tgactctgagttaaaaaaattgaccagcaaaataacattac + +a +s mr.mrrefChr0 64726 18 + 130230 gatttcaggtttcacaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68639 18 + 636262 gatttcaggtttcacaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 60383 18 + 647215 gattttaggttccacagt + +a +s mr.mrrefChr0 64744 2 + 130230 tg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68658 2 + 636262 tg +s simRat_chr6.simRat.chr6 60401 2 + 647215 tg + +a +s mr.mrrefChr0 64746 84 + 130230 caaccattgccgaaacaacactccactggtataaacagatcattactatacaatatgcgtataagatagaTCATTCTAGGGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68660 84 + 636262 caaccattgccgaaacaacactccactggtataaacagatcattactatacaatatgcgtataagatagaTCATTCTAGGGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 60409 84 + 647215 caaccattaccgaaacaacactccactggtatataaacatcattactatacaatatgggtataagatggaTCACCCTAGGGATA + +a +s mr.mrrefChr0 64830 35 + 130230 CCCACACCCTTAAGTAATTTGACACCTTAGGGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68745 35 + 636262 CCCACACCCTTAAGTAATTTGACACCTTAGGGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 60493 35 + 647215 CCCACACCCTTAAGGAAATCGACTCCTCAGGGTTT + +a +s mr.mrrefChr0 64865 169 + 130230 AGAAAGCTGTTGTCATGTATACAGCAGCAAGAAGACCACACCTgcttcaggttcaccccattgaaggtaactcatgcatgcaattgtcaattggtattgtccattggtcctccttgtcctgtgacttgagcatattaattttataaccagacacattctacaaccctca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68780 169 + 636262 AGAAAGCTGTTGTCATGTATACAGCAGCAAGAAGACCACACCTgcttcaggttcaccccattgaaggtaactcatgcatgcaattgtcaattggtattgtccattggtcctccttgtcctgtgacttgagcatattaattttataaccagacacattctacaaccctca +s simRat_chr6.simRat.chr6 60529 169 + 647215 ATAAAGCCGTTGTCATGTATACAGCAGCAAGAGGGCCACACCTGCTCGAGATTCACCCCACTGAGTGTgactcatgcatgcaattgtccattggtattgtccattggtcatccttatcttacaacttgagcacattaattttacaaccagatacatttgacaaccctca + +a +s mr.mrrefChr0 65034 47 + 130230 ctgaggaatttgaggaggttactggattcctggatggtataggctta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68949 47 + 636262 ctgaggaatttgaggaggttactggattcctggatggtataggctta +s simRat_chr6.simRat.chr6 60703 47 + 647215 ctgatgaatttgacaaggttactggattcctggatggtataggctca + +a +s mr.mrrefChr0 65081 32 + 130230 tttgggtgtacgataatgtcatctgcaaatcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 68997 32 + 636262 tttgggtgtacgataatgtcatctgcaaatcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 60750 32 + 647215 tttgggtgtacaatcctttcatctgcaaatcc + +a +s mr.mrrefChr0 65113 20 + 130230 aaccttaatctcctcttcat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69029 20 + 636262 aaccttaatctcctcttcat +s simRat_chr6.simRat.chr6 60785 20 + 647215 aagattaatctcctcttcat + +a +s mr.mrrefChr0 65133 278 + 130230 gtcacgcatcttgcacctttcccctagcatattgTAACTTAAATTATACGACACCCTATCAGGATACCATACAATGTAGTGTTGTGGCTTGTTTGACATCCTATTTCAATGAGGTCATTCCTGTGTAAGAGAGAAATACTTGAAAGTGTCTGCATAGTTCCTCTAGAACATGCATTTCCCCTCAAGTTGGTACAGGTGCAGCTCAGAACTTGACACTTGGGATAACTGGTTTCTGGAAGGCTTCTACCAGGGTGGATCACAACCCAACAGTAAACGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69052 278 + 636262 gtcacgcatcttgcacctttcccctagcatattgTAACTTAAATTATATGACACCCTATCAGGATACCATACAATGTAGTGTTGTGGCTTGATTGACATCCTATTCCAGTGAGGTCACTTCTGTGTATGAGAGAAATACTTGAAAGTGTCTACATGGTCTCTCTAGGACATGCATTTCCCCCCAAGTTGGTCCAGGTGCAGCTCAGAACTTGACACTTGGGATAGCTAGTTTCTGGAAGGTTTCTACCAAGGTGGAACACGACCCAACAGTAAATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 60805 276 + 647215 gacacacagcttgcaccttttccctagtatattgTAACTTGAATTATACGACACCCCATCAGGATACCACACAATGTAGTATTGTGGC-TGTTTGACCTCCTATTTCAATGAGGTCTTTCCTGTGTAAGAGAGAAATACTTGAAAGTGTCTGCATAGTTCCTCTAGAACA-GCATTTTCCCTCAAGTTGATACAGGAGCAGCTCAGAACTTGACACTTGCGATAACTGGTTTCTGGAAGGCTTCTACCAGGGTGGATCACAACTTAAAAGTAAACGTG + +a +s mr.mrrefChr0 65411 78 + 130230 AAGAGACACAGAGTAGTTTGCATTTGCTCTGAGATGCACCTCCGTTAGCATGAAGAAGTTCAAGCATTCCAGGCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69334 78 + 636262 AAGAGACACATGGTAGTCCGCATTTGCTCTGACATGCACCTCCGTTAACGTGAAGAAGTTCAAGCATTGCAGGCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 61081 78 + 647215 AGGAGACACCGAGTAGTTTGGTTTTGCTCTGAGATGCACCTCTGTTAGCATGAAGAAGTTCACACATCCCAGGCACAT + +a +s mr.mrrefChr0 65489 83 + 130230 TCATGCTTCACTTCGACTAATTGAAGAAGCCTTGCACAAAAGGAGGGAATGGTATTACTTCATCTATAATCCTTGCTGTTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69412 77 + 636262 TCATGCTTTACTT------ACTGAAGAAGCCTTGCACAAAAGGAAGGAATGGTATTACTTCATCTAGAATCCTTGCTGTTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 61184 82 + 647215 TCATGCTTCACTTCGACTAATTAAAGAAGCTTGGCAC-AAAGGAGGAAATGGTATCAGTTCATCTATGATCCTTGCTGTTATG + +a +s mr.mrrefChr0 65572 11 + 130230 GCCTAAGATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69493 11 + 636262 GCCTAAGATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 61266 11 + 647215 GCCTAAGATTA + +a +s mr.mrrefChr0 65583 71 + 130230 GTACTCAGAAAAATGCCACACTGTTCTGGGCGGACCCCCATAAAAGATATGACCTCTCTTCTTGGAGTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69504 71 + 636262 GTGCTCAGAAAAATGCCCCACTGTTCTGGGCGGACCCCCATAAAAAATATGACCTCTCTTTTTGGAGTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 61278 71 + 647215 GTACTCAGAAAAATGCCACGCTGATATGGGCGGCCCCCCATAAAAGATATGACCTCTCTTCTTGGAGTTGT + +a +s mr.mrrefChr0 65654 244 + 130230 AGAGTGGTGACACTGTCCCCATCCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAATTAAATGAAACACATTTTATGTCAGCGGACTCCAATTTAACTAAGGAGTATAAAAGTGACATTTCTCACACACTTGCCAATGCCCTGCTACAAATTTCCCTATGCAGGTACTCACACCAGTATACTTCTTCTTGCACCTGAAAACAGCTGGATGAATGTACACCCACCACAATAGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69576 243 + 636262 AGAGTGGTGACACTGTCTCCATCCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAATTAAATGAAACACATTTTATGTCAACGGACTCCAGTTTAACTATGGAGTATAAAAGTGACATTTCTCACAC-CTTGCCAATCCCCTGGTACAAAGTTCCCGATGCAGGTACTCACACCAGTATACTTCTTCTTGCACCTGAAAACAGCTGGATGCATGTACACCTACCACAATCGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 61349 229 + 647215 AGAGTGGT---TCTGTCCCCAACCTGTTGCTTCTCAGCTAAATGAT--AAATGCAACACGTCTTATGTCAGCTGACTCCAATTTAACTAAGGA----------GATGTTTTTCACACACTTGCCAATGCCCTGCTACAAATTTCCCTATGCAGGTACTCACACCAGTAGACTTCTTGTTGCGACTAAAAATGGCTAGATGAAACTATACCCACCACAATAGCCAGCTGCTTATAATACCATGTG + +a +s mr.mrrefChr0 65898 143 + 130230 AGTTGTGTGCAACATTGACTTTAAAGGGATGAACACCTGTTGAAGTCAGCCTGAAAAAAAGTATAAAACAACATTCCTTTGCATGAAATTGCCTATAAAACCAGGAAAAGGCAGCCACATCCTACCCTTACTTAACTGCGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69821 137 + 636262 AGTTGTGTGCAACATTGACTTTAAAGGGATGAACACCCATTGAAGTCAGT------GAAAGTATAAAACAACATTCCTTTGCATGAAATTGCCTATAAAACCAGGAAAAGGCAGCCACATCCTACCCTTACCTAACTGCGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 61578 142 + 647215 AGCTGTGTGCAACATTGACTTTAAAGGGATGAACACCTGTTGAAGTCAGCCTGAAAAAAAGTATAAAACAACATTCCATT-CATGAAATTACCCATAAAACCGGAAAAAGGCAGCCACATCCTACCCTTACTTAACTGCATAC + +a +s mr.mrrefChr0 66041 236 + 130230 TGTTTTAATCTACCTAGCATGGTTATGAATGTTTTAGTCTGTGCAAGTGGAAAGCCCTTCCACTATTGCTTTCTTTAATGGGAACACTGTGAATTGAGCACAAGCCTGCCAGTCCACGGCACTATTGGTGCCTTGTCACTGGTCCAGCTTTTTTCTAAGTTCAAGAACTCTACGCCATCTTAACGCTAGACTCAATTCATGCACAATTGGGTGTAAATGAGTTAGACCATACCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 69958 235 + 636262 TGTTCTAATCCACCTAACATGGTTATGAATGTTTTAGTCTGTGCAAGTGGAAAGCCCTTCCACCATTGCTTTCTTTAAT-GGAACACTGTGCATTGAGCATAAGCCTGCCAGTCCACGACACTATTGGTGCCTTGTCACTGGTCCAGCTTTTTTCTAAGTCCAAGAACTCTACGCCATCTTAACGCTAGATTCGATTCATGCATAGTTGGGTGTAAATGAGTTAGACCATACCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 61723 208 + 647215 TGTTTTAATCTACCTAGTATGGTTATGAA------------TGCAAGTGAAGAGCCCTTCCACTATTGCTTTTTTTAATGGGAACACTGTGAATTGAGGACAAGTCTGCCAGTACATGGTACTATTGGTGCCTTGTCACTGGTCCAGCTTTTTTCTAAGTTCAAGAACTCTGCGCCATCTTAACCCTAGACTCAATTCATGTGCAATTGGGTGTAAATGA---------------- + +a +s mr.mrrefChr0 66277 267 + 130230 CTGCTGTACTTCAGTTGGTGCAGGAGCATTGTTAACACCGGGATTCAATGTCTGGTGCTCTGCATCTAGGTTCTAGGACCAAGTGAGACACAAGTTTGCAGTTGAAATGTGCAGGAAAGAAAGAAGCACTCACTGTGTGTCATTGTATAGTTCCAAAAACATCAATTTGAACCTGGTCAAATACACAGAGTAGCCACTGTGTCAGGATATTCATCTGGGGTTGGAATGAACTTACTGCGGGTGTGAGTCAGGCCTGTATAATGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70196 266 + 636262 CTGCTGTACATCAGTTAGTGCA-GAGCATTGTTAACACCGGGATTCAATGTCTGGTGCTCAGCATCTAGATTCTAGGACCAAGTGAGTCACAAGTTTGCAGTTGAAATGTGCAGGAAAGAAAGAAGCACTCACTGTGTGTCATTGTACAGTTCCAAAAACATCAATTTGACTCTGGTCAAATACACAGAGTAGCCACTGTGTCAGGATACTCATCTGGGGTTGGAATGAACTTACTGCGGGTGTGAGTCAGGCCTGTATAATGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 61931 261 + 647215 ------TACTTCAGTTGGTGCAGGAGCATTGATAACATCAGCATTCAATGTCTGGTGCTCTGCATCTAGGTTCTAGGACTGAGTGAGACACAAGTTTGCAGTTGAAATGTGAAAGAAAGAAAGGCACACTCACTGTGTGTCATTATATAATTCCGAAAACATCAATTGGAACCTGGTCAAATACACAGAGTAGCCAAGGTGTTGGGATATTCATCAGGGCTTGGATTGAACTTACCGTGAGGGTTAGTAAGGCCTGTATGATGATGA + +a +s mr.mrrefChr0 66544 80 + 130230 CCTTTTCCAAGATGTGAAATTGGGGATTGAGAATGAGTGGCGTGCAAGGATTTTTACTTAGTCTACTGTCATTCAATCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70462 77 + 636262 CCTTTTCCAAGACGTGAAACTGGGGATTGAGAACGAGTGGCGTGCAAGGATTTTTACTTAATCTGCTGTCATTCAAT--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 62195 79 + 647215 TCTTTTCCAAGATGTGAAATTGGGGATTGAGAATGAGTGG-GTGCAAGGATTTTTACTTAGTCTACTGTCATCCAACCCT + +a +s mr.mrrefChr0 66624 175 + 130230 AATCCTCATGAACTGTCTGTCAATAATCTGGCATATATTGTCCTGTTGTGAATAGATGGTTATGTGCCCTAACTTAAATCCATCTTAGGATATTTCACCCTCCACTAAGGATAATCATGTTTTACTAAGTCTAATAAAAAGTATATTAGCTCCAACCAGATTTGATGTGATAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70631 169 + 636262 ------CATGAACGGTCTGTCAATAATTTGGCATATATTGTCCTGTTGTGAATAGATGGTTATGTGCCCTAACTTAAATCTATCTTAGGATCTTTCACCCTCCACTAAGGATACTTATGTTTTACTAAGTCTAATGAAAAGTATATTAGCTCCAACCAGATTTGATATGATAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 62276 175 + 647215 AATCCTCAAGAATTGTCTGTCAATAATCTGGCATATATTGTCCCATTGTGAATAGATGGTTATGTGCCCTGATTTAAATCCATCTTAGGATATTTCCCCCTCCACTGAGGATAATCATGTTCTACTAAGTCTAATAGAAAGTATATCAGCTCCAACCAGATTTGATGTGATAAAT + +a +s mr.mrrefChr0 66799 296 + 130230 CATACATAGGTAGAAGGAACTATTCATGTCTAGGGAGGCTCATGATATCAGCTTCCTTGATGTTTATTACCCAGCCCACAAAATCCTTACAAAACTTTGGTCCCATTGGGCAGAACACCCAACTAGATCCAAAGTCTAATGTTCTAATGTGTGTTTCTTAGGGACAAGCCCAATTTGGTCTTCAAGCATTCATGGACTCTATAATGCACCCCTGGACACATGTAAGGTACATAAGCTTTTTAGCTTCTCCTGCTCCTCCCTAACTATGGCAAGTTAAGTTTCACCATATCATGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70801 296 + 636262 CATACATAGGTAGAAGGAACTATTCATGTCTAGGGAGGCTCATGATATCAACTTCCTTGATGTTTATTACCCAGCCCACAAAATCCTTACAAAACTTTGGTCCCATTGGGCAGAACACGCAACTATATCCAAAGTCTAATCTTCTAATGTGTGTTTCTTAGGGACAAGCCCAATTTGGTCTTCAGGCATTCATGGACTCTATAATGCACCCCTGGACACACATAAGGTACATAAGCTTTTAAGCTTTGCCTGCTCCTCCCTAACTATGGCAAGTTAAGTTTCACCATATCATGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 62451 290 + 647215 CATACATAGGTAGAAGGAATTATTCATCTCTGGGGAGGCTCATGATATCAGCTTCCTTGAAATTTATTACCTAGCCCACAAAATCCTTCCAAAACTTTGGTCCCATTGGGCAGAACACCCCACTTGATCTAAATTCTAATGTTCTAATGTATGTTTCTTATGGACAAGCCCCATCTGGCCTTCAAGCACTCGTGGACTCTATAATGCACCCCTGGACACATGGAAGGCACATAAGCTTATTAGCTTCTCCTGCTCCTCCCCAACTAT------TTAAGTATCACCATATCATGCTT + +a +s mr.mrrefChr0 67095 148 + 130230 AATAAGAGTGTAATGTTATTGATGGCATCTCATTTTTGGATGCCCAAGATGATCACAGGGTTCGGCATGACAAAAGTTATTCAATTTTTGCAGGTCTTTCAACTAGTATTGTTCAGCATCTAAAATCCTTTACAGTCTTATCTCCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71097 147 + 636262 AATAAGAGTGTAATGTTATTGATGGCATTTCATTTTTGGAAGCCCAAGATGATCACAGGGAACGGCATGCCAAAAGTTTTTTGATTTATGCAGGTCTTTCAACTAGTATG-TTCAGCATCTAAAATCCCTTACAGTCTTATCTCCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 62743 148 + 647215 AATAAGAGCGTACTGTTATTGATGGCACCTAATCTTTGGATGCCCAGGATGATCATAGGGTTCAACATGACAAAAGTTATTCAATTTTTGCAGGTCTTTCGACTAGTATTGTTCAGCATCTCAAATCCTTGACAGTCTTATCTCCACC + +a +s mr.mrrefChr0 67243 25 + 130230 TGAATCTCTTTGTTTGTTTTTAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71264 25 + 636262 TGAATCTCTTTGTTTGTTTTTAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 62891 25 + 647215 TGAATCTCTTTGTTTGTTTTTAATG + +a +s mr.mrrefChr0 67268 35 + 130230 TGCATATAGGTAGCTGCATTAACTGAGCTATAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71294 35 + 636262 TGCATATAGGTAGCTGCATTAACTGAACTATAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 62916 35 + 647215 TGTATTTAGGTAGCTTCATCAACTGAGCTATAGTC + +a +s mr.mrrefChr0 67303 298 + 130230 ACACACCTCATTCGCGATTCTCCTATTTTTCCTCTGTGATGAGGCTTATATTGCCTTACGAGATGCAAGGGACGAAGACACTTCTGCACCATTGAATTTGTTATCAGGTCTATAATTCTGTGTGCATGAAAGGCAATGGAACTAAGAATTAAACCCCTCATTCTAGGTAACTCCCCCTTACATCAGTGATTCATTATCTGTGCATGCAGATGGATATGCACATAGATTTCCACTCATTGCATACACCTGATTTCTAAGGTGGTATTCCACCTCTTGCCACACCCTTATACAGATTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71329 297 + 636262 ACACACCTCAT-CGCAATCCTCCTATTTTTTCTCTGTCATGAGGCTTATAATGCCTTACGAGATGCAAGGGACGAAGACACTTCTGCACCATTGAATTTGTTATCAGGTCTATAATTCTGTGTGCATGAAAGGCAATGGAACTAAGAATTAAACCCCTCATTCTAGGTATCTACCCCTTACATCAGTGATTCATTATCTGTGCATGCAGATGGATATGCACATAGATTTACACTCATCGCATACACCTGATTTCTAAGGTGGTATTCCACCTCTTGACAGACCCTTATACAGATTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 62952 298 + 647215 GCACACCTCATTCCCGGTTCTCCTATTTTTCCTCTGTGATGAGGCTTATATTCCCTTATGAGACACAATTTACAAAAGGATTTCTGCACCATTGAATATGCTATCAGGCCTATATTTCTGTGTGCATGAAAGGCATTGGAGCTAACAGTTAAACCCCTCATTCTTGATAACTCCCCCTTACATCAGTGATTCATTATCTGTGCATGCAGATGGATATGCACATAGATTTCCACTCATTGCATACTCCTGATTTTTAAGGCGGTATTCCACCGCTTGCCACATCCTTATACAGAGTTCT + +a +s mr.mrrefChr0 67601 174 + 130230 CTTGCCACATCCTTATACAATGTGTGGTTATGTGCACATGTGCCATGGTAATGACATCAATATAGTTGCCCAGTTTTGTTGCAGCCCAATAGGTACATAACTAGAGAATCACTTGGACGTGGAGGATCACCTGGGAATATAAGACTAAGGCACTCAGATTTATAGGATGGCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71626 174 + 636262 CCTGCCACATCCTTATACAATGTGTGGTTATGTGCACATGTGCCATGGTAATGACATCAATATAGCTGCCCAGTTTTGTGGCAGCCCAATAGGTACATAACTGGAGAATCACTTGGACGTGGAGGATCACCTGGGAATATAAGACTAAGGCACTCAGATTTATAGGATGGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 63267 174 + 647215 CTTGCCACATCCTTATACAATAAGTACTTATGTGCACATGAGCCATGGTAATGTCATCATCATAGTTGCCCAGTTTTGTTGCAGCCCATTAGGTACATAAGTAGAGAATCCCCTGGGAGTGGAGACTTACCTGGGAATCTAAGACTAAGGCACTCAAATTTATACGATGGCTTT + +a +s mr.mrrefChr0 67775 745 + 130230 GTGGGCTGGGGGAGAAGGAGAGTATCATAGGCATGCACAGGGTTCAGGCCATCCAGTGATAGCTTCCCCTAGGAGCAATTTCCAGAAAGCCCCAATAACCAAGTCCACTTCCAGTCTTAGACTTCAAAATAAATGGGCTATGCTTTAGCCCATTTAGTACATCCTGATTGAAGAATCAGCTGGGGGGAATTAGTCCAAGTTAGAACAGAAGTGACAGAAGGGAACATTGTATATGCACCTTTGCAGTTAGATCAAATCATCATATAGGTTCACATATACTCCTGCATGCCCAACCTCTAGGTAACTGTATAAATTAGTTCCATCCATGGAATAACGGCTGCGTAGTGGTTAGTGAAGTGTTGTGCAAGGCTTAGCAGACAGTGCCAGAGTCAAGGTCTGGAAGTTCTGTTTCTGATAATAACAGATATTCAACTTTTAATGCCGTCTTTTTGGGAAAATTAGCAGCTCACTCCACATTCCTCCAGAAGTACCTTGAGGAAACTACATTTGCTGATACATAGACTTCCCCACTGTGCTGTTTAGTAACCAACCAGTACATAACAATGCAATAATGTACCACTCCCTTGGTTAAATCTCTTGACTATCCATTGTCAATTGAAGGACCATGTCTGAGTAACCCAAGTGATAAGTGAACCAAATAAGAAAGTCATGAAAATTAATTATGTTACTATTAAGAGTGGCCAATGGAACCAGCCCATCTCATGCGTTTAAACTATCAAGACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 71814 737 + 636262 GTGGGTTGGGGAAGAAGGGGACTATCATAAGCATTCACAGGGTTTAGGTCACCCAGTGATAGCTTCCCCTAAGAGCAATTTCTGGAAAGCCCCAATTACCAAGTCCACTTCCAGTCCTAGACTTCAAAATAAATGGGCTATGCTATAGCCCATTTAGTGCATCCTGGTTGAAAAATCAGATGGGGGGAATTAGTCCAAGTTAGAACAGAAGTGTCAGAAGGGAGCAATGTATATACACCTTTACAGTTAGATCAAAGCATCATATAGGTTCACATATACTCCTGCATGCCCAACCTCTAGGTAACTGTATAAATTAGTTTCATCCATGGAATAACGGCTGCGTAGTGGTTAGTGAAGTGTTGTGCAAGGCTTGGCAGACAGTGCCAGAGTCAAGGTCTGGAAGTTCTGTGTCTGATAATAACAGATACTCCACTTTTAACGCCGTCTTTTTGGGAGAATTAGCAGCTCACTCCACATTGCTCCAGAAGTACCTTCAGGAAACCACATTTGCCAATACATAGAC--CCCCACTGTGCTGTTTAGTAACCAACCAGTACATTACGATGTAATA---TACCACTCCCTTGGTTA--CCTCTTGACTATCCATTACCAATTGAAGGACCATGTTTTAGTAACCCAAGTGATAAGTGAAGCAACTAAGAAAGTCATGAAAATTAATAATGTTACTATCAAGAGTGGCCAATGGA-CCAGCTCATCTCATGCGTTCAAATTATCAAGACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 63441 738 + 647215 GTGCGCTGGGAGAGAAGGAGAGTATCATAGGCATGCACAGGGTTCAGGCCATCCAGTGATAGCTTCCCCTAGGAGAGATTTCCAGAAAGCCCCAATAACCAAGTCCACTTCCCCTCTTAGACTTCAAAATATATGGGCTATACGTTAGCCCATTTAGTACATCCTGATTGAAGAATCAGCTGGGGGGAATTAGTCCAAGTTAATATGGAAGTGACAGAAGGGAACATTGGACATGCACCATTGCAGTTAGATCAAATCATTATACAAGTTCATATACACTCCTGCATACCCAACCTTTAGGTAACTGTATAAGTTAGTTCCGTCCATGAAATAATGGCTGCATAGTGGTTAGTGAAGTGTTGCGT--GTCTTAGCAGACAGTGCCAGAGCCAAGGTCTGGAAGTTCTGTTTCTAATAATAATACATATTCAACTTCTAATGTC-----TTTTGTAAGCTTCGCAGCCCACTCAACATTCCACCAGAAGGACCTTGAGGAAACTACATTTGCTGATACCTAGACTTCCCCACTCTGCTCTTTCGGAACCAACCAGTACATAACAATGCAATAATGTATCACTCCCTTGGGTAAATCTCCTGACTATCCCTTGTCAATTGAAGGACCATGTCTGGGTAACCCAAGCGGTAAGTTAACCAAATAAGAAAGTCATGAAAATTAATTATGCTGCTGTTAAGAGTGTCGGATGGAACCAGCCCATCTCATGCGTATAAACTATCAAGACGC + +a +s mr.mrrefChr0 68520 252 + 130230 CTTGCTTGCTACCTACAATAGTGTGCTCATACTCCAACAAAGAGAGCTTAAGCTCCTATAGCAACTAAGTCCCTATAAAACCATGAGCTGGTGAAGCTAAGTCGTATAACCAGGCTGTTGGCAAAGGTCATCCACTTTGTAATTGACTATCCTTTATGTCTCCCTGTCACAAGTTGGTTGTCATTACAACGATTCCTAGGTTACCTAAATTACTGGTGCAAACGTAGCCCATGTCCAAACATTCAAAGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 72555 252 + 636262 CTTGCTTGCCACCTACAATAGTGTGTTCATACTCCAACAAAGAGAGATTAAGCTCCTATAGCAACTAAATCCATATAAAACCATGAGCTGGAGAAGCTAAGTCGTATAGCCAGACTGTTGGAAAAGGTCATCCACTTTGTAATTGACTATCCTTTATGTCTCCCTGGGACAAGCCAGTTGTCAGTACAATGCTTCCTAGGTTACCTAAATTACTGGTGCAAATGTAGGCCATGTCCAAACATTCAAAGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 64179 252 + 647215 CTTGCTTGCTACCTACAATAGTGTGCTCATACTCCAACAAAGAGAGCTTAAGCTCCTATAGCAACTAAGTCCCCATAAAACCTCTAGCTGGTGAAGCTAAGTTGTATAACCAGGCTGTTGGCAAAGGTCATCCACTTTGTAATTGACTATGCCTTATGACGACCTGTCACAAGTTGGTTGTTATTACTACGATTCCTAGGTTACCTAAATTACTGGTGCAAACATAGCCCATGTCCAAACATCCAAAGCACA + +a +s mr.mrrefChr0 68772 28 + 130230 TTATACTATTAAAAGTATCCCAACACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 72810 28 + 636262 TTATACTATTAAAAGTATACCAACACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 64431 28 + 647215 GTATACTAATCAAAATATCCCAACATAG + +a +s mr.mrrefChr0 68800 209 + 130230 CATCAAATGCAATGTCTATTGTCCACTCCTAATTTCTTCTTACTGCAATGAACATGTACAGCTTTCTGACTGAATGGATCCCTACATGTTACAGTGACCACATTTGACTGTATTGTAAGTTGTCAAACATATACCACTCAGAGAACGGGTTAATTAACCTCATATTAATTTTTATCACCTATCCTTGTCAACTGAGGCTAATAATCGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 72840 209 + 636262 TCTCAAATGCAACGGCTATTGTCCACTCCCAATTTCTTCTTACTGCGATGAACATGTACAGCCTTCTGACTGAATGGACCCCTACATGTTACAGTGACCACATTCGACTGTATTGTAAGTCATCAAACATATACCACTCAGAGAACGGGTTAATTAACCTCATATTAATTTTTATCACCTATCCTTGTCAACTGAGGCTAATAATCGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 64459 209 + 647215 CATAAAATGCAATGTCTATTGTCCAGGCCTAATTTCTTTTTGCTGCAGTGAACATGTACAGCTTTCTGACTGGATGGATCCCTACATGTTATAACGACCACATTTCGTTGTACTGTAAGTTGTCAAACATATACTGCTCAGAGAATGTATTAATTAACCTCATAGTAATTTTTATCACTCGTCGATGTCAACTGAGACTAATGAGCAGT + +a +s mr.mrrefChr0 69009 35 + 130230 GACATACTGCAAGTCAGGATACCAACCTTAGATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73049 35 + 636262 GACATACTGCAAGTCAGGATACCAACCTTAGATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 64669 35 + 647215 GACACACTGCAACTCAGGATACCAACTGTAAATTC + +a +s mr.mrrefChr0 69044 14 + 130230 AAGATTTATTAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73089 11 + 636262 AAGATTTATTA--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 64704 14 + 647215 AAGATTTATTAATA + +a +s mr.mrrefChr0 69058 30 + 130230 CAGATGCAGGTGCTACACATACTGAAGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73100 13 + 636262 -----------------CATACTGAAGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 64719 30 + 647215 CAGATGCAGGTGCTACACATCCGGAAGAAC + +a +s mr.mrrefChr0 69088 477 + 130230 CCAGGACTTCCTTTACATATTTCATAGGAATGTGGAGTGAGTTGAATCAATCCTCCAAGCTGCATCCTGACTTACTTAAGAACTGGAAGCAAGTATAATATGTGTAGTCCTATCCAGGCATATATATGGTGAACTAACTGAGATCTGATATTAACCTGAAGTTGTTTTTACCAAACCATTTGTGCAACAGACTTTATAAGGTTTACTTGATTATTCAACATAGGGATACTTTCTTGTTTCTCTGCATGTAAGGAACCCAATACTGCTGACCAACTAGTCTTCCCTGACTGGTAATTTCATGATTGTATATTGGGAAGGGAAGACTAATCATTGCCCTATGTTTCTCTTAGGGGTTGCCTAACATCAAAATCCACCCATCTAAATACACCAGGTCTTTATCTACCTCAAATGAATTTATAAGCAAAGTACTGTGCTCAGGTAATTTCACCCCCCCTCATAGCATCCACTGAGCACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73113 459 + 636262 CCAGGACTTCCTTTACATATTTCATAGGAACGTGGAGTGAGTTGAATCAATCCTCCAAGC-GCATCCTGACTTTCTTAGGAACTGGAAGC--------------CAGTCCTATCCAGACATATATATGGTGAACTAACTGAGGTCTGATATTAACCTGAAGTTGTTTTTACCAAGCCGTTTGTGCA---GACTTTTTGAGGTTTACTTGATTATTCAACATAGGCATACTTTCTTGTTTCTCTGCACGTAAGGAACCCAATACTGCTGACCAACTAGTCTTACCTCACTGGTAATTTCACGATTGTATATTGGGAAGGGAAGACTAATCAATGCCCTATGCTTCTCTTAGGGGTTGCCTAACATTGAAATCCACCCATCTAAATACACCAGGTCTTTATCTACCTCAAATGAATTTATAAGCAAAGTACTGTGCTCAGGTAATTTCACCCCCCCTCATAGCATCCACTGAGCACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 64750 469 + 647215 CCAGGGCTTCCTCTGCATATTTCATAGGAATGTGGAGTGAGTTGAATGAATTCTCCAAGCTGCATCCTGACTTACTTAAGAACTGGAAGCAAGTATAATATGTGTAGTCCTATCCAGGCATATATATGATGAACTAACTGAGATCTGATATTAACCTGAAGTTGTCTTTAACCAACCATCTGTGCAACAGACTTTATAAGTTCTATTTGATTATTCAATATGGGGATACTTTCTTGTTTCTTGGCATGTAAGGAACCCAATACCGCTGAGCAACTGGTCTTCCCTGACTGGTAATTTCATGATTGTATATTGGGCTGGGAAGACTATTCATTGCCCTATGTTTCTCTTAGGGGTTGCCTAACATCAAAATTCACCGATCTAAATACACCAGGTCTTTATCTACCTCAAATGAATTTATAAGCAAA--------CTCAGGTAACTTCAACCCCCCTGAGAGCATCCACTGAGTACAGG + +a +s mr.mrrefChr0 69565 33 + 130230 GGAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTACACCGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 73572 33 + 636262 GGAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTGAACAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 65232 33 + 647215 GCAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTACCCCGC + +a +s mr.mrrefChr0 69598 266 + 130230 AAAAAGAAGAGATACACCATCTTTGCTTCTAAGGACTGACAGTGTCCCATGTTTTCAATTTCATTGAGTCTTCAATTTCATTGAGTTGAACTTATCTCCTAAGCCCTATTATGGAGATTATACTTTCAAATTGGAGATTTCACTTTTAAAATGATTGATCAGATCCATAGTTATGACCATATAGTCACATACCTAAACAGAAAGAGCTGTTCAAGAAGTGTGTATGTTTCCTCTCTGAGCGTCACTAATGTTTTAAAGCCTGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562255 234 - 636262 AAAAAGAAGACATACACCATCTTTGCTTCT-AGGACTGAGAGTGTCCCA-------------------TTTTCAATTTCATTGAGTTGAACTTATGTCCTAA--CCTATTATGGAGATTATACTTTCAAATTGGAGATTTTACTTTTAAAATGATTAATCAGATCCATAGTTATGACCATATAGTCAGATATCTAAATAAAAAGAGCTGTTCAAGAAGTGTGTGTGTTTCCTCTCTG----------ATGTTTTAAAGCCTGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65265 264 + 647215 AAAAAGAAGAGATACACCAT-TTCGCTGCTAAGGACTGACAGTGTCCTATGTTTTCAATTTCATTGAGTCTTCAGTTTCATTGAGTTGTAACTATCTCCTAAGCCCTATTATGGAGAGTATACTTTCAAATTGGAGATTTCACTTTTAAAATGATTGAACAGAT-CATAGTGATGACCAGATAGTCACATACCTAAACAGAGAGAGCTGTTCACGAAGTGTGTATGTTTCCTCGCTGAGCGTCACTAATGTTTTAAAGCCTGGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 69864 44 + 130230 AATGAATCTTGCCATGATCGACATAAGCATTCTAAAGCATGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562491 44 - 636262 AATGAATCTTGCCATGATCGACATAAGCATTCTAAAGCATGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 65529 44 + 647215 AATGAATCTTTCCATAATTGACACAACCATCTTAAAGAATGGTA + +a +s mr.mrrefChr0 69908 96 + 130230 CAATAAATATTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATATCTAGTGGTTGTGATAACAGTCCAGGGGGAGGCACCCATCTACTTTATCTAACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562535 96 - 636262 CAATAAATGTTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATACCTAGTGGTTGTGATAACAGTCCAGGGGGAGGCATCCATCTACTTTATCTAACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65581 96 + 647215 TAATAAATATTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATATCTAGTGGTTGTGAGGACACTCAAGGGAGATGCACCCATCTACTTTATCTAGCATT + +a +s mr.mrrefChr0 70004 23 + 130230 TATTTGGTAAGACTCCAGGCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74007 10 + 636262 T-TTGGGTA----AC-------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 65677 23 + 647215 TATTTGGTAAGACTCCAGGCTTA + +a +s mr.mrrefChr0 70027 308 + 130230 CATGCCGTTCAAGTAACCTTACCAGATTTCACAATGATGTTTGAGAGTCAGCTGTTGTAGAGCTTGTCTCATTTATAGCAGATGATCAAGTTGTTTATAGCAGATGATCAAGTGCAAAAGATAGTTATAGGGCCATTATTGGGAGCTACTGCATCTGAATTTTTGAACGTCAACACCATTTGCCAGAGTGATGAGTGCCAAAGAGGAGCAAACCCTTGATATAAGATAGTCTATCAAATCTTTTCTGGACAACTAGATTTTTTCACAATATGCACGATGACAAACCTTTTCTAGTCAAGATTCAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74017 295 + 636262 -------------TAACCCTACCAGATTACACAATGACGTATGGGAATCAGCTATTGTAGAGCTTGTCCCTTTTATAGCAGATGATCAAGTCCTTTATAGCAGATGATCAAGTCCAAGAGATAGCTATAGGGCCATTATTGGGAGCTACTGCATCTGAATTTTTGAACTTCAACACCATCTGCCACAGTGATGAGTGCCAAAGAGAAGCAAACCCTTGATATAAGATAGTCTATCAAATCTTTTCTGGACAACTGCATTTTTTCACAACATGCACGATGACAGACCTTTTCTGGTCAAGATTCAGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65706 289 + 647215 CATGCCGTTCAAGTAACCTTACCAGACCTCACAATGATGTTTGAGAGTCAGCTGTTGTGGTGCTTGTCTCATTTATAGCAGATGATCAAGTTGT-----------------GTGCAAAAGATAGTTATAGGGCCATTATTAGGAGCTACTGCATCTGAATT--TGTACGTCAACACCATTTGCCAGAGTAATGAGTCCCAAAGAGGAGCAAACTCTTGGTATAAAATGGTCTATCGAATCTTGTCTGGACAACTAGATTCTTTCACAATATGCATGATGGCAAACCTTTTCTAGCCAAGATTCAAAGT + +a +s mr.mrrefChr0 70335 177 + 130230 ATACTGGCTCTGGTAAAAGGAGGCTCTTGCCATGCCAAGGAAAAGAAATGTACACATTAACTGTTAACCATTTACAAACACTGACCTAAATTAAATAATGAATGACTGCAGGGTACCATGGATTCAGTGAATCATGCCTGCCCATGGGTAGTGTTAGTATTTCCTTGCTGAAGCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74316 177 + 636262 ATACTGGCTCTGCTAAAAGGACGCTCTTGCCATGCCAAGGAAAAGAAATGTACACATTAACTGTTAACCATTTACAACCACTGACCTAAATTAACTAATGCATGACTGCAGGGTACCCTGGATTCAGTGAATCATGCCTGTCCATGGTTAGTGTTAATATTGCCTTTCTGAAGCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65995 177 + 647215 ATACTGGCTCTGGTGAAAGGAGGCTCTTGCCATGCCAAAAGGAAGAAATGTAAGCATTAACTGTTAACCATTTACAAACGGTAACCTAAATTAAATAATCAGTGACTGCAGGGTACTATAGATTCAGTGAATCTTGCCTGCCCATGGGTATTGTTAGTATTTCCCTGCTGAAGCAAT + +a +s mr.mrrefChr0 70512 1 + 130230 T +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74495 1 + 636262 T +s simRat_chr6.simRat.chr6 66172 1 + 647215 T + +a +s mr.mrrefChr0 70513 5 + 130230 TGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74496 5 + 636262 TCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66179 5 + 647215 TGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 70518 113 + 130230 ATATCCTGACACCTGCTAAGGTGGAGGTGCCCAGGTGGCTAACTTGGCCTATTCCTCTGATTGGGAATGTGCCACTGATTCATGTTTGAGGTCTACATCCAAGCATGTCATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74501 109 + 636262 ATATCCACACACC----AAGGTTAGGGTGCCCAGGTGGCTAACTTGGCCTGTTCCTCTGATTGGGAATGTGCTACTGATACATGTTTGAGGTCTACATCCAAGCATGTCTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 66187 113 + 647215 ATAGCGTGAAACCTGCTAAGGTGGAAGTGCCCAAGTGGCTAACTTGGCCTATTCCTCTGATTGAGAATGTGCCACTGATTCATGTTTGAGGCCTACTTCCAAGCATTTCATAG + +a +s mr.mrrefChr0 70631 36 + 130230 AGCAGGCCCTTGCTTGAAATAGCCTGTGTTGCCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74844 29 + 636262 AGTTGGCCTTTGCTTGA-------TGTGCTTACTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 66300 36 + 647215 AGCAGGTCCTCGCTTGAAATAGCCTGAATTGCCCCC + +a +s mr.mrrefChr0 70667 7 + 130230 TGAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74873 2 + 636262 TG----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 66338 7 + 647215 TGAAACA + +a +s mr.mrrefChr0 70674 21 + 130230 GATGAGCTCATGCAAGTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74875 20 + 636262 -ATAGGCCCCTGCAAGTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66359 21 + 647215 GATGAGCTCAGGCAAGTTGTT + +a +s mr.mrrefChr0 70695 279 + 130230 CAATGCAAAGTAGGATTCTTATTTCTCCTATTGCCAGCAGCCTCCCAGGTGTCTGGCCTAGTTAGGGATATTTATGGGGATGGGTTCACCTGAAAATTTGTAGCCCAAGCACTGCATACACCTCCTTCTAGACCCATAAACTCACCATTAACCCTACCCCCCAAATTGGTTCAGTTGCTCAACCGAACTCAGCTGAACTACAAAAGGTTAAAGCTGATTGAATGATGATAACCTGTGGGTGAGTCCTTTCTTGTTATTCCTCTCTATTTTGATTACAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 74895 279 + 636262 CAATGCAAAGTAGGATTCTTACTTCTCCTATTGCCAGCAGCCACCCAGGCGTGTGGCCTAGTTAGGGATACTTTTGGGGATGGGTTCACCTGAAAATTTGTAGCCCAAGCTTTGCATACACCCCCTTCTAGACCCATAAACTCGCCATTACCCCTACCCCCCAAGTTGGTTTGGTTGCTCAACCAAACCCAGCTGAACTACAAAAGGCTAAAGCTGCTTGAATGATGATGACCTGTGGGTGAGTCCTTTCATGTTATTCCTCTCTATTTTGATTACAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 66400 279 + 647215 CAATGCAGTGTAGGATTCTTATTTTGCCTATTGCCATGAGTCTCCCAGGTGTCTGGCCCCAGTAGGGATATTTATGGGGATGGGGTCACCTGAGAATTTGTAGCCCAAGCACTGCATACACCTCCTTCTAGAGCCATGAACTCACCATTAACCCTACCCCCCAAATTGGTTCAGTTGCTTAACCGAACTCAGCTGAACTACAAATGGTTAAAGTTGATTGAATGATGATAACCTGTGAGTGAGTCCTTTCTTGTTATTCCTCCGTATTTTGATTACAGC + +a +s mr.mrrefChr0 70974 13 + 130230 CAAGGTTCTTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75182 13 + 636262 CAAGGGTCTTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 66679 13 + 647215 CAACGTTTTTTTG + +a +s mr.mrrefChr0 70987 44 + 130230 ACAGCTTTTCAGTAGGAAGCAAGCGCCAAAAAAAACAACTTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75195 44 + 636262 ATAGCTTTTCAGTAGGAAGCAAACGCCAGAAAAAACAACTTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 66693 44 + 647215 ACAGATTTACGATAGGAAGCAAGCACCAAAAAAATCAACTTGTC + +a +s mr.mrrefChr0 71031 15 + 130230 AAGATGGAGTTTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75239 15 + 636262 AAGATGGAGTTTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 66977 15 + 647215 AGGATGGAGCTTTCC + +a +s mr.mrrefChr0 71046 14 + 130230 GTGGCAGGGGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75254 14 + 636262 GTGGCAGGGGATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66994 14 + 647215 GTGGCACAGGAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 71060 268 + 130230 AAAGGGAGGGGTATTTAAGTTTGAACCTGTTTAGGAACCTTTAAGTGGATGAACTTAGTGCTGGGGATTTTCACATAATTTGTTCCCCCATCTGTTGCTATAATTGGTATATCATCAACCACTAGGGAGAGCCTGCTGAAACTTGCAAGTGCATCTCCACCATACTCAATCATTCTTGCCATATAGCAACATGTGATCATTTTGCTGAATGATTTGCTGCCAGCTTGGTTATAAACCTCTAAGAATAATCATCATTGTCTCGCATATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75272 268 + 636262 AAAGGGGGGGGTATTTAGGTTTGAACCTGTTGAGGAATTTTTAAGTGGATGAACTTAGTGCTGGGAATTTTCACATCATTTGTTCCCCCATCTGTTGCTATAATTGGTATATGATCAACCACTAGGGAGAGCCTGCTGAAACTTGCAAGTGCATCTCCACCATACTCAATCATTCTTGCCACATCACATCATGTGATCATGTTGCTGAATAATTTGCTGCCAGTTTGGTTATAAGCCTCTAAGAAAAATCATCATTGTCTCGCATATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 67008 267 + 647215 AAAGGGAAGGGTATTTAAGTTTGAACCTGTTTAGGAACCTTTAAGTGGTTGAACTTAGTGCTGGGGATTTTCACATAATTTGTGCCCCCATCTGTTGCTACAATTGGTATATCATCAACCACTAGGGAGAGCCTACTCTAAGTCGCAGGTGCATCTCCACTATAGTCAGTCATTCTTGGCATATAGCAACATGTGATCATTTTACTGAACGATTTGCTGCCAGCTTTGTTATAAACCT-TAAAAATAATCATCATTGTCTCATGTATC + +a +s mr.mrrefChr0 71328 119 + 130230 TATTGAAGCCTAGTTTTGTATAGATTATTTGTGTGTAGCTGGCTGGAAAAGTGCTCATGACGAAAGAGATATAGAGACTATGTTGTGACTCCTTTGTCAGCTCCAAAACATTATTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75541 119 + 636262 TTTTGAAGCCTAGTTTTGTATAGATTATTTGTGTGTAGCTGGTTGCAAAAGTGCTCATGACGAAGGAGATATAGAGACTATGTAGTGACTCCTTTGTCAGCTCCAAAACATTATGTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 67275 119 + 647215 CATTGAAGCTTGGTTTCTTATAGATTATTTGTGTGTAGTTGGCTGGAAAAGTGCCCATGACACAAGAGATATAGAGACTTTGTTGTGACTCCTTTGTCAGCTCTAAAACATTATTTGAT + +a +s mr.mrrefChr0 71447 29 + 130230 GATCTGCAATGACTTGCTTACCTCTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75660 29 + 636262 GATCTGCAATGACTTGCTTACCTCTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 67427 29 + 647215 GATCTGCAATGACTAGCTTACTTTTGAAT + +a +s mr.mrrefChr0 71476 139 + 130230 TATCAAGACATGGATCAAAGGGGATGAGTGTCCCTTACAGGGCTGTATGAGGCTCTTTTACTCTGGAGAGAATCCCCTCATTATCTGACCAAAATTGGGACATTTGGCTATATTGAGGGACACAATAATCTTGGTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75689 139 + 636262 TATCAAGACATGGATCAAAGGGGACGAGTGTCCCTTACAGGGCTGTATGAGGCTCTCTTACTCTGGAGAGAATCCCCTCATTATCTGACCAAAATTGGGACATTTGGCTATATTGAGGGACACAATAATCTTGGTTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 67460 138 + 647215 TATTAAGACACGGATCAAAGGGGATGGGTGTCCCTTACACAGATGTATTAAGCTGTTTTACTCTGGAG-GAATCCCCTCATTATCTGGCCAAAATTGGTACATGTGGCTATATTGTGGCACACAATAATCTTGGTTGAT + +a +s mr.mrrefChr0 71615 43 + 130230 GGGCTTATATACATCAATTATGGAATGATTGTGCTGCTGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75828 43 + 636262 GGGCTTAAATACATCAATTATGGAATGATTGTACTGCTGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 67761 43 + 647215 GGGCTTATATACATCAATTATGGAATGATTGTGTTGCTGATGT + +a +s mr.mrrefChr0 71658 72 + 130230 TGAGTTTCCCTACAATTAGGGAGCAGGATTACTGAAATGTAGCAGTGCATAAGGCCAACAATTCACAGAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75878 72 + 636262 TGAGTTTCCCTACAATTAGGGAGCAGGATTACTGAAATGTAACAGTGCATAAAGCCAACAATTCACAGAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 67804 72 + 647215 GGAGTTTCCCCACAATTAGGAAGCAGGACTACTGAAATGTAGCAGTGTATAAGGTCAACAATCCCCAGAGAG + +a +s mr.mrrefChr0 71730 116 + 130230 AAAATCCTGTCTCCTAGAACAACAGTAACATTGAGCGTTGCAAATCAAGACAGATGTAAATCAACTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGAAGAACCACAAAGATCCAAGAGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 75950 116 + 636262 AAAATCCTGTCTCCTAGAACAACAGTAATATTGACCGTTGCAAATAGAGATAGATGTAAATCTTCTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGAAGAACCACAAAGATCCAAGAGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 67884 116 + 647215 AAAATCCTGTCCCCTAGAACATCAGTAACATTGAGCATTGCAAAGCAAGACAGATGTAAATCAACTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGATGAACCATAAAGATCAAAGAGGCT + +a +s mr.mrrefChr0 71846 162 + 130230 TTCCCATACTGCCAAAATTATTGATTCCCTTCCTGGTCTCCTGGCAGGGGAGGGATTGAATCTTGCACTGAACAGTTTACAGACCTTTACACTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGAGAAAAGATGAAAGATGGATAGCACAACCGAGTTCTCCTGATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76066 161 + 636262 TTCCCATACTGCCAAAATTATTTATTCCCCTCCTGGTCCCCTGGCAGGGGAGGGATTGA-TCTTGCACTGAACAGTCTGCAGACCTTTACTCTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGAGAAAAGATGAAAGATGGATTGCACAACCGAATTCTCCTGATACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 68001 162 + 647215 TTACTATACTGCCAAAATTAATGATTCCCTTCCTGGTCTTCTGGCAGGGGAGGGGTTGAATCTTGCACTCAACTGTTGATGGACCTTTACACTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGTGAAAAGATGAAAGATGAATAGCACAACCGAGTTCTCCTGATAGC + +a +s mr.mrrefChr0 72008 17 + 130230 TGGCATATCTAGGGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76227 17 + 636262 TGGCATATCTAGGGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 68172 17 + 647215 TGCAAACTGCAGGGTGG + +a +s mr.mrrefChr0 72025 4 + 130230 TATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76244 4 + 636262 CTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 68249 4 + 647215 TACA + +a +s mr.mrrefChr0 72029 15 + 130230 GCTCTAATCCAAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76248 15 + 636262 GGTCCAATCCTAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 68257 15 + 647215 GCGATAATTCAAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 72044 7 + 130230 GGCAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 68286 7 + 647215 GGCAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 184505 7 + 647215 GGCTACC + +a +s mr.mrrefChr0 72051 174 + 130230 TGACATGAGGAACCAATGACTACTTCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAAACACCATGGACCCAGGAAGATTTTGGCCACTATGAACCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76263 174 + 636262 TGACATGAGGAACCAATGACTACTTCTGAGAGACTGTTAAATGCAGCTGGTCAGTTTGACAGCCACACTATTTAATGGGCACACCCTAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTTAAACTTTAGGGAGATGTCAAACACCATGAACCCTGGAGGATTTTAGTCACTATGAACCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 68334 172 + 647215 TGACATGAGGAATTGATGAC--CTTCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTTCTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAAACACGATGGACCCAGGAAGATTTTGGCCACTATGAACCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 184512 155 + 647215 -----------------TGC--GTCCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAGACACTATGGGCCCAGGAAGATTTTGACCACTACGAACCCATA + +a +s mr.mrrefChr0 72225 59 + 130230 GGTAGGCACCCTATCAGTCTAGGAGGCAAGTCCTTCTGCCCTTTGCAGTTGTGCTTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76437 59 + 636262 GGTAGGCACCATATCAGTCTAGGAGGCAAGTCCTTCTGCCCTTTGCAGTTGTGCTTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 68506 59 + 647215 GGTAGGCAGCCTATAAGTTTAAGAGGCAAGTCCTTCTGCCCTTTGCAGTTGTATTTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 184668 10 + 647215 GGTAGGCACC------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 72284 39 + 130230 CATAAGCAAGAAACACCAATTCTCATGAATCAATGCTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76496 39 + 636262 CACAAGCAAGAAACACCAATTCTCATGGATCAATGCTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 68566 39 + 647215 CATAAGAAAGAAACACCAATTATTGTGAATCAATGCTCC + +a +s mr.mrrefChr0 72323 85 + 130230 TCCTAAGAAGAACTGGCAGCAAACCCGATGCCCCTCCCCCAAAGATGACAAGCTGTGGGCCTGGGAATGATACTAACAGGCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76535 78 + 636262 TCCTAAGAAGAACTGGCAGCAAACCAGATGCCCCTCCCCCAAAGATGACAAGCTGTGGGTCTGGGAATGATACTAACC------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 68609 79 + 647215 TTCAGAGGAGAACTGGCAGCAAACCCGATGCCC------CAAAGATGACAAGCTGCAGGCCTGGGAATGATACTAACAGGCCAAA + +a +s mr.mrrefChr0 72408 490 + 130230 TTCATCAGGCCAAAAAGATATGCTCCTACAAACTAGACATAGTGTCCCATGGTAATCAAACATATCACAGTCCTGCTGATCCTCTTTAACATGAGCTGCTTATAATAATCCGTACCATTGTAGAACATCTCTCCCTTTGTTCCACAAAACTCTGCTATTTGCTATTTCTACAAATGTGTGGTGTTATTCACTTAGCATCAAGGCAAAGCTGAAAGTGGGGTATGATGGGTCACTGCCAACAATGCCTATACACATCTGTGTAGAATCTAGCTAATATGCCCACCTAATACAGAGATGGTCATTGTCCCTCATACTCAAACCCACCAAAGCTGAATTACTGCAAGTTAGCTATAAATATGTATGAATTAACTGGTCAGAACACCAAGTCTAGCCAACTTATATAGGTCACAAGTGGACCAAAGACGCAGGATGTAAGACTGGTGGGGGGACCCCTAGTAGGTACCATTGTGGATCTATGGTAAATTAATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 76613 476 + 636262 -------------AAAGATATGCTCCTAGAAACTAGACAGAGTGTCCCATTGTAATTGAACATATTACAGTCCTGCTAATCCTCTTTAACATGACCTGCTTGTCATAATCTGTCCCATTGTAGAACATTTCTCCCTTTGTTCCACAAAACTGTGCTATTTGCTATTTCTACAAATGTGTGGTGTTATTCACTTAGCATCAAGGCAAAGCTGAAAGCGGGGCATGATGGGCCACTGCCAACAATGCTTATACACATCTGTGTAGAATCTAGCTAATATGCCCACCTAATACAGAGATGGTCATTGTCCCTCGTACTCAAACCCATCAAAGCTGGATTACTGCAAGTTAGCTGTAAATATGTATGAATACACTCATCAG-ACACCAAGTCTAGCCAACTTATATAGGTCACAAGTGGACCAAAGACGCAGGATGTAAGACTGGTGGGGGGACCCCTAGTAGGTACCATTGTGGATCTATGGTAAATTAATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 68689 490 + 647215 TTCATCAGGCCAAAAAGATATGCTCCTACAAACTTGACATAGTTTCCCATGGGAATCAAACATATCACAGCCCTTCTGATCCTCTTTGACATGAGCTGCTTATAGTAGTCCGTACCATAGTAGAACATCTCTCACTCTGTTCCACAAAACTCTGCAATTTGCTAGTTCTACAAATGTGTGGTGTTATTTACTCAGTACCGACACGAAGCTGAAAGTGGGGTATGATGAGTCATTGCCAAGAATACCTACACACATCTGTGTAGAATCTAGCTAGCATGTCCACCCAAGACAGAGATGGTCATTGTCCCTCATACTCAAACCAACCAAGGCTGAAGTCCTGCAAGTTAGCTATAAATATGTATTAATTAACTGGTCAGAACACCAAATCTAGTAGCCTTAAATAGGTCACAAATGGACCATACACACAGGATGTCAGACTGATTGGGGGACTCCTAGTAGGTACCATTGTGGACTTATAGTTAATTAATTC + +a +s mr.mrrefChr0 72898 129 + 130230 TTTATGACAGAGATGTGTACTTGTTCACTTCCCCATCATCTCTTACCTAGGATCACTCTGCCCATTTGTCAGCCACACTGTTTACCATCCATGGGCGGTTCTCTTTCCTCTGCGTTATGGGATGGCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77090 129 + 636262 TTTATGACAGAGATGTGTACTTGTTCACTTCCCCATCATCTCTTACCTAGGATCACTCTGCCCATTTGTCAGCCACACTGTTTACCATCCATGGGCGGTTCTCTTTCCTCTGCGTTATGGGATGGCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 69179 129 + 647215 TTCATGACAGAGATGTATACCTGTTCACATCCCCATCATCTCTTGCCTAGCATCTGTCTGCCCATGTGTCAGCCACCCTGTTTACCATCCATGGGAGGTTCTCTTTCTTCTGTGTCTCGGATAGGACCT + +a +s mr.mrrefChr0 73027 33 + 130230 TGGTACCATGGAGCTGATGCTTCTCACACAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77219 33 + 636262 TGGTACCATGGAGCTGATGCTTCTCACACAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 69558 33 + 647215 TGGTACCATGAAGCTGATGATTATCACACAGAG + +a +s mr.mrrefChr0 73060 209 + 130230 TTTGAATCATCTATGAGTTCAACTAATGAAATAACACCTAGTGACAACTGCCCAGCATATCTGTACCACAGTACACTCCAGGTTCATAGGCCTCCATTTCTAGATACTAGAATAATTATGTGaggattgagacttgaggttgatcttattgttcggtgtagttcacatcacacctccagttcagtttcattgctcagatctcaggtccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77254 209 + 636262 TTTGAATCATCTATGAGTTCAACTAATGAAATAACACCTAGTGACAACTGCCCAGCATATCTGTACCACAGTACACTCCAGGTTCATAGGCCTCCATTTCTAGATACTAGAATAATTATGTGaggattgagacttgaggttgatcttattgttcggtgtagttcacatcacacctccagttcagtttcattgctcagatctcaggtccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 69591 209 + 647215 TTTGAATCATGTATGAGTTCAACTAATGGAATAATACCTAGTGACAATTGCCCAGCATATTTGTACCACAGCACACTCCAGGTTCATATGTCTCCATTTCCACATATTAAAACAGTTATGTGaggattgagactccaggttgatctacttgcttggtgtagttcacataacacctccagtttagtttcgtggctcagatctcaggtcCC + +a +s mr.mrrefChr0 73269 169 + 130230 ccagactgaaggctgcttggatatcaagaaggaagtttggagttgttacaaaatacccttgtagtgtctcatcttcaagacttaatatacaccaaatagaagacttttacggtatgagcactggggggtgggcaaacagcttcaggatcgccaccccaaccaagtgcca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77463 169 + 636262 ccagactgaaggctgcttggatatcaagaaggaagtttggagttgttacaaaatacccttgtagtgtctcatcttcaagacttaatatacaccaaatagaagacttttacggtatgagcactggggggtgggcaaacagcttcaggatcgccaccccaaccaagtgcca +s simRat_chr6.simRat.chr6 69804 169 + 647215 CCGGACTGAAGGCTGCTGGGATATCAAGAAGGATGTTCAGAGTTGTTACAAAATACCCGTGCAGTGTCTCAGCTTTAAGACTTAACATACACCAAATAAaagacttttatggtatgagcagtgaggagtgggcaaacaccttcaggattgccacaccatctaagtgcta + +a +s mr.mrrefChr0 73438 43 + 130230 gcattctttaagtagactgactatagacagaatgcagtggtgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77632 43 + 636262 gcattctttaagtagactgactatagacagaatgcagtggtgt +s simRat_chr6.simRat.chr6 69975 43 + 647215 gtattctttaagtagactgattatagacaagatgcagtgatgt + +a +s mr.mrrefChr0 73481 31 + 130230 aacttcacaaacacaaTGTCCCCTCCAAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77675 31 + 636262 aacttcacaaacacaaTGTCCCCTCCAAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 70024 31 + 647215 aacttcacaaacacgaTGTCCCCTCCAAGTC + +a +s mr.mrrefChr0 73512 19 + 130230 TGGAAAGTTGCTTGAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77751 19 + 636262 TGGAAAGTTGCTTGAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 70055 19 + 647215 TGGAAAGTTAGTTGAATCA + +a +s mr.mrrefChr0 73531 108 + 130230 CCTGCTTGGTTCTCAAATAGTACTGTAAGGTTGCCTGCTATTATTCGGTCTTACAATGCTGTGGAATTGTTACCCTACTGGGGATTGCTTTTTTAGATTCTATTGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77770 108 + 636262 CCTGCTTGGTTCTCAAATAGTACTGTAAGGTTGCCTGCTATTATTCGGTCTTACAATGCTGTGGAATTGTTACCCTACTGGGGATTGCTTTTTTAGATTCTATTGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 70075 108 + 647215 CCAGTATGATTCTAAAACAGTAATGTAAGGGTGCCTTCTACTATTTTGTTCTACAATGCTATGGAATTGCTACCCTAGTGGGGATTGCTTTTTTAAGTTCTCAGGCTA + +a +s mr.mrrefChr0 73639 29 + 130230 TAATATTACAACATCAGGTGTTGGAAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77879 29 + 636262 TAATATTACAACATCAGGTGTTGGAAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 70183 29 + 647215 CAATATTACAACCTCAGGTGTTGGAAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 73668 18 + 130230 AAAGGGTGAGGTGACGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77914 18 + 636262 AAAGGGTGAGGTGACGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 70212 18 + 647215 AAAGGGTGAGATGATGGG + +a +s mr.mrrefChr0 73686 72 + 130230 TGGACTAGTTCCAGGAAATCCCCTTTCTGTGTGTGTGTGGCATGCTGATTGACTGCTTTTTTCTGTCTGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 77932 72 + 636262 TGGACTAGTTCCAGGAAATCCCCTTTCTGTGTGTGTGTGGCATGCTGATTGACTGCTTTTTTCTGTCTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 70231 72 + 647215 TGAACTGGTTCCAGGAATCCCACTTTATGTGTGTGTGGGCCCTGCTGGTTGACTGCTCTTTTCTATCTGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 73758 41 + 130230 CTAGATACCTATGTATCAGATTTTATGCACTATCAGCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78004 41 + 636262 CTAGATACCTATGTATCAGATTTTATGCACTATCAGCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 70349 41 + 647215 CTAGATATCTATGTATCAGATTTGATGCACCCTCACAATAC + +a +s mr.mrrefChr0 73799 20 + 130230 TCTATGCACTATCAGCAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78045 20 + 636262 TCTATGCACTATCAGCAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 70391 20 + 647215 TCTACCCAATGACAGTAAGC + +a +s mr.mrrefChr0 73819 135 + 130230 CATCTACCCAATGATAATAAATAAGCTGCAACAGGCAGGAAGGTGGCCTGTCCAAATAACAAATAAGCCTTCACACAATCCATCATGCTCAGCTCCAATATAAGGCAGATGTGGCCATGTACATGTGGTAGGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78065 135 + 636262 CATCTACCCAATGATAATAAATAAGCTGCAACAGGCAGGAAGGTGGCCTGTCCAAATAACAAATAAGCCTTCACACAATCCATCATGCTCAGCTCCAATATAAGGCAGATGTGGCCATGTACATGTGGTAGGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 70415 135 + 647215 CATCTACCCAATGACAATAAATAAACTGCAACAGGCCGGAAGGTGGCCTGTCTAAATAACAAGCAAGCTTTCACACAATGCATCATGCCAAGCTCCATTACAAGGCAAACATGGTCATGTACATGTGGTAAGTAC + +a +s mr.mrrefChr0 73954 62 + 130230 TCGGCTCTGAGCTCCTCAGGTGGCCAATCACCATCTAGCTTCAGTGCAAATTCTAGTTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78201 62 + 636262 TCGGCTCTGAGCTCCTCAGGTGGCCAATCACCATCTAGCTTCAGTGCAAATTCTAGTTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 70550 62 + 647215 TTGGCTCTGAGCCCCTCAGGTGGCCAATCACCATCTAGCTTCAGGGCAAATTCTAGCTAAGT + +a +s mr.mrrefChr0 74016 79 + 130230 GATAGCACCCCCCATTTGGATCCAGGGACTAGTGGGCAGTTAATCTTTTGCTCTAGCCCATGCGTATCAATAATTAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78294 79 + 636262 GATAGCACCCCCCATTTGGATCCAGGGACTAGTGGGCAGTTAATCTTTTGCTCTAGCCCATGCGTATCAATAATTAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 70612 79 + 647215 TATAGCACCCCCCATTTGGATCCAGGCACAAAAGGGGAGTTTGTCTCTTGCTCTAGCCCATGTGTATCGAAAATTGGAA + +a +s mr.mrrefChr0 74095 40 + 130230 TGCTTCCATGGGCATCACAAATTATAAGACAAGTAGTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78432 40 + 636262 CACTCCCATGGGCATCACAAATTATAAGACAAGTAATAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 70691 40 + 647215 TGCTTCCATGGGCATCACAGATTAGAAGACAAGTAGTAGA + +a +s mr.mrrefChr0 74135 41 + 130230 ACTTATCTTGCCTGGATACACTTAAACAACTAGCACTCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78472 27 + 636262 ACTTATCTTGCCT--CTACCCTAAAAAAA------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 70751 41 + 647215 ACTTATCTTGCCTGGATACAGTTAGACAACTAGCACTCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 74176 88 + 130230 AAAAAAAGCCCAAACCAAAAAAAGCTTAAAGGTAGTTATGTAGCTGTCAACAAGCACCTTTGGGCGAAGTGGTAAACCATGTTAACGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78499 88 + 636262 AAAAAAAGCCCAAGCCAAAAAAAGCTTAAAGGTAGTTATGTAGCTCTCAACAAGCACCTTTGGGCGAAGTGGTAAACCATGTTAACGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 70795 88 + 647215 AAAAAAAGCCAAAACCAAAAAAAGCTTAAAGGTAGTTATGCAGCTGTCAACAAGCAACTGTGGTGAAAGTGGTAAACCATGTTAGCAA + +a +s mr.mrrefChr0 74264 42 + 130230 CAGCAGAGTTTGGTCCGGGTCTGTGCAGGGAAAGAATTGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78592 42 + 636262 CAGCAGAGTTTGGTCCGGGTCTGTGCAGGGAAAGAATTGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 70883 42 + 647215 CAGTAGAGTTTGGTTGGGGTGTGTGGAGGGAAAGAATTGCCG + +a +s mr.mrrefChr0 74306 330 + 130230 CTTAGACCAGAGTTTATCACATGCTAGCTCTGAGTAGCTTTGGTGCCTAGTCTGTGTCGAATGGCAATTCCCACCATATCATTGTTGCACTTATGCTGTTTTCATACATTCTTTGTACATCTTATGCCACATAAATTTTTAGCTTGCTCACTATCTAGTATATACAGTTTTATACCAACCGATAACAGCTGTTTCTTTGAGACCAGTGCTTTTGGAAGCCTTTCATTTATAATGTGGGTACATGTGAGGTGGATTTCTTATCACTTTGCAGTTTTTGTAGCTTGTATCATTTTCATAACATTAATTACATCATCTTAAAGTTTATACAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78635 325 + 636262 CTTAGACCAAAGTTTATCACATGCTAGCT----GTAGCCTTGGTGCCTAGTCTGTGTGGAATGGCAAT-CCCACCATATCATTGTTGCACTGATGCTGTTTTCATATATTCTTTGTACATCCTATGCAACATAAATTTTTAGTTTGCTCACTATCTAGTATATACAGTCTTACACCAACCGATAACAGCTGTTTCTTTGAGACCAGTGCTTTTGGAAGCCTTTCATTTATAATGTGGGTACAAGTAAGGTGCATTTCTCATCACTTTGCAGTTTTTGTAGCTTATATCATTTTCATAACATTAATTACATCATCTTAAAGTTTATACAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 70925 330 + 647215 CTTAGACCAGAGTTTACCACATGCTAACTCTGAGTAGCTTTGGTGCCTAGCCTATGTCTAATGGCGTTTCCTACCATATCATTTTTGCACTTATGCTATTTTCATACATTCTTTGTACATCTTATGCCACACAAATTTTTAGCTTGTCTACTATCTAATATATACAGTTTTATACCAAACGATGACAGCTGTTTCTGTGAGACCAGTGTTTTTGGAAGCCTTTCATTTGTAATGTGGGTACATGTGGGATGGATTTCTTATCACTTTGCAGTTTTTGTCACATGTACCATTTTCTTGGCCTTAATTACATCATCTTTAGGTTTATACAAT + +a +s mr.mrrefChr0 74636 47 + 130230 ATGATGTTTTAACAGGCTGGCGTTGGCTTCGGCTTATGTCTAAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 78961 47 + 636262 ATGATGTTTTAACAGGCTGGCGTTGGCTTCGGCTTATGTCTAAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 71255 47 + 647215 ATGATGTTTTAACAGGCTGGCCTTGGCTTCAGCTTACATCTAAATGT + +a +s mr.mrrefChr0 74683 380 + 130230 TTTATGTGTCTTCAAGCACCTATGTGGACAGTACTGACATTGCTTCACTGCCTGCTTCCTATATATGTATATTTCTTTTAGGTGTTTACATCCTGTCATCACAAAGCGCCACACTGATTACTTATTTCTAAAACACTAGCAATGGCTCCACCTACAACTTTTCTACTTTTTACTGCTAACTCTATCATCTGGGCTTTGTTAAACTCAACATGTGTTCTTTGCTTGTTGGCTTACTCTAAAAGGCTGAAATCATTGTGGCTATGTATGTGTTAAATCCATATCAGGGCTTCATACATCTGGGCCTCCCTTGTTTTGGTAGAACTCTGACACTCTCCATGATATACCGAACAGACTTGTTTCAATGAATGTTAGTCTCAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 79008 363 + 636262 -----------------ACCTGTGTGGACAGTACTGACATTGCTTCACTGCCTGCTTCCTAAATATGTATATTTCTTTTAGGTGTTTACATCCTCTCATCACACAGCGCCACACTGGTTACTTACTTCTAAAACACTAGCGATGGCTCCACCTACAACTTTTCTACTTTTTACTCCTAACTCTATCATCTGGGCTTTGTTAAACTCAACATGTGTTCTTTGCTTGCTGGCTTACTCTAAAAGGCTGAAACAGTTATGTCTATGTATGTGTTAAATCCATATCAGGGCTTCATACATCTGGGCCCCCCTTGTTTTGGCAGAACTCTGACTCTCCCCATGATATACCGAACAGACTTGTTTCAATGAATGTTAATCTCAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 71304 370 + 647215 TTTATGTGTCTTCAAGCACCCACGTGGACAGTACTGACATTGCT-CACTGCCTGCTTTCTATATATGTATAATTCTTTTAGGTGTTTACATCCTGTCATCACAAAGGGGCACACTAATTACTTATTTTTAAAACACTAGCAACGGCTCCACCTAGAACTTTTCTACTTTGTACTGCTAACTCTATCAGCTGGGCTTTGTTAAACTCAGC---------TTGCTTGTTGGCTTACTCTAAAAGGCTGTAATCATTGTGGCTTTGTATGTGTTAAATCCATATCAGGGCTTCATACATTTCGGCCTCCCTTGTTTTGGTAGAGCTCTGGCAATATCCATGTGATACCCAACGGGCTTGTCTCAACGAATGTTAGTCTCAGCT + +a +s mr.mrrefChr0 75063 20 + 130230 AAGAGGCTGGTTTCTGAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 79372 20 + 636262 AAGAGGCTGGTTTCTGAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 71674 20 + 647215 AAGAGGCTGGTTTCTGAGAG + +a +s mr.mrrefChr0 75083 567 + 130230 AATTGGCAGACTATACCATTGTGATTCTTAATTACACATCCTGGGACCTCCCTATCTGTGTTGGAGTTTGTCAGATTGTGACCTTTAACAGCAACGGAGAGCAACTTTACTGCTCAGCACTCAGATTTAATTAGTGTTTATTACAGTTGTGCCTGCCTTGGAATCTACACCTATCATTCTCTCTAACTGAAGAAGCAAAATCTGATCACCACATTTCAGCATTATCTCTCCCACTCTGCGCACTCTCTGAGTCTTATTGTGAAGGGCCAATAGAGTTTTAGATCAACGAACCTCTAGCCCAATGCACCCGAGCATTTATGAATACGGCCGTCTGTGTATTCTGTACTTCCAATCCTGGACACCAGATGTCTCTTCAGTACAGGAAATGATAGTGGTTCTAAAAAGTTTGTGATTACAGTGATTTCTACTCTAGTGTTCTTTAGCAACTAAGTGCACAATTTTTGTTTTTAAGTTGAAAGTTGAGAAGTTGATGCGCCTTGGAAATCTGAGAACCTTTCCCTCCCACTGGGATTTGAGTACATAAATCTGACACGTTCCATTCTCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 79393 566 + 636262 AATTGGCAGATTATACCATTGTGGTTCTTAATTACACATCCTGGGACCTTCCTATCTGTGTTGGAGTATGTCAGATTATGACTTTTAACAGCAACGGAGGGCAACTTTACTGTTCAGCACTCAGATTTAATTAGTATTTATTGCAGTTGTGCCTGCTTTGGAATCTACTCCTGTCATTCTTTCTA-CTGAAGAAGCAAAATCTGACCAATGCCCTCAAGCATTATCTCCCCCACTCTTCGCACTCTCTGGGTCTTATTGTGAAGGGCCAGTAGAGTTTTAAATCAACGAACCTCTAGCCCAATGCACCCGAACATTTATGAATACGGCCGTTTGTGTATTCTGTACTTCCCATCCTGGACACCAGATGTCTCTTCAGTACAGGAAATGATAGTGGTTCTAAAAAGTTTGTGATTACAGCGATTTCTACTTTCATGTTCTTTAGCAACTAAGTGCACAATTTTCGTTTTTAAGTTGAAAGTTTAGAAGTTGATGTGCCTTGGACATCTGAGAATCTTGCCCTCCCACTGGGATTTGAGTACATAAATCTGACACGTTCCATTCTCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 71694 539 + 647215 AATTGACAGACTATACCATTGTGATCCTTAATTACACATCCTGGGACCTCCCTATCTGTGTTGGAGTTTGTCAAAGTGTTACCTTTCACAGCAATGGGGAGCAACTTTACTGCTCAGCAATCTGATTTAATTAGTGTTTATTACAGTTGTGCCTGCCTTGAAATCTACACCTAGCGTTCCCTCTAACTGAAGAAGCAAAGTCTGATCACCACATTTCACCATTATCTCTCCCACTCTGAGTACCCTCTGAGTCTTGTTGGGAAGGGC--ATAAAGTTTCAGATCAATGAAC------------------AAGCATTTATGAATAGGGCCATCTGTGTATTCTGTACTTCCAATGCTGGACCATAGATGTCTCTTCAGTACA-----TGATATTGGTTCTAAAAAGTTTGTGATTACAGTGATTTCTACTCTAGTGTTCCTTCACAACTAAGTGCA---TCTTTGTTTTTAAGTTGAAAGTTGAGAAGTTGATGCGCCTTAGAAGTCTGATGACCTTTCCCTCCCACTGGAATTCGAGCACATAAACCTGAGACATTCCATCCTCTCT + +a +s mr.mrrefChr0 75650 536 + 130230 TCAACGATCACAATCTGTGTTACTTCTAGGACACTACAGCCTGGCAAGTATTCTGCCCATCTTGAGATAATCTGTAAAAATTCCATAAGATGTCTGAATTATCTTAGATTTGCGAGAAGAGATGACTTGGTATAGAGAAGAGGGATCAGATGCCTCCTGCCAGTGGGTGGTTGGCCACCATGCAGGATCTTACCTCTAGCACTTGTGGGGCATTTCAGTACTGACGGTTTCCCTAATGAATGAAAGCACAAATCAATAATAAAGTGACCTGTCTTAATAATCATTGAAATACATTGTGTTATAGTTATTCCACATACATATGATTGGTATGAACACTATAAGGGTGGCATAAACTAAGATGTTCTACCTGACATCTTAAATCTCCCTATGAGATAACAGAATAATGAGTAGAGGCATCCCCATCCAAACATGCTCATTACATGAAAGATGGGGGAACGCTCCTTTTATTCATGCAATGGCACAATGAATCGAATAGGCTCTGGATTCTCAGTTGCACAATGATGATTGGTGTCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 79959 531 + 636262 ----CAATCACAATCTGTGTTACTTCTAGGACACTACAGCCTGGCAAGTATTCTGCCCATCTTGAGATAATCTGTAAAAATTCCATAAGGTGTCTGAATTATCTTAGATTTCCGAGAAAAGATGACTTGGTATAGAGAAGAGGGATCAGATGCCTCCAGCCAGTGGGTGGTTGGCCACCATGTAGGATCTTACCTCTAGTACTTGTGGGGCATTTCAGTACTGATGGTTTCCCTAATGAATGAGAGCACAAATCAATAATAAAGTGACCTGTCTCGATAATCATTAAAATACACTGTGTTATAGTTATTCCACATACATATGATTACTAGGAACACTTTAAGGATGGCATAAACTAAGATGTTCTACCTGACATCTTAAATCTCCCTATGAGATAACAGAATACTGAGTAGAGGCATCCC-ATCCAAACATGCTCATTACATGAAAGATGGGGGATCGCTCCTTCTATTCCTGCAATGGCACAATGGATCGAATAGGCTCTGGGTTCTCAGTTGCACAATGACGATTGGTGTCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 72239 536 + 647215 TCAATGATCACAATCCGTTTTACTTCTAGGACACTACAGCCCGGCAAGTATTCTGCCCATCTTGAAATAATCTGTAAAAGTTCCATAAGACGTCTGAATTATCTTAGATTTGCAAGGAGAGATGACTTGGTATAGAGAAGGAGGATCAGATGCCTCCTGCCAGTGGGTGGCTGGCTACCGTGCAGGATCCTACCTCCAGCTCTTTTGGGGCATTTCAATACTGACAGTTCCTCTAATGAATGAAAGCACAAATCACTAATAAAGTGACCTGTCTTAATAATCATTGAAATAGATTGTGTTATAATTATTCTACATACATATGATTGGTATCAATGCTATAAGGGTGGCATAAACTAAGACGTTCTACCTGACATCTCAGATCTCCCTCAGAGCTAACAGAATAATGAGTAGAGGCATCCCCATCAAAACATGCTCATTACATGAAAGATTGGGGAAGGCTCCTTTTATTCATGCAATGGTGTTGTGAATTGAATAGGCTCTGGATTCTCAGTTGCACAATGATGATTGGTGTTATT + +a +s mr.mrrefChr0 76186 120 + 130230 AAGGTCCAATTAGTGTGGCTACAAATTGACATGAGTGAACATTATGAAAAATTATCTTGTTTGTTCACCATCCATAACATTGCAGGCAATACTACAAATTGTAGTTTTACCTACCTTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80490 120 + 636262 ACGGTCCAATTAGTGTGGCTACAAATTGACATGAGTGAACATTATGAAAAATTATCTTGTTTGTTCACCATCCATAACATTGCAGGCAATACTACAAATTGTAGTTTTACCTACCTTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 72776 120 + 647215 AAGGTCCAATTTGTGTGGCTACAAATTGACACGAGTGAGCATTATAATAAATTTTCTAGTTTGTTTATCATCCATAAAATTGCAAGCAATACCTCAGATTTCAGTTTTATCTACCTCCTT + +a +s mr.mrrefChr0 76306 7 + 130230 ATCTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80611 7 + 636262 ATCTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 72896 7 + 647215 ATCTGTT + +a +s mr.mrrefChr0 76313 5 + 130230 CTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80627 5 + 636262 CTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 72903 5 + 647215 CTAAC + +a +s mr.mrrefChr0 76318 42 + 130230 CATTATATGTAATGCAGCCAGGATTCATCTGCATCTTCTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80633 42 + 636262 CATTATATGTAATGCAGCCAGGATTCATCTGCATCTTCTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 72908 42 + 647215 CATTATCTGTAATTAAACCAAGATTCATTTTCATCTTGTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 76360 85 + 130230 TACGTGGCCCCACTTGATATGCCCTCCTAAACATGGCCCCACCTGAGGTCTCCTCCCAATTTTTTTGGGACTCAGGACCCCATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80675 85 + 636262 TACGTGGCCCCACTTGATATGCCCTCCTAAACATGGCCCCACCTGAGGTCTCCTCCCAATTTTTTTGGGACTCAGGACCCCATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 72951 85 + 647215 CACATGGCCCCACCTGATGCGCTCCCCCAAACATGGCCCGACCTGAGGTGCCCTCCCAATTTTTTTCAGACTCAGGACTGCATAA + +a +s mr.mrrefChr0 76445 9 + 130230 AGAACAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80763 9 + 636262 AGAACAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 73036 9 + 647215 GGAACAACC + +a +s mr.mrrefChr0 76454 69 + 130230 TTGTGTCTTCTGTTCCAGCGGATTAATGGGGTTGGTGAGTCTGCAGAACTCTGGATAAGGCTATCCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80773 69 + 636262 TTGTGTCTTCTGTTCCAGCGGATTAATGGGGTTGGTGAGTCTGCAGAACTCTGGATAAGGCTATCCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 73045 69 + 647215 TTGTGTCTTTTGTTCCATTGGATTAATGGGGTTGGTGAATCTACAGAACTCTGCATAAAGCTATCCTTT + +a +s mr.mrrefChr0 76523 89 + 130230 CTGTTGTTGGGAACTAGGCTCTGGATTCTCGGTTATACAATGAATTAGATTTGGTACTCTTAACAGTCCAGTCAGTGTGGCTATAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80849 89 + 636262 CTGTTGTTGGGAACTAGGCTCTGGATTCTCGGTTATACAATGAATTAGATTTGGTACTCTTAACAGTCCAGTCAGTGTGGCTATAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 73114 89 + 647215 GTGTTGTTGGAAACAAGGCTCTGGATTCTCAGTTACACAATGAATTAGATTTGGTATTCTTAACAGTCCAATCAGTGTGGCTATAAACT + +a +s mr.mrrefChr0 76612 111 + 130230 GAATGAGCATATTCTCCTGTTTGTTTATCATCCATAAAATTGCGGGCAATTCTACAGATTTCAGTTTGACATATCTCCTTATCTGTAATTCAGTCAAGATTCATCTGCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 80938 111 + 636262 GAATGAGCATATTCTCCTGTTTGTTTATCATCCATAAAATTGCGGGCAATTCTACAGATTTCAGTTTGACATATCTCCTTATCTGTAATTCAGTCAAGATTCATCTGCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 73208 111 + 647215 GAGTGATCATATTATCCTGTTTGTTTGCCATCAATAACATTGCAGGCAATACCACAGATTTCAGTTTGACCTATCTCCTTATCTGTAATTCAGTCAAGACTTGTCTGCATC + +a +s mr.mrrefChr0 76723 40 + 130230 GTAAATGCCCCATATGGCCCCACCTTATGTGCCCTCCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81051 40 + 636262 GTAAATGCCCCATATGGCCCCACCTTATGTGCCCTCCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 73319 40 + 647215 ATAAATGCCTCACATGGCCCCACCTTATGTGCCTTCCCAA + +a +s mr.mrrefChr0 76763 47 + 130230 TCTGCTCTCCCAATTTATTTGCCCTCCCAATTTATTTCGGACTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81091 47 + 636262 TCTGCTCTCCCAATTTATTTGCCCTCCCAATTTATTTCGGACTCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 73360 47 + 647215 TCTGCCCACCCAATTTATTTGACCTCACAATTTATTTGGGACTCAGG + +a +s mr.mrrefChr0 76810 86 + 130230 TAGAGGACAACCTTCTGTCTTCTGTTCCAGAGGATTATTGGGGCTGGACTCTATAGAACTCTGGATAAGGCCACTCTGACAACTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81138 86 + 636262 TAGAGGACAACCTTCTGTCTTCTGTTCCAGAGGATTATTGGGGCTGGACTCTATAGAACTCTGGATAAGGCCACTCTGACAACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 73413 86 + 647215 TAGAGGACAACCTTCTGTCTTCTGTTCCAGAGGATTATTGGAGCTGGACTCTTCAGAACTCTGTATAAGGCTATCCTGACAACTCA + +a +s mr.mrrefChr0 76896 24 + 130230 CTTCTCTCATCTTGTGTTGATGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81224 24 + 636262 CTTCTCTCATCTTGTGTTGATGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 73500 24 + 647215 TTTCCCTCATTTTGTGTTGTTGGA + +a +s mr.mrrefChr0 76920 21 + 130230 TCCTCTTGAGCCACCCAAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81249 21 + 636262 TCCTCTTGAGCCACCCAAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 73524 21 + 647215 TCCTCTTGAGCCACCTAAAGG + +a +s mr.mrrefChr0 76941 6 + 130230 TATCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81270 6 + 636262 TATCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 616153 6 - 647215 TGACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 73545 6 + 647215 TATCAG + +a +s mr.mrrefChr0 76947 72 + 130230 ATTGTATTACTATGATCATCTCCAAACTTTCAGGCACACCTTGCCTCTAGCCCAGAATAGCTACCTCAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81276 72 + 636262 ATTGTATTACTAAGATCATCTCCAAACTTTGAGGCAGACCTTGCCTCTAGTCCAGAATAGCTACCTCAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 616162 72 - 647215 ACTGTATTACTATGATCATCTCAAAACTTTCAGGCACACTTTGCCTCTAGCCCAGAATAGCTACCTCAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 73551 72 + 647215 ATTGTATTACTATGATCATCTCCAAACTTTCAGGCACACCTTGTCTCTAGCCCAGAATAGCTACCTTAATTT + +a +s mr.mrrefChr0 77019 29 + 130230 TGATCTGTGTATGTATACATATTGCTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81350 29 + 636262 TGATCTGTGTGTGTATACACATTGTTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 616234 29 - 647215 TGATCTGTCTATGTATACATATTGCTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 73623 29 + 647215 TGATCTGTGTATGTATACCTATTGCTCTT + +a +s mr.mrrefChr0 77048 1 + 130230 C +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81379 1 + 636262 C +s simRat_chr6.simRat.chr6 73652 1 + 647215 C + +a +s mr.mrrefChr0 77049 3 + 130230 ACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81380 3 + 636262 GTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 616263 3 - 647215 ACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 73653 3 + 647215 ACT + +a +s mr.mrrefChr0 77052 56 + 130230 CTAACCATGTTCCTTAACCTAACCTGGAACAGTTGAATTTTACTTATAGTGGACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81383 56 + 636262 CTAACCATGTTCCTTAACCTAACCTGGAACAGTTGAATTTTACTTATAGTGGACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 73656 56 + 647215 CTAACCATGTTGTTCAACTTAACCTGGGACCGTTGAATTGTATGCATAATGCACTG + +a +s mr.mrrefChr0 77108 73 + 130230 TAATCGTTGAACGGGTTACTATGAGGTGCTCTTTCTTCCTCTTGAGTATTATGTGGTCCATATCCAACTGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81444 73 + 636262 TAATCGTTGAACGGGTTACTATGAGGTGCTCTTTCTTCCTCTTGAGTATTATGTGGTCCATATCCAACTGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 73712 73 + 647215 TAATCATTGATCAGATTACTCCAAAGCGCTCCCTCTTCCTGTTGATTAAAATGTGGACCATATCGAATTGCTT + +a +s mr.mrrefChr0 77181 146 + 130230 CTGTAGTCAAGAGCGGATTATGAATTTGTGGGGCCAGCCACACTCCCCTAAAATAAACTCTTATCTACTATAGACTTGTGCACCTATTAAGACTTGTGCCATTATTATTTACCATTTAAGGATGTTATAACCTAAGCGCTGTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81605 143 + 636262 CTGTAGTCAAGAGCGGATTATGAATTTGTGG---CAGCCACACTCCCCTAAAATAAATTCCTATCTATTATAAACTTGTGCACCTATTAAGACTTGTGCCATTATTATTTACCATTTAAGGATGTTATAATCTAAGCGCTGTGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 73785 146 + 647215 TGGTAGCCAACAATAGATTTTGAATCTGCTGGGCCAGCCACGTCCCCTGAAAATAAACTCTTACCTACTATAGATTTGTGCACTTATTAAGACTTGTGCCATTATTATTTACCATTTAAAGATGTTATAACCTATGCGCTGTGGCA + +a +s mr.mrrefChr0 77327 67 + 130230 TGTCTGTTAGAACCTAATGTGGGATAACTGGTGCCAAGGTCAGTTCAGACTCAGCATGCAAACATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81755 67 + 636262 TGTCTGTTAGAACCTAATGTAGGATAACTGGTGCCAAGGTCAGTTCAGACTCAGCATGCAAACATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 73931 67 + 647215 TGTCTGTTAGGATCTAATGTGGGATAACTGGTGCCAAGGTCACTTCAGACTCAGCCTGGAAATGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 77394 19 + 130230 GACTTCTATAAACTCTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81822 19 + 636262 GACTTCTATAAACTCTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 73999 19 + 647215 GACTTCTATAAATTCTATA + +a +s mr.mrrefChr0 77413 51 + 130230 AGGTTTGTCATTTTCTACATGTGGCACACTAGTGATTTGCACTTCTCTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81841 50 + 636262 AGGTTTGTCATTTTCTACATATGG-ACACTAGTGATTTGTACTTCTCTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 74019 51 + 647215 ATGTTTGTCATTCTCTACATGTGGCACACTAATGATTTGCACTTTTCTTGT + +a +s mr.mrrefChr0 77464 42 + 130230 GCTCATGGTATGTTTGGGTGGGGAGTTCACAAGATTCTCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81908 42 + 636262 GCTCATGGTATGTTTGGGTGGGGAGTTCACAGGATTCTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 74070 42 + 647215 GCTCATGGTATGATTGGGTGGTGAGTTCACAAGTTTCTCTGT + +a +s mr.mrrefChr0 77506 101 + 130230 GAAAAATCCATCCTAGTTTGCTGATGCCAGTGTTAATGAGGGAAATTTGACTTTTGTATAAGATCGGTGTGTGTTGTTTCTGCAAACCAGGGTTTATGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 81950 101 + 636262 GAAAAATCCATCCTAGTTAGCTGATGCCAGTGTTAATGAGGGAAATTTGACTTTGGTGTAAGATCGGTGTATGTTGTTTCTACAAACCAGGGATTATGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 74113 101 + 647215 GAAAAACCCATCCTAGTTTGCTGATGCCAGCGCTAATGAGGGAAATTTAGCTTTTGTATAAGATCAGTGTGTATTATTTCTGCAAATCAAGGTTTATGACT + +a +s mr.mrrefChr0 77607 110 + 130230 ACAATCCTCCCATACAATCTGTTGAATTTCCACTAACATTAGTGGTGACTTTAAGGCTGCTGAGTTTAATACCTCACGTTAATTTTAGAGGCGTTTTAATTACAGTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82054 110 + 636262 ACAATCCTCCCATACAATCTGTTGAATTTCCACTAGCATTAGTGGTGACTTTAAGGCTGCTGAGTTTAATACCTAACGTTAATTTTAGAAGCGTTTTAATTACAGTAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 74214 110 + 647215 ATACTCCTCCCATACAATCTGTTGAATTTTCACTTACATTAGTACTGACTCTAAGGCCACTGAGTTTAATACCTCAAGTTAATTTTAGAGGCATTTTAATTATAGTAACT + +a +s mr.mrrefChr0 77717 158 + 130230 AGCTACAGAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCTGACACAATTTTGATAATTGTAAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATAGATGGCAATGGTGGGGTATAACCATGTCTTGTTAATATGGGTTTGTCCAGCCCATTAAGTATAGTCAATGTAAGGGGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82164 158 + 636262 AACTATAGAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCTGATACAATTTTGATAATTGTCAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATAGATGGCAATGTTGGGGTATAACCATGTCTTGTTAATATGGGTTTGTCAAGCCCATTAAGTATAGTCAATGTAAGGGGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 74387 158 + 647215 AGCTACAAAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCGGACTCAATTCTGAGAATCGTAAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATATATGACAATGGTGGGGTATAACCATGTCTTGATAATATAGGTTTGTCCAGCCTGTCAAGTATAGTCAATGTAAGGGGGC + +a +s mr.mrrefChr0 77875 301 + 130230 TGTGATGAACAGGTTATGATCTATATGTTAATGATCTAGAAGAAGCATGTTACCAAATACTGCCATCGCATTCAGATCCATAAATAGACATCTAGGGCAAAGCACATATTACTTTTTAACCATGCCACATATCTTTCCTTAACCTGAGTATCCAGCATATAATAATGGGAACATTAATCAAAGCTACTTGGGTACCTAAGGTGATCGGTCTGCATGCTCAAATTCTTAGAGCTCACATTACGTTTAACACCACTAGGAAAAGTGACTAGCCTGTCAGAAGGTGTCATGTCACTAATAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82324 298 + 636262 TATGATGAACAGGTTACGACCTATATGTTAATGATCTAGAAGAAGTATGTTACCAAACACTGCCATCGCATTCAGATCCATAAGTAGACATCTAGGGCAAAGCACATATTCCTTTTTAACCATGCCACTTATCTTTCCTTAACCTGAGTATCCAGCATATAATAATAGGAACA--AATCAAAGCTACTTGGGTACCTAATGTGATCGGTCTGCATGCTCAAATTCTTAGAGCTCAC-TTACGTTTAACACCACTAGGAAAAGTGACTAGCCTGTCAGAAGGCGTCATGTCACTAATAATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 74545 284 + 647215 CGTGATGAACAGGCTATGATCTATATGTTAACGACTTAGAGGAAGCATGTTACCAAATG-TGCCATCAAATTCAGATCCATAAATAGACATCTAGAGCAGAGCACATATTACTTTTTGACCGTGCCACATATCTTTCCTTAACCTGAGTATCCAGCATATAATGATGGGAACATTAATCAAAGCTACTTGGGTAC-TAAGGT---------------TCAAATTCTGAGAGCTTACATCACGTTTAATACCACTAGGAAAAGTGACTAGCCTGTCAGAAGGTGTCATGTCACTAATAATAT + +a +s mr.mrrefChr0 78176 177 + 130230 TCCTGCTTTCATACACCCTACTAAATGTCATTACAGCATAAGGTTATGTTGTTGATATTACTCCCTTTCCACTGCACATTTTTAATTCTCAGTTTaTTGACTGACTCCCTAATGACtacACATGcttcaataatatactgctcaagaacTATCACATCCTAGTGACTGAACCCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82622 176 + 636262 TCCTGATTTCATACACCCTATTGAATGTCATTACTGTATAAGGTTATGTTGTTGATACTACTCCCTTTCCACTGCACATTTTTAATTCTCAGTTT-TCAACTGACTCCCTAATGACTACACATGCTTCAATAATATACTGCTCAAGAACTATCACATCCTAGTGATTGAACCCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 74844 149 + 647215 TCCTGCTTCCATACACCCTACTAAGTGTCATTACAGCATGAGGCTATGCTGTTGAGATTACTCCCTTCCCACTGCGCATTTTTAATTCTCTGTTTATTGACTGACTCCCTAATGAC---ACATG-------------------------TATCACATCTTAGTGACTGAACCCAATG + +a +s mr.mrrefChr0 78353 130 + 130230 GGGGAAAGGAAAGTAAATCGCAGAGTTAACATCTCCAGACCATTTTTCTATAGATCATCACCTATGCAAGTGGAGGCTGGGTCTACTTGGTTAGATCCCAACTGACATCAGTTGGCATACCCAGCACGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82798 126 + 636262 GGGGAAAGCAAAGTAAATCGCAGAGTTAACATCTCCAGACCATTTTTCTATAGATCATCA----TGCAAGTGGAGGCTGGGTCTACTTGGTTAGATCCCAACTGACATCAGTTGGCATACCCAGCACGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 74996 130 + 647215 GGGGACAGGTAAGTAAATTGCAGAGTACACATCTTGAGACAATCTTTCCATAGATCATCACCTATGCAAGGGGAGGCTGGGTCTCCTTGGTCAGAGTCAGACTGACATCAGTTGGCATACCCAGTATGGG + +a +s mr.mrrefChr0 78483 91 + 130230 GCGGCCTTCTAAATCCAACCATCCATGCAGACCCTTATCCTCACAGGAGGTTAGCTTGGGACACCAAAGCATAGGGTATCAGGAACCTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 82924 91 + 636262 GCGGCCTTCTAAGTCCAACCATCCATGCAGACCCTTAGCCTCACAGGAGGTTAGCTTGGGACACCAAAGCATAGGGCATCAGGAACCTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 75191 91 + 647215 GAGGCCTTCCAAATACAACCATCCATGCAGACCCTTATGCTCAGAGGATGCTAGCTTGGGACACCAAAGCACAGGGTGTCATGAACCCCTG + +a +s mr.mrrefChr0 78574 108 + 130230 GCCTCCGAACCCAGGGCACTCTATGGAACACTATTCTCTCATCGTCCCAGAAATTATATAGTTTCTGAGCTTGTACTTCAAACTCATCCATAGGTAGGTCCAGTCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83021 108 + 636262 GCCTCCGAACCCCGCACACTCTATAAAACACTATTCTCTCATCGTCCCAGAAATTATATAGTTTCTGAGCTTGTACTTCAAACTCATCCATAGGCAGGTCTAGTCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 75282 108 + 647215 GCCTCCAAACCCAGGGCACTCTATGGGACACTATCCTCTCATCAACCTAGAAATTACATAGCATCTGAGCCGGTGCTTCAAACTCATACATAGGTAGGGCCAGTCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 78682 239 + 130230 TTCACCCCTCAAGCTGCTTATTTTGTAAATAGGTAATGTAGCGCCTGTCCAGTCTACATGGTCCAACTGGTTGTTGTATAGAGATTCTTATTGCTGATATTCCATGATCTAGCCATTGTTTTGTGGTACAATTGTTGCCCTTCTGCTCTCAAATCAGAACCAAGAAACATTCGTAATATGTAATTTTTCAATCTAGACAAGAAACTTAACGATGTTTAGATTTTGCGCTGTGCCTGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83129 239 + 636262 TTCACCCCTCAAGCTGCTTTTTTTGTAAATGGGTAATGTAACGCCTGCCCAGTCGACATGGTCCATCTGATTGCTGTATAGAGATTCTTATTGCTGATATTCCATGATCTAGCCATTGCTCTGTGGTACAATTATTACCCTTCTGCTCTCAAATCAGAACCAAGAAACATTCGTAATATGTAATTTTTCAATCTAGACAAGAAACTTAACGATGTTTAGATTTTGCGCTGTGCCTGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 75391 239 + 647215 TTCACCCATCAAGCTGCTTATTTTGTAAATAGGTAATGCAGTGCCTGTCCAGCCTACATGGTCCAACTAGTTGTTGTATAGCAACTCTTATTGCTCATATTCCATGATCTAGCCATTGTTTTGTGGTACAATTGATGCCCTTCTGCACTTAAATCAGAGCCAAGAAACATCTGTAATATGCAATTTTTCAACCTAGACAAGAAACTTAACATTGTTGAGATTTCGCACAGCACCCTGTG + +a +s mr.mrrefChr0 78921 22 + 130230 CAAAGCCCCAGAAAAAGGCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83368 22 + 636262 CAAAGCCCCAGAAAAAGGCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 75631 22 + 647215 CAGAGCTCCAAAAACAGGCAAA + +a +s mr.mrrefChr0 78943 85 + 130230 TGTGGGTATGTACACACGGGTAGTGCTTGGCTATGACCATGTGCCACATCGCCATGTACAGACGGTTAGTGGCTGGGTATGAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83396 85 + 636262 TGTGGGTATGTACACACGGGTAGTGCTTGGCTATGACCATGTGCCACATCGCCATGTACAGACGGTTAGTGGCTGGGTATGAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 75653 85 + 647215 CGTGGCTATGTACACACAGTTAGTGCTTGACTATGAGCCTGCCCTGTGTGCCCATGTACACATGGTTAGTGCCTGGCTATGAGCC + +a +s mr.mrrefChr0 79028 31 + 130230 CACAGAGTCTGCCTGCCTCACACAAGAGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83481 31 + 636262 CACAGAGTCTGCCTGCCTCACACAAGAGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 75766 31 + 647215 CACAGAGTCTGTCAGCCTCATGCTTGAGGTT + +a +s mr.mrrefChr0 79059 46 + 130230 TGCCAGGCGTAGTTCCCCACATTGTAGATCTCCTGTCCGATTCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83512 46 + 636262 TGCCAGGCGTAGTTCCCCACATTGTAGATCTCCTGTCCAATTCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 75809 46 + 647215 TGTCAGGCGAAGTCCCCCACTATGTAGAGCTCCTGTCCGATTCACA + +a +s mr.mrrefChr0 79105 102 + 130230 GATAGGCACCTACTTCATGTCCAGAATGAGCCTCCCCATAGTACTGTGACTGGGCTATACCGTCTGTGTCTATTAGTCTGATAGTTCTTATAGCAGGTATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83558 102 + 636262 GACAGGCACCGGCGTCATGTCCAGAATGAGCCTCCCCATAGTACTGTGACTGAGCTATACCGTCTGTGCCTATTAGTCTGATAGTTCTTATAGCAGGTATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 76185 101 + 647215 GATACGCACCTATTTCATGTCCAGAATGAGCCTCCGCACAGTATTGTG-CTGGGCTATCACATCTGTGTCTATTGGTCTGATAGTTCCTATGGCAGGTATGG + +a +s mr.mrrefChr0 79207 6 + 130230 CAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83660 6 + 636262 CAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 76287 6 + 647215 CCACTG + +a +s mr.mrrefChr0 79213 11 + 130230 ACCTTGACAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83666 11 + 636262 ACCTTGACAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 76295 11 + 647215 ACCCTGTAAGC + +a +s mr.mrrefChr0 79224 90 + 130230 ATTTTGTAATTTTTCTAGAGCATAGTTAGTTGGCGTTACAGTTAGTTGGCAGGTAGGAAAAATAGCATGTCAAGGAAATGCCCACTAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83677 90 + 636262 ATTTTGTAATTTTTCTAGAGCATAGTTAGTTGGCGTTACAGTTAGTTGGCAGGTAGGAAAAATAGCATGTCAAGGAAATGCCCACTAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 76309 90 + 647215 ATTTTGTAATTTTTCTAGAGCATAGTTAGTTAGCATTACAATTAGTTGGCAGGTTAGGAAAATTACATGTCAAGGAAACGCCCACTAAGT + +a +s mr.mrrefChr0 79314 29 + 130230 GCCTAGCTGTGTGTCTTTATAGGTTTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83892 29 + 636262 GCCTAGCTGTGTGTCTTTATAGGCTTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 76399 13 + 647215 ----------------TTACAACTTTTCA + +a +s mr.mrrefChr0 79343 10 + 130230 TTACAATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83921 10 + 636262 TTACAATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 76419 10 + 647215 TTACAACCAT + +a +s mr.mrrefChr0 79353 561 + 130230 CCACATGGAAAATTAGCTCGGTCTTATTTTGCCTCTGTCATATATCCCTAGGTCGTTTGGCATTTGGGGTGATAGCAACAGATTAATGCCACCAATGCCCAACTCCCAGTTGCAAATGAAATGTAGCTTCTGGAGCATTGTCAACACCAACAGGCAGCATAAGCTCAAATGAATATTGTATATGTTAAATACATAGCCCAAAAATACATTCATTTACCTATATGTGTTGTTGCTGTGGTCCAGGAGATCTATGTCACTGCATGGTACGTACCATTGGAATGGATCACACATTATGGCTTTGGCGTTAAGATCAAGACTCTGTCCAGGAAGACTATGGATCCATTGTCTCAGTCATAGCTGCTGGTTGTGTTACAGTGAGGTTGATCAAAACTTGGCGAGTTTTGAGGGAAAGTCACCTAATCGATTTTAAATGCTAGTCACCTATGGGTTGAGATCTATGAAAGCTACATTGGATGATCTCCTCTCTATTGGTTTGATTAGTTTTTTGGGTTTTTAGTCAGAAATGCTAGCAACTCAAAGTATGGGCTTAGCGTTAGACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83931 557 + 636262 CCACGTGGAAAATTAGCTCGGTCTTACTTTGCCTCTGTCATATATCCCTAGGCCGTTTGGCATTTGGGGTGATATCAACAGATTAATGCCACCAATGCCCAACTCCCAGTTGCAAATGAGATCTAGCTTCTGGAGCATTGTCAACACCATGAGGGAGGGTAACCTCAAATGGATATTGTATATGTTA--TACATAGCCCAAAATTACATTCATTTACCTATATGTGTTGTTGCTGTGGTCCAGGAGATCTATGTCACTGCATGGTACGGACCATTGGAATGGATCACACATTTTGGCTTTGGCGTTAAGATCAAGACTCTGTCCAGGAAGACTATGGATCCATTGTCTCAGTCATAGCTGCTGGTTGTGTTACAGTGAGGTTGATCAAAACCTGGCGAGTTTTGAGGGACAGTCAGCTAATCAATTTTAAATGCTAGTCACCTATGGGTTGACATCTATGAAAGCTA--TTGGATTATCTCCTCTCTATTGGTTTGATTAGTTTTTTGTGTTTCTAGTCAGAAATGCTAGCAACTCAAAGTATAGGCTTAGCGGTAGACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 76430 560 + 647215 CTGCATCACCAATTAGCTCGGTCTTATTTCGCCTCTGTCATAAATTCCAAGGTCGTTTGGCATTTGGGGTGATAGCAACAGATTAATGCCACCAATGCCCACCTTCCAGTTACAAAGGAAATGTAGCTTCTGGAGCATTGTAAACACCAACAGGCAGCATAAGCTCAAATGACTATTTTATATGTTAAATCCATAGCCAAAAAATACATTCTTGTATCTATATGTGTTGTTGCCATTGTACAGGAGATCTATGCCACTACATGGCATGTACCATTGGAATGGATCACACATTATGTCTTTGGCGGTGAGATCAAAACTCTTAACAGAAAGACTGCGGGTGCATTGTCTCAGTCAAAGCTGCTTGTTGTGTTAAAATGTGGTTGATCAAAGCTTGGCAAGTTTGGAGGGAAAGTCACCTAATCGATCTTCAATGCTAGTCACCTATGGGTTGAGATCTATGAAAGCTACATTGAATGATCTCCTCTCCATTGGTTTGACTAGTTTTTTGGGTTTTTAGTCAGAAATGCTAGAAACTTAAAGTATGGGGTCAGTGTTAGACT- + +a +s mr.mrrefChr0 79914 18 + 130230 GTGAGACAACACTACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84490 18 + 636262 GTGAGACAACACTACAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 76990 13 + 647215 -----ACAACACTACATG + +a +s mr.mrrefChr0 79932 7 + 130230 ATATAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84508 7 + 636262 ATATAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 77009 7 + 647215 ATATCAC + +a +s mr.mrrefChr0 79939 74 + 130230 CCAGAAGTAGTAATGATGGTCAGTCATATCATGGATATAGCAATCAATCTCTATCTGGCTACTTCTCCGTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84520 74 + 636262 CCAGAAGTAGTAATGATGGTCAGTAATATCATGGATATAGCAATCAATCTCTATCCAGCTACTTCTTTGTATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 77016 64 + 647215 ----------TAGCGATGGTCAGTCACATCATGGATATAGCCATCAATCTATATCTGGCTACTTCTCCGTATTG + +a +s mr.mrrefChr0 80013 182 + 130230 TACACGCCTGGGACATACATTTTTAAGCAGAATAAAGCTTTTCTAAATTTAGGAATCATATGTATAAAACGAAGATGGAGGTTAACTGCATCAACAACAACTTTGTAATGTCTCTATACATTGCATTGTGGCCCATCATGACTCTTGGGCTAGTATTGCTAGTTTATAGCAACTCCACATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84595 182 + 636262 TACATGCCTGGGACATACTTTTATAAGGAGAATAAAGCTTTTCTAAATTTAGGAATCACATGTATCACACCAAGATGGAGGTTAACTGCATCAACAGCACGTTTGTAATGTCTCTATACATTGCATTGTGGCCCATCATGACTCTTGGGCTAGTATTGCTAGTCTATAGTGACTCCACCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 77080 182 + 647215 TACACTCCTGGTACATACATTGTTACCCAGAATAAAGCTTTTGTAAATCTAGGAATCATATTTATAAAGCGAAGATGGAGGTTAACTGCGTCAACAACAACTTTGTAAGATCTCTATACATTGCATTGTGGCCCATGATGACTCTTGGGCGAGTATTGCCAGATTATAGCAACTCCACATGC + +a +s mr.mrrefChr0 80195 96 + 130230 GACTGAGACTGGAGGTGCTAAGAAGTCCTACTGAGTATTATGGCGATCAACTTGCAATAAGAACCTGGTATAGTAAAAAGTAAGGCAACCTGTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84777 96 + 636262 GAGTGAGACTGGAAGTGCCAAGAAGTCCTACTGAGTATTATGGCGAGCAACTTGCAATAAGAACCTGGGATAGTAAAAAGTAAGGCAACCTGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77263 90 + 647215 TACTAAGACTGGAGGTGCTAAGAA------CTGAGTATTATGGTGATCAACTTCCAATAAGAACCTGGTATAGTAAGAAgtaaggcaacctgttaa + +a +s mr.mrrefChr0 80291 84 + 130230 ATAAAAAGACTCACatGATCTTAttATGTGGACAATGATGAGGTGTCCGCAAAATAGAATTATGTACATCTGACCAATCATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84873 84 + 636262 ATAAAAAGACTCACATGATCTTATTATGTGGACAATGATGAGGTGTCCGCAAAATAGAATTATGTACATCTGACCAATCATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 77360 84 + 647215 ataaaaagaatcacacgatcttattgtatggacaATCATCAGATATCGGCAAAATAGAATTATGCACATCTGACCAATCATGTG + +a +s mr.mrrefChr0 80375 26 + 130230 TTCCCCCACATGCCTTGCCTTTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84957 26 + 636262 TTCCCCCACATGCCTTGCCTTTTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77450 25 + 647215 CCCCCCCACATGCCTCGCCAC-TTTA + +a +s mr.mrrefChr0 80401 73 + 130230 ACGAAATGGCTGGAACTGTAAAGCCAGGCAACTTTATTGCATCTCCTGACCGGGGGGGCACAACTCTAGCGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 84989 73 + 636262 ACGAAATGGCTGGAACTGTAAAGCCAGGCAACTTTATTACATCTCCTGACCGGGGGGGCACAACTCTATGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77475 73 + 647215 ACGAAATGGTTGGTACTGTAAAGCCAGGCAACTTTATTGCTTCTCCTGACTGAGGGGGCAGAACCCTAGCGTA + +a +s mr.mrrefChr0 80474 100 + 130230 AAACAGAGTTGACTAGTGTGGTTGAAGATACTAAGAAGTCTGCCACTGTTTAATGTTCTTTTTGGGGACAGAACACTTATGGGCAAGCCAAGTTGTAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85120 100 + 636262 AAACAGAGTTGACTAGTGTGTTTGAAGATACTAAGAAGTCTGCCACTGTTTAGTGCTCTTTTTGGGGACAGAACACTTATGGGCAAGCCAAGTTGTAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77548 100 + 647215 AAACAGAGTTGACTAGTGTGGTTGAAGATACTAAGAAGTGTGCTGTTGTTTAATGTTCTTTTTGGGGGCAGAACACTTATGGGCAAGCCAAGTTGTAAGA + +a +s mr.mrrefChr0 80574 65 + 130230 ATGATAAGAAAGTACTCCATGCCTCAAACTAATGGATATAGCAAATTGATACATGAAGGTGAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85222 65 + 636262 ATGATAAGAAAGTACTCCGTGCTTCAAACTAATGGATATAGCAAATTGATACATGAAGGTGAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77648 65 + 647215 ACAATAAGAAAGTACTCCATGCCTCAAACCAACGGAGATAGTAAATTGACACATGAAGGTGAAGA + +a +s mr.mrrefChr0 80639 281 + 130230 GTCCAGTCTAGTGGTCATGTACTACAGTTTGCGGCTTGTTTGAGGGAATCCTTATGACTGTGTGCGGTACTGGTCCCTAGGAGGCAAGAGGTATTATGCTGGAAACAAAAACATTAGCCTTTTAAAGCAAGTACCTAAAAGCACAGACAAGAGAGTGCTGGATGAGACCATAGAGACCTTCCTGATGGATATGAAAATAGGCATAGAAAATAAGCATGAGATGATCTGATGGTTATGCCTAGTCACTAAGATCTGACATATACGGGCTACAGTCTACTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85305 277 + 636262 GTCTGGTCTAGTCGTCATGTACTACAGTTTGCAGCTTGGTTGAGGGAATCCTTATGACTGTGTGCGGTACTGGTCCCTAGAAGGCAAGAGGTCTTATGCTGGAAACAAAAACATTAGCCTTTTAAAGCAAGTACCTAAAAGCACAGACAAGAGAATGAAGGATGA--CCATAGAGACTTT--TGATGGATATGAAAATAGGCATAGAAAATAAGCATGAGATGATCTGATGGTTATGTCTAGTCACTAAGATCTGACATATACGGGATACAGTTTACTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 77713 276 + 647215 GTCCAGTATAGTGGTCATGCACTACAGTGTGCGGCTTTTT----GGGGCTCCTATGTATTTGTGGCGTATTAGTCCCTAGGAGACAGAAGGTATTATGCTGGAGACAAAAACATTAGCCTTCTAAAGCAAGTGCCTAGAAGCACAGATAAGGGAGTGCTGGATGAGACCATAGAGACCTTCCTGATGGATATGAAAATAGGCATAGAAAATAAGCATGAGTTGATCTGCTGGT-ATGCCTAGTCAGTAGGATTTGCCACATACGGGCTACAGTCCACCAAC + +a +s mr.mrrefChr0 80920 77 + 130230 CCATTAGCTTAGCCAACCCTAAGATCATGACATCTCTAAGATTGCAATGACCTAACACGGGGCTAGGGATTATGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85583 77 + 636262 CCGTTAGCTTAGCTGACCCTAAGATCATGACATCTCTAAGATTGCGATGACCTAACACGGGGCTAGGGACTATGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77989 76 + 647215 CCATTAGCTTAGCCAACCCTA-GATCATGACATCTCTAAGATTGCAATGGCCTAACACACGGCTAGGGATTATGGAG + +a +s mr.mrrefChr0 80997 121 + 130230 ATTATCTAGCTAGTTTTCAGTTTTGGCACTGCCCCCCCCTTTTGTTTACCTCATCAGTCTTCCATAAAATTAGTTTGGCAGTTCAGCTTGAAATAGCTCTCACAGGATGTTGCCCCATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85660 121 + 636262 ATTGTCTAGCTAGTTTTCAGTTTTGGCACTGCCCCCCCCTTTTGTTTACCTCATCAGTCTTCCATAAAATTAGTTTGGCAGTTTGGCTTTAAATAGCTCTCACAGGATGTTGCAATATTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 78066 103 + 647215 ATTACCTAGCCAGTTTTCTGTTCTGGCACTGCCCCCCCCTTTTGTTGATTTCATCAGTTTTCCGTAAAATTTGTTTAGCAGTTCAGCTTGA------------------TTGCCCCATTTG + +a +s mr.mrrefChr0 81118 17 + 130230 AGGGTAGTGACTCAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85786 11 + 636262 AGGGTAGTGAC------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 78169 17 + 647215 AGGATAGTGACTCAGTC + +a +s mr.mrrefChr0 81135 127 + 130230 AATGGTGTATTGAATATCTTAACTCTGGAAGACACAGAATACGCACCCTTGAATAAGTTTTTCCTGAAATGGGGTATCAAAAATCTTAACTCTGGAAGACATAGAATCTGTATTCTTGAGTGAGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85797 127 + 636262 ATTGTTATATTGAATATCTTAACTCTGGAAGACACAGAACACACACCCTTGAATAAGTTTCTCCTGAAATGGGGTATCAAAAATCTTAACTCTGGAAGACATAGAATCTGTATTCTTGAGTGAGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 78187 127 + 647215 AATGGTGTATTGAAAATCCTAACTCTGGAAAACGTTGAATAAGCACCCTTGAATCAGTTTTTCCTGAAAGGGGGTATCAAAAATCTTAGCTCTGGAAAACATAGAATCTGTATTCTTGAATCAGCTT + +a +s mr.mrrefChr0 81262 22 + 130230 TACAAGAAGGTAGGTGTTCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85932 22 + 636262 TACAAGAAGGTAGGTGTTCCTT + +a +s mr.mrrefChr0 81284 170 + 130230 TTCTAGTATCAGATGGAAAGAGTGAACTCACATGTGAAAGTGCAGATGGGATTGTTGATGGAATGTTTAGATCCCCAATATTTGTCCCACCTCAGTCACCTACAAAATGTGATGCTACTGGGCCTGATCGAGAAGGGAGTTATGAAGTGTCCTTTGCCCCAATCCACTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 85955 170 + 636262 TTCTAGTATCAGATGGAAAGAGTGAACTCACATGTGAAAGTGCAGATGGGATTGTTGATGGAATGTTTAGATCCCCAATATTTGTCCCACCTCAGTCACCTACAAAATGTGATGCTACTGGGCCTGATCGAGAAGGGAGTTGTGAAGTGTCCTTTGCCCCAATCCACCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 78314 36 + 647215 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGAGTCATGATGCATCCTTTGTCCCAATCCACTAC + +a +s mr.mrrefChr0 81454 61 + 130230 ACCCGGCCTTGATATGTGTCTGCAACCTGTAGGATGTACCCTGACCTGTTGGATTTTCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86128 61 + 636262 ACCCGGCCTTGATATGTGTCTGCAACCTGTAGGATGTACCCTGACCTGTTAGATTTTCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 78350 61 + 647215 ACCTGGCCTCAATATGTGTCTGCGACCTCTAGGATGTACCCTGACCTGTTGCATTTTCTTT + +a +s mr.mrrefChr0 81515 104 + 130230 TTATAGTTAATGACTGGCATGTTCTGTACATTGATTGGGAGATTAATTGATTAGTTAACTGACTACTTTAGTTAGTGTTCTTTGTAGCTCCTCACTCACATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86196 104 + 636262 TTATGGTTAATGACTGGCATGTTCTGTACATTGATTGGGAGATTAATTGATTAGTTAACTAACTACTTTAGTTAGTGTTCTTTGTAGCTCCTCACTCACATGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 78411 104 + 647215 TTATAGTTAATGACCGGCATGTTCTGTACGTTGATCTGGAGATTAATTGATTAGTTAACTGACTACTTTAGTTGGTGTTCTTTATAGTTCCTCACTCACATGTG + +a +s mr.mrrefChr0 81619 20 + 130230 ATATGATACTGTGCTTCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86399 20 + 636262 ATATGATACTGTGCTTCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 78515 20 + 647215 ATATGATACTCTGCTTCCTA + +a +s mr.mrrefChr0 81639 19 + 130230 CTTTCATCTAGGCGTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86420 19 + 636262 CTTTCATCTAGGCGTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 78535 19 + 647215 CATTCATTTAGGCATGAGT + +a +s mr.mrrefChr0 81658 6 + 130230 CTGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86442 6 + 636262 CTGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 78554 6 + 647215 CAGGTC + +a +s mr.mrrefChr0 81664 75 + 130230 ATAGGAGATGGGGAAGATGGGAAGGCTGGCAGTATTTCGCCATAGTATGTCACTGCTGTGGTCCTAAACTAAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86452 75 + 636262 AGAGAAGATGGGGAAGATGGGAAGGCTGGCAGCATTGCGCCATAGTATGTCACTGCTGTGGTCCTAAACTAAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 78560 65 + 647215 ATAGGAGATG------ATGGGAAGGCTAGCAGTATCTCGCCATAGTATGATGTTGCTGCTGCT----ACTGAGTT + +a +s mr.mrrefChr0 81739 55 + 130230 TTCACTTATGCTGCTGCCACCCACTCAATTGCTTGCTTTTTTTTTATAGTTGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86527 55 + 636262 TTCACTTATGCTGCTGCCACCCACCCTATTGCTTGCTTTTTTTTTATAGTTGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 78626 55 + 647215 TCCACTTATGCTGGTGCCACCCACTCAATTGCTTCCTCTTTTTTTATGGTTGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 81794 14 + 130230 CCCCGGGCCATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86584 14 + 636262 CCCCGGGCCATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 78681 14 + 647215 CCCTGGGCCAGATG + +a +s mr.mrrefChr0 81808 32 + 130230 GATTCATCCATCCTCTTCCTGATACCCCAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86598 32 + 636262 GATTCATCCATCCTCTTCCTGATACCCCAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 78706 32 + 647215 GATTTGTTGGTCCCCCTTCTGGCACCCCATGA + +a +s mr.mrrefChr0 81840 26 + 130230 CAGATGAGTACTAGGCCCACAAGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86703 26 + 636262 CAGATGAGTACTAGGCCCACAAGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 78738 26 + 647215 CAGATGAGTACTATGCCCATGAGTCC + +a +s mr.mrrefChr0 81866 35 + 130230 AGTTCAATCTTATTCACAGCATctgggtgacgctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86729 35 + 636262 AGTTCAATCTTATTCACAGCATCTGGGTGACGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 78765 35 + 647215 AGCCCATTCTTATTCACAGCATttccgtgacgcct + +a +s mr.mrrefChr0 81901 11 + 130230 tcctaggttgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86784 11 + 636262 TCCTAGGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 78800 11 + 647215 ttctaggttgt + +a +s mr.mrrefChr0 81912 82 + 130230 ggaatgggctcttcaaccacttggttaacaaaggtgcacatcaggatccccaaatccattagggtgtcagcaaataatcatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86796 82 + 636262 GGAATGGGctcttcaaccacttggttaacaaaggtgcacatcaggatccccaaatccattagggtgtcagcaaataatcatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 78811 82 + 647215 tgaatgatcacttcaactatgtggttaacaaaggtgcacatcaggatctccaaacccattaaggtgtcagcaaataattatg + +a +s mr.mrrefChr0 81994 37 + 130230 atgcaagcacaacttgaatggtcacagcttcaaaact +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86879 37 + 636262 atgcaagcacaacttgaatggtcacagcttcaaaact +s simRat_chr6.simRat.chr6 78893 37 + 647215 atgtaattacaatttgaatggtctcagcttgaaaact + +a +s mr.mrrefChr0 82031 21 + 130230 ccatacacaaagtatgtcttg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86918 21 + 636262 ccatacacaaagtatgtcttg +s simRat_chr6.simRat.chr6 78930 21 + 647215 ccatacacaaagtatgtcttg + +a +s mr.mrrefChr0 82052 67 + 130230 ttggtcctagcttctggactaggactcttatgttctgagaacttggcgaatagcaaatagttctaga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 86939 67 + 636262 ttggtcctagcttctggactaggactcttatgttctgagaacttggcgaatagcaaatagttctaga +s simRat_chr6.simRat.chr6 78952 67 + 647215 ttggtcatagtttcaggagtaggactcttatgttctgagtactgggggaatagcaaatagttctaga + +a +s mr.mrrefChr0 82119 19 + 130230 cggtcgggtacctgagcac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87006 19 + 636262 cggtcgggtacctgagcac +s simRat_chr6.simRat.chr6 79021 19 + 647215 tgttctagaatttgcacac + +a +s mr.mrrefChr0 82138 12 + 130230 aaccaagcacct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87025 12 + 636262 aaccaagcacct +s simRat_chr6.simRat.chr6 79041 12 + 647215 aactaagcacCT + +a +s mr.mrrefChr0 82150 10 + 130230 aaactattta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87039 10 + 636262 aaactattta +s simRat_chr6.simRat.chr6 79053 10 + 647215 AACATGTTCA + +a +s mr.mrrefChr0 82160 14 + 130230 CTGTGCACTATTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87049 14 + 636262 CTGTGCACTATTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 79066 14 + 647215 CAGAGTATAATTAG + +a +s mr.mrrefChr0 82174 10 + 130230 GGAGTTAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87068 10 + 636262 GGAGTTAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 79080 10 + 647215 GGCAACAATT + +a +s mr.mrrefChr0 82184 15 + 130230 CTAGTTATACTTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87081 15 + 636262 CTAGTTATACTTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 79090 15 + 647215 CCAAGTACACCATAT + +a +s mr.mrrefChr0 82199 62 + 130230 GAACATGTTAACATCATAATTGTTGACCGGTATTCTAATGTGTGACAGTCAAACAGCTTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87103 62 + 636262 GAACATGTTAACATCATAATTGTTGACCGGTATTCTAATGTGTGACAGTCAAACAGCTTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79105 62 + 647215 AAAGTTCTAAATATAGTGATTGTTGACTGGTATTCTAACGTCTGACAATCAAACAGCTTCTA + +a +s mr.mrrefChr0 82261 38 + 130230 AAGTACATAACAAAAGGTTAATGATTCACATACCCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87196 38 + 636262 AAGTACATAACAAAAGGCTACTGACTCACATACCCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79167 38 + 647215 AAGTACATAACAAAACGTTAATTATTCACATACCCTCA + +a +s mr.mrrefChr0 82299 160 + 130230 ACCTGCTCTGTACCAAGGAGTATGTTTATTGCTTACATAAATTGGTAATGATACTTTTCCTCATATCACTCTGAACACTATAGGTATCTCATAGTGGGATGCGCCTAGCTGTATAGTTCTGGGTAAAGTCAATAACAATGACCTATGACCAATGGTACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548632 160 - 636262 ACCTGCTCTGTACCACGGGGTATGTTTATTGCTTACATAAATTGGTAATGATACTTTTCCTCATGTCACTCTGAACACTATAGGTATCTCATAGTGGGATGCGCCTAGCTGTATAGTTCTGGGTCAGGTCAATAGCAATGACCTATGACCAATGGTACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 79205 157 + 647215 AACTGTTC---ACCAAGGAGTATGTTTGTTGCTTATTGAAATTGGTAATAACACTATTCCACATATCACTCTGAACACTATAGGTATCTCATAGTGGGATGCAACCAGCTGTAGAGTTCTGGGTAAACTCAATAACAATGACCTATGACTGATGATACAG + +a +s mr.mrrefChr0 82459 207 + 130230 ATACCAATCTTCAAAGGAAAACATCAGGCAAGAACCCCCAACCCAGGAGAAAAAGAGCTGCTTGCATTAACTGGATTCACTGGTGAGCAGCATATCTAGAGTGCTCCAGTATATAGATATTCTGCAAATCATAGACTTCTTTGTGGGGCAACTATTCATGGAGCCTGGTCTTCTCAGTTTAAAAAACCTCAGGTAGGTGTTTGTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548793 188 - 636262 ATACCAATCTTCAAAGGAAAACATCAGGCAAGAACCCCCAACCCAGGAGAAAGAGAGCAGCTTGCATTATCTGGATTCACAGGTGAGCAGCATATGTAGAGTGCTCCAGTATATAGATATTCTGCAAACTATAGTCTTCATTGTGAGGCAACTATTCATGG-------------------AAAAAACCTCAGGTGGGTGTTTGTCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 79362 207 + 647215 ATATCAATCTTCAAAGGAAAACATCAGGTAAGATCCCCCACCCCAGGAAAAAAAGAGCTGCTTGCATTAACTGGATGCACTGGTGAGCAGCATATCCAGAGTGCTCCAGTATATAGATATTCTGCAAATCATAGACTTCTTTGTGGGTCAACTATTCATGGAGCCTGGTCTTCTCAGTTTAAGAAACCTCAGGTAGGTATCTGTCAT + +a +s mr.mrrefChr0 82666 37 + 130230 TTACCAGCCTGAACATAAGGAAATATTAACACCGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548981 37 - 636262 TTACCAGCCTGATCATAAGGAAATATTAACACCGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 79571 37 + 647215 TTACCAGCCTGAACATAAGGAAACATTAACACAGGTT + +a +s mr.mrrefChr0 82703 2 + 130230 CA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549018 2 - 636262 CA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79609 2 + 647215 CA + +a +s mr.mrrefChr0 82705 28 + 130230 TAGTGCCAGCCTTCATATGGCTTTAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87633 28 + 636262 TAGTGCCAGCCTTCATATGGCTTTAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 79622 28 + 647215 TCACGATGGCCTTCATCTGGCTGTAACC + +a +s mr.mrrefChr0 82733 33 + 130230 GGAGCATCCAAGAGTCAAAAAGTAAAACTGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87668 33 + 636262 GGGGCATCCAAGAGTCAAAAAGTAATACTGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 79650 33 + 647215 GAAGCATCCAAGAGTCAAAAAGTAGAACTGTAG + +a +s mr.mrrefChr0 82766 11 + 130230 TACACAGGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87705 11 + 636262 TCTGCAGGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 79683 11 + 647215 TACACAACCAC + +a +s mr.mrrefChr0 82777 68 + 130230 GGTCACATGTTACTCATAAAGCTATTATAGTCCAGACTACACAGTTGGGCCTCTTGCAATGAATAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87719 37 + 636262 GGTCACATGTTACTCATAAAGCTATTATAGTCCAGAC------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 79694 68 + 647215 GGTCACATGGTACTCATAAAGCTATTATAGTCCAGACTACACAGTTGGGCCTCTTGCAATGAATAATA + +a +s mr.mrrefChr0 82845 87 + 130230 TACAGAGATCTTCCAAGTCGGCTTCGAAACATACTCATGTGCTCAATCCTGTTATTCCTAAAACAGACACACTGCTGGGCAGTTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 79767 87 + 647215 TACAGAGATCTTCCAAGTCGGCTTCGAAACATACTCATGTGCTCAATCCTGTTATTCCTAAAACAGACACACTGCTGGGCAGTTACT + +a +s mr.mrrefChr0 82932 373 + 130230 GAACACAAGGGTGGTACTATCTGATGAACTCTCACATTTTGGCTTCAGTACGCTCCATCAAATCATAGAGTAATGCTCATTAACTGGGAATCTTCTCTCCTGAAGCCAACCCATGTGTAACCAGGTGTCTCTGTATGATTGACTTCCTCCAGACCAGCATTATCAGCAAAGGCAGATTTATTGCCAGGCCCTCAGCTGCAAGTTGCTATAGTTAATTTCTTGTCTCTGTGCCTCATCATTATTAACCAATGTCGATTTCATGGTGGATGGTCAACGGGTTTACTGGAGATTAGCAAATTATATGACACTAGCAGAACAATAGGAAGGTTCAGCTGGAGAAAGATCACAAGCTACAGCTGCCAAGACTCAAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 87756 280 + 636262 ----------------------------------------------------------------------------------------AATCTTCTCTCCTGAAGCCAACGCATGTGTAACCAAGTGTCTCTGTATGATTGACTTCCTCCAGACCAGCATTCTCAGCAAAGGCAGATTCATTGCCAGGCCCTCAGCTGCAAATTGCTATAGTTAATTTCATGGCTCTGTGCCTCATCATTATTT-----TGTAGATTTCATGGTGGATGGTCGACGGGTTTACTGGCGATTAGCAAACTATATGACACTAGCAGAACAATAGGAAGGTTCAGCTGGAGAAAGATCACAAGCTATAGTTGCCAAGACTCAAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 79856 373 + 647215 GAACACAAGGGTGGTACTATCTGATGAACTCTCACATTTTGGCTTCAGTACGCTCCATCAAATCATAGAGTAATGCTCATTAACTGGGAATCTTCTCTCCGGAAGCCAACCCATGTGTAAACAGATGTCTCTGTATGATTGACTTCCTCCAGACCAGCATTATCAGCCAAGTCAGATTTATTACCATGCCCTCAGCTGCAAGTTGCAATAGTTAATTTCTTGTCTCTACGCCTCATCATTATTAACCAATGTCAATGTCATGGTGGATAATCAACGGATTTAATGGAGATTAGCGGATTATATGACACTAGCAGAACAATAGGAGGGTTCAGCTAGAGAAAGGTCATGAGCTACAGCTGCCAAGACTCAACTG + +a +s mr.mrrefChr0 83305 387 + 130230 AGGGGTTATAGCAGCATCAAACAAATAAGCTGATGGATGTAAGCTTAAGCTGAAAGAGAATTGAAAATTACCTCTCGCCAAAAAGGTGAAAGTACTTTGTCGGAACACAATATCAGACTTTGGCTAATTCCAGAGAAAATTCTAATATGAATATTAGCGTGAATAGTAGAAGGGGGTTAAATGCACAGAGGGGATAGGGCTCTACTGGGATCAGACAAACATGAAGCTAAGTAGTAGTTTAGGACAGTTGTAGCCCCAAGGGACCAATTGTCATGTATCTGATACACCGGACCTGTCCTCATGGTCCCTGTCTTCATAAAACAAATCTCAATACGGTAATTAATCCTGAGAAGCAAAGAATGAATAACCAAAGCATTACTTGACAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88040 380 + 636262 AGGGGCTATAGCAGCATTAAACAAATAAGCTGACGGATGTAAGCTTGAGCTGAGAGAGAATTGAAAATTACCTCTCGCCAAAGAGGTGAAAGTACTTTGTC-------ATTATCAGACTTTAGATCATACCAGAGAAAATTCTAATATGAATATTAGCATGAATAGTAGAAGGCGGTTAAATGCACAGAGGGGATAGGGCTCTACTGGGATCAGACAAACATGAAGCTAAGTAGTAGTTTAGGACAGTTGTAGCCCCAAGGGACCAATTGTCATGTATCTGATACACCGGTCCTGTCCTCATGGTCCCTGTCTTCATAAAACAAATCTCAATATGGTAATGTGTCCTGAGAAACAAAGAATGAATAACCAAAGCATTACTTGACAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 80229 384 + 647215 ---AATTATAGCAGCATCAAACAAATAAGCTTATGGATGTAAGCCTAAGCTGAAAGAGAATTGAAAATTACCTCTCACCAAAAAGGTGAAAGTACTTTGTCGGAACACAATATCAGACTTTGGCTAATTCCAGAGAAAATTGGAATATGAATATCAGCGTGAATAGTAGAAGGGGATTGAATGCACAGAGGGTATAGGGCTCCACTGGGGTCAGACAAACACCAAGCTGACTTGTAGCTTAGGACAGTTGTAGCCTCAAAAGACAAATTGTCATGTATCTGATACACTGGACCTGTCTTCATGGTCCCTGTCCTCATGAAGCAAATCTCAATACGGCAATTAATCCTGAGAAGCACAGTATTAATAAGCAAAGCATTACTTGGCAAG + +a +s mr.mrrefChr0 83692 39 + 130230 TGATAGTTAACACATTGTCTGAGCCTTCTGGTTGGCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88435 39 + 636262 TGATAGTTAACACATTGTCTGAGCCTTCTGGTTGGCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 80613 39 + 647215 TGATAGTTAACACATTGTCTGAGCCCTCTAGTTGTCAGA + +a +s mr.mrrefChr0 83731 44 + 130230 CCAGACAATTCACCTTTTAGTGGTTGCATAATGCAAACCATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88476 44 + 636262 CTAGACAAGTCACCTTTTAGTGGTTGCATAATGCAAACCATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 80652 44 + 647215 CCAGACAATTGACCTTTTAGTGGTTGCATAATGCAAACTATCAA + +a +s mr.mrrefChr0 83775 22 + 130230 CTCCATCATTTACTATTGGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88520 22 + 636262 CTTCATCATTTACTATTGGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 80697 22 + 647215 CTCCATCATTTACTATTGGAGC + +a +s mr.mrrefChr0 83797 7 + 130230 AGTTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88542 7 + 636262 AGTTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 80720 7 + 647215 AGTTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 83804 22 + 130230 CTTCTTCCACCATTGAACATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88550 22 + 636262 CTTCTTCCACCATTGAACATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 80727 22 + 647215 CTTCTTCCACTATTGAATGTTA + +a +s mr.mrrefChr0 83826 87 + 130230 GACTCATCTTGTAAGTATACCCCCCATACATAGGCTAAGAATCCATTTCAGTCTGTGGTACGAAATTTAGTCTGTTAGGGGAAATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88575 87 + 636262 TACTCATCTTGTAAGTGTACCCCCCATACATGGGCTAAGAATCCATTTCAGTCTGTGGTACGAAATTTAGTCTGTTAGGGGAAATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 80749 86 + 647215 GACTCATCTTGTAAGTATACCCCTCACACATAGGCTAAGA-TCCATTAAAGTCTGTGGTATGAAATTTAGACTATTAGGGGGAATTT + +a +s mr.mrrefChr0 83913 50 + 130230 ATGAAATCCCAACCTATGGGATGCAGATCTGGCAGAAAGGTAACAACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88662 50 + 636262 ATGAAATCCCAACCTATGGGATGCAGACCAGGCAGAATGGTAACAACAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 80836 50 + 647215 ATGAAATCTCAACCAATGGGGTGCAGATCTGGCAGATAGGTAACAACATA + +a +s mr.mrrefChr0 83963 59 + 130230 CCACTCACTTTAATAACACAAAAAAGCAATTGAATCACTGTGTCCTCTACTGAATTCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88713 59 + 636262 CTACTCACTTTAATAACACAAAAAAGCAATTGAATCACTGTGACCTCTACTGTATTCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 80886 59 + 647215 CCCCTTATTTTAATAACACAGAAAAACAATCAAATCACTGTGTCCTCTACTGACTTCGC + +a +s mr.mrrefChr0 84022 18 + 130230 AATGGTATCCCACCATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88780 18 + 636262 AATGGTATCTCACCATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 80945 13 + 647215 AATGGTATCCCAC----- + +a +s mr.mrrefChr0 84040 50 + 130230 TCAAATTACCATCATGAGTTCATTAATGGAGGGATAGGGAATTTAACAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88800 44 + 636262 TCAAATTA------TGAGTTCATTAATGGAAGGACAGGGAACTTAACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 80958 50 + 647215 TCAAATTACCATCATGAGGTCATTAATGGAGGAATAGAGAATTTAAGAAG + +a +s mr.mrrefChr0 84090 230 + 130230 GTAACATAATCCAGGACAGTAGAAGTCTAGTGTCAATGCCTGCAATTCTATTAGTAAGGTGCTAGCTGTCATTGGCTGCAAATACCAATTTATGACAAGTACCCACTTGTGACCCTGTTTTGCACCATAACTTCCTTTCCTGCATGGAACCTCCATCCTTATTATTCACATCTTCATGAACTGACTCTTGCATCAGAGATTTTACGATAGCAACCCTCTTAGCCTGCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 88844 230 + 636262 GTGACATAATCCAGGACAGTAGAGGTCTAGTGCCAATGCCTGCAATTCTGTTAGTAAGGTGCTAGCTGTCATTGGCTGCAAATACCAATTTATGACAAGTACCCACTTGTGACCTTGTTTTGTGCCATAACTCCCTTTCCTGCATGGAACCTCCATTCTTATTATTTATATCCTCATGAACTGACTCCTGTATCAGGGATTTTACGATAGCAACCCTCCTGGCCTGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 81171 217 + 647215 GTAACATAATCCAGGACAGTAGAAGTCTTGTGTCAGTGCCTGCAATTCTATTAGTAAGGTGCTAGC-------------AAATACCAATTTATGACAAGTACCCACTTGGCACCCTGGTTTGCACCATAACTTCCTTTCCTGAATGGAACTACCATCCTTATTATTCACATGTTTATGAACTGACTCTTGCATTAGAGATTTTACTATAGCAACCTTCTTAGCCTGGCTT + +a +s mr.mrrefChr0 84320 350 + 130230 AAATAGACAGAAGGAATATTATAATATATTTTGCTTAAGGTACCAATGCAGAGGTCCCTGTCCCCACACTATAGACTTTTTGCTGCTGCCAAACCACATCCTGGTGGGTGATAATAGCCCATCAAGACATTAGTAGCATGGTGTGTTTCTGTAAGTTCTCCCATACTAAAACATAACTGCTAGTTGCCAGTGATGTGTCATACAATGCTCCTGTGGCACATGCTTGCGGCTAGAGCCATGCCTAACTCCCAATGAAAGCCCTTAGGTGGGCAAAATTGTCATCACAATATTTAAAAAGCCATCTTCCTTGCCTCAACAGTGATGAGCTAAAAACTTTAAGAATAAGTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89081 340 + 636262 AAATAGATAGAAGGAATATTATAATATATTCTGCTTAAGGTACCAATGCAGAGGTTTCTGTCCCCACACTATAGACTTTTTGCTTCTGCCAAACCAC-TCCTG-TGGGTGATAGTAGCCCATCAAGACATTAGTAGCATGGTGTGTTCTTATAAGTTCTCCCATACTAAA--------GTTAGTTGCCAGTGATGTGTCATGTAATGCTCCTGTGGCACATGCTTCCGGCTAGAGCCATGCCTAATTCCCAATGAGAGCCCTTAGGTGTGCGAAATTGTCATCACAATATTTAAAAAGCCATCTTCCTTGCCTCAACAGTGATGAGCTAAAAACTTTGAGAATAAGTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 81388 348 + 647215 AAGTAGACAGAAGGAATACCGTAATATATTTTGCTTAGGGTACCAATGTAGAGGTCCCTGTCCCCACTCTAGAGACTTTTTGCTGCTGCCAAACCACATCCTGGTGGGTGATAATAGCCCACCAAGACATTAGTAGCATGGTGTGTTTCTGTAAGTTCTCCCATACCAAAACATAACTGCTAGTTGGCGGTGATGTGCCATACAATGCTC-TGTGGCACATGCTTGCGGCTAGAGCCATGCCTAACTTCCAATGAAAGCCCTTAGGTGGGCAAAATTGTCATCACAATATTTAAAAAGCCATCTTCCTTGCCTTAACAGTGATGTTCTAAGAACCT-AAGAAGATGTAAC + +a +s mr.mrrefChr0 84670 47 + 130230 AACGTATCAGCACTACACTGCTTTGTAATAAGTATATCATCTGCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89421 47 + 636262 AACCTTTCAACATTACGCTGTTTTGTAATAAGTATATCATCTGCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 81737 41 + 647215 AAAGAAGCAGCACTCCAATACTTTATG-TAGG-----CGTCCCCCAG + +a +s mr.mrrefChr0 84717 133 + 130230 GAATATGTAGCCACAAAAGCACTTTTATCTTCTACTCATCCACAAAGCACCAGCTTATAGTAAGCCTTGCAACTTCAGACCAGTGCATTGCATACCCTGAACTATGAATGGGTGTCAATGGACTAGCTTTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89468 122 + 636262 GAAGATGTAGCCAAAGAAGC-----------ATACTCATTCATAAAGCACCAGCTTATAGTAAGCCTTGCAACTTCAGACCAGTGCATTGCATACCCTGAATTATGAACGGATGTCAATGGACTAGCTTTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 81780 133 + 647215 GAATAGTCAACTGCAAGAGCACTTTTATCTTCTACTCATCCACAAAGCACCAGCTTACAGGAAGCCTTGAAACTTCACAGCAGTGTGTTGCATACCCTGAACTATTAATGGGTGTCAATGGACTAGCTCTCAA + +a +s mr.mrrefChr0 84850 140 + 130230 GTATCACATGGTGTCTTGGTCATGGGTACtaaagagttcaataggacttggttggagtgtgagtcccaaaactttatactttcccctcagcacttacaccctgagaaagaggctacgttccatgaggcgtcttATATAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89592 140 + 636262 GTATCACATGGTGTCTTGGTCATGGGTACtaaagagttcaataggacttggttggagtgtgagtcccaaaactttatactttcccctcagcacttacaccctgagaaagaggctacgttccatgaggcgtcttATATAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 81913 140 + 647215 GTACCAGATACTGTCTTGGTCATGGGTACtaaagagttcaatagcacttggttggagtacaaatcccaaaactttctactttcccgtcagcacttactccctgagaAACAGGCTGCCTTCCATGTGCCTTCTTATATAGT + +a +s mr.mrrefChr0 84990 55 + 130230 GATTCCAGTTAACTCCTCTGGTTCACTTGACAAAGTTACACCCTCATATAGCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89733 55 + 636262 GATTCCAGTTAACTCCTCTGGTTCACTTGACAAAGTTACACCCTCATATAGCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 82053 55 + 647215 GATTCCAGTTAACTGCTATAGCTCACTTGACAAAGTTGCACCCTCATATCACAAA + +a +s mr.mrrefChr0 85045 60 + 130230 AATCTTTTAGAGACCCCCCAAGATGCATTCTGTGAACGTCAAGATTTGGTGCTTTATCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89788 60 + 636262 AATCTTTTAGAGACCCCCCAAGATGCATTCTGTGAACGTCAAGATTTGGTGCTTTATCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 82118 60 + 647215 AATCTTTTAAAGACCCCCCAAGATGCATTTTGTGAACATTGAGATTTGGTACTTTATCTA + +a +s mr.mrrefChr0 85105 20 + 130230 ACCCAGAGCTGTGACCCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89849 20 + 636262 ACCCAGAGCTGTGACCCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 82178 20 + 647215 ACATAAAGTTCTGAGGCTGT + +a +s mr.mrrefChr0 85125 59 + 130230 CAATCAGCCATTGGTCTGAGGCACCTGGGGTTACGCTCTCATTAAGTAAACTATGAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89869 59 + 636262 CAATCAGCCATTGGTCTGAGGCACCTGGGGTTACGCTCTCATTAAGTAAACTATGAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 82200 59 + 647215 CAATCAACCATTGGTGTGGGGGACCTGAGGTCACACTCCCATTAAGCAAACTATAAAAG + +a +s mr.mrrefChr0 85184 17 + 130230 TATAGGAGTCCACTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89928 17 + 636262 TATAGGAGTCCACTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 82260 17 + 647215 TATAGGAGTCCACTCAA + +a +s mr.mrrefChr0 85201 407 + 130230 GAAGTGTGTCATGGTATTACCAGCTCATCCTGTTCCACTCCATCTTCTTGCTAAGAGGCACCAGAAAACAGAGGCAGCATATTTGAATGCCAGCTTGAACATAGCAGGCAAGCGGGTGCAATTGTCCAAACTCATGTAGAGATAAAGGTGAGCCTAGGTCTGGTGTGTGGGATATACCTGGCTAATTGAGTGAATAGCAAACTGTGCAAAGGTCCCACTGGTGCTGCCAAATCCCCCACTCACTCACTCACTCAACCTTATAACAGTGTTTTATCAGTAAGTAGTACTTGTGTGTAACTTATGTCACAGTCCATCCAAGCATGAGGAGCTATCAGGGAGGCCCTCGGTCAGTTCTTCTTTTTTCAGATCAGAGTTTTTGCCATGGATACAGGTACCTTTAATGGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 89953 398 + 636262 GAAGTGTGTCATGGTATTACCAGCTCATCCTGTTCCACTCCATCTTCTTGATA----GCACCACAAATCAGAGGCAGCATATTTGAATGCCAGCTTGAACACAGCAGGCAAGCGGGTGCAAGTATCCAAACTCATGTAGGGATAAAGCTAAGCCTAGGTCTGGTGTGTGGGATATACCTGAATAATTGAGTGAATAGCAAACTGTGCATGGGTCCCACTGGTGCTGCCAAATACCCCACTCATTCACTCACTCAACCCTATAACAGTATTTTATCAGTAAGTAGTATTTGTGTGTAGCATATGTCACAGTCCATCCCAGCATGAGGACCTATCAGGGAGGCCCTTGGTCAGTTCTTCTTGT-----ATCAGAGTTTTTGCCATGGATACAGGTACCTTTAATTGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 82277 399 + 647215 GGAGTATTTCGTGGTATCCCCTGCTCATCTCATTCCACTTCATCTTCTTGCTAAGAGGCACCAGAAAACAGAAGCAGTATACTTGAATGCCAGCCCGAACATAACAGGCAAGCAGGTGCAATTGTCCAGACTCATGTAGAGATGAAGGTGAGCCTAGGTATGGCGTGTGGGATAGACCTGGCTAATCGAGTGAATGGCAACCTGTGCAAAGGTCCCACTGGTGCTGCCAAATCCCCCACTCACTCGC--------ACTTATGACAGTGTTTTATCAGTAAGGCGTGCTTGTGCGTAACTTTTGTCACAGTCTGTCCAAGCATGAGGAGCTATCAGGGAGGCCCTCGATCAGTTCTTCTTTTTTCAGCTTAGAGTTTTTGCCCTGGGCACAGGTATCTTTAATGGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 85608 49 + 130230 TAGCCATAAATGGTACTGGGCAGAGCAGGTGTTAGACTAAGGTTGTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90357 49 + 636262 TAGCCATAAATGGTACTGGGTTGAGCAGGTGTTAGACTGAGGTTGTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 82676 45 + 647215 TAGCCATAAATGGTACCGGACAGAGCAGGTG----ACTAATGTCGTCAA + +a +s mr.mrrefChr0 85657 22 + 130230 CCATTTGTCAAGCAAGGTAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90406 22 + 636262 ACATTTGTCAAGCAAGGTAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 82722 22 + 647215 CCATTTGTCAAGCATGGTAATA + +a +s mr.mrrefChr0 85679 203 + 130230 TGCCAGAAGTGCTCTGGCAACACTGTTGGAGCCACATTTTCTTCTAACCCAGAGGGGGGTTGTGAAGTGGGTTTAATGTTATCAGGATAGGTGGTGCATTGAGAACCTATAATCAATCCAAGGTTAAAAGGTTAGTCAGAACAATACTGATGCCAGTATTGTTGATGGGCCGGTAGTAATGTCCAAACGACGGGATGATCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90430 198 + 636262 TACCAGAAGTGCTCTGGCAACACTATTGGAGCCTCATTTTCTTCTAACCCAAAGGGGGATCGTGAAGTGGGTCTAATGTTATCAGGATAGGTGGTGCATTGAGAACCTCTAATCGATCCAAAATTAAAAGGTTAGTCAGGACAATACTGATGCCAGTATT-----TGGGCCGGTAATAATGTCCAAACGACGGGATGGTCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 82744 203 + 647215 TGCCAGAAGCGCTGTGGCAACACTGTAGGAGCCACATTTTCTTCTAACCCAGATGGGGGTTGTGAAGTGGGTTTAATGTTATCAGGATAGGTGATGCATTTTGAACCTATAATCAATCCAAGGTTAAAAGGCTAGTCAGAACAATACTGATGCTGGCATTGTTGATGGGCTGCTCGTAATGTCCAAACAATGGGATGATCATA + +a +s mr.mrrefChr0 85882 11 + 130230 GGTGCTCTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90628 11 + 636262 GGTGCTCTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 82990 11 + 647215 GGTGCTCTATC + +a +s mr.mrrefChr0 85893 67 + 130230 AGGTACTTACTTGGGTACTACTCTTCTGGCTATGCACTACAATGATGCAGATATGATAGGTCCCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90640 67 + 636262 AGGTACTTATTTGGGTACTACTCTTCTGGCTATGCACTACAATGATGCAGATATGATAGGTCCCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 83001 67 + 647215 AGGTAATTACTTGGGTACTACTCTCCTGGTTATCCACTACAATGATGCAGATATGATGGGTCCCTTT + +a +s mr.mrrefChr0 85960 84 + 130230 GGAATTACAAAAGACATGCATATTATTGGGGAGACGTACTATAAGTAAGCATTTTAACCTCAACAGTAGATGAGGAAATGCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90712 83 + 636262 GGAATTACAAAAGACATGCATATTATTGGGGAGACGTACTATAAGTAAGCATTTTAACCTCAACAGT-GATGAGGAAATGCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 83068 84 + 647215 GGAATTACAAAAGACGTGCATATTTTTGGAGAGAAGTACTATAAGGAAAACTTTTTAACTCCACAGGAGATGAGGAAACGCAAG + +a +s mr.mrrefChr0 86044 8 + 130230 CAAGATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90797 8 + 636262 CAAGATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 83152 8 + 647215 CAAGATGG + +a +s mr.mrrefChr0 86052 235 + 130230 AACATAGGACTATTGAGAACTCCAAGGCGAGGGGGCTGGTGCAATAAAGCTCTCACTGCATAGAAGAGATAGGGTGGCAATACTCCCCAATAGAAAATAATCCAGCATAGACTCATTGGGTTGCAGGAGTGGGGGACCACAGTCAATTGGCAGTGCCTGGAAAAGTCTAAACTCTATCTAGGAAAGTCATCTGCACTTAGAAACCTAGATGGGGGTTGCAACAACGGGGGACCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 90808 235 + 636262 AATACAGGACTATTGAGAACTCCAAGGCGAGGAGGCTGGTGCAATAAGGCTCTCACTGCATAAAAGAGATAGGGTGGCAATGCTCCCCAATAGAAAATAATCCAGCATAGACCCATTGGGTTGCAGGAGTGGGGGACCACAGTCAATTGGCAGTGCCTGGAAAAGTCTAAACTCTATCTAGGAAAGTCATCTGCACTTAGAAACCTAGATGGGGGTTGCAACAACGGGGGACCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 83160 232 + 647215 AACATAGGACTATTGATAACTCCAACGTGAGGGGGCTCGTGCAACAAAGCTCTCACTGCATAGGAGAGATAGGGTGGCAAAACCCC---ATAGAAATTCATCTAGCCTAGACTAATTGGGTCGCAGGAGTGGGGGACCACAGTAAGCTGGCAGTGCCTGGAAAAGTCTAAACTCCAGCTAGGAAAGTCATCTGCACTTAGAAGAGAGTCTGTAGGTTGCAACAATCGGGGACCAC + +a +s mr.mrrefChr0 86287 9 + 130230 GTCAGTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91044 9 + 636262 GTCAGTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 83392 9 + 647215 GTTAGTTGA + +a +s mr.mrrefChr0 86296 159 + 130230 CTATGCCTATAAATGGTCTAAATTCTAGCTAAAAAAGTCAACTACATTTAGGACTTGCTAATATACATAAGAGTACCCACAATGGACCTGGTGTAGTCTGTGAGAAAACTATCAAAGACTTAGTGGCTCTGGGGTTGAAGATATCTGATAAGATGGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91056 159 + 636262 CTATGCCTATAGATGGTCTAAATTCTAGCTAAAAAAGTCAGCTACATTTAGGACTTGCTAATATACATAAGAGTACCCACAATGGACCTTGTGTAGTCTGTGACAAAACTATCAAAGACTTAGTGACTCTGGGGTTGAAGATATCTGATAAGATGGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 83401 150 + 647215 CTATGCCTAGAAATGTACTAAATTCTAGCTAAAAAAGTCCAATACATTTAGGACTTGCTAATATACATAAGA---------ATGGAGCTGGTGTAGTCTGTGAGAGAACTATATGAGACTTAGTGGCTCCGGGGTTGAAGATATCTGATAAGAGGGTCA + +a +s mr.mrrefChr0 86455 91 + 130230 AGTAATATATTAATCGTCCACCTTGCATAAAGGTGACCCACGCCATGGCAAAATTTAATTGGGTTCCATGTGCTATGGTACCTCCAATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91215 90 + 636262 AATAATATATTAATC-TCCACCTTGCATAAAGATGACCCACGCCATGGCAAAATTTAATTGGGTTCCATGTCCTATGGTACCTCTAATTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 83553 91 + 647215 AGTAATAGATTATTCGTCCACCTTGCATAAAGGTGAACCAGGCCATGGCAAAACATAATTGGACTCCATGTGCTATGATACCTCCAAGCGG + +a +s mr.mrrefChr0 86546 42 + 130230 TCTGGTCATAGTAGCTTGGGAAAAATAAATCAAGACAAGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91305 42 + 636262 TCTGGTCACAGTAACTTGGGAAAAATAAATCAAGACAAGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 83646 15 + 647215 CAGGGTCATAGTAGC--------------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 86588 13 + 130230 AATTTAAATGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91381 13 + 636262 AATTTAAATGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 83661 13 + 647215 ACACTAACTGTGT + +a +s mr.mrrefChr0 86601 9 + 130230 TCCATGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91394 9 + 636262 TCCATGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 83675 9 + 647215 TACATGGCC + +a +s mr.mrrefChr0 86610 12 + 130230 ATGGTACCTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91404 12 + 636262 ATGGTACCTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 83684 12 + 647215 ATGTGAAGTCTA + +a +s mr.mrrefChr0 86622 303 + 130230 TTAATCTGGTCACAGTAACTTGGGAAAAAATAATTAAGACAAGGGTGGCTGTTTATTATGTGAGGCTAGAACAGTGTCTAGATTATCTCTACTTAGTATACTCTCACTACATGTGGTGGGGACAGATTATCCTCAATTAATATTGTTGGGACTGTCCCTGAACCATCAATATATTCTTTATCTTAGGGTTGCCCGATACAACCGTCAACTAATATAATATGGATGCCTATAACTTGATGCCCTCAGGTCAATGTATGGAGAGCAAGAAGTAAACATGATTCTTCAATAGCAGCACACTTCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91417 303 + 636262 TTAATCTGGTCACAGTAACTTGGGAAAAATAAATCAAGACAAGGGTGGCTGTTTATTATGTGAGGATAGAACAGTGTCTAGATTATCTCTACTTGGTATACTCTCACTACATGTGGTGGGGACAGATTATCCTCAATTAATATTGTTGGGATTATCCCTGAACCATCAATATATTCTTTATCTTAGGGCCACCCAACACAACCGTCAACTAATCTAACATGGATGCCTATAACTTGATGCCCTCAGGTCAATGTATGGAGAGCAAGAAGTAAACATGATTCTTCAATAGCAGCACACTTCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 83696 303 + 647215 TTAATCTGGTCGCAGTAACTTGGGAAAAAATAATTGAGATAAGGGTAGGTGTTAAATATGTGGGGCTAGCACAGTGTCTAGATTATCTTGACTCAATATACTCTCACTACATGGGGTGGGGACAGTTTACCCTCAATCAATATTGTTGGGACTGTCACTGTATCATCAATATATTCTTTATCTTAGGGTTGCCTGATACAACCGTCAACTAATATAATATTGATGCCTATAACATTGTGCCCTCAGGTCAATGTATGGAGAGCAAGATGAAAGCATGATTCGTCAATAGCAGTGCACTTCAAT + +a +s mr.mrrefChr0 86925 55 + 130230 ATATTATCAACCCGGAGCTTCGCAGGCTAGTACCCACCCTTATATCAGATAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91721 55 + 636262 ATATTACCAACCCAGAGCTTCGCAGGCTAATACCCACTCTTATATCAGATAGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 83999 53 + 647215 ATATTATCAACCCGGAGCTTGGCCGG-TAGAACTGACCCTATTATCAGATAGAC- + +a +s mr.mrrefChr0 86980 5 + 130230 GCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91778 5 + 636262 GCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 84052 5 + 647215 GCCAG + +a +s mr.mrrefChr0 86985 152 + 130230 CCAGCACTGTGGAAACAAACAATTATAAACTATGGGAAGGTGTAAAAACTGTATAGATCTATTGTGTTCTGTACCACTTTGGAGTTCCATTGGCCTATCATCAGGACATGTTAGTGGTAGTTGTCATGGAGAGTTAGCCAGACCTGAGCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91789 152 + 636262 CCAGCACTGTGGAAACAAACAATTATAAACTATGGGAAGGTGTAAAAACTGTATAGATCTATTGTGTTCTGTACCACTTTGGAGTTCCATTGGCCTATCATCTGGACATGTTAATGGTAGTTGTCATGGAGAGTTAGCCAGACCTGAGCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 84057 92 + 647215 ------------------------------------------------------------ATTATGTTCGGTATCATTATGGAGTCCCATTGGTCTATCATCAGGACATGTTAGTGGTAGTTGTCATGTGGAGTTAGCCAGACCTGAGCTCG + +a +s mr.mrrefChr0 87137 284 + 130230 TTCAGATTTGATTCAGATACCACTCTTGAACCTCTAGAAACATTTGCTGTACTGAGAGGTAAGTATGTTACTCCCTCATCAACAGGTGCAATGCACTGTGTTGCAGAATACAGTCCTTGCATCATAACAGATTTTGTCTGGTTGCCCAAACCCCTAGCACTTGAGCTGAGAATCCTCAGACTGGCACCCAAGAAGCTGTGTTACATAGTATTACTCAAGCTGGAGCAGTGATATTGTATGCACCAGGTTTTGATTCGGCTTTATGTTTATAGCTGCTCAAATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 91941 284 + 636262 TTCAGATCTGATTCAGGTGCCACTCTTAAACCCCTAGAAACATTTGCTGTACTGAGAGGTAAGTATGTTGCTCTCTCATCAACAAGTGCAGTATACTGTGTTGCAGACTACAGTCCTTGCATCATAACAGATTTCATCTGGTTGCCCAAACCCCTAGCACTTGAGCTGAGAGTCCTCAGACGGGCGCCCAAGAAGCTGTGTCACATAGGATTACTCAAGCTTGAGCAGTGATATTGTATGCACCAGGTTTTGATTCGGCTTTATGTTTATAGCTGCTCGAATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 84160 278 + 647215 TTCAGATTTGATTCATATACCAGTATTGAACCTCTGGAAACATACATTGTCCTGCGAGGTAAGTATGTTACTCCCTCGTCGACAGGTGCAATGCACCATGTTGCAGAAATCAGTCCCTGCATCATACTAAATTTTGTCTGGTTGCCCAAACCCCTAGCACTGG---TGTGAATCCTCA--CTGGCACCCGGGAAGCTGTGTTGCACAGTATTACTCAAACTGGAGTAGTTATATTATATGCACCAAGCTG-GCTTCAGCTTTATGTTTATAGCTGCTTAAATAA + +a +s mr.mrrefChr0 87421 82 + 130230 TTATAATTTACTTATGTTTACAGATGATGCCTAAACAGATTTAGATGTGGGTAAGTGAATTATAGACTAATGTTTAAGCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 92232 82 + 636262 TTATAATTTACTTATGATTACAGATTATGCCTAAACAGATTTAGATGTGGGTAAGTAAATTATAGACTAATGTTTAAGCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 84438 68 + 647215 CTGT-----------GTTTACAGATGAT---TAAACAGATTTAGATATGGGTAAGTGAATTATGGACTAATGTTTATGCATT + +a +s mr.mrrefChr0 87503 372 + 130230 GGTGGATACCCATACCTGCTAGCAGTATCTGAGGGCATGGCTACACAAGCCCCCAATAAGTATGACATGATCTGCTGTGCAATGCTCCTCCCTGCATAGAATGGCTATGATCAAATAAGAGCCAATTTAGTACATAGTACTAGTGCCTTGAATACTGCCTAACATTGTTTAGATTTTGCACAGTGCCTCGTGCAAAGCTCCAATTAAAGGCAAATGCGTGCATTCCCATTTAGTACTTGACATGCTGTCGAGCACTCATAGGTGCCTATAGAAGGAGCCTGCCCTCCTCATGCAAGCACCCTAATGGTCCAAAATGTCACTGCTATTCAAAGTACTATAAACCTTGTAAAATTTTACAAACATAGTTGTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 92315 362 + 636262 GGTGGATACCCATACCTGCTAGCAG---------GCATGGCTACACAAGTCCCAAATAAGTATGATATGATCTGCTGTGCAATGCTCCTCCCTGCATAGAATGTCTATGATCAAATAAGAGCCAATTTAGTACATAGTACTAGTGCTTTG-ATACTGCCTAACATTGTTTAGATTTTGCACAGTGCCTCGTGCAAAGCTCCAATTAAAGGCAAATGCGTGCATTCCCATTTAGTACTTGACATGCTGTCGAGCACTCATAGGTGCCTATAGAAGGAGCCTGCCCTCCTCATGCAAGCACCCTAATGGTCCAAAATGTCACTGCCATTCAAAGTACTATAAACCTTGTAATATTTTACAAGCATAGTTGTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 84506 362 + 647215 GGCAGATACCCAACCCTACTAGCAGTATCTGAGGGTGTGGCTTCAGAAGCCCCCA----------CATAATCTGCTGTGCAATGCTCCTCCCTGCATAGAATGGCTATGATCAAGTAAGAGTCAATTTAGTACATAGTAATAGTGCCTTGAATACTGCCTAACTTTGTTCAGATTTTGCGCAGCAGTTCGTGCAAAGCTCCAATAAAAGGCAAATGTCTGTATACACATTTAGCACTTGACACGCTATCAAGCAGTCAAAGGCACCCATCGAAGGAGCCTGCCCACCTCATGCAAACACCCTACTGGTCCAAAATGTCACTTCTATTCAAAGTACTATAAACCTTGTAAAACTCTACAAACATGATTGTCAG + +a +s mr.mrrefChr0 87875 20 + 130230 TATGATATGGAATGCTAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 92677 20 + 636262 TATGACATTGAATGCTAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 84869 20 + 647215 TATGATGTGTGATGACAGAA + +a +s mr.mrrefChr0 87895 146 + 130230 CTTAAAAGAAGAACATCACAAGCTTAAGAGTTTTTCAGCCAAATAATCTTTGATGGAAGAAGCTGAAGAGATTACTGACAACTACTTACACGCCTTGTTGACCACTCATTCCCTTGGAAACAGCATTATGGGAAGGAGTAACAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 92701 146 + 636262 CTTAAAAGAAGAACATCACAAGCTTAAGAGTTTTTCAGCCAAATAATCTTCAATGGAAGAAGCTGAAGAGATTACTGACAACTACTTACACGCCTTGTTGACCACTCATTCCCTTGGAAACAGCATTATGGGAAGGAGTAACAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 84889 145 + 647215 CTTAAAAGAAGAACATCACAAGCTTAAGAGTTCTTCAGCCAAATAATCTCTGATGGAA-AAGCTGAGGAGATTACTGACAACTACTTACACACCCTGTAAACCGCTAATTCCCTTGGAAAGAGCCTTATAGGAAAGAACATCAGGT + +a +s mr.mrrefChr0 88041 575 + 130230 GCCTAGGAAGACCTAGTCCCTCTGATGCATCCTTTATGAGTTCAGCAGTGAAAATGTATTTGAGATCCATAGGACAGAAAGCATATAAGTACAAACACTAGTATGATTTGTCCATGACTTGTGATGTGACTGTTCCAGACACTAGGTCTCCTTGCTGCATGCACTATGCGACCTGTTGAATCCTGCCCAGTTAAATATATTGTTGAAATAAATTCTGTCTTCTGATTTTTGATAGACCAGATCTTGTCCTCCACATTAATAGGTGATGGGGCAAGGGTACAATAACTGAAAGGGAACGCCGACCCTACTAAAAGGATAGACAGAGTTAAACCGCCTTCAGTTACAAATGTTTGAATTGGTGATTGGGATTGATAACATAACGTAGGTAGTTGCTTTTAGCATAGCATTATAACACAGGTACCCTAATAATCAGAAACTAGATCTAAGATGCAATGGTGAACCATCTTTTTAAAGCGCATAAGCAGGCTTGAGCTTGGGTGCTGAAACAGCATAGGTGCCCAGTGGAGTCATCCCAGTGCCCTGAATTTGGCAAGGAAGCACCACTGAAGGTCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 92885 567 + 636262 GCCTGGGAAGACCTAGTCCCTCTGATGCACCCTTTATGAGTTCAGCAGTGAAAA-GTATTTGAGATCCATAGGACAGAAAGCATATAAGTACAAACACTAGTATGATTTGTCCATGACTTGTGATGTGAATGTTCCAGACACCAGGTCTCCTTGCTGGATGCACTATACGACCTGTTAAATCCTGCCCAGTTAAAGATATTGTTGGAACAAATTCTGTCTTCTGATTTTTGATAGACCAGATCTTGTCCTCCGCA------GGTGATAGGGCAAGGATACAAAAA-TGAAAGGGAACGCCGGCCCTACTAAAAGGATAGACAGTGTTAAACCGCCTTCAGTTGTAAATGTTTGAATTGGTGATTGGGATTGATAACATAATGCCGGTAGTTGCTTTTAGCATAGCATTATGACACAGGTACCCTAATAATCACAAACTAGATATAAGATGCAATGGTGAACCATCTTTTTAAAGCGCACAAGCAGGCTTGAGATTGGGTGTTAAAACAGCATAAGTGCCCAGTGGAGTCATCCCAGTGCCCTGAATTTAGCAGGGAAGCACCACTGAGGGTCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 85034 534 + 647215 GCCTAGGAAGACCTAGTCCCTCTGATGCATCCTTAA-GAGTTCAGCGGTGAAAATGTATTTTAAATCCAAAAGACAGATAGCATATAAGTGAAAACAGTAGTATGATCTGCCCATGACTTGTGATGTGACTGTTCCAGACACTAGGTCTCCTTGCTGCCTGCATAATGTTACCTGTTGAATCCTGCCCTGTTAAATATGTTGTTGAAATAAATTCCGACTTCTGACTTTTGCTAGACCAGATTTTGTCCTCCACATTAATAGGTGATGGGGCAAGGGTATAATAACTGAAAGGGAAAGCGGACCTTACTAAAAGGATAGACAGAGTTAAACCACCTTTAGTTAC------------------------TTCATGACATAACATAGGTA----------------TGATATAACACAGGTACCTTAATAATCAGGAATTAGATCTAAGGCGCAATGGTCAACCACCTTTTTGAAGAGCATAAGCAGGCTTGATCTTGGGTGCTGAAACAGCTTAGGTGCCCAGTGGAGTAATCCTGGTGCCCTGAATTTGGCAAGGAAGCACCACTGAAGGTCCTG + +a +s mr.mrrefChr0 88616 48 + 130230 AACATATCCCTATCCCCACTCACCGGTAGTGATTGGATCAAAAGTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 93482 48 + 636262 AACATATCCCTATCCCCACTCACCGGTAGTGATTGGATCAAAAGTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 85568 48 + 647215 AACACATTCCTATCCCTAGCCACCGGTAGGGATTGGATCAAAAATAGG + +a +s mr.mrrefChr0 88664 18 + 130230 AGGACTTGCAATTGTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 93530 18 + 636262 AGGACTTGCAATTGTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 85618 18 + 647215 AGAACTTGTAATTGTTCC + +a +s mr.mrrefChr0 88682 106 + 130230 CTCTTGGCCAGCCAATTTTCCAATATCTGGTAATAGGCAGAACCACCTCTTCTGTGAAGGCATTAGATTCCAATATAATGGAGGATGTCGATTCCTCTGAATGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 93549 106 + 636262 CTCTTGGCCAGCCAATTTTCCAATATCTGGTAATAGGCAGTACAACCTCCTCTGTGAAGGCATTAGATTCCAATATAATGGAGGATGTCGATTCCTCTGAATGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 85636 102 + 647215 CTCTTGGACAGCCAATTTTCCAATATCTGGTAATAGGCAGAACCACCTCTTCTG----GGCATCAGATTCCAACGTAATGGAGGATGTTGATTCCTCTGAATGTGC + +a +s mr.mrrefChr0 88788 418 + 130230 ACTGAAGTGAGATTCCTGGGTTAGTTTCACATTCAATGGCAGTGGGTCAATGTAGCAATGTCAACTTTTCAGCTATACTACTCTCCACTATCAACAATATTGGGGTCAGTTGAGCCAGGGTGCATAATGGAGGCACAACTTGTCCAGTCAGGAAGGATAGACATGCACATTGACTGTTGGGGCAATGCCAGCTAATATTATAAAGATCTGCCTGAGGGTGGAAAACTAGCATTCCCAAACTAATGTCCTAGAGATTTTTATGGGTACAGATGAAACAAAGTCACAAGGACCCTTTCAGCTCTATGAGGAGGAAGAATTGAGGGGCAAGTAATTACATGGCAGAGAAGGAACACAAATTGGAAACTTGTGCCCATGACAATGGTATCAAGTCAAATAGATTAATATATAATAAGCTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 93655 412 + 636262 ACTGAAGTGAGATTCCTGGGTTAGTTTCACATCCAATGTCAGTGGGTCAATGTAGCTACGTCAACTTGTCAGTTATACTACTCTCCTCTATCAACAATATTGGGGTCAGTAGAGCCAGTGTGCATAATGGAGGCACAACTTGTCCAGTCAGGAAGGATAGACATGCACATTGACTGTCGGGGCAATGCCAGCTAATATTCTAAAGATCTGCCTGAGGGGGGAAAACTAGCATTCCCAAACTAATGTCCTAGAAATTTTTATGGGTACAGATG------AGCCACAAGGACCCTTTCAGCTCTATCAGGAGGAAGAATTGAGGGGCAAGTAAATACATGGCAGAGAAGGAACACAAATCGGAAACTTGTGCCCATGACAATGGTACCAAGTCAAATAGATTAATATATAAAAAGTTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 85781 418 + 647215 ACTGAAGTGAGATTCCAGGGTTAGTTATACATTCAATGGCAGTGGGTCAATGTGGCAATGTCAACTTTTGAGCTATACTACTCTCCACTATTAACAATATTGGGATCAGTTGGGCCAGGGTGCATAATGGAGGCATAACTTGTCCCGTCAGGAGGGATAGACATGCACATTGACTGTTGGAGCAATGCTCGCTAATATTATAAAGACCTGCCTGAGGGTGGAAAACTAGGATTCCCAAACTAATGCCCTAGAGATTTTTGTGGGTACAGATGAAACAAAGTCACAAGGACCCTTTGAGCTCTATGGGGAGGAAGAATTGAGGGTCGAGTAATTACATGGCGGAGAAGGAATACAAATTGGAAACTTGTGCCCATGACAATGGTGTCAAGTCAAATAGATTAATATATAATAAGCTTAA + +a +s mr.mrrefChr0 89206 78 + 130230 TATACAATAATTAGATGCAAAATTGACTAAGCATCTGTGTGGACATGTGCTGATTGTTATATTAACTGCCTGTGCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94070 78 + 636262 TATACAATAATTAGATGCAAAATTGACTAAGCATCTGTGTGGACATGTGCTGATTGTTATATTAACTGCCTGTGCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86199 78 + 647215 TATACAATACTTAGATGCAAAATTGATAAAGCATTTGTGTCAACATGTGCTGATAGTAATATTAACTACCTGTGCCAA + +a +s mr.mrrefChr0 89284 161 + 130230 GCATATTGACATATACTATGACATGCTTAACTCTCTTACTTACAAGCCAAGGTTCCCTATTTTGCTTATACCTCACAGTGATCCAGATTGGCCCATGAGTTCATGTGAAAGGTTACATTAATCTATGTGCTATTAACACCTGTGGAAGGAGTGTGCCCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94149 161 + 636262 GCATATTGACATATACTATGACATGCTTAACTCTCTTACTTACAAGCCAAGATTCCTTATTTTGCTTAAACCTCACAGTGATCCAGATTGGCCCATGAGTTCATGTGGAAGGTTACATTAATCTATGTGCTATCAACACCTGTGGAAGGAGTGTGCCCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 86277 161 + 647215 GCATATTGACTTGTACTATGACATGCTCGACTCTCTTACTTACAGGCCGAGGTTCCCTATTTTGCTCGTACCTCACAGCGATCCAGATTGGCCCATGAGTTCATGTAAAAGATCACATTACTCCATGCACTATTGACACCTGTGGAAGGAGCATGCCCGCC + +a +s mr.mrrefChr0 89445 226 + 130230 CACTCACTGTCAAGGAATCACACTTGTATATCATAAGATGATCTAGCACCACACTGACAGTGATGTCTAGTTAGACATCTAATGCCCATGTTGAACTATTTCACACCACCATCTGGCATATAAATATAAGTAGACATCTGCATCATATGACAGCTGAAACTAGTCTGAGCAAAAGCATGTCCTGAGATGCGAGTATAGAAGTACCATCCAGTAAAAAGCACCTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94310 226 + 636262 CACTCACTGTCAAGGAATCACACTTGTATATCATAAGCTGATCTAGCACCACACTCACAGTGATGCCTAGTTAGACATCTAATGCCCATGTTGAACTATTTCACACCACCATCTGGCATATAAATATAAGTAGACATCTGCATCATATGACAGCTGAAACTAGTCTGAGCAAAAGCATGTCCTGAGATGCGAGTATAGAAGTACCATCCAGTAAAAAGCACCTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86439 226 + 647215 TACTCACCATCAAGGAACCACACCTGTATATCATAAGATGACCTAGTACCACACTGACAGTGATGTGTAGTTAGACACCTAATGCCCAGGTTGAACTGTTTCACACCACTACCTGGCATATACATGTAAGTACGCATCTGCATTATAGGACAGCTGGCGCTAGTCTGAGGAAAAGCATTTCCTGAGATGTAAGTTTATAAGCACCATCCAGCAAAAAGCACCTAAA + +a +s mr.mrrefChr0 89671 139 + 130230 TATCATAGCAATAGAATCAAACAGAATGTGGTTGAAGGCCTGACATGCCAACTACCCTTTGGCTATTATGACCGCTCCTCCCTCCTTTGGCCCCAAGCTATCAGTGGACACTTTGCTGAGCTGATATAACAACCTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94536 139 + 636262 TATCATAGCAATAGAATCAAACAGAATGTGGTTGAAGGCCTGACATGCCAACTACCCTTTGGCTATTATGACCGCTCCTCCCTCCTTTGGCCCCAAGCTATCAGTGGACACTTTGCTGAGCTGATATAACAACCTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 86671 139 + 647215 TATCATAGGAGTAGAATTGAAAAGGATGTGGTTGATGGTCTGACATGCCCACTACCCTTTGGCCATTATCACCACTCCTCCCTCATTTGGCCCCGAGCTATCAGTAGATGCTTTGCTGAGATTACATGACAAACAATCT + +a +s mr.mrrefChr0 89810 21 + 130230 CCATATTTCCAATTGGTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94677 21 + 636262 CCATATTTCCAATTGGTGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86810 21 + 647215 CCATATTCCCAAATGGTGACA + +a +s mr.mrrefChr0 89831 21 + 130230 CTTCAAAGTGTATTAACATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94730 21 + 636262 CTTCAAAGTGTATTAACATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 86831 21 + 647215 TTTCAAAGTACATTAAGACCT + +a +s mr.mrrefChr0 89852 127 + 130230 GGACTCAGAGACAGAAAATTGGAGCTATATAAAATATTGTATTCCATAGCCAAATGAAACAGTAACGGAATGGGCAGTCATGTGTGGTACACCCAAAAAGAAAATCTCAGGACGATTGTTATTGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94787 127 + 636262 GGACTCAGAGACAGAAAATTGGAGCTATATAAAATATTGTATTTCATAGCAAAATGAAACACTGACGGAATGGGCAGTCATGTGTGGTACACCCAAAAAGAAAATCTCAGGAAGATTGCTATTGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86852 116 + 647215 GGACTC-GAGACACAA------ATCTGTAT-GAATATTGTATTCCATAGCCCAATGAAACAGTAATGGAATGGGCAGTCACACTTGGTACACCTGAAAAGAAAATCTCAGGACCATTGTTAT---TG + +a +s mr.mrrefChr0 89979 92 + 130230 TTGTAACCAAAAGAGTGAAGGTAGACACTAAAACTCCGATCTCAGTAAACACCTTATGATTTACATACAGTCAAGGTTGGTTTTATCAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94914 83 + 636262 TTGTAACCAAAAGTGTGAAGGTAGACACTAAAACTCTGATCTCAG---------TATGATTTACATACAGTCAAGGTTGGTTTTATCGACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 86969 92 + 647215 TTATAACCAAAAGAGTGAAGGTAGACACTAAAACTCCGATCTCAGTAAACACCTCCTGATTTACATACAATCAAGGTTGGTTTTATCAACAT + +a +s mr.mrrefChr0 90071 58 + 130230 ACCAATTAAAAACCATACTGTTGTGAGTTTTTTGAGTTCTGTCTGCCACATAAAGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 94997 55 + 636262 ACCAATTAAAAACCATATTGCTGTGAGTTTTTT---TTCTGTCTGCCACATAAAGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 87079 58 + 647215 ACCAATTAAAATCCATACTGTCGTTAGTTTTTTGAGTTCTGTCTGCCACATAAAGGAG + +a +s mr.mrrefChr0 90129 55 + 130230 TTCAAGTCCCAATATAAAGGAGTTTAGCAGAATAATGGCACAGCAGGTAGAAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95052 55 + 636262 TTCAACTCCCAATAAAAAGGAGTTTAGAAGAATAATGGTACAGCAGGTAGAAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 87138 55 + 647215 TTCAGGCCCCAATATAAAGGAGTTTAGCGGAATAATGCCATAGCTCGTAGATAGA + +a +s mr.mrrefChr0 90184 90 + 130230 GCACTACCTGCATTGGTAGGTTGAGGCTTTCTTACTGAGCATCCCTCCTTGGCCTTTGCAATGGCCACTGACTGGACATGTCAAGAAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95119 89 + 636262 GCGCTACCTGAATGGGTGGGTTGAGTCTTTCTTACTGAGCA-CCCTCCTTGGTCTTGGCTATGGCCACGGACTGGACATGTCAAGAAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 87193 90 + 647215 GCACTACCCGCATTGGTAGATTGAGGCTTTCTTACTGAGAATCCCTCCTTGGCCTTTGGAATGGCCACTGACTGGGCATGTCAAGAAATG + +a +s mr.mrrefChr0 90274 162 + 130230 ATGGTTTCAAGCAAGATAGGGACACAAGGTTGTTATAAAACCAGCAATGTACTAATGGAAAGGGCCCAATCAAGGTACAGCACTTAGTTTATGTATTGACTCCTGTAGGAGTGCTGTGTGAGGTTGGTGTGATCATTACAAATAGTGGACTGAGCACTCGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95208 145 + 636262 AGGGCTTCAAGCAAGATCAGGACGCAAGGTTGTTAT---ACCAGCAATGTACTAATGGAAAG--------------ACAGCACTTAGTTTATGTATTGACTCCTGTAGGAGTGCTGTGGGAGGTTGGTGTGATCATTACAAATAGTGGACTGAGCACTCGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 87285 162 + 647215 ATGGTCTCAAGCTAGATAGGGACACAAGGTTGTTATAAAACCAGCAGTGTACTCATGCAAAGGGCCCAATCAAGGTACAGCACTTAGTTTATGTACTGACTGCTTTATGAGTGCTGTGTGAGGGTGGTGTAATCGTTACAAGTAGTGGACTGAGCACTCGGC + +a +s mr.mrrefChr0 90436 172 + 130230 AAGTAATTCAAGTAACCCTGATCTACCTGTCTGCATACTGATGCCGCATGGTGATTTCCGGGGATTTAAAATAACATAAGTACTGTGTGTGTAGCCTTGTCCTAAAACTTGCTGGTGGTCTATATAGTTACATGGCAATAATGGCATTTTCTATGAAGAATGTGAGGGAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95355 164 + 636262 AAGTAATTCAA--------AATCTGCCTGTCTGCATACTGATACCGCATGGTGATTTCCGGGGATTTAAAATAATATCAGTAGCGTGTGTGTAGCCTTGTCCTAAAACTTGCTGGTGGTCTACATAGTTACATAGCAATAATTGCATGTTCTATGAAGAATGTGAGGGAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 87447 167 + 647215 AAGTAATCCAAGTAACCCTGATCTACCTGTCTGCATACTGATGCCATAAGGTGATTTCCAGATATTTAAAATAACATAAATACTGTGTGTCTAGCCTTGTCCTAGAA----GTGGTGGT-GATATAGTTACATGGCAATAATGGCAATTGCTATGATGAATGTGAGGGAGGT + +a +s mr.mrrefChr0 90608 32 + 130230 CATTGGCCACCTCCTGCTTCTGGCATAGCTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95519 32 + 636262 CATTGGCCACCTCCTGCTTCTGGCATAGCTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 87615 32 + 647215 CACTGGCCACCCCCTGCCTCTGGCATAGCTTC + +a +s mr.mrrefChr0 90640 157 + 130230 GGTAGACCTGGTAAGTACCAGTAAATGGACACAAGTATAAGCTACATATAGGACCATGACAAACAATAAAGTCAGTTAATGACAACTCTTTTCAGAGAATCAAAAGAAAAGGCAAATGCAGTCTACTTAGATAGGAACGGCAATTAAAATATGCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95563 157 + 636262 GGTAGACATGGCAAGTACCAGTAAATGGACACAAGTATAAGCTACATATAGGACCATGACAAACAATAAAGTCAGTTAATGACAACTCTTCTCAGAGGATCAAAACAAAAGGCAAATGCAGTCTACTTAGATAGGAACGGCAATTAAAATATGCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 87647 134 + 647215 AGTAGAGCTGGTGAGTACTATTAAATGGAC-CAAGTATAATATACATATAGGACCATGGGAAATAATACAGTCAGTCAATGACAACTCTTTTCAGAGAATCAAAAGTAAAGGTGAACGCAGTCTACTTAGATAGA---------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 90797 10 + 130230 AAAATTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95726 10 + 636262 AAAATTATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 87781 8 + 647215 --AATCATTG + +a +s mr.mrrefChr0 90807 59 + 130230 TTGGTGCTAATAATTTATGGAAAATTAAAGTAGACAACATTCCCGTTACTAGCTTTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95736 59 + 636262 TTGGTGCTAATAATTTATAGAAAATTAAAGTAGACAACATTCCCGTTACTAGCTTTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 87790 25 + 647215 TTGGTGCCAATAGTTTATGGCAAAT---------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 90866 22 + 130230 AGTACCAATAAGTTCATAAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95796 22 + 636262 AGTACCAACAAGTTCATAAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 87815 15 + 647215 -------ATAAAGTCATAAAGA + +a +s mr.mrrefChr0 90888 117 + 130230 AAGGGGCGGGACTAACCATAGTGTGGTGTTATTATCCACATTCTTACTCTATGCCTCTTAAAGATTGCTCCTGGCCACATGTCACTGGATTCATGAGCCTGATAAGTTTTGGCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95820 116 + 636262 AAGGGGCGGGACTAACCATAGTGT-GTGTTATTATCCACATTCTTACCCTATACCTCTTAAAGATGGCTCCTGGCCACATGACACTGGATTCATGAGTCTGATAAGTTTTGGCTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 87830 117 + 647215 AAGCGGTGGGACTAACCATAGTGTGGTGTTATTATCTACATTAATCCTCTATGCCTCTTAAAGATTGCTCCTTGCCACATGTCATTGGGTTGATGAGCGCGATGAGTTTGGGCTGCA + +a +s mr.mrrefChr0 91005 277 + 130230 GGGAACATTAATAGCATTGATGTACATGGATTAGGTGTGATATAACCTAAGGAATAATAATGCATCTCAAGTGATGATATATTCATCACCTTTGTTTAGGATAAAGAGCTGCAAACTGAAAAATGACATATGAACTGTTAATGTTGTTTGGCTGGCTGTGGGACCCAGCACTTTTTATGGATCTTGACCAATCACAGCTTTGCATGCTAAATACAACTGCCATCTACATACTTCATGTCAAATACACAATTGATGGATTGAGCACTGTCATGTATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 95936 276 + 636262 GGGAACATTAATAGCATTGATGTACACGGATTGGGTGTGATATAGTCTGAGGAATAATAATGCATCTCAAGTGATGATATATTCATCACCTTTGTTTAAGATAAAGAGCTGCAAACTGAAAAATGACATATGACTTGTTAATGTTGTTTGGCTGGCTGTGGAACCCAGCACTTTTTATGGATCTTGACCAATCACAGCTCTGCATGC-AAATACAACTGCCATCTACATACTTCATGTCAAATATACAATTGATGGATTGAGCACTGTCATGTATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 87949 277 + 647215 GGGAGCATTAATAGCATTGATGTACATGGATTAGGTGTGATATAACCTAAGGAATAACAATGCATCTCAAGTGATGATACATTCATCACCTTTGTTTAGGATATAGAGCTGTAAACTGAAAAACTGCATATGAACTGTTAATGTTGTTTGGCTGGCTGTGGGACCCAGAACTTTTTATGGATCTTGACCTATCACAGCTTTGCATGCTAAATACAACTGCCTTCTACATTCTGCATATCAATTACATGATTAATGGATTGAGCACTGTCATGTTTAT + +a +s mr.mrrefChr0 91282 61 + 130230 GTTGTGATGGTTGTGTCTTCAATACTGCTAATTGTTCTGTATTAAGCCATTAGCCTTGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96216 60 + 636262 GTTGTGGTGGTTGTGTCTTCAAT-CTGCTAATTGTTCTGTATTAAGCCATTAGCCTTGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 88226 61 + 647215 GTTGTGATGGTTGTGTCTTCAATACTGTTACTTGTTCTGTATTAAGCCATGAGCCTTGAGG + +a +s mr.mrrefChr0 91343 11 + 130230 CATATTTATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96277 11 + 636262 CATATTTATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 88287 11 + 647215 CATATTTATGA + +a +s mr.mrrefChr0 91354 26 + 130230 CTAATGGGGTACTGACCTCTGATCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96288 26 + 636262 CTAATGGGGTACTGACCTCTGATCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 88301 26 + 647215 CTAATGGGGTACTGACCTCTGATCCT + +a +s mr.mrrefChr0 91380 32 + 130230 TAACATCTACAGAAGGGCTGCTTGCCTCTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96314 32 + 636262 TAACATCTACAGAAGGGCTGCTTGCCCCTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 88408 28 + 647215 TTACGTCTACA----GGCTGCTTGCCTCTGGC + +a +s mr.mrrefChr0 91412 138 + 130230 TCATAGGATGGTGCTGTTACACTTCTCATCCATGGTTCCTAGCTTTTTTGTGATGTTGCTGTGCTTGCAGTATACACCATGGTGCAGTATACACCATGTTTCAACTGGTCTAGCTAAAATTGTCAGTGGGTAAGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96346 138 + 636262 TCATAGGATGGTGCTGTTACATTTCTCACCCATGGTTCCTAGCTTTTTTGTGATGTTGTTGTGCTGGCAGTATACACCATGGTGCAGAATACAGCATGTTTCAACCAGTCTAGCTAAAACTGTCAGTGGGTAAGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 88441 138 + 647215 TCATAGGATGGTGCAGTTACACTTTTCATCCCTGGTTCCTAGCTTTTTTGTGGTGTTGCTGTGCTTGCAATATACACCATGGTGCAGTATACACCATGGTTCAGCTGGTCTAGCTAAAATTGTAAGCTGGTAAGCACA + +a +s mr.mrrefChr0 91550 7 + 130230 AATACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96484 7 + 636262 ACTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 88582 7 + 647215 AATACAA + +a +s mr.mrrefChr0 91557 62 + 130230 TATATACTAATGAAAACTGATAAAGATGTTGGAGCTCAGATAATTGTATTTCGTCTGGATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96491 61 + 636262 TATA-ACTAATGAAAACTGATAAAGATGTTGGAGCTCAGATAATTGTATTTCGTCTGGATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 88596 62 + 647215 TATATGTTAATGAAAACCGATAAGGACGTGGCAACCCAGATAATCGCATTACGCCTGGAACA + +a +s mr.mrrefChr0 91619 7 + 130230 TACACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96552 7 + 636262 TACACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 88662 7 + 647215 TATGCAA + +a +s mr.mrrefChr0 91626 108 + 130230 ATACTGTGGGGGCCATGTAATTGCAGTTACAGTGAGGGACTAGCTTAACTCATACACCAGGATATGGGTGCACCAGGATATGGAGGGATATGCAAGATACTGATTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96559 108 + 636262 ATACTGTGGGGGCCATGTAATTGCAGTTACAGTGAGGGACTAGCTTAACTCATACACCAGGATATGGGTGCACCAGGATATGGAGGGATATGCAAGATACTGATTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 88670 108 + 647215 ATACTATAGGAGTCATGCAATTGCAATCACAGTGAGGGACTGGCTTAACTTGTGCACCTGGATATGGGTGCACCAGGATATGTAGGGGTATGGGAGATACTGATTGCA + +a +s mr.mrrefChr0 91734 31 + 130230 ACAACATTAAGATTGCATCAAACATTAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96667 31 + 636262 ACAACATTAAGATTGCATCAAACATTAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 88783 31 + 647215 AAAACATTAAGATTGCAACAAACATTAATTT + +a +s mr.mrrefChr0 91765 40 + 130230 ATTGGCCTTAAAAATTGATTTCCCCACTCCTAAGGTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96698 40 + 636262 ATTGGCCTTAAAAATTGATTTCCCCACTCCTAAGGTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 88815 40 + 647215 ATTGGCCATAAAAATTGAGTTCACTGCTCCTAAGGTTATT + +a +s mr.mrrefChr0 91805 176 + 130230 GACAAATTTGTAAGAAACACCAGGTGAGCAGGTTCATATGATTTCAATCCAATTCGCAGATCCTACTTTGCATCATTTAGTACTGCTATATGCATAATCCTGGCTTAGCCCAATGACCTTTCTGCTGAAAGCCACTTCCCACGATTATAGGCACATCTGACACTCAGATCTCCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96738 169 + 636262 GACAAATTTGTAAGAAACACCAGGTGAGCAGGTTCATATGATTTCAATCCAATTCGCAGATCCTACTTTGTGTCATTTAGTCCTGCTATATACATAATCCTGGCTTAGCTAAATGACCTTTCTGCTGGAAGCCACTTCCCACGATTAAAGG-------GACACTCAGCCCTCCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 88857 176 + 647215 GACAAAATTGTAGGAAGCACAAGGTGAACAGGTTCATATGATTCAATCCTATTTTGCAAATCTTACTTTGCATCATTTAGTACTGCTATATGCATAGTCCTGGCTTAGCCCAATGACCTTTCTGCTGAAAGCCACTTCCCACAATTATCGGCACATCTGACACTCAGATGTCCCAT + +a +s mr.mrrefChr0 91981 28 + 130230 CCTCTTTTGGCTAGTCAGGTCACACCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96907 28 + 636262 CCTCTTTTGGCTAGTCAGGTCACACCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 89034 28 + 647215 CCTCTTTTGACTAGCCAGGTCACAGCCT + +a +s mr.mrrefChr0 92009 319 + 130230 TTAAATTGTTTAATGATGTCTACACATTTCTAGTCTAAACATTTCTAATGTTCACAAATTTAACAAGAACACCTGTAAGTATAAGCCTAGTATTGTGTGCATGGTGTGGAATTGTGCTCTTTTATTCATGTCATAGCTGACATCCCCATAAAGAATCCTCTGATGGAAGCCCAGTGTAAGTCTTAACTGGTACTTGTTCATAGGCTGGATAGAGAAGAGAACACATGGTCTGAATTGGATTCCAAAGCAGTAACAAAATAGATTCCAAAACAGCAGTGTATCTAGATATGGTTCTATTCATGTTTTCAAATTGGAATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 96935 318 + 636262 TTAAATTGTTTAATGATGTCTACACATTTCTAGTCTAAACATTTCTAATGTTCACAAAATTAACAAGAACACCTGTAAGTATAAGCCTAGTATTGTGTGCATGGTGTGGAATTGTGCTCTTTTATTCATGTCATAGCTGACATCCCCATAAAGAATCCTCTGATGGAAGCCCAGTGTAAGTCTTAACTGGTACTTGTTCATACGCTGGATAGAGAAGAGAAT-CACGGTCTAAATTGGATTCCAAAGCTGTAACAAAATAGATTCCAAAACAGCAGTGTATCTAGATATGGTTCTATTCATGTTTTCAAATTAGAATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 89067 307 + 647215 TTGAATTGTTCAATGAAGTCTACACATTTCTAGTCTAAACAATTCGAATGTTTGCAAATTTATCAAGAACACCCATAAGTATAAGCCTTGTATTGTGTGCATGGTGTGGAATTGTGCTCTTTTATTTATGTCATAGCTGACATCCCCATAAAGAATCCTCTGATGGAAGCCCAGTGTAAATCTT-ACTGG-----------AGGCTGGATAGAGAAGAGAACACATGGTCTGGATTGGAGTCCAAAGCAGTAACAAAATAGATACTAAAACAGCGGTGTATCTAGAGATGGTTCTATTCATGTTTTCAAATAGGAGTGC + +a +s mr.mrrefChr0 92328 173 + 130230 ATCAAAAATTATGAATAGCCTAGTGTGATTGATGCATATGAGATTAAAACAGAGCCCACTTCACTACAAATTGGTTGTAAACATATCAGACTATATTTTACTAATGCTTTGGGATCGACTTTTGTTCTATCATACCCTCCCGATAATCATATACTTAGATGAGGCCCCCTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97253 173 + 636262 ATCAAAAATTCTGAATAGCCTAGTGTGGTTGATGCATATGAGATTAAAACAGAGCCCACTTCACTACAAATTGGTTGTAAACATATCAGACAATATTTTACTAATGTTTTGGGATCGACTTTTGTTCTATCATACCCTCCCGATAATCATATACTTAGATGAGGCCCCCTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 89375 173 + 647215 ATCAAAAATTATGAACAGCCTAGTGTAATTGCTGCATATGAGATTGGAACAGAGTGCACTGCACTACAAATGGGTTGTAAACATATCAGACTATATTTTACTAATTCTTTGGGATTGACTCTTGTTCTATCACCTCCACCCGAGAATCACATACTCTGATGTGCTCCGCTCTG + +a +s mr.mrrefChr0 92501 211 + 130230 GAAACAATAAATGTTTCATGAACTGGCCCTCTCTTCAACAGTAGGCAAGCTCCCCTAGGTATTGTCTGTCCACATTTCTTGAGCTAAGCATATTTGTATGAATCACTCTACAAAGAGCCAAGTGGTTTTTCTGGTCAACATAAATTCTAGATGTCATCTTAATGTAGGGTTATATGCCTGCCATTGAGAATGTATTTCTGCGGAAGCAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97427 211 + 636262 GAAACAATAAATGTTTCATGAACTGGCCCTCTCTTCAACAGTAGGCAAGCTCCCCTAGGTATTGTCTGTCCACATTTCTTGAGCTAAGCATATTTGTATGAATCACTCTACAAAGAGCCAAGTGGTTTTTCTGGTCAACATAAATTCTAGATGTCATCTTAATGTAGGGTTATATGCCTGCCATTGAGAATGTATTTCTGCGGAAGCAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 89548 211 + 647215 AAAGCAATAACTGATTCATGAACTGGCCCTCTCTTTAGCAGTAGGCATGCTTCCCTAGGTATTGTATGTTGACATTTCTGGAGCTAAGCATATTTGCATGTATCACTCTACAGTGTGCTAAGTAACTTGTCTTACTAACATAACTTCTAGGTGTCATCTTAATGTGAGGCTATGTGCCTGCCATTAAGAGTATATTGCTGCAGCAGCAATT + +a +s mr.mrrefChr0 92712 29 + 130230 GGACTTACTGAGCTTAACTTTGTTCTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97638 29 + 636262 GGACTTACTGAGCTTAACTTTGTTCTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 89760 29 + 647215 GGACTTACTGAATTTAACTTTATTTAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 92741 42 + 130230 TTAACACAGTGCCTCATGCAACACCCCAGTAAAAGACAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97667 42 + 636262 TTAACACAGTGCCTCATGCAACACCCCAGTAAAAGACAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 89805 42 + 647215 TTCACACAGTGCCTCATGCAACACTCCAATAAAACGCAAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 92783 69 + 130230 CATCCGGGTATATGAGGCTAGTGCTTGGAGCTATACCAATGTAATACTATACTTCATGATCTCTCTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97709 69 + 636262 CATCCGGGTATATGAGGCTAGTGCTTGGAGCTATACCAATGTAATACTATACTTCATGATCTCTCTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 89854 69 + 647215 CGGCCAGGTATGTGCAGTTAGGGTTTTGAGCTATAACAATTTAATACTATATTTCACAGCCTCTCCTGT + +a +s mr.mrrefChr0 92852 12 + 130230 ATGAGCCTTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97778 12 + 636262 ATGAGCCTTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 89925 12 + 647215 ATGTGCCTTTAT + +a +s mr.mrrefChr0 92864 62 + 130230 TCTTCTTCTGCTTTGGCAATGGATCTGTAATGTTGTAAAACATCTGCCTAAACAGTTTATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97791 62 + 636262 TCTTCTTCTGCTTTGGCAATGGATCTGTAATGTTGTAAAACATCTGCCTAAACAGTTTATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 89937 62 + 647215 TCTTCTTCTGACTTGGCAATGGACCTGTAATGTTGTAAAACACCTGCCTAAATAATTTATAC + +a +s mr.mrrefChr0 92926 189 + 130230 CCCTAAGCCTTATTTAAGAGAAGCAGCTTTGCAAAGCTATGCTTGGTCATGCCCGCCAGTTAATTTGTTTATATTGTGTTCTTCGGAGATGTATTTTCTATGATCAGGATCGGTTTGGTATGTATGCCATGACTGCTAACAAAGAATTTAACAGGTTCAAAGGAGAAATCAATGCCCAGGTAGACTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 97855 189 + 636262 CCCTAAGCCTTATTTAAGAGAAGCAGCTTTGCAAAGCTATGCTTGGTCATGCCCGCCAGTTAATTTGTTTATATTGTGTTCTTCGGAGATGTATTTTCTATGATCAGGATCGGTTTGGTATGTATGCCATGACTGCTAACAAAGAATTTAACAGGTTCAAAGGAGAAATCAATGCCCAGGTAGACTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 89999 189 + 647215 CCACTATCCTTATTTGAGAGAAGCAACTTTGCAAAGCTACACTTGGTCATGCCTGCCAGTTAATTTGTTTATATTGTGTTTGCGGGAGATGTATTCTCAATGATTAGGATCGGATTGGTATGTGTGCCACAATTGTTAACAAAGAGTTGAACAGATTCAAGGGAGAACTCAACATCCAGGGAGACTGGT + +a +s mr.mrrefChr0 93115 31 + 130230 GGCACCTCCTAACCTGGTGATGAGTACTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98044 31 + 636262 GGCACCTCCTAACCTGGTGATGAGTACTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 90189 31 + 647215 GGCACCACCTAACCTGGTGATCAATACCTTT + +a +s mr.mrrefChr0 93146 34 + 130230 CCTAGCTGAGGTTGTGTATGTGACTTTACTGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98081 34 + 636262 CCTAGCTGAGGTTGTGTATGTGACTTTACTGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 90220 34 + 647215 CTAAGCTGAGTTTGTGTATGTGACTTTACTACTT + +a +s mr.mrrefChr0 93180 35 + 130230 AGCTCACAGTAGGTGTGCTTCTCACTCCCCTGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98116 35 + 636262 AGCTCACAGTAGGTGTGCTTCTCACTCCCCTGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 90254 35 + 647215 AGCTCACAATAAGTGTGCTTCTCACTCCCCTGGGA + +a +s mr.mrrefChr0 93215 213 + 130230 GAACATATAGATTCAAGGCAACACACTCTCTATGGGTATGGAAATATCAAAGTAAATTGGTTATGTGCATCACATTTTATTGCAAGTCTGTCAAAACTTGCTACGTCTGGGATTATCTTTGGTTCCCACCGACACAATGGTGTTACAGAATGTATTTAGTGACAATTAATCACTTTTTGAGGTCTGCATGACCTCTAAAATATCAGTTTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98151 213 + 636262 GAACATATAGATTCAAGGCAACACACTCTCTATGGGTATGGAAATATCAAAGTAAATTGGTTATGTGCATCACATTTTATTGCAAGTCTGTCAAAACTTGCTACGTCTGGGATTATCTTTGGTTCCCACCGACACAATGGTGTTACAGAATGTATTTAGTGACAATTAATCACTTTTTGAGGTCTGCATGACCTCTAAAATATCAGTTTTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 90292 213 + 647215 AAACATATAGTCCCAAGGCAGCACCCTCTCTATGGGTATGGAAATATCAAAGTAAAATTGTTAGGTTCACCACATTCTATTACAAGACTGTCAAATCTTGCTACTTCTGGGACTTTCGCTGGCTCCTACCAACACAAAGGTGTTGTAGAATGTATTGAAGGACAATTAATCATTTTTTAAAGTCTGCATGACCCCAAAAATATCAGCTTACCA + +a +s mr.mrrefChr0 93428 43 + 130230 ACTAGCATTCAACCAGACAGTTTTTTACTGGTTAGGACTATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98364 43 + 636262 ACTAGCATTCAACCAGACAGTTTTTTACTGGTTAGGACTATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 90513 43 + 647215 ACTAACATTCAACCAGACAGTTCTCTACCAGTTAGGACTAGCC + +a +s mr.mrrefChr0 93471 38 + 130230 ATCCTTTCCCACAAGATGCCGACCCTGTAAGATATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98407 38 + 636262 ATCCTTTCCCACAAGATGCCGACCCTGTAAGATATTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 90557 38 + 647215 ATCCTGTCCCACAAGATGCAGACCTTGTAAGGTTTAAA + +a +s mr.mrrefChr0 93509 42 + 130230 TTTTTTTTACTGATTTTGCAGGTCATATTGAATGACTATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98448 42 + 636262 TTTTTTTTACTGATTTTGCAGGTCATATTGAATGACTATTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 90595 42 + 647215 TACATCCCACTGGCTTTGCAGATCATATTGAAGGACCATTAA + +a +s mr.mrrefChr0 93551 38 + 130230 TCGTTTTCTGAGTCCTGCACGACCTCTATAATATCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98490 38 + 636262 TCGTTTTCTGAGTCCTGCACGACCTCTATAATATCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 90639 38 + 647215 TCATATTCTCAGGCCTGCCTGACCTCTATAATATCAGC + +a +s mr.mrrefChr0 93589 55 + 130230 TACCAACTAGCATTCAACCATACAGTTCTCCTATCCTATTGTTTCTCATAAGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98528 55 + 636262 TACCAACTAACATTCAACCAGACAGTTCTCCTATCCGACTGTTTCCCATCAGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 90678 54 + 647215 TAACGGCTAGCATT-ACTCCTTCAGTTGTCCTATCCTATTGTTTCTCACAAGATG + +a +s mr.mrrefChr0 93644 6 + 130230 GACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98583 6 + 636262 GACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 90734 6 + 647215 GACTAC + +a +s mr.mrrefChr0 93650 36 + 130230 TTGCAAGGTTTAAGCATCTCTCCATCTGGCTACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98589 36 + 636262 TTGCAAGGTTTAAGCATCTCTCCATCTGGCTACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 90743 13 + 647215 TTG--AGGTTGTAGC--------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 93686 9 + 130230 CCTTGTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98626 9 + 636262 CCTTGTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 90756 9 + 647215 CCTTGTCCT + +a +s mr.mrrefChr0 93695 8 + 130230 TACAGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98643 8 + 636262 TGCAGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 90765 8 + 647215 TACAGGGT + +a +s mr.mrrefChr0 93703 84 + 130230 GTGGTCTAATTTGTGGGAAGCCTAGGATATGTTTGCCAAACTCTCTCACCAGCAAAACACCAGCAAAACTTGACCCAGAATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98651 84 + 636262 GTGGTCTAATTTGTAGGAAGGCTAGGATATGTTTGCCAAACTCTCTCACCAGCAAAACACCTGCAAAACTTGCCCCAGAATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 90774 82 + 647215 CTGGTCTAATTTGTGGGAAGCCTAGG--ATGTTTGTCAAACTCTCTCACCAGCAAAACACCAGCAAAACTTGACCAAGAATCCT + +a +s mr.mrrefChr0 93787 187 + 130230 GTTTTAAGTTGTAATAGTTATCAGATTATATTAACTCTTTAAATACAATTAGATAATTGTTGTAGTAATACAAAATAATTAAATAAGCAGCAAGTGCCTCAAACTTCTTGTCACATCAGTCTAACAACTCCTACACAAATACACAATGCCATTTTTGTTGCCATCCAGGCCACAAGAAGCTTGCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98735 187 + 636262 GTTTTAAGTTGTAATAGTTATCAGATTACATTAACTCTTAAAATACAATTAGATAATTGTTGTAATAATACAAAATAATTAAATCAGCAGCAAGTGCCTCAAACTTCTTGTCACATCAGTCTAACAACTCCTACACAAATACACAATGCCATTATTGTTGCCATCTAGGCCACAAGAAGCTTGCCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 90859 186 + 647215 CTTTTAAGTTGTAATATTTATCAGATTATCTTAACTCCTTAGGTACAATTAGATAATTGTTGTAGTATTAGAAAATAATTAAATAGGCAGCAAGTACC-CAAACTTCTTGTTACATCAATCTGACAACTCCCACACAATTACATAATGCCATTTTTGTTCCTATCCAGGCCACAAGGAGTTTGCCAA + +a +s mr.mrrefChr0 93974 103 + 130230 CCCCACAAAAACAGGAATCATTCCAGCTTACTACTAACTTGCTAGGCTCAAAATTTGTCAATTTATGAGCAGCTGGAATGTGGGGTTGGTAAATACCATATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 98922 103 + 636262 CCCCACATAAACGTGGATCATTCCAGCTTACTACTAACTTGCTAGGCTCGAAATTTGTCAATTTATGAGCAGCTGGAATGTGGGGTTGGTAAATACCATATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 91046 103 + 647215 CCCCACAAGAACAGGAATCATTCCAGCTTACTATTAGCTTTCCAGGCTCAAAATTTGTCAATTCATGAGCAGCTGGAATGTGGGGTTGGCAAATACTATATAT + +a +s mr.mrrefChr0 94077 9 + 130230 GTTGGTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99039 9 + 636262 GTTGGTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 91149 9 + 647215 GATGGTGAA + +a +s mr.mrrefChr0 94086 22 + 130230 ACGATCATTAGGTTTATTAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99049 22 + 636262 ACCATATTTAGGTTTATTAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 91158 22 + 647215 ACGAACATTAGGTTTAATTGGA + +a +s mr.mrrefChr0 94108 114 + 130230 CCATTAGGCTTTGGGCACATGAACCATTGACTTTAGTGAAAAGCCTGTAGCCTAGTTCAGAATTCCTTAATTCACTAGCCCGGCTCACACCCCATATAATGACTGTCCGTCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99085 114 + 636262 CCATTAGGCTTTGGGCAAATGAACCATTGACTTTAGTGAAAAGCCTGTAGTTTAGTTCAGAATTCCTTAATTCACTAGCCCGGCTCACACCCCATATAATGACTGTCCGTCTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 91180 112 + 647215 CCACTGGGCTTTGGGCACATGAACCATTCACTTTAGTG--AAGCCTGTAGCCTAGTTCAAGATTCCTCCGTCGACTAGGCCGGCTCACACCCCATATAACAACCTTCCATTTAG + +a +s mr.mrrefChr0 94222 31 + 130230 AACTCCTAAAATGGATGTGCAGCAACCCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99201 31 + 636262 AACTCCTAAAATGGATGTGCAGCAACCCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 91292 31 + 647215 AACCTCCTAAATGGATCTGCAGCAACCCCCT + +a +s mr.mrrefChr0 94253 40 + 130230 AACAGGAAAATAGGATATAGGACAGTTTCCAGAGAGGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99232 40 + 636262 AACAGGAAAATAGGATATAGGACAGTTTCCAGAGAGGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 91324 40 + 647215 AACCGGGAGATAGGATATAGGAGAGTTTCCAGAGAGGACC + +a +s mr.mrrefChr0 94293 13 + 130230 GGCTCCTGTTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 91365 13 + 647215 GGCTCCTGTTTAT + +a +s mr.mrrefChr0 94306 78 + 130230 TCTTAAACATATTGCTCAACCACCTCTTTGGGAATTTGCATCCGCTTGCTTCAGCTCATTGATGAAGATATGGAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99272 53 + 636262 -------------------------CTTTGGTAATTTACATCCGCTTGCTTCAGCTCATTGATGAAGATATGGAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 91381 77 + 647215 TCTTAAACATATTGCTCAACCACCTCTTTGGGAATTTGCACCCACTCGCTTGAGCCCATTGATGAA-ACAGGCAGCAT + +a +s mr.mrrefChr0 94384 42 + 130230 GCAGCATATGTGGGCAGGCAATTCCTAGGATTTCTCAATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99325 42 + 636262 GTAGAATATGCGGGCAGGCAATTCCTAGGATTTCTCAATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 91463 42 + 647215 GCAGCATTTGTGGGCAGGTAATTCCTAGGATATCTCAATTCA + +a +s mr.mrrefChr0 94426 92 + 130230 CTTAGACAAATCAGATTCATGCACCAAGAACTAACCAAACGCCTCTTCTTGGGAATGTGAAATGGCGACATGCGGAACAATAAATTCTGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99368 91 + 636262 CTTAGACAGATCAGATTCATACACCAAGAACTAACCAAAC-CCCCTTCTTGGGAATGTGAAATGGCGACATGCGGAACAATAAATTCTGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 91505 91 + 647215 CTTATACAAATCAGAATCATGCAC-AAGAACTAACCAAATGCCTCCTCTTGGGAATGTGAAATGGTGACATGCAGAACATTAAATCCTGTCT + +a +s mr.mrrefChr0 94518 85 + 130230 GGAGTCCTCAATGCTTTCTCCAAGGGTAGAGTCCTTAGTGCTTTTTTGAAGAGGCCTCTGTGTATGCAGACTGTTGTAATGTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99474 85 + 636262 GGAGTCCTCAATGCTTTTGTCAAGGGTAGAGTCCTTAGTGCTTTTTTGAAGAGACCTTTGTGTATGCAGACTGTTGTAATGCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 91596 85 + 647215 GAAGTCCTCAATGCTTTCTCCAAGGGTAGAGTCCTTAGTGCTTGTTTGAAGAGGCCTCTGTATATGCAGACTGTTGTGATGTCAG + +a +s mr.mrrefChr0 94603 26 + 130230 TGCCAATGGAAAATACCACCAACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99559 26 + 636262 TGCCAATGGAAAATACCACCAACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 91682 26 + 647215 TGCCAATGGAAAATACCACCATCACA + +a +s mr.mrrefChr0 94629 3 + 130230 AGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99586 3 + 636262 AGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 91708 3 + 647215 AGA + +a +s mr.mrrefChr0 94632 184 + 130230 TATTAAGTCACAGAACAGTGGAGTGATTCAGAAGCCTCCCATCACCAGGACTAATGAACCTAAAAAAGGGTATTGACAGGCAGGTCATATTTCAGACAAACATTTGGCCATCACAAACTAAGGTTTCACATGGGACTTAAACAATGACAACTTCCAGAGGACATGACCTCTATCATGGGGTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99597 139 + 636262 TATTGAGTCACAGAACAGTGGAGTGATTCAGAAGCCTCCCATCATCAGGGTTAAT---------------------------------------------CATGTGACCATCACAGACTAAGGTTTCACATGGGACTTAAACCATGACTACTTCCGCAGGACATAACCTCTATCATGGGGTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 91711 184 + 647215 TATCAAGTCACAGACCAGTGGAGTGATTCAGAAGCCTCCCAGCACCAGTACTAATGAACCTAAAAAAGGGTATTGACAGGCAGGTCATATTTCAGACAAATATTTGGCCATCACAAACTAAGGTTTCACATGGGACTTAAACAGTGACAACTTCCAGAGGACATGTCCTCCATCACGGGGTTGG + +a +s mr.mrrefChr0 94816 410 + 130230 TGCATACACCAACTTGACCTGTTTCGATGGTGCTGGGATACTTCATACAACAGATATAGTGTATCAAGATAGCCTACATCAGGTCTGCAAACCTATATCAAAGTTTAATGAATGGGTTACAATAGCTAATTGCATTGGATAGTCACGTACATACACATAATTAATGAAGGCCACCGACACTGGTATGAGCAAAGTAGGCTTTTCCATGCAACCCCCACATCTATGCTCCCTCCCTCCATACTATACTTGTCCAGCCATGCAGGTGATTATGACTAACCACTCTGCCCATCACTGTTAGGCAAGTATACCACCAACACTTGTACTGTCCGCTGGGTTATCTAAGGCATAATTAATGTAGTATTGGTAGAACAAATAGTTGACACCCAAGATGGCTTACTTTGTCCACAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 99736 407 + 636262 TGCAAGCACCACCTTGACCTGTTTCGATGGCGGTGGGATACTTCACACAACAGATATAATGTATCAAGATAGAATACATCAGGTCTGCAAACGTATATTAAAGTTTAATGAATGGGTTACCATAGC---TTGCATTGGATTGTCACGTACATACACATAATTAATGAAGGCCACCGACACTGGTATGAGCAAAGTAGGCTTTACCATGCAACCCCCACATCTATGCTCCCTCCCTCGATACTATACTTGTCCAGTCACACAGCTGATTATGACTAACCACTCTGCCCATCACTGCTAGGCAAGTATACCACCAACACTTGTACTGTCCGCTGGGTTATCTAAGGCCTAATTAATGTAGTATTGATAGAACAAATAGTTGACACCCAAGAGGGCTTACCTTGTCCACAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 91896 397 + 647215 TGCATACACCGATTTGACCTGTTTACATGGTGCTCGGATGCTTCATGCAACAGTTATAGTGTACCAAGCTAGCCTACATCAGGTATGCAAACCTACATCAAAGT--------TAGGTTACAATAGCTAATTGCATTGGATAGTCACATATGTACACATGATTAATAAGGGTGACCCACATCGGTATGACCAAAGTAGGCTTTTCCTTGCAACCTCCACATCTATGCTCCCTCCCTCCACACTATCCCTGTCCAGCCATGCAGGTGATTATGACTAACCATTCTGCCCAT-ACTGTTAGGCAAGTATACCACCAACACTTGTACTGTCTGCTGGGTCATCTAAGGCATAATTAATGTAGTATTCGTAGAACTAATAGTTGACACCCAAGATGGCTTACTGT----ACAGGA + +a +s mr.mrrefChr0 95226 143 + 130230 TGATTCGACAATTTCTCTTGACAGGCTTTTGAAACTAACTAAGTTTTGGTGACATCTAGAGCCATGTCAAGTGCCACTTACACAATGTTCCATTTACTTAACCAACGTGTGGCCAAAATATCATTTCTAACCAGACCAGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100144 142 + 636262 CGATTCGACAATTTCTCTTATCAGGCTTGCGAAACTAACTAAGTTTTGGTGACATCTAGAGCCATGTCAAGTGCCACTAACACAATGTTCCATTTACTTAACCAACGTGTGGCCAGAATATCATTTCTAG-CAGACCAGCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 92293 143 + 647215 TGATTCGACAATTTCTCTTGAGAGGCTTTTGAAACTAACTAAGTTGTGGTGACATCTAGAGCCATGTCAAGTGCCACTTACACGATGTTCCATTTACTTAATCAATGTATGGCCAAAAAATCATTTCTAACCAGACCAGTGTG + +a +s mr.mrrefChr0 95369 20 + 130230 GCAACTGTACAATATCTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100286 20 + 636262 TCAACAGTGCAATATCTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 92438 20 + 647215 GCAACTGTACAAAATCTGGC + +a +s mr.mrrefChr0 95389 33 + 130230 TCCTGCAATTGGTAGGGCATTCATGGTATACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100306 33 + 636262 TCCTGCAATTGGTAGGGTATTCATGGTATACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 92463 33 + 647215 CCCTGTAATTGGTAGTGCATTCATGGTATGTTT + +a +s mr.mrrefChr0 95422 21 + 130230 TTAGTTGTTAAGGTCCTAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100343 21 + 636262 TTAGTTGTTAAGGTCCTAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 92496 21 + 647215 TTAGTTGCCCAGGTTTTAGGA + +a +s mr.mrrefChr0 95443 19 + 130230 AAGCTATACTCTTCTAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100369 19 + 636262 AAGCTATACCCTTCCAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 92517 19 + 647215 AAGCTATACTCTTCTAAGG + +a +s mr.mrrefChr0 95462 374 + 130230 CTATTAAGCCAAGAATTTAGGGGTCTTGAGGGTTTCTCCATGGAAATAATCTCCATAAGAACCTGGATTGTATTCACTGTCTCACTTAAGTTTTTCTTAATAGTCTGACATGCTTTGCAAGTCTATTTCAGATATAGGTCCAGTCCTAGAGTAGACAAGTCCTAGAATAGACATGGCTTATGCTAGCCTGCCGAGAAGAGATTAGCAAGTTGAATGCTGCATATACTGCATCTGAATTCACTGCAATAAGGCCATTATTATATGTAACACATAGGGGAAGGCTATGGCTCCATGTGAAGAGGCGAGAACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCTAACGTACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCCAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100388 366 + 636262 CTATTAAGCCAAGAATTTAGGAGTCTTGAGGGTTTCCCCATGGAAATACTCTCCATAAGAACCTGGATTGTATACACTGTCTCACTTAAGTTTTTCTTAATAGTCCGACATGCTTTGCAAGTCTATTTCAGATATAGGTCCAGTCCTAGAGTAGACAAGTCCTAGAATAGACATGGCTTATGCTAGGCTGCCGAGAAGAGATCAGCAAGTTGAATGCTGCATATA------CTGGATTCACTGCAATAAGGCCATGATTATATGTAATGCATAGAGGAAGA--ATGGCTCCATGTGAAGAGGCGAGACCCTTTACAGTTCAGTCTACCCTCTCTCTAACGTACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCCAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 92537 370 + 647215 CTATTGAGCCCAGAGTTTAGGGGTCCT----GTCTTTCCATGGAAATAATTTCCCTAAGAACCTGGATTGTATTCACTGTCGCACTTGAGTTTTTCTTAATAGTCTGACATGCTCTGCAAGTCTATTGCAGATATAAGTCCAGTCCTAGAGTAGATAAGTTCTATAATAGGCATGGCTTATGCTAGCCTGCCGAGAAGAGGTTATTAGGTTGAATGCTGCATATGCTGCATCTGAATTCACTGAAATAAGGCCATTACTATATGTAACACGTAGGGGAAGGCTATGGGTCCATGTGAAAGGGCATGAACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCTAACATACCATTATGATTCATTCTGCCCTCTCTCTGACT + +a +s mr.mrrefChr0 95836 25 + 130230 TAATGATGGTGATGAAATGGTCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100754 25 + 636262 TAATGATGGTGATGAAATGGTCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 92908 25 + 647215 GAATGATGTTGATGAAATGGTCATT + +a +s mr.mrrefChr0 95861 65 + 130230 CAAACTCATGTGGATTAGATGGTGTTTAATCAGGAGTATGTACACATAATGTCCACAACCTTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100797 61 + 636262 CTAACTCATGTGGATTAGATGGTG-TTAATCAGGAG---ACACACATAATGTCCACAACCTTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 92933 65 + 647215 CAAACTCATGTGGATTATATGGTGTTTAATAAGGAGTATGTAAACATGACGTCCACAACCTACCT + +a +s mr.mrrefChr0 95926 26 + 130230 TCTTCAGGATCACCTCTTTAGCAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100882 26 + 636262 TCTTCAGGATCACCTCTTTAGCAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 92998 26 + 647215 TCTTCAGGATGTCCTCTTTAGCAAGA + +a +s mr.mrrefChr0 95952 144 + 130230 GCACCAAAATGACATGCACCTGGTCTTGATCACTCACAGGATGTGAGTATCTCACAGGAGGGATCTACACTATTACAGAATGCACCTGTACTATCCTGGATTCTCACAACACATTTGCAGCGATCAAGGAGCTTCAAATACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 100908 144 + 636262 GCACCAAAATGACATGCACCTGGTCTTGATCACTCACAGGATGTGAGTATCTCACAGGAGGGATCTACACTATTGCAGAATGCACCTGTACTAGCCTGGATTCTCACAACACATTTGCAGTGATCAAGGAGCTTCAAATACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 93027 144 + 647215 GCACCAAAATGACATGCATCTGGTCTTGATCACTCACAGGGTGTGAGTATCTCACAGAAGGGATCTACACTATTACAGAATGCACCTGTACTATCCTGGATCCGCACAACACATTTGCAGCCATCAAGGAGCATCAAGTGCACA + +a +s mr.mrrefChr0 96096 270 + 130230 CATTGCAACAATATTTTGAACCCCATAGACTCTTATAGATGGCCTACAAACAGTGCGAAATCCACTACTTGGACACTGTATGCCTGCTTAGATAGCACACTTGCTTTATATCGGTGATAACACATTATTGCTAATATTCCCATAGGAATGAAACTATTGCTCAGTGCCACTGACAACAAATTAGAAGCTCATACCAAGTGCTACAGGAACTAGGAGGTGTGGTTGCATGATTAAGTTTTTAGACTGTAGGTATGCCAATCAAATCAGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101096 270 + 636262 CACCGCAACAATATTTTGAACCCCATAGACTTTAATAGATGGCCTACAAACAGTGCGAGATCCACTACTTGAACACCGTATGCCTGCTTAGATAGCATAATTGCTTTATATCGGTGATGACACATACTGGCTAGTATTCCCATAGGAATGAAACAATTGCTCAGTGCAACTGACTACAAATTAGAAGCTCATACCAAGTGCTACAGGAACTAGGAGGTGTGGTTGCATGATTAAGTTTTTAGATTGTAGGTATGCCAATCAAATCAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 93171 270 + 647215 CATTGCATTAATATTTTGAACCTCATATAATCTTATAGATGGCCTACCAACAGTGCAAAATCCACTACTTGGACACTGCATGCCTGCTTAGATAGCACACTTGCTTTGTACCAGTGATAACACATTATTGCCTATATTCCAATAGGAAGGTAAATTATCCAGAGTGCCACTGACAACAAGTTAGAAGATCATACCTAGTGCTAAAGGAACAAGTAGGTGTGGTTGCATGAATAATTTTTTAGACTGCAGGTATGCCAACCACATCAGGTG + +a +s mr.mrrefChr0 96366 25 + 130230 TTTGGTCAACTATTACCTCATACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101367 25 + 636262 TTTGGTCAACTATTACCTCATACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 93441 25 + 647215 TTTGGCTAACTATTACTTCATACTA + +a +s mr.mrrefChr0 96391 51 + 130230 ATATTCTGTGGGCTATCAATGACTGGCAAACTTTGCAGTGAACGGTGCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101392 50 + 636262 ATATTCTGTGGGCTATAAATGACTTGCAAAC-TTGCAGTGAGCGGTGCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 93468 51 + 647215 ATATTCTGTAGACTATCAATGACTGGCAAACTTTGCATGAAACAGTGCTTG + +a +s mr.mrrefChr0 96442 113 + 130230 CTAAGTTAGATGTCTAGGGGATGCTTGTTGATAGGTAAGGGAGGAGCCTAATGTTGTGATAAAAAAAAAAAACCCCACTAGGACAAAGAAAAGCCAATTAGAACAATACCGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101442 113 + 636262 CTAAGTTAGATGTCTAGGGCATGCTTGTTGTTAGGTAAGGAAGGAGCCTAATGTTGTGATAAAAAAAAAAAACCCCACTAGGACAAAAAAAAGACAACTAGAACAATACCGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 93526 113 + 647215 CCTAGTTAGATGTCTAGGGGATGCTTGTTGATATGTAATGGAGGAGCCTAATGTTGTGATAAAAAAAAAAAATCCCACTAGGACAAAGAAAAGCCCATTAGAACAATACTGAA + +a +s mr.mrrefChr0 96555 269 + 130230 ATTGATTATTCCAGTGGAAGATGCTTGAAAAAATTAAATCTCCTGTTGATCCGATATCGCCAGGGAAGAAAGACCCTGAAGAGGGTGCTTTCTGGAGATGCTCAAAAACTCATGTGTTTACCTCACAAATAGTTATCACTTGTTAACATCGCTGACCCTGGACCCAGGAGGGGACAGTCAAATCAACAGATATTTCTGTTCTGATGTGTATAGATGAATTCATTGATCACCACTTGGCTATCAACTGGATAGGATTGTTTTCACTTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101560 235 + 636262 ATTGATTATTCCAGTCGAAGGTGCTCAAAAAAATTAAATCTCCTGTTAATCCGATATCACCAGGGAGGAAAGACCCCGGAGAGGATGCTTTCTGGAGATGCTCAAAAACTCATGTGTCTACCTCACAAATAGTTATCACTTGTCAACATTGCTGACCCTGGAGCCAG----------------------------------TGATGTGTATAGATGATTTCATTGATCACCACTTGGCTACCCACTGGATATGATTGTTTTTATTTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 93639 266 + 647215 ATTG--TACTTCAGTGGAAGATACTTG-GAAAATTAAATCTTCAATTGATCTGATATCGCCAAGGAAGAAAGACCATGAAGAGAGTGCTTTCTGGAGATGCTCAAAAACTCATGTGTTTATGTCACAAATGATTATCAATTGTTAATGTCGCTGATGCTGGACCCAGGAGGGGACAGTCAAATCAACAGATATTTCTGTTCTGGTGTGTATAGATGAATTTCTTGATCACCACTTGGCTATCAGCTGGATAGGATTGTTTTCACTTTTG + +a +s mr.mrrefChr0 96824 23 + 130230 GGGTGTAACAAGCTTTTAAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101795 23 + 636262 GGGTGTAACAAGCTTTTAAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 93906 23 + 647215 GAGTGTAACAAGCTGTTAAGTGT + +a +s mr.mrrefChr0 96847 22 + 130230 CTTAGTAAGGAAACTAATGCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101818 22 + 636262 CTTAGTAAGGAAACTAATGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 93930 22 + 647215 TTTAGTAAGGGAACTAACGCGA + +a +s mr.mrrefChr0 96869 348 + 130230 TGTTGTGTGCTCATGGAATGTAACAATTGTTGTAGTGCACATCATGAGCCGTATGAGTCAGCAGGCCTTCAATAGATGGCCACAGACTCTTGACTAACAGACTTTGTGATGTCAGGAGTAGGAAGTATCAAAGAATCATGTTGGCAAGTTGTAGCCTATTTGAACCTCTCACATGTGATCTGAGATTTAACGATCTTATAGGGGACTCTGTGATGTCTGCAATAAATTACCTAGATGTCATTTGCATCATTGGTGCTGCTCACACTTTTTGGTAAGTGGCTGCATTCTGAGATGACACCAATGTTTAACAGGCTTGGTTTGAGCTCTCCTGTCTCTGTATGGCAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 101840 334 + 636262 TGTTGTGTGCTCCTGGAATGCAACAATTGTTGTAGTGCACATCATGAGCCGTATGAGTCACCAGGCCTTCCATAGCTTGCCACAGACTCTTGATTAACAGGCTTTGTGATTTCAGGAGTAGGAAGAATCAAAGAATCATGTCGGCAAGTTGTAGCCTATTTCAACCTCTCACATGTGATCTGAGATTTAACGATCTCATAGGGGACTCTGTTATGTCTGCAATAAATTACCTAAATGTCATTTGGATCATTGGTGCTGCTGACACTTTTTGGTAAGTGGCTGCATTCTGCAATGGCACTAATGTTTAACAGGCTTGGTTTGAGC--------------ATGGCAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 93953 348 + 647215 TGTTGTATGCTCATAGAATGTGACAATTGTGGTAGTGCACATCATGAGCAGAATGAGTCAGCAGGCCCTAAATAGATGGGCACAGACTCTTGACTAACAGACTTTGTGATGTCAGGAATAGGAAGTATCAAAGAATCATGTTGGTAAATTGTAGCCTATTTGAACCTCTCGCATGTGACCTGAGATTTGATGATCTTATAGGGGACTCTGTGGTGTCTGCAATAAATTACCTAGATGTCATTTCCATCATTGGTGCTGCCCACACTCTTTGATAAGTGGCTGCATTCTGAGATGACACCAATATTTAACAGGTTTGGTTTGAGCTCTCCTGTCTCTGTATGGCAAACA + +a +s mr.mrrefChr0 97217 139 + 130230 AAAGAGTCAAACATTAAGAATCATCCTGGAGGTATCCGACCATTCGTACACTCACAGAAGTTTTAGCGCGCATGCAAAGGAAAATGGCCTCCTCTCCATATGGTTTTGTCTATATGGTTCTACTTAATCTTTAACCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102174 139 + 636262 AAAGAGTCAAACATTAAGAATCATCCTGGAGGTATCCGACCATTCGTACACTCACAGAAGTTTTAGCGCACATGCTAAGGAAAATGACCTCCTCCCCATATGGTTTTGTCTATATGGTTTTATTTAATCTTTAACCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 94302 139 + 647215 AAAGAATCCAACATTAAGCATCATCCCAGAGGTATCCAACCATTCGTACACTCACAGAAGTTTTAGCTCGCATGTAAAGGAAAATGGGCTTCTATCCATATAGTTTTGTCTATCCGGTTCTACTTAATCTTTAGTGTAA + +a +s mr.mrrefChr0 97356 3 + 130230 GAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102313 3 + 636262 GAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 94458 3 + 647215 GAA + +a +s mr.mrrefChr0 97359 323 + 130230 TTCTTAATCAAGTTGGCATTTTTGCCCATGGCACCTCAAGTGACATCAACTCTAACGTTGACATTGTGCTTACCTGATGGTTGCAGCATGATCTTGTATAGATGGCTTCTCACAAAAGATGCCTTGCAAGGAAACAGTAGCTTACCATGGATGCTTTTGTTTAAACGGAGTTATACATGAGTGTTATTTCTCTGTATCTATGTCAACAAGCTCTGTATATACAATGGAACTTGCATGGGTTTTGACGGCTCGTATGTCATCAAATATGATGTCTAAGTTGGGATACCATCCAGAAGGGGAGGACATTACCAGCTCCTCAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102316 319 + 636262 TTCTTAATCAAGTTGGCA--TTTGCCAATGGCACCTCAAGTGACATCAACTCTAACGTTGGCATTGTGCTCTCCTGATGGTTGCAGCATGATCTGGTATAGATGGCTTCTCACAAAAGATGCCCCGCAAGGAAACAGTG--CTACCATGGGTGCTTTTGTTTAAGCGGAGTTATACCTGAGTGTTGATTCTCTGTATCTATGTCAACAAGCTCTGTATATACAATGGAACTTACATGGGTTTTAACAGCTTGTATGTCATCAAATATGATGTCTAAGTTGGGATACCATCCAGAAGGGGAGGACATTACCAGCTCCTCAGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 94464 322 + 647215 TTCTTAATCAAGTTGGCATTTTTGCCCCTGGCGCCTCAAGTGACATCAACTCCCGGGTTGACATTGTGCTTACCTTATGGTTGCAGCATGATCTTGTATAAATGGCTTCTCACAAAAGGTGCCTTTCAAGGAAACAGTAGCTTACTATGGATGCTTTTGTATAAACAGAGTTATATATGATTGTCATTTCTCTGTATCTATGTCAACAAGCTCCCTGTACACAAAGGAACTTGCATGGGTTTTGTTGGCTCATATGTCATCAAATATGATGCATAAGTTGGGATACCA-CCAGACGGGGAGGACGTTGCTAGCTCCTCAATTT + +a +s mr.mrrefChr0 97682 115 + 130230 AACACTAGGAAGATAACAGTAGTTTTTGCTTATGCCACCCTAAAGAATATATTTATTTTCTTTGACCTATTGATTGCCCTATGGATGCTCTGCCACAGTTCACTTTTATTGATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102635 115 + 636262 AACACTAAGAAGATAATAGTAGTTTTTGCTTATGCCACCCTAAAGAATATATTTATTCTCTTTGACCTATTGATTGCCCTATGGGTACTCTGCCACAGTTCACTTTTACTGATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 94788 115 + 647215 AACACTAGGAAAATAGCATCAGTTTTTATTTATTCCACCCTAAAGAATATATTTATTTTCTCTGACCTATTGATTGCCCTATTGATGCTCCGCCACAGTTCACTTCTATAGACTT + +a +s mr.mrrefChr0 97797 135 + 130230 AACATTGCTAAGTACATGTGTGTGTAGTCTTACATATTTTATCCAGTAGTAAGCTTTATAACTTTCATGTACAGTAAGGCACATCAAATAATCACCCTCATCTGGAGAGATAATCATCCTTGCATTTGTATATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102750 135 + 636262 AACATTGCTAAGTACATGTGTGTGTAGTTTTACATATTTTAGCCAGTAGTAAGCTTTATAACTTTCATGTACTGTAAGGCACATCAAATAATCACCCTCATCTGGAGAGATAATCATCCTTGCATTTGTATATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 94914 122 + 647215 AACATTGCTAATTA-------------TCTTCCATATTTTCTCCAGTAGGGAGTTTTATAACCATCATGTACAGAAAGGCACAGCAAATAATAACCCTCATCTGGAGAGATAATCATCCTTGCATCTGTATATAT + +a +s mr.mrrefChr0 97932 307 + 130230 GTCTAAATGGTATACAGTAGTTGCCCTCCCATTAATAACTGTTTATAGAACTTTCTCTTGGAGTTGTGTTGTGCATGTGATGCCTGTCTTGATTAGTGCAAAGTCTACTCCAAAAACCTTGGGTACACACCGATAACACTGCAATTGACCAATCTGGCTCATCCGAGTGTAGATCATATACCTGAGCCTAGTTCCTATCTGTCCTAACTAATTTTTAATTGCTGTAGTTTACATACATACTGAGCATAGGACTGAGTAAACATTATTGGGCTAAAGGACAGAGAGTTAGGTCACTTTGGACAGTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 102885 305 + 636262 GTTTAAATG--ATACAGTAGTTGCCCTCCCATTAATAACTGTTCATAGAACTTTCTCTTGCAGTTGTGTTGCACATGTGATGCCTGTCTTGATTAGTGCAAAGTCTACTCCAAAAACCTTGGGTACACACCGATAACACTGCAATTGACCAATCTGGCTCATCCGAGTGTAGATCATATACCTGAGCCTAGTTCCTATCTGTCCTAACTAATTTTTAATTGCTGTAGTTTACATACATACTGAGCATAGGACTGAGTAAACATTATTGGGCTAAAGGACAGAGAGTTAGGTCACTTTGGACAGTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 95073 307 + 647215 GTCTAAATGGTATACAGTAGTTGCCCTCCCATAAATAACTGTTTATAGTACTTTGTCTTGGTGTTGTGTTGTGCATGTGATGCTTGCCTTGATTGGTGTAAAGTCTACTCCGAAACCTTTGGGTATACCCCAATAACACTGCAATTGACCAATCTGGCTTTTCCCAGTGTAGATCAAATACCTTAGCCTAGTTACTAGCTCTCCTAACTAATTTTTAATTGCCATAGTCCACATACATACTGAGCACAGGACTGAGTAAACATTATTGTGCTTAAGCACAGAGAGTTAGGTCAGATTAGAGAGTTGC + +a +s mr.mrrefChr0 98239 31 + 130230 CGCATTTTGTATGTTAGAGGTGTCTACCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103190 31 + 636262 CGCATTTTGTATGTTAGAGGTGTCTACCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 95381 31 + 647215 CATATTTTGTATGTTTGAGGTGTCCACCTGA + +a +s mr.mrrefChr0 98270 6 + 130230 GCCGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103227 6 + 636262 GCCGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 95412 6 + 647215 GCCTGC + +a +s mr.mrrefChr0 98276 170 + 130230 AACAGGCTGACATTAGCTTGATAGTATTTCTAACTGGCATGCCAAATGTTTAAACTTATAACAGGAGGTAGGTCAAGTGGGACAACATATCTTTGCAATATCTTATAGACACACATGGTCCATAAAAAGTGGTTCACCACTGATGGAAGTCACATGAGGAGGGTATCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103234 170 + 636262 AACAGGCTGACATTAGCTTGATAGTATTTCTAACTGGCATGCCAAATGTTTAAACTTATAACAGGAGGTAGGTCAAGTGGGACAACATATCTTTGCAATATCTTATAGACACACATGGTCCATAAAAAGTGGTTCACCACTGATGGAAGTCACATGAGGAGGATATCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 95418 170 + 647215 AGCAGGTTGACATTAACTTGAGAGTATTCCTGACTGACATGCCAAACATTCAAAATTATAACAGGGGATACGTGAAGTGGATCAACAAATCTTTGCAGTACCCTATGGGCACAAATAGTCCACACAAAGTGGTTCACCACTGATGGAAGTCACATGAGGAGGGTATCAAG + +a +s mr.mrrefChr0 98446 201 + 130230 GTTAGACCATGTGTGCTACAATGCAACAGATGGGGCTTCCACATCCAGGGAAGAATAATTGACTAAGACTGCATTAAACTATAGTAGCCTAGCCCATTTGCCAGTGTAACCACACCTCACTCGGTACAGTAGGTCAGAACATATCATACTCTGATATGGGGGAGTGTACAATAGTGTGAAGGAGCAGGTCACCTAGATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103407 182 + 636262 GTTAGCCCATGTGTGCTACAATGCAACAGATGGGGCTTCCACATCCAGGGAAGAATAATTGACTAAGAATGCATTAA----TAGTAGCCTAGCCCATTTACCAGTGTGACCACACCACACTTGGTACAGTGGGTCAGTACATATCATACTCT---------------CCAATAGTGTGAAGAAGCAGGTCACCTAGATTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 95588 173 + 647215 GTTAGACCATGTGTGCT----------------------------CAGGGAAGAATAATTGACTAAGACAGCATTGAACTATAGTAGCCTAGTCCATTTGCCAATGTAACCACACCTCACCCGGTACAGTAGGTCAGAACATATCATACTCTGATATGGGGGAGTGTACAATAGTGTGAAGGAGCAGGTCATCTAGACTAA + +a +s mr.mrrefChr0 98647 101 + 130230 CTGCTCATAGTAGTTACAGGCTAAAGAGCGCTTATCATTGTCCAGTGAGTGATTGCTTCAGCAATTTAACAAGACAACCATGAAGTAAACAGTGGAATCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103594 101 + 636262 CTGCTCATAGTAGTCACAGGCTAAAGAGCGCTTATCATTGTCCAGTGAGGGATTGTTTCAGCAATTTAACAAGACAACCATGAAGTAAACAGTGGAATCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 95761 101 + 647215 CTGCTCATAGTAGTTGCTGGCTCAAAAGTGCTAATCATTGTCCAAGGCTTGATTGCTTCAGCAATTTAACAAGACAACCATGAATTAAACAATGGAATCCT + +a +s mr.mrrefChr0 98748 209 + 130230 TACTAGTATAGGCAATGCATTGTTTATAACTTCCACCAAGATACTCCTTTAGTTAGGCTATATAGGATGAAAAGCCTTAACCTGTAGGATGTATCCAAATGTAGGGGGCAAGCCAGGAGTGTGCTGGACAGAAAGGTTTTCGTCACACAGACAGTCAGAAACAGGTGGATGGCAAAGAATGTTACAACAATCCTAACTAAGGTCAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103695 209 + 636262 TGCTAGTATAGGCAATGCATTGTTTATAACTTCTGCCAAGATACTCCTCTAGTTAGGCTATATAGGATGAAAAGCCTTAACCTGTAGGATGTATCCAAATGTAGGGGGCAAGCCATGAGTGTGCTGGACAGAAAGGTTTTCGTCACACAGACAGTCAGAAACAGGTGGATGGCAAAGAACGCTACAACAATCCTAACTAAGGTCAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 95887 203 + 647215 TACTTGTATAGGCATTGCATTGTTTATAACTTCCACCAAGATACTCCTTTAGTTAGGCAGCATAGGATGAAAGGCCCTAACCTGTAGGATGGATCCAAATGTAGGGGGCAAGCCAGGAGTGTGCTGGACAGATAGGTCTTCGTCACACATACAGTCAGAAACAGGTGGATGGCAAAGAATGTCATAACAATCATGACTAACAT------ + +a +s mr.mrrefChr0 98957 18 + 130230 TCCACATTGAATTGATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103907 18 + 636262 TCCATATTGAATTGATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 96090 16 + 647215 --CACATTGAATTGATTA + +a +s mr.mrrefChr0 98975 45 + 130230 GGTTGGTGTTTCTTTAAGTACCACTGTCACACTAAGTAACACACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103944 45 + 636262 GGTTGGTGTTTCTTTAAGTACCACTGTCACACTAAGTAACACACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 96106 45 + 647215 GGTTGGTGTTTCTTCAAGTACCACTGTCACACTAAGCAACACACG + +a +s mr.mrrefChr0 99020 27 + 130230 AGGGAGAGTGAGAATAGCTTGACGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 103989 27 + 636262 AGGGAGAGTGAGAATAGCTTGACGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 96170 27 + 647215 AAGGAAAGCGAGAATAGCTATATGTAT + +a +s mr.mrrefChr0 99047 48 + 130230 TACATGGTCCTGTCCCCTTGTTCAATGTATCTACCTCTCGTCCCTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104016 48 + 636262 TACATGGTCCTGTCCCCTTGTTCAATGTATCTACCTCTCGTCCCTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 96203 48 + 647215 TACGTGGCCCTGTCCCCTTATTCAATGTATGTACCTCTCGTCCCTTTT + +a +s mr.mrrefChr0 99095 116 + 130230 CATTGCGTGTATCTTTGCCCATCACCTGTTAGGTGATGCCAAGTTTAAGGGTGACACCTCTTGATAGATCACAATTTTTATCCTCCAAAACGAATGAACTCAGTACTCTATTTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104064 116 + 636262 CATTGCGTGTATCTATGCCCATCACCTGTTAGGTGATGCCAAGTTTACGGGTGACACCTCTTGATAGATCACAATTTTTATCCTCCAAAACGAATGAACTCAGTACTCTATTTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 96255 63 + 647215 CATTGTGTGTATTTTTACCCATCATATGTTATGTGATGACAAGTTTAAGGCTGACACCT-----------------------------------------------------TCAA + +a +s mr.mrrefChr0 99211 8 + 130230 TCACTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104180 8 + 636262 TCACTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 96321 8 + 647215 TCTCTTTT + +a +s mr.mrrefChr0 99219 127 + 130230 AGCGACTTCAGCCAATGTCATCCCAAGGTTATTCAACTGAGGTGGCCACAGTGAAGTGCTTTTTCTTGGAAACCTCTTTTGTGAACCTCCTTTTCTGGCTATCCAAGCTTTCATTCAGGTCTAATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104199 127 + 636262 AGCGACTTCAGCCAATGTCATCCCAAGGTTATTCAACTGAGGTGGCCACAGTGAAGTGCTTTTTCTTGGAAACCTCTTTTGTGAACCTCCTTTTCTGGCTATCCAAGCTTTCATTCAGGTCCAATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 96329 127 + 647215 AGCAAAGTCAGCCAATGTCATTCCAAGTTTATTCAACTGAGGTGGCCACAGTGAATCGCTTTTTTTTGTCAACCTCTTTTGCAAACTGCCTTTTCTGGCTATCCAAGCTATCATTCAGGTCTAATGT + +a +s mr.mrrefChr0 99346 93 + 130230 CTGACCCATGACTACCAAGATATCATATAGTTATGCCTCCAAATTCCAGTCCTGGGCTTTGCTCCCTGGAGTTTCAGGCCTCGGCTTTTGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104326 93 + 636262 CTGACCCATGACTACCAAGATATCAGATAGTTATGCCTCCTAATTCCAGTCCTGGGCTTCGCTCCGTGGAGTTTCAGGCCGCTGCTTTTGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 96460 85 + 647215 CTGACCCATGA--------ATACCATATATTGATGCCTCCAAATTCCAGTCCTGGGCTTTGCTGCCTGAAGTTTCAGGCCTCGATTTTTGTCT + +a +s mr.mrrefChr0 99439 167 + 130230 TTTACAATACATAAATGGGGGACCTTTTTAAAAGTGTCATTAAATCATGCAACCTATTATTAGCCATGTGTGGAAGAAGAGAAGAAGGTGAAGCTTTCTTTTTTGATTGAGCTCATTTCTTACCCATTCATATCAGATATTCTATGATAAGCCTGAATTGTTACTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104423 164 + 636262 TTTACAATACATAAATGGGGGACCTTTTTAAAAGTGTCATTAAATCACACAACCTATTATTAGCCATGTGTGGAAGAAGAGAAGAAGGTGGAGCTTTCTTTTATGATTGAGCTCATTTCTTACCCATTCATATCAGATATTCTATGATAAGCCTGAATTGTTAC--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 96545 167 + 647215 TTTACAATACATAAATGGGGGACCTTTTTAAAAGTGTCATTACATCATGCAGCCTATAATTCACTATGTGTGGAAGAAGAGAAGAAGGTGAAGTTTTCTTTTTGGATTGGGCTCATTTGTTACCCATTCGTGTCAGATATAGTATGATAAGCCTGAATTGTTACTTA + +a +s mr.mrrefChr0 99606 71 + 130230 CGTTACATTGGGAGTAACCTAGCAGTCCCATTGGGAGTATCAGAGAAGAAATCGAGATAGTCCCCCTCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104587 53 + 636262 ------------------CTAGCAGTCCCTTTGGGAGTATCAGAAAAGAAATCGAGATAGTCACCCTCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 96714 71 + 647215 CGTTACATTGGGAGTAACCTAGCAGTTACATTGGGAGTATCAGAGAAGATATCGAGATAATCCCCTTCCAT + +a +s mr.mrrefChr0 99677 289 + 130230 AGCCTAATTAATGCTACAGGTCCATTTTGATTGCTTAGGCTACTTTTGTAAAGCTTGTATCTCTGAAGCCCTCTGACTATCACATATGGTCGGGGTGGGGACAGCCCTGTTGCTCTCATAGAGTTATGTGCTTAGCTGCATTTAGATGTGCCATCATATTTGGTTCCATGAAATAGTTGTTGTTTAATGACATAATGAGGAATAGCCTCACCATCACTACTACCCCATGATCTCACTGCTTTAGCGTGGGGAGTGGGTTAGGGCATCCCAGAACACCTCAAGAGAGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104641 279 + 636262 AGCCTAATTGATGCTACAGGTCCATTTTGATTGCTGAGGCTACTTTTGTAAAGTTTGGATCTCT-AAGCCCTCTGACTATCACATACAGTCAGGGTGGGGACAGCCCTGTTGCTCTCATAGAGTTATGTGCTTGGCTGCATTTAGATGTGCCATCATATGTGGTTCCATGAAATAGTTGTTGTTTAATGACATAATGAGGAATAGCCTCACCATCACTACTACCCCATGATCACACTGCTTTAGCATGGGGA-----TTAGGGCATTCCAGAAC----CAAGAGACAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 96785 287 + 647215 AGCCTAATTAATGCTCCA--TCCACTTTGATTGCCTAGGCTACTTTTGTAAAACTTGTATCTCTGAAGGCCTCTGACTATCACATATGGTCGGGGTGGGGACAGCCATCTTGCTCTCATAGAGTTATGTGCTTAGCTACATTTAGACGTGCCATCATCTTTGGTACCATGAAGTAGTTGTTGTCTAATATCATAACGAGGAATAGCCTCACCATCACTACTACCCCATGATCTCACTGCTTATGCGTGGGGAGTGGGTTAGGGCATCCCAGAACACCTCAATAGAGAAA + +a +s mr.mrrefChr0 99966 103 + 130230 ATCATTTCTAGGATTATGGACGAGGCAAGCACTACAAATACAGAAGTATGCAACACCATTGCACATAGGTACCTCTATATGAAGCCAATATTCTTGCTACCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 104924 90 + 636262 ATCTTTTTTAGGATTATGGGCAATACAAGCACTATAA------AAGTATGCAACACCATTGCACATAGGAACCTCTATGTGAAGCCAATATTCTTG------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 97072 103 + 647215 ATCATTTCTAAGATTATAGATGAGGCAAGCACTACAAATACAGAAGTATGCAACATCATTGCACATAGGTACCTCTATATGAAGCCAATATTCTTGCTACCTC + +a +s mr.mrrefChr0 100069 13 + 130230 TGAAGTCAATATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105014 1 + 636262 ------------T +s simRat_chr6.simRat.chr6 97179 13 + 647215 TGAAGTCAATATT + +a +s mr.mrrefChr0 100082 64 + 130230 ACAATTCAATATGTCAAATTTCCACAAGTGACCATCCGTAACCAAGAGATCACAGTGACAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105015 64 + 636262 AAAATTCAATATGTCAAATTTCCACAAGTGACCATCCGTAACCAAGAGACCACAGTGACAAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 97197 64 + 647215 ACAATTCAATATGTCAAATTTCCACAAGTGATCATCCATAACCAAGAGATCACAGTGACAAATT + +a +s mr.mrrefChr0 100146 60 + 130230 GATCTTTTGATTCATTTGAGACCTGTTTCCAGGTGGACTTGATAGGTCCTAATGTAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105089 59 + 636262 GATCTTTTGATTCATTTGAGACCTGTTTCCAGGTGGACTTAATAGGTCCT-ATGTAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 97261 60 + 647215 GACCCTTTGATTCACTTGAGACCTGTTTCCAGGTGGACTTGATAGGTCCCAATGTAATAG + +a +s mr.mrrefChr0 100206 200 + 130230 ACTCCCACATGCACCAGGATGATTTCTACTACAAAAACAAGTCTACTGGTGATTCCAAGCTTACTCTACCATCTTGTGTATAAGTACACTGACCATAGCAAGTCTATTTTGAAATCTATTAGATGTGGCTGCTGAGTCTCTAACTCGGTGCTCATCTGTTTGCATTCTGTAGATTGAAGTATCATACTTCCATTCCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105150 179 + 636262 ACTCCCACATGCACCA--ATGAATTCTACTACAAAAACAAGTCTACTGGTGATCCCA-------TCTACCATCTTGTGTATAAGTACACTGACCATAGCAAGTCTATTTTGAAATCTATTAGGTGTGGCTGCTTA------------GTGCTCAACTGTTTGCATTCTGTAGATTGAAGTATCATACTTCCATTCCTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 97321 200 + 647215 ACTCCCCCATGCACCAGGATGATTTCTGCTACAAAAACAAGTTCACTGGTGATTCCAAGCTTACTCTACCTTCCTGTGTATAGGTACACTGACCATAGCAAGTTTATCTTGAAATCTATTAGATGTGGCTGCTGAGTCTCTAACTCGGTGCTCATCTGTTTGCATTCTGTAGATTGAAGTATCATACTGCCGTTCCTGCA + +a +s mr.mrrefChr0 100406 113 + 130230 AATTTCTGTAAGGAGATCACCCCCCTCCTGCACTTCAACTTCCTTCTTTTACACAATTCAGAATGTAACTTGTCTGTTGGGGGCATGCTTGTCCTCCAATCTAAATACAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105329 113 + 636262 AATTTCTGTAAGGAGATCACCCCCCTCCTGCACTTCAACTTCCTTCTTTTAGACCATTCGGAATGTAACTTGTCTGTTGGGGCCATGCTTGTCCTCCAATCTAAATACAGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 97531 112 + 647215 AATTTCTGCAAGAAGAGCACCCCCCTCCTGCACTTCAACTTTCTTTTTCTACACAATTCAGAATGTAACTTGTCTGTTGGGGGCATGCTTGTTGTCCAATCTAAATACGGAA- + +a +s mr.mrrefChr0 100519 89 + 130230 CTCTTCAGCCTGTGCACTCCACTCTCCCACTCAGGTTTATTAGCATTCACAGTAGGAGCATACTGTTCCCAGTTGATGATTCCCAATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105443 89 + 636262 CTCTTCAGCCTGTGCACTCCACTCTCCCACTCAGGTTTATTAGCACTCACAGTAGGAGCATACTGTACCCAGTCGACGATTCTCAATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 97643 88 + 647215 -TTTCCAGCCTGCGCATTCCACTCTCCCACTCAGGTTTAATAGCATTCTGAGTAGGAGCATACTATTTCCAGTTGATGATTCCCAATGC + +a +s mr.mrrefChr0 100608 43 + 130230 TGGTTTACTCTTGGATGTTCACTTCCAATTAGCTAAATTCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105536 43 + 636262 TGGTTTACTCTTGGATGTTCACTTCCAATTAGGTAAATTCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 97731 43 + 647215 TGGTTTACTCTTGAATATTCACTTCCAATTAGCTAAATTCTGA + +a +s mr.mrrefChr0 100651 383 + 130230 TAGGCCCTTCCAAGTCTCCATTAGCCAGCAAGGTCTGCTGAAATCTGCTGGTGATCATAGAAAGGGATTAACTTTAACTTTGTTCCATATTACCTCAAGAATAGCTGTAGGTCCCAGTAAGTACAAACAGTAACATATGTAGATATGTCATTTACCACCCCTTATTACTATTTGTGTATAATTTGGAAGGTAATACTTTGGCAGGGCTTTGAAGTTTCAATGAATTTAGTTATCGTGACCCTTTTCTCAGAGTCATTATATTTTGTGCCCTCCCTATTTCTTTCATCTGTTTTCATTGGAATGATGGTAGTCAGAATGTGTAGTGATTATCAGTATGGCAGTAATTTTAATCACTGATGGTTACAAGGCACATGGGTGTATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105579 383 + 636262 TAGGCCCTTCCAAGTTCCCATTAGCTAGCAAGGTCTACTGAAATCTGCTGGTGATGATAGAAAAGGATTAACTTTAACTTTGGTCCATATTACCTCAAGAATCGCTGTAAGTCCCAGTAAGTGCAAACAGCAACATATGTAGAAATGTCATTTACCACCCCTTACTACTATTTGTGTATAATTTGGAAGGTAACACTTTGGCAGGGCTTTGAAGTTTCAATGAATTTAGTTATCGTGATCCTTTTCTCAGAGTCATTATATTTTGTGCCCTCCCTATTTCTTTCATCTGTTTTAATTGCAATGATGGTAGTCAGAATGTGTAGTGATTATCAGTATGGCAGTAATTTTAATCACTGATGGTTACAAGGCACATGGGTGTATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 97791 383 + 647215 GAGGCCCTTCCAAGCCTCCATTACCCAGCAAGGTCTGCTGAAATCTGCTGGTGATCATAGAAAGCGATTAACTTTAACTTTGTTCCATATTACCTCAAGAGTAGTTGTAGGTCCCAGTAAGTACAAACAGTAAGATATGAAGATATGTCATTTACCACCCCTTATTACTCTTTATTTGTATTTTGAAAGGTAGTACTTTAACAGGGCTTCAAGGGTTCAATGAATTTAGTCATCATGACCCTTTTGTCAAAGTCTTTATATTTTGTGCCCTCCCTACTTCTTTCACCTGCGTTCATTGGAATTATGGTAGGCAGAACGTTTAGTATTTATCACTATGACATTAATTTTAATTACTGATGGTTACCATGCATGTGAGTGTATTA + +a +s mr.mrrefChr0 101034 581 + 130230 TTTGATCAGGTACAAGATGACATCTTCCACTTCCATACCTAAGTCTTGCATATCACTCTCCCATAAAAGCTCTTGTATGTTGATTGGTGTGCTGCTGTAACCATTGCAGCTGGGTACCCAGTGCAGTAATTGTCTCCTTGTTAACAACATTTGCAACTGAATTTAGTTACAACATTGTTGCTTTGTTTAGCACATCCATATGTTTGGGACATAACCAATAAAAACTTTCAAGGGGCCTGTGGATATGACCTTGTTTAACTATAGTGGTAGTTGCATTTAATGTGAAACATCTTTTTCTGGATACCTGGAACAACATGACATCATGTTCTAGTGGGTCTAAGGCATTCACGAGTTTGGAGAACACCATCCGGGTAGTCAAAATGCCTATCTGTCCCATACGATGGGAGGTCTGCATTAACTTGGTAGAGGTCTAGAGGTCATCTATTCACCAACCACAATGGGAGTGAGCCAAAGCAAGCTGGTGACTGGCCAAATGGGATATTCCTTCTTGTTCAATGGGGTCCATCTTAGGCCCCCAGTGTGATTAATAGGGGCTTCGATAACCTAGGGTGTGACATAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 105967 580 + 636262 TTTGATCAGGTACAAGATGACATCTTCCACTTCCATACCTAAGTCTTGCATATAATTGTCCCACAAAAGCTCTTGTATGTTGATTGGTGTGCTGCTGTAACCACTGCAGCGGGGTACCCAGTGCAGTAATTGTCTTCTTGTTAACAACCTTTGCAACTGAATTTAGTTGCAACATTGTTGCTTTGTCTAGCACATCCATATGTTTGGGACATAGCTAATAAAAACCTTCAAGGGGCCTGTGGATATGACCTTGTTTAACTATAGTGGTAGTCACATTTAATGTGAAACATCTTTTTCTGGATACCTGGAACAACATGACATCATGTTCTAGTGGGTCTAAGGCATTCAC-AGTTTGGAGAACACCATCCCGGTGGTCAAAATGCCTATCTGTCCCATACGATGGGAGGTCTGCATTAACTTGGTAGAGGTCTAGAGGTCAGCTATTCACCAACTACGATGGGAGTGAGCCAAAGCAAGCCGGTGACAGGCCTAATGGGATATTCCTTCTTGTTCAATGGGGTCCATCTTAGGCCCCCAGTGTGATTAATAGGGGCTTCGATAACCTAGGGTGTGACATAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 98174 552 + 647215 TTTGATCAGGTACATGATGGCATCTTCCACTTCCATACTTAAGTCTTGCATATCACACTCCCATACAAGCTCTTGTATGGTAATTGGTGTG-TGCTAAA---ATTGCAGCTGGGTTGCCATTACAGTAATTTTCTCCTTGTTAACAACATTTACAACTAAATTTAGTTACAACATTGTCAGTTTGTTTAGCATATCTGTATGTTTGAGACATAACCAATAAAAACTCTCAAGGGGCCTGTGGATATGACCTTGTTTAACTATAGTGGTAGTTGCATTTATTGTGGAACCTCTTCTTCTGGACACCTGGAACAACATGGTGTCATGTTCTAATGGGTCTAAGGCTTTCACGACTTTGGAGAACACCATCCGGGAAGTCAAAATGCCTATATGTCCGACACGCTGGGAGGTCTGCATTAACTTGGCAGAGGCCTAGAGGTCATCTATTTACCAACCACAATGGAAGAGATCCAGGGCAAGCTGGTGACTGGTCAA-------------------------GGGTCCATCTTAGGTCTCCAGTGTGATTAATGGGGGCTTCAATAACCAAGGGTGTGACCTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 101615 40 + 130230 TTCGCCAGCCCAATTGCCAGCTCAAATAGCACCAGCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106547 40 + 636262 TTCGCCAGCCCAATTGCCAGCTCAAATAGCACCAGCTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 98727 40 + 647215 TCCCCCAGCCCAATTGCCAGCTCACATGGATCTGGTTGTA + +a +s mr.mrrefChr0 101655 14 + 130230 TGTACACATCATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106587 14 + 636262 TGTACACATCATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 98785 14 + 647215 TATACACATCGCTC + +a +s mr.mrrefChr0 101669 69 + 130230 GGCCAACGGCCAGTGCAATGAGGTCAAGTCTTACTTAATGTATGCAACAAAGATCAGATGGGCTCATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106601 69 + 636262 GGCCAACGGCCAGTGCAATGAGGTCAAGTCTTACTTAATGTATGCAACAAAGATCAGATGGGCTCATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 98800 69 + 647215 GGTCAATGGCCAGTGCAAAGAGCTCATGTCATACTTTATGCATGCAACAAAGATCAGATGGGCGGATTT + +a +s mr.mrrefChr0 101738 64 + 130230 ACTGTCATAGATTGATTCTAGGTAGGTTTGCCATGTAAAAATGTTACAACACTTTGATGTCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106670 64 + 636262 ACTGTCATAGATTGATTCTAGGTAGGTTTGCCATGTAAAAATGTTACAACACTTTGATGTCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 98870 64 + 647215 ACTGTCATAGATCTGTTCTAGGTAGGTTTGCCATGTAAAGATGTAACAACACTTTGATCTCTTA + +a +s mr.mrrefChr0 101802 190 + 130230 ATGTCTTAGTGACCAGAAACCTCAGATTTACTCATAGATAATTAAAATAAAATGTCACATGAACCTGTGCGGCTGTAGGTTATTAGATCAAAGAGGCCTGTCTAGATGCCGAAGAGTGTAATGGAGATTGTGTACCGGAGTGGTTTCTTTTCAGTGACTTTTCTGACTATCATCATTAATGTTTGTTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106736 190 + 636262 ATGTCTTAGTGACCAGAAACCTCAGATTTACTCATAGATAATTAAAATAAAATGTCACATGAACCTGTGCGGCTGTAGGTTATTAGATCAAAGAGGCCTGTCTAGATGCCGAAGAGTGTAATGGAGATTGTGTACCGGAGTGGTTTCTTTTCAGTGACTTTTCTGACTATCATCATTAATGTTTGTTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 98934 190 + 647215 ATTGCTTAGTGACCAGAAATCTCAGATTTACTCATCGATAATTAAAAAAAAAGGTGACATAAACCTGTGTAGCTGTCGGTTATTAGATCAAAGAAGCCTGTGTATATGCAGAAGAATGTAGTGGAAATTGTGTACCCAAGTGGTTTCTTTTCAGTGTCTTTTCTGACTATCATCATTAAGGTTTGTTCTC + +a +s mr.mrrefChr0 101992 22 + 130230 TATAAGTTGATCCCAACTCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 106972 22 + 636262 TATAAGTTGATTCCAACTCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 99124 22 + 647215 TACAAGTTGATCCCAAATCACA + +a +s mr.mrrefChr0 102014 215 + 130230 TGTTAGAATGCTGGTGGTTATGTGAAATTTTTAAACACACCACATATTACCCAAACCTCCCACAGATGTGCAGACTAACCTCACTTACTTTTTAGTACTTTGCCAGCGTGAAGCAACAATAAAATCTAGAGGATGAGCATAAATAAATCGAGAATTAGGCTAATCCTTTGAAGTTTGGCATCTGAGAGCACATCTGCTCCAATGCATACCTATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107040 208 + 636262 TGTT-------TGGTGGTCATGTGAAATTTTTAAACACACCTCATATTACGCAAACATCCCACAGATGTGCAGACTAACCTAACTTAGTTTTTAGTACTTTACCAGCGTGAGGCAACAATAAAATCTAGAGGATGAGCATAAATAAATCGAGAATTAGGCTAATCCTTTGAAGTTTGGCATCTGAGAGCACATATGCTCCAATGCATACCTATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 99146 208 + 647215 TGTTAGAATGCTGGTAGTTATGTGAAATTTTTAAATACACCACATACTACCCAAACCTGCCACAGATTTGCAGACTAAACTCACTTACTTTTTAATCCTTTGCCAGCTTGAAGCAACGG-------TATAGGATGAGCACAAATAAATAGGGAATTAAGCTAGTCCTTTGAAGTTTGGCATCCCAGACAAGATCTGGTCTGATGCATACCTATAC + +a +s mr.mrrefChr0 102229 153 + 130230 TGGTTTGTGGTGCCCTGTGTATATACATCTCTAGTACATACCACAATTCATGGCCCTGCACAGATAGCTTGTGGTCTAGTTTGTTCCCCAATGTTCCCTCTTTTACCCCACAGCCACAACCAAGACAAATTACTTATGGAATGTAGCTATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107248 153 + 636262 TGGTTTGTGGTGCCTTGTGTATATACATTTCTAGTACATACCACAATTCAAGGCCTTGCACAGATAGCTTGTGGCCTAGTTTGTTCCCCAATGTTCCCTCTTTTACCCCACAGCCACAACCAAGACAAAATACTTATGGAATGTAGCTATAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 99372 153 + 647215 TGGTTTGTGGTGCCCTGCGTATATACACCTCTAGTACATAGCAGAACTCATGACCCTGCACAGATAATTTGTGGTGCAGTTTGTTCCCCAATGTTCACTCTCATACCAAACAGCCACAACCAAGACCAGTTACTTATAGAATGCAACTATAGC + +a +s mr.mrrefChr0 102382 142 + 130230 ATATTGTCAGGGGTCATGGTGTGATGAACTAAGGTGTGGACTAGGACATAGCTGGATGGTAACTGCATATGGCTTTCACCCAGCTACCTAACCTTACAGTAAGACAGAACCTAAGCACTAGCTATTTAATATCTCATGGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107406 142 + 636262 ATATTGTCAGGGGTCATAGTGTGATGAACTAATAAGTGGACTAGGACATGGCTGGCAGGTAACTGCATATGGCTTTCTCCCAGCTACCTAACCTTACAGTAAGACAGAACCTAAGCACTAGCTATTTAATATCTCATGGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 99525 90 + 647215 ATATTGTCAGGGGTCACGGTGTGATGAACTAAGGTGTGGACTAGGACATAGCTGAATGGCAACTGCATATAGCTTTCACCTAGCTACCTG---------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 102524 16 + 130230 AAACATGGGTGACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107549 16 + 636262 AAATGTGGGTGACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 99615 16 + 647215 AATCATAGGTGACGAT + +a +s mr.mrrefChr0 102540 17 + 130230 GCAAGCATATACAACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107565 17 + 636262 GCAAGCATATACAACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 99632 17 + 647215 ACAAGCGTATACAACAG + +a +s mr.mrrefChr0 102557 4 + 130230 AGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107586 4 + 636262 AGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 99649 4 + 647215 AGCT + +a +s mr.mrrefChr0 102561 57 + 130230 AAAAATCAATCTTGAGGCGAAAGTGTCCCTTATGTCTGGAGTTTCATTCCATATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107599 57 + 636262 AAAAACCAGTCTTGAGGCGAATGTGTCCCTTATGTCTGGAGTTTCACTCCATATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 99653 57 + 647215 AAAAATCAATCTTGAGGTGAAAGTGTCCCTTATGTCTGAAGTTTCATTCCATATACG + +a +s mr.mrrefChr0 102618 282 + 130230 TAGAGGCCATCATAAGATTGTACTCAACAAACATCACCACCCCTGCTTTATCTTGTCTGGTTACAACACAGTTACCTTCTTGGTGGTAAAGACTACTTCATCTGTCTCAAAAAGTAATCATCAGGCAATGAGAGGTCAAGCATTTGGATAGTACCTACTTATCAGGGATTAGCTCAAAGTGAAACTGAATAACAAGTTGAAGGTGCTAACGCTTATTGATAGCACAAAATGATTCCACGTACAATACTGAGAAAGGAATGCAAACAGGAACGCAAAAGGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107656 280 + 636262 TAGAGGCCATCATAAAATTGTACTCAACAAACATCACCACCCCTCCTTCATCATGTCTGGTTACAACACAGTTACCTTCTTGGAGGTAAAGACTACTTC-TTTGTCTCAAAAAGTAATCATCAGGCAATGAGAGGTCAAGCATTTGGATAGTACCTACTTATCAGGGACTAGCTCAAAGTGAAACTGAATAACAGGTTGAAGGTGCTAA-GCTTATTGATAGCACAAAATGGCTCCACGTACAATACTGAGAAAGGAATGCAAACAGGAACGCAAAAGGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 99718 281 + 647215 TAGAGGCCATCATAAGATTGTAGTCATCAACCATCACCACCCCTGCTTTGTCTTATCTAGTTACAACTCAGTTATCTTCTTAGTGGTAAAGGCTACTTCATCTGTCTCAAAAAGTAATCATCAGGGAATGAGAGGTCAAGCATTTCGTTAGATCCTACTTATCAGGGATTCACTCAAAGT-AAACCGAATAACAAGTTGAAGGTGCCAACGCTTATTGATAGCACAAAAGGATTCCACGTACAATACTGTGATGGGAATGGAAATGGGAATGCAAAAGGACA + +a +s mr.mrrefChr0 102900 97 + 130230 GTAATCTATCAATACAGTAAATCCTAATATTGATCTCACATGTAACTCATAAGTGATTAAGGACATTAAAAAGTAAAGCAGCAGTTACTGTCTGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 107936 97 + 636262 GTAATCTATCAATACAGTAAATCCTAATATTGATCTCACATGTAACTCATAAGTGATTAAGGACATTAAAAAGTAAAGCAGCAGTTACTGTCTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 100008 97 + 647215 GTAATCTATCCAAATATTAAATAATAACATTGATCTCACATGTGACTCACATGTGATCAAGGACATTAAAAAGTAAATCAGCAGTTACTGTCTGTAA + +a +s mr.mrrefChr0 102997 340 + 130230 TAACGTGTGGTTCTTTGTAAAGTATCCCACTCGTCGGCAGGTGCCAAGAGTATGCTGGGGTATGGAGGTTGCCTGGGCGAATGTGGAAAATTATGAGGGGCAAAATTTGTCCTACAATAAATCTTGGCTTAGTGGCCTGACACAATAGCCCTTTGGACTTGTCATGTGAATGTAGTATAGTAATATACAGTTGTATTTAGGGCATCATTCATAATATTGTTACAGTGGGTGTTAGATCATTTTGGGTTTGTGCAACTTTGCTTCTGCAGCACATTCACTCAAATCTATTGTTATACCATACTTACAAGACAAGATGGTGGAAGAGGAGCTAAAGATGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108163 340 + 636262 TAACGTGTGATTCTTTGTAAAGTATCCCACTCGTCGGCAGGTGCCAAGAGTATGCTGGGGTATGGAGGTTGCCTGGGCGAATGTGGAAAATTATGAGGGGCAAAATTTGTCCTACAATAAATCTTGGCTTAGTGGCCTGACACAATAGCCCTTTGGACTTGTCATGTGAATGTAGTATAGTAATATACAGTTGTATTTAGGGCATCAATCATAATATTGTTACAGTGGGTGTTAGATCATTTTTGGCTTGGGTGACTTTGCTTCTGCAGCCCATTCACTCAAATCTATTGTTATACCATACTTACAAGACAAGATGGTGGAAGAGGAGCTATAGATGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 100105 335 + 647215 TAATGTGTGGTTCTTTGTAAGGTATCCCTCTCATTGGGAGGTGCCAAGAGTATGCTAGGGTATAGAGCTCGCCTAGGCAAATGTGGAAATTTATGAGGTACAAAATTTGTCCTACTATACATCTTGGCTCATTGGCCTGATGCAGTAGACCTTTGGACTTGTCATGTGGACGTAATATACTAATATACAGTTGGCTTTAGGGCGCCATTCATAATATTGTTACAGGGCCTGTTAGATC----TGGGTTTGTGCAGCTTTGCCTCTGCATCACATTCATTCAAATTCGTTG-AATACCATGCTTACAAGACAAGATGGTGGAGGAGGAGATAAAGCTGGTT + +a +s mr.mrrefChr0 103337 81 + 130230 CTGTCCATTTATGGACAGATTATGGATGATCTATAACTTGAATTCTGTGCCCATTAGTAGTGTACACACAACTTTCTGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108503 81 + 636262 CTATCCATTTATGGACGGATTATGGATGATCTATAACTTGAATTTCGGGACCATTAGTAGTGTACACATAACTTTCTGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 100441 81 + 647215 CCGTCCATTTATGGACAGACTATGGGTGATCTATGACTTGAATTCTGTACCTATTAGTAGTGTACACACAACTGTCAGCTG + +a +s mr.mrrefChr0 103418 163 + 130230 TACTATATATCACTTTGCCATTACCCTGCCATAAACAATCTGTATAATCATTTTATCTCCTGTTTGTTTGGAACTGCTTTTTTGATGCACTCCTACAGCATTGATGTAAACCCTGTCATCAATAAGTTATTGGTTACTTCTAAAGTACTTAAAAAGAGCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108584 161 + 636262 TACTACATATCACTTTACCATTACCCTGCAATGAACAATCTGTATAATCATTTTATCTCCTGTTTGTTTGGAACTGCTTTTTTGATGCACTCCTACAGCA--GAGGTAAACCCTGTCATCAATAAGTTATTGGTTACTTTTAAAATACCCAAAAAGAGCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 100523 160 + 647215 TACTATATATCACTTTGC---TACCCTGCCATAAACAATCTGTATAATCATTTTATCTCCTGTTTGTTTGGAAATGCTTTTTTGATGCACTCCTACACCATTGATTTAAACCCTATCATCAATAAGTCATCGGTTACTTCTAAAGTACTTAAATAAAGCCATA + +a +s mr.mrrefChr0 103581 182 + 130230 TTTGTTTACCTTGTCAAGGTAGATTAGGATAACACACATGTTTCTCATGCTAAATGGCTTTTCTCTAAATCACTTTTGTTCCAGAGTGTTCATTATTGTATATAGTAGAGCTTTAGGAGGCTGACCAATATCTACTCCCCACTGATGCCTGTCTGCTGGGTATCTGTATACTATAACCGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108745 182 + 636262 TTTGTTTGCCCTTTCAAGGTAGATTAGGATAACACACATGTTTCTCATGCTAAATGGCTTTTCTCTAAATCACTTTTGTTCCAGAGTGTTCATTATTGTATATAGTAGAGCTTTAGGAGGCTGACCAATATCTACTTGCTACTGATGCCTGTCTGCTGGGTGTCTGAATACTATAACCGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 100685 165 + 647215 TTTGTTTACCTGGTCAAGGTAGATTAGGTTAACACACTTGTCTCTCATGCTAAATAGCTTTTCTCTAAATCAATTTTGTTCC-GAGTGTTCATTATTGTATATAGTAGAGCTATAGGATGCTGACCAATATCTACTCCACACTGATGCCTGGCTGCTTTG-ATCTGT--------------- + +a +s mr.mrrefChr0 103763 35 + 130230 AAACCCCAACACAAAGGCCAAAAATCCAAAGAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108935 35 + 636262 AAACCCCAACACAAAGGCCAAAAATCCAAAGAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 100850 35 + 647215 GAACTCCAACACAGAGGCAAAAGATCCAAAGAATT + +a +s mr.mrrefChr0 103798 183 + 130230 CCCAGGAATTGCTCTGCTAGAGGATTTGACTTACTCATACTATCTTGCATAGCACTTGTGTCCTATGGCAGCAAACATGCCAGTACTTTTCCTACTCTCTGTGCAATCTTATTCATCTCTCACTAGCAAGTATGCACAATTTTAGGCTTTTCACAACTGCTTTTGTGTCATGTAGTTTTTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 108981 183 + 636262 CCCAGGAATTGCTCTGCTAGAGAATTTAACTTACTCATAGTATCTCGCATAGCACTTGTGTCCTATGGCAGCAAACATGCCAGTACTTTTCCTACTCTCCCTGCTACCTTATTCATCTCTCACTTGCAAGTATGCACAATTTTAGGCTTTTCACAACTGCTTTTGTGTCATGTAGTTTTTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 100885 179 + 647215 CCC----ATTGCTCTGCTAGAGGATTTGGCTTACTCATGCTATCTTGCATAGCACGTGTGTCCTATGGCAGCAAACGTGTCGGTACTTTTCCTACTGTCTGTGCAATCTTATTCATCTCTCACTAGCAAGTATGCACTAATTTCGGTCTTTCACAACTGCTTTTGTGCCATGTAATTTTTTAA + +a +s mr.mrrefChr0 103981 29 + 130230 TAAGGTAATGGCTGAGAAGGTCTTCTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109164 29 + 636262 TAAGGTAATGGCTGAGGAGGTCTTCTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 101072 29 + 647215 TAAGGCAATAGCTGAGAAGGTTTTCTAAC + +a +s mr.mrrefChr0 104010 230 + 130230 TTACTTATGCTTAGAGACACATCTAACTAAGAACTAAGTGCCAACCATAACCCTTGACTGTATATATCAATATCTTCATTCTATTAAAGACTATAGAGCAGACATCGTGGAAGAAGGGTGTAGCTCTCTTGTGGCCCCTACTGTCAAGATATATCATTCCTAGTTTGCCTTGTATATAAGAGATCTATCAGTGGGGATCATAATAAACAAAAATACCTCACTGCTTTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109194 208 + 636262 TTACTTATGCTTAGAGACAGATCTAACTAAGAACTAAGTGCCAACCATGACCCTTGACTGTATATTTCTATGTATTCATTCTATTAAAGACTATAGAGTAGACATCGTGGAAGAAGGGTGTAGCTCTCTTGTGGCCACTACTGTCAAGATATATC----------------------AAGAGATCTATCAGTGGGGATCATAATAAACAAAAATACCTTACTGCTCTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 101101 229 + 647215 TTAAGTATACTTAGAGACACATCTAACCAAGAACTAAGCGCTAGCCATAACCTTCAACTGTATATATCAATATCTGCGTTCTATTAAAGACTATAGACCAGAC-TCATGGGAGAAGGGTGTAGCTCTCTTGTGGCTCCTACTGTCAAGATATATCATTCCTAGTTTGCCTTGTATATATGAGCCTCAGCAGTGGGGATCATAATAAACAAAAATACCTCAATGATTTGTA + +a +s mr.mrrefChr0 104240 23 + 130230 ATGCACTATCTCATTGAGTGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109402 23 + 636262 ATGCACTATCTCATTGAGTGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 101331 23 + 647215 ATGCATTATCTTGTTGAGTGAAC + +a +s mr.mrrefChr0 104263 118 + 130230 TATGCGCAGCAGCAATGTTTGTGCTGATGTGATTTAAAATTTTTGTGATCATGACTTTTGAAACATGCAATCCACCCACATTGTCCAGTGACTGCCTTGTATTATTTATTCTGTTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109425 115 + 636262 TATGCCCAGCAGCAATGTTTGTGGTAGTGTAATTAATAAGTTTTGTGAT---GACTTTTGAAACATGCAATCCAACCATATTATCCAGTGACCACCTTGTCTCGTTTACTCTGTTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 101354 118 + 647215 TATGCGCAGCAGTAATGTATGTGCTGATGTGATTTAAAATTTTTGTGATCATGACTTTTGAAACATGCAATCCACCCACATTGTCCAGTGACTGCCTTGTATTATTTATTCTGTTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 101497 118 + 647215 TGTGCGCAGCAGCAATGTTTGTGCTGATGTGATTTAAAATTTTTGTGATCATGACCTATGAAACATGCAATCCACCCACATTGTCCAGTGACTGCCTTGTATTATTTATTCCGTTTAT + +a +s mr.mrrefChr0 104381 25 + 130230 TAAAAAATCCATTGTGCAACACTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109544 25 + 636262 TAAAAAATCCACTATGCAGCACTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 101472 25 + 647215 TAAAAAATCCATTGTGCAACACCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 101615 25 + 647215 TAAAAAATCCATTGTGCAACACTTC + +a +s mr.mrrefChr0 104406 634 + 130230 GGAGACTGCCTGATTTTTAGAAAATGCAGCACCATTGGTTTATTTTAAATTAAAACCCGCGAGCTAAATCATTTGGTGACTTAAACACTAACTTCGGAGCATAGACGAGGCTCGGGGTTCGTACGAGGGGTCTAATTCACCCAGTAGTTAGTCGGCCCTGCCGGAGATCTATTCCCTATCCTACACAGATCGGCTAACAGCTTCGCACGCTTAGTCCTCGTCTCTTGGGTGTGGGTATCTCTTAGATGCGGTTGGCAGCTTTCCTTACCGCACCAGGAGAGGCGTGTTCTGGCCCAAGGCATAGGGATATCCGGTTAAATTCGGAGAGCAAGGCGCATTTATAGTTCGAGCGACCAGAGTTATATTAGGTGCACGTGGCAGTATAATTTTAGGGTTCAAAGCTCAACCCACGGGCGTGCCAAACTCCCGAATGGGGGGGCTTGTGTTATTGTGGTGGCTTTGCACTGGCTAAACTTGAGCACTAGGATGTAGAAAGGTTAGCTAGCTGCTGTGAAGCAGGTTCCTGACTTTTACTTTCCCAGCTCCCCACACTATTGATGCATCCTTGATCATAGGGTAGCTGTCTTTGAAAGTTTATGCATCAGTAGTTGCACTACTTCTTAAGCTCGGCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 109569 621 + 636262 GGTGACTGCCTCATTTTTAGAAAATGCAGCATCATTGGTTTATTG-AAATTAAAACCTGCGAGCAAAATCATTTGGTGACTTAAATACT--CTTCGGAGCATAGACGGTGCTCGGGGTTCGTGCGACGGGTCTAATTCACCCAGTAGTTAGTCGGCCCTGCCGGAGATCTACTCCCTATCCTAGACAGATCGGCTAACAGCTTCGAACGCTTAATCCTCGTCTCTT-------GGTCTCTCTTAAA-GCGGTTGGCGGCTTTCAGTACCCCACCAGGAGAGGCGTGCTCTGGCCCAAGGCATAGGGATAGCCGGTTAAATTCGGAGAGCAAGGCGC--TTATAGTGCGAGCGACCAGAGTTATATTAGGCGCACGTGACAGTATAATTTTAGGGTTCAAAGCTCAACCCACGGGCGTGCCAAACTCCCGAATGGGGGGGCTGGTGTTATTGTGGTGGCTTTGCACTGGCTAAACTTGAGCACTAGGATGTAGAAAAGTTAGCTGGCTGCTGTGAAGCAGATTCCTGATTTTGACTTTCCCAACTCCCCACACTATTGGTACATCCTTGATCATAGGGCAGCTGTCTTTGAAAGTTTATGCACAAGTAGTTGCACTACTTCTTAAGCTCGGCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 101640 617 + 647215 TGAGACTGGCTGATTGTTAGAAAATGCGGCACCATTTGTTTATTTTAAATTAAATCCCGCGATGTAAACCATTTGGTGACTTAAGCACCAACTTCGGAGCATAGACGAGGCTCAGGGTTCGTACGAGGGGTCTAACTCACCCGGTAGTTAGTCGACCCTGCAAGAGAT---TTCCCTATCCTACACAGATCGGCTATCAGCTTCCCACGCTTAGTCCTTGTCTTTTGGGTGTGGGTATCTCTTAGATGCGGTTGGCAGCTTTTCTTACCGC--------------GTTCTGACCCAAGGCATAGGGATATCCCGTAAACTTCGGAGGACATGGCGCATTTATAGTTCGAGCGGTCAGAGTTATATTAGGTGCATGTTGCAGTATAATTTTAGGGTTAAAAGCTCAACCCACGGGCGTGCCAAACTCCCAAATGGGGGGGTCTGTCTTATTGTGGTGGCTTTGCACTGGCTAAAACTGAGCACTAAGATGTCAAAAGGTTAGCTACCTGCCATGAAGCAGGTTCTTGACTTTTACTTTCCCAGCTTCCCACACTATTGATGCATTCTTGATTATAGGGTAGCTGTCTTTGAAAGTTTATGCATCAGTAGTTGCACTATTTCATAAGCTCAGCCAA + +a +s mr.mrrefChr0 105040 84 + 130230 TCACATGGATTGTCAATCAAAGTGCTCACTGATCTCAACAGGCTGTTCAGTCTTCCTGTGTGTCCTTGTCATGATTCATTTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110190 84 + 636262 TCACATGGATTGTCAATCAAATCACTCACTGATCTCAACAAGCTGTTCAGTCTTCCTGTGTGTCCTTGGCATGATCCATTTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 102258 84 + 647215 TCACATGGATTGTCAATTAAAGTGCTCACTGATCTCAACAGACTGTTCAGTCTTCCTGTGTGTTCTTGTCATGATTTATTTGGG + +a +s mr.mrrefChr0 105124 31 + 130230 ACACCTTGTGTTGTTGCTGCACCTCTGGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110274 31 + 636262 ACATCTTGTGTTGGTGCTGCACCTCTGGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 102348 31 + 647215 ACACAGTGAAGTATTGCTACCAATGTTGTCT + +a +s mr.mrrefChr0 105155 272 + 130230 CAGCCATGTCAATGATCATAAGCAACACAGTGAAAGCATGCTGGCCCAACCAAATAAATTGGTATCATAAGCCAAATTTGCCTTGCAGTTACCTGTCAATCAGCTGTGTCTGGCCAGTTGCAATAACTTGTGGTAGACATATATAACATCATCTATGCCCACTGGGGTTCTAATTTAATAGTTTGCTTGTCACTCCCTATCCACCAATATTTggtaacctccccaagctaattaataatctgagtgacatccctggttacaaagttaatgtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110305 271 + 636262 CAGCCATGTCAATGATCATAAGCAACACAGTGAAATATTGCTGGCCCAACCAAATAAATTGGTATCATAAGCCAAATTTGCCTTGCAGTTACATGTCAATCAGCTGTGTCTGGCAAGTTGCAATAACTTGTGGTGGACATATATAACATCATCTATGCCCACT-GGGTTCTAATTTAATGGTTTGCTTGTCACTCCCTATCCACCAATATTTggtaacctccccaagctaattaataatctgagtgacatccctggttacaaagttaatgtg +s simRat_chr6.simRat.chr6 102381 258 + 647215 CAGCTATGT------TGATTAGCAACCTATTGTAAGCAT-----CCCAACCAAGTCAATTTGTATCTTAAGCCAAATCTGCCTCGCAGTTACCCGTCAGTCAGCTGTGT---GCCAGTGGCTATAACTTTTGGTAGACATAGATAACTACTGCTACACCCACTGGGGTTCTAATTTAATAGTTTTCTTGACACTGACTATCCACCAGTATTTggtaacctccccaggctaattaatactttgagtgacatcactggttacaaagttaatgtg + +a +s mr.mrrefChr0 105427 102 + 130230 ctctctcaaaattattaagggaagccgctagtaattcacaaaatactagatgttcatgggttggcctgcagaaagttttgaatctgagaattttaatcttac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110576 102 + 636262 ctctctcaaaattattaagggaagccgctagtaattcacaaaatactagatgttcatgggttggcctgcagaaagttttgaatctgagaattttaatcttac +s simRat_chr6.simRat.chr6 102783 102 + 647215 ctttttcaagattaataagggaagccactagtaatacaaaaaataccagatgttcatgggttgacttgcagaaagttttgaatctgagaattttgatcttgc + +a +s mr.mrrefChr0 105529 47 + 130230 gactgataacaaatctaattcaaagttaaaaaaattgagcaagcaga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110678 47 + 636262 gactgataacaaatctaatTCAaagttaaaaaaattgagcaagcaga +s simRat_chr6.simRat.chr6 102989 47 + 647215 gactcatagcaaatccaatttaaagtcaaaaaaattgggccagcaaa + +a +s mr.mrrefChr0 105576 37 + 130230 tcaggttactatgaatgagttttaccaccaagttacc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110725 37 + 636262 tcaggttactatgaatgagttttaccaccaagttacc +s simRat_chr6.simRat.chr6 103037 37 + 647215 tcaggatatagtaaataatttttactgccaagttacc + +a +s mr.mrrefChr0 105613 52 + 130230 agccggcactactggtatgaaagtgtgaataacagtcttttcactagttcaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110769 52 + 636262 agccggcactactggtatgaaagtgtgaataacagtcttttcactagttcaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 103074 52 + 647215 acccagcactactggtatgaaagtgtgaataacggtcttttcactagttcaa + +a +s mr.mrrefChr0 105665 41 + 130230 atggagccatcaacaaatagttttgtacgccagccaattga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110821 41 + 636262 atggagccatcaacaaatagttttgtacgccagccaattga +s simRat_chr6.simRat.chr6 103142 41 + 647215 atagggcgctgtacaaatagtttgattccccagccaactga + +a +s mr.mrrefChr0 105706 12 + 130230 ttgcttaatgtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110864 12 + 636262 ttgcttaatgtt +s simRat_chr6.simRat.chr6 103183 12 + 647215 ttgcttaatgtt + +a +s mr.mrrefChr0 105718 71 + 130230 gagccagggatccattaatcaataagtggtgttggacaaatgtgttatctatccacaaagaattaaagctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110902 71 + 636262 gagccagggatccattaatcaataagtggtgttggacaaatgtgttatctatccacaaagaattaaagctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 103195 71 + 647215 gaaccaaggatacacgaattaataagtattactggggaaatgtgttatctatccacagaaagtaaaggctt + +a +s mr.mrrefChr0 105789 30 + 130230 tcctaacttcttatatcagctgcaatggga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 110980 30 + 636262 tcctaacttcttatatcagctgcaatggga +s simRat_chr6.simRat.chr6 103266 30 + 647215 tcctaaggtcttatataagctgtgagggga + +a +s mr.mrrefChr0 105819 51 + 130230 acaaccaagaattaaaacttgactttttcttcactccttatgtgaactgta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111010 51 + 636262 acaaccaagaattaaaacttgactttttcttcactccttatgtgaactgta +s simRat_chr6.simRat.chr6 103298 51 + 647215 acaaccaagaattaaaacatgactttttcataacactttgtgtgaactgta + +a +s mr.mrrefChr0 105870 20 + 130230 gactacaaatcagaactcct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111065 20 + 636262 gactacaaatcagaactcct +s simRat_chr6.simRat.chr6 103349 20 + 647215 gaccacagatcagaattcct + +a +s mr.mrrefChr0 105890 75 + 130230 gccaaaaaaaacattgtaaaatgccacctaacatttggcacggggaaaatatatatctgaaggcaccaaaaacaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111085 75 + 636262 gccaaaaaaaacattgtaaaatgccacctaacatttggcacggggaaaatatatatctgaaggcaccaaaaacaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 103370 75 + 647215 gtcaaaaaaaacattgtaaaacaccactgaacatttggcacagggaaaatatgtatctgaaggcgctaaaaacaa + +a +s mr.mrrefChr0 105965 103 + 130230 tacagccaaacctaaaattgtgtggagtgaaagaaaagatgtctgcgggcatggtgaactccaggcctagaattttggacaaaaccgtcacctcctatgcccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111161 103 + 636262 tacagccaaacctaaaattgtgtggagtgaaagaaaagatgtctgcgggcatggtgaactccaggcctagaattttggacaaaaccgtcacctcctatgcccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 103445 103 + 647215 tacacctaaacctaaaattgtgtggagtgaaagtaaagacatctgtgggtatggtgaactccaggcttagaaatttggacaaaatcgtcaccacttatatccc + +a +s mr.mrrefChr0 106068 42 + 130230 aaaaggggtcgagcctcccgggttcggaaggaacccacaaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111265 42 + 636262 aaaaggggtcgagcctcccgggttcggaaggaacccacaaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 103548 42 + 647215 aagaggggactagtcccccggtttcagaaggaacccacaaag + +a +s mr.mrrefChr0 106110 68 + 130230 tccaaaaagaatgccaatgcactaatcagaagatggactagaaacattaacagtctgtcagtgtttgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111312 68 + 636262 tccaaaaagaatgccaatgcactaatcagaagatggactagaaacattaacagtctgtcagtgtttgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 103590 68 + 647215 tccaaaaagagaaccaatgccacaatcagaagatggactagagacattaatagtcggtcagtgttttg + +a +s mr.mrrefChr0 106178 50 + 130230 attgccagaggaagtgtgcttcttccccatcagctcattggatgggcaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111387 50 + 636262 attgccagaggaagtgtgcttcttccccatcAGCTCATTGGATGGGCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 103658 50 + 647215 agtgccagaggaagtctgcttcttcctcatcagcccattgcacagccaag + +a +s mr.mrrefChr0 106228 77 + 130230 caccaggggaagtaagacttttcctgaggcctatcgtgcaggtattggtggtaggacaacactatgttgtgtcaggc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111438 77 + 636262 caccaggggaagtaagacttttcctgaggcctatcgtgcaggtattggtggtaggacaacactatgttgtgtcaggc +s simRat_chr6.simRat.chr6 103708 77 + 647215 caccaggggaagtgagacttttcctgaggcctatcatgcaggtattggtggtaggacaacgccatgctgtgctatgc + +a +s mr.mrrefChr0 106305 38 + 130230 aatgagtaacgatggagaaacctttttctaatatCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111515 38 + 636262 aatgagtaacgatggagaaacctttttctaatatCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 103786 38 + 647215 aatgagtaacaatcgagaaacctttttctaatatCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 106343 33 + 130230 ACAAGCATAATAAAAATGGTGACCTTATACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111553 33 + 636262 ACAAGCATAATAAAAATGGTGACCTTATACAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 103851 33 + 647215 ACCAACATAAGAAAGATGGTGGCCTTATACAGC + +a +s mr.mrrefChr0 106376 279 + 130230 AAAGCCCTTTTTCCTTGCCACAAGCTACCCACAGGTTTAACTGCACTTTAACTACATGATAAAATATAGCTGTGCACCAACATTGCTGGGCTTGTTAGAGTATCAATATTACAGTAGTAATTGGATGGTATGTGGGTCACCAAAATCCCTTTATGCCAAAGGGTACTATTCATGTATTACAACCCACAATGCCCTCCACTCTGAAAGTAAGATGTTACCAGAGTTCTAACAATTCATAATGTAGATGTAGTTGCCTTACAATGTCATAGAGGACATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111614 274 + 636262 AAAGCCCTTTTTCCTTGCCACAAGCTATCCACAGGTTTGACTACACTTTGACTACATGATAAAATATAGCTGTGCACCAATATTGCTGGGCTTATTAGAGTATCAATATTACAGTAGTAATTGGATGGTATGTGTGGCACCAAAATCCCTTTATGCCAAAGGGTACTATCCATGTATTACAACCCACAATGCC-----CTCTGAAAGTAAGATGTTGCCAGAGTTCTAACAATTCATAATGTAGATGGAGTTGCCTGACAATGTCATGGAGGACATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 103884 269 + 647215 AAGGCCCTTTTCCCTTGCCACAAGCTACCCACAGGTCTAACTGCAGTTTAACTACCTGATAAAATATAGCCGTGCACCAACATTGCT-GGCTGGTTAGAGTATC---------GTAGTAATTGGATGGTATGCGGGTCACAAAAATCCCTTTATGCCGTAGGGTACTATTCATGTATTACAACCCACAATGCTCTCCACTCCGAAAGTAAGAAGTTATCAGAGTTGTAACAATTCATAATGAAGATGTAGATGCCTTACAATCTCATAGAGTGCATATG + +a +s mr.mrrefChr0 106655 7 + 130230 TGGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111894 7 + 636262 TGGCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 104153 3 + 647215 T----CA + +a +s mr.mrrefChr0 106662 103 + 130230 TTTTTAGTGGTTATGCCATTTGTTCATTCCAAGAGGAACAGCCCTCTTATTGTTCACCAACACAAGTTTAGGATATAAAGCTTATATTTTGTAACATGCTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 111914 103 + 636262 TTTTTAGTGGTTACGCCATTTGTTCATTCCACGTGAAACAGCCCTCTTATTGTTCACCAACATAAGTTTAGGATATAAAGCTTGTATTTTGTTACAAGCTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 104156 103 + 647215 TTTTTAGTGGGTATGCCATTTGTTCATTCCAAGAGGAACAGCCTTCTTATTGTTCACCAAAACAAGTTTAGGATATAAAGCGTATAATCTGTAACATGCTCCT + +a +s mr.mrrefChr0 106765 151 + 130230 TTCCATTTAGGATATAAAGCCTATAATCTGTAACATGCTCCTGTCCTATTCATTATGGGCATTATCTCTATTCATTATGGGCATTGTGAGTCTGAGTGAGAGGTGCAGTAACTTGTTGAAAGAAGTCAGAGACAAGTTCTTCCTGAGGACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112017 150 + 636262 TTCCATTTAGGATATAAAGCCTATAATCTGTAACATGCTCCTGTCCTATCCATTATGGGCATTATCTCTATTCATTATAGGTATTGTGAGTCTGAGTGAGAGGTG-AGTAACTTGTTGAAAGAAGTCAGAGACAAGTTCTTCCTGAGGACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 104264 151 + 647215 TTCCGTTTAGGATATAAAGCCTCTAACGTGTAGATTGCTCCTATTGTATTCATTATGGGCATTATCTCTATTCATTATGGGCATTGTGAGTCTGAGTAAGAGATGCAGTAACTTGTCAAAAGGAGTCAGAGACAAGTTCCTCATGAGGATG + +a +s mr.mrrefChr0 106916 138 + 130230 ATTAATTCCCAGGAGAGGACCATGTGGGGAGGTGCTATCTTAGCCTCACATCATAGAGTTATTGCAAATCTTTTTCATACCTGTCAGAAAAACCTGGCATAGATAGCTAAAGTCAGAGATGTCAGCTCAATCTAAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112167 137 + 636262 ATTAACTCCCAGGAGAGGACCATGTGGGGAGGTTCTATCTTAGCCTTACATCATAGAGTTATTGCAAAGCTTTTTCATACCTG-CAGATTAACCTGGCATAGATAGCTAAAGTCAGAGATGTCAGCTCAATCTAAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 104418 138 + 647215 ATTAATTCCCAGGAGAGGACCAAGGTGGGAGGTGCTATCTTACTGTCACGTCACAGAGTTATTGCACATCTTTTTTATACCTGTCAGAAAAACCTGGCATAGATAGTTAAAGTCAGAGGCATCAGCTCAATCTAAGGA + +a +s mr.mrrefChr0 107054 94 + 130230 TCAGAGATATGTCTGCCCAGTCTTAAGTATAATTCAATTTATTCTCTCTGCAGAGATAATTCCCATGTCCTTCACAATAAATTTAACTTAGATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112324 92 + 636262 TCAGGGATATGTCTGCCCAGTCTTAAGTATAATTCAATTTATTCTCTCTGCAGAGATAATTCCCATGTCC--CACAATAAATTCAACTTAGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 104556 94 + 647215 TCAGAGACATGTCCGGCCAGTCTTGAGTATAATTGAATTTACTCTCTCTGCAGAGATAATTCCCATGTCCTTCATAATAAATTTCACTTAGATC + +a +s mr.mrrefChr0 107148 20 + 130230 TCATTACTCATGGATAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112416 20 + 636262 TCATTCCTAATGGATAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 104695 20 + 647215 TCATTACTCATGGATAAACC + +a +s mr.mrrefChr0 107168 170 + 130230 GAACTTCTTTGAGCCTGTAGGCAATTAAAAGAAGTTAAGGAGACTGGTTTTTTAAAAGGCCCTCAGTGTTGCATTAGTCATAAACCTCAAGATGAAGGTGGTGGACTCCTAGAAATGTGTCAACCTATAACCTTCAGTATTCATTGTTAAAACTTATACTATTTCATTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112436 170 + 636262 GAACTTCTTTGATCCTGTAGGCAAGTAAAAGAAGTTAAGGAGACTGGGTTTTTAAAAGGCCCTCAGTGTTGCATTAGTCATAAACCTCAAGAGCAAGGTGGTGGACTCCTAGAAATGTGTCAACCCATAAGCTTCAGTATTCATTGTTAAGACTTATACTATTTCATCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 104747 167 + 647215 GAACTTCTTTGAGCCTGTAGGCAATTAAAAGAAGTTGAGGAGACGGGTTTTGTAAAAAGTCCTCAGTGTTGCATCAGTCATAAACCTCAAGCTGAAGGTGGTGGACTCCTAGAAGTGTGTCAACTTATAGCCTTCAGTGTTCATTGTTAAAACTTATATTGTT---CTAG + +a +s mr.mrrefChr0 107338 275 + 130230 TGGATGTTGTTGTAGTCTAGGACACACAATCCTTAGTTCATAAATTTCATGCATTGTCTTCTTGCAGGGTGGCCTTCACTGCCAAGACTTGCTGTTGTTATATGAAAGACTATAGTGCTGATACTGACCCACCGGCAGCCAGGGGCTCCTTTTCTCACGTTGCCTGATATAACCTTCTTGTTAAACTGTAACTACTAAAGATCTATCATGGATTTATCCTACCCTGCAGCAACTATGTTGCATAGTCAGCAAATGAGTATAATACAAGTAGATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112609 273 + 636262 TGAATGTTGTTGTAGTCTAGGACGCACAATCCTAAGTTCATAAATTTCATGCATTGTCTTCTTGCAGGGTCGCCTTTACTGCCAAGACTTGCTGTTGTTATATGAAAGACTAT-GTGCTGA-ACTAACCCACCGGCAGCCAGGGGCCCCTTTTCTCACGTTGCCTGCTATAACCTTCTTGTTTAACTGTAACTACTAAAGATCTATCATGGATTTATCCTACCCTGCAGCAACTATGTTGCATAGTCAGCCAAAGAGTACAATACAAGTAGATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 104914 273 + 647215 TGGGTCTTGTTGTAGTCTAGAACACCCAATCTTTAGTTCACAAATTTCATGCATTGCCTTCTTGCAGGGTGGCCTTCACTGCCAAGATTTGCTCTTATTATATGAAATACTATAGTGCTGATACTGACCAACCAGCAGCCAGGGGGTCCTTTTCTCACCTCGCCTGATATAACCTTCTTGTTAAACTATAACTACTAA--ATTTATCATGGATTTATTCTACCCTGCTGCAACTATGTTGCATACTCAGCAGTTGAGTATAGTACAAGAAGATAG + +a +s mr.mrrefChr0 107613 19 + 130230 ATTTGTTTATTTGGAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112885 19 + 636262 ATTTGTTTATTTGGAGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 105187 19 + 647215 GTTTGTTTATTTTGAGTAG + +a +s mr.mrrefChr0 107632 24 + 130230 AAACTGAGTTTGATACCAGTACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112905 24 + 636262 AAACTGAGTTTGATACCAGTACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 105206 24 + 647215 CAACTGAGTTTAATTCTGGTCGAT + +a +s mr.mrrefChr0 107656 47 + 130230 TAACATTTGTTCATTTCAGCCATGGAACAAAAGTAGTGCAATACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112932 47 + 636262 TAACATTTGTTCATTTCAGCCCTGGAACAAAAGTAGTGCAATACAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 105230 47 + 647215 TAACATTTGTTCATTTCAGTCACGGAACAATGGTAGTGCAATAAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 107703 85 + 130230 ATTGTGTTCTTGGTGAGTTGACTTGTCACAAAACCCATAAATAACAAAGGGTGACAGGTAATTAGAGACGATAACCCCCCCTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 112979 85 + 636262 ATTGTGTTCTTGGTGAGTTAACTTGTCGCAAAACCCATAAATAACAAAGGGTGACAGGTAAGTGGAGACGATAACCCCCCCTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 105281 84 + 647215 ATTGTCTTCTTGATGAGTTGACTTGTCACAAAACCCATAAATAAT-AAGGGTGATAGGTAATTAGAGACCATAGCCCCCCCTATC + +a +s mr.mrrefChr0 107788 174 + 130230 AAATTGAAGCACCTGTAGTAAGACTATAGTGGCTGGTTGACCAGTAAACCATTGTGGGTCTCCCTCTAGGAGGGGAATTGGGGCATACATGGTTGCCAAGGAAAGGGGCAGAGCAGGGTGAAGGGGCAGAGCAGAGTATAGTTGGGCAGGTAAACAAATAGTCCCACACATGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113064 174 + 636262 AAATTGAAGCAACTGTAGTAAGACTATAGTGGCTGGATAAGCAGCAAACCATTGTGGGTCTCCCTCTAGGAGGGGAATTGGGGCACACATGGTTGCCAAGGAAAGGGGCAGAGCAGGGTGAAGGGGCAGAGCAGAGTATAGTTGGGCAGGTAAACAAATAGTCCCACACATGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 105367 174 + 647215 AAATTGAAGCACCTGCAGCAAGAATATAGGGGCTGGTGGACCAGTACACCAATGTGGGTCTCCCTCTAGGGGGGGAATTGGGGCATACATGGTTGCCATGGAAAGGGGCAGAGCAGGGGAAAGGGGCACAGCAAGGTATAGTTGGGCAGGTAAACAAATAGTCCCACACATGTG + +a +s mr.mrrefChr0 107962 34 + 130230 TCTAAACTGTGGTGAGGGTAGTACAGAGCCGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113238 33 + 636262 TCTAAACTGTGGTGAGGGAAGTACAGA-CCTCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 105543 34 + 647215 TCTAACCTGTGGTGAGGGTAGTACAGAGCAGGGT + +a +s mr.mrrefChr0 107996 158 + 130230 GTCATAGCTCTTTGCAAAGGTTCTCTATCACAAGCTTCAGATTGAGGTTTTGTATGCTGCAAATGGGATATATACTTAGAAGTATGGGTTTGGGCACACATCCCTAGTCTGAAAGAAGTTTCTCACAAGAGTCTACGTCAATTATGTGACTGACAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113271 157 + 636262 GTCATAGCTCTTTGCAAAGGTTCTCTATCACAAGCTTCAGATTGAGGTTTTGTATGCTGCAAATGGGATATATACTTAGAAGTATGGGTCTGGGCACACATCCCTAGTCTGAAAGAAATTTCTCACAGGAGTGTA-ATTAATTATGTGACTGACAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 105587 158 + 647215 GTCATAGCTATTTGCAGAGGTTCTCAACCACAAGCTTCAGATCAAGGTTTTGTATGCTGCAGACAGGACAACTTCTTGGAAGTACGGATTTGGGCACACTTTCCCAGTCTGAAAGAAGTTTCTCACAAGAGTCTACGTCAATTATGTGACTGACAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 108154 174 + 130230 GAGACTATGTCTAGGGGAATGCAGCCCTGGATGGCGGGTATGTTATGTATTATCAGGAGATCCAGTTCACTAGCAAACCTGACAAGTATATAAACATAAACGCTCAGAACACATTTCGGAGGCATATATCAGGGTACTTTACAGGTTTTGGAAGCAATGCGCCATGCATTGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113428 174 + 636262 GAGACTCTGTCTAGGGGAACGCGGCCCTGGATGGCGGGTATGTTATGTATCATCAAGAGATCCAGTTCACTAGCAAACCTGACAAGTATATAAACATAAGAGCCCAGAACACATTTCAGAGGCATATATCAGGATACTTTACAGGTTTTGGAAGCAATGCACCATGTATTGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 105751 166 + 647215 GAGACTATGTCTAGG---ATGCAGCCCTTGGTGGTGAGTA---TATGCATTATCAGGAGATACAGTTCACTACCAAACCTGCCACATGTATCAACATAAACGCTCAGAATAC--TTAGGAGGCATATATCAGGGTACTTTACAAGTCTTGGAACCAATGCGCCATGCATTGTTG + +a +s mr.mrrefChr0 108328 10 + 130230 GATAATCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113602 10 + 636262 GATATTCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 105974 10 + 647215 GATAATCTAT + +a +s mr.mrrefChr0 108338 165 + 130230 ATCATATGCAGGTCACAAATCTCAATAGTGTCCATAAACATTTTCCATAAACATTTCCACATAAAGAGTTCATCTAGGAAAGGTTATGCAAAATGCCTACTATGGAAATTTTGACAACAGAAAGAAGTGAACTAAGACACCAAACAATAAACATTTAAACAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113613 153 + 636262 ATCACATGCAGGGCATA-----------TGTCCATAAACATTTTCCATAGACACTTCCACGTAAAGAGTTCATCTAGGAAAGATTATGCAAAGTGCCTACTATGGAAATTTTGACAACAGAAAGAAGTGAACTAGGACACCAAACAAT-AACATTTAACCAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 105984 162 + 647215 ---ATATGCAGGTCACAAATCTCAATAGCGTCCATAAACATTTTCCATAAACATTTCCACATAAAGAATTCATCTAGGAAAGGTTACGCAAAATACCTACTATGGAAATATTGACAACAGAAAGAAGTGGACTAAGACACCAGTCAATAAACATTCAAACAGTAA + +a +s mr.mrrefChr0 108503 206 + 130230 GACATGGGCTAATCATTGCATAATAATGCCAAGAATGAATTACCAAGAAAGAATAACCTTAATAGTTCCATGATATGGTGGTGGGGAAATCAGACCATTAGTGATCTACCACCATCTTATTGTGCCACATTAAAATGGAGGGGGGGCACAAAATGGACTCAATTATTGTAATGACAATACTTTGGTGGTAGGTTTAATCTTTAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 113815 206 + 636262 GACGTGGGCTATTCATTGCATAATAATGCCAAGAATGAAGTACCAAGAAAGAATAACCATAATAGTTCCATGATATGGTGGTAGGGAAATCAGAACACTAGTGATCTACCACCATCTTATTGTGCCACATTAAAATGGAGGGGAGGCACAAAATGGACTCAATTATTGTAATGACAATATTTTGGCAGTAGGTTTAATCCTTAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 106146 205 + 647215 GACATGGGTTAATCATCGCATAATAAAGCC-AGAATGAATTGCCAAGACAGAAGAGGCTTAATAGTTCCGTGATATGGTGGTGTGGAAGTCAGACCATTAGTGAACTATCTCCATCTTAGTGTGCCACATTAAAATGGAAGGGGGGCACAAAGTGGACTCAATTATTGTAACAATAATCCTTTGGTGGTGGGTTTAATCTTTAGAA + +a +s mr.mrrefChr0 108709 94 + 130230 GAAGTATTCCTAAAAAGAATAAGCACTCTTCTGTCTGAGCTTGGCTGCCCAAGGCTTTGATAGGCAAAAGGACACAGGTTGAGGGCACAAAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114026 93 + 636262 GAAGTATTCCTAAAAAGAATAAGCACTCTTCTGTCTAAGCTTGGCTGCCCAAGGCTTTGATAGGC-AAAGGACACAGGTTGAGGGCACAAAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 106351 92 + 647215 GATGTCTTCCTAGAAGAAACAAGCACTCTTTAGTCTGAGCTTGGCTGCCCAAGGCTTTGATAGGCAAAAGGATACAGGAT--AGGCACAAGGTT + +a +s mr.mrrefChr0 108803 70 + 130230 ACTTACAGGAGTGTCAATGGGGATGTTGATCGGGGAAGTCTTCTTGAACCTGGCTTTTGACCAAGATGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114119 54 + 636262 ACTTACAGGAGTGTCAATGGGGATGTTGA---------TCTTCTGAAACCTGGCTTTTGACCA------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 106451 70 + 647215 ACTTTCAGGAGTGTCAATGGAGATGTCAATCGGGGAAGTCTTCTTGGACCTGGCTTTTGACCAAGATGAT + +a +s mr.mrrefChr0 108873 52 + 130230 TGCTATTGGATTATTCCCAAACAAGAAGTCCTCTCTATTTTGATCTTGGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114173 52 + 636262 TGCTATTGGATTATTCCCAAACAAGAAGTCCTCTCTATTTTGATCTTGGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 106530 52 + 647215 TGCTATTGACTTATTCCCAAGGAAAAAGTACTCTCTATTTTGATCTTGGCTG + +a +s mr.mrrefChr0 108925 39 + 130230 CTAAGGCTTTGATAGACACTGCATCACAGGTTGACATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114225 39 + 636262 CTAAGGCTTTGATAGACACTGCATCACAGGTTGACATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 106607 39 + 647215 CTAAGACTTTGATAAGCACTGCATCACAGGTTGGCAGCT + +a +s mr.mrrefChr0 108964 15 + 130230 TGGGAATGTCAATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114273 15 + 636262 TGGGAATGTCAATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 106646 15 + 647215 TGGCACCTTTATTGG + +a +s mr.mrrefChr0 108979 316 + 130230 GGAAGGTATTATTGGACCATACTTTTTTCATCTATGATTATCTCAAGTCATATTGCTACTTGATTATAGTAAGGAATCCTCCTCACATACTTATTGGTACTTCAAATCCTAATACTATGGAAGCCAAGTACTGGGGCTCTCTGAGATAGCAGGCCTTAACCTATTTATCCAATGGTTTAGTTATCTCCTGGCTGCCATTTTGGACAGATGTTAATCAGATCATAAGACTAGAGTACCTTGTAAGTGACATTTTGGGGGAGAAAAAAACCTACAAAGACAAAGAAGTGAGCTCAAACATGCAATTGACTTACCTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114288 314 + 636262 GGAAGGTATTATTGGACCATACTTTTTTCATCTATGATTATCTCAAGCCATATTGCTGCTTGATTAGAGTAAGGGATCCTCCTCACATACTTATTGGTACTTCAAATCCTAATACTATGGAAGCCAAGTACTGGGGCTCTCTGAGATAGCAGGCCTTAAGCTATTTATCGAATGGATTAGTTATTTTCTGGCTGCCATTTTGGACAGATGTTAATCAGATCATAAGGCTAGAGTATCTTGTACGTGACATTTTGGGGGAG--AAAAAACTACAAAGACAAAGAAGTGAGCTCAAGCATGCAATTGACTTACCTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 106664 314 + 647215 GGAAGGTATTATTGAGCCGTACTGTTGTCATCTAGGATTATCACAAGTCATATTGTTACTTGATTATAATAAGGAAG-CTCCTCACAAACTTATTGGTACTTCACAACTTAACACTATGGAAGCAAAGTACTGGGGCTCTCTGAGATAGCAGGCCTTAACCTATTTAACCAATGGTTTAGTTATCTCCTGGCTGCCTTTCTGGACAGTTGTTAATCAGATCATAAGACTAGAGTACCTTGTAAGTGACATTTTGGAGGAGAAAAAAAC-TACAAAGACAAAGATGTGAGCTCAAACATGCAACCGACTTACTTTCT + +a +s mr.mrrefChr0 109295 15 + 130230 TCTGAGTTCTGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114603 15 + 636262 TCTGAGTTCTGGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 106978 15 + 647215 TCTGAGTTCGGGAAA + +a +s mr.mrrefChr0 109310 396 + 130230 GAAATTCCTAGTGACTTATCCTACTGCACTACAAAATGAGAGTTTTTCTCTGTAAAAATACAAGTGTTCACTTGCTATTAGCATGATATTTGAATGACAATACTAGCCACTTTCACATTCACAGTTAGATATTCGACTAGGTGTTATGGGATAGGAACCTGCCTCAATTCAGGCTTACAACCCATATTCCCTTATCAAATATCTAAGTGTGCCTGTTAACTGGCTAGCATGTCCAATTGAATATCTTACTAACTGCAGCTGCAGGAAAACACTTCTATTTCTGTGATAGGTCCATGTCAGGAACAGTGCTGGCAAAGCTAGTAATTGCCGCTTTACTTTGCAATTTGCTCGATCAAATGTGTGCTACACGTGAGATCAATATTACAATTTATTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 114619 396 + 636262 GAAATTTCTAGTTAGTTATCCTACTGCACTACAAAATGAGAGTGTTTCTTTGCAAAAATACAAGTGTTCACTTGCTATTAGCATGATACTTGAATGACAATACTAGCCACTTTCACATTCACAGTTAGATATTCGACTAGGTGTTATGGGATGGGAACCTGCTTCAATTCAGGCTTACAACCCATATTCCCTTATCAAATATCTAAGTGTGCCTGTTAACTGGCTAGCATGTCCAATTGAATATCTTACTAACTGCAGCTGCAGGAAAACACTTCTATTTCTGTGATAGGTCCATGTCAGGAACAGTGCTGGCAAAACTAGTAATTGCCGCTTTACTTTGCAATTTGCCCGAGCAAATGTGTGCTACACGTGAGATCAATATTACAATTTATTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 106993 393 + 647215 GAAATTCCTAGTGACTTATCCTACTACACTGCGACATGAGAGTTTCTCTCTGTAGAAACACAAGTGTTCACTTACTGCTAGCATGATATCTGGATGGCAATTCTAGCCACTTCCATATGCACAGTTAGATATTCAACTAGGTGTTATGGGATAGGAACCTGCCT---TTCAGGCTTGCAACTCACATTCCCCTATCAAATATCTAAGTGTGCCTGTCAACTGGCTAGCCTGTTCAATCGAATATCCTACTAACTGCAGCTGCAGGAAAACACTTGTATTTCTATGATAGTTCCATGTCAGGAACAGCGCTGGCAAAGTTAGTAACTGCCACTTTACTTTGAAATTTGCTCGATCAAATGTGTGTCGCATGTAAGATCATTATTACAATTTATTATA + +a +s mr.mrrefChr0 109706 71 + 130230 ATGGGTGACTTATTCAGGGCTTACACTCTTTGTCCTGAACGTGAAATTTGTGACATTACAATTATATCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115015 71 + 636262 ATGGGTGACTTATTCAGGGCTTACACTCTTTGTCCTGAACGTGAAATTTGTGACATTACAATTATATCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 107441 71 + 647215 ATAGGTGGCTTATTCAGGGCTTGCACTCTTTGTCCTGGACGTTAAATTTATGACCTTACAATTATATCTTG + +a +s mr.mrrefChr0 109777 14 + 130230 TGAAGTAAGACTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115086 14 + 636262 TGAAGTAAGACTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 107513 14 + 647215 TGAAATAAGACTCT + +a +s mr.mrrefChr0 109791 50 + 130230 AGCTAGTTAGATGTGGGTCAAGCAAAGTACAAAAAGTGGTGAGAACTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115100 50 + 636262 AGCTAGTTAGATGTGGGTCAAGCAAAGTACAAAAAGTGGTGAGAACTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 107532 50 + 647215 AGCCAGTTAGATGTGGGACAAGCAAAGTACAAAATGTGGTAAGAACTGAG + +a +s mr.mrrefChr0 109841 230 + 130230 TTGAAGTTGGGTACCAAGTAGAGAAAGTAGCAAAAGACAGGAGATTGTGTGGAAGGACATCTTTGACAGTGATCTGAGACATCCAATCTGACCTTTCTCTATTGCATACCACAGAAATGGTGTAAGATTGTTCCTTCTTTATCGGTTGCATAATCTCAGAGAACACATCATAATTTTTGCATAACTATTAGGGTCCACATCTGATGATTAGTATGGTGAGTACGGCATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115163 229 + 636262 TTGAAGTTGGGTACCAAGTAGAGAAAGTAGCAAAAAACAGGAGATTGTGTGGAAGGACATCTTTGACAGTGATTTGAGACATCC-ATCTGCCCTTTATCTATTGCACACCACAGAAATGGTGTAAGATTTTTCCCTCTTTATCAGTTGCATAATCTCAGAGAACACATCACAATTTTTGCATAACTATTAGGGTCCACATCTGATGATTAGTATGGTGAGTACGGCATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 107582 230 + 647215 TTTAAGTTGGGCACCACGTAAAGAAAGTAGCAAAAGACCGGAGATTGTGTGGAAGGACATCCGTGACAGTTATCCAATACATCCAACCTAACCTTTCTCTATTGCATACCACAGAAATGGTGTAAGATTGTACCTTCTTTATCGGATGCATAATCTCAGAGAACCCACCATAATGTTTGCATAACTATTAGGGTCCACATCTGATGATTAGTAGGGTGAGTGCGGCTTGT + +a +s mr.mrrefChr0 110071 234 + 130230 TTCTATAACCCCCACAGATAAGACTAAGGTGGGCCCCTATCTGCAGTCGCAATGGTTCTATCCTGTTGGGAGCTGGTGAACGTTGCTCACGTAAAGTAAGAGAGAGCAGAGCCACTCCTTGCTGCAAATCCTATGACTTGACTGGGAGACTGCATAGAAAAAGATATAAGGTGATTGAGCAAAGAAAGTCACAAAAGCAACACTTGAAAGGGAAATGGCTATACTGTTTTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115394 218 + 636262 TTTTATAACCCCCACGGATAAGACTAAGGCAGGCCCCCATATGCAGTCGCAA---TTCTATCCTGCTGAGAGCTGGTGAACATCGCTCATGCGAAGTAAGGGAGA--------ACTCCTTGCTACAAATCCTTTGACCTGACTAGGAGACTGCATAGAACAAGATACAAGGTGAT-----AAAGAAAGTCACAAAAGCAACACTTGAAAGGGAACTGGCTATACTGTTTTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 107812 232 + 647215 TTCTATAACACCCA-AGATAAGACTAAGGTGGGCCCCTATCGGCA-CCGCAATGGTTCTATCCTGTTGGGAGCTGGTGAACGTTGCTCACATAAAGTAAGAAAGGGCAGAGCCACGTCTTACTGCAAATCCTACGACTGGACTGGGAGACTGCATAGAAAAAGATTTGAGCTGATTGAGCAAAGAAAGTCAAAAAAGCAACGCTTCAAAGGGAAATAGCTATACTGTTTTAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 110305 204 + 130230 CACTGCTAGTTTGCACTTTTATCATTATTTATAAGTGTATCTTTTGAGAGCTGGATCATATTGTAACTTTGACATGACGTTTTGTTAATAAGGCCAGTGCCAGAGAATGCACATTTGCCAATCAATGCATACTAACTAAAACTTCAGTGTATGCTAACTACTACTAATACTCTTCACTGTCTTGTGTCACAACTGACAGTGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115612 203 + 636262 CACTGCTAGTTTGCACTTTTATCATTACTGATAAGTGTTTCTTTTGTGAGCTGGATCATATCGTA-CCTTGGCATGACGCTTTGTTAATAAGGCCAGTGCCAGAGAGTGCACATTTGCCGATTAGTGCATACTAACTAAAACTTCAGTGTATGCTAACTCCTACTAATACTCTTCACTGTCTTGTGTCACAACTGGCAGTGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 108045 201 + 647215 CACTGCTACTTTGCATTTTTACTATTATCTATAAGTGTAGCCTTCGAGAGCAGGATGATATTGTAATTTTGACACAACTTTTTCTTAATAAAGCCAGTGCCAGAGAATGCATATTCGCCAATCAAT---TACTAACTAACACTTCAGTACACACTAACTACTGCTAATACTCTTCACTGTCTTGTGTCACAACTGACAGTGAGC + +a +s mr.mrrefChr0 110509 10 + 130230 AAAAGTTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115839 10 + 636262 AAAAGTTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 108246 10 + 647215 AAAAGTTATT + +a +s mr.mrrefChr0 110519 248 + 130230 GGTGGAGAAAGTAGCTGTCATCAGACTTTGGATGTTTCATGCCAAGCTGGACTTATCAATGCGAGGCAAGCCAAGCTGATGGTCTTCCAGGCGTAGCAGACCTTATAAGGGAATATCAGCATTAGTAGATGTCCAAAAGTGAATCCCACTACTATGGTGACTGAAAACAGTCCGGTTCCAGTAAGTGTATCTATCATTTTCTGTCCATAGCCTTATGATTACTTTGTCTCTATGCTCTGAACTTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 115849 245 + 636262 GGTGGAGAAAGTAGCTGTCAGCAGACTTTGGATGTTACATGCCAAGCTGGACTTATCAATGCGAGGCAAGCCAAGCTGATGGTCTTCCAGGCGTAGCAGACCTTATAAGGGAATATCAGCATTAGTAGATGTCCAAAAGTGAATCCCACTACTATGGTGACTGAAAACAGTCCGGTTCCAGTAAGTGTATCCATCATTTTCTGACTATAGCCTTTTAATAACTCTGTCTCTGTGCTGTGAAC---GAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 108258 244 + 647215 GGTGGAGACAGTAG-TGTCATCAGACTTTGGATGTCTCATGCCAAGCTGGACTTATCAATGTGATGCAAGCCAAGCTGAAGGTCTTCCAGGTGCAGTGGACCTTATAAGTGAACATGAGCATTAGTAGATGTCCAAAAGTAAATCCCA---CCATGGTGACTGAAAACAGTCTGGTTGCAGTAAGAGCATCTATTATTTTCTGTCCATAGGCTCATGTCTACTTTGTCTCTATACTCTGAAGTTTGAT + +a +s mr.mrrefChr0 110767 36 + 130230 GCAATGGTTTATGCACGTATGGTCATGCTAACTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116094 35 + 636262 GCAATG-TTTATACACTTATGGTCATGCTAATTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 108505 36 + 647215 GCAATGGATTATGCATGTATGGTAGTGGTGCCTAGT + +a +s mr.mrrefChr0 110803 252 + 130230 TAAATATTGAGATACTATCTTCAACACTCTTCTAAGCATATCTTGGTGGGTGTGGAGTCAAGGCATGATGTTCTAGTCAGGGGTACCCTTAGTCTCAGAAGGTACTCTTCATACTCTATCCCTAAGCTTAAGCAAGTGGAAATAAAGCTGAGATATTCTGTAAAGAATAAACAGTTGTTGGGTATATAAAAGTATATGAAACACACTCACTGTTACCTGGGATTAGTCTAGAATTGATGAGGCTATATGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116133 251 + 636262 TAAATATTGAGATTCTATCTTCAACACTCTTCTAGGCATATCTTGGTGGGTGTGGAGTCAAGGCATAATGTTCCAGTCAGGGGTACCCTTAGTCTCAGAAGGTGCTCTTCATACTCTATCCCTCAGCTTAAGCAAGTGAAAATAAAGCTGAGACATTCTGTAAAGAATAAACAGTTGTTGGGTATATAAAAGTATATGAAA-ACACTTACTGTTACCTGGGATTAGTCTAGAATTGATGTGGCTATATGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 108541 252 + 647215 TAAATATTGAGATACTATCTTGAACACTCTACTAAGCATATCTTGGTGGGTGTGGAGTCAAGGCATGTTGTTCTAGTCAGGGGTACCCTTGGTCTCAGAAGGTACCCTTCATACTCTATGACTAGGCTTAAGCGAGTAGAATTAAAGCTGAGATATTCAGTAAAGAGTAAACAGTTGTTGTGTATATAAGAGTATAAGAAACACACTCACTGTTACCTGGGATTAGTCTAGAATGGATGAGACTATATTTTG + +a +s mr.mrrefChr0 111055 264 + 130230 ACCCTCTCCAATAGGGATGGGTCATCTATTCTTTCATGACGACTATGGAGTTATTGATCATGATCCTGGGACATGCACCATGTCCTTTTATTGGGCACCCCAATGTCCAGGAGCACACCCTAAATTTGCATCTGGGGGAGGTTGAGGCCATAGTTTACCAACATGCAAGCTTGCCTTCATTTCTTGTCTGACCCCCATCATGTGTAAAAATAACAATATTTTTGAAAAACACCAGGGTGTATCTGGTGATCTAAAAGTGAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116394 249 + 636262 ACCCTCTCCAATAGGGATGGGTCATCTATTCTTTCATGACGACTATGGAGTTATTGATCATGATCCTGGG---------------TTTTATTGGGCACCCCAATGTCCAGGCGCACACCCTAAATTTGCATCTGGGGGAGGTTGAGGCCATAGTTTACCAACATGCAAGCTTGCCTTCATTTCTTGTGTGTCCCCCATCATGTGTAAAAATAACAATATTTTTGAAAAACGCCAGGGTGTACCTAGTGATCTAAAAATGAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 108793 263 + 647215 ACCCCCTCCAATAGGAATAGGTTATCTGTTCTTTCATGGAGACCATGGAGTTATTCATCATGATCCTGGGACATGCACCATGTCCTTTTATTGGCCACCCCAATGTTCAGGAGTACACCGTAA-TTTGCATCTGAGGGAGGTTGAGGCCACAGTTTACCAACATGCAAGTTTGCCTTCATTTCTTGTCCGATCCCCATCATGTGTAAAAATAACAATATTTTCGAAAAACACCAGGGTGTATCTGGTGATCTATAAGTGAAAAA + +a +s mr.mrrefChr0 111319 136 + 130230 CAAATACTTTCATGCTTGTTGTGATGTAGGAATATTTAGAACACCCAAAAAGCATGAGGTTGTGGGAGTTCCTCTTTGGTTACAGCAGTATCATTCAGTGTGAGAAGATTCGGACTGACAGTTCTCCCTAGTTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116644 136 + 636262 CAAATACTTTTATGCTTGTTGTGATGTAGGAATATTCAGAACACCCAAAAAGCATAAGGTTGTTGGAGTTCCTCTCTGGTTACAGCAGTATCATTCAGTGTGAGAAGATTCAGACTGACAGTTCTTCCTAGCTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 109056 136 + 647215 CAAAGACTTTCATGCTTGTTATGATGTAGGAATATTTCGAGCACCAGAAAAGCATGAGGTTGTGGGGGTTCCTCTTTGGTTACGGCAGTATCATTCAGTGTGAGAAGATTCGGACTGACAATTCTCCCTAGTTTTC + +a +s mr.mrrefChr0 111455 25 + 130230 AAGGTATCTGTGAGGATGTACCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116780 25 + 636262 AAGATATTTGTGAGGATGTACCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 109194 25 + 647215 AAGGTATCTGTGAGGATGTATCATG + +a +s mr.mrrefChr0 111480 9 + 130230 TTAACAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116808 9 + 636262 TTAACAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 109219 9 + 647215 TTAACAACA + +a +s mr.mrrefChr0 111489 187 + 130230 GAATTGTCAAGGTCAATGTCTCCTGAGAAGTCAACATATTATTAACTTCACGGTTTCCACTGACTGGCTACTATCCCCAGACCGGATCAGGAAGGGGAAGCATTGTGTTCAACAGGAAGTGTTCAACATCTAATCTGCTAATCCCAATAAGTATTGAGTCAAAAACAACTTCACCTGATGAGCCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 116819 187 + 636262 GAATTGGCAGGGTCAATGTCTCTTGAGAAATCAACATATTATTAACTTCCCAACTTCCACTGGTGGGCTACTGTCCCCAGACCAGATCAGGAAGGAGAAGCATTGTGTTCAACAGGAAGTGTTCAACATCTAAACTGCTGACCCCAATAAGTATTGAGTCAAGAACAACTTCACCTAATGAGGAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 109228 178 + 647215 GAATTGTCAAGGCCAATATCTCCTGAGAAGACAACATTTTATTAACTTCACGGTTTCCACTGACTGGCCACTATCCCCAGATTGGATGAGGAAGGGGAAGCATTGTGTTCAACA---------CAACATCTAATCTGCTAATCACAATAGGTATTGAGTTAAAAACAACTTCACCTGATGAGCCAAC + +a +s mr.mrrefChr0 111676 18 + 130230 AAAATGCCTCAATAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117008 18 + 636262 AAAATGCCTCAATAATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 109406 18 + 647215 AATATCCCTCAATAATGA + +a +s mr.mrrefChr0 111694 330 + 130230 GGAATTACTCAGGGCTTGGCTGTTTGGTCATACTCAAATAATGGTACCCAAAGTGAAGGGTAGTAGGGAGTTCCTCTGGAGGTGTCCACTTCTTATAAGGAATTTAGTAGTCTCAATAGGTATATAAAACTTTGCTAACTTAATAAAGAACAGTAAAGACCAATCTGCTGACTCAAAGGCCAAGAAAAATGTTATGTCTGTCTGTTAATGAGTATGTTTAATGATGGTGCAGTATAAAGCCTATAGCTCTACTAGATTATCTCTTGTGAACATATTCACTCCAGCTAGCGAACAGTAAAACAATGGACCATTATGCCTCCTGTGTTAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117026 325 + 636262 TGAATTACTCAG----TAGGCGCTTGGTCATACTCAAATAATGGTTCCCAAAGTGAAGGGTAGTAGGGAGTTCCACTGGAGGTGTCCACATCTCATAAGACAT-TAGTAGTCTCAATAGGTAAATAAAACCTTGCTAACTTAATAAGGAACAGTAAAGACCAATCTGCTGACTCACAGGCCAAGAAAAATGTTATGTCTGTCTGGGAATGAGTATGTTTAATGATGGTGCAGTATAAAGCCTATAGCCCTACTAGATTATCTCTCGTGTACATATTCATTCCAGCTAGCGAACAGTAACACAATGCACCATTATGCTTCCTGTGTTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 109424 330 + 647215 GGAATCACTCATGGCTTGGCTGTTTGGTCATACTCAAATGATGGTACCCAAAGTGAACGGTAGTAGGGAGTTCCTCTGGAGGTGTCCACTTCTTATAAGGGATTTAGTGGTCTCAATAGGTATATAAAACTTTGCTAACCTAATAAAGAACAGTAAAGACCAATCTGCTGACTCAAAGACCAAGAAAAATGTTATGTCTGTCTGTTAATGAGTATGTTTATTGATCGTGCAGTACAAAGTCTATAGCTCTACTAGATTATCTCATGTCAACATATTCACTCCAGCTAGCGAACAGTAAAACAATGGACCATTATGCCTTGTGTGCTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 109899 330 + 647215 GGAATTACTCAGGGCTTGACTATATGGTCATACTCAAATAATGGTACCCAAATTGAAGGGTGGTAGGGAGATCCTCTGGAGGTGTCCACTTCTTATAAGGAATCTCGTAGTCTCAATAGGTATATAAAACTTTGCCAGTTTAATAAAGAACAGTAGAGACCAATCTGCTGACTCAAAGGCCAAGAAAAATGCTATGTCTGTTTGTTAATGAATATGTTTAATGATGGTGTAGTATTAAGCCTATAGTTGTACTAGATTATCTCTTGTGAACATATTCACTCCAGCTAGCGAACAGTAAAACTATGGACCATTATGCCTCCAGTGTTAGTC + +a +s mr.mrrefChr0 112024 1 + 130230 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117352 1 + 636262 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 109754 1 + 647215 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 110229 1 + 647215 A + +a +s mr.mrrefChr0 112025 3 + 130230 CAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117353 3 + 636262 CAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 110230 3 + 647215 CAC + +a +s mr.mrrefChr0 112028 185 + 130230 ACACCCTGAGGTGAGAAAACTTTTGATGGCCATCATATAGTTTTAGAATACCTAGGGTCTACCCCCTCAGCAACTCTAATGTCAAAACAACTGACCATGCCATGGTAGTCACTGAGCATGCCTTTGATAACCATGTGGCCAAATAAGTAAAGCTATGTAATCAGACTGACATGGAACACCACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117356 184 + 636262 ACACTCTGAGGTGAGAACATTATTAACGGCCATCAGATTGTTTT-GAATACCTAGGGTCTACCCCCTCAGCAACTCTAATGTCACAACAACTGACCGTGCCATGGCAGTCACTGAGCATGCCTTTGATAACCGTGTGGCCAGGTCAGTTAAGCTATGTAATCAGACTGACATGGAACACCACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 109755 144 + 647215 ACACCTAGAGGTGAGAAAACTTTTGATGGCCATCATATAGTTTTAGAATACCCAGGGTCTG----CTCAGCAACTCTAATGTCAAGACAACTGGCCATGCCATGGTAGACATTGAGCATGCCTG-GATAACAATATGTCTCAATAACTA------------------------------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 110233 47 + 647215 ACACCCTGAGGTGA-------TGTGATGGCCATCATATAGTTTTAGGATACCTA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr0 112213 116 + 130230 TGTGTGCAGTACCAAAGAGCATAAGACCACAAAAGTCTTGGGAGTCCAGAAAGTCAGCCAGCATAAAGTGGCTGACTGGAGTCAGTCTGCATTAAATGGCTGGCTGGAAAAGAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117540 116 + 636262 TGTGTGCAGTACCAAAGAGCATAAGACCACAAACCTCTTGGGAGTCCAGAAAGTCAGCCAGCATAAAGTGGTGGGCTGGAGTCAGTCTGCATTAAATGGCTGGCTGGAAAAGAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 110280 116 + 647215 TGTGTGCAGTACCAAAGGGCATAAGACCACAAAAGTGTTGCAAGTCCAGAAAGTCAGCCAACATAAAGTGGCTTACTTGTGTCAGTCTGCATAAAATGGCTGGCTGGAAAAGAAGA + +a +s mr.mrrefChr0 112329 42 + 130230 AAAAGTAAGAAGACACTGTACTCACTATTATTCTATGTTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117658 42 + 636262 AAAAGTAAGAACACACTGTACTCACTATTATTCTATGTTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 110396 42 + 647215 CAAAGTATGAAGACACTGTACTCACTACTATTCCATGTTTGT + +a +s mr.mrrefChr0 112371 344 + 130230 ACAATGCAACTACATCCATGCTCTTCCCAATTTTGTAAGCTAGTTCATCTCTAATATGTTGATTATTTATTGACTGTCTCCTGTCTAAACTGCGAGGACTACAGTGATGGCTGCATCTGTGAATTGCAGACCTTGTCTAATTCAGTGAGGGCATTCAACTCAAACTGGATATTCTATTAGACTGCTGCCAATTTGTCCTAGTTGATTTTTCCCATTCTTAATGGTGTATAGGTGAAGGTTTTGTTACCTGTATTTTGCAGCTCAAAGTTTCAATGCCAGAGCAGGTTTAGGAGAGTAGCTGTGTTCAACATTCAGTTCTTCAGCTACTCATCTGCCTAGATTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 117700 333 + 636262 ACAATGCAACTACATCCATGCTCTTCCCAATTTTGTAAGCTAGTTCATCTCTAATATGTTGATTACTTATTGACTGTCTCCTGTCTAAACTGCGAGGACCACGGTGATGGCTGTATCTGTGAATTGCGGACCTTGTCTGATTCAGTGAGGGCATTTAACTCAAATTGGATATTCTATTAGACTGCTGGCAATTTGTCCTAGTTGATTCTCCCCATTCTTAATGGTGTAGAGGTCAAGGTTTTATTACCTGTATTTTGCAGCTCAAAGT------GCCAGAGCAGGTTTGGGAGAGTAGCCGTGTTT-----TCAGTTCTTCAGCGATTCATCTGCCTAGATTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 110442 344 + 647215 ACACTGCAACTACAGCCATGCTCTTCTCAGTTTTTTAACCTAGTTCACCTATAATATGTTGGTTATTTATTGACTGTCTCCTGTCTAAACTGCCAGGACTACAGTGATGGCTGCATCTGTGCATTACAGACTTGGTCTAATTCAGTGAGGGCATTCCACTCGAACTGGATATTCTATTGGACTGCTGCCAATTTGTCCTAGTTGATTTTTCCCATTCTTCATGGTGTATAGGTGAAGGTTTTGTTACCTGTATTTTGCAGCTCAAGGTTTCAATGCCAGATTAGCTTTAGGAAAGTTGCTGTGTTCAACATTCCATTCTTCAGCTACTCATCTGCCTAGATTTT + +a +s mr.mrrefChr0 112715 44 + 130230 CTTGATTACACCAACTAATCAAAAGTATTCACATCTCTACTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118033 37 + 636262 -------ACACCAACTAATCAAAAGTATTCACATCTTTACGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 110788 43 + 647215 CTTGATTACACCAACTAAT-AAAAGTAGCTACATCTCTGCTGAG + +a +s mr.mrrefChr0 112759 172 + 130230 AGTTCACTAAAACATACATGTTACAGGCTATTACAGTTAAGGCCTACTCATGTGGATCCCTTGATCCTGGCGTACTGCGTAATAGCATTGTGTATGTTGAGAATTGTACAGCACTGTTAGATCTGCCCTCACACCAACCGAGTTGCATACACCAAAGTGGGATTAGATCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118071 170 + 636262 CGTTCACTAATACATACATGTTACAGGCTATTACAGTTAAGGCCTGCTCATGTGGGACCCTTGATCCTGGTGTACTGCGTAATAGCATTGTGTATGTTGAGAATTGTACTGCACTGTTAGATCTGCCCTCAC--CAACCGAGTTGCATACACCAAAGTGGGATTAGATCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 110831 170 + 647215 AGTTGACTAAAACATATCTGTTACAGGCTATTATGGTTTTGGC--ACTCATGTGCATCTCTTGATCCCAGCGTAATGCATAATAACTTTATGTATGGTGAGTATTGTACAGCACTGTTAGATCTGCCCTCACACCAACCAATTTGCATACACCAAAATGGGATTAGATTGAA + +a +s mr.mrrefChr0 112931 157 + 130230 ACTCATCCTTGGCTTTAAGAAAACCAACCATGATTCACGACCCACAATCATCAAAAACTCTCAGTTATATGCTTGTCTTTCAATGCTAAACTTGTTGCTCCTAACATTTCATCAGGTAAACTATGCACCTGTGATTAGAACAATATGGCCAATCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118241 142 + 636262 ACTCATCATTAGCTTTAAGAAAACCAACCATGATG-ACGACCCACATTCATAAAAAACTCTCAGTTGAATGCTTGTCTTTTGATGCCAAA--------------CATTTCATCCGGTAAACTACGCACCTGTGATTAGAACAATATGGCCAATCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 111004 157 + 647215 ACTCATCCTTGGCGTTAAGAAAACCCACCATGATTCATGCCCCAAAATCATCAAAAACTCTCAGTCATATGCTTATCTCTCAGTGCTAAACTTGTTGCTCCTAACATTTCATCAGGTAAATTATGCACCTGTGACTAGAACAATAAGGCTAATCATG + +a +s mr.mrrefChr0 113088 371 + 130230 CACTCATTATTATAACAGCAACAATACGGGGTCCCTAGTGCTGTACCTAGTACATATCCTTGTCCACTAGCAGTTCATATATTGTCCACTAGCTGGTTAAACAATACCTACTCCCCTAGTGTCAAAAAACAAGATTCATCAGACATGGTACATAATAAGGTACTTGATTATATTACGTCCATTCTTGTTGAAGTTTATCCATCCCAGCAGAGTGTGAGAGTCATCTATAGGTAAAACTCCAGTCAGTAGCAAGTGGTGTGTATTAAATGAGGTATGTATTGTGATCACGAGGAGAATATGTGGATCCACAACTTCCATTAAGGGGGAGTTCACCCTGATATCAGGGGAATTAGCTGATGCAAAGTGCACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118383 368 + 636262 CACTCATTATTATAACAGCAACAAT-CGGGGTCCCTAGTGCTGTACCTAGTACATATCCTTGTCCACTAGCAGTTCATATATTGTCCACTAGCTGGTTAAACAACAACTACTCCCCTACTGACAATAAACAA--TTCATCAGACATGGTATATAATAAAGTACTTGATTATATTACGTCCATTCTTATTGAAGTTTATCCATCCCAGCATAGTGTGAGAGTCATCTATAGGTAAAACTCCAGTCAGTAGCAAGTGGTGTGTATTAAATGAGGTATGTACTGTGATCACGAGGAGAATATGTGGGTCCACAACTTCCATTAAGGGGGAGTTCACCCTGATATCAGGGGAATTAGCTGATGCAAAGCACACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 111164 371 + 647215 CACTTGTTATTGTAACAGCAACAATACGGGGTCCTTAGTGCTGCACCTAGTACATATCCATGTCCACTAGCAGTACATATATTGTCCACTAGCTCGTTATACAATACCTACTCCCCTAGTGTCAAAAAACAAGATTCATCAGACATGGTACAGAATTAGGTACTTGATTATATTACATCCATTCTTGTTGAAGTTTATCCATCCCAGCAGAGTGTGAGAGTCATCTATGGGTAAAACTCCAGTTACTAGCAGGTGGCGTGTATTAATTGAGGTATGTATTGTGATCATGTGAAGAGTATGTGGATTCACAACTCCCATTCAGGGGTTGTTCAGCCTGGTACCAGGAGAGTTAGCTGACATAAAGTGCACAA + +a +s mr.mrrefChr0 113459 53 + 130230 AAGGTTGAATTCTGAAGCAATTGTTGACTGAATGGGCTCTCCTTGTAGCACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118773 53 + 636262 AAGGTTGAATTCTGAAGCAATTGTTGACTGAATGGACGCTCCTTGTAGCACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 111535 53 + 647215 AAGGTTGAATTCAGAAGCAATTGTTGACTGAATGGGCTCTCTGTCTAGGACAT + +a +s mr.mrrefChr0 113512 11 + 130230 CTCCATGTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118826 11 + 636262 CTCCATGTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 111594 11 + 647215 CTCCATGTGCT + +a +s mr.mrrefChr0 113523 10 + 130230 TAGCACAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118838 10 + 636262 TAGCACAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 111605 10 + 647215 GACCATAACT + +a +s mr.mrrefChr0 113533 64 + 130230 TATCCTCCATGCGCTCACCATAATTCCTATGTTTACCACCACAGATAAGTTTGTATCCTGCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118848 64 + 636262 TATCCTCCATGTGCTCATCATAATTCCTATGTTTACCACCACAGATAAGTTTGTATCCTGCGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 111623 64 + 647215 TATCCTCCATGCACTGACCATAATTCATATGTTTGTAACCACAGATAAGTCAGTATCCTGCAGC + +a +s mr.mrrefChr0 113597 80 + 130230 TCACTATCCTATGATGGCCACCACAGATAGGTCCGTATCCTGCAGCACACTATGGAGGGCACAGCCGCCCAACTTTTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118912 80 + 636262 TCACTATCCTATGATGGCCACCACAAATAGGTTCCTATCCTGCAGCACACTATGGAGGGCACAGCCGCCCAACTTTTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 111689 80 + 647215 TCTATATCCTATGTTTGCCACCACAGATGAGTCGGTATTCTGCAGCACACTAGGGACGGCACAGGTCCCCAACTTTTTTG + +a +s mr.mrrefChr0 113677 13 + 130230 TATGTGACCACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 118992 13 + 636262 TATGTGACCACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 111783 13 + 647215 TATGTGACCACCC + +a +s mr.mrrefChr0 113690 281 + 130230 TCTGGACACAATAGTAGCACTCTTTTTGCCAGTATATGGCTGAGCATGAGTTACTCTTACTAATTGGATCATGCGATCTAAATTAGAAACACTTTATGGGGTGGAGATGGCCCCTGCTAGTCATGTACTGCTAAATAAATGCATTGAATACATAGTCCTGTTAACATCTGACACAGCTGGCTTTTCGAGCTGGCTGTGCTCAACCTTATCATGTACTATGATAAAGCTCACCAATGTTGGATACACTGAGATCTCTGCTTTTTATGAATTACTGGGAAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119006 281 + 636262 TCTGGACACAATAGCAGCACTCTCTGTGCCAGTATATGCCTGAGCATGAGTTACTTTTACTAATTGGATCACACCATCTAAATTAGAACAACTTTATGGGGTGGAGATGGCCCCTCCTAAGCATGTACTGCCAAATAAATGCATTGAATACATAGTCCTGTTAACATCTGACACAGCTGGCTTTTCGAGCTGGCTGTGCTCAACCTTATCATGTACTATGATAAAGCTCACCAATGTTGGATACACTGAGATCTCTGCTTTTTATGAATTACTGGGAAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 111796 281 + 647215 TCTGGGGAGAATAGTAGCACTCTTTTTGCCAGTATATGGCTGAGCATGAGTTACTCTTACTAATTGGATCATGCGACCTAAATCAGAAACACTTTATGGGGTGGAGATGGCCCCTGCTAGTCATGTACTGCTAAATAAATGCACTGAATACATAGTCCTGTTAATAGCTGACGAAGCTCGCTGTTTGAGCTGGCTGTGCTCAATATTATCACGTGCTATGATAAAGATCACCAATGTCGGATACACTGAGATCTGCGCTTTTTATGGACTACTGGGAAGTA + +a +s mr.mrrefChr0 113971 17 + 130230 AGAGATTTACTGTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119288 17 + 636262 AGAGATTTACTGTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 112077 17 + 647215 AGGAAGTTACTGTTTGC + +a +s mr.mrrefChr0 113988 8 + 130230 CAGCCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119305 8 + 636262 CAGCCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 112105 8 + 647215 TAGCCCTT + +a +s mr.mrrefChr0 113996 48 + 130230 TAAGCTTTTCTATATTTAGCGTTGAAGAGCTAGCCAGTTTTAATGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119313 48 + 636262 TAAGCTTTTCTATATTTAGCGTTGAAGAGCTAGCCAGTTTTAATGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 112131 48 + 647215 TAAGCTTTTCTATATTTTGAGTTGGAGTACTAGCCAGTTTTAATGAGC + +a +s mr.mrrefChr0 114044 33 + 130230 AAAGGACATATAGACCCAATTAGACTTCAAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119361 33 + 636262 AAAGGACATATAGACCCAATTAGACTTCAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 112180 33 + 647215 AAAGGACCTGTTGACCTAATTAAATCTCAAGTG + +a +s mr.mrrefChr0 114077 30 + 130230 ACTAGTCTTCTGACATCCTGCGCTGGCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119394 30 + 636262 ACTAGTCTTCTGACATCCTGCGCTGGCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 112231 30 + 647215 ACTAGTCTTCTGTCATCTTTCCCTGGCAGT + +a +s mr.mrrefChr0 114107 8 + 130230 CACAGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119425 8 + 636262 CACAGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 112261 8 + 647215 TACATCAT + +a +s mr.mrrefChr0 114115 35 + 130230 TGCCAGTCAAAATTAGTGGTTCTGTATCGGGAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119474 35 + 636262 TGCCAGTCAAAATTAGTGGTTCTGTATCGGGAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 112269 35 + 647215 TCCATGTTAAAATCAGTGGTTCTGTAGCTAGAATT + +a +s mr.mrrefChr0 114150 23 + 130230 GACTTTCTTATCTTCATCTATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119509 23 + 636262 GACTTTCTTATCTTCTTCTATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 112305 23 + 647215 GAATTTCTTATCTTCATCTATCC + +a +s mr.mrrefChr0 114173 10 + 130230 ACATGAACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119537 9 + 636262 ACA-GAACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 112328 10 + 647215 ACATGAACAC + +a +s mr.mrrefChr0 114183 8 + 130230 AGCTATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119547 8 + 636262 AGCCATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 112338 8 + 647215 AGCTGTCA + +a +s mr.mrrefChr0 114191 174 + 130230 GGTGCTTTAATTCATTTAGAACCCCTAATCTATAAATGCAGCGATTGCAATGTATGTATAAATTAACTAGGTCCTGGCCACATGGGTATTGATCTTTGAAGACATCTGTTTGTATCTTGAAGAAATGATTTTGTGGCTGAGTATTAGTGTGCACGAGCAAATAGTGGGTTCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119638 172 + 636262 AGTGCTTTAATTCATTTAGTACCCCTAATCTATAGATGT-GCGATTGCAATGTATGTATAAATTAGCTAGGTCCTGGACCCATGGGTATTGATCTTTGAAGATGTCTGTTTGTATTTT-AAGAAATGATTTGGTGGCTGAGTATGAGTGCGCATGGGCAAATAGTGTGTTCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 112346 170 + 647215 GGTGCTTTAATTCATTTAGAATGTCTAATCCATAAATGCAGAGGTTGCAATGTATATATAAATTAACTAGG----GGCCACATGGGTATTGATCTTTGAAGACATCTATTTGTATCTTGAAGTAGTGATCTTGTGGCTGAGTACTAGTGTGCACGAGCAAATAGTGGGTACAAC + +a +s mr.mrrefChr0 114365 56 + 130230 TAACTATGTCTGTCCAAAAGGGCTTAAATTAAAGGATGAACTGCACTCTTGGTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119811 56 + 636262 TAACTATGTCTGTCCAGAAGGGCTTAAATTAAAGGATGAGCTGCACTCTTGGTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 112516 56 + 647215 TAACTATGTCTGCTGAAAAGGGCTTAAATTAAAGAATGAACTGCACTCTTGGTTTA + +a +s mr.mrrefChr0 114421 185 + 130230 TAATTTCCAAGTTTAGGATGACCTAACCCCAGCCTAGCCTTGAGCTTGTTGTCCACATGACATGTTAAAGGGACACAGAGAATGAGTAGTCAGGCTTAACAAAATTTGGTACACCAGTGCTAGCATCTTAGTCCCACACATTGTTTAACAGGGGGTTCAGGTAACAAGGGTGTAATCTAATGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 119867 183 + 636262 TAATTTCCTAGTTTAGGATGACCTAACCCTAGCCTAGCTTTAAGCTTGTTGTCTACATTACATGTTAAAGAGACACAGAGAATGAGTAGTTAGGCTTAACAAAAT--GGTACACCAGTGCTAGCATCTTAGTCCCACACATTGTTTAACAGGGGGTTCAGGTAACAAGGGTGTAATCTAATGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 112575 185 + 647215 GAATGTCCAAGTTTAACATGATCTAATCCCAGCCTAGCCTTGAACTTGTTGTCCACATGGCATGTAACAGGGATACAGAGAATGAGTAGTCAGGCTTAACAAAATTTGGTACACTAGTGCTAGCATCTTAGTCCTACACATTGCTTAATGGGGGGTTCAGATAACAAGGGTGGAATCTAATTTCC + +a +s mr.mrrefChr0 114606 26 + 130230 AAGATTGATATCTGTCCCCAAGATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120050 26 + 636262 AAGATTGATATCTGTCCCCAAGATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 112761 26 + 647215 AAGATTGATATCGATCCCCAAGATTG + +a +s mr.mrrefChr0 114632 11 + 130230 TAGCCCACTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120077 11 + 636262 TAGCCCACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 112787 11 + 647215 CAGCTAACTCA + +a +s mr.mrrefChr0 114643 161 + 130230 TGTACCTGCATATAATTGTCAATAACAGAACTGCATGACAAAAAGAGAATATCAGAGTGTGAATCTGCTTCTACCGCCTTGGGAGGCCTGCATACTTAAACCTACATCTTAGGCTCTGTGTCCTACATCCAGATGGATATAGAGCTAATAACAGAACTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120092 161 + 636262 TGTACCTGCATATAATTGTCAATAACAGAACTGCATGACAAAAAGAGAATATCAGAGTGTGAATCTGCTTCTACCGCCTTGGGAGGCCTGCATACTTAAACCTACATCTTAGGCTCTGTGTCCTACATCCAGATGGATATAGAGCTAATAACAGAACTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 112798 161 + 647215 TATACCTGTGTACCATTGTTAATTACTGAACCGCATGACAAAAAGAGAATAGCAGAGTGTGAATCTGGTTCTATAGCCTTGAAAGGTTTGCATACTGATACATACATCTTTGGTTCCACGTCCTACATCCAGGTGGATAAAAAGCTAATAACAGAACTTGA + +a +s mr.mrrefChr0 114804 84 + 130230 ACACATAGTACTGTAACCCTTTGAGCCATATTGAATGTGGCATCGCTGCAATTGCAGTGTTTGCCATGTCATGACCAATCCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120253 84 + 636262 ACACATAGTACTGTAACCCTTTGAGCCATATTGAATGTGGCATCGCTGCAATTGCAGTGTTTGCCATGTCATGACCAATCCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 112975 84 + 647215 ACACATAGTGCTGTAACCCTTTGAGCCATATCAAATGTGGCATTCGTGCAATTGCAGTGTATGCCATGTTTTGATCAATTGAAC + +a +s mr.mrrefChr0 114888 362 + 130230 TAAAACTGTTCTAAAAGACAAGTCAATAAGCACTATTACAACATAAACATATCCAGACTCTGTTACCAAGAACAGCTAATGATGTTGTGCCTCAGTTGATTCCAGCCTATCAATTAGCAGAACACACAAGCCTGTGGCAGACTACATTAACTTTTTTTATTATACACCTTGTATTATACACCCCCACACCAAAAAGTTCAAAATCAAAAAAAACTATAGCACATCTACTAGATTGATGAACGTAGGGCCTTCCGGGCCTGATAGGTAAAGGTATAATTGAGTGCATCTGTGAGAGATGCATTAAGTAGAGGGAGTTCTATGGCTATCTCTCCAGATAAACCTTACCACTGCGGGGCTGGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120337 362 + 636262 TAAAACTGTTCTAAAAGACAAGTCAATAAGCACTATTACAACATAAACATATCCAGACTCTGTTACCAAGAACAGCTAATGATGTTGTGCCTCAGTTGATTCCAGCCTATTAATTGGCAGAACACACAGGCCTGTGGGAGACTGCATTAACCTTTTGTATTATACACCTTGTATTATACACCCCCACACCAAAAAGTTCAAAATCAAAAAAAACTATAGCATATCTACTAGATTGATGAACGTAGGGCCTTCCGGGCCTGATAGGTAAAGGTATAATTGAGTGCATCTGTGAGAGATGCATTAAGTAGAGGGAGTTCTATGGCTATCTCTCCAGATAAACCTTACCACTGCGGGGCTGGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 113061 222 + 647215 TAAAACTGTTCTAAAAGGCAAGTGAGTAAGTACTATTACTACATAATTGCATCCAAACTCTGTTACCAAGAAAAGCTAATGATGTTGTCCCTCAGTTGATTCCACCCCATCAATTAGCAAAACACACGAGCCTATGGCACACTACATTAACTTTCTTTA--------------TCATACACCCCCACACCAAAAAGTTCAAGGTCAAAAAAGACTATAGCACATCTACCAGGCCGA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr0 115250 52 + 130230 CTAGGTTTAGCTACAGTGAACGTTGAAGAATGAGAAGGTTGAACAGGTCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120709 52 + 636262 CTAGGTTTAGCTACAGTGAACGTTGAAGAATGAGAAGGTTGAACAGGTCAGT + +a +s mr.mrrefChr0 115302 75 + 130230 GACTAGAAACTGACATTTCTTTCCACTAAAGAGGGAGGGACAGGATGGTTCTAACATACTGGCCATAGCTGAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120762 75 + 636262 GACTAGAAACTGACATTTCTTTCCACTAAAGAGGGAGGGACAGGATGGTTCTAACATACTGGCCATAGCTGAGTT + +a +s mr.mrrefChr0 115377 41 + 130230 ATTGTTTAGGAAGCAAAATGGTGAGTGAGTGATGTTTTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120849 41 + 636262 ATTGTTTAGGAAGCAAAATGGTGGGTGAGTGATGATTTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 113283 41 + 647215 ATTGTCTAGGAATCAAAATGGAGAGTGAGTGATGTTTTAGA + +a +s mr.mrrefChr0 115418 15 + 130230 AAATACCTGCCCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120893 15 + 636262 AAACACCTGCCCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 113324 15 + 647215 AAATACCTGGCCAGC + +a +s mr.mrrefChr0 115433 164 + 130230 ACAATGGTATTAACCCTTAACCGTGACACAATTTTATTTGTATGCAGCAGGTCCAGCAAAGGCCTACAACAGTACTTTTATTGGTTTTAGCTCATATCTGTGGGTGGCAACCCCATTGTAAAGGCAATGTGTGGATCCTCTACTTACACTGCACCTGACCATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 120908 157 + 636262 AAAATGGTATTAACCCT-------GACACAATTTTACTTGTATGCAGCAGGTCCAGCAAAGGCCTACAACAGTACTTTTATTGGTTTTAGCTCATATCTGTGGGTGGCAACCACATTGTAAAGGCGATGTGTGGATCCTCTACTTACACTGCACCTGACCATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 113344 163 + 647215 ACAATCTTACTAACCCTTAACCGTGGCACAATTTTATTTGTATGCAGCAGGTCCAGCAAAGGCTTATAACAATACTTTCATTGGTTTTGGCTAATATGTGTGGGTG-CAGACCCATAGTAAAGGCAGTGTGTGAATCCTCTACTTATACTGCACCTGACTATGG + +a +s mr.mrrefChr0 115597 355 + 130230 GAGAGAAAAATATTAGTGTCTGGGAATTCTTAAGTAAGATGTAGCTCTTGCTTATTCCTTTAGGACACGGCACTAATGGGTGAGACCATAGTATTAATCTTTCTGCATGATATGAAGAATGCCAAGACTTGTTATTTTTCTTAAAACTTAAGAAATCCTCCTACAGATGTGAGGTTTGTCAAACATAGCTAGGCAGTATCAAAACATCAAAAACTTCCATGTACCATTCTTAATCCTTAATCATGTCAGCGCAGTTCCCTACTTTTCACAGTTTATGTAATTGATTGTGATCTTCACAATACATTATAAGTGTTTGGATCTTTTGAGTCTTGATATGATGAGTTACCACCTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121065 338 + 636262 GAGAGAAAAATATTTGTGTCTGGGAATTCTTAATTAAGATGTAGCTCTTGCTTATCTCTTTAGGACACG--ATTAATGGGTGATACCATAGTTTTAATCTTTCTGCATGATATGAAGAATGCCAAGATTTGTTATTTTTCTTATAACTTAAGAAATCCTCCTATAGATGTGGGGTATGTCAAACATAGCTAGGCAACATCAAAACATCAAAAAGTTCCATGTACCATTCTTAATCCTTAATCATGTCAGCGCGGTTCCCTACTTTCCACAG---------------GTGATCTTCACAATACAGTATAGGTGTTTGGATCTTTTGAGTCTTGATATGATGAGTTACCACCTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 113510 348 + 647215 GAGAGAAAGATATTAGTGTCTGGGAAGTCTTAAGAAAGATGTAGCTCCTGCTTATTCCTTTAGGACACGGCACTAATGGGTGAGACCATAGTATTAATCTATTTGCATAATATGAGGAATGCCAAGACTTGTTATTTTTCCTAAAACTTAAGAAACCCTCCTACAGGTGTGAGGTTCGTCAAACATAGCTGGGCAGTATCAAAA-------AACTCATGTATACCATTCTTAATCCTTAATCACGTCAGCGCAGTTTCCTACTTTTCACAGTTTATGTAATTGATTGTGGTCCTCACAACTCATTATAAGTATTTGGATCTTTTGAGTCCTGATATGATGAATTACTGTCTTGAA + +a +s mr.mrrefChr0 115952 81 + 130230 TCCAGGAGGAATCCCTCGAAGTACAGTGACAACTTCTCAACAGGATGTGTACAGCCAGCATAGCATATAAAAGCTTGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121403 81 + 636262 TCCAGGAGGAATCCCTTGCAGCATAGTGACAACTTCTCAACATGATGTGTACAGCCAGCATAGCATATAAAAGCTTGATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 113859 81 + 647215 TCTATGAGGGATCCCTCAAGGTGCAGTGACAACTTCTCAACAGGGTGGGTACAGCCATCATAGAGTATAAAACCTTGATAT + +a +s mr.mrrefChr0 116033 19 + 130230 AACATGGCTTAATTATATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121487 19 + 636262 AACATGGCTTAATTATATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 113940 19 + 647215 CACATGGCTTAGTTATATT + +a +s mr.mrrefChr0 116052 71 + 130230 TATTACCACAGCACTTCATCCATTTAATGACCTGGAGCTACCTTTGGCGTTCCAACCCTGAATAGCACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121506 71 + 636262 TATTACCACAGCACTTCATCCATTTAATGACCTGGAGCTACCTTTGGCGTTCCAACCCTGAATAGCACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 113962 71 + 647215 TATGAACATGGCGCTTCATCGATCTAATAACCTGGAGGTAGCTTTGGTGTTTCAACCCTGAATAGCACGTT + +a +s mr.mrrefChr0 116123 16 + 130230 CATATTATTTCCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121579 16 + 636262 CATATTATTTCCTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 114033 16 + 647215 CATCTTATTTCTTGTC + +a +s mr.mrrefChr0 116139 38 + 130230 CTAGGTCTTATCATCCGTTAACACAGACAGTTGTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121615 38 + 636262 CTAGGTCTTATCATCCGTTAACACAGACAGTTGTATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 114049 38 + 647215 CTAGGTCTTGTCATCAGTTAAGACAGGGAGTTGTATGG + +a +s mr.mrrefChr0 116177 60 + 130230 TGAGCCTCCAGGAGATCTGCAGTATTTACGCATAACAATGTATAGACATGCTGCTATTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121653 60 + 636262 TGAGCCTCCAGGAGATCTGCAGTATTTACGCATAACAATGTATAGACATGCTGCTATTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 114093 60 + 647215 GGAGCCTCCAGGAGACCTGCAGTATTTTCACATAGCAATGTGTAGACATGCTGCTATTGA + +a +s mr.mrrefChr0 116237 24 + 130230 CTGTCTGGCTCAGGTATGATGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121713 24 + 636262 CTGTCTGGCTCAGGTATGATGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 114154 24 + 647215 CTGTCTGGCTCAGGTATGGTGGTT + +a +s mr.mrrefChr0 116261 93 + 130230 TCTAAGATTCATACTTGGTTCGGGCCTATTAGTTATTTGTGCACTTTGGCATGCTGCTCTGTGTGTTGACTATATCATAAGACATTATACCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121737 93 + 636262 TCTAAGATTCATACTTGGTTCGGGCCTATTAGTTATTTGTGCACTTTGGCATGCTGCTCTGTGTGTTGACTATATCATAAGACATTATACCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 114181 93 + 647215 TTTAAGATTCATACTTGGTTTGAGCCTATTAGTTATTAGTGCACTTGGGCAGGCTGCTCTGTGTGTTGACTACATGATTAGTGATTATGCCAA + +a +s mr.mrrefChr0 116354 138 + 130230 AAAGGATAGCCTCTGTTGTGCTTCTTTGTCACTATCTCATCCTAACTGTGTGAAAGTAATTGTTAGAGATCACCTAGGCATACATATAAGTCTTCGCACCTGTTTCATTCTCTTGGTGATCCCAATGAGCAAAGGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121834 138 + 636262 AAAGGATAGCCTCTGTTGTGCTTCTTTGTCACTATCTCATCCTAACTGTGTGAAAGTAATTGTTAGAGATCACCTAGGCATACATATAAGTCTTCGCACCTGTTTCATTCTCTTGGTGATCCCAATGAGCAAAGGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 114274 138 + 647215 AAAAAATAGCCTCTTTTGTGCTTTGTTGGCATTATTTCATCCTGACTGTGCAAGAGTAGTACTTAGAAATCATGTAGACATACATATAAGTCTTCTGAACTGTTTCACCCTCTTGGTGACCCCGATGAGCAAAGGTTG + +a +s mr.mrrefChr0 116492 133 + 130230 CTACAAAGTGCCACTCTACATATTGATAAGAGACTCCATTAATTCTTCCTGAGGTTTCCATTGATGACAAGGATGATTGTTTTTCTCTTTTATTTTTGACTTGATCATTGGGAACAATAATGGCCTTATTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121975 133 + 636262 CTACAAAGTGCCACTCTACATATTGATAAGAGACTCCATTAATTCTTCCTGAGGTTTCCATTGATGACAAGGATGATTGTTTTTCTCTTTTATTTTTGACTTGATCATTGGGAACAATAATGGCCTTATTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 114412 133 + 647215 CAACTAAGTGCCACTCTGCAGATTGATAACAGACCCCATTAAACCTTCCTGAGGTTTCCATTGATGTCAAGAGTGATTTTTTTCCTCTTTTATATTTGATGTCTTTAGCTTAGTTGTCCTTGGGCTTAGTTAC + +a +s mr.mrrefChr0 116625 452 + 130230 ACCTGGTCATTGGGAACAATAATGGCCTTACTTGAAAAATATTTAAGGGGCTATCAAGTTCTACAAGTTGACCCATATCAGCCCAATATGCTGCACATCGCATAAGTTATTTACAGTATGTGATTATCTTGCCAATAGGCAGCAAAATCCCCGGGTTCTTTGGTTTAGACACATCAGCAACTTGGGATGAGGTTGAACATGAGCTGTAAAGGAAGTGAGATACTTGGCCCATCGAAGATTTGTGCTTTTAATGCACAATAAAGCATTGCTCCAAGTAGTTCAAGAATGGCTATTTTATCCTATAGATTTTATTGGAACTCCTGCATTAAACTTAACGAAACCAGATGTGCTAACCATGATAATGATATGTAAGGTTGGTGGGTTCCGTCATGACTGTAAGTGCGTATCAAACACTGATGGCTTTTGCAAAGATTAGGATTCGCAATCTGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 122108 438 + 636262 ACTTGATCATTGGGAACAATAATGGCCTTATTT-AAAAATATTTCAGGGGCTATCAAGTTCTACAAATTGACCCATATTAGCCCAATATGCTGCACATCATGTAAGTTATTTCCAGTAGGCGATTATGTTGCCAATAGGCAGCAAAATCACCGGGTTCTTTGGTTTAGACACAT--------TGGGATGAGGTTGAACATCAGCCGTAAAGGAAGTGAGCTACTTGGCCCATCGAAGAATTGTGCTTTTAATGCACAATAAAGCAT-GCTCCAAGTAGTTCAAGAATGGCTATTTTATCCTATAGATTTTATTGGAGCTCCTGCATTAAGCTTAACAAAACCAGATGTGCCAACCATGATAATGATATGTAAGGTTGGTGGGTACCGT----ACTGTAAGTGCGTATCAAACACTGATGGCTTTTGCAAAGATTAGGATTCGCAATCTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 114550 452 + 647215 ACCTGGTCATTGGGAACAATAATGGCCTGACTTGAAAAACACTTAAGGGGCTGTCAAATTCTACAAGTTGACCCATATCAGCCCAATATGCTTCAACTTGCATAAGTTATTTACAGTATGTGATTATCTCTCCAGTAGGCAGCTAAACCCCCAGGTTCTTTTGTTTAGACACATCAGCAACTTGGGATGAAGTTGAACATGAGCTGTGCAGGAAGTGAGATACTTGGCCCATTGAATATTTGTGCTTTTAATGCACAATAAAGCATTGGTCCAAGTAGTTCAGTAATGGCTATTTTTTCCTATAGATTTTATTTGAACTCCTGCATTACACTTTATGAAACCAGATGTGCTAACCAGGATAATGATATGTAAGATTGGTAGGTTCTGTCATGACTGTAAGTGTATATCAAACACTGATGGCTTATGCAAAGATTAGGATTCGCAATCTGTCA + +a +s mr.mrrefChr0 117077 210 + 130230 TCCTGGAACCTAGGAAAGTGGCACACCCTGCTAAACTATTGTGTTGTGCCTTTTACCATGAACATATAGATAGCAAAAATGAGCCCCCTTCTTGAAAACCCCATAAGCCAACTGGCATTCATTAGACGACCATCTTATCTTATAGGTTGGGCCTTTTGTGTTGCTGGGACATAAGCTTCAGACTCCTGCTATGCTTGTATTATAAAGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 122546 209 + 636262 TCCTGGAACCTAGGAAAGTGGCACACCCTGCTAAACTATTGTGTTGTGCCTTTTACCATGACCATATAGATAGTAAAATCGAACCCCCTTCTTGAAAACCCCATAAGCCAACTGGCATTCATTAGACGACCATCTTATCTTATAGGTTGGGCCTTTTGTGTC-GTGGGACATAAGCTTCAGACTCCTCCTATGCTTGTATTATAAAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 115006 209 + 647215 TCCTGGAAC-TAGGAAAGTGGGACACCCTGCTAAACTATTGTGTTGTGCCTTTTACCACGAACATATATATAGCAAAAATGAGCCCCCTTCTTGGAAACCCCATAAGGCAACTGGCATTCATTGGACAACCATCTTGTCTTACAGGTTGGGCCTTTTGTGTTGCTTGGATGTAAGCTTCAGTCTGCTGCTATTCTTGTGTTATAAAGAGA + +a +s mr.mrrefChr0 117287 82 + 130230 TCTTCTTTTCAGCATTTAGAGGTAAAACATTGTGCTCACAAAGGCTATACCATTGATGAATGATTTAGTCCCACGTAGAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 122755 82 + 636262 TCTTCTTTTCAGCATTTAGAGGTAAAACATTGTGCTAACAAAGGCAATACCATTGATGAATGTTTTAGTCCCCTGTAGATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 115251 81 + 647215 TCTTCCTTTCAGCATTTAGTGGTAAA-CATTGTGCCCACGAAGGCTATATCATTGATGAACGATTTAGTCCCACGTAGAGGC + +a +s mr.mrrefChr0 117369 38 + 130230 TACACAATTGTGGCGTCCTTATTGAGAGTTTGATCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 122841 38 + 636262 TACACAATTGTGGTGTCCTTATTGAAAGTTTGATCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 115332 38 + 647215 TACACAATTGTGGCATCCTGATTGAGAGTTTGATCAAG + +a +s mr.mrrefChr0 117407 219 + 130230 AAAATTTTGATCAAGATGTGAGTGCAAAGCACTCACTATGAGTTTTTAACTGACACAACTTGGGTGGAGCTTTTAAATACTACTCAAAAGATTTTAACTCTAACTCATGTGTTCCTTTGCACCAGGTGGAACTATTGAATACTAACTATAAGCTCTAACTCATTTGTTCCTTTGAGCCTTTCAGCTTTAGTTAGAGTTTCACAGTTTGTGAATAGCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 122880 219 + 636262 AAAATTTTGATCAAGATGTGAGTGCAAAGCACTCACTATGGGTTTTTAACTGACGCAACTTGGGTTGAGCTATTAAATACTACTCAAAAGATTTTAACTCTAACTCATGTGTTCCTTTGCACCAGGTGGAACTGTTGAATACTAACTATAAGCTTTAACTAATTTGTTCCTTTGAGCCTTTCAGCTTTTGTTAGAGTTTCACAGTTTGTGAATAGAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 115370 218 + 647215 AAAATTTTGATCAAGATGTGAGTGTAAATCATT-GCTATGAGTTCTTAACTGACACAACTCGGGTGGAGCTTTCCAATACTAATTAAAGGATTTTAACTCTAACTCATTTGTTCCTTTGCACCAGGTGGAACTATTGAATACCAATTAAAAGCTCTAACTCATATGTTCTTTTTAGTCTTTCAGCTTTAGTTAGAGTTTCACAGTTTGTGAATAGCTCC + +a +s mr.mrrefChr0 117626 170 + 130230 AATAATTAGCAGTCATTATTTGCTTGTATTGCTATGATAAGCAACCATAGCTGAGCTATGACTGTGTTGCTGTGAAGTACTAGATAAAGGACTCTGCTTATTAGCATGGTCCAGGTTACTATCCGACTTCAAGTGCCCCCAATGTCCTTAGCTCATATGACCAACAGATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123101 170 + 636262 AATGATTAGCAGTCATTATTTGCTCGTATTGCTATGATAAGCAACCATAGTTGAGCTATGACTGTGTTGCTGTGAAGTACTAGATAAAGGACTCTGCTTATTAGCATGGTCCAGGTTGCTATCCGACTTCAAGTGGCCCCAATGTCCTTAGCTCATATGACCAACAGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 115588 170 + 647215 AATAACTAGCAGTCATTATTTTCTTGTATCGCGATGATAAGCAACCATAGCTGAGCTATGACTGTGTTGCTGCGAAGTACTAGATAAAGGTCTCTGCTTACTAGCATCGTCCAAGCTATTATCTGACTTCAAGTGCTCCCAATGTCCCCAGCTCATATAACCAACAGATC + +a +s mr.mrrefChr0 117796 281 + 130230 TAAGATACATCATTCTAGGTAGATTAGATTTGGTCAGCTGGTATAGCACTACATGATTTATAAATTTGGCAACAATTATAAATTTAGGCACAATAGTGTGGAGGTTATCATGACTTTGGTATTTCTAAATAAAGAGACTAGGCCTAATTTTTTAAATGCATGCAACTGCACAGCTTCAGTCTCTCTCCACCTTCCACACATGTAAACAGGGTAATTCAGCATATTTTTGGTTGACGGTGCTCCCCCCAAAGAATCCACTGTAAAAACAAACTCTCATGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123272 256 + 636262 TAAGATACATCATTCTAGGTAGCTCAGATTTGGTCAGCTGGTATGGCACTATATTATTTATAAATTTGGCAACAATTATAAATTTAGGCACAATAGTGTTGAGGTTATCAGGACTTTGGTATTTCTAAATAAAGAGACTAGCCCTAATTTTTTAATTGCATGCAACTACACAGCTTCAGTCTCTCTCCACCTTCCACACATGGCCACAGGGTAATTCAGCACATTTTTA-------------------------CCACTGCAAAAACAGACTCTCATGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 115758 281 + 647215 TAAGATACATCATTCTAGGTAGATTAGATTTAGTCAGCTGGTATAGCACTACATGATTCATAAGTTGGGCAGCAATTGTAAATTTAGGCACAATAGTGTGGAGGTTATCATGACTCTGGTATTTCTAGGTAAAGAGACTAGGGCCAATTTTTTGAATCCACGCAACTGCACAGCTTCAGTCTCTCTGCACCTTCCACACATGTAAGCAGGGTAATTCAGCATATTTTCGGTTGACGGTGCTCCCCCCAAAGAATCCACTGTAAAAACAAACTCTCATCCTT + +a +s mr.mrrefChr0 118077 20 + 130230 ACCAGACTATGATTTTAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123547 20 + 636262 ATCAGACTATGATCTTAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 116039 20 + 647215 ACCAAACAATGATTTTAATT + +a +s mr.mrrefChr0 118097 23 + 130230 AATGCAACATCAAAAATACAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123567 23 + 636262 AATGCAACATCAAAAATACAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 116060 23 + 647215 AATGCAACATCAAATATACAATT + +a +s mr.mrrefChr0 118120 123 + 130230 CATCAAAAGACATATATATTGATGTTTCAACCTCCCATAAGCTCATATGTGTTCATACTGGATTCAAGAACATGACAAGACAGATTTTTATGCAGTTTTCAAAGGTGATTAATCCAATTCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123592 123 + 636262 CATCAAAAGACATATATTTTGATGTCTTAACCTCCCATAAGCTCATAAGTGTTCCTACTGGATTTAAGGACATGACAAGACAGATTTTTATGCAGTTTTCAAAGGTGATTAATCCAATTTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 116083 123 + 647215 CACCAAAAAACATATATATTGATGTTTCAACCTCCCATAAGCTCATATGTGTTTATACTGGATTCAAGAACATGACATGACAGGTTTTTATGTAGTTTTCAAAGGTGATTGACCCAATTCTCT + +a +s mr.mrrefChr0 118243 161 + 130230 TTTCACATGAAATTTGCTTTGTAATTGTTAATATGAATTTTATACTCTATTCTATGACATGCTTTCACACGTCAGGGATTGCTGTAAACTGCTGTTCACATGGGGTAAGCTATTGTCTGATGTCTTGATGGCAGTATGAAATATGATTAAAAAATTTGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123716 161 + 636262 TTTCACATGAAATTTGCTTTGTAATTGTTAATATGAATTTTATACTCTATTCTATGACATGCTTTCACACGTCAGGGATTGCTGTAAACTGCTGTTCACATGGGGTAAGCTATTGTCTGATGTCTTGATGGCAGTATGAAATATGATTAAAAAATTTGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 116206 65 + 647215 CTCCACATGAAATTTGCTTTGTAATCATTAATGTGATCTTTATACTCTATTACATGACAGGCTTT------------------------------------------------------------------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr0 118404 92 + 130230 AACAAACATAACTGCTTAACTTGCAACAAATGAGGATGCATGGCTTGTTTCTGTATTTGAGGGTTATACTGAGCCGAGTACACTCACCTGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123906 92 + 636262 AACAAACATAACTGCTTAACTTGCAACAAATGAGGATGCATGGCTTGTTTCTGTATTTGAGGGTTATACTGAGCCGAGTACACTCACCTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 116271 92 + 647215 GTCAGACTTAGCTGCTTAACTTGTGACAGATGTGGATGCTTGGCTCGTTTCTGTATCAGAGGGCTAGGCTGAGCCGAGTACACTCACCTGAC + +a +s mr.mrrefChr0 118496 502 + 130230 TCAATAGTCCCTGCCCTAACCCACTCATTTATCGTTATATTTTTTTTCACATTTGTATTGCTCCCAGTCACACAGGGGGCATCTTTCAAACTAAAGTCTATGTCTGTGCTATTTGGCTAGGACGCGCCGTTGACTTCCACATAAACCTCAACTGCAAGCTGACACATAACGGATTTTCACTTTGGGCTTTAGAAAATACAGCAACTCAGTTCCAATAACTCTGTACCTCAAGTTAATTTCAATGAGGGCCTTTTGGGTGGTAGTAGGGTAAAATAGACATTTAGCTAAAGCTTCTTTTAAGGTACAACAGCATAATATATTGTCATTATATGTAAAAGCTCATTGCTGTTTTGGAAAATGGTGAACAAGCAGGTAAGTGCTCAGCAAGGTGGCACAATCACATTCTGACTTAACCTACTTATTTGACTTGCATTCACTGTGGCAGGATCAATTCTGGTAAATTGTCAGTGATGGCTATAAACTTCAAATTAGGATTGTCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 123998 491 + 636262 TCGATTGTCCCTGCCCTAACCCACTCATTTATTGTTATATTTTTTTTCACATTTGT--TGCTTCCAGTCACACAGGGGGCATCTTTCAAACTAAAGTCTATGTCTGTGTTATTCGGTTAGGATGCGTTGTTGACTTCCACATAAACCTCAACTGCAAGCTGACACATAACGGATTT-CACTTTGGGCTTTAGAAAATACAGCAACTCAGTTCCCATAGCTCTGTACCTCAAGTTAATTTCAATGAGGGCCTTTTGGGTGGTAGTAGGGTAAAATAGACATTTAGCTAAAGCTTCTTTTAAGGTACAACAGCATAAAATATTGTCATTATATGTAAAAGCTCATT--------GGAAAATGGTGAACAAGCAGGTAAGTGCTCAGTCAGGTGGCACAATCACATTCTGACTTAACCTATTTATTTGACTTGTGTTCATTGTGGTAGGATCAATTCTGGTAAATTGTCAGTGATGGCTATAAACTTCAAATGAGGATTGTCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 116365 482 + 647215 TCAATAGTCCCTGCCCTAACTTTCTCACTTATCGTTATTTTTTTTTTCACATTTGTATTGCTCCCAGTCACACAGGTGGCATCTTTCAAACTAAAGTCTACGTTTGTGCTATTTGGCTCGTACGCACCATTGGCCTCCACATAAA--------------------ACAATGGATTTTCACTTTGGGCTTTGGAAAATACAGCAACTCAGTTACAATAACTCCGTACCTTAAGTTAATTCCAATGAGGGCCTTTTGGTTGGTAGTAGGGAACAATAGATATTTAGCTAAAGCTTCTTTTAGGGTACAACAGCATAATAAATTGCCATTATATGTAAAAGCTCATTGCTGTTTTGGAAAGTGGTGAACAAGCTGGTAAGTGCCAGGCAGGGTGGTACATGCACATTCTGACTAAACCTACTTATTTGACATGCATGCACTATGGCAGGAGTGGTTCTGGTAAATTGTCGATGATGGCTATAAACTTCAAATTAGGATTGTCACT + +a +s mr.mrrefChr0 118998 19 + 130230 GGGATCTTTATTCAATGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124489 19 + 636262 GGGATCTTTATCCAATGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 116848 19 + 647215 GGGATCTTTATTCAGTGAT + +a +s mr.mrrefChr0 119017 71 + 130230 CTGAGTGTGACAGCACAATCCACACAATGCTAGCTAAATGCGCATGACAGCTTGATCTCGGTTGTTCAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124509 71 + 636262 CTGAGTGTGACAGCACAATCCACACAATGCTAGCTAAATGTGCATGACAGCTCAATCTTGGTTGTTCAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 116867 71 + 647215 CTGAATGTGACAGCACAAGACACATAATGCTAGATAAATGCACATGACACCTTGATGTCGGTTGTCacact + +a +s mr.mrrefChr0 119088 411 + 130230 GTCCGAGACCACGGTAAGGCCAGGCCTATGGACCAAGGAACATTGATCTAAATTGGACTATGAGCACAAGTCAAGCTTTTTTGGGTTAAGGTCACCCTTAAAGGATTGTATGCATTAATATCCAGAGGCCAATGGCAGTGTACGGATTAAAATCAGGATGGTTTGTAATTTTATTGCACTAACATGCAGAGGCCAATGGCAGTATTTTGGCTTATATCCAGATGATTCGCTTAGAGAGTTATCAGTTACAGGCCATTATTTGGATGGCCTGTGTAGTGAGAGAGCCACTTGATAACTGAATTATGCAGTTAGAATAGCACCAACCTCGAGTAAATTTGGAGGCTAGCCAAACCCCCCCCACCCCTGACTCAACCTCAGGTATAATCATACCAATACCAGCCATATTAGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 118690 411 + 647215 GTCCGAGACCACGGTAAGGCCAGGCCTATGGACCAAGGAACATTGATCTAAATTGGACTATGAGCACAAGTCAAGCTTTTTTGGGTTAAGGTCACCCTTAAAGGATTGTATGCATTAATATCCAGAGGCCAATGGCAGTGTACGGATTAAAATCAGGATGGTTTGTAATTTTATTGCACTAACATGCAGAGGCCAATGGCAGTATTTTGGCTTATATCCAGATGATTCGCTTAGAGAGTTATCAGTTACAGGCCATTATTTGGATGGCCTGTGTAGTGAGAGAGCCACTTGATAACTGAATTATGCAGTTAGAATAGCACCAACCTCGAGTAAATTTGGAGGCTAGCCAAACCCCCCCCACCCCTGACTCAACCTCAGGTATAATCATACCAATACCAGCCATATTAGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 119121 411 + 647215 GTCCGAGACCACGGTAAGGCCAGGCCTATGGACCAAGGAACATTGATCTAAATTGGACTATGAGCACAAGTCAAGCTTTTTTGGGTTAAGGTCACCCTTAAAGGATTGTATGCATTAATATCCAGAGGCCAATGGCAGTGTACGGATTAAAATCAGGATGGTTTGTAATTTTATTGCACTAACATGCAGAGGCCAATGGCAGTATTTTGGCTTATATCCAGATGATTCGCTTAGAGAGTTATCAGTTACAGGCCATTATTTGGATGGCCTGTGTAGTGAGAGAGCCACTTGATAACTGAATTATGCAGTTAGAATAGCACCAACCTCGAGTAAATTTGGAGGCTAGCCAAACCCCCCCCACCCCTGACTCAACCTCAGGTATAATCATACCAATACCAGCCATATTAGACT + +a +s mr.mrrefChr0 119499 20 + 130230 GTGGAGGAAAGCAGGGGCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 119101 20 + 647215 GTGCAAGAAAACAGGGGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 119538 20 + 647215 GTGGAGAGAGGCACGAGCCG + +a +s mr.mrrefChr0 119519 55 + 130230 CAGGAATCATGGACCAGGGGGTGTAACTTGTTCTGCAGATAAAAGAACAATCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124580 55 + 636262 CAGGAATCATGGACCAGAGGGTGTAGCTTGTTCTGCAGATAAAGGAACAATCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 123093 55 + 647215 caggaatcattgaCCAGGGAGAGTTACTTGTTTTGCAGATGAAAGAACAATATTG + +a +s mr.mrrefChr0 119574 20 + 130230 AGTGGAGGAATTAACAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124636 20 + 636262 AGTGGAGGAATTAACAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 123148 20 + 647215 GGCGGAGGAATGAACAGAAT + +a +s mr.mrrefChr0 119594 250 + 130230 AAACAAGCCCCAAAATAACACCTGAGCAGCTATTGTGAGACCTATGTCAGATTGTGACTGATGCAATGTTTGATCAGCAGAACAATAGCAGGGAGCCGAGAAGTGTATGAATGTATGGTGATGAGCCCGAAGTGTTCTGGGTTTTCAGTATAGCACCATTGCCCTGCTCAAGAGGGTTCAGTATTGTTGCCCAATGTTGCGATGTGATCCTCTTAGAAGGAAATGCAAATAGCTGGTAGACATCAGCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124663 250 + 636262 AAACAAGACCCAAAATAACACCTAAGCAGCTATTGTGAGACCCATGTCAGATTTTGACTGATGCAATGTTTGATCAGCAGAACAATAGCAGGGAGCTGAGAAGTGTATGAATGCAGGGTGATGAGCCCGAATTGTTCTGGGTTTTCAGTATAGCACCATTGCCCTGCTCAAGAGGGTTTAGTATTGTTGCCCAATGTTGTGGTGTGATCCTCTTAGAAGGAAAAGCAAATAGCCGGTAGACATTATCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 123168 245 + 647215 AAACGAGCCCCAAAATAACGACTGAGCAGCTATTGTGAGACCTGTGTCAGATTGTGACTGATGCAATGTTTGATCAGCAGAACAATAGCG-----CCGAGAAATTTATGAATGTATGGTCATGAGCCTGAAGTGTTCCGGGTTTTCAGTATAGCACCACTGCCCTGCTCAAGAGGGTTCAGTATTGTTGCCCAATGTTGCGATGTGAGCCTCTTAGAAGGAAATGCAAATAGCTGGTAACCATCAGCGGT + +a +s mr.mrrefChr0 119844 175 + 130230 GTGGCAATAGTGAGGATGGTCCTCATATACGATGTTTGCTACAAACTTAGCATCCTGGGATGTTGATTCATAGGAAGGTCCAGACAGGGATGCCACCCCATAAGAAGCATGCTTTATATCATATCTTACTGAGATGTAACTTAATGCAAAGTGTGAGTTTGTACTGATCTACTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 124914 172 + 636262 GTCGCAATAGTGAGGATGAGCCTCATATACGATGTTTACTACAAACTTACCATACTGGGATGCTGATGG---GGAAGTTCCAGACAGGGATGCCACCCCATATGAAGTATGCTTTATATCCTGCCTTACTAAGGTGTGACTTAATGCAAAGTCTAAGTTTGTACTAATCTACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 123413 174 + 647215 GTGGCAATTGTGAGGATGGTCCTCATATAGGATGTTTGCTACACGCTTAGCTTCCTGGGATGTTGGTTCATAGGGAGGTCCACACAGGGATGCCACCCCATAAGAAGCAT-CTTTATGTCACATCTCACTGAGATGTAACTTAATCCAAAGTGTGAGTTTGTACTGATCTATCCA + +a +s mr.mrrefChr0 120019 235 + 130230 ACGAGAAGGCTCGTAAATATCATGACCAGAATTGGATGTGTTCATTAAGGCCAGCGCAAAGCAGTTCAAGTGAATAAAGCCACCCTACCCTTAACCTCTCATAAGCACCTAACCTATGGTGGGAGGCTGATTGGACTCCACTAACTGTAGGATGCACAGTTCTATGGTAACTGTTCTCTTTTTTCAACAACATTTTATGTCTAGACTGCTAGGGCCTAGCAAGCTAAGTAGCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125086 231 + 636262 ACGAGAGGGCTCGTAAATATCATGACCAGAATTGGATGTGTTCATTAAGGCCAGCGCAAACCTGTTCAAGTGAATAAAGCCACCCTACCCTTTACCTCTCTAAAGCACCTAACCTATGATGGGAGGCTGAT-GGACTCCACTAACTGTAGGATGCACAGTTCTACGGTAACTGTTCTCTTCTTTCAACACTATTTTATGTCTAGA---CTAGGGCCTAGCAAGCTAAGTAACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 123588 222 + 647215 ACGAGGAGCCTCATAAATATCATGACCAGAATTGGATTTGTTCGTTGAGGTCAGTGCAAAGCAGTCCCAGTGCATAAAGCCGCCCTACCCATAACCACTCATAAGCACCTAACCTATGGTGGAAGGCTGATTGGACTCCACTA-------------CAGTTCTATGATAATCGTTCTTTTTTTTCAACAACTTTTTATGTCTAGACTGCTAGGGCCTAGTAAGTTAAGTAGCAAT + +a +s mr.mrrefChr0 120254 123 + 130230 TACCACCACTTCAGCCCTCAACTGATGCTAACATATCATGTGATGGATTACTCTGGGACTTCAACTTATTGTGTTATTGGGCAATGCTATGTGTGGTTTACCTTTACCAACCGCTTGAGCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125317 123 + 636262 TACCACCACTTCAGCCCTCAACTGATGCTAACATATCATGTGATGGATTACTCTGGGACTTCAACTTATTGTGTTATTGGGCAATGCTATGTGTGGTTTACCTTTACCAACCGCTTGAGCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 123812 123 + 647215 TACCACCACTTCAGCCCTTAACCAACGCCAACATATCATGTGATGGATTACTCTTCAACTTCAACTTTTTACATCATTGGGCAAGGCTATGTGCGGTTTACCTTTACCAACCACTCGCTCATT + +a +s mr.mrrefChr0 120377 43 + 130230 TCAAACACCCCTATTACTACTTAATAGCATTAGGAATTATAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125442 43 + 636262 TCAAACACCACTAGTACTACTTAATAGCATTAGGAATTATAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 123935 43 + 647215 TCAAACACCCCTATTACTACTTAGTAGCATTAGGAATTATAAC + +a +s mr.mrrefChr0 120420 125 + 130230 ATAAATTATTAATCCCCAATCAAACCACTCCCTCACTTCTCAAACACCCCAATTATTGGATAATATAGGCATAAGGAATTATAACTGACACTGATGAATTATTAATTGACAATTGAATCAGTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125493 122 + 636262 ATAAATTATTAATCCCCAATCAAACTACTCCCTCACTTCTCAAACACCCCAATTACTG---CATATAAGCATAAGGAATTATAACTGACACTGATGAATTATTAATTGACAATTAAATCAGTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 123978 113 + 647215 ATAAATTATTAATCCCCAATCGAACC------------CTAAAACACCCCTATCATTAGATAATATAGGCATAAGGAGCTATAACAGACCCTGATGAATTATTAATTGACAATTGAATCACTGAA + +a +s mr.mrrefChr0 120545 332 + 130230 CTTTTCCATACATTCAGCATTTTTTCTTTTGTAAAACCTGCGCCTTTAGATCATATTCTAAGTAAGGGTAAGAATAGATTCACTTCCTTGTGGCATTCTGCAGCAGTATACACTATTGTCTGTCTCAGATAACAATCAAATAGTTAGCAGCCAGTTAAAGACAAATGACATATCTTAAGAAGAAGGTACTCTCCAAACTGACTGGCAAATATACCTCAAACTACTCACTAACCTAAAATATGCAAGTTCCCCAATGGGCTGACCACGAATTGAAGTTAACTAACAGATGTTACTCATTTTTTATCATTCAACTCTCACAAGGGTCATGTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125616 331 + 636262 CTTTTTCATACATTCAGCATTTTTTCTTTTATAAAACCTGCGCCTTTGGATCATATTCTAAGTAAGGGTAAGAATAGATTCACTTCCTTGTGGCATTCTGCAGCAGTATACACTATTGTCTGTCTCAGATAACAATCAAATAGTTAGCAGCCAGTTAAAGACAAATGACGTATCTTAAGAAGAAGGTGCTCTCCAAACTGACAGGCAAATATACCTCAAACTACTCACTAACCTAAAATATGGAAGTTCCCC-ATGGGCTGACCACGAATTGACGATAGCAAACAGATGTTACTCATTTTTTATCATTCAACTCTCACAAGGGTCATGTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 124091 327 + 647215 CTTTTCCATACATTCAGCATTTTTTCTTTTGTAACACCTGCGCCTTTAGATCATATTCTAAGTAAGGGTATTAATGGACTCACTTCCTT-TCACATTCTGCAGTGGTAGACACTATTGTCTGTCTCAGAT-ATAATCAAATAGCAAGCAGCCAGTCAAAGACAAATGACATATCTTAAGAAGAAGGTACTCTCCAAACTTACTGGCAAATATCCCTCAAACTACTCACTAACCTAAAATGTGCAAGTTCCCCAATGGGCTGACCACAAATTGAAGTTAACTAGCAGATGTTCCTCATTTTTTATCATTCAACTCTCATAAGGG---TGTGCA + +a +s mr.mrrefChr0 120877 87 + 130230 TCTAAATACAGATACCTTAATTTCTTCCAATGAAAAAAAGTGAAAAAAGACACCACCCTATGTGGTGTCACTGCTCCTCTGGTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 125971 87 + 636262 TCTAAATACAGATACCTTAATTTCTTCCAATGAAAAAAAGTAAAAAAAGACACCACCCTATGTGGTGTCACTGCTCCTCTGGTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 124418 87 + 647215 TCTAAATACAGATACCTTAATTTCCTCCAATGGAAAAAAGTGAAAAAAGACACCGCGCTACGTGGTGTCACTGCTCCTGTGGTGTAC + +a +s mr.mrrefChr0 120964 16 + 130230 ATCTGACAGGTCCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126063 16 + 636262 ATCTGACAGGTCCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 124505 16 + 647215 TTCTGATAAATCCAGC + +a +s mr.mrrefChr0 120980 47 + 130230 TACCGTTTTAACCGACAAGTATGTCAGTAGAGGCGGATTAGGGTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126079 47 + 636262 TACCGTTTTAACCGACAAGTATGTCAGTAGAGGCGGATTAGGGTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 124524 47 + 647215 TACTGTCTTAGCGGACTAGGATGTCAGCAGGGGTGACTTAGGGTATT + +a +s mr.mrrefChr0 121027 53 + 130230 GTAACTCACGGATCATGCGAGGAATGATAGTATGCAACACACTATAGGAGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126129 53 + 636262 GTAACTCACGGATCATGCGAGGAATGATAGTATGCAACACACTATAGGAGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 124571 53 + 647215 GTACCTCACATGTCTTGCCAGGAATGATAATATGCCACACACTACAGGAGTCA + +a +s mr.mrrefChr0 121080 19 + 130230 CACAATTACCATCCCAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126197 19 + 636262 CACAATTACCATCCCAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 124624 19 + 647215 CACAATCACAATCCCAGCA + +a +s mr.mrrefChr0 121099 158 + 130230 GGATTCGCAGGAAACATTTATTAATAGGTAACAGGCCAGATACTTGTCTCTTGGTGACATTGTCTCTTAGTAATAACAATGTACTAACTCTCCAGCCATTCTTAAATACACCTGTAGAGAAAGAGATATGAATTAGTATATGTAAGAATCACAACCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126218 158 + 636262 GGATTCGCAGGAGACATTTATTAATAGGTAACAGGCCATATACTTGTCTCTTGGTGACATTGTCTCTTAGTAATAACAATGTACTAACTCTCCAGCCGTTCTTGAACACACCTGTAGAGAAAGTGATATGAATTAGTATATGTAAGAGTCACAACCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 124643 151 + 647215 GGATTCGCAGGAAACATTTATTTATAGGTAACAGGCCAGATACTTGTCTCGTGGTGATATTGTCTCTTAGTTATAACAAAGTACTTATTCTCCAGCCATTCTTAAATTCACCTGTAGGGAAAGAGATC-------GTATATATAAGAATCACAATCAG + +a +s mr.mrrefChr0 121257 319 + 130230 GGTCATCCCCTTATTATAACTTCTGTCTGGGACTATACTTCTGGTTGGGACTATATAGGGCAGCTGTCTCAGGGTTGCTCATTACAAACTAACATGACATATTATGACATGAATGATATGAAGGCATGCAAAGACATTTTTTTCTTCTGTGCTCACCTAACTCTACCGAATCAGTGACAGCCTAAAGCTTAATAATGTTACTCACCTCCCAATTTGATCGTCCTAAGAATGCTACCCGGGTGTGACTAGCTGAGCCACTCTGTGCAATGACCTGGTCAAACAGTTAATGAAATATTCTAGCTCAAAGCTCAACTTAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126376 303 + 636262 GGTCATCCCCTTGTTATAACTTCTGTCTGGGACTATACTTCCGGTTGGGACTATATAGGGCAGCTGACTCAGGGTTGCTCAGTACAAACTAACATGACATATTATGACATGAATGATATAAAGGCATGCAAAGACATATTTTTCTTCTGTGCTCACCTTACTCTACCGAATCAGTGACAGCCT--------------TTACCCACCTCCCATTTTGATTGTCCTAAGAATGGTACCCGGGTGTGACTAGCTGAGCCACTCTGTGCAATGAACTGGTCAAACACTTAATGAAATATTCTATCTCAAAGCTCAACTTAA-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 124795 319 + 647215 AGAGTTCCCCTTATTATAACTTCTGTTTGGGACCATACTCCTGGTTGGGACTATATAGGGCGGATGTTTCAGGGTTGCTCATTACAATCTAACATAACATATTATGGCATGAATGATATGAAGGCGTGCAAAGAGATTTTGTTCTTCTGTGCTCACCTAACTCTACCAAATCACTGGCAGCTTAAAGCTTAATAATGTTCCTCTCCTCCCAATTTGATCGTCCTAAGAATGCTACCAGGGTGTGACTAGCTGAGCCACTGTGTGCAATGACCTGGTCAAACAGTTAATGAAATATTCTAGCTCAAAGCTCAACTTGTAG + +a +s mr.mrrefChr0 121576 24 + 130230 TGGGGAAATATACCTACACAGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126679 23 + 636262 -TGGGAAATACACCTACACAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 125117 24 + 647215 TGGGGAAATATATCCATACAGGAG + +a +s mr.mrrefChr0 121600 102 + 130230 AATATGTAGTGGCATTGCCTGCAAGTAGGTGCAAATTAATACCTTCTTCAGTGCACCAGCTGTATAGGAGGACCTCACACACTTGCAGACTCGCACTAGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126703 102 + 636262 AATATGTAGTGGCATTGCCTGCAAGTAGGTGCAAATTAATACCTTCTCCAGTGCACCAGCTGTATAGAAGGACCTCACACACTTGCAGACTTGCACTAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 125141 87 + 647215 AATATGTAGTGACATTGCCTGCCTGCA-----------ATACCTTCTTCAGTGTACCAGCTGCATAGGAGGACCTCACATAC----AGATGCTTACTAGAAC + +a +s mr.mrrefChr0 121702 46 + 130230 AATTTATTTGTGATATCCCATAGCAGATGTACCAGAGGATGCACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126809 46 + 636262 AATTTATTTGTGATATCCCATAGCAGATGTACCAGAGGATGCACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 125228 46 + 647215 AATTATTTTGCAATATCCCGTAGCAGATGTACCAGGGGATCCCCAA + +a +s mr.mrrefChr0 121748 321 + 130230 GACCACTTTGAGTTACAATCTAACACTAATGCTGAGAAAATAAAATAAGCACAGCTCCAAATCACCACAGTTGATTGATACAAGCAAAACTAACACTGCTCTGTGTCTTCTGGTACTCATCAGAAACACCATAAGTTGTATTAACATCCATTCTGGGGCCAAGCCATGAGGGATCACTTATGGGATTCAAGGCTTTGGAGAGAGGTAACTTCATTACCTCCTCTAGAATAGCCATGACCATTCAGTGTTCTTATGTCCAAACTACACTTACTGTATCTCATAACACAAACTGGATGAATCAATGATGTCATCCTGTGTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 126855 320 + 636262 GACAACTTTGAGTTATAATCTAACACTAATGCTGAGAAAATAAAATAAGCACAGCTTCAAATCACCACAGTTCATTGATACA-GCAATACTGACACTGCTCTGTGTCTTCTGGTACTCATCAGAAACACCATAAGTTGTATTAACATCCATTCTGGGGCCAAGCCATGAGGGATCACTTATGGCATTCAAGGCTTTGGAGACAGGTAACTTCATTACCTCCTCTAGAATAGCCATGACCATTCAGTGTTCTTATGTCCAAACTACACTTACTGTATCTCATAACACAAACTGGATGAATCAATGATGTCATCCTGTGTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 125275 319 + 647215 GACCAATTTGAGTTACAATCTAACACTAATGCTGGGAAAATAAAATAGGCACAGCTCCAAATCACCACAGTTGATTGTTACAAGCAAAAGTAACACTGCTCTACGTC--CTGGTACTCATCAGAAGCATCAGAAGTTGAATTAACATCCATTTTGGGGCCAAGCCATGAGGGATCACTTATGGGATTCGGGGCTTTGGAGAGAGGTATCTTTGTTACCTCCTCTAGAGAAGCCATGCTCATTCAGTGTTCTTATGTCCAAACTACACTTTCTGTATCTCATAACAGAAACTGTATAAATCAATGATGACATTCTGTGTAGA + +a +s mr.mrrefChr0 122069 192 + 130230 GGTGCAACTCAATGCTGTGAAGAGAATAGTTTGTCTTATAAACTAGCATATATTGTCCTGTTGCTTGGGGAATAGATGAAGATTCGCACCTTGCACCAACCTGGATTCCTGCTAGGATATCTCATCACCTCACCAGCATGAGATCTCAAATCAATAGCTCTAACAATCTGTCAGAAAAGAAATTTTACCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 127175 192 + 636262 GGTGCAACTCAATGCTGTGAAGAGAATAGTTTGTCTTATAAACTAGCATATATTGTCCTGTTGCTTGGGGAATAGATGAAGATTCGCACCTTGCACCAACCTGGATTCCTGCTAGGATATCTCATCACCTCACCAGCATGAGATCTCAGATCAATAGCTCTAACAATCTGTCAGAAAAGAAATTTTACCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 125597 192 + 647215 GGTGCAACTCAATGTCATGAAATGAACAGACTTTCTTATAATCTGACATATATTGTCCTGTTGCTTGGGGAATGGATGAATATTTGCACCTTGCATCAACCTGGATTCACGTTAGGATATCTCATCACCTCACCAGCATGAGATCTCAAATCAATAGCTCCAATGATCTGTCACAAAATTAACTTTACCAGC + +a +s mr.mrrefChr0 122261 421 + 130230 GCTAACCCAGACATTTTAAGTATCCAGTTCCCTTTCCGGCAGACATCTCAGCAACATTAGGTTGTCTGCAAAAGCCAGGTTATGTTCTACACCTGAGAGGTACTCTTGATGCACTGAGCCTTTACCACCCTCTAAAGTTTCAAGCTTTATAGAATAGGTAGAATTAGAAATGAACGGTACACACCATGGACATGAGGGGCTAAATTCTGCAGAGTGAAAGGCTGATCCAACCAAATGCCTTTTAATGTCTTTTATTTGTAGATGCCCTGACTCCTGTATGTTTCATAGCAATCTATGTGTATATCAGCGGCCTACTTGTTATTGAATGGTTCTGAAGTGCAAAGTTATCCTTCAAGTAAAAAGCATATAACCAAACAAAACTTGGCCGTGGTGAATCAACACAAAATTCTTAGATAGTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 127367 420 + 636262 GCTAACCAAGACATTTTAAGTACCCAGTTCCCTTTCCGGCAGACATCTAAGCAACATTAGGTCGTCTGCAAAAGCCATGTTATATTCTACACCTGAGAGGTACTCCTGATGCACTGAGCCTTTACCACCCTCTAAGGCT-CAGACTTTATAGAATAGGTAGAATTAGAAATGAACGGTACACACCATGCACATGAGAGGCTAAACTCTGCAGAGTGAAAGGCTGCTCCAACCAAATGCCTTTTAATGTCTTTTATTTGTAGATGCCCTGACTCCTGTATGTTTCACAGCAATCTATGTGTATATCAGCGGCTTACTTGTTATTGGATGGTTCTGAAGTGCAAAGTTATCCTTTAAGTAAAAAGCGTATAACCAAACAAAACTTGGCCGTGGTGAATCAACACAAAGTTCTTAGATAGTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 125791 417 + 647215 GGTAACCCAGACATTTTAAGTATCCAATTCCCTTTGCGGCAGAGATCTCAGCAATGTTAAGTTGTCTGCAAAAGCCAGGTTATGTTCTACATATGAAAGGTACTCTTGATGCACTGAGTTTTTACAACCCTCTAAAGTTTCAAGCTTTATTGAATAGGTAGAATTAGAAATGAATGGTACACACCATGGACTTGAGGGGCTGAATTCTGCAGAGTGAAAGGCCAATCCAACCAAATGCCTCTCAATGACCTTA----GTAGGTGCCCTAACTCATGTATACTTTATAGCAATCTATGTGTATATCCGTGGCCTCCTTGTTATTGAATGGCTCTGAAATGCAAGGCTGTCCTTCAAGTAAAAAGTATAAAACCAAACAAAACTTGGCCGTGGTGAATCAACATAAAATTCTTACATAGTGAT + +a +s mr.mrrefChr0 122682 234 + 130230 TCAAAGCCTTGTTACCTACTACACATAATCTTGTGTTCCTAACATTATGGCATGTCACTAGACCCTAGCAGGTCTCATTACCTCCAACAGGCTGCCTTGTGTCACCAACATTGCTCACTCTTTGGTGCATCAAAGCATCTGAAAAAATATGACATACAATATTCTTTGAAAGGGGCTCAACGGATCTGAACAAAGTCCAGCTTTGTCCCTTGACACTTAAAAAGGATGGTGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 127787 233 + 636262 TCAAAGCCTTGTTACCTACTACACATAATCTTGTCTTCCTAACATTATGGAATGTCACTAGACCCTAGCAGGCCTCATTACCTCCAACAGG-TGCCTTGTGTCAGCAACATTGCTCACTCTTTGGTGCATCAAAGCATCTGAAAAAATATGACATAAAATATTCTTTGAAAGGGGCTCAACGGATCTGGACCAAGTCCACCTTTGTCCCTTGACACTTAAAAAGGATGATGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 126217 229 + 647215 TCAAAGCCTTGTTACCTGCTAGACATAATCTTGTGTTCCTAACATTATGGCATGTCACTAGATCCTAGCAGGTCCCATTACCTTCAACAGGCTGTCTTGTGTCACCAACATTGCCCACTCTTTGGTGCATCAAAGCATCTGAGAGAATATAACATACAATATTCTTTGAAAGGAGGTCAACGG--CTGAACAGAGCCCAGCCTTGTCCTTTGACACTTAAAAAGGATGGTG--- + +a +s mr.mrrefChr0 122916 533 + 130230 CCCTGAGAAATACATATTAAGGTTTGATAGGCATCCACTGGGAATGCCACCTTTAGGTAGAAGATTATAACAATACATTGCTTAACCAATACATTGCTCTTGAGGAGAAGATGCGAAAATACTTATCTGTTCATATAGTCTGAGTCTGTATGTAAATGTAGATATGTGTGGAAATGTAGCTGTGTGTTGCAATTCAAGCTCCCTCTGGATCATCATATGTTATACTCTTCATGTATAGGTAGGTATACCAGAGCACCAATGGAACTTTTAATCAGTGACAGTGTCAGAGAATTAGTCATTCTGAATGCACAAAATTCTGGGAAACTTTAGGTCACAATCTGGCCCAAAAAAGTTGCTTGCATTTAATTTCCACATTATTCCCATGGATGATTAACAACCAGATTAGCACGAGCTTTGCCACATTACTTGCATTTCATTATTTTTACAAATTAAGGCTGCCACTATTGAAAGTCCATCTGTTCCATTAGTGAAAATTCTTGATTGAAAAGATCACTCACAATATAGACTATAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128023 529 + 636262 CCCTGAGAAATACATA---ATGTTTGACAGGCCTCCACTGGGAATGCCACCTTTAGGTAGAAGATTATAACAATACATTGCTTAACCAATACATTGCTCTTGAGGAGAAGATGCGAAAATACTTATCTGTTCATATAGTCTGAGTCTGTATGTAAATGTAGATATGTGTGGAAATGTGGCTGTGTGTTGTGATTCAAGCTCCCTCTGGATCATCAGATGTTATACTCTTCATTTATGGACAGGTATACCAGAGCACCAATGGAACTTTTAATCAGTGACAGTGTCAGATAATTAGTCATTCTGAATGCACAAAATTCTGGGAACCTTTAGGTCACAATTTGGCCCCAAAAAGTTGCTTGGATTTAATTCCCACATTATTCCCATGGATGATTGACAGCCAGATTAGCATGAGCTTTGCCACATTACCTGCATTTCATTATTTTTTCAAATTAAGGCTGCCACTATTGAAAGTCCATCTGA-CCATTAGTGAAAATTCTTGATTGACAAGATCACTCACAATATAGACTATAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 126446 524 + 647215 CCCTGAGAAATACATATTAAGGTTTGATAGGCATCCATTGGGAATGTTACCTTTTTGTTGAATATTGTACCAATACATTGCTTAACCAATACATTGCTTACTAGGAGAAGATGCAAAAATACTTATCTGTTCATACACCCTGACTCTGTATGTAAATCTAGCTATGTACAGAAATGTATCTGTGTGTTGCAATTCAAGCTCCCTCTGTATCATCGTATGTTATGCCCTCCATGTATAGGTAGGTATACCAGAGCACCAATGGAGATTTTAATCAGTGACAATGTCAGAGAATTA--CATCCTGGATGCATAAAATTCTGGAAAACTTTAGGTCACAATCTGGCCCAAAAA-GTTGCTTGCATT-AATTTCCACACGATTCCCATGGATGATCATCAACCAAATTAGCACAAGC-----CACATTACTTGCAGTTCATTATTTTTACAAAGTAAGGCTGCCACTATTGAAAGTCCATCTGTTCCATTAGTGAGAATTCTGGATCAAAAAGACCAGCCACAATCTAGACTATAAG + +a +s mr.mrrefChr0 123449 14 + 130230 TGCGCATTGCTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128552 14 + 636262 TGCGCATTGCTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 126971 14 + 647215 TGCACATTGCTGAC + +a +s mr.mrrefChr0 123463 26 + 130230 CAGGCCTTACGAGGCGGCAAACCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128567 26 + 636262 CGAGCCTTACGAGGCGGCAAACCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 126985 26 + 647215 CAGGCCTTACGAGGCAGCAAACCAGC + +a +s mr.mrrefChr0 123489 234 + 130230 AATTAGCAACCAATTGAGCAAGCAGGTTATGATGCACATTTAAAATAACCTGAGAGTAGTTTTTCTATCATCCATGTGACGAACTAAACTAGCCGCTACCCTAACACCACTTTTGTGTGATGTACATGAGCAAAGGAAAGCAATAATCTACCTATAGCCATGTTGTACTTCAACCTTTGTTTTGCTAGTTTACTCCACATTGTAATACCAGCAAACCATTGCTAAATATTATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128593 229 + 636262 AATTAGCAACCAATTGAGCAAACAGGTTATGATGTGCATTTAAAATAACCTGAGAGTAGTTTTTCCATCATCCATGCGGCAAACTAAACTAGCTGCTACCCAAACACCACTTTTGTGTGATGTACATGAGCAAAGGAAAGTGATAATCTACCTATAGCCATGTCATAC-----CCTTTGTCTTGCTAGTTGACTCCACATTGTAATACCAGCAGAACATTGCTAAATATTATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 127044 232 + 647215 AGTTAGCAACCAATTGAGCAAGCAGGTTATGAAGCACATTTAAAATAACCTTAGAGTTGTTTTTCTGTCATCCATGTGATGAGCTAAACTAGCCGCAACCCTAACAACACTTTTGTGTGATGTACAGGAGCATATGAAAGCAATAAT--ACCTATAATCATGATGTACTTCAACCTTAGTTTTGCTAGTTTAGCCCACATTGTAACACCAGCAAACTGTTGTTAAATATTATTT + +a +s mr.mrrefChr0 123723 19 + 130230 ATTTCAATTTAACCAGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128822 19 + 636262 ATTTCAATTTAACCAGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 127277 19 + 647215 ACTTCAATTTAAGCAGACC + +a +s mr.mrrefChr0 123742 209 + 130230 GTTTACAATCCACTAACCCTCTCAGATCACTCAATGTGTTGAATCCGCTGGAATATTACATCAGAAGTGAATCCCCAGTATATAGGTATTTGTAAGTGTTGACATCTGAATGTTAATATTTCGAGATGCAAGGTGTCACATGAGGTTTCTCGCCAGTCCCAGGAGGTTAGGTTTCTCACCAACATCACATGATGAGGTGTATGAGGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 128841 209 + 636262 GTTTACAGTCCACTGACCCTCTCAGATCACTCAATGTGTTGAATCCGCTTGAATATTACATCAGAAGTGAATCCCCAGTATATAGTTATTTGTAAGTGTTGACATCTGAATGTTAATATTTCGAGATGCAAGGTGTCACATGAGGTTTCTCGCCAGTCACAGGAGGTTAGGTTTCTCACCAGCATCACATGATGAGGTGTATGAGGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 127297 138 + 647215 GTTTACAATCCACTAACT---TCAGATCACTCCATGTGTTGAATCCACAGGAATATTACAGCAGAAGTGATTCCCCAGTATACAAGTGT---------------------------------------------------------------CCAGTCCCATGAAGTT-----TCTTGCCAACATCACGTGATGAGGTGCATGAGGTGT + +a +s mr.mrrefChr0 123951 195 + 130230 CTTCATATAACATGGGTCCACAAAAGTTCTGTGTCCAGGGGCACTGGGGTCTTGCCTAAGCAATAGAGAATGTACAGTATCTTATGACTTATAATGTGAGGACTTGACTTTGGTACTGACTTTGACCTACTTATGTGGCTCTAGAAGTGCTGACAACTCTTATATGGTAGATGTTACTGAGATCACTATATAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129056 194 + 636262 CTTCATATAACATGG-TCCACAAAAGTTCTGTTTCCAGGGGCACTGGTGTCTTGCCTAAGCAATAGAGAATGTACAGTATCTTATGACTTATAATGTGAGGACTTAACTTTGGTACTGATTTTGACCTACTTATGTGGCTCTAGAAGTGCTGACAACTCTTATATGGTAGATGTTACTGAGATCACTATATAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 127435 125 + 647215 CTTTACAAAACATGGGTTCACAAAAGTTCTGGGTCCAGGGGCACTGGGGTCTTGTCTAAGCAA----GAATGTACAGTATCTTATGACTTACAATGTGAGGACTTGAATTTGGTACTGACTTTGACCTA------------------------------------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr0 124146 88 + 130230 TATTATGACAGTCCTTTGTGATTATAGGAAAACTTTAAAAACTCTTTGATCTATCATGCAGAACATGGTCTCAAGTCGATGAAATTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129262 88 + 636262 TATTATGACAGTCCTTTGTGACTATAGGAAATCTTTAAAAACTCTTTGATCTATCATGCAGAACATGGTCTCAAGTCGATGAAATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 127560 88 + 647215 TATTATGACAGTCCATTGTGATTATAAGAAAACTTTCGAAACTATTTGATCTATCATGCAGAACATGGTCTCAAGTTGATGAGATGGT + +a +s mr.mrrefChr0 124234 2 + 130230 AT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129350 2 + 636262 AT +s simRat_chr6.simRat.chr6 127653 2 + 647215 AT + +a +s mr.mrrefChr0 124236 355 + 130230 AGTTGTAACCAATTATATTGCATATGTGTTATTCAACAAGAAAGCAGTAACATTTTTCAAGTATACCCAAGTTACTATGAAGGTCAATTGCTACAAGTCTGATGGTTGTTTGCTCACAAGAGGGTCCAATGATTAATGTTATCATTCATATGTTTGAACTTGAGATAGGTTGCATTGCACACCCATAGGCTATTACAATGTTCCTCAATTGAGTTTTTCTATCTAGTATCTTTCCATATCAATTAATATTCTTTGTCAAAAGTCTTTATGGATATCAAGTCATTCCATGTTCGGATTAGCAATCAGTAATTAACCCAAACGCTGGAGTTCCAGTATATATTTGCCCAATCTGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129352 355 + 636262 AATTGTAACCAATTATATTGCATAGGTGTTATTCAACAAGAAAGCAGTAACATTTCTCAAGTATACCTAAGTTACTATGAAGGTCAATTGCTACAAGTCTGATGGTTGTTTGCTCACAAGAGGGTCCAATGATTAATGTCATCGTTCATATGTTTGGACTTGAGATGGGTTGCATTCCACACCCAGCGGCTATTACAATGTTCCTCAATTGAGTTTTTCTATCTAGTATCTTTCCATATCAATTAATATTCTTTCTCCAAAGTCCTTACAGATATCAAGTCATTCCATGTTCAGATTAGCCATCAGTAATTAACCCAACCGCTTGAGTTCCAGTATGTATTTGCCCAATCTGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 127657 353 + 647215 AGTTGTAACCAATTAGATTTCATATGTGTTATTCAACAAGAAA-CAGTAACACTTTTCCAGTATACCCAAGTTACTATGAAGGTCAATTACTATAAGTCTGATGGTTGTTTACTTGCAAGAGAGTCCAATGATTAATGTTATCATTCATATGTTTGAATGTGAGATAGGTTGCATTGCACACCCATAGGCTCTCACAATGTTCCTCAATTGAGTTTTTCTATCCAGCAATTTACCATTTCAATTAATATTCTTTGTCAAAAGTCTTTATGGATATCTAGTCATTCCATGTTCGGATTAGCAATTAGAAATTAATCCAAAC-CTGGAGTTCCAGTATATATTTGCCTAAACTGTTC + +a +s mr.mrrefChr0 124591 33 + 130230 TAACTACTGTGAACAGTAATACAGGGGGCCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129707 33 + 636262 TAACTCCTGTGATTAGTAATACAGGGGGCCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 128011 33 + 647215 CAACTACTGTGAACAGTGAAATAGGGGGCCTAC + +a +s mr.mrrefChr0 124624 133 + 130230 TGCAACACAGCACCCACAAAAGAGTGAGAACTACTTTGGCCAGATCTTGTCCATTTCAATAATCATGTGCACCCATCATGCCCCCATCACTGACATCTAAGGCCTTGGATGTATTAATATGGCAAGAGGCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129757 133 + 636262 TGCCACACAGCACCCACAAAAGTGTGAGAACTACTTTGGCCAGATCTTGTCCATTTCAATAATCATGTGCACCCATCATGCCCCCATCACTGACATCTAAGGCCTTGGATCTATTTATTTGGCAAGAGGCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 128044 133 + 647215 TGTAACACAGCATCCACAAAAGAGGGAGAACTACTTTGGCCAGATCTTGCCCATTTCAGTAATGATGTGCACCCATCATGCCCCCATCACTGACATCTAAGGCCTTGGATGTATTAATATGGCAAGAAGCCTG + +a +s mr.mrrefChr0 124757 274 + 130230 AATGCTTACGGAGCGGTCCCCAGTAATTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAATGGGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTAACCCCTCCTTAGTTGGAATTGAAATCGAACAATATTATCTTAAGGACAACCTGGCTTCATACAATGTGGCAATCAGTAGCGGTTGCTTTGTTATTCTTTTGGTAATCTACAAGAATGTGTGCCGTTAACAGGCTGGAACGGGGACTCATGTAATACAGCTCCTTGTTTGGTGGATTACAGCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 129990 259 + 636262 AATGCTTACGGAGCGGTCCCCAGTAACTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAAT-GGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTAACCCCTCCTTAGTTGGAATTGAAATCGAACAATATTATCTTAAGGA--------------ACAATGTGGCAATCAGTAGCGGTTGCTTTGTTATTCTTTTGGTAATCTACAAGAATGTGTGCCGTTAACAGGCTGGAACGGGGACTCATGTAATACAGCTCCTTGTTTGGTGGATTACAGCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130311 259 + 636262 AATGCTTACGGAGCGGTCCCCAGTAATTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAAT-GGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTAACCCCTCCTTAGTTGGAATTGAAATCGAACAATATTATCTTAAGGA--------------ACAATGTGGCAATCAGTAGCGGTTGCTTTGTTATTCTTTTGGTAATCTACAAGAATGTGTGCCGTTAACAGGCTGGAACGGGGACTCATGTAATACAGCTCCTTGTTTGGTGGATTACAGCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 128177 247 + 647215 --------------------CAGTAATTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAATGGGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTGACCCCTCCTTCGTTGG----AACATCCAACAATATTATCTTAACAACAACCTGGCTTCATACAATCAGCCAATCAGCAGGGGTTTCTTTGCTATTCTTTTGATTAT---CAAGAATGTGTGCTGTTAACAGGTTGGAAGGGAGACTTATGTAATGCAGCTCCTTGGTCGGTGGATTACAGCTTA + +a +s mr.mrrefChr0 125031 62 + 130230 CCCTCTTGTTTAATTAATGAGGGGGCTTGAACCTCTTGCAGCTCCTTGTTTAGTGGTTCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130249 62 + 636262 CCCTCTTGTTTAATTAATGAGGGGGCTTGAACCTCTTGCAGCTCCTTGTTTAGTGGTTCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130570 62 + 636262 CCCTCTTGTTTAATTAGTGAGGGGGCTTGAACCTCTTGCAGCTCCTTGTTTAGTGGTTCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 128441 61 + 647215 CCCTCTTGTATAATTAATGAAAGGCCAAGGGTCCCATGCAGCTCCTTGTGTGGTGATTC-TA + +a +s mr.mrrefChr0 125093 52 + 130230 CCCCTTCAGTCCGATTGATGAGGGTGTGACCCTAATGTCTCTCAGACCGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130632 52 + 636262 CCCTTTCAGTCCGATTGATGAGGGTGTGACCCTAATGTCTCTCAGACCGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 128502 52 + 647215 CCCCTTCCATCCGGTTGATGAGGGTGTGACCCTAAAGTCCCTCAGTCTGATA + +a +s mr.mrrefChr0 125145 23 + 130230 CCACCCAAAACACATTACAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130684 23 + 636262 CCACCCAAAACACATTACAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 128556 23 + 647215 CTACCCAAAATACATCACAAAAT + +a +s mr.mrrefChr0 125168 447 + 130230 AGATTTTATGTAGACTTGAATATGTGACCAGGCTATACTACCTGTTTATCATTCTGTACCCCAAGCAAATCTTTCTTGGAAATTGAAATGATTCCCCCTGTGACCCATTAACAATGGTTGGCCTTCATCCATTCCTTGGGAATGCCCTGAGACCTACAGTCTGGGCTGTATGAGGTTTTGAAAAGGCAATTAGCTGTTATTGGAACAATACGCCAGGTGCGAGCACCAGCTGGTGGGAAACCACTCCTGTAGCCATTCTTACTGGACGAGCTCGATTTCCATCATCAGAAGCTAGCTGTGCACTCCAATACGATCTCTCACCAGATCTGTTTGGTCAGAGTTATATACTAGTATCTTTGAAAGATTTCTAGCACCACCTGTCTGGGGTGGTCATCGAATACAACTGTTTCCTGGTAGTTGGGCAGTTGATATCCAAGAACACCCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 130729 375 + 636262 AGATTTTATGTAGACTTGAATATGTGACGAGGCTAGACCACCTGTCTATCATGCCGTACCCCAAGCAAAT--------GAAAGTGAAATGATTCCCCCTGTGACCCATT-ACAATGGTTGGCCTTCATCCATTCTTTGGGAATGCCCTGAGACCTACAGCCTGGGCTGTACGAGGTTTTGAAAAGGCAATTAG-TGTTATTGGAACGATACACCAGGTGCGAGCACCAGCTGCTAGGAA--CACGACCGTAGCCATTCTCACTGGTCGAG------------------------------------------------------------TTGGTCAGAGTTATATACTAGTATCTCTGAAAGATTTCTAGCACCACCTGTCTGGGGTGGTCATCGAATACAACTGTTTCCTGGTAGTTGGGCAGTTGATATCCAAGAACACCCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 128579 447 + 647215 AGATTTCATGTAGACTTGGATATGTGACCAGGCTATACTACCTGTTTATCATTCTGTACTCAAAGCAAATCTTTCTTGGAGATTGAAATGATTCCCCCTGTGACCTATTAACAATGTTTGGCCTTCATCCATTACTTGGGAATGCCCTGAGACCCACAGTCCGGGCTGTATGAGGTTTAGAAAAGGTAATTAGCTATTATTGGAATAATACGCCAGATGTGACCACCAGCTGGAGGGGAACCACTCGTGTAGCCGTTCTTACTAGATGAGCTCGATTTCCATCATCAGAAGCTAGCTGTGCACTCCAATACGATCTCTCACCAGATCTGTTTGGTCAGGGTTATAGACTAGTATCTTTGAAAGATTTCTAGCACTATCTGTTTGGGGTGGTCATCCAATACTGCTGTTTGCTGGTAGTTGAGTAGTTAATACCCAGGAACACCTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 125615 14 + 130230 GTCAAAATTACCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131104 14 + 636262 GTCAAAATTACCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 129039 14 + 647215 GTCAAAATTACCTC + +a +s mr.mrrefChr0 125629 23 + 130230 CATTTGTTTGAGCCATTTAGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131119 23 + 636262 CATTTGTTTGAGCCATTTAGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 129053 23 + 647215 CCTTTGTTTGAGCCATTTAGCTA + +a +s mr.mrrefChr0 125652 42 + 130230 GCATAACAGAACAATCCTCAAGTACGTTTAGGTGGATCATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131142 42 + 636262 GCATAACAGAACAATCCTCAAGTACGTTTAGGTGGATCATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 129077 42 + 647215 GTGGAACAAAACAATCCTCAAGCATGTTGAGGTGGATCAGTG + +a +s mr.mrrefChr0 125694 104 + 130230 GTACCCATAGAAAGGAGGAATCCTGGGCTTACTACACTGGGAACACAGGGGTTAAAAAAAAAACCACACTTAGTTTACTTGTACTGCGCATAGGGTAACTGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131196 104 + 636262 GTACCCATAGAAAGGAGGAATCCTGGGCTTACTACACTGGGAACACAGGGGTTAAAAAAAAAACCACACTTAGTTTACTTGTACTGCGCATAGGGTAACTGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 129119 104 + 647215 GTACCCATAGAAAGGAGGGATCCTCAGCTTACTACAGTGGGAAGACAGGGGTTAAAAAAAACACCGCACTTGGTTGACATGTACTGTGCATAGGGTAACTGTGA + +a +s mr.mrrefChr0 125798 263 + 130230 CTTAGGAGACCTATTGTATAGAAAAACTCTACTGGAATTTGAGCAAGTACAAGAAAAAACATAGTATTGAGATTGCTAAGTAGAAGTTGTCCTGTTAGTCTTGTTAATAAAATGTCTAAAGAATCCCTCAGCCCCTGTTTGTGAATTGAAGGCTATGAACAGTGGTCTCAGCAAGGCATGTCATAATGATATTAACTACAATTTTTACACTATTCAGTATCTCATCATGATATGATACTAACACATGATGCTATGTATAGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131300 263 + 636262 CTTAGGAGACCTATTGTATAGAAAAACTCTACTGGAATTCGAGCAAGTACAAGGAAAAACATCGTATTGAAATTGCTAAGTAGAAGTTGTCCTGTTAGTCTTGTTAGTAAAATGTCTAATGAATCTCTCTGCCCCTGTTTGTGAATTGAAGGCTATGAACAGCGGTCTCAGCAAGGCATGTCATAATGATCTTAACTACAATTTGAACACTATCCAGTATCTCATCATGATATGATACTAACACGTGATGCTATGCATAGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 129232 257 + 647215 CTTATGAGAACTATTGTATAGAATAACACTACTGGCCTTTGAGCTAGTACAAGAAAAAACATAGTATTGAGGTTGCCAAGTAGAATTTGCACCACTAGGTTTGTCAATAAAATGTCCAAAGAGTCCGTAAGCACCT--TTGTGAATTGAAGGCAATGA----TGGTCTCAGCAAGGCATGTCATAATGATATTAACTACAATTTTTACTCTAATCAGTATCTGGTCATGATGTGAAACTAACACATGATGCTATATATAGAGC + +a +s mr.mrrefChr0 126061 48 + 130230 TCAAGATAATGCAAGCCTGCTTGGGACAATTCTAGCCTCTATATGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131580 48 + 636262 TCAATATAATGCAAGCCTGCTTGGGACAATTCTAGCCTCTATATGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 129489 30 + 647215 TAAAGATAATGCAAGCCTGCTTGGGACAGT------------------ + +a +s mr.mrrefChr0 126109 12 + 130230 CTCAATGCACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131695 12 + 636262 CTCAATGCACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 129519 6 + 647215 ------GCACTT + +a +s mr.mrrefChr0 126121 18 + 130230 ATGCAAAAAACTAACACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131707 18 + 636262 ATGCTAAAAACTGACACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 129526 18 + 647215 ATGCAAAAAACTAACACT + +a +s mr.mrrefChr0 126139 246 + 130230 GATACATCACACTTTGCTTCATGACCGTCCCAGGTTATAATTTTTGTCTGAGAACAACTGGTTATTTACCAGCACATTTATCCTGCAAGCTGGAGCTTCATTCATTGCTGCAACACCAACATGATCCAATATACCTTGTTGGGTGTTGAAGGAGCCTTTAGTGTTCAAGGATTTAAGTAGGATTAGACTGATATAAGCAGGGCTCAATCTGTGTGACAATGTCTTGGATTTATCAAATGATTAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131725 246 + 636262 GACACATAACACTTCGCTTCATGACCGTCCCAGGTTATAATTTTTGTCTGAGAACAGCCAGTTATTTACTAGCACATTTATCATGCAAGCTGGAGCTCCATTCATTGCTGCAACACCAACATGATCCAATATACCTTGTTGGGTGTTGAAGGAGCCTTTAGTGTTCAAGGATTTAAGTAGGATTAGACTGATATAAGCAGGGCTCAATCTGTGTGACAATGTCTTGGATTTATCAAATGATTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 129579 245 + 647215 GTTGCGTCACAGTTTGCTTCATGACCGTCCCAGATTATAATTTTTGTCTGAGAACAACTGGTTGTTTACCAG-ATGTTTATCCTGCAAGCTGGAGCGTCATTCATTTCCCCAACATCAAGAAGATCCAACATGTCTTGTTGACTGTTGAAGGAACCCTTAGGGTTTGAGGATTTACATAGAATGAGATTGATATAAGCAGGGTACAGTCTATGCAACAGTGTCTTGGATTCAGCAAATCATTTGTT + +a +s mr.mrrefChr0 126385 84 + 130230 TCACTTTTACTGTACACACATAACCCTGTAATGTCTAATCTGATGCTTATTATATCAGATTGTCCTGACCTAGGTATGTAGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 131971 84 + 636262 TCACTTTTACTGTACACACATAACCCTGTAATGTCTAATCTGATGCTTATTATATCAGATTGTCCTGACCTAGGTATGTAGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 129829 84 + 647215 TCACTTTTAATGCACACAAATAACACTATAAGGTCTAATCTGATGATTACTTCAACAGATTGCCCTTACCTAGGTATGTAATCA + +a +s mr.mrrefChr0 126469 14 + 130230 TCCAGCTCTAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132055 14 + 636262 TCCAGCTCTAGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 129915 14 + 647215 TCCAGCTCTAGTGT + +a +s mr.mrrefChr0 126483 47 + 130230 TTGTTCTAGTTAACATATTGCATTATCTTACCCATAAGGCCAACCGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132075 47 + 636262 TTGTTCTAGTTAACATATTGCATTATCTTACCCATAAGGCCAACCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 129929 47 + 647215 TTGCTCTAGTTGACATATTGCATTATCTTACCCACAAGTCCAACCAC + +a +s mr.mrrefChr0 126530 71 + 130230 AATACTGTCTCAATTATTTGCAAATAATTACAATGTTGTATTGGTTCACTCACAAGCACATTCTCATCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132177 71 + 636262 AATACTGTCTCAATTATTTGCAAATAATTACAATGTTGTATTGGTTCACTCACAAGCACATTCTCATCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 129976 71 + 647215 AATGTGGCCTCAAATATTTGCAAACAATTACTATGTTGTATTGGCTTGCTCGCAAATACATTTTTATCTCC + +a +s mr.mrrefChr0 126601 330 + 130230 AAGCAGAGAGAGGAGTTCAGAATTTTCCCTGCCACTCAGGAAGTTGAAATAGATGCAGGTACTTAGTTGGGTAGGACTTGTTTATCAGTATGCAATGTGCCCTTAGTAACAGCCAGCTAACACATGCATCTAGTGTTCAATTAATAGTTCTCCTATGCTCACTTCCCTCCCTACATGGAATGGTGGAGGGCCTTTATCTGGTGTGTACCAGTTCTCCGGTGTGCGGACCAGTTCTCTGGAGTTCATTTGCTCTTCCTGTCCAACGGATTCTGCAGATTGCATTGGCCCCTGTGATTCCAACTTATTGGTAGGTTAGCCTCCCCCAAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132273 317 + 636262 AAGCAGAGAGAGGAGTTCAGAATTTTCCCTGCTGCTCTGGAAGTTGAAATAGAAGCAGGTACTTAGTTGGGTAGGACATGTTTATCAGTATGCAATGGGCCCTTAGTAACAGCCAACTAACACATGCATCTAGTGTTCAATCAATAGTTCTCCTATGCTCACTTCCCTCCCTACATGGAATGGTGGAGGGCCCTTATCTGGTGTGTACCAGTTCTCCGGTGAACGGACCAGT-------------CTTGGTCTTCCTGTCCAACGGATTCTGCAGATCGGATTGGCCCCTGTGATTCCAGCTTATTGGTAGGTTAGCCTCCCCCAACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 130047 329 + 647215 AAGCAAAGAGAGGAGTTCAGAATTTTCCTTGCCACCCAGGAAGTTGAAATAGATGCATGTACTT-GTTGGGTAGGACTTGTTTATCAGTATGGAATGTGCCCTTAGTAACAGCCAGCTAACACATGCATCTAGTGTTCAATTTATAGTTCTCCTATGTTCACGTTACCCCCTATATGGAATGGTGTAGGACCTTTGTCTGTTGTGGACCAGTTCTCTGGGGTGCAGACCAGTTCTCTGGAGTTCATTTGCTCTTCCTGCCCAACGGATTCTACATATTGCATTGGCCCCTGTGATTCCAACCTATTGGTAAGTCAGCCTCCCCCTAATCA + +a +s mr.mrrefChr0 126931 136 + 130230 TGATATGCACCCCCATACCCCTTGATGAACAGGCCCACCCTTGTGAAAATACAGTTAGCCCAATGCTAAATGAAGGCTATTGCTAGACAAGAGCACATGGAACAAGACTAGGAAAAATGGAATCAAAATCAAGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132590 119 + 636262 TGATATTCACCCCCATACCCCTTGATGAACAGGCCCACCCTTGTGAAAATACAGTTAGCGCAATACTGAATGAAGGCTGTTGCTAGACAAGAGC-----------------GAAAAATGGAATCAAAATCAAGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 130377 136 + 647215 TGGTATGCGCCCCCAGACCCCTTGATGAACAGGCCCACTCTTGTGAAAATACAGTTAGCCCAATGGTAAATGAAGGCCAGTGCTAGACAAGAGCACATGGAACAAGACTAGGAAAAATGGGATCAAAATCCAGCGC + +a +s mr.mrrefChr0 127067 77 + 130230 AGTGAGGCCAAAGAAAGTGGATCTAAATCCTGGGGAAGTGTGCAAATGGGTGTGGTCCCTCTTGTTACTACCCTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132733 63 + 636262 AGTGAGGCCAAAGAAAGAGGATCTAAGTCCTGGGGGAGTGTGCCAATGGGTGTGGTCCCTCTT-------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 130513 77 + 647215 AGTGAGGCCAAAGAAAGTAGATCTAAATCCTGGGGAAGTGTGCAAATGGGTGTGTTCCCTCTTGTTACTACCCTTCA + +a +s mr.mrrefChr0 127144 33 + 130230 TCAACTCTAATGAACTAGGATGCATACCTTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132796 33 + 636262 TCAACTCTAACGAACTTGGGTGCATACCTTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 130595 28 + 647215 TCAACTCTAATAAACTAGGATGATGACC----- + +a +s mr.mrrefChr0 127177 39 + 130230 CTGCTTACTTGCTGACTTTGTTATTTATAAGAAGTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132836 39 + 636262 CTGCCTACTTGCTGACCTTGTTATTTATAAGAAGTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 130623 38 + 647215 -TGCTGACCTGCAGACTTTGTTACTAATAAGAGGTTTGA + +a +s mr.mrrefChr0 127216 208 + 130230 CTGGCCAGCTTTTCATTATCAGTTCCATTGTCCGAGAGAGATATTTTGGCTGGGATATGAATAGTGCAGTGGATGTCTTAGGTATAAGAAGACTTTTATTGGCCCACTGGCAAGTCGTCAAAATAGCAGGATCTTAGTGTATAAACTATCTTGATAACCTTATAATGGGCTTATTTGGCAGTTACAAGTCTTTCTAAATTTCACCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 132875 192 + 636262 CTGGCCAGCTTTTCATTATCAGTTCCATTGTCCGAGAGAGATATTTGTGATGGGATATGAATAGTGCAGTGGATGT-TTAGGTATAAGAAGACTCTTGTTGGCCCACTGGCAAGTCGTCAAA--------------GTGTATAAATTATCTTGATA-CCTTATAATGGGCTTATTTGGCAGTTACAAGTCTTTCTAAATTTCACCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 130662 208 + 647215 TTGGCCAGCTTTTCATTATCAGATCTATTGTCCAAGAGAGATATTTTGACTGGGATATGAATAGTGCAGTGGATGTCTTAGATATAAGAAGACTTTTATTGGCCCCCTGGCAAGTCATCAAAATAGCAGGATCTTAGTGTACAAACTATCTTGATAACCTTATATTGGACTTATTTGGCAGCTACAAGTCTTTCTAAATTTCACCCTA + +a +s mr.mrrefChr0 127424 78 + 130230 TCTCTAACTTTCATTTTTATAGCAGTATATCAAAGGTATACTTCCACTGTACACCTCCTTCATCAACAACAAGACACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133067 78 + 636262 TCTCTAACTCTCATTTGTCTAGCAGTATATCAAAGGTATACTTCCACTGTACAACTCCTTCATCAACAACAGGACACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 130871 78 + 647215 TCTCTAACTTTCCTTTTTATAACAGTATATCAAAGGTATACATCCACTGTACACCTCCTTCATCAACAGCAAGACGCT + +a +s mr.mrrefChr0 127502 247 + 130230 ATGAATACTTCTCTTGGTCCTAACTAACCAGGCTAATATACTCTGGGTCCTAACCAGCCAGGCTCTATCTTTGAGTGTCATGGGCATGAGGTTTCCCTTAATTGAAAGATTGATTAACAGAGTATCAGAATAGGTTCATGACTCCATACAATTTTAATCTTAGTCAAGGCCATGCCTTAGTAATCTGTATTTGCCCATAAGCTTTGTTAACCTACCTAGCAGTACTTAGGAATGGGAAAAACCTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133238 226 + 636262 ATGAATACTTCTCTTGGCCCTAGCTAACCAGGCTAATATACTCTGGGTCCTAACCAGCCAGGCTCTATCTTTGAGTGTCATGGGCATGAGATTTCCCTTAATTCAAAGATTGCTTAACAGAGTATCAGAATATGCTCATGACTCCATACAATTTTAATCTTAGTCAAGGCAATGCCTTAGTAAT---------------------GTTAACCTACTTATCAATACTTAGGAACGGGAAGAACCTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 130949 247 + 647215 ATGAATACTTCTCTTGGTCCTAACTGACCAGGCTAATATACTCTGGGTCCTAACCAGCTCAGCTCTATTCTTGAGTGTCATGGGCATGTGGTTTCCCTTAATTGAAAGATTGATTAACAGAGTGTCGGAATAGGTTCATGACTCCATACAACTCTAATCTTAGTTAAGGCCATGTCTTAGTAATCTGTATTTGCCCATAAGCTTTGTTGAGCTACCTAGTAGTACTTAGGAATGGGAAAAATGATAA + +a +s mr.mrrefChr0 127749 11 + 130230 GGAACTCTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133464 11 + 636262 AGAACTCCTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 131199 11 + 647215 GTAATTCTCGG + +a +s mr.mrrefChr0 127760 126 + 130230 TGATAATTGGTAATTCTCAAACTGTACATTTTAGATCCACTTGGGATAAATTATTCATGTCACCAGATTAGTAATGTTTTTTTGGTCTGGCACTCAGGACACGTCAGGCATAATATCTGGAGTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133475 126 + 636262 TGATTATTGGTAATCCTCAAACTGTACATTTTGGATCCACTTGGGATAAATTATTCATGTCACCAGATTAGTAATGTTTTTTTGGTCTGGCACTCAGGACATGTCAGGCATAATATCTGGAGTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 131216 125 + 647215 TGATAATTTGTAATTCTCAGACTGTACATTTTAAATACACTCTGGACAAATTCTTCATGG-ATCAGATTAGTGATGTTTTTTTGGTCTGGCACTCAGGACACTTCAGGTATAATATCTGGAGCCTT + +a +s mr.mrrefChr0 127886 338 + 130230 GATATGCATAAGAGTAACCAGCATCGGAGTACTAAGTGGGTTTTTTAGGAGACACTATACATGGTCAAGAGAGAAGGCTATTACAGACTGTGGCTTTGCATGAACCTGTCAACAGCTTAACTATCAATCAGTTCCTACCAGTGCTCACAACTGTCAAATTCTTACTGGATAATGGCCATCATATAAGAGAGCATATAGCCCAAATGTTTTAAAACTTTCTTATTCACACCATGGACATTGAACATTAGATGATAAATGGGAATACAATCTTGTATACTTCAGCAACCAGATATAAATCTCTGCCCAATACATCATGCTAAATTAAGCACTGCAAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133613 334 + 636262 GATATGCATAAGAGTAGCCAGCATCGGAGTACTAAGTGGGTTTTTTAGGAGACACTATACATGGTCAAGAGATA----TATTATAGACTGTAGCTTTACATGAACCTGTCAACAGCTTAACTATCAATTAGTTACTACCAGTGCTCACAACTGTCAAATTCTTACTGGATAATGGCCATCATATGAGAGAGCATATAGCCAAAATGTTTTAAAACTTTCTTATTCACACCATGGACCTTGGACATTAGATGATAAATGGGTATACAATCTTGTATAATTCAGCAACTAGATATGAATCTCTGCCCAATACATCAAGCTAAATTTAGCACTGCAAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 131341 336 + 647215 GATATGCATTTGAGAAATC--CGTTGGAGTACCAAGTTGGATTTTTAGGAGACACTATACAGGGTCAAGAGAGAAGGCTATTTCAGACTGTGGCTTTGCATGAACCTGTCAACAGCTTAACAATCAATCAGTTCCTACCAGTGCTCACAACTGTCAAATTCTTACTGGATAATGGCCATCATATAAGAGTGCATGTAGCCCAAATGTTTTAAAACTTTCCCATTCACACCATGGCCATTGAACATTAGATGATAAATGGGAATACAATCTTGTGTACTTCAGCAACCAGAAATAAATCTCTGCCTGATACGTCATGCTAAATTAAGCAAAGCAAACTT + +a +s mr.mrrefChr0 128224 450 + 130230 TTATTTTAGGCAGCACTGTACCGAGGAAAGAGGATAGTCCTTGCTCACAGGTGATGCTTGGGGAAGCATAACAATGCACAACATTGAAAAGCATCCACCCATAGCATAGACGCATTAACATTATGCTAACGCCAACAATTGTGGGAACAAGACCCCCTAGGGAGTCACTCTTCAATTACGAGGAGTCTACGTTCCGTGTCTTTTCCAATGGACTGCACATGTGTAGGCATCCTTGGGGTTGGTGCACACCAAGGACTTCATGAAACCCTTAATACCTGGTTCTAAAAAGTGGATTAATGGTGAGTAGAAACAAATGTTCTTGTCTGTTGGCCATAATACATGGTGCAAGTCTCTATGTCCAAAAATGATGCCTAACAGTAAATGTGCCTTTATCACGTGGTTATTTACAACCTGGTTATTTACAGATGTTATTACAAAGTATATATTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 133947 450 + 636262 TTATTTTAGGCAGCTCTGTACCGAGGAAAGAGGATAGTCCCTGCTCACAGGTGATGCTTGGGGAAGCATAACAATGTACAACATTGAAAAGCATCCACCCATAGCATAGACACATTAACATTATGCTAATGCCAACAATTATGGGAACAAGACCCTCTAGGGAGTCACTCTTCAATCATGAGGAGTCTACGTTCCGTGTCTTTTCCAATGGACTGCACATGTGTAGGCATCCTTGGGGTTGGTGCACACCAAGGACTTCATGAAACCCTTAATACCTGGTTCTAAAAAGTGGATTAATGGTGAACAGAAACAAATGTGCTTGTCTGTTGGCCATAACACATGGTGCAAGTTTCTATGTCCAAAAATGATGCCTAACAGTAAATGTGCCCTTATCACGTGGTTATTTACAACCTGGTTATTACCAGATTGTATTACAAGGTATATATTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 131682 434 + 647215 TTATTTTAGGCAGCACTGTACCGCGGAGAGAGGATTGGCCTTGGTCACACATGATGCTT---------CACCACTGCACAACATTGAAAAGCGTCCACCCACAGCATAGAAGCATTAAC-TTATGCTAACGCCAACAATTGTGGGAGCAAGACCCCCTAGGGAGTCAATCTTTAATTACCAGGAGTCCATATTCCATGTCTTTTCCAATGGCCTGCACATGTGTAGGCATCCTTGGGGTTTATGCACACCAAGGACTTTATGAAACCCTAAATACCTGGTTTTAAACAGTGGATTAATGGTGAGTAGAAACAAATGTTCTTGTCTGGTGGCCATAATACATGGTGCAACTCTCTATGTCCTAAAATGATGCTTAACAGTAAATGTGCCTTTCTCACATCGTTACTTACAACCTAGCTATTTACAAATGTTATTCCAAAGTATAT------ + +a +s mr.mrrefChr0 128674 497 + 130230 CTATGGATGATAAAATAGCTTTGTAGGACTTTTTTTGGTCCACATGAAAAGGGTCATAATCTGGTCATCCATCCATATCCATTACAGAATACAGGATATTCTATCTCTTGTAGTCCTATTTACTGAAATATACCACTTAGACAAAATAGTGTACAAATGGAGTGAATACATGGTATACCAATGTGAGGGATGTACATGTGTTCATATGCATGGATTCTGGCTAATGTACTTCCAAAAAGTATAAAAATTAATTACACCAATTTAACCATGGTCATACAGTTCATATAGTTATAGACCAAGTCTGAGGACGCTCAAGTTGTACGAATTCCAGTATGATTTCCCCTCGACAAACCAAAACTGTCTGCACTTCCAAAGTGGGGTGGAACAAGAACTAGGTGTTCTATCTCTACATCACCACATATCCAAGCTTATGTCAGTCTAACTAAATCATGATTCTCTGCTTTTGTCTCCCTTCTAATAGCCTGACACGCTTTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 134397 491 + 636262 CTATGGATGATAAAATAGCTTTGTAGGACTTTTTCTGGTCCACATGAAAAGGGTCATAATCTGGTCATCCATCTATATCCTTTACAGAATACAGGATACTCTATCTCATGTAGTCCTATTTACTGAAA-ATACCACTTAGACAAAAGAGTATACAAATAGACTGAATACATGGTATACCAATGTGGGGGATGCACATGTGTTCATATGCATGGATTCTGGTCAATGTACTTCCAAAAAGTATAAAAATTGATTACACCAATTTAACCATAGTCATACAGTTCATATAGTTATAGACCAAGTCTAAGGACGCTC--GTTGTACGAATTCCAGTATGACTTCCCCTTGACAAACCAAAATTGTCTGCACTTCCAAAGTGGGGTGGAACTAGG---AGGTGTTCCATCTCTACATCAGCACATATCCAAGCTTATGTCAGTCTAACTAAATCATAATTCTCTGCTATTATCTCCCTTCTAATAACATGACACACTTTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 513099 486 - 647215 TTAAGGATGATAAAACGGCTTTGTAGGACTTTTTTTAGTCCACATGAAAAGGGTCATAATCTGGTCATCCATCCATATCCACTACAGAATACAGGATATTCTATCTTTTGTAGTCCTATTTACTGAAATATACCTCTTAGAAAAAATAGCGTACAAATGGAGTGAATACATGGTATACCAATGTGATGGAGGTACATGTGGACATATGCATGGATTCTGGCTAATGTACTTCCAAAAGGTATAAAAAGTAATT-TGCTAATTTAATCATGGTCGCTCAGGTTATATGGCTATAGACCAAGTCTGAGCAGGATCAAGTTGTACCGATTCCACTTTGATTTCCCCTCCACAAA-CAAAACAGTCTGGAATTCCACAGTGGGGTGGACCAAGAACTAGGTGTTCTATCTCTACATCACCACATCTCCAAGCTTATGACAGTCTAACTATATCATG---------TTTTGTCCCTCTCCTAACAGCCTGACAAGCTTTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 129171 9 + 130230 TTGAACAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 513591 9 - 647215 TTGAACAAG + +a +s mr.mrrefChr0 129180 38 + 130230 TTACTACTTTAATTTGGCAGGGGACTGGTGCATGGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 513603 38 - 647215 TTACTACTTTAATTTGGCAGGGGACTGGTGCATGGGGT + +a +s mr.mrrefChr0 129218 21 + 130230 ATGAGGGCTAGGATCTTTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 134888 20 + 636262 -TGAGGGCTAGGATATTTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 513642 21 - 647215 ATAAGGGCTAGGAGCTTTGGG + +a +s mr.mrrefChr0 129239 359 + 130230 CTGAACAATTGATCTCCTATAGTACATCCTAAACTCACTCCCAGGCATAGTAAGCAACTATATCTGGCAAGGCCTTCTGCCATTTTCTACTGTGTTCTTTAATTAGACCTGAAGTTTTCTGAGGATCTGTCACATTTGGCTTGGCTGAATTCTCAGGTTCTCAAGTTGAAATTGTTCTGATTAATTTTCACTCTTCTTATGGTAACCCTCAATACATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTACATACATGCATGGCTGGGGGTCTACCTTTATGCATCACACTGGGTGGGCTGATTGGGTTTTGCTGTAGAAGGGGCCCAGGATAGTTGGGAATGTTATGATCACTTTGTCCTTGTTAGAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 134910 359 + 636262 CTGAACAATTGAACCCCTATAGTACATCCTAAACTCACTCCTAGGCATAGTCAGCAACTATATCTGGCAAAGCCTTCTGCCATTTTCTACTGTGTTCTCTAATTAGACCTGAAGTTTTCTGAGGATCTGTCACATTTGGCTTGGCTGAATTCTCAGGTTCTCAAGTTGAAATTGTTCTGATGAATTTTTACTCTTATTATGGTAACCCTCAATGCATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTCCATACATGCATGGGTGGAGGTCTACCTCTATGCTTCACACTGAGTGGGCTGATTGGGTTTTGCTGTAGAAGGGGCCCAGGATAGTTGGGAATGTTATGAGCACTTTGTCCTTGTTAGAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 513663 359 - 647215 CTGAACAGTTGATCTCCTATAGTACCTCCTAAGCTTACTCCCAGGCATAGTAAGCAACTATATCTGGCTAGCCCTTCCGCCATGATCTAATGTGTTCTTTTAATAGACCTGAAGTGTTCTGAGGATCTGTCATGTTTGGCTTGGCTGAATTGTTAGTTTCTCAGGTTGAGATTGTTCTGACTAATTCTCACCCCTCTTATGGTAACCCTCAGCACATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTACATACATGCATGGCTGAGGGTCTGCTTTTATGCATCACACTGGATGAGCTAATTGGCTTTTGCTGTAGAAGTGACCCAGGATAGTTGGGAAAATAATCATCACTTTGTCTCTGTTACAAAG + +a +s mr.mrrefChr0 129598 125 + 130230 CCTTCTCAGGCTCTGACAATCAGGCATAACACAGCTAGTTAATCAATCCTTGATGTGCTCAGCTGTGAATGGGAGTGGGATCTTGAAGGAAGTTGGTTAATAAAAAGTATATCAACTCAATTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135275 125 + 636262 CCGTCTCAGGCTCTAACAATCAGGCATAACACAGCTAGTTAATCAATCCTTGATGTGCTCAGGCGTGAACGGGAGTGGGATCTTGAGGGAAGTTGGTTAATAGAAAGTATGTCAACTCAGTTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 514022 125 - 647215 ACTTCTCAGTCTCTGACACTTGGGCATAACTCAGCTAGTTAATCAATCCTTGATATGCTCTGCTGTTAATGGGAGGGGGATCTTGAAGGAAGTTAGTTAATAAAGAGTAAATCAACTGAATTAAT + +a +s mr.mrrefChr0 129723 87 + 130230 GTGCCAAAATAATGTTTGCTTGTCTATAGCACAAATACAACGGAAAAGTAACAGAATGTATAAAGCACCCTGCAAGATTTAAAAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135400 87 + 636262 GTGCCAAAATAATGTTTGCTTGTCTATAGCACAAATACAATGGAAAAGTGACAGAATGGATAAAGCACGCTGCAATCTTTAAAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 514150 87 - 647215 GTACCAAGATAATGTTCCCTTGTTTGTAGCATGAATACATCTGAAAAGTAACAGTATGTATAAATCACCCTGTGAGATTTAAATGCG + +a +s mr.mrrefChr0 129810 62 + 130230 GGGGTTTTGACATTAGATGTACGCACCCTGCAATCACCCTGGGGTGTTGTTATATATATCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135487 62 + 636262 TGGGTTTTGACATTAGATGTACGCACCTTGCAATCACCCTGGGGTGTTGTTATATATATGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 514253 62 - 647215 GGCGTTTCGAAATTAGATGTACGCACCCTGCAATCACCCCGGGGTGTTGTTATATATATCTC + +a +s mr.mrrefChr0 129872 104 + 130230 AGGATGTCTCAACCTGCTCACATCTCTCAACTTGGGGTCTAAGGGCCTGTCTTCATATAAATAACTAGGACTACTTAATTTGAACAAATGAAAAACAGACAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135550 102 + 636262 AGGATATCTCAACCTGCTCACATCTCTCAACTTGGGGTCCAAGGGCCCA--TTCATATAAATAGCTAGGACTACCCAATTTGAATAAACAAAAAACAGACAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 514315 104 - 647215 AGGATGTCTCAACCTGCTCACATCTCTCACCTTGGGGTCTAAGGGTCTGTCTTCATATAAATAACTAGGATTACTTGATTTGAACAAATGAAAAACAGACAGAT + +a +s mr.mrrefChr0 129976 105 + 130230 GGATAATTTTCTAGAGGGTAACAACCATCTGCCATACAATTAGCATTCTCCTAACGTAGGAGGGACAGGAGAAAGTGTAGGCCTACAGATTTTCAGTACAGGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135652 105 + 636262 GGATAATTTGTTAGAGGGTTACAACCATCTGCCATATAATTAGCATTCTCCTAACGTACAAGGGACGGGAAAAAGTGTAGACCTACAGATTTTCAGCACAGGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 514426 105 - 647215 GGATAACTTTCTAGAGGGTAACAACCAACTGCCATACAATCAGCACTCTCCTAATGTAGGACAGACAGGGGAGAGTGTAGGCCTACAGATTTCCAGTACAGGGGG + +a +s mr.mrrefChr0 130081 11 + 130230 CATTCTTATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135757 11 + 636262 CATTCTTATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 514535 11 - 647215 CATTCTTATAA + +a +s mr.mrrefChr0 130092 80 + 130230 TCCCACTCTTTGGTTTCTCAGGAGTTGCCTCTTGGGCTAGGTTAGGTGAAACCTTTAAGGTCAGCTAGCCTGTTCAGGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135771 80 + 636262 TCCCACTCTTTGGTTTCTCAGGAGTTGCCTCTTGGGCTAGGTTAGGTGAAACCTTTAAGGTCAGCTAGCCTGTTCAGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 514546 80 - 647215 TCCCACTCTTGGGCGCCTCATGAGTTGCCTCTGGAGCTGGATTTGGTGAGACCTTTTAGGTCACCTAGCGTGTTCAGGGC + +a +s mr.mrrefChr0 130172 50 + 130230 ATGAGGAGTAGACGAAAGTGCCACTAGTGAAAAGTACCTACATAATTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135851 50 + 636262 ATGAGGAGTAGACGAAAGTGCCACTAGTGAAAAGTACCTACATAATTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 514627 50 - 647215 ATGAGCAGCAGATGGAAGCGCGACAGGTGAAAAGTATATACATAATTGTG + +a +s mr.mrrefChr0 130222 8 + 130230 ACATCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 135902 8 + 636262 ACATCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 514677 8 - 647215 GCATCTCA + +a +s mr.mrrefChr1 0 107 + 670 TACTATGTGTCCATGGAGTTATGACAGGTTTGAGTCTCCAAACACCAGGAATCTGTTTGATCCTGAGGGTTTGTAATTTTCTATTCCAAGCCACCATCCAAAAGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635573 82 + 636262 TACTATGTGTCCATGGAGTTATGACAGGTTTGAGTCTCCAAACACCAGGAATCTGTTTGATCCTGAGGGTTTGTAA-------------------------AAGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 613 107 - 647215 TACTACATGGCCATGGAGTTTTACTGGGTTTGAGTCTCCAGGCGCCAGAAACCTGTTCGATCCTGAGGTTTTGTAATTTTCTATTCCAAGCCACCATCCAAAAGGGA + +a +s mr.mrrefChr1 107 22 + 670 TATCTGTACTAGATGCCTCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635659 22 + 636262 TGTCTCTACTAGTTGCCTCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 720 22 - 647215 TATCTGTACTAGATGCCTCATC + +a +s mr.mrrefChr1 129 44 + 670 CAGGAGGTTATCTGTGCTTGATACCTGCCATTAGTGTGAAATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635684 44 + 636262 CAGCAGATTATCTGTGCTTGATACCTGCCATTAGTGTGAAATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 742 44 - 647215 CAGGAGGTTACGTATGCTTCATATCTGCCAGTAGTGTGAAATGG + +a +s mr.mrrefChr1 173 218 + 670 CTATTCTTACTGCGACCCACTTGAGTAGTATTGATGTGATCTAGTGGCCATCCTGATAACAGACGAGATGCCAAGGATTAGAAGCGAAAAATTTAAAACTAATTTGAACACAAGATGAGAACCTATAAGTTGGCCAAAGACAGTGAGAAATACCCTGAACCAACCTAGGTGCCAACAATCTCTACAGTTCAGTGCCTGAGATTCAAGAGAGGCCCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635728 215 + 636262 CTATTCTTACTGTAACCCAATTGAGTAGT---TATGTGATGTAGTGGCCATCCTGATAACAGACGAGATGCCATGGATTAAAAGTGAAAAATTTAAAACTTATCTGAACACAAGATGAGAACCTATAAGTTGGCCAAAGACAGTGAGAAATACCCTGAACCAACCTAGGTGTCAACAATTTCTACAGTTCGGTGCCTAAGATCCAAGAGAGGCCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 787 218 - 647215 CTATTCTTACTGCGACCCACTTGAGTAGTATTGATGTGCTCTATTAGCCATCCTGATAACAGACAAGATGCCAAGGGTTAGAAGCAAAAAATTTAGAACTAATTTGAATACAAGACGAGAACCTATAAGTTGGCCAAAGACAGTGAGAAATGCCCTGCACCAACCTAGGCGCCAACAATCTCTACAGTTTAGTGCCTGAGGTTCACAAGTGGCACAGA + +a +s mr.mrrefChr1 391 101 + 670 CTCTTTTGACCCCTTTGCTAGCTGTAACTACGATATTATGACATTTGGCAGTATGACCCTCACACTGAGACTTTAGAACTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 635943 101 + 636262 CCGTTTTGACCCCTTTGCTAGCTGTAACTACGATATTGTGATGTTTGGCAGTATCACCCTCACACTGAGACTTTAGATCTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 1007 101 - 647215 CTCTCTTGACCCCTTTGCTAGCAGTAAATACAATACTATGACATTTGGCAGTATGACCCTCACACTGAGACTTTAGAACTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA + +a +s mr.mrrefChr1 492 62 + 670 ATGAACCACTCAAGAACATTATGAGCCTTATAGGGACAACATATTATTAACCTCATGGAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 636055 62 + 636262 ATGAACCACTCAAGAACATTATGAGCGTTATAGGGACAACATATTATTAACCTCATGGAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 647041 62 + 647215 CAGTACCACTCAAGAACATTATGAGCCTTATAAGGACAACACATTGTTAGCCTCATGGAGAC + +a +s mr.mrrefChr1 554 116 + 670 ATTGCCAAAGATGTATTAAATACTGTTATCCCATGTTATATTCACAAACAACTCTCATCCCAACAAATGCTTTGTACACATTAAGACTCACAAATTGAAGACACTGTTGTGAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 636146 116 + 636262 ATTGCCAAAGATATATTGAATACTGTTATCCCATGTTATATTCACAAACAACTCTCATCCCAACGAATGCTTTGCACACATTAAGACTCACAAATTGAAGACACTGTTGTGAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 647103 112 + 647215 ATTGCCAAAGATGTATTAAATACTGTTATCCCATGTTATATTCACAAACAAC-CTCATCCCAACAAATGCTTTGTACACATTAAGACTTACA---TAAAGACATTGTTGTGAGAAT + +a +s mr.mrrefChr2 0 16 + 16 CCTATAGTATAGGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 370394 16 - 647215 CCTATAGTATAGGGTG + +a +s mr.mrrefChr3 0 202 + 181019 ACTGTCCTTATACAGCTTTTTGTGTCTATCCTGGTGAAAAAATTAAGCTGATTGGAGCTCTAGTGGCGTAAAAGAAATCAGAATGGGAATCATACATACAAGGGGGCTTGGTTTCACTCCCTGCAACTACTTTAGATACAGCTAAGAAGGAAAGATAGGACTTGAGGGCTAGGATGCTCCACACTGTTGTGTTTTAACCTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 441679 201 + 636262 ACTGTCCTTATACAGCTTTTTGTGTCTATCCTGGTGAAAAAATTAAGCTGATTGGAGCTCTAGTGGCGTAAAAGAAATCAGAATGGGAATCATACATACAGGGGGGCTTGGTTGCACTCCCCGCAACTACTTTAGA-AAATTTAAGAAGGAAAGATAGGACTTGAGGGCTAGGATGCTCCACACTGTTGTGTTTTAACCTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 453762 202 + 647215 GCTGTCCCTATACAGCTTTTTTTGTTTATCCTGTTTAAAAAATTAAACTGGTTGGAGCTTTAGTGGCATCCAGGAAACCAGAATGGGAGTCATACATACAAGGGGGCTTGGGCTCACTGCCTGCAACTACTTTAGATACAGCTAAGAAGGAAAGATAGGACTGGAGGGCTAGCATGCTCAACACTTTTGTGTTTTAACCTGC + +a +s mr.mrrefChr3 202 47 + 181019 AACACCCAATCCATCACCTACCTCACCTTATCAATACGTTTTACTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 441880 47 + 636262 AACACCCAATCCATCACCTACCTCACCTTATCAATACGTTTTACTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 453965 47 + 647215 AACACCCAATCCATCACCTCCCTCACCTTGTCGATTTGTTTTACTGT + +a +s mr.mrrefChr3 249 74 + 181019 CTGGTAGGAGTGCACACTTTTTGCCTTATTTGACAGGACACTGACTTTTTCTCTTTGTTGTCAGTAATGTTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 441929 74 + 636262 CCGGTAGGAGTGCACACTTTTTGCCGCATTTGACAGGACACTGACTTTTTCTCTTTGTTGTCAGTAATGTTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 454012 74 + 647215 CTGGTAGGAGAGCACACTCTTTCCCTTATTTAACAGGACACTGACTTTTTCTATATGTTGTCAGTAATATTGCG + +a +s mr.mrrefChr3 323 151 + 181019 CCTCTCTGTTACTTCTCATCGAGTTTTGTTTGAAGCTACTCCTTTCGAACAGTCTTTAATTGTCCAAACTGAATGAAACAAAGCATAAACATACGTTATATTCATGGCTGCTGGTCATCTAATTACAGAGAGTGATAAGGTAGATAACTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442003 151 + 636262 CCTCTCTGTTACTTCTCATCGAGTTTTGTTTGAAGCTACTCCTTTCGAACAGTCTTTAATTGTCCAAACTGAATGAAACAAAGCATAAACATACGTTATGTTCATGGCTGCTGGTCATCTAATTACAGAGAGTGATAAGCGAGATAACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 454087 146 + 647215 TCTCTCTGTTACTGCTCATTGAGTTTTGGTTGAAACTACTCTTTGTGAACAGTCTTTAATTATCCAAACGAAATGAGACAAAACATACACATACCTTATATTCAT-----CTGGTCATCTAATTACCAAAAGAGATAAGGTAGATAACTCA + +a +s mr.mrrefChr3 474 303 + 181019 CCTTCCCTATATTTCCATCCTAGTGGCATAGTAGCTTTCGTGGAGCCATCTGCTGGGGGCCCAGGACTCAGTTGCAGCAGCTTAAGAAATCTCAACAACCTTAGACCCCCTAGCCTTAAATAGTGTATAAAGTGATGCTTGTTTCCAGAAATAACTTAGAACAACAAGGGTGATTAACATTACTCATGTTAGGTTCTGTTGGGTACTATACTGGGAAGAATGCATATAGTCAGTACATTCATACGCTGAATACCTGGGCAGGAAAGGATCCATCTTGGAAGAAGATCTGCCTTAAAGAACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442164 274 + 636262 CCTTCCCTATATTTCCATCCTAGTGGCACAGTAGCTTTTGTGGAGCCATCTGCTGGGGGCCCAGGACTCAGTTGCAGCAGCT----AAATCTCAACAACC-TAGACCCCCTAGCCTTAGATAGTGTATAAAGTGATGCTTGTTTCCAAAAATAACTTAGAACAACAAGGGTGATTAACATTACTCATGTTAGGTTCTGTTGGGTACTATACTGGGTAGAGTGCATATAGTCAGTACATTCATACGCTGAAAACCTGGGCAGGAAAGGATCCATCTTGAA------------------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 454233 303 + 647215 CCTTCCCTATATTTCCATCCTAATGGCATAGTAGCCTTCATAGAGCCATCTGCTGGGGGCCAAGGACTCAGTTGCAGCAGCTTAAGAAATCTCCACAACCTTAGACTCCCAAGCCTTAAATAGTGTATCAAGTGATGTATGCATCCAGAAATAACTTAGAACAATAAGGGTGATTAACATTACTCATGGAAGGTACTGTTGGGTACTATACTGGGAAGAATGCATATAGTCAGTACATTGATGTCATGAATACCTGGACAGGATGGGATCCATCTTTGAAGAAGATCTGCCTTAAAGAACAGG + +a +s mr.mrrefChr3 777 123 + 181019 ATCGTTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442438 119 + 636262 ----TTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 454537 123 + 647215 ATCGTTGTGATAAGGACCTGTAGTGTACCCACAGCACAGCATTAAAAGTCAGAGGTTAATGGGGTTGATAATTTTTTCTGTGGTGTGGGGCAGTTTTATAATACAGTTAGTGAGCCGCAGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 900 63 + 181019 AATAAAAGGATCACACATTAATGTTGCACCAATGGCACCAACCAGTGATACAGATCCAGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442559 63 + 636262 AATAAAAGGATCACACATTAATGTTGCACCAATGGCACCAACCAGTGATACAGATCCAGCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 454660 63 + 647215 AATAAAAAGATTGCACATTAATGTTGCACCAACGGCACCGGCCAGGGATACAGATCCAGCATG + +a +s mr.mrrefChr3 963 27 + 181019 GTTCAACTCTCTATTACACATCAAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442625 27 + 636262 GTTCAACTCTCTATTACACATCAAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 454723 27 + 647215 GTTCATCTCTCTATTACACATCAAACC + +a +s mr.mrrefChr3 990 19 + 181019 CAGTAATGAAAGAGTCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442654 19 + 636262 CAGTAATGAAAGAGTCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 454750 19 + 647215 CATTAATAAAAGAGGCTCA + +a +s mr.mrrefChr3 1009 156 + 181019 TTTACAGTGTGAGAGATGCATTAGCATAGCATAACTCATAAGGATGGATGGTCATTTCTGTCTGATATGGGCTTGTAACATCCTACTATATAGGGCTGACTAAAGTCAATATTACAATGTGTAGGTAGTACAAAAACTGATTCTCAATTACTTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442674 156 + 636262 TTTACAGTGTGAGAGATGCATTTGCATAGCATAACTCATAAGGATGGATCGTCTTTTCTGTCCAATATGGGCTTGTAACATCCTACTATATAGGGCTAGCTAAAGTCAATATTATAATGTGTAGGTAGTACAAAGACTGATTCTCAATTACTTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 454769 155 + 647215 TTTATGGTGTGAGAGATGTATTAGCATAGCATAACACATAGGGATGG-TGGTCATTTTTGTCTGATATGGCCGTGTACCATCCTACTATATAGGGCTGATTACAGTCAACATTACAATGTGCAGGTAGTACAAAAACTGATTCTCAATTACTTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 1165 491 + 181019 GCTTCTTACAAGGGGTGCCTTGCGGCACCCTGGGTAGAGACCCATACACATATACACCACGGAAACCATGGTCGACCAAATGATCTTAATAAGACTGGCAAATGTTTCTTCAAAGGGCTAAATAGGCAGCCTACTATAACAGCTAAGGGGCTCACGCATTAATCAGTATCCATGTGCTGTATGCACATAGAATTCTTACTTAAGGAAGGATATGATAGCTTAGTTTGAATGCAATAGCCTCACATGATCAAATTGTACTTTCAAGTGAGGTTCCACAGCAATAAAATGGAGTAGACTGACCTTTGGAAAGACACTTTACACTCCGTCAGGTCAATATTGTCTTAAGTTACATCTCAGGACAGCCCTTTTCCCACTCAAGCCGGAGTTATAACTACACTCAGCAGACCAGCAAAACCAGAAGCCATTAGTATCAATACACCAACGCGGCGGGAAAGTACATGGGCTTGCGGGTGCTCCGCCGCCACGTTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442830 468 + 636262 GCTTCTTACAAGGGGTGCCTTG-------CTGGGTAGAGGCCCACACACATATACCCCACGGAAACCATGACCGTCCAAATGACCTTAATAAGACTGGCAAATGTTTCTTCAAAGGGCAAAATAGGCAGCCTACTATAACAGC-AAGGGGCTCACGCATTAATCAGTATCCATGTGCTGTATGCACATAGAATTCTTACTTAAGGAAGGATATGATAGCTTAGTTTGGATGCAATAGCCTCACATGATCAAATCGTACTTTCAGGTGAGGTTCCACAGCAATAAAATGGAGTAGACTGACCTTTGGAAAGTCACTTTACACTCTGTCAGGTCAATACTGTCTTAAGTAACATCTCAG--CAGCCCTTTTCCCACTCAAGCCAGAGTTATAACCACACT---TGGACCATGAAAA-------CCATTAGTATCAACACACCAACGCGGCGGTAAAGTGCATG---TTGCGGGTGCTCCGCCTCCACGTTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 454925 480 + 647215 AATTTTTAGAAGGGGTCCCTTGCGGCACCCTGGTAAGAGACCCATATATATATACACCACGGATAGCAAGGTGGACCAAATGATCTTAATAATACTAGCAAATGT-----------GCTAAATGGGCAGCCTACTATAACAGCTAAGGGGCTCATCCTTCAATCAGTATCCAAGTGCTGTATGCACATAGAACTCTTACTTAAGGAAAGATATGCTAGCTTAGTGTGAATGCAATAGCCTCACATGAACAAATTGTACTTTCAAGTGAGGTTCCACGGCTATAAAATGGAGTAGACTGACCTCTGGAAAGAAACTCTACACTCCGGCAGGTCAATATTGTCTTAAGCTACATCTCAGGACAGCCCCATTCCCACTCAAGCCGGAGTTATAACTACACTCAGCAGGCCAGCAAAACCAGAAGCCATGAGTATCAATCCACCAACGCGGCGGGAAAGTACATGGGCTTGTGGGTGCTCCGCCGCCACGTTTTC + +a +s mr.mrrefChr3 1656 79 + 181019 GCCGGTCGTGATGCTCGCGTTCATGTCCGCAGGACCCGCCCGGGGCCCTACTCCCTTGACCAACGATATCTCGTCGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443298 79 + 636262 GCCTGTCGTGATGCTCGCGTTCATGTCCGCAGGACCCGCCCGGGGCTCTACTCCCTTGACCAACGATATCTCGTCGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 455475 73 + 647215 GCCGGTCGTGATGGTCGTGTTCATGTCCGCGAAACCCGCCCGAGGCCCCACTCCCTTGACCAACGTTATCACG------ + +a +s mr.mrrefChr3 1735 57 + 181019 GGACGGGCGGAAACTGAATGTTGCATTTTCCGCGCAATGGAGACGTGCTATATCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443378 57 + 636262 GGACGGGCGGAAACTGAACGTTGCATTTTCCGCGCAATGGACACGTGTTATATCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 455548 53 + 647215 ----GGGTCGAAACTGAATGTTGCACTTTCCGCGCAATGGAGATTTGCTACATCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 1792 146 + 181019 TGTCATAGGTCAAAATATTCCGGTCGATGGGGCGGCTAAAGCAATTCATGCGTTGGCCTTTTAAATAACCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATCTACTGATTGGTTGACTTGCAACAGTCCCATAGTGATTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443435 146 + 636262 TGACATAGGTCAAAATATTCCGGCCGCTGGGGCGGCTAAAGCAATTCATGCGTTAGCCTTTTAAATAGCCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATGTACTGACTGGTTGACTTGCAACAGTCCCATAGTGATTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 455602 146 + 647215 TGTCAAAGGTCGAAATACTCCGGTCGATGGGGCGGCTAAAACAATTCATGCGTTGACCTTTTGAATAACCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATCTACAGATTGGTCAACTTGCAACAGTCCCATAGTGGTTTGA + +a +s mr.mrrefChr3 1938 30 + 181019 AACAAGCCACAGTTCCATAGTGGTTTAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443589 30 + 636262 AACAAGCATCAGTCCCATAGTGGTTTAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 455748 30 + 647215 AACAAGCCACAGTTCCATAGTGGTTTGACA + +a +s mr.mrrefChr3 1968 417 + 181019 AGCAAGAATGTCCTGTCCTATCTGGTCCGTATCACCTCTGTGATCTATAGACATCTCAGATTCAATACATTAATAGACTTAAATTGGGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGACAGCCTAGCACTGCAGTGAGGAACATGGGCCTAATGTCTTCATACCATAGCATAACCATTTCGTATATAATTTGGCTATGAAGATATAGTTTTAATGTGACCCAGCTAAAGAATTGGAAGTCAAATTACTGGGCTCACCAGTGATCGGTGTTACACGATCGGTTTGTATAGTTGCATGCCTCAGCACTAGGCATGTTTGCAAGCCTAACCAAGGCTACAAGAAAGAAGGCAAAACAGGAGGATTACTGGGCTATAGCAACATAGTACTACATGACCAGGTGGAGCAATGCAAAATTTCTGCATGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443633 416 + 636262 AACAAAAATGTCCTGTCATATCTGGTCCGTATCACCCCTGTGATCTATAGACATCTCAGATTCTATACATTAATAGACTTAAATTGGGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGGCAGCCCAGCACTGCAGTGAGGAACATGGGTCTAATG-CTTCATACCATAGCATAACCATTTCGTATATAACTTGGCTATGAAGTTATGGTTTTAATGTGACCCAGTTAAAGAATTGGAAGTCAAATTACTGGGCTCACCAGTGATCGGTGTTACACGATCGGTTTGTATAGTTGCATGCCTCAGCACTAGGCATGTTTGCAAGCCTGACAACGGCTACAAGAAAAAAGGCAAAACAGGAGGATTACTGGGCTATAGCAACATAGTACTACATGACCGGTGGGAGCAATACAAAGTTTCTGCACGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 455778 415 + 647215 AGAAAGAATGTGCTGACCTATCTGGTCTGTACCAACTCTGTGATCTACGGACAACTAAGA-GCAATACATTAATGGAC-TAAATTGAGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGACAGCCTAGCACTGCAGTGAGGAACATGTGCCTAATGTTTTCATACCATGTCTTTATCACTTCGTATCTAATCTGGCTATGAAGATATAGTGTTAATATGACCCAGCGAAAGAATTGGAAGTCTGATTACTAGGCTCACCAGTGGACGGTGTTGCATGTTCCGTCCATATAGCTGCATGCCTCAGAACTAGGCATGTCTGCAAGCCCAACCAAGGCTACAAGAAAGAAGGCAATGCAGGAGGATTACTGGGCTATATTAACATAGTACTACATGACCAGGTGAAGTATTGCAAAATTTTTGCATGCCT + +a +s mr.mrrefChr3 2385 489 + 181019 GTGTTAGCTGGTCCAGACAAGCCTTAAGTTTAGATTATGAATACTGGATCTAACCTAACAGAGATACCTGGAGATAGTACTAGGGTCCGTAATTGAAGTTAATTTCAGTAGCTAACAATAATGCCTGCATGATGGCATGAAAACATTGTTGGCTTTATGTTCACATTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCACAGCTTGCATTACCTCCTTTATATTGGCTGGAATCTTACAACAAACAATATGCGGACCTCATTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGACACTAATACTTCGACATCAAGCATAGGCCTCAGGGAATGCTGTTTCCCAGTGTGCACAAAAAAATTCTTAACACTCCTTTAATCATGGGTGCATGGTAGACGAATTTCTTAAATAAACTGTTGTGTTGTCTCAGTATCTGATGTTGGGTGTGGGAATGATAAGTTTAAGCCTCGCACTCTTAGTCCCATTGTCAGCCTGACTTATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444050 446 + 636262 GTGTTAGCTGGTCAAGACAAGCCTTAAGTTTAGATTGTGAATACTGGATCTAGTCCAACTGAGATACCTGGAGACAGTAGTAGGGTCCGTAATTCAAGTTCATTTCAGTAGCCAATAGTAATGCCTGCATGATGGCATGGAAGCATTGTTGGCTTTACACTCACATTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCACAGCTTGCATTACCTCCTTTATATTGGCTGGAGTCTTACAACAAACAATATGCGAACCTCCTTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGACACTGACAC-TCGGCATCAAGCATAGGCCTCAGGGAATGCTGTTTCCCAGTGTGCACAAAAAAATCCTTAACACTCCTTTAATCATGGGTGCATGGTAGACGAATTTCTTAAATAAACCGTTGTGTTATCTCAGTATCTGATGTTGGGTGTGGGAATGGTAAGTTT------------------------------------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 456193 489 + 647215 GTGTTGGCTGGTCCAGACAAGCCTTAACTTTAGATCATGAATACTGGATTTAACCTTACAGAGATACCTTGAGATAGTACTTGTGTCTGTAATTGAAGTTAACTTCAGTAGTTAACAATAATGCCTGCATGATGGCATGAAAACATTCTTGGCTTTATGTTTACACTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCCCAGCTTGCATAACCTCCTTTATATCGGCTGGAATCTTACAACAAACAACATGTGGACCTCATTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGCCACTAATACTTTGACATCAAGCATAAGCCTCAGGGAATGCTGTTTACCTGTGTGCACAAAAAAATTGTTAAGACTCCTTTAATCATGGCTTCATGGTAGACAAATTTCTTGAATAAACTGTTGTGTTGTCTCAGCATCTGATGTTGGGTGTGGGTATGATAAGTTTAAGCCTCGCACTCTTAGTCCCATTGTCAGCCTGACTTATATG + +a +s mr.mrrefChr3 2874 386 + 181019 AGAGTGATAGCCCACCATGATCCTTCAATGCTCCTTATTTGTGATCTGGTGGATTGGTAAATGTGTATATCATATCCTGGGAGAGGGTTGGTTGCAGGCTTTTCTTCAGTGCCAGGGCAATAGAAATTTTAGCAGTTTAGTATCTACGTTAAATTATCTTTAACATCACAAATTATAACAGTGAGGTGTACTGTACATGGTACTCTTATCACAGCAGTAATAAGAAATCTAGGGACAGTGTATGGTAATTCTCAGTACTGTATGCTTGTGGTGAACATGTGCTACTCCTGTCTACCCCTTTTCCAAGTGCTGAATCGAGTTAACCAAGATTCTATATATAGTCCTTATTTTTGCCATCCTATGTACAGGATGTAGCATGCATGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444496 335 + 636262 -------------------------------------------ACCTGGTGGATTGGTAAATGTGCATATCAACTACTGGGAGATGGTTGGTTGCAGGCTTTTCTTCAGTGCTAGGGCAATAGAAATTTTAGCAGCTTAGTATCTACGATAAGTTATCTTTAACATCACAAATTATAACAGTCAGGTGTACTGT-CATGGTACTC-TATCACAGCAGTAATAAGAAGTCTAGGAACAGTGTATGAGAATTCTCAGTACTGTAAGCTTGTGGTGAACATATGCTACTCCTGTCTACCCCTTTTCCAAGTGCTGAATCAAGTTAGCCAAGATCCTATATGTAGTCCCTATTTTTGCCATCCTATGTACAGGATGTAGCATGC------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 456688 363 + 647215 AGAGTGATAGCCCACCATGATCCTTCAATGCTCCTTATTTGTGATCTGTTGGATTGGTAAATGTGTATATCATATCCTTGGAGAGGGTTG----CAGGCTTTTCTTCAGGGCCAGGGCGAGCAAAATTTTGGTGGTTTAGT-------TTAGATTATCTTTAACATCACAAATTCTGACCGTGAGGTGTACTGTACATGGTACTTTTATCA---CAGTAATAAGAAATCTAGAGACAGTGTATGGTAATTCTCAGTACTGTATGCTAGTGGTGAACATGTGCTACTCCTG--------TTATCCAA-TGCTGAATGGAGTTAACTGAGATTCTATATATAGTCCTTATCGTTGACATCCTATGTACAAGGTGTAGCATGCATGGCA + +a +s mr.mrrefChr3 3260 112 + 181019 GGAGCAACTGGAAATTCCTGGAATGTGTTTCAATCTTGATCCACTTAACCTGTATGACATTTTGCTGAGTACATCTCGGGATATATTCACAGACTGAAGTCGGCAATTCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444831 100 + 636262 ------------AATTCCTGGGATGTGTTTCAATCTTGATCCACTCAATATGAATGGGACTTTGCTGAGTACATCTTGGGGTATATTCACAGACTGAAGTTGGCAATTCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 457052 111 + 647215 GGAGCAACTGGAAATTCCTGGAATGTGTTTCATTCTTGATCTACTTAACCTGTACGACATTTTGCTGAGTACGTCTCGGGATATATTCATAGACTGAAG-CGGTAATCCACA + +a +s mr.mrrefChr3 3372 9 + 181019 ACTGAAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444932 9 + 636262 ACTGAAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 457163 9 + 647215 ACTGAAGTC + +a +s mr.mrrefChr3 3381 44 + 181019 CATTGTGCAGCTATCATTGTCAGGTAATTCTGAGCAGGCCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444943 44 + 636262 CATTGTGCAGCTATCATTGTCAGGTAATTCTGAACAGGCCCGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 457172 44 + 647215 CATTGTGCAGCTAGTACTGTCAGGTAAATCTGAGCAGGCCTAAG + +a +s mr.mrrefChr3 3425 56 + 181019 TACCCATTTCAAGGCAGTTGAAAGATTTGAGTGGAAAGTGTCACCTCCATGTAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444987 56 + 636262 TTCCCATTTCAAGGCAATTGAAAGATTTGAGTGGAAGGTGTCACCTCCATGTAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 457226 49 + 647215 TACCCATTTCAAGGCGGTTTGAAGATTTG-------AGTGTCACCTCCATGTAACA + +a +s mr.mrrefChr3 3481 73 + 181019 CTTCTTGAGAATCCAAGTCCTAATTACTGCCCTATATGTGTGGATTTAATGTGTCAGGATTAGGTCACAAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445043 71 + 636262 CTTCTTAAGAATCCAAGTCCTAATTACTGCCCTATATGTGTGGCTTTAATGTGTCAAG--TAGGTCACAAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 457278 73 + 647215 CCTCTTGAGAATCCAGGTCCTAATTACTACCCTATATGTGTGGATCTAATGTGTCAGGATTAGGTGACAAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 3554 85 + 181019 AAGGACCTAACAAAGCCAACTTACTTCGCTAAATAGATCCTGTCTTACCCAAAGCAATATATTCTTGTTCATAATAAGTAATTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445115 85 + 636262 AAGGACCTAACAAAGCCAACTTACTTCACTAAATAGATCCTGTCTTACCCAAAGCAATATATTCTTGTTCATAATAAATAATTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 457351 85 + 647215 AAGGACCTAACAAAGCCAACATACTTTGCTAAATGGATCCTGTCTTATCCACAGCAATATATTCTTGTCTATAATAAGTAATCAT + +a +s mr.mrrefChr3 3639 43 + 181019 AGAAGTTCCAGACATAATTGACATGTTTCCAATGTCTTACTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445200 43 + 636262 AGAAGTTCCAGACATAGTTGACATGTTTCCAATGTCTTACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 457527 43 + 647215 AGAAGTACCAGACATAATTGACATGTTTCCAATGGCTTACTGG + +a +s mr.mrrefChr3 3682 50 + 181019 ATGCACAGGTTAAAGGGTCACCAGCATTTCTGAGAGTGGGTTCATAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445245 50 + 636262 ATTCACAGGTGAAAGGGTCACCAGCATTTCTGAGAGTGGGTTCATAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 457570 50 + 647215 ATGCACAGGTTAAAAGGTCACCAGCATTTCTATGGGTGGATTCACAAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 3732 54 + 181019 TCAGCTGCTGGCGAAAGTTTACCCTCTATCTCACTCAACTGCTAGGCCTAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445296 54 + 636262 TCGGCTGCTGGCGGAAGTCTACCCTCTATCTCACTCAACTGCTAGGCCTAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 457620 47 + 647215 TCAGCGGCTGGCGAAAGTTTACCCTCTATCTCATTCAACTGC-ATGCT------ + +a +s mr.mrrefChr3 3786 60 + 181019 AGAATTGGCCCTAGTATTGGCTAGTCCCCTTGGTTTATATCACTTTAGATCCCACTTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445351 59 + 636262 AGAATTGGCCCTAGTATTGGCTAGTCCCCTTGGCTTATATC-CTTTAGATCCCACTTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 457667 60 + 647215 GGAATTGTCCCTAGTATTATCTAGTCCCCTTGGTTTATATCACTTTAGATCCCACTTCAG + +a +s mr.mrrefChr3 3846 157 + 181019 TCCCACTTCAAGCAACATGTAAGTTCCATAGAAGTGCTTATCACATCTAGTTTCAAAATTCTCTAAACCTATAACTACAGAGGCATACAACCCTCTTCTGCAGGCTTCCAAACAAAGGAAGAGACCTGCTGTGGTGGGCTCATCAGTCACTCTCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445410 154 + 636262 TCCCACTTCAAGCAACATGTAAGTTCCATAGAAGTGCTTATCACATCTAGTTTCAAAATTCTCTAAACCTATAAGTATAGAAGCATACA---CTCTTCTGCAGGCTTCCAAACATAGGAAGAGACCTGCTGTGGTGGGCTCATCGGTCACTCTCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 457728 157 + 647215 TCCCACTTCATGCAACATGTAAGTTCCATACGAGAGCTTATCACATATAGTTTCAGAATTCCCTAGGCCTATAACTACACAGGCATACAACCCTTTTCTACAGGCTTCCAAACAAAGGAACAGACCTGCTTTGGTGTGTTCATCAGACATGCCCTAG + +a +s mr.mrrefChr3 4003 70 + 181019 CCTGGATTGTGTTTAGTGGCATTACAATAATTGCCCCAATGATTCCCATGGGGGTTTCAAGTCATACTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445566 70 + 636262 CCTGGATTGTGTTCAGAGGCATTACAATAATTGCCCCAATGATTCCCATGGGGGTTTAAAGTCATACTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 457885 70 + 647215 TGTGGATTGTGCTTGGTGGCATTACAATAATTGCTCCAATGATTCCCATGGGGGTTTCAAGTCAAACTTC + +a +s mr.mrrefChr3 4073 131 + 181019 TTCTCAATTTCTAAGTGAAAGGTTTTCTATGCCACCTACCCTGGTCCAGAACATCTCAGTAGCGATCAGTGATGTAGAAAAATGAATCATTATCAATCAACTGTGGGAGTTGATTGGTGGAGATTCCTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445637 131 + 636262 TTCTCAATTTCTAAGTGAAAATTTTTCTATGCCACCTACCATGGTCCAGAACATCTCAGTAGCGGTCAGTGCTGTAGAAAAATGAATCATCATCAATCAACTGTGGGAGTTGATTGGTGGAGGTTCCTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 457955 115 + 647215 --------TTCTAAGTGAAAGGCTTTCTATGCCACCTACCCTGGTCCAGATCATTTCAGTAGCGATCGGTGATGTAGAAAAATGAATCATTAT--------TGTGGGAGTTGATTGGTGGAGATTCCTATG + +a +s mr.mrrefChr3 4204 14 + 181019 TGTGAGAGTTTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445892 14 + 636262 TGTGAGAGTTTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 458070 14 + 647215 GGTGAGAGTTTAGT + +a +s mr.mrrefChr3 4218 4 + 181019 CATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445906 4 + 636262 CATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 458094 4 + 647215 CATG + +a +s mr.mrrefChr3 4222 4 + 181019 GAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445910 4 + 636262 GAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 458106 4 + 647215 GAAA + +a +s mr.mrrefChr3 4226 22 + 181019 CATCAAACTTTGAGTTGGAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445914 22 + 636262 CATCAAACTTTGAGTTGGAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 458117 22 + 647215 CATCAAACTGTGAGTTGGAGAT + +a +s mr.mrrefChr3 4248 138 + 181019 TACTAAACTAATTTTCACAGCTAAGAGGTTCAGTCACAAGGTGCAATAGTGATTTTAATGATATTATCTATTGTTTAATTATTCCATGATCAGATACAATGAAGATGTCTGAGACAATCTATCCAACCTGCAAACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445936 138 + 636262 TACTAAACTAATTTTCACAGCTAAGAGGTTCAGTCACAAGGTGCAATAGTGATTTTAATGATATTATCTATTGTTTAATTATTCCATGATCAGATACAATGAAGATGTCTGAGACAATCTATCCAACCTGCAAACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 458142 138 + 647215 TACTAAACTAATTTTCATGACTCAGAGATCCAGTCACAAGCTGGAATAGTGATTTTAATGATATTATCTATTGTTCAATTATTCTATGACCAGATCAAATGCAAATGTTTGAGACAATCTAGTCAACCTGTAACTAAT + +a +s mr.mrrefChr3 4386 52 + 181019 GCAAATTACTTCTAACATGTAGTGTAAGGAGGCAGTGAAGGGCTCCATGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446074 52 + 636262 GCAAATTACTTCTAACATGTAGTGTAAGGAGGCAGTGAAGGGCTCCATGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 458281 52 + 647215 GTAAATTATCTCTAACATGTAGTTAAAGGAGCCAGTCAAGGGCTCAGTGATG + +a +s mr.mrrefChr3 4438 78 + 181019 TTTATATTATTGGTACAAAGAGAGGGGGGTCCCAGTTTTAAGGATTTCGGGTGATGAGTTCCTTAATGTTATTTAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446127 78 + 636262 TTTATATTATTGGTACAAAGAGAGGGGGGTCCCAGTTTCAAGGATTTCGGTTGATGAGTTCCTTAATGTTATTTAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 458333 78 + 647215 TTTATATTTTTGGTACAAGAAGAGGGGGGTCCCAGTTTTAAGGATTTCAGGTCATGAGTTCCCTAATGTTGTTTAGAT + +a +s mr.mrrefChr3 4516 93 + 181019 TTCGAACAAGGTCTCATGCAAAGCTCCAAAAAAAGGCAAATGTGGCTATGTACACATGGTTAGTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCACGTGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446219 93 + 636262 TTCGAACAAGGTCTCATGCAAAGCTCCAAAAAAAGGCAAATGTGGCTATGTACACATGGTTAGTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCACGTGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 458411 93 + 647215 TTCGCACAGGGCCTCATGCAAAGCTCCAAAAAAAGGCAAATGTGGCAATGTACACATGGTTAGTGCTTGGCCATGGGCCTGCCCCGTACGGCC + +a +s mr.mrrefChr3 4609 12 + 181019 TGTACACTCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446313 12 + 636262 TGTACACTCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 458504 12 + 647215 TGTGCACACAGT + +a +s mr.mrrefChr3 4621 24 + 181019 TAGTACTTGGCTATGAGCCCACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446325 24 + 636262 TAGTACTTGGCTATGAGCCCACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 458525 24 + 647215 TAGTGTTTGACTATGAGCCTGCCC + +a +s mr.mrrefChr3 4645 75 + 181019 actaGGGGATTAGCAAATATCAGCTGCTTTGATAATAGGGAGTGATATTCTTCAAAAAAGACTTTTGGGTAGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446355 74 + 636262 ACTAGGGGATTAGCAAATACCAGCTGCTTTGATAATAGGGAGTG-TATTCATCAAAAAAGACTTTTGGGTAGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 458549 71 + 647215 ----GGGGATTAGCAAATATCAGCTGCTTTGATGATAAGGAGTGATTTTCTTCAAATAAGACTTGTGGGTGACTT + +a +s mr.mrrefChr3 4720 74 + 181019 AAACTTCTGGCATGGATCTCGGCTGCTGCATCAGGTGTCAACCCTGCAGCCTTGACAGCATACAGAGAGACCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446429 74 + 636262 AAACTTCTGGCATGGATCTCGGCTGCAGCATCAGGTGTCAACCCTGCAGTCTTGACAGTATGCAGAGAGACCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 458632 71 + 647215 AAATTTCTGGCATGGATCTCGGCTGCTGCATGAGGTGTCAGCCC---AGCCTTGACAGCCTACAGAGAGATCAG + +a +s mr.mrrefChr3 4794 221 + 181019 TTACCTTTTAAGAGGCTAGAACCTACACAGGGAGGTAATAGTAGCAAGAAGTTCTATAACTGCCCAAAGGGAGCCCAAAGGGAAAGCACATGGAGGTGCTTGACTTTAAGATTTTAAAAATGGGGTGAACACATGCAACATCATGTGCAATTAGCAGCTGGGATCTAGCATCCCTAGCACTTATCCAAGGTATGCATCAATCAATCATAGACAGTTATACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446507 221 + 636262 TTACCTTTTAAGAGGCTAGAACCTACACAGGGAGGTAATAGCAGCAAGAAGTTCTATAACTGCCCAAAGGGAGCCCAAAGGGAAAGCACATGGAGGGGCTTGACTTTAAGATTTTAAAAATGGGGTGAACACATGCAACTTCATGTGCAATTAGCAGCTGGGATCTAGCACCCCTAGGATTTATCCAAGGTATGCATCAATCAATCATAGACAGTCACACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 458703 219 + 647215 TTA--TTTTAAAAGGGTACAACCTCCACAGGGAGGTAATAGTAGCAAGAATTTCTATAACTGCCCAAAAGGAGCCAAAAGGGAGAGCACATGTAGGTGCTTGACTTTAAGATTTTAAAAATGGGGTGAACACATGCAACATGATGGGCAATTGGCACCTGGGATCTAGCATCCCTAGCACTTACCTAAGGTATGCATGAATTCATCATACACAGTTATACT + +a +s mr.mrrefChr3 5015 143 + 181019 AAATAACTAGTATCACTGGATTGATCTACTGTAACAGAACTGTTATCAGTCCCAGCTATAACAAACGTAATGAATACCTCATACACAGTCCTAATAGAATTGCACGTCATCTGGAAAGTAAGCTTCACAACATTACTTGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446778 142 + 636262 AAATAACTAGTATCACTGGATTGATCTACTGTAACAGAACTGTTATTAGTCCCAGCTATAATAAACCTAATGAATACTTGATACACAGTGTTAATAGAATTGCA-ATCATCTGGAAAGTAAGCTTCACAACATTACCTGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 458922 139 + 647215 AAATAACTAGTATCACTGGATTGATCTACTGTCATAGGAATGTTATCAGTCCCAGCTATAACAAAAGTAATG----CCTCATGCACAGCCCTAATAGAATTGCACGTCATCTGGAAAGTAAGCTTCACAACATTACTTGTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 5158 109 + 181019 CTTATGGAGTGGTATCCTCCCATAGGATGGTATAATTAAAATTTCTTCCTCTTCACTCCATTCCCTATCCAGTACCATTGCTCACTTCACGTTATAGTGGTTTGCTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 446920 105 + 636262 CTTATGGAATGGTATCCTCCCATAGGATGGTATAGTTAAAATTTCTTCCTCTTCACTCCATTCCCTATCCACTATCATTGCTCACTTCATGTTATAGTGGTTTGC---- +s simRat_chr6.simRat.chr6 459093 109 + 647215 CTCATAGGGTGGTATCCTCCCATAGAATGGCATAATAAATATTTCTTCCTCTTCACTTCATCTTCTATTCAGTACCATTGCTCAATCTACGTTATAGTGGTTTGCTTAC + +a +s mr.mrrefChr3 5267 68 + 181019 TAGGATGACTCCCTCTCCACTCTGCAGAGTATCCAGCATGTGACTTCCTGAGCCATGTTGCATCCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447025 68 + 636262 TAGGATGACTCCATCTCCACTCAGCAGGGTATCCAGCATGTTACTTCCTTAGCCATGTTGCATCCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 459203 63 + 647215 TAAAGTAACATGCTGGATACTCTGCAGAGT-----GGAGATGGAGTCCTGAGTCATGTTGCATCCCAA + +a +s mr.mrrefChr3 5335 78 + 181019 ACTAGAAGGTTCAGAAGGCAATGTATTAGTACGCTGTGAGTTATATGGAACTATAACCTGACAAGCATTGCAGCCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447099 73 + 636262 ACTAGAAGGTTCAGAAGGCAATGTATTAGTA----GTGAGTTATATGGAACTATAACA-GACAAGCATGGCAGCCTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 459266 69 + 647215 ACTAGAAGGTTCAGAACACAATGTATTCGTACGCTGTGAGTGATAT---------ATCTGTCAAGCATTGCAGCCTAG + +a +s mr.mrrefChr3 5413 35 + 181019 TTTAGGTTTAGAACTGAGTCTGTGTTAACTGGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447173 35 + 636262 TTTAGGTTTAGAACTGAGCCTGTGTTAACTGGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 459335 34 + 647215 TTTAGGTTTAGAACTGAGTCTGTG-TAATTTGTAG + +a +s mr.mrrefChr3 5448 48 + 181019 TGACAGAGATATAGAATCTGTAGATAAGAGAAGGACTCATTTGATGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447208 48 + 636262 GGGCAAAGACACAGAATCTGTAGATAAGAGAAGGACTCATTTGATGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 459370 12 + 647215 TAAGAGAAGTAT------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr3 5496 90 + 181019 TATTAACTACAAGCTGAATTGGAAATCAGGAAATCATCTTAAATAATTCAAGTGTGATTACAAGTTACTTGTGGGTGCTGGGAGTATTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447258 87 + 636262 TATTGACTATGAGCTAAATCAGAAATCAGGAAATCATCTTAAATAATTCAAGTGTGATTACAAGTTACCTGTGGGTGCTGGGAG---TCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 459382 86 + 647215 ----AACTACAAGCTGTATTGGAAATCAGGCAATCATCTTAAATAATTCAGGTGTGATTACAACTTACTTGTAGGTGCTGGAAGTATTTT + +a +s mr.mrrefChr3 5586 56 + 181019 CCCTTGCAAAGAGAACAGAGGAGGAATAACAAGAGCAACTTTCCTTGAGCATAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447345 56 + 636262 CCCTTGCAAAGAGAACAGAGGGGGAATAACAAGAGCAACTTTCCTTGAGCATAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 459505 56 + 647215 CCCATGCAAAGAGAACAGAGGAGGAATAACAAGAGCAACTTTCCTCGAGCATAAAG + +a +s mr.mrrefChr3 5642 19 + 181019 CATAACACAAGTCTATTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447425 19 + 636262 CATAACACAAGTCTATTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 459561 19 + 647215 CATAATAGAACTCTATTTC + +a +s mr.mrrefChr3 5661 252 + 181019 ATCAATTTTTACGATGTACCTATAGAATCTTTTTTAGCTAATTCAAACAATGTCATCACCAATCTATTCAACTGAGGTGACCACAATGGATTGCTTTATAATAATACATAATTGTGAAAGAAAAGAACCAGGCCAGCAGACCACAATTAAGGTAACTCATGGGGTGCGTGGCTCTGAGGATATAAGCGCAACAGTAGTATGACCACCAGAATATACATGATTCTGATAGGGAGGGGAACGGATACCACAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447444 252 + 636262 ATCAATTTTTACGATGTACCTATAGAATCTTTTTTAGCTAATTCAAACAATGTCATCACCAATCTATTCAACTGAGGTGACCACAATGGATTGGTTTATAATAATACATAATTGTGAAAGAAAAACACTAGGCCAGCAGACTACAATTAAGGTAACTTATGGGGTACGTGGCTCTGAGGATATAAACACAACAGTAGTATGACCACCAGAATATACATGATTCTGATAGGGAGGGGAACGGATACCACAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 459581 248 + 647215 ACCACTTTTTACAGTGTACCTAAAGGATTTCTCTTAGCTAGTTTAGACAATGTCATCCCAAACCTATTCATCTGAGGTGGCCACAATGGATCGCTTTATAATAGTACATAACTATGAAAGAAATGAACCAGGCCGGCAGACCACAATTAAGGTAACTCACGGGGTGTGTGGCTCTGAGGATATAAGTGCAACAGCAGTATGAGCACCAAAATATACAGGATGTTGAGAGGGA----GACAGACACCACAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 5913 28 + 181019 TTTAGACACGCCTGAGTTTGGGAAGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447698 28 + 636262 CTTAGACACACCTGAGTTTGGGAAGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 459829 28 + 647215 TTTAGACATGCTTAAGTCTGGGAAGGCC + +a +s mr.mrrefChr3 5941 75 + 181019 AACTCTATACTAAGTAATGGTACATAAGTGCTGTCGCCTTGCTGGCACAACAGAATGATAAGCAGAACATGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447727 75 + 636262 AACTCTATACTAAGTAATGGTACATAAGTGCTATCACCTTGCTGGCAGAACAGAATGATAAGCAGAACATGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 459857 75 + 647215 AACTCTATACTAAGTAATCGTACATTATTGCTGTCGCCACACTGGGACAGCAGAATGGTAAGGAGAACATGTCTC + +a +s mr.mrrefChr3 6016 45 + 181019 ATAATAAGTATCCAATCAATCTATCTGTTAAAGGCCAATTCCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447808 45 + 636262 ATAATAAGTATCTAATCAATCTATCTGTTAAAGGCCACACCCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 459932 34 + 647215 -----------CCAATCCTTTTCTTGGTTAATGTAGAATTCCTTA + +a +s mr.mrrefChr3 6061 16 + 181019 GTTAATGTACATTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447854 16 + 636262 GTCAAGCTATAGCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 459966 16 + 647215 GTTAGTGTACATTGTC + +a +s mr.mrrefChr3 6077 64 + 181019 TTTTAAAACCAGCAAGCCTAAAATATCACTTCAAGAAACCCTTACTAGATGATCATAAATCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447878 64 + 636262 TTTCAAAACCAGCAAGCCTAAAATATCACTTCAAGAAACCCTTACTAGATGACCATAAATCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 459982 64 + 647215 TTTTAAAACCAGCAAGCCTAAAATATCACTTCAAGAAATCCTTATTAGATGATCATAAATCTAC + +a +s mr.mrrefChr3 6141 17 + 181019 TCTTGCACCCAGAGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447943 17 + 636262 TCTTGCACCCAGGGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 460046 17 + 647215 TCTTGGGACCAGAGACA + +a +s mr.mrrefChr3 6158 163 + 181019 TCATAGTATCCTTCCTGCTGTATGTTTAAGATCCCAAAATTGATATTCAAGGTTTTGTATCCTTTGTTGTTGGTTTGACTATTATGGGTGGCACAGCGGTGTTTCCATCATCACACGATATTTTGGAGGGCCAACCATGGAGGTTTGCAACTTTGCATCGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 447963 162 + 636262 TCATAGTATCCTTCCTGCTGTATGTTTAAGATCCCAAAATTGATATTCACTGTTTTGTATCCCTTGTTGTTGGTTCGACTATTATGGGTGGCACAGCGGGGGTTCC-TCATCACACGATATTTCGGAGGGTCAACCATGGAGGTTTGCAACTTTGCATCGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 460063 162 + 647215 CCATAGTATTCTTGCCGCTGTATGTTTAAATCCCCAAAATTAATATTCGAGGTTTTGTATTCTTTGTCATTCGTTTGACTATTATGGGTGTTACAGCAGTGTTTCCAGCATCACATGAGATTTTGGAGTGCCAAACATGGAGGTTT-CAACTTTGCATCACAC + +a +s mr.mrrefChr3 6321 335 + 181019 CAACAATTATCTAGTATCAGGGTGTATACATTCCAATAAGATACTCAATTGGAATAGGGGACTAATAACACATGAGTTACATGAAAGACCTGAGCTAGGCCCCATGAGAAAGAAGGAAACAAGGTACGTTCTTTACTGGAAGGAAATAGAAGATGAAATCTCTTTTATGGCTGATAGTGAAAGATCACCGGAATAACAACAAGAACAGCATTTATTGTCTTACTTCTATTCTTGTACCAATCTGACTGAATCTCACATAGATAATTATCAACACCCTGACTAATGTATGTGGAACAATGTCCAAAAAGGGAGACCTTGGGGGTTTGAAACAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448142 335 + 636262 CAACAATTCTCTAGTATCAGGGTGTATGCATTCCAATAAGATCCTTAGTTGGAATAGGGGACTAAGAACACATGAGCTACATGAAAGACCTGAGCTAGGCCCCATGAGAAAGAAGCAAACAAGGTACGTTCTTTACTGGAAGGAAATAGAAGATGAAATATCTTTCATGGCTGATAGTGAAAGATCACCTGAATAACATCAATAACAGCATTCATTGTCTTACTTCTATTCTTGTACCAATCTGACTGAATCTCACATAGATAATTATCAATACCCTGACAAATGTATGTGGAACAATGTCAAAAAAGGGAGACCTTGGGGGTTTGAAACAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 460225 312 + 647215 CAACAATTAGCTAGTATCAGGGTGAATATATTCCAATAAGATACTCAATTGGAATAGGGGACTAGTAACACATGAGTTACATGAAAGAC--------------------AAGACGGAAACAACGTACGTTCTTTA---TAAGGAAATAGAAGATGAAATCTCTTTTGTGGCTGATAGTTAAAGATTACCGTAATAACAACAAGAACAGCATTTGTTGTCTTACTTGTATTCTTGTACTAAACTGAATGAATCTCACATAGATAATTATGAACACCCTGACTAATGTATGTGGAACGAGGTCCAAAGAGAGAGACCTTGGGGGTTTGAAACAGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 6656 122 + 181019 AATGGAATGTCAGTTTAGTATTGATATAGCGAACTTTGCTCTTGAAGGCAAAGTCTCTACAATCTGACCAATCAGATAACTGTGGTGGAAACTCAGCCCTCTGCCACGTCCACAATGTGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448477 122 + 636262 AATGGAATGTCAGTTTAGTATTGATATAGGGAACTTTGCTCTTGGAGGCAAAGTCTCTACAATCTGACCAATCAGATAACTGTGGTGGAAACTCAGCCCTCTGCCACGTCCACAATGTGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 460551 122 + 647215 AATGGAATTTCAGTTTAGTATTGATGTAGCGAACTTTGCTCGTGAAGGCAAAGTCTCAACAATTCTACCAATCAGATAACAGTTGTGGAAACTCAGCCCTCCGCCACATCCACAATGTGGAT + +a +s mr.mrrefChr3 6778 138 + 181019 ATCAAGTGAAGAAAAAGCCACAGCCATTCCCTTAAGCTGGGATGGTATGGAACTTTGCCATAAACATAACAACATTTGTTGTTACTGATCTTATATTCTGAAGTGGGACTGTATAAATTTCTAAAATGTACTCTGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448607 138 + 636262 ATTAAGTGAAGAAAAAGCCACAGCCACTCCCTTAAGCTGGGATGGTATGGAACTTTGCCATAAACATAACAACATGTGTTGTTACTGATCTTATATTCTGAAGTGGGACCGTATTAATTTCTAAAATGTACTCTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 460673 138 + 647215 ATCAATTGAAGAAAAAGCCACAGCCATTCCCTTAAGCTGGGATGGCATGGACGTATGCCATAAACATAACAACATTTGTTGTTACTGATCTTATATTCTGGAGTGGGACTGTATAAATTTCTAAAATGTACTCTGAAA + +a +s mr.mrrefChr3 6916 37 + 181019 TGTACTCAATTGAAGGATCTAGTAGTTGTTGAGCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448745 37 + 636262 TGTACTCAATTGAAGGATCTAGTAGTTGTTGAGCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 460812 37 + 647215 TGTATTCAATTGAAGAATCTAGGAGTTTATAAGCCTA + +a +s mr.mrrefChr3 6953 23 + 181019 CAGAGCTTCATAATGGTTAGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448784 23 + 636262 TAGAGCTTCATAATGGTTAGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 460849 23 + 647215 CGGAACTTCATAGTGGTTAGGCA + +a +s mr.mrrefChr3 6976 420 + 181019 GGTAGTTTCTCCCATGGCTTATTGATAATCTAGGCCAAAATAATGCTAGACCATACACCATACTGATGAATTTGTGTAAAGGACTAATGCAGCTATCACTCTTAGCTGTCCCACTTCCATGTGTTCTAGTCTTCTATCCCCCAGTCAGTCTGACGTTCCATGGTAGTTCTCCCACACAATCTGCCATGGTCCAAGCATGCTGGCTGATAAACCCTGACAAAGAATCCACTATCACTCTTAGCTATTAGTTTTAATCATGAGATTTAGTTTTTCATTTCCACATTGGGCTTGCAATCCATCACAGTTCTTTCACACAAGCCACCAACTTCATGAACTGTCAAATTTGAACTTGGACCTGAATGGTTAACCCCAAGTACTACCTGTGGTCCTCATTCTGAGCTTGGAAAATGTGCTGCATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 448808 415 + 636262 GGTAGTTTCCCCCATGACTTATTGATAATCTAGGCCTAAA----GCTAGACCATACACCATACTGATGAATCTGTGTAAAGGACTAATGCAGTTATCGCTCTTAGCTGTCCCACTTCCATATGTTCTAGTCTTCTATCCCGCAGTCAGTCTGACGTTCCATGGTAGTTCTCCCATGCAATCTGCCATGGTCCAAGCATGCTGGCTGATAAACCCTGACAAAGAATCCACTATCATTCTTAGCTATTAGTTTTAATCATGAGATTTAGTTTTTCATTTCCACATTGGGCTTGCAATCCATCACAGTTCTCTCATACAGGTTACCAACTTCATGAACTGTCAAATTTGAACTTGGACCTGAATGGTTAACCCCAAGTACTACCTGTGGTCCTCATTCGGAACTTAGAAAATGTGCTGCATC- +s simRat_chr6.simRat.chr6 460872 399 + 647215 GGTAGTTCCTCCCATGGCTTATTGATAATATAGGCCAAAATAATGCTAGACCAT-----GTACTTATGAATTCGTGTAAAGGACTTATGCTGCTATCACTCTTAGCCGTCA-------ATGTGCTCTAGTCTTCTATCCCCCAGTTGTGCTGAAGTTCGATGGTAGTTCTCCCACACAATCTGCCATGGCCGAAGCATGCTGGCTGATTAACCTTGACAAAGAATCCACTAT-GCTCTTAG-TATTAATTTTAGTCATGTGAATTAGTTTTTTATTTCCACATTGGCCCTGCAATCCGTCACAGTTCTTTCACACAAGCCACCAACTTCATGAACTGTCAAACTTGAAGTTGACCTTGAATGGTTATTGCCAAGTACTACCTGTACTCCTCATTCTGAGGTTGG-------GCTGCATCT + +a +s mr.mrrefChr3 7396 4 + 181019 TTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 461272 4 + 647215 TTCT + +a +s mr.mrrefChr3 7400 853 + 181019 AACAAATGCAGAAATTCTACCAAAGTACTCCAAAGATGCCTATCTTGCTATCAAATGGGAAGTTGTTGCAAGAAAGGAGTAGACAAATACTGAAAGGCTGATTGACTGATAGAGGCATTAATCCAGGATATGCACCTTCAGACTCCAGTTCATGGCTAATTTGCGACAACACACCTGCAAGTTACTAAAAATGTGGAGATTATTCACACATCTATGTTTAGATTTCACTGCCAGACTAAAAAGGAGTAGGTAACTAGACATGCACTGATTGTTATGGATATGTTGCATTAAGTTGACACAAGGGGGGGGATGATGATTTACAGATCTTATTAAGGTATTACAGTTTTAGTTGAAAGTACAGCATGACAGCCACAGATACCTTCTAATAAACATTGTCTTGTTTCTCCACCTTGTAATATCAATAGCCATATAGTACATGTCCTGCCCAAATTGTAGCTGTGAAGAGTCCCTATGATCTAGTGACTGGGTCCCATGCATCTTCACAGAACCATTGGGATACTGCTTTACTGGCTGCTTCAGGTGATCGTTGAATACCTGACTTGTTAGTAGCCTGAAGAGTTTGCTGGGTCCCAGCATCCTGCACCTTGACAGGAGAACCTTGAGTTCCAACCTCCTGTACTTTAACAGAGCGTTGTGTCCCAGTGTCTCGAGGCTCCACTGGTCGTTGTGTGCCAGCTTCCCTCACAGCTATTGAGGAGCGCTTAGTCTTGGATTTCTGTGTGGCTACATCTTTAGCAAGGGCTTTCCCCGAACCTTGCAATGTTATGAAACATACCATGTCTATTTGTCTCCACATGAGCTGTAGTGGAAACATGACAGATGATCATTCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 449223 839 + 636262 AACAAATGCAGAAATTCTACCAAAGTACTCCAAAGACGCCTGTCTTGCTATCAAATGGGAAGCTATTACAAGAAAGGAGTAGACAAATACTGAAAGGCTGATTGACTGATAGAGGCATTAATCCAGGATATGCACCTTCAGACTCGAGTTCATGGCTAATTT-------CATACCTGCAACTTACTAAAAATGTGGAGATTATTCACACATCTATGTTTAGATTCCACTGCCAGACTGAAAAGGAGTAGGTAACCAGACATGCACTGATTGTTATGGATATGTTGCATTAAGTTGACACAAGGGGGGGTATGATGATTTACAGATCTTATTAAGGCATTACAGGTTTAGTTGAAAGTGCAGCATGACAGCCACAGATACCTTCTAATAAACATTGTCTTGTTTCTCCACCTTGTAATATCAATAGCCATATAGTACATGTCCTGCCCAAATTGTAGCTGTGAGGAGTCCCTATGATCTAGTGACTGGGTCCCATGCATCTTCACGGAACCATTGGGATACTGCTTTACTGGCTGCCTCAGGTGATCGTTGAATACCTGACTTGTTAGTAGCCTGAAGAGTTTGCTGGGTCCCAGCATCCTGCACCTTGACAGGAGAACCTTGAGTTCCAACCTCCTGTACTTTAACAGAGCGTTGTGTCCCAGTGTCTCGAGGCTCCACTGGTCGTTGTGTGCCAGCTTCCCTCACAGCTATTGAGGAGCGCTTAGTCCTGGATTTCTGTGTGGCTACATCTTTAGCAAGGGCTTTCCCTGAACCTTGCAATGTTATGAAACATACCATGTCTATTTGTTTCCTCATGAGCTGTAGTGGAAACATGCC-------CATTCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 461283 804 + 647215 AAGAACTGCAGAAATTCTACCAAAGTACTCCAAAGATCCCTATCTTGCTA--AAATGGGGATTTGTTGCAAGGAAGGGGTAGACAAATACTGAAAGACTGACTAACTGATAGAGGCATTAAATCAGGAAATGCACCTTCAGACTCCAGTACATGGCTAATTTGCGACAATACAGCTGCAAGTTACTAAAAATGTGGAAACTATTCACACATCCATGTTTAGATTTCACTGCCAGACTAAAAAGGAGTAGCTAACTAGACATGCACTGATTATTATGGATATGTTGCA--AAGTTGATAAAAAGGGAGGGATGATGATTTATAGATCTTATTAAGGTATTACAGTGTTAGTTGAAAGTACAGCATGACAACCACAGATTCCTTCTAATAAACATTG-----------------------------------------ATGTCCCACCC----TATAGTTGTGAAGAGTCCCTATGATCTAGTGACTGGGTCCCAAGCATCTTCACAGAACCATTGGGATACTGCTTTACTGGCTGCTTCTGGTGAGCGTTGAATACCTGACTTGTTAGTGGCCTGAAGAGTTTGCTGGGTCCCAGCATCCTGCACCTTGACAGGAGAACCTTGAGTTCCAACCTCCTGTACTTTAACAGAGCGTTGTGTCCCAGTGTCTCGAGGCTCCACTGGACGTTGTGTACCAGCTTCCCTCACAGCTATTGAGGAGCGCTTAGTCTTGGATTTTTGTGTGGCTACATCTTTAGCAAGGGCTTTCCCCGAACCTTGCAATGTTATGAAATATACCGTGTCTAATTGTCACCACGTGAGCTGTAGTGGAAACATGACAGATGATCAGTCAGT + +a +s mr.mrrefChr3 8253 130 + 181019 TCTTAGACAGGTCATGTATTCCAACAGGTCAATAAGTGTTTAGTGCCCTACCATGATTGGTAAAGAAGACCTGCCTAGCAGATGGAATTAAGACATAAACCATTTCATAGTTTCCACAGCCTTTGAACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450065 130 + 636262 TCTTAGACAGGTCATGTATTCCAACAGGTTGATAAGTGTTTAGTGCCCTACCATGATTGGTAATGAAGACTTGCCTAGCAGTTGAAATTAAAACATAAACCATTTCTTAGTTTCCACAGCCTTTGAACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 462087 129 + 647215 TCTTAGACAGGTCATGTATTCCTACAGATCAACAAGTGTTTAGTGCCCTACCATAATTGGTAAAGAGGACCTGACTAGCAGATGGAATTAAGACATAAACCATTTCAAAGTTTC-ACATCCTTTGAACAA + +a +s mr.mrrefChr3 8383 25 + 181019 CATTACCAGCTCAAACTGACTAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450195 25 + 636262 CATCACCAGCTCAAACTGACTAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 462220 25 + 647215 CATTACCAGCTCAAACTGTCTAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 8408 22 + 181019 ACACAGAAAACCTTTTGCCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450220 22 + 636262 ACACAGAAAACCTCCTGCCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 462246 22 + 647215 ACACGGAAAACCTTTTGCCCAA + +a +s mr.mrrefChr3 8430 494 + 181019 AGCAAGTGATGATAGTCAGCCAGGTTCATAATCATTTTTATGTCTTCCTGGAAGGAAGATCTTCCAAATACCAGGATTTCTGCTTCACCATTAGGATCTAGGCGATTGACATGAACTAAGATTTGAGACATACCCTGGACATGTGGAATACGTTCCCCACCCCGGCCTGTGTGGGATGGACTAGCATGTGCAAGGAAATGATCAGCTTTATTTTGTGCAAGACAGGAGGGCTGCACTAAGTGACCTGCTGATCCACAACTACTCAAGAAAGTTACCACAGATCACAATCACCTCTTACCAAAGATCTTGTCCACCAACCAGACCTCCAGCCGTACTACTTTTGGATTCTTGAGGAACTCTGAGTGAAACCAAGAAAATTGCTGAGGGAGGTGACTGAGCACCTCTACTGGCATTGCCCTAAGCTGCATCAAATGTACAAGCGATGGGCTGGGAGCATCCATAGCAGACAGGCAATCATAAGGTACTTACTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450289 381 + 636262 AGCAAGTGATG---------CAGGTTCATAATCATTTTTATGTCTTCCTGGAAGGAAGATCTTACAAATATCAGGATTTCTGCTTCACCATTAGGATCTAGGCGATTGACATGAACTAAGATTTGAGACATACCCTGGACATGTGGAATACGTTCCCCACCCCGGCCTGTGTGGGATGGACTA--------------------------------------------------------------------------------------------------------TGACCTCTTACCAAAGATCTTGTCCACCAACCAGACCTCCAGGCGTACTACTTTTGGATTCTTGAGGAACTCTGAGTGAAACCAAGAAAATTGCTGAGGGAGGTGACTGAGCACCTCTACTGGCATTGCCCTAAGCTGCATCAAATGTACAAGCGATGGGCTGGGAGCATCCATAGCAGACAGGCAATCATAAGGTACTTACTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 462268 488 + 647215 AGCAAGTGATGATAGTCAGCCAGGTTCATAATCATTGTTATGTCTTCCCAGAAGGAAGATCTTCCAATTACCAGGAATACTGCTTCACCATTAGGATCTAGGCAATTGACATGAACTAGGATTTGAGACATACCCTGGACATGTGGAATACGTTCCCCACCCCGGCCTGTGTGGGATGTATTAGCATGTGCAAGGAAATGATCAGCTTTATTTTGTGCAAGACAGGAGGGCTGCACTAAGTGACCTGCTGATCCACAACTACTCAAGAAAGTTACCACAGATCACAATCACCTCTCACC------CTTGTCCACCAACCAGACCTCCAGCTGTACTACTTTTGGATTCTTGAGGAACTCTAAGTGAAACCAAGAAAACTGCTGAGGGAGGTGACTGAGCACCTCTACTGGCATTGCCCTAAGCTGCATCAAATGTACAAGTGGTGGGCCGGGAGCATCCATGGCAGACAGGCAGACATAAGGTACCTGCTTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 8924 148 + 181019 ACTTCGCCTGGAGTCAACCCTGCAAGATTCAACTACTTCCCTAGAAGTGCATCACAGTAGAACTGAGGGATATAAGCAGGCAGGGCCACTATAAGATTATTGAGACTTCTGCTGCAATAGAGACTTTGCAATTAAGCAGTCTTGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450670 141 + 636262 ACTTCTCCTGG-------CCTGCAAGATTCAACTACTTCCCTAGAAGTCCATCACAGTAGAACTGAGGAACATAAGCAGGCAGGGCCACTATAATATTATTGAGACTCCTGCTGCAATAGAAACTTTGCAATTAAGCAGTCTTGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 462759 148 + 647215 ACTTCGCCTGGAGTCAACCCTGTAATATTCGACTACTGCTCTAGAAATGCATCATAGTACAACTTAGGGATATAAGCAGGCAGAACCACTAAAAGATTATCAAGACTTCTATTGCAATAGAGACGTCGCAATTAAGCAGAGTTGGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 9072 91 + 181019 AAGTGTTAGGTCTTTTGCTTAGTTGCTTTTAGCGTTGTGTCTTGGCCCTTATTCGCTTCATACAACCACACAGACACATTTTCAGCTATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450816 91 + 636262 AAGTGTTAGGTCTTTTGCTTAGTTGCTTTTAGCGTTGTGTCTTGGCCCTTATTCGCTTCATACAACCACAGAAACACAGTTTCAGCTATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 462907 90 + 647215 AAGTGTTATGTCTTGTGCACAGTCACTGTTAGTGTTATGTCTTG-CCCTTAGTTGCTTAGCACAACTACACAGACAGATTAACAGCTATAA + +a +s mr.mrrefChr3 9163 53 + 181019 TAACACCATGTCTGTATGAGAATCCATTGTCTTCCAAGGGGAAGCACTTGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450907 53 + 636262 TAACACCATGTTTGTATGAGAATCCATTGTCTTCCAAGGGGAAGGACGTGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 462998 53 + 647215 TAACACCATGACTATATGACAATCCATTGTCTTCCAAGGGGAAGCACTTGTAA + +a +s mr.mrrefChr3 9216 125 + 181019 TGAGTCTACTATTCATTGGGCTAGATGCCTATGTTTACATGTTTCAAACTATAATGCATGTTCTAGTTTAACTTGCTTTGCTTTTCTGCAGGTCATCCCCTCGAGCAGATGAATACTATCTCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 450960 124 + 636262 TGAGTCTACTATTCACTGGGCTAG-TGCCTGTGTATGCATGTTTCAAACTTTAATGCATGTTCTAGTCTAACGTGCTACCCCTTTCTACAGGTCATCCCCTCGAGCAGATGAATACTATCTCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 463052 125 + 647215 TGAGTCTACTATTCATTGGGCTAGATGCCTATATTTACACATTTCAAACTATAATGCATCTTCTAGTTTAGGTTGCTTTGCTTTTCTGCAGGTCAGCCCCTCGAGCAGATGAATACTATCTCTAT + +a +s mr.mrrefChr3 9341 96 + 181019 TAATGGCTACAAGGCAACAACAGAAGCTTATTAGGTGTAAGATCCGAGAGACATCTCTATGACTACTAATCTCCAAGAACTATAATCTGCAGCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451084 95 + 636262 TAATGGCTAC-AGGCAAGAACAGAAATTTATTAGGTGTAAGATCCGAGAGACATCTCTATGACTAGAGATCTCCAAGAACTATAATCTGCAGCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 463192 79 + 647215 TAATGGCTACAAGGCAACAACAGAAGCTTACAA-----------------ACATTTCTATGACTACTAATCCACAAGAACTATAATCTGCAGCTCT + +a +s mr.mrrefChr3 9437 9 + 181019 CAGCTCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451183 9 + 636262 CAGCTCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 463271 9 + 647215 CAGCTCATA + +a +s mr.mrrefChr3 9446 193 + 181019 CTCGGATTCTGTACTATGAATTTACAGAACCCTGGTATAGGTCTGTGAAAATGTTGTCATGTTAATTTCATTACTGTCATATCATGATGAATTAATCCCTGTGCTGTCCATAGAAGTTAATAGGCTAGGCATAAATACACAGATCTTGTTTTGGGTCTTAAGATGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451193 193 + 636262 CTCGGAGTCTGTACTATGCAATTACAGAACCCTGGTATAGGGCTGTGAAGATACTGTCATGTTAATTTCATTATTGTCATATCATGATGAACTAATCCCTGTGCTATCCATAGAAGTTAATAGGCTAGGCATAAATAAACAGATCTTGTTTTGGGTCTTAAGGTGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 463280 190 + 647215 CTCGGATTCTGTACTATGAATTTAAAGAACCCTGGTATAGGTCTGTGAAAATGTTGTCATGTTAAGTTTATTACTGTTGTATCATGATGAATCAATTCCTGTGCTGTCCATCGAAGTTAATAG---GGGCATAAATACACAGATCTTGTTCTGGGTCTTAGGATGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT + +a +s mr.mrrefChr3 9639 36 + 181019 CTACTTACCTTGGTGTTTTCCCTCAAGACAAGCGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451388 36 + 636262 CTACTTACCATGGTGTTTTCCCTCAAGACAAGCGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 463470 35 + 647215 CTACTTACCTCGGTGTTTTCCCTCAAGATAAGTGC- + +a +s mr.mrrefChr3 9675 74 + 181019 AGTGGTATGCAAATAAATACTGATAGATTGACATTGATGGAAGTTGAACACATGGGAAGTGACGACTATCTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451433 53 + 636262 AGTGGTATGCAAATAAATACTGATAGGTTG---------------------ATGGGAAGTGATGACTAACTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 463505 73 + 647215 AGTGGTATGCAAATAG-TACTGATAGATTGACATTGATGGAAGTTGAACACATGGGAAGTGACGACTATCTTGA + +a +s mr.mrrefChr3 9749 9 + 181019 CAGGTAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451489 9 + 636262 CAGGTAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 463578 9 + 647215 CAGGGAATG + +a +s mr.mrrefChr3 9758 198 + 181019 TCTTACTAGCCACAGTGAAGATTATCTTGAACCCAGGTAATTATTAAATGTCTTACTAGTCACTGTACTAGGGGAAGCCGGACCAGTTGGGATTCCTAGATATGGGTCAGGTGGTCCCTGTATGCATTTTCATATTCAATAGTTCACATGCGAATGCTCTGTGGAAGCTAATGAGCGATACTGTCTTCTGGTACTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451498 198 + 636262 TCTTACTAGCCACAGTGAAGATTATCTTGAACCCAGCTAATTATTATATGTCTTACTAGTCACTGTACTAGTGGAAACCGGACCAGTTGGGATTCCTAGATATGGGTCAGGTGGTCCCTGTATGCATTTTCATATTCAATAGTTCACATGCGAATGCTCTGTGGAAGCTAATGAGCGATACTGTCTTCTGGTACTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 463595 100 + 647215 CCACACTAGCCACAGTGATGACTATCCTGAACCCAGGCAATTATTAAATGTCTTACTAGTCACTGTACTAGGGGAAGCCTAACCAGTTGGGATTCCTAGA-------------------------------------------------------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr3 9956 64 + 181019 CTTTGGTTGGGACAACCATTAATCATCAACACAAGCTTTTGAGTACATTCTAAAAACTCAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451700 64 + 636262 CTTTGGTTGGGACAACCATTAATCATCAACACAAGCTTTTGAGTACATTCTAAAAACTCAACTT + +a +s mr.mrrefChr3 10020 74 + 181019 TCTAGTGTGAATGTTGTTGAACTCCTGTTTTGTTAATGGTTCAAAAACAGCCTTCCCTTGGTTTAAATAAGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451769 69 + 636262 TCTAGTGTGAATGTTGTTGAACTCCTGTTTTGTTAATGGTTCAAAAACAGCCTTCCCTTGGTTTAAATA----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 463695 5 + 647215 ---------------------------------------------------------------------AGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 10094 22 + 181019 AATCATTATGAGGTATTGCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451838 22 + 636262 AATCATTATGAGGTATTGCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 463724 22 + 647215 AATCATGATGAGGTTTTGCCCA + +a +s mr.mrrefChr3 10116 360 + 181019 CAAATGCTAATGGGTTGACTTAGGGGGGCTACTGCCACAAATATCAGTAGGGTGACATACGGGGACTAGTGTAAGCCCCCTTGTAGACCAAGATAATGACAGATTGCTATAAAATGCATGTGATGTTCATACTATACCAGTATTCAAGGTGTCTCCCTAACTCTATGTTCCCTTTTTGATCTAAGCTCCTGTCTCCCTGTAATCCTTTTCCTGCCCCAGCTTCCCCAGTGTATCAACCAAGAATTGAATAACCTGAATAAATTGCACGATTTCTGTGTATAGCTGGAAACCAGTATATTTATGGTTCACCTGCATTGGTGAACCATTTTCCATAAGTATGTACACCAGCAAAGTAATGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451865 354 + 636262 CAAATGCTAATGGGTTGACTTAGGGGGGCTACTGCCACAAATATCAGTGGGGTGACATACGGGGACTGGTGTAAGCCCCCTCGTAGACCAAGATA---ACAGATTGCTATAAAATGCATGTGATATTCATACTATACCAGTATTCGAGGTGTCTCCCAAATCCTATGTTCCCTTTTTGATCTAAGCTCCTGTCTCCCTGTAATCA---GCCTGCCCCAGTTTCCCTAGTGTATCACCCAAGAATTGGATAACCTGGATAAATTGCACGATTTCTGTGTATAGCTGGAAACCAGTATATTCATGGTTCACCTGCACTGGTGAGGCATTTTCCATAAGTATGTACACCGGGAAACTAATGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 463746 360 + 647215 CAAATACTAATGGGTTGACTTAGGGGGCCTACTGTCGCAAATATCAGTAGGGTGACATATAGGCACTACTGTTAGCCCCCTTGTAGACCAAGATAATGACAGATTGCTATAAAATGCATGTGATGTTCATACTATACCAGTACTCAAGGTGTCTCCCTAACTCTATGTTCCCATTTTGATCTAAGCTTCTGTCTCCCTGTACTCCTTTTCCTTCCCCAGCTTCCCCAGTGTATCAACCAAGAATTGAATCACCTAAATAAATTGCACGATTTCTGTGTGTAGCTGGAAACCAATATATTTATGGTTCACCTGCATTGGTGAACCATTCTCAATAAGTATGTACACCAGCAAAGTAATGGA + +a +s mr.mrrefChr3 10476 396 + 181019 AATTTCTTTTTGTGTGATGTGAAGTGTAGACCCCCGTGGCAAGTACAGAGAGTAGAAGGTATTACTGTGTTTGGGTTTGTGGACTTGAAATGACAATCAGGGATGATCATTGTCCCTTGAAGAGTTGAGCAGTATTTCCACAACTCTTGCCATAGTGATAATTGGCTGTGCTCAGCAGTGCTACTCTATGTCAAGAGTACAACTCCATTAAAAATATGCATGTCTTAACATTGATCATTACTAGGACATGTTATTGAATTTGCCAATTTTGCAGGTGTAGTAATGAAACTAGCTTGCATATGAAGGGACTTGTTTCCTTGTTAAAACAGGAGCAGAGCTGTGAATTTCATTGATCAAATCAGTATAACAACAGGAACAGGGATGTGAATTCTACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 452237 395 + 636262 AATTTCTTTTTGTGTGATATGAACTGTAGACCCCCGTAGCAAGTACAGAGAGTAGAAGGTATTACTGCGCTTGGGTTTGTGGACTAGAAATGACAATCAGGGATGATCATTGTCCCTTGAAGAGTTGACCAGTATTTCCACAACTCTTGCCACAGTGATAATTGGCTGTGCTTAGAACTACTACTCTTTGTCAAGAGTACAACACCATTAAACTTATGCATGTCTTAACATTGATCCTTACTAGGACATGTTATTTAATTTGTCA-TTTTGCAGGTGGAGTAATGAAACTAGCTTGCATACGAAGGGACTTGTTTCCTTGTTAAAACAGGAGCAAAGCTGTGGACTTCATTGATCAAATCAGTATAACAACAGGAACAGGGATGTGAATTCTACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 464106 394 + 647215 AATTTCTCATTGTGTGTTGTGAAGTGTAGACCCCAGAGGTAAGTACAGAAAGTAGATGGTATCAGTGTGTTTGGGTTTGTGGACTTGAAATGACAATCACGAA-GATCATTGTCTCCAG-AGAGTTGAGCAGTATTTTAACAAGTCTTGCCATAGTGGCAATTGGCTGCCCTCAACAGTGCTACTCCATGTCAAGAGTGCAACTCCATTAAAAATATGCATGTCTTAACAATCATAATTACCAGGACTCGTTATTGAATTTGCAAATTTTGCAGGTGTAGTAATGAAACTAGCTTGCTTATGAAGGGACCTGTTTCCTTGTTAAAACAGGAGCAGAGCTGTGAATTTTATTGATTAAATCAGTATAGCAACAGGAACAGGGATGTGAATTCTACAT + +a +s mr.mrrefChr3 10872 53 + 181019 ACATGGGTTCAATCAAAGTAAGAGCCTACATTTTATACACATGAGCTCAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 452632 53 + 636262 ACATGGGTTCAATCAAAGTAAGAGCCTACATTTTATACACATGAGCACAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 464513 53 + 647215 ACATGGGTCCAATCAAAGGAAGAGCCTACATTTTATAGACATGAGCTCAATAA + +a +s mr.mrrefChr3 10925 47 + 181019 CACTCAATACCAATGTCAATGGTCATGTCAAGATGCCTGGTCTTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 452686 47 + 636262 CACTCAATACCAATGTCAATGGTCATGTCAAGATGCCTGGTCTTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 464566 47 + 647215 CGCTCAATACAAACATTAATGCTCATGTCAAGATGCCTGGACTTGCT + +a +s mr.mrrefChr3 10972 77 + 181019 GATTGGTTCAGCTGAAAGAGGTGTAGTGTTTAGAAAATCCTCTTAATGGATGGCATGTTATCCTTAATAAATCAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 452733 77 + 636262 GATTGGTTCAGCTGAAAGAGGTGTAGTGTTTAGAAAATCCTCTTAACAGAAGGCACCATATCCATAATAAATCAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 464614 77 + 647215 GATTGATTCAGCTAAAAGAGGTGTAATGTTTAGAAAAACCTCTTAATGGATGGAATGTTATCCTTAAAAAATTAATA + +a +s mr.mrrefChr3 11049 252 + 181019 AAGTTGGGCACATCAAACAAGAACCATATAATTCCAAAGAGTGGCAATCCTGTGATAGCCAGAGACAATGGGGCTGTCTACAGCCTGGCAGTGTATTCCCAGATACAGCATCAAGGTTTCTATAATCTCAGTAGAGTTATTTTAAATTGGAAAACATGTGGTGAAGTAAAATGTAAACATGTCCTCCTAATCCCTGGCCTTTGCAGAAAATGTTGTCATGATGATATCCTTGACACTTATATCAGCTATCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 452810 247 + 636262 AAGT--GGCACATCAAACAAGAACCATATAATTCCAAAGAGTGGCAATCCTGTGATAACCAGAGACAATGGGGGTGTCTATAGCCTGGCAGTGTATTCCCAGGTGCAGCATCAAGGTTTCTATAATCTCAGTA--ATTATTTTAAATTGGAACACATGTGGTGGAGTAAAATGTAAACATGTCCTCCTGATCCCTGGCCTTTGCAGAAAATGTTGTCATGATGATATCCTTGACACCTATATCAG-TATCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 464692 251 + 647215 AAGTTGGGCACATCAAACTAGAGCCATATAAGTGCAACGAGTGGCAATCCTGTGATAGCCTGCGACAATAGGGCTGTCTACAGCTT-GCAGTGTATTCCCAGATACAGCACCAAGGTTTCTATAATCGCAGTAGAGTTATTTTAAATTGGAAAACATGTGGTGAAGTAAAGTGTAAACCTGATCTCCTAATTCTTGGCCTTTGCAGAAAATCTTGTCATGATGGTACCCTTGACACTTATATCAGCTATCAG + +a +s mr.mrrefChr3 11301 417 + 181019 GTTTTGGAGGTTTCACTCCAATGAGAACCTATGCTAGTTCCTTTCTTCCAAATACACTGACTCTTGTGTATCAGAAACAAACCTGAAAGAAATCGTGAGTGTAACTGATCGGGGTGAGTGGATTAGACATTACATCCATACATATTTACCTGGCCTATACAATAAACTCCCCCTAAAAACTGCAACAAAAATGAAGCCTTTGAGAAACTGTAAGACAAATGAAATGGCTTGTCAGTAGTTGAATAAGCCTAACCAATGCAAAAAATATCCACAGGTCACTTGAAGCTGTGTACCAGGCCTAGCTTGGATTTCCTATCTCTGGCTGATGCTGGTGAGAAGCTCTGCACAGGCACCAATACCAATAGAACACTTGCCCCCTCAGGCAATGGTTACAACCACATGGAAAATTCATCTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453057 389 + 636262 TTTTTGGAGGTTTCACTCCAATGAGAACCTATAATAGTTCCTTTCTTCCAAATACACTG---------------------------AAGTAACCGTGAGTATAACTAATCGGGGTGAGTGAATTAGACATTACATCCATACACATTTACCCAGCCTATACAATAAACTCCCCGTAAAAACTGCAACAAAAATGAAGCCTTTGA-AAACTGTCAGACAAATGAAATTGCTTATCAGTAGTCAAATAAGCCTAACCAATGCAAAAAATATCCACAGGTCACTTGAAGCGGTGTACCAGGCCTAGCTTGAATTTCCTATCTCTGGCTGATGCTGGTGAGAAGCTCTGCACAGGTACCAATACCAATAGAACACTTGATCCCTCAGGCAATGGTTACAACCACGTGGAAAATTCATCTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 464945 413 + 647215 GTTTTGGAAATTTTACTCCAATGAGAACCTATGCTAGTTCCTTTCTTCCAAATACACTGACTCTTGTGTATCAGAAACAAACCTGAAAGAAATCCTGAGTGTAACTGATCAGGGTGCGTGGACTAGACATTACATCCATGCATATTTA--TGGCCTATACAATAACCTCCCCCTAAAAACTGCAACAAAAATGAAGCCTTTGAGAAACCATAATACAAATGAACTGGCTTGTCATTAGTTGAATAAGCCTAACCAATGCAAAAAATATCCACAGGTCACTTGAGGCTGTGTACCAGGCCTAACTTGGATTTTCTATCTCTGGCT--TGCTGGTGGGAAGCTCAGCACAGGCACCAATACTAATAGAACACTTGCCCCCTCAGGCTACGGTTACCACCACATGGGAAAGTCATCTGGA + +a +s mr.mrrefChr3 11718 316 + 181019 TGGCAAAGTCCATCTTGATTATAATTGAGGGACATGTGATTATACAATGGGCATCATGCTACAAAAAGTTGTGGAAACACTCAGTAAGCAGAAAGTTTTTTGGACAGGTGAATGTATCAAAAAATCTACTGCATGACCATGTGATGAGAATATGCAGGTTAAGGGCCAGACTAAACTAATAGGTTTAGTACAGGTGTGAACACTCTTAAATAATTTAGGACAAAGCAACAAGTGGGAAACTATAGGGTACAGGTGTGAACACTCTTTAATAATTTACAACAAAGAAACAAAGAAACAAGTGGTAAACTATAGGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453446 236 + 636262 --------TCCATCTTGATTATAATTGAAGGACATGTGGTTATACAATGGGCAGCATGCTACAAAAAGTTGTGGAAACACTCAGTAAGCAGAAAGTTTATTGGACAGGTGAATGTATCAAAAAATGTACTGCATGACCACATGATGAAAATATGCTGGTTAAGGGCCAGACT---CTAAGATGTTCA-------------------------------------------------------------ACAGGTATGAACACTCTTTGATAATTTACAACAAAGA--------AACAAGTGGTAAACTATAGGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 465362 316 + 647215 TGGCAAAGTCCATCTTGATTATGATTGAGGGACATGTGATTATACAATGGGCATCATGTGACAAAAAGGTGTAGAAATAGTCAGTAAGCAGAAAGTTTTTTGGATGGGTGTATGTATCAAAAAATCTACTGCATGACCATGTGATGAGGATAAACAGGTTAAGGGCCTGAGTAAACTAATAGAAGTTGTACAGGTGTGAACACTCTTAAATAATTTAGGACAAAGCAACAAGTGGGAAACTATAGGGTACAGGTGTGAACACTCTTTAATAATTTACAACAAAGAAACAAAGAAACAAGTGGGAAACTATAGGGAA + +a +s mr.mrrefChr3 12034 116 + 181019 GCAGTCAGCTAGGCTTATTAAAAACCTGGCAGTTTTGAAGGTCAGAATATGGGGGGTGCGACTACAAGCAACTATGGGGAAGCTGGACACTTGGCAGTCAGGACTAGACAAGAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453683 116 + 636262 GCAGTCAGCTAGGCTTATTAAAAACCTGGCAGTTTTGAAGGTCAGAATATGGGGGGTGCGACTACAAGCAACTATGGGGAACCTGGACACCCGGCAGTCAGGACTAGACAAGAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 465678 105 + 647215 ACAGTCAGCTAGGCTTATTAAAGACCTGGCAGTTTTGAAAGTCAGAATATGGGGGGTGCAACTACAAGCAACTATGGGGAAGCTAGACACTTGGCAGTCAGGTCT----------- + +a +s mr.mrrefChr3 12150 28 + 181019 TATGTGTCTAAGCCTGACTTAGCCGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453809 28 + 636262 TATGTGTCTAAGCCTGACTTAGCCGGCA + +a +s mr.mrrefChr3 12178 16 + 181019 CTATCAGACAATCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453847 16 + 636262 CTATCAGACAATCACA + +a +s mr.mrrefChr3 12194 22 + 181019 GGGCTGACAGGCTGCAATGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453867 22 + 636262 AGGCTGACAGGCTGCAATGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 465783 22 + 647215 GGGCTGACAGGCTGCAATGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 12216 344 + 181019 AGTAAAATTTACTCCATGGAAGAATGGAAGATATGATTTGGATTCTCCTGGCTTGGCCTATTTTCTTGTTCTTGCTATGTGGTTTGTGAGATATATGGTGTCCATCAGAAATTATTCTAGTAATCTGATTAGTAGAAAGGGATAAGAAGAATAAGGTTCAACAGTGAGACAAGTTAGGTCCACTAACTAGTTGTTCAGATCACATCCCATGGTTGGAACTCTCTTTCATCTGCCTCTGGGGTCTCTTATTAATAGTTCGATGCTCAGTCAGAGTTGTTTTGGCCTGGTGTCTTTAATGTTTCAATGCATTAAACCCTTAATGCCCCCATCATTGGTACACCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 453897 344 + 636262 AGTAAAATTTACTCCATGGAAGAATGGAAGATATGATTTTGATTGCCCTGGCTTGGCCTATTTTGTTGTTCTTGCTATGTGGTTTGTGAGATATATGGTGTCCATCAGAAATTATACTAGTCATCTGATTAGTAGAAAGGGATAAGAAGGGTAAGGTTCAACAGTGTGACAAGTTAGGTCCACTAACTAGTTGTTAAGATCACATCCCATGGTTGGAACTCTCTTTCATCTGCCTCTGGGGTCTTTTATTAATAGTTCGATGCTCAGTCAGAGTTGTTTTGGCCTGGTGTCTTTAACGTTTCAATGCATTAAACCCTTAATGCCCCCATCATTGGTATACCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 465805 343 + 647215 AGTAAAATCTACTCCACAGAATAATGGCAGATGTGATTTGGATTCTCCTGGCTTGGCCTATTCTCTTGTTCTTGCTATGTTGTTCGTGAGA-ATATGGTGCCCATGAGAAATTATTCTAGTAATCTGATCAGCACAAAGGGATCTGACTAATAAGGCTCAACAGTGATACAAGTTAGGTCCACTAACTAGTTGTTCAGATCACATCCCATGGTTGGAACTCTTATTCGTCTGCCTGTGGGGTCTCTTATCAATTGTTCAATCTTCAGTCAGAACTGTGTTGGCCTGGTTTCTTTAATGTTTTAATCCATTAGACCCTAAATGCCCCTGGCATTGGTACACTCAT + +a +s mr.mrrefChr3 12560 82 + 181019 TACTGACAAATACAGTGACTTTCCACAAAAGTGATAAAAAGTAATCATCATAGAAGTTTCAATCATTCTATGGAGGGTTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454241 82 + 636262 TAATGACAAATACAGTGACTTTCTATAAAAGTGATAAAAAGTAATCATCATAGAAGTCTCAATCATTCTGTGGAGGGTTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 466153 82 + 647215 CACTTACAAATACAGTAACTTTCCACGAAAGTGATAAAAAGTAATCATCTTAGGATTTCCAATCATTCCATGAAGGGTTCTT + +a +s mr.mrrefChr3 12642 19 + 181019 TGATGTTATGAGTCATGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454323 19 + 636262 TGATGTTAAGATTTATGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 466241 19 + 647215 TGAAATTATGAGTCATTGC + +a +s mr.mrrefChr3 12661 64 + 181019 CGAGCACCCCTAATAAACCAATGTGGAACCCTACTCAACCAGAGAGAGCCCAACTGTGTTATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454342 64 + 636262 CGAGCACCCCTAATAAACCAATGTTAAACCCTACTCAACCAGAGAGTGCCAAACTGTGTTATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 466276 63 + 647215 CACGCA-CCCTAATAGGCCAATGTGGAACTGCACTTAACTAGAGAGAGCCCATCTGTGTTATGT + +a +s mr.mrrefChr3 12725 26 + 181019 CCTTTATTCTTAGAATCTAGATCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454406 26 + 636262 CCTTTATTCTTAGAATCTAGATCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 466340 11 + 647215 CCTTTATTGTT--------------- + +a +s mr.mrrefChr3 12751 54 + 181019 TGGTGTTTAGATACCAACCTAAGGTGATGTGCTCTCTCCTAGCTTGGTCAGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454440 54 + 636262 TGGTGTTTAGATACCAACTCAAGGTGATGTGCTCTCTCCTAGCTTGGTCAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 466351 41 + 647215 -------------CCCACCTAAGGTCATGTGTTTTCCCCTAGCTTGGTTAGACG + +a +s mr.mrrefChr3 12805 70 + 181019 AACTTTTATGGGCAAACACAGATAGCAATTCCAATGAATATGAGTGTTAACCTGATAAGTAAACTTAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454494 70 + 636262 AACTTTTGTGGGCAAACACAGATACTAATTCCAATGAATATGAGTGTTAACCTGACATGTGAACTTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 466393 68 + 647215 AACTTTCATGGGC--ACACAGATAGCAATTCCAATGAATTTGAGTGTTAACCTGATAAGTAAACTTAAGT + +a +s mr.mrrefChr3 12875 567 + 181019 AGTTAGTAGCACACTGGGGGACATTCGGGTCTAACCAAGTATGAAAAAGGGAGGTTCCCTCGTGTTTACAAGCCAACCTCCTACCCTGTAGCCTGTTTTGCATCCATGAGTAATTAAAAAATTACTGAAGTGGCACATGCCTTTTTACAATGCCACAGAGATCCTTTAAGTTCTTCTTCTCAACTGTATAGATATTGCGTGCTGTAAATATTCCATTGTTTATGCGGGGCATGTTACATAAACTTCTCAGTCTCAGTCATATATGACAACTTACTATTTAAGCACCCTAATTTGCTGCCCTGATTTCAGCTGCCCTAGCTCCACTCTAGGAGGTCAATGACTGGCATTGACCATGTTTGAACTGGCATTAACCATGTATGAGCCTCAGGTACGTCTTTCTTAATTTTATACTACTATGTATATCAAATAGATGAATAATGCTTGCTTGTAGTGAGAATAAGAAATACCTATATAGCCCCTTACAAATTTTGTCAATACGATTAAGAGTTAGTCCTCTCTAGGGCAATAGGTTAGCAGAAGTAAAATTGTGCTGAAGATGTAAATTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 454571 560 + 636262 AGTTAGTAGCACACTGGGGGACATCCGGGTCTAACCAAGTATGAAAAAGGGAGGATCCCTCGTGTTTACAAGCCAACCTCCTACCCTGTAGCCTGTTTTGCATCCATGAGGAATTAATAAATTACTGAATTG------GCCTTTTTACAATGCTGCAGAGATCCTTTAGGTTCTTCCCCTCGACACTATAGATATTGCGTGCTGTAAATATTCTATTGTTTATGCGGGGCTTGTT-CATAAACCTCTCAGTCTCAGTCATATATGACAACTTACTATTCAAGCACCCTAATCTGCTGCCCTGATTCCAGCTGCCCTAGCTCCACTCTAGGAGGTCAATGACTGGTATTGACCATGTTTGAACTGGCATTAACCATGTATGAGCCTCAGGTACGTCTTTCTTAATTTTATACTACTATGTATATCAAATAGATGAATAATGCTTGCTTGTAGTGAGAATAAGAAATACCTATATAGCCCCTTACAAATTTTGTCAATACGATTAAGAGTTAGTCCTCTCCAGGGCAATAGATTAGCAGAAGTAAAATTGTGCTGAAGATGTAAATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 466461 567 + 647215 CATTAGTAGCACATTGGGGGACATTTTGGTCCAACCAAATATGACAAAGGGAGGTTCTCTTGTGTTTACAAGCCAACCTCCTAACCTGTAGCCTGTTTTGCATCCATGGGTAATTAGAAAATCAGTGAAGTGGCACATGCCCTTTTACAATGCCACAGAGATCCTTTAAGCTCTTCTTCTCAACTGTATAGATATTGCGTCCTGTCACTATTCCATTGTTTGTGCTGAGCATGTTATGTAATCTCCTCAGTGTCAGTCATATATGACAACTTACTACTTAGGCACCCTAATTTGCTGCCCTGACTTCGGCTGCCCTAGCTCCACTGTAGGAGATCAATGACTGGCATTAACCATGTTTGAACTGGCATTAACCATGTATGAGCCTCAGGTACATCTTTGTTAGCTTTATACTACTATGTATGTCAAATTGATGAATCATTCTTGCTTGTGGTGAGAATAAGAAATACCTATATAGCCCCTTACAAATTTTGTCAAAACATGTAAAAGTCAGCCCCCTTTAGGGCAATAGGTTAACATAAGAAAAAATGGGCTGAAAATGTAAATTGT + +a +s mr.mrrefChr3 13442 140 + 181019 GTGCTACATCCCCAGTATAAGGTTAGGAAACAACAAAAGTAAAATTCTCTCTTAGGGTTGAGTTGGCAAGTCAACATTGAGAAATCTTCATTGACAATAATTTCTTGCATGAACATTCTGTTATGTCACTCAGAGCAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455131 139 + 636262 GTGCTACATCCCCAGTATAAGGTTAGGAAGTAACAAAAGTAAAATTCTCTCTTGGGGTT-AGTTGACAAGCCAACATTGAGAAATCTACATTGACAATAATTTCTTGCATGCACATTCTGTTATGTCACTCAGAGCAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 467029 140 + 647215 GTGCTACATCCCCAGTAAAAGGTTAGGAAACAAGAAAAGTAAAATTCCCTCTCAGGGTTGAGTGGGCAAGTCAACATTGAGAAATCTTCATTGACAATAATTTTTTGGGTGAACATTCTGTTATGTCCTTAGGATTTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 13582 11 + 181019 CATACCAGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455281 11 + 636262 CATACCAGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 467169 11 + 647215 CATACAAGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 13593 44 + 181019 TAGGATTTGAACATACAAGAATTTCATAAGTAGCCTGTGATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455292 44 + 636262 TAAGAGTTGAAAATACAAGAATTTCATAAGTAGCCTGTGATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 467240 44 + 647215 TAGGATTTGAACATACAAGAATTTTATAGGTGGCCTGTGGCCTT + +a +s mr.mrrefChr3 13637 179 + 181019 TCACCATTAGTCCTAGGCTTAGGACCTAAGATAGACCTACAAGGGCCTACCAGTATCACACAAAATAACCAAGAAACAAATATGACCAATCTTCTGTCAGTTGAGAAAAAGCATGTGTTGCTATACGATTTCTCAAACACCTGCCATCTGTGCATGTGTGTGTAAAAATACAGAATCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455336 179 + 636262 TCACCATTAGTCCTAGGCTTAGGACCTAAGATAGACCTACAAGGGCCTACCAGTATCACACAAAATAACCAAGAAACAAATATGACCAATCTTCTGTCAGTTGAGAAAAAGCATGTGTTGCTATACGATTTCTCAAACACCTGCCATCTGTGCATGTGTGTGTAAAAATACAGAATCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 467286 179 + 647215 TTACCATGAGTTCTAGGCTTAAGACCTAGGCTAGACCTACAAGGGTCTACCAGTATCACACGAAACAATCAAGAAACAGATATGATCAATCTTCTGTCAGTTAAGAAAATCCACTTGTTGCTATCTGATTTCTTAACCGCCTGCCACATGTGCATGTATTTGTGAAAATACAGAATTAC + +a +s mr.mrrefChr3 13816 107 + 181019 ATAATGCATGTTCTACACCTGGAGCCACCCTCATGATTTTAGTGCGTCCTAGTCCTGTTGCCGTAATACACATTAGAATGTGCTCCACCAAATGTGATAATGATACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455520 107 + 636262 ATAATGCATGTTCTACACCTGGAGCCACCCTCATGATTTTAGTGCGTCCTAGTCCTGTTGCCGTAATACACATTAGAATGTGCTCCACCAAATGTGATAATGATACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 467465 107 + 647215 ATTATGTATGTTCTACACCTAAAGCCACCCTCATGATTTTAGTGTATCCTAGTCTTGTTGCAGTAATGCACATTATAATGGGCTCCACCAATTGTAATAATGAGACT + +a +s mr.mrrefChr3 13923 31 + 181019 GATGGATGTTTATGCTACTACTTAAGGAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455627 31 + 636262 GATGGATGTTTATGCTACTACTTAAGGAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 467573 31 + 647215 GATGGATGTTTATCCTACTACTTAAGCAATA + +a +s mr.mrrefChr3 13954 299 + 181019 AAGTAAATTGAGTGAGGGTGTATAGAGCTGAAGATCTTAGGCTACAGGCAATGGGTGCCAAAAGTGTTCATTACCTAAACTAAATCATTAAGCACCTGGGACTGTTATTTTTTTTGGATGTGTGTAGGTGTTGGCAACTTAGGGTTTGATCCACATTGAGATCACAGGATATATATTATACTAGTTCAGTCATGGGACACTGCCTTGTTGGGATTGTAAAAGTCATGTCCCAATGGGATAATTCTAGGACAGTGATCTAGGACGGTGCAGATGAACTTCAAGTACATGGAGTCCAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 455667 299 + 636262 AAGTAAATTGAGTGAGGGTGTATAGAGCTGAAGATCTTAGGCTACAGGCAATGGGTGCCAAAAGTGTTCATTACCTAAACTAAATCATTAAGCACCTGGGACTGTTATTTTTTTTGGATGTGTGTAGGTGTTGGCAACTTAGGGTTTGATCCACATTGAGATCACAGGATATATATTATACTAGTTCAGTCATGGGACACTGCCTTGTTGGGATTGTAAAAGTCATGTCCCAATGGGATAATTCTAGGACAGTGATCTAGGACGGTGCAGATGAACTTCAAGTACATGGAGTCCAAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 467604 299 + 647215 AACTAAGTTGATGGAGGGTGCATAGAGACAGAGCTCCTAGGATACAGGCAATGAGTGTCAAAAGTGTCCCTGACTTAAAATAAATTGTTAAGCACCTGGGACTGTTATTTTTTTTGGATGGGTGTAGGTGTTGGCAACTTAGGGTTTGATCCAGATTGAGAGCACAGGATATATACCATACTGGTTCAATCATGGGACACCATTTTGGTGGGATTGTAAAAGTTATGTCTCGATGGAACAATTCAAGAATAGTAATCTTGGAAAGCATAGACAAACTTCAAGTACATCGAGTCCAAAGT + +a +s mr.mrrefChr3 14253 44 + 181019 AAATAGGACCCTTATCTCAGATTATAAGTAAACCCCAACAGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458523 44 + 636262 AAATAGGACCCTTATCTCAGATTATAAGTAAACCCCAACAGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 467923 44 + 647215 TGACAGGACTCTTATCTCAGGTTTTAAGCGAGCCCCAACAGACT + +a +s mr.mrrefChr3 14297 270 + 181019 GTTTATGATTGTTGGAAAGGGCTAACTGGGATTCGTCATCCAAAGATTTGCCTTTGAGCGTTCTAGACCACGGTTTGATACTGGATGTGATGGACCTTGAGCAGTAGATTATCGAGGCATGTGTGGTTATTAGGGAGTCAGTCAATAAACTGAGAATTAAAAATGTCCAGTGGAAAGGGAGTAATGTCAACAGCACAAGCTTATACTGAAATGTTATTCAATAAGTTGTATGGAAGCAGGAATATTAACAGTGACACAACACCTTCTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458568 270 + 636262 GTTTATGATTGTTGGAAAGGGCTAACTGGGATTCGTCATCCAAAGATTTGCCTTTGAGCGTTCTAGACCACGGTTTGATACTGGATGTGATGGACCTTGAGCAGTAGATTATCGAGGCATGTGTGGTTATTAGGGAGTCAGTCAATAAACTGAGAATTAAAAATGTCCAGTGGAAAGGGAGTAATGTCAACAGCACAAGCTTATACTGAAATGTTATTCAATAAGTTGTATGGAAGCAGGAATATTAACAGTGACACAACACCTTCTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 467967 270 + 647215 GTTTGTGATTGTTGGAAAGGGCTAACTACAATTCGTCATCCAAAGATCTGCCTTTGAACAGTCTAGACCATTGTTTGACACTGGATGTGATGGATCTTGACCAGTACATTATTGAGGCATCTATAATCATTACGGAGTCAGTTGATAAACTGAGGATTAAATATGTGCAGTGGAAAGGGAGTAATGTCAACAGCACAGCCTTATACTGAAATGACATTCAATAGAGTGCATGTCAGCAGGAATATTATTAGTGACACAACACCTTCTGAC + +a +s mr.mrrefChr3 14567 10 + 181019 AGTTGCTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458838 10 + 636262 AGTTGCTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 468242 10 + 647215 AGTTGATTTT + +a +s mr.mrrefChr3 14577 9 + 181019 CCAGTGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458849 9 + 636262 CCAGTGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 468252 9 + 647215 CTAGTGGTG + +a +s mr.mrrefChr3 14586 39 + 181019 TTAAACATGATGAAGGCTCTCAGAATTTGAATATGCCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458859 39 + 636262 TTAAACATGATGAAGGCTCTCAGAATTTGAATATGCCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 468261 39 + 647215 TTAAAAATGATGTAAGCTCTCAGAATTTGAACATACAGA + +a +s mr.mrrefChr3 14625 156 + 181019 ATGAGCATTGGTACTCAAGTAACTTTGATTAATGTTCCCATTATTATATTGAGCTGGTATGATCAGGCTAAGCAATGATATGTGAGATGGCCAAAGTAATATGCACTTTGCTCCAGGTGTCTATTTTTGGAACTGAACCTGATGGCAGCATTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 458909 156 + 636262 ATGAGCATTGGTACTCAAGTAACTTTGATTAATGTTCCCATTATTATATTGAGCTGGTATGATCAGGCTAAGCAATGATATGTGAGATGGCCAAAGTAATATGCACTTTGCTCCAGGTGTCTATTTTTGGAACTGAACCTGATGGCAGCATTTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 468300 156 + 647215 ATCAGCATTGGTACTCAAGTAGCTTTGATTAATGTTCCCATCATTCTATTCAGCTGGTATGCTTAGGTTATGGAAAGATATGTGACATGGTTAAAGTAATATGTGCTTTGCTCTAGAGATCTATTTTTAGATCTGAATGTGATGGCAGCATTTGGT + +a +s mr.mrrefChr3 14781 57 + 181019 ATAGGGTCACTTTAAGGTTGTGTCTTATCTAGGAGTCAAATTTGTCGACTTGTAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459065 57 + 636262 ATAGGGTCACTTTAAGGTTGTGTTTTATCTAGGAGTCAAATTTGTCGACTTGTAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459193 57 + 636262 ATGCGTCCACTTTAAGGTTGTGTCTTATCTAGGAGTCAAATTTGTCGACTTGTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 468456 55 + 647215 ATAGGGTCACTTTAAGGT--TGTCTAATCTAGGAGTCAAATTTGTCGATTTGTAAGT + +a +s mr.mrrefChr3 14838 25 + 181019 TGTACAGATGCTATTGGTGCTGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459122 25 + 636262 TGTACAGATGCTATTGGTGCTGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459250 25 + 636262 TGTACAGATGCTATTGGCGCTGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 468535 24 + 647215 AGTATAAATGATATTGGTG-GACTC + +a +s mr.mrrefChr3 14863 41 + 181019 AACGCACAAGCCTGAGATCACATTTTACAAGCATTACTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459152 41 + 636262 CACACACAAGCCTGAGATCACATTTTGCAAGCATGTTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459275 41 + 636262 AACGCACAAGCTTGAGATCTCATTTTACAAGCATTACTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 468559 40 + 647215 AATGC-CAAGCCTGAGTGCACATGTCTCAAGCATTACCCAA + +a +s mr.mrrefChr3 14904 35 + 181019 TACACCTTGATTTCTAAACTATGCAGCATCCAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459316 35 + 636262 TACACCTTGATTTCTAAACTATGCAGCATCCAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 468599 35 + 647215 TATATCTAGATATCTAAACTATGCAACATCCAGAC + +a +s mr.mrrefChr3 14939 33 + 181019 CACCCAGCATGAGATATAACATTTAGAGCTCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459356 33 + 636262 CACCCAGCATGAGATATAACATTTAGAGCTCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 468634 33 + 647215 TGCCCAGCATGAGATATAACATTTAGAGCTCGA + +a +s mr.mrrefChr3 14972 206 + 181019 GTTGTATGAGCTTTTATAACATACCATATGAGTATGTAAACTCATCAAGTTTTAGTACGTACAGACAATCTCCCATAAGTTTCAAGGATGCCCTTCAAGCACTGTCATTTAAACTGCCATTAAAGCTGATGCCATATATAATAACTAGTGGCTATCAAGATTTTTGGTTCTACAAACACTCATGCATTCTGTTGTACATTTTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459390 206 + 636262 GTTGTATGAGCTTTTATAACATACCATATGAGTATGTAAACTCATCAAGTTTTAGTACGTACAGACAATCTCCCATAAGTTTCAAGGATGCCCTTCAAGCACTGTCATTTAAACTGCCATTAAAGCTGATGCCATATATAATAACTAGTGGCTATCAAGATTTTTGGTTCTACAAACACTCATGCATTCTGTTGTACATTTTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 468667 206 + 647215 GTTGTATATGCTCTTATAACATACCATATGAGGGTGTAAACTCATCAAGGTTTAGTATGTACAAATAACCCCCCATAAGTTTCAAAGATGACCTTTCAGCTCTGTCATTTAAACTGCTATTAAGACTGAGGCCATCTATGATAATTGGTGGCTATCAAGTTTTTTGGTTCTACAAATACTCATGCATTCTGTTGTACATTTTCGTT + +a +s mr.mrrefChr3 15178 84 + 181019 GGAAATCCCTCCCTTAGCATCTGAATTGTCTTAGCAACATCATTCCTTAATTGGAGGATGCCCACAACAAGATGCACACCTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459597 84 + 636262 GGAAATCCCTCCCTTAGCATCTGAATTGTCTTAGCAACATCATTCCTTAATTGGAGGATGCCCACAACAAGATGCACACCTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 468873 84 + 647215 GGAAATCCCCCCCTTAGCGTCTGAATTGTCTTGGTAAAATCATTCCTTAATGGAAAGATGCCCTCACCAAGAGGCACACCTTAT + +a +s mr.mrrefChr3 15262 51 + 181019 TCCCTGTCTCAGCCTGATCAGTTCATTGAACTTGACATGGAAGAAAATTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459683 51 + 636262 TCCCTGTCTCAGCCTGATCAGTTCATTGAACTTGACATGGAAGAAAATTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 468957 51 + 647215 TCCCTGTCTCAGCCTGATCGGTTAATTGAACTTGACATGGGAGAAAATTTT + +a +s mr.mrrefChr3 15313 61 + 181019 TGCAAGGCTGCCCTTCAATTGCATGGCAACCTTCTGATCAAACCAGTGAACAATCTGATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459734 61 + 636262 TGCAAGGCTGCCCTTCAATTGCATGGCAACCTTCTGATCAAACCAGTGAACAATCTGATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 469048 61 + 647215 GGCAAGGCTGCCCCTCAATTGCATGGCAACCTTCTGATCGAACCAGTGAACAATCCCATAC + +a +s mr.mrrefChr3 15374 225 + 181019 TAGGGCCAAAAATCGAGTTGGTTGAAATTGACAGCCACTTCCCCACAGAGTAAAACAGTTTCATGCCCTGCATGCCACTCCTCAAGTTTGGTGATTCAGAACACTTGCCTATCGTGTCCACATCATCGCTAGGCCAACCAAAAaccttgatgagtctgagttttacaattttcaaatcactactgctggaagggctgcaagcaagttGATTGTCTAAAATGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 459806 225 + 636262 TAGGGCCAAAAATCGAGTTGGTTGAAATTGACAGCCACTTCCCCACAGAGTAAAACAGTTTCATGCCCTGCATGCCACTCCTCAAGTTTGGTGATTCAGAACACTTGCCTATCGTGTCCACATCATCGCTAGGCCAACCAAAAACCTTGATGAGTCTGAGTTTTACAATTTTCAAATCACTACTGCTGGAAGGGCTGCAAGCAAGTTGATTGTCTAAAATGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 469109 225 + 647215 TAGGGCGAAAGATCGGGTTAGTTGAAATTGACAGCCACTCCCCCATAGAGCAAAACAGTTTCATGGCCTGCATATCACTCTTCTAGTGTGGTGATTCAGAACACTTGCCTATCATGTCCACATCATCACTAGGCCAACCAAAAaccttgatgagtctgaactttgcgactttcaaatcactagtgctggaagggctgcaaacaagttGATTTTGTAAAATGATGT + +a +s mr.mrrefChr3 15599 98 + 181019 AAGAGGGAGTAAGTCAGTGACACAACCTTATTGTAAGTTAGACAGTGAAAAGGAGATTCTAACAGCTCCATAGCTTTATGTCAAGATACTTACCTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460032 98 + 636262 AAGAGGGAGTAAGTCAGTGACACAACCTTATTGTAAGTTAGACAGTGAAAAGGAGATTCTAACAGCTCCATAGCTTTATGTCAAGATACTTACCTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 469334 98 + 647215 AAGAGGGAGTAAGTCAGTGACACAACCTTATTGTAAGACAGACATTGAAAAGGAGATTTTAATAGCTCCATAGCTTTATGTCAAGATACTTACCTTAC + +a +s mr.mrrefChr3 15697 9 + 181019 AGTTACACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460130 9 + 636262 AGTTACACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 469433 9 + 647215 AGTTATACT + +a +s mr.mrrefChr3 15706 88 + 181019 AAGCATATAGGAGCCAGTAGGTGGGTCGGGCCATTCATAGTTAAGAGCACACGTGGGGCAAGGAATGTCTTAAGCTGTTGAGAAGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460139 88 + 636262 AAGCATATAGGAGCCAGTAGGTGGGTCGGGCCATTCATAGCTAAGATTACACGTGGGGCAAGGAATGTCTTAAGCTGTTGAGAAGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 469443 88 + 647215 AAGCATATACAAGCCAGTAGGTGGGTCGAGCCATCTATAGTTAAGAGCACACATGGGGCAAGGAATGTCTTAAGCTGTTGAGAAGCAT + +a +s mr.mrrefChr3 15794 154 + 181019 AAAGTTCAGATGACGCAGATGAGACACCGATGGCTGGTAGCGTGAGGCGCCATGTAACCCCAAGCGACTAGGTAAGTTGCAGGTATCTCTTCGGACCAGTCAGAATAGCAACGAAACTGGATGCTCAATCTAACGTTCAGGCCAGCGGGCCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460233 154 + 636262 AAACCTCAGATGACGCAGATGAGACACGGATGGCTGGTAGCGTGAGGCGCCATGTAACCCCAGGCGACTAGGTAAGTTGCAGGTATCTCTCCGGACCAGTCAGAATAGCAACGAAGCTGGATGCTCAATCTAACGTTCAGGCCAGCGGGCCCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 469531 149 + 647215 AAAGT-----TGAAAAAGATAAAACAGCGTTGGCTGGTAGCGTGAGGCGTCATGTAACCCCAAGCGATTAAGTAAGGTGCAAGTATTTCTTCGGACCAGTCAGAATAGCAAAGAAATTGGCTGCTCAATCTAACGTTCGAGCTACAGGTCCCGT + +a +s mr.mrrefChr3 15948 64 + 181019 TGGAGATCAGGAGTGAGTCATAGCCAACTGTCTGGTAGTCTGGAGGTGGATTACATAGCACTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460387 55 + 636262 TGGAGATCAATAATAAGTCATAGCTAA---------ACTCTGGAGGTGGATTACATAGCACTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 469682 64 + 647215 GAGAGATCAGGAGTGAGTCATAGCCGACTGTCTGGTAGTCTGGAGATGGATTACATTGCACTTT + +a +s mr.mrrefChr3 16012 156 + 181019 TCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTATAGCTCAACAGGCTCCAATTGTGTAACCTCTAAGCTGTAAGTGACAGAGGGTTAGCTAGTAATATTGAGGATGTTAAAAGACAGGGGGGGAtggctGTGACAATACAAATATATGTGGAATGGAGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460442 156 + 636262 TCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTAGAGCTCAACAGGCTCCAATTGTGTAACCTCTAAGCTGCAAGTGACAGAGGGTTAGCTAGCAATATTGATGATGTTAAAAGATAGGGGGGGATGGCTGTGGCAATACAAATATATGTGGAGTGGAGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 469775 151 + 647215 CCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTATAGCTCAACATGCTCCAATTGCTTAACCTCTAAGCTGTAAGTGACAGAGTGTTAGCTAGTAATATTGAGGATGTTAAAAGACAGGGGGGGG-----GGGACAATACAAGCATATGCGGAATGGAGTATG + +a +s mr.mrrefChr3 16168 132 + 181019 AGAGgcaaaacggagtgggaatgttagcaacacaacacattcatgagggagtaatgtACTGACCCTATACGGTACACGATCAGGACGTCCTACCCTTCGAGAATAAATTAATATGAAGGGATTCTGGTCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460598 131 + 636262 AGAGACAAAACGGAGTGGGAATGTTTGCAACACAAC-CATTCATCAGGGAGTAATGTACTGACCCTCTACGGTACACGATCAGGACGTCCTACCCTTCGAGAATTAATTAATATGAAGAGATTCTGGTCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 469956 132 + 647215 AGAGgcaaaatggagggggaatgttagcaacacaacacactcatgagggagtaacatACTGACCCTATACGGTACACGATCAGGACGTCCTACCCTTCGAGAATATATTAATATGAAGGAATTCTCGTCTTT + +a +s mr.mrrefChr3 16300 7 + 181019 GGGCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 351919 7 - 647215 GGGCAGG + +a +s mr.mrrefChr3 16307 18 + 181019 AGAGCATTCCCCAACCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 351930 18 - 647215 AGTGCATTCCCCAACCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 470088 18 + 647215 GAATCATTGACCCACCCA + +a +s mr.mrrefChr3 16325 33 + 181019 GTGTGATTAGATCAGTAAACTATCCCACCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 351948 33 - 647215 GTATGATTAGATCAGTAAACTATCCCACCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 470110 33 + 647215 GTGTGATTAGTTCAGTAAACTATCCCACCCAGT + +a +s mr.mrrefChr3 16358 6 + 181019 CTAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 470143 6 + 647215 CTAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 16364 55 + 181019 GATTGATTTGTAGAGATTGAAAGGACGTGATGCTTGGCCTATAATGCTCCATAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 470156 55 + 647215 GATTGATTTGTAGAGATTGAAAGGACGTGATGCTTGGCCTATAATGCTCCATAAA + +a +s mr.mrrefChr3 16419 24 + 181019 AGATCTATAGATAAAGTTGGAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 351981 24 - 647215 CTGTCTATAGATAAAGTTGGAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 470211 23 + 647215 AGA-CTATAAATAAAGTTGGAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 16443 1 + 181019 T +s simRat_chr6.simRat.chr6 470234 1 + 647215 T + +a +s mr.mrrefChr3 16444 96 + 181019 GAAGGGCTCACATGCTAAGCCTGTAATATCCAGGTGAATACAGTAGAACCATATTGACCCAAAAGAATTTGCTGTTCTTGGATGGTATGGTACTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 352005 96 - 647215 GAAGGGCTCACATGCTAAGCCTGTAATATCCAGGTGGATATAGTAGAACCATATTGACCCAAAAGAATTTGCTATCCTTGGATATTATGGTACTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 470235 96 + 647215 GAAGGGCTCACATGCTAAGCCTGTAAAACCCAGGTGAATACAATAGAACTTTATTGACCCAAGAGATTTTGCTGTTCTTGGATGGTATGGTACTAG + +a +s mr.mrrefChr3 16540 22 + 181019 ATGTGTGATTGACCCACACTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460732 17 + 636262 -----TGATTGACCCACACTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 352101 5 - 647215 ATGTG----------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 470332 5 + 647215 ACCTC----------------- + +a +s mr.mrrefChr3 16562 21 + 181019 TGTTCATCAGGGTTTTTACCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460749 21 + 636262 TGTTCATCAGAGTTTTTACCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 470337 21 + 647215 TGTTCATTAGGGTTTTTACCG + +a +s mr.mrrefChr3 16583 42 + 181019 TATGGATGATGGTCCCGGCAACGACACGTCACACACGGATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460772 42 + 636262 TATGGATGATGGTCCCGGGAACAACACGTCACACACGGATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 470358 42 + 647215 TATGGATGATGGTCCCGACAACGACACGTCACACACGGATTG + +a +s mr.mrrefChr3 16625 437 + 181019 GTCAAAAAGGGGTCAGTCATTTCTACTGGTAGAATCTATTGACCTATTGTCAGCGTGCATACGAATGCAAACTCATTCCCTCCATGTTATATGCCCTTTAACCCACCCGAAACGAAGAGTAGCCGGATCAGAAGAACTTGATGGCAGCAGGCCCAATAGATTGCTGTCTAGCCGGGCCAGACTTAGAGGTGTGGACACTGAATAGAGAATTATAGGTATTTTGGTAAATCGTCGACCATGCACAGGAAGTCGTAGAACCGCGCCGCGGGAGCGGCGGCGGCCAGAACCATTCCGTGACAAGTGGGATATTCAGCAACCTAGTATCTCGTTGCCACTAGCACACACACCTGACAGACCCTTACTCGCAGCCCTTTAAGATTAAATGAAGTTGTTGAACTTTTAACAACAACCATGCAGGTATGCTGCAAGCAGGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 460822 432 + 636262 GTCAAAAAGGGGTCAGTCATTTGTACTGGTAGAATCTATTGACATATTGTCAGCGTGCATACGAATGCAAAGTCATTCCCTCCATGTTATATGCCTTTTAACCCACCCGAAACGAAGAGTAGCCGGATCAGAAGAACTTGATGGCAGCAGGCCCAATAGATTGCTGTCTAGCCGGGCTAGACTTAGAGGTGTGGACACTGAATAGAGAATTGTAGGTGTTTTGGTAAATCGTCGACCAGGCACAGGAAGTCGTAGAACCGCGCCACGGGAGGGGCGGCGGCCAGGGACATTCCGTGACAAGTGGGAT-TTCAGCTACCTAGTAACTCGTTTCCACTAGCATACACACCTGACAG----TTACTCGCAGCCCTTTAAGATTAAATGAAGTTGTTGAACTTTCAACAACAGCCATGCAGGTATGCTGCAAGCAGGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 470400 436 + 647215 GTCAAGAAGGGGTCAGTCATTTCTACTGGTAGAATCCAG-GACCTATAGTGAGCGTGCCTACGAATGCAAACTTACTCCCTCCATGTTATATGCTCTATAACCCACCCGAAAGGAAGAGTATCCGGATCAGAAGAATTAGATGGCAGCAGGCCCAATACATTGCAGTCTAGCCGGGCCAGACTTAGAGGTGTGGACATTGAATAGCAATTTATATGTATTTTGGTAAATCGTCGACCATGCACAGGAAGTCGTAGAACCACGCCGCGGGAGCGGCGGCGGCCAGAACCATTCCGTGACAAGTGGGATATTCAACAACCTCGTATCTCGTTGCCACTAGCACACAGACCTGTCGGACCCTTACTTGCAGCCCTTTAAGACTAAATGAAGTTGTTAGACTTTTAACAACAACCATCTAGGTATATTATAGGCAGGCACA + +a +s mr.mrrefChr3 17062 563 + 181019 GGAAGGGTTTACAGTGAGTTGTACAATGGAGGCAGTGAACTAGGAGGCCTCAAGGTTTTGACACAACCATTGATTATAATGCAACCCTAATATGGTAATCTCAGCGCCAATTGTTTGGTACCATCAGACCCAGAACATTCAGACCAAGGGAATGCAGGAGCAGCTCCAAAACAACTAACACAAAGGGAGCCTTAAAGATTGTGTAGGCCATTCCCCTCGCAATTAACACCAAGCTAAAGTTGGTTCAGATCTTTTGCATAGCCATTTGCTACAAAAGACCAAACCACAGAGTTCTCAGACCTTTTCATAATTTCAGTATGGTTTGAGGGCAGCACCTACTTATGAGAGTTTGAATGTCATGTTAGCAATCTCTAAGCTTCACATGTGTGGCTCTGGCCCTTTTTTCCTCATCCATCTACCATGCAAAACTCCCAATGACTAAGGTCAGAAGATCTATGTGGACTCGTTAGATTGGCACGGTTTGTATAAATCCATGTTTGATGTCGTGATCAGTATATCATTGGCCTGACAACTAGTTGTGAGGTATTCTCTTATCGCAGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 461254 542 + 636262 GGAAGGGTTTACAGTGAGTTGGACAGTGGAGGCAGTGAACTAGGAGGC-TCATGGTTTTGACACAACCTTTGATTATAATGCAACCCTAATATGGTAATCTCAGCGCCAATTGTTTGGAACCATCAAGCCCAGAACATCCAGACCAAGGGAATGCTGGAGTAGCTCCAAAACAACTAACACAAGGGGAGCCTTAAAGATTGTGTCAG--------------------ACCAAGCTAAAGTTGGCTCAGATCTTTTGCATAGCCATTTGCTACAAAAGACCAAACCACAGAGTTCTTAGACCTTTCCATATTCTCAGTATGGTTTGAGGGCAGCACCTACTTATGAGAGAATGAATGTCGTGTTAGTGATCTCTAAGCTTCACATTTGTGGCCCTGGCCCTGTTTTCTTCATCCGTCTGCCATGCAAAACTCCCAATGACTAAGGTCAGAAGATCTATGTGGACTTGTTAGATTGGCACAGTTTGTATAAATCCATGTTTGATGTCGTGATCAGTATATCGTTGGCCTGACGATTAGTTGTGGGACATTCTCTTCTCGCAGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 470847 560 + 647215 GGACGAGTTTAGAGTGAGTTGTACAACGGAGGCAGTGAACTAGGAGGCCTTAAGGTTTTGCCAGGAACAATGATTGTAATGCTACCCTAATATGGTAGATTCAGCACGAATTGTTTGGTACCATCAGACTCAGAACATTCAGCCCAAGGAAATGCAGGAGCAGCTCCAAAAAAGCTAACACAAAGGGAGCCTTAAAGATTACATAGGCCATTCCCCTCGCAATTAACACCAAGCTAAAGTTGGTTCGGATCTTTTGCATAGCCATTTACTACAAAAGACCAAATCACAGAGTGCTCAGAACTTTTCAAAATTTCAGGATGGTTTGTGGGCAGCACCTAATTATGGGAGTTTGAATGTCATGTTAGCAATCTCTAGGCTTCACATGTGTGGCTCTGGCCATTTTTTCCTCATCCATCTACCACGCAAAACTCCCCATGACTAAGGTGAGAAGATCTATTAGG---CTTTAGATTGGCACGGTTTGTATATATCCATCTTTGATGTTGTTATCAGTATATCATTGGCCTGGCAACTCGTTGTGAGGTATTCTCTTATCGCAGAAG + +a +s mr.mrrefChr3 17625 179 + 181019 TAACTCTTCCAGACAGCATTGCTATACAGCACACCCTACACTATCCTCAGGTTAGGTGACTATTTTATAATCATGTTTTGTGCTTTTTGTTTTGATTGTTAAACTCTTGACTCGTTTGGAATTGGTTCAGTTGCACTTTTGACCTGTACCAATATCATACATTGCAAAGCACTAATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 461799 178 + 636262 TAACTCTTCCAGACAGCACTGCTATACAGCACACCCTACACTATCCTCAGGTTAGGTGACTATTCTAGAATCATGTTTTGT-CTTTTTGTTTTGACTGGTACACTCTTGACTCGTTTGGAATTGGTTCAGTTGCACTTTTGACCTGTACCAATATCATACATTGCAAAGCACTAATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 471407 179 + 647215 TAACTCTTCCAGACAGCATTGCAATACAGCACACTCTACGCTATCCTCAGGTTAGGTGACTATTTTATAATCATGTTTTGTGCTTTTTGTTTCAATTGTTAAACTCTTGACTGGTTTGGGATTGGTTCAGTTGCACTCTTGACCTGTACTGACTGCATATATTGCAAAGTGCTAATCAT + +a +s mr.mrrefChr3 17804 11 + 181019 TCATCTTCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462007 11 + 636262 TCATCTTCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 471586 11 + 647215 TCATCTTCCTG + +a +s mr.mrrefChr3 17815 11 + 181019 CCAGCCTTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462018 11 + 636262 CCAGCCTTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 471598 11 + 647215 CCAGCCTGGAA + +a +s mr.mrrefChr3 17826 14 + 181019 GATTAGTTCTCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462031 14 + 636262 GATTAGTTCTCCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 471609 14 + 647215 GTTTAGTTCTCCCC + +a +s mr.mrrefChr3 17840 165 + 181019 TTAATAACTTGAATGGTCCTCACCAGAGGAAGAACTTAAGCTTTTGGCTGCATAATGTTTGAATACTGGTGTTTAGATTTAAGTGGTTGCCTGTACACTAGAGTGTTTCCAGCACTTGAGGAAAATTATTGAATTGCCTGTAAATAAATGTCAAATCTGTGAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462045 158 + 636262 TTAATAACTTGAATGGTCCTCACCAGAGGAAGAACTTAAGCTTTTGGCTGCATAATGTTTGAATACTGGTGTTTAGATTTAACTGGTTGCCCGTACACTAG-------CCAGTACTTGAGGAAAATTATAGAATTGCCTGTAAATAAATGTCAAATCTGTGAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 471643 165 + 647215 TTCATGACTTGAATGATCCTCACCAGAGGAAGAACCTCATCTTCTGGGCCAATATTGTTTGAATACTTGTGTTCAGATTTAAGTGGTTGCCTGGTCACTAGAGTGTTTCTGGCACTTGAGGCAACTTATTGAATTGCCTGTAAATAAATGTCAAATCTGTGAAGT + +a +s mr.mrrefChr3 18005 231 + 181019 CATTTTAGTAAATATTCTCAGAAGCTGTGCATTACATAGATCAGCATCAACCTGTAAGATGCAGAACATCCTATGTCAAATTTAATTAGTATAATAGGGTGCAATAAGTAGCTTTTCTGGTCATCACTATGAATGTGTAGGCAAGTGTGTAGACCTAAAAACCTAACAATTGTACTCGTTGCACATTTCTATATCCTTCAATATCCTTCTGCATGAGTGGAGCTAGCCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462203 231 + 636262 CATCCCAGTAAATGTTCTCAGAACCTGTGCATTACATAGACCTGCATCAACCTGTAAGATGCAGAACATCCTATGTCAAATGTAATTAGTATAATAGGGTGCAATAAGTAGCTTTTCTGGTTATCACTATGAATGTGTAGGCAAGTGTGTAGACCTAACAACCTAACAATTGTACTCGTTGCACATTTCCATACCCTTCAATATCCTTCTGCATGAGTGGAGCTAGCCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 471819 231 + 647215 TATTTTAGTAAACAGTCTTAGAAGCTATGCATTACATAGATCAGAATTAACCTGTAAGATACAGAACATTCTATGTTAAACTTAATTAGTATGATAGCGTGCAATAAGTAGGTTTTCGGGCCATCACGATTAGTGTGTAGGCCAGTGCGAAAACCTAAAAACCTGACAATTGTACTCATTGCACATTTCTATATCCCTCAATACCTGGATTCATGAGTTGAGCTAGTCCCT + +a +s mr.mrrefChr3 18236 70 + 181019 CATTGTCCACCTTCATTAACTTCAGATATGGTTGGTCGTAATAGTGCTTACTCTCTTATCCATTAAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462434 70 + 636262 CATTGTCCACCTTCATTAACTTCAGATATGGTTGGTCGTAATAGTGCTTACTCTCTTATCCATTAAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 472131 70 + 647215 CCTTAGCCATCTTTATTAACTTCAGATATGGTTAGTTGTAATAGTGCTTACTCTCTTATCTGTTAAAACA + +a +s mr.mrrefChr3 18306 41 + 181019 ATTTTAGCTAAATTGGTCAAAACATGGCATACACTGCAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462504 41 + 636262 ATTTTAGCTAAATTGGTCAAAACATGGCATACACTGCAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 472203 41 + 647215 ATTTTAGCTAGATTGGTCAAAACATGGCACACACTGCAAGT + +a +s mr.mrrefChr3 18347 265 + 181019 AGTGACGCCACAGATTTTACTACAGTGTAAAACTTGAACTGCAGACCCCCAGGGCATCTGAATCATCAGTTAAACTACTCAAGGATACAATGCACAATTAATGTGCCCCTTATATGTTATTGACTTCTTTTCATGAGTCTGACATCTTATATGTCTATCCTATGTTAAACACAATGTCTAGCAAGTATGGACCTTCCAGGTTGATTCCTCCTCAGTCCTCATCAGAAAGACTGGTGAAAAATCCACTTTTAACATCACTGTGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462545 264 + 636262 AGTGACGCCACAGATTTTACTACAGTGTAAAACTTGAACTGCAGACCCCCAGGGCATCTGAATCATCAGTTAAACTGCTCACGGATACAACGTACA-CTAATGTGCCCCTTATATGTTATTGACTTCTTTTCATGAGTCTGACATGTTATATTTCTACCGTATGTTAAACACAATGTCTAGCAAGTATGGACCTTCCAGGTTGATTCCTCCTCAGTCCTTATCAGAAAGACTGGTGAAAAACCCACTTTTAACATCACTGTGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 472246 221 + 647215 AGTGACACCACAGATTTTACTACAGTGTAGAACTTGAACTGCAGAGCCCCAGGGTATCTGAATTATCAGTAAAACTACTCAAGGATACAATGCACAATTAATGTGCCCCTAATATGTCATTGACTTATTTTCATGAGTCAGACATCTTATGTGTCAATCCTATGTTACACTA--------------------------------------------CCTCATCAGAACGACTGATGAAAAATCCACTTTTAACATCATTGTGCTT + +a +s mr.mrrefChr3 18612 126 + 181019 AAGGGCGGGCTGTGGATATACCCTTAGGGCCTGGGAGACCATGGTCACTGTATGTTGAAACTGTTGAATAAAGAAACAATGGTCCCTGAATGCCACCCAGGTAGTGGAACACTAAATGCGATAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462809 126 + 636262 AAGGGCGGGCTGTGGATATACCCTTAGGGCCTGGGAGACCATGGTCACTGTACGTTGAAACTGCTGAATAAAGAAACAATGGTCCCTGAATGCCACCCAGGTAGTGGAACACTAAATGCGATAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 472484 126 + 647215 AAGTGTGGGCTACCAATCTACCTTTAGGGCCAGGGAGACCATGGTCACTGTATATTGAAACTGTTGAATAAAGAAACAATGGTCCCTAAATGCCACCCAGCTAGTGGGACACTAAATGTGCTAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 18738 61 + 181019 ACTTTATTGAGTCTGAATTGTAGATAGGGATGTGTAAACCATCATAGAATTTAATAGTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462935 61 + 636262 ACTTTATTGAGCTTGAGTTGTAGATAGGGATGTGTAAACCATCATAGAATTTAATAGTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 472650 57 + 647215 ACTGTATTGAGTCTGAATTGTAGGTAGGGATTTGTCATCCA----AGGATTTAGTGGTACA + +a +s mr.mrrefChr3 18799 20 + 181019 TGTGGTGAATCCTGAAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 462996 20 + 636262 TGTGGTGAATCCTGAAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 472708 20 + 647215 TATGGTGAATCCTAAAATAG + +a +s mr.mrrefChr3 18819 8 + 181019 TGTTTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463022 8 + 636262 TGTTTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 472728 8 + 647215 TGAATCCT + +a +s mr.mrrefChr3 18827 14 + 181019 ACTAGACTGCCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463038 14 + 636262 ACTAGACTGCCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 472736 14 + 647215 AAAAGACTACCCAA + +a +s mr.mrrefChr3 18841 38 + 181019 ATAGGAACTCAACAATAACTGGAGTACCTTAGGTAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463057 38 + 636262 ATAGGAACTCAACAATAACTGGAGTACCTTAGGTAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 472750 38 + 647215 ATAGGAATTCAAGAATAACTGGAGTAGCCTGCAATATG + +a +s mr.mrrefChr3 18879 392 + 181019 AGCAACTGGGGAATTTTACTGTAAAAGACTCTAGATTGTGTCCAGAAAGCATTACAAAATCAATGTGATGACCCCATAAGGAAAAGGTGCAGCTCTGTTAGAACAGCTGCTAGGCGGCAGGTGAGTCCAGCAATGACCTGAGTAACTTACACGATGATCTGAGTACTATATATATATATAGATGTCAGCATCCATAGAATTTTTTCATTCTAGTCTCTGGAGTCTCCTTGAGACTTTATGAACATAAATGGCAGCATTAGAAGTTTTGTAGCTTTACCTATGTACTGCCATAGGTGTATTATCTCACTAAGTCGACTCTTGTGTCATGTGGTAATACTTTATAGGATTCACCTCAGCACCTGCATTGCTCACCATTGAACTGATGGAGGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463095 385 + 636262 AGCAACTGGGGAATTTTACTGTAAAAGACTCTAGATTGTGTCCAGAAAGCATTACAAAATCAATGTGATGACACCATAAGGAAAAGGTCC---TCTGTTAGAACAGCTGCTAGGCGGC----GAGTCCAGCAATGACCTGAGTAACTTACACGATGATTTGAGTACCATATGTATATATAGATGTCAGCATCCATAGAATTTTTCCATTCTAGTCTCTGGAGTCTCCTTGAGACTTTATGAACATAAATGGCAGCATTAAAAGTTTTGTAACTTTACCTATGTACTGCCATAGATGTGTTATTTCACTAAGTTGACTCTTGTGTCATGTGGTAATACTTTATAGGCTTCACCTCAGCACCCGCATTGCTCACCATTGAACTGATAGAGGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 472790 384 + 647215 AGCAGTTGAGGTATTTTACTTCGTAAGACTCTAGCTTATGTCCAGAAAGCATTACAAAAAGAGTGCGATGACCCCATAAGCAAAAGGTGCAGCTCTGTTAGAACAGCTGCTAGGCGGCAGGTGGGTCCAGAAATGGCCTGAGCAACTTACATGATGAACTGAGTACTATATATATATATAAATGTCAGCATCCACAGATTTTCTTCATTCTAGTCTATGGAATCTCCTTGAGACTTTATGAACATAAATGGCAGCATTAGAAGTTTTGCAGTTTTACCTA--------CATAGGTGTATTATCTCACTTAGTCAACTCTTGTGTCATGGGGTATTACTTGATAGGATTCACCTCAGTACCTGCATTACTCACAGTTGAACTGATGGAGCTGA + +a +s mr.mrrefChr3 19271 62 + 181019 CAAGTCAACCTGTTGACTGGATGCACTAAGTGGGGCTGCTTATGTGTACTGACTAATGGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463480 14 + 636262 CAAGTCAACCTGCT------------------------------------------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 473178 62 + 647215 CAAGTCAACCTGTTGACTGGATGCACTAAGTGGGGCTGCTTATGTGTACTGACTAATGGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 19333 18 + 181019 AACACAATGATATGCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463494 16 + 636262 --CACAATGATATGCTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 473243 18 + 647215 AACACAATGATACGCTTG + +a +s mr.mrrefChr3 19351 62 + 181019 TCAGAGATGAAAACAGCATTTACATCTACGCTAGACAAATGCAACATTTGTCTCACAAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463513 41 + 636262 TCAGAGATGAAAACAGCATTTACAT---------------------TTTGTCTCACAAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 473261 60 + 647215 TGAGA--CGAAACCAGAATTCACGTCTACGCTAGACAAATGCAACATTTGTCTCACACAATT + +a +s mr.mrrefChr3 19413 176 + 181019 GGACTTCTTAAGTTTGAGTTTGTAGAAATAAAAGGCAATTGCTGTGATCCCGTAGAGATAAATGTGAAAGGTAACATTATCAACTGCTAATAGTAAATGTTATCAAGGTTAGAGATGGAGTTACATACCTATTAGACATCAGACATATAAGTGACACCAAAATTTGATGTTGGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463554 172 + 636262 GGACTTCCTAAGTTTGAGTTTGCAGAAATAAACGGCAATTGCTGTGATCCCGTAGAGGTAAATGTGAAAGGTAACATTATCAACTGCTAATAGTAAATGCTACCAAGGTTGGAGATGGAGTTACATACCGATTACATATCAGACATATAAATGACACCAAAATTTGATATTG---- +s simRat_chr6.simRat.chr6 473331 176 + 647215 AAACTTCTTAAGTTTGAGTTTGTAGAAATAAAAGGCAATTGCTATGGTCCTGTAGAGATAAATGTGAAAGGTAACATTATCAACTGCTAATAGTAAATGTTGTCGAGGTTAGAGATGGAGCTACACACCTATTAGACATCAGGCATATAAGTGACCCCAAAATTTGGTGTTGGGTG + +a +s mr.mrrefChr3 19589 11 + 181019 GCGTAAGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463726 10 + 636262 -CCTAAGGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 473509 11 + 647215 GAGTAAGGAAA + +a +s mr.mrrefChr3 19600 217 + 181019 CATATGGAGTTTGAGCCCCTGACACAGATCAGCATCAAATATCTCTGTGCCAAATTATACTAGGCACACCTGGATACTAAGACTGGCCTGGTTTAGATAGCTTGTCCCAATATTTATGCACACATTTATGAAGGGTGGGAAAGATGAGACAAGGGATCTAATAATATCAGTAGAGAGGTCTGCAAAAGTCCTAGTAGTTTTGGGTGTGTTGGGTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463736 217 + 636262 CATATGGAGTTCGAGCCCCCAACACAGATCAGCATCAAACATCTCTGTGCGAAATTATGCTAGACACAGCTGGATACTGAGACTGGCCTGGTTTAAACAGCTTGTCCCAATATTTATGCACACATTTATGAAGGGTGGAAAAGATGAGACAAGGGATCTAATAATATCAGTAGAGAGGTCTGCAAAAGTCCTAGTGGTTTTGGGTGTGTTGGGTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 473523 215 + 647215 CGTATGGAGTTTGAGCACCTGACACAGATCAGCATCAAATGCCTCTGTGTCAAATTACACTAGGCACACCTGGACACTAAGACAGGC--GGTGTAGATAGCTCGTCCCAATATTTATGCACACATTTATGAAGAGTGGGAAAGATGAGATGAGGGATCTGAGACTGTCCGTGGAGGGGTCTGCAAGAGGCCTAGTAGTTTCAGGTGTGTTGGGTATG + +a +s mr.mrrefChr3 19817 132 + 181019 GTGGAATATCTCTCCTGAACATGTCAGTTCATACAGGCTCCATATAATTCCCAAGATTGGATACACACACACATCGTGTGAGTGTAGATGATGAGAGGTTGTTAGGTTGGCAAAACTGCCATATGGAGTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 463953 132 + 636262 GTGGAATATCTCTCCTGAACATGTCAGTTCATATAGGCTCCATATACTTCCCACGATTGGATACACACACACATCGTGTGAGTGTAGATGATGAGAGGTTGTTAGGTTGGCAAAACTGCCATATGGAGTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 473740 132 + 647215 GTGGAATATCTCTCCTGAACATGTCAGTTCATACCGGCTCCATATAATTCCCAAGATTGTATACACACACACATTGTGTGAGTGTGGACCCTGAGAGGTTGTGAGCTTGGCGAAGCTGGCATATGGGATGTT + +a +s mr.mrrefChr3 19949 102 + 181019 AACCACAGCTACCTAACAGTATTATTAATACCAGAGTGGAGCTGGAAAAATGCTAGACCATCTACTGTGTTACACTTAGACCTGGTAAGGGGAAGATGTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464085 98 + 636262 AACCACAGCTACCTAACAGTATTATTAATACCAGAGTGGAGCTGGAAAAATGCTAGACCATCT----TGTTACACTTAGACCTGGTAAGGGGATGATGTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 473882 102 + 647215 AGCCACAGCTACCCAACAATGTTATTCGTACCAGAGTGGAGTTGGAAAAATGCTAGACCATCGACTGTGTAACACTTGGACCTGGTAAGGGGAAGATGTTTA + +a +s mr.mrrefChr3 20051 214 + 181019 TTGAGGAAGTTTAATGCTAAGACCTGAGTCAATCTATAGCACTCCAAAAATGAGTTGTCTGTCCATTGTTTTCATAGTGAGCCCTAGTGCGTGAAAGTTTAGAATAGTAAAACCAAATTGGGGAGGGGGAGGGTCAAATCACTTCTGATGATATAGTATTTTTATCATTCACCTTAGTAGTGTACATATGTGCAGGTGTAAGAACATACATGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464184 214 + 636262 TTGAGGAAGTTTAATGCTAAGACCTTAGTCAATCTATAACACTCCAAGAATGAGTTGTCTGTCCATTGTTTTTATAGTGAGCCCTAGTGCGTGAAAGTTTAGAATAGTAAAACTAGATGGGGGAGGGGGAGGGTCAAATCACTTCTGACGAAATAGTATTTTTATCATTCACCTGAGTAGGGTACATATGTGAAGGTGTAAGAGCATACATGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 473984 213 + 647215 TTGAGGAAGTTTAAAGTGAAGAC-TGAGTCAATCCAAAGCACTCTAAAACTGAGTTGTCTGTCCATTGTTTTCATAGTGAGCCCTAGTGCATGAAAATTTAGGATAGTAAAATCAAATTGAGGAGGGGGAGGGTCAAGTCACTTCTGATGATACAGTTTTTTTATAATTCACCTTAGTGGTGTACATATGTGCAGGTGTGAGGACATACATGGA + +a +s mr.mrrefChr3 20265 57 + 181019 GCTACATAAATATCTGTAGCACATTGTTGACAGATAGGAGCTATAATATCTTGTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464398 54 + 636262 GCTACATAAATATCTGTA---CATTGTTGACAGATAGGAGCTATAATATCTTGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 474198 57 + 647215 GCTAGATAAATATCTGTAGCACATCGTTGACAGATAGAAGCTACAAGATCTTGCTGA + +a +s mr.mrrefChr3 20322 36 + 181019 GAAAACTTCTATTCACAAGCTCCTTAGATCTACTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464452 36 + 636262 GAAAACTTCTATTCACAAGCTCCTTAGATCTACTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 474261 36 + 647215 GAAAATGTCTACTCTCAAGCTCATTAGTTCTACTTA + +a +s mr.mrrefChr3 20358 22 + 181019 GTCTTTATGACTTTCCAGCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464488 22 + 636262 GTCTTTATGACTTTCCAGCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 474298 22 + 647215 GCCTTTATGTCTTCCTGGCCTT + +a +s mr.mrrefChr3 20380 51 + 181019 CCTATTCCAAATGTAAATTGATTTGAACTAGGCAACAGGGTCACCTAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464510 51 + 636262 CCTATTCCAAATGTAAATTGATTTGAACTAGGCAACAGGGTCACCTAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 474334 51 + 647215 CCTTTTCCAAATGTATATTGACTTGAACTAGATGATGGGGTCAACTAAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 20431 13 + 181019 ATAACCTGGACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464561 13 + 636262 ATAACCTGGACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 474391 13 + 647215 AAAACCTGGACAC + +a +s mr.mrrefChr3 20444 14 + 181019 TGAGGGAGAACCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464692 14 + 636262 TGAGGGAGAACCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 474404 14 + 647215 TGAGGGAGAACCTC + +a +s mr.mrrefChr3 20458 45 + 181019 ATGGTCTTTCCCGTGTTAATTGTCTTGGATGGAAAGCACTGGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464706 45 + 636262 ATGGTCTTTCCCGTGTTAATTGTCTTGGATGGAAAGCACGGGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 474420 45 + 647215 ATGACATTTCCTGTGTTAATTGTCTTGGATGGAAAGCACTGGATC + +a +s mr.mrrefChr3 20503 51 + 181019 AGTTCATTAGAACTCCAGACTCAATGTTGTTCAGGCAGCATTTCAAGACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464761 51 + 636262 AGTTCATTAGCACTCCAAACCCAATGTTGTTCAGGCAGCATATCAAGACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 474465 42 + 647215 ---------GAACTCCAGGCTCAATGTTGTCGAGTCAGCATTTTAAGACTC + +a +s mr.mrrefChr3 20554 247 + 181019 AACTTTCAATATATTACGATACTTAACAGACAGTTGGTATTGGAGGATGTGACTGCTAGGGTTTACCACATAGATCAATACCAACCAGTGGATACCTTAGCTTGTAGCATCATCTAGTACAAATTGTATGTTAGTCAGTTCAAGAACCTCCAAGCACTAACATAGCCACTTACTCAAACACTAGATAATAGCCATTATCTTTAGAGTACTACTCCCTTGCTCACACCTGAATGGTAAGAGATCACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 464821 247 + 636262 AACTTTCAATATATTACAATGTTTAACAGACAGTTGGTATTAGAGGATGTGACTGCTAAGGTTTACCACATAGATCAACACCAGCCAGTGGATGCCTTAACTTATGGCATCATCCAGCCCAAATTGTATGTTAGTCAGTTCAAGAACCTCCAAGCACTAATGTAGCCACTTACTCGAACACTAGATAATAGCCATTATCTTTAGAGTACCACTCCCTTGCTCACACCTGAATGGTAAGAGATCACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 474507 247 + 647215 AACTTTCAATATATTAGGATACTTAACAGACAGTTGGTATTGGAGGCTGTGACTGTCAGGGTTTAGCACATAGATCAATACCAACCAGTGGGTACCTTAGCTTGTAGCATCGTCTAGTACAAATTGTATGATAGTCAGTTCAAGAATTTCCATGTACTAACATAGCCACTTACTCAAACACTAGATAATAGCCATTATCTTTAGAGTACTACTCCCTTGATCACACCTTAATGGTTAGAGATCACCG + +a +s mr.mrrefChr3 20801 157 + 181019 AAAAGTTATTATAATAACAGATGAGTTATCTTCCCAAGTAATTGGTTTCTCTTGGTAACTGTGTTGTGAACAGTTATTTTCTTCCAGTCAGTGGGATGAGCATTTTGGTTGTGACAGTACAACTGATATGAGTTCTTGTGCCATTAACAATGCATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465078 157 + 636262 AAAAGTTATTATAATCACAGATGAGCTATCTTCCCCAATAATTGGTTTCTCTTGGTGACTGTGTTGTGAACAGTCATTTTCTTCCAGTCAGTGGGATGAGTATTTTGGTTGTAACAGTACAACTGATATGAGTTCTTGTGCCATTAACAATGCATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 474754 157 + 647215 AGTAGTTATTATATTAACAGGTGAGTTATCTTCCCAAGTAGTTGGTTCCTCTTAGTAACTGTGTTGTGAACAGTTATTTACTTCCAGTCAGTGGGATGAGCGTTTTGGTAGTGACAGTACAACTGATATGAGTTCTTGTGCCATTAACAATACATTC + +a +s mr.mrrefChr3 20958 440 + 181019 ACTTGAGGTTGTGCAGCACTGTTTAATCTAATAGTGTTGTGTTGAAGTCAGTAGCATGCATTGGGCTAATGACATGTGATATTGCTACTTGCTTAAGGATGTCAGTAACAAGTTGCTACTTGTTAAGGACCACATAATAAAACAGCCTATCTGTTCACTAGCATCAAACTTTTTAACACCATGATTCTTGGAGAGCCCAAATTAATACTAATGTGAGGGATCCAATTGAAGATCCAACAGTCAATGGGACCTGAGGTGGCTCAGGTCCATACGGGAGAAATACATGTGGATTAGAGCCACATGCTCTTGGCATTTAATTTAACTATGTGCGGTGTGTAATGGTTGTCCACAATCCCTAATTGTGAAAGCGTTAGAACATTTGGTCCTATAAGGCCATACATGAGTTTTCTGTCATTATCATTAGGAGCTAGGAACCAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465235 412 + 636262 ACTTGAGGTTGTGCAGCACTGCTGAATCTAATAGTGTCGTGTTGAAGTCAGTAGCATGCATTGGGCTAATGACATGTGATATTGCTGCTTGCTTAAGGATGGCAGTTACAGGTTGCTACTTGTTAAGGACCACATAATAGAACAGCCCA--------CTGGCATCAAACTTTTTAACACCATGATTCTTGGAGAGCCCAAATTAATACTAATGCAAGGGATCCGTTTGAAGATCCAACAGTCAATGGGACCTGAGGTGGCTCAGGTCCATACGGGAGAAATACATGTCAATTAGAGCCACATGCTCTTGGCATTTAATTTAACTATG--------------------CACAATCCCTTATTGTGAAAGTGTTAGAACATTAGGTCCTATAAGGTTATACATGAGTTTTCTGTCATTATCATCAGGAGCTAGGAACCAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 474913 440 + 647215 ACTTGAGTTTGAGCAGCACTGTTTAATCAAATAGTGTTGTGTTGAAGTCAGTAGCATGCGTTGGGCTAATGAGGTGTGATGTTGCTACTTGCTTAGGGACATCAGTAATGAGTTGGTACTTGTTAAGGACCTCATGACAAATCAGCCTATCTGTTCACTAGTATCAAACTTTTTAACACCATGAATCTTGGAGAGCCCAAATTAACACTAATGTGAGAGATCCAATGTAAGCTCCAACAGCAAATGGGACGTGAGGTGGCTCAGGTCTATAGGAGAGAAATACATGTGGATTAGAGCCACATGCTCTTGGCTTTTAATTTAACTATGTGCGGTGTGTAATGGTTGTCCGCTATCCCTAATTTTGAAAACTTTTGAACATTTGGGCCTATAAGGCCATATGCGAGTTTTCCGTCATTGTCAATAGGAGCTAGGGACCAGTC + +a +s mr.mrrefChr3 21398 49 + 181019 TAACCAGCTTTAGCTAAATATAAGTGCTGATGTGATTTGTCATGATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465655 48 + 636262 TAACCAGCTTTACCTCAATA-AAATGATGATGTGATTTGTCATGGTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 475353 41 + 647215 --------TTTAGCTAAATATAAGTGCTGATGTGATTTGTCATGATTTG + +a +s mr.mrrefChr3 21447 46 + 181019 GCAGGATCTGCCCCATGTTGTCCGACTGGGGATAAAGGATGGAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465712 46 + 636262 GCAGGATCTGCCCCATGTTGTCCGACTGGGGATAAAGGATGGAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 475394 46 + 647215 GCAAGATCTGCCCCATATTGTCAGACTGGGGACAAAGGATGTAGTG + +a +s mr.mrrefChr3 21493 47 + 181019 CATTGAATGGTACCAGTGACATTGGAATTACCAGGGATACTCATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465758 47 + 636262 CATTGAATGGTACCAGTGACATTGGAATTACCAGGGATCCTCATAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 475512 47 + 647215 CGTTGAAAGGTACCCGTGTCATTGGAATTACCAGGGATACTCATAGC + +a +s mr.mrrefChr3 21540 145 + 181019 AATAGACAAAGCACTACACTGTCAAAGCCATTTGCAGTTCGTCAGGAACTTGACTTAATAAGTTTATCCAGTTGTACTTGCAGCACCAAGCAGTACAACCTGACTGGACTTTGCCTCTCTCCTAGATAAGACTTTTAAGGTAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465806 145 + 636262 AATAGACAAAGTACTACACTGTCAAAGCTATTTCTAGTTCGTCAGGAACTTGACTTAATAAGTTCATCCAGTTGTACTTGCAGCACCAAGCAGTACAACCTGACTGGACTTTGCCTCTCTCCTAGATAAGACTTTTAAGGTAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 475559 137 + 647215 ATTGGACAAAGCAATACACTTTCAAAGCCATTTGCAGTT--------GCTTGACTTAATAAGTTTATCCAGCTGTACTTGCAGTACCAAGCTGTACAATCTGACTGGACTCTGCCTCTGCCCTAGATAAAACTTTTAAGGTAATA + +a +s mr.mrrefChr3 21685 82 + 181019 GCAAAATTTGGGTTTCCCTCTGTGATCACCTGGAGTACAACGCTCTGCACCTGTGGTCCTGATTATCATCATAGTGGAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 465951 82 + 636262 GCAAAATTTGGGTTTGCCTCTGTGATCACCTGGAGTACAACGTTCTGCATCTGCGGCCCTGATTAACATCATAGTGGAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 475699 82 + 647215 GCAAGATTTGGGTTTCCCTCTGTGACCACCTGAAGTACAACGCTCTGCACCCGTGGTCCTGAGTATCATCATAGTGGCAACA + +a +s mr.mrrefChr3 21767 12 + 181019 TAGCTGACATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466033 12 + 636262 TAGCTGACATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 475969 12 + 647215 TTGGTGACTTGC + +a +s mr.mrrefChr3 21779 15 + 181019 TAGGGCCTCAATGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466045 15 + 636262 TAGGGCCTCAATGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 475994 15 + 647215 TGAAGTCTAAATAGC + +a +s mr.mrrefChr3 21794 308 + 181019 GTGATTGTATAATTATGCGATCTGGCCTACAAACAGTCCTATCTGACTACAATGATGTGTAGGGGAACAgggatcccttatggtgtaatatgtgttgatattttaaaattgtatgctgatcctcctgtatggcctgaagtcTTAAACTCATAAGGAATCCTAATCTTGTCTCATCTACATGCACATTAACTAAGCAAATCCTATTTCATTAAAAAGGTTAAGCAAAGCACAAAAAAATCCAGAAGAATGGGAAGCACAAACTAGTAGTTAAGAAAGCAGAAAGAGCAGTGGTGGAGTAGGGAAAAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466061 308 + 636262 GTGATTGTATAATTATGCGATCTGGCCTACAAACAGTCCTATCTGACTACAATGACGTGTAGCGGAACAGGGATCCCTTATGGTGTAATATGCGTTGATACTTTAAAATTGTATGCTGATCCTACTGTATGGCCTGGAGTCTTAAACTCATAAGGAATCCTAATCTTGTCTCATCTACATGCACAGTAACTAAGCAAATCCTATTTCGGCAAAAAGGTTAAGCAGAGCGCAAAAAAATCTAGAAGAATGGGAAGCACAAACTAATAGTTAAGAAAGCAGAAAGAGCAGTGGTGGAGTAGGGAAAAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 476009 305 + 647215 ---GTTAAATAATTATGTGCCCTGGCCTACAAACCGTCCTATCTGACTATATTGATGTGTAGGGGAACAgggatccctccttgtgtaatatgtgttgattttgtaaagttatatgctgatcctcctgtatggcctgaagtcTTAAACTAATAAGGAACCCTAATCTTGTCTCATCTACATGAACATTAGCTAAGCAAATCCCATTTCATTATAAAGGTTAAGCAAAGCACAAAAAACTTCTGATGAATGGGAAGCACAAACAAGTACTTAAGAAAGCAGGAAGACCAGTGATGGAGTAGGGAAAAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 22102 175 + 181019 GCATTAAGTCAGATTATAGTTAATTCTGGATTACCAATCTTCGATAGCACTATATCCTACAAGTAGTCGGCATTTTACACCTGACAGCCATCAAATATAAAGTGCCACAAGGGTAACAGGGCAGGCTCAGAAAGCTTAAATGGCTGTGACTGTTGGTTAAACAAAATGCAGATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466370 172 + 636262 GCAT---GTCAGATTATAATTAAGTCTGGATTTCCAATCTTCGATAGCTCTATATCCAACAAGTAGTCGGCATTTTACACCTGACAGCCATCAAATATAAAGTGCCACAAGGGTGACAGCACAGGCTCAGAAAGCTTAAATGGCGGTGACTGTTCGTTAAACAAATTGCAGATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 476314 172 + 647215 GCATTAAGTCAGATTATAGCTAATTCTGGACTAGCAATCATAGATTGTACTATATTTTACTAGTAGTCAGCATTTTACACC---CAGCCATCAAATGAAAAGTGCCACAAGGGTAACAGGGCACGCTCAGAAGGCTTAAATGGCTGTGACCGTTGGTTACACAAAATGCAGATAC + +a +s mr.mrrefChr3 22277 129 + 181019 ACTGCACCCCATCACTCAGTGGTTGCTCTTGGAAATGACATATGCATATATCACTGTCTACATGGCTGCTACCTAAGTGCCTAGGGCTTGTGCTCCGTCATAAAGACTGCTTCAAGGAGTGCAATAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466542 127 + 636262 --TGCACCCTATCAGACAGTGCTTTACCTCGGTAATAACATATGTATATATTACTGTCTACATGGTGGCTACCTAAGTGCCTAGGGCTTGTGCTCCGTCATAAAGACTGCTTCAAGGAGTGCGAAAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 476487 127 + 647215 ACTGTGCCCCATCACTCAGTGGTTGCTCTTGCAAATGACATATGCATATATCATTGTCTATATTGCTGC--GCCAAGTGTCTTAGGCTTGTGCTCCGTCATAAAGACTGCTTCAAGGAGTGCAATAATC + +a +s mr.mrrefChr3 22406 263 + 181019 GATACTTCATGTTTTATGTAAATACTCCAAGCCAACATTTTAGGGCAGGGTTTCCCATTATGAGAGTAGTGATCATTGTCCAAATTACAGCCAGTTCTATAGTCCTTACACTCCACCTTGAACAGGCCACATTAACCAGCACAGTCGGGCATGTCAGTTATCCTAAAAGCAGAATCAGATTAACTTACTACTTGTCACACTAAAATTAACTTTAGGTAAAGATAGTGTCTAACCAGTGACTATTCAATATACTAACCAGTGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466670 261 + 636262 GATACTTCATATTTTATGTAAATACTCCAAGCCTACATTTTAGGCCAGGGTTTCCCATTATGAGAGTAGTGATCATTGTCCCAATTACTGCCAATTCTATAGTCCTTACATGCCACCTTGAACAGGCCATATCAGCCA--ACAGTCGGGCATGTCAGTTATCCTAAAAGCAGAATCAGATTAACTCCCTACTTGTCACACCAAAATTAACTTGACGAAAAGATGGTGTCGAACCAGTGACTATTCAGTGTACTAACCAGTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 476614 257 + 647215 GATACTTTATGTTTTATACAAATACTTCAAGCCAACATTATA-GGCCGGGTTTCCCATTATAAGAGTAATGATCATGGTCCAAATTACAGCCAGTTTTATAGTCCTTATACTTCACCTTCAACAGGCCACATTGACCAGCACTGTCGGGCATGTCAGTTATCCTAAAAGCAGAATCTGA----CTTACTACATGTCATGCTAAAATTTATTTTAGGTAAAGATAGTG-TTAACCAGTGACTATTCAATATACTAACGAGTGAC + +a +s mr.mrrefChr3 22669 171 + 181019 CAGCCAACGTGCACCATGCTGCTTCTGGTAGAACATGCTGTCATACTTAACTCAACTGATTAGGAGGCAAGTCACCCAGATCTTTTCAAGTTATGTATATCTCTGAGTTTAGCTAGGAGCCAGATGAAGTGACTATGCACTAGATGGGGTGTGGTATGGGCTGCTATATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 466935 165 + 636262 CAGCCAACGTGCACCATGCTGCTTCTGGTAGAACATGCTGTAATACTTAACTCAACTGATTACGAGGCAAG------AGATCTTTCCAAGTTATGTATATCTCTAAGTTTAACTAGGAGCCAGATGAAGTGACTATGCACTAGATGGGGTGTGGTATGGGCTGCTATATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 476871 136 + 647215 CAACCAACGTGCACCATACTGCTTCTGGTAGAAAAGGCCGTCATACTTAACTCATCTGATTAGGAGGCAAGTCACCCAAATCATTTCAAGTTATGTATATCTCTGAGTTTAGCTAGGAGCCAGGC-AACTGACTATG---------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr3 22840 86 + 181019 TAGGTAGCTAGAGTAAGGGTACAAAGTGGTCCATGTTACCCAAGGACTGCTCAAAGTGAAAGCATCGAAGAGTATTAGACAGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467107 86 + 636262 TAGGTAGCTAGAGTAAGGGTACAAAGAGGTCCATGTTACCCAAGGACTGCTCAAAGTGAAAGCATTGAAGAGTATTAGACAGGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 477007 73 + 647215 TGGGTAGCTAGAGTAAGAGTACAAAGTGGCCCATGTTCTCCAAGGACTGCTCAAAGTGAAAGCAGCGAAGATT------------- + +a +s mr.mrrefChr3 22926 55 + 181019 CAGGTGTGAGTTAATATCACCTATATTGAAAGTTACTATCAGAAATACTACTACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467194 55 + 636262 CAGGTGTGAGTGAATATCACCTATATTGAAAATTACTATCAGAAATACTACCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 477080 55 + 647215 CAGGTGTGAGTTAATATCACTTATATTGAAGGTTACTATCAGAAATACTACTGCC + +a +s mr.mrrefChr3 22981 6 + 181019 CATAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467254 6 + 636262 CATAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 477135 6 + 647215 CATAAA + +a +s mr.mrrefChr3 22987 39 + 181019 CTTAATAAAACATAGCTAATAATCCCAACTTTCTATCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467266 39 + 636262 CCTAATAAAACATAGCTAATAATCTCAACTTTCTATCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 477141 37 + 647215 CTTAA--AAACATAGCTAATAATCCCAACTGTCTATCCA + +a +s mr.mrrefChr3 23026 96 + 181019 GAGGGGGTTCATTCATGCCACAAAGATGCTGTCAATAAGCCAGTTGAGCCCAGTGAAGGGCACAATAGCCATGGAGGGTCCCTAAAGAAATTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467305 96 + 636262 GAGGGAGTTCATTCATGCCGCAAAGATGCTGTTGATAAGCCAGTTGAGCCCAGTGAAGGGCACAATAGCCATGGAGGGTCCCTAAAGAAATTGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 477180 96 + 647215 GAGGGGGTTCATTCAGGCCACAACAATGCTGTCAATAGGCCAGTTGAGTCCACTGGAGGTCTCAATGGCCACGGAGGGTCCCTCAGGAAACCATCA + +a +s mr.mrrefChr3 23122 57 + 181019 TGCCGCTTGTATTTTAAAAGTGGGCAAACAAATTCTCTGCTGTTATCACTGGGGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467428 57 + 636262 TGCCGCTTGTATTTTAAAAGTGGGCAAACAAATTCTCTGCTGTTATCACTGGGGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 477276 57 + 647215 TGCAGCTTCTATTTTAATAGTTAGCGAGCAAATTCTATGCTGTTATCACTGGCACTT + +a +s mr.mrrefChr3 23179 18 + 181019 TGAACTGCTCTCAATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467485 18 + 636262 TGAACTGCTCTCAATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 477355 18 + 647215 TGAGCTGCTCTCAGTGGT + +a +s mr.mrrefChr3 23197 337 + 181019 CAAGGAACCTATGCATTCCTTCCCCCCCTTGTTCACTCACTGTTACCAGGGGGCTGGAATGTATTGGTTATTAAGCATGCTACTGGTATCAAATTCCAGGGTGCTGTGGTGACACCCAGGGGAAACAAAAGTATAACCTGGCATAACTCATTTGCTTAAAAAGCACCAAAAGATGTGTCCTTAACTAATTATAATAACTTACTATGCAGGTTCTATGTATCAAGGAATTACCTCTGCCTAACTTATTAACCGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTACCCTGCCTGATGGCTAAGGGTCTTTAAGACTGGGCAACTACCCTTCACAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467504 337 + 636262 CAAGGAACCTATGCATTCCTTCCCCCCCTTGTTCACTCACTGTTACCAGGGGGCTGGAATGTATTGGTTATTAAGCATGCTACTGGTATCAAATTCCAGGGTGCTGTGGTGACACCCAGGGGAAACAAAAGTATAACCTGGCATAACTCATTTGCTTAAAAAGCACCAAAAGATGTGTCCTTAACTAATTATAATAACTTACTATGCAGGTTCTATGTATCAAGGAATTACCTCTGCCTAACTTATTAACCGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTACCCTGCCTGATGGCTAAGGGTCTTTAAGACTGGGCAACTACCCTTCACAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 477373 337 + 647215 CTAGGTACCTATGTATTCCTTCCCCCCCTTGCACACTCACTGTTAGCAGGGGGCTGGCATATATTCATTATTAAGCATGCTACTGATATCAAATCCTAGGGCGCTGTGGTGACATTCAGGGCAAACAAAAGTACAACCTGGCATAATTCATTTGCTTAAAAAGCACTAGAAGGTGTGTTCCTCACTAATTACAATAACTTACTATGAGGGTTTTATGTGTCAAGGATTAACTTCTGCCTAACTTATGAAGTGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTATACTGCCTGATGGCTGAGGGTCTTTGAGACTGGGCAACTACATTTCACTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 23534 24 + 181019 GGCTAATCATGTTTCCATGTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467841 24 + 636262 GGCTAATCATGTTTCCATGTGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 477711 24 + 647215 GGCTAATCAGGGTTCCAAATTGTA + +a +s mr.mrrefChr3 23558 30 + 181019 ATCAGGAATATTGGCTATGATCCTTTTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467865 30 + 636262 ATCAGGAATATTGGCTATGATCCTTTTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 477787 30 + 647215 ATCAGCAGTATTGGCTATGATCCTCTTTAC + +a +s mr.mrrefChr3 23588 20 + 181019 CACCATAACTGCACCCCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467902 20 + 636262 CACCATAACTGCACCCCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 477817 20 + 647215 AGCCATAACTACACCCCAAG + +a +s mr.mrrefChr3 23608 13 + 181019 AGTTAGCTAAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467922 13 + 636262 AGTTAGCTAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 477840 13 + 647215 AGTTAGCTAAGCG + +a +s mr.mrrefChr3 23621 104 + 181019 TGTAAAGAAACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGATTGTCTTAGTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTCCCTATGCTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 467938 104 + 636262 TGTAAAGAAACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGATTGTCTTAGTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTCCCTATGCTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 477853 104 + 647215 CGGCAAGATACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGCTTGTCTTATTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTTCCTATGCTTAT + +a +s mr.mrrefChr3 23725 98 + 181019 GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACTTGTTTTAAAGCACTTCACTGTCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468045 98 + 636262 GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGAATACCTTCCTTTGCAAGGTCTTGTTTTAAGGCACTTCACTGGCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 477957 98 + 647215 GGATTGTATTAGCACTGTCTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACATGTTTAAAAGCACTTCACTCTCTGGGCTACTCAAGGGACATGTATTATCA + +a +s mr.mrrefChr3 23823 58 + 181019 ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468168 32 + 636262 ACACAAGCCTCAGACAGCTTAATGCTCCAGGC-------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 478055 58 + 647215 ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA + +a +s mr.mrrefChr3 23881 356 + 181019 ACAGCTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCTGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAAACTTCCAGCTTCACCTAACCCCACCATGACAGGATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATGTGCAACTGTTTACCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCATCAGGGCTCCGATGTGGGGTCAACCATCACTATCAAGGATCAACCAAAATTCCAGGCTGGGTGTCACATTGTCTTTCTTCACACTTCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGACATTCATATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468200 337 + 636262 ACAGTTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCCGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAA-------------------CCCACCATGACAGAATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATTTGCAGCTGTTTGCCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCAGCAGGGCTCTGATGTGGGGTCAAGCATCACTACCAAGGATCAACCATCATTCCAGGCTGGGTGTTGCATTGTCTTTCTTCACACTCCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGGCATTCATATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 478117 353 + 647215 ACAGCTCCATTCAGATGTGCATTGGCTATGGACCTGCTGCTTCGACAGTTGCATCTGCTGCTTCCCACAGTTGCCATAGGTTGTATATCAACACTTCCAGCTTCACCTAACCCCACCCTGACAGGATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATGCATGACTGTTCACCATGCACAACCTTAAGGGCAAGTAAAAACTAATCTGTCTGCTTCCAGTATAATTTGACAATTCATCAGGGCTCCGATGTGGGGTCAACCATCACTATGACAGATCACCCAAAATTCCATGCCAGGTGTCACCTTGTCTCTCTTCACACTTCAAGCTGTG---CACCCAGGTATAATTTAGACATTCAAATT + +a +s mr.mrrefChr3 24237 313 + 181019 TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACCACACCACAGCCGTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAATGGAACTCCTCTGCATTGTGCTTTCCTGTGCTCTGTAATGACTTGTGGGATGATCCCATTGTATGAACTAAAGTACTGATGCCATTGAACACAAGGGGTTACAGAGTGGACATAAGACTGTGTCCTGCAACTTGGACAACATCTCAGGTTAAGGATTGTTATTAATACTGCAATCCATTTGCACTTTGGCTCTTTAATTAGATACTTGATAACTAACATTGTCACCCTCCAAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468537 308 + 636262 TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACTACAACACAGCTGTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAGTGGAACTCCTCTGCAGTGTGCTTTCCCGTGCTCTGTAATGACTTGTGGGATGATCCCATTGTATGAACTCAAGTACCGATGCCACTGACCACAACGGGTTAC-GAGTGGACATAAGACTCTCTCCTGCAACTTGGACAACATCT----TTAAGGATTGTTATTAATGCTCCAATCCATTTGCAATTTGGCTCTTTAATTGGATGCTTGATAACTAACATTGTCACCCTCCAAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 478472 313 + 647215 TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACCACACCACAGCCTTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAATTGGACTCCTCTACATTGTACTTTGCTGTGCTCTGTAAGGGCTTGGGGGATAATCCCATTGTGTGAACTAAAGTACTTTTGCCATTGAACCTAAGGCATTACAGAATGGACATAAGACTGTGTCCTGCAACTTCAACCACGTCTCAGGTAAAGGACAGTTATTAACAGTGCAATCCATTTGCACTTTGGCCCTTTAACTAGATAATTCGTGACTAACATTGTCCCTCTCCAAAGGG + +a +s mr.mrrefChr3 24550 131 + 181019 CTTCAAAGTTGCAAACAGAGCATACGCAAGTCAATTGCATACCGGAGCCCTCAAATGGCAATTAGTCCCAAGCCAACAATGATTGTGGGCCCACACGTTATGTTGTAGAATTCATTGGTTATAACGACTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468846 131 + 636262 CTTCAAAGTTGCAAACAGAGCATACGCAAGTCAATTGCATACCGGAGCCCTCAAATGGCAATTAGTCCCAAGCCAACAATGATTGTGGGCCCACACGTTATGTTGTAGAATTCATTGGTTATAACGACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 478785 131 + 647215 CTTCAAAGTTGCAAGCAAAGTATACACAAAGCAATTGCATACTGGAGCACTCAAATGGCAGATAGCCCCAAGCCAATAATGACTGTGGGCCCACCCGTTATGATGTAGCACTGACTGGTTATAACGACTTG + +a +s mr.mrrefChr3 24681 20 + 181019 GACCTGACTTATCACACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468985 20 + 636262 GACCTGACTTATCACACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 478916 20 + 647215 GACCTGGCTTATCACACTAT + +a +s mr.mrrefChr3 24701 512 + 181019 TGATTACCAACAAACTGTGGATTTACTGATCACTATACAGCACTCATTGCCTCGTTTATCATAGCCAAAGCAGTAAGAATCTTTAACAGCGCTGTCTGCAAGGTAGGCCGAATACAATTGAAGGCTTTGATTTCATCACAGGATAGTCACATGCTAATGAATAGTGTTAGTGGCAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTGCTGGTTTGTTCTAGTAGTGTAAATCTCCACAAGATATTGAGGTAATGGAAAATAAACAGTGTCAACGCGAGGTGATTGCTCTTTATATAATGGAATGTATATATAAGCTCTAATATGCTTGACACACATTTGAGACATGTGATACTGAACTACAAGAAATGCTCACAATTGCTAGGCTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTACGACTCATGTTGATTCTCAGTATATACTAGAACTGGACCAATAGTGGTCCATGAATACCTCCCTGTGCCTATCTTCTCGTCTTTCAAGCATATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469006 506 + 636262 TGATTACCAATGAA-TGTGGATTTACTGATCACTATACAGCACTCATTGCCCTGTTTATCATGGCCAAAGCAGTAAGAATCTTTAACAGCGCTGTCTGCAAGGTAGGCCGAATACAA-TGAAGGCTTTGGTTTCATCACAGGATAGTCACATGCTAATGAATAGTGTTAGTGGCAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTG--GGCTTGTTTTAGCAATGTAAGTCTCCACAAGATATTGAGGTAATGGAAAATAAACAGTGTCAACGCGAGGTGATTGCTCAGCTTATAATGGAATGTATATATAAGCTCTAATATGCTTGACACACATTTGAGACATTTGATACCAAACTACAAGAAATGCTCACAATTGCTAGACTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTACGACTCATGTTGATTCTCAGTATATACTAGAACC--ACCTATAGTGGTCCATGAATACCTCCCTGTGCCTATCTTCTCGTATTTCAAGCATGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 478936 472 + 647215 TGGTTACCAACAAACTGTGGA----------------CAGCACTCACTGGCTCGTTTATCACAGCCAAAGCAGCAAGGATCTTTAGCAGCTCTGTCTGCAAGGGAGGTTGAGTACAATTGAAGGTTTTGATTTCATCACAGG-TGGGTACATGCTAATGAATAGTGTTGGTTACAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTGCTAGTTTGTTCTGGTAGTTTAGATCTCCACAAGATATTGCAGTAATGGAAAATA-----------------------GCTTTTTATATAATGGAATGCATATATAAGCCCTAAAATGCTTGACACACATTTTAGACATGTGATACTGTACTACAAGAGATGCTCACAACTGCTAGGTTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTATCATTCATATTGACTCTCAGTACATACTAGAGCTGGACCAATAGTGGTCCATGAATGCCTTGCTGTGCCTATCTTCTTGTCTTTGAACCATATGTT + +a +s mr.mrrefChr3 25213 451 + 181019 TGGAGCCAGTCACCTGGATGGAGATGTTACTATGACTGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAGGTGGCACCATATAAGGTAGGGGGTCCCTTTGTTTATAATTCACAAATACGCATATACCATTGAAACACACCAAAACCCTGCGTACACAAGCCTGGTAATAGCTAATATTAACTTGCAAGATTGGAACACAGGATTGGCCAGGTTACCTGGCTGGCAGGAGAGACCCTTTAGCATTGGCATCCCTTGACAGCCTGAGTTGATGATTTAGGGTTAGTCTACAAAAAACAATAAATGTAAGAACCATCATTTTTCTCATACAGTTAATTGTCTCATACAGGTGAAGGTAGTCTAAAGGCTGCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTGACCTTGTTTTACAAGGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGTTACCAGTCTTTAGGTAGAATAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469515 435 + 636262 TGGA---------ATGGA----GATGTTACTATGACTGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAG-TGGCACCATATAAGGTAGGGAGACCCTTTATTTATAAT-CACAAATACGCATGTACCATTGAAACACACCAAAGCCCTGCGTACACAAGCTTGGTGATAGCTAATATTAACTTGCAAGATTGGAACACAGGATTGGCCAGGTTACCTGGCTGGCAGGAGAGACCCTTTAGCACTGGCATCCCTTGATAGCCTGAGTTGATGATGTAGGATTAATCTACAAAAAACAATAAATGTAAGAACCATCATTTTTCTCATACAGTTAATTGTCTCATACAGTTGAAGGTAGTGTAGAGGCTGCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTGACCTTGTTTTACAAAGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGT-ACCAGTCTTTAGGTAGAATAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 479408 426 + 647215 TGAAGCCAGTCACCTGGATGGAGATCTTACTATG--TGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAGGTGGCACCATATAAGGTAGGGGGTCCCTTTGTTTATAATTCACAAATACACACATACCATTGAAACACACCAAAACTCTGCGTACAC----CTGATAATAGCTAATATTAACTTGAAAGATTGGAACACAGGATTGGCAAGGTCACCTGGCTGACAGTAGAGACCCTTTAGCATTGGCATCC--TGGCAGCCTGAATTGATGATTTACGGTCAGTCTATGAAAACCAATAAATGTAAGAACCACCATTT-----------------GCCTCATTCAGGTAAAGGTAGTCCAATGGCTCCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTCATCTTGTTTTACAAGGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGTTACCAGTCTTTAGGTAGAATACT + +a +s mr.mrrefChr3 25664 19 + 181019 TAAAATTTGTATGAAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469950 7 + 636262 TAAAATT------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 438821 19 + 647215 TAAAATTTGTATGAAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 479834 19 + 647215 TAAAATTTGTATGAAACTT + +a +s mr.mrrefChr3 25683 1 + 181019 T +s simRat_chr6.simRat.chr6 479853 1 + 647215 T + +a +s mr.mrrefChr3 25684 42 + 181019 AAGGCTCTTAAGAATGAACAGCTTCAAGAGGTAACGATAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469957 4 + 636262 --------------------------------------AATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 438840 42 + 647215 GAGGCTCTTAAGAATGAACAGCTTCACGGGGTAACGATTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 479854 42 + 647215 AAGGCTCTTCGAAATGAACGGCTTCAAGAGGCAACGATAATT + +a +s mr.mrrefChr3 25726 134 + 181019 CATACATTTTTGTCAGAGACATGGCCCAGTGTAAACTTAGCATCATAAAAACTTTTATTTCTGGTACATTTATACTATGTCAACTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTGTGAATTTCTACCAAAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 469961 133 + 636262 CGTACATCTTTGTCATAGACATGGCCCAGTGTAAACCTAGCATTGTAAAAACTTTGATTTCCTGTACATTTATACTATGCCA-CTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTCTGAATTTCTACCAAAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 438886 133 + 647215 CACACATTTTTGTCAGAGACATGGCCCAGTATGAACTTAGCATCATATAAATTTTTATTTCTGGTACATTTATACTATGTAAACTAAAGTAAGAATTTTGCTACTGGAGGAGTTTGTGAATTTCTATCCAAG-C +s simRat_chr6.simRat.chr6 479896 130 + 647215 CATACATTTTTGTCAGAGGTATGACCAAGTGTAAACTTAGCATCATAAAAACTTTTA---CTGGTACATTTATACTACATCAACTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTGTGAATTCCTACCAAAG-A + +a +s mr.mrrefChr3 25860 10 + 181019 ATCTCCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470094 10 + 636262 ATCTCCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 439022 10 + 647215 ATCTCCCGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 480026 10 + 647215 ATCTCACAAA + +a +s mr.mrrefChr3 25870 430 + 181019 AATGAGTTTGTAAAATCAATGGATTGATAGTGATGGGGTTGTATATATGACTCCTTTCACTCTGCATGCTAACATTGTTCAGAATTTATTTTTGTAGATGACTTTTCATGTTATGGCAGGAGTATCAATTGGCTTGAGCCATCAGAAAATTGTTCATCCCTGAATAGCTTGTGCACTTGGAGACAGCTGTGATCTCTGAGTGAACCTCTTAGACAAGATAGCTACATAAACCTATAGAGTACACCTAAGTTCTCTTTGCACTACCCCTCAGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCACACGTCCTAAATTACTTACACTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTGTGTTCAAGTCCACCCAACACTCTGGATCACTATGTTATCAAAACCACTACAAATCTCCACATGTTTCGCATTAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470104 429 + 636262 AATGAGTTTGTAAAATCAATGGATTGATGGTGGTGGGGTTGTATGTAGGACTCCTTTCACTCTGCATGCTAACATTGTTCAGAATTTATTTTTGTAGATGACTTTTCATGTTATGGCAAGAGTATTAATTGGCTTGAGCCATCAGAAAATTGTTGATCCTTGAATAGCTTGTACACTTGGAAACAGCTGTGATCTCTGAGTGAACCTCTTAGACAAGATAGCTACATAAACCTATAGAGTATACCTAAGTTCTCTTTGTGCTACCCCTCAGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCA-ACGTCCTAAATCACTTACAGTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTACATTCAAATCCACCCCACACTCTGGATCACTATGTTATCAAAACCACTACAAATCTCCACATGTTTCACATAAGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 480036 430 + 647215 AATGAGTTTGTAAAATCGATGGATTAATAGTGATTGGGTTGTATATGTGACTCCCGTCACTTTGCATGCTAATCTTGTTCAGAATCTATTTTTGTAGGTGACTATTCTTGTTATGACTGGAGTATCAATTGGCTTGGGCCATCAGAAAAATGTTCATCCCTGAATAGCTTGTGCACTTGGAGACAGCTATGACCTCTGAGTGAGCTTTATAGACAAGATTGCTACATAAACCTTGATAGTACACCCAAGTTCTTTTTGCACCACCCCTCGGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCACAGATCCTAAATTACTTAAACTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTGTGTTCAAGTCCACCCAGTACTCTGAATCATTATTTTATCAAAACCACTACACACCTCCAGGTGTTTCGCATTAGGCA + +a +s mr.mrrefChr3 26300 55 + 181019 TATGGGCACTTGCTATGACCACTACCTGAGGAGTGGTAGGTAGAGCGAGGAGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470536 55 + 636262 TGTGGGCGCTTGCTATGACCACTACTTGAGGAATGGTAGGTAGAGCGAGGAGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 480466 55 + 647215 TATGGGCACTTGCTATGACTACTACCTGAGGAGTGGTAGGTAGATTGAGGAGTAG + +a +s mr.mrrefChr3 26355 8 + 181019 AGGTAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470591 8 + 636262 AGGTAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 480522 8 + 647215 AGGTAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 26363 38 + 181019 TAAATATACAAATACATACGACTGAGCACTAATTAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470599 38 + 636262 TAAATATACAAATACGTACGGCTGAGCACTAATTAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 480534 38 + 647215 TAAACATATAAATACATATGACTGGGCACTAATTAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 26401 110 + 181019 GTATCACATCAGATCTAGGCACTAAAACTCAATTTATGACCAGTGCTTTTATGACCATAGCTAAGCCCAACTAAAAAAGGAAGTAGCAATGAAAAAATCAGCTTAGCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470637 110 + 636262 GTATCAAATCAGATCTAGGTACTAAGACTCAATTTAAGACCAGTGCTTTCATGACCATAGCTAAGCCCAACTAAAAAAGGAAGTAGCAATGAAAAAATCAGATTAGCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 480590 110 + 647215 GTATTACATCTGATCTAGGCACAAAAACTCAATTTATGACTGACGCTTTTATGACCGTAGCTAAGCCCAACTAATAAAGGAAGTAGCAACGAAAAAATCAGCTTACCAGT + +a +s mr.mrrefChr3 26511 71 + 181019 AACACCAGGTTGAGACAACTGTCTTCAACCTGGTTAGGTAGACACAAGAAGGGCCTTTATTATGTTCTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470751 71 + 636262 AACACGGCATTGAGACAACTGTCTTCAACCTGGTTAGGTAGATGCAACAAGGGCCTTTATTATGTTCTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 480700 71 + 647215 AACACCAGGTTGAGACAACTATCTTCAACCTGGTGAGGTAGACATAAGGAGGGCCATTATTATGTTCTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 26582 100 + 181019 TCCACCCACAGAAAGCAGGAGTTATCTTACACTTGAGGTTCCACTTAGGGAGGTTTGTGGAAGATTTACTACAAGGGTGAGGGGCAGGCTCGTTGAGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470823 100 + 636262 TCCACCCACAGAAAGCAGGAGTTATCTTACACTTGAGGTTTCACTTAGGAAGGTTTGTGGAAGATTGACTACAAGAGTGAGGGGCCGGCTGGTTGAGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 480771 86 + 647215 TCCACCCACAGAATGC-----------TACACTTGTGGTTCCACTTAGGGAGGTTTGTGGAA---TTACTACAAGGGTGAGGGGTAGGTTCATTGAGCTC + +a +s mr.mrrefChr3 26682 37 + 181019 TAGATGCAGAATTATGTAGGGACTATTACTAGGGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470935 37 + 636262 TAGATGCAGAATTATGTAGGGACTATTACTAAGGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 480857 37 + 647215 AAGATGCAGTTTTATGTAGGGACTATTACTAGGCTAG + +a +s mr.mrrefChr3 26719 137 + 181019 CAAAAGACATTTACTGCATGGCCTTAAAGACAGATATCAATTTTGCCCCTGTATCTTCCTGTCTTGGCATGTAATGACTCTCACATTCTTCAGGAGTATGTTGTCCAGGAGACCTTAGTAAATCTTTGCTCATTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 470976 137 + 636262 CAAAAGACATTCACTGCATGGCCTTAAAGACAGAAATCAATTTTGCCCCTGTATTTTCCTGTCTTGGCAGGTAATGACTCTCACATTCTTCACGAGTATGTTGTCCAGGAGACCTTAGTAAATCTTTGCTCATTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 480894 136 + 647215 -GAAAGCCATTTACTGCATCACCTTAGAGTAAGATATCCATTTTGCCCCTTTACCTACTTGTCTTGGCATGTAATTACTCTCATATTCTTCAGGAGTCTGTTGACCGGGAGGCCTTATTAACTCTTCGCTCATTAGA + +a +s mr.mrrefChr3 26856 144 + 181019 TATGCTAACCCTCATCTGCCATCACCATTATTTAAGAACATTGGTCTATGAGCTTATGCTTAAGAGGACCCCTGGCTGTGTCCGTGTTTGGTATTGTTTGGCTTTTGTCTGCATCCATCCTTAGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471113 144 + 636262 TATACTAACCCTCATCTGCCATCACCATTATTTAAGAACATTGGTCTATGAGTTTATGCTTAAGATGAACCCTGGCCGTGTCCGCGTTCCATATTGTTTGGCTTTTGTCTGCATCCATCCTTGGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 481032 144 + 647215 TGTGCTAACCCTCAACTGCCATCCCCATTGTTTAAAAACACTGGTCTATGAGCTTGTGGTTAAGAGGACCCCTGGATGTGTCCATGTTTGGTATTGTTTAGCTTTTGTCACCAACCATCCTCAGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC + +a +s mr.mrrefChr3 27000 52 + 181019 ATAGGCTGACAATCAAATCATTCCACCTGTTATTATCATCAATTCATAGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471257 52 + 636262 ATCGGCTGACAATCAAATCATTCCACATATTATTATCATCAATTCATAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 481184 52 + 647215 ATAGGCTAACAACCAAACCATTCCGACCGTTATCATCATTAATTCATAGAGA + +a +s mr.mrrefChr3 27052 23 + 181019 ACAGGGTTAGGATACTTGATTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471313 21 + 636262 ACAGGG--TGGATGCTTGATTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 481236 23 + 647215 ACAGGGTTAGGATACTTGATTGG + +a +s mr.mrrefChr3 27075 132 + 181019 AAGAAATGCTAACATTGCAAATTGGCATTGGGATTTGTCTAAATCTGCTTAGAGTATCTAGTTGAACAGCCCCCAGAAGGTGACCAAACGTTGGAGAAAGCAGATAACACTCAATACAATAAAGCTGGGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471334 131 + 636262 AAGAAATGCTAACATTGCAAATTGGCATTGGAATTTGTCTAAATCTGCTTAGGGTATCTAGTTGAATAGCCCCCAGAAGGTGACC-TACATTGGAGAAAGCAGATAACACTCAATACAATAAAGCTGGGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 481261 132 + 647215 CAGTAGTGCAAACATTGCAAATTGGCGTTGGGATTTGTCTAAATCCGCTTAGAGTATCTAGTTGATCAGCCCTGGGAAGGTGACCAAATGTTGGAGAAAGCAGAAAACACTCAAGACACTAAAGCTGGGGGA + +a +s mr.mrrefChr3 27207 204 + 181019 TGAGATGGACAAACCATCATCAGAGGGACCAATTTTCTCTGATTATGCTGAGTTAGTGTACATCCAGATTTGATCTCTCTTAGAATCTCAAATGGCAAATGTTAGACAATCTTTTGGATGCAATTTCTAGAGCATAGGTTCTAATTCATGCCAATGGAGAGGCAAGGATGTATAACACTTATTTTATGAGGCATGCTTGTTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471466 200 + 636262 GGAGACGGACATACCATCATCAGAGGGACCAAGTTTCTCTGATTATACTGAGCCAGGGTACATCCAGGTTTGAACTCTCTTAGAATCTCAAATAGCACA--CTAGATAATCTTTTGGATGCAATTTCTAGAGCATAGGTTCTAATCCATGCCAAAGGAGAGGCAAGGATATATAACACTCATTTTA--AGGCATGCCTGCTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 481393 176 + 647215 TGAGATGGACAAACCCTCCTCAGAGGGACCAATTTTCTCTGATTATGCTGAGTTGGTGTACTTCTAGATTTGATTTCTCTTCGAATCTCAAATGGCAAATGTTAGACAATC----------------------------TCTAATTCATGCACATAGAGAGGCAAGGATGTATAACACTTATTTTATGGGGCATGCTTGTTACA + +a +s mr.mrrefChr3 27411 156 + 181019 GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTTACTGATATCATTGGACCTACCTGTAATGGGGAAGCCCTCTGGACCATGCAAGGCTGAGGAGTGGACCACTAGATGGAATTGCTAGTACAAGAATTAAATAGATCATCATGATTGTAGCACTATAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471666 131 + 636262 GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTT-------------------------ATGGGGAAGCCTTCTGGACCATGCAAGGCTGAGGAGTAGACCACTAGATGGAATTGCTAGTATAAGAATTAAATAGATCGTCATGATTGTAGCACTATAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 481570 156 + 647215 GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTTACTGATATCATTGGACCTACCTGTAATGGGCAAGCCCTTTGGTCCATGCAAGGCTGAGGAGTGGACCACTAGATGGAATTGCCAGTACAAGAATTAAATAGATCATTATGATTGTAGCACTATGAA + +a +s mr.mrrefChr3 27567 11 + 181019 AAAGGGTAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471797 11 + 636262 AAAGGGTAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 481730 11 + 647215 AAAGATTAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 27578 192 + 181019 CCTGCTCATATCAATGATTAAAAGGAAAAACCAAGGATGTTCAAGTGAGAAAACAAGAAAATGGATGATCCTACTAGTAAGGAGGTGTAAATTATTCAATTAGCATCTATGGTCAGTTACATTAATGGTACAGAAGCAGGGGTACTCAGATGCTTAATAATTTTGACCTTGAGCTATTCCAGATCTAATGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 471808 192 + 636262 CCTGCTCATGTCAATGACTAAAAGGAAAGACCAAGGATGTTCAAGTGAGAAAATAGGAAAATGGATGATCTTACTAGTGAGGAGGTGTAAGTTATTCAATTAGCATCTATTGTCAGTTACATTAATGGTAAAGAAGCAGGGGTCCTCAGATGCTTAATAATTTTGACTTTGAGCCATTCCAGATCTAACGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 481830 191 + 647215 ACTATGAATATCAAAGATTAAATGGAAAAAGCAAGGATGTTTAA-TCAGAAAACAAGAAAATGGATCATCCTACTAGTAAGGAGGTGTAAAGTATTCAATTAGCATTTATGGTCAGTTACATTAATCGTACAGAAGCATAGGTACTCAGATGCTTAATAATTTTGACCTTGAGCTGTTCCCAATCTAGTGTA + +a +s mr.mrrefChr3 27770 94 + 181019 ACTTACTACACTTCACCCTGCCTTAGTGCATGGTCCTGGCCTGAGCTCTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAACTCTGATTGCAGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472004 94 + 636262 ACTTACTACACTTCACCCTGCCTTAGTGCATGGTCCTGGCTTGAGCTCTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAGCTCTGATTACAGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 482021 94 + 647215 ACATACTACACTTCACCCTGCCTTACTGCATGGTCCTGGCCTGAGCTTTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAAATCTGATTGCAGACA + +a +s mr.mrrefChr3 27864 32 + 181019 GCAGTTGCATGACTATGATGATCCTTGTACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472098 32 + 636262 GCAGTTGCATGACTATGATGATCCTTGTACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 482123 30 + 647215 GCAGTTACATGATTATGATGATCCTTTCAT-- + +a +s mr.mrrefChr3 27896 27 + 181019 TTGGCCAGACAAAGTCTTAATGTTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472133 27 + 636262 TTGGCCAGACAAAGTCTTAATGTTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 163578 27 - 647215 TTGGCCAGATAAAGTCTTAAAGTTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 27923 41 + 181019 AGGGGGAGTTATCGTCACTTTCTATTGTCTGGTGTCCTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472161 41 + 636262 AGGGGGAGTTATCGTCACTTTCTATTGTCTGGTGTCCTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 163605 41 - 647215 AGGGGGAGTTACCTTCCCTTTCTATTATCTGGTGTCCTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 27964 219 + 181019 AAGCAAGCGACCAACAAAAACAGGTGACTAACTGCAGAATTGTACGATTATGACTCTGCTCATTTGGAGGACCATATCTAATGCAGGTACCAGCACCCCTAGCCACCCTATCCAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCAATGCACCTCCTTGTTGATTGGAATCCATCATCTAATGTACCCCAGACTGAGAGCCAACTCAAATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472203 219 + 636262 AAGCAAGCGACCAACAAAAACAGGTGACTAACTGCAGAATTGTACGATTATGACTCTGCTCATTTGGAGGACCATATCTAATGCAGGTACCAGCACCCCTAGCCACCCTATCCAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCAATGCACCTCCTTGTTGATTGGAATCCATCATCTAATGTACCCCAGACTGAGAGCCAACTCAAATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 163646 219 - 647215 GTGCAAGCAACCAACAAAACCAGATGGCTAACTACAGAATTGTACTATTGTGACTCTGCTCGTTCGGAGGACAATTTCTATTTCAGGTACCAGTATCCCTAGCCACCCTATACAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCGATGAGCCTCCATGTTGAGTGGAATCCATCATCTAATATACCCCAGACTAATAGCCAATTTAAATCGC + +a +s mr.mrrefChr3 28183 172 + 181019 CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCCTACACTCATAGCCACCTCAAAAGGTGGCAGCCACCCCTTACATATGTAAAAAGATCTAAGGGGCTTATATGGATTTCAAGCCTACTCATGTTTTTAGATTATCTGCTGAGTGTTTTTGGCTTGCACCTGTATCCTGGATATCTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472422 172 + 636262 CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCCTACACTCATAGCCACCTCAAAAGGTGGCAGCCACCCCTTACATATGTAAAAAGATCTAAGGGGCTTATATGGATTTCAAGCCTACTCATGTTTGTAGATTATCTGCTGAGTGTTCTTGGCTTGCACCTCTATCCTGGATATCTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 163870 172 - 647215 CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCATATACTAATAGCCACCACAAAAGGTTTCGACCCTCCCTTACATATATATGAAGATCCAAAGGGCTCACGTGGACCTCAAGCCTACTCATGTTTTTAGATTATCTGTAGAGTGTTTTTGGCTTGCATCTGTATCCTGGATATCTATT + +a +s mr.mrrefChr3 28355 206 + 181019 CTGGATGCCTGACATTGGAAAAGATGGGGGCCATGGATGAATTAAATGTATAAAGTTGAGGACACACTATCATGTAACAGTCTGGTCAGTAATCAATTAAAAGAAGCCAAACTCGGAAGGCTCCAGACCAGGGGTACATTGAGTGCTACATGGATTGCAAATTCACAGTCAATAGTGAATATTGGCTACCAGTACATTCTTAAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472595 202 + 636262 CTGGATGCCTGACATTGGAAAAGATGGGGACCATGGATGAATTAAATGCATAAAGTTGATGACACACTACCATTTAACAGTCTGGTGAGTAATCAATTAAAAGA--CCAAACTCGG-AAGCCCCAGACCAGGGGTACATTGAGTGCT-CATGGATTGCAAATTCACAGTCAATAGTGAACATTGGCCACCAGTACGTTCTTAAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 164042 203 - 647215 CTGGGTGACTGACATTGGAAAAGATGGGGGTTGTGGATGAACTAAATGTAAAAAGTTGAGGACA---TATCATGTTACAGTTTGGGCAGTAATCAATTGAAAGAAGCCAAACTCGGAAGGCTCCAGACCTGGGATACATTGAGTGCTACATGGATTACAAATTCACAGTCAATAGTGACTATTAGCTACTGGTACATTCTTTAAAC + +a +s mr.mrrefChr3 28561 57 + 181019 ATCTAAGCTTAAACCTAATAGTCAGGATATTGCAATGTAGTGCCTGGAACTTTGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472799 57 + 636262 ATCTAAGCTTAAACCTAATAGTCAGGATATTGCAACATAATGCCTGGAACTTTGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 164245 57 - 647215 ATCTAAGCTTAGCCCAAATAGTCAGGATATTGTAATGTAGTGCCTGGAAGTGTGCAT + +a +s mr.mrrefChr3 28618 10 + 181019 TCAATTCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472857 10 + 636262 TCAATTCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 164302 10 - 647215 TCAATTCCAT + +a +s mr.mrrefChr3 28628 17 + 181019 CCTATATTCCCACAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472867 17 + 636262 CCTATACTTCCACAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 164313 17 - 647215 CCTGTATTCCCACAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 28645 24 + 181019 CTGGAATTGAATTGGAAGTTAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472896 24 + 636262 CTCGTATTGAATTGGAAGTTAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 164330 24 - 647215 TTGAAATCGAATTGCAAGTTAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 28669 261 + 181019 TTCTTTTCCTTGTTTGGTTTGTCTGCTAGAAGGATTAGTACGTCATGTTTTGTCTTCTACAATGGCAGTGTAGCTGACCTGAAAACTAAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTCTTATGGAGCTTTCTATGGTGTGACCTTGAGGGGGAGATCTAGAGGAACTTATCTTATAAGTGAAGATAGTAGCTCTGACATGATGGATGAGGAATCCCTCTTGAGTATACAGTGCCACCCAGGATGAAATCTCAAGGAACTCCAAAGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 472920 251 + 636262 TTCTTTTCCTTGTTAGATTTGTCTGCTAGAAGAACTAGTACATCATGTTTTATCTTCTGCAATGGCAGTATAGCCGACCTGAAAACTGAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTATTATGGGGCTTTCAATGGTGTGAC----------AGATCTAGAGGAACTTATCTTATAAGTGAAGATAGTAGCTCTGACATGATGGATGTGGAATCCCTCTTAAGTATACATTGCCACCCAGCATGAAATCTCAAGGAACTCCAAAGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 164355 258 - 647215 TTCTTCCCCTAGTTTGGTTTGTCTGCTAGAAGGATTGGTACGTCATGTTTTGTGCTCCACAATGTGAGTGTAGCTCACCTGAAAATTAAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTCTTATGGAGCTTTCTATGGTGTGACCTTGAGGGGGAAATCTAGAGGAAC---TCTAATTAGTGAAGATAATAGCTCTGATGTGATCAATGAGGAATCCCTCTTGAGTATACAGTGCCACCCAGGATGAAATCTCAAAGACCTCCAATGACA + +a +s mr.mrrefChr3 28930 62 + 181019 CAGGAATCCCCACCTCACTGTCTTGAAATAGCTCACATAAAGGAAAGAGTCTTTTAAGAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473172 62 + 636262 CAGGAATCCCCACTTCACTGTCTTGAAATAGCTCACATAAAGGAAAGAGTCTTTTAAGAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 164613 62 - 647215 CAGGAATCCCCACCTCACTGGCTTGAAATAGTTCACATAAAGGAAAGAGTCTTTCAAGAGAC + +a +s mr.mrrefChr3 28992 19 + 181019 CTCCACTTATATGAGTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473234 19 + 636262 CTCCACTTATATGAGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 164677 19 - 647215 CTCATCTTATATGAGTTAA + +a +s mr.mrrefChr3 29011 110 + 181019 GGTGATGTTTTAGGTGTCACTCCCTTAGGTGTCGCTTCTTTGACACTGTTCATGACACTTAGTATGATATATTCATATGGCTTGCCATCCCGATTATATGGTCAAATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473253 110 + 636262 GGTGATGTTTTAGGTGTCACCCCCTTAGGTGTCGCTTCTTTGACACTGTTCATAACACTTAGTATGATATATTCATATGGCTTGCCATCCCGATTATATGGTCGAATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 164697 110 - 647215 GGTGAGGTTTTGGGTGTCACTCACTTGGGTGTCACTGCCTTGACACTGTTCATGCCACTTAGTATGATATATTCATATGGCTTGCCATCCCGATTATATGGTCAACTTTG + +a +s mr.mrrefChr3 29121 114 + 181019 AATAGAGCAGGGGTAGACCATGATATTGGGTAGAACAGGATTTTCCAATACCAATACTTCTGTCAAGCACCAGAGGAATATAGATCAAGGTTGAGAAAGTATTGATATTTTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473363 113 + 636262 AATAGAGCAGGGTTCGACCATGATATTGGATAGAACAGGATTTTCCAATA-CAATACTTCTGTCAAGCACCAGAGGTATACAGATCAAGGTTGAGAAAGTATTGACATCTTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 164849 114 - 647215 AATAGAGCAGGGGTAGAATATGATATTGGGTATAATGGGCTTTTCCACTACCAATACTTCTGTCTAGCATCAGAGGAATCTAGATCAAGGTTAAGACAGTATTGGTATTTTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 29235 99 + 181019 TTGCTACAGCTGTTGAGCATTTCTATGTGTTTTGGAATCTTGGGCAGATCACAAGAATAGGTTTATTTGGGGTAAATAAAGTCACTTTAAGATGAGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473477 99 + 636262 TTGCTACAGCTGTTGAACATTTCTATGTGTTTTGGAATCTTGGGCAGATCACAAGCATAGGTTTATTTGGAGTGAATAAAGGCACTTCAAGATGAGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 164963 99 - 647215 TTGCTAGAGCTGTTGAGCACTTCTATGCATTTTGGAATTTTGGGCAGATCACAAGAAAAGGTTTACTTGGGGTAAATAAGGTCGCTTTAAGATGTGTAC + +a +s mr.mrrefChr3 29334 193 + 181019 TAGTTAAGCTACATCATCGGAATTGGTGGATGAGTATAATTGCATCAAAGGCATAGAAGAAGTAACGTGGAGAACGATTCAGCTTTTCATGACATGCTAGAAAGTTTACCCCCTATCAATAATCACCAAGGTGAGTAATCTTGACGACCAGGGGACCACTAGGAATCCTTACTGATAGAACTTATATCATGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473576 192 + 636262 TAGTTAAGCTGCATCATCGGAATTGGTGGATGAGTATAATTGCATCAACGGCATACAAGAAGTGACGTGGAGAATG-TTCGGCTCTTCATAACATGCTAGAGAGTTTTCCCACTGTCAAGAATCACCAAGGTCAACAATCTTGACGACCAGGGGACCACTAGGAATCCTTACCGCTAGAGCCTATATCATGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 483642 191 + 647215 TAATTAAGCTACATTATCGG-ATTGGTGGATGAATATAATTGCATCAAAGGCATAGAAGAA-TAAGGTGGAGAACGATTCAGCTTTTCATGACATGCTAGAAAGGTTACCCCCTATTAATAATCACCAAGGCGAGTAATCTTGACGACCAGGGGACCTCTAGAAAACCTTGCTGATAGAACTTATATCATTCA + +a +s mr.mrrefChr3 29527 233 + 181019 TACTAAAGGCATGCAGATGTGTTGCCAGCTCTCAACCAAGAGTCAAGAGTCAATTTAATCTGCAGATTAATAAAGATGCTGTCCAGTGCTCATGCAGTAGCTTTCTGCCTTGAATTATTCTGATGTCCATCCATCAATAACTCTGATCACTTGAGAGCAGGACTGTCTACAGGTTGTGCACCTGTGTTGAAAGGTGCTAGACTGGACCTGGGTCCATATTCAGAAGAGATCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473768 232 + 636262 TACTAAAGGCATGCAGATGTGTTGCCAGCTCTCAACCAAGAGTCAAGAGTCAATTTAATCTGCATATTAATAAAGATGGTGTCCAGTGCTCATGCAGTAGCTTTCTGCCTTGAATTATTCTGATGGCCATCCATCAATAGCTCTGATTACTTGAGAGCAGGACTGTCTACAGGTTGTGCACCTGTGTTAAAAGGTACTA-ACTGGACCTGGGTCCATATTCAGAAGAGATCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 483837 232 + 647215 TACTAAAGGCATGCGGATGTGTTGCCAGCTCTCATTCAAGAGTCAAGCGTCCATTTAATATGTAGCTTAATAAAGTTGCTGTCCAGTGATCATTCAGTAACTTTCTGCCTTGAATTG-TCTGATGTCCATCCATTAATAACTCTAATCACTTGAGAGCAGGACTGTCCACAGGTTGTACACCTCTGTTGAAAGGTGCTAGACTGGCCCTTAGTCCATATTCAGAAGAGATCCT + +a +s mr.mrrefChr3 29760 22 + 181019 GCACCATTGTCACTTCTTTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474000 22 + 636262 GCACCATTGTCACTTCTTTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 484070 14 + 647215 GTAACAAAATCAGT-------- + +a +s mr.mrrefChr3 29782 179 + 181019 TGCCAGATACCAAATTGAAACCTCTGTATTAGTATAGCATGTGCATTATTTATAACAACAGCTCCTAATGGCCCTACCTAGAAGGGGCAAAAGGCAAGGCAGATTGAGGGAGCCTGACTTGTCATAATTCGCGCTTTTCCAAAGGGCCTTCCATGATGATGTTGGTCAAATCATTTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474036 179 + 636262 TGCCAGATACCAAATTGAAACCTCTGTATTAGTATAGCATGTGCATTATTTATAACAACAGCTCCTAATGGCCCTACCTAGAAGGGGCAAAAGGCAAGGCAGGTTGAGGGAGCCTGACCTGTCATAATTGGCGCCTTACCAAAGGGCTCTCCAAAATGATGTTGGTCGAATCATCTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 484084 106 + 647215 ----------------------------------------------------------------------GCCCTACGCAGAAGGGGCAAAATGCAAGGCAGATTGAGAGAGCTTGACTTTTCATAATCCGCGCTTTTCCACAGGGCCTTCCGTGATGATGT---TCAAATCATTTTTG + +a +s mr.mrrefChr3 29961 17 + 181019 TGAATATAGGTCTAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474233 17 + 636262 TGGATAGAGGTCTAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 484190 12 + 647215 TTAGTGT-GGTCT---- + +a +s mr.mrrefChr3 29978 39 + 181019 ATAGAAAGTACGGTGCCCTTGTGTGAATTCAAGTTACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474256 39 + 636262 ATAGAAAGTACGGTGCCCTTGTGTGAATTCAAGTTACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 484202 39 + 647215 ATAGAAAGCGCAGTGCCCTGGTGTGAATTCAAGTTACTT + +a +s mr.mrrefChr3 30017 123 + 181019 GGACTAGAAAATACATGATGCTGAAGCCTGCCATTCAAGGATTAATAATACCCAAGAAGGCACTCCTCTTATCCCCATGTATAAAAACAACCGCATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474298 123 + 636262 GGACTAGAAAATACATGATGCTGAAGCCTGCCATTCAGGGATTAATGATACCCAAAAAGGCACTCCTCTTATCCCTATGTATAAAAACAACCGCATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 484241 123 + 647215 GGACTAGAAAGTACATCATGCTGAAGTCTACTATTCAAGGATGAGTAATACCCATGAGGGCACTCCTCTCATCCCCATGGGTAAAAACAACCACATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 30140 12 + 181019 AAGATGGATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474722 12 + 636262 AAGATGTAACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 484364 12 + 647215 GAGATGGATTTG + +a +s mr.mrrefChr3 30152 367 + 181019 GTATTTGCTTAAATATAGAGGCCTGACAAGTCTTTTTGGACAGAATTGGAGGATTGCAAATAATAACATTTCCCTTGGTTCTCGTAACAAGATTGTAATGTTGGGTTGGAACTAAGGTAGTTAGAATTTAGCATTGCAGCAATCTAGTACTTGTATGTGACACACGGTTGGAATGGCTCACCCAACCCCAAGCTCCTTGAATTGAGTGACTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACATCTTGAAGGTTAGTAAGCACAAAGGTGATGATTGACTCTTCAAGTGTTGATTGATAGGACAGCAAGGGGTTGCACAGTTCCAGCAGGTTTCCATGTCCAACACAAGGTATTGTAATCTTCTCTAAATTGGGAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474735 313 + 636262 GTATTTGCTTAATTATATAGGCCTGACAAGTCTTTTTGGACATAATAAAAGGATTGCAAATAATAACATTTCCC---------------------------------------------------ATTTAGTATTGCAGCAATCTAGTACTTCTATGTGACG---GGTTGGAGTGACTCACCCAACCACATACTCCTTGAATTGAGTTACTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACACCTTGGAAGTTAGTAAGCACAAGGGTGATGATTGAGTCTTCAAGTATTGATTGATACAACAGCAAGGGGTTGCACAGTTCCAGCAGGTTTCCATGTCCAACACAAGGTATTGTAATCTGCTCTAAATTAGGAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 484376 367 + 647215 ATATTTACTTAAACATAGAGGCCTGACAAGCCTTTTTAGAGAGAAATGGACGATTGCAAATAATAACATTTCCCTTGGTTCTCGTAACAAGATTGTAATGTTGGGTTGGAACTAAGGTAGTTAGAACTTAGCAATGCAGCAGTCGAGTACTTGTAGGTGACACACGGTTGGAATGGCTCACCCAATCCCAAGCTCCCTGAATTGAGTGATTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACATCTAGAAGGTTAGCAAGCACAAAGGTGATGATTGACTCTTCAAGTGTCGATGGATAGGACAGCAAGGGGTTGCAAGGTTCCAGCAGGTTTCCATGTTCAACACAAGGTATTGTAATCCTCTCTAGATTGGGAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 30519 31 + 181019 CCCATGCATCCCAGACTCAGCATTTTCAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475049 31 + 636262 CCCATGCATCACAGACTCAGCATTTTCAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 484743 31 + 647215 CCCATGCATCCCTGACTCAGCATTTTCAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 30550 174 + 181019 CTACTATGGCTGTTAGCTGGCTTTTTAAGCACAATTAATCCAAACGTTGAGACGCAACGATCATTAGAAGACCTTCATGGGCCATCCATTGTTATAGACAAACAGTGTTCATAGAGTGATAGTGAACAGGGATGGTCTACAGCCTGAGTGGCCCACCTAATTCACATCGAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475084 160 + 636262 CTACTATGGCTGTAAGCTGGCTTTTTAAGCACAATTAATTTGAACGGCAAGACCCGACGATCATTAGAAGACCTCCATGGGCCATCCGTTGTTCCAGACAAACAGTATTCTTAGAGTGATGGTGA--------------CAGCCTGAGTGGCCCACCTAATTCACATCGAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 484774 174 + 647215 CTACAATGGCTGTTAGCTTGCTTTTTAAGCACAATTAATCCAAATGTTGAGACGCAACGATCCTTAGACGGCCTTCATGGGCCATCAATTGTTATAGACAAATAGTGTGCAAAGAGTGATAGTGAACAGGGATGGTCTATAGCCTTAATGGCCCACCTAATTCATATAGACAGT + +a +s mr.mrrefChr3 30724 37 + 181019 GAATGATTCGGGGTTAGCATTCCTCCAGCTGTAGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475638 37 + 636262 GAATGATTCGGGGTTAGCATTCCTCCAACTGTAGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 484948 37 + 647215 GTATGAGTTGGGGTTAGGTTTCCTCCAGCTGTAGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 30761 54 + 181019 TGCACAAGTAATAGAATGTGCTGGATGATGTGTTAAATATTGCTACATTGGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475675 54 + 636262 TGCACAAGTAATAGAATGCATTGGATGATGTGTTAAATATTGCTACATTGGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 484988 52 + 647215 TGCACAAGT--CAGAATGTGCTGGACGATATGCAGGATATCACTACATTGGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 30815 101 + 181019 GAGTCCTACCAGGGTGCTTTAAACATCAAGACGCGTTGCCAGCAGCAAACCACCCATTCATTGGACATTTGGGTACAGCAACCAGGAAGACTGACCAAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475729 101 + 636262 GAGTCCTACCAGGAGGCTTTAAACATCAAGACGCGTTGCCAGCAGCAAACCACCCATTCATTGGACATATGGGTACAGCAACTAGGAAGACTGACCAAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 485044 101 + 647215 GAGCCCTACCAGAGTGATTTGAACATCAAGACTGGTCACCAGCAGCAAACCACCCATTCATTGAACATTTGGGTACAGCAACCAGAAAGACTGACCAAGAC + +a +s mr.mrrefChr3 30916 70 + 181019 AACCAGTACATAGATATCCGTCCTATTTGGGTGTAAAATGGAGCTAACAGCTTATCCTACGAGCAGTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475830 70 + 636262 AACCGGTACATAGATATCCGTCCTATTTGGGTGTAAAATGGAGCTAACAGCTTATCCTACGAGCAGTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 485147 70 + 647215 AACCAGTACATAAATATCCGTCCCGTCTGGGTGTAAAATTGAGCTAACAGCTTATCCTATGAGCAATGGG + +a +s mr.mrrefChr3 30986 80 + 181019 ACTGTTTAGACTTCACACAGTGCCGTGTGAAAATTTCTAAAAAAAGGCAAACACGGCCCGGTAAACATGGCTAGTGCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476109 80 + 636262 ACTGTTTAGACTTCACACAGTGCCGTGTGAAAATTTCTAAAAAAAGGCAAACACGGCCCGGTAAACATGGCTAGTGCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 485217 80 + 647215 ATTGTTTAGACTTCACATAGCGCCTTGTGCAAATCTCTAAAAAGAGGCAAACGTGGCCAGGTAAACATGGTTAGTGCTTA + +a +s mr.mrrefChr3 31066 40 + 181019 GGCCATGTACACACAGTTAGTCCTTGGCGACGAGGCTACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476189 40 + 636262 GGCCATGTACACACAGTTAGTCCTTGGCGACGAGGCTACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 485317 40 + 647215 GATCATGTACAAGCAGTCAGTGCTTGGCTATGTGCCTGCC + +a +s mr.mrrefChr3 31106 62 + 181019 CGAGAAGTCAAGCAATCTCCCTGCATGCATTGTCGATCCCCTGTTCAATTCACACATCCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476236 62 + 636262 CGAGAAGTCAAGCAATCTCCCTGCATGCATTGTCGATCCCCTGTTCAATTCACACATCCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 485357 62 + 647215 TGAGAAATCAAGCACTCCCCCTGCATACATTGTTTATCCCATGTCTGTTTCACACACGTCAA + +a +s mr.mrrefChr3 31168 14 + 181019 GTCCTGACAGGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476317 14 + 636262 GTCCTGACAGGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 485419 14 + 647215 GTGATGACAGGTCC + +a +s mr.mrrefChr3 31182 23 + 181019 CCAATTCATGCACTGTCAAGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476355 23 + 636262 CCAATTCATGCACTGTCAAGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 485433 23 + 647215 CCGATTCATGCACTGTCAAGTAA + +a +s mr.mrrefChr3 31205 27 + 181019 GACAGGCATCTGGTTCATGTCTAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476379 27 + 636262 GACAGGCATCTGGTTCATGTCTAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 485456 27 + 647215 GACAGGCACCTAGTTTGCATTCAGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 31232 56 + 181019 GCCTGCCCGCACTACAGTGGACAGTAACTCATTGTCTATTGGTGGGCATAGTGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476406 56 + 636262 GCCTGCCCGCACTACAGTGGACAGTAACTCATTGTCTATTGGTGGGCATAGTGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 485485 56 + 647215 GCCCGCCTACGCTACAGTAAACAATAACTGATTGCCTGTTGATGGACATAGTGTTC + +a +s mr.mrrefChr3 31288 18 + 181019 AGTCACCTCTTTCAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476462 18 + 636262 AGTCACCTCTTTCAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 485542 18 + 647215 AGTAACTTCTTTCAAACA + +a +s mr.mrrefChr3 31306 42 + 181019 TTTTAGCGTGTATGTTTCATTGGTAATATTTAGCATGTATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476499 42 + 636262 TTTTAGCGTGTATGTTTCATTGGTAATATTTAGCATGTATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 485560 42 + 647215 TTCAAACAAATATAAAGGATTGGTAATAATTAGCATCTGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 31348 148 + 181019 AGTCTATGGATTGTGAATATTTAGAATTGGCAGGCAGGAATTTAAAATCAATTTGGCAGACACACGTACTGGCTTTAACATCAATTCAATAAGCCAACAAACCCTCCCTTCAACATCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATTAATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476550 148 + 636262 AGTCTATGGATTGTGAATATTTAGAATTGGCAGGCAGGAATTTAAAATCAATTTGGCAGACACACGTACTGGCTTTAACATCAATTCAATAAGCCAACAAACCCTCCCTTCAACATCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATTAATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 485602 148 + 647215 ATTTTAGGCGTTGTGGACATTTAGAATTTGTGGGCAGGAATTTAAAATCAACTTGGCATACACACGTACTGGATTTAACATCAAATCAATAAGCCAACAAACCTTCCCTTCAACAGCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATCAGCTTG + +a +s mr.mrrefChr3 31496 21 + 181019 TTCCCTCTGCATCAATATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476699 21 + 636262 TTCCCTCTGCATCAATATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 485750 21 + 647215 TTCCCTCTGCAACACTCTATA + +a +s mr.mrrefChr3 31517 23 + 181019 GTCCTCTGTCGAACTCACAGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476730 23 + 636262 GTCCTCTGTCGAACTCACAGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 485771 23 + 647215 GTCCTCTGTTAAACACACAAATG + +a +s mr.mrrefChr3 31540 109 + 181019 AAGTTACTGCATGGTGTATCAAGGTTTAGTTTTGAGTCTAAGTGACCTGATTTCTATGCAAAGTGGTATTGCATCAAACTTGAGGATTGTCTATTGGAAATATACAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476753 109 + 636262 AAGTTACTGCATGGTGTATCAAGGTTTAGTTTTGAGTCTAAGTGACCTGATTTCTATGCAAAGTGGTATTGCATCAAACTTGAGGATTGTCTATTGGAAATATACAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 485801 109 + 647215 AAGTTATCGCATGGTGTATCAAGGTTTAGTTTTGAGTGTAGGTGACCTGATCACTATGCAAAGTGGTATTTCATCAAACTTCAAGATTGTCTTTTGGAAATATACAAAG + +a +s mr.mrrefChr3 31649 8 + 181019 CATAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476863 8 + 636262 CATAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 485910 8 + 647215 CATAAGAT + +a +s mr.mrrefChr3 31657 85 + 181019 TGTCCACAATACTTTAAGtcacttctcataggaaggatggcatctcccctgcaactgtaacaatgaatgtacacactagaatggt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476885 85 + 636262 TGTCCACAATACTTTAAGtcacttctcataggaaggatggcatctcccctgcaactgtaacaatgaatgtacacactagaatggt +s simRat_chr6.simRat.chr6 485918 85 + 647215 TGTACACAATACTTTAAGTTACTCCTTATAGGAAGAATGGCATCTCCCCTGCAACTGTAACACTGAATGTACACACTAGTATGGG + +a +s mr.mrrefChr3 31742 63 + 181019 acagggaaaagcataacttctcaaactgagccatccacTGGCACACAGCTTATTGGAAGGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 476970 63 + 636262 acagggaaaagcataacttctcaaactgagccatccacTGGCACACAGCTTATTGGAAGGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 486010 63 + 647215 ACAGGGAAGAGCATAACTTCTCAAGCTGAGTCATCCACTGGCAAGTAGCTTACAGGAAGGCAC + +a +s mr.mrrefChr3 31805 23 + 181019 AGGAGAAAGCATAGTACTAATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477033 23 + 636262 AGGAGAAAGCATAGTACTAATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 486083 23 + 647215 AGAAGGAAGCATAGTACTAATTC + +a +s mr.mrrefChr3 31828 113 + 181019 TTCACTCACCTACTAGTCCACATTCAATTGTAGGTGCTCTGTGAGAATGCACACCCCCCCTCCCTGGAGGGCATGGTCTGAAGGCTTTAGAACCTTGAGTTATAATCCGGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477061 113 + 636262 TTCACTCACCTACTAGTCCACATTCAATTGTAGGTGCTCTGTGAGAATGCACACCCCCCCTCCCTGGAGGGCATGGTCTGAAGGCTTTAGAACCTTGAGTTATAATCCGGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 486106 113 + 647215 TTCATTCACCTATTCGTCCACATTCAATTGTAGGAGCTCTGTGAGTATGCACACCCCCCCTCCCTGCAAGGCATGGTCTGAATGGTTTAGACCCTGGAACCATAACCCAGCCT + +a +s mr.mrrefChr3 31941 81 + 181019 GTTATTGTGTACAGGCTGAATGGAGGACTAGTGATGGAGAATCTTTAAGTGCACAATTATATACTCAAAGTTTGATAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477175 81 + 636262 GTTATTGTGTACAGGCTGAATGGAGGACTAGTGATGGAGAATCTTTAAGTGCACAATTATATACTCAAAGTTTGATAAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 486219 81 + 647215 GCTAGTGTGTAAAGGCTCATCAGAGGACTAGCGCTGGAAAATTTTTAAGAGCACAATTCTGTACCCAAAGTTTGGTAAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 32022 108 + 181019 CTATAACCTGTTAGAGTTCAAAAGCACTCTCTCTGTCTCACCAGACTGTTCGAAGTTCGAGCTAATGCCATTATTAATACTTAATTCCCTTTTGCTGGTTAAAAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477256 108 + 636262 CTATAACCTGTTAGAGTTCAAAAGCACTCTCTCTGTCTCACCAGACTGTTCGAAGTTCGAGCTAATGCCATTATTAATACTTAATTCCCTTTTGCTGGTTAAAAGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 486314 108 + 647215 CTAAACCCTGTTAGAGTTCAAAAGCCATCTCTCTGTCCCACCAGTCTGTTAGAAGTGGGAGCTAATGCCATTCTTCATACTTAATTCCCTTTTACTTGTTAAAAGGCA + +a +s mr.mrrefChr3 32130 20 + 181019 GGGCCTCCCAGCTTGTATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477364 20 + 636262 GGGCCTCCCAGCTTGTATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 486424 20 + 647215 GGGCCTCCCAGCATTTATGG + +a +s mr.mrrefChr3 32150 77 + 181019 CAATCAAACTATTGTAACTGTCTCAAACGAGTGTAACTGTGGCAGGGTAACCTGAACTCACATAATCTTGGCTGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477747 77 + 636262 CAATCAAACTATTGTAACTGTCTCAAACGAATGTAACTGTGGCGGGGTAACCTGAACTCAAATGATCTTTGCTGGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477824 77 + 636262 CAATCAAACCATTGTAACTGTCTCAAACAAGTGTAACTGTGGCAGGGTAACCTGAACTCACACAATCTTGGCCGTAG + +a +s mr.mrrefChr3 32227 113 + 181019 GGTTCAGCCCCCTGGCTGTAAAGATTTAACTGCTGTGTGAGGTTGTACATTGTGGCTATGACGACTTGGGCTGAAGAGAAGACCATTAGAATGTGTCCCCAGAAGTGTAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 477938 113 + 636262 GGTTCAGCCCCCTGGCTGTAAAGATTTAACTGCTGTGTGAGGTTGTACATTGTGGCTATGACGACTTGGGCTGAAGAGAAGACCATTAGAATGTGTCCCCAGAAGTGTAATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 486444 113 + 647215 GGTTCAGACCCCTGGCTGTATAGAATTAGATGCTGTGTGATGTTACACATTGTCGCTATGACAACTTGGGCCAAGAATAAGACCATTAGAGCCTGTCCCCAGAAGTGTAATTA + +a +s mr.mrrefChr3 32340 80 + 181019 AAGATTCCAGCTTTACTGCCTGAAAGGGGCTGAGTACTATTGTGTGCACACCTATTATTGCCCCTGGGTTTAGGAAGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478051 80 + 636262 AAGATTCCAGCTTTACTGCCTGAAAGGGGCTGAGTACTATTGTGTGCACACCTATTATTGCCCCTGGGTTTAGGAAGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 486562 80 + 647215 AACATTCCAGCTTCACTACCTGAAAAGGGTTGAGTACTATTGTGTGAACACCTATTATTACCCCTGGGTTCAGGAAGCAT + +a +s mr.mrrefChr3 32420 22 + 181019 ACATTGTGAAGGGAATACTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478131 22 + 636262 ACATTGTGAAGGGAATACTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 486643 22 + 647215 ACGTTGTAATGAGAATATGAGT + +a +s mr.mrrefChr3 32442 19 + 181019 CCTCCTCTTGTTCATCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478197 19 + 636262 CCTCCTCTTGTTCATCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 486665 19 + 647215 CCTCCACTTGTTCATTGGA + +a +s mr.mrrefChr3 32461 11 + 181019 CATCAGACACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478218 11 + 636262 CATCAGACACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 486684 11 + 647215 CACCATATGAC + +a +s mr.mrrefChr3 32472 750 + 181019 TTTTCGGATTTGATTGTAAAGTTAGGAGTACCAGCTAGCAATCACTGAGTGCATTCAATGCAGTGTTGCATCCAGTCTCCCAGACTGAGAGTGCTAGGGTGTCAAAAAAAACCCTTAAAAGGCGTTCAGGCTGAGAGTGCTGGGTCTTTAAGAAAAGCCTTAAGAAGATAAACACATGAAGAGATTCACCATGAGACATAATTTTTCTTACCAAATATCAGACTGCTAGAGCATGGGATAAGGAGACTCATCTTAAAATGGACTGTAGACCATGGTTTTGACATGGTGCCAGTAGATATCTCTAAAGCCTCGTGCATGTCCGCTTAATTGCAGGTGTGACCAGTAGGCTATTGAATGTGCTAATCAAGGCAAGTCAAGAATATTATTGGATAGACTAAGGTTGTTCTCCACACTACCTCATTATGCATCAAGCTACCAATAATTATTTCAACCACTACACAACCCATGAGCTTTTGTTGGGGCTACACACACTGCATTTTGAAAAGTGTCTACAATTGAACTTTTCTTTGTTCAAGGTTGGATGCTGTTGAAATTGAATGAGTGTTTCAGTGACATGCCACTATAAGTGTTACCATCAGTTTGGAGAGAGGTAGGTTTCTATCCACCCGACTGCCTTCAGATAGAGGTAACTTTTCTAGGGCAGACACTTCATTCACTTATCTTCACTCTACCTATGGTATGTGATAAATCAGCTCATAATCAAGAATAAAAAGTAATTGAACACGCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478230 750 + 636262 TTTTCGGATTTGATTGTAAAGTTAGGAGTACCAGCTAGCAATCACTGAGTGCATTCAATGCAGTGTTGCATCCAGTCTCCCAGACTGAGAGTGCCAGGGTGTCAAGAAAAACCCTTAAAAGGCGTTCAGGCTGAGAGTGCTGGGGCATTAAGAAAAGCCTTAAGAAGATAAACACATGAATAGATTCACCATGAGATGTAATTTTTCTCACCAAAGATCAGACTGCTAGAGCATGTGATAAGGAGACTCATCTTAAAATGGACTGTGGACCATGGTTTTAACATGGTGCCAGTAGATATCTCTAAAGCCTCGTGCTTTTCCCCTTAATTGCAGGTCAGACCAGTAGGCTATTGAATGTGCTAATCAAGGCGAGTCAAGAATATTATTGGATAGACTAAGTTTGTTGTCCACACTACCTCATTATGCAGTGAGCTACCAATAATTATTTCAACCACTACACAACCCATGAGCTTTTGTTGGGGCCACACACACTGCATTTTGAAAAGTGTCTACAATTGAATTTTTCTTTGTTTAAGGTTGGATGCTGTTGAAATTGAATGAATGTTTCAGTGACATGCCACTATAAGTGTTACCATCAGTTTGGAGGGAGGTAGGTTTCTATCCATCCGACTGCCTTCAGATAGAGGTAACTTTTCTAGGGCAGACACTACATTCACTTATCTTCACTCTACCTATGGTATGTGAAAAATCAGCTCATAATCAAGAGTAAAAAGTGATGGAACACGCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 486695 726 + 647215 TCTTCAAATTTGATCGTAGGGTGATAAGTACCAGCTAGCAATCACTGAATGCGTTGAATGCAGTGTCACATCCAGTCTTCCAGACTAGGAGTGCTGGGGTGTCAAAAAAAACCATTAAAAGGTGTTCAACTGGAGAGTGCCGGGTCTTTATGAAAAACCTTAAGAAGATAAAAACATGAAGAGATTCACCATGAGACATAATTTTACTTTCCAAATATCAGACTGCTAGTGCATGGGATAAGGAGACTCATCTTAA-GTACACTGTAGACCATGGTCTTGATGTGGTGCGAGTAGATATCTCTAAAACCTCGTGCATGTCCGCTTAATTGCGGGTGTGACAAGTAGGCTATTGAATGTGCTAATCAAGGCAAGTTGAGAATATTGTTGGATAGACTAAGGTTGTTCTCCACACTACCTCGTGATGAATCAAGTTACCAATAATTATTGCATGCAATACACAACCCATGACCTTCTGTTGCGGCTACACACACTGCAATCTGAATGGGGTCTACAATTGAACTTTTCTTTGTTCAAGGATGGATGCCGTTGAAATTGAATGAGTATTTGAGTGACATGCCACTATAAGTGTTACCATTAGTCTGGAGAGTGTTGGGTTTCTAGCCACCAGA-----------------------TTCTAGGGCAGACCCTTTGTTCGCTTATCTGCACTCTACCTATGGTATGTGATAAATCAGCCCATAATCAAGAATAAAAAGTAATTGAACACACTTG + +a +s mr.mrrefChr3 33222 274 + 181019 GAAGACAATGAGTGTCCCCAAATCCATTTGACTTGGCAGGCTAGCAAATTTGTGATCTAGTTTTCTTCTTTGCCAGATTGTGACAGTGGTACAGGATGGCCATGGTATGGCTCTGGGCTTTAGGGACTGGTCTCATTTTCAACAGAAGAGGGTTGAAGGATTCTCCCATGGAATAACACTGGATCAATCTAAGACATTTGGAATGTGCACTGGAGATGTTAATGTCTTCACAAAAATGTAATTACAGCTTCTTATACAATGTCAATGTTAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 478980 273 + 636262 GAAGACAATGAGTGTCCCCAAATCCATTTGACTTGGCAGGCTAGCAAATTTGTGATCTAGTTTTCTTCTCTGCCAGATTGTGATAGTGGTACAGGATGGCCATGGTATGGCTCTGGGCTTTAGGGACTG-TCTCATTTTCAACAGAAGAGGGTTGAAGGACTCTGCCATGCAATAACTCTGGATCAGTCTAAGACATTTGGAATGTGCACTGGAGATGCTTCTGTCTTCACAAAAATGTAATTACAGCTTCTTATACAATGTCAATGTTAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 487435 274 + 647215 TAAGACAATGAGTGTCCCCAAATCCATTTTACTTGGGGGGCTCGCAAATTTGTGATCTGGTTTTCTTGTTTGCCAAATTGTGACAGAGGTACAGGATAGCCAGTGCATAGCTCTGAGCTTTAGGGACTGGTCCCATTCTCAAGAGGAGAGGGTTGAAGGATTCTCCCATGGAATACCACTGGACCAATCAACGAAAATTAGAATGTGCACTGGAGATGTTAATATCTTCATAAAAATGTAATTACAGCCTCTTACTCAATGTCAATGTCAATTT + +a +s mr.mrrefChr3 33496 209 + 181019 CTATGCACATAAGGGGTGGGCAGAGAATCCCAAATATAGACCATCTCTCTAGCCCCAATGCCAAGCTGCTGTAGTGCACACAGAGGTCGTACTAAAGGAACATTTAAGAAGATACACACTTTTCAAGCCCCTTACACTATTTAGTCTGAATCTGATTCTCTATTTATTGTCCAATGATGGTGGGCCCCCGATTTAGTGTCTGCTTATCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 479274 209 + 636262 CTATGCACATAAGGCGTGGGCAGAGAATCCCAAATATAGACCATCTCTCTAGCCCCAATGCCCAGCTGCTGTAATGCACATAGAGGTCGTATTAAAGGAACATTTAAGAAGATACACACTTTTCATGCCCCTTACACTAGTTCATCTGAACCTGACTCTCTATTTATTGTCCAATGATGGTGGGCCCCCGATTTAGTGTCTGCTTATCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 487709 194 + 647215 CTATGCACATAAGGGGTGGGTAGAGAATTCCAAATATAGACCATCTC--------------CAAGCTGCTATAGTGTACACAGAGGCCAAACTAAAGGAACATTTAAGAAGATACATATCTGTCAAGCCCCTTAC-CTATTTAGTCGGAATCTGATTCTCAATTCGTTGCCCCATGGTGGTGGGCCCCCGATTTAACGTCTGCTTATTG + +a +s mr.mrrefChr3 33705 213 + 181019 CATGCAATTTCAGTCTTATTGGGTTTGACATATTAGTGTCTCAAAGTATCGTTTGCACTTTAAAGATGTACCATGTGGCCGATCAACTGGCAACCACTGTGAGGCTTCTGCCTTTTTGTCCCTATACATCCACCATGTAATAGTTCCCCAATCTCAGACTTATCATAACTACCACAACAAATAAATCCTACATACTGTCAGCAAGCTCACTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 479487 213 + 636262 CATGCAATTTCAGTCTTATTGGGTTTGACATATTAGTGTCTCAAAGTATCGTTTGCACTTTAAAGATGTACCATGTGGCCGATCAACTGGCAACCACTGTGAGGCTTCTGCCTTTTTGTCCCTATACATCCACCATGTAATAGTTCCCCGATCTCAGATTTATCATAACTACCACAACAAATAAATCCTACATACTGTCAGCAAGCTCACTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 487903 78 + 647215 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTAATAGTTCCCCAATCTCAGACTTATCATAACTACCACTGCAAATAAATCATATAGACTGTCGGCAAGCTCACTTT + +a +s mr.mrrefChr3 33918 414 + 181019 TATACACTGTCAACAAACTCACCTTTATTTCATGGTGCCCATGTCCACTACTTATTGCAGATTCTGACCAAAGTGCATAAGTCCACTAATCAAACTTAAGAAATACTGCCATAATGTTAGTGTGTCACTGTCTCTTCAATCTGCACGTCTGGTAGATACATGTCATTCTTGACCTTGAGCAGTTGATGACTTTATGTATAAAAAGCTTTTACTGATTAATTGATTTTGCTGATTAGTACAAAGTCATTGGCAGTTCTCTAACTTAAGACATTATGGGCTCAGGCCCCTTACATCCCATACTTGAAATAAACAGTTTTGACAGCAACTGTCCGAGTTGGAAATCGCAAGCTCCTTTTGTGCTGACCTTTGTGGTTGTGTGTGGGTTGTTACTTTCAATTAATCGGGTCTCCCGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 479707 414 + 636262 TATACACTGTCAACAAACTCACCTTTATTTCATGGTGCCCATGTCCACTACTTATTGCAGATTCTGACCAAAGTGCATAAGTCCACTAATCAAACTTAAGAAATACTGCCATAATGTTAGTGTGTCACTGTCTCTTCAATCTGCACGTCTGGTAGATACATGTCATTCTTGACCTTGAGCAGTTGATGACTTTATGTATAAAAAGCTTTTACTGATTAATTGATTTTGCTGATTAGTACAAAGTCATTGGCAGTTCTCTAACTTAAGACATTATGGGCTCAGGCCCCTTACAACCCATACTTGAAATAAACAGTTTTGACAGCAACTGTCTGAGTTGGAAGTTGCAAGCTCCTTTTGTGCTGACCTTTGTGGTTGTGTGTGGGTTGTTACTTTCAATTAATTGGGTCTCCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 487981 414 + 647215 TATACATTGTCGGCAAGCTCACTTTTATTTCATGATGCCCATGTCCACAAATCATTGCAGATTCCAGCCAAAGTGCATAAGTCCCCTAATCAAATTTAAGAAGTACTGCCAAAATGTTAATGTGTCACTATATCTTCGATCTGGACCTTTGGCAGATATATGTCATTATTGACCTTGAACTGTTGATAACTTTATGTATGAAAGGCTTGTCCTGTTTAGTTGAATCTGCTGACTAGTACAAAGTCACTGGCAGTTCCCTAACTTAAGACATTATGGGCACAGGCCCCTTACATCTCGTACTTGAAATAAACAGTTTTGACTGCTACTGTCCGAGTTCAAAATCGTAAGCTCCTTTTGTGCTGACCCTTGTGCATGTGTGTGGGTTGTAACTTTTACTTGATCAGGTCTCCCGTA + +a +s mr.mrrefChr3 34332 11 + 181019 CCCATGCAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480123 11 + 636262 CCCATGCAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 488395 11 + 647215 CCCATGCAATC + +a +s mr.mrrefChr3 34343 52 + 181019 TAAAGCACCATGCTCCGTCTAAGCTCCCATCCTGTTCCAGTAAACAAGCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480135 52 + 636262 TAAAGCACCATGCTCCGTCTAAGCTCCCATCCCGTTCCAGTAAATAAGCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 488406 52 + 647215 TAATGCAGCATGCTCAGTCTAAATTCCCGTCCTGTTCCAGTAAACAAGCCAC + +a +s mr.mrrefChr3 34395 103 + 181019 TCACAGATGCACTCTGAGACCCACCCCACTAAGATAGTCTACACCACTCAGCTTGCAGTGGAGACTGTTCCTTAATGAACATAGGGGCCTACATAAGTTGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480189 103 + 636262 TTGCAGATGCACTCTGAGACCCACCCCACTAAGATAGCCTACACCACTCAGCTTGCAGTGGAGACTGTTGCTTAATGAACATAGGGGCCTACATAAGTTGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 488458 103 + 647215 TCACAGATACACACTGAGATGCACCCCACTGAGGTAGTCCACACCAGCCAGCTTGCAGTGGAGACTGTTCCCTAATGAACATTGTGGTCTACATAAGTTGGAT + +a +s mr.mrrefChr3 34498 272 + 181019 ACCATAGAGGCAACATTTGCCATGGTCAGACTTCAATAAGCAGCTGGCACAGAAACAGTTACTTCTCTGATCTCGTACCACATCCTGTTATTATACCACCCCCTACCAATAATCTACTAGAGCCAAGATTAGGGGGAATGCCCCAACCTCTTGACCCACGACATTTGTAATTTATGAACATAAGGTAAACATAGGTACATTATTGTGCATAGGAGGAACGCACGTTCACATCTGTATCTTCCCATGGCATAGTCTCTCTAACAAGCATCGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480292 272 + 636262 ACCATAGAGGCAACATTTGCCATGGTCAGACTTCAATAAGCAGCTGGCACAGAAACAGTTACTTCTCTGATCTCGTACCACATCCTGTTATTATACCACCCCCTACCAGTAATCTACTAGATCCAGGATTAGGGGGAATGCCCCAACCTCTTGACCCACGACATCTGTAATTTATGAAGGTAAGGTAAACATAGGTACATTATTGTGCATAGGAGGAACGCACGTTCACATCTGTATCTTCCCATGGCATAGTCTCTCTAACAAGCATCGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 488565 239 + 647215 ACTATAGAGGCAACATTTGCCATGGTCAGATTAC-----------------------------ACTCTGATCTCATACCTCGTCCTGTTATTATACCACCCCCTACCAATAATCTACTAAAGCCAAGATTAGGGGGAATGCCCGAACCTCTTGACCCACAACATTGGTAATTTATGAACATAAGGT----ATAAGTAAATTATCGTGTACAGGAGGAATGTGCATTCACACCCGTATCTTCCCATGGCATAGTCTCCCTAACAATCGTCGCA + +a +s mr.mrrefChr3 34770 38 + 181019 ATAGTCTCTATGCCCATAGGTCGGTCTTGTGGTTAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480569 38 + 636262 ATAGTCTCTATGCCCATAGGTCGGTCTTGTGGTTAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 488804 38 + 647215 ATAGTCTTTAATCCCATGGGTCTGTCTTGTTTTAGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 34808 26 + 181019 GCTGTACTTTGACATGTCAAGGGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480610 26 + 636262 GCTGTACTTTGACATGTCAAGGGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 488842 26 + 647215 GCTGCACTTTGACATGTTAAGGGGTG + +a +s mr.mrrefChr3 34834 198 + 181019 CTAGATTGCATGCCCGTGGCAGACCATCTCAACCAAGGCTTGCATGGTTGCATGGGAAACCACACAGTAGGCTCTTGTTTAACTAAAGTAGATTAACAATCTGCAAGGGGACCAAGATACATGAGATTGCATTAAGACTTCATTTACTCACTGACTATAGTTTGATATGAGCACCAATGCCAATGTCTGGAGTGTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480637 198 + 636262 CTAGATTGCATGCCCGTGGCAGACCATCTCAACCAAGGCTTGCATGGTTGCATGGGAAACCACACAGTAGGCTCTTGTTTAACTAAAGTAGATTAACAATCTGCAAGGGGACTAAGATACATGAGATTGCATCAAGACTTCATTTACTCACTGACTATAGTTTGGTATGAGCACCAATGCCAATGTCTGGAGTGTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 488868 198 + 647215 CAAGATTTCATCCTCATGGCAGACCATCTCAACCAAGGCTTGCATGTTTACATGTGAAACCACACGGGAGGCTCTTGTTTCACTAAAGTAGCTTAACAATCTACAAGGGGACCAAGATACATGAGCTTGCATTAAGACTTTATTTACTCACTGACTATGGTTTGATATAAGAACCAATACCAATTCCTAGAGTGTATT + +a +s mr.mrrefChr3 35032 35 + 181019 GGAAAGACGTGCGATGCACTGTCAATTTTCCAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480835 35 + 636262 GGAAAGACGTGCGATGCACTGTCAATTTTCCAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 489072 35 + 647215 GGAAAGATGTGTGATGCACTGTCGATTTTCCAAGC + +a +s mr.mrrefChr3 35067 137 + 181019 ATAGAGCTAAATAATGAGTTATACTGGTACTCTACTTGAATCAGCTAGGTCTCTTTCTGCCTGTCCAACCACCATATAGCACTTTTTAGCATCACATTGCCTTTGATTCCAATCTGAAGCTGAGTACAGGATACTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 480870 137 + 636262 ATAGAGCTAAATAATGAGTTATAATGGTACTCCACTTGAATCAGCTAGGTCTCTTTCTGCCTGTCCTACCACCATATAGCACTTTTTAGCATCTCATTGCCTTTGATTCCAACCTGTAACCAAGTACAGGATACTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 489116 137 + 647215 ATAGTGCTAAATAATAAGATATACTGTGACTCTGCTTGAATCAGCTAGGTTTGTTCCTACCTGGCCAACCAACACATAGCAGCTTTTAGCATAACATTGTCTTTGATTCCAGTCCAAAGCTGAGGACAGGACACTGA + +a +s mr.mrrefChr3 35204 92 + 181019 ATATGATGACGGACAGATACCTCTAACATGGGGGAGTTTCACTCCTTATAAGTTAAGAAGATGCCACCTCCAGTCATTGGATTAGTCAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481007 92 + 636262 ATATGATGATGGACAGATACCTCTAACAAGGTGGAGTTTCACACCTTATAAGTTAAGAAGATGCCACCTCTAGTTCTTGGATTAGCCAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 489255 92 + 647215 ATATGATGACGGACAGATACCTCTAATATGGGGGAGTTTTACTCCTAGTAAGTTAAAAAGATGCCACCTCCAGTCACTGGATTAGTCAAAAA + +a +s mr.mrrefChr3 35296 58 + 181019 CAAGTCACCCTCACCCAGGAGATGAAGCATGCCAGGCTAGTTAATGTGGCATAGTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481100 58 + 636262 CAAGGCACCCCCAACCAGGAGATGAAGCATGCCAGGCTAGTTAATGTGGCATAGTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 489347 58 + 647215 CAAGTCGCCCTCACCTTGGAAGTGAAGCATGCCAGGCTAGTTAATGTGGCATAGTAGA + +a +s mr.mrrefChr3 35354 9 + 181019 ATAGTTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 489408 9 + 647215 ATAGTTAGA + +a +s mr.mrrefChr3 35363 31 + 181019 GAGATATTTACGAAAGTCATCCTGGGGGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 489421 31 + 647215 GAGATATTTACGAAAGTCATCCTGGGGGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 35394 242 + 181019 ACTGGCTGTGACAAAGGAATACCACAGCATTTACCTGGTAACTTATAGGCATTTGAACTAAAAGGGTATGATGTCCTCATTTGTCTCAGCTGGGATCTGGGGCCCAATAGCCTGAGAGACATGCCTGAGGAATGCCCTGAGATTAGCACAAGGCATAAGGGTATCCACCTCAGCTCTCTAGAGTGCTGGCAAATGAAAGACTAAGTCCAGTACATATATAAACGTGAGTGGTGTCTCCTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481158 169 + 636262 -------------------------------------------------------------------------TCCTCATTTGTCTCAGCTGGGATCTGAAGCCCAATAGCCTGAGAGAAATGCCTGAGGAATGCCTTGAGATTAGCACAAGGCATAAGGGTATCCACCTCAGCTTTTTAGAGTGCTGGTAAATGGAGAACTAAGTCCAATGCATATACACACCCAAGTGGTGTCTCCTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 489455 242 + 647215 ACTGGCTGTGACAAAGGAATACCACAGCATTTACCTGGTAACTTATAGGCATTTGAACTAAAAGGGTATGATGTGCTTATTTGTCTCAGTTGGGATCTGGGGCCCAATTGCCTGAGAGACATGCCTGAGACATGCCCTGATATTAGCACAAAGCATAAGGGCATTCACCTCAGCTCTCTAAAGTGCTAGCAAATGAAAGACTAAATCTCGTACCTATATAAACGTGAATGGCATCTGACCCA + +a +s mr.mrrefChr3 35636 41 + 181019 ATCAGTACAGCCCATTAAACCTTCTGTGGATTGCTTGAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481371 41 + 636262 ATTAGTACAGCCCATTAAACCCTCTGTGGATGGCTTGAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 489697 37 + 647215 ATCAGTACAGCCAATTAAACCTTC----ACTTGCTTGGACA + +a +s mr.mrrefChr3 35677 16 + 181019 TTAAGACAAGCCTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481412 16 + 636262 TTAAGACAAGCCTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 489739 11 + 647215 TTAAGAAAAGT----- + +a +s mr.mrrefChr3 35693 208 + 181019 ACTAATCAGTTACCCTCAGGTCTGACCCACATCCTTTCTTGTATTGTTTACCAAGCTACATCCCACATTCCAGTGCTTGCCCATTAAGTCCACCATCCATGAATATATATACTGATAGTAGAGAAATAACTGAGTTCAGTGCAAGAGACCCATGCGTTTGATGTGGATCACGATAATAATACCTAATGGATAACGTGCAATCATTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481429 208 + 636262 ACTAATCAGTTACCCTCAGGTCTGACCCGCATCCTTGCTTGTATTGTTTACCAAGCTACACCCCACATCCCAGTGCTTGCCGATTAAGTCCACCATCCATGGATATATATACTGATAGTAGAGAAATAACTGAGTTCAGTGCAAGAGACCCATGCGTTTGATGTGGATCACGATAATAATACCTAATGGATAACGTGCAATCATTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 489750 204 + 647215 ----ATCAGTAATCCTCAGCTCTGACCCACATCCTTTCTTGTATTGTTTACCAAGCTACATTCCACATTCCAGTGCTTGCCCACTAAGTCCACCAGCCATGAATATATATGTTAATAGTGGGAAAATTACCGAGTTTGCTGCAAGAGACGCATGAATTTGATGTGGTTAATGATAACAATACCTAATGGATAACTTGCAATCATTAGA + +a +s mr.mrrefChr3 35901 118 + 181019 TAAAAATTTATTAAGCTCTTGTAGTAAGGGGCACCTGCACAGATGTTGCCTTCTCACTTAGTTGTCCTGCATTACATGTATGATGTTCTCCTTACAGATGAGTTGGATCAAAACCTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481637 118 + 636262 TAAAAATTTATTAAGCTCTTGTAGTAAGGGGCACCTGCACAGATGTTGCCTTCTCACTTAGTTGTCCTGCATTACATGTATGATGTTCTCCTTACAGATGAGTTGGATCAAAACCTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 489955 118 + 647215 TAACAACCTATTATACTGGTGTAGCAAGGAGCACCTGCAAGGATGCTGCCTTCTCATTCAGTTGTGATGTGTTACATGTATGATGTTCCCCTTACAGATGAGTTGGATCAAAGCCTGC + +a +s mr.mrrefChr3 36019 2 + 181019 CA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481756 2 + 636262 CA +s simRat_chr6.simRat.chr6 490073 2 + 647215 CA + +a +s mr.mrrefChr3 36021 19 + 181019 TCAGTGGGTGCAAGAAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481767 19 + 636262 TCAGTGGGTGCAAGAAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 490075 19 + 647215 TCAGTGGGTGCAAGAAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 36040 35 + 181019 CAACAAAGTAAGCACTTCTCTCCCAGATACTGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481787 35 + 636262 CAACAAAGTAAGCACTTCTCTCCCAGATACTGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 490094 35 + 647215 CAATGAAGTAAGCACTTCTCTCCCAGACCTCGCTC + +a +s mr.mrrefChr3 36075 23 + 181019 ACAATCAATCCAGCTGCTAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481823 23 + 636262 ACAATCAATCCAGCTGCTAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 490129 23 + 647215 ACAATCAATTTAGCTGCTAACAT + +a +s mr.mrrefChr3 36098 122 + 181019 TCTTAATGAAGTTGTGAGGATGTTAGATGATTATGTCACGGTGTTACATACTGCACATAAGTTCAATATCTTGTCATGATAACCCCTATTTTGAGGCATCTATCCCCCTGAGCAGGAATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481848 122 + 636262 TCTTAATGAAGTTGTGAGGATGTTAGATGATTATGTCACGGTGTTACATACTGCACATAAGTTCAATATCTTGTCATGATAACCCCTATTTTGAGGCATCTATCCCCCTGAGCAGGAATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 490152 122 + 647215 TGTTAACGAAGTTTTGAGGATCTTAGATGATTATGTCACAATGTTACACACTGCACATAATTTTACTAGCTTGTCCTGATAACTCCTGTTTTGAGGTCTCTATCCCCCTGACCAGGGCTGCT + +a +s mr.mrrefChr3 36220 79 + 181019 GATGATTCAGTGGAGACTATTGATGATTCAGTGGGTTTCAATACATGATTCCTGAATAGTTGGCACACACTGCTGAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 481970 79 + 636262 GATGATTCAGTGGAGACTATTGATGATTCAGTGGGTTTCAATACATGATTCCTGAATAGTTGGCACACACTGCTGAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 490276 79 + 647215 GATGATTCAGTGGGGACTATTGATAATTCAGTCGGTTTTAATACAAGATGCCTGGGTAGTTTGCACCCACTGCCGAATA + +a +s mr.mrrefChr3 36299 68 + 181019 ATAAGCGTGCTTTAATACACCAAAATGCATTACCAGCAAGCATTATTTTTGGAGCTGGTCATGCCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482049 68 + 636262 ATAAGCGTGCTTTAATACACCAAAATGCATTACCAGCAAGCATTATTTTTGGAGCTGGTCATGCCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 490356 68 + 647215 ATAAGCTCACTTTTAGAGACCAAAATGCATTACTAGTGAGCATTATTATTGAAGCTGGACATGCCTAT + +a +s mr.mrrefChr3 36367 52 + 181019 CTACCCCACTACTGAAGTCGCTCCTAGGGCATTACCTGCACCAACTAGCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482136 52 + 636262 CTACCCCACTACTGAAGTCGCTCCTAGGGCATTACCTGCACCAACTAGCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 490424 52 + 647215 CTACTCCATAATTGAAGTCACTACCAAGGTGTTACCTGCACCAACTAGCTAT + +a +s mr.mrrefChr3 36419 16 + 181019 TGTGCACCATACCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482194 16 + 636262 TGTGCACCATACCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 490476 16 + 647215 TGTGGCCCGTACTTGT + +a +s mr.mrrefChr3 36435 71 + 181019 ATTCCATTGGTAAGCCCATGTGAAAAAATATTTATAGCTAAATTCTTGGATTAGCAGACCACAATCCTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482210 71 + 636262 ATTCCATTGGTAAGCCCATGTGAAAAAATATTTATAGCTAAATTCTTGGATTAGCAGACCACAATCCTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 490493 71 + 647215 ATTCCACTGTTAAGCCAATGTGAAAAAATAAATATAGCTAAATTCTGGGATCACCAGACCACAATCTTGCA + +a +s mr.mrrefChr3 36506 14 + 181019 CCAGTGTTGCCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482298 14 + 636262 CCAGTGTTGCCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 490564 14 + 647215 CCAATACTGCCCCA + +a +s mr.mrrefChr3 36520 318 + 181019 TAATTTTATCACCTCTCTACATCAAATGATATCATGCTAGTAGGAAAACTATTTAACAGACTGAGCAATGTTTTGATTTGGTTGATGATAATTATACCTAATGGTCAACATGAAATTATAGGGTAGAAATCTATAATGCTCTTGTAGAGCAGGGCATGGAATGTCTTATTGTAGTATGTTGCCTTCTTATTCAGATGCCCTGTGTCTGAAATATTTCTCCAATCAGATAAGCTGTATCTAAACTTGGTCACTGAAACTCTCATTGTATCGTGTACAAATGGAAACAATAAAGCAAATATTTATCAATAAAGCATGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482312 318 + 636262 TAATTTTATCACATCCCTACATCAAATGATATCATGCTAGCAGGAAAACGACTTAACAGACTGAGCAATGTTTTGATTGGGTTGATGATAGTTATAACTAATGGTCAACATGAAATTATAGGGTAGAAATCTATAATGCTCTTATAGAGCAGGGCATGGAATGTTTTATTGTAGTATGTAGCCCTCTTATTCAGATGCCATGTATCTGAAATACTTCTCCAATCAGATAAGCTGTATCTAAACTTGGTCACTGAAACTCTCATTGCACCATGTACAAATGGAAACAATAGAGCCAATACTTATCAATAAAGCATGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 490579 315 + 647215 TAATTTTATCACCTCTCTCCATCAAATGATATCATCCTATTAGGAAAACTATTTAACAGCCTGAGCAATGTTATGATCTGGTTGATAATAATTATACCTAATGGTCAACATGAAATTATGGGGTAGAAATCTATAATGCCCT-GCAGAGCAGGGCATGGAATTTCTTATTGCAGTATGTTGTCTT--TATTCGGATGCCCTGTGTCAGAAATATTTCTCCAATCAAATAAGCTGTATCTATACTTGGTCACCAAAACTCTCAGTGTGTCGTGCACAAGTGGAAGCATTAAAGCAAATATTTATCAATACAGCAAGCAT + +a +s mr.mrrefChr3 36838 231 + 181019 CTCTCCGTAATACTCTACTAAGTTTTCTAGCTGCTGACGTGTTGTTATGAGGTTTTCAAGTTGATAAACATCCTGGGGCTACATGCTGTACTTGAACCTGGTGTGGTGGGGACTGTAGGAGTACTACTGATTAGCTGGCACTTAACCCAAGTGTCCAACTGTAAATTCAGCATGGTTTTGGGGATCTGAGTCTGAAAACTGTTATTTCAAAAGTTTTGTCTCTTGAGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482633 214 + 636262 CTCTCCGCAATACTCTTCTAAGTTTTTTAGCTGCTGACGTGTTGTTACAAAGTTTTCAAGTTGAGATACATCCTGGGGCTACATGCTGTACTTGAACCTGGTGTGGTGGGGACTGTAGGAGTACTACTGATTAGCTGGCACTTAACCCAAGTGTCCAACTGTAAATTCAGCATGGTTTTGGGGATCTGAGTCTGAAAACTGTCATTTCAAAAGA----------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 490894 228 + 647215 CTCACTGTAATACTCTACTAACTCTTCTAGCTTCTGAC---TTGTTATGAGGTTTTCAAGTAGATAAAAATCCTGGGGCTACATGCTGTACTTGAGCCTGGTGTGGTGGGGACTGTAGGAGTAATATTGATTACCTGGCACTTAACCCAAGTATCCAACTGTAAATTCAGCATGGAGTTACAGATCTGACTCTGAAAGCTCTTGTTTGAAAAGTTTTGTCTCTTGAGTATG + +a +s mr.mrrefChr3 37069 22 + 181019 CAACCTGTGAACTAGTGGGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482847 22 + 636262 CAACCTGTAAACTGGTGCGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 491123 22 + 647215 CAACCTGTGAACTAGTGGGATA + +a +s mr.mrrefChr3 37091 11 + 181019 AAATATGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482869 11 + 636262 AAATATGATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 491147 11 + 647215 AAATAAGATGT + +a +s mr.mrrefChr3 37102 66 + 181019 GTATGAGGAGTCCCCTTTGTTCAGAGATGATGTAGAATAGCTAATGACACTGTAATAAGTCAATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482880 66 + 636262 GTATGAGGTGTCCCCTTTGTTCAGAGATGATGTAGCATAGCTAATGACACTGTAATAAGTCAATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 491168 66 + 647215 GTATGAGGAGTCCCCTTTGTTCAGAGCTAATGTAGAATAGCTAATGACCCTGTAATAAGTGAACAC + +a +s mr.mrrefChr3 37168 60 + 181019 ATTATCATCAACTATGTTTATTAGAATTGGACATGGTGTAACTCATATGCCATTGGGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 482948 60 + 636262 ATTATCCTCAACTATGTCTATTAGAATTGGACATGGTGTAACTCATATGCCATTGGGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 491234 59 + 647215 ATTATCATCAACTATGTTTATTAGAACTCAACATG-TGTAACTCCTCTGCCATCGGCATT + +a +s mr.mrrefChr3 37228 57 + 181019 GCTACCATGCCCTTACTTGAATAAAACAATGTACTCAAATGTATATTGTATATACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483008 57 + 636262 GCTACCATGCCCTTACTTGAATAAAACAATGTACTCAAATGTATATTGTACATACGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 491299 57 + 647215 GCTACCACTCCAATACTTGAATAAAACAATGTACTTAAAGGTATACTGTATGTACTC + +a +s mr.mrrefChr3 37285 31 + 181019 CCATTGTTATGTCAGTGCTGAGCCAAAATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483065 31 + 636262 CCAGTGTTATGTCAGTGCTGAGCCAAAATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 491391 23 + 647215 CCATTGTCATGTCAGTGCTGAGC-------- + +a +s mr.mrrefChr3 37316 14 + 181019 GAACTGTTATTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483097 14 + 636262 GAACTGTTATTATA + +a +s mr.mrrefChr3 37330 106 + 181019 ATTTGTAAGTAGATTGACCACAGTCATACATCATTAAGAAGCAAGATATATAGTGGGATAATTCAAGAACAGTGCCCCTAGGATGACTGATCTCAATGACTGATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483116 93 + 636262 ATTTGTAAGTAGATTGACCACAGTCATACCTCATTAAGAAACAAGATATATAGTGGGA-------------GTGCCCCTAGGATGACTGATCTCAATGACTGATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 491414 103 + 647215 --TTGTA-GTAGATAAACCACAGTCATACATCGTTAAGAAGCAGTATATATAGTGTGATAATTCAAGAACAGTGCCCATAGAATGACTGATCTCGATGACTGGCCT + +a +s mr.mrrefChr3 37436 61 + 181019 CTAATAAAAAATGTATTAGGGTAGCAAAGTGTTTGTATATAGGAAAGGTTCTGTGCCCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483209 61 + 636262 CTGACAAAAAAAGTATTAGGGTAGCAAAGTATTTGTATATAGGAAAGGTTCTGTGCCCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 491518 60 + 647215 CTAATAAAAAATGTATTAGGATAGCAAAGTGTTTGTAT-TAGGAAAGGTTCTGTGCCCACT + +a +s mr.mrrefChr3 37497 32 + 181019 CCTAAACAATACTCTCCATCATTGTTACGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483270 32 + 636262 CCTAAACAATACTCTCCATCATTGTTACGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 491579 32 + 647215 CCTAAACAATACTCTCCGTCATTGTGATGGGT + +a +s mr.mrrefChr3 37529 48 + 181019 ATAAACATCCTTACAAGGAATACACTACATGTGTTCAAGTTATTGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483303 48 + 636262 AGAAACATCCTTACAAGGAATACACTACATGTGTTTGAGTTATTGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 491611 48 + 647215 ATAAACATCCTCACAAGGAACTCACTACATGTGTTCAAGTTATTGGGG + +a +s mr.mrrefChr3 37577 115 + 181019 TCTAAACTCAGTGTGGGTCATGCTCTGGCATTAACGTAGTAGTCAAAATCAAGTGGGTGTGGATTGTCTGAGTATGACCTGAGTAGGAGAATTGCCTCATTGAAACAGTCCTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483470 105 + 636262 TCTAAGCTCAGTGTGGGTCATGCTCTGGCATTAACGTAGTAGTCAAAATCAAGTGGGTGTGGATTGCCTGAGTATGACCTGAGTAGGAGAATTGCCTCATTGAAA---------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 491659 115 + 647215 TCTAAACCCAGTGTGGGTGATGCTCTGGCATTAACGTAGTAGTCAAAATCAAGTAGGTGTGGATTGTGTGAGTAGGACCTCAGTCAGAGGATTGCCACATTGGAACAGTCCTCAT + +a +s mr.mrrefChr3 37692 33 + 181019 ACAATCGGGTGTTGGAGGTAATTGGTATTCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483575 33 + 636262 ACAATCGGGTGTTGGAGGTAATTAGTATCCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 491778 33 + 647215 ACAGTGGGGCGTTGGAGGTAATTGGTATTCTTT + +a +s mr.mrrefChr3 37725 376 + 181019 GTTATTTGTTGAAATCTTGTTCTCATATTTAATCAGTATAAGACACCTGGTGTCTTGCCCCTTTATGCATATATAATGTCTCACCATCGGGGAGCCCCTAAAGCCTCCACCTGTGTTATTGCCAGTCGGCGTAGTTTAACAGTGTCACAAGCCCCTGATAGGAGACCAGCAGGAGAATTAAATTGGTCAGGTCCCGAAGGGTATAGTGTAGGCAGAGGTGGTTGTTGGAGGGCTACCTCAAGACACCCAGAGGCAGTTGCTGTGGGTCCTGATGAGCTATTGTTTCTTGCACTTACAAGCCACTTTGTTGGTGCAGTAATTAGTCAATCTCCTACCAAAATGCATGGGGTAACACTGGGGTTGGACCAACACAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483608 372 + 636262 GTTATTTGTTGAA-TCTTGTTCACAT---TAATTGGTAAAAGACACCTGGTATCTTGCCCCTTTATGCATATATAATGTCTCACCATCGGGGAGCCCCTAAAGCCTCCACCTGTGTTATTGCCAGTCGGCGTAGTTTAACAGTGTCACAAGCCCCTGATAGGAGACCAGCAGGAGAATTAAATTGGTCAGGTCCCGAAGGGTATAGTGTTGGCAGAGGTGGTTGTTGGAGGGCTACCTCAAGACACCCAGAGGCAGTTGCTGTGGGCCCTGACGAGCTATTGTTTCTTGCACTTACAAGCCACTTTGTTGGTGCAGTAATTAGTCAATATCCTATCAAAATGCATGGGGTAACACTGGGGTTGGACCAACGCAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 491812 375 + 647215 GTTATTTGGTGAAATCTGGTACTCGTATTTAATCAGTATAAGACACCTGGTGTATTGCCCCTTTATGCATATATAATGTCACACCATCGGGGAGCCCCTAAAGCCTCTACCTGTGTTATTGCCAGGCGGCGTAGTTTAACAGTGTCACAAGCACCTGATAGGAGACCAGCAGGAGAATTAAATTGGTCAGGTCCCGAAGGGTATAGTGTAGGCAGAGGTGGTTGTTGGAGGGCTACCTCACGACACCCGGAGGCAGTTGCAGTGGGTCCTGATGAGCTATTGTTTCTTGCACTTACAAGTCACTTTGTTGGTGCAGTAATTAGTCATTCTCCTACCAAAAAGCACGGGGTAACAA-GGGTTCGGACCAACACAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 38101 85 + 181019 CAGAGTTTAAGTCTATCTCCTACTCTGCTAGCCCAATGCTCCTCTTAATACCATGACACCTGATATGGAATAGGCATAGGTACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 483980 85 + 636262 CAGAGTTTAAGTCTATATCCTACTCTGCTAGCCCAATACTCCTCTTAATACCATCACACCTAATATGGAATAGAAATAGGTACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 492188 85 + 647215 CAGGGTTTAAGTCTATCTCTTACTCTGCTAGGTGGATGCTCCTCTTAACACCATGACACCTGATATGGAATAGGCATAGGTACCC + +a +s mr.mrrefChr3 38186 203 + 181019 AAGAAGTGTTAGTATAAAATAGAATAATGTGTTAGCTAGGGTACACGCACACATGCAGTTCCTTCCTGGTGACCCACCTGTACCCAGATCTTGGCACCAGTATGTTCCACAACTTCTCAACTGCCCTTCCCCTACCAATTAATTAAGCAGGTTGTGTTTACGACATAAAGCTTTCCAAAGTTGGCAATAATGGGACTATGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484066 203 + 636262 AAAAAGTGTTAGTATAAAATAGAATAATATGTTAACTAGGGTACATGCACACATGCAGCTCCTTCCTGATGACCCACCTGTACCCAGATCTTGGCACCAGTATGTTCCACAACTTCTCAACTGCCCTACCCCTACCAATTAATTAAGCAGGTTGTGTTTACGACACAAAGCTTTCCAAAGTTGGCAATAATGGGACTATGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 492273 203 + 647215 AAGAAGTGTTAGTATAAAATACAATAATGTGTTAGGTTGGGTACACGCACACATGCAGTTCCTTCCTGGAGACCCACCTGTACCCGGATCTAGGCACCAGTATGTTCCACAACTTCTCAACTGCCCTTCCCCTACCAATTAATTAAGCAGGTTGTGTCTATGACATACAGCTTTCCTGAGTTGGCAATAATGGGCCTATGATT + +a +s mr.mrrefChr3 38389 73 + 181019 CAGTGATTGGCATCTGTGTAGGCATCTGTCTTTTTGCAGGTGAACACTTTTCTATCATGGATGTGAGGGTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484273 73 + 636262 CAGTGATTGGCATCTGTGTAGGCATCTGTCTTTTTGCAAGCGAACACTTTTCTATCATGTATGTGAGGGTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 492476 73 + 647215 CCATGGTCGGCATCTGTGTAGGCATCGGTCTTTTTGCGGGTGAACACTTTTCTATCAAGGATGTGAGGGTCCT + +a +s mr.mrrefChr3 38462 60 + 181019 TGTTGATAGGCCTACAGAAATTCACAGAGTTGGCAAATATAATTGACACAGTTGGCATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484346 60 + 636262 TGCTGAGAGACTTACAGAAATCCACAGAGTTGGCAAATATAATTGACACAATTGGCATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 492656 60 + 647215 TGTGGATAGGGCTACAGAAACTCACAGAGTTGGCAAATATAATTGACATGGTTGGCACAC + +a +s mr.mrrefChr3 38522 324 + 181019 ACCTATAGTGCTGTTGGGAGACCTTTACTAGTCGGGCATGCCCAACATTGGTCTTGTGTCTAAAATTGTGATGAGCTGGTATTATAATGCACACTATATTGTTTTGATTAGCAAAACCCTACTGGTTCTTTGCAACTACAGGGAGCTGTGCAGGACTCTCAAACCAGTGTCAAGGGGTTTTCCAAGTGTTTTGCATATCCAGATGAGGAAGATTATGGAACAAAATGTCAAACATCCAACTCCTTATATTGTCTTAACACAAAAATGAAATAAAAAATACAACATAGCACAGGAATTATAATTCCCGCTAGTGTTCCAAGAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484406 319 + 636262 ACCTATAGTGCTGTTGGGAGACCTTTACTAGTTGGGCATGCCCAGCATTGGTCTTGTGTTTAAAATTGTGATGAGCTGGTATTCTAATGCACTCTATATTGTTTTGATGAGCAAAACCCTACTGGTTCTTTGCAACTACAGGGAGCTGTGCAGGTCTCTCAAACTAGTGTCAAGGGGTTTTCAAAGTGTTTTGCACATCATGATGA-----ATTATGGAACAAAATGTCAAACATCCAACTCCCTATATTGTCTTAACACAAAAATGAAGTAAAAAACACAAGATAGCACAGGAATTATAATTCCCACTAGTGGTCCAAGAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 492718 324 + 647215 ACCTATAGTGCTGTTGGGAGCCATTTACAAGTCGGGCATGCCCAAAATTGGTTTTGTGTCTAAAATTGTGATGAGCCGGTATTATAATGCAGACTATATTGTTTTGATTAGCAAAAGCCTACTGGTTCTTTGCAACCACAGGAAGCTGTGCAGGACTCTCAAACCAGTGTCAAGTGGTTTTCCAAGAGTTTTGCATATTCAAATCAGGAAGATTATGGAACAAAATATCATACATCCAACTCCTTATATTGTCTTGACATAAAAATGAAATAAAAAGTACAACATAGCACAGGGATTATAATTCCAGCCAATGTTCCAAAAGTT + +a +s mr.mrrefChr3 38846 40 + 181019 TGCGAATTACAGTGGTATTGCACCTTGCGCACTATTTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484725 40 + 636262 TGTGAAATACAGTGGCATTACACCTTGCGCACTATTTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 493043 39 + 647215 TGCGAATTACAGTGGTATTGC-CCTTGTGCACTATGTATA + +a +s mr.mrrefChr3 38886 14 + 181019 CCATTTAAGGTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484765 14 + 636262 CCATTTAAGGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 493084 14 + 647215 CTATTTAAGGTTAA + +a +s mr.mrrefChr3 38900 415 + 181019 TAAACAAATTAGAATTTATGTCCCACAATTCTTGAAATGTTTCTATTTAAAAGTCATCTGTTACTATATCAAATTCCTTTAAAAGCTTCACTCTGCTTAATGAATGGTTTTCAGTGATGTCCCAGTCCTATTATGAACAATGCTCATTATTTAGCAACGCATGTTATCTGCCCTATCAAGTGTTAGTCCATAGAGAGATTCGAGTTGGAAGGTTAGAACAAATAAATTTATCAGTTTTTGGTTCTCCAGTATCTTCACTAATTAACCACTAACTGTGCTGACTAGTAAACCTATGATCCTGATTTGTTTTGCGATAGCAGACCTATTGTACTGAATCACTATTTATGCAGTTTTTATCACAGTTCCTGTCCTGTTCTGACTTGTATGCGTACAAACACCTTTGCTAAGTATGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 484779 404 + 636262 TTAACAAATTAGAATTTGTGTCCCACAATTCTTGAAATGTTTTTATTTAAAAGTCACCTGTTACTATATCAAATTCCTTTAAAAGCTTCACTCTGCTTAATGAATGGTTTTCAGTGATGTCCCAATCCTATTATGAACAATGCTGATTACTTAGCAACGCATGTTATCTGCCCTGTCAAGTGTTAGTCCATAGAGAGATTCGAGTTGGCCAGTTAGAACAAA---ATTTGTCAGTTTTTGGTTCTCCAGTATCTTTACTAATTAACCACTAACTGTGCTGACTAGTAAACCTATGATCCTGATTTGTTTTGCGATAGCAGACCTATTGTACTGAATCACTATTTATGCAGTT---ATCAC----CCTGTCCTGTTCTGACTTGCATGCGTACAAACAT-TTTGCTAAGTATGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 493100 415 + 647215 TAAACAAATTAGAATTTATGTCCCACAGTTCTTGAAATGTTTCTATTTAAAAGTCATCTGTTACTATTTAAAATTTCTCTATAAGCTTCACTCTGCTTAATGAATGGCTTTCAGTACTGTCCCAGTCCTATTATTAACAATGCTCATTATTTAGCAATGCATGTTAGCTGCCCTATCAAGTGTTAGTCCATAGAGAGATTCAAGTTGGAAGGTTAAAACAAATAAATTTATCGGTTTTTGGTTCTCCAGTATTTTCACTAATTGACCACTAACTGCCCTGTCTTGTAAACCTATGATCCTGATTTGTTTTGCAAAAGCGGACCTATTGTTCTGAATCACTATTTATGCAGCTTTTATCACAGTTCCTGTCCTGTTCTGACTTGTGTGTGCACATACACCTTTGCTAAGTATGAGT + +a +s mr.mrrefChr3 39315 38 + 181019 GCAAGCGATTGCCCTAGACTCCTTGTCTAATATTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485183 38 + 636262 GCAAGCGATTGCCCTAGACTCCTTGTCTAATATTTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 493516 38 + 647215 GCGAGCGATTGCCCAAGACTTCTTGTCTAATATTTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 39353 104 + 181019 GACAAAATGATTGATTGAGGTCATCTAGAGACTGCCCCATTAATTTCGTTCCCATATATAATTCTAAAGGTTCTCTTCTCTCAGCATATTTCACTCAAGGAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485222 104 + 636262 GACACAATGATTGATTAAGGTCATCTAGAGATTGCCCCATTAATTTCATTCCCATATATAATTCTAAAGGTTCTCTTCTCTCAGCATATTTCACTCAAGGAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 493554 104 + 647215 GACAAAATAAGACGCTGAGGTCATCTAGAGACTGCCTCATTAATTTAGTTCACATATATAATTCTACGGGTTCTCTTCGCTCAGAGTATTTCACTTAAGGAAAC + +a +s mr.mrrefChr3 39457 10 + 181019 TGCACAGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485332 10 + 636262 TGCACACTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 493658 10 + 647215 TGCACAGTAA + +a +s mr.mrrefChr3 39467 18 + 181019 AGGTTCTCAACCAAACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485342 18 + 636262 AGGTTCTCAACCAAACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 493677 18 + 647215 AAGTCTTCAACCAAACCT + +a +s mr.mrrefChr3 39485 62 + 181019 TTACACTATGATCTGATATTGCTTGCCTTTGCCTACAGTTGTCACTTCATGTAGATAACAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485360 62 + 636262 TTACACTATGATCTGACATTGCTTGCCTTTGCTAGCAGTTGTCCCTTCATGTAGATAACAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 493697 62 + 647215 TTACACCATGATCTGATATTGCTTGCCTTTGCCTACAGTTGTCACTTCATGTAGATAACAAG + +a +s mr.mrrefChr3 39547 133 + 181019 TTGACCAGTACCAAACCTGGTAAAGAGCACATCTTGGAAATGGATAGGGGTATCTTGGGGCATACTGAGCAATATATGTTGGTAGGCAGGTTAGTTAAGGTAAGTGAGTAAAGACATGGCAAGCCACCCCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485422 133 + 636262 TTGACCAGTACCAAACCTGGTAAAGAGCACATCCTGGAAATGGATAGGGGTATCTTGGGATATACTGAGCAATATATACTGGTGGTCAAGTTAGTTAAGGTAAGTGAGTAAAGACATGGCAAGCCACCCCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 493764 133 + 647215 TTGACCAGTACCAAACCTGGTAAAGAGCAGATCTTGGAAATGTACAGGGGTATCTTTGGGCATACTGAGCAATATATGTTAGTAGGCAGGTCAGTTAAGGTAAGTGAGTAAAGACATGGCAAGCCGTTCCTAT + +a +s mr.mrrefChr3 39680 16 + 181019 CCCATACTAGGGGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485557 16 + 636262 CCCATACTAGGGGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 493897 16 + 647215 CCTGTACTAGGCGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 39696 15 + 181019 TTAGGACCTGGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485573 15 + 636262 TTAGGACCTGACCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 493921 15 + 647215 TAAGGACCAGGACGC + +a +s mr.mrrefChr3 39711 158 + 181019 CCTGTTTGGCAATGAGAAGCCTTGAATATGACAACACAGAAACATTCAGTTCAAGATATAATCATCTTGCAAGACAAGTCAAGTAGTAAGATGTTTAAGGTACTGAGCATGCTGATCATTCTCAGTAGGCATAACATCAATAGGAGACTAATGACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485588 158 + 636262 CCTGGTTGGCATTGAGAAGTATTGAATATGACAGCACAGAAACATTCAGTTCAAGATATAATCATCTTGCATGACAAGTGAAGTATAAAGATGTTTAAGGTACTGAGCATGCTGATCATCCTCAGTAGGCATAACATCAATAGGAGACTAATGACATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 493937 158 + 647215 CCTGTTTGGCAATGAGAAGCCTTGAATATGATAACACAGAAACATTCAGTTTAAGATATAATGACCTTGCAAGACAAGTCGAGTAGTAAGATGTTTAATGTACTGAGCATGCTGATCATTATCAGCAGAGATAACATCAATAGGAGAATAATGACACA + +a +s mr.mrrefChr3 39869 52 + 181019 GACTTTCCACAACCCTCATACCATCTCTCATGCTATGGCAGGTACTCAAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485746 50 + 636262 GGCTTTCCACAACCCTCATACCA--TCTCATGCTATGGCAGGTACTCAAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 494097 51 + 647215 GAGTTTCCACAACTCTCATACCTTCTC-AATGCCATGGCAGGGACTCAAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 39921 100 + 181019 TGTTGCTGTGTAAAGTAGAACAAGTGCCTTAGTGGTCAGATCAATAGTTATTAATTCATTGCAGATATACTGCTTTGGATGTCTGAGCTCTTTCACAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485800 100 + 636262 TGTTGCTATGGAAGTTAGAACAAGTGCCTTAGTGGTCAGATCAGTAGTTATTAATGCATTGCAGATATACTGCTTTGGATGTCTGAGCTCTTTCACAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 494148 97 + 647215 TGTTGCTGTGTCAAGTAGAACAAGTGCCTTAGTGGTCGGATCAACAGTTATTAATTCATTGTGGATAT---GCTTTGGATGTCTGAGCTCTTTCACAGGC + +a +s mr.mrrefChr3 40021 109 + 181019 AGGGAGCCCTCCCAAGGAAAAAGCAGGGAATGAAACCTACCCTTAGAAGCCCAGGCCAAATGGTAGTGGGGACAGCCTCTCAGAGGGTGCCACTCTTTGGACCAGTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 485901 109 + 636262 AGGGAGCCCTCCCAAGAAAAAAGCAGGGAATGAAACCTACCCTTAGAAGCCCAGGCCAAATGGTAGTGGGGACAGCCTCTCAGAGGGTGCCACTCTTTGGACCAGTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 494245 109 + 647215 AGGGAACCCTACCAAGGAAAAAGCAGGGAATGAGACCTACCCAGAGAAGCCCAGGCTGAACGGTAGTGGGGTTGGTCACTTGGGGGGTGCCACTCTTTGAACCAGTACC + +a +s mr.mrrefChr3 40130 249 + 181019 AACCCAGTAtttcttcttaagtcagcaacatacagtctttcttgttatgtgattggtcagattgtagtgaaaatatctaaggacccctgagacaaggatggagtgaacttagccctggagcacaaccccacaggttggtgtactccattccaattcataAACATGGAAAGTTAGGCCCACAGCAACATGGAAGCTGCGCAGAGTCTTGGCTCAATGGTTAGTTTTCACAATATGTGTAGAACTCATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486010 249 + 636262 AACCCAGTAtttcttcttaagtcagcaacatacagtctttcttgttatgtgattggtcagattgtagtgaaaatatctaaggacccctgagacaaggatggagtgaacttagccctggagcacaaccccacaggttggtgtactccattccaattcataAACATGGAAAGTTAGGCCCACAGCAACATGGAAGCTGCGCAGAGTCTTGGCTCAATGGTTAGTTTTCACAATATGTGTAGAACTCATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 494360 249 + 647215 AACCCAGTAGTTcttcttaaggcaggatcatactgtctttcttgtgatgcaattggacacactgcagtgggaatatctaggggcccctaagaccaggacgaggcagacttagccctggagcacaaccccacaggttggtgtactccattccaatTCATGATCACGAAAAGTTAGGCCCATGTCAACATGGAAGCTGCACAGAGTCTTGGCTAGATGATTAGTTCTCGCAATATGCGTAGAACTCATACA + +a +s mr.mrrefChr3 40379 65 + 181019 GCCATAACAGGATAGATTACCCCCAATGTCTCTGTCACCAGATAGCTATATTCACTTCCTACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486260 64 + 636262 GCCATAACAGAATAGATAACCCCCAA-GTCTCTGTCACCAGATAGCTACATTCACTTCCTAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 494609 65 + 647215 GCCATTACAGGATAGATTACCACCAATGCCTCTGTCACCAGTTAGCTATATTCACTTCCTACAAA + +a +s mr.mrrefChr3 40444 91 + 181019 TCATTATTTACCTCGTATTATGACTGAGTTTAGGGGCCCTAGTATAATAGACAAATCATTTGTAATAGATCACCTTATAGAAAAGACGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486325 80 + 636262 TCATTATTTACCTCGTATTATGCCTGAGTTTAGGGGCCCCAATATAATCGACAGATCATTTGTAATAGATCACCGTATAG----------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 494674 91 + 647215 GCATTATTTACCTCGTATTTTGACTGAGTTCAGGGGTCCTAGTATAATAGACAAATCACTTGTAGTTGATCATCTTATAGAAAAGACGATA + +a +s mr.mrrefChr3 40535 576 + 181019 TACCTGTATGAGAGCCTCCAAACTAGGGAGTTTAGGACTTTTTTAGCTTACTTCTACATGCATCTTAAAACTCACAATTGATGTAAAATGGCCATTAAGCAACAAATCATTCCAGCCATGGCTTCATGTATAGTGAGCAGTACTACTCATCTTTGCTCTATCCTAGGAACCCAGTTTACAGTAGATACATGGCACATAGGTTCCATTGATTGCTATGTTGAGAATTTGGTAGTGCTACTTACAATAGTACTATGTAGGATGAACTTCATATCTTCATCTGAACATTTCCGGTTGGTTGGGATTCCTTCTGGTAGTAAAGAGTAACACCAGTTAATGTATTGGCCTAACACATCATTGCTGCTATTGTGGTGGTTGGAGTTTGTTGGTGTTTGGAGTGAGTTAGGGTGCGAAGTGTTTTGGCCCATGTTACTTAGATGATGTTATCGTTATTTGAGAACTCATATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAGAATATACAAACTCCAACCAACACCACCATTCAGGTATGATACATTCACATGTTTAATATATTTGTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486405 555 + 636262 -----------GAGCCTCCAAGCTAGGGAGTTTAGGACTTTCGTAGCTTACTTCTACATGCATCGTAAA---CACAACTGATGTAAAATGGCCATTAAGCAACAAATCATTCCAGCCATGGCTACATGTATAGTGAGCAGACCTACTCATCTTTGCTCTATCCTAGGAACCTTGTTTACAGTAGATACATGGCACATAGGTTCCATCGATTGCTATGTTTAGAATTTGATAGTGCTACTTACAATAGTACTATGTAGCATGAACTTCCTATCTTCATCTGAACATTTCCGGTGGGTTGGGATTCCTTCAAGTAGTAAAGAGTAACACCAGTTAATGTATAGGCCTAACACATCATCACTGCTATTGCGGTGGTTGGAGTTTGTTAGTGTCTGGAGTGAGTTAGGATGCGAAGTGTTTTGACCCATGT-------ATGATGTTATAGTTATTTGAGAACTTGTATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAAAATATACAAACTCCGACGAACACCACCATTCAGGTATGATACATTCATATGTTTAATATATTTGTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 494770 562 + 647215 TACCTGTATGAGAGCCTCCAAACTAGGAAGTTGAGGACTTCTTTAGCTTACTTCTACATGCATCTTAAAACTCACAATTGATTTAACATGGCCACTAAGGAACAAACCATTCCAGCCATGGCTTTATGTATAATGATCAGTACTACTCTTCTTTGCTCTATCCTTGGAATACATTCTACAGTAGATACATGGCAGGTAGGTGCCATTGATTTCTATGTTGAGAATTTAGTAGTGCCACTTACAATAGTACTATGTAGGATGA-CTTCATATCTTCATCTCAACATTACCAGTTGGTTGGGATTCCTTCTGGTAGTAAAGAGTGAGATCAGTTAATGTATTGGCCTAACATGTCAGTGCTGCTATTGTGGTGGTTGGATTTTGTTGGTAGTTGGAGTGTGTTTGGGTGCGAAGTGTTTTGGCCGATGTTACTTAGATGATGTTATCATTATTTGCGAGCTCATATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAGAATATACAAACTCCAACCAACACCACCATTCAGGTATGGTAGCTTCACATGTCTA------------- + +a +s mr.mrrefChr3 41111 120 + 181019 ACAGCCCATAGCTGTACAGCCCATTGTCTGACCAACTTGGAATCTAAGTTTTTCCTTCTTTAGGGACAGACAAGCCTTAGGTAAAACCTCCATGATGAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 486962 120 + 636262 ACAGCCCATAGCTGTACAGCCCATTGTCTGACCAACTTGGAATCTAAGTTTTTCCTTCTTTAGGGACAGACAAGCCTTAGGGAAAACGTGAATGATGAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 495332 68 + 647215 ----------------------------------------------------CCCATCTTTAGGCACAGAAAAGCTTTAGGTAAACCCTCCATGGTTAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG + +a +s mr.mrrefChr3 41231 143 + 181019 AGCACTACTCTCTTCCTGTTCAAGATTAGGGAGTATTTTAATCTTAGATAGGCCCTAGCATCTGCTTTTTTAAAAACAATCTACCTCACTTCCCTGAGGAAAACCTATAGCTGCTCTATCGTTGCGGATGAAGCTCTATTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487084 143 + 636262 AGCACTACTCTCTTCCTGTTCAAGATTAGGGAGTATTTTAATCTTAGATAGGCCCTAGCATCTGCTTTTTTAAAAACAATCTACCTCACTTCCCTGAGGAAAACCTATAGCTGCTCTATCGTTGCGGATGAAGCTCTATTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 495400 143 + 647215 AGTACTACTCTCTTCCTGTTAAAGTTTAGGGAGTATTTTAATTCTAGGTAGGGCCTAGCACTTTCTTTTTTAAAAGCAATCTACCCCACTTCCCTGAGGATAACTTAAATGTGTTCTATTCTTGCAGATGAAGCTCTATCCTA + +a +s mr.mrrefChr3 41374 24 + 181019 TACACAATTACTTTCTTCACTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487251 24 + 636262 TACACAATTACTTTCTTCACTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 495543 24 + 647215 TAGACAATTACTTGCTTCACTTCA + +a +s mr.mrrefChr3 41398 130 + 181019 CGTCAGATAGCTCGAGACTCTAAAGTATTCTGCACAATATGTATATAGACAAATCAAAGGGGTGAGATTTAGTGGACATAAACTAGGTACAACCTAGTACTACTGAGCTTACGTTGTTGTAGAACAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487276 130 + 636262 CGTCAGATAGCTCGAGACTCTAAAGTATTCTGCACAATATGTATATAGACAAATCAAAGGGGTGAGATTTAGTGGACATAAACTAGGTACAACCTAGTACTACTGAGCTTACGTTGTTGTAGAACAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 495567 130 + 647215 TGTCGGATAGCTAGAGATTCCTAAGTGCTCTGCACAATATGTATATAGACCAATCAGAGGGGTAAGATTTAGTGGACGTAAACTGGGTACAACCTAGTACTACTGAGGTTAAACTGCTGTGGAACAAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 41528 33 + 181019 AAATGGAACATTATGTTGTTTGCGGAGAAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487407 33 + 636262 AAATGGAACATTATGTTGTTTGCGGAGAAATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 495697 33 + 647215 AAATGCAACATTATGCAGTTTGCAGAGAAATGT + +a +s mr.mrrefChr3 41561 29 + 181019 ATACCTCTTTTACACACAATTTCTAACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487445 29 + 636262 ATACCTCTTTTACACACAATTTCTAACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 495730 29 + 647215 ATACCTCTTTTATACACAACTTCTAACCC + +a +s mr.mrrefChr3 41590 22 + 181019 TACCAATAGTCACTTGGGTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487476 22 + 636262 TACCAATAGTCACTTGGGTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 495759 22 + 647215 TACCAATAGTCTCTTGTGTGCC + +a +s mr.mrrefChr3 41612 59 + 181019 ATTTCAGTCCACTATACATGGCCACTTCAAGATTATTCTAATAATGCATAATGCCTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487501 59 + 636262 ATTTCAGTCCACTATACATGGCCACTTCAAGATTATTCTAATAATGCATAATGCCTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 495781 59 + 647215 ATTTCAGTCCACTATGCATGGCTACTCCAAGATTGTTCTAATAACCCATAATGCCTAGA + +a +s mr.mrrefChr3 41671 147 + 181019 CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCACACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTGTCTATGTGAGATATTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487567 147 + 636262 CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCCCACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTATCTATGTGGGATGTTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 495840 147 + 647215 CCCAGGGCATAGATCCCATCAATCATTCTCTTCATGTTCTGTTAGCCTATTAGATCTACGGAGCTTTGGTGTCATATTTCAAATACCACCATTTAGCATGCTCCCTTTGTCTATGTGAGATATTAGGTAAGCCTGATAAATACTACT + +a +s mr.mrrefChr3 41818 64 + 181019 TGGTTGACTTTCAATTTGTCCCAAATCTCAATCTTTGTTTTTATTCATCTTACCAGTTCTTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487718 64 + 636262 TGGTTGTCTTTCGATTTGTCCCAAATCTCAATCTTTGTTTTTATTCATCTTACCAGTTCTTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 495987 64 + 647215 TGGTTGACTTTCAATTTGGCCCAAATCTTAATCTTTGTTTTTATTCATCTTACCAGTTCTTGGT + +a +s mr.mrrefChr3 41882 11 + 181019 AGGACCACCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487786 11 + 636262 AGGAGCACCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 496051 11 + 647215 ATGACCACCTA + +a +s mr.mrrefChr3 41893 18 + 181019 TGGTCAAGCCACAATGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487798 18 + 636262 TGGTCAAGCCACAATGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 496062 16 + 647215 TGGTAGAGTCACAATG-- + +a +s mr.mrrefChr3 41911 46 + 181019 ATGAATGTCTGAATCTCAGCAGGATACCAATACCTAACGGCAACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487817 46 + 636262 ATGAATGTCTGAATCTCAGCAGGATACCAATACCTAACGGCAACAG + +a +s mr.mrrefChr3 41957 97 + 181019 GGTAAGGCTAGATGACATATGTACTTTCATATGGAGTAATCAAAGAGAGTTTCCAGGAATCACTCACCCCCATCCATCAGAGTGTCTAATCTGCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487864 97 + 636262 GGTAAGGCTAGATGACATATGTACTTTCATATGGAGTAATCAAAGAGAGTTTCCAGGAATCACTCACCCCCATCCATCAGAGTGTCTAATCTGCCCC + +a +s mr.mrrefChr3 42054 56 + 181019 AGGACTCACGGGAGACAGACATATAGCAGTAATTTTCCAGACAAGGCGATGTGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487962 56 + 636262 AGGACTCACGGGAGACAGACATATAGCAGTAATTTTCCAGACAAGGCGATGTGCTG + +a +s mr.mrrefChr3 42110 50 + 181019 GAGGCTATCCTAGTTGGAAATCAAGTTTTCATTAAAGTACCCACACTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488024 50 + 636262 GAGGCTATCCTAGTTGGAAGTCAAGTTTTCATTAAAGTACCCACACTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 496078 36 + 647215 --------------TGGAAATCAAGTTTTCATTAAAGTGCCCACACTTAC + +a +s mr.mrrefChr3 42160 40 + 181019 TTCAGAGGAAGGATACAGTCATGCAAAAGTGGAACCCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488076 40 + 636262 TTCATAAGAAGGATACAGTCATGCAAAAGTGGAACCCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 496114 40 + 647215 TTCAGAGGGAGGATACAGTCATGTAAAAGCGGAACCCTAA + +a +s mr.mrrefChr3 42200 17 + 181019 CTATCAGGCAAAGGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488135 17 + 636262 CTGTCAGGCAAAGGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 496154 17 + 647215 CTATCAGGCAAAGGTGG + +a +s mr.mrrefChr3 42217 123 + 181019 CCTAACAGCCTAAAATCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCCAGGGAGAATGGGAAATGGAAAAATCAACAAATGGAGAAATCAACAACATGATGTGCAATTCTCTATATACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488154 123 + 636262 CCTAGCAGCCTAAAACCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCCAGGGAGAATGGGAAATGGAAAAATCAACAAATGGAAAAATCAACAACATGATGTGCAATTCTCTATATACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 496171 101 + 647215 CCTAACAGACCAAAATCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCAAGGGAGAA----------------------ATGGAGAAATTAGCAATATGATGTGCAATTCTCCATATACATG + +a +s mr.mrrefChr3 42340 54 + 181019 AGTCAGATCAAATAAACAGTTGATGTACCCGCTTCATATTAGTGCAAAAGTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488291 54 + 636262 AGTCAGATCAAGTAAACAGTTGGTGTCCCTGCTTCATATTAGTGCAAAAGTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 496272 33 + 647215 AGTCAGATCAAATAAACAGTTGATGTACCCACT--------------------- + +a +s mr.mrrefChr3 42394 26 + 181019 CATTGAATCACTGCAGGCTTAGGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488373 26 + 636262 CATTGAATCACTGCAGGCTTAGGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 42420 27 + 181019 TACAGATTCATAAATTCTCATTCCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488400 27 + 636262 TACAGATTCATAAATTCTCATTCCCAC + +a +s mr.mrrefChr3 42447 18 + 181019 TAGAGAGACGAGAGACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488430 18 + 636262 TAGAGAGACGAGAGACAA + +a +s mr.mrrefChr3 42465 295 + 181019 TCAAATGACAGGCCCAGGAATGGTGAACTTCAAATAGATATTTTTATGACACCCAGAACATTGTTATAATGTTTATAGAATTACTTCATACACCAGTAAGAGTAAATACTGTAGGAAAAATATTCTTAGATGTGTAGTCCCATTCAATTCTAGTGGCATTTCTGGTCTAGCAGCTCCTGGTATTTGTAAGCAAGCTCTGGCCTCAGGTAACTATAGTATTTATTACGTACCAGTATTAGACAATGAGTTCAAGTTGCGCTAGTAAGTGCCTTGGCATTTTACTTGTTACCACTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488449 295 + 636262 TCAAATGACAGGCCCAGGAATGGTGAACTTCAAATAGATATTCTTATGACACCCAGAACAGTGTTATAATGTTTATAGAATTACTTCATACACCAGTAAGAGTAAATGCTGTCAGAAAAATATTCTTAGATGTGTAGTCCCATGCAATTCTAGGGGCACTTCTGGTCTTGCAGCTCTTGGCATTTGTAAGCAATCTCTGGCCTCAGGTAACTATAGTATTTATTACATACCAGTATTAGACAATGAGTTTAAGTTGCGCTAGTGAGTGCCTTGGCATTTTACTAGTTACCACTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 496305 269 + 647215 -------------CCAGGAATAGTAAACTTCAAATAAATATTTTTACGCCACCCAGAACATTGTTATAATATTTATAGAGTTACTTCATATACCAATAGGAGTAAATACTGTAGGAAA------------CGTGTAGTCCCATTCAATTCTAGTGGCATTTCGGATCTAGCAGCTCCTGGTATTTTTAAGCAAGCCCTGGCCTCAGGTCATTACAGTATTTATTAAGT-CCAGTATTAGACAATGAGTTCAAGTTGTACTAGTAAATGCCTTGGCATTTTATATGTTTCCACTGC + +a +s mr.mrrefChr3 42760 23 + 181019 TGGATGGATAACAAGCGCCACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488744 23 + 636262 TGGGTGGATAACAAGCGCCACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 496578 23 + 647215 TGGATAGATAGCAAGCACCACCC + +a +s mr.mrrefChr3 42783 48 + 181019 TTGTAAATTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAGTGGATGGAGCGCTGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488767 48 + 636262 TTGTAAGTTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAATGGATGGAGCGCTGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 496603 48 + 647215 TTGTAAATTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAGTGGATGGAGTGCTGGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 42831 14 + 181019 AGTGCTTTGGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488817 14 + 636262 AGTGCTTTGGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 496651 14 + 647215 AGTGCTTTGGCTGT + +a +s mr.mrrefChr3 42845 115 + 181019 CATGTTAATCCACTCCACCCTCCAAGGGCAATATTGCAGTCACCTGGTTTCACACACATGCTAGTGGTTTACTCCTAAACAGGCCTGTTCTTCAATCATTAGCTCTTGCAGCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488831 114 + 636262 CATGTTAATCCACTCCACCCTCCAAAG-CAATATTGCAGTCACCTGGTTTCACACACATGCTAGTGGCTGACTCCTAAATGGGCCGGTTCTTCAACCATTAGCTCTTGCAGCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 496670 115 + 647215 CATGTTAATCCACTCGACCCTGCAAGGGCAATATTGCAGTCACCTGATTTTGCACACATGCTAGTGGTTTACTCCTAAACAGGCCTGTTCTTGAATCATTAGCTCTTGCTGCGTA + +a +s mr.mrrefChr3 42960 35 + 181019 AGCCCAGAGTTTAGGCCTCATTTGAGATTGTGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488958 33 + 636262 AGCCTAGAGTTCAG--CTAATTTGAGATTGTACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 496785 35 + 647215 AGGCCAGAGTTTAGGCCTCATTTGATATTGTGCTT + +a +s mr.mrrefChr3 42995 53 + 181019 TCAAACTCACATAAGGTCAAAGCTCATGTACACTGGGAGGCTCCATACTCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488992 53 + 636262 TCAAACTCATATAAGGTTGAAGCTCATGTACACTGGGAGGCTCCATACTCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 496820 53 + 647215 TCAAACTCACATAAGCTCAAAGCTCATGTACACTGGGAGGTTCCGTACTCTAC + +a +s mr.mrrefChr3 43048 21 + 181019 CTGTCTTATTATAGCCTGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489054 21 + 636262 CTGTCTTATTATAGCCTGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 496873 21 + 647215 CTGTCTTATCATAGCCTGATT + +a +s mr.mrrefChr3 43069 46 + 181019 AAGCATGATTTATACTGTGACATGACTCTCTATTCAACATAGTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489075 45 + 636262 AAGCAT-ATTTATACTGTGACATGACTCTCTATTCAACATAGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 496898 46 + 647215 AAGCATGATTGTTATTCTGACATGACGCCCTATTAAAGATAGGTAA + +a +s mr.mrrefChr3 43115 93 + 181019 TTGTATTTTTTCCTGGAGTGAAGCCAGGGTATAAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTGTTGCTGTGCAGATTATAAATTGTGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489121 80 + 636262 TTGTGTTTTTTCCTGGAGTGAGGCCAAGGTATAAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTG--------CAGATT-----TTGTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 496944 93 + 647215 TCGTATTTATTCCTGGACTGAAGCCAGGGTATTAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTGTTGCTGTGCAGATGATAAATTGTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 43208 217 + 181019 TGAGGCAAACTCTCCCCATGGGCACTGAGCCTCTATTGATTGTCATGCCTCCATCTTATCTACTTGCTTTTCAAACTTTGTAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGGGCATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCGCTCATTCAGGGTTTAGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTCTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489202 214 + 636262 TCGGGTGAACTCTCCCCATGGGCACTAAGCTTCTATTGATTATCATGCCTCTATCTTATCTACTTCCTTCTCAAACCTTGCAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGG-CATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCACTCATTCAGGGGTTCGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTC--TT +s simRat_chr6.simRat.chr6 497037 215 + 647215 TGAGACAAACTCTCCCCATGGGCACTGAGCCTCTACTGATTGTCATGCCTCCATCTTATCAACTTGCTTTTCAAACTTTGTAGGTTTGCC-ACATATAGCAGGGAGATATGTTTGAATGGGTATTGTAGAGATAGTCCCTCACCAGTGCCCGTTCATTCAAGGTCTAGCTTATGCACTTCAGACTGCATTAGATTTCTCC-TCTTGTCCCTTCTGTT + +a +s mr.mrrefChr3 43425 118 + 181019 CCAATCACCAACAATCCCATTGCGTTTATCAATCAATCTTGTATCCTGATGACCAGGTAGCACATAATAAATAAAAATGGAGTGACAACAATACACCAGTTGCTATATGTTGTCTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489417 118 + 636262 CCAGTCACCAGCAGCCCCATTGCGTTTATCACCCAATCTTGTATCCTGATGACCAGGTGGCATCCAATAAATAAAAATTAAGTGACAACAGTATACCAGTTGCTATATGTTATCTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 497252 118 + 647215 CCAATCACCAACAATCAAATTGCGTTTATCAATCAATCTTGTATTCTGATGACCAAGTAGCACATAATAGATAAAAATGGAGTGACAACAATACACCAGTTGATATATGTTGTCTCCC + +a +s mr.mrrefChr3 43543 368 + 181019 GAATCTAGGTACTTTGGGGAAGGACTCTTGGGAGTTCACAGTCCTGGGACACACTATTAGAATCTGATTCACCCAGATTATACAGGAACAGCCTGAATCATTAGTCAAGGTCTTTGGCAGTAAGGCTATGCAATCTAAAGCAAAAGCGGTAATTGAAAATTTTGTTAAAAAGTTGGAAGAAAATTACAATCCAGAATGTGGAATTGGTGCATTCCATGACTCAGATCTAGTCCAAAGGTTATGTCAGTGTAAAGGGTTTGGATGTGAATTCTGGTACCAACATAAAGGGGACTACATACCAAGTGTTACTGTACAAATTCATGGTCAGATCTAAATTTATACACTAAGTAATCGTGATTTTCAGCTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489535 323 + 636262 GAATCTAGGTACTTCGGGGAAGGACTCTTGGGCGTTAACAGTCCTGGGACACACTATTAGATTCTGATTCACCCAGATAATACAGGAACAGCCTGAATCATTAGTCAAGGTCTTTGGCAGTAAGGCTATGCAATCAAAGGCAGAAGCGGTAATTGAAAATTTTGTTAAAAAGTTGGAAGAAAATTACAATCCAGAATGTGGAATTGGTTCATTCCATGACTCAGATCTAGTCCAAAGGTTATGTCAGTGTAACAGGTTTGGATGTGAATTCTGGTATGAACACAAAGGGGACCACGTACCAAGTCTTACCGTACAAATTCATG--------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 497371 366 + 647215 GAATCTAGGTACTTTGTGGAAGGACTCTTGGGAGTCCGCAAGCCTGGAACGTGCTATTAGAATCTGATTCACCCAGATTATACAGGAACAGCCTGAATCATTAGTCAAGGTCTTTGGCAGTAAGGCTATGCAATCTAAAGCAAAAGCCATCATTGATAATTTTGTTAAAAAGTTGGAGGAAAATTACAATCCAGAATGTGGAATTGGTGCATTCCATGACTCATATCTAGTCCAAAGGTT-TGTCAGCATAAAGAGTTTGGGTGTGAATTCCGTTACCAAAATAAAGGG-ACTACAGACCAGGTGATACTGTAAAAATTCATGGTCAGATCTAAATTTATACACTAAGTAATCGTGATTTTCAGCTGC + +a +s mr.mrrefChr3 43911 27 + 181019 CTCCAAGGTGAATCAGTGTTGTGTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489858 19 + 636262 --------TGAATCAGTCTTGTGTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 497740 27 + 647215 CTCCAAGGTGAATCAGTGTTGTGTCAA + +a +s mr.mrrefChr3 43938 19 + 181019 CCTATTAATTCCATTGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489881 19 + 636262 CCTATTAATTCCATTGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 497767 19 + 647215 CCTATTTATTCCATTGGTG + +a +s mr.mrrefChr3 43957 49 + 181019 TAGTTACTTGAAAGCTCCAGTGCTTGCTTAATGCCACAATATCATACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489900 49 + 636262 TAGTTACTTGAAAGCTCTGGTGCTTGCTTAATGCCACAATATCATACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 497801 49 + 647215 TAGTTATCTAAAGGCTCCAGTGCTTGCTTAATGCCACAATATCATACCT + +a +s mr.mrrefChr3 44006 41 + 181019 TACAGCACATCAGGGAAATGATAGTTCACTATATTATCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490065 41 + 636262 TACAGCACACCAGGGAAATGATTGTTCACTATATTACCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 497850 40 + 647215 TACAGAACATGAGGGAAATGATAATTCACCATATGATCCT- + +a +s mr.mrrefChr3 44047 119 + 181019 GAACCACTAAGCAATCACATCTACAAGATGAGAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCTGGAAGGTATGGCTCTAACCTGTGCAGTCTGTATCAATGGGTGGCTCAACTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490109 119 + 636262 GAACCACTAAGCAATCATATCTACAAGATGAGAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCGTGAAGGTAAGGCTCTAACTTGTGTGGTCTGTATCAGTGCGTGGCTCAACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 497890 116 + 647215 GAACCACTAAGTAATCTCATCTGCAGTATGACAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCTGGTAGGTGTGGCTCT---CTGTGCAGTCTGCATCAATGGGTGGCTCAATTCA + +a +s mr.mrrefChr3 44166 76 + 181019 TCTTGACATGATGAAGTTCTTACAGTGGTTCCTGGGGAGAAATAATGGAAAGGTGCAATAGATATCTGTAGTCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490228 76 + 636262 TCTTGACATGTTGAAGTTCTTACAGTGGTTCGTGGGGAGAAATAATGGAAAGGTGCAAAAGACCTCTGTAGTCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 498010 76 + 647215 GCTTGACATGATGAGGTTCTTACAGTGGTGCCTAGGGAGAAATAATGGAAAGGTGTAATAGATATTTGTAGTCCAA + +a +s mr.mrrefChr3 44242 10 + 181019 TAAACTGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490305 9 + 636262 TAAATTGTC- +s simRat_chr6.simRat.chr6 498086 10 + 647215 TAAACTGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 44252 15 + 181019 ATGACTAACAACTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 498112 15 + 647215 ATGACTAACAACTAT + +a +s mr.mrrefChr3 44267 152 + 181019 CTCTGAGTACTCAGCAGGGGGGTGATCCTTAACAATGCACAACATTGGTTAATTCCATACTAATGTGTTTATTACACACATTATCAAAGGATGACCTATGCAACTCTCAGGAGAGTTCAATGGCAATGAAGATTACTCAAAATCCAATCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 498129 152 + 647215 CTCTGAGTACTCAGCAGGGGGGTGATCCTTAACAATGCACAACATTGGTTAATTCCATACTAATGTGTTTATTACACACATTATCAAAGGATGACCTATGCAACTCTCAGGAGAGTTCAATGGCAATGAAGATTACTCAAAATCCAATCATT + +a +s mr.mrrefChr3 44419 20 + 181019 TCCTTTTATTGCCCAGTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 498287 20 + 647215 TCCTTTTATTGCCCAGTGTG + +a +s mr.mrrefChr3 44439 69 + 181019 AGGTGAGTGAGCAAAAGCAAACTACTGCTAAAGCTCAAGTTCCTAACATTATATTGAACTAGATTCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 498308 69 + 647215 AGGTGAGTGAGCAAAAGCAAACTACTGCTAAAGCTCAAGTTCCTAACATTATATTGAACTAGATTCTCC + +a +s mr.mrrefChr3 44508 385 + 181019 CTTGGTACCAATGCACTGGGAACCTCTTTTATCTTGCAGCCAAGAACTTACACATGTGCTGCATACCTACTTACTTATATATCCCAGATAAGATTATTATATATCCCCAACACACAGTGCATCAATTAAGGATGCCCTATGAGGGACTTAGACAGAACTATCTCGGTGAGATCATTAGTGTTGAATGCCATGTTGCAGTACGATGGTGAGGTGACTGGCTCAGATCTCAAGCCGGTGTTATAGAGTACAGACCACTGCCGAAGTAGACATTGGGTAATTTAAATTAGATGGTGTAAGTTGCCAGCAAGAGTTGCTACAAGATCTCATAAACTTACACACCTTGACAGGATCCAGGAAAAACCCTGATCTCTCAACTCTATCCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490314 382 + 636262 CTTGGTGCCAATGCACTGGGAACCTCTTTTATCTTGCAGCCAAGAACTTACACATGTGCTGCATACCTTCTTACTTATATATCCCAGATAAGTTTATTATATATCCCCAACACACAGTGCATCAATTAAGGATGGCTTATGAGGGACTTTGACAGAACTATCTCGGTGTGATCATTAGTGTTGAATGCCATGTTGCAGTACAATGGTGAGGTGACTGACTCAAATCTCAAGCTGGTGTTATAGAGTGCAGACCAT-GCCAAAGTAGACATTGGGTAATTTAAATTAGATGGTGTAAGTTGCCAGCAAGAGTTGCTACAAGATCTCATAAACTTACGCACCTTGACTGGATCCAGGAAAAACCCTGATCTC--AACTCTATCCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 498386 384 + 647215 CTTGGCACCAATGCACTGGGAACTTCTCTTATCTTGCAGCCAAGAACTTACACATGTGCTGCATACCTACTTACTTATATATCCCAGATAAGAGTATTATTTA-CCCCAAGACATGGTGCATCAATCAAGTATGCTCTATAAGGGACTTAGATAGAACTATCTAGGTGAGATCATTAGTGTTGAATGCCATGCTGCAGTACGATGGTGAGGTGACTGGCTCAGATCTTGAGCCGGTGTTATAGAGTACAGACCACTGCTGGAGTAGGCATTGGGTAATTTAAATTAGATGGTACATGTGGCCAACAAAAGTTGCTTCAGGATCTCATAACATTAAATACCTTGACAAGATCCAGGAAAAACCCTGCTCTCTCGATTCTAGCCATT + +a +s mr.mrrefChr3 44893 77 + 181019 TTTCCTTTGAATTCAGTTCAACACCTCCCCATCACATTCAGGACCATTTTCCTGGGGCTGAGTTCACAATGCCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490702 76 + 636262 TTTCCTTTGAATTCAGTTCAACACCTCCCCATCACACTCAGGACCATTT-CCTGAGGCTGGGTTCACAATGCCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 498770 77 + 647215 TTTCCTGTGAATTCAATTCTACACCTCCCTATCACATTCAGGACCATTTTCCTGGGGCTGAGTTGACAATGCCATAT + +a +s mr.mrrefChr3 44970 27 + 181019 GTAACATAACATAATAGTAAGGGGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490784 27 + 636262 GTAACATAACATAATATTAAGGGGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 498847 27 + 647215 GTAACACAACCTAATAGTAAGGGGTGC + +a +s mr.mrrefChr3 44997 64 + 181019 CCCTCTTTCTGTAAGGGGTGCTCCTTTTTGTTGTACAACCAGCCACAAAATTGGCCCAAAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490811 62 + 636262 CCCT--TTCTCTAAGGGGTGCTCCTTCTTCTTGTACAACTAGTCACAAAATTGCCCCAAAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 498923 64 + 647215 GCCTCTTTCTGTAAAGGGTGCCCTTTTTTGTTGTACCACCAACCATAAAATTGGCCCAAAAATT + +a +s mr.mrrefChr3 45061 31 + 181019 ATTTTAACCTATAGTGCAAAGTGTCCCAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490874 31 + 636262 ATTTTAACCTATAGTGCAAAGTGACCCAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 498987 31 + 647215 ATTTCAACCTATAGTGCAAGGTGTCCCAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 45092 71 + 181019 TTTTGTCTTTTAGTTCATCAATTGGGATACAACTATAGCATAGGGAGTTCCAGTTTCTTGCCTCTGAATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490905 71 + 636262 TTTTGTCTTTTGGCTCATCAATTGGGATACAACTATAGCATAGGGAGTTCCAGTTTCTTGCCTCTGAATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 499044 71 + 647215 TTTTGTCTTTCAGTTCACCAATTGGGATACAACTATCGCGCAGGGAGTTCCAGGTTTTTGCCTCTGAATCC + +a +s mr.mrrefChr3 45163 161 + 181019 TTAAGAGACACTTAAAAATATTCACATGTATTGATGGCTAGTAGGGGGGGGCATGTTTAAAGCAGGAGGATGTGTTGCCAGGTGTTCAGTACTAGCTTATGCATTATGCATGAAGTACACTGGATCCTGAGTACATATGAATAGAGGCCTTCGTGGAATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 490981 159 + 636262 TTAAGAGACACTTAAAAATATTCAAATGTATTGATGGCTAGTA-GGGGGGGCATGTTTAAAGCAGGAGGATGTGCTGCCAGGTGCTCAGTACTAGCTTATGCATTATGCATGAAGTACACTGGATATTGAGTACATATGAGTAGTGGCCTTCGTGGAATG- +s simRat_chr6.simRat.chr6 499115 161 + 647215 TTAAGAGACACTTAAGCATATGCACGTGTATTGACGGCTAGTAGGGGGGGGCATGTTTAAAGCAGGAGGATGTGTTTCCAGGTGTTCAGTACTTGCTTATGCATTATGCATGAAGTACGCTGGATCCTGAGTACATGTGAATAGAGGCCTTCGTGGCATGT + +a +s mr.mrrefChr3 45324 606 + 181019 TCATTGGCATTAGAAAAATTACTTGCAGATTCCCAGCCACCAACTGGAAAAGATGGAAGAATGACAGATAATAATGTTATCTCAGGCCAGCAACCACTAATAGATTGGGATCAAATCAAGGAGGAGGGATTAAAATGGCAAAAGAGTGAGTGGGCAGGTTGGGCCTGTTGACCATGTACTCCAAAGTTATCCATGTGTTAGGGTGCTTTTGATACCTTGGTGTTTCTATACTTGAATCACAGGATAAGCATTCACTAGACTAGTACCAGCTGTCATAATGTAAACGGTCTATATCTTTACTGCCGACAAGGAATGGTGAGAACCAGTTCAACATGTCTAGTTTACAATTGAAACTACCCTACACATGACCTCAATGGCCCATCTGGCCCCACTAGGTGATCAGAAGTAACTAGGGGCCTTTGTCTTGTAAACAAATTGCTAAGAGTTAAAGTAATGTAATAAGACATGTCAACCTGCTTGGTGTCTAGCGAAACAACCAGCAAATTCCAATGTGTGTGCTTTGTTTTGATAGATTATAAAACAAGTATGATGATTTTCATTTGTTAAGTGATAATCACGATTTGTCATCTGTGTGTCTAGCCCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 491140 560 + 636262 TCATTGGCATTAGAAAAATCACTTGTAGATTCCCAGCCACCAACTGGAAAAGATGGAAGAATGACAGATAACAATGTTATCTCAGGCCAGCAACCACTAATAGATTGGGATCAAATCAAGGAGGAGGGATTAAAATGGCAAAAGAGTGAGTGGGCAGGTTGGGCCTGTTGACCATGTACTCCAAAGTTATCCATGTGTTAGGGTGCTTTTGATACCTTCATGTTTCTATGCTAGAATCACAGGATAAGCATTCACTATACTAGTACCAGCTGTTGTAATGTAGACGTTCTATATCTTTACTGCCGACAAGGGATGATGACAACCAGTTCAACATGTCTAGTTTTCCATCAAAACTACCCTGCACATGACCTAAATGGTCCATCTGGCCCCACTAGGTGATCAGAAGTGACTAGGGGCCTTTGTCTTGCAAACAAATTGCT-AGAGTTAAAGTAATGTAATAAGACATGTCAACCTGCTTGGTGTCTAGTGAAACAACCGGCAAATTCCAATGTGTGTGCTTTGTTTTGATAGATTATAAGACACATATAATAACTTTCATT--------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 499279 593 + 647215 TCATTGGTATTAGAAAAATTACCTGCAGATTCCCAGCCACCAACTGGTAAAGATGGAAGGACGACAGACAATAACGTTATCTCAGGCCA------ACTAATAGATTGGGATCAAATCAAGGAGGAGGGATTAAAATGGCGAAAGAGTGAGTGGGCAGGTTGGGCCTGTTGATCATCTACTCCAAAGTTATCCATGTGTTAGCGTGCATTTGATACCTTGGTGTTTCCATACTTCAATCACTGAATGAGCATTCAATGGACTGGTACCGGCTGTCAGAGTGTAAACCGTCTATATCTTTACTGCCGACAAGGAATAGTGAGAACCAGTTCAACATGTCTAGTTCACAGTTGAAACTACCGCACCCATGACCTCAATGGCCCATCAGGCCCCACTAGGTGATCAGAAGCAACTAGGGGCCTTTGTCTTGTAATCAAATTGCCAAGAGTTAATG------AATAAGACATGTCAACCTGCTTGGTGTCCAGC-CAACAACCAGCCAATTCCAATGTTTGTGCTTTGTTCTGATAAATTATAGAACAAGTATGATGATTTTCATTTGTTAAGTGATAATCACGATTTGTCATCTGTGTGTCTAGCCCATT + +a +s mr.mrrefChr3 45930 107 + 181019 AGTAAAACAGAAAATTCTGTGATACACTGACAAGGTTCCTGCAGAAATATTCCTTATGCAGCCTTTTCTAGGAATGGCCAGTGTGTTTGTTTCCTTTACTTCAATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 500061 107 + 647215 AGTAAAACAGAAAATTCTGTGATACACTGACAAGGTTCCTGCAGAAATATTCCTTATGCAGCCTTTTCTAGGAATGGCCAGTGTGTTTGTTTCCTTTACTTCAATGG + +a +s mr.mrrefChr3 46037 285 + 181019 ACTACAACACAGCTACATTCctgtaatgcaatggaaaggactatatgacattggtacTgGAGAGACAGCTGGAGACACTTGATTCTAGACCCTCACTTGATTTCTACAGCATGTCACTTCCTACTCGTTTCAATATGGTAGTACTTGAGAATTGATGGTATGCCAATAGTTTTTGAAACGATTGGTTTGGATTGTCTGACTAGGCAAATGTTATATGTGTCTGATGACCAGCTAACTAATCAGTTACTGAGATATGAACACATGGTAATTCACAAGCCTAATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 491700 226 + 636262 ---------------------------------------------------------T-GAGAGACAGCTGAAGTCACTTGATTCTAGACCCTCACTTAATATCT-CAGGTTGTCACTTCCTACTTGTTTCAATATGGTAGCACTTGAGAATTGATGGTATGCCAATAGTATGTGAAGCGATTGGTTTGGAATGTCTGACCAGGCAAATGTTATATGTGTCTGATGACCAGCTAGCTAATCAGTTACTGGGATATGAACACATGGTAAATCTCAAGCTTGATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 500175 283 + 647215 ACTACAACACAGCTACATTCCTGTAATGCAATGGAAAGGACTATATGACATTGGTACTG-AGAGACAGCTGGAGACACTTGATTGTAGACCCTCACTTGATTTCTACAGCATGTCACTTCCTACTCATTTCAATATGGTAGTGCTTGAGAATTGATGGTATGCCGATAGTTTTTCGAACGATTGGTCTGGATTGTCTGATTAGGCAAATGCTATATGTGTCTGAAGACCAGCTAACTAATCAGTTACTGAGATATGAACACATGGCAATTCAC-AGCCTAATCAA + +a +s mr.mrrefChr3 46322 69 + 181019 TTTTATGAGATTGGATGTTAACACACTAGGATGGAGAACGTCTCATGAGCAGGGTATACTCCCTTTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 491930 69 + 636262 TTTTATGAGATTGGATGTTAACACTCTAGGATGCTGTACATCTCATGAGCAGGGTATACTCCCTTTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 500458 69 + 647215 TTTTATGAGGTTGGATGTTAACACACTAGGATGGAGAACGTCTCATGAGCAGGGTATACCCCCTTTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 46391 47 + 181019 ATCGACCCGCAGGTTCAGGGACCCAATGCTCATAAGAGACCATGGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 491999 47 + 636262 ATCCACCCACAGGTTCAGGGACCCAATGCTCATAAGAGACCATGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 500529 47 + 647215 ATCGTCCAGCAGTTTCAGGGACCCAATGCTCATAAGGGGCCACCAGC + +a +s mr.mrrefChr3 46438 30 + 181019 ATCCTTGTTAAGTCTGTTAATAGTAAGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492046 30 + 636262 ATCCTTGTTAAGTCTGTTAATAGTAAGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 500577 30 + 647215 ATCTTCGTCCAGTCTGTTAACAGTAAGCAT + +a +s mr.mrrefChr3 46468 97 + 181019 ATCAGACCAAATAATGGGTTTGCTTATGTATACCTGGTTGGCATCAACTTTTTAATTGACTCTTCCAATGGACTCTCTATTGTGTCTGGATCTTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492081 97 + 636262 ATCAGACCAAATAATGGGTTTGCTTATGTATACCTGGTTGGCATCAACTTTTTAATTGACTCTTCCAATGGACTCTCTATTGTGTCTGGATCTTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 500607 97 + 647215 ACCGGACCAGATAATGGGTTCGCTTATGTATGCCTGGCTGGCATCAACTCTCTAATGTACTTTTACAATAGACTCTTTATTGTGTCTGGATCTTAAG + +a +s mr.mrrefChr3 46565 88 + 181019 ATTTTTGCCAACTTTGTGGGTGGACTAAGTACAAGAGGCGAGCACCCTATCTTGACCAGCTGGATCTGGCTCATGTCATGAACAGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492182 88 + 636262 ATTTTTGCCAACTTTGTGGGTGGACTAAGTACAAGAGGCGAGCACCCTATCTTGACCAGCTGGATCTGGCTCATGTCATGAACAGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 500704 88 + 647215 ATATTTGCTAATTTGGTGGGTGTATTAAGTACAGGAGGGGAACACCCTATCTTTAGCTGCTGGATCTGGCTGATGTCATGAACAGCTA + +a +s mr.mrrefChr3 46653 7 + 181019 GAAGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492270 7 + 636262 GAAGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 500793 7 + 647215 GGAGATA + +a +s mr.mrrefChr3 46660 18 + 181019 GGATCCTCTTCCAGTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492287 18 + 636262 GGATCCTCTTCCAGTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 500800 18 + 647215 GGATCATGTAACATAACA + +a +s mr.mrrefChr3 46678 75 + 181019 CACCAAGGACACAACTGTGTGAAAAAGCCTTTAGTGGGAAATCTAGGACTCCATCCATAAGTCATGCTTGCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492305 75 + 636262 CACCTAGGATGTAAATGGGTGAAAAAGCCTTTAGTGGGAAATCTAAGACTCCATCCATAAGTCACGCTTGCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 500835 75 + 647215 CACCAAGGACACAACTGTGTGAAAAAGCCTTTGGTGGGAAATCTTGGACTCCATCCATAAGTCATCCTTGCAATA + +a +s mr.mrrefChr3 46753 223 + 181019 GAGAAGCATTTATAACCTAGGGCATCAAATAGGACTGACCCCTCAGGCAAAATTGTCAGAGACATGCTATTGTAGTGAGGTCTTAAGGAGACAAGTGTCATGATAGCTTGTTGAATCATAAAGTTAAAGAATACTAGGTATGTGCATAATAACTGTGCTGGAAAACATCAGTGACATTACGCAAACTTGATTAGCCATATGCAGTTGTAAGCATTGACGGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492381 223 + 636262 GAGATGCATTTATAACCTGGAGCATCAAATAGGACTGACCCCTCAGGCAAAATTGTCAGAGACCTGCTATTGTAGTGAGACCTCAAGGAGACAAGTTTCATGATAGCTTGTTGAATCATAAAGTTAAAGAATACTAGGTATGTGCATGATAACTGTGCTGGAAAACATCAGTGACATTACGCAAACCTGATTAGCCATACGCAGTTGTAAGCATTGACGGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 500910 221 + 647215 GAGAAGCGTTTATAACCTATGGCTTCAAATAGGACTGACCTCTCTGGCAACATTAT--GAGACAAGCTATTGTAGGGAGGTCTTAAGCAAACAAATGTCATGATACCTTGTTGAATCATAAAGATAGAGAACATTAGGTATGTGCACAATAACTGTGCTGGAAAACACCAATGACGTTATGCAATCTTGATTAGTCATATGCAGATGTGGGCATTGAAGGGAG + +a +s mr.mrrefChr3 46976 44 + 181019 TCTGCTACAATGATAGAGGTCTGTTAAAATGACTTTGGCTAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492609 44 + 636262 TCTGCTGCAATGATAGAGGTCTGTTAAAATGACTTTGGCTAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 501131 44 + 647215 TCTGCTACAATGATACTGGTCTGTTAAAATAGTCTTGGCTAGAT + +a +s mr.mrrefChr3 47020 16 + 181019 TGGTTGAAACTTGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492689 16 + 636262 TGGTTGAAACTTGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 501175 16 + 647215 TGGTTGAGACATAGTG + +a +s mr.mrrefChr3 47036 6 + 181019 CCTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492760 6 + 636262 CCTAGA + +a +s mr.mrrefChr3 47042 65 + 181019 GCAAAAGATCAGTCTAGTCCTGTCCAGCAACCATGCATTTGAGATCAAAATCCAGAGGAAAGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492780 65 + 636262 GCAAAAGATCAGTCTAGTCCTGTCCAGCAACCATGCATTTGAGATCAAAATCCAGAGGAAAGGAT + +a +s mr.mrrefChr3 47107 88 + 181019 TATTAGTTGAGATGGAAAAGTGGCCTTAAGGTCCCGATCTGCATTTATGACACCTTAGTTTAATGTTAAAGGCCTCTAGCCAGTTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 70543 88 + 636262 TAATCCTTGAGATGGAAAAGTGGCCTTAAGGTCCCGATCTGCATTTATGACACCTTAGTTTAATGTTAAAGGCCTCTAGCCAGTTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492845 88 + 636262 TATTAGATGAGATGGAAAAGTGGCCTTAAGGTCCCGATCTGCATTTATGACACCTTAGTTTAATGTTAAAGGCCTCTAGCCAGTTCTA + +a +s mr.mrrefChr3 47195 24 + 181019 GTCTTGATTTGATTGCCGAAGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492933 24 + 636262 GTCTTGATTTGATTGCCGAAGGAT + +a +s mr.mrrefChr3 47219 37 + 181019 TTGCTGTGGCCCCTAAAAGGTCTGATGAAAGTATAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492959 37 + 636262 TTGATGTGGTCCCTAAAAGGTCTGATGAAAGTATAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 501208 37 + 647215 CTGCTCTGGCCCCTAAAAAGCCTGATAAAAGTATAAT + +a +s mr.mrrefChr3 47256 43 + 181019 ACAGCCAGTGATAATAACAGACAGTGTAATGTCATGACAGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 492996 43 + 636262 ACAGCCAGTGATAATATCAGATGGTGTAATGTCATGACAGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 501246 43 + 647215 ACAGCCAGTGATAATAATAGACAGTTTAATGTCATGACAGCAG + +a +s mr.mrrefChr3 47299 214 + 181019 TACAAAAATAATATGGATGGTTAAGAGTAGTGGGTACAGAATTGAAGGATGCAGCATAATACAAAGGCCCTTGACATTGGACCATCATTACTGTCGCTGACAACTTCATCTAGGCTTGATACTCTTCGCAACCCAATGGTAGAGCATTCAATAACTATGTTTGGCTTGGTTAACACCACCCTAAGCTCCTAGTACTGATTAATTAGCTTTAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493039 208 + 636262 TACAAAAATAATATGGATGGTTAAGAGTAGTGGGTACAGAATTGAAGGATGCAGCATAATACAGAGGCCCTTGACATTGAACCATTATTACTGTCGCTGACAACTTCATCTAGGCTTGATACTCCTCGCAACCCAATGGTAGAGCATTCAATAACTATGTTTGGCTTGGTTAACAGCACCCTAAGCTC------CTGATTAAATAGCTTTAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 501290 207 + 647215 AACAAAAATAATATGGATGGTTAAGATTAGTGGGGAC------GAAGGATGCATTA-AATACAAAGGCACCTGAAACTGGACCGCCATTACTGTCGCTGACAACTTCATCAAGGCTTGATACTCTTTGCAACCCAATGGTAAAGCACTCAATAACCAAGTTGGGCTTGGCTAAGACCACCCTACGCTCCTAGTACTGATTAATTAGCTTTAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 47513 128 + 181019 AGCAGACCAGCAGAGATTGGTCTTTTTTATTTTGGAACCCTTGCCCTTGGCTTGCACAGGTTAAGGAAGATGACAACCTTAACTTGATGCCTGTAAGTTCATCAAGTTCAGCAGCTTTGTGAAATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493250 128 + 636262 AGCAGACCAGCAGAGATTGGTCTTTTTTATTTTGGAACCCTTGCCCTTGGCTTGCACAGGTTGAGGAAGATGACAACCTTAACTTGATGCCTGTAAGTCCATCAAGTTCAGCAGCTTTGTGAAATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 501497 83 + 647215 AGCAGAC------------------------------------------GCCTGCACTAGTTAAGGAAAATGACAACCTAAACTAGATGCCTGTAAGTTTAACAAGTTCAGCAGCTTTGTGAAAT--- + +a +s mr.mrrefChr3 47641 8 + 181019 CCCTAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493387 8 + 636262 CCCTAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 501580 8 + 647215 CCCTAAGG + +a +s mr.mrrefChr3 47649 31 + 181019 CTTCAGTAGAGGAAATGAAGGTGCTGGTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493403 31 + 636262 CTTCATTAGAGGAAATGAAGGTGCTGGTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 501588 31 + 647215 CTTCAGTAGAGGAAATGAAGGTACTGGTGCT + +a +s mr.mrrefChr3 47680 3 + 181019 ACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493434 3 + 636262 ACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 501636 3 + 647215 ATT + +a +s mr.mrrefChr3 47683 12 + 181019 CTATAGGTACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493510 12 + 636262 CTATAGGTACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 501639 12 + 647215 CTACTGGTCCAA + +a +s mr.mrrefChr3 47695 16 + 181019 CTTACAACATTTTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493522 16 + 636262 CTTACAACATTTTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 501656 16 + 647215 CATACCTCATCTTCTC + +a +s mr.mrrefChr3 47711 9 + 181019 GAAGAGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493542 9 + 636262 GAAGAGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 501672 9 + 647215 AAAGTCCTG + +a +s mr.mrrefChr3 47720 331 + 181019 GTGCTGTGTCATTCAACCATAATGAAAAGAGATCCAAATGAATTGTTTCACCCTGTTATCATTGTTACCAAGCATGTGACCTCAGTGTAAGTTTCAGTCATAAGGATGAGTATCTTCCCCCAGACCTACCACCAATCAAGAAAAACTTTTATAAGGAGTCCACTGCAATGAGCACCATGACAAAAGTGCAAGCAGATAGTTGGAAGTATATCCCCATCCCACCATAGAGGGAAACAGAAATACTGTGCCACTGGACTGTGATAATGTATATGGACATATGTCAATGGGAGAATAATGTTAAGTCATAGCATCTGAGAATAATGTTAAGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493552 327 + 636262 GTGCTGTGTCATTCAACCATAATGAAAAGAGATCCAAATGAATTGTTTCACCCTGTTATCATTGTTACCAAGC-TGTGACCTCAGTGTAAGTTGCTGTCATAAGGATGAGTATCTTCCCCCAGACCTACCACCAATCAAGAAAAACTTTTATAAGGAGTCCACTGCAATGAGCACCATGACAAAAGTGCAAGCAGATAGTTGGAAGTATATCTCCATCACACCACAGAGGGAAACAGAAATACTGTGCCACTGGACTGTGATAATGCATATGGACACATGTTAA---GAGAATAATGTTAAGTCATAGCATCTGAGAATAATGTTAAGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 501681 316 + 647215 GGACTGGGAGGTCTAACAATAATGAAAAGAGATCCTAATGAATTGTTTCAACCTGTTGCCATTGTTTGCAGCCATCTAACTTCAGTGTAAGTTTCAGTCATAAGGATGGGTATCTTCCCCAAGACCTACCACCAATCAAGAAAAACTTTTATAAGGAGTCCACTGCAATGAGCACCATGACAAAGGTGCAAGCAGATAGTTGGAAGTATACCCCCACTCCATCATAGGGGGAAAGAGAAATAATGCGCCACTGGGCTGTGATAACCTATATGGATTTACGTCAATGGGAGAATAATGTTAAGTCATAGCATCTGGT--------------- + +a +s mr.mrrefChr3 48051 73 + 181019 TAGCATCATGAAGGGATGGAGTTTAGGGTCAGCATCATGGATGGTCAATTGGAGCCTAATGTCTAGCACAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493882 73 + 636262 TAGCATCATGAAGGGAAGGAATTTAGGGTCAGCATCATGGATGGTCAATTGGAGCCTAATGTCTAGCACAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 501997 61 + 647215 ------------GGGATGGAGTTTAGGCTCAGCATCATGGATGGTCAACTGGAGCCTAATGTCTAGCACAAGA + +a +s mr.mrrefChr3 48124 52 + 181019 tttgtgtgtgtaaagtcacgatgttgggaccctttgaggggtattttgtata +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 493955 52 + 636262 tttgtgtgtgtaaagtcacgatgttgggaccctttgaggggtattttgtata +s simRat_chr6.simRat.chr6 502062 52 + 647215 TCTGTGTATATAAAGTCATGATGTTGGGCTCCTTTGGGGGGCATCTTATATA + +a +s mr.mrrefChr3 48176 24 + 181019 acctgctaaagttagttgctcccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494007 24 + 636262 acctgctaaagttagttgctcccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 502115 24 + 647215 ACCTGCGAGAGTGAGTTGCCCTCC + +a +s mr.mrrefChr3 48200 18 + 181019 tcaagcatcaactgatgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494031 18 + 636262 tcaagcatcaactgatgc +s simRat_chr6.simRat.chr6 502158 18 + 647215 TCCAGCATCAGCTGATGC + +a +s mr.mrrefChr3 48218 76 + 181019 agcatcctAGACCTACCTACATGAATGAACAATGTATAGTGAAGGGTGATGACATATCTCATGCAATGTGAGACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494049 76 + 636262 agcatcctAGACCTACCTACATGAATGAACAATGTATAGTGAAGGGTGATGACATATCTCATGCAATGTGAGACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 502177 76 + 647215 AGTATCCTAAACCTACCTACATGAATGAACAATGCATAGTGAAGAGTGATGACATGTCTGATGCAATATGAGACTC + +a +s mr.mrrefChr3 48294 9 + 181019 TTTTTATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494411 9 + 636262 TTTTTATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 502253 9 + 647215 TTTTAAAGT + +a +s mr.mrrefChr3 48303 64 + 181019 AAGTATGAGGGGGTGAGGACCCTAGTTCTAGATGTGGTAAAATAggagtggggggggaggaggg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494420 64 + 636262 GAGTAGGAGGGGGTGAGGACCTTAGTTCTGGATGTGGTAAAATAggagtggggggggaggaggg +s simRat_chr6.simRat.chr6 502264 64 + 647215 AATGATGAGGGGGTGAGGACCCTAGTTCTAGAGGTGGTAAAATAGGGGCagggggggaggaggg + +a +s mr.mrrefChr3 48367 232 + 181019 agggtgggggggggggaggggagggAAGTAAAGGAGGTAAAGTTTAAAGCATAACAGTGCTTTGTAAACAAATTTCACAAAATAGCATATTGCGCCAAGTTTTATAAATTGAATTCTGTTATGGTTAGGCACAGATAAGGGCTCACATTGGGTCATGACTGGTTATGTTAAAGGTAGACTCATTTTTTCTTCAATTAACAACTTGGCAAAGGCTTTTAGGTTTAAATATGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494485 210 + 636262 agagtggggggggggtaggggagggAAGTAAAGGAGGTAAGGTTTAAAGCATAACAGTGCTTAGTAAACAAATTTCACAAAATGGCATATTGCGCAAAGTTATGTAAATTGAATTCTGTTATGGTTAGGCACAGATAAAGGCTCACATTGAGTTATGACTGGTTATGTTAAAGGTAGACTCATTTTTTCTTTGATT----------------------GGATTAAATATGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 502328 230 + 647215 agggtgggggggagggaggggagggaggTAAAGGAGGTAAAGTTTAAAGCATAATAGTGCTCTGTAAACAAATTTCACAAAATAGCACATTGC-CCAAGTTTTATGAATCGTATTCTGTTCTGGTTAGGCACAGATAAGGGCCCACATTGGCGCATTACTCACTATGCTAAAGGTATACTCA-TTCTTCTTCAATTAACAACTTGGCAAAGGCTTTTAGGTTTAAATATGAC + +a +s mr.mrrefChr3 48599 524 + 181019 GAGAAGGTTTTTCATATCATTTTTCATGCAAGTCAAAATGCTCAGTTGGACAAGGTAATTTTCCTATTGGGGAATTTAATAATTATGATCTAACTTACTGTAAAGGCACAATCAGAGTTACTTTATCTAGGGATTACATACTGTCAGATCCAGTTGCCTTTAATATCTCTCCACAAGTTTCCTCCATAACTATAAACTGATTGTATAGGGTAATCAGCTGTGAAGCCTAATAATAAGTAAGTTATTGGATAGTGCTCTTTTAGTCTGGATGTTTTTTTAATTTAAAGGGAAGAAAATTTTAACTTAACATGGGATGACTTAAAGGATGGAGAAAAACATCCCTCCAACCCCTGTACTTTCGACGATGCTTCTCCATGTTATCATCCTGATGTTACCGAAAACATCAAGAAGACCTTTCAGAAACCTACACCAATTCATGTAAGATAGTGTGACTGAACAATGGATGTAACACTGCTGGGTTTATTGGGTTCAATGCGACCTCTCTTTAGAAAGAAGATAATGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 494695 519 + 636262 GAGAAGGTTTTTCATATCATTTTTCATGCAAGTCAAAATGCTCAGTTGGACAAGGTAATTTTTCTATTGGGGAATTTAATCATTATGATCTAACTTACTGTAAAGGCACGATCAGAGTTACTTTATCTAGGGATTACATACTGTCAGACCCAGTTACTTTTAATATCTCTCCACAAGTTTCCTCCATAACTATAAACTGATTGTATAGGGTAATCAGC-----AGCCTAATAATAAGAAAGTTATTTAATAGTGCTCTTTTAGTTTGGATGGCTTTTTAATTTAAAGGGAAGAAAATTTTAACTTAACATGGGATGACTTAAAGGATGGAGAAAAACATCCCTTGAACCCCTGTACTTTCGACGATGCTTCTCCATGTTATCATCCTGATGTTACCGAAAACATAAAGAAGCCCTTTCAGAAACCTATGCCAATTCATGTAAGATAACGTGATTGAACAATGGATGTAACACTGCTAGGTTTATTGGGTTCAATGCGACCTCTCTTTAGAAAGAAGATAACGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 502559 510 + 647215 GAGGAGGCTTTTCATATCATTTTTCATGCAAGTCAAAATGCTTAGTTGGACAAGGTAATTTTCCTATTTTCAAATTTAATAGTAGTGATCTAACTTACTGTAAATGTACAAACGGAGTTACCTTGTCTCGGGATTACATACTGTCAGATCCAGTTGCCTCCAATATCTCTCCACAAGTTT-GTCCATAATTAT-------------ATGGCTAACAGCTGTGAAGCCTAATAATAAGTAAGTTATTGGATAGCGCTCTCTTAGTCTGGATGTTTATGTAATTCAAAGGGAAGAAAATTTTAACTTAACATGGGATGACTTACAGGATGGAGAAAAACATCCCTCCAACCCCTGTACTTTCGACGATGCTTCTCCATGTTATCATCCTGATGTTACAGAAAACATCAAGAAGACCTTTCAGAAACCTACACCAATTCATGTAAGAGAGTGTGACTGGACAATGGATATTACACTGCTGAGTTTATTGGATTCAACACGGCCTCTCTCTAGAGAGAAGATAATGTA + +a +s mr.mrrefChr3 49123 109 + 181019 GGGTGCTGCCTCTTCTTTTCTGGGACAGGAGGAACTGACCTTACCTGGGTCAGTCTCTGTTGCACAGGTATTGTATTTGGGTACACTCATTCACCCCTTCAGTTGTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495217 109 + 636262 GGGTGCTGCCTCTTCTTTTCTGGGACAGGAGGAACCGACCTTACCTGGATCAGTCTCTGGTTCACAGGTACTGTATTTGGGTACACTCATTCACCCCTTCAGTTGGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 503069 109 + 647215 GGGTGCTGCCTCTTCTTTTCTGGGACAGGATGAACTGACCTTACCTGGGTCAGCCTCTGTTGCACAGGTATGGTATTTGGGTTCACTCATTCACTCCTTCAGTTATTCC + +a +s mr.mrrefChr3 49232 323 + 181019 TAGAGATAAAGTGACTCAATGCTCACTTCTGAGATACAGAGGTTTGATCATAACACAATGAACATCACCTAGGACAGAGTGACCTCATTCTAGGAAATAGCGTGTACTAAGCAACGAAGTACAGGGTTTGGTAAAAATTCTGAGCACTGCCAGGAACTGTTCTAATAAGAGCAAAATTATTTTAGTCCCATGCGTGGCCACTATTGTATGGTATAGATCTGATAGGTGTAGCCCGTGCTGGCACAGGGAAGACGTTGTGCTATGTAATGCCCGGTCTCATTCACCTGGTGCTCCAGCCCAGGTCACCTTATGTATTATTCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495326 323 + 636262 TAGAGATAAAGTGACTCAATGCTCACTTCTGAGATACAGAGGTTTGATCATAACACAATCAACATCACCTAGGACAGAGTGACCTCATTCTAGGAGACAGTGTGTACTGAGCAACGAAGTACAGGTTTTGGCCAAAATTCTGAGCACTGCCAGGAGCTGTTCTAATAAGAGTGAAATTTTTTTAGTCCCATGCGTGGCCACTATTGTATGGTATAGATCTGATAGGTGTAGCCCGTGCTGGCACAGGGAAGACGTTGTGCTATGTAATGCCCGGTCTCATTCACCTGGTGCTCCAGCCGAGGTTGCCTTATGTATTATTCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 503179 304 + 647215 CAGAGATGGAGCGACTCAATGCTCACTTCTGAGATACGGAGGTTTGATCACAACATAACGAACATTATCTAGGTC-------------------GAATAGCATGTTCTAAGCAAAGAAATACAGGGTTTGGTAAAAATACTGAGCACTACCAGGAACTGTTCTAATGCAAGCAAAGTTATTTTAGTCCCATGCGTGGCCACTATTGTATGGTATAGATCTGATAGGTGTAGCGCGAGCTGGCACAGGGAAGACATTGTGCTATGTAATGCCCGGTCTCATTCACCTGGTGCTCCAGCCCAGGTCACCTTATGTACGATTACTG + +a +s mr.mrrefChr3 49555 83 + 181019 TTCTGATCTCCTGGATGCCGCTGAAGCTCGAATGAGtTTTACCTTCTTCAACAGGATCAACAAAAAAACTTTATAAGGGCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495649 83 + 636262 TTCTGATCTCCTGGATGCCGCTGAAGCTCGAATGAGTTTTACCTACTTCAACAGTATCAATAAAAAAACTTTGTAAGGGCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 507966 83 + 647215 ttcgggtatcctgggtgccgctgaagctccattgagttttcccttcttcaacaggattaacaaaaaaaccttataagggcgGC + +a +s mr.mrrefChr3 49638 5 + 181019 TGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194583 5 - 636262 TGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495732 4 + 636262 TGA-A +s simRat_chr6.simRat.chr6 193453 5 - 647215 CAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 508049 5 + 647215 TGGTG + +a +s mr.mrrefChr3 49643 40 + 181019 TAATTTGCTTCACTGCAGATTGTGATGATGCTTATAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495736 40 + 636262 TAATTTGCCTCCCTGCAGATTCTTATGATGCTTACAATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 193458 40 - 647215 TGGTTTGGTTCACTTCAGAGTGTGACAATAATTATAAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508054 39 + 647215 TTATTTGCTTCA-TGCAGATTATGATGGTGCTTATAATAT + +a +s mr.mrrefChr3 49683 19 + 181019 GTTGACAGCAGCCACGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495776 4 + 636262 GTTG--------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 193498 19 - 647215 GTAAACAGCAGCCACGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508098 4 + 647215 GTTG--------------- + +a +s mr.mrrefChr3 49702 5 + 181019 TGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495780 5 + 636262 TGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508102 5 + 647215 TGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 49707 82 + 181019 TCTCTTGACTAAAACCACCCAGTTTTGTAGTACTACTGCAGTACACAACCTTGTTAGACTGCACTGAACCTATCATTAGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495785 82 + 636262 ACTCTTGACTCTAACCACCCAGTTTTGTAGTACTACTGTAGTGCACTACCTTGTTAGACTGCACTGAACCTATCATTAGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 193517 82 - 647215 TCTCTTGATCAAGGCCAAGCAGTTTTGAAGTACGATTGCAGCACACAACCATGTGAAACTGTGTTGAACCTAACATTAGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508107 82 + 647215 TCTCTTGACTAAAACCACTCAGTTTTGTAGTACTACTGCAGTACACAACCGTGTTAGACTGCACCGAACCTATCATTAGTAC + +a +s mr.mrrefChr3 49789 21 + 181019 ATGACAATGACACGGGTTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495879 21 + 636262 ATGACAATGACATGGGTTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 193599 21 - 647215 GTAACAATGACACAGCTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508189 21 + 647215 AGGACAATGGCACGGGTTCAA + +a +s mr.mrrefChr3 49810 4 + 181019 TTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495900 4 + 636262 TTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 193627 4 - 647215 CCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508210 4 + 647215 TTAA + +a +s mr.mrrefChr3 49814 29 + 181019 GATTGGCTAGAGTGAACTGTCCACATCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194588 29 - 636262 GAATGGCTAGTGTGAACTGTTCATGACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495904 29 + 636262 GATTTGGTAGAGTGGACTATCTACATTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 193631 29 - 647215 GAATGGCTAGTGTGAACTGTCCACATCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 508214 29 + 647215 GATGTGGTAGAGTGAGCTGTCCACATTTA + +a +s mr.mrrefChr3 49843 1 + 181019 G +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495933 1 + 636262 G +s simRat_chr6.simRat.chr6 508243 1 + 647215 G + +a +s mr.mrrefChr3 49844 6 + 181019 AGACGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194617 6 - 636262 AAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495934 6 + 636262 AGAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 193660 6 - 647215 AAACGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508244 6 + 647215 AGTGGT + +a +s mr.mrrefChr3 49850 5 + 181019 TATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194623 5 - 636262 TATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495941 5 + 636262 TATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 193666 5 - 647215 CAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508250 5 + 647215 ATTAG + +a +s mr.mrrefChr3 49855 42 + 181019 CTGTATTTAAAAAAGGAAAAGCTATACAGTAAGTGAAATCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194628 42 - 636262 CTGTATTTAGAAAAGGACAAGTTGTATAGTAAGTTATATCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495946 39 + 636262 TTG---TTAAAAGAAGAAAAGCGATACAATAAGTGGAAACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 193671 42 - 647215 CGGTATTTAGACAAAGAAAAGTTGTAAAGTAAGTCATATCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 508305 42 + 647215 TTGGATTGAAATGAGGAAAAGCCATACAGCAAGTGAAAACAG + +a +s mr.mrrefChr3 49897 60 + 181019 TGAGGATATTCCAATTGTTAAGGCTCTGCCAGGTTCTACATCTGTCATCCTATATAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194679 60 - 636262 TGAGGATATTTCAATAGTTAATTCTCTACCAGGTTCTGCATCTGTAATCATATATAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495985 52 + 636262 TGAGGAAATTCCAATTCTTGAGGCTCTGCCAGGTTCTATGG--------CTATACAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 193713 60 - 647215 TGAGGACATTCCTACAGTGAATGCTCTGCCAGGTTATGCATCTGTGATCCTATATGAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508347 60 + 647215 TGAGGATATTCCAATTCTTGAGGTACTGCCAGGTTCTATATTAGTCATGTTATACAAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 49957 6 + 181019 CAGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194746 6 - 636262 CGGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496037 6 + 636262 CAGCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 193773 6 - 647215 TAGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 508407 6 + 647215 CATTTG + +a +s mr.mrrefChr3 49963 1 + 181019 C +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496043 1 + 636262 C +s simRat_chr6.simRat.chr6 508413 1 + 647215 C + +a +s mr.mrrefChr3 49964 15 + 181019 CCATGTATAATCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194752 15 - 636262 CCATGTATAATCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496044 15 + 636262 CCATGTATGAAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 193779 15 - 647215 CCATGTATAATCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508414 15 + 647215 CCATGTATTATCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 49979 2 + 181019 AT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194767 2 - 636262 AT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496059 2 + 636262 GT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508429 2 + 647215 AT + +a +s mr.mrrefChr3 49981 14 + 181019 CTCTTAGTTATGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194769 14 - 636262 CTACTAATTAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496061 14 + 636262 TTCTTAGTTATGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 193794 14 - 647215 CTGTTAGTTAAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508431 14 + 647215 CTCTTAGTTATGCA + +a +s mr.mrrefChr3 49995 38 + 181019 GTAGAGAGGTGGATCATCAGCAGTTTTTTTGCAGCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194783 38 - 636262 GAAGAGAGGTGGGCCATCAGCAATTTTTTTGCAACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496075 38 + 636262 GTAGATAGCTCAATCATCAGCAGTTTTATTGCAGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 193808 38 - 647215 GAAGAGAGGTAGGCCATCAGCAGTTTTTTTGCAACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 508451 38 + 647215 GTAGATAGCTTGATCATTGGCAGTTTTGTTGCAGTATA + +a +s mr.mrrefChr3 50033 4 + 181019 CAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496113 4 + 636262 CAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 193846 4 - 647215 TGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 508489 4 + 647215 CAAC + +a +s mr.mrrefChr3 50037 5 + 181019 AGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194821 5 - 636262 TGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 193850 5 - 647215 AGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 508493 5 + 647215 AGATG + +a +s mr.mrrefChr3 50042 1 + 181019 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 508498 1 + 647215 A + +a +s mr.mrrefChr3 50043 91 + 181019 TCACATCACAAATGGTCTCTGAGGTAAATGTATCTGGTAGCTTATCTATCAAAGGGTATCCTCTCCTTGCCTAGATATTAACACTAGTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194826 88 - 636262 TCACATCACAAATGGTCTCTAAGGTT---GTAACTGGCAGCTTGTCTATCAAAGGGTATCCTCTCCTTGCCTAGGTATTAACACTAGTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496117 48 + 636262 -------------------------------------------ATCTATCAAAGGGTATCCTCTTCTTGCCTAGAGATTAGCACTAGTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 193855 91 - 647215 TCACATCACAATTGGTCCCTGAGGTAAATATATCTGGTGGCTCATCTATCAAAGGGTATCCTCTCCTTGCCCAGATATTAACACTAGTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 508499 90 + 647215 TTACATCATAAATGGTCTCTGAGGTAAGTGTATCTGGTAATCT-TGTATCAAAGGGTATCCTCTTTTTGCCTAGACATTAGCGCCAGTGGC + +a +s mr.mrrefChr3 50134 9 + 181019 ATGATCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194914 9 - 636262 ACAATCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496165 9 + 636262 ATGATTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 508589 9 + 647215 ATCATCATG + +a +s mr.mrrefChr3 50143 16 + 181019 ACTTGCTACACATACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194923 16 - 636262 ATTTGCAACACCTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496174 16 + 636262 ACTTGCTATGCATACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 196843 16 - 647215 ACTTGCAACACATATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508598 13 + 647215 A--TGCTATGC-TACT + +a +s mr.mrrefChr3 50159 40 + 181019 TTCCTGATTCTTGTTCTCAGGGTTGAAGAGCACGGGGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194939 40 - 636262 CTCCTGATTCTTGTTCCCAGGGAAAAAGAGCATGGGACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496190 10 + 636262 TTC------------------GT------------GGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 196862 40 - 647215 CTCCTAATTCTTGTTCTCATGGTCGTAGAGCACGAGACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508611 22 + 647215 TTC------------------ATTGCAGAGAGCCGGGGTA + +a +s mr.mrrefChr3 50199 1 + 181019 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496200 1 + 636262 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 508633 1 + 647215 A + +a +s mr.mrrefChr3 50200 58 + 181019 TCATCTTTGAATTCCTGATTTCCTTTACATTCAGCTTCTAGAACTAATTCTGGTGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194979 58 - 636262 TCATCCTTGTATTCCCAATTGCCTTTACACTTAGCTTCTAGAACTAACTCTGGTGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496201 58 + 636262 TCATTTTTAAATTCCTGATTTCCTTTACATTCAGCTTGTAGAACTGTTACAGGTGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 196902 58 - 647215 TCATCTTTGAATTCCCAATTGCCTTTACACTCAGCTTCTAGGACTAACTATGGTATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508634 58 + 647215 TCGTTTCTGAATTCCTGAGTTCCTTTGCATTCAGCTTGTAGAACTGTTACAGGTGTCT + +a +s mr.mrrefChr3 50258 13 + 181019 TATCTCAGTAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195044 13 - 636262 TGTCCCACTAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496259 13 + 636262 TATCTCAGTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 196960 13 - 647215 TGGGTCACTAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508692 13 + 647215 TATCTCAGTAATC + +a +s mr.mrrefChr3 50271 7 + 181019 GAAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496272 7 + 636262 GAAGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508705 7 + 647215 GAAGACA + +a +s mr.mrrefChr3 50278 9 + 181019 TATTCCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195057 9 - 636262 CATTCCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496279 9 + 636262 TATTCCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 196973 9 - 647215 TATTCCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508712 9 + 647215 TATTCCCAA + +a +s mr.mrrefChr3 50287 9 + 181019 GATAAGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195067 9 - 636262 GATAAGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496288 9 + 636262 TATAAGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 196982 9 - 647215 GATAAGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 508721 9 + 647215 CATAAGCCC + +a +s mr.mrrefChr3 50296 1 + 181019 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496297 1 + 636262 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 196991 1 - 647215 G +s simRat_chr6.simRat.chr6 508730 1 + 647215 A + +a +s mr.mrrefChr3 50297 51 + 181019 TACCTTAATCATAGTTTGCACATTTTACAACTTCAATTTACAGGTTCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195076 51 - 636262 TAGCTCCATCATAGATTGAACATTTTACCATATCAACTTCCAGGTTCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496298 47 + 636262 ---CATAA-CACACTTGGCACTTTTGACAACTTCAATTCAAAAGTTCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 196992 51 - 647215 TACCTCAATCATAGATTGAACATTTTACTATATCAACTTACAGGTTCATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508731 47 + 647215 ---CCTGG-TAGACTTTGCACATCTGACAACTTCAATTCACAGGTTCATTA + +a +s mr.mrrefChr3 50348 15 + 181019 CTCCAGTCATGGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195127 15 - 636262 CTCCTATCATGGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496349 15 + 636262 CCCCAGACCTGGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 197043 15 - 647215 CTCCTGTCATGGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 508778 15 + 647215 CCCCAGTGATAGAAG + +a +s mr.mrrefChr3 50363 1 + 181019 C +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496364 1 + 636262 C +s simRat_chr6.simRat.chr6 508793 1 + 647215 C + +a +s mr.mrrefChr3 50364 8 + 181019 CAATAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195142 8 - 636262 CAATAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496365 8 + 636262 CAATTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 197058 8 - 647215 TAATAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508794 8 + 647215 CAATAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 50372 7 + 181019 TTTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496373 7 + 636262 TTTAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508802 7 + 647215 TTTAACT + +a +s mr.mrrefChr3 50379 53 + 181019 CACAAGTCATGACCCCAAGTCATGGAAGCCAACAGAAACACATGGGAGCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195150 53 - 636262 ACACAGCCATGGCCCCAATCTGTGGAAGTGAACAGAAACACATGGGAGATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496380 53 + 636262 CACAAGTCGTGACCCCAAGTCATTGAAGCCAACAGAGACACACGGAAACTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 197066 53 - 647215 CACAAGTCATGGCCCCAAGCCATGGAAGTGAACAGAAACACATGGGAGATTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508809 53 + 647215 TACAAGTCATGACCCCAAGTCATTGAAGCCAACAGAAACGCATGGAAACTTGG + +a +s mr.mrrefChr3 50432 13 + 181019 TCAGGAACTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496433 13 + 636262 TTGGGAACTAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 197119 13 - 647215 TCAAGAACCAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 508862 13 + 647215 TCTGGAATTAAAA + +a +s mr.mrrefChr3 50445 6 + 181019 TTTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195203 6 - 636262 TATCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496446 6 + 636262 CTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 197132 6 - 647215 TTCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 508875 6 + 647215 TGTCAT + +a +s mr.mrrefChr3 50451 47 + 181019 CTATCTTAAGCTTAAGGGGTCAAAGGAATAGACCTAGTACCTTAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496452 47 + 636262 ATAGCTTAAGCTTAAGGGGTCAAAGGAACAGACCTAGTACCTTAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 197138 47 - 647215 CTTTCGCAAGCTTAACGAATCAAAGGAATAGACCTAGTACCTTAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 509109 38 + 647215 CTACGTTAAGCTTAA---------GGGGTAGACCTAGAACCTTAGTC + +a +s mr.mrrefChr3 50498 1 + 181019 C +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496499 1 + 636262 C +s simRat_chr6.simRat.chr6 509147 1 + 647215 C + +a +s mr.mrrefChr3 50499 29 + 181019 TGACACCTACACATGAGCTAGCAATTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496500 29 + 636262 TGACACCTACACATGAGCTAGCAATTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 197185 29 - 647215 TGATGCTTACAAATGAGCTTGCAATTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 509148 29 + 647215 TGACACCTACACATGAGCTAGCAATTCAA + +a +s mr.mrrefChr3 50528 17 + 181019 GTGGAAGAAGGTGACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496529 17 + 636262 GTGGAAGAAGGTGACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 197215 17 - 647215 GTGGAGGAAGACGGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 509177 17 + 647215 GTGGAAGAAGGTGACTG + +a +s mr.mrrefChr3 50545 41 + 181019 TTGTAAATATTTTCACAAAGGGCTCCAGAGGTGGATAGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496546 41 + 636262 TTGTAAATATTTTCACAAAGGGCTCCAGAGGTGGATAGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 197254 41 - 647215 GTGGGAACTTTTTCTCAAAGGCGTCCAGAGGCAAATAGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 509194 41 + 647215 TTGTAAATATTTTCACAAAGGGCTCCAGAGGTGGATAGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 50586 2 + 181019 AT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496587 2 + 636262 AT +s simRat_chr6.simRat.chr6 509235 2 + 647215 AT + +a +s mr.mrrefChr3 50588 101 + 181019 TTGTTCTCTCCAGCATTACCTGTACCATTGTAGTACTCTGATAATTACGCCCTTTCATTCTTTACCTTTATTTTTTTGGGTACAAATTCTCCTCTCAGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496589 100 + 636262 TTGTTCTCTCCAGCATTACATGTACCATTGCAGTACTCTGATAATTAAGCCCTTTCATTCTTTACTTTTATTTTTTTGGGTGCAA-ATCCACTCTCAGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 197295 101 - 647215 CTGGTCTCTCAAGCATTACCTGTACCATTGTACTCCCCTGATACTTCCTCTCTTTCATACTTTATCTTCTTTTTTTTAGGTACAAATTCTCCTATCAGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 509237 100 + 647215 TTGTTCTCTCGAGCATTACCTGTACCCTTTTAGTACTCTGTGAATTATGCCCTTTCATTCTTTACCTTTACTTTTTTGGGTACAA-TTCTCCTCTTGGTTC + +a +s mr.mrrefChr3 50689 14 + 181019 TACCTCCTTGCTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496689 14 + 636262 TACCTCCTTGCTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 509337 14 + 647215 TACCTCCTTACTTC + +a +s mr.mrrefChr3 50703 1 + 181019 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496703 1 + 636262 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 197396 1 - 647215 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 509351 1 + 647215 A + +a +s mr.mrrefChr3 50704 6 + 181019 GAAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496714 6 + 636262 GAAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 197397 6 - 647215 GGAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 509352 6 + 647215 GAAGAT + +a +s mr.mrrefChr3 50710 259 + 181019 CTTTAGTAGTCATAGTTGTCTTGGCTATCCAGTTTGGTACCTCTGGGGCCGAGTGATATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAGTTGTTATCTCACTCCTACAACGCTAGTCCGTTTCAGGTGGACTCTCACATATTGAGGATCCAAAGCCACCTGCTATGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCTCTTCGTACTAGAGCATTTGTATATATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496720 259 + 636262 TTTTAGTAGTCATAGTTGTCTTGGCTATCCAGTTTGGTACCTCTGGGGCCGAGTGGTATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAGTTGTTGGCTCCTTCCTGCAACACTAGTCCATTTCAGGTGGGCTCTCACAAATTGAAGATCCAAAGCCACCTGCTATGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCTCTTCGTACTAGAGCATCTGTATACATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 509358 258 + 647215 CTTTAGTAGGCTTAGTTGTCTTTGCCATGCAATTTGTTACCTCTGGGGCCAAGTGA-ATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAATTGCTATCTCACTCCTACAACGCTAGTCAGTTTCAGGTGGACTCTCACATATTGAGGATCCAAAGCCACCTGCTGTGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCCCTTTGTACTAAAGCATTTGTATATATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 50969 73 + 181019 GGATATTATAATTGTAACACCTGGCAGATTAAATGATTTGCAAATGAGTAACTTTGTTAATTTGAAGAATATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 496979 73 + 636262 GGATATTATAATTGTAACACCTGGCAGATTAAATGATTTGCAAATGAGTAACTTTGTTAATTTGAAGAATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 449557 73 + 647215 AGATATTCAAATTGTGATACCTGGCAAATTAAATGATTTGCAGATGAGTAACTTTCTTAATTTGAAGAATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 509616 73 + 647215 GGATATTATAATTGTAACACCTGGCAGACTAAATGATTTGCAAATGAGTAACTTTGTTAATTTGAAAAACATA + +a +s mr.mrrefChr3 51042 26 + 181019 ACTTACTTGGTGTCAGGTCTATCGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497052 25 + 636262 ACTTACTTGGTGTCAGG-ATATCGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 449632 26 + 647215 CCTTACTTGGTGTGAAATCTATTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 509689 25 + 647215 ACTTATTTGGTTTCAGG-CTATCGGA + +a +s mr.mrrefChr3 51068 9 + 181019 GGTTAGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497077 9 + 636262 GGTTATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 449748 9 + 647215 GATTAGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 509714 9 + 647215 GGTTAGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 51077 1 + 181019 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497086 1 + 636262 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 509723 1 + 647215 A + +a +s mr.mrrefChr3 51078 42 + 181019 TCATATCCTCAGAGTGAATGGTTGAGGGTTGGTTACCCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497087 42 + 636262 TGATATCCTCAGAGTGAATGGCTGAGGGATGGTTACCCACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 449757 42 + 647215 TCCTTGCTGCATGGTGTGCAGTTTAGTGTTAATAATACAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 509724 42 + 647215 TCATATCCTCAGAGTGAATGGTTGAGGGTGGGTTACCCATTA + +a +s mr.mrrefChr3 51120 24 + 181019 GTTGGCCATAGTAGCTGTTTAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497129 24 + 636262 GCTGGCCATAGTAGCTGTTTGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 449800 12 + 647215 TTTG------------ATATAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 509766 12 + 647215 GTTG------------GTTTAATA + +a +s mr.mrrefChr3 51144 9 + 181019 GTCTGTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497153 9 + 636262 GGCTGTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 509778 9 + 647215 GTCTGTTAA + +a +s mr.mrrefChr3 51153 21 + 181019 GATAGGAATATAACGCTGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497162 21 + 636262 GATAGGAATATAACGTGGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 509798 21 + 647215 GATAGGAATATAACACTGTCT + +a +s mr.mrrefChr3 51174 78 + 181019 CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCATATAAGGCACTTCTAAAGTCAGAAGCCTGAACAAAGGAGACTCCTCATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497183 78 + 636262 CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCTTATAAGGCACTTCTAAAGTCAGAAGCCTGAACAAAGGAGACTCCTCATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 509838 78 + 647215 CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCATACAAGGCACTTCTAAAGTCAGCAGCCTGAGCATAGGTGACCCCTCGTACA + +a +s mr.mrrefChr3 51252 28 + 181019 TCATATTGTATCCCACTAGTTTACAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497263 28 + 636262 TCATATTGTATCCCACTAGTTTACAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 509916 28 + 647215 TCATATTGTAACCCACTAGTTTACAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 51280 365 + 181019 TGTCATACTCAAGAGACAAAACTTTAGAAATGAGAGTTTTCAGAATTAGACCTGTAACTTCGTGCTACCTCACGACAACTCAGCAGCACCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGGAAGTTAATGTAGACGGGAAACTAACTTGTACACCTGCAAAATGAATACACATTCTTACACAGTACCTTGTTGTACCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTGGACATTATGAAGCCCTTAATTTGAAGCTTCAGGCAATTTGAGGATTAGATAATACAACCAGAAaatgggcaaggtctctgattcactttgcacacgggagaaatggtacttc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497293 365 + 636262 TGTCATACTCAAGAGACAAAACTTTAGAAATGAGAGTTTTCAGAATTAGACCTGTAACTCCATGCCACCTCACGACAACTCAGCAGCACCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGGAAGTTAATGTAGACGGGAAACTAACTTGTACACCTGCAAAATGAATACACATTCTTACACAGTACCTTGTTGTACCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTGGACATTATGAAGCCCTTAATTTGAAGCTTCAGGCAATTTGAGGATTAGATAATACAACCAGAAaatgggcaaggtctctgattcactttgcacacgggagaaatggtacttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 509944 365 + 647215 TGTCATACTCAAGAAACAGAGCTTTTGAGATGAGATTTTTTGGAATTGGATCTGTAACTTCGTGCTACCTCATGACAACTCAGCAGCTCCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGATAGTTGATATAGACAGGAAACTAACTTGTATACCTGCAAAATGTATACACTTTCTTACACATTACTTTGATGTTCCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTACTCATTATAAAGCCCTTAATTTGAAGCTTTAGGCAATGTGAGGATTAGATAACACAATCAAAAagtgggcaagacctctgattcactctgcacatgagaaagatgTTACGCC + +a +s mr.mrrefChr3 51645 85 + 181019 tgagggtggcgttccgcccacagactctactaccccactgctgggtgcccctgggttcttttttgaaggattCATAGTGGTAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497712 85 + 636262 tgagggtggcgttccgcccacagactctactaccccactgctgggtgcccctgggttcttttttgaaggattCATAGTGGTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 510309 85 + 647215 TgagggtggcattccgcccacagagccacctaccccattgcttggtgtccctgggttctctttgAAGGGATCTATAGTGGTAGTT + +a +s mr.mrrefChr3 51730 50 + 181019 GAAGATATGGTCAATGTGAATAAAAGGCAGTGGTCATGTACACGTGATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497798 50 + 636262 GAAGATATGGTCAATGTGAATAAAAGGCAGTGGTCATGTACACGTGATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 510394 50 + 647215 GAAAATATGGTCAATGAGAATAAAAGACAGCGATCATGTACATGTGGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 51780 133 + 181019 GTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCGCTTGACAAGATGTCAACCGATCACAGAAGATGTCTGCCCACCTCATGGAAGAGGTTTGTCATGCATAGTTCCCCCTGCATGTTACTATTACTAGACCTTACTGACGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497848 133 + 636262 GTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCGCTTGACAAGATGTCAACCGATCACAGAAGATGTCTGCCCACCTCATGGAAGAGGTTTGTCATGCATAGTTCCCCCTGCATGTTACTATTACTAGACCTTGCTGATGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 510445 133 + 647215 ATGCTTGACTATGAGCCTGCCCTGCTTGATGAGACGTCAAGCAATCACAGAAGTTGTCTGCCCGCCTCATGCAAGAGGTTTATCCTGCATAACTCCCCCTGCATATTACTATTATTAGGCCTTACTAACGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 51913 111 + 181019 CTAAAGTTGAATGTTCTAACATACCTATACTCTCTTCCCTCCTACTAGAGTTATCAGTTATGCAGAGTTGCTTGGGACTCGACATTACCCTTATGCATCTGGCTTGTTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 497981 111 + 636262 CTAAAGGTTAATGTTCCAACATACCTATACCCTCTTCTCTCCTACTAGAGTTATCAGTTCTGCAGAGTTGCTTGGGACTCGACATTACCTTTATGCATCTGGATTGTTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 510579 109 + 647215 CTAGAGTTGAATGTTCTAACATACCTATACTCTCTTCCCTCCTACTGGAATTATTGGTCAT--AGAGTTGCTTGGGATTGGACATTACCCTTATGCATCTGGCTTGTTTAG + +a +s mr.mrrefChr3 52024 329 + 181019 TTCAGCCACAATGTTAGTTGTGAGTATTTAGGTGCATTATTCCTGGTTAAGGATCTGCAATTTTGTTAAGGTCTTACTGTATGAGAGATATTTGAGGGTACCAAGCACTGAGCACCCATCGGACCTTTTGGCGGTGTATAGACCATGGTGACTCTCTTGGGTGTGATGTGTGTTGTAATTTAAACAAATTTGAAGCTAGCTGCCTGTTCTCTTATTCAGGGCTGTTAGTCTAAGTCTGACAATTAAAATTAGGACTAAATAGATGTCTCTTCTAACTTTGATTTGGGAATTGACTAATTTTTTGGGATTACACTTGATCAGGCTAGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498098 329 + 636262 TTCAGCCACAATGTTCGTTGTGAGTATTTAGGTGCATTATTCCTGGCTTGGGATCTGCAATTCTGTTAAGGCCTTACTGTATGAGAGATATTTGAGGGTGCCAAGCACTGGGCCCCCAACGGACCTTTTGGCGGTGTAGAGACCATGGTGACTCTCTTGGGTGTGATGTGTGTTGTAATTTAAACAAATTTGAAGCTGGCTGACTGTTCTCTTATTCAGGGCTGTTAATCTAAGTCTGACAATTAAAATTAGGACTAAATAGATGTCTCTTCTAACTTTGATTTGTGAGATGACAAATTTTTTGGAATTACCCTTGATCAGACTAGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 510688 316 + 647215 ATCAGCCACAGTGTTAGTTGTGAGTATTTAGGTGCACTAATCCTGGTTAAGGATCTGCAATTTTGTTAAGATCTTACTGTAT-------------GGGTACCAACAACTGAGCACCCATTGAGCATTTTGGCAGTGTGTAGACCATGATGATTCTCTTGGGTGCACTGTGTGTTGTAATTTATACAAATTTGAAACCAGCTGCCTGTTCTCTTATTCAGGGCTGTTAGTCTAAGTCTGACAATTAAAATTAGGACTAAATAGATGTTTCTTCTAACTTAGTTTTGGGGATTCACTAATTTTTTGGGACTACACTTGATCAGGGCAGGCC + +a +s mr.mrrefChr3 52353 7 + 181019 ATTATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498427 7 + 636262 ATTATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 511011 7 + 647215 ACTACGT + +a +s mr.mrrefChr3 52360 234 + 181019 TGACAGTCAGTAGATAGGTTGTATTGTTGATATGGGTTCTGGTGGAGGAGTCTAAACAACTCAAAGGAGGTTTTGGATGACGCGAAAAGGATGTTAGAGATGGGTTATAAACCCCAAGTAATGAGGATTCTATTAGATGTATGTCCAGACAAACAAGCATTGATGACCAGGTTGGAAATCACAAACAGGCATTGACATGACCAGGTTGGGAATTGCACTTCCCTAAGTGCTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498434 234 + 636262 TGACAGTCCACAGAAAGGTTGTATTGTTGATATGGGTTCTGGTGGAGGAGTCTAAACAATTGAAAGGAGGTTTTGGATGACGCGAAAAGGATGTTAGAGATGGGTTATAAACCCCAAGTAATGAGGATTCTACTAGATGTATGTCCAGACAAACAAGCATTGATGACCAGGTTGGAAATCACAGACCAGCATTGACATGACCAGGTTGGGAATTGCACTTCCCTAAGTGCTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 511022 234 + 647215 TGACAGTCAGTAGATAGATTGTATTGTTGATATGGGTTCTGGTGGAGGAGACTAAGCAACTCAAAGGAGGTCTTGGAGGACGCAAAAAGAATGTTAGAGATGGGTTACAAACCCCAAGTAATGAGGATTCTATTAGACGTATGTCCAGACAAGCAAGCATTGATGACCAGGTTGGAAATCACAAGCAGACATCAGGATGATCAGACTGGGAATCGCACTTCCCTAACTGGTATG + +a +s mr.mrrefChr3 52594 71 + 181019 ACTATGAAGATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTCGCCTTTTGCTTTGTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498670 71 + 636262 ACTATGAAGATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTCGCCTTTTGCTTTGTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 511256 71 + 647215 ACTGTGAACATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTTGCCTTTTGCTTTATTGA + +a +s mr.mrrefChr3 52665 10 + 181019 AAAGTGTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498743 10 + 636262 GCAGTGTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 511327 10 + 647215 AAAGTGTAAG + +a +s mr.mrrefChr3 52675 63 + 181019 CAGGTCTTGGGGCAATATTAGGAGGTTAATAAACTTTTGTTATAATCTCGAGTGCATAGTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498753 31 + 636262 CAGGTC--------------------------------GTTATAATCTCGAGTGCATAGTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622335 31 + 636262 CAAGTC--------------------------------GTTATAATCTCGAGTGCATAGTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 511337 63 + 647215 CAGGTTTTGGGGCAATATTAGGAGGTTAATAAACTTTTATTATACTCTTGAAGGTATAGCGAG + +a +s mr.mrrefChr3 52738 48 + 181019 ATAATGCAGAAATGGACCCCATCACCCATCAGACCAGATAACCCTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498784 48 + 636262 ATAATGCAGAAATGGACCCCATCACCCATCAGACCAGATAACCCTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622366 48 + 636262 ATAATGCAGAAATGGACCCCATCACCCATCAGACCAGATAACCCTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 511403 48 + 647215 ATAATGCAGAAATGGACCCCTTCACCTATCAGACCAGATAATCCTAAA + +a +s mr.mrrefChr3 52786 194 + 181019 CCCTTTCCAATTGGTGAATACTTTTCCACTATATTAAGGTGTCACTAATAGGTACACGTGCCAATATTCTATACTACCAGTAGGGATAAGGAAGGCAGGCAACCAATTGCCTTCTATTTGCACACTTGCTTACTGAGACCTGTAGTCCTTATTTAGATGATTCTCTCATGGGCTAGGGAGGTTGGCCCAGCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 498832 194 + 636262 CCCTTTCCAATTGGTGAATACTTTTCCACTATATTAAGGTGTCACTAATAGGTACACGTGCCAATATTCTATACTACCAGTAGGGATAAGGAAGGCAGGCAACCAATTGCCTTCTATTTGCACACTTGCTTACTGAGACCTGTAGTCCTTATTTAGATGATTCTCTCATGGGCTAGGGAGGTTGGCCCAGCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622414 194 + 636262 CCCTTTCCAATTGGTGAATACTTTTCCACTATATTAAGGTGTCACTAATAGGTACACGTGCCAATATTCTATACTACCAGTAGGGATAAGGAAGGCAGGCAACCAATTGCCTTCTATTTGCACACTTGCTTACTGAGACCTGTAGTCCTTATTTAGATGATTCTCTCATGGGCTAGGGAGGTTGGCCCAGCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 511454 194 + 647215 CCCTTTCCAATTGGTGAATACTTTTCCACTATTTTAAGGTGTCCCTAACAGGTATACATGCTAATGTTCTATATTACCTGTAGGGATAAGGAAGGCAGCCAACTAATTGCCTTCTACTGGCACACTTGCTTACTGACACCTGTAGTCCTTCTTTAGACGGTTCACCCATGGGGCAGGGAGATTGGGCCATCCCT + +a +s mr.mrrefChr3 52980 9 + 181019 AACCCTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 499026 9 + 636262 AACCCTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622608 7 + 636262 AAGGC--TC +s simRat_chr6.simRat.chr6 511649 9 + 647215 AACCCTTTC + +a +s mr.mrrefChr3 52989 274 + 181019 GAACTGGTGAACACTCCTCCATTATCTTAAGACATATATTGTTTCACTTATGCTATTGCCTATTGCAAAAGTCTTTGTATGTACAGCTAGTTAAGAACTAATTGCAGGGCAATGCGGATCTATGAAACTTTCCTCCATTTCACACTCTGCCAGTGTTTTATTCTCTTATTTGCAATAACCACATCCAGTTAACAAGTCAGTCTGTGACGACCACATAAAGTTGACACATGGTCATGGAAATGAGGACAAACCCCGCAATTCTAATACACTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 499035 269 + 636262 GAACTGGTGAACACTCCTCCATTATCTTAAGACATATATTGTTTCACTTATGCTATTGCCTATTGCAA----CTTTGTATGTACAGCCAGTTAAGAACTCATTGCCAGGCAATGCGGATCTATGGAACTTTTCTCCACTTCACACACTGCCAGTATTTTA-TCTCTTATTTGCAATAACCACATCCAGTTAATGAGTCAGTCTGTGACGACCACATAAAGTTGACACATGGTCATGGAAATGAGGACAAACCCCGCAATTCTAATACACTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622615 18 + 636262 AAAT-------AACTCCTAC-------TGATA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 511669 274 + 647215 CAACTGGTGAACACTTTTCCACTATCTTAAGCCATATTTGGTTTCAGTTATACTATTGTCTATTGCAAAAGTCTTTGTATCTACAGTTAGTTAAGAACCAATTGCAGGGCAATGCTGTTCTCTGAGACTTTCCCCCATTTGACACTCTGCCAGTGAGTTATTCTCTTATTAGCAATAACCACATCCAGTTTACAAGCCAGTCTGTGATGACTGGATAAAGCTAACACATTGTCATGGAAATGAGGAGGAAGCCCGCAATTCTAATCCACTTCCA + +a +s mr.mrrefChr3 53263 311 + 181019 TCAGGGATGGTATATGACACCCTCAGCAAGTCACATAGGTTAGCTCATTGGGCATATGCAGAGAAAACAGATCTGATCAAACCCTGTCTTAGGGAGGAGGGTAAAATATTCCTGTAGTCACACCCTTTGGGGGAGTTGTTTCACTGCAATTGGAGGATTGTCTAAGTGGAGTCCTTCCTAAAACAAAACGCAGATGCAAAAATGGACATAGGGTTACAATGGCACCAAATCATTTAATGTCTAACAATTAAATATGTCAGACTCTGTACCTATGGTCACTCATAAGAAGAGAGCCAAGTGTAAATTTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 499329 311 + 636262 TCAGGGATGGTATATGACACCCTCAGCAAATCTCATAGGTTAGCTCCTTGGGCATATGCAGGGAAAACAGATCTGATCAAACCCTGTCTTAGGGAGGAGGGTAAAATATTGTTGTAGCCACACCCTTTGTGGGAGTTGTTTCACTGCAATTGGAGGACTATCTAAGTGGAGTCCTTCCTAAAACAAAACACAGATGCAAAAATGGACATAGGGTTACAATGGCACCAAATCATTTAATGTCTAACAATTAAATATGTCAGACTCTGTACCTATGGTCACTCATAAGAAGAGAGCCAAGTGTAAATTTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500913 114 + 636262 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAAAATGGACATAGGGTTACAATGGCACCAAATCATTTAATGTCTAACAATTAAATATGTCAGACTCTGTACCTATGGTCACTCATAAGAAGAGAGCCAAGTGTAAATTTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 511943 305 + 647215 TCAGTGATGGTATTTGACACCCTCATCAAGTCACATAGGTTAGCTTATTGGGCAGATGCTGAGAAGGCAGATCTGATCATACCCTGTCTTAGGGAGGAGGGTAAAATATCCCTGTGGTCAGACCCTTTGGGGGAGTTGTTTCACTGCATTTGGA-TATTGTCTAAGTGGAGTCCTCCCTAAAACAGAATGCAAATGCACAAATAGACATGAGGTTACAATGACACCGAATCGTTTAATGTCTAACTGTTAAATACATGAGACCCTGTACC-----TCACTCATAAGAAGAGAGCCAAGTGTAAATTTTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 53574 390 + 181019 GGACGCATTTTTGGCCACATACCCTGTGCCCTAGCACCTTACTGTACCAAATTTGTCTTTAAAAATGTGGTTATATTATTACTGGAATATCCTAGCTACGTGCTGACTTCTATTGTGCTTTAGTAAAGCTCTGGCTGCGGACACCTATCATGCTGAGTGGTTTAGTAAAGCTTTTTGGAATAAATTTCATCATGTTTCCTGCTAAGTTCGCCCTATGTCCACATGTACTAGTACAAAAACAGACCTATGAAAAAGATCCAAAAGGATTGCAGACCATTCCAGTCAAGGAGAATCATTTTTAAAGGAGTTAAAAATATACTTTGGTATTATTAAGATGATATGAGCAATACTTACCCTAGGACCCTGTTTGTGTGATTAGAATCCCATACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 499640 378 + 636262 GGACGCATTTTTGGCCACATACCCTGTGCCCTAGCACCTTACTGTACCAAATTTGTCTTTAAAAATGTGGCTATATTATTACTGGAATATCCTAGCTACGTGCTGACTTCTATTGTGCTTTAGTAAAGCTCTGGCTGCGGACACCTATCATGCTGAGTGGTTTAGTAAAGCTTTTTGGAATAAATTTCATCATGTTACCTGCTAAGTTCGCCCTATGTCCACATGTACTAGTACAAAAACAGACGTATGAAAA------------ATTGCAGACCATTCCAGTCAAGGAGAATCATTTTTAAAGGAGTTAAAAATATACTTTGGTATTATTAAGATGATATGAGCAATACTTACCCTAGGACCCTGTTTGTGTGATTAGAATCCCATACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501027 378 + 636262 GGACGCTTTTTTGGCCACATACCCTGTGCCCTAGCACCTTACTGTACCAAATTTGTCTTTAAAAATGTGGTTATATTATTACTGGAATATCCTAGCTACGTGCTGACTTCTATTGTGCTTTAGTAAAGCTCTGGCTGCGGACACCTATCATGCTGAGTGGTTTAGTAAAGCTTTTTGGAATAAATTTCATCATGTTTCCTGCTAAGTTCGCCCTATGTCCACATGTACTAGTACAAAAACAGACCTATGAAAA------------ATTGCAGACCATTCCAGTCAAGGAGAATCATTTTTAAAGGAGTTAAAAATATACTTTGGTATTATTAAGATGATATGAGCAATACTTACCCTAGGACCCTGTTTGTGTGATTAGAATCCCATACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 512281 368 + 647215 AGATGTATTTTTGATCAGATACAATGTGCCCTAGCAC---------CCAGATGTGCCTTTAAAAATGTGGTTATATATTTACTGAACTGTTCTAGTTGGGTGCTGACATCTATCATAGTTTAGTAAAGCTCTGGCCACTGACACCTATCATGCTGAGTGGTTCAATAAAAC-TTTTGGAATAAATTTCATCATGTTTCCTGC------------ATGTCCACTTGTACTAGTCCATGAACATACCTTTGAAAAAGATCCAAAAGGGTTGCAGCCCACCCCAGCCAAGGAAAATCATTTTCAAAGGAGTCAAAAATATACTCTGGTATTATTGAGATGATATAAGAAATGCCCACCCTAGGACCCTGTTTGTGTGATCAGAATCCCATACT + +a +s mr.mrrefChr3 53964 303 + 181019 TAAAAGGTCTACCATTTGCAGATTTAAGGTAAGTGCCTAAGTTGAGACAGTatggctgttaaaaattagtctcccagctatccaattacttgatgtttgagcaaaatccttcagtgggctatgagtttgaacttgaccctttaggcccagagttcattattcaataaatgatactgggggaaccgggttatctgtccatcaagagtttaaatttgatactttttcttaaacacccgatgtgttttatactaagattaagaccatatgcaagcggactaaagatgtaaattcttgttcctcaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500018 303 + 636262 TAAAAGGTCTACCATTTGCAGATTTAAGGTAAGTGCCTAAGTTGAGACAGTatggctgttaaaaattagtctcccagctatccaattacttgatgtttgagcaaaatccttcagtgggctatgagtttgaacttgaccctttaggcccagagttcattattcaataaatgatactggaggaaccgggttatctgtccatcgagagtttaaatttgatactttttcttaaacacccgatgtgttttatactaagattaagaccatatgcaagcgcactaaagatgtaaattcttggtcctcaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501405 303 + 636262 TAAAAGGTCTACCATTTGCAGATTTAAGGTAAGTGCCTAAGTTGAGACAGTatggctgttaaaaattagtctcccagctatccaattacttgatgtttgagcaaaatcctttagtgggctatgagtttgaacttgaccctttaggcccagagttcattattcaataaatgatactgggggaaccgggttatctgtccatcaatagtttaaatttgatactttttcttaaacacccgatgtgttttatactaagattaagaccatatgcaagcggactaaagatgtaaattcttgttcctcaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 512650 299 + 647215 GAAGACATCGACCATTTGCGGAGTTAAGGAAAGTGCCTAAGTCGAGACAACATGGCTGTTGAAGTTCAGTCTcccaactattcaattacttgatgtttaaggaaaatccttcagtgggctatgagtttgaacgtgaccc-ttgggcccaaagtgcattatccaataaatgatgctggtggaact-ggttatctatccaccaacagtttaaatttgctcc--tttcttatacaccctatatgttttataccgagattaagaccatgtgcaagtggactaaagatgcgaattcttgttcctcaaa + +a +s mr.mrrefChr3 54267 7 + 181019 gagtaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500321 7 + 636262 gagtaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501708 7 + 636262 gagtaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 512951 7 + 647215 gagtaaa + +a +s mr.mrrefChr3 54274 19 + 181019 aggacagaagaattgtcta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500328 19 + 636262 aggacagaagaattgtcta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501715 19 + 636262 aggacagaagaattgtcta +s simRat_chr6.simRat.chr6 512998 19 + 647215 aggacagaagaattgccta + +a +s mr.mrrefChr3 54293 26 + 181019 tcctgaagctgtcaaaatcaatggca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500347 26 + 636262 tcctgaagccgtcaaaatcaatggca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501734 26 + 636262 tcctgaagctgtcaaaatcaatggca +s simRat_chr6.simRat.chr6 513019 26 + 647215 cactgaagatgccaaagtcaaaggca + +a +s mr.mrrefChr3 54319 76 + 181019 gttaaacccacaatccacaagaatgtgaatgtacacatttaaagacgccatgtaggttacaagaagagaagtctTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500373 76 + 636262 gttaaacccacaatccacaagaatgtgaatgtacacatttaaagacgccatgtaggttacaagaagagaagtctTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501760 76 + 636262 gttaaacccacaatccacgagaatgtgaatgtacacatttaaagacgccatgtaggttacaagaagagaagtctTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 513046 76 + 647215 gttcaacccataatccacaagaatgtgaatgtacacaatcaaagaggccatgtgtattacaagaagagaagtctTG + +a +s mr.mrrefChr3 54395 69 + 181019 AAAGCATATTGTAAGATAAGATGTGCCCAGTGCCCAATTATCTTTTGGGTTTTAATCACTGTGATGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500449 69 + 636262 AAAGCATATTGTAAGATAAGATGTGCCCAGTGCCCAATTATCTTTTGGGTTTTAATCACTGTGATGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501836 69 + 636262 AAAGCATATTGTAAGATAAGATGTGCCCAGTGCCCAATTATCTTTTGGGTTTTAATCACTGTGATGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 513127 40 + 647215 AAAGCATATTGCAAGGTA------------TGCCCAGTCATCTTTTGG-----------------GGAT + +a +s mr.mrrefChr3 54464 285 + 181019 TCGCTGTGACACTGGTCTGAATGCATCTACCTCTGAGGAAACAAATGGTTATTGTTGCATAAATAGTTAATTGACCCTACTTTTTGACCCTAGCTACCTTAGTTATCCATAGCTTTTAATAGCATGAGTCAAGAATCGGGGGTTATTTGGGATGGAAGTAGTTGGTTTCAGATCCTATGGCAAAAAAGTAAGGTGTGGGAGCCGCAATGTATGTTAGGTGCCACCCAAATCTACCGTGTGCCACATACAGCATGACAACTATTGAATAGCAACACAACTTCACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500533 283 + 636262 TCGCTGTGACACTGGTCTGAATGCATCTACCTCTGAGGAAACAAA--GTTATTGTTGCATAAATAGTTAATTGACCCTACTTTTTGACCCTAGCCACCTTAGTTATCCATAGCTTTTAATAGCATGAGTCAAGAATCGGGGGTTATTTGGGATGGAAGTAGTTGGTTTCAGATCCTATGGCAAAAAAGTAAGGTGTGGGAGCCGCAATGTATGTTAGGCGCCACCCAAATCTACCGTGTGCCACATACAGCATGACAACTATTGAATAGCAACACAACTTCACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 501905 283 + 636262 TCGCTGTGACACTGGTCTGAATGCATCTACCTCTGAGGAAACAAA--GTTATTGTTGCATAAATAGTTAATTGACCCTACTTTTTGACCCTAGCTACCTTGGTTATCCATAGCTTTTAATAGCATGAGTCAAGAATCAGGGGTTATTTGGGATGGAAGTAGTTGGTTTCAGATCCTATGGCAAAAAAGTAAGGTGTGGGAGCCGCAATGTATGTTAGGTGCCACCCAAATCTACTGTGTGCCACATACAGCATGACAACTATTGAATAGCAACACAACTTCACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 513167 246 + 647215 TTGCTGTAACACCGATCTGACTGTTTCAACCTTTGTGGAAAAGAATGGTTGTCATTGCAC--ATCGTTAATTGACTCTAGTTTTTGAGCTTAGCTACCTTAGTTATTCATACCTTTCAATAGCATGAGTCAAGAACTGGGGGTTATTCAGGGTGAAAGTACTAGGTTTCTGATCCTAAGCCAA-------------------------------------TCGCCCAAGTCTGCCTTGTGTCACATGCTGCATGACAAGTATTGAATATCAACACATCTCCACCA + +a +s mr.mrrefChr3 54749 97 + 181019 AGTCCACTGTGGGTCCAACAGAGTGTAATACTCCCCACAACAGTTTTAGGGACCATCCACTTTCAAGTGCAAAATGTGGAAGGATGTCTCAATACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500816 97 + 636262 AGTCCACTGTGGGTCCAACAGAGTGTAATACTCCCCACAACAGTTTTAGGGACCATCCACTTTCAAGAGCAAAATGTGGAAGGATGTCTCAAGATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502188 97 + 636262 AGTCCACTGTGGGTCCAACAGAGTGTAATACTCCCCACAACAGTTTTAGGGACCATCCACTTTCAAGTGCAAAATGTGGAAGGATGTCTCAATACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 513414 97 + 647215 AGTCCACTGTGGGTTCACCACAGTGTAATACTCCCCGCAAGAGTTTGAGAGACCATCCACTTTCTAGTGCGAAACGTGGAAGGATGTCTCAATACTG + +a +s mr.mrrefChr3 54846 9 + 181019 TCTTACCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502285 9 + 636262 TCTTACCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 513511 9 + 647215 TCTTACCCT + +a +s mr.mrrefChr3 54855 11 + 181019 TTCTCCCATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502295 11 + 636262 TTCTCCCATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 513520 11 + 647215 TCCTCTCATGA + +a +s mr.mrrefChr3 54866 274 + 181019 CATTTTTGTCCACCTCCATGTGCTATTAACTATGTCAGCACTTATCATCAGATACATACTTCTAGTGGAGTTATACTGGATTCTAATATTTATAGGGGAGTTTAATATTGCTAATTTCTATTGGCCCTGAGTGTGATTTCTCTGGCCCCCTTGGTGCCCACTTAGTATGCTACTAAATAAAGAGGCTGAGAGACAGCTCGATGTGATTTGGACCTCAATAAGTCTTCTTTGTTTGCATAGTCGTTAATAACTCTCTCACCACATTGTTGCCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502309 274 + 636262 CATTTTTGTCCACCTCCATGTGCTATTAACTATGTCAGCACTTATCATCAGATACATACTTCTAGTGGAGTTATACTGGATTCTAATATTTATAGGGGAGTTTAATATTGCTAATTTCTATTGGCCCTGGGTGTGAGTTCTCTGACCCCCTTGGTGCCCACTTAGTATGCTACTAAATAAAGAGGCTGAGAGACAGCTCAATGTGATTTGGCCCTCAATAAGTCTTCTTTGTTTGCATAGTCGTTAATAACTCTCTCGTCACATTGTTGCCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 513531 274 + 647215 CATTTTTGTCCACCTCTATGTGCTATCAGCTATGTCAGCACTTATCATCAGATACACACTCCTGGTGGAGTTATACTGTATTCTAATCTTTATGGGGGAGTTTAATATTGCTAATTCCTATTGGACCTGAGAGTGATTTCTCTGGCTCCCTTGGTGCCCACTTAGTATGCTACTAAATACATAGGCTGAGAGACAGCTCGATGAGATTTGGACCTCAATAAGTCTTCTTTGTTTGCATAGTCTCTAATAACTCTCCCACCACGTTGTTTCCACC + +a +s mr.mrrefChr3 55140 146 + 181019 CCAGTAATCTACTGCAGCATTGGGTAAATCTCGGTCTGGAAGTGTCACAACTATTGGGATCATAGTTAGAATGACTGGATGTTAACAGCTTAACCTGACTGTGCTTTACTGAGTTTGTATTTATTTATTCAGATCAAGGGTTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502591 146 + 636262 CCAGTAATCTATTGCAGCATTGGGTAAATCTCGGTATGGAAGTGTCACAACTATTGGGATCCTAGTTAGAATGACTGGACGTTAACAGCTTCACCTGACTGTGCTTCACTGAGTTTGTATTTATTTATTCTCATCAAGGGCACCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 513805 146 + 647215 CCAGTATTCTGCTGCAGCATTGGGTAAATCTCGGTCTGGAAGTATCACAACTATTAGGATCATAGTTAGAATGACTGGATGTTGATAGCTTACCATTACTGTGCTTTATCGAAGTTTCTCCCATGGATACAGATTACCAGTTTCCA + +a +s mr.mrrefChr3 55286 130 + 181019 CTTACCCTGGCTTGAGGAGCTAATTGAATTGTATTGTGGCACTTTAGATTGCTAGAACTTCAAAGAATCTGTCAAGACCATACTTGAAAAGGGAAGAGGGTGCAGTATGCACCAATCCATAAGTCAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502748 130 + 636262 CTTGCCCTGGCTTGAGGAGCTAATTGAATTGTATTGTGGCACTTTAGATTGCTAGAACTTCAAATAATCTGTCAAGACCAAGCTGGAAAAGGGAAGAGGGTGCTGTATGCACCAATCCATAGGTCAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 513951 130 + 647215 CTTACCCTGGCTTGAGGAGCTAATTGAATTGTATCGTAGCACCTTAGATTGCTAGATCTCCAAAGAATCTGTCAAGACCATACTTGAAAGGAGAGAAGGGTGCACTATGCACCGATTCATAAGCAAATTA + +a +s mr.mrrefChr3 55416 149 + 181019 ATGTATATCTCATATAGAATATATGACTCTGCAAATGGAAGTCAAAAAATTAGGGGCAGTCCTGCGCATCAAGGACTCCCACGAACTATGGGAACTATGAGAGATGAGAGAAACAAGCCACATTGGTGACTACCTGAGCCTTATAGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 502878 149 + 636262 ATGTATTTCTCATATAGAATACATGAATTCGCGAATGGAAGTCAAAAAATTAGGGGCAGTCCTGCACATCAAGGAATCCCACGAACTATGGGAACTATGAGAGATGAGAGAAACAAGCCACATTGGTGACTACCTGAGCCTTATGGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 514103 149 + 647215 ATGTATATCTCTTGTAGAATATATGACTCTGCAAATGGAAGTCAAGAAATTAGGGGCAGTCCTGCGCATCAAGTACTCCCACAAACTATGGGAATTACAGGAGATGAGAGAAACAAGCCACATTGGTAACTACCTGAGCCTTATAGGAT + +a +s mr.mrrefChr3 55565 6 + 181019 TTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503027 6 + 636262 TTGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 514256 6 + 647215 TTTACA + +a +s mr.mrrefChr3 55571 55 + 181019 GTTGTCACACTTGGCTAAAGTTGGGATTGAACATGTCTTAAGGATTACAGTGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503033 55 + 636262 GTTGTCACACTTGGCTAAAGTTGGGATTGAACATGTCTTTAGGATTACAGTGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 514274 55 + 647215 GTTGTCACACTTGGCTAAAGTTAGGATTGAACACGTCTTAAGGATTACAATGTCC + +a +s mr.mrrefChr3 55626 36 + 181019 CCACAAGTTGACCTACATGCATTGCATTTTGCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503123 36 + 636262 CCACAACTTGACCTACATGCAGTGCATTTTGCAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 514329 35 + 647215 CCACAAGTTGA-CTACATGCATTGCATTTTGCCAAA + +a +s mr.mrrefChr3 55662 39 + 181019 CCCAATTCTACTGAACAAGATATATACAGTGTTTTAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503161 23 + 636262 GCCAATTCTACTGAACAAGATAT---------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 514364 39 + 647215 CCCAATTCTACTAAGCAAGATATATACAGTGTTTTAACA + +a +s mr.mrrefChr3 55701 248 + 181019 CTCTTAGACCTGACACCAGTGTTCCTCCTCAGTGTCTCACACAATCTTATTTAAAAGAGCCCATGATGGTTTATGTTGGGACTTTGGATCATATAGTCTAGGTGAAGGAATTTGCCTACTTCAGCTGTATACCTATTAGTTTTTGTTTATTGTGTACTTTGGAGAATGTGGATTTCTTTGGAAAATTTTAAACTTTTGAGAATCACTATCAGTAGTAGGTACCCATGGTCCACATCAGCCCACATGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503184 248 + 636262 CTCTTAGACCTGACACCAGTGTTCCTCCTCAGTGTCTCACACAATCTTATTTAAAAAAGCCCATGATGGTTTATGTTGGGACTTTGGATCATATAGTCTAGGTGAAGGAATTTGTCTACTTCAGCTGTATACTTATTAGTTTTTGTTTATTGTGTACTTTGGAGAATGTGGATTTCTTTGGAAAATTTTAAACTTTCGTGAATCACTATCAGTAGTAGGTACCCATGGTCCACATCAGCTCACATGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 514481 234 + 647215 TTCTCGGACTTGACACCAGTGTTCCTCCTCAGTGTCTCACACAATCTTATTTAAAAGAGCCCATGATGGTATATGTTGGGACTTTGGATCATATAGTGTAAGTGAAGGAATTTGCCTACTTGAGCTGTATACCTATTAGTTTTTGTTTATTGTTATCTTTGGGGAATATTGA--------------TTTAAATTTTTGAGAATCACTATCACAAGTAGGTACCCAAGGTCCACATCAGCCCACGTGTA + +a +s mr.mrrefChr3 55949 37 + 181019 TCAAGGACTCCACCTAGTGGAGATCAGTTCCTAGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503445 37 + 636262 TCAAGGACTCCACCTAGTGGAGATCAGTTCCTAGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 514715 37 + 647215 TCAAGGACTCCACCTAGAGAGAATTAGTTCCAAGGGT + +a +s mr.mrrefChr3 55986 21 + 181019 ACTGTGCTCACAGTGCTGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503482 21 + 636262 ACTGTGCTCCCAGTGCTGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 514756 21 + 647215 ACTGAGCTCACAGTGATGATT + +a +s mr.mrrefChr3 56007 71 + 181019 AGCAGTTGATTGAACCCATACTTCCAGTGGGAGCATATATTGTGAATAATAAACAGATAGTGACAGGGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503503 71 + 636262 AGCAGTTGATTGAACCCATACTTCCAGTGGGAGCATATAGTGTGGATAATAAATAGATAGTGACAGGGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 514791 71 + 647215 AGCAGTTGATTGAACCCATACTTCCAGTAGGAGCATATATTGTGAATAATGAACAGATAGTGACAGGGGCT + +a +s mr.mrrefChr3 56078 270 + 181019 GGGGATCTCTCATATTACCTATCTCCCTCATGCACAGACTGGAGCTTCATGAAACAATAACTTGCCAATGGGATGACTCTGGGTTATCTATGCATGCATAAATACCTATTTACTTACATATTCATTGCCATAGGTCAGTTATAACAATAAGAATGTGCATTTATTGCCATGCCAACTTCTAAACACCTGAATAAGAGGTATTTTGACAGACAAATTGGTAATTCCTCTAACAACCGAACATGAAGAATTCTTATACACTGAATACTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503574 265 + 636262 -TGGATCTCTCATATTACCTATCTCCCTCATGCAGAGACTGGAGCTCCATGAAACAATAACTTGACAAC--GATGACTCTGGGTTATCTATGCATGCATAA--ACCTCCTCACTTACATATTCATTGCCATAGGTCAGTTATAACAATAAGAATGTGCATTTACTGCCATGCCAACTTCTAAACACCTGAATAAGAGTTATTTCGACAGACAAATTGGTAATTCCCCTAACAACCGAACATGAAGAATTTTTATGGACTGAATGCTAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 514863 270 + 647215 GGGGATCCCTCATGCTATCTACCTCCCTCATGTACAGACTGGAGCTTCATGAATCAATAACTTGCCAATGGGACCACTCTGGGTTATCAAGGCATGCATAAATACCTATTTACTTACATATTCATCACCACAGGTCAGTTATAACAATGAGAATGTGCATTTATTGCCATGCCAACTTCTAAACAACTGAATAAGATGTACTTTGGCAGACTAAATGGTAATTCATAAAATGACCAAACATGAAGTATTCTTATACACTGAATACTAATT + +a +s mr.mrrefChr3 56348 114 + 181019 TTTAACTTTTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAGAACAATAAAACAATTGTGTACACTGTAGTGAGAGGTGAATGCCATGAGTATTCAATTACATGCTAGGGTTTCATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503839 108 + 636262 ------TTGTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAAAACAATAAAACAATTGTGTACACTGTACTGAGAGGTGAATGCCATGAGTATTCAATTATGTGCTTGGGTTTCATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 515135 107 + 647215 TTTAACTTTTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAGAACGATAAAGCTATTGTGTTCACTGTAGTGAGGGATGAATGTC-------TACAATTACATCCTAGGGTTTCATTC + +a +s mr.mrrefChr3 56462 286 + 181019 ATTTAATCAACTTGCGATGAAAAGCCATCTCTTAGTTACTATTGCTTGGTCTTATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGAACTCATTGTAACGTAAAGTTCAGTCATTTTGATTTTGTATAATAATAAGTGATTTCCTGTGCTGCTTTATCACTGTAGGGCCTGCAGAGGCCCGCCCTTACCCAGCAGTCTGGCGGAAGTACTCACAGGGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAATAACAATGTAGGTGGGATATGAGTTAAATGTCATTGAACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 503947 285 + 636262 ATTTAATCAACTTGCGATGAAAA-CCATCTCTTAGTTACTATAGCTTGGTCTTATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGAACTCGTTGTAACATAAAGTTCAGTCATTTTGATTTTGTATAGTAATAAGTGATTTCCTGTGCTGCTTTATCACCGTAGGGCCTTCAGGGGCCCGCCCTTACCCAGCAGTTTGGCGGAAGGACTCACAGTGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAAGAACCATGTAGGTGGGATTTGAATTAAATGTCATTGAACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 515244 283 + 647215 ATTTAGTCCA-GTGCGGTGAAAAGGCATCTCTTGGTTACTATTGCTTGGTCCCATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGACCTCATTGTAACGTAAAGGTCAGTCA--TTGATTTTGTATAATAGTAAGTGATTTCCAGTGCTGCTTTAAAACTGTAGGGCCGGCAGAGGCCCATCTTTACCCAGCAGTCTGGCAGAAGTACTCACAGGGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAATAACAATGTAGGTGCGATATGAGTTAAATGTCATTGGACT + +a +s mr.mrrefChr3 56748 219 + 181019 CACAGCACCCAAAGCCTCCCACTTGGAACCATACTTGTAATCAATTTCTAGTCCATAAGTTCAGTGAAGCAAAATATAATTGTTACAACAGAAGAGGATAAATGGAGCCACATGCATAATTCCCTTCAGAGTGTCTCATCTTCAGACAAAGTTATTGTCTTTGTGCCCCGAAGGACTTTGTATAGAGACCATGTGAGGGCGGCAGAAACTAATAGAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 504232 219 + 636262 CACAGCACCCAAAGCCTCCCACGTGGAACCATACTTACAATCAATTTCTAGTCCATAAGTTCAGTGAAGCAAAATATAATCGTTACAACAGAAGAGGATAAATGGAGCCACATGCGTAATTCCCTTCAGAGTGTCTCATCTTCAGACAAAGTTATTGTCTTTGTGCCCCGAAGGACTTTGTAGAGAGACCATGTGGGGGCTGCATAAATTACTAGAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 515528 218 + 647215 CACAGCACCCAAAGCCGCCCACTTGGAACCCTACTTGTAATCAATTTCTAGTCCATAAGTTCAGTGAAGCAAAATATAATTGTTACAACAGAAGAGGATAAATGGAGCCACATGCATAATTCCCTTCAGAGTGTCTCATCTTCAGACAAAGTTATCGTCTTTGTGCCCCGAAGGACTTTGTATAGA-ACCATGTGAGGGCGGCAGAAACTAATAGAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 56967 226 + 181019 AAGCATTATTGACCCCCTGTAGGGAGACTTATCTGCCCAACTATTTACACAAACACTAAGTTGAAACTGTCTCCTGAAGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCAAGTGATTTAATACTTGGAACCAACTCAGTAGCTTTGCAAGCAGATAAGGAACAGCGGGATCAAGAGAAGCTAGAAAATTTTAAAACAGGTGTGTTCTCAGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 504451 226 + 636262 AAGCATTATTGACCCCCTGTAGGGAGACTTATCTGCCCAACTATTTACACAAACACTAAGTTGAAACTGTCTCCTGAGGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCGAGTGATTTAATACTTGGAACCAACTCAGTAGCTTTGCAAGCAGATAAGGAGCAGCGGGATCAAGAAAAGCTGGAAAATTTTAAAACAGGTGTATTCTCAGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 515762 226 + 647215 AAGCATGATTGACCCTTTGTAGGGAGGCTTATCTGCCCAACTATTTACATGAACACTAAGTTGAAGCTGTCACCTGAAGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCAAGTGATCTAATACTTGGTACCAACTCGGTAGCTTTGCAAGCAGATAAAGAACAGCAGGATCAAGAGAAGCTAGAAAATTTTAAAATGGGTCTGTTCTCAGATG + +a +s mr.mrrefChr3 57193 571 + 181019 CAGGTACGTATTCCAGGTTGGATGCCTATTATTACCTGCTGATCAACTGTTTCCATCCTATGAGCTGACCTCGATCATGCATAGTCTAATTTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATGAAACCAATGATTGATAAGGAGATAAACTATGGTGAGTGCTTTAGTATGGGTCTGGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAAATAGTTGATGTAGGCTTACTAATAGATATGTATCGACATTGTCTAACTATTTCTTCTAGGACAGGACAGAATCCTGGTTGCAGCTGATCTTGGCACTCGAGGTGTCCATGATGTGTCTCACATTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTTGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCATGAATAGTAGGCCATCTCTGTTAGCTTTTCATACCTCTCACTGTAGACCACCATAATTGCCCTTCATGAGTGTACTGCATACTCACAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCCATCAGAATAAAATATCTTATCCATTGGAGTCCCAAATCTATGAATAAATTATCAAACACAAGTTAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 504678 565 + 636262 CAGGTACGTTTTCTAGGTTGGGTGCCTATTACTACCTGCTGACCAACTGTTTCCATCCTATGAGCTGACCT--GTTATGCATAGTCTAATCTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATGAAACTGATGATTAATCAGGAGATAAACTATGGTGAA-GCTTTAGTATGGGTCTAGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAAATAGTTGATGTAGGCTTACCAATAGATATGCATCGACAGTGTCCAACTATTTCTTCTAGGACAGGACAGAATCCTGGTTGCAGCTGATCTTGGCACTCGAGGTGTCCATGAGGTGTCTCACACTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTAGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCTTGAATAGTAGGCCATC---GTTAGCTTTTCATACCTCTCACTGTAGACCACTATAATTGCCCTTCGTGAGTGTACTGCATACTCCTAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCCATTAGAATAAAATATCTTATCCATTTGAGTCCTAAATCTATGAATAAATTATCAAACACAAGTTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 515988 571 + 647215 CAGACACGTATTCCAGGTTGCATGCGTATTATTACCTGCTGATCAACTGTTTCCGTCCTATCAGATGACCTCGATCATGCATAGTCTAATTTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATTAGACCAACCATTGCTAAGGAGATAAACTATGTTGAGTGCTATCGTATGGGTCTGGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAGATAGTTGATGTAGGCTTACTAATAGGTAAGTATCGACATTGTCTAACTACTTCTTCTAGGACAGGACAGAATGCTGGTTGTGGCTGATCTTGGGACTCGAGGTGTCCACGATGTGTCTCACATTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTTGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCATGAAAAGTAGGCCATCTCTGTTAGCTTTTCATACCTCTCGCTGTAGGCCACCATAATTGTCCCTCATGAGTGTAGTGAATGCTCACAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCTATCAGAATAAATTATCTTATCCATTGGAGTCCCAAGTCTAAGAGTAAATGATCAAACACAAGTTAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 57764 253 + 181019 CTGTATGCCATTGTCTCTTGTGCCACCTATTTGTAAGCAGAACTGGTGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATATTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCATCATTTCATGCACACTGTTAATTAGACGAAAACTCCTGCTAATTCATTCAGGCAACTGCACCAGAAAAGGAATATGGGATATACCAAGAGTGAAGGACATATCCATGGAGTCTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505243 253 + 636262 CTGTATGTGATCGTGTCTTGTGCCACCTATTTGTAAGAAGAACTGGTGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATATTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCATCATTTCATGCACCCTGTTGGTTACACGAAAACTCCTGCTAATCCATTCAGGCAACTGCACCAGAAAAAGAGTATGGGATATACCAAGAGTGAAGGACATATCCATGGAGTTTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 516563 252 + 647215 CTGTATGCCATTGTCTCTTGTGCCACCTATTTGGAAGCAGCACTGGCGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATGTTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCA-CATTTCATGCACACTGTTAATTAGACCAAAACTCCTGCTACTTCATTCAGGCAACTCCACCAGAAAAGGAATGTGCGATATACCTAGAGTGAATGACATATCCATGGAGTCTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 58017 95 + 181019 ATAACAAGGTATGGATATGGGTACCCACAACAGAGAGAGTCAACATATGGTTTATATGGTTTAAACTGTTTGAGCTTGTTTAATTGCTTCAGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505501 42 + 636262 ATAACGAGGTAT-----------------------------------------------------CTGTTTGAGCTTGTTTAATTGCTTCAGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 516815 95 + 647215 ATAACAAGGTATGGATATGGGTACCCACAACAGAGAGAGTCAACATATGGTTTATATGGTTTAAACTGTATGAGCTTGTTTAATTGTTTGAGGTC + +a +s mr.mrrefChr3 58112 23 + 181019 AACTGTGAATTTAGCTTAAAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505545 23 + 636262 AACTGTGAATTTAGCTTAAAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 516910 23 + 647215 AACTGTGCATTTAGTTTAAAGGG + +a +s mr.mrrefChr3 58135 31 + 181019 CAGTTCTATGAACATGTAGGCGTTAACAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505568 31 + 636262 CAGTTCTATGAACATGTAGGCGTTAACAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 516934 31 + 647215 CAGTTCTCTGAACATGCAGGTGTTAATGGGA + +a +s mr.mrrefChr3 58166 81 + 181019 CTAAAACTTATTACCCCTTAGCAGGTAAGAATGCCCCTGGCAACTTCATATCTGAACAGCTATATTGACAACCTGCTCTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505600 81 + 636262 CTAAAACTTATTACCCCTTAGCAGGTAAGAATGCCCCTGGCAACTTCATATCTGAACAGCTATATTGACAACCTGCTCTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 516965 81 + 647215 CTAAAACTTATTACCCTTTAGCAGGCAAGAATACCCCTGGTGTCTTTGTATCTGAACAGCTATATTCACAACCTGCTCTGC + +a +s mr.mrrefChr3 58247 18 + 181019 AACTCATATCTCACAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505696 18 + 636262 AACTCATATCTCACAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 517046 18 + 647215 AACTCATATCTCACAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 58265 23 + 181019 ACACAATAATAAGAAGTTGGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505715 23 + 636262 ACACAATCATAAGAAGTTGGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 517064 23 + 647215 ACACAATACTAAGGATTGGGTCT + +a +s mr.mrrefChr3 58288 232 + 181019 CAGAGCATCCCAGAAGAGCTAGTTTCAATGGTTGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGAGGAGTGAGATGGAGAGAAAGATGGAAAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCACCAATTTTTTCAGGGAGGCAGGTGTGGTACCTCCAACTATATTATTGGCTTTTAGCTACAAAACTGCTTACTCTAGATGCTAGTAGAAATGTTTTCAATTAGTTCCCATTACTTTGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505739 226 + 636262 CAGAGCATCCCAGAAGAGCTAGTTTCAATGGTTGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGCGGACTGAGATGGAGAGAAAGATAGAGAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCACCAGTTTTTTCAAGGAGGCAGGTGTGGTACCTCCAACTATATTATTGGCTTTTAGCTACAAAGCTGCTTACTCTAAATGC------AAATGTCTTCAATTAGGTCCCATTACTTTGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 517087 232 + 647215 CAGAGCATCCCGGAAGAGCTAGTTTCAATGGTCGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGAGGAGTGAGATGGAGAGAAAGATGGAAAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCATCAATTTTTTCAGGGAGGCAGGTGTGGTACCTTCAACTACACTATTGGCTTTTAGCTACAAAACTGCTCACTCAAGATGCTAGTAGGAATGTTTTCAATTATTTTCAATTACTTTGGCT + +a +s mr.mrrefChr3 58520 262 + 181019 AGTATACAAGCAACTGTTCCCATCGTTTATTCAAAATTTTAAGGCTCTCAGGATGCATTGATGGTGCCAAAAGATGGGCCTCTGTTCTTGATAATGAGATATCTTACTCTGGGAAATCTAGATGTAAACCAACATTTCGGGGTTTTGTGGACTCACCAAGACTTGATTAATCCGAAAGGCAGGCCTATTCACATGATGCTGAGATATCTTATTCTGGGAGATGTAGATGTAAAAGCTCTACACAATGAAGGACCTTAGTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 505965 260 + 636262 AGTGTACAAGCAGCTGTTTCCATAGTTTATTCAAAATTTTAGGGCTCTCAGGATGAACTGATGGCACCAAAAGGTGGGCCT--GTTGTTGATACTGAGATATCTTACTCTGGGAGATCTAGATGTAAACCAACATTTCGGGGCTTTGTGGACTCACCAATACTTGATGAATCCGAAAGGCAGGCCTATTCACTTGATGCTGAGATTTCTTATTCTGGGAGATGTAGATGTAAAAGCTCTACACAACGAAGGACTTTAGCGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 517321 262 + 647215 AATATACAAGCAACTGTTCCCATCGTTTATTCACAATTTCAAGACTCTCAGGATGCCTTGATGGTGCCAAAAGATGGGCCCCTATTCCTGATAATGAAATATCTTACTCTGGGAAATCTTGATGTAAACCGACATTTTGGGGTTTTCTGGACTCACCAAGACTTGATTAAGCCAAAAGGCAGGCTTATTGACATGATACTGAAATATCTTACTCTGGGAGATGTCAATGTAAAAGCTCTAAACAATGAAAGACCTTAGTGGC + +a +s mr.mrrefChr3 58782 53 + 181019 GGGTGAAAAATAATTGTAAACATATAATGTATAAGCCTTGGGAAGGTATAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506279 53 + 636262 GGGTGAAAAATAATTGGGAACATATAATGGATAGGCCTTGGGAAGGTATAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 517583 53 + 647215 GGTTCAAAAATAATCATAAATATATGATGTATAAGCCTTGGGAAGGTATAATG + +a +s mr.mrrefChr3 58835 31 + 181019 GCATAATCCTACATACTAAGGCTATATAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506334 31 + 636262 GAATAATCCTACATACTAAGGCTATATAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 517636 31 + 647215 GCATAGTCCTACATGCTGAGGTTATATAACA + +a +s mr.mrrefChr3 58866 160 + 181019 TAATGCCACTTGGCTTTTGATAAAGGTAGAGACAAGCGGTAACCCATTATACATAATGGGTATTTGGAAATCTGGGACCCAATGTAAAATATAATGTATGATCCTACATACTGAGACCACATTAATAATTGGTCAACTAGTCTTCCATTAGGGCAGAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506365 160 + 636262 TAATGCCACTTGGCTTTTGATAAAGGTAGAGATAAGCGGTAACCCATAATACATAATGGGTATTTGGGAATCCAGGACCCAATGTAAAATACAATGTATAATCTTACATACTGAGACCACATTAATAACTGGTCAACTAGTCTTCCATTAGGGCAGAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 517681 160 + 647215 TAATTCCACTGGGCTATGAATAAAGGTAGAGACAAGCAGTAATCCATTATACAAAATGGGTACTTGGAAATCTGGGACCCTATGCAAAATATAATGTATGAGCCTACATACTGAGAACACATTAAAAATTGGTCTACTAGTCTTCCTCTAGGGCAGAGGC + +a +s mr.mrrefChr3 59026 207 + 181019 CACATTTTAACTACTTGTACAGGGTCATGAAATGGGTACCTTGAAGACTTTGCTTGGAAGACCAATAATTTTTTGATTGTGCAGGTGCTTATCTTTTCCAGGGCACTGCTGATGATAAAGATTCTTCTAGTGTAATGTTAGAATAATTCACCTATTAGTAGCTCAGTAAAAAATGGTTTTGGTACTCTAGTAAGCCTGGAGACATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506525 205 + 636262 CGCAGTTTAACTACTTGTACAGGGTCATGAAATGGGTACCTTGAAGACTTTGCTTGGAAGACCAATAATTTTTTGATTGTGCAGGTGCTTATCTTTCCCAGGTCACTGCTGATGATAAAGATTCTTCT-GTGTAATATTAGAATCATTCACCTATTAGTAGCTTAGTAAAAAATG-TTTTGGTACTCCAGTAAGTCTGGAGACATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 517849 192 + 647215 CACATTTTAACTACTTGT---------------GGGTACCTTGACAACTGCGCATGGAAGACCAATATTTTTTTCATTGCACAGGTGCTTATCTTTTCCAGGGCACTGCTGATGATAAAGATTCTGCTAGTGTAATGTTAGAATAACATGCCTATTAGTAGCTCAGAAAAAAATGGTTTTGGTTCTCTTGTGAGCCTGGATATATGT + +a +s mr.mrrefChr3 59233 51 + 181019 CTGGATGTATGCTTACTCACTTACCCACAACATACTTCACTCAAGAGTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506738 51 + 636262 CTGGATGTATGCTTACTCACTTACCCACAACATACTTCCCTCAAGAGTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 518041 51 + 647215 CTGGATGTATGCTTGCTCACCTACCCACAAGATACTTCACTCAAGTGTTAA + +a +s mr.mrrefChr3 59284 37 + 181019 TTCAGCATTGAAAACGAACCAGAGATCTCTTGTTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506796 37 + 636262 TTCAGCATTGAAAAGGAACCAGAGATCTCTTGTTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 518092 37 + 647215 TTCAGCATTGAAAACGAACCAGGGCTTTCTTGTTGGC + +a +s mr.mrrefChr3 59321 50 + 181019 TCAAACAGAAAAGAATATTCTGAAGCAGCTAAAATGCTAACATATTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506833 50 + 636262 TCAAACTGAAAAGAATATTCTGAAGCAGCTAAAATGCTAACATATTCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 518130 50 + 647215 TTAACCAGAAAAGAATATTCTGAAGCAGCTAAAATGCTAACATATTCAGG + +a +s mr.mrrefChr3 59371 98 + 181019 CAGAAAAAACAAAGATCCATCAGTGGCTAGTACCCCATAAGGAATTTGTGTTTCCCCCAGTTGGTAATAATCCTATTGTGCAGAATTAAGGATAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506883 98 + 636262 CAGAAAAAACAAAGATGCAGCATCAGCAAGTACCCCATGAGGGATTTATGTTTCCCCTGGTTGGTAATAATCCTATTGTGCAGAATTGAGGATAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 518187 98 + 647215 CCGAAAAAACAAAGATCCATGAGTGGCTAGTAACCCACAAGGAATTTGTGTTTCCCCCAGTTGGTAATCATCCTATTGTGCAGAATTAAGGATAACAT + +a +s mr.mrrefChr3 59469 123 + 181019 TTTTTGGCTTGGCTGATCAATTGAAAATGACTTGCCATGTCAGTATGGAATTGCATTATTCCTAATGTAAAGAAGGCTGGTATATCCAGACTTTCTTTGGTTCAATTTCACCAAGGAGAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 506982 123 + 636262 TTTTTGGCTTGGCTCAGTAACTGAGAAAGGCTTGCCATGTCAATATGAAATTGCATTATTCCTAATGTAAAGAAGGCCGGTATATCCAGACTTCCTCTGGTTCAATTTCACCAAGGAGAGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 518285 123 + 647215 TTTCTGGCTTGGCTGATCAATTGAAAATGACTTGCTATGTCAGTATGGAATTGCATTATTCCTAATGTATAGTAGGCTGCTATATCCAGACTTTCTTTGGCTTAATTCTACCAAGGAAAGAGG + +a +s mr.mrrefChr3 59592 103 + 181019 TAATAGCAAAATTAGGGAGTCCTCTCTCTTAGTTGTATAAGTACCACCAAATTGAATGAGGGTCAATCTATCTCCCAGTTACATTCACATGAAGCTATCAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507105 103 + 636262 TATTAGCAAAATTAGGGAGTCCTCTCTCATAGTTGTATAAATACCACCAAATTGAATGAGGGTCAATCTATCTCCCAGTTACATTCACGTGAAGCTATCAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 518409 103 + 647215 TAATCTCAAAATTAGGTAGTTCTCCCTCTTAATTGTATAAGTACCACTAAATTAAATGAGGGCCTATCTCTCTCCCAGTTGCATTCACATGAAGCTATAAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 59695 180 + 181019 ATCCTCTCATCAAACGTAATGAAAGTTCACAGAACGTCACATGTCTTGCAATACTTTAAGAAGTTGGTTTCTGTGAAGAGTCTGACTCCCAAAAATGTTATGTTTCAAGGAAGTCTCCTTTGACCTATGGACACTATAACACTGCTTGTCCCAAATTTCCATGCCATTAGATTCCTTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507208 180 + 636262 ATCCTCTCATCAAACGTAATGAAAGTTCACAGAACGTCACATGTCTTCCAGTACGTTAAGAAGTTGGTTTCTGTGAAGAGTCTGACTCCCAAAAATGTTATGTTGCAAGGAAGTTTCCTTTGGCCTATGGACTCTATAACACTGCTTGTCCCAAATTTCCATGCCATTAGAGTCCTTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 518513 177 + 647215 ATCCTCTTGTCTAATTTCATGAGAGTTCACAGAAAGTCACATGTCTTGCAATACTTTAAGAAGTCGGATTTTGTGAACAGGCTGATTTCCTAAAATGTTATGCTTCAAGCAGGACTCCTTTGACCTATGGGCACTATAACACT---TTTCTCAAATTTTCACGCCATTAGGTTCCTTTGC + +a +s mr.mrrefChr3 59875 28 + 181019 AAGGAGACAAGTGACACATTGGAACTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507389 26 + 636262 AAGGAAACAAGTGACACATTGGAGCT-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 518690 28 + 647215 AAGGAGACAGGCGACACATTGGAAATTT + +a +s mr.mrrefChr3 59903 100 + 181019 TTTGAATCAGCCATGTCTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAGCCTCTGCATCTATCATCCAAGGCTGCTTTTTATTGAAAGTTGCCCGCTGGATTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507415 93 + 636262 -------CAGCCATATTTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAGCCTCTGCGTCTATTATCCAAGGCTGCTTTTTATTGAAAGTTGCCCGTGGGATTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 518750 97 + 647215 TTTGAATCACCCAAGTCTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAACCTCTGCATCTATCATCCAAGGCTGCTCTTTATTGAAAGTTGCCCGCTGGAC--- + +a +s mr.mrrefChr3 60003 641 + 181019 CACCTTAATGTACTTGTTATCTTGGGAAGGCTGTCAACTAGATTTACAGCGGCACACCAGCAGCATTAGATACATAGGTCAGCATACAGCATGATGCTGTTTAAGAAATGTTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACTCTGGGTCCTAACTTATGTAAGGGTAGAGTGTCTAAGGGGCCAAAAAAGTAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACGTAATTTACAGAAGTCTAGCACGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCACACTTTGAAATCTAAAGTGAATAGGGTGACTAGGACAATGGACACAGGCATATAATAGTGCCAAAGAAATACCACCCCATAACAGATCAGTCTATCTTGTCCTTCATACAAGTAAACTCTAATACATTCCAAGTGGGACCATTATGACCCTATTACCTGTACCCTTCTCTTGCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTTAAGGGGAAGACTTGTGGTACAAAAGTTGAGTCAGAATCTCCTGAAATGGGCAGGAGCTGAGCCCAATGTGATCTTGACACCCTGGAGCCATAGCAACAAATAATTCATAGGAGGCTGTCAGACAGGGCATATGTCACAGAGAGGCAGAATCTTGCTACTTATGACAATTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 507509 641 + 636262 CACCTTAATGTACTTGTGATCTTTGGGAGGTTGTCAACTAGATTTATAGCAGCACATCAGCGGCATTTTATACATGCATCACCATACAGCATGATGCTGTTTAAGAAATGCTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACTCTGGGTCCTAACTTATGTAAGGGCAGAGTGTCTAAGGGTCCAAAAAAGAAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACGTAATTTACAGAAGTCTAGCACGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCACACTTCGAAATCTAAAGTGAATAGGGTGACTAAGACAATGGACACAGGCATATATTAGTGCCAGAGAAATACCACCCCATAACAGATCAGTTTACCTTGTCCTTCATACAAGTAAACTCTAATACATTCCAAGTGGGACCATTATGGCCCTATTACCTGTACCCTTCTCTTGCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTCACGGGGAAGACTTGTGGTACAAAAGTTGAGCCAGAATCTCCTGAAATGGTCAGGAGCTGAGCCCAATGTGGTCTTGACACCCTGGAGCCATAGCAACAAATAATTCATAGGAAGCTGTCAGACAGGGCATGTGTCACAGAGAGGCAGAATCTTGCTACTTATGACAGTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 518847 631 + 647215 CACCTTAATGTGCTGGTTATCTTGAGAAGGCTGACAACTAAAAGTACAGCGGCACACCAGCAGCATTAGATACATAGGTCAGTGTACAGCATGATGTTGTTGAAGAAATGTTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACGCAGGGTCCTAACTTATTTAAGGATAGAATGTCTATGAGGCCTAAAGAGTAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACATAGTTTACAGAAGTCTAGCATGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCATACTTTGGAATCTAAAGTGAATAGGGTGAATAGGACTGTGGACCCGGGCAAATAATAATGCCAAAGGAATACCACCACATAACAGATCAGTCTATTTTGTCCTTCATACACATAAACTCTAATACTTTCCAAGTGGGACCATTATGACCATATTACCTGTACCCTTCTGTTCCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTTAAGAAAAGGACATGCAGTACAAAAGTTAAGTCAGAATCTCCTGAAATGGGCATGAGGTGAGCCAAAGGTGATCTTGACACCCTGG--------CAACAAATAATTCATAGGAGGTTGTCTGGCAGAGCATATGTCACAGAGA--GAAAATCTTGCTTATTTTGACAATTCC + +a +s mr.mrrefChr3 60644 155 + 181019 GTAGACCTAACAGAAAAATCAACTTCTGAGTTACTCATGATTGTCTGGGCTATTCAGGGGGCTATAGTATGAACACATTTAAAGATTTCAAAGAAGCTCTAAGATCTCCTCATTTTTAGATCAGCCTTCTTCAAAGTTCAGATTGAGTCAGTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508152 151 + 636262 GTAGACCAAACAGAAAAATCAACTTCTGAGTTACTCATGATTGTCTGGGCTATTCAGGGGGCTATAGTATGAACACATTTAAAGATTTCAAAGAAGCACTAAGATCT----ATTTTTAGATCAGCCTTCTTCAAGGTTCAGACTGAGTCAGTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 519478 155 + 647215 GCAGACCTAACAAAAAAATCAACTTCTGATTTACTCATGACTGTTTGGGCTATTCAGCGGGCTATAACAAAAAGACATTTAAAGATTTCAAAAAAGCTCTAAGATCTCCTCATTCTTAGAGCAGCCTTCTTCCAAGTTCAGATTAAGTTAGTAAA + +a +s mr.mrrefChr3 60799 83 + 181019 GATGGAACAGTTTCCTGCCCCAAAAGTTCAACCACTTGGCCGGCATTACCACAACCAATCAGCACTACTAATAGAACTGTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508305 83 + 636262 GATGGAACAGTTTCCTGCCCGAAAAGTTCAACCACTTGGCCGGCATTACCACAACCAACCAGCACTACTAATAGAACTGTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 519633 83 + 647215 GATGGAATAGTGTCCTGCCACAAAAGGACAACGGCTTGGCCAGCATTACCACAACCAATCAATCCTACCAATAGACCTGCTAG + +a +s mr.mrrefChr3 60882 5 + 181019 TGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508388 5 + 636262 TGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 519721 5 + 647215 GATGA + +a +s mr.mrrefChr3 60887 135 + 181019 GTCCAAAGGTCTGCTTCTTCCAATAAAATAATGATACTATGTGGTGCCATTCAGAAGATTCACACCCCTCAACACTTTGTTACACTATCCCGTGTCACATTGGATATACTTGGAGCCATAGGTACTCCCAGTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508425 135 + 636262 GTCCAAAGGTCTGCTTCTTCCAATAAAATAATGATACTATGTGGTGCCATTCCGAAGATTCACACCCCTCAACGCTTTGTTGCACTACCCCGTGTCACATGGGATATATTTCGAGCCATAGGTACTCCCATTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 519726 134 + 647215 GTCCAAAGGTCTGCTTCTTCCAATAAAATAATGATACCATGTGGTGCCATTAAGAAGATTCACGCCC-TCAAAACTTTGTTATACCATCCATTATCACATTGGATACACTTGGAGCCATAGGTACTCCCAGTTGA + +a +s mr.mrrefChr3 61022 161 + 181019 ATCCATTGTTTCACAGGGCAGTATAAAGGGGAAGCAATTGATTGAGACTGTGGAACACAGTGTCTTAGTACGAAATAAAAGATTGACACTTTCAGGAACTCTAATTACAATGCATTTATATGGGACCCTTTAGAATGTAGCTTTGAGTAACCTAGGACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508568 161 + 636262 ATCCATTGTTTCACAGGGCAGCATAAAGGGGAAGCAATTGATTTAGACTGTGGAACACAGTGTCTTAGTACGAAATAAAAGATTGACACTCTCTGGAACTCTAATTACAATGCATTTATACGGGACCCTTTAGAATATAGCTTTGTGTAACCTAGGACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 519860 160 + 647215 ATCCATTGTTTCATAGGGCAGTGTAAAGGGGAGGCATAAGATTGAGAGTGTGGAACCTAGTGTCTTAATATGAAAGAAAAGATTGA-ACTTCCAGGAACTCGAATTATAATGCAGTTATATGTGACCCTTTAGAATGTAGCTTTGAGTAACCTGGGACAGG + +a +s mr.mrrefChr3 61183 97 + 181019 TCTGCAAGTTACTGGGATTGCTTTACTGTCCCTCAAGGTTCCTAATCTTGACTTTACAATTAACAAGTGTGGTCCTTGGAAAATGCGTTTCCTTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508729 97 + 636262 TCTGCAAGGTACTGGGGTTGCTTTACTGTTGCTCAAGGTTCCTAATCTTTACTCTACAATTAACAAGTGTGGTCCTTGGAAAATGTGTTTCCTTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520021 96 + 647215 TCTGCAAGTTACTGGCATTGCTTTACTGTCCCTCAAGATTCCTAATCTTGACTTTACAATTAACAAGCGTGGTCCT-GGAAAATGCGTTTCCTTTGC + +a +s mr.mrrefChr3 61280 130 + 181019 GTTTTTACTACAGGAAAACTTTAGCAATGTTCCTGGTACTCAGGACAGGTTATATCACAACAGGGTTACTGTTCTAGTTAGAGTATTCTGACACTGTTGATACCCTGGCCATCAATTGTGCTCAATCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508826 130 + 636262 GTTTTTACTACAGGAAAACTCTAGCAATGTTCCTGGTACTCAGGACAGGTTATATCACAACAGGGTTACTGTTCTAGTTAGAGTATTCTGACACTGTTGATACCATGGCCATCAATTGTGCTCAATCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 520120 130 + 647215 GTTTTTACTACAGGGAAACTTTAGCAATGCTCCTTGTACTCAGGACAGGTTGCATCACAACAGGGATCCTGTTCTAGTTAGAGTATTCTGATACTGTTGATACCCTGGCCATTAACTGTGCTCAATCTAT + +a +s mr.mrrefChr3 61410 31 + 181019 CCAGCCATCATCCCTCGGAGGATACCTAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508956 31 + 636262 CCAGCCATCATCCCTCAGAGGATACCTAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520251 31 + 647215 CCATCCATCATCACTTGGAGGATACCTAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 61441 45 + 181019 CAGGCCTATTAGGACTACAGATTGTGATCCAATCTTACACACTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 508987 45 + 636262 CAGGCCTATTAGGACTACAGATTGTGTTCCAATCTTACAAACTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520287 45 + 647215 CAGGCCTATTAGGACTACAGGTTGTGATCCAATCTTAAACACTCC + +a +s mr.mrrefChr3 61486 165 + 181019 ATTTAGCTTTCATACTGACCTGCTATCCATACATAGGCCTAAGGCATCAGGTAAGTCCAGCAACCCCCATTACTGCCAGGGTGGATGGTTCAATAACATATAGAACAGGACAGCTTATAGTAATGGGGATGCTAAAAAAAATCTAAGGACAGTCCTGAGCCAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509035 162 + 636262 ATTTAGCTTTCATACAGACCTTCTATCCATACATAGGCCTAAGGTATCAGGTAAGTCCAGC---CCCCATTACTGCCAGGGTAGATGGTTCAATAGCATATGGAACAGGACAGCTTATAGTAATGGGGATGCTAAAAAAAATCTAAGGACAGTCCTGAGCCAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 520332 163 + 647215 AATTAGCTTTCATACTGATCTGCTATCAATACATAGGCCTAAGGCATCAGGTAACTCCAGCAACCACCATTGCTGCCAGGGTGGATGGTTCAATGACATGTAGGACAGGACAACTTATAGTAATGGGGATACTAAAAAAAACCTAAGGCCAGTCCTGAGCCTG-- + +a +s mr.mrrefChr3 61651 299 + 181019 CATTTTAATTCATTTCAGGGCGTCAAGTTACAGGAGGCACAGTAATCTCTGGTGCCAGAGAAGTAATCTGCCACCTAAGTAGACTTGAGGTAGACTTCAAGGACATGTGTTACCAGACTGTATACGATTAGCCACTATCCACGACCAATACTTTCTAGCAGTACCAGAAAGAGGGATTTTAAAGGATTGAGGAATACAGATAGCACATTAATTCCTCAATCTATTATGGGAAATAAAACCCAGTTGATGATAGAGAGTTGTAGGGCTCACCTCAGGGTGATTCAGGTATATAAGCAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509206 299 + 636262 CATTTTAATTCATTTCAGGGCGTCAAGTTATAGGAGGCACAGTAATCTCTGGACTCAGAGAAGTAATCTGCCACCCAAGTAGACTTGAGGTAGACTTCAAGGACATGTGGTACCAGACTGTATAAGGTTAGCCACTATCCCCGACCAATACTTTCTAGCATTACCAGAAAGAGGGATTTTAAAGGATTGAGGGGTACAGATAGCACATTAATTCCTCAATCTATTATGGGAAATAAAACCCAGTTGATGATGGAGAGTTGTAGGGCTCACCTCAGGGTGATTCAGGGATATAAGCAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520495 289 + 647215 ---------TCATTTCAGGGAGTGAAGGTACAGGAGGCACTGTAATCTCTGGTGCCTGAGAAATAATCTGACACCTAGGGAGACTTGAGGTAGACTTCAAGGACATGTGTTAAAAGACTGTACACGATTAGCCACTATCCATGACCAATACTTTATAGGAGTACAAGAAAGATCGATTTAAAAGGATTGAGGAATACGGATAGCACATTAATTCCTCAAGCTATTATGGGAA-TAAAACCCAGTTGATGACAGAGAGTTGTAGGCATGACCTGAGGGTGATTCAGGTATACAAGCAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 61950 22 + 181019 TACATAAACATATAACTTCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509505 22 + 636262 CACCTAAACATATAACTTCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 520806 22 + 647215 TCCATAAACATATAACTTCTTG + +a +s mr.mrrefChr3 61972 84 + 181019 GTCTTATGCAATAGCTGAAAAATAAAAAATTACTGGTGACAACCAGTTATGAGATGCTTCTTAGCTCTGGGCATTATGGTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509532 80 + 636262 GTCTTATGCAATAGCTGAAAAATAAAAAATTACTGGCAACTACCACTTATGAGATG----TTAGCTCCGGGCATTATGGTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520828 84 + 647215 GTCTTATGCAATAGGTGAGACATAAGAAATTACTGGTGACAACCAGTTTTGAGATGCTTCTTAGCTCTGGGCATTATGGTGTAC + +a +s mr.mrrefChr3 62056 54 + 181019 CCAGTTTGTGAAGAAGGATGTAACAGCTTCATATTTGTCCAATTCTTACCAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509622 43 + 636262 CCAGTTTGTGAAAAAGGATGAGAC-----------TGTCCAATTCATACCAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 520912 54 + 647215 CCAATTTGAAAAGAAGGATATAACAGCTTCATATTTGTCCAATTCTTACTGGAC + +a +s mr.mrrefChr3 62110 276 + 181019 AAGTAGAGAGTGACATACTTGGCAATTCCGGATCTACCTAGCCGGCTGGACACACCTTGAAAGACAAATACCTAGCTCAGTGATTGAATATGATTGATAATTGTTCTACCTCAATGCTGAATGTACTGGTCTCTGTGTTAATGTGACTAGACATACAGATACATGGATGAACACAGAAAAATAAATTTGGTCATCCAAAGATGTATGGCTTTTAGAAAAAAACTAGTGGAAAGAAATCCAGATAAGGTTCCTGGGTCCACACCTTCCATGTTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509666 276 + 636262 AAGTAGAGAGAGTAATACTTGGCTATTTCGGATCTACCTAGCCGGGTTGACACGCCTCGAAAGACAAATACCTAGATCAGTGATTGAATATGATTGGAAATTGTTCTACTTCAATGCTGAATGTACTGGTCCCTGTGTTAATGTGACTAGACATACAGAGTCATGGATGAAAACAGAAAAGTAAATTTGGTCATGCAAAGATGTATGGCTTTTAGAAGAAAACTAGTGGTAAGAAATCCAGATAAGGTTTCTGGTTCCACACCTTCCATGTTTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 520966 272 + 647215 AACTAGAGAATGACATACTTGGCAATCCCTGACCTACCTAGCCAGCTGGACACACTTTGAAAGACCAATACTTAGCTCAGTGATTGAATATGATTGATAATCGTACTACCTAAAGCCTGGATGTACTGGTCTGTGTACTAATGTGACTAGACATACAGATACATGGCTGAACACAGAAAAATAAATTTGGTCATCCAAATGTGTATGGCTTTTAGAAAAAGACTAGCGGAA----GTCCAGATAAGGTTCCTGGGTCCACACCTTCCATGCTTGCA + +a +s mr.mrrefChr3 62386 7 + 181019 TGAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509942 7 + 636262 TGAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 370153 7 - 647215 TGAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 521238 7 + 647215 TGAGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 62393 3 + 181019 TAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509949 3 + 636262 TAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 521245 3 + 647215 TAC + +a +s mr.mrrefChr3 62396 13 + 181019 AAGACATTTCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509952 13 + 636262 AAGACATTTCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 370160 13 - 647215 AAAAGTTCACTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 521248 13 + 647215 AAGACATTTCTAC + +a +s mr.mrrefChr3 62409 2 + 181019 TT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509965 2 + 636262 TT +s simRat_chr6.simRat.chr6 521261 2 + 647215 GT + +a +s mr.mrrefChr3 62411 7 + 181019 TTAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509967 7 + 636262 TTAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 370173 7 - 647215 TCATCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 521263 7 + 647215 TTAATAG + +a +s mr.mrrefChr3 62418 4 + 181019 GCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509974 4 + 636262 GCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 521270 4 + 647215 GCTA + +a +s mr.mrrefChr3 62422 146 + 181019 GTTGGGGATTAATGGCCTGCCAAATTGGTTTTATAGCATGTGTTACAGCATGGCTGTAGGAGTCCTAGTGTGCAGTGGATCTCTGTTTCTAAACTTGATGATATAATTATCATCCTTGTTTCATATATCTGGAACATGCCTGAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 509978 143 + 636262 GTTGGTGATTAGTGGCCTGCCATATTGGTTTTATAGCATGTATTACAGCATGGCTGTAGGAGTCCTAGTGCGCAGTGGATCTCTGTTTCTAAACTTGATGATATAAGTATCATCCCTGTTTCAT---CCTGGAACATGCCTGAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 370180 146 - 647215 GTTGGGAATATAAAGCCTACTGAGTAAGCCTTGCTACATGTGTTACAGTGTGGTTGTAAGAGTCTTGGTGTGCAATTTGCTCCTCCTTCTACATTTGATGCTGGAATTATCCTTCTTGCTCCATGTATGAATGATAGGGCTGACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 521274 146 + 647215 GTTGGGGATTAATGGCCTGCCAAATTGGTTTTATAGCATGTCTCGCAGCATGGCTGCAGGACTCCTAGTGTCCGGTGGATCTCTGTTTCTAAACTTGATGATATAAATATCATCCTTGTTTCATAATTCTGGAACATGCCTCAGCT + +a +s mr.mrrefChr3 62568 31 + 181019 GGGTGGCGCATATATCATTCTTTTTTTGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510121 31 + 636262 GGGTGGCGCATATACCATTCTTTTTTTGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 370326 31 - 647215 TGGTGGTACGGTTATTCTCCATGCTCTGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 521421 31 + 647215 GGGTGGCGCATGTATCATTCTTTTTTTGGAT + +a +s mr.mrrefChr3 62599 2 + 181019 AC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510152 2 + 636262 AC +s simRat_chr6.simRat.chr6 521452 2 + 647215 AC + +a +s mr.mrrefChr3 62601 37 + 181019 ACATATACAAGTCTGAGGTCAATGCATCATAAGAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510154 35 + 636262 ACATATACAAGTTTGAGATCA--GCATCATAAGAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 370357 37 - 647215 AGATATACTTGGCTAGGGTAAATGCATCAGAACAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 521454 35 + 647215 ACATATACAAATCTGAGGTCA--GCATCATAAGAAAC + +a +s mr.mrrefChr3 62638 14 + 181019 ACTTTATGTCACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510189 14 + 636262 ACTTTATGTCACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 521489 14 + 647215 ACTTTATGTCACAA + +a +s mr.mrrefChr3 62652 247 + 181019 GAGGTGATTCTTAATTGCAGTATTCGGGCAAAAAGGGTTTATGTGTAAGACTGTTTCTGCAAGATATAATTGTTCGCTTGCCAGAAAATGTCATGGATTGTTTGGCATAACCTCACAAAATCAGCCATCATTTCCTTAGAAGTGGGTTTGATAATTCATATGTAGACATACAGGAAGTGCTTACATTCACTCTTGTCTAGTCTTCAGTCTCTTGTCATCTTCCTGCAATCCCTTATCCGCCTGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510203 232 + 636262 GAAGTGATTTTTGATTGCAGTATTCGGGCAACAAGGGTTCATGTGTAAGACTGTTTCTGCAAGACATAATTGTTCGCATGCCAGAAAATGTCATGGATTGTTTGGCATAACCTCACAAAAGCAGCCATCATTTCCTTAGAAGTGGGTTTGATAATTCATATGTAGACATAA---------------TCACTCTCGTCTAGTCTTCAATCTCTTGTCATCTACCTGCAATCCCTTATCCGTATGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 521541 246 + 647215 GGGGTGATTCTCAATTGCAGCATTCGGGCAAAAAGGGTTTATGTGTAAGGCTGTTTCTGCAAGATCTAATTGTTTGCTTGCCAGAAAAAGTCATGGATTGTTTGGCATAGCTTCACCAAATGGGCCATC-TTTCCTTAGAAGTGTTTTTGATAATTCGTATGTAGACATACAGGAAGTGCTTACATTCACTCTTGTCTAGTTTCCAGTCTCTTGTGATCTTCCTGCAATCCCTTATCCTCCCGCGCA + +a +s mr.mrrefChr3 62899 35 + 181019 CACTTAACTTAAGTCCCTGTGTGACGCTAAGGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510435 35 + 636262 CGCTTAACTTAAGTCCTTGTGTGATGCTAAGGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 521792 35 + 647215 CACTTAACTTAAGTCCCTGTTTGACATTAAGGACA + +a +s mr.mrrefChr3 62934 171 + 181019 TTTTGTTATCAACACAGTAGATAGATAGATAAATCAATTTAATATGTAGCTTCTCAGTCTATACAGTTGATGGTCCTGCAAGGGGCATGCCTCACTTAGCTGGAGGTACTCTGATACACACTTGAAGACCTAAAGTCAAGCATAGAGAGTGAATATCTAGCTGATCCCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510470 167 + 636262 TTTTGCTATCAGCACAGT----AGATAGATAAATCAATTTAGTATGTAGCTTTACAGTCTATACAGTTGATGGTCCTGCAAGGGGCATGCCTCACTTAGCTGGAGGTACTCTGATACACACTTGAAGACCTAAAGTCAAGCATAGAGAGTGAATATCTAGCTGATCCCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 521838 171 + 647215 TATTGTTATCAACACAGTAGATAGATAGATAAATCACTTTAATATGTAGCTCCTCAGTCTATACGGTTGATGGTACTGCAAAGAGCATGTCTTACTAAGCTGGAGGTACTCTGACATGCACTTGAAGACATAAAGTCAAACATAGAGAGTTAAGGTCTGGCTGAACTCAAT + +a +s mr.mrrefChr3 63105 46 + 181019 AGCTTATCTACCAACACAGTGCAGTATAATACTTGGGTTTCCAGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510637 46 + 636262 AGCTTATCTACCAACACAGTGCAGTATAATACTTGGGTTTCCAGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 522020 46 + 647215 AGCTTATCTGTCAACACAGTGCTACATAATACTTGGACTTCCAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 63151 20 + 181019 CAAAAGATGCAACTTGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510683 20 + 636262 CAAAAGATGCAACTTGCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 522067 20 + 647215 CAATAGATGAAACTTGCGCA + +a +s mr.mrrefChr3 63171 27 + 181019 AATCAAAGGCTGTCATGTATACACTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510704 27 + 636262 AATCAAAGGCTGTCATGTATACACTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 522087 27 + 647215 GATCAAGAGCTGTCGTGTATACACTGC + +a +s mr.mrrefChr3 63198 108 + 181019 TGAAGTGTGGAACTGTTCTTTGGTGTTGCAAAATGGTGTTTGTCCCCAAAGATGGGCCCATTGTTGCCAATCCATGGTGAGAGCCTCAGTAAGTTGCACGTCTCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510736 108 + 636262 TGAAGTGTGGAACTGTTCTTTGGTGTTGCAAAATGGTGTTTGTCCCCAAAGATGGGCCCATTGTTGCCAATCCATGGTGAGAGCCTCAGTAAGTTGCACGTCTCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 522114 108 + 647215 CAGAGTGTGGAACTGTTCTTTGATGTTGTGAAATGGTGTTCATCCCCAAAGATAGGCCCTTTTTTGCCAATCCGTGAAGAGAGTCTCAGTAAGCTGCAAGTGTCTTTG + +a +s mr.mrrefChr3 63306 18 + 181019 TATTCGATCACAAGTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510856 18 + 636262 TATTCGATCACAAGTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 522222 18 + 647215 TATTCCATCACAAGTTCG + +a +s mr.mrrefChr3 63324 43 + 181019 ATACTCCAATTAGCATTATACACTATCTAGGGATAGATACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510879 42 + 636262 ATACTCCAATTAGCATTCTACACT-TCTAGGGATAGATACATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 522240 43 + 647215 ATAATCCAATTAGAATTATACACTATCCAGGGAAGGATACATA + +a +s mr.mrrefChr3 63367 37 + 181019 CCAAGCTTCTTCCATTAACAACTGATAAACATTCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510922 37 + 636262 CCAAGCTTCTCCCACTAACAAATGATAATCATTCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 522283 37 + 647215 CCAAGCTTGTTCCATTAAAAACTGATAAACTTTCCAA + +a +s mr.mrrefChr3 63404 42 + 181019 TAAACCATCTTAAGGCAGTGGGGCTCAGTACTCTCTACATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 510960 38 + 636262 TAAACCATCTTAAGGCA----GGCTCAGTACTCTCTACATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 522320 42 + 647215 TAAACCATCTTAAGGCAGTGGGGCTCAGTACTCTCTACATGA + +a +s mr.mrrefChr3 63446 81 + 181019 TTGTAGGACAGTATAGTAAACACTAAAAAGCTCCCACAAAGGATGCCAATCCTCTCGTTGGTTGGTCTGGCTAAGAAAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511002 81 + 636262 TTGTAGGACAGTATAGTAAACACTAAAAAGCTCCCACAAAGGATGCCAATCCTCTCGTTGGTTGGTCTGGCTAAGAAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 522362 81 + 647215 TTGTAGGACAGCGTAGCAAACTCTAACTAGCCCCCACAAAGGATGACAATCCTCTGGTTAGTTGGTCTTGATAAGAAAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 63527 58 + 181019 GTTGTTCTTGTACCCCATCATATTTTTATGATTTTGTTAACTATGAACATACTTAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511089 57 + 636262 GTTGTTCTTGTACCCCATCATA-TTTTATGAGTTTGTTGACCATGACCATACTTAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 522443 58 + 647215 GGTGTTCTAGTACCCTATCACATTTTTACAATTTTGTTAACTATGAACATACTTAAGA + +a +s mr.mrrefChr3 63585 145 + 181019 AAGAATCAGCAAGGATGTGCAGAAAAAATACCTAGTAATTGGCGAATTTTGTTCACAATCTATTTACAAGTCATTAATTGGATGTTTTATTATTCTATTAACCTGTTATCTTGCCTCTGTTGTAAGGATACTCATAGGAACCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511146 135 + 636262 -------AGCAAGGATGTGCATAAAAAATACCTATTCGTTGGCGAATTCTGTTTAAAATCCATTTACAAGCCATTAATTGGATGTTTTG-TACTCTATTAACCTGTTATCTTGCCTCTGTTGGAAGGATA--CATAGGAACCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 522504 143 + 647215 AAGAATCAGTAAGGATGTGCAGAAAAAATATCTAGTAATTGGCCAATTTTGTTCCCAAACTATTT-CAAGTCATTAATTGGATGTTTTATTATTCTACTAACCTGTTATCTCATCTCT-TTGTGAGGATACTCCTAGGACCCCCC + +a +s mr.mrrefChr3 63730 994 + 181019 CAGACTAGGAGCTATAAAATTTGAAATAAGCTGGCAAAAAGATACACCTCATGCTGTTTATAGAGAAGAATAACAATGAATAACATGAAGTCTTTCTAACATAGACTTGTAAGTTTATTGTATCGGATAACATGTTTTTTCTTCATTCCCTTGATCACCAACCCCTTCCTTCCTTTTTTGTATCAGACCAAAAGGACATACCACACCTCCCCACACCTTCAGGTTGTTTTTCTATTATGGTCATGTATCTATCATTGGGACAACATCTGAGGAGTTTCATAAGCTAACCCCTTGGACATGGATGTTCCAGCTGGAATCCATGAACCTAATTCACCAGAGCCAACATGGTTGCTAACTTTTGCGCTTGGAATGCTTGCTCAAATTTACAGCCATATGATAGTGGGATACACCCTTTTGGATGCATATATTATGGCTGCAAGATAAGTGGAACTTAATCTCCGGTAACTCTGGCAGTCTCTGAAATAATTGTGATGGAAAAGTGCAACCCACATTGTGTCTGGTGGCATAAAATGTGACTAACACACCAGAGAATGGGCCTTTAGCAAGAAAAAGCATTTTGACAAATAAATTACACACAATTCCTATTGTACAGACGGACCATGTACAATATTCTAGGATTTCTTTTGTCCCTTAATGTCTCTCCACGTCTTGCCCTAGCGATCCCCACTGCTAGCAGATCACCATCTGGGGGGTAACAAACATAAAGGATCTGCTGGTGCAATCACAAATTTTTTCGTTTGTTAGTGTTTGAACATAGGGGTAATGGTGCTTCTGCTTGTCATTCAATTCTTTCTGTCATGATCTTATTGTGAAATCACACTCTCTGGTTGATATCAAGTCCCAACTTTAGACACTGGGCTGTGGAGAACATATAACGTGCATTCCTGGTTCTACCCTGCTATCTTTTGTATGATTCCAGCCTGGCCATAGGCTTATGTtgctgacatcactaccttatactgcattgtTGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 511281 934 + 636262 CAGACTAGGAGCTATAAAATTCGAAATAAGCTGGCAAAAAGATACACCTCATGCTGTTCATAGAGAAGAATAACAATGAAGAACATGAAGTCTTCCTAACATAGACTTGTAAGTTTATTGTATTGGAAAACATGTTTTTTCTTTATTCCTTTGATCACGGATCCCTTCCTTCCTTTTTTGTATCCGACCAAAAGGACATACCACACCTCCCGACACCTTCAGGTAGTTCTTCTACTATGGGCATATATCTATCATTGGGACAACATCTGAGAATTTTGGTAAGCTAACCCCTTGGACATGGATGTTCCAGCAGGAATTCATGGACCCAATTTGCCGGAGCCACCATGGTTGCTAACTTTTTTGCTTGGAATGCTTGCTCAAATTTACAGCTATATGATAGTGGG------------------ATATATTATAGCTGCCAGATAGGTGGAACTTAATACCCGGTAACTCTGGCA------TAAATAATTGTGATGAAAAAGTGCAACCCACATTGTGTCTGGTGACATAAAATGTGAC-TAAACACCAGAGAATGGGCCTTTAGCAATAAAAAGCATTTTGACAAATAAATTACACACAATTCCTATTGTACAGCTGGACTATGTACAATATTTTTGGATTCATTTTGTTCCCTCACAGTTCTCCATGACTTGCCCCAGCGATCTCTACTGCTGGCAGATCACCATCTGGGGGGTGACATACATAAAGGATCTGCTAGTGCAATCACAAGTATTGTGATTTGTTAGTGTTTGAACGTAGGGCTAATGGTGCTTCTGCTTGTGATTCAATTCTTACTGTCATGATCTTATTGTGAAATCACACTCTCTGGTTGATATCAAGTCCCAACTTTAGACACTGGGCTGTGGAGAACATATAACGTGCATTCCTGGTTCTAACCTGCTATCTTTTGTATGATTCAAGCCTGGCCATAGGCTTATGT----------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 522649 974 + 647215 CAGACTAGGAGCCTTAAAATTTGAAATAAGCTGTCAAAAAGATACACCTCATGCTGTTT-----GAAGAATAACAATGAGTAACATGAAATCTCTCTAACATAGACTTGTAAGTGTATTGTATCGGATAACATGTTTTTTCTTCATTCCCTTGATCACCAACCCCTTCCTTCCTTTTTTGTATCAGAG----------TACCACACCTCCCCACACCTTCAGGTTGTTTTTCTATTACGGTCATGTATCAATCATTGGGACAACATCTGA-GAGTTTCATAAGCTAACTCGTAGGACAAGGATGTTCCAGCTGGAATCCATGAACCTGATTCACCAGAGCCAACATGGTTGCTAAC--TTGCACTTGGAATGCTTGATCAAATTTACAGCCTTATGATAGTGGGATACACCCTTTTGGATGCATATACTATGGCTGCAAGATAAGTGGAACTAAATCTCCAGTAACTCTGGCAGTCTCTGAAATAATTGTGATGGTAAAGTGCAAGCTACATTGTGTCTGGTGGCATAGAATGTGACTAACACTCCAGAGAATGGGCCTTTAGCAAGAATAAGCATTTTAACAAATAAATTACACACAATTCCCATTGTACAGACGGACCATGTACAATATTCTAGGATTTCTTTTGTCCCTTAATGTCTCTCCACCTCTTGTCCTAGCAA--CCCACTGCTAGCAGATCATCATCTGGGGGGTAACAAACATCAAGGATCTGCTGGTGCAATCACAAATTTTTTCGTTTGGTAGTGTTTGAACATAGGGGTAATGGTGCATCTACTTGTCATTCAATTCTTTCTGTCAAGATCTTACTGTGAAATTGCACTCTGTGGTTGAAATCAACTCCCAACTTTAGACGCTGGGCTGTGGAGAACATATGATGTGCATGCCTGGTTATACCCTCCTATCTTTTGTATGATTCCAGCCCAGCCGTAGACTTATGTTGCTGACATCACTACCTTATACTGCATTGTTGCAG + +a +s mr.mrrefChr3 64724 45 + 181019 CTCACCTTatctttgaaCTCCTTATCACtAGCTgatctggaagtc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512215 28 + 636262 -----------------CTTATTATCACTAGCTgatctggaagtc +s simRat_chr6.simRat.chr6 523624 44 + 647215 CTCACCTTATCTTTGAACGCCTTATCAC-AGCTGATGTGGAAGTC + +a +s mr.mrrefChr3 64769 502 + 181019 tcttaaaaattgggaagccaagacctattgagctgtactgtgtcatagtaaccaaactagaaaagggatatggaatctaGGTCGACAGTATTGAATCACAGACTCTCTACAATTGATTGTCACTGTTCAATCTAACTATTTTTGGGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTTCAAGTGGAGTGGCTACTGCAGTAGGCTTGTCTATAGCAAACCTAAACAAGTTTCTGCCTAATGTATCGGAACACTAATACCTCTATAACACTAAACTAAGATCAAGGTTCACTTGCTCGGCCTTTTTATTGGCCTTTAAACAATATTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCAACATAACTAGGAGCATCAAATAACGGAATTGTCAAAAGGTCCTTTTAGTATGTAATGCATTCTAGAATTTTTGGGACTAGGAGTAAACATGCCCTAGAGTATCCCTCCAGGTTTATACAAAATGTGCTTAGGGTAGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512244 476 + 636262 tcttaaaactgggcaagccaagacctattgagctgcactgtgtcatagtaaccaaactagaaaagggatatggattctagGTAGACAGTATTGAATCATAGACT---TACAATTTATTATCGCTGT------------------GGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTTCAAGTGGAGTGGCTATTGCTGTAGG-TTGGCTCTAGCAAACCTAAACAAGTTTCTCCCTAATGTATCAGAACACTAATACCTCTATAACACTAAACTAAGATCAAGGTTCACTTGCTCGGCCTTTTTATTGGCCTTTAAACAATACTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCAACACAACTAGGCACATCAAATAACGGAATTGTGGAAAGGTCCTTTTAGTATGTAATGCAGTCTAGAAATTTTGGGACTAGGAGTAAACATGCCCTAGAGTATCCCTT---ATTCATCCAAAATGT-CTTAGGGTAGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 523668 502 + 647215 TCTTAAAAATTGGGAAACCAAgacctattgagctgtgctgtgccatagtaaccaaattagaaaagggatatggaatctaTGTCGACTGTATTGAATGACTGACTCTCTACTATTGATTGTCACTGTTCAATCTAACTATTTTTGGGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTCCCAGTGAAGCGGCTACTGCAGTAGGCTTGTATATAGTAAACCTAAACTAGTTTCTGCCTAATGAATGGGTACACTAATACCTCCATAACACTAAACTAAGATCTAGGTTCACTTTCTTGGCCTTTTTATTGGCCCTTAAACAATGTTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCGACATAATTAGGAGCATCAAATAACTGTGTTGCCAAAAGGTCCTTTTATTATGTAAACCATCCTAGAATTTTTGGGACTAGGAATAAACATGCCCTAGAGTAACCCCCCAGGTATGTACAAAATGTGCTTAGGGTAGCCC + +a +s mr.mrrefChr3 65271 167 + 181019 TGTACACCCCGAATAAGTGATTTGTGTACTTCAAATAACCCCCATGAGCTTTGAGATTCCCCATACATGTCTCTTGTCTAGAATTAATAATTGACTGTCTAGATTGCCAGGACTTCTGGTCTAGACAGGAACTGTGTTGGCTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512721 167 + 636262 TGTACACCCCGAATAAGTGATTTGTGTACTTCAAATAACCCCCATGAGCGTTGAGATTCCCCATACATGTCTCTTGTCTAGAGTTAATAATTGACTGTTTTGATTGCCAGAACTTCTGGTCTAGACAGGAACAGTGTCGGCTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 524170 161 + 647215 AGTTCACCCAGGATAGGTAATTTGTGTACTCCGAATAACCCCCATAAGGTTTGAGATTCCCAACACATGTCTCTTGTCTGGAATTAA----TGGCTTGCTAGATTGCCAGG--TTCTGCTCTAAACAAGAGCTGTGTTGATTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 65438 73 + 181019 TGTTAAATTCACATTCTTGTTATGCATAATTGCACCCAAATGTAAAAATTGAGTATAGCTGATAGCAAACTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512888 73 + 636262 TGTCAAATTCACATTTTTGCTATGCATAATTGGACTCAAATGTAAAAGGTGGGTATAGCTGATAGCAAACTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 524334 71 + 647215 TGTTAAATTCACAACCTTGTTATGCATAATGGCACCCAAATCTAAAAATAGAGTATA--TGATAGCAAACTTG + +a +s mr.mrrefChr3 65511 146 + 181019 AACATTAGATTTTACATTCTACCCTACTTTCAAATAGGAAGGTATGTTAAATGGCAGTGACTAAGACCCAGTATAAGTAGTAAGAGCAGCCTAACCATGATGTAGATTCTTAAATGCAATGTGGTGAATATGACAACAGTATTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 512961 146 + 636262 AATATTAGATTTTACATTCTACCCCAGTTTGGGATAGGAAGGTATGTTATATGGCAGTGACTAAGGCCCAGTATAAGTAGTAAGAGCAGCCTAACCATGATGTAGATTCTTAAATGCAAAGTGGTGAATATAACAACAGTATTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 524407 146 + 647215 AACATTAGATTTTACATTCTACCCTACTTTCAAATAGGTAGGTATGTTAAATGGCAGTGACCAAGACCCAGTATAAGTAGTAAGAGCAGCCTAACCATGATGCAGATTATTAAAAGCAATGTGGTGAACATGACAACAGTATTAAT + +a +s mr.mrrefChr3 65657 69 + 181019 GGCAAGATAAGTATATCATTTGTCGATGATGTGGCCAATAATGACCATCCACACTACACCCATGGATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513107 69 + 636262 AGCAAGATAAGTATATCATTTGTCGATGATGTGGCCACTAATGACCATCCACACCACACCCATGGATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 524555 69 + 647215 GGCAAGATAATTATATCATTTGTCGATGATGTGGCGAATAATGACCATCCGCACTACACCCATGGATAG + +a +s mr.mrrefChr3 65726 129 + 181019 GAAGAGGATAAGGAGCGGGTTTTCTGCTTAAAGAGAACCTGAGAATCAAGGGAATCAGGTAATAAGAAAAGTCATCTACTCTGAGCCAGTACAATGCTAATTTGAAGGAGAACCTATACTTGATATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513176 65 + 636262 GAAGAGGATAAGGAGCGAGTTTTCTGATTAAAG----------------------------------------------------------------TAACTTGAAGGAGAACCTATACTTGATATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 524626 129 + 647215 GAAGAGGATAAGGAGCGGGTTTTCTGCTTAAAGAGAACCTGAGAATCAAGGGAATCAGGTAATAAGAAAAGTCATCTACTCTGAGCCAGTACAATGCAAATTTTAAGGAGAACCTATACTCGATATGCT + +a +s mr.mrrefChr3 65855 23 + 181019 TAATTGGTAACTAAGTCACAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513241 23 + 636262 TAATTGGTAACTAAGTCATAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 524756 23 + 647215 TAATTGGTAACTAAGTCACAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 65878 156 + 181019 AAGTGAATATTACCGATGCATGCTGAGATGGACAAGCAGTTAGATACCATTATGGAATCCAAGGTAGGGGTAGAAAGATAGGTGGTGGAATTTATGATCTATAAAAAACTGGGATAACACCAGCATTTAAGTACTTAATTTACCCCTCCAAAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513276 150 + 636262 AAGTGAATATTACCCATGCATGCTGAGATGGGCAAGCAGTTAGATACCATTATGCAATCTAAGGTAGGGGTACAAAGATAGGTAGTGGAATTTATGATCTATAGCAATAT------ACACCAGCATTTGAGTACTTAATTTCCCCCTCCAAAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 524779 145 + 647215 AGGGGAATATTAATGATGTATGCTAAGATGGAC-AGCAGTTAGATACCATTATGGAATCCAAGGTAGAGGTAGAAAGATAGGTGGTGGATTTTGTGAGCTATAAAAAACTGGGATAACACCAGCATTTAAGC-CTTAATTTACCCGT--------- + +a +s mr.mrrefChr3 66034 201 + 181019 CCAAAGAATTAGAGACTGTAGAGTACAGTTTTAAGGATGCTGAAAGTAATAAGCAAAGGAAAGTGAACCTGGATATAGGGGCTGGGTTGATCTAGGGTAAATATCTGATGAAAACAGTAGTTAGGTGCTAACGTGTGTTACTGTGGACCAAACCAGGGCACTATGACCTGAGCTACCATACTAAGTTCCTCAAAGAGGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513437 187 + 636262 CCAAAGAATTAGAGACTGTTGAGTACAGTGTTAAGGATGCTGAAAGTAATTAGCAAAGGAAAGTGAACCTGGATATAGGGGCTGGGTTGATTTATGGTAAATATCTGATGAAAACAGTAGTTAGGTGCTAACGTGTGTTACTGTGGACCAAACCAGGGCACTATGACCTGAGCTCCCAGACTAAGTT-------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 524924 192 + 647215 CCAAAGAATTAGATGCTGTAGAATACAGTTTTAAGGGTGCTGAAAGTAATAAGCAAAGGAAAGTGAACCTGGATATAGGTGCTGGGTCGATCTAGGGTAAATATCTGATGAAAACAGTAGTTAGGTGCAAA--------ATTGTGGACTGAACTAGGGCACTAC-ACCTGAGCTACCATACTAAGTTCCTCAAAGAGGCTT + +a +s mr.mrrefChr3 66235 32 + 181019 GAAGAGGCTTTTATCCACAAAGAGGCTTGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 525128 32 + 647215 GAAGAGGCTTTTATCCACAAAGAGGCTTGTTC + +a +s mr.mrrefChr3 66267 19 + 181019 TGGACTAGATGACTCTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 525236 19 + 647215 TGGACTAGATGACTCTCTT + +a +s mr.mrrefChr3 66286 147 + 181019 GGATGATGCGTTCTGTATAGTGAATGTGACTATTCAGGGTGGGGAGGGTCAAAATGGACTAGATACAACCTTAACTTTAAATATGAACTGTCCTTGAGTGTATTTGAAACGTTTCATTCTCTCAGTGCCCTAATGAACAGAAAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513624 124 + 636262 -----------------------ACATGACTATTCAGGGTGGGGAAGGTCAAAATGGACTAGATGTAACCTTAACTTTAAATATGAACTGTCCTTGAGTGTATTTGAAACGTTTCATTCTCTCAGTGCCCTAATGAACAGAAAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 525265 147 + 647215 GGATGATGCGTTCTGTATAGTGAATGTGACTATTCAGGGTGGGGAGGGTCAAAATGGACTAGATACAACCTTAACTTTAAATATGAATTGTCCTTGAGTGCATTTGAAACACTTCATTCTGTCAGTGCTCTACCGAACAGAAAATCA + +a +s mr.mrrefChr3 66433 17 + 181019 CTATCATGTGGAATAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513749 17 + 636262 CTATCATGTGGAATAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 525412 17 + 647215 CTATCATGTGGAATAAA + +a +s mr.mrrefChr3 66450 65 + 181019 TCCCCACAAGGCAGCGTGTATGGCTGTGTATGCCACCACTTGCTCAGAAATGGTGTCTTTATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513767 65 + 636262 TCCCCACAAGGCAGCATGTATGCCTGTGTATGCCACCACTTGCTCAGAAATGGTGTCTTTATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 525429 65 + 647215 TTCCTGCAAGGCAATGTGTATGGCTGTGTATGTCCCCACTTGCTGAGAAGTGGTGTCTTTAGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 66515 197 + 181019 CCCGACTGTTTGCTATGTAACTCCCTGTGGCCCTGCTTTGTGTATAAACACTCAATATCCTTGGTATTCTGTAGTATGTCTTGGTTCATTTCTTCGAATAGCTGCTCTGTTATATACCATCTCCTTGTGTAGATAAAATCTAATATGAATATAGTAGCATCTATGTGTTGTGCATATTATGTTGACTATATGTGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 513834 176 + 636262 CCCCACTGATTGCTATGTAATT-----------TGCTTTGTGTATAAACACTCAATATCCTTGGCATTCTGTAGTATGTCTTGGTTCATTTCTTCGAATAGCTGCTCTGTTATATACCATCTCA----------AATATCTAATATGAATATAGTAGCATCTATGTGTTGTGCATATTATGTTGACTGTATGTATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 525494 185 + 647215 CCTGACTGTTTGCTACGTAGCTCCCTGTGGCCCTGTTTTGTGTATAAACACTCAATATCCTTGGTATTCTGTAGTATGTCTTGGTTCACT------------TGCTCTGTTATATACTATCTCCTTGTGTAGATAAAAATTAATATGAATATAGTAGCATCTATGTGTTGTGCATATTAGGTTGACTATATGTGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 66712 128 + 181019 ACATGCCCAGCCCATGTCCCAACTAGGATCAAAGGATGGAGCCTTAATGAAAGGACCGCTAGAGCCTTAATAAAGCCTTATTTGATAGAATAGGTATACCTGGCTTCCTATTTGCAGATAAATGAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 514010 128 + 636262 ACATGCCCAGCCTATGTCCCAACTAGGATCAAAGGATGGAGCCTTAATGAAAGGACCGCTAGAACCTTAATAAAGCCTTATTTGATAGAATAGGTATACCTGGCTTCCTATTTGCAGATAAATGAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 525684 123 + 647215 ACATGCCCAGCCCATGTCCCATCTAGGATCAAAGAATAGAGCCTTACTGAAGGGGCCGCTAGAGCCTTAATAAAGCCTTATTCG-----ATAGGTATACCTGGCTTCCTATTTGCAGATAAATGAGTG + +a +s mr.mrrefChr3 66840 132 + 181019 ATGGGTCAACAGCCCAGAGCCCTAGAGGTGATTGGCAGGTAAGAAAGGGGTATGATTAAAGACTTGTTCATTGATTTTGACTTGAGAATAAACACTCTAGGCAGACTTATAAATTGATATTTAGTCTTACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 514138 127 + 636262 ATGGATCAACACCCCAGAGCCCTAGA--CGATTAGCAGGTTAAAAAGGGGTATGATTAAAGACTTGTTCATTGATTTTGAC--GAGAAT-AACACTCTAGGCAGACTTATAAATTGATACTTATTCTCACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 525808 132 + 647215 AGGGGTCACCAGCCCAGAGCCCTAGAGGTGGTTGGAGGATAAGAAAAGGTAATGATTAAAGACTTGTTCATTGACTTTAACTTGAGAATAAACACTCTAGGCAGACCTATAAATCAATATTTAGATTTGCTA + +a +s mr.mrrefChr3 66972 103 + 181019 TCAGGGTGGCTGTGTGAGTCATGCCATTGCCACTATTATCTCTCCTAGAGACTCAACATCATCACATCAGATTTTTCCAGTGCTTTCTTCTTGATGTGTGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121557 103 - 636262 TCAGTGTGGCTGTGTGAGTCATGCCATTGCCGCTATTATCTCTCCTAGAGACTCAACATCATCACCTCAGATTTTTCCAGTGCTTTCTTCTTGATATGTGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 525940 103 + 647215 TCAGGATGGCTATCCGAGTGATGCCATTGCCACTATTATCGCTCCTAGAGACTCAACATCATCATATCAGATTTTTCCAGTGCTTCATTCTGGATGTGTGTGC + +a +s mr.mrrefChr3 67075 16 + 181019 GAAAGTAACTGATAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121663 16 - 636262 GTAAGTAACTGAGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 526043 16 + 647215 GAAAGTAACTGATAAA + +a +s mr.mrrefChr3 67091 14 + 181019 CACCAAGCCTACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121682 14 - 636262 CACCAAGCCTACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 526059 14 + 647215 TGCCAAGCCTGCAG + +a +s mr.mrrefChr3 67105 294 + 181019 GGGACACCATCACTTGATTTTATGACACTAACTGCAGTTGCAGCTAATTTGTTGATATAATGATTTGCCAATCTATCTAAAGAGTGTTAAGATACATCTAGGGAGTACACCCACAAGCATTCTTACATCTTGCTGTGGGAACTAATGAAGGAATACACTGAATAGAAGGTTACACGCAGTGGCTCAATACCGAAGGATATTAACAGTAGGAGGCATATGGCACTAAGCTTCAACATGTGAAAGTCAACTGTCATATGAGGAATCTACCCTCTGGCATAGTGTACACTGTGTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 121701 293 - 636262 GGGACACCATCACTTGATTTTATGACACTAACTGCAGTTGCAGCTAATTTGTTGATATAATGATTTGCCAATCTATCTAAAGAGTGTTAAGATACATCTAGGGAGTACACCCACAAGCTTTCTTACATCTTGCTTTGGTAAGTAATGTAGG-ATACTCTGGATAGAAGGTCACACGCAGTGGCTCAATACCGAAGGATATTAACAGTAGGAGGTCTACGGCACTAAACTTCAGAATGTCAAAGTCAATTGTCATATGAGGAATATACCCTCTGTCATAGTGTACACCATGTACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 526073 279 + 647215 GGGACACTGTCATTTGATTTTCTGATACTAACTGCAGTTGCAGCTAATTTGCTGATATAAGATGTTGCCAACCCATCTAAAGAGTATTAATATACATATAGGGAGTATACCTGAAAACATTCTTACATCTTGCTGTGGGAACTAATGAAGGAATACACTGAATAGATGGTTACATGCAAGGTCTCA---------------AACAGTAGGAGGCATATAGCACTAAGCTTCAACATGTGAAAGTCAACTGTCATATGAGGAATCCACCCTCTGGCATAGCGTACACTGTATAGC + +a +s mr.mrrefChr3 67399 80 + 181019 CAATGCAACTAAGTCCTGGTGACTACACAGGATAGTAATATAGATCTAGGGTGTTCATACTCTTGCCTTCCAAGATTGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 514705 80 + 636262 CAATGCAACTAAGTCCTGGTGGCTACATGGGGTGGTAATTTAGATCTAGGGTCTTCATACTCTTGCCTTCCAAGATTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 526355 74 + 647215 CAATGCAACTAAGTC------ACTACACAGGATAGTAATATAGATCTAGGACGTTCATACTTTTGCCTTCCAAGAATGAC + +a +s mr.mrrefChr3 67479 35 + 181019 TATCACCCAGGGAAACTCTACCCAGTTACAACTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 514793 35 + 636262 TATCACCCAGGGAAACTTTACCCAACTACAACTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 526429 35 + 647215 CATTGCCCAGGGAAACTCTACCCAGTTGCAACTCT + +a +s mr.mrrefChr3 67514 315 + 181019 TGTAATTCAGACAGGCTTGACTCCAGGGTCTAAGCTAACTGCAGAAAGTTAACATGTTTAAACACTTGGGATGATTGCCTAATGTATTTCATGCAGACCATAAAAGAGCATGCTCGCCCTGTGGCATCATCAGAAAGGTTGCCCACTTGCAAGTGTTGCTGCATCAGGTTGGACTAGCACGTTGACATTGTGGTAGGTCAGAAATGCAGCTAGTGCTACATCAGGGCGGACTAGCATGATGACATTGTGGGAAATCAGAAATGCAGCTAGTAACTAATGAGTTGTTTGGGAATACTATCAGGGAGCTTCAAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 514842 306 + 636262 TGTAGTTCAGACAGGCTTGACTCCAGGATCTAAGCTAACTGTGGAAAGTTAATATGTTTAAACACTTGGGATGATTGCCTAATGTATTTCTTGCAGACCCTAAAAGAGCATGCTCGCCCTGTGGCATCATC-GAAAGATTGCCCACTGGCAAGTGTTGCTGCAGCGGGTTGGACTAG--------CATTGTGGTAGGTCAGAAATGCAGATAGTGCTACATCAGGGCGGACTAGCATGATGACATTGTGGGAAATCAGAAATGCAGCTAGTGACTAATGAGTAATTTGAGAATACTATCAGGGAGCTTCAAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 526464 315 + 647215 TGTAAATCAGACAGGATTGACTCCAGGGTCTAGGGCAACTGCAGAGAGTTAACATGTTTAAACACTTGTGATGATTGCCTAATACATTTCATGCATATCATAAAAGAGCATGCTAGCCCTGTAGCATTATCAGAAAGGTTGCCCACTTGCAAATGTTGCTGCATCAGGTTGGACTAGCACGTTGACATTGTGGTAGGTCAGAAATGCAGCTAGTGCTGCATCAGATTAGACTAGCATGGTGACATTGAGGGAAGTCAGAAATGCAGCTAGTAACTAGTGAGTTGTTTGGGAATGCTATCAGGGAGTTGCAAGTGG + +a +s mr.mrrefChr3 67829 371 + 181019 GGAAGAAGTGTAAGGATCTAGCAATCATCAGACCATATTGAATTGTATCTAAAAGGCAAAAGGTGGGTGCAGTGTACAGACTGATTCAGTTTGACAAGCCATAGTAAAGAAATCGATGACACCTGTCAAAGTAAAGTGAATCGATCAGGAGAAACACTGTTATTCTGTTAGTAAGGATAACATCTAGTGTCTTAAGATCAAAAATTGGGAGCACATGTGCAGAACAAGTTCTGTCTCTCAAGCAGATATGTTCCATCAGAATTAAGTGTGGCGCCAGCATCATATAAGAGAGTCTGATACAGCATTCAACTAGTGCACAAAGATGAGCATCTACCTTTTGTGATCACCTGGCTATTATTGTCTGATATATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 515185 366 + 636262 GGAAGAAGTGTAAGGATCTTGCAATTATCGGACCAT-TTGAATTGTATCTAAAAGGCAAAAGGTGGGTGCAGTGTACAGACTGGTTCAGATTGACCAGCCACAGTAAAGAAATAGATAACACCTGTCAAAGTAAGGTGGATCTATCAGGAGAAACACTGTTATTCTGTTAGTAAGGATAACATCTAGTGTCTTAAGATCAAAAGTTGGGAGCACATGTGCAGAACAATTTCTGGCTCTCAAGCAGGTATGTTCCACCAGAATTCAGTGTGGCGCCAGCACCATATAAGAGAGT----TACAGCATTCAACTAGTGCACAAACATGAACATCTACCTTTTGTGATCACCTGGCAGTTATTGTCTGATATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 526779 371 + 647215 TGAAGAAGTGTAAGAATCCAGCAATCATCAGATCATATTGAATTATATCTAAAAGGCAAAGGGTGGGTGCAGTGTACAGACTGATCCAGTTTGATAAGCCATAGTAAAGAAATCGATGACACCTGTCCAAGTAAAGTGAATCGACAAGGGGAAACACTGTTATTCTGTCAGTAAGGACAATATCTAGTGTCTTAAGATCAACAATGGGGAGCACATGTGCAGAACAAGTTCTGTCTCTCAAGCAGATATGTTCCGTCAGGATTAAGTGTGCCGCGAGCATCATCTTAGAGAATCTGATACAGCATTCAACTAGTCCACAAAGATGAGCAACTACCTTTTGTGATCACCTGGCTATTATTGTCCGATATATA + +a +s mr.mrrefChr3 68200 52 + 181019 ATAGCCCTTAGTTGTTTGCCTCATTTAGATTACCTTCAGATCCTGTGGTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 515553 52 + 636262 ATAGCCCTTAGTTGTTTGCCTCATTTAGATTCCCTTCAGATCCTGTGGTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 527150 52 + 647215 ATAGCCCTTAGTTGTTCGTCTCATTTAGATTACCTTCAAATCCTGTGCAATA + +a +s mr.mrrefChr3 68252 12 + 181019 CAAACTATAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 515606 12 + 636262 CAAACTATAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 527202 12 + 647215 CAAGCTATAAAG + +a +s mr.mrrefChr3 68264 50 + 181019 ACACAAACCGGATTGTCATAAAGTGGAATCAAATTGATGCACCAACCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 515626 50 + 636262 ACAGAAACCGGATTGTTATAGAGTGGAATCAAATTGATGCACCAACCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 527214 50 + 647215 ATACAAATAGGAATATCATAAAGTCGAATCAAATTGATGCATCAACTAGA + +a +s mr.mrrefChr3 68314 366 + 181019 TCTACATTAATTATACGATGGTCTTCTTTTAACCAATATCTGTATTCAGACTTTTGTGCCTGTTACTTGAGGATCTAGGAGTGGAATAGGCAGTCATCGCATAAGTGACTTTACGGGTAACTCAAATTTTATCCATAATCCTGTTTCATTGAGAACATTTCTATACCCAAAGCGACTATAATTCAAGAGAACTGAGAAGTTATACTGCTTTTAGACATGTGTAGCACCAAAGCATCCTGTTGTGTTCTTAAGATGGCTGGACTCTTTTTTCTGCTCCTGCTAATTTATACATCAAAAGTACCACAAAGAGTTGGGATCAATTAAGTATTACAGAATCCATTGAGGCTTCAGCACTGTTAACAGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 515677 362 + 636262 TCTACATTAATTATACGATGGTCTTCTTTTAACCAATATCTATATTCAGAC----GAGCCTGTTACTTAAGGATCTAGGAGTGGAATAGACAGTCATCGCATAAGAGACTTTACAGGTAACTCAAATTTTATCCATAATCCTGCTTCATTGAGAACGTTTCTATACCCAATGCAACTATAATTCAAGAGAACTGAGAAGTTATACTGCTTTTAGACATGTGTAGCACCAAAGCATCCTGTTGTGTTCTTAAGATGGCTGGACTCTTTTTTCTGCTCCTGCTAATTTATACATCAAAAGTACCACAAAGAGTTGGGATCAATTAAGTATTACAGAATCCATTGAGGCTTCAGCACTGTTAACAGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 527264 366 + 647215 TCTACACTAATTATATAATAGTCTTCTTTTAACCAATATCTGTATTCGGACTTTTGTGCCTGTTTCTTGAGGATCTAGGAGTGGGGTAGGCAGTCATCACATAAGTGGCCTTACGGATAACTCCCATTTTAGCTTTAATCCAGTTTCATTGAGAACATTTCTATACCCAAAGCGACTATAATTCAAGAGAACTGAGAAGTTACACTGCTTTTAGACATGTCTAGCATCAACACATCATCTTGTGTTCTTAAGATGGCTGGACTGTTTTGCCTGCTCCTGCTAATTTATACATCAAAAGTACCACAAAGAGTTGGGATCAACTAAGTCTTACAGGATCCACTGAGGCTTCAGCATTGTTAACTACTT + +a +s mr.mrrefChr3 68680 28 + 181019 CTCTCATATTCATTATACCAGGTTGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516047 28 + 636262 CTCTCATATTCATTATACCAGGTTGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 527630 28 + 647215 CTGTTGTATTCTTTACACCAGGTTGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 68708 14 + 181019 GTAACAGCAGGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516075 14 + 636262 GTAACAGCAGGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 527666 14 + 647215 GTAACAGCAGAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 68722 89 + 181019 CATGTTCATTTCGTTAGAGAGGAGTCCATTCAACTGGGTCTAGTTCAAGATTGAGCTGGTAATAACCTCACTCTGCTTTATTGCCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516095 89 + 636262 CATGTTCATTTCGTTAGAGAGGAGTCCATTCAACTGGGTCTAGTTCAAGATTGAGCTGGTAATAACCTCACTCTGCTTTATTGCCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 527680 89 + 647215 CATGTTCAGTACATGAGAGAGGAGTCCATTCAACTGGGTCTAGTTCAAGAATGAGATGATAATAACCTCACTCTGCTCTATTGCCCAAA + +a +s mr.mrrefChr3 68811 79 + 181019 CACTGCTATATACTACCCATAGAAGCTATTTCTCTTTATCATCTTGGCTGACTATCTACTTTCACACTTATAGCCAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516198 79 + 636262 CACTGCTATATACTACCCATAGAAGCTATTTCTCTTTATCATCTTGGCTGACTATCTACTTTCACACTTATAGCCAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 527769 79 + 647215 TACTGCTGTAGGCTTCCTAAAGGGGCTGTTTTTTCTTGTCATCTTTGGTGACTATCTATTTTCATGTTTACAGCCATTC + +a +s mr.mrrefChr3 68890 116 + 181019 TCTACTCATCAGAATATTATCCATGTAAATGGGTTATACATCAATTGCCTCACTCTAGATGTTTAGTCACTGTGGGCTACCCCACAGGTTCACACCACGAGACTAGCCAGGTCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516280 115 + 636262 TCTACTCATCAGAATATTATCCATGTAAATGGGTTATACATCAATTGCCTCACTCTAGATGTTTAGTCACTGTGGGCTACCCCACAGGTTCACACCACGAGACTAGGCAG-TCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 527848 116 + 647215 TCTAATCATCAGAATATTACGCATGCAAATTGGTTATATGCCAATTTCCTCACTCCAGATGTTTAATCAATGTGGGCTGCTCCATCGGCTCATACCAAGAGTCTAGCCAGGTCAGT + +a +s mr.mrrefChr3 69006 5 + 181019 AATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516397 5 + 636262 AATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 527964 5 + 647215 AATCG + +a +s mr.mrrefChr3 69011 14 + 181019 AGATAAGCCATCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516404 14 + 636262 AGAAAAGTAATCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 527969 14 + 647215 AGATAGGCCATCAC + +a +s mr.mrrefChr3 69025 165 + 181019 CCAGCCTAGTTCACTTGCATTAATGGCTCATTGTTAGTCTTTGAGAGCTGCCACTTTCACTTTTAGAAAGTAGATTTTTTGAGGTGACCATCAGTCAGCTTGGGGCTTAGTGGAACCCTCCTCCCTTTCCTGTGCTTGGATGGTAATTTGAGAGAAGGGAAGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516493 126 + 636262 CCA--TTGGCCCACATGCATTACTGTCTCATTGGTAGTCTTTGAGAGCTGCCACTTTCACTTTTAGGAAGTATAGTTTTTGAGGTGACCATCAGTCAGCTTGGGGCTTAATGGGACCCTCCTCCCTTT------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 527983 156 + 647215 CCAGCCTAGTTCACTCG-ATTAATGGGTCATTCTTAGGACGTAA--------AGTTTCACTTTTAGAAAGTAGATTTTTTAAGGTGACCGCCAGTCAGCCTGGGGCTTAGTGGAACTCTCCTCCCTTTCCTGTGCTTGGATGGTAATTTGAGAGAAGGGAAGCTG + +a +s mr.mrrefChr3 69190 93 + 181019 GTTGTAGATGTAGCTTGCTTGGGGTGCAATTGAAGAGAAGCATGTCACCACTGTAAATTAAGTCTATTGCATGAGGAAGAACAGGGATCTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 528140 93 + 647215 GTTGTAGATGTAGCTTGCTTGGGGTGCAATTGAAGAGAAGCATGTCACCACTGTAAATTAAGTCTATTGCATGAGGAAGAACAGGGATCTGCA + +a +s mr.mrrefChr3 69283 35 + 181019 TATAACAGCAAGCATACAAGGTATGGAAAGTTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516619 10 + 636262 -------------------------GAAAGTTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 528238 35 + 647215 TATAACAGCAAGCATACAAGGTATGGCAAGTTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 69318 104 + 181019 CTAAATTCTTACGATTTCACATGAAATGAAGTCATGCAGCCCACAAAAAATAACTGTAATAACCCTGGTCTGCACATAGGGCTGTCAGAGTACTGCACATGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516703 100 + 636262 CTAAATTCTTT---TTTCACATGAAACAAAGTCATGCAGCCCGCAAAAAATA-CTGCAATAACCCTGGTCTGCTCATAGAGCAGTCAGAGTACTGCACATGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 528273 104 + 647215 CTAAATTCTTACGATTTCCCATTAAATGAGGTCATGCAGCCCACAAAAAATAACTGTAACAACCCTGGTCTGCACATGGGGCTCTCAGAGTACTGCACACGTTC + +a +s mr.mrrefChr3 69422 10 + 181019 ATGTGGTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516804 10 + 636262 ATGTGGTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 528377 10 + 647215 ATGTGGTTTC + +a +s mr.mrrefChr3 69432 18 + 181019 ACTAGTTCATACAGGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516815 18 + 636262 ACTAGTTCATACAGGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 528387 18 + 647215 ACTAGTTCATACAGGGCT + +a +s mr.mrrefChr3 69450 81 + 181019 CTAACACCATTTGAGCTATGGGGCTAAGAGTTAAGTCCATTGCCTCAGCATATTAACACTTATCTCAGGCTTGGCAGACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516833 81 + 636262 CTAACACCATTTGAGCTATGGGGCTAAGAGTTAAGTCCATTGCCTCAGCATATTAACACTTATCTCAGGCTTGGCAGACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 528421 81 + 647215 CTGACATCATTTGAGCTATGGGGCTAAGAGTTAAGTCCATTACCTCGGCATATTAATCCTTACCTCACCTCTGGCAGACTG + +a +s mr.mrrefChr3 69531 149 + 181019 ACTCAGGGTCCATTCTCAGTACCATCAACTATAATATATGAGGCTGTAGTGATCTCTTGGCCTGATAAAACAGCCTGACATATGGACGCCTGCAAAAGGCTAGCAGTGCCTATATTGTAACCATCAGTAGTATGGCATGTGTGTGGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 516914 149 + 636262 ACTCAGGGTCCATTCTCAGTACCATCAACTATAATATATGAGGCTGTAGTGATCTCTTGGCCTGATAAAACAGCCTGACATATGGACGCCTGCAAAAGGCTAGCAGTGCCTATATTGTAACCATCAGTAGTATGGCATGTGTGTGGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 528507 149 + 647215 ACTCAATGTCCATTCTCAGTACCATTATCTATAATGTAGGAGGCTGTGGTGATCTCTTGGCCTGATAAAACAGCCTGACATATGGACACTTTCAAAAGGCTAGCAATGTCTATATTGTAACCATCAGTCATATGTAAAGTGTGTGGTGA + +a +s mr.mrrefChr3 69680 187 + 181019 AATCTACATTGTTTGGAACTTGATACCATCTTCAGGTTGTCAGGTCTACCACGGTACTGCTCACCTCAATGCTATCAGGATGCCCATTCGTCTGTTTATTATCTTGACATGGATATCCCCTCTTCAGGGAAGTGGAGAATTAGTGACACAGATAGTATAACATTATATATAGTAACCAGGCCGGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517064 187 + 636262 AATCTACATTGTTTGGAACTTGATACCATCTTCAGGTTGTCAGGTCTACCACGGTACTGCTCACCTCAATGCTATCAGGATGCCCATTCGTCTGTTTATTATCTTGACATGGATATCCCCTCTTCAGGGAAGTGGAGAATTAGTGACACAGATAGTATAACATTATATATAGTAACCAGGCCGGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 528656 187 + 647215 GATCTACATTGTAAAGCACTTGATACCATCTCCAGGTTGTCAGGTTGACCACAGTACTGCTGGCCTCATTGTTGTTACCACACCCATGTGTCTGTTTATTATCTTAACATGGATCTCCCATCCTCAGGGAGGAAGAGAGTTAGTGACAGAGATAGCTTATCATCATATGTAGTCACCAGGCTGGTCT + +a +s mr.mrrefChr3 69867 54 + 181019 TCCCCTTATCTATTGGAGATGACTGATTCTTCTGCTGTCTTTCCCTGAAGTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517252 54 + 636262 TCCCCTTATCTATTGGAGATGACTGATTCTTCTGCTGTCTTTCCCTGAAGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 528843 54 + 647215 TCCCCTTATCTAGTAGAGATAAATGATGCTTCTGCTGCCTGCCCCTGAAGTTAA + +a +s mr.mrrefChr3 69921 16 + 181019 CTATAATAAAAGGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517318 16 + 636262 CTATAATAAAAGGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 528897 16 + 647215 CTATAATAAAAGGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 69937 83 + 181019 ACGCACTAGCTTGCCATATGAAGGGGGGCTGACTTTAGATTTGCTGTGCTCGTTAAATGTAATTTGCTATTTCCCCAGTGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517695 83 + 636262 ACGCACTAGCTTGCCATATGAAGGGGGGCTGACTTTAGATTTGCTGTGCTCGTTAAATGTAATTTGCTATTTCCCCAGTGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 528913 83 + 647215 AAGCAATAGCTTGGCATATGAAGGGGGACTGACTTCAGATCTGCTATGCCCGTTAAATGTGATATGCTAATTCCCCAGCATAT + +a +s mr.mrrefChr3 70020 4 + 181019 TCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517778 4 + 636262 TCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 529023 4 + 647215 CCCA + +a +s mr.mrrefChr3 70024 416 + 181019 ATTGATAGTCCAATGTCTTGTAGCTTAGTTCACtcagtgtattccatacagctcttctaggtcagttcacaagggtgtgacttcatgtcatcctgggggttgtgcaaacaactttggaatttgtatacaaaGATCTAGAATGTGAGACACAGTCTGATTGGTCACATTTCAAGGGCTTATTCCTATCTTGCCAATTGCCTAGTACAATCTTAGCTTAAGGAACGAATATACCATGGCCATGGGATGGGCCCAGTGAGGGGGAGAACATCAGTGTCTAAAATATCCACCTGGCATGTGATGTATACATGAATTGCTAATTCCAAGGTAGGGTGAATTAATTGTTAATGTCAGAGATAAGAGGTCATAAATGATAAACATGACATACATTCTCTCTTGTTTCTTTTGCTGGCAGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 517782 306 + 636262 ATTGATAGTCCAATGTCTTGTAGCTTAGTTCACtcagtgtattccatacagctcttctaggtcagttcacaagggtgtgacttcatgtcatcctgggggttgtgcaaacaactttggaatttgtatacaaaGATCTAGAATGTGAGACACAGTCTGCATGATCATATATCAAGGGCTTATTCCTATCTTGCCAATTGCCTAGTACAG---TAGCTTAAGGAACGAATATACCATGGACATGTGGTGGGCCCTGTGAGGGGGAGAACATCAATGTCTAAAATATCCACCTGGCTTGTGATGTATACATGA----------------------------------------------------------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 529031 415 + 647215 ATTGATCGTCCAATGTTTTGTAGCTCAGTTCACtcaatgtaatccatgtagctcttctaggtcggttcacaggggtgtgacttcaagttatgctgggggtggcgtcaacaactttggaatttatatacaaaGATCTAAAATGTGAGACAC-GTCTGATTGGTTACATTTCAAGGGCTTACTCCTACCTTGCCAATTACCTAGTACAATCTTAGCTCAAGGAACGAATATACCATGGCCATGGGATGACCCCAATGAGGGGGAGAGCGTCAGTGTCTAAGATATCCACCTGGCATGTGATGTATACATGAATTGCTAATTCCAAGGTAGGGTGAATTAATTGTTAATGTCAGAGATAAGAGGTCATAAATGATAAACATGACATACATTCTCTCTTGTTTCTTTTGCTGGCAGATAT + +a +s mr.mrrefChr3 70440 8 + 181019 CTGTATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 529448 8 + 647215 CTGTATGA + +a +s mr.mrrefChr3 70448 16 + 181019 ACGCTCACCCCTCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 529458 16 + 647215 ACGCTCACCCCTCAGT + +a +s mr.mrrefChr3 70464 24 + 181019 ATTACATATGAGAAGATTTTGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518088 21 + 636262 ---GCATATGAGAAGATGCTGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 529480 24 + 647215 ATTACGTATGAGAAGATTTTGACC + +a +s mr.mrrefChr3 70488 65 + 181019 GACAAAGGGGAGCCCATCTCTCTCACTATCCAAATAAGCTTGTATGCTGTACGTGCTTCCCTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518112 65 + 636262 GACAAAGGGGAGCCCATCTCTCTCACTATCCAAATAAGCTTGTATGCTGTACGTGCTTCCCTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 529504 65 + 647215 GACAAAGGGTAGCCCATCTTACGCACTATCCAAATAAGCTTGTATGTTGTATGTGCTTCCACCCT + +a +s mr.mrrefChr3 70553 133 + 181019 AAACTCCACAAGTTATACATGCAAGCACTGAAATCCCATATCCCATACACCAGGCGCTCATTTGGATCTAGCTGGCCATGGAGGTAATCTCAGAGTAGACTACAAGAGTGCTAGATGTAACAGCAACAAATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518177 131 + 636262 ACACTCCACAAGTTATATATGCAAGCACTGAAATCCCATATCCCATACACCAG--GCTCATTTGGATCTAGCTGGCCATGGAGGTAGTCTCAGAGTAGACTACAAGAGTGCTACCTGTAACAGCAACAAATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 529571 131 + 647215 AAACTCAACAAGT--TACATGCAAGCACCGAAATCCCATAGCCTATACACCAGGCGCTCATTTGGATCTAGCCGGCCATTGGGGTAATTTCAGAGCCGACTATGAGGGTGCTAGATGTAACAGCAACAAACGG + +a +s mr.mrrefChr3 70686 94 + 181019 TTGTAATAATTAACCATCTTGTATTCTGAAATGTATATTGGACTATATAACTGGTATATTTATTTGTATTTATTCTCACTATCCTTGAAGCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518312 94 + 636262 TTGTAATAATTAACCATCGTGTATTCCAAAATGTATATTGGACTAGATAGCTGGTATATTTATTTGTATTTATTCTCAGCATCCTTGAAGCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 529702 94 + 647215 TTGTAATAATTAACCACTTTTTATTCTGAGATGTATATAGGACTATATAACTGGTATATTTATTTGTATTTAATCTCACTATCCTTGAAGCAGC + +a +s mr.mrrefChr3 70780 97 + 181019 TAGATACAAGCCACCTGGCACAGTGCAAGCTTACAAGCCTATAATGTTCGGACTTGGGGATTAATTAACCTGTTACCATCAAACACCCTGTCTTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518407 97 + 636262 TAGATACGAGCCACCTGGCACAGTGCAAGCTTATAAGCCTATAATGTTCAGACTTGGGGATTAATTAACCTGTTATCATCAAACACCCTGTGTTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 529796 97 + 647215 CAGATACAAGCCACCTGGCACAGTGCAATCTTACGAGCCTCTAATGTTCGGGCTTGGGGATTAATTAACCTATTACCGTCAAACACCCTGTCTTAGG + +a +s mr.mrrefChr3 70877 221 + 181019 GATGTGACCTGTCTTAGTTTATAAAATTTTACAGTATTCAAGTGGCTTGTTAAGCCGCCATGATTGTTCCCAATGCTAAGTCACATTGGCCCACCAATGCATATTCTTTATGGTATTGTTCTGTGTGAGATCATTAGAGATGTAAACCCACAACAGAATGGTTGGATTGTCTCTTCAACGATGCTACAAAGGGAAATGGTATGTATGAAATCTGTGAGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518529 221 + 636262 GATGTGACCTGTCGTAGTTTATAAAATTTTACAGTATTCAAGTGGCTTGTTAAGCCGTCATGATTCTTCCCATTGTTAAGTCACATTGGCCCACCAATGCACATTCTTTATGGTATTGTTCTGTGTGAGATCACTAGAGATGTAAACCGACAACAGAATGGTTGGATTGTCTCTTCAACGATGCTACAAAGGGATATGGTATGTATGAAATCTGTGAGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 529893 218 + 647215 GATGTGACCTGTCTTAG---ATAAAATCTCGCAATATTCCAGTGGCTTGTTAAGCCACGATGATTGTTACCAATGCTAAGTCTCGTTTGCCCACCAATCCATATTCTCTATGGTATTGTTCTGTGTAAGATCATTGGAGATGTAAACCCACCACAGAATGGTTGCATGGTCCCTTCAGTGATGCTACCAGGGGAATTGGTATGTATGAAATCTGTGATGCT + +a +s mr.mrrefChr3 71098 43 + 181019 AGCAGGCATACCAAAAGATAGTTAGCTCAATGTGTTGATAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518750 43 + 636262 AGCAGGCATACCAAAAGATAGTTAGCTCAATGTGTCAAGAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 530114 43 + 647215 AGCAGGCATACTATAAGATAGTTAGCTCAATGTGTTGATAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 71141 143 + 181019 AGATAATAGAGGATCACCAACACTTGATTGCGTACACTAATTGATCAACGAATACGAGCTTAAGTCACCTTTATGCTCAACACCTAGATTTCTCAGTATTGTTTGCTAAGAAGAGAGTCAACATGGTATATCCCCACTTACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518794 139 + 636262 AGATAATAGAGGATCACCAACACTTGATTGCTTATA-TAACTGATCAACGAATACGAGCTTAAGTCACCTTTATGCTCAACACCTAG---CCTCAGTATTGTTTGCTAAGAAGAGAGTCAACATGGTATATCCCCACTTACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 530157 135 + 647215 AGATAATAGATGATCACCAA--------TCCGTACACTAATGGATCAACGAATACGAGTTTGAGTCACGTTTATGCTCAACACCTAGATTTCTCAGTATTGTATGCTAAGAAGAGGGTTTAAAGGGTATATCTCCACTCACCA + +a +s mr.mrrefChr3 71284 173 + 181019 AACCCTCCAGGTTGTTTAAGCTAGGTTGCCAGGGTCAGGAATTCCCTACAGAGTCTTATAAGGACCTGGTATCCGAGTGACTGGGCATCCCAAGTTCATTGTGTTCACCTACTTCAATCCACAGTTTCTAGGCCATAGCAATAACCCACCATGCAATGTTTGCCAAGAAGCCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 518933 156 + 636262 AACCCTCCAGGTTGTTTAAGCTAGGTTGCCAGGGTCAGGAATTCCCTAGAGAGTCTTATAAGGACCTGGCAT-----------------CCAAGTCCATTGTGTTCACCTACTTCAATCCATAGTTTCTAGGCCGTAGCAATAACCCACCATGCAATGTTTGCCGAGAAGCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 530295 173 + 647215 AACCCTCGAGGTTATCTAAAGTAGGTTGCCAGGGTCAGGAATTCCCTACAGAGTCTCATAAGGATCTGGTATCCGAGTGACTGGGCATCCCAAGTTCATCATGTTCACCTATTTCAATCCACAGTTTCTAGGCTATAGCAACGACCATCCATGCACTGTTTGCTAAGAAGCCG + +a +s mr.mrrefChr3 71457 26 + 181019 GGGCACAAAAATGTATTTGGGATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519091 26 + 636262 GGGCACAAAAATGTATTTGGGATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 530468 26 + 647215 GGGCACAAAAACATAATTGGGATTTG + +a +s mr.mrrefChr3 71483 24 + 181019 CTGGCAAAAAACATGCTCATAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519117 24 + 636262 CTGGCAAAAAACATGCTCATAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 530499 24 + 647215 CTGGCAAAAAACATGCTCATGACA + +a +s mr.mrrefChr3 71507 17 + 181019 AAAGGCAGGTGACACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519145 17 + 636262 AAAGGCAGGTGACACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 530523 17 + 647215 AAGGGCAGGTGACACAT + +a +s mr.mrrefChr3 71524 37 + 181019 GTGTTAGAGTATGAAGAGATTTTTTGTTACCCCCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519175 37 + 636262 GTGTTAGAGTATGAAGAGATTTTTTGTTACCCCCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 530540 21 + 647215 ----------------AGATTTTTTGTTAACCCCTTT + +a +s mr.mrrefChr3 71561 60 + 181019 GACGACTTATGCAAATGATAACAGGATTATGTCTGAATTTAAACAAATATGTGACACAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519213 60 + 636262 GACGACTTATGCAAATGATAACAGGATTATGTCTGAATTTAAACAAATATGTGACACAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 530561 60 + 647215 GACGACTTATGCAAATGATACCAGAATTTTGCCTTAGTCTCAACGAAAGCCACCCACAAC + +a +s mr.mrrefChr3 71621 8 + 181019 ATCGACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519273 8 + 636262 ATCGACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 530622 8 + 647215 ATAGACAT + +a +s mr.mrrefChr3 71629 54 + 181019 TGTATATTTTTTATTTTTCTGCAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519283 54 + 636262 TGTATATTTTTTATTTTTCAACAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 530630 54 + 647215 TGTATATTTTTGATTTTTCTGCAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTCAA + +a +s mr.mrrefChr3 71683 9 + 181019 TCAGCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519338 9 + 636262 TCAGCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 530684 9 + 647215 TCAGTCATA + +a +s mr.mrrefChr3 71692 334 + 181019 TGCACCAGGACCACCATGTACTGTGATTTCTGTATCTCTTCTTCTCACAGAGGAAATTAGTCAGCAATGGAGTAGGGTGATGGTTTTAGTAAGCTAGTCCAAAAAACATTTCCCTGTGAATCAATCTCATGATATGGTAGGTTCTGATTGTGATATTCAGTGACACCAGCCAGATCTTGAGTGTTTAGTTGTCTAGTCGCAGCCAAGGCACCATTGAGTTTGATAGTCAAGTTTTGTAACTGTCCTGGGGTTTAATTGAATCCAGCATAGACTACTATGATGTGGAGAAGTTAGTGAACTTGTATATCTTGCCTAGCCATTATTAGGTAATATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519347 306 + 636262 TGCACCAGGATCACCATGTACTGTGATTTCTGTATCTCTTCTTCTCACAAAGGAAATTAGTCAACAATGGAGTAGGGTGATGGTTTTAGTAAGCTAGTCCAAAAAACATTTCCCTGTGAATCATTCTCATGATC----------------------------ATGCCAGCCAGATCTAGAGTGTTTAGTTGTCTTGTCGCAGCCAAGGCACCTTTGAGTTTAATAGTCAAGTTTTGTAACTGTCCTGGGGTTTAATTGAATCCAGCATAGACTACTATGATGTGGAGAAGTTAGTGAACTTGTATATCTTGCCTAGCCATTATTAGGTAATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 530702 334 + 647215 TGCACCAGGACCACCATGTGCTCTGATTTCTGTATCTCTGCTTTGCACAGGGGAAATTAGTCAGCAATGGAGTAGGGTGATGGTTTTAGTAAGCTAGACCAAAAAACATTTCCCTGTGAATCAATCTCGTGATATGGTAGGTTCTGATTGTGATATTCAGTGCCACTAGCGAGATCTTGAGTGGTTGGTTGTCTACTCTTGGCCAAATTACCATTAAGTTTGATAGTAAAGTTTTGTCACTGCCCTGGGGTTTAATTGAACCCTGCATAGGCTACTATGATAAGGAGAAGTTAGTGAACTTGTTCATCTTGCCTAACCATTATTAGGTAATATA + +a +s mr.mrrefChr3 72026 76 + 181019 CCCTTGTGAATCAGGTACAGTGATTTTATGCCGGCCTTGGCACCATCAaatagacatttggctgttagagaagaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519654 76 + 636262 CCCTTGTGAATCAGGTACAGTGATTTTATGCCGGCCTTGGCACCATCAaatagacatttggctgttagagaagaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 531036 76 + 647215 CCCTTATGAATCAGGTATAGTGATTTTATGCTGGCCATTGAACCATCAAATAGACACTCACTTGCCAAAGAAGAAG + +a +s mr.mrrefChr3 72102 76 + 181019 tccacgctccaaagaagcatttacaaaagtgtacattctcgtaactcgtctcaTGAAGCTTGTAAGGGATGTGCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519730 76 + 636262 tccacgctccaaagaagcatttacaaaagtgtacattctcgtaactcgtctcaTGAAGCTTGTAAGGGATGTGCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 531127 76 + 647215 tctacgctccaaagaagcatctacaaaagtgtacatgctcataacccgtcCCATGAGGATTGTAAGGGATGTACGT + +a +s mr.mrrefChr3 72178 65 + 181019 TGGTGAAGCCGCTGATATCTGCACTACAGTCTGCCCACTATAATTTCCCACACCCCACAACTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519828 65 + 636262 TGGTGAAGCCGCTGATATCTGCACTACAGTCTGCCCACTATAATTTCCCACACCCCACAACTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 531203 65 + 647215 TGGAGAAGCAGTCGATATGTGCACATAGGTCTGCCCACTATAAGTTCCCACACCTTTCTACTAAC + +a +s mr.mrrefChr3 72243 141 + 181019 GTGGGAGCGATACTCTGAAGAGCCATTAGAAGGACTTAAGAAGCCTAATATATGAGAAGGACAGTACAGAAACCTATCATAGTGGAAAAGCACATGAAGAGGACCAGCACTCAAACTCTGAAGAGCCATAACGTGGACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 519893 141 + 636262 GTGGGAGCGATACTCTGAAGAGCCATTAGAAGGACTTAAGAAGCCTAATATATGAGAAGGACAGTACAGAAACCTATCATAGTGGAAAAGCACATGAAGAGGACCAGCACTCAAACTCTGAAGAGCCATAACGTGGACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 531269 141 + 647215 GTGGGGGTGTTACTCTGAAGACCCATGAAAAGGACTTAAGAAACCTAAGATATAAGAAGGATGTTTCAGAAGCCTAATGCAGTGGAGAAGCACACGAAGAGGACCAGCAGTGAAACTCTGAAGAGTCATAACACGGACAAT + +a +s mr.mrrefChr3 72384 23 + 181019 CAAGAAACACAATATAGTGGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520034 23 + 636262 CAAGAAACACAATATAGTGGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 531453 23 + 647215 CAAGGACAATCATATATTGGGGA + +a +s mr.mrrefChr3 72407 113 + 181019 GAAAGCGGTCATGGTCATAAGTGCCATCTCCAAGTACACCTAATATGGTGAGGGAACAAAAACAGTCAAGTAATCCTCACATGGCATGATGGACAGGAGAATGCAGGTAAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520064 113 + 636262 GAAAGCGGTCATGGTCATAAGTGCCATCTCCAAGTACACCTAATATGGTGAGGGAACAAAAACAGTCAAGTAATCCTCACATGGCATGATGGACAGGAGAATGCAGGTAAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 531476 113 + 647215 GAGAACGGCCATACTCAAAAGTGCCACCTTCAAGTACACCTAATATAGTGAGTGAACAAAAAGAGTCTAGTAAACCTCTCATAGCATGATGGACAAGAGCATTCAAGTAAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 72520 49 + 181019 CAAGCAAACCTCATCTGGTATAAAGGAGCATAAGAGATAGATTGTATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520177 49 + 636262 CAAGCAAACCTCATCTGGTATAAAGGAGCATAAGAGATAGATTGTATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 531602 49 + 647215 CAAGTAAACCTCATTCGGTATGAAGGAGCATAAGAAATAGATTGTATTA + +a +s mr.mrrefChr3 72569 12 + 181019 TAGTCAGACTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520226 12 + 636262 TAGTCAGACTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 531654 12 + 647215 TAGTAGGAGTAG + +a +s mr.mrrefChr3 72581 17 + 181019 ATGAAATGCATGTGCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520238 17 + 636262 ATGAAATGCATGTGCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 531669 17 + 647215 ATGAAATGCATGTGTGA + +a +s mr.mrrefChr3 72598 39 + 181019 TCAGTTTTTCCATCAACCAGACATCTTACCACTAAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520256 39 + 636262 TCAGTTTTTTCATCAACAAGACACTTTACCACTAAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 531686 39 + 647215 TCAGTTTCTCCATCAAACAGGCATCTTACAACCGAATCT + +a +s mr.mrrefChr3 72637 19 + 181019 AATGTGTTACCTGTTGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520295 19 + 636262 AACGTGTTACCTGTTGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 531726 19 + 647215 AATGTGTTACCTGTTGTCT + +a +s mr.mrrefChr3 72656 163 + 181019 AATCACATTACAGTGTTACAGATGGTTCTCTCTTTGAGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTCAATACCACTCATGCTGATAGAAATCACTAGTCTGCCAGCTTTGGCAGTGAGTGGTGCATTTGGGCCATAAGGTATGTTACTATGCTTGCTATGTAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520315 149 + 636262 AATCACACCACAGCGTTACAGATGGTTCTCTCTTTGCGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTCAATACCACTCATGCTGATGGAAATCACTAGTT--------------GTGAGTGGTGCATTTGGGTCATAAGGTATGTTACTATGCTTGCTATGTAGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 531745 163 + 647215 AATCACATTACAGTGTTACAGACGGTTCTCTCTTTGAGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTGAATACTACTCATGCTGATAGAAATCATTAGTCTGCCAGCTTTGGCAGTGAGTGGTACACTTGGGCCATAAGGTATCTTCCTATGCTTGCTATTTAGTAT + +a +s mr.mrrefChr3 72819 100 + 181019 TAATGTAGCCTTGTGTTTCTCCTGTGTCTAGTTACCTGACAGAATTTCCACTCAGTTAAATACGAACCCAGCCACTTCAAATGTCAAGTGACAGTAGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520465 100 + 636262 TAACCTGGCCTTGTGTTTCTCCTGTGTCTAATTAACTGACAGAATTTCCACTCAGTTAGATACGAACCCAGCCACTTCAAATGTCAAGAGACAGTAGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 531908 100 + 647215 TAATGCACCCTGGTGTTTCTCCTGTGTCTAGTTACCCGAAAGAGTTTCCATTCAGTTAAATATGTATCCAGCCACTTCAAATGTAAAGTGACAGTAGTAT + +a +s mr.mrrefChr3 72919 7 + 181019 AGGGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520565 7 + 636262 AGGGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 532011 7 + 647215 AGAGACA + +a +s mr.mrrefChr3 72926 8 + 181019 GTGGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520573 8 + 636262 GTGGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 532018 8 + 647215 GTAGTATA + +a +s mr.mrrefChr3 72934 151 + 181019 AGGATCTAACCATAGTGTTGTCAGAGGATTGAACTTCACCATTGAGAGTAGCTTATACCATGATGAAATCTTGCTTTAATATGTTGTTCTTGCAGTTCCTCTGAGAGGCCTGCCCCTCTCAGGCAATTACCAAATATACCATGCATTAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520594 151 + 636262 AGGATCTAACCATAGTGTTGTCAGAGGATTTAACTTCACCATGGAGAGTAGCTTATACCATGATGAAATCTAGCTCTAATATGTTGTTCTTGCGGTTCCTCTGAGAGGCCTGCCCCTCTCAGGCAATTATCAAATATACCATGCATTAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 532026 150 + 647215 GGGGTCTAACCATAGTGTTGTCGGAGGGTTGAACGTTATCCGTGAGAGTAGCTGATATCATGATGAAATCTTGCCTTAATATGTTGCTCTTGCAGTTCCTCG-AGGGACCTGCCCCTCCCAGGGAATTACCAAATGTCCGATGGATGGGAT + +a +s mr.mrrefChr3 73085 99 + 181019 TCCCCAAATAGCAACTTAATGGTCAACTATACAGGGCCATGTAGTACCTGGATGCTAGATTATGTAAAGGGATGCTGCCTTGGCTAAAGAAACAAGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520747 99 + 636262 TCCCCAAATAGCAACTTAATGGTCAACTATACAGGGCCATGTAGTACCTGGATGCTAGATTATGTAAAGGGATGCTGCCTTGGCTAAAGGAACAAGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 532176 99 + 647215 TCCCCAAATAGCAACTTAATGGTCAACTATACAGGGCCATGTACTACCTGGAGGCTAGATTACGTAAGGAGATGCTGCCTTGGCTAAAGAAATAAGAGG + +a +s mr.mrrefChr3 73184 734 + 181019 GACTTACACAGTATATAAATACACAGAAAGCACCTGGTGAGCAGCAGAACAGACAGATACACAGCTGCAGGCATTAGACTGCACGCAGGTATCTAACACTGGCATATAGGGAATCTCAAGGACTTTAGAATATTTCAAGCAAGAGTCTCCCAAAAATGGTGGCAACTAGAGTGGTCTTTAATATGAGGCATGTAAGGTTTTAGGAAATAGGTGAAATGCGGCCTTGTCACTGTAATGCTTTTTTGGCCTCAATTGAATTAATTGTATGCTCATTGGATAGAAGTCTTGCAACTTGAGAACTGGAGACTGGAGGTTGGTGCTAAGTTATGATCCTGCTAAATCAGATGGCACAGGAGGTTAAAGTCCATTGAGCCTCATGGTGAAAGGTTAAAGTCTATAATGAAAAATAAAGATAAGGGAGACCCATATGGTTTGTTGGTATGGAAGATATGGTAGGTGAGTAGGAGGCCCATACACTTTATCCCCCCACAGAATACAGGGCAAAACTGTTGTTATTATATTTTGTGGGTCACAAATGGAGCATAAAAGACACTTGTACAAGTGAACACCAGTACCTATCAGCATGCACATGACAAAATGACAAGGTCATTTTAAGTACTAACTAAACAAATATGGTATTTGTCTCAAAGGTACAATGTGGTGGTATCTGGCATTATCACAGCATAAACTATGACTGGTGCAAGTTAGTTATTAGCCGGGGGGACATGTACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 520846 719 + 636262 GACCTAAACAGTATATAAATACACAG---GCACCTGGTGAGCAGCAGAACGGACAGATATACAGCTGTAGGCATCAGACAGCACACAGGTATCTAACACTGGCGTTTAGGGAATCTTGAGGACTCTAAG-----------AAGAGTCTTCCAAAAATGGTGGCAACTGGTGTGGTCTTTAGTAAGAGGCATGTAAGGCTTTAGGAAATAGGTGAAATGTGGCCTTGGCACTGTAATGCTTTGTTGGCCTCAATTGAATTAATTGTCTGCTCATTGGATAGAAGTCTTGTAACTTGAGAACTGGGGACTGGAGGTCGGCGCTAAGTTATGATCCTGCTAAATCAGATGCCACAAGAGGTTAAAGTCCATTGAGCCTCATGGTGAAAGGGCAAAGTCTATAATGAAAAATAAAGATAAGGGAGACCCATATGGTTTGTTGGTATGGAAGATCTGGTAGCTGAGTAGGGGGCCCATACACTTTATCCCCCCACAGAGTACAGGGCAGAACTGTTGTTATTATATCTTGTGGTTCATAAATAGAGCATAAAAGACACTTGTACAAGTGAACACCAGTCCCTATCAGCATGCACAAAACAAAATGACAAGGTCATTTCAAGT-CTAACTAAATAAATATGGTATTTGTCTCAAAGGTACAATGTGGTGGTATGTGGCTTTATCACAGCATAAACTATGACTGGTGCAAGTTAGTTATTAGCCGGGGGGACATGTACATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 532276 730 + 647215 GATTTACACAGTATGAAAATACACAGAAAGCACCTGGTGAGCAGCAGAACAGACAGGGACACAGCTGCAGGCATTGGACTGCCCGCAGGTATTTAACACTGA-ATATCGAGAACCTCAAGGACTTTAGAATATTTCAAGCAAGGGGCTCCCAAAAATGGCGGCAGCTAGAGTGGTCATTAATATCAGGCATGTAAGGTTTCAGGAAACAGGTGAAATGCAGCCTTGTCACAATAATGCATCTTTGGCCTCAATTAAATTAATTGTATGCTCATTGGATAGAAGTCTTGCAACTTGAGAACTAGAGACTGGAGCTTGGTGCTAAGTTTTGATCCTGCTAAGTCAGATGGCACAGGAGGTTAAAGTCCACCGAGCATGATGATGAAAGGTTAAAGTCTATAATGAAAAATAAAGACAAGGGAGACCCATATGGTTTGTCAGTATGGAAGATATGGTAAGTGAGTAGGAGGCCCATACACTCTATCCCCCCACAGAATACAGGGCAAAACTGTTGT--TTATATTTTGTGGGTCGCAAATGCAGCATAAAAGACACTTGTACAAGTGAACACCAGTACCTATCAGCATGCACATGACAAAATGACAAGGTCATTTTAAGTACTAACAAAACAAATATGGTATTTGTCTCAAAGGCAC-ATGTTGTGGTATCTGACATTATCACAGCATAATCTATGACTGGTGTGAGCTCGTTATCAGCCACAGGGACGTGTATATA + +a +s mr.mrrefChr3 73918 14 + 181019 GCTGTTCCAAGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 521858 14 + 636262 GCTGCTCCAAGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 533006 14 + 647215 GTTGTTCCAAGTGC + +a +s mr.mrrefChr3 73932 216 + 181019 CTACACAAATAAGTATAAGGAGACTGTTATAAAAGTGCTTATAGCTCATATCCCCTCAATTTACAACACAGAACCAGAGTTGTCCAAATAGTGGTTCTCTAGGCATGGCTTAAATAAATAAGGGCTTAATAATTGGACAATAAAGTTCACATAGAGTGGCAGATTTGTTCCAAATTTAGTGTAAATCATCTAGGGTGGACCCCTGACCTGGTTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 521879 216 + 636262 CTACACAATTGAGTATAAAGAGGCTGTTATAAAAGTGCTTATAGCTCATATCCCCTCAATTTACAACACTGAACCAGAGTTGTCCAAATAGTGCTTCTCTCGGCGTGGCTCAACTAAATAAGGGCTTAATAATTGGACGATTAAGTTCATATAGAGTGGCAGATTTGTTCCAAATTTAATGTAAACCATCTAAGGTGGACCCCTGACCTGATTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 533020 216 + 647215 CTACACAAACACGTATGAGGAGATTGTTCTAAAAGTGCTTATAGCTCATGACCCCTCAATTTACAACACAGAACCAGAGTTGTCCAAATAGTGGTTCTCTAGGCATGGTTTAAATAAATAAGGGCTTAATAATTGGACAATAAAGTTCACTTAGAGTGACAGACTAGTTCCAAATTTAGTGTAAATCATCTAGGGGGGACCCCTGGCCTGGCTGGC + +a +s mr.mrrefChr3 74148 55 + 181019 GAATGGCAAAGATCAATGCCCCATGACTACATGTAAATATCTGACACTTATGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522095 55 + 636262 GAAGGGAAAAGTTCAACGCCTCATGACTACATGTAAATATCTGACACTTATGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 533241 55 + 647215 GAATGGCAAAGATTAATGCCCCATGACTACATGTAAATATTTGACACTTATATTT + +a +s mr.mrrefChr3 74203 251 + 181019 ACACAATAGCCTGTTCAAGATTTCTTCTTCAGTTAATGTGATGGTTGGGAACAACATGTTAGTTTTGATGAACATCTGGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATGGAACCAAGAAATTAAAAGAAGTAGAAGAAAACTTAACTGCACATGAGGGAAAGACATCCTTGTTCTTCTGAGAACAGTATTGATATGATTGGCAATTGTATTTAGTAGTTGTACATGACCTCACAAGTAAGCTGAATCCCAAGTCCAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522166 242 + 636262 ACACAATAGCCTGTTCAAGATTTCTTCTTCAGTTAATGTGATGGTTGGGAACAACATGTTAGTTTTGATGAAAATCTGGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATGGAACCAAGGCAATAAAAGAAGT-GAAGAAGCCTTAACTGCACATGAGGGAAAGACATCCTTGTTCTTCTGAGAACAGTATTGATATGATTGGCAATTGTATATA--------ACATGACCTCACAAGTAAGCTGAATCCCAAGTCTAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 533296 251 + 647215 ACTCAATAGTCTGATCAAGATGTCTTCTTCAGGTAATGTGATGGTTGGGTACAACATGTGAGCTTTGATGAACATCTAGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATTGTACCAAGAAATTAAAAGAAGTAAAAGAAAACTTAACTGCACATGAGGGGAAGACATCATTGTTCTTCTGAGAACTGTATTGATTTCATTGGCAGGTGTACTTAGTAGTTGTACATGACCTCACAAGTAAGCTGTATCCTAAGTCCAAGC + +a +s mr.mrrefChr3 74454 14 + 181019 AGAAACAGAGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522408 14 + 636262 AGAAACAGTGTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 533550 14 + 647215 ATAAACAAACCACT + +a +s mr.mrrefChr3 74468 40 + 181019 ATAAACAGTGTGTGTAGGTGCAACATGCATTCAATCAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522437 40 + 636262 AGAAACAGTGTATCTAGGTGCAACATGCATTCAATCAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 533564 39 + 647215 ATAAACAGTGTGTGTAGGTGCAACATGCACTC-ATCAATA + +a +s mr.mrrefChr3 74508 249 + 181019 AAATGTTAGTAGACAGATGAGGCTAATCAACTAGCTAACCTTTACAATGTCATACCTAAGTGCGAGTGGGAACAAACATACAGGATTTTGTCCATAATTGTGCCAGATACCTAAATCAGTGGCATTTTATCTGCCTACTTCCCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGGCTTACTAGCACGACCACATCATTGCAGCACACATCCAAATGGGGATCAACTCCCATGTGTTATATGGCATATTAGAAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522481 249 + 636262 AAATGCTAGTAGGCAGATGACTCTAATCAACTAGCTAATCTTTACAATGTCATACCTAAGTGCGAGTGGGAACAAACATACAGGATTTTGGCCATAATTGCACCAGATACCTAAATCAGTGGCATTTTATCTGCCTACTTCCCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGGCTTACTAGCACGATCACATCATTGCAGCACACATCCAAAGGGGGATCAACTCCCATGTGTTATATGGCATATTAGAAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 533603 249 + 647215 AAATGTTAGTAGATAGCTGAGGCTAATCAACTAGCTAACCTTTACAATGTCATACCTGAGTGCGAGTGGAAACCAACATACAGGATTTTCTCCATAGTTGTGCCAGATACCTAAATCAGTGGCACTTTATCTGCCTACTTCTCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGCCTTAATAGAACCACCACATCGTTGCAGCACGCATCCAAATGGGGATCAACTCCCATGTGTTAGATGGCATGTCAAAAGAAG + +a +s mr.mrrefChr3 74757 66 + 181019 CAGCAAAAACTGAAATGGACGGGTGTGCAAATCTTTGATACAATGTAAGTCTATGACTCATGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522731 66 + 636262 CAGCAAAAACTGAAATGGACGGGTGTGCAAATCTTTGATACAATGTAAGTCTATGACTCATGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 533852 66 + 647215 TGGCAAAAACAGAAAGAGATGGGCGTGCAAATCTTCGATACAATGTAAGTATATGACTCATGAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 74823 159 + 181019 CTGGAAATTGGTTATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAGTTCTTTCTTGGGCAGGGCTATTCACACACTCACTTGCCAAAAGGAATGACCATTTACTACTTACCTTCCACCTAACCCATGAATAATTAAATAACAACCCTGCATTGGTACAAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 522998 159 + 636262 CTGGAAATTGGTTATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAATTCTTTCTTGCGCAGGGCTATTCACACACTCGTTTGCCAAAAGGAATGACCATTTACTACTTACCTTGCACCTAACCCATGAGTAATGAGATAACAACCCTGCATTGGTACAAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 533918 158 + 647215 CTGTAAATTGGTGATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAGTTCTTTCTTGGGCATTTCCATTCACACACTCACTTGCCAACAGGAATGACTATTCACTATTTACCTTCCA-CTAACCCATGAATAGTTAAATCACAGCTGTACATTGGTACAAGAC + +a +s mr.mrrefChr3 74982 65 + 181019 AATATCCATGAGAAGCTCTGAATGGCACAAGTGGCCCTATCATCAATAAATCAATGTTTCCCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523157 63 + 636262 AATATCCATGAGAAGCCCTGAATGGCACAAGTGTCCCCATCATCAATGAATCA--GTTACCCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 534119 65 + 647215 AATGTCCATGAGAAGCTCTGCATGGCACAAGTGGCCCTATCATCAACAAATCAATGTTTCCCTGA + +a +s mr.mrrefChr3 75047 125 + 181019 CTGTCAGAATATTGTACTGATCACATTACATCAGGACACAATTTTTATTTTACTGTCAGCAGCAACTAGGGGATAATTGCGTTTAGTTTCCCTACTTAGAAATGAAGTGTCTTGAACAGGTGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523220 125 + 636262 CTGTCAGAATACTGTACCGATCACATTACATCAGGACACAATTTTTATTTTACTGTCAGCAGCAACCAGGGGATAATTGCGTTTAGTCTCCCTACTTAGAAATGTAGTGTCTTAAACAGGTGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 534185 124 + 647215 CTGTCAGAATATTGTACTGAGCACACTACATCAGGACACAATTTTTA-TTTACTGGCAGCAGTAACTGGGAGATAATCACATTTAGTTTCCCTGCTTAGAATTGAATTGTCTTGAACTGGCACAT + +a +s mr.mrrefChr3 75172 180 + 181019 GTACCCTCTAGCACCTATATGGTGAAATCCAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAACTAGTTTATTGTTTCTCCGTTGAGATTCACACTTAAGATCCACCTGACCTTAGGTGATCTCCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATGCCTACTAATTCAATGCATCCTTTGATGATACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523346 173 + 636262 GTACCCTCTAG-------ATGGTGAAATCAAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAACTAGTTTATTGTTTCTCCGTTGAGATTCACACTTAAGATCCACCTGACCTGAGGTGATCTCCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATGCCTACTAATCCAATGCATCCTTTGATGATACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 534309 175 + 647215 GTACCCTCTAGCACCTATATGATGAAATCCAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAGCTATTTTATTGCTTCTCTGTTGAGATTCACACTTAAGATCCG-----CCTTAGGTGATCTTCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATACCTACTAATTGAATGCATCCTTTGATGATACAT + +a +s mr.mrrefChr3 75352 121 + 181019 TGCGGAGGGTAAATGCCCATGCCACTCGTTACTAGACTACCCTAAGCTTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTACTTAACTATATTGCTTTGTGACAAAGTTTTGACATTAGACTATTATAGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523529 121 + 636262 TGCAGAGGGTAAATGCCCATGCCTTTTGTTACTAGACTACCCTGAGCCTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTATCTAACTATATTGCTTTGTGACAGAGTTTTGACATTAGACCATTATAGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 534484 119 + 647215 TGCGGAGGGTAAATGCCCATGCCACTCGTTACTAGACTACCCTATGCTTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTACTT-ACTATATCGCTTTGAGACAAAGTTTTAACA-TAGACTATTATATGGA + +a +s mr.mrrefChr3 75473 320 + 181019 TTTTGGTGCCATTTTTTGCTTCAGACTACCATGCTAACTGGACATGAGGACTGGCTGGAATCTAGGCCATTCCAGTAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGAGCTCTTATGTGCAGCAGACCACAAATTCATGAGAAATAGTCTTTCCAGAGCCATTTTGCTACTTATACATGAACCCGGTTCTCTAAATTGATTCCCAATGCAGATGAAATATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAGAGCAAATGTGTAACATTCATAGGTTTATAGTTTTCTGTTCCTACATCCTTAGTGCCAGACCATCCGACTTCCAGCCACTTGGACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523704 315 + 636262 TTTTGGTGCTGTTTTTTGCTTCAGACTACTGTGCTAACTGGACATGAGGACTGGCTGGAATCTAGGCCATTCCAGTAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGTGCTCTAATGTGCAGCAGACCACAAATTCATGAGAAGTAGTCTTTCTAGAGCCATTTTGCCACTTATACATCAACCCAGTCCTCTAAATCGATTCCCAATGCAGATGAAATATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAAAGCAAATGTGTAGCATTCATAGGTTTATAGTTTTCTGTTCCCACATCCATAGTGCCAGACCATCCGACTTCCAGCC-----GACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 534603 306 + 647215 TTTTGGTGCCATTCTTTGCTTCAGACTACCATGCTAATTGGACATGAGGACTGGCTGCAGTCTAGGCCATTCCAGCAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGAACTTCTA-------------ACAAATTCATGTGAAATAGCCTTTCCAGATCCATTTTGCTACTCATTCATGAACCTGGTTCTCCAGATTGATTCCCAATGCAGAGGAAGTATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAGAGCAAATGTGTAACATTTGTAGGTTTATAA-TTTCTGTTCCTAAATACTTAGTGCCAGTCCATCCAACTACCAGCCACTTGGACCA + +a +s mr.mrrefChr3 75793 214 + 181019 GCCCTTCCACAAGCTGCCATGGCCCAAATCTTAAAGTGTTGTCATTACAAACATGACAGGGCGCAGCCGTCTAGGAGGTCGAGAGTTGTGAGGGCGTACACTAATGACTCACACTCATGAAAGCATTATAGATTACTTGTGTATGGAGCATGGCCTTGTGTTATCTTCCAAGCACCATTCCTGCCAGGTGTGAATTGACACACTGGGCAGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524022 214 + 636262 ACCCTTCGACAAGCTGCCATGGCCCAAGTCTTAAAGTGTTGTCATCACAAACATGACAGGGCGCAGCCGTCTAGGAGGTCGAGAGTTGTGAGGGCGTACACTAATGACTCACACTAATGAAAGCATTATAGATTACTTCTGTGTGGAGCATGGCCTTGTGTTATCTTCCAAGCACCATTCCTGCTAGCTGTGAGTTGACACACTGGGCAGCCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 534909 211 + 647215 GTCCTTCCACAGGCTGCC---GCCCAAATCTTAAGGTTTTGTCATTACAAACATGACAGGGCCCACCCGTCTAGGAGGTTGAAAGCTGTGAGGGTGTACACTAATGACTCACACTCATGAAAGCATTATAGAATACTTGTGCATGGAGCATGTCCACCTATTATCTTCCAAGCACCATTTCTGCCAAGTATGAATTGACATACTAGCCATTCAC + +a +s mr.mrrefChr3 76007 149 + 181019 ATCCTGGTCTGAAGTGAAAAGGTACCATATAAAAGAAAGTTATGGGGACACATTCTCCATAGTATCAATAGGGTAATCATAGTCTTAGGAATTCCAAATTGTATCAAATTTTGACACAGTAAGCGGACACCTTCACATGTTAGAGGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524236 149 + 636262 ATCCTGGTCTGAAGTAAAAAAGAGCCATATAAAAGAGAGTTATGGGGAAGCATTCTCCATAGTATCAATGGGGTAATCATAGTCTTAGGAATTCCAAATTGTATCAAATTTTGACACAGTAAGCAGACACCTTCACATGTTAGAGGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 535178 142 + 647215 ATCCTG-------GGGACCAGGTACAGTAATGGAAGAAATTATGGGGACACATTCTTGATAGTGCCAACAGGGTAACCATAGTCTTAGGAACTCCATATTGTAACAACTTTTGACACAGTAAGAGGACACCTTCACATGTCAGAGGACA + +a +s mr.mrrefChr3 76156 162 + 181019 CGCTAAACTCCCCCAGATGCAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTTCAATGTGTTGTAATGCAGAAGTGAATGATGAGATATGGATGCATGCACATACTTCAAGCCTATCTTGGATGGTAAAATTTGTGAAACTTAACAGCTTCTATTGACTGGAAGGAAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524385 149 + 636262 -------------CAGACACAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTCTGATGTGTTGTAATTCAGAAGTGAATAATGAGATATGGATGCATGCACTTACCTCAAGCCTATCTTGGATGGTAAAATTTGTGAAACTTAACAGTATCTATTGACTGGAAGGAGAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 535324 161 + 647215 CGCTAAACTCCCCCAAATGCAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTTCAATGTGTTGTAATGCAGAAGTGAATGATCAGATATAG-TATGTGTGCATACTTCAATCCTATCTTGGATGGTACGATTTGTGGGACTTAACAGCTTCTATTGACTTGAAGGAAGAAG + +a +s mr.mrrefChr3 76318 101 + 181019 TATTATAATTCTTTATAGCTACATTTGCATCACAGTTACAGGTGAGGTGATACATTAGCAGTTGGACAATGATGAAAGAGTCTATTGGGTTTAAGAACTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524535 96 + 636262 TATTATAATTCTTTATAGCTACACTTGCATCACAATTACAGGTGAGGTGATACATCAGCAGTTGGATAATGATGAAAGAGTTCATTGGGTTTAAGA----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 535485 101 + 647215 TATTATAATTCTTTATGGCTACATTTGCAGCACAGTTACAGGTGAGGTGATACATTAGCAATTGGACAATGTTGAAAGAGTCTATTGGGTTTAAAAACTCA + +a +s mr.mrrefChr3 76419 5 + 181019 CCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 535587 5 + 647215 CCAAG + +a +s mr.mrrefChr3 76424 94 + 181019 CAATCAATTCTGATATCAATAATATGCCAGTTTTGTCCCTTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAGTTAATCCAATATTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524631 92 + 636262 CAATCAATTCTGATATTAATAATAAGCCAGTTTTGTCCCTTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAATAACACC--TATTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 535593 94 + 647215 CAATCTATTCTGATATCTATAATATGCTAGTCTTGTCCATTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAGTTAATCCAATATTGA + +a +s mr.mrrefChr3 76518 233 + 181019 ATGAGGATCATATACTCATCAGCACAAAGAATAAAACTAAACTTAAATGGATACTATGCCTTATCAATAAAAGTTGTTAGGGACCATGTTAGAAAACCAGTGTTAGGCTGGAGTCCTTAAGAAGGCTGGTCACTCAACTGGAGCCTTGGGTGGCCTCCAATCTCAGTTCAAATTTGAGCTACTGGATGGATTAATAGTTTGCTGTAGACAGTGAAGGAGCCATAATACTAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524723 217 + 636262 -------------ACACATCTGCACAAAGAATAAA---GAACTTAGATGGATACTATGCCTTATCAATAAAAGTTGTTGGGGACCATGTTAGAAAACCAGTGTTAGGCTGGAGTCCTCAAGAAGACTGGTCACTCAACTTGAGCCTTGTGTGGCCTCCAATCTCAGTTCAAATTTGAGCTACTGGATGGATTAATAGTTTGCTGTAGACAGTGAAGGAGCCATAATACTGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 535692 232 + 647215 ATGAGGATCATATACTCATTAGTACAAAGAATAAAACTAAACTTAAATGGATACTATGCCTTATCAATTAAAGTTGTCAGGGACCATGGTAGCAAACCAGTGTTAGGCTGGAGACCTTAAGAAGGCTGGTCACTCAACTGTAGCCTCGGGTGACCTCAAATTCCAGTTCAGGTTTGAGCTATTGGTTGTATTAATAGTTTACTGTAGACATTTAA-GAGCCATAATACTAGGA + +a +s mr.mrrefChr3 76751 37 + 181019 CTGCCATGCACTGTAGCACATCCTGCATACCTGAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524940 37 + 636262 CTGCCCTGCACTGTAGCACATCCTGCATACCTGAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 535925 37 + 647215 CTGCCACACACTGTATCACATCCAGCGTACCTGAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 76788 125 + 181019 GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGGGAGTGTAGTGAGTAAATAGCCTAGTAATGGGCTGTTTCTGTGATCAACATCATGTTCCCCTGATACTACTTCCCAAGGAGTCACTCTGTCATGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524978 125 + 636262 GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGGGAGTGTAGTGAGTAAATAGCCTAGTAATGGGGTGATTCTGTGATCAACATCATGTTCCCCTAATGCTACTTCCCATGAAGTCACTCTGTCATGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 535962 125 + 647215 GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGAGGGTTTATTGGTTAAATAGCCTAGTAATTGGCTGTTTCTGTGATTGACATTATGTTTCCCTGATACTAATTCCCAAAGAGTCACTCTATAATGATG + +a +s mr.mrrefChr3 76913 177 + 181019 TACCATTACCTGATAGTTAAATACTACCAGTTCACTGAAAAACCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTTCACTAAGCTGTTACAGGTGAGTTAGAGCCCTATCTCCCTTTACTGGACTGTACCCTTGGAATAGGCAAGGATCAATAGGAAGCTCTGGATCAGTACTATTTATATGTTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525105 176 + 636262 TACCATTATCTGGTAGTTAAATACTACCAGTTCACTGAAAAACCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTTCACTAAGCCGTTACAGGTGAGTTAGAGCCCTATCTCCCTTTACTGGACTGTACACTCGG-ATGGGTAAAGATCAATAGAAAGCTCTGGATCAGTACTATTTATATGTTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 536087 175 + 647215 TACCATTACCTGATAGTTAAATACTACCAGTTCATGGAAAACCCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTCCATTAAGCTGTTACAGGTGAGTTATAGCCCTACCTCCCTTTACTGGACTATACCCATGGAAAAAGCAAGGATCAATAGGAAGCTCTGGG--AGTACTATTGATATGTTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 77090 66 + 181019 CATTGCTATCAGAGGATAAGTGCACAGATGACAGGTGCACTCAGGGAGGCTAAGGAGGGAATGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525281 45 + 636262 -------GGTAGAGGACAAGTGCACAGATGACAGGTGCACTCAGGGAGGCCA-------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 536265 66 + 647215 CATTGCTATCAGAGGATAAGTGCACAGTGGACAGGTGCACTCAGGGAGGCTAAGGAGGGAATGGCT + +a +s mr.mrrefChr3 77156 12 + 181019 GTGCAGTTAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 536365 12 + 647215 GTGCAGTTAATT + +a +s mr.mrrefChr3 77168 224 + 181019 TAAGTGAATAAAAGAGAACATAGTGAACAAAGAGGGGCATATGTCTTGAAAAATTGTTTCCCTGAAGGACGATCAGAGAACTACCACATACAGCAGCAAGACTTTTGGAATTGCCCAAGATTATGCAACCACCCTGCTGCCTCTAGGGGCCTTCTTTTCTAATCAGAGTAATGACTTGGGGTAAGGGTCTACACCCTTAGAAAAAGGGCCGGAGTAATAAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525326 198 + 636262 TAAGTTAATAAAAGAGTAATTAGTGAACAAAGAGTGGCATATGTCTTGAAGAATTGTTTCCTTGAAGAACGATCAGAGAACTACCACATACAGCAGCAAAACTTTTGGAATTG-------TTATTCAACCACCCTGCTGCCTCTTGGGGCCTTCTTTTCTAATCAGAGTAATGATTTGGTGTAAGGGTCTACACCCTTAGATAAA------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 536378 224 + 647215 TAAGTGAATAAAAGAGAACATAGTGAACAGAGAGGGGAATATGTATTGAAAAATTGTTGCCCTGAAGGACAATCAGAGAATTACCACATACAGTAGCAAGACTTTTGGAATTGCCCAAGATTATGCAACCACTCTGCTGCCTCTAGGGGCCCTCTTTTCTAATCAGAGTAATGACAAGGGGTAAGGGTCTGCACCATTAGAAAAAGGGCCGGAGTAATAAAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 77392 25 + 181019 TCCAGAGGAGGTTGGTGAAATGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525524 25 + 636262 TCCAGAGGAGGTTGGTGAAATGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 536606 25 + 647215 TCCAAAGGAGGATGGTGAAATGTAC + +a +s mr.mrrefChr3 77417 47 + 181019 AAAAATTACCTCCAAAGAGGGACGGTGAAATGTACAGATCAATGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525550 44 + 636262 AAAAATTACCTCCAAAGAAGGACGGTGAAA---ACAGATCAATGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 536631 46 + 647215 GAAAATTACCTCCACAG-GGGAGGGTGAGATGTACAGATCAATGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 77464 145 + 181019 TACCTATATCCATAGTTGTTTAAGATCTTGACTGTCTTGCCTACCAAAAACTACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCCTGCAGGACAATAACTTGTGAGTAATGTCATTCTGTGGTCACTGCCTTCCTATCTCAGTTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525594 145 + 636262 TGCCTATATCCATAGTTGTTTAAAATTTTGACTGTCTTGCCTACCAAAAACGACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCCTGCAGAACAATAACTTGTGAGTAATGCCATTCTGTGGTCACTGCCTTCCTGTCTCAGAAGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 536697 145 + 647215 TACCTACATCCATAGTTGTTTAAGATCTTGACTCTCTTGCCTACCAAAAAATACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCTTGCAGGACAATAACTTGCGAGTAATGTCCTTCTGTGTGTACTGCCTTCCTATTTGAGTTGAGT + +a +s mr.mrrefChr3 77609 310 + 181019 GGGCAATAAGGGTAGGAGGTGAATAAAATTTTTGAATAAAACTCTAGGTTGACACTCATCAGTGACACACATGCATGCATTCCTGCCATGCACAGGGAAGCATTGCATTGGCTAATCAAAGAGATGAGTAACTATATATGGTATAGATCAACTCTATCTTCCACAACAAATAAGCAGCCTTTTAATGGTGTGCTGTGGAATCTTTTGTTCTCATTGCCATCTGTTATCATTTAATCTGCAGCATATCTCAAGAAACAGTTAAAGGTCTGCAGAACAGGAAGGACCACATGTGTTTTTTCTTTATTACCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 525741 271 + 636262 GGGCAATAAGGGTAGGAGGTGAATAAAGTGTTTGAATAAAACTCTAGATTGACACTTATCAG-------------------------------------GCGTTGCGTTGGCTAATCAAAGAAATGAGTAACTGCATATGGCATAGATCAACTCTATCTTCCACAACAAATAAGCAGCCTTTTAGTGGTGTGTTGT--AATCTTTTGTTCTCATTGCCATCTGTTATCATTTGATCTGCAGCATATTTTGAGAAACACTTAAAGGTCTGTAGAACAGGAAGGACCACATATGTTTTTTCTTTATTGCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 536842 310 + 647215 GGGCAATAAGAGTAAGAGGTAAATACAACTTTGAGATAAAACACTAGGTCAACACTCATCAGTGACACACATGCATGCATTCCTGCCATGCACAGGGAAGCATTACATTGGCTAATCAAAGAGATGAAAAACTATATATGGTATAAATCAACTCTTTCTTCCACAACAAATAAGCCGCCTTTTAATGGTATGCTGTGGAATCTGTTGTTCTCATTGCCATCTGTTGTCATTTAATCTGCAGCCTATCTCAAGAACCTGTTAGAGGTCTGCAGAGCAGGAAGGACAACATGTGTTTTTTCCTTATCACCCT + +a +s mr.mrrefChr3 77919 320 + 181019 ACCTTATTGACATGACCCTCAAATGATTAAAGATTTCTGCAATCATAACACCAGTTTACCTCACTCCTAGCTAACCAATGGGCCCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTACATCCCAAAGCTAAGAATTGTCAGGTGTTAAGAACCCAAGATATAGTTTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGTCTATGTCACCTAACCCTACCTTCCTCTTATTTATCCACTTGTCTATCTGACATCTGAAATTGGAGGCATCTAAAGCTAGAAGGCAATTGGAGGAGAGCAATAATAGACCTCTGTCAATCTAGTCATGGAATGATAATTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526012 305 + 636262 ACCTTGTTGACATGACCCTCAAATGATTAACGATTTCTGCAATCATAACACCAATTTACCTCACTCCTGGTGAACCAATGGGCCCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTACATCCCAAAGCTAAGAATTGTCTGGTTATAACAACCCAAGATATAGTCTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGGCTA--------AACCCTACCTTCCTCTTATTTATCCACTTGTCTTTCTGACATCTGAAA-------CACCTGAAGCTAGAAGCCAACTGGAGGAGAGCAATACTAGACCTCTATCAATCTAGTCATGGAATAATAATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 537164 319 + 647215 ACCTTATTGGCATGACCCTCTAATGATCAAAGATTTCTGGAATCATAACACCAGTTTACCTCACTCCGAACTAACCACTGGGTGCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTAGATCCCTAAGCTAAGAATTGTTAGATGTTAGGAACCCAAGATATAGTTTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGTCTGTGTCACCTAACCCT-CCTTCCTCTTATTTATCCACCTGTCTATCCGACCTCTGAAATTGGAGGCATCTAAAGCTAAAAGGCGATTGGAGGAGAGCAATAATAGACCTCTGTCAAGCTAGTCATGGAATGATAATTGT + +a +s mr.mrrefChr3 78239 93 + 181019 ATCCCAGATTGTCTCCACCCATGAAGTGCACAGAAGAACACCTAAGTATTAAGAGAAGAGATTAAAGCAGGCTAAAGTCATAGGGGGTCTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526327 93 + 636262 ATCCCAGGTTGTCTCCACCCATGAAGTGCACAGAAGAACACCTAAGTATTAGGAGAAAGGATTAAAGCAGGCTAAAGTCATAGACGGTCTCGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 537483 92 + 647215 ATCCCGGATTG-CTCCACCCATGAAGTGCATAGAAGAACAGCTAAATATTAAGTGAAGAGATTAAAGCAGACTAAGGTAATAGGGGGTCTTGG + +a +s mr.mrrefChr3 78332 58 + 181019 CGGATCAACAGGGTGTTAATGACAGCTATGTGTGGTAGATGGTGCTAGAAATGCTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526420 58 + 636262 CGGATCAACAGGGTGTTAATGACAGCTATGTGTAGTACATGGTGCTAGAAGGGCAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 537576 58 + 647215 TGGATCAACAGGGTGTTATTGACAGCTATGTGTGGTAGATGGTAGTAGAAATGCTAGT + +a +s mr.mrrefChr3 78390 17 + 181019 CATCCATTCATGTGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526484 17 + 636262 CGTCCATTCATGTGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 537634 17 + 647215 CATTCATTCATGTGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 78407 159 + 181019 CAGCCTGCAGCCTGTCATGTGCCAAAGAGACCCTCAGTCTCGGAGACTTGAACAACATCTACAGCATATGACTAGCCTGTAGCCTTTCTGCTGCAGAAATCAAACAGCATAGGCAGTATGTGAACTGAAAGTCCCCTCAGGTTATATCTCACAAGGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526592 158 + 636262 CAGCCTGCAGCCTGTCATGTGCCAAAGA-ACCCTCACTCTTGGAGACTTCAACAACATCTACAGCATATGACTGGCCTGTGGCCTTTCTGCTGCAGAAATCAAGCAGTATAAGCAGTATGCCAACTGAAAGTCCCCTCAGGTTATATCTCACAAGGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 537651 159 + 647215 TAGCCTGCAGCCTTTCATGTGCCAAAGAGACCTTCGGTCTCGGAGACACGGACAACATCGACAACATATGACTAGCCTGCAGCCTTTCTGCACCAGAAATCAGACAGCAGAGGCAGTAAGTGAACTGAAAGTCCCCTCATGTTATATCTCACAACGTAG + +a +s mr.mrrefChr3 78566 177 + 181019 CACACAAGAGAGACTAGAAGACAAATTGATTCTATATCACTCATTTTCTCTACTCTGGGTTCCTCTACAGAAAATAGTAAGCAGCAATACTTAGGTCCAATGTTTACTATGCCTGGACAACAGAAACCCAACTATCCACTATCCTTTTATCTGGGTTGCAACTCAGTTTCCCTAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526751 174 + 636262 CACACAAGAGAGACTAGAAGACAAATTGATTCTACATCACTCATTTTCTCTACTCCGGGTTCCTCTACAGAAAATAGTAAGCAGCAATACTTAGGTCCAATGTTTGCT---CCTGGACAACAGAAACCCAACTATTCACTATCCCTTTATCTGGGTTGCAACTCAGTTTCCCTAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 537810 174 + 647215 CACACAAGAGAGA-TAGAAGACAAACTGATCCTATATCACTCATCCTCTCTACTCTGGGTTCCTCTACAGAAGATAGCAAGCAGCAATACTTGGGTATGATGTTTACCATGCTTGGCCAACAGAAACCCCACTATCCACTATTCTTTTATCTGGGTTGTAACTCAGTTTCCCTAA-- + +a +s mr.mrrefChr3 78743 183 + 181019 CACTTTTGTTTAGTTTGGAATAAGTCACATTGATCAACTGGGACCCTAATGTCATGACTTCAGTCCTGCCACCACAATCCTGTTTTGAAAGATGTATTGTGCTACCTCTTTCCTGGTGACAAAGTGTCTGCCTTTCCCGAGCTAGTTCCTTATGATTACCTGTTCATATGTCTCATCAGATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 526927 183 + 636262 CACTTTTGTCTAGTTTGGAATAAGTCACATTGATCAACTGGGACCCTAATGTCATGACTTAAGTCCTGCCACCACGATTCTGACTAGGAAGATGTATTGTGCTACCTCTTTCCTGGTGACAAAGTGTCTGCCTTTCCTGAGCTCTTTCCTTATGATTACCTGTTCATATGCCTCATCAGATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 537984 172 + 647215 CACTTCTGTTCAGTTTAGAATCAGTCACATTGCTCAACTGCCACCCTAATGTCACGGCTTCAGTCCTTCCACTACAATCCCGTTTTGAAAGATGTACT---CCCGCTCTTTCA----GACAAAGTTTCTGCCTTTCCCGAGCCAGTTCCTTATGAT----TGTTCAGATGTCTCATCAGATAG + +a +s mr.mrrefChr3 78926 200 + 181019 GAGCTCTAACATGATTGGATGTTGATAGAGTGATATTAAAATAATAGTAGCTGACGGCCCGTAGTTTAAGTCAATGATGCCCACTGGCTAGAAGTCCATGAAAACTTCTTAACTAATCATACGCAGAGATGACACTGTAACCTCAACAAGTTGCAGACTCGCTGAGGCGTCAGTAGAAATTTACAACAATTCACCCTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527110 200 + 636262 GACCTCTAACATGATTGTGTGTTGATAGAGTGATATTAAAATACTAGTAGCTGACGGCCCGTAGTTTAAGTCAATGATGCCCACTGGCTAGAAGTCCATGAAAACTTTTTAACTAATCATATGCAGAGATGACACTGTAACCTCAACAAGTTGCAGACTCGCTGAGGCGTCAGTAGAAATTTAGAACAACTCACCCTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 538158 131 + 647215 GAGTTGTAACATGATTGGATGCTGATAGAGTGGTATAAAAATAATTGT-------------TAGTTTAAGTCAATGATGTCTGCCGGCCAGAAGTCCATGAAAACTTCTTCACTAATCATAC--------------------------------------------------------ATTTACAACAATTCACCCTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 79126 126 + 181019 TAACTAACTCAAGTCTATTGCTCCCCTGTGGAATTAATTGTTATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGTTCATATAGGAATGCACTAGTTCCACTGTTGTTTGTAACTGAACCATATGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527310 75 + 636262 TAACTAACTCAAGTCTATTGCTCCCCTGTGAAATTAATTGTTATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGT--------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 538292 126 + 647215 TAACTAACTCAGGTCTATTGCTCCCCTGTGGAGTTAATTGTGATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGTTCATATAGGAATGCACTAGTTCCACTGTTGTTTGTAACTGAACCATATGCC + +a +s mr.mrrefChr3 79252 37 + 181019 GTACTGGGACGTAAGCAACATGGACATGGATATGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527385 34 + 636262 ---CTGGGACGTAAGCAACATGGACATGGATATGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 538420 37 + 647215 GTATTGGGATGTAAGCAACCTGGACATGGGTATGTGA + +a +s mr.mrrefChr3 79289 97 + 181019 TTTTGTTCTGAAtaaaagggctcaccaccacttgtagttgcagtccaaatcctagaactctttactaacccctgagtgcttgcaaccaaaaagtcac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527419 97 + 636262 TTTTGTTCTGAATAaaagggctcaccaccacttgtagttgcagtccaaatcctagaactctttactaacccctgagtgcttgcaaccaaaaagtcac +s simRat_chr6.simRat.chr6 538459 97 + 647215 TTTTGTTCTGAAtaaatgagttcaacaccacttgtagtcgcagtccaaatcctaaaactatttactaacccccgaatgcttgcgaccgaaaagtctt + +a +s mr.mrrefChr3 79386 130 + 181019 acaactccttgaaatgttttttgacatgttatttacatatggtccctaagctgggatgAATAGCGAATGGCCCACACTAATACTGCCCCTTTTCTCTATGGTTAATCTATTCTGTCCACATTAAGTCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527516 130 + 636262 acaactccttgaaatgttttttgacatgttatttacatatggtccctaagctgggaTGAATAGCGAATGGCCCACACTAATACTGCCCCTTTTCTCTATGGTTAATCTATTCTGTCCACATTAAGTCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 538558 130 + 647215 aaaaccccttggaatgttttttgacatgtcattcacatatggtccataagcagggaccAATAGCAAATTGCCCACTCGAATACATCCTCCTTTCTCTATGGTTAATTTATTCTGTCCACATTAAGACTTT + +a +s mr.mrrefChr3 79516 20 + 181019 CAGCTGGGACTCCTAAAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527654 20 + 636262 CAGCTGGGACTCCTAAAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 538688 20 + 647215 TAGCTGGCCCTCCTTGAGTT + +a +s mr.mrrefChr3 79536 24 + 181019 GGTTACTGGTCTGGTGGTCAtgaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527675 24 + 636262 GGTTACTGGTCTGGTGGTCATGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 538708 24 + 647215 GGCTACTGGTTTGGGGGTCAtgaa + +a +s mr.mrrefChr3 79560 19 + 181019 ttacaccgttgtcaatagg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527699 19 + 636262 TTACACCGTTGTCAATAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 538733 19 + 647215 ttaaacccttgtcaactgg + +a +s mr.mrrefChr3 79579 17 + 181019 gatccagcaaaggaaga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527718 17 + 636262 GATCCAGCAAAGGAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 538770 17 + 647215 gatccagcaaaggacga + +a +s mr.mrrefChr3 79596 300 + 181019 gtcacatggaatccccagAAAACTTCTGTTCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCTTATGCAGCTGTTGACATGTGCATATCTACCTGTGCATATCTACCAGGTATAACATAGATGGAAATGAAGTTCTTACAAGACACAAGTATACTCATCCCCCTTAAGCAAGGTTAAAAAAACATTATTCCACTTTATGCAATTAAAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGGAGTAAATCTTCTACAACTACAAATATATTAATGCCTACTTTGCATTTTGAATGGTCTGAGGTCACTATTTCAGTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527735 198 + 636262 GTCACATGGAATCCCCAGAAAACTTCTGTTCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCTTATACAGCTGTTGGCATGTGCATATCTACCTGTGCATATC------------------------------------------------------------------------------------------------------AAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGGAGAAAATCTTCTACAACTACAAATATATTAATGCCTCCTTTGCGTTTTGAATGGTCTGAGGTCACTATTTCAGTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 538788 279 + 647215 gtcacatggaatccctagGCACCTTCTGTGCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCCTATGCGGCTGCTGACATGTGCATATCTACCTGTGCATATCTACCAGGTATAACATAGATGGAAATGAAGTTCTTACAAGACACAAGTATACTCATCCCCCTTAAGCAAGGTTAAAAAAACATTATTCCACTTTATGCAATTAAAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGAAGTAGGTCTTCTAGAACTACAAATA----AATGTCTACTTTGCATTTTGAATAGTATGAG----------------- + +a +s mr.mrrefChr3 79896 228 + 181019 GAGCTAGGGATAACTAACTAAGCTCCCTTGTCTCTTGGCTTCAGCAGACGTTTATGTCATTTATCTATCATTACATCTGATATCTGCTACTACTTGAGTGAACTGCACTGAGCTAACCAACATGTGGTCCAGATCAAGGGAGAAGCCACATATGCAAAGCACAATTCTGTATTGGTTTGTCAGGCTAGAGATTGTATTCACCCTACTTGATTAACATCCTTAATCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527935 210 + 636262 GAGCTAGGGATAACTAACTAAGCTCCCTTTTCACTTGGCTTCAGCAGACGTTTATGTCACTTATCTATCATTACATCTGATATC------------------CTGCACTGAGCTAACCAACAGGTGATCCAGATCAAGGGAGAAGCCACATATGCAAAGCACAATCTTGTATTGGCTTGTCAGGCTGGAGATTGTATTCACCCTACTTGATTAACATCCTTAATCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 539067 197 + 647215 ------------------------CTCTTGTCTCTTG------GCAAACGTTAATGTCATTTATTGATCATTACATCTGATATCTGCTACTACTTGAGTGAATCGCACTTAGCTAACAAACATATGGTCCAGCTCAAGGAAGAAGCCGCATATGCAACACACAATTCTCTATC-GTTGGCCAAGCTAGAGATTGTACTTCTCCAACTTGATCAACATCCTTAATCCAT + +a +s mr.mrrefChr3 80124 21 + 181019 GCGTTTTGTGGATATTGACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528175 21 + 636262 GCGCCTTGTGGATATTGACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 539264 21 + 647215 GAGTTGTGTGGATATTGAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 80145 626 + 181019 CCACAAAGGAGTGACTGTGAGAACTATGTTAAACTATTCATCCTTGTTCATGTGTTCTAACTGGTTGGTGTCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAGATATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGTAGCATTTATGATTTAGGTTACAATCATGAATATAAAATACAGTAGCTTTTGGTACCAGCTATCAGTAACCGTGAAAACAGATGCTGTACATTCACTAAGTCCGGGCTGGAAGCACATGAATGATAAAGAACTTTCTGAATTACTCCCAAATATAAAATTTCATCAGCAGACTATGGCAAAGTGGCTTCAATTCTTTTTAAGGCATAGGCCTCTACCATGGCTGATGAGTTGTGTTCTGATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGATTTTGACAGTAAACTAGAGCATCACATGGGCTAATGACGAATCACAGCATAGGAATACTGCAACCTTCAGGGTTAATATTAGTCTAGTCAATCGGTACCAATTATGGTATCTCTGACTGTCATTTGCCAGACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTATCTGCATACACTACCACAAGAGGAATACTTGTTTGCACTCCTTTAACAGCTAATGCACAATGTATGACTTGACGACAAGTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528196 622 + 636262 CCACAAAGGAGTGACTGTGAGAACTATATTAAACTATTCACCCTTGTTCATGTGTTCTAACTGGTCGGTGCCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAGAGATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGTAGCATTTATGATTTAGGTTACAATCATGAATATAAAATACAGTAGCTTCTGGTACCAGCTATTAGTAACCGTGAAAACAGATGCTGTACATTCACTAAGTCCGGGCTGGAAGCACATGAATGATAAAGAACTTTCTGAATTACTCCC--ATATAAAATTTCATCAGTAGACTATGGCACTGTGGCTT-AATTCTTTTTAAGGTATAGGCCTCCACCATGGCTGATGAGCTGTGTTCTTATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGATGTTGACAGTAAACCAATGCATCACATGGGCTAATGACGAATCATAGCATAGGAATACTGCATCCTTCAGGGTTAATATTAGTCTAGTCAATCGGTACCAATTATGGTATCTCTGACTGTCATTTGCCAGACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTTTCTGCATACACTACTACAAGAGGAATACTTGTCTGCACTCCCTT-ACGGCTAATGCACAATGTACAACTTGACCACAAGTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 539286 624 + 647215 CCACAAAGGAGTGACTGTAAGAACTATGACAAACTACTCATACTTGTTCATGTGTTCTAA-TGGTTGATGTCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAACTATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGGGGCACTTATGATTTAGGTCACAATCATGAATTTAAAATTCAGTAGCTTTTAGTACCAGCTATCAGTAACTATGAAAATAGATGACATCCATTCACTATGTCCTGGCTGGAATCACCTGGATGATAAAGAACTTTCCTAATTACTCCCAAATATAAGTTTTCGTCAGCAGACTATGGCAAAGTGGCTTCAATTCTCTTTAAGGCATAGGCCTCTACCATGGCTGATGAGTTGTGTTCTGATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGGTTTTGACAGTAAACTGGAGCATCACATTGACTAACAAAGAATCACGTCATGTGAATACTGCAACGTTCAGGGTTAATATTAGCCTAGTCAATCAGTACCAATTATGGTATCTCCGACTGTCACTTGCCACACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTATCAGCATACACTAACACAAGAGGAATACTTGTTTGCACCCCTTTAACAGCTAGTGCACGATGCATGACTT-ACGAGGAATCTG + +a +s mr.mrrefChr3 80771 13 + 181019 TTTGGTCAATAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528827 13 + 636262 TTGGGTCAATAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 539910 13 + 647215 TCTGATCTATATG + +a +s mr.mrrefChr3 80784 8 + 181019 ATCTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528840 8 + 636262 ATCTGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 539928 8 + 647215 GTCTGACA + +a +s mr.mrrefChr3 80792 19 + 181019 TGACCCGGATTGTTAAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528850 19 + 636262 TGACCCGGATTGTTAAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 539936 17 + 647215 --ATCCGGATCAGTAATAT + +a +s mr.mrrefChr3 80811 10 + 181019 GTTTCATTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528869 10 + 636262 GTTTCATTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 539966 10 + 647215 ATCTCATTCA + +a +s mr.mrrefChr3 80821 19 + 181019 CATCAGACAGATTCCTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528879 19 + 636262 CATCAGACAGATTCCTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 539979 17 + 647215 CATTAAAC--CTGGCTTGT + +a +s mr.mrrefChr3 80840 135 + 181019 CTGAATACCTTGATCTACATAGTTAAGTCTATGGATGAAAGACAGAAGGATGAAGCTTTCATGCCTACAGCCTTTGTGGTTTAAGATAAGATATCCTTGGCTAATAGAGCCACTCATAGTGCTTACTTTATCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528898 135 + 636262 CTGAAAACCTTAATCTGCATAGTTAATTCTATGGATGAAAGACAAAAGGATGAAGCTTTCACACCTACTGCCTTTGTGGTTTAAGATAAGATATCCTTGGCTAATAGAGCCACTCATAGTGCTTACTTTATCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 540000 135 + 647215 CTGAATGCCTTGATCCACACAGTTAAGTCTATGAATGAAAGACAGAAGGATGAACCTTTCATGCCTACAGCCTTTTTGGGTTAAGATAAGATATCCTTGGCTAATAGAGCCACTCATAGTCCTTATGTTATCAGT + +a +s mr.mrrefChr3 80975 41 + 181019 TTCCAAGAAAGCGGAAACCTAACTGCATATGTTACCTCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529033 41 + 636262 TTCCAAGAAAGCGGAAACCTAACTGCATATGTTACCTCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 540138 41 + 647215 TTCCCAGAAAGCACAAACCTATGTGCTTATGTTACCTCAAG + +a +s mr.mrrefChr3 81016 71 + 181019 ATAATTGTATGCACCCCCTCAACAGCTAAAAGGAGATTGGGAAACTTGACCACAATTAATGTCAAATGCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529074 71 + 636262 ATAATTGTATGCACCCCCTCAACAGCTAAAAGGAGATTGGGAAACTTGACCACAATTAATGTCAAATGCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 540183 71 + 647215 ATAATTGTCTGCACCCCCTCAACAGCTAGAAGGAGATTGGGAAACTTTACCACAATTCATGTCAAATGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 81087 14 + 181019 GGGAACGAGGTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529145 14 + 636262 GGGAACGAGGTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 540256 14 + 647215 GGGAAGAAGGTCCG + +a +s mr.mrrefChr3 81101 161 + 181019 ACTGGTAAGGATATGACTGACCTTGATTGTCAAACTGTTCCAAATAAATCACACAGATCCCTTGTCTGTACATCTTACCTTGCTTTTCGCAAATGCTCTACATAGTTAAGTGTATTAATCAAGGGCAGCAGGCTGCAGCTTTCATGTCTATAGCCTGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529159 161 + 636262 ACTGGTAAGGATATGACTGACCTTGATTGTCAAACTGTTCCAAATAAATCACACAGATCCCTTGTCTGTACATCTTACCTTGCTTTTCGCAAATGCTCTACATAGTTAAGTGTATTAATCAAGGGCAGCAGGCTGCAGCTTTCATGTCTATAGCCTGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 540288 161 + 647215 ACTGGTAAGGATATGGCTGACTTTGATTGTCAAACTGTTCCAAACAAATGACACAGATCCCTTGTCTGTAGGTCTTACTCTACCTTTGGCAGATGCTCTACATAGTTAAGTGTCTTAATCAAAGGCAGAATGATGCAACTTTCATGTCTATAGCCTTCATG + +a +s mr.mrrefChr3 81262 454 + 181019 TCTCCTATTTTATCAGTATATCTTCTAGGGTTCATCACAAATGTTGCAGGACTCTGCATCCCGTCTACACACTTATAAATTGTTGATAAGAATACACTTGCTGTATGCCTAGGAAACGCTTAATATAAAATCACTCATGTAAGTACATGGGTCTGAAGTGGGGGAACAGGCACCCAGCGCACACTTAACCTTTTGCACTTAAAGTTCTCGTGCCCTTTATGACTAAGAATTAATAATTGAAAGTGTGCTGCCACCCAATAATACAAGACTCATATAGAATGGTATTGACAGATGAACAGTTTATACATCTCGCTGATTTTTCCTGAATGGGTTTGAAGAACATTACAACAAGGATGAGGCTACTCATGATGACCATTCACAACTTCAATATCCAGAGATCCCAAAGTAGGAAATAGCTATTGAAGTGAGCGGGGTTACACAGCAGGACTTAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529320 429 + 636262 TCTCCTATTTTATCAGTATATCTTCTAGGGTTCATCACAACTGTTGCGGGACTCTGCATCCCGTCTACATACTT---------------GAATACACTTGCTGTATGCTTAGGAAACGCCTAATATAAAATCACTCACGTAAGTACCTGGGTCTGAAGTGCAGGAACAGGCACCCAGCGCACACTTAACCTTTTGCACTTAAAGTTCTC-TGCCCTTTATGACTAAGAATTAATAATTGAAAGTGTGCTGCCACCCAATAACACAAGACTCATATAGAATGGCATGGACAGATGAACAGTTTATAC--CTTGCTGATTTTTCCT------GTTTGAACAACATTACAACAAGGATGAGGCTACTCATGATGACCATCCACAACATCAATAACCAGAGAT-CCAAAGTAGGAAAAAGCTATTGAAGTGAGTGGGGTTAAATGGCAGGACTTAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 540504 453 + 647215 TCTCCTATTTTATCAGTATGTCTCCTAGGGTTCATCACAAATATTGCAGAACTTTGTATCCCGTCTACACACCTATAAATTGTTGATAAGAATACACTTGCTGTGTGCCTAGGAAATGCTTAACATAAAAGCACTCATGGAAGTACATGGGTCTGAAGTAGGGGGACAGGCACTCAGTGCACACTTAACCTTTTGCACTCAGTGTTCTTGTGCACATTATGACCAAGAATTAATAATTGATAGTGTGCTGCCACCCAATAATACAAGACTTATATAGACTGGTATTGACAGATGAACACTTTATACATCTCTCTGATTTTTCCTGAATGGGTTTGAAGAACCTTACAACAAGGATGAGACT-CTCATGAAGACCCTTCACAACTACAATATCCAGAGATCCCGAAGTGGGGAATAGCTATTGAAGTGAGCGGGGTTACACAGCAGGCCTTAATG + +a +s mr.mrrefChr3 81716 57 + 181019 ATTGAGATTTTGAACAGCACCTCATACAAAGCTCCAATAAAAGGGCAAAAGTGGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529751 57 + 636262 ATTGAGATTTTGAACAGCACCTCATACAAAGCTCCAATAAAAGGGCAAAAGTGGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 540957 57 + 647215 ATTGAGATTTTGAACAGCACCTCATAGAAAGCTCTGATGAAAGGGAAAAAGTGGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 81773 50 + 181019 GATGTGTGTGGTTAGGATTCGGCGGATGAGCCTGCCGGCGTCATGCACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529808 50 + 636262 GATGCATGTGGGTAGGATTCAACGGATGAGCCTGCCGGCGTCATGCACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 541016 50 + 647215 GGTGTGTGTGGTTAGGATTTGGCTACTGAGCCTGCCTGCGTCATGCACTG + +a +s mr.mrrefChr3 81823 38 + 181019 TAGGTGATGACAGGTTCATCATATAGTGCAAAATCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529858 38 + 636262 TAGGTGATGACAGGTTCATCATATAGTGCAAAATCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 541067 38 + 647215 TAAGTGATCACAGGTTGGTCATACAGTGCAAAATCAGG + +a +s mr.mrrefChr3 81861 55 + 181019 GAAAGTCTTGAAGCTGGGTCCCTGTATACATAGTGCCTTGCAATCTTGCAACTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529896 55 + 636262 GAAAGTCTTGAAGCTGGGTCCCTGTATACATAGTGCCTTGCAATCTTGCAACTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 541128 55 + 647215 GACAGTCCTAAGGCAGGGTCCCTGTATACCTAGTACCTTGCAATCTTGCAACTGA + +a +s mr.mrrefChr3 81916 121 + 181019 CCCTATGAGTTATCCATTGGTCTGGGGGACATGAGGCTGAACTCTAATTAATTGAACTGAACCAGTCATGGATTTCGGTGAACAAAGGGGGAATGGAACAATTATGGTGAACACACATTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 529952 121 + 636262 CCCTATGAGTTATCCATTGGTCTGGGGGACATGAGGCTGAACTCTAATTAATTGAACTGAACCAGTCATGGATTTCGGTGAACAAAGGGGGAATGGAACAATTGTGGTGAACACACATTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 541183 121 + 647215 ACCTATGAGTTATCCATTGGTCTGGGGGACATGTGGCCGAACCCTAATTAATCGAACTGAACCAGTCATGGATTCCAGTGAACAAAGGGGGAATGGGGCAATCATGCTGAATACATATTTA + +a +s mr.mrrefChr3 82037 86 + 181019 GGTTGTGCAGCTCACCTCACTGGTGCTTACTTACAAATTAACCACCCAGATTTGTAAGGTGAGTCAGGCTTTGAAAGATCATGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530081 86 + 636262 GGTTGTGCAGGTCACCTCACTGGTGCTTACTTACAAATTAATCCCCCAGATTTGTAAGGTGAGTTAGGCTTTAGAAGATCATGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 541304 85 + 647215 GGTTGTGCAGCTCACCTCACTGGTGCTTACTTACAAA-TAACCACTCAGATTTGTAAGGTGAGTCAGACTTTGAAAGGTTATGTGG + +a +s mr.mrrefChr3 82123 150 + 181019 TTTAAGTAGATTTGGAGCTAGATTGCTCTTAAACCAGTTTGCCTTAAACATAAACTCCATATCCCCTAATATCCACTCAGCATGTCTCAAAAGACATGCATGTACTTACTTACTATGTTATCATAGGCACATGCATAACATGATTTCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530167 150 + 636262 TTTAAGGAGATTTGGAGCTAGATTGCTCCTAAACCAGTTTGCCTTGAATATAAACTTCATATCCACTAATATCCACTCAGCATGTCTCAAAAGACATTCATGTACTTACTTACTATGTTATCATAAGCACATGCATAACATGATTTCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 541395 150 + 647215 TCTGGGTAGATTTGGAGTTAGATCACTCTTAAACCAGTTTGCCCTAAACATATACTCCACATCCCCTAGTGTCCACCCAGCATATCTCTAAAGACATGTATGTACTTAGTGACTATGTTATCCTGGGTACATGGTTAACATGATTTCTCA + +a +s mr.mrrefChr3 82273 223 + 181019 GTTTGATAATAGTTCTGTGGTGCATTTTGATTTTTGCAGTCTCTAGTTAGTCCTGGTCGATAAACTGGCTGATCTACCATTCTGGTCAAAGTTAGAGTTGGAAACATAGAAACTGGGCTAAGCTGCAAGTGGTGCTGGATATAGTTTATTGTCAGAAGCATGGGTATATGCAACATTAAGTTCATTCCTCCCTCTGTAGGTCTTAAGTTGTCTCCATGTTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530391 216 + 636262 GTTTGATGATAGTCCTTTGGTGCATTTTGCTTTTTGCAGTCTCTAGTTGGT-------GATAAACCAGCTGATCTACCATTCTGGTCAAAGTTAGAGTTGGAAACATAGAAACTGGGCTAAGCTGCGAGTGGTGCTGGATGAAGTTTATTGTCAGAAGCATGGGTATATGCAACATTAAGTTCACTCCTCCCTTTGTAGGTCTTAGGTTGTTTCTATGTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 541545 223 + 647215 GTTAGATAATAGTTATGTGGTGTATTTTGATTTTTGCAGTCGCTAGTTAGTCCTGGTCAATGAACTGGCTGATCTACCATCCTGTACAAAGTTAGAGTTGAAAACATAGAAACTGGGCTAACCTGCAAGTGGTGCTGGACATAGTTTATTGTCAGAGGCATGGGTCTAGGCCACATTAAGTTCATTCCTCCCTCTGTAGGTCTTAAGTTGACTCCATGTTGTG + +a +s mr.mrrefChr3 82496 72 + 181019 TGGTGTTACTGGGAGGAGCCACATTAAATGCAGTAGTGAATATGATTTTCCAGAGAACAAGAACCTCAGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530650 72 + 636262 TGATGTTATTGGGAGGAGCCACATTAAATGCAGTATTGAATATGATTTTCCAGAGAACAAGGATGTCAGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 541768 72 + 647215 TAGTGTTACTGGGAAGAGCCATATCAAATGTAGAAGCAAATATGATTTTTCAGAGAACAAGATCCTCAGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 82568 156 + 181019 GTATCCTTATTCTTAATGTGAGTCTACCAAATTCTGACATATTCAAATCCACATCTGAAACTCCATTATAAGAAGACTGCGTCTGAGTTATGGCCTAGAAATACTGGCCAGAGTCATTAACTTGCATCTGTAGGTGTGGGAAATCTTCCTTTCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530722 156 + 636262 GTATCCTTATTCTTAATGTGAGTCTACCAAATTCAGACATATTCAAATCCACATCTGAAGCTCCATTATAAGAAGACTGCGTCTGAGTTATGGCCTAGAAATACTGGCCAGAGTCGTTAACTTGCATTTGTAGGTGTGGGAAATCTTCCTTTCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 541841 156 + 647215 GTATCCTTATTCTTAATGTGAGTTTACCAAATTCTGACAGATTCAAATCCACATCTAAAACTCCGTGATAAGAAGTCAGCATCCAAGTTGTGGCCTAGGAATACTTGCCAGCGTAACGGACTTGCATCCGTAGGTGTGACAAATTTTCCTTTCATA + +a +s mr.mrrefChr3 82724 84 + 181019 TAGTCACTGTATGCCTAACTCCATTTTCATTCCTTTTAGCATCACCCTTATTTGGTGTTCACCTTTTGGGAAAACTGCAGCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530878 82 + 636262 TAGTCACTGTATGCCTAACTCCATTTTCATTCCTTTTAGCACCACCCAGATTTGGTGTTCACCTTT--GGAAAACTGCAGCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 541998 84 + 647215 TAGTCACTGTATGCCTAACCCCATTTTCATTCCTTTTAGCATTACCTTTATTTGATGTTCGCCTTTTGGGAAAATTGCATCATA + +a +s mr.mrrefChr3 82808 80 + 181019 CCAAGTTCTCAAGGGGTACCTGTGGTTatacagaaagactttcaatgttggtgcatgacctaggaatggtaaatttccct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 530998 80 + 636262 CCAAGTTCCCAAAGGTCACCTGTGGTTatacagaaagactttcaatgttggtgcatgacctaggaatggtaaatttccct +s simRat_chr6.simRat.chr6 542082 80 + 647215 ATAAGTCCTTGAGCGGTACCCATGGTTacacagaagaaccctcaaggttggtgcatgatttaggagcggtaaatctccct + +a +s mr.mrrefChr3 82888 19 + 181019 agaacagtcaatacagggt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531085 19 + 636262 agaacagtcaatacagggt +s simRat_chr6.simRat.chr6 542162 19 + 647215 aaaagattcagtacagcct + +a +s mr.mrrefChr3 82907 6 + 181019 gtcagc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531104 6 + 636262 gtcagc +s simRat_chr6.simRat.chr6 542767 6 + 647215 gacaac + +a +s mr.mrrefChr3 82913 81 + 181019 cagtgggtggatgctctagatcatgtcaaatgaaaacaaactccagttcttacataaggagtatgaacttgataaatatgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531665 81 + 636262 cagtgggtggatgctctagatcatgtcaaatgaaaacaaactccagttcttacataaggagtatgaacttgataaatatgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 542773 81 + 647215 CAGAgggtggacaatctacatcatgtcgaatgaaaacaaactacagttcttacatgaggaggatgaacttgataaatatgg + +a +s mr.mrrefChr3 82994 71 + 181019 tcactcactgagtgaagatgtgcaggtagcacttcctaccgacagaatagggaatgacaaacttcaatttt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531752 71 + 636262 tcactcactgagtgaagatgtgcaggtagcacttcctaccgacagaatagggaatgacaaacttcaatttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 542854 71 + 647215 tcactcaataagtaaaggtgagcaggtagtacttcctacccacgaaacagagtatgacaaactaggttttt + +a +s mr.mrrefChr3 83065 123 + 181019 cgcttagaataaagtaccacttagctggagtgaatctcaatgtagcttacagagtaggagctgtgatctattgtaccaagctctctatttaaagtgatctgtggcatctggggtagacacaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531829 123 + 636262 cgcttagaataaagtaccacttagctggagtgaatctcaatgtagcttacagagtaggagctgtgatctattgtaccaagctctctatttaaagtgatctgtggcatctggggtagacacaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 542925 123 + 647215 tgcttagaataaagtgccacttagctggagtgaatcttaatatatcttacacagtgggagatgtgctccaatgtactaagctctctatccagagtgatctgccacatctagggtaaacacaaa + +a +s mr.mrrefChr3 83188 28 + 181019 aactgaaattactactctgtctacaccg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531957 28 + 636262 aactgaaattactactctgtctacaccg +s simRat_chr6.simRat.chr6 543048 28 + 647215 aactgaaattactactccatctacactg + +a +s mr.mrrefChr3 83216 57 + 181019 ttaaagcttgaaactaaagtcctctacctgatgcttttcagcttgatattcatcaca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 531986 57 + 636262 ttaaagcttgaaactaaagtcctctacctgatgcttttcagcttgatattcatcaca +s simRat_chr6.simRat.chr6 543076 57 + 647215 ttaaagcttgaaactaaagccctctaccttttgcttttcaccttaatattcatcaca + +a +s mr.mrrefChr3 83273 72 + 181019 ttgcagttcctcacaaggttaagcttgctctgtgttactagctcttttagccattcgatatcacatgctggg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532043 72 + 636262 ttgcagttcctcacaaggttaagcttgctctgtgttactagctcttttagccattcgatatcacatgctggg +s simRat_chr6.simRat.chr6 543135 72 + 647215 ttgcagttcctcacaaggttaagcttgttctgtgttactagctcttttagccactacatatcagatgttgga + +a +s mr.mrrefChr3 83345 16 + 181019 attgacctttgatagg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532115 16 + 636262 attgacctttgatagg +s simRat_chr6.simRat.chr6 543237 16 + 647215 attgattgatgatagg + +a +s mr.mrrefChr3 83361 124 + 181019 cccttcatcttgcattagtgcctggccaacgagataggtaaataagaggaatacaatcttggggagagaaatcagatgcctatacttctctagtaataccacagtggttgcagtgtgtattgtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532131 124 + 636262 cccttcatcttgcattagtgcctggccaacgagataggtaaataagaggaatacaatcttggggagagaaatcagatgcctatacttctctagtaataccacagtggttgcagtgtgtattgtt +s simRat_chr6.simRat.chr6 543254 124 + 647215 ccctttatctcgtattagtgtctgaccaacaagatagggaaataagagaaatgcaattgcggggagagaagtcgcttggctatagttcgttggtgctaccatggtggttgctgtgtgtattgtt + +a +s mr.mrrefChr3 83485 93 + 181019 gcatgttatcttcatcatgacaccgcatgtccaaaacgttatttgaaatataacacccaccaacaggcagagaaattgctggaaatgtgagtc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532355 93 + 636262 gcatgttatcttcatcatgacaccgcatgtccaaaacgttatttgaaatataacacccaccaacaggcagagaaattgctggaaatgtgagtc +s simRat_chr6.simRat.chr6 543378 93 + 647215 gcatgttatcctaatcatgacactgcatgtccaaaacattatttgaaatataacacccaccaacaggcagagaaatggctggatatgtgagtc + +a +s mr.mrrefChr3 83578 21 + 181019 agaacgctcaaatatgactgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532448 21 + 636262 agaacgctcaaatatgactgt +s simRat_chr6.simRat.chr6 543476 21 + 647215 agaatgcttgaatgtgaatgt + +a +s mr.mrrefChr3 83599 16 + 181019 gtataataccatagta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532482 16 + 636262 gtataataccatagta +s simRat_chr6.simRat.chr6 543497 16 + 647215 gtttgataccattgta + +a +s mr.mrrefChr3 83615 20 + 181019 tatgaataccttttccaacc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532498 20 + 636262 tatgaataccttttccaacc +s simRat_chr6.simRat.chr6 543515 20 + 647215 taagcataccttttccaacc + +a +s mr.mrrefChr3 83635 104 + 181019 ttgctaggaaggagaagatggagaataaagatagatacctctaatgttgagacagagtggaattaaacaaacaaaccttctgttgtgactgaggctggattagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532521 104 + 636262 ttgctaggaaggagaagatggagaataaagatagatacctctaatgttgagacagagtggaattaaacaaacaaaccttctgttgtgactgaggctggattagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 543535 104 + 647215 ttactaggaaggagaagaaggaaaaaagagatagttacctctgatgttgaagcagaatggaattaaacaaagacaccctctgttgtgattgaagctggattagt + +a +s mr.mrrefChr3 83739 82 + 181019 gaagtgctgtaaggataacttccatatccagaacacagcgggcagcatggaactagtgtctgatggttcttctgggatactt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532626 82 + 636262 gaagtgctgtaaggataacttccatatccagaacacagcgggcagcatggaactagtgtctgatggttcttctgggatactt +s simRat_chr6.simRat.chr6 543639 82 + 647215 ggagttctgtagggataacttcaatatcctgaacacagctggcagcatggaactggtgtctgacgtttcttctgagaccctt + +a +s mr.mrrefChr3 83821 28 + 181019 ccctccccacagctaggtgcacccaccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532905 28 + 636262 ccctccccacagctaggtgcacccaccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 543721 28 + 647215 ctctccccacagataggtgcacccactc + +a +s mr.mrrefChr3 83849 79 + 181019 agaatacacagtagttaataaaatgggcagggaattggaaaggaggctatgggtggcagtactgtcagctggggacgtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 532979 79 + 636262 agaatacacagtagttaataaaatgggcagggaattggaaaggaggctatgggtggcagtactgtcagctggggacgtt +s simRat_chr6.simRat.chr6 543749 79 + 647215 agaatacacagtagttaataaaaagggcagggaattggaaaggagggtttgggttgcagtagtgtcagctggggacatt + +a +s mr.mrrefChr3 83928 24 + 181019 gctggaccacatctgaaatatcca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533058 24 + 636262 gctggaccacatctgaaatatcca +s simRat_chr6.simRat.chr6 543859 24 + 647215 gctggacttcatctaaaacatcca + +a +s mr.mrrefChr3 83952 40 + 181019 gtgagaacatggaaccatcaggtatggagataatgagtag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533082 40 + 636262 gtgagaacatggaaccatcaggtatggagataatgagtag +s simRat_chr6.simRat.chr6 543884 40 + 647215 gtgagcacattgactgaccagatatggaaacaatgaggaa + +a +s mr.mrrefChr3 83992 10 + 181019 cattaggcta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533123 10 + 636262 cattaggcta +s simRat_chr6.simRat.chr6 543924 10 + 647215 aattaggcta + +a +s mr.mrrefChr3 84002 103 + 181019 tacatttatactacactggaccgacttaaggtgtcaatttactagaatccaagagcacaaaatttttttcaaccgcaaaagtgattcttgggcttaggctccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533133 103 + 636262 tacatttatactacactggaccgacttaaggtgtcaatttactagaatccaagagcacaaaatttttttcaaccgcaaaagtgattcttgggcttaggctccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 543936 103 + 647215 tacattcatatcacactggaccatcttaaggtgtcaattcactagaagccaagaacacaatattatttgaaggcacacaagtgattcatgggcttaggttttt + +a +s mr.mrrefChr3 84105 50 + 181019 gtaccctgtattgaaataacagataaaaaccacttttttccagagacagg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533236 50 + 636262 gtaccctgtattgaaataacagataaaaaccacttttttccagagacagg +s simRat_chr6.simRat.chr6 544144 50 + 647215 gagccttcttttcaaatatcagatgaagaccatttttttccaaagacagg + +a +s mr.mrrefChr3 84155 226 + 181019 attagatccatggcatagccctccctataatagctagcacatgaactgcttacacaaggtgactctctctgaagtgcaccgttgacacatgagccccggactcaggtgtctattttggcttctgaactgttggcacctgaaatgcaacctggcaaacaactgacacaggacctacttaatgacgatgcaagcaacagcatacctgagcaccctaactgtgtgagtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533286 226 + 636262 attagatccatggcatagccctccctataatagctagcacatgaactgcttacacaaggtgactctctctgaagtgcaccgttgacacatgagccccggactcaggtgtctattttggcttctgaactgttggcacctgaaatgcaacctggcaaacaactgacacaggacctacttaatgacgatgcaagcaacagcatacctgagcaccctaactgtgtgagtg +s simRat_chr6.simRat.chr6 544199 226 + 647215 atcaaatcagtggcatagccctcccgatcatacctaacatttgaaccactcactcaaggtaactctatctggagtgcactgttagcacatgaactgctgactcaggtgcctattttggttttcggactgttggagcctggaatgccacttggctaacaactgacacaggacctacctaacgaggatgctagcaacagcgttcctgagcaccctaattttgcgagag + +a +s mr.mrrefChr3 84381 166 + 181019 tgtctcagtttttgagcccaacgggctatgggcttggggatcagctgtacatggagacacatcactttgaaatacacgtccatgactcaaatcaacaactatctacccacccgcctacatgcggatcgtgttttgcctgcatccatatcaacaggatggtatacca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533523 166 + 636262 tgtctcagtttttgagcccaacgggctatgggcttggggatcagctgtacatggagacacatcactttgaaatacacgtccatgactcaaatcaacaactatctacccacccgcctacatgcggatcgtgttttgcctgcatccatatcaacaggatggtatacca +s simRat_chr6.simRat.chr6 544425 166 + 647215 tgcctgagtatttgagcccagtgggctatgggcttggggctcagctgtacctggagacacatcacttcgaaatacacatccataactcaaatcaacaactatccaccaacccccctacatgtggatcatattttgcctgcatccatatcaacaggatggtatatca + +a +s mr.mrrefChr3 84547 7 + 181019 cacagca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533689 7 + 636262 cacagca +s simRat_chr6.simRat.chr6 544593 7 + 647215 cagagca + +a +s mr.mrrefChr3 84554 111 + 181019 gatagatttgacatcggacggagaatacttgcttacaaatgtgctggggggataatacttacttatgtcgccagagagatgagcctacacattggagaaaaacacaggatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533696 111 + 636262 gatagatttgacatcggacggagaatacttgcttacaaatgtgctggggggataatacttacttatgtcgccagagagatgagcctacacattggagaaaaacacaggatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 544603 111 + 647215 gtttggtttgacatcggacggagaacacttgcatacaactgtggtggggtgataatactcacttatgtcgccatagagatgagagaacacaattgaaagaaatgcaagatg + +a +s mr.mrrefChr3 84665 3 + 181019 atg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533810 3 + 636262 atg +s simRat_chr6.simRat.chr6 544714 3 + 647215 acg + +a +s mr.mrrefChr3 84668 90 + 181019 gtatgttgggagtacatgggagcctccacaaggcacccgactaagagcggatcaaatactaattcactgtggtggtggagatgaactgca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533813 90 + 636262 gtatgttgggagtacatgggagcctccacaaggcacccgactaagagcggatcaaatactaattcactgtggtggtggagatgaactgca +s simRat_chr6.simRat.chr6 544719 90 + 647215 atacgttgggaggacatgggagcccccacaaggccctgaactaagtgcagatggaatactcgttcactgtggtggtggacatgaactgca + +a +s mr.mrrefChr3 84758 9 + 181019 tgactggat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 533903 9 + 636262 tgactggat +s simRat_chr6.simRat.chr6 544812 9 + 647215 tggctggat + +a +s mr.mrrefChr3 84767 44 + 181019 agtcccccaactgaggctcagtacagcacataagatttgtagag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534097 44 + 636262 agtcccccaactgaggctcagtacagcacataagatttgtagag +s simRat_chr6.simRat.chr6 544821 44 + 647215 agttccaagactgaggctcagtagagcacataaaattagtagag + +a +s mr.mrrefChr3 84811 98 + 181019 tgatggtagaagaaatggctccccttcgtatgggtaacctctttagaaaggtttaatatactttgcgaaaggaatcatctaagaagaataacattgtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534147 98 + 636262 tgatggtagaagaaatggctccccttcgtatgggtaacctctttagaaaggtttaatatactttgcgaaaggaatcatctaagaagaataacattgtt +s simRat_chr6.simRat.chr6 544865 98 + 647215 tgatggtggaagaagtgcctccccttcatatgggtaacctctttagaaaggtttagtatactttgcctaaagaatcatctaaaaagactagcattgtt + +a +s mr.mrrefChr3 84909 59 + 181019 gacaatatggtgagtatactaatgctgagtcattctgtgcttaggggcatagtggatac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534245 59 + 636262 gacaatatggtgagtatactaatgctgagtcattctgtgcttaggggcatagtggatac +s simRat_chr6.simRat.chr6 544964 59 + 647215 gagattatggcaattagactaatgctgagtcattctgtgcttaggggcatagtggatac + +a +s mr.mrrefChr3 84968 74 + 181019 gcttgacatcaactctgccatcaaacggagtcatttcagtgcctgtgacatagtggcctaactatttccctatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534308 74 + 636262 gcttgacatcaactctgccatcaaacggagtcatttcagtgcctgtgacatagtggcctaactatttccctatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 545023 74 + 647215 acttgacatcaactctgctatcaaacagagttattttaatgcccgaggcataatggtctaactatttccttatt + +a +s mr.mrrefChr3 85042 131 + 181019 acgttgctttgaatagcttggaagggtggtctttccctttatgacttgttagctggctaggtgtacctctattaggaactgtattgatggaagattgtctcagccctatcattgagaaaggccttaggcat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534382 131 + 636262 acgttgctttgaatagcttggaagggtggtctttccctttatgacttgttagctggctaggtgtacctctattaggaactgtattgatggaagattgtctcagccctatcattgagaaaggccttaggcat +s simRat_chr6.simRat.chr6 545123 131 + 647215 acattgcttgggatagctaggaagggtggtctttccccctatgccttgtcatctggcctggtgtactctgataagggaatatactgacggaagattctctgagccctatcattgtaaaaggccttagacat + +a +s mr.mrrefChr3 85173 6 + 181019 agcctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534513 6 + 636262 agcctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 545258 6 + 647215 accctt + +a +s mr.mrrefChr3 85179 11 + 181019 cactggagctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534519 11 + 636262 cactggagctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 545265 11 + 647215 cactggaattt + +a +s mr.mrrefChr3 85190 5 + 181019 ccatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534530 5 + 636262 ccatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 545296 5 + 647215 ccgtc + +a +s mr.mrrefChr3 85195 91 + 181019 atccacatgaaggtctttctaatagttaaatagagacccgacgctgtccactagaagcagtgtcctgcagacacagagttactataaaaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534535 91 + 636262 atccacatgaaggtctttctaatagttaaatagagacccgacgctgtccactagaagcagtgtcctgcagacacagagttactataaaaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 545302 91 + 647215 atccataccaaggtctttcttatagttaagtagagagccagggttgtcaaccagaagcagtgtcctgcagacacagggttactatgaaaat + +a +s mr.mrrefChr3 85286 40 + 181019 gtgacctctgatattgtctttatggtggactgtaaggctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534627 40 + 636262 gtgacctctgatattgtctttatggtggactgtaaggctc +s simRat_chr6.simRat.chr6 545393 40 + 647215 gtgacttctgatattgccatttcggttgactgtaaggctc + +a +s mr.mrrefChr3 85326 63 + 181019 atattccccagtaactgcattcggcacttgaactgtaacttgacaggctgttcttttatagtc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534667 63 + 636262 atattccccagtaactgcattcggcacttgaactgtaacttgacaggctgttcttttatagtc +s simRat_chr6.simRat.chr6 545440 63 + 647215 ataatccccactaactgcgtatggcacttgaactgtaatgtgacaggctgttctattatagtc + +a +s mr.mrrefChr3 85389 176 + 181019 gcctcccagattgtagtgtgacacagggcattttgctttcaggcaatggaccggatgagggtcaactaactaccacctgccacttcgctatgggggtcagatgaggtgagtaatacatgtgcttgggttggatccaactatggtaaccaatctggcttggatgattagcaatgctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534733 176 + 636262 gcctcccagattgtagtgtgacacagggcattttgctttcaggcaatggaccggatgagggtcaactaactaccacctgccacttcgctatgggggtcagatgaggtgagtaatacatgtgcttgggttggatccaactatggtaaccaatctggcttggatgattagcaatgctc +s simRat_chr6.simRat.chr6 545503 176 + 647215 acccctcagattgtaaggaaacacagggcattttgcttttaggctatggctaggatcgaagtcaactaactatcaccagccacttcataatgggggtcaaatgaggtgagtaatataccttcatgggttggatccaattatggtaactaatcttgctgggatgatcagcaatgcac + +a +s mr.mrrefChr3 85565 62 + 181019 attgggaaggaacgccaccacaccccagtagatcggtcatcaatgttatgaagatagtggtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534931 62 + 636262 attgggaaggaacgccaccacaccccagtagatcggtcatcaatgttatgaagatagtggtt +s simRat_chr6.simRat.chr6 545679 62 + 647215 attggcaaagaacgccaccacaccccagcagcttggtcaccaatgttctgaagatagtggtt + +a +s mr.mrrefChr3 85627 43 + 181019 ccataggccatcaatcttgacaccttgcaaggtgtcaaaatct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 534993 43 + 636262 ccataggccatcaatcttgacaccttgcaaggtgtcaaaatct +s simRat_chr6.simRat.chr6 545750 43 + 647215 caataggtcatcaatcttgacaccttgcaaggtctgggaatct + +a +s mr.mrrefChr3 85670 89 + 181019 aacttgtgcaattggacaagtattttcgtcccaagcccaacacaggctacagtagtgcaccaccctatccttgctcggatgatatctgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535036 89 + 636262 aacttgtgcaattggacaagtattttcgtcccaagcccaacacaggctacagtagtgcaccaccctatccttgctcggatgatatctgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 545807 89 + 647215 agcttgtgcaattggacaagtatttttgtcccaagcccaacacaggctacagtagtgcctcaccccatcctaactgggatgatatctgg + +a +s mr.mrrefChr3 85759 22 + 181019 tggctgtcaacatagattgaga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535140 22 + 636262 tggctgtcaacatagattgaga +s simRat_chr6.simRat.chr6 545896 22 + 647215 gggCTGTCAACGTATGTTGAGA + +a +s mr.mrrefChr3 85781 64 + 181019 acagtaggagacagtgtttacgaacggacatcactggaaaagaccctcttggtgttttgttctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535163 64 + 636262 acagtaggagacagtgtttacgaacggacatcactggaaaagaccctcttggtgttttgttctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 545918 64 + 647215 ACAGTGAAAGACAGTgtttgcgagcagacatcgctggaaaagatcttcttagcagtttgttctt + +a +s mr.mrrefChr3 85845 27 + 181019 aactgtactcctcaccttgcttggaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535227 27 + 636262 aactgtactcctcaccttgcttggaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 545995 27 + 647215 aattgtacgtcttaccttgcttggaag + +a +s mr.mrrefChr3 85872 30 + 181019 tgactcctccaaacccaaataacacctgaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535255 30 + 636262 tgactcctccaaacccaaataacacctgaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 546022 30 + 647215 tgactactacagatccaaataacacctgag + +a +s mr.mrrefChr3 85902 7 + 181019 aagcact +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535285 7 + 636262 aagcact +s simRat_chr6.simRat.chr6 546053 7 + 647215 aagcact + +a +s mr.mrrefChr3 85909 12 + 181019 cccctgagaatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535298 12 + 636262 cccctgagaatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 546060 12 + 647215 cccctgacaatg + +a +s mr.mrrefChr3 85921 214 + 181019 aagctggtgaagctgacagagttcaaaggtctatggatatccctaggtattgagatcggatagtaccagaacatcaatgggtgggcttagcttcaccatgcaagcttggattgggagcaattgctatgcatgtactggcctaagccaggaggtgtaatagaagtggacaatcggatatagcatatcacatgaatgttttagccttggctgcagg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535310 214 + 636262 aagctggtgaagctgacagagttcaaaggtctatggatatccctaggtattgagatcggatagtaccagaacatcaatgggtgggcttagcttcaccatgcaagcttggattgggagcaattgctatgcatgtactggcctaagccaggaggtgtaatagaagtggacaatcggatatagcatatcacatgaatgttttagccttggctgcagg +s simRat_chr6.simRat.chr6 546077 214 + 647215 aagcacataaagctgatagagttcaaaggtctatggatatccctaggtattgggattgggtactaccaaaacatcaatgggtgggcttagattcaccaggcaagcttggaatgggaacaattgctatgcatgtacaggcctaagtctgggtgtgtaatgcaagtggacaatcggatatagcatatttcacaaacgtctgagccttggctgcagg + +a +s mr.mrrefChr3 86135 72 + 181019 aggttgcaactacaagcagtgccgattctactaggatgggacccagaccctggtgggatgtactgcatgttg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535525 72 + 636262 aggttgcaactacaagcagtgccgattctactaggatgggacccagaccctggtgggatgtactgcatgttg +s simRat_chr6.simRat.chr6 546291 72 + 647215 aggttgcccatacaagcagtgctgaatctactagggtgagacccggaccctggttggaagtactgcatggtg + +a +s mr.mrrefChr3 86207 13 + 181019 ctctctaacataa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535598 13 + 636262 ctctctaacataa +s simRat_chr6.simRat.chr6 546363 13 + 647215 ctctccaacataa + +a +s mr.mrrefChr3 86220 29 + 181019 taagaacacgtgggaaaatgagatatgta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535621 29 + 636262 taagaacacgtgggaaaatgagatatgta +s simRat_chr6.simRat.chr6 546376 29 + 647215 taagaacacctgaggaaatgagatgtgta + +a +s mr.mrrefChr3 86249 31 + 181019 gacagtcctatttcccgaatcacatagacca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535657 31 + 636262 gacagtcctatttcccgaatcacatagacca +s simRat_chr6.simRat.chr6 546405 31 + 647215 gacagtcctatttcctgaattgcgtagacca + +a +s mr.mrrefChr3 86280 137 + 181019 agattccaaccttttcaacagacagtctgagtcatccatcttgcttcctgcaaaaagtgacttgattcaataaatcagttgaccaactatctccttgtactcacatccctaatgtatctggagattcacccaacaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535688 137 + 636262 agattccaaccttttcaacagacagtctgagtcatccatcttgcttcctgcaaaaagtgacttgattcaataaatcagttgaccaactatctccttgtactcacatccctaatgtatctggagattcacccaacaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 546445 137 + 647215 aggttccagccttttccgcagacaatctggatcatccatcttgtttcatgaagaaagtgactttattcaataaatcagttgtccaactatctacttgtactcacatcactaatgtcactggagagtcatcccacagg + +a +s mr.mrrefChr3 86417 30 + 181019 attatttggaaaccctgcacatatcacatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535825 30 + 636262 attatttggaaaccctgcacatatcacatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 546583 30 + 647215 attatttggtggcgctccacaaatgtcaca + +a +s mr.mrrefChr3 86447 96 + 181019 ttggttgtaactggataaggacttgcacccttattttgctcgccattccctcttcctcttcataaacacttcacaaatacccaagtacctgtacat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535855 96 + 636262 ttggttgtaactggataaggacttgcacccttattttgctcgccattccctcttcctcttcataaacacttcacaaatacccaagtacctgtacat +s simRat_chr6.simRat.chr6 546663 96 + 647215 ttgtctctaactggataaggacttgcacccttgttttgcttgccattcctttttcctctttataaacactttgcaaatgccaaagaaattgtacat + +a +s mr.mrrefChr3 86543 43 + 181019 cataggaatcacttagatatcgccaattcattcaggaccataa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535952 43 + 636262 cataggaatcacttagatatcgccaattcattcaggaccataa +s simRat_chr6.simRat.chr6 546759 43 + 647215 catatgaattactgagatatcatcaatttatccgggaccaaaa + +a +s mr.mrrefChr3 86586 94 + 181019 atggattaatgccatatatttcaaccagcagttgattataagctattcctataactcagccgaagggtatcatcagtcacttggatacaatgag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 535995 94 + 636262 atggattaatgccatatatttcaaccagcagttgattataagctattcctataactcagccgaagggtatcatcagtcacttggatacaatgag +s simRat_chr6.simRat.chr6 546803 94 + 647215 atggattaattcgatatatttcagtcagcagtggattatgagctattcatgtaactcagccgaagggtatcatcagatacttggatacaatgag + +a +s mr.mrrefChr3 86680 84 + 181019 caaatagcattgggagaacaggctaactctggataagattttggctggcactggcggtacatatttcatgctgaggggaaatca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536090 84 + 636262 caaatagcattgggagaacaggctaactctggataagattttggctggcactggcggtacatatttcatgctgaggggaaatca +s simRat_chr6.simRat.chr6 546897 84 + 647215 cagataggattgggtgaacaggataactctggataaaattttggctgacactggcagtacatgtttcatgctaggagtacatca + +a +s mr.mrrefChr3 86764 18 + 181019 atctgcacatccagaaga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536176 18 + 636262 atctgcacatccagaaga +s simRat_chr6.simRat.chr6 546981 18 + 647215 atctgtacatccaaaaga + +a +s mr.mrrefChr3 86782 101 + 181019 agttccaaatggaactattagaaagacattgcaaggacctataatgctggctatggagtcggtggtaaacacaggtaccgatgatcctttctcggggtggt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536198 101 + 636262 agttccaaatggaactattagaaagacattgcaaggacctataatgctggctatggagtcggtggtaaacacaggtaccgatgatcctttctcggggtggt +s simRat_chr6.simRat.chr6 546999 101 + 647215 agctccaaattgaactattaaaaagacattgcagggatttatagtgctggccatggtgttggtggtaaacacaggtatagatggtcctttcttggggtggt + +a +s mr.mrrefChr3 86883 81 + 181019 ctggtttggccactcgaagggctccatagctctggtaccAAATTTACCTCTAGTCAGCAATCTAATTAGACAAGACTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536306 81 + 636262 ctggtttggccactcgaagggctccatagctctggtacCCAATTCACCTCTGGTCAGCAATCCAATTAGACAAGACTGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 547100 81 + 647215 ttggtttggccactcgaaggggtccatggctctggaactaagtttgccTCTAGTCAGCAATCTAATTAGATAAGACTGACA + +a +s mr.mrrefChr3 86964 152 + 181019 CATTTGTAAGCTTGTTCTTTATAACAAAGGTGTGTGACATACATATAAATTGTGTAATGACCTGTAGTGTCAACCAATTGGGACCTTATAATGCTTCAGTCTAGAATCATCTTATGAACCATGTGAAATCAATAATGTCAGACCCATTGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536387 149 + 636262 CATTTGTAAGCTTGTTCTTTATAACAAAGTTATGTGACATACATATAAATTGTGTAATGACCTTTAGTGTCAACCAATTGGGTCCTTATAATGCTTCAG---AAAATCATCTTATGAACCATGTGAAATCAATAATGTCAGACCCATTGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 547188 152 + 647215 CACTTGTAATCTTGTGCTTTTTAACAAAGGTGTATGTCATACATATAAATTGTGTGTTGACCTGTAGTGTCCACCAATTGGGACCTTATAATGTGTCCGTCTAGAAACATCTTATGAACCCCGTGAAATGAATTCTGTCAGACACATTGGTC + +a +s mr.mrrefChr3 87116 59 + 181019 ATATCTCCCAAAGTTTTGTGTATATGACGCCTCAAGTGTCTgctgatcattgttcccaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536536 59 + 636262 ATATACCCTAAAGTTTTGTGTATATGACGCCTCAAGTGTCTgctgatcattgttcccaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 547341 59 + 647215 ATATCTTCCAAAGTTATGTGTATGTGACCCTTCAAGTGTCTgccaaacattgtttccaa + +a +s mr.mrrefChr3 87175 36 + 181019 aacatacagaaggcagctgttggattccatgccatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536595 36 + 636262 aacatacagaaggcagctgttggattccatgccatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 547401 36 + 647215 aacgcacagagggcagctgtcagattttgccccatc + +a +s mr.mrrefChr3 87211 29 + 181019 tgcagagtctggcccagaggtacctgtaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536638 29 + 636262 tgcagagtctggcccagaggtacctgtaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 547437 29 + 647215 tgcagagtctggcccagaggtaattgtaa + +a +s mr.mrrefChr3 87240 29 + 181019 aacagcaatgaaaactaagtagatgtctg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536670 29 + 636262 aacagcaatgaaaactaagtagatgtctg +s simRat_chr6.simRat.chr6 547466 29 + 647215 gacagcaaggaaaactaagcagatgtcca + +a +s mr.mrrefChr3 87269 126 + 181019 atgctttccaactgaacaatttgctgtttctagaaacaaagctgaattcacacttaaatgaggatgagagtaaatgcattttagacgccttgaacatcaaaaggtcctaaatagaaatgagaaaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536699 126 + 636262 atgctttccaactgaacaatttgctgtttctagaaacaaagctgaattcacacttaaatgaggatgagagtaaatgcattttagacgccttgaacatcaaaaggtcctaaatagaaatgagaaaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 547502 126 + 647215 atgatttgcaactgaataatttgctggttctagaagcaaggctgagttcacacttaaatgaggatgcgagtaattgctttctagacactttgaacatcaaaaggtcctatatagaaataagacaaa + +a +s mr.mrrefChr3 87395 11 + 181019 gacaacaaata +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536826 11 + 636262 gacaacaaata +s simRat_chr6.simRat.chr6 547628 11 + 647215 ggtaccaaatT + +a +s mr.mrrefChr3 87406 22 + 181019 attagcagttatgtagaaatgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536837 22 + 636262 attagcagttatgtagaaatgt +s simRat_chr6.simRat.chr6 547684 22 + 647215 GTTTACATTTCTACAGAACTGT + +a +s mr.mrrefChr3 87428 15 + 181019 aatcacacacatctg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536859 15 + 636262 aatcacacacatctg +s simRat_chr6.simRat.chr6 547710 15 + 647215 AATTACTTGCTGCTA + +a +s mr.mrrefChr3 87443 17 + 181019 tacagccaagTCCGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 536879 17 + 636262 tacagccaagTCCGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 547725 17 + 647215 TACAGCAAGGTTCCTCA + +a +s mr.mrrefChr3 87460 25 + 181019 GCAAATCACTTCAGGAATAGAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537116 25 + 636262 GCAAATCACTTCAGGAATAGAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 547742 25 + 647215 GCAAATCACTTCAGGAATAGAATTT + +a +s mr.mrrefChr3 87485 5 + 181019 CCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537141 5 + 636262 CCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 547771 5 + 647215 CCCTG + +a +s mr.mrrefChr3 87490 89 + 181019 TCTGATTCATGTAACCATTCCCTTAACGAAATGTCGGAGATATCGTAGATTTTGGCCCCCATTCTGATGAAAGCAACCAGTTCCTATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537146 89 + 636262 TCTGATTCATGTAACCATTCCCTTAACGAAATGTCGGAGATATCGTAGATTTTGGCCCCCATTCTGATGAAAGCAACCAGTTCCTATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 547777 89 + 647215 TCTGATTCATGTCACGATTCCCTTGATGAAATGTCAGAGGTATGGTAGACTTGGGCCCCCATTCTGGTTTAAGTAACCAGTTCGTACAA + +a +s mr.mrrefChr3 87579 48 + 181019 TAGAATGTCACCTGCTCTCCTTGGAACACCATGGCCACAGATTGAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537235 48 + 636262 TAGAATGTCACCTGCTCTCCTTGGAACACCATGGCCACAGATTGAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 547867 48 + 647215 TAAAATGTCCCATGACCTCCTTGGATTGCCAGGGCTAAGGATCAAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 87627 154 + 181019 TGTAAATGAGCTAGAGAAGTATAATCAGCCCAACTAATTTTAGAGTTTCTGATGCCCAACAGGCTTGCATAAGTTTATACTTGCTGCTAGTATGCAGGTCCAAATCCTAGGAACTGTGTTGTTGATACAATGCGCCACTTCATGCCCACAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537285 147 + 636262 TGTAAATGAGCTAGAGAAGTATAACCAGTCCAACTAGCTTTA-------TGATGCCCAACAGGCTTGCATAAGTTTATACATGCTGCTAGTATGCAGGTCCAAATCCAAGGAACTGTGTTGTTGATACAATGTGCCACTTTATGCCCACAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 547915 154 + 647215 TGTATGGGAGCTAGAGAAGTGTAATCAGCCCAGCCAATTTTAGAGTTTCTAATGCCCAACAGGCTAGCATAAGTTTATACTTGCTGCTAGTATGCAGGTCCAAATCTTAGGAACTGTCTTGTTGATACATTGCGCCACTTCATCCCTACAGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 87781 286 + 181019 GTATCTCACCACTGGGATTGGCATGACTCACTGTATGATCAACTATCCATCAGTATTGATCACTGCTTGTCCTAGCAATATTTCAAGCAGAAGCCAGTAGTATAAGGTTCTACCTAGAGGATCATAAACACATCTTCCCTACTACTTTGCTCCCCCTCTAGACAAAGCTTATTTGTAACATTGCCCTAACCATGACCTACAATCCAAGCTTGTATATAGTTGATAGCTCTTGGCTTATTACCTGGGTGCTGATATGAGCTCAACACTGGGGCTCAAACCTTAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537432 286 + 636262 GTATCTCACCACTGGGATTGGCATGACTCACTGTATGATCAACTATCCATCGGTATTGATCACTGCTTGTCCTGGCAATATTTCAAGCAGAAGCCACTAGTATAAGGTTCTACCCAGAGGATCAGAAACACATCTTCCCTACTACTTTGCTCCCACTCTAGACAAAGCTTATTTGTAAGATTGCCCTAACTATGACCTACAATCCAAGCTTGTATATAGTTGATAGCTCTTGGCCTATTACCTGGGTGCTGTTATGAGCTCAACATTGGGGCCCAAACCTTAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 548099 267 + 647215 GTATTTCACGACTGGGATTGGCATTACTCACTGTATGATCTACAATGCATCACTATTGATCACTGCTTTTCCTAGCAATATTTCAAACAGAAGCCAGTAGTATAAGGTTCTACCTGGAGGATCAT-------------------CTTTGCTCGCCCTCTAGACATGGCTTCTTTGTAACATGACCCTAACCATCGCCTACAATCCAAGCTTGTATATAGCTGATAGCTCTTGGCTTATTACCTGGGTGATGATATGAGCTCACCACTGGGGCTCAAACCTTTATTT + +a +s mr.mrrefChr3 88067 94 + 181019 ACCAACCCACCCCACCACCTTTACTTATTGCTTTAACACACTAGAACGAATCCTCGTGTATCCAAATTTATTGTTTAGTAAATTCAACTATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537718 94 + 636262 ACCAACCCACACCGCCACCTTTACTTATTGCCTTAACACACTAGAACGAATCCTCGTGTATCCGAATTTATTGTTTAGTAAATTTGACTATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 548367 94 + 647215 ACAATCCCACCCCACCACCTTTACTTATTGGTTTCACACACTACAAGGAATCCTTGCGTATCCAAATTTGTTGTTTAGTAGATTCAACTTTGGT + +a +s mr.mrrefChr3 88161 118 + 181019 TACTTAGACTTGTACTGTGCATGCAGTGGGCCGGTTCAGGCCATAATTCTACTGTACATAACTATCATTAGAAACCCTAATGTAATAGGACATGCTGATCCTCAGATACCTGCACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537812 118 + 636262 TACTGAGAGGCTTACTGTGCATGCAGTGTGCTGGTTCAGGCCATAATTCTACTGTACATTACTACTATTTAAGACCTTAATGTTATAGGACATGCTGATCCTCAGATACCTACACAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 548463 118 + 647215 CACTTATACTTGTCCTGTGCATGCAGTGGGCCAGTTCAGGCCATGGTTCTACTGTACATAACTATCATTAGAAACCCTAATGTAATAGGACATGCTGACCCTCAGATACCTGGACAAA + +a +s mr.mrrefChr3 88279 343 + 181019 TCCAATCCTGATTGCAGTTTTGTAAACTCTTGGCCAATCGTGTTGTATAGATACACCCTACCTTTGTGATACAGCCACTGTCTGGTGATTTATAGCTCAGGCACTGGAAGATTTTAAGGCCTGTCTGTCACTCTAGGACTCCCGGAGTGTCCCTGTATTAGCATGGAGCCTTTGAGCAGGCAGCGAACATCACTGGCAGGCACCTTTGACATTTTTTCAAGCATGGGTTTCACTGGCAGACCTGAAAGTTAAGGATGTCTTCAAGTAGTATAGCACAGGAGTTTCCTCTGTATAGATGTCAGAGTTTGACTGTCCAAAACAGTGCATATCCACCCCTTGAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 537930 343 + 636262 TCCAATCCTGATTGCAGTTTTGAAAACTCTTGGCCAATCGTGTCGTATAGATACAGCCTACCTTTGTGATACAGCCACTGTCTGGTGATTTATAGCTCAGGCATTAGAAGATTTTAAGGCCTGTCTGTCACTCCAGGACCTCCGAAGTGTCCCTGTATTAGCATGGAGCCTTTGAGCAGGCAGCGAACATCACTGGCAGACACCTTTGACATTTTTTCATGCAGGGGTTTCACTGGCTCACCTGAAAGTCAAGGATGTCTTCAAGTAGTATAGCACAGGAGTTTCATCTGTATAGATGTCAGAGTTTGACTGTCCAATACAGTGCATATCCACCCCTTGAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 548584 327 + 647215 TTCAATCCTGATTGCAGTTTTGTAAACTCTTGGCCAATCCTGTTGTATAGATGCACCCTACCTTTGTGATACAGCCACTTTCTGGTGATTTGTAGCTCAGACACTGGAAGGTTTTAAGGCCTGTGTTTCACTCTGGGACTCCCGGAGTGTCCCCGTTTTCGCATGGAGTCATTGAGCGGGCAGAGAACATCATCGGCAGGCACCTT-GACATTTCTCCCAGCGTGGGTTGCACTAGCAGACCTGAGACTTAAGCATGTCCCCAAGTAGTGTAGCACAGGAGTTTTCTCTGTATAGATGGTAGGGTTTGACTGACCACAACGGTGCCTA--------------- + +a +s mr.mrrefChr3 88622 37 + 181019 CATGCCTTATGTGTGCTCAGCAGTGTATGTTGGATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538277 35 + 636262 CATGCCTTATGTGTGCTCAGCAGT--ATGTTGGATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 548911 18 + 647215 -------------------GCAGTGTATGTCGGATAC + +a +s mr.mrrefChr3 88659 18 + 181019 AGTTAGGCATTTAGGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538313 18 + 636262 AGTTAGGCATTTAGGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 548929 18 + 647215 AGTTATGCATGTAGGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 88677 18 + 181019 GCCATTTAGGTGTTGGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538331 18 + 636262 GCCATTTAGGTGTTGGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 548948 18 + 647215 GCCATGTAGGTGTTGGAC + +a +s mr.mrrefChr3 88695 18 + 181019 ATTTGTAAAATTTAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538349 18 + 636262 ATTTGTAAAACTTCATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 550506 18 + 647215 atTTGTAAAATTTAATAG + +a +s mr.mrrefChr3 88713 60 + 181019 CATTAGCCTGTCCCATACATAAAAGTTAACACCACAAAGGCACCAATCATTATGTTCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538367 60 + 636262 CATTAGCCGGTCCTATACATAAGAGTTAACACCACAAAGGCACCAATCCTTATGTTCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 550526 60 + 647215 CATTAGCCTGTCCCATACATAAAAGTTAATACCACAAAAGCACCAATCATTATGTTCATA + +a +s mr.mrrefChr3 88773 221 + 181019 GAGATCTGGTCTTTTCAAGCTACACACTCGACTCTCTCCTGTGTAGCCTCGCCCCTGTGCAGAATAGCATAATAGCTCCAATATGCAGGTGCTCAAAACTTGGGTGCCTTGAGCCACTTATAAACCATAGGCAGGCCATAGCATGGTTATTTCCTAAGTGGACATCTTGTTTGTAAAACCAAGCTGATTTGCCATCTGCAGAGGGGTGTTAAATCTATGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538481 220 + 636262 GAGATCTGGTCTTTTCTAGCTACACACTCGACTCTCTCCTGTGTAGTCTCGCCCCTGTGCAGAATAGCATAATAGCTCCAATATGCAGGTGCTCAAAACTTGGGTGCCTTGAGCTACTTATAAACCATAGGCAGGCCATAGCATGTTTATTTCCTAAGTGGGCATCTTGTTT-TAAAACCAAGCTGATTTGCCATCTGCAGAGGGGTGTTAAATCTATGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 550586 174 + 647215 GAGATCTTGTCTTTTCAAGCTACACAC-----------CTGTGTAGC------------------------------------TCCAAGTGCTTAAAACTCAGGTGCCCTAAGCCACTTATGAACCATTGGCAGGCCATAGCATGGTTATTTCCTAAGTGGACATCTCGTTTGTGAAATGAAGCTGACTTGCCATCTGCAAAGGGGCCTTAAATCTGTGCA + +a +s mr.mrrefChr3 88994 139 + 181019 TCAATGGTCTTATATTGCTGCTATAATTTTTCTGGCCAATTTGGGTTGTATGTGGTCCTATGTACATACTTACTCCACAGACTTAACTATGCTACCCTGTCCACTTACTTAACAGAAGGGTATCATTGCCTTGATTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538701 139 + 636262 TCAATGGTCTTATATTGCTGCTATAATTTTTCTGGCCAATTTGGGCTGTATGTGGTCCTATGTACATACTTACTCCACAGACTTAACTATGCTACCCTGTCCACTTACTTAACAGAAGGGTATCATTGCCTTGATTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 550772 138 + 647215 TCAAGGGTGTTATATTGCCGCTATAATTTTTTTAGCCCAATTCGGTTGTATGTCGTCCTGTGTACATACTTACACCACAGACTTGA-TATGCCACCCTGTTCACTTACTTAACAGAAGGGTATCATAACCTGGATTATT + +a +s mr.mrrefChr3 89133 118 + 181019 AACTAATACATACACTAGTCATTATATGCCTCAATTTACATAGATTTTAGCCTAGACATGGAAAAGTCTGTAGTGGACTCCTGGATGACTTGTGCCAACATACTACATGCCAGATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538840 118 + 636262 AACTAATCCATACACAAGTCATTATATGCCCCAATTTACATAGATTTTAGCCTGGGCATGGAAAAGTCTGTAGTGGACTCCTGGATGCCTTGTGCCAACATACTACATGCCAGATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 550913 110 + 647215 ACCTAATACATAAACTAGTTATTATATGCCTCCATTTTCATAGTTTTTAGCCTAGACATGGA-------GTAATGGACTC-TGGATGACTTGTGCCTACATACTACATGCCAGATTCA + +a +s mr.mrrefChr3 89251 121 + 181019 ATAAAGATGGTCTCCGTGTCATATGATAAAACGAGCCAAATATAGACAATCAATAGGTTTATGTTACTATATGGTATACTACCAATGAATTGAATTTAATTAGTTTGTGTTCATTACATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 538959 121 + 636262 ATAAAAATGGTCTCCGTGTCATATGATAAAACGAGCCAAATATTGACAATCTACAGGTTTATGTTACTATATGGTATACTACCAATGAATTGAACTTAATTAGTTGGTGTTCATTACATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 551023 99 + 647215 ATAAAGATGATCTCCGTGTTACATGATAAAACGAGCCGAATATAGACAATCAATAGGTT----------------------CCAATGAATTGAATTTAATTAGGTTGTGTTCATTACACTA + +a +s mr.mrrefChr3 89372 86 + 181019 GCAAACCGAAAAACAGTGCAATATACTAGACCTGGAACCACAAGTTACTATACATCAAATAATTCGTTCTGTTTCTCTCAGGCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539146 86 + 636262 GCAAACCGAAAAATAGTGCAATATACTAGACCTGGAACCACGAGTTTCTATACATCAAATAATTTGTTCTGTTTCTCTTAGGCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 551122 86 + 647215 GCAACCCCATAAACTGTGCAATATAGTCGACCTGGAACCACAAGTTACTATACATCAATTAATTCATTCTGTTTCTCTCAAGTCTC + +a +s mr.mrrefChr3 89458 70 + 181019 AACATAATAATTGAGCCAAATTGAGTTGGTGGGTCTACTAAGCCACCAGACTGGCCAGACAGCTGCAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539254 70 + 636262 AACATAATAATTGAGCCCAATTGAGTTGGTGGGTCCACTAAGCCACCAGACAGGCCAGACAGCTGCAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 551208 61 + 647215 CACATAATAATTGAGACACATTGAGTTCTTGTGTCTACTAAGCCACCAGGCTG---------CTGCAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 89528 123 + 181019 GAGTTCTAGGTATAGTAATATGcaaagacagcaatatttgataactggtgccagagtatttggtgtcctatctgttaggagctAAACTAAAATGAGCTGCATGGCACCCCTGGCCCTCTCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539325 121 + 636262 GTGTTCTAGGTATAGTAATATGCAAAGACAGCAATATTTGATAAC--ATGCCAGAGTATTTGGTGTCCTATCTGCTAGGAGCAAGACTAAAATGAGCTGCATGGCACCCCTGGCCCTCTCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 551269 123 + 647215 GAGTTGTAGGTATTGTaatacacaaaggaagcaatattcatcaactggtgccagagtatttggtatcctatctcttgagagctAAACTAAAATGAGTTGCATGGCATCCCTGGCCCTCTCAGT + +a +s mr.mrrefChr3 89651 179 + 181019 CTAGAGGAGTAATATGGACTCCACCAGACAAGGAACTACATCGTGTGGAATTCTACCCTACTCCTCATTCCTAATCctttcagctgccaaagtgtgttccagaggattatttgggtcacaggattcaatattctgacattaaaatgacttgcaagcttgagacaccaaggaaggtagag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539453 178 + 636262 CTAGAGGAGTAATATGGACTCCACCAGACAAGGAACTACATTGTGTGGAATTCTGCCCTACTCCTCATTCCTACTCctttcagctaccaaagtgtgttccagaggattatttgggtcacagaattcaatattctg-cattaaaatgacttgcaagcttgagacaccaaggaaggtagag +s simRat_chr6.simRat.chr6 551392 179 + 647215 CTAGAGGGGTAAGATGGACTCCACCAGACAAGGAAGTACATCATTTGGCATTCCACCCAACTCCCCATTCCTAATCctgtcagctgccaaagtctgttccagaggattatttgggtcacatgactcaatattctgacattaagatgtcttgcaagtttgtgacaccaaagaagggagag + +a +s mr.mrrefChr3 89830 98 + 181019 aaactgaggcttggtctacaagatggggatactacagTTAACTGcAAACCTACACAATATGTAATGTATTCATCATAAGAAGGCTAGCCTCATGGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539632 98 + 636262 aaactgaagctcagtctaccacatggggatactaCAGTTAACTGCAAACCTACACAATATGTAATGTATTCATCATAAGAAGGCTAGCCTCATGGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 551571 97 + 647215 aaactgaggcttggtctacaagatggggatactaccaCCAACTG-AAACCTACACAATATGTACTATATTCATCATAAGAAGGCTAACCACATGGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 89928 41 + 181019 AATATACAAAACTAACAATGGGCAAAGAATGTGAATAGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539730 41 + 636262 AATATACAAAACTAACAATGGGCAAAGAATGTGAATAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 551672 41 + 647215 AACATATGAAACTAACAATGGGCAAGGAATGTGAATAGGTG + +a +s mr.mrrefChr3 89969 126 + 181019 CTAGGGAAGATATCCCTTAAGGATATACTAGTGCATAGCCCACTTTAGTGGCTGCGTTTTAACTGACATAGAGAAGGATTATAAACACTAATAACATAACTAATCAACCCCAAGGGAGACAGTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539771 126 + 636262 CTAGGGAAGATATCCCTTAAGGATATACTAGTGCATAGCCCACTTTAGTGGCTGCGTTTTAACTGACATAGAGAAGGATTATAAACACTAATAACATAACTAATCAACCCCAAGGGAGACAGTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 551718 126 + 647215 CTAGGGAGGATATCCCTCAAGAATAGACTTGCACATTGCCTGCTTTAATGGTTGTGGTTTAACCGACTTAGAAGAGGACTATAACCACTAATAACATAACTAATCAACCCCAAGGGAGACGGTAGT + +a +s mr.mrrefChr3 90095 9 + 181019 GCTGTCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539966 9 + 636262 GCTGTCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 551844 9 + 647215 GCTGAGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 90104 84 + 181019 TTAAAATATAAATGAAACAAGAGTGAGACCTTAAATCAGTTCTATggagtggtcattagaatacttcagagtaaaaatgagaca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 539976 84 + 636262 TTAAAATATAAATGAAACAAGAGTGAGACCTTAAATCAGTTCTATGGAGTGGTCATTAGAATACTTCAGAGTAAAAATGAGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 551853 84 + 647215 TTAAAATATAAAAGAAATAAGGGTGAAACCCTAACTCAGTTCTATgaaatggtcattagactacttcagagtaaaagtgagaaa + +a +s mr.mrrefChr3 90188 14 + 181019 tttttgagaaaatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540060 14 + 636262 TTTTTGAGAAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 551964 14 + 647215 ttttcgagaaactt + +a +s mr.mrrefChr3 90202 36 + 181019 gagaataataAAAGCCTTGAGGTTTGATGCAAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540074 36 + 636262 GAGAATAATAAAAGCCTTGAGGTTTGATGCAAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 551979 36 + 647215 aagaagaataAAAGCTTTGAGGTTTGATACAATTGT + +a +s mr.mrrefChr3 90238 66 + 181019 TCAAAAAACAAAAAAATAGAGGTGAAGGATCCACAGTCTAAGAATGGATTCGAAGATGAGACATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540110 66 + 636262 TCAAAAAACAAAAAAATAGAGGTGAAGGATCCACAGTCTAAGAATGGATTCGAAGATGAGACATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 552017 66 + 647215 TGTCAAAATAAAAGAATAGAAGTGAAGGATCCACAGTCTAAGAATGGATTCAAAGATGAGATGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 90304 234 + 181019 AATGCAGAGCTCACTTAGTTAaatgtgatccacctagtgaattgaaaagcaagacctgggaaaatgaaaagaagctttcatatccactaagataattccaagaagcatgccaggcagtaggaatactccatgcagttaaagacctgttggaaactgttcccatcaaatttacaactcttaagaaggggtcacttgtttgacagatcacatacttcctgtgcattcaccacaaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540177 234 + 636262 AATGCAGAGCTCACTTAGTTAaatgtgatccacctagtgaattgaaaagcaagacctgggaaaatgaaaagaagctttcatatccactaagataattccaagaagcatgccaggcagtaggaatactccatgcagttaaagacctgttggaaactgttcccatcaaatttacaactcttaagaaggggtcacttgtttgacagatcacatacttcctgtgcattcaccacaaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 552083 234 + 647215 GATGCAGTGCTCAATTAGTTTAATGTGATCCAGCAAGTCAATTCAAAACCCAGATCTGGGAAATTGAAAAGAAGTTGTCATATCCAGTAAGATAATTCCAAGAAACATGCCAGGcagtaggcatactccatgtagttaaggtcctgttggaaactgttcccaacaaatttacaaccttaaagaaggggtcacttgtttgacaggttgcatacttcttgtgcattcaccacaagt + +a +s mr.mrrefChr3 90538 64 + 181019 ctcaaattgagcacagtttcaaaacataTAGAACATATTGTAGCACTACATTTAACCCCTTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540411 64 + 636262 CTCAAATTGAGCACAGTTTCAAAACATATAGAACATATTGTAGCACTACATTTAACCCCTTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 552328 64 + 647215 cttaaattgatcccagttacaaaacataTAGAACATACTGTGGCACCACACTTAACCTCTTTTC + +a +s mr.mrrefChr3 90602 72 + 181019 TATTTTTAGATGTCAATTATGTGATACTTATCAAGGGGCAATTGGGGTAGAAAGAGGGGTGTTCAACTGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540476 72 + 636262 TATTTTTAGATGTCAATTATGTGATACTTATCAAGGGGCAATTGGGGTAGAAAGAGGGGTGTTCAACTGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 552392 72 + 647215 TATTTTTAGATGTCAATTATGTGATACTTGTGGAGGGGCAATTATGGTGGTAGGAGGGATGTTCAACTGACA + +a +s mr.mrrefChr3 90674 30 + 181019 CAGCCCTCTAGCTGCTCTGCCTCTTAGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540550 30 + 636262 CAGCCCTCTAGCTGCTCTGCCTCTTAGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 552464 30 + 647215 CAGCCACCTACCTGCTCTGACTCTCAGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 90704 144 + 181019 TTAATCAATGTTAGCTTCTTCCATTCTACCTACCTTGACTCAGAGTGGTAAGGCAAACTTCATTAGACTGATTAGTTATGCCCTCAGAGCCTTCATCCCTGGTAAAATAAGGGGAAATGAGTAGAAGTGATAGCCCTCATCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540583 144 + 636262 TTAATCAATGTTAGCTTCTTCCATTCTACCTACCTTGACTCAGAGTGGTAAGGCAAACTTCATTAGACTGATTAGTTATGCCCTCAGAGCCTTCATCCCTGGTAAAATAAGGGGAAATGAGTAGAAGTGATAGCCCTCATCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 552494 144 + 647215 TTAATCAGTGTTAGCTTCTTCCATTGCACCTACCTTGACTCAGAGTGGTAAGGCAATCTTCATCAGCCTGATTAATTATGTCCTCAAAGCATTCATCCCTGGTGAAATAACAGGGAATGAGTGGAAGCAATAGCCCTAGTCAAA + +a +s mr.mrrefChr3 90848 118 + 181019 TTTTGTCTCTTAATTATTTTTGTGTGCTTCTAGCTCCTTAAACCCTTAGCTGCTCTAGTCTTGATAGGGCCCCAGTGCATGCTGTGTAGGTAATGGTGGCTATCGGGTGTTGACATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540731 118 + 636262 TTTTGTCTCTTAAGTATTTCTGTGTGCTTCTAGCTCCTCAAACCCTGAGCTGCTCTAGTCTTGATAGGGCCCCAGTGCATGCTGTGTAGGTCATGGTGGCTATCGGGTGTTGACATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 552638 107 + 647215 TTTTGCCTCTTGATTATTTTTATGTGCTTCTAGCTCGTTAAACCCTTGGCTGGTCTAGTCTTGA-----------TGCATACTGTATAGGTAATGGAGGCTATCGGGTGTTGACATTG + +a +s mr.mrrefChr3 90966 48 + 181019 CTTAGTGAATCTTTCTGTTTTAATGCAGAGAAAATTAGCTATTTACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540884 48 + 636262 CTTAGTGAATCTTTCTGTTTTAAGGCAGAGAAAATCAGCTACTTACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 552745 48 + 647215 CTTAGTGAATCTTTATGTTTTAATGCAGAAAAAATTAGCGATTCACTG + +a +s mr.mrrefChr3 91014 54 + 181019 TTGTGAATTGCAACTCACACTATATCAAGCGAAATAAAAATAATAATCATCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 540942 54 + 636262 GTGTGAATTGCAACTCACACTATATCAAGCGAAATAAAAATAATAATCATCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 552793 54 + 647215 TTGTGAATTGCCACTCACACTATATCAAGCACCATAAAAATAATAATCATCAAC + +a +s mr.mrrefChr3 91068 6 + 181019 AGTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541013 6 + 636262 AGTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 552847 6 + 647215 AGTACA + +a +s mr.mrrefChr3 91074 146 + 181019 AATAGCTTGGTAGTATATCCCTGATAACACTACCACCTGCCCTCTGTATAGTACAAATTCTACACCTGTTCATATTTCTTAGTGATTCATTTGTCTCTCATAGACTGATGTGAGGTATATGGAGGAATCTCCAATTCCAGTACTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541022 146 + 636262 AATAGCTTGGTAGTATATTCCTGATAACACTACCACCTGCCCTCTATATAGCACAAATTCTACACCTGTTCATATTTCTTAGTGATTCATTTGTCTCTTATAGAGTGATGTGAGGTATATGGGGGAATCTTCAATTCCAGTACTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 552853 145 + 647215 AATAGCGTGGTAGTATATCCCTGATAACACTACCACCTGCCCTCTGTATAGTACACATTCTACACCTGTTCATATGTCTTAGTGATTCATTTGTCTCTCATGGACCGA-GTGAGTTATATGGAGGAATCTCCATTTCCAGTACTGA + +a +s mr.mrrefChr3 91220 219 + 181019 TTAGGGCTTGGGCAGCCATGATATTTAGGAGATAATCTGCTATGATTCACTGTTGATCTACTTGTCATTGGCTCACAAAAAGTTGTGGCCCCAAGTTAGATTGAGTAGGGATTTGTAACCTCAGATATGGCTTGTGAAGGGCACACACCTTAACTAATATGACTCCAACTCGCATACATATTCTAACTGTGCCTGCCTTAAGCTAACTACTGTCCTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541199 218 + 636262 TTAGGGCTTGGGCAGCCATGATATTTAGGAGATAATTTGCTATGATTCGCTGTTGATCAACTTGTTGTTGGCTCACGAAAAGTTGTGGCCCCAAATTAGATTGAGTAGGGATTTGTAACCTCAGATATGGCTTGTGAAGGGCACACATCTTATCTAATATAATTCCA-CTCGCATCCATATTCTAACTAGGCCTGCTTTAAGCTAAGTACTGTCCTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 552998 218 + 647215 TTAGGGCTAGGGCAGCCATGATATTTAGGAGATAATCTGCTATGATTTACTGTTGATCTATTTGTCATTGGCTCACAAAAAGTTGCAGCCCCAAGTTAAATTGAGTAGGGATTTGTAACCTCAGACGTGGCATTTGAAAGGCACATACCCGAACTAATATGACTCCAACTTGCACACATATTCTAACTGTGCCTGCCTTAAGCGAACTACTGTC-TGTG + +a +s mr.mrrefChr3 91439 48 + 181019 TTTAAAGTGGGAGATGGAATTAGTTGAATTTCAAAAAGTGAGAGTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541472 48 + 636262 TTTAAAGTGGGAGATGGAATTAGTTGAATTACAAAAAATGAGAGCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 553216 48 + 647215 TTTAGAGTGGGAGATGGAATTAGTTGAGTTTCAAGAAGCGAGAGTCTT + +a +s mr.mrrefChr3 91487 187 + 181019 ACTATGGTAGCCTTACCTGGGCCGTGAATAAAGTGACCCCTTAAGCCACAGGGCACCTAGCGCATATGAGTGGGGTGAGTAATTAATCACCTGCAGTCCACTACCACCCTAACATTGCCTATAACTAAATTCACCCCAGCCCATTGTTGGACTAGGACTGAAGGGCATTATGGGATGTACTGTAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541520 187 + 636262 ACTATGATAGCCTTACCTGGGCCGTGAATAAAGTGACCCCTTAAGCCAAAGGGCACCTAGCGCATATGAGTGGGGTGAGTAATTAATCACCTGCAGTCCGCTACCACCCTAAAACTGCCTATAACTAAATTCACCCCAGCCCAATGTTGAACTAAGACTGATGGGCATTATGGGATGTACTGTAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 553265 187 + 647215 GCTAGGGTAGCCTTACTTGGGCCATGAATAAAGTGACACTTTAAGCCACAGGGGACCTAGCACATGTGATTGGGTTGAATCATTAATCACCTGCAGTCCACTACCACCCTAACATTGCCTATAACTAAATTCACCACAGACCATTGTTTGACTAGGACTGAAGGGCATTATGGGATGTACTATAATC + +a +s mr.mrrefChr3 91674 96 + 181019 ACTATACCAGGGCCAAGGTGAGGTTACATGTAAATGTCTCAATATTTGATGTGGTCCACAATTTCCCCTTATTAGCATGGAATTGAACTTTTTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541717 96 + 636262 ACTATACCGGGGCCAAGGTGAGGTTACATGTAAATGTCTCAATATTTGTTTTGGTCCACAATTTCCCGTTATTAGCATGGAATCGAACTTTTTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 553452 78 + 647215 ACTATACCAGGGC------------------AAATGTCTCAATATTTGATGTGGTCTACAATTGCCCCTTATTAGTATGAAATTGAACTTTCTTTG + +a +s mr.mrrefChr3 91770 46 + 181019 CATCCTGCTTGCAGGCTTTTAACCATCCACCAGGAAACATAGGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541836 46 + 636262 CATCCTGTTTGCTGGCTTTTAACCATCCACCAGGAAATGTAGGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 553530 46 + 647215 CACTGTGCATGCAGGCTTTTAACCATCCACCAGGAAACATAGGTCT + +a +s mr.mrrefChr3 91816 488 + 181019 ATGGTATTGGCTCTAGTTGCAAGATATGATCTTGGTTAGACTTTACCATGTCATCTGGTTACTATTTTTGATCATCATCTAGGGGCATGTACACATCAACTCCTGCCTGGAGACAGAGGTTGAAGAATAGACATAACAGCAGGagaaatcccatttcagccataagcttgttccctctccacagcattctgactatttaaagagttcagtagtacctggttcgtgggcatatgctaagttctttactacttatggctgtcctcgcaacctgaaaactctcagatctaaaagctggaacccctaaggtgGTATCACATGTGGCTAGTCgCATTATAAAACTGGAGCCCACCAAGCTGTGTGACTTGCAAAGAGGTCTCTTGGATGGTTTCTGAAGCATTGTCACACTGGGATGTTGACAGCTCCAGGAGACTTGTTCACATTGCTTAAGTGGCAGCCACACAAAAAGGTTAGCCTTTAGATAGGCACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 541882 458 + 636262 ATGGTGTCAGCCCCAGTTGTAAGAAATGATCTTGGTTGGGCTTCACCAAGTCATCTGGTTACTAATTTTGATCATCATCTAGGGGCATGCACACATCAACTCCTGTCTGGAGACAGGGGTTGCAGACTAGACATAAAAGCAGGagaaagtccatttcagccataagcttgctccctctc---agcattctgactatttaaagagttcagtagtacctggt----gggcatatgctaggtt--------------actgtccttgcaacctgaaaactctcagatctaaaagctggaacccctaaggtgGTAACACGTGTGGCTAGTCGCATTGTAAAACTGGAGCCCACCAAGCTGTGTGTCTTGCAAA---------TGGATGGTTTCTGAAGCATTGTCTCACTGGGATGTTGACAGCTCCTGGAGAATTGTTCACATCACTTAAGTGGCAGCCACACAAAAAGGCTAGCCTTCAGATAGGCACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 553725 487 + 647215 GTGGTATTGGCTCTAAGTGCAAGATACAATCTTGGTTAGACTTTACCATGACGTCTGGTTACTATTTTTGATCATCATCTAGGGGCATGTACACAACAACTCCTGCCTGGAGACAGAGATTGAAGAATAAATATAACAGCAGGagaaatcccatttcagccataagcttgttccctctccacagctttctgactatttaaagagttctgtggtacttggttcgtggtcatatgctaagttctttactaCTTATGGCTGTCCTCACTACTGGAATATTCTACGATCCAAAAGTTATAACCCCTAAGGTGGTATCATATGTAGCTAGTC-CATTATAAAACTGGAGCCTGCCATGCTGTGTGACCAGCAAAGAGGTCTCTTGGATGGTTTCTGAAGCATTGTCACACTGGCATGTTCATAGTTCCAGGAGACTCGTTCACATTGCTTTAGTGGCTGCCACACAAAAAGGTTAACCTTTTGATAGGCGCTA + +a +s mr.mrrefChr3 92304 63 + 181019 TACGACTAGAGCTACTGTTATTCATATATTCAGCATTTGCCCTATTGCTGTTAGCCCTAGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542340 63 + 636262 TACAACTAGAGCTACTGTTATTCATACATTCAGCATTCGCCCTATTGCTGTTAGTCCTAGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 554213 63 + 647215 TATGAGTAGAGCTAGTGTTATTTATATATTCAGCATTTGCCCTATTGCTGTTAGCCCTAGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 92367 81 + 181019 TTCCCTCCACCTAATTTCAGCCCGATGTGGTAAATTGGATAAACACTATTGGTAAGGTACATCCATGTGTTTGATATAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542404 81 + 636262 TTCCCTCCAACTAATTTCAGGCCGATGTGGTAAATTGGATAAACACTATTACTAAGGTACATTCATGTGTTTGATATAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 554276 69 + 647215 TTCCCTCCACCTAA---CAGCCGGGTGTGGCAAA---------CACTATTGGCAAGGTACATCCTTGTGTTTAATATAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 92448 402 + 181019 ATGAAAGCAATCATTTAGTGTTTCTGTACTCACTAAATCCAGTCATCCTTCACTAATGGTACTTCCATGGTTCATTGGGAGGATTTACCACACCAGAGGGAATTACACAGACCCGACTGTATTATATCTCCACTAAAGCCCCTTGGGAGGTGTCAAAGAAGTGTGCCATATTCATGTGCAGAAATCTGGTGTCTCAGGTACCATTGAGATCGCTCAACAGGTGCCAGGGCAGGGTGAATCATCTATAAGTTTAGTATTAAGGGACCTAACTCATTGGATGTGTGGGTGAGCTTTTGCCTATTGAAACATAGTATATATACACAGGCACAAGTTATTAGCCAGGACAAAACTTGCCAGATATTTATATGCAGCATGCAAAACCATATATTTACATGGAACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542485 389 + 636262 ATGAAAGCAATCATTTAGTGTTTCTGTACTCACTAATTCCAGTAATCCTTCTCTAACAGTACTTCCATGGTTCATTGGAAGGATTTACCACACCAGAGGGAATTACAAAGACCTGACAGTATTATATCTCAACTTAAGCCCCTTGGGAGGTGTCAAAAAAGTGCGCCATATTCACATGCAGAAATCTGGTGTCTCAGGCACCATTGAGATCGCTCAACAGGTCCTAGGGCGGGGTGAATCATCTATAAGTTTAG---------ACCTATCTTATTGGATGTGTGGGTGAGCTTTTGCCTATTGAGACATAGTCTATATACACAGGCACAAGTTATTAGCCAGGGCAAAACTTGCCAGATAATTATAT----CATGCAAAACCATATATTTACATGGAACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 554346 385 + 647215 ATGAAAGCAATTGTTCAGTG------------CTAAATCCAATCATCCTTCACGAATGATACTTCCATGGTTCATCGGGAGGACTTACCACACCAGAGGGAATTACACAGACCCAACTTTATTATATCTACACTAAAGCTCTTTGGGAGGTGTCAAAGAATTGTGCCATATTCATGTGCAGGAAT--GGTGTCTCGGGTGCCAGTGAGATCACTCAATGGGTGCCAGGGCAGGGTGAATCAACTAT--GTTTAGTATTAAGGGACCTAACTCATTGGATGTATAGGCGTGCATTTGCCTATTGAAACATAGTATATATACATAGGCACAAGTTAT-AGCCGGTACAGAACTTGCCACATATTTATATGCAGCATGCAAAACCATATATTTACATAGAACCTG + +a +s mr.mrrefChr3 92850 74 + 181019 AAACATAGGAGAATGAGTTACTGGGAAGTTGGGATACTGGAAATCTAGTATCCACATAAATGTTTAATATTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542874 64 + 636262 AAACATAGGAGAATGAGTTACTGGGAAGTTGGGATACTGGAAATCTAGTTTCCA----------TAATATTCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 554735 74 + 647215 AAAAGTAGGAGAATGAGTTATAGGGAAGATGGGATACTGGGAATCTAGTATCCACATAAATGTTTAATATTCAT + +a +s mr.mrrefChr3 92924 34 + 181019 AAGATCAAGAAGGTTAATGTCTGGTGGATCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542938 34 + 636262 AAGATCAAGAAGGTTAATGTCTGGCAGATCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 554814 34 + 647215 GAGATCATTAAGGTTAATGTCTGATGGATCCATA + +a +s mr.mrrefChr3 92958 45 + 181019 TATGGCATGTTAGTTCCAATTCAAAGGATGTAAGAGCAATTTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 542972 35 + 636262 TGTGGCATGTTAATTCCTATTCAAAGGATGTAAGA---------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 554852 45 + 647215 TATGGCATGTTAGTTCCAATTCACAGGATATAAGAGCAATTTCAG + +a +s mr.mrrefChr3 93003 18 + 181019 CAGAGACACAGTCAACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543007 18 + 636262 CAGAGACATGGTCAACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 554898 18 + 647215 CAGAGACACAGTCAACAA + +a +s mr.mrrefChr3 93021 82 + 181019 TATTGTCAGTTGGACTAATTTGTAGTTCATTTTAATAACAATTAACAAAGCAATACCTCAAGCTGTTACTATGAGTATGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543025 82 + 636262 TATTGTCAGTTGGACTAATTTGTAGTTCATTTTAATAACAATCAACAAAGCAATACCTCAAGCTGTTACTATGAGTATGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 554986 81 + 647215 TATTGTCAGCTGGACTGATTGGTAGTTC-TTCTAATAGCAATTAACAAAGCAATATCTCAAGCTGTTACTATGAGTATGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 93103 104 + 181019 AAGCCGATAGAGGTATTATATGTAAGAGATACACTTACTTTAGAACACTTTAGTGGTGCTACATAAAAACCCACTCTCACTGTGATGAATCTAACAAGGAGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543107 98 + 636262 AAGCCGATAGAGGTATTATATGTAAGAGATAAACTTGCTTGAGAACACTTTAGTGGTGCTACATAAAAACCCAC------TGTGATGAATCTAACAGGGAGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 555076 104 + 647215 AAGCCGATAGAGGTCTTATATGTAAGAGTTACACTTACTTTTGAACACTTTAGTGGTGCTACAGAAGAACTCACTCTCACTGTGATGAATCTAACAATGAGGAA + +a +s mr.mrrefChr3 93207 91 + 181019 GGCACCTGTGGTGTGTAAATATTCCTAGTTGCCTCAGGATCTCTTCTTGACTGATTTTGTGTCGTATTTAATTCCATGGAGGTTGTAGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543233 91 + 636262 GGCACCTGAGGGGTGTAAATATTCCTAGTTGCCTCAAGGTCTCTTCTTGAGTGATTTTGTGTTGTAGTTAATTCCATGGAGGTTGTAGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 555180 90 + 647215 GGCACATGTGGTGTGTAAATATTCCTAATTGCCTCAGGATCTCTTCTCAACTAATTTTGTGTCGTATTTA-TTCAACAGAAGTTGTAGTGG + +a +s mr.mrrefChr3 93298 103 + 181019 GTGTGTGGACACCCACATTCTAGACTTTTCCTTCACCGGTAAATAAGTTACTAAAAATATGCAATGGTCTCCTTATAAAGGATGGATCACTTCTCCTAATAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543324 103 + 636262 GTGTGCAGCCACCCACATTCTAGACTTTTCCTTCACTGGTAAATAAGTTACGAAGAATATGCAATGGCCTCCTTGTAAAGGATGGATCACTTCTCCTAATAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 555271 103 + 647215 GTGGTTGGACATCCACGTTGTACACTTTTCCTTCACCGGTAAATAAGTTACTAAAAATATGCGATGGTCCCCTTATAAAGGATGGATTGCTTCCCCTAGTAGT + +a +s mr.mrrefChr3 93401 95 + 181019 ACATGACTACTTTGACCATTTTGAATTTGAGCTCCTACATGCCTGTTTTCATTATTATGATTTTGAGCTTTGGGTGGGAGCCTTACTGGCAACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543429 95 + 636262 ACATGACTACTTTGATCATTTTGAATTTGAACTCCTACATGCCTGTTTTCATTATTATGATTTTAAGCTTTGGGTGGGAGCCTTACTGGCAACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 555374 95 + 647215 ACATGACCACTTTGACCATTTTGAATTTGAGCTCCTACATGCCTGGTTTCAGCATTATGATTTTGAGCTTTGAGTGGCAGCTTTACTGGCAACCT + +a +s mr.mrrefChr3 93496 93 + 181019 TCAAGGTCTTGATCCTGGTTGTCAGGGATCAGAATTTGGTCTAATTAGTATGGTTCAAAATAAGTCAGCCTAACCATGCACCTAACTTGTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543526 78 + 636262 TCAAGGTCTTGGTCCTGGTTGTCAGGGATCAGAATTTGGTCCAACTAGTGTGGTTCAAAGAAAGTCAGTCAAACCATG--------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 555469 93 + 647215 TCAAGGTCTTGATCCTGGTTGCCAGGGATCAGAATTTGATCTAATCAGAATGGTTCAAAATAAGTCAGCCTCACCATGCACCTAACTTGTATT + +a +s mr.mrrefChr3 93589 54 + 181019 TGGTTTTAATCATTTCCAAACTAACCTAGATTCAGTGCAAGTTAACTGATAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 555566 54 + 647215 TGGTTTTAATCATTTCCAAACTAACCTAGATTCAGTGCAAGTTAACTGATAAGT + +a +s mr.mrrefChr3 93643 36 + 181019 CATTCTTGCCAGGTCCAGGTCGGGGTTCTCTATCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 555625 36 + 647215 CATTCTTGCCAGGTCCAGGTCGGGGTTCTCTATCCA + +a +s mr.mrrefChr3 93679 130 + 181019 GGCCCTAGTACTCTGTATTTAACATCCAGTACCAGTTACACCCTAAGACGGTGTGTCATTATCCTTAGAGTGGCACACGACACACATCATCATAAGTAGCCGAGCCATGATAGTGCCATGGGGGGTAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543604 56 + 636262 --------------------------------------------------GTGTGTCATTATCCTTAGACTGGCACACGACACACATCATCCTAAATAGCCGAATC------------------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 555662 130 + 647215 GGCCCTAGTACTCTGTATTTAACATCCAGTACCAGTTACACCCTAAGACGGTGTGTCATTATCCTTAGAGTGGCACACGACACACATCATCATAAGTAGACAAGCCATGATAGTGCCATGGGGGGTAGCT + +a +s mr.mrrefChr3 93809 124 + 181019 TAGGGGGGGGGGTGTATGGACTGTGATGCCTCATAGTTAGTTTTCATTATGTAAAGTCAATCTTTCACGTTAACAGCAAATTGTTGCCTATAATATATCTGGGACTACAAGCGACACATTGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543660 82 + 636262 ------------------------------------------TTCATTATGTAAAGTCAATCTTTCACATTAACAGCAAATTGTTGCCTATAATATATCTGGGACTACAAGCGACACATTGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 555805 124 + 647215 TAGGGGGGGGGGTGTATGGACTGTGATGCCTCATAGTTAGTTGTTATTATGCATGGTCAATCTTTCACGTCAACGGCAAATTCTTGCCTATAATATATCTGGGACTTCAAGCAAAACGTTGATT + +a +s mr.mrrefChr3 93933 43 + 181019 CCCCTGGTAAATATATTTAGAAGTATGAACCCCTCAAGGCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543742 43 + 636262 CCCCTGGTAAATATATTTAGAAGTATGAACCCCTCAAGGCTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 555931 43 + 647215 CCCCTGGTGAATATTTACGGAAGTATGAACCCCTAAATGATAG + +a +s mr.mrrefChr3 93976 39 + 181019 CATGCAACTATCCTTGCAGTCTCCAAAATGGCTTCTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543785 32 + 636262 CATGCAACTATGCTTGCAGTCTCCAAA-------CAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 555975 39 + 647215 CATGCAACTATCCTTGCAGTCTCCGGAATGGCTTCTAGG + +a +s mr.mrrefChr3 94015 204 + 181019 ACCCCTCTGGCTGTGTGGAGACCGACACATTGATAGGATCCAACCACCGGCAGCACATTACTGTGGATTAACTTGCTGCCACACAGGGGAGTGTGGAAGAGGTGGATACTTGTTAACCCTACTGACCGCTGCAGCACATGAGGAGGGCTTGAACCAATGAAAGATCAGACCACCACACATTTCTGTACATGAACCGAAGGAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 543817 203 + 636262 ACCACTCTGGCTGTGTGGAGACCGATACATTGATAGGATTCAACCACCGGCAGCACATTACTATGGATTAACTTGCTGCCACCCAGGGGAGTGTGGAAGAGGTGGATACTTGTTAACC-TACTGACCGCTGCAGCACATGAGGAGGGCTTGAACCAATGAAAGATCAGACCACCACACATTTTTGTACATGAACTGAAGGAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 556026 204 + 647215 ACCCCCTTGGCCATGTGGAAACTGACACATTGCTAAGATCCAACCACCTGCAGCACATTAATGTGGATTAACATGCTGCCGCACGGGGGAGTGTGGAAAATGTGGATACTTATTACCCCTACTGACCACTGTAGCATGTGAAGAGGGCTTGAACCAATGAAAGTTCAGATTACCACACATTTCTGTACATGAACCGAAGGAGAC + +a +s mr.mrrefChr3 94219 192 + 181019 CCAAGGGCTAGAACTGGAGTCCCCATAGGGAAGGGATAGCAGTTGGTCAGTGATCTGATCTAGGTTCTCTTGTTTTGAACATAAAATGGCACATCCCCTCTTGTCATGTCATCATGTCACCATCATAATTACTAATGCCTACTTCTATAAATATCCCACAGGATTGTATTTCTCCATGACCTCTTATTTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 544029 192 + 636262 CCAAGAGCTAGAACTGGAGTCCCCATGGGACAGGGATAGCAGTTGGACAGTGATCTGATCTAGGTTCTCTTGTTTTGGACATAAAATGGCACATCCCGTCTTGTCATGCCACCATGTCACCATCATACTTACTAAAGCCTACTTCTATAAATATCCGACAGGATTGTATTTCTCCATGACCTCTTATTTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 556230 187 + 647215 CCAGGGGCTAGAAC--GGGTCCCCATAGCGAAGGGATAACAGTTGGTGAGTGATCTGATCTAGGTTCTATTGTTTTTAACA---AATGACATATCTCCTCTTGTCAAGTCATCATGGCACCATCATAATTACTAATGCCTACTTCTATAAATATCCCACAGGATTGTATTTCTACATAAATTCTTATTTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 94411 197 + 181019 AAGAAACCTTACCTAAGAACATCTCACATCCCAAATTCTGAATGATCATTGCTGTGAGGGTGGGCTACACAAGCACCATTCCATCATCTGGTACAAGTGTTTCCCTTTTGAGCTAAATTGTTGAATTACAGTGACTCAGGTGAAAAGCAAGTTATAGGGGATAGCTATGGGGTTAAAAGGTGTACCCTAGTAGATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 544222 193 + 636262 AAGAAACCTTACCTAAGAACATCTCACATCCCAAACTCTGAATT----CTGATGTGAGGGTGGGCTACACAAGCACCGCTCCATCATCTGGTACAAGTGTTTCCCTTTTGAGCTAACTTGTTGAGTTACAGTCACTTGGGTGAAACGCGAGTTATAGGGGATAGCTATGTGGTTAAAAGGTGCGCCCTAGTTGATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 556417 194 + 647215 AAGAAACCTTACCTAGGATCATCTCACATCCCAAATTCTGACTGATCATTGCTGTAATGGTGGACCTCACAA---CCATTCCATCATCTGGTATGAGTGCTTCCCTTTTGAGCTAAATTGTTGAATTACAGTGACTCAGGTGAAAAGCAAGTAATAGGGGATAGCTATAGAGTTAAAAGTGGTACCCTAGTAGATTC + +a +s mr.mrrefChr3 94608 411 + 181019 ACTATCAACAGAAAAAACTAATAAATAATGATCAACCAACAATGCATTCTTGCTTTAGAGGGACTCTCATTTTTATCACCTCCACACGGTTCCCTGTTCACTGGGTATGTTTATTTTTGATAAATCATGGCCATAAGTAGGAATAGCAACTGTGTACATCCAAACTTGTACGAGAGTGTTTCATTTTCCTCTGAGTAATTGGGCCTGATCAGATATGGCCATCTGTCCTAACCAATTGGCTGAATCGGTGTGTAAGACAAGGTAGCTATGCATAAGCATTGATATTTAGCTGTGAGCTTTCACTTTGGGTGAGCCCATGTATGGACACATCTCTGTTCCCGTACTAGAAATAAAATTAATTCCTTTGCAAGTTTGGTAACTCCAATACAAGCTATATTCaataattatttg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 544417 405 + 636262 ACTATCAACAAAAAAAACTAATAAATAATGATCAAC----AGTGCATTCTTGCTTTAGAGGGACTATCATTGTTA-CACCTCCACACGATTTCCCATTCACTGGGTATCTTTATTTTT-ATGTATCTTGGCCACAATTAGGAACAGCAACTGTGTACATCCAAACTTGTACAAGAGTGTTTCATTTTTCTCTGGGTAATTGGGCCTGATCAGATATGGCCATCTGTCCTAACCAATTGGCTGAATCGGTGTGTAAGACAAGGTAGCTATGCATAAGCATTGATATTTAGCTGTGAGCTTTCACTTTGGGTGAGCCCATGTATGGACACATCTCTGTTCCCGTACTAGAAATAAAATTAATTCCTTTGCAAGTTTGGTAACTCCAATACAAGCTATATTCAATAATTATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 556611 411 + 647215 AATATCAACAGAAAAAACTCTTAAATAATGATCAACCAACAATGCGTCCTTGGTTTAGAGGGACTCTCATTTCTATCACCTCCACATAGTTCCCTGTTCACTGGGTATGTTCATTTTTGACAAATCATAGCCATAAGTAGGAATAACAACTATGTACATCCAAATTTGTATGACAGTGTTTCATTTTCCTTTGAGTAATTGGACCTGATTTGATATCCCCGTCTGTCCTAACCAATTGGCTGAATCTGTGTGCAAGACAAGGTGACTAGGCATAAGGATTGATATTTAGCTGTGAGCCTGCACTTTGGGCGGGCCATTGTATATAAACATCGCTGTTCCTGTACTAGAAATAAAATCAATTCCTTTGTAAGCATAGTAAATCAATTCCTAGCTACATTCaataattatttt + +a +s mr.mrrefChr3 95019 170 + 181019 attaatcgTCCAAACTAATGAGTGGATACAGTGAAATAACAGAATCCTCAGAGATGGAAAGTCTGAACCCGACCACCTAGTGTGAAAAACTATCTGAAGCCAAGGTGCTAAGGTGTTGGACACCAGAATCAGAATTGAAGAGCCCTTTCATCTGCAGGCAGGTTACATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 544822 170 + 636262 ATTAATCGTCCAAACTAATGAGTGAATACAGTGAAATAACTGAGTCCTCAGAGATGGAAAGTCTGGACCCGACCACCAAGTGTGAAAAACTATCTGATGCCAAGATGCTAAGGTGTTGGATACCAGAATCAGAATTGAAGAGCCCTTCCATCTGCAGGCAGGTTACATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 557029 170 + 647215 attaattatCCAAACCAATCAGTGGACACAGTGAAATAACAGAATCCTCAGAGATGGAAAGTCTGAACCCGATCACCTGGAGTGAAAAACTATCTGAAGCCAGGGTGCTAAGGTGTTGGACACCAGAATCCGAATTGAAGAGCCCTTTCATCTGCAGGCAGGTTACATTG + +a +s mr.mrrefChr3 95189 33 + 181019 TTCAATATAGGGCACCCCTAAAAAACAGTCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 544992 33 + 636262 TTCAATATGGGGCACCCCAAAAAAACAGTCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 557212 33 + 647215 TTCAATATAGGGCACCCCTAAAAAACAGTCACA + +a +s mr.mrrefChr3 95222 316 + 181019 ATGATAAGTAACAAAGTGGGTTTGCCTACCTTTTGAAACCTTTGAAGTGTAATTAACTTCTTATCTTAGGTGGAATTCAATCTGTGATCAAGTTGAAATGCATTTGCTTCTGGTTACCAAAACATATAATCTTGTGAGATTTAGGGTTCCTTTGAATCTGCATTCAACTGAGGATTAACAATTAACTAGGATAGAGTTGGGACAAAACTGCCATGGGGATCAGAGAGCCTCCAGAAATAAATTTGTTGTGTGATAAGCAAACCTGTGAGATTCAGAAAAGCACAACTGTTAGAAGGGAAGTGAAAAGCAGCATACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545027 316 + 636262 ATGATAAGTAACAAAGTGGGTTTGCCTACCTTTTGAAACCTTTGAAGTGTAATTAACTTCTTATCTTAGGTGGAATTCAATATGTGATCAAGTTGAAATGCATTTGCTTTTGGTTACCAAAACATATAATCTTGTGAGATTCAGAGTTCTTTTGAATCTGCATTCAACTGAGGATCAACACCAAACCAGGATAGAGTTGGGACAAAACTGCCAAGGGGATCAGAGAACCTCCAGAAATAAAGTTGTTGTGTGATAAGCAAACCTGTGAGATTCAGAAAGACACAACTGTTAGAAGGGCAGTGAAAAGCAACATACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 557245 314 + 647215 ATGATAAGTAGCAAAGTGGGTTTATCTACCTTTAGAAACCTTTGAAGTGTACTTAAGTTCTTACTTTATGTGGAATCCAATCTGCGATAAAGTTGAAGTGAATTTCCTTCTGGGTACAAAAACATAAA--CTTGTGAGTTTTATGGTTCCTTCGAATCTCCATGCAACTGAGGATTAACAATTAGCTAGGATAGAGTTAGGACAAAACTGCCGTGGTGATCAGGGAGCCCCCAGAAATATATCCGTTGTGTGATGGGCAAACCTGTGAGGTTCAGAAAAGCCCAACTATTAAAAGGGAAGTGAAAAGCAGCATACC + +a +s mr.mrrefChr3 95538 22 + 181019 AATTGAATTGATACTGATAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545343 22 + 636262 AATTGAATCGACACTGATTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 557561 22 + 647215 AATTAATTTGATACTGATAATT + +a +s mr.mrrefChr3 95560 135 + 181019 TGTTAAGTTTACCTGAGTGTGTGATTGCATGGTTGGCTCAGTCACTTTCCTGAGGAGTCCAACACTACTAGTTGCAAGATTGGGCTGCAACAGAATGTGACTGTGCAAGCAATAATGTGAGAGTCCTAAACCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545365 135 + 636262 TGTTAAGTTTCCCTGAGTGTGTGATTGCATGGTTGGCTCAGTCACTTTCCTGAGGAGTCCAACACTACTAGTTGCAAGATTGGGCTGCAACAGAATGTGACTGTGCAAGCAATAATATGAGAGTCCTACACCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 557588 134 + 647215 TGTTAAGTTTACCT-AGTGTGTGATTGCATGGTTGGCTCAGTCACTTGCCTAAGGAGTCCAACACTACTAGTTGCAAGATTGGGCTGCAACAGAATGTGACTGTGCAAACAATAATGTGAGAATCCTGAACCACA + +a +s mr.mrrefChr3 95695 36 + 181019 GCTTGGCATGTATACACCGAGGTGTGATGCAGGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545500 36 + 636262 GCTTGGCATGTATACATTGAGGTGCAAGGCCGGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 557723 36 + 647215 GCTTGGCATGTATACACCGAGGTGTGATGCAGGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 95731 233 + 181019 TTTTGCAGGATAGATTTTAAAGCAGAAAACAGAGCTTGAACATGTTTGAGGATGCAATGACTGTGCAGTATACTAGCATGCTGGGAGTATGGGACAGTGTGTCAGACTAAGGCTCTGGCAGCATTGTTCTTAGTCAGCATAGCCTAGTGAGAATTGCTAAGTCATGACAATAGTGCCAATGTTAGCTTCAGGCAAGCTATAATACAGTTAGTGAAGTACATTGCACAGGAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545536 233 + 636262 TTTTGCACGATAGATTTTAAAGCAGAAAAGAGAGCTTGAACATGTTTGAGGATGCAATAACTGTGCAGTATACTAGCATGCTGGGAGTATGGGACAGTGTGTCAGACTAAGGCTTTGGCAGCATTGCTCTTAGTCAGCATAGACTAGTGAGAATTGCTAAGTCATGACAATAGTGCCAATGTTTGATTCAGGCAAGCTATAATACAGATAGTGAAGAACATTGCACAGGAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 557760 227 + 647215 TTTTGCAGGATAGATTTTAAAGCAGAAAACAGAGCTTGAGCATGTTTGAGGATGCA-TGACTGTCCA-----CTAGCATGCTGGGAGTATGGGACAGTGTGTCAGACTAAGGCTCTGACAGAATTGTTCTTTGTCAGCATAGCCTAGTGAGAATTGCTAAGTCACGACAATAGATCCAATGTTAGCTTCAGTCCAGCTATAATATGATAAGTAAAGTAGACTGCACAGGAACA + +a +s mr.mrrefChr3 95964 218 + 181019 AGTCGAACATATGTGGATAACAGGCTCCCAGGTACAGTTGGCCTGGAATTAGATTAATGAGACCCAATATTTTGAGTGCTAAGATTACCTGGTCAGTTAGCCAGTATAACACAGATGTTTTTCAAGTGATACATGTTCATTAGCGACATTTCTGACCATAATGCACCACTAGTAGGGAGTGAATTAGAATGGAGTTCATCAGTATCTTAGCTACAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545769 213 + 636262 AGCCGAATATATGTGGATAACAGGCTCCCAGGTACCGTTGGTCTGGAATTAGATTAATGAGACCCAATATTTTGAGTGCTAAGATTACCTGGTCAGTTAGCCAGTATAACACAGATGTTTTTCAAGTGATACACGTTCATTAGCGACGTTTCTGACCATAATGCACCACTAGTAGGGAG---ATTAGAATGGAGTTCATCAGTATCTTAGCTACAG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 557996 195 + 647215 AGTCAAACATACTAGGATAACAGGCTCCCAGATACAGTTGGCCTGGAATTGGAGTAACTACACCCAATATTTTGGGTGCTAGGATCACCTGGTCGGTTAGTCAGTATGACACAGATGTTTTTCAAGTGGTACATGTTCATTAGCAACATTTCCGACTGTAATGCACTACCAGTAGGGAGTGAATTAGAATAGA-----------------------CC + +a +s mr.mrrefChr3 96182 37 + 181019 CGAAGCGATCAAGATACCAAACTTGCCCTGATTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 545982 37 + 636262 CGAAGCGATCAAGATACCAAACTTGCCCTGATTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 20785 37 - 647215 CACAGGAATCAGGATACCAAGCTTGTCTAGATTAATA + +a +s mr.mrrefChr3 96219 19 + 181019 TTAACTTCAGAGGGTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546019 19 + 636262 TTAACTTCAGAGGGTGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 20828 19 - 647215 TAGATTTGAGCAGGTGGCA + +a +s mr.mrrefChr3 96238 14 + 181019 TTACAGTATCATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546038 14 + 636262 TTACAGTATCATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 20850 14 - 647215 TAAATTTGTCAAGA + +a +s mr.mrrefChr3 96252 5 + 181019 GTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546052 5 + 636262 GTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 20866 5 - 647215 GTCTC + +a +s mr.mrrefChr3 96257 5 + 181019 ACTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546063 5 + 636262 ACTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 20871 5 - 647215 ACCAT + +a +s mr.mrrefChr3 96262 9 + 181019 AGTGATTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546068 9 + 636262 AGTGATTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 20879 9 - 647215 AGTGGGTGC + +a +s mr.mrrefChr3 96271 33 + 181019 ACCCACTAGAGCTAGCTAAAAAAAAAGCTATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546079 33 + 636262 ACCCACTAGAGCTAGCTAAAAAAAAAGCTATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 20888 33 - 647215 AAACACTAGAGCTAGCTGAAAAAAAAGCTATAA + +a +s mr.mrrefChr3 96304 95 + 181019 AGACCAAGTGAGTGCTACTGGGAGATGTGAGTTGCCTTTACTCTCTTATCAGAAATAGAGCCATGGGAGGGCTATTGGGTATCTGCGGCAGTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546133 95 + 636262 AGACCAAGTGAGTGCTACTGGGAGATGTGAGTTGCCTTTACTCTCTTATCAGAAATAGAGCCATGGGAGGGCTATTGGGTATCTGCGGCAGTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 626188 95 + 647215 AGACTAGATGTGTTCTACTGGGAGATGTGAGTTGCCTTTACTCTCCTATCAGAAATAGAGCCATGGGAAGGCTGCTGGATATTGGCGGATATGGC + +a +s mr.mrrefChr3 96399 174 + 181019 TTTCCACACAGGGCTTGTAGCATGCCCTCTGGCCAGTAAGCAAGCAACAATAAAGTGGAGTCAATTAATGAGAATAACATGGAACCATTTTGTGTACTGCCTGTGTATTGTGGATGGTTCTCTTAGGTTGGCCAGTCTTCTACAACAGTTTGGATGCCTCTGACCAGGGGCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546228 152 + 636262 TT----------GCTAGTTGCATGGCCTCTGGCCAATAAGTGAGCAACAATCGAGTAAAGTTAATTAATGAGAATAAC------------TGTGTAATGCCTGTGTATTGTGGATGGTTCTCTTAGGTTGGCCAGTCTTCTACAACAGTTTGGATGCCTCTGACCAGGGGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 21134 174 - 647215 TTTCCACACAGGGCTTGTAGCATGCCCTCTGGTCAGTAAGCAAGCAACAATAAAGTGGAGTCAATTAATGAGAATAACATGGAACCATTTTGTGTACTGCCTGTGTATTGTGGATAATACTCATAGGTAGGCCAGTCGTCTACAACGGTTTGGACCCCTATGACTAGGGGCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 21027 106 - 647215 TTTCCACACAGGGGTTGTAGCATGCCCTCTGGCCAGTAAGCAAGCAACAATAAAGTGGAGTCAATTAATGAGAATAACATGGAACCATCTTGTGTACTGCCTGTGT-------------------------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr3 96573 11 + 181019 ATTTCTGACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546383 11 + 636262 ATTTCTGACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 21308 11 - 647215 ATTTCATGCTA + +a +s mr.mrrefChr3 96584 41 + 181019 GGGGACTGTATTACTAATAATTGGGTCTCAACAAGCAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546394 41 + 636262 GGGGACTGTATTACTAATAATTGGGTCTCAACAAGCAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 21324 41 - 647215 AGTGGTCAGATTACCAATAATTAGGTCTCAACAATCACCAA + +a +s mr.mrrefChr3 96625 46 + 181019 CGTCAAAGAAGTTGGCAGTGGGTCATTTGAAACTTATGCAGTAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546435 46 + 636262 CGTCAAAGAAGTTGGCAGTGGGTCATTTGAAACTTATGCAGTAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 21374 46 - 647215 CGTTAAAGAGGTTGGCATTGATTCATTTGAAAGCTTTGCATTAGGA + +a +s mr.mrrefChr3 96671 14 + 181019 ATGAGTCAACAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546481 14 + 636262 ATGAGTCAACAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 21421 14 - 647215 ATGACTCAACAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 96685 98 + 181019 TGCTCAAGGAATTGGAGCCTCTTAGTTGCCCTTTCTACTCCACCCAGTCCACCCAATCTGCTGCTTGAAAACTTGATTCTACATCCTTGAAAAGGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546495 98 + 636262 TGCTCAAGGAATTGGAGCCTCTTAGTTGCCCTTTCTACTCCACCCAGTCCACCCAATCTGCTGCTTGAAAACTTGATTCTACATCCTTGAAAAGGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 21438 98 - 647215 TGCTCAAGGGACTGGAGTGCCTTAGGTGCCCTTTCTAGTCCACCTGGGCCACCGAAACTGCTGCTCAAAAACTTGAATCTACATCTTTGAGAAAGCTT + +a +s mr.mrrefChr3 96783 88 + 181019 TAAGTTTTTCATTTGCCCCCCATCTTATGATCTTAGACACGTTTTCCTCCCACCTGTCTGTACAGGAGGTCTTACAAAAAACTCCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546597 88 + 636262 TAAGTTTTTCATTTGCCCCCCATCTTATGATCTTAGACACGTTTTCCTCCCACCTGTCTGTACAGGAGGTCTTACAAAAAACTCCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 21536 88 - 647215 TAAGTTTTCCATCTGACCCTCGCCATATGATCTTTGACAGGTTTTCCTTCCACCGGTCTGTAAAGGAGCTCTTACAGAAAAGTCCAGG + +a +s mr.mrrefChr3 96871 23 + 181019 AATGTCTTGTCAAAGTTTTGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546687 23 + 636262 AATGTCTTGTCAAAGTTTTGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 21624 23 - 647215 AAAGTATTGTCAAAGTTTTGCAT + +a +s mr.mrrefChr3 96894 131 + 181019 AGGACCTCAGGGAAATTGATCTCTGAGTGTGAGTGTGATGTTTTGTTAGATTAGTTTGGGGCAGTTGAAAATGAAAGGGCCTGCCCAGCTTATTTATTTCATATCTTTCAATTCTTTGGGTTAAGAAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546711 131 + 636262 AGGACCTCAGGGAAATTGATCTCTGAGTGTGAGTGTGATGTTTCGTTAGATTAGTTTAGGGTAGTTGAAAATGAAAGGGCTTGCCCAGCTTATTTATTTCATATCTTTCAATTCTTTGGGTTAAGAAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 21647 119 - 647215 AGGACCTCAGGGAAATTGATCTCTGAGAGTTAGTGCTATGTTTTGTTAGATTAGTTTGGGGCA------------AGTGTCTGCCCAGCATATTTATTTCATATCTTTTGATTCTTTGGGTTAAGGAACTT + +a +s mr.mrrefChr3 97025 89 + 181019 AAGCATTAACCACTAAGAGGTAAAGTGGTAAAACCAGTGTTTTGAGGAAAGCAATGTTACTAGGAAATATAATGTGATAAAAGACAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546842 88 + 636262 AATCATTAACCACTAAGAGGTAAAGTGGTAAAACCAGTGTTTTGAGGAAAGCAATGTCACTAGGAAATATAATG-GATAAGAGACAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 21787 89 - 647215 AAGTGCTAACCACTCAGAGGTAAAGTGATAAAACCAGTGTTTTGAGGAAAGCGATGTTATTAGATAACATAATGTGATAAAAGACAACC + +a +s mr.mrrefChr3 97114 78 + 181019 TTTATATTTCTTGTCTTGTATACCAGCTACATATTCTAAAATGTTCTGACTGGCATTGGGGGCCTTCTTGAGGTACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 546930 78 + 636262 TTTATATTTCTTGTCTTGTATACCAGCTACATATTCTTAAATGTTCTGACTGGCATTGGGGGCCTTCTTGAGGTACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 21883 75 - 647215 TTTATATCTCTTGTCTTGGATACCAGCTCCATATTCTAAAATGTTCTG---GGCATTGGGGGCCCTCTTGAGGTACCT + +a +s mr.mrrefChr3 97192 378 + 181019 AACATCCCTTGTTGCAAAATCAATACGGCTGGTGATACAGTAAACCCATTACCATTAGTAGTGCCAAACTCCTCCTGCCCTGGTCTAGTATGCCTGTATAAATAGTAGTAGTACATAACAGATACTTTTGTCAATGTCAGTGTCTGTCACTGCTTGACACATTATATGTGTGTGCAGTGCCCTCAGCAGCCATTATGCCACATTGGTTTAGCCTAATATTGTAAACCCTTCTGGTTTGTATTAACCATCAGTGGCCGTTTTTCATTTGCCGCCTTTTTTTGTGTATTGATAGTTAGCGGAATTTATTGTTCCATTAGCCGCAGGTCAGCGAAATAAAATCCCAGTGGCTGCAGGTTAGCAGAAGAAAGTTGACTCGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547016 378 + 636262 AACATCCCTTGGTGCAAAATCAATACGGCTAATGATACCGTAAACTCATTACCATTTGTAGTGACAAACTCCTCCTGCCCTGGTCTAGTATGCCTGTATAAATAGCAGTAATACATAAAGGATACTTCTGCCAATGTCAGTGTCTGTCACTGCTTGACACATTATATGTGTGTGCAGTGCCCTCAGCAGCCATTATGCCACGTATGTTTAGCCTAATATTGTAAACCCTTCTGATTTGTATTAACCATCAGTGGCCGTTTTTCATTTGCCGCCTTTTTTTGTGTAATGAGACTTAGTGGAATGTATTGTTCTATTGGCCGCAGGTCAGCGAAATAAAATCCCAGTGGCTGCTGGTTAGCAGAAGAAAGTTGACTTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 21958 376 - 647215 AACATCCCTTGTTGTAAAATCAATATGGCTGGTGATACAGTATACCCATTACCATTAGTAT-GCCAAATTCCTCCTGCCCTGGTGTACTATGCCTGTATACATAGTAGTAGTACATAACAGATACTTTTGTCAATGTCAGGGTCTATCACTGCTGGCCACATTATAAGTGTGTGCAGTGCTCTCAGCAGCCATTATGCCACATTGGTTTAGCCTAAT-TTCTAAACCCGTCTGGTTTGTATTAACCATCAGTGGCTAATTTTCACTTGCTGCCTTTTTTTTTGCATTGGTAGTTAGCGGTACTTATTGTTCCAGTAGCCGAAGGTCAGCGAAATAAAATCCCAGTGGCTGCAGGTCAGCAGAAGAAAGTAGACTCGGT + +a +s mr.mrrefChr3 97570 2 + 181019 GT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547445 2 + 636262 GC +s simRat_chr6.simRat.chr6 22334 2 - 647215 TT + +a +s mr.mrrefChr3 97572 177 + 181019 AAGTTTTGTATTTCTAAGCTTGGGAGCTATGCTTGCCCAATTTGAATTTATGTGGAGATTCCATTGATGCTAACCAGGAAACCTTAGAAGGAGCCTTAATGGCCACAACACCTCAATCAACTCTAAAACCAAATTCATCATTGATGGGTCTTTCTGATGTTAGGTTTTATGATGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547477 177 + 636262 AACTTTTGTGTTTCAAAGCTTGGGAGCTATGCTTGCCCAATTTAAAGTTGTGTGGAGATTCTATTGATGCTAACCAGGAAACCTTAGAAGGAGCCTTAATGGCCACAACACTGCAATCAACTCTAAAACCAAATTCATCATTGATGGGTCTTGCTGATGTTAGGTTTTATGATGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 22336 148 - 647215 AAGTTTTGTATTTCTTAGCGCGGGAGCTATTCTTGCCCAATTTGAATTTATGTGGAGATTCCATTGATGCTA-----------------------------GCCACAACACCTCAATCAACTCTAAAACTGAATTCATCATTGATGGGTCTTTCTGGTGTTGAGTTTTATGATGTTG + +a +s mr.mrrefChr3 97749 226 + 181019 CTCATGATTTTTTGTGAGCATCAACCTCATGGGTAACACATTGATTGCATGCAGAGCTTGGCCAGAATTAGAACGCTTGTTTTGTACAATCCACTCTACATTCATTTTGAGAGAATTGAGCCTTACTATTCTCCATTAAACATAATTAGCCTCTCAACCTTATTAAACAGCAGCCTGTGCACTGTCTTATACATGTATTCTAGGTGCCACATCATTAGCCAGTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547654 221 + 636262 CTCATGAATTTTTGTGAGT-TCAACCTCATGCATAACACATTGGTTGCATGCAGAGCTTGGCCAGAATTAGAACGCTTGTTTTGTACAATCCACTGTACATTCATTTTGAGGGAACTGAGCCTTACTATTGTCCACTAAACATAATTAGCC---CAACCTTATTAAACAGCAGCCTGTACACTGTCTTATACATGTATT-TAGGTGCCACATCATTTGCGGGTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 22485 224 - 647215 CGCATGATTTTTTGTGAGCATCAACCTCATGGGTGAAACATTGATTGCATGCAGAGCTTGGCCAAAATTAGAACACTTGTTTTGTACCATCCACTCTACATTCATTTTGAGAGAATCTAG--TAGCTATTCTCCATTAAATATAATTAGCTTCTCAACCTTACTAAACAGCAGCCTATGCACTGTCTCATAGATGTACTCTAGGTGCTACACCATTAGCCAGTAAC + +a +s mr.mrrefChr3 97975 3 + 181019 TTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547884 3 + 636262 CTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 22709 3 - 647215 TTA + +a +s mr.mrrefChr3 97978 126 + 181019 CCAGTGTTAATGATATTGCCACGTGGTATCCTGATATCACACATACCACACTGCATACCTGAATGGCAACAAAGATCCCCACCCTCCAGAGCATTTAAGCCAGGGGGGCCTGGACTGAAGAATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 547887 126 + 636262 CCGGTGTTAATGATATTGCCACGTGGTATCCTGATATCACACACACCACACTGCACACCTGAATGGCAATAAAGATCCCCACCCTCCAGAACATTTAAGCCAGTGGGGCCTGGACTGGAGGATTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 22720 125 - 647215 CCAGTGTTAGTGATATAGCCAGGTGA-ATCATGATATCACACATACCACACCACATACCTGAATGGCAACACAGATCACAACTCTCGAGAGCATTTCAGCCGGGGGGGCCTGGTATCAAGAATTGA + +a +s mr.mrrefChr3 98104 85 + 181019 GCACTTCAGGCTCACTGATTATTTAGACTTGATTAATCATATCCATCTGCAGTAAGCCAAATAACCAAACTGCTCAATTGGCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548013 85 + 636262 GCACTTCAGGCTCACTGATTATTTAGGCTTGATTGATTATATCCATCTGCAGTAAGCCAAATAACCAAACTGCTCAATTGGCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 22870 85 - 647215 GTGCTTCAGGCTATCAGATTATTCACACTTGATCAATCATATCCATATGCAGTAAATCAGATAACCAAACTGCTCAATTGGATGT + +a +s mr.mrrefChr3 98189 120 + 181019 TTATTTACGTCCTGGGGTTCATGGCTAACTGCAATGCTAAAGCGCTTTTCCCAACATGCCCCATTTTAAGTACCCACAGTTTACAAGCTCGAGTCCTAAACCCGGGAGTTATCATAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548098 97 + 636262 TTATTTACGTCCTGGGGTTCATGGCTAACTGCAATGCT------------CCAACATACCCCATTTTA---ACCCACAGTTTACAAGCTCGAGTCCTCAACCCGGGAGTTAT-------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 22956 118 - 647215 TTATCTACGTCCCGGGGTTCGCGGCTAAGTACAATGCTAAAGCGCTTTTCTGAGCATGCCCCATTTTAAGTACCCACAGTTT--AAGCTCGAGTCATAAACCCAGGAGTTATCATAGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 98309 41 + 181019 GTGAGAAGGGGAGAACCAACTTAGTTTTAACTTCAAGTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548195 36 + 636262 -----AAGGGGAAAACCAGCTTAGTTTTAACTTCAAGTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 23080 41 - 647215 GTGAGAAGGCGAGAACCAACTTAGTTTTATCTTCAAGTAGC + +a +s mr.mrrefChr3 98350 146 + 181019 AACCTGTCACCCCCAAGTCAGCCTGGTTGATACCCCCCCTGCGAGGAATCACTAACCAGCCGCTCTGCAGACACGATATGGGGACGTCTCATGTGCCGTCGTCGCAGACGCAATGCGGGGTGGGTATGTTCGCGCGGCGTTGGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548231 146 + 636262 AACCTGCCCCCCCCAAGTCAGCCTGGTTGATACCCCCCCTACGAGGAACCACTAACCAGCCGCTCTGCAGACACGATATGGGGACGTCTCATGTGCCGTCGTCGAAGACGCAACGCGGGGTGGGTATGTTCGTGCGGCGTTGGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 23122 146 - 647215 AACCTGTCAGCCCCAAGTCGGCCTGGTTGATACCCCCCCTGTGAGGAATTACTGACCGGCCGCTCTGCAGTCACGATAAGGGGACGTTTCATGTGCCGTCGTCGCAGACGTAGTGCGGGGTGGGTATGATCGCGCGGCGTTGGGCA + +a +s mr.mrrefChr3 98496 67 + 181019 ATACGCCCCATCGCTTATTGATTGAGCTCAATATCATCTCTGAGCTCCATGGTCTCCAGCTCCATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548377 67 + 636262 ATACGCCCCATCGCTTATTGATTGAGCTCAATATCATCTCTCAGCTCCACAGTCTCCAGCTCCATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 23289 67 - 647215 ATACGACCCACCGCTTATTGATTGAGCTAAATATCATCTCTGAGCTCCATGGTCTCCACCTCCACTG + +a +s mr.mrrefChr3 98563 145 + 181019 TTTTCCCTGCGACAAGTACCACTGTGGGCATTATCCTGTTCCATTGTACAATGCAAACATTATGTAAAACTGGTTTGAGTGGGGAGCTCAACATACAAGGTCTCCCTTCACATCATAAACAATGACCAAGGTTTATACTAGACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548444 145 + 636262 TTTTCCCTGTGACAAGTACCACTATGGGCATTATCCTGTTCCATTGTGCAATGCAAGCATTATGTAAAACTGGTTTGAGTGGGAAGCTCAACATACAAGGTCTTCCTTCACATTATAAACAATGACCAAGGTTTATACTAGACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 23358 145 - 647215 TTTTCCCTGCAACAAGTACCACTGTGGGCATTATCCTGTTCCATTGTACCTTGCAAACATTATGTATAACTGGTTTGGGTTGGGAGCTCAACATACAAGGTCTCCCCACATATCATAAACACTGTCCAAGGTTTATACAATACAT + +a +s mr.mrrefChr3 98708 70 + 181019 CTTATCCTACTCCACACGCTTCATAACACTAATATGCACTGACCACATGGATCCTATCTGTGGGCATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548605 70 + 636262 CTTATCCTACTCCACACGCTTCATAACACTAATATGCACTGACCACATGGATCCTATCTGTGGGCATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 23503 70 - 647215 CCTATCCTACTCCACATGGTTCATAACACTAGTCCAGACTGAAAAAATGGATCCTATCTGTGGGCATACA + +a +s mr.mrrefChr3 98778 93 + 181019 GGCGCAGCAAAGAAGCTTTCATTCCCACTATACCACAAAAAAATGCATTTTTCTATGTGATGCAGGTTATTCAGCCAAGGATATCTCTTCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548676 93 + 636262 GGCGCAGCAAAGAAGCTTTCATTCCCACTATACCACAAAAAAATGCATTTTTCTATGTGATGCAGGTTATTCAGCCAAGGATATCTCTTCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 23573 93 - 647215 GGCTCAGCAAGGAAGATTTCTTTCTCATTACACCACACAAAAATGCTGTTTTCTATATGATATGGGTTTTCCAGCCATGGCTGTCTCTTCCTA + +a +s mr.mrrefChr3 98871 55 + 181019 TCTATTGTTAGAATGGGAGAGGACTGACCTTTTCTGTGTTGCAAAATAGGCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548769 55 + 636262 TCTATTGTTAGAATGGGAGAGGACTGACCTTTTCTGTGTTGCAAAATAGGCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 23689 55 - 647215 TCTATTGTTGGAATGAGGGATAGCTGACCTGTTCTGAGTTGCATAATAGGCATAT + +a +s mr.mrrefChr3 98926 64 + 181019 TAATTATCTACCCAATAGCATTTGTGTTACAGGGCATATAAAGTTCAAGTGTCTCCTAGTCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548824 64 + 636262 TAATTATCTACCCAATAGCATTTGTGTTACAGGGCATATAAAGTTCAAGTGTCTCCTAGTCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 23752 64 - 647215 TACTTATCTACCCAATAGCATTTGCGTTACAGGGCATATAAATCTCAAGTAACTTCTAGTCCTT + +a +s mr.mrrefChr3 98990 51 + 181019 GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548888 51 + 636262 GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 23817 51 - 647215 GATCCAGCATGAAGTGGATGCGCTAAAAGAGAGACATCAAGCATTTTGGGA + +a +s mr.mrrefChr3 99041 243 + 181019 CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCAAAGAGCTATTGATGTGCTACTAGGTATGAGAGGCTGGTCTAATGATAACCAGAATGTCCCTGCCAGCGGGTGTACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTGGCTGCTGTTGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATTTGGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548939 234 + 636262 CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCGAAGAGCTAT-GATGTGCTACTAGGTATGAGAGACTGGTCTAATGATAGCCAGAATGTCCTTGCCAGCGGGTGAACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTG--------TGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATCTAGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 23871 235 - 647215 CGTAATCAACCAGGCAGAAATGTAGTACCAGCCAAGAGCCCTTGTCCAAATAGGTATTGATGTGCT-CTAGGTATTTGGGGCTGGT-TATTGATAACCAGAACGTCCCTCCCAGCGGGTGTACACAATCGTTCGGCCGTTTACATAATTATTTGGCTGCTGTTGTAAGCCTGCGTCCCGTGAGTGTTGAATTTGGAAGTGAGCGCGGGGCGAATATACCCTCGTTTCTGCAT------CTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 99284 81 + 181019 TACAGGAAGAGTGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAGCTATTCGATTCTGACCCAGTAAGAACTATTGGATTCTGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549173 81 + 636262 TACAGGATGAGCGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAACTATTCGATTCTGACCCAGTAAGAACTATTATATTCTGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 24107 81 - 647215 TGCAGGAAGAATGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAGCTATTGGATTCCGACGCAGTCAAAACTATTGGATTCCGACT + +a +s mr.mrrefChr3 99365 21 + 181019 TACCACTGGATCCGTATTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549254 21 + 636262 TACCCCTGGATCCGTATTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 24228 21 - 647215 TACCACTGGATCCGTATTTAA + +a +s mr.mrrefChr3 99386 70 + 181019 GTCGCATAACCGCTGGAACGACTTAAATAAGAGCAACGTCGCTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549275 70 + 636262 GTCGTGTAACCGCGGGAATGACTTAAATAAGAGCAACGTCGCTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 24251 70 - 647215 GTCGCAGAACCGCTGGGACGACTTAAATGTGAGCAACGTCGTTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAACG + +a +s mr.mrrefChr3 99456 92 + 181019 CTGCTGGGAAAGGGGATCTGTAAAGGATGCTCAGTAAAGGTTATGCCCACATTAGCTTATGTCACTGCAGGAAGAGATATGGACTACACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549345 92 + 636262 CTGCTGGGAAAGGGGAACTGTAAAGGATGCTCAGTAAAGGTTATGCCGACATTAGCTTACGTCGCTGCAGGAAGAGATATGGACTACACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 24322 92 - 647215 CTGCTGGGAAAGGGGATCTGCAAAGGCTGCTCAGTAAAGGTTATGCCCACGTTAGGTTATGTCACTGCAGGAAGAAATATGGACAACACCCC + +a +s mr.mrrefChr3 99548 90 + 181019 TTTCTTGGTCCTGTGTCATCCTACAAATTTTCCTAGGTCATTTGAAACCATGCACTCATGCAATAAATTAGCTGCTTGACATCACAAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549438 90 + 636262 TTTCTTGGTCCTGTGTCATCCTACAAATTTTCCTGGGTCATTTGAAACCATGCACTCATGCTATAAATTAGCTGCTTGACATCAGAAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 24414 90 - 647215 TTTCTTGGTCATGTCTCATCCTACAAGTTTTCCTAGGTCATTTGAAACCATGCATTCGTGCAATAAATTAGCTGCTTGACATCACAAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 99638 93 + 181019 TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTCTACGTCTAATACCACCAGTGTGTGTGAGCACACAGTTGATAGCTTAGACAGTCAAGTTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549528 93 + 636262 TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTCTACGTCTAATACCACCAGTGTGTGTGAGCACACAGTTGATAGCTTAGACAGTCAACTTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 24506 93 - 647215 TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTGGACGTCTAATACCTCCAGTGTTTGTGAACACACAGTGGATAGCTTAGACAGTCAAGTCAAA + +a +s mr.mrrefChr3 99731 231 + 181019 CCCTCACTGTAGTACAGAGATTGAGAGTCATGAGCCTTAAGCTCTTGAGTGGAAAGAGGTTATAAACTTGTCATAGCTACGGGCTGCTATTATCCATCTAGAAAAGTAGCTGGTGGTAATTTTCATGTCCATAGTGTAAATGAGGGATAATAGTGCTACAACCCCTGACAGGGGAGTTTAAAAGAGCTCTTACCTGTAGCTAGAATACTGCTCATTGATAAGACACTACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549621 231 + 636262 CCCTCACCGTAGTACAGAGATTGAGAGACATGAGTCTTAAGCTCTTGAGTGGAAAGAGGTTATAAACTTGTTATAGCTAGGGGCTGCTTTTATCCATCCAGAAGAGTAGCTGGTGGTAATTTCCATCTCCATAGTGTAAATGAGGGATAATAGTGCTACAACCCCTGGCAGGGGAGTTTGAAAGAGCTCTCACCTGTAACTAGAATACTGCTCATTGATAAAACACTGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 24617 231 - 647215 CACTCACTGCAATACAGAGAGTGAGAGTCATGGGCGTTAAGCTCTTGAATGTAGAGAGGTTATAAACTTGTCATAGCTACGGGCTGCTATTATCCATATAGAAAAGTAGCGGATGGTAATTTTCATGTCCATAGTGTATACGAGGGATAATAGTGCTTCAACCCCCGACAGAGGAGTATAAAGGAGCTCTTACCTGCAGCTAGAATACTGCTCATTGACAAGACACCACTG + +a +s mr.mrrefChr3 99962 58 + 181019 CTGGAATTAGAGACACAGTAACTGACCCAGGATATGGATCGGTATTCTCCTAAATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549857 58 + 636262 CTGGACTTGGAGACACAGTAACTGACCCGGGATATGGATCGGTATTCTCCTAAATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 24848 58 - 647215 CTAGAATTAGAGACACAGTGACTGACGCAGGATATGTATTGGTATTCTCCTAAATCTT + +a +s mr.mrrefChr3 100020 23 + 181019 CTGTATGAGCCACCTGCGTGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549938 23 + 636262 CTGTATGAGCCACCTGCGTGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 24906 23 - 647215 CTGTATGAGCTACCTGCTTGTGG + +a +s mr.mrrefChr3 100043 60 + 181019 GAGATTATTGAACTGTACTTCACAATCTGGTAAACCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549965 60 + 636262 GAGATTATTGAACTGTACTTCACAATCTGATAAACCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 24929 50 - 647215 ---------GAACTGTACTTCACAATCTGGTAATCCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAA-TCT + +a +s mr.mrrefChr3 100103 82 + 181019 GGTATAAAAGGAGAATAGTATAATTGAAGGACAATAGTATGAAACCAAAACCTCTGCATCTTGGTACAAATTGAGGAATTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550025 82 + 636262 GGTATAAAAGGAGAATTGTATATTTGAAGCACCATAGTATGAAATGAAAACCTCTACACCTTGGTACAAATTGAGGAATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 25021 82 - 647215 GATATAAAAGGAGAATATTATAACTGAAGGACAATAGTATGAAACCAAAACCTCTGCATCTTGGTACAAATTGAGGAATTGT + +a +s mr.mrrefChr3 100185 21 + 181019 TGAATCTAGCCTTGGCCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550109 21 + 636262 TGAATCTAGCCTTGGCCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 25103 21 - 647215 TGGATATAGCCTTGGCTATAA + +a +s mr.mrrefChr3 100206 33 + 181019 GGTAATCCCTCAGTCATGTGTTGCTAACAGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550143 33 + 636262 GGTAATCCCTCAGTCATGTGTTGCTAACAGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 25124 33 - 647215 GGTAATCCCTCAGACATGTGTTCCTAACAGATA + +a +s mr.mrrefChr3 100239 37 + 181019 GAGAAATCAAATAATATACCTGTGTGTACAGTTCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550176 37 + 636262 GAGAAATCAAATAATATACCTGTGTGTACAGTTCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 25165 37 - 647215 GGAAAATCAAGTAATATTCCTATGTGTACAGGTACCA + +a +s mr.mrrefChr3 100276 56 + 181019 GCTCATGCCCTTCCTGCCCACAGCCCCCTTTTTGTGTACATATTATCAGTACAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550213 56 + 636262 GCTCATGCCCTTCCTGCCCACAGCCCCCTTTTTGTGTACATATTATCAGTACAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 25203 56 - 647215 GCTCATGCCCTTCCGGCCCACAGCCCCCTTCTTGTGTACATATTATCAGTACAACT + +a +s mr.mrrefChr3 100332 45 + 181019 GAGCAACTGACTCAAATGACCTAGCTACTGACCCATGGACCAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550269 45 + 636262 GAGCAACTGACTCAAATGACCTAGCTACTGACCCATGGACCAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 25272 45 - 647215 GAGTAACTGACTCAAATGACCTATCTACTGACCCATAGACCAATC + +a +s mr.mrrefChr3 100377 6 + 181019 CAGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550346 6 + 636262 CAGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 25317 6 - 647215 TAGTAT + +a +s mr.mrrefChr3 100383 86 + 181019 TTATTTATGATTTCAGTACTAACTGCTGGCAAATAAAACAGAGGTACACCAATGGGGATGGAATTGATCCAATTGATTGCCGTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550360 86 + 636262 TTATTTATGATTTCAGTACTAACTGCTGGCAAATAAAACAGAGGTACACCAATGGGGATGGAATTGATCCAATTGATTGCCGTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 25323 86 - 647215 TTATTTTTGATTACAGCACTAACGGCTGTCAAATAAAACAGAGATTCGTCAACGGGGGTGGAATTGATTCGATTGATTGCTGTTAG + +a +s mr.mrrefChr3 100469 51 + 181019 CATACATATATGGAACCTATACCATAAGAGATGAGCATTAAACCTCAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550446 51 + 636262 CATACATATATGGAACCTATACCATAAGAGATGAGCATTAAACCTCAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 25410 51 - 647215 CATGCATATATGGAACCTACACCATAAGAAATGAGCATTAAACCCCAGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 100520 282 + 181019 CATACCAGCCTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACAGTAACTTGTAGTTATCATACCCAAGTGAAAGGGCCATTGGCACCCAAGGTCCACAAAAGTAACAGTTTGTAACCACGCTAGAAGGCAGCTTATAGCCATCTACACATTTCTTCTTAAATCCCAGTGGCACTCTTCTTCTCCTTTTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCTCACAACTATAAACATTTCAGATTGAAAAGAGTAAGGGAGAGTGTACTGCAGACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550498 282 + 636262 CATACCAGCCTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACAGTAACTTGTAGTTATCATACCCAAGTGAAAGGGCCATTGGCACCCAAGGTCCACAAAAGTAACAGTTTGTAACCACGCTAGAAGGCAGCTTATAGCCATCTACACATTTCTTCTTAAATCCCAGTGGCACTCTTCTTCTCCTTTTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCTCACAACTATAAACATTTCAGATTGAAAAGAGTAAGGGAGAGTGTACTGCAGACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 25461 282 - 647215 CGTATCAGTTTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACGGTAACTTGTAGTCATCATACCCAAGTGAATAGGCCACTGGCACCAAAGGCCCACAAAGGTAAGAGTTTAGAACCACATTAGCAGGCAGTCTATGACCTTCTAAACATTTCTTCTTCAATTCCAGTACCTCTCTTCTTCTCCCTTTCTTTTCTCCTAGTCCTTTTCTCACAACTATAAACACTCTAGAGCGAGAAGAGTAAAGAAGGTTGTACTGTGGACAC + +a +s mr.mrrefChr3 100802 176 + 181019 CATTTTGGAAGTTGACAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTGATATGATGGTGTAGCCTGGGGAAGAGCAACCTCCCACATCCAGTAATGTTAGCCCAGCCTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGAATAAACACAGTTTCTGTAGTTCAGTGTCTGTGATAAGTAAAAGTATCATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550796 176 + 636262 CATTTTGGAAGTTGACAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTGATATGATGGTGTAGCCTGGGGAAGAGCAACCTCCCACATCCAGTAATGTTAGCCCAGCCTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGAATAAACACAGTTTCTGTAGTTCAGTGTCTGTGATAAGTAAAAGTATCATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 25743 176 - 647215 CACTTTTGAAGTTCATAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTAGTATGATGGTGTAGCCCAGGGAAGAGCAGCCTCCCACATGCAGTGATGTTAGCCCAGCTTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGGACTGATACAATTTCTCTAGTTCAGTATCTGTGATAAGTAAAAGTATCCTAG + +a +s mr.mrrefChr3 100978 111 + 181019 TCCTACAGTTTTGTCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGAAGTCAAGCTTTTTCTCATCCTAATGTTACTTTTTAACTATGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550972 111 + 636262 TCCTACAGTTTTGTCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGAAGTCAAGCTTTTTCTCATCCTAATGTTACTTTTTAACTATGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 25924 111 - 647215 TTCTGCCATTTTGCCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGATGTCAAGCTCTTTCTCATCCCAGTGTGGATTCTTAACTAGGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 101089 59 + 181019 AATGAAGTATGTACTTAATCAACATATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551083 59 + 636262 AATGAAGTATGTACTTAATCAACATATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 26039 59 - 647215 AATGAGGTATGTACTTAATCAATGCATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC + +a +s mr.mrrefChr3 101148 154 + 181019 ATCATCTTCAAGTCAGGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGCTGCAAGGTAGTGTAACACTTAATGGATGACAAACGTTTAGGTATGTTTAGATAGGGGCACATGGAATTAGGGTTGTTTGTCTAAAAGTGCATACGTACATCAACTTATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551142 154 + 636262 ATCATCTTCAAGTCAGGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGCTGCAAGGTAGTGTAACACTTAATGGATGACAAACGTTTAGGTATGTTTAGATAGGGGCACATGGAATTAGGGTTGTTTGTCTAAAAGTGCATACGTACATCAACTTATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 26101 154 - 647215 ATTATCTTTAAGTCAAGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGTTGAGGAATAGTGTAACACTCAATGGACAGCAAATGTCTAGGTATGTTTAGATTGGGGTACATGGAATTAGGGTTGTTTCTCTAAAAATGCATACATACATCAGCTTGTGG + +a +s mr.mrrefChr3 101302 91 + 181019 TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551297 91 + 636262 TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26255 91 - 647215 TACCCTACCAAAAATCAAGGAAGTTATTTTTCAAGCATAACATAGCAAACCTTGCAGGTTACAATGCCTTATCGATTCTTTGAACTTACAT + +a +s mr.mrrefChr3 101393 13 + 181019 ATGTGAGAGATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551397 13 + 636262 ATGTGAGAGATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26346 13 - 647215 ATGTAAGAAATTA + +a +s mr.mrrefChr3 101406 7 + 181019 TGCTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551412 7 + 636262 TGCTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26359 7 - 647215 TGCTAAT + +a +s mr.mrrefChr3 101413 15 + 181019 CATCAGTGATATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551421 15 + 636262 CATCAGTGATATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26366 15 - 647215 CATCAGTGATATTGA + +a +s mr.mrrefChr3 101428 95 + 181019 TACAAGCAATTATTTAATGCTATGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCTCCTCTGTCCTTTGAAGAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551437 92 + 636262 TGCAAGCAATTACTTGATGCTATGATAAAAGTGCAGGTGAACTTAAGTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCCCCTCTGTCCTTT---GAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26381 94 - 647215 TACAAGCAAT-ATTTAATGCTAGGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCATCCAGTTGTGGTCAGTGGTCTCCTCTGTCCGTTGAAGAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 101523 1 + 181019 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551574 1 + 636262 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 26475 1 - 647215 G + +a +s mr.mrrefChr3 101524 15 + 181019 ACCTGTTACCCTCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551575 11 + 636262 GTCTGT----CTCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 26478 15 - 647215 ACTTATTACCCTTGT + +a +s mr.mrrefChr3 101539 353 + 181019 ATAAGCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTACCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGTCGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTGATTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTTGGGCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTGCCAAGCCAGCCTAGACTAATCTAGGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAAATGCCACCTCACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551586 352 + 636262 ATGACCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTGCCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGCTGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTCCTTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTCAGCCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTACCAACCCAGCCTAGACTAATCTAGACTTAAGACACACAATAACCA-TGTTAAAATGCCGTCTAACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAGAGAAGCACCACTGACAATACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26498 352 - 647215 AGAGGTGGCTTGCTTCTCGCTTGAGTTACCATTAGCCTACCCCCTCAACTCACTGAAGGATTAATATCGGCAGATGCATGTCGTGATGGGCCAGCACAGTCTTTATAAAGATTTGATTCAATTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCGAAGCTTGGGCCGAGAAGAATTTGGAAAAATCTTACATCCTAGCTGAGTGCCCACTACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGTA-GCCTGCCAAGCCAGCCTAAACTAACCTGAGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAGGTGCCACCTCACTGTTCTAGATGGACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT + +a +s mr.mrrefChr3 101892 51 + 181019 TCCCCTACTTGCATTTATGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551938 51 + 636262 TCCCCTACTTGCATTTATAAGTACTAGCACCATAGTTTTTTCAGCTTTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 26863 51 - 647215 TCCACTACTGACATTTGTGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA + +a +s mr.mrrefChr3 101943 169 + 181019 TCAAATCACCGTAAGGGATCCTATCTGGTTAGCACTGGCATCTATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGTTGAGATTGCGACATGCAGCACTTAGGATTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551992 155 + 636262 TCAAATCACTGTAAGGGTTCCTATCTGGTTAGCACTGGCACCAATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCTATCAGACCCA--------------GCAGTTCTGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGCTGAGATTGCAACATGTAGCACTTAGGATTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 26914 169 - 647215 TCAAACCACCGAAAGGGATCCTATCTTGTTAGCACTGGCATCTATTATCAAAGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTGGATAAAGTTGAGAAGATACAACTGTTGAGATTGTGACATGCAACACTTAGGATTAT + +a +s mr.mrrefChr3 102112 113 + 181019 AATCAGAGTATATTCTGCAGCACCCCGATTGGGGACAAATACAGAACAATAGTGTCCTGAGCCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAGACCAAGAAATAACTGAATGGGATATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552151 112 + 636262 AATCAGAGTATATTCT-CAGCACCCCGCTTGGGGACAAATATAGAACAATAGTGTCCTGAATCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAGACCAAGAAATAACTGAATGGGATATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 27083 112 - 647215 ACACAGAGGATATTGTGCAGCTCCCCCATTGGAGACACATACAGCACAACAGCGTCCTGAGCCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAAACCAATAAATA-CTGAATGCGATGTGTT + +a +s mr.mrrefChr3 102225 205 + 181019 GTAAGTAGCCCTATCATATGGCTTTTTCAGGATTTAGCAGTCTTCACAGAGGCTGTTCATTTGCTGAGGACATTATGAGATACTCTAGAATGAATCCATTATGATGGCCAATGAGGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGACATGGATCATAGGCCATTCGGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGAGTGCTTAGAATTCAAAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552263 202 + 636262 GTAAGTAGCCCTATCATACGGTGTTTTCAGGATTTAGTAGTCTTCACAGAGGCTGT--ATTTGCTGAGGACATTATGAGATACTCTAGAATGAATCCATTATGATAGCCAATGAGGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGAGAGGGATCATAGGCCATTCAGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGAGTGCTTA-AATCCAAAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 27196 205 - 647215 GTAAGTAGGCCTATCATATTGCTTTTTCAGAATTTAGCAGTCTTCACAGAGGCTGTTCATTTGTTGAGGACATCAGGAGATACTCTAGAATGAGTCCATTATGATGGCCAATGAAGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGACATGGATCATAGGCCATTCGGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGTGTGCTTAGAATTCAAAGACA + +a +s mr.mrrefChr3 102430 54 + 181019 AGATGAATCTATGCTTAAATGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552465 54 + 636262 AGATGAGTCTATGCTTAACTGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 27499 54 - 647215 AGGTTAATTTATGCTTAAATGCCATTCTGATTTTAATAGACACTTTGTCTGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 102484 11 + 181019 AATCTCAAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552519 11 + 636262 AATCTCAAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 27557 11 - 647215 AATCCCAAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 102495 38 + 181019 CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552531 38 + 636262 CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 27568 38 - 647215 CGCATGCACCAAAGTCATTAGTAGGACTAGGTCAAAGC + +a +s mr.mrrefChr3 102533 494 + 181019 AAGCGTTCTATATATGATGATGCTGAGCTACAGAGCCTCAATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATGGAAGTAAAAACAGCCTTTCCCACTTATACATGTGCTGGTAGGAATTTCAACTTCAACTGCTGTACTTTTTTTTTAAGGCATGCACATCTTTTGTCTGGGGACAGAGAGGCACTACCCTAACATATGAACTCGCTCACTTGTAAGCTAGGGTGACAAAACAATCTGCCCTCTTAAATGTGATTTTATAATTACGTTACTCTCTGCCTAGAAGTGACATTACAGGCTGCTTGAATAAGAAACTCCCTGTCTGGGTCTGTGCCTAGTCAATTGTGATCCTCCATAGAAATCCAGTTGTGGATATGCTTGGGCACCAAACTCTCATTGTTGTACTGAGAGAACTGACATCAGTTGAAGATAGATTTATTATAGAGGGCTCTAAGTACTCCCTCATATAGTTATTTGTTTATGGGGGCTATGGGCAATAGGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552569 492 + 636262 AAGCGTTCTATATATGA-GATGCTGAGCTACAGAGCCTCAATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATAGAAGTAAAAACAGCCTTTCCCACTTATACATGTTCTGGTAGGGATTTCAACTTCAACTGCTGTACTTTTTCTTTAAGGCATGCACATCTTTTG-CTGGGGTCAGAGAGGCACTACGCTAACATATGAACTCGTCCACTTGTAAGCTAGGGTGACAAAACAATCTGCCCTCTTAAATGTGATTTTATGATTATGTTACTCCCTGCCTAGAAGTGACGTTACAGGCTGCATGAATAAGAAACTCCCTGTCTGGGTCTGTGCCTAGTCAATTGTGATCCTCCATAGAAATCCGGTTGTGAATATGCTTGGGCACCAAACTCTCCCTCTTGTACTGAGAGAGCTGACATTAGTTGATGATAGATTTATTATAGAGGGCTCTGAGTACTCCCTCATATAGTTATTTGTTTATGGGGGCTATGGGCAATAGGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 27615 488 - 647215 AAGCATTCTATCTATGATGATGCTAAGCTACAGACCCTCTATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATGGTAGTAAAAACAGCCTTTCCCGCTTATACATGTGCTGGTAGGAATTTCAACTTTAACTGCTGTACTTTTCTTTTGAGGCATCCACATCTTTTGTCTGACGACAGAGAGGCACCACCCTAACATATGTACTCACTCACTTGTAAGCTAGCGCGACAAAACAATCTGGACTCTTAAATCTGTTC----AATTACTTTACTCTCTGCCCAGAAGTGACAT--CAGGCTGCTTGAATAAGAAAATCCCTGTGTGGGTCTGTGCCTAGTCCATTGTGATCCTCCATAGAAATCCAGTTGTGGATATTCTTGGGCACCAAACTCTCATTGTTGTACTGAGAGAACTGACATCAGTTAAAGACAGATTTAATATAGAGGGCTCTAGGTACTCCCTAATGTAGTTATTTATTTATAGGGGCTATGGGCAATGGGCCC + +a +s mr.mrrefChr3 103027 319 + 181019 TGGACAAACTCTTGGAATAAGATAAGCAGCCAGACTCTATAATAGCACCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCAAAATTCAAGTTCTGTCATTGTTGAGTTTGTAAGTTTCTCCCCATCACTCTTACTATAATGTTGACCCCATATGGGGACGCATATCTTAAATGCCTACTGTTAGGTTAAAATAAACATCATGAGAGCACCTTATCTAATGCTGGTTTCACATGACCCTTGTCGGCCTTGAGTCATCTCTTTATCCAAGCTAATACCCATGTGATGTGCCTAATGGGAATGCTTTGGTGCAGCTATGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553062 314 + 636262 TGGACAAACTCTTGGAATAAGATAAGC-GCCAGACTCTTTAATAGCACCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCCAAATTCAAGTT---TCATTGTTGAGTTTGCAAGTTTCTCCCCATCACTCTTATTATAATGTTGACCCCATATGGGGACGCATATCTTAAATGCCTACTGTTAGGTTAAAATAAACATCATGACAGCACCTTATCTAATGCCGGTCTCACATGACCCTTGTCGGCCTTGAGTCATCTCTT-ATCCAGGCTAATCCCCATATGATGTTCCTAATGGGAATGCTTTGGTGCAGCTATGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 28103 312 - 647215 TGGACAAACTCTTGGAGTAAGATAAGCAGCCAGACCCTATAATAGTAGCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCAAACTTCAAGTTCTGTCATTGTTGAGTTTGT-------TCCCCATCATTCTTACTATTATGTTGACTCCATATGGGGATGCGTATCTTAAATGCCTACTGTTATGTTAAAATAAACACCATGGGAGCACCTTATCTAATGCTGGTTTCACATGACCCTTGTAGGCCTTGAGTCCTCTCTTTATCCAAGCTAACACCCATGTGATGTGCCTAATGGGATTGCTGTGGTGCAACTGTGCTT + +a +s mr.mrrefChr3 103346 57 + 181019 CTGTGTATGAATACAGGATTAATAACTTAATGACATGTCTGATTTAGCCCCTCAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553376 57 + 636262 CTGTGTATGAATATAAGATTAATAACTTAACGACATGTCTGATTTCGCCCCTCAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 28416 57 - 647215 CAGTGCATAAATACAGGATTAGTGATTCAATGACATGTCTGATTTAGCCCCTCAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 103403 32 + 181019 GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553433 32 + 636262 GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 28481 30 - 647215 GAGACCAATAATCTCATAAACGGAAGGTAA-- + +a +s mr.mrrefChr3 103435 167 + 181019 GGCAGTCCCTCCTGTATATTGTATCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGCATAGTGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553467 167 + 636262 GGCAGTCCCCCCTGTCTATTGTGTCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGTTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGGATAGAGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 28511 167 - 647215 GGCAGTCCTTTCCGTATATTGTATCAGAAGGATCAGGGAAAGATTTACAAGCCAATATAAGTATCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATATAATGTGACCACTGGAGGACCAGCTCAGTGGATGGGTGGCTGGACATCTGAGCAAATTCAACTTGGGCTAACTTATTCC + +a +s mr.mrrefChr3 103602 217 + 181019 TCCAGTTCAATTAGTGGCGGGGATAAGGGGTCCATGCCACTACAGTTTTGGGCAAAGCCATCTTACTCAGCCAGTTATATAAATAAGGGAAGGGAACTTAGTAATCAACCATAATAGGACTGCATATAGTTAATTATGAGCCTTTGATATGCATGGATGTATAATACCCTGATTTCATAGTGTAGTGATTTTATACCCCGGCTTTACATTATACCGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553634 216 + 636262 TCCAGTTCAATTC-TGGCGGGGATAAGGAGTCCATGCCGCTGCAATTTTGGGCAAAGCCATCTTGCTCAACCAGTTATACAAATAAGGGAAGGGAACTTAGTAATCAATCATAATAGGACTGCATACAGTTAATTAGGAGCCTTTGATATGCATGGATGTACAATACCCTGATTTCATAGTGTAGTGATTTTATAACCCGGCTTTATATTATACCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 28787 215 - 647215 TCCAGTTCAATTAGGGGTGGGGGTAAGGGGTCCATGCCACTAGAGCTTTGGGCAAAGCCATCTTACTCAGCCAGTTATATAGATAAGAGAAGAGAACTTAGTAATCAACCATAATAGGACTACATATGG--AATTATGAGCCTTTGATATGCATGGATGTATTCTACCCTGATTTTATAGTGTAGTGATTTTATACCCTGGCTTTACACTATACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 28678 109 - 647215 TCCAGTTCAATTAGTGGCAGGGCTAAGTGGTCCATGCCACTACAGTTTAGGGCAAAGCCATCATACTCAGCCAGTTATATAAATAAGGGAAGGGAACCTAGTACTCAAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr3 103819 187 + 181019 CGTGCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAATATTTATTATCCAATTATTTGATTTTTGATTGGGTATGACACCCTGTCCCCCCCTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAGGTTTGGTGGCAATGTTACACTATTACCACTATATTTACAATGAGTAACAGATTCCTTTGCACCCTTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553850 186 + 636262 CGTGCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAA-ATTTACTATCCAATTATTTACTTTTTGATTGAGTGTGACACCCTGTCCCCCCCTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAGGTTTGGTGGTAATGTTACACTACTACCACTATATTTACAATGAGTAACAGATTTCTTTGCACCCTTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 29005 175 - 647215 TACTCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAATGTTTATTATCCAATTATTTGATTTTTGATTGGGTATGTAACCCTGTCCCCCTTTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAAGTTTG-TGGCTATGTTACACTTTTACCATTATATTTACAGTGGGTAACAGTTTCCTTA----------- + +a +s mr.mrrefChr3 104006 105 + 181019 CAGAGTATCAGTGCTATAAACACTGGGCTTACAGACATCTGTAGAATAGGATTCTGGAAAAAAGTGAAGGAACACAATGCCAGAGTTAAAACAGCCATATCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554037 101 + 636262 CAGAGTATCAGCGCTATAGACACTGGGCTTACAGACACCTGTAGAATAGGATTCTGGAAAAAAGCGAAGGAACACAATGCCAGTGTTAA----GCCATATCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29180 104 - 647215 -AGAGTATTAGTTCCATAAACACCGGGGTAACAGACATCTGTAGAATAGGATTCTCGTAAAGAGTGAAGGAACATAATGCCAGAGTTAAAACAGCCATTTCATAT + +a +s mr.mrrefChr3 104111 70 + 181019 TCTTTGTTTGTATGAAGAGTCCACACTTCATCTCAAAAAATTTTAGAATGTGCATATAGATACTTTTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554138 70 + 636262 TCTTCATTTGTATGAAGAGTCCACACTTCATCTCAAAAAATTTTAGAATGTCCATATAGATACTTTTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 29285 70 - 647215 TCTTTGTTTGGATGAAGAGTCCAAACTTCATCTCAAAAAATTTTAGAATGTGCATACAGATACTTTTTCA + +a +s mr.mrrefChr3 104181 32 + 181019 TCACTCCAGAGGTTAGGGCACACACATTGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474426 32 + 636262 GCATTTGAGAGGTTAGGGCACACACATTGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554208 32 + 636262 TCACTCCAGAGGTTAGGGCACACACATTGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29355 32 - 647215 TCACTCCAGGGGTTCGGGCACACACATTGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 104213 164 + 181019 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGTCCTGAAAGAATAAGCTCCAGTAATCAGGTTCATGTGGTTAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGTGGTGGAGCAAGTAACCTTAATTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474459 164 + 636262 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGCCTTGAAAGAATAGGCTCCAGTAATCAGGTTCATGTGGTTAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGTGGTGGAGCAAGTAACCATAAGTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554240 155 + 636262 AAATAAA------GGCAGGTGGTCCTGAAAGATTACGCTCCAGTAAACAGGTTCATGTGGTAAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGCAGTGGAGCAAGTAACC---ATTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 29387 164 - 647215 AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGTCCTGAAAGAATAAGCTGCAGTGCTCAGTTTCCTGTGGCTAGCAGTTTCCCTAATCTCAAGGGAGTATATTTAACTGGTGGAGCATGTAACCTTAATTTTGCCAGTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATATATAAGTCCCC + +a +s mr.mrrefChr3 104377 48 + 181019 AAAGCTGCTCATAGTATAACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474623 48 + 636262 AAAGCTGCTCATAGTATAACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554395 48 + 636262 AAAGCTGCTCATAGTATGACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 29552 48 - 647215 AAAGCTGTTCATGGTATAGCTGAATTCTAATGTCCATATCTGGAAATA + +a +s mr.mrrefChr3 104425 51 + 181019 GGTTGTACCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATTACCAACCAGGGGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474671 51 + 636262 GGTTGTACCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATTACCGACCAGGGGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554443 51 + 636262 GGTTGTGCCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATCACCAACCAGGGGAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 29608 51 - 647215 GGTTGCACCATGATGACAGTGACCCTACCTTAATTAATAACCACGGGGAAA + +a +s mr.mrrefChr3 104476 248 + 181019 AAGATGTACCTGTGCATATCGAGGTATAATTCTTGAGTTAATTCCTTGCAATGGGTGATGACAACCTCAGCCTATCCAAGAATTAGTGTGGTTTACATGTGACCTAAAACCCTCAGAGACTTCAAATTGCCTCCCCCTTTTCTGGGAGTTCCTGTATCGTTGATACTAAAACAAGCTGAACAATCATTTAGTAGAGAGGCCCTGGGAAGGTGGCCTCCTTACTAAGAAACTTGCTCAATGACTGAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554494 248 + 636262 AAGATGTAACTGTGCATATCGAGGTATAATTCTTGAGTTAATTCCTTGCAACGGGTGATGACAATCTTAGCCTATCCAAGAATTAGTGTGGTTTACATGTGACCTAAAACCCACAGAGACTTCAAATTGCCTCCCCCTTTTCTGGGAGTTCCTGTACCGTTGATACTAAAACAAGATGAATAATCATTTAGTAGAGAGGCCCTGGGAAGGTGGCCTCCTTACTAAGAAACTTGCTCAATGACTAAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29659 214 - 647215 AAGATGTACCTGTGCACATCAAGGTATGGTTTCTGAGGTAATCCCCTACAATGGG-GATGACAGCCTCAGTCTACCCAACAATTAGTGTGGTTTGCATGTGACCTAAAATCCTCAGACACTTCAAATTTCCTCCCCCTTTTGTGGGAGTTCCTGTATGGTTGAGACTAAAACAAGCTGAACAATTATTTAGTA---------------------------------AAACTTGCTCAATGGCTGAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 104724 142 + 181019 TTGAATTCTTTTGTCAAGGATTAATACATATTTCGAGTATGAGTCTTGTTAGGTTGAATGAAGAAAGGATGCTGGACTGAAGATCTGATCAACTGGTCTCCAACCAAGATTGGTGATGCTGGAGGACTATTTGCACCTAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554749 142 + 636262 TTGAATCCTTTTGTCAAGGATTAGTACATATTTCGAGTATGAGTTTTGCTAGGTTGAAAGAAGAAAGGATGCTGGACTGAAAATCTGATCAACTGGTCTCCAACCAAGATTGGTGATGCTCGAGGAATATTTGCACCTAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 29873 141 - 647215 TTGAATTCTTTTGTCAAGGATTAATATATATTTCTAGTATGAGGCTTGTTAGGTTGAATGA-GAAAGGATGCTGGACTGAAGGTCTGATAAATTGGTTTCCAAACAAGATTGGTGATGCTGGAGGACTATTTGGACCTAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 104866 33 + 181019 AGCTTAGATTTTAGGGCTATAAGCATAATTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554891 33 + 636262 AGCTTAGAATTTAGGGCTATAAGCACAATTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 30015 33 - 647215 AGCTTTAATTTTAGGGTTACAAGCATAATTTGT + +a +s mr.mrrefChr3 104899 240 + 181019 TTAAAATGTGTGTGGTCCTGGATGCACTGTATCTTTGCAACTCTATTCTAGAGCCCTTAAAGTACAACCAGGCCTCTACAAATGCACGTGATTGTAAGGCACCAGCAATTGCTGGTGTGGAATAAATGTGCAGCATTCCAGTAAACCTTTATTGATTACAAAGCAAGCATATATGGTTGTCCTCAATGCAGCTCTCATGCATAGCAAACTTTCCTTCAAATATTAGCAACTCTCGGCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554924 239 + 636262 TTAAAATGTG-GTGGTCCTGGATGCACTGTATCTTTGCAACTCTATTCTAGAGCTCTTAAAGCACAACCAGGCCTCTACAAATGCACGTGATTGTAGGGCACCAGCAATTGCTGGTGTTGAATAAATGTGCAGCATTCTAGTAAACCTTTATTGATTACAAAGCAAGCATATATGGTTGTCCTCAATGGAACTCTCGTGCATAGCGAACTTTCCTTCAAACATTAGCAACTCTCAGCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 30057 232 - 647215 TTAGAATGTTTGTGGTCCTGGATGGACTGTACGTTTGCAAATCTATTCTACAGCCCTTAAAGTACAACAGGGCCTCTACAAGTGCACATAATTGTAAGGCACTAGCAATTGCTGTTGTGGAATAGATGTGC--CATGCCACTAAAACTTTATTGGTTACAAAGCAAGCATACATGGTTGTCCTCAATGCAGTTCTCATGCATAGCAAA------TTCAACTATTAGCAACTCTCGGCCCA + +a +s mr.mrrefChr3 105139 250 + 181019 TTTGGAACTAATGGGCTCATTTTGGACTAATGGTGGTACTTCCTGAATGTTTCCTGTTTAACAAGGGTCCCTATTGGGACCCATAGCGTAGAGCAATGCACTGTAACCAATTTTCAAGTATTGCAATGCATTCCCCCAGCACATTAAGTATGGGGAGGAGAAGAATTCCTGACCAGTATTTGTTTGTTTTTAATGATGATTTTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACTCAACCCTCATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 555163 248 + 636262 TCTGGAACTAATGGGCTCATTTTGGACTAATCGTGGTACTTCCTGAATGTTTCCTGTTTAACAAGGGTCCCCATTGGGACCCATAGCGTAGAGCAACGCACCATAACCAATTTTCATGTATTGCAATGCATACCCCCAGCACATGAAGTATGGGGAGGAGAAGGATGCCTGACCAGTATTTGTTTGTCTTTAATGATGATTCTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACT-AACCCTCATG- +s simRat_chr6.simRat.chr6 30308 250 - 647215 TTTTGACCTCATGGGCCCAGTTTGGACTAATGGTGGTGCTTCCTGAATATTTCCTGTTTAACATGGGTCCCTATTGGGACCCGTAGTGTAGAGCAATGCACTGTAACCAGTTTTCAAGTATTGCAATGCATTCCCCCAGCACATTAAGTATGGGCAGTAGAGGAATTCCTGACCAGTATTTGTTTGTTATTAACGATGATTTTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACTCAACCCTCATGT + +a +s mr.mrrefChr3 105389 481 + 181019 ATGCCCATAGCTGGCGAGGGTACCATATATCAGTCAGGTTTCATCTAGTGTAGGTTCTGTTTTCCTACTGCTAGCAGGCAAAAATAGCCAAGATCATCATTCATGAGTAAGCTGCCATGTTGGCTAATGAGAACTACTGAGAAAACTTCACACATTAGAAAAAGCAGTCTGTAGGTTGTATTTTTGAAAGTGGTTTGTAGGGCAGTCCCTCATTTTAATGTGACTTTGAGTAACCTCAAACTCTATGCCCACTGTTGTGTGCTGAACTGGCCAACAATCCTTGCATCTAAAAGACCCCCTACCCTCCCATATAATTGGATAATTCTCTATGTCCTTGAGGAAAAAATAACCATGTTATACTTTGAAACATAATATACCAGCTCTATATCTTGGTAAAAGCATTGCGTGAATTTGCCTAATCCCCATGAGCACTCTTGTACCAAGACTAAAAACATTGAAACTGTCTCAGGTCAAGATTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 555411 476 + 636262 ---CCCATAGCTGGCGAGTGTACCATATATCAGTCAGGTTTCATCTAGTGTAGGTTCTGTTTTCCTACAGCTAGCAGGCGAGAATAGCCAAGATCATCATTCGTGAGTATGCTGCCATGTTGGCTAATGAGAACTACTAAGAAAAATTCACAC-TTAGAAAAAGCAGTCTGTAGGTTGCATTTTTGAAAGTCATTTGTAGGGCAGTCCCTCATTTTAATGTGAC-TTGAGTAACCTCAAACTCTATGCCCACTGTTGTGTGCTGAACTGGCCAACAATCCTTGCATCTAAAAGACCCCCTACCCTCCCATATAATTGGATAATTCTCTATGTCCTTGAGGAAAAAACAACCATGTTATGCTCTGAAACACAATACACCAGCTCTATATCTTGGAAAAAGCATTGCGTGAATTTGCCTAATCCCCATGAGCACTCTTGTACCAAGACTAAAAACATTGAAATTGTCTCAGGTCAAGATTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 30559 448 - 647215 ATGCCCATAGCTGGCAAGGGTACCATAC--------GGTTTTA-------------CTGTTTTCCGACTGCCAGCAGGAAAAAATAGCCAAGATCATCATTGATGACTAAGCTGCCATGTTGGCTA----------CTGAGTAAACTTCATGCATTAGAAAAAGCAGTTTGTAGCTTGTATTTT--AAAGTGGTTTGTAGCGCAGTCCCTCATTTTAAGGTGACTTTGAGTTTCCTCAAACCTTATGCCCACTCTTGTCTGCTGAACTGGCCAGCAATCCTCGCATCTAAAAGACCAACTTCCCTCCTATGTAATTGGATAATTCTCTATGTCCTTGAGGAAAAAATAACCATGTTATACTTTGAAACATATTATACCGGCTCTATATCTTGATAAAAGCATTGCATTAATTTGCCTACTCCCCATGAGCACTCTTGTACCAAGACTATAAACACTGAAACTGTCTCAGGTTAAGGTTATT + +a +s mr.mrrefChr3 105870 186 + 181019 GTGTACCAGGGCTAAAAACCCTAAGTCTGTTTTAGGTTAAATTTGTTGTAAAGAATATAATAATTGTATAGCAGGCCAATCTATGACAGTTCAATGCATAATTGTTGACTTAGCTTTAAGGTTCTATCACACTGTCTTCTACATTTGGTAACTGTATCATGAGCAACACCCATTTTGTGACTGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 555888 186 + 636262 GTGTACCAGGGCTAAAAACCCTAAGTCTGTTTTAGGTTGAATTTGTTTTAAAGAATATAATAATTGTATAGCAGGCCAATCTACGACAGTTCAATGCATATTTGTTGGCTTAGCTTTAAGATTCTATCACACTGTCTTCTACATTTGGTAACTGTATCATGAGCAACACCCATTTTGTGACTGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 31007 185 - 647215 GTGCACCAGGGCTAAAGACCCCAAGTATGTTTTAGGTTAAATTTGATGGAAAGAAT-CAGTAATGGTGCAGTGGGCCAATCTATGACAGATCAATGCAAAATTGGTGACTTAGCTTTAAAGTTCTATCACATACTCTTCTACATCTGGAAACCGTATCATGAGCAACACCCATTTTGTGACTGTAT + +a +s mr.mrrefChr3 106056 101 + 181019 TTAGGATTTAGCTTTCCCTCAACTGATGAACTCAAACAATGCTTTAACTGGTCAAACAAGCAAATTAAAGAGTACAATTAGTTACTCTCTGCAATCTCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556078 101 + 636262 TTAGGATTTGGCTTTCCCTCAACTGATGAACTCAAACAATGCTTTAACTGATCAAACAAGCAACTTAGAGAGTACAATTAGTTACTCTCTGCAATCTCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 31192 101 - 647215 TTAAGATTTAGCTTTCGCTCAGCTGATGTACTCAAACAAAACCTTAGCTGGTCAAACAAGCAAATTAAAGAGTACAATTACTTACTCCCTGCAATCTAAAG + +a +s mr.mrrefChr3 106157 288 + 181019 TGAAATTTGGAACAATTAAACAAGTAGTAGCTAAGCCATCAGATTAAATTATGAATAGTTGCACAATCTGCAATCTTGATCATCAGTTCCTAATCACATTACACAGGACCAAGCACTATTCTTTTATGGCAAAGGCTTCGACTAATCACCCTGTGTAAACTTAAATGAATCCACCCAACCCCCAGTAGAAGAGTGGGATAAGTTCAGTGTTGGCTCTGTTGGTACACCTGTCTCCTTTAAGTTAGTGTTCTAGGGGCTCATATAGTAGGTGCCACTGAACTACATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556184 288 + 636262 TGAAATTTGGAACAATTAAACAAGTAGTAGATAAGCCATCAGATTAAATTATGAATAGTTGCACAATCTGGAATCTTGATCATGAGTTCCTAATCACATTACACAGGACCAAGCATTATTCTTTTATGGCAAAGGCTCCGACTAATCACCCTGTGTAAACTTAAATGAATCCACCCAGCCCCCAGTAGAAGAGTGGGATACGTTTAGTGTTGACTCTGTTGGTACACCTGTCTCCTTTAAGTTAGTGCTCTAGGGTCTCATGTAGTAGATGCCACTGAACTACATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 31293 259 - 647215 TTAAATTCAGAACAATTGAATAAGTAGCAGCTAAGCCATCAGATTAAATTATGCAAATTTGCACAATCTGCAATCTTGAACACCAGTTTGTAATCACATTACATAGGACCAAGCACTATTCTTCTATGGCAAAGGTTTCAACTAA-------------------ATG-------CCAAGCCCCAGTAGA---GTGAGATAAGTTCAGTGTTGGCTCTGTTGGTACACCTGTCTTCTTTAAATTAGTATTCTAGGGGCTCATATAGTAGGAGCCACTGAACTACATCTT + +a +s mr.mrrefChr3 106445 43 + 181019 GTTCAATTTAAAAGTTTATTAGGGTGCCGTATTGAGTGGTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556478 43 + 636262 GTTCAATATAAAAGTTTATTAGGGTGCCGTATTGAGTGGTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 31552 43 - 647215 GTTCAATTTAAAAATTTCTTGGGCTGCACTATTGAGTGGTGCA + +a +s mr.mrrefChr3 106488 169 + 181019 TGTTTGGTTCAGTAATTGAATCTGTGCTAGGCAAACCTGGGTCTAACAATAGGCCATTTCAACATAAGCACAGCAAGATCAAGTCAGCACTATATCACTGAAACCACCTTGTCTTATATAGTGTTTATGTTGAAATCAGATTGCGACTGTAGTTTTCACTTCTTTTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556522 162 + 636262 TGTTTAGTTCAGTAATCAAATCTGTGCTAGGCAAACCTGGGTCTAATGATAGGCCATTTCAACATAAGCACAGTAAGATCAAGTTAGCACTATACCACTGATA-------GTCCTACAAAGTGTTTATGTTGAAATCAGATTGCGATTGTAGTTTTCACTTCTTTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 31595 166 - 647215 TGTTTGGTTCAGTAACTGAATCTATACTA--CAAACCTGAG-CTAACAATAAGCCATTTCAACCTAAATACAGCGAGCTCAAGTCAGCACTATATCACTGAAACCACCTTATCTTATGTAGCATTTATGATGGAGTCAGATTGCAACTGTAATTTTCACTTCTTTTCAA + +a +s mr.mrrefChr3 106657 107 + 181019 AACGAAACTCCTAGATTGTCTGGCACATACTTTCTTTGACAAGTTCAACAAATTAGGAACTCAAACACCTGATCCTTACATGGCCTTAGTACCCACTGTTACCCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556687 106 + 636262 AACGAAACTCCTAGATTGTCTGGCACATGCTTTCTTTGACAAGTTCAACAAATTAGGAACTCAAACACCTGATCCTTAC-TTGCTTTAGTACCCTCTGTTACCCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 31761 107 - 647215 AACAAAGCTTCTAGATTGTCTGGCACATACTTTCTTTGACAAGTTCAACTAATTAGGAATTCAAACACCTGATCCTTACATGGCCTTAGTACCCACTGTTATCCATT + +a +s mr.mrrefChr3 106764 29 + 181019 CATGGCTTGCTATTGCAACTTGCCACCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556793 29 + 636262 CATAGCTTGCTATTGCAACTTGCCACCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 31869 29 - 647215 CATGGCTTGCTATTGCAACTTGTCACCAA + +a +s mr.mrrefChr3 106793 14 + 181019 ACCGTTGATTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556822 14 + 636262 ACTGTTGATTTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 31901 14 - 647215 ACCGCAGATTTCCA + +a +s mr.mrrefChr3 106807 33 + 181019 ACTGCTTGGCTGTAGATGGTACGATTATATAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556836 33 + 636262 ACTGCTTGGCTGTAGATGGTACGAGTATATAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 31986 33 - 647215 ACTGCTTGGCTGTAGATGGTACGATTATATAAT + +a +s mr.mrrefChr3 106840 128 + 181019 AGCAGACAAAGAGTTATCAAGTACCATGTAGAGCTTAACCCATACAATTGGGACTATTGTTACAATGGATATGGAACAACCAAATTGCCAATGGGCTGTTGGTAAAATAGGAGAGAACATGGAGGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 556883 128 + 636262 AGCAGACAAAGAGTTATCAAGTACAATGTAGACCTTAACTCATACAACTGGGACTATTGTTACACTGGATATGGAACCACCAAATTGCCAATGGGCTGTTGATAAAATAGGAGAGAACATGGAGGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 32019 128 - 647215 AGCAGACAAAGAGTTATCAAGTACCATATGGAGCTTAACCCTTGCAATTGGGACTATTGTTACAATGGATTTGGGACACCCAAATTGCCAATGGGCTGTTGGTAAAATGGGAGAGAACATGGAGGGGG + +a +s mr.mrrefChr3 106968 400 + 181019 CTTTTGCCTTTTACAGTTAAGGAGGAGGGCATGCATTTGAGACAAAACCATTGGTGCAATTTCTCAAAATAAAATCCTGGATAACCACAGATTGGGTTCTAACAAAGATCATCATGACTGGCCCCATGGAAGGGCAGGATGACTGATGCTCATATAGGGAAACAGTAAAGCGGATTTTCAAATAAAATGTCATACCCACATACCATGTTAAAATAGAGGGCCCCATTAGATCTCATCAGAGTTCTTACCACAATCACCCTCTAATCAAGTTTTGTAGTGTGACACCATTTTCTTCTAGGAGATGCATTTCTTGCTTTAAACCAAGTATCTGTAAAATTGCAATCTACAGAAGTTCAAATAAGCATAGCTGCACAAAGTTATTAAGGTGTGAAATATTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557012 397 + 636262 CTTCTGCCTATCACAGTTAAGGAGGAGGGTATGCATTTGAGACAAAAC-ATTGGTGGAATTTCTCAAAATAAACTCCTGGATAACCACAGATTGGGTTTTAACAAAGATCATTATGACTGGCCCCATGGAAGGGCAGGATAACTGATGCTCATATAGGGAAACAGTAAAGCGGATTTTCAAATAACAC--CCTACCCACATACCATGTTAAAATAGAGGGCCCCATTAGATCTCATCAGAGTTCTTACAACAATCACCCTCTAATCAAGTTTTGTAGTGTGACACCATTTTCTTCTAGGAGATGCATTTCTTGCTTTAAACCAAGTATCTGTAAAATTGCAAGCTACAGAAGTTCAAATAAGCATAGTTGCACGAAGTGATTAAGGTGTCAGATATTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 32147 397 - 647215 CTTTTGCCTTTTACAGTTAATGAAGAGGGC---CATTTGAGACCAAACCACTGGTGCAATTTCTCAAAATAAAATCCTGGATGACCAAAGATTGGGTTCTAACAGAGATCATCATGACTGGCCCCATGGAAGGGCAGGATGACTGATGCTCAGATCGGGAAACAATTAAGCCGATTCTCAAATAAAATGTCATACCCACATACCATCTCAAAATGGAGGGACCCACTAGATCTCACCAGAGTTCTTACCACAATCACCCTCTGATCAAGTTTTGTTGCGTGACACCAGTTTCTTCTGGGAGATGCAGTTCTTGCTTTAGACCAAGTATCTCTGAAATTGCAATCTACAGAAGTTCAAGTAAGCATAGCCGCACAAAGTTATTAAGGTGTGAAATATTATA + +a +s mr.mrrefChr3 107368 140 + 181019 CCAGATACTAATTATGCCGCCATGCAGATGTCTACATTTGTTAAGCCTTGATCCGCAAAAACCAGCAGCCTCATGACGCTGGGTTACATCAAAGCCAGAATGAAATCCTACCCAACCAATGTATTGGAATGAGAAAGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557409 140 + 636262 CTAGATACTAATTATGCCGCCATGCAGATGTCTACATTTGTTAAGCCTTGATCCGCAAAAACCAGCAGCCTCACGACACTGGGTTACATCAAAGCCAGAATGAAATCCTACCCAACCAATGTATTGGAATGAAAAAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 32611 140 - 647215 CCAGATACTACTTATGCCGCCATGTAGATGTCCATATTTGTTAAGCCTTAATCCGCAAAAACCAGCAGCCTCATGACGCTGGGTTACATCAAAGCCAGGATGAAATACTACCCAACCAATGTCTTGGGATGAGGAAGAAA + +a +s mr.mrrefChr3 107508 55 + 181019 TACTTTTATGAGCTACTATGTGAGCATAAGGGTGCCCCTTGTGTAGTTTTCTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557550 52 + 636262 TACCTTTATGAGCTACTATGTGAGCATAAGGGTGCCCCTTGTGTAGTTTTCT--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 32751 53 - 647215 --CTTTTATAAGCTATTATTTGAGCATAAGGGTGCCCCTTGTGTAGTTTTCTCAT + +a +s mr.mrrefChr3 107563 16 + 181019 CCAAAGAAGTGTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 32808 16 - 647215 CCAAAGAAGTGTAGTT + +a +s mr.mrrefChr3 107579 103 + 181019 GGTCCGAAGATCTCTTAATGGTCATCTCTGAAGATCATGGTCCTCCCCAGATCAGAAGGCGAGACCAGTTCCTTAACTATTGCAGGCTATCAATGAGTCTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557602 101 + 636262 GGTCCGAAGAACTCTTAATGGTCATCTCTGAAGATCATGGTCCTCCTC--ATCAGAAGGCGATACCAGTTCCTTAACTATTGTAGGCTATCAATGAGTCTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 32832 102 - 647215 GGTCCAAAGATTTCTTAATGGTCATCTCTGAAGATCACGGAGCTCCCCAGGTCAGAAGGCGAGACCGGTTCCTTCACTATTGCAGGGTATCAATGAATCTTA- + +a +s mr.mrrefChr3 107682 163 + 181019 GTAACTGAAGACAGCCAATGCAATAGTACTAAGATAGTCCTGTGGATGGGTTTACTTGTGCTTGTGCCTAAGGATAATAATTGAGAGGGGGATTAATGAGGATCAGAGCCTACAAGTTACAGGGTGCTGACAGTGAGCCTAGGTTTGATTTCTATTAGTACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557704 163 + 636262 GTAACTGAAGACGGCCAATATAATAATACTAAGATAGTCCTTTGGATGGGTTTACTTGTGCTTATGCCTAAGGATAATGATTGAGAGGGGGATTAATAAGGATCAGAGCCTACAAGTTACAGGGTGCTGACAGTGAGCCTAGGTTTGATTTCTATTAGTACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 32934 162 - 647215 GTAACTGAAGACAACCAATGCAA-AGTACTAAGATAGGCCTGTGGATGGGTTTGCCCGTGCTTGAGCCTAAGGACAACAATTGAGAGGGGGATTAATGAGGATCTGAGCCTATAAGTTACAGGGTGCTGGCAATGAGCCTAGGTATGGTTTCTATTAGTACAC + +a +s mr.mrrefChr3 107845 28 + 181019 CGCTTGCCCCACATATTAATCTATGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557867 28 + 636262 CGCTTGCCCCACATATTAATCTATGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 33102 28 - 647215 CCCTTGCCCCACATGTTAATCTATGTAG + +a +s mr.mrrefChr3 107873 10 + 181019 GCCTCAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557896 10 + 636262 GCCTCAGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 33130 10 - 647215 GCTTCAGAGG + +a +s mr.mrrefChr3 107883 8 + 181019 ATGTGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557911 8 + 636262 ATGTGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33140 8 - 647215 ATGTGCAG + +a +s mr.mrrefChr3 107891 19 + 181019 ACAGTCTTAATATCTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557919 19 + 636262 ACAGTCTTAATATCTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33150 19 - 647215 ACAATCTTTATAGCTCAAC + +a +s mr.mrrefChr3 107910 79 + 181019 TGTCCTATCATTACCCCAGTGAATATCATGGAACCCTGAGGTATCTCTGATATGGATATCATGTGATAGACAGCATCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 557938 79 + 636262 TGTCCTATCATTACCCCAGTGAATATCATGGAACCCTGAGGTATCTCTGATATGGATATCATGTGATAGACAGCATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33170 79 - 647215 TATCCTATCATTACCCCAGTGAACATCATGGTACCCTGAAGTATCTCAGATATGAATATCATGTGAAACACAGCATCCC + +a +s mr.mrrefChr3 107989 45 + 181019 ACTCGTTTTATAGGGTAAAATGTGTTGGGCCCTTCTCCAGATGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558090 45 + 636262 ACTCGTTTTATAGGGTAAAATGTGTTGGGCCCTTCTCCAGATGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33249 45 - 647215 ACTTGTTTTATGGCGTGAAATGTGTTGGGTCCTCCTACGGGTGCC + +a +s mr.mrrefChr3 108034 17 + 181019 AATGATTGGTTGATAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558136 17 + 636262 AATGATTGGTTGATAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33294 17 - 647215 AGTGGTTGCTTGACAAC + +a +s mr.mrrefChr3 108051 68 + 181019 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTAGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439433 68 + 636262 ACATGAGGTGGATAGGTTCCTTCTTGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558153 68 + 636262 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTAGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33311 68 - 647215 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTACAGATGCTGGTGATTATTTGGCAGCACATGAGGCAGGTGGGCT + +a +s mr.mrrefChr3 108119 58 + 181019 CAGCAGCCAAGTAATGACTGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTAATGGGAGCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439501 58 + 636262 CAGCAGCCAAGTAATGACCGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTGATGGGAGCTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558222 58 + 636262 CAGCAGCCAAGTAATGACTACATGCACATGGCCGTGTTTGCCCTTAATGGGAGCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 33379 58 - 647215 CACCAGCCAAGTAATGACAGCACGCACATGGCCATGTTTTCCTTTAATGGGAGCTTTG + +a +s mr.mrrefChr3 108177 58 + 181019 CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439559 58 + 636262 CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558280 58 + 636262 CACATGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33438 58 - 647215 CACAAGGAGCACTTGAAATCTTGACAACATTAAGGAGGTCCAAAAAGAGTTTAAGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 108235 33 + 181019 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558338 33 + 636262 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33496 33 - 647215 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT + +a +s mr.mrrefChr3 108268 21 + 181019 ATAGGCCAAATGTTTGATCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558388 21 + 636262 ATAGGCCAAATGTTTGATCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33529 21 - 647215 ATAAGCCAAATGTTGGATATC + +a +s mr.mrrefChr3 108289 29 + 181019 ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558409 29 + 636262 ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 33553 29 - 647215 ATTTATCAGGCTACAGCGATACAGAGACA + +a +s mr.mrrefChr3 108318 35 + 181019 TGAGTTACAACCCTGGGGCAACACAATATGTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558450 35 + 636262 TGAGTTACAACCCTGGGGCAACACAATATGTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 33582 35 - 647215 TGAGTTGCAACCTTGGGGCAGCACAATATCTGAAC + +a +s mr.mrrefChr3 108353 84 + 181019 TCTCTTCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGGGAGTGCAATGCAGGACCTTCCCTGGTACATGTTGGTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558492 84 + 636262 TCTCTTCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGGGAGTGCAATGCAGGACCTTCCCTGGTACATGTTAATTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33617 84 - 647215 TGTCTCCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGTGAGTGCAGTGCAGGACCTTCCCTGGTAAATGTAGGTTAT + +a +s mr.mrrefChr3 108437 422 + 181019 ATATAAGATTATTCACATAGTGCACATCAAGGTAAGCAACATTTAATAATGCCTGGTAGCTTCTCCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAATAGATAGTTGAACTGTTCCAATTATAAACTTGTATTCACAATTGCTATCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATTTAATAGCAAGGGAATTTGTTCTTCCAAACAACTGTTCTATGTTGACCTACTCAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTCCCCTTACTGGTGTTATGAATGCTAGTATAGTCTTCAGCTCAAATGCTAGTATAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCGTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558576 370 + 636262 ATATAAGACTATTCACATAGTGCACATCAAGGCAAGCAACATTTAATAGTGCCTGGTAGCTTC-CCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAAGAGACATTAGAACTGTTCCAATTATAAACTTG--TTCACAATTGCTTTCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATCTAATAGCAAGGGAATATGTTGTTCCAAACAACTGTTCTA--CTGGCCTACTTAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTGCCTT-----------------------------------------------TAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCACAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 33703 413 - 647215 ATATAAGGTTATACTCATAGTGCACATCAATGTAAGCAACATTTAATAATGCCTGGAAGCTTCTCCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTCGTAAAATTGGGAAATAGATAGTTGAACTTTTCCAATTATAAATTTGTATTCACAATTGCTATCTCATTTCTTTCACTTAAGCAGCTACTTTTCCTCTGTTTGATTAAATAGCAAGGGAATTTGTTCTTCCAAACAACTGTTCTATGTTGACCTACTCAACTGTGTAGCACAGTAATTGTTGGCTTG---------GGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTCGCCTTACTGGTGTTATGAATGCTAGTATAGTCTTCAGCTCAAATGCTAGTATAGTCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTCGGACAGGTTTTAATATTTATGATCCCGTAGT + +a +s mr.mrrefChr3 108859 57 + 181019 ATCCTGTCGTCGTGGACAATAGATTATAGGCCCAGACCAAAGCAACTGTCTACTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558953 57 + 636262 ATCCTGTCGTCGTGGACAATAGATTATAGGCCCAAACCAAAGCAACTATCTACTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 34116 57 - 647215 CGCCCGTAGTCGCGGACAATAGATTATAGGCCCAGACCAAAGCAACCGCCTATTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 108916 434 + 181019 ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCATATCTCCCAAGGCAGTGGACAGGGGCCACTAAACTCTCTTAGCTTCAGAGCCTCAAATGAGTAGGTCTTGTTGTGGTTGCAGGAGTCATACACTGTGGCCCTAATGACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCAGTGGCACTAATCTAGAGCTAAATTAGGCTTAAAAACCGCTCACTGGCTAGTGAATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACAGGAGACTATTACCTAGCACTCGTGCAATTAAGTGTGACCAAATCTCCTGAATTATAGAAATTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAAACGGTCGGACCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559010 418 + 636262 ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCACGTCTTCCAAGGCAGTGGATGGGGGCCAATAAACTCTCTTAGCTTCAGAGGTTCAAATGAGTAGGTCCTGTTGTGGTTGCAGGACTCATACACTGTGGCCCTAATAACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCCGTGGCACTGATCTAGGGCTAAATAAGGCTTAAAAACC---------------CATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACTGGAGACTATTACCTAGCACTC-TGCAATTAAGTGTGCCCAAATCTCCTGAATCATATAAACTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAATCGGTCGGACCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 34176 433 - 647215 ATGTACCCATCAGATACTCTAATCAATGACAGTTCAACCCATAAATCCCAAGGCAGTGGACAGGGGCCACTAAAATCTCTCAGCAC-AGAGCCTCAAATGAGTAGGTCTTGTTGTGGTTGCAGGCGCCATACACCACGGCTCTAATGAACATGCACCTTGGGGAGTGACTACTATGAATCTTTGACTCAGTGGTACTAATCTAGAGCTAAATTTGGCTTAAAAACCGCTCACTGGCTAGTGAATATCTGCTTTTCTCTCTTTGCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACAGGAGACTATTGCCTAGCACTCGTGCAATTAAGTGGGACCAAGTCTCCTGAATTATAGAAATTCACCTCCTTTCAGTAAACTGTACAGAATAAAAATAAAGGTAGGTTTACACAGAAGGAATCAGGGAATGAAACGGCCGGACCTA + +a +s mr.mrrefChr3 109350 171 + 181019 GCGATGTTCCGGCCCTTCGCAAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCGACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559429 171 + 636262 GCGATGTTCCGGCTCTTCGTAAACAGCTTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCACGACAAACATGTATCAGGCGGTCTTCGACCACTTCTGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 34609 171 - 647215 GCGATGGTCCGGCCCTTCGCCAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGTCTCTAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCTACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTAATCCCTCTAACCAGATGGCAGTCTTAATTCAATTACTACGCGTGTCTTGCGCG + +a +s mr.mrrefChr3 109521 365 + 181019 GAACACGTTGCGTTTATTCCTGAATCATCGATTCCCCTACTCAAAACATAGCTTCACACCGCTGTAAAGGGCGCAAACTTTGACGACAGTTCGGTAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTGCGGGAGTGCTCCGATACCATTAGCTGTGGACCGACTTTATGGGTCGACAATATTGTTTAACGACTTGGCTTCCCTGCATCTTATTCTGCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTACCAAAGGTGGATGCCAGGGGGACAACTAGGGCTTAATAAATGGAAGCCTGCCCATGATACTCTGTTTCTGTTGTCTGCAGTCATTGAGCAACATATCGCTCAGAGAGACATCTATCCATAGATCTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559600 355 + 636262 GAACACGTT--GTT---TCCTGATTCATCGATTTCCCTACTCAAAACATAGCTTCACACCGCTGTAAAGGGCGCAAACCTTGACGACAGTTCGGTAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTACGGGAGTGCTCCGATACCATTAAGTGTGGGCCGTCTTTATGGGTCGACAATATCGTCTAACGACTTGGCTTCCCTGCATCTTATTCTTCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTACAAAAGGTGTATGCCAGGGGGACTACTAGGGCTTAATAAATGGAAGCCTGCCCATGATAC-----TTCTGTTGTCGGCTGTCATTGAGCAACATATTGCTCAGAGAGACATCTATCCATAGATCTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 34783 365 - 647215 TAATACGTTGCGTTTATTACTGAATCAACGATTCCCCTACTCAAAACATCGCTTCACAACGCTGTAAAGGGCGCAAACTTTGACTACAGTTCGATAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTGCGGGAGAGCTCCGATACCATGAGCTGCGGACCGACTTTATGGGACGACAATATTGTTTAACTACTTGGCTTCCCTGCTTCTTAATCTGCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTGCCAAAGGTGGATGCCAGGGGGGCAACTAGGGCTGAATAAATGCAAGCCTGCCCATGATACTCTGTTTCTGTTGTCTGCAGTCATTGAGCACCATGTCGCTCAGAGAGACATCTATCCAGAGACCTATG + +a +s mr.mrrefChr3 109886 83 + 181019 CTTTGAGATTGAGCCTTATGTGTGATGCAGCCATGAAAATTGGGTTATTTCAACATTATGTGATACATATTCTATCTTCCGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559957 83 + 636262 CTTTGTGATTGAGCCTGATGTGTGATGCAACCATGAAAATTGGGTTGTTTTAACAGTATGTGATACCTATTCTATCTTCCGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 35148 83 - 647215 CTTTGAGATTGAGCCTTCTATGTAATACAGCCACAAAAAGTGGATTATTTCAACATTATGCGATACACATTCTATCTTCCAAG + +a +s mr.mrrefChr3 109969 11 + 181019 GTCCAAGCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560040 11 + 636262 GTCCAAGCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 35235 11 - 647215 TTCCAAGTTCC + +a +s mr.mrrefChr3 109980 13 + 181019 AGCATTCACTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560051 13 + 636262 AGCATTCACTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 35247 13 - 647215 AGCCTTCACTTTA + +a +s mr.mrrefChr3 109993 153 + 181019 TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGAATTATAATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCAACTGGGATCATGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560064 151 + 636262 TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAAT-GTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGGATTATGATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAACTACTGCAGCTGGGATGATGG- +s simRat_chr6.simRat.chr6 35273 153 - 647215 TGATTATTGTCAATATATGTAATGGGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTTTATGATTTGGTGAGCTTATCAAAAAAAATAATGTGAATACTATTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCGACTGGGATCACGGG + +a +s mr.mrrefChr3 110146 20 + 181019 TCTGTTTGTCACAGACTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560215 17 + 636262 ---GTTTGCTACAGACTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 35427 20 - 647215 TCTGTTTGTCACACACTTGA + +a +s mr.mrrefChr3 110166 353 + 181019 CATCTAATGCACTTTGCTCATGAACTCACTACAATCTGCAGCTAAGTCAGACTATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATGGCCCGGGTCTTACAATACAAGTTCTACACCACCATTAGAAGCTAGTTGTAGTCTTAAGTCTAAATGAGGGAAACTCTCAGGTGAGGCAATTTAAGTCTGAGGGACACCACTACAATTGTGTATGCAAGGTGTAGCaGTACAAAAAATTTGAGTGCAAGGAGAAGGAGTAACAatgtTAATATGCATTAAGTGGTGGCAGGTGTTGTCAGTACTCTGAAGTGTACTAGCAATAGGCCCGATTCCCTTGCATGTTTAATATATGGCTCCTCAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560282 322 + 636262 CATCTAATGCACTTTGCTCATGAACTCACTACAATCTGTAGCTAAGTCAGACTATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATGGTCCGGGCCCTACAATACAAGTTCTACACCACCATTAGGAGCTAGTTGTAGTATTATGTCAAAATGA----------CAGGTGAGGCAATTT-----TGAGGGACACCACTACAATTGTGTATGCAAGGTGTAGT-GTACAAAAAATTCGAGTTCAAGGAGAAGGAGCAACA----TAATAT-----------TGGCACGTGTTGTCAGTACTCTGAAGTGTACCAGCAATAAGCCCGATTCCCTTGCATGTTTAATAAATGGCTCCTCAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 35447 353 - 647215 CATCTAATGCTGTTTGCTCATGAACTCACCACAACCTGCAACTAAGTCAGACCATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATAGCCCGGGTCTTACAATACAAGTTGTACACCACCAATAGAAGCTAGTTGTAGGCTGAAGTCTAAATAAGGGAAACTCTCAGGCGAGGCAATTTAAGTCTGAGGGACACCACTACAATTCTGTATGCAAGGTGTAGCAGTACAAAAAATTTGAGTGCCAGGAGAAGGAGTAACAATGTTAATATGCATTAAGTGGTGGCAGGAGTTGTCAGTACTCTGACATGTACTATCAATAGGCCCTATTCCCTTGCATGTTTAATATATGGCTCCTCAGACA + +a +s mr.mrrefChr3 110519 78 + 181019 AACCAAGGGACGGACCTTATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGTTATGCCATTCTTATCAGCTTGAGTCTGGGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560604 78 + 636262 AGCCAAGAGACGGACCTCATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGCTATGCCATTCTCATCAGCTCGAGCTTGGGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 35801 76 - 647215 AAGCAGGGGATAGACCTTACT--TATTACATTTGCCTGCTGTTCATTGTGCCATCCTTATCAACTTGAGTCTGGGTAC + +a +s mr.mrrefChr3 110597 168 + 181019 ATCTCAATGCCACCACCAAGGGATCCAACCTAAATTATATCTGGGATGAGTTTCCAGTAAGAAACCTCTCCTTTAGTTGAGCTCTGTCTTTCCATGCTGACTATGGTGAGCATGCTCTAATTAACACACTCACCTTATTGCTAGGTACCCTGCATGTTGCATTGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560682 168 + 636262 ATCTCAATGCCACCACAAAGAGATCCAACCTAAATTATATCTGGGACGAGTTTCCAGAAAGAAACCTCTCCATTGGTTGAGCTTTGTCTTTCCACACTGACTATGGTGAGCATGCTCTAATTAACACACTCACCTTATTGCTAGGTACCCTGCATGTTGCATTGCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 35878 168 - 647215 ATCTCAATCCCACCACCAAGGGATCCAACCTAAATTATGGCTGGGATGAGTATCCAGTAAGAAACCTCTTCTTTAGTTGAGCTCTGTCTTTCCATGCTGAGCATGGCGAGCATACCCTAATTAACGCACTCTCCTTATTGCTAGGTACCCTACAAGTTGCATTGGATG + +a +s mr.mrrefChr3 110765 10 + 181019 AAGGTTTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560851 10 + 636262 AAGGTTTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36046 10 - 647215 AAGTTTTAAT + +a +s mr.mrrefChr3 110775 45 + 181019 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATATTGATGAGATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560861 45 + 636262 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATAATGATGAGATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 36067 45 - 647215 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATATTGATGAGATTA + +a +s mr.mrrefChr3 110820 254 + 181019 TGTGCCCAAATATAGGGTATATTCCTTGAAGAACATAGCCTGTCTTATGAAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACACAGAAATGAAGGATAATTAAAGAATCTCTATAAGGACCAACATACAAACGATCGTTAATACATACTCATCTCTATTGTTCAACTTACCCAGCTCTAGTTTGGCACTTCTTAATGGACAATACGGTACCATCTCACCCCAAGCCCCCCACGTAGCTATCACCTGTAGCTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560906 240 + 636262 TGTGCCCAAATATAGGGTATATTCCTTGAAGAACATAGCCTGTCTTATGGAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACGCAGAAATGAAGGATAATTAAATAGTCTCGATA-----------ACAAACGATTGTTAATACATTC---TCTCTATTGTTCAACTTACTCAGCTCTAGTTTGGCACTTCTTAACGGACAATACGGTACCATCCCACCCCAAGCCCCCCACGTGGCTATCACCTGTAGCTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 36113 254 - 647215 TGTGCCCAAATATGGGGTATGTTCCTTCGAGAACATACGCTGTCTCATGAAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACACAGAAATGAAGGATAATTAAGGAATCTCTATAAGGACCAACATACAAATGATCGTTAATACATACTCATCTATATTGTTTAACTTGCCCACCTCTAGTTTGGCACTTCTTAATTGACAATTTGGTACCATCTCCCCCCAAGCCCCCCACATAGCTATCACCTGTGTCTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 111074 47 + 181019 TGTCTATCTACCTCCTAGTTCACATAACAGGATACCAAAGTGGACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561147 47 + 636262 TGAGTATCTACCTCCTTGTTCACATAACAGGATACCAAAGTGGACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36367 47 - 647215 TATCTATCTATCTCCTATTTCACATCACAGGATACCAAAGTGAAACT + +a +s mr.mrrefChr3 111121 19 + 181019 GGAGTGGACCTGGGATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561194 19 + 636262 GGAGTGGACCTGGAATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36417 19 - 647215 GGAGTGGACCTGGGTTCAT + +a +s mr.mrrefChr3 111140 67 + 181019 TCTCCAAATCCATAGCTGACCCTCATGCCAGAGGCTTTCCTCATGCTGGAGTGGCGGCCCCAGAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561213 60 + 636262 TCTCCAAATCTGTAGCTGACCCTGATGCCAGAGGCTTTCCCCATGCTGGAGTG-------CAGAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 36439 67 - 647215 TCTTCAAATCCATAGCTGACCCTCATGCCAGAGGCTTTCCTCATGCTGGAGTGGCGGCCCCAGAATA + +a +s mr.mrrefChr3 111207 83 + 181019 TTGTTAACATCATCAGTCATTCTTAGAAACAATTAGAAGAAGAACTTGCCTATAAGTTATATGGCACGCAGCAGTTTATTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561273 83 + 636262 TTGTTAACATCATCAGTCATTCTTAGAAACAATTAGAAGAAGAACTTGCCTCTAAGTTATATGGCACGCAGCAGTTTATTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36507 83 - 647215 TTGTTAATATCATCGCTTGTTTTTAGAAACACTTTGAAGAAGAACTTGCCTATAAGTTATATGGCACGCAGCAATTTATCCTT + +a +s mr.mrrefChr3 111290 27 + 181019 GGCCTATGGAAGAATGAGTACATACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561356 27 + 636262 GGCCTATGGAAGAATGAGTACATACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 36641 27 - 647215 GGCCTATGGAAGAATGAATACATACAC + +a +s mr.mrrefChr3 111317 13 + 181019 AATCTTTCATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561383 13 + 636262 AATTTTTCATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 36669 13 - 647215 AATCTTTCATATG + +a +s mr.mrrefChr3 111330 137 + 181019 TATAATTATGTGCAATTCTTGACTGATATTCTAAGTTTTATTGAATGAGTCAGAACTTGGTTAAACTGTGGTGATTGGTATGACTGTGGACTTATCGTCAACAGGGATGAATCTGAAGCCATGGACTATATCAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561397 135 + 636262 TATAATTATGTGCAATTCTTGACTGATATTCTAAGTTTTATTGAATGAGT-AGAACATGGTTAAACTGTGGTAATTGCTATTACTGTGGGCTTATC-TCAACAGGGATGAATCTGAAGCAATGGACTATATCAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36682 133 - 647215 TGTAATTATGTGCAATGCT----TGATATTCTAAGTTTTATTGAGTGAGTCAGAATTTGGTTAAACTGTAGTGATTGGTATGACGGTGTACTTATTGTCAACAGGGACAAATCTGAAACCATGGAGTATCTCAACAT + +a +s mr.mrrefChr3 111467 397 + 181019 GCACTTTGTGACCAGGTGTATCAATATGGGATTCTTGTGTATTAGTATTTGCAGACAAGCTTGTACTTTGGACCATAAATCCAAGATTCACCCTTGACTTGTGGTTGATGCACTTGCCACTTAATATTATTTGGCTGTCAGGTGTATTGTCCTGAAATGATGGCTTATAGCAGCTAGAAAAATGTGACATATCTGGTGACAGATACAATTTCCTTTAACAATTCAATATGATTTTTATACAGTTCAAAGAAAGTTTCTCACTGAACTGCCAATCATACCAACCAAAAAGAGTTGTATTAGCAAGCAATCTATTGTTTATGAGTGCCGAGGAATTATTATGAATTTAATTACACATTGAGGCCCTGGGAGTCTTGAGACCACACAAGAGGCATGTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561532 397 + 636262 GCACTTTGTGACCAGGTGTATCAATATGGGATTCTTGTGTATTAGTATTTGCAGACAAGCTTGTACTTTGGACCATAAATCCAAGATTCACCCTTACCTTGTGGTTGATGCACTTGCCACTTCATATTATTTGGCTGTCAGGTATATTGTCCTGAAATGATGGCTTATAGCGGCTAGAAAAATGTGAAATAGCTGGTGACAGATACAATTTCCTTTAACAACTCAATATGATTTTTATACAGTTTGAAGAACGTTTCTCACTGAACTGCCAATCATAACAACCAAAGAGAGTTGTATTAGCAAGCAATCTATTGCTTATGTGTGCTGAGGAATTATTATGAGTTTAATTACACATTGAGGCCCTGGGAGTCTTGAGACCACACAAGAGGCATGTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 36816 386 - 647215 GCACTTTGTGACCAGTTGTAGCAATTTGGAATTC-TGTGTATTTGTAT------ACAAGCCTGTACTTTAGACTATAGATGCTAGATTCAC--TTGACCTGTGGTTGATACACTTACCACTGAATATTATTTGGCCGTCAGGTGTATTGTCCTGGGATGATGGCTTATAGCAGCTAGTAAAATGTGGCATATCTTGTGACAGATACAATTTGTTTTAACAATTCAATATGATTTTTATACAGTTCAAAGAGAGCTACTCACTGA--TACCAATCATACCAACCAAAAAGAGTTGTATTTGCCAGCAATCTATTGTTAATCAGTGCCGAAGAATTATTATGAATTTAATTATGCATTGAGTCCCTGGGAGCCTTGGGACAATGCAAGAGGCATGTGGT + +a +s mr.mrrefChr3 111864 10 + 181019 GTACATATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561931 10 + 636262 GTACATATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 37202 10 - 647215 ATACATAAAA + +a +s mr.mrrefChr3 111874 120 + 181019 CTTAAAACTGCAGCCCTCCGATTTATTTTGACTCTAGAAACATTGCAGCTGGTGCCCCTTGAATTGGCCATTGATTTGGAGGGCAAGAGTGCTGTTACACCTTCATCAGCTGAGTTGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561941 120 + 636262 CTTAAAACTGCAGCCCTCCGATTTATTTTGACTCTAGAAACATTGCAGCTGGTGCCCCTTGAATTGGCCATTGATTTGGAGGGCAAGAGTGCTGTTACACCTTCATCAGCTGAGTTGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 37213 120 - 647215 CTTGTAATTGCAGGCCTCTGATTTATTTTGTGTCCAGAAATATTGCAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGGCCATCAATTTGGAGGACTTGAGTGCTGTCATACCTTCACCAACTGAAATGGGG + +a +s mr.mrrefChr3 111994 8 + 181019 GAGGTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562065 8 + 636262 GAGGTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 37333 8 - 647215 GGAGTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 112002 33 + 181019 TCAACCTGCTCAGGACACGCAGAATCGGTCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562073 33 + 636262 TCAACCTGCTCAGGACACGCAGAATCGGTCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 37347 33 - 647215 TCAACCTAGTCAGGACACACAGAACCAGTCCGA + +a +s mr.mrrefChr3 112035 18 + 181019 GACCCCACAAGAGACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562128 18 + 636262 GACCCCACAAGAGACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 37380 18 - 647215 GACCCCACAAGTGGCACA + +a +s mr.mrrefChr3 112053 52 + 181019 TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCGGCTGGTGCCCTCTAAGTTGGCCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562146 52 + 636262 TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCGGCTGGTGCCCTCTAAGTTGGCCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 37399 52 - 647215 TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCAGCTGGTGCCCTCTGAATTGGCAATT + +a +s mr.mrrefChr3 112105 17 + 181019 AGAGGACATGAGGTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562198 17 + 636262 AGAGGACATGAGGTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 37453 17 - 647215 GGAGGACATGAGGTTGC + +a +s mr.mrrefChr3 112122 23 + 181019 GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562215 23 + 636262 GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 37473 23 - 647215 GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG + +a +s mr.mrrefChr3 112145 59 + 181019 GACACATGGGACTCCTAGCCCCCTTGTCAATGGAACTGGAGCAGTTAGATAGATTCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562238 59 + 636262 GACACATGGGACTCCTAGCCCCCTTGTCAATGGAACTGGAGCAGTTAGATAGATTCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 37521 59 - 647215 AACACATGGAACCCCTGGCCCCCTTTTGAATGGAACCGGAACAGTTTTATGAATTTGCC + +a +s mr.mrrefChr3 112204 24 + 181019 AACAGGGAGCCCACATTCCATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562298 24 + 636262 AACAGGGAGCCCACATTCCATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 37580 24 - 647215 AACAAGGAAGCCGCTTTGAATGTG + +a +s mr.mrrefChr3 112228 132 + 181019 CTAGCATCACAGGATCTAAGGAACCATGGAATTATAAATCAGTATGGAATGGGCAGCTTAGCATTAGCAAGTCATATGCTTGTGGCATCATATCCCCAAAACAGTACATAACAGTCTGACCCATGCAACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562322 132 + 636262 CTAGCATCACAGGATCTAAGGAACCATGGAATTATAAATCAGTATGGAATGGACAGCTTAGCATTAGCAAGTCATATGCTTGTGGCATCATATCCCCAAAACAGTACATAACAGTCTGACCCATGCAACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 37618 132 - 647215 CCAGCCTCACAGGGTCGAAGGAACCATGAAATTGTAAATCACTATGGAATGGGCACCTTAGCATTAACAAATCATATGCTTGTGTCATCATATCCCCAAAACAGTACACAACAGTCTGACCCATGCAACAAG + +a +s mr.mrrefChr3 112360 108 + 181019 CATGTTTCTGCATACAATGTGCAAAATCAAGTAGCAGTGGAAATTTAACACTAGACTTGACTTCCATCAAAGAATCGGGTTGTTTTTCCTTGTTATTATTATGCAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562454 108 + 636262 CATGTTTCTGCATACAATGTGCAAAATCAAGTAGCAGTGGAAATCTAACACTAGACTTGACTTCCATCAAAGAATTGGGTTGTTTTCCCTTGTTATTATTATGCAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 37754 108 - 647215 CATATTTGTGCATACAATGTGCAAAATCAAGTAGCACTGGAAATTTAACACTAGATTTGACTTCCATCAAAGAAACGGGTTCATTTTCCTTGTTAATATTATGCAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 112468 156 + 181019 GGGGACTCAGTTCAACAATTGGTAAAAGCCTGTTCTGAACGACTCCCTCTAATGTGCCAACAGCCTTGAGACTTAGGTGTCTCTGTCTAAAGGGCATTCTGTTCTGCTAGAAGAGGCAACCCAAAATTATACTTAAGACTTATAATCTCCAGGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562562 156 + 636262 GGGGACTCAGCTCAACAATTGGTAAAAGCCTGTTCTGAATGACTCCCTTTAATATGCCAACAGCCTTGAGACTTAGGTGTCTCTGTCTAATGGGCATTCTGTGCTGCTAGAAGAGGCAACCCAAAATTATACCTAAGACGTATAATCGCCAGGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 37863 156 - 647215 GGGGGCTCAGTTTAATGATTGGTGAAAGCCTGTTCTGAACGACTCCCTCTGATGTGCCAACCGCCTTGAGACTTAGGTGTCTCTCTCTAAAGGGCATCCTGTTCTGGTAGATGAAGCAACCCAAAATTATCCTTAAGACTGACAATCTCCAGGGTG + +a +s mr.mrrefChr3 112624 32 + 181019 ACCTACACCTACTATCATGAAACTACATAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562777 32 + 636262 ACCTACACCTACTATAATGAAACTACATAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 38019 32 - 647215 TCCTACGCCTACCATCATGAAACTACATAATT + +a +s mr.mrrefChr3 112656 212 + 181019 TCTCCAAGGAAAACATCAAATCATTCATCATTCTCTTCTCAACGTCCCATAGGGTTGTACTGCTGACAATCTACTTTACCTCATACCCAAAATCTATCTACCAATGCTCAGAACCTGACAGTCACACTTAAACTGGCTCTAATTTCATGCTGAAATTCaTGAAACTGGGAGTATATAACCAGACTAAAAACGTAAacagtgaagcctACGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562809 194 + 636262 TCTTCAAGGAAAACATCAAATCATTCATCATTCTCTTCTCAACATCCCATAGGATTGTACTGCTGACAATCTACTTTCCCTGATACCCAAGATCTATCTACCAATGCTCAGAACCTGACAGTCCCCCTTGAACTGGCTCTAATTGCATGCTGAAATTC-TGAAACTGGGAGTATGTAACCAGACTAAAGACTTAA----------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 38069 212 - 647215 GCTCCAAGGAAGACATCAAAACATTCATCATTCTCTTCTCAATGTCCCACAGGGTAGTACTACTGATAATCTATTTTACCTCATACCCAAAAACTATCCACCAATGCTGAGAACCTGTCAGTCACACTCAAACTGGCTCTAATTTCATGCTGAAATTCATGAATCTGGGAGTGTATAACCAGACTAAAAACGTAAACAGTGAAGCCTACGGT + +a +s mr.mrrefChr3 112868 72 + 181019 GCATCAGATATCAAAACTCTGATTTTGGTCCCCAGGACAATCATCTTCACTAAATTAGCTTACTGGTCGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563003 68 + 636262 ----CAGATAACAAAACTCTGACTTTGGTCCCCAGGACAATTATCTTCAATAAATTAGCTTACTGGTCGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 38282 72 - 647215 GCATTTGATATCAAAGCTCTGATTATGGTCCCCAGGCCAATCATCTTCACTAAATTAGCTTAGTGGTAGTAA + +a +s mr.mrrefChr3 112940 70 + 181019 TCATCTGACTATCAGATCTGACCTCTCTAGTGTAAAGTAAGAGATTGAGTAACACTCGACTTACAGACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563072 70 + 636262 CCATCTGGCTATCAGATCTAACCCCCCTAGTGTAAAGTAAGAGATTGAGTAACACTCGACTAACAGACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 38354 70 - 647215 TCATCTGACTATCAGATCTGACCTCTCTAGTGTTCACTGAGAGATAGAGTAACACTAACCCTAATCTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 113010 59 + 181019 TAGTCTACAAGGAGTAATGTTCTCAGGGAACTCTTATTATGGGGGGATAAATTGCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563143 42 + 636262 TGGTCTACAAGGAGTGATGTTCTCAGGGAGCTCTTATT-----------------GATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 38424 58 - 647215 TAGTCTA-AAGGAGCAGTTTTCTCAGGGAACTCTTATTATGGGGGGATAAATTGCAATG + +a +s mr.mrrefChr3 113069 155 + 181019 TGACACATAGCATCTAAGATGTGCAATAGGAGTATAAGAAATTTTCTGGCTCAAGATCATCTTAATCTAACTCCAAGATTAAACGTAACAGGGGGCAGAAATTATGTACCAGTTCATTCTAGGGGGACAGTTGTTTTTGGGTGGCTCACAAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563186 155 + 636262 TGACACATAGCATCTAAGATGTGCAATAGGAGTATAAGAAATTTTCTGGCTCATGATCATCTTAATCTAACTCAAAGATTAAACGTAACAGGGGGCAGAAATTATGTGCAGGACCATTCTAGGGGGACAGTTGTTTTTGGGTGGCTCACAAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 38482 155 - 647215 TGACACGTAGCATCCAAGATGTGCAATAGGAGTATAAGAAATTTTCTGGTTTAAGATCATCTTAATCTAACTTCAAGCCTAAACGTAACAGGGGGCAGAAATTATGTACCAGTTCATTCTAGGGGGACAGTTGTTTTTGTGTGGCTCATAAGGAA + +a +s mr.mrrefChr3 113224 10 + 181019 GTGTACCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563341 10 + 636262 GTGTATGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 38640 10 - 647215 GTGTACCACA + +a +s mr.mrrefChr3 113234 217 + 181019 TCTTGAATTCCTTAGCCACGCCAGGTTGTTCTTAGTAAGATCCCCCTCAGTGGTAATAATTTCAGGGGCTTCCACAAGTTCTCTCAAGTTGTGGCACTGTTTTTAATACTTTACATCAGATGGGTCTGTGGGGAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGTTGATCACAACTCTAGCCAGACCCTTGCAATAGCGTGCAGCTCTGTAAGACAGTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563352 217 + 636262 TCTTGAATTCCTTAGCCCCGCCAGGTTGATCTTAGTAAGATCCCCCTCAATGGTAATAATTTCAGGGGCTCCTACAAGTTCTCTCAAGTTGCGGCACTGTTTTTCATATTTTATGTCAGATGGGTCTGTGGGAAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGTTGATCACAACTCTAGCCAGACCCTTGCAATAGCGTGCAGCTCTGTAAGACAGTTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 38650 211 - 647215 TCTTGAATTCCCTAACCACACCAGGTTGTTCTTCGTAGGATCCC---CTG---CAATAATTTCAGGGTCTTCCACAAGTTTTCTCAAGCTATGGCAATGTTTTTAATACTTTACATCAGATGGGTCTGTGGGGAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGCTGGTGGCAACTCTAGCCAGACCATTGAATTAGCGTCCAGCTCTGTAATACTGTTCCA + +a +s mr.mrrefChr3 113451 109 + 181019 TTCATGCTGCAGATAAAATGGGACCATGGATCAAACTGGGAGAACCTGTAAGATAGTACAGATGTTTATGGAAGGGTCTTATAGTTACTACTACCTCTGCTAGTTCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563570 109 + 636262 TTCATGCTGCAAATAAAATGGGAGCATGGATCAAACTGGGAGAACCTGTAAGATAGTACAGATGTGTGTGGAAGGGTCTTATAGTAACTACTACCTCTGCTAGTTCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 38861 109 - 647215 TTCATGCTGCAGATAAAATGGGACGATGGATCCAACTGGGAAAACCTGTAACACAGTACGAATGTTTATGGAAAGGTATAATAATTAACACTACCTCTGTTAGTTCCAG + +a +s mr.mrrefChr3 113560 472 + 181019 ATAATACCTCATGTGAAGGGAGCCTATGTCCTCTATGCCTGCAAAAGAAATCTAAGAGTGGATTTTTTCAGGATGAGATTGGACTACTGCTTGAAGAACCTCTAAGTCTCACAGATGTTAACAGTTGGATATTTCCTATGGCAGGCATAGTGCCAAGAATGTTTGGTATCCACTACTTCCAAACTCTGTTTAACTCTGAAGTTGAATTATGACAAGGATGGTGCTTTGTCATGATCTACTTGCGCATAGTTTATATAGACTTATGGCGGGCTAAAGGGGCCAACTTATTATCAAGCTGTTTTTTGTGACCATTCTCCTTTTACACTTCCAATCCGCCCAGAACCCTTTAAAAAGTTTTGTCTGAGCTATGAAGGAGTGGTAATGTCATCTTACATCACAGTCCTTACATGCTAGCCCAGGAACTTCAGGGAAACCACCCCAGAGGAGTATGTGGTTTGGCAAAGGTTCAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563679 472 + 636262 ATAATACCTCATGTGAAGGGAGCCTATGTCCTCTATGCCTGCAAAAGAAATCTAAGGGTGGATTTTTCCAGGATGTGATTAGACTACTGCTTGAAGAACCTCTCAGTCTCACAGATGTTAACAGTTGGACATTTCCTATGGCAGGTATAGTGCCAAGAATGTTTGGTATCCACTACTTCCAAACTCTGTTTAACTCTGAAGTTGAATTATGACAAGGATGGTGCTTCGTCATGATCTACTTGCACATAGTGTGTATAGACTTATGGCGGTCTAAAGGGGCCAACTTATTATCAAGCTGTTTTTTGTGACCATTCTCCAGTCACACTGCCAATCCGCCCAGAACCCTTCAAACAGTTTTGTCTGAGCTATGAAGGAGTGGTAATGTCATCTTACGTCACAGTCGTTACATGCTAGTCCAGGAACTTCAGGGAAACCACCCCAGAGGAGTATGTGGTCTAGCATAGCTTCAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 38971 464 - 647215 ATAATACCTCATGTCAAGGGAGCTTATGTCCTCTAGGCCTTCAAAAGAAATCTAAGAGTAGATATTCTTAGGATGAGATTGGAGTACTGCTTGAAGAACCTCTAAGTCTCACAGATGTTAACAGTTCAATATTTCCTATGGCAGGCATAGTGCCAAGGATTAT-----TCAACTACTTCTAAACTCTGTTTAACTTTGAAGTTGAATTATGACAATGGTGGTGCTTTGGGATGATCTACTTGAGCATAGTTTATATAGACTTATGGCAGGCTATA---GCTGACTTATTATCAAGCTGTTTTATGTAACCATTCTCCTTCTACACTTCCAATCAGCCCAGAACCCTTTAGAAAGTCTTGTCTGAACTATAAAGGAGGGGTAATGTCATCTTACATCACAGTCCATACATACTAGCCCAGGAACTGCCTAGAAACCACCCCAGAGGAGTTAGTGGATTGGCAAAGGTGCTACC + +a +s mr.mrrefChr3 114032 690 + 181019 AAGTGACATGAAATCACAGTAGCTGCTGGTAGGGCGCAACTTGAAGCAAATTGCAAATAAAGGAAATACATGATAAACTCATTCAACATGGAGGATAAAGTTGTAGACAATAAGCTGTACTAACTCTTATTATATTAACAAAGATTTCTCATATTATTTATATTAATAATGGCCAGATTCATGTCATGTAATCCCTCCTTTGGTGGCATTGGAAAAGGACATCTAATGCGAGAAGTAGATGCACTGGATGGGTTGTGTTCTCATATCTGTGACCAGTCTGGTGCCCTTTATAAAGTATTGAACCGTCGTAAGGGACCTGATGTGGTGGGGGGGTTGCGGGCACAGATTGATAGAAAACTTTATAAGCAGAACATGCAAGTAACAAATATAAAGCGTTATTGTAGCAGACCCGAGCATTGAATTCCTAGATGTAAGTGTAGACTCCACATTGAGAAAGAGATATTAAACACACCATTGTTGACAGTCCAAGAAGGAGCAGTTGAAGAGCTTACTCTCCCTGAACCAGAGCCTGAACACACTGGTGAATGTCATGTCAGTGGTGTTGTCTTAGGTTTGTATTTAAAACCTGTGATATATGATACTCCAAGATGGTTGTGTGCACAGATTATCTCTCCAAGTTGGTTCAGTACAGGCTCACAGGGAAAGTGATTTCTACGTGAAACCCCCCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564152 683 + 636262 AAGTGACATGAAGTCACAGTAGCTGCTGGCAGGGCACGACTTGAAGCAAATTGCAAATAAAGGAAATACATGATAAGCTCATTCAACATGGAGGATAAAGTTGTAGACAATAAGCTGTACTAACTCTTATTATATTAAC----ATTTCTCATATCAATTATATTAATGATGGCCAGATTCATGTCATGTAATCCCTCTTTTGGTGGTATTGGAAAGGGACATCTAATGAGAGAAGTGGATGCACTGGATGGGTTGTGTTCTCATATCTGTGACCAGTCTGGTGCCCTTTATAAAGTATTGAACCGTCGTAAGGGACCTGATGTGGTGGGGGGGTTGCGGGCACAGATTGATAGAAAACTTTACAAGCAGAACATGCAAGTAACAAATATAAAGCATTATTGTAGCAGCCCCGAGTATTGAATTTCTGGATGTAAGTGTAGTCTCCCCATGGAGAAAGAGATATTAAACACACCATTGTTGACAGTCCAAGAAGGTGCAGTTGAAGAGCTTACTCTCCCTGAACCAGAGCCTGAACACACTGGTGAATGTCATGTCAGTGGTGTTGTCTTAGGTCTGTACTTAAAACTTGTGATATATGATACTCCAAGATG---GTGTGCACAGATTATCTCTCCAAGTTGGTCCAGTACAGGCTTACAGGGAAAGTGATTTCTAGGTGAAACCCCCCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 39435 690 - 647215 AAGTGACATGAAATCACAGTAGCTGCTGGTAGGGTGCAACTTGTAGCAAGTTGCAAATAAAGCAAATATACAATTAACTCATTCAACCTGGAGGATAATGTTATAGACAAAAAACTGGACTAACTCTTATTACATTAACAAAGATTTCTCATATTATTTGTTTTAATAATGACCAGATTCATGTCATGTAATCCCTCCTTTGGGGGCATTGGAAAAGGACATCTAATGCGAGAAGTAGATGCACTGGATGGGTTGTGTTCTCATATCTGTGACCAGTCTGGTGCTCTTTATAAAGTCCTGAACCATCGTAGGGGGCCTGACGTGGTGGGGGGGCTGCGGGCACAGATCGATAGAAAGCTTTATAAGCAGAACATGCAAGTTACAAATATAAAGCGTTATTGTAGCAGATCCCAGCATTGCATTCCTAACTGTAAGTGTAGACTCCAGATTGAGAAAGAGATATTAAATACGCCATTGTTGACAGTTCAAGAAGGAGCAGTTGAAGAGCTTACTCTCCCTGAACCAGAGCCTGAACACACTGGTGAATGTCATGTCAGTGGTGTTGTCTTAGGTTTGTATTTAAAACCTGTGATACATGATACTCCAAGATGGTTGTGTTCACAGATTATCTCTCCAAGTTGGTTTGCTACAGGCTCACCAGGAAAGTGATTTGTACGTGAAACCCCCCGG + +a +s mr.mrrefChr3 114722 34 + 181019 CTGGTGACTACAAAACACCATGATCTTTTGCGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564835 33 + 636262 CTGGTGGCTACAAAATACCATGA-CTTTTGCGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 40128 34 - 647215 TTGGTGACTACACAACACCATGATCTTTTGAGAT + +a +s mr.mrrefChr3 114756 10 + 181019 AACTTTTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564869 10 + 636262 AACTTTTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 40162 10 - 647215 AACTTTTGTT + +a +s mr.mrrefChr3 114766 25 + 181019 TTGTATTGCCCTCTTGCTCCATCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564882 25 + 636262 TTGTATTGCCCTCTTGCTCCGATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 40172 25 - 647215 TTGTGTTGCCCTCTTGCTCCATCAC + +a +s mr.mrrefChr3 114791 51 + 181019 CATCTCATACGGTTCTCAGCTCTGGCGGACATCATAGATGGTAAATTGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564907 51 + 636262 CATCTCCTACGGTTCTCAGCTCTGGCGGACATCATAGATGGTAAATTGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 40202 51 - 647215 CATCTCATCCGGTTCTCATCTCTGGTTGACACCATAAATGATAAATTGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 114842 133 + 181019 TATATATCTACAATACAGCTTATAAGATAAAGCAAGATGCTTTCCACGCACTCAAAAGATAAGTCTGTTAATGAACCCATAACCTGTTTTTATGATGCTCTCATCTACTCAAAGTAATCCCCGCATGCTCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564958 133 + 636262 TATATATCTACAATACAGCTTACAAGACAAAGCAAGATGCTTTCCACGCACACAAGAGATAAGTCTGTTAATGAACCCATAACCTGTTTTTATGATGCTCTCATCTACTCATAGTAATCCCCACATGCTACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 40254 133 - 647215 TATATATCTACAATACAGCTTATAAGATAAAGCAAGATGCTTCCTACACACTCAAAAGATGGGTCTGTTAATGAACCCATAACCTGTTTTTATGATGCTATCATCTACTCAAAGTTAACCCGGCATGCTCCTC + +a +s mr.mrrefChr3 114975 45 + 181019 CTTAGCCTGCAAACAACCCAGGACAGTGATCCAACAGACATTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565091 45 + 636262 CTTAGCCTGCAAACAACCCAGGACAGTGATCCTACAGACATTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 40394 45 - 647215 CTTAGCCTCCAAACAACCCAGGACAGTGATCCAACCCATATTTAA + +a +s mr.mrrefChr3 115020 82 + 181019 GAAGAAGCGTCTAGTGTTATAAACCTAGCAATCTAGGGATCCAACATACTCACAGGCAGATGGGACACTCATGTGAAGATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565136 82 + 636262 GAAGAAGCGTCTAGTGTTATAAACCTAGCAATATAGGGATCCAACATACTCATAGGCAGATGGGACACTCATGTGAAGATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 40440 82 - 647215 GAAGAAGTGTCTGGTACTATAAACCTACCAATCTACAGATCCAACATACTCACAGGTAGATTGGACACTCCTGAGAAGATTG + +a +s mr.mrrefChr3 115102 247 + 181019 CTCAGTTTGCTGTACAATACAAGGAATTTGTATGGGGTGACCTGAAGAGAAATCTGGCCAAGTGCTATACTATAGAACTGAATATGATATATTAGGGTATAATGGAGTCACTCCTATTAAAATACCCATGAAATGTTTAGCAGTCTAAAGGAAACGGTAAGGTACCATATAGTAGAATCTTTTGTTGAATAAGTGAAGCACAAATATTACCTCTCCTGATAAAAATCAATCATACTAAACATTAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565218 247 + 636262 CTTGGTTTGCTATACAATACAAGGGATTTGTATGGGGTGACATGAAGAGAAATCTGGCCAAGCACTATACTATAGAACTGAATATGATATATTAGGGTATAATGGAGGCACTCCCATTAAAATACCCATGAAATGTTTAGCAGTCTAAAGGAGCCTGTAAGGTACCATATAGTAGAATCTTTTGTTGAATAAGTGAAGCACAGATACTACCTCTCCTGATAAAAATCAAGCATACTAAACATTAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 40535 239 - 647215 CCCAGTTTGCTGT--------AGGAATCTGTATGGGGTGACCTGAAGAGAATTCTGGCCAAGTGCTATACTATAGAACTGAATATGATATAGTAGGGCAGAATGGAGTCACCCCTGTTAAAATACCCATGAAATGCTTAGCACTCTAAAGGAAACGGTAAGGTACCATATAGTATAATCTATCGTTGAATAAATGGGGCACAAATATTACCTCTCCTGATAAGAATCAATCATACTAAACATTAGCG + +a +s mr.mrrefChr3 115349 15 + 181019 GATGAAGGTTGTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565465 15 + 636262 GATGAAGGTTGTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 40782 15 - 647215 GATGAAGGTTGTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 115364 60 + 181019 ACTGGGTATTATCTGAGAAATCTGAGTTAATTAGCCACCCAAAACAAAACCACTTATAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565480 60 + 636262 ACTGGGTATTATCTGAGAAATCTGAGTTAATCAGCCACCCAAAACAAAACCACTTATAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 40798 60 - 647215 AACAGGTAATAGCGAAGAGATCTGAGCTAATTAGCCAACCAAAACAAAACCACTTGTAAT + +a +s mr.mrrefChr3 115424 516 + 181019 GGTTGCTCTAAAGGTTCAACCAACTGAAGATCTTGGGATTAGACCTTAATGCCTGATCCTAGATCATAATCACCTTGGTGTCTCAGTTCAATGCCTGTCAGGTGGGGTGTCAAGGGGTATCCACATACAGTATGTAAGGTAAAGGGACTCTTGGTGGGAGAGGCTTTTCTTTGTCATACTTATGGTTCATTCAGCTGAAAAATTACTTTTCATGTCCTACATTCATCAGATGTCATCCATTAGCTAATGTGGCCATGATGGCCAAGCTCAAACTCTGTtgTTTtacaaatttaaccagatgaaataagcccctgttgtgaatggttaggaaaaaatgctcaaaaagtctcttggggaatcatccatagcacataaccactgaatctgctcttgttcaaatctgttgcaggaagtaagagaagtacaaacaaccaacctctttgtggcaagatatgtaactcagttaaagtagagcctttacattgtttaaccatatctattgttctccccacatca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565571 499 + 636262 GGTTGCTCTAGAGGTTCAACCAACTGAAGATCTTGGGATTAGACCTTAATGCCTGATCCTGGATCATAATCACCTTGGTATCTCAATTCAATGCCTGTCAGGTGGGGTGTCGAGGGGTATCCACATAGAGTATGTAAGGTAAAAGGACTTTTGGTGGGAGAGGGTTTTCTTTGTCATACTTATGGTTCATTCAGCTTGAAAGTTACTTTTCATGTCCTACATTCATCAGATGTCCTCCACTAGCTAATGTGACCATGATGGCCAA--CCAAACTCTGT--TTTTACAAATTTAGCCAGATGAAATAAGATCctattgtgaatggttaggaaaaaatgctcaaagagtctcttggggaatcatccatagcacataaccactgaatctgctcttgttcaaatctgttgcaggaagta-------------caacccacctctttctggcaagatatggaactcagataaagtagagcctttacattgtttaaccatatctattgttctccccacatca +s simRat_chr6.simRat.chr6 40858 509 - 647215 GGTTGCTCTAAACGTTCAACCAACTGAAGATCTTGGGATTAGACCTCAATGCCTGATCCTAGACCATAATCACCTTGGTGTTTCAGTTCAATGCCTGTCAGGTGGGGTGTCAAGGGGTCTCCGCATACAGGATATAAGGTAACGAGACTCCTGGTGTGAGAGGCTTTTCATTGTCATACTTATGATTCATTTAGCTGAAAAATTACTTTTCATGTCCTACATTTATCAAATGGCATCCATTAACTGATGTGGCCATGATGGCCAAGCTCAAACTCTGTTGTGTgacaaattcaacaagatgacataagcccctgttggaagtcattaggaaataatgctaaaaaagtctcttggggaatcatccatagcatataaccacggaatctgcttttgttcaaatctg-------aagtaagagaagtacaaacaaacaacctctttgtggcaagatatgtaactcagttaaagtagagcctttacattgtttaaccatatatattgtcctcgccacatca + +a +s mr.mrrefChr3 115940 277 + 181019 agatcgactcaacaaagaagctatggtgtcacaggggttgaattctaaatagaccctcaatgccccaactaaaagtcacttatcaacaagcagacaaagagattacagggtctactgacacaagctccactgacacacagtaaaacagaagagttggaaccatttctgcacaaaccacaatccattgaagatggctcaattctatatgcactgaaacccatataaagcaaatgagagaagaatacggaatgcaaggcatgttttttccaatgtcaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566082 274 + 636262 agatcgactcaacaaagaagctatggtgtcacaggggttgaattctaactggaccctcaatgccccaac-aaaagtcactcatcgacaagcagacatagagattacagggtctactgacgcaagctccactgacacacagtaaaacagaggagttggaaccatttctgcacaaaccacaatccattcaggttggctccattctatatgcactgaaacc--tgtaaagcaagtgagaggagaatacggattgcaaggcatgtttttgccaatgtcaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 41367 263 - 647215 ------actcaacaaagaagctatgctgtcacaagggttgaatcctaaatagaccctcaatgccccaactaaaa-----ttatcaacaagcagacaaagagattacagggtctactgacataagctccactgacacgcactaaaacagaagagttggaatcatttctgcacaaaccacaatc--ttgaagatgaCTCAATCCTATATGCACTGAAACCCATATAAAGCAAATGAGAGAGGAATACAGAAT-CAAGGCATGTTTTTTCTCATGTCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 116217 276 + 181019 tgctggagatctgtgatcagtgtactagacatcatgcactggacatttgcaatcagaacactagtcaactgaataattgattagaaagcccatctactatgaaccagtatataagatgtgtggaactataagttatgtaacctattaactgaaccatcatgaatcacatgatattattgtgaggacacattgaatacaccaggccagtttacatattaagaatcctgaactgagggaaattaccaatgttgtttgggtgattaaagaataagcaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566356 275 + 636262 tgctggaggtctgtgatcagtgtactagacatcatgtgctggacatttgcaatcagaacactagtcaactgaataattcattagaaagcccatctactatgaaccagtatataagatgtgtggaactatatgttatgtaa-ttattaacgtaaccatcatgaatcacacaatattactgtgaggacacattgaatacaccaggccagtttacatgttaagaatcctgaactgagggatattaccgatattgtttgggtgattaaagaataagcaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 41686 276 - 647215 TACTGGACATCTGTGACCAGGGTGCCTGACACTAAGCACTGGACATTTGCGATCGGAGTGCTAACCAATTGAATAATTGATTAGAAAACCCATCCACTATGAATTAGTATATaagatgtgtggaactgtaagttatgtaacctattaactgaaccatcatgaatcacatgatattattgtgaggacacattggatacaccaggccagtttacatattaagattcctgagatgagggaaattaccaacgttgtgtgggtgtttaaagaatgataaag + +a +s mr.mrrefChr3 116493 82 + 181019 acatccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcctaagatgggcacaagaatgaaggaaacaaaatat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566631 82 + 636262 acatccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcccaagatgggcacaagaatgaaggaaacaaaatat +s simRat_chr6.simRat.chr6 41971 81 - 647215 acaaccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcctgagatgggaacaagaaTGAAGGAAACAAAATC- + +a +s mr.mrrefChr3 116575 103 + 181019 ttccacgttctcagatgatatgatgctctaccttggaaaccctAGCATGGCAAGTTGGGCACAGCTAGCCTAGATGTAATTGAGAGGTACGAGAACAAGAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566714 103 + 636262 ttccacgttctcagatgatatgatgctctacctaggaaaccctGGCATGGAAAGTTGAGCACAGCTAGCCTGGATGTAATTGAGAGGTACGAGAACAATAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 42052 78 - 647215 -------------------------CTCTACCTTGGAAACTCTAGCATGGCAAGCAGGGCACTGCTAGCCTAGATATAATTAAGAGGTATGAGAACTAGAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 116678 165 + 181019 GGTAatactaaagaaacacccactggtaatactaaagaaacacccacctacagtttaggtaggaagatcatagttgggaaaggctaaagagacagccactccactcaattttatttttctcagtaggcacctccagcctcatcttaggcagggagacccttagcg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566818 165 + 636262 GGTAatactaaagaaacacccactggtaatactaaagaaacacccacctacagtttaggtaggaagatcatagttgggaaaggctaaagagacagctactccacccaattttatttttctcagtaggcacctccagcctcatcttaggcagggagacccttaggg +s simRat_chr6.simRat.chr6 42130 163 - 647215 GGTAACACC-AAGAAACACCCACCGGTTATACTGAAGAAacacccacctacagtttaggtaggaagatcatggttggaaaaggctaaagagacagccactccacttaattttatttttctcagtaggcacctccaaccttatcttaggcagag-gaccctcagcg + +a +s mr.mrrefChr3 116843 269 + 181019 atgaagcaaaagtgggccctcaactcaaattaagggaTGAATTCAGttttacccACAAAAAGGAAACGAAAGTTAGAATGGTTCATATCTAGCAGCAAAAtaggagtgagagtgaaacacccatccagttgaacagagtagctcttgcagaccttaagaagatatcaagggCTagtacTCAGACCCTAGATCTAAGGGGAAGTATTTAAGTAAAgaattgacagtgaggcacacACTTCCACAGAATGGTTCACATGTGAAGAAATGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566984 249 + 636262 atggagcaaaagtgggccctcaactcaaattaagggaTGAATTCAGTTTTACCCACAAAAAGGAAACAAAAGTTAGAATGGTTCATATCTAGCAGCAAAATAGGAGTGAGAGTGAAACACACATCCAGTTGAACAGAGTGGCGCTTGCAGCCCTTAAGAAGATATCAAGGGCTAGTACTCAGACCTTAGATCTAAGGGGAAGTATTTAAGTAAA--------------------ACCTCCACAGAATGGTTCTCATGTGAAGTAATGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 42293 256 - 647215 atgaagcaaaagtgggccctcaactcaaattaagggaTGAATTCAC--------ACAAAAAGGAAACGAAAGTTAGAATGGTTTATGTCTGGCAGCAAAAtaggagcgagagtgaaacacccatccaattgaacagagtagctcttgcagaccttaagaagatatcaagggCT-----TCAGACCCTATATCTGAGGGGGAGTATTTAAGTAAAGAATTGACAGTGAGGCACACACTCCCACAGAGTGGTTCACATACGAAGAAATAAT + +a +s mr.mrrefChr3 117112 20 + 181019 GGAGAAGCACCTTACTTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567233 20 + 636262 GGAGAAGCACCTTACTTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 42550 20 - 647215 GGAGAAACATGTTGCTTTAG + +a +s mr.mrrefChr3 117132 127 + 181019 TTATCATGCTATGGCTGATTGGCCTCATTAGTCTAGTGTAATCTCCTTAATCAATTATAGTGGaCAATAGCGAGGAAATAGGTATGAAGCACTCATTCAGCTaaggggaGAGGGTTGTGTTTCAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567263 127 + 636262 TTATCATGCTATGGCTGATTGGCCTCATTAGCCTTGTGTAATCTCCTCAATCAATTATAGTGGACAATAGCGAGGAAATAGGTACAAAGCACTCATTCGGCTAAGGGGAGAGGGTTGTGTTTCAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 42570 119 - 647215 TTATCACGCCATGGCTGCTTGGTCTTGTTAGTGTAGTGTAATTTCCTTAATCAATTATAGTGG-CAATAGCGACAAAATAGGTATGAAGTACTCATTCAGCA-------GTCAATCATGGTTCACAA + +a +s mr.mrrefChr3 117259 35 + 181019 TGTTCCAGCAAGAAgATACACACGTTCTATTCTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567390 35 + 636262 TGTTCCAGCAAAAAGATACAAACATTCTATTCTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 42695 34 - 647215 TACTCTATAAAGTC-ATGGACGCGTTTCATTCTTC + +a +s mr.mrrefChr3 117294 168 + 181019 TGGTGCCCAATAATACTACTCCATAAAGTCATAGACGTGTTTCatATTCTTCTTTTATGAGTCAAAAAGACTAAGAAACAGGTTCCCTTTGTGATTAGACATAAGTAACCCCCCTTTTTCAACATCCAGCCACCTCAGAAGAATTCTCAGAAAAAAACCATCAATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567426 168 + 636262 TAGTGCCCAATAATGTGACTCCATAAAATCACACAAGTGTTTCATATTCTTCTTTTATGAGTCAAAAAGACTAAGAAACAGGTTCCCTTTGTGATTAGACATAAGTAACCCCCCTTTTCCAACATCCAGCCACCTCAGAAAAATTCTCAGAAAAAAACCATCAATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 42729 163 - 647215 TGGTTTACAATAATACTACTCCATAAAGTCATGGACGCGTTTC--ATTCTTCTTATCTGAGTAAAAAAGACTAAGAAATAGATTCCCTGTGTGATTAGGCATAAGTAACCCCCCTTTTT---CGTCCAGCCACCTCAGAAGAATTCTCACAAGGAAACCATTATTTTG + +a +s mr.mrrefChr3 117462 22 + 181019 TCAGTTATCATTTGAATAAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567603 22 + 636262 TCATTTATCATTTGAATAAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 42892 13 - 647215 TCAGTTATCACTC--------- + +a +s mr.mrrefChr3 117484 356 + 181019 TGTTAGTCAAACATCAGGATCCACCCCATATGACCACTCTATTTGCCCTGCCCTATGAAATGTTGTGAGATATGGTGTATGGAATGTGAGTTCTAGGGAAGGGCGATCAAGGGCCCATAGGAATCAAGCATGTGGAATCCTGAGAGTAATCATATTTCAAGGGATAGCTGTCAAGGTATTTATTTTCTGACTAACCCCTCATCATGCCAACCTATTGTTCTTGCTTGTCTGATGTCTGTATTCTTGATTGTAAATCCATCTCTCCTGGCTTATCCAGTGTTTACACCAATAAAATGTGGGACTGAAAGGAATGTTAGGATTCAGTAGAACCAAGGGTTAAGGCAGCTGCATGTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567631 355 + 636262 TGTTAGTCGAACATAAGGATCCACCCCATATGACCACTCTATATGCCCTGCCCAATGAAATGTTGTGAGATATGGAGTGTGGAATATGAGTTCTAGGGAAGGGCGAACAAGGGCCCATAGGGATCAAGCATGTAGAAGCCTGAGAGTAATAACATTTCAAGGGATAGCTGTCAAGG-ATTTATTTTTTGACTAACCCCTCATCATGCCAACCTATTGTCCTTGCTTGTCTGATGTCTGTATTCTTGATTGTAAATCTGTCTCTCCTGGCTTATCCAGTGTTTACACCAATAAAATGTGAGACTGAAAGGAATGTTAGAATTCAGTAGAACCAAGGGTTAAGGCAGCTGCATGTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 42905 354 - 647215 --TTAGTCAAGCATCAGTATCCACCCCATATGACCACTCTATTTTCCTTTCCCTATGAAATGTTGTGAGATACAGTGGATGGAATGTAGGTTCTAGGGAATGGCCATCAAGAGCCCATAGGAATCAAGCATGTGGAATCCTGGGAGTAACCATATTTCAAGGGATGGCTCTCAAAGTATTTGTTTCCTCACTAACCCCTCATCGCGCCAACCCACTGTTCTTGCTTGTCTGATGTCTTTATTCCTGATTGTAAATCCAACTCTCTTGGCTTATCCGGTGTTTACACCAATAAAGCGTGGGACTGAAAGGTATTATATGCCTCAGTAGAACCTAGGGTTAAGACAGCTGCCTGTTAT + +a +s mr.mrrefChr3 117840 550 + 181019 TTTTGTGCATGGTGGGATGCATTGGATCTGCCCTTACCTACCAGACCAACACCTATTGATAGGAACTGTAAACATCTCACAGACCACTTGTAATATCTAATGATCAGACTAAAGAATATAATACTCTGTAGCATCTTGTCTGGGTACTGTGCACCAGTGCTGCTCTTGTTACCCTCCCATTAAGTAATGTGTCCACATTCCAAATTGGATGTAGTTTTGTATGGGTGATCTGAATTATTTAGTTTACAGTTGGAAAATAGTGCTGATGGGGGCCTACCATTTTGCACCTGGAATGTTTCCAACAGTGTTCAGTCCAGTGTGATAAGTGTCATCCTAATTTCTAAGCTCCCAGTGTTATTACAGTTAGAGTTCTCCAATGGAATAGGTGGATGCCAATTAATAAATGTATAATCACATTGAGGTCAGTAGAATAACTGGAAAAACAGCAGTAAGGTTGGTTACAGATATCTTGTGATGCACCTCCTGTACAAGAGCACCAACAGCACACCTAAACTTGCAGAATTCTGTGGACAACCATCCCGTTTTTCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 567986 549 + 636262 TTTTGTGCATGGTGGGAT-TATTGGATCTGCCCTTACCTACCAGACCAACACCTATTGATAGGAACTGTAAACAGCTCACAGACCTCGTGTAATATCTAATGATCAGACTAAAGAATGTAATACTCTGTAGCATCTTGTCTGGGTACTGGGCACCAGTGCTGCTCTTGTTACCCTCCCATTAAGAAATGTGTCCACATTCCAAATTGGATGTAGTTTTGTATGGGTGATCTGAATTATTTAGTTTACAATTGGAAAATAGTGCTGATGGGGGCCTACCATTTTGTACCTGGAGTGTTTCCGACAGTGTTCAGTCCAGTGTGATAAGTGTCATACTAATTTCTAAGCTCCCAGTGTTATTACAGTTAGACTTCTCCAATGAAATAGGTCAATGACAATTAACAAATGTATAATAACATTGAGGTCAGTAGAATAACTGGAAAAACAGCAGTGAGGTTGTTTACAGATATCTTGTGATGCACCTCCTGTACAAGAGAGCCAACAGCACACCTAAACTTACAGAATTCTATGGACAACCATCCCGTTTTTCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 43260 538 - 647215 TTTTTGGCATGGTGGGATGCACTGTATCTGCCCTT------------AATACCTATTGATAGGAACTGTAAACATCTCACAGACCACTTTTAATATCTAACGCTCATACTAAAGAACATAATACTCTGTAGCATCTTGTTTGGGTACCATGCACCAGTGCTGCTCTGGTTACCCTCCCATTAAGTAATGTGCCCACATTCCAAATTTGATGTACTTTTGTATGGGTGATCTGAATTATTCAGTTTACAGTTGGAAGACAGTGCTGGTGGGGGCTTACCATTTTGCACCTGGGATGTTTCTAACAGTGTTCAGTCCAGTGTGATAACTGTCATCCTCATTTCTAAGCTCCCAGTGTTATTACAGCTAGAGTTCTCCAATGGAGTAGGTGGATGCCAGTTAATGAATGTGTAAGCACATTGAGGTCAGTAGAATAACTGGAACAACAGCAGCAAGGTTGGTGACAGATCTCTTGTGATTCACCTCCTGCACGAGGACATCAACAGCAAACCTAAACCTGCAGAATACTGTGGACGACCATCCCGTTTTTCGT + +a +s mr.mrrefChr3 118390 94 + 181019 TTCCCATTATTAGAAAGACCAAAAACTGTTAATTGCAGTAACATCTGTTCTGGTCTAGATGAATGCCTCATCACCAGCCTCCACAAGAAATGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568535 92 + 636262 TTCCTGTTATT--AAAGACCGAAGACTGTTAATTGCAGTAACATCTGCTCTGGTCTAGATGAATGCCTCATCACCAGCCTCCACAAGAAATGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 43799 94 - 647215 TTCCCATTGTTAGAGAGACCAAAAACCTTTAAGTGCAGTAACATCTGTTCCGGTCTAGATGAATGCCTCATCACTAGCCTCCACAAGAAATGAG + +a +s mr.mrrefChr3 118484 33 + 181019 ATCTGTGCAAGCATCTGGTTGGGGGGAACTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568633 33 + 636262 ATCTGTGCAGGTATCTGGTTGGGGGGAACTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 43893 33 - 647215 ATCTGTGCAAGCATCTTGCTGGGGGGAACTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 118517 185 + 181019 ACTACCCCAATGCTTAAGACTAATTTATCTAGAATGCTAATAGACACCTGATGTGCTTCAATGATTAATCATTGTGAGAGGTAAGAATTCTTTTTTTGTTTGATCTGAGATTAAGGAGCTATTGGTTTAGGATTGCCTTAAATTGGTTTCACTTTTGCTTACTATGGGCGTCTCCTTTGGTAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568666 183 + 636262 ACTACCCCAATGCTTAAGACTAATTTATCTAGAATGCTAATAGACGCCTGATGTGCTTCAATGATAAATCATGGTGAGAGGTAAGAATTCTTTTTTTGTTTCATCAGAGATTAAGGAGCTATTGGTTTAGGATTGCC--AGAGCGGTTTCACGTTTACTTACTATGGGCGTCTCCTTTGGTAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 43930 183 - 647215 ACTACCCTGCTGCTTAAGACTAATTTTTCTAGAATGCT--TAGACACCTGATGTGCTTCAATGATTAATCATTGTGAGAGGTAAGAATTCTTTTTTTGTTTGATCTGAGATTCAGGAGGTATTGGTTTAGTACTGCCTTAAATTGGTTTCATTTTTGCTTGATTTGCGTGTCTCCTTTGGTAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 118702 100 + 181019 TTGGTCAGGGTCTTGTCTTCCTATTAAGATGAAATTCTTTACATGTTTCTTCACAATGTGAATGTCAGAAGAATGCGCCTCCATAACCTTTGCTGGTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568849 100 + 636262 TTGGTCAGGGTCTTGTCTTTCTATTAAGATGAAATTCTTTCCATGTTTCCTCACAATGTGAATGCCAGGAGAATGCGCCTCAATAACCTTTGATGGTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 44114 100 - 647215 TTGGTCAAGGTCTTGTCTTCCTATTAAGATGAAATTCTTTACATGTTTCTTCACAATGTGAATGTCACAAGAATGTAGCTCCATAACCTTTGCAGTTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 118802 15 + 181019 TTATTTTTGTTTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568949 15 + 636262 TTATTTTTGTTTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 44230 15 - 647215 TTATTTTTGTATTGG + +a +s mr.mrrefChr3 118817 32 + 181019 ACAACCTCCTTCTGTAACAGAGTAAAATCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 568971 32 + 636262 ACAACCTCCTTCTGTAACTGAGTAAAATCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 44245 32 - 647215 ATGAGCTCCTTCTTTAATAGAGTGAGATCAAC + +a +s mr.mrrefChr3 118849 53 + 181019 AGTATGATCATGATGGATATATGAAAGTAGGCCTTCTATCAGCTAATGAGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569005 53 + 636262 AGTATGATCGTGATGGATATATGAAAGCAGGCCTTCTATCAGCTAATGAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 44277 53 - 647215 AGTATGATCATGATGGATATATGAAAGTAGGCCTTCTATCAGCTAATGAGAAA + +a +s mr.mrrefChr3 118902 133 + 181019 TGAGTATAGTCTTCCAAACTGTAGCACATAGGGGAGTGTATCAACAAACTATAGCTCCACTGACACACACAAGGCATTTAACCTAATATTTTTGTGCCATCATTCATTGACTAGCTGCAACTATGTTTGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569058 133 + 636262 TGAGTGTAGTCTTCCAAACTGTAGCACATAGGGGAGTGTATCGATAAACTATAACTCTACTGACACACACAAGGCATTTAACCTAATATTTTTGTGCCATCATTCATTGACTAGCTGCAACTATGTTTGGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 44337 133 - 647215 TGAGTATCATCTTTCAAACTGTAACCGATAGGTGAGCGTATCAACAAACTATAGCTCCACTGACACACACATGGCATTTAACCTCATATGTTTGTGCCATCATTCATTGACAAGCGGACAATGTGTTTGGTGT + +a +s mr.mrrefChr3 119035 9 + 181019 TTGACACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569193 9 + 636262 TTGACACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 44470 9 - 647215 TTGACACAG + +a +s mr.mrrefChr3 119044 149 + 181019 AGTCCCTCCATTGCTAGGATCCTGGGTGTTCTTGCTGGGAACATTATTCTTGCAAGAAATTCTATAGCTGCCCCAAGAGGGCCCTAAGGTAGAGCACATGTAGGTGCTTGATTTTAATATTTTAAAAATGATGTGAACATATGTGACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569202 149 + 636262 AGTCCCTCCATTGCTAGGATCCTGGGTGTTCTTGCTGGGAACATTATTCTTGCAAAAAATTCTATAGCTGCCCCAAGAGGGCCCTAAGGTAGAGCACATGTAGGTGCTTGATCTTAATATTGTAAAAATGATGTGAACATATGTGACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 44480 149 - 647215 ACTACCTCCATTGCTAAGATCCTGGGTGTTCTTGCCTGGAACATTATTCTAGCATGGAATTCTATAGCTACCTAAAGAGAGCCCTAAGGTAGAGCACATATAGGTACTTGAATGTAAGATTTAAAAAATGGAGTGAACACATTCGACAT + +a +s mr.mrrefChr3 119193 302 + 181019 CATGTGCAATTAGCACGCAGAACCTTTCAATatcttgacactctttagtggttcagatttacttagatccctgatccatctgcacttagtctcagctttgatgtaaggagtgagcaaatgtgggggtccagcttcttgttgatggatgtccaatttcaatgtcacttcctgcggagtgactattagcaattctcttagccttctccctgaacaatgaaggatagaacgatcaatgaaagatagaacaatccagttcgctgagaagtaaacagaagtctcgacaagcccactttcttgccagg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569351 272 + 636262 CATGTGCAATTAGCATGCAGGATCTTTCAATATCTTGACCCTCTATACTGGTTCACATTTACTTAGATCCCTGATCCATCTGCACTTATTCTCAGCATTG-----------------------------AGCTTCCTGTTGATGGATGTCTAATTTCGATGTCACTTCCTGCGGAGTGACTATTAGCAATTCTCTTAGCCTTCTCCCTGAACAATGAAGGATAGAACGATCAatgaaagatagaacaatccagttcgctgagaagtaaacagaagtct-gacaagcccactttcttaccagg +s simRat_chr6.simRat.chr6 44635 302 - 647215 CATGTGCACTTAGCACGCAGAACCTCACCATatcttgacactctttagtggttcagaatcacttagatccctgattcatctgcacttagtctcagctttgatgtaaggagtgagcaaatgtgggggtccagcctcttgttgatggatgtccaatttcactgtcacttcttggggagtgactattaacaattctcttagtcttctccctggacaatgaaggatagaacagtcaatgaaggatagaacaatccagtttactgagaagtaaacagaagtctcaacaagcccactttcttgccggg + +a +s mr.mrrefChr3 119495 191 + 181019 tatggtttctgacctcctggtaccagcatattgggtttaatgctgttttggtcccatttactcATAATATATCCAAAAAACCAGGTAGtgaccTTCGAATTGAATTAGTGCTCCCTGCACTGACTAATCAGCATTGGAGAGGGACATAACCAAAGTGGGTGCTCACAGAATCTGCTACTCCTAACACAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569623 186 + 636262 tatagtttctgacctcctggtaccagcataTTGGGTTTAATGCTGCTTCGGTCCCATTTACTCATAATATTTCCAAAAAACCAGGTAG-----TTCAAATAGAATTAGTGCTCCCTGCACAAACTAATCAGCATTGGACAGGGACATAACCAAAGTGAGTGCTCACAGGATCTGCTACTGCTAACACAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 44940 191 - 647215 tatggtgtctgatctcctggtaccagcacattgggtttaatgctcttttggttgcatttgctcATAATATATCCGAAAAACCAGGTAGTGACCTTTGAATTGAATTAGTGCTCCCTGCACTGACTAATCAGCATTCGAGAGGGACCTCCCTAAAGAGGGTGCTCATAGAAGCTGCTTCTCCTAACACAACA + +a +s mr.mrrefChr3 119686 467 + 181019 AATAATCAAGTTCAAATGTATCAAATACTATAATGTTTGTGTGTATCTGTGTCATAGGGTTTCGGAAATGTTGATTCACTTACTGTTGTACTATTCCTTTAATAACCCAAGCCCTAGATAATAACCTCAACAACTAGCAAGCATAAACGGCTGAATGATTTGCCTAAGTCATTTTGGCCATCTCATGAAGATTAGCTTTTGGTCATAAAGTGTGGTAATTCTGTATTGACCTCAGAAGCTATCTGGTTCAGTGTAATTATTAGGTCATTGTCAACTGTAAGTTACAAGTTTCTACTAATAGAAGTCCTTTGTGTATCTATTGTCATTAAAAAGTGAGTGTCAACGAAATAATTTAAATATTGGGAACTGGGATTACCACAAAAACTACCTTGGCCTTTGCTGCATTTTGCATGGACAACTCAGTGTTATTGTGCTCAATGTATGAACCAGTGGTTTGTTCTATAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569814 459 + 636262 AATAATCAAGTTGAAATGTGTCAAATACTATTGTGTTTGTGTGTATCCGTGTCATAGGGTTTTGGCAATGTTGATTCACTTACTGTTGTACTACTCCCTTAATAACCCAAGCCCTAGATAATAACCTCAACAACTAGCAAGCATAGACGGCTGAAT--TTTGCCTAAGTCATTTTGGCCATCCCAGGAAGACTAGCTTTTAGTCATAAAGTGTGGTAGTTCTGTATTGACCTCAGAAGCTATCTGGTTCAGTGTAGTTATTAGGTCATGGTCAATTGTAAGTTACAAGTTTCTACTAATAGAAGTCCTTTGAATATCTATTGTCATTAAAAAGTGAGTGTCAACAAAATAATTTAAATATT------CGGGATTACCACAAAAACTACCTTGACCTTTACTACATTTTGCATGGACAACTCAGTGTTATTGTGCTCAATGTATGAACCGGTGGTTTATTCTACAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 45131 458 - 647215 AGTAACCTAGTTCAAATGTATCAAATATTATAATATTTGTGTGTATCTGTGCCATAGGGTTACGGAAATGTTGATTTGCTGACTGTTGTACTATTCCTTTAATTATCCTGGTCCTATATTATAA-CTCAACAAATAGCAAACGTAAACGGCTGAATGATTAGCCTAAGTCATTTTGGCTATTTCATGAAGATTAGCTTTTGGTCATAAAGTGTGGTAATTCTGTATTGACTTCAGAAGCTACCTGGTTCATAGTGACTACTAGGTCATTGTCAACTGTAAGTTAAACATTTGTACTAATTGAGGTGCTTTGTGTATCTATTGTCATTAAAAAG--------AAGGAAATAATTTGAATATTGGGAACTGGGATTACCACAAAAACTGCCTAGGCCTTTGCTGCATTTTGCATGGACAACTCAGTGTTATTGTGCTCCATGAGTCAACTAGTGGTTTGGTCTATAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 120153 20 + 181019 TCCATCCAGCAGTTTGTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570273 20 + 636262 TCCATCCAGCAGTTTGTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 45590 20 - 647215 CCCATCCAGTGATTCGTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 120173 42 + 181019 ATGGAGTTCATCCATGGTGCATATCTAGTTCATCCATGGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570293 42 + 636262 ATGGAGTTCATCCATGGTGCATATCTAGTTCATCCATGGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 45612 42 - 647215 ATGGAGTCCATCCGTAGTGCATATCCAGCTCATCCATGGTGC + +a +s mr.mrrefChr3 120215 40 + 181019 AAAGTATCTCAGATGCTTTTGTTATTTGGCAAAAGCAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570335 40 + 636262 AAAGTGTCTCAGATGGTTTTGTTATTTGGCAAAAGCAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 45655 40 - 647215 AAAGTATCTCAGATGCCTTTGTTATTTGGTAAATGCAAAC + +a +s mr.mrrefChr3 120255 202 + 181019 AATTAGGTGGCATTGTAGCTGTGGGTGCAATGCTGAACTTAGCCTAGCAGGTGTAGGCTCCCACCATTCCCTTACCTTAGCTGTTTGTTTTGATCTGTGTAACTGCAGGCAAGGAAGATTAACTAGATAAACAAATCCCCTAGACTGCTTAGTCGTGGAAATTATCACAATAAATTGTGATAGTAGACAAGAGTCAGTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570425 202 + 636262 AATTTGGTGACATTGTAGCTGTGGGTGCAATGCTGAACTTAGCCTAGCAGGTATAGGCTCCCACCATTCCCTTAGCTTAGCTGTTTGGTTTGATCTGTGTAACTGCAGGCAAGGGAGATTAACTAGATAAACAAATCCCCTAGACTGCTTAGGCATGGAGATTACCACAATAAACTGTGATAGCAGACAAGAGTCAGTGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 45695 202 - 647215 AATTAGGTGGCGGTGTAGCTGTGGGTGCAAACCTGAACTTAGCTTAGCAGGTGTAGGCTCCCACTATTCCCTTACCTTAGCTATTTGTCTTGATCTGTGTAAATGCAAGCAAGGAAGATGAACTAGATAAACCAATCCCCTAGACTGCTTAGTTGTGGGAATTATCACAATAAATTTTGATAATGGACAACAGTCAGTGGCA + +a +s mr.mrrefChr3 120457 14 + 181019 AAGGATTTGCAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570628 14 + 636262 AAGGATTTGCAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 45897 14 - 647215 AAGGATTTGCAGTC + +a +s mr.mrrefChr3 120471 158 + 181019 CACTTGGGTTCTAGTTAGGTAAGTATGAGGCATGGGGGACAATACCATATAGTAGTAGGATTCCTTCCACCTTGTTTACAGAGTCTCTTGACTTATACTCACGAGATAATTTCAATAACTGCACAGCCCCAAGACATTTGCTTGAGAGCAATGGTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570642 158 + 636262 CACTTGGGTTCTAGTTAGGTAAGTAGGAGGCATGGGGGACAATACCATATAGTAGTAGGATTCCTTCCACCTTGTTTGCAGAGTCTCTAGATTTATACTCACGAGATAATTTCAATAACTGCACAGCCCCAAGACATTTGCTTGAGAGCAATGGTCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 45966 158 - 647215 CACTTGGGTTCTAGTTAGCTAAGTATGAAGCTTGGGGCACAACACCATATAGTAGTAGGATTCCTTCCACCTTGATTACAGAGTCTTTTGACTTATAGTCACCAGATAGTTTCAATAACCTTTCAGCCCCAAGACATTTGCTTGAGAGAAATGGTTAT + +a +s mr.mrrefChr3 120629 158 + 181019 GCATATTGGACCAAGTGTTTCAGCCCTAAGGTGTAGAAAATTCTCCCCATGAATAATGCTCCTCCCAACACATTAGCAATCAATGTGGATGACACAAGATCCAAAATAGTCCTCATTGACATTATGGTCAAGACAGCTTTGTATCATGCAGTGCTACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570800 97 + 636262 GCATATATGACCAAGTGTTTCAGCCGTAATGTATAAAAAGTTCTCCCCATGAATAATGCTTCCCACAACACATTAGCAATCAATGCAGATGACACAA------------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 46125 158 - 647215 GGATATTGGGCCAAGTTTTTCAGCCCTAAGGTGTAGAAAATTCTCCCCATGAATAATGCTCCTCCCAACACATTAACAATCAATGTGGGTGATACAAGATCCAAAATAGTCCTCATTGACATTATGGTCAAGACAGCTTTGTATCATGCAGTGCTACC + +a +s mr.mrrefChr3 120787 50 + 181019 ATCGGTCAATCACCCAGCATACAAGACACCTATTCATTTTGACACCATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 46284 50 - 647215 ATCGGTCAATCACCCAGCATACAAGACACCTATTCATTTTGACACCATGA + +a +s mr.mrrefChr3 120837 5 + 181019 TGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 46393 5 - 647215 TGGGA + +a +s mr.mrrefChr3 120842 38 + 181019 TAAATGTTATTATTATTGCCCTGCTGGATAAAGCAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570897 19 + 636262 -------------------CCTGCTGGATAAAACAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 46401 38 - 647215 TAAATGTTATTATTATTGCCCTGCTGGATAAGGCAACC + +a +s mr.mrrefChr3 120880 169 + 181019 AATTAACCTTTTAAAAACAGTGTCTTATGGGATATCTAATGGTGAGGACCTAGCCAAACCCATATAAAATAGGCAACATTCCACTCCACAATTACATCAATTCTCCTGACACACTGCAGCATGGTCCCTGGGTGCAAGTTCATAAGGTATAATCTCTCCATAGTATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 570917 164 + 636262 AATTAACTTTTTAAAAATAGTGTATTATGGGATATCTAATGGTGAGGACCTAGCCAAACCCATATATAATAGGCAACATCCCACTCTACAATTACATCAATCCCCCTGACACACTGCAGCATGGTCCCTAGATGCAGGTTCATAAGGTATAATCTCTCCAGTGT----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 46439 169 - 647215 AATTAACCTTTTAAAAACAGTTTCTTATGGGATATTTAATGGTGAGGGCCTGGCCAAACCCATATAAAATAGGCAACATTCCACTCCACAGATACATCACTTCTCCTGACACACTGCAGCATAGTCCCTGGGTCCAAGTTCATAAGGTATAATGTCTCCATAGGATGTG + +a +s mr.mrrefChr3 121049 143 + 181019 CAAGAATAAATGGAATGGGTGCCTCCAATGAACATAAACAACAAAGATACATACTAGGAGCAAAGGAAAACATCCATTATGCTGATCAGATCCTACTTCTGATTTTGCACTGCTCTTTTGATTTGCTGTTTAGGCTATGCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571081 141 + 636262 --AGAATAAATGGAATGAGTGCCTCCAATGAACATGAACAACAAAGATACATACTAGGAGCAAAGGAAAACATCCATTATGCTGATCAGATCCTACTTCTGATTTTGCACTGCTCTTTTGATTTGCTTTTTAGGCTATGCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 46613 143 - 647215 CAAGATTAAATGGAATGGGTGCCTCCAACGAACATAAACAACAAAGATACATACTAGGAGAAAAGGAAAACATCCATCATGCTGATTACATCCCGCTTCTGATTTTGCATCGCTCTTTTGATTTGCTGCTTAGGCTATGATGT + +a +s mr.mrrefChr3 121192 73 + 181019 TAGGGAGTCCTTATTCTGCATGAAATTGTGAGCCATAATGTGGCTTCTTACTGAATCTAGTTATATATACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571222 73 + 636262 TAGGGAGTCCTTATTCTGCATGAAGTTGTGAGCCATAATGTGGCTTCTTACTGAATCTAGTTATACATACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 46761 73 - 647215 TTGGGAGTCCTTATTCTGCATGAAATTGTGAGCCATAATGTGACTTCATACTAAATCTAGTTATATTTATACA + +a +s mr.mrrefChr3 121265 8 + 181019 CCTTGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571295 8 + 636262 CCTTGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 46835 8 - 647215 CCTTGCAG + +a +s mr.mrrefChr3 121273 18 + 181019 TGGATATACACACCTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571321 18 + 636262 TGGATATACACACCTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 46843 9 - 647215 ---------CTACCTTGC + +a +s mr.mrrefChr3 121291 63 + 181019 AGCTATGAAGATAGATAGTTGTGGTAATATGTTAGCCACAATGTGGTCTACTACTCCTAGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571341 60 + 636262 AGCTATGAAGATAG---GTTGTGGTAATATGTTAGTCACAATGTGCTCTACTACTCCTAGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 46852 63 - 647215 AGCTCTCAAGATAGATAGTTGTGGTGATATGTTAACCACTATGTGGTCTACCACTCCTGGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 121354 77 + 181019 CTTTTGATTTCACTTTAATAAATATGCACACCTTTGGTATAGAGGTATGTGCTTTCTGTTGCCCCTTAGGGGAGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571402 77 + 636262 CTTTTGATTTCACTTTAATAAATATGTACACCTTTGGTATAGAGGTTTGTGCTTTCTGTTGCCCCTTAGGGGAGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 46915 77 - 647215 CTTTTGATTTTACTTTAATAAATATGCACACCTTTGATATAGAGGTATGTGCTTTTTGTTGCCCCGTAGGGGAGTAC + +a +s mr.mrrefChr3 121431 29 + 181019 TCTTTTGGGGAGTACTCCTTTCTGCTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571483 29 + 636262 TCTTTTAGGGAGTACTCCTTTCTGCTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 46992 29 - 647215 TCTTTTGGGGAGTACTCCTCTCTGCTTTC + +a +s mr.mrrefChr3 121460 13 + 181019 GTCATCATACTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571512 13 + 636262 GTCCTCATACTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 47024 13 - 647215 GTCATCATACTCC + +a +s mr.mrrefChr3 121473 182 + 181019 AATCATTGCACTAAGTTAAGCGAAGGTGTGAGAGACTGAACATGGATGTATAGGTCATAGATTAGAGGCACTCCACCACGAAGGATAAGGACAGCTGGTGTGATAGCTGCAGATGTGACCAGAGGATCTCTGCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCAACTGCTGAATAAGATAGCATGCTCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571525 182 + 636262 AATCATTGCACTCAGTTAAGTGAAGGTGTGAGTGACTGAACATGGATGTATAGGACATAGATTTGAGGCATTCCACCGCAAAGGATAAGGACAGCTGGTGTGATAGCTGCATATGTGACCAGAGGATCTCTGCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCAACTGCTGAATCAGATGGCATGCTCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 47038 178 - 647215 AATCATTGCACTAGGCTAAGCAAAGATGTGAGAGACTGAACATGGGTGTATAGGTCATAGATCAGAAGCACTCCACCATGAAGGATAAGGACAGCTGGCATGAGTGCTACAGATGTGACCAGAGGAGCCCTCCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCATCTGCGGAATAAGATAGCATGCT---- + +a +s mr.mrrefChr3 121655 338 + 181019 GTGTTACTATAGTGCAAGCACTTACAGTCCCCATGGGACTCATTATCAAAGGCCACACCCTGTACATTTGAGTACCCATACATTAACATGTGATGTTTTTATGGTAATTAATGTATCCATAGAGATATAGATCTCAATGACTAAGATGCCTCTGATTGTAGTTTGTTTGGTGCATCATTTCAAAGAAATCAGAGTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACATTTTGTGGATGTTGGACTACACAAATTTGGATGCCAATGCATCCAGACGGAGCTGCGGGATTGAGATTAAGTGATGGTGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCAGTTCCATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571710 338 + 636262 GTGTTACTATAGTGCAAGCACTTACAGTCCCCATGGGACTCATTATCAAAGGCCACACCCTGTACATTTGAGTACCTATACATTAACCTGTGAAGTTTTGATGGTAATTAATGTATTCATAGAGATATAGATCTCAATGACTAATATGACTCTGATTGTAGTTTGTTTGATGCATCATATCAAAGAAATCAGAGTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACATTTTGTGGTTGTTGGACTACTCAAATTTGGATGCCAATGCATCCAGACGGAGCTGCGGGATTGAGATTGAGTGATGGTGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCAGTTCCATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 47216 338 - 647215 GTACTACTATAGGGGAGGCAATTACAGACCCCATGGGACTTATCATCAAGGGCCACCCCCTGTACATTTGTACAGCCATACATTAACATGTGATGTTTTTATGGTAATTAATGTATCCATAGAGATATTGATGTCAACGACTGAGATGCCTCTGATTGTCGTGTGTTTGGTCCATCATTCCAAAGAAGTCAGATTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACTTTTTACGGATGCAGGACTACACGAAAAAGAATTCCAATGCAACCAGACAGTGCTGATGGATTGAGATTAAGTCATGAGGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCCGTTCTTTTA + +a +s mr.mrrefChr3 121993 57 + 181019 ACTAAGCTCCATAATGCTTGGACTGCCCTGGAGGACTGTATATTAGGTGGGGTAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572049 57 + 636262 ACTAAGCTCCATAATGCTTGGACTGCCCTGGAGGACTGTATATTAGGTGGGGTGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 47554 57 - 647215 CCTGAGCTGCATAATGGTTGGACTGCCTTGGAGGACTGTTTATTAGGTAGAGCAGCT + +a +s mr.mrrefChr3 122050 10 + 181019 AAAGGAGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572112 10 + 636262 AAAGGAGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 47611 10 - 647215 AAAGGGGAGA + +a +s mr.mrrefChr3 122060 11 + 181019 GAGAGCACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572123 11 + 636262 GAGAGCACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 47621 11 - 647215 GAGAACACCCC + +a +s mr.mrrefChr3 122071 57 + 181019 TAACATAAAACTTAAATTGAAGGGAGCTATAATTCTGACAAGGTGTTATTACCAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572135 57 + 636262 TAACATAAAACCTAAATTGGAGAGAGCTATAGTTCTAACAAGGTGTTGTTACCTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 47632 57 - 647215 TAACATAAGACTTAAATTGAAGGGAGCTTTAATTCTGACAAGATGCCATTGCCAAAA + +a +s mr.mrrefChr3 122128 101 + 181019 TTCATGAGATTAGAATTCTAGATAATTGCATCATGAATTATTGGACAGAGATGAAATCCACATGTCATATGGATTAACTCATAGGTTGCCGGGTATCCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572192 101 + 636262 TTCATGAGATTAGAATTCTAGATAATTGCATCATGAATTATTGGACAGAGATGAAATCCACATGTCATATGGATTAACTCATAGGTTGCCGGGTATCCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 47690 101 - 647215 TTCATGGGATTAGAATTCTAGATAGTTGCATCATGAATTAATGGACGTTGATGAGATCCTCATGGCATATGGACTAACTCATAGATTGCCAGCTATACCTT + +a +s mr.mrrefChr3 122229 19 + 181019 AGAAATTGTAGTGCTGACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572304 19 + 636262 AGAAATTGTAGTGCTGACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 47791 19 - 647215 AGGAATTGTAGGGCTGACT + +a +s mr.mrrefChr3 122248 45 + 181019 TCAAGTTCCTGTTTCCAATGTGACTATTGGTTTGGGGGAGAAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572329 45 + 636262 TCAAGTTCCTGTTTCCAATGTGACTATTGGTTTGGGGGAGAAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 47810 45 - 647215 TGAAGTTCCTGTTTCCAATCGGACTATTGGTCTAGGGGAAATGGA + +a +s mr.mrrefChr3 122293 59 + 181019 ATAAACATTGCACCTGGCACCATAGGAGTTGGCTGTCAGTCGGGGGGACACTAGATCGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572374 59 + 636262 ATAAACATTGCACCTGGCACCATAGGAGTTGGCTGTCAGTCGGGGGGACACTAGATCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 47856 59 - 647215 ATAAATATTGCACCAGGCACAATAGGTGTTGGCTGTCAGTCCGGGGGATACTAGATTGC + +a +s mr.mrrefChr3 122352 40 + 181019 ACCCTCACTTATCAAACTCTTCTGTTGGTCAAACTGAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572433 40 + 636262 ACCCTCACTTATCAAACTCTTCTGTTGGTCAAACTGAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 47951 40 - 647215 ACCCTCGCTTATTAAACCCCTCTATTGATAAAACTGAAGG + +a +s mr.mrrefChr3 122392 118 + 181019 TTAACATGGATTCCACTGAATAAGGGGGTACATCACACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGCATGAGCCAGCTGGGTTTAAGAGGGCCGTATCTATGGGGTCCTATCAAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572473 118 + 636262 TTAACATGGATTCCACTGAATAAGGGGGTACATCACACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGCATGAGCCAGCAGGGTTTAAGAGGGCCATATCTATGAGGTCCTATCAAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 47992 118 - 647215 GTAACACAGATTCCACTGAACAAAGGGGCACATCATACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGTATGAGCCAGCTGGGTTTCAGAGGGCTGTTTTTATGGGGTCCTATTAGGCC + +a +s mr.mrrefChr3 122510 57 + 181019 ACTTTTTGACAAAAACTTTATTCATAGAATAAAATGTGGAGATAATCTCAAACATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572595 57 + 636262 ACTTTTTGACAAGAACTTTATTCATAGAATAAAATGTGGAGATCATCTCAAACATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 48110 57 - 647215 ACTTCTTGACAAAACCTTTATTCATAGAATAACATGCAGAGATAATCGCAAGTATAC + +a +s mr.mrrefChr3 122567 45 + 181019 AATAGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATCTTCCATCAATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572652 45 + 636262 AATAGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATTTTCCATCAATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48215 45 - 647215 AATGGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATCTTCCATCAATTTG + +a +s mr.mrrefChr3 122612 249 + 181019 AACACCAAAACATTAAATATTGAGTGTAACCAAAGTGACCAGGCCAATAGTTGAACGGCTTACAGGATCTCTAGTTTATCGTGTTTAAACAAATCTCTAGACCCGTTGAATCTCTAAGCAACCAAAAGTAAAGAAACTGTGTGCAGAGATGTTTTGGAGGTTATATTAGTTATTTTACCTACTTACTTCTGTACAAGTATTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGCGCTGGGAAGGTGCATTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572703 239 + 636262 AACATCAAAATATTAAATATTGAGTGTAACCACAGTGACCAGGCCAATAGTTGAACGGCTTACAGGA--TCTAGTTTACCGTGTCTAAACAAATCTTTAGACC--------CTCTAAGCAACCAAAAGTAAAGAAACTGTGTGCATGGATGTTTTGGAGGTTATATTAGTTATTTTACCTACTTACTTTTGTACAAGTATTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGCGCTGGGAAGGTGCATTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48260 246 - 647215 AGACCCAAAACATTAGATATTGAGTGAGACCAAAGTGACCAGGCCAATAGTTGAAAGGCTTACAGGATCTCTAGTTGATTGTGTTTAAACAACTCACTAGACCCGTTGAATCTCTAAGCAACCAAAATTAAAGAAACAGTGCACAGAGAGGTATTGGAGGTTATATTAGTTATTTTGCTTACTTACTTCTACACAAGTACTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGAAC---AAAGGTGCATTCAG + +a +s mr.mrrefChr3 122861 161 + 181019 TAGGACCATCCTCTACACATATGGCTCCTATTGAATGGGATAATGTATCCATATTTTAAGCACAGTATATTAAGCCTAAACCTTATCTCCTCACCCACTGGGCACTTTGGTGCACCCATACTCTTGCTGTATTTACTTTCCTTATTAGTCTGAGGCTTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572943 161 + 636262 TAGGACCATTCTCTGCACATATGGCTCCTATTGAATGGGATAATGTATCTGTATTTTAAGCACAGTATATTAAGCCTAAACCTTATCTCCTCACCTACTGGGCATTATGGTGTACCCATACTCTTGCTGTACTTACTTTCCTTATTATTCTGAGGCTTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48506 161 - 647215 TAGGACCATCCTCTACACATCTGGCTCCTATTAAATGGGATAATGTATCCATGTTTTCAGCACGATATATTAAGGCTACACCTTATCTCCTCACCCACTGGGCACTTTGGTGCACCCATACTCTTAATGTATTTACTTTCCTTATCAGTCTTAGGCTTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 123022 7 + 181019 GAGAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573104 7 + 636262 GAGAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48668 7 - 647215 GAGAAAG + +a +s mr.mrrefChr3 123029 177 + 181019 TGCTGCTTTCAGCGCAGGTTGCGCTAACCATCATGGGTGACCTTTAAATACACATATAGTTATATCGCGTGGCTAAGTATATATTATGCAGATGTATATATGATATTAATTACTGTAGCCATGAGGAGTAAGATTGTTCTGCTCCACCCTTCATACATGTGATAGACACTAATATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573111 177 + 636262 TGCTGCTTTCAGGGCAGGTTGCACTAACCATCATAGGTGACCTCTAAATACACATATCATTATATCGCGTGGCTGACTGTATAATATGCAGATGTATATATGATATTAATTACTGTAGCCATGAGGAGTAAGATCATTCTGCTCCACCCTTCATACATCTGATAGACACTAATATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 48677 177 - 647215 TGCTGCTATCAGCGCGGGTTCAGCTAACCACCATGGGTGACCTTTAGACACAGATATAGCTACATCTTGTGGCTAAGTACATATTATGCAGATGTATTTATGATATTAATTACTGTAGCCACGAGGAGTCAGGCTGTTCTGCTCCACCCTTCATACATGTGATAGACACTAATATCT + +a +s mr.mrrefChr3 123206 10 + 181019 AAGGGAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573288 10 + 636262 ACGGGAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 48855 10 - 647215 AAGGGAGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 123216 106 + 181019 AACCAGACAAGACATGAATAACTATGTGGGGTCAATGAGAAAACTGTTCTCATAACTGAACACTTCAAGGTACAGATCCTGACTGTATTGGAATCTTGAAAATCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573299 106 + 636262 AACCAGACAAGACATGAATAATTATGTGGGGTCAGTGAGAAAACTGTTCTAATAACTGAACACTTCAAGGTAGAGCTCCTGACTGTATTGAAATCTTGAAAATCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 48865 106 - 647215 GACTAGACAAGACATGAATAACTATGTGGGGTCAATGAGAAAACTGTTCTCATAACTGAACACTTCAAGGTACAAATTCTGACTGTATTGGAATCTTGAAAATCCA + +a +s mr.mrrefChr3 123322 53 + 181019 CTTGAAGCTGCATGTACATATTCCAAGGGGTGTACTAGATTTAATCAGTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573411 53 + 636262 CTTGAAGCTGCATGTACATATTCCAAGGGGTGTACAAGATTTAATCAGTCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 48971 53 - 647215 ATTGAAATTACATGTACATATTCTAAGGGGTGTACTAGATTTAATCAGTCAGG + +a +s mr.mrrefChr3 123375 840 + 181019 ACAAGTAAGGCCAAGACACACAAATGAGACCATAGATTTCTATAACAATTGCTCCCACAGATCCTTACAGTCTTAAGATCAAATTATCCCAGTGGCACTAATGGACATGTAATGTGTTTTTTCAAGTGGCTTCTCTGAAGCAGTAATTCAAGCCAGTAATTCGAGTCAAAAGTTTGGGCAACTGTGCTTCTAAAAGCCCCAACCAACAAATAGAACTGTTTGGGAACAAGGCAAGTGGGATGCGCTCACCTACCAGAATAAGGAAGCCCATCAGCAGTTCCTCTCCAATATTTGCACATGAAATCACCCTATATTAGCGACTTTTGAATAAGTTTACCATTTAGCTTGCAACACTAAAAAGACCTGCGTGACCTGAATAAAATCAAATTACACTCTAAGGCCTCAACACAATATTGAAGATATTTGATGTACAGATTAGCAATGCAACCTCCTAGCTATGAGCTGATGGAAGCAGAGTTTATGCAGAGGTAATTCTACTAACTTCTGGGAGCTTTTTGAGAGGAACAATTGTGATTGGCTTAGAGACACACCCAGCTGGACGTCTGGATGATCAGCCTTCCATAGGCTTAGCTCAGACACTAGAAAAGTTGGGTTTTGTGGTAGGCAGATTGAAAACTGGAACACCTCCCCGAATTGCCAAAGAGTCTATCAATTTTAGTATCCTTAATAAACATATACCAGATAATCCTTCCACCCCATTTGGCTTTACCAATGAGACTGTCTACAGGTGGTCAGGTCTCTTCCCGTATATGTGGAGGAAATTTGAACTTTCATTGAACTCCTGTTGTACAGATGGTAATCTTTTTGTTCTGGTATCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 573474 811 + 636262 ACAAGTAAGGCCAAGACACACAAATGAGACCATAGATTTCTGTAACAATTGCTCCCACAGGACCTTACAGTTTTAAGACCAAATTATCCCAGTGGCACTAATGGACATGTAATGTGTTTTTTCAAGTGGCTCCTCTGAAGCAG------------------------AGAAGTTTGGGCAACTGTGCTTCTAAAAGCCCCAATCAACAAATAGAACTGTTTGGGAACAAGGCAAGTAGGATGGGCTCACCTACCAGAATAAGGAAGCCCATCAGCAGTTCCTCTCCAATATTTGCACATGCAATCACCCTATATTAGCGACTTTTGAATAAGTTTACCATTTAGCTTGCAACACTAAAAAGACCTGCGTGACCCGAATAAAATCAAATTACACTCTGAGGCCTCAACACAATATTGCAAA-----GATGTACAGATTAGCAATGCAACCTCCCAGCTATGAGCTGATGGAAGCAGAGTTTATGCAGAGGTAATTCTACTAACTTCTGGGAGCTTTTTGAGAGGAACAATTGTGATTGGCCTAGAGACACACCCAGCTGGACGTTTGGATGATCAGCCTTCCATAGGCTTAGCCCAGACGCTAGAAAAGTTGGGTTTTGTGGTAGGCAGATTGAAAACTGGAACACCTCCCCGAATTGCCAAAGAGTCTATCAATTTTAGTATCCTTAATAAACATATACCAGATAATCCTTCCACCCCATTTGGCTTTACCAATGAGACTGTCTACAGGTGGTTAGGTCTCTTCACGTATATGTGGAGGAAATTTGAGCTTTCATTAAACTCCTGTTATACAGATGGTAATCTTTTTGTTCTAGTATCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 49024 837 - 647215 ACAAGTAAGGCCAAGACGCACAAATGAGACCACAAATTTCTATAACAATTGCTCCCATGGATCTTTACAGTCTTAAGATCAAATTATCCCAGTGCCACTAAAGGACACGTAATGTGTTTTCACAAGTGGCTTCTCTGAAGCAGTAATTCAAGCCAGTAATTCGAGTCAAAAGTTTAGGGAACTGAGCTTCTAAAAGCCCCAACCAGCAAGTAGAACTGTTTGGGAACAAGGTAAGTGGGATGCACTCACCTACCAGAATAAGGAAGCCCCTCAGCAGTCCCTCTCTAGTATTTGCCCATGAAATCACCCTACATTAGCCACTTTTGAATAACTTTACCATGCATCTTGCAACACTAAAACGATCT--GTGCCCTGAATATGATTGAGTTACACTCTAATGCCTCAAGACTATATTGAGGATATTTGATGTACAGATTAGCGATGCAACCTCCTAGCTATGAGCTGATGGAAGCAGAGTTTATGCAGAGGTAATTCTACTAACTTCTGGGAGCTTTTTGAGAGGAACAATTGTGATTGGCTTAGAGACACACCCAGCTGGACGTCTGGATGATCAGCCTTCCATAGGCTTAGCTCAGACACTAGAAAAGTTGGGTTTTGTAGTAGGCAGATTGAAAACTGGAACACCTCCCCGAATTGCCAAAGAGTCTATCAATTTTAGTATCCTTAATAAACATATACCAGATAATCCTTCCACCCCATTTGGCTTCACCAATGAGACTGTTCACAGGTGGTCTGGTCTCTTTCCCCCTATGTGGAGGAAATTTGAACTTTCATTGTACTCCTGTTGTACAGATGGTAATA-TGTTGTTCTGGTATCTC + +a +s mr.mrrefChr3 124215 62 + 181019 CTCGCAGTCTATAACATAAAGTGTTTCCGGCACTTAAAGCAGAAGCACACTTGACATCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574285 62 + 636262 CTTGCAGTCTATAACGTAAAGTGTTTCTGGCACTTGAAGCAGAAGCTCACTTGACATCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 49891 59 - 647215 TTCCCAGTCTTTAACATAAAGTGTTTCCGGTACTTAAAGAAGAAGCATGCTTGGCTTCC--- + +a +s mr.mrrefChr3 124277 169 + 181019 AATCATAAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTTACTTTGACCACTCACAAATTGTAGGTATACATTATGCTTGGCTTAGCTTTGGGATTTTTAGAGCCAACTTGTGGTTGGACCAGTAGAATTGTAGTATAGAACATAATTAGAATAACCAAGTTCTCATATCGGTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574348 167 + 636262 AATTATAAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTTACTTTGACCACTCACAAATTGTAGGTATACCTTATTCTTGGCTGAGCTTTGGGATTTTTAGGGCCAACTTGTGGTTGGATCAGTAGAATCGTAGTATAGAGCATAATTAGAATAACCAAGTTCTCATATCGCTTG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 49950 156 - 647215 AGTCATGAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTCACTTTGACCAT-------------GTATTCATTATGCTTGGCTTAGCTTTGAGATTTTTAGAGGCAACTTGTGGTTGAACCAGTAAAATTGTAATTTAGAACATGATTAGACTAACCATGTTCTCATATGGGTTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 124446 118 + 181019 TGACTCATTTGGAGGATACCAGATTAAAGGGATGGTGAAAATCTCTACCATTAATATTTTGGTAGTGTCTCTAAGACCTCATTAGTGATCTTATGCACTACTTGTTTGTTAGGAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574515 85 + 636262 ---------------------------------GGGGTAAATCCCTACCATTAATATTTTGGTTGTGTCTCTAAGACCTCATTGGTGATCTTATGCACCACTTGTTTGTTAGAAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 50109 116 - 647215 TGACTCATTTGGAGGATACCAGATTAAAGGGATGGTGATAATCTCTACCATT--ATTTTCAGTAATGTCTCTAAGACCTCATTAGTGATCTTATGCACTACTGGTTTGTTGGGAATCT + +a +s mr.mrrefChr3 124564 14 + 181019 CCATGAGTGTGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574600 14 + 636262 CCAAGAGTGTGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 50231 14 - 647215 ACATGAGGGTGAAA + +a +s mr.mrrefChr3 124578 168 + 181019 TAAATGTGAGTTTGGAGGCAGTGTTGGATCTTCAAGCAGTTAGACACAAAAGTTGTTATAGGTATGGCACTACACGCCTGGATGTATTAAATATCTGTGAAGAATTAACTGGTTGCCATGCCTGAGTTACATTATTTTGTAACGAGGCTGTCACCATTTCAAGCTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574614 168 + 636262 TAAGTGTGAATTTGGAGGCAGTGTTGAATCTTTACACAGTTAGACACAAAAGTTGTTATAGGCATGGCACTACACGCCTGGATGTATTAAATATCAGTGAAGAATTAACTGGTTGCCATGCCTGAGTTACATCATTTTGTAACGGGGCTGTCACCATTTCAAGCTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 50272 167 - 647215 TTAATGTGAGTTCGGAGGCAGTGTTGGATATTCAAGCAGTTAGACAC-AAAGGTGTTATAGGTATGGCATTACACGCCTGGATGTACTAAATATCTGTGAAGAATTAATTGTTTGCCATGCCCAAGTTACATTATTTTGTAACGAGGCTGTCACCATCTCAAGCTCCA + +a +s mr.mrrefChr3 124746 73 + 181019 CTTCAGTCAATTGCATGATTGACTGACTGTCTTAGTATTACAATGATAGATTTAGAATCTCAAGGAATATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574782 73 + 636262 CTTCAGTCAATTGCATGATTGACTGACTGTCTTAGCATTACAATGATAGATTAAGAATCTCAAGGAATATAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 50440 73 - 647215 CTTCAGGCAATTGCATGATTGACTGACTGTCTGAGTATTACAATGATAGGTTTAGAATGTCAGGGAATATAGC + +a +s mr.mrrefChr3 124819 528 + 181019 TCTGAAATAATGTAGCATTGGTTTCAATTGTAATTATAAAATGTAGTGTAGCATTGGATGCAAATATAGTTGTAAGAGTTCAGTTATCACGTGGGTTTGTCAAGCACATCCAATGTCCTATCAACAATCCCCAAGACTTTGTGTGTACCATGGCACATAATTAGATCTGGCTCCCTGAATAGGGCAATACCTTAACACTCTACATCCTGTAGGCCATCATCAAACATGAAGTCAATAATACCTACTGTGGAAGGAGGACCTGACCAGTGAATCCTACAGTGCTAGTCCAGACTTTGGCCTGGTGAGTACAAATGAATGCCTGTCACCCCACCTTTTCCAATCTGGCTACTAGAATCCAAGGTGAACCATTGAACCCAAATTCTTGCTAACACCTCAGAGCTTGCAACCTGCTGAAAGATTAAAAAATGGGGACCCCCTGAGGAAAATTACTCCACATACAAAGCACTGTGCTGCTGAGATTATTTCTCCCTTCTGGGGCCATAATAGATTTCTATCCCAAGATAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 574855 527 + 636262 TCTGAAATAATGTAGCATTGGTTTCAATTGTAATTGTAAAATGTAGTGTGG-ATCGGATGCAAATATAGTTGTAAGAGTTCAGGTATCACGTGGGTTGGTCAAGCACATCCAATGTCCTATCAACAATCCTCAAGACTGTGTGTGTACCATGGCACATAATTTGATCTGGCCCCCTGAATAGGACAATACCTTAACACTCTACATCCTGTAGGCCATGAACAAACGTGAAGTCAATAATTCCCGCTTTGGAAGGAGGACCTGACCAGTGAATCCTACAGTGCTAGTCCAGACCGTGGCCTGGTGAGTACCAATGAATGCCTGCCACCTCACCTTTACCAATCTGACTGCTAGAATCCAAGGTGAACCATTGAACACAACTCCTTCCTAACACCTCAGAGCTTGTAACCTGCTGAAGGATTAAAAAATGGGGGCCCCCCAAGGAAAATTACTCCACATACAAAGCACTGTGCTGCTGAGATTATTTCTCCCTTCTGGGGCCATGATAGATTTCTATCCCAAGATAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 50584 515 - 647215 TTTGGAGTAATGTAGCATTGGGTTCAATTATAATTATAAAATGTAGTGTAGCATTGGATTCAAATATAGTTGTAGCAGTTCAGTTATCACATGGATTTGTCAGGCACATCCAA-GACTTATCAGCAATACCCAAGACTTCATGTGTACCATGGCACATCTTTACATCTGGCTCTGTGAATTGGGCAATA-CTCAACACTCTACTTGCTGTGGGTCATCATCAAACATGAAGTCAATAATACCTACTGTACAAGGAGGACCTGACCAGTGAGTCTTACAGAGCTAGTCCACACTTTGGCATGGTGAGTAGAAATAAATGCGTGTCACCCCATCTTTTCCAATCAGGCTACTA-----------GGACCATTGAAGCCAAATTCTTGCTAAAACCTCAGTGCCTGCAACTGGCTGAAAGTTTAAAAAATGGGGACCGCCTGAGGAAAGTTAATTCACATTCAAAGCACTGTGCTGCTAAGATTATTGCTCCTTTCTGGAGCCACAATAGATCTCTATCCCAAGGTTATCT + +a +s mr.mrrefChr3 125347 467 + 181019 AATCCCGAGATAAGATTGTACTGCCAAgATTACTCCCTCCTCCCCGCTGTGTCTAACATCTCAGCACAGATGCAAAGTTTATTCACTAATCCCCATGTGATCCTGACCTGATAGTCTTAACACTAGGCCTCTAAGAGCTGCATTGTgtctgagttgcaaattgaaaaccccaaaactggtactcaccaaactaGGCTGCGCCCACAAAAGTGAACAAGCGTGAATGGGCATCCTAGcTGATGATCTCGGACTATAGCAGTTGTGCCCCAATCTGTATACCATCCAAATGACCTAAGTGGAAGAGTAgTGTGGAATCCACTCTTGCTGGTTCCTCTGCCCATATCATGGACTATATCTTTGCTGCCATCATATCATGTCACACTCTATTTGTCAAGAAAGGGTAGAATGACACAATCTCTGCAGCCTGAAACAATTATTGTACTTTCTTTCATCCCCAATCAACTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 575383 467 + 636262 AATCCCGAGATAAGATTGTACTGCCAAGATTGCTCCCTCCTCCCCGCTGTGTCTAACATCTCAGCACAGATGCAAAGTTTATGCACTAATCCCCATGTGATCCTGACCTGATAGTCTTAACACTAGGCCTCTAAGAACTGCATTGTGTCTGAGTTGCAAATTGAAAACCCCAAAACTGGTACTCACCAAACTAGGCTGCACCCACAAAGGTGAACAAGCGTGAATGGGCATCCTAGCTGATGATCTCGGACTATAGCAGTTGTGCCCCAATCTCTATACGATCCAAATGAACTAAGTGGAAGGGTAGTGTGTGATCCACTCCTGCTGGTTCCTCTGCCCAGATCATGGACTATATATTTGCTGCCATCATATCATGTCACACTCTATTTGACAAGAAAGGGTAGAATGACACAATCTCTGCAGCCTGAAACAATTATTGTACTTTCATTCATCCCCAATCAACTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 51099 416 - 647215 ATCCCCAAGATAAGATTGTACTGCCAA-CTTACTCCCTCCTCCCCGCTGCGTCTAATATCTCAGCACAGATGGAAAGTTTATTCACTAATCCCCATGTGATCCTGACCTGATAATCTTAACACTAGGCTTCTAAGAGCTGCATTGT-----------------------------------------------GGCTGTGCCCACAAAAGTGAACAAGCTTGAATTGGCATCCTAG-TGATAATGTCGGGCTATATCAGTTGTGCCTAAATCTGTATCCCATCCATATGACTTAAGTGGAAGAGTA-TGTGGAATCCCTTCTTGCTGGTTCCTCTGCCCATAGCATGGACTATATCTTTGTTACCATCAAATCATGTCACACTCCATTTGTCAAGATTGGGTAGAATGACACAATCTCTGCTGCCTGAAACAATTATTGTACTTTCTTTCAT-CCCAATCAACTAAT + +a +s mr.mrrefChr3 125814 356 + 181019 CAAAGAGTGGTGCCACCCCACTTATGGCAAATTTTTGTCCCAGTTTCGAACTCACTACATGCTACTATAATAAGTACAGAGGTATTCACTTGTTCTCATAAGCTTCCATTTTGTGAACCCCACAGAGAAGGATCAGGAAACACACAGTTTTTACCTGACCATATTACTCAGCCCCAGTGGGTCTGGGAAGGTGTTGATAACAGCCTTGAGATTGACCCGACTTTAAATGCATTTTGTTGGCTCACAAGTTACTGACATGCACTACAGGCCCTGAATGTTAAATAGACAAGTTTTTAGCATGGTGCTTGTGGACGACAATGAAGCATTACCTCAGTTTCTTAAACACGCTCATCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 575880 355 + 636262 CAAAGAGTGGTGCCACCCGGCTTATGGCAAATTTTTGTCCCAGTTTCGAACTCACTACATGCTACTATAATAAGTACAGAGGTATTCACTTGTTCTCATAAGCTTCCATTTTGTGAACCCCACAGAGAAGGATCAGGAAACACACGGTTTTTACCTGACCATATTACTCAGCCTCAATGGGTCTGGGAAGGTGTTGAGAACAGCCTTAAGATTGA-CTGACTTTAGATGCATTTTCTTGGCTCACAAGTTAGCGACATGCACTACAGGCCCTGAATCTTAAAAAGACAAGTTTTTAGAATGGTGCTTGCGGATGACAATGAAGCATTACCTCAGTTTCTTAGACACGCTCATCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 51515 318 - 647215 CAAAGAGTGGTGCCGCCCCATGTACAGCAAATTTTTGTCCCAGTTTCAAATTCACGTCAAGCTGCTATAATAAGTACAGTGGTATTCACTTGTT--------------------------------------TCAGGAAACATACAGTTATTACCTCGCCTCATTACTCAGTCCCAGTGGGTCTGGGACGGTGTTGATAAGAGCCTTGAGATTGACCCAACTTTAAATTCATTTTGCTGGCTCACAAATCACTGACATGCACTACGGGCCCTGAATGTTAAATAGACAAATTTTTGGCATGGTGCTCGTGGACCACAATGATGCATTAACTCAATTACTTAAACACACTCCTCATG + +a +s mr.mrrefChr3 126170 64 + 181019 GGGTTGCTAGGTGCAGGGGTCTTATGTATAATAGGTAGTATATCGGAATGGAGATACAGTGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576235 64 + 636262 GGGTTGCTAGGTGCAGGGGTCATATGTATAATAGGAAGTATAACAGAATGGAGATACAGTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 51853 64 - 647215 GGGTTGCTAGGTGCAGGGATCTTATGTATAATAGTTAGTATATCGGAATGGACATACAGAGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 126234 189 + 181019 GCCAGGTGAGAGTCACTAGTTGCTTGTCAAATTATGACTGGAGTTGCAGGGTGAGCAGGATATTCAGAGTCTCTCAAGCCACCTCAGCCATTCTCCCACAGATTGGACTGCATAGTCTCAGTTCCCTACACCACATCTGTTCTGGGATCTTGGAAGGCATCATAATGGCTGGAATCTATTGCAGTGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576299 187 + 636262 GCCAGGTGAGAGTC-CTAGTTGCTTGTCAAATTATGACTGTTGTTGCG-GGTGAGCAGGATATTCAGAGTCTCTGAAGCCACCTCAGCCATTCTCCCACAGATTGGATTGCATAGTCTCAGTTCCCTACACCACATCTGTTCTGGGATCTTGGGAGGCATCATAATGACTGGAATCTATTGCAGTGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 51924 188 - 647215 GCCAGGTGAGAGTCAATAGTTGCTTGTCAGACTATGACTGGAGTTGCAGGGTGTGCAGAATACTCGGAGTTTGACAAGCCACTTCAGCCATTCTGCCACAGATTGGACTGTATATTCCCAGTTCCTTACACCAAATCTGTTCTGGGAT-TTGGAAGACATCATAATGGCTGGAATGTATTGTAGTGAGC + +a +s mr.mrrefChr3 126423 72 + 181019 ACTCTACCCAAATGGCGAACCGCTCCACTAAGGGCAATGGGTTAAACTAATGCTTAACAGGGCTAACGTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576486 72 + 636262 ACTCTACCCAAATCGTGAATCGCTCCACTAAGGACAATGGGTTAAACTAATGCTTAACAGGGCTAATGTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 52113 72 - 647215 ACCATACCCAAATGGCGAACCGCTCCACTAAGGGCAATGTGATAAACTAATGTGTAACAGGGCTAACATCTA + +a +s mr.mrrefChr3 126495 4 + 181019 AGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576558 4 + 636262 AGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 52250 4 - 647215 AGTG + +a +s mr.mrrefChr3 126499 57 + 181019 GCACATAATTGTTGGGAAGGTAGTTTGTGAGATTTAATAAGGAATGTGTTCCATAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576562 57 + 636262 GCACATAATTGTTGGGAAGGTAGTTTGTGAGATTTAATAAGGAACATGTTCCATAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 52256 51 - 647215 GCACATAACTGTTGGGAAGGTAGTTTGTGTAACTCAATAAGGAATGTCTTC------ + +a +s mr.mrrefChr3 126556 38 + 181019 ACCAATCTGACTGTACATAGCCCAGATATCCCAACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576621 38 + 636262 ACCAATCTGACCATACATAGTCCAGATATCCCAACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 52467 22 - 647215 --CTATCTAACTGCACATAGCCCA-------------- + +a +s mr.mrrefChr3 126594 96 + 181019 AAAAAAAAAAAGAAGTTTGCTGTCCCATTTAGTGAGCAGCAATATGAGGGTATCTGGAGGTGCCAAGTCCCTTTTTGATACTATGACAGGCTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576665 96 + 636262 AAAAAAAAAAAGAAGTTTGTTGTCTCGTTTAGTGAGCAACAATATTAGGGTATCTGGAGGTGCCAAGTCTCTTTTTGATACTATGACAGGCTTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 52489 96 - 647215 AAAAAGAAAAAGAAGCGTACTATCCCATCTGTTGAGAAGTTATATGAAGGTATCTGGAGGTGCCAAGACCCTTTTTGATACTATGACAGGCTTGAT + +a +s mr.mrrefChr3 126690 34 + 181019 GTGCACATTTGCACTGGACATTCAATCTGAAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576783 34 + 636262 GTGCACATTTGGACTGGACATTCAATCTGAGGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 52585 34 - 647215 GTGCACTTTTGCATTGGACATTCAATCTGAAGAC + +a +s mr.mrrefChr3 126724 122 + 181019 TCCAAACAAACAGTAAGAAGTGGGATAGCTAGCACGCTATGGAAGAAGGAAGGTATGGAATCATAAAGGAGGGGATTATTAGTTGCAAATCAAGAAGGCTGATAGCACCTGCTAGGGACTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576831 122 + 636262 TCCAAACAAACAGTAAGGGGTGGGATAGCTAGCATGCTATGGAAGAAGGAAGGTATGGAATCATAAAGGATGGGATTTTTAGCTGCAAATCAACAAGGCTGATAGCACCTGCTAGGGACTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 52619 122 - 647215 TTCAGACAAACAGTAAGAAGAGGATTAGCTAGCACTCTATGGAAGGGCGAAGGTATGGAATCATAAAGGAGCAGTTTATTAGTTGCAAATGGAGAAGGCTGATAGCAACTACTAGGGATTAT + +a +s mr.mrrefChr3 126846 220 + 181019 ACCACCATTAGGACACTTTTCATTGTGCAGGAGCGAAGGCTTCAAGGTAGGTGGTGTGCCTAGGTACAGTGGTGTACTGTCTCTGAAATGATGAATTTTATTTACAGTCCCTGATATGGCAGACTTTCAGGAGAATGGGATTTATTCCCCATCTATTGAGTATAGAAGTCCCAAGTATTCACATTGCTTGATATGCTCTGATTCCAATTGGTAGTGGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 576953 219 + 636262 ACCACCATTAGGACACTTTTCATTGTGCAGCAGCGAAGGCTTCAAGGTAGGTGGTGTGCCTAGGTACAGTGGTGTACTGCCTCTGAAATGATGAATTTTATTTACAGTCCCTGATACGGCAGACTTTCGGGAGAATGGTATTTACTCTCCATCTATTGAGTATAGAAGTCCCAAGTATTCACATGGCTGGATATGCTCGAGTT-CAATTGGTAGTGGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 52764 213 - 647215 ACCACCATTAGGATACTTTTCATTGTGCAGGAACGAAGGCTTCAAGGTAGGTGGTGGGCGTAGGTACA-TGGTGTACTGTCGCTGAAATCAT---TTTTATTTATGTTCCCTGAAATGGAGGACTTTTAGGGGAATGGGATTTATTCCCCATTTATTGAGTATAGAAGTCCCAAGTATTCACATTGCTTGATATG---TGATTCCAATTGGGAGTGGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 127066 220 + 181019 CTAATTCCCATACTCCTCAAACTTCTAGCCACAAAGACTTGTGGTTATCTACCGATGCAAATAGTCCGACACTGGCCAAGGACAAAACTCACGTATTATAGAAAAGTGGCAAATTCTCAGTGTACATCCTCAGTGAAGTATTGTTGATACTACTAGATTATAGATATTGAAGGTAGCAAAAAACGTGTGGCCAATATCAATAATTACCACTATCCAGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577184 212 + 636262 CTAATTCCCACACTCCTCAAACTTCTAGCCATAAAGACTTGGGGTTATCTACCGATTCAAGTAGTCTGACACTTGCCAAGGACAAAACTCACGTATTGTAGAAAGGTGGCAAATTCTCAG--------CTGAGTGAAGTATTGTTGATAATACCAGATTATAGATATTGAAGGCAGCAAAAAACATGTGGCCAATATGAATAATTACCGCCATCCAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 52977 220 - 647215 ATAGTTCCCATACTCCTCAAACTTTTAACCACAGAGACTTGTGGTTATCTACCAATGCAAATAGTCCCACACTGTCCAAGGACAAACCTCATGTATTACAGAGAAGTAGCAAATTCTCAGTGTACATCCTCAGTGAAGTACTGCTGATACTACTAAATTATCCATATGGAAGGTAGTAAAAAACGTGTGGCCAATATCATTAATTACCAATATCCGGCTG + +a +s mr.mrrefChr3 127286 115 + 181019 TCCTACGGATAGTCTGAAGCAACACATCAACTAAGGTCCCCAGAGTAAAATAAGGCTGTAGTGAATTTAAACTGAGTTAGCATACTGAATCCTAGGTCCTAGGTAACTGCAAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577396 115 + 636262 TCCAACGGATAGTCTGAAGCAACACATCAACTAAGGTCCCCAGAATAAAATAAGGCTGTAGTCAATTTAAACTGAGCTAGCATACTGAATCCTAGGTCCTAGGTAACCGCAAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 53199 113 - 647215 TCCTACAGAGACTCTGAAGCAACACATCAAC--AGGTCCCCAGAGTAAAATACGGCTGCAGTGAATTTAAAGTGAGTGAGCATTCTGAATCCTAGATCCTAGGTAACTACAAGTT + +a +s mr.mrrefChr3 127401 6 + 181019 GGACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577518 6 + 636262 GGACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 53312 6 - 647215 GGACAA + +a +s mr.mrrefChr3 127407 285 + 181019 TATTAGATAGATGAAAAGTCCATAGAAGGAGAGGATCATATTCAATGTAGTATATAAGGTGTATAATGTGTGGCTGGATCTGTGAGGCTTTAGTACCCAACCACATCTTAATATTTTTTCAAATGGAACTTCTCTAGTGTAGGTATACTGTTAATACAACGCAGCCAATCTGGCCCACTTTGCCTTCTTCTTAACGTGTAACAACCAGTATAGATGGTTAGCACTGTTTCCTCTGATGGGTTACTTGCACAACTGTTTATCTGATGGGTTACTTGTACAAACCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577525 285 + 636262 TATTAGATCGATGAAAAGTCCATAGAAGGAGAGGATCATAATCAATGTAGTATATAAGGTGTATAATGTGTAACTGGATCTGTGAGGCTTTAGTACCCAACCACATCTTAATATTTTTTCAAATGGAACTTCTATAGTGTAGGTATACCGTTAATAAAACGGAACCAATCTGGCCCACTTTGCCTTCTTCTTAAGGTGTAACAACCAGTATAGATTGTCAATACCTTTTCCTCTGATGGGTTACTTGCACAACTGTTTATCTGATGGGTTACTTGTACAAACCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 53318 283 - 647215 TATTAGATAGAGGAACAGTCCATAAACGGAGAGGACCGTATTCAATGTGGTATATAAGGTATATAATGAGTGGCTGGATCTGTGAGACTTTAGTACCCAACCACATCTTAATACTGTTTCAAATGGAACTTCCCTAGTGTAGGGATACTGTTAATACAAACCAGCCAATCTGGCCCGGTTTGTCTTCTACTTAACGTGTAACAACTAGTATGAATGGTTAGCACTGTTTCCTCTGATGTGTTACTTGCACAACTGT--ACCTGATGGGTTACCTGTACAAATCCA + +a +s mr.mrrefChr3 127692 123 + 181019 GTGCTTTGTGTTCTGAAATGTCCAAACAGTGTAGGAGTGCAACAGTGGGACGTAGGCACTGCAGTTGTAAATGGCCTGGGTTTAAATTTTCAATTGTATATAGTAACTACATGCAGGCTCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577813 121 + 636262 GTGCTTTGTGTTCTGAAATGTCCAAACAGTGTAGGAGTGCAACAGTGGGATGTAGGCACTGCAGTTGTA--TGGCCTGGGTTCAAATTTCCAATTGGATATAGTAACTACAGGCAGGCTCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 53601 121 - 647215 GTGGTTTGTATTCGGAAATGGCCAAACAGTGTAGAA-TGCAACAGTTGG-CGTAGGCACTGTATTTGTAAATGGTCTGGGTTTAAATTATCAATTGTATATGGTAACTACGTGCAGGCGCATT + +a +s mr.mrrefChr3 127815 71 + 181019 TAAAGGCGAAACAGGTGCCTGTTCTTGATCACTTGACGGTGTGTGAGATGGACAGGGGATCTACAATGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 577935 71 + 636262 TAAAGGCGAAACAGGTGCCTGTTCTTGATCACTTGACGGTGTGTGAGATGGACAGGGGATCTACAATGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 53722 71 - 647215 TAAGAGCAGGACAGGTGCTTGTCCTTGGTCACTTGACAGTGTGTGAGTTGGACAGGGGATCTACAATTCAC + +a +s mr.mrrefChr3 127886 76 + 181019 GGGGAACTACACATGACAAACCTCTTTCGAGGTGGACATACTCTCTCTGTGATCGCTTGACATCTCGTCAAGTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578008 76 + 636262 GGGGAACTACACATGACAAACCTCTTTCGAGGTGGACATACTCTCTCTGTGATCGCTTGACATCTCGTCAAGTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 53793 76 - 647215 GGGGAACTACTCATGACAAACCTTGTGTGAGGTGGACAGACTCTTTCTGTGATCACTTGACACCTCATCAAGCGGG + +a +s mr.mrrefChr3 127962 41 + 181019 CAGGCTCATGGCCAAGCACTAACTGGGTGTACATGGCCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578084 41 + 636262 CAGGCTCATGGCCAAGCACTAACTGGGTGTACATGGCCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 53870 41 - 647215 CAGGCTCATGGCCGCGCACTAATTGTGTGTACATGGCCACA + +a +s mr.mrrefChr3 128003 8 + 181019 GAGGCGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578125 8 + 636262 GAGGCGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 53913 8 - 647215 GGGGAGGC + +a +s mr.mrrefChr3 128011 12 + 181019 TCTGAGTCAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578134 12 + 636262 TCTGAGTCAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 53921 12 - 647215 TCATAGCCAAGC + +a +s mr.mrrefChr3 128023 74 + 181019 CTAACCATGTGTACATGGCCGCATTTGCCTTTTATTGGAGCTATGCACGTGGCATGGTGTGAAATATAAACGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578146 74 + 636262 CTAACCATGTGTACATGGCCGCATTTGCCTTTTATTGGAGCTATGCACGTGGCATGGTGTGAAATATAAACGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 53934 74 - 647215 CTAACCGTGTGCGCATGGCCACATTTGCCTGTTATTAGAGCTATGCACATGGCATTGAGTGAAATCTAAACAAT + +a +s mr.mrrefChr3 128097 331 + 181019 ATTTGGGGTTATTGCATCTGACAACTTTGTACTGTTCTTAGACTCATGCTCTAGAGAGGCACTAGCAATCTAGGGTCCTGTACACTGATGAGAGAGTTGTGGCTTCATGTATATATACTGCTTGTAATTGTCTTCATGTTTATGGTGAAGTGTTGACTGCATTGCTGTTTGGCCAGCTAGTGCAGTTCTCACCACAGAGAAACCAAGGAATTTAGACCAGTCTGCGTCAAGCACCCTTTAAGGAAAAAGCAGGTGTTAGTAATGTACAGAACACCCTTTAACTAAGGTGGTTGAGGTTACCAGAAATTCCCTAATTGTAAGGGGTATATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578227 330 + 636262 ATTTGGCGTT-TAGCATCTGACAACTTTGTACTGTTCTTAGACTCATGCTCTAGAGAGGCACTAGCAATCTTGGGTCCTGCTCACTGATGATAGAGTTGTGGCTTCATGTATATATACTGCTTGTAATTGTCTTCATGTTTATGGTGAAGTGTTGACTCCATTGCTGCTTGGCCAGCTAGTGCAGTTCTCACTACACAGAAACCAGGGAATTTAGACCAGTCCGCGTCAAGCACCCTTTAAGAAAAAATCAGGTGTTATTAATGTACAGAACACCCTTTAACTAAGGTGGTTGAGGTTACCAGAAATTCCCTAATTGTAAGGGGTATATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 54008 314 - 647215 ATTTGGGGTTATTGCATCTGACAACCTTCTGCTCTTCTCATACTCATCCTCTAGAGAGGCACTAGCATCCTAGGGTCTTGTACAGTGATGAGAGAGTTGTGGCTTCATGTATATATACTGACTGTAATCGTCTCCATTTCTATGGCAAAGTGTTGATTGTATTGCTGTTTGGCCAACTAATGCAGTTCTCACCATGGAGAAACCAAGGAATTTAGGCCAGACTGCATTAAGCACCCTTTAAGGAGAAAGCAGGTGTTAGTAATGTAAAG-----------------GTGATCAAGGTTCCCAGAAATTCCCTAATTGTAAGGGGCATATGT + +a +s mr.mrrefChr3 128428 226 + 181019 GACTAGGCTCACATCTCTTCTACATTATCCAAGGCCCTGCACTGCATTGCTGAACTGTTAACCATTGTGCCAACTTATTCACCCAGTAAATCTACCTGCACCTTGTTACTGTTATGACCCTTCAGGATGTCCTTTGGAAGCCTCAATTGTCTTAGGATAAGCTAGTATGGTCATACAATCCTCATTAGCACCATGTCTGACAGGTAGCCCTTTTATGATGCATGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578558 218 + 636262 GACTAGGCTCACACCTCTTCTACATTATCCAAGGCCCTGCACTGCATGGCTGAACTGTTAACCATTCTGCCAACTTATTCACCCAGTAAATCTACCTGCACCTTGTTACTGTTATGACCCTTCAGGATGTCCTTTGGAAGCCTCAATTGTCTTGGGATTGGCTAGTATGGTCATAC--------TTAGCACCATATCTGGCAGGTGGCCCTTTTGTGATGCATGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 54322 221 - 647215 GACTAGGCTCACATATCTTCTACATTATCCAAGGCCCTGCACTGCATTGCTGTACTGTTAACCATTGTGCCAACTTATTTACCCAGTAAATCTACCTGCACCTTGTTACTGTTATGACCCTTCAGGATTTCCTTTGGAAGCCTCCATTGTCTTAGGACAAGCCAGTACGATCATACAATCCTCATTAGTACCATGCCTAACAGGTAA-----TTATGATGCATGCA + +a +s mr.mrrefChr3 128654 65 + 181019 TTGTCTAAGCTAGTGGATGTTTCTGCAATTGGAGAAGTCATCGTGGGTTGGTGGCAGCTTAACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578776 65 + 636262 TTGTCTAAGCTAGTGGATGTTTCTGCAATTGGAGAAGTTATCGTGGGTTGGTGGCAGCTTAACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 54545 65 - 647215 GTGTCTAAGCTAGTGGATGTTTCTGCAATTGGAGAAGTCATCATGGGTTGGTGGCAGCTTAACAA + +a +s mr.mrrefChr3 128719 159 + 181019 CTTAAAAATGTTTGGCCATAATTTTATAGGAGTGCTCTCAAAGCTATGCAACACAAATTAAGACACTAACTCAGTTTCCCTGTGATCATGGGTGGCTGTTCCCTCTCTCTTACATGAGGTATATAGAACCAGCATGACACCAACCTCCTATTCACAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578843 159 + 636262 CTTAAAAATGTCTGGCCATAATTTTATAGGAGTCCTCTCAAAGCTATGCAACACAAATTAAGACACTAACTCAGTTTCCCTGTGATCATGGGTGGCTGTTCCCTCTCTCTTACATGAGGCATATGGAATCAGCACAACACCAACCTCCTATTCACAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 54610 156 - 647215 CTTAAAAATATTTGGTCATAACTT-ATAGGAGTGCTCTGAAAGATATGCAGCACAAATTAAGAC--TAACTCAGTTTGCCTGTGATCATAGGTGACTGTTCCCTCTCTCTTAGATGAGGTATATAGAACCAGCATGACAATAAGCTCCTATTCACAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 128878 102 + 181019 GCAATGAGACCTGGTATTTGATCATTTGTATGCTTGTTAGACAACTTTGGTTTCCAGAGGTGCTACTATAGGCGTTAAGTGTCAATTCACTGTGGGGTGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579029 102 + 636262 GCAATGAGACCTGGTATTTGATCATTTGTATGCTTGTTAGACAACTTTGGTTTCCAGAGGTGCTACTATAGGCGTTAAGTGTCAATTCACTGTGGGGTGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 54766 32 - 647215 ACAATGAGACCTGGTATTTGATCATCTGTATT---------------------------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr3 128980 173 + 181019 TTCTGTAAGAGGTATGTTGTTCAGAATGTAGTATGGATCCTTGGCGGTGTAAATCACCTGGGGGCTCATTCTCATGGTGACTCAACTGGATGCAATATATAGGCTCCCATAATAGATCCCTCATAATACAGATTGGATTGGTCCAAGCAACCTCTCTGGTATCCATAAGGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579132 169 + 636262 TTCTGTAAGAGGTATGTTGTTCAGAATGTAGTATGGATCCTTGGCGGTGTAAATCACCTGGGGGCTCATTCTCATGGTGACTCATCTGGATGCATTATATAGGCTCCCACACTAGATGCCTCA----ACAGATTGGATTGGTCCAAGCAACCTATCTGGTATCTATAAGGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 54798 132 - 647215 -------------------------------------TCCTTGGTGGTATATGTCACATGTGGGCTCATTCTCATGGTGAGTCAACCGGATCCAATGTATAGGCTCCTATAATAAATCCCTCATAATACAGATTGGATTGGTCCAAGCAAC-TCTCTGGTACCCATAAGG--- + +a +s mr.mrrefChr3 129153 155 + 181019 TCTATGGCCCAGTTTATGCAATGTTTCAGCCATCGTCACTTAGCATTTTCATTCAAAACCATGTGTTAAATCAGCTTACTAAGCTGTTATGCAAAGATAATAACATTCAATAAGTGGGTCTTAAATTATAATCTCATGTTCCCCAAACCACAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579332 155 + 636262 TCTATGGCCCAGTTTATGCAATGTTTCAGCCATCGTCACTTAGCATTTTCATTCAAAACCATGTGTTAAATCAGCTTACTAAGCTGTTATGCAAAGATACTAACATTCAATAAGTGGGTCATAAATTATAATCTCATGTTCCCCCAACTACAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 54930 72 - 647215 -----------------------------------------------------------------------------------CTGTTATGCAAGGATAATAACCCTCAATTCGTGGGTCTTAAATTATAATCTCATGTTCCCCAAACCACAACA + +a +s mr.mrrefChr3 129308 119 + 181019 TTCTTAGCCAGCCATTGGTAACGATTTAGCAATACACTTCAAGGATTATAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACAGATGCATGGTAACATTTCAGCTTTACAGTGGTTGGAGTGACAGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579487 119 + 636262 TTCTTAGTCAGCCATTGGTAACGATTTAGCAATACACTTCAAGGATTATAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACAGATGCATGGTAACATTTCAGCTTTACAATGGTTGGAGTGACGGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 55006 119 - 647215 TTCCTATCCAGCCATTGGTAACGATCTATCAATAAACTTCAAAGATTTCAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACCGACGCATGGTAACAGTTCAGCTTTACAGTGGTTGAAGTGACAGTTC + +a +s mr.mrrefChr3 129427 76 + 181019 CCATCTTCTGCATGTTGACTACTCCCATACTAGAGAGTCCAGGGGAGATGATGACAGAGTGGCTAGAATTGTGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579609 76 + 636262 CCATCTTCTCCATGTTGACTACTCCTATACCAGGGAGTCCAGGGGAGTTGATGCCAGAGTGGCTAGAATTGTGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 55125 76 - 647215 CCATATTCTGCATGTTGACTACTCCCATATTAGAGAGTCCAGGCAAGATGGTGACAGGGAGGATAGCATTGTAGGG + +a +s mr.mrrefChr3 129503 128 + 181019 CACTATGGGTTGTTTTCGAGCCATAGTACTTTGTCTTTATAAGTTTTTTGGTGTAAACAAGAGAGTGTCAGATTGTGGGTACAGCGTAAAAGATAGTGCCCTGCTGGTTTATACTTGATGATAGAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579686 128 + 636262 CACTATGGGTTGTTTTCAAGCCATAGTATTTTGTTTTTATAAGTTTTTTGGTGTAAACAAAAGAGTGTCAGACTGTGGGTACAGCGGAAAACATGGTGCCCTGCTGGTTTATACTTGATGATAGAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 55201 124 - 647215 CACTATGGGTCGTTTTTGAGCAATAGCACTTTGTCTTAATAACTTTTTTGGTGTAAACCAGAGAGTGTCCAATTGTGGGTACAGGGTAAAAGATAGTGCC----TGGTTTATACTTGATGCCCACCCA + +a +s mr.mrrefChr3 129631 107 + 181019 CCCTTTTATATCTAATCCTGTATTACTTCAGCCTGTTGAAAACCTAGCCCATTTATTAAGTTATGGTTCTGTCCATTGTATTATGGGGAACTACTTTTCTAATGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579814 107 + 636262 CCCTTTTATATCTAATCCTGTATTACTTCAGCCTGATAAAAACCTAGCCTGTTTGTTAAGTTATGGTTCTGTCCATTGCATTGTGGGGAACTATTTTTCTAATGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 55326 107 - 647215 CCCATTTATATCCAATCTAGTATTACCTCATCCTATTGAAAACCTAGCCCATTTATTCAGTTATGGTCCTGTCCATTGTGTGATGGGGAAATACTTTTCTAGTGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 129738 27 + 181019 GTGACTAACGTTTTTTTTATTGACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579921 27 + 636262 GTGACTAACGTTTCTTTTATTGACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 55483 27 - 647215 ATGACTATTGTTTTTTATATTGACACA + +a +s mr.mrrefChr3 129765 285 + 181019 CATCTTGAGATTGACCTTTTACACATGGATAAACTTAGTAATTAGCAGTTACACACCTAATATCCAGGCTGATCTAAGTTCTCTGTGGAATCTTCACTTAGTTAGGTGAATAACAATGACACAGGTAGAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTGTTCTAGTCTGGAGATCAGCTACCATGTTACCTCACTCATACCAACCCAAGAGTTGAGGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGTGGACCAAGGTATAGCTAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579948 280 + 636262 CATCTTGAGATTCACCTTTTACACATGGATAACTT----AATTAGCAGTTACACACCTAATATCCAGGCAGATCTAAATTCT-GGTGGAATCTTCACTCAGTTAGGTGAATAACATTGACACAGGTCAAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTATTCTAGTCTGGGGATCAGCTACCATGCTACCTGACTCATACCAACCCAAGAGTTGAAGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGTGGACCAAGGTATAGCCAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 55515 285 - 647215 TATCTTGAGATTGCCCTTTTACACTTGGATAAACTTAGTAATTAGCAGTTACATGCCTAATATCCAGGCTGATCTAAGTTCTCTATAGAATCATCACTTGGTTGGGTGAATAACTATGACCTAGGTAGAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTGTTCTAGTCTGGAGATCAGCTACCATGTTACCTCACTCATACCAACCCAAGAGTTGAGGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGCGGACCAAGGTATAGGTAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 130050 98 + 181019 AATTTTAGAAATTCATTATGCCCTTTCGGCTTTTTATATCTGCTACTATTTCCCGAGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580228 98 + 636262 AATTTTAGAAATTCATTATGCCCTTTCGGCATTTTACATCTGCTACTATTTCCCGAGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 55804 95 - 647215 AATTATAGAAATTCATCATGTGCTTTCAGCTTTGTATACCTGCTA---TTTCCCGGGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 130148 433 + 181019 CCAAACCGCCTGCATCAAGTTTGGTTAGAGCCTGAGGGTATGGATTCAGAGCTTATATATCCTCAAGGGCTATCTATGACACTGCCCTCTGATTTACAGAAGAAGATGATTACATGTAACCGGGGCCTCGAGAAAGCCAAAGTCATTCAGCCAGGTAAGTTCCAGAAGAACATTTGATACAACAACAGCGGTAGTTTAATAGGATTATGTTTAGCTCAACAACAAAAACACAGAGACACTTGTAGCCAATAACCCCCCCTTTGTTAAACTGTTAAACTCACATGTCGTGCAGAAGCTAAGATGGAGTATTATTTTTATTGCCCAAGATGGAGTGTAATGGTGCAATAGGCCTGGCATACCATAAGCTCCCCCTGCCTGGTACCTAGACTTCACTTGTTACAATGAGGCTAGAAGGAACACAGACTTCCTGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580329 433 + 636262 CCAAACCGCCTGCATCAAGTTTGGTTAGAGCCTGGAGGTATGGACTCAGAGCTTATATATCCTCAAGGGCTATCTATGACACTGCCCTCTGATTTACAAAAGAAGATGATTACCTGTAACCGGGGCCTCGAGAAAGCCAAAGTCATTCAGCCAGGTAAATTCCAGAAGAACATTTGATACAACAACAGCGATAGTCTAATAGGATTATGTTTAGCTCAACAACAAAAACACAGAGATACTTGTAGCCAATAACCCCCCCTTTGTTAAACTGTTAAACTCACATGTTGTGCAGAAGCTAAGATGGAGTATTGTTTTTATTGCCCAAGATGGAGTGTAATGGGGCAATAGGCCTGGCGTACCATGAGCTCCCCCTGCCTGGTACCTAGACTTCAGGTGCTACAATGAGGCTAGAAGGACCACAGACTTCCTGTCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 55899 420 - 647215 CCAAACCGGCTGCATCAAGTTTGGTTAGAGCCTGAGGGGATGGATTCAGAACTTATATATCCTCAAGGGCTATCTATGACACTGCCATCTGATTTGCAGAAGAAGATGATTACATGTAACCGGGGCCTCGAGAAAGCCAAGGTCATTCAGCCAGGTAAGTATCAGAAGAACAATTGATACAACAACAGTGGTAGTTTAATAGGATTATGTTTAGCTCTATAACAAAAACACAGAGACACTTGTAGCCAATAACCCCGCCATTGTTTAA-------------ACCGCGTGCAGAAGCTAAGATGGAGTATTATTTTTATTGCCCAAGATGGAGTGTAATGGTGCAATAGGCCTGGCATACCATAAGCTCCCCCTGCCTGGTACCTGGACTTTACTTGTTACTATGAGGCTACAAGGAACACAGACTTCCTGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 130581 32 + 181019 GGTGTACTGTCATAGAAATTGTATAAGACTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580763 32 + 636262 GGTGTACTGTCATAGATATCGTATAAGACTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 56319 32 - 647215 GGTGTACTGTCATAGAAAGTGTTTAAGTCTCT + +a +s mr.mrrefChr3 130613 63 + 181019 CATCCAAATCTTAAAACACCATATAATGCTGTCTAAATTGGTGAGAATAAAGGATAACACCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580795 60 + 636262 CATCCAAATCTTAAAACAC---ATAATGCTGTCTAAATTGGTGAGAATAAAGGATAACACCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 56352 63 - 647215 CATCCAAATCTTTAAACACCATATAGTGCCGTCTGACTAGGTGAGAATACAGGATAGCACAAC + +a +s mr.mrrefChr3 130676 97 + 181019 ACTCCTCTGTGCAACCTACTTGAGGTTCAATTTATCTTCATGTTCAAAGTATAATTCAAAAAAAGTGAGTTGTGAGGAGCTTGCATGCAAATGTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580855 97 + 636262 ACTCCTTTGTGCAACCTACTTGAGGTTCAATTTATCTTCATGTTCAAAGTATAATTCAACAAAAGCGAGTTGTGAGGAGCCTGCATGCAAATGTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 56418 97 - 647215 CCTCCTCTGTGCAACATACTTTAGGTTCAATTGATCTTCATGTTGAAGGTATAATTCAAAAAAAGTGAGTTGTGAGAAGCTTGCCCACAAATGTTAA + +a +s mr.mrrefChr3 130773 404 + 181019 AAAATACTTTGCCTTACCTAGATTAATCCTTCCCTAATGTCTTTGCTCTTGAAGAATGAGGGTCTGCGGTCCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCAACCCCTCTTTAGAGGCACATCTGTTGCAACGACTTTTCTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACTACCAGCTACAAGGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTGGTTAACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCTGCTGTGCTGTTTTATAAACATTGGTACAGGTCTGTCTATAACAAGTCAACTGAGTCCTTTGTACTCAGATCAGTTCTGGCTTGACATTGTGGTTGTGTTGATTTTCTGTATAGTAATGATACCTGCTCTTAAAATAACCTTCTGCAATCCCCATTCTAAGCAAGCAGGAATAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580952 402 + 636262 AAAATACTTTGCCTTACATAGATTAATCCTTCCCTAATGTCTCTGCTCTTGAAGATTGAGGGTCTGCGGTTCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCAACCCCTCTTTAGAGGCACATCTGTTGCAGCGACTTTTCTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACTACCAGCTACAAGGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTAGTTGACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCTGCTGTGCTGTTTTATAAACATTGGTACAGGTCTATCTATAACAGGTCAACTCAGTCCTTTGTACTCAGATCAGTTCTGGCTTGACATTGTGGTTGTGTTGATTTTCTGTCTAGTAATGACACCTGCT--GAAAATAAACTTCTGCAATCCCCATTTTAAGCAAGCAGGAATGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 56518 403 - 647215 AAAATACTTTCCTTTACCTAGATTAATCCTTCCTTAATGCCTTTGCTCTTGTAGAAGGAGGGTCTGCCGTCCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCATCCCCTCTTTAGAGGCCCAACTGTTGCAACGACTATTTTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACAACGAGCTACAAAGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTGATTAACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCGGCTGTCCAGTTTTATGAATGTCGGTACAGGTCCGTCTGTAACAAGTCAACTGAGTCATT-GTACTCAGTTCAGCTTTGGCTTGAAATTGTGGCTCTATTGATTTTCTGTATAGCAATGATGCCTGCTCTTAAAATCACCTTCTGCAATCCCCATGCTAAGCAACCAGGAATAGGC + +a +s mr.mrrefChr3 131177 28 + 181019 AACCACCTGGGCCAATCTAGTCCTAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581354 28 + 636262 ACTCACCTGGGCCAGTCTAGTCCTGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 56928 28 - 647215 AACCACCTGGGCCAATTTTGTCCTAAGG + +a +s mr.mrrefChr3 131205 51 + 181019 AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCATAGGAACTATTGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581383 51 + 636262 AAACAAACTACCCAACTGCTCTTATACCATGATCATAGGAACTATCATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 56956 51 - 647215 AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCACTGGAACTATTGTGTG + +a +s mr.mrrefChr3 131256 34 + 181019 TCGTATCTCTGCAGATCTAACTGTTCAGAACCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581439 32 + 636262 TCGCATCTCTGCAGATCTAACTGTT--GAACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57007 34 - 647215 TCGTAGTTCTACAGATTTAACTGTTCAGTACCTG + +a +s mr.mrrefChr3 131290 130 + 181019 CATTACATTCCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCTCCAGGCTTGAATGATCGGGTGGTAGCGAAGGATTGTTTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581471 120 + 636262 CATTACATTCCCTTGCACTCTGTA----------ATCAACCACAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCTGAATAATCCTATATCGTATAGCTCCAGGCTTGAATCATTGGGTGGCAGCGAAGGATTGTTTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57044 130 - 647215 TATTACGTTTCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATTGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCGCCAGCCTTAAATGATCTGGTGGTGACTAAGGATTGTTTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 131420 157 + 181019 CTGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGGCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCTAGTGCCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGCGTAAGCTGGAAACATTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581637 157 + 636262 CCGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGCCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCCAGTGCCACTGAGGGGGTATCTTAACAGTATGCGTAAGCTGAAAACATTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 57174 155 - 647215 CTGAATTT-ACCACAACACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAATTGCCAATGCATGGCAGCCCC-TGCTAACGGTAGGGGGGAATGAATGCACAGGTACCTATTGTCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGTGGAAGCTGGAAACATTGG + +a +s mr.mrrefChr3 131577 51 + 181019 AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTATTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581794 51 + 636262 AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTGTTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57330 51 - 647215 AATCCCAATTCTAACACCACTGGATTAATTGGGTAAGTTTTAATGGGGAAG + +a +s mr.mrrefChr3 131628 58 + 181019 ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581845 58 + 636262 ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 57382 57 - 647215 GGCTTCAAGACGTAATTCTGACTTCAT-GAGAAGAGATTATAGTCAACCTTCCCACTT + +a +s mr.mrrefChr3 131686 104 + 181019 ACATAGAACTATTTCACACCCTCATGTACTTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACCCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581903 104 + 636262 ACATGGAATTATTTTACACCCTCATGTACCTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACGCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 57443 104 - 647215 ACATAGAACTATTTCACAAAATAATATACTTTGGATTCATGGAGGTATACATGACCCTCTTTAATACTGAGGGCACAAAAGCTTGTGAAAATTAGTACCACCCC + +a +s mr.mrrefChr3 131790 231 + 181019 CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCAAGGCCGTGTATGCGCTCAGTAATACCTAACAGCTACCCTTATCCCAAATAAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582007 230 + 636262 CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTGACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCTAGGCCGTGTATGCGCTCCGCA-TACCTAACAGCTATCCTTATCCCCAATAAGGCAACCAGTCCCCATTGAGAGCACACCGGATACTCTGGAAAGCTCTCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 57548 228 - 647215 CTGAGAAGAGAGGTCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTACAGCCAGGGCACAACCAGGGTAGTGGAGGGAAATGCAAGGCCATGTATG---TCAGTAATGCCTAAAAGTTACCCTTAGCCGAAATGAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAAGCCCCCAAGAGACATCATGCAGGAAGATCAGCCCTTCTAAGGCCATATGAAAAT + +a +s mr.mrrefChr3 132021 679 + 181019 CAATCCTTTGTTGAATATGCACACTAACTGGCTCTTTGATTGTTGTCCCAGCATCTGGTATTATTACACTGAGGAGACTATAGTATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCCAGCTGTTCAGGTGGCCAAGTGTCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCAATGCCAGTTTACGGGTTAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATTAGCCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTGATTGATGGTGTTCCCACACTGGGCACCAGTGAACCCTATTGCATGTTTGCAAGCTGGGTTGAATTCCGTTTGTCACTGCACCCTGATAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCGTCAGGAGTGAACATATTATTCTGAATGACATTTCAGTAAATTTATATCTATTTTGTGAAGAATAAAGACATTTTTCTATCTGATAGTGTTCTGCATTGCACTCTCGACTTCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCAGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAAGAAGGAATATCAGTGTTAAGGTCTATTGAATTTTTCAGTTCAAGGTGGAACAAATTGGTTCCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGTAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAAATCTCTATAAAGAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582238 679 + 636262 CAATGCTTTGTTGAATATGTACACTAACTGGCTCTTTGATTGTTGTGCCAGTGTCTGGTATTAATACACTGAGGAGACTATAGTATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCTAGCTGTTCAGGTGGCCAAGTGCCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCAATGCCAGTTTACGGGTTAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATCAGCCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTCATTGATGGGGTTCCCGCACTGGGCACCAGTGAACCCTATTACATGTTTGCAAGCTGGGTTGAATTCCGTTTGTCGCTGCATCCTGATAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCGTCAGGAGTGAACATATTATTCTGAACGACATTTCAGTGAATTGATATTTATTTTGTGAAGAATAAAGGCATTTCTCTATCTGATAGTGTTCTGCATTGCATTCTCGACTCCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCGGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAGGATGGAATATCAGTGCTAAGGTCTATTGAATTTTTCAGTTCAAGGTGGAATAAATTGGTTCCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGTAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAAATCTCTATAAAATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 57776 676 - 647215 CAATCCTTCGTTGAATATGCAGACCAACTTGCTCTCTGATTGTCATCCCAGCATCTGGTATTATTACACTGAGGAGACTATAGCATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCCAGCTGTTCAGA---CCAAGTGTCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCATTGCCAGTTTACGGGTGAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATTAGTCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTGATTGATGGTGTTCCCACACTGGGCGCCAGTGAACCCTATTGCATGTTCACTAGCTGGGTTGAATTCTGTTTGTCACTGCACCCTGACAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCATCAAGAATGAACATATTAGTCTAAATGACATTGCTGTAAATTTATACCTATTTTGTGAAGAATACAGACATTTTTCTAACAGATGGTGTTCTGCATTGCACTATCAACTTCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCAGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAAGAAGGGATATCAGTGTTAAGATCTATTGAATTTTTTAGTTCAAGGTGGAACAAATTGGTACCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGCAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAATTTTCTATAAAGAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 132700 9 + 181019 GTACCCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582920 9 + 636262 GTACCCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 58452 9 - 647215 GTACCATGG + +a +s mr.mrrefChr3 132709 16 + 181019 AGTCATGCTTGTATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582929 16 + 636262 AGTCATGCTTGTATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 58462 16 - 647215 AGTAATGCTTGTATTA + +a +s mr.mrrefChr3 132725 205 + 181019 TTCACCTGTACAGTCCCTCAACCAATATCTGGCTAAAGGAGTAAACCTCCCCTCTTTTCAAGCAGCATACCATACTAATGTGATGGCTCTCTTGTCTCTTTAGCAACAAGGGCTGCAAGTGATCCCCTAGATCTTTCATGGCTATGTACAAGGGTTATTTTTACACCTACTTAGTCACCTTCATGGCAGCTTCTAACCTCTAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582946 205 + 636262 TTCACCCGTACAGTCCCTCAACCAATATCTGGCTAAAGGAGTAAACCTCCCCTCTTTTCAAACAGCATACCGTACTAATGTGATGGCTCTCTTGCCTCTTTAGCAACAAGGGCTGCAAGTGACTCCCTAGATCTTTCATGGCTATGGACAAGGGTTATTTTTACCCCTACTTACTCACCTTCATGGCAGCTTCCAACCTCTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 58478 195 - 647215 TTCACCTGTACAGCCCCTCACCCAATATCTGGT----------AACCCGCCCTCTTTTCAAGCAGCATACCATACTAATGTGATGGCTTTCTTGTCTCTTTATCAACAAGGGCTACCAGTGATCTCCTAGAGCTTTCGCGGCTATCTACAAGGGGCATTTTAACACCTACTTAGTCACCTTCATGACAGTTTCTAACCTGTACTT + +a +s mr.mrrefChr3 132930 60 + 181019 TTTGTACCTCTTTGCAAAGTTAGTCCCTACCAATTGACAACTCTTAGACTACAGAACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583152 60 + 636262 TTTGTACCTCTTTGCAAAGTTAGTCCCTACAAATTGACGACTCTTAGACTACAGAACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 58673 60 - 647215 TTTGTACCTCTTTGCAAGGTTAGTGCCAACCAATGGGCAACCCTTAGACCACAGAACCTT + +a +s mr.mrrefChr3 132990 33 + 181019 GTCCTTTACACCCATGTCACCTTTAGTTGAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583212 33 + 636262 GTCCTTTACACCCATGTCACCTGTAGTTGAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 58735 33 - 647215 GTCCTTTACACCCATGTAGCATTTAGTTGAATC + +a +s mr.mrrefChr3 133023 74 + 181019 TGGCAATGAAGTCACAAAGGGGGGGCAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGAGGGGTAGCAGCGACTCAGCCCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583246 74 + 636262 TGGCAATGAAGTCACCAAGGGGGGGCAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGAGGGGTAGCAGCGACTCCGCCCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 58768 69 - 647215 -----ATGAAGTCACAAAGGGTGGGTAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGGGGGGGGGTAGGGACTCAGCCCCTG + +a +s mr.mrrefChr3 133097 21 + 181019 AAATTAACTATTACAGCCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583320 21 + 636262 AAATTAACTGTTACAGCTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 58838 21 - 647215 AAACTAACTATTACTGCCTCC + +a +s mr.mrrefChr3 133118 70 + 181019 TTGGGCCTTGACTGTGTGACACAATGGCCCACCCTGTTAGCAGATCTTACCAACTACCCTCTTGATTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583341 70 + 636262 TTGGGCCTTGACTGTGTGACACAATGGCCCACTCTGTTAGCAGATCATACCAACTACCCTCTTGATTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 58860 61 - 647215 TTGGGCCTTGACTGTGTGACACAATGGCCCACCCTGTTAGCAGATCTTACCTGCTACCCTC--------- + +a +s mr.mrrefChr3 133188 288 + 181019 AAAACCTAGAAATTAAGGGAATTGCAGATGTTAGTCTTTAGAATGGACCAGGAAGTGATATGTAAACTGCCCCTCCCCATGCAGGAATGACCACACCTACCCTGTCTTATCCAGCAATAAGAAGTCTGTGGCACACAGTTTCTGAAAGGGGAATGGAAATTTCCACTCCTCGACACCCTGATCATGAAGGTTGCACCACCCATCTCTTAAAGGATCCCATAATCCAATAGAATTGGTCAGTTATACTAGTCAGGTTTAAGAATGGGACCCTGTGCCAGGTGCAGCGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583413 282 + 636262 AAAACCTAGAAATTAAGGGAATTGCAGATGTTAGTCTTTAGAATGGACCAGGAAGTGATATGTAAACTGCCCCTCCCCATGCAGGAAC--CCGCACCTACCATGTCTTATCCAGCAATAGGAAGTCTGTGGCACACAGTTTCTGAAGGGGGAATGGAAATTTCCACTCCTCGACACCCCGATCATGAAGGTTGCACCACCCATCTCCTAAAGGATCCCATAATCCAATAGAGTTGGTCAGTTATTCTAGTCAGGTTTAAGAATGGGACCCTGTGC----TGCAGTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 58921 264 - 647215 ------------------------CAGTTGCTAGTCTTTAGAATGAACCAGGAAGTGATATGTAAACTGCCCCTCCCCATACAGGAGTGACCAAACCTACCCTGGCTTATCCAACAATAAGAAGTCTGTGGCACACAGTTTCTAAAAGGGGAATGGAAATTTCCACTCCTCTACACCCTGATCATGAAGGTTGCACCACCTATCTCTTAAAGTAGCCCAAACTTCAATAGAATCAGTCTGTTATACTAGTCAGGTTTAAGAATGGGACCCTGTGCCAGGTGCAGCAGC + +a +s mr.mrrefChr3 133476 24 + 181019 GGTACTAATACGGTCAAAGTTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583745 24 + 636262 GGTACCAATACGGTCAAAGTTCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 59185 6 - 647215 TATCCT------------------ + +a +s mr.mrrefChr3 133500 61 + 181019 TCAGGTGCAGTGACTACCCTTCCTGTCTCTCATCTTGTCTCATCCAAGTTTACTACATGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583772 61 + 636262 TCAGGTGCAGTGACTACCCTTCCTGTCTCTCATCTTGTCTCATCCAAGTTTACTACATGTC + +a +s mr.mrrefChr3 133561 5 + 181019 TGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583844 5 + 636262 TGCAC + +a +s mr.mrrefChr3 133566 461 + 181019 TTCCACATTAGAGATTTATGTATGGTGCCTCAATAAACATTTTCACATTGTTACTCCAAACTGCGCTGGTCAGACCACAGTATTCTAGCTCACCAATTCCAGACAATTCCACTAAAGACTTTATAAGCCACCACTAGACCATATCAGCTACTCACCTCCCTTTCAGAGAGACAGTTTGTAAAACCTGACTAGTGAACTGGTTAAGCCAATTCCAGTGTAGTGGTCCTCAAATGCCCAATTCTGATTATCGCTAATATAGGTATAAACTAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATTACCTATAAGTGCACCTACATGGAGTAAATGTAGTTGGAGGTGAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTTTCAATCATCAGTAAATTTTAGGAGATGTGTATTCACCAAACCCTATTACATATGCATGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATTTAGGTACAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583857 460 + 636262 TTCCACATTTGAGATTTATGTATGGTGCCTCAATAAACATTTTCATGTTGTTACTCCAAACTGAGCTGGTCAGGCCACAGTATTCTAGCTCACCACTTCCAGACATTTCCATTAAAGACTTTATAAGCCACCACTAGACTATATCAGCTACTCACCCCCCTTTCAGAGAGACGGTTTGTAAAACCTGACTAGTGAACTAGTTAAGCCAATTC-AGTGTAGTGGGCCTCAAATACCCAATTCTGATTATCACTAATATAGATATAAACTAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATGACATATGAGTGCACCTATATGGAGCAAATGCAGTTAGAGGTGAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTATCAATCATCAGCAAATTGTGGGAGATGCGTACTCACAAAACCCTCTTACATATGCCTGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATTTAGGCACAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 59191 443 - 647215 -TCCACACCACAGATTTC---------CCTCAGTAAACATTTTCACATTGTTACTTCAAACTGCACTGGTCAGACCATAGCATTCTTGCTCACCAATTTCAGACAATTCCACTAAAGACTTTATCATCCACCACTAGACCATATCAGCTGCTCACCTCCCTTTCAGAGAGCCA-TGTGCAAATCCTGACTAGTGGACTGGTTAAGCCAATTCCAGTGGAGAGGTGCTCAAATGC-------TGGTTATTGCTAATATAGGTATAAACCAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATTACCCATAAGTGCACCTACATGGAGTAAATGTATTTGGAGGTAAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTTTCAATCATCAGTGAACTTCAGGGGAGGTGTATTCACCAACCACTATTACATATGCAGGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATCTAGGTGTGTA + +a +s mr.mrrefChr3 134027 14 + 181019 TTCACCACAAGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 584317 14 + 636262 TTCACCACAAGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 59754 14 - 647215 TTCACTACAAGAGT + +a +s mr.mrrefChr3 134041 360 + 181019 TGCTATTTGCATCAGTAACTAGATGACATATGAAATGAGGTAAAAGGAATATCCAATATGTGTTTTCACTGGTGGCAACTTCAAAGAAGCCAAGCATCCTGGTTTTGATGGCATGCTCTGATGTTTTCTGGGCTGGGGACTTGGATGCTCAGATGGTTCTTATGATGTACCCAGTAATTTGACAAAGCCTCCGAACCCTGTTAACTTTTATAATCCCTCACCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCCAATCAGATAAGAGAAAAAATATGGACAGCATTGTCTAACTAAGAAAGAAAAGAATACTGAAACAGTTTCATTGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 584431 360 + 636262 TGCTATATGCATCAGTAACTAGATGACATATGAAATAAGGTAAAAGGAATATCCAATATGTGTTTTCAGTGGTGGCAACTTCAAAGCAGCCAAGCGTCCTGGTTTTGATGGCATGCTCTGATGTTTTCTGGGCTGGGAACTTGGATGCTTGGATGGTTCTTATGGTGTACCTAGTAATTTGACAAAGCCTCCGAACCTTGATAACTTTTATAGTCCCTTGCCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCCAATCAGATGAGAGAAAAAATATTGACAGCATTGTCTAACTAAGAAAGAAAAGAACACTGAACCAGTTTCATTGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 59768 354 - 647215 TGCTGTTTGCATAAGTAACTAGATGACATATGAAATGAGATAAAAG-AATACCCAATGTGTGTTTTCACTGGTAGTAACTACAGAGAAGCCAGGCATCCCGGTCTTGATGGGGTGCTTCAATCTTTTTTGGGCTGGGGACTTGGATGCTCAGATGGTACTTATGATGTACTCAGTAATTTG-----GCTTTCAAACCCTGTTAAGTTTTATAATCCCACACCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCAAGTCAGATAAGAGAAAAAATATGGACAGCATTGTATAACTAAGAAAGAGAAGCATACTGAAACAGTGTCCTAGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA + +a +s mr.mrrefChr3 134401 354 + 181019 GCTGTGATAGGTATCTGTAAAAGAGCCCAGACATTTGTCTATCACCTCTGACAATATTTGAGGTCTGCCATATGCAATACCCGCCCACTGATATTAACTTCTGAATTGATTAAACAATGATTAACTAAAGTGATCGAGCTTACCATTGATTAGCTCAGGTATATCGGGTAGAGGATTGTTTGGTGCAAGTATCTACAGGCTGACCAATTTGGGGTAATTGTAATCAATGGGACAGGTGGCTCCATTAACTAATGCATGGTTCACACATCACATGTAAAAAAAAGAAGAATGCCATTTCACCTAGAGTACTACCTGAGTGATGGGTGATTGATTGTTACAAGTATTAATAGATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 584794 347 + 636262 GCTGTGATGGGTATCTGTAAAAGAGCCCAGACATTTGTCTATCACCTCTGACAATATTCGAGGTCTGCCATATGCAATACCCGCCCACTGATATTAACTTCTGAATTAATTAAAGAATCATTAACTAAAGTGATCGAGCCTAGCATTGATTAGCCCAGGTATATTGGGTAGAGGATTGTTTGGTGCAAGCATCTACAGGCTGACCAATTTGGGGTAATTGTAAACAATGGGAGAGGTGGCTCCGTTAAGTAATGTATGTTTCACACATCACATCTAAAAAAAAGAACAGT-------CACCTAAAGTACTACCTGAGTGATGGGTGATTGGTTGTTACAAGTATTAATAGATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 60122 351 - 647215 GCTTTGACAGGTATCTGCAAAAGAGCTCAAACATTTGTCTATCACCTCTGACAAT---TGGGGTCTGCCATATGTAATACCAGCCCACTGATATTAACTTCTGAATTGATCATACAAAGATTCACTAAACTGAGTGAGCTTACCATTGATTAGCTCACGTATATCGGGTGTAGGATTGTTGGGTGCAAATATCTACAGGCTGACCAATATGGGGTAATTGCAATCAGGGGGACAGGTGGCTCCATTAACTAATGCATGGTTCAGACATCACATGTAAAAAAAAGAAGAATGCCATTTCACCTAGAGTACTACCTGAGTGATGGGTGATTGATTGTTACAAGTATTAATAGATGA + +a +s mr.mrrefChr3 134755 294 + 181019 CTTCTAGTGGCAAGCTATGAGGCTTATTTCAACCCTTAATCCAGGCAGAGATGCGCTTGTTTGATCTACTGACTATTGACACTGTTAAAATCAGCATGATTGGGCGACCGATGAAACACTGCAGATGTGGTCTCTAATAATGTACAAGGCTCTATAGCAGTCAGATATTACTCAATTCCTCAGGCTGCACAGTTCACCTACAACTGATGTCACACATGCACACACCATGAAAGCTCTGGGGTATATAAGTAGGTAAGGAGGAATGCAATCCCTGATAGTGAGAGCCTAGATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585141 293 + 636262 CTTCTAGTGGCAGGCTATGAGGCTGATTTCAACCCTTAATCCAGGCAGAGATGCGCTTGTTTGATCTACTGACTATTGACACTGTTAAAATCAGCATGATTGAGCGACCGATGAACCACTGCAGATGTGG-CTCTAATAATGTACAAGGCTCTATAACAGTCAGATGTTACTCAATTCCTCAGGCTGCACAGTTCACCTACAACTGATGTCACACATACGCACACCACGAAAGCTCTGGGGTATATAAGTAGGTAAGCAGGAATGCAATCCCTGATAGTGAGAGCCTAAATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 60474 294 - 647215 CTTGTAGTGGCAAGCTATGAGGCTTTTTTCAACCTTTAATCCAGGCTCAAATGCACTTGTTTAATCTACTGAGTATTGGCACTGTTAAAAACAGCATGACTGGGCAACCAATGAAACACTGCAGAGGTGGTCTCTTATAATGTACAAGGCTCTATAGTAGTTGGATATCGCTTGATTCCTCATGGTTCCCAGTTCATCTACAACTGATGTCACACATGCAAACACCATGAAAGTTCTGGGGTATATAACTAGGTTAGGAGGAATACAATCCCTGATAGTGAGAGCCTAGATCAA + +a +s mr.mrrefChr3 135049 92 + 181019 CTAGCACAAGGGCACCCAGTACCATAATATTTGGGTCTCTTAGGTAGTTATGACAACCCCCTAAACTTTTTGCAAATATGTGGGTCTTCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585434 91 + 636262 CTAGCACAAGGGCACCCAGTACCATAATATTTGGTTCTCTTAGGTAGTTATGACAACTCC-TAAACTTTTTGCAAATATGTGCGTCTTCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 60769 91 - 647215 CTAGCACAAGGG-CTCCAGTACCATAATACTTGGGTCTCTTAGGTAGCTATGACAACCCCCTAAACTTTTCACAAATATGTGGGTCTCCATG + +a +s mr.mrrefChr3 135141 34 + 181019 TTTGGTCTAACATCTTATCATGCCGATATGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585530 34 + 636262 TCTGGTCTAGCATCTTATCATGCCGATACCAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 60860 34 - 647215 TTTGGTCTAACATCCTAACATGCCCATGTGGATT + +a +s mr.mrrefChr3 135175 154 + 181019 CCATTACTCCAGGGGTATCTTATATCTGACTTATTTGTGAGTCTGCTAATTTCCGTTGGCTCTGGAGATTTGCGTAAGTAATATCTCTCATATGTTCACTATAGGCCACAGTTATAACTGTAGCCCCTACATCAGATGGCCCCTATCTGTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585564 140 + 636262 CCATTACTCCAGGGGTATCTTATATCTGACTTATTTGTGAGTCTGCTAATTTCCGTTG--------------CATAAGTAATATCTCTCATATGTTCACTATAGGCCACAGTTATAACTGTAGCCCCTACATCAGATGGCCCCTATCTGTTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 60910 154 - 647215 CCAGTACTCCAGGGGTATCCTGTATCTGATTTATTTGTGAGTTTGCTAACTTCTGTTGGCTCTGGAGATTTGCGTAAGTAATATCTCTCATAAGTTCACTATAGACTATAATGATAACGGTAGCCCCTACATCAGATTGCCCCTATCTGTTGCA + +a +s mr.mrrefChr3 135329 17 + 181019 CCTCTTTGTCAGACCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585705 17 + 636262 CCTCTTTGTCAGACCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 61064 17 - 647215 CCTCTTTGTCAGATCGG + +a +s mr.mrrefChr3 135346 64 + 181019 TTGTCTCACTATTGGATCACCGGCATCAATTGCACCAAGGATATGGATTGCATGCCTGTTTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585722 64 + 636262 TTGTCTCACTATTGGATCACCGGCATCAATTGCACCAAGGATATGGATTGCATGCCTGTTTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 61082 64 - 647215 TTGTCTCACTGTCAGACCACCAGCATCAATTGCAATAGGGGTTTAGAGTGCATGCCTGTTTGTC + +a +s mr.mrrefChr3 135410 69 + 181019 TCTGAGGTATGCCAATTTAACCTAGTCATATGTGTTGCACTAGCAAGCTTCAATTTTAGTACCCTCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585789 69 + 636262 TCTGAGGTATGCCAATTTAACCTAGTCATATGTGTTGCACTAGCAAGCTTCAATTTTAGTACCCTCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 61146 69 - 647215 TCTGAGGTATGCCAAGTTAACCCAGTCATATGTGTTTCTTTAGCAGACTTTGACTTCAGTATCTTCGTC + +a +s mr.mrrefChr3 135479 26 + 181019 TTAAAATCACCCTCTTGTAAGCACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585870 26 + 636262 TTAAAATCACCCTCTTGTAAGCACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 61215 26 - 647215 TTAAAATCACCCTCTTGTAAGCCCAT + +a +s mr.mrrefChr3 135505 8 + 181019 TATCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585896 8 + 636262 TATCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 61254 8 - 647215 TACCAATG + +a +s mr.mrrefChr3 135513 98 + 181019 AGCTGTCCCTCCTTAAAGTGATATGTAAAGCTGGTGGTATCAATCAAAGGGTGAACTACCATCAATTAAGGTATCATCATTATACATTCCATCATGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 585904 98 + 636262 AGCTGTCCCTCCTTAAAGTGATATGTAAAGCTGGTGGTATCAATCAAAGGGTGAACTACCATCAATTAAGGTATCATCATTATACATTCCATCATGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 61265 98 - 647215 AGCTTTCCCTTCTAAGAGTAACATGTGAATCTAGTAGCATCAATTAAAGGGAGAACTATCATCAATTAAGGTATCATCATAATACATTCCATCATGTA + +a +s mr.mrrefChr3 135611 2 + 181019 AT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586002 2 + 636262 AT +s simRat_chr6.simRat.chr6 61374 2 - 647215 AT + +a +s mr.mrrefChr3 135613 12 + 181019 AGAGATTTGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586005 12 + 636262 AGAGATTTGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 61376 12 - 647215 AGAGATTTACTA + +a +s mr.mrrefChr3 135625 28 + 181019 AGACAGGTTAAATTGCAGGACTAGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586017 28 + 636262 AGACAGGTTAAATTGCAGGACTAGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 61397 28 - 647215 AGACACGCTAAATCGCAGGACTAGTATG + +a +s mr.mrrefChr3 135653 12 + 181019 GTCggaacacag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586045 12 + 636262 GTCggaacacag +s simRat_chr6.simRat.chr6 61449 12 - 647215 GTAGGAACACAG + +a +s mr.mrrefChr3 135665 6 + 181019 aacaca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586059 6 + 636262 aacaca +s simRat_chr6.simRat.chr6 61461 6 - 647215 GACTCA + +a +s mr.mrrefChr3 135671 22 + 181019 acccatcaaatacccacaaact +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586065 22 + 636262 acccatcaaatacccacaaact +s simRat_chr6.simRat.chr6 61473 22 - 647215 ATTTACTCAAAATCAGCAAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 135693 16 + 181019 aagattcaaggaacat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586087 16 + 636262 aagattcaaggaacat +s simRat_chr6.simRat.chr6 61509 16 - 647215 AGGACTCAAGGTGCAT + +a +s mr.mrrefChr3 135709 59 + 181019 tcgtaaaatcagtaaggggaagccactaacaattcaaagattactgactgaacattctg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586103 59 + 636262 tcgtaaaatcagtaaggggaagccactaacaattcaaagattactgactgaacattctg +s simRat_chr6.simRat.chr6 61527 59 - 647215 tcttaaaatcagtaaggggaagctgctaacaattcagagattactgtctgaacattctg + +a +s mr.mrrefChr3 135768 32 + 181019 tcttagtcgttcaccggcaaacataattgagc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586162 32 + 636262 tcttagtcgttcaccggcaaacataattgagc +s simRat_chr6.simRat.chr6 61599 32 - 647215 tcttgatctttcaccagcaaatataattgagc + +a +s mr.mrrefChr3 135800 58 + 181019 accattatcgtgaaatcagtggccttgttcaccacacacagaaagaccactatagatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586197 58 + 636262 accattatcgtgaaatcagtggccttgttcaccacacacagaaagaccactatagatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 61631 58 - 647215 actattattgtgaaaccagtggtcttgttcaccacacctaaaaagaccattgttgaat + +a +s mr.mrrefChr3 135858 19 + 181019 tggcctggagtgagaaaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586258 19 + 636262 tggcctggagtgagaaaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 61689 19 - 647215 ctgcctggaatgagaaaag + +a +s mr.mrrefChr3 135877 171 + 181019 gaacccatggcagaatcctttcttagtgaaagaaatcaagggagtgcagtcatatccttgaactttaagtgttactatcaggtaactattgtgaaagcaacactatacttgcatcaaaagatcagtacaatacaccatggaattagaagtgatggagctaccacatttaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586277 171 + 636262 gaacccatggcagaatcctttcttagtgaaagaaatcaagggagtgcagtcatatccttgaactttaagtgttactatcaggtaactattgtgaaagcaacactatacttgcatcaaaagatcagtacaatacaccatggaattagaagtgatggagctaccacatttaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 61709 171 - 647215 gaacccaaggcagaaccttttcttattgaaaaaaatcaggggagtgcgatcatatcctcgaactttaagtgttactcttgagtaacagtttggaaagcaacactatattagcatcaaaagatcattacaatacaccatgggattagtagtgatggagctaccacacttagg + +a +s mr.mrrefChr3 136048 52 + 181019 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586448 52 + 636262 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat +s simRat_chr6.simRat.chr6 61906 52 - 647215 aaacgcttcatattatgatgagaaattttaacaaggactcattattcaatct + +a +s mr.mrrefChr3 136100 73 + 181019 gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586509 73 + 636262 gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 61958 73 - 647215 gaatcagtttattaccttccaaaaattaaaacttgacatttccccattaccttataccatgattaatacaagc + +a +s mr.mrrefChr3 136173 37 + 181019 tgtaactaatctaaagaattgaggttcggagctacca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586583 37 + 636262 tgtaactaatctaaagaattgaggttcggagctacca +s simRat_chr6.simRat.chr6 62031 37 - 647215 tgttactggtctaatgaattgaggttctcatccccca + +a +s mr.mrrefChr3 136210 44 + 181019 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586628 44 + 636262 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta +s simRat_chr6.simRat.chr6 62068 44 - 647215 aaaagtgttaagggctgagtagattttctgagaaggacctttta + +a +s mr.mrrefChr3 136254 24 + 181019 caatatgtacttagggaattggtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586674 24 + 636262 caatatgtacttagggaattggtt +s simRat_chr6.simRat.chr6 62112 24 - 647215 agatattggaacgggggaatggtt + +a +s mr.mrrefChr3 136278 59 + 181019 atacaaaaaaaccacaaggatagagtggccataacatggacatatgtcttgcagaactc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586869 59 + 636262 atacaaaaaaaccacaaggatagagtggccataacatggacatatgtcttgcagaactc +s simRat_chr6.simRat.chr6 62136 59 - 647215 atacaataccaccacaaggatagtgtgggcataacatgcaaatatgtcttgcaaagccc + +a +s mr.mrrefChr3 136337 63 + 181019 aagataaatgatcaacaaacatgagtgggatgtaaacaagggaaagagcacacttacagtaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586928 63 + 636262 aagataaatgatcaacaaacatgagtgggatgtaaacaagggaaagagcacacttacagtaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 62215 63 - 647215 gagataaatgatcaagaaatatgaatggggtgtaaacaaggtaaagagcatacttagagtaga + +a +s mr.mrrefChr3 136400 25 + 181019 ccaggagtttagcaaataggataga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586992 25 + 636262 ccaggagtttagcaaataggataga +s simRat_chr6.simRat.chr6 62278 25 - 647215 ccatgaggttagtaaataggataga + +a +s mr.mrrefChr3 136425 141 + 181019 acctttgtcacctatttgtccaaaaggggtccagtctctcaggtctcatagcaaactcacccaaatacacaaggagaagcccagtgacataatcaatagacagattggaaccataaacaggctctcactggtaaggggaga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587017 141 + 636262 acctttgtcacctatttgtccaaaaggggtccagtctctcaggtctcatagcaaactcacccaaatacacaaggagaagcccagtgacataatcaatagacagattggaaccataaacaggctctcactggtaaggggaga +s simRat_chr6.simRat.chr6 62310 141 - 647215 accttcgacacctacttgtccaaaaggggcccagtatctaaggtgccacagcaaactcacacagatacgcaaagagaaacccggtaacacgaccaatagatggactgaaaccataaatgggctctcataggcaaggggaga + +a +s mr.mrrefChr3 136566 28 + 181019 cccggtgcaaggaagcaccataggaagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587158 28 + 636262 cccggtgcaaggaagcaccataggaagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 62452 28 - 647215 cccgttgcaaggaaccaccataggcagt + +a +s mr.mrrefChr3 136594 21 + 181019 gtgctgaggtttttcaggacC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587186 21 + 636262 gtgctGAGGTTTTTCAGGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 62481 21 - 647215 gcactgaggtttttctgatcC + +a +s mr.mrrefChr3 136615 11 + 181019 CCTCCGTAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587207 11 + 636262 CCTCCGTAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 62504 11 - 647215 TCACAGTAAGC + +a +s mr.mrrefChr3 136626 6 + 181019 GCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587520 6 + 636262 GCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 62515 6 - 647215 GCCATA + +a +s mr.mrrefChr3 136632 168 + 181019 GCAGTTATCTATCTCTCAGTCGGCCTGTCAAAGAGGCCTCTGTGGCCACTGCAGTGCTACTCCAATGAGTAACTACAGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGCACAACTTAAACAGGACACTGCATAGCTTGTGATATTAAATGCTTAGCAGAAGGGCACAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587526 168 + 636262 GCAGTTATCTATCTCTCAGTCGGCCTGTCAAAGAGGCCTCTGTGGCCACTGCAGTGCTACTCCAATGAGTAACTACAGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGCACAACTTAAACAGGACACTGCATAGCTTGTGATATTAAATGCTTAGCAGAAGGGCACAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 62522 168 - 647215 GTGGTTAGCTACTGCTCAGTCAGCCCATCAAAGGGGCATTTGTGGCTACTCTAGTGCTACTCCAATGAGTAACCATGGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGTGCAACTCAAACAGGATACTGCATAGCATGTGATAATAAATGCTTGGCAGCAGGGCACAATAA + +a +s mr.mrrefChr3 136800 6 + 181019 ttagac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587701 6 + 636262 TTAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 62690 6 - 647215 ttagac + +a +s mr.mrrefChr3 136806 26 + 181019 cttttttaatagcattattgctagat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587710 26 + 636262 CTTTTTTAATAGCATTATTGCTAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 62696 26 - 647215 cttttataatcgcattattgctagat + +a +s mr.mrrefChr3 136832 17 + 181019 agtggttaaatccataa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587736 17 + 636262 AGTGGTTAAATCCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 62723 17 - 647215 agtggataaatccatag + +a +s mr.mrrefChr3 136849 13 + 181019 tatggtgatcaca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587753 13 + 636262 TATGGTGATCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 62743 13 - 647215 tgaggggattgaa + +a +s mr.mrrefChr3 136862 160 + 181019 ggagccaggaaacaagactttttctccttgtcacaACCTGGAGGAATCCTAGTTTTATCCCTAATGCTGCACTTGTTTTCACAAATTGGCCTTCTTTTTCTTTCCCAAAGTTGGAAACAAAGCACCCATGCTCTCCTTGATAACGATCAATAGTATACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587766 160 + 636262 GGAGCCAGGAAACAAGACTTTTTCTCCTTGTCACAACCTGGAGGAATCCTAGCTTTATCCCTAATGTTGCACTTGCTTTCACAACTTGGCCTTCTTATTCTTTCCCAAAGTTGGAGACAAAGCACCCATGCTCTCCTTGATAACGATCAATAGTATACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 62765 118 - 647215 gaaaccaggaaacaaagctttctctactagtcacaACCGGGAGGAATCCTAGTTTCATCCCTAATGCTGCACTTGTTTACATAAATTCGCCTTCTTTTTCCTTCCCAAAGTTGGAAAC------------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr3 137022 680 + 181019 TTGGAAAGTGAGGTGTATTGCTAGTATAATCAGAGCACTTTCCACTCCATTTTTGCAATGTATGACCCAAGCATTTACTCTCGCTCATTCATTACAAGTCTTAATCTACTTGTATGATCAAAACCCTGGGATTATGAGTATCAAGAGTAGGTTATGAAACATCACTTCCCATGTGCTTCAACAATATAGATCCACTGCCGTAGCTGCTCTGGCATACGCACAGCTATACTGCACTTGATAAGGACTTTTAGTATGGGATAGATTTGTTGGTAGGGTAGCCATGGTGTGTAAACGTACTGACCTTCCATCAACCACAGGCTTAGAAAACACAGATGATTGACAATATCATAGTACCTCCTAAAAAGCCAAAAACCCCAAACATATTTCAGTCACTATTGACAACCATTTTCCTTTCTATTATATATTCTTGATCATGTGGATTTGTATATTTACAACGCGCTGCACAGCTGTTTAAAAGTTAAAAATTCTTAGAACAAATTTGGAATCAGCAAGTGCTTCATGTGGAGGGATATCAGTTTCATGTATAAGTGAGTTGTATGATCCTCTAGATGGCATATGTTCCATCCCTGGCTGACCAAATCTGTGTCATTCATGGAGTGATCATCCAATAACAGTGCCACTAGCCGTCCTGTAGTCCCTCTTAGATCCATTTGTCTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 587928 675 + 636262 TTGGAAAGTGAGGTGTATTGCTAGTATAGTCAGAACATTTTCTACTCTATTTTTGCAATGTGTGACCCAATCATTTACTCTCGCTCATTTATTGCAAGTCTTAATCTACTTGTATGATCAAAACCCTGGGATTATGAGTATCAAGAGTAGGTTATGAAACATCACTTCCCATGTGCTTCAACAATATAGATCCACTGCCGTAGCTGCTCTGGCAGACGCACAGCTATACTGCACTTGATAAGGACTTTTAGTACGGATTAGATTTGTTGGTAGGGTAGCCATGGTGTGTAAAC---CTAACCTTCCATCAGCCACAGGCTTAGAAAACACAAATGATTGACAATATCATAGTACCTTCTACAAAGCCAAGAACCCCAAACGTATTTCAGTCATTGTTGACAACCATTGTTCTTT--ATTATATATTCTTGATCATGTGGACTTGTATATTTACAACGCGCTGCACAGCCGTTTAAAAGTTAAAAATTCTTGGAACAAATGTCGAATCAGCAAGTGCTTCATGTAGAGGGGGAGCAGTTTCATGAATAAATGAGTTGTATGATTCTCTAGATGTCATATGTTCCACCCCTGGCTGACCAAATCTGTGTCATTCCTGTAGTCATCATCAGATAACATTGCCACTAGCCATCCTGAAGTCCCTCTTAAATCCATTTGTCCGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 62883 666 - 647215 --------------GGATTGGTTGCATAATCAGAGCACTTTCCACTCCATTTTTGCAATGCATGATCAAAGCATTTACTCTAGTTCACCCATTACAAGACTTACTTCTCTTGTAAGATCAAAACCTTAGGATTACGAGTATCAAGAGTAGGTTATGAAACACCACTTTCTATATGCTTGAATAGTATAGATCCACTGCTGTAACTACTTTGGCATACGCACAACTATACTGCACTAGATAAGGACTTTTAGTGTGGGATAGATTCGTTGGTAGGGCAGCCATGCTTTGTAATCGTACTGACATTCCACCAAACACAGGCTTAGAAAACACAGATGATTGACAATATCCAAGTACCCCCTAAAAAGCCAAAAACCCCATACATATTTCAGTCACTATTGACAACCATTTTCCTTTCTATTACATGTCCTTGATCATGTGGATTCATATATTTACAATGCGCTGCACAGCTGTTTAAGACTAAAAAATTCTTAGAACAAATTTGGAATCAGCAAGTGCTTCATGTGGAGGGATATCAGTTTCATGTATAAGTGAGTTGTATGGTCCTCTAGATGGCATATGTTCCATCCCTGGCTGGCCAAATATGTGTCATACATGGAGTGATCGTTCAGTAACAGTACCACTAGGTGTCTTGTAGTCCCCCTTAGATCCATTTGTCTGTC + +a +s mr.mrrefChr3 137702 38 + 181019 ATGGAGATAGAAAGATTATAGAAATATCCCCGTTGGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 588735 38 + 636262 ATGGAAATAGAAGGATCATAGAAATATCCCCGTTGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 63549 38 - 647215 AGGGGGATAGAAAGAGTGTAGAAATATCCCTGTCAGGC + +a +s mr.mrrefChr3 137740 157 + 181019 ACTCCTGTAAAGTGTGATATGGATAGTCTTTAAGTGCCTGAAAGATAAAAATATAGAGCATAGCCCAGCTCTTTGAGAGATGGTAATCATGAGGGAGTCATATAGGGTAGTTCTTATAAAATGAAGGGCCTGCCTGTTCTATGCTCTGGTATTGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 588773 156 + 636262 ACTCCTGTAAAGTGTGAT-TGGATAGTCTTTAAGTGCCTGAAAGATAAAAATATAGGACATGGCCTAGCTCTTTGAGAGATGGTGATCATGAGGGAGTCGTATAGAGTAGTTCTTATCAAATGAAGGGCCTGCCTATTCTGTGCTCTGGTATTGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 63597 141 - 647215 ACTCCTGTAAGGTGCGGTATGGATAGTC----------------ATAAAAATATAGAGCATAGCCCAGCTCTTTGAGAGATGGTAATAATGAGGGAGTCATATAGGGTAGTTCTTATAAAACGAAGCACCTGCCCGTTCTATACTCTGGTATTACAA + +a +s mr.mrrefChr3 137897 65 + 181019 ACACGGCATTGAATGCATAATATTGTAATATTTTGTTAGTGAGCCAGTTGTTAACATTCATCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589000 65 + 636262 ACACGGCATTGAATGCATAATATTGTAATATTTTGTTAGTGAGCCTGTTGTTAACATTCATCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 63738 65 - 647215 ACCAGGCATTGAATGTATAATATTGTAATATTTGGTTAGTGAGCCAGTTGTTAACATTCATCCTG + +a +s mr.mrrefChr3 137962 276 + 181019 TGTGCATTTGCATTCTTTGATTTGGGCTGCTGTGCCTTAGGGATATTGAGTGATATTGTGGTAGATAAGACAGTAAAGAATCATAGCTCATTTCCATGTGTGTCTCCTCAAGAGAGACATGTTAATGAAATGTTATTTCTACCACAGATCATTGACTCCAGAGAATACAATGTCTTTATCAGCTGTGCTTCAGCTTGCAAGTGGTACATTTATATGTAGAGGAAACAGAGTGGGGGTAAATGTGAAAAGGTTAGCTCTGTATGGCCATGTAGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589163 269 + 636262 TGTGCATTTGCATTCTT-GATTTGGGCTGC-----CTTAGGGATATTGAGTGCTATTGCGATAGATAAGACAGTAGAGAATCATAGCTCATTTCCATCTGTCTCTCCTAAAGAGAGACA-GTTAATGAAATGTCCTTTTTACCACAGATCATTGACTCCAGAGAATACAATGACTTTATCAGCAGTGCTTCAGCTTGCAAGTGGTACATTTATATGTAGAGGAAACAGAGTGGGGATAGATATGAAAAGTTTAGCTCTGTATGGCCATGCAGATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 63803 250 - 647215 TGTGCATCTGCGTTCTTTGATTTGGGCTGCTGTGCCTCAGTGATATTGGGTGATATTGTGGTAGATAAGACAGTAAAGTATCAAAGC--AC----ATGATTGTCTCCTCAAGAGAAACATATTAATGAGACATTATTTCTACCACAGATCAT-------------------GTCTTCATCACCTGTGGTTCAGCTTGCAAGTGATACGTTCATATGTAGAGGAAACATAGTGGGGGTGAATGT-AAAAGGTTAGCTTTGTATGGAAATGTAGATAT + +a +s mr.mrrefChr3 138238 32 + 181019 CCAGCCCTGGGGAGATTACCAAGTATTGGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589444 32 + 636262 CCAGCCCTGGGGAGATTACTAAGTATAGGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 64053 32 - 647215 CCAGCCCAGGGGAGATTACCAAGTATTAGGGG + +a +s mr.mrrefChr3 138270 168 + 181019 GTTATGTACAATGATGTATTCAACAGCATGCCTGAACCTATAAAATAAAGTATCCTCCTATAAAATAAGGTATCCTGGATCTTGTAATGTTACCCTATTTTTATAATACATGATGGTATTCCTCTTATTGATCACACTGTGACCCCTTGTGTTAACATAATGAACCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589476 166 + 636262 GTTATGTACAATGGTGTATTCAACAGCATGCCTGAACCTATAAAATAAAGTATCCTCCTATAAAATAAGGTATCTTGGATCTTGTAATGGTACCCTATTTTTATAATACATGATCGTATTCCTCTTATTAATCACACTGTGACCCCTTG--TTAACATAATGAGCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 64087 163 - 647215 GTTATGTACAATGATGTTTTCAACAGAATGCCTTAACCTATAAAATAAAGTATCCTCCTATACAATAAGGTATCCTGGATCTGGTA-TGTTACCCTATTTTGAAAGGACATGATGGTATCCCTCCTATTGATCACACTGTGACCT----TGTTAACATAATGAATCTA + +a +s mr.mrrefChr3 138438 57 + 181019 AAGGTCTTGGGTAGTCCTCCCTAGGACATATAAGGGGAGATAACACTTTAGAACACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589642 56 + 636262 TAGGTCTTGGGTAGTCCCCCCTAGGACATCTAAGGGG-GATAACAGTTTAGCACACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 64251 57 - 647215 AAGGTCTTGGGTAGTCCTCCCTAGGACATACAAGGAGAGATAGCACTTTAGACCACT + +a +s mr.mrrefChr3 138495 138 + 181019 TTCCCAACTAATAGATGGAGTCTTTATCTGTTATTATAGTTCCACACTAAGCACTCAATTTATAGTGGTAATATGTTATGTGGAGACCACATCACGTCTAAATTGTCTGCGAAACCTCAACCCCTAACCTCACTACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589700 129 + 636262 TTCCTGACTAATAGATGGAGTCTTTACCTATTATTATAGTTCCACACTAAGCACTCTATTTATAGTGGTAATATGTTATGTGGGGACCACATCCTG--------ATCGGCGAAACCTCAACCTCTAACCTCACTACA- +s simRat_chr6.simRat.chr6 64308 138 - 647215 CTCTCAACTAATAAGTGGAGTCTTTATCTGTTCTTATATCTTCATACTAAGCACTCAATGTATACTGGTAGTATGTTATGTGGAGACCACATCACGTCTAAATTGTCTGCGAAACCTCAATCCCTAACCTCACTACAG + +a +s mr.mrrefChr3 138633 89 + 181019 GAGTTCACAGGTTTTTTTCTGCTTTTCACTCATAAGCATCTCTAATGGCATTGTGATGAAAGGTGAATCTATTGTGACAACTGTTAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589829 86 + 636262 GAGTTCACAGGTTTTTTTCTGCTTTTCACTCATAAGCATCTCAAATGGCATTGTGATGAAAGGTAAATCTATTGTGACAATTGTTA--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 64447 85 - 647215 GAGTTCACAGGTTTTT----GCTTTTCACTTATAAGCTTCTCTAATGGCATTGTGATGAAAGGTGAATCCATTGTGACAACTGTTAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 138722 127 + 181019 TCCTAACACAAACTCTAATCCATCTTTCTGAAACAAATCTTCAAAACGTGAATTGGATATAAGATATGTCCACAGTTGTCTCCTAATTATTTAGTCTCTGCCTGTACACGTACTCTGTGGTTAATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589915 119 + 636262 --------CAAACTCCAATCCATCTTTCTGAAACAAATATTCAAAACGTGAATTGGATATAAGATATGTCCACAGTTGTCGCCTAATTTTTTAGTCCCTGCCTGCACACGCACTCTGCGGTTAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 64534 127 - 647215 TCCTAACACAAGTGCTAAATCATCCTTCTGAAACAAATCTTCAAAATGAGCATTGGATGTGAAATATGTCCACTGTTGTCTCCTAATTATTTAGTCTCTGCCTGTACATGTACTCTGTGGTTAATAC + +a +s mr.mrrefChr3 138849 30 + 181019 TTTCCCCCTAGTGGAATTCAAATCTCTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590034 30 + 636262 TTTTCCCCTAGTGGAATTCAAATCTCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 64663 29 - 647215 TTTCCCG-TAGTGGGAGTCAAATCTCTGTG + +a +s mr.mrrefChr3 138879 224 + 181019 CTTCATAATGTCTATTTGTAATGCTTTCTTGTCAGATATTATATCTATTTGCTCATGTGTCCACGTTTCTTACAAGCGTAACATTAATATAACATTTGAATAGTACACATGTACGTTAAAGTGACAATTGCTACCCGCAAAGGGTATTTTTCGTGCTTTTCAATCTAGGTGTTACCCCAAGTAGCCCAAAGCATGCTGAATAAGACATGTTATAGGGTCCACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590065 218 + 636262 CTTCATCATGTCTATGTGTAATGCTTTCTTGTCAGATATTATATCTGATTGCACATGTGTCCACATTTCTTACAAGCGTAACATTAATATAACATTTGAATAGTACACATGTATGTTAAAGTGACAATTGCTACCCGCAAAGGGTATTTTTCGTGCCTTTCAATCTAGGTGTGACCCCAAGTAGCCTAAGACATGTTGA------CATGTTATAGGGTGCACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 64692 223 - 647215 CTTTATAAAGTCTATTTGTAATGCTTTCTTGTCAGATAATATATCTAT-TGCTTGTGTGTTCATGTTTCTTGCAGGCAGAACATTAATATAACATTTGAATAGTACATACGTACGTTATAGGGACAATTGCTACCCACAAAGGCTATTTTTTGTGTTTTTCAATCTAGGTGTTACCCCAAGTAGCTCCAAGTTGCCTGAATAAGACATATTATAGGGTCCACAA + +a +s mr.mrrefChr3 139103 144 + 181019 AGTACAGTACATGTTAACAATTCTATGTAATACCATGCCATTAGCACCTGTTAGTATGGACTAGACTAAAATTCATCATTCTTTGCATTCACGTTTAATTTATGCAAATTCTAGAGTAAGAAAGGTTCAAAGTCAAACATCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590283 144 + 636262 AGAACAGTACATGTTAACAAGTCTATGCAATACTGTGCCATTAGCACCTGTTAGTATGGACTAGACTAAAATTCATCATTCTTTGCATTCACACTTAATTTGTGCAAATTCTAGAGTAAGAAAGGTTCAAACTCAAACATCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 64933 144 - 647215 AGTACACTACATGTTAACAATTCTATGTAATACCATGCCATTAGCACCTGTTAGAATGGACTAGACTAAAATTCATTATTATTTGCATTCACGTTTAATTTATGCAATTTCTAGAGTAAGGAAGGTTCAGAGTCAAACATCTGG + +a +s mr.mrrefChr3 139247 7 + 181019 TCTGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590429 7 + 636262 TCTGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 65077 7 - 647215 TTTGTGA + +a +s mr.mrrefChr3 139254 60 + 181019 TATCAATAACTGAAATAACTCCTATGTGGTGAGGTATGGGCCACAGAGAAGGAGACCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590436 60 + 636262 TATCAAGAACTGAAATAACTCCTATGTGGTGAGGTATGGGCCACAGAGAAGGAGACCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 65085 60 - 647215 TATCAATACCTGAGATAACTCCTATGTGGTGAGGTGTGGACCACAGAGAAGGAGACCTTG + +a +s mr.mrrefChr3 139314 181 + 181019 ATGTATCAGCTAACTCAACACTAGCAACCTAACATGCCTATTTACTGCAGTCTTAATAGTAGACATTATAGGTAGAGGTAGTCCTGTGTGAGCTAGATTCCTAGAATCCCTGTCAACAGAAGCAAGAATGTCTTGAGTATAGGCTAAATCCGTCAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590496 181 + 636262 ATGTATTAGCTAACTCAACACTAGCAACCTAACATGCCTATTTACTGCAGTCTTAATAGTAGACATTATAGGTAGAGGTAGTCCTGTGTGAGCCATATTCCTAGGATCCCGGTCAACAGAAGCAAGAATGCCTGGAGTATAGGCTAAATCCGTTAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65147 177 - 647215 ATGTATCAGGGAACATGACACTACCAACCTATCATGCATC----CTGTAGTCTTAATAGTAGACATTATAAGTAGAGGTCGTCCTGTGTGAGCTAGCTTCCTAGAATCCCTGTCAACAGAAGCAAGAATGTCTTGAGTATAGACTAAATCTGTCAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATAT + +a +s mr.mrrefChr3 139495 63 + 181019 GTTTAGGTGGTGCTGTTATCATCTAGGAGGATACTGGTCGCCACCTACATTGACAGAATAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590677 63 + 636262 GTTAAGGTGGTGCTGTTATCATCTAGGAGGATACTGGTCGCCAACTACATTGACAGAATAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 65326 63 - 647215 GTTTATGTGGTGATGTTATCATCTCGGAGGTTACTGGCCACCACCTACATTGATAGAATAATA + +a +s mr.mrrefChr3 139558 27 + 181019 GGCTAAACATTCACTATTACCCCTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590741 22 + 636262 GACTAAACATCCACTATAGCCC----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 65389 27 - 647215 GGCTTAACATTCACTATTACCCCTACA + +a +s mr.mrrefChr3 139585 30 + 181019 AGTCTTCTCACTCAATAAATTTTTTTATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590763 23 + 636262 -------TCACTGAATAAATTTTTTTATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 65423 30 - 647215 AGTCTTCTCACTCAATAAATTTTTTTATGG + +a +s mr.mrrefChr3 139615 79 + 181019 CAGCATCACAATCAGGTAGCATCCAGACCTAAGGGCTCTCCTTGGCAATCTTAACTTGGGGGGTGTCAGAAATTCAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590786 79 + 636262 CAGCATCACAGTCAGGTGGCATCCAGACCTAAGGGCTCTCCTTGGCAATCTTAACTTGGGGGGTGTCAGAAATTCAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 65454 78 - 647215 CAGCATCATAATTGGGTAGCATCTAGACCTTAGGGCTCTCCTTGGCAATCTTAACTTGGGGG-TGTCAGGAATTTAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 139694 39 + 181019 GCTCCAAGATATATGTATAACTGGCTGACCAGATTAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590867 39 + 636262 GCTCCAAGATATATGTATAACTGGCTGACCAGATTAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 65532 39 - 647215 GCTCCAAGATATATGTGTGATTGGAGGACCAGATTAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 139733 76 + 181019 TGCTATAGCCCCTAGTACATTGCAGACCCAGTCATTGGGAGTTTGTAACCTGAGTTTATATATCTTAATGCATGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 590924 76 + 636262 TGCTATAGCCCCTAGTACATTGCAGACCCAGTCATTGGGAGTTTGTAACCTGAGTTTATATATCTTAATGCATGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 65571 76 - 647215 TGCTGTAGCCCCTAGTACATTGCAAACCCAGTCATTGAGAGTTTGTGACTTGAATTGGTATATCTGAATGCCTGAC + +a +s mr.mrrefChr3 139809 13 + 181019 TGATCTATATCCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591002 13 + 636262 TGATCTATATCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 65647 13 - 647215 TGATCTATATCCT + +a +s mr.mrrefChr3 139822 62 + 181019 AATAATTCAAGAAGACTGCACACAGCACTAGTACACTTCTGTGCCTAACTCTAGTGCTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591023 62 + 636262 AATAATTCAAGAAGACTGCACACAGCACTAGTACACTTCTGTGCCTAACTCTAGTGCTTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65660 62 - 647215 AATCATTCAGGGAGACTGTGCTCAGCATTGGTGCACTTCTGTGCCCAACTCCAGTGCTTGAT + +a +s mr.mrrefChr3 139884 6 + 181019 TTAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591086 6 + 636262 TTAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 65722 6 - 647215 TTCGCC + +a +s mr.mrrefChr3 139890 62 + 181019 TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTTGACAACTTTATGAAAGAGGGATAGCACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591145 62 + 636262 TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTTGACAACTTTATGAAAGAGGGATAGCACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 65728 62 - 647215 TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTAAGCCCCTTTATGAAAGAGGGATAGCATGG + +a +s mr.mrrefChr3 139952 68 + 181019 CAGGCATAAACTCTGAAAGGAACATATTCAATAGTCTGCAACTGCATATCCTCAATGACATTTTTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591226 68 + 636262 CAGGCATAAACTCTGAAAGGAACATATTCAATAGTCTGCAACTGCATATCCTCAATGACATTTTTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65790 68 - 647215 TGTGCATAAACTCTGAAAAGGACATATTCAATAGCCTGTAGCTGCGTATCCTCAATGACATTTTTGCC + +a +s mr.mrrefChr3 140020 120 + 181019 CATAGATATGGATGTGTATGAGTCCTTGATTGATGTCTGTATGAGTACTGTCTACTCAGTAACAATAGACTGGGCAAGTCTTGCCCTATGAGTTACCATAAAAATCGTTCCATAAGTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591294 120 + 636262 CATAGATATGGATGTGTATGAGTCCTTGATTGATGTCTGTATGAGTACTGTCTACTCAGTAACAATAGACTGGGCAAGTCTTGCCCTATGAGTTACCATAAAAATCGTTCCATAAGTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 65863 120 - 647215 CAGAGACATGGATGTGCATGAGTCTATGATTGATGTTTGCACGAGTATTGTCTACTTAGTAACAATAGATTGGGCAAGTCTTGCCTTATGAGTTACAGTAAAAATTATTCCCTAAGGTAC + +a +s mr.mrrefChr3 140140 49 + 181019 TCTGCAGAAGTCTCAGTCCTCAATATACACCACCAACTTGCCTCTACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591418 49 + 636262 TCTGCAGAAGTCTCAGTCCTCAATATACACCACCAACTTGCCTCTACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 65983 49 - 647215 TGTACTGAAGTCTCAGACTTCAACATACACCTCGAATATGCATCTACCA + +a +s mr.mrrefChr3 140189 53 + 181019 AACAGGTAGGATATTTATGCCTTTCCTGCACGGATGAAAATGAATCTTCTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591473 53 + 636262 AACAGGTAGGATATTTATGCCTTTCCTGCACGGATGAAAATGAATCTTCTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 66032 53 - 647215 AACAGGTGGGATGTATATTCATTTCCTGGATGGATGAGAACAAATTCTCTAAA + +a +s mr.mrrefChr3 140242 71 + 181019 GATCATACTGGGGTGCCCCAGATATTCTATTATTCAGCAATTCCCTAGCTCCCATACAACATCAAAGGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591526 71 + 636262 GATCATACTGGGGTGCCCCAGATATTCTATTATTCAGCAATTCCCTAGCTCCCATACAACATCAAAGGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 66086 71 - 647215 GATCAGACGGGGGTGCCCTAGTGATTCTATTATTCAGCAATCCTCTAACTCCCATACAACACCAAAGGTTG + +a +s mr.mrrefChr3 140313 107 + 181019 TCTTGGCTTGGTGTGATCCATCATCTTAATCCCCCAGTCTGATAAACAGGGTGGTTCAATAAACAAGGGCGCAATCCAATGTCCCCCAGACTGATAAGCAACTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591597 107 + 636262 TCTTGGCTTGGTGTGATCCATCATCTTAATCCCCCAGTCTGATAAACAGGGTGGTTCAATAAACAAGGGCGCAATCCAATGTCCCCCAGACTGATAAGCAACTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 66185 107 - 647215 TCCTTGTTTGGTGGAATCCATCATCTTAATCCTCCAGTCTGATAAACGGGGGGGTTCAATAAACAAGAGTGCAATCCAATGTCCCCCACACCAATAACCAACTGAAA + +a +s mr.mrrefChr3 140420 18 + 181019 TCCAGTTGTAATACTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591704 18 + 636262 TCCAGTTGTAATACTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 66296 18 - 647215 TCCAGCTGTAATACTCTA + +a +s mr.mrrefChr3 140438 11 + 181019 TGTATCCGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591722 11 + 636262 TGTATCCGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 66319 11 - 647215 TGTATCCGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 140449 26 + 181019 CTGATAGCCAATTCAAGGGGTTTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591739 26 + 636262 CTGATAGCCAATTCAAGGGGTTTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 66330 26 - 647215 CTAATAGCCAATTCAAGGAGTGTCAG + +a +s mr.mrrefChr3 140475 81 + 181019 TCATACTTTATATATGAGAACAAGATTGAAGGGACACAGAGTGCTATTTTGCATCACCCAATATCAGAAATCCATATCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591765 81 + 636262 TCATACTTTATATATGAGAACAAGATTGAAGGGACACAGAGTGCTATTTTGCATCATCCAGTATCCGAAGTCCATATCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66359 81 - 647215 TCATACTTTATATATGCAAACAGGATTGATGTGACACAGAGTGCTATTTTGCATCACCCAATATCAGAAATCCATATCACT + +a +s mr.mrrefChr3 140556 201 + 181019 CTATGGTGGGAGACATTAGATAGGATGACATTCACGCTAGACAAACCATCCTCACTGTTGTCAAAAGTACAATAGTGCTCTGCATTACCAGTACAAGACGTCTGTTTGATTTCTTCTTCTGCCATCTAGGGGACATCTTCTGTTTAGCTCTTCCTATACATATTTTTAGTTGCAATCCATGGCATTGGATCGGGACTCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591846 201 + 636262 CTATGGTGGGAGACATTAGGTAGGATGACATTCACGCTAGACAAACCATCCTCACTGTTGTCAAAAGTACAATAGTGCTCTGCATTAGCAGTACCAAAAGTCTGTTTGATTTCTGCTTCTGCCATCCAGGGGACATCTTCTGTTTAGCCCTCCCTATACATATTTTTAGTTGCAATCCATGGCATTGGATCGGGACTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66442 155 - 647215 CTATGGTGGGAGACGTTAGATAGGATGACATTC----------------------------------------------CTGCATTACCAGTACAAGACGTCCATTTGATTTCTTCTTCTTTCATCTAGGGGGCATAGACTGTTTATCTATTCCTATACATATTTCTAGTTGCAATACATGGCATTGGATAGGGACTCTGT + +a +s mr.mrrefChr3 140757 16 + 181019 GGCTGTCCTTATTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592048 16 + 636262 GGCTGTCCTTATTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66597 16 - 647215 GGCTGTCCATATTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 140773 250 + 181019 AGCTCCAGTACATGGCATTCGATAGGGTGCTACATTTATTTATATCCCCTAGTGAGGGCTAAAACTAGTCACATTACCTGGTACATTACACAATTAAACCAGATTTAGGGTCTGCTCTGATGGTTTACATAGTCTGATTTATCCCTATGGTGATGCTGGCTCAATTACTCCAACCTTTTGGTTTACAGTAGTTGAGGATAAGTGATAATGGACTTATGTTATTGTCTTACAATTTCTCTATTTATCCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592066 250 + 636262 AGCTCCAGTACATGCCATTCTATAGGGTGCTACATTTATTTATATCCCCCAGTGAGGGCTAACACTAGTCACATTACCTGGTACATGACACAATTAGACCAGATATAGGGTCTGCTCTGATGGTTTACATGGTCTGATTTATCCCTATGGTGATGCTGGCTTAATTAGTCCAACCTTTTGGTTACCAGTAGTTGAGGATAAGTGATAATGGACTTATGTTATTGTCTTACAATTTCTCTATTTATCCCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 66613 240 - 647215 AGCTGCAATACATAGCATTCGATTGGGTGCTACATTTATTTATATGCACTAGTGAAGGCTAAAACTAGTCTCATTACCTGGTATGTTACACAATCAAATCA-ATTTAGGGTCTGCTCCGATGGTTTACATAGTCTGATTTAACCCTATGGTGGTGCTCATTCATCTACTCCAACCTTTTGGTTTACAGTAATTGAGGATAAGTGATAATGGACTTGTGTTATTGTCTTACAATTTCTCTAT--------- + +a +s mr.mrrefChr3 141023 53 + 181019 TCTAATTTATGTAGAGGTGGATAACCCAACCTATGAACATCCTACGCCCAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592319 53 + 636262 TCTAATTTATGTAGAGGTGGATAACCTAACCTATGAACATCCAACGCCCAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 66853 27 - 647215 -------------------------CCAACCCATGAACATCCTACGCCCAAG- + +a +s mr.mrrefChr3 141076 61 + 181019 GAAGAGGCAAGATCAGTATGTATGCCATCTCCATGACTAGTCAGACAGTCTTGACACACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592372 60 + 636262 AAAGAGGCAAGATCAGCATGTATGCCATCTCCATG-CTAGTCAGACAGTCTTGACACACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 67225 59 - 647215 gaagAG--AAGCTCAGTATGTATGACATCTCCATGACTTGTCAAACAGTCTTGACACACAA + +a +s mr.mrrefChr3 141137 113 + 181019 CTCGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAATATCATGACAAAGTTACCTTGAAGAAAAGTTACCTTCATAGAGATTCAGCAAAGCCTGCAACCATATTTAGAATGAGCTAAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592432 113 + 636262 CTTGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAGTATCATGACAGAGTTACCTTGAAGAAAGGTTACCCCCATAGAGATTCAGCAAAACCTGCAACCATATTTAGAATGAGCTAAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 67298 113 - 647215 CTCGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAATATCATGACAAAGTTACCTTGAAGAAAAGTTACCTTTATAGAGATATGGCAAAGCCTCCAACAATATTAAAGCTTGACTGGAGC + +a +s mr.mrrefChr3 141250 4 + 181019 TCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592551 4 + 636262 TCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 67411 4 - 647215 ACAT + +a +s mr.mrrefChr3 141254 98 + 181019 GAGCTAAGTCTTGCTATCTCAACACTAACCCCAGGCTGGCAAGGCAGATATCCATGATGAATACATATAAGAGGTGCACCTGAAGCTAAGTAGAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592555 98 + 636262 GAGCTAAGTCTTGCTATCTCAACACTAACCCCAGGCTGGCAAGGCAGATATCCATGATGAATACATACAAGAGGTGCACCTGAGGCTAAGTAGAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 67419 97 - 647215 GAGCTAAGGCTTGCTATCTCAACGCTAACCCCAGGCTGGCAAAGCATACATCCATGATGAA-ACATATAAGAGGTGCACCTGAAGTTAAGTAGAACTG + +a +s mr.mrrefChr3 141352 64 + 181019 TGGCACACTTTGGGTAGCCATGACTTGCACCTGAATGAGGTTACTCAGAGGCCATTAGTGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592666 64 + 636262 TGGCACACTTTGGGTAGCCATGACTTGCACCTGAATGAGGTTACTCAGAGGCCATTAGTGGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 67516 64 - 647215 TTGCACACTTTGGGTGGCCATGACTATCATCTCAATGAGGTTATTCAGACATCATTGGGGGATG + +a +s mr.mrrefChr3 141416 31 + 181019 CAGTCAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592730 31 + 636262 CAGTCAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 67583 31 - 647215 CAGTTAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT + +a +s mr.mrrefChr3 141447 11 + 181019 CAGGTTGTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592761 11 + 636262 CAGGTTGTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 67648 11 - 647215 CAGGTTGTCTT + +a +s mr.mrrefChr3 141458 46 + 181019 TTGAGTACCATTAAGTATTGAGTATGGGTCTTGTATTTTAGATCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592772 46 + 636262 TTGAGTACCATTAAGTATTGAGTATGGGTCTTGTATTTTAGATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 67707 46 - 647215 TTGAGTACCATTGAGTATTGAGTATGTGTCTTGTATTTTGGATTTG + +a +s mr.mrrefChr3 141504 50 + 181019 ATAATACTCCCATAAAATATTATGTTATACACAGTCACTTGTGAATTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592836 50 + 636262 ATAATACTCCCATAAAAGAACATATTATACACAGTCACTTGTGAATTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 67753 49 - 647215 ATAATACTCCCATAAAATATTATGTTATACACAGTC-CTTGTGAATTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 141554 297 + 181019 GATATATGGCCCTCCTCATACTGAAAAATTGAGACTGCACACCTTGCCCCTTTTTAGCAATAGTGACACCCAAGGGTGACTAAGATCATTGGTATGTTGTCCCTGCAAAAAGCTTATGCCTGCGAATCAGCAATCCACATCATAATAGTTTCTTCACTAGGAGATGGTAAGCACAATGGTCCCAGGCAAATGCTAATTGAGGTAGGGTGCAGGTAGACATTTTGATCTCTAATTGAAGGGAGAAGCTCGTTGGAGAATCGAAAAAGAACTGAACCAGTGGACACCTCATAATTTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592958 293 + 636262 GAAATATGGCCCTCCTCATACTGGAAAGTTGAGACTGCATACCTTGCCCCTTTTCAACAATAGTGACACTCGAAGGTGACTAAGACCATTGGTATGTTGTCCCTGCAAAAAACTTATGCCTGCAAATCAGCAATCCACATTATAATGGTTTCTTCACTAGGAGATGGTATGCACAATGGTCCCAGGTAAATACTAACTAAGGTAGGGTGCAGGTAGACATTTTGATCTCTGAT----GGGAGAAGCTTGTTGGAGAATCAAAAAAGAACTGAACCATTGGACACCTCATAATTTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 67802 292 - 647215 GATATATGGCCCTCCTCATACAGAAAAATTGAGACTGCACATCTTGCCCCTTTTTAGCAATAGTGACCCCCAAGGCTGACTAAGTTCATTGGTATGTTGTCCCTGCAAAAAGCTCATGCCTATGAATCAGCAATCCACATCATAACAGTGTCTTCACTAGGAGATGGTAAGCGCAATGGTTCCAGGCGAATGCTAATTGAGGTAGGTTGCAGGTTGACATTTTTATCTCTAATTGAAGGGAGAAGCTCGTTGGAGAAGTGAAAAA-----GAACCAGTGGACACCTCGTAATTTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 141851 25 + 181019 GGTAGTCATATTATCTTTCTCCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593251 25 + 636262 GGTAATCATATTATCTTTCTCCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 68124 25 - 647215 GGTAGTCATGTTATGTTTCTCCTCA + +a +s mr.mrrefChr3 141876 12 + 181019 CTCAGTGTCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593276 12 + 636262 CTCAGTGTCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 68155 12 - 647215 CTCAGTCTCTAA + +a +s mr.mrrefChr3 141888 95 + 181019 ATGGACTTGGACTGTTTCACATTGACAGCCCATTTGTGAAAGTAGTCCATGCAAATGGACTATGTAGCCTGATTAGGATCTTAAAGAACTCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593288 95 + 636262 ATGGACTTGGACTGTTTCACATTGACAGCCCATTTGTGAAAGTAGTCCATGCAAATGGACTATGTAGCCTGATTAGGATCTTAAAGAACTTCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 68171 95 - 647215 GTGGCCTTAGACTGTGTCACATTGACAGCCTATCGGTGAAAGCAGTCCAAACAAATGGACTAGGTAGCCTGCTTAAGATCTTAACCAACTCTATA + +a +s mr.mrrefChr3 141983 45 + 181019 CCTGTCTCGGGGTCTGGGAGTGGGAGACTGGGATGGTTTAAACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593383 45 + 636262 CCTGTCTCAGGGTCTGGGAGTGGGAGACTGGGATGGTTTAAACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 68403 45 - 647215 TCTGTCTCGGGGTCTGAGAGTGGTAGACGGGGATGGTTTAAACAA + +a +s mr.mrrefChr3 142028 235 + 181019 ATATCAGAGCCTTTGGATGCTCTGCTTAGTCTTGATTCAATAAGCTGGATCTTATCCCAGTGAAGTTGTAACACATCTCTACAGAGCTCTAGACATTCTGAGATATGAGGAAGTTGACATGGCCTCATTGTCCAAAGCAGTTCCTGAATCCTTGAAGAAATACACTAAGTGCAGGGAATTGGCAGAAAGACTGAAGATAGAAGGTCAGGGTCAAAAGTGCCTTTTAAACCACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593428 235 + 636262 ATATGGGAGCCTTTGGGTGCTCTGCTTAGTCTTGATTCAATAAGCTGGATCTCATCCCAGCAAAGTTGTAACACTTCTCTACAGAGCTCTAGACATTCTGAGATATGAGGAAGTTGACATGGCTTCATTGTCCAAAGCAGTTCCTGAATCCTTGAAGAAATACACAAAGTGCAGGGAATTGGCAGAAAGACTAAAGATAGAAGGTCAGGGTCAAAAGTGCCTTTTAAACCACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 68449 232 - 647215 ATATCAGAGCCTTTGGATGCTCTGCCTACCCTTAGTTCACTAAGCTGGATCTTAGCCCAGTGAAGTTGTAACATACTTCTACAGAACTCTAGACATTCTGAGATATGAGGAAGTTGACATGGCCTCATTGTCCAAAGCAGTTCCTGAATCCTTGAAGAAATACACTAAGTGCAGGGAATTGGCAGAAAGACTGAAAATAGAAGGTCAGGGTCAAAAAT---TTTTAAACCACACA + +a +s mr.mrrefChr3 142263 180 + 181019 CTCTATTTAGAAGTGTGACCTAATTACACCCTACTGATGTCTTAGCTATCAAATATGCCCCTTCTCAAACATGTCACTCAGACTACCTGTTTAATTGGATATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGACTAGGTTAATGTCTCCATTACTGGAGTACATGTTACATGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593663 180 + 636262 CTCTATTTAGAAGTGTGACATTATTACACCCTACTTATGTCTTAGCTACCAAACATTCCCCTTCTCAAACATGTCACACAGACTATCTGTTTAGTAGAAAATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGGCAAGGTTAATGTCTCCATTACTGAAATTCATATTACATGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 68685 180 - 647215 CTCTATTTAGAAGTGTGACCTAATTAGACCCCACTGATGTCTTACCTATCAAATATGCCCCTTATCAAATATGTCACTTAGACTACCTGTTTAATTGGATATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGACTAGGTTAATGTCTCCATTACTGGAGTACATGTTACATGATT + +a +s mr.mrrefChr3 142443 165 + 181019 TACCTTGCATATCCTTGTAACAGGAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAAAAATGCATATTCTACAGAACCATCCATAACATGTTCTCAATGAGATGAATATGATGCTAAATCTAGAAGTGCCTACCATAGCATCATAGATCATTTTAGAGCAACACATAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593843 160 + 636262 TAGATTGCATATCCTTGTAACAGAAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAAAAATGCATATTCTCCAGAGCCATCCGTATCCTGTTCTCAATAAGATGAA-ATCATGCTTAA--GGGAAGTGCTTACCATAGCATCATAGATCATTTTAGAGCAACA--TAGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 68873 165 - 647215 TACCTTGCAGATCATCTGAACAGGAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAACAATACATAGTCTACTGAACCATCCAGAACATGTTCTCAGTGAGATGAGTAGGAGGCAAAATCTAGAAGTCCCTACTGTCGCATCATAGATCGTTTTACAGCAACACATAGAAG + +a +s mr.mrrefChr3 142608 114 + 181019 TGATGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTATGGCAAATAACGCCTCTTTAGCAGTAAGTTAACTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594004 114 + 636262 TGATGAACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTCTGGCAAATAACGCTTCTTTGGCAGTAAGTTAATTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 69038 110 - 647215 CAAAGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGGTCCTCACCTATGGCAAA----ACCTTGTTACCTTTTAATGAACTGATGGATTTCAACTAGGCCTATT + +a +s mr.mrrefChr3 142722 86 + 181019 GCTTTTTAATGGACTGATGGGCTTCGCCTATGCCTATTTGATGGCATATCTAACATGTACATAGGGTTTTATGTTATCCACTTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594118 86 + 636262 GCTTTTTAATGGACTGATGGGCTTCGCTTATGCCTGTTTAATGGCATATCTAATATGTACATCGGGTTTTATGTTATCCACTTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 69175 84 - 647215 GTTTGATTATCCACTTTTGGGCTTCACCTATGCCTATTTGATAGCATATCTCACATGTACATAGGGTTTGA--TTATCCACTTTAG + +a +s mr.mrrefChr3 142808 128 + 181019 AATTTCTTTTTATTGATGAATTACTGTTTATGCCAAAACTATAAGACTGTTTTCCATATTTGGAGTGAGTCCTGGGTGAGTTTCCCCAGCTGTGTTGCTATTATTTCTGCCCCTGTATGGGATACCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594204 128 + 636262 AATTTCTTTTTATTGATGAATTCCTGTTTATGCCATAACTATAAGACTGTTTTCCATATTTGGAGTGAGTCCTGGGTGATTTTCCCCGGTTGTGTTGCTATTATTTCTGCCCCTGTATGGGACATCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 69272 124 - 647215 AACTTCTTTTTATTCATGAGTTACTGTTTATGCCAAAACTTTAAGACTATTTTCCATGTTTGGGGTGAGTGCTGGGCAAGTTTCCCCAGCTGTCTTGCTATTATTTTT----CTGTATGGAATACGCA + +a +s mr.mrrefChr3 142936 40 + 181019 TGGTGGGCCATGTACCATGGCACTTAGAAAATCAGTTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594332 40 + 636262 TGATGGGCCATGTACCATGGCACCTAGAAAATCTGTTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 69398 40 - 647215 TGGTGAGCCATGTACCATGGCACTTCGAAAATCAGTTGTG + +a +s mr.mrrefChr3 142976 135 + 181019 GGCTATTTACTTTGGTCAATGGTACTCCTGAATAGAAAAAAAGTCTTGAGACTCCCCAAGTGGTGAGTTGTCCCCATAAAATGGCAAACTGGACCCTTTGATTTGTTTTCTGTACGTAAAGGACTGCAGCTGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594372 135 + 636262 GGCTATTTACTTTAGTCAATGGTACTCCTGAATAGAAAAAAAGTCTTGAGACTCCCCAAGTGGTGAGTTGTCCCCATAAAATGGCAAACTGGACCCTTTGATTTGTTTTCTGTACGTAAAGGACTGCAGCTGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 69583 135 - 647215 GGCTATTTACTTTGGTCAATGCCACTCCTGAATAGAAGAAGACTATAGAGACTCCCAAATTGGTGAGTTGTCTCCATAAAATGTCAAACTGGACCCTTTAGTCTGTTTTTTGTACATAAAATATTGCAGCAGGAG + +a +s mr.mrrefChr3 143111 24 + 181019 TCCATTGAGTTGGCTATTAGTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594509 24 + 636262 TCCATTGAGTTGGCTATTAGTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 69718 24 - 647215 TCCGTTGAGTCGGCTATTAGCCCA + +a +s mr.mrrefChr3 143135 31 + 181019 ATGGGAGTGCACAAACTGTGGCACTAAGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594533 31 + 636262 ATGGGAGTGCACAAACTGTGGCACTAAGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 69748 31 - 647215 ATGAGAGTGCACAAACTGCAGGAGTAAGACG + +a +s mr.mrrefChr3 143166 36 + 181019 CCAGGAGATACATGGAATCCCTGGCCCCTCTGTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594576 36 + 636262 CCAGGAGATACATGGAATCCCTGGCCCCTCTGTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 69779 36 - 647215 CCTGGAGCTACATGGAATCACTAGCCCCTTCGTAAC + +a +s mr.mrrefChr3 143202 134 + 181019 TGGATGCTATACCACGTGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCCCAGATATAGTGAACTAGTCATTCGTAAAGCCAAACTGCAGGCCCTGTTTATGTGCTTCTTGTGCATCTAGGCTTACGAGAGAGGTTTGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594621 132 + 636262 TGGATGCTATACCACGTGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCCCAGATATAGTGAACTAGTCATC--TAAAACCAAACTGCAGGCCCTGTTTATGTGCTTCTTGTGCATCTGGGGTTACAAGAGAGGTTTGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 69815 122 - 647215 TGGGTGCCTTACCACATGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCACAGGTATAGTGAACTAGTCATTCGTAAAGCCAAAGTACAGGTCCTGTTTATGAGCTTCCTGTGCACCTAGGCTTACGAG------------ + +a +s mr.mrrefChr3 143336 9 + 181019 GCTCACTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594757 9 + 636262 GCTCACTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 69937 3 - 647215 ------TCT + +a +s mr.mrrefChr3 143345 224 + 181019 CTTAGTCTCAGCTTGGGGTGGCATGATACATCCTATACCATATGTCTCCACTTGCCAGATTGTGTAATGGGTACTAAGCCAAGCAAGTCAGACAAGTTATGAGTCAGCAACCAGTTGCCTAAGTTACTAGGTCTAATCTGGTAAAGTATAGTTCATTTGAGGTATTTCAAATGACTTTGAGCTATGCAGACTGTACCTGAATGCAATGCAACGTGGTGCATTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594767 223 + 636262 CTTAGTCTCAGCTTGAGGTGCCATGATACATCCTATACCATATGTCTCCACTCGCCAGATTGTGTAATGGGTACTTAGCCAAGCAAGTCAGACAAGTTATGAGTCAGCAACGAATTGCCTAAGCTACTAGGTCTAATTTGGTAAAGTATAGTACATTTGAGGGATTTCAAATGACTTTGAGCTATGAATAC-ATACCTGAATGCAATGCAACGAGGCGCACTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 69940 220 - 647215 CTTAATCTCA-CTTGGGGTGGCA--ATGCATTCTATACCACATGTCTCCACTTGTCAGAGTGTGTAATGGGTACTAAGCCAAGCACGTCAGACAGGTTATGAGTCAGCAACCAGTTCCATAAGTTACTAGGTCTAA-CTGGTAAAATATATTTAATTTTAGGTACTTCAAATGACTTTGAGCTATGCAGACTGTACCTGAATGCAATGCAACATGGTGCATTGC + +a +s mr.mrrefChr3 143569 18 + 181019 AAAAGCTCAGGTTTAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594990 18 + 636262 AAAAGCTCAGGTTAAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 70162 18 - 647215 AAAAGCTCAGGTTTAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 143587 105 + 181019 AAGTTCCCCCACAGTAACAAGCCTCGAATGCATATAAAAGCCCCTCTATCTTTAAATGAATAGCCAAGGAGTACAACACACCATGAAACACACATATCAATCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595009 102 + 636262 AAGTTCCCCCACAG---CAAGCCTCGAATGCATATGAAAGTCCCTCTATCTTTAAATGAATAGCCATGGAGTATGACGCACCATGAAACACACATATCAATCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 70180 93 - 647215 AAGTTCGCCCAGAGTAACAAGAC-----------TAAAAGCCCCTCTTTC-TTAAATGAATAGCTGAGGAGTACAACACACTGTAAAACACACATATCTACCAGT + +a +s mr.mrrefChr3 143692 22 + 181019 GTGACATTTCCTTAGGCAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595112 22 + 636262 GTGACATTTCCTTAGGCAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 70273 22 - 647215 ATGACATTCCCTTAGGCAAAAA + +a +s mr.mrrefChr3 143714 210 + 181019 GGGCTCAGAGGTAATGCTCAGGAATAGACAGTGTCACTGGGGTCAATTCAATTACTGCTAAGCTATAAGAACAATTGTGGATATGCTTGAAAACTAACAGATTCATTCAACCAATGCATGCATTCCATCTCTCAGATCACAAACAACAAATTGCTAGGAATCCTTACATAAGTAGCAGTTCCTAGGAGTTGGCACACCAGACCATGCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595135 210 + 636262 GGGCTCAGAGGTAATGCTCAGGAATAGACAGTGTCACTGGGGTCAATTCAATTACTGCTGAGCTATAAGAACAATTGAGGATATGCTTAAAAGTGGACAGATTCATTCAACCAATGCATGCATTCCATCTCTCAGATCACAAACAACAAATTGCTAGGAATCCTTACATAAGTAGCAGTTCCTAGGAGTTGGCACACCAGACCATGCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 70295 172 - 647215 GGGCTC-------------------------------------CAATTCAATTAC-GCTAAGCTATACGAACGATTGTGTATAGGCCTGTAAACTAACAGATTCATTCAAGCAATGCATGTGTTCCATCTCTTAGATCAGAAACAACAAATTGCTGGAGATTCTTACATAAGTAGCAGCTCCTAGGTGTTGACACACCAGATCTTGCCGT + +a +s mr.mrrefChr3 143924 42 + 181019 AGAGTTAATGTTTGTGTTAGTAGTCAGTTGTCAGCTGTCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595493 42 + 636262 AGAGTTAATGTTTGTGTTAGTAGTCAGTTGTCAGCTGTCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 70467 42 - 647215 AGAGTTAATCTTTGTGCTAGTAGTCAGCTGTCAGCTGCCGGT + +a +s mr.mrrefChr3 143966 160 + 181019 GGTGCTATGCCAGGTGGGTCGTAGAAACCACACAGTGTTCATTTACTTAACTGATACCTGCCCCACGTGGCCATTTACAGACGGTCAGTGCTTTGCTACACCTTCCCCATGCAGCCATGTACACATGGTATCCCTTATCTAAATGAAAGCTAGGCATCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595535 160 + 636262 GGTGCTATGCCAGGTGGGTCGTAGAAACCACACAGTGTTCCTTTACTTAACTGATACCTGCCCCACGCCGCCATTTACAGACGGTCAGTGCTTTGCTACGCCTTCCCCATGCAGCCATGTACACATGGTATCCCTTATCTAAAGGAAAGCTAGGCATCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 70518 155 - 647215 GGTGCTATGCCAGGTGGGTCATAGAAACCACACAAGGTTCATTTACTTAACTGATACCTGCCCTGCATGGCCATGTACACACGGTCAGTGCTTGGATACACCTGCCCCGCACGGCCGTGTACACACGGTATCCCTTATCTAAATAAAAGC-----ATCCT + +a +s mr.mrrefChr3 144126 232 + 181019 GGGACACCTATCCATGGTAGATGTCATACCACCATATACAGATTTCAGCTCAACCAGGCAGACTGCAGAGTCGTAATATCATGGCCAGAGCTCACCGTATGATATAGAGTCTTAGGACCATATAAAGGCTATAGGGATTTTAGTGCCTATTGTGGTCAAATCCCGTGTTTAATAATTAGGCAGATCAGTTTTTGTCATTCATTTAAAATCCATACCCTGTCAGGCTCAGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595696 232 + 636262 GGGACACCTATCCATGGTAGATGTCATACCACCATATACAGATTTCAGCTCAACCAGGCAGACTGCAGAGTCGTAATATCATGGCCAGAGCTCACCTTATGATATAGAATCTTAGGACCATATAGAGGCTATAGGGCTTTTAGTGCCTATTGGGGTCAAATCCCGTGATTAATAATCAGGCAGACCAGTTTTTGTCACTCATTCAAAATCCATACCTTGTCAGGCTCAGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 70673 218 - 647215 GGGACACATATCCATGGTATATGACATACCACCATTTACAGATGTCAGATCAACCATGCGGACTGCAGAGTCGTAATATC------------CACTGTATG--ATAGAGTTTTAGGGCCATATTAAGGCTATAGGGATTTTAGTGCCTATTGTCATCAATTCCCCTGTTTAACAATTAACAAAATCAGTGTTTGTCATTTATTTAAAATCCATACCCTGTCAGGCTAACAGT + +a +s mr.mrrefChr3 144358 338 + 181019 TTGTAACTACAGGTTATTGGTACTGACCCAACATGACCATTGAAGCATGCCAACCTTGTAAACAACACAGTAAACCTAGATTTTTAGCCTCAATACACACTCTACATAGTCTTATGATTCTAAAACATCATTGTTACTTATATCTTGATCCGAACTGCACCCAGTTTCTTGATCACTATTGTATAGTTATAAGTGTTATAGAATACAGAGTTCAATGGTTGAGGTGATGACAAATTGCATAATGGTAACAAAGACATGAGACTATTTATATCCTGTATTACATAAGGATTATTGGTCTAAGATACTGGCATAGGAAATTTTGCATGTCATCTTAGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595931 338 + 636262 TTGTAACTACAGGTTATTGGTACTGACCCAATATGACTGTTGAAGCATGCCAACCTTGTAAACAACACAGTAAAACTAGATTCTTAGCCTCAATACACACTCTACACAGTCTTATGATTCTAAAACATCATTGTTACTTATATCATGACCCAAACTGCACCCAGTTTCTTGATCACTGTTGTATAGTTATAAGTGTTATAGAATGCAGAGTTCAATGGTTCATGTGATGACAAATGGCATAACGGTAACAAAGGCATGAGAGTATTTATATCCTGTGTTACATAAGGATTATTGGTCTAACATACTGGGATGGGAAATTTTGCATGTCATCTTAGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 70891 311 - 647215 --------------------------CCCAACATGACCATTGCAGCATGGCAACCTTGTAACCAACACAGTTTACCTTGATTTTTAGCTTCAATACACACTCTGCATGGTCTTATGATTCTAAAGCATCATAGTTACTGACCTCTTGATCCGAACTGAACCTGGTTTCTTGATCACTATTGTATAGTTAATAGTCTTATAGAATAGAGAGTTCAATGGTTGAGGTAATGAAATATTGCATAATGGTAACAAAGACATGAGACTATTTATATCCTATATTACATAA-AATTATTGGTCCAAGTTACTGGCATAGGAAATTTTGCATGTCACCTTAGCTG + +a +s mr.mrrefChr3 144696 292 + 181019 ATGAGAGCAACACTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGAGTATAATAATTGCTACATATGTAATCCTAGCTTTATGAAGTCCACAATTTGAACAATATATAGTGGAAAGAGAAAGAATTGCATACATGCAATACATGACACAAATGATAATCTGACAGTTATATTATCCCTATCTGTAGCAATTACATGGTGCATGATGGCCCCCTCACTTGGTTAGGCAGGACAAAGACTGAATGCCTTTAAGGAGGTTTATCCTCAATTTCTGTTGCCAATGACCAAACAGGAAAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596271 292 + 636262 ATGAGAGCAACATTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGAGTATAATAATTGCTACATATGTAAACCTAGCTTTATGAAATCCACAATTTGAACAATATATAGTGGAAAGAGAAAGAATTGCATACATGCAATACATGTCACAAGTGATATTCTGAAAGTTATATTATCCATATTTGTAGCAATTACATGATGCATGATGGCCCCCCCACTTGGTTGGGCAGGACAAAGACTGAATGCCTTTAAGGAGGTTTATCCTCAATTTCTGTTGCCAATGAACAAACAGGAAAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 71202 279 - 647215 ATGAGAGCAACACTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGTGTATAATAATTGCTACATATGTAATCCTAGCTTTATGAAGTCTACAATTCGAACAATATATGGTGGAAAGCAAACGAATTGCATAGATGCAATACATGACACCAATGATAATCTGACAGTTATATTCTCCCTATCTGTAGCAATTACGTGGCGGAAGATGGTCCCCTCACTTGGTTAGGCAGGGCAAAGACTGAATGCCTTTAAGAAGGTTTATGCTC-------------AACAACCAAACAAAAAAACC + +a +s mr.mrrefChr3 144988 40 + 181019 ATACATAATAATTGCAGAATTCCATTATTATGAATCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596574 40 + 636262 ATACATAATAATTGCAGAATTTCATTATTATGAATAAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 71481 40 - 647215 ATACATAATAATTGCAGAATTCCATTATTATGAATCAGTT + +a +s mr.mrrefChr3 145028 28 + 181019 CATTCTGAGGACAATCTAGCCAATCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596614 28 + 636262 CATTCTGAGGACAATCTAGCCAATCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 71522 28 - 647215 CATTTTGAGGACAATCTAGCCAAGCTGT + +a +s mr.mrrefChr3 145056 85 + 181019 ATATACACATTTAATGCAGATACGGCAGCATCCCTGGCCACCCAATACCAAATTGAAAAGCTCAGGATGGATCCTACTACTCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597072 79 + 636262 ATATACACATTTAATGCAGATACAGCGGCATCCCTGGCCACCCAATACCAAATTGA------CAGGATGGATCCTACTACTCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 71550 73 - 647215 ATATATAC------------TAAGGCAGCATCCCTGGCCACCCAATATCAAATTAAAAAGCTCAGAATGGATCCTACTACTCCTC + +a +s mr.mrrefChr3 145141 75 + 181019 TCTGTAAAAGAGTGCCTCTTAATATGCATTATCACTTAGCTGGACTGTCTGAGCCTGAGGTCTCATTCTCCACGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597154 75 + 636262 TCTGTAAAAGAGTGCCTCTTAACATGCATTATCACTTAGCTGGACTGTTTGAGTCTGAGGTCTCATTCTCCACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 71623 75 - 647215 TCTGTAAAGGGGTGCCTCCTAATATGCATTATCACTCAGCTGGACTGTCTGAGCCTAAGGTCTCACTCCTGAGGT + +a +s mr.mrrefChr3 145216 30 + 181019 CTCACTCTCTCCATACAATTATACTATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597230 30 + 636262 CTGGTATTGTCTTTACAATTACACTATCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 71698 30 - 647215 CTCACTCTCCCCATGCAATTATACTATCAA + +a +s mr.mrrefChr3 145246 149 + 181019 TGTAGTTTAATGAGGATAAGAAAATGGTGCCATATTTACATTTATGAATTAGGAAATGTAGTTGCTACTTTGAACAGACATTGACCAACATGCCTGAAAGAGAACTGAATCTTAATATCTTTAATGCAAGCCTCACTATCTATCATGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597261 149 + 636262 TGTAGTTTAATGGGGATAAGAAAATGGTGCCAGATTTACATTTATGAATTAGGAAATATAGTTGCTACTTTGAGCAGACATTGACCAACATGCCTGAAAGAGGACTGAATCTTAATATCTTAAATGCAAGCCTCACTATCTATCATGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 71728 138 - 647215 TGTAGTTTAATGAGGATAAGAAGATGGTGCCATATCTAGATTTATGAATTAGGAAATGTAGTTGCTACTTTGGACAGACACTGACC-----------AAGAAAAGTGAATCTTAATATCTTTAATGCAAGCATCCATATCTATCATGAG + +a +s mr.mrrefChr3 145395 15 + 181019 AGCCAACAATGGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597410 15 + 636262 AGCCAATAATTGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 71893 15 - 647215 GACCAACAATGGCTT + +a +s mr.mrrefChr3 145410 97 + 181019 TTATCACACAAAGCCATGATGCTTGAGTAGAGTAACGGCATGTGATCATGCTTGTCAATGTTCACCTGTCTAAGTCTGTGCCAAGAAGTGTGCCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597426 88 + 636262 TGATCACACAAAGCTATGATGCTTGAGTAGAGTAACGGCATGTGATCATGCTTATCAATGTTCACCTGTCTA---------CAAGAAATGTACCTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 71908 94 - 647215 TTATCACAC---GCCATGATGCTTGAGTAGAGTAGCAGCAGGTGATCATGATTGTCAATGTTCACCTGTCTAAGTCTGTGCCAAGAAGTGTGCCTGT + +a +s mr.mrrefChr3 145507 88 + 181019 CCACCACCTATACTTTTTGTTTGCATCTTTGCTTATGTCAAACCCAGCCCCAGATAGTTCAAATTACTGAAAGAGGGATGTTGTCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597516 85 + 636262 CCATCACCTATACTTTTTGTTGGCATCTTTGCTTATGTCA---CCAGCCCCAGATAGTTCAAATTACTGAAAGAGGGATGTTGTCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 72002 88 - 647215 CCACCACCTATACTTTATGCTTGCATCTTTGCTTATGTGAAACCCAGCCCCAGGTGGTTCAAATTCCTGAGAGAGGTATGTTGTCTAC + +a +s mr.mrrefChr3 145595 39 + 181019 CAGAGAGGTGTGTTTGCTAGATAAACCCTCGTAGCTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597601 39 + 636262 CAGAGAGGTGTGTTTGCTAGATAAACCCTCGTAGCTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 72091 39 - 647215 CAGAGAGGTGTGTTTGCTAGATCAACCCTTGATGGTGCA + +a +s mr.mrrefChr3 145634 15 + 181019 CCAATCAATCTATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597641 15 + 636262 CCAATCAATCTATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 72130 15 - 647215 CCCATCAATCCAGTT + +a +s mr.mrrefChr3 145649 120 + 181019 TATATACATAAACTATTTGCAACTTGATCTATTGTACATACCTAAAGTACTGTAGCTGGTGCCCTATGAGTTGGCTATCAGCCTCAGATTCATGGAGACTGGACGCTCATTTATTAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597727 120 + 636262 TATATACATAAACTATTTGCAACTTGATCTATTGTACATACCTAAAGTACTGTAGCTGGTGCCCTATGAGTTGGCTATCAGCCTCAGATTCATGGAGACTGGACGCTCATTTATTAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 72145 120 - 647215 TGTATACGTAAGTTAGGTGCATCTTGATCTATTGTACATACCTAAAGTATTGTAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGGCTATCAGCCTCAGAGCCATGGAGAGTGGATGCTCATTTTTTCAACT + +a +s mr.mrrefChr3 145769 57 + 181019 GGAGGAGAAGGATAGAATCGACCCAACCAGGATGGAATCCTTAGCTACCTCGTTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597848 57 + 636262 GGAGGAGAAGGATAGAATCGACCCAACCAGGATGGAATCCTTAGCTACCTCGTTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 72265 57 - 647215 GGAGGACAAAAATGGAATTGACCCAATCAGGATGGAATCGTTAGCTCCCTTGTTAAT + +a +s mr.mrrefChr3 145826 214 + 181019 GAAGGAATAGCATGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTGGCCTGTAGAGACATGATAGGCATACAAAGTACAGCCATGAGGGAACACCTAATATGCAAATACCCATTATCTGTAGGCCCACTTCCTATGGTTCATCCCTGTGTTTAATCTAGCCCTCAAGGCATAATAGCCATAGTGGTTTGACCCTAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597905 214 + 636262 GAAGGAATAGCATGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTAGCCCGTAGAGACATGATAGGTATACAAAGTACAGCCATGAGGGAACACCTAAGATGCAAATACCTATTATCTGTAGGCCCACTTCCTATGATTCATCCGTGTGTTAAATTTAGCCCTCAAGGCATAATAGCCATAGGGGTTTGACCCTAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 72326 212 - 647215 GAAGGAATAGTCTGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTGGACTGCAGAGACATGATAGGCACACAAAGTACAGCTATGAGGGAACACCTAATATGCAAATACCCATTATCTGTAGGCCCAC--CCTATGGTTCATCCCTGTGTTTAATCTAGCCGTCAAGGCGTAATAGCCATAGTGGTTTGACCCTAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 146040 67 + 181019 GGCTTTCAGACCACAAAATCAAGAATATTCCCATAGTATAGTATATTGAGGAAGACATGGGATCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598121 67 + 636262 GGCTTTCAGACCACAAATTCAAGAATATTCCCATAGCATAGTATATTGAGGAAGACATGGGATCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 72538 67 - 647215 GGCATTCATACCTCAAAATCAAGAATAATCCCATAGTATAATATAGTGAGGAAGACGTGGAATCTTG + +a +s mr.mrrefChr3 146107 84 + 181019 TTGGCTCCTTGTTCAGTGGAATCAATCCCTCCAGTTCAATCGACGAAGGGGCTATGGTGAAGGTGGATTCAGTGAGTCTAAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598188 84 + 636262 TTGGCTCCTTGTTCAGTGGAATCAATCCCTCCAGTTCAATCGACGAAGGGGCTATGGTGGAAGTGGGTTCAGTGAGTCTAAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 72613 84 - 647215 TTGACTCCTCATTCAGCGAAATCCATCCCTGCAGTTCAACCGATGAAGGGGCTATGGTGAAGGTGGATTTAGTGGGTCTAATGA + +a +s mr.mrrefChr3 146191 35 + 181019 ATTCCAGTGCTTGCAGGAACTGCAGAGATACAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598273 35 + 636262 ATTCCAGTGCTTGCAGGAACTGCAGAGATACAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 72697 35 - 647215 ATGCCAGTGCTTGCAGGAAATGCAGAGATCCATCC + +a +s mr.mrrefChr3 146226 36 + 181019 TATATCATGTTCCACAGGTCCTATAAGCCCCAAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598310 36 + 636262 TATATCATGTTCCACTGGTCCTGTAAGCCCCAAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 72732 36 - 647215 TGTATCATATTCGACAGGTCCTATAAGTCCCAAGAC + +a +s mr.mrrefChr3 146262 222 + 181019 TTAAGGGGTAATGACCACCCCAAGATTTCATCTTTGTTCAACCACTTTGACTCATCAACTCACAGGTTTTTCAAAGATTACTCCTGGAATACTACATTTGGATTCTAAACATTTACTTATGGTCATTTGTCATAGCTTTCACTTCCCTTGTCTATGATTTGCCTTGGCCATCATATGATTAGCACTTGTAGAATCAACCCCACCAATAAAGCACACTACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598347 222 + 636262 TTAAGGGGTAATGACCATCCCAAGATTTCATCCTTGTTTAACCGCTTTGACACATCAATTCACAGGTTTTTCAGAGATTGCTCCTGGAATACTACATTTGGATTGCAACCATTTACTTATGGTCATTTGTGATAGCTTTCACTTCCCTTGACTATGATTTGCCTTGGCCATCATTTGATTAGCACTTGTAGAATCAACCCCACCAATAAAGCACACTACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 72768 207 - 647215 TTAACAGGTAGTAATCACCCCAAGATTTCCTCTTTGTTCAACCACTTTAACTCATCAAC--------------AAGATTACTCCTGGAATACTACATTCAGATTCTGCACATTTACTTACAGTCATTTGTCATAGCTTTCAGTTCCCTTGTCTATGA-TTGCCTTGGCCATCATATGATCAGCACTTATAGAATCAACCCCACCAATAGAGCACACTACAAT + +a +s mr.mrrefChr3 146484 65 + 181019 CAGATTCGGAAACTGAGGGCAACCTTCAGACATCTATCTTCCTACGGCAAAAGAATTTAGGTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598584 65 + 636262 CAGGTTCAGAAACTGAGAACAACCTTCAGACACCTATCTTCCTACGGGCAAAGAATTTAGATGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 72975 65 - 647215 CAGATTCGGAGACTGAGGGCAACCTTCAGACATGTATCTTCCTATGGCAAAATAATTTAGGTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 146549 18 + 181019 CATATGGCTTGAAAATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598649 18 + 636262 CATATGGCTTAAAAATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 73041 18 - 647215 CATATGGCTTGAAAATAA + +a +s mr.mrrefChr3 146567 93 + 181019 TGGCCTCGGAATGGGATTTGATTGTGCACAGTGTACTTCATACGTAAACATTGCCTGAGTAGCCATACTATAAGGATACAAAATATTCAGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598668 93 + 636262 TGGCCTCGGAATGGGATTTGGTTACGCACAGTGTACTTCATACATAAACATTGTCTGAGTCGCCGTGCTATAAGTATACAAAATATTCAGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 73059 92 - 647215 TGGCCTCAGAATGGGATTTGATTGTCCACAGTGTACTT-ATATGTAGACACGGCCTGAGTAGCCATACTATAAGGATACAAGATATTCTGAAG + +a +s mr.mrrefChr3 146660 23 + 181019 AAATAATACATTTCTATTCCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598762 23 + 636262 AAATAGTACATTTTTATTCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 73151 22 - 647215 -AATAATACATTTCTATCCCCAG + +a +s mr.mrrefChr3 146683 295 + 181019 TAGTTCCTACATATAACTCCAGGGCGGTGTCCTGGGAACATACATCATACAAATGATTGTGCTCCATTTCTCCATTGTGTGGAGCTGCATCTGTGCCTCATGGATGGTCTTCATTATCATTTTCAGCCTCTTTAGTTCAGCATTTTAATGTAGGTTTTGTGTGGACACACATAGCAATTTTTTTAAGATAACATTCTAGTTCCATCGGGGGTCAACATTGGGAATTAGTCATTATATGGCTGCAATATGACCTGGTCTTAGCAGAGAGGCTTATGATCTTCATCATGTGTGTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 598785 287 + 636262 TAGTTGCTCCATATAACTCCAGGGCGGTGGCCTGGGAACATTCATCATACAAATGATTGTGCTCAATTTCTCCATTGTGTGGAGCTGCTTCTGTGCCTCAAGGATGGTCTTCATTATCATTTTCAGCCTGTTTAGTTCAGCATTTTAATGTAGGTTTTGTGTCGATACACATAGCAATTTTTTTGAGATAACATACTAGTTCCATTGGGGGTCAACATAGGGAATTAGTCATTATATGGCTGCAATATGACCTGGTCTTAGCAGGGAGACTTATAATCTTCATCATG-------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 73174 295 - 647215 TAGTTCCTACATATAACTGCAGGGCGGTCTCCTGGGAACATACATCATACAAATGATTGCACTCCATTTTTCCATAGTGTGGAGCTGCATTTGTGCCTCATGGATGGTCTTCGTTGTCACTTTCAGCCTCTTTAGTTCAGCATTTTAATGTTGGTTATATGTGGACACATATAGCAATTTTTTTAAGATAACATTCTAGTCCCATCGGGGTTCAAGATTGGGAATTAGTCATTATATGGTTGCAACATGACCTGGGCTTAGCAGAGGGGTTTATGATCCTCATCATGTGTGTACA + +a +s mr.mrrefChr3 146978 71 + 181019 CTTGTGTTGTTCTGGCAAAAAACATACCCCTGTTCAGCTTGCTAAGAGTGGTTTGTGGTACTAATCTAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599072 71 + 636262 CTTGTGTTGTTCTGGCACAAAGCATACCCCTGTTCAGGTTGCTAAGACTAGTTTGTGGTACTAATCTAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 73489 71 - 647215 CTTGTGTTGTTCCAGCAAACTACATACCCCTGTTCATCTTGCTAGGAGTGATCTGGGGTACTAACCTAATT + +a +s mr.mrrefChr3 147049 92 + 181019 AAATTACCTCAGACACCATTATTATTTCTCCTGCCCATCATCATGTTATACAGAATTATCTTTGGCTTCACTGCAAGTGGTCAACACTGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599144 92 + 636262 AAATCACCTCAGACAGCATTTTTATTTCTTCTGCCCATTATCATGTTTTACAGACTTATCTTTGGCTTCAGTGCGGGTGGTCAACACTGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 73560 89 - 647215 ---TTACCTCAGACACCATTATTATGTCTCCTGCCCATCATCATGTTATACACAATTATCTTTGGCTGCACTGCAAGTGGTCAACACCGTGC + +a +s mr.mrrefChr3 147141 235 + 181019 ACTAAGTCTGTCATGCTAGATTACTGATGTTGGGTGGTGATACTCCATTCGGCACTTTTTTGTAAATATTATTGTTATCTAACTTCCACTCCCTCACTCCCCGGACCCTGGCAGTCATACATTGCTCTCACTTCATCGCACAAGCCACTTTGAACTAGGGGGACAAGTGGTATCTGGGTGGATGGTAACATCTTGAAGGGTAATTGTTGTCAGGTGTAACTGTCCAGTAGATTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599238 228 + 636262 GCTAAGTCTGTCATGCTGGATTGCTCATGTTGGGCGGTGATACCCCATTCGTCACTTTTTTGTAAATATTATTGTTGTCTAACTTTCACTCCCTCACTCCCCGGACCCTGGCAGTCATACATTGCTCTCACTTTGTC-------CCACTTTTACCTAGGGGGATGAGTGGTATCTGGGTGGATGGTAACATCTTGAAGGGTAATTGTTGTCAGGTGTAGCTGTCCAGTAGATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 73649 235 - 647215 ACTAATTCTGTCATGCTAGATTACTGATGTTGGGTGGTGGTACTCCATCTGGCACTTTTTTGTAAATATTATTGTCACCTAACTTCCACTCCCTCACTCACTGGACCCTGGCAGTCATACATTGCTCTCATTTCATCGCACAAGACACTTTGAACTGGTGGGACAAGTGGTATCTTGGTGGATGGTAACATCTTGGAGGATATTTGTTCTCAGGTGTAACTGTCCAGTAGACTGT + +a +s mr.mrrefChr3 147376 146 + 181019 ACCACCTCTACCTAAAGAGGCCCAAATATGAGCAGTCCTACAATGTGCCACCAGTACTGTGGAATTTACCCCCATGAGTCAACACAATAATAACATCTtatgtttttcagataagtagatatcttttttagcaggatgcttattaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599467 144 + 636262 GACACCTCTACCTAAAGAGGCCCAAATATGAAGAATCCTAAAATG--CCACCGGTACTGTGGAATTTCCCCCCATGAGTCAACACAATAATTACATTTtatgtttttcagataagtagatatcttttttagcaggatgcttattaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 73884 146 - 647215 ACCAGCTCTACCTAAAGATGCCCAGAAATGAGCAGCCCTACAATGTGACACCAGTACTGTGGAATTTACCCCCATGAGTCAACACAATAATAACAGCTtatgtttttcagataagtagatatcttctttagcaggatgcttatttg + +a +s mr.mrrefChr3 147522 11 + 181019 aggtatttctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599619 11 + 636262 aggtatttctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 74030 11 - 647215 aggtacttctt + +a +s mr.mrrefChr3 147533 23 + 181019 ttgttggttttattcttgtaagc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599637 23 + 636262 ttgttggttttattcttgtaagc +s simRat_chr6.simRat.chr6 74041 23 - 647215 ttgctggttttattctcgtgagc + +a +s mr.mrrefChr3 147556 9 + 181019 cttgttgta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599660 9 + 636262 cttgttgta +s simRat_chr6.simRat.chr6 74073 9 - 647215 cttgttgta + +a +s mr.mrrefChr3 147565 17 + 181019 agttcacacatgaggag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599669 17 + 636262 agttcacacatgaggag +s simRat_chr6.simRat.chr6 74091 17 - 647215 ggttcagacatgagggg + +a +s mr.mrrefChr3 147582 40 + 181019 ttccaatgggtaagttcatgatgggcttcattgaagatga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599704 40 + 636262 ttccaatgggtaagttcatgatgggcttcattgaagatga +s simRat_chr6.simRat.chr6 74108 40 - 647215 ttccaatgggttagtgcatgatgggcttcattgaagatga + +a +s mr.mrrefChr3 147622 26 + 181019 agctgcattgagatttaagcttacac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599745 26 + 636262 agctgcattgagatttaagcttacac +s simRat_chr6.simRat.chr6 74148 26 - 647215 acctgcattgagatttaggcttacac + +a +s mr.mrrefChr3 147648 86 + 181019 tacatcttgtatctaatTTTCACTAGTAATAGCTTAATATCTTAAAGATGGCAATAAATGTACATTAGGTCTAGTGTATAGTTTCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599771 85 + 636262 tacatcttgtatctaatTTTCACTAGTAATAGCTTAATAACTCAAAAATGG-AATAAATGTACATTAGGTCTAGCATATAGTTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 74176 86 - 647215 tacatctcgaatctgatTTTCACTAGTAATAACTTCATATCTTAAAGATGGCAATAAATGTACATTAGGTCTAATGTATAGTTTCG + +a +s mr.mrrefChr3 147734 76 + 181019 TGTGTCTTTCCCATTATCAGAGATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTAACAGTGAATCACATCTCACCTGCTTCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599856 75 + 636262 TGTGTCTTTCCCATTATCAAAGATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTAACAGTG-ATCACATCTCACCTGCTTCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 74273 76 - 647215 TGTGTATTTCCCATTATCAGAAATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTGACAGTGAATCATATCTCACCTGCTTTTCC + +a +s mr.mrrefChr3 147810 47 + 181019 AATTCTAAATACTTTTGTCTATGATGTGATGTTCAAAAATTATTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599939 47 + 636262 AATTCTAACTACTTTTGTCTATGATGTGATGCTCGAAAATTATTCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 74349 47 - 647215 AATTCTAAATACTTTTGTCTATGATGTGATGTTCAAAAATTATTCCA + +a +s mr.mrrefChr3 147857 120 + 181019 TATGCCCAGTTTGCAAATCTGGGGATTAATTTTATGCCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCTGGGCTAGCACCTACCCTGCACCTTACATTGGCATAAGTGGAGATACAGTTGAACCCATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600018 120 + 636262 TATGCCCAATTTGCAAATCTGGGGATTAATTTTATGTCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCAGGGCTAGCACCCACCTTGCACTTTACATTGGCATAAGTGGAGATACAGTTGAACCCATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 74396 120 - 647215 TATGCCCAGGCTGCAAATCTGGGGATTGATTTTATGCCTGATGAGTAAAGCAAGCAGCTGGGCTAGCACCTACCCTACACCTCACATTGGCATGAGTGGAAATACAGTTGAACCCGTCTT + +a +s mr.mrrefChr3 147977 443 + 181019 TGACGTAATCTGCCCCATTGTCATGTCAAAATTCCTCTTGCTTGGTGCACACAGAATTTCTAGTTTCTGTGCACAAAGAACCATACTTTGTCCCTTAGGTAAATTTATGCGGTATGACGCACTTGCTAATTTTTAGATAAGACTTTCCAATTTTTAGATATTTGGATACACTCTGTGAAACTCTCAGTTCCTGTTTTGACTTTAATAGCCTTAAGCAGCCTCCCATAAATATCATGGTTGATTTGGATTCTTAATGCTGCTCTACACTTTCAGATTAGCCCAAGTGCCTCCCATAATGGTCCTGTGTTAGGATCCTCCTACACTGTCAATCCCTTTTATCTTGCTCCCTGAAATGGGGTGATTTCAAGGTGAGACCAAATATTTGGAAAAAATGAAATATGGATCATGATCACATGGTGCTGGAGCATGTTGAAGCTATCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600156 431 + 636262 TGATGTAATCAGCCCCACTGTCATGTCAAAATT--TCTTGCTTGGTGCACACAGAATTTCTAGTTTCTGTGCACAAAGAACCATACGTTGTCCCTTAGATGAATTG----GGTATGACGCACTTGCTAATTTTTAGATAAGACTTTCCAATTTTTAGATATTTGGATACACTTTGTGAAACTCTCAGTTCCTGTTTTGACTTAAATAGTCTTAAGCAGCCTCCCATAAATATCATGGTTGATTTAGATTCTTAATGCTGCTCTACACTTCCAGATTAGCCCAAGTGCCTCCCATAATGGTCCTGTCTTAGGATGCCCCTACACTGACAATCCCTTTTATCTTGCTTCCTGAAATGGGGTGATTTCAAGGTGAGACCTAATATTTGGAAAAAATGAAATATGGATCATGATCACATGGTGCTGGAGCATGTTGAAGCT------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 74516 441 - 647215 TGACTTAATCTGTCCCATTGCCATCTTAAAATTCCTCTTGCTTGGTGCACACAGAATTTCTAGTTTCTGTACACAAAGAACCATACTTTGTCCCTTAGGCAAATTTATGCGGTATGATGCAATTGCAAACTTTTAGATAGCACTACTCAATTTCTAGATATTTGGATACACTCTGTGAATCTCTAATTTCCTGTTTTGACTTTCATAGCCTTAAGCAGCCTTCTATAAATATCATGGTTGACTTGGATTCTTAATGCTGCTCCACACTTTCACCTTAGCCCAAGTGCCTGCCATAATGGTCATGTGGTAGGATCCTCCTACACTGTCAATCGCTTTTATCTTGCTCCCTGAAAAGGGGTGATTCCAAGGTGAGACCAAATGTTTAGAAAAAATCAAATATGGATCGTGAACACATGGTGCTG--GCATGTTGAAGCTATCTAA + +a +s mr.mrrefChr3 148420 296 + 181019 GGTTGATCTGTGCACTTGAATAAAAAAAACATCATTTTGATGTGATACCCCTGTATTATTTTGTATTAGCTACTTACGAGTCTGTCGTGATATATCAGCAGTTACAAGAAATCAAGGGAGTTCAGCAAGATGATGCCCTCCAGCTCCCAAAAGACCTCGATTATTTGACAATCAGGGATGTTACGCTAACACATGAACTAAGGGCAAAGTTACATTTTAGTCCTCCACAGACTGTTGTATATAGTAGTCCAAAGTGAGGAGTTGTCATACGGAAAAAAGTGTATCTTGAAGTTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600587 282 + 636262 --------------CTTGAATAAAAAAAACATCATTTTGATGTGATACCCCTGTATTATTTTGTATTAGCCACTTACGAGTCTGTCGTGATATACCAGCAATTACAAGAAATCAAGGGAGTTCAACAAGATGATGCCCTCCAGCTCCCAAAAGACCTCGATTATTTAACAATCAGGGATGTTACGCTAACACATGAACTAAGGGCAAAGTTACATTTTAGTCCTCCACAGACTGTTGCATATAGTAGTCCTATATGAGGAGTTGTCATACGGAAAAAAGTGTATCTTGAAGTTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 74975 296 - 647215 GGTTGATCTGTGCACTTGAATAAAAAAAACATCATTGTGATGTGATACCCCTGTATTATTTTGTTTTAGCTACTTACGAATCTGTCTTGATATATCAGCAGTTACAAGAAATCAAGGGAGTTCAGCAAGATGATGCCCTCCAGCTCCCAAAAGACCTGGATTATTTGATGATCAGGGATGTTACACTAACACATGAACTAAGGGCAAAGTTACATTTTAGTCCTCCACAAACTGTCGTATATCGTAGTCAAAAGCGAGGAGTTGTCATATGGAAGAAAGTATATCTTGGAGCTAAA + +a +s mr.mrrefChr3 148716 164 + 181019 CTCCTGGTCTGATCCAGTCATAAGAACTGCAATAGAGATTGCTAACAGTTACCCAATTGAGGGTTTCCAGACTCTGGACACCCCCATATAAATAACCTGTTAGGTCTACAAATGCATGGTCTGCCAAGAAAAGACATAAGTAAAGATAGTCTTCTATGAAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 600870 164 + 636262 CCCCTGGTCTGATCCAGTCATGAGAACTGCAATAGGGATTGCTAATAGTTACCCAATTGAGGGCTTCCAGACACTGGACACCCCTATACAAATAACCTGTTAGGTCTACAAATGCATGGTCTGCCAAAAAACGACATAAGTAAAGATAGTTTTCTATGAAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 75271 163 - 647215 CTCCTGGTCTGATCTGGTCATAAGAACGGCAGTAGAGTCTGCTAACAGTTACCCAATTCAGTGTTTTCAGACTCTGGGCGCCCCCATATAAAAAACCTGTTAGGTCTACAAATGCATGGTCTGCCATGAAAAGACATAAG-AAAGGCAGTCTACTATGCAAATT + +a +s mr.mrrefChr3 148880 5 + 181019 TTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601034 5 + 636262 TTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 75436 5 - 647215 TTTCT + +a +s mr.mrrefChr3 148885 149 + 181019 CTCACACCCATGATGATATCTCATGGGGATATTCCAATTTCAGAGTTCCAAGAACAATATAGTTTTGGTAATGGATTCTTATCTTGTCTACCACACACTGATTTGTTTCACATTAGGCTAATCACTTTTTCAACTGAACCTAATTAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601039 149 + 636262 GTCACACCCATGATGATATCTCGTGGGGACATTCCAATTTCAGAGTTCCAAGAACAATATAGTTTTGGTAGTGGATTCTTATCTTGTCTACCACACACTGATTTGTTTCACATTAGGCTAATCACTTATTCAACTGAACCTAATTAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 75442 149 - 647215 CTCACTCCAACAATTATATCTCATGTGGATATTCCAATTTCACGGTTCCAGGAATAATATAGTTTTGGTAATGGATTCTTATCTTGTCTAACACACATTGAGTTTTATCACATTAGGCTAACCGCCTTATCAACTGAACCTAATCAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 149034 53 + 181019 TATGTCATGAATTGTAGAGTCCATTGCCATACGTATCACACCTGTTTAGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601214 53 + 636262 TATGTCATGAATTGTAGAGTCCATTGCCTTGCGTATCACACCTGTTTAGGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 75591 53 - 647215 TATGTCATGAATTGTGGCATCCATTGGCATACATATCACAGCTGTTTAGGACT + +a +s mr.mrrefChr3 149087 10 + 181019 AGCTGAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601267 10 + 636262 AGCTGAGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 75645 10 - 647215 AGCTGCAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 149097 65 + 181019 TTTCTGAAAGCCTTCTAGAAGGAGCTTCTAATCATCCAAACAAGGTCCTAGGTCAAGCATTACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601283 65 + 636262 TTTCTGAAACAATTCTAAAAGGAGCTTCTAATCATCCAAACAAGGTCCTAGGTCAAGCATTACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 75655 65 - 647215 GTTCTGCCAGCCCTGAAGAACGAGCTTCTAATCATCCAAACAAGGTCCTAGGTCAAGCGTTGCTC + +a +s mr.mrrefChr3 149162 82 + 181019 ATAACCCTTCACAAACAGCACATATTGCCATGTGTACTTTGATTACAGACACCCTACTGAGCAGGTGAAAGGACACAGAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601348 64 + 636262 ATAACCCTTCACAAACAGAACCTATTGCCATGTGTACTTTGATTACAGACACCCTATTGAGCAG------------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 75723 71 - 647215 ATAACCCTTCACAAACAGCACATGTTATCAT-----------TTAGAGACACCCTACTGGGCAGGTGAAAGGACACAGAGAG + +a +s mr.mrrefChr3 149244 50 + 181019 TTCCATGTCCACACTGCAAACATTTGTGCACCCAAATATTTAAGGGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601412 47 + 636262 ---CTTATCCACACTGCAAACATTTGTGCACCCAAATATTTAAGGGATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 75795 50 - 647215 TTCCATGTCCACACTGCAAACATTTGCACACCCCGATATTTAAGGGAGAT + +a +s mr.mrrefChr3 149294 37 + 181019 ATAAGACAACCTTAGACAGGGAAGTGTTGACTCCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601461 37 + 636262 AGAGAACAACCTTAGACAGGGAAGTGTAGACTCCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 75845 37 - 647215 ATAAGACAACAATAGACAGGGAAGTGCTGACTCCCAC + +a +s mr.mrrefChr3 149331 181 + 181019 AAGCCATGTACTGGCAATGTCTGTTGAACAATGGATTAACAAGAATAACGATACACAAACTAAATAAACCTCATATAAACACTAGCATCAGTACAGCTAGCAAGTCATTGCAAAGTCATACCTTAAGTTTGACTCTGATCTGTCACAATACATGTTACTTAAATAATTGGGCTCCTGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601498 179 + 636262 AAGCCATGTACAGGCAATGTCTGTTGAACAATGGATTACCAAGAATAAC--TACACAAACTAAATAAACCTCATATAAACACTAGCATCAGTACGGCTAGCAAGTCATTGCAAAGTCATACCTTAAGTTTGCCTCTGATCTGTCACAATACAGGCTACTTAAATAATGGGGCTCCTGCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 75907 180 - 647215 ATGCCATGTACTGGCAATTTTTGTTAAACAATGTATTAACAAGAGTAGCGACACACATACTAAGTAAACTTCATACAAACACTCGCATCAGTACAGCCAGCGAGTCATTGCAAAGTCGTACCTTAACTTTGACTCTGATTTGTCACAATACATGTTACTTAAA-AACTGCGCTCCTGCACT + +a +s mr.mrrefChr3 149512 221 + 181019 GATAATGTAAACATCGAGGGAGGTCTCTGTGTGTTCCCACAGCCAATCAGAGTACTCATGGGAGTAGTTGCCAGGGCATAGCACTACCACTTATCACTATCTGACTGAGGGTTTTGCGAATAGGATTCAGGTCTCTCAGGCCTGACAGAGAGGTATTATTCTCCATTACCTTAATCATCGGGGGAAGGTTAAAGATTTCATGTTGTTCTTTTTTTTTAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601686 221 + 636262 GATAATGCAAATATCGAGTGAGGTTTCTGTGTGTTCCTACAGCCAATTAGGGTACTCATGGGAGTAGTTGCCAGGGCATAGCATTATCAATTATCACTATCTGACTGAGGGTTTTGCGAATAGGATTCAGGTCTCTCAGGCCTGACAGAGAGGTATTATTCTCCATCACCTTGATCATCGGGGGAAGGTTAAAGATTTCATGTTGTTCTTTTTTTTTAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 76087 220 - 647215 GATAATGTAAACATCCAGGGAGGTCTCTATGTGTTTCCACAGTCAATCAGAGTGCTTATGCG-GTAGGTGCCAGGGCATAGTGCTACCACTTATCACTATCTAATTCCAGGTCTTGACAATCGGATTCAGGTCTTTCAGGCCAGACAGAGAGGTATTATTCTCCATTACCCTAATCACCAGGGGAAGACTAGAGATTTCATGTTGTTCCATTTGCTCAGTG + +a +s mr.mrrefChr3 149733 51 + 181019 tggctttcatataacatgtatcttagtctacgagcgtgcaacctcaggtca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601936 51 + 636262 tggctttcatataacatgtatcttagtctacgagcgtgcaacctcaggtca +s simRat_chr6.simRat.chr6 76307 51 - 647215 TGGCTTTCATATAACCCGTATTGTAGTCTAAGCGGGCGCAACCTCAGGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 149784 288 + 181019 tggcattaggacgtagcaccaatgttcaaggcaaaaaattttgatgtacaccaaacgcaactcgaaaggtcctaacttctagactctatgtatacaaattacatcttgtggagtGATGGTCAGATCTCTCCCCCCAGGTAGTTTTATCAGTTGTACTTTACTGCATGCACTGCGTTAGCAGGGTCACAATCAGGCACAATGCACTACTATGACTCTAGACACTGACAATCACTTTCCCTGCTCATCTTTTTATTGACAGATCTCCATGTCATCTGTCCTACTGCCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 601987 277 + 636262 tggcattaggacgtagcaccaatgttcaaggcaaaaaattttgatgtacaccaaacgcaactcgaaaggtcctaacttctagactctatgtatacaaattacatcttgtggagtGATGGTCAGATCTCTCCCCCCAGGTAGTTTTATCAGCTGTACTTTACTAC-----------TAGCAGGGTCACAATCAGGCACAATGCACTACTATGACTCTAGACCCTGACAATCACTTTCCCTGCTCATCTCTTTATCGACAAAGCTCCATGCTATCTGTCCTACTGCCCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 76367 281 - 647215 TAACATTAGGACATAGCACCAATGTTCAAGGCAAATAATTTTGATACACACAAAATGCAACTTGAAAAGTCCTCACTTCTAGACTGTATGCACACAAAATACATCCTGTGGAGTACTGGTCAAATCTCTCCACCCAGGCGGTTTTATCAGTTGTGCTTTACTGCATGCACTGCGTTAGTAGGGT-------AGGCACAATCCACTACTATGACTCTAGACACTGAAAATCACTTTCCCTTCTCATCTTTTTAATGACAGATCTTCATGTCATCCATGCTGTAGCACCC + +a +s mr.mrrefChr3 150072 33 + 181019 CTTATCTGTTTCCAACTGTAAGCATACATGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602272 33 + 636262 CTTATTTGTTTCCAAGGGTAAGCATACGTGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 76648 27 - 647215 CTTGTCTGTTTCCAGCTG------TACATGTCT + +a +s mr.mrrefChr3 150105 215 + 181019 GCCCAAACACATAAGGGCCAGAGGTCATTCAAATTAAGACACCTTCAGAACTGTCCTGGAGATTCTGAGGCATCTTTGTGCAAGCACAGCTGGGTTTTAATTGTGTTGTCGTCATCTGATAATTTTATAATAGAAGAAGGTACCTGGTTCTGAGACATTTAATATAGCCTTCTTCTCAGCCTAGTGCCACTTCAGCCACCCATCAGACATGCTCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602305 215 + 636262 GCCCAAACACATGAAGGCCAGAGCTCATCCTAATCAAGACACCTGCAGAACTGTCCTGGAGATTCTGAGGCATCTTTGTGCAAGCACATCTAGGTTTTAATTGTGTTGTTGTCATCTGGTAATTTTATAATAGAAGAAGGTACCTGGTTCTGAGACATTTAATACAGTCTTCTTCTCAGCCTAGTGCCATTTCAGCCACCCATCAGACATGCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 76676 215 - 647215 GCCCAAACACATAGGTGCCAGAGGTCAGTTACATTAAGACACCTTCAGAACCGTCCTGGAGATTCTGTGGGATATTCGTGCAAGCATAGCTGGGTTTTAATTGTGTTATCATCATCTGATAATTTTCTATTAGAAGAAAGTATCTGGTACTGAGGCATACAATATAGCCCCCTTCACAGCCAAGCACCACTTGAGCTGCCCATCAGCCATGCTCG + +a +s mr.mrrefChr3 150320 144 + 181019 GAACTTATAAGTTGAGTGGATAGGTTGCCGGCAACTCAAGCGCAGTGGAACTTGTTTCCTCAGAAGTAGAAGTTTGCATACCAAAAAGCTACCTTCAATGGAACCTGTACAAAATTGGACATGTGTAGTTTCTACCAATTATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602521 144 + 636262 GAACTTATAAGTTGAGTGGATAGGTTGCCGGCAACTCAAGCGCAGTGGAACTTGGTTTCTAAGAAGTAGAAGTTTGAATACCAAAAGGCTACCTTCAATGGAACCTGTACAAAATTAGACATGTGTAGTTTCTACCAATTTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 76891 144 - 647215 GAAGTTTTAAATTGAGCAGATGAGTTGGTGGTAACTCAAGCCCAGTGGAATTTGTTCCCTCAGAAGTAGAAGTTTGCATACTGAAAAGCTACCTTCAATGGAACCTGTACAAAATTGGACATGGGTAGTTCCTACCAATCATTT + +a +s mr.mrrefChr3 150464 31 + 181019 ACTTAGGTGGCTCACAATTAGCTTTCTCGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602666 31 + 636262 ACTTGGGTGGCTCACAATTAGCTTTCTCGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77035 31 - 647215 ACTTAGGTGGCTCACAATTAGCTTTCTTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 150495 47 + 181019 TTTGCTGTTAATCTCAGTCCAATTGCACCGTTGTTCAGCCAAATGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602698 47 + 636262 TTTGCTGTTAATCTCAGTCCAATTGCACCGTTGTTCAGCCAAATGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77066 47 - 647215 TTTGCCATCCATCTCGGTCTAATTGCACACTTGTTCATCCAACTGGA + +a +s mr.mrrefChr3 150542 15 + 181019 GGGAGTCCTAGCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602745 15 + 636262 GGGAGTGTTAGCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 77120 15 - 647215 GGAATTCCTCGGCCT + +a +s mr.mrrefChr3 150557 15 + 181019 TTGTAATTGAGATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602761 15 + 636262 TTGTAATTGAGGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77135 15 - 647215 TTGCAATTGAGATTA + +a +s mr.mrrefChr3 150572 74 + 181019 GTGATGGATTTGGCCCCCAAACAAGGGGTTACTGTGCATGAGGACCCTTACGAGCCCCACAGCCTGGTATTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602782 71 + 636262 GTGATGGATTTGGCCCCCAAACAAGGGGCTACTGTGCATGATGTCCCTTACGAGCC---CAGCCTGGTATTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 77150 71 - 647215 TTGATGA---TGCCCCCCAAACAAGGAGTTGCAATGCATGAGAACCCTTATTGGCCCCACAGCCTAGTATTTTG + +a +s mr.mrrefChr3 150646 60 + 181019 GTGAATAAGAAATGCATGTAGAGAACATCCATGACAGCTGCCTACTCCACTTTAACATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602855 60 + 636262 GTGAATAAGTAATGCATGTGGAGAATGTCCATGAAAGCTGCCTACTCCACTTTAACATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77221 60 - 647215 GTGAATAAGAAATGCATGCAGGAAACATCCATGACGGCTGCCTACTCCACTTTTACATGA + +a +s mr.mrrefChr3 150706 145 + 181019 AATCACCAAGTTGACTTTTGCTTCGGGCTGCTTGTTACAGTGCATGGGCTGACACAGGAGCATCCTCACAATGTCTGATACAGAAGCATTCTCACTATAATGAACATCTTGTAAACACATGTATAGACATTTGTGGTATGGGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 602916 145 + 636262 AATCACCAAGTTGACTTTTGCTTCAGGCAGCTTGTTACAGTGCATGGGCTGACACAGGAGCATCCTCACAATGTCTGATACAGAAGCATTCTCACTATAATGAACATCTTGTAAACACATCTATAGGCATTTGTGGTATGAGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 77281 145 - 647215 AATTGCCAAGCTGACCTCTGCTTCGGGCTTCTTGTTACTGTGCATGGGGTGACACAGGAGTATTCTCACAATGTCTGATACACAAGTATTCTTACTATAATGAACATCTTGTAAACACATGTATAGACATTTGCAGTACGGGGAT + +a +s mr.mrrefChr3 150851 23 + 181019 AATCTAAATTAAACAAAAGTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603063 23 + 636262 AATCTAAGTTAAACAAAAGTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 77426 17 - 647215 ------AATTACACAAAAGTCTC + +a +s mr.mrrefChr3 150874 121 + 181019 TATTACATGAAAATCTGCAACAGAGATAGCGGTGAAATGAGATGTAAGTTTCTGCCCGGGAAGCTACAGCACTTAGCATGCCAGAGGGGGATATTACCTACTATTTGTGTCTCCCATTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603087 121 + 636262 TATTACATGAAAATCTGCAACAGAGATAGTGGTGAAATGAGATGTAAGTTTCTGCCCGGGAAGCTACAGCACTTAGCTTGCCGGAGGGGGACATTACCTACTATTTGTGTCTCCCTTTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 77443 100 - 647215 AGTTACATGAAAATCTGCAACAGAGACAGCGGTGAAATGAGATGCA---------------------AGCATTTACCATGTCAGAGAGGGATGTTACATACTATTTATGTCTCCCATTCCT + +a +s mr.mrrefChr3 150995 28 + 181019 GCTAAAGAAGCTTCTGTTGATGGCACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603208 28 + 636262 GCTAAAGAAGCTTCTGTTGATGGCACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 77545 28 - 647215 GATAAAGAAGCTTCTGTTGATGGCACCC + +a +s mr.mrrefChr3 151023 71 + 181019 TACTGTGTTGATACCTGCTCTCTCCATAGCCCAGGAGTGTGGTCTAAGAAATATTAAGGTATTTACCCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603244 71 + 636262 TACTGTGTTGATACCTGCTCTCTCCATAGCCCAGGAGTGTGGTCTAAGAAATATTAAGGTATTTACCCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77573 71 - 647215 TACTGTGTTGATACCTGCCTGGTCCATAGTGCAGGAGTGTTGTCTAGGAAATATTAAGGACTGTACCAACA + +a +s mr.mrrefChr3 151094 113 + 181019 TCACACCATGCTTAATGGTCCACGAGGCTGTAAATGAAATTCAGACAACAACCAGCATTATCAATTCCTGGCAGAATCATTCTGAAGACTGGTGCTATTCACTGCCCTCAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603316 113 + 636262 TCACACCATGCTTAATGGTCCACGAGGCTGTAAATGAAATTCAGACAACAACCAGCATTATCAATTCCTGGCAGAATCATTCTGAAGACTGGTGCTATTCACTGCCCTCAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 77644 113 - 647215 TCACACCATGCATAATCATCCATGAGGCTGTAAATGCAATTAAGCCAACAACCAGCATTATGAATTCCTTACAGAATCATTCAGAAGACTGATGTTATTCACTGCCCACAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 151207 282 + 181019 TGTGCCAAGGTCTCACAAAATCTGATAATAACCTTAAAGTTCACTCAAAGGCTCATGTGGACATTGCATTGGGCCCCCAGTTCACTTTTGTCTCATGGGTGGTGAAGACAAATGAGCCAATGGGGCCCTGAGCTCTGCATGATGCAGAGTGTAATCAGGGTGTTGCTACAAGAGATGGTGAAACACTGCCAACATGTCATACTCACCATGTCCTATCTAACTTCAGCATAAACCTGGTCGGGGCTAGAACCATATGTGGCCATATACTGACTTGATTCTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603480 282 + 636262 TGTGCCAAGGTCTCACAAAATCTGATAATAACCTTAAAGTTCACTCAAAGGCTCATGTGGACATTGCATTGGGCCCCCAGTTCACTTTTGTCTCATGGGTGGTGAAGACAAATGAGCCAATGGGGCCCTGAGCTCTGCATGATGCAGAGTGTAATCAGGGTGTTGCTACAAGAGATGGTGAAACACTGCCAACATGTCATACTCACCATGTCCTATCTAACTTCAGCATAAACCTGGTCGGGGCTAGAACCATATGTGGCCATATACTGACTTGATTCTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 77757 282 - 647215 TGTGCCAAGGTCTCACAGAATCTGATAATAACCTTAAAGTTCGCTCAAAGGCTCATGCTGACATTGCAATAGGCCCCCAGTTTACTTGTGTCTCATGGGGGGTAAAGACTGAGGAGCCAATGGAGCCCTGAACTGTGTATGATACAGAGTGTAATGAAGGTGTTGCAACAAGAGATAGTGAAACCCTGCCAACATGCCATACTCACAATGACCTGTCCAATTCCAGCATACACTTGGTCTGGACTAGAACCATATGTGGCCAAATACTAACTTGATTCATTT + +a +s mr.mrrefChr3 151489 663 + 181019 CCTCTTTACTGGATTGCTTGCACCGTTGCTTGTCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGCTTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATATTGGTGAATTCTACTCAACGACAGTCTGCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGCGGACCGTCTACAGGAAATAGAATTACAGCTACCCTGCTATAAAAACTGATGATGAAAAATCATGCATAGCAGCTATGTTAGACTGCAGGTAATGCTATAACCATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATTTGCTGCACTATAGGCAGATGAAGAAGAAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCACAATTGATGCTCCAATGTCCTAGGTCAATAATCCTGCTTTTATTTTCATTCTGGAGATTAGGGTTGAAAGCATGTTAATTTAGATTCAGACCAGACATCCTTCAAGTGTCATACCAGTGGATGGAATGACATGGTATGAACAGTATGTACAAACAGCAAATTAAGCAGCCATTTTACTAGCCATATATACTACAGGCATTGACCCAAAGACCCCTGAGCCTTCAGATGTGGCATAGTTTAGAACCCAAGCTTAATATTATGTCACTCAATGTGTGACAAACACTCTCCTGCTATTCACCAGTGTCACCTGGCTGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 603762 656 + 636262 -----TTCCTGGATTGCTTGCACCGCAGCTTGTCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGATTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATCTTGGTGAATTCTACTCAACGACAGTCTGCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGCGGACCGTCTACAGGAAATAGAATTACAGCCACCCTGCTATAAGAACTGATGATGAAAAATCATGCATAGCAGCTATGGCAGACTGCAGGTAATGCTATAACCATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATATGCTGCACTATAGGCAGATGTGGAAGGAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCGCAATTGATGCTCCAATGTCCTATGTCCATAATCATGCTTTTATTTTCATTCTGGAGATTAGGGTTGGAAGCATGTCAATTTAGA-TCAGACCAGACATCCTTCAAGTGTTATACCAGTAGATGGAATTACATGGTATGAACAGCATGTATAAACAGCAAATTAAACAGCCA-CTTACTGGCCATATATACTACAGGCATTGACCCAAAGACCCCTAAGCCTTCAGATTTGGCATAGTTTAGAACCCAAGCTTAATATTATGTTGCTCAATGTGTGACAAACACCCTGCTGCTATGCATCAGTGTCACCTGGCTGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 78043 652 - 647215 CCTCTTTATTGGATTACTTGCACCCTTCCTCATCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGCTTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATATTGGTTAATTCTACTCAACGACAGTCTCCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGTCGACCGACTACAGGAAATAGAATTACAGCTACCCTGCTATAAAAACTGATGATGAAAAATCACGCATAGCAGCTATGTTAGAGTGCAGGGAATGTTATGACTATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATTAGCTGCACTATAGGCAGATGAAGAAGAAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCACAATTGGTGCTCCAATGTCCTAGGTCAAAAATCCTGCTTGTAATTTTATCCTGGAGATTAGGGTTGAAAGCATGTTAATTTAGATTCAGACCAGACATCCTTCAAATGTCATGCCAGTGGATCGACTGACACAGTATGAACAGTATATACAAACAGCAAATTAAGCAGCCATTTTACTAGCCATGTATAGTACAGGGATTGACCCAAAGACCCCTGAGCCTTCAGATGTGGCATAGTTTAG-----------AATATTATGTCACGCAATGTGTGACAAACACTCTCCTGCTATTCACCAGTGTCACCTGACTGAGG + +a +s mr.mrrefChr3 152152 20 + 181019 CTGTGCCTGAGCATAATCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604419 20 + 636262 CTGTGCCTGAGCATAGTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 78695 20 - 647215 CCGTACCTGAGCATAATCTG + +a +s mr.mrrefChr3 152172 19 + 181019 GCCGTTGGGCCCAAAGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 78718 19 - 647215 GCCGTTGGGCCCAAAGTGC + +a +s mr.mrrefChr3 152191 32 + 181019 ATAGGCACAGAACACTGGGCCCTGTGGCCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604439 27 + 636262 -----CACAGCACACTGGGCCCTGTGACCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 78738 32 - 647215 ATAGGTGTAGAACGCTGGGCCCTTTGGCCAAG + +a +s mr.mrrefChr3 152223 272 + 181019 CCAAGTACCTTGTTAGGGGGAAGATTGATGAAGTTGTTAGGGGTTATGAGTTTATTATCAGCTACTTTATCAGGAAATACTTGTACATGGTTGCAGTCACCCCTGCACAGAACGCTGTGGGTTTCTTAAGGAAGCTGTGGATTTCTTCAAACTACAGTCCTGCAAAACTTCACAAACAGTACCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTTAACCTTCTTAAACTTCATTCAAAGGTTGTATGCCACGATCAAATAACCATCCGTACAGAGCGAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604467 272 + 636262 CCAGGTACCTTATTAGGGGGAAGATTGATGGAGTTGTTAGGGGTTATGAGTTTATTACCAGCTTCTCTATCAGGAAATACTTGTACATGGTTGCAGTCACCCCTGCACAGAACGCTGTGGGTTTCTTAAGGAAGCTGTGGATTTCTTCAAACTACAGTCCTGCAAAACTTCACAAACAGTATCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTTAACTTTTTTAAACTTCATTAAGAGGTTGTATGCCACGATTAAATGACCGTCCGTACAGAGCGAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 78770 272 - 647215 CCAAGTACCTTGTTCTTAGGAAGGTTGATGAAGTTGTTAGGGGCTAAGAGTTTATTATCAGCTACTTTATCAGGAGATATTCGTAGATGGTTGTGTTCACCCCTGCAAAGAAAGCTGTGCACTTCTTAAGGAAGTGGTGAATTTGCTCACACTACAGTTCTGGAAAACTTCTCAAACAGTACCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTAAACCTTCTTAAGCTTCATTCAAAGGTTGTATGCCACTATCAGATAACCATCTGTACAGAGTGAATG + +a +s mr.mrrefChr3 152495 24 + 181019 ATGAAAAAAGTTCAAGAGGACCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604750 24 + 636262 ATGAAAAAAGTTCAAGAGGACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 79042 24 - 647215 ATGAAAAAAGTTCAAGAGCGCCCC + +a +s mr.mrrefChr3 152519 7 + 181019 TTAATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604775 7 + 636262 TTAATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 79066 7 - 647215 TTGATGC + +a +s mr.mrrefChr3 152526 91 + 181019 TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604783 91 + 636262 TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79073 91 - 647215 TTTTTGGCTCATAGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCTGGCTTTTGGACTGGGGGACGTGTACATAAAATATTGCAGCTGGCACCATTTGA + +a +s mr.mrrefChr3 152617 20 + 181019 GGACATTAGATTACACCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604874 20 + 636262 GGACATTAGATTACACCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 79213 20 - 647215 GGATATTAGATTACACCCTC + +a +s mr.mrrefChr3 152637 8 + 181019 TATACCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604894 8 + 636262 TATACCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 79239 8 - 647215 TGTACCCC + +a +s mr.mrrefChr3 152645 157 + 181019 CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAACAAAGGACTTGGTACTCTCCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604915 157 + 636262 CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAATAAAGGACTTGGTATTCTCCCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 79247 157 - 647215 CCCCCATTAGTTGAACTGGGGCACTAAGATAGATTCTGCTGAACAGGGAGGGACGTCACATATGATCCTTGGCCAACCTAATTTGCTTTAGCAAGCTTCTACAATTGTGTCTCTATTTATCACCTGTAAACTAACAAAGGACTTGGTACTCTGCCAT + +a +s mr.mrrefChr3 152802 43 + 181019 ATCTCCCTTGGGTAGGTCTATTTTAGACAAGATAATGCAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605073 43 + 636262 ATCTCCCTTGGGTAGGTCTATTTTAGACAAGATAATGCAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79404 43 - 647215 ATTTCCCTTGGATAGGTCTATTTCAGACAAGATAATGCAGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 152845 90 + 181019 TCACCATTGCCTGCCAGATTCTTTATAAAGGTGTCCTTACTCAGTCCTGGTGCAGAAAAATTACAGGCAATAGCATTAGACTCCCCCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605116 90 + 636262 TCATCATAGCCTGCCAGATACTTCATAAAGGTGTCCTTATTCAGTCCCGGTGCAGAAAAATTACAGGCAATAGCATTAGACTCCCCAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79448 89 - 647215 TCACCATTGCCTTCCAGATTCCTTATAAAGGTGTCCTTACTCAGTCCTGGTGCAGAAGAATTAGAGG-AATAGCATTAGACTCCCCCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 152935 250 + 181019 CCAATTGCAGATGACCTACAGTTCCTTGTCTGTGTATGATTTCAGTTCAAGGACTCTTTGCACCAAGGTATGAGATAATCTTTGCTTGTTGCAGATCATTTCCATAGCAATTCAGTATTTTTAAAGGTAGGAGGATTCTACAAAGCCTACAAACCATTCTATTCTTGTTAGATGCCCTTGATTGGCCAATGTACATCACCTATTGAAACATTTATCCTTTAATCAGTACCACATCTGTGGTGAACCAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605206 250 + 636262 ACAGTTGCAGGTGACCTACAGTTCCTTGTTTCTGTATGATTTCAGTTCAAGGACTCGTTGCACCAAGGTATAAGATAATCTTTGCCAGTTGCAGGTCATTTCCATAGCAATTCTGTATTTTAAAAGGTAGGAGGATCCTATAAAGCCTACAAACCATTCTATTCTTATTAGATGCCCTTAATTGGCCAATGTACATCACCTATTGAACCATTCATCCTTTAACCAGTACCACATCTGTGGTGAACCAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 79538 250 - 647215 CCAATTGCAGATAACCTCCAGTTCCCTGTCCGTTTATGATTTCAGGTCAAGAAATTTTTGCACCAAGGAAGGAGATAATCTTTGCTTGTTGCAGATCATTTCCATAGCAATTCAGTATTTTTTAACGTAGGAGGATTCTACAAAGCCTAGCAAGCATTCTATTCTTGTTAGATGCCCTTGATTGGCCGATGTACGTCACCTATTGAAACATTTACCCTTTAATCAGTACCACGTCTGTAGTGAACAAAGG + +a +s mr.mrrefChr3 153185 56 + 181019 TTAGCTGGCCTTTGTTTTTACCTCAAGCTGGCAATTGTACTAAGATCTAGTACAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605458 51 + 636262 TCAGCTGGCCCTTGTTTTGGCCTCAAGCTGTCAATTGTTC-----TCTAGTACAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79788 56 - 647215 TTAAGTCACCTTTGTTTTTACCTCAGCCTGGCAATTGTACTAAGATCTAGTACAGA + +a +s mr.mrrefChr3 153241 70 + 181019 AGAACAAAATGGTCCCTCAAGATCCTCTGAGGGCCCAAAACTGATTCCTTAATCTAACTGTGTCAAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605509 48 + 636262 AGAACAAAATGGTCCCTCAA----------------------GGTTCCTTAATCAAACTGTGTCAAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79845 70 - 647215 AGAACGAGATGGTGCCTCAAGATCCTCTGAGGGCCCAAAACTGATTCCTTAATCTAACACTATCAAGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 153311 48 + 181019 GAAGTAGACAGGATGGGCTGCACCAGGGTAGGTGAACAACCTATCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605562 48 + 636262 GAAGTAGACAGGATGGGCTGCACCAGGATAGGTGAACAACCTATCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 79915 48 - 647215 GAAATATACAGGATGGGCTGCACCAGGGTAGGTGGACAACCTATCTAC + +a +s mr.mrrefChr3 153359 54 + 181019 ATAACCAAAAATAAGTATTAAGCATTGATTCTTTAACACAGAACCTACCATTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605615 54 + 636262 ATACCCAAAAATAAGTATTAAGCATTGATTCTTTATTACAGCACCTACCATTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 79963 50 - 647215 ATGACT----ATAAGTATTAAGCATTGATCCTTTAACACGGACCACACCATTGG + +a +s mr.mrrefChr3 153413 74 + 181019 GCTGTTTAGTCTCTAGAGGAACAGAACCCGCCATTGTGTTGTTTAGTTTTGAGATGTGAGTATAAGTTAAGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605669 74 + 636262 GCTGTTTAGCCTCTAGAGGAACAGAACCCGCCATTGTGTTGTTTAGTTCTGAGATGTGAGTATAAGTTAAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 80019 66 - 647215 GCTCTTCAGTCTCTAGAGGAACAGAAACCACCA--------TGTAGTTTTGAGATGTGAGTATAACTTTAGGGA + +a +s mr.mrrefChr3 153487 220 + 181019 GTACCCCAGCTTCAACCTGTATGGTGCAAGATTGTTGTCCCTTCAAGAAGGAGTAACCATCATATGCCTTCATGGTAGTTAGCTACTGAACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTAATAAAGCACTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTACCCTTTTGAAAGGATCAGATAGCACCATAAACATGTGACTCTGTTAAGAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605743 220 + 636262 GTACCCCAGCTTCAATCTGTATGGTGCAAGATTGTAGTCCCTTCAAGAAGGAGTAACCATCATATGCCTTGATGGTAGTTAGCTACTGGACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTATTGAAGCAGTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTAACCTTTTGAAAGAATCAGATAGCACCATAAACATATGACTCTGTTAAGAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 80086 220 - 647215 GTACCCCCGCCTCTACCTGTATGGTGAAAGATTGTTGTCCCCGCAAGAATGTGTAACCGTCATATGCGTTCATGATAGTTAGCTGCTGAACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTAATAAGGCACTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTACCCTTTAGAAAGGATCAGATAGCACTATAAACTTGTGACTCTGTTACAAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 153707 102 + 181019 GTCTTGTAGGCGCCTAGAACTCACTTGAACTCTATGCAAGTCTGTAACATGGAGTAAACAAGCAGTTACAAAATCATAGGACAGTCTTCTGTACAAAATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605963 102 + 636262 GTCTTGTAGGCGCCTAGAGCTCACTTGAACTCTATGCAAGTCTGTAACATGGAGTAAATAAGCAGTTACAAAATCATAGGACAGTCTTCTGTACAAAATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 80335 102 - 647215 GTCATGTAGGTGGCTAACATCCACATGAACCCTATGCAAGTCTGTCATATGGAGTAGACAAGCAGTTACAAAATCATAGGTCAGTCTTCCGTACAAAATCAT + +a +s mr.mrrefChr3 153809 332 + 181019 AGAACAGTCGTCTGAGGTTTCTTATGTTCATTTACAGTTATTGTTGCATGTCCTGTAATTCAGTAAACTTTTGGCAATGCTGTATATTGCCCTACTAGGGTTGGCATCACTATAGGAATGATTCCCTCAAAACTCATGACTGTAGAGAGGCAGTGGCTCATACTTATGAGACTGCTGGTAGTGGTTTGCACAACTCTAGCTGTTAATCAAGTCATTGCATAGAACCACTAACTCAGGAGAAATGGTAAGTTCACAACCAGTATATAGGTGCAGCAATTGTGTGCAGGCCCTAAGAGCCATATGTATTGGCACTTTGGAGTCAACCCTTTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606065 332 + 636262 AGAACAGTCGTCTGAGGTTTCTTATGTTCATTTGCAGTCATTGTTGCATCTCTGGTGATTCAGTAAACTTTTGGCAATGCTGTATATTCCCCGACTAGGGTTGGCATCACTATAGGAATGATTCCCTCAAAACTCATGACTTTAGAGAGGCAGTGGCTCATATCTATAAGACTGCTGGTAGTGGTTTGCACAACTCTAGCTGTTAATCAAGACATTGCACGAAACCACTAACTCAGGAGACATGGTAAGTTCACAACCAGTATATAGGTGCAGCAATTGTGTGCAGGCCCTAAGAGCCATATGTATTGGCACTTTGGAGTCAATCCTTTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 80443 307 - 647215 AGGACAGGCTTTTGAGGTTTCTATTGTTCATTTACAGTTATGGTTGCATGCTCTGCAATTCAGTAAACTTTT-GCAACACTGTATATTGCCCTACTAGGGTTGGCATC-----------------------AGTCATGACTGTAGAGTGGCCATGGCTCATACTTATGAGACTAGTGGTAGTGGTTTACACAACTCTAGCCGCTAATTGAGTCATTGCATAGAATCACTGGCTCAGGAGAAATGGTAAGTTCACAACCAGTATATAGGTCCAGTAATTATGTGCAGGGCCTAAGAGCCATATGTA-TGGCACTTTGAAGTCAACCCCTTATA + +a +s mr.mrrefChr3 154141 35 + 181019 GGAGTAAATTTTAAACCTTACCAGACAAGCTTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606397 35 + 636262 GGAGTAAATTTTAAACCTTACCAGACAAGCTTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 80767 35 - 647215 GGAGTGAATTTTTGACCTTACCAGACAATCTTCTC + +a +s mr.mrrefChr3 154176 42 + 181019 ACCATCTAAGTAAAATTAATTAATAGGGCTGCTTTAATCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606432 42 + 636262 ACCATCTAAGTAAAATTAATTAATAGGGCTGCTTTAATCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 80803 42 - 647215 ACCATCTAAATAAAATTAATTAAAGGGGTTGCTTTAGTATGT + +a +s mr.mrrefChr3 154218 12 + 181019 CACAGTTTTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606478 12 + 636262 CACAGTTTTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 80845 12 - 647215 CCCTATCCTCTA + +a +s mr.mrrefChr3 154230 15 + 181019 AATGTTTTGTGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606490 15 + 636262 AATGTTTTGTGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 80859 15 - 647215 ATAGCATTCACCTGT + +a +s mr.mrrefChr3 154245 58 + 181019 GCCTAGCCAACCCTTTTTATAAATTACTAATATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606505 58 + 636262 GCCTAGCCAACCCTTTTTATAAATTACTAATATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 80881 58 - 647215 GCCTAACAAACCCTTTCTACATATTACTCAAATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACGT + +a +s mr.mrrefChr3 154303 22 + 181019 AGTTCTGGTGGATTGCTCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606563 22 + 636262 AGTTCTGGTGGATTGCTCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 80940 22 - 647215 AGTTCTGGTGGACTGCTCAATG + +a +s mr.mrrefChr3 154325 39 + 181019 CCCATAAGCTGTTGGGATTGCAGGACTATGATGGTAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606585 39 + 636262 CCCATAAGCTGTTGGGATTGCAGGACTATGATGGTAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 80977 39 - 647215 CCAATATGCTGTTGGGATTGCAAGACTTTCATGGTAATT + +a +s mr.mrrefChr3 154364 26 + 181019 ATCATTGCCAATCTGTGAAGTCTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606629 26 + 636262 ATCATTGCCAATCTGTGAAGTCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 81016 26 - 647215 ATTATCCCCAATCTGCGAAGTCTTTA + +a +s mr.mrrefChr3 154390 14 + 181019 GTAGATGGTAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606663 8 + 636262 GTAGATGG------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 81042 14 - 647215 GTAGCTGGTAACCA + +a +s mr.mrrefChr3 154404 94 + 181019 AATTATATCCCAAGTCATATCAATCCTGGTGGGCAGAGGGCAGAAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCAGGGGCCAGCAAAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606671 90 + 636262 ----ATATCCCAAGTCATATCAATCTTCGTGGGCAGAGGGCAGAAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCTGGGGCCAGCAAAGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 81059 94 - 647215 AATTATATCCCAAGTCTTATCAATCCTGGTGGGCAGAGGGCAGGAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCAAGGGCCCGCAAAGAGG + +a +s mr.mrrefChr3 154498 85 + 181019 TAACTAAGATATTATACCAATCTGCAACATATGCAATCCAATACCCCAATCAAACTGAGCTTGCCAAATTGAGCCAAAATCAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606776 76 + 636262 TAACTAAGATATTGTACCAATCTGTAACATATGCAATCCAATACCCCAATCAAACTGAGCTTGCCAAATTGAGCCA--------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 81153 85 - 647215 CAACTAAGATATTATACCAATCTACAGCATAAGCAATCCAATACACCAATCAAACCGAGCTTGCCAAGTTGGGCCAAAATCAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 154583 110 + 181019 AAAGGTGGATTGACTAAGTCTCGTATGCCTAAATTGACTATCTATTATGCTTTCCTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTGTGCCAGATGTCATGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606852 67 + 636262 --------------------------GCTTAAATTGACTACATATTAT-CTTTCCTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTG---------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 81244 110 - 647215 AAAGGTGGATTGACTAAGTCTCGTATGCCTAAATTGACTATCTATTATGCTTTCTTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTGTGCCAGATGTCATGCA + +a +s mr.mrrefChr3 154693 66 + 181019 ACGACTTTACAATTTACAAGAAAGCCAGACGCAAAAGTAGTGCTCATGGCTTTGCTACTGCTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 81359 66 - 647215 ACGACTTTACAATTTACAAGAAAGCCAGACGCAAAAGTAGTGCTCATGGCTTTGCTACTGCTACAA + +a +s mr.mrrefChr3 154759 22 + 181019 AAATAGGTACAAAAATAGTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 81431 22 - 647215 AAATAGGTACAAAAATAGTTGC + +a +s mr.mrrefChr3 154781 17 + 181019 TAGAGCCACAACGTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 81456 17 - 647215 TAGAGCCACAACGTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 154798 123 + 181019 TTTATCATACAAGTCAATCCTGTTCTAATCACCTGGACAAGATCACTACAAGCTTGCTGCCACAGATCAAGCTCTTTCTGATAGGAGTCTTGTCTTTATGAAGTGTGTGGAGTGCCTACCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 606919 123 + 636262 TTTATCATACAGGTCAACCCTGTTCTAATCACCTGGACAAGATCACTACAAGCTTGCTGCCACAGAGAAAGCTCTTTCTGATAGGAGTCTTGTCTTTATGAAGTGACTGGAGTGCCTACCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 81483 111 - 647215 TTAATCATAGAAGTGAATCCTGTTCAAGTCACCTTGATAAGATCGCTGCAAGCTTGCTGCCACAGATCAA------------ATGACTTTTGTCCTTATGAAGTGTGTGGGGTGCCTACTCAA + +a +s mr.mrrefChr3 154921 84 + 181019 TGCCTATGCAAGCATGGATAAGGCAACTTGGAGTGTAGCATTATGCAAGCATGGTATAGACTATTTGGAGTTTGACATACTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607042 84 + 636262 TGCCTATGCATGCATGGATAAGACAATTTGGAGTGTAGTGTTATGCAAGCATGGTATAGACTATTTGGAGTATGACATACTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 81618 84 - 647215 TGCCTATCCAAGCATGGATAAGGCAACTTGGAGTGTAGCATTATGCAGGCATGGTATAGACTATTTGGAGTTTGACATACTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 155005 109 + 181019 TTAGTAATTTTAGGTTCCAGTCTGAGCTTCTATTGGACATTATGCAAAAAGCCTTGCATATTGCTAGGAACTTTGGATATTCCAAGGCCATTGGTATAATATCACATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607130 109 + 636262 TTAGTAATTTTAGGTTCCAGTCTGAGCCTCTATTGGGCATTATGCAAAAAGCCTTGCATATTTCTAGGAATTTCAGATATTCCAAGGCCATTGGTATAATATCACATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 81702 103 - 647215 TTAGTACTTTTAGGTCCCAGTCTGAGCTTCTATTGGACACTATGTGAAAAGGCTTGTGTATTGTTAGGAACTTTGGATGTTCCAAGGCCATTGGTATAATATT------ + +a +s mr.mrrefChr3 155114 46 + 181019 CAGACATAGGCTAGTCAAGTCCTCCACAGTGACAGACTTAACATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607240 46 + 636262 CAGACATAGGCTAGTCAAGTCCTCCACAGTGACAGACTTAACATTT + +a +s mr.mrrefChr3 155160 191 + 181019 ACCACTGCCTGCTCATCAGAACCCCACAATTGCCAACATAAAGTTAGAATAATATGTTACTTGTATGTCGACATTAAAACTTTTATCTTAACAATGTTCTAAGAACTACAGCTAACCAGCGGCCTGCCATAATCAAGAATCCATTTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACCCAGTGCAGAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607297 191 + 636262 ACCACCGCCTGCTCATCATAATCCTACAATTGCCAACATATAGTTAGAATAAGATGTTACTTGTATGTCGACTTTAAAACTCTTATCTTAACAATGTTCTAAGAACTACAGCTAACCAGCGGCCTGCCATAATCAAGAATCCATTTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACCCAGTGCAGAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 81805 191 - 647215 ATCACTGCCTGCTCATCAGAACCCCACAATTGCTAACATAAAGTTAGAATAATATGTTACTTGTATGTCCACATTAAACCTTTTATCTTGACCATGTTCTAAGAACTACAGCTAATCAGCAGCTTTCCATAATCAACAATCCATGTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACACAGTGCAGAATG + +a +s mr.mrrefChr3 155351 222 + 181019 GGTTCACTAGGATGCAGCCCTAATGCGCACTGGATAGAGGTACATCTACAACATTGCTGAAAATCCAGGGCAAGAACACATCCATAACATTGCATAAATTTAAAAATGGAGAATGTTGGGGAATGTTGAGGGTATATGCTGGGAAGAATGGCACTCATAGAATAAGAATTGCAGGCTGCTGACATCATGGCTACTATATCACTTTCTGTCCACTGCTAAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607490 173 + 636262 GATTCACTAGGATGCAGCCCTAATGTGCACTGCATTGAGGTACATCTACAACATTGCTGAGAATCCAGGGCAAGAATACTTCCATAACCTTGCATAAATTTAAAAATGGAGAATGTTGGGGAATGTTGAGGGTATATCCTGGGAAGAGTGGCATTCA-------------------------------------------------TGTCCACTGTTAAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 81996 222 - 647215 GGTTCACTGGGATGCAGCCCAAAGGCGCACTGGAGAGAGGTACATCCACAATGTTGCTGGAAATCCAGGGCAAGAACACATCCATAACATTGCATAAATTTAAAAATGGAGAATGTTGGAGAATGTTGAGGGTGTATGCTGGGATGCATGGCACTTATAGAATAAGAATTGCAGGCTGCTGACATCATGGCTACTATATCACTTTCTGTCCACTGCTAAGAC + +a +s mr.mrrefChr3 155573 420 + 181019 CCCAGTGTTGCACACCAATCTTTCCAACCACTACACTCTCGTGTTCTTTTACACTCAATCTAAAGTAGTTACACCCGAGCGTCCCGATTTCTGGATCATGTGCACAGAGACTCACGATCCTGTGAGTTGGCTAAAGTTTTAGCACAAGTAGGCCAAGAACCAGAATAAGCCTTGATTGGACACATTTAGATCAAGCCTCTACTTAGGACTGACTTAATCTGACTTTAACAAGCTTGGCCCAATAGAAATGATATGACTGTTCTTACCGCTCTGATGTGCTAGTAGGACAAAAGATACCAATTGAAAAGATGCCAATGTAAGCTTGGGCCTACACTATATAGGTGAGAAGAGAGTATGATCACTCTTACCCTGAGGTATCGGGGAGCCAAGAATGGTAATTAGTGTTGTAAGATGCTGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607669 415 + 636262 CCCAATGTTGCACACCAATCTTTCCAACCACTACACTCTCGTGTTCTTTTACACTCAATCTAAAGTAGTTACACCCGAGCGTCCCGATTTCTGGATCATGTGCACAGAGACTCACGATCCTGTGATTTGGTTAAAGTTTTAGCACAAGTAGACCAAGAACCAAAATAAGCCTTGATTGGACACATTTAGATCAAGCCTCCACTTAGAACTGACCTAACCTGACTTTAGCAAGCTTGGCCCAATAGAGATGATATGACTGTTCTTACTGCTCTGACGTGC-----GGACAAAAGATACCAATTGAAAAGATGCCAATGTAAGCTTGGGCCTAGACTATATGGGTGAGAAGATAGTATGATCACTCTTACCCTGAGGTATCGGGGAGCCAAGTATGGTAATTAGTATTGTAAGATGCTGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 82218 404 - 647215 CCCAGTGATGCATGCCAACCTTTCCAACCACAACACTCTCGTGTCCTTTTACACTTGTTCTGAGGTAGTTACACCCGAGTATACCGCTGTCTGGATCATGTGTACAGAGGCTGACCATCCTGTGCGTTGGCAAAAATTTTAGCAGAAGTAGGCCAAGAACCAGAATATACCTTGATTGGACAC-TTTAGATCAAGCCTTTACTTAGGACTGACTTAATCTGACTTTAACAAGCTTGGCCCAATAGAAATGATATGACTGTTCTTATCGCTCTCATGTGCTAGTAGGACAGAAGCGAAC-------------CCAATGTAGGATTGGGCCTACACTATATAGGTGAGAAGAGAGTACGATTACTCTTACCCTGAGGTATCGCGGAGCCAAGAATGGTAAGTAATGTTGTAAAATGCTGC-- + +a +s mr.mrrefChr3 155993 40 + 181019 TAGTTCGAGTGCCCCCTAAATGGGCTGCACCAACTGAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608086 34 + 636262 TTGTTTGAGTGCTCCCTAAATGGGCCGCACTAAC------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 82622 40 - 647215 TAGTTCAAGTGCCCGCCAAATGAGCTGCACCAACTGAATA + +a +s mr.mrrefChr3 156033 304 + 181019 CACTTACAGATATATTGCACGCATCCATAGGTCCTCAAAATTTTACCTGAAGAAAGTCAATAATATACAATGGATGCTAACCTTACCCAATTTTAATCCAGCAAGAACCTAGCTGTAAAAGGCACTTCAGAGGATGTCTGTTACCATCATATGTGATCTAGCTGACCTAGAATTTCAGGAAAAGGGGCAGTCAACATTTTATAGCCATAGTAATAGGAGAAATTAGGAATTGATTTCATCACTGCAGACTCAGATGCTTTTACCTGGGCCTGAACCTTGCTCAATCACCACTTAATCTTTCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608120 304 + 636262 CACTTACAGATATACTGCACGCATCGATAGGTCCTCAAAATATTACCTGAAGAAAGTCAATGATATACATTGGATCCTAACCTTACCCAATTTTAATGCAGCAAGAACCTAGCTGTAAAAGGCATTTCAGAGGATGTCTGTTACCATCATATGTAATCTAGCTCAGCTAGAATTTCAGGAGAAGGGGCAGTCAACATCTCATAGCCATAGTAATAGGAGAACTTAGGAATTGATTTCATCACTGCAGATTCAGATGCTTTTACCTGGCCTTGAACCTTGCTCAATCACCACTTCATCTACCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 82664 299 - 647215 CACTTACAGATATATTGCACACATCCATAGGTCCTCAAACTTTTCCCTGAAGAAAGTCAATAATATGCAATGGATGCCAACCTTACCCGATCTTAATCCAGCAAGAACCTAGCTGTAAAGGGCACCCT----GATGTCTGTTACCATTGTATGTGATCAAGCAGACCTAGAATTTCATGAAAAGGGGCAGCCAACATTTTGTATGCATAGTAATAGAAGAAATTAGGAGGTGATGTCATCACTGCAGACTCAGATGCTTTTACCTTGGCCTGAACCTTGCTCAATC-CCACTTAGTCTTTCTTT + +a +s mr.mrrefChr3 156337 5 + 181019 GAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608425 5 + 636262 GAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 82963 5 - 647215 GAATA + +a +s mr.mrrefChr3 156342 9 + 181019 GGCATCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608430 9 + 636262 GGCATCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 82973 9 - 647215 GGCATTTCC + +a +s mr.mrrefChr3 156351 51 + 181019 ATATCATTTTATGTATACGAGAGGGCCCATCCTTAGATATAAGTAGAACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608439 51 + 636262 ATATCATTTTATGTATACGAGAGGGCCCATCCTTAGATATAAGTAGAACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 82996 51 - 647215 ACATTATCTTATGTATAGGAGAAGGCCCATCCTAAGATAAAAGTAGAACAG + +a +s mr.mrrefChr3 156402 6 + 181019 TGCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608492 6 + 636262 TGCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 83047 6 - 647215 TGCATA + +a +s mr.mrrefChr3 156408 7 + 181019 GACTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608501 7 + 636262 GACTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 83053 7 - 647215 GCTTGCA + +a +s mr.mrrefChr3 156415 42 + 181019 GCTTCCAGAGAAAGAACAGCTGGGCCTGAACCTTGCTCAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608510 42 + 636262 GCTTCCAGAGAAAGAACAGCTGGGCCTGAACCTTGCTCAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 83060 42 - 647215 GTTTCCAGAGAAAGATCAGTTGGGCCTGAACCTTGCTCAATC + +a +s mr.mrrefChr3 156457 14 + 181019 TCTTTCTTTTGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608552 14 + 636262 TCTTTCTTTTGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 83111 14 - 647215 CCTTTCTTTGGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 156471 60 + 181019 AGTCATCTCCAGTAGTCACACTATATATCATCTTATGTATACAAGAGCGCTCATCCTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608571 57 + 636262 AATCATCTCCAGTAGTCACACTATATATCATCTTATGTATACAAGAGCGC---CCCTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 83125 60 - 647215 AGTCATCTCCAGTAGTTACACTATATAATATCTTATGTATATGAGACAGTTCATCCTTAG + +a +s mr.mrrefChr3 156531 51 + 181019 CTATGTGTAGAGTTGACTGTCTGTCCAATCCACACTGCTTGCAGTTTCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608638 51 + 636262 CTATGTGTAGAGTAGACTGTCTGTCCAATCTGCACTGCTTGCAGTTTCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 83185 51 - 647215 CTATGTGTAGAGTTAACTGTCTGTCCAATCCACACTGCGTGTAGTTTCCAG + +a +s mr.mrrefChr3 156582 65 + 181019 AAGATCAGGCCACTCATCACTTGGTGAGCACAAGTTGGCAGATTTTATAACTCAAGTTATGAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608689 65 + 636262 AAGATCACGCTACTCATCACCTGGTGAGCACAAGTTGGCAGATTTCATAGCTCGAGTTATGAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 83239 62 - 647215 AAGATCAGGCCAC---TCACTTGTCAAGCACAATTTGGCACATTTTATAACTCAAGTTATGAATA + +a +s mr.mrrefChr3 156647 406 + 181019 GTAGCATCATTAAGTTCAATTGGACTCCTCTTTGCCAAAACTGATGCTATTCTCAGTACCATACTCACAGCATGACCCATATATGGGCTGTAATAACAAAAATTGTTATAGGCCCTGCTTGAATGACATTTCAAAGTTCAAGACTGGTGGCCCAATTTGCTGGCTGCTATCTTAGCCACTGATCTGTTGATGTGCAACACTGCTCGAAACTAAGCAACTTGCTCAGTAATGTACAACCCTAGGGTATAATCACACTTCTGTGCTGCTAATACTGTGCCAGTGCCTATTCCCCCCAGTATTTCCTTGGTGATCTGCTGGCTATAGGGTGTACCCCATAATTACACATAAAATGTGTCTACAAACTTAGCTTTACTTGGCACCAGCAACCCCTCTGGGACGAGGTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 608755 405 + 636262 GTAGCATCCTTAAGTTCAATTAGACTCCTCTTTGCCAAAACTGATGCTATTCTCAGTAACATACTCACAGCATGA-CCATATATGGGCTGTAATTGCACAAATTGTTATAGGCCCTGTTTGAATCACATTTCAAAGTTCAAGACTGGTGGCCCAATTTGCTGGCTGCTATCTTAGCCACTGATCTGTTGATGTGCAACACTGCTTGAAACTAAGCAACTTGCTCAGTAATGTACAACCCTAGGGTATAATCACACTTCTGTGCTGCTAATACCGTGTCAGTGCCTATTCCCCCCAGTATTTCCTTGGTGATCTGCTGGCTATAGGGTGTGCCCCATAATTACACATAAAACGTGTCTAAAAACTTAGCTTTACTTGGCACCAGCAGCCCCTCTTGGACGAGGCGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 83301 402 - 647215 GTAGCATCACTAGTTTCAATTGGC--TCCCTTTGCCAAGACTGATGCTATTCTTAGGACCATACTCACAGCATGACCCGTATATAGGCTGTAATAATGAAAATTGTTATAGGCCCTGCTTGAATGACATCTCAAAGTTCAAGACCGGTGGCCTAATTTGCTGGTTGCTATCTTAGACACTCATCGATTGATGTGCAACACTGCTCCAAACTAAGCAACTTGCTCAGTAATGTATGACCCTAGGGTACAATCACACTTCAGTGCTGCTAATACTGTGCCAGTGATTATTCCCCCCAATATTTCCTTGGTGATCTACTGGCTATAAGGTCTACCCCATAATTACACATGAAATGTGTCTACAAATTTAGCTTTCCTTGG-CCCAGCAA-CCCTCTGGGACGATATAAT + +a +s mr.mrrefChr3 157053 9 + 181019 AACTTGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609160 9 + 636262 AACTTGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 83704 9 - 647215 AACTCGGTC + +a +s mr.mrrefChr3 157062 151 + 181019 AAAACAATATAATCTAAAGAGGACTCAAATGACCATGTATCAGGTATGAGGCTTCGAAGCCGCAAACAAAGCATACGCAAGGCAATTGCATACTAGAGCACTCAAATGGCAAATAGTCTTGAGTTAATAATGACTGTGGGCCCACACATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609169 151 + 636262 AAAACAACATAATCTAAAGAGGACTCAAATGACCATGTGTCAGGTATGAGGCTTCGAAGCCGCAAACAAAGCATACGCAAGGCAATTGCATACTAGAGCACTCAAATGGCAAATAGTCTTGAGTTAATAATGACTGTGGGCCCACACATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 83721 151 - 647215 ATAACTATAAAATTTAAAGAGGACTCAAATGACCATGTATCAGGTATGAGGCTTCGAAGTCACAAACAAGGCATACACAAGGCAACCGAATACCAGGATGCTTAAATGGCTAATATTCCTGAGTGATTAATGACTGTGGGCCCACACATTA + +a +s mr.mrrefChr3 157213 22 + 181019 ATGTAGCACTCACTGGTTATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609320 22 + 636262 ATGTAGCACTCACTGGTTATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 83874 22 - 647215 ATTTAGGACTCACTGGTTATAG + +a +s mr.mrrefChr3 157235 31 + 181019 CACTCACATACCCAGATCCGACTTATCACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609343 31 + 636262 CACTCACATACCCAGATCCGACTTATCACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 83896 31 - 647215 TGCTCACATACCGGGACCCAACTTATCACAC + +a +s mr.mrrefChr3 157266 29 + 181019 GTTACCAACGAACTGCGGATTTACCCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609374 29 + 636262 GTTACCAACGAACTGCGGATTTACCCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 83932 29 - 647215 GTTACCAACAAACTGCAGATTTACCCATC + +a +s mr.mrrefChr3 157295 16 + 181019 CATTGCAGCACTCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609404 16 + 636262 CATTGCAGCACTCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 83961 16 - 647215 CAATGCACAACTCATT + +a +s mr.mrrefChr3 157311 357 + 181019 GCTCATTTATCATGGTCACAGGAGTCCCCCTATCTCCATGTCTGTATAACTAATAAGGGACTAGTTTAATTGTTCTAACATGATCAGTAAAGAGACACAGAGACAAGACCCTACTGTCTCTATCCCATTAACTGTACATGGTGGGCGAGACATAACAATGATACCTTGTGGCAGTTGTTTATGAAGAGGGCTTAGTATACATGCTCTGATATTACTTACACTTTGGCAGGAGCCTTGTGCAGGTGCTTCTGGCAACTGGTGTTTTGTTGCCTGTGTTGATTAGCACCTTGTTCCCTTAGTTGATAATACAGGCAATTTCATGACATGTGGCAGATATCTGCCCTGTAAACCATCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609421 357 + 636262 GCTCATTTATCATGGTCACAGGAGTCCCCCTATCTCCATGTCTGTATAACTAATAAGGGACTAGTTTAATTGTTCTAACATGGTCAGTAAAGAGACGCAGAGACAAGACCCTACTGTCTCTATCCCGTTAATTGTTCATGGTGGGCGAGACATAACAATGATACCTTGCGGCAGTTGTTTATGAAGAGGGCTTAGTATACATGCCCTGATATTACTTACACTTTGGGAGGAGCCTTGTGCAGGTGCTTCTGGCGACTGGTGTTTTGTGGCTTGTGTTGATTAGCACTTTGTTCCCTAAGTTGATAATACAGGCAGTTTCATGACATGTGGCAGATATCTGCCCTGCAAGCCATCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 83977 352 - 647215 GTTCATTTATCACAGCTATGTGAATCCCTCTATCTCCATGTCTGTATAGCTGATAGCAGACCAGTTCTATTGTTCTAATATTATCAGTAAAGAGACACAGAGACAAGACCCTATTGTCTCTATCTCATTAACTATACATGGTGGGCGAGACATAACAATGA---ATTTTGGCAGTTGTTCATGTAGAGTGCTTAGTAGACATGCTCTGCTATTACTGACACTATGGCAGGAGCCTTGTGCAGGTGCTTCTGGCAACTGGTGTTCTGTTGCCTGTGTTGA-TAGAACCTTGTTCCCTTAGTTGATAA-ACAGGCAATTTCATGACATGTGGCAGATATCTGCCCTGTAAACCATCTAT + +a +s mr.mrrefChr3 157668 39 + 181019 TCTTTGCATCCCCTAATATTAGACATTCACACACAACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609779 39 + 636262 TCTTTGCATCCCCTAATATTAGACATTCACACACAACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 84329 20 - 647215 TCTTTGCATCCCCTCATATT------------------- + +a +s mr.mrrefChr3 157707 7 + 181019 TGATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609819 7 + 636262 TGATCTT + +a +s mr.mrrefChr3 157714 52 + 181019 TGGCCTTTACCTGGAGGCAGCCGTACAGACAAGTCAAAGCCAACATGTTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609834 52 + 636262 TGGCCTTTACCTGGAGGCAGCCGTACAGACAAGTCAAGGCCAACGTGTTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 84349 35 - 647215 -----------------CAGCCGTCCAGACAAATCAAAGCCAACATGTTCTC + +a +s mr.mrrefChr3 157766 333 + 181019 TTATCTCAAGAGAGGATTTTGGAGTCTGTACAGGTGTCCTAACAATGAACTCACACAATCTCCCATCATTCAATCTTTTGCTCAGACTTTTGCCTGGTTGTCAAGACATTTCATTGAAAATGACAAGTGCATGCTTAGGTTCCCCGTACCACATCACTAGGTGGTGACTCAACTATTCAGTTACCTGTTCATTCCAAGCCAGGCTCAAGCTAATGGGAGTCTACATGGCTGTGGCTTTGTTTATACTCCTCTTGGTTTTAAATGAATGGGGATCCTGACCTTCTCAGTTTCGTGAAACCTAACTTGAAGCACTATTGCTTATAATTACAGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 609886 332 + 636262 CTATCTCAAGAGAGGATTTTGGAGTCTGCACAGGTGTCCTAACAATGAACTCACACAATCTCCCATCATTCAATCTTTTGCTTAGCCTTTTGCCTGGTTGTCAAGCCTCTTCATTGAAAATGACAAGTGTATGATTAGGTTCCCCGTACCATATCACCAGGTGGTGACTCAACTATTCAGTTACCTGTTCAATTCAAGCCAGGCTCAAGCTAATGGGAGTCTACATGTCTGTGGCTTTGTTTATACTCCTCTTGGTTTTAAATGAATGGGGATCCTGACCTTCTCAGTTTCGTGAAACCT-ACTTGGAGCACTATTGCTTATAATTACAGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 84386 322 - 647215 TTATCTC-AGCGAGGATTTTGGAGTCTGTACAGGTGTGCTAGCAATGAACTCACACAATCTCCCATCATTCAATCTTTTGCTCAGACTTTTGCCTGGTTA-CAAGACATTTCATTGAAAGTGACAAGTGCATGCCTAGGTTCCCTGTACCACATCACTGGGTGGTGACTCAACTATTCAGTTACCTGTTTATTCGAGGC---------GCTTATGGGAGTCTACATGGCTGTGGCTCTGTTTATAGTCCTCTTGGATTTAGGTGAATGGGGATCCTGACCTTCTCAGTTTGGTCAAACTTAACTTGAAGCACTTTTGCTTAAATTAACAGCTT + +a +s mr.mrrefChr3 158099 29 + 181019 CATGATTCAAAATCACAATCAGGTAACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610219 29 + 636262 CATGATCCAAAATCACAATCAGGTGACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 84708 29 - 647215 CATGACTCAAGATCACACTCAGGGAACCC + +a +s mr.mrrefChr3 158128 76 + 181019 CACCACTGGAGTATTACAAGGTTCGAATATAATTACAATCATCTTTATGGATTACCTGTGTTTGTGACACAGTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610248 76 + 636262 CTCCACTGGAGTATCACCAGGTTCAAATACGATTACAATCATCTTTATGGATTACCTGTGTTTGTGACACAGTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 84752 76 - 647215 CACGACTGGAGCATTACAAGATTCGAATATAATTACAATCATCTTTATGGAGTACCTGTGTTTGTGACAGGGTATA + +a +s mr.mrrefChr3 158204 62 + 181019 CATATTGACAGACAACCATTTTAAATGGAAAAAAAAGTGATAATTATTCCTCTGGGTACTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610324 2 + 636262 ------------------------------------------------------------TG +s simRat_chr6.simRat.chr6 84851 62 - 647215 CATATTGACAGACAACCATTTTAAATGGAAAAAAAAGTGATAATTATTCCTCTGGGTACTTG + +a +s mr.mrrefChr3 158266 111 + 181019 CTGATGTTTAGTGTTAATGTCTAATTAAATTAAATAACTAAGAGGTTTGAAGTGGTCAACTTTTGATTATCAGTTCCCTTGTCTTAGGTGTGGATCATACTCATATGCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610326 104 + 636262 CTGATGTTTAATGTTAATGTCTAATTAAATTAACTAACCAAGAGGTCTGAAGTGGTCC-------ATCATCAGTTCCCTTGTCTTAGGTGTGGATCATACTCATATGCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 84924 111 - 647215 CTGATGTTTAGTTTTAATCTCTAATTAAATTAAATAACTAAGAGGTTTGAAGTGGTCAACTTTTGATTATCAGTTCTCTTGTCTCAGGCGTGGGTCGTACTCATATGCGGA + +a +s mr.mrrefChr3 158377 393 + 181019 CAGACTTTGTATTTGAACCCAGAGTACATACAACATTCATCTGCTACTCCTGCCTGATATATAAGTGTGATTGAGCCTAGGGCTGACTGTCTACTGTAAATGTAACCCACAGAAGTGAGCTCTGCCCCCAGTGTCCAGTCTCATGTGTGCTAACAGTGTTGCTTGGAGCAAGACCCCCCTTCAAGTTTCAGATGCAGTATGTTGTTGATTGTTGGCAGCCAGCCTCCCGGTTTAAGTGAGGAACTATAACTGTAAGTCAATCTATGCACATAGAACTGGTTTATGTCTTCGGTCTTAATGTAGCAAGATGGTGGTTCATGTGTTCAGTCATAATGTAGCAGGATGTGAGTAGAAAGAGCCCCATTTCTAGTTCTTCCAGATTTTCATGGAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610430 393 + 636262 CATACTTTGTATTTGAACCCAGAGTACATATAACGTTCATCTGCTACCCCTGCCTGATATACAAGTGTGATTGAACCTAGGGCTGACTGTCTAATGTAAATGTAACCAACAGAAGTGAGCTCTGCCCCCAGTGTGCTGTCTCATGTGTGCTAACAGTGTTGCTTGGAACAAGACCCCCATTCAAGTTTCATATGCAGTATGTTGTCGATTGTTAGCAGCCAGCCTCCCGGTTTATGTGAGGAACTATAACTGTAAATCAATCTATGCACATAGAACGGTTTTATGTCTTCGGTATTAATGTAGCAAGATGGTGGTTCATGTGTTCAGTCAAAATGTAGCAGAATGTGAGTAAAAAGAGCCCCATTTCTAGTTTTTCCAGATTTTCATGGAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 85082 393 - 647215 CGGACTGTGTATTTGAACTCAGAGTACACACAACATTCGTCTGCTACTCCTGCCTGGTATATGAGTGTGGTCAAGCCTTGGGCTGACTGTGTACTGTAAATGTAACCCACAGAAGTGAGCACTACCCCCGGTTCCCAGTGTCTGGTGTGCTGACAATGGTAATTGGAGCAAGATTCCCCTCCAAGTTTCAGATGCAGTATGTTGTTGATTGTTGGCAGACAGCCTCCCAGTTTAAGTAAGGAACTATAACTGTAAGTAAATCTATGTATACAGAACTGGTTTATATCTTCGGTCTTAATGTAGCAGGATGGTTGTTCATGTGATCGGTTATAACGTAGCAGGATGTGAGTAGAGAGAGCCCCACTTCTAGTTCTTCCAGTTTTTCATGGTAGC + +a +s mr.mrrefChr3 158770 97 + 181019 GACAGGCATGCATTTCTAAAATCGATTAAAATTGGATGCAGCTAACTGTTGACAGTGTGGAAACTGCCCCCTGTACATTAGGGAGGGAATGCCTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610823 87 + 636262 GACAGGCATGCATTTCTAAAATCGATTAAAAGTGGATGCAGCTAACTG--GACAGTGTGGAAACTGCCTG--------TAGGGCGGGAATGCCTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 85484 92 - 647215 GTCAGGCATGTATTTACAAAAT-CATTAAAATCGGGTGCAGCTAAGTGTTGGCAGTGTGGGAACTGCCCCCTGTACATTAGGGAGGGCATG----CC + +a +s mr.mrrefChr3 158867 25 + 181019 TAGAGTGGAATTGACAATTTAGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610913 25 + 636262 TAGATTGGAATTGACAATTTAGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 85576 9 - 647215 TAGAGTGGA---------------- + +a +s mr.mrrefChr3 158892 17 + 181019 TTTTCTGAAACAATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610947 17 + 636262 TTTGCTGAAACATTTCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 85585 16 - 647215 -TTTCTGAGACAATTCA + +a +s mr.mrrefChr3 158909 23 + 181019 TCCATCATAACTTCGCTCTATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610968 23 + 636262 TCCATCATAACTTCGCTCGATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 85601 23 - 647215 TCTAACATAACCTTGCTGTATAT + +a +s mr.mrrefChr3 158932 54 + 181019 AACTGTCCATACTATTCAGCTAACAGAACCTTTCTAGCATATCATGAGTGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611000 54 + 636262 AACTGTCCATGCTATTCAGCTAACAGAACCTTTCTAGCGTCTCATGAGTGCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 85624 54 - 647215 AACTGTCCATACTATTTAGCTAACAGAACGTTTCTTCCATATCCTGAGTGCACT + +a +s mr.mrrefChr3 158986 37 + 181019 GATCCCTGTGTGTGAAAGGAGTAGGTAATGGGTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611054 37 + 636262 GATCCCTGTGTGTGAAAGGAATAGGTAATGGGTATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 85679 37 - 647215 GACCCCTGTGTGTAATAGGAGTATGAAATGGGTATTG + +a +s mr.mrrefChr3 159023 9 + 181019 TGCCCCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611092 9 + 636262 TGCGCCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 85716 9 - 647215 TACCTCTAC + +a +s mr.mrrefChr3 159032 21 + 181019 CGTGGTCTATACTTACAGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611101 21 + 636262 CGTGGTCTATACTTACAGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 85727 21 - 647215 CGTCGTCTGATCTTAATCTAC + +a +s mr.mrrefChr3 159053 3 + 181019 TAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611123 3 + 636262 TAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 85748 3 - 647215 TAC + +a +s mr.mrrefChr3 159056 12 + 181019 CAGGGTATCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611127 12 + 636262 CAGGGTATCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 85751 12 - 647215 CCGGGAACCCCA + +a +s mr.mrrefChr3 159068 8 + 181019 GGATCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611139 8 + 636262 GGATCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 85768 8 - 647215 AGACCATT + +a +s mr.mrrefChr3 159076 9 + 181019 CCAAGTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611147 9 + 636262 CCAAGTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 85780 9 - 647215 CCTACTATA + +a +s mr.mrrefChr3 159085 32 + 181019 AGATCTCTGTATGTGACATGTGTTTAAGGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611159 32 + 636262 GGATCTCTGTATGTGACATATGTTTAAGGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 85789 32 - 647215 AGTCTTTTTTATGTGAGATGTGTTTAAGGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 159117 195 + 181019 AGGATGATATGCTCATTTGTCATGGAGTGATTTGACCATTTATGCAAATGCATCCTTTTAATGACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGATTCATAGGGATATGCAATTTGTGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGACTAGCAGTTATCTGTCACATAAGGCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611191 195 + 636262 AGGAGGATATGCTCATTTGTCATGGAGAAATTTGACCATTTATGCAAACGCATCCTTTTAATCACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGGCTCATAGGGATATGCAATTTATGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGATTAGCAGCTATCTGTCACATCAGGCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 85828 181 - 647215 AGGATGATATGCTCCTTGGTCATGGAGTGACTTGACCATTTATGTAAATACAT-CTATTAATGACATTTACTGCTCCCCGTGAGGT-------------AGACAAGATTCATAGGGATACGCAATTTGCAAATTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAGAAGGCTATTAGTTATCTGTCACATAAGGCCCC + +a +s mr.mrrefChr3 159312 49 + 181019 ACAGCTGATCATATGGCTTTAATAACATAACTGGGTAGGACTTGATGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611386 48 + 636262 ACAGCTGAT-ATATGGCTTTAATAACATAACTGGGTAGGACTTGATGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 86014 49 - 647215 ACGGCTGATCAGATAGCTTTAATCATGTAACTGGATAGGACCAAGTGAT + +a +s mr.mrrefChr3 159361 10 + 181019 ATCTCATAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611439 10 + 636262 ATCTCATAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 86063 10 - 647215 ATCTCATGAG + +a +s mr.mrrefChr3 159371 38 + 181019 AAAATATGTACATTGACTGTTGTGAAACCCAATTCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611449 38 + 636262 AAAATATGTACATTGACTGTTGTGAAACCCAATTCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 86074 38 - 647215 AAAATATGCTCATTGAATGTTGTGAAACCTGATTCTGG + +a +s mr.mrrefChr3 159409 43 + 181019 AAAGTGTAGGAGATACCCTAAGTGAAATTCTTCCCAACATTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611487 43 + 636262 AAAGTGTAGGAGATACCCTAAGTGAAATTCTTCCCAACATTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 86114 43 - 647215 AAAATGTAGGGTATCCCGTAAGTTGAATTCTTCCCAACATTAT + +a +s mr.mrrefChr3 159452 17 + 181019 CCACTTCAGAGTGTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611530 17 + 636262 CCACTTCAGAGTGTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 86158 17 - 647215 TCACTTCAGAGTGTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 159469 18 + 181019 TGACTTTGACCGAGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611548 18 + 636262 TGACTTTGACCGAGGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 86175 18 - 647215 TGACCTTGAATGAGTACT + +a +s mr.mrrefChr3 159487 90 + 181019 TATCTGGGTACTGTACTTGCAAAGCCCGAAAACATTGGCCTGAGATTCCCCTGGGCTACTTTAAGTAGAAGTTCTACCAACATTATGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611566 90 + 636262 TATCTGGGTACTGTACTTGCAAAGCCCGAAAACATTGGCCTGAGATTCCCCTGGGCTACTTTAAGTAGAAGTTCTACCAACATTATGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86231 90 - 647215 TATCTGGGTACTGTACTTGCAAAGCCTGAAAACATGGGCCTGGAATTCCCCTAGGACACCTTAGGTAGAAGTTCTCCCAACATCATGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 159577 12 + 181019 TTCAATGTGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611657 12 + 636262 TTCAATGTGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 86321 12 - 647215 TTCAATGTGTGG + +a +s mr.mrrefChr3 159589 111 + 181019 TTTATTAAAGGAGCCACAGCAGTTAAGCCTATGTTTGGTAGCTGGGTAGTGTACTGGCAAAGCCTGAAAACACTTGTTTGGGAAGCCCCTTGTATTGGGACTGGGGGCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611670 111 + 636262 TTTATTAAAGGAGCCACAGCAGTTAAGCCTATGTTTGGTAGCTGGGTAGTGTACTGGCAAAGCCTGAAAACACTTGTTTGGGAAGCCCCTTGTATTGGGACTGGGGGCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86333 111 - 647215 TTCATTGGAGGGTCCACAGCAGTTAAACCTATGGTTGGTGGCTGGTTAGTGTACTTGCAGAGCCCGGAAAGACTCGTGTGGGAACCACCTTGTATTGGGACTGGGTGCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 159700 22 + 181019 GGTGGAAGCTACCAACATTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611790 22 + 636262 GGTGGAAGCTACCAACATTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86444 22 - 647215 GGTGGTAGCTACCAACGTTAGA + +a +s mr.mrrefChr3 159722 39 + 181019 GCGACTATGCCACCCTGGGCTAGATCTTAGGAACCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611816 39 + 636262 GCGACTATGCCACCCTGGGCTAGATCTTAGGAACCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86466 39 - 647215 GCAACGATGCCACCCTGGGCTAGATCTTAGGAACTCGAA + +a +s mr.mrrefChr3 159761 36 + 181019 CTAGTTGGGCTGTGAGTATCTTGGGCTGGCGAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611858 36 + 636262 CTAGTTGGGCTGTGAGTATCTTGGGCTGGCGAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 86505 36 - 647215 CAAGTTGGGCCATGAGTATCTTGGGCTGGTGTGAAA + +a +s mr.mrrefChr3 159797 70 + 181019 AATATCTTACAGATATTTACCATGACTTATATAAGTCCCATGCAGCACACCTCATCATACTGCACCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611894 70 + 636262 AATATCTTACAGATATTTACCATGACTTATATAAGTCCCATGCAGCACACCTCATCATACTGCACCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86552 70 - 647215 AATATCTTAGAGACATTAACCATGACCAATTTAAGTCCCACGCAGCACAGCTCATCATGCTGCACAGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 159867 14 + 181019 CATAGTAGGAAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611965 14 + 636262 CATAGTAGGAAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86622 14 - 647215 CATATTAGACAACA + +a +s mr.mrrefChr3 159881 31 + 181019 TCCTGTGACCCTACCAAGGGGACATTCACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611980 31 + 636262 TCCTGTGACCCTACCAAGGGGACATTCACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 86636 31 - 647215 TCCTGCCACCCTACCAAGGGGAGGTTCATGC + +a +s mr.mrrefChr3 159912 34 + 181019 AAGATTTTAGTGCCACTAATCAGATCAGAAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612011 34 + 636262 AAGATTTTAGTGCCACTAATCAGATCAGAAAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 86668 34 - 647215 AAGATTTTAGTGCCACTAATCAGATCAGAAAAGT + +a +s mr.mrrefChr3 159946 98 + 181019 TTAGCCTGTTGAATGAATGCCCTGATAACTATTAGTTGTACTGAGGTCGCAGCACTTGATGACTATTGGTTGTACTATTGCTCTAGCTTGGGCGTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612046 98 + 636262 TTAGCCTGTTGAATGAATGCCCTGATAACTATTAGTTGTACTGAGGTCGCAGCACTTGATGACTATTGGTTGTACTATTGCTCTAGCTTGGGCGTCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 86702 98 - 647215 TTAGCCTGTTGAATGAATGCCTTGATTACTGTTGGTTGGACTGCGGTCTCAGCACTTGATTACTGTTCATTGTACTATTGCTTCAGATCGGGTGACAT + +a +s mr.mrrefChr3 160044 26 + 181019 AAAGTATCAAGAGATGGAATGATGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612148 26 + 636262 AAAGTATCAAGAGATGGAATGATGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86800 26 - 647215 AAAGTAAAAAGAGATGGAATGATGGA + +a +s mr.mrrefChr3 160070 11 + 181019 AACCCCCTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612174 11 + 636262 AACCCCCTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 86837 11 - 647215 CACACCCTATG + +a +s mr.mrrefChr3 160081 75 + 181019 GAGGTCGCAGCATTTGTCATTTTGATTTGGTTAATCCCAGTCTTATGACCTCCAGGGCATTTAAGCATCCTTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612185 75 + 636262 GAGGTCGCAGCATTTGTCATTTTGATTTGGTTAATCCCAGTCTTATGACCTCCAGGGCATTTAAGCATCCTTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86850 75 - 647215 GAGGTCTCAGCATTTGTCACTTTGGTTTTGTTACTCCTAGTCTTATGATCTCCAGGGCATATGAGCATCCTTCAA + +a +s mr.mrrefChr3 160156 20 + 181019 CCACAGTTAAAAATCATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612260 20 + 636262 CCACAGTTAAAAATCATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 86930 20 - 647215 TCCCAGTTAGAAATCAAAGG + +a +s mr.mrrefChr3 160176 9 + 181019 TTCTTGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612291 9 + 636262 TTCTTGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 86950 9 - 647215 TTCTTACAC + +a +s mr.mrrefChr3 160185 34 + 181019 TGAATTCTTGCACTGGCCTAAGATAGAATTGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612301 34 + 636262 TGAATTCTTGCACTGGCCTAAGATAGAATTGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 86959 34 - 647215 TGAATTCTTGCACTGGCATAAGATAGAATAGAGA + +a +s mr.mrrefChr3 160219 52 + 181019 AAGAGATGATCGGCCCACCAGAGATATGTAAAGAAAGAACTGGTAGACCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612335 52 + 636262 AAGAGATGATCGGCCCACCAGAGATATGTAAAGAAAGAACTGGTAGACCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 87003 52 - 647215 AAGAGATGGTGGGCCCACCAGAGATATGTACAGAAAAAACTGGTGGACCCCA + +a +s mr.mrrefChr3 160271 8 + 181019 ATTCCGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612394 8 + 636262 ATTCCGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 87055 8 - 647215 ATTCTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 160279 74 + 181019 AAAACACTAAAGAATAATCCAGGTGGCAGAGCTAGAATAATGGTTTTACTCAAAGGCGTATTATTTCGCTCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612403 74 + 636262 AAAACACTAAAGAATAATCCAGGTGGCAGAGCTAGAATAATGGTTTTACTCAAAGGCGTATTATTTCGCTCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 87063 74 - 647215 AAACCACTGAAGAATAAACGGCGTGGAGGGGCTTGAATGCTAGTTATACTCTAAAGTGTATTATTTCGCTCCTG + +a +s mr.mrrefChr3 160353 60 + 181019 GTCCTGCCGATCTTGCTACTATTCTCTTGGCATCATACATTCTAAGCACCTTATCTCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612477 60 + 636262 GTCCTGCCGATCTTGCTACTATTCTCTTGGCATCATACATTCTAAGCACCTTATCTCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 87230 60 - 647215 ATCCTTCAGATCTTGCTACTATTCTCTTGGTATCGTACATTCTACGCACCTTGTCATCAA + +a +s mr.mrrefChr3 160413 17 + 181019 GGTTTACTGTGATTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612537 17 + 636262 GGTTTACTGTGATTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 87295 17 - 647215 GATTTATTGTGATTGAT + +a +s mr.mrrefChr3 160430 23 + 181019 AATATGATTTGAGTAGTCTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612559 23 + 636262 AATATGATTTGAGTAGTCTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 87312 23 - 647215 AATATGATTTGAGTGGTGTTTGA + +a +s mr.mrrefChr3 160453 21 + 181019 TGAACAGCCAAGAGACTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612582 21 + 636262 TGAACAGCCAAGAGACTGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 87336 21 - 647215 TGAATAGCCGAGAGACTGACA + +a +s mr.mrrefChr3 160474 4 + 181019 ACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612610 4 + 636262 ACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 87357 4 - 647215 ACAG + +a +s mr.mrrefChr3 160478 22 + 181019 CAGGGGGCGAGTGTAGAAGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612614 22 + 636262 CAGGGGGCGAGTGTAGAAGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 87362 22 - 647215 GGGGGGGCAAGTGTAGAAGTAG + +a +s mr.mrrefChr3 160500 31 + 181019 GTGAGTTTATAGAATTGCTTAATCATGAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612636 31 + 636262 GTGAGTTTATAGAATTGCTTAATCATGAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 87488 31 - 647215 GTAAGCCTATACAATTGCTTGATTGTTAGTT + +a +s mr.mrrefChr3 160531 95 + 181019 AACAAGGGGTATAGGACATGGTGTGTCTGTACATCCACCCACTCAATGTTTCTCTATTTGCTACTGGGGAGTTTCTTAACCTGGAGATATCCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612667 95 + 636262 AACAAGGGGTATAGGACATGGTGTGTCTGTACATCCACCCACTCAATGTTTCTCTATTTGCTACTGGGGAGTTTCTTAACCTGGAGATATCCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 87524 95 - 647215 AACAAGGGGTATAGGACATGGTGTGTCTGTACCTCTACCCACACGGCTTTTCTCTCTTTGCTACTGGGAAGTTCCTCAACCCGGACATATCCCCT + +a +s mr.mrrefChr3 160626 100 + 181019 TTCCCTAATGCCCTCTCCCCCATGATAATGGTGCAGATTTCAGTTCTCTCTTCAAATACAAAACTGTTGTTACTGAAATATCAGCTGGAGGTTTATCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612762 100 + 636262 TTCCCTAATGCCCTCTCCCCCATGATAATGGTGCAGATTTCAGTTCTCTCTTCAAATACAAAACTGTTGTTACTGAAATATCAGCTGGAGGTTTATCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 87620 100 - 647215 TTCCCCAAGCCCCTCCTCCCCATGATAATGGTGCAGATTTCAGTCCTCTGTTTAAATATAAAACTGTTGTCACTGAAATATCAGTTGGATGTTTATCTTC + +a +s mr.mrrefChr3 160726 12 + 181019 GCAAGACCATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612863 12 + 636262 GCAAGACCATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 87720 12 - 647215 ACAAGACCCTCT + +a +s mr.mrrefChr3 160738 19 + 181019 TAAGACTAGGTCAGGCGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612875 19 + 636262 TAAGACTAGGTCAGGCGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 87738 19 - 647215 TAAGACTAGGCCATACGAG + +a +s mr.mrrefChr3 160757 104 + 181019 TGAATGAACAATTGCACACAACTACAAGGGCTTCCATGAAGTCCCCCTATCACGTAGACACCTGAGAACTGCCAGGAATCTAATAGTCAAGGCCTTCTGGATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612894 104 + 636262 TGAATGAACAATTGCACACAACTACAAGGGCTTCCATGAAGTCCCCCTATCACGTAGACACCTGAGAACTGCCAGGAATCTAATAGTCAAGGCCTTCTGGATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 87791 104 - 647215 TGAATGAAGTTATACACACCACTACAACAGCTTCCGTGTGGTCCCCCTATCACGTAGACACCAGAGAACAGCCAGGGATCTAATGGCCAAAGCCTTATGGATTT + +a +s mr.mrrefChr3 160861 15 + 181019 CAAATTTGATAAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 612998 15 + 636262 CAAATTTGATAAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 87897 15 - 647215 CAAATTTGATAAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 160876 40 + 181019 TGTTACTATTTAGCTATCATAACCACATCCTGGGCGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613013 40 + 636262 TGTTACTATTTAGCTATCATAACCACATCCTGGGCGATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 87931 40 - 647215 TGTTCCTACTTATCTATCATCACCACATCCTAGACCCTAT + +a +s mr.mrrefChr3 160916 4 + 181019 ATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613053 4 + 636262 ATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 87972 4 - 647215 ATCA + +a +s mr.mrrefChr3 160920 131 + 181019 GGAATCGTGTCTGGGCATGAGTTATAGTTTTACCATCTTTGACAACAACAAGTCACTTTGACCTTTTATACCTGCTTCTCTCTATTGTTCTTAGAGCATAAAAAAAGGCTGATCTTAACAGCCAATGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613057 131 + 636262 GGAATCGTGTCTGGGCATGAGTTATAGTTTTACCATCTTTGACAACAACAAGTCACTTTGACCTTTTATACCTGCTTCTCTCTATTGTTCTTAGAGCATAAAAAAAGGCTGATCTTAACAGCCAATGCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 87998 131 - 647215 GGAATAATGTTTGGGCATGAGTTACAGCAGTGACCTCTTTGACAACAGCAAGTGACTTTGACCTTTTATACCTGCTTCTCTCTATTGTTCTTAGAGCACAAAAAGATGCTGCTTCTAACAGCCAAGAGCAC + +a +s mr.mrrefChr3 161051 91 + 181019 ACATATATCAGATAGGCTCAAATGTTCACTCATCACTTTCGTTCATACAGACTGACAGTTCACTATGTTGAGGGTTACAGGGAGAGAGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613188 91 + 636262 ACATATATCAGATAGGCTCAAATGTTCACTCATCACTTTCGTTCATACAGACTGACAGTTCACTATGTTGAGGGTTACAGGGAGAGAGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 88131 91 - 647215 ACATCCATCAGATAGGCTAAAATGTTGAATCATCACTTTTGTCCGTGCAGACTGATAATTCACTATGTTGAGGTTTATAGGGAGAGGGACC + +a +s mr.mrrefChr3 161142 234 + 181019 AATTATCAGGGCATCTTTATGAGATTGCTAACCTAAAAGTGTGGTAATCTGGAAAGCTGAGGAATCTTGTTTGTAGCCATCATGCACTCAGCACTGTACTTGGGGTAGTTTGAAGAGTGGCGCAAGCACATCTTGATTATTTTTTATTTTCCATGACTGCTTTCTTCAATCACGTCCTCAATCATGATATAATCTCTTTTTCTCTCTCATTGTACAGTTTCACTATCTATAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613279 234 + 636262 AATTATCAGGGCATCTTTATGAGATTGCTAACCTAAAAGTGTGGTAATCTGGAAAGCTGAGGAATCTTGTTTGTAGCCATCATGCACTCAGCACTGTACTTGGGGTAGTTTGAAGAGTGGCGCAAGCACATCTTGATTATTTTTTATTTTCCATGACTGCTTTCTTCAATCACGTCCTCAATCATGATATAATCTCTTTTTCTCTCTCATTGTACAGTTTCACTATCTATAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 88262 234 - 647215 AATTATCAGGGCATTTGTATGTGATTGCTAATCAAAAAGTGTTGTAATCTGGAAAGCTGAGAATGTTTGTTTGTGGCCATCATGCAATCAGCACTGTACTTGGAGTAATTTGAGGGGTGGTGCAAGTGAATCTTGTTTATGTTTTATTTTTCATGACTGCTTTCTTCAACCATGTCCTCAATCAAGATAGAATCTCTTTTTATTACTCATTGTACAATTTCACTGTCTATAGTT + +a +s mr.mrrefChr3 161376 62 + 181019 TTTCATTGGTGCAAACACATTGTGGCAGTTAGTATTACTGAGTCTAACAACCTGGAAGGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613516 62 + 636262 TTTCATTGGTGCAAACACATTGTGGCAGTTAGTATTACTGAGTCTAACAACCTGGAAGGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 88496 62 - 647215 TTTCATTGGTCCAAACACATCGTGGCAATAAGTATCACTGAGTTTAATAATTTGAACCGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 161438 110 + 181019 ATGATGCTCCTGACTTTAGTCGATGAGTCTACACTCAGTCTGTAAGGGGCTGTGTGGGACAAAATAGATTTGCCCCAGAAGATTTGAAGCAATACCAACaccactacatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 613579 110 + 636262 ATGATGCTCCTGACTTTAGTCGATGAGTCTACACTCAGTCTGTAAGGGGCTGTGTGGGACAAAATAGATTTGCCCCAGAAGATTTGAAGCAATACCAACaccactacatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 88558 110 - 647215 CTGAAGTTCCTGTCTTTAATTGATGAGCCTACACTCACTCCGTAAGGGGCTGTGTGGGACAAACTAGGTCTGCACCAGAAGATTTGAAATAACACCAACACCACTACATC + +a +s mr.mrrefChr3 161548 364 + 181019 CAAGGTTTCTTTCTCTGGTTAGCCTTGAATCTCGGTTCATGAGTGTGAACTGATAGTCAACTTAATAACAAACAGCAGATTGAGGTGGACTCGTTATCTGGGACAATGGCTCTTTATATGTATTCTAGTGCATTGTTGTCCTAATTACAGTACACTCTACACACCAGCTGGCAGGTAGGGGCTCCAATGCACACTGTTTGTTTTTAGGTCTAGTCAAACTTGGCAACAAAAGCATAAATTGGCAAGGTTTGAAGTCCTCCATATCTTTCTAACATTCAATCATTATCAGTATGCACATAGATATCACAGATCTAGTGTAATGCAATAAAAGGGAAACTTGCAGCAGTTGATTATAAGTCTTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 614279 358 + 636262 CAAGGTTTCTTTCTCTGATTAGCCTTGAATCTCGGTTCATGAATGCGAACTAATAGCCAACTTAATGACAAGCAGCAGATTGAGGTGGACTTGTTATCTGGGACTATGGCTCTTTATATGTATTCTAGTGCATTGTTGTCCTAATTACAGTACACTCTACACACCAGCTGGCAGGTAGGGGCTCCAATGCACACTGTTTGTTTTAAGCTCTAGTCAAATTTGGCAACAAAAGCATAAATTGGCAAGGTTTG------TCCGTATCTTTCTAACATTCAATCATTATCAGTATGCACATAGATACCACAGATCTAGTGTAATGCAATAAAAGGGAAACATGCAGCAGTTGATTCTACGTCTTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 88668 349 - 647215 CAAGGTCTCTTTCTCTGGTTAGCCTTGAATCTCGGTTCATGAGTGTGATCTGATGGTCAACTTAATAAAAAACAGCAGATTGAGGTGGACTCAT----TGGAACAATGGCTCTTTATACGTATTCTAGTGCATTGTTGTCCTAATTACAGGACACGCTACACACCAGCTAGCAGGTAGAGGCTCCAATGCACACTGTTTGTCTTTAGGTCCAGTCAAGCTTGGCAACAAAGG----AATCCGCAAGGTTTGAAGTCCTCCATAACTTTCTAACATTCTATCATTATCATGATGCACATAGATATCACAAATCTAGTGTAATGCAATAAAAGGGAAGCTTGTAGCAGTTGATTATAAA------- + +a +s mr.mrrefChr3 161912 3 + 181019 GAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 614637 3 + 636262 GGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 626583 3 + 647215 GAG + +a +s mr.mrrefChr3 161915 231 + 181019 GGTCCACTTAAATTAGATGGCTCAAAAGAGCTTTGTGGATGGTACGAACCTACCTCTACAGAAGACAGAAATTACCAGCATGCCTATGAGATTGGTCAATTCATGACACACATCTCATATAGTGTCAAAATGCCTTCCAATGCCCACAAACATTCTGCCACGAGCTTGTGTCTCAATAAACTGGTCTTGCCCATGCACCATCTAGAGTAAGATTGTGAACTGCGGAGCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 614640 202 + 636262 GGTCCACTCAAATTAGATGGCTCAAAAGAGCTTTGTGGATGGTGCAAAC-----------------------------CATGCCTATGAGATTGGTCAATTCATGACACACATCTCATATAGTGTCAAAATGCCGTCCAATGCCCACAAACATTCTGCAACGAGCTTATGTCTCAATAAACTGGTCTTGCCCATGCACTATTTAGAGTAAGATTGTGAACTGCGGAGCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 626587 231 + 647215 GGTCCACTTGAATTAGATGGCTCAAAAGAGTTTTGTGGATGGTACGAAACTACCTCTACAGAAGACAGAAATTACCAGCATGCCTATGAGATTGGTCAGTTCATGCTGCACATCTCACACAGTGTCAACATGCCTTCCAAAGGCCACAAACTTTCTGCCACAAGCTTGTGTCTCAATGAACTGGTCTTGCCCATGCACCATCTAGAGTTACATTGTTAACTGAGGAGCCAT + +a +s mr.mrrefChr3 162146 302 + 181019 AAAATCAGATTGAATGTATGGTCCTAGGTCAGGAAGTCAGGCTTGAGACTGGAAAATAGTTGGGGTCTTTCTAGAGTGGTTCCTTGACAAGATAGGTGTCGCAATTGAAATACCAAGGTATACCATTTTAGTGTATACCACTTTAGTGGTCTAACAGAAAAGATGGGGTGGGCAAGCTTAAGTGGTCCTGATATGTCTGAGTGACCTCTGTGCCAGGTATGGTGGTCACTTGTGGGCCTTCCATGGATACATTTATGGTAACACTGGCTCTGTACATCCAGCAACATTGTCTTAGACTAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 614848 302 + 636262 AAAATCAGATTGAATGTATGGTCCTAGGTCAGAAAGTCAAGCGTGAGACAGGAAAATAGTTGGGGTCTTTCTAGAGTGGTTCCTTGACATAATTGGTGTCGCAATTGAAATACCAAGGTATACCATTTTAGTGTATACCACTTTAGTGGTCTAACAGAAAAGATGGGGTGGGCAAGTTTAAGTGGTCCTGATATGTCTGAGTGACCTCTGTGCCAGGAATGTTGGTCACTTGTGGGCCTTCCATGGATACATTTATGGTAACACTGTCTCAGTACATCTGGCAACATTGTCTTAGACTAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 626818 286 + 647215 AAAATCAGATTGAATGTATGGTCTTAGGTCAGGAAGTCAGGTTTGAGCCTGGAAAATAGGTGGGGTCTTTCTAGAGTGGTTCCTTGACAAGGTAGGTGTCACAATTGAGATACCAAGGTATACCATTTTAGTGTATACCATTTTAGTTGTCTAATGGAAAAGATGGGGTGGGCAAGCTCAACTG----------------GTGACCACTGTGCCATGTATAGTGGTTACATGTGGGCCTTCCATGCATATATTTATGGTAACACTGGCTCTGTACATCCAGCATCATCGCCTTAGACTAGCC + +a +s mr.mrrefChr3 162448 44 + 181019 AAAATAATAGAGTCTTCCACTGACAGATCCAATTCTACCCCACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615150 44 + 636262 AAAATAATAGAGTCTTCCACTGACAGATCCAATTCTACCCCACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 627105 44 + 647215 AAAATAATAGAGTCTACCACTGAAAAACCTTCTTCTACCCCAAG + +a +s mr.mrrefChr3 162492 70 + 181019 CTCTACCCCAGGGTATAGTAGTAATTCAGGCCTCACATAATCCAACAGGATGCCATGCAAACAATGCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615194 70 + 636262 CTCTACCCTAGGGTATAGTAGTAATTCAAGCATCACACAATCCAACAGGATGCCATGCAAACAATGCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 627152 70 + 647215 CTCTACCCCAGTGTATGGTAGTAATGCAGGCCTCACATAATTCAACAGGATGCCATGCAAACAATGCAGA + +a +s mr.mrrefChr3 162562 19 + 181019 GATACATTGTAAGCAAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615266 19 + 636262 GATACATTGTAAGCAAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 627222 18 + 647215 GATATATT-TAAGCAAGTC + +a +s mr.mrrefChr3 162581 58 + 181019 AATTGCTGGTGGCCCTACCAGTAAACACCTGAGGATGAGCTCGTGAAGTGTCAAATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615287 58 + 636262 AATTGCTGGTAGCCCTACCGGTAAACACCTGAAGACGGGCTCGTGAAGTGTAAACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 627240 58 + 647215 AATTGTTGGTGGCCCTACCAGTAAGCCCCTGAGGATGAGCTGCTGAAGTGTCAAATTG + +a +s mr.mrrefChr3 162639 120 + 181019 GCTATTGGGTAGGAGGCAGGACTCAGGTTCATGATGTGAGCACAGCATGCTGCCTGTGAATCTAGGGGCATGAGGTTTGTATTGTACTATGAGGTCTTGCATATTTGCTAATAGATCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615357 117 + 636262 GCTATTGGGTAGGAGGCAGGACTCAGGTTCATAATGTGAGCACAGCATGCTGCCTGTGAATCTAGGGGCATGGGATTTGTATTGTACTATGAGGTCTTGCA---TTGCTAATAGATCCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 627298 110 + 647215 GCTATTGGGTAACAGGCAGGACTCTGATTCATGATGGGAGCACAGCATGCTGCCCTTGAACCTAGGGGCATGAGGTTATTATTTTACTATGAGGCCTCGCATATTTGCCG---------- + +a +s mr.mrrefChr3 162759 86 + 181019 CATATGCATGAGACCCAGAGCAAATGCTAAGTGGTTGAAAGCAAATCATCACACATATGATATTGTAGTATTGATTTGGGGGTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615475 86 + 636262 CATATGCATGAGACCCAGAGCAAATGCTAAGTGGTTGAGAGCAAATGGTCACACATGTGATATTGTAGTATTGATTTGGGGGTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 627408 49 + 647215 -----------------------------------TGAAGGCAAACCAT--CATATATGATATTGCAGTATTGGTATGGGGGTAAC + +a +s mr.mrrefChr3 162845 23 + 181019 AAATATATCAGATCAAACTCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615574 23 + 636262 ATATATATCAGATCAAACTCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 627457 23 + 647215 AAATATACCAGGTCAAAATCCTA + +a +s mr.mrrefChr3 162868 56 + 181019 TCTCTAGTTTAATCAAATCAGAGGCTAGTCAAAAAGAGAGAAGGACCATATGACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615598 56 + 636262 TATCTAGTTTAATTAAACCAGAGGCTAGTCAAAAAGAAAGAAGGACCATATGGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 627480 56 + 647215 TCTCTAGTTTAATCATATAAGAGGATAGCCGGAAAGAGAGAAAGACCATATGACAT + +a +s mr.mrrefChr3 162924 76 + 181019 GTGGGACCTGTATTGACAGGTATTGGCAAGTGTGGACCCTGTGTTAGTCAATGGGCATGAGACTATTTGAGTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615658 76 + 636262 GTGGGAACTGTATTGACAGGTATTGGCAAGTGAGGTCCCTGTGTCAGTCAATGGGCATGAGACTATTTGAGTGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 627536 76 + 647215 GTGGGACCTGTATTGACAGGTATTAGCAAGTGTGGACTCTGTGTTAGTCAATGAGCATGAGACTATTTGAGTGACA + +a +s mr.mrrefChr3 163000 49 + 181019 GCTGTAAACCATCCCCTCACTACTAATACTAAGGGGGGACTACTCAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615734 49 + 636262 GCTGTAAACCATCCCCTCACTACCAATACTAAGGGAGGACTACTCAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 627619 49 + 647215 GCTGTAAACCATCCCCTCACTATTAATACTAAGAGGGGATTACTCAAAA + +a +s mr.mrrefChr3 163049 82 + 181019 TAGACCTCCCCACAGTAATTGCTTCTTTGCCTGGGCCCTACGGCAATAGCATATGCAGATATGTTAGCATTAGAAATCATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615793 80 + 636262 TAGACCT--TCACATTAATTGCTTCTTTGTCTGGGCCCTACAGCAATAGCATCTGCAAATATGTTAGCATTAGAAATCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 627668 82 + 647215 TAGACCTCCCCAAAGTAAGTGCTTCCTTGCCTGGGCCCTTCGGCCATAGCATATGCAGATATGTTAGCATTAGAAATCAAAC + +a +s mr.mrrefChr3 163131 36 + 181019 ATGAGATCTATATTGTAATTCCTGTAATGAGCATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615920 36 + 636262 ATGAGATATATATTATAATTCCTGTAATGAGCATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 627750 36 + 647215 ATGAGATCTATATTGTAATTCCTGTAAAAAGAAAAG + +a +s mr.mrrefChr3 163167 260 + 181019 GTGTAAAAGCATCGAACCTTGAATACAAAACAGTGTGTGAATGGGGGTTGTGGCCTAAGGCAAATTGAAGGGTAAGTTAAGAGCACTGATCTAATTTGGCGGCTCATAAGTGATGGTCAAGGCCTGATCTACAGCTAATAAACAAACAGTGCTTATGTAAACTGGTGCCTAGCATGTACACTTTGAAGGGATAATGGGGGAGTAATCAGAATAATTGACATAGTCTTAATGTTGTTTAGATCTGGCACTGTGACTGATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 615956 259 + 636262 GTGTAAAAGCATCGAACCTTGAATACAAAACAGTGTGTGAATGGTGATTGTGGCCTAAGGCAAATTCAAGGGTATGTTAAGAGCACTGATCTAATTTGGCGTGTCATGAGTGATGGTCAAGGCCTGATCTACAGCTAATAAACAAACAAC-TTTATGTAAACTGGTGGCTAGCATGTACACTTTGAAGGGATAATGGGGGAGTAATCAGAATAATTGACATAGTCTTAATGTTGTTTAGATCTGGCACTGGGACTTATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 627790 255 + 647215 GGGTAAAAGCA--GAACCTTGAATTCAAAACAGTGTGTGAAGGGGGGCTGTGGCCAAAGGCAAATTGGAGTGTAAGTTCAGAGCACTGGTCTAATTAGG-GGCTCACAAGTGAAGGTCAACGCCTGGTCTACAGCTAATAAACAAATAGTGCTTATGTAAACTGGTGCCTAGT--TTACACTTTTAATGGCTAATGGAGGAGTAATCAAAATAATTGACATAGTCTTAATGTAGTTTAGATGTCGCACTGTGCCTGATGC + +a +s mr.mrrefChr3 163427 60 + 181019 AAAGCTCAAATAAAAGGCAAATGTGGCCATGTACATGCAGTTAGTGCTTGGTGATGAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616215 60 + 636262 AAAGCTCAAATAAAAGGCAAATGCGGCCATGTATATGCAGTTAGTGCTTGGTGGTGAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 628046 60 + 647215 AAAGCTCAAATAAAAGGCAGACATGGCCATGTACACGCAGTTAGTGCTTGGCTATGAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 163487 92 + 181019 CCGCTTGATGGGACAGAATACCACCAGAAAAACCTGTGTACATGATGCAAATAGTGAATATAATCTGACTTTGGCTCATAACATTACTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616279 92 + 636262 CCGCTTGATGTGACAGAATACCACCAGAAAAACCTGTGTACATGATGCAAATAGTGAATATAATCTGACTTTGGCTCATAACATTACTATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 628106 92 + 647215 CCGCTTGATGGCACAGAATACGACCAGAGAAACTTGTGTACATGATGCAAATATTGAATATAATCTGACTTTGGCTCATAACATTACTATTG + +a +s mr.mrrefChr3 163579 215 + 181019 AAACTTGCAAGGAACTGAATAGAGCCTACAATAAACAGCAAAGTTTCCCATCCTCTCAAAAATACTGCCTAGTGATACACCAGTTCTCTAAAGAGAATTACCTTTCTAGCCTTTTGGAAAGTGAAATCATCCCTGAGGAATGACACAAGTTCAATATACAGACAACTTGCCTGGACGGCTGGACTTAAGGTTGTTTGGATTCCGCAAAGTGCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616375 202 + 636262 AAACTTGCAAGGAGCTGAATTGAATCTACAATAAACAGCAAAGGTTCCCATCCTCTCAAAAATACTGCCTAGTGATACACCAGTGCTCTAAAGAAAATTACCTTTCTAGCCTTTTGGAAACTGAA-------------AATGACACAAGTTCAATATACAGGCAACTTGTCTGGACGGCCAGACTTAAGGTTGTTTGGATTCCGCAAAGTGCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 628198 215 + 647215 AACCGTGCAAGGAACTGCATAGAGCCTACAACAAACAGCAAAGTTTCCCATCCTCTCAAAAATACTGCCTAGTGACACACCAGTTCTCTAAAGAGAATTACCTTTCTAGCCTTTCGGAAAGTGAAATCATCCCTGAGGAAAGACACAAGTTCAATATACAGACAACTTGCCGGGATGACTGGACTTAAGGTTGTTTGGATTTCGCACAGTGCCTC + +a +s mr.mrrefChr3 163794 14 + 181019 AAATAAAAAACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616588 14 + 636262 AAATAAAAAACAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 628413 14 + 647215 CAATAAAAGGCAAA + +a +s mr.mrrefChr3 163808 11 + 181019 CTCAGCCATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616604 11 + 636262 CTCAGCCATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 628427 11 + 647215 CTCAGCCATGT + +a +s mr.mrrefChr3 163819 42 + 181019 ATGCAGTTAGTATTTGGCTATGAGCCTGCACTGCTTGGCGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616615 42 + 636262 ATGCAGTTAGTATTTGGCTATGAGCCTGCACTGCTTGGCGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 628440 42 + 647215 ATGCAGTTAGTATTTGGTCATGAGCTCGCCCTGCTTGGCGTG + +a +s mr.mrrefChr3 163861 155 + 181019 ATGTCAAGCGATCACAGGTACCTGTGAAGGAGCCTGCATGTGTCTCTCAAGAGTTTGTCCACCTGCCTCACACTAGAGGTTTGTCATGCATCTTGCACAGCTCCCCGCATACATTCTATATTCCCTGTCTGCCTCTTGTTCAGTTAAGTGATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616657 155 + 636262 ATGTCAAGCGATCACAGGTACCTGTGAAGGAGCCTGCATGTGTCTCTCAAGAGTTTGTCCACCTGCCTCACACTAGAGGTTTGTCATGCATCTTGCACAGCTCCCCGCATACATTCTATATTCCCTGTCTGCCTCTTGTTCAGTTAAGTGATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 628483 155 + 647215 ATGTCAAGTAATCACAGGTACCTGTACTAGAGCATGCATATGTCCCACAAGAGTTTGTCTGCCTGCCTCACACTACGGGTCTGCCATGTATCATGCAGAGCTCCCTGTATACATTCTAGATTCCCTGTCTGCCTCTTGCACAGTCAAGTGATCGC + +a +s mr.mrrefChr3 164016 9 + 181019 GGCACCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616813 9 + 636262 GGCACCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 628638 9 + 647215 GGCACCTGT + +a +s mr.mrrefChr3 164025 321 + 181019 CCTCTAGAAGGAGCCTGCCTGTGGGGCTATAATGGGCTCAGTCTTGCATTAGGCCATTTGTGAGCCATAGGGGATCAACCTGGCTTGTGCCAGGTTTGGCCAGCCTACAAGAATTACCAGCCTCCACCAAACCAGCTTCATCTACTATGATTGCCATGATTCTTCTTGTCAAGGTATCACTCACAAATCTATTGGTGATCAGACTTTGGTTATTACATTTCAAATAGTTGTATTGAAACCTCCCTATGTGATTGACACTATAAGTTGAAGTTCAATTTCTGCACTGCATTAGCTCTATAAAGGCAACACTCTCATAGAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 616824 270 + 636262 CCTCTAGAAGGAGCCTGCCTGTGGGGCTATAATGGGCTCAGTCTTGGATTATGCCGTTAGTGAGCCATAGGTGATCAACCTGGCTTATGCCAGGT---------------------------------------------TCTACTATGATTGCCATGATTCTTCTTGTCAAGGTATCACTCA-AAATCTAGTGGTGATTAGACTTTGGTT-----ATTTCAGATAGTTTTATTGAAACCTCCCTATGTGATTGACAATATAAGCTGAAGTTCAATTTCTGCACTGAATTAGCTCTATGAAGGCAACACTCTCATAGAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 628647 318 + 647215 TTTGTAGAAGGAGCCTGCCTGTGGGGTTATTATGGGCTCAGTTTTGCATTAGGCCATTTGTGAGCCATAGGGGATGAACCTGGCTAGTGCCAGGTTTGGCCAGCCTACAAGAATTACCAGCCTCCACCAAACCAGCTTCATCTTCTATGATTGCCATGATTCTTCTTATCAAAGTATCACTCACAAATCTATTGGTGATCACACTTTGGTTATTACATTTAAAATAGTTGTATTAAAACCTCCCTATGTGATTGACACTATAAGTTGAAGATCAGTTTTTGCACTGCTTTAGCTCGATAATGGTAACACTCTCATAGA--- + +a +s mr.mrrefChr3 164346 84 + 181019 GGGCTGTATCAATAGGGGCTATCAGGTACCCACAAAATGTCTCCCTCAACTCACAGTGTAAGCCCTGGACACAGGAAAGAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617095 84 + 636262 GGGCTGTACCAACAAGGGCCATCAGGTACCCACTGAATGTTTCCCTCAACTCACAGTGTAAGCCCTGGACACAGGAAAGAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 628965 78 + 647215 ------TATCCATAGGGGCTATCAGACAACCACAAAATGTCTCCCTCAACTCAAAGTGTAAGCCCTGGATGTGGGAAAGAACTT + +a +s mr.mrrefChr3 164430 151 + 181019 ACATATACACACTCTTGAAGGGTCTACCAAGAGTAACACAACTTGGTAATGACTATGCTCTTTTCAATTGACCTTCTACACTAACATCACACTACAAATCAGGGGGTATAAGACATTCAAACAGTTTCACTAACAAAGTAGGCCAGAAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617179 143 + 636262 --------ACACTCTAGAAGGGTCTACCAAGAATAACAGAACTTGGTAATGACTATGCCCTTTTCAATTGACCTAATACACTAACATCACACTACAAATCAGGGGGTATAAGACATTCAAACAGTTTCACTAATAAAGTAGGCCAGAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 629059 151 + 647215 ACATATACACACTCTTGAAGGCTATATCAACAGTAACACAACTTGGTAATGACTATGCTCTTTTCAATTGACCTTCTACACTAACATCACACTACAAATCAGGGGGTATAAGACATTCAAACATTTTCACAAACCAAATAGGCCATTAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 164581 6 + 181019 ATGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617322 6 + 636262 ATGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 629230 6 + 647215 ATGAGC + +a +s mr.mrrefChr3 164587 28 + 181019 TCTAAGACCCCAGTTGTTATGTTATAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617331 28 + 636262 TCTAAGACCCCAGTTACTATGTTATAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 629236 28 + 647215 TCTAAGACCCCAGTTGTTATATCATAAA + +a +s mr.mrrefChr3 164615 254 + 181019 GTTAACTTATTACCTATTCTTGACTCCTCCAAAAAAATTACAGCGCTATGTACCTGATGCTATAGCAGAACAGACATTGCATTGGGGTTGAAGTACCACATTTTGGTTGCCTGAAGTACCACACACCAGTTGACAAAATTCAAAAAAAAGGTACACTGCTTGTTGTATGGGTAGGTTAGCATGAGTAGAAATGGACCATGTGTATTGTGTTGAAAGCCTTGCTACTTAGCCTATGTCACTATTCCCCCACAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617359 250 + 636262 GTTAACTTATTACCTACTCTTGACTCCTCCAAAAAAATCACAGCGCTATGTACCTGATGCTATAGCAGCGCAGACAGTGTATTGGGGTTGATGTATCACATT----CTGCCTGAACTACCACAAACCAGTTGACAAAATTCAGAAAAAAGGTACACTGCTTGTTGTATGGGCAGGTTAGCATGACCAGAAATGGACCATGTGTATGGTGTTGAAAGCCTTGCTACTTAGCCTATGTCACTATTCCCCCACAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 629265 252 + 647215 GTTAGCTTATTACCTATTTTTGACTCCTCCAAAAAAATTACAGTACTATGTACCTGATGCTACAGCAGAACGCACATTGCATTGGGTTTGAAGTACCACATTTTGGTTGCCTGAAGTACCACACACCAGTTGACAAAATTAAAAAAACAGGAACACTGCTTGTTGTACTGGTAGGCTAGCATGAGTAGAAATGGACCATGTGTATTGTGTTGAAAGCC--GCTACTTAGCCTATGTCACTATTTCCCCACTAGG + +a +s mr.mrrefChr3 164869 130 + 181019 CCCACTGGGCAAAGTTGTCTCATATAATCTAGATGAAAGAACAATTCAATTCTCACAAAATGGAACCGTGTTGTACTCTGGTTTTTTCATGGCACTGGGGAACCCTCCACAATTGCCAGGGATAATAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617617 130 + 636262 CCCACTGGGCAAAGTTGTCTCATATCATCTGGATGAAAGAACAATTCAATTATCACAAAATGGAAACATGTTGTACACTGCTTTTTTCATGGCACTGTGGAACTCTCCACAATTGCCAGGGATAATAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 629517 130 + 647215 CCCACTGGGTAAAATTGCCTCATATAATATAGATGAAAGGACAATTCAATTCTCATAAAATGAAGCCGTGTTATACTCTGGTTTTTTCATGGCACTGGGGAACCTACCACAATTGCCAGGGGTAATAACC + +a +s mr.mrrefChr3 164999 241 + 181019 TATATTCTTCATAGTTAAAAAAAGATTGCAAGAAAGCCTGAGTTTTTCCTGATAAGTTTTACAACCTTACCGGATAACTAGGAAAAATTGGCAATATAACGTAGGGGATATTAAGTGACATAATACCTAATCACCACAATAGATTGATACTGGTGAATGTTATATGGCAGAAGATTAGTAAAAGAACACATTAACTTCTCCTGTGGCTCAGAGGAAAGGATGGGGTTACACATAGGATGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617750 240 + 636262 TATTTTCTTCATGGTTAAAAAAAGATTGCAAGAAAGCCTGAGTCTTTCCTGATAAGTTTTACAACCTTAACGGATAACTAGGAAAAATTGGCAAAATAGCATAGGGGATATTAAGTGACATAATACCTAATCACCACTATATATTGATA-TGGGGAATGTTATATGGCAGAAGATTAGTAAAAGAACACATTAACTTCTCCTGTGGCTCAGAGGAAAGGATGGGGTTACACATAGGATGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 629647 241 + 647215 TAAATTCTTCATAGTTAAAAAAAGACTGCAAGAAAGCCTGAGTTTTTCCTGATAAGTTTTACAACCTTACTGGATAACTAGGAAAGATTGGCAATACGACGTAGTGGATATTAAGGGACATAATACCTACTCACCACAATAGATTGATACTGGTGAATGTTGTATGGCAGAAGATTAGTAAAGGAACACGTTAACTTCTCCTGTAGCTCAGAGGATAAGATGAGCTTACAGACAATGTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 165240 4 + 181019 GTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617990 4 + 636262 GTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 630115 4 + 647215 GTGA + +a +s mr.mrrefChr3 165244 47 + 181019 AGTGGACTGGTCTTTACACTATACCCTTTGTGGGCAAGAGGGGGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 617995 47 + 636262 AGTGGACTGGTCTTTACACTATACCCTTTGTGGGCAAGAGGGGGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 630119 47 + 647215 AATGGACTGATAGTTACACTAGATCCTTTGTCAGCAAGAGGGGGGGA + +a +s mr.mrrefChr3 165291 18 + 181019 TCAACCAGCTGGGTCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618042 18 + 636262 TCAACCAGCTGGGTCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 630186 18 + 647215 TCAAATGGCTGGGTCCAG + +a +s mr.mrrefChr3 165309 39 + 181019 GTGGCTGGGTAAACCAGGAGTTGAAGGTCTCTAACAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618060 39 + 636262 GTGGCTGGGTAAACCAGGAGTTGAAGGTCTCTAACAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 630211 39 + 647215 GTGGCTGGGTAAATCCGGAGTTGGTGGTCTCTAACAAGG + +a +s mr.mrrefChr3 165348 5 + 181019 CCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618099 5 + 636262 CCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 630253 5 + 647215 CCCTA + +a +s mr.mrrefChr3 165353 12 + 181019 CTGAGTACCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618106 12 + 636262 CTGAGTACCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 630258 12 + 647215 CAAAGAACCATC + +a +s mr.mrrefChr3 165365 8 + 181019 AAAAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618118 8 + 636262 AAAAAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 630274 8 + 647215 AAAAAACT + +a +s mr.mrrefChr3 165373 30 + 181019 GGTAATCATAGGTCAGTCAAAACCAGTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618129 30 + 636262 GGTAATCATAGGTCAGTCAAAACCAGTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 630282 30 + 647215 GGTTCTGACTGACCAATGGTTGCCTATACT + +a +s mr.mrrefChr3 165403 16 + 181019 TGGCGCAATGGCGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618160 16 + 636262 TGGCGCAATGGCGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 630312 16 + 647215 TTGCTCGTTGGTGCTC + +a +s mr.mrrefChr3 165419 37 + 181019 ATTGTAGAGGGCCCTTGCAGATAGTTGTGTTGGGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618176 37 + 636262 ATTGTAGAGGGCCCTTGCAGATAGTTGTGTTGGGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 630330 37 + 647215 ATTATGGTTATGCTTTGCAGATAGTTGTGTTAGAGCT + +a +s mr.mrrefChr3 165456 22 + 181019 TATGTGATTAATGATATCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618213 22 + 636262 TATGTGATTAATGATATCAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 630371 22 + 647215 TATGTGATTAATGATATCAGTT + +a +s mr.mrrefChr3 165478 97 + 181019 ACTTTCAGGATTTTAGCACCCTCCAAAAAGGTCAGAGATAAGCCAGGAAGTACTCAGATAACTGATTGGTGCGGGGTGCGCTGCTAGAAGATTGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618258 97 + 636262 ACTTTCAGGATTTTAGCACCCTCCAAAAAGGTCAGAGATAAGCCAGGAAGTACTCAGATAACTGATTGGTGCGGGGTGCGCTGCTAGAAGATTGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 630393 97 + 647215 ACTTTCAGGATTTCAGCACCCTCCAAAAAGGTCTCAAATAAGCCAGGCAGTACTCCGATCACTGATTGGTGTGGGGTGTACTGCTAGGAGATTGCAA + +a +s mr.mrrefChr3 165575 32 + 181019 CATTAGGAAAGGTAGGTAGGGAACTTACATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618356 32 + 636262 CATTAGGAAAGGTAGGTAGGGAACTTACATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 630490 32 + 647215 CATTAGGAAAGATAGGTAAGGAACTTACACAC + +a +s mr.mrrefChr3 165607 8 + 181019 AAGGGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618388 8 + 636262 AAGGGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 630528 8 + 647215 AAGAGTAT + +a +s mr.mrrefChr3 165615 12 + 181019 CCAAAAGTGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618397 12 + 636262 CCAAAAGTGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 630536 12 + 647215 CCAAGAGTGGTA + +a +s mr.mrrefChr3 165627 54 + 181019 CATTTGGTGATTACTATGACCTGTGCATCTGACTTTGTATAACAACATCACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618409 54 + 636262 CATTTGGTGATTACTATGACCTGTGCATCTGACTTTGTATAACAACATCACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 630549 54 + 647215 GATTTGGTGATTACTACGACCTGTGCATCCAACTTTATATAACAACATCACAAC + +a +s mr.mrrefChr3 165681 7 + 181019 AAAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618463 7 + 636262 AAAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 630613 7 + 647215 GAAATCA + +a +s mr.mrrefChr3 165688 17 + 181019 GGGGCCTTACAACATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618470 17 + 636262 GGGGCCTTACAACATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 630621 17 + 647215 GGGACAATACAATGTTC + +a +s mr.mrrefChr3 165705 100 + 181019 AAAAACATTTTCACGACCGGGGGTCATACAACGTTCAAAAGACAGTTTCACTAACAGAGTAGGCCAGGCGAAACAAGGTCCATGACGTAGGTTGTCAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618487 100 + 636262 AAAAACATTTTCACGACCGGGGGTCATACAACGTTCAAAAGACAGTTTCACTAACAGAGTAGGCCAGGCGAAACAAGGTCCATGACGTAGGTTGTCAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 630639 100 + 647215 AAAAACAGTTACACAATCAGGGGACATGCAACGTTCGAAAGACAGTTTCACTAATAGAGTAGGCCAGATAAAACAAGGTCCTTGACCTAAGTTGTCATTA + +a +s mr.mrrefChr3 165805 21 + 181019 TAGTCAAATTTCTTATTATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618587 21 + 636262 TAGTCAAATTTCTTATTATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 630740 21 + 647215 TAGTCAGATTACTTATTACCA + +a +s mr.mrrefChr3 165826 38 + 181019 ACTCTTAACTCCTTGAAAAAAAGCACAGCACGAGATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618608 38 + 636262 ACTCTTAACTCCTTGAAAAAAAGCACAGCACGAGATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 630762 38 + 647215 ACTGTTGACTCATTGAAGAGAAGCACAGCACAAGGTAC + +a +s mr.mrrefChr3 165864 27 + 181019 TACCTCATCTCAATTACCCCCCAGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618762 27 + 636262 TACCTCATCTCAATTACCCCCCAGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 630800 27 + 647215 CACAGTAGCTCAGTTACCCCCTGGTTC + +a +s mr.mrrefChr3 165891 191 + 181019 TAACAAACAATACAGGAACTAGAATAAACTGTTACTCTTACTGTATAGGTAGGTCAAGTTTGAGTAGACCATCTGTAGTATCACTATGTTACCACAACACAAGATGGCCTCATATAATAAAAATGAAAGGACAATCCCAGTCTCACAGTGAAGATGTGCTACACTCTTAGTTTTTGTTACCACTGGAGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618792 190 + 636262 TAACAAACAATACAGGAACTAGAATAAACTGTTACTCTTACTGTATAGGTAGGTCAAGTTTGAGTAGACCCTCTATAGTATCACTATGTTAGCACAACACAAGATGGATTCATATAACAAAGATGAAAGGACAATCCCAGTCTCACAGTGAAGATGTGCTACACTCTTAGTTTTTGTCACCACTGGAGGA- +s simRat_chr6.simRat.chr6 630827 191 + 647215 CAACAAACAATACAGGAAATAGAGTAAAATGTTACTCTTAATGTATGGGTAGGTCTGGTTTGAGTACACCATCTGTAGTATCACGATGTTGCCACCACACAAGATGGCCTCATATAATAAAAATGAAAGGACGATCCCAGTCTCCCCGTGAAGATGTGATACACTCTTAGTCTTTGTTACCACTGGAGGAG + +a +s mr.mrrefChr3 166082 127 + 181019 AAGGAATCCTCCATAGTTGCCAGGGATGCTAGCATTTATCATAATTAAAAGGATGTTGCAGGGGGCCCTGAGTTTTTAGTGATATAGGTCTGATAGCTTGTTGAGTACTTGTTTAGTAATATGGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 618982 127 + 636262 AAGGAATCCTCCATAGTTGCCAGGGATGCTAGCATTTATCATAATTAAAAGGATGTTGCAGGGGGCCCTGAGTTTTCAGTGATATAGGTCTGATAGCTTGTTGAGTACTTGTTGAGTAATATTGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 631019 108 + 647215 ACTAGATCCTCCATAGTTGCCAGGGCTGCTAGCATTTATCATAATTAAAAGGACATTGGTGGGGGCCCGGAGTTTTTAATGATA-------------------AGTCTCAGTTTAGTAATATGGTTT + +a +s mr.mrrefChr3 166209 66 + 181019 GGATTTCACACAGTGCTCTTGTACAAAGCTTGAATGAAAGGCAAAGTGTGGTCATGCACCCATGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619109 61 + 636262 GGATTTCACACAGTGCTCTTGTACAAAGCTTGAATAAAAGGCAAAGTGTGGCCATGTACCC----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 631128 65 + 647215 AGCTGTCACATAGTGCTCTCATGCAAAGCTCCAATGAAAGGCAA-GTGTGGTCATGCACCCATGGA + +a +s mr.mrrefChr3 166275 16 + 181019 ATTAAAACATGCACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 631194 16 + 647215 ATTAAAACATGCACTA + +a +s mr.mrrefChr3 166291 126 + 181019 TTGCCTGAAATTATAACATGCGCTACTATCATAATCAGCTAAGCAGGTAGTGAAATAAAAACTCATATTTTATAAAAGCACACCTCTTCCAATTTATCTCCAGTAATTTTAGCCCACAATCCCCCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619170 121 + 636262 TTGCCTAAAATTAAAACATGCGCTATTATCATAATCAGC----CAGGTAGCAAAATAAAAACTCATATTTTATAAAAGCACACCTCTTC-AATTTATCTCCAGTAATTTTATCCCACAATCCCCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 631213 123 + 647215 TTGCATGCACTTATTGCATGCACTACTATCCTAATCAGCTAAGCAGGTAGTGAAATAAAAACTCATATTTTATAAAAGCCCACCT---ACAACTTGTCTCCAGTAATTTTAGTCCACAATCCCCCC + +a +s mr.mrrefChr3 166417 200 + 181019 ACATCACAGGTGAACTAATAATTGCAAGGGTAGTCTACAGTGTTTCTAGGGTTAAAACCACATGAGAGTTGTCCCTATGGAAGGCTCAAATAGAGTCTTGAAGGAACCCTTAGGCCATTTACTCTTGTTGATATTAAGAAATTGGTAGAGAAAGTAAGAAAAATGACAATCAAACACTTAGAACATACATTGTGCCACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619300 200 + 636262 ACATCACAGGTGCACTAATAACTGCAAGGGTAGTCTACAGTGTTTCTAGGGTTAAAACCATATGAGAGTTGTCCCTATGGAAGGCTCAAATAGAGTCTTAAAAGAACCCTTAGGCCATTTACTCTTGTTGATATTGAGAAATTGGTAGAGAAAGTAAGAAAAATGACGGTCAAACACTTAGAACATACATTGTGCCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 631336 200 + 647215 ACATAACAGGTGAATTAATAATTGCAAGGGGAGTATACAGTGTTTCAAGGGTAAAAACAACATGAGAGTTATCCTGATGGAAGGTTCAAATAGAGCCTTGAAGGAACCCCTAGGCCATTTACTCTTATTGATACTAAGAAATTGGTAGGGAAACTAAGAAAAATGACAATCAAACACTTAGAACGTGCATTGTGCCACAA + +a +s mr.mrrefChr3 166617 190 + 181019 GCAGACTTGCAGGCCTTTAGTTCTGTTCCCGGATTGTTTGGCACCTTCTTACTAGCCTCTCACCATCTGTCATGTCTGGGCATAATATCAGGCCACATATCTGTCCTTGTAAAGATGTTAGGCTACAAGAGCAATACCCTGTCACATCTCATTCATCCTTCAACCTGCATTTAGGAGATCTGAGCAATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619500 190 + 636262 GCAAACTTGCAGGCCTTTAGTTCTGTGCCCGGATTGTTCAGCACCTTCTTACTAGTCTTCCACCATCTGCCATGTCTGGGCATAATATCAGGCCGCATATCTGTCTTTGTAAAGATGTTAGGCTACAAGAGTAATACCCTGTCACATCTCATTCATCCATCAACCTGCATTTAGGAAATCTGAGCAATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 631544 190 + 647215 GCAGACTTGCAGGCGTTTAGTTCTGTTCCCAGATTGTTTGGCACCTCCTTACTAGCACCTCACCATCTGTCATGTCTGGGCATAATAGCAGGCCACATATCTGTTCTTGTAAAGATGTTAGACTACAAGAGCAATACCCCTTCACATCTCATTCATCCTTCAACCTGCATTTAGTAGATCTGAACTATGC + +a +s mr.mrrefChr3 166807 54 + 181019 CACTGACTGAACAAACCATTAGCTTACTAGAGGATAGGCAGGCAAGACCAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619730 54 + 636262 CACTGATTGAACAAACCATTAGCTTACTAGGGGAAAGACAGGCAAGACCAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 631734 54 + 647215 CACTGACTGAGTAAACCATTGTCTTACCAGAGAATAGGCAGGCAATACCAGCGT + +a +s mr.mrrefChr3 166861 142 + 181019 TGGGTTTACTGGCCAATGATAATGCCACATGTTATAGTATGCTGAACAGTGTGTTCGGTTTGGTCCCAAGAGAGACAATTACTTGATTATTACCTGAATGGATATTTCAACACATAGAAGTGGGTGAGAAAGAAAAGTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619792 141 + 636262 TGGGTTTACTGCCCAATGATAATGCCACATGTTATAGTATGCTGAACAGTGTGTTCGGCTGGGTCCCAAGGTAGGCAATTACTTGATTATTACCTGAATGAATA-TTCAACACATAGAAGTGGGTGAGAAAGAAAAGTAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 631788 142 + 647215 TGGGTGTACTGGCCAATGTTAATGCCACATGTTATAGTATGCTGAATAGTGTGTTGGGTCTGGGCCCAAGAGAGACAATTACTTGATTATTACCTTAATGGATATCTCAACATCTAGAAGTGGGTGAGAAAGAAAAGTAAAA + +a +s mr.mrrefChr3 167003 285 + 181019 ATTTGGCTGTAAGACATGTATTGTGACTTTTATGGACTTAACTTACCTGGCCCAGACTTTTTGAAAGTAATTTCAAATCAAAGAGCAATAGAGTGAGATGCCTCATGCCCTATCATTAAAGCTAACCAAGATTAGACTACCTTAGTCATTCCATTTGAGTGATCTTTTAATAGCTGCAAATCCTGCAAATAAATGCATGCCTTCTTTGAGGTTCCATTTTAGAGGGCAATTGTGGATACATAAACTGTAAGAGTCTTATGAGGGCACCAAAAAGGATGCCACAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 619933 284 + 636262 ATTTGGCTGTAAGACATGTATTGGGACTTTTATGGTCTTGACTTACCTGGCCCAGACTTTTTGAAAGTAATTTCAAATCCAACA-CAACAGAGTGAGATGCCTCATGCCCTATCATTAAAGCTAACCAAAATTAGACTACCTCAGTCATTCCATTTGAGTGATCTTTTAATAGCTGCAAATCCTGCAAATAAATGTATGCCTTCTTTGAGGTTCCATTTTAGAGAGCAATTGTGGATACATAAACTGTAAGAGTCTTATAAGGGCACCAAAAAGGATGCCACAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 631933 272 + 647215 ATTTGGCTGCAAGACATGTATTGTGCCTTTTGTGGAATGAATTTACCTGGCCCAGACTTTCAGAAAGTAATTTCAAATCAAAGAGCAATACA------TGCCTAATGCCCTATCACTAAAGCTAACCAAGATTAGACTACTTTTGTCATTCCATTTGAGTGATCTGTTGATAGTTGCTAACCCTGCAAATAAATGCATGCCTTCTTTGAGGTTCCATTTTAAATGTCAGTTGTGGATACATACACTGTAAG-------TGGGGGTGCCAAATAGGATGCCACAGA + +a +s mr.mrrefChr3 167288 32 + 181019 AATGAGACTAGGACAAGGTAACTGATTTACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620217 32 + 636262 AATGAGACTAGAACAGAGTAACTGATTTACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 632211 32 + 647215 AATGAGACTAGGAAAAGGGAACTGATTTATAG + +a +s mr.mrrefChr3 167320 24 + 181019 TAGTAAGTAGGCCACTGCTACTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620278 24 + 636262 TAGTAAGTAGGCCACTGCTACTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 632243 24 + 647215 TAGAAAGTAGACCACTGCTACTCT + +a +s mr.mrrefChr3 167344 146 + 181019 GTGCCCCCAAATTCGAACAATTACATGAGGTTCAATCATATAAAAATCATGTCACACAACATAACTAAATAACATATGAGGATCTTGCAGACATCTTTGGCCCCTCGTTCTCCAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTATTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620303 146 + 636262 GTGCCCCCAAATTCGAACAATTACATGAGGTTCAATCATATAAAAATCATGTCACACAACATAACTAAATAACATATGAGGATCTTCCAGACAACTTTGGCCCATGGTTCTCCAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTATTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 632267 94 + 647215 GTGCCCCCAAATTTGAACAATTACATGAGGATTAATCATATAAAAATCATGTCACACA-----------TAACATATGACG-TATTGCAGACATCTTTGGCCCCTC---------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr3 167490 133 + 181019 CAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTACTACAAAATTCCCTCATCAGCTGGTTTAAATGATGTCTTAGTGTAATCTAACTCTTTTGAGTCTCACCCTTTTGTGACTTATTGGAGTGTGGAAATGTTCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620495 132 + 636262 CAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTATTACAAAATTCCCTTATCAGCTG-TTTAAAGGACGTCTGAGTGTAATCTAACTCTTTTGAGTCTCACCATTTTGTGACTTATTGGAGTGTGGAAATGTTCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 632361 132 + 647215 CAATAGAGCCTTTGTCATTGCCTACTTGTACTACAAAATTCCATCAGCA-CTAGTTCAAATGTTGTCTTAGTGTGGCCTAACTCTTTGGAGTCTTGCCCTTTTGTGACTTATTGGAGTGTGGCACTGTTCTTT + +a +s mr.mrrefChr3 167623 17 + 181019 GCGGTCTGGAGTGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620633 17 + 636262 GCGGTCTGGAGTGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 632493 17 + 647215 GTAGCCTGGAGTGATGT + +a +s mr.mrrefChr3 167640 18 + 181019 TGTGAAGTGATGTTTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620655 18 + 636262 TGTGAAGTGATGTTTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 632510 18 + 647215 TGTCAAGTGATCTTTATC + +a +s mr.mrrefChr3 167658 22 + 181019 CCTATTCTTGCCAATCCATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620673 22 + 636262 CCTATTCTTGCCAATCCATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 632540 22 + 647215 CCTAGTGTTGCCAATCCATCAC + +a +s mr.mrrefChr3 167680 40 + 181019 GAAAGTTCCAGTGAGTTATTGGCAAGTGACCAGTCTGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620695 40 + 636262 GAAAGTTCCAGTGAGTTATTGGCAAGTGACCAGTCTGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 632564 40 + 647215 GAAAGTTCCAGTGAGTTATAACCAAGTGACCACTCAATTT + +a +s mr.mrrefChr3 167720 106 + 181019 GTATTCCATCAATTTTTGATGTTACCTACTTCACAAACAAAAAACCAGTCCATTACATCCTCTAACTAGCTTGTCCCAAGAGCTGGATGGCGTAGCTCTCCATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620735 106 + 636262 GTATTCCATCAACTTTTGATGTTACCTACTTCACAAACAAAAAACCAGTTCATTACTTCCTCTAACTAGCTTGTCCCAAGAGCTGGATGGCATAGCTATCCATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 632612 106 + 647215 GTATTCCATCAATTTTTGATGTTACCTACTTCACAAACAAAAAACCAGTCCATCACACTCTCTAACCAGCTTGTCCCAAGAGCTGGATGACGTAGCTCTCCATGTT + +a +s mr.mrrefChr3 167826 141 + 181019 GCCCAAAATGATCTGAGTTGACGGTGCTGAAAGAAGTCATAAGCTTTATACTATTTTTTTGATTTGAATGCCATCCAGTTTGGTATTGATAAATGTCTTGGATAGATGGTCTAAAGTTTGAGAAATTGACTTGATATCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620844 133 + 636262 GCCCAAAATGATCTGAGTTGACGGTGCTGAAAGAAGTCATAAGCTTTATATTATTTTTTTGACTTGAATGCTGTCCAGGTTGGTTTCGATAAATGTCTTGGATAGATGG--------TTGAGAAATTGACTTCATATCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 632718 134 + 647215 GCCCAAAATGATCTGAGCCAACGGTGCTGAAAGGAGTCATAAGCCTTATAC------ATTAATTTGAATGCCAT-CAGTTTGGTATTGATAAATGTCCTGGATAGATGGTCTAAAGTTTGAGAAATTGGATAGGTATCATG + +a +s mr.mrrefChr3 167967 106 + 181019 TCAACTTATCATAAGTTGTGCCATTGATGAGGCCCCCATTGCAACTATGCATACAGATGAAAAGGAGCTTATGTATAATAGGGGTATCATGAATTGTCAATGATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 620979 106 + 636262 TCAACTTATCATAAGTTGTGCCATTGACGAGGCCCCCATTGCAACTATGCATACAGATGAAAAGGAGCTTATGTATAATAGGGGTATCATGAATTGTCAATGATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 632852 32 + 647215 --AATTTGCAATGATTGATCACACTGATTAGGTA------------------------------------------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr3 168073 45 + 181019 TGTGAAACCTAATTAAATATTTCTGTAGTACTAGGACCATGAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621086 45 + 636262 TGTGAAACCTAATTAAATATTTCTGTAGTCTTAGGACCATGAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 632884 27 + 647215 ------------------ATTTCTGTAGTACTAGAATCATGAAGC + +a +s mr.mrrefChr3 168118 147 + 181019 ACCTTACTAATTCCTTAATTGCAGGCAAGGGCTTACTGGTGCTTCAGTGCTAGGCAGGCATGCCTAGTGAAGTAGACCCAGGGTTACAACTGGACTTCTGTTGGACTGCTATTCTGGATTCGAAAACCTAAGGACTCAGGGCAGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621131 139 + 636262 ACCTTACTAACTCCTTAATTGCAGGCAA--------TGGTGCTTCAGTGCTAGGCAGGCATGCATAGTGAACTAGACCTAGGGTTACAATTGGACTTCTGTTGGACTGCTATTATGGATTCGAAAACCTAAGGACTCAGGGCAGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 632919 147 + 647215 ACCTTACTAATTCTCTAATTGGAGGTAGGGGCTTACTGGTGCTTCAGTCCTAGGCAGGCATGCCCACTGTAGTAGACCCAGGGTGACACCTGGACTTCTTTTGGACTGCTATTCTGAATTCAAAAACCTAAGGACTCAGGGCAGCAT + +a +s mr.mrrefChr3 168265 19 + 181019 GTCTCCCAAAAATGGTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621270 19 + 636262 GTCTCCCGAAAATGGTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 633074 19 + 647215 GTCTCCCAAAAATGGTGTC + +a +s mr.mrrefChr3 168284 170 + 181019 ATCATACATAGACAGGACAGCTCCTATTGGGATGTCCCTGAAATGCCCAGACCAAAGAAAAAATATCAACCCCAAATGATTGCATTGACTTGACTCCCACCTTGTAATATTGGGAAACTCTGCCAGCTAGTCTCAATTAGAGATGATAGGCTCGTCAGGTTCAGCCCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621290 170 + 636262 ATCATACATAGACAGGACAGCTCCTATCAGGATGTCCCTGAAATGCCCAGACCACAGAAAAAATATCAACCCCAAATGATTGCAATGACTTATCTCCCACCTTGTGATATTGGGAAACTCTGCCAGCTAGTCTCAATTAGGAATGACAGGCCTGTCAGGTTCAGCCCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 633093 170 + 647215 ACCATACATAGACAGGACAGCTCCTATTGGGATGTCCCTGAAGTGCCCAGACCAAAGAAAAAATATCAACCCCAAATGATTGCATTGACTTGACACCCACCTTGTAATATTGGGAAACTCTGCCAGCTAGTCTCAATTAGAGATGATAGGCTCGTCAGGATCAGCCTCCT + +a +s mr.mrrefChr3 168454 96 + 181019 TCTGGTATCAATTTGATACTGTGATCTTCATCTGTGTGAACTCATGACTTTAACAATGAAGATTATAGCCTTGAAAAATGCATCCTGTTGAATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621461 96 + 636262 TCTGGTATCAGTTTGATACTGTGATCTTCATCTGTGTGAACTCATGACTTTAACGATGAAGATTATAGCCTTGAAAAATGCAGCCTGTTGAATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 633263 96 + 647215 TCTGGTATCAATTTGATACCATGATCTTCTTTTGTGTGAAATCATGACTTTAACAAAGAAGATTACATCCTTGAAAAATGCATCCTGCTGAATGTT + +a +s mr.mrrefChr3 168550 113 + 181019 TTGGCATTTTTAACACTGGCTTTCCATTGTAACACCCTCTTTCCCAACAATTTTAATACTGCTGTCTGGCTAGATTAACTGTCTTGCTTAATGTGCTTGACTGAGAGTACTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621564 113 + 636262 TTGGCATTTTTAACACTGGCTTTCCACTGTAACACCCTTTTTCTCAACAATTTTAATACTGCTGTCTGGCTAGATTGACTGTCTTGCTTAAAGTGCTTGACTGAGAGTACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 633359 112 + 647215 TTGGGATTTTTAACACTGGCTTCCCATCATAACACACTCCTTCCCAACAATTCTAATACTG-TGTCTAGCTAGATTAACTGTCTTGCTTAATGTGCTTGATTGAGAGTACACA + +a +s mr.mrrefChr3 168663 271 + 181019 AGTTGAACTAGACTCACCTTTTAGTTTCAATTCACTAGTCTGTATCATGTTCACTACTCCACAGGCCAGTCTACTCAGTTTGTTACCTTTTGTTTGCTAGTAGGCTGATCTATTTGAGCCAATATTTTACAACACAGAGATGGGCCTTCATAGACTTTTGTACGCTGTCCAAGCATTCTATGAGCCTAACAGAATTCAGCCCTTTATGGTTCAACATCTTGCATCCTTGAAACCTTGGAATTCCCGGTTGAGCAAATGAAACTTGACAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621677 270 + 636262 AGTTGAACCAGACTCACCTTTTAGTTTCAATTCACTAGTCCGTATCATATTCACTACTCCACAGGCTACCCTACTCAGTTTGTTACCTTTTGTTTGCTAGTAGGCTCATCTATTTCAGCCAATATTTTACAACACAGAGATGGGCCTTTGTAGACTTTTGTACGCTCTCCAAGCATTTTATGAGCCTAACAGAATTTGGCCCTTTATGGGTCAACATCTTGCATTCTTGAGACCTCGGAATTCCCGGTTGAGCAATTGAAACTT-ACAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 633473 258 + 647215 ATTCGAGCTGGAATCACCTCTTAATTTCAATTCACTAGCCTGTATCATGTTCACTA---------CCAGTCTACTCAGTTTGTTACCTGTGGTTCGCTAGTAGGCTGATCCACTTGAGCCAATATTTTACAACACAGAGATGCGCCTTCATAAGCTTTTGTAAGCTGTCTAAACATCCTATGGGCCTAACAAAATTCAGTCCTTT----TTCAACATCTTGCATCCTTGAAACCTTGGAATTCCCAGTTAAGCATACGAAACTTGACAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 168934 112 + 181019 AAGCTTTAGCAGATAAAGGGCACTGCAACCCTCAGTCAAGGAGCTTGGTTCCACAGCACACCATTGAGGATAACCATTGATGGTTCCAAGTTTAGAGGACATGAAGAATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 621953 112 + 636262 AAGCTTTAGCAGATAAAGGACACTGCAACCCTCAGTCAAGGAGTGTGGTTCCACAGCACACCATTGAGGATAAGCATTGATGGTTCCAAGTTTAGAGGACATGAAGAATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 633731 112 + 647215 AAGTTGTAGCAGATAAAGGGCACTGCAACCCTAGGACAAAGACCTCGGTTCCACAGCACACCATTGAAGGTAACTTTTGATGGTTCCCAATTTAAAGGACATGAAGAATTTT + +a +s mr.mrrefChr3 169046 23 + 181019 GATCTCAAGGCCTAGTGACCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622065 23 + 636262 GATCTCAAGGCCTAGTGACCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 633844 21 + 647215 GGTCTCAAGGCC--GTGACCTAT + +a +s mr.mrrefChr3 169069 63 + 181019 TTATCTAAGTTCTTTCGTACTAATTTACTGACCATAAGGGTAGTGCATAATTTGATACTATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622088 35 + 636262 TTATCTAAGTTCTTTCGTACTAATTTACTGACCGT---------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 633870 63 + 647215 TTATCTAAGTTCTTTCATACTAATTTACTGACCACAAGGGTAGTGCATAATTTGATACTATAG + +a +s mr.mrrefChr3 169132 56 + 181019 GCAATCAATTAAAAATTGCCTTTCAAATTGCCCTTATTCAGTCCCAAGGGTGTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622123 30 + 636262 --------------------------ATTGCCCTTAATCAGTCCCAAGGGTGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 633944 56 + 647215 GCAATCAATTAAAAATTGCCTTTCAAATTACCCTTATTCAGTTTCATGGGCCTTCA + +a +s mr.mrrefChr3 169188 42 + 181019 CCCAACCTAGTGAGGAATGATTCCTAGAATAATATGACTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622153 42 + 636262 CCCAACCTAGTGAGGAATGATTCCTAGAATAATATGACTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 634025 42 + 647215 ACCAAACTAGTGAGGAATGATTCCTATAATAATATGACTTGC + +a +s mr.mrrefChr3 169230 77 + 181019 ATGCTTGAGCATTGTAAAGTTGAGAAGTGAATAGGCTTTAAGAGACAAAATACTCAAAGAGAGAAGAAACAATGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622195 77 + 636262 ATGCTTGAGCATTGTAAAGTTGAGAAGTGAGTAGGCTTTAGGAGACAAAATACTCAAAGAGAGAAGAAACAATGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 634072 67 + 647215 AAGCTTGAGCATCGTAAA----------GAATAGGGTTTAAGAGGCAAAATACTCAAAGAGAGAATAAACAATGCCC + +a +s mr.mrrefChr3 169307 51 + 181019 AATGACTGCGACCAACACTATCTGCCCTTTGACTCAAACAGGGAAGATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622272 51 + 636262 AATGACTGCGACCAACACTATCTGCCCTTTGACTCAAACAGGGAAGATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 634140 51 + 647215 AATGCCTGTGACTAACAGTATCTCCCCTTTGACTCAAAGGGTGAAGATCAA + +a +s mr.mrrefChr3 169358 6 + 181019 GAGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622324 6 + 636262 GAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 634191 6 + 647215 GAGAGA + +a +s mr.mrrefChr3 169364 13 + 181019 GCCCAAATAACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 634206 13 + 647215 GCCCAAATAACTC + +a +s mr.mrrefChr3 169377 333 + 181019 CACCTGATACTATCTCCCCTTTGAGTAATTGCTAGCTGCAGCCCTTGTGTACCACATCTGACTTTACTTTGAATTCATACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGTAAAGGTAGTGTGCTGTCAGATCACTTATGCTCCATTGTCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGATCCCATGGCAATGTATTAAGCCAATACCTACCATGGGTAGGCATAAACTGTATCACCTGTAGGATAGATGGGGTGACAACTATGAACCTCCATATTCAGCCCAAATAAAGATATATTATATCAAGAACACAGACCACCAAAATTAGCACGCACTTGAATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622633 324 + 636262 ---------CTATCTCCCCTTTGAGTAATTGCTGGCTGCAGCCCTTGTGTATCACATCTGACTTTACTTTGAATTCCTACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGTAAAGGTAGTGTGCTGTCAGATCACTTATGCTCCATTGTCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGATCCCATGGCAATGTATTAAACCAATACCTACCATGGGTAGGCATAAACTGTACCACCTGTAGGATAGATGGGGTGACAACTATGAACCTCCATATTAAGCCCAAATAAAGATATATTATATCAAGAACACAGACCACCAAAATTAGCATGCGCCTGAATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 634224 332 + 647215 CACCTGATAATATCTCCCCTTTGACTAATTGCTAGCTGCAACCATAGTGTACCACATCTTACTTTAATTTGAATTCATACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGCAAAGGTGGTGTGCTGTCAGATCACTTGTGCTCCATTATCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGAACCCATGGATATGTAATAAGCCGATACTTACCATGGATAGGCATAGACTGTCTCACTCATGGGATTGGTGAGGTGACAACTGTGAACCTCCAT-TTCAGCCCAAATAATTAACTATTATATCAAGAACACAGAACCCCAAACTTAGCACGCACTTGATGGCT + +a +s mr.mrrefChr3 169710 17 + 181019 TGTTCTCCTTGTGGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622957 17 + 636262 TGTTCTCCTTGTGGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 634569 17 + 647215 CATGCTACTTGATGCCA + +a +s mr.mrrefChr3 169727 19 + 181019 AAATCATTGTCCTGATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622974 19 + 636262 AAACCATTGTCCTGATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 634721 19 + 647215 AAATCATGACAATGGTTTT + +a +s mr.mrrefChr3 169746 12 + 181019 CATGTGGCCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622993 12 + 636262 CATGTGGCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 634743 10 + 647215 CATGAGGGGA-- + +a +s mr.mrrefChr3 169758 31 + 181019 AGGCTGAGAGTGCTTCTCACTCCTCATCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623006 31 + 636262 AGGCTGAGAGTGCTTCTCACTCCTCATCATG + +a +s mr.mrrefChr3 169789 81 + 181019 TAAGCGTTGTATATAAGATAGGCATATTTGTACTGAATCATTACATACTGAACACACAAGCATTGTATCAAGTAGCATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623065 81 + 636262 TAAGCGTTGTATATAAGATAGGCATATTTGTACTGAATCATTACATACTGAACACACAAGCATTGTGTCAAGTAGCATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 634753 20 + 647215 -------------------------------------------------------ACAGATATTGTATA------CACGGT + +a +s mr.mrrefChr3 169870 321 + 181019 AGGCGACTGTATAGGCTAAAACTGTGTTACAGGTGAAATATCATGCAAATTTAATACTGATATCTTGTACATTGTTTCACATCACTATATGTAGAAAACCAGCCACCAAAGGCTAGTATAATTTGTATGAGGATGAGTAGTGACAATGCAGCAATTCTTCCTCACTCATTCTAGTTCCTAAATATATCTGTGCCTGAGTAACAACTCTGAAAACATACAGGTACTATTTTATATGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATTATATCGATTAATGGCTCTCCCAATGAGCACTATCAATTATCCCTCACATCCCACTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623146 321 + 636262 AGGCGAATGTATAGGCTAAAACTGTGACACAGGTGAAATATCATACACATTTAATACTGATATCTTTAACATTGTTTCACATCACTACATGTAGAAAACCAGCCACCAAATGATAGTATGATTCGTATGAGGATGAGTAGTGACAATGCAGCAATTGTTCCTCACTCTTTCTAGTTCCTAAATATATCTGTGCCTGAGTAACTACTCTGAAAACATACATGTACTATTTTATATGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATTATATCTATTAATGGCTCTCCCAATGAGCACTATCAATTACCTCTCACAACCCACTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 634774 320 + 647215 AGTAGACTGCATAGGCTAAAACTGTGTTACAAGTGAAATATCATGCAAATTTGATACTGGTACCTTGTACTTCGTTTTAGATCTCTATATGTA-AAAACCAGCCTTCAAAGGCTACTATAACTTATATGTGGATGAGTAGTGACAACGCAGCAATTCTTCCTCACTCATTCTAGTTCCAAAATATATCTGTCTTTGAGTAACAACTCTGAAGGCATACAGGTACTATTTTATAGGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATGATATAGATTAATGGCTTTCCCAATTAGCACTATCAATTATCCCACACATCCCACTATA + +a +s mr.mrrefChr3 170191 168 + 181019 CTACTTTCCTTATGAGGGTTGGGGCTTGTGTTAATAACTGAGGAGTTGGAACACATCCCCTACTGGGGTTTTGTTTGCTCCTAGCCTCCTGTTGACCCCATATTGACAATCAGAGGCTCCATGCAGTTGAGCATAACACCTTGGGCAAAGATAAAGGGCACCCTTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623468 168 + 636262 TTACTTTCTTTATGAAGGTTGGGGCTTGTGTTAATAACTGAGGAGTTGGAACGCATCCCCTACTGGGGTTTTGTTTGCTCCTAGCCTCCTGTTGACCCCATATTGGCAATCAGAGGCTCCATGTAGTTGAGCATAACACCTTGGGCATAGATAAAGTGCACCCTTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 635094 168 + 647215 CTACTCTCCTTACAAGGGTTGGTGCTTATGTTGATAACTGAAGAGTTGGAGCACATCCCCTACTGGGGTTTTGTTCGCTCCTAGCCTTCTGTTTGCCGCTTAGCGACAATCAGAGGCTCCATGCAGTCAGGCGTAACACCTTAGGCAAAGATAAAGGGCACCCCTCTA + +a +s mr.mrrefChr3 170359 13 + 181019 TCACCTATTTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623636 13 + 636262 TCACCTATTTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 635263 13 + 647215 TCACCTATATAAC + +a +s mr.mrrefChr3 170372 25 + 181019 AATGCTCATACTATCTAGCACTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623650 25 + 636262 AATACCCACACTATCTAGCACTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 635276 25 + 647215 AATGCTCGTACTATCTAGCACTCCA + +a +s mr.mrrefChr3 170397 239 + 181019 CTACTCTATCACTATTTATCTCTTAGCCAGAGGTCATCAATTTGATGCAGTCAGGATAACTTTGTGAATTCTCTAAATATGTCTGGCCTACTTTGTTGAATTGGGCTTGTACCTCTTGCATGACCAAAATAATTTTGCAGAGACATGTCATGTCATGTGGTACTTCAGAGTGTGTTTGTGCTCAGAAGGCATCAATTCTAAACAGAGTCACATCATGCCATGGTTGTAGTGACTTATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623675 239 + 636262 CTACTCTATCACTATTTATCTCTTAGCCAGAGGTCATCAATTAGATGCAGTCAGGATAACTTTGTGACTTCTCAAAATATGTCGGGCCTATTTTGTTGAATTGGGCTAGTACCTCTTGCATGACCAAAGTAATTTTGCAGAAACATGTCATGTCATGTAGTACTTCAGACTGTGTTTGCAATCAGAAGGCATCAATTCTAAACGTAGTCACTTCATGCCATGTTTGTAGCGACTTATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 635305 239 + 647215 CTACTCTATCACTATTTATCTCTCAGCCAGAGGTCATCAATTTGATGCAGTTGGGATAACTTTGTGTATTCTCTACATATGTCTGGCCTACTTTGTCAAGTTGGGCTTGTACCTCTTGCATGACCAAAATAATTTTGTAGAGACATGTTATGTCATGTGGTACTTCAGAGTGTGTTTGTGCTCAGAAGGCATCAATTCTAAACAGAGTCACATCATGCAATGGTTGTACTGACTTATAT + +a +s mr.mrrefChr3 170636 206 + 181019 ATGGTCCCTTCACTAGGTTTAATCCTCATGAAATGGTAGTTAGCTTTTATTCATGATTCCGAACCAGACTGGCTTTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCAGTAGAGAAGGTCTACCCAGGAATAGGTCACTTCTGACTCGGTTCGTTGTATCTCAATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCAAAAAAAATGCACTCCTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623921 206 + 636262 ATGGTCCCTTCACTAGGTTTAATCCTCATGAAATGGCATTTAGCTTTCCTTCATGATTCCGTACCAAACTGGCTTTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCGATAGAGAAGGTGTACCCAGGAATAGGTCACTTCTGACTCGGCTCGTTGTATCTCAATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCACAAAGAATGCACGCCTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 635544 200 + 647215 GTGGTCCCTCCAGTAGGTTTAATCCTCATGAAATG-TAGTTAGCTTTTACTCACGATTCCCATACTGGTGGGGTCTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCAGTAGAGAGAGACTACCCAGGTATAGGTCACTTCTGACTTGGTTCTTTGTATCTCGATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCAAAAAAAACGCATTC----- + +a +s mr.mrrefChr3 170842 103 + 181019 AGTATCACGCACGATAAGTGTCACACGCTCTGCTGCATTAAGTACATGCCATGTCCGATGACATCAAGACCTAACCTAGTATGTCCTGTATCTTGATTTCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624133 103 + 636262 AGTATCACGCACGATAAGTATCACATGCTGTGCTGCATTAAGTTCATGCCATGTCGGATGACATCAAGATCTAACCTAGTATGTCCTGTATCTTGATTTCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 635744 87 + 647215 ---------------AAGTGTCAGACGCTCTGCTGCATTAAGTACATGCCATGTCCTATGACATCAAGACCTAACATAGTATGTCCTGTA-CTAGATTTCGGA + +a +s mr.mrrefChr3 170945 275 + 181019 TACCATTGTAATCATAATATAATGCATGAATGTTAGAAATGAGTTCAGCAGGCAGGTTTTCCCACCTGACTAGTATTAGTGGTAGCCTCTGGTATTTAACCGTCTGAATTCATCTTGTGTTCTAACACTCCAGGGCCCTACGGCAACATTTGTCAGAGCTGCAAATTAAGAACTTTCCTCAGCACTTAGGTGACCTACATGGTCTGTACTAATTCTTCCTTGATTTACTGGTCCAGTTGAGTATTAATTACAACAACCACATGCTATACCAAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624239 275 + 636262 TACCATTGTAATCATTACATAATGCATGAATATTAGAAATGAGTTCAACAGGCAACTTTTCCCACCTGACTAGTATTAGTGGCAGCCCCTGGTATTTAACCGTCTGAATTCATCTTGTGTTCTAACACTCCAGGGCCCTACGGCAACATTTGTCAGAGCTGCAAATTAAGAACTTTCCTCAGCACTTAGGTGACCTACATGGTCTGTACTAATTCTTCCTTGATTTACTGGTCCAGTTGAGTATTAATTACAACAACCACATGCTATACCAAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 635831 275 + 647215 TACCATTGTAATCGTAATATAACCCATGAATGTTAGAAATGAGTTCAGCAGGCAGGTTTTACCACCTGACTAGTATTAGTGGTAGCCTCTGGTATTTAACCATCTGAATTCATCTCGTGTTCTAACACTTCAGAGCCATATGGCAATATCCATCAGAGCCGCAAATTAAGAACTTTCCTTGACACTTAGATGACTTATGTTGTCTGTACTAAACCTTTTTTGATTTATTGGTCTGATTGAGTAATAATTACAGCAACCACACACTATACCAAGAA + +a +s mr.mrrefChr3 171220 67 + 181019 TACATTGTTATGGACGTTGTTCCAGCTTACATTCACTTAAGAATGGCTGGCGCATTAAGCCATTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624516 67 + 636262 TACATTGTTATGGACGTTGTTCCAGCTTACATTCACTTAAGAATGGCTGGCGCATTAAGCCATTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 636106 67 + 647215 TACATTGTTACAGACATTGTAACAGATTACATTCACCTAAGGATGACTGGGGCACTGAGCCAACAGG + +a +s mr.mrrefChr3 171287 320 + 181019 TAAAAAACAACTTATGTTACAATGTTAAATCTTTCTCCAGATTTTATAGTGTGACACTCTGTTGTAACACGGGGGTTCAGTCTCGCCAGAAGTGATATGTATACATTTGGAAATTACTAAATTCACAATGTGATTGATACCATATTTAGTTGGGGGAGGTTTATGGGTGCCAACAAATTTGGCCCAGCATGATTGTCATGTCTGCCTTGAAATTGAAATAAAGTCACTTTCATAGCTGTAGTTCTAATCATTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGGATATGTGCAATCAGACAGAATTGAGTAATTCTTCCCTGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624584 320 + 636262 TAAAAAACAACTTATGTTACAATGTTAAATCTGTTGCCAGACTTTGTAGTGTGACACTCTGTCATATCTCGGGGGTTCAGTCTCGCCAGAAGTGATAAGTATACATTTGAAAGTTACTAAATTCACAATGTGATCAATACCATATTTAGTTGGGGGAGGTTTATGGGTGCCAACAAATTTGGCCCAGCATGATTATCTTGCCTGCCTTGAGATAGAAATAAAGCCACTTTCATAACTGTAGTTCTAATCATTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGGATATGTGCAATCAGACAGAATTGAGTAATTCTTCCCTGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 636173 320 + 647215 CAAAAGACAACTTATGTTATAGTGCTAAACCTTTCTCCAGGTTTTATAGTGTGACACTCTGTTGCAACATGGGGGTTCAATCTCTCGAGAAGTGATATGTATACATTTGGTGATTACTAGATTCACAATGTGACTGATACCATATTTAGTTGGGGTAAGTTTATGCTTGCCAACAAATTTGGTCCAGCATAATTGTCATGTCTGCCTTGAAATTGAAATAAAGTCACTCTCATAGCCATAGGACTATTCGTTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGTATACGTTCAATCAGACAGCATTGAGTAATTCTTCCCAGAAC + +a +s mr.mrrefChr3 171607 109 + 181019 CAGGTCTTTAATGGAGAGTATTGTATTGCCAGGGAGTGACTCCCAGGGAGTGACTGACAGTTCTTCTTCTATTCCCCTCCCCTGTCTTCCCCCACTATTAAGTTTTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 624904 109 + 636262 CAGGTCTTTAATGGAGAGTATTGTATTGCCAGGGAGTGACTCCCAGGGAGTGACTGACAGTTTTTCTTCTATTCCCCCCCCCTGTCTTCCCCCACTATTAAGTTTCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 636496 109 + 647215 CAGGTCTTTAATGGAAAGTATTGTATTGCCAGGGAGTGACTCCCAGGGAGTGGCTGACAGTTCTTCTTCAATTCCCATCCCCTGTCTTCCCCCACCATTAAACCTTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 171716 323 + 181019 TAGTGGGTCCTTGTGAGATACATGATGCCCACCCTGCTGAGTGTTATAATACACAAAATAATGGTGACAATTACCAATATCCCAATGAACAAACCAATTGAAGATATGTATACTCATTAATTAGTATAGAACACTCAAGTGGGTACTCATATTAATGTAGAAAGATATGGCAGTTCTTGGATACTTACAGATTTGCATTACCTGAGAGGATACTTAAATTTCTGAGGTCATTAAAAATTTTACAAGGTCTACTAATTTCACTCGATAAACTATGTCTGTATTGAGATAGCAAGGCTATGAAGTTTTGAGAGACCCACATGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625013 322 + 636262 TAGTGGGTTGTTGTGAGATACATGATGCCCACCCTGCTGAGTGTTATAATACACAAAATGATGCTGACAATTACCAATATCCCAATGAACAAACCAATTGAAGATATGTACACTCATTAACTAGTATAGAACATTCAAGTGGGTACTCATATTAATGTAGAAAGATATGGCAGTTCTTGGAAACTTACAGATTTGCATTAC-TGAGAGGACACTTAGATTTCTGAGGTCATTAGAAACTTTACAAGGTCTACTAATTTCACTCGATAAAGTATGTCTATATAGAGATAGCAAGGCTATGAGCTTTTGAGAGACCCACACGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 636608 312 + 647215 CAGTTGGTCCATGTCATATACATGATGCCCACTCTGCCGGGTGTTGTAATACATAAGATAATGGTGACAATTATCAATATTCCAATGAACAAACCATTTGAAGAGATGTATACTCATTAATTATTATAGAACACTCAACTGGGTACTCATACTAATGTAACAAGGTTTGGCAATCCTTGGATACTTACAGATTTGCATTACCTGAGAGGATACTTAAGTTTGTGAGGTCATTAAAAATTTTACAGAGTCTACT----------GATAAACTATATCTGTATTGAGATAGCCAG-CTATCAAGTTTTGAGATACCCAAATGTTT + +a +s mr.mrrefChr3 172039 22 + 181019 CAGCACTACAGGAGTATGTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625353 22 + 636262 CAGCACTACAGGAGTATGTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 636920 22 + 647215 CAGCACCACAGGAGGATGTGTG + +a +s mr.mrrefChr3 172061 97 + 181019 AGACACTCCATGTGACATTGTCTACTGGGCTAGATAGGATTGTCTCTCATGAAATCTAATTGTTGTATTAGCCAACTTAATGGCATCAATTACGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625375 96 + 636262 AGACACTCCATGTCACATTGTCCAGTGGGCTAGATAGGATGGTCTCTCATGAA-TCTGATTGTTGTATTAGCCAACTTAATGGCATCAATTACGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 636944 97 + 647215 AGACTCTCCATTTGGCATTGTCTACTGGGCTAGAAAGGATTTTCTTTCACGAAATCTAATTGTTGTATTAGCCAACTTAATTGCATCAATTAGGTCA + +a +s mr.mrrefChr3 172158 41 + 181019 GCTGGTTGCGGATTACATCAGGCTTATTCCTTGGCTTCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625475 41 + 636262 GCTGGTTGCAGATTACAACAGGCTTGTTCCTTGGCTTCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 637041 41 + 647215 GCCAGTTGCGGATCACGTTGCGCTTATTCCTTGGGTTCCCA + +a +s mr.mrrefChr3 172199 106 + 181019 TTGATTAGGGTCCCAAGCTTATCCTGAACTCCAGTGAATAATTCAGATATATTAGGCCCAGGTAGACCCTCCATATGCTATTATCCTTTTACATGCACATAAAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625517 104 + 636262 TTGATTAGGGTCCCGAGCTTATCCTGGACTCCAGTGAATAATCCAGATATATTAGGCCCA--CAGACCCTCCATATGCTATTTTCCGTCTACATGCACATAAAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 637082 95 + 647215 TTGATTCGGGTCCCAAGTTTATCCTGAACTCCAGTGAATAATTCATATATATTAGGCCCAGGTAGACCCCCCATATGCTATTATCTTCTTACATA----------- + +a +s mr.mrrefChr3 172305 15 + 181019 TCTAGGAAGGGTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625633 15 + 636262 TCTAGGAAGGGTCTC + +a +s mr.mrrefChr3 172320 5 + 181019 TTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625659 5 + 636262 TTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 637177 5 + 647215 TTTGA + +a +s mr.mrrefChr3 172325 58 + 181019 TAGTCTGACGCACCTGCTATCAGCCCATGTAGTGGAAATTTGGACTGTTATCGGTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625665 58 + 636262 TTGTCTGACGCACCTGCTATCAGCCCATGTAGTGGAAATGTGGACTGTTATCGGTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 637182 58 + 647215 TAGTCTGACGCACCTGTTCTCAGCCCATGTAGTGGAATCTTGGACTGTTAGCGGTACC + +a +s mr.mrrefChr3 172383 104 + 181019 TCATCTATTTGTATTGTCCCTGAGTTACCAGTCACAGCAAAGGGACCAGCATACCAGTGCCACAGCACCCAGCTGGGTCCTATGGCAAGTTAGATCCAGATGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625723 80 + 636262 ------------------------GTACCAGTCACAGCAAACGGACCAGCATACCAGTGCCACAGCACCCGGCTGGGTCCTATGGCAATTTAGATCCAGGTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 637241 101 + 647215 TCATCTATTTGTATTGTCCCTGAGTTACCAGTC---GCAAAGGCACCAGCATACCAATGCCACAGCACCCAGCTGGGTCTTAGGGCAAGATAGATTCAGATGAG + +a +s mr.mrrefChr3 172487 106 + 181019 GTCTCAGAAGTCTAGACTCAATGATCAAGCAAGTTTACCATCTTTTTGATGTTGCAATACATTATGTGTTCATTGCATGATGTATGGAGTTGGCTCTCTATGATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625804 106 + 636262 GTCTCAGAAGTCTAGACTCAATGATCAAGCAAGTTTACCATCTTTTTGATGTTGCAATACATTATGTGTTCATTACATGATGTATGGAGTTGCCTCTCTATGATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 637342 106 + 647215 GTCTCAGAAGTCTAAACTCAATGATCAAGCAAGTTTACCATCTTTTTGATGTTGCAATGCATTATCCGTTCATTGCGGGATGTATGGAGTTGGCTCTCTATGATTC + +a +s mr.mrrefChr3 172593 28 + 181019 TAATACTCCTTGCAACCACTTGTGGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625927 28 + 636262 TACTACTTCTATAAATTACTTATAGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 637448 28 + 647215 TAATAATCCTTGCGACCACTTGTGGTGC + +a +s mr.mrrefChr3 172621 32 + 181019 CCCTGTTAAGTGGTCCTTACAGCCTCTTTCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625967 30 + 636262 CCCTGTTAAGTTTTCCTGTC--CCTCCATCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 637476 32 + 647215 CCCCTTTGAATGGTCCTTATAGCCTCTTTCGA + +a +s mr.mrrefChr3 172653 13 + 181019 TCAATTCAAGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 625997 13 + 636262 TGAACTCATGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 637509 13 + 647215 TCAATTCAACAAA + +a +s mr.mrrefChr3 172666 11 + 181019 CAAGTTGATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626011 9 + 636262 TAAGTTGAT-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 637522 11 + 647215 CAAGCTACTGG + +a +s mr.mrrefChr3 172677 38 + 181019 AAGCATGCTTGTACTCCTTCTAGGAATTACTTATAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626020 36 + 636262 -ACCATGGTGGGATACCAT-TGGGAATACTGTAGAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 637536 38 + 647215 AAGCAGGCTTGTACTCCTTCTATGAATTACTTATAGGA + +a +s mr.mrrefChr3 172715 5 + 181019 GTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626060 5 + 636262 GTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 637574 5 + 647215 GTGAT + +a +s mr.mrrefChr3 172720 225 + 181019 CAACAATACCTTATACATTAGGATGAGGGATGAGGGTACAATCAAAAATGTTCTGGGCACCTGGGATTCTTTTAATATAAATGATTAGCCCCATCACCACCCAATATCAAATAGGCAGGGGCTGGGGATCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCATGTGACTGCCAAGGACATGAGTTGCTAAAGAATCTGGTCCCATCAGCCCGACCAGCCCAGATTTGTTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626071 225 + 636262 CAACAATACCTTATACATTAGGATGAGGGATGAGGGTACAATCATAGATGTTCTGGGCACCTGGGATTCTTTTAGTATAAGTGATTAGCCCCATCACCACCCAATATCAAATAGGCAGGGGCTGGGGATCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCATGTGACTGCCATGGACATGAGTTGCTAAGGAATCTGGTCCCATCAGCCCAACCAGCCCAGATTTGTTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 637579 225 + 647215 CAGCAATACCTTATACATCAGGATGAGGGATGAGGGTCCAATCAAAAATATTATGGGCATCTGGGATTCTTTTAATATAAATGATTAGCCCCATAAGCACCCAAGATCGAATAGGCAGGGGCTGGGGACCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCAGGTGACCACCAAGGACGTGAGTTGCTAAAGATTCTGGTCCCATCAGCCCGACCAGCCCAGATTTTTTGGA + +a +s mr.mrrefChr3 172945 166 + 181019 GCACAACTTAAATACTATCACTCAAACGAGACTCAAACAAATTCACTTCATGACCACATTCAGAATCAATAATTACGTTGCCTGGAGCATATTTTCAAACTTGGATATGTGCAGTATACTTGTAAATCTATACTTTTGAGTGCCTATTTTTTTGTTGGACCTGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626296 162 + 636262 GCACCACTTAAATACTATCACTCAAACAAGACTCAAGCAAATTCTTTTCATGACCACATTAAGAATCA----TTACATTGCCTGGAGTATATTTTCAAACTTGGATATGTGCAGTATATTGGTAAATCTATACTGTTGAGTGCCTATTTTTTTATTGGACCTGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 637814 159 + 647215 GCAAAACTTAAATACTATCACTCAAATGAGACTCAAACAG-TTCACTTCATGACCACACCCAGTATCAATAAGGACGTTGCCTGGAGCTTATTTTCAAACTTAAATATGTGTA-TATACTTGT-----TATACTTTTGAGTGCCTATTTTTTTGTTGGAATGGCTT + +a +s mr.mrrefChr3 173111 35 + 181019 ATTTGCTTTAGCAAATTGGTATGAAAACACTGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626627 14 + 636262 ACTTGCTAAAGCAA--------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 637973 35 + 647215 ATTCGCTTTAGCAAATTGGTATGAAAACACTGATA + +a +s mr.mrrefChr3 173146 12 + 181019 ACATCTTGTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 638009 12 + 647215 ACATCTTGTCAA + +a +s mr.mrrefChr3 173158 28 + 181019 TGGATATTTGCCCGAGGCACTGTGTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 638093 28 + 647215 TGGATATTTGCCCGAGGCACTGTGTGAA + +a +s mr.mrrefChr3 173186 11 + 181019 TCTAAACAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626641 7 + 636262 ----ATGAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 638122 11 + 647215 TCTAAACAGCA + +a +s mr.mrrefChr3 173197 40 + 181019 TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTCTCCTCCAGGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626651 40 + 636262 TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTCTCCTACAGGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 638133 40 + 647215 TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTGTCCTCCAGGGCC + +a +s mr.mrrefChr3 173237 10 + 181019 CACGGGGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626704 10 + 636262 CATGGGGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 638173 10 + 647215 CACGGGGAAT + +a +s mr.mrrefChr3 173247 107 + 181019 GAACCTTGGGTAGAACCTAAAATCTGCATTTTTTTTGGAAGGTATGTTACTTTTTGCAGGTTAAGTTACTGCACTACACATACAACAGAATCATGCTGTATTCCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626714 106 + 636262 GAACCTTGGGCAGATCTTCAAA-CTGCGTTTTTTTTGGAAGGCATGTTACTTTTTGCAGGATAAGTTACTGCACTACACATGCAACAGAATCATACCGCATTCCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 638184 107 + 647215 AAACCTTGGGTAGAACCTAGAATCTGCATTTTTTTTGAAAGCTATGTTACTTTTCGCTGGTTAAGTTATTGCACTACATATATAACAGAATCATGCTGTATTGCCCT + +a +s mr.mrrefChr3 173354 38 + 181019 CCTGTTCTAAAAAGCTTGCCCAGGTCTAGGTCCTATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626842 34 + 636262 CCTGTTCTAAAAAGCTTGACCAGGTTTAGGTCCT---- +s simRat_chr6.simRat.chr6 638291 38 + 647215 CCTGTTCTAAAAAACTTGCCCGGGTCTAGGTCCTATAT + +a +s mr.mrrefChr3 173392 20 + 181019 TCATGTTTTCAATGTTATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626876 20 + 636262 TCATGTTTTCAATGTTATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 638339 20 + 647215 TCATGTTGCCAATGGTATTT + +a +s mr.mrrefChr3 173412 41 + 181019 TTTGCAGATCTGATGTGTATGAAGGCTATTTTGATTTCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626898 41 + 636262 TTTGCAGATCTGATGTGTATGAAGGCTATTTTGATTTCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 638359 41 + 647215 TTTGCAGATCTGATGTGTATGAAGGTTATTTTGATTTCTAT + +a +s mr.mrrefChr3 173453 73 + 181019 TCAACATGCCACAACAGCTTCTATCACTGCTGATTTGCATTTCAGCTTAGACTGATAAAGCATCTTAGAACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 626939 73 + 636262 TCAACATGCCACAACAGCTTCTATCACTGCTGATTTGCATTTCAGCTTAGACTGATAAAGCATCTTAGAACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 638497 73 + 647215 TGATTATGCCACAACAGCTTCTATTACTGCTGATTTGCATTTTAGCTTATACTGATAAAGCATCTTAAGACAC + +a +s mr.mrrefChr3 173526 109 + 181019 AGTAGCTATGTTCCATTTACCACACTGTAGACTTGCAAACATTGTGTACTTGGGTTATTGACCCACTTTGCTTCTCCCACAGAACGAAATAATTACGGCATTGGACTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627066 109 + 636262 AGTAGCTATGTTCCATTTACCACACTGTAGACTTGCAAACATTGTGTACTTGGGTTATTGACCCACTTTGCTTCTCCCACAGAACGAAATAATTACGGCATTGGACTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 638570 109 + 647215 AGTGGCTTTGTTACTTTTACTGCACTGTGGACTTGTAAACATGGCATACTTGGGTTATTGGCCCACTTTGCTCCTCCTACAAAATGAAATAATTATGGCCTTGATCTCC + +a +s mr.mrrefChr3 173635 55 + 181019 ACACTCTTTCATAGCGTTCAAGTTTGGTTATTTATTCTATACCTATCTGGACTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627178 55 + 636262 ACACTCTTTCATAGCGTTCAAGTTTGGTTATTTATTCTATACCTATCTGGACTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 638679 55 + 647215 ATACTCTTTCATAGTGTTCGTGTTCGGTTATTAATTCTATACCTATCTGGATTTA + +a +s mr.mrrefChr3 173690 130 + 181019 AGGCAGAAGAGGGGACATATCTTTAACAATGCATATCTTTCAGGACTGGAGGCGTTTGACAAATTCTCAATATCTCTGCAGCAACAATACCCAGCATGATTAGAGACTAAACTACTCTATTCATACTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627235 130 + 636262 AGGCAGAAGAGGGGACATATCTTTAACAATGCATATCTTTCAGGACTGGAGGCGTTTGACAAATTCTCAATATCTCTGCAGCAACAATACCCAGCATGATTAGAGACTAAACTACTCTATTCATACTGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 638734 130 + 647215 AGGCCAAACAGGGGACGTATCTTTAACAATGCATGGCCTTCAAGACTGGAAGGGTTTGACACATGCTCAATATATACGCAGTAACAATCCCCAGCATGATTAGAGACTAAAATACTCTATTCATACTAGG + +a +s mr.mrrefChr3 173820 74 + 181019 CTTTTTTTAGATGACAATGACAATACCATGTATATACTTTACATCTATATGTCTAAGGATGACTGAGGGCTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627365 74 + 636262 CTTTTTTTAGATGACAATGACAATACCAGGTATATACTTTACATCTATATGTCTAAGGATGACTGAGGGCTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 638870 74 + 647215 CTTTTTTTAGATGACAATGACAAGACTATGTATATACCTTACATCTATATGTCTAAGGATGACTGAGGGCTTCG + +a +s mr.mrrefChr3 173894 112 + 181019 AGGGCACATATCTCTATGTAGGCCCTCCAATTAGGATCAAACTCATGCTGAACAAGCTTAACAGACTTCAACATCATGGCAAGATCTGAAGCTTGCTATAATAAAACATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627440 103 + 636262 AGGGCACATATCTCTATGTAGGCCCTCCAAT---------ACTCATGCTGAACAAGTTTAACAGACTTCAACATCATGGCAAGATCTGAAGCTTGCTATAATAAAACATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 638944 112 + 647215 AGGGCACATATCTCCATGTAGCCCCTCCAATTAGGATCAAACTCAAGCTGAACAAGCTTAATAAACTTTAACATCATGGCAAGATCTGAAGCTCACTATAATAAAAGACTCA + +a +s mr.mrrefChr3 174006 107 + 181019 CAAAATGTGGTCTATGTGTTTGTTCTGTTTGCTTTATGTCATGTACAGAGTTTTGGAGACATGTGCATAACCTACAAGTCACCTTTGGAAATCAATTGCTGCTCTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627544 107 + 636262 CAAAATGTGGTCTATGTGTTTGTTCTGTTTGCTTTATGTCATGTACAGAGTTTTGGAGACATGTGCATAACCTACAAGTCACCTTTGGAAATCAATTGCTGCTCTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 639056 107 + 647215 CAAAATGTGGTCTATGTGTTTGTCACACTCGTGTCATGTCATGTACAGAATTTTGGATACACGTGCTTAAGCTGCAAGCCAGCTTCAGAAATCAATTGCTTTACTGC + +a +s mr.mrrefChr3 174113 9 + 181019 GGGCAAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627660 9 + 636262 GGGCAAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 639163 9 + 647215 AGTCAAAAC + +a +s mr.mrrefChr3 174122 17 + 181019 AATATTTAATGCAGTCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627669 17 + 636262 AATATTTAATGCAGTCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 639175 17 + 647215 ATCATCTTACATGTCTG + +a +s mr.mrrefChr3 174139 15 + 181019 TAAGGCCTAACTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627686 15 + 636262 TAAGGCCTAACTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 639193 15 + 647215 TGAGGCTAAACTGCA + +a +s mr.mrrefChr3 174154 18 + 181019 ATCATGTAGAGTTAGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627701 18 + 636262 ATCATGTAGAGTTAGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 639213 18 + 647215 GTCATGTTGAGTTAGGAA + +a +s mr.mrrefChr3 174172 87 + 181019 AAAAAGCAAGTCATCGGCTATAAAAGCACACATGTCCAGTCCTACTCACCATTCTAATTGGGTCTAGACAGTGGGTGCAACAGCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627719 87 + 636262 AAAAAGCAAGTCATCGGCTATAAAAGCACACATGTCCAGTCCTACTCACCATTCTAATTGGGTCTAGACAGTGGGTGCAACAGCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 639232 87 + 647215 AAAAAACAAGTTATCAGCTATAAAACCACACATGTCTGGTCCTACTCACCATTATAATTGGGTCTAGATGGTGGGTGCAACAGCTTA + +a +s mr.mrrefChr3 174259 29 + 181019 CTTCAGCCACCTAATTGCAAAGTTTCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627806 29 + 636262 CTTCAGCCACCTAATTGCAAAGTTTCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 639347 29 + 647215 CTTCGCCCACCTAATTGCAAAGTTTCATA + +a +s mr.mrrefChr3 174288 122 + 181019 TTTCTCAATTGTGTGGCAGGGTCGAATTACAGACAGCTTGGAAGGAAGCACAGGCTATAGGCTTGCCCCTGCAAGTGCAAGTCAGTAATTTTTGGAACAGTATCAGGGCCATTACAAACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627835 122 + 636262 TTTCTCAATTGTGTGGCAGGGTCGAATTACAGACAGCTTGGAAGGAAGCACAGGCTATAGGCTTGCCCCTGCAAGTGCAAGTCAGTAATTTTTGGAACAGTATCAGGGCCATTACAAACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 639390 122 + 647215 TTTCTCTATTGTACAACAGGGTTGGATTACAGACACCTTGGGAGGAAACACATGCTATAGGTTTGTCCCTGCATGGGCAAGTCAGTAATTTTTGGAACAGTCTCAGGGTCATTACAAACAAC + +a +s mr.mrrefChr3 174410 45 + 181019 TACTTAAGGCCTGATTCTTATGCAACATAATCTGTACTTTTTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 627957 45 + 636262 TACTTAAGGCCTGATTCTTATGCAACATAATCTGTACTTTTTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 639514 45 + 647215 TAATTATGGTCTGTGTCCTATGGAATATAATATGTACTTTTTATC + +a +s mr.mrrefChr3 174455 76 + 181019 TGATGCAGACTGTGCTCATACCTGCTTTTCCATCAGCTAACACATCTGTGTTAACAGGCTTTAGTGTTGTGTTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628012 76 + 636262 TGATGCAGACTGTGCTCATACCTGCTTTTCCATCAGCTAACACATCTGTGTTAACAGGCTTTAGTGTTGTGTTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 639559 76 + 647215 TAATGCAGACTGTGTCCATACCTGATTTTCCATCAGCTAACACATCTGTGTTAACAGGGTTTAGTGTTGTGTTGAG + +a +s mr.mrrefChr3 174531 71 + 181019 TACCCGTGCAAGTCTTGAAGCCTGCCCTGGGTGACCCTCATCAGTTATATTAGTAATAAGCATTTGAGTCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628088 71 + 636262 TACCCGTGCAAGTCTTGAAGCCTGCCCTGGGTGACCCTCATCAGTTATATTAGTAATAAGCATTTGAGTCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 639636 71 + 647215 TACCTGCACATGTTTGGAAGCTTGCCCTGGGTGACCCACAGTGGTTGTATTAGTAATAAGCATTTGAGTTG + +a +s mr.mrrefChr3 174602 132 + 181019 GGTGTTTTAGAACTGTTCACAAACAGTTCAGTCAGAGGGGCATTTACTAGGTATTGCTCTGTGACACCTGTCCCTTTGCTGCTAGAATTATCCCTGTCTGTTCCTCTACAAATCCTACCTTATAAACATCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628159 132 + 636262 GGTGTTTTAGAACTGTTCACAAACAGTTCAGTCAGAGGGGCATTTACTAGGTATTGCTCTGTGACACCTGTCCCTTTGCTGCTAGAATTATCCCTGTCTGTTCCTCTACAAATCCTACCTTATAAACATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 639712 132 + 647215 GGTGTCGTAGAACTTTTAGCAAATAGTTCAGTCAGAGGGGCATTGACTAGGTATTGTTCTGTGACACCTGTCCCTTTGTTGCTCGAATTATCCCTATCTATTCCTGTACAAGACCTACGTTATAAAGATTTG + +a +s mr.mrrefChr3 174734 28 + 181019 AACATATCTACCCAGGCACAATGTTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628291 28 + 636262 AACATATCTACCCAGGCACAATGTTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 639846 28 + 647215 AACATATCTACCCAAACACAATGTTGTC + +a +s mr.mrrefChr3 174762 45 + 181019 ACTCAATTAAGTAATATAAAGACTAGACCAAGACTAGCCTTACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628319 45 + 636262 ACTCAATTAAGTAATATAAAGACTAGACCAAGACTAGCCTTACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 639875 45 + 647215 ACTCAATTATGTCATATAACGACTAGACCAAGACTAGCCTCACCT + +a +s mr.mrrefChr3 174807 59 + 181019 AAATGGCGGTGACGAACGGTTAAGAGAATTAACATAGGCAGAGTGGGCAAGATATGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628364 59 + 636262 AAATGGCGGTGACGAACGGTTAAGAGAATTAACATAGGCAGAGTGGGCAAGATATGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 639921 59 + 647215 GAATAGCAGGGGTGGATGGTATAGAGAATCAACATCGGCGGCGCAGTCAAGAGATGATT + +a +s mr.mrrefChr3 174866 86 + 181019 GTCTCTGCTGCCATATCTACAGATTCCATGGGGGTCATTCTGTTCTGAGATGTCAAATCCATAGAATTGTACCATTGCCTCCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628426 86 + 636262 GTCTCTGCTGCCATATCTACAGATTCCATGGGGGTCATTCTGTTCTGAGATGTCAAATCCATAGAATTGTACCATTGCCTCCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 639980 86 + 647215 GTCGCTGCTGCCATCTCTACAGATTCTGTGGACATCATTCTGGTCTTAGATGTCAAATCCATAGAATTAAACTATTGCCTCCGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 174952 39 + 181019 GACTGAATTCACCATTAACTGGGGTGCATGTATAACCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628532 39 + 636262 GACTGAATTCACCATTAACTGGGGTGCATGTATAACCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 640066 39 + 647215 GTCTGAATTCATCATTGCCTGGGGTGCATGTATAACCGG + +a +s mr.mrrefChr3 174991 4 + 181019 TGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628571 4 + 636262 TGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 640111 4 + 647215 TAAC + +a +s mr.mrrefChr3 174995 61 + 181019 ACCTCTCCTGATCCCCAGAGTGGGGTTGAGTGGTGATGATCCTTGTACATAGTCAGTTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628575 61 + 636262 ACCTCTCCTGATCCCCAGAGTGGGGTTGAGTGGTGATGATCCTTGTACATAGTCAGTTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 640122 61 + 647215 GGCTCTCTTGATCCCCAGGGTGATGTTCTGTTGTTATGATTCATGTGCATTGTCAGCTTCA + +a +s mr.mrrefChr3 175056 145 + 181019 TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCACATCGATGGAATTAAAGCTGTATCCATCAACTAGACTTCTATTACAAGCAGTGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGTCTAGTATAATAACTGCGTTTAGCACATCCAGTCATTTGACATCCACTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628638 145 + 636262 TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCACATCGATGGAATTAAAGCTGTATCCATCAACTAGACTTCTATTACAAGCAGTGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGTCTAGTATAATAACTGCGTTTAGCACATCCAGTCATTTGACATCCACTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 640183 145 + 647215 TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCAAATTGAAGGAATTAAAGATGTAACCATCAACTAGACTTGTATTACAAGCAATGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGCTTAGTCTAATAACTGTGTTTAGCACATCCAGCCATTGGACATCCTGTAT + +a +s mr.mrrefChr3 175201 73 + 181019 TCAAACCATCAGCATAGGGCTTTTCTAAGCTCTCCAGTATATGACAACCTCAGAGCACCCCTAGAGAAGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628783 73 + 636262 TCAAACCATCAGCATAGGGCTTTTCTAAGCTCTCCAGTATATGACAACCTCAGAGCACCCCTAGAGAAGCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 640329 73 + 647215 TCAGACCGTCAGCATGGAACCTCTCAAAGCTCTCCAGTATGTGACAACCTCAGAACATCCCTGGAGAAGCACT + +a +s mr.mrrefChr3 175274 59 + 181019 GTATGTTAAACAAGGACTACTAGTTTAATTTCAAATCACATATGTATACTTGTGAATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628857 59 + 636262 GTATGTTAAACAAGGACTACTAGTTTAATTTCAAATCACATATGTATACTTGTGAATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 640402 59 + 647215 GTACCTAAAACAAGGACTACTAGTTCAATTTCAAATTATATATGTGTACTTGTGCATGA + +a +s mr.mrrefChr3 175333 60 + 181019 TACTTGACAACACAGCTCTCAAAGAGACATGTGCAAAGAACAGCATGGACAGAGAATATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628916 60 + 636262 TACTTGACAACACAGCTCTCAAAGAGACATGTGCAAAGAACAGCATGGACAGAGAATATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 640462 60 + 647215 TTCATGACAGCAGAGTTCTCAAGGGGACGTGTGCAAAGAACAGCGTGCACGGAGAATATC + +a +s mr.mrrefChr3 175393 69 + 181019 ATTCATGGGAAGGATTGACCCTTTAGCAAGCGCATTGAGTAATTTTTGAAAATTTGCCTTCTATTTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 628980 69 + 636262 ATTCATGGGAAGGATTGACCCTTTAGCAAGCGCATTGAGTAATTTTTGAAAATTTGCCTTCTATTTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 640522 69 + 647215 ATTTGTGGGAAGGACTGATCCTTTGGCAAGAACACTGGGTAATGTTTGAAAATTTGCCTTCTATCTCTT + +a +s mr.mrrefChr3 175462 324 + 181019 AGTGGAGGTACAAATGCTAGAACCAGAATCGATCACATCCCAGCCAGAGCTGTGGACTCAATGCTTAAGTGGGAACCCAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTATGGTCACTCAAGGGCATGTGAGGTGAACAAGGGGTCTAGAATGTATGCAGGGGGGGCTGTGCATGACAAACCTCTCGTGTGGGGAGCAGGCTCCCTCTACAGCTGCCTGTGATCGCTCGATACCATGTCAAATGGCAGAGTCTTATAGCCAAGCACTATCCGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCATTTATTGGAGCTTTGCACGAGGCACTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629059 319 + 636262 AGTGGAGGTACAAATGCTAGAACCAGAATCGATCACATCCCAGCCAGAGCTGTGGACTCAATGCTTAAGTGGGAACCCAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTGTGGTCACTCAAGGGCATGTGAGGTGAAGAGGGGAT-----GTGTACACAGGGGGGGCTGTGCATTACAAACCTCTCATGTGGGGATCAGGCTCCCTCTACAGGTGCCTGTGATCACTTGATACCATGTCAGGTGGCACAGTCTTATAGCTAAGTACTATCTGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCATTTATTGGAGCTTTGCACGAGGCACTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 640591 324 + 647215 AGTGGGAGCACATATGCTACAACCATAATTCATTACATCATAGCCAGAGCTGTGGACTCAGTGCTTAAGCAGGGACCTAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTATGGTCACTCAAGAGCATGTGGGGTGAACAAGGGGTCTAGAATGTATGCAGGGGGAGCTGTGCATGACAAACCTCTTGTGTGGGGAGCAGGCTCTTTATACAGCTGCCTGTGATCGCTCTACATCATGTCAAATGGAGGAGGCTTATAGCCAAGCACTAACCGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCTTTTATTGGAGCTTTGCATGAGGCACTGC + +a +s mr.mrrefChr3 175786 47 + 181019 GTCTGAACAATGTTATGTGTCCTCCATATGCACAACCTATTTTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629378 47 + 636262 GTCTGAACAATGTCACAAGTCCTCCATATACACAACATATTTTTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 640923 44 + 647215 ATCTAAACAATGTTATGTGTCCTC---ATGTACAACCTATTGTTTTA + +a +s mr.mrrefChr3 175833 145 + 181019 CATCAGTCAATTAACCAGACTGGAGTTACATTTAAGGGATCCACTCCTTACAAGTGCAAACAATAAGCAGTTAGCTTCTGTGAGCATGCAGGCACAGAGTTGCGAGTTGTCATTTGTAAATTTACCCATTAAGGAATCCCATATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629509 144 + 636262 CATCAGTCAATTAACCAAACTGGAGTTACATTTAAGGGATCCACTCCTTCCAAGTGCAAACAATAAGCGGTTAGCTTCTATGAGCATGCAGGCACAGAGTTGCGAGTTGTCATTCG-AAGTTTACCCATTAAGGAATCCCATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 640967 143 + 647215 CATCAGTCAATTAACTGGGTTGGAGTTACATGTAAGGGACCCACTCCTTACAAGTGCAAACAATAAGCAGTAAGCTTATGTGAG--TCCAGCCGCAGAGTTGAGAGTTATCTCTTGTAAATTCACCCATTGAGGAATCTCATACA + +a +s mr.mrrefChr3 175978 4 + 181019 GTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629664 4 + 636262 ATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 641110 4 + 647215 GTTC + +a +s mr.mrrefChr3 175982 278 + 181019 TAGTTGTTGAAGCTAGTAGCTACAAATTCTCCTATGTGAGAGAGCAGTCTGGACAGGTGGCAGTCTAAGCAGGCAAGGCATAGTGCCAGCTTATCCTTCTAGAATTCGAAAGTGTATAGAATTTGTTGGAACTCAGACAGGATGTTCTTACATCCAACAACTGCATGCCCAGTTAGTGAAAAAGTGCAGCTCACCCAAAAACCATATCTAATATCATAGGTTGCAGTCTGTGGGAATCCCTGGTGATTGCCAACTTCCCTGTTGTCCCCATGAACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629670 276 + 636262 TAGTTGTTGAAGCTAGTAGCTACAAATTCTCCTATGTGAGAGAGCAGTCTAGACAGGTGGCAGTCTAAGCAGGCAAGGCATGGTGCCAGCTTATCCTTCTAGA--TTGAAAGTGTATGGAATTTGTTGGAACTCAGACAGGATGTTCTTATGTCCAACAACTGCTTGCCCAGTTGGTAAAAAAGTGCAGCTCACCCAAAAAGTATATTTAATATCATAGGTTGCAGCCTGTGGGGAGCCCTGGTGATTGCCAACTTCCCTGTTGGCCCCATGCACATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 641114 266 + 647215 TGGTTGTTGAAGCTAGTAGCTACAAATTCTCATAAGTGAGAGAGCAGTCTGGAAAGGTGGCAGTTTAAGCAGGCAAGGCACAATGCCAGCTTACCCTTCTAGAATTCTAAAGTGTATAGAATTTGTTGGAACTCAGAC------------CATCCAACAACTGCATGCCCAGTCAGTGAAAAAGTCCAGCTCACCCAAAAACCATATCTAACATCAAAGGTTGCAGTCTGGGGGAATCCCTGGTGATTGCAAACTTCCCTGACATCCCCATGAGCATG + +a +s mr.mrrefChr3 176260 62 + 181019 TTGAGTTTCAATGGAATTATTAGCCTCATTGTCACACAGCTAGTCTTTCTGCCTTAATGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629947 46 + 636262 TTGAGTTTCAATGGAATTATTAGCCTCATTCTCACACAGCTAGTTT---------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 641380 62 + 647215 TTGAGTTTCAATAGAATTATTAGGCTCATTGTCGCGCAGCTAAACTTTCTGCCTTAATGTTC + +a +s mr.mrrefChr3 176322 69 + 181019 TGAATCATGACTGTGTGCATCCACTTTTATTGGTTCATTCAACTGCATTAGGAATTTACAGGTTCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 629993 33 + 636262 ------------------------------------ATTCAACTGCATTAGGAATTTACAGGTTCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 641443 69 + 647215 TGAATCATGACTGTGTGCATCCACTTTTATTGGTTCATTCAACTGCATTAAGAATCTAAAGGTTCATTA + +a +s mr.mrrefChr3 176391 16 + 181019 CCTCCCAAATTTTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630026 16 + 636262 CCTCCCAAATTTTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 641513 16 + 647215 CCTCCCAAATTTTGTA + +a +s mr.mrrefChr3 176407 29 + 181019 TTTCTTAGTTGTTGTCAACCTATTATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630043 29 + 636262 TTTCTTAGTTGTTGTCAACCTATTATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 641529 29 + 647215 TTTTTTAGTTGTTGTAACCCTACTATAAA + +a +s mr.mrrefChr3 176436 76 + 181019 CTGCATTAGGAATTTAAAGGTTCATTATCTTCCCAAATTTTATAGTTTCTTAGTTGTTGTCAACCAATTCTTCGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630072 75 + 636262 CTGCATTAGAAATTTAAAGGTTCATTATCTTCCCAAATCTTATGATTTCTT-GTTGTTGTCAACCAATTCTTCGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 641561 76 + 647215 CTGCATCAGGAATTTAAAGGTTCTTTAACTTCCCAAATTTTATAGTTACTCAGTCGTTGTCAACCAATTCTTGGGC + +a +s mr.mrrefChr3 176512 25 + 181019 GCTCACAACCACAGAGATACTGATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630147 25 + 636262 GCTCACAACCACAGAGGTTCTGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 641656 25 + 647215 ACTCACTACCACGGAGATACTGAAC + +a +s mr.mrrefChr3 176537 579 + 181019 TGAAATTTTAATGAGTGTTTACTAGGGGCCTTTTTTTTGCAAAAAATATCTGTCCATCCCGTGAGTAAGTTCCAAAGCAGCACACACTGAGAATATTCTCTGGTATGTGAATTTCTCCACTTACACTCAGTACTTCTAATTTGCCTGGTGCAGCATTTTCTGATTTTAGCTTCTAGGCCTTTTCTTTATTTTTGGATCTTTAGGCCAGCTCTATCAATCTATGGGGTTCCACAGAATCATAACACATACTGCTCATGGCCTTGTAAACCCAAGTCCGGAGAGAAGCACTCTCCAGAGTTACACGAACATTGTTTATACGACTTGGAATTTTAGAAGGCCTCAATTTTTGTGCTACAGGCTAGTTCGCTCAGAGTTCTTCAAGCAATATTCCTCACTTGTTTAAATGTAGCCTGTATAATCTCCAGCCTTATTGAATCTGGACTGCAGCTGATTGGGCAACCCCAAGTTATTGTCAAGCTCTGTACATACTAGATTGGACATTCATGGATGAAACTGTGACTGAACAAAAAAAAAATCTTCTTCCTATTATCAGTTTGATTATTCTGAAAATCAGCTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630172 576 + 636262 TGAAATTTTAATGAGTGTTTACTAGGGGCCTTGTTTTTGCAAAAAAT--CTGTCCAACCCGTGAGTAAGTTGCGAAGCAGCATACACCGAGAATGTTCTCTGGTATGTGAATTCCTCCACTTACACTCAGTACTTCAAATTTGCCTGGTGCAGCATTCTCTGGTTTTATCTTCTAGGCCTTTTCCGTATTTTTGGAGCTGTAGGCCAGCTCTATCAATCTATGGGGTTCCACAGAATCACAACACGTACTGCTTATGGCCTTGTAAACCCAAGTCAGGAGAGAAGCACTCTCCAGAGTTACACGAACATTGTTTATACGACTTGGAATTTTAGAAGGCCTCAATTTTCGCGCTACAGGCTAGTCCGCTTAGAGTTCTTCATGCAATACGC-TCACTTCTTTAAATGTAGTCTGTATAATCTCCAGCCTTATTGAATCTGGACTGCAGCTGATTGGGCAACCCCAAGTTATTGTCAAGCATTGTACATACTAGATTGGACATTCATGGATGACAATGTGACTGAACAAAAAAAAAATCTACTTCCTATTATCAATTTGATTATTCTGAAAATCAGCTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 641692 563 + 647215 TAAAATTTTAATGAGTGTTTACTAGGGGCCTTTTTTCTGCAAAAAATATTTGTTCATACCGTGAGTAAGTTCCAATGCAGCACACACTGAGAATATTCTCTGGTATGTGAATTTTTCCAC------TCAGTACTTCTAATTGACCTGGTGCA--CTTTTCTGATTTTGGCTGCTAGGACTTTTCTTTATTTTTGGATCTTTAGGCCAGCTCTATCAATCTACGGGGTTCCACAGAATCATAATACATACTGCTCATGGCCTTGTCAACCCCAGTCCGGAGCGAAGCACTCTCCAGAGCTACACGAACATTGTTTATACGACTTGGAATTTTAGAAGGCCGTAATTTTTGTGCTACGGGCTAGTTCGCTCAGAGTTCTTCAAGCAACATTCCTCACTTGTTTAAATGTAACCTGTATAATCTCCATCCTTAT--AGTCTGGAATCCAGCTGATTGGGCAACCCCAAGTTATTGTCAAGCTCTGTAAATAGTAGATTGGACATTCATGGATGAAACTGTGCCTGAACAAAAAAAAAATCTTCCTCCTATTATCAGTTTGAT------GAAAAACAGCTAGG + +a +s mr.mrrefChr3 177116 56 + 181019 AATGAGCAAGATTGGGTAGTTACCATCAGCCCCAGATGGATGCCGAGGTGACCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630775 56 + 636262 GATGAGCTAGATTGGGTAGTTACCATCAGCCCAAGATGGATGCCGAGGTGAGCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 642255 53 + 647215 AATAAACAAG---GGGTAGTTACACTCAGCCCCAGATGGATGCCGAGGTGACCTTA + +a +s mr.mrrefChr3 177172 50 + 181019 GGTCCGACCGATCCCTCCACTGGAGGGTGTAACGCCTCTCTAGTGCTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630831 50 + 636262 GGTCCGTCCGATCCCACCACTAAAGGCTGTAACGCCTCTCTAGTGCTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 642311 50 + 647215 GGTCCGATCGATCCCTCTACTGGAGGGTGTAACGCCTCTTTAGTGCTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 177222 288 + 181019 CTTGAAAGACATATTATCACCACTCGGCCGCGGACGGGTGAGATTTCTGAGCACAAGCTGGTATCCTGGGGGAGAAGAGGGATAATAGTGAACGAAGAAAACGAAAAGGCGCCAGGCAACGCCCTCAGGATCGCTTTCATGTGCCTTGGGGTACGCTGGGGAAAAACAAGTGTAAATTTGTTCCGCCGGCCTAGTACTAGAATACGGTAGCCGGCACCTAATTGAGTAACGGAGCACAGCCATCCAAAGGAAGTGCAGGTCTGGATGTCTGTATATCTGAACGTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 630909 288 + 636262 CTTGAAAGGGATATTATCACCACTCGGCCGCGGACGGGTGAGATTTCTGAGCACAAGCTGGTATCCTGCGGGAGAAGAGGGATAATAGTGAACGAAGAAAACGAAATGGCGCGAGGCAACGCCCTCAGGATCGCTTTCATGTGCCTTGCGATATGCTGGGGAAAAACAAGTGTTAATTTATTCCCCTGGCCTAGTACTAGAATACGGTAGCCGGCACCTAATTGAGTAACGGAGCACTGCCAGCCAAAAGAAGTGCAGGTCTGGATGTCTGTATATCTGAACGTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 642361 283 + 647215 CTTGATAGACATATTATCACCACTCGGCCGCGGACGGGTGAGGTTTCTGAGCATAAACTAGTATCCTGGGGGAGAAAAGGGATAATAGTGACTGAAGAAAGCAAAAATGCGCCAGGCAACGCCCTCAGGATCGTTTTCAAATGTCTTGGGGTACG-----GAAAAACAAGTGTAAATTTGTTCCGCCGACCTAGTACTAGGATACGGTAGCCGGCACCTAATTGAGTGCCGCAGCACAGCCATCCAAAGGAAGTTCAAGTCTGGATGTCTGTATGTCTCAACATAAAA + +a +s mr.mrrefChr3 177510 320 + 181019 AGAAAATCTATGTTTTCAGCCATAAAAAAAAAAAATCTATGTTTCTGGCATGTTGTTTCTGTAAGGGCAGTCAACTTCGGTTGCTATCGGTTTCCCCGACATGACACCCAGGCTGCTGGGCCCACAAAATGAGACACCTGGATTGCCAGGGGTGTCCTCGGGAACATGGGGAATTTACTCGGATAATAGTGAACCTCCGTGTGATAATTGCAACTCATTTAACGTTTAAGAGGCTACTATTGTGTTGTCTCTCGGCATGTTGATGTACCACTCAAACTTACAGAGCATTGAAGTGGCACTTAACTATCTTATTCATTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 631199 320 + 636262 AGAAAATCCATGTTTTCAGCCATAAAAAAAAAAAATCTATGTTTCTGGCATGTTATTTCTGTAAGGGCAGTCAACTTCGGTTGCTATCGGTTCCCCCGACATGACGCCCAGGCTGCTGGGCCCACAAAATGAGACACCTGGACTGTCAATGGTGTCCTCGGGAACATGGGGAATTTACTCGGATAATAGTTAACCTCCGTGTGACAGTTGTAACTGATTTAACGTTTAGGAGGCTACTATTGTGTTGTCTCTCGGCATGTTGATGTACCACTCAAACTTACAGAGCATTGAAGTGGCACTTAACTATCTTATTCATTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 642644 300 + 647215 AAAAAATCTATGTTTACGGCCATAAAAAAAAAAAATCTATGTTTCTGGCATGTTGTTTCTGTAAGGACAGTC---TTCGATTGCTATCGGTTTCCCCGACATGACAGGCAGGCTGCTGGGCC-ACAGGATGA--TGCTTTGATTGCTAGGGGTCTCGTCCGGAACATGGGGGATTTACTCGGATAATAGTGATCCTTCGTGTGATAATTGCAAGTCATTTAACATTTAAGAGGCTACTATTGTCTTGTCTCTCGTCATGTTGATGTACCACACAAAGTTATAGAGCATTGA-GTCGCA----ACTCTCTTA--------- + +a +s mr.mrrefChr3 177830 136 + 181019 ATCTGTAATAAGTTTTTTTTCCATCTTCTTCTCATCTTTTCACTAGGGTCCATCTTCTGTAGTATCATTGCTATGTCATCCCATGGACTGAGTATCCTAGGCCAGCCTGGGATCTCGCGTGATGGGGCTAGTTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 631520 132 + 636262 ATCTGTAATAAGTTTTTTTTCCATCTTCTTCTCATCTTTTCACTAGGGCC----TTCTGTAGTATCATTGCTATGTCATCCCATGGACTGAGTATCCTAGGCCAGCCTGGGATCTCGCGTGATGGGGCTAGTTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 642944 136 + 647215 ATCTGTAATAAGTTTTTTTTCCGTCTTCTTCTCATCTTTTCACTAGGGTCCATCTTCTGTACTATCATTGCTATGCCATCCCATGGACTGAGTATCCTAGGCTGGTCTGGGATCTCAGGTGATATGGCTAGTTTTC + +a +s mr.mrrefChr3 177966 13 + 181019 TCCCCCAATTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 631654 13 + 636262 TCCCCCAATTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 643080 13 + 647215 TCACCGAATTGGG + +a +s mr.mrrefChr3 177979 314 + 181019 CTGGAGTTCCATGGTAGTTCTTCCCCATAATCTGTTAATGGTCCATTGTACAAGTTGAGAATGCATGCCGGCTGACAAGCCTTGACAAAGAATCCATACAGCTACCTCTCTAAGCTCCTTGCTGAGGTTGGAAAATTGTTGGTGATGTATTTTAATATTGGTCATTGACACCAAAAAACCTTGCTTTTGAGATGCCAGCTCTGCTAGCCGGACCTGGATCACCCATTAGAGCTTAGCTATCCAAGGTCTATCATGTTAACAGGAGAGTCAGCCTTGCATGGTAACTGGGGAGCCAGTGTTGGGCAACAGAAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 631667 314 + 636262 CTGGAGTTCCATGGTAGTTCTTCCCCATAATCTGCCAATGGTCCATTGTGCAAGTTGAGAATGCATGCCGGCTGACAAGCCTTGACAAAGAATCCATACAGCTACCTCTCTAAGCTCCTTGCTGAGGTTGGAAAATTGTTGGTGATGTATTTTAATATTGGTCATTGACACCAAAAAACCTTGCTTTTGAGATGCCAGCTCTGCTAGCCGGACCTGGATCACCCATTAGAGCTTAGCTATCCAAGGTCTATCATGTTAACAGGAGAGTCAGCCTTGCATGGTAACTGGGGAGCCAGTGTTGGGCAACAGAGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 643094 314 + 647215 CTGAAGTTTCATGGTAGTTCTCCCCCACAATCTGTTAACAGTCCGTTGTACAAAGTGAGAATGCATGCTGGCTGACAAACCATGACAAAGAATCCATACAGCTACCTCTCTAAGCTCCTTGCTGAGGTGGAAAAATTGTTGGTGATGGATTTCAATATTGGTCATAAGCACCAAAAAACCTTGCTGTTGGGATGCCAGCTCTGCTAACCAGAGCTGGGTCAACCTTTAGAGCTTAGCTGTGCAAGGTCTGTCATGTTAACGGGAGTGTATGCCTTGAATGGTAACTGAAGACCCAGCCTTGGGAAACCGAAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 178293 217 + 181019 CCCTGTCAGAGCAGCCCAATGGGTAGTCTCCAAGAGATCCTTATGATCCCAAAATATCTGTCACATTGCCCATCCTTGTTTTTGTAGCATAACTTATGATTCTTTATATTCTACTCATCCATAAACTCTAGTGTTGCTTTTGCCTTTAAAGATAAGTCATGCTTCATTTTCATCCTCATTCAGGTCCCTAAAAGAATCCCGTAAGTCTAGATGAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 631981 217 + 636262 CCCTGTCAGAGCAGCCCAATGGGTAGTCTCCAAGAGATTCTTAAGATCCCAAAATATCTGTCACATTGCCCATCCTTGTTTTTGTAGCATAACTTACGATTCTTTATATTATACTCATCCATAAACTCTAGTGTTGCTTTTGCCTCTAAAGATGAGTCATGCTTCATTTTCATCCTCATTCAGGTCCCTAAAAGAATCCCGTAAGTCTAGATGAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 643411 217 + 647215 CCCTGTCAGAGCAGCCCAATGGGTAGTCTCCAAGAGAGCCTTCTAATCCCAAAATATCTGTCACATTGCCCATCCTTGTTCTTGTAACATAACTTATGCTTTTGTATATTCTACCCATCCATAAACTTTAGTGTTGCTTTTGCATTTAAAGACAAGTCATGCTTCGTTTTCATCCTCATTTTGGACCCTACACGAATCCTGTAAGTCTAAATGAACT + +a +s mr.mrrefChr3 178510 353 + 181019 CATGAGAGTTGTCATGCTAGCAGTGATAGCAGGAAAGAATATAACCTAAGGTTGGATTCCAAGTCACTCCTCTAACTCAATTATTGAGATGTAAGACAGTTCTAGGATTCTCATAGACAACCTTAAGCTGTCACTTAGTTTTGTGGTACAACTGAGGTCAACAACCACAAACCATATAGTATAAAGACTTGTTTAGTGTATCAAATGTGCTAATGGTAACAACTAGATGAGCTGAAGTAATTGGTTAGGCATATATAGTGGCTTTAATGAAAGTTTGGTGAGGAGAAAATGAACTTGTTAATTGTTAGGTTGTATTAGTTTGTCTTGGCATTGGATTTGCTGGTCAAAGGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 632220 353 + 636262 CATGAGAGTTGTCATGCTAGCAGTGATAGCAGGAAAGAATATAACCTAAGGTTGGATTCCAAGTCACTCCTCTAACTCAATTATTGAAATGTAAGACAGTTCTAGGATCCTCATAGACAACCTTAAGCTGTCACTTAGTTTTATGACACAACTGAGGTCAACAACCACAAACCATATAGTCTAAAGACTTGTTCAGTGTATCAGATGTGCTAATGGTAACAACTAGATGAGCTGAAGTAATTAGTTAGGCATATATAGTGGCTTTAATGAAAGTGTGGTGAGGAGAAAATGAACTTGTTAATTGTTAGGTTGTATTAGTTAGTCTTGGCATTGGATTTGCTGGTCAAAGGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 643628 304 + 647215 CATAGGCAACCTTAAGCTGCCACT--TAGCTTTATGACATATTACAT----TTAGGTCACAAGTC------------------CTGAGAGGTGTGGTGGTGCTGAGATTGTC-----CAAC--------------------TGTGGTCAACTTGTGGTCAACAACCATAAATCATATAGTATAAAGACTTGTTTAGTGTATCAAATGTGCTAATGGTAACAACTAAATGAGCTGAAGTAATTGGTTAGGTGTATATAGTGGCTTTAATGAGAGCTTGGTGAAGAGAAAATGAACTTGTCCGTTGTTAGGTAGTATTAGTTTGTCTTGGCATTGGATATGCTGGTCAAAGGTAT + +a +s mr.mrrefChr3 178863 33 + 181019 TGCCTAGGCTATCTAACAAGTAATATAGGTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 632575 33 + 636262 TGCCAAGACTATCTAACGAGGAATATAGGTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 643932 33 + 647215 TGCCTAGGCTATCTAACAAATAATATGGGTCAG + +a +s mr.mrrefChr3 178896 31 + 181019 ATTGGGGGTTATTTACCGCCCTGCTATAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 632609 29 + 636262 ATTGGGGGTTATTTATCGCCCTGTTATAG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 643965 31 + 647215 ATTGGGGGTTATTTACCACCCTGCTATTGGA + +a +s mr.mrrefChr3 178927 183 + 181019 TAATCCTACCAGTGTGACCGGGACCCATGGTCAGGTTTTGTAAGTGCAAAACTTCATTTGGCCAAATGTGCAAAAGATAAGGACAAATATTACTCCCATTTGAGGGTCGAAAATTTTAACAGGGTAGAACATTTTAACTCTTAAAGTTATCAGGTATACACCCTTGATTCAGCTGTCCTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 632638 175 + 636262 -AATCTTACCAG-------GGGACCCATGGTCAGGTTTTGCAAGTGCAAAACTTCATCTGGCCAAATGTGCAAAAGATAAGGACAAATATTACTCCCATTTGAGGGTCGAAAATTTTAACAGGGTAGAACATTTTAACTCTTAAAGTTATCAGGTATACACCCTTGATTCAGCTGTCCTTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 643997 182 + 647215 TAATGCTACCAGTGTGACCGGGACCCATG-TCATGTTTTGTAATTACAAAACTTCATTTGGCCAAATGTGCAGAACATAAGGACAAATATTCCTCCGGTTAGAGCGTAGAAAATTTTGACGGGGTAGAAGACTTCAACTCTGAAATTTATCAAGAAGGCACCCTTGATTCAGCTGTTCATTTA + +a +s mr.mrrefChr3 179110 83 + 181019 CAGACTAATGCACCACTTATAGAAAGCACTTGCCAAGTATTATGGGAGCTGTCAAGAATTTAAATGCTTGTAGAGTGCTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 632865 83 + 636262 CAGACTAATGCACCACTTATAGAAAGCACTTGCCAAGTATTATGGGAACTTTCAAGAGTTTAAATGCTTGTAGAGTGCTTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 644179 83 + 647215 CAGACTAACGCTCTTCTTATAGAAAGCACTTGGTAAGCATTACGGGAGCTGTCGAGAATTTAAATGCTTGTAAAGTGCTTTTA + +a +s mr.mrrefChr3 179193 57 + 181019 TTAAGACACCCTCATAGGACATCTATCTAAATACCTTAGTATAAAACATTGACTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633084 56 + 636262 TTAAGACACCCACATAGGACATCTA-CTAAATACCTTAGTATAAACCTTTGACTACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 644262 57 + 647215 TTAAGACACCCTTCTGGGACATCTATCTAAATACCTTAGTATAAAACATTGACTATG + +a +s mr.mrrefChr3 179250 68 + 181019 TTGTCCTTCCTCTTCATTGCTTTCCACCTTTTATCAGATGTCACAGCGCTAAATATTTCATATATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633145 68 + 636262 TTGTCCTTCCCCTTCATTGCTTCCCACCTTTTATTAGATGTCACAGCGCTAAATATTTCATATATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 644319 68 + 647215 TTGTCCTTGCTCCTCATCAGTCTACACCTTTTATCAGATGTCGCAGTGCTATATGTTCCATATATCGA + +a +s mr.mrrefChr3 179318 81 + 181019 ACCCATGCTTACCAGTTTATCTCTTGTTTTTGACCAGCTATTAAGAGGTCACAATGCAATGTCTTTTAAATGGAACAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633213 81 + 636262 ACCCATGCTTACCAGTTTATCTCTTGTTTTTGACCAGCTATTAAGAGGTCACAATGCAATGTCTTTTAAATGGAACAGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 644389 81 + 647215 ACCCATGCTTACCAGTCTATCTCTTGTTTTTGACCAGCTATTAAGAGGATAAAGTGCAATGTCTTCTCAATAGAACAATAT + +a +s mr.mrrefChr3 179399 57 + 181019 GAGGTTGTCTCTTATTTAATAAGCTGTAAAACACTGTGGACTACCTATCACTAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633298 57 + 636262 GAGGTTGTCTCTTATTTAATAAGCTGTAAAACACTGTGGACTACCTATCACTAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 644470 57 + 647215 GAGGTTTTCTATTATTTAATAAGCTACAAAACACTGTGGACTATCTATCACCAGTTA + +a +s mr.mrrefChr3 179456 20 + 181019 GTAGTCCCTCCATAGCAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633355 20 + 636262 GTAGTCCCTCCATAGCAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 644538 20 + 647215 GTAATCCCTTCATACCAACT + +a +s mr.mrrefChr3 179476 63 + 181019 CTAGATATCATAAGGACAGGAGAATAGAATAAATAGATTCCTTGTAGACTAATTCTAATGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633376 63 + 636262 CTAGATATCATAAGGACAGGAGAATAGAATAAATAGATTCCTTGTAGACTAATTCTAATGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 644558 63 + 647215 CTAGATGTCCTGAGGACAGGAGAATTGACTAAATAGATGCCTTGCAAACTAAGTGTGACGGAT + +a +s mr.mrrefChr3 179539 145 + 181019 GCTGCCTGGAATAGTTTGCATATAATGCTGTCAAGCGGATTTTGTGTAGATCATCCAATGATCTGCGGCCACGAAGGGCAAACCTGTGGCGGTTAAAAAGGCACTAATTTCTCAATGGACAAAATTGTCTGATAGAAGGCTTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633448 145 + 636262 GCTGCCTGGAATAGTTTGCATATAATGCTGTCAAGCGGATTTTGTGTAGATCATCCAATGATCTGCGGCCACGAAGGGCAAACCTGTGGCGGTTAAAAAGGCACTAATTTCTCAATGGACAAAATTGTCTGATAGAAGGCTTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 644621 145 + 647215 GCTGCTTGGAGTCGTTAGCATAAACTGCTGTCAAGCGCATTTCGTGTAGATCATCCACTGAGCTGTGGCCCCCAAGGGCAAACCTGTGGTGATTAAAAAGGCACTAATTTCTCAATTGAAAAAATTGTCTGATAGAAGACTTCGT + +a +s mr.mrrefChr3 179684 24 + 181019 GATTCATGATTGTGTAGAGGCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633593 24 + 636262 GATTCATGATTGTGTAGAGGCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 644767 24 + 647215 GATTCATGCTTGTGTAAAGGCAGG + +a +s mr.mrrefChr3 179708 148 + 181019 AATATGGGAATGCTCTGATTTCATGGGGGAGGCTTGATTGGTTTTCCTTTGTGCAAGTGACCTGACTGGAAAAGCAAATGGTGTACCACTGCCCACTAGGTCTTGCAATAATCTAGGGATGATTGTTTAGGGTTAGAACATAGGTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633618 148 + 636262 AATATGGGAATGCTCTGATTTCATGGGGGAGGCTTGATTGGTTTTCCTTTGTGCAAGTGACCTGACTGGAAAAGCAAATGGTGTACCACTGCCCACTAGGTCTTGCAATAATCTAGGGATGATTGTTTAGGGTTAGAACATAGGTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 644791 148 + 647215 CATATGGGGATGTTCTGGTTTCAGGGGGGAGGCTTGATTGGCTTTCATTTGTGCAAGTGACTCGACTGGAAAAGCAAGTGGTGTACCACTGCTCTCTAGGTCTTGCAGTAGTCTAATGATGAATGTGTAGTGTTGGACCATAGGTATT + +a +s mr.mrrefChr3 179856 40 + 181019 TGATTAGTCTAATGACTAATGCATAAAATCTGCTGAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633766 40 + 636262 TGATTAGTCTAATGACTAATGCATAAAATCTGCTGAATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 644951 40 + 647215 TGATCAGTCTAATGACGAACATCTAATATCTGCTGGATAT + +a +s mr.mrrefChr3 179896 30 + 181019 TTAAATTTGTGCGGATAATTCAAAGGGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633806 30 + 636262 TTAAATTTGTGCGGATAATTCAAAAGGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 644993 30 + 647215 TTAAAATTATGCAATTAATTTAAAGGGTAA + +a +s mr.mrrefChr3 179926 110 + 181019 GTGAATGGCCCAATGATTTGGTTCCCAGATGTTTCAATCCGACAACATAATATGACTAGTCCTACAAGAGGCACTACACCATTAGACCCTCCTTCAGAGATAAATTATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633837 110 + 636262 GTGAATGGCCCAATGATTTGGTTCCCAGATGTTACAATCTGACAACCTAATATGACTAGTCCTCAAAGAGGGACTATACCATTAGACCCTCCTTAAGAGATAATTTATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 645023 110 + 647215 GTGAATGGCCCAGTGAATTGGTTCCCAGATGTTTCAATCCAACAACATAACATGACTAGTCCTACAAGGGGCACTACATCATTAGAGCCTCCTTCAGAGATAAATTATAA + +a +s mr.mrrefChr3 180036 37 + 181019 GTAGAAGTCTATCGATGGTGTGGGGTAATCACCTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 633947 37 + 636262 GTAGAAGTCTATCGATGGTGTGGGGTAATCACCTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 645136 37 + 647215 GTAGAAGTCGATCGATTGTGTCAGGTAACCATCTTTA + +a +s mr.mrrefChr3 180073 67 + 181019 AGGGGACACACATGGTGCGTTGACTTATGTACTTTCTTGCCGGACGATCCATACCATTTGTCTACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634039 67 + 636262 AGGGGACACACATGGTGCGTTGATTTATGTACTATCTTGCCGGACAGTCGATACTATTTGTCTACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 645173 67 + 647215 AGGGGACACACACGGTGCGTTGACTTATGTACCTTCTTGCCGTACGATCCATACCATTTGTCTACCC + +a +s mr.mrrefChr3 180140 49 + 181019 CTTTGTGAAGCCATTTTTTTGGATGGGGTCAGCCTTCTAGGCTGCTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634355 44 + 636262 CTTTGTGAAGCCATTTTTTTGGCT-----CAGCATTCTAGGCTGCTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 645240 49 + 647215 CTCTGTGGAGCCAGTTTTCTGGATGGGGTCAGCCTTCTAGGCTGCATCA + +a +s mr.mrrefChr3 180189 112 + 181019 GTTCCATTTACCAATACACTCACATTTACGATTATACTATTTTACATCTCGAGTTGGATAAGATTAGACCTCCTAACAGGTGCTGCTCTCCATACATTTGTAATTACTCGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634400 109 + 636262 GTTCCATTTACCAATACACTCACATTTACAATT---CTATTTTACATCTCGAGTTGGATAAGATTAGACCTCCTAACAGGTGCTGCCCTCCTTACATTTATAATTAGTAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 645289 112 + 647215 GTTCCAGTTACCAATACACTCACATTTATGATCATACTACTTTACATCTTGAGTTGTATAAGATCAGACCTCATAACAGGTGCTTCTTGCCATACATTTGTAATTACTCGCA + +a +s mr.mrrefChr3 180301 24 + 181019 TGATATATTTCTTCCCAGCTATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634511 24 + 636262 TGGTATATTACTTCCCAGCTATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 645401 24 + 647215 TGATATATCTCTTACCAGCTATGA + +a +s mr.mrrefChr3 180325 44 + 181019 ACAAACCGCTTGTGTGAGGTGGGAAGACTCCTTCTGTGATCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634535 44 + 636262 ATGAACCGCTTGTGTGAGGTGGGAAGACTCCTTCTGTGATCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 645427 44 + 647215 ACAAACCACTTGTGTGATGCGGGCAGACTCCTTCTGTGATCATT + +a +s mr.mrrefChr3 180369 59 + 181019 GCCGCATCCATGCTGTGAAGCTTTGCCTGTCAGTGGACCGCAATTCCTCTTGGTCAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 634579 55 + 636262 ATTGCATCCATGCTGTGAAGCTTTGCCTGTCAGTGGACCGCAATTCCTCTTGGTC---- +s simRat_chr6.simRat.chr6 645501 8 + 647215 GCCG---------------------------------------------------AGCA + +a +s mr.mrrefChr3 180428 269 + 181019 CTGACATGGGGATCATTAAACTACATATATACAAGTAAATATGTGGAACTTATCTTCGATAGGGAGAAACTAGTAAGTCTCTTCCAGAGCAGGCTAACCTATTGCTTATAAATACAAAGTTGTACTCAAATCTGTGCTAATTCAAACCAGTGCTTTGGGTTGCTCTTTTCAGATAACTGACACTTCCTCGATCATTTTATAGCGAGATTCCCTGCTCCTCCCTCATATCAACTGAAAAGAGCCCTGGCCCAAGTAGGGTGAATAGTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1003 269 - 636262 CTGACATGGGGATCATTAAACTACATATATACAAGTAAATATGTGGAACTTATCTTCTATGGGGAGAAACTAGTAACTCTCTCCCAGAGCAGGCTAACCTATTGTCTACAAATACAAAGTTGTACTCAAATCTGTGCTTACTCAAACCTGTGCTTTAGTTTAATCTTTTGAGATAACTGACACTTTCTCGATCATTTTACATCGAGATTCCCTGCTCCTCCCTCATATCAACTAAATAGAGCCGTGACCAAAGTAGGGTGAGTAGTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 645578 219 + 647215 --------------------------------------------------CATCTGTGATAGGGAGAAATTAGTAAGTCTCTTCCAAAACAGGCTTACCTATTGCTTATAAATACAAAGTTGTACTCAGATCTGTGCTAATTCAAACCAATGCTTTGGGTTGCTCTTTCCAGATAACTGACACTTCGTAGATCATTTTATAGTGAGATTCCCTGCTCCTCGCTCATATCAACTGAAAAGAGCCCTGGCCCGAGTAGGGTGAATAGTCTG + +a +s mr.mrrefChr3 180697 65 + 181019 TGTTAAATTGTTGAGGAATGGACCCATTTTATGTACACTCCCCTCTAAGTGATCTTGCTTGATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1293 63 - 636262 TGTTAAATTGTTGAGGAATGGACCCATTTTATGTACACTCCCCTCTAAGCGATCTTGTG--CTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 645797 65 + 647215 TGTTAAATTGTTGGGGAATGGAAACATTTTATGTATGCTCCCCTCTAAGTGATCTTGCTTGAGTA + +a +s mr.mrrefChr3 180762 18 + 181019 GCTAACAGAACAGCCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1358 18 - 636262 GCTAAAAGAACAGCCTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 645862 18 + 647215 GCTAACAGTACAGCTTAG + +a +s mr.mrrefChr3 180780 46 + 181019 CCAACTATCAACCATTCATCGCCTCCTATGACATTGCTTGCTACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1391 46 - 636262 CCAACTATGTGCCATTCATCGCCTGCTGTGACATTGCTTGCTACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 645880 46 + 647215 CCAACTATCAACCATTTATTGCCTCCTATGACATTGCTTGCTACAT + +a +s mr.mrrefChr3 180826 187 + 181019 ATAGGACCACATCCCATTCAAAAAATACAACCCACTCATGCAATACAACCAACCTATGCAACTGGCCTGGGTGTGTTATTGTGGATCTGCATAGCACTGATTTCTGCCAATTAGGTGGGGGGATCCAACACCTGATTGCCTTGAATCCCAGCTTGGCGTGGTCTCCTTTCTGACCAACAGGTGGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1437 173 - 636262 ATGGGACCACATCCCAT-------------CCCAATCAGAAAAAACAACCAACCGATGCAACTGGCCTGGGTGTG-TAGTGTGGATCTGCATAGCACTGATCTTTGCCAATTAAGTGGGGGGATCCAACACCTGATTGCCTTGAATCCCAGCTTGGCGTGGTCTCCTTTCTGACCAACAGGTGGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 645927 163 + 647215 ACAGGACTGCATCCCAGTCAAAAAATACAACCCACCCATGCAATACAACCCACCTATGCAACTGGCCTGGGTGTGTTATTGTGGAACTGCATAGCACTGATTTCTGCCAATTTGGTGGGGAGATCC--CACCAGATTGCCCTTAA----------------------ATGTGACCAACAGGTGGGTT + +a +s mr.mrrefChr3 181013 6 + 181019 GGACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 1610 6 - 636262 GGACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 646101 6 + 647215 GGCCTA + +a +s mr.mrrefChr4 0 68 + 409 TGCTGATAAATTAGATTGACATATTGTAATTACCAGTAAAGTAAGGCCAGCACTTTGCAAGGATTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 499913 62 - 636262 ------TAAATTAGATTGACATATTGTAATTACCAGTAAAATAAGGTCAGCACTTTGCAAGGATGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 132120 68 + 647215 TGCTGATAAATTAGATCGACATACCGTAATTACCAGCAAAGTAAGGCCAGCACTTTGCAAGGATTAAC + +a +s mr.mrrefChr4 68 6 + 409 TGACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500011 6 - 636262 TAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 132188 6 + 647215 TGATCA + +a +s mr.mrrefChr4 74 297 + 409 ATCAACCAGGATGGATCTACTCAGGAAGTTGAAATACAATATTGCAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATCTTTTTATGGAGCAATACAATCTGCAGGACAGAGAGTTCTGCTTACTAATCAAGCTATAAAGTTATTAAGGAGGGTGAGGATTAACAGAATGTAGTCTAAAGCTATTGAGGTCTGGCCTTATATCTTCACACTTATCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGTGGAGAACCCCACCATATGTTCTCATAAAAAAATATTCACATATGGCATTGGTAAAGGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500017 296 - 636262 ATCAACCAGGATGGATCTACTCAGGAAGTTGAAATACAATATTGCAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATATTTTTATGGGGCAATACAATCTGTAGGACAGAGAGTTCTGCTTACT-ATCAAGCAATAAAGTTATTAAGGAGGGTCAGGATTAACAGAATGTAGTCTAAAGCCTTTGAGGTCTGGCCTTATGTCTTCACACTTATCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGTGGATAACCCCACTATATGTTCTCATAAAAAAATATTTACATATGGCATTGGTAAAGGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 132197 294 + 647215 ATCAACCAGGATGGATCCACTCAGAAAGTCAAAATACTATATTGGAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATCTTATTATGGAACAATACAATCTGCAGAACAGAGAGTTCTGCTGACTAACCAAGCTATAAACTTATTAAGGAGGGTGAGGATTGGCAGAATGTAGTCTAAAGATATTGAGGTCAGGCCTTTTATCTTCACACTTGTCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGCGAAGAACCCCACCAT---TTCTCATAAGAAAACATTCACAAATGGCATTGATAAAGGGGT + +a +s mr.mrrefChr4 371 33 + 409 AAGGTTAGCCTAGGAATCTGTGTGTCCTGGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500313 33 - 636262 AAGGTTAGCCTAGGAATCTGGGTTTCCTGGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 132492 33 + 647215 AAGGTTAGCCTAGGAATCTGTGTGCCCTGGAAC + +a +s mr.mrrefChr4 404 5 + 409 GCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 500347 5 - 636262 GCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 132525 5 + 647215 GCACC + +a +s mr.mrrefChr5 0 98 + 294542 TTTCTAGTCTTGACTGATCTTTTCAAGAAGGTGTGAATTGTTTTCACTTTGACAACTAAAGTAAAATGCTCTGCCCACACCAAGCTCCAAGCCCATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136356 98 + 636262 TTTCTAGTCCTAACTGATCTTTTCAAGAAGGTGCGAGTTGTTTTCACTTTGACAACTAAAGTAAAATGCTCTGCCCACACCAAGCTCCAAGCCCATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 134116 98 + 647215 TTTCTAGTCTTGACTGATCTTTTCTAGAAGGTGTGAATTGTTTTCACTTTGATGACTAAAGTAAAATGCTCTGCCCACACCAAGCTCCAAGCCCATGC + +a +s mr.mrrefChr5 98 99 + 294542 AAGAACAAACACCTTAAGCAGAGACTTAATTGAACAGTTCATAAGTATGGGGCTTTCCCCCTCCCTGTCTCTATCTAGTTTTTTTGGCATCAACTTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136454 99 + 636262 AAGAACAAGCACCTCAAGCAGAGACTTAATTGAACAGTTCATAGGTATGGGGCTTTCCCCCTCCCTGTCTCCATCTAGTTTTTTTGACATCAACGTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 134215 99 + 647215 AAGAACAAACATCTTTAGCAGTGATTTAATTGGACAGTTCAAAAGTATGGGGCTTTCCCCCTCCCTGTCTGTATCTAGTTTTTTTGGCATCAACTCAAA + +a +s mr.mrrefChr5 197 104 + 294542 CCCAGGCCATAGCTGGCCTCTCATGATCAATAAATAAACATAATAAAACTTTAATTGCTAGCTAAGTTATCCTGGTGGCCAAGCAGTGTAGTTCTCACAGTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136553 104 + 636262 CCTGGGCCATAACTGGCCTCTCATGATCAATAAATAAACACAATAAGGCTTTAATTGCTAGCTAAGTTATCCTGGTGGCCAAGCAATGTTGTTCTCACAGTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 134322 104 + 647215 CCCAGGCCATAGCTGGCCTCTCATGATCAATAAACAAACGTAACAAAATTTTATTTGCTAGCTAAGTCACCCTGGTGGCCAAGCAGTGTAGTTCTCACACTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 301 86 + 294542 CCTCACCAGGGGCATGGTCATTGTACAGCTTCTGTCTTTGCCCTGTATGATCACCTTGCCTTTAAAAACTCCCAATCCTAATACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136684 84 + 636262 CCTCACCAGGGGCATGGTC--TGTACAGCTTCTGTCTTTGCCCTGTATGATCACCATGCCTTTAAAAACTCCCAATCCTAATACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 134426 86 + 647215 CCTCACCAGGAGGATGGGCATTGTACAGCTTCTCTCTTTGCCCTGTAAGATCACTTTGCCTTTAAAAACTCCCAATCCTAATACAT + +a +s mr.mrrefChr5 387 6 + 294542 GTGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136771 6 + 636262 ATGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 134512 6 + 647215 GTGGCT + +a +s mr.mrrefChr5 393 249 + 294542 CCCAATGTGTTAATTCTTATTTTATACACTTGAACTTACTCAGTGTATCACCAGCATGAGGTGAATAATTCCTCATTATTTTTTGCTGTGGCCTCTGGATGGATCTCTATGACCACATGTAAGAAGAGGCTGGGTCAATGAGATGGGCCCTGCATCAAATATATGGTCCATGAGATAGGACAACAAAAGTAGCCTTACAAAAGAAGTGCCAATAAATGGAAGCACAATAATGGAGTTGAATTTTGTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136783 175 + 636262 CCCAATGTGGTAGTTCCTATTTTATACACTTGAACTTGCTCAGTGTATCACCAGCATGAGGTGAATAATTCCTCATTATTTTTTACTGTGGCCTCTGGATGGATCTCTATGACCACATGTAAGAAGAGGCTGGGTCAACGAGATGGGCCCTGCATCAAATATATGGTCCCTGAGT-------------------------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 134518 246 + 647215 CCCAATGGGTTGATTCTTATTCTATACACTTATCCTTAC---ATGTATTACCAGCATGAGGTGAATAATTCCTCATTATTTTTTGCTGTGGCCTCTTGATAGGTTTCTATGACTACATGTAAGAAGAGGATGGGTCAATGAGATGGGCCATGCATGAAATAGATGGTCCATGAGATAGGACAACAAAAGTAGCCTTACAAAAGAAGTGCCAATAAATGGAAGCACAATAATGGAGTTGAATTTTGTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 642 120 + 294542 AGAAGGAGAGGGCTCAACATTAGGAAATGCTCTTTACCTTTAATATTTCTTATAGCACTCAGCTTAGGCCCAACACAAGTGTTCTGGTAGGCCTCTCTCTTGTATCGCAGGTGTGAACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 134786 120 + 647215 AGAAGGAGAGGGCTCAACATTAGGAAATGCTCTTTACCTTTAATATTTCTTATAGCACTCAGCTTAGGCCCAACACAAGTGTTCTGGTAGGCCTCTCTCTTGTATCGCAGGTGTGAACCC + +a +s mr.mrrefChr5 762 116 + 294542 CTGTGCTCACTCCTTCTCACCTTCCAGACATGTATTATTGTCATACTACAACCCAAACTATCTGGATCGGGGCTGCTACAACTTGTAGACAGGAGCTATGAGCCTAAGGCATTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137102 58 + 636262 ----------------------------------------------------------TATCTGGATCGAGGCTGCTACCACTTGTAGAAAGGAGCTATGAGCCTAAGGCACTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 134919 116 + 647215 CTGTGCTCACTCCTTCTCACCTTCCAGACATGTATTATTGTCATACTACAACCCAAACTGTCTGGACTGGGGCTGGTACAACTTGTAGGCAGGAGCTATGAGCCTAAGGCATTACA + +a +s mr.mrrefChr5 878 42 + 294542 ATATGCACTTGCTTGTGCATTTGGATGAGAGTAGATGTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137162 42 + 636262 ATATGCACTTGCTTGTGCATTTCGATGAGAGCAGATGTTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 135035 42 + 647215 ATACGCACTTGCTTGTGCATTTGGATGAGAGTAGATGTTGCA + +a +s mr.mrrefChr5 920 1 + 294542 G +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136958 1 + 636262 G +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137204 1 + 636262 G +s simRat_chr6.simRat.chr6 135077 1 + 647215 G + +a +s mr.mrrefChr5 921 12 + 294542 TATTACTGAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137205 12 + 636262 TTTTACTGAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 135078 12 + 647215 TATTATTGAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 933 86 + 294542 ATACATCTAGAGCATGCTCTGTGTGCTCCTCTTCTAATGGAGTGCAcagctaccaagttGTGCTCCTgttctaaTGGAGTGCACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 136959 54 + 636262 ATACATCTAGAGCATGCTCTGTGTGCTCCTCTTCTAATGGGGTGCA-------------GTGCTCCT------------------- +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137217 54 + 636262 ATACTTCTCGAACATGCTCTGTGTACTCCTCTTCTAATGGAGTGCA-------------CTGCTCCT------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 135090 86 + 647215 ATACAACTAGAGTGTGCTCTGTATGCTCCTGTTCTAATGGAGTGCACAGCTACCAAGTTATGCTCCTGTTCTAATGGAGTGCACAG + +a +s mr.mrrefChr5 1019 80 + 294542 CTAAGTTGATGCAGCACATTTCTTGTAGATAAGAGGCGACTTTCTAGTAAGTCATCAAATGCAAACTAATGAACTCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137013 79 + 636262 CTAAGTTGATGCAGCACATTCCTTGTAGATAAGAGGCGACTTTCTAGCAAGT-ATCAAATGCAAACCAATGAACTCAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137271 79 + 636262 CTTAGTTGATGCAGCACATTTCTTGTGGATATGCGGCGACTTTCTAGTAAGT-ATCAAATGAGAACTAATGAACTCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 135179 78 + 647215 CCAAGTTGAAGCAGCACATTTCTTGTAGATAAGAGGCAACTTTC--GGATGTCATCAAAGGCAAGTTGATGAACTCAATG + +a +s mr.mrrefChr5 1099 9 + 294542 TTAGATTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137093 9 + 636262 TTAGATTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137350 9 + 636262 TTAAATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 135257 9 + 647215 TTAGATTGT + +a +s mr.mrrefChr5 1108 33 + 294542 CTGTGCCCCATGTATATAAAGTAGTGCCATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137359 33 + 636262 CTGTGCCTCGTGTATATAAAGTAGTGCCATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 135266 33 + 647215 CTGTGCCCTATGTATATATAGTAGTGACATATG + +a +s mr.mrrefChr5 1141 67 + 294542 ACCAGCCTGACAAGTGCGTGACATATGGAATGAGAAAGACAAGGGTGCTAACACACAACATTTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137392 59 + 636262 GCCAACCT--------CGTGACATATGGAATGAGAAAGACAAGGGTGCTAACACACAACATTTTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 135301 16 + 647215 ATAAGAAAGACAAGTG--------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 1208 78 + 294542 AAGCCTCAGTTTTAGTTTCCTCAGGGCTATAAATATGGCGCGGAAGTAAACCTATAGTCAGGGCAAAGGAGCCTCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137457 78 + 636262 AAGCCTCAGTTTTAGTTTCCTCAGGGCTATAAATATGGCGCGGAAGTAAACCTATAGTCAGGGCAAAGGAGCCTCTAA + +a +s mr.mrrefChr5 1286 14 + 294542 TCCAGGAGATGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137536 14 + 636262 TCCAGGAGATGGAG + +a +s mr.mrrefChr5 1300 113 + 294542 TCCTTCTGACACAAAGGTCTGTCACTTTTATGGGGTGGCCACACTTATCCACTAACACACCCAGTTTTCCTTCCCTACTTGTACAAGTATATTTGACTTTCATATTCGGATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137552 113 + 636262 TCCTTCTGACACAAAGGTCTGTCACTTTTATGGGGTGGCCACACTTATCCACTAACACACCCAGTTTTCCTTCCCTACTTGTACAAGTATATTTGACTTTCATATTCGGATAG + +a +s mr.mrrefChr5 1413 927 + 294542 CCGAATGCAATGTATGGAGTATTCTCTATATATCCTCTGCATTAGGTGTCAGGGGCATTACATTGTTTTGGTACTGCCTGTAATCAGTGTAAAGATTCATGGGATCATGAGTAAGTACACAGTAGTATTTGATACAGACAAAGGCTCACCCCTGATGGAAGTAGAAGATGGGACAATTCTCTATGATAGTTCAGTGAATATTTGAGCTACTCAGTCTTAGCGTTCCTTACTTTAGTATACAGTAAACTTAGAGTATGAACCTAGCAAAACCCAAAAGAAACTAGATGTAACAGACATGTTACTTGGGTATCAAACTGTGTACATCTCTATCTAACTGCCCTCCGGATCCATGCCTTCTCAACACTACTTTGCACCCAGCTGTACTTTAGCCTTGTTAAGAGTCCAACTGCAGCATGTCCACAGCTGTTATCACCCATATAGGTCCCACAATGATATGGATTTTTGGGTGAAATGCCTAATAGTCTTCTTTGTCCTCAAAACGCCCACAGGGACCAACCATCATGATTTGACTGTCCCTCATAAAAGTACCTATAGACATTAACTGATGCAATTCAAGAATTCCACAGCAGGGCGAGGATAAGCAGGTGGGGTACCAAACAAAAGTATAGTAGACAGTATGTTTGATGACCAAGATCTCAAAGGTGTAGATACTTGATCACCACAATTAGCGATCAACACCAACTCAGTAGAGTAATGGGAAGTAGTGAGATCTTTTTAGGGTGATTAATAACAGTGTCCAGAATCTAACACCAAATGAACTAGAATCCTTTCGTGCTCCTGTTTCTTAGCGCATCAGTTCTAGCAAAGTAGCTAATTAGATTAGACTGGAGATAAACAGCCCCTTTTTACCATTCCTTTTAACATGACCTATACTGTGAGAAGGACTCAGTCGACTTACCTTATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 137673 925 + 636262 CCGAATGCAATGTATGGAGTATTCTCTATATATCCTCTGCATCGGGTGTCAAGGGCATTACAT-GTTTTGGTACTGCCTGTAGTCAGTGTAAATATTCATGGGATCAGGAGTA-GCACACAGTAGTATTTGATACAAACAAAGGTTCACCCCAGATGGAAGTAGAAGATGAAACAATTGACTATGATAGTTCAGTGAATGTTTGAGCTACTCAGTCTTAACATTCCTTACTTTAGTATATGGTAAACTTAGAGTATGAACCTAGCAAAACCCAAAAGAATCTAGATGTAACAGACATGCTACTTGGGTATCACACTGTGTACAGCTCTATCTAACTGCCCTCCAGATCCATGCCTTCTCAACACTACCTTACAACCAGCTGTACTTTAGTCTTGTTAAGAGGCCAACTGCAGCATGTCCACAGCTGTTATCACCCATATAGGTCCCACAATGATATGGATTTTTGGGTGGAATGCTTAATATTCTTCTTTGTCCTCAAAACGCCCACAGGGACCAACCATCATGATTTGACTGTCCCTCATAAAAGCACCTATAGACATTAACTCATGCAATTTAAGAATTCCACAGCATGGCGAGGATAAGCAGGTGGGGTACCAAACAAATATATTGTAGACAGTATGTTTGATGACTAAGATCTCAAAGGTATAGATACTTGATCACCACAACTAGCGATCAACACCAACTCAGAAGAGTAATGGGAAGTAGTGAGCTCTTTTTAGGGTGATTAATAACAGTGTCCAGAACCTAACACCAAATGCGCTAGAATCCTTTTGTGCTCCTGTTTCTTAGCGCATCAGTTCTAGCAAAGTCGCTAATTAGATTAGACTGAAGATAAACGGCTCCTTTTTACCATTCCTTTTAACATGACCTATACTGTGACAAGGACTCAGTCGACTTACCTGATAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 135317 878 + 647215 ---------------------------------------CACTAGGTGTCAGGGGCATTACCTTGTTTTGGTAATGCCTGTAATCAGC-TAAAGAGTCACAGGCTCATGAGTAAGTGCACAGTAGTATTTGATACAGACAAAGGCTCACCCCTGATGGAAGTAGAAGATTGGACAACTCTCGATGATAGTTCAGTGAATATTTCAGCTACTCGGTCTTAGTGTTCCTTACTTTAGTATACAGTACAATTAGAGTATGAACTTAGCCAAACCCAAAAGAAACTAGATGTAACAGACATGTTACTTGGGTATCAAGCTGTGTACATCTCCATCT--------TGCGGATCCATGCCTTCTCAGCACCACTTTGCACCTAGCTGTATTTTAGCCTTGTTAAGGGTCCACCTGCAGCATGTCCAGAGCTATTAGCACCCATATAGATCCCACAATGATATGGCTTTTTGGGTGAAATCCCTAATAGTCTTCGTTGTTCTCAAAACGACCACAGGGACAAAACATCATGATTTGACTGCCCCTCCTAAAAGTACCTATAGACATTAACTGATGCAACTCAAGAATTCCACAGCAGGGCAAGGATAAGCAGGTGGCATAACAGACAAAAGTATAGTAGACAGTATGTTTGATGACCAAGATCCCATAGGTGTAGATACTTGATCACCACAATTAGCAATCAACACCAACCCAGTAGAGTAATAGGAAGTAGTGAGAGCTTTTTAGGGTGATTAATAAGATTGTCCAGAATCTAGCACCAAAGGAACTAGAATCCGTTCGTGCTCCTGTTTCTGTGTGCATCAGCTCTGGCAAAGTAGCTGAT-AGACTAGATTGGAAGTAAACAGCCCCTTTTTACCATTCCTTTTAACATGACCTATACTGTGAGAAGGGCTCAGTAGACTTACCTTCTAGC + +a +s mr.mrrefChr5 2340 22 + 294542 TCATTCTTTGAATATAACCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138605 22 + 636262 TCATTCTTTGAATACCACCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 136195 21 + 647215 TCATTCTT-GAATATAACCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 2362 23 + 294542 ACAATTGGTAGTTGGACAGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138627 23 + 636262 TCAATTGGTATTTGGACAACACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 136219 23 + 647215 ACAATTGGTAGTTGGACAGCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 2385 17 + 294542 CTACCAATAATCTAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138651 15 + 636262 CTACCAATA--CTAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 136242 17 + 647215 CTCCCAATAATCTAGAG + +a +s mr.mrrefChr5 2402 122 + 294542 GGCAATTAGGACACAGTGAAAGTACAAGCGATATTTTATGTTCTATCTGCAATTGGTGCCAAGCTTGACTTGGTGACCCTTCTCTTGTTTAGTTAATCCTGGAGCCACCTTGGATAGCTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138667 122 + 636262 GGCAATTAGGACACAGTGAAAGTACAAGCGATATTTTATGTTCTATCTGCAATTGATGCCAAGCTTGACTTGGTGACCCTTCTCTTGTTTAGTTAATCCTGGAGCCACCTTGGATAGCTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 136259 114 + 647215 GGAAACTAGGACATGGGCAAAGTACAAGCAATATTTTATGTTCTATCTG------GTGCCAACCTTGACTTGGTGACCCTTGTCTTGTTTAGCTAATC--AGAGCCACCTTGGATAGCCATC + +a +s mr.mrrefChr5 2524 132 + 294542 ATAATAATACAATACAGTTAGACATGTAAGGATACTGTTATTCATCTGAGAACTTGTTTACCTTCATTCTTGGGGTTGGCATACCAGATGATAATAAATAGATATGAGCTAAACTGTGATTAAGATTGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138789 128 + 636262 ATAATAATACAATACAGTTAGACATGTAAGGATACTGTTATTCATCAGAGAGCTTGTTTACTTTCA----TGGGGTCGGCATACCAGATGATAATAAATAGATATGAGCTAAACTGTGATTAAGACTGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 136699 132 + 647215 AAAATGATACAATACAGTTAGAGATGCAAGAATACTGTTAATCATCTGAGAACTTGTTTACCTTCATTCTTGGGGTTGGTATACCAGGTGATAAGAAATAAATATGAGCTAAACTGTGATTAAGATTATTTT + +a +s mr.mrrefChr5 2656 134 + 294542 TGTCCTTTGCTCTGTTGTTTGGATTGAGTCCACGATGTTAATTACTGCTTGTGGCTAAACATAAATTTCCCATCTGAATACAAAATCAACTTTGTGTTCTTTCACTAACACCTCAATACAAAGTAATTACCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 138981 134 + 636262 TGTCCTTTGCTCTGTTGTTTGGATTGAGCCCACAATGTTAATAACTGCTTGTAGCCAAACATAAATTTCCCATCTGAACACAAAATCAACTTTGTGTTCTTTCACTAACACCTCAATACAAAGTAATTACCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 136831 131 + 647215 TGTCATTTGCTCTGTTGTATGGATTGAGTC---GATGTTAATTACTGCTTGTGGCTAAACATAAATTTCCCATCTGAATACAAAATCAACTTTCTGTTCTTTCTCTAACACCTCAATAGAAAGTAATTACCCAG + +a +s mr.mrrefChr5 2790 292 + 294542 ACTCTTTTTGATCCCAAAGGAACCTGTACTGTTCAAGGTTTTTTCCAACACAACAGAGGAGATGGTTGAGAAGGAGACAGTTAAGATATTTGTAGTATATCCAGACCCCCTATAGGCACCATTCGGCGTGCATGGAGAGCTTGTTTCTTTAGATTGACCTTTTATGCACGATTCAAGACAGTTTGCTGTCATCATTCATATATAACAGCTCCCCCCCACAAAAGGAAGAGGACCTTCAATCTAGCTGACTGCGCCACCATCTTTCAACATAATGTCACAATATTACCACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139115 286 + 636262 ACTCTTTTTAATCCCAAAGGAACCTG----GTTCAAGGTTTTTTCCAACACAACAGGGGAGATGGTTGAGAAGGAGACAGTTAAGATATTTGTAGTATATCCGGACACCCTATAGGCAC--TTCGGCGTGCATGGAGAGCTTATTTCTTTAGATTGACCTTTTATGTATGATTCAAGACACTTTGCGGTCATCATTCAAATATAACAGCTCCCCCCTACAAAGGGAAGAGGACCTTCAATCTAGCTGACTGCGCTACCATCTTTCAACATAATGTCACAATACTACCACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 136965 288 + 647215 ACTCTCTTTGATCCCAAAGGAGCCTGTACTGTTCAAGGTTAATTCCAACACAACAGATAAGACAGTTAAGAAAGAGATGGTTAAGATATTTGTAGTATATCTAGACCCCCTATGGGCACCATGGGGTGTGTATGGCGAGCTCGTTTCTCTAGGTTGATCTTCTATGCACAATTCAAGAAAGTTTGCTTTCATCATTCATATACAACAGCTCCCCCCCACAAAAGGAGGAGGACCTTCA--CTAGTTGACTGTGCCACCATCTATCAACGTCATGTCA--ACATTACCACATG + +a +s mr.mrrefChr5 3082 148 + 294542 GGTGGTGGGTCCGACTGTTATCCAATTGGCCTATGACAATTGCTGCCAAGGCTAAAGCTATTAGAAAGAGTGTTAAGATGTTGGCCATGTGTAACCAGGATACTTAAGAGAGTAACAAGCTGCACCGAGTCAAAACATGCAGGACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139401 148 + 636262 GGTGGTGGGTCCGACTGTTATCCAATTGGCCTATGACAATTGGTGCCAAGGCTAAAGCTATTAGAAAGAGTGTTAAAATGTTGGCCATGTGTAACCGGAATACTTAAGCGAGTAACAAGCTGCACCAAGTCAAAACATGCAGGACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 137257 145 + 647215 GGTGGAGGGTCCAGCTGTTATCCAATTGGCCTATGGCAAACGCTACCAAGGCTACAGGTATCTGAAAGAGTGTTAAGATGTTGGCCATGTGGAACCAGGATACTTAAGATAATAACAAACTGCACCGAGTCA---CATGTGGGACAAT + +a +s mr.mrrefChr5 3230 16 + 294542 GAGAGTCAACAAAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139550 16 + 636262 GAGAGTCAACAAAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 137402 16 + 647215 GAGAGTCAACAAAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 3246 27 + 294542 AAAAATTATGTTATTTAAAAGGTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139566 27 + 636262 AAAAATTATTTTATTTAAAAGGTAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 137419 27 + 647215 AAAAATTGTGTTATTTAAAAGGCAACT + +a +s mr.mrrefChr5 3273 188 + 294542 AAAGTCAATTACATTAAGTAACAAACCATGTGAGCCTTAAGATCCAAAGTAGATTCCTGAGACTCTATAATTAGGAAATAGAGTTCACAGCTGCGCCCTGCTCTTTAGGCCTATGAATGTCTACCACATAGTTGAGGCACAGTTGCCACAGACCCAAACATGGCCTCGGTGATGGAGTAGAAGCCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139640 185 + 636262 AAAGTCAATCAC--CAAGTAACAAGCCATGTGAGCCTTAAGATCCAAAGTAGTTTCCTGAGACTCTATAATTAGGAAATAGAGT-CACAGCTGTGCCCTGCTCTTTAGGCCTATGAATGTCTACCACATAGTTGCGGCACAGTTGCCACAGACCCAAACATGGCCTCGGTGATGGAGTAGAAGCCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 137446 187 + 647215 AAAGTCAATTACATTAAGTAACAAACCATGCGAGTGTTAAGATCCAAAGTAGATGCCTGAGACTCTTTAATTAGGAAAGAGAGTTCACAGCTGCGCCCTACTCTTT-GGCCTATAAATGTCTACCACATAGTTGAGGCACAGTTGCCACAGGCCTAAACATGGCCTAAGTGGTGGAGTAGAAGCCATC + +a +s mr.mrrefChr5 3461 14 + 294542 TGATGGCAACCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139826 14 + 636262 TGATGGCAACCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 137633 9 + 647215 TGAT-----CCATG + +a +s mr.mrrefChr5 3475 158 + 294542 GGCCCCTAGCTGAGTGGGCGTATTATGACAGTGGAAGTCGTTACTAGGTAGTCGACACAAAGCTGGAGATGAAGTTTACTTCTTATCTACATCCTCCTAATTTGTACTGAtccAATGCTCAATATCAAATTTGGATATATTGATGAGTGGGGGCTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139840 120 + 636262 --------------------------------------CGTGCCTAGGTAGTCGACAGAAAGCTGGAGACGAAGTTTACTTCTTATCTGCATCCTCCTAATATGTACTGATCCAATGTTCAATATCAAATTTGGATATATTGATGAGAGGGGGCTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 137701 153 + 647215 GGCCCCTAGCTGAGTGGGCGTATTATGACAGTGGAAGTCGTTACTAGATAGTACACACAAAGCTGCAGATGAACTTTACTTCTGATCTAcatcctcctaatttgtactgatccaatgctcaatatcaaatttggagTTAATGATGAGTGGGAG----- + +a +s mr.mrrefChr5 3633 18 + 294542 GCTGGCATCTCACCCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139961 18 + 636262 GCTGGCATCTCACCCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 137854 18 + 647215 ACTGGCATCCCAGGCTGG + +a +s mr.mrrefChr5 3651 34 + 294542 TATTCACTTGAGAAGTCACTCAAACAAAGTGGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 139982 34 + 636262 TATTCACTTGAGAAGTCACTCAAACAAAGTGGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 137872 34 + 647215 TGCTCACTTGAGAAATCACTCAAACATAATGGAA + +a +s mr.mrrefChr5 3685 153 + 294542 ACTTACACTCATGTCAGAAGTGGCTTGAACACCATTGAACACCTTACAAGCAACAAAGTAGGAAATGTAATTATTGAGTATAAAATCTATCAAGTAGCCAGTAGGTAGTATGGTTGAAGACTGCGTAAATAGTGTCTGTCAAATGTACATAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140016 153 + 636262 ACTTACACTCATGTCAGAAGTGGCTTGAACACCAATGAACACCTTACCAGCAACAAAGTAGGGAATGTAAATATTGAGTATAAAATCTATCAAGTAGCCAGGAGGTAGTATGGCTGAAGACTGCTTAAATAGTGTCTGTCGAATGTACATAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 137907 151 + 647215 ACTTACACTCTTATCAGAAGTGGTTAGAACACCATTGAACACCTTACAAGCGACAAAGTAGGAAATGTGATCATTGA--ATAAACTCTATCAAGTAGCCAATAGGTAGTATGGTTGATGACTGCGTAAATAGTGCCTGTCAAATGTACACAAT + +a +s mr.mrrefChr5 3838 104 + 294542 ATGAGGGGCTTTAATATACTCTACAGGTTATGCTTATGATACATTACTTAAGACTGGTCTTCTTGCTTGAAGAACACCCTCAAATCTGCATAATCAAAGACTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140170 104 + 636262 ATGAGGGGCTTTAATATAATCTACAGGTTATGCTTATGATACGTTACTTAAGACTGGTCTTCTTGCTTGAAGACCACCCTCAAATCTGCCTAATCAAAGACTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 138058 104 + 647215 ATGAGGAGCTTTGATATACTCTACAGGTTATGCTTATCATAAATTACTTAAGACTGGTCTTCTTGCTTGAAGAACACCCTCCAAACTGCAATATCAAAGACAGA + +a +s mr.mrrefChr5 3942 69 + 294542 TTGCTAGATTAATGGAGATTATTATGTATGGTATCCTACAGATGTATGAGTAACATTGCACTAATGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140274 55 + 636262 --------------GAGATTATTATGTACGGGATCCTACAGGTGTATGAGTAGCATTGTACTAATGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 138168 69 + 647215 TTGCTAGATTAATGGAGATTATTATCTATGGTATCCTACAGATGTATGAGCAACATTGCACTAATGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 4011 66 + 294542 TCCCTTGAAGCTTTTGGTCAAGGACCAGAAATTTTTTTGCCTGTGAGCACACTTAGGCAACCGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140330 66 + 636262 TCCGTTGTAGCTTTTGGTAAAGGGCCAGAAATTTTTTTGCCTGTGAACACACTTAGGCAACCGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 138237 66 + 647215 TCCCTTGAAGCCTTTGGTCAAGGACCAGAAATTTTTTTGGCTATGAGGACACTTAGGCAACAGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 4077 89 + 294542 TAGGTTACAAGCAATTGGCATAAGATTGGTCAGAGGCCGTTACTAGGATCCCTAGGCAAATGCTGGAGCTCACCATAGACATCTGTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140423 89 + 636262 TAGGCTACAAGCAATTGGCATAAGATTGGTCAGAGGCCGTTACTAGGATCCCTAGGCAGATGCTGGAGCTCACCATAGACATCTGTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 138303 89 + 647215 TGGGTTACAGACAAATGGCATAAGATTGATCAGAGGCCATTCCTAGGATACCTAAGCAAATGCTGGAGCTTATGATAGATATCTGTCCA + +a +s mr.mrrefChr5 4166 91 + 294542 GGAATGTGATGGTGGTACCAATTAACACTTCGATGGCTGAATGATTTAGGCTGGGCTCATTATTGCAACTGAATGACAATCTTATATTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140514 91 + 636262 GGAATGTGATGGTGGTACCAACTAACACTTCGGTGGCTGAATGATTTAGGCTGAGCTCACTATTGCAACTGAATGACAATCTTATATTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 138392 91 + 647215 GGAATGTGATGGTAGTACCAATTAACACTTAGATGGCTGAATGATTTAGGCTGGGCTCATTATTGCAGCTAAATGACAATCTTATATTTGG + +a +s mr.mrrefChr5 4257 249 + 294542 TCTGTAGCTAGACTTAGCTATAAAAATGATACAGCTGTCACAAAGAAGAATGGTTAAAGATGGAATTTTGTCTGTGGCCAAGGTGGTCACATAACAAAAAGTGAGTAAGTCAGATTAAACATGATGTAGGAACTACATACCATTTGAGCAAAGACATGCATAGTTACAGGAGACTGACATATCCCTGTGTGTGTGGACAGTACCTACACCTGGTGTGTATGGTTCTGAAGGCATAGAGTCGGGATTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140605 248 + 636262 TCTGTTGCTAGACTTAGCTATAAAAATGATACAGCTGTCACAAAGAAGAATGGTTAAAGATGGAATTTTGTCATTGGCCAAGGTGGTCACATAACAAAGAGTGAGTAAGTTAAATTAAACATGATGTAGGAACAACTTGCCATTTGAGCAAAGACATGCATAGTTAAAGGAGACTGA-ATATCCCTGTGTGTGTGGACAGTACCTGCACCTGGTGTGTATGGTTCTGAAGGCATAAAGTCGGGATTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 138487 241 + 647215 CCTGTAGCTAGACTTAGCTATAATAATGATATAGCTATCACAAAGAAGAATGGTTAAAGATGGAATTTTGTCTGAAGCCAAAGTG-TCACATAACAAAAATTGAGTAAGTCAGATTAAACATGATGTAGGTACTACAGACCATTTGAGCAAAGACATGCATGGTTACAGGAGACTGACATATACCTGTGTGTCTGGACGGTACCTACCCCTGGTGTCTATGGTTCTGGTATCATGGAGCCAG------- + +a +s mr.mrrefChr5 4506 171 + 294542 CCACACAAAGTACTGTGTTTTTGGCCACGAAACTGTCATTTGCTAAATCCCACCTGGCAACAAAGTTTTTCCCTCCTATGCACACCTTATAGCTGAAAAATCGTTCTACATATCAGTAGTTTCAGGTACTATCTGTGAAGTAATTACTGTACCAACACTGGGAAGCAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 140858 159 + 636262 CCACACAAAGTACTGTGTTTTTGGCCACGAAACTGTCATTTGCCAAATCCCACCTGGCAACAAAGTTTTTCCCTCCT--GCACACCTTATAGCTGAAAAATCGCTCCATATATCAGCAGTTTTAG-------CTGTTAAGTAATTACTGTACCAACA--GGGAAGTAAAG- +s simRat_chr6.simRat.chr6 138728 170 + 647215 -CACACCAGGTACTGTGCTCTTGACCACAAAGCTGTCATTTGCTAAGTCCCACCTGGCAACAAAGTTTTTCCCTCATATGGACACCTTATAGCTGAAAAATCATTCTACATATCAGTAGTTTCAGGTACTATCTATGGAGTGATTACTTTAACAACTCTGGGAAGCAAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 4677 90 + 294542 AGTGTATTCAAAATGTCTTCCTCTAACAGGGGCAATGGTGCTTTTGTATTATTAGATCATTATAGTCAATATCTTACACATATATTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141017 88 + 636262 --TGTGTTCAAAATGTCTCCCTCTAACAGGGGCAATGGTGCTTTAGTACTATTAGATCATTATAGCCAATATCTTACACATATATTTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 138981 90 + 647215 AGTGTATTCAAAATGTCCTGATCAAACAGGGGCAATGGTGCTTTTGCATTACTAAGTCATTAGAGTTGATATCTTACACATATATTTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 4767 271 + 294542 GCGCTTTCATACATGACTCAGTTTGTGGTAATGATGCACAAATCAACAGACAATTGAGTACAGGCCTTTTTACCATGGGCTTTTTATTTCATTGGCCAGCTATTCATTCACATCACCTTCCCTCATTAAGGGTCAACAGATGAGTACCAGTCTATGATTTGAGCTCCTTTCCTAAAGATAAATCAAATCCTGTGTGTTAATTAAGTGCTTCAATGCTCAAGCCTTTATTTAAGACCAATCATGCCGTTAGTCTGCATAGGTTTTTGATTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141110 264 + 636262 GTGCTTGCATACATGGCTCAGTTTGTGGTCATGATGCACAAATCAACAGATAATTGAGTACAAGCCTTTTTACCATG---TCTTTATTTCATCGGCCAGCTATTCA----CATCACTTTCCCCCATTAAGGGTCAACAGATGAGTACCAGTCTATCATTTGGGCTTCTTTCATAGAGATAAATCAAATCCCATGTGTTAATTAAGTACTTCAGTACTCAAGCCATTATTTAGGACCCATCATGCCGTTAGTCTGCATAAGTTTGTGATTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 139071 266 + 647215 GCACTTTCATGTATGACTTAGCTTGTGGTAATGATACACAAATCCACAGACAATTGAGTGCAGGCCTTTT-GCCATGGGCTTTTTATTTCATTGGCCAACTATTCATTCACATCACCTTCCCTCACTAAGGGTCAACAGATACGTACCAGTCTATGATTTGAGCTCCTTTCCTAAAGATAAATCAAATCCTGCTTGGTAATTAAGTGCTTCAATGCTTAACCCTTTATTTAA----AATCATACTGTTAGTCTGCATAGGTTTTTGGCTGG + +a +s mr.mrrefChr5 5038 111 + 294542 CCACCTTGTATCATTATGTGTTGTTGTACAGGACCTCCATGCTTCCGATATAAATACTCAGATGTTCAACCAATGATTAGGTTGAGCTTTCCCATGGAGCGACTCACTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141375 99 + 636262 CCACCTTGTATCATTATGTGTTATTGTACAGGACCTCCATGCTCCCGATGTCAATACTCAGTTGTTCAACCAATGATTAGGTTGAGCTTTGCCATA------------AAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 139337 109 + 647215 CTACCCCGTATCATCACCTGTTGTTGTGCAGGGTCTCCATG-TTCCCATATA-ACACTCAGATGTTCAAACAATGATTAGGTTGCCCTTCCCCATGGAGCGACTCACTAAG + +a +s mr.mrrefChr5 5149 120 + 294542 AACTTAGTCTACAAGGTGCTACTGACTATTTTCTATGTAAAATTCTTATGTTGGTCTAGAAATTCTTATCTTGATCTAGACAAACCCCATTATGACAGGATGTCCATATTACCAGAGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141474 120 + 636262 AACTTAGTCTACAAGGTGCTGCAGACTTTTTTCTATGTAAAATTCTTATGTTGGTCTAGAAATTGTTATCTTGATCTAGACAGACCCCATTATGCCAGGATGTCCATATTGCCAGAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 139448 120 + 647215 GACTTAGTCTACAAAGTGCTATTGACTATTTCCTATGTAAAATTCTTAAGTTGGTCTAGAATTCCATATGTTGAACTAGACAAACCCCATTATGAAGGGATGTGCATATTACCAGAGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 5269 391 + 294542 GATTATGTAAACCCCTACTCCCTCTTCAGTACAATTTTGTTCCTTACCCCAAACTGCCATTGTAGAAGGCTATTTCGCTACTATTCAATTGTCCCTTCCTCATGACCTTATGGATTCCACTGTAGTTATGATTACATTGCAGGTCATAAAGCTCTCGTTCCTTATTCGCCTGCATCACAGCACTTTGTTGATGCTGCATGTTGGTGTATGCCCAGCTTGGTGTATAATGTCTATGTGTACTGGTACATGGTGAGATGATGAGAAAAATATGGACAAATGTGAGTGCATACTGTGAAAGTCCGATAGGCCGGTTCTTAAGATCCCCATTCGCCACCCTATGACCTGAGGGTCCATAGACAGACAGCTGAATCAGCCTGCTCCAATACCCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141599 380 + 636262 GATTATGCAAACCCCTAATCCCTCTTCAGTACAATTTTGTTCCTTACCCT---------TTGTAGAAGGCTATTT-GCTACTATTCAATCGTCCCTTCCTCATGACCTTACAGATTCCACTGTCGTTATGATTACATTGCTGGTCATAAAACTCTCGTTACTCATTCGCC-GCATCACCACACTTGGTTGATGCTGCATGTTGGTGTATGCCCAGCTTGGCGTATAATGTCTATGTGTACTGGTACATGGTGAAATGATGAGAAAAATATGTACAAATGTGAGCACATACTATGAAAGTCCGATAGGCCAGTTCTTAAGATCCCCATTCACCACCCTATGACCTGAGGCTCCATAGGCAGACAGCTGCATCATCCTGCTCTAATACCCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 139568 388 + 647215 GATTATGTAAACCCCTACGCCCTCTTCAATCCAAGTTCGTTCCTTAGCCCAAACTGCCATTGTAGAAGGCTATTTCGCTACTATTCGATTGTCCCTTCCACTTGACCTCATGGATTCCACTGCAGCTAAGATTATCCCACAGGTCACAAAGCTACCGTTCATTGTTCACCTGCGTCACAGCACTTTGTTGATGCTGCATGTTGT---ATGCTCAGCTTGGTTTAGAATGTCTATGTGTACTAGTACTTGGACAGATGCTGAGAGAAATATGGACACATGTGAATGCAAACTGTGGAAGTCCAATAGGCCGGTTCTTAATATCTCCATTTGCCACCCTATCTCCTGAGTGTCCATAGACAGACAGCTGAATCAGCCTGCTCCAATACCCTTA + +a +s mr.mrrefChr5 5660 52 + 294542 CAACAATCTAGGGTTGGGTTCTGCTCCACAGACCAATTGGAAGATTAGCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 141982 52 + 636262 CAACAATCTAGGGTGGGGTTCTGCTCCACAGACCAATTGGAAGACTAGTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 139956 52 + 647215 CAACAATCTAGGGTTGGGTTCTGCTCCACAGACCAATTGGACGATTAGCATT + +a +s mr.mrrefChr5 5712 105 + 294542 ACCCTTGTGTTTACGTCATATGCTCAATTTTTTTATGTTGTGCTTGGTAGATGTGACATGCCCTAGCGGGTGTCAAAGTTAGATCCCGGTGGTGCCTGGGTGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 142326 105 + 636262 ACCCTTGTGCTTACATCATATGCTCAATTTTTTTATGTTGTGCTTGGTAGATGTGACATGCCCTAGCGGGTGTCAAAGTTAGATCCCGGTGGTGCCTGGGTGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 140008 94 + 647215 ACCCTTATGTTCACGTCATATGCTCAATTTATTTATGTTGTGCTTGGTAGATGTGACATGTACCAGCAGGTATCAAAGCAAGATCCTGGTGGTC----------- + +a +s mr.mrrefChr5 5817 6 + 294542 AGATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 142441 6 + 636262 AGATAA + +a +s mr.mrrefChr5 5823 149 + 294542 TCTGTTTTATTGTTATTGTATAAGTGCTTAGGGATTAGTGGTATCTCTGTCAGTCTTTCCCAGTCAGCTATAATCATGATCCAAAACTGGATGGACTGACATGTCTTCTTTTCTTCCAGCAGAAACTAATTGTAGGAGCACCAACACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 142450 149 + 636262 TCTGTTTTATTGTTATTGTATAAGTGCTTAGGGATTAGTGGTATCTCTGTCTGTCTTTTCCTGTCAGCTATAATCATGATCCACAACTGGATGGACTGACATGTCTACTTTTCTTCCAGCAGAAACTAATTGTAGGAGCACCAACAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 140102 149 + 647215 TCTGTTTTATTGTTATTGTGTAAGTGCTTAGGGACCATTGGTATCTCTGTCAGGCTTTCCCAGTAAGCTGTAACCATGATCCAAAACCGGATGGACTGACATGTCATCTTTACTTTCAGCGGAAACTAATTGTGGGAGCACCAACACAT + +a +s mr.mrrefChr5 5972 320 + 294542 CACCCAGCGTAAATACGGCCACTATCATGACCTAAGTCAGATCCTTATTTAGTTTATGATTGACCCAGTGGGCACTAGCATTCAGGGGCAGTCTAAACAATATTGCCTTGCGTGGTTCGGGCAAACTATGCAGGTGGAGCATTAAAACTCTGCTTCTATGTGACTACCAGGCTCTTGCTTAACAAAGTCGTAAGTATTAAAGCTTCTAAATTGAAATGCTGCATACATGAGGCAGGACCATGAGTGCAGTGAGAGGGGCAAACCATATGGCACAAACTTACTGAATTATTGAATTGTCTCAGTATGTCTCCACCCCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 142599 308 + 636262 CACCCAGCGTAAATACGGCCACTATCATGACCTAAGTAAGATCCTTATTTAGTTTATGATTGACCAAGTGGGCACTAGCATTCAGGGGCAGTCTAAACAATATTGCCTTACCTGGTACGGGTAAACTATGCAGGTGGAGCACTAAAACTTTGGTTCTATGAGACTAC-------TTGCTTAACAAAGTCGTAAGTATTAAAGCTTCTAAATTGAAATGTTGCACACATGAGGCAGGACCATGGGTGCAGTGAGAGGGGCAAACCATATAGCACAAACTTACTGGATTATTGAATTGTCTCAGTATGTATCCACAC----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 140255 316 + 647215 CACCCAGCTTAGATAAGGCCACTA----GATCTAAGACAGATCCTTTTTTATGTTATGATTGACCCAGTGGGCACTAGCATCCAGGGGCAGGTCAAACAATATTGCCTTGTGTGGTTCGGGCAAACTATTCAGGTGGAGCATGAAAACTCTCCTTCTATGTGACTACCAGGCTCTTGCTTAACAAAGTCAAAAGTATTAAAGCTTCTGAATTGAAATCCTGTATACATGAGGCAGGGCCATAATTGCAATGAGAGGGGCAAACCATATGGCACAAACCTACTGAATTATTGAATTGTATCAGTATGTCTCTGCCCCATTA + +a +s mr.mrrefChr5 6292 318 + 294542 TTCATGTCAGGGTACACTGGTAGTGATCAGCACTTTACCTGTCAACTCAACCTATTTTTGCTGAATAAACATCTGTATAACTAAAAATGTTGGGGGATTAAGTTATTCTCTAATAGGAGAAAACACCAAGTGCCATCTCATGGAAAGCAAAATGTGTAGAAATAAAAGAATCCATCTTTAGGAGTTATATGGCATCATGTAGACATTTAGGATCTAAGATATAACACAGACTATACCTGAAATAAGATGCCCCTTCATCATACATCCCTTAATCAAGTTTCATGCCATGGATTTGAATAGCCAGTTTATCCAAATGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 142907 318 + 636262 TTCATGTCAGGGTACACTGGTAGTGATCAGCACTTTACCTGTCAACTCAACCTATTTTCGCTGAATAAACATCTGTATAACTACAAATGGTGGGGGATTAAGTTATTCTCTAATGGGAGTAAACACCAAGTGCCATCTCATGGAAAGCAAAATGTGTAGAAATAAAAGAATCCATCTTTAGGAGTTATATGGCATCATGTTGACATTTAGGATCTAATATATAACACAGACTATACCTGAAATAAGATGCACCTTCATCATACATCCCTTAATTAAGTTTCATGCCATGGATTTGAATAGCCATTTTATCTAAATGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 140573 303 + 647215 TTCATGTCTGGGTACACTGGTAGTGATCAGCACTTTTCCTGTCAATTCAACCTATCTTTGCTGAATAAACATCTGCATAACTAAGAATGTCGGGGGATCAAGTTATTCTCTTATAGTAGAACACACCAAGTGCCATCCCATGGAAAA------------AAATAAAAGAATCCATCTTTAGAAGTTATATGGCATCATGTAGAAGTGTAGGATCTAAGATATAACA--GAATATACCTGAAATTAGAT-CCTCTTCATCATACATCCCTTATTCAAATTTCATGCCATGGATTTAAATAGTCAGTTTATCCAAATGTC + +a +s mr.mrrefChr5 6610 22 + 294542 ATAAACTGTAATAACAATTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143225 22 + 636262 ATAAACTGTAATAACAGTTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 140884 22 + 647215 ATAAACCACAATAACAATTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 6632 225 + 294542 GCTCCTTCTGAATAACCAAGCAAGCTTAAAGGACACAATAATTGTTAATCCCCTTAAACAAGATTGAAAACTTGATTTTAATTTGGTGTACATTTGAATGTCCATCTTCAATAAAGGGTATAGGGTTAAATATCGCATTTAGTATTATCTCTGACCATTTAGAATTTAATTGATGACAACTTCTTGCAGTGCATGGCAGTTTCTGGGTCTGATTGAACTCCTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143248 225 + 636262 GCTCCTTCTGAATAACCAAGCAAGCTTAAAGGACACCATAATTGTTAATCCCCTTAAACAAGATTGAAAACTTGATTTTAATTTGGTGTACATTTGAATGTCCATCTTCAATAAAGGGGATAGGGTTAAATATCGCATTTAGTATTAGCTCTGACCATTTAGAATTTAATTGATGACAACTTCTTGCAGTGCATGGCAGGTTCTGGGTCTGATTGAACTCCTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 140906 225 + 647215 GCTCCTTCTGGATAACCAAGCAAGTTTAAAGGACACAACCATTGTTAGTCCCCCTGAACAAGATTTAAAAGTTGATGATAATTTGGTGTACATTTGAATGTCCGTCTTCAATAAAGGGTATAATGGTAAATGTAGCATTTAGCGTTATCTCTTACCATTTAGAGTTTACTTGATGACAACTTCTTGCAGTGCATGGCAGTTTCTGGGTCTGATTGAACTCCTCTC + +a +s mr.mrrefChr5 6857 37 + 294542 TGGTACCTTCAGAGCCTGATTGGACTCCTCTCTGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143474 35 + 636262 TGGTACCTTCAGAGCCTGATTGGACTCCACTCTGG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 141131 37 + 647215 TGGTACCTTCAGAGTATGGCTGAACTCCTCTCTGGGT + +a +s mr.mrrefChr5 6894 78 + 294542 TTCGGATAACCTGATTTGTGTGAGATGGACAGCCTCCTGGACAGTCACCCCTTCAATTTGGTGCAATAATTGGAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143509 68 + 636262 ----------CTGATTTGTGTGAGATGGACAGCCTCTTGGACAGTCACCCTTTCAATTTGGTACAATAATTGGAGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 141171 78 + 647215 TTCGGATAACCTGATTTGTGTGAGATGGACTGCCTCCTGAACAGTCACCCCTTCAATTTGGTGCAATAATTGGAGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 6972 9 + 294542 CTTGTAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143577 9 + 636262 CTTGTAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 141253 9 + 647215 CTTGTAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 6981 10 + 294542 TCAGATTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143586 10 + 636262 TCAGATTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 141268 10 + 647215 TTAGATTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 6991 98 + 294542 CAATAAGTGGAGGTAGGGCACTTGCAGTGTTAGGGGACCTTCTGTGGAGCATGGTAGCACAAAATCCTAATAAAGGCTTAAGTGTGGGTAGGTTTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143601 98 + 636262 CAATAAGTGGAGGTATGGCACTTGCAGTGTTAGGGGACCTTCTGTGGTGCATGGTGGCACAAAATCCTAATATATGCTTAAGTGTGGGTAAGTTTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 141278 98 + 647215 CAATAATTGGATGTTGGGCACTTGCAGTGTTAGTGGACCTTCTGTGGAGCATGGTAGCACTAAATCCTAATAAAGACCTAAGTGTAGGTAGGTTTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 7089 334 + 294542 TTGGGAGGGCCTTGATTCAGATCATTCAAACTGAGGGCTGGGAGAGAGCTCCAGGGATCGGAAGGATTGGTACCCCATGCTGTACATTCAAGATATTTTTATAAAAAGTTAAAACAATAGAAAAAAATATACACAGTAGAGTGGGGGACCTGCCCTCAGATAAGATCTTGTTGGGTAGAGTCAATAGAAGCAGGTGGGCAAGAATTTTTAATAGTTCCTGGGTCACTAATGTGCTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCACAGGACAGTCAAATTCCACCTCTAACTATCATAGTAGTGTAAAAGTGGAGAATGTGCACTTAGTCTAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143704 334 + 636262 TTGGGAGGGCCTTGATTCAGATCATTCAAACTAAGGGCTGGGAGAGAGTTCCAAGGATCGGAAGGATTGATACCCCATGCTGTACATTCAAGATATTTTTATAAAAAGTTAAAACAATAGACAAAAATATACACAGTAGAGTGGGGGACCCGCCCTCAGATAAGATCTTGTTGGGTAGAGTCAATAGAAGCAAGTGGGCAAGAATTTTTAATAGTTCCTGGGTCACTACTGTACTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCACAGGACAATCTAATTCCACCTCTAATTATCGTAGTAGTGTAAAAGTGGATAATGTGTGCTTAGTCTAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 141376 333 + 647215 TTGGGAGGGCCTTGAATCAGATCATTCAAACTGAGGGCTGGGAAAGAGCTCCCGGGTTTGGAGGGATCGGTACCC-ATGCTGTACATTCAAGATATTTTCACAAAAAGTTGAAACAATAGAAATAAAGATACACAGTAGAGTGGGGGACCTGCCCTGAGATGAGACCTTCTTGGGTAGAGTCAATAGAACCCGGTGGGCCAGAATTTATAATAGTTCCTGAGTCACTAATGTGCTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCATAGGATGGTCAAGCTCGAACTCTAACTATCATAGTCATATAAAAGTGGAGAATGTGCATTTAGCCTAATT + +a +s mr.mrrefChr5 7423 34 + 294542 ATAAAGAAATCGAATTCCACCCTTTCTTAGCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144038 34 + 636262 ATAAAGAAATCGAATTCCATCCTTTCTTAGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 141710 34 + 647215 ATAAAGAAATCGAATCCCACCCTTTCTTAGCTTT + +a +s mr.mrrefChr5 7457 19 + 294542 AAAGGTATTCCATGTTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144124 18 + 636262 AAAGG-ATTCTATGTTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 141744 19 + 647215 AACGGTATTCCATGTTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 7476 72 + 294542 CCCCAAGTCACTTTTGTGTTATACCATCTCAATATACAGGTTAGATGATCTACTAATGCAAAGATCTGCGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144143 72 + 636262 CCCCAAGTCACTTTTGTGTTATACCATCTCAATATACAGGTTAGATGATCTATTAATGCAAAGATCTGCGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 141763 72 + 647215 CCCCAGGTCATTTTTGTGTTATACCTTCTCAATATACAGGCTAGATGATCTACTGATGCAAAGATCTGCACT + +a +s mr.mrrefChr5 7548 91 + 294542 TAAAACTGCTTTAATCTAAAAGTTTGGGGCGAGTGCTAATTTGTAAGGTCCCTCATGCCTCATCCATAGGATGCTAGATTTGTTGGACTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144215 90 + 636262 TAAAACTGCTTTAATCCAAAAGTTTGGGGCGAGTGCTAATT-GTAAGGTCCCTCATGCCTCATCCATAGGATGCTAGACTTGTTGGACTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 141839 91 + 647215 TAAAACTGCTTTAATCTAAAAGGTTGGGGTGAGAGCTAATTTGTAAGGTCCCTCATGCCTCATCTGTAGGATGCTAGATTTGTTGGACTTC + +a +s mr.mrrefChr5 7639 37 + 294542 CCCTATGTTACAATCAGTGAATTGTTGTCAGCAGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144305 37 + 636262 CCCTATGTTACAGTTAGTGAATTGTTGCCAGCAGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 141965 37 + 647215 CCCTATGTTACAATCAATGAATTGTCGTTAGCAGGGT + +a +s mr.mrrefChr5 7676 73 + 294542 TGTACACAGTCAATGGCAAGTCGTTTTATGAACTGTGACCACCATTAGAGGGTAGGCTATCTATAGTTCCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144342 73 + 636262 TGTACACAGTCAATGGCAAGTCGTTTTATAAAGTGTGACCCTCATTAGAGGGTAGGCTATCTATAGTTCCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 142003 73 + 647215 TGTACACAGTCAATCACAAGTCGTTTTATGAACTGTGACCACCATTAGAGGGTAGGCTATCTATAGTTACACA + +a +s mr.mrrefChr5 7749 21 + 294542 GAAGGCTATAGCCACACTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144415 21 + 636262 GAAGGCTATAGCCAGACTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 142079 21 + 647215 GAAGGCTACAGCCACTCTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 7770 25 + 294542 AAGGTTCACATTCAACTATCTGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144436 25 + 636262 AAGGTTCACATTCAACTATCTGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 142101 25 + 647215 AAGTTTCATATTCAACTATCTGCTC + +a +s mr.mrrefChr5 7795 541 + 294542 AGGCTGCCTTGCCATTATGTTTACCTTGTCCTATGACTCATTGTTGTGTGTGCAATGTCCTGTGACTGGTGTGCAAGGGAAGCCATAACACCTCTCAAATCCCATCATATGTCACATGCCATCATAGCTCATTCTTTCAAACTTCTGCTTTGGATGAATGTAGTTGTCCTTTGGAGCAAACAAATGCAAGGCAGGTATCCTGTGATCAATTTATTCTAAGTGGTCTCCCACTCATTAGCAGTGAATTCAGCTCCCTTGGACATCCTTTGGTCATCATTTTTCCTATAAAATGCTTTTTAATTTTGACAGGAAACACTAATGCCCTTATGTAGATTTGCTCTATTTGTAGGTATTGCGCACAGTACCCCAGTGAGAGTATTAGCCAACAGACATTGTGCTTGGTGAGTAGTACAGTTGAGGGGATTCATAACAATATATGGAGACTTCATCCTTTACCCTGCAATTATAATACCCAGCTAGCCTATCCCTATTTCAGGGGTGCTGTGCAAGAGGTCATGCATATAGGTAAAAAGCAGTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 144461 533 + 636262 AAGCTGCCTTGCCATTATGTTCACCTTGTCCTATGACTCATTGTTGTGTCTGCAATGTCCCGTGACTGGTGTGCAAGGCAAGCCATAACACTGCTCAAATCCCATCATATGTCACATGCCATCATAGCTCATTCTTTCAAACTTCTGCTTTGGATGAATGTAGTGGTCCTTTGGAGCAAACAAATGCAATGCAGGTGTCCTGTGATCAAT--------AGTGGTCTCCCACTCATTAGCAGTGAATTCAGCTCCCTTGGACATCCTTTGGTCATCATTTTTCCTATAAAATGCTTTTTACTTTTGACAGGAAACACTAATGCCCTTATGTAGATTTGCTCTATTTGTAGGTATTGCGCACAGTACCCCAGTGAGAGTGTTAACGAACAGACACTATGCTTGGTGGGTAGTACAGTTGAGGGGATTCATAACAATATATGGTGACTTCGTCCTTTGCCCTGCAATTATAATACCCAGCTAGCCTATCTCTACTTCAGGTGTGCTGTGCAAGAGGTCATGCATATAGGTAAAAAGCAGTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 142128 525 + 647215 AGGCTGCCTCACCATTATGTTTACTGTGTCCTGCGAGTCATTGTTGTGTGTGCAACGTTCTGTGACTTGTGTGCAAGGGAAGCCGTAACACCTCTCAAATCCAATCATACATCATATACCATCATACCTCATTTTTTCAGACTTTTACTTTGGATGAATCTAGTTGTTATTTGGAGTAAACAAATGCACGGCAGGTATCTTGTGATCAGTTTATTCTAAGTGGTTTCCCAATCATTAGCAGTGAATTCAGCCCCCTTGGACATGCCTTGGTCATCATTTTTCCTAAAAAATGGTTTTTAACTTTGACAGTAAACACTAATGCCCTTA----GATTTCCTCTATTTGTAGG-----CACGCAGTACCTTAGTGAGAGCATTAGCCAACAG-CATTGTGCTTAGTGAGTAGTACAGTTGAAGGGATTCATATCAATATATGGACACTTCATCCTTCACCCTGCAATTATAATAACCAGCTAGCCTATCCCTATTTGAGGGGTAATGTGCAAGTGGT------TATAGGTAAAAAGCAGTAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 8336 73 + 294542 TGGCTTCACCCTACAGTTAGCTCGAGCAGAAATCTGTCTATGTGTGTCCTTCCAACTGTTCTGGCTGGTACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145003 73 + 636262 TGGCCTCACCCTACAGTTAGCTCGAGCAGAAATCTGTCTATGTGTGTCCTTCCAACTGTTCTGGCTGGTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 142653 73 + 647215 CGGCTTCACCCTACAGTTAAGTCAAGCAGAAATTTGTCTATATGTGTCCTTCCACCTGTGCTGGCTATTACAA + +a +s mr.mrrefChr5 8409 41 + 294542 ATGAAGGTGAAACATCCTGCCAATCAGATATCATGCCTCGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145076 41 + 636262 ATGAAGGTGAAACATCCTGCCAATCAGATATCATGCCTCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 142735 41 + 647215 ATGAAGATGAATCATCCGGCCAACCCAATTTCATGCCTCAC + +a +s mr.mrrefChr5 8450 56 + 294542 CTCAACGGCACAGTAGGCATTTATTCATATGGAAAACTGGAATCTTGGGTTATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145117 56 + 636262 CTCAACGGCACAGTAGGCATTTATTCATATGGAAAACTGGAATCTTGGGTTATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 142780 56 + 647215 CTCAATGGTATGGTAGGCATTTATTGACATGGAAAACTGGAACCTTGAGTTATCAA + +a +s mr.mrrefChr5 8506 60 + 294542 CAAATATCTCCATGTCTTATCGTGTAAATGCCTGTAACTATCTGCATGTTGAATTTAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145193 60 + 636262 CAAATATCTCCATGTCTTATCGTGTAAATGCCTGTAACTATCTGCATGTTGAATTTAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 142836 60 + 647215 CAAATATCTCCACGCCTGATTGCGCCAATACCTGTAACTATCTGCATGTTCAATTCAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 8566 23 + 294542 AAGATGACTATAGTATTGAGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145254 23 + 636262 AAGATGACTATAGTATTGAGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 142896 23 + 647215 AAGATGGCTATTATATTGAGATG + +a +s mr.mrrefChr5 8589 85 + 294542 CAGTTGTGAACCCATACTGATTCTGAAGGGATAGATATACATTTCTGATCTCTTGACAGTGTGAGCTATCAATCTCATATATTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145278 85 + 636262 CAGTTGTGAACCCATACTGATTCTGAAGGGATAGATATACATTTCTGATCTCTTGACAGTGTGAGCTATCAATCTCATATATTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 142919 85 + 647215 CAGTTGTGAACCCATACCGCTTCTGAAGGGATACATATACGTTTAAGAGTTCTTGACATTGTGCACTGTCAGCCTCATATACTAT + +a +s mr.mrrefChr5 8674 46 + 294542 TCTTAGGGATCCAGGTCCATTTGCCACACAGCTAAGCAGCTATCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145363 46 + 636262 TCTTAGGGATCCAGGTCCATTTGCCACACAGCTAAGCAGCTATCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 143005 46 + 647215 TGTTAGGGATCCAGGTCAAGTTACCACACTGTTAACCAGCTATCCT + +a +s mr.mrrefChr5 8720 97 + 294542 GAAGATGGTTTGGTGTGTCTGTGCCCATTCTAAGTCTGTCGCTGCTGTACAAATAGTCCACTTAAAGCAGGTCACCTATACAATCTGCATGCTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145410 97 + 636262 GAAGATGGTTTGGTGTGTCTGTGCCCATTCTAAGTCTGTCGCTGCTGTACAAATAGTCCACTTAAAGCAGGTCACCTATACAATCTGCATGCTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 143051 97 + 647215 GAAGAGTGTTTGGTGTGTCTGTGCCCATTCTGAGTCTGTCACTGCTGTATGAACAGTCCACTTGAGGTAGGTCACCTATACAATCTGCATGCTTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 8817 32 + 294542 TAATGTGGGAATAATTCTTCAATGAGTACTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145508 32 + 636262 TAATGTGGGAATAATTCTTCAATGAGTACTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 143148 32 + 647215 TAATGTTGGAATAATTCTACAATGAGGACCAA + +a +s mr.mrrefChr5 8849 8 + 294542 GTTATATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145540 8 + 636262 GTTATATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 143208 8 + 647215 GTTATATC + +a +s mr.mrrefChr5 8857 12 + 294542 TGGTTGATACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145549 12 + 636262 TGGTTGATACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 143216 12 + 647215 TGGTCAGTACGG + +a +s mr.mrrefChr5 8869 94 + 294542 AGACTGAATCAAAGTCATTCACAATATAGGGCCCTTCTGGTGCCCACAGATTGAAGTCCATAATGATAATTATGGAAGACCACATGCCTGATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145676 94 + 636262 AGACTGAATCAAAGTCATTCACAATATAGGGCCCTTCTGGTGCCCACAGATTGAAGTCCATAATGATAATTATGGAAGACCACATGCCTGATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 143228 94 + 647215 AGACTGAATCAGAATTATTTATAATATAGGGCCCTTCTGGTGCCCACAGATTGAAGTCCATAGTGATAATTACGAAAGACCACATGCCTGATCT + +a +s mr.mrrefChr5 8963 186 + 294542 GCTCTTGAGGGATTCCAGCCTGAAGTATATTATTAAAGGTCAGGTCCCATAAACAGTGTAGTTGTAGAGGGAATACAAAAGTGTTCCATCATCATGCCATCTCCACAGATTTCCCAAGGTGTACCTTGCCAGCTGCAGAGTGCTATACCACAACTGTCTTCCTTCACATTAAAGTCCAACTTCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145777 164 + 636262 GCTCTTGAGGGATTCCAGCCTGAAGTATATTATTGAAAGTCAGGTCCCATAAACAGTGTAGTTGTAGGGGGAATACAATAGTGTTCCATCATCATGCCAT--------------------GTACCTTGCCAGC-GCAGAGTGCTATACCACAACT-TCTTCCTTCACACTAAAGTCCAACTTCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 143322 186 + 647215 TCTTTCAAGGGATCCAAGCCTGAAGTATATTATCAAAGGTCAGTTCCCATAAACAGTGTAGTTGTAGAGGGAATACCAAAGTGTTCCATCATCATGCCATCTCCACAGATTTCCCAAGGTGTACCCTGCCAGCTGCAGAGTGCTATACCACAACTGTCCTCTTTCACATTAAGGTCCAACTTCCTT + +a +s mr.mrrefChr5 9149 20 + 294542 TGTGACCAAGTTTCAACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145943 20 + 636262 TGTGACCGAGTTTCAACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 143508 20 + 647215 TGTGACCAAGTTTTAACATC + +a +s mr.mrrefChr5 9169 20 + 294542 TGAGTACTCAGTGAAACTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145964 20 + 636262 TGAGTACTCAGTGAAACTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 143528 20 + 647215 TGAGTATTCAGTGAAACTTA + +a +s mr.mrrefChr5 9189 276 + 294542 TACTTCTCAGTAAATTCTAATATTTGAGGCTTCAATATTGGTAGGCAGTGGGCGGACATCAGATCTGTGGGACTTGCAGGTAAGGTTAGGGTATAGTAAGAATTGCAGAACTGTAGTTACAGGAAATGATTTTGGTACAGTTTTGATCAGCTGGTTTTAATATTATTTTCATAGTGGTGTTTAGGCTACAACTGGTCATTTGTTTTTGCACACACTGGCAGGGAAGTTTGCTACTCTCTGTTGACACTGAGTAATGCCTATGATCTCCATATACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 145985 272 + 636262 TGCTTCTCAGTAAATTCTAATATTTGAGGCTTGCATATTGGTAGGTAGTGGGCGGACGTCAGATCTGTGGGACTTGCAGGTAAGGTTAGGATATAGTAAGAATTG--GAACTGTAGTTACAGGAAATGATTTTGGTACAGTTTTGATCAGCTGGTTTTAATATTATTTTCATAGTGGTGTTTAGGCTACAACTGGTCATTCGTTTTTGCACACACTGGCAGGGAAGTCTGCTACTCTCTGCTGACACTGAGTAGTGCCTATGATCTCAATATAT-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 143548 274 + 647215 TACTTCTTAGTAAAATCGAATACTTTAGGCTTCAATATTGGTAGGCAG-GGGCGGACATCAAATCTGTGGGACTTGCAGGTAAGGTTAGGGTATAGTAAGAATTGCAGAACTGTAGTTGCAGGAAATGATTTTGGT-CAGTTTTGATCAACTGGTCTTAATATTATTCGCATAGTGGTGTTTAGGGTACAACTGGTCATTTGTTTCTGCACACACTGGCAGGGAGATTTGCTACTCTCTGTTGACATTGAGTAATGCCTGTGATCTTCATATACAC + +a +s mr.mrrefChr5 9465 364 + 294542 TTGGAGGTTGTTAAACCCCATTACAGTTAACTGTCTCTTCATGCAACATAGCTATTTTCTGTATATCTTCCAAACTACCAGCTGATTTTCCAACTTCTTCCATCTAAAATGCTCATAAAGAAGCACAACTCAGAAGTGTACATAACCAGAGAAGGCACAGATCCCCTCATCATCTAAGCTAATGCATACCCCTATACTTCCCATGAATGTGCTGAAGACCATAGTAAAAGTCATAATGATGTTCCTGTCATATTTTTGTTGCCTCTCCTAGAAGGTTTGTCTTTTTGCCATGAATTTATTTCATCCTAATAATATAGACCTGTCCCTGTCATATTTTTGTTTCCCCTCCAAGAAGTTTTATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 146257 359 + 636262 TTGGAGGTTGTTAAACCCCATTACAGTTAACTGTCTCTTCATGCAACATAGCTATTTTCTTTACATCTTCCAAACTACCAGCTGATTTTCCAACTTCTTCCATCTAAAATGTGCATAAAG-----TAACTCAGAAGTGTACACATCCAGAGAAGGCACAGATTCCCTCATCATCCAAGCTAATGCCTAACCATATACTTCCCATGAATGTGCTGAAGACCATAGTAAAAGTCATAATGATGTTCCTGTCTTATTTTTGTTGTCTCTCCTAGAAGGTCTGTCTTTTTGCCATGGATTTATTTCATCCTAATAATATAGACCTGTCCCTGTCATATTTTTGTTTCCCCTCCAAGAAGTTTTATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 143823 352 + 647215 TTTGGGGTTGTTAAACCCCATTACAGTTAACCGTCTCTTCATGCAACATAGCTATTTTCTGTATGTCTTCCAAACTACCAGCAAAATGTGCA------------CGAAATGCTCATTAAAAAGCACAATTCAGAAGTGTACATAACCAGAGAAGGCACTGATCCCCTCCACATCTAAGCTAATGCACACCCCTAAACTTCGCACAAATGTCCTGTAGACCATAGTATAAATCATAACTATGTTCCTGTCAGATTTTTGTTGCCTCTCCTAGAAGATTTGTTTTTTTGGCATAAATTTATTTCATCCTAATAACATAGACATATTCTCATTATATTTTAATTGCCCCTCCAAGAAGATTTATCTT + +a +s mr.mrrefChr5 9829 65 + 294542 GAAAAAAGATGATCCTAGTCCCTAGGAACAGGAAGAAAAGTTTCCACTAGTACAGTTGCTTGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 146659 64 + 636262 GAAAAAAGATGATGCTAGTCCCTAGGAACAGGAAGAAAAGTTTC-ACTAATACAGTTGCTCGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 144175 60 + 647215 -----AAGATGATCCTAGTCTTTAGAAGCAGGAAGAAAAGTTTCCACGAGTACAGTTGCTTGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 9894 470 + 294542 CTGACACTCTTTAAGCTTTGAAGCCTATGTGGTTTCAAAACCACCACAGAGCCTTGATTATGATCTACCCTAGATTTACGTGCTCTAATCATGAACTTCCCCAATCTAAATGCTGCCAAGACTACAAACAGACTTTACTATGGATATGGGGATTTATCTAAAAATCTCTGAGCCATTAAGATGATTTTTTACTTTTATTGCTATACACAACCATGTTCTGGATGATCATATTAGTAACACAGACATACTAATAATTTTTACCTCTTATATAACTAAGATTTTTCTATCTAACATACGTTATTCTGTAAGGCACTTAGTCCTTAAATTCTATGTTCATCATTACCAGGATCATGATGTAATACTCTTATTTACCATGTACTAGACATCAATACCACAAATATAACTATGACTGCCAACAGGCTAGGATGCATTCTTTTGACCTCCCATCCCTACAGGGGACATAAAGTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 146728 470 + 636262 CTGACACTCTTTAAGCTTTGACGCCTATGTGGTTTCAAAACCACCACAGAGCCTTGATCATGATCTACCCTAGATCTACGTGCTCTAATCTTAAACTTCCCCAATCTAAATGTCATCAAGACTACAGACAGACTTTACTATGGATATGGGGATTTATCTAAAAATCTCTGAGCCATTAAGATGATTTTCTACTTTTATTGCTATACACAGCCATGTTCTGGATGATCATATTAATAACACAGACATACTAATAATTTTTACCTCTTATATAACTAAGATTTTTCTATCTAACATACGTTATTCTGTAAGGCACTTAGTCCTTAAATTTTATGTTCATCATTACTAGGATCATGATGTAATACTCTTATTTACCATGTACTAGACTTGAATACCACAAATATAACTATGACTGCCAACAGGCTAGGATGCATTTTTTTGGCCTCCCATCCCTACAAGGGACATAAAGTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 144235 464 + 647215 CTGACACCCTTTAAGCTTTGAAGCCTATGTGGTTTCAAAACCACCACTGAGCCTTGATTACGATCTACCCTAGATTTATGTGCTCTAATCATGAAAATCCCCAACCTAAATGCTGCCAAGACTACAAACAGACTTTCCTATGGATATGAGGATTTATCTAAAAGTCTCAGAGCCTTTAAGTCAATTTTTTACTTTTATTGCTATACACAACCATGTTCTGGATGATCATGTTAGTAAAACAGGCATACTAATAATTTTTACTCATTATATAACTAAGATTTTTCTATCTAACATGAGTCATTCAGTAAGACACTGAGTCCTTATATTCTATGTTCACCATTACCAGGATCAT------ACACTCTTATTTACCATGTACTAGACATCAATACCACAACTATAACTATGACTGCCAACAGGCCAGAACGCATTCTTTCGACCTCCCATCCCTACAGGGGGCATAAAGTAAG + +a +s mr.mrrefChr5 10364 54 + 294542 GCATCATACATCCCTATTATTTGAGGTAGCTCATTGTATGCTGAAGGAAAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147199 54 + 636262 GCATCATACATCCCTATTATTTGAGGTAGCTCATTGTATGCTGAAGGAAAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 144699 54 + 647215 GCCTCATACATCCCTATTATTTGAGGTAGTTCATTGCGTCCTGAGGGAAAAATT + +a +s mr.mrrefChr5 10418 59 + 294542 AATTCTTATCTAGCACTTGCCCGATGCTGTGAAGATGTTACTATCAACTTGTAACCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147253 59 + 636262 AATTCTTATCTAGCACTTGCCCGATGCTGTGAAGATGTTACTATCAACGAGTAACCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 144754 58 + 647215 AATTCTTATCTAGTACCTGCTCGATGACGTGAAGATGTTACTATCAACTTGTA-CCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 10477 17 + 294542 ACAGTATGTGAAGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147313 17 + 636262 ACAGTATGTGAAGCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 144812 17 + 647215 ACAGTCTGTGAAGTCAC + +a +s mr.mrrefChr5 10494 59 + 294542 CTCCATTTGTAGGTGCCACCACTTACAGTAGCAACTTGTGCAACTGTAGGTGGTAGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147330 57 + 636262 CTCCATTTGTAGGTGCCACCACTTACAGTAGC--CTTGTGCAACTGTAGGTGGTAGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 144831 59 + 647215 CTCCATTTGTAGGTGCCATCACTTACCGTAGCAACTTATGCAAATGTAGGTGGTAGGTT + +a +s mr.mrrefChr5 10553 262 + 294542 ACTTAAGCAATTAGCTTGGAATGTGGAGGCATTATTGGTTATCATGAGTGATGCATGACACAAGACTGTTAACAGTAGCAACTTGACTGCAATTATAGATTGCCCTACGTGGTACAAGCCCTTCACAGACAAGCCCCTATGACTCTGATGAAACAAAAATAAGAATAATTATATCAGTGTATGAGAAGTACCTGCATGAGTTATCCCATTGTATACCCACTGAACTGTTATACCTCCTGGTTCTCTGGTCTTAGTGACTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147387 262 + 636262 ACTTAAGCAATTGGCTTGGAATGTGGAGGGATTATTGGTTATCATGAGTGATGCATGACACAAGACTGTTAACAGTAGCAACTTGACTGCAATTATAGATTGCCCTACGTGGTACAAGCCCTTCACAGACAAGCCCCTATGACTCTGAAGAAACAAAAATAAGAATAATTATATCAGTGTATGAAAAGTAACTGCATGAGTTATCCCATTGTATACCTGCTGAGCTGTTATACCTCCTGGTTCTCTGGTCTTAGTGACTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 144891 245 + 647215 ACTTAAGCAATTAGCTCGGAATGTAGAGGCATTATTGGTTATCATGAGTGATGCATGATACAAGACTGATAATAGTGGCAACGTGATTGCAATTATAGATTGCCCTATGTGATATAAGCCCTTCACGGACAACCTCCTATGGCTCTGATGAAAAAACAATAAGAATCATTACATCACTGTATGAGAAGTACCTGCAGGAGTTATCCCATTGTATACGCACTGAACTGTTGAACCTCCTGGTTCTC----------------- + +a +s mr.mrrefChr5 10815 3 + 294542 CAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147650 3 + 636262 CAT + +a +s mr.mrrefChr5 10818 4 + 294542 ATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147654 4 + 636262 ATCC + +a +s mr.mrrefChr5 10822 23 + 294542 GAAATGCCTATCAACAGGTGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147663 23 + 636262 GAAATGCCTATCAACAGGTGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 145136 23 + 647215 AAAATGCCTACCAACAGTTGAGC + +a +s mr.mrrefChr5 10845 15 + 294542 ACATGGTACACAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147686 15 + 636262 ACATGGTACAGAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 145161 15 + 647215 ACATGGTACACAATA + +a +s mr.mrrefChr5 10860 147 + 294542 GCTTTAATGATATGGTTCTGCATTGAGTGCATCTAAGGGTCTGCTTGATACGGGCTAAGGTGGTATAACATTAGTCAAAGTATGAGCCCAAAAGCCCAAACTTGTGAAGCGATCTATACTCTGTAGATGATTCATAAGGTACACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147701 147 + 636262 GCTTTAATGATATGGTTCTGCATTGAGTGCATCTAAGGGTCTGCTTGATACGGGCTAAGGTGGTATAACATTAGTTAAAGTATGAGCCCAAAAGCCCAAACTTGTGAAGCGATCTATACTCTGTAGATGATTCATAAGGTACACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 145177 121 + 647215 GCTTTAACTATATGGTTTTGCATTGTGCGCATCTAAGGGTCTGCTTGGCACAGGCTAAGGTGGTATAACATTCGTCAAAGTAT--------------------------TGACCTATACTATGTAGAATATTCATAAGGTACACAAC + +a +s mr.mrrefChr5 11007 78 + 294542 TGGCTGAGTACCCTTTGGAGGACCCATAAAGTATACAACAAATAGCTGCGTCCTTTTCTTAGTGGCATTGCTGTGCGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147848 78 + 636262 TGGCTGAGTACCCTTTGGAGGACCCATAATGTATACAACAAATAGCTGCGTCCTTTTCTTAGTGGCATTGCTGTGCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 145301 77 + 647215 TGGCTGAGCACCCCTTGGGGGACCTATAAAGAATACAACAAATGGCTGTGTCCCTTCCT-AGTGGCATTGCTGTGCTC + +a +s mr.mrrefChr5 11085 61 + 294542 TAGTGTACACTAGTAGGGTGCCAGCTCCTCCTAGGTAGCTGCTATCTGGGAAAGCTGGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147927 61 + 636262 TAGTGTACACTAGCAAGGTGCCAGCTCATTCCAGGTAGCTGCTATCTGGGAAAGCTGGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 145378 61 + 647215 TAGTGTATGCTAGTAGGGTGCCAGCTCCTCCTAGGTAGCTGCTACCTGGCAAAGCTGATTA + +a +s mr.mrrefChr5 11146 308 + 294542 TGGGTAGGTACCAGGTGACTGTAAAACATTACGAAATGTATGTAGAGACAGGGCCTGCTTTTGTTTGCTCTAGAGCCTAGGGCTGTTAATGCAGTCCCTGGTTGAGACCTCTCACAGAGCAAATGATGTTCTTTTCATATATACCTACAATTAACATTAGTTTTGCCCTACACTACTTGCAGAATATGGTGGGCTTCTAAGAAATTCCGCACCACAATGCTTTATATCAACGAAGGGATCTGGTGTTCAAGCAGAGTGAGAATCCCCAAGGTAGACAAATCCTTGTTACAACATCTTTACCTTATAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 147991 294 + 636262 TGGTTAGGTACCAGGTGACTGTAAAACATTACGAAATGTATGTAGAGACAGGGCCTGCTTTTGTTCACTCTATAGCCTAGGGCTGTTAGTGCAGTCCCTGGTCGAGACCTCCCACAGAGCAAATGATGTTCTTATCATATACACCTACAACTAACATTAGTTCTGCCCTACACTACTTGCAAAATATGGTGGGCTTCTAAGAAATTCCACACCACAATGCTTTATATCAACGATGGGATCTGGTGTTCAAGCAGAGTGAGAATCCCCAAGGTAG--------------CAACATCTTTACCTTATAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 145439 299 + 647215 TGGGTAGGTACCAGGTGACTGTGAAACATTACGAAATGTT--------CAGGGCCTGCTTTTGTTTGCTCTAGAGCCTAGGGCTGTGAATGCAGTCCATGGTTGGGACCTCTCACAGAGGAAATGATGTTCTATTCATATTT-CCTACAATTAACACTAGCTTTGGCCTACACTACTTGCAGTATATGGTGGGCTTCTTAGGAATTCCGCACCACAACACTTTATATCAACGAAGGAATCCGGTGTTCAAGCAGAAAGAGAATCCCTGAGGTAGACAAATCCTTGTTACAACATCTTTACCTTATAAG + +a +s mr.mrrefChr5 11454 129 + 294542 TAGGGGGCATGTGGACCAATTCTACTGGGTATAAGTATTGGGTTTCTTGCATAATAGGCTATTCACACCAGTTAACTGTTTTTGTGTTGATCAATTTCTAATAGCTCATTACCGTTAAACTGTAAAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148285 125 + 636262 TAGGGGGCATGTGGACCAATTCTTCTGGGTATAAGTATTGGGTTTCTTGCATA----GCTATTTACACCAGTTAACTGTTTTTGTGTTGATCAATTTCTGATAGCTCATCACCGTTAAACTGTAAAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 145741 129 + 647215 TAGCAGGCCTCTGGATCAATTCTATTGGGAATGAGTATATGGTTTCTTGCATAATAGGCTATTCACACCAGTCAACTGTTTTTGTGTGTATCAATTTCTAATAGCTCGTTACTGTTAAACTGTAAAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 11583 85 + 294542 TGCAAACCATAAGCATAGGGAGCTAGAGTTTCTGCATGTATAAGTTTAACATGCTGAGATCATGTGGTGATGCATCATGGTTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148411 81 + 636262 TGCAAACCATAAGCATAGGGAGCTAGAGTTTCTGCATGTAGAAGTTTAACATGCTGAGATCATGTGGTGATG----ATGGTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 145870 85 + 647215 TGCAAAGCATAAACATAGGGAGCCAGAGTTCCTGCATGTATAAGCTTAACATGCTGAGATCACATGGTGTTGCATCAAGGTCGTA + +a +s mr.mrrefChr5 11668 81 + 294542 TCCTGTGGGAAAAGTTGTAAGCTTGGTGGGCATTTCTTTGACATGCAATTTTTCATACCTAAAGGACAAGATTTATCACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148492 60 + 636262 TCCTGTGGGAAAGGTTGTAAGCTTGGTGGG---------------------TTCATACCTAAGGGACAAGATTTATCACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 145956 81 + 647215 TCCTGTGGGAAAAGTTGTAAGCTTGGTGGGCATTTCTTTGACATGCAATTTTTCATACCTAAAGGACAAGATTTGTCATGA + +a +s mr.mrrefChr5 11749 168 + 294542 GCACACTCAATTTTACTAAGTTATACAGTCCATTAACTCAAGAAGGATTGCATTAACTTGGGCCCAAGATTTACGGAGGATAGCAATTGTGGTACAGAGCCTAGTGGGCATAATTAGTCATAAATTTGGAAGCCTAGTAAACACAAGGGAAACACAGAACATGACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148552 168 + 636262 GTACACTCAATTTTACTAAGTTATACAGTCCATTAGCTCAAGAAGGATTGCATTAACTTGGGCCCAAGATTTACGGAGGATAACAATTGTGGTACAGAGCCTAGTGGGCATAATTAGTCATAAATTTGGAAGCCTAATAAACACAAGGGAAACACAGAACATGACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 146040 165 + 647215 GCATACTCAATTCTACTAAGTTATACAGTGTATGAACTTAAGAATAATTGGATTAATTTGGGCCCAAGATTGAGGGAGGATAGCAATTTTGGTACAGAGCCTAG--GGCATAATTAGTCATGA-TTTGGAAGCCTAGTAAACACAAGGGAAACATGGAACACGACAAT + +a +s mr.mrrefChr5 11917 87 + 294542 CATAACTATGAAACCATGGGCTAGTTACAAGGGCAATTGTCAGAAACCCTGGAGTCCTATAATCACACTTGTATATGTACACAATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148737 87 + 636262 CATAACTATGAAACCATGGGCTAGTTACAAGGGCAATTGTCAGAAACCCTGGAGTCCTATAATCAGACTTGTATATGTACACAATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 146205 86 + 647215 CATAACTATGAAACCATGGGCTAGTCATAAGG-CCATTGTCAGAAACCCTGGAGTCCTATAATCACACTTGTACATGTATACAATCC + +a +s mr.mrrefChr5 12004 271 + 294542 TAAATAGAGACCGTGGCAGCCATAGGACCTCAACTTTGCTATCCCTGAGACATAGGAATACGTTGGCCCTATCTTCCAACCTAGGCTTGATGAATTACTCATTATAGAGCCTTTCATACGCATAATTATTTCCATACAATTTGACACAGTCAAATTTCTTGACTATTTGACTTCATGGGCAAAAAGGAGATGTAGATTACTCTCAGCAATTACCTGGGCAAAGAGGCACTGGACCTTGCTGGCATGGATAAAAACTGTCAGACAATTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148825 233 + 636262 TAAACAGAAACCGTGGCAGCCATAGGACCTCAACTTTGCTGTCCGTGAGACATAGGAATGCGTTGGCCCTATCTTCCAACC----------------------------------ATACGAATAATTATTTCCATACAATTTGAGACAGTCAAATTTCTTGACTATTTGACTTCATGGGGAAAAAGG----GTAGATTACTCTAAGCAATTACCTGGGCAAAGAGGCACTGGACCTTGCTGGCCTGGATAAAAACTGTCAAACAAATAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 146291 268 + 647215 TAAATAGAGACCATGTCAGCCATGTGCCCTCAACTCTGCTATCCCCAAGACATAGGAATACATTGGGCCTATCTTCCAACCTAGGCTTGATGAATTACTCATTATAGAGCCTTTCATACACATAATTATTTCCATGCAATTTGACACAGTCAAATTTGTTGACTATTTGACTTTATGTGCAAAAAGGAGATGTAGATTACCCTCAGCAATTACCGGGGTAAAGACGCACTAGACCTTGCTGGCAC---TAAAGACTGTTAGACAATTAACT + +a +s mr.mrrefChr5 12275 122 + 294542 GGCCAGAGCTGATGTGTGGTAATTTTTATTGCACGGATGAATCATTCTCCACTCGGTTTAGCTGGGGCAAATTCTTTGATATACCCAATAAGCATTTTTGTCATATTTACTATCCTCTTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149059 122 + 636262 GGCTAAAGCTGATGCGTGGTAATTTTTATTGCATGAATGAATCATTCTCCACTCGGTTTAGCTGGAGCAAACTCTTTAATACACCCAATAAGCATTTTTGTCATGTTTACTATCTTCTTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 146559 122 + 647215 GGCCAGAGCTGATGTGTGTCAATTTTTATTGCACGGATGAACCATTCTCCACCCAGTTTAGCCTAGGCAAATTCTTTGATATGCCCAATAAGCATTTTTGTCATACTTACTATCCTCTTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 12397 90 + 294542 ATGACATTGTAGAAATGTGACAACTGGGGACTGGGGGCCTGCTGAGGGCCAATACACTGACAGCTGCTGGATACACCATATTGAATCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149181 90 + 636262 ATGACATTGTAGAAATGTGACAACTGGGGACTGGGGGCTCGTTGAGGGCCAATGCACTGACAGTTGCTGGAGACACCATATTGAATCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 146684 90 + 647215 ATGACAATGTAGAAATGTGAGAGCTGGGGCCTGGGGGCCTGCTGAGGGGCAATACACTGACAGCTACTGGATACACCATATCAAATCACA + +a +s mr.mrrefChr5 12487 140 + 294542 CAGTACTATTACTATTCTTCTCAGATTAGTGAGCAGAATGTTACTACAGCCAAGGGTCTCCATCATAATTCTATATGGTTCAATCCTTGTAAAATGCATGCCCCATCTGAATTTAAACAAATACATGCTTTAGTATGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149272 135 + 636262 CAGTACCTTTACTATTCTTCTCAGATTATTGAGCAGAATGTTACTACAGCCAAGGGTCTCCATCATAATT-TATATGGTTCAAGCCTTGTAAAATGCAG----CATCTGAATTTAAACAAACACATACTTTAGTATGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 146774 139 + 647215 CAGTACTATTACTATTCT-CTCAGATTAGGGAGCAGAGTGTGGCTACAGGCAAGGGTGTCCATCATAATTCTATATGGTTCAGTCCTTGTAAAATGCGTGCCCCATCTGGATTTAAACAAATACACGATATAGTATGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 12627 20 + 294542 TATGCCTGGGTCAAAATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149407 20 + 636262 TATGCCTGGGTCAAAATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 146994 20 + 647215 TATGCCTGGGTCAAAATTCA + +a +s mr.mrrefChr5 12647 277 + 294542 AGTTACATCTCAGATAGAGGGGGCATCTAATTTGACTTGTGTATGATGCCATAGAAAGATGTCTTATGGATAGTGCAATCTTATGAACACCACCTGGAGACATCCCAGTTTTCCCTGACTTGAAGCACCTCAGATAATGCCCCTGAGAAAAGACTGGCTAACACTAACACATGAGACCTGAATGTTGCTCTCTGTGTCATGGTTCAGCATGTTCTATTATCCAAGTGGTGTCAGTTAGGGAGTTTGGGTTGTAAGCGGGTTTGATGGCAAGGGACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149434 271 + 636262 AGTTATTTCTCAGATAGAGGGGGCATCTAACTTGACTTGTGTATGATGTCATAGAAAGATGTCTTATGGATAGTGCAGTCTCATGGACACCACCTAGAGACATCCCAGTTTTCCCTGACTTGAAGCACCTCAGATAATGCCCCTGAGAAAAGACTGGTTAAC------ACATGAGACCTGAATGTTGCTCTCTGTGATATGGTTCAGCATGCTCTAATATCCAAGTGGTGTCAGTTAGGGAGTTTGGGTTGTAAGCGGGTTTGATGGCAAGGGACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 147014 277 + 647215 ATTCCCATCCCAAAAATAGGGGGCATCTAATTTGACTTGTGTATGTTGCTATAGAAAGATGTCTTATAGAAAGTGCAATCTTATGAACACCGCCTGCAGACATCCCAATTTTCCCTGGCTTGAAGTACCTCAGATAATGCCCCTGGGAAAAGTCTGGCTAACACTAACACATGAGGCCTGAGTTTTGCTTGCTGTGTCATGGGCTAGCATATGCTATCATCCGAGTGTTGTCAGTTAGGGAGTGTGGGTTGTGAGCGGGTTTGATGACAAGGGATAG + +a +s mr.mrrefChr5 12924 120 + 294542 AATCCTGGGCTTGATAGCAAGGGACAGGCTCCCATATGCACATCATGTTATTAAAATCTATCCCTCGGAGCTCAATTCATTACTGAGGCAATAAATCATCCCTCCTGTGTGTAGAAGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149705 120 + 636262 AATCCTTGGCTTTATAGCAAGGGACAGGCTCCCATATGCACATCATGTTATTAAAATCTATCCCTCGGAGCTCAATTCATTACTGAGGCAATAAATCATCCCTCCTGTGTGTAGAAGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 147297 120 + 647215 TATCCTGGGCTTGATGGCATGGGACAGACTCCCATATATGCAACATGTTACTTAACTCTATCCCTTGGAGCTCAATTCATTACTGAGGCATTAAATCATATCTTCTGAGTGTACATGATC + +a +s mr.mrrefChr5 13044 82 + 294542 TGCCACAGTTCACAAATGCTCAAAATTCAATGGGCAGCATGTACTTAGTCATGGTTAAAGTGATTTCATGCTATACCTTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149825 60 + 636262 TGCCACAGTTCACAAATGCTCAAAATTCAATGGG----------------------AAAGTGATTTCATGCTATACCTTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 147423 82 + 647215 TTCCACAGCTTACAAATGCTGAAAATTCCATGGGCAGCATGTACTTAGTCATGGTTAAAGTGATTTCATGCTCTACGCTCGG + +a +s mr.mrrefChr5 13126 34 + 294542 CATGACTGGAACTGGGATGAGAAATGCTATGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149886 34 + 636262 CATGACTGGGAATGGGATAAGAAAAGCTATGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 147505 34 + 647215 CATGACTGGAACTGTGATGAGAAATGATGTTATG + +a +s mr.mrrefChr5 13160 80 + 294542 AGTTGGGTTGGCATGTCAGACCCCAACAGTTATGTTGACTAGACTGGGTATGGGCTTAAGAGGGGCAGCATTAGCCACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150043 80 + 636262 AATTGGGTTGGCATGTCAGACCTCGATAGTTATGTTGACTAGACTGGGTATGGGCTTAAGAGGGGCAGCATTAGCCACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 147539 72 + 647215 AG--------GCGTGTCAGACACCAACAGTTATGTTGACTAGAATGGGTATGGGCCTAAGAGGGCCAGCATTGGGGGCAT + +a +s mr.mrrefChr5 13240 3 + 294542 GAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150123 3 + 636262 GAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 147642 3 + 647215 AAT + +a +s mr.mrrefChr5 13243 21 + 294542 GTCCCCAAATTATTTAGACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150168 21 + 636262 GTCCCTAAATTATTTAGATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 147645 21 + 647215 GTCTCCAAATTATTTAGACAT + +a +s mr.mrrefChr5 13264 489 + 294542 AACATAAATTCAGTAGATAATTGAGATCTCAAGTCGGAGTTCATAAGGTCAGCCCTTATAGACACCTGACATATTGTGTTTTAGTAGCCACATGCCACATCATTGTGAACCTGTTTTCAAACCCAAGCTATGGATATTTTAGATGCGCCATGCCTGCTAGTCCATTAGCTGCATTGTGTTTGCAGGGACCAACAAGAATGCTACTCATTATAGACATATGGTTTGAGACCCCTGTAAATCTAGTAGAGTGATAAGTAGTAGGCTTCCCTTTTCTAATGTGATTGCTTCTCTACTGTCAGCTCTCTAACTCGATTGCTTCTCTACTGTCAACTCTATCATCTATTGACCAGATGGAGGAAATATCATTTACCATTCCTGAACAGGTTAGTCATCCAGTTGGGGAAGTCACAAATTGGGTTATTATCATATGATGATATAAGCATACAACTCATTAGTCAACTTTGCATTATTGTTCCAAATCACACATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150189 478 + 636262 AACATAAATTCAGTAGATAATTGAGATCTCAGGTCGGAGTTCATAAGGTCAGCCATTATAGACACCTGACATACTGTGTTTTAGCAGTCACATGCCACATCATTGTGAACCTGTTTTCAAGTCCAAGCTATGGATATTTCAGATGCGCCATGCCTGCTAATCCATTAGCTGCATTGTGTTTACAGGGACATACAAGAATGCTACTCATTATAGACATAGGGTTTGAGACCCCTGTAAATCTAATAGAGTGAAAAGTAGTAGGCTTCTCTTTTCTAATGTGATTGCTTCTCTACTGTCAGCTCTCTAACTCGATTGCTTCTCTACTGTCAACCCTATCATCTATTGACCAGACGGAGGAAATATCATTTGCCATTCCTGAACAGGTTAGTCATCCAGTTGGGAAAGTTACAAA-----------TCATCTGATGATATAAGCACACAACTCATTAGTCAACCTTGTATTATTATTCCGAATCACCCATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 147772 489 + 647215 AGCATAAATCCAATATATAATTGAGATCTTAAGTAGGAGTTCATAAGGTCAGCCCTTATAGATACTTGACACATTGTGTTTTAGTAGCCTCATGCCACATCATTGTGAACCTGTCTCCATACCCAAGCTGTGGATATTTTAGATTCACCATGCCTGCTAGTCCATGAGCGGCATTGTCTTTGCAGGGACCAAAAAGAAAGCTACTCACTATAGACATATGGTTTAAGACCCCCGTAAATCTAGTAGAGTAATAAGTAGTAGGCTTCCCCTTTCTAACGTAATTGCTTCTCTACTGTCTACTCTCTAACTTGATTGCTTCTCTACTGTCAACTCTATCATCTATTGACCAGATGGAAAAAATATCATTTACCATTCCTGAACAGATTAGTGATCCAGTTGGGGAAGTCACGAGTTGGGTTATTATCATATGAGAATATAAACATACAACTCACTAGTGAACTTTGCATTATTGTTTCAAATTACACATGC + +a +s mr.mrrefChr5 13753 139 + 294542 ACTGGCTCTTCTCTAGTGATGATTGAGATCAGGGGTTCAAGCTTCTGTGGTTGTCCTGAAGTATACTTGGCAACCACACAGATGAGGAGTGGAATGGTATTCTAGTGGTATTCTTGTGCTGATTCTATAAAGGCCATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150667 138 + 636262 ACTGGTTCTTCTCTAGTGATGATTAAGATCAGGGGTTCAAGCTTCTGT-GTTGTCCTGACGTATACTTGGCAACCACACAGATGAGGAGTGGTATGGTATTCTAGTGGTATTCTTGTGCTGATTCTATAAAGGCCATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 148262 139 + 647215 ACTGGCTCTTCTCTAGTGATGACTGAGATCAGGGGTTCCAGCTTCTGTGGTTGTCCTGAAGTATACTTGGCAACCACACAGACGAGGAGTGGAATGGTTTTCTTGTGGTATTCTTGTGCTGATTCTATAAAGGCCGTCC + +a +s mr.mrrefChr5 13892 37 + 294542 TATTCTTGTATTTAATTGTAAGCATTCATGTTAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150805 30 + 636262 TATTCTTGTATTTAATTGTAA-CACTCATGT------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 148402 37 + 647215 TATTCATATATTTAATTTAAAGATTTCACATTAGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 13929 140 + 294542 TGCAACTGAGTGAACTGAATAATGTGGATTATGAACACAGATTAATTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAAGCAAGACAATTGAGGTGAGGACTAGTTGGTCACTGTTAGAAGGTAATAATCTATGAATACATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150835 139 + 636262 TGCAACTGAGTGAACTGAAAAATGTGGATTATGAACACAGATTAATTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAAGCAAGACAATTATGGTGAGGACTAGTTGGTCACTGTTAGAAGGT-ATAATCTGTGAATACATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 148440 140 + 647215 TGCAACTGAGCGAACTGAATAATGTGGTTTGTGAACACAGATTAACTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAATCAAGACAATTGAGCTGAAGGCTAGTTGGTCACTGTTAGTAGGTAATAATCTATGAAGACACAC + +a +s mr.mrrefChr5 14069 183 + 294542 AATCTTGTAACTCATTGTTCAAAGCTAATTTGTATTAGTAGGCTTTGTACTCATAACTGCCAGCATTTATGGTAACTAGCCCTTGAATATCTGTCCAATTATGAACTGGGATAGGAATTATAAAAACTATGTAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCCATATATATAGAGACATTTTAATATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150974 179 + 636262 AATCTT-TCACTCATTGTTCAAAGCTAATTACTATTGGTAGGCTTTG---TCATAACTGCCAGCATTTATGGTACCTAGCCCTTGGAGATCTGTCCAATTATGAACTGGGGTAGGAGATATAAGAACTATGTAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCCATATATACAAAGACATTTTAATATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 148581 179 + 647215 AATCTTGTAACTCATTGTGCAAAACTAATTTGTATTAGTATGCTATGTACTTATAACTGCCAGCCCTTATGGTAACTAGCCCTTGAATATC-GTCCAATTATGAACTGGAATAGGAATTATAAAAACTACGCAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCTGTATATATAGAGAC---CTAATCTATG + +a +s mr.mrrefChr5 14252 149 + 294542 TAAGTTGTTGTCCAGCCTCTATTCCCCATGTTCACATGGCATACACTATCAGTTTTACCAGATTTTAGTATTCTAAACCCTCTATATGGGATCTACCTGTGAGTGTAATTTACTAGTGGGCTGAATATTGGATGGGAACTGCCCATAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151153 149 + 636262 TAAGCTGTTATCCAGCCTCTATTCCCCGTATTCCAATGGCATACACTATCAGTTTTACCAGATCTTAGTATTCTAAACCCCCTATATGGGGTCTACCTGTGAGTGTAATTTATTAGTGGGCTGAATATTGGATGAGAACTGCCCATAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 148764 149 + 647215 TGAGTTGTCGTCCAGCCTCCATTCCCCATGTTCACATGTCATGCTCTATGAGTTTTACCAGATTTCAATATTCTAAGCCCTCCATATGGGATCTACCTGTGAGTGTAATTTACTAGTGGGCTGAATATTGGATGGGAACTGCCTATAGA + +a +s mr.mrrefChr5 14401 7 + 294542 GGACTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151302 7 + 636262 GGACTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 148914 7 + 647215 GGATTGA + +a +s mr.mrrefChr5 14408 7 + 294542 CTGGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151309 7 + 636262 CTGGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 148959 7 + 647215 CTGAGCA + +a +s mr.mrrefChr5 14415 39 + 294542 CTAACCAATTCCTAATCCATAGATCATTTGTTGAGACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151316 39 + 636262 CTAACCAATTCCTAATCCATAGATCATTTGTTGAGACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 149027 38 + 647215 CTAACCAATTCCTAAT-CATAGATCATTTGTTGAGACAT + +a +s mr.mrrefChr5 14454 42 + 294542 ACACTTGGGCCTACCATTTGGGCCAGATAGGATTAAGTGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151356 42 + 636262 ACACTTGGGCCTACCATTTGGGCCAGATAAGATTTAGTGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 149065 42 + 647215 ACAGTTGGGCCTGCCATTTGGGCCAGATAGGATTAAGTGGCC + +a +s mr.mrrefChr5 14496 7 + 294542 ATAAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151399 7 + 636262 ATAGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 149107 7 + 647215 ATAAATA + +a +s mr.mrrefChr5 14503 40 + 294542 GGAATACCATTGAGGTAGGATTTTGTGTTGTAGATCAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151406 14 + 636262 --------------------------GTTGCAGATCAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 149119 40 + 647215 GGAATACCATTGAGGTAGGATTTTGTGTTGTTAACCAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 14543 19 + 294542 AGTAAAAATGAAGTGTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151420 19 + 636262 GGTAAAAATGAAGTGTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 149165 19 + 647215 AGTGACAGTGCAGTGATTT + +a +s mr.mrrefChr5 14562 102 + 294542 GACCAGTAAATTAAGTTGCTGTCTCTTAGATAACATGTGTCCAAGATGTGTAACTTGCTAAGTTTCGTTAAAATAACTTAAATTTAAGGAAGTACCTGTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151439 102 + 636262 GACCAGTAAATTAAGTCGCTGTCTCTTAGATAACATGTGTCCAAGATCTATAACTTGCTAAGTTTCGTTAAAATAACTCAAATTTAAGGAAGTACCTATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 149242 102 + 647215 GACCAGTAAATTAAGTTGCTGTCTCTTAGGTAACATGAGTCCAAAAGGTGTAACTGGCTAGGTCTCGTTAAAATTCCTTAAATTTAAGGAAGCACCTGTCCT + +a +s mr.mrrefChr5 14664 339 + 294542 AACTCAAGTTATCATTAGCCATATGTTACCCAAATCCATGCAACTTAAGAACCTGAAATGGTTATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGATGAGGGCAGGCTCCTTGGATAAGTCCCAACACCATGGCGTGGGGGCTCACTGGACTGAGTCTAACTCTCACAGTTGGGAGTATCAATTTCTGATATGGAGCCCTTTTTAGCACAATAAGGTTACCTTACTACAGTCATTAGCAATATACCATAGGGCTCATGGCACGCTACTACAGTAAGCATGTAAGTGAACAACTGCAAGGATGTAAGAGATCATGATATGTGGGCTACCTGAGATAGAATTAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151541 335 + 636262 AACTAAAGTTATCATTAGCCATATGTTACCCAAATCTGTGCAACTTAAGAACCTGGAATGGTTATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGATGAGGGTAGGCTCCTTGGATAAGTCCCATTACCATGGCGTGGGGGCACACTGGACTGAGTCTAACTCTCACAGTTGGGAGTATCAATTTGTGA----GAGTCCTTTTTAGCACAATAAGGTTACCTTACTACACTCATTAGCAACATACCATAGGGCTCATGGCACGCTACCACAGTAGGCATGTAAATGAACAACTGCAAGGATGTAAGAGATCGTGATATGTGGGCTACCTGAGATAGAATTAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 149345 339 + 647215 AACTCAAGTTATGATTAACAATATGTTGCCCAAAGCCATGCACCTGAAGAGCCTTAAATAGTAATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGGTAAAGGCAGGCTCCTTGGATCTGTCACAACATCATGGTGTGGGGTCTCACTGGACTGAGTCTACCTATGCCAGTTGGAAGTGTCAAATTCTGATATGAAGCCCTTTTTAGCGCAATAAGGTTTACTTACTACAGACATTAGCAATATAGCATAGGGATCATGGCACACTGCTACAGGAAGTATGTAAGTAGACAATTGCAAGGATGTAAGAGATCATGATATGTGGGTTACCTGACATAAAATCAATTT + +a +s mr.mrrefChr5 15003 678 + 294542 AATCCTAAGCCTACCAAAAATCCATTCTTCCCAGCTAACAAGTCAGGTATGACTACTGATACTGGGTGGTGTGGAGTGAATGCCACTAGAAACAATTGGTCTTGTTGGCAAAGTGGGGAACAAGCTTAATAGAAGGCAGTTTTATTCTGGTGTGTGCATCATTTACTTTGACTAATATAGGGAAAGGAATGACAAGTTGCACTGGGTTAAAGAAGTTGCACTGGGTCATGAAACAACGAATACTAGATAGTCCTTCAATACTAAATGTACAGGTTCAATCAGTAACCCCACCTAGGTTACCAGTCAGCAGTGCTGGTAAAAGATCCCTAGTTAGAGTTGATATAGGCTGGGTTCCACTGGGCTCCATGTCACTCTTTGAGTGCGAGTTAACACTTAATGACACTATCACTACTTCACATTGGACACCATATTGACTTGCCAATTCTTTAAATCTTGCAGCGTATAACTGGGTTTCCAGGCAGAATTCGTTAGGCTAAATCCAATAATGACAACTCTTTCCATACCATGATGTCTGATTGGGAAGAATAGGAACAAGAAAGAATCTTTAGACAATAGGATTTTAAACACAAAAATAGTTAATTATGTGTTCCATGGAAGTAAAGTAATTGTTGCATGTCCAAGAGTGGCCTTGGTTTTACACTTGAGGGGGTAAAGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151881 673 + 636262 AATCCTAAGCCTACCAAAAATCCATTCTTCCCAGTTAACAAATCAGGTATGACCACTGATACTGGGTGGTGTGGAGTGAATGTCACTAGAAACAATTGGTCTTGTTAGCAAAGTGGGG--CAAGCTTAATAGGAGGCAGTTTTATTCTGGTGTGTGCATCATTTAATTTGACTAATATAGGGAAAGGTATGACAAGTTGCACTTGGTTAAAGAAGTTGCACCAGGTCATGAAATGACGAATACTAGATAGTCCTTC---ACTAAATGTACAGGTTCAATCAGTAACCCCATCTAGGTTACCAGTCAGCAGTGCTGGTAAAAGGTCCCTAATTGGAGTTGATATAGGCTGGGTTCCACTGGGCTCCATGTCACTCTTTGAGTACGAGTTAACACTTAATGACACTATCACTACTTCACATTGGACACCATATCGACTAGCTAGCTCTTTAAATCTTGCAGCGTATAACTGGGTTTCGAGGCAGAATTCGTTAGGCTAAATCCAATACTGACAACCCTTTCCATTTCATGATGTCTGATTGGGAAGAATAGGAACAAGAAAGAATCTTTAGACAATAGGATTTTAAACGCAAAAATAGTTAATTATGTGTTCTATGGAAGTAAAGTAATTGTTGCATGTCCAAGAGTGGCCTCGGTTTTACACTTGAGGGGATAAAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 149684 676 + 647215 AATCCTAAGCCTACCAAAGATTGATTCCTCTCAGCTAACAAGTCAGGTATAAGTACTGATAGCGGGTGGTGTGGAGTGCATGCCACTAAAAACAGTTGGTCTTGTTGGCAAAGTGGGGAAGAAGCTGAATAGAAGGCAGTTCTATTCTGGTGT-TGCATCAGTTGCTCTGACTAATATAGGGAAAGGAATGACAAGTTGCACTGGGTTAAAGAAGTTGCACTGGGTCATGAAACAACGAATACTAGATTGTCCTTCAATACTAAATGTACAGGTTCACTAAGTAGCCCCACCCAGGTTACCACTCAGAATTGCTGATAAAAGATCCCTAGTTACAATTGAAATAGGCTGGGTTCCACTGGGCTTCATGTCACTCTTTGAGTGGGAGTTAAGACTTAATGACACTATCACTACTTCACATTGAACACCATATTGACTTGCCAATCCTTTAAATCATGCAGCGTATAACTGGGTCTCCAGGCAAAATTCCTTAGGCTAAATCCAATAATGGCGATTCTTTCCATACCATCATGTCAGATTGGGAAGTAGAGGAACAAAAAAGAAACTTTAGACAATA-GATTTTAAACACAAAAATATTTAGTTATGTGTTCCATGGAAGAAAGGTGATTGTTTCATGTCCAAGAGTGGTCTTGGTTTTACACTTGAGGGGGTAAAGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 15681 116 + 294542 GGAGAATTAGCTCCTAATCACCTTGAGCCAGTGTGACACTCAAGACATAGTCAAAATGAAATCAATCACTGAGATTGCACCTATTAGAGGACACAACAACAAGCTATTCAGCCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152558 110 + 636262 GGAGAATTAGCTCCTAATCACCTTGAGTCAGTGTGACACTCAAGACTTAGTCAAAATGAAATCAATCACCGAGATTGCACCTATTAGAGGACATAACAATAAGCTATTCA------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 150360 111 + 647215 ----AACTAGCTTTTAATCACCTTGGGCAAATGTGACACCCAAGATATAGGCACATTGAAATCAATCACTGAGATTGCAC-TATTAGAGGGCACAATAACAAGCTATTTAGCCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 15797 177 + 294542 CCAATATTACTTGAATACAATGATTATGTCATAAGATGTCACTCATGTCTGATAACATGACTATGATTATGCTCTTACTGTTGCGTGCCCGAAGGGTATATAGAATCTCAAAAAGCTTGTTCACTTTAACCTAAAGTTTTAACGTTGTTCATTGTCTTTGTATCTATCAATGAAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152668 171 + 636262 CCAATATTACTTGAATACAATGATTATGTCATAGGATGTCACTCGCGTCTGATAACATGACTACGATTATGCCCTTACTGTTGCGTGCCCGAA------AAAGAATCTCAAAAAGCTCGTTCACTTTAACCTAAAGTTTTAACATTGTTCATTGTCTTTGTATCTATCAATTAAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 150473 176 + 647215 CCAATCTTACTTGTATACAATGATTATGTGATAAGATGTCACTTATGTCTGATAACATGGCTATGATTATACTCT-ACTGTTGCATGCCCTGAGGGTATATAGAATTTAAAAAAGCTTGTTCACTTTAACCTAAAGTTATGACGTTGTTCATTGTCTTTGTATCTATCAATGAATTG + +a +s mr.mrrefChr5 15974 57 + 294542 TTTCCTCCTAGAGATTGCTCTCTTCTGGTGGCTTCTTTGAGGACTCATGCTTCTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152839 46 + 636262 TTTCCTCCTAGAGATTGCTCCCTTCT------TTCTT-----ACTCATGCTTCTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 150685 57 + 647215 TTTTCTCCTAGAGATTGCTCTCTTCTGGTGGCTTCTTTGAGGACTCATGCTTCTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 16031 86 + 294542 GGACCAGTTATTGGATCATATTGATATGATAGGATGTGGAGCGTATTCAAGTCTCTTCCAGCCTTGTCTCGGCACCCTATATAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152886 86 + 636262 GGACCAGTTATTGGATCATATTGATATGATAGGATGTGGAGCGTATTCAAGTCTCTTCCAGCCTTGTCTCGGCACCCTATATAGCC + +a +s mr.mrrefChr5 16117 28 + 294542 CTGCAAGATAATATCTTACTCTGCAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 152978 28 + 636262 CTGCAAGATAATATCTTACTCTGCAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 150742 17 + 647215 -----------TATCTTTCTCTGTGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 16145 91 + 294542 GGTGTCTATCTTGGTGTTTAATCCATAATAGGGGAAGCAGGCATGTTAGCATCCCTGGTTTTAATAAGGAAAATGAGACTCAGGCTATTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153006 91 + 636262 GGTGTCTATCTTGGTGTTTAATCCATAATAGGGGAAGCAGGCATGTTAGCATCCCTGGTTTTAATAAGGAAAATGAGACTCAGGCTATTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 150761 91 + 647215 GGTGTGTATCTTGGTGTTTACATCATGGTAGGGGCAACAGGCGAGTTAGCATCCCTGGTTATAAGAAAGAAAGAGATACTCAGACAGTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 16236 34 + 294542 AAGTACAAGCTCCAAGTAAGTGGAACCATAGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153097 34 + 636262 AAGTACAAGCTCCAAGTAAGTGGAACCATAGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 150853 34 + 647215 AAGTACAAGCTCCAAGTAAGTGGAGCCATAGTTC + +a +s mr.mrrefChr5 16270 123 + 294542 TGAGTAGCACAGGCACCACATAAATGATCACAAACACACTTGTTTAGTAAATGGTATAATTGTTTGATCATGATAGATAAAACTTTGACTCAAACATCTCTATCGCCTGGGTTTATCACATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153131 123 + 636262 TGAGTAGCACAGGCACCACATAAATGATCACAAACACACTTGTTTAGTAAATGGTATAATTGTTTGATCATGATAGATAAAACTTTGACTCAAACATCTCTATCGCCTGGGTTTATCACATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 150901 123 + 647215 TGTGTAGTACAGACCCCACATAAATGATCAAAAACACACTTGTTTAGTAAATAGTATAAGTGTTTGATCATGATAGATAAAACTTTGACTCAAAGATCTCTATTGCCTGGGTTTAATGCACTG + +a +s mr.mrrefChr5 16393 14 + 294542 CTCTAGAGGTCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153254 14 + 636262 CTCTAGAGGTCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 151026 14 + 647215 CTCTACAGGTCACA + +a +s mr.mrrefChr5 16407 12 + 294542 TTACAAGAACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153270 12 + 636262 TTACAAGAACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 151040 12 + 647215 TTACAACAACAA + +a +s mr.mrrefChr5 16419 33 + 294542 AAATCGATTTAATGAGGCATTAATTGAGCAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153294 33 + 636262 AAATCGATTTAATGAGGCATTAATTGAGCAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 151052 33 + 647215 AGATCAATTTAATGAGGCATTAATTGAGCTGGG + +a +s mr.mrrefChr5 16452 19 + 294542 CAAGGCCTTTCTGTGTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153344 19 + 636262 CAAGGCCTTTCTGTGTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 151085 19 + 647215 CAAGACCTTTCTGTGTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 16471 58 + 294542 GACATAATGCCAATACTTGAGACAAGTGTATGTGACAGTGACAACTAAGGATGACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153363 58 + 636262 GACATAATGCCAATACTTGAGACAAGTGTATGTGACAGTGACAACTAAGGATGACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 151110 58 + 647215 GACACAATGCCTATACCTGAAACAAGTGGATGTGACATGGACACCTAAGGATGACCTC + +a +s mr.mrrefChr5 16529 34 + 294542 TATCTTGTATGGGAGTGGGACCCTATGTCCTCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153421 34 + 636262 TATCTTGTATGGGAGTGGGACCCTATGTCCTCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 151172 34 + 647215 TACTTTGTGTGGAAGTGGGACCCTGTGTCCTCCC + +a +s mr.mrrefChr5 16563 31 + 294542 TCCTCAAGCGGCCCCTTTACCTGCTTAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153460 31 + 636262 TCCTCAAGCGGCCCCTTTACCTGGTTAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 151206 30 + 647215 TCCTCAAGCG-CCCCTTTACCTGCTTAGCAT + +a +s mr.mrrefChr5 16594 77 + 294542 TGCTCACGCGGAGCAAGAAGTGCTGTTTTGCAGATACTTTTTATGAATTGATATCTTTTCAACTTTTATTAGAGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153573 65 + 636262 TGATCACACGAAG--AGAGGTGCTGTTTTGCAGATATTTTTTATGAA----------TTCAACTTTTATTAGAGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 151236 77 + 647215 TGCTCACGCCGAGCAAGAAGTGCTTTTTTGCAGATACTTTTTATGAATTGATATCTTTTCAATTTTTAATAGAGTTG + +a +s mr.mrrefChr5 16671 462 + 294542 TCTTGTGTTAAGTATCTCTGCTGACCTTGATGTTACTCATGCTCAGTTCCCCTAGCGTACTGCAACTCTTTACTTTCTTATGCTGATCTCTTGGAGGCATGGGCATGGCAGCTATGATAATGACTATCACTGAGATTCTTATTAATTACCCTTCAATCTTATTATGATTATAAATTGTGCGCTTGTGACAGAGGGTTTCTTTTTATCACTACAACCACTTTTTTTTTCTGATAGCCAAAAGTGAGATGACAGTCCAGGGGCGTCCCTCAGAATGCTTTGAGTTGTACCTTCCCATAGTGATGAGAGTGATATACACAGAAAATCACTGTGTCTAATAGAATTGTTATACAATGTCCTTCAGTCTTACTAAGAGCACATACCTTGGGGATATGTTACGTAAGTTATACTGTTGATTGGAAAAGGGAAAATCAGTCTCTTTCGCATTCAAATTTCACTGTCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 153639 461 + 636262 TCTTGTGTTAAGTATCTCTGCTGACCTTGATGTTACTCTTGCTCAGTTCCCCTAGCGTACTGCAACTCTTTACTTTCATTTGCTGATCTCTTGGAGGCATGGGCATGGCGGCTACAATAATGACTATTCCTGAGACTCTTATTATTTACCCTTCAATCGTGCTATGATTATAAATTGTACGCTTGTGACAGAGGGTTTCTTTTTATCACTACAACCACTTGTTTTTTCTGACAGCTAAAAGTAACATGACAGTCCAGGGGTGTCCCTCAGAATGCTTCAGGTTGTACCTTCCCACAGTGATGAGAGTGATATACACAGAAAATCACTGTGTATAATAGAATTGTTATACAATGTCCTTCAGTCTTACTGAGAGGACATACCTGGGG-ATATGTTACGTAAGTTATACTGTTGATTGGAAAAGGGGAAATCAGTCTCTTTCGCATTCAAATTTCACTGTCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 151313 457 + 647215 TCTAGTGGTAGGTATCTCTGCTGACCTTGATGCTACTCATGTTCAGTTCCCCTAGTGTACTGCAGCCCTTTACTTTCTTATGCTGATCTTTTGGAGGCATGGACGTGGCATCTATGGTAATGACTATCACTGAGATTCTTATTAATTACCCTTCAATCTTATTATGATTATAGATTGTGCG---GCGACAGAAGGTTACTTTTTATCACTACAACCACTTTTTTTTTCTGATAGCCACAAGTGAGATGACAGTCCA-GGGCATCCCTC-GAATGCTTTGAGTTGTACCTTCACATGGTGATGAGAGTGACATACACAGAAAACCACTGTGTCTAATAGAATTGTTATACAAAGTCCTTCAGTCTTACCAAGAGCACATACCTTGGGGATATGTTACGTAAGTTATACTGTTGATTGGAAAAGGGAAAATCAGACTCTTCTGCATTTAAATTTTACCGGCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 17133 35 + 294542 GGCAGTCTAGCGGACTTGGCTTTGGCATTACTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154110 35 + 636262 GGCAGTCTAGCGGACTTGGCTTTGGCATTACTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 151770 35 + 647215 GGCAGTCTAGCAGACTTGGCTTTGGCATCACTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 17168 175 + 294542 ACATAAAATGTTCACTCATATGAATTTAGTGCTTCGGTGTAGTATTAATTAAGCTGGGCATGGCACATGTTTTCTATCATTACCTCTTATGGGACAGAACTAGCTTGTCTTAGGAAGTCTCAGTGTTCATTTCTTCAACCTCTCATTTTCCCACCTACTTCCCTCTGTCTGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154145 175 + 636262 ACATAAAATGTTCACTCATATGAATTTAGTGCTTCGGTGTAGTATTAATTAAGCTGGGCATGGCACATGTTTTCTATCATTACCTCTTATGGGACAGAACTAGCTTGTCTTAGGAAGTCTCAGTGTTCATTTCTTCAACCTCTCATTTTCCCACCTACTTCCCTCTGTCTGCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 151808 175 + 647215 ACTCAAAATGGGCACTCATATGGGTTGAGTGATTAGGTGTAGTAATAATTAAGCAGGGCAAGGCACATGTTTTTTATTATCATTCTTTATGGGACAGAACTAGCTTGTCTTACGAAGTCTCAGTGTTCACTTAATCAAACTCTCATTTTCCCACCTATTTCCCTCTGTCTGCACC + +a +s mr.mrrefChr5 17343 13 + 294542 AGGACTTTGTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154330 13 + 636262 AGGACTTTGTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 151983 13 + 647215 AGGACTTTGCTGA + +a +s mr.mrrefChr5 17356 5 + 294542 GTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154345 5 + 636262 GTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 151996 5 + 647215 GTGGA + +a +s mr.mrrefChr5 17361 40 + 294542 CTGCAGGCACAACTCCATAGTTGAATTGTTTCACCTTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154350 40 + 636262 CTGCAGGCACAACTCCATAGTTGAATTGTTTCACCTTCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 152017 40 + 647215 CTACAGGCATAATACCATAGTTGAATTGTTTCACCTTCAC + +a +s mr.mrrefChr5 17401 4 + 294542 CACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154390 4 + 636262 CACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 152057 4 + 647215 CACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 52307 4 - 647215 CATA + +a +s mr.mrrefChr5 17405 20 + 294542 TAAATGATCTCTTTAAAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154394 20 + 636262 TAAATGATCTCTTTAAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 152061 20 + 647215 TAAATGATGTCTTTAAAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 52312 20 - 647215 TAGATGATCTCTTTAAAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 17425 6 + 294542 GTGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154415 6 + 636262 GTGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 152081 6 + 647215 GTTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 52332 6 - 647215 GTGCTC + +a +s mr.mrrefChr5 17431 14 + 294542 CTATAATGAAGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154421 14 + 636262 ATATAATGAACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 152097 14 + 647215 CTATAATGAAGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 52338 14 - 647215 CTATAATGAAGACA + +a +s mr.mrrefChr5 17445 3 + 294542 ATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 52352 3 - 647215 ATG + +a +s mr.mrrefChr5 17448 73 + 294542 ATGATAGGAAGGAAAGTAAGCTTTATTGAATTTGTTGCCACAATTATCAACACTCAAGAACTGAACCATAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154435 64 + 636262 CCAATAGTAAGCAAAGTAAGCTTTATTAAATTTGTATCC---------AACACGCAAGAACTGAACCATAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 152111 73 + 647215 ATGATAGGAAGGAAAGCAAGCTTTATTGGATTTGTTGTCACAATTATCAACATTCAAGAACTGAACCATAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 52355 63 - 647215 ATGATAGGAAGGAAAGTAAACTTTATCGAATTTGTTGCCACAATTATC----------AACCGAACCATAATA + +a +s mr.mrrefChr5 17521 133 + 294542 GCCTGGTGTGATGATGGAGAGGGAGCATTCGCTATCTAGCATTAGCTATGTCTACTCCTGGTTATTATACTACATGAGACTTGCCCCCTGATATCAGAACACATGTCAGTTGAAGCCATATGAGGAGGTGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154499 120 + 636262 GCCTGGTGTGATGGTGGAGAGGGA-------------AGCATTAGCAATGTCTACTCCTGGTTATTATACTACATGAGACTTGCCCCCTGATATCAGAACACATGTCAGTTGAAGCCATATGAGCAGGTGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 152184 133 + 647215 GTATGGTCTGATGATGGAGAGGGCGCATTCACTATCTAGCATTAGCTATCTCTACTCCTGGTCATTATACTACATAAAACTTGCCACCTAACATCTCAACACATGTCAGTTGAAGTTATACAAGGAAGTGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 52419 43 - 647215 GCGTAGTGTGATGACGGAGAGGAAGCATTCGCTATCTATCATT------------------------------------------------------------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 17654 485 + 294542 ATGTCAATACTAAGCCCTTAATGATATCTAATGTCTTATTACCACATTGGATAGAAGGTTCATGGACTAAGACATTCAGAGTTGAGTGGAAAAGTTAGCCATAATCCAACCAAAATAGAGAAATTTTGTTAAATTAATACATAGAAGCCCATGTGTCATATTAATAGCAATGCAGGACATTTCAACTATCCAATGAATATATCAGATAAATATGTCTCAAGGACCAGCATAATATGACTTTCAGATCACCACTTGAGTGTCTTAAAATGAATAATAGTGGTCATCAGCTAAGCCAGAAAGATTGTGTAAGTTGTTATGCCAGGTTAGTATCACTCGATAAAGTTACATTTTCTTTTGGGCACTGTACAGTATTTTTGGACTTTTATTAGTACAAGTATAAAATAAATCTATGCAGTTGTTCTAGGGCCCTCAATGTTGTTCATTCATTGATAAGTTCAACATACTCTAAGATAGCTATTTCACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 154619 474 + 636262 ATGTCAATACTAAGCCCTTAATGATATCTAATGTCTTACTACCACATTGGATAGAAGGTTCATGGACTAAGACATTCAGAGTTGAGTGGAAAAGTTAGCCATAATCCAACCATAATAGAGAAATTTTGTTAAATTAATACATAGAAGCCCATGTGTCATATTAATAGCAATGCAGGACATTTCAACTATCCAATGAATATATCATATAAATATATCTCAAGGACCAGCATAATATGACTTTCAGATCACCACTTGAGTGTCTTAAAATGAATAACAGTGGCCATCAGCTAAGCCAGAAGGATTGTGTAAGTTGTTGTGCCAGGTCAGTATCACTTGGTAAAGTTACATTTTCTATTGGGCAGTGTACAGTATTTTTGGACCTTTAATAGTACAAGTATAAAATAAATCTATGCAGT-----TAGGGGCCTCAATGTTGTC------TTGATAAGTTCAACATACTCTAAGATAGCTATTTCACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 152319 456 + 647215 ATGTCAATACTGAGCCCTTAATGATATCTGTTGTC-TATTACCACATTGGATGGAAGGTCCATGGACTAAGACATTCAGAG----------------------ATCCAACAAAAATAGAGAAATCTTGTTAAATTAGTACATGGAAACCCATGTGTCGTATTAATGGCAATGTAGGATATTTCAACTATCAAATGGATATATCAGATGAAAATGTCTCAAGGACCAACATAATATGACTCTCAGATAACCACTTGAGTGTCTTGAAGTGAATAATAGTGGTGTTCAGCTCAGCCAGAAA------GTAAATTGTTATGCTAGGTTAGTATCGCCCAATAGAGTTACATTTTCTTTTGGGCACTGTACAGTATTTTTGTGTTTTTATGAGGACGAGTATAAAATAAATCTATGCAGTTGTTCTAGGGCCCTCAATCTTGTTCATTCATTGATAAGTTTAACATTCTCTACAATAGCTATTACACAA + +a +s mr.mrrefChr5 18139 76 + 294542 TATCCACTATAACTCCATAAGCTTGTCTCCAGTGGAACATATCAAACAGTATGTAGTCAATTTAACAACAGTTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155109 76 + 636262 TATCCACTATGACTCCATAAGCTTGTCTCGAGTGGAACATTTCAAACAGGATGTAGTCAATTTAAAAACAGTTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 152775 76 + 647215 TATCTACTATAACTCCGTGAGCTTGTCTCCAGTGGGTCATATCAAACAGTATGTAGTCAATTTAACCACAGTTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 18215 28 + 294542 ACGTAGAGGCCTTTGAATAATGAAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155189 28 + 636262 ACGTAGATTCCTTTGAAAAATTAAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 152851 28 + 647215 ATGTAGAGGCCTTTGAATAATGAACACT + +a +s mr.mrrefChr5 18243 46 + 294542 ATGAGAACGAATGATGTGGGATGCTACTAACTGATTGTAATGATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155217 46 + 636262 ATGAAAATGAATGATGTGGGACGCTACTGACTAATTGAAAGGATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 152934 46 + 647215 ATGAGAACGAACGATGTGGGATGCTACTAACAGATCATGATGATTG + +a +s mr.mrrefChr5 18289 116 + 294542 ATAGTATCCTCACTATTTTGACCCAGGAGTACAAATCTTAATGAAAAAGTAGCATCTTTTTACACTGCTTCTCATCTAGATAGCTCAGGATCGACCCATGCAATAAGTGTCCTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155267 116 + 636262 ATAGTATCCTCACTATTTTGACCCAGGAGTACAAATCTTGATGAGACAGTAGCATCTTTTCCAACTGCTTCTCATCTAGATAGCTCAGGATCACCCCATGCAATAAGTGTCCTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 152980 93 + 647215 ----------TGCTATTTTGACCCAGGAGT----ATCTTAATGAAAAAGTAACATCTTTTTACACTG---------TAGATAGCTCAGGATTGACCCATGCAATAAGTGTCCTTGG + +a +s mr.mrrefChr5 18405 39 + 294542 TGGGAGAAGTGGTCTTGACTTAGTCTAGAGAATATGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155385 39 + 636262 TGGGAGAAGTGGTCTTGACTTTGTCTAAAGAATGTGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 153073 39 + 647215 TGTGATAAGTGGTCTTGACTTAGTCTAGAGAATATGATT + +a +s mr.mrrefChr5 18444 36 + 294542 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155425 36 + 636262 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 153112 36 + 647215 GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAGCATG + +a +s mr.mrrefChr5 18480 10 + 294542 AGATAGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155523 10 + 636262 AGATAAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 153148 10 + 647215 AGATAGCATG + +a +s mr.mrrefChr5 18490 498 + 294542 AACGAAGGTATACCTTGAAGGTCCAACAGTCTATACCCAAGGTACTACATAATTTTTTTGGAACTCTTTACACTCTAGACATTGGAAGCCCTCACCTCGTCATGCTGCATAATGCATAGTTTTTAGCATTTCATCTGAATTTAAATGCGTGGTACCTCGTTGCCACATGAAGGCACCCAATGCCATGTTTAAAACTCACATTTGTATCAGTACAGGAATAGGAAGCGAACATGGGAGACCCACAATATCTTTTCCCACAACATCTTCTCTCTCTTAGGAGTAATCTGCCAATCAAGTGCCCCCAGTTGGGGTAACAACCAGAATTCTGTACATATAATTTACCCAATCCCAAACACTGTCAGAGGAGGACTGACTTGATGTGTTCATTTGACCAAACCTGTGGCATTATTGATACAATTGTACTTATGGCTGTACACATCTGTGCAAAACATTCAACCAAGCCTATCAAACAGCAAATAGGCCAACCAATGAGTCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 155533 481 + 636262 AACAAAGGTATACCTTGAAGGTCCAACAGTCTATACTCAAGGTACTACATCATTGTTTTGGAACTATTTACACTCTAGATATTGGAAGCCCTCACCTCGTCATGCTGCATAATGCATAGTTTTTAGCATTTCATCTGAATTTAAATGCGTGGTACCTCGTTGCCACATGAAAGCACCCAATGCCATGTTGAAAGCTCACATTTGCATCAGTACAGGAATAGGAAGCAAACATGGGAGACCCACAATATCTTTTCCCACAACATCTTCTCACTCTTAGGAGTAATCTGCCATCCAAGTGCCCCCAGCTGGGGTAACAACCCGAATTCTGTACATATAATTTACCCAATCCCAAACACTGTCAGGGGAGGACTGACGTGATGTGTTCATTTGACCAAACCTGTGGCATTATTGATACAATTGTACTTATGGCTGCACACATCTGTGCAAAACATTCAACCAAGCCTAT-------CAAATAGGCCAACCA---------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 153163 483 + 647215 AACGAAGGCATAATTTGAAGGTCCAACAGTCTATACCCAATGTACTACGTAATTTTGTTGGAACTCTTTACACTCTAGACACTGGCAGCCCTCACCTTGTCATACTGCATAATGCATAGTTTTTAGCATTTCATGCTAATTTAAATGACTAGTACCTCATTGCCACCTGAAGACATCCAATGCCATGTTTAAAACTCACATTTGTATCAGTATGGGAATAGGAAGCGAACATAGGAGACCCACAAT---------------ATCTTCTCTATCTTAGGGGTAATCTGCCAATCAAGTGCCCCCTGTTGGGGTAACAACCAGAATTCTGTACATGTAATTTACGCAATCCCAAACACTGTCAGAGGAGGACTGACTTCATGGGATCATTTGACCAAACCTGTGGCAGTATTGAGACAATTGTATTTATCACTGTACACATTTGTGCAAAACATTCAACCAAGCTTGTCAAACAGTAAATAGGCCCACCAATGAGTCATG + +a +s mr.mrrefChr5 18988 344 + 294542 AAGATCGGGCCACAAAAACAGATGAGTCATGAAAGGTCAGGCCACAAAAACAGGACTGAAAGCCTAGGTTCAGACTTAGGATACCTCATTATGTGTAATCTCTCCAATTTCCAGGGAAATAAAGATAGTTGTGGTAAGCTGATCTGGGATGTTTCTATGATTCTTGTCTTTCCAGACCAAGGTGCAATCATGGGATGAGTCTAGGATGATATTAGCAAAGAACAGGATTACTAATTCTCACACCTATACCTAGGTTACACTTATTAATTTTTGACCATATCATATATTCACTGTGTCTCCCGGTCTTACATGTCTAGCTGTACATTTATAACTCCTACAAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156014 323 + 636262 ---------------------ATGAGTCATGAAAGGTCAGGCCACAAAAACAGGGCTGAAAGCCTAGGTTCAGATTTAGGATACGTCATTATGTGTAATCTCTCCAATTTCCAGGGAAATAAAGATAGGAGTGGTAAGCTGATCTGGGATGTTTCTATGATTCTTGGCTTTCCAGACCAAGGTGCAATCATGGGATGAGTCTAGGATGATATTAGCAAAGAACAGGATTACTAATTCTCACACCTATACCTAGGTTACACTTATTAATTTTTGACCATATCAGCTATTCACTGTTTCTCCCGGTCTCACATGTCTAGCTGTACACTTATAGCTCCTACAAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 153647 343 + 647215 AAGATCGGGCCACAAAAACAGATGAGTCATGAAAGGTCAGGCCACAAAAACAGGACTGAAAGCCTAGGTTCAGACTTAGGCTACCTCATTATGTGTAACCTCTCCAATTTCAAGGGAAATGAGGATAGTTGTGATAAGTTAAACT-GGATGTTTCTACAATTCTTGTCCTCCCAGACCAACATGCAATCATGGGATGAGTCCAGGATGATATTAGCAAAGAAATGGATTACTAGTTGACACACCTATACCTAGGTTACACTTATTAATTTTTGACCATGTCATATATTCTCTGTGTCTCCAGGTCATCCAGGTCTAGCTGCACATTTACAACTCATACAAAACA + +a +s mr.mrrefChr5 19332 51 + 294542 ACAGAAGAAGGTGGGTGTTTACCCACACTTAAGTGGCTAAGTTTTTGTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156344 51 + 636262 ACAGAAGAAGGTAGGTGTTTACCCACACTTAAGTGGCTAAGTTTTTGTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 153990 17 + 647215 ACATTGGGTGGTGGGTG---------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 19383 8 + 294542 AGTGCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156404 8 + 636262 AGTGCTGT + +a +s mr.mrrefChr5 19391 52 + 294542 TAGTGTGTCCCATGACACTTTCAAGCAGAACTTAAGCATTGATGGGTAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156416 52 + 636262 TAGTGTGTCCCATGACACTCTCGAGCAGAATTTAAGCATTGATGGGTAAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 154007 39 + 647215 -------------GCCACTTCCAAGCAGAACTTAGGCATGGATGGGTAGGGG + +a +s mr.mrrefChr5 19443 79 + 294542 TAATCAAAATTGCCTTAACAGCAGTTATAGAGCTGTTTCTTGTTAGCCTCATTGGAGTTGTACTTATAGGCCAAACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156469 79 + 636262 TAATCAAGATTGCCTTAACAGCAGTTACAGGGCTGTTTCTTGTTAGCCTCACTGGAGTTGTACTCATAGGCCAAACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 154046 71 + 647215 TAATCAAAATAACCCTAACAGCAGTTATAGAGCTGTTTCTTGTTAGCCTCAT--------TAATTATTGGCCAAACATA + +a +s mr.mrrefChr5 19522 114 + 294542 CATATCTTGTCCAAAGTGAGGAGAGGTTTAGCACTAATCTTTTAGTACTAGTGTCTTACACCAGCTGGGCAGTCTACTGCATCCGCTATCTTGATGCTATTATTCAGTTAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156549 114 + 636262 CCTATCTTGTCCAAAGTGAGGAGAGGTTTAGCACTAATCTATTAGTACTAGTGTCTTACACCAGCTGGGCAGTCTATTGCATCCGCGATCTAAATATTATTACTCAGTTAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 154117 114 + 647215 CATATCTTGTACAAAGTGAAGTGAGGTTTAGCACTCATCTTTCAGTACTAGAGTCTTACACCAGCTGAGTACTCTGCTGCATCCTCTATCTTGATGCTATTATTCAGTTATACT + +a +s mr.mrrefChr5 19636 124 + 294542 CTAAGTCTGGGGATTCACCTGTCTTCCACTATCAATATGAAATAGAAGCTGTCCAATTATATTCTGCACATATGCCAGTTTTGGATAGGATTCAAATCCTGCACACATTGCAGTTCTTGTGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156664 117 + 636262 CTAAGTCTGGGGATTCACCTGTCTTCCACTATCAATATGAAATAGA-------CAATTATATTCTGCACATATGCCAGTTTTGAATAGGATTCAAATCCCGCACACATTGCAGTTCTTGTGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 154231 124 + 647215 CTAATTCTGGGGATTCACCTGTTTTCCACTATCAATATGAAATAGAAGCTGTCTGACTACATTCTGCACATATCCCAGTTTTGGATAGGATTCAAGTCCTGCACACACTGCAGTTCTTGTGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 19760 243 + 294542 GTACTTTCTAGGGGATTGATTGTGTAAGTATTTCTACATAACATATTATTGTTGGTTCAGCACCAATAAAGACTCCTCCATATGAAACTCATACATAATATAGTTTTTAACATAGATGTCTTTGTCACAAAGATGTCATCTTTTCCACATAGATGTCTCATACAGATTCAATTCCTGTGATTGGGCTCTTTGTAAAGTAATTAAACATTGAATTTTTGCCAAAAGTTTTAATTATGACATTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 156781 233 + 636262 ----------GGGGATTGATTGTGTAAGTATTTCTACATAAGTTATCATTGTTGGTTCAGCACCACTAAAGACTCCTCTGTATTAAACTCATACATAATGTAGTTTTTAACATAGATGTCTTTGTGACAAAGATGTCATCTTTTTCACATAGATGTCTCATACAGATTCAATTCCTGTGATTGGGCTCTTTGTAAAGTAATTAAACATTGAATTTTTGCTAAAAGTTCTAATTATGACATTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 154356 243 + 647215 GTACTTTCTAGGGGATTGATTGTGTATGTATATCTACATAACATATTATTGTTGGTTCAGCACTAATAAAGACTCCTCCATATGAAACTGATATGTAACATGGTTTTTCACATAGATGTTTTTTTCATATAGGTGTCATCTTTTCCACATAGATGTCTCATACAGATGCAATTCCTGTGATTGAGCTCTTTATAAAGTAACTAAGCATTGAATTTATGCCAAAAGTTTTAATTATGACATTAT + +a +s mr.mrrefChr5 20003 187 + 294542 CTAGACGGGTGACTCTAATCTGTTTCCAAATTACCCATTGTGATTAAAGACTGAGGAACTGCATTCATTGATAGAGTCATGTTTTATCTGAACAGTGACTGTAAGTCGTTCGGCTGATTCAAGCAACATATTGGATGCTTCATTTTCAAAAACTGTCTTCTCCAGAATTCCAAACTCCAGCATTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157014 174 + 636262 CTAGGTGGGTGACTCTAATCTGTTTCCAAATTACCCATTGCGATTAAAGACTGAGGAACTGCATTCATGGATAGAGTCATGTTTTATCTGAGCAGTGCCTATAAGTC------CTGA-------AACATATTGGATACTTCATTTTTAAAAACTGTCTTCTCCAGAATTCCAAACTCCAGCATTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 154607 187 + 647215 CTAGACGGGTGACTCTAATTTGTTTCGAAATTACCCGTTGTGACTAAAGACTGAGGAACTGCATTCATTGATAGAGTCATGTCTCATCTGAACAGTGACTGTAAGTCGTTCGGCTGATTCAAGCAACATATTGGATGCTTCATTTTCAAAAACTGTCTTCTCCAGAATTCCGAACTGCAGCATTACT + +a +s mr.mrrefChr5 20190 42 + 294542 GAAAGGCCCTCCCAGAAATACTGTGATATAATAGGTAATAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157189 42 + 636262 GAAGGGCCTTCCCCGAAATACTGTGATACAATAGGAAATAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 154794 42 + 647215 GAAAGGCCCTCCCAGAAATACTATGATATAATAGGTAATGAA + +a +s mr.mrrefChr5 20232 72 + 294542 TAATACTTGGTCACATCCAACTGACAATGTACACACCATATTGAGAAAACTAGCAATAGGTGTGCTCCAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157233 72 + 636262 TAATACTTGGTCACATCCAACTGACAATGTATCCACCATATTGAGAAAACTAGCAATAGGTGTGCTCCAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 154836 72 + 647215 TGATACTTGGTCACGTCCAACTGACATTGTACACATCAAATCAACAGAACTAGCAATAGTGGTGCTCCAGAA + +a +s mr.mrrefChr5 20304 148 + 294542 CAGATAAAGTGCAAACCATACCTGCGTCAAAACAAATAAGGTGGGCTAACTCTGGAATAGATATCTCACTAACCCTTATTATAAGAGGATGTAGTGTTTTCTTTTAATACCAGATGAGTTCTGTATCTGCCTAGTCCCTTTCCTTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157305 148 + 636262 CAGATAAAGTGCAAACTATACCTGCGTCAAAACAAATAATGTGGGCTAACTCTGGAATAGATATCTCACTAACCCTTATTATAAGAGGATGTAGTGTTTTCTTTTAATACCAGATGAGTTCTGTATCTGCCTAGTCCCTTTCCTTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157460 145 + 636262 CAGATAAAGTGCAAACCATACCTGCGTCAAAACAAATAAGGTGGGCTAACTCTGGAATAGATATCTCACTAACCCTTATTATAAGAGGATGTAGTGTTTTCTTTTAATACCAGATGAGTTCTGTATCTGCCTAGTCCCTT---TTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 154908 144 + 647215 CAGATAAAGTGCAGACCATACCTGCTTCAGGACTAACAAGGGGGGCTAACTTTGGAATAGATATTTCACTAACCCTTATTATATGAAGGTGTAGTGTTTTCTTTCAAAACCAGATGAGTTCTGTGTCTGCCTAC-CCTTT---TTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 20452 7 + 294542 GCCCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157453 7 + 636262 GCCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157605 7 + 636262 GCCCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 155056 7 + 647215 ACCCATG + +a +s mr.mrrefChr5 20459 157 + 294542 GGGCCCCCAGCTATTAGATACCCGAGACACTAAGACCACATGGTGCTTCAATCAGGCATATGTGCTCCCATGTACAGTTCCATTGGGTTTAATTAGCATGTAGTACAGTAAAAAACTACTTAGTGGTAGTAGGTAGGGATTGTGAGTACCATGATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157612 75 + 636262 GGGCCCTCACCCATTAGACACCCAACAC----------------------------------------------------------------------------------CAAAACTACTTGGTAGCAGTAGGTAGGGATTGCGAGTACCACTATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 155063 157 + 647215 GGGCCACCTGCTGTTGTATGCCCGAGACACTAAGACCACATGGTGCTTCAATCAGGCATATGTGCTCCCATGTACAGTTCCATTGGGTTTAATTAGCATGTAGTACAGTAAAAAACTACTTAGTGGTAGTATGTAGGGATTGTGAGTACCATGATTC + +a +s mr.mrrefChr5 20616 14 + 294542 CCCACAAAACCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157688 14 + 636262 CCCACAAAACCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 155220 14 + 647215 CCCACAAAACCACT + +a +s mr.mrrefChr5 20630 149 + 294542 TGGAGATAATTTTGGAATTGATAAGCTTGGTGGTCTGGGGTTGTGAGATCTACTAAAGAGGAATTACTTGGCCTGTAGAGAAAGCCCTAGTAATCCTGGATTGTTTTCTGGGGCTTGGAGAGGTACTTCTCTCTGCCATGTCCTTACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157719 146 + 636262 TGGATATAATTTGGGAATTGATAAGCTTGGTGGTCTGGGGTTGTGAGATCTACTAAAGAGGAATTACT---CCTGTAGAGAAAGCCCTAGTAATCCTGAATTGTTTTCTGGGGCTTGGAGAAGTACTTCTCTCTGCCATGTCCTTACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 155234 149 + 647215 TGGAGATGGTTTTGGGATAGCTAAGTTTAGTGGTCTGGTGTTGCGAGATCTACTAAGGATGAATTACTTGGCCTTTAGAGAAAGCCCTAGTTATCCTGGATTGTTTTCTGGGGCTTGGGGAGGCATTTCTCTCTGCCATGTCCTTATTC + +a +s mr.mrrefChr5 20779 46 + 294542 TAGAGCTTGATGGACAATTTGTGACACCAGGTTGTGATAAGCCGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157865 43 + 636262 TAGAGCTTGATGGACAGTTTGTGACACCAGGTTGTGATAAGCT--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 155393 44 + 647215 TAGAGCTTGATGGA--ATTTGTGGCACTGGGTTGAGATAAGCCGAT + +a +s mr.mrrefChr5 20825 273 + 294542 TACTTTGGGAATTTGCAATGCAATCTACACCTTGTATGTGAATCCAGAAGCTTAAGGGCTTCAGGATACCACATTTAGCTATAGAGAATTATTGATTGTTATTCTTGTTTTGGTTCCTATGAACCGTGAGTCTCATAGCTGATGCAAAAGTATCGTCACTATTCAGAGGAAAAATCAAAACTCCATTGCACCCAACTTGCCCAATCATGTGTATGAATCCCCACTTGGGTTCAAGTACCAGTAAGTTGCATTATGAGACCAGGTGCCCCATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 157908 268 + 636262 ---TTTGGGAATTTGCAATGCAATCTACACCTTGCATGTGAATCCAGAAGCTTAAGGGCTTCAGGATACCACATTAAGCTATATAGAATTATTGATTGTTATTCTTGTTTTGGTTCCTATGAACTGTGAGTCTCATAGCTGA--CAAAAGTATCGTCACTACTCAGAGGAAAAATCAAATCTCCATTGCACCCAACTTGCCAAATCATGTGTATGATTCCCCACTTAGGTTCAAGTTCCAGTAAGTTGTATTATGAGACCAGGTGCCCCATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 155439 273 + 647215 TACTTTGGGAATTTGCAACACAATTATCGCCTTGTATGTGAAACCAGAAGCTTAAGGGCTTCAGGATACCACATTTAGCGATAGAGAATCATTGATTGTCATTCTTGTTTTGGTTCCTATGAACCGTGAGTCTCATAGTTGATGCAAAAGCATTGTCACTGTTCAGAGGACAAATCAAAACTCCATTGCACGCAATGTGGCCAATCATGTGTATGAATCCCCACTTGGGTTTATGTAACAGTAAGTTGCATGAAGAGACCAGGTGCGCCATCT + +a +s mr.mrrefChr5 21098 607 + 294542 GGGTCTATCTAACCATGTATGATGTCTGAATTCAGATAGAACAGCATTTGCAACCCTGGAAGGTGTTCTGCTGAGGCTACTAAAAATGGTCCCCAAATGTGGAACAACCCAGTACCACTCGGGTCATGTAACTATTGCTTAAGGAGGGTAAAGGTGTTGTGGGTATCAGATTCTGATGGGTGATGAGATTCTCAAAGCTGCTCTCTAGTACAGCATCCCTACTTCTCCCATCAGGGATCTGGTCTTATACTGACTAAAGATTGCCACAGTATAAGCCTCTCTTTAACTGAAAAGTCTGACTCGTTAGCCCCTTTATTAGGAGGCTCCCTTCGTCTTGCATGGCCAGAAGGCAGTCACATGATTGCCATACCACACAGAAGGGTTGCTGCAGAGCTTTGGGCTGCTACAACAATCTTAGCATGTCCTGAGTGCCACCGATATATCCTCTGTAAACATAATGTGTTATTTTACTTGGCTGCTGATAGTATACCACTGTCAAGCAAGTATTTAGGTAAGATTCTTGTGAGTGGTGGGAAAGTACTTGACTTGTCTGCTGTCTACCTGCCATAACACATCTGCACATTTTTTTCAACCACTGAACTTTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158176 607 + 636262 GGGTCTATCTAACCATGTATGATGTCTGAATTCAGACAGAACAGCATTTGGAACCCTGGAAGGTGTTCTGCTGAGGCTACTAAAAATGGTCCCCAAATGTGGAACAACCCAGTACCACTCAGGTCATGTAACTATTGCTTAAGGAGGGTAAAGGTGTTGTGGATAACAGATTCTAATGGGTGATGAGATTCTCAAAGCTGCTCTCTAGTACAGCATCTCTACTTCCCCCATCAGGGATCTGGTCTTATGCTGACTAAAGATTGCCACAGCATGAGCCTCTCTTTAACTGAAAAGTCTGACTCGTTAGCCCCTTTATTAGGTGGCTCCCATCGTCTTGCTTGGCCAGAAGGCAGTCACCAGATTGTCACACCACACAGAAGGGTTGCTGTAGAGCTTTGGACTGCTACAACAATCTTAGCATGTCCTGAGTGCCACCGATATATCCTCTGTAAACATAATGTGTTATTTTACTTGGCTGCTGATAGTATACCACTGTCAAGCAAGTATTTAGGTAAGATTCTTGTGAGTGGTGGGAAAGTACTTGACTTGTCTGCTGTCTACCTGCCATAACACATCTGCACATTTTTTTCAACCACTGAACTTTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 155714 598 + 647215 GGGTCTATCTAGCCATGTACAATGTCTGAATTCAGATAGAATAACATTTGCAACCCTGGAAGGAGTTCTGCTGAGGCTACTAAAAATGGTCCCCAAATGTGGATCAATCCAGTACCACTCGGGTCATGCAACTATTGCTTAAGGAGGGTAAAGGTGTTGCAGGGATCG-ATTCTGATGGGTGATGAGATACTCAAAGCTGTTCTCATGTACAGCATCCCTACTTCTCCCATCAAGGATCTGGTGTTATACTGACTAAGGATTGGATCAGTATAAGCCTCTCTTTAACTGAAAAGTCTGACTTGTTAGCC--TTTACTAGGAGGCTCCCTTTGTCTTGCATTGCCAGAAGGCAGT-ACATGATTGCCATACCACA-----GGGTTGCTTCAGAGCTTTGGGCTGCTACAACAATGTTAGCATGTCCTGAGTGCCACCAATGTATCCTCTGTAGTCATAATATGTTATTTTATGTGGCTGTTGATAGTATAGTACTGTACTGCAAGTATTAGGGTAGGATTCTTATGAGTGGTGTCAAAGTACTTGACTTGTCTGCTGTCTACTTGCCATAACATACCTGCACATTTTTTTCAACTACTGACCTTTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 21705 23 + 294542 ATGTTTTGACTGGGTGCCTGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158783 23 + 636262 ATGTTTTGACTGGGTGCCTGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 156314 23 + 647215 ATGTTTAGACTGGGCACCTGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 21728 27 + 294542 CCCATTCTCTTGAGCTCACATAGTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158806 27 + 636262 CCCATTCTCTTGAGCTCACATAGTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 156343 27 + 647215 CCCATTCTCTTGAACTCACACAGTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 21755 31 + 294542 CTCGAACAATGACAGTGTAGTGAACCCAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158833 31 + 636262 CTCGAACAATGACAGTGTAGTGAACCCAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 156395 31 + 647215 CTTGGATGATGACAGTATAGTGAACCCAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 21786 40 + 294542 AATGTCATTTCATGTGTGTCCTTCATTAATAGGCTCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158864 40 + 636262 AATGTCATTTCATGTGTGTCCTTCATTAATAGGCTCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 156427 39 + 647215 AATGTCATTCAATGCATGTCTCTCATAAATAAGCTCATA- + +a +s mr.mrrefChr5 21826 95 + 294542 AGAGTCTCATCTCGTTGACCTGGCCGCAGATGCAGCAGTCAGGTAACCTCTATTCCAGCAAATGCAAAATCTCACACATCTTACTTTAGTTGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 158904 95 + 636262 AGAGTCTCAACTCGTTGACCTGGCCGCAGACGCAGCTGTCAGGTAACCTCTATTCCAGCAAACGCAAAATCTCACACATCTTACTTTAGTTGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 156651 86 + 647215 AAATTCTCATTTAGT---------CACAGATGCAGTAGTCGGGTGACCTCTCTTCCAGAAGATGCAAAATCTCGCACATCTTACTTTAGTTGGAG + +a +s mr.mrrefChr5 21921 33 + 294542 AGGGTTGCCAATCCTATATTTCAATGAATGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159000 33 + 636262 AGGGTTGCCAATCCTATATTTCAATGAATGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 156737 27 + 647215 GGGGTTGCCAATCCTATATTTCAATGA------ + +a +s mr.mrrefChr5 21954 3 + 294542 CTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159034 3 + 636262 CTC + +a +s mr.mrrefChr5 21957 198 + 294542 CAAACCCCTTAAGTTGTGTACCAACCATCTACTCCGTAATGCTTCGTACCATATGAAAGTGGGTGAGATTCTCTGCTAGCCATAAGTTGTATGTTCAGTATTTTTGGAATAGACACATTCTTGAAGGAGGACCAGCTCAATTGCAGTATGACTTGACAGGAATGATAGTCAGTAAGTTCTAGTAACTTCCATTATACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159038 196 + 636262 CAAACCCCCTAAGTTGGGTACCAACCATCTACTCTGTAATGCTTCGTACCATATCAAAGTGGGTGAGATTCTTTGCTAGCCATAAGGTGTGTGCTCAGTATTTTTGGCATAGACACATTCTTGAAGGAGGAACAGCTCAATTGCA-TATGACTTGACAGGAATGATAGTCAGTA-GTTCCAGTAACTTCCATCAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 156764 193 + 647215 CAAACCGATGAAGTTGTGTACCAGCCATCTACTCCGTAATGCTTCATACTATATGAAAATGGGGTA-----TCTGCTAGCTACAAGTGGTATGTTCAGTATTTTTGGAATAGGCACATTCTTGAAGGACGACTGGCTCAATTGCAGTATGACTTGACAGGAATGATAGTGAGTAAGTTCTAGTAACTGCCATTATGCT + +a +s mr.mrrefChr5 22155 342 + 294542 GCTCACTGCTTAGTTCACATGCTCAATGCTCAGTTCAGTTATCAACAGAACCTTGGGCAATACGGCGTGCGATTGAATATCAAACCACCAACACTGCAACATGAAAATAGATAACAAATGTTGCTGTGTGCATATGTTCAATCTTTAAACTGCCAACTGGAAACCATTCACACCGTTTGGAAGTAAACCCTAAATTATTGCTACTAGAACTTTTGGCGTGCATTCAGTAAAAGATAGCATATTACTCTTAAAGACCCTAACTTGATGGATGTTCCAAAGATTTTGGGATGTCAAAACAAATGATGGCCCACTGTGTCTCCACATCTGAGCTTGCATGCTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159238 336 + 636262 GCTCACTGCTTAGTTAACATGCTCAACACTCGGTTTAGTTATCAACAGAACCTTGGGCAATACGGCGTGCGATTGAATATCAAACTACCAACACTACAACATGAAAATAGATACCAAATGTTGCTGTTTGCATATGTTCAGTCCTTAAACTGCCAACTGGAAACCATTCACACAGTTTGGAAATAAACCATAGATCATTGCTACTAGAATTTTTGGCGTGCATCCAATAAAAGATAGCATGTTACTCTTAAAGACCCTAACTTGATGGA-GTTCTGAAGATTTTGGGATGTCAAAATAGATGTTGGCCCACTG-----CTGCATCTGAGCTTACATGCTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 156957 342 + 647215 GTCCACTGCTTAGTACACATGCTCAATGTGCAGTTCAGTTATTGTCAGAACCTCGGGCAATACAACGTGAGATCGCATATCAAACCACCAACACTGCAACATCAAAATAGACAACAAATGTTGCTGTGTGCATATGTTCAATCTTTAAACTGCAAACTGCAAACCATTCACACCGTGTGGCAGTAAACCCTAAACTATTGCTACTAGATCTTTTGGGATGCATTCAGTAAAAGATAGCACATTACACTTAAAGACCCTAATCTGATGGCTGTTCCAAAGATTTTGAGATGTCAAAACTAATGACGGCCGGCTTTGTCTCCACATCTCAGCTTGCACTCTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 22497 472 + 294542 ACACCCATGGGGCAGCTATTAAAGACATACCAATAACATGACCATTGTGCTTAATAAGGCGTAAGACCAATGGTATCCAGAGATCCACATATAGCTTGGCTAAACACTAATCATCCCTTAATAGATGGCAAATCAAATACTTAATAGCACAAATATAAAAATCAGCATTTAAAAGATCATGGACAGGCACCACACTCAACAGAGAAGCCTGCTACTAGTGTATACCCTGTTTTTAAATTCTATGACATTTTGCTTGTGGCCTGAGGCCACTATATCCAAAATGATAAACTACTCCACTAAGTCAATGCATGGAGAACATTTAGATTCTGGCCATTTGCCTTTATGTGTTAGGTTATCACCTTATGTAATGCCCTGCAAAGTTTTACTCATCAAGTGCAATTTTCGTAAATGTTCAAGGGTTTAGCACCTAACTGATCTGACACTGGAAGTTCAATTCTGACCTTACAATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159580 457 + 636262 ACACCCATGGGGCGGCTATTAAAGACATACCGATTACATGACCATTGTGCTTGATAAGGCGTCGGCCCAATGGTATCCATGGATCCGCATATAGCTTGGCTAATCACTAATCGTCCCTTAATAGATGGCAAATCAAATACTTAATAGCACAAATATGAAAAATAGCATTTAAAAGATCATGGACAGACACCACACTCAACAGAGAAGCCTGCTACTAGTGTGTACCCTATTTTTAAATTCTATGACATTTTGCTTGTGGCCTGAGGCCACTATA-CCAAAATGATAAACTG------------GATGCATGGAGAACATTTAGATTCTGGCCATTTGCCTTTATGTGTTAGGTTATCACCTTATGTAATGCCCTTCAAAGTTTTACTCACCAAGTGCAATTTTCGTAAATGTTCCAGGGTTTAGCGCTT--CTGATCTGGCACTGGAAGTTCAATTCTGACCTTACAATAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 157299 468 + 647215 ACATTGATGGGTCAGCAATTAAGGGCATACCAATACCATGAGCATTGTGCTTAATAGGGCATAAGAAAAATGGTTTCCAGAGATCCACATATAGCTTGGCTGAACACGAATCATCCCTTAATAGATGGCAAATCAAATACTTAATAGCACAAATATAAAGATCAGGATTTAAATGATCATGGACATGCACCACACTCAAAAGAGAAGCCTGCTACTAGTGTATACCCTGTTTTTCAATTCTTTGACATTTTTCCCGTGGCCTGGGGCCACTACATCCAAACTGATAAACTACTCCACTAAGTCAATGCGCGGAGAAAACTTAGGT-CTGGCCATTTGCCTTTATGTGTTAGGTTATCACCTTATGTAAGGGCCTGCAAAGTT--ACTCATCCAG-ACAATTCTGCTAAATGTTCAACAGTTTGGCACCTAACTGATCTGACACTGGAAGTTCAATTGTAGTCTTACAATAGT + +a +s mr.mrrefChr5 22969 261 + 294542 TTGGTTATGGTTCCCTTAATTGGGCCTCACCATCTTGAGTGTGCGATGCCAGATGACATCACATTAATCCATAATTATTTGCTTTAATAAATTAAAGAAGCTACCCAAGTTTGCAACCCTCCACAGACCCTGTCTGAAAATGTACTGTTCAGAATGCAGTCAAGTGTATTAATACCAAGATTTCCATTGTTATCTCTGACAATCTCCACTTTAACCTGAACTCTCAGAAGAGACAGTAATCAGTAACCTTACGGCAGCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 160037 256 + 636262 TTGGTTATGGTTCCCTTAATTGGGCCTCACCATCTTGAGTGTGTGCTGCCAGATGACATCACATTAATCCATAATTATTTGCTTTA-----TTAAAGAAGCTACCAAAGTTTGCAACCCTCCACAGACCCTGTCTGAAAATGTACTGTTCAGAGTGCAGTCAAGTGTGTTAATACCAAGATTTCCATTGTTATCTCTGACAATCTCCACTTTAACCTGAACTCTCAGAAGAGACAGTAATCAGTAACCTTACGGCAGCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 157770 199 + 647215 TTGGTTATGGTCCCCTTAATTGGGCCTTACCATCTTGAGTGTGCTATGCCAGATGCCATCACATTAATCCATGATTATTTGCTTTAATAAATTAAAGAAGCTCCCCAATTT-GCGACCCTCCACAGACCCTGGCTGAAAATGTACTGTTCAGAATGCAGTCAAGTGGATTAATACCGAGATTTCAATTGTGATCTCTGAC------------------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 23230 111 + 294542 AGGGCAGCAGACTGGGGTTGGCATTGAAAGATATTCTGTGATGCCTCTATTACACTACATAGACCCCCCATGAGTCAACCTATTAACCTGGCAGCTACATTTATAGCCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 160299 111 + 636262 AGGGCAGCAGACTGGGGTTGGCATTGAAAGATATTCTGTGATGCCTCTATTACACTACATGTACCCCCCATGAGTAAACCCATTAACCTGGCAGCTACATTTATAGCCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 157969 60 + 647215 ---------------------------------------------TCTATTAGAC--CTTAGACCCCTTATGAGCCAACCTATTAACCTGG----TCCATTTATAGACCTT + +a +s mr.mrrefChr5 23341 45 + 294542 CTCAGGACGTCAAAATTGTTCTATCAACTGCTGGCATAGGACTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 160411 45 + 636262 CTCAGGACGTCAAAATTGTTCTATCAACCGCTGGCATAGGACTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 158029 42 + 647215 ---GGGACGTCAAACTTGTTCTATCAATTGGTGACTTAGGCCTGG + +a +s mr.mrrefChr5 23386 332 + 294542 ATTTGTACAATTTAAGCAACACCTTGTGATGAAGACTTTCCATGCAATTCCACATGCAATACATTTCTCTCAATGATACATACAGTTGTGTTTGCAGGGAAGCTGTAAATGAAGTATGGGCAAAAGGAGAAAAGTGTAAGGACAAACTACCAACGTAAGAATTGAATGTAACTTGATATAAATTTTTTATATTAAACCTTTTTAAGCACATCACCTTGTACAAATAGTAAGGATGGATCTGAATATTGAATTAGTTGAGATTTACTAAGTGTTTCTCATTCCATAGCAATGACTTACTCTTCTGTTATAACCATTTGTCTATAAACAAGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 160456 330 + 636262 ATTTGTACAATTTAAGCAACACCTTGTGAT-AAGACTTTCCCTGCAATTCCACATGCAATACATTTCTCTCAATGATACATACAGTTGTGTTTGCAGGGAAACTATAAATGAAGTATGGGCAAAAGGAGAAAAGTGTAAGGACAAACTACCAACATAAGAATTGA-TGTAACTTGCTATAATTTTCTTATATTAAACCTTTTTAAGCACATCACCTTGTCCAAATAGTAAGGATGGATCTGAATATTGAATTAGTTGAGATTTACTAACTGTTTCCCTTTTCATAGCAATGCCTTACTCTTCAGTTATAACCACTTGTCTATAAACAAGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 158072 322 + 647215 GTTGGGACAATTTAAGTGACACATCGTGATGAAGACTTTCCATGTGATTGCACATGAGATACATTTCTCTCAATGATACATACTGTTATGTTTGCAGGGAAGCTGTAAATGAAGTATGGGCAAAAGGAG----------GGACACACTACCAATGTAAGAATTGAATGTAACTTGATATAAATCTTTTATATTAAACCTTTATAAGCACATCAGCTTGTACAAGTAGTAAAGGTGGATCTGAATACTGAATTAGTGGAGATTTACTAAGTGTTTCTCATTCCATAGCAATGACTTACACTTCTGTTATAACTATTTGTCTATAAACAAGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 23718 22 + 294542 CTTAGTGCTTCTTCTGCTTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473770 22 - 636262 CTTAGTGCTTCTTCTGCTTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 158394 22 + 647215 CTTAGTGCTTCTTCTGCCTTCC + +a +s mr.mrrefChr5 23740 60 + 294542 TAAATGCAAGATGGATGATACAGATTATATACAAAACAGAGTAGGTAGACACCTGTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473792 60 - 636262 TAAATGCAAGATGGATGATACAGATTATATACAAAACAGAGTAGGTAGACACCTGTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 158417 60 + 647215 TAAATTCAAGGTGGATAATACGGGTTGCAAACAAAACAGAGTAGGAAGACACCTGCAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 23800 28 + 294542 ATAAGAGAGGAGTAATATTTGACTCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473853 28 - 636262 ATAAGAGAGGAGTAATATTTGACTCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 158477 28 + 647215 ATAAGAGAGGAGTAGCATCTGACTCTTT + +a +s mr.mrrefChr5 23828 12 + 294542 CAGCAGTCAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473881 12 - 636262 CAGCAGTCAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 158506 12 + 647215 CACCAGTCAACC + +a +s mr.mrrefChr5 23840 32 + 294542 AAACCATCAGTTGAATCAGTTGAAGATTATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473893 32 - 636262 AAACCATCAGTTGAATCAGTTGAAGATTATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 158519 32 + 647215 AAACCATAAGTTGAATCAGCTGAAGGGTATGA + +a +s mr.mrrefChr5 23872 21 + 294542 GATGTTGCACACGCTTATTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473925 21 - 636262 GATGTTGCACACGCTTATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 158574 21 + 647215 GATGCTGCACACACTTATTGT + +a +s mr.mrrefChr5 23893 37 + 294542 ACCGAACACATACAATCCAGTATCATCTAAGCTCGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473946 37 - 636262 ACCGAACACATACAATCCAGTATCATCTAAGCTCGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 158598 37 + 647215 ACCAAAGACATCTGATCCAGTATCATCTAAGCTTGCA + +a +s mr.mrrefChr5 23930 13 + 294542 ACACTTATCGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473984 13 - 636262 ACACTTATCGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 158635 13 + 647215 ACACTTATCACCA + +a +s mr.mrrefChr5 23943 89 + 294542 GAGACATCTGATATAGTATCATCTAAAGTTAAAACATCTCGGCATGTGATTGGTGTCAACTAAATGAGAAACCCAACTGATTGTCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 473999 89 - 636262 GAGACATCTGATATAGTATCATCTAAAGTTAAAACATCTCGGCATGTGATTGGTGTCAACTAAATGAGAAACCCAACTGATTGTCAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 158648 89 + 647215 GAGACATCTGAGCCAGTAACGGCTAAGCTTAAAACACCTGGGCATGTCATCAGTATCAACTAAATGAGAGACCCAACTGATTGTCAGTT + +a +s mr.mrrefChr5 24032 72 + 294542 GCATCATTCTTCCCCCATCATACTCCAACTAAATATAGAGAAGCCCTATCACACTCAGGTAGTGGCGCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474088 72 - 636262 GCATCATTCTTCCCCCATCATACTCCAACTAAATATAGAGAAGCCCTATCACACTCAGGTAGTGGCGCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 158753 72 + 647215 GCATCATTCTTCCTTCACCATGCTCCATCTAAATGTAGAGAAGCTAAATTACCCTCAGGTAGTGGTACATAA + +a +s mr.mrrefChr5 24104 162 + 294542 GTGACATGTGCCTGGACTCCTCCTCTTCTGAGGCTGGGAATTGAAGCCGCTTATTTTCATTGGAAGGTCAGTTACCATATACATACTTTGCAAAATGCAATAAAGTTTGGATGGGTCAATCAGCGTAGGGTCCCATTGCCTGCATGCATACTAAGTTTGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474161 162 - 636262 GTGACATGTGCCTGGACTCCTCCTCTTCTGAGGCTGGGAATTGAAGCCGCTTATTTTCATTGGAAGGTCAGTTACCATATACATACTTTGCAAAATGCAATAAAGTTTGGATGGGTCAATCAGCGTAGGGTCCCATTGCCTGCATGCATACTAAGTTTGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 158825 162 + 647215 GTGACATGTCCCTGGACTCCTCCTCTTCTGAGGCTGGGAATTGAAGTCACTTAGTTTCATTGGAAGGTTAGTTACCATACACATACTTTGTAAAATGCAATAAAGATTGGAGGGGCCAAACAGAGTAGGGTCCCATAGCCTGCATGTACACTAAGGTTGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 24266 117 + 294542 ATATCTATTACACCAAGAGGTAAAGCCATTCATTACAGTGTGGTCAGTCAGACCGTCTAGTCACTCAGGGCTTAGTGGTACCCAGCGCGTTTTATGTATGACAAAAGGAACTTGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474323 117 - 636262 ATATCTATTACACCAAGAGGTAAAGCCATTCATTACAGTGTGGTCAGTCAGACCGTCTAGTCACTCAGGGCTTAGTGGTACCCAGCGCGTTTTATGTATGACAAAAGGAACTTGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 159004 117 + 647215 ATATCCGTTACATCAAGCTATAAAGCCATACATTACAGTGTGATCACTCAGACAGTCCAGTCACTCCGGGATTAGTGGTACCTAGTGCATTTTTTGTATGGCAAAAGGAACTTGGAA + +a +s mr.mrrefChr5 24383 82 + 294542 AGGAACCCAAGTGGTCCACAGTAAATTAGATGGCCCCAGATTTCTGTAGCCTGTAACAGCTCATGTGGTCATGTCACCCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474440 82 - 636262 AGGAACCCAAGTGGTCCACAGTAAATTAGATGGCCCCAGATTTCTGTAGCCTGTAACAGCTCATGTGGTCATGTCACCCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 159155 82 + 647215 AGGAAACTAAGTGGCTGACATTAAATTAGGTGGCCCCAGATTTCTGTGGCCTGTCTCAGCTCATGTGGTCATGTCACACCAT + +a +s mr.mrrefChr5 24465 39 + 294542 GGCCTAGCTCAGCCACATCTAGCTATATCTAGAACATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474522 39 - 636262 GGCCTAGCTCAGCCACATCTAGCTATATCTAGAACATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 159246 39 + 647215 GGCATAGCTCAGCCACATCTAGCTGTATTTAGGACATAG + +a +s mr.mrrefChr5 24504 32 + 294542 ATATAAATAAGATAGCATCTCACTCATCAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474561 32 - 636262 ATATAAATAAGATAGCATCTCACTCATCAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 159291 32 + 647215 ATATGTATAAGATAGCATCTCACTCTTAAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 24536 107 + 294542 TGAAGCGTGTTGGATCCTTCTACAGGGGCCTGCGATCACTTGACACTGCACGAGGCGGGTAGGATCCTTTCACAGGTGCCTGTGATTGCTTGTTGTTGTAGACGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474593 107 - 636262 TGAAGCGTGTTGGATCCTTCTACAGGGGCCTGCGATCACTTGACACTGCACGAGGCGGGTAGGATCCTTTCACAGGTGCCTGTGATTGCTTGTTGTTGTAGACGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 159324 107 + 647215 TAAAGGGTGTTGGGTCCTTCTACAGGGGCCTGTGATCACTTGACACTGTATGAGGCATGTATGATCCTTCTACAGGTGCGTGTGATTGCTTGTTGTTGTGCACAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 24643 10 + 294542 CTGTAGGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474702 10 - 636262 CTGTAGGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 159431 10 + 647215 CTGTATGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 24653 107 + 294542 TCTCAACAACGTTAAGGCTATCAACACAAAATGGAGACAGGAAATTTTGTGATTTATGCCGCAAAAGGTTCCAAGATGGGTATCCATCACCCCAGAGACCCTCGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474747 107 - 636262 TCTCAACAACGTTAAGGCTATCAACACAAAATGGAGACAGGAAATTTTGTGATTTACGCCGCAAAAAGTTCCAAGATGGGTATCCATCACCCCAGAGACTCTCAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 159441 96 + 647215 TCTCATCAACGTTAAGGCTAT-----------GGAGACACGAAATTTTATGATTTATGCCGCAAAAGGATCCAAGATGGTTCTTCATTGCCCCAGAGACCCTCGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 24760 59 + 294542 AGTCTACCCGGAACTATTATATATCAAACATTTAGACCCACTACCTCCAAAATTATGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474854 59 - 636262 AGTCTACCCGGAACTATTATACATCAAACATTTAGACCAATTACCTCCAAAACTATGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 159539 59 + 647215 AGTCTACCTGGAATTATTATATATCAAACATTTAGACCCACTACCTCCAAAATTATGAA + +a +s mr.mrrefChr5 24819 141 + 294542 ATTTAAATACCATAGGTACGGTAGCAGATATAGCACATGTGACATTCCAAACCTGGTTAGTTAAGGTGGGTCAGTATTGCAAGTTTTGTAAAATTAATTGTCTAAGGAAATTTTTATTGTGATGACACAAGATGTCAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474913 141 - 636262 ATTTAAATACTATAGATACGCTAGCAGATATAGCACATGTGGCATTCCAAACCTGGTTAGTTAAGGTTGGTCAGTATTGCAAATTTTGTAAAATTAACTGTCTAAGAGCATTTTTATTGTGATGACACAAGATGTCAGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 159599 141 + 647215 AGCTAAATACCCTAGGTATGGTATGAGATATAGCACATGTGACATTCCAAACTTAGTTAGTTTAGGTGGGCCAGTATTGCCAGTTTTGTAAAATTAATTGCCCAAGGAAATTTATATTGTGATGACACAGGATGTCAGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 24960 44 + 294542 TGTTTTATAGTGAATAACAGAGAACACTGTGCTAGGGGGAGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475054 44 - 636262 TGTTTTATAGTGAATAACAGAGAACACTGTGCTAGGGGGAGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 159760 26 + 647215 TGTTTTACGGTGCA-------GAAAACTGTACT----------- + +a +s mr.mrrefChr5 25004 13 + 294542 TCATGATGCTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475102 13 - 636262 TCATGATGCTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 25017 9 + 294542 AGATAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475124 9 - 636262 AGATAATAT + +a +s mr.mrrefChr5 25026 55 + 294542 CATGATGTTGCTTAATCAGTACCCACCCACAGCCCATTACTATAAGTGGGCTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475134 55 - 636262 CATGATGTTGCTTAATCAGTACCCACCCACAGCCCATTGCCATAAGTGGGCTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 159786 50 + 647215 -----TGTTGGGTAATCAGTACCCACCCACAGCCCATCACTACAAGTGGTCGAGA + +a +s mr.mrrefChr5 25081 183 + 294542 ACTATATATCTTAACCCTTCTGAGAATGAAGTTCTCTTTTAAGAAGTTGGGTATGGAACTGCAAACGCAGCACAAGGCAAGAGTTAGGTACCACAAACAAATCAAACTCTGAGCTGTATAACCATGGGATGTGTGCTGTTCTTTGTGAGGGTATAATATAGGGATCATCTATATAATATATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475189 183 - 636262 ACTATATATCTTAATCCTTCTGAGAATGAAGTTCTTTTTTAAGAAGTTGGGTATGTAACTGCAAACGCAGCACAAGGCAAGAGTTAGGTACCACAATCAAATCAAACTCTGAGCTGTGTAACCATGGGATGTGCGCCATTCTTTTTGAGGGTATAATATAGGGATCATCTATATAATATATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 159840 178 + 647215 ACTA-ATATCTTAACCCTTCTGAGAATGAAGTTCTCTTTTAAGAAGTTGGGTATGGAACTGGAAACACAGCACAAGGCAAGAGTTAGGTACCACAAACAAATT----CCTGAGCTGTATAACCATGGGATGTGTGCTGTTCTTTGTGAGGATATAACATAGGGATCATCTATATAATATATGT + +a +s mr.mrrefChr5 25264 26 + 294542 GCAGCACATGGATCAGAAAATTGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475372 26 - 636262 GCAGCACAGGGATCAGAAAATTGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 160028 26 + 647215 GCAACACATGGATCAGGAAATTGCTG + +a +s mr.mrrefChr5 25290 69 + 294542 TTGTGTTGACATATTAAGAAAGCATATACTGCATGTTTGCTGGAGATTTTGGATACTCTGTTAGGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475407 69 - 636262 TTGTGTTGACATATTAAGAAAGCATATACTGCATGTTAGCTGGAGATTTTGGATACTCTGTTAAGGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 160054 69 + 647215 TTGTGTTTACATACTAAGAAAGCATATACTACATGTTTGCTGGATATGTTGGATACTCTGTTAGGGACT + +a +s mr.mrrefChr5 25359 128 + 294542 GCAGTGCAGCTGCTGACTAGGTTATATTGAATCTTCCAGTGTGAAGCATGGTCATGGGTCTATGCAGTCAGAAATGTCATGTCATAGGCAGTTCATCAGATAACTTCACTTTCTAGCATCACAATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162497 128 + 636262 GCAGTGCAGCTGCTGACTAGGTTCTATTGAATCTTCCAGTGTGAAGCATGGTCATGGGTCTACGTAGTCAGAAATGTCATGCCATAGGCAGTCCATCCGATAACATCACTTTCTACCATCACAATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 160130 122 + 647215 --AGTGCAGCTGCTGGCTAGGTTATATAGAATCTTCCAGTGTCATGTATGGTCAAGGGTCTATGCAGTCAGAAATGTAATGTCATAGGCAGTTCATCAGATAACTTCATTTTCTAGCATCACAA---- + +a +s mr.mrrefChr5 25487 57 + 294542 ACCACTACTGTATCCACGCCAACTGCAAGCTTGTCCTAGGCCAATATAGACAACATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162626 45 + 636262 ACCACTACTGGATCCATGCCAACTGCAAGCT------------ATATAGACAACATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 160252 53 + 647215 ----CTACTGTATCCACGTCAACTGTAAACTTGTCCTAGGCCAATATAGACAACATC + +a +s mr.mrrefChr5 25544 50 + 294542 TTCCCATCATAAAGTTTGCATGCTGCACTGAATCTCAAAACCTGACAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162671 50 + 636262 TTCCCATCATAAAGTGTGCATGCTGCACTGAATCTCAAAACCTAACAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 160306 50 + 647215 TTCCCACCATAAAGTTTGCATGCTGCACTGAATCTCAAAACCTGTCAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 25594 14 + 294542 ATTGGTTGAATCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162721 14 + 636262 ATTGGTTGAATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 160358 14 + 647215 ATTGGTTGCATCCA + +a +s mr.mrrefChr5 25608 165 + 294542 CCCCTTGCTTAAACATCAGAAATGAATCAGTGAGAATGAAGCAGCAGAATGAATAGCCTATCTGGAGCAACCCTCCTGAACTTTGAAACCATTCAAGGGTCCTCTAAAAGTAGTCTTCAAGATTAGAGGAGTGGTTTTAGCTAAGGTTGGTTAGCCCGCTTACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162735 163 + 636262 CCCCTTGCTCAAACATCAGAAATGAATCAGTGAGAATGAAGCAGCAGAATGAATAGCCAATCTGGAGCAACCCTCCTGAATTTTGAAACCATTTAAGGGTCCTCTAAAAGTAGTCG--AAAATTAGAGGAGTGGTTTTAGCTAGGGTTGGTTAGCCCGCTAACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 160373 163 + 647215 CCCCTTGCTTAAACATCAGAAATGAATCAGTGAGAATGAAGCAGCAGAATGGATAGCCTATCTGGATCATCCCCCCTGAACCTTAAAACTATTCAAGGGTCCTCTAAAAGTAGTCTTCAAGCTTAGAGTAGTGAGC--ACCTAAGGTTGGGTAGCTTGCTTACCT + +a +s mr.mrrefChr5 25773 138 + 294542 CTAAAGGTCTCTATTGTGGGAGCAGGTGTGCGCGACTGTGTGAAATGTGAATGCATTTTATAAAGGAGCTGCTTCAGTGCCAGCATATTCAACTGTTCCCTCTCCCCCCCCACATGAGTTTTGGATCATCAGGAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162898 134 + 636262 CTAAAGGTCTCTATTGTGGGAACAGGTGTGCGCGACTGTATG----GTGGATGCATTTTATAAAGGAGCTGCTTCAGTGCCAGCATATTCAATTGTTCCCTCTCCCCCCCCACATGAGTTTTGGATCATCAGGAGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 160585 138 + 647215 CTAAAGGCCTCAATTGTGGGGGCATGTGTGCGCAACTGTGTGAAATGTGAATACATTTTATAAAGGAGCTGCTCCAGGACCAGCATATCTAACTGTTCCCTCTCCTCCCCCACATGAGTTTTGGATCATCAGGAGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 25911 337 + 294542 GTTAGAAGTACACACAGGCCGTTGGCACTCTCCCAAGGAGAACCCACTTACAAGATCACCTTTGACTTCTATCAGTGCAAGTGGGTCAAGCTTCCTGGATCAAAAAGTCTCTTGCCCACATGAGATCTTAAATTGTGATTCACTAGAACTGCTAGTGCCCTTCCAATAATGTTCACCCCACCAACACTTATTTCTTCCATCAGGATCTGGAGGCCATATGCTCATCTCTACACTCATTTCAACACTAGGGCCTGGTAATTGGATCCCAAAATGGTGTAATTGAGCATTTTTGAATGTTTCAACCTTTTTGAAAACCTTACTTGATACAGGGCAGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163032 336 + 636262 GTTAGAAGTACACACAGGCTGTTGGCACTCTCCCAAG-AGAACCCACTTACAAGATCACCTTTGACTTCTATCAGTGCAAGTGGGTCAAGCTTCCTGGCTCTAAAAGCCTCTTGCCCACATGAGGTCTTGAATTGTGATTCACTAGAACTGCTAGTGCCCTTCCAATAATGTTCACCCCACCAACACTTATTTTTTCTATCTGGGTCTGGAGGCCATATGCTCATCTCTACACTCATTTCAGCACTGGGGCCTGGTAATTGGATCTCAAAATGGTGTAATTGAGCATTTTTGAATGTTTCAACCTTTTTGAAAACCTTACTTGATACAGGGCAGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 160726 330 + 647215 GTCAAAAGTAAATACAGACCGTTGGCACTTTCCCAAGGAGAACCCACTAACAAAATCACCTTTGACTCCT------GCAAGCAGGTCGAG-GTCATGGATCAAAAAGTCTCTTGCCCACATAAGATCTTAAATTGTGATTCACTTGGAATGCTAGTGCCCTTCCAATAATGTTCACCCCACCAACACTTATTGCTTCCATCAGGATCTGGAGGCCATATGTTTGTCTCTACACTCATTTCAACACCAGGTCCTGGTAATTGGATCCCAAAATGATGTATTTTAACATTTTTGAATGTTTCAACTTTTTTCAAAACCCTACTTGGTACAGGGCAGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 26248 116 + 294542 TCTGAGTCATTTAGAAACATATTATAAAGGAATCAACATGCACCAGATTTTGAAGCCAATTCTGTCAGGCCCAGTACACCCCCCCTGGTTGTACCACCGCTATTCAGGGCATTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163370 116 + 636262 TCTGAGTCATTTCGAAACATATTATAAAGGAATCAGCATGCACCAGATTTTGAAGCCAATTCTGTCAGGCTCAGTACACCCCCCCTGGTTGTACCACCGCTATTCAGGGCATTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 161056 110 + 647215 TCTA---CTTTTAGAAATATATTA---AGGGATCAACATGCCCCAGATTTAGAAGCCATTTCGGTCAGGCCTAGTACACCCTCCCTGGCTGTACCACTGCAATTCAGGGCATTGCA + +a +s mr.mrrefChr5 26364 87 + 294542 TGCACCAGATTGTCTGGTCATCATGGGGCTGGTGCCTGATGACTGCCCATAGATGCGGCCCATACACATGTAGTATGTGGTTCCTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163486 87 + 636262 TGCACCAGATTGTCTGGTTGTCATGGGGCTGGTGCATGATGACTGCCCATAGATGTTGCCCATACACATGTAGAATGTGGTTCCTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 161168 87 + 647215 TGCCCCAGATTGCTCGGTCATCATGGGGATGGTGCCTGATGACTGCCCATAGACGCGGCCCATACACACGTAGTATGTGGTTCCTAG + +a +s mr.mrrefChr5 26451 84 + 294542 AACCTGTGACTAGCATCACAAAGTAACCATCTGGGAAGTGGAATAATTAAGGAATAGCAAACAGTTATACATGTCTGTGTATCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163573 84 + 636262 AACCTGTGACTAGCATCACAAAGTAACCATCTGGGAAGTGGAATAATTAAGGAATAGCAAACAGTTATACCTGTCTGTGTATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 161260 77 + 647215 AACCTCTGACTAGCAT-------TAATGATCTGTGAAGTGAAGTAATTAAGGAATAGGAAACTGTTGTATATGTCTGCGTATCG + +a +s mr.mrrefChr5 26535 68 + 294542 GTGCAGTTATGACAGAAAACTTGCAGGGACCTGGAGGATGGTGTTATAATAGACTTGAAACAGGACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163657 68 + 636262 GTGCAGTTATGACAGAAAACTTGCAGGGACTTCTAGGATGGTGTTATAATAGACTTGAAACAGGACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 161339 68 + 647215 AGGCAGTTATGACTGAAAACTTGCAGGGACCAGGAGGATGATGTTACAATAGACTCGAAATAGGACTA + +a +s mr.mrrefChr5 26603 180 + 294542 TGGAGTTAGTGGTGCAATTCTAGGAAAATCTGGGGAAATTTGTTGTGTGTTTCATCTTTTTGTCACTATCAATATGTAGGACAAGAGGTCAGCAGACCCAGTACACTTGGTTTAGTGTAATGACCTCCATATATGGAGCAATGATAATCTGAATAGATAGATAGGATATATCTACTGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163725 179 + 636262 TGGAGTTAATGATGCAATTCTAGGAAAGTCTGGGGAAAGTCGTTGTGTGTTTCATCTTTTTGTCACTATCAATATGTAGGACATGAGGTCAGCCGACCCAGTACACCTGGTTTAGT-TAATGACCTCCATATATAGAGCAATGATATTCTGAATAGATAGGTAGGATATATCTTCTGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 161424 178 + 647215 TGGAGTTCGTGGTGCAATTCTAGGAAAATCTGGTGAAATTTGTTGTGTG--TGATCTTTTTCTCACTGTCAATATATAGGTCAAGGGGTCAGGAGTCCCAGTATACTTGGTTTAGTGTAGTGACCTCCATATATGGACCAATGATAACCCAAATAGACAGATACGACATGTCTACTGCAA + +a +s mr.mrrefChr5 26783 10 + 294542 CCGCAGTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163904 10 + 636262 CCGCAGTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 161631 10 + 647215 CCACAATGAG + +a +s mr.mrrefChr5 26793 26 + 294542 AGATCAGCGGTTTAGACAAATAGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163914 26 + 636262 AGATCAGCGGTCTAGACAAACTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 161644 26 + 647215 AGATTAGTGGTTTAGACAAATAGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 26819 157 + 294542 CTCCTGGCTGGGCTGGTTACCTATTGTGCATACACTGTGTGAGATGAGCCAGTTGGACAACTGGTGAGCACCAACTAGGTCCCTTGTTTGTGATCATGCTAAGAAAATTAATCCTATTGGCTGGTAATTTTAGCTGGCAAAACTATTCACGTCTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 163940 157 + 636262 CTCCTGGCTGGGCTGGTTATCTATTGTGCATACACTGAGTGAGATGAGCCGGTTGGACAACTGGTGAGTACCAACTAGGTCCCTTGTTTGTGATCATGCTAAGAAAATTAATCCTATTGGCTGGTAATTTTAGCTGGCAAAACTATTCACGTCTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 161671 153 + 647215 CTCCTGGCTGGGCTGGTTACCTATCGTGTATGCAATGTGTGA----AGCCAGTTGCACCACTGGTAAGCACCAACTAGGTCCCTTGTTTGTGATCATGCTAAGAAAATTTACCCTGTCAGCTGATCACTGCAGCTGGTCCAACTATTCACATCTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 26976 131 + 294542 TTGTGTGGCCGGAACTTGTGGATCTGCCAGTGAGTATGCACTCACGCAAAGAACCTCACATAACACAACCATTGGGCTGACCCAGAGTCCAAACATACCAACAAACTGCATTGCTTGTATTGACAACACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164113 131 + 636262 TTGTGTGGCCGGAACTTGTGGATCTGCCAGTGAGTATGCACTCACGCAAAGAACCTCACATAACACAACCATTGGGCTGACCCAGAGTCCAAACATACCAACAAACTGCATTGCTTGTAGTGACAACACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 161824 122 + 647215 CTGTGGGGCCGGAACTTCTGAGTCGGCCAGTGAGTATGTACTCACTCGAAGAACCTCACATAACACAACCATTGGGTTGAACTGGAGTCCAAAAATAC---------GCATTGCTTGTATTGACAACACAG + +a +s mr.mrrefChr5 27107 35 + 294542 TTAATTGAGATATCGCTTCAGCCTCATCTGACTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164245 35 + 636262 TTAGTTCAGATATCGCTTCAGCCTCATCTGACTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 161946 35 + 647215 TTAATTGAGATATCACTTTGGCTTCATCTGACTAC + +a +s mr.mrrefChr5 27142 16 + 294542 AGGAAGGGACGTTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164280 16 + 636262 AGGAAGGGACGTTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 161982 16 + 647215 GGGAAGGGATGTTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 27158 60 + 294542 ACACTCCCTCTCTGGGTCATGTGTACTCCTGAGTACCTTTATAGCAAATTGACCGGTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164297 60 + 636262 ACACTCCCTCTCTGGGTCATGTGTACTCCTGAGTACCTTTATAGCAAATTGACCGGTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 161998 60 + 647215 AGACTCCCTCTCTGAGTCATGCGTACTCCTGAATAACTTAATAGCAAACTCACCAGTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 27218 28 + 294542 GCATTTGCCTTTTATTGGAACTTTGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164357 28 + 636262 GCATTTGCCTTTTATTGGAACTTTGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 162114 28 + 647215 GCATTTGCCTTTTATTGTAGCTTTATTC + +a +s mr.mrrefChr5 27246 76 + 294542 GAGGTACTGTGCAACTTCTAAACAATGTTAAAGTTTCATTCACACTAGTACTGGAGGAAATCCTGCATTGAAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164385 76 + 636262 GAGGTACTGTGCAACTTCTAAACAATGTTAAAGTTTCATTCACACTAGTACTGGAGGAAAGCCTGCATTGAAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 162149 76 + 647215 AAGGCATTGTGTAAAGTCTAAACAATGTTAGGGTTTCATTCACACTACCAGTGGAGGAAATCCTACATTGAAGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 27322 10 + 294542 CTAATCTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164461 10 + 636262 CCAATCTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 162294 10 + 647215 CTAATCTAGC + +a +s mr.mrrefChr5 27332 17 + 294542 ATGTAACCTCTTCCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164474 17 + 636262 ATGTAACCCCTTCCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 162304 17 + 647215 ATGTAACCTCTTCCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 27349 126 + 294542 ATTGACCTTTCCAACCAGACTGTAGCACCATACCGTTAGTCTAAACAGAGGTATTTATGCCATCTCACAATGAAAAACCCTGAGTAGTGAAACTTGGTCAGTCAATTGGCATGTCAACTCTGTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164491 65 + 636262 ATTGACCTTTCCAACTAGACTGTA-------------------------------------------------------------AGTGAAACTCGGTCAGtcaattggcatgtcaactctgtgag +s simRat_chr6.simRat.chr6 162329 126 + 647215 ATTGACCTTTCCAACCAGACGGTAGCACCATACCGTTAGTCTAAACAGAGGTATTTATGCCATCTCACAATGAAAAACCCTGAGTAGTGAAACTTGGTCTGTCAATTGGCATGTCAACTCTGTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 27475 85 + 294542 ATGATTATGTGGTTCTTTTAATGAGAGCAGGCTATAGGTTCCATCACATTTAGAGGcttTCAGCTGCAACAGAGGTTCATGGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164556 85 + 636262 atgatttcatggttctttgaatgagagcaggctataggttccatcacatttagaggcttTCAGCTGCAACAGAGGTTCATGGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 162460 85 + 647215 ATGATTATGTGGTTCTTTTAATGAGCGCTGGCTACCCGTTTCATTTCATTTAGAGGCTTTGAGCTGCAGCAGAGCTTCATGGCAG + +a +s mr.mrrefChr5 27560 100 + 294542 TAGCTATTGCTCACGTAGCCCCCTTGAGAAGTTAAAGATGTGTGTGATATTAAAGCCATGTAAACCCAATTTGCTTCAGTACAATCTTTATAGCCATATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164642 94 + 636262 TAGCTATTGCTCACGTAGTCCTCTTGATAAGTTAAAGACGTGTGTGATATTAAAGCCATGTAAAC------TGCTTCAGTACTATCTTTATAGCCATATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 162545 100 + 647215 TACCTACTGCTCACATAGCCTCCTTGAGAAGTTAAAGATGTGTGTGATATTTAAGCCATGTAAATCCAATTTGCTCCAGTACAATCTTTATAGCCATATT + +a +s mr.mrrefChr5 27660 19 + 294542 GAATCACAATACTCAAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164969 19 + 636262 GAATCACAAGACTCAAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 162645 19 + 647215 GAAACACAATACTCACGGG + +a +s mr.mrrefChr5 27679 362 + 294542 TTGGTGTGATAAGGCTCTAGGGCTCTTTCTTCTTCATCTGATGAAGCTTGTGTGGGATGAACATAACCGCTACAGGAATCTCAATTGCATGTACCATTCATGCTATGGATGCCCCACAGAAATATGAACTGCATGCCCTAGTCACACAATGGATGTTGAGTCCACAGTACTGAGATAGGTCATGATACCATACTAATCATGACACAGTCAGTGTGATCAAGATAGCTCATTTAGGGCTATATCACTGCCTATATTCATCATAAAGTGTATGCACAACAAGAACCATGTATACTCCTAAGTTTTTCTAGACTGAGTACTACACTGGTGTGGTGACACTGTGCCATGTAGTATTGGTTGCAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 164991 362 + 636262 TTGGTGTGATTAGACTCTAGGGCTCTTTCTTCTTCATCTGATGAAGCTTGTGTGGGATGAACATAACCGCTACAGGAATCTCAATTGCATGTACCATTCATGCTATGGATGCCCCACAGAAATATGAACTGCATGCCCTAGTCACACAATGGATGTTGAGTCCACAGTACTGAGATAGGTCATGATACCATACTAATCATGACACAGTCAGTGTGATCAAGATGGCTCATTTAGGGCTATATCACTGCCTATATTCATCATAAAGTGTATGCACAATCAGAACCATGCATACTCCTAAGTTTTTCTAGACTGAGTACTACACTGGTGTGGTGACACTGTGCCATGTAGTATTGGTTGCAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 162664 290 + 647215 TTGGTGTGATAAGGCTCCAGGGCTCATGCCTCTTGATCTGATGAGGCTCATGTGTGATGAAAATAACTGCCACAGAAATCTGAATTCCCTGCACCAGCCATGCTATGGATGCACCACAAAAATATGAATTGCATGCCCCAGCCACACAATTGATGCCGAGTCCACAGTACTGAAATAGGGCATGACACCATACTAATCCTGACACAGTCAGTGTGATAAGGATAGCTTGTTTAGGTTTATACCACTGCCTACACTCATCATAAAGTGTATGCACAACAAAAACCATGTAT------------------------------------------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 28041 187 + 294542 CAGGTAGAATGTAGCTTCATCTAATATTGGCTAATTAACGACTCAGTACGGAATTTCCAGATGTTGGATCTGTTTAGAGGAAATATGCACGAGAATTTCAGTGCCAAGCGATGATTTCAGTACTTGACTGATAAAGCAGTTGAACTGGATTGTTCTATCTAATGTAGGAGAGGTGGATAGATGGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165360 187 + 636262 CAGGTAGAATGTAGCTTCATCTAATATTGGCTAATTAACGACTCAGTACGGAATTTCCAGATGTTGGATCTGTTTAGAGAAAGTATGCATGAGAATTTCAGTGCCAAGCGATGATTCCAGTACTTGACTGATAAAACAGTTGTACTGGATTGTTCTATCTAATGTAGGAGAGGTGGATAGGTGGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 162954 149 + 647215 -------------------------------------AAGACCCAGTACGGAATTTCCAGATGTTGGATCTGTTTAGAGGAAATATGCACCACAATTTTAGTTCGGAGCGATAATTTCAGTATTTGACTGATAAAGCAG-TGAACTAAATTGTTCTATCTGATGTAGGGGAGGTGGATAGATGCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 28228 86 + 294542 ATGAGCACTCTAATAGGGCTAAGTTCAAATTATCCCTAGTTAGGTCAAAAGCCCAATTCTCACACTGTTGGAGTGACCACTCCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165553 83 + 636262 ATGAGCACTC---TAGGGCTAAGTTCAAATTATACCTAGTTAGGTCAAAAGCCCAATTCTCACACTGTTGGAGTGACCACTCCCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 163103 86 + 647215 GTGAGCACTCTAATAGGGCTAGGTGCCAATTATCGCTAGTTATGTCAAAAGCCCAATTCTCACACCGTTCGAGTGACCACTCCTGT + +a +s mr.mrrefChr5 28314 63 + 294542 GGATTGGTATGTTGAATCAGCCAAGGTGAAATCAAAGTGCTTGAACTTAGTTCCTTGCGGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165636 63 + 636262 GGATTGGTATGTTGAATCAGCCAAGGTGAAATCAAAGTGCTTGAACTTAGTTCCTTGCGGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 163190 63 + 647215 GGATTGGTATGTTGAATCAGCCAATGTGTGATCAGAGTGCTTGAACTTAGTTCCTTGCAGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 28377 44 + 294542 TAAGGGCCGCGCATAAGTTGGTCCCACCTCAATCAATGATAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165700 44 + 636262 TAAGGGCCGCGCATAAGTTGGTCCCACCTCAATCAATGATAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 163253 44 + 647215 TAAGAGTAGCCCATGAGATGGTCCCACCTCAAGCAAGTAAAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 28421 23 + 294542 CTATTGTGGTCGCGATTGAGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165744 23 + 636262 CTATTGTGGTCGCGATTGAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 163299 23 + 647215 CTATTGTGGTTGCAATTGGGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 28444 90 + 294542 GATGAGCTCAGTTGTGTACCTTTACCCCATGCTAGATGTGGTCAGCAGTTACTGGCCCTTGCAAGTCCGCCCAACAGTGCACAAGTGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165777 88 + 636262 GATGAGCTCAGTTGTGTACCTTTACCCCATGCTAGATGTGGTCAGCAGACAC--ACCCTTATAAGTCTGCCTAACAGTGCACAAGCGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 163322 90 + 647215 AATGAGCTCAGTTGTGTACTTTGTCCTCATGGTAGATATAGTCAGCAGTTACTGGCCCTTGCTAGTCCCCCCAACAGTGGACAAGTGCTG + +a +s mr.mrrefChr5 28534 78 + 294542 AGCTCATAGGATTAGAATAGTGGTGGCCTGATATGATTGTATTTCTGAACACGTTCCTGTGGCTGCTAAAATGTCCCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165882 77 + 636262 AGCTCATAGGATTTGAATAGGCATGGCCTGATATGATTGTA-TTCTGAACACGTTCCTGTGGCTGCTAAAATGTCCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 163412 78 + 647215 AGCATATAGGATTACAACAGTGGTTGCCTGATCTGATTGTATTTCTGAACTTGTTCCTGTGGCTGCTAAAAAGTCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 28612 286 + 294542 CCTCTACTAGAACAATTTCTCCCAGAAATTGCTGGTAACAAGGGGTTCCTTGAGAGATAAGCTAGTTTCTGAAAGCCCAAAGTTCACACTAATCAATTGAGACGTATTCAAACTTGATAATTGTAGTCGCCAGGATTAGAATGACTCACATGTGAAGCAACATGTAGATTTACAGGCTCTTTTATGGAGGGTAATTCAGAGATTAATACTGCTTCTTACGTAAACCACTTGCCCCATAGAGAAACCAACTGAACACCATGTGTAAAGTCAGTATTCACCTCAAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 165960 280 + 636262 CCTCTACTAGAACAATTTCTCCCAGTAATTGCTGGTAACAAG-----CCCTGAGAGATGGGCTAGTTTCTGAAAGCCCAAAGTTCACACTAATCAATTGTGAAGCTTTCAAACTTGATGATTGTAGTCACCAGGATTAGAATGACTCACATGTGAAGCTACAAGTAGATTTACAGGCTCTTCTATGGAGGGTTATTCAGAGATTAATACTGCTTCCTACGTAAACCACTTGCCCCATAGAGAAACC-ACTGAACACCATGTGTAAAGTCAGCATGCACCTCAAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 163490 284 + 647215 CCTCTATTAGAACATTTTTTCCCAGAAAGTGCTGGTAATAAGGGGTTCCTAT-GAAATAAGCTAGTTTCTGAAAACCCAAAGTTCACACGAATCAATTAACGCCTAGGTAGACTTGATAATTGTAGTCGCGACGATTAGGTTGACTCACATATGAAGCAACATGTGGATTTACAGGCTCTTTTATGAAGGGTAATTAAGAGATTAATACTGCTACTTACGTAAACCACTTGC-CTATAGAGAAACTAATTGAACACCATGTGTAAAGTCTGTATTCATCTCAAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 28898 287 + 294542 AACACAAGGTAGGATTTGCTTTTTCTTTATCATATAAGATTAATGTTTGGTCTAACCAGAGGACCACCAATCATTTCCACAAACTTTTACAATTTGGAATTGCCTGGAGTCTACAATTTATGGTTAGTCTCTCCCTGATTTTCTCCAAGAGTATCTATAAATAAGACATGATTATCGAGCTGCTGCACAGCATTGTAGTCTGGCGGTACATCATCTTTGAGGTTTTCAGTGTAACAGCAGTGTCTGTTTGTCTACCACATCAAATTCAATTATAGAAGCCAATAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166243 269 + 636262 AACACAGGGTAGGATTCGCTTTTTTTTTATCATATAAGATTAATGTTTGGTC---CCAGAGGACCACCAATCATTTCCACAAACTTTTACAATTTGGAATTGCCTGG-----ACAATTTATGGTTGGTTTTGACCTGATGTTCCCCAAGAGTATCTATAAATAAGACATGTTTATTGAGC----------CATTGTAGTCTGGCGGTACATCATCCTTGAGGTTTTTGATGTAACAGCGGTGTCTGTTTGTCTACCACATCAAATTCCATTATAGAAGCCAATAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 163774 287 + 647215 GACACAAGGTAGGATTTGCTTTTTCTTTATCATATAAGATTAATGTTTGGTCTAAGCAGATGACAACCAAGCATTTCCACCAACTTTTACAATTTGGGATGGCTTGGAGTCTACAATTTATGGCTAATCTCTCCCTGATTTTCTCCTAGAGTATCTATAAATAAGACATAATTATCAAGCTGCTGCACAGCATTGTAGTTTGGGGGTACATCATGTTTGAGGTGTTCAGTGTAGCAGCAGTGTCTGTTTGTCTACTGCAACAAATGCAATTATAGGAGCCAATAGTC + +a +s mr.mrrefChr5 29185 183 + 294542 ACAATTCATACCTTTAATATATTCATTAATCACCTTTAAGCCACTATAGTAGCAAGAAATAATTTCTGCTGCTCACAGGTCTATGTCCCCCCATGGGACTGGGTCCAGGGCATATCACCCACCATTGTCTTGAGGGACTAACCATATATAATGACATGGATAATTCAATTGTATGTCACAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166515 181 + 636262 ACAATTCATACTTTTAATACATTCATTAATCACCCTTAAGCCACTATAGTAGCAAGAAGTAATTTCTGCTGCT--CAGGTCTATGTCCCCCCATGGGACTGGGTCCAGGGTATAGCACCCACCATTGTCTCGAGGGACTAACCATATATAATGACATGGATAATTCATTTGTATGTCACAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 164061 183 + 647215 ACAATTCATACCTTTAATTTATTCATTAATCACCTTTAAGCCACTATAGCAGCAGGAAATAATTTCTGCTGCTCACAGGTCTATTTCCCCCCAGGGGACTGGGTCCAGTGCATATCACCCGCCATTGTCTTGAGGGATTAACCTTATATAACGTCATGGTTAATTCAATTGTGTGTCACAACA + +a +s mr.mrrefChr5 29368 15 + 294542 ATTTAAATTGTCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166696 15 + 636262 ATTTAAAGTGTCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 164246 11 + 647215 ATTTACATTG-A--- + +a +s mr.mrrefChr5 29383 23 + 294542 TACACTGAATGACATAGAATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166713 23 + 636262 TACACTGAATGACATAGAATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 164257 19 + 647215 ----CTGAATGACATAGTATGTT + +a +s mr.mrrefChr5 29406 162 + 294542 CAACATGAAGTTTCTCCAATGTAGGAAGATGTAATTATGTGGGGTATAGGCACGATGTAAAACAATCAAGGAGTAAAACTCGGCCATGTGGATGGGAAATAAGGAGGGTATCTCTGATAGCAGACATAGCCTATTCTGTCATTCAGCACATAAAGGGGATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166737 161 + 636262 CAACATGAAGTTTCTCCAATGTACGAAGATGTAATTATGTGGGGTATAGGCACGATGTAAAACCATCAAGGA-TAAAACTCGGCTGTGTGCATGGGATATAAGGAGGGTATCTCTGATTGCAGACATAGCCTATTCTGCCATTCAGCACATAAAGAGGATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 164276 162 + 647215 CAACATGAAGTTTCTCCAATGTTGGAAGATGTAATTATGTGGGGTATAGGTATGATGTAAAACAATCAAGGAGTGAAACTAGGCCATGTGGATGGGAATTAAGGAGGGTATTTTTGATAGCAGACATAGCCTATTCTGTCCTTCAGCACATAAAGGGGATAA + +a +s mr.mrrefChr5 29568 208 + 294542 ATCCCCCTGCTAATTTTAGGACATGTTGGATACTTGCCAGACCCCTACAGACCCACTGGTCCCCTGTGTACACTTTTGCTATCTAACATGCAGTCTTAATGAGGACGTGAAAGCTAAAGCATATCTCACATGACAGTGTACTTGGTCTGGTTGAACAAATTGACCAGTTGTGCGCCATTGGAGTTCACCACCTACAAGATATACCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 166898 205 + 636262 ATCCCCCTGCTAGTTTTAGGACATGTTGGAAACTTGCCGGACCCCTACAGACCCACTGGTCCCCTGTGTACACTTTTGTCATCTAACATGCAGTCTTAATGAGGACGTGAAAGCTAAAGCATACCTCACATGACAGTGTACTTGGTCTGATTGAACAAATTGACCAGTTGTGCGTCATTGGAGTT---CACCTACATGATAGACCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 164440 203 + 647215 ATCCCCCTGCCAATTTTAGGACATATTGGATACTTGCAAGACCCCTACAGACCTAATGGTCCTCTGTGTACACTCTTGCTATCTAACCCGCAGGCTTAAACAGGACATGAAAGCTAAGGCATATCCCACATGATAGTGTACTTGGTTTGGCTGAACAGATT-----GTCGTACCCCATTGGTGTTCACCACCTACAAGATATACCCCT + +a +s mr.mrrefChr5 29776 17 + 294542 TCACCATATCTTTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167103 17 + 636262 TCACCATATCTTTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 164644 17 + 647215 TCATCATATCTTTTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 29793 27 + 294542 TAACTATCAATTCTGAATACATCCGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167120 27 + 636262 TAACTATCAATTCTGAATACAGCCGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 164664 27 + 647215 TAACTATCAATTCCAAATACATCCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 29820 41 + 294542 TGCATAACAAATATGATTCTACAACCTCGACATCCAAGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167147 41 + 636262 TGCATAACAAATATGATTCTACAACCTCGACATCCAAGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 164706 41 + 647215 TGCATAACAAATATGATTCTATAACCTCGACATCCAAGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 29861 98 + 294542 AACACCAACATCATAATTCCTGAAGTGAACTCACATTCTCCAGGTGAACTCAGTCCATTGCCATATAAATGAATGTCAGGTGAAGATAGGATGGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167188 98 + 636262 AACACCAACATCTTAATTCTTGAAGTGAACTCACATTCTCCAAGTGAACTCAGTCCATTGCCATATAAATGAATGTCAGGTGGAGATAGGATGACTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 164749 96 + 647215 AACACCAACAGCATAAATCCTGAAGTGAACTCACACTCTCCAGTTAAACTCAGTCCATTGCCATATAGATGAATGTTA--TGAAGGTAGTAAGGCACC + +a +s mr.mrrefChr5 29959 24 + 294542 AAAACTAATATTTACACAGGCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167286 24 + 636262 AAAACTAATATTTACACAGGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 164980 24 + 647215 AAAACTAATATTTATACAGGCTGG + +a +s mr.mrrefChr5 29983 163 + 294542 TCCCTTCCCCTACACAACCATGGGGTAACAACATGAAACACTTACCAACGGAACTCACAGGAGTTGAACTCTATCAAAGTGCACCTAAAAACACCTAAGAACAGGTCTGGTCTAGCTGCATAAGTGGGTTACAGAAGCCAACGTGGCGGCTTGCTTCTGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167310 163 + 636262 TCCCTTCCCCTATACAACCATGGGGTAACACCATGAAACACTTACCCACGGAACTCACAGGCATTGAACTCTATCAAAGTGCACCTAAAAACACCTAAGAACGGGTCTGGTCTAGCTGCATAAGTGGGTTACCGAAGCCAACGTGGTAGCTTGCTTCTGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 165009 163 + 647215 TCCCTTCCTCTACACAACCATGGGGTGACAACATGAAACACTTACCAATGGAACTCACACGAGTTGAACTCTATCAAAGTGCACCTCAAAACACCTAAGAACAGGTCTGTACTAGCTGCATAAGTGGGATACAGAGGCCAACGTGGCGGCATGCCTCTGTACG + +a +s mr.mrrefChr5 30146 67 + 294542 TTTCTGGACCAAGAGTGCAGCAGTCACATCGCCACATGTGTTTATTTAAATCTACATACGGTGTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167473 67 + 636262 TTTCTGGACCAAGAGTGCAGCAGTCACATCACCACATGTGTTTATTTAAATCTACATACGGTGTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 165179 67 + 647215 TTTCTGGACTAAGAGTGTAGCAGTCACATCGCCACATGTGTTTATTTAAATCTACATATGGCGTAGC + +a +s mr.mrrefChr5 30213 154 + 294542 GGCAAGTATGCCCTAGACATGGTTTGGATCGCATGATGTACATTTTTATTCTTTATACACGGCGTTTATACACAGCGTACGGTCATCCGAGTCACACGCCAGATAAAGGACGTTCTCTCGGTGGCATTTAGATGTTTGACAACATATGGAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167544 154 + 636262 AGTAAGTATGCCCTAGACATGGTTTGGATCGCATGATGTACATTTTTATTCTTTATACACGGCGTTTATACACAGCGTACGGTCATCCGAGTCACACGCCAGATAAAGGACGTTCTCTCAGTGGCATTTATATGTTTGACAACATATGGAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 165246 154 + 647215 GGCAAGTATGCCCTAGACATATTTTGGATCGCACGATGTACAGTTTTATTCTTTATACACGGCGTGTATACACGGCGTACGGTCATCCCAGTCACACGCCAGATAAAGGACGTTCTCTCGGTCGTATTTAGATGTTTGACAACATATGGAACAT + +a +s mr.mrrefChr5 30367 13 + 294542 AAGGCTGGCTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167698 13 + 636262 AAGGCTGGCTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 165401 13 + 647215 AGGGATGACTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 30380 68 + 294542 ATGGCATTTTCTCTGTGGAAAGTACAACATAATGATGTGGGCAGGAGTGCGTCGCTTCATTCTTTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167711 68 + 636262 AAGGCATTTTCTCTGTGGAAAGTACAACATAATGATGTGGGCAGGAGTGTGTCGCTTCGTTCTTTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 165417 68 + 647215 ATGGCATTTTCTCTGTGGAAATTACAACATAATGATGTGGGCAGGAGTGCATCGCTTCATTCTTTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 30448 261 + 294542 CTTTCACACACTGCCTCACTAGCCCTGGTAAAATTGTGTAAAACTTAAATTATACTCACTCCAAAAATGTCAAAGTTGTCAAGCTAGGGGTTCTAACATTCCAAAGGCATCCTCCCATGGCAAGTTGTATGTAAACTAGATAAGGCAGCATTTTAAAAACTATTCCTACCTTAAATTTTCATTCAAAGACCTACTCGTCCTCCCCTTTCCTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTGAGCCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 167785 261 + 636262 CTTTCACACACTGCTTCACTAGCCCTGGTAAAATTGTGTAACACTTAGATTATACTCACTCCGAAAGTGTAAAAGTTGTCAAGCTAGGGGTTCTAACATTCCAAAGGCATCCTCGCACGGCAAGTTATATGTAAACTAGATAAGGCAGCATTTTAAAAACTATTCCTACCTTAAATTTTCATTTAAAGACCTATTTGTCCTCCCCTTTCCTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTGAGCCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 165485 256 + 647215 CTTTCACACACTGCCTCACTACCCCTTGTCAAATTGTGTAAACCTTAAATTATACTCACTCCAAAAATGTCAAAGTTGTTAAGCTAGGGGTTCTAACATGCCAA----ATCCTCCCATGGCAAGTTGTATGTAAACTAGATTGGGCAGTGTTTTAAAAACCATACCTACCTTAAATTTACATCCAAAGACCTACACGTCCTCCCCTTT-CTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTAAGCCTGT + +a +s mr.mrrefChr5 30709 64 + 294542 GTCCTAGGGCAAGATGTATTATGAGTACTAAGTACTGACAGGATATAGGGAATAAGGAACACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168046 64 + 636262 GTCCTAGGGCAAGATGTATTATGAGTACTAAGTACTGACAGGATATAGGGAATAAGGAACACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 165742 64 + 647215 GTCCTAGGGCAATATGTATTATGGGTACTGAGCACTGATAGGATATTGTGTATAAAGAACATAC + +a +s mr.mrrefChr5 30773 13 + 294542 TTGTTAATTACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168111 13 + 636262 TTGTTAATTACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 165806 13 + 647215 TTGTTAATTAATA + +a +s mr.mrrefChr5 30786 18 + 294542 CCTGCCAACTCATCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168124 18 + 636262 CCTGCCAACTCATCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 165822 18 + 647215 CCTGTCAACTCACCATTA + +a +s mr.mrrefChr5 30804 75 + 294542 TGTTATTGTATGTAATGTACCAAACGATAGGCTATCTATTCAAAGCAACCTAGCATAAAGTTGAGGGTGGACCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168142 75 + 636262 TGTTATTGTATGTAATGTACCAAACGATAGGCTATCTATTCAAAGCAACCTAGCATAAAGTTGAGGGTGGACCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 165909 75 + 647215 CGTAATTGTATGTATTGTACCAAATGATGGGCTATCTGTTCCAAGCAACCTAATATAAAGTTAAGGGCAAACCTA + +a +s mr.mrrefChr5 30879 82 + 294542 AAACTTCCAGTCTAGCTATGCTGCACTGGCACATAAGCCACCTCTGCTGTACTGGATTACATCCCCTTACATGTCCTGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168217 82 + 636262 AAACTTCCAGTCTAGCTATGCTGCACTGGCACATAAGCCACCTCTGCTGTACTGGATTACATCCCCTTACATGTCCTGGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 165985 82 + 647215 AAACTTCCAGTCTAGCTGCACTGCACTGGCATGTAAGCTAACTACGCTGTGCTGCTTAACATCCCCTTACATGTTTTGAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 30961 38 + 294542 ACCTGATTTTCCTTTTAAACTCAAGAAGTTTGGTGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168300 38 + 636262 ACCTGATTTTCCTTTTAAACTCAAGAAGTTTGGTGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 166067 38 + 647215 ACCTGGTTTTCCTTTTAAACTCAAGGAGTTTGGTGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 30999 135 + 294542 AGCTTGCTACAGAGCGCACCACATGGAGACTTATGAGAATATTTACAGCTTGAGCAGATATTAAATAGTAGCCTCTGGTATCATTGCCAGTATTGGATAATGACTCTGTCACACAAAATGATGACTCCAGATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168339 135 + 636262 AGCTTGCTACAGAGCGCACCACATGGAGACTTATGAGAATATTTACAGCTTGCACTGATATTAAATAGTGGCCTCTGGTACCATTGCCAGTATTGGATAATGACTCTGTCACACAGAATGATGACTCCAGGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 166105 93 + 647215 ------------------------------------------TTACAACTTGAGCAGACATTAAATAATAGCCTCTGGTATCATTGCCAGTATTGGATTATGACTCTGTTACACAAAATGATGACTCCAGAGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 31134 146 + 294542 AAGTGTAGCCCAAGAGACAGATGTTGCCTTGGAACACTACAAAAGCCAGAGTCATTCCTTCTATTGGATTGGGGAAGATTGAGGAATCTTAGGAGTACCAAGGGCTGAGCATACATATTCATCTGGAAAAGAAAGTTAGGTGGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168474 146 + 636262 AATTGTAGCCCAAGAGACAGATGTTGCCTTGAAACACTACAAAAGCCAGAGTCATTCCTTCTATTGGATTGGGGAAGATTGAGGAATCTTAGGAGTACCAAGGGCTAGGCATACAAATTCATCTGGAAAAGAGAGTTAGGTGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 166200 146 + 647215 AAGGGTTGCACAGGGGCCAGATGTTGTGTAGGCGGTCTATGAAGGGCAGAGTCACTCCTTCTATTGGATTGAGGAAGATCAAGGATTCTTAGGAGTACGAATGGCTGATCATACATATTCATCTGCAAAAGAAAGTTAGGTGGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 31280 143 + 294542 GGTAAAGTCAGGTGAAATGCTGATAGATCCCTTCAGTGTGGTGCTCTTGTTCTACTAACTGACAATGTAGCTCCAAGGGTAACTGAGACGGGGTTAGCCAATAGGGGAAGCCCACAAGTGGCCCTCACAGACAAATATCCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168621 143 + 636262 GGTAAAGTCCGGTGAAATGCCAATAGATCCCTTCAGTGTGGTGCTCTTGCTCTACCAACTGGCCATGTAGCTCCAAGGGTAACTGAGACGGGGTTAGCCAATAGGGGAAGCCCACAAGTGGCCCTCACAGACAAATATCCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 166346 114 + 647215 GGTGAAGCCAGGTGAAAAGCTGATAGATCCCTTCGGATT--TGCTCTTGTGCTAGTAACTGAGAATGTAGCTGC---------------------------TAGGGGAAGCCCTCAAATGGCTCTCACAGGAAAACATCCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 31423 32 + 294542 GGGGAGGTCTAGAACTTCAGCAGGCACCGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168784 32 + 636262 GTGGAGGTCTAGAACTTCAGCAGGCACCGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 166460 32 + 647215 GGGGAGGTCTAGAATTTTAGCAGGCACTGGCC + +a +s mr.mrrefChr5 31455 47 + 294542 CATTAAGTGTCAAGCTTATTAGCTAGTTTTGACCAACTTGATAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168819 47 + 636262 CATTAAGTGTCAAGCTTATTAGCTAGTTTTGACCAACTCGGCAATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 166492 47 + 647215 CATTAAGTACCAAGCCTATTAGTTAGTTTTGATCAACTTGATAATTA + +a +s mr.mrrefChr5 31502 227 + 294542 TATCTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAGATAACAGGATTTAAAATCAGTTCAATGTTATGGTGGTGAACTGGAGGCCACCATTCAAGGTTCTTAAATTCATACTTGTTTTATTACTTCTTGTGGCAGCTCACATATTGCCTCAAAGACATTCTTTCACATAAAAATTAGAACTTCATCATCCTGTCCCCCCCGAGTAGAGATATGTACAATAAGTGGCGATGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 168874 227 + 636262 TATCTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAGATAACAGGATTTAAAATCAGTTCAATGTTATAGTGGTGAACTGGAGGCCACCATTCAAGGTTCTTAAATTCATACTTGTTTTATTACTTCTTGTGGCAGCTCACATATTGCCTCAAAGATATTCTTTCACATAAAAATTAGAACTTCATCATTCTGACAGCCCCGAGTAGAAATATGAACAATGAGTGGCGATGCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 166539 224 + 647215 TAACTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAAATACCAGCATTTAAATTCAGTTCAGCGTTATGGTGGTGAACTGGAGGCCACCTTTCTAGGTTCTTA---TCATATTTGTTTTATTACTTCTTATGGTATATCACATATTGTCTCAAAGACATTCTTTCATATAAAGATTAGAACTTCATCATCCTGTCCCCTCCGAGTGGAGGTCCGTACAATAAGTGGAGATGCACC + +a +s mr.mrrefChr5 31729 19 + 294542 AAAGATTTCCAGGTGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169101 19 + 636262 AGAGATTTCCAGGTGGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 166764 19 + 647215 AAAGATTTCCAGGTGGACT + +a +s mr.mrrefChr5 31748 306 + 294542 AGTTACAATATTCCTGTTGACCCATTACTAACCCCCAAGAGTGCTGCCAGTCATTGAAATTTCCATTCTTTTCATTGACATATGTGCAATTGTCACCACTTCCTTGATCCTTTTAAGTCTGCAGTTTAAGAGAGACTAGGTGCAAAGATGCTACTTATTATAGGTAATGCTGAGTTAGTGGTGAGTTCATTTGATAGTGGCTATCTTGACAAAGCAATATTAATCATTCTTTGTAACTAGGTGGCTATGCTAAATAATCCTCATTATATTATTATAGGTTGAGTTACCCTTTTGAGCAGTCTCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169121 306 + 636262 AGTTACAATATTCCTGTTGACCCATTACTAACCCCCAAAAGTGCTTCCAGTCATTGCAATTTCCATTCTTTTCATTGACATATGTGCAATTGTCACCACTTCCCTGATCCTTTTAAGTCTGCAGTTTAAGAGAGACTAGGTGCAAAGATGCTACTTATCACAGGTAATGCTGAGTTAGTGGTGAGTTCATTTGATAGTGGCTATCTTGACAAAGCAATATTAATCCTTCTTTGTAACTAGGTTGCCATGCTAAATAATTCTCATTATATTATTATAGATTGAGTTACCCTTTTGAGCAGTCTCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 166783 305 + 647215 AGTTACAATATTCCTGTTGGCCCATTGCTAACCCCCAAGAGTTTTGCCAGTCATTGAGATTTCCATTCTTTTCATTGACATATATGCAAATGTAGCCACTTCCTTGATCCTTTTAAGACTGCAGTTTAATGGAGACTAGGAGAAAAGCTGCTACTTATTATAGGTAATGCCAAGTTATTCGTGAGTTCATCTTATAGTGGATATCTCAACAAAGCAATACTTATCATT-TTTGCAACTAGGTGGATATGCTAAATAATCCTCATCATATTATTATAGGTTGAGTTACCCTTTTGAGCATTCTCACA + +a +s mr.mrrefChr5 32054 137 + 294542 AGCTTATATATATGGCCTATTAACCAATGTTAATAGTGTATCATAATACGTATATATTATGAGGTTATTTCTATAAATCTATAGGTACAACTAGAGAACTACCTACAAAGTCAGTACTCAAATATTGTGTCAAAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169427 133 + 636262 AGCTTATATATATGGCCTATTAACAAATGTTAATAGTGTATCATA----GTATATATTATGAGGTTATTTCTATAAATCTATAGGTACAACTAGAAAACTACCTACAAAGTCAATACTTAAATGTTGTGCCAAAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 167095 136 + 647215 AGCTTATATATATGACCTAGTAACCAATGTTGGTAATGTATCATAATACGTACATATTATGAGTTTTTGTCTATAAATCAAT-GGTACAACTACAGAACTACCCACAAAGTCAGTACTCAAATATTGTGTCTAAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 32191 140 + 294542 AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTAGAAGTACTACACTTAGTTGAAAACTGACAGATAAGTCATACTGTATGCTGGTATAGTGCATTTTCGGCCATGCTGGGAAATTAGAGGTCATGGCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169560 140 + 636262 AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTGGGAGTACTACACTTAGTTGAAAACTAACGGATAAGTCATACTGTATGCTGGTATAGTGCATTTTCGGCCATGCCAGGAATTTAGAGGTCATGGCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 167235 140 + 647215 AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTAGAAGTACTACACTTAATTGAAAACTGACAGATAAGTCATACTGTATGCTTGTATAGTGCATCGTCTGCCATGCTGGAAAATTGGAGGTCATGGCCCG + +a +s mr.mrrefChr5 32331 15 + 294542 CTCTTTCTTTTGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169700 15 + 636262 CTTTTTCTTTTGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 167379 15 + 647215 CTCTTTCTTTTGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 32346 198 + 294542 CATCTTGGGAAAAACAACAACTGCCAAGGGGGGGTAAATTATGAATCCCTTGAGCACCATACATAACCATCCAACCATTCCAGTTATTAGGTATCAACTTTGCCTTTGCTCATCTTGTATTCCTCTTGAACACTTTTACACCATCCTGACAGCCTTTGAATTTAACAGACAGGCAATCTAGACAGCCTCTTAACCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169715 198 + 636262 CATCTTGGGAAAAACAACAACTGCCAAGGGGGGGTAAATTATAAATCCCTTGAGCACCATACATAACCATCCCACCATTCCGGCTATTAGATATCAACTTTGCCTTTTCTCATCTTGTATTCCTCTTGAACACTTTTACACCATCCTGACAGCCTTTGAATTTAACAGACAGGCATTCTAGACAGCCTTTCGATCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 167396 197 + 647215 CATCCTGGGAAGAACAACAACTGCCAAGGGGGGCTGGATTATGAATCCCTTGAGCATCATAAATGACCATCCAAGCATTCCAGTGATTAGGTATCAACATTGTGCTCGCTCTTCTTGTATTCATCCTGAACACTTTTACACCATCCTGATCACCTTTGAATTGAA-AGACAGCCAATCTGGACAGACTCTTAACCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 32544 23 + 294542 ATGGAAACAATTTAAAGCAAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169913 23 + 636262 ATGGAAACAATTTAAAGCAAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 167601 23 + 647215 ATGGAAACAACTTAAAGCAAATA + +a +s mr.mrrefChr5 32567 86 + 294542 GATAGTTTGCTGTTGAGAGCTTTGACACCACAGAGCAAGAGGAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAGCCATTAGGGCAAGCTTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 169936 86 + 636262 GATGGTTTGCTGTTGAGAGCTTTGACACCACAGAGCAAGAGGAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAACCATTAGGGCAAGCTTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 167628 67 + 647215 GATAGTTTTCTGTTGAAAGCTTTAACATCAGAAAGCAAGACAAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAGC------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 32653 97 + 294542 GGCAAGCTTAAAGGAATAGAGGCCCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTAAAGCAAGGAAGCAAGATATAGGTCCAAGTGAAAATTTATCTATCGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170026 97 + 636262 GGCAAGCTTAAAGGAATAGAGGCTCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTCAAGCACGGAAACAAGATATAGGTCCAAATGAAAATTTATCTATCGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 167695 97 + 647215 ACCAAGCTTAAAGCAATAGAGGTCCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTAAAGGAAGGAAGCAAAATTTAGGTCCAAGTGAAAATTTATCTAGTGAG + +a +s mr.mrrefChr5 32750 50 + 294542 TGATTACTAACCAGGGGAGATGTGAGAATCACTTCATATTATTGGACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170123 50 + 636262 TGATTACTAACCAGGGGAGATGTGAGCATAGCTTCATATCATAGGACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 167793 48 + 647215 TGA--ACCAACCAGGGGAGATGTGAGAATCACTTGGCATTATTGGACAGC + +a +s mr.mrrefChr5 32800 8 + 294542 TTGGGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170177 8 + 636262 CCGGGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 167841 8 + 647215 TTGAGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 32808 212 + 294542 CCACTTCATATTATGTGTCTGTATCTTTGATTTGCAAGAATAGTGTTTCCTAAGAGTGGCTGCCTTCTGAGAGCCCTCCTCAAATGGATGTTATACAGCAAGAGTGCATGAGTTGAAAACATTGTGCATCCTGAAGAGAAAAAGAATGGGATTATGGAAATTAAACTGTCAAATTGCAGTGTAGACATAGAAACTACTGCAAATCTTCAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170185 209 + 636262 CCACTTCATATTATGTGTCTGTATCTTTGATTTGCAAGAATAGTGTTTCCTAAGAGTGGCTGCCTTCTAAGAGCCCTCCTCAAATGGATGTTATCCAGCAAGAGCGAACGAATTGAGAACATTGTGCATCCTGAAGAGAAACAGAA---GATTATGGAAATTAAACTGTCAAATAGCAGTGTAGACACAGAAACTACTGCTAATCTTCAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 167854 212 + 647215 CCACTACATATTATGTGTCTGTACCTTTGATTTGCAAGAATAGCGTTTTCTAAGAATGGTTGCCTTCTGAGAGCCCTCCTGAAATGGATGTTATACAGAAAGACTGCATGAGTCGAAAACATTGTGCATCCCGAGTAGAAAAGGAATGGGATTATGGAAATTAAACAATCAAATTGTAGTGTAGACATAGAAACTGCTGCAAACCTTCAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 33020 125 + 294542 CTGATGTGGTCCACTAATCAATACACCTACAATCTACTTCTCTAACTAATCCGGCCCCTTGCAGTGCACAAATACAAATTACTGCAATCTTAGATGAACCACTGGCTGTAGTCCACTAATTAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170394 125 + 636262 CTGATGTGGTCCACTAATCAATACACCTACAATCTACTTCTCTAACTAATCCGGCCCCTTGCAGTGCACAAATACAAATTACTGCAATCTTAGATGAACCACTGGCTACAGTCCACTGATTAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 168072 125 + 647215 CTGATGTTTTCCACTAATCGATACACCTACAACCAATTTCTCTAATTAATCTGGCCCCTTGCAGTACACAAATACAAACTACTGCAATTTCAGATGAACCACTGGCTGTAGTCCACTAATTAATG + +a +s mr.mrrefChr5 33145 8 + 294542 TGTCTACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170519 8 + 636262 TGTCTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 168198 8 + 647215 TATCTACG + +a +s mr.mrrefChr5 33153 108 + 294542 AGTTCTCTAATTGATCCTGCCTTAAAGAAGAAAAAGCACAGCCAATAGTAACAACCCCTAGTGATAACCATCACAAAATTTGGAGATGGAGTGCCCCCTTCTTGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170531 108 + 636262 AATTCTCTAATTGATCCTGCTTTAAAGAAGAAAAAGCACGGCTAATAGTAACATCTCCTAGTGAGAACCACCACAAAGTTTGGGGATTGAGTGCCCCCTTCTTGCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 168206 108 + 647215 TGTTTCCTAATTGATCCTGCCTTAAAGAAGAAAAAGAACAGCCAATAGTAACAACCCCTAGTGATAACCATCACAAAATTTGGAGATGGTGTGCCCCCTTCTTGGATG + +a +s mr.mrrefChr5 33261 130 + 294542 GAGCCCCCTTCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTCATGCGGGCCCCGTCAGTTTGGGATGTGTCATGTCCAGCCATAGGCGATAAGGCCAAGTCTATAGAGCTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170640 130 + 636262 GAGCCCCCTTCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTTATGCGGGCCCCATCAGTTTGGGATGTGTCATGTCCAGCCATAGGCGATAAGGCCAAGTCTACAGAGCTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 168314 130 + 647215 GTACCCCCTCCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTCCTGCTGGCCCTGTCAGTTTGGGGTGTGTCATGTCCAGCCATAGGTGATAAGGCCAAGTCCATAGAACTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT + +a +s mr.mrrefChr5 33391 76 + 294542 ACTATCATGAGTGTACTGATGGGTCTAGACAATTTGCATGTCTCATAATGGATTGCTTACACCTAAATGTTGAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170771 76 + 636262 ACTATTACAAGTGTACTGATGGGCTTAGACAATTTGCGTGTCTCATAATGGATTGCTTACACCTAAATGTTGAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 168444 69 + 647215 GCTATCATGGGTGTACCGATGGGTCTCGACAATTGGCATGTCTCATAATG-------TACACCTAAATGTTGAATT + +a +s mr.mrrefChr5 33467 564 + 294542 TGACAGAGATGCAATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAACATACAGTCTTCGACATCTATGTGACTTCAACCAGTGATATCCCTATCCCGAAATCCCATTGGAACTAGGAGGGCTGACTGATTGTTCTTGTTCTATTGAATGCTCTCACTCTACAACTGTAATGATAGCTAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGAGAGTGTGAGCGCAGTGCCTCACCTTCCTGTTTCTGACTGAACTACTTAACCTAAAATAATGCCACAACTAGCTTTGCAAAACAAGTCAGTATCTCAAATATCCTAATAGACACAAAAGAAACAGCCATTAGCATTCCATATGTCCAACCAGCAATGTGCTCCATGAGAGGGAGTTTTTAAACTAAGTCATCTCCTTTACATCCATCCTCTATTTATCTAGTGGAATCCACTAGTAACTATTCTTCCCTTCAGGAGTAACAGTATCTTATGGATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTATATAAGTCACCCCCATTAGGCAGAAATATGTCCAGTTATTTGCAGGAAAGGTCTGAATAAGATACTAAATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 170847 554 + 636262 TGACAGAGATGCAATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAACATATAGTCTTCGATATCTATGTGACTTCAATCAGTGATATCCCTATCCCAAAATCCCATTGGAACTAGGAGGGCTGACTGATTGTTCTTGTTCTA--GAATGCTCTCACTCCACAACTGTAATGAGAGAAAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGAGAGTGTGAGCG--------CACCTTCCTGTTTCTCACTGAATTACTTAACCTACAATAATGCCACAACTACCTTCGCAAAACAAGTCAGTATCTCAAATAACCTAATAGACACAAAAGAAACAGCTATTAGCATTCCATATGTCCAACCAGCAATGTGCTCCATGAGAGGGAGTTTTTAAACTAAGTCATCTCCTTTACATCCATCCTCTATTTATCTAGTGGAATCCACTAGTAACTATTCTTCCCTTCAGGAGTAACATTATCTTATGGATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTATATAAGTCACCCCCATTAGTCAGAAATATGTCCGGTTGTTTGTAAGAAAGGTCTGAATAAGATAGTAAATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 168514 544 + 647215 CGACAGAGATGCGATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAATGGACAGTCTTTGACATCTATGTGATTTCAACAAGCAATATCCCTATCCTGAAATCCCATTGGAACTGGGAGGACTGATTCATTGTTCTTGTTCTATTGA---CTATCCCTCTGCAATTGTAAGGATAACTAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGGGAGTGTATGTGCAGTGCCTCACATTCCTGTTTCTGACTGAACTACTTAACCTAAAATAATGGA------TGCTTTGCAAAACACCTCAGTATCTCAAAAATCCTAATAGACACAAAAGAAAAAGCCATTACCAGTCCATATGTCCAAGCAGCAGTGTGCT----------GAGTTTTTGAACGAAGTCATCTCCTTTACATTCATCCTCTATTTATCTAGTGGGATCCA-GAGTAACTATTCTTCCTTTCAGGAGTAACGGTATGGTATGAATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTGTATAAGTCACCCCCATTAGGTAGAAATATGTCCAGTTATTCGCAGGAAAAGTCTGAATAAGATACTAAATGTG + +a +s mr.mrrefChr5 34031 229 + 294542 CCTACAGTGCCATGTTGCGTAGTTCAAATAAGTCAGGAAAAAGCAGAGTTGTGGTTCGATGCAGACATGGGTATTACGGTGCATTTAATCTTCCCTCATTTTGAGACTAATAAGGTTAAGAGTGAAAGGTAAACCAGACAAATAACTCAGAATGGAAGGCAAATTTACATCCTAGCTTAGCCATAATACTTACAAAGTGGAAAGTTTAACGTCAAATTATGCATTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171415 223 + 636262 CCTACAGTGCCATGTTGCGTAGTTCAAATAAGTCAGGAAAAAGCAGAGTTGTGGTTCCATGCAAACATGGTTATTACAGTGCATTTAATCTTCCG------TGAGACTAATAAGGTTAAGAGTGAAAGGTAAACCAGACTAATAACTCAGAATGGAAGGCAAGTTTACATCCTAGCTCAGCAGTAATACTTAAAAAGTGGAAAGTTTAACGTCAAATTATGCATTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 169058 172 + 647215 -------------------------------------------------------TCGTTGCCGATATGGGTATTACGGTGCATTTAATCTTCCCTCATTTTGAGATTAACAAGATTAAGAGTAACAAGTAAATCAGACAAATA--TTAGAATGGAAGGCAAATTTACTTCCTAGCTTAGCCATAATACTTACAAAGTGAAAAGTTTAAATGCAAATTATGCATCTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 34260 74 + 294542 TGTCGACTGAGGAGATCCGAGTGGCCAATGGATGTGGAGACAGTTTTTTAGTGCCCACCTGTTTTCATAAGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171638 73 + 636262 TGTCGACTGAGGAGATCTGAGTGGTGAATGGATGTGGAGACTGTTTTTTAGGGCCCACCTGTTTTTATAgtta- +s simRat_chr6.simRat.chr6 169236 74 + 647215 TGTTGACTGAGGAGATCCAGGTGGCCAATGGATGTGGGGACAGTTTTTTGGTGCCTACCTGTATTCATAAGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 34334 36 + 294542 ATATCTTCTCTGCTGCAGTAGATCTCCTAAATTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179059 36 + 636262 GTGTCTTCCCTACTGCAGTAGATCTCCTAAATTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 169310 36 + 647215 ATATCTACTCTGCTGCAGTAGATCTCCTAAATTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 34370 27 + 294542 GATTACCTCCCCCTTTTCAATTACTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179095 27 + 636262 GATCACCTCACCCTTTTCAATTACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 169347 26 + 647215 TACTACCTCCCCGTTTTCAATTACTT- + +a +s mr.mrrefChr5 34397 117 + 294542 CAGCCAAATAATATCATGAACATCTCAGAATTTACCACTTGGGTGCACATGCTCTACTAGTTCACTAGCTCCTGTGGCAGGTTACAAAAACAGCCAGCCCAGGATTTGGGGATATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179133 117 + 636262 CAGCCAAATAATATCATGAACATCTCAGAATTTACCACTTCGGTGCACGTGCTCTACTAGTTCACTAGCTCCTGTGGCAGGTTATAAAAACAGCCAACCCAGGATTTGGGGATATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 169373 112 + 647215 -----CAATAATATCATAAACATCTCCGAATTTGCCACTTGGGTGCACATGCTCTACTAGTTCATTAACTCCAGTAGAAGGTGACAAAAACAGCCAGCCCAGGATTTGGGGATATAC + +a +s mr.mrrefChr5 34514 99 + 294542 GTAAACCATTTCTTGCTGCATTTAGGGCAAGACTTTTGACCTCCTCCTGACACCATGATGCTACTGCAGAGACCTGGTATAATGCTACATTCTTATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179251 99 + 636262 GTATACCATTTCTTGCTGCATTTAGGGCAAGACTTTCGACCTCCTCCTGACACCATGATGCTACTGCAGAGACCTGGTATAATGCTGCATTCTTATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 169485 98 + 647215 ATAAACCATTTCTTACTGCATTTAGGGCAAGATTTTTGACCTCCTCCTGACACCAGGAT-CAACTGCAGAGCCCTGATATAATGCTACGTTCTTATGGT + +a +s mr.mrrefChr5 34613 83 + 294542 CTTTATTTTCTTACTATGTCAGGTAACTCTATCAGGTGACTCACACTCCATTTATGAACCCACACATACTACTGAAAAGATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179350 83 + 636262 CTTGATTCTCTTACTATGTCAGATAACTCTATCAGGTGACTCACACTCCATCTATGAACTCACATATACTACTGAAAAGATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 169596 83 + 647215 CTTTATTTTCTTAATTTGTCAGGTAGCTCTATCAGGTGACTCACACTCCATTTATGAACCCAACCATACTAATGAAAAGATAC + +a +s mr.mrrefChr5 34696 321 + 294542 CACAAGCTTATACTGCTCTCCTTAGTGTTTTTATGGCCAGACACAGAACAAACTCTTCATGTTGTGCTTAATGTTGGATATGTGCTTCTGAGCATGCCTGTTTTTGAGTAGTTACTCAAGGATGTATTTTGGCTTAGGTAGAGTGGTAATAAGGTTGCATACATACACTGCCAACATTGTTTGACTTGTGCATTAAGCTGACCACAACTCAAATTTAACCTGGCTGTCCCATATACCTGTCCAATCTGCACTCTCTTATCCATTTACAGTTTCTTTCCTGAAGGCCTGAAACCCTAACTTGTCAGGCACACACTTAGACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179443 320 + 636262 TACAAGCTTATACTGCTCTCCTTAGTGTTTTTATGGCCAGACACAGAACAAACTCTTCATATTGTGCTTAATGTTGGATATGCGCATCTGAGCAAGCCTGTTTTTGAGTAGTTACTCAAGGATGTATTTGAGCTTAGGTAGAGTGGTAATAAGGGTGCATACATACGCTGCCAACATTGTTTGACTTATGCATTAAGCTGACCACAACTCAAATTTAGCCTGGCTGTCCCATTTACCTGTCTAATCTGCGCTCTCTCATCCATTTACAGTTTCTTTCCTGGAGGCCTGAAACCCTAACTT-TCAGGCACACACTTAGACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 169679 321 + 647215 CACAAACCTATACTGTTCTCCTCAGTGTTTTTATGGCCAGACACAAAACAAACTCTTCATGTTGTGCATAGTGTTGGATATGTGCTTCTGAACATGCCTGTTCTTGAGCATTTACTCAAGGATGTATTTTGGCCTAGGTGGACTGGTCATAAGGTTGCATACATACACAGCCAACATTGTTTGATTTGCACATTAAGCTAACCAGAACTTGAATTTAACCTGGCTGTCCCGTATACCTGTACAATCTGCACTCTCTTATCCATTTGCAGTTTCTTTCCTGAAGACCTGAAACCCCATCTTGTCAGGCACACACTTAGACCA + +a +s mr.mrrefChr5 35017 243 + 294542 GCTGACTCTCCATGCACTATTCTGCTTACTTCTAGCTCAAAAAGCAGGGGCATTGTCATAAACTGCCAGATCATGCAACTAGCCAGACCCTACAATCATGGAACAAGGCTAGATCATGCAATTTGTTAAACCCTACAACCATGGAACAAGGCTAATCTTAGTGCCATTCTAATCTTGGATTAACATGCTTTTACTTATCCATACTGGTATTGCTTAGAATGATGATTACAGTTACTCCCTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179763 243 + 636262 GCTGACTCTCCATGCACTATTCTGCTTACTTCTAGCTCAAAAAGCAGGGGCATTGTCATAAACTGCTAGATCATTCAACTAGCCAGACCCTACAATCATGGAACAAGGCTAGATCATGCAACTTGTTAAACCCTACAACCATGGAACAAGGCTAATCTTAGTGCCATTCTAATCTTGGATTAGGACGCTTTTACTTATCCATACTGGTATTGCTTGGAATGATGATTACAGTTACTCACTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 170001 223 + 647215 GCTGACTCTCCATGCACTCTTCTGCTCATGTTTAGCTCAATAAGCAGGGGCATTGTCAAAGACTGCCAGATCATGCAACTAGCCAGACCCTACAATCACGGAACAAGGCTAGATCGTCCAATGTGTTAAACCCTACAACCATGGAATAAG--------------------AATCTTGGATTAACATACTTTTATTTATCCAAACTGGTATTGCTCAGAATGATGATTAGAGTTCCTCCCTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 35260 91 + 294542 TCCACTGTCCTTGATCGCTTTGTAGGAGAATTTGTGGGATTTAGACTACATATTTTGCTTTTCCATGGTGAGTCACTCTCACCATGTAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180006 91 + 636262 TCCACTGTTCCTGATCACTTTGTAGGAGAATTTGTGGGATTTAGACTATGTTATTTGCTTTGCCATGGTGAGTCACTCTCACCATGTAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 170226 76 + 647215 TCCACTGTCCTTGAAAGC-TTGTAGGAGAATCTATGTGTTTTAGACTACATATTTTGCTTTTCCATG--------------CCCTGTAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 35351 32 + 294542 CATGTTTTCTTTGCATGTATATGTCTACACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180099 32 + 636262 CATGTTTTCTTTGCATGTATATGTCTACACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 170302 32 + 647215 CATGTTTTCTTTGCATATATATGTCTAAACTC + +a +s mr.mrrefChr5 35383 196 + 294542 TCGGATCATCAAACACATATTTTGACTCTACGTATACAAAGAGAATTTGCAGAGTAAAAATCTCTCAACATGAAAGTGGAGCTCCCATGTTGTGCGTGGTGCACTGTGCATGGGCACAATGAACAGCTGCAGCGTAGTATCCCTCTGACTGTTTACGACTACAATGGCACATGCTTTGTTTCTACCTACAAACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180133 196 + 636262 TCTGATCATCAAACACATATTTTGACTCTACGCATACAAAGAGAATTTGCAGAGTAAAAATCTATAAACATGAAAGTGGAGCTCCCATGTTGTGCGTGGTGCACTGTGCATGGGCACAATGAACAGCTGCAGCGTAGTATCCCTCTGACTGTTCACGCCTACAATGGCACATGCTTTGTTTCTAGCTACAAACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 170334 174 + 647215 TCGGCTCACCAAACACATATTTTGATTCTATGTATACAAAGAGAATTTGCAGAGTAGAAATCTCTCAACATGAAAGTGGAGCTCCCACGTTGTGTGTGGTGCACTGTGCATGGACACGATGAACAG----------------------CAGTTTATGACTACAATGGGACATACTTTGATTCTACCTACGAGCAAC + +a +s mr.mrrefChr5 35579 6 + 294542 ATACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180329 6 + 636262 ATACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 170509 6 + 647215 ATACAG + +a +s mr.mrrefChr5 35585 66 + 294542 CAGAGCACAGTCCATCTTTAGAAAGTCAAAACTGCAAAATAGGGTAGGTCTCTAAATGCTCTGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180336 66 + 636262 AAGTGCACAGTCCATTTTTAGAAAGTCAAAATGGCAAAATAGGGTAGGTCTCTAAATGCTCTGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 170515 66 + 647215 CAGAGCACAGTCCATCTTTAGAAGGTCAAAACTGCAAACTGGGGTGGTTCTATACATGGTCTGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 35651 146 + 294542 TGTTGAATTGCTACTATATGCAATTATCAATTGCTTCAACAAAGGCGTAGCATGTCCCCGGCCTCTGTTTAAAGTCCTAGTTGCTTAGAAAAGCACTAGAGTGTGCAAGTAACAGGTGAAATGGGCAGATTCAACACTTGCTGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180402 146 + 636262 TGTTGAATTGCTACTATATGCAATTATCAATTGCTTCAACAAAGGCGCAGCATGTCCCCGGCCTCTGTTTAAAGTCCTAGTTGCTTAGAAAAGCACTAGAGTGTGCAAGTAACAGGTGAAATGGGCAGATTCAACACTTGCTGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 170642 146 + 647215 TGTTGAGTTGCTACTTTATGCAATTATCAATTGCTTCAATAAAGGTGTAGCATGTCCTCAGCCTCATTATAAAGTCCTAGTTGCTTGGGAAAGCACTAGAGCATGCAAGTAAAAGGTGTAATAGGCAGATTTAACATTGGGTGGCT + +a +s mr.mrrefChr5 35797 11 + 294542 GTTGTGTTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180551 11 + 636262 GTTGTGTTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 170788 11 + 647215 GTTGTCTTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 35808 51 + 294542 GGTTCCCTATCCCTTAATATGAATTACTCGTTACGACAATCTGCCTTGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180604 51 + 636262 GGTTCCCTATCCCTTAATATGAATTACTCGTTACGACAATCTGCCTTGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 170799 51 + 647215 GGTTCCCTATCCCTTAGTATGAACCACTAGTCACTGCAATCCGCCTTGCAA + +a +s mr.mrrefChr5 35859 314 + 294542 ATATTATTTTGGTCTCTCGAGCATAACACTCTCCTAATGTATTTGAGTAGCACATTCAAACCTTTCAAGACCAAATGTGAACTATTTTGGTTCCAGGCTAATTTTGGCTCACCTTTCTCAAGGGGGCAAATTCTTTCCAACAGCAGTGGTGCTATTGCCTTGTACCAATAAGTCCAATTAGCCAAATTTCCACTCAGGGGTAATTTTTAATGTGGGTTATTGATTGAGAGGTGTTGTCCCACAGTGCACAGGCTGACTGGATATCCTATGCAGAGGCCAGCTAGACACTTTGGAATCATGTCCTAAATGTCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180655 313 + 636262 ATATTATTTTGGTCTCTCGAGCATAACACTCTCCTAATGTATTTGAGTAGCACATTCAAACCTTTCAAGACCAAATGTGAACTATTTTGGTTCCAGGCTAATTTTGGCTCACCTTTCTCAAGGGGGCAAATATGTCCCAACAGCATTGGTGCTATAACCGTGTACCAAT-AGTCCAATTGGCCAAATTTCCATTCAGAGGTAATTTTTGATGTGGATTATTGATAGGGAGGTGTTGTCCCACAGTGCACAGGCTGACTGGATGTCCTATGCTGAGGCCAGCTAGACACTCTTGAATCATGTCCTAAATGTCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 170851 314 + 647215 AAATTATCTTGGTCTCTCATGCATAACACTCCACTAATGTATTTGAGTAGCACATTCAAACCTTACAAGATTGTATGAGAACTATTTTGGCTCCAGTATAATTTTGGCTCACCTTTGTCAAGGGGGCAAATTCTTTCCAACAGCAGTGGTGCTATTGCCTTGTACCAATAAGTCCCATTAGCCAAATTTCCACTTGGGGGTAATTTTTAATGTGGGTTATTGATTGAGAGGCATCATACCACAGTGCATAGGCTGACTGGATATCCTATGCAGAGGCCAGCTAGCCATTTTGGAATCATGTCCTAAATGTCCTA + +a +s mr.mrrefChr5 36173 110 + 294542 TGTGGATTGTCATTACAAGTATTAGTCATGTACTGGTCCCATATTAAGGGCATTAATTCAATCACAAAATTTTAATGTGGCCAAACACTTACGTGGATAAACTCTGTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180970 108 + 636262 TGTGGATTGTTATAAC--GTATTAGTCATGTACTGGTCCCATATTAAGGGCGGCAATTCAATCACAAAATTTTAATGTGGCCAAACATTTACGTGGATAAACGCTGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 171165 110 + 647215 TATGGATTGTCATTACAAGTATTAGTCATGTACTGGTCCCATCTTAAGGGAATTAATTCAATCACAAAATTTTAATGCGGCCAAAGACTTACATAGATAAGCTCTGTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 36283 324 + 294542 CTTATAAAATATTATCAACTGCACTTATATCTTCCATCACTGCTGTTCATGAGCATAATGACTGCTCCTGCTTAGGCTGAGCTTATCGCTTGTCATGTGCCATTTACTCACAGTTGATATATGATCAACATATAAATGCAACCACAATCTATCTTAGCTTAAGTATTTATCAATTATACCTCTATCTTGAACCTTTATCAGTGgtgtgtcttgtagctacaactgttttaggctgcctcccaattttagcatgtgtgtgcaacaagtgtgtgcctgccctgttgaaaaggtgacccttcctgtaatattgtgtagttagagagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181079 316 + 636262 CTTATAAATTATTATCTACTGCACTTATATCTTC-----CTGCTGTTCATGAGCATAATGACTGCTCCTGCTTAGGCTGAGCTTCTCGCTTGTCATGCGCCATTTACT--TAGTTGATGTATGATCAACAAACAAATGCAACCACAATCTATCCTAGCTTAAGTATTTATCAATCATACCTCTGTTTTCAACCTTTATCAGTGgtgtgttttgtggctacgactgttttaggctgcctcccaatattagcatgtgtgtgcaacaagtgtgtgcctgccctg-tgaaaaggtgacccttcgtgtaatatggtgtagttagagagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 171275 324 + 647215 CTTGTGACATATTATCAACTGCACTTATATCTTCCATCACTACTGTTCATGAGCATAATGACTGCTCCTGCTTAGGCTGAGCTTATCCCTTGTCATGTGCCATTTACTCACAGTAGAGATATGATTGACATATGAATGCAACCACAACCTATCTTGGCTTAGGTATTTATCAATTACACCTCTATCTTGAACCTTTATCATTGgtgtgtcttgtagctacaactgtgttaggctgccttccaattttgccatgtgtgtgcaacaaatgtctgcctgccctgttgaaaaggtaacccttcctgtaatattgtgtagctagagagt + +a +s mr.mrrefChr5 36607 92 + 294542 attaggcggggaagaatggcaccaaatctaagggccccatggacaagttctgatgagaacttactacaaagttaatatgagcttccccacta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181396 92 + 636262 attaggcagggaaggatgacaccaaatctaaggaccccatggacaagctttgatgagaacttactacaaagttaatatgagctttcctacta +s simRat_chr6.simRat.chr6 171599 84 + 647215 attaggcggggcagaatggcatcaagtcta---gcactcTA-----GTTCAGATGAGAACTTACTACATAGTTAATATGAGCTCCCCCACTA + +a +s mr.mrrefChr5 36699 370 + 294542 cactaaggctcaacctgatggacaacccctctgggttgatttactgcaaaattttgaattgtgattctcttctgtccttccaaattcactaccacttccttactccaaggcttggactgactaggtggagttttgtaattctgacagcatgagttcttgatccagtatcaaattttagacattttagactcctgttagacctagagagtttgcacaaaaaacaattccttaaactggagaaggttgcactacaagcttcctctttgaatacacttcaaagagtcactcaaaatatgagctgctcttctaagttgaaagggtctgttgctgctatggcaacttaattagaaccctttttcctcattctcct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181488 368 + 636262 cactaaggctcaacctgttggacaacccctctgggttgatttactgcaaaattttgaattgtggttctcttctgtccttccaaattcactgctgcttccttactccaaggcttggactgcataagtggggttttgtaattctgacagcatgagttcttgatccagtaccaaatttttgacactttagactcctgttagacccagagagtttgcacaaaaaacaattccttaaactggagaaggttgtagtacaagcttcctccttgaatacacttcaaagagtcactcaaaatatgatctgctcttctaagttgaaagggtctgttgctactatggcaacttaattagaaccctttttcctcattctc-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 171761 357 + 647215 TACTAAGGCTCAACATGATGGACAACCTCTCTGGCTTGATTTGCTACAAAA--------AGTGACTctctcctgtccttcc-aattcactaccacttccttactccagggcttggactgaccaggtggagttttctaattctgacagcatgagttctggatccagtatcaaattttacacattttatactcctgttagacctagagagggtgcacaaaaaagaattccttaaactggagaaggttgcactacaagcctcctctttgaatacgcttaaaagagtcactaaaaatatgagctgc----ctaagctgaaagggcctgtggctgctatggcaacttaattagaaggctttttactcattctcct + +a +s mr.mrrefChr5 37069 47 + 294542 tgtgttgttctcttttatgtgtttacttatgtgcacatgccttcatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181856 47 + 636262 tgtgttgttctctactatgtgtttacttatgtgcacatgccatcatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 172121 47 + 647215 tgtgttgttctcttttatatgtttacttatgtgcacatgccttcatg + +a +s mr.mrrefChr5 37116 424 + 294542 tgtttacatactggcccctccctcaggttatgcgtaccctgagcagaataatatgagacagctgtgttaattctccaattaagtcaagttggacaggtgccgcaatcacactgcaccacttatttatggtcctaccccttagactgggagtaatgtgtactatcaaattggctggatttctctcaagtatggtcctcccaactgagtcatggttgaccctccacttgtatatccaagtgtggtccttctcccttaggtatttaaggtgaggctaagcttatcttttaagggggctacttaggtggtgctacaagacagtacacttttgtgagtgctttcctgcagtatttctaggttgattaaagcaaaaaccactagaaggctgataagaaggtaccctttcttatttaattactaccctggc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 181905 410 + 636262 tgtatccataatggcccctctgtcaggttatgcatgccctgagcacagtaatatgagacagctgtgttaattctccaattaagtcaagttggacaggtgctgcaatcacactgcaccacttatttatggtcctaccccttagactgggagtgatgtgtactatcaagttggctggatt--tctcaagtatggtcctctcaactgag------------ctccacttgtatatccaagagcggtccttctcccttaggtatttaaggtgaggttaagcttatcttttaagggggctagttaggtagtgctacaagacagtacacttttgtgagtgctttcctgcagtatttctaggttgcttaaagtgaaaaccactagaaggctgataagaaggtaccctttcttatttaattactaccctggc +s simRat_chr6.simRat.chr6 172168 417 + 647215 tgtttacatactggcccctccctcaggttATGCGTACCCTGAGTGGAATAATataagacagctgtgttaattctccaattaagtcaagttgcacaggtgccgcaatcattctgcactacctatttatggtcctaccccttagactgagggtaatatgtaccttcaaagtggctggatttctctcaagtatggtcctcccaacagagtcatggttgaccctccacttatatatctaagtgtg--ccttctcctttaggtatttaaggtgaggctaagctgatcttttaagggggctgcttaggtgttgctacaatacagtacacttttgtga-----ttcctgcagtatttctaggttgatcaaagcaaaaaccactataaagataataagaaggtaccttttcctatttaattgccaccttggc + +a +s mr.mrrefChr5 37540 21 + 294542 cagagacatctgaccatgtaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182315 21 + 636262 cagagacatctgaccatgtaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 172586 21 + 647215 catagaaatctgactatgtag + +a +s mr.mrrefChr5 37561 199 + 294542 aaggtatccaggtcccttgctcatttattaaatcattcttatcaggtatctgtgaaattttgcctgcatagccagtctctttcagacaaataagtggcagatataacactcagtttgttggtcaggattggtcatggtcttttctttttttgtctttaccttccttcagccaattagggcccctaacttgatattagtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182336 199 + 636262 aaggtatccaggtcccttgctcatttattaaatcattcttatcaggtatctgtgaaattttgcctgcatagccagtctctttcagacaaataagtggcagatataacactcagtttgttggtcaggattggtcatggtcttttctttttttgtctttaccttccttcagccaattagggcccctaacttgatattagtg +s simRat_chr6.simRat.chr6 172608 199 + 647215 agggaatccaggtcctttgcccatttattaaaacattcttagcaggtatctgtaaaagtttgcctgcatagctagtctctttcaaatgaataagaggcaaatataacactcagtttgttagccaggtttggtcctggttttttccttttttgtctttacgttctttcagccagttaggaccttaaacctgatattagcc + +a +s mr.mrrefChr5 37760 14 + 294542 cgctctcactcaac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182537 14 + 636262 cgctctcactcaac +s simRat_chr6.simRat.chr6 172807 14 + 647215 cactctcactcaat + +a +s mr.mrrefChr5 37774 27 + 294542 ttgcatccattttaggccccttgagca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182551 27 + 636262 ttgcatccattttaggccccttgagca +s simRat_chr6.simRat.chr6 172825 27 + 647215 ttggctccattttgggcaccttaagca + +a +s mr.mrrefChr5 37801 8 + 294542 taggtccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182579 8 + 636262 taggtccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 172852 8 + 647215 taaatgcc + +a +s mr.mrrefChr5 37809 40 + 294542 ccaatatttcaaatcatactgtccaagttgccagaatctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182594 40 + 636262 ccaatatttcaaatcatactgtccaagttgccagaatctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 172860 40 + 647215 ccaacatttgaaatcatcctgtccaaattatttgaatctt + +a +s mr.mrrefChr5 37849 158 + 294542 aagctttcgcagctaagtttttaaatccccaacgcatcagtgtattgtccacacttcgggataaggagcgagaaggcagtcaagttccaggtcctggtagatagagtgccaatttcttctgcaatcttttggctgaaccataagtccttcttgattgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182636 158 + 636262 aagctttcgcagctaagtttttaaatccccaacgcatcagtgtattgtccacacttcgggataaggagcgagaaggcagtcaagttccaggtcctggtagatagagtgccaatttcttctgcaatcttttggctgaaccataagtccttcttgattgt +s simRat_chr6.simRat.chr6 172900 158 + 647215 aagcttttgcaactaaaacttcaaatccccaacccatcagcgttttgtccacactttggggtaaggagtgagaaagcagtcaagttccaggtcctggcggatggactgtgaatttcttcaccaatcttttagctgaaccataagtccttcttgattgt + +a +s mr.mrrefChr5 38007 7 + 294542 ctcatat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182797 7 + 636262 ctcatat +s simRat_chr6.simRat.chr6 173058 7 + 647215 ctcatat + +a +s mr.mrrefChr5 38014 18 + 294542 agcactcgagagcaaatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182822 18 + 636262 agcactcgagagcaaatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 173065 18 + 647215 aacactctagaacaaata + +a +s mr.mrrefChr5 38032 196 + 294542 ctcttcagcaagtctaactacaatgcatatttggtttatggtaccaattcactcagttgggatgctaatgataggttgctacagaatattggtaacactacttcatcttactgcaatggcccaaggacctgaggttctggtgcaagtagagacgagagtgttattttggttgagacaaaacttataacctggtgta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182843 196 + 636262 ctcttcagcaagtctaactacaatgcatatttggtttatggtaccaattcactcagttgggatgctaatgataggttgctacagaatattggtaacactacttcatcttactgcaatggcccaaggacctgaggttctggtgcaagtagagacgagagtgttattttggttgagacaaaacttataacctggtgta +s simRat_chr6.simRat.chr6 173083 196 + 647215 ctcttcagcaaattcaactacaaggcaagtttggcttatgagaccaatttacttggttgggatgctaatgataggttgctacacaatattggaagcactactttatcctactgctatggcctgaggacctgatgttctggtgcaagcagagactagagtgttcttttggttgagacacaacttacaacctggtgta + +a +s mr.mrrefChr5 38228 31 + 294542 ccaccagcttgatttgtctgacttatgggct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183039 31 + 636262 ccaccagcttgatttgtctgacttatgggct +s simRat_chr6.simRat.chr6 173282 31 + 647215 ccaccagcttgatttatctgacttgtgagct + +a +s mr.mrrefChr5 38259 57 + 294542 ctctttggtggtcttacacaaacttgacaattgtttttttgcactctgtaaccagag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183073 57 + 636262 ctctttggtggtcttacacaaacttgacaattgtttttttgcactctgtaaccagag +s simRat_chr6.simRat.chr6 173313 57 + 647215 ctctttggtggttccatgcagacttgacaattgttcttttgcactctctaaacagag + +a +s mr.mrrefChr5 38316 19 + 294542 gggttttttttacagagat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183130 19 + 636262 gggttttttttacagagat +s simRat_chr6.simRat.chr6 173377 19 + 647215 gggttttttttacagagag + +a +s mr.mrrefChr5 38335 76 + 294542 tcatcaaacttattagatctgtacatttaatttgcagaacaatatgttaatgtgtgtaggtttagcatcttcaggt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183149 76 + 636262 tcatcaaacttattagatctgtacatttaatttgcagaacaatatgttaatgtgtgtaggtttagcatcttcaggt +s simRat_chr6.simRat.chr6 173406 76 + 647215 taatcaaaggtattagatctgtacattttatttgcagaacaatatgtttatgtgcatgggtttaccatcttcaggt + +a +s mr.mrrefChr5 38411 34 + 294542 gaaaacattgagcctatagacccatgaacgacta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183226 34 + 636262 gaaaacattgagcctatagacccatgaacgacta +s simRat_chr6.simRat.chr6 173482 34 + 647215 gtaatcattgagcctattgatccatgaactaata + +a +s mr.mrrefChr5 38445 54 + 294542 aacatatataaagtcatatatcttgatcgtatgcacttgatgccttgggtaaac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183260 54 + 636262 aacatatataaagtcatatatcttgatcgtatgcacttgatgccttgggtaaac +s simRat_chr6.simRat.chr6 173540 54 + 647215 aacatatataaagttacatatcctgatcatatgtacttgatgtcttgggtaaac + +a +s mr.mrrefChr5 38499 22 + 294542 ggggggttcattcatctggaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183315 22 + 636262 ggggggttcattcatctggaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 173594 22 + 647215 ggggggttcattcatctggaat + +a +s mr.mrrefChr5 38521 85 + 294542 caatggtcagaggttactacactaggctctcgattgggctTGCCTGGGTGAAAGACTAAAGGAGACCTCAGAACTTGTGCTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183347 85 + 636262 caatggtcagaggttactacactAGGCTCTCGATTGGGCTTGCCTGGGTGAAAGACTAAAGGAGACCTCAGAACTTGTGCTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 173616 85 + 647215 cttctgtcagaggttactacactaggctcctgattggtctTGCCCATTTGGAGGACTAAAGGAAATCTCAGAACTAGTGCTGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 38606 9 + 294542 GTACCTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183436 9 + 636262 GTACCTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 173701 9 + 647215 GTACCCGCA + +a +s mr.mrrefChr5 38615 62 + 294542 ATTGATTAGAGTTCCAAAATCCAAGCAGGCATCTGCTTGATTTATCTATAGTTACTGAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183452 62 + 636262 ATTGATTAGAGTTCCAAAATCCAAGCAGGCATCTGCTTGATTTATCTATAGTTACTGAGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 173710 62 + 647215 ATTAATTAGGGTTCCAAGATCCAAGCAGGCCTTTGCTTGATTTATCTATAGATACCAAGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 38677 44 + 294542 TGTGCTATGAACACAATTGATCAACTCAAGGGCATGTAATGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183514 44 + 636262 TGTGCTATGAACACAATTGATCAACTCAAGGGCATGTAATGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 173773 44 + 647215 TCCAGAATGAACACAACTAATCAACTCAATGGTATGTAATGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 38721 35 + 294542 GGGGCCCATGTTCAGCATTCTATACGCAGACTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183558 35 + 636262 GGGGCCCATGTTCAGCATTCTATACGCAGACTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 173818 35 + 647215 AGGACCCATGTTCAGCAGTCCATACGCAGACTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 38756 59 + 294542 CTTCCACTGCTCCAAAATCCATGCTATGATAACTATCTTCTTAGCTTGGAAAACTACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183593 59 + 636262 CTTCCACTGCTCCAAAATCCATGCTATGATAACTATCTTCTTAGCTTGGAAAACTACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 173863 59 + 647215 CTTCCACTGGTCCATGCTCCATGCTTTGATAACTATGTTCTTGGCTAGGAGAACTACAT + +a +s mr.mrrefChr5 38815 46 + 294542 TCAGATATCTAAAGTCAGCACCTATTGATAATGTACTAACTTCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183656 46 + 636262 TCAGATATCTAAAGTCAGCACCTATTGATAATGTACTAACTTCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 173922 46 + 647215 TCAGATATCTAAAGTCAGCACTTATTGATCATGCACTAACTTCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 38861 138 + 294542 ATCATGTACTAACTTCAAAGTACTGAGTGGTCCCCAGAAGGGTCTATGTTCCTTCTACTAAGAGCTCTTGTAATAAGTAGTGTATCCATAGTGGTAAGGGAATGTATTACATTCCAGTCCTTCCGGCATTTTGAAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183703 135 + 636262 ATCATGTACTAACTTCAAAGTATTGAGTGGTCCCCAGAAGGGT---TGTTCCTTCCACTAAGAGCTCTTATAATAAGTAGTGTGCCCATAGTGGTAAGGGAATGTATTACATTTCAGTCCTTGCGGCATATTGAAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 173968 134 + 647215 ATCACATGCTAACTTCGAAGTACTGAGTGGTTCCCAGAAGGGTCTATGTTCCCTTTACTAAGA---CTTGTAATAAGTGGTCAATCC-TAGTGGTAAGAGAATGTATTACGTTCCACTCCTCCCAGCATTTTGAAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 38999 223 + 294542 AATTTTAGATGGGTATAACTGCAAGCAAGCCTATATCCCCCTAGAAACTATAAACCATTTGATCAGCCATCCACTGGCACTTGAGCTGACTGAACCATAACTTTATTCATTAATCACATACTATTATCTACATATTTATTTAAGTATTATAACCACTCTACTCTCAAAAGCCATCCTCCTTGCTAACAGTGAGGTAGCAACAATCAGGCCACTAGATGGAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183838 223 + 636262 AATTTCAGATGGGTATAACTGCAAGCAAGCCTATAGCCCCCTAGAAACTATAAACCATTTGATCAGCCATCCACTGGCACTTGAGCTGACTGAACCATAACTTTATTCATTAATCACATACTATTATCTACATATTTATTTAAGTATTATAACCACTCTACTCTCAAAAGCCATCCTCCTTGCTAACAGTGAGGTAGCAACAATCAGGCCACTAGATGGAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 174103 223 + 647215 AATTTTATATGGGTATAACTGCCAGCAAACCTATATCACTCTAGAAACTATAAACCAGCTGATCAGCCACCCACTTGCACTTGAGCTGACTGAACCGTTGAGTTATCCAATAATCACAAACTATTGTCTACACATTTATTTAAGTACTATCACCACTCTGTTCTCAAAAGCCGTGATCCTTGCTAACAGTGTGGCAGCAAAAATCAGGTCACTTGAGGGGGTT + +a +s mr.mrrefChr5 39222 23 + 294542 GTGTTTGTGCTTTTCCCGACTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184061 23 + 636262 GTGTTTGTGCTTTTCCCGACTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 174327 23 + 647215 ATGTTCTTGCTTATCCTGACCAG + +a +s mr.mrrefChr5 39245 19 + 294542 CCCCTGAATCTCAGAAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184085 19 + 636262 CCCCTGAATCTCAGAAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 174350 19 + 647215 CCCATGAACCTCACAGACA + +a +s mr.mrrefChr5 39264 11 + 294542 ATCTGCCAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184104 11 + 636262 ATCTGCCAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 174371 11 + 647215 ACCTGCTGGGT + +a +s mr.mrrefChr5 39275 76 + 294542 CTGTGTATCTCAATGACACAAGAGTGTTGGCTCACCAACAGGCTTCCTGCCTGCAGGACTCCCTGTAATGGTCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451527 76 - 636262 CTGTGTATCTCAATGACACAAGAGTGTTGGCTCACCAACAGGCTTCCTGCCTGCAGGACTCCCTGTAATGGTCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 174399 76 + 647215 CTGTCTACCTCAATAACACAAGGGTGTTGGCTCACCAATAGGCTTCTTGCCTGCAGGACTCTCTGTAAGGGTCCAC + +a +s mr.mrrefChr5 39351 6 + 294542 AGCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451603 6 - 636262 AGCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 174476 6 + 647215 GGCTTA + +a +s mr.mrrefChr5 39357 21 + 294542 AATATATATTGGTGTATGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451609 21 - 636262 AATATATACTGGTGTATGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 174484 19 + 647215 AATATCTATTGGC-TAT-ACT + +a +s mr.mrrefChr5 39378 52 + 294542 TAGGCCCAAGGCATGAGCAATACAGAAGAATTGTTTTATCACTTTGGACCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451630 52 - 636262 TAGGCCCAAGGCGTGAGCAATACAGAAGAATGGCTTTATCGCTTTGGATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 174505 52 + 647215 TATGCCCCAGGAATGAGCAGTACAGATGAATTGTTTTATCACTTTGGACCTG + +a +s mr.mrrefChr5 39430 52 + 294542 CTGGATTTGCCATCCGATATGGTGAATATAAGATAAGATTTCATTGTTCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451683 48 - 636262 CTGGATTTGCCGTCCAATATGGTGAAT----GATAAGAGTTCATTGTTCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 174557 52 + 647215 CTGGATTTGCCATCCGATATGGTAAATATAAGATGAGATTTCATTGTTCAAA + +a +s mr.mrrefChr5 39482 26 + 294542 GCCATCTAGGTGAAGCTGCTGAAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451765 26 - 636262 GCCATCTAGCTGAAGCTGCTGAAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 174609 26 + 647215 GCCATCTAGGCGGACCCACTGAAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 39508 65 + 294542 GAGAAACTTTGCCTAGAACTATTACACTACCCCTTGATTGCTGTGACACCTATCTTAACCAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451791 65 - 636262 GAGAAACTTGGCCCAGAACTATTACACTACCCCTTGATTGCTGTGACACCTATCTTAACCAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 174636 65 + 647215 GAGAAACGTTGCCTAGAACTACTACACCTCCCCATCATTGCTGTGACACCTATCTTAGACAGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 39573 15 + 294542 CTGTGGCAAAACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451856 15 - 636262 CTGTGGCAAAACATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 174702 15 + 647215 CTATTGCAAAACATA + +a +s mr.mrrefChr5 39588 28 + 294542 TTATCACAGGACTTGTCTGTCTGGTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451872 28 - 636262 TTATCACAGGACTTGTCTGTCTGGTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 174717 28 + 647215 TTAGCACAGGACTTGTCTGTGTTGTGCC + +a +s mr.mrrefChr5 39616 96 + 294542 TCAGTAAATTGGCATACGTGAACATGTTCACAACAGTACCCACTTTCAGGTGCTGGGGATATGTGCATCAGTCAGGATGAGACATATGGTGTTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451900 95 - 636262 TCAGTAAATTGGCATACGTGAACATGTTCACAACAGTACCCATTTTCTGGTGCTGGGGAGATGGGCATCAGTCAGG-TGAGACATATGGTGTTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 174746 96 + 647215 TCAGCAAATTGGCATACATGAGCATGTTCACGACAGTAGCCACTTTCAGGTGCTCGTGATACATGCATCTGTCAGGATGAGACATATGGTGTTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 39712 152 + 294542 GGTCCACATTACAGGTGTAATATCGTCTCAACCTACAGTCGGGTACGTTAGTAGTATCAATATGGAACATTTGACAAGGCTTGGCCTTCACATGATAACCCTAGGTAGTTGAAGACCTATATTATTCCTATGCAATAGATAGTTACAAGCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 451996 151 - 636262 GGTACATATTA-AGGTGTGATATCGTCTCAACCTACAGTCGGGTACGTTAGTACCATCAATACGGAACATTTGACAAGGCTTGGCCTTCACATGAAAACCCTAGGTAGTTGAAGACCTATATTATTCCTATGCAATAGATAGTTCCAGGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 174842 151 + 647215 GGTCCACATAACAGGTGTAATACCGTCTCAAC-TACAGTCGGGTACAGAAGTAGTGTCAATATGAAACATTTGACAACGCTTGGCTTTTACATGATACCTGTAGGCAGGGGAAGACCTCTATTATCCCTGTGCAATAGATAGTTACAAGCGA + +a +s mr.mrrefChr5 39864 54 + 294542 AGAGAGCTGCAATCTTGTCAAGTTTCCTCTCCTCCTTCTGTAGTCTTAGAGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184752 53 + 636262 AGAGAGCTGCCATCTTGTCAAGTC-CCTCTCCTCCTTCTGTAGCCTTAGAGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 174993 54 + 647215 AGAGAGCTGCAATCTTGTCAAATTTCCTCTCCTCCTTCTGTAGTTTTAGAGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 39918 71 + 294542 CTGCTTCTTGAGGCATTTATAAAATGAGGAGCAGGTCTACTCCAAATAATAGTATTATGGTAATGATGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184826 70 + 636262 CTGCTTCTTGAGGCATTTATAAGATAAGGAGCAGGTCAACTCCAAAT-GTTGTATGATGGTAATAATGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 175047 71 + 647215 CTGCTTCTTGAGGCATTTATAAAATGAGGAGCAGGTCTACTCCAAATAATAGTATTATGGTAATGATGACT + +a +s mr.mrrefChr5 39989 461 + 294542 GTTGATATGGGAATAGGTAAAATTATGGTACACATATTCCTGAAGAATATATGGATTTATAAATCTAACCGAGCATTGGCCAAAGCATATTATATCCCTATGTTCTACACTCTATGATCTTTTCAGGAGTCTACAAGAAGAAAGTTGTCTTTGCAGATTGACACATAAGAGAAAAAATGTCCACAGGTGAACTGCCAACATATTCTTATCTACTCTCAGAACCTCAAAACCAATCACACTGCTATCCATAGGATTTGAATACATTTTAGGGATGCAACACAAGGGCAGTGGAGATACTCTTCCCTTGTGTGGGGGGCAGGCTCCTTCTACAGGTGCCTGTAAATGGCTTGACATTGCGTCAAGTGGGACTGGCTCACAGCCAAGCACCAATCATGTGTACATAGCTGCTTTTGCTTTTTATTGGAGCTGCACGAGGCACTGTGTGGAATCTAAACAATGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 184914 461 + 636262 GTTGATATGGGAATAGCTAAAATTATGGTACACATATTCCTGAAGAATATATGGATTTATAAATCTAACCGCGCAACACCCAAAGCATATTATATCCCTAGGTTCTACACTCTATGATCTCTTTAGGAGTCTACAAGCAGAAAGTTGTCTTTGCAGATTGACACACAAGAGAAAAAATGTCCACAGGTGAACTGCCAACACATTCTTATCTAATCTCAGAACCTCATAGCCACTCACACTGCTATTCATAGGTTTTGAATACATTTTAGGGATGCAACACAAGGGCAGTGGAGATACTCTTCCCTTGTGTGGGGGGCAGGCTCCTTCTACAGGTGCCTGTAAATGGCTTGACATTGCGTCAAGTGGGACTGGCTCACAGCCAAGCACCAATCATGTGTACATAGCTGCTTTTGCTTTTTATTGGAGCTGCACGAGGTACTGTGGGAAATCTAAACAATGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 175118 457 + 647215 GTTGTTATGGGAATAGGTAAAATTATGGTACACCAATTCCTGAAG-ATATATGGTTTAATAGAGCTAACCAAGCATTGGCCAAAACATATTATATCCATATGT--CCCACTCCATGAT-TTTTCAGGACTCTACAAAAAGGAAGTGGTCTTTGCAAATTGACACATTGGATAAAAACTGTCCTCAGGTGAACTGCCAACATATTCTTATCTACTCTCAGAACTTCAAGACCAATCACACTGCTAACCATTGGATTTGAACACATTTTAGGGATGCAACACAGGGGCAGTGGAGGTACTTTCCCCTTGTGTGGGGGGCGGGCTCCTTCTACAGGTGCCTGTAAATTGCTTTACATTGTGTCAAGCAGGACAGGCTTATAGCTAAGCACTAATCATGTGTGCGTGGCCATGTTTGCTTTTTATTGGAGCCGCAAAAGGCACTGTGTGGAATCTAAACAATGTG + +a +s mr.mrrefChr5 40450 51 + 294542 AGGCCCCATTTTGGTTTAGAAGTGGATATTGTGCTGCTTCTTCTCACCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185379 51 + 636262 AGGCCCCATTTTGGTTTAGAAGTGGATATTCTGTTGCTTCTTCTCACCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 175575 51 + 647215 AAGCCCCATTTTGATTTAGAAGTGGATATTGTGCTGCTTCTTATCACCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 40501 68 + 294542 CCTCCGGATCTTGGTTGATTCATTTCCCTCTTGTGCAATGTAGGTCTCTCACAATCACCGCCAGTCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185431 68 + 636262 CCTCTGGATCCTGGCTGATTTATTTCCCTCTTTTGCAATGTAGCTCTCTCACAATCACCACCAGTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 175626 68 + 647215 CCTCCGGACCTTGATTTATTCATTTCCCTCTTGTGCAATGTAGGTCTCTTACAATCACCGCCAGTCCC + +a +s mr.mrrefChr5 40569 157 + 294542 GTTTGTTTAGTTTCTTCTAAGACAGCAAGTTCTCCTGTCAGTGTGCTTGCATACCCAGTTGAGTGAATAAGAAGTAAGGTCCTCCTTGAAGGGGAATCTTACATCCAGGGCCTCCAAGGTGCAAAGTGAAGGATTACGATAAAGAATCGTTAAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185499 157 + 636262 GTTTGTTTAGGCTCTTCTAGGACAGCAAGTTCTCCTGTCAGTGTGCTTGCATACCCAGTTGAGTGAATAAGAAGCAAGGTCCTCCTTGAAGGGGAATCTTACATCCAGGGCCTCCAAGGTGCAAAGTGAAGGATTATGATAAAGAATTGTTAAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 175806 148 + 647215 GTTTATTTAGTTCCTTC-AAGAAAGCAATCTCTCCTGTCAGTG--------TACCCAGTTGAGTGACTAAGAGGTAAACTCCTTCTTGAAGGGGAACCTTACATCCAGGGCCTCCAGGGTGTAAAATGAAGGATTGCTATAAAGAATCGTTAAATCT + +a +s mr.mrrefChr5 40726 61 + 294542 GTTGAGACAGACCTCATGACCTCTCCACATGTGTGAACTGATGTAATCATTGTCAAGTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185656 61 + 636262 GTTAAGACAGACCTCATGACCTCTCCGCATGTGTGAACTGTTGTAATCATTGTCAAGTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 175958 61 + 647215 ATTGAGGCTGACCTCATGACCTCTCCACGTCCGAGAACCGATGTAATCAATATCAAGTACA + +a +s mr.mrrefChr5 40787 12 + 294542 TGCTATTGGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185718 12 + 636262 TGCTATTGGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 176019 12 + 647215 GGCTATTGGTGC + +a +s mr.mrrefChr5 40799 255 + 294542 CTGAGAGGAACAATGAAGTCAAGCTGCAAAGGGTCTACTGATTTGATGTACATTGATGTAAATATTTCTTGCATCATGACCTTCTCTTCTATGGTGAAATTATATACCACCCTTGATATTGGTTTCTCTACTTATTTAAGGCAATAATAGGCCTGAACTTCTTCTGTGCAATAGCAAGCCAAGTTGAATCAGTCCTTTTTGACTCTTCACAGTGTAGTGGCTAGTCACCAGAAATAACTAATGGCATTTCTACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185730 255 + 636262 CGGAGAGGAACAATGAAGTCAAGCTGCAAAGGGTCTACTGATTTGATGTACATTGATGTAAATATTTTCTTCATCATGACCTTCTCTTCTAGGGTGAAATTGTATACCACCCTTGATATTGGTTTCTCTACTTATTTAAGGCAATAGTAGGCCTGAACTTCTTCTGTGCAATAGCAAGCCAAGTTGAATCAGTCCTTTTTGACTCTTAACAGTGTAGTGGCTAGTCACCAGAAATAACTAATGGCATTTCTACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 176036 255 + 647215 CTAAGAGGAACAATGAAGTCAAGTTGTAAAGGGTCTACTGATTTGATGTACATTGATGTAAATATTTCTTGCATCATGACCTTCTCTTCTATGGTCAAATTATATAGCACCCTCGATAGTGGTTTCTCTACTTATTTAAGGCAATAATAGGCCTGAACTTCTTATGTGCAGCATCAAGCCAAGTTGAATCAGTCTTTTTTGAATCTTCACAGGGTAGAGGCTAGTCACCAGAAGTAACTAATGACATTTCTACCC + +a +s mr.mrrefChr5 41054 60 + 294542 TGAGAGCCAATTTGAAACTTACAAGACTGCATTATGCACATCTGACCATACACTTATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 185985 60 + 636262 TGAGGGCCAATTTGGAACTCACAAGGCTGCATTATGCACATCTGACCATACACTTATTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 176294 60 + 647215 TGAGAGCCAATTTGACACTTACAAGACTGCCTGATGTACATTTGACCGTAGTCTTATTAA + +a +s mr.mrrefChr5 41114 151 + 294542 AACCTAACAGGGGCAATGGTGTGTACGACCAGCTTTCACTCCACAGCTTCCCTTTTAGAATTGCAGCCATTAGGATGGCCTGCAGCTCTGCCCATTCCAGCAAATGAAATACTCACAGTGTCTGATTAATGCAAGGAGGGTCAAGGTGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186046 151 + 636262 AACCTAACAGGGGCAATGGTGTGTATGACCAGCTTTCACTCCACAGCTTCCCTCGTAAAATTGCAGCCACGAGGATGGGCGGCAGCTCTGCCCATTCCAGCAAATGAAATACTCACAGTGTCTGGTTAATGCAAGGAGGGTCAAGGTGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 176354 143 + 647215 AACCTAACAAGGGCAATGGTGTGTACTACCAGCTTTCACTCCATGGCTTCCCTTTTAGAAGTGCAGTCATTAAGTTGGCCTGCTGTTCTGCCAAT--------ATGAAATACTCACAGTGTCTGACTAATACAAGGAGGGTCAAGGTGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 41265 344 + 294542 AGCCAGAGGATAATCTACAAGCTGAGCAAAAACAAAAACAGAATTCAAGATAGTACATTTTCCAGTAAAAGGCTTAGATGGACTGACAGGCTCAATTAGATATAATCTTCAAGAGTGTGCATCCTGAATCACTAAGATTTATAAGGAGAATATAGGTAACAACTCACAGGTACATGGTTAGCCTTACACGTGGTTAACAATTTAGTGATGTTGATACTGTTGATGTGACCAACAGGATAAGTTTACTTGTATAGGGAGGTGTAAAAGAGGCCTTTTATAGGAAACAACTATGCAAACCATGATCCCTAGTGACTATGTTAATAGTGACAACCAAAATGATAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186197 337 + 636262 AGCCAGAGGATAATCTACAAGCTGAGCACAAACAAAAACAGAATTCAAGATGGTACATTTTCCAGTAAAAGGCTTAGATGGACTAACAGGCTCATTTAGATATAATCTTCAAGAGTGTGCATCCTGAATCACTAAGATCTATAAGGAGAATACAGGTAGCAACTCACAGGTACATGGTTAGCCTTACCTGTGGTTAACAATTTAATGATGTTGATACTGTTGATGTGACCAACAGGATAAGATTACTTGTATAGGGAGGTGTACAAGAGGCCCTTGATAGGAAACAACTATGCAAATCATGA-------TGACTATGTTAATAGTGACAACCAAAATGATAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 176498 343 + 647215 AACACGAGGATAATCTACAAGCTGAGCAAGAAAAAAAACAGAATTCAACACAGTTCACTTTCCAGTAAAAGGCTTCGATTGACTGACAGGCACAATTAGATATAATCTTTAGGAGTGTGCTTCCCGAATCGCTAAGACTTATATGGAGAATATAGGTAAGAACTCACAGGTA-ATGATTAGCCTTGCACGTGGGTAACAATTTAGTGATGTTGATAACGTCAATGCAACAAGCAGAATAAGTTTACCTGTAGAGGGAGATTTAAAAGAGGCCTTTTATAGGAAACCATAACGCAAACCATGATCCCTAGAGACTATGTTAATAGTGACAGCCAAAATGATAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 41609 161 + 294542 GAGACCTGGAGTACAAAATCAGGGCCGAATAAAAGATTTTGAGATTCAAAACATTCTGGATTTTTCAAAGAGTCAGTTCTCCTTCATATTGGTAATGCTTGACCGAGTTTCCTGGTTTTTGTTCTACATACCAGTGAGATACTATATTATAGCTGCATTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186534 161 + 636262 GAGACCCGGAGTGCAAAATCAGGGCCGAATAAAAGATTTTGAGATTCAAAACATTCTGGATTTTTCAAAGAGTGAGTTCTCCTTCATATTGGTAAAGCTTGACTGAGTTTCCTGGTTTTTGTTCCACATACCAGTGAGATACTATATTATAGCTGCATTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 176846 161 + 647215 GAGTCTTGCAGCACAAAATCAGGGCTGAATAAAAGATTTTGAGGTGCATAACATTTTGGATTTTTCAAAGAGTCAGTTCTCCTTTATGTTGGTAGTGTTTGATCGAGTTTCATGGTTTTTGTTCTACATGCCAGTGAGATACTATGTTATAGCTGCATTGC + +a +s mr.mrrefChr5 41770 119 + 294542 TCTAGATCTAACTTACGTAGAGAGTTGAGGGTCAGATTTAGATTCATGTTCTAGAAAGAATTGAAAAGTTGGTTGGCTAGGAATACACTGTGAGCTATAGGCCTATATAAGAGATGGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186704 118 + 636262 TCTAGATCTAACTTACGTAGAGAGTTGAGAGT-AGATTAAGATTCATGTTTTAGAAAGAATTGAAAAGTTGGTTGGCTAGGAATACACTGTGAGCTATAGGCCCATACAAGAGATGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 177007 119 + 647215 TCTAGATCTAACATGTGTGGAGAGTTGAGGGTCAGATTTAGATTCATGTTCTAGAAAGAATTGAAAAGTTTGTTGGCTAGGAATACACTGTGAGCTATAGGACTATATGAGAGATGGGC + +a +s mr.mrrefChr5 41889 19 + 294542 CCACTATCACATAAGGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186822 19 + 636262 CCACTATCACATAAGGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 177132 19 + 647215 CCACAATTACATAAGGGAA + +a +s mr.mrrefChr5 41908 88 + 294542 AAAAGTTGCAAAGGAATCAGGCCAGACTCAGAATGAGGGTTGAGCACTGAATTCCATTTGGAAGTATAAGACTATATCTTGCCTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186842 73 + 636262 AAAAGTTGCAAAGGAATCCGGCCAGACTCAGAATGAGGGTTGAGT---------------GAAGTTTAAGACTACAGCTTGCCTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 177151 88 + 647215 AAAATTTGGAAAGCAATCAGGCCAGACTCAGAATGGGGGTTGAGCACTGAATTCCATTTGGAAGCATAGAACTATATCTTGCCTGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 41996 78 + 294542 GTAGCTTTAACTGGTGCTAAAAATGGTTACAGTATAAGCTAGCTGTCCAACCTTGTATTCACCTACATTTCCAGATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186915 77 + 636262 GTAGCTTTAACTGGTGCTAAAAATGGTTACAGTATAAGCTAGCTG-CCAACCTTGTATTCACCTACATTTCCAGATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 177240 78 + 647215 GTAGCTTTAAATGGTGCTAAAGATGGTTACAGTATAAGCTAGCTGTCCAACCTTGTATTCACCTACATTTCCAGATCC + +a +s mr.mrrefChr5 42074 14 + 294542 AATTGCACAACAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 186992 14 + 636262 AATTGCACAACAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 177345 14 + 647215 AATTTCACAACAGG + +a +s mr.mrrefChr5 42088 202 + 294542 ACTCTCCAAATTTTTCAAATGCTATGTGTGGAACGAGGTAAATTTGAATTGTAAATTTTTGGTAGCAAGTCTCTTGATTGGTACAACTTCCCTGTTCATGTGATGCGGCAGAAAATAAATGGGGCCAGCACAATCTTTCAGTGTTTATGTAACATACCATTTCCATGTTCTAATAGCTTATATTCAGTAATTCAGACCCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187006 202 + 636262 ACTCTCCAAATTTATCAAATTCTATGTGGGGAACGAGGTAACTTTGAATTGTAAATTTTTGGTAGCGAGTCTCTTGATTGGTACAACTTCCCTGTTCATGTGATGCGGCAGAAAATAAATGGGGCCAGCACAATCTTTCAGTGTTTATGTAACATACCATTTCCATGGTCTAATAGCTTATATTCAATGATTCAGACCCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 177360 199 + 647215 GCTCTCCAAA-TTTTCAAATGCTATGTGTGGAACAAGGTAAATTTGAATTGTAAATATACAATGGAAAGTCTTTTGTTTGGTACAACTTCCCTGTTCATGTGATGCGTCAGAAAGTAAGTGGGGTCAGCACAATCTTTCA--GTTTATGTAACATACTGTTTTCAAGTTCTAATAGCTTATAATCAGTAATTCAGACCCCCA + +a +s mr.mrrefChr5 42290 16 + 294542 ATAATTACCAGCAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187208 16 + 636262 ATGATTACCAGCAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 177565 16 + 647215 ATAATTACCAGCAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 42306 61 + 294542 AGAAAGCCAGGCATCGTGGTTAGTCATCAAACCAACACAGGTCAGTGGGGAAGTTGGCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187232 61 + 636262 AGAAAGCCAGGCATCGTGGTTAGTCATCAAACCAACACAGGTCAGTGGGGAAGTTGGCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 177581 61 + 647215 AGAAAGCCAGGCATCTCGGCGAGCCATCAAACCAACACAGGTCAGTGGGGAAGTTGGCAGC + +a +s mr.mrrefChr5 42367 131 + 294542 GTTACATGTAATGGTACCATAACTTGCCATTTACCCTGTGATTTATTGTGAGAACTCGTGCTTCTAAAGAAAGCCAGGTACTATCAAATTGGTCACCTGATATAGAGCTGTACAACATTTTGAACGTCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187300 130 + 636262 GTTACATGTAATGGTACCATATCTTGCCATTTACCTTGTGATTTATTGTGAGAACCC-TACTTCTAAAGAAAGCCAGGTACTATCAAATTGGTCACCTGATATAGAGCTTTACAACATTCTGAACGTCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 177642 131 + 647215 GTTACATGTAATGATACCATAATTTGCCATTTACCCTGTCATTTATTGTGAGAATTTGTGCTTCTAAAGAAAATCAGGTACTATCAAATCGGTCACCTGATAGAGATCTGTACAACATTTCGAACATCATG + +a +s mr.mrrefChr5 42498 101 + 294542 ATAAGTATGTTAGTTTACTACATCTGGATAATGACGCTAAGGGTGAGACTTAATGATTGAAATGCAATTTTAGAGTCAACTAGATGGGAAATAACCCATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187430 101 + 636262 ATAAGTAGGTTAGTTTGCTACATCTGGATAATGACGCTAAGGGTGAGACTTAATGTTTGAAATGCAATTTTAGAGTCAACTAGATGGGAAATAACCCATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 177775 83 + 647215 ATAAGTATATTAATTTACTACATATGGATAATAACTCCAAGGGTGAGACTTAATGACTGA---------------TCCACTAGATGGGAAATA---CATGG + +a +s mr.mrrefChr5 42599 90 + 294542 CCCTAATCATAAAAAGTTTGTGCTTTATAAATGATTTGCAACACACAATAGTTGTAAGGCTGTAAAGAATTACCCTGGTAGAATCAAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187532 90 + 636262 CCCTAATCATAAAGAGTTTGTGCTTTATAAATGATTTGCAACACACAATAGTTGTAAGGCTGTAAAGAATTCCCCTGGTAGAATCAAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 177858 90 + 647215 CACTAATCATAAAAAGTTTGGGCTTTATACACGATCTGAAACACACAATAATTGTAAGGCTGTAAAAAACTACCCTGGTAGAATCAAGGC + +a +s mr.mrrefChr5 42689 72 + 294542 TGGGACAAAGTGCAACTTAGCACAGACCTTCACTGCTGTTTATAGTGAGGAGAAGATAGTAATATACTAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187622 72 + 636262 TGGGACAAAGTGCAACTTAGCACAGACCTTCACTGCTGTCTATAGTGAGGAGAAGATAGTAATATGCTAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 177981 72 + 647215 TGGGGCACAGTGCAATTCAGTGCAGACCTCCACTGGTGTTTATAGCGAGGAGAAGATAGTAATATACTAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 42761 82 + 294542 TTAATGTTGAGTTCAGTGTATAAATCTTTTAGTGTGTGAACTTATGACAACAGTTGTAACTAATGAATGTTAGTACTAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187694 81 + 636262 TTAATGTTGAG-TCTGTGTGTAAATGTTTTAGTGTGTGAACTTATGACAACAGTTGTAACTAATGAATGTTAGTACTAATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 178057 82 + 647215 TTAATGTTGAGTTCAGTGTATAAATCTTCCAGCTTGTGAACTTATGACAACGGTTGTAACAAATGAATGTTAGTACTAATGT + +a +s mr.mrrefChr5 42843 127 + 294542 TAGTAGCAGAGCTTCAGGGGACAGGGGAAAAGCCATTGCAGGTGGCACAGTCAATCTACCTACAGGTCTTTCTATATGTTTACCCTGATAATTCAACTCAATGATAATCTCTCTATATTCTTGTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187775 127 + 636262 TAGTAGCAGAGCTTCAGAGGACAGGGAAAAAGCCATTGCAGGTGGCACAATCAATCAACCTACAGGTCTTTCTATATGTTTACCCTGATAATTCAACTCTATGATAATCTCTCTATATTCTTGTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 178175 94 + 647215 TAATAGATGAGCTTCAGGGAGCAGGAGAAAAGCCATTGCAGGTGGCACAGTCAATATAC---------------------TACCCTGATAATTCAACTCAATGATACTCTCTCTA------------ + +a +s mr.mrrefChr5 42970 239 + 294542 TGTTTGAAAATCATACTGGGCATTAAACCCCTTCATCTGATTTGGTTAACAATCACCAATCTCAAACAACTTTGCCTGTTGAACAGATAAATTCCAAGCAAAAATCTGAGGGTGATCATTAAATGATCTTACTTAGTATGCTAACTCTCATGGGACTGCACTCTTTCAGGATTAACTAGTCCCTATATTATGAAAAAATCTGGCTTATAACTGATTTTTATCCACTCAGAAGCAGAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 187906 238 + 636262 TGTTTGAAAATCATACTGGGCATTAAACCTCTTCATCTGATTT-GTTAACAATCACCAATCTCAAACAGTTTTGCCTGTTGCACAGATAAATTCCAAGCAAAAATCTGGAGGTGATCATTAGATGATCTTACTTAGCATGCTAACTCTCATGGGACTGCACTCTTTCAGGATTAACTAGTCCCTATATTATGAAAAAATCTGGCTTATAACTGATTTTTATCCACTCAGAAGCAGAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 178269 234 + 647215 -----GAAAATTAAACCGGGCATTAAACCCCTTAATCTGATTTGGTTAACCATCACCAATCTCAAACAACTTTGCCTGTTGAACAGGTATATTCCAAACAAAAATCTGAGGGTGATCATTAAATGATCTTACTTAGTATGCTCATTCTCATTGGACTGCATTCTCTTCGGATTAACTTGTCCCTATATTATGACAAAATCTGGCTTATAACTGATGTTTATCCAGTCAGAAGCCAAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 43209 58 + 294542 TTGTAACCTAGTAAGATTGACATTGTCATTGTTGACATACCAGAAATTAGGGGCAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 188144 58 + 636262 TTGTAACCTAGTAACATTGACATTGTCATTGTTGACATACCAGAAATTAGTGACAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 178505 58 + 647215 TTGTCACCTAGTAAGATTGGCGTTGTCGTTGTTGACATACCAGAAATTAGGGGCAATT + +a +s mr.mrrefChr5 43267 281 + 294542 TGCAAAGTACATGGGTGCACATGGCTGCGTTTGCCTTTTTTTGGAGCTCTCCATGAGGCACTGTGCAAAATCTAAACAGTGCTAAGACCATGGGCCCTAAAAATTCTGGAGAAAATGAACTGTCATTTCTCCTCTTGCTGGGGGGTCCATTAGGTGCTGCTTGACGTATGTCAATAAATTTTTTGGTTACTCACAATGTCCATTTTTAAGTTGCACTTCATCATCTTCCATAACAACCAACACCAGTGTTACTGATCAGTTTGCCTGGGAGCTTAGTCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 188202 279 + 636262 TGCAAAGTACATGGGTGCACATGGCTGCGTTTGCCTTTTTTTGGAGCTCTCCATGAGGCACTGTGCAAAATCTAAACAGTGCTAAGACCATGGGCCCTAAAAATTCTGGTGGAAATGTACTTTCATTTCTCCTCTTGCTGGGGGGTCCATTAGG-GCTGCTTGATGTCTGTCAATAACCTTTTTGGTTCCTCACAGAGTCCATTTTTAAATTGCACTTCATCATCTTCCATA-TAACCAACACCAGCGTTACTGGTCAGTTCGCCTGGGAGCTTAGTCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 178565 281 + 647215 TGCAAAGTACATGGGTGAATGTGGCCGCATTTGCCTTTTATTGTAGCTTTGCATGAGGCACTGTGCAAAATCTAGTCAATGCTATGACCACGGTCCCTGAAAATTCTGGAGAAAATGAACTGTCATTTCTACTCTTGCTGAGGGGTCCATTAGGTGTTGCTTGACGTATGTCAAGGAATTTTTTGGTTACTCACAATGTCCATTTTTAAGTTGCACTTCATCATTTTCCATAACAACCAACAGCAGTTATACTGACCAGTTTACCCAGGAGCTTAGTCCAC + +a +s mr.mrrefChr5 43548 190 + 294542 AAGGAACTCCTTCTCCTCCACCTAAGTGATCCTTAAGTGCAACTACAAATTAACTGTTCTTAAAGTGCTGAGACTACACACTAGTGCAGTGCACTGCATGGTTTAGTTAGTGGCTACACTGATAACAATTAACTTCAATAAAAATTACCTTCTCACTCACAGTCTACTTTCCCTGATGCCTCCAAGATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 188527 189 + 636262 AAGGAACTCCTT-TCCTTCACACAAGTGACCCTTAAGTGCAACTACAAATTAACTGTTCTTAAAGTGGTGAGACTACACACTAGTGCAGTGCACTGCATGGTTTAGTTAGTGGCTACACTGATAACAATTAACTTCAATAAAAATTATGTTCTCACTCACAGTCTACTTTCCCTGATGCCTCCAAGATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 178846 190 + 647215 AAGGACCTCCTTCCCCTCCACCTAGGTGATCCTCAAATGCGGCTACAAATTAACTGTTCTTAAAATCCTGAGACTACACACCAGTGCATTGCACTGCATGCTTTAATTAGTGGCTCCACTGGTAACAATTAACTTCAATAAAAATTACCTCCTCACTCACAGTCTACTTTCCCTGATGTATCCAAGATAC + +a +s mr.mrrefChr5 43738 372 + 294542 TTCTTCACTCACATCCTTAACATCCTTATCTGGACCATGGTCCACGTCTTTCAATGGATTTTGAGCATCATATTTACTATCCTTCTTCTAGCTGCAATTTTCATGGATTGTTGGGATGAAGTCTAAGGCCAAAATAGTGCAAGTCTGGGTCTAGCAAGACTCTCATATAGCATGGGAGTTGTACATCTTTTACACACATATGGGCATCACCTTCTAAAGAAGCCCTCATTAACCCAGATTTCCAGTCCCTATGTGGGACAAATTAGTCTGTGTTTCCCAGGTTGACAGGTGACATCTATTCATGACGACTAAACTTTCTGGGTGGACCACATGGGTGTGGATGAGTCAACAGAACTATGAAGAATACTATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 188716 372 + 636262 TTCTTCACTCACATCCTTAACATCCTTATCTGGACCATGGTCCACGTCTTTCAATGGATTTTGAGCATCATATTTACCATTCTTCTTCTAGCTGGAATTTTCATGGATTGTTGGGATGAAGTCTAGGGCCAAAATAGTGCAAGTCTGGGTCTAGCAAGACTCTCATATAGCATGGGAGTTGTACATCTTTTACACACATATGGGCATCACCTTCTGAAGAAGCCCTCATTAACCCAGATCTCCAGTTCCTATGTGGGACAAATTAGTCTGTGTTTCCCAGTTTGACAGGTGACATCTATTCATGACGACTAAACTTTCTGGGTGGACCACTTGGGTGTGGATGAGTCAACAGGACCATGAAGAATACCGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 179037 372 + 647215 TTCTTAACTCACATCCTTAGCATCCTTATCTGAACCATAGACCACGACTTTCAATGGATTTTGAGCATCATAATCACTATCGTTCTTCTAGCTGCAATTTTCATGGATTGTTGGGATGAAGTCTAACGCCAAAATAGTGCAAGACTGGGTATGGCAAGACTCACATATAGCATGGGAGTTATACATCTTTAACACACATATGGGCACCCCCCCCTAAAGGAGACCTCATAAACCGGGACTTCCAGTCCTTATGTGAGACAAATTAGTCTGTGTTTCCCAGGTTGACATGTGCCATCTGATCACAATGACTAAACTTTCTAGGTGGACCACATGGGAGTGGATGCGTCAACAGAAGTATGAAGATTACTATAT + +a +s mr.mrrefChr5 44110 138 + 294542 ACATCTTTACTATACTATGCATATCGCAAATGACCAATCACAGTGTTGAACCAAGATTTATTGTGTTAAACGAGTCAGTAACAGTTAGCTTTGCACATAAATCCTCTATGTACTTTTAGACATGTTACCAAGTCCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189089 138 + 636262 ACATTTTCACTATACTATGCATATTGCAAATGACCAATCACAGTGTTGAACCATGATTCACTGTGTTAATCAAGTCAGTAACAATTAGCTTTGCACATAAGTCCTCTATGTACTTTTAGACATGTTACTAAGTCTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 179409 138 + 647215 ACATCTTTACTATACTATGCATATCGAAAATGACCAATCACAGTGTCAAACCAAGATTTATTGTGTTAAACGAGTCAGTAACAGTTAGCTTTGCACATAAATCCTCTACGTAATTTTAGACATGTTACCAAGTCCCCT + +a +s mr.mrrefChr5 44248 99 + 294542 TCATAACCTTGTATAGGTATACTATTGTCTTGTCTCTCGTTCCCTTGTTGAAATGCATTACTCATCACATGAAGAGGCTTAGGCACTGTGAACAGCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189232 99 + 636262 TCATAACCTTGTATAGGTATACTATTGTCTTGTCTCTCGTTCCGTTGTTGAAATGCATTACTCATCACATGAAGAAGCTTAGGCACTGTGAACAGCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 179547 99 + 647215 TCATAACCTTGTATAGGTATACTATTGTCTTGTCTCTTGTTCCCCTGTTGAAATGCATTACTCATCACATGAAAAGACTTAGGCACTATGAACAGCCTA + +a +s mr.mrrefChr5 44347 82 + 294542 CATTGTTGCAAAATCATATGCCAGTCCTCTGCCTTTTCCATATGTTTTCTTTCATCTTAACAAGGGTTTTGCATCCACATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189331 82 + 636262 CATTGTTGCAAAATCATATGCCAGTTCTCTGCCTTTTCCATATGTTTTCTTTCATCTTATCAAGGGTTTTGTGTCCACATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 179663 82 + 647215 CATTGTTGCAAAATCATATGGCAGTCCTCTGCTTTTTCCACAAATTTTCTTTCATCTTAACAAGGGTTTTGCATACACATGA + +a +s mr.mrrefChr5 44429 130 + 294542 TGGACCATTATACCATTTTTGTGATTGTTAGACTCTTTCATCCTATTTGGGTGTACCTGACTTGTTAGAGGTCATTTCTTAAGTTCTCTCAGGTTTTAATAGGTATGCCTAGAGTGATGGCTAGGATGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189413 130 + 636262 CGGACCATTATACCATTTTTGTGATTGTTAGACTCTTTCATCCTACTTGGGTGTACCTGACTTGTTAGAGGTCATTTCTTAAGTTGTCTCAGGTTTTAATAGGTATGCCTAGAGTGATGGCTAGGATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 179746 130 + 647215 TGGACTATTGTACCACTATTGTGATTGTTGGATACTTTCAACCTATTTGTGTGGACCTGACTTGTTAGAGGTTATTTCTTAAGTTCTCTCAGGTTTTAATAGGTGTGCCTAGAGTGATGGCTAGAATGCC + +a +s mr.mrrefChr5 44559 57 + 294542 CCAGCATTAGGATGCTTTAAATTGCTATCTGTAGGTTCCACTGTATAACCTGACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189545 57 + 636262 CCAGCTTTAGGTTGCTTAAAATTGCTATCAGTAGGCTCCACTATATAACCTAACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 179876 57 + 647215 CTGTTATTAGGATGCTGTAAATTGCTATCTGTAGGTTCCACTGTATAACCTGACAGG + +a +s mr.mrrefChr5 44616 82 + 294542 CAAACTGACTTTTTAATTCTCTTAACTGTGGACTCACAGAAGAGGACAACAATATTCTGCAAGTCTACTTAGTTATCACTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189602 82 + 636262 CAAATTGACTTTTTAATTCTCGTAACTGTGGATGCACAGAAGAGGACAACAATATTTTGCAAATCTACTTAGTTACCACTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 179937 81 + 647215 CAAACTGACTGTCTAATTTTCTTAACTATGGACTCACAGAAGAGGACAAC-ATATTCTTCAAGTCTACTTAGTTATCACTCA + +a +s mr.mrrefChr5 44698 248 + 294542 TAACCTTGTAGAGGCAATTATTACTCTCTCTTCATTGCTCTTAAGAGTCTTATCAACTACCACTCATAAGGTCCGTGTCACTAACACTACTCTATCTTCATTACATCCTAACACCTGTACTAGTAGGTAGGCAAAAACATGGGACTGCCTGTGCTTGGCCACATACTAATTGACAATTTGAACATCCTATATAGACAAATTCCAGACAATGTACTGGGACTCCTCTGTTAGAGAGCAACAGCCTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189685 246 + 636262 TAACCTTGTAGAGGCAATTATTACTCTCTCTTCATTGCTCTTAAGAGTCTTATCAACTACCACTCATAAGGTTCGTTTCACTAACACTACTCTATCTTCATTACATCCTAACACCTGTACTAGTAGGTAGGCAAAAACATAGGACTGCCTGTGCTTGGCCACATACTAATTGACGATCTGAACATCC--TATAGACAAATTCCAGACAATGTACTGGGACTCCTCTGTCAGAGAGCAAAAGCCTGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 180018 244 + 647215 TAACCTTGTATTGGCAATAATTACTCTCTGTCCATTGATCTTAACAGTCTTATCAACTACCACTCATAGGGGCGGTGTCACTAACATCACTCTGTCTTCATCACATCCTAACACCTGTACTA----ATAGGCAAAAAGTTGGGACTGCCTGTGCTGGGCCACATACTAGTTGACAATTTGAACATCCTATATAGACAAATTCCAGACGATGAACTGGTACTCCTCTGTTAGAGAGCTACAGCATAACA + +a +s mr.mrrefChr5 44946 73 + 294542 GGGTTGAGTATTCAAAATACATCAAGGCTTCCTGCTTCATTGGAATTCATTCCAGGCACTAATAGTTATGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 189932 73 + 636262 GGGTTGAGTATTCAAAATCCATCAAGGCTTCCTGCTTCATTGGAATTCATTCCAGGCACTAATAGTTAGGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 180262 73 + 647215 GGGTTGCGTATTGAAAATACATCAAGGCTTCCTACTACATTGGAATTCATTCCAGGCACTAATAGTTATGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 45019 57 + 294542 TCAGATGATCAGTTGATTCCTCTGAGTGCCCTGATCTCAACTTTTGTTTGGAAGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190006 57 + 636262 CCAGATGATCAGTTGATTCCTCTGAGTGCCCTGAACTCAACTTTTGTTTGGAAGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 180335 57 + 647215 TCAGCTGATTAGTTGATTCCTCTGAGTGCCCTGATTTCAACTTGTATTTAGAAGGCC + +a +s mr.mrrefChr5 45076 42 + 294542 CAGACACAGCTCCATGCAGATGGGACATACCTCTACGGACGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190063 42 + 636262 CAGACACAGCTCCATGTGGATGGGACATACCTCTACGGACGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 180393 42 + 647215 CAGATACAGCTCCATGCAGATGGGACATACCTCCACAGACAG + +a +s mr.mrrefChr5 45118 49 + 294542 GGTTTGAGCAATGTAACGAATATTGCGCGTGATGATCTTCCCCTACTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190106 49 + 636262 TTTTTGAGCAATGTAACAAATATTACACGTGATGATTTTCCCCTATATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 180435 49 + 647215 GGTTTGAACAATGCAACGAAAATTGCGCCCGATGATCTTCCCCTACTTC + +a +s mr.mrrefChr5 45167 133 + 294542 TAACTGACAGTGCCATCATATAGAATATAATCTGTTACAACAGTTGAATCTTGTTGTTTCATTGCTCTGTATATTAGGTAGGTGCAAGGATTTCTTTTATGGTTTGGATGAGATGAGTAAGAGGTGCAAGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190156 133 + 636262 TAACTGACAGTGCCATCATATAGAATATAATCTGTTACAACAGTTGAATCTTGTTGTTTCATTGCTCTGCATGTTAGGTAGGTGCAGCAACTTCTTTTATGGTTAGGATACGATGACTAAGAGGTGCAAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 180484 133 + 647215 TAACTGACAGTGCCATCATATGGAATATAATCTGTTACAACAGTTGAATCTTGTTGTATCATTGCTCTGTATATTAGGTAGGTGCCAGGATTTCTTTTATGATTTGGACGAGATGAGTAAGAGGTGCAAGAAG + +a +s mr.mrrefChr5 45300 123 + 294542 AGGGGGTCCACAATTTCAAGGTCCATTGAATAAGCTACCTGAACTGCTTGCTGACCCACTAGAGGCAGTGTTGATTGCAAGATCATGAATGTTGCACCCATAAATCACAGGGGAATTGGGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190289 123 + 636262 AGGGTGTCCACAGTTTCAAGGTCCCTTGAATAAGCTACCAGAACTGCTTGATGAGCCACTAGAGGCAGTGTTCATTGCAAGATCATGAATGTTTCACCCATAAGTCACAGTAGAATTGGGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 180620 123 + 647215 AGGGGCTCCACAATTTCAAGGTCCAATCAATGAGCCACCTGAACTGCTTGCTGACCTACTAGAGGCAGCGTTGATTGCAAGATCATAAATGTTGCACCCATAAATCACAGGGGAATTTGAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 45423 192 + 294542 TGGAGTATGAATAGTCTAGACGATGGCTTGAGCCAGGCTGCATAGTCTCCCTAAAAATACTGTCCCTGACAAAAAAAGATAATTTATCTTTCTAGTTTGGCATCAAGAAAATAGCTCATCATGCCATCCCCCACACAATAGATTTGAGTTTGGTAAACCTTGAAACTGGAGTATTTGAGGTAATAAATCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190418 163 + 636262 TGGGGTAAGAATAGTCTAGATGATGGCTT-------GCTGTATAGTGTCCCTAAAAATAC--TCCCTGACAAAAAATGATAATTTATCTTTCTGGTTT------GAGAAGATAGCTCATCATGCCATCCCCCACACAATAGAATTGAGTTTGGT--------------GAGTATTTGAGGTAATAAATCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 180743 192 + 647215 TGGAGTATGAATAGTCTAGACCATGGCTTGAGCCAGGCGGCATAGTCTCCCTAAAAATACTGTCCCTGACAGACAGAGATAATTTATATTTCCAGCTAGGCATCAAGAAAATAGCTCATCAGGCCATCCCCCACACAATAGATTTGAACTTGGTAAACCTTGAAACTGGAGTATTTGAGGTAATAAATCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 45615 146 + 294542 TAGAACTAGACATAATATGAGCGTGGTGCTGGTAGTAGGCTGGTAAGACAGGAGAATAAGGAGACCAGTGTGGAGTATAAAGATCTCAGAGTATGAAGTCTCGTTCGTTACTCCAGTTTGCCAAGTTAAGGAGAGTTTCAGACTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190582 145 + 636262 CAGGACTAGACATAATATGAGCGTGGTGCTGGTATTAAGC-AGCAAGACAGGAGAATGAGGAGACTCATGTGGAGTATAAAGATCTCAGAGTATGAAGTCTTGTTCATTACCCCAGTTTGCCAAGTTAAGGAGAGTTTCAGACTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 180935 140 + 647215 TAAAACTAGACACAAC------GTGGTGCTGGTAGTAGGCTGGTAAGACAGAAGAATAAGGAGACCAGTGTAGTGCATAAAGATCTTACAGTATGAAGTCTCGTTCGTTACTACAGTTTGCCAAGTTCAGTAGGGCTTCAGGCTAA + +a +s mr.mrrefChr5 45761 17 + 294542 GAGACTGTCCAATAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190728 17 + 636262 GAGGCTGTCCAATGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 181075 17 + 647215 GAGACTATCCAGTAGTC + +a +s mr.mrrefChr5 45778 9 + 294542 CTAACAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190746 9 + 636262 CTAACAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 181092 9 + 647215 CTAACAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 45787 72 + 294542 CAATCAAATATGCATGGCTCCCTAGCTTGAGCACTTGTGAAGGCTGAGGGTTTCCTTTCATGCTACTCCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190755 64 + 636262 CAAGCAAATATGCATGGCTCCCTAGCTTGACCTCATGTGA--------GGTTTCCTTTCAGCTAACAGCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 181103 72 + 647215 AAATCAAATATGCATGGCTCCCTAGCTTGAGCACTTGTGAAGGCTGAGGGTTTCTTTTCATGCTATTCCTAA + +a +s mr.mrrefChr5 45859 58 + 294542 ACACTAACACTTCTTGTTGGACTCAGCCATAGCACAGTATATCTATCACAATATGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190820 56 + 636262 ACCTAAACACTTCTTGTTGGACTCAGCCATAGCACAG--TATCTATCACAATATGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 181175 58 + 647215 ACACTAACACTTCATGTCAGACTCAGTCATAGCACAGTATATCTATCACAATAAGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 45917 289 + 294542 TATTTTGTGTGAGTAATCACAAGTACTAGATGATTGGAAGACCAAGTTTGTCTACTGGGAAAAGTTTGGGGTGTATCACAGTAGCCTCAAGAGGTGCCAAGCTCTGGTATGCACTCCCTCAATGAGCGAGATTACTGAATTAGGACACATGGGAGCCTTCAAATCCGGCTTCAATAATCTCCACTGTAACTAAATGATACAAGTACCGATTTGTGATGCTATAGATTTTAGAATATGAATTCGTGGGATTTCCATGGGTTAATTTATGGCTGCTTACCAATGACTTCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 190880 255 + 636262 TATTTTGTGTGATTAATCACAAGTACTAGCTCATCGGGAGACCAAGTTTGTCTAGTAAGAAAAGTTTGGGGTGTATCACAGTAGCCTCAAGAGGTGCCAAGCTCTGATATGCACTCCCTCAATGCGCGAGACTACTGAATTAGGACACATGGGAGCCTTC--------------------------------AATGAAACAAGTACCGATTTGTGATGCTATAGATTTTAGAATATGAATCCGTGGGATTTTCATGGGTTAATTTATGGC--CTTACCAATGACTGCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 181233 289 + 647215 TATTTTGTGTGAGTAATCACAAGTACTAAATGATTGGAAGAGTAAGTTTGTCTACTGGGCAAAGTCTGGGGCGTTTCACAGTAGACTCAAGAGGTACCAAGGTCTGGTATGCACTCCCTCAATGAGCGAGATTACTGGATTAGGACACATTGGAGCCTACAAATCCGGCTTCAATAATCTCCACTGTAACTAAATGATTCAAGTACAGATTTGTGAAGCTATAGATTATATAATCTGAATTTGTCAGACTTCCATGGGTTGATTTATGGCTGCTTACCAATGACATCTT + +a +s mr.mrrefChr5 46206 6 + 294542 TCCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191136 6 + 636262 TCCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 181522 6 + 647215 TCAATT + +a +s mr.mrrefChr5 46212 200 + 294542 GCTTCAAATGCCACAAAGACATGAGACCTTGCTTTGTACTCATGTGCTTTCCTCAACCAGGAATAGAATCTCCTTCATGACATATGAGCCTACACCTGTAACCCACTAAATGATCAAACGATAGTTCTGTAACATTTTCTGTAACCTACTTGAAGCTGAGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGAAGTTGGATCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191145 184 + 636262 GTTTTAAATGCCACAAAGACATGAGAC----------ACTCATGTGCTTTCCTCAACCAGGAATAGAATCTCCTTCATGACATACGAGCCTACACCTGTAACCCACCAAATGATGAAAC------CCTGTAATATTTTCTGTAACTTACTTGAAGCAGAGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGAAGTTGGAGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 181528 200 + 647215 GCTTCAACTGGCACAAAGACATGAGACCTTGCTTTGTGCTCATGTACTTACCTCGACCATGAATAGCATCTCCTTCATGTCATATGAGCCTATACCTGTAACCTAATAAGTGATCAAATGATAGTTCCGTAACCTTCTCTATAACCTAATTGAAGCTGGGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGACGTGAGCTCTTC + +a +s mr.mrrefChr5 46412 2 + 294542 AT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191329 2 + 636262 AT +s simRat_chr6.simRat.chr6 181730 2 + 647215 AT + +a +s mr.mrrefChr5 46414 7 + 294542 AATAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191332 7 + 636262 AATAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 181732 5 + 647215 AATAA-- + +a +s mr.mrrefChr5 46421 86 + 294542 ATGAAAGTATTTTGCAGATCTTTAGTAAACAGCCTTAGTTAAGTATCTGCTTCGTTGCCAATCTGTTTACAGATTCGTATGACTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191343 83 + 636262 ATGAAAGTATTTTGCAGATCT---GTAAACAGCCTTAGCTATATATCTGCTTCGTTGCCAATCTGTTTACAGTTTCGTATGACTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 181737 76 + 647215 ----------TTTGCAGATCTTTAGTAAACAGCCTAAGTTAAGTCTCTGCTTCGTTGCCAATCTGTTTACAGAGTCGTATGATTCT + +a +s mr.mrrefChr5 46507 57 + 294542 CAAAAGTGCCTTTTCTGCATCTACAGAACTAATGTATTATGGCTAATTCCACACCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191428 57 + 636262 CAAAAGTGCCTCCTCTGCACCCGCAGAACTAATGTATTATGGCTAATTCCACACCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 181813 57 + 647215 CAAAAGTACCTTTTCTGCATCTACAGAACTAATGTATTATGGCTAACTCCATCCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 46564 48 + 294542 CTGCCTCTGTCTAGCCTGTCTAGGCTATGGAAAACTGCCCCCTCTGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191489 48 + 636262 CTGCCTCTGTCTAGCCTGTCTAGGCTATGGAAAACTGCCCCCTTTGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 181870 48 + 647215 CCTCGTCTGTCTAGCTTGTTTAGGCTATGGAAAACTGCCCCCTCTGCA + +a +s mr.mrrefChr5 46612 205 + 294542 ACTCATTATAGTGCATTTCACCCTTGCCCCTTTGTCTAGTAGTATCACATTGCATCTTGACACTCATGAGATCTCCTGCATAAGTTGCCTTGGCAAGCATGCTCAGATCCTTTGACATTTAGATTAGATTGTCGAACAATGAAAAGTATGATTTGCTCTTCATTGCTCAACCCTACCAATGTACCAAGAGCTGAGTGATGTGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191543 205 + 636262 CCTCATTATAGTGCATTTCACCCTTGCCCCTTTGTCTAGTAGTATCACATTGCATCTTGACACCCATGAGATCTCCTGCATAAGTTGCCTTGGCAAGCATGCTCGGATCCTTTGACATTCAGATTAGATTGTCGAACAATGAAAAGTACGATTTGCTCTCGATTGTTCAACCCTACCAATGTACCAAGAGCTGAGTGATGTGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 181918 205 + 647215 ACTCGTTATAGTGCATTTTGCCCTTGCCCATTTGTATGGTAGTATCACCTTGCATCTTGACACTCATGAGATCTCCTGCACAAGTTGCCTTGGCAAGCTTGCTCAGATCCTTTGACATTTCGATTAGATTGTCTAATAATGAAAGGTATGATACGCTCTTCATTGCTCAACCCTACCAATGTACCAAGAGCTGAGTGATGTGGCG + +a +s mr.mrrefChr5 46817 21 + 294542 CATACAGCTCTGCGCTGGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191748 21 + 636262 CATATAGCTCTGCGCTGGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 182132 20 + 647215 TATACAGCTC-ACGCTGGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 46838 86 + 294542 TTGTCTCTTTCTACAAGACAAGCAGCATCTCTTGTATTTTTTATAGTAAAGATTGCTGTCATCTCAATGTGTTGAGACCATGGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 191938 86 + 636262 TTGTCTCTTGCTACAAGACAAGCAGCATCTCTTGTATTTTTTATAGCAAAGATCACCGTCATCTCAATGTGTTGAAACCATGGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 182152 86 + 647215 TTGTCTGTATCTACAAGACAATCAGCATCTCTTGTATTTTTTATAGTAAGGATTGCTGTCATCTCAATGTGTTGAGACTATGGGTC + +a +s mr.mrrefChr5 46924 157 + 294542 TGTGGAATATAACAAATGTATCCTGAAGTCAAAGCTAGCTAGTTTAACAGGATCTGCCATGTTAGACTCTGGGCTACTAGTGAATGATTATTTCTGGCTAAATAATGTGCATATTTGTAAGCCAAAAGAGGTGCTTCAGTCTGACACAGCATGCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192025 154 + 636262 T--GGAATATAACAAATGTA-CCTGAAGTCAAAGCTTGCTAGTTTAACAGGATCTGCCATGTTAGACTCTGGGCTACTAGTGGGTGATTATTTCTGGCTAAATAATGTGCACATTTGTAAGCCAAAAGAGGTGCTTCAGTCTGACACAGCATGCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 182238 151 + 647215 TGTGGGATATAACAAATGTATCTTGAAGTCAAAGCTAGCTGGTGTAACAGGATCTGCCATGTTAGACTCGGGGC------TGAATCCTTATTTCTGCTTAAATAATGTGCATATTTGTAAGCCAAAAGAGGTGCTTTGGTCTGACACAGCACGAGAC + +a +s mr.mrrefChr5 47081 52 + 294542 AAAAAAAATTGAATCCAACTGGTTTCAATATGATAGATGCTACCAACTTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192182 52 + 636262 AAAAAAAATTGAATCCAACTGGTTTCAATATGATAGATGCTACCAACTTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 182389 52 + 647215 ACAAAAAATTGTATCCAACGAGTTTCAACATGATAGATGCTACCAACTTAGG + +a +s mr.mrrefChr5 47133 78 + 294542 ATAACACTATACACTTACCTTAGTTATTCACATCATTTAACCAGTCACAGTCACATGGGCCCTGTGGGGCCCTGTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192252 77 + 636262 ATAACACTATACACTTACCTTAGTTATTCACATCATTTAACCAGTTACAGTCACAT-GGCCCTGTGGCTCCCTGTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 182441 74 + 647215 ATAACACAATAAACTTACCTTAGTTATTCACA--ACTCAAACAGTCACAGTCACATGGGCCCTCTGGGGCCCCGTC-- + +a +s mr.mrrefChr5 47211 514 + 294542 TGAGATTGATCCTTTAAGACAGCATGCCCTGTTAACATGATGTTGGTCCTTTAAGACAGCACGTATAATGAACTCAGCACTTTATATCTCATGGACTGCTCACCGGATGTTATTGGCTAATCCAAATATACATGCAAAGCTTTGCCAGGCCCTTGAGCAGAAAAGAATGTGTTGCTGCATCCGTTGTGGGAGCAGATTTAAGCTGATGACCGCTCCTGTTATATACCAATTACAGTTACTCAGATTCAGGCACAGTCTGACTCTTTCAAGACTGCTTCTAGACAACATACCTCTCCTAAAGTCATAAGATGGGTAAATCGCTAAGATGGGTGTATGATGAAAGGACACAAAAGTATAGCCCTGCTGTAGCACATTAGGTGCAATCATGTGTAGGGAGATTGTTGGTAAGTGTCCTGGGGTACCACTGTAGCCCATAATGACTTGCCCAGTTGGCTGGCACACAGTGGATATTGTAGCTGTGAATTTAAGCGCGCGATGGACTGATCAATAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192331 492 + 636262 TGAGATTGATCCTTTAAGACAGCATGCCCTGTTAACCTGATGTTGGTCCATTAAGACAGCACATATAATGAACTCAGCACTTTATATCTCGTGGACCGCTTACCGGATGTTATTGGCTAATCCAAGCATACATGCAAAGCTTTGCCAGGCCCTTGAGCAGAAAAGAATGTGTTGCTGCATCCGTTGTGGGAGCAGATTTAAGCTGATGACCGCTCCTGTTATATACCAATTACGGTTACCCAGATTCAGGCACAGTCTGACCCTTTCAAGACTTCTTCTAGACAACATACCTCTCCTAAAGTC-----------------CTAAGATGGGTGTATGATGAAAGGACACAGAAGTATAGCCCTGCCATAGCACATTAGGTGCAATCAGGTGTAGGGAGATTGTTGGTAAGTGTCCTGGGGCACCACTGTAGCCCGTAATGACTTGCCCAGTTGGCTGGCACACAGTGGATATTG-----GTTAATTTAAGCGCGCGACGGACTAATGAAGGGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 182515 504 + 647215 TGAGGTTGATCCTTTAAGATAGCAGGCCCTGTCAACATGATGTTGGTCCTTTAAGACAGCACGTATAACGAACTCAATACTTTATGTCTCATAGACTGTTCACCGGATGTTATTGGCTAGTCCAAATATACATGCAAAGCTTTGCTAGGCCCTGGAGCAGCAAAGAATGTGTTGCTGCATCTGTCCTGTGAGCAAATTTTAGCTGATGGCCACTCCTGTTATAAACCAATTAAAGTTACTCGGACTCAGGCACAGACTGACTCTTTCAAGACTGCTTCTAAAGAACATACATCTCCTAAAATCATAAGATGGGTAAATCGTTAAGATGGGTGTACGAAGAAAGGACACAAAAGTA--------CTGTACCACATTAGGTACAATCATGTGTAGGGAGATTATTGGTGAGTGTCCTGGGCTACCACTGTAGCCCATAATGACTTGCCCAGCTGGCTGACACACAGTGGATATTGTAGCTGTGAACATAAATGTTCTATG--CTGATCAATAATCA + +a +s mr.mrrefChr5 47725 10 + 294542 TGTGAACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192825 10 + 636262 TGTGAACATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 183019 10 + 647215 TCCAGACACC + +a +s mr.mrrefChr5 47735 230 + 294542 AATGCAATCCAACCTACCAATCTACATATCCCAAGAGGAGTGCTGCCCAGTAAGTCTCCAGAAAACAATAGGAAAAATCCATGTATTATTCTGTTTATTTGGTTTCTCACACATAGGTGGCCCAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCTGCTCAGGTGCTCTTCAGGGATAGAAATATTCCCAGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTGATATCTCAGAGGCTGTATCAATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 192835 230 + 636262 AATGCAATCTAACCTACCAATCTACATATCCCAAGAGGAGTGCTGCCCAGAAAGTCTCCAAAAAACAATAGGAAAAATTCACGTATTGTTCTGTTTGTTTGGTCTGTCACACATAAGTGGCTCAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCGGCTCTGGTGCTCTTCAGGGATAGAAATATTCCCAGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTGATATCTCAGAGGCTGTATCAATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 183030 226 + 647215 AGTGCAATCCAATCTACAAATCTACATAT----AGAGGAGTGCTTCCGAGTAAGTCTCCAGAAAACAATAGGAAAAATCCGTATATTATTGCAATTATTTGGTTTCCCATACATGGGTGGCCTAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCTGCACAAGTGGCCTTCAGGAACAGAGATATTTCCGGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTTATATCTTAGAGGCTGTATCAATGCT + +a +s mr.mrrefChr5 47965 23 + 294542 TCACGGCTATGACTGTGGGTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193070 23 + 636262 TCACGGCTATGACTGTGGGTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 183256 23 + 647215 TCATGTCTATGACTATAGGTTCG + +a +s mr.mrrefChr5 47988 135 + 294542 GGAAAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTAAGCATAAGGACTCTATGAGAATGATTGCTTTTCTGATGTAGGAGTGGGGCCACCTCCCTACTAAGTCTGGAATGCAGCACATACATCCTCATCTATTAGGCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193093 135 + 636262 GGAAAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTAAGCATAAGGACTCTATGAGAATGATTGCTTTTCTGATGTAGGAGTGGGGCCACCTCCCTACTAAGTCTGGAATGCAGCACATACATCCTCATCTATTAGGCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 183290 135 + 647215 GGACAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTCAGCATGAAGAAACTATGAGAATGACTTCTTTTCAGATGTAGGAGTGGAGCCATCTCCCTTGTAAGTTTGGTACGCAGCACTTATGTCCTCCTCTATTAGGTATAA + +a +s mr.mrrefChr5 48123 63 + 294542 AAAGGGGGTGGTTCTGCATGACTAAGGGCAAATACTTCTAGCTCTTTATATTTGGTGAAGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193228 63 + 636262 AAAGGGGGTGGTTCTGCATGACTAAGGGCAAATACTTCTAGCTCTTTATATTTGGTGAAGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 183426 63 + 647215 AAAGGGGGTCTCTCTGCATGACTCAGGGCAGATACTTCTACCTCTTTATATTTGGTGAAGCAG + +a +s mr.mrrefChr5 48186 83 + 294542 AGACCTCTGTTTTATTTTATCAATCTACATTTGGTCTAAGCCTCAGCAGCCCTAATAACCCTTTGGGCTGGGGACATGGAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193291 83 + 636262 AGACCTCTGTTTTATTTTATCAATCTACATTTGGTCTAAGCCTCAGCAGCCCTAATAACCCTTTGGGCTGGGGACATGGAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 183492 83 + 647215 AGACCTCTTTTTTATTTTGTCAATCCACATTTGGTTAACGCCTCAGCAACCCCAATAACCCTTCAAGCTGGGGACATGGAACC + +a +s mr.mrrefChr5 48269 20 + 294542 TTATGTCATGGCTTCACGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193375 20 + 636262 TTATGTCATGGCTTCACGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 183575 20 + 647215 TTATGTCATGGCCTCATGCA + +a +s mr.mrrefChr5 48289 205 + 294542 TACGAATGAACCTTTCAGGTTAATGAAGTGGGAGTACAACTGCTTTACCATTGTAGGCTTCTGTTATTACGGGGTGGAATCTCAAGGGTTTCAAAAACCCCAGGCATTACTCGATCAACTTATATTGTGGGCTTCATCTACTTCAGTCATGACTTTAGCAGGTGTACAAATGCTTTAGGCTCGAGAAGTGGGAGAATAAACTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193413 205 + 636262 TACGAATGAACCTTTCAGGTTAATGAAGTGGGAGTACAACTGCTTTACCATTGTAGGCTTCTGTTATTACGGGGTGGAATCTCAAGGGTTTCAAAAACCCCAGGCATTACTCGATCAACTTATATTGTGGGCTTCATCTACTTCAGTCATGACTTTAGCAGGTGTACAAATGCTTTAGGCTCGAGAAGTGGGAGAATAAACTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 183595 205 + 647215 CATGTATGAACCTTTCAGGCTTACGAGGTGGGACCACAACTGCTTTACCATTGTAGGCTTCTGCTATTATGGGGTGGAATCTCAAAGGTTTGAAAAGCCCCAAGAATTACTTGATCAACTCATATTGTGGGCTTCATTTACTTCAGTCATGACTCCAGCAGGTGTACGAACTCTTTAGGCTAGAGAAGTGGGAGAGAAAACTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 48494 18 + 294542 AAACAAGAGGCTTTCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193624 18 + 636262 AAACAAGAGGCTTTCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 183800 18 + 647215 AAATAATAGGCTTTCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 48512 12 + 294542 ATCATGGGATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193643 12 + 636262 ATCATGGGATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 183818 12 + 647215 ATTATGGGATCA + +a +s mr.mrrefChr5 48524 21 + 294542 ATCTCAAAAGCTGCAGGAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193655 21 + 636262 ATCTCAAAAGCTGCAGGAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 183835 21 + 647215 ATCTCAAAAGCTGCAGGTATT + +a +s mr.mrrefChr5 48545 13 + 294542 CTCGCTTGGCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193676 13 + 636262 CTCGCTTGGCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 183857 13 + 647215 CTTGCTTGGCTAA + +a +s mr.mrrefChr5 48558 45 + 294542 GTGTTGGCTTTTCGGGGTGCTATCTGAAAGCTTGCAGCATCAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193698 45 + 636262 GTGTTGGCTTTTCGGGGTGCTATCTGAAAGCTTGCAGCATCAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 183870 45 + 647215 GAGTGGGCTTTTCAGGGTGCTATCTGAAAGGTTGCAGCATCATGA + +a +s mr.mrrefChr5 48603 76 + 294542 TTGATGATGTCTTCCATGTGAATCAACATATTATGAACACTTTTGAAACTTGAGGTGAATATGCACACACCATTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193744 76 + 636262 TTGATGATGTCTTCCATGTGAATCAACATATTATGAACACTTTTGAAACTTGAGGTGAATATGCACACACCATTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 183915 76 + 647215 TTGATAAGGTCTTCCATGTGAATCAACATGTTATGCAGACTTTTCAAATATAATGTGGACATGCACACACCATTAC + +a +s mr.mrrefChr5 48679 193 + 294542 GAAGGTTCTCCTTACCTGGGAGAACAAGGTATCTTAGTTAAAGCAACCTGAGCTGAGCCTATCATTTCATATCTGCATAACACATCATGAATACTCATTTCTATAAACCTATTCTCTGCATGCAATGAACTTTCATACCCCTACCCTTGATGTGTCCAGCAAAGGGCTCACTCGTAGTCAAGTCCACCAAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 193820 193 + 636262 GAAGGTTCTCCTTACCTGGGAGAACAAGGTATCTTAGTTAAAGCAACCTGAGCTGAGCCTATCATTTCATATCTGCATAACACATCATGAATACTCATTTCTATAAACCTATTCTCTGCATGCAATGAACTTTCATACCCCTACCCTTGATGTGTCCAGCAAAGGGCTCACTCGTAGTCAAGTCCACCAAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 183993 193 + 647215 GAAGGTTCTTCTTACCTGGGAGCACAAGGTATCTCTGTTAATGCAATGTGAGCTTAACCTGTCATTTCATGTCTGCATAACATGTCAGGAATACTCATTTATACAAACCTATTCTTCTCATGCAATCAACTTTCATACCCCTACTCTTGATATGTCCAGCAAAGGGCTCACTTCTAGTCAAGTTTAGCAAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 48872 207 + 294542 TTCACTCATAGTCAAGTCTAGAAGCATTTAGAATCAAGGTAAAAACTAGTGGACTGTTCAGTCAGGTGTCTCAAATATATCGCTCCCTAATATTGCAGCAGTCTTCTTGACTATAGCAAGAAACTGAAGTTAACTTCAGCTAAAGTAACCAAGGAAGTGAAAACACTACATTGAGCTGGACCTCTAAGGTCAAGCCAGCAACCTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194013 207 + 636262 TTCACTCATAGTCAAGTCTAGAAGCATTTAGAATCAAGGTAAAAACTAGTGGACTGTTCAGTCAGGTGTCTCAAATATATCGCTCCCTAATATTGCAGCAGTCTTCTTGACTATAGCAAGAAACTGAAGTTAACTTCAGCTAAAGTAACCAAGGAAGTGAAAACACTACATTGAGCTGGACCTCTAAGGTCAAGCCAGCAACCTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 184187 207 + 647215 CTCACTCATAATCAAGTCTAAAAGCATTTTGAATCAAGGTAAAAACCAGTGAACTGTTTAATCAGGTTTTTCAAAAATATTACTTCCTTATATTGCTGCAGTCTTCCTGACTATAATAAGTAGCTAAAGTTAACTGCAGCTAACGGACCCAAAGAAGTGAGAACACTACATTGAACTGGATCTCTATGGTCAAACCAGCAACGTATA + +a +s mr.mrrefChr5 49079 4 + 294542 ATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194220 4 + 636262 ATCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 184398 4 + 647215 ATCT + +a +s mr.mrrefChr5 49083 100 + 294542 CTTCCCTTGAAACCAAGATCCTGTTGGAACATCTCCTGTTGGATGGGGAATAGCAGATATGCAGACTGATAGTAGAGCGCAGCCTGAAGGTGTAGCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194224 100 + 636262 CTTCCCTTGAAACCAAGACCCTGTTGCAACATCTCCTGTTGAATGGGGAATAGCAGATATGCAGACTGATAGTAGAGCGCAGTCTGGAGGTGTAGCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 184405 100 + 647215 CTTCCCTTGAAACCAAGATCCTGTTGGAACATCTCCTGTTGGATGGGGAATAGCAGGTATGCAGACTGATAGTGGAGTGCAGCCTGAAGGTGTAGCTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 49183 230 + 294542 CTGTTGTAAAGGAGCAAATCACATCGAGCAATCTTAATTATACCCCTCCCATCTATTGTTTTCCTCTAGCTGTTTGCTCGATGCTTTGTGTCTTCTACTTTCTTGATAGGGAGTTTGGACACATTTATCAAGCTGTGACCCTGGGCAACTGTCAGAAACTACTGTAACAGTACCTGCCAAACATTACCACTTTTCTGAACCCAAACCCAATGAATATAATAGAAAATTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194338 230 + 636262 CTGTTGTAAAGGAGCAAATCACATCGAGCAATCTTAATTATACCCCTCCCATCTATTGTTTCCCTCTAGCTGTTGGCTCGATGCTTTGTGTCTTCTACTTTCTTGATAGGGAGTTTGGACACATTTATCAAGCTGTGACCCTGGTCAGCTGTCAGAAACTACTGTAACAGTGCCTGCCAAACATTACCACTTTTCTGAACCCAAACCTAATTAATATAATAGAAAATTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 184679 229 + 647215 CTGTTATGAATGAGCAAGCCACAACGAGCAATCTTAAGTAT-CCCCTCCCTTCTATTGTTTTCCTCTAGTTGGTTGCTCAATGCTTTGTGTCTTCTACTTTCTTGATAGGGAGTTCAAACATATTTATCAAGCTCTCACCCTGGGCAACTGTCATAAACTACTGTAACAGTACATGCCAAATATTACCACTTTTCTGAACCCAAAGCCAATGAATATAATAGAAATTTGA + +a +s mr.mrrefChr5 49413 62 + 294542 GACTTCATACACAGAAAAATAATGGTGGCACCTAACCTGCCAACTTTATGTTCTGTGTCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194569 62 + 636262 GGCTTCATACACAGAAAAATAATGGTGGCACCTAACCTGCCAACTTTATGTTCTGTGTCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 184908 62 + 647215 GACTTTACACACAGCATGATAATGGAGGCACATAACCTGCCAACTTTATGATCCATGCCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 49475 242 + 294542 AATAGACAATGTAGTAGACTTCATTCAGGTACAGTGTTTATATTTACCAATACATAATGACTCCAGTATACAGCTATAAATGGAAGCTTATTGTGTGGATAGCTAGTCCAAGTGTCTCACCTGAGTTATTCGGTAGTGTTCAGGCTGTTGGTTCAATGGGATGCATTGCAACATATGTTATCTCCTTGAATTTAGAGTAACATGAAGAAAAAGCCTGGTTTCTAGTATGCTTTTGTTATAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194632 241 + 636262 AATAGACAATGTAGTACACATCATTCAGGTACAGTGTTTATATTTACCAACACATAATGACTCCAGCATACTGCTATCAATGGAAGTTCATTGTG-GGATAGCTAGTCCAAGTGTCTCATCTGAGTTATTCGGCAGTGTTGAGGCTGTTGGCTCACTGGGATGCATTGCAACATATGTTATCTCCTTAAATTTAGTGTAACATGAAGAAAAAGCCTGGTTTCTAGTATGCTTTTGTTATAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 184970 212 + 647215 AATAGACAATGCAGTAGACTTCATTCAGGTACAGTGTTTATATTTACCAATACATAATGACTCCAGTCTACAGCTATAAATGGAAGCTTATTGTGTGGATAGCTAGTCCAAGTCTCTCACCTGAATTATTTGGTGGTGTTCAGTCTGTTGTTTCAAGGGGA--------AACATATGTCATCTCCTTGAATTTAGAGTAACATGAAAAAAAAGT----TTTCTA------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 49717 642 + 294542 TCACAGTGACCACTCCTGTTGTAAGTACCTGTTACTAGAATTTCAACATATGGTTCACACTCACCCATTAAACCTTCTATTTCAGTCACTGGAAAGTCCTAATGTTGCTGTGATATTATATTCCATTTCACAGCATACTGAGCCAGATATTGCTTGCAGTACTCACTAAGATCTAAATTACTATAGTAAACCTCACCCTTATCTGCATAGGGATATAATGGACTCACTTCAAATCAACCCAGAAGGGTCCATCTCATTTGTACAAATTCTCTACCTTAGCACAAGGAGCAAAATCCCTCTGCAAGGTCAGGAAAAATTGCAAGGTCAGTGGTTTTAGCTGAGCTGGGGGAAAGAACAATCAATTAATATTGAAAATACCAAATTCATTGAGAAGACTTATATACTCTTATTAAACTGATCTTAGGATACATGCAGCCTCTACAATACTGAAGTACAGGTTATATGTGTTTGAAGGCAGGGTAGAAATAAAAAGTTTTCTCATGCAATGATGTACCAGTTAAGTACCCTCATTGACCTGGATCAAAATATTGAGGGTGACAAATCAGTCATATTTACTGGTTTAAGTTGCCACGCTGCTTATATAGAGAACATATCAACAACATAGCACTATGGCATGTACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 194875 640 + 636262 TCACAGTGACCACGCCTGTTGTAAGTACCTGTTGTTAGAATTTCAACATATGGTTCACATCCACCCATTAAACCTTCCATTTCAGTAACTGGAAGGTCCTAATGTTGCTGTGATATTATAT-CCATTTCACAGCATACTGAGTCAGTTATTGCTTGCAGTACTCACTAAGATCTAAATTAC-ATAGTAAACCTGACCCTTATCTGCATAGGGATATAATGGACTCACTACAAATCAACTCAGAAGGGTCCATCTCAATTGTACAAATTCTCTACCTTAGCACATGGAGCAAAATCCATCTGCTAGGCCAGGAAAAATTGCAAGGTCAGTGGTTTTAGCTAAGCTGGGGGAAAGAACAATCAATTAATATTGAAAATACCAAATTCATGGAGAAGACTTATATACCCTCATTAAACTGATCTTAGGATACATTAAGCCTCTACAATACTGAAGTGCAGGTTATATGTGTTTGAAGGCAGGGGAGAAATAAAGAGTTTTCTCATGCAATGATGTACCAGTTAAGTACCCTCATTCACCTGCATCAAAATAATGAGGGAGTTAAATCACTCATATTTACTGGTTTAAGTTGCCACGCTGCTTATATAGAGAACATATCAACAACATAGCACTATGGCATGTACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 185182 577 + 647215 ---------CCACTCCTGTTG------CCTGTTACTAGAATTTCAAAATGTGGTTCACACTCACCCATTAAACATTCTGTTTCACTCACTGGAAAGTCCTAGTGTTGCCATGAAATTATATTCCATTTCACAGCATTCTGAGCCAGATATTGCTTGCAGTACTTACTAAGATCTAAATTACTATAGTAAACCTCACCCTTAATTGCATAGGGATATAGTGGACTCACTTCAAATCAACCCAGA--------TCTCATTTGTACAAATTCTCTACCTTGGCACAAGGGGGAAAATCCCTCTGCAAGGTCACTAAAAATTGCAAGGTCAGTGGTTTTAGCTGAGC---------------------------------------TTCATTGAAAACACTTATGTACTCTTAGTAAACTGATCTTAGGATACATGCAGCCTCTGTAATGCTGAAGCACAGACTATATGTGTTTGAAGGTAGGGTAAAAATAAAAGTTTTTCTCGT---ATGATGTGCCAATTAAATAACCTCATTGACCTGGATCAAAGTATTAAGGGTGACAAATTAGTCATATTTAATGGTTTAAGTTGCCATGCTATGTGTATGGAGAACATATCAACAGCATAGCCCTATGGCATGTACCA + +a +s mr.mrrefChr5 50359 25 + 294542 CAGCCACTTGAACCATTTGATCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195519 25 + 636262 CAGCCACTTGAACCATTTGATCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 185759 25 + 647215 CACCCACTTGAGCCATTCAATCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 50384 49 + 294542 CATTCTGTCCACACAAGATGTCACAGCTAGTGCCCTTTGAGGGACATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195545 49 + 636262 CATTCTGTCCACACAAGATGTCACAGCTAGTGCCCTTTGAGGGACATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 185784 49 + 647215 CGTTCTGTGCACATAAGATGTTGTAGCTAGCACCCTGTAAGGGACATGA + +a +s mr.mrrefChr5 50433 19 + 294542 GATTGCACCCTTGTTTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195597 19 + 636262 GATTGCACCCTTGTTTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 185833 19 + 647215 GATTGGACCCATGTTTCTC + +a +s mr.mrrefChr5 50452 33 + 294542 CTGGTGAAGTTAGGTGGGATCAACTAAACTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195616 33 + 636262 CTGGTGAAGTTAGGTGGGATCAACTAAACTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 185855 33 + 647215 CTGGTGGAGTTAGATCGAATCACCTAAACCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 50485 60 + 294542 ACCACAGAGAATCTTTAGGGCCCTCATGAATCAAACTCGGGAGTAAGATGGACTTTACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195650 60 + 636262 ACCACAGAGAATCTTTAGGGCCCTCATGAATCAAACTCGGGAGTAAGATGGACTTTACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 185888 60 + 647215 ACCACAGAGAATCTTTAGGGCCCTCATTGATTAAACTGAGGAGTAAGATAGACTCTACCA + +a +s mr.mrrefChr5 50545 60 + 294542 CTAGGAGCCATACTGCATAAAAGCCCTTGCCAGACTTGTCATGTAGGGTTCATTAGTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195710 60 + 636262 CTAGGAGCCATACTGCATAAAAGCCCTTGCCAGACTTGTCATGTAGGGTTCATTAGTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 185949 60 + 647215 CAAGCAGCCATATGGCATAAGAGCCCTCGCCAGACTCATCATGCCTGGTTCATTAGTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 50605 159 + 294542 AGGTCCCATAAAACACACAATACTGCATAAGGTGCTATTACTGAAATTAGTCCCACCTCAGCACGGACTAACAGTATTCACTAACCTCCAAGGTTTACAACCTGAACCTCCTTGATGCCTAAACTCCCCTGTAGTGCTGTCTGAGGTGTCTTTATCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195771 159 + 636262 AGGTCCCATAAAACACACAATACTGCATAAGGTGCTATTACTGAAATTAGTCCCACCTCAGCACGGACTAACAGTATTCACTAACCTCCAAGGTTTACAACCTGAACCTCCTTGATGCCTAAACTCCCCTGTAGTGCTGTCTGAGGTGTCTTTATCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 186009 159 + 647215 AGGTCCTGTAAAACACACAATACTGCATAAGGTGTTCCCCCCAAAATTAGTTCCACCTCAGTGCGGACTAAAAGGATTCACTAGCCTCCAAGGTTTACAACCTGAGCTGACTTGATGGGTAAACTTCCCTATAGTGTTGTCTGAGGTGTTTTTTTCCCT + +a +s mr.mrrefChr5 50764 36 + 294542 CATATGCAGGATAAAACCAAGGGCTTGCCTGCTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195933 36 + 636262 CATATGCAGGATAAAACCAAGGGCTTGCCTGCTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 186168 36 + 647215 CATGTGCAGGGTAAAACTTAGGTCTTGCCCACTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 50800 7 + 294542 AATCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 195971 7 + 636262 AATCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 186204 7 + 647215 AATCATC + +a +s mr.mrrefChr5 50807 54 + 294542 GAACTATGAAACAGCCTCCAAAAGGCATACTGCCCCAAATTCAGATGATCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196005 54 + 636262 GAACTATGAAACAGCCTCCAAAAGGCATACTGCCCCAAATTCAGATGATCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 186211 54 + 647215 GAGCCATAAAACAGCCTTTAAAAGGCGAACTGCCCTAAATATGGATGGTCTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 50861 33 + 294542 TAATGCTGTCTgaggtgtcTTTAaccttcatat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196064 33 + 636262 TAATGCTGTCTgaggtgtctttaaccttcatat +s simRat_chr6.simRat.chr6 186265 33 + 647215 TATGGAGGTCTAAGCAACCTCCACCGGACAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 50894 14 + 294542 acaggataaaacca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196097 14 + 636262 gcaggataaaacca +s simRat_chr6.simRat.chr6 186299 14 + 647215 ACTTTATAAGGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 50908 5 + 294542 agggc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196111 5 + 636262 agggc +s simRat_chr6.simRat.chr6 186314 5 + 647215 AGGGC + +a +s mr.mrrefChr5 50913 50 + 294542 ttgcctgcttgaaatcatcagtaagccagtatcattgtatatgtggaacc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196116 50 + 636262 ttgcctgctggaaatcatcagtaagccagtatcattgtatacgtggaacc +s simRat_chr6.simRat.chr6 186322 46 + 647215 TCGCCT--TTCATAGTGTTGGTATCTGACTATC--TGAATATTTCTAACC + +a +s mr.mrrefChr5 50963 92 + 294542 atgaaacagccttcagaaagcaaactgccctaaatacggatggtctaagcaacctcaactggacagcttactttataaggccatagggccct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196166 92 + 636262 atgaaacagccttcaaaaggcaaactgccccaaatacggatgatctaagcaaccttcactggataacctactttataaggccataggccccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 186395 92 + 647215 ATTAAACAGGCTTTAGAAAGCAAACTGCCCTAAATGTGGACGGTCTAAGCAACCTCAAGTGGACAGCTTACTTTATAAGGCCATAGGGCCCT + +a +s mr.mrrefChr5 51055 22 + 294542 tCTGTAGTGTTGGTATCTGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196260 22 + 636262 tCTGTGGTTTTGGTATCTGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 186487 22 + 647215 TCATTAGTGTTGGTATCTGACT + +a +s mr.mrrefChr5 51077 97 + 294542 ATCTGAATATTTCTGACCTATGTGGTTCTTAGCTGTGGTTTTCCAATCAGTCACATTAATCACTTCAATTACACTTGTCCCCTCCTCAATAGTGCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196288 97 + 636262 ATCTGAATATTTCCGACCTATCTGGTTCTTAGCTGTGGTTTTTCAATTAGTCACATTAATCACTTCAATTACACTTGTCCCCTCCTCAATAGTGCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 186509 97 + 647215 ATCTGAATATTTCTAACCTATGTGGTTCTTAGCTGTGGTTTTCCAATCAGTCACATTACTCATTTGAATTACAATTGTCCCCTCCTCAATAGTGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 51174 96 + 294542 CAATACGATCACAACATTATCGCCTCCTGTGGATAGCTGTGCTGCTCTTCCAGTCCACATGCTTGAGGGGTTCTTGCTCACTGCCAATTTTAGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196386 96 + 636262 CAATACGATCACAACATTATCGCCTGCTGTGGATAGCTGTGCTGCTCTTTCAGTCCACACACTTGAGGGGTTCTTGCTCACTGCCAATTTTGGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 186606 96 + 647215 CAATACGTTCACAACACTATCGCCTCCTGTGGATAGCTGTGCTGCTCTTCCAGTCCACATGCTTGCAGGGGTATTGCTCACTGGCAGTTTTAGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 51270 297 + 294542 CTACAAAACAAAGAACATTATAGAGCTCCTATCTATATCAGCTCACCTCTTATCTAACCATCCTGAAACTAGCTCCTTTTATCCCAACCCCATAGTGATTTCGCCTTATATTCCTTAAATAATCACAATTGATACAAGCCCAAGTCCATTTTCTGTAACGGAGAGCCATAAGGGAAGTGTAGATGCCAACAGCCTATGTGTCCACAGGGTTGCTTTTAAGTGCATCCCAATAAATTAAGTCTAATTTAGAAACTAATTCTATCCACAATCCTAACTTCTGATTATTTTAAGTTCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196484 295 + 636262 CTACAAAACAAAGAACATTATTGAACTCCTATCTTCATCAGTTTTCCTCTTACCTAACCATCCTGAAACTAGCTCCTTTT--CCTAACCCCATAGTGATTTCGCCTTATATTCCTCAAATAATCGCAATTGATATAAGCCCAAGTCCATTTTCTGTAACGGAGAGCCATAAGGGAAGTGTAGATGCCAACAGCCTATGTGTCCACAGGGTTGCTTTTAAGTGCATCCCAATAAATTAAGTCTAATTTAGAAACTAATTCTGTTCACAATCCTAACTTCTTACTATTTTAAGTTCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 186702 284 + 647215 CTTCAAAGCAAAGAACGTTTTAGAGGTCCTATCTATATCAGCTCACCTCTTATCTAACCATCCTGAAACTAGCTCCTTTTATCCCAACCCCATAGTGATTTGCCCTCATATTCCTTAAATAATCACAATTGAAACAAGTCCAAGTCCATGTTCTGTGA-------------GGGAAGTGTAGATGCCAACTGCCTATGTGTCCGCAGGGTTGCTTTTAAGTACATCCCAATAAATTAAGTGTAATTTAGAAACTAATTCTATCCACAATGTTAACTTCTGATAATTTTAAGTTCTGG + +a +s mr.mrrefChr5 51567 36 + 294542 CAAAAGTTACATCTAAAAACCCAGTGCCCAGGGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196779 36 + 636262 CAAAAGTGACATCTAAAAACCCAGTGCCCAGGGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 186987 36 + 647215 CTAAACTTACATCTAAAAACCCAGTGCCCACGGGGA + +a +s mr.mrrefChr5 51603 227 + 294542 AGTGGAGTGAGTGACCAAAGGGAGGATTAGAGCACTATGTGATCAGTCCAAAACTTGGAACCTGCTTGGGGGCATACCTCCATGGTTTAGCCATTGAGGGGCTCAATGGAACTAAGACATAAAGGAATGACAGAATTGTCTGTGCCTGCATGAACTCAAGCCCTAATTCACTTGAATAGGGTAAGTTTAGTCAAGAGAACTCCAAATTAAACATGGAACCGAAGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 196820 226 + 636262 AGTGGAGTGAGTGATCAAAGGGAGGACTGCAGCTCTA-GTGATCAGTCCAATACTTGGAACCTGCTTGGGGGCACACCTCCATGGTTTAGCCATTGAGGGGCTCAATGGAGCTAAGACATAAAGGAATGACAGAATTGTCTGTGCCTGCATGAACTCAAGCCCTAATTCACTTGAATAGGGTAAGTTTAGTCAGGAAAACTCTAAATTCAACATAGATCCGAAGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 187023 227 + 647215 AGTGGAGTGAGTGGCCTAAGGGTGGATTAGTGTACTATGTGATCAGTCCAAATCTTGGCACCTGCTCGGGGGCATACCTCTATGGTTTAGCCATCAAGGGGCTCAATGGAACTAAGACATAAAGGAATGACAAAATTATTGGTGCCCGGATGAACTCAATCCCTAATTCACTTGAATAGGGTAAGTTGAGACAAGAGAACTCCAAATTAAACATGGGACAAAAGATT + +a +s mr.mrrefChr5 51830 205 + 294542 AAAAACCCAAAACATGGTTCAGAAGAATAAGAAACACATGGCTACAGGGGAGCCCAAGGCTTGAAAAGATTTGTTAGAGTTTGCATGAGTGCATGAGTCAGGGTCTGTAAGAAGAAAGATGACTAGAAGGCATCTATATGTACTATAGAATGCAGGGACAACTACAGTGGAGTCTATCCTCAATCAGTCTGTCATTGGAAGCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197047 205 + 636262 AAAAACCCAAAACATGGTTCAGAAGAATAAGAAACACATGGCTACAGGGGAGCCCAAGGCTTGCAAAGATTTGTTAGAGTTAGCATGAGTGCATGAGTCCGGGTCTGTAAGAAGAGAGATGACTAGAAGGCATCTATATATGCTATAGAATGCAGGGACAACTACGGTGGAGTCTATCCGCAATCAGTCTGTTATTGGAAGCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 187250 205 + 647215 AAAAACCTAAAACATGGTTCGGAAGAACAAGAAGCACATGGCTACAGCGGAGCCCAAGACTTGAAAAGATTTGTTAGAGCTTGCATGAGTACATGAGTCATGGTCTGTGTGAAGAAAGATGATTAGAAGGCATCTATATGTACTATAGAATGTAGGAACAACCACAGTGGAGTCTATCCTCAATCAGCCTGTCATTGGAAGCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 52035 187 + 294542 AGTCTCTTATCCACTTCAAGAGGAGCATGGGGTCATTGTGAGTTTGATGTATTAGACAATACTTCAGATTAACAAATTCAGTTAACGAGTTTTTGTGCCCCTATACCCTTTGGTTTCGGCAACATAGGGATCTATGAGCTGACTATGCACTCTTGATGACTGTCTATTTCTCGTAATGTTATTGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197253 186 + 636262 AGTACCATAACTACTTCAAGAGGA-CATCAGGTCATTGTGAGTTTGATGTGTTGGACCATACTTCAGATTAACAAATTCAGTTAACAGGTTTTTGCGCCCCTATACCCTTTGGCTTCGGCAACATAGGGATCTATGAGCTGACTATGCACTCTTGATGACTGTCTATTTCTCGTAATGTTATTGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 187455 180 + 647215 AGTCTCTTATCCACCTGAAGAGGAGCATGGGGTCATTGTAAGTTTG---TACTAGGCAATACTTCAGATTGACAAATTCAGTTAATGAGTTTTTGTGCCC----ACCCTTTGGTTTTGGCAACATAAGGATCTAGGAGCTGACTACGCACTCTTGATGACTGTCTATTTTTAATAATGTTGTTGATA + +a +s mr.mrrefChr5 52222 67 + 294542 ACTACAAGATGACTTAATACAAGTTTTTGAATTGTGCTGCAGGCTCTAAAGTTTGATGGCCTTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197442 67 + 636262 ACTACAAGATGACTTAATACAAGTTTTTGAATTGTGCTGCAGGCTCTAAAGTTTGATGGCCTTTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 187635 67 + 647215 GCTAAAAGATGACTTAATACAAGTTTTGGGATTGTGCTGCAGGCATTAAAGTTCGATGGGCTTTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 52289 100 + 294542 GGTGGGCAATAGAGTGCTGATGGCTAGACTGCATAGCTGGGTGATACATGTGACAGACTTTAGTTTACCCTACCTGCCTTAGGAAAACCAGGCTCTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197509 100 + 636262 GGTGGGCAATAGAGTGCTGATGGCTAGACTGCATAGCTGGGTGATACATGTGACAGACTTTAGTTTACCCTACCTGCCTTAGGAAAACCAGGCTCTTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 187709 100 + 647215 ACTGGGCAATAGAGTGCATATGGCTGAGCCGCATAGCTGGGTGCTGCATGTAACAGACTTTAGTTTACCCAACCTGCCTTAGGAAAACTAGGCTCACGCA + +a +s mr.mrrefChr5 52389 14 + 294542 CAGTGCCAACACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197631 14 + 636262 CAGTGCCAACACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 187809 14 + 647215 CAATGATAGCACAT + +a +s mr.mrrefChr5 52403 43 + 294542 tagtactcagttggtgtgcaaatcctaaaaatatttgaaaagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197652 43 + 636262 tagtactcagttggtgtgcaaatcctaaaaatatttgaaaagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 187823 43 + 647215 TAACACACAGTGCCAACACAACCtttgatgatacttggttggt + +a +s mr.mrrefChr5 52446 5 + 294542 gagca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197718 5 + 636262 gagca +s simRat_chr6.simRat.chr6 187866 5 + 647215 gtgca + +a +s mr.mrrefChr5 52451 10 + 294542 tagcctataa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197725 10 + 636262 tagcctataa +s simRat_chr6.simRat.chr6 187871 10 + 647215 tatcctaaaa + +a +s mr.mrrefChr5 52461 8 + 294542 atattcta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197754 8 + 636262 atattcta +s simRat_chr6.simRat.chr6 187881 8 + 647215 atattcgA + +a +s mr.mrrefChr5 52469 25 + 294542 aaagtcttgaggctgctggggaccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197769 25 + 636262 aaagtcttgaggctgctggggaccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 187889 25 + 647215 AAAATCCTAAAACTATTTGAAAACT + +a +s mr.mrrefChr5 52494 4 + 294542 CCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197799 4 + 636262 CCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 187914 4 + 647215 CCCT + +a +s mr.mrrefChr5 52498 3 + 294542 AGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197806 3 + 636262 AGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 187918 3 + 647215 AGT + +a +s mr.mrrefChr5 52501 340 + 294542 AGGTCTTGCAGAAGACATCCTGTGGGTTGGCCGTTGGCTTGCACGACCTTagtctacaccctcattgattaaagcaaaggagtgatatcgagtacatctaacaagaagagagaaatAGCTCTCCTAATCAGCCTATGATTATGATATGTTTCTCAAGCATAGGGCCACCGTATTGGGGAGTGTGGTTTGAAATGAACATCTTGGATCCACACGGCAATGAAAAAAAATAATTCATTGCATTATTTTACACAAATCAAGAAGAGCCTGTTTTACATTTTCCTTTGCTCATTAGGAGACATGCAGGGTGATTAGATGCAAACATAAGAATTCCAGTGGACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 197826 340 + 636262 AGGTCTTGCAGAAGACATCCTGTGGGTTGGCCGTTGGCTTGCACGACCTTAGTCTACACCCTCATTGATTAAAGCAAAGGAGTGATATCGAGTACATCTAACAAGAAGAGAGAAATAGCTCTCCTAATCAGCCTATGATTATGATATGTTTCTCAAGCATAGGGCCACAGTATTAGGGAGTCTGGTTTGAAATCAACATCTTGGATCCACACGGGAATGAAAAAAAATAATTCATTGCATTATTTTACACAAATCTAGAAGAGCCTGTTTTACATTTTCCTTTGCTCACTAGGAGACATGCAGGGTGATCAGATGCAACCATAAGGATTTCTGTGGACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 187921 340 + 647215 GGGTCTCGAAGCAGACATCCTGTGGGTTTGCCGTTGGTCTGCAGGACTGTaggttacaccctcattgattaaagtggaggagtgatatggaatccatctaacaagaagagccacatACCTCTCCTAATCAGCCTCTTATGATGATGTATTTCTCAAGCATAGGGCCACCGTACTGGAGACTGTGGTTTGAAATGAGCATCTTGGATCCACAAGGCAATGAAAAAAAACAATTCATTACATTATTTTACACAAATCAAGTAGAGCCTGTTTAACATTTTCCTTTGCTCATTAGGAGAAATGCAGGGTGGTTAGATGCAAACATAAGAATTCCAGTGGACAA + +a +s mr.mrrefChr5 52841 23 + 294542 GATTCTAGTACAAATGGCTGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198167 23 + 636262 GATTCTAGTACAAATGGTTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 188261 22 + 647215 GATTGTAGTA-AAATGGCTATAA + +a +s mr.mrrefChr5 52864 100 + 294542 CTCATACATCATTGAGTTGTGAGAATTGTTGGCAAGGATAGCGAGCTAACAGCAGTATGATTCTTTTGATCGGATAGATTTAAAAGCAGACTACAATAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198215 99 + 636262 CTCATACATCATTGAGTTGTGAGAACTGTTGGCAAGGATAGCGAGC-AACAGCAGTATGATTCTTTTGATCGGATAGATTTAAAACTAGACTTCAATAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 188283 96 + 647215 CCCGTACATCATTGAGTTGTGAGAATTGTTGGCAAGGATAGCGAGCTAACAGCAGTATGGTTCTTTTGATCAGATAGATTTAAGGGCAGACTACAA---- + +a +s mr.mrrefChr5 52964 26 + 294542 GATGTATAGAAAAACATAACTGCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198316 26 + 636262 GATGTTTAGAAAAGCATAACTGCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 188379 22 + 647215 ----TAAAGAAAAACATAACTGCCCT + +a +s mr.mrrefChr5 52990 8 + 294542 CAATATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198343 8 + 636262 CAAAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 188401 8 + 647215 CAATATAG + +a +s mr.mrrefChr5 52998 300 + 294542 GTATGTTTTTATGTAATAGAAGAATATCCATTGTCGCTATAGCAGGTCAGTTACAGATATTTGGCCAGTTTTCATCAGACTTCATTAATGTCTAGTAACCTGTCGTCAGGTACTACAGAAATTCCAGAGTATTTGAGTCTAAGAGATCACCTCAAATTTTAATTCCAGGGAGTTTGAGTTTAAGAGTCCACCTCAAATTTTGACTTGGCTTAGCCTCTCAACTATTTACCTGGCCAGACTAATTTTGCATGCAGGCTAATAGTGGGTATCTGCCTTGCTGATCAATGTCGAAGAGCTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198354 299 + 636262 GTATGTCTTTATGTGATAGAAGAAT-TGCATTGTCGTTATAGCAGGTCAGTTACAGATATTTGGCCAGTTTTCATCAGACTTCATTAATGTCTTGTAACCTGTCGTCAGGTACCACAGAAATTCCAGAGTGTTTGAGTCTAAGAGATCACCTCAAATTTTAATTCCAGGGAGTTTGAGCTCAAGAGTCCACCTCAAATTTTGACTTGGCCTAGCCTCTCAACTATTTACCTGGCCAGACTAATTTTGCATGCAGGCTAATAGTGGGAATCTGCCTTACTGATCAATGTCGAAGAGCTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 188409 300 + 647215 GTATGTTTTTATGTAATAGAAGAATATCCATTGGTGCTATGGCAGGTCCGTTACAGATATTTGGCCAGTTTTCATCAGACTTCATTAATGTCCAGTAACCTGTCATCAGGTACTACAGTAATTCCAGAGTATTTGGGTCCAAGAGATCACCTCAAATTTTAATTCCAGGGTGTTTGAGTTTAAGAGTCCATCTCAAATTTTGACTTGGCTTAGCCCCTCAACTATTTACCCGGCAAGACTAATTTTGCATGCTGGCTAACAGTGGGTATCTGCCTTGCTGATCAATGTCGAAGAGCTGGC + +a +s mr.mrrefChr5 53298 146 + 294542 TCACTACCCATGTCCTATTCATATGAAAAGTATGTCTCCATAGTGCTATTGAATTGGTTGAGAGCACGTGAGGTGGGCAGGCTCTTCCCACAGGTGCCTGTGACTGCTTGATAGCGCATGAAGCGGGGCAGGTTCATCAGCTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198654 146 + 636262 TAACTACCCATGTCCTATTCATATGAGTAGTATGTCTCCATAGTGCTATTGAATTGGTTGAGAGCATGTGAGGTGGGCAGGCTCTTCCCACAGGTGCCTGTGACTGCTTGATAGCGCATGAAGCGGGGCAGGTTCATCAGCTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 188709 146 + 647215 TCACTAACCATGCCCTATTCAGATGAAAAGTATGTCTACATAGTGATATTGAATTGCTTGACAACACATGAGGTGGACAGGCTATTCCCACAAGTGCTTGTGATCACTTGATAGTGCATGAAGCAGGGCAGGTTCATCAGCTGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 53444 121 + 294542 CCTAATGTGTGCGCATGGACATTTACCTCCTAATGGAGCTTTGCACAAAGTACTCTGCAAAGTTTCAATAATGTTAAACTTTGCTGGCTGAAGTAAACCATTATAGCGCAGGGGAACAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198800 121 + 636262 CCTAATGTGTGCGCATGGACATTTACCTCCTAATGGAGCTTTGCACAAAGTACTCTGCAAAGTTTCAATAATGTTAAACTTTGCTGGCTGAAGTAAACCATTATAGCGCAGGGGAACAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 188856 121 + 647215 CTTAATGCGTATGCATGGACGCCTGCCTCCTATTGGAGCTTTTCACAAGGTACTCTGCAAAATCTCATTAATGTTAAAGTCTGCTGCCTGAAGGAAACCATTATAGCTCAGGGGAACAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 53565 142 + 294542 AAGTTGTAAAGTCTATACTTAACTACATTTTCCTGCTTCTGATATTGCTCTTTATACTGTATCTTTTGTGCAGTTTTGGGTCTTGCTGCATGGCAACTTATCTTTTAGGCAGTGCAAAGTTAAAAAATATGGGTTAAATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 198923 142 + 636262 AAGTTGTAAAGTCTATACTTAACTACATTTTCCTACTTCTGATATTGCTCTTTATCCTGTATCATTTGTGCAGTTTTGGGTCTTGCTGCATTGCAACTTATCTTGTAGGCAGTGCAAAGTTAAAAAATATGGGTCAAGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 188977 142 + 647215 AAGTTGAGAAATCTATCCTTAACCACATTTTCCTGCTTCTGATGTTGCTCTTTATACTGTATCTTTTGTGCAGTTTTGGGTCTTGTTCACTGGCAACTTATCTTTAAGGCATTGCACAGATAAAGAATATTGGTTAAATTGA + +a +s mr.mrrefChr5 53707 100 + 294542 GTTCTAAGCCCACAGAAGCCGATTAGAATATAGTAACTTTTGACAAAAAAACATTCCTGCCCAGGTCCCACTTTCTGCACTCCAACAAAATGCCACTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199065 95 + 636262 GTTCTAAGCCCACAGAAGCCGATTAGCATATAGTAGCTTTTGA--AAAAAACATTCCTGCCCAGGTCCCACCTGTTGCACTCCAACAAAATGCC---CTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 189136 100 + 647215 GTTCTAATCACACAGAGGCCAATAAGAATATGGTAACTTTTGACAAAAAAACATTCCTGCCCGGGTCCCACTCTCTGCACCCCAACAAAATGCCACTTGA + +a +s mr.mrrefChr5 53807 389 + 294542 CTATGGATCTATTGGACATTCTTTAACCACAGACAACGCAAGGTCCTGTGATTGGTCAAATACAGTTGAGTATTATCATAATCCCACATTGCAAATAACACCTTATATGGAGCATATGGCTGGTGACTAGTGCTCTAAATGTGGCAAGAACTCTAAATGTGGGGAGAAGGACAAACATCTCGCAATTGTGGGGATTATCATACTGGAAGAGGGTGTCAGTTAGTCAGTTTTCTCTATTCTCTATTTAATCACTGGTAAGTGCTAGGTGAGCATATGCCACCTTTGATCTTAGATGGCTAAAGTTGTAATGGTACATAAACAGAGCAAGCATATAGTTCTTCCATTTGATCATCCAATCTTACAGACAGGTGACTTTGATGTACTTCTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199160 388 + 636262 CTATGGATCTATTGGACATTCTTTTACCACAGACAATGCAAGGTTCTGTGATTGGTCAAATACAGTTGAGGATTATCATAATCCCACATTGCAAATAACACCTTATATGGAGCTTATGGCTGGTGACTAGTGCTCTAAATGTGGCAAGAACTCTAAAGGTGGGGCAAAGGACAAACATCTCGCAATTGTGGGGATTAT-ATACTGGAGGAGGGTGTCAGTTAGTCAGTTTTCTCTATTCTCTATTTAATTACTAGTAGGTGCTAAGTGAGCATATGCTACCTTTGATTTTAGATGGCCAAAGTTGTAATGGTACATAAACAGAGCAAGCATATAGTTCTTCTGTTTGGTCATCCCATCTTACAGACAGGTGACTTTGATGTACTTCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 189241 388 + 647215 CTATTGCACTATTGCACACTCTTTAACCACAGACAACATAAGGTCCTGTGATTGGTCAGATACGGATGAGTATTATCACAATCCCACGTTGCAAATAACACCTTGTATGGAGAATATGGCTGGTGACCAGTGCTCTAAACGTGGGGAGAAATCTAGATGTGAGGAGAAGGACAAACATCTTGAAATTGTGGGGAGTATCATACCGGAAGAGGGTGTTGGTTAGTTAGTTTTTTCTATTCTTGATTTAATCACTGGTAAGTGCTAGGTGATCATATGTCACCTTTAATCTTAGATGGCTAAAGCTGCAATGGTACATGGACAGAGTTAGCATA-AGTTCTGGCATTTGATCATCCAACCTTACAGACAGGTGACTTTGATGTACTTCTAC + +a +s mr.mrrefChr5 54196 28 + 294542 TAGTGTGCTGCTGAACTCAGTCCACAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199554 28 + 636262 TAGTGTGCTGCTGATCACAGTCCACAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 189629 28 + 647215 TAGTGTGCTGTTGAACTCCGTCCAGAAG + +a +s mr.mrrefChr5 54224 80 + 294542 ACAATTCTCAATAGGGCCATGGCGGCAATTAGTTATGAGTGATGGGTAATCTGTAGCAAATGTCAGCATTACAACTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199582 75 + 636262 ACAATTCTCAAT-----CATGGCAGCAATTAGTTATGAGTCATGGGTAATCTGTAGCAAATGTCAGCATTACAACTGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 189659 80 + 647215 ACAATTCTCAACAGGGCCATGGTGGCAATTAGTTATGAGTGAAGGATAATCTGTCGCAATTGTCAGCCTTACAACTGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 54304 8 + 294542 TGGACACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199657 8 + 636262 TGGACACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 189740 8 + 647215 TGGGCACT + +a +s mr.mrrefChr5 54312 191 + 294542 GACAATGACGGGATTTTGATTTATGAAGTCTGACCATTTGTAGGCAAGTCTCATTTGGAGAGGTGTTTGCTTATTTCTGCTTATTTGTACAAGCTGACTTCTTTATGTCCCCCAATCAGAATGTAGTTTGGAATTTTCCCAGTTGTTGAACCTTTAAACATGAAACCCTGAGGTTAAGTGTTGGTGGAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199665 190 + 636262 GACAATGACGGGGTTTTGATTTATGAAGTCTGACCATTTGTAGGCAAGTCTCATTTGGAGAGGTGTTTGCTTATTTCTGCTTATTTGTACAA-CCAACTTCTTTATGCCCCCTAATCAGAATGTAGTTTGGAATTTTCCCAGTGGTTGACCCTTTAAACATGAAACCCTGAGGTTAAGTGCTGGTAGAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 189749 174 + 647215 GACAATGACAGGATTATGTTTTATGAAGCCTGACCATGTGTATGCAAGTCTCATTTGG-----------------TTTGCTTATTTGTACAAGCTGAGTTCTTTATGTCCCCCAATCAAAATGTAGTTTGGAATTTTTCCAGTTGTTGAACCTCTAAACCTGAAACCCGGAGGTTAAGTGTTGCTGGAGAC + +a +s mr.mrrefChr5 54503 120 + 294542 AGGACTTCACTCTATAAAGTACACACTTAGCCTCGTTTATACAGTATACTATGTCTGGGTACTACCTGGAGGATCTTTACTCACTACCTAAGTATTCCCTATTGACTCTGATTGATCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199855 120 + 636262 AGGGCTTCACTCTACAAAAGACACACTTAGCCTCGTTTATACAGTATACTATTTTTGGGTACTACCTGGAGGATCTTTACTCACTACCTACATTTTCCCTATTGACTCAGATTGATCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 189927 120 + 647215 ATGACTTCAATGTATAAAGTACACACTTAGCTTTATTTATACAGTGCACTATGTCTGGGTACTACTTGGTGGATCTCTGCTCCCTACCTAAGTACTCCCTATTGACTTTGATTGTTCCAA + +a +s mr.mrrefChr5 54623 190 + 294542 CACCATCTCAGATTACACGCCTGAGAAAGAAGATAAGATGTAGTTACAGGGGCAGAGGAGTATCATGCAAACACTTTGTGGTCTAGACACAGTGACCGTAGTCTAGACACAGTGACCATGGTGTTTTCAAGTCAACACAGTGAAGATTATAGATTCTAATTGAGTATACAATAGTGAGTAGCAGAGAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 199975 171 + 636262 CACCATCTCAGATTACACGCCTGAGAAAGAAGATAAGATGTAGTTACAGGGGCAGAG------------------TTGTAGTCTAGACACAGTGACCGTAGTCTAGACACAGTGACCATGGTGCCTTGAAGTCAACTCAGTCAGGAT-ATAGATTCTAATGGAGTATACTATAGTGAGTAGCAGAGAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 190054 190 + 647215 CACAATCTCAGATTCAAGGTGTGACGAAGGGGATAGGATGTAGTTACAGGGGCAGAGGAGTATCATGCAAACACTTTGTGGTCTAGGCACAGTGACCATAGTCTAGACACAGTGACCATGGTGTTTTCAAGTTGACACAGTGGAGATTATAGATTCTAATTGAGTATACAATATTGGTTAGCGGATCACA + +a +s mr.mrrefChr5 54813 45 + 294542 GAATGTCCATATTGTGTCACTCTCTCCATTATCTATGTATTTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200146 26 + 636262 -------------------CTCTCTCCATTATCTATGTATTTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 190317 45 + 647215 GAATGTCCATATTGTGTCACTGTCTCCATTATCTATGTATTTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 54858 36 + 294542 GAGGGTTTGACAACAAAAGCAAAGTAACCCTTACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200172 36 + 636262 GAGAGTTTGACTACAAAAGCAAGGTAACACTTACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 190363 34 + 647215 GAGGGTTTGACAACAAAGGCAAA--AACCCTTACAC + +a +s mr.mrrefChr5 54894 67 + 294542 CTTGTGTCTCTTCCCATTCATGGTTGAATGCAGAGAACCTGTGACAGTCTCAAAACAGAGAAGTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200208 67 + 636262 CTTGTGTCTCTTCCCATTCATGGTTGAATGCAGAGAACCTGTGACAGACTCAAAACAGAGAGGTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 190399 67 + 647215 CTTGTGTCTCGTCACATTCATGGTTGAATGCAGAGAACCTGTGACAGTCTCAAAACAGAGAAGTGGA + +a +s mr.mrrefChr5 54961 19 + 294542 GTCAGAGCATGTACAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200275 15 + 636262 ----GAGCATGTACAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 190467 19 + 647215 GTCAAAGCATGTACAGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 54980 77 + 294542 AGCATTCATCCTTTTACTTTATGAAAGACAATTTAGAAGGACACCAGTTTTCACTACTTGTCAGATTTAGGAGATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200292 75 + 636262 AGCATTCATCCTTTCACTTTATGAATGATGATTTAGTAGGACACCAGT--TCACTACTTGTCAGATTTAGGAGATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 190486 77 + 647215 AGCATTCATCCTTTTACTTTGTGAAAGACAATTTAGAAGGACACCAGTTTTCACTACCTGTTAGATTTAGGAGATTT + +a +s mr.mrrefChr5 55057 36 + 294542 TTACCAAGGTTTTTGGGTTTGCCATTACCCATGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200367 36 + 636262 TTACCAAGGTATTTGGGTTTGCCATTACCCATGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 190572 36 + 647215 CTACCAAGGTTTTTGGGTTTGCCATCACGCATGCAT + +a +s mr.mrrefChr5 55093 19 + 294542 ATTAGTAACCAGATTGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200405 19 + 636262 ATTAGTAACCAGATTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 190608 19 + 647215 ACTATTTACCAGATTGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 55112 87 + 294542 TCTTCATTTGTTCCAGGTTTGCTATTATGTGAGTGTACAATGCTTGAGTAAGCAAAGTGTCACCAATCTGCATTTGTATTTACTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200428 87 + 636262 TCTTCATTTGTTCCAGGTTTCCCATTATGTGAGTGTACAATGCTTAATTCAGCAAAGTGTCACCAATCTGAATTTGTATTTACTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 190627 73 + 647215 TCCGCATCTGTTCCAGGGTTGCTATTATGTGGGTGTACGATGCTTGAGTAG--------------ATCTGCATTTGTATTTACTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 55199 783 + 294542 CACAGAGTAATCTATGACCCTTAATTCAAGCAATACTTCATCCACAGTCTGTTGATGCTCAATCCACATCGGTTGCAGAGCAGGTGCAACCTAAGTAAAGCTACCAAGAGCTGTCTGAACTCAGTTGAAGAGCAAGACATGGAATGTCTTAGGATCTGCCCTGATGAACTGTCTAGATGTTGGCAAAGACAACTGGGCTGCATACTATTACCTCACGGCAAGATGGGGACAGGAAAGGTCTGGTGTTGGTTCAGAAAGCCTGTGTCATGAGAGATGGTCTTTTCAAGAAATCCAGTTTGGAAATTGGGCTCATATGGAAACATATGACACCTAGTTAAAATAAATAAGAACCTGGTTCCCAGTCATCCGTGGGAATGGTAATGAGTGGACTTGACATTCTGAGGTGACACAACTGTGTTTTTTCTCAGGTTCCTTTTTACTCCTATTTGTATTATGGAATTTGACAGCAACACTTGATGCCTAAGTATAGTGGACCTAGTGTGTAGTTGAAGTCAGGTCTAAGGAACCTATATGAAATTAGCATTCTAGAGTTGGCCCTGCCTGTGTTGTTTGTGAGATCTTTCGTTATTAATTATAGACTGGTAGTTATGGGTGTCTTAATCTGGATTATTTCAGCTTGACACATCATGGATTTTAGCCTTATGCATCAGTTACCATTACCTTTCAAAAGATCTAAGGGAATAAGTGTTCCACGGAGGATTCTTCAAGCAAAAGATAACACTGAAGCACTTTACCCCCTATTGATCTTGTTACCCAGTCGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 200517 760 + 636262 CACAGAGCAATCTATGAGCCTTAATTCAAGCAATACTTCATCCACAGTCTGTTGATGCTCAATCCATGTAGGTTGCAGAGGAGGTGCAACCTAAGTAAAGCTACCAAGAGCTGTCTGAACTCAGTTTAAGAGCAGGACATGGAATGTCTGAGGATCTGCTCTGATGAACTGTCTAGATGTTGGCAAAGACAACTGGGCTGCATACTATCACCTCACAGCAAGATGAGGACAGGAAAGGTCT--TGTTGGTTCAGA---------------------GTCTTTTCAAGAAATCCAGTTTGGAAATTGGGCTCATATGGAAACATATGACACCTAGTTAAAATAAATAAGAACCTGGTTCCCAGTCATCTGTGGGAATGGTAATGAGAGGACTTGACATTCTGAGGTGACACAATTGTGTTTTTTATCAGGTTCCTTTTTACTGTTATTTTTATTATGGAATTTGACAGCAACACTTGATCCCTAAGCATTCTGGACCTAGTGTGTAGTTGAAAGCAGGTCTAAGGGACTTATATGAAATTAGCATTCTAGAGATGGCCCTGCCTGTGTTGTTTGTGAGATCTTTCGTCATTAATTGTAGACTGGTAGTTATTAGTGTCTTAATCTGGACTATTTCAGCTTGACACATCATGGATTTCAGCCTTATGCATCAGTTCCCATTCCCTTTCAAAAGATCTAAGGGAATAAGTGTTCCACGGAGGATTCTTCAAGCAAAAGATAACACTGAAGCACTTTACCCCCTATTGATCTTGTTACCCAGTCGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 190700 761 + 647215 CACAGAGTAATCTACAACCCTTAATTCTAGCAATACCTCATTCACAGTCTGTTGATGCTCAATCCACATCGGTTGCAGAGCGGGTGCAACCTAAGTCAAGGTACAAAAAAGTGTCAGAACTGAGTTGGAGAGCAAGACATGGAATGTCTTAGGTACTGCCCTGATGAACTGTCTAGATGTTGGCAAAAACAACTGGGCTGCATTCTATTAACTCAGGGCAGGATGGGGACAGGAAAGGTCTGGTGTTGGTTCAGAAAGCCTGTGTCATGAGAGATGGTCTTTCCAACAAATACAGTTTGGAAACTGG-CTGATATGGAAA----TTACACCTAGTCAAAGTA-----GACCGTGGTTCCCAGTCACCC------AAGGTAATGGGTGGACTTGACATTCTCAGGTGACACAACGGTGTTTTTTCTCAGGTTCCTCTTTACTCCTATTTGTATTATGGGATTTGAGAGGA------GATGCCTAAGTATAGTGGTCCTAGTGTGTAGTAGGAGTCAGGTCTAAGGAAACTATATGAAATTAACATTCTAGAGTTGGCCTTGCCTGTGTTGTTTGTGAGATCCTTCATTATTAATTATAGACTGGTAGTTATGGATGCCTTAATCTGGATTATTTCAGCTTGACACATCATGAATTTTAGCCTTATGCATCAGTTACCATTACCTTTCAAAAGAACTAAGGGAACAAATTTTCAAGGGAGGATCCTTCAAGCAAAAGATAATACTGAAGCACTTTATCCCCTATTGATCTTGTTACCCACCCATC + +a +s mr.mrrefChr5 55982 113 + 294542 TGGTGTTACTCCCAGAAGACTACATTCAGATTCTTCAGGATGTAGTATAGCCTGGATAGTTGTAGCCCTTGAAGCAAAATGGACAAACACGGCAGCCTAGTTTGACTATAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201278 112 + 636262 TGGTGTTA-TCCCGGCAGACCACATTCAGATCCTTCAGGATGTAGTATAGTCTGGATAGTTGTAGCCCTTGAAGCAAAATGGATAAACACGGCAGCCTAGTTTGACTTTAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 191461 111 + 647215 TGCTGCTACTCCCAGAAGACTGCATTCAGATTCTTTGGGATGTAGTATAGCCTGGATAGTTGTAGCCCTTGAAGCAAAAAGGACAAACATGGC--CCTAGTTTGACTATAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 56095 15 + 294542 CATTTAATTTTAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201435 15 + 636262 CATTTAATTTTAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 191572 15 + 647215 CATTTAATTTTGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 56110 104 + 294542 CAAGAAAGTATGTGTTGTTAGTGTACATCTTATGGGTAGTGTACAATTAGGCAACTACATAGGCCCAGCTATGAAAAGGACAGGTAATTTGAAGAGTCTGTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201450 103 + 636262 CAAGAA-GTATGTGTTTTTAGTGTACATCTTATAGGTAGTGTACAATTATGCAACTACATAGCCCCAGCTATGAAAAGGACATGTAATTTGAAGAGTCTGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 191588 104 + 647215 CAAGAAAGTATGTGTTGTCAGTGTGCATTTTATGGGGAGGGTACAAGTAGGCAAATACATAGGCCCAGCTATGAAACGGTCAGGTCATTTGAAGAGTCTGTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 56214 83 + 294542 CCGACCATTTCATCCACATGAAACTCACAAGGATCATAACACAGTGTTACTGCAGATTGGGGCCTGGTGCTATGGCAGAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201554 82 + 636262 CCGATCATTACATCCACATGAAACTCATGAGGATCA-GACACAGTGTTACTGCAGATTGGGGCCTGGTGCTATGGCAGAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 191692 83 + 647215 CCGACCGTTTCATCCACATGAAACTCACAAGGATCATAACACAGTATTAATGCAGATTGGGGCCTGGTGCTATGGCAGAGGGG + +a +s mr.mrrefChr5 56297 135 + 294542 TTCTGAGATCTCTGGACTTGTACGGAAGAGTTTAGATATTATGTGCATTTTCAAGTTAACAACTCTCTGTGTTGAGCTAGCAATTATCTTGGAGATAAAGGGAGCAGGTTTAGAAGAAACTGCCAGTTCTCAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201638 135 + 636262 TTCTAAGATCTCTGGACTTGTACGGAAGAGTTTGGATATTATGTGCATTTTCAAGTTAACAACTCTCTGTGTTGAGCTAGCAATTTTCTTGGAGATAAAGGGAGCAGGTTTAGAAGGAACTGCCAGTTCTCAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 191775 133 + 647215 TTCTGAGATCGCTGGACTTGTATGGAAGGGTTTAGATATTATGTGCATTTCCAAGTTAGCAACTC-CTGTGTT-CGCTAGCTATTATCTTGGAGAGAAAGGGAGCAGGTTTAGAAGAAACTGTCAGCTCTCAGCC + +a +s mr.mrrefChr5 56432 297 + 294542 TTGAAGAGCAAGCAGGTGGGGCTGTCTGTGGCCTTTGGCCTTTATAGCTTGCCTTACAGCTCAGTGCTAAACACTAGTCAAGATGAAATAAGGGCATGAATACAATGGTACCAGTCAAGCAAACTGGGAAAGAGCTGGACAGGGTTGCTGTATCTACCAAGGGCAAGAGCTTTACTAAATAGGACACTACTAATGAGGCAGATCCAAACCAACCCATTCATGACTTGTTTGGTATTACCCTATGAGTAGGTCATGGAGGGCTCAGTCATAGGCCACGGCAGGCTCAGCAAACACCCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 201775 297 + 636262 TTGAAGAACAAGCTGGTGGGGTTGTCTGTGGCCTTTGGCTTTTATAGCTTGCCTTACAGCTCAGTGCTAAACACTAGTCAAGATGGAATAAGGGCATGAATACAATGGTATCAGCCAAGCAAACTGGGCAAGAGCTGGACAGGGTTGCTGTATCCACCAAGGGCAAGAGCTTCACTAAATAGGACACTAGTAATGAAGCAGATACAAACCAACCCATTCAAGACTTGTTTGGTATTGCCCTATGAGTAGGTCATGGAGGGCTCAGCCATAGGCCACGGCAGGCTCAGCAAACACCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 191908 296 + 647215 TGGAAGAGCAAGCAGGTGGGGCTGTCTGTGGCCTTTTGCCTTTATAGCTTGCCTTAAAGCTCAGTGTTAAACACTAGACAAGATGAAACAAGGGCATGAATAGAATGGTTCCAGTTAAGCATACTGGTAAAGAGCTGGACAGGATTGCTGTATCTACCAAGGGCAAGAGCTTTACTCAATAGGACATTACTAATGAGGCAAATCCAAACCAACCCATTCATGACTTGTTTGGTATTACCCTGTGAGTAGGTCATG-AGGGCTCAGTCAAAGGCCATGGCAGGCTCAGTGAACACCCA + +a +s mr.mrrefChr5 56729 250 + 294542 AAGTTCATATGACAGCGATGTATTGTTAATGAATAGTATCATTAGGGTGATAAGAGTTCACCAAACATCTGTATTTTTATGGACTAAAGTCCAATGGTAAACTGTATAAGTTCACTGCTATCACTGTGCAAACAAAGCTTATCTAACATTAAATTTGCCTTGTAATTTGTACAGCTTTGTCTCATAGGGCCACCAGGTCTTTCATCAAATCTGCAGATTCCTCAGTTTTTTAGCTTCATGAAACATACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 202072 250 + 636262 AAGTTCATATGACAGCGATGTATTGTTATTGAATAGTATCATTAGGGTGATAAAAGTTCACCAAACATCTGTATGTTTATGGACTAAAGTCCAATGGTAAACTGTATAAATTCACTGCTATCACCATTCAAACAAAGCTTTTCCAACATTAAATTTGCCTTGTGATTTGTACAGCTTTGTCTCATAGGGCCACCAGGTCTGTCATCAAATCTGCAGATTCCTCAGTTTTTTAGCTTCAGGAAACATACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 192205 248 + 647215 AAGTTCACATGACAGAGATATATTGTTAATTAATAATATCATCAGGGTGAAAGGAGTTCACCAAACATCTGTATTTTTAT--ACTAATGTCTAATGGTAACCCGTACATGTTCGCTGCTATCACTGAGCAAACAAAGCTTACTTAACATTAAATCTGCCTTGTAATTTCTGCAGCTTTGTCTTATAGGGTCACCAGGTCCTTCATCAAATCTGTAGGTTCCTCAGTTTTTTAACTCCGTGAATCGTACTA + +a +s mr.mrrefChr5 56979 469 + 294542 ACTTTGTCATTGACAAGAGGAACTTGCCTGAAGAATTGCACTTATAACTATAATTGGCATGTCACCAAGATTAAATTTTCTGAAAATTCAGTAGTTGGGGTGCGACATAAATAAACATGGACCACTGGCTTAACTAAGATTTGCAAAGGGGTCTACTAGTGTGAAAACTTATAGTGCTACATAAACAGTGAGTGGCTATAGGTTTACATAAGGTCTATTTACAGCGGGACCTACCTTCATGTTACACATGCTTGACCATGAGATTGTTTTTCTTTATAAGCGCAAGAGGAGATTTACCTCTGAAGAATTAGGGCTCTAGAAGCAGGCTAAACTCTCCCTCTATAGTCAAGTAATTTGTGTATGCTGTCCTATCTTACACCATGGGGAAGAGTGGAGTTTCTTGAAAAGTTAGGTGATATTACCAAATTATAAAACTACAGAATTATAAACAAGATTAATAAATGAGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 202323 459 + 636262 ACTTTGTCAGTGACAAGAGGAACTCGCCTGAAGAATTGCACTTATAACTGTAATTGGCATGTC-TCAAGATTAAATTTTCTGAAAATTTAGTAGTTGGGGTACGACATAAATAGACATGGACCACTGGCTTAACTAAGATTTGCAAAGGGGTTTACTAGTGTGAAAACTTGTAGTGCTACATAAACAGTGAGTGGCTATAGGTTTACTTAAGGTCTATTTACAGCGGGACCTACCTTCATGTTACACATGCTGGACCATGAGATTGTTTTTCTTTAT----GCAAGAGGAGATT-----CTAAAGAATTAGGGCTCTAGGAGCAGGATAAACTCTCCCTCTATAGTCAAATAATTTGTGTATGCTGTCCTATCTTACATCATGGTGAAGAGTGGAGTTTCTTGAAAACTTAGGTGGTATTACCGAATTATAAAACTACAGAATTATAAACAAGATTAATAAATGAGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 192453 464 + 647215 ACTTTGTGATTGATAAGATGAACTTGCCTGAAGAATTGCAGTTATTATTATAATTGGCATGTCACCCTGATTAAATTTTCTGAAAGTACTGTAGTTGGGGTGCAACATAACTAATCATGGACCACT--CTTAACTAGGATTTGCAAAGGGGTCTACTAGTGTGAAGACTTATAATGCTACATAAACAGTGAGTGGTAATAGGTTTGCATAAGGTTTATTTATAGGGGGATCTACCTTCATGTTACACATGCTTGACCATGAGATTGTTTTTCTTTATAAGCGCAAGGGGAAACTTACCTCTGAAGAATTAGGGCTCTAGAAGCAGACTAAACTCTCCCTCTATAGTCAAGTAATTTGTGGATGTTGTCCTATCTTACACCATGGGGAAGAG---AGTTTCTGGAAAAGTTAGATAATATTACAAAATTATAAAACTACAAAATTATGAACCAGACCAGCAAATGAGATT + +a +s mr.mrrefChr5 57448 27 + 294542 TTGTCAACTAATGATGGTGATGAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 202782 27 + 636262 TTATCACCTAATGATGGTAATGAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 192919 27 + 647215 TTGTCCACTAATGATGGTGATGAATTT + +a +s mr.mrrefChr5 57475 659 + 294542 GACAACTTAGTAAGCATCCAAATTCAAAACCAGCCAATTAGCTATGCCTGCACTGTTTGTACTCCCCTTGAGTCTCTAACAGATAACTTCTTATGTGCAGATGGTTGGGATGTTTCCTGAGGATGGGGGAAAGCTAATTAGTGGTCTTGGTTATCTCTACAGAAGTGGAATGGTCTCTTGGCACTAAGTTGTGATGTACATGAAGTCAAACTTGAAAATCTGCAAGCACAAACTATGTTGTATAACCCATCATTATGCTGATGCTGGACAATAAATCAAAACCAACTGCATACAACACTCTTTCGGCCTAGTGGGGTGTTTGTGTATAATCAGTATTAAGATGGGTTTGATATATTTAGTGGCCTGGTGACAGTCTGATATTTGAGAATCTCTTCTTAGTTCAATTTCTTAGTTCAACAAAAATGTAGATTTTCAATCTCACCAATAATTTCAATTGCAACCAATATCCTGGCAGTAGTTTGGGAAGGGTCCAATACATGTGATAACCTACCACTGACCCAGTATGTCTTATTTTAAGACTTGGAAGGGTGATGTCAGCTGTATGAAACGCCTGTGAGTAAAATGTTTCATCTTTGTATAATTTATGTCAGTCTGATAATGCTAGGCTTGAAGGCCTGAGCGCTTCCCCCGGCCTTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 202819 653 + 636262 GACAACTTAGTAAGCATCCAAATTCAAAACCAGCCAATTAGCTATGCCTGCACTGTTTGTACTCCCCCTGAGTCTCTGACAGATAACTCCTTACGCGCAGATGGTTGGGATGTTTCCTGAGGATGGCAGAAGGCTAATTAGTGGTCATGGTTAGCTCTACAGAAGTGGAGTGGTCCCTTGGCACTGAGTTGTCACGAACATGAAGCTAAACTTGAAAATCTGCAAGCACAAACTA------GTAACCCATCGATGTGCTGATGCTGGACAATAAATCAAAACCAACTGCATACAACACTCTTTCGGCCTAGTGGGGTGTTTGTGTATAATCAGTATTATGATGGGTTTGATATATTTAGTGGCCTGGTGACAGTCCGATATTTGAGAATCTCTTCTTAGTTCAATTTCTTAGTTCAACAAAAATGTAGATTTTCAATCTCACCAACAATTTCAATTGCAGCCAATAACCTGGCTGTAGTTTGGGAAGGGTCCAATACATGAGATAACCTACCACCGACCCAGCATGTCTTATTTTAAGACTTGGGAGGGTGATGTTAGCTGTATGAAACGTCTGTGAGTAAAATGTTTCATCTTTGTATAATTTATGTCAGCCTGATAATGCTAGGCTGGAAGGCCTGAGCGCTTCCCCCGGCCTTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 192946 645 + 647215 GACAATTTAGTAAGCATCAAAATTAAAAATCAGCCAATCAGTT--GCCTG---TGTTTGTACTCCCCTTGATTCTTTAATAGATAGCTTTTTATGTGCAGATGGTGATGATGTTTCTAGAGGGTGGGGGAAAGCTAATTAGTGGTCTTGGTTATGTCTACTGAAGTGGCACAGTCTCTTGGCACTAAGTTGTGATTTACATAAAGTCAAACTTGAAAATCTGCAAGCACAAACTATGTTGTATAACCCATCATTATGCTGATGCTGAACAATAAATCAAAACCAACTGCCCACAACACTTTTTCAGCCGAGTGGGGTGTTTGTGTATAATCAGTATTAAGATGGGTTTGATATATACGGTGGCCTGGTGAGAGCCTGATCTTTGAGAATCTCTTCTTAGTTCAACTCTTTAGTTCAACAAAAATGTAGATTTTCAATCTCACCAATAATTTCAATCACTACCAGTATCCTGGCAGTAGTTTGGGAAGGGCCCAATACATATGATAAGCTACCACTGTCCCCGTGTGTCTTATTT--AAGTTTTAATAGGTGATGTCAGC------AAAC-CCTGTCAGTAAAAATTTTCAACTTTGTATAATTTATGTCAGTCTGATTATGCTAGGCTTGAAAGCCTGAGGCCTTCCCCCAGCATTAGT + +a +s mr.mrrefChr5 58134 7 + 294542 GATCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203472 7 + 636262 GATCCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 193592 7 + 647215 TATTCGT + +a +s mr.mrrefChr5 58141 37 + 294542 TTTATTATTACCTGGGGAGAAATTCAATGCGATTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203479 37 + 636262 TTTATTATTACCTAAGGATGAATTCAATGCGATTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 193650 37 + 647215 TTTATTAATACCTGGGGAGAAAGTCAATGCAATTTGG + +a +s mr.mrrefChr5 58178 13 + 294542 TTCATGCAGGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203517 13 + 636262 TTTATGCAGGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 193687 13 + 647215 TTCAGGCAGGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 58191 261 + 294542 GATCAGACCAGTCCCTCTAAACAACCTTATTGTTACCTAAAGGACATTGAGGTTTCTATCAAGATTGAATAACAATGGAAAGAAATGGGGAAGATGTACTTTATAAGTTAGTCTCAGACAGTTCTACACTTGATGTAGGTTGAATGAGATTTCAGATAATAAAAAGAGAAGGTCTGACAGTTCCTATCTTTAGGGTAAACAATTCTCTTGAAGTGAAGCATGTGTGTAATGACTGATGATTTGTTCAGTTATTCTGTGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203530 248 + 636262 GATCAGAACAG--------AACTACCTTATTGTTAACTAAAAGACATTGAGATCTCTATCCAGATTAAATAACAATGGAGAGAAATGGTGAAGATGTACTTTATAAGTTAGTC-CAAAGAGTTCTACACTTGATGTAGGTTGAATGACATTTCAGATAATAAAAAGAGAAGGTCTGACAGTTCTCATCTTTA----AAACAATTCTCTTGAAGTGAAGCATATGTGTAATGACTGATGATTTGCTCAGTTATTCTGTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 193787 260 + 647215 TCATGGACCAATCCCTCTAAACAACCTTATCGTTACCTAAAGGACATTGAGGTTTCTGTCAAGATTGAATAACACTGGAA-GAAATGGGGAAGATCTACTTCATAAGTTAATCTCAGACCGTTCTACACTTGATGTAGGTTGAATGAGATTTCAGATAACCAAAAGAGAAGGTCTGACAGTTCCTATCTTTAGGGTAAACAACTCTTTTGAAGTGAAGCGTGTGTGTAATGGCTGATGATTCATTTGGATATTCTGTGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 58452 4 + 294542 ACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203778 3 + 636262 -CAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194066 4 + 647215 ACAT + +a +s mr.mrrefChr5 58456 246 + 294542 TTTCTCCAGTACCTCACAAAATCATGCTATGTACTGGAGATTTGCCCAGTAAAGTTATGAGACATGAAGTGTCAATATGTCCAAGGACATATGATGTCCTCACTCGAAGGTATAATTGTATGATGTGTGAAGTGGTGCCTGCTCTAATAGAATCTCTTTATAGCTATAGCACTATGTAAATTATGACTTCATTGGAGGTACAATGACTGGCTAAAATTCCCATGTGATGACCATTGGAGCACATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 203781 246 + 636262 ATTCTCTAGTACCTCACAAGGCCATGCTATGTATTCGAGATTTGCCCAGCAAAGTTATGAGACATGAAGTGTCAATATGTCCAAGGACATATGATGTCCTTACTCAAAAGTATAATTGCATGATGTGTGAAGTGGTGCCTGCTCTAATAGAATCTCTTTATAGCTATAGCACTATGTAAATTATGACTTCATCAGAGGTACAATGACTGGCTCAAATTCCCATGTGATGACCATTGGAGCACATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 194071 235 + 647215 TTTCTCCAGTACCACACAAAATCATGCTATGTACTGGAGATTTGACCAGTACAGTTATGGGTCATGAAGTGTCAATATGTCCAGGG-CATATGACGTCCTCACTCGAAGGTATATTTGTATGATGTGTGATG---------CCCTAACAGAATCTTTTTATAGCTATGACACTATGTAAATTATGACTTC-TTGAAGGGAAAATGACTGGCTAAAATTCCCATGTGTTGACCATTGGAGTGCATTG + +a +s mr.mrrefChr5 58702 39 + 294542 TGCTTTTGCAGACCATTGTTGCCACTACATCTATGGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204027 38 + 636262 GGCTTTC-CAGACCATTGTTGCCACTACATCTATGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194317 39 + 647215 TGCATTTGCAGCCCATTGTTGCCACTACATCTATGGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 58741 208 + 294542 AGTGATGGACCTGTGGCAGAACATATACTTCCTTTCTATAGGAGTCACATGTTTGAGGGCCTGAAGGATGTGTGGCTAACCCCTCCATTGAAGCTTTCATGGATCTAGTGATAAACTTTTATCTGGATGGCACTTCAGCAGACTTCACACACTGTAGCTATGCCACACATCAGGGGTGTCATAACTCTAATTACCAGTCAGTCATGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204180 197 + 636262 AGTGATGGACCTGTGGCAGAACATACACTTCCTGTCTATAAGAGTCACATGCTTGCGGGCCTGAAGG------GGCTAACCCCTCCATTGAAGCTTTCATGGATCAATAGATAAACTTTTACCTG-----CACTTCAGCAGACTTCACACACTGTAGCTATGCCACACATCAGGGGTGTCATAGCTCCAATTACCAGTCAGTCATGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 194356 208 + 647215 AGTTATGAACCTGTGGCAGAACATATACTTCCCTTCTATGGGAGTCACCTGTTTGAGGGCCTGAAAGATGTGTGGCTAACCCCTGCATTGAAGCTTTCATGGATCTAGTGATTAACTTTTATCTGGATGGCACTTCAGAGCACTTCACACACTGTAGTCATGTCACACATCAGGGGTGTCACAACTCTAATTACCAGTCAGTCATGGG + +a +s mr.mrrefChr5 58949 88 + 294542 ATACTATTACCTCCTACCTTAAAACGTCATCAGACGCCAGCATCACAGCCCTTAAAGTGCCTGTGATTTCCCAAACGCCAGTCCCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204382 83 + 636262 ATACTATTACCTCCTGCCTTAAAATGCCATCAGACGCCAGCATAACAGCCCTTAAAGTGCCTGTGATTTCCTAAACACCAGTC----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 194564 88 + 647215 ATACTATTACCTCCTACCCTAAAACGTCGTCAGATGCTAGCATCACAGCCCTTAAAGTGCCTGTGATTTCCCAAACGCCAGTCCCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 59037 386 + 294542 ATTGTGGCCCAATCATCCATTCTGTACATGAATGGTCCTCCAAACACAATGTATTAAACTATGCCAAATTTGGTGTTATGATGTATTAGATATATTAGGATGCCAATGGTCCTCCAAACACAATGTATTAATTCACACTGGATTTGGTTCTTAGGATGCAATAGGCCAGTTGATAGAAGAGTAATGCCTGCACTTTAAGATTGTCCTTAGGAATTATATTCAATGTGTATATTCTGTGGTGGGTACCTTGTTGTTCTATCCTATTCTTACCAAATATCCCCTCTTTTACTGTATTACTATGCTGTTGTGGTAAAATTGATCATGTGATATTTGACCATAGACTGTAATTGGCACAGGAATGTTCACAGATGTTTGCAATTATCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204465 364 + 636262 ATTGTGGCCCAATCATCAATACAGTACATAAATGGTCCTCCAAACACAATGTATTAAACTATGCCCAAATTGGTGTTATGATG---------CATTAGGATGCCAATGGTCCTCCAAACCCAATGTATTAAATCACACTGGATTCAGTTCTTAGGGTGCAATAGGCCAGTTGATAGAAGATTAATGCCTGCACTTTAAGATTGTCCTTAG------TATTCAAAGTGTATATTCTGTGGTGGGTACCTTGCTGTTCTATCCTATTCTTACCAAATATCCTCTCTTTCACTGTATTACTATGCTGTTGTGGTAAAATTGACCATGTGCTACTTGACCATATACTGTAATTGGCCCAGGTA-------AGATGTTTGCAATTATCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 194700 386 + 647215 ATTGCATCCCAATTATGCATTCTGTGCATGAATGGTCCTCTAAACACACTGTATCAAACTATGCTAAATTTGGTGTTATGATGTATTAGATATATTAGGATGCCAATGGTTCTCCAAACACAATCTATTAATCCACACCAAATTTGGTTCTTAGGATGCAATAGGCCAGTTGCTAGAAGAGTAATGCCTTCACTTTCATATTGTCACTAGGAATTATATTCAATGTGTACATTCTGTGGTGGGCACTTTGTTCTTATGTCCCAGTCTCACCAAATATCCCCTCTTTTACTGTCTTACTATGCTGTTATGGTCAAATTGATCATGTGATATTTGAGCGTAGGCTGTAATTGGCACAGGAATGTTCACAGATGTTTGCAATAATCATT + +a +s mr.mrrefChr5 59423 15 + 294542 ATCATCACAGTACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204832 15 + 636262 ATCATCACAGTACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 195086 15 + 647215 ATCATCATAGTACTG + +a +s mr.mrrefChr5 59438 357 + 294542 ATCTTTATAACTGAACATAACAAGATTATGCTGTTTGTTGGAACAACAATTAAGCAAGTGGAATATATAACTCCTGGTGCACCTAATAAAAGTAACGATTTTGTTAAACCAATCCAGAGCAATTGGTACATAGGGAAGAAGAGATCTCACCTCTGAGATCAGTGGAGCTATATGAGGATGAGTGTAACTGGTAAGGCTTTATGAGCACAAGAAACCCAATGTCATCTAGTAGCAAGTAAAAAGAAGGAGTAGCACATTATTCCCCAGATAAAGGGGCTTTAGTAACTCCAATGAATAAACGTATGAAGGTCAGGGCCTCCTATATGCTACAACTGATGTAGCACAAGGCATCTGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 204849 327 + 636262 ATCTTTATAACTGAACATAACAAGATTATGCTGTTTGTTGGAACAGCAATTAAGCAAGTGGTATATATAACTCCTGGTGCAACTAATTAAAGTAACAATTTTGTTAAACCAATCCAGAGCAATTGGTACATAGGGAAGAAGAGATCTCACCTCTGAGATCAGTGAAGCTATATGAAGATGAGTGTAACTGGCAAGCCTTTATGAGC-------------------CTAGTAGCAAGTAAAAAGAGG------CATATTATTCCCCAGATAAAGGGGCTTCAGTAACTCCAATGGATAAACATATGAAGGTCAGGGCCTCCCATA-----CTACTGATGTAGCACAAGGCATCTGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 195101 352 + 647215 GTCTTTATAACTGCATGTAACAAGATTATGCTGTTTGTTGGTACAACAAATAAGTAAGTGGAATATA-----CCCAGCACACCTAATAAAATTAATGATTTTGTTAAGCCAATCCAGAGCAATCGATACATAGGGAAGAAGAGATCTCACCTCTGAGATCAGTGGAGCTATATGAGGATGAGTGTAACTGATAAGGCTTTATGAGCACAAGAAACCCAATGTCATCTAGTAGCAAGTAAAAAGAAGGAGTAGCACATTATACCCCAGATATAGGGTCGTTAGTTACTCCAATGAATAAAAGTATGAAGGTCAGGGCCTCCTATATGCTACATCTGGTGTAGCGCAGGGTATTGGATA + +a +s mr.mrrefChr5 59795 27 + 294542 CTGTAATCCTGGAAACTGAAGCATGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205176 27 + 636262 CTGTAATCCTGGATACTGAAGCATGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 195465 27 + 647215 CTGTAACCCTGGAAACTGAAGCATGCG + +a +s mr.mrrefChr5 59822 22 + 294542 TGTCTGAAATCAGACTGTGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205203 18 + 636262 ----TGAAATCAGACTGTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 195495 22 + 647215 TGTCTGTAATCAGACTGTGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 59844 92 + 294542 CCTGTGGTGCATTGCTACATAGAGGATTTACGATGCTTACAGCATACTTATCTACATAACACAGTACCCACATTCCCTATTGAATTGCTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205221 92 + 636262 CCTGTGTTGCATTGCTAGATAGAGGATTTATGATGCTTACAGCATACTTATCTACATAACACAGTACCCACATTCCCTATTGAATTGCTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 195518 92 + 647215 CTTGTGGTGCATTGCTACATAGAGGATTTACTATGCTTACACCATACTTATCTACATAACACAGTACCCACATTCCCTATTGAATTGCTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 59936 40 + 294542 TTGAGGCTACACACCATGATGTTGTGCCGCTTGAGCCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205313 40 + 636262 TTGAGGCTACATACCATGATGTTGTGCCGCTTGAGCCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 195615 23 + 647215 TTTAGGCTACACACCATGATATT----------------- + +a +s mr.mrrefChr5 59976 103 + 294542 GCTTTCATTCTTTAGGCATCCTTCGATAACCTTGTGGGGACGACACTGGCTGCCCTGAATTCTTTACTTCTTAGCCAGTTCACTGACTTCAGAGAGTCGGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205354 103 + 636262 GCTTTCATTCTTTAGGCATCCTTCAATAACCTTGTGAGGATGACACTGGCTGCCCTGAATTCTTTACTTCTTAGCCAGTTCACTGACTTCAGAGAGTCAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 195638 95 + 647215 ----TCATTCTTTAGGCACCTTTCGATAACCTTGTGGGTACGACACTGGCTGTCCTAAATTCTTTACTTCTCAGCCAGCTTGCTGAC----GAGGATTGGAGG + +a +s mr.mrrefChr5 60079 38 + 294542 TTTTACAGGCTTGCTGTGATAACACCGCAGTATGTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205457 38 + 636262 TTTTACAGGCTTACTGTGATAACACTGCAGTATGTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 195734 38 + 647215 TTTTCCAGGCTTGCTGTGATAACACCGCAGTATGTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 60117 355 + 294542 TGAGCATGTTGGTGGAGCAATATACTACTAGTCAAACAAGGAAGTAAGCTGGTTATTTCTAACCATACCCCTAGCCTTAGTGGTCTAGACCAAATCCTTTTCTAAACCGGATCCTTTTGGTTTGTCGCCAAAACTAAACAGGGCAGTGGAGTCTCACTTTCCTGCTCGGTGTGACCAGCCCTTGTAAGGAAACCACATGATGCAAAGTAAAAGCACTCTTCAAGTCCCCATCTTATATCTAAAAAGAAGAAAGAATGCATGAAGTTGGTTATGAAATCCGGCTGAGTCTTGTGCCTAGCTTGATATATTTTTTTCCCTTGGCTGTAATCATGTATTCATGCCTGCCTTTGCTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205495 355 + 636262 TGAGCATGTTGGTGGAGCTATATACTACTAGCCCAACAAGGAAGTAAGCTGGTTATTTCCAACCATACCCCTAGCCTTGGTGGTCCAGACCAAATCCTTTTCTAAACCGGATCCTTTTGGTTTGTCGCCAAAACTAAACAGGGCAGTGGAGTCTCACTTTCCTGCCCGGTGTGACCAGCCCTTGTAAGGAAACCACATGACGCAAAGTAAAAGTGCTCTTCAAGTCCCCATCCTATATCTAGAAAGGAGAAAGAATGCTTGAAGTTGGTTATGAAATCCAGCTGAGTCTTGTGTCTAGCTTGATATATTTTTTTCCCTTGGCTGTAATCATGTATTCATGCCTGCTTTTGCTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 195839 353 + 647215 TGAGCATGTTGGTGGAGCAACATATTACTAGTCAGACAAGGCAGTAAGCTGGTTATTTTTAACCATACCCTTAGCCTTAGTGGTCTAGACCAAATCCTCTTCTAGACCAAATCCTTTTGGTTTGTCCCCAAAACAAAACAGGGTAGTGGAGTCTCACTTTCCTGCTTGGTGTGACTATCCCTTGTAAC-AAACCTCAGGATGCAAAATAAAAGCAGTCTTCAAGTCCCCATCTTATATCTGAAAAGAAGAAAGGATGTATGAATTTGGTTATGATATCCGGCTGAGTTTTGTGCCTAGCTTGATATATTTTTTTCCCTTGGCTGCAATAATGT-TCCCTGCCTTCCTTTGCCAGC + +a +s mr.mrrefChr5 60472 694 + 294542 TCCCACTTAGCCTGCATAGCAGTAGCCAACTGGTTTGGCTTATGGAATATATTTCTTGTAATGTTGAGTACAATATTTGACTCATGGTTATAATGATTATTGTTTTACTTTAATGTAGGAGTACCATCTACACTGGGCTTGGGTCAGACAATTAGCTCTGTGCACACTTATTTCATTACCTGTTGACTCTGACTGATGCTTGTTCAACTAGCTGGAAATTAGCCAAGATTAAGCCTGAGGGACTGTCTGTGCTTGTCTCCAGCTAAATCAGGGAGCAATCCTGGAGAAGTTATCTTTACTAGATACAGATATTAGCAGAAATTAATAATACCACAGCAGGGTAAGGAGTCGAGCAGCATCGTAGATCAGGTTTCACAGAAATCTGTTTATTCCAGAATTACTTTGATCCTGATTGCTAATTGGGGTCTTTGTACATAGGCAAGTTAATCTTTTCTTTGAGAGTATCTTGTGCATACTGATTTTAACCAGGGGGGCCCTCCTTTTAGATAAATGATGGTCTGAGGGACTAAATATGACAAGATTCCCAAACAAAAGAACAGATGTAAGACATCATCAATGTTCTTCCTTACATTCATGACATTATAGGATGCTCCTTCAGTGCCCTCTATTACACAATGGACTCATGTATTTTCAACTTAGGCTGCAGCTCACCGTTACTTTAGGTCTCCTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 205870 605 + 636262 TCCCACTTAGTCTGCATAGCAGTAGCCAACTGATTTGGATTATGGAATATATTTCTTGTAATGTTGAGTACAATATTCGACTCATGGTTATAATGATTATTGTTTTGCTTTAATGTAGGAGTACCATCTACACTGGGCTAGGGTCAAACAATTAGCTCTGTGCACACTTATTTCATTACCTGTTGA------------------------------AATTAGCCAAGACTAAGCCTGAGGGACTGTCTGTGCTTGTCTCCTGCTAAATCAGGGAGCAAT-----------------------------ATAAAAGCCAAAATTAATAATACCACTGCA-----------CTAGCAGCA--GTAGACCAGGTTCCACAGAGATCTGTTTATTCCAGAATTACTTTGATCCTGATTGCTAATTGGGGTGTTGGTACATGGGCAAGTCAATCTTTTCTTTGAGAGTATCTTGTGCATACTGATTTTAACC--------------TCTAGATAAATGATGGTCTGAGGGACTAAATTTGACAAGAGTCCCAGACAAAAGAACAGATGAATGACA-CATCAATGTTCTTCCTTACACTCATGACATTATAGGAT--CCCTTCAGTGCCCTCTATTACACAATGGACTTATGTATTTTCAACTTAGGGTGGAGCTCACCGTTACTTTAGCTCTCCTAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 196192 691 + 647215 GCCCACTTAGCCTGGATAGCAGTAGCCAACTGGTTTGGCGTATGAAATATATTTATTGTAATGATGAGTGCAATATTTGACTCATGGTTATATTGATTGTTGTTTAACTTTAATGCAGCAGTACCCTCTACACTGGGCTTGGGTCAGACAAT-AGCTCTGTGCGCAGTTATTTC-TTACCTGTTGACTCTGACTGATGCTTGTTCAACTAGCTGGAAATTAGCAAAGATTAGGCATGAGGGACTGTCTGTGCTTGTCTCCAGCTAAATCAGGGAGCAATCCTGGAGAAGTTATCTTTACTAGATACAGATATTAGCAGGAATTAATAATACAACAGCAGGGTAAGGAGTTGAGCGGCATCGTAGATCAGGTTTCATAGAAAT-TGGTTATTCCAGAATTGATTTTATCCTGATTGCTAATTGGGGTCTTTGTACATAGGCAAGCTAATCTCTTGTAGGAGAGTATCTTGTGCATACTGATATTAACCAGGGGGGCCCTCCTTTTAGCTGAATGATAGACTGAGGGACTAAATATGATATGATTCCCAAACAAAAAAACAAATGTAAGATATTATCAATGTTATTCCCTACATTCATGACGTTATAGGGTGCTCCTTTTGTGCTCTCTATTACACAATTGACTCATGTATTTTCAACTTAGGCTGCAGCTCACTGTTACTTTAGGTCTCCTAACT + +a +s mr.mrrefChr5 61166 5 + 294542 TGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 206475 5 + 636262 TGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 196884 5 + 647215 TGATA + +a +s mr.mrrefChr5 61171 84 + 294542 TGTCAAATCTTAAGCTTATTCGGTGATTCTTTCTGTAATATGTTCAAGTTTTCCCCTAGTATGGCAGTACTAATAAGCTTTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 206482 84 + 636262 TGTCAAATCTTAACCTTATTCGGTGATTCTTTCTGTAATATGTTCAAGTTTTCCCCTAGTATGGCAGTACTAATACGCTTTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 196889 81 + 647215 TGTCAAATCTTAAGCTTTTTTGGTGATTATTTCTGTAATATGTTCAAGTTCTCC---AGTATGGCAGTACTAATAAGTTTTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 61255 76 + 294542 CCCAGTTATATCTACCATGCAATAACTCCTACCAAGCATGACATCACCACTACTAGCCAGCTGTGCTGAGGACCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 206567 76 + 636262 CCCAGTTATACCTACCCTGCAATAACTCCTACCAAGCATGACATCACCACTACTAGCCAGCTGTGCTGAAGACCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 196970 70 + 647215 CCCAGTTATATCTACCATGCAGTTACTCCTACCAAGCATGACATCACCACT------CAGCTGTGCAGAGGACCCA + +a +s mr.mrrefChr5 61331 162 + 294542 GTGTCAGGAGTGTCCATTCTAAGCATTGTAGAACACCCAATGTGGTGCATTGTTGTTTCTTGAATAACTACAATAGAGGTATTCCATCACATCTCTCATGTTTGGTATCATCTTAGACCTGTCAAGCTcaagctgtacAATTTGTCAATAGAAAGATGGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 206643 152 + 636262 GCGTCAGGAGTGTCCATTCTAAGCATTGTAGAACACCCAATGTGGTGCATTGTTATTTCTTGAATAACTACAATAGAGGTATTCCATCATATCTCTCATGTTTGGTATCATCTTAGACCTATCAAGCT----------AATTTGTCAATAGAAAGATGGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 197043 162 + 647215 GTGTCAGGAGTGTCCATTCTAAGCATTGTAGAACAACCAGTGTGGTGCATTGTTGTTTCTTGGATAACTAAAGTAGAGGTATTCGATCACATCTATCATGTTTGGTATCATCTTAGACCTGTTAAGGTCAAGCTGTACAATCTGTCAATAGAAAGATGGACA + +a +s mr.mrrefChr5 61493 220 + 294542 AGGCTTTTGACTGGATGAAAcagGATGCTGACCTGTCCATAATCaGGAATTATATATGTAGCTTACTTTTTTAATGGTGTGATTATCAGGTAAACCCTTGTCATTTATCTGAGAATTGTGCACAGCAAACACTATACCATACTTAATTAGCACCTTAACTAAGTTATCTAGTGACAATCAAAATGCTAGATTCCCTTTTTtttttaacaAGAATAACCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 206797 219 + 636262 AGGCTTTTGACTGGATGAAACAGGATGCTGACCTGTCCATAATC-GGAATTATATATGTAGTGTACTTTTTTAGTGGTGTGCTGATCAGGTAAACCCTTGTCATTTATCTGAGAATTGTGCACAGTAAACACTATACCATACTTAAATAGCACCTTAACTGAGTGACCTAGTAACAATGAAAATGCTAGATCCCCTTTTTTTTTTAACAAGAATAACCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 197205 208 + 647215 AGGCTTTTAACTCGATGACA---GATGCTGACCTGTCCATAATCAGGAATTATATATGTAGCTTACTTTTTTAATGGTGTGATTATCAGGTAGACCCTTGTCATTTATCTGAGAACTGTGTGCAGCAAACACTATACCATACTTAATTAGCAACTTAACTAAGTTATCTCGTGACAATCAAAATGGGAGAATCCCTCTCT---------AGAATAACCAA + +a +s mr.mrrefChr5 61713 130 + 294542 GGATTGGAGGGTGTTTAGATTCCAAATGCAATAACTGGAATCACACTTAATAAACATAGTAGAGGCCTAGTAACTGTGATACCTAATCAACTATTGTTTTAAGTAGACTGGCAGGGGGTTCCATGCGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207016 120 + 636262 GGATTGCAGG-TGTTTAA------AATGCAAT---TGGAATCACACTTGATAAACATAGGAGAAGCCTAGTAACTAAAATACCTAATCAACCGTTGTTTTAAGTAGACGGGCAGGGGGTTCCATGCGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 197413 130 + 647215 GGATTGGAGGGTGTTGAGATTCCAAGTGCAATAACTGGAGTCACACTTAATAAACATAGTAGACATCTAGTAACTGCGATACCTGATCAACTATTGTTTCAAGTAGACTGGCACGGGGTTCCATGCGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 355274 126 - 647215 AAAACTGTGGGTGTCTAGATTCCAAAT----TAACTGGAATCACACTTAATAAACCTAGTAGAGGCCTAGAAACCGTGATACCTAATCAACTATTGTTTTGAGTAGACTGGAAAGGGGATCCATGGGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 61843 1 + 294542 T +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207136 1 + 636262 T +s simRat_chr6.simRat.chr6 197548 1 + 647215 T +s simRat_chr6.simRat.chr6 355400 1 - 647215 T + +a +s mr.mrrefChr5 61844 36 + 294542 GCCCTGGTGTTACTTCAATTAATGAGGAGGCTACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207145 36 + 636262 GCCCTGGTGTTACTTCAATTAATGAGGAGGCTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 197549 36 + 647215 GCCCTGGTGTTACCCTAATTAATGAGGAGGCTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 355401 3 - 647215 TTT--------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 61880 89 + 294542 TTTGGTGGTTGGTGGATGCCACCTTAGTCCTCCATATGATGAATAATGTGGGATCTGTTAACCACCAGCAGGCTTGCAGAAGAACACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207181 89 + 636262 TTTGGTGGTTGGTGGATGCCACCTTAGTCCTCCATATGATGAATAATGTGGGATCTGCTAACCACCAGCAGGCTTGCAAAAGAACACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 197603 89 + 647215 TTTGGTGGTTGGTGGATGCCACCTTACTACTCCAGATGATGAATAATGTGGGATCTGTTAACCACCAGTAGGTTTGTGGAAGAACACCT + +a +s mr.mrrefChr5 61969 221 + 294542 AGGAATAAATTTGATATAGTGGTACGTGCAAGACTTGCTCTGGAACCTTGGTACTTGCAAGCATTGGCTTTATATATCAACAAAAATGATAACAAATTGGAGATGACAGTCAAAAATGATAAtaaagctggagctacattggctttagtaatatgacacgcCACTCATCTTTCTACAAGAGCACTCGTATACCAAGTCCACAATGAACTCATACTGTCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207270 182 + 636262 AGGAATAAATTTGATATAGTGGTACGTGCAGGACTTGCTCTGGAACCTTGGTGTTTGTAAGTATTGGCTTTATATATCAACAGAAATGATAACAAATTGGACAGAACAGTCAAAAATGATAG---------------------------------------CACTCATCTTTCTACAAGAGCACTCATATACCAAATCCGCAATGAAGGTATACTATCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 197694 221 + 647215 AGGAATAAATTTGACATAGTGGTACGTTCAAGACTTGCTTTGGGACCTTGGTACTTACAAGCAGTGGCCTTGTATATCACCAAAAATGATAACAAATTCAAGATGACAGTCCAAAAACAAAATAAAGCTGGAGCTACATTGGCTTTAGTAATATGACACGCCACTCATCTTTCTACAAGAGCATTCGTAATCCAAGTCCACAATGAACTCAGACTGTACCC + +a +s mr.mrrefChr5 62190 85 + 294542 TTTAATAAATAAAGATTCATTGTCCTAACACCTAACGATAAATTTAAGGGCCTCTACCAGACAAGGAAACCAGACACCAGGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207452 85 + 636262 TTTAATAGATAAAGATTCATTGTCCTAACACCTAACGATCCATTTAAGGGCCTCTGCCAGACAAGGAAACCACACACCAGGCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 197976 85 + 647215 TTTAATAAAGAAAGACTCATTGTCCTAACACCTAAAGATAAATTTCAGGTCCTCTACCGGACAACGAAACCAGAGAGCAGGCCAC + +a +s mr.mrrefChr5 62275 84 + 294542 GGTGTGAAACAGGAATGCGGCACTCTAGTCAACCTGAGGCAGTCAGAGGCATGTTCTGATCAAGCCATTCCATGATTGTAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207553 81 + 636262 GGTGTGAAACAGGAATGCGGCACTCTAGTCAACCTGAGGCAGTTA---GCATGCTCTGATCAAGCCATTCCAGGATTGTAGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 198061 84 + 647215 GGTGTGAGACAGGAATGTGGCACTTTAATCAACCTGCGGCAATCAGAGGCATGTTCTGAGCAAGCCATTCCATGATTGTAAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 62359 31 + 294542 CTTGAATGGGTGATAAGTAAAGGAATATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207634 31 + 636262 CTTGAATGGGTGATAAGTAAAGGAATACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 198151 31 + 647215 CTTGAATGGGTGATAAATAAAGGAATGTCCA + +a +s mr.mrrefChr5 62390 374 + 294542 CCATTCCATATAAGAGAAACTTCAGCCTTCCTTCAAAATCTAAGCATTTACTTCAGTCTCTCTAAAAGATATATGTTCATTCCAGTCATTCAGCCAATCAGCCAATGGCTGTAGGCCATAACTTAAATATTGAGTAAACAAATCATATCTCTAGGTCTAAACATATGACACCAAAAAAAGTGGGGCACTTTCATGAGTCTCTCAACCAGCTCAGAATGTAAGTTCAAGATCTGTAAGCTGGGTATTGATATTTCCATTGGCGTCCCCCTAGTAGGACTCCTCATACAACCTGTTTACCTCTTTAGTATGTCCCATTACATTATCAGTCACATGAGTTTTCACTTACCTTGCTATGATGTGCTCCTTGATGCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 207665 364 + 636262 ------CATATAAGAGAAATTTCAGCCTTCCTTCAAAATCAAAGCATTTACTTCAGTCTCTCTAAAAGGTATATGTTCATCCCAGTCAG----CCAATCAGCCAATGGCAGTAGGCTATAACTTAAATTTTGAGTAAACAAATCATATCTGTAGGTCCAAACATATGACACCAAAAAAAGTGGGGCACTTTCATGAGTCTCTCAACCAGCTCAGAATGTAAGTTCGAGATCTGTAAGCTGGGTATTGATACTTGCATTCGCGTCCCCCTAGTAGGACTCCTCACACAACCTGTTTACCTCTTTAGTATGTCCCATTACATTATCAGTCGCATGAGTCTTCACTTACCTTGTTATGATGTGCTCCTTGATGCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 198186 374 + 647215 CCATTCCATAGAAGAGAAACTTCAGCCTTCCTTCAAAATCTAAGCATTTACTTCAATCTCACTAAAAGATATATGTTCATTTCAGTCATTCAGCCAATCAGCCAATGGCTATAGGCCATAACTTAATAATTGAGTAAACAAATCGTATCTCTAGGTCTAAACATACGACACCAAAAAAAGTGGGGCACTTTCATGCGTCTCTCAATCAGCTCAGAATGTAAGTTCAAGATCTGGAAGCTGGGTATTGATATTCCCAGTGGCATCCCCCTAGTAGGACTCCTCATACAACCTGTTAACCACTCTGGTATGTCCCATTGCATTATCAGTCAAATGAGTTTTTACTTACCTTGCTGTGCTGTGCTCCCTGATGTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 62764 51 + 294542 TGGTGCTCAATCTGACACAAAAAATGTGGCTCCCCACTGTGACTTAATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 208050 42 + 636262 TGGTGCTCAATCTGACGCAAA----GTGGCTCCCCACTGTGACTTA----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 198560 51 + 647215 TGGTGCTCAGTCTGACATAAAAAATGTGGCTCCCGACTGTGCCTTAATCAA + +a +s mr.mrrefChr5 62815 161 + 294542 ATAGCCTTGGGGGTGTGAGCATTATATCTCCTACAATCAGTATCCTCATCTAGATGATACTGTATTGTTGGGCTAGGGGGTCTACAAGAGTGGGTACTCTCTTGATTCACATGCAGCATGTCATAGCTAGGTCATGGAAATTCAAGTAAATAACTGCAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425888 161 - 636262 ATAGCCATGGGGGTGTGAGCATCATGTCTCCTACAATCAGTATCCTCATCTAGATGATATTGTATTGTTGAGCTAGGGGGTCTACAATAGTGGGTAATCTCTTGATTCACATGCAGCATGTCATAGCTAGGTCATGGAAATTCAAGTAAATAACTGCAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 198611 160 + 647215 ATAGCCTTGTGGGTGTGAGCATTACATCCCCTACAATCAGT-TCCTTATTTAAATGATACTGTATTATTGGGCTAGCAGGTCTACAAGAGTGGTTACCCTCTTGATTTACATGCAGCATGTCATAGCTAAGTTGTGGAGATTCAAGTAAATAACTGTAACA + +a +s mr.mrrefChr5 62976 176 + 294542 GCATTCTAGAATTAGAATAGGGCCTATCCCTGTATGAATCCATTGAACTAATACCCATGCTTGCTATTGAAATACTTATAATTCTGTATTGAAAGTTGAAATGTTCAACCTGAGGAAACAACAAAGGCTACACTACCATAGGGGGGGCTCAATGGTTAATGAGAAATTAATTTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426049 175 - 636262 GCATTCTAGAATAAGAATAGGGCCTATCCCTGTATGAATCCATTGAACTAATACCCATGCTTGCTATTGAAATACTTATAATTCTGTATTGAAAGTTGAAATGTTCAACCTGAGGAAACAACAAAGGCTACACTACCATA-GGAGGGCTCAATGGTTAATGAGAAATTAATTTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 198772 176 + 647215 GCTTTCTAGAATTAGAATAGGGCCTATCCCTGTATGAACCCATTAAGACAATACCCAGGCTTGCTATTGTGATACTTATAATTCTGTATTGAAAGTTGAAATGTTCAGCCTGAGGAGACAACAAAGGCTACACTATCACAGGGGGGGCTCACGGGTTTATGAGAAATTAGTTTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 63152 68 + 294542 TCATTAAGTTCAGTTCAGGTCAACTCAAGCAGTAGGCAAGTCTCTGGTAATACTGCCGATAAGTAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426225 68 - 636262 TCATTAAGTTCAGTTCAGGTCAACTCAGGCACTAGGCAAGTCTCTGGTAATACTGCCGATAAGTAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 198948 68 + 647215 TCATTAATTTCAGTTCAGGTCAACTTAAGCAGTAGGCAAGTCTCTGGCCCTGCAGCTCATAAGCAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 63220 243 + 294542 GGGCACCTGTGGACTATGCCCATTTGTGTGGAAATCATCTAGACAAATTTACAGCATAGAGTGCCCTACTGCACCTTCAATATGGCCGCAAGTGATCAGCTCAGTGAAAGTCTAAGGGATCTTTCCATACCTTATACAACTCCACATCTGCTAGTATCAGGTTGATCAATCCAGGTCACAACAAATACTGAGGTGATTGTAATGGGATATCAACGGCACAACACCATCTAACTGGCTGTATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426293 239 - 636262 GGGCACCTGTGGACTATGCCCATTTGTGTGGAAATCATCTAGACAAATTTAAAGCATAGAGTGCCTTACTGCACCTTCAATATGGCCGCAAGTGATCAGCTC----AAAGTCTAAGGGATCTTTCCATACCTCGTACAACTCCACATCTGCTAGTATCAGGTTGACCAATCCAGGTCAAAACAAATACTGAGGTGATTGCACTGGGATTTCAACGGCACAACACCATCAAACTGGGTGTATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 199017 243 + 647215 GGGTAGCTGTGGACTATGCCCATTTGAGTGGAAATCATCTAGACAAATTTACAGCAGAGAGTCCCCTACTGTACCTTCAATGTGGCCGCAAGTGATCAGCTCAGTGAAAGTCTAAATGATCTTTCCATACCTTATACAACTCCACATCTGCTAGTATCAGGTTGATCCATCCAGGTGACAACCAATACTGTGGTGATTGTAAGGGGATATCAAAGGCACAACACCATCTAACCAGCTGTATCA + +a +s mr.mrrefChr5 63463 48 + 294542 ACCACAGGAATACAAAGTGAGATATTCCCTTTAGTTGgtgggtggttt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426550 48 - 636262 GCTACAGGAATACAAAGTGAGGTATTCCCTTTAGTTGgtgggtggttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 199260 48 + 647215 ACCACAGGAATACAAGGTGAGATATTCTGTTTAGTTGGAGGGTGGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 63511 158 + 294542 acccagtgacctggcacatgcgaagtagtactgatgtaaagggagtgccatcttctgcatatgaagtgaatctgaggtcttgcccacttcctatcatgagccagcccatgactggttgtgctgtttcctggtgcctccaggagccttCTGGGTCTCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426620 158 - 636262 acccagtgacctggcacatgcgaagtagtactgatgtaaagggagtgccatcttctgcatatgaagtgaatctgaggtcttgcccacttcctatcatgagccagcccatgactggttgtgctgtttcctggtgcctccaggagCCTTCTGGGTCTCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 199308 158 + 647215 acccagtgacctgcctcatgtgaagtagtactgatgtacaggcagtgccatcttttgcaagtgaagttaatctgaggtcttgcccactcactatcatgagccagcccatgactggttgtgttgttttctggcgtctccgggagacttTTAGGTCTACC + +a +s mr.mrrefChr5 63669 32 + 294542 GGATTGAATCTGTAAATGATGCTGCCGTGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426778 32 - 636262 GGATTGAATCTGTAAATGATGCTGCCGTGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 199467 32 + 647215 GGGTTGAACCTGTAAATGATGATGCCCTGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 63701 49 + 294542 TGTCAATGGTCCATGTGATATCAATACTGGGAAGTGAATTAGCAGAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426810 49 - 636262 TGTCAATGGTCCATGTGATATCAATACTGGGAAGTGAATTAGCAGAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 199524 49 + 647215 TATCAATGGTCACTGTGATATGAATGCTGGGAAGTGAATTAGCAGAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 63750 87 + 294542 TGTTATTGAGTCTAGCTTTTATAAATCGAAGAGACCCAGAACCAATAGAAATAGGAAACTTATTGACTATGATTCAGATAGTGAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426859 87 - 636262 TGTTATTGAGTCTAGTTTTTATAAGTCAATGAGACACAGCACCAATAGAAATAGGAAACTTATTGACTATGATTCAGATAGTGGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 200095 87 + 647215 TGTTATTGAGTCTAGCTTTTAAAAATGGAAGAGACCCAGAACCAATAGAAATAGGAAACTTATTGACTATGATTCAGACAGTGAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 63837 120 + 294542 CTTGAACCTTTCCGCGTTGGGGTGGCATAATGCCGCAGATTGCATTCAAGAATCATGACCAGGAACTATTACAACAAATGGCTTAAATCTGAAAGGAGAAGAGGAACTGGTCTGGTGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426951 120 - 636262 CTTGAAGCTTTCCGCGTTGGGGCGGCATAGTGCCGCAGATTGCATTCAAGTATCATGACCAGGAACTATTACAACAAATAGCTTAAATCTGAAAGGTGAAGAGGATCTGGTCTGGTGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 200182 112 + 647215 CTTGAACTTCCCCAAGTTGGGGTAGAATAATGCTGCAGATTGCATTCAAGAATCATGACCAGGAACTATTATAACATATGCCT--------AAGGAAGGAGGGGAACTGGGCTGGTGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 63957 424 + 294542 ATGCATTCTATTTAAGAAGTGAGAAGCAGCATAATTTTACCCTTTGCACTGACAACAAATAAAGCAAGTAAAAATATTCAGATGTTCATATTGCTTTGAAATTAGTAAAACAGCACAATTGCTTAAGGGTTTAATAATATGTATTTTCATGCCCAGGCACCACAGTGATCAGCCTGCATAATCATAATATAATGGAATACAGTCCACACTTCCTATAGGTGCCCTAGAGCAGAATGGTTGAGTAATCCACTCTGGAAGTAAAAAGACTTGGATGTCTTTCATCATCTAGGTATACAGATTATATCTATGGATTGTACTTGCACCCTTTTCATTTAAACTTTTCTTAAAGTCAGGCTTCAGAAAAGCACAGATATGCCTATGTCTCGTAGTTGGGTAGTCTTTAGGATACTATACTCCAATGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427071 422 - 636262 ATACATTCTATTTAAGAAGTGAGAAGCAGCATAATTTTGCCCTTTGCACTGACTACAAATAAAGCAAGTAAAAATATTCAGATGATCATATTGTTTTG-AATTAGTAAGACAGCACAATTGCTTAAGGGGTTAATAATCTG-ATTTTCATGCCCAGGCACCACAGTGATCAGCCTGTATAAGCATAGTATAATGGATTGTGATCCACACTCCCTATAGGTGCCCTAGATCGTAATGGTTGAGTAATCCATTCTGGAAGTAAAAAGACTTGGATGTCTTTCATCATCAAGGTATACAGAATATATCTATGGATTGTACTTGCACCCTTTTCATGTAGACTTTTCTCAAAGTCAGGCTCCAGAAAAGCATAGATATGCCTATGTCTCAAAGTTGTGTAGTCTTTAAAATACTATACTCCAATGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 200295 418 + 647215 ATGCATTCCATTTAAGAAGTGAGAAGCAGCATACTTTTACCCTTTATGCTAACAAGAAATAAGGCATTCAAAAATATTCAGCTGTTGATATTGCTTTGAAATCAGTAAAATAGCACAATTGCTGAAGGGTTTAATAATATATATTATCATGCCCAGGTGCTATAGTGATCAGCCTGCATAATCATAATATATTGGAATACAGTCCAAACTTCCCATAGGTGCCCTAGAGCAGAATGGGTGAGTAATCCACTCTGGACATAAACAGACTTGAATGTCTTTCACCATCTAGGTATACAGATTACATCCATGGATTGTAGTTGCACCCTTTTCATTTAA--TTTGCTTAAAGTAAGGCTTCAGAAAGACACAGGTATGTCTATGTCTCGTACTTGGGTAGTTTTTAGGA----GTACTCCAATGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 64381 185 + 294542 GTATCTGACATAGATATTGCAGGACCTACTTCTTATCCACCTACCTCTTATTTTGTTGGATTCGGAGTAAAATTAGGCATAGTGGTGAATTTCCAAACCATGTTTGGGAAATGTTAGAGAATCACTGAACCTCTGCAGATAATTTCCAATTGTCCAGTCATGTTTTAATAGCAGATACATCATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427493 103 - 636262 GTATCGGACATAGATA-------ATCTACTTCTTATCCACCTACCTCTTATTTTGTTGGATTCGGAG---------------------------------------------------------------------------TCTCCAGTTGTCCAGTCATCTTTTAGTAGCAGATACATAATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 200714 185 + 647215 GTATCTGACATGGATATTGCAGGACCAATTTCTTATCCACCTACCTTTTATTTTGTTGGATTCAGAGTAAAATTAGGCATAGTGGTGAATTTCCAAACCATGTTTGGGAAATGTTAGAGAATCACTGAACCTCTGCAGATAATTCCGAATTGTCCAGTTACGTTTTAATAGCAGATACATCATTC + +a +s mr.mrrefChr5 64566 42 + 294542 TTTCCTCTCAGAAATAACATCTTGAATAACTTATTAGAAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427596 42 - 636262 TTTCCTTGCAGAAATAACATCTTGAATAACTTATTAGAAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 200900 42 + 647215 TTTCTTCTCAGAAATAACATTTTGGATAGCTTATTAGAAATA + +a +s mr.mrrefChr5 64608 96 + 294542 CGGTCCAACCAAACGGACTTGGATTTGTCAATAAGCCTGTCTGTAATCAATCCTTCTAACAGAGCCAAAGGACCCACTAAGAAAGACTGGAATCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427652 96 - 636262 CGGTCCAATCAAACAGACTTGGATTTGTGAATAAGCCTGTCTGTAATCAATCCTTCTAACAGTGCCAAGGGACACACTAAGAAAGACTGGAATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 200942 90 + 647215 CGGTCCAACCAAATGGAC-----TTTGTCATTAAACCTGTCTGAAATCAATCCTTCTAACAGATCCAAAGG-CCCACTAAAAAGGGCTGGAATCCC + +a +s mr.mrrefChr5 64704 219 + 294542 ATTATTCAAACATAAAGGACAGCATAAGATGTTAAACAGTGAGATGGGGAGCCAGACTGTAATATCCTAGGAATGCACCCAATTAGTATTAATGAGGCAGGAGGACATTCAACATAATGTAGGGCTGTGTCAGGTAGAGCAGTAATTCTCTCGTACCTCCAGGTATCCAGGTGTAGGTTTACACTTGTAAGCCATTAATGTGCTAATCCTATCAAGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427751 218 - 636262 ATTATTCAAACATAAAGGACAGCATGAGATGTTAAACAGTGAGATGAGGAGCCAGACTGTAATATCCT-GGAATGCACCCAATTAGTATAAATGAGGCAGGAGGACATTCAACATAATGTAAGGCTGTGTCAGGTAGAGCAGTAATTCTCTCATACCTCCAGGTATCCTGGTGTAGGTTTACACTTGTAAGCCATTTATGTGCTAATCCTATCAAGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 201032 218 + 647215 ATTATTCAAACATAAAGGACAACATAAGATGTGAAACAGTGAGGTGGGGAACCAGACTGTAATATTCTAGGAATGCACCCAATTAGAATTAATGATGCAGGAGAACATTCAATATAATGCAGGGCTGTGTTGGGTAGAGCAGTAACTCTCTTGTACCTCCAGGTATCCAGGTGT-GGTTTACACTTGTAAGCCATTAATGTGCTAATCCTATCACTCTT + +a +s mr.mrrefChr5 64923 179 + 294542 TACACTGGTAGTTACACCCAATGGCAGCTCCCTAGGAAAGAAGTACTGTACTGTCATGCTCCATGTATTCTGATTGAAACACTGACCAAGGAAATGATAGAAATGACACTTAACCTTGTGCACTCTAAATGTTAGTAAAAAATACTACAACACTGAGAAACTTGAAGAGTAAAAAATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427972 179 - 636262 TACCCAGGTAGTTACACCCAATGGCAGCTCCCTAGGAAAGAAGTAATGGACTGTCATGCTGCATGTAATCTGATTGAAACGCTAACCAAGGAAATGATAGAAATGAGACTTAACCTTGTGCACTCTAAATGTTAGTAAAAAATACTACAACACTGAGAAACTTGAAGAGTAAAAAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 201250 178 + 647215 TACACTGGTAGTAACACCCAATGGCATCTCCCTAGGATAGAAGTACCATACTGTCATGCCCCATGTATACTGATTGGAGCACTG-CCAAGGAAATGATGGAAATGGCATTTAAACTTGTGCACTCTAAGTGTTAGTAAAAAATACCACAACACTGAGAAAGTTGAAGAGTAAAAAATAC + +a +s mr.mrrefChr5 65102 33 + 294542 TTAAGACCTTTTTATGGCTGAACCCTGCCAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210377 32 + 636262 TTAAGACCT-TTTATGGCTGAACCCTGCCAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 201445 33 + 647215 TGAAGACCTTTTTTTGGCTGTACACTGCCAATT + +a +s mr.mrrefChr5 65135 41 + 294542 ATTACAAACACTGCCAATTTGTTACCCTGAAATAAGGTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210410 33 + 636262 ATTACAAACACAGCCAATATGTTACCCTGGAAT-------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 201478 41 + 647215 GTTACGAACGCTGCCAATTTGTTACCCTGAAATAAGGTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 65176 31 + 294542 TCCAGGCACTATACTGCCCACACAATATGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210443 7 + 636262 ------------------------CTATGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 201520 31 + 647215 TCCAGGCACTATACTGCCCACACAATATGGA + +a +s mr.mrrefChr5 65207 103 + 294542 GTCAAGGCAGGGCATTCATGATGTGGTACAAGTGCGTACCAGGATCTGCATAATCATTACCATTGCGGGATCTGTTTTAAGGAAGGCAAAATGAAATATTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210451 103 + 636262 GTCTAAGCAGGGCATTCATGATGTGGTACAAGTGTGTACCAGGATCTGCATAATCAGTACCTTTGCTGGACCTGTTTTAAGGAAGGCAAAATGAAGTTCTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 201551 103 + 647215 GTTAAGGCAGGGCATTCGCAATGTGGTACAAGTGCACACCAGGATCTGCATAACCATTACCATTGTGGAATTTGTTTTAAGGAAGGCAAAATGACATATTACA + +a +s mr.mrrefChr5 65310 277 + 294542 GCAGCACATGACATTCAAGGCTTTGCATTCCTTGTTGGCAATTTTTACTGTCTATCCATGAGCTTTAACCATAGTTTACTTTTAGTTTGTGTTGCTGGTGCTCTAATTTATTATGTGATCAATCCTAACCTTAGTACTCTTGGGCAACATTAACTTCTCCACTATGATGATCCTTGCTTGCCAGGTTGATAATGGACTCATCTTGCACATCTGTTCTTTATGAATCCCTCTTCACTGCCCTGCAATGTGAGATAGGAATAGCATTCAAGGGGGGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210573 270 + 636262 ACAGCACATGACATTCATGGCTTTGCATTGCTTCTTGGCAATTTTTAC--TCTATCCATGAGCTTTAAGCATGGTTCACTTTTAGTTTGTGGTGCTGGTGC-CTAACTTATTATGTGATCAATCCTAACCTTAGTACTCTTGGGCAGCATTCACTTCTCCACTATGAT----CTTGCTTGCCAGGTTGATAATGGACTCATCTTGCACATCTGTCCTTTATGAATCCCCCTTCATTGCCCTGCAATGTGAGACAGGAATAGCATTCAAGGGGGGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 201654 275 + 647215 GCAGCACATGACATCCAATGCTTTGCTTGCCTTGTTGGTGATTGCTCCTGTCCATCCGTGAGCTTTAACCATAGTTTGCTTTTAGTTTGTGTTGCTGGTGCTCTAATTTATCATGTGATCAATCCTAACCTTAGTACTCTTGGCTAACATCAACCTCTCGA-TATGATGATCCTTGCTTGCCAGATTGATAATGGATTCATCTTGCACATCTGTTCTTTAT-AATTCCTCTTCACTGCCCTGCAATATGAGATAGGAATAGCGTACAATAGGGGATA + +a +s mr.mrrefChr5 65587 35 + 294542 TTTAGATTTTTTTCCACTGACCCCTGTCAGTTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210845 35 + 636262 TTTAGATTTTTTTCCACTGACCCCTGTCAGTTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 201929 35 + 647215 TGCAGAGTTTTTTCCACTGAGCTCTGTCAGTTCAC + +a +s mr.mrrefChr5 65622 120 + 294542 TGGTGGACAACCTCTGGAGTCAGGGGCAAACAGACTGGATTAGGGGAACATGGCCAGGAGAGTAATACGCAGCACAAGCATGTGATATCCTACAGTCAAAGATGTAAGAACCATTGTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 210880 120 + 636262 TGGTGGACAACCTCTGGAGTCAGGGGCAAACAGACTGGATTAGGGGAACATGGCCAGGAGAGTAATACGCAGCACAAGCATGTGATATCCTACAGTCAAAGATGTAAGAACCATTGTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 201966 120 + 647215 TGGTGCACAACCTCTGGAGTTAGGGGCAAACAGACTGGATTAGGGGAACATGATCAGGAGAGTGATACGCAGTACAAGCATGTGGGATCCTACAGTCAAAGATGAAAGAACGATTGTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 65742 78 + 294542 TACTGTGTTTACTACTCATCCATGTATACAATTCACATTGTACTTGTTGTGCTAGCAAATACAAGTAGAATTTGGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211006 78 + 636262 TACTGTGTTTACTACTCATCCATGTATACAATTCACATTGTACTTGTTGTGCTAGCAAATACAAGTAGAATTTGGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 202086 78 + 647215 TACTGTGTTTACTACTCATTCATATATCCAAATCACATTAAACTTGTTCTGCTAGGAAATACATGTAGAATTTTAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 65820 59 + 294542 ATGGTACAACAGATGTGTCTGTATGGTTCCAAATCTTGTTTGTAAGCATTTGTTAGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211085 59 + 636262 ATGGTACAACAGATGTGTCTGTATGGTTCCAAATCTTGTTTGTAAGCATTTGTTAGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 202164 59 + 647215 ATAGTACAAAAGGTGTGTTTGTATGGTTCCAACTCTTATCTGTAAGTGTTTGTTAGTGC + +a +s mr.mrrefChr5 65879 8 + 294542 GTGGCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211147 8 + 636262 GTGGCCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 202223 8 + 647215 GAGGCCAC + +a +s mr.mrrefChr5 65887 25 + 294542 GTTATTTGCATCTAAGCACACACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211155 25 + 636262 GTTATTTGCATCTAAGCACACACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 202232 25 + 647215 ATTATTTGCATCTAAGCACAGATAG + +a +s mr.mrrefChr5 65912 57 + 294542 CATGGATTCTATAACCATCACTGTTACCAGTGTTGCTGTTGATAGGGACACCGTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211180 57 + 636262 CATGGATTCTATAACCATCACTGTTACCAGTGTTGCTGTTGATAGGGACACCGTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 202258 57 + 647215 CATGGGCTCCATAAGGATCACTGTTACCAGTGTTACTGTTCATAGGGGCACAGATTG + +a +s mr.mrrefChr5 65969 12 + 294542 ACTTGTCACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211258 12 + 636262 ACTTGTCACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 202315 12 + 647215 ACTCGTCACCAT + +a +s mr.mrrefChr5 65981 383 + 294542 TTGTGACATTTTGGTAGTCTCAATTCAGTTGCAGCACAAATGTACAGGGTAAGATTAACACATCTATAGTTTAACCCTGATGTCTGTTTTGTATTAGTCATTATGACTAGGTGTTCCTTAAGAAATTTACAATAGCTTATATTTCCCAGGGTTACCTAATGCTTATCATTATAGGCTTCTAAACAATGAAAACATGGATGATCACTAGATCCCAGAAATTGGGACATCTAGAGACCCAGAGGACATGCAAATTATAACCAGCAAATTAGACATGTGCAATAAAATAGTTTTATCATTTATTGTCCTGTCTGTTAGTTTTATTAAGCGCAGTTCATCATTCACTCTAACAATTTATTCCAAATATATTAGAGATAATACAGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211334 380 + 636262 TTGTGACATTTTGGTAGTCTCAATTCAGTTGCAGCACAAATGTACAGGGTAAGATTAACACATCTATAGTTTAACCCTGATGTCAGTTTTGTATTAGTCATTATGACTAGCAGTTCCTTAAGAAATTCACACTAGCTTGTATCTCCCAGGGTTACCTGATGCTTATCATTATAGGCTTCTAAACAATGAAAACATGGATGATCACTAGATCCCAGAAATTGTGACATCTAGAG---CAGAGGACATGCAAGTTATAACCAGCAAATTAGACATGTGCAATAAAATGGCGTTAACATTTATTGTCCTGTCTGTTGGTTTTATCAAGTGCAGGTTATGATTCACTCTAACAATTTATTCCAAATATATTAGAGATAATACAGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 202327 377 + 647215 TTGTGATTTTTTGGTGGTCTCAATTCAGTTGTAGCACACATGTACAAGGTAAGATTAATACATATATAAGTTAACCCCGAGGCCTGTAT-GTATTAGGCATTATGACTAGGTGTTCCTTAAGCAATTTACAATAGCTTATATTTGCCAGGGCTGCCTAATGCTTACCATTGTAG-----TACACAATGAAAACATAGATGATCACTAGATCCCAGACTTTGGAACATCTAGAGACCCGGGGGAAATGCAAATTATAAACAGCAAATTAGACATGGTTAATATAATAGTTTTGTGATTTATTGTCCTGTTTGTTAGTTTTACTTAGCGCTGTTCATCATTCATGCTAATAATTTATTCCAAATATATTAGAGATAATACAGGAG + +a +s mr.mrrefChr5 66364 209 + 294542 CCTAAGTTACTGGTGATTTCATGGTATCTTGATTTGACCTACATTACCGTTGTTACAACCAGTGGAGATCCATAGCAGCAACGAGGCAAGGAAAACAGTGGCGTACTTTAATGTTGCAGCTTTTTCCTTGTAGTGTTACAATTGTCCACTGCCAGGAAGCTAGGTCCCTTTGTGTTGTGGTCAAAGAGCTTTCTTTTAAAGATTCACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211714 209 + 636262 CCTAAGTTACTGGTGATTTCATGGTATCTTGATTTGCCCTACATTACCGTTGTTACAACCAGTGGCGATCCATAGCAGCAACAAGACAAGCAAAACAGTGGCGTACTTTAATGTTGCAGCTTTTTCCTTGTAGTGTTACAATTGTCCACTGCCAGGAAGCTAGGTTCCTTTATGTTGTGGTCAAAGAGCTTTCTTTTAAAGATTCACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 202708 199 + 647215 CCCAAGTT---------TTCATGGTATCTGGATTTGACCTACATTACCTATGTTACAATCAGTGGAGATCCATAGCATCAATGATGCAAGGAAAACGGTGGCATACGTTAATGTTGCAGGTTTTTCATTGCAATGCAACAATTGATCACTGCCAGGGAGCCAGTTCCATTGGTGTTGTG-TCAACGAGCTTTCTACTAAAGATTCACTA + +a +s mr.mrrefChr5 66573 76 + 294542 GAATTGTGTTGCTTAAAGACCCTGTTCTGGGTGAACAACACATCTGACTGATGAGGGTGCATACCACCAATGGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211923 76 + 636262 GAATTGTGTTGCTTAAAGACCCTGTTCTGGGTGGACAACACAACTGACTGATGAGGGTTCATACCACCAATGGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 202914 75 + 647215 GAATTGTGTTGTTTAAAGACCTCGTGCTGGGTGAACAACACATCTGACTGATGAAT-TGCATACCACCAATGGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 66649 49 + 294542 GGTAGGCCTAGTGACTCTGAGCAAGAGGTATACTCAGTAACTGTCACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 211999 49 + 636262 GGTAGGCCTAGTGACTCTGAGCAAGAGGTATACTCAGTAACTGTCACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 203060 49 + 647215 GGTATGCTTAGTGACTCTGAGCAAATGGTATATTCAGTAAGTATCACAA + +a +s mr.mrrefChr5 66698 11 + 294542 CAGTCACTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212049 11 + 636262 CAGTCACTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 203109 11 + 647215 CAGTCACTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 66709 200 + 294542 ACATGTGAAACTTAAAAAGTAACTGAGTAAACTGAAACCACCATCAACATATATCATGTTGACCCTTCACATGGAGGAGATCATCCCCATGGAGGCATTGGTTCATAGATTTATTGCCTGTTGAGGCTTGGACCCCATGGAGACATTAGCCCAGAGATTTCGCACCTGTCTAGACTGGGGATGGAATGGCCTAATCTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212061 199 + 636262 ACATGTGAAACTTAAAAATTAACTGAGTAAACTGAAACCACCATCAACATATATCATGTTGACCCTTCACA-AGAGGAGATCATTCCCATGGAGGCATTGGTTTATAGATTTATCACCTGTTGAGGCTTGGACCCCATGGAGACATTAGCCCAGAGATTTCGCACCTGTCTAGACTGGGGATGGAATGGCCTAATCTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 203120 199 + 647215 ATATGAGAAACTTAATCAGTAGCTGAGTAAATTGAAGCCACCATCAACATATATCATGTTGACCCTTTACATGGATGAGATCATCCCCACAGAGGCATTGGTTCGTAGATT-ATTGCCTGTTGAAGCTAGGACCCTATGGAGGCATTAGTTCATAGATTTCTTACCTGTCTAAACTGGGGATGGAATGACCTAATCTGGA + +a +s mr.mrrefChr5 66909 27 + 294542 AGTGGCAAGGAAAGCTCCCTAGTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212261 27 + 636262 AGTGGCAAGGAAAGCTCCCTAGTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 203319 27 + 647215 AGTGGCAAGGAAAGCTCCTCAATGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 66936 76 + 294542 CTCACCTTGAATAGGCTGAAGTAAAGTATCATTAGGCTCCATATGTCATTGCTCCTTGTCTTTGGTACTTGGAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212288 76 + 636262 CTCACCTTGAATAGGCTGAAGTAAAGTATCATTAGGCTCCATATGTCATTGCTCCTTGTCTTTGGTACTTGGAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 203349 76 + 647215 CTCACCTTGAATAGGCTGAAGTAGAGTGGAGTTAGGCTCCCTACGTCATTGCTACTTGTCTTTGGTACTTGGAGAC + +a +s mr.mrrefChr5 67012 129 + 294542 TTTGGTTGCATATAAGGACTTCTGGTCCAACTGAGCTTGACTTTTCATTTTCAGAAATAGAGTGATGCCCCCCTATTGAAAGGcatattactctctcttaattcagttaggaggcaggccaagtgatcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212374 128 + 636262 TTTGGTTGCATACAAGAACTTCTGGCCCAACTGAGCTTGACTTCTCA-TTTCAGAAATAGACTGATGCCCTCCTATTGAAAGGcatattactctattttaattcagttaggaggcaggccaggtgatcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 203425 129 + 647215 TCTGGTTGCACATATGGACTTCTGGTCCAACTGAGCTCGACTTTTCATTTTCAGAGGTAGAGTGAGGCCCCCCTATTGAAAGGCATAATACTctctcttaattcagttaggaggccgaccaagtgatcc + +a +s mr.mrrefChr5 67141 241 + 294542 caggtttagatttccaggtttcgattaggattaaatacagcttatggggtcccagttttaggaacaccatgtaatgagtgcagggaggtagcaaataaactggagacatgtacacTGCTATCTGGAGTCTTATCCCTACTGTTCCTTTTGTTATCCACTTCCATTCTGTACACTAGCTGTAGGCTCTTTTGGAGAGCTCCAGTGAGAGCACAATTATGCCACTTTACCATTCCTAGGGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212502 241 + 636262 taggtttagatttccaagtttcgattaggattaaatacagctcatggagtcagagctttaggaacaccatgcagtgagtgcagggaggtagcaaataaactggagacatgtacacTGCTATCTGGAGTCTTATCCCTACTGTTCCTTTTGTTATCCACTTCCATACTGTACACTGGCTGTAGGCTCTTTTTGAGAGCTCCAGTGAGAGCACAATTATGCTGCTTTACCAGCCCTAGGGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 203569 239 + 647215 caggtttagattcccaggtttcaattaggattaaatacagcttatgaggtccctgttttaggatcaccatgtaatgagcatggggaggtagcaaaaaaactggagacatgtacacTGCTATCTGGAGTCTTATCACTACTATTCTTTTTGTTTTCCACTTCTATTCTG--CACCAGTTGTAGGCTCTTTTGGAGAGCTCCAGTGGGAGCACAATCATGCCACTTTACCATTCCCAGGGTGC + +a +s mr.mrrefChr5 67382 7 + 294542 TTGCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212743 7 + 636262 TTGCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 203809 7 + 647215 TTGCATG + +a +s mr.mrrefChr5 67389 219 + 294542 TACATGTTTGACTTACCAATCCAGAGTGTTTCAGAGATCAGGGTCAATCATTACAGTCCAAGTATCTACTGAAGGCTGAGATGATTCTTTATACATAATCCAAAACTAAACCCTAGAGAGCATCTATTCTCTTCCATCACTTCACACCAGCACATTACCCACCTTGACATGCCCCAAGCCACCAGTATTAATGTACTGTTGTTTTCTCTTGATTATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 212808 219 + 636262 TACATATTTGACTTACCAATCCAGAGTGTTTCAGAGATCAGGGTCAATCATTACAGTCCAAGTACCTACTGATGGCTGAGATGACTCTTTATACATAATGCAAAACTAAACCCTAGAGAGTTTCTATTCCCTTCCATCACTTCACACCATCACATCACCCACCTAGACATGCCCCAAGCCACCAGTATTAATGTACTACTGTTTTCTCTTGATTATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 203816 218 + 647215 TACCTGTTTTACTTGCACATCCAAAGTGTTTCTGAGATCAGGGTCAATCATTACAGGCCAAGTGTCTACTGAAGGCAAAGATTATTCTTTATCCATAATCCAAAACTAAACCCTGGAGAGCATTTATTCTCTTCCATTACTTCACCCCAGCACATTGCCCGTCTTGACTTGCCCCAAGCTGCCGGTATTAATGTGCTGTCGTTTTCTCTTG-TTATGGT + +a +s mr.mrrefChr5 67608 134 + 294542 TGACTGTACAATCCCATCAAATGGATGCCCATGGTCAACAATTAAATGCATGCCTCAATGACACTGTTGCCCCATGGATGAGTATGTTGCACCCCCATCACCATTTCAAGGATGCAGAGCACACATGACCTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213027 111 + 636262 TGACCATACAATCCCATCAAATGGATGCCCATGGTCAACAATCAAATGCGTCCCTCAATGACACCGTTGACCCATTGATTAGTATGTTACACCCCAATCACCATT-----------------------CCCGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 204035 134 + 647215 TGCCTGTACAATACCATCAAATGGATACCCGTGGTCAACAATTAGATGTATGCCTCAATGACCCTGTTGCCCCATGGATGAGTATGTTGCACCCCCAACACCCTTTCAAGGATGCAGAGCACACATGACCTGGT + +a +s mr.mrrefChr5 67742 111 + 294542 GAGTGCTGCCACCACTGCACTTCCCTTACCTACATGTTGTTTTCAAGATCTCACATAAAATTCCAGGTCTTACTGAATGATCATCATCTCTTTCATCTGGTGGAGGATTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213138 111 + 636262 GAGTGCTGCCACCACTGCACTTCCCTTACCTACATGTTGTTTTCAAGATTTCACATAAAATTCCAGGTCTTACTGAATGATCATTATCTCTTTCATCTGGTGTAGGATTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 204170 110 + 647215 GAATGCTGCCACCACTGCACTTCCCTTACCTACCTGTTGATTTCAAGATCTCACATAGAACTCCAGGTCTGACTGAATCAT-ATCATTTCTTTCATGTGGTAGAGGATTGG + +a +s mr.mrrefChr5 67853 334 + 294542 TGTTTGAGGAGTTTGCTCTAAAGAGAGTGTGGGTCCATGCATCTTTATAGAACACCAAGATAATTAGCCCTTTTTTGAAGGGCCCTTTTTTGAAGGAATGTACGTCAATGTACCTCAGTTACGGAGAGGACCAATAAGTGTGTGATCATGATTCTAAACAGGGAAACGAAATGAATAGAGTGGTGAACACATTGGTTGAGCTGCATAAGAGGTTAAAAGAAGTGAGGGCCAGAGACCCCCTCAGAATGAGGATGGTTCATCCTGTCACAAATTTTTTGAGCAAACCAAACCAATGAGTCTGCCTGGCAAGGAAATTCAAGGAGGGAGAAGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213249 334 + 636262 TGTTTGAGGAGTTTGCTCTAAAGAGAGTGTGGGTCCATGCATCTTTATAGAACAACAAGATAATTAGCCCTTTTTTGAAGGGCCCTTTTTTGAAGGAATGTACGTCAATGTACCTCAGTTACGGAGAGGACCAATAAGTGTGTGATCATGATTCTAAACAAGGAAATGAAATGAATAGAGTGGTGAACACATTGGTTTAGCTGCATAGGAGGTTAAAAGAAGTGAGGGCCAGAGACCCCCTCAGAATGAGGATGGTTCATCCTGTCGCAAATTTTTTGAGCAAACCAAACCAATAAGTCTGCCTGACAAGGAAATTCAAAGAGGGAGAAGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 204282 281 + 647215 TGCTGGTGGATTTT----TGAGAAG----------CGTACATCTTTATAGGATACCAAGATATTTAGCCCTATTTTGAAGGGCCCTT----------------------------------AGGAGAGGAACAATAAGTGTGTGATGATGATTCTAAACAGGGAAACAAAATGGATAGAGTGGTGAACACATTGGTTGAGCTGCATAAGA----AAAAGAAGTGGGAGCCATAGACCCTCTCAGAATGAGGATGGTTTATCCTGTCACAAATTTTTTGAGC-AACCAAACCAATGAGTCCACCTGGCAAGGAAATTCAAGGAAGGAGAAGATAT + +a +s mr.mrrefChr5 68187 66 + 294542 AGAAACCTAGTAGGAAGTGTTGCACATAAAGGAGGGCAAGAGTAAACTAGAGAGCACATTTCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213588 66 + 636262 AGAAACCTTGTAGGAAGTGTTGCACATAAAGGAGGGCAAGAGTAAACTAAAGAGCACATTTCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 204563 66 + 647215 AGAAACCCAGCAGGAAGTCTTGCACATAACGGGGGGCAAGAGAAAACTAGAGAGCATAATTCCAAA + +a +s mr.mrrefChr5 68253 93 + 294542 CAAAGTCATAAGCTAAAGGGTATAGAATCTGAACCTAAAGTTGTAATATAGGAACCACAGTATGGCGTGAGTATTTGGTGCAAGAGCATTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213656 93 + 636262 CAAAGTCATAAGCTAAAGGGCATAGAATCTAAACCTAAAGTTGTAATATAGGAACCACAGTATGGCGTGAGTATTTGGTGCAAGAGCATTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 204629 93 + 647215 CAAAGTCATAAACTAAAGGGTATAGACTCCGAACCTAAAGTTGCAATATAGGAACCACAGTATGGGGTGAGTGTTTGCTGCGAGAGCATATAA + +a +s mr.mrrefChr5 68346 238 + 294542 GATGTTTCTTCATGATATTCTTAATGAAAAAATGTTGATTACAACCTAAAAACACGTTGATTAGGTAGATTACAAATTGAAGATATATGTTGGTCCCAACAGTCAACTGGAAGCACATTAACCAGATAAGTGTAGTATTGAAGTTTGGTGATCTGTACAATGATGTGAGGGAATGAACTCAACTATCCGGGCACATAGTGGAACCACTCAAGTTACTTCAGAATGCTTGACATTCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213749 237 + 636262 GATGTTTCTTCATGATACTCTTAATGAAAAAATGTTGATTACAACCTAAAAACACGTTGATTGGGTAGATTACAAATTGAAGATGTGTGT-GGTCCCAACAGTCAACTGGGAGCACACTAACTAGATAAGTGTAGTATTGAAGTTTGGTGATCTGTACAATTATGTGATGAAATGAACTCAACTATCCAGGCACATAGTGGAACCACTCAAGTTACTTCAGAGTGCTTAACATTCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 204723 232 + 647215 AATGTTTCTTCATGATATTCTTAATGAAAAAATTTTGGTTACGACCT---AGCACGTTGATTAGGTAGATTACAAATTGAGGATATATGTTGGTC---ACACTTAACTGAAAACACCTTAACCAGTTAAGTGTATTATTGAAGTTTGGTGATTTGTATAATGATGTGAGGGAATAATCTCAACTATCCGGGCGCATAGTGGTACCACTCAATCTACTTCAGAATGCTTGACATTCTAG + +a +s mr.mrrefChr5 68584 40 + 294542 GTGCATATGATATTATATCTCAGGTCTTACATTTACATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 213986 40 + 636262 GTGCATATGATATTATATCTCAGGTCTTACGTTTACATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 204961 38 + 647215 GTGCATAAGGTATTACA--TCATGTCTTACATTTACCACA + +a +s mr.mrrefChr5 68624 157 + 294542 AATGCATCGATACTTTTTTAAGATGCAGCCTACTGATGCTTGACCTTGATTATGCCACATGTATAAAAATAGGGGCCTGCAGAGTTGCATGATGTGTTGATCTTGAAACCTTGATAAAAATAGCCCGGAATAATTCTGTGTATTTAAATACACTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 214027 157 + 636262 AATGCATCGATACTTTTTTAAGAGGGAGCCTACTGATGCTTGACCTTGATTACGCCACATGTATAAGAATAGGGGCCTGCAGAGTTGCATGATGTGTTGATCTTGAAACCTTGTTAAAAATAGCACGGAATAATTCTGGGTATTTAAATACACTCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 204999 157 + 647215 AATACATCGATATTTTTTTAAGATGCAGCCCACTGATGCTTGACCTTGATTGTGCCACATGTATAAAAATAGGGATTTGCAGAGTTGCATGATGTGTTGATCTTGGAACCTTGACAAAAAGAGCCAGGAACAATTCTATGTATTTGAATACACTCAT + +a +s mr.mrrefChr5 68781 846 + 294542 AAGATTATTAGTCAGGCAAGATCTAATAAGATCTAATGGGTCTGAACGAAATTGTTTGCCAGTGTGGGTCTAGCTTTGTTTTTTGGTTTAGTGTGTGCCTAGGATTCCGCTATACACTCCAGAGAGTTACTAACTTGTGAATATTCCAATGTGGTGTGCTAGTTGTTCCCATATATTGCACTGATACTTTACAGAGATATACTATCAGGATTATCTATTGATGATGGTGCAAGTTATCTCTTGCTCTCCTGCATAGAGGGTTTCTTCAGAAAACAGTGGTTCTCAACATTCAGTCTCAGCAATATGAATGATGCACAACTATACCTGAGTCCCAGCAAAGTGACAGTCAGTGCAGCAGCAGGAGCAACGGAATACCCTACAATATGGAGCACAATATAGAGAGGTTGATAGGCAACAAAGTGCTACGGAAAGGTTGGCATGGGGCCTGCAATTGAAGGGTAAAATCGCAGGTCCAATAGCAAAAAGAGAAGCGCGCTAGCAAGAGAAAATAGGGCCAAGACCTACATAAAGAAAAGCATTAATTGAGTATGTCATTGGCATTAGATGAGTGCTCTAGTAAACCCCTCTCAGGGAGAGTCTTTACCCATATCCTGGGAGGGTTGGGAATGATGGTTTAAACAGTAAAATGGACATATAAGTATTATATGTGATGGTTGTGGAAACACCAGTAAGCATATCAGGTTGGGAGAAGAATTTATCAAATCTTGTATGCCCATTGGTTGAGAGATGGAATGCCCACAATGCTCTGCTAGAGACTTGCAACATACTCTCTATCATGTGTACCAATGGCCCTGAAATCTTAGGAATGAAAACTTTTGTTTGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 214189 836 + 636262 AAGATTATTAGTCAGGCAAGATCTAATAAGATCTAATGGGTCTGGACGAAATTGTTTGCCAGTGTGGGTCTAGCTTTGTTTTTTGGTTTAGTGTGTGCCTAGGATTCTGCTATACACTCCAGAGAGTTACTAATTTGTGAAGATTCCAATGTGGTATGCTAGTT-TTTCCATATAATGCGCTGATACTTTACAGAGACATACTACCAGGATTGTCTATTGATGATGGTGCAAGTTATCTCTTGCTCTCCTGCATAGAGGGTTTCTTCAGAAAACAGTGGTTCTCAACATTCAGTCTC--------GAATGATGCACAACTATACCTGAGTCCCAGCAGAGTGACAGTCAGTGCAGCAGCAGGAGCAACGGAATACCCTACAATATGGAGCACAATATAGAGAGGTTGATAGGCAACAAAGTGCTACGGAAAGGTTGGCATAGGGCCTGCAATTGAAGGGTAAATTTGCAGATCCAATAGCAAAAAGAGAAGCACGCTAGTAAGAGAAGATAGGGCCAAGACCTAAATAAAGAAAAGCAATAGTTGAGTATGTCATTGGCATTAGATGAGTGCTCTAGT-AACCCCTCTCAAGGAGAGTCTCTACCCATATCATGGGAGGGTTGGTAATGTTGGTTTAAACAGTAAAATGGACATATAAGTATTATATGTGATGGTTGCAGAAACACGAGTAAGCAGATCAGGTTGGGAGAGAAGCTAATCAAATTTTGTATGCCCATTGGTTGAGAGATGGAATGCCCACAATGCTCTGCTAGGGACATACAACATACTCTCTATCACGTGTACCAATGGCCCTGAAATCTTAGGAATGAAAACTTTTGTTTGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 205156 836 + 647215 AAGATTATTATTCAGGCAAGATCTAAGAAAATCTAATGAGTCTGAACAAAATTGTTTACCAGTGTTGGTCTAGCTCTTTTTTTTGGTTTAGTATGTGCCTAGAATGCCACTATACACTTCAGTGAGTTGCTAACTTGTGAATATTTCAATGTGTAGTGTTAGTTGTTCCCATGTATTGCACTGACATTTTACAGGGATACACTATCAGGATTATCTATTGATGATAGTGCAAGATATCTCTTGCTCTTCTGCATAGAGGGTTTCTTCAGAAAACAGTGGTTCTCACCATTCAGTCTCAGCAATATGAATGATGCAAAACTAC-TCTGAGTCCCGGCAAAGTGACGATCAGTGCAGCAGCAGGAGCAATGGAATACACTACAATATGGAGTACAATATGGAGCGGTTGACAGGCAACAAAGTGTTACATAAAGGTTGGCATGGGGCCTGCAATTGAGGGGTAAAATCGCAGGTCCAATAGCAAAAAGAGAAGTGAG-CGGCAAGAGTAAAGAGGGACAAGACCTACATAACGGAAAGCATTGATTGGGTATAACA-------TAGGTAAGTGCTCTAGTAAACCCCTCTCAGAGAGAGTCTTTACCCTTATTCTGCGAGGGTTGGGAATGATGGTTTAAATGGTAAAATGGACATATAGCTATTATATGTGAT-GCTGTGGAAACACCAATATGCATATCAGGTTGGGAGGAGAATTTATCAAATCTTGTGTGCCCTGTGGTTGAGAGGTGGACTGTTCACAATGCTCTGCTAGAGACTTGCAACATACTCACTATCATGTGTACCAATGGCCCAAAAATCTTAGGAATAGAAACTTTTGTTTGCCT + +a +s mr.mrrefChr5 69627 117 + 294542 GTATCACATGAGCTAATCAGCCCATAACCCATGCTGTCAAATAAGATAGAGAAACTAAACAGCAACAAAGTCGTTTTGCTTTCCAGAATTGGTACAAAAAAAATTGAAGTCCTTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215025 117 + 636262 GTATCCCATGAGCTAATCAGCCCATAACCCATGCTGTCAAATAAGGTAGAGAAACTAAACAGCAACGAAGTCATTTTGCTCTCCAGAATTGGTGCAAAAAAAATTGAAATCCTTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 206042 117 + 647215 TTAACACATGAGATAATCACCCCATAAACTCTGCTGTTAAATTAGATAGAGAAACTAAACAGCAACAAAGTGGTTTTGCTTACCAGAATTGGTACAAAGACAATTGAAGTCCTTATA + +a +s mr.mrrefChr5 69744 43 + 294542 TAAGCAGGCCTTTAAGGCGAGTGTAGCTGGCATGTTACAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215142 43 + 636262 TAAGCAGGCCTTTAAGGCGAGTGTAGCTGGTATGTTACAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 206168 43 + 647215 TAAGCAGGCTTTAATGGGGAATGTAGATGGCGTGTTACAATTT + +a +s mr.mrrefChr5 69787 17 + 294542 GTGTAATAAGTGAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215186 17 + 636262 GTGTGATAAGTGAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 206211 17 + 647215 ATGTATCAAGTGAATCA + +a +s mr.mrrefChr5 69804 93 + 294542 GTTTTGCTACAAGGCTGGCTAATTCTCATTTATCCCCATTTGGGACGCTTATTAGAGCCATTGTTTCTAGTCCTTACTTGCCTCTAGTGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215204 93 + 636262 GTTTTGCTACAAGACTGGCTAATTCTCATCTAGCCCCATTTGGGACGCTTATTAGAGCCGTCCTTTCTAGTCCTTACTTGCCTCTAGTGCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 206228 93 + 647215 GTTTTGCTACAAGGCTGGCTAATTCTCTGTTATCCCCATTTGAGACGCTTATTAGAGCCATTGTTTCCAGTCCTTACTTGCCTCTAGTGCCAC + +a +s mr.mrrefChr5 69897 65 + 294542 TTTGATAAGGGTTGCAAGTATGAGTATCTTGAGTTGTTGTGAAGTCTGTTGTATGATGGTTATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215297 65 + 636262 TTTGATAATGGTTGCAGGTATGAGTATCTTGAGCTGTTGTGAAGTCTGTTGTATGATGGTTATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 206322 65 + 647215 GTTGATAAGGGACGCAAGTATGAGTATCTTAAGTTGCTGTGCAATCTGGTGTATGATGGTTCGCC + +a +s mr.mrrefChr5 69962 75 + 294542 TTAGATGTATCTTGGGCTGCTGTATAACCTGGTGTAGGATGGCCAGCCTCAAATGCAAAAACCCAATTCTCATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215363 75 + 636262 TTAGATATATCTTGGGCTGCTGTATAACCTGGTGTAGGATGGCTAGCCTCAGATGCAAAAACCCAATTCTCATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 206387 70 + 647215 TTATATGTATCTTGGGCGGCTGTATAACCTGCTGTAGGATGGTCAG-CTCTAATGC----ACCCGATTCTCATCT + +a +s mr.mrrefChr5 70037 126 + 294542 AATTAGTGGTGTTTGTGGAGGTTCACGGAACATACATATTCTAAATCTATGTTACCAGCAGTGAGTCATCAATATAGGGTCTAGAAGGGCATGTCTGATCTGTTCTGAGTAAACTGACTTTTATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215440 126 + 636262 AATTAGTGGTGTTTGTGGACAATCATGGAACATACATGTTCTAAATCTATGTTACCAGCAGTGAGTCATCAATATAGGGTCTAGAACGGCATGTCTGATCTGTTCTGAGTAAACTGACTTTTATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 206457 126 + 647215 AATTACTGGTGTTTGTGCAGGTTCACGGAATATACATATTCTAAATTTATGTTACCAGGAGTGAGTCATCAATACAGGGTCCAGAAGGGCATGTCTGATCTGTTCTCAGTAAATTGACTTTTATAA + +a +s mr.mrrefChr5 70163 513 + 294542 TTCCTTTCATAGCTGTCAGATGGTCATAGAAGCCAACCTACTCTAAAAAACAAATCCACATGTACTAGGTTGAACTCAATATACAGCCCTCCCGGTATTTCACGCTGGCTCAACATGGGTTATCACGTGCACTAGATAAATATTGTCTGGTTACTAGCTGTGGATATTAGGTTGTCTCATACGAGCCTCTTCTGGATAAGTGTATACATTATTGTGAGTAGGTACTAAAGATATTACTGTGAAGATAAAGCCTAGATTACAAAATCTCAAAGCCCTGACAGGGAAGTCCAGAATCAAGAGTCTCCATAATACAGTCCATGCTGAGATAATTGGCCTGACATAGAGAGTCATACAGTAATTTTGACATGCAGAATAATCTGCACTCATCAATCCTTCAATTGTAGCAAAATAAAACTGATTGTCTGTTATAAAAGAGAACTCATTTATTGTCTGCAATCAAGATAGACTACCCAATCTCCAACCACATTCAGTAATACTGCACCTAATGAGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 215566 510 + 636262 TTCCTTTCATAGCAGTCAGTTGGTCATAGAAGCCAACCTACTCTAACAAACAAATCCACATGTACTAGGTTGAACTCAATATACAGCCCTCCCGGTATTTCACGCTGGCCAAACATGGGTTATCATGTGCACAAGATAAATATTCTCTGGTTATTAGCTGTGGATATTGAGTTGTCACATACGAGCCCCCTC---ATAAGCGTATACATTATTGTGATCAGGTACTAAAGATATTACTGTGAAGATAAGGCCTAGATTACAAAATCTCAAAGCCCTGACAGGGAAGTCCAGAATCAAGAGTCTCCCTAATACAGTCCATGCTGAGATAATTGGCATGACTTAGAGAGTCATACAGTAATTTTGACATGCAGAATAATCTGCACTCATCAATCCTTCAATTGTAGCAAAATAAAACTGACTGTCTGTTATAAAAGAGAACTCATTTATTGTCTGCAATCAAGATAGACTACCCAATCTCCAACCACATTCAGTAATACTGCACCTAATCAGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 206584 506 + 647215 TTTCTTTCATAGCTGTCAGATGGTCATAGAAGCCAACCTACTCTAAAAAACAAAGTCACATGCACGAGGTTGAACTCAATATACAGTCCTCCAG-------ATGCTGGCTCAACATGGGTTATCACGTGCACTAGATAAATATTGCCTGGTTACGATCTGTGGAGATTAGGCCGTCTCATATGAGCCTCTTCTGGATAAGTGTATACATTATTGTGAGTAGGAGCTAAAGATATCACTGTGAAGATGAAGGCTAGAGTACAAAATCTCAAAACCCTGACAGGGGAGTCCAGAATCAGGAGTCTTCATAATACAGTCCTTGCTGGGATAATCAGCCTGACACAGAGACTCACAGAGTAATTTTGACATGCAGAATAATCTGCACTCATTAATCCTTCAATTCTAACAAAATAAAACTTATTGTCTGGTATAAAAGAGAACTCATTTATTGTATGCAATCTACATAGACTACCCAATCTCCAACTACATTCAGTAATACTGCACCTAATGAGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 70676 45 + 294542 GCTGTCATGTATGACCAAAGTATCAACACCTGATAGATTCTACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216077 45 + 636262 GCTGTTATGTATGACCAAATTATCAACACCTGATAGATTCTCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 207090 42 + 647215 GCTGTCA--TATGA-CAAAGTACCAAGACCTGACAGAGTTTATTC + +a +s mr.mrrefChr5 70721 13 + 294542 TCCAACCAACCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216122 13 + 636262 TCCAACCTATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 207189 13 + 647215 TCCAAATAACGTG + +a +s mr.mrrefChr5 70734 115 + 294542 TAAGCTAAACAAAACTTATTAGATATGTATAATGAGCAGGGACTCAATCCTTTCTCACAATTGTTAATCAGGACTTGCTCTCCCACCCTGTGGCTGCCAATTTAAGGTGAAAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216139 115 + 636262 TAAACTAAACAAAACTTATTAGGTATGTATAACGAGCAGGGGCTCAGTCCTTTCTCACAGTTGTTAACCAGGACTTGCTCTCCCACCCTGTTGCTGCTAATTTAAGGTGAAAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 207202 115 + 647215 AAAGCTAAACAAAAACTACTAGATATGTATAATGAGCAAGGACTGAATACTATATCATAATTGTAAATCAGGACTTGCCCTCCTACCCTGTGGCTGCCAATCTAAGGTGAGCATT + +a +s mr.mrrefChr5 70849 266 + 294542 TCAGCATAGAAATGGAAGAAGCTCCCTATCTTTATGTCTTACTGGAAGAGACATAATAGATGAGGCTTTAGGGCCTGACTTGATCATCACCGACTGAGGCCCGTGCTGTTGTCATTCCTATGTCATGTCTTCTTATAAGACAAACTAGTCATTTCATCCTTCCTAGACTTCTTCTTGTCCATGTTAAGTGTTGTGCAGGGTGAGACCATGTAATTTATTTACTGTATCTAGTTTTATTTTTTATGATTATAATTTTACACATAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216255 266 + 636262 TCAGCATAGAAATGGAAGAAGCTCCCTATCTTTATGTCTTACTGGAAGAGACATAATAGATGAAGCTCTAGGGCCTGACTTGATCATTACCGACTGAGGCCCGTGCTGTTGTCATTTGTATGTCATGTCTTCTTATAAGATGAATTAGTCATTTCATCCTTCCTAGACTTCTTCTTGTCCGTGTTAAGTGTTGTGCAGGGTGTAACTATGTAATTTATTTACTGTCTCTAGTTTTATTTTTTATGATTATAATATTACACATAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 207317 266 + 647215 TACACATAGAAATGGAAGCAGCTCCCTATCTTTATGTCTTTCTGGAGGAGACATAATAGATGAGGCTTAAGGGCCTGACTTGATCATCACTGACTGAGGCTCGGGCTGTTGTCATTCCTATGTCATGTCTTCTTATAAGACAAACTTGTCATTTTATCCTTCCTAGACTTCTTCATATCCATGTTAAGTGTTGTGCAGGGTGAGACCATGTAATTTATTTACTGTATTTAGTTTTATTTTTTATGAATATAATTTTACACATAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 71115 106 + 294542 ATAGCTCTGATTGTGTTCTCTGTGTACCAAGTTAATCAGGATCAATGGTTAGTTGTGGCACTGAAATTATTGTACAACAGCCACCAGTGGGTGGCAGGTCCCTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216521 106 + 636262 ATAGCTCTGATTGTGTTCTCTGTGTACCAAGTAAATCAGGATCAATGGTTAGTTGTGGCACTTAAATTGTTGTACAACAGCCACCAGTGGGTGGCAGGTCCCTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 207584 106 + 647215 ATAGGTCTGATTGGGTTCTCTCTGTGCCGAGCTAATCAGGATCAATGGTTAGTGGTGGCACTGAAATTATTGTACAACAGTCACCGGTGGGCGGCAGGTCCCTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 71221 459 + 294542 TTCCCTATCTAATAACTGTCACTTTTAGCATCAGGATTATAATTGATGCATGTGTTGAACAGCGTCCCTGGCAGAAAGCTGAGTTAGCACAGTCTTGGTTACTTCTAATTCAATGGGCACAACCAAGTGGCACATAGGATACACCTTTATGCGTGTTGTGGGCTTGTTCTATAGCATATGGTAGTAAATGACATGATTTGAACCAACAGATGCAGCTCAACCTACACAATTACCACACCTGTAAGTTTTAGTCAGTAGCAATCATGTTAGTTAATGAAAAAGTAAGTCCCTCCCACCTAAATTAACTATTAGATGCACCTGGATTACACCCAACTTGAGTATTGAAGTCTGCCTAGTGCACATATTGAATACCCTGATATTGCTTTAACTGAGGACATGACCCTCATGACCATACATATGAGTTGAGGTTACCATAATCCAGAATGCAGACCGATAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 216628 455 + 636262 TTCCCTATCTAAACACTGTTGCTTTTAGCATCAGGATTATAATTGATGCAGGTGTTAAACAGCGTCCCTGGCAGAAAGATGAGTTAGCACAGTCTTGGATACTTCTCATTCAATGGGCACAACCAAGTGGCACATAGGATACACCTTTA----TGTTGTGGGCTTGTTCTGTAGCATATGGTAGTAAACAATGTGATTTGAACCAACAGATGGAGCTCAACCTACACAATTACCACACCTGTAAGTTTTAATCAGTAGCAATCATGTTAGTTAATGAAAAAGTAAGTCCCTCCCACCTAAATTAACGATTAGATGCACCTGGATTACACCCTACTTGAGTATTGAAGTCCGCCTTGTGCACATATTGCATGCCCTGATATTGCTATAACTGAAGACATGACCCTCATGACCATACATGTGAGTTGAGGTTACCATAATCCAGAATGCAGACTGATATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 207690 450 + 647215 TTCCCTATCTAATAACTGGCACTTTTGCCATCAGGACTATAATTAACACATGTGTTGGACATCATCCCTGGCAGAAAGCTGAGTTAGCACAGTCTTGGTTACTTCTAATTCAATGGGCGCCGCCAAGTGGCACATAGGATAACCCTTTATGCGTGTTATGGGCTTGTTCTATAGCAGATGGTAGCAAATGACATGATTTGAACCAACAAAGGCAGCTCAACCTCCATAATTACCATACCAGTAAGTTTTAGTCAGTAACAATCATGTTAGTTAATGAAAAAGTAAGTCCTTCCTGCCTTCATTAACTATT------ACCCGGATTGCACGCAACTTGAGTATGGAA---TGCCTAGTGCACATAATGAATACCCTGATATTGCTTTAACTAAGGACATGACCCTCATGACCATACACAAGAGTTGTGGTTACCATAATCCAGAATGCAGACCAATAACC + +a +s mr.mrrefChr5 71680 77 + 294542 TGGCAGCAATGCATATCTAATGATGTAGTCATGCTTGACAGTTAGAGGTTGGTTACATCTTGAAGTACTGAAGCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217083 77 + 636262 TGGCAGCAATGCATATCTAATGATGTAGTCATGCATGAAAGTTAGAGGTTGGTTACATCTTGAAGCACTGAAACCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 208141 77 + 647215 TGGCAGCAATGCGTATCTAATGATGTAGTCATTCTTGACAGTTTGAGGTTGGTTACATCTTGAGGTATTGAAGCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 71757 7 + 294542 ATCTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217196 7 + 636262 AGCTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 208218 7 + 647215 ATCTGGC + +a +s mr.mrrefChr5 71764 29 + 294542 ATAATGTGATGGGTATAGTTAGTAAATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217203 29 + 636262 ATAGTGTGGTGGGAATAGTTAGTAAATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 208291 20 + 647215 ATAACGTGAAAATTCTAGTT--------- + +a +s mr.mrrefChr5 71793 15 + 294542 TTTTGATTAAATGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217236 15 + 636262 TTTTGATTAAATGAA + +a +s mr.mrrefChr5 71808 157 + 294542 CATTTTCATAGCAAGGATGGACATTCAAACATGGGACTGGCTGCATACATGTCACTTTCTTGTTTCTTTCTCTATAACAGTTAACAAGCTACTAAACAGATTGAGACAGAGAGGGAGTCCCAGAGCACCCTATTTAGGTGCTCCTTCCAATGGAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217253 157 + 636262 CATTTTCATAGCAAGGATGGACATTCAAACATGGGACTGGCTGCATACATGTCACTTTCTGGTTTCTGTCTCTATAACAGTTAACAAGCTACTAAACAGATTGAGACTGAGAGGAATTCCCAAAGCATCCTATTTAAGTGCTCCTTCCAATGGAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 208311 102 + 647215 -------------------------------------------------------TCTCTTGTTTCTTTCTCTGTAACAGTTAACAAGCTACTAAACAGATTGAGACAGAGACGGAGTCCCAGAGCACCCTATTTAGGTGCTCCTTCCAGTGGAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 71965 86 + 294542 CTTGACTTATAGGTTTCATGAATAAGAATGGATTATCTAAAAACAGGCTTTCCTTAACTCTTGTTGGTGTGTTCTGTTTCAGTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217419 86 + 636262 CTTGACTTATAGGTTTCATGAATAAGAATGGATTATCTAAAAACAGACTTTCCTTAACTCTTGTTGGTGTGTTCTGTTTCAGTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 208413 86 + 647215 GTTGACTTATAGGTTTCATGAATAAGAATGGATTGTCTAAAAGCAGGCTTTCATTAACTCTTGTTGGTCTGTTCTGCTTCAGTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 72051 254 + 294542 CCCAATGGTCCAGAACTTGCTGGGTCTTGGGTGGTTGTACTAGTGTGTCTGCTTGCTTGTTTGGTAAGTTCCTTAGGAGAAGAAAAAGGAGACCATGACTATTTGGGAGAAAAATGAACACTGTGAGAAGTTTTTAGCAGTTGGGCATGACACCAAATTAACCATTCAATGGATTCAGTAATTGCAGACATTAGATTGAAGCAACATTCTGCTATCCTATCGATAGATTTTGGACACCAAAGATATGCCAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217508 233 + 636262 CCCAATGGTCCAGAACTTGCTGGGTCTTGGGTGGTTGTACTAGTGTGTC----TGCTTCTTTGGTAAGTTCCTCAGGAAAAGAAAAAGGAGACCGTGACTATTTGGGAGAAAAATAAACACTGTGAGAAGTTTTTAGCAGTTGGGCATGACACCAAAATAACCATCCAGTGGATTCAGTAATTGCAGACATTAGATTGAAGCAA-----------------GATAGATGTTGGACACCAAAGATATGCCATTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 208499 254 + 647215 CCCAATGGGCCAGAACTTGCTGGGTCATGAGTGGCTTTACTAGTGTGACTGCTTGCTTGTTTGGGACGTTCCTTAGGAGAAGAAAAAGGAGACCATGACTATTTGGTAAAAAAATGAACACTGTCTAAAGTTTTTAGTAGTTGGGCATGACACCAAATTGACCATTCAATGGATTTGGTAACTGCAGACATTAGATTGAAGAAACATTCTGCTATCCTATCCATAGAGTGTGTACTCCAAAGATATGCCAATTT + +a +s mr.mrrefChr5 72305 23 + 294542 ATAGTTGACCCACATTTGGTCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217775 23 + 636262 ATAGTTAAGCCACATTTGGTCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 208753 20 + 647215 ATAGTTGACCCACATTTGGT--- + +a +s mr.mrrefChr5 72328 118 + 294542 AACTACCCCCATGCAAGGCATCCCCAGATGATTCTGGTAGGCCAGTAGCCACCTTAGGTTTAAGAAAGCAAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTTGATGTACTCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217799 118 + 636262 AACTACCCCCATGCAAGGTATCCCTACATGATTCTGGTAGGCCAGTAGCCACCTTAGGTTAAAGAAAGCAAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTTGATGTACTCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 208773 102 + 647215 ----------------TGCATCCCCAGATGATTCTGGTAGACCAGTAGCTCACATAGACTTAAGAAAGCGAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTCGACATACTCTTG + +a +s mr.mrrefChr5 72446 47 + 294542 GTGCTGAGGAGGGGGGAGCACCTAGTGTGAGACTGTGAATATTTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217933 47 + 636262 GTGCCAAGGAGGGGCAAGCACCTAGTGTGAGACTGTGACTATTTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 208875 47 + 647215 GTGCTGAGGGGAGGGGAGCACCTAGTGTGAGACTGTGAATATTTCTC + +a +s mr.mrrefChr5 72493 92 + 294542 CTGCTTGGATTTGCTCTTTCACCCCAATAACTATCAGAATGGCAGATGCTCTAAGCCAAATGAGGAGAAACTGATTACCAGCAGGACCGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 217983 92 + 636262 CTGCTTGGATTTGCTTTTTCACCCCAATAACTGTCAGAATGGCAAATGCTCTAAGCCAAATGAGGAGAAACTGATTACCAGCAGGGCCGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 208922 92 + 647215 CTGCTTGGATTTGCTCTATCACCCCAATAACTATCAGAATGGCAGATGCTACCTGCCAAAAGTGGAGAAACTGATTACCAGCAGGACCGGAC + +a +s mr.mrrefChr5 72585 304 + 294542 TGCTTGTGGTGGAGTGGTTAAGTACATGTATCAGGATGTCCCTTTTCACTTAGTTTCAACCTGATTTATCAAATCCTCTGTCGCTTCCCACATGAATGACATCAAAATGGGAATCCTTGAGTTGTATTACATCcaataaCTAAatcacaATAGTAATATTAAAAGTCTATGTTCCCATTGAGCAACTTGGAGTGATTACCATCACTAAGCAGTTTAACAGTCAAGGGATAATAACACCGCCCAAAGTGAATGCACAATTGAGGAAACACACTAAGTGGCAACCTGACAAGTGTGAGCATTCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218077 304 + 636262 TGCTTGTGGTGGAGTGGTTATGTACATGTATCTGGCTGTCCCTTTTCACTTAGTTTCATCCTGATTTAACAAATCCTCTGTCGCTTCCCACATGAATGACATTCAAATGGGAATCCTTGAGTTGCACTACATCCAATAACTAAATCACAATAGTAATATTAAAAGTCTATGTTCTCAGTCAGCAACTTGGAGTGATTATCATCACTAAGCAGTTTAACAGTCAAGGGAGAATAACACCGCCCAAAGCGAATGCACAATTGAGGAAACACACTAAGTCGCAACCCGACAAGTGTGAGCATTCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 209014 283 + 647215 TGCTTGTGGTGGGGTGGTTAAGTACATGTATCAGGACCTCCCATTTCACTTGATTTCAACCTGATTTATCAAATCCTCTGTCACTTCCCACATGAATGGCATCAAATTGGGAATCTTTGAGTTGTATTACATC------CTAA-----------GATATTAAAAGTCTATATTCCCATTGAGCAACTTGGAGTGATAACCATCACTAAGCAGTTTAACAGTTGAGGGATAATCCCACCAACCAAAGTGATTGCACAATTGAGGAAACACACCAAGTGGCAACCTAACAAATGCGAGCATT---- + +a +s mr.mrrefChr5 72889 32 + 294542 AGAATGTTTTAAATGTGGGTAGGCCACAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218386 32 + 636262 AGAATGTTTTAAATGTGAGTAGGCCACAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 209297 32 + 647215 AGAATGTCCTAAACGTTGGTAGGGCCCAACCA + +a +s mr.mrrefChr5 72921 112 + 294542 TGTTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTCCATAGGCAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCGTATGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218425 111 + 636262 TGTTGATTGTAATTTTCAACAAGAACTTTAATCTTTCTCTAT-GGCAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCGTATGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 209329 109 + 647215 TGTTGATTG---TTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCATAAACAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGAAATTTTCAACAACAATTTTAATCTTTCTCCATAGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 73033 11 + 294542 CTTGGATTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218536 11 + 636262 CTTGGATTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 209480 11 + 647215 CTTGGATTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 73044 133 + 294542 GAATACTATCTCCTGGTATCCCTTTGCTGGTCGATACCTCATCCACTATTTAGACATATGTCAATCACACACCTATAAATCCCTTAACTACTACTTCTGGATACTCATGAGCTACTACTGGCTCCTCATGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218548 133 + 636262 GAATACTATCTCCTGGTATCCCTTTGCTGGCCGATACCTCATCCACTATTTGGCCATATGTCAATCACACACCTATAAATCCCTTAACTACTACTTCTGGATACTCCTGAGCTACTACTGGCTCCTCATGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 209491 129 + 647215 GAATACTATCTCCTGGCATCCCCTTGCTGGTCAA----TCATCCACTATTTAGACATATGTCAATCACACACCTATAAATCCCTTAACTACTACTTCTGGATACTCACCAGCTACTTCTGGTTACTCGTGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 73177 186 + 294542 TACAGTCATTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTCCCTTGGACCTTGGACCACCACGATCAAGGGCCCTCACTACCTATCTTTTACCTCATTTGCACTTGCAAGTATAGAGAAGCTAGGCTCTCTAAGGAGGTCAGTCTGAGACTCCAATGGTTTAGTTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218682 186 + 636262 TACAGTCGTTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTCCCTTGGACCTTGGACCACCACGATCAAGGGCTGTCACTACCTATCTTTTACCTCATGTGCATTTGCAAGTATAGAGAAGCTAGGCTCTCTAAGGACGTCAGTCTGAGACTCCAATGGTTTAGTTTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 209620 146 + 647215 TACAGTCATTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTC-------ACTGGGATGACCACGATTAAAGGCCCTCACTACCTATCTTTTACCTCTTTTGCACTTGCAAGTATTGAGAAGC-AGGCT------GGAGGTCAGT-------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 73363 21 + 294542 AGAACCCATGACATTATATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218870 21 + 636262 AGAACCCATGACATTATATCT + +a +s mr.mrrefChr5 73384 59 + 294542 AGACTAACTGTGATGCTGGTAGAGGAACATACCCATGCATTTATCACCTTACAATTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218892 59 + 636262 AGACTAGCTTTGATGCTGGTAGAGGAACATACCCATGCATTTATCACCTTATCATAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 209766 56 + 647215 ---CTAACTGTGACGTTGGTAGAAGAACATACTGATGCATTTATCACCTTACAATTATG + +a +s mr.mrrefChr5 73443 45 + 294542 CAAGGTTAAATGACCAGGTATTAAGCTCTGGGTGGTGATTTGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 218954 45 + 636262 CAAGGTCAAATGACCAGATATTAAGCTCTGGGTGGTGATTTGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 209822 44 + 647215 CAAGGTTAAATGGCCAGGTGACAAGCTCTGGG-AGTGATTTGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 73488 38 + 294542 ACAACCGAACTGACGAATTGGGCTAAGTTGCAAACTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219002 38 + 636262 ACAACCAAACTGACGAATTGGGCTAAGTTGCAAACTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 209866 38 + 647215 ACAACTGACCTAACAAATTGGGCTAAGTTGCACATTAA + +a +s mr.mrrefChr5 73526 494 + 294542 ATCACTTGAGAACGCCCATTAGTAAGCATTTTAGTCCATTCATTACGGGGTAAAATAGCTGGAGGATTCCTACGTTTTTTACATGAGATTGGAGATTTGCCGCCACCAGTAACATGCCACTTAATATAGTATGTTCATTTATCCATGGCTATATGCCTGTGAGACCACAACCTTATTTGAAGCCTCCCTTGTCCCATCAATGAGTGGAACTGGGTCTAAAACCACTTATACCCCTCCTCTATTTTCCACCCTATATCTAGATGGTGACACTAAAGCATGTGAACAATTTACCATCCCTTTTGTTGGCTGTTGTCAAGCCACAAGAATTTTGCTGTCTCAGGTGCCCAGCAATTAGATAATAATTTTGGCTCTTATTTATGTCCCCAACAGTCAGGATATCTATCTTCTCAGGTATCCTTAATAGAGGGCTCTGCAGATTTTCTTATGCCCTATTGAGTGGGTTTTAGGTTCACTCATCCAACCACCACAACCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219049 425 + 636262 ATCACTTGAGAACGCCCGTTATTAAGCATTTTAGTCCATTCATTACGGGGTAAAATAGCTGG---------ACATTTTTTACATGAGATTGGAGATTT---GCCACACGTATCATGCCGCTTAATATAGTATGTTCATTTATCCATGGCTATATGCCTGTGAGACCACAACCTAATTTGAAGCCTCCCTTGTCGCATCAGCA---------------------------ACCCTTCCTCTACTTTCCACCCTATATCTAGATGGTGACACTAA-----GTGAACAATTTACCATCCCTTTTGTTGGCTGTTGTCAAGC------GATTTTGCTGTCTCAGGTGCCCAGTGATTAGATAATGATTTTGGCTCTTATTTATGTCCC--------------TTTGTCTTCTCGCGTATCCTTAGTAGAGGGCTCT---GATTTTCTTATGCCCTATTGAGTGGGTTATAAGTTCTCTCATAC--CCACCACAACCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 209904 486 + 647215 ATCACTTGAGAACCCCCATTAG-----ATTTGAGTCCAGTCATTATGGGGTAAAATAGCTGGAGGATTCCTAGGTTCTCTATATGAGATTGGAGATTTGCCGCCACCAGTTACATGCCACTTACTACAGTATGTTCATTTATCCATGGCTATATGCCTGTGAGACCACAACCTTATTTGAAGCCTCCCTTGTGCCATCAATGAGTGGAACTGGGTCTAAAACCACTTATACCCCTCCTCTATTTTCTACCCTATATCTAGATGGTGACACTAAAGCATGTGAACAATTTACCCTCCTTTCTGTTGGCTGTTGTCAAGCCACAAGAATTTTGCTGTCTCAGGTGCT--GCAAGGAGATAATAATTATGGTTCTTGTTTATGTCCTCAACAGTCAGGATATCTATCTTCTCAGGTATCTTTAATAGAGGGCTCTGCAGATTTTCTTGTGCTCCATTGAGTGGGTGTTAGGTTCACCGATCCAACCACCA-AACCAC + +a +s mr.mrrefChr5 74020 268 + 294542 TAGTTGTCTTTGCTGTATAAAATAGACCACCCTGCATTATTGCATCCCAAGGTTTTCAGGTCCTTACTCTCATTTTTCTTGCATCTTGTGTGTGGTTCGTATTAGTTTTAATAGATGTGAATTGGTGTTATACTACTTTTCTTTCCTGAATCTGTGAGTCTGCTGAGGGTATTCTGTATGTCCATTATGGTGTTAGACTAGGATCAGTAGCATCTGATCTGAGAGGTAGTTTATGGCAGTATTGTTTGCCTTGCATCTATCAAAAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219474 263 + 636262 CAGTTGTCTTTGCTGTATAAAATATACGACCCTGCATTATTGCATCCCAAGGTTTCCAGGTCCTTACTCTCATTTTTCTTGCATCTTGTGTGTGGTTCGTATTAATTTTAATAGGTGTGAATTGGTGTTATACTACTTTTCTTTTCTAAATCTGTGAGTCTGCTGAGGGTATTCTGTATGTCCATTAT----TTAGACTAGGATCAGTAGCATCTGATCTGAGAGGTAGTTTATGGCAGTATTGTTTGCCTTGCAC-TATCAAAAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 210400 268 + 647215 TAGTTGTCTTTGCTGTATAAAATAGACCACCCTGCATTATCTCATCCCAAGATTTTCAGGTGCTTATTCTCATTTTTCTTGCACCTTGTATGTGGTTTGTAATAGTTATTATAGATGTAAATTGGTGTTATACTACTTTTCTTTCCTGAATCTGTGAGGCTGCTGAGGGTATTCTGTATGTCCATTATGGTGTTAGACTAGGATCAGTAGCATCTGGTCTGAGAGGTATTTCATGGCAGTATTGTTTGCCATGCATCTATCAAAAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 74288 48 + 294542 GCCTTGCTTAGTAAATCATGCCCAGTCTCTTAATGTAAAAGCTCTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219738 48 + 636262 CCCTTGCTTAGTAAATCATGCCCAGTCTCTTAATGTAAAAGCTCTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 210668 48 + 647215 GCCTTGCTTAGTAAATCATTCCCAGACTCTTAAGGTATAAGCTCCAGA + +a +s mr.mrrefChr5 74336 117 + 294542 AGCAGAGGAGGACATGGTAGAAGTACAACATAGATCTCCCTTTAGCAATTAATATGACAGACTTGGCACATTGTTAAGTGTTACACATTCAGATGTATAAGACAGTAGGCTACCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219806 96 + 636262 AGTAGAGGAGGACATGGTAGAAGTACAACATAGATCTCCCTTTAGCAATTAATATGACAGACTTGGCACATTGTCAA---------------------AAGACATTAGGCTACCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 210716 117 + 647215 AGCAGAGGAGGACATGGTACACGTACAACATAGGTCTCTCTTTATCAATTAATAGGACAGACTCGGCACATTGTTAAGTGTTACACATTCAGATGTATAAGGTCGTAGGCTACCCAA + +a +s mr.mrrefChr5 74453 73 + 294542 CCTTCAGCATGACTGATTGCACCAAACATTTAAATCCCTGGGTAAGGGTAGGAGGGTAAACAAAACGACATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219902 73 + 636262 TCTTCAGCATGACTGACTGCACCAAACATGTAAATCCCTGGGTAAAAGTAGGAGGGTAAACAAAACTACATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 210834 73 + 647215 CCTTCAGCATGGCTGATTGCACTAAACATTTAAATACCTGGGTAAGGGTAGGAGGGTAAACAAAACGACGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 74526 186 + 294542 CTGCCTTACACTGAAGCTAACAATATTTACTGCTACATGAGGTCAGCAACCAAAAGATTACAAGAAACGACTTGCATAAACAGATGGCAGTGAAATGCAGGACCATAATTGTTCCACTTCAATCACTATAAAAGCTATGATTGACCCTGTCCAGGGCATTGTGGCTCATGACTGTGGTCCTATCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 219976 177 + 636262 CTGCTTTACACTAAAGCTAACAATAT---------CACGAGATCAGCAACCAAAAGATTACAAGAAGCGACTTGCATAAACGGATGGCAGTGAAATGCAGGACCATAATTGTTCTGCTTCAATCGCTATACAAGCTATGCTTGACACAGTCCAGCGCATTGTGGCTCATGACTATGCTCCTATCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 210907 186 + 647215 CTGCCTTACACTGAAGGTAATGATATTTACTGCTATATGAAGTCAGCAACCAAAAGATGACAAGAAACAACTTGCATAAAAAGATGGCAGTGGGATGCAGGACCATAATTGTTCCACTTCAATCACTATAAAAGCTATGATAGACCCTGTCCAGGTCATTGTGGCTCAAGACTGTGGTCCTATCTA + +a +s mr.mrrefChr5 74712 149 + 294542 TCGAGACCTTTTTTCAAGCTTCTTATACCAACAACCAAATGCAATGCCCCCCTGTACAAGGCAGTGCTCACTGTTAGGACCCACCATTTTGCAGAAAGCTGCACAGCCCTTGGCTGGCTATCTTGGGAAAGCTCTAGTGGGCTCTTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220159 148 + 636262 TCGAGACCTTTTTTCAAGCTTCTGATACCAACAACCAAATGCAATGCCCCCCTGTACAGGACAGTGCCCACAGTTAGGACCCACCATTTTTCAGAAAGCTCCACAG-CCTTAGCTGGCTATCTTGGGAAAGCTCAAGTGGGCTCTTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 211093 149 + 647215 TGGAGAGCTGTTTTCAAGCTCCTTATACCAGCAACCAAACACAATGACCCCCTGTACAAGGCAGTGCTCACTGTTACGACCCACCATTGTGCAGAAAGCTGCTCAACCCTTGGCTGACTAGCTGGGGAAGATTCTAGCAGGCTCTTTAG + +a +s mr.mrrefChr5 74861 42 + 294542 GTAGTTTGATGCTATGCCACCAGATGCCAATATCCAGTGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220307 42 + 636262 GTAGTTTGATGCTATGCCACCACATGCCAATATCGAGTGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 211323 42 + 647215 GTAGTTTGATGCTATGCCACTAGATGACGATATCCAATGATT + +a +s mr.mrrefChr5 74903 117 + 294542 GTGTCAACAAGTTTAAGCCTCCCTGATTGTCTCACACAGTTGTGCCTTGTGTAACTGAGAGATATGATGGAACTTACTGTTAGTCATTAAGTTCATGTATGCTTTAGTTCAAAGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220349 117 + 636262 GTGTCAACAAGTTTAAGCCTCCCTGATTGTCTCACACAGTTGTGCCTTGCGTAACTGAGAGATATCATGGAACTTACTGTTAGTCATTAACTTCATGGACGCTTTAGTTCAAAGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 211366 116 + 647215 GTCTCAACAAGTTTAAGCCT-GCTGATTGTCACACAAGGCTGTGGCTTGTGTAAATGAGGGATAAGATGGAACTTACTGTTAGTTGTTATGTTCATGTATGCTTTAGGTCAGAGGCC + +a +s mr.mrrefChr5 75020 18 + 294542 TGTTCCAGTCCCATGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220466 18 + 636262 TGTTCCAGTCCAGTAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 211508 18 + 647215 GGTTCCAGTCCCATGACC + +a +s mr.mrrefChr5 75038 7 + 294542 TGTCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220484 7 + 636262 TGTACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 211527 7 + 647215 TGTCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 75045 17 + 294542 TTTACCCTACACACGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220643 17 + 636262 TTAACCCTACCCTCGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 211534 17 + 647215 TTTACCCGGCACACGGT + +a +s mr.mrrefChr5 75062 66 + 294542 TTATACATTACATAGATGTCACGGTTGTAGGTATTAGGAGCATCATTGGAACTGGTTGACCCAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220660 66 + 636262 TTATACATTACATAGATGTCACGGTTGTAGGTATTAGGAGCATCATTGGAACTGGTTGACCCAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 211579 66 + 647215 TCATAGATTACACAGATGTTGTTCTTGTAGGTATTAGGGTAATCATTGGAACTGGTTGATCCAATC + +a +s mr.mrrefChr5 75128 37 + 294542 AACCCCAGCTGATTCAGCAGATGGGACCACCATTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220727 37 + 636262 AACCCCAGCTGATTCAGCAGATGGGACCACCATTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 211645 37 + 647215 CACTCCAGGTGATTCAGCAGATGGGGCCACCATTATG + +a +s mr.mrrefChr5 75165 49 + 294542 AAGATGGTGATGCCTTATCAAAAACCCTGCCCTCCATGAGGAGGTTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220765 49 + 636262 AAGATGGTGATGCCTTATCAAAAACCCTGCCCTCCATGAGGAGGTTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 211682 49 + 647215 AAGATGGTGATGCCTTATCAAAAACCCTGTCCTCCATCAGGAAGTTTGG + +a +s mr.mrrefChr5 75214 42 + 294542 AGACTATGGCATTCCACCTCCTAGAATTCCACCCCCCTATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 220835 42 + 636262 AGACTATGGCATTCCACCTCCTAGAATTCCACCCCCCTATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 211731 42 + 647215 AAGCTATGGCATTCCACCCCCCACCATTCCACCCCCTTATAC + +a +s mr.mrrefChr5 75256 18 + 294542 GCAGGTCTAAGTCACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221045 18 + 636262 GCAGGTCTAAGTCACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 211773 18 + 647215 TCAGATCTAAGTCACAGG + +a +s mr.mrrefChr5 75274 24 + 294542 CATGCATTACAGCCATCTTCTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221063 24 + 636262 CATGCATTACAGCCATCTTCTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 211792 24 + 647215 TATGCATTACAGCCATCTCATCTA + +a +s mr.mrrefChr5 75298 74 + 294542 ACAGACGGTTATTGTGAGTATGTGCATCAATATGCCCTCCTTTCAATTATACCAAGCCAATGCGACTGTAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221087 74 + 636262 ACAGACGGTTATTGTGAGTATGTGCATCAATATGCCCTCCTTTCAATTATACCAAGCCAATGCGACTGTAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 211821 74 + 647215 ACAGATGGATGTTTTGAGTATGTGCAACAATATGCCCTCCCTTCAATTATGCCAGGCCAATGCAACCGTAGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 75372 138 + 294542 ACCCCTGGATCAGTCTTGCTTGCTCTCTTATTGCAGTGCAATGACCGTTAGTCTCTCAGTGTAAGACTTATCAAAGGGGTGAGTTCTCATATGTACTAACAGTACCCTGACATGTCATTAACTCCAATATTATTGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221163 138 + 636262 ACCCCTGGATCAGTCTTGCTTGCTCTCTTATTGCAGTGCAATGACCGTTAGTCTCTCAGTGTAAGACTTATCAAAGGGGTGAGTTCTCATATGTACTAACAGTACCCTGACATGTCATTAACTCCAATATTATTGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 211895 138 + 647215 ACCCCTAGATCAGTTATGCTTGTTCCTTTATTGCAGTGTAATCACTTTTAGTCTCCCGGTGTAAATCTTGTTAAAGGGGTGAGTTCTCATATGTACTAATAGTACCCTGTCAAGTTAGTAACTCCAATATTGTTGAAG + +a +s mr.mrrefChr5 75510 8 + 294542 AGTGGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221302 8 + 636262 AGTGGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 212033 8 + 647215 AGTGGGCT + +a +s mr.mrrefChr5 75518 10 + 294542 ATTGTGTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221328 10 + 636262 ATTGTGTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 212041 10 + 647215 ATTGTGTGGG + +a +s mr.mrrefChr5 75528 110 + 294542 ATTATAACCTCAGCATTAGACACATTGGTAGGTTGTTTGCAGCCCCCCAATATTCATCAACACACTATGCTTGGAGATTTGTGATCATCACTCAACAGACCTTATAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221338 110 + 636262 ATTATAACCTCAGCATTAGACACATTGGTAGGTTGTTTGCAGCCCCCCAATATTCATCAACACACTATGCTTGGAGATTTGTGATCATCACTCAACAGACCTTATAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 212076 110 + 647215 ATCATAACCTTGGCATTAGACACATCGATAGGATGTTTACAGCCCCCCACTATTCACCTACTCCCTATGCTTGGAGATTTGTGACCATCACTCAATTAGCCTTTTCATTT + +a +s mr.mrrefChr5 75638 62 + 294542 TCATTTAAGAATGGACTCCAAAGGCCCGGTTTTAGTTTAGCTCTCAAAGGAGCAGCACAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221455 62 + 636262 TCATTTAAGAATGGACTCCAAAGGCCCGGTTTTAGTTTAGCTCTCAAAGGAGCAGCACAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 212186 62 + 647215 TCATTTAAGAATGGACTCCAAAGGGCCGGTTTTAGTTTAGGTCTTAAAGGAGCAGCACAGCC + +a +s mr.mrrefChr5 75700 64 + 294542 CGAGGTAGAACACCATCGCCTCAGAAATTCCCCTGATCATATCCTCCATCTAGTAGAGGTACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221518 64 + 636262 CGAGGTAGAACACCATCGCCTCAGAAATTCCCCTGATCATATCCTCCATCTAGTAGAGGTACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 212248 64 + 647215 AGAGGTAGGACACCTTCACCACAGAAACTCCCCTGATCATAACCTCCATCTAGTAGAGGTATAT + +a +s mr.mrrefChr5 75764 193 + 294542 TAATCTTACCAACTCTTTTAGTAACAGAGATTTCAATAGATATACAGAAACTGGCTGGGAGGTTGGAATCAATTCAAAGCAACCTGATTGATCAATTGAGTGAAGACAAGGGCCAGTTAGTCCAGGAGTGAGCCCCATTCTTTTTACCACTGTATTTTAAAATGATACAATGGGTACGAGCGGACTGGTCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221583 193 + 636262 TAATCTTACCAACTCTTTTAGTAACAGAGATTTCAATAGATATACAGAAACTGGCTGGGAGGTTGGAATCAATTCAAAGCAACCTGATTGATCAATTGAGTGAAGACAAGGGCCAGTTAGTCCAGGAGTGAGCCCCATTCTTTTTACCACTGTATTTTAAAATGATACAATGGGTACGAGCGGACTGGTCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 212312 193 + 647215 TGATCTTACCAACTCTATTAGAAACCCACATTTCAATAGACCTACAGGAACTGGCTAGGTGATTGGAAACTATTCAAAGCAACCTGCTCGATTAATCGAGTGAAGACAAGGGCCATTCAGTGCAGGATGGAGCCCCATTCTTCTTACCACTGAATTTTAAAATGATACAATGGGCACAAGGGGATTGGTCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 75957 129 + 294542 GGAGATATTTTTGCACAGGGGGGTTGGTCTCTGGAGATATTTTTACAGTATCTATGGAATTGATCAAGCACCCGACTGCTCCAGCATCAGCAATGTTTGCCAAAATGACCCGTGGAAGGTTGGAGCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221785 129 + 636262 GGAGATATTTTTGCACAGGGGGGTTGGTCTCTGGAGATATTTTTACAGTATCTATGGAATTGATCAAGCACCCGACTGCTCCAGCATCAGCAATGTTTGCCAAAATGACCCGTGGAAGGTTGGAGCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 212505 129 + 647215 GGAGATATCTTTGCACAAGGGGATTGGTCTCTGGAGATATTTTTACATATTCTGTGGAATTGATCAAGCACTTGACTGCTCCAGCAGTAGCAATGCTTGCTAAAACAACCCATGGAAGGTTGGATTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 76086 98 + 294542 CATTGTTCACAGAACCAGCACTTGACTGCCCCAACATTGACAATTTATGCTGAGTAATTTGTGCTTAGACTACCCATTGAAGGTTGGATTGGACATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 221915 98 + 636262 CATTGTTCACAGAACCAGCACTTGACTGCCCCAACATTGACAATTTATGCTGAGTAATTTGTGCTTAGACTACCCATTGAAGGTTGGATTGGACATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 212634 98 + 647215 CATTGTTCACAGATCCAGCACTTGACTGCCCCAACATTGGCAGTTTATGCTGAGAAATTTGTGCCGAGACTACCCGTTGAAGGTTGGATTGAACATTG + +a +s mr.mrrefChr5 76184 190 + 294542 CCCAAAGAGTTCTGGCACTTTAACTTTTTAAATTTTGGGTTGGACGAAGAAAAGAAGGATTTTCCTATCAGCAGCTATGTGCTATGAAGTGATAGGAACTCACTTCTCATACTATCTGTGCTTCTAGCATGAAGTGATTTCAACCTAGCTCAATCATCACTTTTCTCCATTTAATACTGCTGAGAAAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222014 190 + 636262 CCCAAAGAGTTCTGGCACTTTAACTTTTTAAATTTTGGGTTGGACGAAGAAAAGAAGGATTTTCCCATCAGCAGCTATGTGCTATGAAGTGATAGGAACTCACTTCTCATACTATCTGTGCTTCTAACATGAAGTGATTTCAACCAAGCCCAATCATCACCTTTCCCCATTTAATACTGCTGCCAATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 212732 190 + 647215 CTCAAGGAGTTCTATCACTTTGACTTTTTAGATTTTGGGTTGGACAAGGGAAAGAAGGATTTTCCTATCAGCAGCTACGAGCTAGGAAGTGATAAGAACTCACTTCTCATGCTATTGGTGCTTTTGGCATGAAGTGATTTCAACCTAGCTCAATCATCACTTTTCTCCACTTAATACTGCTAAGAGAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 76374 31 + 294542 AAAGGTTGCAGACGGCACAAGCATGTTTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222206 31 + 636262 AAAGGTTGCAGACGGCACAAGCATGTGTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 212922 31 + 647215 AAAGGTTGCAGAGGCCACAAGCATGTTTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 76405 15 + 294542 TCCCCTAATATCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222237 15 + 636262 TCCCCTAATATCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 212957 15 + 647215 TCCTCTAATATCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 76420 184 + 294542 TGTGAATTTCCTGGACAGGTTTGGGCCTACAGCCACTGGCTTTAGAATTATTGTGAATTCAATAGGATGAGGAGTAGTAATGACAGCAATATAATTTATATCAGTAACCCTGTAGCTTTATTAGCATATTCCAACTTAGATTGAAATCATTTTGATGGACAAAAGGTATATTTTGCCAGACCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222252 184 + 636262 TGTGAATTTCCTGGACAGGTTTGGGCTTACAGCCACTGGCTTTAGAATTACTGTGAATTCAATAGGATGAGGAGTAGTAATGACAGCAATATAATTTATCTCAGTAACCCTGTAGCTTTATTAGCATACTCCAACTTTGATTGAAATCATTTTGATGGACAAAAGGTATATTTTGCAAGACAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 212982 184 + 647215 TGTGAATTCCCTGGACAGGTTTGGGCCTACAGCCACTGGCTTTAGAATTATTGTGGATTCAATAGGTTGGGGAATAGTAATGACAGCAATATAATATATATCAGTAACTCTGTAGCTCTATTAGCATCTTCAAACTTAGATTGAAATCATTTTGATGGACAAGAAGTATATTTTGCCAGACCAA + +a +s mr.mrrefChr5 76604 194 + 294542 GGGCCAACTTGATGATAGAATTAGGACAGTCTGAGTAGCAACCAGGAAGTAGAGTGTGTAGGGATCAGTGTCGTCAACCCCTTCAATTAGCCAGAATGGATGTGTCTTAGATTTTGAATTAATTAACTCCCTCAATAAACTTATACACAGTGGTGATGTAGGTGGTTGTCCAACTTGGGTTCTAAGGAGTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222437 170 + 636262 GGGCAAACTTGATGGTAGGATTAGGAGTGTCTGAGTAGCAACCAGGA-----AGTGTGCAGAGATCAGTGTCGTCAACCCCTTCTATTAGCCAGAATCGATGTGTCTTAGATTTTGAATTAATTAACTCCTTCGATAAACT-------------------GGTGGTTGTCCAACTTGGGTTCTAAGGAGTTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 213166 194 + 647215 GGGCCAACTTTCTGATAGAATTAGTCCAGACTGAAGAACAACTAGGAAGTAGAGTGTATGGGGATCAGTGTAGTAAACCCCTTCAATTAGTCAGAATGGATGCGTCTTAGTCTTCGAATTAATTAACTCCCTCAATGAACTTATACACAGTGGTGATGTAGATGGTTGTCCAATTTGGGAGTTAAGGAGTATCA + +a +s mr.mrrefChr5 76798 39 + 294542 TTTATGCCCATGTTGCTACTGGCATATAACAGTAAAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222607 39 + 636262 TTTATGCCCATCTTGCTACTGGCATATAACCGTAAAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 213361 39 + 647215 TTTATGGCCATGTTGCTACTGGCATATAGCAGTAAAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 76837 157 + 294542 AAAGTCCAACAATGCCAGGGCATTCATGCAATCTAATTAATTGCTATATACTATTGCATCTACAAACAGTCCCTTACAATACATATCAAACTCATAAAATATTGCTCTCTTTGAAGCCAATTTGGACCTAGATGCCATCTATCGTTAAGCAATAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222648 157 + 636262 AAGGTCCAACAATGCCAGGGCATTCATGTAATCTAATTAATTGCTATATACTGTTGCATCCACAAACAGTCCCTTACAATACATATCAAACTCATAAAGTATTGCTCTCTCTGAAGCCAATTTGGACCTAGATGCCATCTATGGTTAAGCAATGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 213400 157 + 647215 AAAGTCCAACAATGCCAGGGCATTAATTCAATCTAATTAATTGCTATATACTATTGCATCTACAAACAGTCCCTTACAATACACATCAAATTCATAAAATATCGCTCTCTTTGAAGCCAATTTAGACCTAGATGCCATCTATCATTAAGCAATAATA + +a +s mr.mrrefChr5 76994 154 + 294542 TGTATCTCTAATACAATAGACCTTCTGCCTGGCTCAATAGAACCATGCCATCAGGTTTACCTATCCACACCAGAACGCACATAGACACACCCTCCTAGCATGATGTCATAAGAGTATGAAAGGTTTTGCACTGTATCGACCTCAGGAAACCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222805 154 + 636262 TGTATCTCTAATACAATAGACCTTCTGCCTGGCTCAATAGAACCATGCCATCAGGTTTACCTAACCATAACAGAACGCACATAGACACACCCTCCTAACATGATGTCATCAGAGTATGAAAGGTCTTGCACTGTATCGACCTCAGGAAACCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 213603 144 + 647215 TGTAGCTCTAATATGATAG-CCTTCCACCTGGATCAATAAAACCATGCCATGAGGCTTACCTATCCACACCAGAGTGCACATAGACATACCCTCCTAGCATGATGTCATAAGAGTATGAAAGGTTTTGCACT---------TCAGGAAACCACT + +a +s mr.mrrefChr5 77148 15 + 294542 CGAGACTCTGTAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222960 15 + 636262 CGGGACTCTTTAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 213747 15 + 647215 GGAGACTTTGCAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 77163 164 + 294542 GGATATTACTGCCTTCCAGAATGACAATTAGTTATACAGTTGTGTCATCCATGCCATCCAAGTGTAAGCTCCAGAGTAAGGTAACTAGATGTGGTTGCATGTCCTACACTCTGATGCATGCTCGCGTATATTAGAATCTACCTCTGGTAAAGCTATGGCAGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 222976 152 + 636262 GGATATTACTGCCTTCCAGAATGAGAATTAGTTATAC--TTG---------TGCCATCTGAGTGTAAGCTCCAGAGTGGGGTAACTAAATGTGGTTGCATGTCCTACACTCTGATGCATACTCACGTATATTAGAATCTACCTCTGGTAAAGCTA-GGCAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 213762 164 + 647215 GGATATTACTTCCTTCTAGAATGACAATTTGCTATACAGTTGTGTCATCCATGTCATCCAAGTGAAAGCTCCAGAGTAAGACAAATAGACGTGGTTGCGTGTCCTACACTCTGATGCATGCTTGCATATACTAGAATCTACCTCTAGTAAAGCTATGGCAGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 77327 165 + 294542 GTGAAGTAAGAACCCTGATTCCAACCATTTCTCATGACAAACCCCAGAACTATACAAACTAACTATTCCAACCGTTTCTAATAGCCAAACCTAGAATGATACACTCCTACAACAAGTAAGAAAGATAACACTATGCCAATGGTTTTAGATGACAAGTACTTCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223128 165 + 636262 GTGAAGTAAGAACCCTCATTCCAACCATTTCTCATGACAAACCCCAGAACTATACAAACCGACTATTCCAACCGTTTCTGATAGCCAAACTTAGAATGACACACCCCTACAACAAGTAAGAAAGATAACACAATGCCAATGGTTTTAGATAACAAGTACTTGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 213927 165 + 647215 GTGAAGTAGGAATCCTGATTCCAACCATTTCTCATGACAAGCCCCAGAATTATACAAACTAAGTATTCCAACCATTTCTAATAGTCAAGCCTAGAATGATATACTCCAACAACAAGTAAGAAACATAACACTATGCCAATGGTTTTAAATGACAAATACTTCTGG + +a +s mr.mrrefChr5 77492 206 + 294542 ACAACATGCCCCCAAATCAAACATAACCAGATGAGACGGGGAATAAAATAACTTGAGATTGTAGATGATAGCCTCATTTATCCATCATGAGGGTTCAATTGATGCTAGTACAGTGTACGGGACTAACGTAACCTCAGATGGCCAAGCATCCAAAAAGTATATTAATTGGCATGCAGTTCAATAGGGTAACAACATGTGCACATCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223296 205 + 636262 AAAACGTGCCCCCAAATCAAACATAATCAGATGAGGCGGGGAATAAAATAACTTGAGATTGTAGATGATAACCTCATTTATTCATCATGATGGTTC-ATTAATGCTAGCACAGTGTACGGGACTAACGTAACCTCAGATAGCCAAGCATCCAAAAAGTATATTAATTGGCATGCAGTTCAATAGGGTAACAACATGTGCACATCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 214092 206 + 647215 ACAACATGCCCCCAAATCAAACATAACCAGATGAGATGGGGAACGAAATAACTTGAGATCCTGGATGATAGCCTCATTTATCCGCCATGAGTGTTCAATTGATGCCAGTACAGTTTGCAGGACTAATATAACCTCAGATGGCCAAGCATCCAAAAAGTATATTAATTGGCATAGAGTTCAATAGGGTAACAACATGTGCACATCTC + +a +s mr.mrrefChr5 77698 149 + 294542 TGCTCAGGGCATGACAAGGAAATAATTGTTGCACTATGTGGCATTCATTGGTGCAAGGCATATTATGTTAAGGTGGCTTCCAAAAACTTAACACTCAGATAGGACTTGATTTCTAATTAGATTCAGTCCAGCTTAGTGTGGGAGTTCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223501 149 + 636262 TGCTCAGGGCATGACGAGGAAATAATTGTTGCACTATGTGGCATTCATTGGTGCGAGGCATATCATGTTAAGGTGGCTTCCAAAAACTTAACACGCAGATAGGACTTGATTTCTAATTAGATTCAGTCCAGCTTAACGTGGAAGTTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 214309 148 + 647215 TATTTGGAGCATGACAAGGAAATAATTGTTGCATTCTGTGGCATTCATTTGTGCAAGGCATATTATGTTAAGGTGGCTTCCAAAAAC-TAACACTCATATAGGACTTGATTTCTAATTTGATTTGGTCCAGCTCAGTGTGGGAGTTCTT + +a +s mr.mrrefChr5 77847 79 + 294542 GATTGATAGAGGCACAGGGACATGAAATGCTGTTCATTCAATTTAATCTACTGATTCAAGCATGTTTAGTCCAAGAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223657 79 + 636262 GATTGATAGAGGCACAGGGACATGAAATGCCATTCATTCAATTTAATCTACTGATTCAAGCATGTTTAGTCTGGGAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 214457 78 + 647215 GATTGACAGAGGCACAGGGACATGAAATGCTGTCCATTCAATCTGAG-TACTGATTCAAGCATGTTCAGTCCAAGGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 77926 202 + 294542 TTACAATAACCAATATAGATCTTTTTTTACTAACTATTCTAGTAAAAAGCATACTTACACATGTTGATGCTGCTTAACCATCTATATCCCCTGCACGCTTCAGCAGTCTAATACCCCTCCGAATTTCAATGTCCAAGGCACCTTGGGCTGACTGAATGAATTGTTAATCATCTAAATATTTATTGAACCTAATCCACTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223736 202 + 636262 TTACAATAACGAATATAGATCTTTTTTTACTAACTATTCTAGTGAAAAGCATACTTACACATGTTGGTGCTGCTTAACCATCTATATCCATTGCACGCTTCAGCAGTCTAATACCCCTCCGAATTTCAATGTCCAAGGCACCTCAGGCTGACTGAATGAGTTGTTAATCATCTAAATATTTATTGAACCTATTCCACTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 214544 198 + 647215 TTACAATACCCAATATAGATCTTTTTTGACTAACTATTCTAGTAAAAAGCATACTTACACATGGTGATACTGCATAACCATCTATGTCCCCTACATGCTCCATCAGTCTGAAACCCCTCCGAATTTCAATGTCCATGGCACCTTGGGCAGACTGAATGAATCATTAATCATCTCAATATTT----AACTTAATCCACTGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 78128 77 + 294542 TTTTGAGCTTTAGCCATGTAAAGTTGGGTGTAGTGTCATTATAACACAGGGATACCAAGATGCATTTTGTCGTTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 223953 77 + 636262 TTTTGAGCTTTAGCCATGTAAAGTTGGGTGTAGTGTCATTATAACACAGTGATACCAAGATGCATATTGCCGTTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 214742 77 + 647215 TTTTAAGCCTTAGCCATGTAAAGTTGGGTGTAGTGTCATTATAACGCAGGAACACCAAGGTGCATTTTGTTGTTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 78205 131 + 294542 GCATGATATCGGATGATCAAAATAAGGAGTAGTGCATGACAGACTACTAATCCTTAAGAGATGTTGTCTTATTGTTGTTTAGATTTCATCAAGTGCCTTTGAAAGATAATAACGGAAGAACCATGAAAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224033 131 + 636262 GCATGATGTGGGATGATCAAAATAAGGAGTAGTGCATGACAGACTACTAATCCTTAAGAGATGTTGTCTTATTGTTGTTTAGATTTCATCAAGTGCCTTTGAAAGGCAATAACGGTAGAGCAACGAAAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 214819 112 + 647215 GCATTATATCTGATGATC-AAATAAGGAGTAGTGC------------------TTGAGACATGTTGTCTTATCATTGTTTAGATTTTGCAAAGTGCTTTTGAAAGATAAACATGGAAGAACCATGAAAGAC + +a +s mr.mrrefChr5 78336 142 + 294542 ACCAGAGCACTTGGGGTAAATTAAGACAAGAATATGTGAACAATACAACTCACTATCTAGCTGGACCCCCCTATGGCCTGTGGCTTTTGTTAGTTTAGCTAGCAAAGATCTATACAAAGACAGCAATCACTAAACATATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224164 142 + 636262 ACCAGAGCACTTGGGGTAAATTAAGACAAGAATATGTGAACAATACAACTCGCTGTCTACCTGGACCCCCCTATGGCCTGTGGCTTTTGTTAGTTTAGCTAGCAAAGATCTATACAAAGACAGCAATCACTAAACTTATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 214958 142 + 647215 AACAGAGCACTTGGAGTAAATGAGAACAAGAACATGTGAACAATACAACTCACTATCTCGCTGGACCCCCCTATGCCCTGTGGCTTTTGTTAATTTAGCCAGCAGTGATCTATACAAAGATGGCAAACACTAAACATATGTT + +a +s mr.mrrefChr5 78478 48 + 294542 GGGAACCAGTTAGGATAAGCATAAGCTTTCTAGTTGATAATCTGCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224307 43 + 636262 GGGAACCAGTTAGGA-----ATGAGCTTTCTAATTGATAATCTGCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 215100 48 + 647215 GGGAACCAGTTAGGATAAGCTTAAGCTTTCTAGATTTTAATCTGCCGT + +a +s mr.mrrefChr5 78526 28 + 294542 TTTGCAGGGCAACTGTGAGTATCCTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224351 28 + 636262 TTTGCAGGGCAACTGTGAGTATCCTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 215148 28 + 647215 TTTGCAGGGCAACTGTGAGTATCCTCTA + +a +s mr.mrrefChr5 78554 189 + 294542 CCAATCCTTGTTCTAAGTTTTATTCAAACATTGTCTTCTTGGAGAgcagggtgtgcaactgcgtgaggactcacactggcagggtaacagaatatgtactttggacaagtgctgcaactggacctacccccctcaaactattcagtactctgtgtgatgtttttgagaaattaatgtgctcaacaaaca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224379 189 + 636262 CCAATCCTTGTTCTAAGTTTTATCCAAGCATTGTCTTCTTGGAgagcagggtgtgcaactgcgtgaggactcacactggcagggtaacagaatatgtactttggacaagtgctgcaactggacctacccccctcaaactattcagtactctgtgtgatgtttttgagaaattaatgtgctcaacaaaca +s simRat_chr6.simRat.chr6 215182 189 + 647215 CCAATCCTTGTTCTAAGTTTTGTTCAAACATTGCCTTCTTGGAACGCAGGGTGTGCAACTGAGTGAGGAGCCACGCTGGCAGCATAACAGGATGCGTACGTTGAACAAGGGCTGCAAGAGGGTCTATccccctcaagctattcagtaatctgtgtgatgtttctatgaaatcaatgtgcccaactcaca + +a +s mr.mrrefChr5 78743 147 + 294542 acagaagaataaccaacaaatgattcaaagaatgactggatccccttctatggttgacctggtgtgcagtaggctcttaggaacacagtttgcacaatacaggtacctacataataggatttgcagccctgccttgaaactaataag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224568 147 + 636262 acagaagaataaccaacaaatgattcaaagaatgactggatccccttctatggttgacctggtgtgcagtaggctcttaggaacacagtttgcacaatacaggtacctacataataggatttgcagccctgccttgaaactaataag +s simRat_chr6.simRat.chr6 215380 147 + 647215 acaacagagtaaccaacaaatgattcaaagaatagatggatcaccttctatggttcacctagagggaagttagttcttaggaacacagcttgcacaatacagggaccaacatactaagatttgcaaccctctcttgagattaataag + +a +s mr.mrrefChr5 78890 38 + 294542 acacaagctaatatgcagatttagcaggaccaccaaca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224715 38 + 636262 acacaagctaatatgcagatttagcaggaccaccaaca +s simRat_chr6.simRat.chr6 215669 38 + 647215 acacaagctaatatgcagatttagcacgaccaccaaca + +a +s mr.mrrefChr5 78928 10 + 294542 acaccaatgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224753 10 + 636262 acaccaatgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 215709 10 + 647215 acactgatgg + +a +s mr.mrrefChr5 78938 100 + 294542 cgtaaaaaaaccactgtcaaattagcctggaatcaaaaaagagaacctatggcaaacttagttctaggtaaaaaaaattgagctggttggatcatgttgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224763 100 + 636262 cgtaaaaaaaccactgtcaaattagcctggaatcaaaaaagagaacctatggcaaacttagttctaggtaaaaaaaattgagctggttggatcatgttgc +s simRat_chr6.simRat.chr6 215722 100 + 647215 tgcaaaaaagccactgtcaaatcagcctggaaacaaaaaagagaacccatggcaaaattaattctatgtaaaagaaattgagctggtgggaccatgttgc + +a +s mr.mrrefChr5 79038 15 + 294542 AGattacaatcaatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224863 15 + 636262 AGattacaatcaatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 215828 15 + 647215 ACATTACAATCAATG + +a +s mr.mrrefChr5 79053 77 + 294542 ttcatataggtaggggccaaggattcactagttgatagtggtgttggaggaactggttgtctatcttccaagagcta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224879 77 + 636262 ttcatataggtaggggccaaggattcactagttgatagtggtgttggaggaactggttgtctatcttccaagagcta +s simRat_chr6.simRat.chr6 215843 77 + 647215 TTCGTATAGGTGGgggccaagaattcactatttgatagcagtgttggaggaactggttgtctatctagcaagaggta + +a +s mr.mrrefChr5 79130 23 + 294542 ttcttagtgccttatacaggttt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224956 23 + 636262 ttcttagtgccttatacaggttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 215932 23 + 647215 ttcttaatgctttatacaggttt + +a +s mr.mrrefChr5 79153 112 + 294542 agaaaagggtctaaatgttagtggatgatcccagaaacactgtccaagatattggcatgggacaacatctatttagataccaaagtcaactgctgtgaattgcaaaatcgat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224979 112 + 636262 agaaaagggtctaaatgttagtggatgatcccagaaacactgtccaagatattggcatgggacaacatctatttagataccaaagtcaactgctgtgaattgcaaaatcgat +s simRat_chr6.simRat.chr6 215970 112 + 647215 AAAGAGAAGACTAAACCTTCGCGGATGATCtcagaaacaccatctgggatattggcatagaagaacatctgtttagtcaccaaagtcaactgcagctaaactcaaaatcgat + +a +s mr.mrrefChr5 79265 21 + 294542 gagcacaagtgagatatggac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225091 21 + 636262 gagcacaagtgagatatggac +s simRat_chr6.simRat.chr6 216089 21 + 647215 gagcacaactgagacataaac + +a +s mr.mrrefChr5 79286 24 + 294542 aagagcctgcatggattgaaagaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225118 24 + 636262 aagagcctgcatggattgaaagaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 216110 24 + 647215 aaaagcctgagtggattgatagaa + +a +s mr.mrrefChr5 79310 9 + 294542 tggttacaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225152 9 + 636262 tggttacaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 216134 9 + 647215 TGGTTAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 79319 116 + 294542 atttgaacttggcatgagatctttccaacttattcctctcacacagttacacaaaaggaaaaccaataacaggattaaatgataggttagggacatgaacaggtgctaactggcaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225172 116 + 636262 atttgaacttggcatgagatctttccaacttattcctctcacacagttacacaaaaggaaaaccaataacaggattaaatgataggttagggacatgaacaggtgctaactggcaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 216143 116 + 647215 ATTTAAATTTGGAATGAGAGCTTTGCAACTTATTCCTctcacacaattacccaagaagaagaccaataacatgaacaaatgatgggctcgggacatgaacaggcactaactggcaa + +a +s mr.mrrefChr5 79435 12 + 294542 ttgcagtgaaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225297 12 + 636262 ttgcagtgaaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 216259 12 + 647215 ttgtggcgaaaa + +a +s mr.mrrefChr5 79447 96 + 294542 agcaccagaggaaatgtaattttccttgaacagtttgtcacaggtctattgcatggggagtcatggtagaacaatgccactatgatgcACTACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225309 96 + 636262 agcaccagaggaaatgtaattttccttgaacagtttgtcacaggtctattgcatggggagtcatggtagaacaatgccactatgatgcACTACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 216276 96 + 647215 agcaccagaggaaatgtaatttttcttgaACAGTTCGTCACAGATCTATTGCATGGGGCGTCATGGTAGAACAATGCCACTATGATGCACTATAAT + +a +s mr.mrrefChr5 79543 15 + 294542 ATAAAGTAGACGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225405 15 + 636262 ATAAAGTAGACGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 216374 15 + 647215 GTAAAGTAGGCGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 79558 49 + 294542 GGGTGCACTCCAGGAAGGCGTTTTCCTGGTCCCAAAGCCACAAACAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225424 49 + 636262 GGGTGCACTCCAGGAAGGCGTTTTCCTGGTCCCAAAGCCACAAACAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 216389 49 + 647215 GGGCGTGCTGCAGGAAGGCCTTTTCCTGGTCCCGAGGCCACAAATAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 79607 90 + 294542 TTTTATGCAACAATACTGGACAACACTATTTTGAGACATAATAGAACGGGTGAACACACTAGGCTGTATATGCAGGAAGCCAACAGTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225473 90 + 636262 TTTTATGCAACAATACTGGACAACACTATTTTGAGACATAATAGAACGGGTGAACACACTAGGCTGTATATGCAGGAAGCCAACAGTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 216439 90 + 647215 TTTTATGCGACAATACTGGATAAGACTATTTTGAGACATAATAGAAGGGGTGAACAAATCAGGCTGTATTTGCGCAAAGCCAACAAACCA + +a +s mr.mrrefChr5 79697 59 + 294542 GCAGTACTTCCTAGGCTGCCAACCAACCGATGCCTGTTAGAAATCCGACTAGTCCCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225564 59 + 636262 GCAGTACTTCCTAGGCTGCCAACCAACCGATGCCTGTTAGAAATCCGACTAGTCCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 216529 59 + 647215 GTGGTACTTTCTAGGCTGCCAACTAACCAATGCCTGTGAGAAATCCAACTAGTCCCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 79756 118 + 294542 GCTCAGGGAGGTAGGTGAGTATCTTCGCTCATAGTTGTGCTCAGCATGATGATGTAGGACTATAGTAAATAAGAAATCACATAAACCTTTTCATAATTCTAGTACATGAGAAGACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225624 118 + 636262 GCTCAGGGAGGTAGGTGAGTATCTTCGCTCATAGTTGTGCTCAGCATGATGATGTAGGACTATAGTAAATAAGAAATCACATAAACCTTTTCATAATTCTAGTACATGAGAAGACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 216588 118 + 647215 GCTCAGGGAGGCAGGCAAGAATTTTGGCTAATAGTTGTGCTCGGTATGATGATGCAGGACTATAGTAAATAAGATATCACATAAACCTTGCCATAATTCTAGTACATGAGAAGACACA + +a +s mr.mrrefChr5 79874 11 + 294542 AAGAGTGGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225748 11 + 636262 AAGAGTGGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 216706 11 + 647215 AAGAGTGTGAG + +a +s mr.mrrefChr5 79885 161 + 294542 ATGGAGCCCCAAAGAATGTTGGTTACAAATATCGTGCGATGGATGGCATCCCATTTGTTTTATCGGGTAATGTGTGTTGGTCCCATCAACAGGTGCCTGTGGTCACCTAACATTGTATGAGGCCAGCATGCTCTTTCTACAGGTGTCTCAGATTACTTGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225763 161 + 636262 ATGGAGCCCCAAAGAATGTTGGTTACAAATATCGTGCGATGGATGGCATCCCATTTGTTTTATCGGGTAATGTGTGTTGGTCCCATCAACAGGTGCCTGTGGTCACCTAACATTGTATGAGGCCAGCATGCTCTTTCTACAGGTGTCTCAGATTACTTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 216717 161 + 647215 ATGGAGCCCCAAAAAATATTCGTTACAAGTGTCAAGTGATGGATAGCATACCACTTGTTTTATGGGGTAATGTGTTTTGGGCCTACCAACAGGTGACTGTGGTTGCCTGCCAGTGTGTGAGGCCAGCTTGCTCTTTCTACAGGTGTCTCCAATTGCTTGAC + +a +s mr.mrrefChr5 80046 52 + 294542 GGCATGGGAGGTCAGGCAAGCTCAGCAACTAATTGAGCACATAACACGTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225925 45 + 636262 GGCATGGGAGGTCAGGCAAGCTCAGCAACTAATTGAGCACAT-------TTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 216878 52 + 647215 AGTAAAAGGTGTCAGGCAAGCTCAGCAGCCAAATGAGCACATAACACGTTTG + +a +s mr.mrrefChr5 80098 238 + 294542 TATTAATGGAGCTTTCCACAAGGTGCTGTTTTAATTCTCAACATTGTTAAGCAAGTGATCCTGAGTGATACAGAATGGTCTCTATTATGGTTTTATCCTTGAGGAACCTGTTCCTGGATAAAACATTGATCCTGATCTTAAGTGCAAGCTCTGTTACGAGTTGCTAGAGTTGGGTAGCTAAGGAATCACCTCAATTTGGATTGGTTGGGAAAACGTCTTGGTTATGAAGATTGGTCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225970 238 + 636262 TATTATTGGAGATTTCCACAAGGTGCTGTTTGAAATCTCAACATTGTTAAGTGAGTGATCCTTAGTGATACAGAATGGGCTCAATTATGGTTTTATCCTTGAGGAACCTGTTCCTGGATAAAACATTGATCCTGATCTTAAGTGCAAGCTCTCTTACGAGTTGCTAGAGTTGGGTAGTTAAGGAATCACCTCAATTTGGATTGGTTGGGAAAATGTCTTGGTTATGAAGATGGGTCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 216932 238 + 647215 TTTTAATGGAGCTTTGCACAGGGTGCCGTTTTAATTCCCAACATTGTTACGCAATTGATCCTGCATGACACAGAAAGGTTTCTAATACGATTTTATTCTTGAGAAACCTGTTCCTGGATAGCACAGTGATCCGGATCTTGAGTACATGCTCTGTTTCAAGTTGCTAGAGTTGGATAGCTAAGGAATCACCTCAATTCGGATTGGTTGAGGAAACATCTTGGTTATGAAGCTTGGTCCC + +a +s mr.mrrefChr5 80336 90 + 294542 GCAGCATGTATGTATGAATTGTAGAAAACCATTAACAAATAAATGATCATAACTTTCTCAAGAATTTGCATAGTGCTAATTAGTGTAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 226209 84 + 636262 GCACCATGTATGTATGAATTGTAG-ATACCATTAACAAA-----AATCATGGCTTTCTCAAGAATTTGCATAGTGCCAATTAGTGTAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 217170 90 + 647215 TCAGTGCGGATGTATGAATTGTAGAAAACCATTAACAAGTAAATGATCATAACTTTCTCTAGATTTTGCATAGTGCTAATTAGTGCAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 80426 73 + 294542 TAACTCAAGATATGACACATCTTTTTATTCATTTACTGTCAAAAAGTTGAGTTACTGCGGTCACACCTTTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 226293 73 + 636262 TAACCCAAGATATGACACGTCTTCTTATTCACTTACTGTCAAAAAGTTGAGTTACTGCGGTTACACCTTTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 217262 68 + 647215 TAACTCAGTATATGACACATCTTTCTATTCGTTTACC-----AAAGTTGAGCTACTGTGGTCACACCTTTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 80499 242 + 294542 TGTTTAACCCACAAATAGCTAAAGGAGACAAACATTTGCTACTTGCAAACAACAATTAGACAAATATGCTGGGAACCCAAAGAGGTAGGCCAAAAGGAGATAGAGCTGAGAAGTGGCTATCAGGAGCATCATTAAAACAGGATCTTGGTTGCAGGTCACTTACTTGCACTAAAGAACAGTGTGCATAATTTGCGCGTGCCTGTAGAGCTAAATTCCAATGTGTAGTATCAAATATGAAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 226366 170 + 636262 TGTCTAACCCACAAATAGCTGAAGGAGACAAACATTTGCTACTTGCAAACAACAATTAGACAAATATGCTGGGAACCCA-----GTAGGCCAAAAGGAGATAGATCTGAGAAGTGACTATCAGGAGCG-------------------------------------------------------------------GTGCCTGTAGAGCTAAATTCCAATTTGTAGTACCAAACATGAAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 217333 242 + 647215 CATTTAATCCACAAATAGCTAAAGGAAACAAACATTTGCTACTTGCAAACAAGAGTTAGACAAATATGTTGGAAACCCAAAGAGGTAGGCTAAAAGGAGATAGAGCTGAGAAGTGGCTATCAGGGGCATCATTAAAACAGGATCTTGGTTGCAGGTCACTTACTTGCACTAAAGAACAGTGTGCATAATTTGCGCGTGCCTGTAGATCTAAATTACGATGTGTAGTATCAAATATGAAGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 80741 524 + 294542 TGTCAGCAATAGGAACTGAAAATACAAGAATTTTATTGGTTGCATTCATCACCATTAATCCTGTACTCATTATCAATGAGGCTTTAAGAGAAAATAATAGAGTGAAGCATGATATTACACTTGGGAGGAGTGACACTCTGTTGAAGATAGAGATAGATAGTTCTAATCTTGCAGCATTCTGTAATAGGCACATAGTATCCAGTACCCATCCCAACCATTGGGCCAATACACCCCAAAAACTGACAGAAGCTTGAAATTAGCAAGACCTACTGGACAAAGCTCCACTGGGGGGGCATAAGGTGGAGTGCGGTGCATCTTCAACCTGCTTGTTTTACAGTGTATTCACCAACATTTAGATGTGCTGAATATAGCCTACAGAGATTAATTTTAAGCTATACCATGGAGTAGCCAACTCTATTTTAGATGCCAAATTATAAATTAAGACTAACACTTGGTGGCCTGGAAGTGAACACAGGACGCTTTTAATGGTTCGCAAATATTATGGCCATCTTGTGCTTGTCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 226536 508 + 636262 TGTTCACAATAGGAACTGAAAATACAAGAATCTTATTGGTTGCATTCATTACCATTAATCCTGTACTCATTATCAATGAGGCTTTAAGGGAAAATAATAGAGTGAAGCATGATATTACACTTGGGAGGAGTGACACTCTGTTGAAGATAGAGATAGATAGTTCTAATCTTGCAGCATTCTGTAATAGGCACATAGTATCCATTACCCATCCCAACCTATGGGCCAATACACGGCAAAAACTGAAAGAAGCTTGAAGTTAGCAAGACCTACTGGACAAAGCTCCACTGAGGGGGCATAAGGTGGAGTGCGGTGCATCTACAACCTGCTTGTTTTACAGTGTA-----------TCAGATGTACTGAATATAGCCTACAGAGATTAATTTTAAGCTATACCATGGAGTACCCAACTCTATTTTAGATGCCAAATTAT--ATTAAGACTAACACTTGGTGGCCTGGAAGTGAACACAGGACGCTTGTAATAGTTCG---ATATTATGGCCATCTTGTGCTTGTCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 217582 524 + 647215 TGTCAGCAATAGGAACTGAAAATACAAGAATTTTATTGGTGGTATTGATCACCATTAATCCTGTACTCATTATCATTGAGGTTTTAAGAGAGGAGTATTAAGTGAAGCATGATATTTCACTTGGGCTGAGTGACACTCTGCTGAAGATAGAGATTGATAATTCGAATCTTGGAGCATTCTGTAATAGGCATGTAGTCTCCAGTTCCCATCCCAACCATCGGACCCATACACCCCAAAAACTGGCAGAAGCTTGAAATTAGCAAGACCTACTGGACAAAGCTCCACTGGGGGGATAGAAGGTGGAGTGTGGTGCATCTTAGACCTGCTCGTTTTACAGTATATTCACCAACATTTAGATGTGCTGAACATAGCCCACAGAGATTAATTTTAAGCTATGCCATGGAGTAGCCACCTCTATTTTAGATGCCAAATTATAAATTATGACTATTGTTTGGTAGCCTGGAATAGAACACAGGAGGCCTTTAGTGATTAGCAAACATTATGCACATCTTGTGCCAGTCACC + +a +s mr.mrrefChr5 81265 258 + 294542 AAAGTACCCGCATTTATACCTATGATCTAGTGTATATGTCATTGGAATCCTAAAAGAACACCACAGGAGTCAGTATATGTTGGTTAGAACAGATAGTAGTAATTAAATCAGTGACTGTCCTGCATAACCAATGCATCTCAATTCATAGTTTAAGGCAACAGTAGGTTAGTATCTTCACCTACACTGAAGAGAAAACAGACATGTACATGCACATGGCCCTGTCTAAGGTTCATGTCTCTATGGAGTAAGGAGAGACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227046 258 + 636262 AAAGTACCCACATTTATACCTATGATCTAGTGTATATGTCATTGGAATCCTAAAAGAACGCCACAAGAATCAGTATGTGTTGGTTAGAACAGATAGTAGTAATTGAATCAGTGACTGTCCTGCATAACCAATGCATCTCAATTCATATTTTAAGGCAACAGTAGGTTAGTATCTTTACCTACACTGAAGAGAAAACAGACATGTACATGCATATGGCCCTTTCTAAGATTCATGTCTCTATGTAGTAAGGATAGACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 218106 258 + 647215 AAAGGACCCGCATTTATACCTATGATCTAGTGTATATGTCACTGTAATCCTAAAAGAACACCACAGGAGTCAGTATATGTTGGTTAGAACAGATAGTAGTAATTAAATGAGTGATCATCCAGCATAACCAATGCATCTCAATTTATAGTCTAAGGTAATAGTAGGTTAGTATCGCCACCTACACTGAAGAGAAAACAGACATGTACATGCACATGGCCCTGTCTAAGGTTCATGTCTTTATGGAGTAAGGAGAGTCCT + +a +s mr.mrrefChr5 81523 51 + 294542 TGAAGTAGCAGAACAAGTCTGACTCTTTTGCTGTTCTATTGTGCATCTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227304 51 + 636262 TGAAGTAGCAGAACAAGTCTGACTCTTTTGCTGTTCTATTGTGCATCTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 218365 51 + 647215 TGAAGTATCAGAACAAGTCTGGCTCTTTTGCTGTTTCGTTGTGCATGCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 81574 12 + 294542 TTAAATAGTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227385 12 + 636262 TTAAATAGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 218416 12 + 647215 TAAACCAGTATT + +a +s mr.mrrefChr5 81586 16 + 294542 GGGCTGGGAGAAGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227398 16 + 636262 GGGCTGGGAGAAGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 218428 16 + 647215 GGGCTGGGAAAAGGCT + +a +s mr.mrrefChr5 81602 52 + 294542 GGTCAGCTAAAAAAGCGAACCAAGTAAGGGGGACCATTTACAGGGGTTGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227414 52 + 636262 GGTCAGCTAAAAAAGCGAACCAAGTAAGGGGGACCATTTACAGGGGTTGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 218451 52 + 647215 GGTCAGCTAAAAAAACCAACCAAGTAAGTGAGAGTATTTACGGGGATTGATG + +a +s mr.mrrefChr5 81654 18 + 294542 ACTATTGATATCATGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227466 18 + 636262 ACTATTGATATCATGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 218505 18 + 647215 ACCATTGAGATTATGGAC + +a +s mr.mrrefChr5 81672 11 + 294542 TGGTGTCTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227507 11 + 636262 TGGTGTCTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 218523 11 + 647215 TGGTGTCTGAG + +a +s mr.mrrefChr5 81683 22 + 294542 AGGCAGGATTAGAAATTATCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227524 22 + 636262 AGGCAGGATTAGAAATTATCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 218534 22 + 647215 AGGCAGTATTAGCGAATATCCT + +a +s mr.mrrefChr5 81705 37 + 294542 TCACAATTGAGATCATGATGTCACTTTTGAATCCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227546 37 + 636262 TCACAATTGAGATCATGATGTCACTTTTGAATCCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 218561 37 + 647215 CCACCATTTACGTCATGGTGTAGCTTTTGAATCCTAA + +a +s mr.mrrefChr5 81742 57 + 294542 ATCCAGATGTCACCCTGTTAGTGAATATGGTATTACAATATGGTATTATGTAAGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227589 44 + 636262 ATCCAGATGCCACCCTGTTAGT-------------CAATATGGTATTATGTAAGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 218598 57 + 647215 ATCCAGATGTCACCCTGTTAGTGAATATGGTATTATAATATGGTATTATGTAAGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 81799 112 + 294542 GAGTCCCTGTTCAATCCCTCACACTCATTCTACCATGAGTGAAAGTATATACTATTGTAGCAACATGTGTAAACATTGGGGCACTATTGAGAGTATGGCAATGTCCATACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227633 112 + 636262 GAGTACTTGCTCAATCCCTCACACTCATTCTACCATGTGTGAAAGTATATACTATTGTAGCAACATGTGTAAACATTGGGGCACTATTGAGAGTATGGCAATGTCCATACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 218673 111 + 647215 GAGTCCCTGTTCAATCCCTCACACTCGTCCTACCATGAGCGAAAGTATATACTATTGTGGCAAAATGTATAAACATTGAGGCGC-ATTGTGAGTATGGCAATGTCCATACAG + +a +s mr.mrrefChr5 81911 177 + 294542 GTCATTATTTAGGGTCGCTTCAGGTTCAAAAATACATGGGGCTGAACATTGAAATTATAGTTCCATTATGGAGGGTCCATATGTTAATAATCCCCATACAGAAAATTAGAAATAATATTAGAAATGTCAAACTATGCTTATATACATTGCATGTGCTGTGTGGATAGATATTCCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227765 177 + 636262 GTCATTATTTAGGGTGGCTTCAGGTTCAGAAATACATGGGGCTGAACATTGAAATTATCGTTCCATTATGGAGGGTTCATATGTTAATAATCACCATACAGAAAATTAGAAATAATATTAGAAATGACAAACGGTGCCTATATATACTGCATGTGCTGTGTGGATAGATACTCCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 218784 177 + 647215 GTCACTATTGAGGGGCGCTTCAGGTTCAAAAATACATGGGGCTGTACATTGAAACTATAGTTTCATTGTGGAGGGTCCATATGTAGATAATCCCCATACAGAATATCATAGATGATATTAGCAATGTCAAATTATGCTGATGTACATTGCATATGATGTGTGGTTAGATCTTCCAGC + +a +s mr.mrrefChr5 82088 59 + 294542 CTTTATAATATTCTGTCTGTAGTGGAGTTATCAACATGTCAAGCATCTTCCTGGTGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 227953 59 + 636262 CTTTATAATATTCTTTCTGTAGTGGAGTTATCAACACGTCAAGCATCTTCCTGGTGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 218961 57 + 647215 CCTTATAATATTCTGTCTGTAGTCGAGTTAT--ACATGTCAAGCATTTTCATGGTGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 82147 329 + 294542 TAGAGTAGCTTAGGTCTTGGTCATTTTGTGGGTCAATATGCTCTAGAGTGTATATGGATCCAATTTAGCTGGGTCCTAATTTGTGGGCAAGACAGCTGTTTTAACAGTCCTACTTACCGATGGCTATCTTTAGCAATGAGGTCATATTGAGTGTAGTCATAGCTCATGCTATTAGTTGTTGGCGATCACCTTAGACCCCATTGATCTAAACACAGTCAACCCCTACTAGGTTTCGTACTTTTTGAGAGTAGACCTTATGAGAGCAGAGGTAAGAATGACTATAACCAAGGGCCCTTATTTTTCCAGGAGGGAGTAGTATAACATAGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228012 325 + 636262 TAGAGTAGCTTAGGTCTTGGTCATTTTGCGGGTCAATATGCTCTAGAGTGTATATGGATCCAATTTAGCTGGGTCCTAATTTGT-GACAAGACAGCTGTTTTAACAGTCCTACTTACTGATGGCTATCTTTAGCAATGAGGTCATATTGAGTGTAGTCATAGCTCATGCTATTAGTTGTTCGTGATCATCTTAGAGCCCACTGATC-AAACACAATCAACCCCTACTAGGTTTCGTACTTTTTGAGAGTAGACCTTATGAGAGCTGAGGTAAGA--GACTATAACCAAGGGCCATTATTTTTCCAGGAGGGAGTAGCATAACATAGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 219058 329 + 647215 TAGAGTAGCTTAGGTCTTGGTTGTTTTGTGGGTCAATATGCTCTAGAGTGTATATGGATCCAACTTAGCTGGGTCCTAATGTGTGGGCAAGACAGCCGTTTTAAAAGTCCAACTTACCGAGGCTTATCTTTAGCAATGAGGCCATATTGCGTGTAGTCACGGCTCATGCTATCAGTTGTTGGCGACCACCTTAGACCCCATTGATCTAAACATGGTCAACCCGTACTAGGTTTCGTACTTTATGAGAGTAGACTTTATGGGAGCAGAAGCAACAATGATTCTGACCAAGGGCCCTTACTTTCCCAGGAGGGAGTAGTGTAACATAACTC + +a +s mr.mrrefChr5 82476 34 + 294542 AAAACCCAAGCTTAATCCAAGTCCCCAGGCTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228337 31 + 636262 AAAACACAAGCTTAATCTAAG---TCAGGCTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 219388 34 + 647215 AAAACCCAAACTTAACCCAAGTCCCAAGTCTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 82510 135 + 294542 CTCTGTTTGACAACATGCTATGCAGTCACACTGTTCAGCTGCTGCTATTTTCTGATTCAATACTCTTCTGAGTGTTTGTTTCATAAGCGCCACATTCTGCACACCACACAATCGAATAATAATTTACTTGCTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228368 131 + 636262 CTCTGTTTGACAACATGCTATGCAGGCACATTGTTCAGCTGCTGCTATTTTCTGATACAATATTGTTCTGAGTGCTAGTTTTAT----GCTACATTCTGCACACCACACAATCGAATCATAATATACTTGCTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 219426 135 + 647215 CTCTGTTTGACAACATGCTATGCAGTCACACTGTTCAGCTGCTGATATTTTCTGGTTCAAAACTCTTCTGAGTATTTGTTTCATAAGCGCCACATTCTGCACATCACACAATTGAATAATAATTGACTTGAACTC + +a +s mr.mrrefChr5 82645 94 + 294542 TGGAGCCGTCTTGATCCTCTGTGCCATATTTGTTTTAAACACTTCTGGTTTGGTCCAGTGTGGGATCTAGCCAACTAATTGTTGACTACATGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228499 94 + 636262 TGGAGCCGGCTTGATCCTCTGTGCTAAATTTGTTTTAAACACTTCTGGTTAGGTCCAGTGTGGGATCTAGCCAACTAATTGTTGACTACATGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 219782 94 + 647215 TGGAGACGTCTTCATCCTCTGTGCCATATTTGTTTTAAACACTTCCGGTTTGGTCTAGTATGGGATCTAGCCAGCTAATCATTGACTACATGGA + +a +s mr.mrrefChr5 82739 27 + 294542 CTTCCTATAACATAAACCACTGTCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228600 27 + 636262 CTTCCCATAACATAAACCACTGTCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 219876 27 + 647215 CTTCCTATAACATAAACCACAATCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 82766 529 + 294542 TCTCAACTTCACAGAAGACTTAGACAGGATATTCATCCTGGGCTTCTAATTTCCCCTAGACAGTTGTCTAGACAGTATTGGGTGAAACATATTGATGGATGTATGGTCTTAGGAATATACAATACGTTCATGTCCTCTTGTGACAGCACTGATAATATGTAGGACATATAAGAAAGAGATGATCATCACTGTACTTTTACTTGCACTTTCTTACTGTAGGACATGTAAGAAAGAGTTGATCAACATTGTACTTTTACTTGCACTTTCTTATAATAGGTCCAACCAACTGGACTCAACTGAATCTTGCATTTAGAAGTAAATGTTATAACACTGTATTACCATGATTCCGTTTCAACCCATGGAAGTTCCCATGGAGGTTCCAGTACCATTGCCCTCACACTAAATTGGCTTGGTAACATTTTATCACAAAAATTTAGGTAAAAGCAAGTCACTCGAAATGGCTAATGTGGATGAAGTTCCAGTACCATTGCCCTCACATTAAAATGACTTTGTAACATTTTACCGCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 228627 458 + 636262 TCTCAACTTCATGGAAGATTTAGACAGGATATTCATATTGG--------------CTAGACTGTTGTCTAGACAGTCTTGGGTGAAACATATTGATGGATGTATGGTCTTAGGAATCTACAATACGTTCATGTCCTATTGTGACAGCAGTGATAATATGTAGGACATGTAAGAAAGAGATAATCATCA---------------------------------------------------------TTGTACTTTTACTTGCGCTTTCTTATAATAGGTCCAACCAACTGGACTCAACTGAATCTTGCCTTCAGAAAAAAATGTTATAACATGGTATTACCATGATTCCGTTTCAACCCATGGAAGATCCCATGGAGGTTCCAGTAACATTGCCCTCACGCTGAATTGGCTTGGTAACATTTTATCACAAAAATTTAGGTAAAAGCAAGTCACTCGAAATGGCTAATATGGATGAAATTCCAGAACCATTGCCCTCACATTAAAATGATTTTGTAACATTTTACTGCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 219908 518 + 647215 TCTCACCTTCACAGAAAACTTGGACAGGATACGCATCCTGGGCTTCTAATTTCCCCTAGACAGTTGTCTAGACAGTAATGGGTGAAACAAATTTGCAGATATATGGTATTAGGAATACACAATAGGTTCATGTCCTCTTGTGACAGCACTGATAATATGTAGGACATATAAGAAAGAGATGATCATCACTGTACTTTTACTTGCACTTTCTTACTGTAGGACATGTAAGAAAGAGTTGATCAACACTGTACTTTTACTTGCACTTTCTTATAATAGGTCCAACCAACTGG---CAACTGCATTTTGCATTTAGAAGTAAATGTTTTAACACTGTACTATCATGATTCC-TTTCAACCCATGGAAGTTCCCATGGAGGTTCCAGTACCATTGCCCTTGCACTAAATTG-------AACGTTTAATCACAAAAATATAGGTAAAAGCGGGTCACATTAAATGGCTAATGTGGATCAAGTTCCCGTACCATTGTCCTCACACTAAATTGACTTTATAATATTTTACCGAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 83295 57 + 294542 ATATAGGTAAAAGCAGGTCACTCTAAATGGCTAATGTGGAGAATTCTTTTCATTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229085 57 + 636262 ATATAGGTAAAAGCAGATCACTCTAACTGGCTAATGTAGAAAATTCTTTTCAATTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 220427 57 + 647215 ACATAGGTAAAGGCAGGTCAATCTAAATGGCTAATGTGGAGAATTCTTTTCATTTCC + +a +s mr.mrrefChr5 83352 92 + 294542 AGCCAATTAATTGGAACAGACATTTGTCAATCAGATTGGAAAAATGATGAACCCAAATTGACTCAGTTTGGCCAGGAGACTATGCTAGATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229217 92 + 636262 AGCCAACTAATTGGAACAGACATTTGTCAATCAGATTGGAAAAATGATGAACCTAAATTGACTCAGTTTGGCCAAGAGACGATACTAGATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 220484 92 + 647215 AGCCAATAAATTGGATCAGACATTTGTCAATCAGATTGGAAAAATGATGAACCCACATTGACTCAGCTTGGCCAGGAGACTATGCTAGATTG + +a +s mr.mrrefChr5 83444 71 + 294542 ATGGCAGCAGTACCATCTAGTCAAAAACTCCGGCTATCTCTGTGCTGACTTGGAGCATATATAATTATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229383 71 + 636262 ATGGCAGCAGTACCATCTAGTCAAAAACTCCGGCTATCTCTGTGCTGACTTGGAGCATATATAATTATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 220576 71 + 647215 ATGGCAGCAGTACCATCTAGTCAAAAACTCTGGCTATCTCTGTGGTGTCTTGGGGTATATATATTTATTCA + +a +s mr.mrrefChr5 83515 139 + 294542 GCCATCAACAGCGTGTCTTCAAAACAATTGGTGGCACTACTGGTCTTACAAGGCATCATTCTCCTTCAGGCAATGGGGTATCCCAGTTAAAGTACTCGTTGCATCCTAAGCATAAGAGCTAGAATATGATATTAGAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229459 139 + 636262 GCCATCAACAGCGTGTCTTCAAAACAATTGGTGGCACTACTGGTCTTACAAGGCATCATTCTCCTTCAGGCAATGGGGTATCCCAGTTAAAGTACTCGTTGCATCCTAAGCATAAGAGCTAGAATATGATATTAGAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 220647 139 + 647215 GCCGTCAAGAAGGCACCTTCAAAAGGATCGGTGGCACTACTGGTCTTACAAGGCATCATTCTCCTTCAGGCAATGAGGTATCCCAGTTGAAGTCCTCTTTGCAACCTCTGCATGAGAGCTTGAATATGATATTAGAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 83654 57 + 294542 TTTGGCGGTATATCAACCCTCATTGCTGAAGTCAATTTTCATTTAGATTTGGCTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229598 57 + 636262 TTTGGCGGTATATCAACCCTCATTGCTGAAGTCAATTTTCATTTAGATTTGGCTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 220787 57 + 647215 TTTGGGGGTATATTAACCTTCGTCGCAGAAGTCAATTTTCATTTAGATTTGGCTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 83711 46 + 294542 AAATGTACAGAGTCAGGTCCGGTGATAGACCTGACTTAGATAAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229656 46 + 636262 AAATGTACAGAGTCAGGTCCGGTGATAGACCTGACTTAGATAAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 220844 46 + 647215 CAATGTACAGAGTCAGGTCAGGTGATAGAACTGATTTACATAAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 83757 42 + 294542 AAAACATGCTTGTATCAACACTATGTACAGCATAAAGCTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229702 42 + 636262 AAAACATGCTTGTATCAACACTATGTACAGCATAAAGCTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 220893 42 + 647215 AAAACATGCTTGTATCAACACTATGTACGGTAGAAAGCTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 83799 29 + 294542 GCCTTTTCCTGTTTTATCCTTAAGCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229744 29 + 636262 GCCTTTTCCTGTTTTATCCTTAAGCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 220936 29 + 647215 GCCTTTTCCTGATTTATCCTCAAGCAACT + +a +s mr.mrrefChr5 83828 12 + 294542 CCTCTTGGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229774 12 + 636262 CCTCTTGGGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 220965 12 + 647215 CCTCTTGGTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 83840 47 + 294542 ACACAGGGTGTCACATCATTAATTAAAGCACACTGATGTGATGCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229791 47 + 636262 ACACAGGGTGTCACATCATTAATTAAAGCACACTGATGTGATGCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 220977 47 + 647215 ACACAGGGTGTCACATCTTTAAATAAAGCATACTGGTGGGATGTATA + +a +s mr.mrrefChr5 83887 40 + 294542 ATCTATGCTCAGGTGCCACTTTAAACATCGAACAGTAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229838 40 + 636262 ATCTATGCTCAGGTGCCACTTTAAACATCGAACAGTAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 221025 40 + 647215 ATCTATGCACAGGTGCCACTTTAAAGATCAAATGGTAACT + +a +s mr.mrrefChr5 83927 19 + 294542 CCCTATGGATTTCATACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229887 19 + 636262 CCCTATGGATTTCATACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 221065 19 + 647215 CCCTATGAATTTCATACAA + +a +s mr.mrrefChr5 83946 35 + 294542 GAATTCACAGCTCCAACAGGTTTGTAAGTCCCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229906 35 + 636262 GAATTCACAGCTCCAACAGGTTTGTAAGTCCCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 221085 35 + 647215 GAATGCGCAGCTTCAACAGGTTTGCAAGTCCCCAG + +a +s mr.mrrefChr5 83981 4 + 294542 TGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229952 4 + 636262 TGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 221120 4 + 647215 TGAG + +a +s mr.mrrefChr5 83985 28 + 294542 GTATCCACACAGAACCAAATACTGTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229958 28 + 636262 GTATCCACACAGAACCAAATACTGTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 221124 28 + 647215 GTATCCACACAAAGCCAAATACTGTCTG + +a +s mr.mrrefChr5 84013 24 + 294542 ATATCAACTTTGGGGCATTGGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 229987 24 + 636262 ATATCAACTTTGGGGCATTGGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 221152 24 + 647215 ACATCAGTGTGGACGCGTCAGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 84037 60 + 294542 cttaactaggaccctacaagtaatattacatccaaatatctacaccaagagacgatgtgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230011 60 + 636262 CTTAACTAGGACCCTACAAGTAATATTACATCCAAATATCTACACCAAGAGACGATGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 221185 60 + 647215 cttaactaggacaccacaagcaatattacatcctaatagttaaaccaagagacgatatgg + +a +s mr.mrrefChr5 84097 43 + 294542 CTCGAGTTTCAGTGTTTCAGAGAGGGCTATGTCTTGAAAGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230071 43 + 636262 CTCGAGTTTCAGTGTTTCAGAGAGGGCTATGTCTTGAAAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 221257 43 + 647215 CTCAAGTTTAAGTGTTTCAGAGAGGGCCACACATTGAAAGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 84140 109 + 294542 GATCATCAGCACACAACATATTTCGGTAGGACAGTACCAGTTGTTAGGCAGGATAATTTGAGCTTGAGGAGGTGCAAGGAAGAATATGGATAAGAAATAAGTATGTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230127 109 + 636262 GATCATCAGCACACAACATATTTCGGTAGGACAGTACCAGTTGTTAGGCAGGATAATTTGAGCTTGAGGAGGTGCAAGGAAGAATATGGATAAGAAATAAGTATGTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 221300 109 + 647215 GATTACTAGGGCATAACATATTTTGATATGACAATACTAGTTGCTAGCCAGAATTATTTGAGTTTGAGGGGGTGCAAGGAATAATATGCATGAGAAAAAAATATGTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 84249 14 + 294542 TGGGTTATAACCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230241 14 + 636262 TGGGTTATAACCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 221409 14 + 647215 TGGGTTATAACCTG + +a +s mr.mrrefChr5 84263 9 + 294542 ATTATAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230255 9 + 636262 ATTATAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 221424 9 + 647215 ATTATAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 84272 76 + 294542 GAATCGTAATTGCACAAAAAGCAATGTTTAGTCTATGAAGTTTTATGTTTGACCATGGTTCTAGTATGTACTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230264 76 + 636262 GAATCGTAATTGCACAAAAAGCAATGTTTAGTCTATGAAGTTTTATGTTTGACCATGGTTCTAGTATGTACTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 221438 76 + 647215 TAGTCATAATAGCACAGAAAGCTATGTTTAGTCTATGCAATATTATGTTGCACCATGGTTCTAGTAAGTACTAACA + +a +s mr.mrrefChr5 84348 107 + 294542 CGGCAGCACTTCAGCACCTTAACTTGTCTTTTATTGATAGTTTATTTTAAACCTAGTCTGGATTTGTCACATAGTTGAGTTCTTGGTGTAAAATCGCAACTGCTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230340 107 + 636262 CGGCAGCACTTCAGCACCTTAACTTGTCTTTTATTGATAGTTTATTTTAAACCTAGTCTGGATTTGTCACATAGTTGAGTTCTTGGTGTAAAATCGCAACTGCTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 221517 107 + 647215 TGACAGCACTTCAGCATATTAACTTGTCTTTTATTGATAGCTTATTTTAAACCTAGTCTGTATTTGTCATATAGTTGGGTTCTTGATGTAAAATGGCAACTGCTATA + +a +s mr.mrrefChr5 84455 73 + 294542 GGGTCTTAAGAGCGACCGTGCAGGTTGCTCAGAACCATTGATCAACATCATTATGTGAGCTTCTGAGAGTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230447 73 + 636262 GGGTCTTAAGAGCGACCGTGCAGGTTGCTCAGAACCATTGATCAACATCATTATGTGAGCTTCTGAGAGTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 221645 73 + 647215 GGGTCTTAAAAGCGACCATCAGGGTTACTGAGAGTCATTAATCAACATCATTATGTGAGCTACTGAGAGTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 84528 15 + 294542 ACAATTGTGGACTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230521 15 + 636262 ACAATTGTGGACTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 221718 15 + 647215 ACAACAGTGAATCGT + +a +s mr.mrrefChr5 84543 37 + 294542 AATAGGTTAGGCACAGCCTACGGAACATGTAAGTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230538 37 + 636262 AATAGGTTAGGCACAGCCTACGGAACATGTAAGTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 221733 37 + 647215 AATGGGTTGGACACAGTCTGGGGAACGTGTAAGTACA + +a +s mr.mrrefChr5 84580 43 + 294542 CCATTCAAGTAGGCAATTGGCCTGAGGGAGATTGGATTGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230590 43 + 636262 CCATTCAAGTAGGCAATTGGCCTGAGGGAGATTGGATTGCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 221770 43 + 647215 CCATTTGAGTTGGCAATTGGCCTGGGGGATATCAGGTTATACC + +a +s mr.mrrefChr5 84623 11 + 294542 GTTTACCAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230636 11 + 636262 GTTTACCAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 221813 11 + 647215 GTGTATCAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 84634 89 + 294542 ACCCGACCAGTTGAACTAGGGGACTAAAATGGATTCAACTGAGAATGGAGGTATGTCACACACGGGTGTTTGCCAGCCTGTGAAGTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230647 89 + 636262 ACCCGACCAGTTGAACTAGGGGACTAAAATGGATTCAACTGAGAATGGAGGTATGTCACACACGGGTGTTTGCCAGCCTGTGAAGTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 221825 89 + 647215 CCCCAATCAGTTGAACTAGAGAACTAAGATGGATTCAACTGAGGATGGAGGTCTGTCACATAAGGGTGCCTGCCAGTCTGTGAAGTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 84723 11 + 294542 CAGGTTTGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230736 11 + 636262 CAGGTTTGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 221924 11 + 647215 CAGATTTGCCT + +a +s mr.mrrefChr5 84734 28 + 294542 GTTAGGATTGGTAAGAACAACTAAGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230747 28 + 636262 GTTAGGATTGGTAAGAACAACTAAGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 221943 28 + 647215 GTTAGGACTGGTAAGTACAACTAAGTGC + +a +s mr.mrrefChr5 84762 42 + 294542 AACATGAGGGGGGATGTAGGGGTATAGGTAAATAAATCTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 230779 42 + 636262 AACATGAGGGGGGATGTAGGGGTATAGGTAAATAAATCTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 221971 42 + 647215 AACATGAGTGGGGATGTCAGGGTATAAGCATGTAGAGCAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 84804 8 + 294542 TCACAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231169 8 + 636262 TCACAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 222013 8 + 647215 TCACAATG + +a +s mr.mrrefChr5 84812 20 + 294542 CAGCACTCATTGGGAGCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231178 20 + 636262 CAGCACTCATTGGAAGCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 222021 20 + 647215 CGGCACTCATTGGGAGCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 84832 54 + 294542 ATCATGATTCTTCCATTCTTCTCTGCTTCTTCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231200 54 + 636262 ATCATGATTCTTCCATTCTTCTCTGCCTCTTCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 222041 54 + 647215 ATCATGATTCTTCCATCCTGCTCGGCTTCATCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA + +a +s mr.mrrefChr5 84886 77 + 294542 TCACCAATGTGCTTCCAAGCAATTATCATGCTGCTGTGCTAAGTTAAGGGGTTGATAGTTCACAACTTTTACCTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231254 77 + 636262 ACACCAATGTGCTTCCTAGGAATTGTGGTGCTGCTGTGCTAAGTTAAGGGGTTGATAGTTCACAACTTTTACCTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 222105 77 + 647215 TCATCAATGTGCTTCCAAGCAATTATCATGTTGCTGCATTAAGTTAGGGGCTTGATAGTCCACAACTTTTACCTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 84963 673 + 294542 TGGGATAATTTCTATCACACATCAGAGATCGCTACCTATACATGACTATTATTCCCCCAAGGCGCATCTGGATGGGTGAATTCACAGCAAGTCATACAACCATCTGGAGAGAGTTATACAGAATGCGTAACTTGAAAACACAGCAAGCAGGTGTAAATGCAATAGTGAAAGGTTATGCCTACATGCATATCAACTTTAGAGCTCCAGAGTTGGCTATCACTTATGACATAGAGTGTGAGTCCCCAACTATTAGCATAAAGTGTAATCTTAGCATGACTGCAGTACTGGGATCACTTCAGCAATGATACGCAGTGTCACCAATCTGAGGCATATGCCTTACTAATTTTAGAACCTTAGATAGTAAACTCAAGTCACGGTAAACTCAAGTCAGCTAGAAGAGTTCCGCAATGTCCCAGAACCAGCCAAAAATGCGAATGAGTGTTCTACAGTTCATGTATCATGGAATACGTTCTAGCCAATTCAAAAGGATATATCTTAGTACCTCTTTGCATTGGGATGACCATGACCAGCTTCATGATTGCTGTGAGGCTCATGCATAATAATGTTTTGGTTAAACAGTAGATAGTCTGCCTCCTACTCATTCTGTCAATGTCTGATTGAGATGTGTAATTTTGAACTATTTTTTCCATTCATGACTCCATGAAGCCCCGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 231450 658 + 636262 TGGGATAATTTCTAACACACATCAGAGATCGCAACCTATACAGGACTATTGTTCCCT-AAGGTGCATCTGCATGGGTAAATTCACAGCAAGTCATACAACCATCTGGAGAGAGTTATACAGAAGGCATAGCTTGAAAACACAGCAAGCGGGTGTAAATGCAATAGTGAAAGGTTATGCCTACATACATATCAACTTTAGAGCTCCAGAGTTGGCTGTCACTTATGACATAAAGTGTGAGTCCCCAACTATCAGCATAAAGTGTAATCTTAGCATGACTGCCGTACTGGGATCACTTCAGCCATGATACGCAATGTCACCAATCTGAGGCATATGCCTTACTAATTCTAGCACCATAGACAGTAAACTCGAGTCA------------GTCAGCTAGAAGAGTTCCGCAATGTCCCGGAACCAGCCAAAAATGCGAATGGGTGTTCTACGGCTCATGTATCATGGAATACGTTCTAGCCAATTCGAAAGGATATAGCTTAGTACCTCTTTGCATTGTGATGTCC--GACCAGCTTCATGATTGCTGTGAGGCTCATGCGTAATAATGTTTTGGTTAAACAGTAGATAGTCTGCCTCCTACTCATTCTGGCTATGTCTCATCAAGATGTGTAATTTAGAACTATTTTTTCCATTCATGACTCCATGAAGCCCCGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 222182 671 + 647215 TGGGATAACTTCTATCACATATCAGAGATCGCTACCTATAGATGACTATTATTCCCCCAAGGCGCATCTGGATGGGTGAATTCACACCAAGTCTTACAACCATCTGGCGAGTGTCGTACAGAATGTGTAACTTGAAAACACAGCAAGTAGTTGTAAATGCAACAGTGAAAGGTTTTGCCCACATGCATATCAACTTTAGCGCTCCAGAGTCAGCTATCACCTATGACATAGAGTGCGATTCCCCAAATATT-GCATAACGTGTAATGTTACCATGACTGCAGTACTGGGATCACTTCAGCAA-GATATGCTGCGTCACCAATCTGAGGCATATGCCTTACTAATTTTAGATCTTCAGATGGTAAACTCAAGTTACGGTAAACTCAAGTTAGCTGAAAGAGTTCTACAATGTCCCAGAACCAGCAAAAAGTGCAAATGAGTGTTCTACATTTCATGTATCATGGAATATGTTATAGCCAATACAAAAGGATATATCTTTGTACCTCCTTGCATTGGGATGACCATGACCAGCTTCATAATTGATGTGAGGCTTACTCATAATAATGTTTTGGTTAAACAGTAGGTAGCTTGCCTCCTGCTCATTCTGTCAGTGTATGATTGAGATGTTTAATTTTGAACTATTTTTTCCATTCGTGACTCCATTAAGCCCCTCA + +a +s mr.mrrefChr5 85636 358 + 294542 GACAACACCACTAAAATAACCATGTGTAAAGAGTATCAACTTGAAAATGAAAAGCATGTGGCCAAACCAGAACATGTGAATGCATAGTCTCTGAAGACTATGCACTTGTTATGCAATTTGTGCTCTGTTAGGAGTTGTGAACAAAATTAGAGTTGACCTTCCTCTCCTGTGTGACTTGCTGCTGGAGTGGTTGTAATTCCGGGCCTTGCAGGTCTAGAAATTGGCATTTCAACGTTATGGGAGGAGGAGCATGGGGCCTTAAGATAGGTATGTAATATCTGGAACTATAGGATTACAGGGCAAGTAAACATATTATGTGACCAGTCAGAAGACATATAGCAGCAGTCATATTATGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232110 243 + 636262 GATGATACCACTGAAACAACCATGTGTAAAAAGTATCAACTCGAAAATGAAAATCATGTGGCCAAACCAGAACATGTGAATGCATAGTCTCTGAAGACTATGCACTTGTTATGCAATTTGTGCTCTGTTAGAAGCTGTGAACAA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTAGATAGGTATGTAATATCTGGAACTATAGGATTACAGGGCAAGTAAACATATTATGTGACCAATTAGAAGACATGTAGCAGCAGTCATATTATGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 222853 357 + 647215 GACAACACCACTAAAATAACCATGTATAAAGAGCATCAACTTGAAGATGAAAAGCATGTGGCCAACCCAGAACATGTGAATGCATAGTCTCTGAAGACTATGCACTTGTTATGCAATTTGTGTTCCATTAGGCATTGTTAACAAAATTAGAGTTGACCTTCCTCTCCTGTGTGACTTGCTGCTGGAGTGGTTGTAATTCCGGGCCTTGCAGGTCTAGAAATTGGCATTTCAACGTTATGGGAGGAGGAGCATGGGGCCTTAAGCTAGGTATGTAGTATCTGGAACTCTAGGATTATAGGGCAAGTAG-CATCTTATTTGTGCTGACAGAAGACATACGGCAGCAGTCATATTGTGCAC + +a +s mr.mrrefChr5 85994 344 + 294542 ACCAGGTGACCTGTTTGTAAACCAAGTAAGCCAGAGGCAACCAGGCTGACTTACAAACTAAGGTTCCTTCACAACATATTAACTTCTGAATCTGATTTAACATCTAAATGAACAGGCCTTACATAAAGATAGTGAACCTAATCAATTTTTTGTTGGAATATGTGTGGTTCTTGTATGTCGCTAGCTAGATTAATTTATGATATCACCTTTCTGATTAGTTATAAGCTTACATGTGGTAATGTATACCGTCATGTATTTCCATATTAAGGTAACTATCCACATAATCCATCAAGCCTGGGATACTTAATGGGGATACTTAACCTAACTTGTCCTGCCTATGTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232365 344 + 636262 ACCAGGTGACCTGTGTGTAAACCAGGTAAGCCAGTGGCAACCATGCTGACTTACAAACTATGGTATCTTCACAATATCTTAATTTCTGAATTTGATTTAACATCTAAATGAACAGGCCTTACAGAAAGATAGTGTACCTAATCAATTTTTTGTTGGAATATGTGTGGTTCTTGTTTGTCGCTAGCTAGATTAATTCATGATATCACCTTTCTGGTTAGTTATAAGCTTACATGTGGTAATGTATATTGTCATCTATTTCCATTTTAAGGTAACTATCCACATAATCCATTAAGCCTGGGATACTTAATGGGGATACTTAACCTAACTTGTCTTGCCTATGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 223210 344 + 647215 ACCAAGTGACCTGTTTGTAAACCAAGTAAGCCAGAGGCAACCAGGCTGAGTTACAAACTAAGGTTCCTTCACAACATATTAACTTCTGAATCTGATTTAATATCTAAATGAACAGGGCTTACATGAAGAGAGTGAACCTAATCAATTTTTTGTTTGGATATATGTGCTTCTTGTATGTTGTTAACTAGATTAATTTAAAATATCACCTCCATGATAAAGCATAAGATGACATGTGGTAATGTATACCATCATGTATTGCCATATTAAGGTAACTATCCTCATGACTCATCAAGCCTGGGACACTTAATGGGAAATCTTAATCTAACTTGTCCTGCCTAAGATAA + +a +s mr.mrrefChr5 86338 64 + 294542 CTAATTGATATGTTTACATAAGTGCCAAATTTTGCTGGTGTTAAATGCTTATCACAGCTAGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232820 64 + 636262 CTAAATGATATGTTTACATAAGTGCCAAATTTTGCTGGTGTTAAATGCTTATCACAGCTGGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 223554 64 + 647215 CTAATTCATACGTTTACATAAGTGCCAAGTTTCGCCGGTGCTAAATGCTTATCACTGCTAGATT + +a +s mr.mrrefChr5 86402 16 + 294542 GCAATTCTGAACCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232885 16 + 636262 GCAATTCTGAACCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 223618 16 + 647215 GCAATTCTGAACCACA + +a +s mr.mrrefChr5 86418 11 + 294542 ATCCCTACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232908 11 + 636262 AACCCTACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 223634 11 + 647215 ATCCCTACAAT + +a +s mr.mrrefChr5 86429 3 + 294542 ATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232919 3 + 636262 ATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 223648 3 + 647215 ATA + +a +s mr.mrrefChr5 86432 69 + 294542 AGGTATAATTTGCCTTATTATCTGTTGTGATAACATATACATAGGATTGAGCTAGAAGCTCCCCTAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232923 69 + 636262 AGGTATAATTTGACTTATTAACTGTTGTGATAACATATACATAGGACCTAGCATGAAGGTCCCCTAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 223651 63 + 647215 AGGCTTAATTTGCCTTATTATCT----TGATAACGCATGCATAGGATTGAGATAGAAGCTCCCATAA-- + +a +s mr.mrrefChr5 86501 33 + 294542 TTTCTTTACGCTGCATATGCAGATATAGATAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 232994 33 + 636262 TTTCTTTACGCTGCATATGCAGATATAGATAAG + +a +s mr.mrrefChr5 86534 200 + 294542 GTAGATGGGTTTGCCGATTTTACACATGAGGGGCCTGAGTGATGCATTCTGAATAACCTTCAACTACTTGTATGGGAACCCTTTACCAGCTCGAGTTCTGAGTAGCTTGATGTGCCAGCCATGCACTTACTCCTGGTTGTGCTCCTTTCATCCACTCAAGTGGAGGCTAATATAACAATAATCTAATATCATTAATAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233029 200 + 636262 GTAGATGGGTTTGCCAATTTTACACATGAGGGGCCTGAGTGGTGCATTCTGAATAACCTTCAACTACTTGTATGGGAAGCCTTTACCAGCTCGAGTTCTGAGTAGCTTGATGTGCCAGCCATGCACCTATTCCTGGTTCTGCTCCTCTCATCCACTCAAGTGGAGGCTAATATAACAATAATCTAATATCATTAATAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 223714 166 + 647215 GTAAATGGGACAGCTGCATTTTCACATAAGAGGTCTGAGTCATGCATTCTGAATATCCTTCAACTACTTGTATGGGAACCTTTTACCAACTCAAGTTCTGAGTAACTCAATGTGCCGGCCTTGCACTTACTCCTGGTTGTGCTTCTTGCATTCACTCAAGTGGAGG---------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 86734 10 + 294542 CTAGAAACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233238 10 + 636262 CTAGAAACAG + +a +s mr.mrrefChr5 86744 19 + 294542 GATAAAGATTGATTCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233259 19 + 636262 GATAAAGATTGATTCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 223880 19 + 647215 GATAAAGATGGATTCTACG + +a +s mr.mrrefChr5 86763 114 + 294542 ACTGAGACCTTGTCTTGGTTAGGATCCCAGTCATGCCTGTTCTTTAGTAATCAGAGTTTTCCTCCCTTTTCAGTGGCAGGTCTCAATAGGAAATTGATTAGTACATTATATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233279 110 + 636262 ACTGAGACCTTGTCTTGGTTAGGATCCCAGTCCTGCCTGTTCTTTAGTAATCAGAGTTGTCTACCTTTTTC----GCAGGTCTCAATAGGAAATTGGTTAGTACATTATATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 223899 114 + 647215 ACTGGGACCTTGTCTTGGTTAGGATCCCAGTCATGCTTGTTCTTCAGTAATCAGAGTTTTCCTCCCTTTTTAGTGGCAGGTCTCTATAGGAAACTGATTAGCACATTATCTGGT + +a +s mr.mrrefChr5 86877 140 + 294542 AACAATTTGAACTAATTGAACTGACATCTCCTCAGCAGAACTCTTGTGAGTTGTGCTAGACAAATCATACTTAGGCTGCTCAAGCTTGTATTTAGTTCAATCATAGCAATACAGGTCATTCTTGACTGCATTAGAGCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233389 140 + 636262 ATCAATTCGAACTAATTGAACTGACATCTCCTCAGCAGAACTCTTGTGAGTGGTGCCAGACAAATCATACTTAGGTTGCTCAAGCTTGTATTTAGTTCAATCATAGGAATACAGGTCATTCTTGACTGCATTAGAGCCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 224014 135 + 647215 AACAATTTGAACTAATTGACCTGACATCTCTTCAGCGGAACTCTTGTGAATTGTGTTGGGCAAATCATACTTAGGCCAACCAAATTTGTTTTAAGGCCAATCATAGCAACACAGGTCATTCTTGACTGCATTAGA----- + +a +s mr.mrrefChr5 87017 98 + 294542 AAAAATGGTATTTTTAGTACTAATATTAATAAGTATGGTTATCTGTTTTGTTGTCTGTGATTGCATGCTATCAGAACCTGTTCTAAGGGCTGTTCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233531 95 + 636262 AAAGATGGTATTTTAC---CTAATATTAAGAAGTATGGTTATCTGTTTTATTGTCTGTGATTGCATGTTTTCAGAACCTGTTCTAAGGGCTGTTCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 224149 96 + 647215 --AAATGGTATTTTTAGTACTAATATTAATAAGTATGGTTATCTGTTTTGTTGTCTGTGATTGCCTGCTATCAGAACCTGGTGTAAGGGCTGTTCATC + +a +s mr.mrrefChr5 87115 7 + 294542 AGTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233628 7 + 636262 AGTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 224245 7 + 647215 AGTTCGA + +a +s mr.mrrefChr5 87122 227 + 294542 TCTATGAGTGTGTAGGTTATTAAGTAACTGAGATCGGACTCTCCCACACTTTTAACCATTTTCTCATAAAGGATACAAAAACTAATTTCTTGAATGGTCACTTGATTGAGCATGGAGTGGAATCCTAATAGCTTAATGAGTTTGACCATCAATCTGGAAAATCTGAGTACACTATCGGGAGAGATTGAACTGGGGTTAAAAGGATGGAAGATACAATGCCCTTTGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233635 196 + 636262 TCTATGTGTGTGTAGGTTATTAAGTAACAGAGATCAGACTC-------------ACCTTTTTCT-------------AAAACTAATTTCTTGAATGGTTACTCAATTG--CATGGAGTGGAATCCTAATAGCTTAATGA---TGACCATCAATCTGGAAAATCTGAGTACACTATCGGGAGAGATTGAACTGGGGTTAAAGACATGGAAGATACAATGCCCTTTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 224276 227 + 647215 TCTAAGAGTGTGTAGGTTATTAAGAAACTGAGATCGGACTCTCCCACACTTTTAACCATTTACTCATAAAGGATACAAAGACTAGTTTATTGAATGGCCACTTGATTGAGCTTGAAGTGGAAGCCTAATAGCTTAAAGAGTTTGAACATCAATCTGGAGGTTCTGAGTACACTATAGGGAGAGATTGAACTGGGGTTAAAAGGATCAAATACACAACACCCTTTGAC + +a +s mr.mrrefChr5 87349 206 + 294542 CTCAAAATGCAATAACTTTTGCTTGCTCTTGTCTTGGTGTGAACAAAATTGGTTGTGGATGTAAAGCCAAGTTTTGCAAACTAAACCTAGGGGCATAGGCATGCTAAGGTCAACAGGGTCTAAGAAAGGGCATTTGCCTTGAGTGAAGCAACCTTCTAGGTTCGTAGACCACATGATTCTGCCTGTTGTCTGCTCTGAATTAAACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233838 205 + 636262 CTCAAAATGCAATAACTTTTGCTTGCTCTTGTCTTGGTGTGAACAAAATTGGTTGTGGGTGTAAAGCCAAATTGTGCAAACTAATCCTAGGGGCATAGGC-TGCTAAGGTCAACAAGGGCTAAGAAAGGGCATTTGCTGCGAGTGAAGTGACCTTCTAGGTTCGTAGACCACATGATTCTGCCTGTTGTCTACTCTGAATTAAACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 224503 206 + 647215 TTCAAAATGCAATAACTTTTGCTTGCTCTATTCTTGGTGTGAACAAAATTGGCAGTGGATGTAAAGCTAGGTTTTGCAAACTAAACCTAGGGGCATAGGCATGCGATGGTCAACAGGGTCTAAGAATGGGCATTTGTCTTGAATGAAGCAACCTACTAGGTTTGTATACCACAAGGTTCTGCCTATTGTCTGCTATGAATTAAACG + +a +s mr.mrrefChr5 87555 130 + 294542 ATGTTTATGTAGCAACAAGAACATGCCCACTCAGAAAAGCTACATGGGTGTACCACCTGCATCATATGAAAGGAGGGTTCAAGTAGTCTTTAGAATTAGATCCATATTGGTATATCATTCCACCCCTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234048 130 + 636262 ATGTTTATGTAGCAACAAGAACATGCCCACTCAAAAAAGCTACATGGGTGCACCACCTGCATGATATGAAAGAAGGGTTCAAGTAGTCTTTAGAATTAGATCCATATTGGTATATCATGCCACTCCTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 224709 129 + 647215 AT-TTTATGTAGCAACAAGAACATGCTCACTCAGAAAAGCTACATGGGTCTACCACCTGCATCCTATAAACAGAGGGTTCAAGAAGTCTTTAGAATTAGATCCATATTGGTATATCATTCTACCCCTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 87685 162 + 294542 TTGAGTAGGTAGGCGAATCTAACTTTTTTATATCTGAGTAAATACAAGATCTATATAGGAAAGGTCTGGGCCTTACCATTTCCAGACTAGAAAATTTCCTGTATATACACAGGGATGTGTCCATGGGATTTACAGCTCTGCCTGGGGGCTTGATTGGGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234180 162 + 636262 TTGAGTAGGTAGGTGAATCTGACTTCTTTTTATCTGAGTAAATACAAGATCTATATAGGAAAGGTCTGGGCCTTACCATCTCCAGACTAGAAAATTTCCTGTATATACACAGGGATGTTTCCATAGGATTTACAGCTCTGCCTGGGGGCTTGATTGGGGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 224838 161 + 647215 TTGAGTAGGTAGGCGAATCTAACTTTTCTATATGTGAGTAAATACAAGATCTATGTAGGAAAGGTCTGGGCCTTACCATTTCCAGACTAGAGAATTTCCAGT-TATACACAGGGGTGTGGCCATGGGATATACAGCTCTGACAGGGGGCTCGACTGGGGACT + +a +s mr.mrrefChr5 87847 111 + 294542 TGTGCATGTCCAGGCATTACAGTCTGGAACCTTTGTGATTGAAAATAGTCCCTCACTACCAACAACGCAATCGGCTGATACCCTAGGGGCCTCGCATTTTACATAAAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234345 111 + 636262 TGTGCATGTCGAGGCATGACAGTCTGGGACCATTGTGATTGAAAATAGTCCCTCACTACCAACAACGCAGTCGGCTGATACCCTGGGGGCCTCACATTTTACATAAAGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 224999 108 + 647215 ---GCAAGTCCAGGCATTACAGTCTGGAACCTTTGTGATGGACAATAGTCCCTCACCACCAACAATGCAATTGGCTGATACGCTAGGGGCCTCGCATTTTACTTAAAGAGG + +a +s mr.mrrefChr5 87958 274 + 294542 AGTCTGATATTAAGTGAACCACAACTGAGGGGAGACACTGAAGGTTGGGAATAACCCCCTGGGCCTGGAATAAATGGAATAAAACATAAAGCCTGCTTGGAGTAACTGAGAGGACAAAATGCTCCCGCCCTTGACCCCTGCTAGGGAGAGGCAATTTTGTCAACAATGAGCAACAAATCGGCAAGTTCTTATCTAGGATGGGGATGATGTATGAGAGTACATCATGAATTAATAGTTGCAGGAAAGATAAGCTTGGGTCTCCAACCCAACCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234456 267 + 636262 AGTCTGATATTAAGTGAGCCACAACTGAGGGGAGACACTGAAGGTGAGGAATAACACCCTGGGCCTGGAACAAA------AAAACATAAGGCATGTTTGGAGTAACTGAGAGGACAAAATGCTCCCACCCATGACCCTTGCTAGGGGGAGGCAATT-TGTCAACAATGAGCAACAAATCGGCAAGTTCTTATCTAGGATGGGGATGATGTATGAGAGTACACCATGAATTAATAGTTGCAGGAAAGATAAGCTTGGGTCTCTGACCCAGCCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 225122 273 + 647215 AGTCTGATATCAAGTAAACCACTACAGAAGGGAGACACTAAGGGTTGGGAATAAGCCCCTCGGCCTGGAATAAATGGAATAAAACATAAAGCCTGCTTGGATTAACTGAGAGG-TGAAATGCTTCTGCCCTTGACCCCTGCTAGGGAGAGGCAATTTTGCTACCAATGAGCTACAGATTGACAAGTTCTTATCTGGGTTGGGGATGATGTATGAGAGTACGTCATAAGTTATTAGTTGCAGGAAAGCTAAGCTTGGGTCTCCAACCCAAACCCA + +a +s mr.mrrefChr5 88232 150 + 294542 CATGTTAATACCACATCCAATTTAGTGCAGCGAAGGTATATACGAAGTCATTTCAAGTAGAATTAACACAAAGAAGCCAATTCTGATGAATTTCCATAGGAAAACTGATTCTGACCATTCAGTAATGACGCTCACAATGACGCCCAGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234723 150 + 636262 CATGTTAATACCACCTCCCATTTAGTGCAGCGAAGGTGGATACGAAGTCATTTCAAGTAGAATTAACACAAAGAAGCCAATTCTGATGAATTTCCATAGGAAAACTGATTCTGACCATTCAGTAATGACGCTCACAATGACGCCCAGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 225401 146 + 647215 CATGTTA----TATATACAATTTAGTGCAGTGAAGGTATATATGAAGTCATTTCAAGTAGAATTAACACTAAGAAGCCAATTCTCATGAATTCCCACGTAAAAACCGATTCTTACCCTTCAGTGATGATGCTCACAATGATGCTCAGGAG + +a +s mr.mrrefChr5 88382 24 + 294542 TTCTATGTTAACTGGCTGTCCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234874 24 + 636262 TTCTATGTTAACTGGCTGTCCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 225547 24 + 647215 TCCTATGTTAACTGGCTGTGCAAC + +a +s mr.mrrefChr5 88406 29 + 294542 ATTAAGATATGGCTAGCAATCTCATGATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234898 29 + 636262 ATTAAGATATGGCTAGCAATCTCATGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 225577 29 + 647215 ATAACAATATGACTAGCAATCTCAAGATC + +a +s mr.mrrefChr5 88435 171 + 294542 AATTTTGAGCTGAGCTTAACAACCCCATTGGCTCACACGATTATCATTCATGTGCTTTGTTTCCACTTTCCTATTAGGCATCCAGGGACTAATTAGAGGGCTATTAGCCGCTATTAACCTTGGGATTATTGCTGAAGACAATTCAGGCCAATCACCGACCTATGATATACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234927 171 + 636262 AATTTTGAGCTGAGCTTAACAACCCCATTAGGTCACACGATTATCATTCATGTGCTTCGTTTCCACTTTCCCATTAGGCATCCAGGGACTAATTAGAGGGCTATTAGCCGCTATTAACCTTGGGATTATAGCTAAAGACAATTCAGGCCAATCACCGACCTATGATATACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 225619 171 + 647215 AATTTCGAACTGGGCTTAACAACCCCATTGGCTCACACGATTATCATTCATCTGCTTTGTCTCCACTTTCCTATTTGGCATCCAGGGACTAATTAGGGGGCTAGTAGCAGCTATTAACCTTGGGATTATTGCTGAAGACAGTTGAGGCCAATCACCGACCTATGATATACC + +a +s mr.mrrefChr5 88606 38 + 294542 GTTAATAGGTTACCAATAATTAGTTTGAGGTATGTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235102 38 + 636262 GTTAATAGGTTACCAATAATTAGTTTGAGGTATGTCTG + +a +s mr.mrrefChr5 88644 166 + 294542 TAGAGGTATGTCTGTTTATGATTGGACTCCAGTTGTAAGGTCTGCCTTCCCCTATGTGAGTGTGTAGTGGGTGTTTTCCCCCCATTATCTATTGTGACCAATCTGGCTTTGCCCAGAGTTTTCAATACTGTACTCAAGTTATATTGGCAGAGACAACCATCTCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235142 166 + 636262 TAGAGGTATGTCTGTTTATGATTGGACTCCAGTTGTAAGGTCTGCCTTCCCCTATGTGAGTGTGTAGTGGGTGTTTTCCCCCCATTATCTATTGTGACCAATCTGGCTTTGCCCAGAGTTTTCAATACTGTACTCAAGTTATATTGGCAGAGACAACCATCTCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 225790 166 + 647215 TAGAGGTATGTCCATTTAAGATTGGACCCCAGTTGTAAGGTCTGCCTTCCCCTATGTGAGTGTATAGCGGGTGTTTTCCCCCCATTATCTATTGTGACCAATCCGGCTTTGCCCAGTGTTTTCAATACTGGACTTAAATTATATTGACACAGGCTACCACCTCAAA + +a +s mr.mrrefChr5 88810 80 + 294542 CTGTATTACTAGTTCACCAATTTACACCCACATCACATGGTCTTTATGTGTATTTTACTAATGGCCCCATGTGAACCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235310 80 + 636262 CTGTATTACTAGTTCACCAATTTACACCCACATCACATGGTCTTTATGTGTATTTTACTAATGGCCCCATGTGAACCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 225956 80 + 647215 CTGCATTACTAGTTCACCGATTTAGACCCACATTGCATAGTCTTTTTGTGTATTTTACTATTGGCCCCATGTGAACCTTG + +a +s mr.mrrefChr5 88890 66 + 294542 AACCAGTGGAGTTTACTCTGATCAGAGTGAAACCACAAGGATTCTGCTCCAAACCATAAAGTTCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235390 66 + 636262 AACCAGTGGAGTTTACTCTGATCAGAGTGAAACCACAAGGATTCTGCTCCAAACCATAAAGTTCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 226037 66 + 647215 CACCAGTGGAGTTTACTCTAATCAAAGCAAAACCACAAGGATTCTGCTTCAAATGATAAAGTTCAT + +a +s mr.mrrefChr5 88956 82 + 294542 GGGATATTACAGCATGCTTAGATGTGAATCAACATCCTTAGATGTGAAGCACGGAATATATTTAAGTTCTCTGCCACACGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235456 82 + 636262 GGGATATTACAGCATGCTTAGATGTGAATCAACATCCTTAGATGTGAAGCACGGAATATATTTAAGTTCTCTGCCACACGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 226105 82 + 647215 GGGATATTACAACATTCTTAGATGTGGGGCAACGTCCTTAGATGTGGAGCACGGGATATATTTAAGTTCTCTGCCATACACT + +a +s mr.mrrefChr5 89038 7 + 294542 AAACTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235538 7 + 636262 AAACTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 226188 7 + 647215 AAACTTA + +a +s mr.mrrefChr5 89045 660 + 294542 ACAGTATGCCGCACTCCCCCATTTTGCTCTATCATGATATATGCTTTATCTCACAATAAGTGTTGGACCCTTGGGCTATAAGAATATTCAGAATTAATTTGCATTTTGTCTTCACTTTGTGTGTTTAATATTAAGTGATTTCCATCAGTGTGTGTGGATTTTTTATTACTCTTCCTATTGTGTATAAACATGTGATACCCCAGAACAGATCACTTTCACCAGTGAATAATAGAAATTAGCAGCAGAAGCAACACTTTGTCCACTACCTTAGGACAATATGGGTTGTGTAAGTACCCTGCCTTAAGATGAGGGATCTCCAACTTATTTACCTAGCAGGTTCAATAATGGTGTTCTTAGCCATGCCCATACACAGATGAGTTGGGCTTGATTTGATGCACTGTTGAATTGTTTGGTGTGAAGAGTTAACACCTTGGTGAAAGGTGATCTGTAATTTTGGCTAACAATATCCATTAAATCTGCAACTGTCCATTCTGCAATCAAGTCTGTGTGACAGGTAAACCTGAACACAGACTCTGCCATAGTAACCTTGTTTACCTTAACTGCAACCTATCACAACCCTATCAACATGTCATAGAAACCCATTCAATATTCTTTCACATTCTACAAACCTGGTACAGAAGTAGCCCTTGGACATAATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 235545 660 + 636262 ACAGTATGCCGCACTCCCCCATTTTGCTCTATCATGATACATGCATTATCTCACAATGAGTGTTGGACCCTTGGGCTATAAGAATATTCAGCATTAACTTACATTTTGTCTTCACTTTGTGTGTTTAATATTAAGTGATTTCCATCAGTGTGTGTGGATTTTTTATCACTCTTCCTATTGTGTATAAATATGTGATACCCCAGAACAGATCACTTTCACCAGTGATGAATAGAAATTAGCGGCAGAAGCAACACTTTGTTTACTACCTTAGGACAATATGGGTTGTGTAAATGCCCTGCCTTAAGATGAGGGATCTCCAACTTATTTACCCAGCAGGTTCAATAATGGTGTTCTTAGCCATGCCCATGCACAGATGAGTTGGGTTTCATTTGATGCACTGTTGAATTGTTTGGTGTGAAGAGTTAGCACCTTGGTAAAAGGTGATTTGTAATTTTGGCTAAGAATATCCATTAAATTTGTAACTGTCCATTCTGCAATCAAGTCTGTATGACGGGTAAACCTGAACACAGACTCTGCCATAGTAACCTTGTTCACCTTAACTGTAACTGATCACAACCCTATCAATATGTCATAGAAAACCATTCAATATTCTTTCACATTCTACAAATCTGGTACAGGAGTAGCCCTTGGACATAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 226268 641 + 647215 ATGGATTGCCGCACTCCCCCATCTTACTCTAGCCTGATAT-TGCTTTATCTCACAATAAGTGTTGGACCCT--GGCTATAAGAATCTTCAGAATTAATTTGCAT---------ACTTTGTGCATTTAATATTAAGCGATTTCCATCTGTGTGTGTGGATTTTTTATTAGTCTTCCTATTGTGTATAAACATGTGATACCCCAGAACAGACCACTTTCACGAGTGAATAATAGAAATTAGCAGGAGAAGCTACACTTTGTCCACTACCTTGTGAGAAGATG-----TGTAGGTACCCTGCCTTAAGATGACCGATTTCCAA-TTACTTGCCTAGCAGTATCAATAATGCTGTTTTTGGCCATGTCCATACACAAATGAGTTGGGCCTGATTTAATGCACTGTTAAATTGTCTGGTGTGAAGAGTTAACTCCTTGATGATAGGTGATCTGTAATTTTGGCTAACATTATCCATTAAATCTGCAACTCTCCATTAAGCAATCAAGTCTGTGTCACAGGTAAACCTGAACACAGACTTT-CCATAGTAACCTTGTTTATTTTACCTGCAACCTAACACAACCCTATCAACATGTCATAGCAACCCACTTAATATTCTTTCACATTCTACAAGCCTGGTACAGAAGTACCCCTTGGACATAATCC + +a +s mr.mrrefChr5 89705 84 + 294542 AGCTCACAGACTGGCTGTCAATCTGCAATGGAGACTCATTTATGGTAGTAACATAATGTTGATTGAGAATAAGCCCCATTGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236205 84 + 636262 AGCTCACAGACTGGCTGTCAATCTGCAATGGAGACTCATTTATGGTAGTAACATAATGTTGATTGAGAATAAGCCCCATTGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 227145 84 + 647215 AGTTCACATTCTCACTATCAAACTGCAATGGAGGCTCATTAATGCTAGCCACAAGATCTTGGCTGAGAATATGCCCCATTGATG + +a +s mr.mrrefChr5 89789 21 + 294542 TCCTGTTTCTCATCAGTAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236290 21 + 636262 TCCTGTTTCTCATCAGTAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 227229 21 + 647215 TCCTGCTTTTCATCAGAAATC + +a +s mr.mrrefChr5 89810 125 + 294542 CAATGCCAGTATGGTGCATTCCACCGGGTAAAGCAGATGGCCAGTATGGGTACACTGTGGGAAGGCCCTTTGTGCACTGTGGGAAGGCCCCTTCCTAATACCTAAGTTCACAAATATAGGTTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236319 125 + 636262 CAATGCCAGTATGGTGCATTCCACCGGGTAAAGCAGATGGCCAGTATGGGTACACTGTGGGAAGGCCCTTTGTGCACTGTGGGAAGGCCCCTTCCTAATACCTAAGTTCACAAATATAGGTTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 227250 125 + 647215 TAATGCTAGAGTGGTGCATTCCACTAGGTAAACCAGATGCCCAGTATGGGTGCATTATGGAAAGGCCCCTTGTGCACTGTGGGAAGGCCCTTTCCTAATACCTAAGTTCACATATAAAGGTTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 89935 76 + 294542 ATGTACAATTGAGCAATACTATAATAGAGGGAGCTGACAAATCAGGCTGTATTTCCAGGGACCCAATAAACCATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236445 76 + 636262 ATGTACAATTGAGCAATACTATAATAGAGGGAGCTGACAAATCAGGCTGTATTTCCAGGGACCCAATAAACCATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 227375 76 + 647215 AGGTACAATTGAGCAATACCATAATAGAGGGAGCCGACAAACCAGGCCGTATTTCCAGGGACCCAATAAACCATAC + +a +s mr.mrrefChr5 90011 45 + 294542 TGTGTCTCCAGGGCCCCTGTGTGCCGAGTCCATATATTGGTTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236526 45 + 636262 TGTGTCTCCAGGGCCCCTGTGTGCCGAGTCCATATATTGGTTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 227451 45 + 647215 TGTATCTCCTAGGTCCCCATGCGCTGAGTCCATATATTGGTTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 90056 17 + 294542 GCTTGTGGACCTAATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236571 17 + 636262 GCTTGTGGACCTAATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 227497 17 + 647215 GCGTGTGGACCTAATAA + +a +s mr.mrrefChr5 90073 140 + 294542 GGAGCCCAAGTTGGTGAAACTTGTGACCGCTTCACTACCAGTCGCCTGATGTAACATATAATTTTCCCGACTTTTTACTGATACCCTCTCCTCACAAATCTTATATTGGGATGATCACAGATTTGTCCCAAAATGATCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236588 140 + 636262 GGAGCCCAAGTTGGTGAAACTTGTGACCGCTTCACTACCAGTCGCCTGATGTAACATATAATTTTCCCGACTTTTTACTGATACCCTCTCCTCACAAATCTTATATTGGGATGATCACAGATTTGTCCCAAAATGATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 227571 140 + 647215 GGAGCCTAAGTTGGCAAAACTTGTGACTGCCTCCCTACCATTCACCAGATGTAACATGTAATTTTGGTGGTTTTTTACTAATATCCTCCCTTCACACATCTTATATCAGGATGATCACAGAATTGTCTCAAAATGGCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 90213 43 + 294542 CCCTCTATTGCCATCTCCTGCATCCTACATCTTTCATTATTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236728 43 + 636262 CCCTCTATTGCCATCTCCTGCATCCTACATCTTTCATTATTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 227713 43 + 647215 CCCTCTATCGCCATCTCCTACATCCTACATCTTTCATCATTCT + +a +s mr.mrrefChr5 90256 206 + 294542 GATATAAGGTATAACTAGAATTTGTAGAAACCAAGTACCTCAGTGATTCCCCCATATAAATTATGCATAGATGCTGCTCTCATAGGGCTACCTACTTAAATGCAATGCTCCTTTCAACCTAAGCTGCCTGATTAAAGATCATTCCATGGTTACATAAATATGGGTAGCTGTTGGTCACAGGTTTTATCAAAGAGCATGGCCCAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 236872 206 + 636262 GATATAAGGTATAACTAGAATTTGTAGAAACCAAGTACCTCAGTGATTCCCCCATATAAATTATGCATAGATGCTGCTCTCATAGGGCTACCTACTTAAATGCAATGCTCCTTTCAACCTAAGCTGCCTGATTAAAGATCATTCCATGGTTACATAAATATGGGTAGCTGTTGGTCACAGGTTTTATCAAAGAGCATGGCCCAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 227756 206 + 647215 GATATACGGTATAACTAGAATACGTAGAAACCAAATACCTGAGTGATTCCGCCAGGTGAATTATGGATAGATGCTGCTCTCATTGGGCTACCCACTTAAATGCAATGCTCCTTTCAACTTCAACTGCCAAATTAAAGATCATTCCATGGTTCCATAAATGTGTGCAGCTGCTGGCCACAGGTTATATCAAAGAGAGCAGCCCAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 90462 18 + 294542 GCTGAAGAGTCTAGTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237078 18 + 636262 GCTGAAGAGTCTAGTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 227973 18 + 647215 GCTGAAGAGACTAGTGGA + +a +s mr.mrrefChr5 90480 63 + 294542 ATTTTGTACCCTGGGTGGTTGCCATCCAGTGTGTTTCCTTCATTAAGCTTTGATTAATCACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237097 63 + 636262 ATTTTGTACCCTGGGTGGTTGCCATCCAGTGTGTTTCCTTCATTAAGCTTTGATTAATCACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 227991 63 + 647215 ATTTTGCCCCCGGGGTGGTTTCCATTAACTGCGTTTCCTTCATGAAGCTTTAATTAATCACCC + +a +s mr.mrrefChr5 90543 269 + 294542 GTTCATTGTGTCTGACACATATTATGATACTCCAACATGAAAGGCCAACTTCCATGTTTCTGATAGTGGTGGGTAGGAATAGTTTAAGCATAAAGTGTATGAATCAACAGCCCCCTTACCCTGAGCTGTAATTTATTGTGGATAGTTGCATTATGCAAGCATGAGAAACTAGTGTGCGATCTGGCATCGGCTTTACTGTCTGTTATCTGGGGCATTTTCCAGCAGTTACAGGCTCAGAATTGATAACTCACAAGTAAACCTTCTTACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237245 264 + 636262 GTTCATTGTGTCTGACACATATTATGATACTC----ATGAAAGGTCTACTTCCATGTTTCTAATAGTGATGGGTAGGAATAGTTAAAGCATCAAGTGTATGAATCAACAGCCCCCTTTCCTTGAGCTGCAATTTATTGTGGATAGTTGCATTATGCAAGTATGAGAAACTAGTGTGCGATCTGG-ATCGGTTTTACTGTCAGTTATCTGGGGCATTTTCCAGCAGTTACAGGCTGAGAATCGATAACTCACAAGTAAACCTTCTTACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 228054 269 + 647215 GCTCATTGCATCTGACACATATTATGAAACTCCAACATGAAAGGCCAACTTCCATATCTCTGATAGTGGTGGGTAGGAATAGTTTAAGCATAAAGTGTATGAATCTCCAGCCCCTTTACCCTGAGCTATGATTTATTGTGGACAGTCGCATTGTGCAAGCATGTGAAACTAGTGTTTGATCTGGCATCCGCCTTACTGTCTGTTATCTGGGGCATTTTCCAGCAGTTGCAGGCTCAGGATTGATTACTCACAAGTAAACCTTATTACAG + +a +s mr.mrrefChr5 90812 50 + 294542 TCCAGAACCATAAAAGGTTATCAAGTGGGTTGGGCCTGTTCAAGTAAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237509 22 + 636262 CCCAGAACCATAAAAGGTTATT---------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 228354 50 + 647215 TCCAGAACCATAAAAGCTTATCAAGTGGGTTGGGCCTGTTCAAGTAAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 90862 282 + 294542 TAAAGCAGTATTGCCATTTGGAAGAAATACTAATTTACACCCTCTTCTTTATTTCTAGCACACAACTATTCGAATCATATTCCAAGTGGTTGCCAGCTAACAAGTCATATTGCAAGTGTTTGAATGATATTGTGCCCATTCCCCTGAAACTCTTTGGCTACCCCCATACAAACTTAGGCAGCATACTTGACTGCTTCCCATGTGGCAAGTCCTAGTTCAGCTTTCATGAGAACCATCAAGTGTTTACCAGTGTTGCAAGCATTCACAAGGTCTTCTTAAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237531 274 + 636262 --------TATTGCCATTTGGAAGAAATACTAATTTACACCCTCTTCTTTATTTCTAGCACACAACTATTCGAATCATATTCCAAGTGGTTGCCAGCTAACAAGTCATATTGCAAGTGTTTGAATGATATTGTGCCCATTCCCCTCAAAATCTTTAGCAACCCTCATACAAGCTTAGGCAGCGTACTTGACTGCTTCCCATGTGGCAAGTCCTAGTTCAGCTTTCATAAGAACCATCAAGTGTTTACCAGTGTTGCAAGCATTCACAAGGTCTTCTTAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 228406 277 + 647215 TAAAGCAGTATTGCCACTTGGGAGAAATACTAATTTACACCCTCTTCTTGATCTCTAGTATACAACTATTTGAATCATATAGTAAGTGGTTGCCAGCTACCAAGTCATGTTACAAGTGTTTGAATGAACTTGTGGCCATTCCCCTGAAACTCTGTGACTACCCCCATACAAACCTAGGCAGCATAAC-----GCTTCCCATGTGGCAAGTCCTAGTTCAGCCCTCATGAGAACCATCAGCTGTTGACCAGTGTTGCAAGCATTCACAAGGTATTCTTAAACC + +a +s mr.mrrefChr5 91144 25 + 294542 TATTAGACTAACAGAAAGGTCAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237819 25 + 636262 TCTTAAACTAACAGATAGGTCAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 228683 25 + 647215 TATGAGAGTAACACAAAGGTCAGGA + +a +s mr.mrrefChr5 91169 331 + 294542 AGTTGTGAGAAGATAGGTGGCCCATGTAAAGCTAGGTCATAACATGGCACATCATATTCCACTTAGCTCTATGAGTAACCCTATCCCATGAAAATATTGCTGGTTGTTTCTATAAATAGGGTCCCACCTGTTCTGCATGATGAATACTTGGTTATCTTAATCTTGGTATGTATTTCCACATGTATGCACCTGTAACAGCCAGTGGCATAGTCCTTTGGGTTAGATACAATGACCGGAGTGAACATGTGATTAGCACAATTATCATGTTGTTGCGTTTATCCCAGGACAAATACACCAAAAATGGCCCTCTCATAAATATTATCCCTCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 237845 313 + 636262 AGTTGTGAGAAGATAAGTGGCCCATGTAAAGCTAGGTCATAACATGGCACATCATATTCCACTTAGCTCCATGAGTATCTCTATCCCACATAAATCTTGCTGGTTGTTTCTATAAATAGGGTCCCACCTGTTCTGCATGATGAATACTTGGTTATCTTAATCGTGGTATGTACCTCCACATGTATGCACCTGTAAGAG------------------GAGTTAGATACAATGACCGGAGTGAACATGTGATTAGCACAATCATCATGTTGTTGTGTTTATCCCAGGACAGATACACCAAAAACAGCCCTCTCATAAATATTATCCCTGAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 228708 330 + 647215 AGTTGTGAGAAGATAGGTGGCCCATGTAAAGCTAGGTCATAATACGGCACATTGTATTCCACTTAGCTCTATGAGTAACCCTATCCCATGAGAATATTGTGGGTTGTTTCTATTAATAGAGTCCCACCTGTTTTGCATGATGAATACTTGGTTATTTCAATCTTGGTATGCATTGCCAGATGTATGCACCTGTAACAGCCAGTGGCATAGTCCTTTGGTTCGGATA-AATGACCAGAATGAACACCTGATTAGCACAGTTATCAGGTTGTTGCTATTATCCTGAGACAAATACACCAAAAATGGCCCTCTCGTAAATATTATCCCTCAGTT + +a +s mr.mrrefChr5 91500 43 + 294542 GAGACATCTACACCCTAAGATTCTGTCACACCCTATATAAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 238158 37 + 636262 GAGACATCTACACC------TTCTGTCAGACCCTATATAAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 229060 43 + 647215 GAGACATCTACACCCTAAGATTCTGTCACACCTTATATAAGGC + +a +s mr.mrrefChr5 91543 34 + 294542 AGTGGAGCTTCTTTCTGAGTTAGCTTTGGCAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 238200 34 + 636262 AGTGGAGCTTCTTTCTGAGTTAGCTTTGGCAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 229103 34 + 647215 AGTGGGGCGTCTTTCTGAGTTAGCTTTGGCATGA + +a +s mr.mrrefChr5 91577 208 + 294542 CCTAGTAGAATGACACTGAAATTTTATCAATATGCCAAATGACTGCGCATATATCCAATTTGAAGGGTGATTTGATGTTCAAGGGTATTTATTTTCCACAGATGGCATAGTCTCATCATGATGCTAACATGTTGCTACTATTGGATTAGGCTTCTCTAGTGGGATGTATGGTTGCATCTATAGTTGGATTCTGGATGCCGTTTATGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 238234 208 + 636262 CCTAGTAGAGTGTCCCTGAAATTCTATCAATTTGCCGAACGACTGCACATATATCCAATTTGAAGGGTGATTTGATGTTCAAGGGTATTTAATTTCCACAGATGGTGTAGTCGCATCATGATGCTAACATGTTGCTACTATTGGATTGGGCCTCTCTAGTGGGATGTTTGGTCACAGCTATAGTTGGATTCTGGATGCTGTTCATGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 229139 208 + 647215 CTTAGCAGAATGACACTGAAATTTTATCAATATGCCAAATGACTGCGCATATGTCCAATTTGAAGGTTGATTTGATGTTCAAGGGTCTTTATTTTCCATAGATTGCATAGTCTCACTATGATGCTAACATGTTGCTACTATTGGTTTAGGCTTCTCTAGCGGGATGTATGCTTGCATCTGTAGTTGGATTCTGGATGCCGTTTATGAA + +a +s mr.mrrefChr5 91785 446 + 294542 ACTTCTCACTTAAGGATAATACACTGTAATAATTCTTTAGGATAAATTTGGGAAAACTAGTATATTAAAAAGATGTCAGGTGAAACAATGCATGGGGTTGCAGTTCAAGTAAAAAGATTCCCACACCTAACCTACTCATACCTAGGAGTGAAGCAGAGACTGCCTATTGAGAGAAGGACTAGATACTTACTTCATACCCCAGCAGTACAGTATTATACACTATATTATGTACTATTACTCAATCTCATAGTCAGCCATAGGTAGGAATAGAAGTTAGTTGGGCAGAATAGTAAACTGATATGAGTACATACACTCTGTGTCAGTACCTGACCAGTTAAGCCACACGAGTGTCTGTTGATGCTACATGCTAATTGCTGGCTTTGATCTGAGGGTGAAAATAAAATGCTTTTCATCTTGACATATATGTGGATACAGAAATGATTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 238443 445 + 636262 ACTTCTCACTTAAGGATAATACACTGTAATAAATCTTTAGGATAACTTTGAGAAAACTATTATATTAAAAAGGTGTCAGGTGAAACAATGCATGGGGTTGCAGTCCAAATAAAAAGATTCCCACACCTAACCTACTCATATCTAGGAGTGAAGCAGAGACTGCCTATTGAGAGAAGGATT-GATACTTACTTCACATCCCAGCAGTACAGTATTATGCATTATATTATGTTCTATTACTCAATCTCATAGTCAGCCAGAAGTAGGAATAGAAGTTAGTTGGGCAGAATAGTAAACTGATATGAGTACATACACTCTGTGTCCGTACCTGACCAGTTAAGCCACACGAGTGTCTGTTGATGCTACATGCTAGTTGCTGGCTTTGATCTGAGAGTGAAAATAAAATGCTTTTTATCTTGACATATATGTGGACACAGAAATGATTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 229347 443 + 647215 ACTTTTCACTTAAGGATAATACACTGTAATAATTCTTTAGGATAAATTTAGGAAAACTAGTATATTAAAGAGATGTCTGGTGAAATAATGCATGGGGTTGCAGTTCAAGTTAAAAGATATTCACACCTAACCTACTCATACCTAGCAGTGAAGCAGAGACAGCCTCTTGAGAGAAGCACCAGATACTTACTTCATGCCCCAGCAGTACAGTATTATACACTATAA---GTACTATTACTCAATCTTATAATCAGGCATAGGTAGGAATAGCACTCATTTAGGAAGAATAGTAAACTGATATGAGTACATACACTCCGTGTGAGTACCTGACCCGTTAAGCCACACAATCATCTGTTGATGCTACATGCTAATTGCTGGTTTTGATCTAAAGGTGAAAATAAAATCCGTTTCATCTAGACATTTATGTGGATACAGAAATGATTAGT + +a +s mr.mrrefChr5 92231 100 + 294542 TTTTACCTGAACATGTTTGTGTAGAATATACAATGCAAAAACACATGTACATGCTGTTTCTATAACATACCTGTGAAGTATTACTTTCCATAAAAACACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 238892 100 + 636262 TCTCACCTGAACATGTTTGTTTAGAATGCACAATGCAAAAACACATGTACATGCTGTTTCTATGACATACCTGTGAAGTATTACTTTCCATAAAAACACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 229790 100 + 647215 TTTTACCTGAACATGTTTATGTGGAATATACAATGCAAAAACACATGTACATGACATTTCTAAAACATACCTGTGAAGCATTGCTTTCCACAAAAACACT + +a +s mr.mrrefChr5 92331 99 + 294542 GGCACAAGGAGACTATCGCCCCCTCATGCTTAAATATCACCATGTTTGCAACAGGTTTGCTCTGAACTTGGAAAAGAGAGCTATATGTTTGGTCATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239000 99 + 636262 GGCACAAGGAGACTATCGCCCCCCCATGCTTAAATATCACCATGTTTGCAGTAGGTTTGTTCTGAACTTGGAAAGGAGAGCTGTGTGTTAGGTCATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 229890 84 + 647215 GGCACAAGGAGACTAATTCCTCCTCATGCGTAAATAT----ATGTTTGCAACAGGTTTGCTCTGAGCTTGGGAAAG-AAG--AGAAGGTTG-------- + +a +s mr.mrrefChr5 92430 50 + 294542 TATCTTGGAAGATAGTGTGGAAGATCAGCATATGCCAAGTTTTGTCTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239307 50 + 636262 TATCTTGGAAGATAGTGTGGAAGATCAGCATATGCCAAGTTTTGTCTATT + +a +s mr.mrrefChr5 92480 143 + 294542 ACTTTCCCTACATGTGGGCAAAATAATTCCCCCAGTTATTGCCAAAGGAACTGCACTGTTAACTCAGATCCTCTGTCTTGGTGCCAAGAGGCAGGCTAGTATCTTTGCAGATTTGTTGCTCTAGGATTGGTATGCAGATAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239364 143 + 636262 ACTTTCCCTACATGTGGGTAAAATAATTCCCCCAGTTATTGCCAAAAGAACTGCACTGTTGACTTAGATCCTCTGTCTCAGTGCCAAGAGGCAGGCTACAATTTTTGCAGATTTGTTGCTCTATGATCAGTATGCAGATAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 229974 133 + 647215 ----------CAAGTGGGCAAAGTAATTCCCCCAGTTATTGCCAAAGGGCCTGTACTGTTATCTCAAATCCTCTGTCTTGGTGCCTAGAGGCAGGCTAGTATCTTTGCAGATTTGTCACTCTAGGATTGGTATGCAGATAGAG + +a +s mr.mrrefChr5 92623 265 + 294542 GACTCTTAAGGATTCCAACATCTGCTATGTGCAATTCAACCCTCCTGAGATTCTGGGTTGCAAAATTAGAAATATCATTGAGATATTCCTTAATTTAAGTGGACATGAATTAGCAAATGATATGACATCAGTGACCCTAACTACATGTGTCCACCAGATTAACTTCATTTTCTGTGATGACAAAATTGTTTGTCATCAGGGCTGATTGTAGATGGTCTATGGCCTGAAAAGATAGCCAAAGCAGAAAATGAACAACTACTTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239509 263 + 636262 GGCTCTTAAGGATCCCAACATCTGCTATGTGCAATTCAATCCTCCTGAGATTCTGGGTTGCAAAATTCGAAATATCATTGAGATATTCCTCAATTTATGTGGACATGAATTAGCAAATGATATGACATCAGTGATCCTAACTA--TGTGTCCACCAGATTAACTTCATTTTCTGTGAGGACTCAATTGTCTCTCATCAGGGCTGACTGTAGGTGGTCTATGACCCGAAAAGATAGCCAAGGCAGACAATGAACAACTACTTTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 230108 262 + 647215 AACTCCTAAGGATTCCAACATC--CAATGTGCAATTTGCCCCCCCTGACATTCTGGTTTGCAAAATCAGAAATATCATTGAGATATTCCTTAATCTAAGTGGACATGTATTAGCAAATGATATCACATCAGTGACCCCAACTACATGTGTCCGCCAGATTAACTTCATTTTCTGTGATGACAAAATTGTTTGTCTTCAGGGCTGATTGTAGATGGT-TATGGCCTGAAAAGATACCCAGAGCAGAAAATGAACAACTACTTTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 92888 110 + 294542 TCAAAGGCCTCAACATTTCAAGCTGTACTGAGATGTTAGCCCAACTTCCAGTCCTAACCAGTAGTACTTCCAGGCCAGACAACAATAGTTTACTCCCATCAATTTGGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239772 110 + 636262 TCAAAGGCCTCAACATTTGAAGCTGTACTGAGATGTTAGCCCAACTTGCAATACTAACCAGTAGTACTTCCTGGCCAGACAACAATAGTTTACTCCCATCAATTTGGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 230372 110 + 647215 TCAAAGACCTCAACATTTCAACTTGTACTGAGATGTTAGCCCAACTTCCAGTCCTACATAGTAGTACTTCCAGACCAGACAACACTAGTTTACTCCCATCACTTTGGGGG + +a +s mr.mrrefChr5 92998 27 + 294542 TTATACAAAGTATTACAACTGGTGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239886 27 + 636262 TTATACAAAGTATTACAACTGGTGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 230482 27 + 647215 TTATACAAAGTATCACAACTGGTGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 93025 24 + 294542 TTAGCTATCAGCCTGGAGGATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239919 24 + 636262 TTAGCTATCAGCCTGGAGGATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 230509 24 + 647215 TTAGCTATCAGTCTGAAGGATGCT + +a +s mr.mrrefChr5 93049 166 + 294542 GGATTGCACCCTCATATACTCATGTTACCTGTCTCCTGTTACCTGTTTGCAGTAGATGCTTGGGTAAAGTAGCAGCTAAAGGCTATGATCCACCATTCACTGCTCATAAGAGTGAACATGGATCCCAATGAAGCAGGCTAGTGAGGTTAGACTCCAAATTACTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 239944 165 + 636262 GGATTGCACCCTCAGATACTCATGTTACCTGTCTCCTGTTACCTGTTTGCAGTAGATGCTTTGGTAAAATA-CAGCTAAAGGCTATGATCCGCCATTCACTGCTTATAAGAGTGAACATGGATCCCAGTGAAGCAGGCTAGTGAGGTTAGAATCTAAATTACTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 230533 152 + 647215 GGATTGCACCCTCATATATT--------------TGTGTAACCTGTGTGCAGTAGATGGTTGGGTAAAGTAGCAGCCAGAGGCCACAATCCACCATTCACTGCTCATAAGAGTGAATATGCATCCCAATGAAGCAGGCTAGTGAGGTTAGACTCCAAATTAATTTA + +a +s mr.mrrefChr5 93215 370 + 294542 GGGGTGCCACAACAATGGTGAATCGACTGCCCTCTGGGGCTATAATCTTCTCACATACCTCACCGCAACCATCAGTGAAGGACCAGGTTTAACTATGTCCACGTAGGTCTTGAGTATTACCCCTTCCCCATTGAGGGGATCTTATACGGGGAGAAAATTTCCTTATGGATACTTTTAGAGTATACTCTGATAATACGGTCAGCCCATTTATATATGCTTTGCCTTGCAACAACCTAGCAGAGTTCAAGCGCACTCAGCTGGCAGGATTATTGACCCTATGAGTGAATTAAGGGTCGCATTGTGGGTAATAATGATGTGTCCAAAATAGCATTCAGATTTAAAGTGGTCTCCAAGTCTCTCCTGTCAGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240109 353 + 636262 GGGGTGCCA-ATAAATGGTGAGCCGACTGCCCTCTTGGGCTATAATCTTCTCACCTATCTCACCGCAATCATC---------------TTGACTATGTCCACGTTGGTCTTGAGTATTACCCCTTCCCCATTGAGGGGATCTTATAC-AGGAGAAAATTTCCTTATGGATACTTTTAGAGTAAACTCTGATAATACGGTCAGCCCATTTATATATGCTTTGCCTTGCAACAACCCAGCAGAGTTCAAGCGCACTCAGCTGGCAGGATTATTGACCCTATGAGTGAATTAAAGGTCGCATTGTGGGTACTAATGATGTGTCCAAAATTGCATTCAGGTTTAAAGTGGTCTCCAAGTCTCTCCTGTCAGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 230687 356 + 647215 GGGCTGCCACAACAATGGTGAATCAACTGTCCTCTGGGGCTATAATCTTCTCACATACCTCACCGCAACCAACAGTGAAGGACCAGGTTTAACTATGTCCACGTAGGTGTTGAGTATTACCCCTTCCAGATTGAGGGGATCTTATACGGGGAGAAAATTTCCCTATAGACATTTTTAGAGTATACTCTGATAACACTGTCAGCCCATTTATATATGCTTTGCCCTGCAACAACCTAGCA-AATTCAAGGGCACTCAGCTGACAGGGTTATTGACCCTATGAGTGAATTAAGGGT-------------ATAATGATGCGTCCAGAATAGCATTCAGATTTAAAGTGGTCTCCAAGTCTCTCCTGTCAGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 93585 79 + 294542 TGTATAAATGATAATCAATGTGACTTCGGCCTTTTTTACAGTCCCGAGCACTTATAGAACTCAATCCAAATTGTACTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240491 78 + 636262 TGTATAAATAAAAATCAATGTGGCTTCAGCCTTTTTTA-AGTCCCAAGCACTTATAGAACTCGATCCAAATTGTACTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 231043 79 + 647215 TGTATAAATGGTAGTCAATATGACTTTGGCCTTTCTTACAGCCCCGAGCACTTATAGAGCTCAATCCAAATTGTACTTA + +a +s mr.mrrefChr5 93664 9 + 294542 GGGTCCTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240574 9 + 636262 GGGTCCTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 231122 9 + 647215 GGGTCCTTC + +a +s mr.mrrefChr5 93673 65 + 294542 TAGCCACCCCTTGTTCCTCTCTGACAGGGAAGATTACATCAACACTTTTTAATACATGATTATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240614 61 + 636262 TAGCCACCCCTTGTTCCTCTCTGACAGGGAAGATTACATCCACACTTT----TACATGATTATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 231131 65 + 647215 TAGCCACCCCTTGTTCCTCTCTGACAGGGAAGATTACATCAACACTTTTTAATCTATGATAATTC + +a +s mr.mrrefChr5 93738 49 + 294542 TAGTTCTTGGCGCATTTTTCTGTACTAGTCATATCATAACTAAGGTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240675 49 + 636262 TAGTTCTTGGCGCATTTTTCTGTACTAGCCATATCATAACTAAGGTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 231197 49 + 647215 TAGTCCCTGATCCATTTTTCTCTACTAGTCATATCATAACTAAGGTAAG + +a +s mr.mrrefChr5 93787 152 + 294542 CTAGAATGGAATCAGGACCTAGGAGACTGAACCATCTAAAACACACAAGGTATATCCCCATACTCTTACTGGTGATGTGATGAAGTATTCACATGCTTAAGTCTTGTGAGCATTTAGGTAATAATAAGCTACTGGAGTAATCAACTTGCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240725 151 + 636262 CTAGAATGGAATCAGGACCTAGGAGACTGGACCATCTAAAACACA-AAGGTATATACCCATACTCTGAGTGGTGATGCGATGAAGCATTCACATGCTTAAGTCTTGTGAGCATTTAGGTAATAATAAGCTACTGGAGTAATCAACTTGCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 231246 136 + 647215 CTAGAATGGAATCAGGATCTAGGAGACTGAACCATCTAAAGCACACAAGGTATAGCACCATACTATTACTGGTGATGTGAGGAAGTATACACATGTTTAAGTCTTGTGAGTATTTAGGTAATAATGAGCTACTGGA---------------- + +a +s mr.mrrefChr5 93939 161 + 294542 TACTTGTTAATAAGTGACATAGAGCCTAGAAATTAGTAGCTTTCTTAGAAGGACACCAGCCACATCATTACATGTCTACAAGAATTCAGGGCATCAAAAACATGAGAGAGTGGGGACTCTTCAAGGTCAGTGAAACGAGGAGATTTAGGATGTTGATAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 240881 161 + 636262 TACTTGTTAATAAGTAACATAGAGCATAGAAATTAGTAGCTATCTTAGAAGGACACCAGCCACATCATTACATGTCTACAAGTATTGAGGGCATCAAAAGCATGAGTGAGTGGGGACTCTTCAAGGTCAGTGAAATGAGGAGATTTAGGATGTTGATAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 231382 160 + 647215 TCCTTCTTAATAAGTGACATAGAGCCTAGAAATTAGTAGCTTTCTTAGAA-GACACCAGCTACATCATTACATGTCTACAAGAATTCAGGGCATTAAAAACATGAGAGAGTGGGGGCTCTTCAGGGTCAGTGAAACAGGGAGATCTATGATGTTGATAGTT + +a +s mr.mrrefChr5 94100 63 + 294542 ATAATCACCTGTTATTCTTCCTACAGTATTTTGTCTCAGTGTGGCAAATGTTTGATACTTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241042 61 + 636262 ATAATCACCTGTTATTCTTCCTACAGTATTTTGTCTCAGTGTGGCAAATGTTTGATACTTT-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 231543 63 + 647215 ACAGTCACCCGTTATTCTTCTTAAAGGGTTTTGTCTCACTATGGCAAGTGTTTAATACTTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 94163 170 + 294542 TCTAATTCTATGAAGGAGTATTGTACTGTTGATCTACTCTAGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGCAATCACTATCATCCTTAATGATGTGGCTAACGGCATCTGGTTCATTGGTATTTCACTAACTCAACCTTGGGTAGATACTCTAGCTACTACATCTTTCCTCCCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241103 166 + 636262 TCTAATCCTATGAAGGAGTATTGTACCGTTGATCTA----GGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGAAATGACTAGCATCCTTAATGATGTGGTTAATGGAATTTGGTTCATTGGTATTTCACTAACTTAACCTTGGGTAGATACTCTAACTACTACATCTTTCCTCCCCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 231607 170 + 647215 TCTAATTCTCCGGAGGAGTATTGTACTGTTGATCTACTCTAGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGCAATCACTATCGTCCTTAATGATATGGCTAACGGCTTCTAGTTCATTGGTATTTCACTAACTCAACCTTGGATAGATGCTCTAGCTACTACATCTTTCCTCCCCCC + +a +s mr.mrrefChr5 94333 28 + 294542 AGTAGAGGCCGTACACATTTGGGAACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241270 28 + 636262 AGTAGAGACCGTACACCTTTGGGAACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 231777 28 + 647215 AGTAGATGCGGTACACATTCGGGGAATG + +a +s mr.mrrefChr5 94361 83 + 294542 GGGACACTGGCAGATATGGCTCCAGAAAGATTGACTTTGGTTGACATAAGGGGTACATCAGAGCTGGGATCAGTGGTAATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241298 83 + 636262 AGGATACTGGCAGATATGGCTCCAGAAAGATCGACTTTGGTTGACATAAGGGGTACATCAGAGCTGGGCTCAGTGGTAATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 231812 83 + 647215 GGAACACTGGTAAATATGGCTCCAGATAACATGACTTTGGTTAACATTGGGGGTACATCAGACCTGGGATCAGTGGTAATCAA + +a +s mr.mrrefChr5 94444 125 + 294542 CCCTCACAACAAAAATTAAGGATGCAATGGCAATCGTGCCATCCATTGAGTGGGTAAGCTTTTGATGATACCATGACTGCCTTATTGAAAAGCTAAACACACTGATAGCAAAAACTGTAATCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241385 125 + 636262 TCTTCACAACAAAAATTAAGGATGCAATGGCAATCATGCCATCCATTGAGTGGGTAGGCTTTTGATGATACCATCACTGCCTTATTGGAAATCTAAACACATTGATAGTAAGAGCTGTAATCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 231895 119 + 647215 CCCTCACAACAAGAATTAAGGAGGCAATTGCAATTGTGCCATCC------TGAGCAAGCTTCTGGTGATTCCAGGGTGGCCTTATTGAAAAGCTAAACACACTGATAGCAAAAACTGTAATGCAA + +a +s mr.mrrefChr5 94569 82 + 294542 CCATGAGTAGGAAGCAGCACCTGTTTATTTGCACACCTGGATGCATTTGACTGCATTCTTCACCCCTTAATATCCTCACAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241512 82 + 636262 CCATGAGTAGGAAGCTGCACTTGTTTATTTGCACACCTGGATGCATTTGACTGCATTCTTCACCCCTTAATATCCTCACAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 232014 82 + 647215 CCATGAGTAGGAGGCAGCACCTCGTTATTTGCATGCCTGGATGGCTTTGACTGCATTCTTCACCCCTTAATATCTTCACAGA + +a +s mr.mrrefChr5 94651 50 + 294542 TCCAGGAGGTCACATCTTGATCCCCACTCAGAATGGAGAGCTTTGGTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241596 50 + 636262 TCCAGGAGGTCACATCTTGATCTCCACTCAGAATGGAGAGCTTTGGTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 232096 50 + 647215 TGCAGGCGGTCACATCTTGATCCACACTCAGAATGGAAAGCTTTGGTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 94701 96 + 294542 AGTTGAAGTCTTGGCTGGTCACTTACATATTGGGCAGCCAAGTTCTCAAGTGTGTCTCTCACATGTGGCTTATTGCAGGACAGTCTAATTGAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241646 88 + 636262 AGTTGAAGTCTTGGCTGGTCACTTACATATTGGGCAGCCAAGTTCTCAAGTTTGTCTCTCACATGTGGCATATTGGAGGACAGTCTAA-------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 232147 96 + 647215 AGTAGAAGTCACAGCTGGTCACTCACTTATTGGGCAGTTAAGTTCTCAATTGTGTCCCTCACATGTAGCTGATTGCAGGACAGTCTAATTGAGCAA + +a +s mr.mrrefChr5 94797 55 + 294542 CCGTTCCATAAAGTTTTAAAGGAACCTGTATCATGAAGTGGACCTCAATATGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241734 55 + 636262 CCGTTCCAAAAAGTTTTAAAGGAACCTGTATCGTGAAGTGGACCTCAGCATGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 232246 55 + 647215 CCGTTCCATAGAGTTTTAAATGAACCTGTATCATGATGCGAACCTCAATATGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 94852 103 + 294542 ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATAAATGTGGGAATGTACAAAGCCAGTAGAAAAACATGCCTCTGTAATGACATCGACTGTTACACTGTAAGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241789 101 + 636262 ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATAAATGTGGGAATGTACAAAGCCAGT--AAAAACATGCCTCTGTAATGACATCGACTGTTACACAGTACGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 232302 98 + 647215 ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATGAATGTGGGAATGTA-----CCAGTAGAAAAACATGTCTCTTTAATAACATCGACTGTTACACTGTTAGCAG + +a +s mr.mrrefChr5 94955 208 + 294542 TGAGCTACAGCAGGAGTAGACCTCAGAATGACCTAGGATAACATACGGTAATCGGCCCACGAAGTGAATCAGCTAACCATGTGAGTTGTGAGTTTAACTTAATACTTCTAGTACTCACACAATGCAAGGTATCATTTAGAGCCCCCAGCTGTAGTGAGGGTTCACTTCAGAAGACCCTGGGATTACACATGGAGACTCCTGGAGAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 241917 200 + 636262 TGAGCTACAGCAGGAGTAGATCTCAGAATTATCTAGGATAACATGCAGTAATCTGCCCACGGAGTGAATCAGCTAACCTTGTCAGTCGTGATTTTAACTTAATACTTCCAGTACTCACACAATGCTAGGTATCATTTAAAGCCCCCAGCTGTGGTGAGGGTT--------AAGACCCTGGGATTACACATGGAGAGTCCTGGAGAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 232400 208 + 647215 TGGACTACAGCAGCATTAGGCCTCAGAATGCCCAAGGATAACATATGGTAAGCGGCCCAAGAAGTGACTCGGCTTACCACATGAGTTGTGAGTTTTACTTAATACTTCTAGTACTCTCACAATGCAAGGAATCGTTTGGAGCCCCCAGCTGTAGTGAGGGGTCACTTCAGAAGAGCCTGGGATTACATATGGAAACTACTGGAAAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 95163 94 + 294542 GTCACAGGTAGTCACAGGGCTTGTGGGCATGTTTTGAACTTTACAGTGATGGATGGCACATGCCATGAATATACCGCAAATACCTCTTGAATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242117 66 + 636262 ----------------------------ATGTTTTGAATTTTACAGTGATGGATGGCACATGCCATGAATATACCGCAAATACCTCTCGAATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 232616 94 + 647215 GTCACAGGTAGTCACAGGGCTTGTGGGCATGTTTTGAACTTTACAGTGATAGGTGACACATGCCATGAATAGACCACAAATACCTATTAAATAA + +a +s mr.mrrefChr5 95257 97 + 294542 CTGTAGTCTACTTAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGTGAGGCCCATTTTCTAAGGTTCCCAGCACCATAAAGAAATCCAGCAGGGCGCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242194 97 + 636262 CTGTAATTTACTTAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGCGAGGCCCATTTTCTAAGGTTCCCAGCACCATAAAGAAATCCAGCAGGGTGCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 232710 97 + 647215 GTGTAGTCTACTCAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGTGAGGCCCATTTCCTAAGGTCCCCAGCATCATAGAGAAATCCAGCAGGGCGCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 95354 77 + 294542 GTGAACAAGCCTATCAATTTGTGAATGTATGCTATTTCCTAAAATTGAGGTCAGAACAGGCATGTTCTGAGATCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242295 57 + 636262 GTGAACAAGCCTATCAATTTGTAGATAT--------------------GGTCAGAACACGCATGTTCTGAGATCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 232807 77 + 647215 GTCAATAAGCCTATCAATTTGTGAATGTATGCTATTTCCTAAAATTGAGGTCAGAAAAGGCATGTTCTGAGATCTGG + +a +s mr.mrrefChr5 95431 369 + 294542 GTTCTGAGATCTTGACCCAGAATACATTTAGTACGATTCTTTTGTGAGCTCTCAGTCAGATGAAACAAGAGACATGCAAGATTCTAAATGCCTTGTGAAGTAAGTCAGATTGTGAGGACCCAGATTAGGAGACATATATGGATTGACTGTCCCACTAAGCTTGCTGCACATCACTAAGCGAGCCTCCAGATGATTTACATCTTACCATAGTTTTTCCTTTGCCATTGTGAAAGGCTACAAAAAGTAATGCGTACTCTCTAACAATGATGTGAGTCAGTCTTGATAGGTTGTCAGGATTAAGTGATATATATCAGTAGATGATACACTAGATGATATGAAACGCTAGACCTCTTACAATCATGGGCTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242354 364 + 636262 GTTCTGAGATCTTGACCCAGAATACATTTAGTACGATTCTTCTGTGGGCTTTCAGCCAGATGAAACAAGAGACATGCAAGATTCTAAATGCCTTGAGGAGTAAGTCAGTTTGTGAGGACCCAGATTAGGAGACATGTATGGATTGACAGTCCCACCACGCTTGCTGCACATCACTAGGCGAGCCTCCAGATGATTTACATCTTACCATAGTTCTTCCTTTGACATTGCGAAAGGCTACAAAACATATTGCATACTTTCTAACAATGATGTGAGTCAGTCTCGACAGGTTGTCAGGATTAAGTGATGTATATCAGTAGATGATACACTAGATAATATGAAACACTAGACCTCTTATAATCATGGG----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 232884 326 + 647215 ------------------------------GTACACTTCTTTTGCGAGCTCCCAGTTAGATGAAACTGGATA-------------AAATGCCTTGTGAAGTGAGTCAGATTGTGAGGTCCCAGATTAGGAGACATATATGGATTGACTGTCTGATTAAGCTTGCTGCACATCGCTAAGCAAGCTGCCAAATGATTTATATATTACCATAGTTTTTCCTTCGCCATTGTGAAAGGCTACAAAAAGTAATGCGTACTCTCTAACAATGATGTGACTCAGTCTTGTTAGGTTGTCAGGATCAAGTGATACATCTCAGTTAATGATACATTAGATGATGTAAAACGCTAGACCTCTTCCAATCATGGGCTCAC + +a +s mr.mrrefChr5 95800 8 + 294542 AAtccAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 689 8 - 636262 AATCCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 352577 8 + 647215 ccaccTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66880 3 - 647215 AA-----A + +a +s mr.mrrefChr5 95808 24 + 294542 GACTTCGAAGTCGCAAACAAAGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242718 24 + 636262 GACTTCAAATTCACAAACAAAGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 697 24 - 636262 GACTTCGAAGTCGTGAACAAAGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 352588 24 + 647215 GGCTTCTAAGTCGCAAACAATGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 66883 19 - 647215 GG-----AAGTCGCAAACGAAGCA + +a +s mr.mrrefChr5 95832 4 + 294542 TACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242742 4 + 636262 TACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 721 4 - 636262 TACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 66902 4 - 647215 TATG + +a +s mr.mrrefChr5 95836 61 + 294542 CAAGGCAGTCGCATACCAGAGTGCTCAGTTAGCAAATCGTCTCGAGCGAATCATGACCGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242746 61 + 636262 CGAGGCAGTCGTATACAAGAGTGTTCAGTTAGCAAATCGTCTCGAGCGAGTCATGACCGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 725 61 - 636262 CAAGGCGGTCGCATACCAGAGCGCTCAGTTAGCAAATCGTCTTGAGCGAATCATGACCGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 352612 61 + 647215 CAAGGCTATAGCAGACCAGAGGACTCAAATGGTGGATAATCCCGAGCCAATAATGGCTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 66906 61 - 647215 GGAGGCCATAGCATACCAGAGTGCTCAAGTGGCAGATAGTCCTGAGCTAATAATGACTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 95897 19 + 294542 GGCCCAGACAGTACGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242807 19 + 636262 GGCCCAGACAGTATAATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 786 19 - 636262 GGCCCAGACAGTACGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 66967 19 - 647215 GGGCCACACAATTCGATGT + +a +s mr.mrrefChr5 95916 31 + 294542 AGCACTCACTGGTTATTAAGACTTTCGTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242826 31 + 636262 AGCACTCACTGGTTATTAAGACTTTCGTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 805 31 - 636262 AGCACTCACTGGTTATAACGACTTTCGTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 67036 12 - 647215 AGCACTCATTAG------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 95947 25 + 294542 CATTATTACCAACGAATTTTGGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242877 25 + 636262 CATGGTTACCAACGAAGTTTGTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 836 25 - 636262 CACTATTTGCAAAGAATTTTAGATT + +a +s mr.mrrefChr5 95972 19 + 294542 TCTCCACACAAAACACAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242902 19 + 636262 TCCCCACACAAAGCACCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 958 19 - 636262 TCTCCAATCAAGAAACAAG + +a +s mr.mrrefChr5 95991 4 + 294542 GCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242921 4 + 636262 GCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 987 4 - 636262 GCCA + +a +s mr.mrrefChr5 95995 2 + 294542 CT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 994 2 - 636262 CT +s simRat_chr6.simRat.chr6 352673 2 + 647215 CT +s simRat_chr6.simRat.chr6 67048 2 - 647215 CT + +a +s mr.mrrefChr5 95997 110 + 294542 CGTTTATCACGGCCACATGAGTCCCCCTATCCCAATTTGAAATGTGTcactcatgggctcgcttatgatggccagtggtcaaggcctcggattcacctcgcacatgaaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 242925 97 + 636262 CGTTAGTCACCGCCACATGAGTCCTCCTTTC-------------TGTcagtcatgggctcgcttatgatggccagtggtcaaggcctcggattcaccttgcacatgaaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 996 7 - 636262 TGCTTTT------------------------------------------------------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 352675 110 + 647215 CGTTTATCACGGTGACATGAGTCCCTTTATCCTGATTTGAAATGTGgcacttagggggtcgtctatgatggcctgtggccaaggcctcggattcacctcgcacatgaaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 67050 110 - 647215 CGTTTATCACGGCCACGTGGGTCCCCCTATCCCAATTTGAAGTGTGAcactcatgggctcacttatgagggccagtggtcagggcttcggattcacctcacacacaaaag + +a +s mr.mrrefChr5 96107 103 + 294542 atggtacttcctgtacaacggttccaccgaacatgatgtcaggtcactgggtcagtacagatgccgagggcagagtcccccccacagaatcgcctaccccatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243022 103 + 636262 atggaacttcctgtacaatggttccagcgaatatgatgtcaggtcactgggtcagtactgatgccgagggcagagtcccccccacagaatcgcctaccccatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 353021 103 + 647215 atggtccttcgtgtacaacggtaccaccaaacatgatgtcaggtcactgcgtcagtacagatgccgagggtggcgtcccacccacaaagtcacccaccccact +s simRat_chr6.simRat.chr6 67160 65 - 647215 atggtacttcctgtacaacagtgccactgtacatgatgtcaggtcgctgggtcagtacagatacc-------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 96210 10 + 294542 TAGGTATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243131 7 + 636262 CAAGTAT--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 233210 10 + 647215 TAGGTATAGC + +a +s mr.mrrefChr5 96220 42 + 294542 CAGTCTCAAGAAGAGTTAGGGTGCTTCGTGGTGAATTTCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243138 41 + 636262 -AGTTTCAAGAAGAGTTAGGGTGCTTCGTGGTGAATTTCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 233221 42 + 647215 CAGTCTGAAGAAGAGTTAGGGTGCTTTGTGGTGAATTCTTGG + +a +s mr.mrrefChr5 96262 148 + 294542 CTATCTTCCATTGTGAGACCCAACTGGGTTCTATCTGAAGCTTTACTGCATCAATCAGGCAGTGAACTATAGTCTTGTTTTGTCTTTTAACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAATAGGGGCTTTAAGCGTTTGCATGTATTAATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243184 148 + 636262 CTATCTTCCATTAGGAGAACCAACTGGGTTCTATCTGAAGCTTTACTTCATCAATCAGGCAGTGAACTATAGTCTGGTTTTGTTCTTTAACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAATAGGGGCTTTAAGCGTTTGCATGTATTAATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 233263 136 + 647215 CTATCTTCTGTTGTGAGACCCAACTGGGTTCTATTTGAGGCTTTACTGC---------GCAGTGAACTATAGTCTTGCTTTTTCTTTTGACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAACA---GCTTTAAGTGTTTGCATGTATTGATACA + +a +s mr.mrrefChr5 96410 255 + 294542 TTCCCTAGCACATACATTTAAGAGTCAGGATGAATAATTGAGAGAGAAGTGATGCTTGAACTCAAGAACGCAGAACTGGAATGTATGAATGACTTAACCATGAATTCAGACTGTAATGCACTCCTACGCTAGATATCCTAGACTCTGTATCAATGAGAGCTGCAGCCGAGTAGCTTCTTATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTTGCCCTGTTAAGCCTTACTTTGATATGTTTCCTTGAGACTATCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243333 243 + 636262 TTCCCTGGCACATACATTTAAGAGTCAAGAAGAATAATTGAGAGAGAAGTGATGCTTGAACTCAAGAACGCAGAACTGGAATGTATAAATGACTTAACCATGAAAACAGTC--TAATGCACTCCTACGCCAGATATCCTAGACTCT-TGTCAATGAGAGCTGCAACCTAG--------CATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTCGCCCTGTTAAGCCTTACGTTG-TATGTTTCCCTGGGACTATCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 233399 254 + 647215 TTCCCTAGCACATACCATTAGGAGCCAGGATGAATAACTGAGAGTGAAGTTATGCTTGAATTCAAGAA-ACAGAACTGGAATATATGAATGACTTAACCATAAATTCAAACTGTAATGCACTCCTTCTCTAGATATCCTAGACTCTGCATCAATGAGAGCTACAGTAGAGTAGCTTCTTATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTTGCCCTGTTAAGCCTTACTTTGATGTGTTTCCTTGAGACTATCG + +a +s mr.mrrefChr5 96665 319 + 294542 TGATCGCACACCATTATTGCATTACTGGTTGGGTTGGCCTTCTCTCATCACATATAATGTCTAATACGGAGTTGCACAAAGTTTTAGTACCTGCTGTTGGTCATTAGGGAAACATAATGTGATATTTAAAGTAGAAGATGATGGCCTTGTCCTGCCTCATTCTTGAGATCTACATTTTATTAGTAAAAATTGGGTTCACCTATCACCTGTATAGATAATTCATAGTTGTGGTAGATGCACCTTTACCCTAAACATGGAAATTCAACAGATTGAGTGACTTTAGTGACCACATGATGGGTCAGTCCTGCCCTTTAGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243592 309 + 636262 TGATCGCACACCCTTAT--CATTACT-GTTGGGTTGGCCTTCTCTTATCACAT-TATTGTCTAACACGGAGTTACACAAAGTTTTAGTA------GTTGGTTATTAGGGAAACATAAAGTGATATTTAAAGTAGAAGACGGTGGTCTTGTCCTGCCTCATTCTTGAGATCTACATTTTATTAGTAAAAATCGGGTTCACCTATCACCTGTAGATGAAATTCATAGTTGTGGTAGATGCACCACCACCCTAAACATGGAAATTCAACCGATTGAGTGACTTCAATGACCATACGATGGGTCAGTCCTGCCCTTTAGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 233653 318 + 647215 TGATCGCACACCATTATTGCATTACTGGTTGGGTTGGTCTTCTCTCATCACATATAATGTGTAATACAGAGTTGCACAAAGTTTTAGTACCTGCTGTTGGTCATTAGGGAAACATAATCTGATATTTAAAGTAGAAGATGATGGCCTTGTCCAACCTCATTCCTGAGATCTACATTTTAACACTAAAAATTGGGGGCACCTATCACCTGTATAGATAATTTATAGTT-TGGTAGATGCATCTTTACCCTAAACATGAAAATCCAACAGATTCAGTGACTTTGGTGACCGCATGATGGGTCTGTCCTGCCGTTTAGCACA + +a +s mr.mrrefChr5 96984 200 + 294542 CAAATGGAGGAAGGACATTCACTACAAGATATAATTATTCACATTACAGGATTTTTCGTTGTTTATCCTCCTTGGGTTGTGGTTCATCAAGATGAAAGTTCTTCTCCAGTTGTGGTATGTTGGAACTAAGATACCATTAAACAAAAATAGTGAACAATATATCACCTCCTCTCGTGACTTGATGGAAAGATAGCTAGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243902 199 + 636262 CAAGTGGAGGAAGGACATTCACTACAAGATATGATTACTCACACTACAGGATTTTTCGTTGTTTATACTCCTTGGCTTGTGGTTTATCAAGGTGAAAGTTCTTCTCCAGTTG-GGTATGTTGGAACTGAGATACCATTAAACAAGAATAGTGAACAATATATCACCCCGTTTCGTTACTTGATGGAAAGATAGCTAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 233971 200 + 647215 CAAATGGAGGTAGGATATTCACTACAAGACATAATCATTCACATTACACGCCTCTTCATTGTGTATCCCCTTTGGGTTATGGTTCATCAAGATGAAGCTTCTTCTCCAGTTGTGGAATGTTGGAACTAAGATTCCATTAAACAAAAATATTGACCAACATATCACCTCCTCTCATGACTTGATGAAAAGATTGCTAGGGA + +a +s mr.mrrefChr5 97184 93 + 294542 TTATTATTGAGTAAACCAAGATATTTTTCAGCAAGAAAAGTGTAATAGTAGAAGCAGGAAATGAAACAAATCAGTTAAAGATTGGTGTTGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244102 93 + 636262 TTATTATTGACTAAACCAATATATTTTCCAGCAAGAAAAGTGTAATCATAGAAGCAGGAGAAGAAACAAATCAGTTAAAGATTGGTGTTAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 234171 93 + 647215 TTATTATTGCGTAAACAAAGATATTTTTCAGCAAGAAAAGTATAATAGCAGAAGCAGGAAATGAAACAAATCAGTTAAAGATTGGTGTTGGAT + +a +s mr.mrrefChr5 97277 68 + 294542 CTATCCTATGAATTTATTGGTGTTCATGAAACTTCACTGGGATGGATGAACTCGACTGTGGTTTATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244195 54 + 636262 --------------TATTGGTGTTCATGAAACTTCACTGGGATGGATGAACTTGACTGCATATTATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 234265 68 + 647215 CTATCCTATGAATTTATCCGTGTCCATGAAACTTCACTGGGGTGGATGAACTCGACTGTGGTTCATAA + +a +s mr.mrrefChr5 97345 380 + 294542 CCCACTGAATCAGATGAAAGGGGTATTGTCAAGTGCACATTGCCAATTCTCAGTGAAGTAGTGTAGTGATTGACCATCAGGCACTACTATCAGTGTGAACATCAGTGTGAACAGCATTCTTTAGTGATTAAGCTTTTGATAGAAGACAGCTTCATTGAGAGCACATGAGGTATCTTTTGCTTTCAATAGCAGATGTCCTACCAACTAGAGTCTTTCAATTTCTTTTGTGCACAAATTAATGAGTGCCACATTGCCACAATGTTCGTAGCCCCTATAAGGAGGTTGTTTGTCTTACAAGCATGGGAACCAGAGTGTACTCACTGCCGGTGCTTTCCAGCATCTAGAAAGAATACAGATCAGGATGTTAGAGAGCACTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244251 371 + 636262 CCCACTGAAACAGATGATAGGGGTATAGTCAAGTGCGCAATGCGAATTCTCAGT-----TGTGTCGTGATTGACCATTAGGCACTACTATAAGTGTGAACATCAGTGTGAACAG---TCATTAACAATTAAGCTTTTGATAGAAGACAGCTTGATTGAGAGCACATGAGGTATCTTTTGCTTTCAATAGCAGATGGCCTACAAGCTAAAGTATTTGAATTTCTTTTTTGCACAAATTAATGAGTGCCAGATTGCCACAACGTCAGTAGCCCCTACAAAGAGGATGTTTGTTTTACAAGTATGGGAACCAGAGTGTACTCACTGCCGGTGCGTTGCAGCATCTAATAAGAATACAGATCAGGATGTTA-AGATCACTCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 234333 377 + 647215 CCCACTGAATCTGATGAAAGGGGTAATGCCAAGTGCACATTGCCAATTTTCAGTGAAGTAATGTAGTGACTGAC---CATGCACTACTATCAGTGTGAACATCAGTGTCAGCAGCATTCTTTAGTGATTAAGCTTGTGATAGAAGACAGCTTCATTGAAAGCACATGAGGTATCTTTTGCTTTCAATAGCAGATGTCCTACCAACTAGAGTCTTTCAATTTCTTTTGTGCACAAATTAACGAGTGCCACATTGCCACAATGTTCGTAGCCCCTATAAGGAGGTTGTTTGTCTTACAAGCATGGGAACCAGAGTGTACTCACTGCGGGTGCTTTCCAGCATCTAGAAAGAATACAGATCAGGATGTTAGAAAGCACTCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 234876 189 + 647215 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GATGTCCTACCAACTAGAGTCTTTCAATTTCTTTTGTGCACAAATTAATGAGTGCCACATTGCCACAATGTTCGTAGCCCCTATAAGGAGGTTGTTTGTCTTACAAGCATGGGAACCAGGGTGTACTCACTACCGGTGCTTTCCGGCATCTAGAAAGAATACAGATCAGGATGTTAGAGAGCACTCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 97725 38 + 294542 GTAACACCTTTTCATGATATATTGAACATGAAGATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244668 38 + 636262 GTAACACCTCTACTTGATATATTCACCATGAAAATCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 234710 38 + 647215 GTAACACCTTTTCATGATATATTAAACATGAAGATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 235065 31 + 647215 GTAACACCTTTT-------TATTGAACATGAAGATCTT + +a +s mr.mrrefChr5 97763 128 + 294542 CATGAAGTTGAGACTGGTTAGCACTGGGATGATATGGCTTGCCACAGTCAAGTCCCCTGTGCGAAGCCTAAGGAAGTTAATAGATCAGATCATTCTGACTTTCTTCATAAAGTTGACTTTGAAAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244707 128 + 636262 CATGAAGCTGAGATTGGTTAGTGGTGGGATAATGTGGCTTGTCACAGTCAAGTCCCTTGCGCTAAGCCTAAGGAAGTTGACAGATCAGATCGTTCTGACTGTCTTCATAAAGTTGACTTTGAAAGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 234748 128 + 647215 CATGAAGTTGAGACTGGTTAGCACTGGGATGATATGGCTTGCCACAGTCAAGTCCCCTGTGTGAAGCCTAAGGAAGTTAATAGATCAGATCATACTGACTTTCTTCATAAAGTTGGCTTTCAATAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 235096 128 + 647215 CATGAAGTTGGGACTGGTTAGCACTGGGACGATATGGCTTGCCACAGTCAAGTCCCCTGTGCGAAGCCTAAGGAAGTTAATAGATCAGATCATTCTGACTTTCTTCATAAAGTTGACTTTGACAATCA + +a +s mr.mrrefChr5 97891 33 + 294542 TGTGTATTCAAACAAGCCTAGCAATCTCTACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244835 33 + 636262 TGTGTATTCAAACAAGCCTAGCAATCTATATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 235224 33 + 647215 TGAGAAGGCAAACATGACTAGCAATCTCTACTC + +a +s mr.mrrefChr5 97924 122 + 294542 ACCACATTGAGCCTCAGATTCAACTGTTATTCTAATCTCCTAATTTTGAAAGGGGCCTTAATGCACTGTGCCAGACTGGCAAGGAAGAAGCCCTTCATGAGACACTCGTTGCTCCCACTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244868 122 + 636262 ACCACATTGAGCCTCAGATTCAACTGTTATTCTAATCTCCTACTTTTGAAAGGGGCCTTAATGCATTGTCCCAGACCAGCAAGGAAGAAGCCCTTCTTGAGACACTTGTTGCTCCCACTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 235261 121 + 647215 ACCACATTGAGCCTCAGATTCAACTG-TACTCCAATCTCCTAATTTTGAAAGGGGCCTTAATGCACTGTGCTGGTTTGGCAAGGAAGAAGCCCTTCATGAGACGCTCATTGCTCCCACTCAC + +a +s mr.mrrefChr5 98046 78 + 294542 TATTTAAGTTGAGCTACATTGGGGACCTCTGAACAACAATTACCTGGGTCTTCCCCACCTGTTAGGTGAACATCCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244991 72 + 636262 TATTTAGGTTGAGCTACATTGGGGACCT-TGAACAACAACTGCCTAGGTCT-----ACCTGTTAGGTGAACATCCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 235382 78 + 647215 TATGTAAGTTGAGCTACATTGGGGACCTCTGAACAACAATTACCTGAGTCTTCCCCACCTGTTAGGTGAACATCCAGC + +a +s mr.mrrefChr5 98124 119 + 294542 ATAGCAGTTTTATTTTCCCCTGGCCTCTACTCACATACATGATGCATGCAGCTGCTAGAAACTGGAACAGTTGAACAAGCTAATCCCAATGATTGACTGTGCTCAACGAGATGAATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245063 107 + 636262 ATAGCAGTTTTATTTTCCCTTGGCCTCTACTCACATACATGATGCATGCAGCTGCTAGAAACTGGAACAGTTGAACATGCTAATCCCAATGATTGACTGTGCTCAAC------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 235474 119 + 647215 ATACCAGTTTTACTTTTCCCTGTCTTACACTCACATATATGACGCATTCAACTGCGAGAAACTGGAACAGTTGAATAAGCTAATCCCAATGATTGACTGTCCTCAACGAGATGAATCAA + +a +s mr.mrrefChr5 98243 18 + 294542 CAGTCATGACCTTAGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245170 14 + 636262 ----CACGACCTTAGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 235595 18 + 647215 CAGTCATGACCTTAGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 98261 374 + 294542 GACCATAAATAGAGAGTATACTGGGGCTTCAATACAGAATAAGCATTCCCCCACTGCAGATACTAGAAGTAGTCCATCCAAGTATCAGATATTTCTGAACATTGCTAATAATTTGTCCTTCTTCCCCAGCTGGTGAGGCAGGCACATAACTGCAGCACATTAGTGGTCTAACTGCTCCCATGGTAACTTTTTGTACAAGGAGTACCTTGCTGAATTGTGACTGGATAAGCTATTGCTAGAACAAGATTTGTCACACTTATGGCACCATTATTAACGTGGTATCTAATCTTTTGTACCTGAAACTTGATGTCTAGCTGACAACTGTTGGTGGATGTGTATGGAAGAACCATACCCATGAGGATTTGTTGGTATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245184 308 + 636262 GGCCATAAATTGACTATATACTGGGGCCTCAATACAGAACAAGCATTCCTC----------------------------------------------AACATTGCTGATAATTTGTCCTTCTTCCCCAGCCGGTGAGGCAGGCACATAACTGCAGCACATTAGTGGTCTAACTACTCCCAAGGTAACTTTTTGTACAAGGAGCACCTTGCAGAATTGT--------------------GAACAAGATTTGTCACACTTATGGCACCATTATTAACGTGGTATCTAATCTTTTGTACCTGAAACTTGATGTCTAGCTGACAACTGTTGGTGGATGTGTATGGAAGAACCATACCCATGAGGATTTGTTGGTATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 235614 373 + 647215 GACCATAAATAGCGAGTATACTGGGGCTTCAATACAGAATATGCATTCCCCCACTGCAGATACTAGAAGTAGTCCATCCAAGTATCAGATATTTCTGAACATTGCTAATAATTTGTCCTT-TTCCCCGGCTGGTAAGGCAGGCGCATAACTGGAGCGCATGAGTGGTCAAACTGCTTCCATGGTCACTTTTTGTACAAGAAGTCCCTTGATGAATTGTGACTGGATAAGCTATTGCTAGAACAAGACTTGTCACACTTATGGAACTATTATTAACATGGTATCTAACCTGTTACACTTGAAACCTGCCGTCTAGCTGACAACTGTTGGTGGATGTGTATGGAAGGACCATACACATTAGGGTTTGTTGGTATCA + +a +s mr.mrrefChr5 98635 106 + 294542 ACATCGCTTGTTTCCCTACATCCTAACCTTCTGAAGGTCAAAGATGAGATCCAATTTCAATAAGCTATGGCATTGCACACTCAAGGCCCCATTAAACCTTAGGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245496 106 + 636262 ACATCGCTTGTTTCCCTACATCCTAACCTTCTGAAGGTCAAAGATGAGATCCAATTTCAATAAGCTATGGCATTGCACACTCAAGGCCCCATTAAACCTTAGGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 235987 106 + 647215 GCATGACTTGTTTCCCCACATCCTAACCTTCTGAAGGTCAAAAATGGGATCCAATTTCGATAAGCTATGGTGTTGCACACTCAAGGGCCCATTAAACTCTAAGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 98741 58 + 294542 GCTGTTCCATGCATTGAGGGACTGATCCAGTTGTCAGAATTTTTGTTACGTGTGACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245607 58 + 636262 GCTGTTCCATGCATTGAGGGACTGATCCAGTTGTCAGAATTTTTGTTACGTGTGACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 236093 58 + 647215 GTTATTTCATGCATTGAGGGACTGTTCCCGTTGTCAGAATTTCTGTTATGTTTGACAC + +a +s mr.mrrefChr5 98799 20 + 294542 ATCACATTTGAGGTAAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245666 20 + 636262 ATCACATTTGAGGTAAATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 236151 20 + 647215 ATCATGTCTGAGCCAAATAT + +a +s mr.mrrefChr5 98819 59 + 294542 GAGCTGCCACTACTTCGGTGGAATCCCATAGGATTATAACAACCTGGACAGTAGGTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245686 59 + 636262 GAGCTGCCACTACTTCGGTGGAATCCCATAGGATTATAACAACCTGGACAGTAGGTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 236173 59 + 647215 GAGCCGCCAGCATTCTGGTGGAATCTCATATGATTATAACAACACAGACAGTCGGTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 98878 27 + 294542 TCTTAACACAGCCATACCTACTATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245745 27 + 636262 TCTTAACACAGCCATACCTACTATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 236233 27 + 647215 TCTTGACACAGCTATACCTACTATTCA + +a +s mr.mrrefChr5 98905 42 + 294542 TTGGATTCTGACCGGTAATCTTCAAAAGTCTGTAAATAAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245782 42 + 636262 TTGGATTCTGACCGGTAATCTTCAAAAGTCTGTAAATAAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 236260 42 + 647215 ATGGACTCTGACCAGTAATCTTCACAAGTCTGTAATCAAGTC + +a +s mr.mrrefChr5 98947 94 + 294542 TATTGTTTTGTGCACTTCCAGTTCCCATTCTCAAAGTCACATTGTCTGGCTATACATGTTGGCAATATACCGAGGTCCATAAGCAGTTTGGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245824 94 + 636262 TATTGTTTTGTGCACTTCCAGTTCCCATTCTCAAAGTCACATTGTCTGGCTATACATGTTGGCAATATACCGAGGTCCATAAGCAGTTTGGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 236347 94 + 647215 TATGGTTCTGTGCACTCCCAGCTCCCATTCTCAAACTCACATTCTCCAACAATAAATCTTGGCAATATACTGAGGTCCATGAGCATTATGGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 99041 64 + 294542 TTCTTCAGCAATGGGCTGGGGACTACACTTTGGAGATGGGTTCATGACTTACACAAACTTCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245918 64 + 636262 TTCTTCAGCAATGGGCTGGGGACTACACTTTGGAGATGGGTTCATGACTTACACAAACTTCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 236442 64 + 647215 TTCTTCAGCAATGGACTGGCACCTGCAATCTGGGGATGGATTCATGACTTACACAAACTTCTTC + +a +s mr.mrrefChr5 99105 242 + 294542 GCATGGGAAGGCAGTTAAAGCTTGCATTTACTTAAGCAAGCTAGTGAATACCAGAAATGTTGTATGGTACTGCCACATGAAATGGTGTCCACAAAAAACAGACTATGCAGGATGACCAATGGTGATGATGGGAATTGTACACCACCATGGTGAAGTTATCAACAACAACTCTGTGCAAGATTATCATTTGCTGTATGTCCACACAAAGCGAAATATCAATCTGTAAGTAGTGAGTACAGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246317 242 + 636262 GCATGGGAAGGCAGTTAAAGCTTGCATTTACTTAAGCAAGCTAGTGAATACCAGAAATGTCGTATGGTACAGCCACATGAAATGGTGTCCACAAACAACAGACTATGCAGGATGACCAAAGGTGATGATGGGAATTGCACACCACCATGGTGAAGTTATCAACAACAACTCTGTGCAAGATTATCATTCGCTGTATGTCCACACAAAGCGAAATATCAATCTGTAAGTAGTGAGTACAGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 236506 189 + 647215 -----------------------------------------------------ATAATGTTGTATGGTAGTGCCACAGAAAATGGTCTCCACAAAATACAGACTATGCAGGATCACCAATGGTGATGAAGGGAATTGTACACCACCACGGTGAAGTTATCAACAACAACTCAGTGCAAGGTTATCATTTGCTGTATGTCCACACAAAGTGACATATCAATATGATAGTAGTGAGTACAGGTC + +a +s mr.mrrefChr5 99347 95 + 294542 TGGATGACTACAGTGCCTTCTGTCTTCTCACAGTCTCCACTGTAAGAGCCATACTGAGACATGGAGCACACCTTTTGTTTGTTATCAAAATAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246561 95 + 636262 TGAATGACTACAGTGCCTTCTGTCTGCTCAGAGTCTCCACTGTAAGGGCCTTACTGAGACATGTAGCACACCTCTTGTTTGTGATCAAAATAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 236695 93 + 647215 TGGATGGCTAGAGTGCCTCCTGTCTTCTCACAGTCTCCACTGCAAGAGCCATACT--GGCATGGAGCACACCTTTTGTCCATTATTAGAATAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 99442 147 + 294542 ACCCTCTTCACCTCAGTTACCCACTAAGCTATCTTTACTTAATGGCAACGGACAGTGAAACTAGAGATTGTGGCAGGTTAGCTCATTAGAAGACTGACATATAACATGCTTGCTTGGTTTGGTAGATGTATTTAAGAATGCATAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246656 147 + 636262 ACCCTCTTCACCTCAGTTACCCACTAAGCTCTCTCTACTTAAAGGCAAAGGACAGTGAAACTAGAGATTGTGGCAGGTTAGCTCATTAGAAGGCTGACATATAACATGCTTGCTTGGTTTGGTAGATGTATTTAAGAATGCATAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 236790 132 + 647215 AACTCCTGCATC--------------AGCTATCTTTACTTAATGGTAACGGACAGTGAAACTAGAGAGTGTGG-AGATCAGCTCATTAGAGGACTGACATGTGACATGCTTGCTTGGTTTGGTAGATGTATTTGAGAATACATTAAT + +a +s mr.mrrefChr5 99589 79 + 294542 CTTGCCTCAAAGATGAGTGTCTGTAATTTTCGCCAGGCCACATCACTGGTATATTCCTTTATGTAACATTCATGTTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246807 69 + 636262 CTTGCCTCAAAGATGAGTGCCTGTAATTTTCGCCACGCCACATCACTATTATATTCCT----------TTCATGTTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 236922 79 + 647215 CTCACCTCAAAGATGAGTGTCTGTAATTTCAGCCAGGCTGCATTACTGGTATGTCCCTTTATGTAACATTCAGGTTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 99668 79 + 294542 TGTTCAATTGCTCAGAGCTTTACTAACTAAGAAGTGTGTGCAAGAAGCCCATAGACACAATTTGTGTAAGGCTCTTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246879 79 + 636262 TGTTCAATTGCTCAGAACTTTACTAACCAAGAAGTGTGTGCAAGAAGCCCATAGACACAATTTGTGTAAGGCTCTTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 237001 69 + 647215 TGTTCAATTGCTCAGAGCTTTGCTAATTAAGAAGTGTGTTCAAGAAGGC----------ACTTGTATTAGCTTGTCGTA + +a +s mr.mrrefChr5 99747 273 + 294542 TTACCTTGTGGTAAGGTAACTATAGATACATACCTCTATGTGTTCATGGCATTAACTTTGTCATAACTTCAATCTGCTTATAAGGGTTTACTGCAGTTACACTTCACAAGGAAATATGATGATTACAACAGGAGAAATCAAGATAACTTCAGTAAAATAAAGACATGGCAGCTTCATTTAGTGTAACCTTGAACTGCATATTCAATTAAATATAACCAGCTCCTGGAGACAGGTTAGAACCATTGCTAAGCTTCCTGTTCCTTTTTGAGGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246958 273 + 636262 TTACCTTGTGGGAAGGTAACTATAGATACATACCTCTATGTGTTCAAGGCCTTCACTTTGTCATAACTTCAATCTGCTTACAAAGGTTTAATGCAGTCACACTCCACAAGGAAATATGATAACTACTACAGGAGAAATCAAAATAACTTCAGTAAAATAAAGACATGGCAGCTTCATTTAGTGTAACCTTGAAGTGCATATTCAATTAAATATAACCAGCTCCTAGAGACAGGTTAGAACCATTGCTAAGCTTCCTGTTCCTTTTTGAGGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 237078 264 + 647215 TCAGCTTGTGCTAAGGTAATTATAGTTCCATACATCTATATGTTCATGGCATTAATTTTGTCATGACTTCAATCTGCTTATAAGGGTTTACTACAGTTACACTTCACAAAGAAATATGACGATTACAACAGGAGAAGTTGAGATAGCTTCAATCAAATAAAAACATGACAGCTTCACTTATCATAATCTTGAACAGCATAATCAATCAAACATAACCACCTACTGGAAACAGG---------TTGATAAGCTTTCTGTTCCTTTTTGAGGACA + +a +s mr.mrrefChr5 100020 122 + 294542 TAGGGACACTGGGGATCCCAGTTGGGTGTTGAGCTACAAGTATGCTGGCCAGTATACAGTAAGAGTTGGTTCCAATAGGGTTATAGCATTCTTTCCACTTGTGGGGTAGGAGCTGACATATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247232 121 + 636262 TAGGGACACTGGGGATCCCAGTTGGGTGTTGAGCTA-AAGTATGCTGGCCAGTATACAGTGAGAGTTGGTTCCAATAGGGTTATAGCATTCTTTCCACTTGTTGGGTAGGAGCTGTTGTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 237342 122 + 647215 TAGGGACACTGGGGATCCCAGTTGGGTGTTGAGCTACAAGTACGCTGGCCAGTATACAGTAAGACTAGGTTCCAGGAGGGTTAGAGCATTCTTTCCACCTGTGGGGTAGGAGCTGACATATT + +a +s mr.mrrefChr5 100142 5 + 294542 TTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247361 5 + 636262 TTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 237464 5 + 647215 TTCTG + +a +s mr.mrrefChr5 100147 15 + 294542 GGGTGACCTGATATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247368 15 + 636262 GGGTGACCTGATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 237469 15 + 647215 GGGTGACCTGATATA + +a +s mr.mrrefChr5 100162 96 + 294542 AGACTTCATTCTTTGACATGTCAGCTGGGTAGCATTCAACTTATATCATTTTTGCTCAGTGTACTGAACAACTCTTTCAGACACCCCTATAGTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247393 96 + 636262 AGACTTCATTCTTTGACATGTCAGCTGGGTAGCATTCAACTTATATCATTTTTGCTCAGTGTACTGAACAACTCTTTCAGACACCCCTATAGTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 237484 96 + 647215 AGACTTTGTTCTTTGACAAGTCAGCCACATAGCCCTGAACTCATGACGTCTTAGCTAGGTGCACTGAACAACTCCTCTGGACACTGGTATAGTGGC + +a +s mr.mrrefChr5 100258 189 + 294542 CATATTTGCTTAATTCTATTAAGAAACTCACTCCCGACTATCTAGGTGCCTTTGAGACCCACTGCTCGCAGAAAAGATGAGCCCCCACATACCAGCTAGCTACTGAATGCACACAATGGAATATACTCAGTCACAAACTGAAGTTCTGCATCCAGTTGTCACACTGGTATGACCAAAATGCAAAAGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247491 189 + 636262 CATATTTGCTTAATTCTATTAAGAAACTCACTCCCGACTATCTAGGTGCCTTTGAGACCCACTGCTCGCAGAAAAGATGAGCCCCCACATACCAGCTAGCTACTGAATGCACACAATGGAATATACTCAGTCACAAACTGAAGTTCTGCATCCAGTTGTCACACTGGTATGACCAAAATGCAAAAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 237580 189 + 647215 TCTATTTGTTTAATTCCATTAAGAATCCCACTCTTGACTATCTAGGTGCCTTCAAGACCCACCGCTGCCAGAAAAGATGAGCCCCCCTGTTCCAGCTAAATACTGAATGCACACAATAGAATATGCTTAGCCACGAGCTGTAGTTCTGCATCCAGTTGTGACACTGGTATGACCAAAAAGCAAAAGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 100447 20 + 294542 TGCATATTTTCTATGATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247680 20 + 636262 TGCATATTTTCTATGATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 237770 20 + 647215 TACATATTTTCTATGATTCA + +a +s mr.mrrefChr5 100467 60 + 294542 ATAAATAGCTACATACAACACTTGTTGACTATCATTCATTAAACATATGTATTGAAGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247704 60 + 636262 ATAAATAGCTACATACAACACTTGTTGACTATCATTCATTAAACATATGTATTGAAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 237790 60 + 647215 ATAAATAGCTCCGTACAGCGTTGGTTGACTATCACTCATTAGACATGTGTATTGATAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 100527 5 + 294542 CTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247767 5 + 636262 CTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 237850 5 + 647215 CCTCA + +a +s mr.mrrefChr5 100532 117 + 294542 ACATAGCTGCTTTATTCTTGGCAAATCTTGGTAAGCAGGAATCATCAGAAACATGCAGTCCACATCTCAACTGTCCATTGGTGTATTTCTAGACCCTGCAAGAATGTATTATCACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247773 117 + 636262 ACATAGCTGCTTTATTCTTGGCAAATCTTGGTAAGCAGGAATCATCAGAAACATGCAGTCCACATCTCAACTGTCCATTGGTGTATTTCTAGACCCTGCAAGAATGTATTATCACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 237855 117 + 647215 GCATAGCCCTTTTAATCTTGGCAAATCTTGGTAGACAGAGGTCATCAGAGACTTGCAGTCAGCTTCTCACTTGTCCATTGGTATATTCCTATACCCTACAAGACTGTATTATCACAG + +a +s mr.mrrefChr5 100649 131 + 294542 GGAATGAAAGACAAAAAAAATGAAAGTCATTCTTAGTTTTGATTCCTTAGACTTCCACTGAAGCTACCAGAGGTGGGCGGTTAGATAGTCCATGTGTATTAACAAAGTAACTGATCAATGATACCCTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 247890 131 + 636262 GGAATGAAAGACAAAAAAAATGAAAGTCATTCTTAGTTTTGATTCCTTAGACTTCCACTGAAGCTACCAGAGGTGGGCGGTTAGATAGTCCATGTGTATTAACAAAGTAACTGATCAATGATACCCTATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 238006 131 + 647215 GGAGTGAAAGACAAAAAAAACTAAAGTTATTCTTAGGTTAGATTCCTTACACTTCCACTGAAGCTACCAGAGCTGGGCAACTAGATAGTCCATGTATAATAACACAGTAACTGATCAATAACACCCTACTG + +a +s mr.mrrefChr5 100780 43 + 294542 CCTACCAGCATTGTGATCTGCTGAAACAACAGGTGATGAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248039 43 + 636262 CCTACCAGCATTGTGATCTGCTGAAACAACAGGTGATGAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 238137 43 + 647215 CCTACCCGAGTTGTGATCTGCTGAAACAATAGGTGATGACACT + +a +s mr.mrrefChr5 100823 18 + 294542 ATATAACCAATGTGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248083 18 + 636262 ATATAACCAATGTGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 238180 18 + 647215 ATATAATCAATGTGTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 100841 124 + 294542 GGTCAAGAAGAATTGGTTTCAGATGTAACCTCATGACTGACTAACTGATTGGTTGAGGCAGGTGTTGCCTCATGACTCACTAACTGATTGTTTGGGGTTGGGCAGTCTTGGGGGGCACAAGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248104 124 + 636262 GGTCAAGAAGAATTGGTTTCAGATGTAACCTCATGACTGACTAACTGATTGGTTGAGGCAGGTGTTGCCTCATGACTCACTAACTGATTGTTTGGGGTTGGGCAGTCTTGGGGGGCACAAGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 238198 124 + 647215 GGTCAAGAAGAATCCTTTTCAGATGTAAACTCATAACTCACTAACTGATTGGTTGGGGCAGATGTAACCCTAAGACTCACTATCTGATTGGTTGGGGTTGGGCAGTCCTGGGTGGCACTAACTG + +a +s mr.mrrefChr5 100965 87 + 294542 TTTGGTTGGGGTTGGTCAGTCTTGGGAGGTTTGCCCCTCAGAGTTTGCCCCCACTGTTTAATGGTGAGTGAATTATGAGTACAGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248229 87 + 636262 TTTGGTTGGGGTTGGTCAGTCTTGGGAGGTTTGCCCCTCAGAGTTTGCCCCCACTGTTTAATGGTGAGTGAATTATGAGTACAGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 238322 87 + 647215 TTTGGGAGGGGTCGGGCAGTCTTGGGAAGATTGCCCTTCAGAGTTTGCCCCCACCGCTCAACAGTGAGTACATTATAAGTACAGATG + +a +s mr.mrrefChr5 101052 53 + 294542 GACGGGTTGAGTGAGGCAAAAAAGAAGGTAGGTGCGTGATAGTCATAAAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248317 53 + 636262 GACGGGTTGAGTGAGGCAAAAAAGAAGGTAGGTGCGTGATAGTCATAAAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 238409 53 + 647215 GACAGGTTGAGTGAGGCAAAAAAGAAATTGGATGCATGGTAGTCATAAAACCA + +a +s mr.mrrefChr5 101105 116 + 294542 CCTCAAAATTTCATAGTAGTTTTAGAGAAGTAGCTACAAATTGGAAGGGTGAAAACACCGGTTCAAGGCTGTGAATACTAAGTCTATTTTTGCTAGCCACCATATTTTCAAGTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248378 116 + 636262 CCTCAAAATTTCATAGTAGTTTTAGAGAAGTAGCTACAAATTGGAAGGGTGAAAACACCGGTTCAAGGCTGTGAATACTAAGTCTATTTTTGCTAGCCACCATATTTTCAAGTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 238462 116 + 647215 CCTCAAAATCTCATAGTAGCTTTAGAGAAGTAGCTATGAGTTGGAAGGATGAAAGCACCAGTTCAATCCTGTGTATACTAAGTCTATCTTTGCTAGCCAACCTATTTTCAAGTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 101221 11 + 294542 GACATGTTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248494 11 + 636262 GACATGTTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 238585 11 + 647215 AACATGCTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 101232 50 + 294542 TTATCTATTGTCCCCCAGGCCAATAGCCGATTCAAATGGCAGTAGCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248505 50 + 636262 TTATCTATTGTCCCCCAGGCCAATAGCCGATTCAAATGGCAGTAGCTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 238621 50 + 647215 TGATCTATTGTCCCCCAGACAAATAGCCAACTCACATGGCAGCAGCCATA + +a +s mr.mrrefChr5 101282 78 + 294542 ATGCTTTTTTAGGTCTGAATCCTCCAAGCTAGTAGTTAACTCACAAACAGTGCCAATGGAACAGTAAGGAACAATGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248561 78 + 636262 ATGCTTTTTTAGGTCTGAATCCTCCAAGCTAGTAGTTAACTCACAAACAGTGCCAATGGAACAGTAAGGAACAATGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 238671 78 + 647215 ATACTTTTTTAGGTATGGGTCCCTCAAGCTAGTAGCCAACTCACAAACGATGCCAATGAAGCAGTAAGGAACGATGTA + +a +s mr.mrrefChr5 101360 64 + 294542 TGAATCACAGTGTCTGCTTAAACTCTTTGTGCGCACTAGTATTTAATATGTGACTTGCCCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248639 64 + 636262 TGAATCACAGTGTCTGCTTAAACTCTTTGTGCGCACTAGTATTTAATATGTGACTTGCCCAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 238762 64 + 647215 TGAATCACAGTGTTAGCTTAAGCTTTTTCCAAGCACTAATATTCAATGTTTGACTTGCCCAGTT + +a +s mr.mrrefChr5 101424 39 + 294542 AGGGGGAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTggcac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248749 38 + 636262 AGGGGGAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTg-cac +s simRat_chr6.simRat.chr6 238826 39 + 647215 AGGGTTAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTGGCAC + +a +s mr.mrrefChr5 101463 126 + 294542 tctcttgctaggggagaggtcttgtccctagcatacatatcttgtcctgaaacaactgaacggaactgagctcagtgtcatcctacagatgttgcagataagcactcacaaaggtgggctgtctct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248787 126 + 636262 tctcttgctaggggagatgtcttgtccctagcgaacatgtcttgtcctgaaaggactgaacggaactgagttcagtgtcatcctacagatgttgcagataagcactcacaaaggtgggctgtctct +s simRat_chr6.simRat.chr6 238872 107 + 647215 TTCATTTCAAAGGGAGGGA--------ATAGCATAAGTAT-----------ACAACAAACTTACACAGATCCCACATACATTCAAACTatgttgcagatcagcacacacaaaggtgggctgactct + +a +s mr.mrrefChr5 101589 113 + 294542 cccctatagagtagcaccgcaccacatccctcctaagtagcaacagcctaaaagctagactcagccacatcttactaaccccaaaagcacatcttacccatcccagaggtatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 248913 113 + 636262 cccctatagagtagcaccgcaccacatccctgctaagtagcaacagcctaaaagctagactcggccacatcttgctaaccccaaaagcacatcttacccatcccaaaggtatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 238981 113 + 647215 cccttatgaagtagcactgcaccacatccctcctaaatagcaaagacctaaaagctagacccagccacatcttactaatcccaaaagcacatcttacgcatcccagaggtatt + +a +s mr.mrrefChr5 101702 12 + 294542 gagaggaccata +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 249029 12 + 636262 gagaggaccata +s simRat_chr6.simRat.chr6 239094 12 + 647215 gtagggaccata + +a +s mr.mrrefChr5 101714 161 + 294542 gttaggatatacaatcaggcaacctatggcaacctaagcaggaggactactataggcgggaagacctcagtggaaagatatccactctgctactttagtggggacccactcctaacctgggggaggatttgcaaacatgaaatgggattgatatgccaatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 249043 157 + 636262 gttaagatatacaatcaggcaacctatggcaacctaagcaggaggactactataggcgggaagacctcagtggaaagatacccactctgctacctt----gggaccccctgctaacctgggggaggatctgcaaacatgaaatggagttgatatgccactc +s simRat_chr6.simRat.chr6 239106 161 + 647215 gctaggatatccaataagacaacctgtggcaacctgagcaggaagactaccattggtgagaagacctcagtggaaagatatccactctgcaactttagtggggaccaactcctaacctgggtgaggatttgcaagcatgaaatgggattgaTATGCTAATT + +a +s mr.mrrefChr5 101875 411 + 294542 ctagacaggaaacctggctcaatctgagggagaggctcatatgtaaacattcaaggggaaatgacatatgtaaacattcaaggggaaatgaagggatgcatgtttatgtaaacgcataagagaaagcaagagagagtcagtatgtaattatacccagtgcgtctgtgcaacacccattagaattagagtagtggctcatattgagtatgacaaaaaagtacagggccaaggcttgaactagaactttatcatcctcaaggctgacttagagcctttaaagcctcaaggtctaggaagaggtgtgaggtgaaacattcaccacctcaggacattcccccttagtcaattcaaggcctacattgggtggttaggatgaatttgaattacaggaaagttactttctggtcagtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 249205 399 + 636262 ctagacaggaaacctagctcagtcagagggagaggctcatatgtaaacattcaaggggaaatgacatatgtaaacattcaaggggaaatgaagggatgcatgtttatgtaaacgcataagaagaagcaagagagagtcagtatgtaatgatccccagtatgtctgtgcaacacccattagaattagagtagtggctcatattgagtatgacaaaaaggtacagggccaaggcttgaactagatttttatcatcctcaaggctgacttaaagcctttaaagcctcaaggtctaggaggaggtgtgaggtgaaacattcaccacctcaggacattcccccttagtgaattcgagacctacattgactggttaggataaattcaaattacaggaaagttacc------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 239267 373 + 647215 CTAGACAGGAcacctggctcaatttgagggagcggctcatatgtaaacatccaagggg---------------------------aaatgaagggatgcatgttcatgtaaatgcataacagaaagcaagagagaatcagtatgtcattgtacccagtgcgtctgtgcaagacccactagagttagagtagtggctcatattgagtatgaccaaaaagtacagggccaaggcttgcactagaactttatcatcctaaaaggtgacttag---------agcctcaaggtctaggcagag--gtgaggggaaacacttacctcctcaggacattccctcttagtcaattcaaggactaccatgggtggttatgatgaacttgaattacgggaaaattactttctggtcagtg + +a +s mr.mrrefChr5 102286 89 + 294542 atctatgtggtttcagagttaaaactcgatctacatgagaagctcatggtcttctgggaagtggagacagtatgacctgttgatggatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 249604 84 + 636262 -----tgtggtttcagagttataactcgatctacatgagaagcccatggtctcccgggaagtggagacagtatgatctgttgatggatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 239641 89 + 647215 atctatgtggtttcagagttgaaacttgatctacatgaggagctcaaggtcttctggggagtggagacagtatgacctgttggtggatt + +a +s mr.mrrefChr5 102375 314 + 294542 cctagacctgatgcagacttttcttacctacaacaaagttaaagcaagggttacctcctcaGACAGCTATGGTCAAAAGATAATTGTCTGACTCAACTAAGTGCACTGGTTCTACATACAATGTTCAACTCTTCTATTTTACTGTGGAACACGTAACAATGGCTAAAATTGCCTCTGCAAGTTTAAAAATTTTTATTCCCCAGTTGGAAGATTTTTACAGCTCTGAAAAACTGCTGGGTATATTAAGCATAAGTAGTAAAAGAAGTGCTAGTTGGATGCAAAAGCACAACTTTACAAATCTCTACAAGCTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 249689 312 + 636262 cctagacctgatatagacttttcttacctacaacaaagttaaagcaagggttacctcctcaGACAGCTATGGTCAAAAGATAATTGCCTGACTCAACTAAATGCACTGGTTCTACATACAATGTTCAACTCTTCTATTCTACTATGGAACACGTAACAATGGCTACAA-TGCCTCTGCAAGTTTAAAAATTTTTATTCCCCAGTT-GAAGATTTCTACAGCTCTGAAAAACTGCGTGGTATACTAAGCACCAGTAGTAAAAGAAGTGCTAGTTGGATGCAAAAGCACAACTTTACAAATCTCCACAAGCTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 239730 312 + 647215 actagacctgatgcagactttttttacctacaacaacgttaggg--aggattacctcctcaGACAGCTATGGTCATAAGATAATTGTCTGACTCAACTAAGTGCAATGGTTCTACATACAATGTTCAACAATTTTATTTTACTGTGGGACATATAACAATGGCTAAGATTGCCTCCGCCAGTTCAAAAATTTTTATTCCCCAGTTGGAATATTTTTACAGCTCTGAAAAACTGCTGGGTATATTACGCATAAGTATTAAAAGAAGTGCTAGTGGGATGCAAACATACAGCTTTACACATGCCTACAAGCTGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 102689 193 + 294542 TCCTGGCCATATTCGCCCCTTTACCCTGTGCACTGTAGTTCTGAAGACCCTAAGATTGAGTACTAGTTCATTCCAAAACAATTGTTTAACTACTTCCTTCTAAGTCTGATTTCCTCCTTAAGAGATCAGAGGGGTCTGAGATACTCAAGTAGCTCCAAACCTGTGAGGTTCTATTTCAATTGTGATATGGGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250003 193 + 636262 ACCTGGCCATATTCGCCCCTTTACCCTGTGCATTGCAGTTCTGAAGACCCTAAGATTGAGTACTAGTTCATTCCAAAACAATCACTTAACTACTTCCTTCTAAGTCTGATTTCCTCCTGAAGAGATCAGAGGGGTCTGAGATACTCAAGTAGCTCCAAACCTGTGAGGTTCTATTTCAATTGTGATATGGGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 240042 191 + 647215 TCGTGGCCCTCAGCCCCCCTGTACCTGCTGCACTGTAGTTCTGAGGACCCTAAGATTGAGTACAGGTTCATTCCAAAACAGTTGTTTAACTACTTCCTTCTAAGTCTGATTTCCTCCTTAAGAGATCAGAGGGGTCTGAGATACTCAAGTAGTTCCAAACCTGTGAGGTTCTATTTCAATTGTGATA--GGAC + +a +s mr.mrrefChr5 102882 88 + 294542 TTGAAACGAGGTCTAGGTATGAGAAAGTGCACCCTAAAAATTGTGACAGGAGTGGGGGCCCACTGTGATAACAAGCAGTGGGTCGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250199 88 + 636262 TTGAAACGAGGTCTAGGTATGAGAAAGTGCACCCTAAAAATTGTGACAGGAGTGGGGGCCCACTGTTATAACAAGGAGTCGGTCGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 240233 87 + 647215 TTGAAATGAGGTCTAGGT-TGAGAAAGTGCACCCTAAACATTGTGACAGGAGTGGGGGCCCCCTGTGACAACAAGCCCTGGGTCACGG + +a +s mr.mrrefChr5 102970 34 + 294542 AGACACTTAGATAGTTAAGAGTGGGTTTTTTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250287 34 + 636262 AGACACTTAGATAGTTAAGAGTGGGTTTCTTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 240325 34 + 647215 AGGCACTTAGATAGTTAAGAGTGGGTTTTTTAAT + +a +s mr.mrrefChr5 103004 7 + 294542 GATTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250321 7 + 636262 GGTTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 240360 2 + 647215 GA----- + +a +s mr.mrrefChr5 103011 352 + 294542 ATGGAATTCAACAAATATGCCGCCATTATACAGGTGTCTGAACGAGTTGTTTCAGGGCCATTAGCTAAAATGATACAAATATAAGGCTACCCAACTGACCTGTCAAACAACAAAGTCTATACCAGGTTGCAGGCCTATGACACATCTCCATTGAGCAACCCATAGACCCACCAGCGATTTGATTCTGCATTTTACAGGTTTGTGGCAAGTGTAGTTCTGCTCAATGGCCTCATAAGAAAGTGTTGTTGACTAACATCATAACTCTAACGTGAGTTGGAACTGAATATATATAAAGTGCCAGTCACTAATTTATTGGGGGGACTATATTACATAAGAGATTTGGTCTGCCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250330 319 + 636262 ATGGAATTCAACAAATATG---------TACAGGTGTCTGAACGAGTTGTTCC--------TAGCTAAAATGATACAAATATAAGGCTACCCAACTGACCTATCAAACAACGAAGTCTATATCAGGTTGCAGGCCTATGACATA--TCCATTGAGCAAGCCATAGACCCACCAGCGAATTGATTCCGCGTTTTACAGGTTTGTGGCAAGTGTAGTTCTGCTCAAAGGCCTCATAAGAAAGTGCTGTTGACTAACATCATA--------------TGGAACTGAATATATATAACGTGCCAGTAACTAATTTATTGGGGGGACTATATTACATAAAAGTTTTGGTCTGCCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 240362 340 + 647215 -----ATTCAACTAATATGCCGCCATTATATGGGTGTCTGAATAAGCTGTTTCAGGGCCATTAGCTAAAATGATACAAGT-CAAGGCTACCCAGCAGACCTGCCAAAGAACAGGGTCTATACCAGGTCGCAGGCCTATGACACATCTCCATTGTGCAACCGATAGTCCCACCAGTGATTTGATTCTGTATTTTACAGGTTTGTGGCAAGTGTAGT--TGCTCAATGGCCTCATACGAAAGTATTGTTGACTAACATCCTAACTCTAACGTGAGTTCGAACTGA----ACATAAAGTGGCAGTCACCAATTTATTGGGGGAACTATATTAGATAAGAGATTTGGTCTGCCCTA + +a +s mr.mrrefChr5 103363 184 + 294542 GGCTTAGTTTATTGAACCCATGGCAATCTTGGATGGATATTATAGACTAGGACACAACTGTCTAGGTATCATTAACTGACAATAGACACCCCAGCCTAACTGGAAGCTTCAAGCACATAAGTTATCAATACTTATGTACATCCAGCTAGGCAAACAGCAATGGTGGATGCTAGGCAAACAGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250649 184 + 636262 GGCTTAGTTTATTGAACCCATGGCAACCTTGGATGGATATTATAGACTAAGACACAACTGTCTAGGTATCATTAACTGACAATAGACACCCCAGTCTAACTGGAAGCTCCCAGCACATAAGTTATCAATACTTATGTACGTCCAGCTAGGCAAACAGCAATGGTGGATGCTAGGCAAACAGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 240703 184 + 647215 GGCTTAGTTTATTGAACCCATGGTTATCTTGGATGGATATTTAAGACTAGGACACAACTGTTTAGGTATCATTAACTGACAATAGACACCCCAGCCTAACTGGAAGCTTCAAGCACCTGAATTGTCAATACTTATGTATATCCATCTAGCCAAACGGCAATGGTGGATGCTAGGCAAACATCAT + +a +s mr.mrrefChr5 103547 46 + 294542 AGATGCTAGCTAAAGTCCATCCCAAACAACTACTGGTGTGGCCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250833 46 + 636262 AGATGCTAGCTAAAGTCCATCCCAAACTACTACTGGTGTGGCCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 240888 46 + 647215 GGATGCTAGGTAAAGTCCATCCCAAACAACTACTGGTGTGGCCATG + +a +s mr.mrrefChr5 103593 144 + 294542 CCCACTACACTCCCTAAGTACAAATGTTAACTATAAGAGACTCTGTCAACACTAAACTAAAATGTGGATGTAATTTGCCACAGTGGAACTTGTTTTGACCATGCCACCAGTTATAGAAACACTGAGAGCTATTAAGACCAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 250883 144 + 636262 CCCACTACACTCCATAAGAACAAATGTTAACTATAAGAGACCCTGTCAACACTAAACTAGAATGTGGATTTAATTTGCCACAGTGGAACTTGTTTTGAGCATGCCACCAGTTATAGAAACACTGAGAGCTATTAAGACCAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 240934 144 + 647215 CCCGCTATGCTCCCTAAGTACAGACGTTAACTATAAGAGACTCTGTCAACACTAAACTAAAATGTGGCTGTAATTTGCCACAGTGGAGCTTGTTTTGGCCATGCTACCAGCTGTAGAAACACTGAGAGTTGTTAAGACCAATCT + +a +s mr.mrrefChr5 103737 35 + 294542 AAGTATCTCCAAACACTACCCTTACTATTTGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251027 35 + 636262 AAGTATCTCCAAACGCTACCCTTATTATTTGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 241079 35 + 647215 AAGTATCTCCAAGCACTACCCTTACTATTTCCACA + +a +s mr.mrrefChr5 103772 252 + 294542 TCATAACATTGTTTTACATTAGGACATAAGATGGTTATAGTGACCATTGTTTGAGACTACCCAGTGAGTAATAGACATGATCTGGTGTTAGTTAACAGTATTAAAATAGACTGTGATCTGCTGCTAAGACATCTTATACCACTTCTGTCCTGGATGCAATGCTTCTTGTGACTCAAAGTTTGAACTACATATGCTACATGTTACTTAGTTGGAAAATGCACTAATTTTGCAGTATAACACCCCACACAAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251062 247 + 636262 TCACAACATTGTTTTACATAAGGACATAAGATGGTTATAGTGACCATTGTTTGAGACTACCCAGTGAGTAATAGACATGATCTGGTGTTAGTTAACAGTATTAAAATAGACTGTGATCTGCTGCTAAGACATCTTATACCACTTCTGTCCTGGGTGCAATGCTTCTTGTGACTCAAAGTTTGAACTACATATGCTACATGTTACTTAGTTGGAAAATGCACTAATTT-----TATAACACCCCACACAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 241119 249 + 647215 TTATAACACCATTGTAAATTAGGGCAGAAGA---TTATAGTGACCATTGTTTGAGACTACTCAATATGTTATAGACATGATCTGGTGTTAGTTAACAGTATTAAAATAGATTGCAATCTGCTGTTTAGACATCCTATACCACTTCTGTACTGGATGCAATGCTTCTTGTGACTCAAAGTTTGAACGACATATTCTACATGTTATTTCGTCAAAAACTGCACTAATTTTGCAGTATAACACCCCACACAAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 104024 55 + 294542 CACAGGAGTTTCCAATGTTCCTGTACATGGGCAACTTAATTTTTTCACAAGTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251311 50 + 636262 CACAGGAGATTCCAATGTTCCTGTACAGGGGCAACTTAA-----TCACAAGTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 241368 55 + 647215 CACAAGAGTTTCCAATGTTCCTGTACATGGGCAATTTAATTTTTTCACAAGTATT + +a +s mr.mrrefChr5 104079 5 + 294542 ATTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251361 5 + 636262 ATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 241439 5 + 647215 ACTTA + +a +s mr.mrrefChr5 104084 47 + 294542 AACTTATGTTCTAGCAGTCTCAAATCATATCTTGCTCTCTGTTTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251366 47 + 636262 AACTTGTGCTCTAGCAGTCTCAAATCATATCTTGCTCTCTGTTTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 241449 16 + 647215 AACTTAAGTTCAAGCA------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 104131 114 + 294542 CAGATTTCTAGTTTAGATGACCCTAGTGTTTCAAGGATAAATGAAAAATGCTGTCAATAATCGGGACTTGAGTTGCTACATAGTCTCTGTGTGGTTTTGAGGCGAGGGTATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251477 114 + 636262 CAGATTTCTAGTTTAGATGACCCTAGTGTTTCAAGGATAAATGAAAAATGCTGTCAATAATCGGGACTTGAGTTGCTACATAGTCTCTGTGTGGTTTTGAGGCGAGGGTATACA + +a +s mr.mrrefChr5 104245 16 + 294542 GTAGTGGTGCTAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251592 16 + 636262 GTAGTGGTGCTAGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 104261 9 + 294542 ACCAACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251610 9 + 636262 ACCAACAAC + +a +s mr.mrrefChr5 104270 20 + 294542 CTACTGTGTACCCTCTCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251620 20 + 636262 CTACTGTGTACCCTCTCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 241465 9 + 647215 -----------TCTATCACA + +a +s mr.mrrefChr5 104290 77 + 294542 TCTTTCTATTACTCATCCCTGAGAACACTCGGGTCATCTAACCCAGAAACTGGATAGCAAAGCAGAGAGAGCAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251640 77 + 636262 TCTTTCTATTACTCATCCCTGAGAACACTCGGGTCATCTAACCCAGAAACTGGATAGCAAAGCAGAGAGAGCAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 241475 77 + 647215 TGCATCTTTTACTCATCCTTGAGAACAGTTGGGTCATCTGAACTAGAAACTGGACAATAATGCAGAGAGAGCAAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 104367 6 + 294542 TGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251717 6 + 636262 TGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 241553 6 + 647215 TGATGT + +a +s mr.mrrefChr5 104373 46 + 294542 ATAGACTGCTGGAAAACTTTCGACGAGACTTCTGAAAAAATTAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251723 46 + 636262 ATAGACTGCTGGAAAACTTTCGACGAGACTTCTGAAAAAATTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 241560 46 + 647215 CTAGATTGCTGGAACACTGTGAACAAAACTTCTGGACAAATGAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 104419 14 + 294542 GGACCAGGCACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251769 14 + 636262 GGACCAGGCACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 241709 14 + 647215 GGAGCAGGCACAGG + +a +s mr.mrrefChr5 104433 59 + 294542 GCACTGGAAACCCATTTGTCCACCTGTGTTGGACGTTATGCTGCAAAATTAGTGAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251784 59 + 636262 GCACTGGAAACCCATTTGTCCACCTGTGTTGGACGTTATGCTGCAAAATTAGTGAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 241723 59 + 647215 GCATTGGCAACTCATTTGTGCACCTGTGTTGGATGTTATACCGCAAAATTAGTTAATCT + +a +s mr.mrrefChr5 104492 65 + 294542 TCCTACTAGATAGCATGTGGAATCAGTAATTCAAACCCTTCAAAAGTAGCTACGAGCATCCAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251845 65 + 636262 TCCTACTAGATAGCATGTGGAATCAGTAATTCAAACCCTTCAAAAGTAGCTACGAGCATCCAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 241782 65 + 647215 TCCGACTACGTAACATGGGAAATAAGTAATTCAAACCCTTCAGAAATAGCTTAGAGTATCCAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 104557 53 + 294542 GGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATTGCAGAATTTTAGCTCTAAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251910 53 + 636262 GGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATTGCAGAATTTTAGCTCTAAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 241848 53 + 647215 AGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATCGCAGAATTTTAGCTCTAAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 104610 40 + 294542 AATCAATTGTCACAACTGTAGGACAAACAGTTATCCCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 251970 40 + 636262 AATCAATTGTCACAACTGTAGGACAAACAGTTATCCCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 241901 40 + 647215 AATCACTTGTCACAACTGTAGAGCAAACAGCTATTAATTA + +a +s mr.mrrefChr5 104650 376 + 294542 AGTACTTAGATATGTATTTTTAATTAATTTCATCATCCTTACACTTATAGAATGGTATGGATGGGCCTCTTGATATGTCACCCTAAGAAAACAATAGTAGAAACACTGTATGTTTACAAGCAATCTGATCACTATTCTTATGTGTGAATAGAAATAGAATTTCTATTGTACTAATGCCTGACAAGTTTTTGGGGTAAGATCCAGTACAAATGATGGGTCAAAGTAACGGAATGTTATCAGAATTATGAGAGACCGCCTGTAAGTATTGTCAAGTATTACATGAAATTCTTTCTGTTGGATCCTGATTTTTGAGGATGCAATTAAATTCTGAGCGAGTGCACATTGTCTCCATAGCACATACCTAGTAATGGATCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252010 376 + 636262 AGTACTAAGATATGTATTTTTAATTAATTTCACCATCCTTTCACTTATAGGATGGTATGGATGGGCCTCTTGATATGTCACCCTAGGAAAACGATAGTAGAAACACTGTACGTTTACAAGCAATCTGATCACTATTCTTATGTGTGAATAGAAATAGAATGTCCATTGTACTAATGCCTGACAAGTTTTTGGGGCAAGATCCAGTACAAATGATGGGTCAAAGGAACGGAATGTTATCAGAATTATGAGAGACCGCCCGTAAGTATTGTTGAGTATTATATGAAATTCTTTCTGTTAGATCCTTATTTTTGAGGATGCAATTAAATTCTGAGTAAGTGCACATTGTCTCCATAGGACATACCTAGTAATGGACCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 241942 373 + 647215 AGTACTTAGTTATGTATCTTCAATTAATTTCATCATCCTTACACTGATCGAGTGGTATGGATGGGCCTCTTGAGATGCTACCCTAACAGAACAATGGTAGAAACATTGTATGGTTACAAGCAATCTAATCGCTACTCTTATGTGTGAATAGAAATAAAATTTGTATTGTATTTATGCATAACAAGTTTTTGGGGTAAGATCCAGTGCAATTGATGAGCCAAAGTAACAGAATGTTATGAGAATTATGAGAGACCGCCTGTAAGTGTTGTCAAGTATTACATGAA---CTTTCTGTTGGATCCTGCTTTTTGAGGATGTAACTAAATTCTGAGCGAGTCCATAATGTCTCAGTAGCACATACCTAGGAATGGATCCC + +a +s mr.mrrefChr5 105026 153 + 294542 TGTTGAGATGTGGTTATTGTTCAAAACTACCCTGTGTCAAATGGACAGTACCAAAGGGCTGTGACTCTTTTGTCTGGGGATAGCACTTGTATCATCCAAAACTAGGACTTAGAAAAGTACTCACGCAAAGGAGGGCAGTACAAGCTTAAATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252389 52 + 636262 TGTTGAGATGT----------------------------------------------------------------------------------------------------GAAGGGTACTCACGCAAAGGA-GGCAGTACAAGTTTAAATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 242315 153 + 647215 TGTCGAGATGTGGTTATTGTTCAAAACTACCCTGTGTCAAATGGACAGTACCAAAGGGCTGTGACTCTTTTGTCTGGGGATAGCACTTGTATCATCCAAAACTAGGACTTAGAAAAGTACTCATGCAAAGGAGGGCAGTACAAGCTTAAATGG + +a +s mr.mrrefChr5 105179 149 + 294542 AAAGGGTTCCAATGTCTATAATGCATAAGGCTGAATATACCACAACCTTATCTATTGGTTATTTCAGGCCACGTATGACGTTTCTCTGCACAATCATACTTCAGGGTCTAAGTTGGCATTGAGAGAAGTTGGAGTGTATTTTAGCTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252441 145 + 636262 AAAGGGTTCCAATGTCCATGATGCATAAGGCTGAATATACCACAACCTTATCTATTGGTTATTTCTGGCCACGTATGACATTTCTCTG----ATCATACTTCAGGGTCTAAGTTGGCATTGAGAGAAGTTGTAGTGTATTTTAGCTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 242507 142 + 647215 AAAGGGTTCCAATGTCTATAACACATAAGATTGAATATATCACAACTTTAGCTATCGGTTATTTCAGGCCACCTATGACGTTTCTCTGCACAATCATACTTCAGGGTCTGAGTTGGCATTGAGTGAAGTTGGAGTGGATTTT------- + +a +s mr.mrrefChr5 105328 169 + 294542 CACCAGCTAAGCAGGCCTGACAGAGTGACTATACAAACCTTGTAACTGCATAAACAAGACTAACCACTACCTTAGGACTTAGAACAGTTACATTGGGAATCTGGACACGGTTCATCTGGAAAATGCTTGGGAGTCAATTTCCCTTACTGAATTATCAGGTCTCTGAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252587 169 + 636262 CACCAGCTAAGCAGGCCTGACAGAGTGACTATACAAACCTTGTAACTGCATAAACAAGACTAACCACTACCTTAGGACTTAGAACAGTTACATTGGGAATCTGGACATGGTTCACCTGGAAAATGCTTGGGAGTCAATTTCCCTTACTGAATTATCAGGTCTCTGGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 242649 106 + 647215 ------------------------------------------------CATAAACAAGACTGACCACTACCTTAGGACTT-------TTACATTGGGAATCTAGAGACGGTTCATCT-----ATGC---GGAGTCAGTTTCCCTTACCAAATTATCAGGTCTCTGAGCC + +a +s mr.mrrefChr5 105497 177 + 294542 TTTCAGACACAATAGGGATGAACAGGCAGCAAGGAGTTGCTCTTCATAGGAATCCAGGGACCCAATATTCAGTAGGACTGTGGGTATAATATAACTCGTGTCTGTAGCTAAACAGTCAGTGACTCTAATTTGCTAAATATCTCTTATGAATCTCCGGGGTCTTCTAATGTCCAGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252769 175 + 636262 TTTCAG-CACAATAGAGATGAACAGGCAGGAAGGAGTTGCTCTATATAGGAATCCAGGGACCCAATGTTCAGTAGGAC-GTGTGCATAACGTAACTCTTCTCTGTAGCTAAACAGTCAGTGAATCTAATTTGCTAAATATCTCTTATGAATCTCCGGGGTCTTCTAACGTTCAGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 242755 177 + 647215 TTTCAGACACAATAGGGATGAACAGGTGGCAAGGAGTTGCTTTTCATAAGAATGCAGGGACCCAATATTCAGTAAGACTGTGGGTATAATATATCTCGTGTCTGTAGCTAAACAGTCAGTGACTGTAATTTGCTAAATATCTCTTATGAATCTCCTCGGTCTTCTAATGACCAGATA + +a +s mr.mrrefChr5 105674 8 + 294542 CAAGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252944 8 + 636262 CAAGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 242934 8 + 647215 CAAAAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 105682 10 + 294542 AGGAACTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252952 10 + 636262 AGGAACTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 242946 10 + 647215 AGGAACCCAA + +a +s mr.mrrefChr5 105692 59 + 294542 TGTTGAATGGGTGTGCACAGAGTGTTTTCAGGTCTATCACAAGTATTTCAAATAGATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 252965 59 + 636262 TGTTGAATGGGTGTGCACAGAGTGTTTTCAGGTCTATCACAAGTATTTCAAATAGATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 242956 8 + 647215 TGTTAATT--------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 105751 14 + 294542 AGTAAAGGAGGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253030 14 + 636262 AGTAAAGGAGGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 105765 93 + 294542 AAGGTTGCCAGATTAGTGGTTTTATCTCCATGCCCTAAGAAGACTACTGAATTGTTAGGGTCTATTTTCACAGTCATGAGACTGCCATTGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253057 93 + 636262 AAGGTTGCCAGATTAGTGGTTTTATCTCCATGCCCTAAGAAGACTACTGAATTGTTAGGGTCTATTTTCACAGTCATGAGACTGCAATTGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 242964 17 + 647215 -----------------------------------------------------------------------AGTCTAGACAACGCCAT----- + +a +s mr.mrrefChr5 105858 71 + 294542 AAGTAGAACTTTCAGTGAGAATGATGAAGTCACTAACCAATCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGATCTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253151 71 + 636262 AAGTAGAACTTTCAGTGAGGACGATGAAGTCACTAACCAATCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGATATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 242981 70 + 647215 -GGTAAAACTTACAGTGAGAATGATGAACTCACTAACCAACCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGGCCTTC + +a +s mr.mrrefChr5 105929 26 + 294542 AAGTGTAGTCTAGTGTACAGTTATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253223 26 + 636262 AAGTGGGGTCTAGTGTACAGTTATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 243051 25 + 647215 AAGTGTAGTA-AGTGTACAGTTATTA + +a +s mr.mrrefChr5 105955 106 + 294542 CCTGCACGTCACTTATTTTAGTAACAGCTCAATACTGTAATAGTGGCTACAGATATTAGTATTACCTCCACTATTTTTTGCCCTTGTACCACATTGTAAATCATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253249 90 + 636262 CCTGCACGTCAC----TTCAGTAACAGCTCAATACTGTAATAGTGGCTACAGATATTAGTATTACCT--ACTATTTTTTGAC------CCACATTGT-AATCA--- +s simRat_chr6.simRat.chr6 243080 106 + 647215 CCTGCACATCACTTATTTTACCAATTGCCAGCTACTGCAACAGTCGTGATAGTTACTGGTACTACCTCCACTATCTTTTGCCCTTGTACCACAATGTAAATCATCC + +a +s mr.mrrefChr5 106061 52 + 294542 GGTGAGAATGAAGAATTGGCAAAAGCTGACCCCCAAACTGGAGGAGTGTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253339 52 + 636262 GGTGAGAATGAAGAATTGGCAAAAGCTGACCCCCAAACTGGAGGAGTGTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 243189 52 + 647215 GGTGAGAATGAAGAATTGGCAAAACCCGACACCAAAACTGGAGGAGTGTGAG + +a +s mr.mrrefChr5 106113 15 + 294542 CTATTGAGATTTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253428 15 + 636262 CTATTGAGATTTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 243241 15 + 647215 CAAGTGAGATTTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 106128 71 + 294542 CCCATCAAAAATTTGTGATCACACTCTGCATTATTTCAGGGGCCCTGGGTTTAAAGGCCGCTAAGGTGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253443 71 + 636262 CCCATCAAAAATTTGTGATCACACTCTGCATTATTTCAGGGGCCCTGGGTTTAAAGGCCGCTAAGGTGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 243261 71 + 647215 ACCATCAAAATTTTGTGATCACAATCTGCATTATTTCAGGGGTACTGGGTTTAAAGGTCATTAAGTTGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 106199 27 + 294542 TAATAGTAACCACCAATCCAGTAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253514 27 + 636262 TAATAGTAACCACCAATCCAGTAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 243359 27 + 647215 TAACAGTAACCTCCAACCCAGTAAACC + +a +s mr.mrrefChr5 106226 88 + 294542 CAACAGACAGCATTTTTATTCTGATGTACCTGCCGTAGTAAGAAATAGCTCAACCAGCAAATCATGGTTTAACCGATTAATTTTGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253542 72 + 636262 CAACAGACAGCATTTTTATTCTAATGTACCTGCCGTAGTAAGAAATGGCTCAAT----------------AGCCGATTAATTTTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 243386 88 + 647215 CAAAAGAGATTATTTTTATTCTGCTGTACCTGTCATAGTAAGAAATAGCTCAACCAGCAAATCATGGTTTAACCAATTAACTTTGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 106314 229 + 294542 TTTCGACTTGGAAGGCTTTGGGAAATTCTTTTAGCATAAACCAGGGTTGTCATTGTTTAGCCAATTATGACAAAAGAAGGTCAAACCAAGAAGATCCATATATTCATACATTTTGCATAGAAGCCCATAACACTCCGTGCCAGAGACATTTAATTACAGAACTCCTTGGTACTACCTTTGTTGTTTTTTATGTGCTATCAGAGGCAGGTTAATTACCAGGCCCAAACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253616 229 + 636262 TTTCGACTTGGAGGGCTTTGGCAAACTCTCTTAGCATAAACCAGGGTTGTCATTGTTTAGCCAATTATGACAAAAGAAGGTCAAACCAAGAAGATCCATATATTCATACACTTTGCATAGAAGCCCATAACACTCCGTGCCAGAGACATTTAATTACAGAACTCCTTGGTACTACCTTTATTCTTTTTTATGTGCTATCAGAGGCAGGTTAATTACCAGGCCCAACCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 243474 221 + 647215 --------TGGAAGGCTTTGGGAAATTCTTTTAGCATAAACCAGGGGTGTCATTGTTTAGCCAATGATGACAAAAGAAGGTGAAACCAAGAAGATTCATAAATTCATAAATTCTGCATAGAAGACGATAACACTCCATGCTAGAGACATTTGATTACAGAACTCCTCAGGACTGCCTTTGTTGTTTTTTCTGTGCTATCAGAGGCAGGTTCATTACCAGGCCCAGACAA + +a +s mr.mrrefChr5 106543 68 + 294542 ACCAATATAAGCGAGATAGTAATGTCACTTAGCTGTGGTCTACTAATAATCACCTGAGGAGAAATAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253845 68 + 636262 ACCTACATAAGCGAGATTGTATTGTCAATTAGCTGTGGTCTACTAATAATCACCTGAGGAGAAATAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 243701 68 + 647215 ACCAATACAAGGGAGATAGTAACATCACTTTGCTGTGGTCTCCTAATAATCACCTGATGAACGATCAG + +a +s mr.mrrefChr5 106611 121 + 294542 GCTAAAGAGTACAGCCGTGAGATTAGTAGGGCAACTAAGAGCAAGATATGAGTGTTAGAGAAAATGCTGATGGCAATAAACGCCCCCCATTGAGATTAAGCAAAGGAAATTTGACTTAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 253914 121 + 636262 ACTAAAGAGTACAGCCGTCAGATTAGTAGGGCAACTAAGAGCAACATATGAGTGTTAGAGAAGATGCAGATGGCAATAAACGTCCCCCATTGAGATTAAGCAAAGGAAATTTGACTTAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 243769 121 + 647215 GCTAAAGAGTATAGCCGTGAGATTAGTAGGGTAACTAAGAGCAAGATACAAGTGTTAGAGAAAACGCTGATAGCAATCAAAGCCCCCTGTTGAGATTAAGCAAATGAAGTTTAACTTAGGA + +a +s mr.mrrefChr5 106732 193 + 294542 AATGACAATAGAAGTGGAATCTAAGTTTCTGCTATTAAAGTTTTCCACTATTGACTATGGTGCAAGCTGGCTACTTAAAAAGTGTTTATAAGGCTGTAGGAACATAATAGTCTGCAGTGGTCCTAAATGAATACTAAGCAATAGCGACCGTAAGAGATGTTTACTGGTCTAGTAAGTACAGGGTAGCCGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254068 193 + 636262 AATGACAATAGAAGTGGAATCTAAGTTTGTGCTATTAAAGTTTTCCGATATTGACTATTGCGCAAGCAAGCTACTTAAAAAGTGTTTATAGGGCCGTAGGAACATAATAGTCTGCAGTGGTCCTAGATCAATACTAAGCAATAATGACCGTAAGAGATGTTTACTGCTCTGGTAAGTACAGGGTAGTCCATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 243890 184 + 647215 AATGACAATAGAAGTGGAATCTAAGTTTCTGCTAT-----TTTTCTACTATTGACTATGGTGCAAGCTGGCTACTCAAAAAGTGTTTATAAGGCTCTAGGA----GATGGTCTGCATCGGTCTTAAATGAATACTAAGCAACAGCGACCATACGAGATGCTTACTGGTCTAGTAGCTACAAGGTGGCCGATCT + +a +s mr.mrrefChr5 106925 369 + 294542 GGATGCTGCAATTGTCTACCTATCTTACCCTTAAGTACCAACCATCATTCATGGCTTTTGCCAGGGACATACATGATCTAGCAACACACCCAAACAAACTCTGACATGCAGCTGAAGTCAACTGGCCAATAAAGCAGGTAGTTAGTTTGTGAGATATATGTTGTTGCATGTTTAATGGACAAGGTTCCACACTTACTACTCCGATCAGACATCATATATCCCCAGGTCACTTGGCTAAACTGAACAGTTGTCTACCCCAAAATTACCTTATTAGAATCTAGCTGACCATGGGAATATCACTTGATAGCTAAACAATGTACTTTGTATAGGTGTGGAATTAAAATATGACACACTACAACCCTGTGATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254263 347 + 636262 AGATGCTGCAAGTGTCTACCTA-------------TACCAACCATCATTCATGGCTTTTGCCAGGGACATACATGATCCAGCAATACACCCAAACAAACTCTGGGATGCAGTTGGAGTCAACTGGCCAATAAAGCGGGTAGTTGGTTAGTGAGATATATGTTATTGCATGTTTAATGGACAAGGTTCCAAACTTGCTACTCTGATCAGACATCATATATCCCCAGGTCACTTGGCTAAACTAAACAGTTGCCTACCCCAAAATTACCTTATTAGAATCTAGCTGACCATGGGAATATCATTTGATATCTAAACAATGTACTTTGAGTAGGCGGACAACCAATACACAAC---------CCCTGTGATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 244074 369 + 647215 GGATGCTGCAATTCTCTACCTATCTTACCCTTAAGTACCAACCATCCTTCATGGGTTTTGCCAGTGATATACATGATCTAGCAACACACCCAAACAAACTCCGACATGCAGCTTAACTCAAATGGCCAATAAAGCAGGTAATTAGATTGTGAGACTTATGTTGTTGCATGTTTAATGGACAAGGTTCCACACTTACTACTCCGATCAGACATCACATATCCCCAGGTCACTTGGTTAAACCGAACAGTTGTCTACCTCATAATTACCTTATTAGAATCTTATTGGCTATGGGAATATCACTTGCTAGCCAAACAACACACTTTGTATAGGTGTGGAATTAAAATATGACACACTACAACACTGTGATCT + +a +s mr.mrrefChr5 107294 16 + 294542 GCTGATCTACGTACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254664 16 + 636262 GCTAAACAATGTACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 244443 16 + 647215 GCTGGTCTACGTACAC + +a +s mr.mrrefChr5 107310 170 + 294542 ACAACCAATACACAACCCCTGTGATCTCATTAAACTAAGTTTCATGACTTTGTCCTATAAGTTGTAACTATTGGGTTAGGTATCTGTCAACCTACTGGTGTTTAAGGTCCTTGATAGAGTATGAAGTCCTCGTGCCATGTTGTAGGTGGAGATGTGCTGGCTGCAACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254691 167 + 636262 ACAACCAATACACAACCCCTGTGATCTCAGTAAACTAAGTTTCCTGACTTGGTCCTATAACTTGTAACTATTGGGTTAGGTATCTGTCAACCTGCTGGTATTTAAGGTCCTTGATAGAGTATGAAGTCCTCATGCCATGTTGTAGGTGGAGATGTGC---CTGCAACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 244459 156 + 647215 ACAACCAATACACAACCCCTGTGATCTCATTAAACTAAGTTTCATGACTTTGTCCTATAAGTTGTAACTATTGGCTT--------------CCACTGGAGTTCAAGATCCTTGATAGGGTATGAGGTGCTTGTGCCATGTTGTAGGTGGAGCTGTGCTGGCTGCAACGTC + +a +s mr.mrrefChr5 107480 17 + 294542 GTATGCCATTTTACCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254858 17 + 636262 GTATGCCATTTTACCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 244616 17 + 647215 GTATGGCATTTTACCAG + +a +s mr.mrrefChr5 107497 127 + 294542 CACATAGATTCTAGCTTTGTCCAAACAGTTGTAGTGGAGTCATTCTGTAGGCTGGCAAGATGATGATACAAGAACTTCTACCCACCAAAGAAAGGTCATATCCATCTTATGCAGTATATGAATATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 254875 122 + 636262 CACATAGATTCTAGCTTTGCCCAAATAGTTGTAGTGAAATCATTCTGTTGGCTGGCAAGATGATGATACAAGAACTCTTACCCACCAAAGAAAGGTCATATCCTTCTT-----GTATATGAATATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 244634 127 + 647215 CACAGAGGTTCTAGCTTTCTCCTAACAACTGTAGTGGAGTCAAGCTGGAGGCTGGCAAGATGATGATAGAAGAGCTTCTACCCACCAAAGAAGGGTCGTCTCCATCTTATGCAGTATCAGAATATCA + +a +s mr.mrrefChr5 107624 15 + 294542 TTTGGAACAAGAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255014 15 + 636262 TTTGGAACAAGAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 244761 15 + 647215 CTTGGAACAGGGAAG + +a +s mr.mrrefChr5 107639 18 + 294542 GTCATATCCATCTTATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255029 18 + 636262 GTCATTTCCATTTTATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 244777 18 + 647215 GTCATATCTATCTTACGC + +a +s mr.mrrefChr5 107657 44 + 294542 AGTACATGAATATGACTTGGAACATCCTCCCATTTGGTAGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255048 44 + 636262 AGTACATGAATATGGCTTGGAACATCCTCCCATTTGGTAGCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 244795 44 + 647215 AGTCTATGAATATGACTTGGAACATTCCCCCATTTGGTAGCACT + +a +s mr.mrrefChr5 107701 135 + 294542 GTTAGGGCTAGACCTTTGGCTCTCAGCAACTGCTACTGAGTAAGATATTAATTTCCTTGATCAGAAGATATTCATGATATCACTTTCTTCATGCTTGATGGAGTCCGTTCAGGATATAGCTTCTTTGCTGCTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255098 135 + 636262 GTTAGGGCTAGACCTTTGGCTCTCAGCAACTGCTACTCAGCAAGGTATTAATTTCCTTAATCAGAATATATCCCGGATATGACTTTCTTCATGCTTGATGGAGTCCGTTCAGGATATAGCTTTTTCGCTGCTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 244839 134 + 647215 GTTAGGACTAGACCTTTGGCTTTCAGC-ACTGCTGCTGGGTAAGATATTAACTTGCTTGATTAGAAGATATTCATGATATCACTTCCTTCATGCTTGATGGAATCCGTTCAGGATATAGCTTCTTTGCTGCTGAG + +a +s mr.mrrefChr5 107836 116 + 294542 AGTGTTGTTCAAGGTTCCTCTAGGTATTTTAGCCACGCAGTCAAGACTCCACTCCAATCTCCCCAATTTAATAGTTGTAGGCCCAAGCTTCCTGCTACTGTTTAAGAGACCCATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255242 116 + 636262 AGTGTTGTTCAAGGTTCCTCTAGGTGTTTTAGCTACGCAGTCTAGACTCCACTCCAATCTCCCCAATTTAATAGTTGTAGGCCCAAGCTTCCTGCTACTGTTTAAGAGACCCATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 244973 116 + 647215 AGTGTTGTTCAAGGTTCCCCTAGGCATTTTGGCCACGCAGTCAAATCTCCACTCTGATCTCCCTAACCTAATAATTGTAGGCTCAAGCTTCCCAATACTGTTTGGGAGACCCATTT + +a +s mr.mrrefChr5 107952 122 + 294542 ATGTAGCTTCATTTATGGTTCTCGTAGGTGCTTTAGGTGCACAGTGAACACTCCTATCTCCACAGCTTGAAGAAAGCCCCAAGCTTGCTCCATGGTATGAAAAGTCCTATGCTTACTATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255358 122 + 636262 ATGTAGCTTCATTTATGGTTCTCGTAGGTGCTTTAGGTGCACAGTGAACACTCCTATCTCCACAGCTTGAAGAAAGCCCCAAGCTTGCTCCATGGTATGAAAAGTCCTATGCTTACTATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 245091 122 + 647215 ACGTAGCTTCATTTATGTTTCCCATAGGTGCTTTAGCTGCACAGTGAAGACTCCCATCTCCACAACTTGAAGAAAGCCCCAAGCTTGCTCCATGGTATGAAAAGTCCTATGCTTACTATTAA + +a +s mr.mrrefChr5 108074 8 + 294542 ATCCACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255480 8 + 636262 ATCCATCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 245266 8 + 647215 GTTCACTA + +a +s mr.mrrefChr5 108082 123 + 294542 TCATCATGGACTCTAATTAATAAGACATTAGCTTCATCATATACTGTTCCTCTGACTCTACTTTGCACTCAAGTGTAGTACACAAGCTATCTTATTATCTATCACAGCCTCATGGGGCTAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255488 114 + 636262 TCATCATGGAGTCTAATTA---------TAGCTTCATCATATACTGTTCCTGTGACTCTATTTTGCACTGAAGTGTAGTACACAAGCTATCTTATTATCTATCACAGCCTGATGGGGCCAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 245276 123 + 647215 TCATGATGGACTCTAACTAATAAGACATTGGCTCCATCACATACCGTTGCTCTGACCCTACTCTGCACTCAAGTGTAGTACACATGCTGTCCTATTATCTATCACAGTCTCATGGGGCTGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 108205 71 + 294542 TGATGTCATGTATTTAATTATGGGTAAGAGTAAGGGTGTCCTTACTTGGTCTCAGTAGTATAGGAAGATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255608 71 + 636262 CGATGTCATATATCTAGTTATGGGTAAGAGTAAGGGTGTCCTTACATGGTTTCGGTAGTTTAGGAAGATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 245399 67 + 647215 TGATGTCACGTATTTAATTAT----AAGGGTAAGGGTGTCCTTACTTGGTCTCAGTAGTATAGGATGATAA + +a +s mr.mrrefChr5 108276 156 + 294542 GTTTCAGCATTAGATGGCTTGACATCAGGCTCAGAACACAGGAGAGAAGTACCACGATACTGCGACAAAAGACACTACAACCCTCAGACTAGCAGCAGGGCGGACAAAACATAGAGACAGTAGGTGGTCCCTACTAACAGAGTTCAAACTAACTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255680 99 + 636262 GTTTCAGCATTAGATGGCTTGACATCAGGCTTGGAAGAGAAGAGAGAAGCACCATG---------------------------------------------------------GAGACAGTAGGTGGTCCCTACTAATAGAGTTCAAACTAACTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 245466 156 + 647215 GTCTCAGCATCAGATGGCTTGACATCAGGCTCAGAACACAGGAGAGAAGTACCACGATACTGCGACAAAAGACACTACAACCCTCAGACTAGCAGCAGGGCGGACAAAACATAGAGACAGTAGTTGGTCCCTACTAACAGAGTTCCAACTAACTGG + +a +s mr.mrrefChr5 108432 263 + 294542 GTTCAACTATAGGTCACCAGTACAATATTGTCTCATTCTCTGTAACAAACAAAACATCCTAGGAACTTAACCATTTAATGCACAAGATACAGCAGCCTGTACCTAAGCTGCAGGGGGGTACTGTATACAATGTTCCAGGACTCACAAGTTTACAAATTTCATGATCTAATATATGACAAGGCACCTAATGGACAAAAGCCTGCTGCATCAAGTGACCTTAGCCATTTTACATATCAAACTGCCATGAACCCAATGCCCTGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 255812 259 + 636262 GTTCAACCATAGGTCACAAGCACAATATCGTCTTATTCTCTGCAACAGACAAAACATCCTAGGAATTTAACCATTTAATGCACTAGATACAGCAGCCTCTACCTCAACCGCAGGGGGGTACTGTATACAATGTTCCAGAACTCACAAGTTTACAAA--TCGTGATCTAATATATGACAAGGCACCTAATGG--AAAAGCCTGTTGCATCAAGTGACCTTAGCTATCTTACATAACAAACTGCCATGAACCCAATGCCCTGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 245622 256 + 647215 ATCTCACTATATGTCACCAGTAGAATATTGTCTCATTC-CTCTAACGAACAATACAT-GCAGGAACTTAGCCATTTAGTGCACAAGATACAGCAGCCGGTAGCTAAGCTGCA-GAGTGTACTGTATACAATGATCCAGGACTCACAAGTTTACAAATTTCATGATCTAGTATCTGACAAGGTGCTTAACGGACAAAAGCCTGCTGTGTCAAGTGACCTTTACCACTTTACATATCAAACTGCCATGAAC----TGCCCAGGAT + +a +s mr.mrrefChr5 108695 52 + 294542 TATACAGACTCCCATTGATTAGAATTAGGCTGAAGTGAAATACGCTCTAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256072 52 + 636262 CATACAGACTCCCATTGATTAGAATTAGGCTGAAGTGAAATATGCTCTAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 245878 51 + 647215 TATACAGGC-CTCTGTGATTAGAACTGGGCTGCAGTGAAATACGCTCTAGCT + +a +s mr.mrrefChr5 108747 184 + 294542 TTTCACCTTCTAGTGTAGATTACATTGTGATTTATAGTACAACAGAGTAGCTCATGGTTCTAAATATCATCACACTGAGCAAAGAGAACCCCTACTTCAATACAATCAGCAGAATGGTAATTAAGACCTAATAGTTGTAACCTCGGTCCCTGGAAGAGGTTAGAGTGTTGCTTCAAAGTGTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256127 180 + 636262 T-TCACCTTCTAGTGTAGATTACATTGTGATTTATAGTACAACAGAGTAGCTCATGGTACTAACTATCATCACACTGAGC---GGGAACCCCTACTTCAATACAATCAGCAGAATGGTAATTAAGACCTAATAGTTGTTACCTCAGTCCCTGGAAGAGATTAGAGCGTTGCTTCAAAGTGTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 245929 184 + 647215 CTTCACCTTCTAGTGTAGATTATACTGTGATTTATCATACAGCAGAGTAGCTCATGGTTCTAAATATGATTACACTGAGCAAAGAGCACCCTTACTTCAACACAATCAGCAGAATGTTAATTAAGACCTAATAGTTGCAACCTCGGTCCTTGGGAGAGGTTAGAGTGTTTCTTCAAAGTGTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 108931 101 + 294542 CCATGATAGGATGCCTGTGGTCAACAAACGATGTACTTGTTATTTAAATAACAGAGTAGTTGCTGAGGTGTGCCACACTAGAGCTCACTTATGCATGTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256307 101 + 636262 CCATGATAGGATGCCTGTGGTCAACAAACGATGCACTTGTTATTTAAATAACAGAGTAGTTGCTGAGTTGTGCCACACTAGAGCTCACTTATGCATGTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 246151 101 + 647215 CCATGATAGGATGCCTGTGGTGAACAAACGAAGTACTTGTTATTTAAATATCAGAGTAGTTGCTGAGGTGTGCCCCACTAGAGCTTGCTCATGCCTGTGGT + +a +s mr.mrrefChr5 109032 263 + 294542 AGCAAATAAGCTACCCATTATATAAATAACAAACTTTATGCTTAAGGTGTGCTCCACTAAAGATCCTTTGATTCATAAACCCTTACTTTATGGCCCAGAATAACAAAGAACAACAAATGTGAATACATAAATGTCAGAGTCTCAGAGGAGTCCCCGACTAGCTTAAGCCCTGAGGATACATCTCCCAGTTAGGATCTAAGAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAGACTTTGTCACCTTTGCATTGCTCCGCCTGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256408 263 + 636262 AGCAAATAAGCTACCCATTATATAAATAACAAACTTTATGCTTAAGGTGTGCTCCAGTAAAGATCCTTTGATTTGTAAACCCTTACTTTATGGCCCAGAATAACAAAGAACAACAAATGTGAATAAATAAATGTTAGAGTCTCAGAGGAGTCCCTGACTAGCTTAAGCCCTGGGGATACATCACCCAGTTAGGATCTAAGAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAGACTTTGTCACCTTTGAATTGCTTCGCCTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 246253 253 + 647215 AGCAAGCAATATACCCATAATTTAAATAACAAACTTGTTGTTTAAGGTGTGCTCTGCTAAAGATCCTCTGATTCATAAACCCTTACTTTATGGACCAGAGT----------AACAAACGTGAATGCATAAATGTCAGAGTCTCAAAGGAGGCCCCGACTAGCTTAGGCCCTGAGGATACATCTCCCACTTAGGATCTAGAAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAAACTTTGTCACCTTAGCATTGCTCCGCCTGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 109295 104 + 294542 TTTGGATTTGGTACAATTCTATCTACAAAAAGAAGTTGTTTTTATAAAGGGTCCACCTGAAGGCCACCCAGTTATAGATGACTCATGAGTTCACTGATACAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256673 101 + 636262 TTTAGATTTGGTGTAATTCTATCTACAAAAAGAACTTGTTTTTATTAGAGGTCCACCTGAAAGCCACCCA---ATAGATCACTCATGAGTTCACTGATACGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 246506 104 + 647215 TTTGGATTTGGTACAATTCTATCTAGAAAAAGAAGTTGTTTTTAGAAAGGTTCCACATGAAGGCCACCCAGTTATAGATGACTCACGGGTTCACTGATATAGAC + +a +s mr.mrrefChr5 109399 8 + 294542 ATACACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256775 8 + 636262 ACACACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 400048 8 - 647215 TTTTTCTG + +a +s mr.mrrefChr5 109407 115 + 294542 CAACAGCTCTACTGTTTACAGCAGGTATACAACTAAAATGACTATATTTTCCAGGATATTTAACAAGTTACTAGACTAAAGCCAAGAAAATAGTAAGTTCAAATGAATATGGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256783 115 + 636262 CAACAGCTCTACTGTCTGCAGCAGGTATACAACTAAAACGACTATATTTTCCAGGATATTTAACGAGTTACTAGATTGAAGCCAAGAAAATAGTAAGTTCAAATGAATATGGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 400057 115 - 647215 CGTCATCTCTACTGTTTACAGCAGGTATACAATTGCGGTGACAATATTTCTCAGGATATTTAGCAAGCTGCTAGACTAATGCCAAGAAAATAGTAAGTTCAAATGAATATGGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 109522 78 + 294542 AGTCAAGTATGGGACCTATCAGTCAATGTGTTGACCAAAATACATGCCAAGGGGCCAGGAGACTTTGCAAGAGTGGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256902 78 + 636262 AGTCAAGTATGGGACCTATCAGTCAATGTGTTGACCAAAATACATGCCAAGGGGCCAGGAGACTTTGCAAGAGTGGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 400172 78 - 647215 AGGTAAGTGTGGGAACTTTCAGTCAATGTGTTGACCAAAATCCATCCGAGGGGGCCTGGAGACTATGCAAGGGTGGAC + +a +s mr.mrrefChr5 109600 68 + 294542 TGCTGGCTTTTACTGATACAAATTGCTCTATGGCCTATGGACGACCAAGACATGAGACTAAAATTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 256980 68 + 636262 TGCTGGCTTTTACTGATACAAATTGCTCTATGGCCTATGGACGACCAAGACATGAGACTAAAATTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 400251 68 - 647215 CACGGGTGTTTACTGATACAGATTGCTCTTTGGCCAATGGACAACCAAGACATGAGACTGGAATTATG + +a +s mr.mrrefChr5 109668 82 + 294542 TGGAACTCTATGCGGTGCTGCATGTCCACAATTAGCTTCTACCTTTGAATATGGTTATGATTATGGTAGTGAGATTTGTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257048 82 + 636262 TGGAACTCTATGCGGTGCTGCATGTCCACAATTAGCTTCTACCTTTGAATATGGTTATGATTATGGTAGTGAGATTTGTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 400322 82 - 647215 GGGAACTCTATGGTCTGCTGCAAGTCCATAATTAGCTTCCACCTTGGAGCATGGTTATGATTTTGGTAGTGAGATTTGATTT + +a +s mr.mrrefChr5 109750 15 + 294542 CTATTAGCTTTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257130 15 + 636262 CTATCAGCTTTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 400408 15 - 647215 CTATTACCTTTGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 109765 80 + 294542 AAAGTGAACTTTATCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGATCAGAGATGTGATGTGCAACTACAGTTGAGTTGCCCATGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257156 79 + 636262 AAAGTGAACTTTATCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGAT-AGAGATGTGATGTGCAGCTACAGTTGAGTTGCCCATGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 400423 80 - 647215 AACATAAACTTTGTCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGATCATAGATGTGATGTATGACTACAGTTGAGTTGCCCATGCA + +a +s mr.mrrefChr5 109845 21 + 294542 CTGCATTCAAGATACCTATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257235 21 + 636262 CTGCATTCAAGATACCTATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 400504 21 - 647215 TTGCATCCAAGATACCTATGG + +a +s mr.mrrefChr5 109866 80 + 294542 CTTGTTCAGGGGCATGAGTTATGTGATGAGGTGGTCCCAAGCCCAGCCAACAATGTGACATGCTGGATAGTCAGAACAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257256 80 + 636262 CTTGTTCAGGGGCAAGAGTTATGTGATGAGGTGGTCCCAAGCCCAGCCAACAATGTTACAGGTTGGATAGTCAGAACAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 400526 79 - 647215 CTTGTTCAGGGGCATGAATAATGTGATGAGGTGGTTCCAAGCCCAGCCAACAATGTGAAATGCTGCATGG-CAGTGTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 109946 37 + 294542 TGCAAGTTTCAACCAACAGAGTGACAACTATAATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257336 37 + 636262 TGCAAGTCTCAACCAACAGAGTGACAACTATAATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 247168 37 + 647215 TGCAAGCTTCAACAAACCTAGTGACAACTATAATCAT + +a +s mr.mrrefChr5 109983 8 + 294542 GTCTAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257373 8 + 636262 GTCTCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 247206 8 + 647215 GTCTAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 109991 387 + 294542 GGTGATAGGTTCCTCCCAGGAAAGTAGCACAGGGGGCTGATAGAAGAGCTCCCTGTACCTATGATTGTCAGCATATGCCAGACCTCCTGTTTGGGATGTATGCACTGCCAAACTGGCTATAGATTACATTGGCAAATTAATTCCTTGAGCCCATTAATGCAGCAGCCTGGTATTGATTGGACTAGAGTTGGGCCTCTAAACACCAAGAGAAAGGAGAGAACATTTGTTAAGAAGGATTCTACATGCTACCGACCACACTAGTTAATCTTCTGTATCAAAATAACCCAGTCTACAACATTAAAATCTAACTTAGCCTGTTACTCGTGACACACCACTAAGTCATTGCTTTGAAGGCCATAACTTCTGTAGAAGCTACACTAGAAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257381 383 + 636262 GGTGATAGGTTCCTCCCAGGAAAGTAGTACAGGG-GCTGATAGCAGAGCTCTTTGTACCTATGATTGTCAGCTTATGCCAGACCTCCTGTTTGGGATGTACGTACTGCCCAACTGTCTATAGATTACATTG---AATTAATTCCTTGAGCCCATTAATGCAGCAGCCAGGTATTGATTGGACTAGAGTTGGTCTTCTAAACACCAAGATAAAGGAGAGTACATTTGTTAAGAAGGATTCTACATACTACCGACCACACTAGTTAATCTGCTGTATCAAAATGACCCAGTCTACAACATTAAAATCTAACTTAGCCTGTTACTCATGACACACCACTAAGTCATTGCTTTGAAGGCCATAACTTCTGTAGAAGCTACAGTAGAAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 247215 379 + 647215 GGTGATAGGTTCCTTCAAGGAAAGTAGCACAGGGGGCTGACAGAGGAGCTCCCTGTACCTATGACTGTCTGCATATGCCAGACCTCCTGTTTGGGATGTATGCCCTGCCAAACTGGCTATAAATAACATTGGCAAAATAATTCCTTGAGCCCATCAATGCAGCAGCCTAGTATTGATTGGACTAGCATTGGGCCTCTAAACACCAGAAGAGAGGAGAGAACATTTGTTAAGGAGGATCATACATGCTATCAACCACACTAGTTAATCTTCTGTATCAAAATAACTCAGTCTACAATATTGAAGACTAGCTTACCCTGTTCCCTGTGAC--------AAGTCATCGCTTTGAAGACCATAACTTCTGTAGAAGCTATACTAGAAAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 110378 17 + 294542 GATAAGGAGCTAGATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257764 17 + 636262 GATAAGGAGCTAGATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 247616 17 + 647215 GATAAGGAGCTAGGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 110395 145 + 294542 GAGAGATCAGGGTGATCTTCCTTAGCCAGGCTGGTTCTTTCACAAGTAGGGAGACGAAAAGGTTAACAGCTGTGGTAATGTGTGTTGTTGTTTAAAAGGGAAGGTTGAAGCTCAACTGTAAGCTCACACACTGTTTTGCTAGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257781 143 + 636262 GAGAGATCAGGGTGATCTTCCTTAGCCAGGCTGGTTCTTTCACAAGTGGGGAGACGAAAAGGTTAACAGCTGTGGTAATATGTG--GTTGTCTAAAAGGGAAGATTGAAGCTCAACTGTAAGCTCACACACTGTTTTGCTAGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 247645 135 + 647215 AAGAAATCAGTGTGGTCCTCCTTAGCCAGGCTGGTCCTTTCAGAAGTAGGGAGACAAAAAGGTT--CAGCTGTGATAATGCGTGTTGTTGTTTCAAAGGGAAGGTTGAAGCT--------AGCTCACACATTGTTTTGCCAGATT + +a +s mr.mrrefChr5 110540 308 + 294542 CTCCTGCCTTGGAACCTTGTACTAACACTGGAGATATCAGGTTTCCAACCCTTATTAAACCCTTAGTAAGACCACGGCTCATGGTTTTTACTTCAATATCATGATCAATACCCTACATCAGATTCTTGTGCTGTAAGAAATGGGTGAATTAGTAAAAATGCTTGTAATGGATAAAGATCTAGGCTTTTTATAGAGGAAGCAGCAAGCAAGCACCTAAAATTTAATTTTGCGGGGCTATCTACACTCCAAAAACACTCCAGCAAGTTCAAGTGACAGAATGGTTTTTTTATTTTGCAACTATCATGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 257924 303 + 636262 CTTCCGCCTTGATACCTTGTACT-----TGGAGATATCAGGTTTCCAACCCTTATTAAACCCTTAATAAGATCACAGCTCATGGTTTTTACTTCAATATCATGATCAATACCCTACATCAGGTTCTTGTGCTGTAAGAAATGGGTGAATTAGGAAAAATGCTTGTAATGGATAGAGATCTAGGCTTTTTAGAGAGGAAGCAGCAAGTGAGCACCTAAAATTTAATTTTGCGGGGCTATCTACACTCAAAAAACACTCCAGCAAGTTCAAGTGACAGAATGGTTTTTTCATCTTGCAACTATCATGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 247795 306 + 647215 CTCCTGCCTTGGAACCTTCTACTAACACTGGAGATATCAGATTTCCAACCCTTATTAAGCCCTTAGTAAGACCACGGCTCTTGGTTTTTACTTCAATATCATGATCAATACTCTACATCAGATTCTTCTGCTGTAAGAAATTGGG-AATTAGTAAAAAGGCTTGTATTGGATAAAGATCTAGGCTTTTTATAG-GGAAGCCGCAAGCAAGCACTTAAAATTCAATTTTGTTGGGCTATCTACACTCCAAAAACACTCCAGAAAGTTCAAGTAACAGAATGGTTTTTTTAGTTTGCAACTATCGTGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 110848 409 + 294542 TGCTATCAAAAGATTGAATTCTCAAATTCCTCCTTAGTGCAAGATTATCAGTATGTGGTGCAGTAGCCAGGTCTATTAATCTTTTAAGAGTCCGGTGCTAAAGCACCCACCAATGCGGTGACTTCCATGAGTTTGAAATGATTGCAGGCAACAGGCTCACAGGAGCAATAGACCGATCTAGGAGATTGAGATTATCAGTGGAAAGAGTTCATGTTCTGGAGATATTGTACTATAATTGTGTCAGGGATTAGCTGTTCTTCCTTTCTTCAGAGTATGACAGAATTTGGTTATAGAATAATTGCCCAAGGAAGTATGAGTATAGTAGGCCCTGTGCCTCTACCTGAATTTATATTGTCTATAGGGTAGTCTTCTGTGTAATTCTGCAAAGCTGCAACAAGCAAACACCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 258228 409 + 636262 TGCTATCAAAAGATTGAATCCTCAAATTCCCCCTTAGTGCAAGAGTATCTGTATGTGGTGCAGTAGCCAAGTCTATTAATCTTTTAAGAGTCCGGTGCTAAAGCACCCAACAATGTGGTGACTTCCCTGAGTCTAAAATGATTGCAGGCAATAGACTTAAAAGAGCAATAGACCGATCTAGGAGATTGAGATTATCAGTGGAAAGAGTTCATGTTCTGGAGATACTCTACTATAATTGTGTCAGGAATTAGCTGTTCTTCCTTCCTTCAGAGTATGACAGAATTTGGTTATAGAGTAATCGCTCAAGGAAGTATGAGTACAGTAGGCCCTGTGCCTTTACTTGAATCTGTATTGTCTATAGGGTAGTCTTCTGTGTAATTCTGCAAAGCTGTGAGGAGCAAACACCCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 248101 391 + 647215 TGCTATCAAAAGATTCAGTTCGCAAATTCCTCCTTAGTGCAAGATTATCAGTATATGGTGCAGCAGTCAGGTCCAGTAATCTTTTAAC------------AAGCATCCACCAATACGAAGAGTTCCATGAGTTTGAAATGATTGCAGGCAGCAGGCTCACAGGGGCAATAGACTGATCTAGGAGATTGAGATTATTAGTGGAAAGAGTTCATGC------AATCTTGTACTATAATTTTGTCAGGGATTAGCTGTTCTTCCTTTCTTCAGGATATGACAGAACTTGGTTATAGAATAATTGCCCATGGAAGTATGAATATGGTAGTCCCTGTGCTTCTACCTAAATTTATTTTGTTGATATGGTAGTCTTCTGTGTAATGCTGCTAAGCTGCAACAAATGAACACCAGC + +a +s mr.mrrefChr5 111257 148 + 294542 GCTTTTAACTAATCTGCCTGTTTAGAACAGCTATGTTTATACAGGATGGTCCATCTGGCCCCAGACTTCTATGACCAATTGGAGTCACAATTCTGTGGTGTGTTGGTCCCCTAGCACACAGGTGGACTAGCAGTCCAAGATAATTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 258637 145 + 636262 GCTTTTAACTAATCTGCCTGTTTAGAACAGCTATGTTTATATAGGCTGGTCCATCTGGCCCCAGACTTCTATGACCTATTGGGGTCAGAATTCTGTGGT-TGTTGGGCCTCTAGCACACAGGTGGACAAGCAGTCCAAGATAATTG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 248493 148 + 647215 ACTTTTAACTGATCTGTCTGTTTAGAACAGGTATGTTTATACAGGATGGTCCATCTGGCCCCAGACTTCCATGACTAATTGGAGTCACAATTCTGTGGTGTGCTGGTCCCCTAGTACACAGGTGGACTAGCAGTCCAAGATAATTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 111405 27 + 294542 GCCAGGTTTTGATCGTCACTTGTAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 248644 27 + 647215 GCCAGGTTTTGATCGTCACTTGTAATG + +a +s mr.mrrefChr5 111432 269 + 294542 TTCTGCTGGCACAGAGAAGAGTTACTGAGCTACAGATCTAGATAGCCCCTTCAGTAGTGCTCATTCTAGGATGGAACTCCTCTTGCACAGCTAGCTGGGGGGTGATACACAGATACATCAGTTACCCAGTTAAAAGAATATTACTAGTAGTCTTCTGGTGTTCTGATTGACCTTGGGAGTGGGGGATTCAACAGCACTGCACAAATGATGGAGTACATAGTGCACCTTCTGCAGCATTTGTATAACAAGAGCATTTATAATTGGGCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 258782 217 + 636262 ----------------------------------------------------AGTAGTCCTCATTCTAGAATGGAACTCCTCTTGCACAGCTAGCTGGGGGGTCATACACAGATACATCAGTTACCCAGTTAAAAGAATACTACTAATAGTCTTCTAGTGTTCTGAGTGACCTTGGGAGTGGGGGATTCAACAGTACTGCACAAATGATGGAGTACATAGTGCACCTTCTGCAGCATTTTTACAGCAAGAGCATTTATAATCGGGTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 248673 248 + 647215 TTCTGCTGGCACAGAGAAGAGTTACTGAGCTACAGATCTAGATAGCCCCTTCAGTAATGCTCATTCTAGGATGCAACTCCT-----------------GCGGTGATACACAGATACATCAGTTACCTGTTTAAAATAATATTACTAGTAGTCTTCTGGTGTTCTCATTGACCTTTGGAGTGGGGGATTCAACAGCACTGC----ATGATGGAGTACATAGTGCACCCTCTGCAGCATTTGTATAACAAGAGCATTTATATTTGGGCTCA + +a +s mr.mrrefChr5 111701 86 + 294542 TGTTACCCAAGCCAGATATTCACCAGGCTTGTGGTGTATAAGGGACGAGGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259001 86 + 636262 TCTTGCCCAAGCCAGATATTCACCAGGCTTGTGGTGTATAAGTGACGCGGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 248921 83 + 647215 TGTTACCCAAGCCAAATATGCACAGG--TTGTGGTGTATAAGGGATGAAGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTG- + +a +s mr.mrrefChr5 111787 91 + 294542 CAAAAGCAGAATCCTTCTGATCTACACATTTGGACTATTGACATTTTACTTCCTTACTCCTAAAGCTTCGCTTTTCACTTTTGGCTTGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259088 91 + 636262 CAAAAGCAGAATCTTTCTGATCTATGCATTTGGACTAATGACATTTTACTTCCTTACTCCCAGAGCTTCGCATTTCACTTTTGGCTTGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 249004 80 + 647215 -----------TCCTTCTAATCTACACATCAGGACTATTGACATTTTACTTCACTACTCCTAAAGCTTTGCTTTTCAGTTTTGGCTTGGAT + +a +s mr.mrrefChr5 111878 221 + 294542 TTTCATCTGATCTGTGGCAAATGTTGAGGGCTCTCCAGACTTGTTTCTAATATGGCCACGATAGATTACAGTTGGTTGCCATTTATTCTCTTTGCTTTTATCTTCCCTTCCAAACTTATGTCCTTAATACAAACAATCGCTGTCCTGACATCCAATATTCCCAACATGCTCCCACTGACAGTAACCACATGACCAAACGGAAGTTAGAACCATCATGCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259180 210 + 636262 TTTCATCAGATCCATGGCAAATGTTGAGGGCTCTCCAGACTTGTTT---ATATGGCCACGATAGATTACAGTTGGTTGCCATTTATTTCTCTTGCTTT--------CTTCCAAACTTATGTCCTTAATACAAACAATCGCTGTCCAGACATCCAATATTCCCAACATGCTCCCACTGACAGTAACCACATGACCAAACAGGAGTTGGAACCATCATGCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 249084 215 + 647215 ----ATCTGTTCTGTGGTAAATGTTGAGGGCCCTCTTG--TTGATTCTAATATGGCCACAATAGATTACAATTGGTTGCCATCTCTTCTCTTTGCATTTATCTTCCCTTCCAAACTAATGTCCTTAATACAAACAATCGCTGCCCTGACATCCAGTATTCCCAACATGCTCCCACTGACAGTAACCATGTGACCAAACGGAAGGTAGAACCATCACACAAC + +a +s mr.mrrefChr5 112099 16 + 294542 TTAAGCATTACAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259390 16 + 636262 TCAAGCATTACAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 249300 16 + 647215 TTAAGCATTACAACTT + +a +s mr.mrrefChr5 112115 25 + 294542 AGCACTCTTGTGTTATTGCTAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259406 25 + 636262 AGCACTCTTGTGTTATTGCTAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 249317 25 + 647215 AGCATTTTTGTGTCATCATTGATTT + +a +s mr.mrrefChr5 112140 50 + 294542 TTGGTCATTTTGGGTAGGCCAATCTTTGGGTTGGTCATTTCTAATCTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259452 50 + 636262 TTGGTCATTTTGGGTAGGCCAATCTTTAGGTTGGTCATTTCTAATCTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 249342 50 + 647215 TTCACCGCTTTGGGCAGACCAATTTTTGGGTTGGTCATTTCTAATCTTGG + +a +s mr.mrrefChr5 112190 15 + 294542 CCAATCTTTGGGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259502 15 + 636262 CCAATCTTTGGGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 249397 15 + 647215 CCAATCTTTGGGTTG + +a +s mr.mrrefChr5 112205 318 + 294542 ATTCCTTACTCTGGGGTCAATAGCTTCCCTATTGGAAATATAGACATATTTATGCATAGCAATCTCCTACACAAGCGTGCCCTCAAACAGCTTCTAGAAAAAATGTATACATGTCCCCTCTGGATCACAAAAACTGATCATATAACTCATATCAATTACCCTACACTTCTTATTCAGCTTTGGATTTTCTAAACTGATTGACCGATTCAAACATACCATCGACCATAGACATACTTAATGACCCCTTACTAAGTACCTATCTCAATGTGAGGCATTAGACTAGCGGATGCCTCATAAGATTGCATATGTTCTTAGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259520 311 + 636262 ATTCCTTACTATGGGGTCAATAGC-------TTGGGAATATAGACATATTTATGCATAGCAATCTCCTACACAAGCGTGCCCACAAACAGCTTCTAGAAAAGATGTATACATGTCCCCTCTGGACCACAAAAACTGATCATATAACTCATATCAATTACCCTACACTTCTTATTCAGCTTCGTATTTTCTAAACTGATTGACCAATCCAAACATAACATTGACCATAGACATACTTAATGACCCCTTACTAAGCACCTATCTCAATGTGAGGCATTAGGCAAGCAGATGCCTCATGAGATTGCATATGTTCTTAGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 249412 312 + 647215 ATTCCTTACTCGGAGGTCAATAGCTTCCCTATTGGAAATATAAACATACTTATGCATAGCAATCTCCTACACAATTGTGCTTTCAAACAGCTTCTATAAAAAATGTATACGTGTCCCCTCTGGATGACAAAAACTGATCATATAACTCATATCAATTACCTTACACTTCTTATTTAGCTTTGGCTTTTCCAAATTGATTGACTGATTCAAACATACCCTCAACCATAGACATACCTGATGACCACTTACTAAATACCTATCTCAATGTTAGTCATTGGACTAGCGGGTGCATCATAAG------TATGTACTTAGCAT + +a +s mr.mrrefChr5 112523 4 + 294542 GATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259831 4 + 636262 GTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 249726 4 + 647215 GATC + +a +s mr.mrrefChr5 112527 4 + 294542 TTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259840 4 + 636262 TACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 249730 4 + 647215 TTCT + +a +s mr.mrrefChr5 112531 42 + 294542 TGGAGTTCATGGAAGTCACTTCTTACCCTAGCACCCACATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259951 42 + 636262 TGGAGTTCATGGAAGTCCCTTCTTACCCTAGCACCCACATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 249734 42 + 647215 TGGAGTTCATGGAAGTCATTTCTTACCCTAGCACCCACATAG + +a +s mr.mrrefChr5 112573 162 + 294542 GATCTTCATGCTGCATGTCAATGGGAGTTAGGATCTTGCACTTATGCCTTTCTCATTGCCTGAGTGAAGACCACAGAGCACTAATGATAATCTGTAAATTAAGAAATACTAAAAGAGTGGAAACATCTGTAAGGTATGTATTTCTTTCTAATAGTGGAATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 259993 160 + 636262 GATCTTCATGCTGCATGTCAATGGGAGTCAGGAACTTGTACTTATGCCTGTCTCATTGCCTGAGTG-AGACCACATAGCAC-AATGATAATCTGTAAATTAAGAAATACTAGAAGAGTGGAAACATCTGTAAGGTATGTATTTCTTTCTAATAGTGGAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 249797 162 + 647215 GGTCTTCATGCTGCATGTAAATAGGAATTAGGATTTTGCACTTATGCCTTTCTCATCCCCTGAGTGAAGAGCACAGATCACTGATGATAATCGGTAAATTAAGAAAAACTAAAAGAGTGGAAACACCCGTAAGGTATGTATCTCTTTGTAATACTGTAATAC + +a +s mr.mrrefChr5 112735 138 + 294542 CATCCATTTCACAGAGTCAAGTAACTATTGAAAACACAATCTTACACCACCTCCAAGCCCCATAATATTCTGTTCTTGCCTTTAGGTGAAGTGGACATAGTCACAACGATTTATCTCATACATGAATAAGGTTATGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 260154 138 + 636262 CGTCCATTGCACAGAGTCAAGTAACTAGTGAAAACACAATCTTACACTACCTCCAAGCCCCATAATATTCTGTTCTTGCCTTTAGGTGAGGTGGACCTAGTCACAAGGATTTATCTCATGCATGAATAAGGGTATGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 249959 133 + 647215 CATCCATTTCACAGAGTCAAGTGACTATCGGAAACACAATCATACACCATCTCCGAGCCCCATATGTTTCTTTTCTTACCT-----TGCAGCGGACATAGTCACAACCATTTATCTCCTACATGAGTGGGGTTATGCC + +a +s mr.mrrefChr5 112873 71 + 294542 ACAGGAGTAGTTGCGTCATGATTGTTCAGGTTCACAGTCACGTTTATTCCTATTTATGACAATACCTAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 260300 71 + 636262 ACAGGAGTAGCTGCGTCATGATTATCCAGGTTCACGGTCAAGTTTATTCCTATTTATGACAATACCTAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 250092 71 + 647215 ACAGGAGTAGTTGCATCATGATTGTTCAGGTTCACAGTCACGTTTATTCCAATTTATGACAATACTTGATA + +a +s mr.mrrefChr5 112944 95 + 294542 ATCATTGATGGCAGATACACTGAGCGTTGGGTTGTATGTGGCAGTAAATATTTCCACAACCTCAGGAGGAGTAAGACCTACTACATTTTGAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 260378 92 + 636262 ATCATTTATGGCAAATACACTGAGCGCTTGGTTGTATGTGCCAGTGAATATTTCCATG---TCAGGAGGAATAAGACCTACTACATCTTGAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 250163 92 + 647215 ATCATTGATGGCAGATACACTGAGTGTTGGCCTGT---TGGCAGTAAATATTTCCACAACCTCAGGAGGAGCAAGACCTACCACATTTTGAATTT + +a +s mr.mrrefChr5 113039 113 + 294542 GAAGGTTTTCATAAAACCAGTGCAACTAATGGTAAATATCTTCTCTAGTTCGTCTGAGAAAAGTGATCGCATAACCTTATGCATTTGTGTGATAATGAGTGGTGGAATTCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 260470 113 + 636262 GAAGGTCTTCATAAAACCTGTGCAACTAATGGTAAATATCTTCTCTAGTTCGCTTGAGAAAAGTGATCGCATGACCTTAGGCATATGTGTGATATTGAGTGGTGGAATTCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 250256 113 + 647215 GAAGGTTTTTATAAAACCAGTGTAATTAATTGTAAATATCTTCTCTAGTAAGTCTGAGAAAAGTGATCTCATAACCTTATGCATTTGTGTGATAATGAGTGATGGAATTCATT + +a +s mr.mrrefChr5 113152 34 + 294542 GAATACTCATGGACCAATGGGCACTGTTGTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374493 34 - 636262 GAATATTCCTTTGCCAATGGGCACTGTTGTCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 250369 34 + 647215 GTTTACTCATGGACCAATGGGCACTGTTCTCCGG + +a +s mr.mrrefChr5 113186 57 + 294542 ACTGCTCTATGTCTAATGTTGTGTCAATGAGTAAAACCTGTACTGAGGAGCTTGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374527 57 - 636262 ACTGCTCTATGTCTAATGTTGTGTCAATGAGTAAAACCTGTACTGAGGAGCTTGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 250404 57 + 647215 AATGCTCTATGTCTAACGTTGTTTCAATGAGTGAAACCTATACTGAGGAGCTTGGAA + +a +s mr.mrrefChr5 113243 180 + 294542 AAAGAGTGCAGATAGTACAGGGGTAAGTTTATCAGTGCTAGCCCTCAGAAAATGTGCAGTATACCCTAATTACACCTACGTCTTAGAGAGTTGTAGGTGGATTTAAAAATCCATTTACTGACATCTGGTTGCCCACATTCACACTCCAGAACCAAGCTCTTTATGGTGATAGTAAAGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374585 180 - 636262 AAAGAGTGCAGATAGTACAGGGGTAAGTTTATCAGTGCTAGCCCTCAGAAAATGTGCAGTATACCCTAATTACACCTACTTTTTAGAGAGTTGTAGGTGGATTTAAAAATCCATGTACTGACATCTAGTTGCCCACATTCACACTCCAGAACCAAGCTCTTTATGGTGATAGTAAAGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 250461 180 + 647215 AAAGAGTGCAGATAGTACGGGGGTCAGTTTATCAGTGCTAGCCCTGAGAAAATGTGCCGTATACCCCAATTACACCTCCGTCTAAGAGAGTCTTAGTTGGATTTAAAAATCCATTTATTGACATCCGGCTGCCCACATTCACATTCCAGACCCAAGCTTTTTATGGTGATAGTAAAGTTG + +a +s mr.mrrefChr5 113423 28 + 294542 CAAATCGAATATAAGTGAGGTCTAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374765 28 - 636262 CAAATCGAATATAAGTGAGGTCTAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 250645 28 + 647215 CAAATTGAGTATAAGTGAGGTCTCATAG + +a +s mr.mrrefChr5 113451 17 + 294542 CTTGCATTATTCTCGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374794 17 - 636262 CTTGCATTATTCTCGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 250673 17 + 647215 CTTGCATTTTTCTTGGG + +a +s mr.mrrefChr5 113468 145 + 294542 GAGGTCTGGGGTAGAAATACTGCATGGCAGGCAGTTGGATGAGTATTAGCACCAAATGAAATGTTGTCTGTATTTCCATCAGTCATGTGTCCCTAGTACAGATCTGTTATGGCAGCGTCCTGGACAAGATAGTTGAGATAGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374897 144 - 636262 GAGGTCTGGGGTAGAAATACCGCATGGCAGGCAGTTGGATGAGTATTAGCACCAAATAAAATGTTGTCTGTATTTCCATCAGCCATATGTCCCTAGCCCAG-ACTGTTATAGTAGCGTCCTGGACAAGATAGTTGAGATAGCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 250690 142 + 647215 GAGGTGTGGGGTTGGAATAGTGCATTGGCAGCAGTTGGATGAG---TAACACCTAATGAAATGTTGTCCATATTTCCACCAGTCATGTGTCCCTAGTACAGATCTGTTGTGGCAGCATCTTGGACAAGATGATTGAAATAGCACT + +a +s mr.mrrefChr5 113613 9 + 294542 AGGATTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375043 9 - 636262 AGGATTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 250832 9 + 647215 AGGATTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 113622 146 + 294542 CCTTGAGCACTTCTTCCTAGTTAATCTACATGTTTTCAACAGCAGAATGGAGATACAGTGAAGTCCGTGATGAAGCTAGGAAACTTAGCAGATTGAGCAGATATCCACTCTCAGGGCAGCACTTCCCAATGTCAACAATCTGTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375055 146 - 636262 CCTTGAGCACTCCATCCTAGTGAATCTACATGTTTTCAACTACAGAATGGAGATACAGTGAAGTCCGTGATGAAGCTAGGTACCTTAGCAGATTGAGCAGATAACCACTCTCAGGGCAGCAATTCTCAATGTCAACAATCTGTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 250841 146 + 647215 CCTTGAGCAATTCTTCCTAGTTAATCTACGTGGCTTCAGCAGTGGAATGGAGATACAGTGAAGTCCATGATGAAGCTAGGAGACTTAGATGGTTGAGCAGATATCCACTTGCAGGGCAGCACTTCCCAATGTCAACAAGCTGTTGA + +a +s mr.mrrefChr5 113768 53 + 294542 TGCTCATCAAATTGCAGGAACAGTAGTCAATCTCATATTTGTTACCGAAAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375203 53 - 636262 TGCTCATCAAATTGCAGGAACAGTAGTCAATCTCATATTTGTTACCGAAAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 250987 52 + 647215 TGCTCAT-AAAGTGCAGGAACAGTAGTCCATCTAATATTTGTTACTGGAAGAG + +a +s mr.mrrefChr5 113821 324 + 294542 CGGGGATTCGGATGAACACTTGGACCACTGGCCAGTACTTGTACATACCCTTGGTCACTTATTTAGTCTATTGGGCTTGCTGCTCAGGAATCCATTGGAATTGTTTGTATATGATAGAGTAGACAATTTCTTAATACCCAGTGATGTTCTAATATATGCACACAATCTGACTGGGAGTTAGAAAGATTCTCCTCTAGTTCACTAATGGAGAGGGTTGAAAGAGGGGGTTAGGGAGTCTTGATGGATATTGGCAACATCATTTTGTAAGCTGTAAATGGAACTTGATGCAACCTGTAGCTGTAGCACCACTTGCTTTGTATAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375257 321 - 636262 CATGGGTTTGGATGAACACTTGGACCACTGGTCAGTACTTGTACATACCCTTCGTTACGTATTTAGTCTA-TGGGCTTGCTG--CAGGAATCTACTGGAATTGTTTGTATATGATATAGTAAACAATTTTTCAATACCCAGTGATGTTATAATATATGCACACAATCTGACTGGGAGTTAGAAAGAGTCTCCTCTAGTTCACTAATGGAGAGGGTCGAAAGAGGGGGTTAGGGAGTCTTGATGGATATTGGCAACATCATTTTGTAAGCTGTGGATGGAACTTGATGCAACCTGTAGCTGTGGCACCACTTGCTTTGTATAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 251039 324 + 647215 CGGGGATTCGGATGAATACTTGGACCACTGGCCAGTACTTGTATATACCCTTGGTCACTTATTTAGTCTATTGGGCTTGCTGCTCAGGAATCCATTGAAATTGTTTGTAAATGATCGAGTAGACAGTTTCTTAATACCCAGTGATTTCCTAATATAGGCTCACAATCTGACTGGGAGTTAGAAAGATTCTCCTCTAGTTCACTAATAGATAGAGTTGAAAGAGGGGGTTAGGGAGTCTTGATGGATTTTGGCAACATCAGTTTGTAAGCTGTAAACAGAACATGATGCAGTCTGTAACTGTAGCAACACTTGCTCTGTATAATT + +a +s mr.mrrefChr5 114145 54 + 294542 ATAAGTATTGGCGCCATAATAATAGCATAGGCAAAGCACGATGAAGGTTGTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375580 54 - 636262 ATAAGTATTGGCGCCATAATAATAGCATAGGCAAAGCACCATGAAGGTTGTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 251363 54 + 647215 ATAAGTATTAGCGCCATAATGATAAAATAGGCAAAGCACGATGAAGATTCTCCT + +a +s mr.mrrefChr5 114199 16 + 294542 CTGGCTAGCACAGCGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375634 16 - 636262 CTGGCTAGCACAGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 251425 16 + 647215 CTGGCTAGCACAGCAC + +a +s mr.mrrefChr5 114215 83 + 294542 TAAGATGATAAGATGGGTGATACACTGTGGAGGTGATGCCTGGCCAGCACAGCATAGGCCTAATTATCGTTAAAGGCATATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375650 16 - 636262 -------------------------------------------------------GGGCCTAATTATCGTC------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 251456 83 + 647215 TAAGATGATAAGATGGGTGATACACTGTGGAGGTGATGCCTGGCCAGCACAGCATAGGCCTAATTGTCATTAAAGGCATATTC + +a +s mr.mrrefChr5 114298 53 + 294542 TTCACCACCAGGACAAATAAACCCATCATTGAGTCAGACAGGGAATGGTCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261769 47 + 636262 TTCACCACCAAGGCAAATAAACCCATCATTGAGTCA------GAATGGTCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 251539 53 + 647215 TGCACCACCAGGACAAATAAACCCATCATTGAGTCAGACAGGGAATGGTCATC + +a +s mr.mrrefChr5 114351 60 + 294542 AAGCCTATCTTTCACTGACTACAACATATTTAACTTGTAGGAACAGTCATATATGCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261816 49 + 636262 -----------TCACTGACTACAACATATTTAACTTTTAGGAACAGTCATATATGCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 251594 59 + 647215 AAGCCTATCTTTCACTAACTTCAACATATTTAACTTGTAGG-ACAGTCATATATGCCGAA + +a +s mr.mrrefChr5 114411 45 + 294542 CTTGGCTTGTTGTATTCAAGACTAGAGACAGCAACCAATTCAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261865 45 + 636262 CTTGACTTGTTGTATCCAACACTAGAGACAGCAACCAATTCAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 251654 45 + 647215 CTCGGCTTGTTGTATTCATGACTAGAGACAGTAACTAATACAGGC + +a +s mr.mrrefChr5 114456 252 + 294542 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCATCAAGCAGTATCCACAACGTTGCTAAGATTGATCATGCAAGGAATATGAAGTTTCATCATGGAGAATGGAGAATGGACACAGGAGAAGTGAGGAAACTTCTTGGACTACTACATTTGACTGTGTAGCGGTGGCTGAGTCTACATCAACGGTATGTACCTCTGTTCAGCAAATATGTTTTGTCTTTTAAGATGTTCCAGTATGGGAATAGATTTGCTAAGATGTCATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261915 251 + 636262 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCACCAAGCAGTATCCACAACATTGCTAAGATTGATTGTG-AAGGAATATGAAGTTTCATCATGGCGAATGCAAAATGGACAAAGGAGAAGTGAGGAAACTTCTTGGACTTCTACATTTGACTGTGTAGCAGTGGCTGAGTCTACATTAACGGTATGTACCTCTGTTCGGAAAATATGTTTTGTATTTTAAGATGTTCCAGTATGGGAATAGATTTGCTAAGATGTCATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 251699 252 + 647215 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCATCAAGCTGTATCCACAACGTTGCTAAGATTGATCATGCAAGGGATGTGAAGTTTCATCATGGAGAATGGAGGATGGACACTGGAGAAGTGGGGAAACTTCTTGGACTACTACCTTTGATTGTGTAATGCTGGCTAAGTTTACACCAATGGTATGTACCTCTGTGCAGCAAATATGTTTTGTCTTCAACGATGTTCCAGTAGGGGAATAGATTTGCTAAGACAGCAGGCC + +a +s mr.mrrefChr5 114708 351 + 294542 AAGTCATAGTGGGTATTCAATACTTGCACCTCCAATCCAATTGATTGCCTGCATGTTTCTATTTCTAGGGTTCCCACATAGTTTGTTTTTGGTCTGATAAACAATCTCCAACTTGGTTACACCCAACTAAATGAGCCTGGCACTCCCAAACCTCAAGAAGTTTGAATAACAGACAATGAAGATCATTCTAGAACCACTATGGATAATAGCTAACCAGACTTTCAGATTCACATATTGGGGGTACTCATTTTATTTACAGAGTATTACCAAATATTAGTGGCATCATAATGGCTTCTTAGTTTCAAAGACATGTGCAATCCACAGGAGAAAAGGGTCTAATGTCCTAACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 262169 350 + 636262 AAGTCATAGTGGGTATTCAATACTTGCACCTCTAATCCAATTGATTGCCTGCATGTTTCTATTTCTAGGGTTCCCACATAGTTTGTTTTTGTTTTGACTAACTATTTCCAACTTGGTTACACCCAACTAAATGAGCCTGGCACTCCCAGACGTCAAGAGGATTGATTAACAGACAATGAAGATCATTCTGGAACCACTATGGATAATAGCTAACCAGACTTTCAGATTCACAAATTGGGGGTACTCATTTGATTTAGAGAGTATTACTAAATATT-ATGGCATCATAATGGCTATTTAGCATCAAAGACATGTGCAATCCACAGGAGAAAAGGGTCTAATGTCCTAACAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 251951 332 + 647215 AAGTCATCATGGGTATGCGATCCTTGCAACTCCATTCCAATTGATTGCCCACATGTTTCTATTTGCAGGATTCTCAGATAGTTTGTTTTTGGTCTGATAAATAATCTCCAACTTGGTG-CACCCACCTAAATGAGCCTGGCACTTCCAAACCTCATGAAGTTTGAATAACAGGCAATGGA-ATCATTCTAG------------TAATAGCTAGCCAGAATTCCAGATTCACATAATGGGG--ACTCGTTTTATATACATAGTATCACCAATTATTAGT---ACCACAATGGCTTCTTAGTTTCAAAGACATGTGCAATCCACAGGGGAAAAGGGTCTAATGTCCTAACACA + +a +s mr.mrrefChr5 115059 120 + 294542 CAGATTGTTGTTTGTAGGTCATTTTTGACTCGACATCCCTTCAGAGACTTTTGAAGCTAAGTTCATCAACTTGGAGACTAGTGCACACCTCAGACCTGTCCATCATATAGACAGTTAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 262520 120 + 636262 CAGATTGTTGTTTGTAGGTCATTTTTAACTCGACATCCCTTCAGAGACTTTTGAAGCTAAGTTCATCAACTTGGAGACCAGTGCACACCTCAGAGCTGTCCATCATGTAGACAGTTAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 252283 120 + 647215 CAGGGGTTCATTTGTAGGTCATTTTTGACTTGATAATACTTTAGAGACTTTGGGGGCCAAGTTTATCAACTTACAGCCTAGTGCACACCTCAGACCTGTTCATCACATAGACAGTGAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 115179 437 + 294542 AAATATTATGTTAAAGCAGGGTAACACAATTGTCGTGGGAACTGACCAAAAGTCAGGGTGATGAGGGTTCAGCCAGTTATCCAAGAGGCTAAATCTTTGCAGTGGATTCTCCCATTTTAGTATTCTTAGGAAGTTGCACCCTAATGTTATACCAAAGGGCTAACACATGCAGGACTCAGGTAAAAGAACCATGGGTACTCTGTTGTGAGCACAAGGGAGAGCAACTAACTGGCTTGGATTTTAGCAGGATATTAAAACCTTAGAGTAATAGCTCATAGCAGAGATCAGTGACTATCATGTTTCAGAATATGAATCCAACAGGCATATCATCCCAGCACAAGGGTCAGGATAAATGAAGGCACCCTGTGCTTTTCATTGCAAACACACCCTTATCTATATACTTATGCTACCACTTCTTTGTATTGACACTTAGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 262640 410 + 636262 AGATGTTATGTTAAAGCAGGGTAACACAATTGTCGTGGGAACTGACCAAAATCCAGGGTGATGAGGGTTCAGCGAGTTATCCAAGAGGCTAAATCTTTGCAGTGGATTCTCCCATCTTAGTATTCTTAAGAAATTGCACCCTAGTGTTACACCAGAGGGCCAACACATGCAG--CTCAGGTAAAAGAACCATCGGTACTCCGTTGTGAGCACAAGGGAGAGCAACTAACTGGCTTGG-TTTTAGCAGGATATTAAAACCTTAGAGGAATAGCTCATAGCAGAGATGAGTGACTATCATGTTCCAGAATATGAATCCAACTGGCATATCATCCCAGCACAAGGGTCAGGATAAATGAAGGCACCCTGTACTATTCATTGCAAACACCCC------------------------CTTCTTTGTATTGACACTTAGTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 252404 427 + 647215 AAGTATTATGTTAAAGCAGGGTAACACAATTGTCATGGGAAATGACCAAAAGTCAGGGCGATGAGGGTTCTGCCAGTTATCCAAGCGGCTAATTCTTTGCAGCTGTTTCTCATATTTTACTACTCTTAGGAGGATGCACCCTAAAGTTATACTAAAGAACTATCACATGCAGGACTC------AAGAACGATGGGTACTCTGTTGTGAGCACAAGGGGGAGTGAATAACGGGCTGGGATTCTAGCAGGATATT-AAGCCTTGGAGTACTACTTCATAGCAGAGATCAGTGACTATCGTGTTTCAGAATATGAAACCAACAGGCATATCATCCCAGCAGAAGGGATAGGAGAAATGAAGGCATCCTGTGCTTTTC---GCAAACACACCCTTATCTATATACTTATGCTACCACTTCTTCGTATTGACACTAAGTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 115616 109 + 294542 GAAAAGTAATTTAGAAATTCACCAGGAGCTATTCACTCTGTCAATAGGATGATTAGGTTCACACAATTTATTTTAATGTAGCTTGATTATGCCGGGAACATCAGGTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263055 109 + 636262 GAAAAGTAATTTAGAAATTCACCAGGAGCTATTCACTCTGTCAATAGGGTGATTAGGTTCACACAATTTATTTTAATGTAGCTTGATTATGCCGGGAACATCAGGTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 252831 109 + 647215 AAAAAATCATTTAGGAATTCACCAAGAGCTATTCTCTCTGTCGCTAGGATTATTAGGTTCACACGATTTATTTTAATGTAGATTGATTATGCCGGGAACATTAGGTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 115725 117 + 294542 AATGTATGCCCACACTAACTAAGCTTTTAGAGCTAAGCATCCTCACTCACGCAAAATGGCTTGAGGAAATGGTTGAGCAGGGTAGGCCCACCATCAATATTGAGTTGATTTGAACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263164 117 + 636262 AAAGTATGCCCACACTAACTAAGCTTTTAAAGCTAAGCATCCTCACTCACGCAAAATGGCTTGAGGAAATGGTTGAGCAGGGTAGGCCCACCATCAATATTGAGTTGATTTGAACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 252941 117 + 647215 AATGTACGCCCACACTAACTAAGGTATTGGACCTAAGCATCCTCATTCAGGCAAAATGGCTTGAAGAGATGGTTGGGCAGGGTAGACCCGCCGTCAATATTGAGTTGATTTCAACTG + +a +s mr.mrrefChr5 115842 18 + 294542 TGTGCTTCATGCCACTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263282 18 + 636262 TGTGCTTCATGCCACTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 253058 18 + 647215 TGTGCTTCATGCCACTCC + +a +s mr.mrrefChr5 115860 32 + 294542 AAGGCCCAAAATACAAGGGATTTTAGTTAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263300 32 + 636262 AAGGCCCAAAATACAAGGGATTTTAGTTAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 253077 32 + 647215 AAGGCCCAAATTATAAGGGATTTTAGTGAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 115892 107 + 294542 CATTTGGTATTCAACAAAGAAAGAATTAAGCTTTTATGTGCAGCTTAATATGACGTGTGGAGTGATTTATAGAGTACATTTCCTTAGAACATCTTCACATAGTATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263335 107 + 636262 CATTTGGTATTCAACAAAGAAAGAATTAAGCTTTTATGTGCAGCTTAATATGACGTGTGGAGTGATTTATAGAGTACATTTCCTTAGAACATCTTCACATAGTATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 253109 107 + 647215 CATTTGGTATTCAATAAAGAAGGAAGTAAGCTTTGATGTACAGTTAAATATGGTATATCAAGTGGTTTATAGAGTACATTTTCCTAGAACATCTTGATATAGTATTA + +a +s mr.mrrefChr5 115999 170 + 294542 CAATGAACACGAGGAATAGGTAGAATGCCTAAGAAATGGAGTTTTCACAGGATAAAGGTGATAATAGAATTACTGGAGATTACACCCCAGATAACTTTGGCACTGATTCACTAGTCAACAGTATCAACATGCAAGGCAGCTGATCACCAGTCAGCTCAGGTTTGGGCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263442 170 + 636262 CAATGAACACGAGGAATAGGTAGAATGCCTAAGAAATGGAGTTTTCACAGGATAAAGGTGATAATAGAATTACTGGAGATTACACCCCAGATAACTTTGGCACTGATTCACTAGTCAATAGTACCAACATGTAAGGCAGCTGATCACCTGTCAGCTCAGGTTTGGGGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 253224 170 + 647215 CAATTAGCATGAGGAATAGGTAGAATGCCCAAAAAATGAAGATTCCACAGGATAAAGGTGATAGTGGAATTATCGGAGATTACACCCCAGATAACTTTGGCACTGATTCACTAGTCAACAGTATCAACATGCAAGGCAACTGATCACCAGTCAGCTCAGGTCTGGGCATT + +a +s mr.mrrefChr5 116169 113 + 294542 TGACTCCATACCCTGAAGTAATTACAACAGGGTATTCCTTATAAGCTTGATACTAGCATTGGGGAAGTAGTAGGCGCTAGGGAGAATGTAGTGGTAATAACTTCATGTAGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263613 104 + 636262 TGACTCCATTCCCTGAAGTAATTACAACAGGGTATTCC---------TGATGCTAGCATTGGGGGAGTAGGAGGCGCTAGGGAGAATGTAGTGGTAATAAGTTCATGTAGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 253394 97 + 647215 TAACTGTACACCCTGAAGTAATTACAGCAGGGTGATCCTTATAAGCTTGATACTGGCATTGGGTAAGTAGTAGG---------GAATGT-------ATAACTTCATGTAGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 116282 30 + 294542 CAATCTTTGAACAAAACAAACCCTGTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263717 30 + 636262 CAATCTTTGAACAAGACAAACCCTGTTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 253493 30 + 647215 CAATCTACGAACCAAACAAACCCTGTCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 116312 95 + 294542 TGAGTGCAGGGAAATGGCCCACATCACTCTGAGTCTGCACCTGCACATGTGCTTAAGCCTCCAAGCTAACACCCAAACGAGCCTATTAGCTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263766 93 + 636262 TGATTGCAGGGAAATGGCCCACATCACTCTGAGTCTGCACCTGCACATATGCTTAAGCCT--AAGCTAACACCCAAACGAGCCTGTTAGCTTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 253523 95 + 647215 TGAGTGCAGGGGGATGGCCCACATCACTCTGAATCTGCATCTGCACATGTGCTTAAGCCTCCGAGCTAACACCCAGACATAGCTATCAGCTTGAC + +a +s mr.mrrefChr5 116407 348 + 294542 ATACTATTCTTCAGTAGCCCTCATGTTAGGACTGGTACTCTAGTAGTGTTTTCTAAATGCATGTGATTGTTGTGAGGGTTTGAATGAATGTAGCCAAGTGTGGAACCATGATGATACAGTGTAATCCAATAGTGACATgcaggtacagcctgttcccaaggcgcagtacaaagcgtatagcatacccatcatctatgtatttatggcaagtccccatggattgatgctggtcccctgatgatataattgtagaacttagaacCACATCTATGTGGTTAACGGAGTGCATGATCCTAGTGTatgacggtggtaacataatagtctgatatagtatgcatggattgttag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263859 348 + 636262 ATACTATTCTTCAGTAGCCCTCAAGTTAGGGATGGTACTCTAGTAGTGTTTTCTAAATGCATGTGATTGTTGTTAGGGTTTGAATGAATGTAGCCAAGTGTGGAACCATGATGATACAGTGTAATCCAATAGTGACATGCAGGTACAGCCTGttcccaaggcgcagtacaaagcgtatagcatacccatcatctatgtatttatggcaagtccccatggattgatgctggtcccctgatgatataattgtagaacttagaacCACATCTATGTGGTTAACGGAGTGCATGATCCTAGTGTATGACGGTGGTAacataatagtctgatatagtatgcatggattgttag +s simRat_chr6.simRat.chr6 253637 348 + 647215 ATACTATTCTTCAGTAGCCCTTGTGTTAGGACTGACACTCTGGTGGTGTTTTCTAAATACATATGATTGTTGTGAGAGTTTCAATGAATGTAGCCAAGTGTGGAACTGTGACGATATAGTGTAATCcaacagtgacatgcaggtacaaccagttcccaaagtgcggtacaaagtgtatagaatatccatcatccgtgtgttttcagcaagtccccatgggttgatgctggttcccttatgatataattgtaaaacCTCGAGCCACACCTATGTGATTAAGCGAGTGCATGATTCCAGTGTgtgacgctggcaacataatagtctgatatagcatgcatggattgttat + +a +s mr.mrrefChr5 116755 11 + 294542 aaatctcctaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264211 11 + 636262 aaatctcctaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 253985 11 + 647215 aagtcccctaa + +a +s mr.mrrefChr5 116766 107 + 294542 actgaactgcttacaattgacactgtggagactgaaacactgataccatgcactcagatgatatttggctgttagcagggtccatacaggcaactttccagtgactg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264223 107 + 636262 actgaactgcttacaattgacactgtggagactgaaacactgataccatgcactcagatgatatttggctgttagcagggtccatacaggcaactttccagtgactg +s simRat_chr6.simRat.chr6 253996 107 + 647215 attgaactgctcacaattgacactgtgcggactaaaataccactatcatgcactctaacagtgttatgctcctaacggggtccatacaggcgacttcacagtgactg + +a +s mr.mrrefChr5 116873 70 + 294542 gaggtactggcaaagctgtgacagaaaactgtgggggcacaaaatgctcaattgttgggatttgccgcga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264330 70 + 636262 gaggtactggcaaagctgtgacagaaaactgtgggggcacaaaatgctcaattgttgggatttgccgcga +s simRat_chr6.simRat.chr6 254119 70 + 647215 gaggtactgccaaagctatgacagaacaccgtgggggcacaaaatgcgtactttttggaatcatccgtga + +a +s mr.mrrefChr5 116943 95 + 294542 gtaggctgtagaaaagggaaaaaattattcctaaaacaaaaggttgtaaaaacctctgataaactagcttgctgtcccaACAAACACCTGGATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264401 95 + 636262 gtaggctgtagaaaagggaaaaaattattcctaaaacaaaaggttgtaaaaacctctgataaactagcttgctgtcccaACAAACACCTGGATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 254189 95 + 647215 gtaggctgtaaaaaagggaaaaagttattcctaaaacagaagattatcaaaacctctgataaaccagcttgctgtcccaAAAGACCCATGGATGA + +a +s mr.mrrefChr5 117038 66 + 294542 CTGGGTAGTGCTAGAATTTGAGGACTTCGGTGACTATCACCAAGCACATGTACTAGAGTTTACTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264501 66 + 636262 CTGGGTAGTGCTAGAATTTGAGGACTTCGGTGACTATCACCAAGCACATGTACTAGAGTTTACTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 254284 66 + 647215 CTGGGTTATGCTAGAACTTGAGGCTTTTGGCAACTATCACCAAGTACATATACTAAAGTTTACTTT + +a +s mr.mrrefChr5 117104 19 + 294542 GCTCAACGAATAATTGGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264567 19 + 636262 GCTCAACGAATAATTGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 254351 19 + 647215 GCTCAACGAATAATTAGGC + +a +s mr.mrrefChr5 117123 23 + 294542 GAGACTGCCATCACAAGAGTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264619 23 + 636262 GAGACTGCCATCACAAGAGTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 254370 23 + 647215 GCGGCTGCCACCACAAGAGTTGA + +a +s mr.mrrefChr5 117146 59 + 294542 ACCCTAAGTGTTGGTGTCTCATGGTGGTGTCCTCAATAGCTGCTTAAGAATGGAAAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264806 59 + 636262 ACCCTAAGTGTTGGTGTCTCATGGTGGTGTCCTCAATAGCTGCTTAAGAATGGAAAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 254393 59 + 647215 ACTCTAAGTGTTGGTGTCTCATGGTGGTGTCCTCAATAGCTTGCTAAGAGTGGAAGATG + +a +s mr.mrrefChr5 117205 66 + 294542 TATATATCCCCACAGACTTGAGGAAAAAAACCTGCTCATATTATGGCATATAGAGTGATGTCTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264865 66 + 636262 TATATATCCCTACAGACTTGAGGAAAAAAACCTGCTCATATTATGGCATATAGAGTGATGTCTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 254458 14 + 647215 CATATATCCCCACA---------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 117271 238 + 294542 AGGAAGCCTTGCCACAATACAATAGGGCTCTGTCTGTTTGGATGATATTGCTCAATAGAATTACTTTCTAACAAAATTCCAAAAGCTCCTCATGTTTGGACAGACCCATCTCAAGTATACCCTCCCAGGTTTATCGACGAAAGCCTTACCTAGCACTCTATTAAATCACTGATGCTGTACAAGGTTCTACCACAGTAAGCTGTCACTTTCAAAGTCTGGGTTTAAACATTCATTGGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264932 231 + 636262 AGGAAGCCTTGCCACAATACAATAGGGCTCTGTCTGTTTGGATGATATTGCTCAATAGAATTACTTTCTAACAAAATTCCAAAAGCTCCT-------GGACAGACCCATCCCAAGTATGCCCTCCCAGGTTTATCGACGAAGACCTTACCTAGCACTCTATTAAATTACTGATGCTGTACAAGGTTCTAGCACAGTAATCTGTCACTTTCAAAGTCTGGGTTTAAACATTCATTAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 254472 224 + 647215 --------------CAGTACAATAGGGCTCTGTCTGTTCAGATGATATTGCTCAATAGAATTACTTTCAAACAAAATTCCAAAAGCTTCTCATGTTTGGATAGACCCACCTCAAGCATATCCACTGAGGTTTATTGACAAAAGCCTTACATAGCATTCTATTAAATCACTGATCCTGTATAAGGTTCTACCACAGAAAGCTGTCACTTTCAAAGGCTGGGTTTAAACATTCATTGGAC + +a +s mr.mrrefChr5 117509 104 + 294542 AGTATCAATTGGtgactggttgactggatcctggcatgtagcaggtgtattcagtgtccttacagagacaacattcttgggttatctctagcagccagcttcct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265164 104 + 636262 AGTAGCAATTGAtgactggttgactggatcctggcatgtagcaggtgtattcagtgtccttacagagacaacattcttgggttatctctagcagccagcttcct +s simRat_chr6.simRat.chr6 254696 104 + 647215 AGTATCAATTGGTGCCTGGTTGACTGgtgcctggcatgtagcaggtgtatttagtgtctttccagagatggccttcttgggttatctctagcagctggcttcCC + +a +s mr.mrrefChr5 117613 8 + 294542 aaggattg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265279 8 + 636262 aaggattg +s simRat_chr6.simRat.chr6 254800 8 + 647215 AAGGattg + +a +s mr.mrrefChr5 117621 291 + 294542 taaaagcagtctattaaaataataatgatgaatgttgcatccctcaagggatcattttgggagctagaagtctgggctgcagtactgctggcaccatcagcatcacatctccattttttaaaagcactctatcaggaacttgcaattctcgtaatgtaatGAAggtcattatggtaccccagtatttctgctatcgggaaggcttggtgtatgaccaaaccagacttggcatgcacccatgtatgTCCCCTGCACTTGCTCACCACAGATTAACAAAGGTGACCACGAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265288 291 + 636262 taaaagcagtctattaaaataataatgatgaatgttgcatccctcaagggatcattttgggagctagaagtctgggctgcagtactgctggcaccatcagcatcacatctccattttttaaaagcactctatcaggaacttgcaattctcgtaaTGTAATGAAggtcattatggtaccccagtatttctgctatcgggaaggcttggtgtatgaccaaaccagacttggcatgcacccatgtatgTCCCCTGCACTTGCTCACCACAGATTAACAAAGGTGACCACGAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 254808 291 + 647215 tataagcagtctattaaaataataacaaagaatgttgaatctctcaagggatcattttgcgagccagaagtctgggctgcagtattactgacaccatcagcatcacatttccatcttttaaaagcaccctatcaggaacttgcaattttcataatataatGAAGATCATTATGGTAtgccagtatttctgctatctggaaggcttggtatatgaccagaccagacttggcatacacccaagtgtgCCCTCTGCACTTGCTTACCACAGGTTAAAAAGGGTGACCACATGTC + +a +s mr.mrrefChr5 117912 67 + 294542 CTATACAGACGGCTGAACACGGTGGATTCATAGGCCTGTGCTACTCTTTTACTCTGGAGTCATTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 265579 67 + 636262 CTATACAGACGGCTGAACACGGTGGATTCATAGGCCTGTGCTACTCTTTTACTCTGGAGTCATTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 255101 67 + 647215 CTATACTGACAGCTGAACATAATGGATTCATAGGCCTGTGCTACACTTTTAATCGGGAGTCATCATT + +a +s mr.mrrefChr5 117979 6 + 294542 AACCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266364 6 + 636262 AACCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 255168 6 + 647215 GACCCT + +a +s mr.mrrefChr5 117985 54 + 294542 GATATTGTTTCATTTCCCGGCTGCCCTCTAGATAAATGGAACTTGATGACCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266381 54 + 636262 GATATTGTTTCATTTCCCGGCTGCCCTCTAGATAAATGGAACTTGATGACCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 391942 54 - 647215 AAGATTGTTTCATTTCCTGGTTGCCCTCTAGTCAAATGGAACTTGATGACCATT + +a +s mr.mrrefChr5 118039 45 + 294542 TGTCATTCTGTATGATTTATTGTGTTTGAAGTGAGTCTATTGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266436 45 + 636262 TGTCATTCTGTATGATTTATTGTGTTTGAAGTGAGTCTATTGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 391996 45 - 647215 TGTCATTCTGTATGATTTATTGTATTTGAAGTGAGTCTATACTGC + +a +s mr.mrrefChr5 118084 26 + 294542 GCCCTTCAGAGATATGCTGTGAAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266482 26 + 636262 GCCCTTCAGAGATATGCTGTGAAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 255285 26 + 647215 GCCTTTCAGAGATTTGCTGTGAAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 118110 98 + 294542 TCACTGAGAGAAAAACTCCTAGATGCAAATGTATTGCAAGGTCGGGTATTGTGGGGTGGATACATTTTGCCCACTAATGAATAAGCCAAGGATGGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266508 98 + 636262 TCACTGAGAGAAAAACTCCTAGATGCAAATGTATTGCAAGGTCGGGTATTGTGGGGTGGATACATTTTGCCCACTAATGAATAAGCCAAGGATGGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 255312 98 + 647215 TCACTGAGAAAAGAATTCCTATATGTAAATGTATTGCAATGCCATGTATTGTGGGGCGAATACGTGTTGTCCACTAATAAAGACACCAAGGATGGGTT + +a +s mr.mrrefChr5 118208 41 + 294542 CCCTCTAATCAATCCCTTTGTAACACATGGAGCTCTTCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266606 41 + 636262 CCCTCTAATCAATCCCTTTGTAACACATGGAGCTCTTCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 255413 41 + 647215 CCCTCTAATCAATCCCATTGTAACACATGGAGCCCTTGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 118249 26 + 294542 GCTTCCAATTTGAATGCAATGTGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266654 26 + 636262 GCTTCCAATTTGAATGCAATGTGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 255454 26 + 647215 GCTTCCAATTTGAGTGCAATGTGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 118275 9 + 294542 CTTGCATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266681 9 + 636262 CTTGCATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 255480 9 + 647215 CTTGCATGG + +a +s mr.mrrefChr5 118284 38 + 294542 ATTGACCTGAAGTGTTTCCCAGTGGTCATTGACTTACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266690 38 + 636262 ATTGACCTGAAGTGTTTCCCAGTGGTCATTGACTTACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 255497 38 + 647215 GTTGACCTGAAGTGTTTCCCCGTGGCTATTGACTTACC + +a +s mr.mrrefChr5 118322 8 + 294542 TATGATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266729 8 + 636262 TATGATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 255535 8 + 647215 TACGATTG + +a +s mr.mrrefChr5 118330 69 + 294542 CCCAACATAATTCCAGAATGCTATAGAGTATGAAACCTCCACAACAGTGCGTTGGGGTAGTGAACTTCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266738 69 + 636262 CCCAACATAATTCCAGAATGCTATAGAGTATGAAACCTCCACAACAGTGCGTTGGGGTAGTGAACTTCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 255543 69 + 647215 CCCAACATAACTCCAGAATGCTTTAGAGTATGAAACCTCCCCAATAGTGGGTTAGGGTAGTGTACTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 118399 26 + 294542 TATTAGCACCTCTGCCAGAAGATTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266807 26 + 636262 TATTAGCACCTCTGCCAGAAGATTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 255613 26 + 647215 TATTAGCATCACTGCCAGAAGATGGG + +a +s mr.mrrefChr5 118425 53 + 294542 AGACACTGTAATACACGAACTGGCTTTATGAAATAACAATAGTGTTTAACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266837 53 + 636262 AGACACTGTAATACACGAACTGGCTTTATGAAATAACAATAGTGTTTAACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 255639 53 + 647215 AGACCCTGTAATACATAAACTGATGTTATGAAACAACAATAGTGTTTAACAAC + +a +s mr.mrrefChr5 118478 18 + 294542 TGGCTTGATGGCCTCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266891 18 + 636262 TGGCTTGATGGCCTCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 255692 18 + 647215 CAGCTTGACAGTCTCTTT + +a +s mr.mrrefChr5 118496 130 + 294542 GCTGGCAAGTTGCAAAGTGGGGAGATCCTCTTCTGTTGTCCATTATCTTTGAGCAATGTCTAGAACCCTCTATTCAGATACCTGCAACCCTTGCTCTTTTGCCTCATTTGTAACACAGTCAGGACATCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266909 130 + 636262 GCTGGCAAGTTGCAAAGTGGGGAGATCCTCTTCTGTTGTCCATTATCTTTGAGCAATGTCTAGAACCCTCTATTCAGATACCTGCAACCCTTGCTCTTTTGCCTCATTTGTAACACAGTCAGGACATCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 255711 130 + 647215 GCTGTCAAGTTACAAAGTGGGGGGACCCTGTTCTGTTGTCGGCAATCTTTGGGCAATGTCTAGAACCCTCTATTCAGATACCTACGACCCTTGCCCCTGTGTCTTATTTGTAATATGGCCTGGACATCCA + +a +s mr.mrrefChr5 118626 104 + 294542 CTTCCGCATTGACTGTTAGCTTTTAACTGTCTCTATAATCTGTTGGGACTGGGCTCATGCAGGAAGCGTAATGTGATTACTGTTCTGAATTAGCAAAGTCACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267039 104 + 636262 CTTCCGCATTGACTGTTAGCTTTTAACTGTCTCTATAATCTGTTGGGACTGGGCTCATGCAGGAAGCGTAATGTGATTACTGTTCTGAATTAGCAAAGTCACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 255878 104 + 647215 CTTCTGCATTGACTATAAGCTTTTAACAATCTTTATAATCTGTTGAGGCAGGGCTCATGCAGGAAGCATAATGTGGTTACTGTTTTGAATAAGCAGAGTTATAT + +a +s mr.mrrefChr5 118730 78 + 294542 GAGTCTCTCCCGAGCCTAAGTGCCATGTGGAATTTGCTTGGAAGATTATGGTTCAACAATTCATATAGTTCccctgat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267143 78 + 636262 GAGTCTCTCCCGAGCCTAAGTGCCATGTGGAATTTGCTTGGAAGATTATGGTTCAACAATTCATATAGTTCccctgat +s simRat_chr6.simRat.chr6 256011 78 + 647215 GAGTCTCAGGCAAGCCTCAGTGCCATCGGGAATTTGGTTAGAAAATTATGGTGTAACAATTCATATAGTTCTCCTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 118808 57 + 294542 gtttgacaacctttttacacaatcagttccatagcatcaccatgtttgtctcctgtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267221 57 + 636262 gtttgacaacctttttacacaatcagttccatagcatcaccatgtttgtctcctgtt +s simRat_chr6.simRat.chr6 256095 57 + 647215 GTTTGACAACCTATTTGCACAATCAGTTCAATAGGGTCACCATGCTTGTCTCTTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 118865 14 + 294542 tactcagcAgagaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267278 14 + 636262 tactcagcAgagaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 256176 14 + 647215 TAATCACCAGagaa + +a +s mr.mrrefChr5 118879 162 + 294542 gtaggttcctatctcctccacagttaaagtaaattcctacccttgctgaggctagtagggcttcaggtggaagTCTATAGGTGCCTCTGATAGCTTGACAGCACAACAAGCGGGGCCTGCTCACAGCCAAGTTACTAACTGCATGCACATGGCTACATTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267295 162 + 636262 gtaggttcctatctcctccacagttaaagtaaattcctacccttgctgaggctagtagggcttcaggtggaagTCTATAGGTGCCTCTGATAGCTTGACAGCACAACAAGCGGGGCCTGCTCACAGCCAAGTTACTAACTGCATGCACATGGCTACATTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 256190 162 + 647215 attagttcctatcccccccactgttggagtaaactcctacctttgctggggttagtaggacttcaggttgaagTCTATAGGTGCCTGTGATTACTTGACAGCACATCAAGCGGGGCAGGCTCAGAGCCAAATTACTAACTGCATGCACATGGTTTCATTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 119041 55 + 294542 ATTAGAGCTTTGCACAGTGCGCTGTGCTAAATCTAAACAaggttaagcattgctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267462 55 + 636262 ATTAGAGCTTTGCACAGTGCGCTGTGCTAAATCTAAACAaggttaagcattgctc +s simRat_chr6.simRat.chr6 256352 55 + 647215 ATTAGGGCTCTGCACAAAGTGCTGTACTAAGACCAAACAAGGTTAAGCATTGCTC + +a +s mr.mrrefChr5 119096 96 + 294542 ctgtccctcaactgcaaaacacagtagtgcatggacactttagaaacttctcaaccaagaagcAAGACAAGGTGTATAAGGGAACTCTGTGTAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267518 96 + 636262 ctgtccctcaactgcaaaacacagtagtgcatggacactttagaaacttctcaaccaagaagcAAGACAAGGTGTATAAGGGAACTCTGTGTAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 256407 96 + 647215 CTGCCCCTTAATCCCAAAACACAGTAGTGCATGGACACTTTAGAAACTTCTCAACCAGGAAGCAAGACAGGGTGTATGAGGGAACTCTATGTAGAA + +a +s mr.mrrefChr5 119192 15 + 294542 TTGAAGCGGGTAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267614 15 + 636262 TTGAAGCGGGTAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 256505 15 + 647215 TCAAAATCGATAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 119207 28 + 294542 GATGGCCATTGATGCTTCACTAAATTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267630 28 + 636262 GATGGCCATTGATGCTTCACTAAATTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 256520 28 + 647215 GATGCCAATTGATAGTTCAACAAATTTA + +a +s mr.mrrefChr5 119235 17 + 294542 AAAGTTAGGTGCCAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267658 17 + 636262 AAAGTTAGGTGCCAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 256552 17 + 647215 AAAGTCAGGTGCCAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 119252 12 + 294542 TGATGCTATCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267675 12 + 636262 TGATGCTATCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 256576 12 + 647215 TGATGCTATCAT + +a +s mr.mrrefChr5 119264 43 + 294542 CCTTTCTTTAGAAGAGTTATTTTAGAACACGCCCTGAAAAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267687 43 + 636262 CCTTTCTTTAGAAGAGTTATTTTAGAACACGCCCTGAAAAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 256612 43 + 647215 TTTTGCTTGAGAAGAATTATTTTAGAACAGGCCCTGACAAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 119307 100 + 294542 ATATAGATTTAGCTGGTATAATCTATGGTAGCTGCTGATTCCGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAGTCTGACCATGGAACATAATCAACAATGCTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267730 100 + 636262 ATATAGATTTAGCTGGTATAATCTATGGTAGCTGCTGATTCCGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAGTCTGACCATGGAACATAATCAACAATGCTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 256658 100 + 647215 ATATATATTTAGCTGGTATGACCTATGGCAGCTGCTGATTCTGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAATCTGACAGTAGAACATAATCAACAATGCTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 119407 11 + 294542 CGCTTGACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267830 11 + 636262 CGCTTGACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 256759 11 + 647215 TGCTTGACATG + +a +s mr.mrrefChr5 119418 3 + 294542 TGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267846 3 + 636262 TGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 256770 3 + 647215 TGC + +a +s mr.mrrefChr5 119421 6 + 294542 TCCGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267849 6 + 636262 TCCGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 256775 6 + 647215 TCCACG + +a +s mr.mrrefChr5 119427 38 + 294542 CAATGGGCATAACATTTGACAGAGCTATCGTCTGCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267855 38 + 636262 CAATGGGCATAACATTTGACAGAGCTATCGTCTGCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 256787 38 + 647215 CAGAGGGGATAACATTTGAAAGAGCTATCGTCTGCACT + +a +s mr.mrrefChr5 119465 92 + 294542 ATCATCTGCAGCTATTATAAGTGTTTATTGTAATGGGCCAAGCTCCACAGTAGAACTAGCCACAGGGGGGACATTTGGTATCAAGCCAATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267898 92 + 636262 ATCATCTGCAGCTATTATAAGTGTTTATTGTAATGGGCCAAGCTCCACAGTAGAACTAGCCACAGGGGGGACATTTGGTATCAAGCCAATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 256825 92 + 647215 ATCATCTGCAGCTATTATAAGTTTCTATTGTAATGGGCCACGTTGCACAGGAGGGCCAGCCACAGAGAGGACATCTGGTGTCAATCCAATCC + +a +s mr.mrrefChr5 119557 41 + 294542 AGAGTCTTATCACCCTAGTGGTTTACTTTTGGTGGGTATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 267991 41 + 636262 AGAGTCTTATCACCCTAGTGGTTTACTTTTGGTGGGTATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 256917 41 + 647215 AGAGTCCTACCCCCCTTGTGGTTTATTTTTGGTGGGTACTC + +a +s mr.mrrefChr5 119598 52 + 294542 AAATTAGAGAAGCTGCCTCACTTGGATGAGCAACTGAGGTGAGCAATTTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268039 52 + 636262 AAATTAGAGAAGCTGCCTCACTTGGATGAGCAACTGAGGTGAGCAATTTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 256958 52 + 647215 AAGTTAGAGATGCTGACTCATTTGGGTGAGCAACTGAGACAAGCAATTTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 119650 132 + 294542 TGTCCTACCTCCATGGGGCGCATTCTTCATAGATGACTAGAGAACCACAAAAGGCAAATCATATAGCCTGCATCTCCACCTCCACTTATTACACAGACTGACCCCCTAGTCATGCCCCTGTTTTAGCTGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268094 132 + 636262 TGTCCTACCTCCATGGGGCGCATTCTTCATAGATGACTAGAGAACCACAAAAGGCAAATCATATAGCCTGCATCTCCACCTCCACTTATTACACAGACTGACCCCCTAGTCATGCCCCTGTTTTAGCTGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257010 132 + 647215 TGTCCTACCTCCGTGGGGTGCATTCATCACAGATGACTAATGAACCACAAAAGGCAAGTCATGTAGCCTGCATCACCATCTCCACTTATTACACAGAGTGATCCCCTAGTCATACCCCTGGTTTAGCTTGGG + +a +s mr.mrrefChr5 119782 16 + 294542 AATCTTGGCGTAGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268226 16 + 636262 AATCTTGGCGTAGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 257144 16 + 647215 AATCCATGTGGAACTT + +a +s mr.mrrefChr5 119798 14 + 294542 CGACACAATGCGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268242 14 + 636262 CGACACAATGCGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257171 14 + 647215 CGCTACAACATTCG + +a +s mr.mrrefChr5 119812 14 + 294542 GAGGCATGGGATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268256 14 + 636262 GAGGCATGGGATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 257188 14 + 647215 GTGCCATCAAGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 119826 19 + 294542 AATGTCTTTAGTCCAGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268270 19 + 636262 AATGTCTTTAGTCCAGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 257204 19 + 647215 CAGGTCTATAGTCCAGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 119845 135 + 294542 ATAGTTTCATGACAACCACATGTGACAAACATAGTAGCCCAGACAGGACTAGAAATGATAAGTATGCCAACCATTCTGCAGTGGACATTTAATTTCAATCGAGAGACTATTCGATGAGTATTTCATATGGCTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268292 135 + 636262 ATAGTTTCATGACAACCACATGTGACAAACATAGTAGCCCAGACAGGACTAGAAATGATAAGTATGCCAACCATTCTGCAGTGGACATTTAATTTCAATCGAGAGACTATTCGATGAGTATTTCATATGGCTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 257223 135 + 647215 ATAGTTTCATGACAACTACATGTGACAAACATAATAGCCCAGATAGGGATAGAAATGATAAGTATGACAACCATAGAGCAGTGGACATTTGATTTCAGACAAGAGGCTATTCAATGAGTATTTCATATGGCTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 119980 20 + 294542 CTGATACTTCCAGTGGGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268427 20 + 636262 CTGATACTTCCAGTGGGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 257380 20 + 647215 TTGATATTTCCAGTGGTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 120000 42 + 294542 TAAATTTCTAGACAGCAGCGAAAGCTAGTCAGCATTAAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268447 42 + 636262 TAAATTTCTAGACAGCAGCGAAAGCTAGTCAGCATTAAATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 257404 42 + 647215 TAAATTTCTTGACATCAAGATAAGTTAGTCAGCATTACGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 120042 37 + 294542 TCATCACTTATTTTGTGCCTGACTGGAAATGTCCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268494 37 + 636262 TCATCACTTATTTTGTGCCTGACTGGAAATGTCCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 257446 37 + 647215 TCATCACATATTTCGAGCCTGTCTGTACATGTCCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 120079 12 + 294542 GACTTAGACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268531 12 + 636262 GACTTAGACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257484 12 + 647215 GATTTAAACTGG + +a +s mr.mrrefChr5 120091 25 + 294542 CATTTAGAAACTTTCTGGCTCCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268543 25 + 636262 CATTTAGAAACTTTCTGGCTCCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 257500 25 + 647215 CATTCAGAGACTTTCTGGCACCACT + +a +s mr.mrrefChr5 120116 131 + 294542 GCATAGATTTGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAAGCTCAAATGGTGAGCAACTTCAACATAGATATGTGATACATTAGTGGAAGATATTTGGCTCATCAGACACACGATTTTACTTTACCCTGAGTGATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268570 131 + 636262 GCATAGATTTGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAAGCCCACATGGTGAGCAACTTCAACATAGATATGTGATACATTAGTGGAAGATATTTGGCTCATCAGACACATGATTTTACTTTACCCTGAGTGATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 257525 129 + 647215 GCATAGATTGGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAGGCTCAAATGGTGAGCGACTTCAACATAGATATGTGGTACGTTAGTGCAAGATATTTGGCTTATCAGACACACA--TTTACTTTACCCTTAGTGCTTA + +a +s mr.mrrefChr5 120247 23 + 294542 TTGTAACAATGCGTGGTTATCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268703 23 + 636262 TTGTGACAATGCGTGGTTATCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257654 23 + 647215 TTGTAACAATGTGTGATTATCAG + +a +s mr.mrrefChr5 120270 100 + 294542 CTTAGTCCAACATTGCTCTATGTCCAGAACTATATTGTGATGCTCATGTGATATTTTTATTATCCTATAGGTGCACCTGGCCCCCGTACTATAAAGTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268726 100 + 636262 CTTAGTCCAACACTGCTCTATGTCCAGAACTATATCATAATGCTCATGTGATATTTTTATCATCCTATAGGTGCACCTGGCCCCCGTACTATAAAGTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 257679 100 + 647215 CTTAGTCCAACATTCCTCTACGTCCAGGACTATATTGTGATGCTCATGTGATATTTTTATTATCCTATAGGTGCACCTGACCCCCATACTATAATGTAGC + +a +s mr.mrrefChr5 120370 3 + 294542 CTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268828 3 + 636262 CTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257779 3 + 647215 CTG + +a +s mr.mrrefChr5 120373 185 + 294542 TGTATCTAGTTTTTGTTCTCTCCTAACCTGATGCTTCCCAAAGGTTTACCTTCTTCGATACTATTTCTAAGAAAAAATGGTGGATATTAGGCACACTTCAACATCCTCAATGTAACAAAGGTAGTTATCTGGGCAATTGTCATCTAGTTTACCGTTGGTAAGATCAATCTATTGTTGCCATTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 268832 184 + 636262 TGTACCTAGTTTTTGTTCTCTCCTAACCTGATGCTCCACAAAGGTTTACCTCCTTCGATACTATTTCT-AGAAAAAATGGTGGATATTGGGCACACTTCAACATCCTCAATGTAACAAAGGTAGTTATCTGGGCAATTGTCATCTAGTTTACCGTTGGTAAGATCAATCTATTATTCCCATTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 257782 180 + 647215 TGTGTCTAGTTTTTATTCTCTCCTAACCTGATGCTTTCCAAAGGTTTACCTTCTTTGATACTATTTTTAAGAAAAAATAGTGGATATTAAGCACACTTCA-----TTCAATGTAGCAAAGGTAGCTATCTGGGCAATTGTCATATATTTTACCATTGGTAAGATCGATCTATTGATGCCAGTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 120558 84 + 294542 TTTCTACTACTAGAGAGTGCACTGAAGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTTCCAGTGTTGTTAATTTGGTACGAAGACATGAAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269024 84 + 636262 TTTCTACTACTAGAGAGTGCACTGAAGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTTCCAGTGTTGTTAATTTGGTACGAAGACATGAAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 257962 84 + 647215 TTTCTGCTATTAGAGAGTGAACTGGGGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTAAATGCATAGGTAATTTGGTACAGAAACATGAAATG + +a +s mr.mrrefChr5 120642 10 + 294542 AACATTGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269108 10 + 636262 AACATTGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 258047 10 + 647215 AACATTGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 120652 45 + 294542 CAACTTGACAGCTCGGGGAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269119 45 + 636262 CAACTTGACAGCTCGGGGAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 258057 45 + 647215 CTACCCGACAGCTAGGGCAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGACAG + +a +s mr.mrrefChr5 120697 105 + 294542 GCAATCACTCTTAGATCAAGGATTCAACACAATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCGAAAAAGATATGTTACTTGTTGTTAGGTAGTGCAAGATCAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269164 105 + 636262 GCAATCACTCTTAGATCAAGGATTCAACACAATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCGAAAAAGATATGTTACTTGTTGTTAGGTAGTGCAAGATCAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 258138 105 + 647215 GCAATGACACTTAGGTCAAGGATACAACACTATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCAAAAAAGAAATGTTACTTGTAGTTAGGCAGTGTGATATCAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 120802 15 + 294542 TTTGTTTTGTTCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269296 15 + 636262 TTTGTTTTGTTCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 258243 15 + 647215 TTTGTTTTGTTCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 120817 41 + 294542 GTATAGCTTACTTACGTCGGGAGGCCTTCCCATTTACTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269312 41 + 636262 GTATAGCTTACTTACGTCGGGAGGCCTTCCCATTTACTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 258258 41 + 647215 GTACAGCTTACTTGCATCAGAAGGCTTTCCCATTTACTATT + +a +s mr.mrrefChr5 120858 213 + 294542 TGTGGGATCCAAAAAGCAGGTTGAAGAGCTAGGTGAGGCAAGAAGCCCAGGCTGCTTCTAGAAAAAACAGTTCTGGATTGTGTAGCAAGGCTTCAACTTTAATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTAGGTTAGGAATTTACTGTGTACTCAGCAACACATGAAGTAGCAACACAAGAAGTATTTAATTGTCTGTCTTGGTACTATGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269353 213 + 636262 TATGGGATCCAAAAAGCAGGTTGAAGAGTTAGGTGAGGCAAGAAGCCCAGGCGGATGCTAGAAGATACAGTTCAGGATTGTGTAGCAAGGCTCCGGCTTTAATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTAGGTTAGGAATTTACTGTGTACTCAGCAACACATGAAGTAGCAACACAAGAAGTATTTAATTGTCTGTCTTGGTACTATGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 258336 212 + 647215 TGTGGGTTCCCAAAAGCAGGTTGAAAAGCTAGGAGAGGCAGCAAGCCCAGGCTGCTTCAGGAAATAACAGTCCTGGCATGTGCAGTAAGGCTTCAACTTTTATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTGAGTTAGAAGTTTGTTGTGTACTCTGCAACACAAGAAGTAGCAACACAAGAAGTATATACTTGTCTGTCTTGGTACTATGTA- + +a +s mr.mrrefChr5 121071 45 + 294542 TCCTATCTCATTTAATATCAAGTAGCATTTATTGTCAAAGACATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269581 45 + 636262 TCCTATCTCATTTAATATCAAGTAGCATTTATTGTCAAAGACATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 258548 45 + 647215 TCCTATCTCATTTAAAATCAAGTAGTATTTATTGTCAAAGACATC + +a +s mr.mrrefChr5 121116 150 + 294542 AAGGCAGAAACACACTCTTTAACTAGAGATGTACTTAAAGTTGGAAATTTGTTGTATACGTTGCAACAGAAAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATTAACTTTTTGAAAATTGGGAGCATTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269631 149 + 636262 AAGGCAGAAACACACTCTTTAACTAGAGATGTACTTAAAGTTGAAAATTTGTTGTATACGTTGCAACAGAGAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATCAACTTTTTTAAAGTTGGGAGTACTT- +s simRat_chr6.simRat.chr6 258593 150 + 647215 AAGGTAGAAATAAACTCTTTAACTGGAGATGTACCTAATATTGGAAATTTGTTGTGTACATTGCAGCAGAAAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATTAACTTTTTGAAAATTGGGAGCATCTA + +a +s mr.mrrefChr5 121266 192 + 294542 TTGTCAAAGACATTAAGACAGAAACAAACTCCTCAACCAATTCCTGAACTAATTCAAGGAAAGCCTCTTTTTAAGACTAATATTCAGTATAAAGGCCAAGCAATTGACCCAGCTCTTCCAGATGCACAATCATCAGCTTGACATATGAGCTATTTGTCAATCCTGCCATGCACTTCCCCTTTTGCTTTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269780 184 + 636262 ---TCTAAGACACTCAGACAGAAACAAACTCCTCAACCAATTCCTGAACTAATTCAAGGAAAGCCTCCTTTTAAGACTAATATTCAGTTTAAAGAGCAAGCAATTGACCCAGCTCTTCCACA-----AATTATCAGCTTGACACATGAGCTATTTTTCAATCCTGCCATGCGCTTCCCCTTTTGCTTTTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 258744 191 + 647215 TTGTCAAAGACATTAAGACAGAAACAAACTCCTCAAGTAGTTCCTCAACTA-TTCAAGGAAAGCCTCTCTTTAAGACTAAAATTCAGTATAAAGGCCAAGCAGTTGACCCAGCTCTCCTAGGTGCACAATCATCAGTTTGACATATGAGCTATTTGTCAATCATGCCATGCACTTCCCCTTTCGCTTTTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 121458 74 + 294542 ATGATAGTCTGAATCCCAATGTGTGACACCTAAAATTTTGATTGAGGCAATGAAATACAGTTCGATATGAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 269965 44 + 636262 ATGATAGTCCGA------------------------------TGTGGCAATGAAATACAGTTTAATATGAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 258935 74 + 647215 ATGACAGTCTGAATCCCAATGTGTGACACCTAAAATTTTGATTGAGGCAACGAATTACAGTTCGATATGAAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 121532 701 + 294542 TGAAACCTCTTGTGAGCCAGGCCTAGTTTCTTATGCTGCTTTGGTTAAGAGGTCTACTATATTTGCTTTTTGACATGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTACTGGCTTGATTGCCTACACAGAAAAGAACCTCCATCATCATATAGGTAAATGTACAGGGATGCCTTCAAACACTCAGCCAATATATAATATGGAATAGTCTTGCTAGACTCAATTGAGGGCACAAGCCCAATTAGTTACTCATGGCACAAGGTCAATGAAATACTTGAGGCCCGCAAGATAAATGAGTTGAGCACTGCAATTACAACATTATCATTGTTACTCTTGGGTTAATAACATGCCACCAGGTACCAATCTATCATTCCATTCAGAGAGTGGCTGATTCATGTTGGAAAGTAAACAAAGTGTTCAGGATTCTAACTAATGATCATAAATTGGGACTGGTCTTATGCAAAGTACTGTGGTTCAATACTTCAATTAGTAGCAGCATTTGTAATTATCTGTGACACTACCCAGCCCCACCATAGCAGGGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTGGCTACAAAACCTTCTAGGAGCTGGCCATTCACTCATTGAGGCTTGGATGAGGTTGAGATGAAGTGTAGGCAGCAGAGATTTACTTACTGTTAAAAAGGCACATTTGTTAAATAAACCTATTAGGTCAGGTGATGCACCCACTTTACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270009 691 + 636262 TGAAACCTCTTGTGAGCCAGGCCT-GTTTCTTATACTGCTTTGGTTAAGAGGTCTACTATGTTTGCTTTTTGACATGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTATTGGTTTGATTACCTACACAGAAAAGAACCTCCATCATTGTATAGGTAAATGTACAGGGAAGCCTTCTAACACTCACCCAATATGTAGTATGGAATGGTCTTGCTAGACTCAATTGAGGACACAAGCCCAATTAGTTACTCATGGCACAAGGTCAATGAAATACTTGAGGCCCGCAAGATAAATGAGTTGAGCACTACAATTACAACCTGATCATTATTACTCTTGGGTTAGTAACATGCCACCAGGTACCGATCTATCATTCCATTCAGA---------ATTCATGTAGGAAAGTAAACAAAGTGTTCAAGATTCTAACTAATGATAATAAATTGGGACTGGTCTTATGCAAGGTATTGTGGTTCAATACTTCAATTAGCAGCAGCATTTGTAATTATCTGTGACACCACCCAGCTCCACCATAGCAGGGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTAGCTACAAAGCCTTCTAGGAGCTGGTCATTCACTCATTGAGGCTTAAATGCGGTTGAGATGTAGTGTAGGCAGCAGAGATTTACTTACTGTTAAAAAGGCACATTTGTTAAATAAACCCATTAGGTCAGGTGATGCACCCATTTTACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 259010 694 + 647215 TGATACTTCTTGTGAGCCAGGGCCAGTTTCTTATGCTGCTTTCGTTACCAGGTCTACTATATTCACTTTTTGACACGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTACTACCTTGATTGCCTACACAGAAAAGAACCTCCGACATCATACAGGTAGATGTACAGGGATGCCTTCAAACACTCAGCCAATATATGATATC-AACAGCCTTGCTAGACTCAATTGAGGGCACAAGGCCAATTAGTGATTGTTGGCACAAGGCCAATGCAATACTTGACCACTGCAATATAAATTAGTTGAGCACTGCAATTAGAACATTAACATTGTTACTCTTGGGTCAATAACAAGTCACAAGGTACCAATCTATCATTTTATGCTGAGAGTGGCTGATTCATGTTGGAAAGTAGACAAAGTATTCTGAACTCTAACTCACGATCATAGATTGAGACGGGTCTTATGCGAAGTACTGTGGCTCAATACTTCCATTAGTGGCAGCATCTGTAATTATCTGTGACACTACGCAGCCCCACCATGGCAGAGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTGGTTACAAAAGCTTCTAGAAGCTGGCCATGCACTTATCAAGGCTTGGATGAGGTTGAGATGAAGTGCAAGCAGCAGAGAATCACTTAC------AAAGACACATTTGTTAAAAAGACATATTAGGTCAGGTGATGCACCCACTTTACTG + +a +s mr.mrrefChr5 122233 68 + 294542 CTACAGATCTCCAGACCAATTATTAGTTAATTAGTTGGTGTGGCATGTATCTGTGAGGAGGTGATGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270702 66 + 636262 CTACAGATCCCCAGACCAATTAT--GTTAATTAGTTGGTATGGCATGTGTCTGTGCGGAGGTGATGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 259704 68 + 647215 CTATAAATCTGCAGAGCAATTATTAGTTAATTAGTTGACGCGGTATGAATCTGTGAGGAGGTGGTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 122301 430 + 294542 GTTGCTACCTACTGCACTTTTCATTCTACATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAACAGGAGCCTCAGCAATATCTCCAGTTTGACAGCATAAATAACTGTATTGAGTGTGGGTATGTGTAGAACTTACTGATTTATGCACTGATGCTGGTGTGACTAGGGGAGATGTACCCAGCTCTGCCTTCCTGTCCATCTAATTGCAACTACATATTTTCGTCTGGTTACAGTAAAGTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGACATCACTCACAGACTAGGTAAAAGTTCCAACATGAGGTAGGAGACCTGTGTTCCACTGCCTAGATGTTGGTACAGATCCATACAACTAAATGGTGACACCATTCCTGTCTAGACATCTATCTCATGCATGATGCATAAGAACGGTGCCATGTGAAAGGTCCCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 270768 429 + 636262 GGTGCTACCCACTGCACTCTTCATTCTAAATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAACAGGGGCCTCAGCAGTATCTCCAGTTTGACAGCATAAATAACTGTATTGAGTGTGGGTATGTGTAGAACTTACTGATTTATGCACGGATGCTGGTGTGATTAGGGGAGATGTACCCAGATCTGCCTTCCTGTCCATCTAATCACAACTACATATTTTTGTCTGGTTTCAGTAAAGTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGGCATCACCCACAGACTATGTAAAAGTACCAACGTAAGGTAGGAGACCTGTGTTCT-CTGCCTAGATGTTGGTACAGATCCATACAACTAAATGTTGCCACCATTCCTGTCTAGACATCTAGCTCATGCATGTTACATAAGAACTGTGCCATGTGAAAGGTCCCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 259777 424 + 647215 GTTGCTACCTACTGCACTTTTCATTCTACATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAATGGGAGCCTCAGCAATACCTCCCGTTTGACAGCATAAATAACTATATTGAGTGTGGGTATGCGTAGAAGTTACTGATTTATGTGCTGATGCTGGTGTGACTAGGGGAGATGTACCCTGCTCTGTCTTCCTGTCCGCCTAATTGCAACTA------GTCGTCTGGTTACAGTAAATTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGACATCACTCATAGACTAGGTAAAAGGTACAACATGAGGTAGGAGACCTGTGTTCCACTGACTAGATGTTCGTACAGATCCATACAACTAAATGGTGACACCCTTCCTGTCTAGATATCTATCTCATGCATGATGCATAACACCGGTGCCATGTGAAAAGTCCCTTG + +a +s mr.mrrefChr5 122731 109 + 294542 AGATCCCCTTCAAAACAGTGATCCTATATAGTCTTCCAGCCCTTACAATGTCCACAGAAGAATCATGACGGTTGAATTGTTGACTTTATCAAAGGTTGCAGCTGTCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271204 108 + 636262 AGATCCCCTTCAAAACAGT-ATCCTATATAGTCTTCCAGCCCTTACAATGTCCACAGAAGAATCATGACGGTTGAATTGTTGACTTTACCAAAGGTTGCAACTGTCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 260201 108 + 647215 AGATCCCCTTCAAAACAGCGATCCTATATAGTCTTCCAACC-TTACAATGTCTACAGAGGAATCATGATGGTTGAATTGTTGACTTTTTCAAAGGTTGCAGCTGTCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 122840 30 + 294542 GAGTGTATTATTTTACTCTAGACATACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271312 30 + 636262 GAGTGCATTATTTTACTCTAGACATACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 260310 30 + 647215 GTGTGTATTATTTTACACTAGACATACATG + +a +s mr.mrrefChr5 122870 83 + 294542 TGTTAAACAGATTCTCTGCAAATGTGAGTAACTGTCACATTTTAGGACCAGTTGGATTAAAGATCCTAATGCCTACAATTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271342 82 + 636262 TGTTAAACAGATTCTCTGCAAATGTGAGTGCCTTTCACATTTTAGGACCAGTTGGATTAAAGA-CCTAATGCCTACAATTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 260343 83 + 647215 TGTTAAACAGATCCTCTGCACATGTGAGTAACTGTCACATTTTAGGACCAGTTGGACTAAAGATCCTAATGCCTAAAATTGGT + +a +s mr.mrrefChr5 122953 11 + 294542 AGGATGGTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271424 11 + 636262 AGGATAGTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 260427 11 + 647215 AGGATGGTATA + +a +s mr.mrrefChr5 122964 142 + 294542 AACTCTCTGCTAGAGTTTATGAATCCCAAATACATGGTGACAGTGAATATTACCCACATCAATTAGATGTCCCTCAGAACAGGCTTGGAGAGAGTTGATATTCATAAGACCTGTATTAGTATTCAAGATTTATATATACTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271435 135 + 636262 AACTCTTTGCTAGAGTTTATGAATCCCAAGTACATGGTGACAGTGAACATTACCCACATCAATTAGATGTCTGTCAGAAAAGGCCTGGAGAGAGTTGATATTCATAAGACCTGTATTAGTATTCAAGATT-------ACTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 260440 142 + 647215 AACTCTCTGCTAGAGTTTATAAATCCCAAATACATGGTGACATTGAATATTACCCACATCCATTAGATGTCCCTTAGAACAGGCTTGGAGAGAGGTGATATTTATAGGACCCATATTAGTATTCTAGATTTATATATACTTC + +a +s mr.mrrefChr5 123106 25 + 294542 GATTCTTCACTCCCCATTGAGCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271570 25 + 636262 GGTTCTTCACTCCCCATTGAGCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 260583 25 + 647215 GATTCTTCACTCCCCATTGAGCTTG + +a +s mr.mrrefChr5 123131 112 + 294542 CCTCCAAGTATTGCAACTTAATACATTGCCTCTAGGAAATAGCGACTTTACTCTGCCAAGCATGTGGCGTTGTATCCACACAAGCAGGTTTAGTTAAGGCAAAACTAGCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271596 112 + 636262 CCTCCAAGTATTGCAACTTAAAACATTGCCCCTAGGAAATAGCGACTCTACTCTGTCAAGCATGTGGCGTTGTATCCACACAAGCAGGTTTAGTTAAGGCAAAACTAGCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 260608 112 + 647215 CCGCCAAGTATTGCAACTTGATACATTGCCTCTAGGAAGTAGCAACTTTACTTTGCCAAGCATGTGGTGTCACATCCACACAAATAGGTTTTGTCAAAGCAAAACTAGCTGT + +a +s mr.mrrefChr5 123243 5 + 294542 TCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271708 5 + 636262 TCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 260742 5 + 647215 TCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 123248 337 + 294542 ATGGTGCATCTTAATGTTGACTACTATCAAGAACCAAGGTGGTCACATTAGAGGCATGGACACTCCTATGGTAGGCACTTTGTAGGGATAGCTAAAGAAGAAAACCAAAGACAAAACAAGCACAAATAAATAACTTTTTACTTAGGTGAATTCCATAAAGAAGTCTCTTACATCCTATCAACTACTAACCTTCAACTCTTTATATACCAAATCAAATGGACTCTAGGAAGCATACTGGCTCCATTCAAGTTTCCCATCATTCTGACTCATACAGAATCTTCTGATGTTTCCTATATGTTTTTTAGTGCTAACATTCAACTAGGGCCAACTCAGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 271713 331 + 636262 ATGATGCATCTTAATGTTGACTACTATCAAGAACAAAGGTGGTCACGTTAGAGGCATGGACATTCCTATGGTAGGCAATTTGTAGGGATAGCTAAAGTAGAAAACCAAAGACAAAACAAGCACAAATAAATAACTTTTTACTTAGGAGAATCCCATAAAGAAGTCTCTTACATCCTATCAGCTACTAACCTTTAACTCTTTATGTACCAAATCAAATGGACTCCAGGAAGCATACTGGCTCCATTCAAGTTTCCCATCATTCTGACTCATACAGAATCTACTGATGTTTCTTATATGTTTTCTAGTGCTAACATTCA-G-----CCTATTCAGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 260748 335 + 647215 ATGGTGCATCTTAATTTTGACTACTATTGAGAACCAAGGTGGTCTCATTAGAGGCATGCACACTCCTATCGTAGGCACATTGTAGGGATAGCTAAAGAGGAAAACCAGAGACAAGACTAGCACAAACCAATCA--TTTTATTCAGGTGAATTGCATAAAGAAGTCTATTACATCCCATTAACTACTATCCTTCAACTCTTTATATACCAAATCAAATAGACTTTAGGAAGCATACTGGATTCATTCAAATATCCCATCATTCTGACTCATACAGAATCTTCTTATGTTTCCCACTTATTTTTTAGTGCCAAGCTTCAACTAGGGCCAACTCAGCACA + +a +s mr.mrrefChr5 123585 72 + 294542 GCAAAGCCAACCATTGTTTACAACATTTACACTTCCCATCCCTGCAACATTAGTAGCAAATGCTTCTTGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272046 72 + 636262 GCAAAGCCGACCAGTGTTCACAACATTTCCACTTCTGATCCCTGCAACATTAGTAGCAAATGCTTCTTGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 261083 72 + 647215 GCAAAGCCAACCCTTGTATGCAAAATTTACACTTCCCATCCCTGTAACATTGCAAGCAGATGCTACTTGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 123657 52 + 294542 TAGTCTAATCTTAGGAAACTACTGTACCTCTGTTAGATTACACAGAATTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272118 52 + 636262 TAGTCTAATCTTAGGAAACTACTGTACCTCTGTTAGATTACACAGAATTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 261159 52 + 647215 TAGTCTAATTTTAGAAAACTACTGTATCTCTGTTAGCTTACACAGAATTCTA + +a +s mr.mrrefChr5 123709 43 + 294542 GTGTGGACCAGCAACTCTCACCAAATCAGCAAATCAATGTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272179 43 + 636262 GTGTGGACCAGCAACTCTCACCAAATCAGCAAATCAATGTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 261211 43 + 647215 GTGTGGACCAACAACTTTGACCAAATCAGCAAATCAATGTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 123752 195 + 294542 GAGTCCCGTCCCTTAGATATTGGTAGCAAATGCTACTCCCACAACCTAATCTCATTTCAAAAAACCATTACATCTAGAGTGTAGACAATATGAATCTGATGTCTACCAACCAATTTCTATTGAGATGTTGCTACAAATAGTCAGATGATCAATAGACATAGGTCTTTCTGGACCCCAATGACCCATTTGGCAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272222 193 + 636262 GAGTCCCGTCCCTTAGATATTGGTAGCAAATGTTACTCCCACAACCTAATCTCATTTCAAAAAACCATTACATCTAGAGTGTAGTCGATATGAATCTGATGTCTACCAACCAATTTCTATTGAGATGT--CTACAAATAGTCAGATGATCAATAGACATAGGTCTTTCTGGACCCCAATGTCCCACTTGGCAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 261274 183 + 647215 AAGTCCCATTACTTAGATATAGGTAGCAAAGGCTACTCCCACAACCTAATCCCAT--------AACATGACATCTAGAGTGTAGACAATAT----CTCATTTTTGCCAACCAATGTCTATTGAGATATTGCTATAAATAGTCAGTTTATCAATAGATATAGGCCTTTCTGGACCCCAATGACCCATATGGCAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 123947 23 + 294542 GCAAGATGTGACGTTTCAATTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272415 23 + 636262 GCAAGATGTGATGTTTCAGTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 261459 23 + 647215 GCAAGATGCAACATTTCAATTGG + +a +s mr.mrrefChr5 123970 98 + 294542 ACTAGCATAACTTAGACTTACGTAATAAATGCAATTAATGGAAGAAATTAAAAATACTTTAAATTAAGAGGATGTGGATACTACATAAGGTGGGGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272441 98 + 636262 ACTAGCATAACTTAGATTTACGTAATAAATGCAATTAATGGAAGAAATTAAAAGTACTTTAAATTAAGAGGATGTGGATACTACATAAGGTGGGGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 261482 98 + 647215 ACCAGCATAACTCAGACTTACGTAATAAATACAATTGATGGGAGAAATTAAAAATACTTTAAATTAAGAAGATGTGCATACTACATTAGGTGGGGGCT + +a +s mr.mrrefChr5 124068 313 + 294542 GACTTGGGTTATGTATTCAATTCCAGTTCTTTTGATTCACTTACACTGGGGGCCTCATCCTAAGTATAGTTTTATCTTGTACTGTATGTTGCCAATTCGCTTCCACCATATGATAGTGGAAGCAGATCAGCTATTTCTATGTTGTATCCCTCTCTCCTAATCCCCTAGACTATCATATTAGTTATACTATATGGAAGATTTATAACTTTTCATCTCATTCCACCAGAGAATGACTAGGCCAGATAGCTCTGCAACTCTTCATGCAACCCCATAAGTGGTTGAGGCATTTGTATCATTGGCAACACAAAACCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272539 271 + 636262 GACTTGGGTTATGAATTCAATTCCAGTTCCT------------------GGGCCTCATCCTAAGTATAGTTTTACTTTGTACTGCATGTTGCCAATTTGCTTCCACCATATGATAGCAGAAGCCAGGCAGCTATTTCTATGTTGTATCCCTCTCTCCTAATCCCCTAGACTGTCATATTAGTTATATTATATGGAAGGTTTATGACTCTTCATCTCATTCCACCAGAAAAT------------------------TCTTCATGCAACCCCATAAGTGGTTGAGGCATTTGTCTCATTGTCAACACAGAACCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 261582 313 + 647215 GACTTGGGTTAAGTATTCAATTCCAGTTCTTTTGATTCACTTACACTGGGGGCCTCATCCTGAGTATAGTTTTATCTTGTACTGTATGTAGCCAGTTCGCTCCCACCATATGGCAGTGGAAGAAGATCAGCTATTACTCTGTTGTATCCCTCTCCCCTAATCCCCTAGACCATCATATTAGTTATACTATATGGAAGAATTATAACTTTTCATCTCACTCCACCAGAGAATGACTAGGCCAGATAGCTCTGCAACTCTTCATACAACCCCTTAAGTGGCTGAGGCATTTGTATCGTAGGCAACACAAAACCAA + +a +s mr.mrrefChr5 124381 203 + 294542 CTTCAATTGCTATTTGTCTATTTCAAGCATCCTTTCCAAGCAAGAGATTATGGTAAGGAACTGACACTAATTGAGACGAGCAAGGTGTCAGGAGGAGGCATAGAAATACATGGAATCGAAAATATTCTCCCAGGTGGCATTTATATAGCAACTCTTGTATGAAACAAGTTCTCAATTGGCAATTTCAATTTATGTATAACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 272832 203 + 636262 CTTCAATTGCTATTTGTCTATTTCAAGCATCTTTTCCAAGCAAGAGATTCTGGTAAGGAATCGACACTAATTGAGACGAGCAAGGTGTCAGGAGGAGGCATAGACATACATGGAATCGAAAATATTCTCCCAGGTGGCATTTATATAGCATCTCTTGTATGAAACGAGTTCTCAATTGGCAATTTCAATTTATGTATAACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 261895 192 + 647215 CTTCAGTTGCTATTTGTCTATTTCAAGCATCCTTGCAAAGCAAGAGATTATGGTAAGGAACTGACACTAATTGAGACAAGCAAGATGTTAGGAGTAGGCATTGAAATACATGGAATC-----------CCCTGGTGGCATTTCATTAGCAACTCGTGTATGAAACAAGTTCTCTATTGGCAATTCCAATTTATGTATAAGACA + +a +s mr.mrrefChr5 124584 58 + 294542 AATCTTCATGAAAATGTTTGAAAGAACAGATATTCCTGTATGTAGAAGATATAGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 273036 58 + 636262 AAACTTCGAGAAGATGGTTGAAAGAACAGATATTCCTGTATGTAGAAGATATAGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 262087 58 + 647215 AATCTTTATGAAAATGTTTGAATGAACAGAAAGTCCTGTATCCAGAAGAGATAGTATG + +a +s mr.mrrefChr5 124642 68 + 294542 GTCATTAGTAGTAATTTTGAGTCGAATAATTAATGAGCTATGGGTAATGTTAACCACAGCAGTATGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 273094 68 + 636262 GTCATTAGTAGTAATTTTGAGTCGAATAATTAATGAGCTATGGGTAATGTTAACCACAGTGGTTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 262163 68 + 647215 GTCATTGGTAGTAATGTGGAATTGAATAATTAATGACCTATGGTTAATGTTAGCCACAGCAGCACTAA + +a +s mr.mrrefChr5 124710 500 + 294542 CAGGTCTAATGGTTTGAATGACAAATCTATCCAAAGAAAGAAAACACATAAAAGCTTATTATTGATCAAAATTGTGTATGAAGACTAAATTCACTCTGCAGTAGCCCAGAATATTTTGGCCCTACACTTAATACAACTAAGCCATTCTGCTGGTATTGCAAAACAAGTGACAAACTGCACACTTGAGTAGGTAACTTACCCAGCAGCAGCTCCCCTGGTCATGAATCAAGATTGGTTCTAATTATTTATATGCAGCTCAGTTCATTAAACAATGAGATTGCTGCAGGGCCCAGCTGAGGTTGTGTTCTTAAGTAGCTGCTGATACTCTGGCATTGTAAGTTGAATCTTTATTGCCCCAGCTTAGGACAATATAATGTGATACAAGGTACCTAATAGATCAATTGATATTAAACGGTAGAACCTGCCAAAAGAGCAACTCCCCTACTAAGAGTTAAGAGGATGGCCAATTTGAGGCTAAAAGTAGGGATCTTTGACCGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 273165 478 + 636262 CAAATCTA----------TGACAAATCTATCCAAAGAAAGAAAACACATAAAAACTTATTATTGATCCAAATTGCGTATGAGGACTAAATTCACTCTGCAGTAGCCTAGAATATTTTGGCCCTACGCTTAATACAACTAAGCCATGCTGCTGGCATTGCAAAACAAGTGGCAAACAGCACACTTGAGTAGGGAAATCACCCAGCA---GCTCCCCTGGTCATGAATCAAGATTGGTTCTAATCATTTATATGCAGCTCAGCTCATTAAACATTCAGATTGCTGCAGGGCCAAGCTGAGGTTGTGTTCTTGAGTAGCTG--GATACTCTGGCATTGTAAGTTGAATCTTTATTGCTCCAGCTTAGGACAATAGAATGTGATACAAGGTACCTAGTAGATCAATTGATAATAAACGGTAGAACGTGCCAAAAGACTGACTCCCCTACTA-------AGAGGATGGCCAATTTGAGGCTAAATGTAGGGATCTTTGACTGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 262231 488 + 647215 GGGGTCTAATGGTTTGAACGACAGATCTACCCAAGGAAAGAAAACACACAAAAGCTTATCATCGATCAAAATTGTGTATGAAGACCAAATTTACTCGTCAGTAGCCCAGAA---------CTTACATTTAATACAACTAAGCCATTCCGCTGGTATTACAAAATAAGTGACAGACTGCACACTTTAGAAGGTAGCTTACCCAGCAGCAGCTCCCCTGGTCATGAATCAAGATTGGTTCTGACTATTTATATGCAGCTTAGTTCATTAAACAATGAGATTGTTACAGGGCCCAGCTGAGGTTGTGTTCTTAAGTAGCAGCTGATACTTTGGCATTGTAAGTTAAATCTTTATGACCCAAGCTTAGGATAAAATAATGTGATACATGG---CTAATAGATCAATTGATATGAAACGGTAGAACCTGCCAAAAGAGCAACTCCCCTATTAAGAGTTAAGAGGATGGCCAATTTGAGGCTAAAATGAGGGATCTTTGACCACAG + +a +s mr.mrrefChr5 125210 175 + 294542 TGTCTGAGTGGTCACAATACCTATGCTGACAATCAGCCAAATGGTGGCGCAGGAAGCACTGTCTCGGTAAGGCACCTTAGAATTGCAAACATTCAGGCAGTCACTCAGTACATTGCAATTGTATTCATCAACCCATTTTTAGAAGAGCAGCATGTAGCTAATGTGCCCCAGGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 273643 175 + 636262 TGTCTGAGTGGTCACAATACCTATGCTGACAATCAACCAAATGGTGGCGCAGGAAGCATTGTCTCGGTAAGGCACCTTGGAATTGCAAACATTCAGGCAGTCACTCAGTACATTGCAATTGTATTCACCAACCCATTTTTAGAAGAGAAGCATGTTGCTAATGTGCCCCAGGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 262726 163 + 647215 TGTATGAACAGTTACAATACCTATGCTGAGAATCAGCC-----------CAGGAAACACTCTCTCGGTTAGTCACCTTAGAAT-GCAAACATTCAGGGAGTCACTCAGTACGTTGTAATTGTATTCATCAACCCATTTTTAGAAGAGCTGCATGTAGCTAATGTGCCCAAGGTCC + +a +s mr.mrrefChr5 125385 196 + 294542 CACATAACCTTATGATCCTATTGACCTGGATCCACCACAGCTACTTGGCAGAGAGCTCCTTTGTAAGAATGAAAATTGGTCATAGCTAGAAAGAGCTCAGTGTGTAGTCACCAATATGCAGCTTACTTCTAAATCAACTGTAAAAATAGAATAGAAGTGGGAATCTTTGGGGAATAGACACTTGTCCATAGGTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 273818 168 + 636262 CACATAACCTTATGATCCTAGTGACCTGGATCCACCACAGCTACTTGGCAGAGAGCTCCTTTGTAAAAATGAAAATTGGTCATAGCTAGAAAGAGCTTTGTGTGTA----------------------------CAACTGTAAAAATGGAATAGAAGTAGGAATCTTTGGGGAATAGACACTTGACCATAGGTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 262901 196 + 647215 CACATAACCTTATGATCCTATTGACCTAGTTCCATCACAGCTACTTGGCAGAGAGCTCCTTTGCAAGAATGAAAATTGGTCATAGCTAGAAAGAGCTCAGTGTGTAGTCACCAATATGCAGCTTACTTCTAAATCAACTGTAAATATAGAATAGAAGTGGGAATTTTTGGGGAATAGACACTTGTCTATAGATCTG + +a +s mr.mrrefChr5 125581 221 + 294542 GACTCATTATGGGGTAGCTAGGAAGCCATGTCTTGTGGATGATATGGATACAGCAGGCCACTTGGGTATAAAATCAGCCAACTTGTGCAAGGTTTAATGTAAGGGACAACAGCCGCACTATTTCTTATTCTACCTGATTGAAAAGGATAGTTCTTGGAATAATGTGGGACAAAGTTGAACTGGATCTATGATTTAGCAGCATCCCCCAAAAAAAGTGGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274011 221 + 636262 GATTCATTATGGGGTACCTAGGAAGCCATGTCTTGTGGATGATATGGATACAGCAGGCCACTTGGGTATAAAATCAGCCAACCTCTGCCATGCTTAATGTAAGGCACAACAGCCGCACTATTTCTTATTCTACCTGATTGAGAAGGATAGTTCTTGGAATAATGTGGGACAAAGTTGAACTGGATATATGATTTAGCAGCATCCCCCAAAAAAAGTGGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 263097 212 + 647215 GACTCATTATGGCGTTGCTAGAAAGCTATGGCTTGTGGGT---------ACAGCAGGCCACTTAGGTATAAAATCAGACAACTTGTGCAAGGTTCAATGTAAGGGACAACAGCTGCACTATTTCTTATTTTACCTGATACAAAAGGATGGATCTTGGAGTAATGTGGGACGAAGTTGAACTGGACCTACGATTTAGCAGCTTCCCCCAAAGAAAGTGGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 125802 186 + 294542 TAAATACCCAATGGACTTGTTGAGTAAGTAAACCCATAATAGAGACTCTTCTTTAATGAACACTTATGGAAAAGACATAAGGTACTTTGAATTTAGGATTGATGCCTCCCCATCCCCTGTTACCAAAACTAATATCATCAAAAGCTGCATGAAAAGTTTAACAAACTCAACATTAACAGAGTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274252 186 + 636262 TTAATACCCAATGGACTTGTTGAGTAAGTAAACCCATAATAGAGACTCTTCTTTGATGAACACTTATGGAAAAGACATAAGGTACTTAGAATTTAGGGTTGATGCCTCCTCATCCCCTGTTACCAAAACTAATTTCATCAAAAGCTGCATGACAAATGTAACAAACTCAACATTAACAGAGTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 263309 185 + 647215 TAAGTATCCAATGGACTTGTTGAGTAAGTAAACCCATAATAGAGACTCTTCTTTAATGGACACCTATGGAAAAGACATAAGGTACTTTGAATTTAGGATTGATGCCTGCCCATCCCCTGTCACCAAA-CTCATATCATCAAAAGCTGCATAAAAAGTTTAACAAACTCAACAATAACAGAGTGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 125988 213 + 294542 AGTGGATGCCCTTCTTTGTGCAGTATGATGGATTCCAGCCCTCAATACAGCCTGACAGGAGGCAGCAGCTCAACACATAAATTGCAGTCAAATTGTCAATAGGTGGAATAGAAGCTTAGTGCTGTTATGGTGCAAGAAAATTCAAACATAACAACATTAGGCAGCTTATGAGATGAGATGCGGACCTAGCCTAAAAAAGGTATGTGCTGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274440 212 + 636262 AATGGGTGCCCTTCTTTGTGCAGTATGATGGATTCCCGCCCTCAATACAGCCTGACAGGAGGCAGCAGCT-AACACATAAATTGCAGTCAAATTGTCAATAGGTGGAATAGAAGCTTAGTGCTGTCATGGTGCAAGAAAATTCAAACATAGCAATATTAGGCAGCTTATGAGACAAGATGTGAACCTAGCCTAAAAAAGATATGTGCTGATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 263494 213 + 647215 GGTGGATGCCCTTCTTTGTGCAGTATGATGGACTCCAGCCCTCAATACAGACTAACAAAAGGCTGCAACTCAACACGTAAATTGCAGTTAAATTGTCAATAGGTGGACAAGAAGCTTAGTGCTGTTATGGTGCATGAAGATTCAAACATAACAACATTAAGCAGCTTATGAGATGAGATGCGGACCTAGCCTAAAAAAGGTATGTGCTGATGT + +a +s mr.mrrefChr5 126201 96 + 294542 ATATCATGTTCCACCCTTTGTAGAGGGCCCCTACATCCTCTGTGATATGGGATTTATTGAAGATCATCATAGTATGTAAAACACAATGGCAATCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274652 96 + 636262 ATATCATGTTCCACCCTTTGTAGAGGGGCCCTACATCCCCTGTGGTATGGGATCTATTGAAGATCATCATAGTATGTAAAACACAGTGGCAATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 263713 96 + 647215 ATATCATGTTCCACCCTTTGTAGCAGGCCCCTACATCCTCTGTGATATAGGATTTATTGAAGATCATCATGGTATATAAAACGCAATGGCAATCGG + +a +s mr.mrrefChr5 126297 32 + 294542 AATCTGTATAAGAAGGGCACCAATAGTGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274749 32 + 636262 AATCTGTATAAGAAGGGCACCAATAGTGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 263809 32 + 647215 AATCTGTATAAGAAGAGCATCAATAGTGAATA + +a +s mr.mrrefChr5 126329 49 + 294542 ATGTATGTATGACCTGGGATTATCTTGGCACGCCTTAAGGCTAATATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274788 49 + 636262 ATGTATGTATGACCTAGGATTATCTTGGCACGCCTTAAGGCTAATCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 263841 49 + 647215 ATGTATATATGACCTGTGATTATATTGGCACACCTTAAGGCTAATATGT + +a +s mr.mrrefChr5 126378 18 + 294542 TACCGAAAGTAAGGTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274837 18 + 636262 TACCGAAAGTAAGGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 263894 18 + 647215 TACCGAAAGTAAGGTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 126396 477 + 294542 GTATCCTTGACATAAGTGGCCCCATGTCTAGGGGGGGTGACACCCACAGTATTTCAGGTAGTAAGCATTGCCTTGATGGCCTATAAGTAATGTCACCACTGAATACCACGGCATTTTGGCTGTGAACTTGAACATGATGATAATGCTGGATGTAAAAAGTGGATCCAACATTGATTGAGTGAGTATAAGGAAACATACCAACCAGATGGGAGTTGGTTCATTTGACAGGACTAAAGCATGTCTTATATTCTCCTACATCACTGACAAGTAGACCCCCACAGCAAGGAATTGATTGAATTTACAAGATGGTTTTTTCATGAAGTATAGCAAGCTATAAACCGGATAATGGTGAAACATGAGATATTTTAAGAAAATATACTAAGTGCTTTAGTTACCGTCTGAACATATCCTAAAGGTCATTTGCTAATCtCCAAGCCTCACAACCTtGCagtattgcagctagctcccctcaagtaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 274855 474 + 636262 GTAGCCTTGACATAAGGGGCCCCACTTCTAGGGGGGGTGATACCTGCAGTATTTCAGGTAGAAAGCATTGCCTAGATGGCCCATATGTAATGTCACCACTGAATATCACGGCATTTTGGCTGGGAACTTGAACATTATGATGATGCTGGATGTAAAAAGTGGATCCAACATTGATTGAGTGAGTATAAGGAAACATACCAACCAGATGAGAATTGGTTCATTTGGCA--ACTAAAGCATGTCTTATATTCTCCTACATCACTGACAAGTAGACCCCCACAGCAAGGACTTGATCGAATTCACAAGATGGTCTTCTCATGAAGTATAGCAAGCTACAAACCGGATAATGGTGAAACATGAGATATTTTAAGAAAATATACTAAGTGCTTTAGTTACCGTCTGAACATATCCTAAAGGTCATATGCTAATC-CCAAGCCTCACAACCTTACCGTATTGCAGCTAGCTCCCCTCAAGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 263913 461 + 647215 GTATCCTTTACATAAGTGGCCCCATGTCTAGGGGG--TGACACCCACA----------TAGTAAGTCTTGCCCTGATGGCCTATAAGTAATGTCACCACTGAATACCATGGCATTTTGGCTGTGAACTTGAACGTGATGGTAATGCTGGATGTAAAGAGTGGATCCAACATTGATTGAGTGACTATAGGGGATATTACCAACCAGATGGGAGTTGGATCATGCGACAGGACTGGAGCATGCCTTATA----CTTCCATCTCTGAGATGTACACCCCCGCAGCAAGGAAGTGTTTTAATTTAAAAGATGGTTTTTTTATGAAGTATAGCAAATTATGAACCAGATAATGGTCAAACATGAGCCATCTTAAGAAAATATACTAAGGGCTTTAGTTGCTGCCtgaacatatgctaaaggtcatttgctaatctccaaggctttcagccttgcagaattgcagctcgctcccctcaagtaa + +a +s mr.mrrefChr5 126873 254 + 294542 tatttggtctacacattctaaagGTACTTGCTATGCCTATTTAGATTAAGACATGGTGTCAAAACCTTTAACCACTTAGTGTGAATGACTGGACATATTTTGGATTTCTTCTAGTGTGACACTGCGCCATAGAGGTCATTATGTAGTGAACTGGAATAGGTTTTAACCATAACCATCAAGCTGGCCCTGAGGCATCACTTGACCAAGCATATCTTCTACTAAATGGTAGCAGAGGGTTGTACCATAATTGCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 275330 250 + 636262 TTTTTGGTCTATCCATTCTAAAGGTACTTGCTATGCCTATTTACATTAAGACATGGTGTCAAAACTTTTAACCACTTAGTGTGAATGACTGGACATATTTTGGATTTCTTCTAGTGTGACACTGCGCCATAGAGGTCATTGTGTAG----CTGGAATAGGTTTTAACCATAACCATCAAGCTGACCCTGAGGCATTGCTTGACCAAGCATATCTCCTACTAAATGGTAACAGAGGGTTGTACCATAATTGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 264374 253 + 647215 tatttggtctacacattttaaagGTACTTGCTATGCCTATTTAGATTAATATGTGGTGTCAGAACCTTTAACTACTTAGTGTGGATGACTGAACATATTTTGGATTCATTCCAGCATGAGACTGTACAATTGGAGTCATCATGTAGTGAACTGGAATATGTTTAAACTATAACTGGCAAGCTGGCCCTGAGGCATCACTTGACTAGGCATATCTTCTGCTAAACGGTCGCAGAGCGTTGTAACATAAGTGCT-C + +a +s mr.mrrefChr5 127127 23 + 294542 GGATATTCCATAACAGAGTCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 275582 23 + 636262 GGATCTTCCATAACAGAGTCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 264627 23 + 647215 GGATATTGCATAGCAGAGTTATC + +a +s mr.mrrefChr5 127150 127 + 294542 AAACTGTGGTAGCCTAATGCACATAAGGGTAGCACAAGCATTTGACGGCATATCTAGGGGGGGCAGCTTCTACAAACTACAAGAACAATAACAGTAGAGGGCTAGATTGGGTGCAAGGCAAATATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 275606 118 + 636262 AAACTGTGGTAGCCTAATGCACATAAGGGTAGCACGAGCATTTGACGGCATGTCTAGGGGGGGCAGCTTCTACAAATTACAATAACAATAACAGTAGAGGGCTAAGTTGGGTGCAAG---------A +s simRat_chr6.simRat.chr6 264650 127 + 647215 GAACTGTGGTAGCCTAATGCACTTAAGGGTAGCACAAGCATTTGACAGCATATTTAGGGGGGGCAGCTTCTAAAAACTACAAGAACCCTAACAATAGAGGGTTAGATTGGGTGCAAGGCAAATATGG + +a +s mr.mrrefChr5 127277 72 + 294542 CAAACATGTCACATCACACCTTGGCATGTAAGGGCTCCAGTTAGCGAATTCTCTTGTTACTCCCTTATGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 275724 71 + 636262 CAACCATATCACAT-ACACCTTGGCATGTAAGGGCTCCAGTTAGCGAATTATCTTGTTTCTCCCTAATGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 264799 72 + 647215 CAAACATGTCACATCACACCTTGGCATGTAAAGGCTCCAGTTAGTGAATTCTCTTGTTACTCCCTTATGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 127349 612 + 294542 TTGACCAAAGATAACATTTAATGGGTGAAGTACAGCCTCGGATTAGTAATATTTCATTTCTATATGACTCTATGTAACTCTGTTCCATGTAACTCTAGGTTTTCATAGAATGGCTTCTTCATTTACTCTCAGATAAACTACTGATGTTCTTATCTTGATCATGAGCACCCATCGGAAAGAGTTGTTTGACTAGTGGTCATTTAAAATATATTTTAAGAGAACTTGTCTATTGTTAAAGCTGAGGTATGGACCACTATAGGCTCTCAGCAGAAGAGAAGGGATCAGAAAGGGCTAGGTAGGATTAGGGATATCGCACCCTCTAAAGAGGTGGATACCAATCTGAAACATGGAGATGAGTAATCCGGGCCAACATAGCACAACGGGTTCGTCCTAGTTGCAGTGAGCATCAGAGGGACACTTGCCACGAGCTCCATCATACCTGCTGGGAACAAAAGTCAAGGCTTCTTTCTGAGCCAGGACCATAAATGGCAGGACAAGACACTGCAGATTGCCCTCAAACACCATTTTGGGTAACAAATTATAGCTTAATTTCAAGTCAAACTTAGTATACAAGGTAGTGGTGGGTTAATCATAAGGTAGGTACATACATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 275795 586 + 636262 CCAACCAAAGATAACATTTAATGGGTGAAGTACACCGTCGGATTAGTAATATTTCATCTCTATATGACTCTATGTAACTCTGTTCCATGTAACTCTAGTTTT--------------CTTCATTTACTCTCAGATAAACTACCGATGTTCCTATCTTGATCATGAGCACCCATCGGAAAGAGTTGTTTGACTAGTGGTCATTTAAAACTTATTTTAAGAGAACTTGTCTATTGTTAAAGCTGAGGTCTGGACCACTATAGGCTCTCAGCAGGAGAGAAGGGATCAGAAAGGGCTAGATAGGATTAGGGATATCGCACCCTCTAAAGAGGTGGATATCAATCTGAAACATGGAGATGAGTAATCCGGGCCAACATAGCACAACAGGTTCGTCCTAGTTGCAGTGAGTGTCAGTGGGACACTTGCCACGAGCTCCATCAT--------GGAACAAAAATCAAGGCTTCTTTCTGAGCCAGGACCAT--ATGGCGGGACAAG--ACTGCAGATCGCCCTCAAACACCATTTTGGGTAACACATTACAGCTTAATTTCAAGTCGAACTTAGTATACGAGGTAGTGGTGGGTTAATCATAAGGTAGGTACATACATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 264998 608 + 647215 TTGGCCAAAGATAACATTTAATAGGTGAAGTGCAGCCCTCGATTAGTAGTATTTCATTTCTAGATAACCCTATGTAACTCTGTTCCATGTAACTCTAGGTTTTCATAGAATGGCTTCTTCATTTGACG----ATAACCTACTGATGTTCTTATCTTGATCATGAGCATCCATTTGAAAGAGTTGTTTGACTAGTGGTCATCTAAAATAAATTTTAAGTGAACTTGGCTATTGTAAAAACTGAGGTATGGACCACTATAGGCTCTCAACAGAAGAGAAGGGATAAGAAAGGGCTAGGCAGTTTTAGGGGTATCGCACCCTCTACAGAGGTGGATACTCACCTGAAACATGGAGATCAGTAATCTGGGCCAACATGGCACAACGGGTTCATCCTAGTTGCAGTGAGCATTAGAGGGACACTTGCCAGGAGCCCCATCATACCTGCTGGGAACAAAAGCCAAGGCCTCCTTGTGAGCCAGGACCATAAATGGCAGGATAAGACACTGCAGATTGCCCTCAAAAACCATTTTGGGTAACAAATTATAACTTAATTTCAAGTCAAACATAGCAAACAAGGTAGAGGTGGGTTGATCATGAGGTAGGTACATACATTG + +a +s mr.mrrefChr5 127961 154 + 294542 TGTAACTTACTGCATCCTGATTCGGGTACCGTCCAATATATCAGTGTTTGGTAACTTCTGTGTCCAATATAACCATGGAAATATGTGCAAGGGGTACTACCTGATACGTTGGTGTTTGGTGACTTCTGTGTCCAATATAACCATGGAAATATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276408 154 + 636262 TGTAACTTACTGCATCCTGATTCGGGTACCGTCCAATATATCAGTGTTTGGTAACTTCTGTGTCCAATATAACCATGGAAATATGTGCAAGGGGTACTACCTGATACGTTGGTGTTTGGTGACTTCTGTGTCCAATATAACCATGGAAATATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 265606 154 + 647215 TGCAACTTACCGCATCCTGATTGGGATGCTGTCCAATACATCAGCATTTGGTGACTTCTGCATCCAATATAACCATGGAAATATGCACAAGGGGTACCACCTGATACATCAGTGTTTGGTGATTTTTGTGTCCAATATAGCCAAGGAAATATGT + +a +s mr.mrrefChr5 128115 20 + 294542 GCAGTGCATTGACAATTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276562 20 + 636262 GCAGTGCATTGACAATTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 265776 20 + 647215 GCAGTGCACTGACAATTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 128135 142 + 294542 ATTGAACTAGATATGTTTTACTCTTTAGACCCTGCAAATTATAGTGACTTGTCCACAATTAAGGGGCATTAACCATATTGTTTTGTAACATCCTCACAGGTATCACAACTTGGAAATTGGGGAATCCCCGTAGATCAATCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276582 142 + 636262 ATTGAACTAGATATGTTTTACTCTTTAGACCCTGCAAATTATAGTGACTTGTCCACAATTAAGGGGCATTAACCATATTGTTTTGTAACATCCTCACAGGTATCACAACTTGGAAATTGGGGAATCCCCGTAGATCAATCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 265804 142 + 647215 ATGGACCTAGATATGATTTGCTCTTTAGACTCTGCAAATTATAGTGACTTGTCCACAATTAAGGGGAATTGACCAAATCATTTTCTCATATCCTCACAGGTATCACAACATGGAGATTGGGGAATCCACATAGATCAATTAG + +a +s mr.mrrefChr5 128277 33 + 294542 TGTATTAATGTGAATATGCTTAGACTGTCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276724 33 + 636262 TGTATTAATGTGAATATGCTTAGACTGTCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 265947 33 + 647215 CATATTAATGTGAACATGCTAGGACTATCATAA + +a +s mr.mrrefChr5 128310 95 + 294542 TTGAGCACTACAAACTGGTGACAGGGCCTGTAAAAAAATTGTTACAACAAGCATCCTGACCGACTAGATAGATGGATTTGATCTTAACTGACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276757 95 + 636262 TTGAGCACTACAAACTGGTGACAGGGCCTGTAAAAAAATTGTTACAACAAGCATCCTGACCGACTAGATAGATGGATTTGATCTTAACTGACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 266033 95 + 647215 TTGAGCAGTCCAATCTGATGACAGTGCCTGTAAAAAGATTGTAACAACAAGCATCCTGACAGATTAAATAAATGTATTTGATCCTATCTGACTTT + +a +s mr.mrrefChr5 128405 61 + 294542 TTCCCTTTTGATTTAGGAACACAGTTCATAATTCCACATTTTTAATTATATAAAAACAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276860 61 + 636262 TTCCCTTTTGATTTAGGAACACAGTTCATAATTCCACATTTTTAATTATATAAAAACAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 266128 61 + 647215 TTCAATTATGTTCTTGGCTCACAGTTCATAATTCAGCATCTCTAGTTATCTAAAAACAGTC + +a +s mr.mrrefChr5 128466 3 + 294542 TAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276964 3 + 636262 TAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 266189 3 + 647215 TAA + +a +s mr.mrrefChr5 128469 80 + 294542 CCTACTGACTTGTGGTGACATTGTATTGGTTTGTGTACAACACTTAAGTCGATGAATTCACGGCTACAGGCTTGCCTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 276967 80 + 636262 CCTACTGACTTGTGGTGACATTGTATTGGTTTGTGTACAACACTTAAGTCGATGAATTCACGGCTACAGGCTTGCCTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 266199 80 + 647215 CCCACCGAAGTGTAGGGACATTGTACTGGGTTGTATACAACACATAAATCAGTGAATTGACAGCTACAAGCTTGCCTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 128549 96 + 294542 CAGATATTTATTGTTCTGTGCCTTATTGGATCTGTAGCCAGTGCTGGCCAGCTTTTGGAGCACAAAAGGCCTCAGCCCTGGCTGCGGCCATGAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277052 96 + 636262 CAGATATTTATTGTTCTGTGCCTTATTGGATCTGTAGCCAGTGCTGGCCAGCTTTTGGAGCACAAAAGGCCTCAGCCCTGGCTGCGGCCATGAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 266279 96 + 647215 CAGATCTCTCTTGTACTATGCCTTGTTGGAACTGTGGGGAGTGCTAGCCAGCTTTTAGACCATAAAAGGCCTGACCCCTGGCTGCAGCCATAAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 128645 54 + 294542 AATCACTGTCAATCCTGTCTCATGAGCAGCTTTTAAATTGTAAAAGACCTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277151 54 + 636262 AATCACTGTCAATCCTGTCTCATGAGCAGCTTTTAAATTGTAAAAGACCTGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 266375 54 + 647215 AATCACTGTCATTCCTGTATCTTGCCCAGCTTTTAAATCGTAAAAGACCTGACA + +a +s mr.mrrefChr5 128699 6 + 294542 CTGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277206 6 + 636262 CTGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 266429 6 + 647215 TTGGCT + +a +s mr.mrrefChr5 128705 27 + 294542 TGCAATAAAGCAACTACCACTGTCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277212 27 + 636262 TGCAATAAAGCAACTACCACTGTCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 266437 27 + 647215 GGCAACAAAGCAACTACCACTTCCGAT + +a +s mr.mrrefChr5 128732 64 + 294542 TCAGAATCATGCTGTATAAAGTTATGAAGATTAACGAAGTACAGCATATGAATTATTGATGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277245 64 + 636262 TCAGAATCATGCTGTATAAAGTTATGAAGATTAACGAAGTACAGCATATGAATTATTGATGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 266464 64 + 647215 TCTGAATCATGCTGTATAAAGCTGTAAAGATTAGCGAAATACAGCAAATGAATTATTGATGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 128796 43 + 294542 CCATAAGTAGGGGGGGGTGCCTGTTAATTGTGCAATCTAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277316 43 + 636262 CCATAAGTAGGGGGGGGTGCCTGTTAATTGTGCAATCTAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 266528 43 + 647215 CCATCAGTAGGGGGGGGTGCCTGTTAAGTGTACAATCTAAATT + +a +s mr.mrrefChr5 128839 64 + 294542 ATACTGATGGATCACAGTTGTGCTCTTTAATATGTTCTGAGACACATGTCATGAGCATCAGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277361 64 + 636262 ATACTGATGGATCACAGTTGTGCTCTTTAATATGTTCTGAGACACATGTCATGAGCATCAGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 266571 64 + 647215 ATACTGATGGATCATAGTAGTGTTCTTTAATATGTTCTGACACACATTTCATGAGCATTAAGTC + +a +s mr.mrrefChr5 128903 18 + 294542 ACAGTCAATTGTTCTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277425 18 + 636262 ACAGTCAATTGTTCTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 266636 18 + 647215 ATAGTCAATTGTTGTAAC + +a +s mr.mrrefChr5 128921 81 + 294542 TTTGTCACCTTTTAAAATATATCTAAGGCTACTAAAGAGTTAAGCTGACCTCCTCATTATTATCTACTTTGCTCATTTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277443 81 + 636262 TTTGTCACCTTTTAAAATATATCTAAGGCTACTAAAGAGTTAAGCTGACCTCCTCATTATTATCTACTTTGCTCATTTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 266666 81 + 647215 TTTGACACTATCTAAGATAGAGCTAAGGCTATTAAAGAATGAAGTTGATCTCCTCTTTACTGTCTCCTTTGCTCATTTCCT + +a +s mr.mrrefChr5 129002 102 + 294542 TTAGGCCTGCACAGCCTGGTTATGAGGGAAGCAAAATAGCTGTGTGTTTGTGCATGAATGTTTTGAATACTTAGAGTGCTAAAGAGAATGGTCTATGCCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277524 102 + 636262 TTAGGCCTGCACAGCCTGGTTATGAGGGAAGCAAAATAGCTGTGTGTTTGTGCATGAATGTTTTGAATACTTAGAGTGCTAAAGAGAATGGTCTATGCCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 266748 102 + 647215 GTAGGCCTGCATAGCCTGGTTATCAGGCAAGCAAAATAACAGCATGATTGTGCATGAACTTTTTGAATAGTTAGAGTGTTAAAGAGAATGGTTTGTGTCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 129104 37 + 294542 CTAGTGGTTTAGATAGTGGTTTAGAAGAGATCCTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277628 37 + 636262 CTAGTGGTTTAGATAGTGGTTTAGAAGAGATCCTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 266850 37 + 647215 TTAGTGATTTAGATAGTGGTTCACGAGAGATCTTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 129141 26 + 294542 ATGTATATTTAATGGAAACTGACCGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277667 26 + 636262 ATGTATATTTAATGGAAACTGACCGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 266887 26 + 647215 ATCTAGTGTGAACAGATACCGACCAG + +a +s mr.mrrefChr5 129167 39 + 294542 TTAAGTCAGGTTGAGATACTGTGGGATCTACAACTTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277693 39 + 636262 TTAAGTCAGGTTGAGATACTGTGGGATCTACAACTTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 266915 39 + 647215 TTAAATCAGCTTGAGATACTGTGGGATCTACAACTTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 129206 22 + 294542 ACTGGCATTAGTGGGCACTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277732 22 + 636262 ACTGGCATTAGTGGGCACTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 266958 22 + 647215 GCTGGCCTTATTGGGCACTACT + +a +s mr.mrrefChr5 129228 101 + 294542 AGGTAGGTTGCTCCACCTTTTAGTCTAAGTTGTTTCTGACTTCTAGATAAAGTCTCCGCACTATTACGACTGGTACATCCAGTTAAAATGATGGGTCATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277755 101 + 636262 AGGTAGGTTGCTCCACCTTTTAGTCTAAGTTGTTTCTGACTTCTAGATAAAGTCTCCGCACTATTACGACTGGTACATCCAGTTAAAATGATGGGTCATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 266980 101 + 647215 AAGTAGGTTGCTCCACCTTTTAGTCAAAGCTGTTTCTGACTTCTAGATAATATTTCTGCACCGTCACAACTGGTACATCCAGTTATAATGATGGATTATAG + +a +s mr.mrrefChr5 129329 7 + 294542 CCTCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277856 7 + 636262 CCTCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 267112 7 + 647215 CCATTCC + +a +s mr.mrrefChr5 129336 135 + 294542 TGGTGGTATTGTAAGGAGATTATCTAGTACCAACATTTAGCTATAGAGAGACCCCTTACATATATAGTTAATTGCGTCTCACTGTTTGTGGAATTAATGCTTGGCTCTGTCAATCTCAAGCTTCACATTCAATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277863 135 + 636262 TGGTGGTATTGTAAGGAGATTATCTAGTACCAACATTTAGCTATAGAGAGACCCCTTACATATATAGTTAATTGCGTCTCACTGTTTGTGGAATTAATGCTTGGCTCTGTCAATCTCAAGCTTCACATTCAATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 267123 135 + 647215 TGGTGGTATCGTATGGGGATCATCTAGTACCATCATTTATCTATAGAGCTACCTCTCACATGTATAGTTAACTTCGTCACACCGTTTGTAGAATTAACGCTTTGCTCTGTCAATGTCAAGCTTCAAGATCAATGA + +a +s mr.mrrefChr5 129471 57 + 294542 CCCATTATTACATGGGTTTCATTAAGATTTTTAATAGTAGGCCCACAACTGCCTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 277999 57 + 636262 CCCATTATTACATGGGTTTCATTAAGATTTTTAATAGTAGGCCCACAACTGCCTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 267258 57 + 647215 ACCATTATTATATGGGATTCATTTAGATTTTTAATAGTAGACCCATAAGTGCCTCCT + +a +s mr.mrrefChr5 129528 58 + 294542 TCTTCTGTCTATGCTGGGAAGCAGAGCATTTGAGTTAAGTTTACCTGAAGAAATACGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278064 58 + 636262 TCTTCTGTCTATGCTGGGAAGCAGAGCATTTGAGTTAAGTTTACCTGAAGAAATACGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 267315 58 + 647215 TCTTCTGTCTACGATGGGGAGCGGAGCATTTGAGTTTAGTTTACCTGAAGAAATACAC + +a +s mr.mrrefChr5 129586 32 + 294542 TGGCTTCACACCTTGTATCCGGGTTTACACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278123 32 + 636262 TGGCTTCACACCTTGTATCCGGGTTTACACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 267373 32 + 647215 TGGCTTCATACCGTGTACCTGGGTTTACACCT + +a +s mr.mrrefChr5 129618 146 + 294542 ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAAAAGTGTAGATTTTAGGATTGGCATTTAAGCTGAGATGGGACAAGTATCTCGTTTCCATGCCCAATAACAGTCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCCTGCCATCCTAGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278174 146 + 636262 ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAAAAGTGTAGATTTTAGGATTGGCATTTAAGCTGAGATGGGACAAGTATCTCGTTTCCATGCCCAATAACAGTCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCCTGCCATCCTAGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 267405 146 + 647215 ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAGAAGTGTAGCTTTTAGGATTGGCATTGAAGCTGGTATGGGCCAAATATCTTGTTTCCATGCCTAATAACAATCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCTTGCCATTCTAGTTC + +a +s mr.mrrefChr5 129764 6 + 294542 CAGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278320 6 + 636262 CAGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 267552 6 + 647215 CAGGGT + +a +s mr.mrrefChr5 129770 261 + 294542 TTCCCTTAAGAGGCTTGCTGCATAGAGTCCTGTATTTTGCCCTTCTAGTTCTCTCTGCCCGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGCATTTTGAATATCACTTGACCTGGACATCTGGCTATTGCCATAAGAATGGACTAGCAGAGGAGGTCTATATTACTGTAAGTTGCTGCTCACATGAAGCAATACCTTATTATAACAAGCAGGTGGTCTATATGGTACCCTACAATTCAAGATAGTCTCCAAGCATTTCGTCGGCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278326 261 + 636262 TTCCCTTAAGAGGCTTGCTGCATAGAGTCCTGTATTTTGCCCTTCTAGTTCTCTCTGCCCGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGCATTTTGAATATCACTTGACCTGGACATCTGGCTATTGCCATAAGAATGGACTAGCAGAGGAGGTCTATATTACTGTAAGTTGCTGCTCACATGAAGCAATACCTTATTATAACAAGCAGGCGGTCTCTATGGTACCCTACAATTCAAGATAGTCTCCAAGCATTTCGTCGGCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 267559 231 + 647215 TTCCCTTAAGAGATTTGCTGCCTCAAGTCTGTGATTTTACCCTTCTAGTTCTCTCTGTCGGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGTGATTTGAATATCATTTGACCCGGGCTTCTAGCTCTCACTATAAGAATGGACTAGGAGAGGATGTCTAGAATACTGTAGGTTGTTATTCACATGAAACAATACTTTCTTATAACAAGCAGGTGGTCTATAAGGGACCCTACAATT------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 130031 161 + 294542 GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCGGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTACCATGAGAGGAAGTCTAGAACACTGTAAGTGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278590 161 + 636262 GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCAGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTAGTGTGAGAGGAAGTCTGGCACACTGTAAGTGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 267790 86 + 647215 ---------------------------------------------------------------------------AGACCCGGGCTTTTGGCTCTCACCCTAAGAATGGTCTGGGAGAGGAAGTCAACCATGAGAGGAAGTCTAGAACCCTGTAGGTGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 130192 291 + 294542 AACACATGGAACTATAATTTCTTATAACAAGCAGGCAGTCCATAATGTGGCCTACAATCCTCCATACTCTCCAATCATTTGGTTGGCACTAAGCAGCAACTGGATTCATTGTACCACAGTAGGGGTTATTGGAAGTGATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTCCAGGTGGATGGTATATATACCAAGCTGGTGAAAATATTTTTCAAGTCATCTGGTGTGGTTGCTCTTATAGCTTCATTCTTAGTATGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGATCTGAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278751 291 + 636262 AACACATGGAACTATAATTTCTTGTAACAAGCAAGTAGTCCATAATGTGGCCTACAATCCTCCATACCCTCCAATCATTTGGTTGGCATTAAGCGGCAACTGGATTCATTGTACCACAGGGGGGGTTATTGGAAGTAATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTGCAGGTGGATGGTGTATATACCAAGCTGGTGCAAATATTTTTCAAGTAATCTGGTGTGGTTGCTCCTATAGCTTCATTTTTAGTACGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGATCTGAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 267881 285 + 647215 AACACATGGAACTATAATTTCTCATACTACGCAGGCAGTC-----TGTGGTCTATGATCCACCATACTCTCCAATCATTTGGTTGGCACTAAGCAGCAATTGAATTCATTATACCAGAATAGGGGCTATTCGAAGTGATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTCCAGGTGGATGATATATGTGCTAAGCCGGTGAAAATATTTCTCAAGCCAACTGGTGT-GTTCCTCTTATAGCTTCATTCTCAGTATGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGTTCTGAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 130483 49 + 294542 GGTTAACATATGTAGGACCTAAAACACTGAAAAGTAGCAAGTCCAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279286 49 + 636262 GGTTAACATATGAAGGACCTAAAATAATGAAAGCTAGCATGTCCAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 268166 49 + 647215 GGTCAACATATGTAGGACCTAAAACACTGAAAAGCAGCAAGATAAGCAG + +a +s mr.mrrefChr5 130532 66 + 294542 GGGCTTGGGGCTCCTGTAGTCCAGTGTCTCTCAAAGATGGAATAAACTATGTACCAAGTCAATAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279335 66 + 636262 GGGCCTGGGGCTCCTGTAGTCCAGTGTCTCTCAAAGATGGAATAAACTATGTACCAAGTCAATAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 268216 6 + 647215 AAGATC------------------------------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 130598 98 + 294542 CTGAGTTGGTAGGGTTCAATATCTCAATTATGCTCTGTGACAAACAAAATTGTCTGCATTGGGTTGTTCACATGGAGCCCTACCAAGTTGGAGCCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279406 98 + 636262 CTGAGTTGGTAGGGTTCAATATCTCAATTAAGCTCTGTGACAAACAAAATTGTCTGCAGTGGGTTGTTCACATGGAGCCCTACCAAGTTGGAGCCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 268222 97 + 647215 -TGAGTTGGTAAGGTTCAATGTCTCAATTATGCTCTGTGACAAACAAAATTGCCTGGATTCGGTTGTTCACATGGAGCCCTACCAAGTTGGAGCCTCA + +a +s mr.mrrefChr5 130696 38 + 294542 CAAGTGTATGACAAAAAACTTGAAGACAGGGTGACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279504 38 + 636262 CAAGTGTATGACAAAAAACTTGAAGACAGGGTGACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 268320 38 + 647215 CAAGTGTATGACAAAAAACCTGTAGACAGGGTGACACA + +a +s mr.mrrefChr5 130734 126 + 294542 CTAGCTGTCCAGATCAAAACTAGTGGTATGGTCCAAATTACAGTCTAGCCCAGGGCAGCATGGTGCAGACCAAGAGGACAGTATAATGGAGGAAGCCTAAAAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279637 124 + 636262 CTAGCTGTCCAGGTCAGAACTAGTGGTATGGTCCAAATTACA-TCTAGCCCAGGGCAGCATGGTGCAGACCAAGAGGACAGTATAAT-GAAGAAACCTAAAAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 268358 126 + 647215 CCAGCTGTCCAGATCAAAACTAGCGGTATGGTCCAAATTACAGTCTATCCCATGGGAGCATAGTACAGACCAAGAGGACAGTATTATGGAGGAAGCCTAAGAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 130860 171 + 294542 TACATGCCTAATGGAGTTTAACTTGGAGTACTCATGGTCAGTATCAAAGATACTATTGATCCCAGTCCCTCAGCTTCAGGAGGCAGGTTAGGATAACAATGCACTTTGTCAAAAATTTTCTTACAATTATGTCATCAAAAAATGTGTTCCATTCCGCCTTCATCTTGAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279761 171 + 636262 TAAATGCCTAATGGAGTTTAACTTGGAGTACTCACTATCAGTATCAAAGGTACTATGGATCCCAGTCCCTCAGCTTCAGGAGGCAGGTTAGCATAACAATGCACTTTGTCAAAAATTTTCTTACAATTGTGTCATCAAAAAATGTGTCCCATTCCGCCTTCATCTTGAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 268485 171 + 647215 TACATGTCTAATGGAGTTTAACTTGAAATACTCATGGTCAGTATGAAAGATACTATTGATCCCAGTCCCTCAGCTCCAGGATGCAGGTTAGGATAACAATGCACTTTGTCAGAAATTTTCTTACAATTATGTCATCAAAAAATGTGTTCCATTCTGCCTTCATCTTAAACC + +a +s mr.mrrefChr5 131031 79 + 294542 AAAAAACTATATCATTCTACTGTCATATACTTGATGACTATTTGTTTGTGACCAAAACAGTCAATCAACACACATGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 279933 79 + 636262 AAAAAACTATATCATTCTACTGTCATATACATAATGACTATTTGTTTGTGACCAAAACAGTCAATTGACACACACGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 268656 79 + 647215 AAAAAATTTTATCATTCTGGTTTCATACACTTGATGACTATTTGTTGGTGAACAAAAGAGACAATCAACACGCATGACA + +a +s mr.mrrefChr5 131110 277 + 294542 TTCCACCCATTATTAGTTGACTTCAGTAGGTCTGTCTTGTAAACATAAAAGCATTTTCTTTTTCTCTCATGGTAATGGTGGAAGATAGAAGTTCCAAACCATCTATATTTCTATACCACCGTCACCACACATCATTAATTTGCGGGCCAGCTTTTAGTATTGAGTTCTCCAATTCTAATTGTCCAAACATTCTCCTGCTGTCACTGTTCGTCCAGCTTGGGAGCCAGACTGCTGTATTTTGGTCAGGGCATGGCAGAGACATGGCCCTCTGTGATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280058 275 + 636262 TCCCACCCATTATTGGTTGACTTCAGTAGGTCTGTCTTGTAAACATAAAAGCATTTTGTTTTTCTCTCATGACAATGGTGGGAGATGGAAGTTCCAAACCATCTATATTTCTATACCACTGTCACCACAAATCATTAATTTACAGGCCAGCTTTTAGTATTGAGTTCTCCAATCCTAATTGTCCTAACATTCTCCTGCTGTCACTGTTCGGCCAGCTT--GAGCCAAACTGCTATAATTTGGTCAGGGCATGGCAAAGACATGGCCCTCTGTGATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 268735 263 + 647215 TTCCACGCCTTATTAG---------AAAGGTATGTCTTGTAAACATAGGAGCAGTTTCTTTTTCTCTCATGGTAATGGTGGAGGATAGAAATTCCAAACCATTTATATTTCTAAACCTCCGTCACCAAACAT-----ATTTGTGTACCAGTTTTTTGTATTGAGTTCTTCAATTCAAATTGTCCAAACTTTCTCCTGTTGTCACTGTTTGTCTGGGTTGGGAGCCAGACTGCTGTATTTTAGTCAGGGCATAGCAGAGACATGGCCTGCTTTGATTG + +a +s mr.mrrefChr5 131387 94 + 294542 TCCATCAATTCAATCTAGAGCACAGAACAAGAATTACAGTTTGCCAAGGCGGCAAAGTTGGTCATAGATTAACCCTTCCACTACCCATGCCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280333 83 + 636262 TCCATCAATTCAATCTAGAC---ACAACAACAATTAC--TTTGCCAAGGCGGCAAAGTTG--TATAGATTAACCCTTCCACTACTCCTG----G +s simRat_chr6.simRat.chr6 269003 92 + 647215 TCCATAAATTCGATCTAGAGCACAGAACAAGTATCACAGCTTGCCAAGGCAGCAAGGTTGGTCACAGATTAACCCCTCCACTACCCA--CCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 131481 148 + 294542 CTGGGGATTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAACTAGGAACATGAATTGTAAAATTTGACACTATTGGGTTCATGAGCACCCGTCAGATGTGGTCCAAGAGTGCTATAACAATCAATTCAGTGGGGCGAGAGTTAGATCCCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280416 147 + 636262 TAGGGGACTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAA-TAGCAACCTAAATTGTAAAATTTGACACTATTGGGTTCATGAGAACCCGTCAGATGTGGTCCAAGAGTGCTATAACAATCAATTCAGTGGGGCGAGAGTTAGATCCCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 269101 91 + 647215 CTGGGGATTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAACTTGGAGCATGAATAGGAAAATTTGACACTATTGAGTTCATGAGCAC---------------------------------------------------------TCCCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 131629 146 + 294542 AGACTGACCTTGAAGAATTGTGAGGTCTCATGAAGTCAGACTGAGCATCAATTACAGTGAGGGATACATACTGTTTACCACACCCCATGGAGGGAAGGAGCAAAGTATTATTAGTAGCAGGTCTATGTGTTCTGAAATGAGGAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280564 138 + 636262 AGACTGACCTTGAAGA-------GGTCTCATGAAGTCAGACTGAGCATCGATT-CAGTGAGGGATACATACTGTTTACCACACCCCATGGAGGGAAGGAGCAAAGTATTATTAGTAGCAGGTCTATGTGTTCTGAAATGAGGAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 269192 146 + 647215 AGACTGACTTTGAAGGATTGTGAGGTCTCATGAATTCAGACTGAGCATCAATTATAGTGAGGGATACATACTGTTTACCACATCCCATGAAGGGAAGGAGCAAAGTATTGTTAGGAGCAGGTCTATGTGTTCTGAAATGAGGAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 131775 209 + 294542 GAAAGATGGTGCAAAGCGATTGGGAAACATTCACATGTATTAAGGCATTATGTCAACATACACATCAGTCACAATTGTACTAAGAGTCTGGAATAGGGACTCCAGTTTAATATCTGTAAGAATCTACCCGTGAAAACCACAACTAGAGCATGATAAAATGAGTGGCTGACCAATTAGGATGTTTGCCAGTAGAAACTCAAAAGAGCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280702 203 + 636262 GAAAGATGGTG------GGTTGGGAAACCTTCACATGTATTATTGCATTATGTCAACATACACATAAGTCACAGTTGTACCAAAAGTCAGGAGTAGGGACTCCAGTTTAATATCCGTATGAATCTACCCATGAAATGCACAACTAGGGCATAATAAGATGAGTGGCTGACCAATTAGGATGTTTGCCAGTAGAAATTCAAAAGAGCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 269342 200 + 647215 GAAAGGTAGTGCAAAGCAATTGGGAAACATTCACATGTATTAAGGCATTATGTCAACATACAAATCTGTTACAACTGTACTAAGAGTCTGGAACAGGGACTCTAGTTTCATATCTGTAAGAATCTACCCGTGAAAACTCCAACTAGAGCATGATAAAA---------GGCCAACTAGGATGTTTGCCAGTAGAATCTCAAAAGAACAAC + +a +s mr.mrrefChr5 131984 8 + 294542 CAGAGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280944 8 + 636262 CAGAATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 269542 8 + 647215 CAGAGTGC + +a +s mr.mrrefChr5 131992 61 + 294542 TCTATGTAAGATGAAAGTGGCAGCAGCACAACGCCTCCATCTGATGCTAAATAATCTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280954 61 + 636262 TCTATGCAAGATGAAAGTGGTAGCAGCACAATGCCTCCACCTGATGCTAGATAATCTGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 269550 60 + 647215 TTTATGTAAGATGAAAGGAGCAGCAGTAC-ACGCCTCCATCTGATGGTAAATAATCCGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 132053 133 + 294542 GCTGTTTAACATTGAATTAATGCACTACATTTGTTCAGGGGTCCACTGGTGGTACAAGATTCTCTTATCATGATGTTTGTGCACACCTAGTGGTGTCCTACTTTATTTTTTATAAAGGTAATCTAACATCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281015 133 + 636262 GCTGTTGAACATTGAATTAGTGCACTACATTTGTTTAGGGGTCCACTGGTGGTACACGATTCTCTTATCATGATGTTTGTGCACACCTCGTGGTGTCCTACTTTATTTTTTATAAAGGTAATCTAACATCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 269611 123 + 647215 ACTGTTTAACATTGAATTAATGCACTACATTTGTTCAGGGGTCCACTGGTGGTACAAGATTCTCTTATCATGATGTTTGTACACACCTAGTGGTGTCC----------TTTATAAAGGTAAGCTAACCTCTCA + +a +s mr.mrrefChr5 132186 9 + 294542 TGACTCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281148 9 + 636262 TGACTCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 269736 9 + 647215 TGACTCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 132195 178 + 294542 ACTTTATCTTAGTACTCTCCCCCACTTTCCTTCATTTAAAGGCTTGCTGATGGAATGGAATGCAGTACATCAAAGTAGGTGTTTTATTATCCAACCAGCTCTGTTTGCTTAAAGATAACTCACCTTGTTCATCCTCTCTCACTTTGGGGGTATAGAAGATGTTCATCAGATTCCTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281160 178 + 636262 ACTTTATCTTAGTACTCTCCCCCACTTTCCTTCATTTAAAGGCTTGCTCATTGAATGGAATGCAGTACATCAAAGTAGGTGTTTTATTATCCAACCAGTTCTGTTTGCTTAAAGATAACTCACCTTGTTCATCCTCTCTCACTTTGGGGGTATAGAAGATGTTCATCATATTCCTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 269745 170 + 647215 ACTTTATCTTAGTACTCGCCCCCACTTTCCTTCGTTTAAAGGCTTGATGATGGAATGGAATGCAGTTCATCAAATCAGGTGTTTTCTTATCCAACCAGCT--------TTAAAGATAACTCTCATTGTTCTTCCTCTCTCATTTTGGGGGTATAGAAGCTGTTTGTCAGACTCCTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 132373 21 + 294542 ACAAGAGGCGGGCAACTCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281339 21 + 636262 ACAAGAGGTGGGCAACTCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 269915 21 + 647215 ACAAGAGGCGAGCAACTCATC + +a +s mr.mrrefChr5 132394 103 + 294542 CACCTAGAGCTGTCAGTTGTTCACTTCTCCCCATCAGCAGAGGGTGTCATCCATCATCCTTGGTAACAGTGGCGGCAGCAACAATCATGTCACTAGAGGATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281360 103 + 636262 CACCTAGAGCTGTCAGTTGTTCACTTCTCCCCATCAGCAGAGGGTGTCATCCATCATCCTTCTTAACAGTGGCGGCAGCAACAATCATGTCAGTAGAGGATCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 269942 103 + 647215 CACCTCAAGCTGTCAGTTTTCAGGCTCTCACCTTCGGCAGAGGGTGCCATCCATCATCCTTGGTAATAGTGATGGCAGCAACAATCATGTCACTAGAGCATCA + +a +s mr.mrrefChr5 132497 21 + 294542 TTTCCTTATTATCATATGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281463 21 + 636262 TTTCCTTATTATCATATGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 270052 21 + 647215 TTTCCTTATTATCATATGCCT + +a +s mr.mrrefChr5 132518 95 + 294542 GAGTTGTGGTAAGCACTAACCCCAGACTTCAGACTGAAGATATCAGAATTTGTAGCTCAGGTTTTTCACAATCACAAACTGCCATCGAAAAGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281497 95 + 636262 GAGTTGTGGTAAGCAGTAAGCCCAGACTTCGGAATGAAGATATCAGAATTTGCAACTCAGGTTTTTCACAATCACAAACTGCCATTGAAAAGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 270073 95 + 647215 GATTTGTGACAAGCACTAACCCCAGACTTCAGACTGAAGATATCAGAATTTGTAGCTCAGGCTGTTCACGATCACAAACTGCCATCGAAAAGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 132613 20 + 294542 GACTGAATTCATGGTCCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281596 20 + 636262 GACTAAATTCATGGTCCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 270168 20 + 647215 GGCTGAATTAATGGTCCCTT + +a +s mr.mrrefChr5 132633 108 + 294542 CAACAGACAATACATATTATAAGGTGAGTGGCCCAAATAATTTGGTAAATGAGCAGCAAGAACAGAAGCATAACCCATGGAGTATGTACTGTGTTGGTAATTAAGGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281631 108 + 636262 CTACAGACAATACATATTATAAGGTCAGTGGCCCAAATACTTTGGTAAATGAGCAGCAAGAACAGAAGCATAACCCATGGAGTATGTACTGTGTTGGTAATAAAGGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 270188 106 + 647215 CAACAAACAATACATATTATAAGGTGAGTGGCCCAAATGATTTGGTAAATGAGCAGCTAGAACAGAAGCATAATCAATGGAGTACAAAT--TGTTGGTAACTAAGGAC + +a +s mr.mrrefChr5 132741 218 + 294542 AAGCAAATCATAATTTGCTGCTCCAGTATGATAGGGGATATAGAAGTGTTTAAGGGCCCTGGAGTCCTGTAATCAACATCTAACTTAAAAGTCCCTATAGCCCTATGTTATAGCTTTAGTACCCAACCCACTAAATACTCTTGGTATCTTGAAACATAAGTATTTCATAAGCTTATCATCTTTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGGTAATACCCTGTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281742 218 + 636262 AAGCAAATCATAATTTGCTGCTCCAGTATGATAGGGGATATAGAAGCGTTTAGGGGCCCCGGAGTCCTGTAATCAACATCTTATTTAAAAGTCCCTATAGCCCGATGTTATTGCTTTAGTACCCAACCCACTAAATACTCTTGGCATCTTGAAACATAGGTACTTCATAAGCTTATCATCTCTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGGTAATACCCTGTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 270294 218 + 647215 AAGCAGCTCATAATTTGCTGGCCTAGTATGATAGGGGATATAGTAGTGCTTAAGGGCCCTGGAGGCCTCTAATCAACATCTAACCTAAAAGTCCCTATAGTCTTATGTTATAGCTTTAGTACCCAACCCATTAAATACTCTTGGTATCTTGAAACATTAGTATTTCATAAGCTTATCATCTTTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGATAATACTCTGTACT + +a +s mr.mrrefChr5 132959 69 + 294542 TATGATACACTTGAAGGAAAATAGTTCTGTGATCATAAATTGCAGGAGACTGCCCAGGAATAATAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 281962 69 + 636262 TATGATACACTTGAAGGAAAATAGTTCTTTAATCATAAATTGCAGGAGACTGCCCAGGAATATTAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 270512 69 + 647215 TATGATAAACTTGAAGGAAAATAGTTCTGTGATCATAAATTGCAGTACACTGGCCAGGAAGAACAGGGG + +a +s mr.mrrefChr5 133028 347 + 294542 AAGGAAGATCTTTATGAATGGTAGGTATGCTTACATACCCAGATTGCCCCCATTCACCCTCAGCATCTTAGGGATATGCACAATAAGGCTTGTTGGAGCTCTTAACACGATAAGCTTTCCTGTTCTTGTCCACCAGTTATTGGGTAACTGTTACAATGATGTATTAGCAGGATGGGACCAGCCTCTGGTGAAAGTATTAGGGCATTAATATTCATTTTTAAGCCTGTACCTTCCATGACTCACCTAAGTAGCTCTCCCATCACCTTTATGACTAGATGGCCCTATGTCAGCTCATATCTGCCATTAGATCCAATTAATAAGACCATGAAACAGCTAATGGTCAAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282042 347 + 636262 AAGGAAGATCTTTATGAATGGTAGGTATGCTTACATACCCAGATTGCCCCCTTTCACCCTCAGCATCTTGGGGATATGTACAATAAGGCTTGGAGGAGTTCTTAACACAATAAGCTTTTCTGTTCTTGTCCACCAGTTATAGGGTTACTAGTATAATCTTGTAATAGCAGGATGGGACCAGCCTCTGGTGAAAGTATTAGGGCATTAATATTCATTTTTAAGCCTGTACCTTCCATGACTCACCTAAGTAGCTCTCCCATCACCTTTATGGCTAGATGGCCCTACGTCAACTCATATCTGCTGTTAGAGCCAATTAATAAGACCATGAAACAGCTAATGGTCAAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 270581 254 + 647215 AAGTAAGATCTTTATGTATGGTAGGTATGCTTACATACCCGGATTGCCCCCATTCACCCTCAGCATCTTAGGGGTATGCACAATCAGGCTTGTTGGAGCTCTTAACACGATAAGCTTTCCTGTTCTTGTTCCCCAGTTATTGGGTAGATGTTACAATGATGTATTAGCAGGATGGGACCAGTTTC----------------------------------------------------------------------------------ATTACTAGACTGCCCTATGTCAGCTCATATCTGCCATTAGATCCAATTAATAAAACC-----ACAGCTACTGGT------ + +a +s mr.mrrefChr5 133375 88 + 294542 GAGAGTGAGCCAATGATACAACATGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGCCCGTCAAATTTATTCCTGAGGCTGAAGTTTAACAGTGACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282408 88 + 636262 GAGAGTGAGCCAATGATACAACATGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGCCCATCAAATTTATTCCTCAGGCTGGAGTTTTACAGTAACACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 270835 70 + 647215 ------------------CAACGTGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGTGTGTCAAATGTATTCCTGAGGCTAAAGTTGAACAATGATATT + +a +s mr.mrrefChr5 133463 28 + 294542 CTAAATAGTGCATGGAAGTTCCAGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282497 16 + 636262 CTAAATAGTGCATGGA------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 270905 18 + 647215 ----------CATGGAAGTTCCAGCACA + +a +s mr.mrrefChr5 133491 56 + 294542 CCACTAGATACCTAACCTTGGTTGGGTTCTAAACAAACACAAAGAATAACCAACGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 270927 56 + 647215 CCACTAGATACCTAACCTTGGTTGGGTTCTAAACAAACACAAAGAATAACCAACGA + +a +s mr.mrrefChr5 133547 20 + 294542 GATTTCCTGTGCTGACTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282513 20 + 636262 GATTTCCTGTGCTGACTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 270986 20 + 647215 GACTTCCTGTGCTGCCTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 133567 22 + 294542 ATGAATTGCTCTGCATTGTGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282533 22 + 636262 ATGAGTTGCTCTGCATTGTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 271009 22 + 647215 ATGAATTGCTCTGCATAGTGAC + +a +s mr.mrrefChr5 133589 138 + 294542 TCTTACTTGTGCCATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAATCTTTGCAGCTAAACCCACCTCTCAATTTTTAGTGATCGTGCTTTGAGCTAGAAATACAGTAATATTTCTTGGACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282555 133 + 636262 -----CTTACGCCATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAATCTTTGCAGCTATACCCACCTCTCAGTTTTTAGTGATCATGCTTTGAGCTATAAATACAGTAATATGTCTCGGACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 271032 138 + 647215 TCTTACTTGTGCGATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAACCTTTGCAACTAAACCCACCTCTCAATTTTCAGTGATCGCACTTTGAGCTGGAAATACAGTAATATTTCTTGGACAG + +a +s mr.mrrefChr5 133727 79 + 294542 CTGTGTTCTGGATAGGATAGTGCCACTAGCTCTAGTGTTATGAGAGGTTGTATCAATTAACATAGATAGAATCTTGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282692 79 + 636262 CTGTGTTCTGGATAGGATAGCACCACTAGCTCTAGTGTTATGAGAGGCTGTATCAATTAACATATATAGAATCTTGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 271170 74 + 647215 CCGGGCTGT-----GGATAGTGCCACTAGCTCTAATGTTATGAGAGGTTGTAGAAATTAACATAGATAGAGTCCTGATA + +a +s mr.mrrefChr5 133806 32 + 294542 TGAATATCATTGTTCTGCTAGCATTGTGTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282771 32 + 636262 TGAATATCATTGTTCTGCTAGCATTGTGTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 271248 32 + 647215 TGGATATCAATGTTTTGCTAACATTGTGCAAC + +a +s mr.mrrefChr5 133838 55 + 294542 CTCACTCTCTACCTCGCAATCATTATAATTATATCATTCCAATGACTCATCTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282803 55 + 636262 CTCACTCTCTACCTCACAATCATTATAATTACATCATTCCAAAGACTCATCTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 271283 55 + 647215 CCCACTCACTACCTCGCAATCATTATAATTATATCATTCCAATGACTCATCTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 133893 26 + 294542 ACTTGTACAGGTAAACCTAAAGTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282864 26 + 636262 ACTTGTACAGGCAAACGTAAAGTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 271338 26 + 647215 ACTTGTGCAGGTAAAACTAAGGTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 133919 32 + 294542 GTCAGGGAAGATGGAAAGAAGGCAGAGAGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282890 32 + 636262 GTCAGGGAAGATGGAAAGAAGGCAGAGAGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 271392 32 + 647215 GTGAGGGAACATGGAGATGAGGCAGAAAGGAA + +a +s mr.mrrefChr5 133951 422 + 294542 TCCTGTCTACCGATGCCAAGGAGCGGTCATGATATCAGTGAAAGTTCACTCTGTGTCTGTTGAGTGGTGTTATAGAATGCCAGTGAAGGCCAAACTCTTGCTTAACTCAAGGCAAGAAGGAAATCTAGACATGGGCACAATAGAGCGGCTTCCAATGTACCTGTAGGAGAGTTTTGGATGAACTACCCTATATACCTCTATGCCAAGAAGGAGGCAATCAGTGCACACAGTACGGAGTGTTCCTGAGTTGGAATAACTTCATGGACAGATGGATAAATTAGGAAGGGGAGAGAGTAGAGACAACCAGTTCTTATTCTCCTGAAGACAGAATGTAGGCCAGAAATAGTACCAGGTTAGGCAGGCATTAGCTCAACATATTGCATCCAATGATCGGTGTGGTATTGCATAGGCTGCCCATTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 282925 420 + 636262 TCCTGTCCAAAGATGCCAGGGAGTGGTCATGATATCGGTGAAAGTTCACTCTGTGTCTGTTGAGTGGTGTTATAGAATGCCAATGAAGGTCAAACTCTTGCTTAACTCAAGGCAAGAAGGAAATCTAGACATAG--ACAATAGAGTGGCTTCCAATTTACCTGTAGGAGAGTTTTGGATGAACTGCCCTCTGTACCTCTATGCCAAGCAGGAAGCAATCAGTGCACACAGTACGGAGTGTTCCTGGGTTGGGATAGCTTCATGGACAAATGGATAAATTAAAAAGGGGAGAGAGTAGAGTCAACCAGTTCTCATTCTCCCGGAGACAGAATGTAGGCTAGACATAGTACCAGGTTAGGCAGGCAGTAGCTCAACATATTGGATCCAATGATTGATGTAGTATTCCATAGGCTGCCCATTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 271424 422 + 647215 TCCTCTCTACCGATGCCAAAGAGCGGTCATGATCTCAGTGAAAGTTGGCTCTGTGTCTGTTCAGTGGTGTTGTAGCATGCCAGTGGAGGCCAAACTATTGTTTAACTCAAGGCAAGAAGAGAATCTGGACATGGGCACGATAGAGCAGCTTCCAATGTACCTGGAAGAGAGTTTTGGATGAACTACCCTATATACCTCTATGCCATGAAGGAGGCAATCAGTGCACACAGTAAGAAGTGTTCCTGAGTTGGAATAACTTCATGGACAGATGGATAAATTAGGAAGGGGAGAGAGTAAAGACAACCAGTTCCTATTCTCCTGAAGACAGAATGTGAGCCAGGAGTAATACCAGGTTAGGCAGGGATGAGCTCAACACATTGCATCCAATGATCGGTGTGGTATTGCATGGGCATCCCATTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 134373 71 + 294542 GTCATACTTTGGTACCCAGCAGTCTTTATGGTTGTCATAGGTTACCTTATATAGGAATGCCTGAAAGTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283345 71 + 636262 GTCTTACTTTTGTACCCAGCAGTCATTATGGTTGTCATGGGTTACCTTATATAGGAATGCCTGCAAGTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 271847 71 + 647215 GTCATATCTTGGTACCTAGCAGTCTTTATGGTTGTCATAGGTTACCCTCTCTAGGAATGCCTGAAAGTGCC + +a +s mr.mrrefChr5 134444 148 + 294542 TGAGGATAGAAATAGACTGGAATGTCCACTCAAATATGATGGCTAATAATCATAAAAGTTTGTAGAATTTGTCCCACCCCTCTCAGAAGGCTGTGCAACTTCTGTGTAAATGGATGAGAAGTGGCCTCCATATCAACAACCACATGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283418 64 + 636262 TGAGGATAGAAATTGACTGGAATGTCCACTCA------ATGGCTAATAATCATAAAAGTCTGTAGAATTT------------------------------------------------------------------------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 271918 148 + 647215 TGAGGATAGAAATAGACTGGATTGTCCACTCAAATATGATGGCTAATAATCATAAGCATTTGTAGAATTTGTCCCACCCCTCTCAGAAGGCTGTGCAACTTCTGTGTAAATGGATGAGAAGTGGCCTCCATATCAACAACCACATGAT + +a +s mr.mrrefChr5 134592 74 + 294542 TGTATGACCTTAACCCAAAACTAAGATCAATATTCTACTGTCTAGATGGTGTTAAGTTAAGAAGTGCGTAAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283482 32 + 636262 ------------------------------------------TGGATGGTGTTAAGTTAAGAAGTGCGTAGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 272068 74 + 647215 TGTATGACCTTAACCCAAAACTAAGATCAATATTCTACTGTCTAAATGGTGTTAAGTTAAGAAGTTCATAAATC + +a +s mr.mrrefChr5 134666 78 + 294542 ATACTAGTATATAGGCAGCATTTTGGTGTGAAGCTTCAGCATGCTTACATGGATAGATGGGTGATACTGATTACCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283711 7 + 636262 ATACTAG----------------------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 272142 78 + 647215 ATACTAGTATATAGGCAGCATTTTGGTGTGAAGCTTCAGCATGCTTACATGGATAGATGGGTGATACTGATTACCATG + +a +s mr.mrrefChr5 134744 116 + 294542 GCTACTTTGTCATCAAGCCTTTGCTCTTAAAACTAAGGCTGGGCTTTTACTGTTAAGTAATCCTGAGTCGTTGATAAGCCATGGGAAATGGAACTAAGCCTATCTGGTAATTACGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 272221 116 + 647215 GCTACTTTGTCATCAAGCCTTTGCTCTTAAAACTAAGGCTGGGCTTTTACTGTTAAGTAATCCTGAGTCGTTGATAAGCCATGGGAAATGGAACTAAGCCTATCTGGTAATTACGA + +a +s mr.mrrefChr5 134860 19 + 294542 ACAAACCAGACCACTACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283718 18 + 636262 -CAAACCAAACCACTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 272342 19 + 647215 ACAAACCAGGCCACTCCAA + +a +s mr.mrrefChr5 134879 214 + 294542 ATGCCAGTCACTATGTTGGCTACAGATGACGTTATTAATTTGGCTAAAGATGACCTTAGTCATGATCTGAGCCCTGAACAGCTGGAAATGTGGGTATTCTTCATCTGTCCTCAAAGAATGGAATGTTTTTATGGGTTTACCTGATTGCTGCATATTTGGAGACTGACCTCTAAACTCTTGTCCATCTTTATGTCTTGATTCACAGCATCTAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283738 213 + 636262 ATGCCAGTCTCTAATTTGACAATAGATGACATCATTAGTTTGGCTAAACATGACCTTAGCCATGGTCTGAGGCCTGAGCAGCTGGAATTGTGGGTATTCTTCATCTGTCCTCAAAAAATGGAATATTTTGATGGGTTTACCTGATTGCTGCATA-TTGGAGACTGACCTCTAAACTCTTGTCCATCTTTATGTCTTGATTCACAGCATCTAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 272361 214 + 647215 ATGCTGGTCACTATGTTGGCTACAGATGACGTTACTAATTTGGCTAGAGATGACCATAGTCATCATCTGAGCCCTGAACAACTGGAAAAGTGGATATTCTGCCTCCGTTCTCTAAGAATGGAATGTTTTTGTGGGTTTACCTGATTGCTGCATATTTGGAGACTGACCTCCAAACACTAGTCCATCTTTATGTCTTGATTCATAGCATCTAGGA + +a +s mr.mrrefChr5 135093 83 + 294542 GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCCAGACTCAAATAATGCCTGCATTTCATAGCTGATGCCTACACAGGGGAAAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 283952 83 + 636262 GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCCAGACTCAAATAATGCCTGCACTCCATACCTGATGCCTACACAGGGGAAAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 272575 77 + 647215 GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCAAGACTTAAATAATGCCTGCTTTTCACAGCTGATGCCTTCACAGGGG------ + +a +s mr.mrrefChr5 135176 42 + 294542 AGGCACAGGAATAGATGAGGGCTGGGATCTTAGAAACAGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284048 42 + 636262 AGGCACAGGAATAGATGAGGGCTGGGATCTTAGAAACAGGAT + +a +s mr.mrrefChr5 135218 21 + 294542 GAGAATGAATTCGAAACAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284156 21 + 636262 GAGAATGAATTCGAAACAATG + +a +s mr.mrrefChr5 135239 28 + 294542 AATGAGTTTAAGGAAGAATAGTCTCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284178 28 + 636262 AATGAGTTTAAGGAAGAATAGTCTCTTA + +a +s mr.mrrefChr5 135267 16 + 294542 CAGTACCATTGTATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284207 16 + 636262 CAGTACCATTGTATCT + +a +s mr.mrrefChr5 135283 346 + 294542 TGTGGCTGAAGTAACTTGCACAGTTAACATGGTAAAGGATGCCACCTACAGGCATTAAGCTAATCCTAACATCTGAGGCACTATCTGAGAACTGTGTAATGGAGGGAGAGTAATCATGTCAAGTTGGAGATTAGTTGGAATATACAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGTTAGTATATACAAGAATCTCTCTCTTTGATTTTCTGGTACATGTTGCTTACAAAACCTTTGCCCTGACAGGAGTCAAAAAAGGACCACTGGAATACTACATGGAAGTTTTCAGGATTGCAATATACTACTATCAGACAGATGGAAAGAATGGGGGTTTGATGCTTGGGTACTTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284235 342 + 636262 TGTGGCTGAAGTAACTTGCACAGTTAATATGGTAAAGGATGCCACCTACAGGCATTAAGCTAACCCTAACATCTGAGGCACTATCTGAGAATTGTGTAATGGAGGGAGAGTAATCATGTCAAATTGGAGATTGGTTGGAATATGCAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGTTAGTATATACAAGAATCTCTCTCT----TTTTCCGGTACATGTTGCTTGTGGAACCTTTGCCCCAACAGGAGTCAAAAAAGGACCACTGGAGTACTACATGGTACTTTTCAGGATTGCAATATACTACTATCAGACAGATGGGAAGAGTGGGGGTTTGATGCTTGGGTAATTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 272652 320 + 647215 ------------------------CAACATGGTAAAGAATGCCACCTACAGGCATTAAACTAATCATAATGTCTGAGGCACTATCTCAGAACTGTGTAATGGAGAGGGAGTAATCATGTCAAGTTGGAGGTTAGTTGGAATACACAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGGTAATATATACAAGAATCCTTCTCTTTGATTTTCTGGTACATGTTGCTTACAAAACCTTTGCCTTGACAGCAGTCTATAAAGAACCACTGGAATATTACTTGGAAGTTTTTAGAATTGCAATATATTACTACCAGAAAGATGGAAAGGAG--GGGTATGATGCTAGGGTACTTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 135629 73 + 294542 ATGTGCAGTGGTTCTACCACTTGTGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284577 62 + 636262 ATGTGC------TTTACC-----TGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 272977 73 + 647215 CTTTGCAGTGGTTCTTCCACTTGTGCCACTGTATTAGTCTTGCAAACTCAGTCGCTGCAAGGTGAATCTCTGT + +a +s mr.mrrefChr5 135702 55 + 294542 ACCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284639 55 + 636262 GCCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 273051 55 + 647215 ACCCTTTACAGCCATGAGTACTATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAGCTCTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 135757 68 + 294542 CCTACTTACTCGAACAGAGCTCATTTTGCAACTGTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284694 63 + 636262 CTTACATACTTGAACAGAGCTCATTTTGCAGCTGTACTTGATCGACCTAGGTAGCCAGAGCTA----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 273107 68 + 647215 CCTACTTTCTCGAGCAGAGCTCATTTTGCAACTTTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG + +a +s mr.mrrefChr5 135825 348 + 294542 CTTTATGCATGACTTGGGGTTGCTATAAAGGAAAATAGTGACAGATTTATTGATTCCATGTCTTGGATAATTGGAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGACGGAAGGCCATGAACATACCTCTCCAGCATTGTTTCTGAACATTTTGGGTGGCCCAGGGCAGTGTAGAATGTGTGATCATATCTTGAGGAAGTGCTTCCATGTTAGTAGAAGAAGATAGCCAATTATTGCCAAAAACATACGGTTCCAGTTCAGGTCCTCTTTTTAAGCAGATGGGGGGTGCCATAAACCATAAGTTATGTCAGAATGACATTAAGGGCCCTAGGTTGACTTTTATTCTCCTCTAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284757 337 + 636262 ----------GACTTGGGGTTGTTATAAAGGAAGATAGTGACAGATTTACTGATTCCAGGTCTTGGCTAATTGAAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGACGGAAGGCCATGAACATACCTCTTCAGCAGTGTTTCTGAACATTTTAGGTGGCCTAGGGCAGTA-AGAATGTGTGATCATATCTTGAGGAAGTGCTTCCATGTTAGTGGAAGAAGATAGCCAATTATTGCCAAAAACATACGGTTCCAGCTCAGGTCCTCTTTTTAAACAGATGGGGGGTGCCATAAACCATAAGTTATGTCAGAATGACAGTAAGGGCCCTAGGTTGACCTTTATTCTCCTCTAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 273181 339 + 647215 CTTTATGCATGACTTGGGTTCACTATAAAGGAAAATAGTGACAGATTTATTGAGTCCATGTCTTGGAAAATTGGAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGAAAGAAGGCCATGAACATACCTCTCCAGCATTGTCTCTGAACACTTTGGGTGGCCCAGGGCAGTGTAGATCGTGTGATCATATCTTACAGAAGTGCTCCCATGCTAGTAAAAGAAGATAGCTGATTATTGCCACAAACATACAGTTCCTGTTCAGGCCCTTTTTTTAAGCAGATGGGAGTTGCTATAAACCATAAGTTATGTCAGACTGACATTAAGGGCCCTAGGTTGACTTTTGTTCT--------- + +a +s mr.mrrefChr5 136173 27 + 294542 AACATTGACTTTTATTCTACTCTAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285095 27 + 636262 AACATTGACTTTTATTCTACTCTAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 273520 24 + 647215 ---ATTCACTTTTATTCTACTCTACGG + +a +s mr.mrrefChr5 136200 257 + 294542 AACTTCTTCCAAGTGCCACTGCTATCAGCTAGTGCCTTACCTTGTGATTGCCAGAACATCAGTCTACACTCACAGAATGTCTCCTGTAACCAAATTAACAAAATTAACCTTAACAAAACTAACCTTACTGAAGGTCCTTAGTCTCTTTTATGTGTTTAACATGCAGTTAACAACTTGTTAGCTTACAATTGTTGGACACAATAATATTGCCAGTGTAACCCATTCAAGTCATATAATTTGTTGTCTCATCAGCCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285122 242 + 636262 AGCTTCTTCCAAGGGCCACTGCTATTAGCTAGTGCCTTACCTTGAGATTGCCAGAACATCAGTCTACACTCACAGAATGTCTCCTGTAGCCAAA---------------TTAACAAAACTAACCTTACTGAAGGTCCTTGGTCTCTTTTATGTGTTTAACATGCAGGTAACAACTTGTAAGCTTACAACTGTTGGATACAATGATATTGCCAATGTAACCCATTCAAGTCGTATAATTTGTTGTCTCATCAGCCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 273549 252 + 647215 AACTTCTTCCTAGTGCCACTGCAATCAGCTAGTGCCTTACTTTGTGACTGCCAGAACATCTGTCT---CTCACACAATGTCTCCTGTAACTAAATTAACAAAATTAACCTTAACAAAATTAACCTTACTGAAGGTCCTTAGTCTGTTTTATGCGTTTAACATGCAATTAACAGCTTGTTA--TTACAATTGTTGGACACAACAATATTGCCAGTGTAACCCATTCAAGTCATATAGTTTGTTGTCTAATCAGCCAAC + +a +s mr.mrrefChr5 136457 4 + 294542 TACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285364 4 + 636262 TACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 273802 4 + 647215 TACT + +a +s mr.mrrefChr5 136461 13 + 294542 AACTGATGTAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285373 13 + 636262 AACTGATGTAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 273806 13 + 647215 AACTGATGTAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 136474 212 + 294542 AATTGACCATTCTAGCTAACTTGATGGTTTCAATCCGGGTAAGGTCATAGGTCAACAGTAGTGGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGGTGGGAAATGCAACTGAGAATGTTAGACGCAACCTAGCCCTAGAAATAAATGGATGAATGAACGGGCAATCTAGAAGTTAACGGATGAACAAACGGACGAAATCATCTCACTATCACCAGGGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285386 212 + 636262 AATTGACCATTCTGGCTAACTTGATGGTTTCAATCCGGGTAAGGTAATAGGTCTACAGTAGTGGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGATGGGAAATGCAGCTGAGAATGTTAGACGCAACCTAGCCCTAGAAATAAGTGGATGAATGAACGGGCAATCTAGAAGTTAACGGATGAACAAACGGACGAAATCATCTCACTATCACCAGGGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 273832 212 + 647215 AGCTGACCATTCTAGCTAACTTGATGGATTCAATCAGCGTAAGGTCATAGGTCAACAGTACTAGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGGTGGGAGATGCAACTGAGAATGTAAGATGCAACCTAGGCCTAAGAATAAATAGATGAGTAAACAGGCACTCTAGTAGTTAGTGGATGAACAAATGGACAAAATCTTCTGATGATGGACAGTGGGA + +a +s mr.mrrefChr5 136686 81 + 294542 CCAACATCCAAGTATCTGGAGTTTGGTAATTATGGAGACTTGCAGGGCCTTTTAGTAGTCTTACATCAAACTATTAGGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285600 81 + 636262 CCAACATCCAAGTATCTGGAGTTTGGTAATTATGGAGACTTGCAGGGCCTTTTAGTAGTCTTACATCAAACTATTAGGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 274044 81 + 647215 CCAACATTCAGGCATCTGGAGTATGGTAACTATGGACACTTGCAGGGCCTTTTAAATGTCCTATGTCGAGCTATTGGGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 136767 9 + 294542 GTACAGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285682 9 + 636262 GTACAGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 274125 9 + 647215 GTACAGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 136776 43 + 294542 TCCAAAGGATGACAAGAGTAGACCAATACCTTTTAATTGTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285691 43 + 636262 TCCAAAGGATGACAAGAGTAGACCAATACCTTTTAATTGTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 274145 43 + 647215 TTCAAAGGATGGCAAGAGTAGACCAATACCTTTTAATCGTCCT + +a +s mr.mrrefChr5 136819 147 + 294542 ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAGTGCGCAGACCCAAAGGATGTCAAGAGTAGACCAATGCAATAGATTGCGTAGTTAGCAACAGGCAGCTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGAAGGTTGTGTCATCCTGACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285734 147 + 636262 ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAGTGCGCAGACCCAAAGGATGTCAAGAGTAGACCAATGCAATAGATTGCGTAGTTAGCAACAGGCAGCTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGAAGGTTGTGTCATCCTGACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 274190 147 + 647215 ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAATACACAGATCCAAAGGATAGTAAGAATAGACCAATGCAATAGACCACACAGATAGCAACTGGCAACTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGACTGTTACAGCAGCCTGACCTT + +a +s mr.mrrefChr5 136966 133 + 294542 GTCTTCTGAATCAGGCAATATATTAATTTTAATAGAAAGATTTTAAGGTCAGGGGCATCTTATCTTTGCCAAAATGAAGGTTAATGATACATTACAATTTTCAAGTTGCTCAGCTGAGAAGGTTAAGACCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285881 133 + 636262 GTCTTCTGAATCAGGCAATATATTAATTTTAATAGAAAGATTTTAAGGTCAGGGGCATCTTATCTTTGCCAAAATGAAGGTTAATGATACATTACAATTTTCAAGTTGCTCAGCTGAGAAGGTTAAGACCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 274341 133 + 647215 GTCTTCTGAATCAGCCAATATATTAATATTCACAGAAAGATTATAAGGTCAGGAGTATCTTACTTTTGCCAAACTGAAGATTTACTGAACATTACAAGTTACAAGGTGCTCAGCTGAGAAGGCTAAGACGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 137099 170 + 294542 CAAGTCCAGCACTTTATTTTGTTTAGGCACTGGACTCTTCATAGCCACTAGAGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAACTCCTCCGCTATCAGTATCTTCATCTACAGGTCCAGTCCTTCAATCGTCTTTCCATCAGGACCCTCATTGTGGACACAGGCGCAGATTCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286031 170 + 636262 CAAGTCCAGCACTTTATTTTGTTTAGGCACTGGACTCTTCATAGCCACTAGAGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAACTCCTCCGCTATCAGTATCTTCATCTACAGGTCCAGTCCTTCAATCGTCTTTCCATCAGGACCCTCATTGTGGACACAGGCGCAGCTGCCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 274474 170 + 647215 CAAGCCTAGCATTTTGTTTCATTTGGGCAGTGGGCTCTTCATAGCCACCTGTGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAATTCCTGCTCTATCAGTATCTTCACCTACTGGATCAGTCCTTGAATTTTTTCTCCATCAGGGCCCTCATTGTGGACTCAGGCCCAGAGTCCCC + +a +s mr.mrrefChr5 137269 32 + 294542 TAAATTCCAGATGCTTAAGGATCAGGTCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286204 32 + 636262 TAAATTCCGGATGCTTAAGGATCAGGTCTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 274644 32 + 647215 TAAATTCCAGATGCTTAAGGATCAGGTCTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 137301 97 + 294542 GATATCTGATGCACAATAATTTTCTATCAACCTAATTTCCTATCCACTGTCTCAATGATCTCTTTAGATCTGGATATGTGAAATCTTAGTTACAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286264 97 + 636262 GATATCTGATGCACAATAATTTTCTATCAACCTAATTTCCTATCCACTGTCTCAATGATCTCTTTAGATCTGGATATGTGGAATCTTAGTTACGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 274676 29 + 647215 GAAATCCT--------------------------------------------------------------------TGTGAAATCTTTGTTACAACG + +a +s mr.mrrefChr5 137398 15 + 294542 CAAAGGGATCACTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286362 15 + 636262 CAAAGGGATCACTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 274705 15 + 647215 TAAAAGGATCACTAA + +a +s mr.mrrefChr5 137413 256 + 294542 TAGGTTACTATCCTCCAAGTGACTGTATGGACTTCAAATAACCAATTAGTTAACGGGTCAAGTGTTCAAAATTTTCAGACTCCAACTGCCATGGCAATTCTGCTGACATACCTCCATGCACATTCAAGGAACTCAAGGCGTCTGATGGCCATACAATTAAATCATGGCTTGGAAAATTCTACTTCCTGCAACTTCAAGAAAGGCCTTGAACCCGATTAATAAGTACCCCACAAACCCACCTTTACTTGCCACTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286396 254 + 636262 TAGGTTACTATCCTCCAAGTGACTGTATGGACTTCAAATAACCAATTAGCTAACAGGTCAAGTGTTCAGAATTTTCAGATTCCAACTGCCATGGCAATTCTGCTGGCAAACCTCCATGCACATTCAA--AACTCAAGGCATCTGATCGCCATACATTTGAATCATGGCTTGGAAAATTCTACTTCCTGCAACTTCAAGAAAGGCCTTGAACCCGATTAATAAGTATCCCACAAACCCACCTTTACTTGCCACTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 274720 224 + 647215 TAGGT--------------------------------ATAACCAATTAGTTAACGGGTCAAATGTTCAAAGTTTACAGACTCCCACTGCCATGCAAATTCCGCTGACATACCTCAATGCACACTGAAGGAACTCAAGGCGTATGATGGCCATACAATTAAATCACGGCATGGAAAATTCTTCTTCCTGCAACAGCAAGAAAGGCCTTGAACCCATTTAGGAAATACCCCACAAACTCGCCTTTACTCACCACTATC + +a +s mr.mrrefChr5 137669 58 + 294542 TTCCCTTACTTGGTTCCCTTACAATCACCCCTATGTAATGCAATCAATCAAAGTGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286650 58 + 636262 TTCCCTTGCTTGGTTCCCTTACAATCACTCCTATGTAATGCAACCAATCAAAGTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 274948 56 + 647215 TTCCTTTACTTGGTTCCGTTACAATCACC--TATATAATGCAATCGATCAAGATGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 137727 13 + 294542 AGGGACATCACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286710 13 + 636262 AGGGACATCACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 275004 13 + 647215 AGGGACATCACTG + +a +s mr.mrrefChr5 137740 357 + 294542 TGTCTGAGTTGAGCATTGCAACTTGATAACAATTTCTTACAGTACATACTCTCCTAGACATCAAACATAAGACAAGACTGCCACACACATTCACTATACAGTACCTGTTCTGCTCCCAAAACAAGGGTTATGGTTACCAGAGGTTTTTATAAAAAATTGTCTTCTGAATCTGGAATTTATGCCCTGCTCCACATACCTATTTACTAGATGGTACCAGGCTTCACCAGTAATCCCTGTTGTAGGCTCCCAGTGAAATATCTAGTCTTGGTATTTTATAACTGTCTAATAAGGGATAGTTCAACCCAGAGTCGCAGCTTATTACAGTCATTTCGAGAAGCCATCCACTGGTAAATTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286724 328 + 636262 TGTTTGAGTTGAGCATTGCAACTTGATA--------------------------TAGACACCAAACACAAGACAAGACTGCCACACACATTCACTATACAGTACCTGTTCTGCTCACAGAACAAGGGTTATGGTTACCAGACATTTTTATAAAAAATTGTCTTCTGGATCTGATATTTATGCCCTGCTCCACATACCTATTTACTAGATGGCACCAGGCTTCACCAGTAATCCCTGTTGTAGG-TCCCAGTGAAATCCCTAGACTTGGTATTTTATAACCGTCTAATAAGGGATAATTTAACCCAGAGTCGCAGCTTATTACAGTCA--TCGAGAAGCAGTTCACAGGCAAATTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 275017 357 + 647215 TGTCTGAGTTGAGCATTGCAACCTGATAACAATTTCTTACAGTACATACTCTCCTAGACATCAAGCATAAGACCAGACTGCAACACAAGTTCACTAAACAGTACCTGTTCGGCTCCCAAAACAAGGGTGATGGATACTAGAGGTGTCCATAAAAAATTGTCTGCTGAATCTGGAATTTATGCCCTGCTCCACATCCCTATTTACTAGATGGTACCAGGCTTTGCCAGTAATCTCTGTTGTAAGCTCCCACTGAAATATCTAGTCTTGGTATTTTATCACTGTCAAATGAGGGATAGTTCAAACCAGAGTTGCAGCTTAGTACAGTTCTTTTGAGAAGCCACCCACTGGTAAATTGCA + +a +s mr.mrrefChr5 138097 119 + 294542 TAGAATACTAAGCTCACAGACCTGAAGAAGTTCATAGTACTTGGTAGAGATAATAGGCTGCTTCTATAACTAACATATAGCTTACGGTTAGCATACCAAGGGTATTCCTGAGTCCTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287053 118 + 636262 TAGAATACTAAGCTCACAGACTTGAAGAAGTTCATAGTACTTGGTAGAGATAATAGGCTGC-TCTGTAACTAGCACATAGCTTACAGTTAGCATACTAAAGGTATTCCTGATTCCTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 275374 119 + 647215 TAGAATACTAAGCTCACAGACCTGAAGAGGTTAATAGTACTTGGTAGAGATAATGGGCTACTTCTATAACTAACATATAGCTTACGGTTAGCATACCAAGGGTATTCCTGAGTCCCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 138216 104 + 294542 AAAGAAGTGGAATATGACATCCAACTGATCTTATCTGTCAAGTGAGATGAGATCACTTGGATGTCATGTTCTACTTCTTTACTAAGACTGAGGGATACCCTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287174 104 + 636262 AAAGAAGTGGAATATGACATCCAAGTGATTTTATCTGTCAAGTGAGATGAGATCACTTGGATGTCATGTTCTACTTCTTTACTAAGACTGAGGGATACCCTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 275493 104 + 647215 AAAGAACTTGAATATGACATTCAACTGATCTTATCTGTCAAGTCAGATGAGATCACTTGGATGTTCTACTCTGCTTCTTTACTGAGACTCAGGAATACCCTTAG + +a +s mr.mrrefChr5 138320 25 + 294542 ATGCTAAGGCTAAAAGCTTATGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287278 25 + 636262 ATGCTAAGGCTAAAAGCTTATGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 275598 25 + 647215 ATGCTAACTCTAGAAGCTCAACCCA + +a +s mr.mrrefChr5 138345 118 + 294542 CACGCCAACCTCCCTAATGGAGGGGCTTGTGTTATTGTGGTGGCTCTGCACTGACTAAACATGAGCACAACTATGTGCCAGTTATAGAAGCCTATTATCTCTAACAAATGCTATTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287303 118 + 636262 CACGCCAACCTCCCTAATGGAGGGGCTTGTGTTATTGTGGTGGCTCTGCACTGACTAAACATGAGCACAACTATGTGCCAGTTATAGAAGCCTATTATCTCTAACAAATGCTATTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 275627 118 + 647215 CGTGCCAAACTCCCAAATGGGGGGGCTTGTGTTATTGTGATGGCTCAGCACTGGCTAAACTTGAGCCCAGCTATGTGCCAGTTACAGAAGCCTCTTTTCTCTACCAAACGCTGTTAAC + +a +s mr.mrrefChr5 138463 14 + 294542 AAGTTTCTACCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287441 14 + 636262 AAGTTTCTACCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 275745 14 + 647215 GAGTTTATACCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 138477 60 + 294542 CGCGTCCCACAGCAACATGAGTATTATACCCAACATCTATCTGGGTGAGTTATGGTTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287462 60 + 636262 CGCGTCCCACAGCAACATGAGTATTATACCCAACATCTATCTGGGTGAGTTATGGTTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 275759 60 + 647215 CATGTTCCACAGCTATATGAGTATTACACACGACGCTTATTGGGGTGAGTTATGATAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 138537 69 + 294542 AAGGATTTGGAGTGTAAGTTTTCAGCAACACAGACGACGTAGGCCTATTTCACTCATAATCAAGCAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287522 69 + 636262 AAGGATTTGGAGTGTAAGTTTTCAGCAACACAGACGACGTAGGCCTATTTCACTCATAATCAAGCAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 275821 69 + 647215 AAGCATTTGGAGTCTAGGTCTTCAGCAACACAGGAGATGTAGGCTTATTTCACTTGTAATCAAGCAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 138606 28 + 294542 ATAATGTAGGTCGAAATCATTAGGACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287591 28 + 636262 ATAATGTAGGTCGAAATCATTAGGACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 275987 28 + 647215 ATAATGTAGGTTGAAATTATTAGAACAC + +a +s mr.mrrefChr5 138634 66 + 294542 AAAATAGTCATATATATTTAGTACCATGAAAATATCCCCATGATGATGACCAAGCTTGTTTTTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287621 66 + 636262 AAAATAGTCATATATATTTAGTACCATGAAAATATCCCCATGATGATGACCAAGCTTGTTTTTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 276015 66 + 647215 AAGATAGTTATACATATCTAGTACAATGAAAGTATCACCATGATGGTGACCGAGCCTGGTTTTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 138700 124 + 294542 CTTGTGGGGAGAATAATTAGCACATACTTGTGGACAATTAAGGTATGCCCTACCCATTATCGCATATTTTCTGGCTGGGGGATGGAGACTCTACTCATCTTATTCATCCTCTCTGTGACTCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287692 124 + 636262 CTTGTGGGGAGAATAATTAGCACATACTTGTGGACAATTAAGGTATGCCCTACCCATTATCGCATATTTTCTGGCTTGGGGTTGAAGACACTACTCATCTTATTCAACCTCTCTGTGACTCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 276081 124 + 647215 CTTGTGAAGAGAATAATTAGCTCATACTCATGAACAATCAAGGTATGCCCCACCCATTATTGCATATTTTCTGGCTGGGAGATGGAGACTCTACGCATCTTATTCATCCTCTTTATGACTCCCT + +a +s mr.mrrefChr5 138824 430 + 294542 CCTTCATGATAGTTCCCATTACCTAACAGCTTTGCAGCATAGTAAGTTTAAAACTTTCATGCTCTTTACCACCTCTACTAGCTCCATCCAGCATATTTTGAGGGCAGCAGATCATGGAGGGACAAGTACATTAGGTGATCAAGTGGTGACTTCAAACAAGATCAGTTGGGTTGGAAATTTTCTGAGGGCAAGGTGCTTCTGTCATCTGCATCCTAGTCCCTTGGCCCCACATGTGAGTAAGGTGCCCACAATCATCTGATCTAGGAGTCTGTCTTCTGGATCTGAAGAGGATAGCCTAAAGTATATCATAGAGAAAGGGTCACTGTGGAGGGGAAATGTAAGCACTTCTGGTTGCTGCAGATGGTGTGCATAGGAACAGCAAACTTCAATAATGCTCTTGCTTTTTCCTTGTCATCTATAAAGAAGATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 287816 430 + 636262 CCTTCATGATAGTTCCCATTACCTGACAGCTTTGCAGCATAGCAAGTTTAAAACATTCATGCTCTTTACCACCTCTACTAGCTCCATCCAGCATATTTTGAGAGCAGCAGATCATGGAGGGACAAGCTCATTAGGTGATCAAGCGGTGACTTCAAACAAGATCAGTTGGGTTGGAAATTCTCTGAAGGCAAGGTGCTTCTGTCATCTGCACCCTAGTCCCTTGGCCCCACATGTGAGTAGGGTGCCCACAATCATCTGATCTAGGAGTCTGTCTTTTGGATCTGAAGAGGTTAGCCTAAAGTATATCATAGAGAAAGGGTCACTGTGGAGGGGAAATGTAAGCACTTGTGGTTGCTGAAGATGATGTGGATAGGAACAGCAAACTTCAATAATGCCCCTACTTTTTCTTTGCCATCTATAAAGAAGATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 276206 428 + 647215 CCTTCATGATAGTTCCCACTACCCAACAGCTTTGCAGCATAGTAAGTCTAAAACTTTCATTCTCTTAACCACCTCTACTAGCTCCATCCAGCATATTTTGAGGGC--CAGATCATGGAGGGATAAGTACATTAGGTGATCAAGTGGTGACTTCAAACAAGATCTGCTGGGTTGGAAAGTTTCTGAGGGCATGGTGCTTCTGTCATCTGCATCATGCTCCCTTGGCCCCATGTATGAGTAAGGTGCCCACAATTATCTGATCTAGGAGTCTGTCTTCTGGATCTGAAAAAGATAGCCTACAGTATATCATAGAGAAACGGTCAATATGGAGGGGAAATATAAGCACTTCTGGTGGCTGCAGATGGTGTGCATAGGAACAGCAAACTTCAATAAAGCTCTTGCTTTTTCCTTGTCATCTAAAAAGAAGATAC + +a +s mr.mrrefChr5 139254 104 + 294542 AGAGACATTTTATGTAGTTAAGGTAAGGCATGTCAGAGCCCCTTTGAAGGAATATCCTCTGCGATTTATTTTCACTTGTAGACCACCCATGTTTAACTATCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 288246 104 + 636262 AGAAACATTTTATGTAGTTAAGGTAAGGCATGTCAGAGCCCCTTTGAAGGAATATCCTCTGCGATTTATTTTCACTTGTAGACCACCCATGTTTAACTATCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 276668 104 + 647215 AGGGAGATTTTATGTAGCTAAGGTAAGGTATGTCAAAGCCTCTTCTGAGGAATATCTTCAGCAATTTATTGTCACTTGCAGTCCACCCTTGTTTAATTATCACT + +a +s mr.mrrefChr5 139358 22 + 294542 AAAGTGGGCCTTGTTACCAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 288394 22 + 636262 AAAGTGGGCCTTGTTACCAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 276772 22 + 647215 AAAGTGGGCCTTGTTTTCAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 139380 98 + 294542 ATTCCAGCCTCGGAATTCTGGAGTTAAAACCTGGCTAGGGTTCATCAACCAATGAAGTACCCAATCTAGGTCCTTTGCTACAATAGTACTCTAGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 288543 15 + 636262 ATTCCAGCATCATAA----------------------------------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 277062 97 + 647215 -TTACAGCCTGGGAATTCTGGAGTTAAAACCTGGCTAGGGTTCATCAACCAATGAAGTACCCAATCTAGGTCCTTTGCTACAATAGTACTCTAGGATG + +a +s mr.mrrefChr5 139478 186 + 294542 TGGTTTAAGTGGCTGTTGGCATTTCCTCCAATCAACTAATATATTGAGTACTATGTGTTGTCAAGCGTGTCATAGTGCCGGGCCTTTCTGATTAATGCGATTCTCTTGACAAGAATACAAAGAAGTCTGAATCCTGAATACCAGGTGCTTGGTGACTATCAGATTTTAGCTGCCACAATTACAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 288558 163 + 636262 -------------------CGTTTCCCCCAATCAA--AATATGTTGTGTACTATGTGTTGTCAAGCGTGTCATAGTGCCGG-CCTTTCTGATTAATGCGATCCTCTTGACAAGAATACAAAGAAGTCTGAATCCTGA-TACCAGGTGCTTGGTGACTATCAGATTTTAGCTGTCATGATTACAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 277165 186 + 647215 TGGTTTAAGTGGCTGTTGGCATTTCCTCCAGTCAACTAATATACTGAGTACTATGTGTTGTGAAGCGTGTCATAGCACAGGGCCTTTCTGATTAATGTAATTTTCTTGACAAGATCACAAAGAAGTCTAAATCCTGAATACCAGGTCCTTGGTGACTATGAGATTTTAGCTGCCACAATTACAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 139664 358 + 294542 GGGTGGAATTGGACAGGGGATCTACAATGTACATCGGGGGTTCCGGTCACATCTCATCAAGTAGGGGTGAGGAAGAATGATAAACTAGGGGCCCTTTGTAGTGGGTTTTTTCATAGAACCTGATACTTGTTAGGTATTCCGAGAGAGTAGCAAAGTGAATGGTTCAAACCCTGTAGAACTTTCAAAACCATGGAGAGTGTCACTTTACAAACATGGCCCGAGTAATTTTAACATGTCAGTACACACCTACATTTGGTTCATTATGTTTTATTGGGGAACCCTTCTAAGGGACTCTCAGGGCCAGGGAAACAATTCAGGAAATATGTTCTAACCCCACCTCGATGCTCCGACATACCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 288721 342 + 636262 GGGTGGAATTGGACAGGGGATCTACAATGTACATCGGGGGTTCCGGTCACATCTCATCAAGTAGGGGTGAGGAAGAATGATAAACTAGGGGCCCTTTGTAGTGGGTTTTTTCATAGAACCTGATACTTGTTAAGTATTCCATGAGAGTATCAAAGTGAATGGTTCAAACCCTGTAGAACTTT----------------GTCACTTTACAAACATGGCCTGAGTAATCTTAAGATGTCAGTACACACCTTCATGTGGTTCATCATGTTCTATTGGGGAACCCTTCTAAGGGACTCTCAGGGCCAGGGAAACAATTCAGGAAATATGTTCTAACCCCACCTCGATGCTCCGACATACCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 277363 358 + 647215 GAGTGGAAACAGACAGGAGATCTATAATGGACATGGGGGGTCTCCTTGACATCATGTCAAGTCGGGGTGAGGAAAAGTGATGAACTAAGAGCCTATTGTAGTGAGTTTTTTCACAGACCCTGATACTTGTTCGGTATTCCGAGAGAGTAGCAAAGTGAATGGTTCAAACGCTGTAGAAGGTTCAAAACCATGGAGAGTGTCACTTTACAAACATGGCCCAAGTTATTCTGACATCTCAGTACACACCTACATTTGGTTCATTATGTTTTATTGGGGAACCCTTTCAAGGTAGTCTCAGGACCAGGGAAACAAATCAAGGAATGTGCTCTAATCACACCTCAACGCGCTGCCACATCTA + +a +s mr.mrrefChr5 140022 405 + 294542 ATATTCAACAAATCCCAACCAGAAAGGTGATGCCTGAAAGATACCCTCATCCTTTAGATCACAGATGAACTCTCTATCAATCTAAGTCCATTTTCTAATCAATGAAGATCTCAGGTCACAGAAGTGAGCATAGAATTGCTACTTTGCCCTCAAAAGTTGGTCTGGACCCTTAGATTCCTGTTTCAATACATAGCATCTATCAAGTGTCTCAACACAATTTGCCACCATCGAATCCATCAACCAGGCAACAACATTCTGAAGGTCACGACTAGTCTTTGAACTCATCCACCCAAGGGAGCACCCTACATTTCCACTGTCTTATGGCACCTGAGTTGAGAGCTGGACAATAGCCACAGAATTTAGCTAGCATGCTCTGTTAAGTTGTGAATGAGATTAAAGTAGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 289064 366 + 636262 ATATTCAACAAATCCCAACCAGAAAGGTGATGCCTGAAAGATACCCTCATCCTTTAGATCACAGATGAACTCTCTATCAATCCAAGTCCATTTTCTAGTCAATGAAGATCTCAGGTCACAGAAGTGAGCATAGAATTGCCACTTTGCCCTCAAAAGTTGGTCTGGACCCTTAGATTCCTATTTCAATGCATAACGTCTATCAAGTGTCTCATCACAATTTGCCACCATCGAATCCATCAACCAGGCAACAACATTCTGAAGGTCACGACTAGTCATTGAACTCATCCACCCAAGTGAGCACCCTACATTTCCACTGTCTTATGGCACCTGA---------------------------------------GCTCTGTTAAGTTGTGAATGAGATTAAAGTAGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 277721 405 + 647215 ATATTCAATGAATCCCAGCTGGAAAGGTGATACCTGAAAAGACCCCTCATGCTTTAGATCACAGATGAACTCTCTATCAATCTAAGTCCATTTTCTAATCAAAGAAGATTTGTAGTCACAGAAGTGAGCATAGAATTGCTACTGTGCCCTCGTAAGTTGGTCTGGACCCTTAGATTCCTGTTTCAACACATAGCATCTATCAAGTGTCTCAACACAATTTGCCTCCATCAAATTCATCTACTAGGCAACAACACTCTGGAGGCCAAGACTAGTCTTTGAACTCACCAACCCCAGGGAGCATCCTACATTTTCGCTGTCTTATGGCACTTGAGTTGAGAGCTGGACAATAGCCACAGAATTTAGCTAGCATGCTCCATTAAGTTGAGAATGAGTTTAAAGTAGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 140427 104 + 294542 TATCTGTATAATTTGGTTAGATAGAATGGAGTAGGAAGTGTGTCAGATAAGTAACATTGCCAGTTGTGTATATAAAATTCTGTCAAATAGGGTAGGCTCATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 289430 104 + 636262 TATCTGTATAACTTGGTTAGATAGAATGGAGTAGGAAGTGTGTCAGATAAGTAACATTGCCAGTTGTGCATATAAAATTCTGTCAAATAGGGTAGGCTCATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 278128 104 + 647215 GATCTGTATAATTTGGTTAGAGGGAATGGAGTCGGAAATGTGTTGAATAAGTAACTTAGCCAGTTGTGTATATAAAATTCTATCAAATAGGGTAGGCTCATTCA + +a +s mr.mrrefChr5 140531 252 + 294542 ATAATTGAATTTCTGTTCCTGATTTGCAAGAGAGGAAGTTTAATATCATCCCATACACTGTTAGGAATCTCCCTAATAGGAGGATGCTGTACCTTTATTGATTGATGTCATCCATGCTTTCTTTGCTTTTAGCTTGTATCCTTGTTGAAAATTGCTGATTGTTTATAGAACTCTCCTTTATCAAGTCACCAGTGGCCACCAGAAGTTAACAGGTAAGCTATGAGTGTCTGATTTTAGTACCATACCCCTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 289680 252 + 636262 ATAATTGAATTTCTGTTCCTGATTTGCAAGAGAGGAAATTTAATATCATCCCATACCTTGTTAGGAATCTCCCTAATAGGAGGATTCTGTACCTTTAGTGATTGATGTCATCCATGCTTTGTTTGCTTTTAGCTTGTATCCTTGTTGAAGATTGCTGATTGTTTATAGAACTCTCCTTTATCAAGTCACCAGTAGCCACCAGAGGTCAACAGGTAAGCTATGAGTGTCTGATTTTAGTACCATACTCCTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 278232 250 + 647215 ATAATTAAATTTCTGTTCCCGATTTGCAAGAAAAGAAGTTTAATATCATCCCATACACTGTTAGGAATTTCCCTAATGGCAGGATGCTGTACC--CATTGATCGATGTCATCCATGCTTTCATCGCTTTTAGTGTGTATCCTTGTTGAAAATTGCTGATTGTTCATAGAACTCTCCTTGATCAAATCACCAGTGGCCACTAGAAGTTAACAGGTAACCTATGAGTGACTCATTTTAGCGCCATACCCTTCCT + +a +s mr.mrrefChr5 140783 163 + 294542 TTTATCTCTTCGTTGTGTGAGGAAGATCTGACCCCAATACTAATATAGCAAAAAGGATATTGGACAGCTATATAATGATCTGGTTCTGTTTAATGGAGCACACTTTTAGTATGCACACAAGTGGAATTAGGGTTTATCAGATGATGCTAGGCCAACACTGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 289933 162 + 636262 TTTTTCTCTTTGTTGTGCAAGGAAGATCGGACCCCAATACTAATATAGCAGAAAGGATATTGGAAAGCAATATAATGATCTGGTCCTGCGTAATGGAGCACACTCTTAGTATGCACACAAGTGGAATTAGGG-TTATTAGATGATGCCAGGCCAACACTGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 278482 156 + 647215 TTTATCTCTTCATTGTGTGAGGAAGATTT-------AGACTAATATAGCCAAAAAGATATTGGACGGCTACATATTGGTCTGGTTTTGTTTAATGGGGCACACTTTTAGTATACACACAAGTGGAATTAGGGTTTATCAGATGATGCTATGCCAGTACTCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 140946 199 + 294542 TAAATTCTTCCCAATACCCAATTCATAAAGGTCACCCCCATATAATGCTCTTCCCTTGCCTCGGTGGGCTAATTGCACAAAGATATAGAATCATCTAGATTTCTCAGCTTTAAGTTTACTCAACCATCTGGACATTCACACTTAACAGCAAACTCATAGGTAATCCCCAGTCTCATTTAGATGCTTTAACTGATGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290095 190 + 636262 TAAATTCTTCCCAA---------CATAAAGGTCACCCCCATATGATGCTCTTCCCTTGCTTGGGTGGGCTAATTGCACAAAGATATAGAATCATCTAGATTTCTCAGCTTTAAGTTTACTCAACCATCTGGACATTCACACTTAACAGCAAACTCATAGGTAATCCCCAGTCTCATTTAGATGCTTTAACTGATGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 278645 199 + 647215 TAAATTCTTCCCAATACCCAATTCATAGAGGTCCCCCCCATATAACGCTCTTCCCTTGTCCCGGTGGGCCAATTGCACAAAGATATAGAATCATCTAGATTTCCCAGTTCTAAGTCTACTCAACCACCTGGACATTGACACTCAACAGCCAACTCATGGTTAAACACCAATCTCTTTCAGATGCTTTAACTGGCAAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 141145 25 + 294542 TTCATCGGAACTATTCAACATATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290286 25 + 636262 TTCATCGGAACTATTCAACATATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 278844 25 + 647215 TTCATTTGAGCTATTCAACATATTA + +a +s mr.mrrefChr5 141170 20 + 294542 TCGGGTATGCATATTATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290312 20 + 636262 TCGGGTATGCATATTATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 278869 20 + 647215 TCAGTTATGCTTATTATTCA + +a +s mr.mrrefChr5 141190 96 + 294542 ACTTAAAGGTGGTATTGTTCTTGGGCTGAGGTGTTTATGCAGTTGCCCTTGCGTATGGATAAGTAAACCAATTTCTAAAGAGAGGAAGTTTGCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290342 96 + 636262 ACTTAAAGGTGGTATTGTTCTTGGGCTGAGGTGTTTATGCAGTTGCCCTTGCGTATGGATAAGTAAACCAATTTCTAAAGAGAGGAAGTTTGCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 278889 96 + 647215 ACTTAAAGGCAGTATTGTCCTTGAGGTGAGGTGTTTATGCAGTAGCCCTTGGGTATACATAAGTTGACCAATTTCTAAAGTGGGAAAATTTGTCAT + +a +s mr.mrrefChr5 141286 11 + 294542 CTCTTCTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290444 11 + 636262 CTCTTCTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 278985 11 + 647215 CCCTTCTGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 141297 6 + 294542 AAGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290459 6 + 636262 AAGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 278996 6 + 647215 AAGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 141303 34 + 294542 AATAGAGAAATCAGGTTAATCCCTTGTTAAACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290465 34 + 636262 AATAGAGAAATCAGGTTAATCCCTTGTTAAACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 279009 34 + 647215 AGTAGAGAATTCAGGTTAATCCCTTGCTAAATCC + +a +s mr.mrrefChr5 141337 8 + 294542 TTAAAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290500 8 + 636262 TTAAAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 279043 8 + 647215 TTAAAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 141345 24 + 294542 TGCCCTAAATTTACTATCTTCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290508 24 + 636262 TGCCCTAAATTTACTATCTTCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 279052 24 + 647215 TGCCCTAAATTTACCATCTTCACA + +a +s mr.mrrefChr5 141369 14 + 294542 TGTCCCATTAGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290532 14 + 636262 TGTCCCATTAGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 279077 14 + 647215 TGTGCCATTGGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 141383 16 + 294542 TTAATTGAGAATAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290546 16 + 636262 TTAATTGAGAATAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 279177 16 + 647215 TTAACTGAGATTCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 141399 35 + 294542 ACTGATGGATTGTCTATTAAATGATGCCCATCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290562 35 + 636262 ACTGATGGATTGTCTATTAAATGATGCCCATCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 279196 35 + 647215 ACTGATGGATTGTCTATTAATTGACACTCTTACTG + +a +s mr.mrrefChr5 141434 52 + 294542 ATTGAACTTTGGTAGTGTTAATAGGTCTGACCCTACAGTTCGCACCCTAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290597 52 + 636262 ATTGAACTTTGGTAGTGTTAATAGGTCTGACCCTACAGTTCGCACCCTAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 279236 52 + 647215 ATTCGACTGTGGTAGTGTTAATAAGTCTGACCCTACAATTCACACCCTAATA + +a +s mr.mrrefChr5 141486 4 + 294542 TCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290650 4 + 636262 TCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 279288 4 + 647215 TCAA + +a +s mr.mrrefChr5 141490 38 + 294542 ACTACAAGAGCTCTAGTCTAAGAGCTAAAGTGAATCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290654 38 + 636262 ACTACAAGAGCTCTAGTCTAAGAGCTAAAGTGAATCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 279317 38 + 647215 ACTAGAAGAGCTATAGTCTAAGAGCTAAAGTGAATCCA + +a +s mr.mrrefChr5 141528 45 + 294542 TGGGCTAGATATTCTGGATTCAGTGGTTTTACCAAAGATTTAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290692 45 + 636262 TGGGCTAGATATTCTGGATTCAGTGGTTTTACCAAAGATTTAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 279356 45 + 647215 TGAGCTAGATATTCTGGATTCATTTATTTTACCAAGGATTCTACT + +a +s mr.mrrefChr5 141573 101 + 294542 AAATTAGTCTTTGCTTTTTCGATTTATAGTACTAGACCATTTGGCTAACCTGACATGAGGTAGACATCCTTATATAGGGTCAACCCAGGTGTGCATGGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290740 101 + 636262 AAATTAGTCTTTGCTTTTTCGATTTATAGTACTAGACCATTTGGCTAACCTGACATGAGGTAGACATCCTTATATAGGGTCAACCCAGGTGTGCATGGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 279401 101 + 647215 AAATTAATCTTTCATTTGTCAATTTTTAGTACTAGACCATCTGGCCAACTTGACATGAGGTGCACAGCCATATATAGGATCAACCTATGAGTGTGTGAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 141674 7 + 294542 CAGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290842 7 + 636262 CAGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 279502 7 + 647215 CAGAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 141681 57 + 294542 TTCTCCTCAGATTTTAGCATCTTCCACAAAGCTTGCATTTTATTAATTTCATGCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290850 57 + 636262 TTCTCCTCAGATTTTAGCATCTACCACAAAGCTTGCATTTTATTAATCTCATGCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 279509 53 + 647215 TCCCCCTCAGAGTTTGGGACCTTCC----AGCTTGCATTTTATTAATTTCATTATGT + +a +s mr.mrrefChr5 141738 620 + 294542 TTAACTACAGCTATGTCTAGGAGAATGTGTAAATACCTATCCTCGTGGTTTGGGCAATCTCTGCAACATGACCCAATTGGCTTTGCTGTGGCTGTTTATGGGCATTAGTTGAATAGGTCTAACTAGACACACCCAAATGGACCTGAGTATGATCTGAGGGCTGGGGTTGATTTCGCATGTCCGCATATGCCGTGTCAAATTGCACCTTCATCTTTGGTTTTTTAATTTATTATGGACCCATTATTCCGCCTTGAGTCTTAAAATGCTAAAATGGAGTGTACTTAGCTTTGTGACTGATTTGTGATGGCTCCTGTGGTTTTTTAAAATTATAAAGGAAGGCATCATTGTAACAACATGCCATGGCCTTAGAATAAGGATCCCGCTGGTTAACAAAAATGAACCCAGACCCTCTTTTTCTGCTCAAATGAAAAAATTAGCATTAGAAGAGGATCACATAAGCAAGCATCTGATTGAGTCTAATTTTTTTCATTTGCTTTGCATATCCTCTCTTTTCTATGGTTTGCATCACCTTGGGGAATTTTTGTTAACTCAGGGCCTCATTAATATATGATACTCAGGACATCCTATGCTTCTGCCATATTATGCCCTAATCTGCTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 290907 594 + 636262 -----------------TGGGAGAATGTGTAAGTACCTATCCTTGTGGTTTGGGCAATCCCTGCAACACGACCCAATTGGCTTTGCTGTGGCTGGTTATAGGCATGACTTGAATAGGTCTAACCAGACACGCCCAAATGGACCTGAGTATGATCTGAGGGCTTGGGTTGATTTCGCATGTCCGCACATGCCGTGTCAAATTGCCTCTTCATCTTTGGTTTTTTAATTCATTATGGACCCATTATTCCGCCTTGAGTCTTAAAATGCTAAAATGGAGTGTAATTAGCTTTGTGACAGATTTGTGATGGCTCCAGTGGTTTTTTAAAATTATAAAGCAAGGCATCATTGTAACAACATGCCATGGCCTTAGGATGAAGATCCCGCTGGTTATCAA--------TCAGATCCTCTTTTGCTGCTCAAATGAAAAAATTAGCAACAGCAGAGGATCACATAAGCAAGCATCTGATTGAGTCTAAT-TTTTTCATTTGCTTTGCATATCCTCTCTACTCTATGGTTTGCATCACCTTGGGGAATTTTTGTTAACTCAGGGCCTCATTAATATATGATACTCAGGACATCCTATGTTTCTGCCATATTATGCCCTAATCTGCTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 279566 619 + 647215 TTAACTACAGCTATGTCTAGGAGAATGTGTAAATACCTATTCTCATGGTTTGGGCAATCTCTGCAACATGACCCAATCGGCTTTGCTGTGGCTGTTGATGGGCATTAGTTGAATAGGTCTAATTAGACACACCAAAATGGACCTGAATTTGT-CTGAGGGCTGGGGTTGATTTCGTATGTCCACATATGCTGTGCCAAATTGCACCTTCATCTTTGGTTTTTTAATTTATTATGGACCCATTATTCGACCTTGAGTCTTAAAATACTACAATGGAGTGTACTGAGCTTTGTGACTGATTTGTGATGGCTCCTGTGATTTTTTAAAATTATAAAGGCAGGCATCATTGCAACAACATGCGTGGGCCTTAGAATAAGGTTTGCCCTGGTTAACAAAAATGAACCCAGACCCTCTTTTTCTGCTCAAATGAAAAAATTAGCATTAGAGGAGGATCACATAAGCAAGCATTTGATTGAGTCTAATTTTTTTCATTTGCTTTGCGTATCCTCTCTTTTCTATGGTTTGCATTGACTTGGGAAATTTTTGTTAACTCAGGGCCTCATTAATATATAATACTAAGGACATCCAATGCTCTAACCATATTATGCCCTAATCTGATTAC + +a +s mr.mrrefChr5 142358 8 + 294542 CATTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291501 8 + 636262 CATAATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 280190 8 + 647215 CATTATTG + +a +s mr.mrrefChr5 142366 236 + 294542 ACCGTCCTTTCTGTTGAAGAGTGTTTTCCATCTGAATATCATTCTTGTTCTGACTTGATGTCGTTACATCTTCTCAGACTCCACGAGGGCAATGCTAGAATTGAACATCTCAGGTCCACAAAAGAAGTTGCAACCATCCTTTGTCTCACCTTCAACCCATTTGTGAGGTAGTGTTCTTGCCTGCCTAATATTCTAGGTTAAATACTCTCCTGGTATGTCAGTGAGGGAGATGGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291510 236 + 636262 ACAGTGATTTCTGTTGAAGAGTGTTTTCCATCAGAATATCATTCTTGTTGTGACCTGATGTCGTTACATCTTCGCAGACTCCACGAGGGCAATGCAAGAATTGAACATCTCAGGTCCACAAAATAAGTTGCAACCATCCTTTGCCTTACCTTCAACCCATTTGTGAGGTAGTGTTCTGGCCAGCCTAATATTCTAGGTTAAATACTCTCCTGGTATGTCAGTGAGGGAGATAGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 280198 233 + 647215 ACCGTCCTTTC---TGAAGAGTGTTCTCCATCTGAATACCATTCTCAATCTGACTTGATGTCGTCACATCTTCTCAAGCTCCACCAGAGCAACGTTAGAATACAAGATATCAGGTCCACAACAGCAGTTGGAACCATCCTTTGTCTCATCTACAGCCCATTTATTGGGTAGTGTTCTTGCCTGCCTGATATTCAAGGTTAAATGATCTCCAGGTATGTCAGTGAGTGAGATGGCAG + +a +s mr.mrrefChr5 142602 16 + 294542 AGAGAATCAAAAGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291750 16 + 636262 AGAGAATCAAAGGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 280431 16 + 647215 AGAGAATCACAAGAGA + +a +s mr.mrrefChr5 142618 131 + 294542 GAATCATGTACATTATTTGTTGCTTTGCACTCAAGGAGAAGGACGACATGTGGTCCAAGATATAATGATAATGAATCTGGGCAAATCATGACAGGTTGCATGTTTGTGTTGTGGTTAATTGCAGTAGAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291766 131 + 636262 GAATCATGTACATTATTTGTGGCTTTGCACTCGAGGAAAAGGACAGCATGTGGTCAAAGATATAATGACAATGGATCTGGACAGATCATGACAGGTTGCATGTTTGTGTTGTGGTTAATTGCAGTAAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 280456 131 + 647215 GAATCATGTACACTATTTGTTGCTTTGCACTCAAGGAGAAGGAAGACATGTGCCCCAAGATATAATGATAATGAATCTGGGCAAGTCATGATAGATTGCATGTTTGTGTTGTGGTTAATTGCAATAGAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 142749 49 + 294542 TCCAGCAACTATTGATCTATGAGGCTCTTAGGTTCCTCTGGTAGCTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291897 49 + 636262 TCCAAAAACTATTGATCTATGAGGCTCTTTGGTTCCTCTGGCAACTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 280588 49 + 647215 TCCTGCAACTATTGATCTTTGAGGCTCTTAGGTTCCTCTGGTAGCTCTT + +a +s mr.mrrefChr5 142798 6 + 294542 GTCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569456 5 - 636262 TAACT- +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291946 5 + 636262 GTCCT- +s simRat_chr6.simRat.chr6 280637 6 + 647215 GTCATA + +a +s mr.mrrefChr5 142804 8 + 294542 TGTCCTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291951 8 + 636262 TGGCCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 280643 8 + 647215 TGTCCTGA + +a +s mr.mrrefChr5 142812 462 + 294542 AGTCTTGGTCTGAATTACAGTCCACTCAGATATTGATGTGTTTGCAAATATAATTAATAAGCATGTGCATTTGATATTCATATTGTTATGTTCAACTTTAAAGTGGCATGCCACTGGCAGTATGAATCATGTTCAACACATCTTGGGGGATAAGTTGCATTGATGTAATAACGTTTTATAGGGGGCCATAGCATCACCCATTCCTCACCTAGGACTCTTCTGGGATAAGTGGGCATCTTGCACAGGGGGAATTGTGCTTAAGGCAGAGGAGTTCTGAGGCTGTTTCATCCCACATCATGATCATTCTGAGGGGCAGCATTCCTCTTGAACTGTATGGTTGTTGCTGAAGTGTTGCACATAATACAAGCACAATTGTTCATCTCAGAAATCCCTACTCAGTAGTTTCCAGCACACCCAATATAGGATTGCATAACAGATAATCCTTTGTTTACTTTCAGTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 569461 440 - 636262 AGTCTTGAGCTGAATTACAGTCGACTCAGATATTGATGTGTTTGCAAATATAATTAATAAGCATGTGCATTTGATATTCATATTGTTATGTCCAACTTTAAAGTG----------------------CATGTTCAACACATCTTGGGGGATAAGTTGCATTGATGTAATAACGTTTTATAGGGGGCCATAGCATCACCCATTCCTCACCTAGGACTCTTCTGGGATAAGTGGGCATCTTGCACAGGGGGAATTGTGCTTAAGGCAGAGGAGTTCTGAGGCTGTTTCATCCCACATCATGATCATTCTGAGGGGCAGCATTCCTCTTGAACTGTATGGTTGTTGCTGAAGTGTTGCACATAATACAAGCACAATTGTTCATCTCAGAAATCCCTACTCAGTAGTTTCCAGCACACCCAATATAGGATTGCATAACAGATAATCCTTTGTTTACTCTCACTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 291959 415 + 636262 AGTCT-----------------------GAGATTGATGTGTTTGCAGATATAATTAGTGAGCATGTGCATTTGATATTCATATTGTTGTGTTTAACTTTAAAGTG----------------------CACGTTCAACACATCTTGGGGGATAAGTTGCATTGATGTAATAACGTTTTATAGGGGGCCATGGCATCACCCATTCCTCATCTAGGACTCTTCTGGGATAAGTGGGCATCTTGCACAGGCGGAATTGTGCTTAAGGCAGAGGAGTTCTGAGGCTGTTTCATCCCGCATCATGATCATTCTGAGGGGCAGCATTCCTCTTGAACTGTATGGTTGTTGCTGAAGTGTTGCACATAATACAAGCACAATTGTTCATCTCAGAAATCCCTACTCAGTAGTTTCCAGCACACCCAATATAGGATTGCATAACAGATAATCCTTTGTTTACTTT--GTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 280651 444 + 647215 AGTCTTGGTCTGACTTGCAGTCCACTCAGATAATAATGTGTTTGCAAAGATAATTAACAAACGTACGCATTTGATATTCATATTCTTATGTTCAACTTTCAAGTGGCATGCCACTGGCAGTATGAATCGTGTTCAACACATCTTGAGG-ATAAATTGCATTGATGTGATAATGTTTTATAGGGGGCCACAGCATCTCCCATTCCCCGCCTGGGGCTACTCTGGTACAAGTGGGCATCTTGCACAAAGAGTATTGTGCCTAAGGCCGAGGACTTCCGAGGCTGTTTCATCCCATGTCATGATCATCCTGAGAGGCAGCACACATCTTGAACTGCATAATTGTTGCTGAAGTGTTGCAAAT-------------CAA--TATTCCAGAAACCCCTACTCAGTAGTTTCCAGCATACCCAATATAGAATTGTGCAACAGACGATCCTTGATTTGCCTT--GTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 143274 88 + 294542 GCAAAATGATCTGACCATCTAATGTGAAGAATCAGGTGAGAAGAAGTTAGAAATCTCATTGTACATCTAAACCTATGGGCAATCTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292374 88 + 636262 GTGAAATGATCCAACCATTTGAAGTGAAGAATCAGGTGAGAAGAAGTTAGTAACCTCATTGTACATCTTAACCTATGGGCAATCTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 281095 88 + 647215 ACAAAATGATCTGACCATCTAATATGAAGAATCAGGTGAGAAGGAATTAGAAATCTCATAGTACATCTAAACCTATCAGCAATCTACT + +a +s mr.mrrefChr5 143362 81 + 294542 CGTGTGATCTGTGGCTATAGGGTGTTATAGAGAGCCTGATATTCTGGTCAATGTACCATGATTGTGTTACAGTTGAATCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292463 74 + 636262 CATGTGACCTGTGGCTATAGGGTGTTGTAGAGAGCCTGATTTTCTGGTCAATGTACC-------TGTTACTGTTGAATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 281183 81 + 647215 CGTATGATCTGTAGCTATGGGGTGTTATACAGAGCCCTGTATTCTGGTCAATGTACCATGATTGTGTTACAGTAGAATCCT + +a +s mr.mrrefChr5 143443 47 + 294542 ATAAAAAATTTGTCACTAGGATATGAAGCCTTAACTGTGGACAAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292537 47 + 636262 ATAAAAAATTTGTCACTAGGATATGAAGCCTTAACTGTGGACAAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 281265 47 + 647215 ATCAAAAGTTTGTCACTAGGATATGAAGCCTTAACTGTGGATAAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 143490 38 + 294542 GTAGCTGAGCGCTACCTAGCTTAGCAAGAGAATGAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292584 38 + 636262 GTAGCTGAGCGCTACCTAGCTTAGCAAGAGAATGAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 281348 38 + 647215 GGAGCTGAACACTTCCTAGCTTAGCAGGTGAATGAATC + +a +s mr.mrrefChr5 143528 382 + 294542 GTGTGCCAGATGAATGTCCAACCACAGTCCCATTCCATTGTATAATAAACTATTTCATTTAGTCAGAGCACAATTGTAATCTTACACACATCCAAGCAATCAGGGCTGTTATTGCCACTGTAGTAAGGCAGATCCATTAGAAACAGCAGGTGTATGCAGGGAACATATGGCTATGTGGGTCTTAATCCAGAAGAGTTCTGCCTCACATGTGATAACAGAATAAACATTGAAAACCTTCTAGCTTTGCTCTCTCTGAGCAGAAACCCCAATGTCAGAATGTCATAAGTAAGAGATAATTGCCATTGGTTGGTTATACTTTTACCGACACTTGTGCCGTGACCTCGGCAATTGATAATGCCCATAATTATTTTACTGGCAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292622 355 + 636262 GTGTGCCAGATGAATGTCCAACCACAGTCCCATTCCATTGTATAATAAACTATTTCATTTAGTCAGAGCACAATTGTAATCTTACACACATCCAAGCAATCAGGGCTGTTATTGCCATTGAAGTGAGGCAGATCCATTAGAAACAGCAGGTGTAT--------CATATGGCTATGTGGGTCTTAATCCAGAAGAGTTCTACCTCACATCTGATAACAGGATAAACATTGAAAACCTCCTAGCTTTGCTCCTTC-------------------CTGAATGTCATAGGTAAGAGATAATTGCCATTAGTTGGTGGTACTTTTACCGACACTTGTGCTGTGACCTCGGCAATTGATAACACCCATAATTATTCTATTGGCAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 281387 382 + 647215 GTGTGCCAGATGAATGTCCAACCACAGTCCTATTCCATAATATACTAAACTATTTCATTTAGTCAGAGCACTATGGTAAGCTTGCACATAACCAAGCAATCAAAGCTGATATTGCCACTGTAGTAAGGCAGATCCATTAGAAACAGCAAGTGTAAGCAGGGAACATGTGTCTATGTGGGTCTTAATCCAGAACAGTTCTGCCTAACATGTGATAGCAGAATACACATTGAAAATCTTCTAGCTTTGCACTCTCTGAGCAGAAACCCCAATGTCAGAATGTCATAAGTAAGATATCATTGTCATTGATTGGTTACACTTGTACCCACACCTGCGCCGTGACTTAGGCAATTGATAATGCCCATAATTATTTTACTTGCAGGGG + +a +s mr.mrrefChr5 143910 30 + 294542 ATTGGCTTTGGGTCAGCGAGTCAGGTATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 292979 30 + 636262 ATTGGCTTTGGGTCAGCGAGTCAGGTATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 281769 30 + 647215 ATTGGGTAAGGGTCAGCGAGTCAGGTATAA + +a +s mr.mrrefChr5 143940 86 + 294542 CCTTCTTCAATACACTAAATTGGTGTAACCCCAAGATCAAGAAGTGCAGTGTGATAAGGTAGCAAAGTTGAGGCCAGAGTTTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293010 86 + 636262 CCTTCTTCAACACACTAAATTGGTGTAACCCCAAGATCAAGAAGTGCAGTGTGATAAGGTAGCCAAGTTGAGGCCAGAGTTTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 281799 86 + 647215 CCTTCTACAATACACTAATTTCACGTAAACCAACGATCAAGAAGTGAAGTGTGATATGGTAGCAAAGTTGAGGCCAGAGATTTTGG + +a +s mr.mrrefChr5 144026 95 + 294542 TCCCTTTCCTGGATCTCATATCATGGACTTCGTTAGGCTAATTTGGTCAGGTAGCATCTATGTTGTTTCCTGATCCACACCTGTCGAGTTCATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293096 95 + 636262 TCCCTTTCCTGGATCTCATATCATGGACTTCGTTAGGCTAATTTGGTCAGGTAGCATCTATGTTGTTTCCTGATCCACACCTGTCGAGTTCATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 281895 95 + 647215 TCCCTTCCCTGAATCTCAAATATTGGACTCCAATAGGTTAACTTGGTCAGATAACATCTAGGTTGTTTCCTGACCCACACCTGTGGAGTTCACAG + +a +s mr.mrrefChr5 144121 273 + 294542 GAAGATAGTTTTTGAGACAAAGGGAACTCCTCTGTACTAGTGGCATGGACTGAGTTGCAAAGTGGGACAATGCCAGCCAGAATGAAAAACCCTAGAAGGCATTGAAAAATCTGACACTATTGTGTCGACGTATAACTACCTCCAAACATGATGTAAGTGCACTAAAACCACAAATTTGAATTTGACAAGAGCCATATCTCTGTACACTCACTAACCCATATGTCAGCTGGTGTGACTCTTCCATGGATTCAGTTAAACATGAGAGCTCTGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293192 250 + 636262 GAAGATAGTTTTTGAGACAAAGGGAACTCCTCTGTACTAGTGGCATGGACTGAGTTGCAAAGTGGGACAATGTCAGCCAGACTGAAAAACCCTAGAAGGCATTGAAAAATCTGACACTATAGTATTGACGTATAAGTACCTCCAAACATGATGTAAGTGCACTAAAACC-------------------GAGCCATGTCTCTGTACACTCACTAACCCATATGTCAGCTG-TGTGACTGTTCCATGGATTCAT---AACATGAGAGCTCTGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 281990 271 + 647215 GAGGGTAGTTTATAGTAGCAAGGGAACTCCTCCGCACTAGTGGCATGGACTGAGTTGCAAACTGGGACAATGCCAGCAAGAAAAAAAAACCCCAGAAGGCATTGAAAAATCTGACACTATTGTGTCAATGTATAACTACCTCCAAACAGGATGTAAGTGCACCAAAACCACAAATTTGAATTTGACAAGAGCCATATCTCTGTACACTCACTAACCCATATGTCAGCTGGTGTGACTCTCC--TGGACTCAGTTAAACATGAGAGCTCTGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 144394 169 + 294542 GGACCTTTTTTAATGAATTGTATACTGTATATGTGTTTTCTTAAATAGCAAAAAACATTATTGTTGTGTACAGCTACATAAATACAAGACAGGGAAGAGTTGTACCAGTTTCCAGGCTCTTGACACAAAGTAAGCTCATCAGGAGTTGTACATTTGGGCAGTAGAACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293443 169 + 636262 GGACCTTTTTTAATGAATTGTATACTGTATATGTGTTTACTTAAATAGCAAAAAACATTATTGTTGTATACAGCTACATAAATACAGGATGGAGAAGAGTTGTACCAGTTCCCAGGCTCTCGACACAAAGTATGCTCATCAGGAGTTGTACATTTGGGCAGTAGAACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 282261 169 + 647215 GGACCTTTTTTAATGAATTGTATACTGCATATGCGTTTTCTCAAATAGCAAGAAACATAATTGTTGTGTACAGCTATATAAATACAAGGCAGGGAAAAGGTATGCCAGTTTCCAGGCACTTGACACTAAGTGAGCTCATCAGGAGTTGCACACTTGGGCACTAGAAATG + +a +s mr.mrrefChr5 144563 253 + 294542 TATCAGATGAGTTCCACCTATTTGCAAAAAAAGATGGATGAAGAATAACCCTCTATTTGCAGTTTAGATCGCCAGGGATTCTCTAGGATTTAAAATCTTTTTTGGTACCTGCAATAGAGTTTGATACATGGTGGCTGTAACAGGTGTTACCTATTAAGGGTCCTATTGCAAAGTCATTCTGATCAGTAGATGTTACTTTTGTGAATTAGGTTGAATTAAGATTAATATGTGGCTCTACCTTAATTCATCTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293612 250 + 636262 TATCAGACGAGTTGCACCTATTTGCAAAAAAAGATGG-TGGAGAATAACCCTATTTTTGCAGTCTAGATCGCCAGGGAATCTCTAGGATTTAAAATCTTTATTGGTACCTGCAATAGAGTTTGATACATGGTGGCTGTAACAGGTGTTACCTATTAAGGGTCCTGTTGCAAAGTCATTCTGATCAGTAGAGGTTACTTTTGTGAATTAGGTTGAATTAAGATTAACATGTGGCTCTACCTTAATTCATCTT-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 282431 245 + 647215 TCTCAGGTGAGTTCCACCTATTTGCATAAAAAGCTGGATGAAGAACAACCCTCTATTTACAGTTTAGATCAT----GATTCTCTAGGAGATAAAATCTTTTTCGGTACCTGCAATAGAGTTTTATGCATGGAGGCTGTAAAAGGTGTTAGCGATT----GTTCTATCTTGATGTCAGACTGATCAGTAGATGTTACTTTTGTGAATTAGGTTAAATTAAATTTAATATGTGGCTCTGCCTTAATTCATCTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 144816 93 + 294542 GATTATAGCTGTATGTGTGTTGGGCTGCTGCCTCTTTTGACAGTTAACTCAGAAATGGAGTTCATTTATTGACTCTTACTCTCAAATCTAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293862 89 + 636262 ----ATAGCTGTATGTGTGTTTGGCTGCTGCCTCTTTTGACAGTTAACTCAGAAATGGAGTTCATTTATTGACTCTTACTCTCAAATCTAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 282678 92 + 647215 GATTATAGCTGTATGTGTGTTGGTCTGCTGCCTCTTTTGACAGTAAACTCATAAATGGGGAGCATTTATTTACACTTAC-CTCAAATCTGAAG + +a +s mr.mrrefChr5 144909 112 + 294542 TGTAGGTCAGTATAGGTAGGACGGATAACAACAGTCTTGTCCCCTGTGACCAGGCAGTGTTCTCATATTGTCATTTTAAAACTTCAGTACACAATATATTCCAATGTGATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 293951 112 + 636262 TGTAGGTCAGTATAGGTAGGACGGATAACAACAGTCTTGTCCCCTGTGACCAGGCAGTGTTCTCATATCGTCATTTTAAAACTTCAGTACACAATATATTCCAATGTGATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 282773 112 + 647215 TGTGGGACAGTATGTGTAGGGCAGATAACAACAGTCTTGTCCTCTGTAACCATGCAGTGTTCTCATATTATCATTTTAAAACTTCAGTACACTAGATATTCCAGGGTGATAA + +a +s mr.mrrefChr5 145021 10 + 294542 TATAAGCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294067 10 + 636262 TATAGGCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 282885 10 + 647215 TAAAAGCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 145031 63 + 294542 GGGAATCTGACCAGTATCCATGGTTAGCAATATGACATTGGAGTGTGTACAGCTGATAACTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294078 63 + 636262 GGGAATCTGACCAGCATCCTTGGTTAGCAATATGACTTTGGAGTGTGTACAGCTGATAACTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 282895 63 + 647215 TGGAATCTGGCCAGTATCCATGGTTAGCAATATGACATTGAAGTCTGTACAGCTTATAACTAG + +a +s mr.mrrefChr5 145094 25 + 294542 AGATAAGTACTAGGTCAAGGCAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294141 25 + 636262 AGATAAGTACTAGGTCAAGGCAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 282959 25 + 647215 AGATAAGTACTAGGCCAAGGCGATT + +a +s mr.mrrefChr5 145119 581 + 294542 GGGCTGGCAAAACATGAGTGCAGGTAAGGTTCACCCAAAAAGTATCTAAAACTGCTACCCTTATCATTATAGGAACAATAGTAGTGTCTGTCCCTGTCTGTGATCCAACCTGACATGCATCTTGTGTTGTCCTGTGTGAAGACTGTGATTAGGCAATATGGTAGCCCCCTCATAGCCATTGACCTTTCCGAAGGCAGACTCCAACCTAGGGTGCTTGTAGTATACCTAACAATGTGACTCTCTGTGCTAGCATGCCCTTACATAAGGCGCTGAATGAGAGAAATATAGTGAAGAGTCATTGCCTTACGTCATTAAGTCCAAAATCGTTAATACGGAAACAACTGACAACCTCCAGCTGAGCATTTTGATGCAAGAAAGTGAGAAGTACCATATCAATATGTTTTAACAACCATGGAAGTACATGCCAACTGGTTAGTGGATGCCAACTGGTCTAGTGGATCCTCCAACAAGTGCTAAATGATACAATCTACACTTCATGGCAAAGAATCCAACTTAGATGTTTGATCTCCTTTGACTTACCCTGACGTAAcatttaatattaggctagcaaaccagttagc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294166 581 + 636262 GGGCTGGCGAAACATAAGTACAGGTAAGGTTCACCCAAAAAGTATCTAAAACTGCTACCCTTATCATTATAGGAACAATAGTAGTGTCTGTCCCTGTCTGTGATCCAACCTGACATGCATCTTGTGTTGTCCTGTGTGAAGACTGTGATTAGCCAATATGGTCGCCCCCTCATAGACGTTGATTTTCCCAAAGGCAGACTCCAACCTAGGGTGCTGGTAGTATAACTAACAATATGATTCTCTGTGCTAACATACTCTTACATAAGGCGCTGAATGAGAGAAATATAGTGAAGAGTCATTGCCTTACGTCATTAAGTCCAAAATCATTAATACGGAAACAACTGACAACCTCCAGCTGAGCAATTTGATGCAAGAAAGTGAGAAGTACCATATCAATATGTTTTAAAAACCATGGCAGTACATGCCACCTGGTTAGTGGATGCCAACTGGTCTAGTGGATCCTCCAGCAAGTGTTAAATGATACAATCTACACTTCCGGGCAAAGAATCCAACTTAAATGTTTGATCTCCTTTAACTTTCCATGACGTAACATTTAATATTATGCTAGCAAACCAGTTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 283005 581 + 647215 AAGCTGGCAAAACATGAGTGCAGATAAGAGACTCCCAAAAAGTATCCAAAACTGCTACCCTTATCGTTATAGGGACGTTAGTAGTGTCTGTCCTTATCTGTGATCCAACCTGACTTACATCTTGTGTTGTCCTGTGTAATGACTGTGATTCGGCAATATGGTAGCCCCCACATAGCCATTGACCTTTGAGAAGGCAGACTCCAACCTAGGGTGATTGTAGTATACCTAACAATGTGACTCTCTGTGTTGGCATGCCCCTACATAAGGCGCTGAATGAGAGAAATAGAGCAAAGAGTCCTTGACTTATGTCATTTAGACCAAAATCGTTAATATGGATACAACTGACAACCTCCAGCTGAGCATTTTGATGCAAGAAAATGAGAGGTACGATATCAATATGTTGTAGCAACAATGGAAGGACATACTAACTCGTTAGTGGGTGCCAACTGGTGCCGTAGATCCTTCAACAAGTACAAAATGATACAATCTACACCGCATGTCAAAGAATCCTACTTAGATGTTGGATCTCCTTTGACTTACACTGATGTAAcatttaatattagaataacaaaccagttagc + +a +s mr.mrrefChr5 145700 61 + 294542 ttatttaacagtgtgattctttaaggtgatgtaaatagaagtcggtcttattctgcttaga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294755 61 + 636262 TTATCTAACAGTGTGATTCTTTAAGGTGATGTAAATAGAAGTCGGTCTTATTCTGCTTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 283586 61 + 647215 gtatttaacagtgtgactctctaaggtgatgtaagtagtagtcagtcttatgctgcttgga + +a +s mr.mrrefChr5 145761 57 + 294542 ctacaatctattgaaactgagggagttgaaggaggcatttcgccaatttggaaaaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294832 57 + 636262 CTACAATCTATTGAAACTAAGAGAGTTGAAGGAGGCATTTCGCCAATTTGGAAAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 283647 57 + 647215 ctgcaatctattgaaactgagggagttgaagtagacatttcaccgatttggaacaag + +a +s mr.mrrefChr5 145818 94 + 294542 ctgtgtgttgtactgatttccaaaGCACGCCATAGGATAAAGTGATGGTTGTAACCAGGATCTGGTGGCCTAGAAAAGATGTCACGGGTGATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294890 94 + 636262 CTGTGTGTTGTACTGATTTCCAAAGCACGCCATAGGATAAAGTGATGGTTGTAACCAGGATCTGGTGGCCTAGAAAAGATGTCACGGGTGATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 283704 94 + 647215 ttgtgtgttgtgctgatttccaaaGCATGGCATACGACAAAGTGATGTAGGTAACCAGGATCTGGTGGCCTAGAAAAGACGACAAAGTTGATTA + +a +s mr.mrrefChr5 145912 27 + 294542 TTGTGAATACAGCCTGACTTGTCCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 294984 27 + 636262 TTGTGAATACAGCCTGACTTGTCCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 283803 27 + 647215 TCGTGAACCCAGCCTGAGTCGTTGGCT + +a +s mr.mrrefChr5 145939 302 + 294542 TGCACCAAAATAGTGCCATTCAATAATGTCTCACAAAGCTtaaccactgacttgttctttttagatccacacaggctctttaacttgtgtacatccacacatgcttgttgattttgggtttaactgcagttgacttcggattcttcagcattgactttggcatcttcagcgtgtatgcttcttctgtgctaatgtctagaatggtgcttccaagattatcctgtaaacttttcctgctctttgggcgatgagaatctaaaactttattatactgaccttgtttcttcgaaactgcacctggt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295011 302 + 636262 TGCACCAAAATAGTGCCATTCAATAATGTCTCACAAAGCTtaaccactgacttgttctttttagatccacacaggctctttaacttgtgtacatccacacatgcttgttgattttgggtttaactgcagttgacttcggattcttcagcattgactttggcatcttcagcgtgtatgcttcttctgtgctaatgtctagaatggtgcttccaagattatcctgtaaacttttcctgctctttgggcgatgagaatctaaaactttattatactgaccttgtttcttcgaaactgcacctggt +s simRat_chr6.simRat.chr6 283840 302 + 647215 TGCACCAAAATAGTTCTGTTCAATAATGTCTCATGAAGCTtagctactgactcgtattctttagatccacacgggctctttaacttgtgtaagtccacacatccttgttgattttgggttgaggtgcagttgactttggcatctccaacattgactttggagtcttcagcatgtacgcttcttctgtgcaaatacctagaatgatgttttcaagattatcctgtaaggttttcatgctctttgggggatgagaatttagaactttagtatactcacattgtttcttccaaactgcacctggt + +a +s mr.mrrefChr5 146241 104 + 294542 attaagaaaggctcaagttttaacccttggcagattgataaccagttcctccaacatcacctacttattgagtagcgaatcgttggcccccttaaggcttcgct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295329 104 + 636262 attaagaaaggctcaagttttaacccttggcagattgataaccagttcctccaacatcacctacttattgagtagcgaatcgttggcccccttaaggcttcgct +s simRat_chr6.simRat.chr6 284142 104 + 647215 attaagaaaggcccaagttttaacccttggcggattgataaccagttcctcctacatcacctacttattgaatagtgaatccttggcccacttagggtttcact + +a +s mr.mrrefChr5 146345 16 + 294542 acaaaacgtgatccag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295433 16 + 636262 acaaaacgtgatccag +s simRat_chr6.simRat.chr6 284247 16 + 647215 accaaatgtgacacag + +a +s mr.mrrefChr5 146361 77 + 294542 tagtagatggatagttggacgatagaaccagccttagacagctccattttatttccacgtaaagtaatgattttcag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295449 77 + 636262 tagtagatggatagttggacgatagaaccagccttagacagctccattttatttccacgtaaagtaatgattttcag +s simRat_chr6.simRat.chr6 284264 77 + 647215 tagtaaatgggtagttggaggatagaaccaaccttagacggctccatttgatttctacataaagtaatgattttCAG + +a +s mr.mrrefChr5 146438 5 + 294542 atacc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295526 5 + 636262 atacc +s simRat_chr6.simRat.chr6 284775 5 + 647215 ATACC + +a +s mr.mrrefChr5 146443 11 + 294542 aggatactttc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295531 11 + 636262 aggatactttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 284784 11 + 647215 AGGATGCTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 146454 80 + 294542 gcagtaaaaattgaaagcaggaagcatgatctggccgtcttgatttttttcatttagaatcaactttgacatgggccctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295555 80 + 636262 gcagtaaaaattgaaagcaggaagcatgatctggccgtcttgatttttttcatttagaatcaactttgacatgggccctc +s simRat_chr6.simRat.chr6 284795 80 + 647215 gcagtaaagcttgacatgaagaagcatgatcctgccagctcaatttttttcatttagaatcaaatttgacacgggttcgc + +a +s mr.mrrefChr5 146534 12 + 294542 tttttgatttgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295636 12 + 636262 tttttgatttgt +s simRat_chr6.simRat.chr6 284875 12 + 647215 tctttgatctgt + +a +s mr.mrrefChr5 146546 79 + 294542 caccaacggtttttttacccaatggtttttttacaagcagtgaacaagcagggccatcgttgtcttgataggatgtcct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295648 79 + 636262 caccaacggtttttttacccaatggtttttttacaagcagtgaacaagcagggccatcgttgtcttgataggatgtcct +s simRat_chr6.simRat.chr6 284888 79 + 647215 caaaaacggtttttttacccagtggtttttttacaagcagtgaacaagctgggccatcactgtcttgataggatgtcct + +a +s mr.mrrefChr5 146625 12 + 294542 atcaaatctgta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295732 12 + 636262 atcaaatctgta +s simRat_chr6.simRat.chr6 284967 12 + 647215 atcaaatctgaa + +a +s mr.mrrefChr5 146637 34 + 294542 aagactaggtttctcagattcaaaatgttcacct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295757 34 + 636262 aagactaggtttctcagattcaaaatgttcacct +s simRat_chr6.simRat.chr6 284979 34 + 647215 aggactagatttctcagattcaaaacattcacct + +a +s mr.mrrefChr5 146671 13 + 294542 aagatttaataat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295802 13 + 636262 aagatttaataat +s simRat_chr6.simRat.chr6 285013 13 + 647215 aagatttgataat + +a +s mr.mrrefChr5 146684 27 + 294542 ttgacattaatattggtttcccctatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295816 27 + 636262 ttgacattaatattggtttcccctatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 285026 27 + 647215 ttggcatgaatattggtttcccctatt + +a +s mr.mrrefChr5 146711 15 + 294542 aatttcaagaaaagg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295845 15 + 636262 aatttcaagaaaagg +s simRat_chr6.simRat.chr6 285053 15 + 647215 aatttttagaaaggg + +a +s mr.mrrefChr5 146726 22 + 294542 ttgcaaatcctagtaggctctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295861 22 + 636262 ttgcaaatcctagtaggctctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 285068 22 + 647215 ttgcaaatcctagtaggatcct + +a +s mr.mrrefChr5 146748 13 + 294542 tgatgtcttgtac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295883 13 + 636262 tgatgtcttgtac +s simRat_chr6.simRat.chr6 285103 13 + 647215 tgatgtcttgtac + +a +s mr.mrrefChr5 146761 8 + 294542 aattcact +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295896 8 + 636262 aattcact +s simRat_chr6.simRat.chr6 285136 8 + 647215 aattcact + +a +s mr.mrrefChr5 146769 11 + 294542 tgggttaatca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295904 11 + 636262 tgggttaatca +s simRat_chr6.simRat.chr6 285145 11 + 647215 cgggtcagtca + +a +s mr.mrrefChr5 146780 18 + 294542 tcgagggcaattcactca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295915 18 + 636262 tcgagggcaattcactca +s simRat_chr6.simRat.chr6 285195 18 + 647215 ttgaaggccattcactca + +a +s mr.mrrefChr5 146798 102 + 294542 tgctgtaaactacctgttggttattcttgtatatagaagtatgtgacttgggcacattaactttatcactggcaacttcactcagagtactagtagtttgag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 295933 102 + 636262 tgctgtaaactacctgttggttattcttgtatatagaagtatgtgacttgggcacattaactttatcactggcaacttcactcagagtactagtagtttgag +s simRat_chr6.simRat.chr6 285216 102 + 647215 cactgtgaactgtctgttggatattcttgtatataaatgtatgtgactcgagcacattgactttatcaccagaaacatcactcagagtactagtagttctag + +a +s mr.mrrefChr5 146900 88 + 294542 aaggttactgctcaacagtgtaggccttccttagtatacaatcatggaacctgcaaatacagaaagcataaccctctcctcgcccaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296035 88 + 636262 aaggttactgctcaacagtgtaggccttccttagtatacaatcatggaacctgcaaatacagaaagcataaccctctcctcgcccaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 285373 88 + 647215 Aaggttactggtcaacagtgtcagcctccctaagtatacaaccatgtcatctgcaaatacagaaagtataaccttcacctcacccaat + +a +s mr.mrrefChr5 146988 9 + 294542 cacactgca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296126 9 + 636262 cacactgca +s simRat_chr6.simRat.chr6 285461 9 + 647215 cacacagcc + +a +s mr.mrrefChr5 146997 17 + 294542 ctcatctctcccctggc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296135 17 + 636262 ctcatctctcccctggc +s simRat_chr6.simRat.chr6 285474 17 + 647215 ctcatctttcccctggc + +a +s mr.mrrefChr5 147014 191 + 294542 attgtcctgtggctctggctgattgagaatggtcaacatgtaatcatttttgatttgcttaatcagttggacatatctaggaatggatatcatcatatgcttgttctgattgctgcggtttttgggttgtatcacatttataggcctgcgtgattttagctaacccagctctccagttgtgaaccaaacga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296273 191 + 636262 attgtcctgtggctctggctgattgagaatggtcaacatgtaatcatttttgatttgcttaatcagttggacatatctaggaatggatatcatcatatgcttgttctgattgctgcggtttttgggttgtatcacatttataggcctgcgtgattttagctaacccagctctccagttgtgaaccaaacga +s simRat_chr6.simRat.chr6 285491 191 + 647215 attgccctgcggttctggctgattgagaatgatcagcatgtaatcattgttgatttgcttaattagttggacatatctatgaatggatataatcatatggttgttctgatcgctacagtttttgagttgtatcacagttacaggcttgcgtgattttggctaccccagcactccagttgtggacaagacaa + +a +s mr.mrrefChr5 147205 18 + 294542 ttggtacctagtgcaggg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296464 18 + 636262 ttgGTACCTAGTGCAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 285978 18 + 647215 tcagtacttagttcaggg + +a +s mr.mrrefChr5 147223 25 + 294542 ggacaagaacatagcaaatacattg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296482 25 + 636262 GGACAAGAACATAGCAAATACATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 285997 25 + 647215 ggacaagataaaagcagataggttg + +a +s mr.mrrefChr5 147248 102 + 294542 agcttggaatccacagtgcgaggccgatgatgtttttgctttgtgatgatttaaacatcagctgggttggtggttatcaccccatttttcaaacctatataa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296541 102 + 636262 agcttggaatccacagtgcgaggccgatgatgtttttgctttgtgatgatttaaacatcagctgggttggtggttatcaccccatttttcaaacctatataa +s simRat_chr6.simRat.chr6 286022 102 + 647215 agcttggaattcatagtttgatgccattgatgattttactctgtgatggtttacatgtcagctgggttggaagttatcaccccacttttcaagcctatatga + +a +s mr.mrrefChr5 147350 153 + 294542 ttgtcactgttagcaaaggtctatctgttttgttaatttagtcaaaagacccgggctttcgactcgttgaccttactcaaagtctccagcattttagtgctctttaaattaaattttatcgtggccattttatgctatctgccctttaatgcg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296643 153 + 636262 ttgtcactgttagcaaaggtctatctgttttgttaatttagtcaaaagacccgggctttcgactcgttgaccttactcaaagtctccagcattttagtgctctttaaattaaattttatcgtggccattttatgctatctgccctttaatgcg +s simRat_chr6.simRat.chr6 286146 153 + 647215 ttgtcactgttagcaaaggcctatccattttgttagtttagtcacaaagccagggttttggactcattgaccttactccaggtctcccgcattctagtgccctttaaatcaaattttatcttagccattttctgctagctgctcataaaggta + +a +s mr.mrrefChr5 147503 32 + 294542 aaactcctcagttctttcagtctgaacttcta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296796 32 + 636262 aaactcctcagttctttcagtctgaacttcta +s simRat_chr6.simRat.chr6 286300 32 + 647215 aaactccgaagttctttccatcagaactacca + +a +s mr.mrrefChr5 147535 62 + 294542 tactatgtgtaatatccctcatcccgtctgcccggcatcacacaactgttccaacacccccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296831 62 + 636262 tactatgtgtaatatccctcatcccgtctgcccggcatcacacaactgttccaacacccccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 286332 62 + 647215 taccatgtgtaatgtccctcatcccttccgcatggcatcgcacaactgttctaacacccctc + +a +s mr.mrrefChr5 147597 104 + 294542 taatccagtactaaatagctcccagatgttctgatatgtggggggttgtggttctcattacctttaagagacatcctgatctctggcttaatttcattatgaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 296894 104 + 636262 taatccagtactaaatagctcccagatgttctgatatgtggggggttgtggttctcattacctttaagagacatcctgatctctggcttaatttcattatgaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 286394 104 + 647215 cgatccagttctaaagagctcccagatgttctgatatgtgggcagtcgtggttctcattactctcaaaggacatcttgatctctggctaaatctcaGTATAAgg + +a +s mr.mrrefChr5 147701 39 + 294542 cttaatattcttttttttccgctccgtattgtggttact +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297006 39 + 636262 cTTAatattcttttttttccgctccgtattgtggttact +s simRat_chr6.simRat.chr6 286498 39 + 647215 cttaatttccttttttttctgctctgtatcgtgcttact + +a +s mr.mrrefChr5 147740 29 + 294542 ctgaaattggccccactatagtgagcaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297046 29 + 636262 ctgaaattggccccactatagtgagcaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 286537 29 + 647215 ctaccattggccccagggtagtgagcaag + +a +s mr.mrrefChr5 147769 22 + 294542 catctacaaggagaaatgttca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297075 22 + 636262 catctacaaggagaaatgttca +s simRat_chr6.simRat.chr6 286570 22 + 647215 catctacaagtataaatgttca + +a +s mr.mrrefChr5 147791 65 + 294542 gttatcattgctaactgtttgttggaccatagtgaaataatcagcttaggtctggaacacaggtc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297097 65 + 636262 gttatcattgctaactgtttgttggaccatagtgaaataatcagcttaggtctggaacacaggtc +s simRat_chr6.simRat.chr6 286593 65 + 647215 gttatcatcaccaactgtatgctggaccagagtgaaataatcagcttaggtccggaaaggaggtc + +a +s mr.mrrefChr5 147856 14 + 294542 actgatagaaatca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297162 14 + 636262 actgatagaaatca +s simRat_chr6.simRat.chr6 286659 14 + 647215 acagctagaaacca + +a +s mr.mrrefChr5 147870 139 + 294542 ggcaggacacttaccccgaataacctcacactgatggctctcctacagcctgaattggatgcaaagtctcgtgaatattaatctagtcaagtggacttggtcagaaggtgagttcaatcattgggtgttctcattCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297177 139 + 636262 ggcaggacacttaccccgaataacctcacactgatggCTCTCCTAcagcctgaattggatgcaaagtctcgtgaatattaatctagtcaagtggacttggtcagaaggtgagttcaatcattgggtgttctcattCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 286673 139 + 647215 ggcagggcacttacgcagaataacctcgcgccagtagctctcctacaatcagcattggacgcaaagtctggtaaatattaacctagtcaagtggacttggtggggaagtcagtatgatcattgggtgttctcattTATG + +a +s mr.mrrefChr5 148009 52 + 294542 TGTAGGTGGTGTACACCTGTCACATACTACCAGGTCTCATGCCTGTTGTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297317 52 + 636262 TGTAGGTGGTGTACACCTGTCACATACTACCAGGTCTCATGCCTGTTGTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 286812 52 + 647215 TATAGGTGGCGTACATCTGTCACACACTACTAGGTCTCATGCCAGTTGTCGC + +a +s mr.mrrefChr5 148061 31 + 294542 ACTAACTTATCCAGAATTGTAACAGAATTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297376 31 + 636262 ACTAACTTATCCAGAATTGTAACAGAATTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 286864 31 + 647215 GCTACCTTATCCAGAGTTGTAACATAATTGC + +a +s mr.mrrefChr5 148092 71 + 294542 aaagaaaaccaggatgccagtcattacttgaccatgagtgcacccattgtctccaacttacagccatacat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297407 71 + 636262 AAAGAAAACCAGGATGCCAGTCATTACTTGACCATGAGTGCACCCATTGTCTCCAACTTACAGCCATACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 288277 71 + 647215 atagagaaccagtgggccagtcatcgcttgattgggagtggactgatcatctcaaacttacaaccatacat + +a +s mr.mrrefChr5 148163 4 + 294542 tgat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297485 4 + 636262 TGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 288348 4 + 647215 tgct + +a +s mr.mrrefChr5 148167 36 + 294542 atcaaattacattcttaggaacaGTGTAAGAGTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297490 36 + 636262 ATCAAATTACATTCTTAGGAACAGTGTAAGAGTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 288352 36 + 647215 atcaaattaaataactaggaaccATACAAGGCCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 148203 190 + 294542 ACTTAAGTATGTGGTCCACCTGCTAAAATTAAAGATGGAAGCTACTTAAGAATCAGACAAATGTTTTATGGGTTGTCAGACTTAGTTGGAAAGACATGAAAGTACAAATTTACAACATACATCTAGCCTTAACAGGTAGATGAGAAGCCATCTGAGTCCGAACAGTTGGACAGTACTACTCCACCTAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297526 190 + 636262 ACTTAAGTATGTGGTCCACCTGCTAAAATTAAAGATGGAAGCTACTTAAGAATCAGACAAATGTTTTATGGGTTGTCAGACTTAGTTGGAAAGACATGAAAGTACAAATTTACAACATACATCTAGCCTTAACAGGTAGATGAGAAGCCATCTGAGTCCGAACAGTTGGACAGTACTACTCCACCTAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 288390 190 + 647215 ACTTAAGTACACAGTCCACCTGCTAAAATTAAAGATGGTAGCTACTTAAGAATCAAACACATGTTTTATAGGTTGTCAGACTTAGTTGGAAAGACATGAAAGTACTAATTTACACCAAACATCCAGCTATAACAGGTAGGTGAGAACCTGCCTGAGTCTGAAAAGTTGGATGGTAATACACTACATAATT + +a +s mr.mrrefChr5 148393 62 + 294542 CTTAGTACTAGAAGATAAGAAACATCAACAATACCAGAATTTATTGAGAATAAGGTTTATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297716 62 + 636262 CTTAGTACTAGAAGATAAGAAACATCAACAATACCAGAATTTATTGAGAATAAGGTTTATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 288586 62 + 647215 CTTAGTATAGCAAGATCAGAAACATAAATAATACCAAAATTTGTCAAGAGTAAGATTTATCC + +a +s mr.mrrefChr5 148455 49 + 294542 CACAATGAAGCCAAACAGAAGGGCACTACATATTAGAACAGAAATAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297794 49 + 636262 CACAATGAAGCCAAACAGAAGGGCACTACATATTAGAACAGAAATAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 288648 49 + 647215 CACAATGACGCCAAACAGAAGGCAGCTACATATTAGAATAGAAAAAATA + +a +s mr.mrrefChr5 148504 101 + 294542 AATGGAGGCCAAGAAGGCATAAGACTCCAAAAATCTGCCTCCACAGTCAACAAGGAGCTTAGGAGTTAGGTCAAAACCAGCTGTTCACTCCTAAGAGGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297843 101 + 636262 AATGGAGGCCAAGAAGGCATAAGACTCCAAAAATCTGCCTCCACAGTCAACAAGGAGCTTAGGAGTTAGGTCAAAACCAGCTGTTCACTCCTAAGAGGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 288699 101 + 647215 AGTGGAGGCCAAGAAGGCATAAGACTCCAGAAATCAGCCTCCACAGTCAACGAGGAGCTTAGGAGTTACATCCAAGCCAGTTGTCCACTCCTTAGAGGGTT + +a +s mr.mrrefChr5 148605 71 + 294542 AGTCACCCAAGTCACCTAGGTCTATGATGCACCCTTGCACACATACCACAAGACGGCCAAAGATAGAAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 297944 71 + 636262 AGTCACCCAAGTCACCTAGGTCTATGATGCACCCTTGCACACATACCACAAGACGGCCAAAGATAGAAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 288802 71 + 647215 AGTCACTCAAGTCACCTAGCTCTATGATGCACTCTTGTAGATAGAGCACAAGACAGCCAAAGATGGAAATA + +a +s mr.mrrefChr5 148676 18 + 294542 CTAAGCAAGAGGCATGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298019 18 + 636262 CTAAGCAAGAGGCATGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 288873 18 + 647215 CTAAACAAGAGGTATGAA + +a +s mr.mrrefChr5 148694 97 + 294542 CAAAACTGCTACAAAGGCAAAGATGTCCATGCCTCAGAGCTAAAACAGCATACATTTCCCTTCTTTATTTCAATAAGTTGATATCTCCTCAACTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298037 97 + 636262 CAAAACTGCTACAAAGGCAAAGATGTCCATGCCTCAGAGCTAAAACAGCATACATTTCCCTTCTTTATTTCAATAAGTTGATATCTCCTCAACTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 288894 97 + 647215 CAAACCTGCTATATGGGCTAAGATGTCTGTGCCTCAGAGCTAGAACAGGATACATTTTCCTTCCTTGTTTCAATAAGTTGATATCTCCTTAACTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 148791 18 + 294542 CAGGAGGTCCTTATGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298134 18 + 636262 CAGGAGGTCCTTATGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 288992 18 + 647215 CAAGAGGCCCTTATGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 148809 56 + 294542 ACACATAAAGAGCCAGCTCATACTTCAGAACTTGGAGTGAAATGCATACTCATTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298175 56 + 636262 ACACATAAAGAGCCAGCTCATACTTCAGAACTTGGAGTGAAATGCATACTCATTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 289010 56 + 647215 ACACGTAAAGAGCCAACTCATACTTCAGAACTTGGAGTAAAATGCATACTCATTTA + +a +s mr.mrrefChr5 148865 61 + 294542 AGCATTCTGGGGGGCTTGACCTCAAAAAATGAACACACTAAGTCCATTTTAAGCCTCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298231 61 + 636262 AGCATTCTGGGGGGCTTGACCTCAAAAAATGAACACACTAAGTCCATTTTAAGCCTCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 289067 61 + 647215 GGCATTGCAGGGGGCTTAAGCTTAAAAAATGAACACATTAAGTCCATCCTAAGCCCCATAG + +a +s mr.mrrefChr5 148926 69 + 294542 GAATGCATTAAGTCCATTTCCAACCTCATACCATGAGTGTAAAAAAGACTAGTTAGTGGTTCTGTGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298292 69 + 636262 GAATGCATTAAGTCCATTTCCAACCTCATACCATGAGTGTAAAAAAGACTAGTTAGTGGTTCTGTGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 289165 69 + 647215 GAATGCATTAATTCCATTGCAAACCTCATAGGATAAGAGTAAAAAAGGCCAGTTTGGGGTCCTGTGCTG + +a +s mr.mrrefChr5 148995 20 + 294542 CCTTTCATGTGTGGTAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298361 20 + 636262 CCTTTCATGTGTGGTAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 289235 20 + 647215 CCCTTCATGTGTGGTATCTT + +a +s mr.mrrefChr5 149015 27 + 294542 TGTCCTCTCAGGTCAACTGGGGATTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298397 27 + 636262 TGTCCTCTCAGGTCAACTGGGGATTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 289255 27 + 647215 TGTATGCTTAGGTCAACTGGGGATTAG + +a +s mr.mrrefChr5 149042 10 + 294542 AAAATAGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298424 10 + 636262 AAAATAGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 289286 10 + 647215 AAAACAGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 149052 53 + 294542 ATTTGCACACGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAACATTTTGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298434 44 + 636262 ATTTGCACACGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAAC--------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 289300 53 + 647215 ATTTGCACATGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAACATTTTGAGG + +a +s mr.mrrefChr5 149105 52 + 294542 AGCTACATTACTCTATTCATGGCCTAGGGCAATTTAAGGAAAGGGTGAACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298478 39 + 636262 -----CATTACTCTGTTCATGG--------AATTAAAGGAGAGGGCGTACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 289354 52 + 647215 AGCTACATTACTCTATTCATGGCCTAGGGCAAATTAAGGAAAGGGTGAACTG + +a +s mr.mrrefChr5 149157 197 + 294542 AGACATGAGACATGCATCGCCACCTAATTATCTCATAAGGCAACATAAAATAGTTAAGAGTATGATGTGTGGTGATGGCATAAGGCTGCACTTTGAGAAAATCTAAAAACAGAGAGTTACCTCTAGCCACAGCAATGTGCTCGCACAAGCAGTCTAACAGCACAGCGATGGGCTTGTTCAAAGCATGGAATAAGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298517 193 + 636262 AGACATGAGACATGCATCGCCACCTGATTATCTCATAAGGCAACATAAAGTAGTTAAGAGTATT---TGTGGTGATGGCATAAGGATGCACTTTGAGAAAATCTAGAAACAGAGGGA-ACCTCTAGCCACGGCAATGTGCTCGCACAAGCAGTCTAACAGCACAGCAATGGGCTTGTTGAAAGCATGGAATAAGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 289409 197 + 647215 AAATATGAGACATGCATCACCACCCAATTATCTCATAAGGCAACATAAAAAAGTTAAGAGTATGATGTGTGGTGATGACATAAGGCTTCACTTTGAGATAATGTTAAAACAGAGAGTTACCATTAGCCACAGCAATGCGCTTACACAAGCAGTCTAACACCACAGCGATGGGCTTGTACAAAGCATGGAATACCATA + +a +s mr.mrrefChr5 149354 68 + 294542 GTGTGAACTTGCCATAAGTAGGGTTTTCACTGACGAACAACTCATCAGTAGCTGAATAATACCCCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298722 64 + 636262 GTGTGAACTTGCAATAGGTAGGGTTTTCACTGAC----AACTCATCAGTAGCTGAATAATCCCCCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 289606 63 + 647215 -----CACTTGCCATAAGAAAGGTTTTTACTAACGAACAACTCATCAGTAGCTGAATAATACCCCTAA + +a +s mr.mrrefChr5 149422 78 + 294542 TAGGGGGTGCACACTAAAGGAACAACGCAACATATCCCTACCTTGTGAGCCTGAGCTCACCGTCCGCATTGTAAGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298786 78 + 636262 TAGGGGGTGCACACTAAAGGAACAACGCAACATATCCCTACCTTGTAAGCCTGAAGTCACCGTCCGCATTGTGAGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 289676 78 + 647215 TAGGAGGTGCATGCTAAAGGAACAACACGACATATCCCTACCTTAAGAGCCTGAGCGCGCCTTCTGCATTGTAGGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 149500 22 + 294542 TGTCACTTTGGGAAAGCAAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298865 18 + 636262 TCTCACTTTGGAAAAGCA---- +s simRat_chr6.simRat.chr6 289754 22 + 647215 TGTCACTTTAGGAAAGAAAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 149522 36 + 294542 GAATGGTGGTGGATCATTAGAAATACCAGTTTGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298883 36 + 636262 GAATGGTGGTGGATCATTAGAAATACCAGTTTGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 289777 36 + 647215 GGATGGTAGTGGATCATTAAAAATAACAGTTTGGGT + +a +s mr.mrrefChr5 149558 8 + 294542 GAGGTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298942 8 + 636262 GAGGTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 289813 8 + 647215 GAAATCTA + +a +s mr.mrrefChr5 149566 138 + 294542 CTGCCCTACAGCTCAATCCAGGATTAAGTGGTGTAGCGAAAAATGGTAAAAAATACTATGGTCCCATAGCATAGTAGATGTCTGCTTGCTACACCAGCAAGTCCTAGGTCTTGGGATTAGGTACTCCAACTGCCGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 298950 138 + 636262 CTGCCCTACAGCTCAATCCAGGATCAAGTGGTGTAGCGAAAATCGGTAAAAAATACTATGGTCCCATAGCATTGAAGATGTCTGCTTGCTACAGCAGCAAGTCCTAGGTCTTGGGGTTAGGTACTCCAACTGCCAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 289822 138 + 647215 CTGCTGTGTAGCTCAATCCAGGATTAAGTGGTGTATCGAAAAATGGTGAAAAAAACTATGGTCCCATAGCATAGTGGATGTCTGCTTGCTACACCAACAAGTCCTAGGTCTTGGGATCAGGTACTCCAACTGCCGACT + +a +s mr.mrrefChr5 149704 258 + 294542 GGCCTGGAGCCTGTGTGGCAGGTTAGATCTAAAGTGGTACATAACAGCCCCCTGATCAAATCTGTATCTTGTGATGGAGGTTTTCATGCCCAAAGATATAAGGACTAAGACACCATCTATATCAGTACTGACAATCACATTCCATGCATTTCATTTTCACTAGACCTACAGTCAACTGTATCACATGACACAGGACAGGCCACAGCCCATTCTGAGGCATTCAGAGCTTTAGTGAAGAAGTAGCTGAAGTCCACTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299088 254 + 636262 GGCCTGGAGGCTGTGTGGCAGGTTAGATCTAAAGTGGTATGTAACAGCCCCTTGATCAAATCTGTATCTTGTGATGGAGGTCTTCATGCCCAAAGATATAAGGGCTGAGACACCATCTACATCAGTACTGACAATCACATTCCATGCATCTCATTTTCACCAGATCTACAGTCAACTGT----CATTACATGGGACAGGCCACAGCCCATTCTGAGGCATTCAGAGCTTTAGTGGAGAAGTAGCCGAAGTCCACTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 289965 258 + 647215 GGCCTGGAGCCTGTGTGGCAGGTTAAATCTAAAATGGTACATAACAGCCTCCTGATCAAGTCTGTATCTTGTGATGGAGGTTCTCATGCCCAAAGATATAAGGACTAAGACACCATCTATATCAGTACTGACAAGCACATTCCATGCATTTCATTTTCACTAGACCTGCAGTTGACTGAATCACATGACACAGGACAGGCCATAGTGCATTCTGAGGCATTCAGAGCTTTAGTGAAGAAGTAGTTGAAGTTCACTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 149962 114 + 294542 GCAGGTTGAAAACAGAGATCAATTCTATGAGTCCTGTCAAAGTGGTTGTAATTATGTTAGGCACATAGCAAGATGGCTGTACAGTTGGGATAATAATTCCTCCTTTGATACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299345 114 + 636262 GCAGGTTGAAAACAGAGATCAATTCTATGAGTCCTGTCAAAGTGGTAGAAATTATGTTAGGCACATAGCAAGATGGCTGTACAGTTGGGATAATAACTCCTCCTTTGATACACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 290223 112 + 647215 GCGGGTTGAAAACAGAGATCAATTCTAAGAGTCCTGTCAACGTGGTTGTAGTTATGTTAGGCACATAGT--GATGGCTGTACAGTTGGGACAATAATTCCTCCTGTGATACAGG + +a +s mr.mrrefChr5 150076 100 + 294542 CCCATCCAGAAATAGCAAATAATTCACAATCGTATTCCCCTCATGAAGTACATTTACTACATCAAATGTTTGTAGTCCCCATACTTCATGGAGCGGTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299459 100 + 636262 CCCATCCAGAAATAGCAAATAATTCACAAACGTCTTCCCCTCATGAAGTACATTTACTACATCAAATGTTTGTAGTCCCCCTACTTCATGGAGTGGTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 290397 100 + 647215 CTCATCCAGAAATATGAAATAACTCACCATTTTATTTGCTTCATGAAGTACATTTACTACATTAAATGTTTGCGATCCCCAAACTTCATGGAGCGGGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 150176 90 + 294542 GGTGGCAATTCTTCAGTGTAACATGAAGGAGGGCTGCATTTTACTGCCATTCAAATATCTTCCCAAGATGTATGTCAATTCTTACCTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299562 76 + 636262 GGTTGCAATTCTTCAGTGTAACATGAAGGAGGGCTGCATTTTACTGCCATTTAAATATCTTCCCAAGATATATGTC-------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 290497 90 + 647215 GGTGGCAATTATGCTGTCGAATATGAAGGAGGGCTGCCTTTTACTGCCATTCAAATATCTTCCCAAGATGTATGTCAATTCTTACCTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 150266 166 + 294542 CACTGACTCTTGTCTTAATATTTCTTACATGACTTTGTATAAAATCATTCATAGTCAGAATACAAAACCCCCGTCTGCAAGATGCACAGTCTGCAGATGATAGTCTCACTCGACTAGTAGTCTATGTCCCCTGACACATCTTTAGTTGTTAATTTAAATCACCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299638 166 + 636262 CACTGACTCTTGTCTTAATCTTTCTTATACGACTTTCTATAGAATCATTCATAGTCAGAATACAAAACCCCTGTCTGCAAGATGCACAGTCTGCGGATGATAGTCTCACTTGACTACTGGCCTATGTCCCCTGACACATCTTTAGTTGTTAATTTAAATCCCCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 290589 166 + 647215 CACTAACTCTTGTCTTAATATTTCTTACATGACTTTGTATAAAATCATTCATAGTCATAATCCAAAATCCCCATCTGCAAGATGCACACTCCACAGATAGTAGTCTCACTCAATTAGTAGTGTATGTCCCCTAACAAACCTTTAGTTGTTAAGATAAACCACCATC + +a +s mr.mrrefChr5 150432 59 + 294542 GACAATTGAGTTTAACCTGGTTATCACCATAATCAGATTGGGTTACACATCAGCCTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299804 38 + 636262 GACAATTG---------------------TAATCAGATTGGGTTACACATCAGCCTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 290762 59 + 647215 CACACTTGAGTTTAACCTGGTTATCACCACAATCAGATTGGGTTACAGATCAGTCTTCC + +a +s mr.mrrefChr5 150491 15 + 294542 AGAACACTCCTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299850 15 + 636262 AGAACACTCCTTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 290821 15 + 647215 AGTACGCTCCTTCTA + +a +s mr.mrrefChr5 150506 116 + 294542 GCAAGTTGCTTGTTTAGTCCCCACAGCTGTGGATGCCACAACAATTTGAAATACAAGCTGTCTGCTTGTGAACCAGCACACATGGCAAGGGACCAATTTCAGAGCTCACATAGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299866 116 + 636262 GCAAGTTGCTTGTTTAGTCCCCACAGCTGTGGATGCCACAACAATTTGAAATACAAGCTGTCTGCTTGTGAACCAGCACACATGGCAAGGGACCAATTTCAGAGCTCACATAGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 290836 116 + 647215 GCGAGTTGCTTGTTTAGTCCCCACAGCCATGGATACTACAACAATTCAAAATCCTAGCTGTCTGCTCGAGAACCAGCACACATGACATGGAACCAATTTCAGAGTTCATATAGGCC + +a +s mr.mrrefChr5 150622 13 + 294542 GGTTACCAAGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299982 13 + 636262 GGTTACCAAGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 290987 13 + 647215 TGTTACCAAGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 150635 76 + 294542 TGGGATAAGGGGATTCGTCATTCTTCGTGATTACAACCAAGGTTCAATATATCTTCAGATGGATGATCTACATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 299995 76 + 636262 TGGGATAAGGGGATTCGTCATTCTTCGTGATTACAACCAAGGTTCAATATATCTTCAGATGGATGATCTACATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 291036 76 + 647215 TGGCATAAGGGGGTTTGTCATTTGTCATGATTATTACCAAGGTTCATTATATCTTGAGATGGATGATCTACGGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 150711 91 + 294542 TTTGAGTACCAGGGTTGTTGAGTACCAAGGGTCCAGTATTTACTTACTTGGCTAATAGGAGCCCAATACTCCTGAATGTGGGGGATGAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300071 91 + 636262 TTTGAGTACCAGGGTTGTTGAGTACCAAGGGTCCAGTATTTACTTACTTGGCTAATAGGAGCCCAATACTCCTGAATGTGGGGGATGAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 291116 91 + 647215 TTTGAGTACCAGGGTTTTTGAGTACTAGGGGCTCAGTATTTGTTTACTTGGCTCATAGGGACCCAGTACTGCTTAATGTGGGGGATGTGAC + +a +s mr.mrrefChr5 150802 82 + 294542 TATTTTTAGAACTTGTGGAAAGGACCCTTGGGTGTGGGTGTATACCATAATCTCTAGCAGGTACCTGGATCTTGGTTACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300162 82 + 636262 TATTTTTAGAACTTGTGGAAAGGACCCTTGGGTGTGGGTGTATACCATAATCTCTAGCAGGTACCTGGATCTTGGTTACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 291210 82 + 647215 TATTTTTGAAACTTGTGGAAAGTACCCTTGGGTGTGGGTGTATTCTATAATCTTTAGTTCATACATGGATCTAGGTTACCCT + +a +s mr.mrrefChr5 150884 45 + 294542 TTGAATTGACTTTTGTAGATTTACGCCGGTATACTCCAAGTAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300244 45 + 636262 TTGAATTGACTTTTGTAGATTTACGCCGGTATACTCCAAGTAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 291326 45 + 647215 TCGAATTGACTGTCATAGATTTGTGCCAGTACACTTTGAGAAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 150929 52 + 294542 AGGTGATATAGGATAGGTGACTCTTCTGCCACTTCACAGTTCAATACCCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300290 52 + 636262 AGGTGATATAGGATAGGTGACTCTTCTGCCACTTCACAGTTCAATACCCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 291371 52 + 647215 AGGTGATACAGGATAGTTGACTCTTCTGCCACTTCACAGTTCACTACCCCCC + +a +s mr.mrrefChr5 150981 62 + 294542 CACCATCCACATGTCCAATATTTCAAGGCCTTTGCGTAGGACTTTGAACATAGTCAATGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300345 62 + 636262 CACCATCCACATGTCCAATATTTCAAGGCCTTTGCGTAGGACTTTGAACATAGTCAATGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 291423 62 + 647215 CACCATCCACATGTCCAATATTCCAAGCTTTTTGTGTAGGACTTTGCACATAGTCAATGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 151043 10 + 294542 TAACCTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300408 10 + 636262 TAACCTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 291485 10 + 647215 TAACCTGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 151053 130 + 294542 TCCTTGACACTGAATAATTAATTTCATGCTGAGAGCAAATTACAACTACAATTAATGGTAAGTTTCCAAGAAATACTATTGTTCGAACAGCTATAAGTTTATTAAATGTTTTTCCTTTCAAACTAGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300419 130 + 636262 TCCTTGACACTGAATAATTAATTTCATGCTGAGAGCAAATTACAACTACAATTAATGGTAAGTTTCCAAGAAATACTATTGTTCGAACAGCTATAAGTTTATTAAATGTTTTTCCTTTCAAACTAGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 291495 130 + 647215 TTCTTGACACTGAATCATTAATTTCATGCTGAGGGCAAAATATAACTACAATTAATGGTAAGTTTCCAAGAAATACTATTGTATGGATAGCTATAAATCTGCTAATTGTGCTTCCTTTAAAACTAGATAT + +a +s mr.mrrefChr5 151183 27 + 294542 GAATTCATGTGCCATAGGCTTCTCACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300549 27 + 636262 GAATTCATGTGCCATAGGCTTCTCACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 291629 27 + 647215 GAATTTATGTGACATAGGTGTCTCACA + +a +s mr.mrrefChr5 151210 82 + 294542 AGTGCCCCTTTGACTCTTGGATACATGGAGTATGACTGACACTGTTTGAGCTAGCTTTTGGCTTCAGGGATGTACACAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300657 82 + 636262 AGTGCCCCTTTGACTCTTGGATACATGGAGTATGACTGACACTGTTTGAGCTAGCTTTTGGCTTCAGGGATGTACACAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 291656 82 + 647215 AGTGCCCCTTTGACTTTTGGATACATGAAGTATGACTGACACTGTTTGAGATGGCTATGGGCGTCAGAGATGTACACATCGA + +a +s mr.mrrefChr5 151292 9 + 294542 TGCTACAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300739 9 + 636262 TGCTACAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 291739 9 + 647215 TATTACAGC + +a +s mr.mrrefChr5 151301 9 + 294542 TGCTGCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300748 9 + 636262 TGCTGCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 291749 9 + 647215 TGGTGCCAG + +a +s mr.mrrefChr5 151310 53 + 294542 TTGAATTGGCAATCAGTCTCTGGGAAAATATGGGTCCCCCTGCTACACTTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300778 53 + 636262 TTGAATTGGCAATCAGTCTCTGGGAAAATATGGGTCCCCCTGCTACACTTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 291758 53 + 647215 TTGAGTTGGCAATGAGTCTGTGGGAAAGTCTGTGTCCACCTCCTACCCTTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 151363 107 + 294542 AAGAAGTTCATTCAAGAAGTGGTATCTACATCCCTACTTTAACAGACAATCTTACATGTCTACCACCCTCCTCAACAGCCTGTGGGGACCAAAGTTCTTGATTCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300836 107 + 636262 AAGAAGTTCATTCAAGAAGTGGTATCTACATCCCTACTTTAACAGACAATCTTACATGTCTACCACCCTCCTCAACAGCCTGTGGGGACCAAAGTTCTTGATTCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 291941 107 + 647215 AAGCAGTTCATTTAAGAAGTGGTATCTGCATCCTTACTTTACAAAACAATCTAACTTGCCTGCTGCCCTCCTCTACACCTTGTGGAGACCAAAGTTCTTGATTCACT + +a +s mr.mrrefChr5 151470 116 + 294542 TTGGGATTATCATTGGCTGGAGTCTACCTAACTTTTGGCTTCAAGTGATTGTTTTTACAAGATAGACCCAAGGAATCTAAGATTGCTAACTTCTTCCTCACTGGTGACTTGGTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 300943 116 + 636262 TTGGGATTATCATTGGCTGGAGTCTACCTAACTTTTGGCTTCAAGTGATTGTTTTTACAAGATAGACCCAAGGAATCTAAGATTGCTAACTTCTTCCTCACTGGTGACTTGGTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 292056 116 + 647215 TCAGGATTATCATTGGTTGAAGTCTGCCTGACTTCTGGCTCCAAGTAATTGTTCTTAGAAGGTAGACTCAAGGAATCTAAGATTGTTGACTTCTTCCTCACTGGTGACGTGATAAA + +a +s mr.mrrefChr5 151586 69 + 294542 GATGTATAGCCAATCTCCCCCCTCATGTGCTTTATTGTGGATCAGTCCTACCCTGTACTACCTATTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301059 69 + 636262 GATGTATAGCCAATCTCCCCCCTCATGTGCTTTATTGTGGATCAGTCCTACCCTGTACTACCTATTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 292301 69 + 647215 ATTAGATAGCCAACCTCCCCCCTCCTGTGCTTTATTGAGGATCACTCCTACCCTGTGTTACCTATTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 151655 62 + 294542 GAAGTTGTGTTAGTCCAGTGTGTGTAGGTGTGCCCCCAATCCATAGATGAGGGTTTTCACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301130 62 + 636262 GAAGTTGTGTTAGTCCAGTGTGTGTAGGTGTGCCCCCAATCCATAGATGAGGGTTTTCACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 292370 62 + 647215 GAAGGTGTGTTAAACCAGTATGTACAGGTGTGTCCCCAATCCATAGATGAGGGTTTTCATCA + +a +s mr.mrrefChr5 151717 158 + 294542 TGCCATGATATACTATTAACTCTATCTACTACAAAGAGGTATGATCAGCAGTAGAGTGGTGGTTCAGGTAGAGTCATGGTTTAGTTGGTACCACTGATTAGTGTAAAGAATTTGATCTAAGTGTATCCTGAGCTTACCCCAGTTCCTTGCTTCAGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301192 158 + 636262 TGCCATGATATACTATTAACTCTATCTACTACAAAGAGGTATGATCAGCAGTAGAGTGGTGGTTCAGGTAGAGTCATGGTTTAGTTGGTACCACTGATTAGTGTAAAGAATTTGATCTAAGTGTATCCTGAGCTTACCCCAGTTCCTTGCTTCAGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 292446 158 + 647215 TGCCATGCTATACAGTTGACTCTTTCTACCACAAGGAGGTGTGATCAATAGTAGAGCAATGGTTTGGGTAGAGTCATGGTTTAGTTGGTTTCACCGATTAGCAAAAAGAATTCGATCTAAGTGCATCCTGAGTTTAATCCATTTCCTTGCTTTGGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 151875 24 + 294542 TTTGCTCGAAGATTTGCTTTGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301350 24 + 636262 TTTGCTCGAAGATTTGCTTTGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 292607 24 + 647215 CCTGCTGTTAGACTTGCTTTGCAA + +a +s mr.mrrefChr5 151899 97 + 294542 ATTAATGAGTGATGGCTTAATTACACCTAATCTTGTTGCTATTGTTACATTAGATGAACTACTCAGGTGTAATCCATTATTTCAATAGCTGTATCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301374 97 + 636262 ATTAATGAGTGATGGCTTAATTACACCTAATCTTGTTGCTATTGTTACATTAGATGAACTACTCAGGTGTAATCCATTATTTCAATAGCTGTATCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 292648 97 + 647215 ATTAATGAGCGATGGCTTGATTACACCTAATCTTGTTACTGTCCTTACATTAACTGAGCTACTCGGGAGTAATCTATTATTTCAAGAGCTGTATCTA + +a +s mr.mrrefChr5 151996 25 + 294542 GGCACACAACAGATGGTTTTGACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301471 25 + 636262 GGCACACAACAGATGGTTTTGACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 292746 25 + 647215 GGCACACAATAGATGGTTTCAACAC + +a +s mr.mrrefChr5 152021 53 + 294542 CTTATCTCAGAACCTTACCCCAGGACAAGCTATATCTCAGCACAATTTAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301507 53 + 636262 CTTATCTCAGAACCTTACCCCAGGACAAGCTATATCTCAGCACAATTTAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 292771 53 + 647215 CTTATCTCAGTATCTTACCCCAGGACAAGCTATATCCCAGCACAAATTAAATT + +a +s mr.mrrefChr5 152074 62 + 294542 TATTTAATCATTTAATCTCATAAGCCCCGGTAACATATTCTTGCCAGAAACCACTTTCAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301560 62 + 636262 TATTTAATCATTTAATCTCATAAGCCCCGGTAACATATTCTTGCCAGAAACCACTTTCAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 292831 62 + 647215 TATTTAATTATTTAATCTCATAAGCCCAGGTAAAATACTCTTGCCACAAACCAACAACAATA + +a +s mr.mrrefChr5 152136 104 + 294542 TTAGAGTTAGAGGCCTAAGCCACTGTCAGCCTAAACCATTGATTTCTAGACTCTTGACCATGTGCCCCCCTGTTTATCAATTTATATGAACTTGGCCCTCTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301628 104 + 636262 TTAGAGTTAGAGGCCTAAGCCACTGTCAGCCTAAACCATTGATTTCTAGACTCTTGACCATGTGCCCCCCTGTTTATCAATTTATATGAACTTGGCCCTCTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 292893 104 + 647215 TCAGAGTTAAAGGCCTAAGCCACTGTTTGCTTAAACCATTGATTTCTGGACTCTCAACCATGTTCCCCCCTGTTTATCAGTATATATGAACTTGCCCTGCCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 152240 84 + 294542 CTTTCTCATGACTTGCTTGAGGTTTATTCAGGGCTATGTTGCAGTTCCTCAATACCTCTTCCAGATATTCCAGATTTCTAGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301732 84 + 636262 CTTTCTCATGACTTGCTTGAGGTTTATTCAGGGCTATGTTGCAGTTCCTCAATACCTCTTCCAGATATTCCAGATTTCTAGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 292998 84 + 647215 CTTTATCATGATTCGCTGGAGATTTATTCAGGGCTATGTTGCAATCCCTCAATGCCTCTTCCATGTGTACCAGTTTTCTAGATA + +a +s mr.mrrefChr5 152324 67 + 294542 CCACAAAGTTTATGATCCCTGGAGTGGATATAAGTTGTTTTGCAATTGCTGGCGCCTTGGTTGGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301816 67 + 636262 CCACAAAGTTTATGATCCCTGGAGTGGATATAAGTTGTTTTGCAATTGCTGGCGCCTTGGTTGGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 293083 67 + 647215 CCACAAAGCCTATGATCCCTGGAGTGGCTATGAGTTGTTTTGCAATTGCGGGTGCCTTAGTTGGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 152391 26 + 294542 CATTATCGTGTGTTGCATAATAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301894 26 + 636262 CATTATCGTGTGTTGCATAATAGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 293150 26 + 647215 CTTTTTACTGTTTAGTGTCATGTGCA + +a +s mr.mrrefChr5 152417 120 + 294542 GCAAGTGACTTCTTACTGTTAGTGTCATATGCATACTGTGCAAACTAGCACATATAAGGCTTGCTATGTCAAAAGCTCCAGAAAGCTAGGCAGAATCGATTAAGATGCTCTGAGAGGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 301920 120 + 636262 GCAAGTGACTTCTTACTGTTAGTGTCATATGCATACTGTGCAAACTAGCACATATAAGGCTTGCTATGTCAAAAGCTCCAGAAAGCTAGGCAGAATCGATTAAGATGCTCTGAGAGGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 293222 120 + 647215 GTTGGGCACTTTTTAATGTTAGTGTCATACGCTTACTGTGGAAACTAGCAGATATAAAGCTTGCCATGTCAAAAGCTCCAGTAAGCTAGACAAAATTGATTAAAACAATCTGAGAGGCAA + +a +s mr.mrrefChr5 152537 29 + 294542 CTGTTCCTTTAAGGTTTAAAGTAGAAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302040 29 + 636262 CTGTTCCTTTAAGGTTTAAAGTAGAAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 293355 29 + 647215 CTGTTCCTTTCAGGTTTAAAGTAGAAATA + +a +s mr.mrrefChr5 152566 67 + 294542 GATATGAATAGGATTTATGATACTTCTGTATCCCTGTACTCATTAGGAGAGCCTCACTTGAGAGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302080 67 + 636262 GATATGAATAGGATTTATGATACTTCTGTATCCCTGTACTCATTAGGAGAGCCTCACTTGAGAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 293384 67 + 647215 GATATGAATAGGATTTGTGATATTTCTGGATCCCTGTACTCATCAGGAGAACATCATTCGAGACAAA + +a +s mr.mrrefChr5 152633 41 + 294542 TGGATGATGATAGTTGAATGGAATCTTCAACCATAGAGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302149 41 + 636262 TGGATGATGATAGTTGAATGGAATCTTCAACCATAGAGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 293451 41 + 647215 TGGATGATGATAGTTAAAAGGAATTGTCAACCATGGAGATA + +a +s mr.mrrefChr5 152674 143 + 294542 TACGCAGGCTATATCTATTTGGGCGCACTAGAGCTTCCTGAAAATAATCTTGGAGTAAGTTTGAACACGCAGTACATGGGATATAAGGGGGTAAACCCATTCATAGCTGCATGTACAAGTCATCATGATTCAGGGCAGCGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302192 143 + 636262 TACGCAGGCTATATCTATTTGGGCGCACTAGAGCTTCCTGAAAATAATCTTGGAGTAAGTTTGAACACGCAGTACATGGGATATAAGGGGGTAAACCCATTCATAGCTGCATGTACAAGTCATCATGATTCAGGGCAGCGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 293492 143 + 647215 TATTCAGGCTAGTTCTATTTGGGCCCACTAGAACTTCTTGAAAACAATCTTGGAGTATATTTGAATAGGAAATACATGGGCCATAAGGGGGTAAAGCCATACATAGCATCATATACCAGTCATTGTGATTCGGGGCAGGGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 152817 24 + 294542 AATCCGATATATAGGAAGTTCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302335 24 + 636262 AATCCGATATATAGGAAGTTCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 293637 24 + 647215 AATCCAATATACAGGAAGTTCATA + +a +s mr.mrrefChr5 152841 56 + 294542 GATATGCTAGTGTTCACCTTTTGGGGTGGCTTGAATTTTCTGTGGGGAGGACGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302360 56 + 636262 GATATGCTAGTGTTCACCTTTTGGGGTGGCTTGAATTTTCTGTGGGGAGGACGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 293661 56 + 647215 AATATGCTAGTGTTCACCTTGTGGGGCGGGTTGAATTTCTTGTAGAGAGACCAATT + +a +s mr.mrrefChr5 152897 27 + 294542 GGGCATGACCCTTGGGCATGACAACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302417 27 + 636262 GGGCATGACCCTTGGGCATGACAACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 293717 27 + 647215 GGACATGACCATTGGGCATGACAACAG + +a +s mr.mrrefChr5 152924 80 + 294542 ATACTCCCATTACAGTGGTGACTTATTAAACTTATATCTGTCATGCCCACTGGCTTCAGGAGTGAAGCCCATCTCTACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302450 80 + 636262 ATACTCCCATTACAGTGGTGACTTATTAAACTTATATCTGTCATGCCCACTGGCTTCAGGAGTGAAGCCCATCTCTACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 293744 80 + 647215 ATACTCCCATCACAGTGGTGATTTATTATACTCATATTTATTCATCCCCATGGCTTCGGGAGTGAGGCCCATCTCTACTA + +a +s mr.mrrefChr5 153004 6 + 294542 ACAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302530 6 + 636262 ACAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 293825 6 + 647215 ACAGTT + +a +s mr.mrrefChr5 153010 42 + 294542 ACACATCACACCTCCCTCATCAGCATAAAAGGAGTTACTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302536 42 + 636262 ACACATCACACCTCCCTCATCAGCATAAAAGGAGTTACTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 293833 42 + 647215 ACACACCACACCCTCTTTGTCAGCATTAATGGAGTTACTTTG + +a +s mr.mrrefChr5 153052 18 + 294542 CAGTTGTTCAGTTATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302578 18 + 636262 CAGTTGTTCAGTTATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 293876 18 + 647215 CAGTTGCTCAGTTATGCT + +a +s mr.mrrefChr5 153070 19 + 294542 TGAATAATTCCCTTATTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302596 19 + 636262 TGAATAATTCCCTTATTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 293898 19 + 647215 TGAATAGTTCCCTTATGGC + +a +s mr.mrrefChr5 153089 157 + 294542 CAGGTGCTTCTTCATGCACTCACATTCATGACAACTGGGTCGTGATGCCAGTCCTTATACACAGACTCATTAACTTTTGACTGGGTGTGAGTAGCCAATCTTCTGAAGGTTGGAGACAACTCCACATCCTGCTGACAGAGTTGATCACCTTCATCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302615 157 + 636262 CAGGTGCTTCTTCATGCACTCACATTCATGACAACTGGGTCGTGATGCCAGTCCTTATACACAGACTCATTAACTTTTGACTGGGTGTGAGTAGCCAATCTTCTGAAGGTTGGAGACAACTCCACATCCTGCTGACAGAGTTGATCACCTTCATCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 293920 157 + 647215 CAGGTGCTTCCTCATGTGCTCACTTTCATAACACCTGGGTATTGATGCCAGTCCATCTACTCAGACTAATTAATTTTTGAGTGTGTGTGAACTGGCAGTCTTCTGAGGCTTGGAGACGACTTAAAATCCACCTGACAGAGGTGAGCACGTTCATCCG + +a +s mr.mrrefChr5 153246 9 + 294542 TTATATGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302772 9 + 636262 TTATATGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 294078 9 + 647215 TTATATGTC + +a +s mr.mrrefChr5 153255 16 + 294542 TCTCTCTGAATAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302781 16 + 636262 TCTCTCTGAATAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 294354 16 + 647215 TCTCTGTCAATGAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 153271 46 + 294542 AAGCTAGTAATGTCTCCAGTATATCTAACCTACAACCAGATACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302797 46 + 636262 AAGCTAGTAATGTCTCCAGTATATCTAACCTACAACCAGATACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 294372 46 + 647215 ACACAAGTAATGCTTCCAGTATATCTGACCTACAGCCAGATACAAC + +a +s mr.mrrefChr5 153317 242 + 294542 AACGGGTCACTCTTTGAAATACAGGTACAATTATCTTTATATACCTCATTCTTTAGATGGCTTTATTATACTAGGTGCCTCTGTGCCATACACTTGGGACTTATTTTCCCTACTGACCACTCTATTGAGTGGAATTTGTTAAATAGAAGGAGTAATGGGCGAAAACTCAAAACTTGGCCTACAACTTGAATACACAGAAGGCCTTAAATGGGAATGCCTTAGATGAATAAACTAATTCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 302843 206 + 636262 AATGGGTCAC------------------------------------CATTCTTTAGGTGACTTTATTATACTCGGTGCCTCTGTGCCATACACCAGGTACTCATTTTCCCTACTTACCTCTCTATTGAGTGGAATTTGTTAAAGAGAAGGCGTAATGGGTGAAAACTCAAACTTTGGCCTACAACTCGAATAAACAGAAGGCCTTAGATGGGAATGCCTTAGACAAATAAACTACTTCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 294422 242 + 647215 GACGGGTCATTCTTTGAAATACAGGTACAATTATCTTTATATACCTCATTCTTTAGATGGCCTTGTTATACTAGGTGCCTCTGTGGCATGCACTTGGGAATTGTTTTCCCAACTGACCACTCTATTGAGTGGAGATTGTAAAATAAAAGGAGTAATGGGCGAAAGCTCAAAACTTGGCGTACAACTTGAATGCACAAAAGGCCTTAAATGGGAAAGCCTTAGATGAATGAAATAATTCTATG + +a +s mr.mrrefChr5 153559 69 + 294542 ATGGTCCGGTTACTATAACAAGAGGTACAAGAATGTGAGCCACACTTCCCAAATATTATAGGTCAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303050 69 + 636262 ATGGTCTGGTTACTACAAAAAGAAGTACAAGGATGTGAGCCACACTTCCCAAATCTTATAGGTCAGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 294664 68 + 647215 ATGGTCCAGTTATTATAACAAGAGGGACAAGAATGTGAGCCACACTTCCC-AATATTATAGGTCAGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 153628 222 + 294542 GTACTATACAATATATAATCCATTCTGACAACAATTGAAGGGGAGAATAGTATTGGACTCTACCCCTGGATTTTGAAAGGGCTTGATTTAACACTTAGCACACAGACAGCACATATGGATCAGTGTAACAGCACTTCATGAAAATAAGTTGGCTGATGAGGGATAGGGATGTAGGATGAATGAAGAAGTTCATAGAATAAAGTACCGTCACCAGTTTGTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303124 222 + 636262 GTATCATACAAAATATAATCCATTATGACAACAGTTGAAGGGGAGAATAGTATTGGACTCTACCCACGGATTTTGAAAGGGCTTGATTTAACACTTAGCACACAGACAGCACATATGGATCAGTGTAACAGCACTTCATGAAAATAAGTTGGCTGATGAGGGATAGGGATGTAGGCTGAATGAAGAAGTTCATAGAACAAAGTACTGTCACCAGTTTTTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 294732 221 + 647215 GTACTGCACAATATATAATCCATTCTGACAACAATTATAGGAGTGTATAGTATTGGACTCTACCCCTGGATCTTGAAAGGGCTTGAATTACCAGTTAGCCCACAAACAGAACATATGGATTAGTATAACAGCACTTCATGAGAATAAATTGGCCGATGAGGGATAGGGATGTAGGAT-GATGAAGAAGTTCATAAAATAAAGTACCGTCACCAGTTTGTCAG + +a +s mr.mrrefChr5 153850 40 + 294542 CCACCTCTGTCTTCAATAGTTGTCATCCATTTCTTTGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303350 40 + 636262 CCACCTCTGTCTTCAATAGTTGTCATCCATTTCTTCGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 294953 40 + 647215 CCACCTCTCTCTTCAATAGTTGTCATCTATTTCCTTGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 153890 39 + 294542 ATAGTATGTAGATCAATTCATCAGTTTGTCACTTTGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303390 39 + 636262 ATAGTATGTAGATCAATTCATCAGTTCGTCACTTTGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 294994 39 + 647215 ATAGTGTGTAGATCAATTCTTTAGTTTGTCACTTTGTCC + +a +s mr.mrrefChr5 153929 68 + 294542 CCAAGCACATGCTCTGTGCCAATTGGTCAACCTTGGTGGTTAAAAGAGCTAAGGTTAACTCAGGAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303430 66 + 636262 CCAAGCACATGCC--ATGCCAATTGGTCGACCTTGGTGGTTAAAAGAGCTAAGGTTAACTCAGGAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 295033 68 + 647215 CCAAGCACATGCTCTGGGCCAATTGGTCAACCTTGGTGGTTAAAAGAGCTAAGGCTAACTCAGGAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 153997 5 + 294542 CTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303496 5 + 636262 CCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 295104 5 + 647215 CTATT + +a +s mr.mrrefChr5 154002 12 + 294542 TGTGGTAGCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303563 11 + 636262 TATGG-AGCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 295296 12 + 647215 TGGGGTAGCCTT + +a +s mr.mrrefChr5 154014 128 + 294542 GTCCCTGCTATCTGATCTAGCGTGTGAATCAATCCTAGGCCCACATATGTTGCTTGGATAGCATGAGTTATGGGTGTTGTCATCCTTCAGCAATATGGAATTGACTGCTTAAAACTCATGAGTTATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303574 122 + 636262 ---CCTGCTATCTGATCTAGCGTGTGAATCAATCCTAGGCCCACAAATGTTGCTTTGATAGCATGCGTTATGGGTGCTGTCAT---TCAGCAATATAGAATTGACTGTCTAAAACTCATGAGTTATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 295312 128 + 647215 GTCCCTGCTACCTGATCTAGTGGGTGAATCAATCCTATGCCTGCATATGTTGCTTGGCAAGCATGAGTTATGGGTGTTGTTACCCTTCAGCAATGTGGAATTGAATGCTTAATGCTCATGAGTTATGG + +a +s mr.mrrefChr5 154142 18 + 294542 GTGCCATCGGTTGGCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303696 18 + 636262 GTGCCATCGGTTGGCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 295441 18 + 647215 GTGTCATTCTTTGGCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 154160 149 + 294542 ACTGCTTAAAACTAGGCATTGCTAGAACCCCTGCTCACAGTGCATCAAGATGCAAGATACATGAGAAAGGTGCAGATTCTAGCTGTGCATGCCTCCCAGCTTTGGGTTCCAACTTTAACCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303723 149 + 636262 ACTGCTTACAGCTAGGCATTGCTAGAACCCCTACTCAAAGTGCATCAAGATGCAAGATACATGAGAAAGGTGCAGATTCTAGCTGTGTGTGCCTCCCAGCTTTGGGTTCCAACTTTCACCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 295459 149 + 647215 ACTGCTTAAAACTAGGCACTGCTAAAACCCTTGCTCACAGTGGATCAAGATGCAAGATACAGGAAAAAGGTGCTGATTCTAACTGTGCATGCCTCCCAGCTATGGGTTCCAATCTTAAGCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG + +a +s mr.mrrefChr5 154309 57 + 294542 CAAGATTAGGTTGGTTTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACATTGTCCCAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303873 57 + 636262 CAAGATTAGGTTGATGTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACACTGTCCCAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 295608 53 + 647215 CAAGATTAAGTTGGTTTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACATTGTCCC---- + +a +s mr.mrrefChr5 154366 316 + 294542 GAAACCCAAGCTTCACCAATGTAGTAATGACTATCTTGGATCTATAAGATCTTCCTCTAATAACTGGGGAAGGGCAGAATATTGATGAGTTGACTCTAGAGGTGCTAAAATGCTAATATAAATGAATTGTGATACTGAGCCACATGAGTAGTGAAACAAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCTGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCTAGAGCATTCTCTAAGGCTGACAGACATACTTGAGTTTTTACTCCGATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACATAGGGGGAGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 303931 306 + 636262 GAAACTTAAGCTTCACCAATGTAGTATTGACTATCTTGGACCTACAAGATCTTCCCCTAATAACTAGGGAAGGGCAGAATATTGATGAGTTGACTCTTGAGGTGCTAAAGTGCTAATATAAAGGGATTGTGATACTGAGCCACATGAGTAGTCAAACAAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCTGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCT----------CTAAGGCTGACAGACATATTTGAGTTTTTACTCCGATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACATAGGGGGAGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 295661 312 + 647215 ----CCCAAGCTTCACCAATGTAGTGATGACTATCTAGGGTCTATAAGATCTTCCTCTAATAACTGGGGAAGGGTAGAATATTTATGAGTTGACTCTAGAGGTGTTAAAATGCTAATATGAATGAATTGCAATACTGAGTCACATGAGTAGTGAACCCAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCCGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCTAGAGCATTCTTTAAGACTGACAGACATACTTAAGCTCTTACTCCCATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACACAGGGGGAGGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 154682 14 + 294542 TAGTGAACAACCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304237 14 + 636262 TAGTGGACAACCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 296021 14 + 647215 TAGTGAACAACCAC + +a +s mr.mrrefChr5 154696 364 + 294542 TACGGGATGACTCTGTGTGGTTAGTTAATTAAGCACCCTTGCCCTAACTTGGGTTCAGTCACGCTTCTCATCTTACTGTTTAACATCAGATCTTTGAAGCCATATCAAAGCTCCCCTATTGTATAACCCTCACAACAGCTCAAGGAACATTTTGCATTCAATCATGGAGGTGAGATTGCTGATGATTCATTTCTACCAGCCTAGGATACCACAAGACCCATGGTGATGAGTGGTTGTGTTAAGGACACACATCTAAGTGTGATCAAGGCACCCAGGGGCCTATGGTTCCTTGAATATCCTAAGAAGTAATTGTAGACTGTCATGATAAGACTGTGATTTGCTTGCAATTTAGTCAGTGTCAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304251 357 + 636262 TATGGGATGACTCTGTGTGGTTAGTTAATTAAGCACCCTTGTCCTAACTTGGATTCAGTCACGCTTCACATCTTACTGTTCAACATCAGATCTTTGAAGCCATATCAAAGCTCCCCTATTGTATAACCCTCACAATAGCTCAAGGAACATTTTGCATTCAATCATGGAGGTGAGATTGCTGATGATTCATTTCTACCAACCTAGGATAACACAAGACCCATAGTGCTGAGTGGTTGTGTTAAGAACACACATTTAGGTATGATCAAGGCAACCAGGGGGCTATGTTTCCTGGAATATCCTAAGAAGTGATTGTAGACTG-----ATAAGACTGTGATTTGCTTGCAATTTCGTCAGTGTCAG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 296038 342 + 647215 TACTGGATGACTCTCTGTGGTTAGGTAATTAAGCACCCTTGCCCTGACTTGGGTTCAGTCAAGCTTCTCATTTTACTGTTTAGCATCAGATCTTTGAAGCCACATCAAAGC-------------------CACAACAGCTCAAGGAACATTTTACATTCAATCACAGATGAGAGATGGCTGCTGATTCATTTCTACTGGCCAAGGATACCACAATACCCATGGGGATGAGTGGTTGTGTCAAGGACACACATCTAAGTGTGAACAAGGCACCCAGAGGCCTATAGTTCCTTGATTATCCTAAGAAGCAATTGCAGACTGTCATGGTAAGACTGTGA---GCTTGCAATCTAGCCAGTGTCAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 155060 54 + 294542 TAGACAGGGTGTCTAACACTGTGAGTATACTAGGTTTGTGGGAGTTATTATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304608 41 + 636262 -------------TGACATCGTGAGTATACTAGGTTTGTGGTAGTTATTATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 296381 54 + 647215 TAGACAGGGTGTCTAACACTGTGAGTATACTAGGCTGGTGAGAGTTACTATTTG + +a +s mr.mrrefChr5 155114 38 + 294542 TCCTATCAACCCAATGGGGTTATGAAATGCCAACTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304650 38 + 636262 TCCTATCAACCCAATGGGGTTATGAAATGCCAACTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 296435 37 + 647215 TCCTATCAACCCAATGGGATTATGAAGTGTCAACTCA- + +a +s mr.mrrefChr5 155152 390 + 294542 TTTTCAGCGGCATTTTTTCAGTGAGTATAGCATGAATTAGATGTACAGGGAGGACAAATTTATTGGCATACACTGATAAAACTTAGGGCAATTTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATGTTACAAGGCAACTGTTCATGCCCTGTTAGATTGCTTTAACACACCATGATCATTCCTACTATTGCTACTGTATACTTGCCTCGGGCATGTGGGCACATGTGTTTGGTATTAATATGCCATGAACCTGCTGTTAATCCTCTAACAATGCTGATTACAATCTTCTTACCTAGGAAAACCAGATAGGCTAACCACATTATTAGGACCTGTATTGGAGGTGTTCGTTTACCCACGTCATGCTCCCAAGTGTGATCCCCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 304690 390 + 636262 TTTTCAGCAGCATTTTTTCAATGCGTATAGCATGAATTAGGTGTGCAGGGAGGACAAATTTAATGGCATACACTGATAAAACTTAGGGCAATTTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATATTACAAGGCAACTGTTCATGCTCTGTTAGATTGTTTTAACACACCATGATCATTCCTACTATTGCTACTGTATACTTGCCTCGGGCATGTGGGCACGTGTGTTTGGTATTAATATGCCATGAACTTGTTATTAATCCTCTAACAATGTGGTTTGCAATCTTCTTACGTAGGAAAACCAGATAGGCTAACCACGTTATTAGGACCTGCATTGGAGGTGTTTGTTTACCCACGTCATGCTCCCAAGAGTGATTCCTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 296472 373 + 647215 ---TCAGCGGCATTTTTTCAGTGAGTATAGCATGAATTAGATGTACAAGGAGGACAAATTTATTGGCAAACACTGATAAAACTTAGGGAAATCTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATGTCACAAGGCAACTGCACATGTCCTGTGAGATTACTTTAACACACAATGCTCATT--TACTATTGCTATTGTATACGTGCCTCGGGCATGTGGGCTCATATGTTTGGTATTAATATGCCAGGAGCCTACTGTTAATC----------GCTGATTACAATATTCTTCCCTAGGGAAACCAGATAGGCCAACTACATTATTAGGACCTGTATTGGAGATGTTCTTTTACCCACGTCA--CTCCCAATTGTGATCCCCAGA + +a +s mr.mrrefChr5 155542 247 + 294542 ACCCTTTGCATTAGTCTCAAGGTTATACATATTAGGCTGGATCTCATGTTATCTGAATACATCTGTAGTTGCATCATCACTAAGCTTAATTTGTAATAGTCCATTTTAAAGTCCAATTGATTTTAAGTTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGAGGCCTAAACTATGTGGCATCATCTACCTAACGTTTGGGTAACAATGAGAGTGAAAAAATTTTTCTTTGATGGAGATGTGTAGACAGGGCTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305082 197 + 636262 ACCCTTTGCATTAGTCTCAAGGTTGTACATATTAGGCTGGATCTCACGTTATCTGATTATATGTGTTGTTGCATCATCACTAAGCTTAATTTGTAATAGTCCATATTAAAGTCCAATTGATTTTAAGTTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGACGCCTAAACT--------------------------------------------------TTTCTTTGATTGAGACGTGTAGACAGGGCTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 296845 240 + 647215 ACCCTTTGCATTAGCCTCAAGCTTATACATATTAGGCTGGATCTCATGTTATCTGGATACATCTGTAGTTGCATCATCGCTAAGCTTAATTGGTAATAGTCCATTTTCAAGTCCAATTGATGTTGAGGTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGAGGCCTAAGCTATGTGGCATCATCTACCTAACGTTTGGGTAACAATGAGAGTGAAAAAATTTTTCTTTGATGGAGATGTGTAGACAGG------- + +a +s mr.mrrefChr5 155789 91 + 294542 AACTTATATATCAGCTAAATGACTATGTAAAAAAAATAATATTCCTCTGAGAGATGACGTACACCATATATTACCCTAGGGGATGTAACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305281 91 + 636262 AACTTATATATCAGCTAAATGACTAAATAAAAAAAATAATATTCCTCTGAGAGATGACGTACACCATATATTACCCTAGGGGATGTAACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 297085 60 + 647215 AACTTATAGATCACCTACATGACTATGTTAAAAAAATAAAAT-CCTCTGAGAGATGACGTA------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 155880 128 + 294542 TTGCATAACAGCCATGCCCCCATAACCCAGGTCTTTGTTCCTAATCTGTGTGACATCATTGGAGAGAACAACTGGCATCCAGGTCATCTACTCCTCCAAAGTTATGGCATGAACTCTTAAGCTGTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305373 128 + 636262 TTGCATAACAGCCATGCCCCCATAACCCAAGTCTTTGTTCCTAATCTGTGTAACATCATTGGAGAGAACAACTGGCATCCAGGTCATCTACTCCTCCAAAGCTATGGCATGAACTCTTAAGCTGTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 297145 118 + 647215 ----------GCAATGCCCCCATAACCCAGGTTTTTGTTTCAAAGCTGTGTGACATCATTGGGGAGAACAACTTCCATCTAGGTCATCTGCTCGTCCAAAGTTGTGGCATGAGCTCTTAAACAGTAGT + +a +s mr.mrrefChr5 156008 12 + 294542 GGAAGTGTTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305503 12 + 636262 GGAAGTGTTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 297263 12 + 647215 GGAAGTGTTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 156020 252 + 294542 TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTCTGCTCTATTACATTTATCTATGGAGACTAACGTTCCCTTAAAGTTCTGGTGCTTATCCCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCATATAAGGCCAATCTGTCTACTGCCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCATGATATAACTGAGCTGAGGTTTTTGAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305515 252 + 636262 TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTGTGCTCTATTACATTTATCTATAGAGACTAACGTTCCCCAAAAGTTCTGGTGCTTATCTCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGGACAGCTGGGTCATATAAGGACAATCTGTCTACTGGCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCACGATATAACTGAGCAGAGGTTTTTGAAAATAGAGGATTAAGGTTTAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 297277 252 + 647215 TGAAGCTGTAATTGCTATAATACCCTGGGAAGTTCATGCCTCTTCTGTTCTATTACATTTGTCTATGGAGACTAATGTACTCTTAATGTTCTGGTCCTTATCCCCGAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCACATAAGGCCAATCTGTCTGCTGCCATAACTTTGAAGCATACCTTTTGCCCATCTCCATGATATAACTGAGCTAAGGTTTTTTAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA + +a +s mr.mrrefChr5 156272 72 + 294542 CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAGAAGGTGAGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACAGGGTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305769 68 + 636262 CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAG----TGGGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACTGGGTGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 297529 72 + 647215 CCTGAAGCAATGGGTTTGTGTAGAAGGTGAGTGAGCCCGATTCACATTGAGCTCTATCTGGACAGGATGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 156344 64 + 294542 ATTTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACTTAGAATGGCTAACCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305910 64 + 636262 ATCTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACCTAGAATAGCTGGCCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 297601 64 + 647215 ATTGAGGGGGTTAGCCTGCTCATCAGCACTTACTAATCCGCCGTACTTAGAATGACTAACCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 156408 477 + 294542 CAGTCTGGTGGTTGATGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGGATTGGTATTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATGCCTTTATGTTTCTTTTATCTTAGGCATACTTCCGTCATAAACAGAGTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTCAACCTTATGCTTACACAAGTAAGAACTTAGGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGACAGTCTTGTTAGCACCATTCCTTGTACAGGAACCTCTGATTCGCATTCACAATTCTGCACTACCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACTAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCATACACAAGCTTTTCTCACAGCATGGGTGAGGTGTGGTATAGTGGCTTAATATTTTGGGCACTTTTTCTCTCTGGAAAATCAGTTCAAAGAAGAGCTACATCCAGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306031 473 + 636262 CAGTCTGGTGGTTGATGATTGAAAATTATAAGGTGTGTGTTCTAGTGGATTGGTGTTACAAGGTACGCAT-GCAAGTGTTATGCCTTTATGTCTCTTTTATCCTAGGCATGCTTCCGTCATAGACAGAGTTTGATGTGATG---TTGGGTGACCTCAACCTTATGCTTACACAAGTAAGAACTTAGGTATAGTGTGATAGTCCCATCCAGTTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGACAGTCTTGTTAGCGCCATTTCTTGTACTGGAATCTCTGATTCGCCTTCACAATTCTGCACTACCTGATGAAAGTAGGTACTCACAAAACTAACACATGATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATATATCATACACAAGCTTTTCTCACAGCATGAGTGAGGTGTGGCATAGTGGCTTAATATTTTGGGCACTTTTTCTCTCTGAAAAGTTAGTTCAAAGAAGAACTACATCCAGCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 297665 457 + 647215 CAGTCTGGTGGTTGGTGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGG-----TAGTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATCC------GTTCCTTTTATCTTAGTCATACTTCTGTCATAAAAAGATTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTTAACCTTATGCTTAGACAAGTGAGAACTTAAGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGATAGTCTTGTTAGCACCACTCCTTATACAGGAACCTCTGCTTCACATTCACAATTCTGCACTGCCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACGAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCACGCAAAAGCT--------TGCATGGGTGAGGTGTAGTATAGTGGCTTAGTATTTTGGGCACTTTTTCTCTGTGGAAAATCAG-TCAAAGAGGAGGTACATCCAGCACC + +a +s mr.mrrefChr5 156885 208 + 294542 ATGTAGGATGTCACCCTTGAGTGGCATGGGCAGTGAAACAGCTGGTTTATTAATGTACAACTTCAAGCAGTGTCCCAATGGGTGTAGTCAACATATAATATCAGACCTTCACTACAGAAGGCTCCATACAGAGGTTACACTCACATGCTCTGTCAATCAGAAAGACCCTACATCTATAGGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTATGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306505 208 + 636262 AGGTAAGATGTCACCCTTGAGTGGCACGGGCAGTAAAACAGCTGATTTATAAATGTACGACTTCAAGCAGCGTCCCAATGGGTGTAGTCAACATATAATATCAGACCTTCACTACAGAAGGCTCCATACAGAGGTTACACTCACATGCTCTGTCAATCAGAAAGACCCTACATCTATAGGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTATGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 298122 208 + 647215 ATGTAGGATGTAACCCTTGGGTGGCATGGGCAGTGAAACAGCTGGTTTATTAATGTACAACTTCGAGCAGTGTCCTAATGCGTGTAGCCAATATATAATGTCAGACTTTCACTAGAGAAGGCTCCATACGGAGATTACACTCGCATGCTGTGTCAATCAGAAAGACGCTACATCTATAAGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTGAGCA + +a +s mr.mrrefChr5 157093 196 + 294542 CTTGCTGATAATTTTCCTGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTTACAATCATGTAACAGTGGCTACTTCAATTCCATATGTGAAAGCCAATGCTAGTTGATGATAAAGGTATAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTTAAGTGGCAGACTTGCTGATGCACCAATAAGTTACACACATACTCTAGTCTACAGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306720 196 + 636262 CTTGCTGATAATTTTCCCGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTTACAATCATGTAACAGTAGCTACTTCAACTCCGTATGTGAAAGCCAATGCTAGTTGATGATAAAGGTATAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTCAAGTGGCAGACTTGTCGATGCACCAATAAATTACACACATACTCTAGTCTACAGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 298330 196 + 647215 CTTGCTGATAATTTTTCTGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTCAAAATCACGTAACAGTGGCTACTTCAATTCCATATATGAAAGCCAATGCTACTTGATAACAAAAGTGTAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTTAAGTGGCAGACTTGCTGATGCACCAATAAGTTACACACATACTCTAGACTACAATTGT + +a +s mr.mrrefChr5 157289 182 + 294542 TGCTGCTCTCATGACAGGTAAAAGTGTCTAGGGTTATTCATGTAAATTTCTAGGAACCAACAATTAACCATGACTACAAGGAGCTTGATTTTCACATGTTTCAACATTAAATATCTTTAATCCACATAAGCTGCACCTCAAGACTAACCCTTCTACTATACGACCCTACGCATAGTCCATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306918 181 + 636262 TGCTG-TCTCATGACAGATAAAAGTGTCTAGGGTTATCCATGTAAACTTCTAGGAACCAACAATTAACCATGACTACAAAGAGCTTGGTTTTCACATGTTTCAACATTAAATATCGTCAATCCACATAAGCTGCACCTCAAGACTAACCCTTCTACTATACGACCCTACGCATAGTCCATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 298526 182 + 647215 TGCTGCTTTCATGACAGGTAAAAGTGTCGAGGGTTATTCATGTAAATTTCTAGGAACCCACAATTAACCATGACTACAAGGAGCTTGATTTTCACTTGTTTCAACACTTAATGTCTTTAATCCACACAAGCTGTACCTCTAGACTAGCTCTCCTACTATATGACCCTATCCATAGTCAATGT + +a +s mr.mrrefChr5 157471 86 + 294542 CATGGTCATCTCTATTTGTAACTTAGCCAGTGAATGGCTTCTTGTGGTGCCCTTGAAACACTAGTACCAGATGATGTGGATTCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307099 86 + 636262 CATGGTCATCTCTATTTGTAACTTAGCCAGTGAATGGCTTCTTGTGGTGCCCTTGAAACACTAGTACCAGATGATGTGGATTCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 298709 86 + 647215 CATGGTCGTCTGTAGTTGTAACTTAGTCAGTGAATGGCTTCCTGTGATACCCTTGGAACACCAGTACCAGATGATGTGGATTGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 157557 27 + 294542 ACACTGGTTAACAAGATGCTAATGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307185 27 + 636262 ACACTGGTTAACAAGATGCTAATGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 298799 27 + 647215 AAACTGGTTAACTAGATGCTAATGCCT + +a +s mr.mrrefChr5 157584 28 + 294542 TCTCTTCCTGCTCTGAAACTAAGGTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307212 26 + 636262 TCTCTTCCTGCTC--AAACTAAGGTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 298827 28 + 647215 TCTCCTCCCACTCTGACACTAAGGTGAG + +a +s mr.mrrefChr5 157612 11 + 294542 TTTTGAGTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307240 11 + 636262 TTTTGAGTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 298855 11 + 647215 TTTTGAGTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 157623 366 + 294542 TATTTGCTTGCTCATCTACTCTTCCGCTGTGCTGTTAATCTTATTTTGGGTTGAGTCTATGATTGATATAATGATAAGATTAGTAGGATGAATTGGGGGAAACAAACGCTGGCATGTAAAGACACTCCACCTTACAGTTGATTCCTTATTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGTATAGTAGTGCCATTAAGTGGTGTCTATTGTCAAAGACAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTTACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGTTTTTTCTGTTGCTGCTGCCCATAGGTTCCCAGTAAACCAAATTGATCTGAAGATTGATTGGTCTGACACTCCAGGCATGCAACTAGAAGATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307252 366 + 636262 TATTTGCTTGCTCATCTACTCTTCCGCTGTGCTGTTAATCTTATTTTGGGTTAAGTCTATGATTGGTATGATGATAAGATTAGTAGGATGAATTGGGGGAAACAGATGCTGGCATGTAAAGACACTCCACTTTACAGTTTATGCCTTAGTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGCATAGTGGTGCCATCAAGTGGTGTCTTTTGTCAGAGACAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTTACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGCTTTTTTTGTTGCTGCTGCCCATAGGTTCCCAGCAAACCTAATTGATCTGAACATTGATTGGTCTGACACTCCAGGCATGCAACTAGAAGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 298866 362 + 647215 TATTTGCTTGCTCATCTGCTCTTCTG-TGTGCCATTAATCTTATTTTGGGTTGAATCTATGATTGATATAATGATAAGATCAGTACGATTAATTGGGGGAAACAAACACTGGTGTCTAGAGACACTCCACCTTACAGTTGATTCCTTATTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGTATAGTAGTGCCATTAAGTGGTGTCTATTGTCAAAGGCAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTGACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGTTTTTTCTGTTGCCACTGCCCGTACGTTCCCAGTAAACCAAATTGACCTGAAGATTAATTGCTCTGTCACTCCAGGCATGC---TAGAAGATGT + +a +s mr.mrrefChr5 157989 157 + 294542 AGATCTGTCGGAAATTGTACATTGCTGGAGCAGCAGCACCACACAACCGTATGAGCAGTAAAAAATTGAGGATACCTGTTGAAGAAGAAGTACACTTAGTTGGTGAGAACTATCTGATTGTACCTGATATGTAATTAAGCCAGTTAAAAAAACATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307625 156 + 636262 AGATCTGTCGGAAATTGTACATTGCTGGAGCAGCAGCACCACACAACTGTATGAGCAGTAAAAAATTGAGGATATCTGCTGGAGA-GAAGTACACTTGGTTGGTGAGAACTATCTGATTGTACCTTACATGTAATTAAGCCAGTTAAAAAAACATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 299228 157 + 647215 AGATCTGTCAAAAATTGTACATTGCTGGAGCAGCAGCACCACACAGCCATATGAGCAGTAAAAAATTGAGGATACCTGTTGAAGAAGAAGTACACTTAGGTGGTGAGAAATATCTGATTCTACCTGATATGTAATTAAGCCAGTTAGAAAAACATAC + +a +s mr.mrrefChr5 158146 167 + 294542 TGAATTTTGGTAAGAGGAAACTATCAAGTGTCAGGGAAGCCCACAATCCGAATGTAGTCAGAGAGTGTGTATTGGGAAGTGCCTATATGATCCCTCGCATGCCACTATGGGTTTGAGGGCCAGAGTCTATATCTAAAGAAATCGACCAAAATAGCATAAAGTTCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307781 167 + 636262 TGAATTTTGGTAAGAGGAAGACATCCAGTGTCAGGGAATCCCACAATCCGAATGTGGTCAGAGAGTGTGTATTGGGAAGTGCCTATATAATCCCTTGCATGCCACTATGGGTTTGAGGGCCAGAGTCTATATCTAAAGAAATCGACCAAAATAGCATAAGTTTCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 299386 167 + 647215 TAAATTTTGGTAAGAGGAAACTATCAAGTGTCAGGGAAGCCCACAATGCCAATGTAATCAGAGAGTTTGTATTGGGAAGAAGCTATATGATCCCTCACATGCTACTATGGGTTTAAGGGCAAGAGTCTATATCTAAAGAAAAGGACCAAAATAGCACAAAGTTGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 158313 86 + 294542 TACTACTACAGCTATACTAAGTATTTGAGATGGCCAATTGGAATTGCCTTTCATCTTCGCAGTTTAAAAAACTGTGACCTTACATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 307950 81 + 636262 TACTACTACAGCTATACTAAGTATTTGAGATGGCCAATTGGAATTGCCTTTCATCTTCGCAGTTTAAAAAACTGTGACCTT----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 299553 86 + 647215 TACTACTGCAGCTATACTGAGTATTTGAGATGGCCAATTGGAATTCCCTTTCATCTTCACAGTTCAAAAATCTGTGACCTTACATC + +a +s mr.mrrefChr5 158399 6 + 294542 AGGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 299641 6 + 647215 AGGCAA + +a +s mr.mrrefChr5 158405 17 + 294542 AAGTCAAAACCAACAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 299654 17 + 647215 AAGTCAAAACCAACAGA + +a +s mr.mrrefChr5 158422 27 + 294542 GAAGGTTTGGTATTTTGGGAACAAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 299676 27 + 647215 GAAGGTTTGGTATTTTGGGAACAAGCT + +a +s mr.mrrefChr5 158449 52 + 294542 GTATCTTATAACTGAAGCCAGTCTATCAAGACAGGCAGTGTATTATAAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 299704 52 + 647215 GTATCTTATAACTGAAGCCAGTCTATCAAGACAGGCAGTGTATTATAAGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 158501 15 + 294542 TATGTTTAAACTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 299777 15 + 647215 TATGTTTAAACTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 158516 208 + 294542 GGTTAAGAAAAGGAGAGGTATTACAGAACGTGAAACACAGATTATTTTACACATGCCAAATAATGCATAATCACAAATGAATGGGTAAAACTATTAATAGTAACAATGCAACTTGGCACATGATCATCCTGCACTCTAAGTGTACCCAGTATTGTTCAACTAGCAAACCTTCCCCAGAGAGGCAATAACATACAAGCCCATTCTCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308031 98 + 636262 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACTTGGCACATAGTCATCCTGCACTCTAATTGTACCCAGTATTGTTCAACCAGCAAACCTCCCCCAGAGAGGCAATGACATACAAGCCCAGTCTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 299794 208 + 647215 GGTTAAGAAAAGGAGAGGTATTACAGAACGTGAAACACAGATTATTTTACACATGCCAAATAATGCATAATCACAAATGAATGGGTAAAACTATTAATAGTAACAATGCAACTTGGCTCATGATCATCCTGCATTCTAAGTGTACACAGTATTCTTCAACTTCCAAACCTTCCCCAGAGAGGCAATAACATACAAGCCCATGGTCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 158724 54 + 294542 AACATACTAGCATACTACTAGAATTTCTAGTCTGTTATCAAAAATGTATCCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308129 54 + 636262 AACATACTAGCATAATACTAGAATTCCTAGCATGTGATCAAAGATGTATCCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 608840 54 - 647215 AGCATACAAGCATACTACTAGAATTTCAAGTCTGTTATCTAAAATGTATGTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 300005 54 + 647215 ATCATACTAGCATACTACCAGAATTTCTATTCTTTTATCAAAAATGTATCCCGG + +a +s mr.mrrefChr5 158778 6 + 294542 TATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308183 6 + 636262 TATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 300059 6 + 647215 TACACA + +a +s mr.mrrefChr5 158784 93 + 294542 GAAGGAAATGTCAGCAAGGAGATGTCATACTTCAGCGCTTCTATGTGTATGCCATTTCAAAACAGCACTAAGGGCATATGATATGAACCTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308189 81 + 636262 GAAGG------------GGAAATATCAGACTTCAGCGTTTCTTTGTGTATGCGATTTCAAAACAGCACTAAGGGCATATGATATGAACCTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 608894 93 - 647215 GAAGGAAATGCCAGGAAGGCGATGTGATACTTCAGTGCTTCTATGTGTGTGCCATTTCAACCCAACACCACGGGCATATGTTATGAATCTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 300065 93 + 647215 GAAGGAAATGTCAGCAAGATGATGTCGTACCTCAGCGCTTCTATGTGTATGCCATTTCAAAACAGCACTAAGGACACAAGATATGAGCCTACC + +a +s mr.mrrefChr5 158877 21 + 294542 AGAGAGTGGTTCATTGTTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308270 21 + 636262 AGGGAGTGGTTCATTATTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 608990 21 - 647215 CAATAGTGGTTAACTGGCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 300158 21 + 647215 AGAGCGTGGTTCATTGTTCCA + +a +s mr.mrrefChr5 158898 168 + 294542 GGGTTTTGTCCTTATCAGACCGATGTAAGCATTGGTTGTTCTAGTGGTATTACGGCAGTCTTTTCATAACCCCAATCATAAGTAGATTTGTATCCGCCTGATCTGTCTATGTTGAATGGTATTGCATCATTTCAAAGGACGATGCATTTAAATGACAATGTATTGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308291 165 + 636262 GGGTTTTGTCTTTATCCGAC--ATGTAAGCATTGGTTGTTCTAGTGGTATTACGGCAGTCTTTTCATAACCC-AATCATAAGTATATTTGTATCCGCCTGATCTGTCTATGTTGAATGGCCTTGCATAATTTCAAAGGACGATGCATTCATATGACAATGCATATGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 300179 168 + 647215 GTATTTTATCCTTATCAGACCGATGTAAGCATTGGATGTTCTGGTGATATTACGGCAGTCTTTTCATAACCCCAATCATAAGTAGATTTGTGTCTGCCTGATCTATCTATACTGAATGGTATTGCATCATTTCAAAGGACAATGCATTTAAATGACAGTGTACTGCAT + +a +s mr.mrrefChr5 159066 218 + 294542 AAAGGACAATGCATTCAGATGACAATGCATGTGAAAAGACCTGAACTTGATCAATATCTTGATGAAATTAGCCACACTGTCCCTATACCTCTGAGACTGGCTCTGGCACACTGGTAAGTACCATGGCACTTATGGTTGTAGTATTAGCAAGAGGACTAGAACAGGATCCGCTAGGCAGAGCTGTAAAGCCTATAAAGCTTAGGGTCAAAATTCAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308461 216 + 636262 AAAGGACAATGCATTCAGATGAGAATGCATGTGAAAAGACCTGAACTTAATTAATGTCTTGATAAAATTAGCCACACTGTCCCTATACATGGGAGACTGACTCTGGCACACTGGTAAGTACCACTGCACTTATGGTTGTGATGTTAGCAAGAG--TTAGAATAGGATCCGCTAGGCAGAGCTGTAAATCCTATAAAGCTTAGGGTCAAAATTCAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 300347 211 + 647215 ATAGGACAATGAATTCAGATGACAATGCATGTGAAAAGACCTCAACATGATCAATATCTTGACGAAATAGGGCACACTGTCCCTATACCTCTGAGAATGGCTCTGGAACACAGTTGAGTACCATGGCA-------TTGCAGTACTAGCGAGAGGACTAGAACAGGATGCCCTAGGCAGAGCTGTAAAGTCTATATAGCTTGGGGTCAAAAATCAATCA + +a +s mr.mrrefChr5 159284 112 + 294542 ATGTAGATTTGTACATGAAAATGCTGGTCAAAACAAATATTATGCCCTATAAGAAGTGAATGATAGCTTTTCACATTGGTACAAGGTGGCCAGCAATTTGACATGTTGTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308694 112 + 636262 ATGTAGATTTGTACATGAAAATACTGGTCAAGACAAATATTATACCCTGTAAGAAGTGAATGTTAGCTTTTCACTTTGGCACAAGGTGGCCAACAATTTGACATGTTGTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 300558 111 + 647215 ATGTACATATGTACATGAAAATGCTGGGCACAACAAATATTATGACCTATAAGAAGTGAATCATAGCTTTCCACATTGATACAAGGTGGCCAGCA-TTTGACGTGTTGTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 159396 26 + 294542 TCCTCTGATAAGATTTCTCTTGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308808 26 + 636262 TCCTCTGACAAGATTTCTCTTGCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 300669 26 + 647215 TTCCCTAATAAGATTTTTCTTGCACT + +a +s mr.mrrefChr5 159422 78 + 294542 CCTGATGTTCTTCTACCTCTAGCCTGTGAACTCAGAATAAAATGAGGGTGGCCCATTGGCCCTTTGTAATCATGACGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308835 75 + 636262 CCTGATGTTCATCTAACTCTAGCCTGCGAACTTAGAATAACATGAGGGTGGCCCCTTG---CTTCGTAACCATGACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 300695 76 + 647215 CCTGATGTTCTTCTACATCTAGCATATGAACTCAGAATAAAATGAGGGTGGCCCATTGGCCCTTTGTAATCA--GCGT + +a +s mr.mrrefChr5 159500 274 + 294542 TGTCCTTATTTACCTGTAGGACAAAGGTCTGACCTTGGTTTCCACTGAAATCAACTAGTTtcaatattgctcttgtagtttggtcctaacagtgcaacacagcttgagtggtcccactttcaaggcctccaggttgagaattaagatgtgctgcagcaactagagggttcccagttttaggacttacagTTTGGATGATCAAATAAAGCTGGGTGATGTAGACATATGATGTACCATTTAGGATTCTCTAACTTGCAAACACACAGTTGAGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 308911 274 + 636262 TGACCTTATTTACCTGTAGAACAAAGGTTTGACCTTGGTTTCCACTGAATTCAGCCAGTTTTAATATTGCTCTTGTAGTTTGTTCCTAACAGtgcaacacagcttgagtggtcccactttcaaggcctccaggttgagaATTAAGATGTGATGCACCAACTAGAGGGTTCCCTGTTTTAGGACTTACAGTCTGGATGATCAAATAGAGCTGTGTGATGCAGACATATGATGTACCAAGTAGGATTCTCTAACTTGCAAACACACAGTTGAGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 300771 273 + 647215 TGTCCTTATTTACCTGTAGGACAAAAGTCTGACCTTGGTTGCTGCCGAAATCAActagtttcaatat-gttcttgtagtctggtcctaacaatgcaacacagcttaagaggtcccactttcaaggcctccagtttgtgaatcaggatgtcctgcagtagttggagggttcccagttttaggacttccagTTTGGATCATCAAATAAAACTGGGTGATGTAGACATATGACATACAATTCAGGATTCACTAACTAGGAAGCACACAGTGGAGCGG + +a +s mr.mrrefChr5 159774 34 + 294542 ATCAGTACCTGCAGTTCTGTGACTGTCTTATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309185 34 + 636262 ATCAGTACCTGCAGTTCTGTGACTGTCTTATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 301079 34 + 647215 ATCAGTACCTGCAGTTCCGTGGCCGTTTAATCAA + +a +s mr.mrrefChr5 159808 24 + 294542 ATTTTTTCATAAACACTTGTCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309221 24 + 636262 ATTTTTTCATAAACACTTGTCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 301113 24 + 647215 ATGTTTTCATAAGCACTGGTCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 159832 81 + 294542 CTTACTAGCGGCTCTCCTTGGCATTTAATATATTGACTTTGCCATTTCACTGGCAGCTACACATGTTCTCACTGGCAGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309245 81 + 636262 CTTACTAGCGGCTCTCCTTGGCATTTAATATATTGACTTTGCCATTTCACTGGCAGCTACACATGTTCTCACTGGCAGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 301141 81 + 647215 CTTACCCGCTGCTCTCCTTGGCACTTAATGCATTGACTTCGTCATTTCACTGGCAGCTACACATGTCCCCACTGACAGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 159913 3 + 294542 AGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309337 3 + 636262 AGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 301222 3 + 647215 AGC + +a +s mr.mrrefChr5 159916 40 + 294542 AAATGTATCGGACACCTGCATGAAGTCTGGAGCTACAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309340 40 + 636262 AAATGTATCGGACACCTGCATGAAGTCTGGAGCTACAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 301227 40 + 647215 AAATGGATTGAACACATGTATAAAGTCTTCAGCTAAAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 159956 31 + 294542 CATGGTTAATGTATTGTACTAATGGAGTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309380 31 + 636262 CATGGTTAATGTATTGTACTAATGGAGTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 345812 31 - 647215 CCTCATTTTAGGATTGTACTAATGGAGTAAG + +a +s mr.mrrefChr5 159987 93 + 294542 GTTGGACCATTAGGCAGTGCACCCACCAGGTTTATAATTGGATTCATATGGCTCTGGCCACTTCATGTATATGTCTGATGCACTTTTTCCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309415 93 + 636262 GTTGGACCATTAGGCAGTGCACCCACCAGGTTTATAATTGGATTCATATGGCTCTGGCCACTTCATGTATATGTCTGATGCACTTTTTCCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 345843 93 - 647215 ATTGGACCATTAAGCAGTGCACCCACCAGGTTTATAATGGGGTTCATATGGCTTTGGCTACTTCATGTATATGTCTGATGCACTTCTGCCCAC + +a +s mr.mrrefChr5 160080 12 + 294542 ATCATACTAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309692 12 + 636262 ATCATACTAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 345936 12 - 647215 AACATTACCATG + +a +s mr.mrrefChr5 160092 10 + 294542 GGCTTAATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309704 10 + 636262 GGCTTAATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 301403 10 + 647215 TGCCTAGAGG + +a +s mr.mrrefChr5 160102 64 + 294542 ACTCGGCTGATGCAGGGTAGCCAGGGCTCATTATGTAAATCCTGATTAGTACTGGATTGGATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309714 64 + 636262 ACTCGGCTGATGCAGGGTAGCCAGGGCTCATTATGTAAATCCTGATTAGTACTGGATTGGATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 301414 64 + 647215 ACTCAGTTGATGCTGGGTAGCCAGGGCTCATCATGCTAATCCTGATTAGTGATGAATTGGATTG + +a +s mr.mrrefChr5 160166 18 + 294542 GAGGGTGTCTCAGGGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309784 18 + 636262 GAGGGTGTCTCAGGGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 301478 18 + 647215 GAGGGTGTCTCAGGGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 160184 136 + 294542 AAGGAGGGTGTCGTACTTTAGAATCAGAGATTACCTCCTGGAGTTGGTTATCAAGATTTGTATCCAGGCAAACTTGATCGTGGGGACCACCTACCTATCACCACTGTGGTTAATATTGATTGGTCTTGCACATATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309804 136 + 636262 AAGGAGGGTGTCGTACTTTAGAATCAGAGATTACCTCCTGGAGTTGGTTATCAAGATTTGTATCCAGGCAAACTTGATCGTGGGGACCACCTACCTATCACCACTGTGGTTAATATTGATTGGTCTTGCACATATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 301496 136 + 647215 AAGGAGCATGTCGTACTGTAGAATCAGAGATGACCCCCTGAAATTGGTTCACAAGAATTCTATCCAGGCAGACTTGTTCATAGAGACTGCCTACATGCCACCGCTGTGATTAAAATTGATTGGTTATGCATATATT + +a +s mr.mrrefChr5 160320 29 + 294542 GTGGGCTTAGGTGTAGTTGATGCACAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309940 29 + 636262 GTGGGCTTAGGTGTAGTTGATGCACAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 301643 29 + 647215 GTGGGCATAGGTGAGCTTGATGCACAGAG + +a +s mr.mrrefChr5 160349 41 + 294542 CTCAGATTCGATCTAGCAAGAGATGTTATTAATGACACTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 309969 41 + 636262 CTCAGATTCGATCTAGCAAGAGATGTTATTAATGACACTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 301673 41 + 647215 CTCAGATTCTTTCTAACAAAAGATGTTATTAATTATGCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 160390 207 + 294542 AAGCAAAGTCTATAGGTGCAATGTGTGGGTAACTAAACTCAGCTTGGACAGGTGACAAAAACGTGTAGTCATTTGCATGGGGATACAGGTGTAGCTCAATTGTTGCGATGCCTTGGGATACATGCTGCTGCTGCCACTCCAGACAGAAGAGGACACTCGCAATCACTTCAGTCTTGTGTGGCCATAGACAGGTGTTCACAGCCTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310013 207 + 636262 AAGCAAAGTCTATAGGTGCAATGTGTGGGTAACTAAACTCAGCTTGGACAGGTGACAAAAACGTGTAGTCATTTGCATGGGGATACAGGTGTAGCTCAATTGTTGCGATGCCTTGGGATACATGCTGCTGCTGCCACTCCAGACAGAAGAGGACACTCGCAATCACTTCAGTCTTGTGTGGCCATAGACAGGTGTTCACAGCCTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 301714 207 + 647215 AAGAAGGGTTTATAGGTGCTATGTGCGGCTAACTAAACTCAGCTTGGACAGGTGACATATACACATAGTTACATGCATGCAGATGCAGGTGCAGCTCAATTTTTGTGATGCCTCGGGATACATGCTGTTGCTGTCACTCCAGACAGAAGAGGGCACTTGCAATCACTTTGATTCTGTGCAGCCACAGACAGGTTTTCACAGCATTTC + +a +s mr.mrrefChr5 160597 18 + 294542 ACAGCCTCCCTGGGTCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310221 18 + 636262 ACAGCCTCCCTGGGTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 301921 18 + 647215 ACGACCTCCCTGGATCAT + +a +s mr.mrrefChr5 160615 79 + 294542 CCAGTGGGCATTAAATATGTTGGACCATGCTTGACCAAGTCTTCTCACTGCTAATTGTGTGTATGAGTAGACTTGCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310241 79 + 636262 CCAGTGGGCATTAAATATGTTGGACCATGCTTGACCAAGTCTTCTCACTGCTAATTGTGTGTATGAGTAGACTTGCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 301939 79 + 647215 CCGTGGGGGACCAAATATGTTGGACCATGCATGACCAAGTCTTCTCAATGCTCATTGTGTGCATGAGCAGACTTGCTTG + +a +s mr.mrrefChr5 160694 32 + 294542 CGGGTCACTGAGATGCTCCAAACCCTGCTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310328 32 + 636262 CGGGTCACTGAGATGCTCCAAACCCTGCTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 302018 32 + 647215 CTCGTCACTGAGATGCTCAGAACACTGCTAGC + +a +s mr.mrrefChr5 160726 87 + 294542 TGCACCTGGATTGTGTCTGGCTGAATTTCTTACCACCCTATCCCCCTTTGCAGTAGCCATACTTTGGGTTGGGCCTCTCATGGGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310360 87 + 636262 TGCACCTGGATTGTGTCTGGCTGAATTTCTTACCACCCTATCCCCCTTTGCAGTAGCCATACTTTGGGTTGGGCCTCTCATGGGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 302051 87 + 647215 TGCACCTAGATCATGCCTGGCTGAATTTCTTACTATTCTATCCCCCTGTGCAGTAACCATACTTTGAGTTAGGCCTTTTATGGATAT + +a +s mr.mrrefChr5 160813 188 + 294542 AATGCCGAGATCTGTGAGATTGAGTCAAGGCAAAAAACATTACCACATGAAACTGCACAATCTACTAGATGATTCATCATTCTTTTTCCCCTGTTAGTGTAGGACTGTTCTTTTTCTCTGCCGTCTGCAGTTGAGGTGAAGTTTACCTAAAAAATAGGCCTATTTCTGCCCATCCATACTGAGAAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310461 188 + 636262 AATGCCGAGATCTGTGAGATTGAGTCAAGGCAAAAAACATTACCACATGAAACTGCACAATCTACTAGATGATTCATCATTCTTTTTCCCCTGTTAGTGTAGGACTGTTCTTTTTCTCTGCCGTCTGCAGTTGAGGTGAAGTTTACCTAAAAAATAGGCCTATTTCTGCCCATCCATACTGAGAAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 302138 188 + 647215 AATGGTGAGAACTGTGAGATTGAGTCAAAGTAAACAACACTGGCACATGAAACTGCACAACCTAAGGGATTATTCATCATTCTTCTTCCCCTGTTAGTGTAGAACTGTTCTTTTTCTCTACAGTCTGCAGTTGAGATGAAGTTTACCTATGAAATAGGCCCATTTTTGCTAAACCATGCGGAGAAATA + +a +s mr.mrrefChr5 161001 29 + 294542 TTGTGTTGTTGACAGGTTCTCAAGGAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310694 29 + 636262 TTGTGTTGTTGACAGGTTCTCAAGGAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 302326 29 + 647215 TTATGTTGCTGACAGGTTCTCAGGGAATC + +a +s mr.mrrefChr5 161030 102 + 294542 GAGGTAAAGGATTGAATGTGTAACAAGTAGAAATCTATGGTTGTCCTCATCGCACTGGTCATATATATTTTGATCCTCAGGCAGCAAGTATCCTGAACTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310757 102 + 636262 GAGGTAAAGGATTGAATGTGTAACAAGTAGAAATCTATGGTTGTCCTCATCGCACTGGTCATATATATTTTGATCCTCAGGCAGCAAGTATCCTGAACTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 302355 102 + 647215 TGGGTAGAGGATTGAAGGTGCAATGAATAGGAAGTTAAGGTTGTCCTTGTTGCACGGGTCACATAAATTCTGATCCTCAGGAAGCACATACCCTGGACTGGC + +a +s mr.mrrefChr5 161132 57 + 294542 GCAAATTAGAAATTTAATGAATAGGGAAAGCAGTTTTTCCGAAAAAAAAGAAGAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310859 57 + 636262 GCAAATTAGAAATTTAATGAATAGGGAAAGCAGTTTTTCCGAAAAAAAAGAAGAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 302500 57 + 647215 GCAGGTTAAAAATCTAATGAATTGGGTAAGTGGTTCTTCAGAAGCCAAAGGACACGA + +a +s mr.mrrefChr5 161189 53 + 294542 TAGTCCATAGTTTGTTTTCTTTATAACTATAGGTATATGAAGTATTTCATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310916 53 + 636262 TAGTCCATAGTTTGTTTTCTTTATAACTATAGGTATATGAAGTATTTCATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 302558 53 + 647215 CAGTATATAGTTTTTTTTTTTTGTTACTACAGTTATATGAAGTATTTCATATG + +a +s mr.mrrefChr5 161242 79 + 294542 ACTTGTGTGGATTGCTTTCATGTTGTAAGTATTCAGACTATGTAACCTTGTATCAGGCGTAGGCATATCAGGCAAGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 310969 79 + 636262 ACTTGTGTGGATTGCTTTCATGTTGTAAGTATTCAGACTATGTAACCTTGTATCAGGCGTAGGCATATCAGGCAAGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 302612 79 + 647215 ACTCGTGTGAATTTCTTCCTTGTTGTAAGTATTCAGGCTATGTAACCCCACATCAGACGTAGGCATATCAGGCAAGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 161321 22 + 294542 CTTAGACAGGGTTGCAACCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311050 22 + 636262 CTTAGACAGGGTTGCAACCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 302691 22 + 647215 CGTAGACAGGGTTACAATAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 161343 12 + 294542 TTGTTCCTATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311074 12 + 636262 TTGTTCCTATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 302713 12 + 647215 TTGGTCCTATTA + +a +s mr.mrrefChr5 161355 29 + 294542 ATGCACTGTTATCCTAAAGTTTAAGTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311086 29 + 636262 ATGCACTGTTATCCTAAAGTTTAAGTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 302727 29 + 647215 ATGGGCTGGTATCCTGGAAGTTAAGTTAG + +a +s mr.mrrefChr5 161384 76 + 294542 TAATTAAGCCAAAAAGAGTATGGGTGTGATAGCATGCATTTGCATGAAATTGGATTTTGCCTTTCTATTGGGCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311115 76 + 636262 TAATTAAGCCAAAAAGAGTATGGGTGTGATAGCATGCATTTGCATGAAATTGGATTTTGCCTTTCTATTGGGCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 302757 76 + 647215 TAATTAAGCGGAAGAGGGTATGGGTATGATAGCATGCTTTTGCATGAATTTAGACCTTGCCCTTATAATGGGCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 161460 13 + 294542 AAATGTGCATAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311192 13 + 636262 AAATGTGCATAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 302833 13 + 647215 GAATAAGCTGAGG + +a +s mr.mrrefChr5 161473 52 + 294542 GTAACATAGGATAGCCTATATACCACTGAACTCAAATGTCTGCAGTTTTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311205 52 + 636262 GTAACATAGGATAGCCTATATACCACTGAACTCAAATGTCTGCAGTTTTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 302852 52 + 647215 AAAACATAGAATAGTCAATATACCACTGAACTCAAATGTCTGCAGTTTTATG + +a +s mr.mrrefChr5 161525 8 + 294542 AAAAATGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311257 8 + 636262 AAAAATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 302908 8 + 647215 AAAAATGC + +a +s mr.mrrefChr5 161533 88 + 294542 GATTACTTTTAAGGTGAGAAGCAATGCGTAATCATACATAGTGTTGATGATTTGTATATACATTGTGGTTAAACCCATTTATACTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311266 88 + 636262 GATTACTTTTAAGGTGAGAAGCAATGCGTAATCATACATAGTGTTGATGATTTGTATATACATTGTGGTTAAACCCATTTATACTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 302916 88 + 647215 GATTACTTTCAAAGTGAGAAGCAATGCATAATCATACATAGTGATGATGGTATGTATATACATTGTGGGTAAACCCATTTACACTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 161621 13 + 294542 GTCCTGTGCCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311370 13 + 636262 GTCCTGTGCCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 303004 13 + 647215 GTCCTGTGCCCCA + +a +s mr.mrrefChr5 161634 51 + 294542 ATTTGAATGGGCAATTTCCTTTAACTAATGAACTAGTCCTTTCCCAGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311383 51 + 636262 ATTTGAATGGGCAATTTCCTTTAACTAATGAACTAGTCCTTTCCCAGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 303029 51 + 647215 ATTTGAATGGGCAGTGTCCTTTAACTAATGAACTACTTCTTCCCCAGAATA + +a +s mr.mrrefChr5 161685 46 + 294542 GGAACAATATGTAGTCCCCTTCTCCATAATGCATCAATGAGATCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311439 46 + 636262 GGAACAATATGTAGTCCCCTTCTCCATAATGCATCAATGAGATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 303080 46 + 647215 GGACTAATATGTAGTCCCCTTCTCCATAATGCATCATTGAAATTCC + +a +s mr.mrrefChr5 161731 27 + 294542 GTTTGGTGTACTCCATCTCAGGACAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311487 27 + 636262 GTTTGGTGTACTCCATCTCAGGACAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 303126 27 + 647215 ATTTGGTGTACTTCAGCACAAGGTGGT + +a +s mr.mrrefChr5 161758 51 + 294542 TGACATAGACCTATAAGATAGTTGGTTATTATTTCTGTCTTCTGTCCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311528 51 + 636262 TGACATAGACCTATAAGATAGTTGGTTATTATTTCTGTCTTCTGTCCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 303153 51 + 647215 TGGCATAGACCTATAAGGTAGTTGGTTATTATTTCTGTCTTCTGTCCCTTG + +a +s mr.mrrefChr5 161809 40 + 294542 TATATAAACAGCCATTGCTCTGGTTACCTGGTTATACCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311583 40 + 636262 TATATAAACAGCCATTGCTCTGGTTACCTGGTTATACCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 303204 40 + 647215 TATATAGACAGGCATTGCTCCGGTTAATTGGTTATTCCAA + +a +s mr.mrrefChr5 161849 196 + 294542 AGCTGGTTCATACCAGCAACTTATCCTCTCTTCCTCCTGAACATAAGTAGATTTGATAGCCCCTTGCACCTTTTCATCAGGTCACATGACCTTATACCCCTGAAAGTAGGTCTGACACTGGTAAGTACAATGGCACATATGATCATGATAAAACAGATTGGGACCTAGGACAAGACCAGCTAAGTTGATTGATAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311623 196 + 636262 AGCTGGTTCATACCAGCAACTTATCCTCTCTTCCTCCTGAACATAAGTAGATTTGATAGCCCCTTGCACCTTTTCATCAGGTCACATGACCTTATACCCCTGAAAGTAGGTCTGACACTGGTAAGTACAATGGCACATATGATCATGATAAAACAGATTGGGACCTAGGACAAGACCAGCTAAGTTGATTGATAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 303245 196 + 647215 AGCTGGTTCCTACAAGCAACTTACCCTCTCTTCTTCTTGAACATAAGTACATTAGACAGCCCCTTGCACCTTTCCATCAAGTCACATGACCTTATACCCCTGAGATAAGGTCTAATACTGGTGAGTACAATGGCACAAATGATCATGATAAAATGGAATGGGAACTAGGACAAGACCAGCTAAGTAGATCTATAAG + +a +s mr.mrrefChr5 162045 55 + 294542 CAACCAGGATTAGGTCCAAAGCTGAACTAAGGCATGTCTAACTACTGGGCAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311819 55 + 636262 CAACCAGGATTAGGTCCAAAGCTGAACTAAGGCATGTCTAACTACTGGGCAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 303442 55 + 647215 CAACCAGTAATAGGTCCAGGGCTGAACCAATGTTTGTCTAACTACTGGGCAAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 162100 20 + 294542 CAAAACCATTGTTTTATCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311874 20 + 636262 CAAAACCATTGTTTTATCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 303503 20 + 647215 CAAAACCATCACGTTAGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 162120 46 + 294542 GATAATAACTTTATAAATCAGCACAAAATGCTCAGCAACTTGGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311895 46 + 636262 GATAATAACTTTATAAATCAGCACAAAATGCTCAGCAACTTGGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 303523 46 + 647215 GACGCTAACTTTATAGATCAGCACAAAATGTCCAGCAATTTGGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 162166 34 + 294542 CTCTTTCTTCTACTGCCATGATTTTATCTTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311942 34 + 636262 CTCTTTCTTCTACTGCCATGATTTTATCTTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 303569 34 + 647215 CTCTTTTTTCTACAGCCATGATTTTATCTTGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 162200 45 + 294542 ATCCCCTGGCACACTTTAACCTCTAGCCCTGTATCAGAGTGAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 311976 45 + 636262 ATCCCCTGGCACACTTTAACCTCTAGCCCTGTATCAGAGTGAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 303604 45 + 647215 ACCCCCTGACATCCTTTAACCTCTGGCCCTGTATCAGAATAAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 162245 21 + 294542 AGCATTTGCCTGGCTGTTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312023 21 + 636262 AGCATTTGCCTGGCTGTTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 303649 21 + 647215 AGCATTTGCCTTGCTGTTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 162266 36 + 294542 TTCAAAAATATACTCGTAATAATCAAAACTTTTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312044 36 + 636262 TTCAAAAATATACTCGTAATAATCAAAACTTTTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 303674 36 + 647215 TTCAAAAATATAGTCATTATAATTAAAACTTCTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 162302 50 + 294542 TCTAGTTTGACTGCAGGAGGAACAACAATAGTTTATAGTTACTCACCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312080 50 + 636262 TCTAGTTTGACTGCAGGAGGAACAACAATAGTTTATAGTTACTCACCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 303712 50 + 647215 TCTGGCTTAAATGCAGTTTGAACAGCAATAATTTATAGTTACCCACCCTC + +a +s mr.mrrefChr5 162352 114 + 294542 TAATGCAGAGGGCGGTAATGTGGACTGCACTAGGTACTCCATGTTTCTACTTGAAGGAAAAAGGTCTGACCCCTACTCCCATTTATGTCAACTCAGATTCAGTACCACTTTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312139 114 + 636262 TAATGCAGAGGGCGGTAATGTGGACTGCACTAGGTACTCCATGTTTCTACTTGAAGGAAAAAGGTCTGACCCCTACTCCCATTTATGTCAACTCAGATTCAGTACCACTTTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 303762 114 + 647215 TGATGTGGAGGCAGGTAATGTGGACTACACTAGGTACTCCACATTTCCACCTGAAGGAAAAAGGTCTAACCCCAACTCCCATTTATGTCAGCACAGATTCTATATCACTTTCCT + +a +s mr.mrrefChr5 162466 65 + 294542 GTCTGTCATCTTAGTTCCTTATTCACAAGAGACAGTCATGACAGTGTGAGACACCTTATTTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312253 65 + 636262 GTCTGTCATCTTAGTTCCTTATTCACAAGAGACAGTCATGACAGTGTGAGACACCTTATTTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 303877 65 + 647215 GTTTATCGTCTCCATTCCTATTATACAAGAGACAGTCATGGCAGTGTGAGATACCTTATCTAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 162531 90 + 294542 TGGGcagtcatgacagtgcaagatagttgcaggagtcccatgttgacaggattctggttctgagtatgatgtgatacagcttaagagatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312318 90 + 636262 TGGGCAGTCATGACAGTGCAAGATAGTTGCAGGAGTCCCATGTTGACAGGATTCTGGTTCTGAGTATGATGTGATACAGCTTAAGAGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 303977 90 + 647215 CGGGcagtcatgacagtgcaagatagctgcaagggtcccattttgacaggattctggttctgattataatgtgagacagcttaatggatt + +a +s mr.mrrefChr5 162621 27 + 294542 gtactaagatttccagaggtggcaagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312411 27 + 636262 GTACTAAGATTTCCAGAGGTGGCAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 304067 27 + 647215 gtacttaggctgccaggggtggcaagc + +a +s mr.mrrefChr5 162648 25 + 294542 ctggaggattatcaaacaTACCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312439 25 + 636262 CTGGAGGATTATCAAACATACCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 304094 25 + 647215 ctggaggattggcaaataTATCCCA + +a +s mr.mrrefChr5 162673 84 + 294542 AGTTGGGAGGGACTGATCGCAGTATGTAGCCCTAAGGCAGGAATGAAACTTCTAATTGTACAAGGAAGTGTGCCATCACTCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312464 84 + 636262 AGTTGGGAGGGACTGATCGCAGTATGTAGCTCTAAGGCAGGAATGAAACTTCTAATTCTATAAGGAAGTGTGCCATCACTCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 304202 84 + 647215 AGTTGGGAAGGACTGAATGCAGTATGTAGCCCTAAGGCAGGAACAAAACTTCTAATAGCACAACGAAGTGTGGCATCACTCCTA + +a +s mr.mrrefChr5 162757 217 + 294542 CTGGAATATATGCCATTTTTGACAGGTGAGTAAGCAGAGGTGGCTAGGGGTATTGTACCAGTGAGTAAGGTTATCAACAAAGCACATTAAAGAGAGGCTAACATGGAATGTCACTTGTCTCATACCATGTCTGTACCTGCTAAGACAAATCAACTTCAGTGCCTGTAGCTCCTTGAGAATGATACAGCAAATTTTTTACTGACATCAGTGGAGGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312548 217 + 636262 CTGGAATGTATGCCATTTTTGACAGGTGAGTAAGCAGAGGTGGCTAGGGGTATTGTGCCTGTGAGTAAGGTTATCAACAAAGCACATTAAAGAGAGGCTAACATGGAATGTCACTTGTCTCACACCATGTCTGTACCTGCTAACACAAATCAACTTCAGTGCCTGTAGCTCCTTGAGAATGATACAGCAAATTTTTTGCTGACATCAGAGGAGGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 304311 217 + 647215 CTGGAATATGTGCCATTTTTGACAGGTGAGTAAGCAGAGGTGGCTAAGGGTATTGTACCAACGAGTAAGGTTAACAACAAAGCGCATCACAGATAGGCTAACATGGAATGTCACCAGTCTGATACGATGTCTCTACTTGCTAAGACAAGTCAATCTCAGTGCCTGTAGGTCCTTGCGAATGATACAGCAAGTTTTTTACTGACATCAGTGGTGACAA + +a +s mr.mrrefChr5 162974 181 + 294542 AATACTTGCAGCTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAACTAGAGAGATGTTGGTGTGGTGCGCCAGAATGAATCAGACACATGTATGAAATCCTCGCTCCATCATAGGCCAGGTGGACCCACCATTAAGAGGTCAAATATACCTTTCTCATGCTTAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312768 180 + 636262 AATACTTGCAGCTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAACTAGAGAGACATTGGTGTG-TGCACCAGAATGAATCGGGCACATGTATGAAATCCTCGCTCCATCATAGGCCAGGTGGACCCACCATTAAAAGATCAAATATAACTTTCTCATGCTTAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 304528 169 + 647215 AAGCCTTGTAGTTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAGCTAGAGAGATGTTGGTGTGGTGCGCCAGAATGAATCAGACACATGTATGAAATCCTTGCTCCATCATAGG------------AACATTTAGAGGTCAAATATACCTTTCTCATATATAACGT + +a +s mr.mrrefChr5 163155 16 + 294542 GCTTAGATTTTGCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312949 16 + 636262 GCTTAGATTTTGCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 304697 16 + 647215 GCTTAGATTTCACACA + +a +s mr.mrrefChr5 163171 102 + 294542 GTGCCTCGTGCAAAGCTTCATTAAATGGCAAACATGGACACGTACAAGCGGTTAGTGCTTCACCCTGCCCTGCTTGATGTGATGTAAAACAGTCACAGGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312975 102 + 636262 GTGCCTCGTGCAAAGCTTCATTAAATGGCAAACATGGACACGTACAAGCGGTTAGTGCTTCACCCTGCCCTGCTTGATGTGATGTAAAACAGTCACAGGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 304713 102 + 647215 GTGCCTCGTGCAAAGCTCCATTAAATGGCAAATGTGGCCATGTATATGCAGCTAGTGCTTCACCCTGCCTTGCTTGATGCAATGTTAAACAGCCACAGGCAC + +a +s mr.mrrefChr5 163273 46 + 294542 TGTAGAGGGAGCCTGTTCACCTCACACAAGAGGTTTGACATGTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313078 46 + 636262 TGTAGAGGGAGCCTGTTCACCTCACACAAGAGGTTTGACATGTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 304815 46 + 647215 TGCAAAGGGAGCCTGTTCACCTCACGCATGATGTTTGTCATGTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 163319 182 + 294542 TATTAGCTAGTTGAAGACCTTTTATCTCTTTTAAAAGCCAATCCTAGATAGAGATGGGTTAAAACCTTTTAAGTTCACTGGCTTAGTCAGGTTTTGATTATTGCATTGGTTTGTAGCTGCACTTTGAAGGAAGCTATTCACTTAGCCCACTTAATCATTGGAGCATAAACTGACAAGTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313138 182 + 636262 TATTAGCTAGTTGAAGACCTTTTATCTCTTTTAATAGCCAATCCTTGAATAGAATGGGTTAAAACCTTTTAAGTTCATTGGCTTAGTCAGGTTTTGATTATTTCATTGGTTTGTAGCTGCACTTCGAAGGAAGCTATCCACTTAGCCCACTTAATCATTGGAGCATAAACTGACAAGTTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 304861 159 + 647215 ----------------------TATCTCTTTTAAAAGCCAATCCTAGATAGAGATGGGTTAAAACCTTATG-GTTGACTGGCCTACTCAGGTTTTGATCATTGCGTTGGTTCGTAGCTGTACTTTAGAGGAAGCTATTTACTTAGCCTGCTTCATCATTGAAGAATGAACTGACAGGTTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 163501 36 + 294542 AACAACCTCCTCAATAATAAACTGCTGCATAAGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313342 36 + 636262 AACAACCTCCTCAATGATAAACTGCTGCAAAAGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 305020 36 + 647215 AACAGCTTCCTCAACAAGAAATTGTTGCATAAGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 163537 93 + 294542 ATGAGGCATCCATGCTAAACAGCCAGGGAGATCAGATTGAGACTGGACAGCCAGAACTTAGCTCTTCTGTATTGATTAATGATCAAATCGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313378 93 + 636262 ATGATGCATCCATACTAAACAACCAGGGAGATCAAATTAAGACTGGAGTGCCAGAATTTAGCTCTTCTGTATTGATTAATGATCAAATCGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 305059 93 + 647215 ATGAGGCATCCATGATAAACAGCCAGGGAGATCAGATTGAGACAGGACAGCCAGAACTTAACTCACCTGTTTTGATTAATAATCAAATCGGCT + +a +s mr.mrrefChr5 163630 57 + 294542 GAAGTTTGTTGGGACATCAAGAAGAGTGTCTTGCTGTAGGATCATTTAATCTGGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313471 57 + 636262 GAAGTTTGTTGGGACATCAAGAAGAGTGTCTTGCTGTAGGATCATTTAATCTGGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 305157 57 + 647215 GAAGACTGTTGGGATATCAAGAATAGTGTCTTGCTGTAGGATCACTTAATCTGGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 163687 55 + 294542 TTAATTGTTATATCTAGGCAGATTGGTTAATATAAACCTATTAGAGGTTGCACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313528 55 + 636262 TTAATTGTTATATCTAGGAACGTTTGTTCATATGAACCTATTAGAGGTTGCACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 305215 39 + 647215 TTAATTGTTATATTTAGGCAGATTGGTTAATGTAAATCT---------------- + +a +s mr.mrrefChr5 163742 142 + 294542 CGTTGAACCCTCCTTGGGTAGCTGGCTTGATATGTGTATACTAGACATGATGTGAAGCTGATGCAGTTACAGTCTCATTGTGACAAGCTATTATTAGTGTACTTATTTCAGGTATGTTTAGGTGCTATATGTAGGTAGCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313591 142 + 636262 CGTCTAACCCTCCTTGGGTAGCTGGCTTGATATGTGTATACTGGACACAATGTGAAGCTGATGCAGTTACAGTCACATTGTGACAAGCCATTATTAGCGTACTTGATTCAGGTATGTTTAGGTGCTATGTGTAGGTAGCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 305254 140 + 647215 CATTGAACCCTCCTTGGGCAGCTGGCTGGAT--TTGTAGACTAGACATGATGTGAAGCTGATGCAGTCACAGTCTCATTGTGACAGACTGTTATTAGTGTACTTATTTCTGGTATCTGTAGGTGCTATATGAAGATAGCCAA + +a +s mr.mrrefChr5 163884 256 + 294542 AGCCACAGAAATGAATATGTGTTCATGTTAACAGGTGTAGCTCATATTGATGTGATGCCTTGGGATGCATGCTGCCATGACTTCAAACGCATAGCAGCTTTCTTTGTTTTGAAGATGGTGTATATATAAATATGTATTCACCAGCTCTCTAGGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATAATGAACCTTGCATGACCAATTAATCTTACTACTCAATGAGTGTTGATGTGGCATTGGGATGATGAATGATTTTACTTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313733 248 + 636262 AGGCACAGAAATGAATACATGTACATGTTAACAGGTGTGGCTCATCTTGATGTGATGCCTTGGAATGCACACTGCCATGACTCCAAATGCATGGCAGCTTTCTTTGTTTTGAAGATGGTGTATATATAAGTATGTATTCACCAGCTCTCTAGGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATA-----CCTTGCATGACCAATCAATTTTACTATTCAATGAGTATTGGTGTGGCATTGGGATGA---ATGATTTTACTTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 305413 243 + 647215 ATCCACAGAAATGAATATGTGTTC----------TTGTAGCTCATATTGATGTG---CCCTGGGATGCATGCTGCCATAACTTCAAACACATAGTAGCTTTCTTTGTTTTGAAGGTGGTGTATATATAGATGTGCATTCACTAGCTTTCTAAGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATAATGAACCTTGCATGACCAATTGATCTCACTACTCAGTGAGTGTTGATGTAGCATTGGGATGATGAATAATTTTACTTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 164140 49 + 294542 ACCTAGACCGTGCCTGACTCAATTTCATGGAGATAATGAGACTGAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313981 46 + 636262 ACCTAGACCATGCCTAACTCAATTT---GGAGATAATGAGACTGAATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 305663 49 + 647215 ATCTAGACTGTGCCTGACTCAATTTCATGGAGATAATAAGACTGAACCA + +a +s mr.mrrefChr5 164189 367 + 294542 AAACTAAAGTGCAGAAGTTCAGATTTGGATAAatgataagacCTTGGTGATAACATTCAGTACCCCAGAATGAAGCTTCATGACTAAAGTGCTTGTTACAGTGGTAGATAAAACTAAGGTTGAAACAAATGAATACCATTTTATAATATATCGAAGACTGTAGATATGACGACAGACCAAGTACCACGAGTGTTGGTGTATGAGATCATATAAACGAGCATGAATGAGCTCAAGAACAAGTTAATTGCCCCTGCAGCATAGTCATCAAATAGGGCTCTTGTATCTAGGGTTTCAAATGAGTCAATACAAACCCTTGAGGAAAAGATTAGTAACCCATGAAATGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314028 357 + 636262 AAACTGAAGTGCAGAAGCTCAGACTTGGATAA----------CTTGGTGGTAACATTCAGTGCCCCAGAATGAAGCTTCATGACTAAAGTGCTTGTTACAGTGATAGATAAATCTAAGGTTGGAACACATGCATACCATTTTATAATATATCGAAGACTGTAGATATGACGACAGACCAAGTACTGCGAGTGTTGTTGTATGAGATCATATAAACGAGCATGAGTGAGCTCAAGAACAAGTTGATAGCCCCTGCAGCATAGTCATCAAATAGGGCCCATGTATCTATGGATTCAAGTGAGTCAATACAAACCCTTGCAGAAAAGATTAGTAACCCATGAAATGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 305712 367 + 647215 AAACTAGAGTGCAGAAGTTCGGGTTTGGATAAATGATAAGACATTGATGACAACATCCAGTACCCCAGAATGAAGCTTCACGACTAAAGCACTTTTTACAGTGGCAGATAAAACTAAGTTTGAATCAAATGAATACCAAGTTACAATATATCGAAGACTGTAGATATGACAACAGACCAAGTACCACAAGTGTTGGTGTATGAAGCCATATAAGAGAGCATTCATGAGCTCAAGAAGAAGTTAATTGCCCCTGCAACATGGTCATCAAATAGGGCTCTTGTATCTAGGCTTTCAAATGAGTCAATACAAACCCTTGAGGAAAAGATTAGTAACTCATTAAGTGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 164556 13 + 294542 ATATCTTGATGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314499 8 + 636262 ATATCTTG----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 306079 13 + 647215 ACATTTTGATGGG + +a +s mr.mrrefChr5 164569 68 + 294542 GATCACAAGATATGTTCAAAAGTGACAAAGTTTTATAGGAAGCACCTGTAAAAATGAATGGTTAGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314507 6 + 636262 --------------------------------------------------------------TAGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 306147 68 + 647215 GATCACAAGATATGTTCAAAAGTGACAAAGTTTTATAGGAAGCACCTGTAAAAATGAATGGTTAGACT + +a +s mr.mrrefChr5 164637 10 + 294542 ATGAAGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314516 10 + 636262 ATCAAGATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 306215 10 + 647215 ACGAAGATAT + +a +s mr.mrrefChr5 164647 178 + 294542 CACACTTGGTATCCCTATCTGTGGCAAGAGAGTGGATTAAATGATTTATTTTAGCTATATGACCTTAGATTCACTGCCTTTCCTATAGTTCAGAGGTTGTGGACACACCACCACATATATAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCACACATAGGTGACTTACAGGAATCTGATAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314530 176 + 636262 CACACTTGTTATCCCTATCTATGGCCAGAGAGTGGATTAAATGATTTATTTTAGCTATGTGACCTTAGATTCACTGACTTTCTTAT-GTTCAGAGGTTGTGGACACACCACCACATATATAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCACACATAGGT-ACTTACAGGAATCTGATAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 306225 166 + 647215 CACACTTGGGATCCCTATCTGTGGCAAGAGAGTGG------------ATTTTTGGTGCATGACCTTAGATTCATTGCCTTTCCTTTAGTTCGGAGGTTGTAGACACACCACCAAATATAGAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCCCACATAGGTGACTTTCTGGAATCTGATAACCA + +a +s mr.mrrefChr5 164825 163 + 294542 TTGCATAACTGACTGGGTTTCACACCTTCTTTCCCATCAGGACACTCTGTGCATGGAATCTGACAACATGGCTTCCCATATATGAAGAGCATCTCACTTGCTGTGAGAATTGGAGCCAGCAGATGTGGAAAATACCCTACTTGATAGTCTTATGTCTGGCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314706 163 + 636262 TTGCATAACTGACTGGGTTTCACACCTTCTTTCCCATCAGGACACTCTGTGCATGGAATCTGACAACATGGCTTCCCATATATGAAGAGCATCTCACTTGCTGTGAGAATTGGAGCCAGCAGATGTGGAAAATACCCTACTTGATAGTCTTATGTCTGGCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 306400 163 + 647215 TCGCATTAATGACAAGGTTTGGCCCCTTCTTTTTCATCAGGACACTCTGTGCATTGAATCTCATAACATGGCTTCCTGTGTATGAAGAGAAGCTCACTTTCTGTGAGAATAGGAGCCAGTAGACGCCAAATATATCCCACTTGATAGCCTTATGTCTGGCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 164988 38 + 294542 TGGATTAAATGATTTATTTCGACTGCCTTACCTTAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314869 38 + 636262 TGGATTAAATGATTTATTTCGACTGCCTTACCTTAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 306567 38 + 647215 TGGAGTAAATGATTCAATTCAACTCCCTTACCTTAGAC + +a +s mr.mrrefChr5 165026 405 + 294542 TCACTGGTCTACCTAATATTCAGAGATTATGCTGTGCATCAAAACTGGAAGATTGTCCCCCCATTATATGAACAGCATATCACTGGCCAAAAGGGTTTGATCACCCTCATATTCACAAGAGATCACTCCAGTTCAGAGAGCATCAGATTCTATTTACACATTTCAACCCATTGAATAATCACCTGCTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGGAATATGGCATACCAGTAACCATTAGCATTATATTTTTCCAACCTCATGTGCATCACTCAGCATTATTTTTTTCTGACCTTGTGTGCCTCAGCCCTAACTCAGACCAGAAGTTAGACCCCCATTATGTTAGGGTGGCTTCCATATTATTCTTCCAATTTGATGGCACACAATATAGCTCCCAGAGTTATCTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314907 405 + 636262 TCACTGGTCTACCTAATATTCAGAGATTATGCTGTGCATCAAAACTGGAAGATTGTCCCCCCATTATATGAACAGCATATCACTGGCCAAAAGTGTTAAATCACCCTCATAATCACAAGAGAACACTTCAGTTCAGAGAACATCAGATTCTATTGACAAATTTCAACCCATTGAATAATCACCTGCTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGGAATATGGCATAGCAGTAACCATTAGCATTACATTTTTCCAACCTCATGTGCATCACTCAGCATTATTTTTTTCTGGCCTTGTGTGCCTCAGCGCTAACTCAGACCAGAAGTTAGACCCCCATTATGTTAGGGTGGCTTCCATATTATTCTTCCAATTTGATGGCACACAATATAGCTCCCAGAGTTATCTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 306606 403 + 647215 TCTCTGACTTACCTAATAATCAGAGATTACGCTGTGCATTAAAACTGAAAGATTTACCCCCCAT-ATATGAACAGCACATGACTGGC-ATAGGGGTTTGATGACCCTCATATTCACAAGAGATCACTCCAGTTAAGAGAGCATCAGATTCTGCTTACACATTTCAACTCCTTGAATAATCACCTGTTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGAAATATGGCATACCAGGAACCATAAGCATCATATGCTTCCAACCTTTTGTGCATCATTAAGCATTGTTTTTTTCTGACCTTGTGTGCATCAGCCCTAACTCTGTCCAGAAGCTAGATCCAGATTATGTTGGGGTTGCTTCCATATTATTCTTCCAATTCAATAGCACTGAATATAGCTCCAAGAGTTATTTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 165431 52 + 294542 AATTTAAAGGTCCTGAGCTTGGGGGGTATTTAAACATTTCCAGGACACTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315324 52 + 636262 AATTTAAAGGTCCTGAGCTTGGGGGGTATTTAAACATTTCCAGGACACTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 307009 52 + 647215 GACTTTAAGGTCCTGAGCTTGGGGGGTATTTAATCATTTCCAGGACATAGAA + +a +s mr.mrrefChr5 165483 9 + 294542 TGTGTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315380 9 + 636262 TGTGTTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 307061 9 + 647215 TCTGTTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 165492 37 + 294542 GAGACCCTAGAGGTCATATTGTGCAAGATGGTTCGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315412 37 + 636262 GAGACCCTAGAGGTCATATTGTGCAAGATGGTTCGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 307070 37 + 647215 GAGACCCAGATGGTCATACTATGCGAGATGGTTCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 165529 5 + 294542 GTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315451 5 + 636262 GTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 307108 5 + 647215 GTTTG + +a +s mr.mrrefChr5 165534 77 + 294542 ATAGTGTTCAAAAACTAGAACTATCTCTTTCAGAGTCCCACTACCTAGGTGTCATTCATGAACCATTGTTCCTTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315467 77 + 636262 ATAGTGTTCTAAAACTAGAACTATCTCTTTCAGAGTCCCACTACCTAGGTGTCATTCATGAACCATTGTTCCTTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 307113 77 + 647215 ATAGGGTTCAAAAACTGGACCTATCTCTTCCAGAGTCCCACTACCTAGGCGTCATTCATAGACCCTTGTTCCTTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 165611 21 + 294542 CAAAATGCAGGGGAGATGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315545 21 + 636262 CAAAATGCAGGGAAGATGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 307190 21 + 647215 CATAATGCAGGGGAGATGCAT + +a +s mr.mrrefChr5 165632 63 + 294542 TTATGCAGGTCTATGACTATTATCTGGTAGAGGAATGGGGGATTGGGATTACACATGATTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315566 63 + 636262 TCATGTAGGTCTATGACTATTATCTGGTAGAGGAATGGGGGATTGGGATTACACATGATTATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 307213 25 + 647215 TTATGCAGGTCTATGTGTATTATTT-------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 165695 249 + 294542 CATCCAGCACCAACCACCCTAATGTTAGCTCCAAAATGATGTGCCAGAACTCCAGATATGTGGAAAATTAGGTAAGCTTCACCTGACCGAGCTTTGGAATTTGTGGAGGTAAGCCCTAGTATTAATCCTGACTGGATAGCAACTGAAATAAGCTACATTTCACCCAGATGAGTTTAGTGTTTATCAATCATGCAACCAGGAAGGGTTAAACTGGGGCAATCTGGACTTGTACAGCTATATGAGTATCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315635 242 + 636262 CATCCAGCACCAACCACCCTAATGTTAGCTCCAAAATGATGTGCCAGAACTCTAGATATGCGGAAAATTAGGTAAGCTTCATCTGACTGAGCTTTCAAATTT-------CAAGCCCTAGTATTAATCCTGACTGGACAGCAACTGAAATAAGGTACATTTCACCCAGATGAGTTTAGTGCTTATCAATCATGCAACCAGGAGGGGTTAATCTGGGGCAACCTGGACTTGTACAGCGATATGAGTATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 307238 206 + 647215 -------------------------------------------CTAGAAATTCAGATATGTGGAAAATAAGGTAGGCTTCACCTGACCAAGCTTTGGAAATTGTGGAGGTAAACCCTAGCATTAATCATGCCTGTATAGGGACTAGAAATTGCTACAATTCACCCAAATGAGTTTAGTGTCTATCAATCATGCAACTAGGAAGGGTTAAACTGGGGCAATCTGGACTAGTACAGCTATATGAGTATCCC + +a +s mr.mrrefChr5 165944 170 + 294542 ATCCTCCTCACCCCATGTACTGACAGACATTAGCAATTACATGTATAGAAGAGCTTGGAATCTAAGCAAACACAGAATCATAATCATTTTCAATTTACTAGCATTGTACTGTCTCCCCTTGCCCAAAGATATGCATCGCCAAATAACGGAAGACTGCCTAAAGTGATGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 315877 170 + 636262 ATCCTCCTCACCCCATGTACTGACAGGTATTAGCAAATTCATGTATAGAGGCGCTTGGAATCTAAGCAAACACAGAATCATAATCATTTTCAATCTACTAGCATTGTACTGTCTCCCCTTACCCAAAGATATGCATCGCCAAATAACGGAAGACTGCCTAAAGTGATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 307445 170 + 647215 ATCCTCTTCATGCCATGTACTAACAGACATTAGCAATTACATGTATAGAAGAGCTTGAAATTTAAGCAAACACAGATTCAAAATCATTTATAATTTACTAGAATTGTACTGTCTCCCCTTGCCCAAAGACATGCATCACCAAATAAGGGATAACTGCCTAAAGGGATCGC + +a +s mr.mrrefChr5 166114 101 + 294542 ACTCTAGAAAAAAAGTCCTTAAAGTGCCATTACTTTTAAATTACGTCCCAAAGACATTGTTGGGTGGTACCTGCTTGGTACTTGGTACCAGTGGCTTAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316047 101 + 636262 ACTCTAGAAGAAAAGTCCTTAAAGTTCCATTACTTTTAAATTACGTCCCATAGACATTGTTGGGTGGTACCTGCTTGGTACTTGGTACCAGTGGCTTAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 307616 101 + 647215 ACTTTAAACAAAAAGTCCTTAGTGTGCCATTACTTTTAAATTACATCCCAAAGACATTGTTGGGTGGCACCTGCTCGATACTTGGCACCAGTTGCTTAACG + +a +s mr.mrrefChr5 166215 30 + 294542 TTGTGCAAAGTTCCAATAAAAGGCAAATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316171 30 + 636262 TTGTGCAAAGTTCCAATAAAAGGCAAATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 307717 30 + 647215 TTGTGTAAAGTTCCAATAAAAGGCAAATGT + +a +s mr.mrrefChr5 166245 35 + 294542 GCTGTGTGCATGTGGTTAGTAGTTGGCTGCTGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316202 35 + 636262 GCTGTGTGCATGTGGTTAGTAGTTGGCTGCTGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 307747 35 + 647215 GCCATGTGCATGCGGCAAGCACTCGGCTGCAGAGC + +a +s mr.mrrefChr5 166280 109 + 294542 AGCTGTCAAGCAGCTGCAGACACCAGGAGAAGAAGTCTGCCTGCCTCATGCACTGCCAAGTGATCACAGGGACATGTAGAAGGACCCAACACCCTCCACCCCATAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316252 109 + 636262 AGCTGTCAAGCAGCTGCAGACACCAGGAGAAGAAGTCTGCCTGCCTCATGCACTGCCAAGTGATCACAGGGACATGTAGAAGGACCCAACACCCTCCACCCCATAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 307782 109 + 647215 AGCTATCCAGCAACTGCAGGCACCAGGTGAAGAAGCCTGCCTGCCTCATGCACTGTCATGTGATTGCAGACACCTGCGGAAGGACCCAACACCCTCCACGCCATAAACC + +a +s mr.mrrefChr5 166389 42 + 294542 CATGAGATGCTATTTATTGCACAATACTCATAACCAAGATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316362 42 + 636262 CATGAGATGCTATTTATTGCACAATACTCATAACCAAGATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 307891 42 + 647215 CGTAAGATGCTATTTATTGCACAATACTCATAATCAACATTC + +a +s mr.mrrefChr5 166431 326 + 294542 TTCCAGCTTCATGATGTTCACAACTCTTGGCTCTTGGGGGCAGGGGTCTGCAAATACTGCCTCTGACTATCTCTTGTAGCATTGAAGAAGTTTATGTATTCCATGCCTAACATCCAAAACTTTAGTGGCTCTTAAAGCACAAGCACACTGCCTTAACACTGAGGATTGCCCCTGTTCTGTCACACTAAAGTATGTGCAGTACATTATGCTGCAGACACAGAGGGATCAATAAAATGAGTCGACAATAATACAACATTAAGAATAGCTTTCTAGTCCCCTCTGGGGTTTGTTCGTTGGACAGGGCATCTATAATGTACTCGGGGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316405 326 + 636262 TTCCAGCTTCATGATGTTCACAACTCTTGGCTCTTGGGGGCAGGGGTCTGTAAATACTGCCTCTGACTATCTCTTGTAGCATTGAAGAAGTTTACGTATTTCATGCCTAACATCCAAAACTTTAGTGACTCTTAAAGCAGAAGCACGCTGGCTTAACACTGAGGATTGCCTCTGTTCTGTCACACTAAAGTATGTACAGTACATTATGCTGCAGACACAGAGGGATCAATAAAATGAGTCGACGATAACACAACGTTAAAAATAGCTTTCTAGTCCCCTCTGGGGTTTGTTCGTTGGACAGGGCATCTATAATGTACTCGGGGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 307933 303 + 647215 TTCCGTCTTCATGGTGTTCATGACTCCTGGCTATTGGGGGCTGGGGTCTGCGAACAATGCCTCTG-----------------------AGATTATGTATTCCATGCCTAACATCAAAAACTTTAGTGGATTTTAAAGCACAAGCAAACTGCCTTAGCGCTGAGGAGTGCCCCTGTTCTGGCACAATAAAGTATGGGCAGTACAATATGTTGCAGACACAGTGGGATCAATAAAATGAGTCAACAATAATATAACATTCAGAAAATCTTTTTAGTCACCACTGGGGTTTTTTTGTAGGGCAGGGGATCTACAATGTATGCGGGGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 166757 80 + 294542 CACATGACAAGCCTCTTGTTAGAGGCACCACACTCACAAATTATGAGTTTATTTCTAGTGAGTGATTTGCCTATGCAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316733 80 + 636262 CACATGACAAGCCTCTTGTTAGAGGCACCACACTCACAAATTATGAGTTTATTTCTAGTGAGTGATTTGCCTATGCAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 308236 80 + 647215 CACATGACAAACCTCTTGCACGATGCGTTGCACTCATAAATTATGAATTTGTATCCAGTGAATGATTTGCCTATGCGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 166837 10 + 294542 CTTCTGGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316813 10 + 636262 CTTCTGGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 308373 10 + 647215 CTTTTGGATT + +a +s mr.mrrefChr5 166847 70 + 294542 TGGAGTATTTACAAGTTGTGGGCCATCTCGTGTGCCATGCACAGACTATAAGTTCTCAACTGACTGAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316823 70 + 636262 TGGAGTATTTACAAGTTGTGGGCCATCTCGTGTGCCATGCACAGACTATAAGTTCTCAACTGACTGAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 308388 70 + 647215 TGGAGAATTTACAAGTTGTGGGCCAGCTCATGTGGCATGCACAGACTTCAAGTTCTGAACTGACTGGACC + +a +s mr.mrrefChr5 166917 71 + 294542 AGATTAATGAAGAGGGGATGCGATCAAAAGGATGGGAAGCAGTGACCTAAAAAATGATTACTCTCTAGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316893 71 + 636262 AGATTAATGAAGAGGGGATGCGATCAAAAGGATGGGAAGCAGTGACCTAAAAAATGATTACTCTCTAGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 308459 71 + 647215 AGATTAGTGAAGAGCAAATACGATCAGAAGTATGGAAAGTAGTGACTCAAGATATGATTACTCTCTTAACC + +a +s mr.mrrefChr5 166988 11 + 294542 CAATGAATTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316970 11 + 636262 CAATGAATTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 308530 11 + 647215 CAATGAATTCT + +a +s mr.mrrefChr5 166999 88 + 294542 GGATCATCCCTACAAATATCATCAGATGTGGAAACTCAAGTGGACCTAACTAAAGTTCAGTTTTACACAATTTGCCAAGCTAATTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 316984 88 + 636262 GGATCATCCCTACAAATATCATCAGATGTGGAAACTCAAGTGGACCTAACTAAAGTTCAGTTTTACACAATTTGCCAAGCTAATTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 308541 88 + 647215 GGATCATCCCTACAAATACCATCAGATGCGGAAACTCCAGTGGATCCGGCTAAAATTCAGTTTTACACAATTTGCCAAGCTAATTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 167087 3 + 294542 GAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317072 3 + 636262 GAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 308640 3 + 647215 GAA + +a +s mr.mrrefChr5 167090 61 + 294542 ATTCTTTCTACACAGTTTATGAAGTTTGCCTCTTACTGGAGCTTTGCATGAGGCATTGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317075 61 + 636262 ATTCTTTCTACACAGTTTATGAAGTTTGCCTCTTACTGGAGCTTTGCATGAGGCATTGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 308646 61 + 647215 ATTCTGTCTACTCAGTTCATGAAGTTTGCCTCTTATTGAAGCTTTACATGATGCATTATGT + +a +s mr.mrrefChr5 167151 39 + 294542 AAATATAATCCATGTTAAGGTGCAACTCAGATGTAGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317136 39 + 636262 AAATATAATCCATGTTAAGGTGCAACTCAGATGTAGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 308708 39 + 647215 AAATACAACCAATGTTAAGGTGCAACTCAGGTCGAGATT + +a +s mr.mrrefChr5 167190 19 + 294542 GCCAATGCAGGTTCCCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317175 19 + 636262 GCCAATGCAGGTTCCCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 308750 19 + 647215 GCAAAATCAGGTTCCCAGA + +a +s mr.mrrefChr5 167209 23 + 294542 TTGGTCTGGCTTACTTCACAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317197 23 + 636262 TTGGTCTGGCTTACTTCACAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 308769 23 + 647215 TTGGCTTGGCCTACTTCACAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 167232 131 + 294542 CATTCCCAGCAAGAGGTTTCCTGTTCTAGCTGCTTTCCCAGCAAGAGGTATCCCAGGCTACATGTCAACTTCATGAGACTTCTCACAGAACCTAATCAGGCACTGCGGTACTGCACAATGTATGCATTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317222 131 + 636262 CATTCCCAGCAAGAGGTTTCCTGTTCTAGCTGCTTTCCCAGCAAGAGGTATCCCAGGCTACATGTCAACTTCATGAGACTTCTCACAGAACCTAATCAGGCACTGCGGTACTGCACAATGTATGCATTTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 308792 131 + 647215 CATTCCCAGCAAGAGGTTTCCTGTTCTAGCCAGATTCCCAGCAACAGGAATCATGTTCTACATATCAACTTCAAGAGACACCTCACAGAACCTATTCAGGTTGTGGGGTGTTGTACAATGTATGCACTTCC + +a +s mr.mrrefChr5 167363 101 + 294542 AAAATATCGTGCATTATATGCATTTCCAAACTTTTCTGGTATAACTCACCCTTCTACCTAAGAGCTTGTTGGATCGCTTGAGTCCTTCTAGGATAAGACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317353 101 + 636262 AAAATATCGTGCATTATATGCATTTCCAAACTTTTCTGGTATAACTCACCCTTCTACCTAAGAGCTTGTTGGATCGCTTGAGTCCTTCTAGGATAAGACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 308924 101 + 647215 AAAAGATCGTGCATTATATGCATTTTCAAACTTTGCTTGTACAACTCGTCCTTCCACCTAAGAGCTTGTTGGATTGCTTGAATCCTTTTAGGATAAAACAA + +a +s mr.mrrefChr5 167464 21 + 294542 ACTATGCACACTGAATTACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317455 21 + 636262 ACTATGCACACTGAATTACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 309025 21 + 647215 ACTGTGTGCGCCAAACAACTT + +a +s mr.mrrefChr5 167485 16 + 294542 AAGACTTGCATAACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317476 16 + 636262 AAGACTTGCATAACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 309047 16 + 647215 AAAACTTGCATAACAG + +a +s mr.mrrefChr5 167501 15 + 294542 TCCAGACAATGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317492 15 + 636262 TCCAGACAATGATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 309065 15 + 647215 TCCAGACAATGCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 167516 25 + 294542 ACTGGAATCGTACTGTATCATCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317541 25 + 636262 ACTGGAATCGTACTGTATCATCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 309080 25 + 647215 ATTTGAATCATACTGTATCAGCCAA + +a +s mr.mrrefChr5 167541 25 + 294542 CCCGACTCACAATGCTTCTCTCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317581 25 + 636262 CCCGACTCACAATGCTTCTCTCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 309105 25 + 647215 CCTGACTCACAATGCTTCTCTCAAA + +a +s mr.mrrefChr5 167566 177 + 294542 TTACAAACTAATGGACAATTCCATCCCTATACCATTCATAAATTCCCAACTAACCTTGTTCAGCCTTTGAAGAGACCATTGCATTCAATACATAGGCCATTGGCCCTAGTACTATTCCAATTCCATAGACTGGTGAGATTGGTGCAAAATTCAAATTATTCCTACATTGCTTTTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317610 144 + 636262 TTACAAACTAATGGACAGTTCCATCCCTTTATCACTCATAAATTCCCAACTAACCTTGTTCAGCCCTTGAACAGACCATTGCATTCAATACATAGGCCATTTACCCTAGAACTATTCCAATTCC---------------------------------ATTCCTACATTGCTTTTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 309130 177 + 647215 TTGCAAACTTACGTACAAGTCCATCCCTATACCATGCATAGATTCCTGACTAACCTTGTTCAGCCTTTGAAGAGACCATTGCATTCAATACATAGGCCATTGGCCCTAGTACTATTTAAATTCCATAGACTGGTGAGATTGGTGCAAAATTCAAATTATGCCTACATTGCTATTTTG + +a +s mr.mrrefChr5 167743 237 + 294542 CTTTTGGCATATAATAGGTTGTTTATCCATGAGATGTATAGGAAACTTATCTCACCCAATAAGTAAACAAAACTTATTATCTGGGTTCAGGCACATTAGAGTGCTGTGGCACAGTACAAGTGTGAGTTTGCTGCCCTCATTCTCAGGAACCTGTCAGGCACTCAAACTGTACAAAATAGAACAGTCTACACACTCATGTGTGGGATCCTGTCAGATTTCATATTCTGACTGAAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317754 232 + 636262 CCTTTGGCATATAATAGGTTGTTTATCCATGAGATGTATAGGAAACTTATCTCACCCAATGAGTAAACAAAACTTATTATCTGGGT-----CACATTAGAGTGTTGTGGCCCAGTACAAGTGTGAGTTTGCTGTCCTCATGCTCAGGAACCTGTCAGGCACTCAAACTGTACAAAATAGGACAGTCTACACACTCATGTGTGGGATCCCGTCAGATTTCATATTCTGACTCAAGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 309308 230 + 647215 CTTTTGGCATATATTAGGTTATTTATCCATGAGGTATATAGGAAACTTATCTCACCGAATAGGTAAACAAAACTTATTATCTGGGTTCAGGCATAT-------CTGTGGCACAGTACAAGTGTGAGTTTGCTGCCCTCATTCTCAGGGACCTGTCTGGCACTCAAAATGTACAAAATAGAACAGTCTACACACTAATGTGTGGGGTCCTGCAAGATTTCATATTCAGACTGAAGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 167980 9 + 294542 CTCAGGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317986 9 + 636262 CTCAGGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 309606 9 + 647215 CTCAGGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 167989 98 + 294542 TTGCCTGGATAGCTCTACCTCTGTTCCAATTTGTCCTTCTTGCTCCTGGGAATAGTTTCTTGAGAATAGTCTCTTTTTGTAGCCCGAAACCCACAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 317996 98 + 636262 TTGCTTGGATAGCTCTACCTCTGTTCCAATTTATCCTTCTTGCTCCTGGGAATAGTTTCTTGAGAATAGTCTCTTTTTGTAGCCCGAAACCCACAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 309615 98 + 647215 TTGCCTGGATAGCTCTACCTCTGTCCCAATTTGTCCTTCTGTCCCCTGGGAATAGTTTCTTGAGAATGGTCTCTTTTTGTGGACCACAACCCAGAACA + +a +s mr.mrrefChr5 168087 31 + 294542 CTTGTTCCACTTAGTTCCATCCATTGCCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318094 31 + 636262 CTTGTTCCACTTAGTTCCATCCATTGCCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 309718 31 + 647215 CTTGTCCCACTGAGTTTCATCCATTGCCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 168118 90 + 294542 GTATCCTATTTTCTATATACTTGGTAAGCCTCTGATATGTGTTTCTTGCTCTTGAGAACAGTTTCTTTAGAATAGTCTTTTTTTGTGGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318125 90 + 636262 GTATCCTATTTTCTATATACTTGGTAAGCCTCTGATATGTGTTTCTTGCTCTTGAGAACAGTTTCTTTAGAATAGTCTTTTTTTGTGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 309750 90 + 647215 GTATTCTATTTTCTATATACTTGGTAAGCCTCTGATTTTTCTCTCTCGCTCCTGGGAACATTTTCTTGAAAATAGTCTCTTTTTGTGGGC + +a +s mr.mrrefChr5 168208 26 + 294542 CCATTTGGTTTAGTCCATTGCCAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318215 26 + 636262 CCATTTGGTTTAGTCCATTGCCAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 309860 26 + 647215 CCACTTAGTTTAGTCCATTGCCAATT + +a +s mr.mrrefChr5 168234 119 + 294542 GAATTCTATTTTCTATGTACTTGAAAAGCCTGCCTAGGTGTACTCCTTTCCTGAGTTAACAGCTCCAACTACAGACTTCATGAGCTGGGGCAGCCTAAACACCTAGTATTCATCATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318241 119 + 636262 GAATTCTATTTTCTATGTACTTGAAAAGCCTGCCTAGGTGTACTCCTTTCCTGAGTTAACAGCTCCAACTACAGACTTCATGAGCTGGGGCAGCCTAAACACCTAGTATTCATCATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 309887 119 + 647215 AAACTCGATTTTCTATGTATTTGGTAAGCCTGCCTGGGTTTACACCTTTCCTGAGTTGACAGCTACAACTATAAACTTTATGAGCTGGGGCAACCTAAACATCTAGGATTCATCAGCAA + +a +s mr.mrrefChr5 168353 72 + 294542 GTTGGAAACTGGCCTCTCTCCCTTCATTGGTCAAAGCTCACGTCAGCCTTCTATAGTGACTATAAACAATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318363 72 + 636262 GTTGGAAACTGGCCTCTCTCCCTTCATTGGTCAAAGCTCACGTCAGCCTTCTATAGTGACTATAAACAATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 310006 72 + 647215 ATTAAAAACTGGCCTCTCTCCCTTCTTTGGCTAGAACACACATCAGCTTCCTATAGTGACTGCAAACGATGG + +a +s mr.mrrefChr5 168425 43 + 294542 CTGCTCCACAGCACTGAGATACATGCTAATGATATCCAGGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318437 43 + 636262 CTGCTCCACAGCACTGAGATACATGCTAATGATATCCAGGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 310078 43 + 647215 CTGCTCCAAAGCAATGAGATACATGTTAATGATATCCAGGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 168468 103 + 294542 AATTCATTTTCTCTCATAGGACAACCTCTTCTTGTCTTAGAGGACAGACTTCTTGACTAGAAGCTTTCCTGCATTGGTTTATGGATGCGTTTACAGGACAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318480 103 + 636262 AATTCATTTTCTCTCATAGGACAACCTCTTCTTGTCTTAGAGGACAGACTTCTTGACTAGAAGCTTTCCTGCATTGGTTTATGGATGCGTTTACAGGACAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 310137 103 + 647215 AATTCATTTTCTCTCATAGGTCAACCTCTTCTAGTCTTAGGGAGCAGACTCCTAGACCTGAAGCCCTCCTGTATTGGTTTATGGATTTGTTGACAGGACAGAA + +a +s mr.mrrefChr5 168571 20 + 294542 CTGACTACTTATATGTGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318583 20 + 636262 CTGACTACTTATATGTGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 310253 20 + 647215 CTAAACATTTATACGTGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 168591 11 + 294542 CATGTAAGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318603 11 + 636262 CATGTAAGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 310274 11 + 647215 CATATAAGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 168602 61 + 294542 ATATTTCAAAGCTTATATAAAGTGAAACAGCAAATTAACTTACTGGACTGTTATGTGAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318628 61 + 636262 ATATTTCAAAGCTTATATAAAGTGAAACAGCAAATTAACTTACTGGACTGTTATGTGAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 310285 61 + 647215 ATATTTGGAAGTTTATACAAAGTGATAAAGTAAATTAACTGACTAGAGTGTTATGTGAGCC + +a +s mr.mrrefChr5 168663 46 + 294542 ACAAGCGCAATCATGAACAATCTGCTGTTGGCAGCGAGTCTGCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318691 46 + 636262 AAAAGCGCAATCATGAACAATCTGCTGTTGGCGGCGAGTCTGCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 310346 46 + 647215 ACAAGCGTAATCATGAACAATCTGCCTTTGGCAACTAATCTGCATT + +a +s mr.mrrefChr5 168709 139 + 294542 CATATCTGCCTGTGTAACTGACCTAGATTTTATGGATTGAAATTATTGTGCAATAAACTGATTCTTGCCCATTGACCATATGGTCTAATGATGTTTCTACACCACAGCTGGAAGAAAACTAGTGGTAATGCCAGCTGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318746 139 + 636262 CATATCTGCCTGTGTACCTGACCTGGATTGAATGGATTGAAATTACTGTGCAATAAACTGATTCTTGCCCATTGACCATATGGTCTAATGATGTTTCTACACCACAGCTGGAAGAAAACTAGTGGTAATGCCAGCTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 310392 134 + 647215 CATATCTGCCTGTGTAATTGACGTAGATTTTATGGATTGAAATCATTGTGCAATAAACTGCTTC-TGCCCATTGACCATA-GGTCTAACAATGTTTCTACGCCACAACTGGAAG---ACTAGTGGTTATGCCAGTTGGC + +a +s mr.mrrefChr5 168848 111 + 294542 TATTCTCAGCCAGTACCAGAAGCATTTGGCAAGATAATTAACCTCGCTATGAGCTTTGATGTGAGGATAAAAAGTTATAAAGACATGGTCTACACTGTGGATTGCCACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318885 109 + 636262 TATTCTCAGCCAGTACCAGAAGCATTTGGCCAGATAATTAACCCTGCTATGAGCTTTGATATGAGGAT--AAAGTTATCAAGACATGGTCTACACTGTGGATTGCCACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 310539 111 + 647215 TATTCTCAGCCAGTACCAGAAGCATTTGGCAAGATAATTAACCTCGCTATGAGCTCTGACGTGAGGATAAAAAGTTATAAAGACAAGGTTTATGCTGTGGATTGCCATGTT + +a +s mr.mrrefChr5 168959 14 + 294542 TGGGTGTGGTGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 318997 14 + 636262 GGGGTGTGGTGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 310650 14 + 647215 TGGGTGTGGTGAGA + +a +s mr.mrrefChr5 168973 432 + 294542 ATATGGAATATGTGTGATTCTCTGTTACAGCAAGATGGGTCAAGACTACAAGCTCAGTATGTGTAATTCCCATTAGGTAATACCTTGATTTTTAAGCCTACAAATGTCCAAGTATCTGCACCACTCTTGGTATGCTTTACAGGGCTGAAATCGTGGCCCAGTTCATGAACATACAGGCTGGGAGACTGGCCTCAAACCATGTCTATCATTTTATTAAACTTTCTAACTCCAGCATTCTTAAAACCTAAGTCCTCTGACCCTAAAGTGTGACTTTAAGTATCATTCGGGCTCCACTTTAGAATCACACAGTTATTAATAACTTTGGTATCTTGATGGAATGTATGCAGGAAAAAACCATGAATCAAGTTCTCCTTGGGGCATATATTGCCCCACACAATTAATTTTGAGGATAAAATAGAAAGGACATAGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319011 431 + 636262 ATATGGAATATGTGTGATGCTCTGTTACTGCAAGATGGGTCAAGACTACAAGCTCAGTATGTGTAGTTCCCATTAGGTAATACCTTGATTTTTAAGCCTACAAATGTCCAAGTATCTGCACCACTCTTGGTATGCTTTAGAGGGCTGAAAGTGT-GCACAATTCATGAACATACAGGCTGGGAGACTGGCCTCAAACCATGTCCATCATTTTATTAAACTTTCTAACTCCAGCATTCTTAAAACCTAAGTCCTCTGACCCTAAAGTGTGACTTTAAGTATCATTCGGGCTCCACTTTAGAATCACACAGTTATTAATAACTTTGGTATCTTGACGGAATGTATGCAGGAAAAAACCATGAATTGAGTTCTCCTTGAGGCATATATTGCCCCACACAATTGATTTTGAGGATAAAATGGAAAGGACATAGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 310717 429 + 647215 ATATGGAATGTATGTGATTCTCCATTACAACAAGATGGATCAAGACTGCTAGCTCAGTATGTGTCATTCCCATTAGGTAATACCCTGATTTTTGAGACTACAAATATCCAAGTATCTCCATCGCTCTTGGCATTCATTACAGGGGTGAAATCGTGGCCCAGTTCATGAACATACAGGTAGGGAGACCGGCCTCAAACCATTAGTATCATTTTATTAAACTCTGTAACCCCAGCATTCTTAAATCCTAAGTCCTCTGACCTTACAGTGTGACTTTAAGTATCATTCGGGCTCCACTTTAGACCCACGCAG---TTAACAATTTTGGTATCTTGATGAAATGTATGCCGGAAAAAACCATGAATCAAGTTCTCCTTGGGGCATATATCGCCCCACACAATTAATTTTGAGGATAAAATAGAAAGGACATAGACA + +a +s mr.mrrefChr5 169405 21 + 294542 ATATGGATAGATCACATTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319442 21 + 636262 ATGTAGATAGATCACCTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 311183 21 + 647215 ATATGGATAGATCTCATTCGA + +a +s mr.mrrefChr5 169426 64 + 294542 ATAACACAGTACGCTGGTTGCAAGTTGTTTCCTTCTACTATAGTACAGGGATTTTGTGAGGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319465 64 + 636262 ATAACACAGTACGCTGGTTGCAAGTTGTTTCCTTCTACTATAGTACAGGGATTTTGTGAGGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 311204 64 + 647215 ATAGCATAGTACACTGGTTGCAAGTTGTTTCCTACTACTATAGCACATGAATTTTATGAGGCAT + +a +s mr.mrrefChr5 169490 248 + 294542 ATAGAGGAGCACAGCATTGTATCTTTAGGGTGAATTGTATTGCAGTATTGGTTTGCTCATAATTGGCCCACCAAAGGATTGTTGAGGTGACTGTACCCCACACCTCCAGGCCTCCCATCCAGTACAGCTATTTCAATTGTATGATGGGCGACTAGGCAACAATGGCTGCAGTCTAGGCAGTTGAAACATTTTTTACTTTGGTACCTGCATATATTCTCTGGCTATTAATTCGGTTGCATGGTGTACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319535 239 + 636262 ATAGAGGAGCACAGCATTGTATCTTTAGGGTGAAT--TACTGCAGTATTGGGTTGCTCATAATTGGCCTACCAGAGGCTTGTTGAGG-------ACCCCACACCCACAGGCCTCCCATCCAGCATAGCTATTTCAATTGTATGAAGGGCGACTAGGCAACAATGGCTGCAGTCTAGGCAGTTGAAACATTTTTTACTTTGGTACCTGCATATATTCTCTGGTTATTGATTCAGTTGCATGGTGAACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 311268 246 + 647215 ATAGAGGAGCACAGCATTGCACCTTTAGCATGACTTGTGTTGCAGTATTGGTTTGCTCATAATTGTCCCACCAACGTATTGTTGAGGTGACTGTACCCCACATTTCCAGAGCTCCCATCCAGTGCAGCCATCTCAATTGTATGATGGGAGACTCGGCAGTGATGGCTGCAGTCTAGGCAG--GAAATATTTTGTACTTGGGTACCTGCATATATTCCCTGGCTATTAATTCGGTTGCATGGTGTACTT + +a +s mr.mrrefChr5 169738 129 + 294542 AGCTACTCTCCTTATTCGTCAGGAGGGTGCGAAGGTGTTTATGGATAGATCATGTGGTCTACACACATCTTGTATTCACAGAATTCTGAAATTAAAACATTTAGTCTTCCCAAATCTACTTATGATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319809 129 + 636262 AGCTACTCTCCTTATTCGTCAGGAGGGTGCGAAGGTGTTTCTGGATAGATCTTGTGGTCTACAAACATCTTGTATTCACAGAATTCTGAAATTAAAACATTTGGTCTTCCCAAATCAACTTATGATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 311514 127 + 647215 GGCTACT-TCCTCATATATCAGAAGGGTGAGAAGGTGTTTATGGATAGGTCATGTGGTCTACACG-ATCTTGTAATCACAGAATTTTGAAATTAGAACATTTAGTCTTGCTAAATCTACTTCTGACATG + +a +s mr.mrrefChr5 169867 95 + 294542 TACCGTTCAAGATTGAGTGGTGCTTGTCCCCAACCAAGATAGAAAAAATACTTTACCTTCTCCAGGGAAGTAATATTCAGCTGAGTAGTAAGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 319938 95 + 636262 TGCTGTTCAAGATTGAGTGGTGCTTGTCCCCAACCAAGATAGAAAAAATGCTTTACTTTCTCTGGGGAAGTAATATTCAGCTGAGTAGCAAGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 311695 93 + 647215 TACCGGTCAAGATTGAGTGGTGGTTGTCCCCAACCAAGATAGAAGAAATACTTTACCTTCTACAGGGAAGTAATATTCAGCCAAGTTGTAAGG-- + +a +s mr.mrrefChr5 169962 171 + 294542 ACACACCAGCAGCCTCATGTTAAATAGATCCCCCATGGTGCTCAGGTTCAAAAAGGAGAGGGAAGAGTTTACAAAACTAGATCAGAAGTTTGATATTCAAAAGGTTGGGTCGGACAAGGTTGCTATTAGGATTCTATAGCATACCCCTAGTCAGTCTCCTGACAGGAACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320035 171 + 636262 ACACACCAGCAGCCTCGTGTTAAATAGATCCCCCATGGTGCTCAGGTTCAAAAAGGAGAAGGAAGAGTTTACAAAACTAGATCAGAAGTTTGATATTCAAACGGTTGGGTTGGACAAGGTTGTTATTAGAATTCTATAGCATACCCCTAGTCAGTCTCCTGACAGGAACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 311788 145 + 647215 --ACCCCAGCAGACTCATGTTAAATAGATCCCCCATGGTGCTCAGGTTCAAAAAAGAGAGGGAAGAGTTTACAAAACTAGATCAGATGTTTGATATTTGAAAAGTTGGGTCAGACAAGGTTGCTATAAGGATTCTATAGCACACCCC------------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 170133 35 + 294542 AGAAAATAGGTAGCAACCACCAGTCAATGCAGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320213 35 + 636262 AGAAAATAGGTAGCAACCACCAGTCAATGCAGGAG + +a +s mr.mrrefChr5 170168 4 + 294542 ACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320342 4 + 636262 ACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 311933 4 + 647215 ACCC + +a +s mr.mrrefChr5 170172 30 + 294542 AGACCAGACCTTATCAAGGAGTGTGGGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320346 30 + 636262 AGACCAGACCTTATCAAGGAGTGTGGGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 311939 30 + 647215 GGACCAGACCTTATCAAGGACTGTGGTCCC + +a +s mr.mrrefChr5 170202 20 + 294542 ACCCATTACGATGTAGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320383 20 + 636262 ACCCATTACGATGTAGCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 311969 20 + 647215 ACCCATTACGATGTAGCACT + +a +s mr.mrrefChr5 170222 102 + 294542 TGACGCGTGTCATACCTGGACCAGATTTATTAATGACTATGGGTCCACCTACCTCAATGTAGGTCTCACTGGGGGAAATGAATTTCACTTCTACAGCAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320403 101 + 636262 TGACGCGTGTCATACCTGGACCAGATTTATTAATGACTATGGGTCCACCTACCTCAATGTAGGTCTCACT-GGGGAAATGAATTTCACTTCTACAGCAGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 311999 102 + 647215 TAATGACTGGCATACTTGGACCAGACTTATTAATGACTGTGGGTCCACCCATCTCAGTGTAGCACTCATTGGGGGAAATGAATTTCACATCTACAGCAGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 170324 21 + 294542 AGGTCAGATTGCTTATCATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320504 21 + 636262 AGGTCAGATTGCTTATCATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 312106 21 + 647215 AGGTCAGATTGCTTATTATCA + +a +s mr.mrrefChr5 170345 120 + 294542 ATTGCACTTGTCACACTATCTCCGCTATATATGGGGTTTGATCAATGAAGATTCAACTTTCCATGAGTCCTTTTTGTTTATATTGTTAAATCACCCGTGATATCCTAGCAAATTTCCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320525 119 + 636262 ATTGCCCTTGTCACACAATCTCCGCTATATATGGGGTTTGATCAATGAAGATTCAACTTTCCATGAGTCCTTTTTGTTCATATTGGTAAATCA-CCGTGATATCCTAACAAATTTCCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 312135 114 + 647215 ATTGCACTTG-----CTATCT-TGCTATATATGGGGTTTAATCAATGAACATGCAACTTTCCATGAGGCCTTTTTGTGTATCTTGTTAAATCACCCGTGATATCCTAGCAAGTTTCCTTA + +a +s mr.mrrefChr5 170465 148 + 294542 ATGAGGCAGAACAGCAACCACTATCTGAAGAGTTGGGAATGGTACTATGCATAAGTAAATCCGCTTGATGAAAACCAACTCAAAAACTGCTTCTGGAGGCTCCAGAGTCTAGATGCTCTAAACACCCAAGTATTTGGAGGCTTCTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320694 122 + 636262 ATGAGGCAGAACAGCAACCACTATCTGGGGAGTTGGGAATGGTACTATGCATAAGTGAATTCGC---ATGTAAACCAACTCAAAAACTGC-----------------------TGCTCTAAACACCCAAGTATTTAGAGGCTTCTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 312249 148 + 647215 ATGAGGCAGAACAGAAACCACTATCTGAAGATTTGGTAATTGTACTGTGCATATGTAAATCAGCTTGATGAAAACCAACTCCAAAACAGCTTCTGGAGGCTCCAGAGTCTAGATGCTCTAAACACTCAAGTATATGGAGGCTTCTGGA + +a +s mr.mrrefChr5 170613 122 + 294542 TGATGTATGGATCCTCAGTCAATGGCTTTCCTCTCCTACAGCTCTTTGAAATACCCCATATCATTAGAAACAAACTTACTTTATGTTTACTTTGCTAACCTTCCAGGCCTTATGACCTTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320816 122 + 636262 TGATGTATTGATCCTCAGTCAATGGCTTTTCTCTCCTACTGCTCTTTGACATGTCCCATATCATTAGACACAAACTTACTTTATGTTTACTTTGCTAACCTTCTTGGCTTTAAAATCCTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 312420 122 + 647215 TGCTGTATGGATCCTCAGTCAATGGCTTTCCTATCCTACAGCCCTTTGAAATACCCCATATCATTAGAAACAAACTCACTATATGTTGATTATAGTGGCCTTCCAGTGCTTGTGGCTTCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 170735 196 + 294542 TCTTAACATTATTTCGGAAGATGTAATACCTCAACTCAATATGTATGATATTAAATGACATCAGAGATGGCTATGCCTACTGCACTAACCTAGTAGGTCTTATGATTATAGTCAATTAGAGCATAACATATGTCTGCCTGAAGAGTGCGTCCTTTCTGTGTACATAACAGGTCCAATGGTCACATTATGCAAGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 320940 196 + 636262 TCTTAACATTATTTCGGAAGATGTAATACCTCAACTCAATATGTATGATGTCAAATGACACCAGAGATAGCTATGCCTACTGCACTAACCTAGCAAGTCTTATAATTATAGTCAATTAGAGCATAACATATGTCTGCCTGAAGAGTGCGTCCTTTCTGTGTATATAACAGGTTCAATGGTCACATTATGCAAGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 312542 196 + 647215 CCTTAACATTATTTCGCAAGATATAATACCTCAACCCAATATGTATGATATTAAATGACATCAGATGCGGCTATGCCTGTTGCACTAACCTAGTAGGTCTTGTGATTATGGTCAATTAGGGCATAGCTTATGTCTGCCTGAAGAGTGCATCCTTTCTGTGTACATAAGAGGTCTGATGGTCACATTATGCAAGGTC + +a +s mr.mrrefChr5 170931 167 + 294542 AATGTATTACAATCATCACAATGTCAATTAATGCCCACCCCAGGCTGCTCCTAACTTAACACTTTTAACCATGATAAGTACAATAATAGCCCAGATATTTAGGGGACCTGGTAGTGGGGAACACCTGAAAATGCAAGCCCATACTAATATGATCCCACACTATCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321136 167 + 636262 AATGTATTGCAATCATCACAATGTCAATTAATGCCCACCCCAGGCTGCTCCTAACTTTACACTTTCAACCATGTTAAGTACAATAATAGCCCAGATGTTTAGGGGACCTGGTAGCGGGGAACACCTGAAAATGTCAGCCCATGCTAATATGATCCCATGATATCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 312740 167 + 647215 ATTGTATGACAATCATCAAAATGTCAATTGAAGCCCACCCCAGGCTGATCCTAACTTAACACTTTTAACCATGAGAAGAACAATCATATTACAGACATGTAGGGAACCTGAGAGTGGGGAACACCTGAAAGTGCAAGTCCATACTAATATGATTCCACACCATCAGC + +a +s mr.mrrefChr5 171098 166 + 294542 AGGCAAAGAGATGTGGCACATTTGACAACAAGATGCATCAAAATGCCTCATGTCTCGGGAAGTCCCACTTCATGATTAAGGTCCAGGAGGCAAGGTCTCAAGAAAACAGGCTGCTGTGCTTGAGCACCCCTCCATGTGGGGATTATAACCCTTGTCTATGTCCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321303 166 + 636262 AGGCAAAGGGATGTGGCACATGTGACAACAAGATGCATCAAAATGCCTCATGTCTCTGGAAGTTCCACTTTATGATTAAGGTCCAGGGGGCAAGGTCACAAGAAAACAGGCTGCTGTGCTTGGGCACCCCTCCATGTCGGGATTATAACCCCTGTCTATGTCTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 312946 165 + 647215 AGGAAAAGAGATGTGGCACCTTTGACAACAAGATGCATCAACATGCCTCATGTCTTGAAGAGTCCCCCTTCATGATTAAGGTCCAGAAGGCAAGGTCTTAAGAAAAAAGGCTGATGGGCTTGAGCACCCCTCCATGTGGGGATTATAACACTTGTCTATG-CCAGA + +a +s mr.mrrefChr5 171264 157 + 294542 ATGTCGAGACAAAACCTGGCCAATGTCAATGTCCTGAAAGACCATACAGCCTCATGCTGAGGTATCACTGGCAAGATGAGGTTGGGCAATCTTCACTTTGCACTGTGGTTGGGTATCTTTTTATGACTTAGCCCTCAATCTTGACAACCCTAGTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321470 155 + 636262 AAGTCTAGACAAAACCTGGCCAATGTCAATGTCCTGAAAGACCATACAGCCTCATG-TGAGGTATCACTGGCATGATGAGGTT-GGCAATCTTCACTTTGGACTGTGATTGGGTACCTTTTTATGACTTAGCCCTCAATCTTGACAACCCTAGTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 313111 157 + 647215 ATGTAGAAACAAAACCTGGCCAATGTCAATGTCCTGAAAAACCCTACTGCCTCATGCTGAGATATCACTAGCAAGATGAGGTCGGGCAATCTTCACTGTGCACTGTGGTTACGTATGTCTTTATGACCTAACCCTCAATCTTTACAACCCTAGTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 171421 63 + 294542 TGCACCACCTTAACTATAATCCTTTATCCCGCTATGATTGCATTAAAGCTGAACCCTTCAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321625 61 + 636262 TGCACTGCCTTAACTATAACCCTTTACCCCGCTAGGATTGCATTAAAGCTGAACCCTTCAG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 313279 59 + 647215 TGCCCCACCCTAACTAGAATGCTTTATCC--CTATGATTGCA-TAAAACTGAA-CCTTCAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 171484 113 + 294542 ACCCAATATGTAGTAGCCCTCACCTTGATTTGGCAAGGAGAATGCATATAAGCCCTTAGTACCATGATTCTCCAATGAATAGGAGAGTAATAAGTCAAGAACCTGAACATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321686 113 + 636262 ACCCAATATGTAACAGCCCTCACCTTGATTTGGCAAGGAGAGTGCATATAAGCCCTTAGTACCATGATTCTCCAATGAATGGGAGAGTAATAAGTCAAGAACCTGAAGATTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 313339 112 + 647215 ACCCAACATGTAGTAAAACTCACCTTGACTTGGC-AGTAGAATGCATATAATCCCTTAGTGCCATGATTCTCCAATGAATAGGACAGTAATAAGTCAGGAACCTGAACATTCA + +a +s mr.mrrefChr5 171597 80 + 294542 TATATGGCTTTTGGGAACCCCAGGGTCTAAGTTCATTGAGCTACAGGGTCACAATAGAGACTATTGAGTCCTCAGAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321799 80 + 636262 TATATGGCTTTTGGGAACTCCAGGGTCTAAGCTCATCGAGTTACAGGATCACAATAGAGGATATTGAGTCCTCACAAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 313463 80 + 647215 TATATGGCTTTCGTGAACCCCAGGGTCTAAGTTCATTAAGCTACAGGGTCACAATAGAGACTATTGAGTCCTCAGAAGTT + +a +s mr.mrrefChr5 171677 34 + 294542 AGTGCCCTGCTGGAAATATTCCTATTTGCAATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321896 34 + 636262 AGTGCCCTGTTGGAAATATTCCTATTTGCAGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 313543 34 + 647215 AGTGCCCTGCTGGAAATGTTCCTATTAGCAATAA + +a +s mr.mrrefChr5 171711 122 + 294542 cctcgacaaacaactcatagaggattgttagcatgtgatcctgctctgcctgctcgatcggcccgtcatctcttaggtgattctcttgatcagcccagttaataggttgtattatgctaata +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323656 122 + 636262 cctcgacaaacaactcatagaggattgttagcatgtgatcctgctctgcctgctcgatcggcccgtcatctcttaggtgattctcttgatcagcccagttaataggttgtattatgctaata +s simRat_chr6.simRat.chr6 315210 122 + 647215 cctctatacacaactcattgaggatcattagcatgtgattgtgctctgttggttcaatcagcccatcatctcttatgtgattctcctgattggccttgttaatgggttgtatagtgttaata + +a +s mr.mrrefChr5 171833 227 + 294542 aggtcttcatatcttgcacactcctgggatccctggggtgagttgcaagtgattgtaatgtattggctttccgaccatttgctggtagtttcggttggcaagtatctggttcaagttcctgtcttgcaagatcaaaaccacaggtctaactctctgtcctctcactatggctttacttggtttggataccagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323797 227 + 636262 aggtcttcatatcttgcacactcctgggatccctggggtgagttgcaagtgattgtaatgtattggctttccgaccatttgctggtagtttcggttggcaagtatctggttcaagttcctgtcttgcaagatcaaaaccacaggtctaactctctgtcctctcactatggctttacttggtttggataccagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta +s simRat_chr6.simRat.chr6 315332 227 + 647215 atgtcttcatttcttgcaccatcctggcattcctggggcgaattctgagtggttgtaatgaattaactgtctggccatttgctggtagtttcgcttggcaagtgtctgggtcaggttcccatctttcaagatcaaaaacaaaggtctaactctctgttctctcactgtggctttactcgatttggatatcagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta + +a +s mr.mrrefChr5 172060 95 + 294542 tccccttaatttcaatggactgtggatcaagaaCTTTAGCAGCTGTGTGGAATGACCTGGAACCATAGCATAGGTAGTCAAAACCAAAAATGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324025 95 + 636262 tccccttaatttcaatggactgtggatcaagaaCTTTAGCAGCTGTGTGGAATGCCCTGGAACCATAGCATAGGTAGTCAAAACCAAAAATGTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 315559 95 + 647215 tccccttgctttcaatgaattgtggctcgggAACTTTACCAGCTGTGTGGAATGACCTGTAACCATAGTGTGGGTAGACAAAATCAAAAATGTTC + +a +s mr.mrrefChr5 172155 104 + 294542 AAGCTTGTCTTCAAATTGCATGAAGTCACACCTTGATGGCATGATCCTTGCCTCTTTGTAGAAAACAATCATGTTCCCTGCTTCTTAGAAGTAAACAGTGGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324120 102 + 636262 AATCACACCTTCAAAT--CATGCACATAGATCTGGGTAGGATGATCCTTGCCTCTTTGCAGAAAATAATCATGTTCCCTGCTTCTTAGAAGTAAACAGTGGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 315655 104 + 647215 AAGATTGTCTTCCATTTGCATGAAGTCACACCTTCAAGGCATGATCCCTGCTTCCCTGTAGAAAACAGTTGTGTGCCCTGCTTCCTAGAAGAAAACAGTTGCAC + +a +s mr.mrrefChr5 172259 153 + 294542 TATGATTCTGTGGAATTCTCAGAGATAAGATCACTTACACTCTTACATCCCATATATATGTTTATAGTATCCTCAAGTGGTTATTATGGTCATGGCATCAAACCAGTCCGCAAGTAGATCGGTAGATCTAGGATAGTGTGAACTGGCTGCACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324222 153 + 636262 TATGATTTTGGAGAATCCTCAGGGATAAGATCACTTACACTTTTACATCCCATATGTACGTTTATAATATCCTCAAGTGGTTATTATGGTCATGGTATCAGACCAGTCCGCAGGTAGATTGGTAGATCTAGGATAGTGTGAATTGGCTGCACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 315761 144 + 647215 TATGATTCTGTGGAATTGTCAGAAATAAGATGACTTACATTCTTGCATGTCATCTATATGTTTATAGTATCCTCAAGTGGTTGTTATGTTCACGGCACCAAATCAGTTGGCAAGTAGATCGGTAGATCTAGGATAGTGAGAACT--------- + +a +s mr.mrrefChr5 172412 111 + 294542 TACTTGAATGATAATAATAAGTTAAGAGGTCAATAATTTGCCAGAGATCTTGAATCAGAACATAGCCAAATTACAACAGCCAGGTAATCCCAGTTTGTGTCTGCACGTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324376 109 + 636262 TACTTGAATGATAATAGTAGGTTAAGAGCTCAATAATTTGCCAGAGATCTTGA--CAGAACATGACCAAATTATAACAGCCAGCAAATCCCAGCTTGCGTCTGCATGCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 315905 107 + 647215 --CTGGAATGCTAATAATAAGCCAAGAGGTCAATAAT--GCCAGAGACCTTGAATCAGAACATAGCCAAATTACAACAGCCAGGTAATCCCAGTTTGTGTCTGCCCGTTGA + +a +s mr.mrrefChr5 172523 15 + 294542 CCCCACCTAGAGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324486 15 + 636262 CCCCGCTTAGAGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 316012 15 + 647215 CCCCACCTAGAAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 172538 114 + 294542 GCCTGGTAGTTGTTGTTTTTTAGGGCATACTTTGTTACTGTTTGCGTGACTTTCACTCTCCCAGAGATTAGGTTGTTGGACTCCAGAAGGGACAGAGCTAAAGAGCGGCTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324505 114 + 636262 GCCTGGTAGTCTTCGTTTTTTAGGGCATACTTTGTTACTGTTTGGGTGACTTTCTCGCTTCCAGAGATTAGGTTGTTGGACCCCAGAAGGGACAGAGCTAAAGAGCGGCTTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 316027 87 + 647215 GCCTGGTAGTTGTTGTTTTTTAGGGTGTACTTTGTTACTGTTTCCGCGACTTTCACTCACCCAGAGTTTAGGTTGTTGGACTCCAGA--------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 172652 176 + 294542 TGATGGTCTGTCATGGTATTCATTAGTGTACATGAGCTTAGCAAAACAATCTCGTATGCCCAAATGCTGCCTGTATTTGCTTTGCTTGTGTAGAGTGATGTAAACGAAAAATCTGGATATTACACTCAAAAAGTTCATTAAGGCAGTCCTCCCAATTCTGATCCGTAAGTAACCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324620 175 + 636262 TGATGGTCTGTCATGGTATTCATTAGTGTACATGAGCTTAGCAAAACAATCTCGTATGCTTAAATGCTGCCTGTATTTGCTTTGCTTGTGTAGGGTGATGCAAACGAAAAATCTGGATATTACACTCAAAAA-TTCATTAAGGCAGTCCTCCCATTTCTGATCTGTAAGTAACCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 316114 113 + 647215 ----------------------------------------------------CATATGCCCAAACGCTGCCT----TTGCTTTGTTTGTGTAGAGTGATGTAAACGAAAAATCTGGATATTACACTCAAAAAGTACATTAAGGCAGTCCTCCTAATTCTGACACGTAAG------- + +a +s mr.mrrefChr5 172828 289 + 294542 TACTAACTTACTCATTATTTAAACAGCGGTCAAGATTGTGGTCTTATTAGTTTGAGCTTCATGTATAGGCATGTGAAGCTGTGCGCCCTGTATTTAACACCCTCTCCTTTGTATTCCCCCCAGGTCTGCTTCCCTCAGAGGCTTTTCTGCACGGATCTTCTGCAGGTGAGGCTGTTCTATTTTGAATTGCTGGTCAAATCAAGACTCAATTACAGTGGATAAGTAATCAACTGAAAACAATCTGCTCCTTCTGGTCCTCTGCTCCTGAATCTTGAGTGATGACTAATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 324797 289 + 636262 TACTAACTCACTTACTATTTAAAAAGCGGTCAAGCTTGCAGTCTTATTGGTTTGAGCTTCATGTATAGGCATGTGAAGCTGTGCGCCCTGTATTTAACACACTCTCCTTTGTATTCCCCCCAGGTCTGCTTCCCTCAGCGGCATTTCCGCACGGATCTTCTGCAGGTGAGGCTGTTCTATTTTGAATTGCTGGTCAAATCAAGACTCAATTACAGTGGATAAGTAATCAACTGAAAACAATCTGCTCCTTCTGGTCCTCTGCTCCTGAATCTTGAGTGATGACTAATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 316227 285 + 647215 ---TAACTTACTCATTATCTAAGCACCGGTCG-GATTGTGGTCTTATTAGGTTGAGCTTCATGTCCAGGTACGTGAAGTTGTCTGCCCTGTATGTAACACCCTTTCCTTTGTTTTCCCCCCAAGTCAGTTGCGCTCAGAAGCTTTTCTGCACGGATGTTCTGAAGCTGAGGCTGTTCTACATGGAATTGCTGGTCAAACAAAGACTCAATCACAGTGGATAAGTAATAGACTTAAAACAATCGGCTCCTTCTGGTGCTCCGCTTTTGAATCTTGAGTGATGACTGATGT + +a +s mr.mrrefChr5 173117 10 + 294542 ACCACACCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325089 10 + 636262 ACCACACCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 316512 10 + 647215 ACCACACCTC + +a +s mr.mrrefChr5 173127 80 + 294542 TGAACTCCTGCAATCCATACAAGTCCAATGTATAGTTTTTGACCCTTCATATCGAATTGTTGTGACAGGTCCTAAACTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325112 80 + 636262 TGAACTCCTGCAATCCATACAAGTCCAATGTATAGTTTTTGACCCTTCATATCGAATTGTTGTGACAGGTCCTAAACTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 316522 80 + 647215 TGAAGTCCTGCAATCTGTACAAGTTCAATGGATAGTTTTCTACCCTCCATATCGAATTGTTATGACAGGCCATAGACTTA + +a +s mr.mrrefChr5 173207 117 + 294542 TTTTAAGACAACCTCAAACAACATGAGGTAAGGCCCTGTAATGATAATATTTGCTGTCATGGCAACTTGTGGGAAAAGACATACAGCTTGTGTATGAGCTTGAATGCTAATTATGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325193 117 + 636262 TTTTAGGACAACCTCAAACAACACGAGGTACAGCCCTGTAATGATAACATTTGCTGTCATGGCAACTTGCGGGAAAAGACATACAGTTTGTATATGAGCTTGAATGCTAATTATGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 316602 106 + 647215 CTTTAAGACAACCTCAGACAGCATGAGTTAAGGCCATGTATTGACAATATTTGTGGTTATGGCAACTTGTGAGAAAAGAGATACAGCTTGTGTAT-----------TTAATTATGAA + +a +s mr.mrrefChr5 173324 84 + 294542 TCAATTGGCATCTAATACTATAATCAATCTGTATTCAATGCTACTTATTGCACTAAGTTCTGCGGGCACACTTCCAAAAAATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325310 84 + 636262 TAAATTGGCATCTAATACTATAATCAATCTGTATTTAATGCTACTTATTGCACTAAGTTCTGCGGGCACACTTTCAAAAAATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 316709 84 + 647215 TCAATTGGCATCTAATACTAAAACCAATCTGTATTCAATGCTACTTTTTCAACTTAGTTCTAGGGACACACTTCCAAAAAATGG + +a +s mr.mrrefChr5 173408 166 + 294542 GTCATTGTCCTTCTTCCCTATCCAATAATGAACTCACAACAACTCTCTTGATGCATATTGGGGTTAAGGTTCAAACACTTGGGTGTTTCTTAGTGCTTGGGGATCTAGGCCTTGACCCCAGAGGCCTCACTGATTACACATTGTGGTAAGTCACCCAGGTTTTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325396 158 + 636262 GTAATTGTCCCTCTTCCCTATCCAATAATGAACTCACAACAACTCTCTAGACG-----TGGGGTTGAGGTTCAAACACTTGGGTGTTTCTTAGTGCTTGGGGATCTAGGCTTTG---CCAGAGGCCTCATTGATTACACGTTGTAGTAAGTCACCCAGGTTTTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 316793 160 + 647215 ATC----TCTTTCTTCCTTATT--ATAATGAACTCACAACAACTCCCATCGTGCATATTGGGGTTAAGGCTCACACACCTGGGTGCTTCTTGGTGCTTGAGGCTCTAGTCCTTGACCCCAGAAGTCTCACTGATTACACATTGTGGTAAGTCACGCAGGTTTTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 173574 183 + 294542 CATAATAGTGATTCTTTAGTTTAATCTCTGCTTTATGGCTGTCATAACTGTGAGTGTAGACAATATGGACGCTAAAGGATCATGGCCCTACTTGCACTTACATTTTATCTGAAGCGTGTGATCTATTGCAGTACTTGGTGATAAACTCAACTAAAAACAATGCTTCTAGTAATAGTCTGTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325571 183 + 636262 CATAATAGTGATTCTTTAGTTTAATGTCTGCTTTATGGCTGTCATAACTGTGAGTGTAGACAATATGGACGCTAAAGGATCATGGCCCTGCTTGCACATACATTTTATCTAAAGCGTGTGATCTATTGCAGTACTTGGTGATAAACTCAACTAAAAACAGTGCTTTTATTAATAGGCTGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 316953 181 + 647215 CATAATGGTGATTCTTGAGTTTAACCTCTGCTTTATGGCTGCCATAACTGAGAGTGTAGACAATGTGGATACTAAAGGCCCATGGCCCTACTTGCACTTACATTTTATCTGAAGCGTG--ATCTCTTGCAGTACTTGGTGATAAATTGACCTGAAAACAATACTTCTAGTAATACTCTGTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 173757 44 + 294542 ACAGGTCCAAGGAGAGTCAATTGAGATGGCTACCAACTTTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325754 35 + 636262 ACAGGTC---------TCAAATGAGATGGCTACCAACTTTTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 317135 44 + 647215 ACAGGGCCAAGGAGAGTCCATTAAGATCGCTAGCAACTTTTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 173801 63 + 294542 CAAAAGCTTCAAATTTGTTGACAATGTCTAACTCCTAGTATTGATTGCATTAATCTGCTCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325791 63 + 636262 CAAAAGCTTCAAATTTGTTGACAATGTCTAACTCCTAGTATTGATAGCATTAATCTGCTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 317179 63 + 647215 GAAGAGCTTCAAATTTGTTGACAATGTCTAACTCCTGGTATCCACTGCATTAATCTGCCCTGT + +a +s mr.mrrefChr5 173864 121 + 294542 AACCTAGCCTGGTGTTTATACACCTTGAGTGATGGTCTGAACCTAAATAGGCGTGATATGACTAGAATGCATGATATCACTGCAATCATTTACATCTCAAAGACACCTAATTGATGGGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325855 121 + 636262 AACCTATCCTGGTGTTTATACACCTTGATTGATGGGCTGAACCCAAATAGGCGTGATATGAATAGAATGCATGATATCACTACAATCATCTGCATCTCAAAGACACCTAATTGATGGGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 317242 120 + 647215 AACCTAGCCTG-TGTTTATACACCTTGAGTGATGGTCTGAACCTGAGTTGACACGACATGTCTAGAATGCATGATATCACTGCAATAAATTACATCTCAAAGACACCTAATTGAGGGGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 173985 162 + 294542 TATGATTTCCCTCAGTTTGAGACAGTGTATGCCCATGTAGGGACAATACCCACTTTTTATATCAAAAAATACGGACTATCAGTCAATAAAGGTCTGTACTGAGAATACTGCATCTAATTACCAACACTATGAAGTTTAGTTGACTCCTGCTATCCTTTGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325977 162 + 636262 TATTATTTCCCTCAGTTGGAGACAGTGTATGCCCATGTAGGGACAATACCCATTTCTAATATCAAAAAATACGGACTATCAGTCAATAAAGGTCTGTACTGAGAATACCGCATCTAATTACCAACACTATGAAGTTTAGTTGACTCCTGCTATCCTTTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 317362 145 + 647215 TATGATTTCCCTCAGTCTGAGACAGTGTATGCCCATGCAGGGACAATGCACACTTTTTTCAATACAAAA-----ACTATCCTTCAATAAAGGTCTGTACTGAGAATAGTGCATCTAATTA------------AGTTTAATGGACTGGTGCTATCCTTTGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 174147 60 + 294542 TATGGCCATGGCCAGGGTGATATGGAGTATCCATATCACACCTTATGTCAAACACTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326139 60 + 636262 TATGGCCATGGCCAGGGTGATATGGAGTATCCATATCACACCTTATGTCAAACACTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 317509 60 + 647215 TATGGCCACGGCCAGGGTGATACGGAGTATCCATGTCACACCTTATGTCAAACACTTGGA + +a +s mr.mrrefChr5 174207 210 + 294542 ATCTGGTTAGGTTCAGCATCAACAATGAGTAGATATTCTATCCCATGTGTCTGACTACCATAGTTGCATGATATTTTGTTGTCCATGCCACACCCAACCTCCTTTTGTCAATTGGTATCCTGACTGTTCATTATAACAATATTTAGTCTTTAAAGCTACACAATAGTGGTTTCATTGTGTAAATGTGGCACCTTCAACAATTCAACCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326199 206 + 636262 ACCTGGTTAGGTTTAGCATCAACAATGAGTAGATATCCTCTCCCATGTGTC--ACTCGCATAGTTGCATGTTATCATGTTGTCCATGCCACACCCAACCTCCTTTTGTCAATTG-TATTCTGACTGTTCATGATAACAATATTTAGTCTTTAAAGCT-CACAATAATGGTTTCATTGTGTAAACATGGCGCCTTCAACCATTCAACCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 317572 210 + 647215 ATCTGGTTAGGTTCAGCATTGACAATGAGTAGAAATTCTATCCCATGTGTCTGACTACTATAGTTGCATGACATTTCGTTGTCCATGCCCCACCCAACCTCCTTTTGTCAATTGGTATCCTGACTCTCCATTATAACAATATTTAGTCTTTAAAGCTACACAATAGTGGTTTCAGTGTGTAAGTGTGGCACCTTCAACAATTCAACCCCA + +a +s mr.mrrefChr5 174417 108 + 294542 GGAATTCTCTTGTAATACAATCAGGGATCTGCTGAGACTCAGTTGCAATATGTCTAGGGCTTCAAAACCTTAGTACAATGTAGGATGAAAAGTGATTACAGCGGGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326405 108 + 636262 GAAATGCTAGTGTAATACAATCAGGGATCTGCTGAGACTCAGTTGCAATATGTCTAGGGCTTCAAAACCTTAGTACAATGTAGGATGAAAAGTGATTACAGCGGCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 317784 88 + 647215 AGAATTCTCTTGTGGTATGATCAGGGATCTGCTGAGACTCAGTTGCAATGTGCTT--------------------CAATGTAGGATGAAAAGCAATTACAGCAGGTCC + +a +s mr.mrrefChr5 174525 59 + 294542 AACCAGAACAGACTACTATCACCCAACAAATTAGCATGTTTAGCATGTTGGAATTGGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326514 59 + 636262 AACCAGAACAGACTACTATCCCCCAACTAATTAGCATGTTTAGCATGTTGGAATTGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 317872 59 + 647215 AACCAGAACAGACTACTATCACCCAACAAATTAGCATGTTTCGCATGTTGGAATTGGGC + +a +s mr.mrrefChr5 174584 34 + 294542 GACAGTTTCCCCACTATTCTTACATTAAGCACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326576 34 + 636262 GACCGTTTACCCACTATCCTTACCTTAAGCAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 317931 33 + 647215 GACAGTTTCCAC-CTGTTCTGACATTAAGCACAG + +a +s mr.mrrefChr5 174618 85 + 294542 CTTCTCTCTTTGCTTCAGGAGTGGGCATGCAGTCATATTGTTCTGGAGCCTCAGAGTATTACTGATGGTATGCATATGCAGCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326610 85 + 636262 CTTCCCTCTGTGCTTCAGGAGTGGGCATGCAGTCATATTGTTCTGGAGCCTCAGAGTATTACTGATGGTATGCGTATTCAGCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 318000 85 + 647215 CTTCTGTCTTCACTTCAGGAGTGAGCTTGCAGTCATATTGTTCTGGAGCCTGAGAGTATTACTGATGGTATGCATATGCAGCCCA + +a +s mr.mrrefChr5 174703 59 + 294542 GGAAATTGGCCATTGCCCATACTAGCTCCCCAAAATACATAGGTAGACTCATTGGTCCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326695 59 + 636262 GGAAATTGGCCATTGCCCATACTGGCTCCCCAAAATACATAGGTAGACTCGTTGGTCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 318086 59 + 647215 GGAAATTGGCCATTGCCCATACTAGCTCCCCCAAATACATAAGTAGATTCATCCATCTT + +a +s mr.mrrefChr5 174762 142 + 294542 GTTCCAGATTGCACCCACTTAACCAGCTTTTCCTCCAGTAGTATCTTCTTTATACATTTTTCAAACTTAGTTTATTCTTCATAAATTTTTCAATGTAAGTTTATGGGCAGGTCTTTAGAGTGTTTGGGGTACCTGAATGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326767 142 + 636262 GTTCCAGATTGCACCCACTTAACCAGCTTTTCCTCCAGTAGTATCTTCTTTATACATTTTTCAACCTTAGTTTATTCTTCATAAATTTTTCAATGTAAGTTTACGGGCAGGTCTTTAGAGCGTTTGGGGTACCTGTATGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 318145 135 + 647215 GTTCCAG-------CGACTTAACTAGCCTTCCCTCCAGTAGTATCTTCTTTATAAATTTTTCTAACTTAGTCTATTCCTTATACATTTTTCAAAGTAAGTTTATAGGCAGGTCTTTAGAGTGTTCAGGGTACCTGAATGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 174904 7 + 294542 CTGCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326912 7 + 636262 CTGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 318280 7 + 647215 CTGCATA + +a +s mr.mrrefChr5 174911 451 + 294542 AGTGAAATGCCTTGCTTGAACAGCAATTTAATTTTGCATAAGTGAAATGCTTTGCTTGAATAGCAGTTTAATTGATTTACCAGGAGATAGCAAGTGTTCAATATGACTGGCAATAAACACCCAAGTTGAACTCCCAGAATTTCAGCGTGTGACTCGTAAATCATGAGTACGTTAGCACCTATTAACAATTGGATGTTCCATCCTTTTTAATTTAACCTTTTCCCTTTTTGTTATGCTGGATATCTCACATTGTGCTTTCTTAATCTCCAATTTCCAAGTGAGTGGCAACAACCTTCCTGTTCTCTCCAGGCTCCCTCGTAGCCCAATTGACTGGGAGCCCCTATCCTTGAGGTCTATCCTACTTAGGGGTGGTAGCTGGCTTGTAAGATTGACTGCAACCAATTATTATAGACTGGCCAAACCAGACATCTTTGCATGTTGGTTCAACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 326924 451 + 636262 AGTGAAACGCCTTGCTTGAACAGCAATTTAATTTTGCATAAGTGAAATGCTTTGCTTGAATAGCAGTTTAATTGATTTACCAGGATATCACAAGTGTTCAATATGACTGGCAATAAACACCCAAGTTGAACTCTCAGAATTTCAGCATGTGACTCGTAAATCATGAGTACGTTAGCACCTATTAACAATTGGATGTTCCATCCTTTTTAGTTTAATCTTTTCCCTTTTTGTTATGCTGTGTATCTCACATTGTGCTTTCTTAATCTCCCATTTCCAAGTGAGTGGCAACAACCTTCCTGTTCTCTACAGGCTGCCTCGTAGCCCAATTGACTGGGAGCCCCTATCCTTGAGGTTTATCCTACTTAGGGGTGGTAGCTGGCTTGTAAGATTGACTGCAACCAATTATTATAGACTAGCCAAACCAGACATCTTTGCATGTTGGTTCAACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 318287 443 + 647215 AGTGAAATGCCTTGCTCGAATAGCGACTTAATTTTGCATAAGTTAAATGCCTTGCTTGACTAGCAGTTTAATTAATTTACCAGGAGATAGTGAGTGGTCAATATGACGGG-AATAAACACCCATGTTGAACTCCCAGAATTTCAGTGTGTAACTTGTAAACAATGAGTATGTTAGGACGTATTAACAACTGGATGTTACATCCTT---AATTTAACCTTTTCCCTTTTTGTTATA---GATCTCTCACATTGTGCTGTCTTAATCTCCAATTTCCAAGTGTGTGGCAACAACCTTCCTGTTCTCTCCAGGCTCCCTCGTAGCCCAATTGACTGGGGGCCCCTACCCTTGAGGTCTATCC-ACTTAGGGGCAGTAGCTGGCTTGTAAGATGGACCGCAACCAATTATTATAGAATGGCCAAATGAGAAGTCTTTGCATGTTGGTTCAACACA + +a +s mr.mrrefChr5 175362 33 + 294542 CAGCACATCATATCAATTGGTAAGCAATCAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327375 33 + 636262 CAGCACATTATATCAATTGGTAAGCAATCAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 318733 33 + 647215 CAGAACATCATCTCAATTGGAAAGGCAACAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 175395 66 + 294542 TGTATTCTGCCACAAATGCCCTAGATTCTGAAGTGCTGATGTTCGTGTTGATACATGCCTTTTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327409 66 + 636262 TGTATCCTGCCACAAATGCCCTAGATTCTGAAGTGCTGATGTTCGTGTTATTACATGCCTTTTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 318766 66 + 647215 AATATTCTGCCACAAATGCCCTAGATTCTGAAGTGCTGAAGTTCGCATTGATACATGCCTTTTAGT + +a +s mr.mrrefChr5 175461 8 + 294542 CATATGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327476 8 + 636262 CATATGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 318832 8 + 647215 CATATGTA + +a +s mr.mrrefChr5 175469 125 + 294542 ACTGTGGATGAAAAAAACCTCTGACTGATAGTCTAGATGTTTCATGGACCTGTTCCGTCCCTCATGGCCCAGGTAATGATTTGGCTAACTACGTCCAACAAGATTCTGGAGGAAAATGAAGAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327485 69 + 636262 ACTGTGGATGAAAAGAACCTCTGACTAATAGTCTGGATGT--------------------------------------------------------CACAAAATTCTGGAGGAAAATGAAGAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 318840 125 + 647215 ACTGTGGAGGAAGTAAACCTCTGACTGATAGTTAAGAGGTTTCATGGACCTGTTCCGTCCCTCATGGCCCAGGTAATGATTTGGCTAACTACGTCCAACAAGATTCTGGGGGAAAATGAAGAATA + +a +s mr.mrrefChr5 175594 43 + 294542 CAATAAATTGACGTGTTCAGGATTGGCAAGAACATAATCTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327557 39 + 636262 CAATAAATC----TGTTCAGGATTGGCATAAACATAATCTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 318965 43 + 647215 CAATAAATTGACGTGTTGAGGATTGTCAAGAACATAATCTGGA + +a +s mr.mrrefChr5 175637 46 + 294542 GTCCAGTCTGCAGCCTCACCCTTATAGAAGGACAAGGGATTCAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327596 46 + 636262 GTCCAGTCTGCAGCGTCACCCTTATAGGAGGACAAGCGATTCACGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 319020 46 + 647215 GTCCAGTCTGCAGCCTCACGCTTGTGAAAGGACAAGGGATTCAGGA + +a +s mr.mrrefChr5 175683 33 + 294542 GGGGTTGGGACACTTTGAGTGATACTTTTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327655 33 + 636262 GGGGTTGGGACACTTTGAGTGATACTTTTGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 319066 33 + 647215 GGGGTTGGGACACTTTGAGTGACGCTTATGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 175716 339 + 294542 ACTGATAAAAAAGCAACTGGCAACACACATAGCCTAAACCAGGAATAAGTTCCATAAGAGATAGCCAATTGCCATGTGTATTTGATGAAGTTACAACACTGGAAGACCAACTTTTGGCAGAGGTTGCTATAATGTTTGAAAAATTTACATTTTGCACAAGTTGTTTTCTTACAGGGCAGTGCTGTGTGCTCTTATCAAGAGACTTGCCTGCAAGTGATGCATAACTTTGACAGTGCTTCTGTATATTATAATACCAAAATTACCCTACCAGTGTTATCTTCCTCTGCTTGACAAAAAAGTGAATTAAGTATCCCAATTTTAGAGTATAAGCTTTCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 327688 316 + 636262 ACTGATAAAAAAGCAATTGGCAACACACATAGCCTAATCCAGGAATAAGTTCCA-AATAGATAGCCAATTGCCATG-GTATTTGATGAAGTTACAACACTGGAAGACCAACTTTTGGCAGAGGTTGCTATAATGTTTGAAAAATTTACATTTTGCACAAGTTGTTTTCTTACAGGGCAGTGTTGTGTGCTCTTATCAA---------------------CATAACTTTTACAGTGTTTCTGTATATTATAATACTGAAATTACCCTACCTGTGTTATCCTCCTCTGCTTAACAAAAAAGTGAATTAAGTATCCCAATTTTAGAGTATAAGCTTTCACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 319105 324 + 647215 ACTGATAAAAAAACAACTGAAAACTGGTATAGCCAAAATTGGGAATAAGTTCCATAAGAGATAGCCAATTGCTATGTGTATTTTATGAGGCTACAACACTGGGAAACTAATTTTTGGGAGAGGTTGCCATAATGTTTGAAAAATCTAC---------------TATTATTACAGGGCAATGCTGTGTGCTCTTATCAAGAGACTTGCCTGCAAGTGATGCATAACTTTGACAGTGCTTCTGTATAGTATAATACCAAAATTACCCTACCAGTGTTATCTTCCTCTACTTGACAGAAAAGTGAATTAAGTATCCCACTTTTAGAGTATAAGCTTTCATGA + +a +s mr.mrrefChr5 176055 279 + 294542 CTCAACATATGATTAGACTAAACTGTCTATTGGAATGCAAGTCTCCTCACTAGATGCAACTTACAATGAACTGTGCTGCACTGAAAGCTACCCTGAGAGGGTTTCCCCATCCAAACCTTAATGTAACTGTCTCTGCGCCAATCTCCACAGATTCCAGTTCCGTCCACTAGTGGAACAACATCCCATTAACTCCAAATTACTATCTGTATTGCGCAGAAATTAATTCTCCAGTTTATTCCTCTGACCAGAATACTATTCAGTGTCCCCTACTTATTCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328018 279 + 636262 CTCACCATATGATTAGACTAAACTGTCTATTGGGATACAAGCCTCCTCACTAGATGTAACTAACAATGAACTATGCTGCACTGAAAGCTACCCTGAGAGGGTTTCCACCTCCCAACCTTAATGTAACTGTCTCTGTGCCAATCTCCACAAGTCCCAGTTCCGTCCACTAGTGGAACAACATCCCATTAACTCCAAATTACTATCTGTATTGCGCAGAAACTAACTCTCCAGTTTTTTCCTCTAGCCGGAATACTATTCAGTGTCCCCTACTTATTCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 319429 272 + 647215 TTAAACATATGGTCAAACTAAACGGTCTGTTGGAATGCAAGTCTCCTCTCTAGATGCGACTTTCAATGAACCGTGCTCCACTGAAGGCTAGCCTGAGAGGATGTCCCCATCCAAGCCTTAACATAACTGTCTCTGCGCCAATCTCCACAGATTCCAGTTC-------TAGTGGAACAACATCCTGTTCACTCCAACTTACTATCTGTATTGTACAGAAATTAATTCTCGAGTTTATTCCTCTGACCAGAATACTATTCGGTGTCCCCTACTTATTCCTA + +a +s mr.mrrefChr5 176334 155 + 294542 TCATGCATAAGATAGGACATACGTTTGGCTCAGACCATAGACACTATAGATTGCAGATCTTTCAGCAGTATGTCTTCAACATGGACTTATAATGAATGGGACCTCTGGCCAAGGCGCATCATTGACTTAAACTATTGGCCAGCTGCTACCATTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328298 155 + 636262 TCATGCATAAGGTAGGACATACGTTTGGCTTAGACCATAGACACTATAGATTGCAGATCTTTCAGCAGTATGTCTTCAACATGGACTTATAGTGAATGGGACCTCTGGCCAAGGCGCATCATTGACTTAAACTATTGGCCAGCTGCTACCATTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 319701 155 + 647215 TCATGCGCAAGATAGGACATACATTTGGTTCAGACCATAGACACTATAGATTGTGGATCTTTCAGTAGTATGTTTTCAACATGGACTTATAATGAATGAGACCTCTGGCCGGCGGACATCATTGATTTAAACTACTGGCCATCTGCTATTATTTT + +a +s mr.mrrefChr5 176489 86 + 294542 TTTGATACCCCCCTATCAGCACACAATCATGTTAGAGCTCCTATCTGATGAGACATATGAACAGGTAATTATAAGGAACTAGCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328453 86 + 636262 TTTGATACCCCCCTATCAGCACACAATCATGTTAGAGCTCCTATCTGATGAGACATATGAACAGGTAATTATAAGGAACTAGCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 319902 86 + 647215 TTTAATACCACTCCATAAGCACACAATCATGTTAGAGCTTCTAATTGATGAGACATATGGACAGGTAATTACAAAGAACTAGCTCA + +a +s mr.mrrefChr5 176575 87 + 294542 GAAAGGCAGACACTTTATCTCCAGGAAAGAAGTAGCGGCTCATAGTGGATGGGATAGGTTCGAGTCACTGGGCTAGTTCAGTGTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328540 87 + 636262 GAAAGGCAGACACTTTATCTCCAGGAAAGAAGTAGCGGCTCATAGTGGATGGGATAGGTTTGAGTCACTGGGTTGGTTCAGTGTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 319988 87 + 647215 GGTAGGCGGACACTTTATCTCCAGGAAAGAGGTAGCAGCTCATAGTGAATGGGATAGGTTCGAGTCACTGGGCTAGATCAGTGTCTC + +a +s mr.mrrefChr5 176662 222 + 294542 ACCCAGATGTTATATTGTCCTGCTTTAAATTTGAAGGTGTTTGAAGTCCAGGGGGGGAATGGTATATGACACAGATAGGTTGGCAAACATTGTAGCATGGGGCTAAGAACCAGTCAGGTCAAATGGATAGGTCAGTATGTGTAGCATAGGATCAAAAACTAGCTTTATGGCCTATAAGAGGAGCTCAACATCTTTTAAAGCTACCATTCTGTCCTAATTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328628 222 + 636262 ACCCAGATGTTAGATTGTCCTGCTTTAGAATTGAAGGTGTTTGAAGTCCAGGGGGGCAATGGTATATGACGCAGATAGGTTGGCAAACATTGTAACGTGGGGCTAAGAACCGTTCAGGTCAAATGGATAGGTCAGTATGTGTAGCATAGGATCAAAAACTAGCTTTATAGCCTATAAGAGGAGCCCAACATCTTTTAAAGCCACCATTCTGTCATTATTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 320075 216 + 647215 ACCCAGATGTTATCTTGT------TTAAATTTGAAGGTGTTTGAAGTTCAGGGGGGGAATGGTAGATGACACAGATAGGTTGGCAAATCTTGTAGCATGGGGCTAAGAACCAGCCAGATCAAATGGATAGGTCAGTATGTGTAACATGAGGTCACAAACCAGCTCTATGGTCTATAAGATGAGTTCAACATCTTTTAAAACTACCATTCTGTCCTAATTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 176884 120 + 294542 ATAAGGTAGAGGAGTGACCAGGATTAGAACTCTAGAGACCCATATGTTCCAAGAGTTCGCTGAAGCCCATATGTGCACAGAGTTTGCTTTTGAACAATTATACGGGCTCACAGACAGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328850 120 + 636262 ATAAGGTAGAGGAGGGACAAGGATTAGAACTCTAGAGACCCATATGTTCCAAGAGTTCGCTGAAGCCCATATGTGCACAGAGTTTGCTTTTGAACAATTATATGGGATCCTGGACAGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 320298 120 + 647215 ATAAGGTAGAAGAGTGACCAGGATCAGAACTCTAGAAACCCATATGTTCTCAGAGTTTGCTGAAGCCCACCTGTACCCAGAGCTTGCTTTTGAACAATTATACGGGCTCACAGACAGCGA + +a +s mr.mrrefChr5 177004 66 + 294542 TTTAAATATTATGCATCCTGACCTTGACCTTTAGCTCCCTGCTCTGAAACAACAATACATTAGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 328970 66 + 636262 TTTAACTATTATGCATCCTGACCTTGACCTTTAGCTCCCTGCTCTGAAACAACAATCCATTAGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 320424 65 + 647215 TTTAAAT-TTATGGATCGTGACCTTGACCTTTACCTCCCTGCTCTGAAACAACGACACATTAGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 177070 40 + 294542 GCTTACTACTCAGATAATGCTCAATTATTCATAGGAGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329036 40 + 636262 GCTTACTACTCAGATAATGCTCAATTATTCATAGGAGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 320490 40 + 647215 GATTACTCCTCAGATAATGCTGAATTATTCATGGTAGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 177110 40 + 294542 CTACAACTCAGTTGAAATCATGAAAGAAAGAAAGGCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329076 37 + 636262 ---CTGCTCAGTTGAAATCATGAAAGAAAGAAAAGCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 320531 40 + 647215 CTACAATTCAGTTGAAATCATGAAAGAAAGAGAGGCATTA + +a +s mr.mrrefChr5 177150 123 + 294542 CTTTAAATCCAGCTGATGATTCCAACCACCTGCACACAAGGGATGGGTACTATTGAAACTCTGGGACCCATACACACCCTTTTCCTTGGTTGGGTAGGCTTATGCAGATTTACACACCCTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329113 123 + 636262 CTTTAAATCCAGCTGATGATTCCAACCACCTGCGCACAAGGGATGGGTACTATTGAAACTCTGGGACCCATGCACACCCTTTTCCTTGGCTGGGTAGGCTTATGCAGATTTACACACCCTTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 320581 122 + 647215 CTTCAAATCCAGCTGAGGATTCCAACCACCTGCACACAGGGGATGGGTACTACTGAAA-TCTGCGACCCATACGCGCCCTTTTCCTTGGTTGAAGAGGCTTATGCATATTCACAGACTCCTAG + +a +s mr.mrrefChr5 177273 176 + 294542 CAGGGTTAACACCTATTAGCTAAGACTGCTCTCGATTGGCATCCAAATATGTTTGCCATTCTAACACCCTTCCATACCCTTTCACTCTAATTTGTTTGTGTTATAAGTGTCTACCTCCTTATCTTGCTTACAATAGTTGTCATCACCAATGGCCCAATTCCCTCGTTATGCAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329236 166 + 636262 CAGGGCT--CACCTCTTAGCTAAGACTGCTCTTGATTGGCATCCAAATATTT--------CTCACACCCTTCCATACTCTTTCACTCTAATTTGTTTGTGTTATAAGTGTCTACCTCCTTATCTTGCTTACAATAGTTGTCATCACCAATGGCCCGTTTCCCTCGGTATGCAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 320709 174 + 647215 CAGGGTTAACACCCATTGCCTAAGACTACTTTCGATTGGCATCCAAATATGTTTGCCATTCTAGCACCCTTCCATACCCTTTCACTCTCATTTGTTCTTGTTATAAGGGTCTACCTCCTTATATTGCT--CAATAGTTGTCATCACCAGTGGCCCAATTCCTTGGTTATTCAATAG + +a +s mr.mrrefChr5 177449 151 + 294542 GTTTTGACAAGCTTTTTCCTGGTCATGCCTGCATATCCAAACCTTATGACTTGGGGAGACATGTGCCTTATTGTCAGACATGTATTGTTATGCCAATTTCAGAGTTTCAATAACACACCAGATGTCTTTGACACAAGTAAACTGCAAAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329502 142 + 636262 GTTTTGACAATCTTTTTTCTGATCATGCCTCCATATCCAAACTTTATGACTTGGGGAGACAT---------TGTCAGACATGTAATGTTATGCCAATTTCAGAGTTTCAATAAGACACCAGATGTCTCTGACACAAGTAAACTGCAAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 320883 151 + 647215 GTTTTGACAAGCTTTTTCCTGGTTGTTCCTGCATATCCAAAACTTATGACTTGGGGAGACATGTGCCTTATTGTCAGACATGTATTGTTATGCCAACTTCAGAGTTTCAATAACACACCAGATGTCTTTGACACAAGTAAACTGCAAAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 177600 68 + 294542 AATCAGAATAAACATCATCTTCCACATCTATCTATGAGAGTGATCTTGCAGGAATCACAGTCAGCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329672 67 + 636262 AATCAGAATAAACATCTTCTTCCACATCTATCTGTGAGAGTGATCTTGCAGGAAACACA-TCAGCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 321034 68 + 647215 AATCAGAATAAACATCATCTTCCACACCTATCTATGAGGCTGATCTTGCAGGAATCACAGTCAGCTGG + +a +s mr.mrrefChr5 177668 63 + 294542 TCTTTCTCAGGCAAGAATCCAGCCTACTCTAGTGCACTTAACCAGATCTGTGCCAAGGTTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329768 63 + 636262 TCTTTCTCGGGCAGGAATCCAGCCTACTCTAGTGCACTTAACCAGATCTGTGCCAAGGTTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 321102 63 + 647215 TCTTTCTCAGACAAGAATCCAGCCTGCTCTAGTGCACTTAACCAGATCTGTGCCAAGGTACAG + +a +s mr.mrrefChr5 177731 253 + 294542 TTGTCCTTAAGAGTTCAAGTTTGAATTGAACCATTTAACGCAGGTAACACCATAAGCAAGCAGATAATAATGTATTGATAAGGCACAACCAGTTTAGTAACTTGTATGGGGATGTGTAATGGTTGGCAACCCATCCTGTTAGTTATCCCATAGATGCCATGATATTCTTGACATACTGTGCCACGGGAACTCCCCATTTTGTAGTGGGTCCTTAGTTGTCACATGATTACACTCTGCCTTCAGAGGTCACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 329831 253 + 636262 TTGTCCTTAAGAGTTCAAGTTTGAATTGGACCATACAACGCAAATAATACCATAAGGAATCAGATATTAATGTATTGACAAGACACAACCAGTTTGGTAACTTGTATGGGGATGTGTAATGGTTGGCAACCCATCCTGTTAGTTATCCCATAGATGCCATGATATTCTTGACATACTGCGCCACAGGAACTCCCCATTTTGTAGTGGGTCCTTAGTTGTCACATGATCACACTCTACCTTCAGAAGTCACTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 321171 253 + 647215 TTGTCCTTAAGAATTCAACTTTGAATTGAAGCATTTAACGCAGGTAACACCCTAAGCAAGCAGATAATAATTTATCGATAAGGTACAACCAGTTTAGTAACTTGTATGGGGATGTGTAATGGCTGGCAACGCACCCTGTTAGTTATTCCATAGATGCCATGATATTCTTGACATACTGTGCCACGAGAACTCCCCATTCTGCAGTGGGTCCTTAGTTGTCACATGATTGCACTCTGCCTTCAGAGGTCACCTT + +a +s mr.mrrefChr5 177984 35 + 294542 CCTGAGTGGATATTTGGATGGGGCACCTAAGATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330085 35 + 636262 CCTGAGTGGATATTTGGATGGGGCACCTAAGATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 321424 35 + 647215 CCTGAGTGGATATTCGGATAGGGCATTTAAGATCA + +a +s mr.mrrefChr5 178019 35 + 294542 GTACTCAAAATCCATTACCTGAACCATTCTGGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330120 35 + 636262 GTACTCAAAATCCATTACCTGAACCATTCTGGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 321464 35 + 647215 GTAATCAAAATCTATTGCCTGAACCATTCTGGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 178054 84 + 294542 CTGAACCGTACTGCCTGGAGACAATTGGCCCTATCCAAACGCGTTGAAAGTGGTGGTGAACCATGACAGATTATTTTCTAGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330156 84 + 636262 CTGAACCGTACTGCCTGGAGACAATTGGCCCTATCCAAACGCGTTGAAAGTGGTGGTGAACCATGACAGATTATTTTCTAGAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 321499 84 + 647215 CTGAACCCCACCGCCTGGAGACAATTGCCCTTATCAAAATATGTTGCAAATGGTGTTGACCCATGCCAGATTATTTTTTAGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 178138 116 + 294542 AACTAACATGGCATAAGACCTCCAATCACTAAGTTTGGATACTTCATATCTTAATTTTTGGCAGGTCATCCTGTTAGCTACTCAGCCTCTCCTTAGTGACACACCTGGTGTCCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330240 116 + 636262 AACTAACATGGCATAAGACCTCCAATCACTAAGTTTGGATACTTCATATCTTAATTTTTGGCAGGTCATCCTGTTAGCTACTCAGCCTCTCCTTAGTGACACACCTGGTGTCCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 321584 116 + 647215 AACTAGCACAGCATAAGACCTCCAGGTATGTATTTTAGATACTCCATATCTTATTTTTTGGCAGGTTGTCCTGTTAGCTAGCAAGCTTCTCCTTAGTGACAAACCTGGTGTTCGTG + +a +s mr.mrrefChr5 178254 147 + 294542 ATTTCTCCATCTCAAAGTTCACACTGTTTTACAGTCAGGTTCTCTTCAACTCAATTGGGATGTGAAGTTCATATAACAGGGATTGGTGAGCTGACTTGATAGCCTGTTAATATTGTCACAGAATAAAACTGGGACTATATGATTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330356 147 + 636262 ATTTCTCCATCTCAAAGTTCACACTGTTTTACAGTCAGGTTCTCTTCAACTCAATTGGGATGTGAAGTTCATATAACAGGGATTGGTGAGCTGACTTGATAGCCTGTTAATATTGTCACAGAATAAAACTGGGACTATATGATTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 321703 147 + 647215 ATTTCTTCATTTAACAGTTCACATTATTTTACAGTCAGGTACTCTTCAACTCAATTAGGATGAGAAGTTAATATAACAAGGATTGGTGAGCTGACCAGATAAGCTGTTAATGTAGTCACAGAGTAAAACTGGGACTATATGATTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 178401 6 + 294542 CAGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330503 6 + 636262 CAGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 321852 6 + 647215 CAGGTT + +a +s mr.mrrefChr5 178407 16 + 294542 CATTAGATTGTGTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330509 16 + 636262 CATTAGATTGTGTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 321865 16 + 647215 TATTTAATGGTGTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 178423 62 + 294542 TGGTGTAGTTTGAGCATCACTGTGAGGATTAATTGGATGTTTCGGAATCCCAGATGTTTCGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330537 62 + 636262 TGGTGTAGTTTGAGCATCACTGTGAGGATTAATTGGATGTTTCGGAATCCCAGATGTTTCGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 321881 62 + 647215 TGGTGTAGTTCGAGCATCACTGTGAGAACTAATTGGATGTTTCGGAATCTCAGATGTTTCGG + +a +s mr.mrrefChr5 178485 61 + 294542 AATCCCGGCAGCTATCCTGAGGTAACCGACCTTACTCGGGCTCAATTGGAATCGTTCCGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330600 61 + 636262 AATCCCGGCAGCTATCCTGAGGTAACCGACCTTACTCGGGCTCAATTGGAATCGTTCCGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 321943 61 + 647215 AATCCCAGCAGCTAACGTGAGGTAACCGACCTCTGTTGGGCTACATTGGAATCGTTCCGGG + +a +s mr.mrrefChr5 178546 35 + 294542 TAAACACATTGGGCAGGCTCATTCTAGATGCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330661 35 + 636262 TAAACACATTGGGCAGGCTCATTCTAGATGCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 322016 35 + 647215 TAAACATATCAGGCAGGCTCATTCTAGATGCGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 178581 134 + 294542 AGTGCCGGTCATTGCTTGACAGTGTTTGAATCGGACAGGGGATCTACAATGTACACAGGGGCCTGTCATTGCTTGACAGTGCATGAATCGGACAGGGGATCTACAATGTATGTGAGGAGATCATTTGATGTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 330698 132 + 636262 AGTGCCGGTCATTGCTTGACAGTGTATGAATCAGACAGG--ATCTACAATGTACACAGGGGCCTGTCATTGCTTGACAGTGCATGAATCGGACAGGGGATCTACAATGTATGTGAGGAGATCATTTGATGTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 322051 134 + 647215 GGTGCCTGTCATCTCTCAACAGTGGTTGAATCGGACAGGGGATCTACAATGTACACAGGTGCCCGTCTTTCCTTGACAGTGCACGAATCAGACAAGGGATCTACAATATATGCAGGAAGATCCATTGACATCTC + +a +s mr.mrrefChr5 178715 89 + 294542 ATCAAGCGGAGCAGGCTTGTAGCCAAGTACTGAGCGTGTGTACATGGCTGTGCAGGGCAGGCTCATAGCCAAGCACTGACTGTGTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331145 89 + 636262 ATCAAGCGGAGCAGGCTTGTAGCCAAGTACTGAGCGTGTGTACATGGCTGTGCAGGGCAGGCTCATAGCCAAGCACTGACTGTGTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 322185 89 + 647215 ATCAAGCAGGGCAGGCTCGTAGCCAAGCACCAACCATGTGTACATGGCCGCGTGGGGCAGGCTCATAGCCAAGCACTAACCGTGTGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 178804 57 + 294542 ATGGCTGGATTTGCTTTTTTTTGAAGATTTGCATGAGGCACTGTGCGAAGTCTAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331235 57 + 636262 ATGGCTGGATTTGCTTTTTTTTGAAGATTTGCATGAGGCACTGTGCGAAGTCTAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 322274 57 + 647215 ATGGCTGCATTTGCCTTTTTTTGGAAATTTGCACGAGGCACTGTGCAAAGTCTAACC + +a +s mr.mrrefChr5 178861 7 + 294542 AGTGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331293 7 + 636262 AGGGCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 322331 7 + 647215 AGTGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 178868 55 + 294542 GCCGGTCGCTGACGTGCCCAACTAGTTAGGATAGACAGGAGCAGCACGCGTTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331303 55 + 636262 GCCGGTCGCTGACGTGCCCAACTAGTTCGGATAGACAGGAGCAGCACGCGTTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 322338 55 + 647215 GCCGGTCGCTGACGTGCCCAACTGGTTAGGATAGACAGGAGCAACACGCGTTGGG + +a +s mr.mrrefChr5 178923 18 + 294542 CCTAATTGTGTTACTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331364 18 + 636262 CCTAATTGTGTTACTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 322393 18 + 647215 CCTAATCGCGTTACTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 178941 55 + 294542 CAGATAACAAAACAAAAAGTCTTGGAAATTGAATGCGGCTGTTTCCAAACTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331387 55 + 636262 CAAGTAACAAAGCAAAAAGTCTTGGAAATTGGATGAGGCTGTTTCCAAGCTTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 322411 55 + 647215 CAGAGAACAAAACAAAAAGTTTTGGAAATTGAACGCGGCTGTTTCCAAACTTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 178996 71 + 294542 CCATCCTCATTAATTCCAGTTACTAGTTGAATTGTCAGTTCTGTGATTTCCAGTATGATAATCCAACCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331443 61 + 636262 CCATCCTCATTAATTCCAGTTACCAGTTGAATTGTCAGT----------CCAGTATGATAATCCAACCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 322466 71 + 647215 CCATCCTCATTAATTCCAGTTACTAGTCAAATTGTCAGTTCTGTGATTTCCAATATAATAATCTGACCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 179067 168 + 294542 CTATGGAGTATCCAAACAACTTTTAAGTCTTTTTGCTAAGTTAAGAAATGACACTACGTCTCAAGAGAAACCACTCTCTCTTTGACATAAGGGTTAGACTCCCTCGACTAGTTCCACAATGCACAGCTCTCAGAAGAGCCCACCACAGCCAGTTCTCAGACCAGGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331505 167 + 636262 CTATGGAGTATCCAAACAACTTTTAAGTCATTCTGCTAAGTTAAGAAATGACACTACGTCTCAAGAGAAACCACTGTTTCTTTGACATAAGGGTTAGACTCCCTCGACTAGTTCCACAATGCACAGCTCACAGAA-AGACAACCACAGTGAGTTCTCAGACCAGGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 322537 144 + 647215 CTATGGTGTATCCAAACAACTTTTAAATCTTTTTGCTAAGTTATGAAATGACCCTACATCTCAAGAGGATACACTCTCTCTTTGACATAAG-------------------GGTCCACAATGCACAGCTCT-----GAGCCCACCACAGCCAGTTCTCAGTCCAGGATA + +a +s mr.mrrefChr5 179235 137 + 294542 CCTTATAAGGAGCATGCTCCAGTGATGTCAGGCACATGTTTGGGGTAGTCTGTCTCAATGTTCAGACAAGAACTAGCCCAACACTGGGATGGCGGAAGGGAGCCCTACTCAACCCTCCAGGACAGCAAAATGAAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331675 137 + 636262 CCTAATAAGGAGCATGCTCCAGTGATGTCAGGCACATGTTTGGGGTAGTCTGTCTCAATGTTCAGACAAGAACTAGCCCAACACTGGGATGGCGGAGGGGAGCCCTGTTCAACCTTCCAGGACAGCAAAATGAAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 322681 124 + 647215 CCTTATATGGAGCATGCTCCAGTGATGTCAGGCACATGTTTGGGGTAGCCTGTCTCAATGCTCAGACAAGAACTAGCCCA-------------GGTAGGGAGCCCTACTCAACCCTCCAGGCCAGCAAACTGAATCC + +a +s mr.mrrefChr5 179372 40 + 294542 CTGCTCAACCTTTCAGATAAGAAACTATCACCAACTAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331816 36 + 636262 CTGCTCAACCTTTCAGATAAGAA----TCACCAACTAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 322805 40 + 647215 CTACCCAACCTTTCAGATAAGAAACTATCACCAACTAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 179412 57 + 294542 TTTGTTCTACCTGTACGAGTATAAAGCATCAAAAACAACTCCTGAACACCCACTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331852 57 + 636262 TTTATTTTACTTGTACAAGTGTAAAGCATCGAAAACAACTCCTGAACACCCACTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 322851 57 + 647215 CTGGTTCTACCTGTACGAGTATAAAGCAACAAGAACAACTCCTGAGCACCCACTACC + +a +s mr.mrrefChr5 179469 214 + 294542 ATCCAATTGATCTATGCTCCCCTCCTGAGCACCGACTCCAATCCAATTGAGCTATGTGCCCACAATTCGCTCATAGACACCAACAATCTCTTTTTAGATAAACAGCTGGGTGCTTCAAATTACTCTAGGTGATATCAGATTTTGGTAATAAACCACCAGACTGTTTTGAATCTGAAACAATGGTTTCCTTCCACAGTATATGTAATCCATTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 331909 211 + 636262 ATCCAATTGCACTATGCTCCCCTCCTGACCACCCACTCCAATCCACTTGAGTTATGCGCCCGCAACTCGCTCATAGACACCAACAATCCCTTTTTAGATAAAAAGCCGGGTGTTTCAAATTAGTCTTGGTGATATCAGATTTTGGTAATA---CACCAGACTGTTTTGAATCTGATACAAATGTTTCCTTCCACGGTATATGTAATCTGTTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 322915 214 + 647215 ATCCAATTAATCTATGTGCCCCTCCTGAGCACGGACTCCAATCCAATTGAGCTATGTGCCCACAATTCGCTCATAGACACCAACAATCTCTTTTTAGATGAACAGCTGGGTGCTTCAAATTACTCTAGGTGATATCAGATTTTGGCAATAAACCACCAGACTGTTTTGAATCTGAAACAATGGTTTCCTTTCACAATATATGTAATCCATTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 179683 5 + 294542 AATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332120 5 + 636262 AATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 323135 5 + 647215 CATGT + +a +s mr.mrrefChr5 179688 20 + 294542 TCCATTCACAGTAGGGCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332171 20 + 636262 TCCATTCACAGTAGGGCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 323140 20 + 647215 TCCATTCACAACAGGACAAT + +a +s mr.mrrefChr5 179708 119 + 294542 TATGCCAGATTATTGGCTGATAGTTCATGAGGATTAAAGGATTTAGTGACACTAGGCTAAATAAAACTTCTTGCAAACCACTCAGTCTCAATCCCCAAGATGCTAGCTTCCATTTCCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332191 119 + 636262 TATGCCAGATTATTGGCTGATAGTTCATGAGGATTAAAGGATTTAGTGACACTAGGCTAAATAAAACTTCTTGCAAACCACTCAGTCTCAATCCCCAAGATGCTAGCTTCCATTTCCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 323161 119 + 647215 TATACCAGATTATTGGCAGATAGCTCACAGGGCTTAAAGGACTGAATAACATTAGACTAAGTGAAACTTCTTGCAGACCACTCAGTCTCAATCCAGAAACTACTAGCTTCCATTTCCTA + +a +s mr.mrrefChr5 179827 60 + 294542 TTATGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATCTAAAGGGGTGTACTCATGTCAAACACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332312 60 + 636262 TTATGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATCTAAAGGGGTGTACTCATGTCAAACACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 323280 60 + 647215 TTGTGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATTTAAAGGGGTGTACCCCACTCAAATACC + +a +s mr.mrrefChr5 179887 31 + 294542 ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332373 31 + 636262 ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 323340 31 + 647215 ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAGATTT + +a +s mr.mrrefChr5 179918 9 + 294542 CCGGACAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332404 9 + 636262 CCGGACAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 323383 9 + 647215 CCTTACTGC + +a +s mr.mrrefChr5 179927 129 + 294542 GAGTAGCTTGCTGAGTGAGGAGATAGCTGTAGGCCCGGAGTCCTCTTAGAAGAGAGCCAGGAATGCTAGCCAAGAATCTATGTCAGATTGCTCACTTAGGTCATGCAAGGATGGTTGACCAGATACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332413 129 + 636262 GAGTAGCTTGCTGAGTGAGGAGATAGCTGTAGGCCCGGAGTCCTCTTAGAAGAGAGCCAGGAATGCTAGCCAAGAATCTATGTCAGATTGCTCACTTAGGTCATGCAAGGATGGTTGACCAGATACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 323399 129 + 647215 GGGAAGTCATCTGAGTGGGGAGTTAGTTGTAGGTCCTGAGTCCTCTTAGAAGAAAGCCTGGAATGCTAGCCAAGAATTCAAGTCAGATTCCTCACTTAAGTCACACAAGAAGGGTGGACCAGCTACCTT + +a +s mr.mrrefChr5 180056 50 + 294542 CAAAATATACCAGGTACATGTGATGGCTTCTCTTCTGCCACACTATTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332543 50 + 636262 CAAAATATACCAGGTACATGTGATGGCTTCTCTTCTGCCACACTATTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 323528 50 + 647215 CTAAATATACCAGCTACATGTGATGGCTTCCCTTCTACCATACTATTATT + +a +s mr.mrrefChr5 180106 95 + 294542 TTTTTTTGTTATCTGCTACAGGCAAACCGAACCATTGGTTCACAACGCAGTATTTATGATGTGATACTAAATGACATGGAGATTGTTGCACAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332600 95 + 636262 TTTTTTTGTTATCTGCTACAGGCAAACCGAACCATTGGTTCACAACGCAGTATTTATGATGTGATACTAAATGACATGGAGATTGTTGCACAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 323578 95 + 647215 TTTTTTTGCTTTCTGCTACAGGCTCAAAAAACAATTGGTCCACAAAGCAGTATTTATAATCTGCTACTAAATTACATGGAAATTGTTGCAAAGAG + +a +s mr.mrrefChr5 180201 20 + 294542 TGTCCATATGAGGGGGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332698 20 + 636262 TGTCCATATGAGGGGGCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 323673 20 + 647215 TGTCCATATGAGGGTGCTCC + +a +s mr.mrrefChr5 180221 18 + 294542 CAACCATTTTTTGACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332721 18 + 636262 CAACCATTTTTTGACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 323693 18 + 647215 CAACCATACTTTGACATG + +a +s mr.mrrefChr5 180239 58 + 294542 CATAGCGTTAACCTACATTGAAAAACAATGAATATTGAGTATGATTCCAGAAAACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332740 58 + 636262 CATAGCGTTAACCTACATTGAAAAACAATGAATATTGAGTATGATTCCAGAAAACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 323711 58 + 647215 CATATCATTGACCTACTTTAAACAACAATGGATATTGAGTGTGATTTCAGAAAACACA + +a +s mr.mrrefChr5 180297 94 + 294542 TGTCTCTGTGTCATTTTAAAAATGTAGATACAGCTCCCAGCATCACTTTGACTAACTGCATTGCTATGGCCACAGTGTGTTAGACCCCAAACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332804 94 + 636262 TGTCTCTGTGTCATTTTAAAAATGTAGATACAGCTCCCAGCATCACTTTGACTAACTGCATTGTTATGGCCCCAGTGTGTTGGACTCCAAACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 323769 94 + 647215 TGTCTCTGTTTCATTTTAAAAAAGTAGATCCAGCTCCCAACATCACTTTGACTAACTGCACTGCTGTGGCTACAGTGGGTTAGACCCTGAACCA + +a +s mr.mrrefChr5 180391 5 + 294542 TGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332898 5 + 636262 TGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 323878 5 + 647215 TGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 180396 21 + 294542 GCTCCCACACGTGACTATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332903 21 + 636262 GCTCCCACACGTGACTATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 323889 21 + 647215 ACTCCAACACTTGACTATTTG + +a +s mr.mrrefChr5 180417 187 + 294542 ATAGCACAGACTCCATTGTAACTACAGATAGCAGCTGAAGTAGCAGTTAGTGAGTGGGACATATGTTGCTGAGCAGTATAACTTTTATAAAATCTGTTTCATCTATACTGGTAAGTATAGATGATGTCGTGTACACAAATGTGGACTGGTATAACAACCAAGGGATGAAGACAAGGCTAGAGATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 332929 178 + 636262 ACAGCACAGAACCCATCATAACTACGGATAGCAGCTGTAGTAGCAGTCAGTGAGTGGG---------GCTGAGTAGTAGAACTTTTATAAGATCTGTTTCATCTATACTGCTAAGTATAGATGATGTCGTGTACATAAATGTGGACTGGTATAACGACCAAGGGATGAAGACAAGGCTAGAGATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 323910 186 + 647215 ATGGCACTGACTCCATTGTAACTATAAATAGCAGCTGAAGTAGCAGTT-GTGAGTGGGACATATGTTGCTTAGCAGTATAACTTTTATAAAATCTGGTTCATCTCTACTGGTAAGTATTGATGATGTTGTGTACACAAATGTGGACTGGTATAACAACCAAGGGATGAAGAGAAGGTTAGAGATGTT + +a +s mr.mrrefChr5 180604 611 + 294542 AAAATTGGACTGGTGCCAGTGGTCTGGGCCTTTGCCCCACAGGGGGCAGTCATGGTCCATGACACAACAGAATGTGTAAGCAGACTCGGAAGTATATGTCTTTTCCTTTTTGAGCCCACTTTCTATTAGGAATCTCATCTATATTCTTTTAAAACACATGAACAATCGTCAAATTAGGATTTGATACTATAGAAACCACCAGGTGTTGTGATATGCAATaaagtcttgtagctgtgattcttcaagtctattttgcgtacataaagtcttgCGTCTGCCACATTTGAAATAATGAATGGATATTGCATATAATGGGCGACTATCATACCATAAGATGCTTTCTTAGCGGAGCCAGGACAGGATGCAGCATAGGTATGAATTGCGGTTTGCAAGTTATTGAAATATTGCAGCAATTCTGAGCTGTCAGTAGGGATGAATAAAATTGAAACTTAGAATACATGAGGACAACCTAATTGTCATAAACAAACCATAGTAGACATGTTAAATCACAATGccccacAGCTTATGTGGTAATATAGCATGATTGGTATGGATAGGCCATAAACAGGCCATAAAAAAAACTCTGACTGTATTACTCATACTGAGTTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 333108 604 + 636262 AAAATTGTACTGGTTCCAGTGGTCTGGGCCTTTGCCCCACAGGGGGCAGTCATGGTCCATGGCACAACAGAATGTGTAAGCAGACTCGGATGTATATGTCTTTTCCTTTTTGGGCCCACTTTCTATTAGGAATCTCATCTATATTCTTTTAAAACACATAAACAATCGTCAAATCAGGATTTGATATTATAGAAACCACCAGGTGTTGTAATATGCAATaaagtcttgtagctgtgattcttcaagtctattttgtgtacataaagccttgCGTCTGCCACATCTTAAATACTGAATGGATATTACATTTAATGGGCGGCTATCATACCATAAGAGGCTTCCTTAGAGGAGCAAGGACAGGATGCAGCATAGGTATGAATTGTGATTTGCAAGCTATTGAAATATTGCAGCAATTTTGAGCTGTCAGTAGGGAAGAATAAAATTGAAA-TTAGAATACATGAGGACGACCTAATTGTCATAGACAACCTATAGTAGACATGTTAAATCACAATG------GGCTTATGTGGTAATATAGCATGATTGGTATGGGTAGGCCATAAACAGGCCATAAAAGAGACCCCAACTATACTACTCATACTGAGTTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 324096 611 + 647215 AAAATTGGACTGGTGCCAGTGGTCTAGGCCTTTGCCCCACAGGGGGCAGTCATGGACCATGACACAACAGAATGTGTGAGCAGGCTCGGAAGTATATGTCTTTTCCTTTTCCAGTCCACTTTCTATTTGGAATCTCATCGATATTCTTTTAAAACACATGAGGAATCATCAAATTGAGATTTGATACTATAGAAACCGCCAGGTGTTATGATATGCAATaaagtcttgtagttgtgattcttcaagtctattttgcgcatataaagtcttgtatctgCCACATTTGACATAATGAATGGATCTTGCATATAATGGGTGACTATCATACTATAAGATGCTTTCTTAGCGGAGCCAGGACAGGCTGCAGCATAGGTATGAATTGCTGTTTGCAAGTTATTGAAATATTGATGCAACTCTGAGCTGTTAGTAGGGATGAATAAAATTGAAACTTAGCATACATGAGGACAACCTAATTGGGATAAACAAACCATAGCAGACATGTTAGGTCATAATGCCCCACAGCTTCTGTGTTAATCTATCAAGATTGGAAAGGATAGGCCATAAACAGGCCATAAAAAAAACTCTGACTGTATCACTCATACTGAATTACA + +a +s mr.mrrefChr5 181215 492 + 294542 CAGTACCAGAGGCTGTCTCACAAGAGAGTAGACTTTTGACTAATATTTGTTCTTCTTTTCAGTGTGGGTAAGAACACTTGTATGGGCTGAGCATCACACCAATAAATCGACACTCCATGTCAGAATACATGCTAGTTAAGCATGAAGGAATGAGTGCCTCAATATACATCCCTTATCTCAGTTTGTATCGTTCTGACTTTTAGGGTATGCTAGTTTTCAGATAGAGTCTTGTACACTTTTAAGGCATTGGTTTGAATTCTGACTTTGGATGGCTACTGAGTAGCACTAGAGCACCACAAACCCTAAGCATAAGTGTGAAATTGTAACAAGTTAATTCCCAAGTGCTTGTGCCCAAGAAGACAGCATTGCTACGTAAAACAGCCTACACCACTTAATCTCTTCACGTATTTAGTGTAGCAAATTTGCTAAGTTTTTGGATGGTGCTTCAGTGCATAGTTGTCAGCATCTAACCTTGTCACTATAGGGGACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 333712 474 + 636262 CAGTACCAGAGGCTGTCTCACAAGAGAGTAGACTTTTAACTAATATTTATTGTTCTTTTCAGTGTGGGTAGGAG-ACTTGTGTGGGCTGAGCATCACACCAATAAA-------TCCATGTCA-AATACATGCTAGTCAAACATGTAGGAGTGAGTGCCTCAATATACATCCCTTATCTCAGTTTGTATCGTTCTGACTTTTAGGGTATGCTAGTTTTCAGATAGAGTCTTATACACGTTTAGGGCGTTGG------CTCTGACTTTGGATGGCTACTGA-TATCACTAGGGCACCACAAACCATAAGCATAAGTGTGAAATTGTAACAAGTTAATTCTGAA--GCTTCTGCCCAAGAAGACAGCATTTCTACGTTAAACAGCCTACACCACTTAATCCCTACACGTATTTAGTGTAGCAAATTTGCTAAGTTGTTGGATGGAGCTTCAGTGCAGAGTTGTCAGCATCTAACCTTGTCACTATAGGGGACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 324775 492 + 647215 CAGTACAAGAGGTTTTCTCACAAGAGTGTAGACTTTTGACTAGTATTTGTTCTTTTTTTCGGTGTGGGTAAAAACACTTGTATGGGCTGAGCATCACACCAATAAATCGACACTCCATGTCAGAATTTACACTAGTTAAGCATGAAGGAATGAGTGCCTCAGCACACATCCCTTAGCTCAGGTTTTATAGTTCTGACTTTTGGAGTATGCTTGTTTTCAGATAGAATATTGTACATTTTTAAGGCATTGGTTTGAATTCTGACTTTGGATGGCTACTGAGTTGCACTAGAGTACCACAAACTCCAAGCATAAGTGTGAAATTGTAACAAGTTAATTCCCAAGTGCCTGTGCCTAAGAAGACAGCATTGCTACGTAAAACAGCCTACACCATTTGATCTCTTCAAGGATTTAGTGTAGCAAATTTGCTAAATTTTTGGATGGTGCTTCAATACATGGTCGTCAGCACTTAACCTTCTCACTATAGGGGACATG + +a +s mr.mrrefChr5 181707 26 + 294542 CTCACTACTTCTCACATGAACCTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334186 25 + 636262 -TTACTACTTCTCACATGGACCTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 325270 26 + 647215 CTCACTACTTTTTACATGAACCTAGG + +a +s mr.mrrefChr5 181733 98 + 294542 ATGCTAATAAACCATTGCATGGAAAGCTTTTGGGCTCCGAGACAACCAGCTGATTTGGAGATCTTAACTTTGGAATGTCATTAACAAGCCCAGCTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334240 98 + 636262 ATGCTAATAAACCATTGTATGGAAAGCTTTTGGGCTCCGAGACTACCAGCTGATTTGGAGATCTTAACTTTGGAATGTCATTAACAAGCCCAGCTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 325296 98 + 647215 ATGTTATTAAATGGTGACATAGAAAGCTTTAGGGCTCTGAGACAGCCAGCTGATTTGGAGGTCTTGCCTTTGGAATGTCATTAACAAGCCCAGCTACA + +a +s mr.mrrefChr5 181831 60 + 294542 GGCTTGCCCTAGCAAGGTCACTTTGGATCCTGCCAGTGTATGCCTGAATTGCACCCGCCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334339 60 + 636262 GGCTTGCCCTAGCAAGGTCACTTTGGGTTCTGCCGGTGTATGCCTGAATTGCACCAGCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 325394 60 + 647215 GGCTTGCTCTAGCAAGGTCACTTTGGATCCTGCCAGTGTATGCCTGAATTGCCCCCACCA + +a +s mr.mrrefChr5 181891 52 + 294542 TTTGGGAGGACTCAAGCTTGGAACCCAGCTGGCGTTGCTGCCTGCAGGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334402 21 + 636262 TTTGGGAGGAATTGAGCTTGG------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 325454 52 + 647215 TCTAGGAGGGCTCAAGCTTTGAACCCAGCTGGCGTTGCTGCCTGCAGGCCAC + +a +s mr.mrrefChr5 181943 36 + 294542 CACACCATCAACCTCAACAGATATGTCATCAATGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 325545 36 + 647215 CACACCATCAACCTCAACAGATATGTCATCAATGAT + +a +s mr.mrrefChr5 181979 9 + 294542 CAATATTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 325583 9 + 647215 CAATATTTT + +a +s mr.mrrefChr5 181988 23 + 294542 GAATCCAGCACTCTGAGGCCGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334423 9 + 636262 --------------GGGGCCGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 325593 23 + 647215 GAATCCAGCACTCTGAGGCGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 182011 40 + 294542 TAGAATTAGTCTGGGGATAATTCCATAAAAATCTGCTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334447 35 + 636262 TAGAATTATCCTCGGACTAATTCTATG-----CTGCCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 325616 40 + 647215 TAGAATTAGTCTGAGGATAATTCCATAAAAATCTACTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 182051 25 + 294542 GAAAGAACCCTTAACATAGAATCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334605 25 + 636262 GAAAGAACCCTTAACAAAGACTCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 325656 25 + 647215 GAAAGAACCCTTAACGTAGAATCAC + +a +s mr.mrrefChr5 182076 101 + 294542 ACCTCTTGTTTTTTTTATACCTACCCATTGATTTCTAAGTGTGGATAGCCATAAGTCATCTTTGTTGTTGGATTTGCAGTTTTAGTAGTTGCTTAGTAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334640 100 + 636262 ACCTCTTGTTTTTTTTATACCCACCCATTGATATCTCAGTGTGGATAGCCATAAGTCATCTTTGTTGTTGGATTTGCAGTTTTAGTAGTAGCTT-GTAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 325681 101 + 647215 ACTTCTTGATTTTTTTATATTTACCCATTCCTTTCTAAGGGTGGATAGCTATAAGTCATCTTTGTCGGTGGATTTGCAGTTTTAGTAGTTGCTTAGTAGTC + +a +s mr.mrrefChr5 182177 203 + 294542 TTCTGCTAAACAGAGCTATTATCTCTCACTAAGGTATGTATCACTTCCCCCATTCTGATCATAATAGTGGTTGTGCTGAGATGTGGTCACTTCTCACTGTTCTATACATAGAAGATTGTAGGCATTCTAGGGGCTTGGCCCCATCACTAGTCTTGCAAGGCTAGAACGACACTTATGTGATCCAGTAAAGAGTCATGCATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334741 183 + 636262 ATCTGCTAAACAGGGCTATCCTCTCTCA--------------------CCCATTTTGATCATAATAGTGGTTGTGCTGAGATGTGGTCATTTCTCACTGTTCTATACATAGAAGATTGTAGGCATTCTAGGGGCTTGGCCCCATCACTAGTCCTGCAAGTCTAGAACGACACTTATGTCATCCAGTAAAGAGTTATGCATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 325782 162 + 647215 TTCTGCTAAATAGAGACATTATCTCTCACTAAGGTATGTATCACTTCCCCCATTCTGCTCATAATAGTGGTTGTGCTAAGATGAGGTCACTTCTCACTGTTTTATACATTG-----------------------------------------TTGCAAGGCTAGAAAGAGACTTATATGATCCAGTAAAGAGTCATGCATGCT + +a +s mr.mrrefChr5 182380 66 + 294542 CCCAAAGTGCATAGGTTCATGTGCACTCAGGACACTGCTTTGAACTTTTCATTCTCTCACATATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334924 66 + 636262 CCCAAAATGCATAGGTTCATGTGCATTCTGGACACTGCTTTGAACTTTTCATTCTCTCACATATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 325945 66 + 647215 CCCAAAGTGCTCAGGTTCATGTACACTCAGGACACTGCTTTGAACTTCTCATTCTCACACATACTC + +a +s mr.mrrefChr5 182446 81 + 294542 GCAATGTTAGGTAGCTCCTACCTGCAAAACTGTGCAACAGCACTAGCACTTCACCATGTCACCACTTATGAGTCTGAACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 334990 81 + 636262 GCAATGCTAGGTAGCTCCTACCTGCAAAACTGTGCAACAGCACTAGCACTTCACCATGTCACCACTTATGAGTCTGAACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 326014 81 + 647215 GCAATGTTAATTTGCTCTTACCTGCAAGTCTGTGTAACAGCACTAGCATTTGATCATGTTATCATTTAGAAGTCTCAACTC + +a +s mr.mrrefChr5 182527 139 + 294542 CGCTACTCACTTGTGTGTGTGCTATTGTTCTGGTCAATACTGATTCATGGTGGTAAGAGAGGCAAAGTCAATTAAAAAATAATCTTCAGTGGCAACACAAAAACAAACTTCAGTGACAATCCATTGTATGACAGTGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335071 139 + 636262 CCCTACTCATTTGTGTGTGTGCGTTTGTGTTGGTCAATACAGATTCATGGTGATAAGAGAGGCAAACTCAATTAAAAAATAAACTTTAGTGGCAACACAAAAACAAACTTCAGTGACAGTGCATTGTATGACAGTGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 219561 139 + 647215 CGCTACTCACTTGTGTGTGTGCTATTGTTCTGGTCAATACTGATTCATGCTGGTAAGAGAGGCAAGGTCAATTAAAAGATAATCTTCAGTAGCAACACAAAAACAAACCTCAATGACAATCCATTGTATGAAAGTGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 326095 137 + 647215 CGCTACTCACTTGTGTGTGTGCTATTGTTCTGGTCAATACTGATTCATGGTGGTACGAGAGGCAAAGTCAATTAAAAAATAATCTTCAGTGCCAACACAAAAACAAACTTCAGTGACAATCCAT--TATGACAGTGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 182666 72 + 294542 CACCTGTGCATGAAATGGTCCCCCCCTGTTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATAGGAAAGTTATTACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335211 72 + 636262 TGCATGTGCATGAAATTATCTCCCCCTATTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATATGAAAGTTATTCCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 219700 72 + 647215 CACCTGTGCATGAAATGGTCCCCCCCTGTTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATAGGAAGGTTATTACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 326232 72 + 647215 CACCTGTGCATGAGATGGTCCCCCCCTGTTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATAGGAAAGTTATTACATT + +a +s mr.mrrefChr5 182738 1 + 294542 G +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335283 1 + 636262 G +s simRat_chr6.simRat.chr6 326304 1 + 647215 G + +a +s mr.mrrefChr5 182739 50 + 294542 AAGTAATATCCCACGACCCAAGCACAACTAGTAAGAGTGGCACCTATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335284 50 + 636262 AAGTAATATCCCATGATCCAAGCACAACAAGCAAGAGTGGCACCTATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 193706 50 + 647215 AACAGATATCCCACAACCCAAGCACAACTAGTGAGAGTGGCACCTATCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 326305 50 + 647215 AAGTAATATCCCACGACCCAAGCACAACTAGTTAGGGTGGAACCTATCAT + +a +s mr.mrrefChr5 182789 9 + 294542 CTTAAACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335345 9 + 636262 CTTAAACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 193756 9 + 647215 CTTAAACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 326355 9 + 647215 CTTAAATAG + +a +s mr.mrrefChr5 182798 1 + 294542 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335354 1 + 636262 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 326364 1 + 647215 A + +a +s mr.mrrefChr5 182799 22 + 294542 ATTTTTTATTAGGAAGGTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335355 22 + 636262 ATTTTGTATTAGGAAGGTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 193765 22 + 647215 ATTTTTTATTAGGAAGGTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 326365 22 + 647215 ATTTTTTATTAGGAAGGTGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 182821 259 + 294542 TCATGGACTAACCAATCCCTCTACACCAAGGGACTGCCTTAAGAAGATAGCCCTTGTACCCAGATCATCTAAGAGCCACTAGAAGTAGGGCACAGTATTAACCTTTCCAGGCACGTGGAGGGAATGTGTCATATTGAGATACCTGCTATATTAATTAATGAAGAGGCCGTGTCAGTAGCACATTTGCCTTAATAATATGGGCTTCCAGCCCTGCCCTCAATTCTCTTATGTTCTAGACATATCCATGAGGCTATGTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335377 259 + 636262 TCATGGACTAACCAATCGCTCTACACCAAGGGACTGCCTTAAGAAGATAGCCCTTGTATCCAGATCATCTAAGAGCCACTTGAAGTAGGGCACAGTATTAACCTTTCCAGGTACGTGTAGGTAATGTGCCATATTGAGAAACCTACTATATTAATTGATGAAAAAGCTGTGTCAATAGCACATTTGCCCTAATAAGATGGGCTTCCAGCCCTGGCCTCAATTCTCTTAGGTACTATACATGTCCATGAGGCTATGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 326387 254 + 647215 CCATG----CACCAATCCCTCTACACCAAGGGATTGCCTTAAGAAGACAGCCCTTGTACCTAGATCATCTAAGAGCCACTAGAAGTAGGGTCTAGTATTAACCTTTCCAGGCACACGGAGGGAACGTGTCAT-TTGAGATACCTGCTATATTAATTAATGAAGAGGTCGAGTCAGTAGAACATTTGCCTTAAGAATATGGGCTTCCAGCCCTGCCCTCGATTCTCTTATGTTCTAGATATATCCATGAGGCTATAGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 183080 130 + 294542 AGCTAGGCTATGCCTACGTATCTGATCCCTTTAGAGTCATATCCACCCCCAGCTTCGACACGACTAAGACAGTGGATACCTAAGCTGGGCCTGCTATACAGTGGTCGGTAGCACCTATTTGACATTTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335636 105 + 636262 ------------------------ATCCCTTTGGCGTCATATCCACCCCCAGCCTCGGCACGACTAAGACAGTGGATACCTAAGATGGGCCTGC-ATACAGTGGTCGGTAGCACCTATTTTACATTTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 326725 130 + 647215 AGCTAGGCTATGCCTACGTATCTGATCCCTTTAGAGTCATATACGCCCCCGGCTTGGACGCTGCTAAGACACTGGATACCTAAGCTGGGCCTGCTGTACTGTGGTCAGTAGCACCAATTTGACATTTATA + +a +s mr.mrrefChr5 183210 94 + 294542 TTGAAAGGGATAGCATACATATGGCCATTGCAGGAGAGTGTCTTAGTGCCCATATAGTCTTACACTCACTTGGTGACAGACAGGATGCAGTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335741 92 + 636262 TTGAAAGGGATAGGATACATGTGGCCATTGCAGAAGA--GTCTTAGTGCCCATATAGTCTTACACTCACTTGATGACAGACAGGAGGCAGTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 326900 94 + 647215 TTGAAAGGGATAGCATACATATGGCCAGTGCAGGAGAGTGTCTCAGTGCCCATACAGTCTTAACCCCACTTGGTGACAGATAGGATGCAGCAGA + +a +s mr.mrrefChr5 183304 80 + 294542 ATAAATCATAACCAATAACTAAAAAATTGATGGAGACATCAATCCTGTGGTGTGCAGACTGTGATGACCACATGACACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335833 80 + 636262 ATAAATCATAACCAATAACTAAAAAATTGATGGAGACATCAACCCTGTGGTATGCAGACTGTAATGACCACAGGACACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 326998 80 + 647215 ATAAATCATAACCAATAACTAAAAACTTGATGGAGGCATCAATCCTGTGGTGTGCAGAGTGGGATGACCACATGAGCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 183384 35 + 294542 ATTGTTCGGGGTACACAAAGCATCACAAGGCATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335937 35 + 636262 ATTGTTCGGGGTACACAATGCATCACAAGGCTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 327078 35 + 647215 ATTGTTTGGGGCACACTAAGCATCACAGGGCATGT + +a +s mr.mrrefChr5 183419 62 + 294542 AGGAATTTTGCTGAAGTTATTTCATGTTGCGGGCCTATGGCAATTAGCTTGCTGAAAGCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 335972 62 + 636262 AGGAATTTTGCTGAAGTTATTCCATGTTGCGGGTCTATGGCAATTAGCTTGCTGAAAGCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 327126 62 + 647215 AGAAATTTTGTTGAAGTTATTTCATGTTGCGGACCTGGGGGAATTGGCTTGCTAAATGCTTT + +a +s mr.mrrefChr5 183481 272 + 294542 CAGCAGTTTGGAATTTAGGAGACAATGCAACAAAGACTTGGAGAATAACAGTATCTAAGTGTGCACACCAATCGGGGACATTACACACAGTCAAGAGGCCAGTAAATTCTCTGGTACTTCCACCATCAAAAACATGCTTCACATCAGCTCTCTCTCTGGGTGTAGTGAAGATTCATTGGATAGGTAATAGTCACCATTTAGATCACAGCCTTGTTCCATTGGCATCGGTCATATATTAAGACACAAGATAATAAGATAATCTTTATTCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336034 248 + 636262 CAGGAGTTTGGAATTTAGGAGTCAATGCACCAGAGACTTGGAGAATAACAGTATCTAAGTGTCCACACCAATCAGAGACATTACACACAGTCAAGAGGCCAGTGAATTCTCTGGTACTTCCACCATCAAAAACATGCTTCACATCAGCTCTCTCT------------------------ATAGTTAATAGTTATCATTTAGATCACAGCCTTGTTCCATTAGCATCGGTCATATATTAAGACACAAGATGATAAGATAATCGTTATTCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 327190 271 + 647215 CAGCAGTTTGGAATTTAGGAGACGGTGCAACAAAGTCTTGGAG-ATAAAAATATATAAGTGTGCACATCAATTGGGGACATTTCACATAATCAAGAGGCAGGTAAATTCTCTGGTCCATCCACCAGCAAAATCATGCTTAAAATTAGCTTTCTCTCTGGGTGTAGTGAAGATTCATTGGCTAGGTAATAGTCACCATTTAGGTCTCAGCCTTGTTCCATTGGCATCGGTCATATATTAAGACACAAAAGAATAAAATAATCTTTGTTCAATG + +a +s mr.mrrefChr5 183753 10 + 294542 CAGGCGAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336282 10 + 636262 CAGGCGAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 327466 10 + 647215 CAGTTCAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 183763 122 + 294542 GCTAGACTAATGTGATGAATTTTCCCAACAGTGGGCTAACTTTGTAAATTCTGACTGATCCCACCTATTTAACATTCTACGGATATACGGGTAAGACCTACCCTGAGTTTCAGCTGATGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336292 121 + 636262 GCTAGACTAATGTGATGCA-TTTCCCAACAGTGGGCTAACTTTGTAAACTCTGACTGATTCCACTTCTTTACCATTCTACGGATATACGGCTAAGACCTACCCTGAGTTTCAGCTGATGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 327478 122 + 647215 GTTAGACTAATGCGATGAATTTTCCCAGCACTGGGTTAACTTTGTAAATTCTGATTGACCCCACCCATTTAACATTCTATGGATATATGGGTAAGACCTACTCTGAGTTCCAGCTGATGATG + +a +s mr.mrrefChr5 183885 379 + 294542 GGTCCTTGGTGTCAGCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCGTTTTTGACAGTGCCTAGCTAACCAAAACCTACAATCTGTAAGGTTAGTGAACTAATGGGATCAACCCTCTATCGTGACCAGTCCCGGAGGACATTGGCACTCTTGCTATTGAATATCCTAAGTCAGGCAATAAATTAGATCATTGCTCTGTACCTCGAGTCTCAACTAGGTAGCTAGGTACCACACAGCAATCAATCATAATAGATTGACTTCCCTACTAACTAAATCTAGGAATTCATTTTTAGATCCAATAATATCTATGCTGTTAACTAAAGCATTAAGGGTCTTGGGGGGGTGAGTTTCTAGGGGATGGGTTTTGGAAGTAGCCAATGAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336413 378 + 636262 GGTCCTTGGTGTCAGCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCATTCTTGACAGTGCCTAGCTAGCCAAAACCTACAATCTGTAAGGTTAGTGATCTAATGGGATCAACCCTCTATCGTGACCAGTCTTGGAGGACATTGGCACTCTTGCTATTGAATGTCCTAAGACAGGCAATAAATTAGATCATTGCTCCATACCTCGAGTCTCAACTAGGTACCCAGGTACCACACGGCAAACAATCTTAATAGATTGACTTCCCTACTAACTAGATCTAGGAATTCATATTTAGATCCAATAATCTCTATGCCGTTAACTAAAGCATTAAGGGTC-TGGGGGGGTGAGTTTCTAGGGGATGGGTTTTGGACGTAGCCAATGAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 327601 354 + 647215 CATCCTTGGTGTCTTCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCGTTTTTTACAATGCTTAGCTAAGCAAAGCCTACAATCAGTAAAGTTAGTGAACTAATGGGATGAACCCTCTATAGTGACCAGGCCCGGAA---------------------GCATATCTTAAGTCAGGCAATAAAATG----ACTGCTCTGTATCTCAAGTCTCAACTAGTTAGCTAGGTACCACACAGCAATCAATCATAGTAGATTGACTTCCCTACTAACTAAATCTATGAGGTCATTTTCTGATCCAATAATATCCGCCCTCTGTACTAAAGCATTAAGGGTCTTGGGGGGGTGAGTCTCGTGGGGATGGGTTTTGGAAGTAGACAATGAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 184264 115 + 294542 AGGCAATGAGAAATGACAGTGACCAACATATGGCAAGCCCTGTGGAGACCTATTGTGATAGAGGAACCCTCACATATTGTTTCCATTGCTTGTAGAGGGCAATGGGTAATGGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336829 115 + 636262 AGGCAATGAGGAATGACAGTGACCAACATATGGCAAGCCCTGCACAGACCTATTGTGATAGATGAACCCTCACATATTGCTTCCATTGATTGTAGAGGGCAATGGGTAGTGGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 327955 114 + 647215 AGGCAATGAGATATGACAGTGACCAACATATGGTAGGCCCTGTGGAGACTTTTTGTGATGGAGGAGCCCTC-CATATTGTTTCCATTGCTTGTAGAGGGCAATGGGTAATAGGGA + +a +s mr.mrrefChr5 184379 232 + 294542 AAGTACTTATATAACCACACTCCCCAGACTTACATTTAGGACATAGTTATTAAGCTTATAGCTTTACCAATAACTCCCTCCTAATGAGATGTATGACCTCAATGGCTTGTATTTACCCCTACACCACAGATGTAGTGTCTAATCATACAGGCAAGTTGGGCAAGTGATTGCTAAGATGAGATTTTTAACTAAGAAGGGGAATAGTGGCAGACATAGTGCCCAAATAGCAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 336944 232 + 636262 AAGTACTTATATAACCGCACTCCCCAGACTTACATTTAGGACATAGTTATTAAGCTTATAGCTTTACCAATAACTCCCTCCTAATGAGATGTATGACCTCACTGGCTTGTATTTACCCCTACACCACAGATGTAGTGTCTAATCATACAGGCAAGTTGGGCAAGTGATTGCTAAGATGAGATTTTTAACTAAAAAGGGGAGTAGTGGAAGGCATAGCGCCCAAATAGCAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489949 116 + 636262 AAGTACTTATATAACCACACTCCCCAGACTTACATTTAGGACATAGTTATTAAGCTTATAGCTTTTCCAATAACTCCCTCCTTATGAGATGTATGACCTCAATGGCTTGTATTTAT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 328069 223 + 647215 AAGTCCTTATCTAACCATACTCCAAAGACTTACATTTAGGACATAG---TTAGGCTCATATACTTACCCATGAGTCCCACCTAATGAGATGTATGAACTCAATCGCTTATATTTACCCCTACACCACAGATTTAGCATCTAATAATACAGGCAAGTTGTGCAAGTGATCGCTAGGCTGAGATTGTTAACTATGAAGGGGAATAGTGGCAGACATAGTGCCCAAATA------ + +a +s mr.mrrefChr5 184611 208 + 294542 CACACATACCAGCCAGTGATCTCTCAAGGGTGATAGCATTATTCAAGGCATGGACAGTGCCTTGGTCTCAAATCATACTGCCCCAGTTGTAACCATTATTCTTCTGAGAGGGTCATACCATTGATGGTTTGTCTCTGTTTGCCTATTTATGTCCAGTTATATATATCCATCTATATTCATGTGGTATACTTGAGATTAGACGTTGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337178 208 + 636262 CACACATACCAGCCAGTGATCTCTCAAGGGTGATAGCATTATTCAAGGCATGGACTGTGACTTGGTATTAAATCATACTGCCCCAGTTGTAACCATTATTCTTCTGAGAGGGTCATACCATTGATGGTTTGTCTCTGTTTGCCTATTTATGTCCAGTTATATATAGCCATCTATATTCATGTGGTACATATGCGCTTAGCCGTTGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 328292 191 + 647215 ----CATA-------------TCTAAAGGGTGATAGTGATATTCAAGGCATGGGTACTGCCTTGGTCTCAAATCATACTGCCCCAGTTGTAACCATTATTCTTCTGAGAGGGCCATACCATTGATGGTTTGTCTCTGTTTGCCTATTTATGTCCAGTTATATATATCCATCTATATTCATGTGGTATACTGGAGATCAGATGTTGCCT + +a +s mr.mrrefChr5 184819 77 + 294542 GTTGTACCGTGTGACTATTAAGAGTGAGGTGACTCATAGAGAACATAAAGAATTCATAAGGTCACTTTATAATGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337386 77 + 636262 GTTGTACCGTGTGACTATTAAATGTGAGGTGATTCCTAGAGAACCTAAAGAATTCATAAGGTCACTTTGCAATGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 328492 77 + 647215 GTTATATCATGGGACTATTAAGAGTGAGGTGACTCATAGAGAACATCTAGCTTTCATAAGGTCACTTTATAATGATA + +a +s mr.mrrefChr5 184896 13 + 294542 CTCACATTATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337463 13 + 636262 CTCACATTATTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 328572 13 + 647215 CTCACCTTGTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 184909 73 + 294542 TTTGCCAAGCTAGTACCTGCTCATTTGCAAACCAAGAAATCCCAGCATAAATATTTAATGATGTTTAGATTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337476 73 + 636262 TGTGCCAATCTAGTACCAGCTCATTTGCAAACCAAAAAATCTCAGCATAAATATTTAATGATGTTTAGATTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 328586 73 + 647215 TTTGCCCAGATAGTGCCTGCTCATTTCCAAACCAAGAAATCCCAGCATAAATACTTAATATTGTTTGGATTTC + +a +s mr.mrrefChr5 184982 135 + 294542 GCACAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAACACAAACGTGGCCAAGTATATGCAGTAAATGATTGGCTGTGAGCCTGCCCCACATGGCCAAGTACATACAGTTAGTACATGGCTATGAGTAATATCAAGCCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337550 135 + 636262 GCACAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAACACAAACGTGGCCAAGTATATGCAGTAAATGATTGGCTGTGAGCCTGCCCCACATGGCCAAGTACATACAGTTAGTACATGGCTATGAGTAATATCAAGCCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 328659 135 + 647215 ACTCAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAATGCAAACGTGGCCATGTACGAACAGTTAATGATTGTCTTTGAGCCTGCCCTGCGCAGCTGCATACATACAGTTAATGCTTGACTATATGTAATAACAAGCCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 185117 8 + 294542 TACTGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337685 8 + 636262 TACTGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 328795 8 + 647215 TACTGCAG + +a +s mr.mrrefChr5 185125 35 + 294542 ACACTAGACATTGCATGGAATGTACACCTGTAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337693 35 + 636262 ACACTAGACATTGCATGGAATGTACACCTGCAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 328804 35 + 647215 ACACTAGATATTGCATGGAATGTACATCTGTAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 185160 28 + 294542 GCAGACTTCAGATTCATCATCAATATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337728 28 + 636262 GCAGACTTCCGATTCATCATCAATATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 328863 28 + 647215 ACGGACTTCAACTTCATCATTAATATAT + +a +s mr.mrrefChr5 185188 213 + 294542 AGATTTAAGGCTAGCGTGGGGGTGGGGAGAGGATGAGAGGGAGGACAATATTAGAAAATAAGTGTTCATCCTGGTATGCTTGCAGATATACGACATCCAGACAATGAGGTGAGCTTACTGTTCAGAGGATCACTCAATTGACTTTCCTAGACCAAAAGGCTTGTACAAAATCATTGAATCAACAACTTGTTTTTCCATCTCAATAAATTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337756 213 + 636262 AGATTTAAGGCTAGCGTGGAGGTGGGGAGAGTATGAGAGGGAGGACAACATTAGAAAACAAGCGTTCATGCTGGTATGCTTGCAGACATACGACATCCAGACAATGAGGTGAGCTTACAGTTCAGAGGATCACTCAATTGACTTTCCTAGACCAAAAGGCTTGTACAAAATCATTGAATCAACAACTTGTTTTTCCATCTCAATAAATTGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 328892 189 + 647215 GGATTCAAGGCTAGCATGGGGGTGGGGAGAGGATTAGAAGGAGAAAAATATTAGAAAATAAGTATTCATCCTGGTATGCTTGCAGATATATCACATCCAGACAATGATGAGAGTTTACTGTTCAG------------------------GACCAAAAGGCTTGCACAAAATCATTGAATCAATAACTTGTTCTTCCATCTCAATTAATTGACA + +a +s mr.mrrefChr5 185401 70 + 294542 TTCAACCAAAGGGGGCCAGATTTAGGTTTCAAAGAGAAAAGAAAAACTGTCTAGAACAAGATAACATCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 337969 70 + 636262 TTCAACCAAAGGGGACCAGATTTAGGCTTCAAAGAGAAAAGAAAAACTGTCTAGAACAAGATAACATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 329082 70 + 647215 TTCAATCTAAGGGGGGCAGATTTAGGTTTCAAAGAGAAAAGAAAAACTGTCTAGAACAATATAACATCCG + +a +s mr.mrrefChr5 185471 59 + 294542 GCCACAAATTGATTTGGTGCATGGAGAAGCATGGGGGGACCAAATAGTAggtccaataa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338039 59 + 636262 GCCACTAATTGATTTGGTGCATGGAGAAGCATGGGGGGACCAAATAGTAGGTCCAATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 329198 59 + 647215 GCCACAAATTGATTTGGTGCATGGAGAAGCATGGGGGGACCAGATAGTAggttcaatga + +a +s mr.mrrefChr5 185530 75 + 294542 tggaagaaactgtgtcccagcatggcagggtttatgatccaccctaagaaggaaaccttgatagaggtggtggac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338098 75 + 636262 tggaagaaactgtgtcccagcatggcagggtttatgatccaccctaagaaggaaaccttgatagaggtggtggac +s simRat_chr6.simRat.chr6 329265 75 + 647215 tggaagaaactgtgtcccagcatggcagggtttatgatccagcctaagaaggaaaccttaatagagctggtggac + +a +s mr.mrrefChr5 185605 58 + 294542 tctaagaaatcagaggagagggctttcatggattggattcaggccaggttcaaggaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338173 58 + 636262 tctaagaaatcagaggagagggctttcatggattggattcaggccaggttcaaggaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 329344 58 + 647215 tcaaactaatcataggagagggctctcagggattgaattcaggccaggttcaagcaat + +a +s mr.mrrefChr5 185663 97 + 294542 aattgacacaacacttaacactttaatgcaagtatttatgagtattggcttagaccgtgcaatcatcttcctcctgacgatgatggataatggatca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338231 97 + 636262 aattgacacaacacttaacactttaatgcaagtatttatgagtattggcttagaccgtgcaatcatcttcctcctgacgatgatggataatggatca +s simRat_chr6.simRat.chr6 329403 97 + 647215 aatggatacaacacttaacattttagtgcaggtattggtgagtattggcttagatcgtacatctatcttccttccgatgatgatggatgatggattg + +a +s mr.mrrefChr5 185760 100 + 294542 ccttcagtaccgagcaagtggttgcaatgaatgtgactgggtatttgtaggggcattatgatgtttgatgtacttaacttgcccaggcctgcccacttcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338328 100 + 636262 ccttcagtaccgagcaagtggttgcaatgaatgtgactgggtatttgtaggggcattatgatgtttgatgtacttaacttgcccaggcctgcccacttcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 329501 100 + 647215 ccttcagtactgagcaagtggttgtgatgaatatgatggtgcatttgtaggggtgtaacgatgttcaatgtacttaattcgtccaggcctgcccattttc + +a +s mr.mrrefChr5 185860 141 + 294542 acttttcagaagtttacctgccttttgtgagatggatcataccatgattagtttagtctgattgacccctattgatgaagtgctctatggaaatatcttaagagaaatgaatacataagaaaaatcaccaagtattgtctg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338429 141 + 636262 acttttcagaagtttacctgccttttgtgagatggatcataccatgattagtttagtctgattgacccctattgatgaagtgctctatggaaatatcttaagagaaatgaatacataagaaaaatcaccaagtattgtctg +s simRat_chr6.simRat.chr6 329601 141 + 647215 actattcaggattttccctgctttttgtcagatggatcaaaccatggttagtgtagtctgattgaaactaattgatgaagtgccctatgaaactatcttgagagaaatgaaaactttaggaagatcaccaagtgttgtttg + +a +s mr.mrrefChr5 186001 35 + 294542 aggcccgcatcagcccaactagctgtgcagggact +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338570 35 + 636262 aggcccgcatcagcccaactagctgtgcagggact +s simRat_chr6.simRat.chr6 329743 35 + 647215 aggcccctgtcagcccagctacctctgcggggatt + +a +s mr.mrrefChr5 186036 54 + 294542 tcactggttgctgccagtacacctggtgcaagctccattcctactcctctccta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338605 54 + 636262 tcactggttgctgccagtacacctggtgcaagctccattcctactcctctccta +s simRat_chr6.simRat.chr6 329787 54 + 647215 tcacctgctgttgcccgtacacctgatacaagctccattccaactcctcttcaa + +a +s mr.mrrefChr5 186090 151 + 294542 tgctaagttgtcaagatgagtcatggcatactcccctcttatgtactctgctaaacgccctgatggtggagtgccatgatgatccactagtgcctgactaccagtaagtactaatcttatccctctgatgtaTTTCTGGTGATCCAGTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338659 151 + 636262 tgctaagttgtcaagatgagtcatggcatactcccctcttatgtactctgctaaacgccctgatggtggagtgccatgatgatccactagtgcctgactaccagtaagtactaatcttatccctctgatgtaTTTCTGGTGATCCAGTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 329848 151 + 647215 tactaagttgtcaagatgagatatgacttgctcccctcttatgtagtctgctgaatcccctgatggaggactgctaggatgattcactaccacctgattaccagtaagtacTAATCTTATCCCTATGATTGATGTCTGCGGAACCAGTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 186241 52 + 294542 TGATTAACAGTTGGTATCCATCTGCGTCGTCTTGTGTCTTTGTCTCAGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338810 52 + 636262 TGATTAACAGTTGGTATCCATCTGCGTCGTCTTGTGTCTTTGTCTCAGGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 330002 52 + 647215 TGATTAACAGTTGGTATCCATCTTCGTTGTCTTCTGTTGGTGTCTCAGGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 186293 29 + 294542 CACTAAAGCACACCCAACCATACTAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338862 29 + 636262 CACTAAAGCACACCCAACCATACTAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 330055 29 + 647215 TACTAAAGCACACCCAACCAGACCATCAG + +a +s mr.mrrefChr5 186322 8 + 294542 ATGCTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338891 8 + 636262 ATGCTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 330085 8 + 647215 ATGCTAGT + +a +s mr.mrrefChr5 186330 14 + 294542 AGTTGGAAATTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338899 14 + 636262 AGTTGGAAATTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 330141 14 + 647215 AGTTGAAAATTAGC + +a +s mr.mrrefChr5 186344 34 + 294542 ACCATTTTCTTATCTCAGTAGCATATTTTACTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338917 34 + 636262 ACCATTTTCTTATCTCAGTAGCATATTTTACTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 330155 34 + 647215 ACCATTCTCTTCTCTAAGTAGCATATTGTACTAC + +a +s mr.mrrefChr5 186378 5 + 294542 AGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338952 5 + 636262 AGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 330189 5 + 647215 AGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 186383 209 + 294542 GCATCTGCGAGGTTCTGAAAGTGTCATCttcttatgttgaacctagaagcatacaaagttgtttcccagtcccacacctgcacaatatctacacacctgatcgctctttctcagtatttaatgactgtgttggagggtgcTTGGTACACCAGTAAGTACATCGCTGTCTTATCTGCACTTGATTTACGGTATGCTCAGGTGGAATGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 338957 209 + 636262 GCATCTGCGAGGTTCTGAAAGTGTCATCTTCTTATGTTgaacctagaagcatacaaagttgtttcccagtcccacacctgcacaatatctacacacctgatcgctctttctcagtatttaatgactgtgttggagggtgcTTGGTACACCAGTAAGTACATCGCTGTCTTATCTGCACTTGATTTACGGTATGCTCAGGTGGAATGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 330195 209 + 647215 GAATCTGTTTTGTGTTGAAAGTGCCATCttcttgtcttgagccttgaagcatacaatgttgtttaccagtcccacatctgcacagtatctacacacatgattggtctttctcagtttttaatgactgtgttagagggTTCTTTGTGCACCAGTAAGTGCATCACTGTCTTATCTGCACTTGATTTAGGGTATGCTCAGGTAGAATGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 186592 37 + 294542 GAATTAAGTTAGACTTGCTCTGAGACTTGCTATGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339171 37 + 636262 GAATTAAGTTAGACTTGCTCTGAGACTTGCTATGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 330404 37 + 647215 GAATCATGTTAGACTTGCTATGAGATTGGCTATGAGA + +a +s mr.mrrefChr5 186629 447 + 294542 CCTGTCAGGCCTGATCTTGTTTCTTTTAACAACATCTGGTATGCAGGCCTGTCTGTAAACTTAAATTAAAAATGGTTAGACTTACTTTTTTTTATCACTGTCATACTTGATTGACCTAGTGGTGATGGAGGTGCCACTAAGGAGCAGTGAAACAATTGCTACAAATTAAACTATAGCTCTGTTATCCTAGGTATGACTGGGAGACTAAATCATGTGCTGCAAATTAATAGTCTACAAAATAAAAAAGCTTTGCAAGCACCGTCAACAAACTTTTTGGCTAAGGAGATGAGTATTAACAAAAAATTGTGAACTTGGAAGATGGGCCTACATATTTGCTGTGGTACCATCTGCTTCTTGAACCGAGGTGACCAGCCTGCAAAAGTCCACCCTGGTCTACTTGCCCATTTCATTGCATTTGCCTGTGAAGTTTACTTGGCCACGAGCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339208 430 + 636262 CCTGTCAGGCCTGATCTAGTTTCTTTTAACAATATCTGGTATGCA----------TAAACTTAAATTAAAAATGGTTAGACTTACTTTTTTTTATCACTGTCATACTTGATTGACCTAGTGGTGATGGAGGTGCCACTAAGGAGCAGTGAAACAATTGCTACAAATTAAACTATAGCTCTGTTATACTAGGTATGACTGGGACACTAAATCATGTGCTGCAAATTAATAATCTAGAAAATAAAAAAGCTCTGCAAGCACCGTCAACAGACTTTTTGGTTAAGGAGATGATTATTAACAAAAAATTGTGACCTCGGAAGATGGGCCTACATATTTGCAG-------ATCTGCTTCTTGAGCCCAGGTGACCAGCCTGCAGAGGTCCACCCCGGTCTACTTGCCCATTTCATTGCATTTGCCTGTGAATTTTACTTAGCTACGAGCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 330472 443 + 647215 TTTGTCAGGCCTGATATTGTTTCTTTTAACAACATTGGATATGCAGGCCTGTCTGTAAACTTAAATTAAAAATGGTTAGACTTACTTTTTTGTAGCACTGTCATGTTTGACTGACCTAGTGGCGATGGAGGTGCCACTAAGGAGTAGTG-AACAACTGCTACAAGTTAAACTATAGCTTTGTTATCCTGGGTATAACTGGGTGACTAAATCATGTGCCGCAGGGTACTAGTTTACAAAATAAAAAAGCTTTGCAAGCACCATCAACAAACTATTTGACTAATGAGATGAGTAC---CGAAAAGGGGTGAACTTAGAAGATGGGCCTACATATTTGCTGTGGTACCATCTGCTTCTTGAACCGAGGTGACTAGGCTGCAAAAGACTACCCTGGTCTACTTGCCCATTTCATTGTATTTGCCTGCCGAGTCTACTTGACCATGAGCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 187076 49 + 294542 CCCGCTTGATGAGATGTCAAGCAATCTCCCCGTGTACATTGTAGATCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339638 49 + 636262 CCCGCTTGATGAGATGTCAAGCAATCTCCCCGTGTACATTGTAGATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 330916 49 + 647215 CCTGCTTGGTGAGATGTCAGGTGCTCTCCCCACGTACATTGTAGATCCC + +a +s mr.mrrefChr5 187125 52 + 294542 TGTCCGATTTATGCACTATCAAGCGATGACAGGCCCTCTTGTACATTGAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339687 52 + 636262 TGTCCGATTTATGCACTATCAAGCGATGACAGGCCCTCTTGTACATTGAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 330966 52 + 647215 TACCCAATTCACGCACTATCAAGCAATGACAAGCCCTCACATACATTGCAGA + +a +s mr.mrrefChr5 187177 45 + 294542 CCCCTGTCTGATTCACGGACTGTCAAGCGATGTTGTATTCAACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339740 45 + 636262 CCCCTGTCTGATTCACGGACTGTCAAGCGATGTTGTATTCAACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 331018 45 + 647215 TCCCTGTCTGATTCATGCGCTGGCAAGTGATGTTGTATTGAACAT + +a +s mr.mrrefChr5 187222 81 + 294542 GCCCTTGGTCTACTTGCGCCTTCTGTTGTATTTAACATCTACTCTTTAACAAGTTAGGGTGAGCACACAGTTGTAACTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339839 81 + 636262 GCCCTTGGTCTACTTGCGCCTTCTGTTGTATTTAACATCTACTCTTTAATAAGTTAGGGTGAGCACACAGTTGTTACTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 331063 81 + 647215 GCCCTTGGTCTACTTGCACCTTCTGTTCTATTTAACATCTACTCTGTAGCAAGTTAGGGTGAGCACACATTTGTACCTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 187303 22 + 294542 AGCAGCTCATCTAGATCCTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339922 22 + 636262 AGCATCTCATTAAGATCCTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 331144 22 + 647215 AGCAGCCCATCTAGATCCTCTG + +a +s mr.mrrefChr5 187325 14 + 294542 AAGAAATTTATAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339945 14 + 636262 AAGAAATTTATAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 331166 14 + 647215 AAGAAATTTATAAA + +a +s mr.mrrefChr5 187339 64 + 294542 TAGAATGTTATGGTGTGCATCAATTTGAAAGCATAATTTCTAATTTCATACAAGGAAGATATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 339961 64 + 636262 TAGAATGTTATGGTGCACATCATTTTGAAAGCATAATTTCTAATTTCATACAAGGAAGATATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 331180 64 + 647215 TAGAATATTAAGGTGTGCATCAATTTGAAAGCATGATTTCTAATCTCATACAAAGAAGATATGA + +a +s mr.mrrefChr5 187403 56 + 294542 TTTTATTTAAAGACCAGTGTCCTAATTGGAAGTTAATGGAGTTTGAGACAAATTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 331252 56 + 647215 TTTTATTTAAAGACCAGTGTCCTAATTGGAAGTTAATGGAGTTTGAGACAAATTAC + +a +s mr.mrrefChr5 187459 94 + 294542 AAGCAGGGTGTTGTGCCATAGGCTGTGTATTCAAATCAATTCTACTGTTGTTGGCCAATAGAATGATCCACACCAGGGCTAAGTATGTGTGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 331311 94 + 647215 AAGCAGGGTGTTGTGCCATAGGCTGTGTATTCAAATCAATTCTACTGTTGTTGGCCAATAGAATGATCCACACCAGGGCTAAGTATGTGTGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 187553 16 + 294542 GTCCAATCAGCAATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 331629 16 + 647215 GTCCAATCAGCAATTC + +a +s mr.mrrefChr5 187569 55 + 294542 AATCGAAGGCGTAAGACCACTAGCTTATTTAAGAATAGATACAATAGGGAATGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 331646 55 + 647215 AATCGAAGGCGTAAGACCACTAGCTTATTTAAGAATAGATACAATAGGGAATGAG + +a +s mr.mrrefChr5 187624 116 + 294542 TAAAGTATTTTAGACTCTGTTGGATTGGATGATTACTTAATTCAGGCTGTTGACCACACTAACTAAAGCTCTCATTGGTGTTCAACCAGGTAAGTATATTAATGCTGGATTGATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340025 73 + 636262 -------------------------------------------AGGTAGTTGACCACACTAACTAAAAGTCTCATTGGTGTTCAACCAGGTAAGTATATTAGTGCTGGATTGGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 331703 116 + 647215 TAAAGTATTTTAGACTCTGTTGGATTGGATGATTACTTAATTCAGACTGTTGACCACACTGACCAAAGCTCTCATTGGTGTTCAACTAGGTAAGGATATTCATGCAGGATTGAATG + +a +s mr.mrrefChr5 187740 175 + 294542 CACAGTTCTATTTTCTGTGTTAAGACAGACAAGAGTGATTGCCTTGGAGCTGTGTGGTACATGGTACAAGTCAGCCCTTCCAAAAAGCAGGCAGCCTGTTCAACAACAGGAGTTCTTATGTCACAAGAGAAGTACAGATGGGTAGCTGTTATTGGGATTTGGATATGTTGCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340099 175 + 636262 CACAGTTATATTTTCTGTGTTAAGACAGACAGGAGTGATTGCCTTGGAGCTGTGTGGTACATGGGACAAGTCAGCCCTTCCACAAAGCAGGCAGTCTGTTCAACAACAGGAGTTCTTATGTCACAAGAGAAGTACAGATGGGTAGCTGTTATTGGGATTTGGATATGTTGCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 331819 127 + 647215 CACAGTTCT--TTTTGGCGTTAAGACAGGCAAGAGTGATTGCTTTGAAGCTGTGTGGTACATGGTACAAGTCAGCCCTTAGAAAAAACAGGCAGCCTGGTCAACAACAGGAGTTCTTATGTCACGAGGG---------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 187915 144 + 294542 AACTGTTCATGAAAGTTATGGTCCAGGGTAGTGAAATAGTCTGTGGACCATTTTACTATATAATCCTCTCTGAACACTTTATACTTCCAGGGTATTGGAAGCTAGTGATGGCACCTCATCAGGACACAGACTTGTCACGTTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340275 127 + 636262 AACTGTTCATGAAAGTTATGGTCAAGGGTAATGAAATAGTCTGTGGACCATTTTACTATATAAT-----------------TACTTCCAGGGTATTGGAAGCTAGTGATGGCACCTCATCAGGACAAAGACTTGTCACGTTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 331946 131 + 647215 ----GTTCATGCAAGT------CCAGGATAGTGAAATAGTCGGTGGACCATTCCACTATATAATCCTCTCTGAACACTTTATACTTCCAGGGTATTGGAAACTAGTGATGGCACCTCATCAGAACACA---TTGTCATGTTAAC + +a +s mr.mrrefChr5 188059 81 + 294542 TACAGTCTGTCCCATGCCCACTATCAGTCCATATAAAACATCTTGAAATCAGAAAAAATGAGCTCTAGTAACTCAAGACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340408 81 + 636262 TACAGTCTGTCCCATGCCCACTATAAGTCCATATAAAACATTTTGAAATCAGAAAAAATGAGCTCTAGTAACTCAAGACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 332077 78 + 647215 CAAAGTCTGTCTTATGTCCTCTATCATTCCATAACAAATATCTTGGAATCGGAAAAAACAAGCTCTGGTAAC---AAGCTG + +a +s mr.mrrefChr5 188140 107 + 294542 TAGAATAATTGGAGAAAATAAGTGCACTGTGCAAACAAATATCAATGTGTATGGTCTCAAAGGTGGGCCCTAGAAAAGTCCATGGATCATCATAGAGCTAATGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340549 107 + 636262 TAGAGTAATTGATGAAAATAAGTGCACTGTGCAGACAAATATCAATGTGTATGATCTCAAAGGTGGGCCCTAGAACAGTCCATGGATCATCATAGAGCTAATGGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 332155 103 + 647215 TAGAATAATTGGAGAGAGTAAGTGCACTGTGCAAACC----TCGATGTGTATGGTCTAAAAGGTGGGCCCTAGAAAAGTCCATGGACCATCTTAGATCTAATGGATG + +a +s mr.mrrefChr5 188247 74 + 294542 TAACTATCCTACATAGGAACTTGATTGTGGATCATGTGCCTATAGCCCATTACCAATTCAAATGTATGTAGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340656 73 + 636262 TAACTATCCTA-ATAGGAACTTGATTGTGGATCATGTGCCTATAGCCCATTACCAATTCAAATGTATGTAGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 332262 74 + 647215 TAACTATCCTACACAGGAACTTGCTTGTGGACCATGTGCCTATAGCCCATTACCAGTTTAAATGTATGTAGGTC + +a +s mr.mrrefChr5 188321 169 + 294542 TTGTCTAGGAGCAGCTCTTATTATATGAGTGCAGGGGATCAATGGCTACAGTTGGGAGTCAACAATCATTTACATGTTCTATATAATCATGGCATCTCTGTTCAGTAAATTTCTAGGTAGGTACTGTTTTTGTCTTTTGGATCCAAAGATGGAATAACAAGCAAGGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340745 164 + 636262 TTGTCTAGGAACAGCTCTTATTATATGAGTGCAGGGGATCAATGGCTACAGTTGGGAGTCAACAAT-----ACACGTTCTAGATAATCAAGGCATCTCTGTTCAGTAAATTTCTAGGTAGGCAGTGTTTTTGTCTCTTGGATGCAAAGATGAAATAACAAGCAAGGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 332336 168 + 647215 TTGTTTAGAAGCAGCTCTTATAATATGAAAGCAGGGGATCAATG-CTATAGCTGGGAACCAACAATCATTTACATGTTTTATATAATCATGGCATCTCTGTTCAGTAATTTTCTAGGTAGGTACTGTCTTTGTCTTTTGGATCCAAAGATGGAATAATAAGCAAGAGCA + +a +s mr.mrrefChr5 188490 145 + 294542 GGTTATTGGAACTAACTTCACTAGATATATAAAAGGAAAACAATAATTGGTTGGAAGGTGAAAGACTGAAAAGGCGGTCTACCACCTCTACTAATAGTCGTGGTGGGAAAAGACTGAGAAGGCTGCACACTGCTCTACTAGCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 340909 145 + 636262 GGTTATTGGAACTAACTTCACTAGATATATACAAGGAAATCAATAATTGGTTGGAAGGTGAAAGATTGAAAAGGTGGTCTACCACCTCTACTTATAGTCGTGGTGGGAAAAGACTGAGAAGGCTGCACACTGCTCTACTAGCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 332505 145 + 647215 GGTTATTGGAACTACCTTCACTGGATATAGGAAAGGAAAACAATAATAGTCTTGAAGGTGAAAAACTGGGAAGGCAGTCTACCACCTCTACTAATAGTCTTGGTGGTCAAAGATTGAGAAGGCTGCACAATGCTCTACGAGCTTA + +a +s mr.mrrefChr5 188635 106 + 294542 CCTCTGTAATTCTGCTAAATTTCCACAAAAAGACAAGACAAGAGAAGGCAAGACCTTTATAGCAATAAGAGAAGACAATGATGGAAAGTAGCTTGAATCCGTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341054 105 + 636262 CCTCTGTAATTCTGCTAACTTTCCACAAAAAGACAAGACAAGAGAAGGCAAGACCTTTATAGCAATAAGAGAAGACAATGATGGTAAGTAGCTTGAATCTGTCAG- +s simRat_chr6.simRat.chr6 332652 106 + 647215 CCTCTGTAATTTCGCTAAATGTCCACAAAAAGACAAGTCAAGAGACGGCAAAACCTTTATAGCAATAAGAGAAGACAATGATGGAAAGTAAATCGAATCCATCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 188741 91 + 294542 TACAGGGATAAAAGGACCCACTCGTGCTCTCTTAAAAATGTGGGACAACTTTGGTTAACCAATCTGATAATGTAGCCTTGGGCGTATGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341159 91 + 636262 TACAGGGATAAAAGGACCCACTCGTGCTCTCTTAAAAATGTGGGACAACTTTGGTTAACCAATCTGATAATGTAGCCTTGGGCGTATGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 332763 91 + 647215 CGCAGGGATAAAGGGACCCACTCCTGATATGTTATAAATGTGTGATAACTGTGGTTAATCAGTGTGATATTGTAGCCTTGGGTGTATGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 188832 192 + 294542 AATTGGAACAAAGCATTCATGTTGTTTAGGTGTTGATTTCAACAGAAGATTGTGCACTCTGGGCATTAAAAAAGGCAGTAAGTTAAGCTGGCACATCGGTAAGTTCAAAGTTTGCCACCTTTCCCAATGCAAGATGCAGAGCATCTGAGCCTACCCCCTTCTCTATGTATAATTGTCATGTGGGAGTTAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341251 192 + 636262 AATTGGAACAAAGCATTCATGTTGTTTAGGTGTTGATTTCAACAGAAGATTGTGCACTCTGGGCATTAAAAAAGGCAGTAAGTTAAGCTGGCACATCGGTAAGTTCAAAGTTTGCCACCTTTCCCAATGCAAGATGCAGAGCATCTGAGCCTACCCCCTTCTCTATGTATAATTGTCATGTGGGAGTTAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 332854 192 + 647215 AATTGCAACTAAGCATTTATTTTGTTTAGGTGTTGATATCCACACAAGCCTGTCCACTCCAGTCATTAAAAAAGGCAGTAATTTGAGCTGGCACATCGATAAGTTCAAAATTAGCCATCTTGCACTATGCAAGATGCATAACATCTCAACCTATCCCCTTACCTATGTACAATTGTGGTGTGGGGGTCAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 189024 30 + 294542 CAAAGTTGTTACTCATATTTTCAGACACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341444 30 + 636262 CAAAGTTGTTACTCATATTTTCAGACACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 333046 30 + 647215 CAAAGTTGTTGCTCATATTTTCAGACACAA + +a +s mr.mrrefChr5 189054 266 + 294542 GCCTGGAGTCCTCAATAACCATGGCATAAACAGCAGCTGGAAGGAGGCCTTAGCCCCATTGTGCAGTGAACTGGAGGGGCAAATTGGACTTCAGTGAACAAGCTGGGGGGGGCTTGGCCACCTCTAAGGACCCATCACAAATAGCCACTTGGGGACCGCCTGAATTCCACCCATCACTACTCAATGTCTGCACCGAACAAATTTCTCCAGTTCAGTATGTTTATTTCTCCTTCTATGATTCAACTGTGCGTGTAGTTTGATTGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341479 266 + 636262 GCCTGGAGTCCTCAATAACCATGGCATAAACAGCAGCTGGAAGGAGGCCTTAGCCCCATTGTGCAGTGAACTGGAGGGGCAAATTGGACTTCAGTGAACAAGCTGGGGGGGGCTTGGCCACCTCTAAGGACCCATCACAAATAGCCACTTGGGGACCGCCTGAATTCCACCCATCACTACTCAATGTCTGCACCGAACAAATTTCTCCAGTTCAGTATGTTTATTTCTCCTTCTATGATTCAACTGTGCGTGTAGTTTGATTGTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 333076 266 + 647215 GTATGGAGTCCTCTATATCCGTGGCATGAGCCGCAGCTGCAAGGAATCCCTAGCCCCATTGTTCAGCTAACTGGAGTAGCAAATTGGATTTCAGTGAACAAGCTGGGGGGAGCTAGGCTGCCTCTAAGAACACATTGTTAATGACCACTAGGTACCACCCTGAATTGCATCCATTACTATTCAATGTCTGTACCACACCAATTTCTCCAGTTCAGTATGTTTATTTCTATTTGCATGATTCCACTGTGCATGTAGTTTGATGGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 189320 52 + 294542 TTCCTGTCGAGGTGGACCCTACATATAAGACTTGGACTCACCTAGGGTCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341746 52 + 636262 TTCCTGTCGAGGTGGACCCTACATATAAGACTTGGACTCACCTAGGGTCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 333342 52 + 647215 TTCCTGTAGTTGAGGACCCTATAAATAAGACCTGGACCCACCCAGGGTCTTT + +a +s mr.mrrefChr5 189372 109 + 294542 ATTGCCCTGTTATATGGACTGTCTGTTTTAAAGTGGATGGTTATGACCAGGGATCTTACTAGACACTCAGGTAAGAATTATATGAGAATAAATTGTGGCATTGCTGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341798 109 + 636262 ATTGCCCTGTTATATGGACTGTCTGTTTTAAAGTGGATGGTTATGACCAGGGATCTTACTAGACACTCAGGTAAGAATTATATGAGAATAAATTGTGGCATTGCTGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 333395 109 + 647215 ATTTCCCCGTTATATGGAATGTCTGTTTTAAAGTGGATGATTATGACCAGGGATCGTAATAGACACTCAAGTAAGAATTATATGAGAATCAATTGTGGTGTTGCTGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 189481 58 + 294542 CTGCCTATGCCATTTTTGACAGATATAGCTACAACTGTTTTAACAGGCTAGGGAGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341907 58 + 636262 CTGCCTATGCCATTTTTGACAGATATAGCTACAACTGTTTTAACAGGCTAGGGAGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 333525 58 + 647215 CTCCAAATGCCATTTTTGAAAGATATAGCTCCAACTGTTTTAACAGGCAAGGGAGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 189539 55 + 294542 CAGAATTATGCAGAAAGAATTATTGGTTTGCCAGGTGCAGAAAATTGATAACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 341965 55 + 636262 CAGAATTATGCAGAAAGGATTATTGGTTTGCCAGGTGCAGAAAATTGATAACATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 333584 55 + 647215 GAGCATTATGCAGAAAGAATTGTTGGTTTGCCAGGTGCAGAAAATTGATAACATA + +a +s mr.mrrefChr5 189594 124 + 294542 TTGAATAGTATGGTCCAGAGGCAGATAGTGATTCATAACCTTCATGCCTGCCTTTCTCAGCATCCCCAATCTCCCACACCACACAAGGTATATAATACTTGTAAACACTTCTCTGGGTTGTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342020 124 + 636262 TTGAATAGTATCGTCCAGAGGCAGATAGTGATCCATAACCTTCATGCCTGCCTTTCTCAGGGTCCCCAATGCCCCACACCACACAAGGTATATAATACTAGTAAACACTTCTCTGAGTTGTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 333640 119 + 647215 TTAAATAATATGGTCC-----CACATAGTGATTCATTACCTTCATGCCTGCCTTTCCCAGCACTCCCAATCTCACACACCACACAAAGTATATAATGCTTGTAACCACTTCTCTGGGGTGTCTT + +a +s mr.mrrefChr5 189718 43 + 294542 TCAAGGCACAACAGGTAAGTATGAGTGACCAACTTTGCTGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342144 43 + 636262 TCAAGGCACAACAGGTAAGTATGAGTGACCAACTTTGCTGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 333764 43 + 647215 TCAAGGCATAACAGATAAGTATGAGTGACCAACTTTGCTGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 189761 18 + 294542 TTCTTTGTTTTACAGTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342187 18 + 636262 TTCTTTGTTTTACAGTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 333815 18 + 647215 TTCATGGTTTTACAGTCC + +a +s mr.mrrefChr5 189779 66 + 294542 AGTTGTTAAAGGTGGTCTATGATTGTCCAACCCCCAAAATAACAATATAAGGTAACCCCCAAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342220 66 + 636262 AGTTATTAAAGCTGGTCTATGATTGTCCAACCTCCAAAATAACAATATAAGGTAACCCCCAAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 333833 66 + 647215 AGTTGTTAAAAGTGGTCTATGTCTATCCAACCCCCAAAATAACACTAATAGGTAACCCCCAAAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 189845 24 + 294542 GTCAGTGACAAAACATTCACCTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342297 24 + 636262 GTCAGTGACAAAACATTCTCCTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 333899 24 + 647215 GTCACTGACAAGACATTCACTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 189869 38 + 294542 ACTTGGAGTAGTAGTGCTTTACTTCCACTGTGAGTGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342321 38 + 636262 ACTTGGACTAGTAGTGCTTTACTTCCACTGTGAGTGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 333924 38 + 647215 GCTTGGAGTAGTCATGCTTTACTTTCACTGTGAATGAC + +a +s mr.mrrefChr5 189907 144 + 294542 TAATGAAGCCCCCCCATGGCATATTAACAACCAGGAAGTGTCATGTACAATATAATCCCTGCAATCTACTGAGGTGTGAGTCTAATGTTGAAGGATCTCTTCATAAAGATAACTTTTACACTGTAAATTGTCTCTATTAAAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342359 144 + 636262 TAATGAAGCCACCCCATGGCATATTGACAACCAGGAAGTGTCATGTACAATATAATCCCTGCAATCTACTGAGGTATGAGTCTAATGTTGAAGGATCTCTTCATGAAAATAACTTTTACACTGTCAATTGTCTCTATTAAAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 333969 132 + 647215 TAATGAAGCCCCCCCATGGCATAATAACAACCGGGAAGTGTCATGCACAAT------------ACCTACTGAGGTGTGAGTCTAATGATGAAGGATCTCTTCATAAAGATAACTTTTACGCTGTAAATTGTCTCTATTAAAGAA + +a +s mr.mrrefChr5 190051 4 + 294542 TCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342506 4 + 636262 TCTA + +a +s mr.mrrefChr5 190055 4 + 294542 GAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342516 4 + 636262 GAGA + +a +s mr.mrrefChr5 190059 86 + 294542 CCTTGTGACCATAGACATTGGACTAATGAAGCTGAAAAAAGGCCAAATGAATCAAGCAAGTAAAAGAGGTTCCTAGTAATAGTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342523 85 + 636262 CCTTGTGACCATAGACATTGGACTAATGAAGCTGAAAAAAGGCCAAAT-AATCAAGCAAGTAAAAGAGGTTCCTAGTAATAGTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 334101 67 + 647215 -------------------GGACTAAGGAAGCTGAAAAAAGGCCAAGTGAATCACGCAAGTGACAGAGGTCCCGAGTAATATTCCA + +a +s mr.mrrefChr5 190145 67 + 294542 CTATAAATAGAAAAATCATAGTTGACAGGATACAGTAGATGTCAATTGATATTATATGCTGTATCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342608 67 + 636262 CTATAAATAGAAAAATCATAGTTAACAGGATACAGCAGATGTCAATTCATATTATATGCTGTATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 334173 67 + 647215 CTATAAATAGAAAAATCATAGTTGACAGAATACAATAGATGTCAATTGATATTACATTCTGTATCTG + +a +s mr.mrrefChr5 190212 27 + 294542 ATAATTAGACTTTCGTTGATCACAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342675 22 + 636262 -----TAGACTTTCGTTGATCACAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 334241 13 + 647215 ATAATTAAACTTT-------------- + +a +s mr.mrrefChr5 190239 267 + 294542 TGGGGCCATGGTCTGAAAGCTGGCCTATCAGTGTCTTAGCCCCCCAGATATTGTATACAACTAATCAGAGTGATCACTACAGGACATTAGCTTTGAGTCAAAGCAGTCCTCTGATGTTAGGCCATTGTGACTTGAGCTGCATTACATTCATCTCATTAAATCATGGGGTTCTGACACTTGTTATTGTTGACACATTATTTaaactctatgcacatgcaatacacctcaaagggtgaaagtctcaggaatttaaggtgttcagagcaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342706 253 + 636262 TGGGGCCATGGCCTGAAAGCTGGCCT--------------CCCCCAGATATTGTATACAACTAGTCAGAGTGATCACTACAGGACATTATCTTTGAGCCAAAGCAGTCCTCTGATGTTAGGCCATTGTGACTTGAGCTGCATTACATTCATCTCATTAAATCATGGGGTTCTGACACTTGTTATTGTTGACACATTATTTaaactctatgcacatgcaatacacctcaaagggtgaaagtctcaggaatttaaggtgttcagagcaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 334254 245 + 647215 -----CCATGGTCTGCGAGCTGGCCTATCAGTGTCTTAGCCCCCAAGATATTGTATACAATTAACCAGAGTGATCACTACAGGATATTAGTTTTGAGTCAAAGCAATGCCCTT-TGCTAGCAGAT---------------ATTTCATTCATCTCATT-AATCATGGGGTGCTGACACTTGTTATTGTTGACACATTATTTaaactccatgctcatgcaatacacctaagggggtgtaaatttcaggaattttaggtgatctgagcag + +a +s mr.mrrefChr5 190506 36 + 294542 ggtagcgaaataaatttgggatatgtacaccaacca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342963 36 + 636262 ggtagcgaaataaatttgggatatgtacaccaacca +s simRat_chr6.simRat.chr6 334499 36 + 647215 cgtaggaaaatgattttgggatatgtacaccaacca + +a +s mr.mrrefChr5 190542 111 + 294542 cctatcgagctctttatgaaggATCGAACCAACATGTGACCCAAACTTAGTAATTCACCTTCCACCTTACTAGATATAATTGACATGTAACAAGGGCCTACACTAAAATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343000 79 + 636262 cctatcgagctctttaTGAAGGATCGAACCAACATGTGACCCAAATTTAGTAATTCACCTT-------ACTAGATAT-------------------------CTAAAATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 334535 111 + 647215 cttatcgagctctttatgtagaATCAGGCCAGCATGTGACCCAAACTTAGTAATCCACCTTCCACCTTACTTGATATAATTGACATGTAACAAGGGCCTACACTAAAATGA + +a +s mr.mrrefChr5 190653 54 + 294542 GTTATCCCTACCAAGCCTGCACGTGAGCCGGCCACTGATGACATTGGCAAGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343080 52 + 636262 GTTATCCCTACCAAGCCCACTCGTG-GCCGGCCACTGATGACATTGGCAAGGT- +s simRat_chr6.simRat.chr6 334646 54 + 647215 GTTATCCCTACCAAGCCTGCACATGAGCCGGCCACTGATGACATTGGCAAGGTT + +a +s mr.mrrefChr5 190707 221 + 294542 CAGGTGTTTAAGCAAGGACGATCACTCTCAATTATGAGACCAAAAGTTGAGTCTTAATTTTTGTGGAGGGAGATTCAGCCATCTCTGAAATGAAAAGAGGTCTCACACTACTGATTACAACCTTAGAGTAGTGTAATGCCCAGGTGAATGCTTAGTTTAAACACTCTGGTTTATATCAAAAAGCGGTGCAAGTGGCACTGTAAGTCAATAAACATACACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343132 221 + 636262 CAGGTGTTTAAGTAAGGACACTTACTCTCAATTATGAGACCAAAAGTTGGGTCTTAATTTTTGTGGAGGGAGATTCAGCCATATCTGAAATGAAAAGAGGTCTCACACTACTGATAACAACCTTAGAGTAGTGTAATGCCCAGGTGAATGCTTATTTTGAACATTCTGGTTTATATCTAAAAGTGGTGTAAGTGGCACTGTGAATTGATAAACATACACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 334705 221 + 647215 CAGGTGTTTGAGCAAGGAGGATCACTCTCAATTATGAGACCAAAAGTTAAGGCTCAATTTTTGTGGAGGGAGATTAAGCTATCTCTGAAATGAAAAGAAGCCTCACACTTCTGATTACACCCTTAGACTACTGTAATGCCCAGGTGAGTGAGTAGTTTAAGCACTCTGGTTTATAACAAAAAGCGGTGCAAATGGCACTGCAAGTCAATAAACATATACCA + +a +s mr.mrrefChr5 190928 8 + 294542 AATGGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343360 8 + 636262 AATGGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 334926 8 + 647215 AATGGGTT + +a +s mr.mrrefChr5 190936 119 + 294542 AATCAACCTCATATTCATTGTCATTTCTTACTTGCCAATTAAGGTTGACACTTGGTGGCACACTGCAAGTAAGGATACCAACCTTAGAAGCCAAAACCAACCTACAAGTACCAGAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343412 119 + 636262 AATCAACCTCATATTCATTGTCATTTCTTACTTGCCAATTAAGGTTGACACTTGGTGGCACACTGCAAGTAAGGATACCAACCTTAGAAGCCAAAACCAACCTACAAGTACCAGAGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 334934 119 + 647215 AATCAACCTCATATTCACTGTCATTACTTACTGGTCAATTAAGGCTGACAATTGGTGGCACACTGCAAGCAAAGATATCAACCTTAGAGGCCAAAACTGACTTACAAGTACCAGAGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 191055 408 + 294542 GTAAAAGAACTGTTACAGTGGCTTAATACTTTTTTAGATGGTTATTTTACATATGGCATTATCTACCGTGGTGGACTAGTTTCTCCAAGAAACATTTTAGTTATAATCTAGTCAAGCTACAATTAAACTCAATGGTGTAAAAAAGCCTTTACTAATGAACTAAACCCTAGACAGGTTTCATTACATGAGGTGGTGGACATACCGGCCACTCAGATTATGGAGATTAAAATGGGTAACAACAAATCGCTAGATTGACTTTCTCCTGGACACAAAGTACTTATGTTAATTTCCCAGGCTCAAATGCTAAGGTCCCTCTTTGTAGATCTGACATGGATTTTTAAGGCAGGGTGCTGGGTATTCAGGGTTTAATATTGTTAATACTGGTGGGGCCTGTATGTGCATTAAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343531 408 + 636262 GTAAAAGAACTGTTACAGTGGCTTAATATTTTTTTAGATGGTTATTTTACATATGGCATTATCTTCTGTGGTGGACTAGATTCTCCAAGAAACATTTTGGTTACGATCTGGTCAAGCTACAATTAAACTCATTGGTGTAAAAAAGCCTTTACTAATGAAGTAAGCCCTGGACAGGTTTCGTTACATGAGGTAGTGGACATGCTGGCCACTCAGATTATGGAGATTGAAGTGGGTAATAATGAATCACTAGATTGACTTTCTCCTGGACACAAAGTACTTATGTTGATTTTCCAGGCTAAAGTACTAAGGTCCCTCTTTGTAGATCTGACATGGATTTTTAAGGTAGGGTGCTGGTTATTCAGGGTTTAATATTGTCAATACTGATGGGACCTGTATGTACATTAAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 335055 393 + 647215 GTAAAAGACCTGTTACAGCAGCTTAATACTTTTTTATATGGTTATTTTACATAT------AACTACCGTGGTGGTCTAGTTTCTCCATGGAACGTTTTAGTTATAATCTAGTCAAGCTACAATTAAACTATACAGTGTAAAAAACCATTTACTAACGAACTAAACCCTAAACAGGTTTCATAACATGAGGTGGAGGACATACCAGCCCCTCAGAATATGGACAATAAGATGACTAACAACAAATTGCTAGATTGACTTTCTCCTGGTCACAAACTACTTATGTTAATTTCCC---CTCCAATGCTAAGGTCCCTCTTTGTAGATCTGACCTGAATTTTTAAGACAGGCTGCTGGGTATTCAGGATTTAATATTGTTGATATTGGTGGGGCCTGTATGTGCAT------ + +a +s mr.mrrefChr5 191463 97 + 294542 TAATGTGGCGGGGTCCTTGTACTAAGGCTGTTAGGTCTCATACTGTAACAGCTAAAATTGGCCAGATTTTCTATTATAAAGCTAATGCTGTAACTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343940 97 + 636262 TAATGTGGCGGGGTCCTTGTACTAAGGCTGTTAGGTCTCGTACTGTAACGGCTAAAATTGGCCAGATTTTCTATTATAAAGCTAATGCTGTAACTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 335448 82 + 647215 ---------------CTTGTACTATGGCCATTAGGTCTCATACTGTAACAGCTAAAATTGGCCAGATTTTTTATTATAAAGCTAATGTTTTAACTTC + +a +s mr.mrrefChr5 191560 128 + 294542 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACTGTGGCCCTTGATAATTATGTGGTAAATGGGATAATACAGGTTAAGATGCATTCCATGGTAGTGATCAGAGCTACAAATACTAAACCAGAATTTTTTGATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344037 121 + 636262 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACTGTGGCCCTTGATAATTCTGTGGTAAATGGGATAATACAGGTTAAGATGCA-------GTAGTGATCTGAGCTACGAATACTAAACCAGAATGTTTTGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 335535 128 + 647215 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACCGTGGCGCTTGATAACTATGTGGTAAATGTGATAATACAGGTTAAGATGCATTCCATGGTAGTGATCAGAGCTACAAATACTAAACCAGAATTTTTTGATT + +a +s mr.mrrefChr5 191688 135 + 294542 ATTTGTTTCCTGCTACCTACCATTAGTGCATATCAGCAGCCCTCAAACTACCCTGACCTTTGTGTATCGCACAGTCAACCCTTTGGCTTCTTTCTATAGCAATTTCAGAAAGTGTTATTCAATGTACTAATCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344159 135 + 636262 ATTTGTTTCCTGCTACCTACCATTAGTGCATATCAGCAGCCCTCAAACTACCGTGACCTTTGTGTATCGCACAGTCAACCCTTTGGCTTCTTTCTATAGCAATTTCAGAAAGTGTTATTCAATGTACTGATCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 335663 129 + 647215 ATTTGTTTCCTGGTACCTACTATTAGTGCATATCGG------TCAAACTACCCTGACCTTTATGTACCACACAGTCAACCCTTCGGACTCTTTCTAGAACAATTTCAGAAATAGTTATTCAATGTACTAATCCTC + +a +s mr.mrrefChr5 191823 20 + 294542 ATCTCAGGCAGCATGAATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344356 20 + 636262 ATCCCAGGCAGCATGAATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 335792 20 + 647215 ATCTCAGGCAACACGAATTC + +a +s mr.mrrefChr5 191843 47 + 294542 GTCACTCTTGGTTACAATGTTTTATACTGATTTTAGTGTGTAACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344380 47 + 636262 GTCACTCTTGGTTACAATGTTTTATACTGATTTTGGTGTGTAACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 335812 47 + 647215 GCCACTCTTGGTTACAATGTTTCATGCTCATTTTAGTGTGTAATGTA + +a +s mr.mrrefChr5 191890 203 + 294542 TTAGATCATACTCTTAACAAGCTTTCCCATGACTTGTGTGTTGTGTGATATGCCCCATCTATGGTCAAGTTCAAGCAAGCTGCCTGTGGGATCTATACCAAGCATTGCCACCGTGGGTCTCTATATGCATCTTGCATGTGCAACATAACATGGGACTACATACAAGTACATAAAATTGGTATCTCTGAGGTATTCCATGCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344427 203 + 636262 TTAGATCATACTCTTAACAAACTTCCCCATGACCTGTGTGTTGTGTGAGGCGCCCCATGTATGGAGAAATTCAAGCAATCTGCCTATGGGATCTATACCAAGCATTGCCACCGTGGGTCTCTATATGCATTTTGCATGTGCAACATAACATGGCACCATATACAAGTACGTAAAATTGCTATCTCTGAGGTATTCCATGCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 335864 203 + 647215 TCAATTCATACTCTTAACAAGCTTTCCCATGACTTGTGTGTTGTGTGATATGCCCCATCTATGGTCAAGACCAAGCAAGCTGCCTGTGGGATCTATACCAAGCACTGCTGCCGTGGGTCTCTATACACATCTTGCATGTGCACCATAACATGGGACTCCATACAAGTACATAAAATTGGTATCTCTGAGGTATTACAGGTAGG + +a +s mr.mrrefChr5 192093 42 + 294542 ACTCACTGGAGTTAAAGACCAAAGGAGCCAGGAATGGCACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344631 42 + 636262 ACTCACTGGATTTAAAGACCAAAGGAACCAGGAATAGCACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 336067 42 + 647215 ACTTTCTGGAGTTAAAAACCAAATGAGCAAGGAATGGCACGC + +a +s mr.mrrefChr5 192135 279 + 294542 TAGCTTTCCATACACTACTGGATTATTGTTCAGAAAGCAGGGTATCTCAAGGAAAACCTAGTAGCACACCTTTTCTATGTGTTCACCAAATGTGAATAGATCATGGCAATCAGAAGTCAAAATGTATGGACCAGTTCTTGACACATGACCAGGGATACAATCATTCTGCATGCAGAACATCTGGTGAGCTAAGGGCCTCCTGTATGAACAGTCCTTTGCTGGTTAGGATAGCATGGTTCACTCCCATATGAGGACATGCCAGGATTCATCAAAGATCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344675 279 + 636262 TAGCTTTCTATACAGTACTGGATTATTGTTCAGGAAGCAGGGTATCTCAAGGGAAACCTAGTAGCACACCTTTTCTACGCATTGACCAAATATGAACAAATCATGGCATTCAGAAGTCAAAGTGTATGGGCCAGTTCTTGACACATGACCAGGGATACACTCATTCTGCGTGCAGAAGATCTGGTGAGCTAAAGGCCTCATGTATGAACGGTCCTTTGCTGGTTAGGATAGCATGGTTCACTCCTATATTAGGACATGCCAGGATTCATCAAGGATCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 336109 279 + 647215 TAGCCTTCCATACACTACTAGGCTATTGTTCAGAAAACAGGGTATCTCGAGGAAAACCTCGTAGTACAACTTTTCTATGTGCTCACCAAATGTGGATAGATCATGGCAATCAGAAGTCGAAATGTATGGATCAGTTCTTGACACATGGCCAGGGATACAATCATTCTGCATGCAGAACATCTGGTGAGCTAAGGGCCTCCTGTATGAACAATCCTTTGCTGGTTAGGACAGCATGGTTCACTCCCATATGAGGACATACCAGGATTCATCACAGATCCT + +a +s mr.mrrefChr5 192414 128 + 294542 AAGGAACTTTTATAATGCCAATTTAATTCAACCAGTTCCAGATGCAATCATGCCCCATGGGTGTTTTGGGTCAGTCTGAGGCCAGAATATATCAAACCTGTCTGGGTTCTATAACACTTCCATCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344954 128 + 636262 AAGGAACTTTTATAATGCCAATTTAATTCAACCAGTTCCAGATGTAATTGTGCCCCATGGGTGTTTTGGGCCAGTCTGGGGCCAGAATATATCAAACCTGTCTGAGTTCTATAACACTTCTATCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 336395 128 + 647215 AAGGAACTCTCATATTGCCAATATAGTCCAACCAGTTCTAAATGCAATCATGCCCCATGGGCATTTTGGGTCAGTGTGAGGCCAGAATATATCAATCCCATGTGGATCCTAGAACACTTCCCTCGCAT + +a +s mr.mrrefChr5 192542 272 + 294542 GCTGGAGTATGGGAATAATAATGGGATCTAGTTGGATAGAGTATGCTTATATTACTATTTGGGTCCTGCATTAGTTTAGCCACCACCATGAATGATAAGTAGTGGTGGACCCAGGGACTTCTGTGGCTGGCAGGCCCAGTGTAAAGTGCCTATGCCTAGGATCCGCTCCCAAAGGCTCGCAAGTACCTCAAATGTACTAGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGACATATCCCCTTACACTTATACAATTTTTCGGTGCATCAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345087 270 + 636262 GCTGGAGTATGGGGATAATAATTGGACCTAGTTGGATAGAGTATGCTTATGTTGCT-TTTGGGTCCTGCACTAGTTTA-CCACCACCATGAATGATAAGTGGTGGTGGACCCAGGGACTTCTGTGGCTGACAGGCCCAGTGTAAAGTGCCTATGCCTAGGATCCACTACCAAAGGCTCGTAAGTACCTCAAATGTACTAGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGAGATATCCCCTTATACTTATACAATTTTTCGGTGCATCAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 336523 268 + 647215 GTTGGAGAATGGGAATAATAATGGGATCTAGTTGGATAGTGTGTGCTTATATTACTATTTGGGTCCTGCATTAGTTTAGCCGCCACAATTATTGATAAACATTGATGGACCCGGGGACTTCTGTGGCTGGTAGGCCCAGTGCAAAGTGCCTATGTCTGAGATCTGCTCCCTGAGGCTCGCAAGTACCTTAAATGTACTGGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGACACATCCCTTTACACTTACAAAATTTTTTGGTGTATC---- + +a +s mr.mrrefChr5 192814 185 + 294542 TCCTAAAATCCATTGATTCTCAGACATGGTGGATATGGAGCTCAGTAGATTAGAGGCCTGACTGGAGGTGACAGCTTCATAATGTGAAGAAGTCTGAGGCATAATGGCAGATCCCTGTATTTTTATTAGAAAAAATGGAAACAAGGCTCACGAAAGAACAGGGCTAACTTCGCTCTAGGCATACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345358 181 + 636262 TCCTAAAATCCATTGATTCTCAGACATTGTGGAGATCGAATTCAGT----TAGAGGCCTGACTGGAGGTGACAGGTTCATAATGTAAAGAAGTCTGAGGCATAATGGCAGATCCCTGTATTTTTATTAGAAAAAATGGAAATGACGCTAACGAAAGAACAGGGCTAACTTCGCTCTAGGCATACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 336791 183 + 647215 TCCTAGAATCCATTGATTCTCAGACATGGTGTATATGGAGCTCAGTAGATTAGAGGCCTGACTGGAGGCAACAGCTGCATAATGTGAAGGAGTCTGAGACAT--TGGCAGATCCCTGTATTTTTGTTAAAAAAAATGGAATCAAGGCTCACAAAAGAACAGGGCTAACTTGGCTGTAGGCATACT + +a +s mr.mrrefChr5 192999 150 + 294542 AGGCTAACTTGGCTGTAGTCATACTTTCATAGATCAGACATAGACATCAAGTGGAAACTGATGCTTGAGGGCCCTTACTGCAGGAGCTGGATGGTAGAGAGGATAAGGCCACCTTTGTTATGATTTTTCACTGGGGTCATTTGTAACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345539 150 + 636262 AGGCTAACTTGGCTGTAGGCGTACTTTCATAGATCAGACATAGAGATCAAGTGGAAACTGATGCTTGAGGGCCCTTACTCCAGGAGCTGGATGGTAGAGAGGATAAGGCCACCTTTGTTATGATTTTTCACTGGGGTCATTTGTAACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 336979 150 + 647215 AGGCTAACTTGGATGTAGTCATACTTTCATAGATCAGACAGTGACATCAACTTGAAACTTATGCTTGGGAGCCCTTACTGCAGGAGCTGGATGGTAGAGAGGATAATGCCATCCTTGTTATGATTTTTCACTGGGGTCACTTGTAACATT + +a +s mr.mrrefChr5 193149 9 + 294542 GAACAGCCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345689 9 + 636262 GAACAGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 337138 9 + 647215 GAAAAGACA + +a +s mr.mrrefChr5 193158 147 + 294542 ATGAATCCTGGAAAGGCTAATGATGCTGGATAGTGTATGCTTGGATTTGGTTGTGAATGTCTGCCATGCTTCAACATGAGTCTTTCCACTTTTGCATTGGTAAAGATAATAAGTTTTAATACAAAACTCATTGAAGATGTAATCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345698 146 + 636262 ATGAATCCTGGAAAGGCTAATGATGCTGGATAGTATATGCTTGGATTTGGTTGTGAATGTCTGCCATGCTTCAACATAAGTCTTTCCACTTTTG-ATTGGTAAAGATAATAAGTTTTAATACAAAACTCATTGAAGATGTAATCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 337149 147 + 647215 ATGAATCCTGGAAAGGTTAATGATGCTGGATAGTGTATGCTTTGATTTGGTTGTGCATTTCTGCCTTGCTTCAACATGAGTCTTTTCGGTTTTGCATTAGTGAAGGTAATAAGTTTTAATATAGAACTCATTGAGGGTATAATCGGT + +a +s mr.mrrefChr5 193305 29 + 294542 GTCACAAGGTTAGGTGAAGCTTAGTAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345844 29 + 636262 GTCACAAGGTTAGGTGAAGCTTAGTAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 337297 29 + 647215 GTCACAAGATTAGGCAAAGCCTAGTAACA + +a +s mr.mrrefChr5 193334 17 + 294542 CTTCCCCCTAAAACTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345873 17 + 636262 CTTCCCCCTAAAACTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 337333 17 + 647215 CTTCCCTGCAAGACTGT + +a +s mr.mrrefChr5 193351 203 + 294542 GATGTGCTAACCCATTGGTGGCTAGATTCCACAACATAGAGACGCTACAATTGTGTTATGGACAAACATCAGGCAGGTCGGCTGTGCACTTGAGAGTTTTCATGTTTAATTGCTTCAATTTTGGAATTTTGTTTTCCTGATAACTTTCAAGGCACAAATACCAACCCAGCCAAAGATAATAGCGTTTGGTGGTTCAACTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 345890 203 + 636262 GATGTGCTAACCCATTGGTGGCTAGACTCCACAACATAGAGACGCTGCAATCATGTTATGGACAAACATCAGGCAGGTCGGCTGTGCACTTGAGAGTTTTCATGTTTAATTGCTTCAATTTTGGAATTTTGTTTTCCTGATAACTTTCAAGGCACAAATACCAACCCAGCCAAAGAAAATAGCGTTTGGTGGTTCAAGTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 337356 152 + 647215 AATACACTGACCCATTGGTGGCTAGATTTCACAACAGAGAGACACTACAGTTGTCTTATGGACACACATCAGGCA---------------------------------------------------TTTTGTTTTCCTGATAACTTTCAAGGAACAAATACCAACCCAGACAAAGATGATAGCGTTTGGTGGTTCAACTTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 193554 45 + 294542 TGATTGTTACCTGTTCACCTGCATACTTGATATTACAGTTTTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346095 40 + 636262 TGATT-----CTGTTCACCTGCATACTTGATATTACAGTTTTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 337611 40 + 647215 -----GTTACCTGTTCACCTGCATACTTGATATTACAGTTTTACA + +a +s mr.mrrefChr5 193599 101 + 294542 TGCCATCTGAAGAGGGATGGAATTATACACACCATCTTAGCTGGGGAGTGTCATAAGGTTCTGAAAGGCAGATGTTCCTACACTCAAAAGAAGTGCAGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346137 101 + 636262 TGCCATCTGAAGAGGGATGGAATTTTGCACACCATCTTAGCTGGGGAGTGTCATAAGGTTCTGAAACGCAGATGTTCCTGCACTCAAAGGAAGTGCAGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 337651 95 + 647215 TGCTGTCTGGAGAGGGGTGGAATTATACACACCATCTTAGCT------TGTCATAAGGTTCTGAAGGGCAGAAGCCCCTACGCTCAAAAGAAGTGCAGAAG + +a +s mr.mrrefChr5 193700 180 + 294542 CTATTATCAAGGGCCAAAAATTTGCCTACATTCTAGTAGTGAAGCCCATATGGTAATCTAATGTAGGGCTATATTACCTGGATCTATCCCAACTTTTATCATGCTTCAAAATTTCAGAGCTACATTTATGGACACCCTATGGGATGCATCAATCAATTAAAGACACAAAAGTAAGATGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346238 180 + 636262 CCATTATCAAGGGCCATAAATTTGCCTACATTCTAATAGTGAAGCCCATATGGTAATCTAATGTAGGGCTATATTACCTGGATCTATCCCAACTTTTATCATGCTTCAAAATTTCAGAGCTACATTTATGGACACCCTATGGGATGCGTCAATCAATTAAAGACACAAAAGTAAGATGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 337749 179 + 647215 ATACTATCAAGGGACAAAAATTTGTCTACATTCTCGTAGT-AAGCCCATGTGGTAATCTAATATAGAGGTAGACTACCGGGCTCTATCCCAACTTGTATCACGCTTCAAAATTCCAGAGCTACATTGATTGACACCCTATGGGATGTATCGATCAATTAAAGACGCGAAAGTAAGATGCG + +a +s mr.mrrefChr5 193880 94 + 294542 GATCTAGTGAGTTATGTTGCCAATTAAGCATATTGAAGTAGCATCAGTAATAACAGGTGTCAATCTGCATCTATTAACAGGGGTTGTAACTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346418 94 + 636262 GATCTAGTGAGTTATGTTGCCAATCAAGCATATTGAAATAGCATCAGTAATAACAGATATCAATCTGCATCTATTAACAGGGGTTGTAACTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 337930 82 + 647215 GATTTAGTGAGTTATGTTGCCAGTTGAGCATATTAAAGTAGCATC----ATGACAGGTG------TGGATCTATCAACAGGGGT--TCACTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 193974 289 + 294542 AATTGAACTGAAGTGGAAGATTTCGGAAATGTAATGAACATATTACTGACCATCAAAACCCAGCTTTCTGAAGACATTGATAAACTTCTAGTTAAAGCTTGTAAGAACAAGGCAAAGACACATGATTGTTAAAATATTACATGTAACATCAGAAATTAGACTAGATCCAAAATACTTGAGAAAAGGATGTAGTATACCTCACCAAGTCTCATGTTTTATATGATGACATTACATCAAGGTGATAACAGAAGCAGCAAGCCCAAGTCATTTGCTTAGCTGGTTTAGGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346512 281 + 636262 AATTGAACGGAAGTGGAAGATTTCGGAAATGTAATGAACATATTACTGACCATCAAAAACCAGCTTTCTGAAGACATTGATAAACTTCTAGTTAAACCTTGTAAG---AAGGCAAAGACATGTGATTGTTAAAATATTACATGTGATATCAGAAATTAGGTTAGATCCAAAATACTTGAGAAAAGGATGTAGTATACCTCATCAAGTCTCATGTTTTATATGATG-----AGATCAAGGTGATAACAGAAGCAGCAAGCCCAAGTCATTTGCTTAGCTGGTTTAGGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 338023 286 + 647215 AATTGAACTGAACTGGAAGA-TTCAGAAATGTAATGAACATATCACTGACCATCAAAACCTAGCTTTC--AAGACATTGATATACTTCTAGTTACAGCTTATAAAAACAAAGCAAAGACACATGATTGTCAAAATATCACATGTAACATCAGAAATTAGACTAGATCCAATATACTCGAGAAAAGGATGTAGTATACCTCACCAATCCTCATGTTTTACATAATGACATTACATCAAGGCGATAACAGCGACAGCGAGTCCAAGTTATTTGCTTAACTGACTTGAGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 194263 46 + 294542 GGGCTCTTGAATAATACTTAACTCACTGACCAAAAACAAAAAACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346798 46 + 636262 GGGCTCTTGAATAATACTTAACTCACTGACCAAAAACAAAAAACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 338309 46 + 647215 TGACTCTTGATTAATACTTAACTCACTGACCCATTAAAAATATCCA + +a +s mr.mrrefChr5 194309 24 + 294542 TCCAGGCAGCACACATACACTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346844 24 + 636262 TCCAGGCAGCACACATACACTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 338371 24 + 647215 TGCAGAGAGTATACACATAATCTT + +a +s mr.mrrefChr5 194333 7 + 294542 GAGTCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346872 7 + 636262 GAGTCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 338395 7 + 647215 GAGTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 194340 8 + 294542 GTACCCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346880 8 + 636262 GTACCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 338402 8 + 647215 GTATCGAG + +a +s mr.mrrefChr5 194348 11 + 294542 GGACTCACATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346888 11 + 636262 GGACTCACATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 338411 11 + 647215 AGACCCTGATA + +a +s mr.mrrefChr5 194359 28 + 294542 ATTCATATGCGCAACATAATGAATATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346903 28 + 636262 ATTCATATGCGCAACATAATGAATATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 338422 28 + 647215 ACTCAAATAGTCCAGGTAACACACATAA + +a +s mr.mrrefChr5 194387 39 + 294542 CCATGGTGGCCCTATAAAAATGGTCTAAAGTGAAGTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346933 39 + 636262 CCATGGTGGCCCTATAAAAATGGTCTAAAGTGAAGTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 338450 39 + 647215 CCATGGTGGCCCTATAAAAGGGGGTCCAAGTGAAGTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 194426 9 + 294542 ACCCCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 346972 9 + 636262 ACCCCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 338491 9 + 647215 AACCCATTG + +a +s mr.mrrefChr5 194435 38 + 294542 TGCTGGGTTATTTATGGGGGACAAGACCCTGGTGTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347143 38 + 636262 TGCTGGGTTATTTATGGGGGACAAGACCCTGGTGTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 338500 38 + 647215 TGCTGCGTTATTTATGGGGAACAAGACGCTTGTAGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 194473 175 + 294542 GAAAACATTGAAATAACCGCATTGATCACTGCCAAACTCCATTTCAAAGGGCTATTGGAAAACCGTTCAATCGGAAAAGGTGGTTTTAAGTAATGGTGATGCAGGATTACTGGGATGAATCCAGGTGCTGGGCAGTAGAAAAGTCACTATCTTTAAAAAATAGTAAAAACAGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347181 175 + 636262 GAAAACATTGAAATAACCGCATTGATCACTGCCAAACTCCATTTCAAAGGGCTATTGGAAAACCGTTCAATCGGAAAAGGTGGTTTTAAGTAATGGTGATGCAGGATTACTGGGATGAATCCAGGTGCTGGGCAGTAGAAAAGTCACTATCTTTAAAAAATAGTAAAAACAGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 338543 175 + 647215 GAAAACATTGAAATAACCACATTGACCAATACCAAACTCCATTTCGAGGGGCTATTGGAAAACTGTTAGATCAGAAAAGGATATTTTTAGTAATGGAGATGTAGGATCACTGAGATGAATCCAGCTGCAAGGCAGTAAAAAAGCCACTATCTTTGAAAAATAGTAAAAATGGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 194648 87 + 294542 CTTCCAGAAAGTCACTGGCTGATAACTTGGGAAACATCTTTGCCATGTACTGGGCCATTAGGTCGGGCTCATTCACAAGCACATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347360 87 + 636262 CTTCCAGAAAGTCACTGGCTGATAACTTGGGAAACATCTTTGCCATGTACTGGGCCATTAGGTCGGGCTCATTCACAAGCACATTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 338718 87 + 647215 CTTCCAGAAAGTCATTGGTTGATGACTGGGGAAACATCTTTGCCAAGTACTGGGCCATTAGATTGCGCTCATCCACAAGCACATTAA + +a +s mr.mrrefChr5 194735 32 + 294542 AAAAATTCCTAGTCAGAGTACTAAATTAAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347447 32 + 636262 AAAAATTCCTAGTCAGAGTACTAAATTAAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 338830 32 + 647215 AAAAATTCCTAGTCATACTACTAAATTAAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 194767 63 + 294542 GAGAATTATAATGCGGTGTCCTGCTTGTAGGTCGTCTAAGAGTATAGCTAACAATGTTCTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347479 63 + 636262 GAGAATTATAATGCGGTGTCCTGCTTGTAGGTCGTCTAAGAGTATAGCTAACAATGTTCTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 338883 63 + 647215 AAGAACTATAACGTGGTGGCCTGTTAGTAGGTTGTTTAAGAGCACAGCTAAAGATGTTCTACT + +a +s mr.mrrefChr5 194830 82 + 294542 GTGGTTGGGTTTTCCCTCAAGCATACCACTAGCATGAACTCAATTTTGGATACCAAAATTATTCCAAGGTCCTTTCTAGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347542 81 + 636262 GTGGTTGGGTTTTCC-TGAAGCATACTACTAGCACGAACCCAATTGCGGATACCAAAATTATTCCAAGGTCCTTTCTAGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 338954 82 + 647215 GTGGTTGAGTTTTCCCTCAAACATACCACTAGCATTAACTCATTTTTGGGTACCAAAATCATTCCAAGGTCCTTTCTAGCAA + +a +s mr.mrrefChr5 194912 205 + 294542 GCTTCAACCATTGTCTCACTACCTTTGTACTTAGGGACAAACTTGGTGTAACTTCTGGTGCAACTTCATTGGTGAAGTTTCTCATATTCCTGTGTGTGTAACCACATATTTAAAATCAAACTATAAAGAAACAGCTCTACATTCACGCTCTTCCGTGGTAGATTAGTTAACTAGCTGTCACCAGTAATTAATTTTAAACTAGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347623 205 + 636262 GCTTAAACTATTGTCTCACTACCTTTGTACTTAGGGACAAACTTGATGTGACTTCTGGTGCAACTTCATCAGTGAAGTTCCTCATATTCCTGTGTGTGTAACCACATATTTAAAATCAAACTATAAAGAAACAGCTCTACATTCACCCTCTTCCAGGGTAGTTTAGTTAACTAGCTGTCACCAGTAATTAATTTTAAACTAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 339037 205 + 647215 GCTTCAACCATTGTCTCACCACCTTTGTACTTAGGGACAAATTTGGTGCAACTTCTGATGCAACTTCACTGGTGAGGTTTCTTATATTCCGTTATGTGTAACCACACATCTAAAATCAAACTATGAAAAAACAGCACTACATGCATGCTCATCTGTGTTAGATTAATTAACTAGCTGTCACTAGTAATTAATTTTAAACTAGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 195117 236 + 294542 CTAATAATTCAAGAGAGCTAGGAAGTCATAATGTTTAGTTGCATATAGATCGTAACGTTCTGGTTTACTCTTTAGATGGCTGGAACTGTTTTTTGCTGGTATATTTCAGGTACATATGGTATACCAGCCATTTGTGTATTGGGTATAACAGACATCAAGGGCATGGTGTTAGGATCAACTGGACATTATAAATTCTATCAGGGCACAGCAGCGTTTACAACTGGTCTGGGCCTGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 347828 235 + 636262 CTAATAATTCAAGAGAGCTAGGAAGTC-TAATGTTTAGTTGCATATAGATCGTAACGTTCTGGTTTACTCTTTAGATGGCTGGAACTGTTTTTTGTTGGTATATTTCAGGTACATATGGTATACCAGCCATTTGTGTATTGGGTATAACAGACATCAAGGGCATGGTGTTAGGATCAACTGGACATTATAAATTCTATCAGGGCACAGCAGCGTTTACAACTGGTCTGGGCCTGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 339250 233 + 647215 TTAATAATTCAAGAG--CCAGGAAGTCATAATGTTTAGTGGGATATAGATCATAACATTTTGGTTTACTCTTTAGATGACTGGAACTGTTTTTTGCTGGTTAAGTTCAGGTACATATGCTATACCAACCATTTGTGTATTGGTTATAACAGACATCAAGGGCATAGTGTTAGGA-CAACTGGACATTATAGATTCTATACGGGCATTACAATGTGTACAACAGGTCTGGGCCTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 195353 258 + 294542 CAGCATTACCAATGTTATGATAATAACTCAGGATTGAGCCTGGTGCCTTTGCTACTGATGGACAAACAGGTGCGACTTCTGGTGCACCTACTATGGTAATCATTTTGTGTTGCTTTCAGTATAACGATGATGACACAACTCTCAGTTCAGGTTCCTTGGTGGTAGTTTAGTCAACTAACCCTGTTATTCACCAATTGATGTATAATGATGCAAGAAAGTGGTTGTAATGCTCAGGCATTGCTAGGATACAAGAGAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348063 258 + 636262 CAGCATTACCAATGTTATGATAATAACTCAGGATTGAGCCTGGTGCCTTTGCTACTGATGGACAAACAGGTGCGACTTCTGGTGCACTTACTGTGGTAATCATTTTGTGTTGCTTTCAGTATAACGATGATAACATAACTCTCAGTTCCAGTTCCTTCGTGGTAGTCTAGTCTACTAACCCGGTTATTCACCAATTGATGTATAATGATGCAAGAAAGTGGTTGTAATGCTCAGGCATTGCTGGGATACAAGAGAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 339490 243 + 647215 CAGCATTACCAGTGTTATGATAAGAACCCAGGATTAAGTCTGGTGCCTTTTCTACTGATGGACAAACACGTGCAACTTCTGGGGCACCTACTATGGTAATCCT------TTGTTATCAGTATAAATATGATGACACAACTCTGAGTTCAGGTCCCTTGGTGGTAGCTTAGTCAACTAACCCTGTTATT---------ATGTATATCGATGGAAAAAAGAAGTTGTAGTGCTCAGGCGTTGCTAGGATACAAGAGAGCT + +a +s mr.mrrefChr5 195611 59 + 294542 GAGAGGTTATAATGCTAATGCCCAGTGGTGTTTCCCTAAGACACTGGCACAGCCTGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348321 59 + 636262 GAGAGGTTATAATGCTAATGCCCAGTGGTGTTTCCCTAAGACACTGGCACAGCCTGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 339737 59 + 647215 GAGAGGTTATAACACTAATGCTCACTGGTGTTTCCCTAAGGCATTGCTAATGCCTACAA + +a +s mr.mrrefChr5 195670 33 + 294542 TCCAGATTGTTTTTTGCTGTTCTATTCCTGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348382 33 + 636262 TCCAGATTGTTTTTTGCTGTTCTATTCCCGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 339796 33 + 647215 ATCAGATTGTTTTTTGCTGTTCTATTCCTGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 195703 145 + 294542 TCGGACACCTATTGGCCTTTGGTCCATTGGAAGTACCACAAGTCAAGATATAGGATAAAGAGTTAGGATCAACTGGGCATTAAAGATAACATTGGGGCTGCAACAGTGTGAACAGTTGGTCTGGACCTGTACCATTTACTGCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348415 145 + 636262 TCGGACACCTATTGGCCTTTGGTCCATTGCAAGTACCACAAGTCAAGACATACAATAAAGGGTTAGGATCAACTGGGCATTAAAGATAACATTGGGGCTGCAACAGTGTGAACAGATGCTCTGGCCCTGTACCATTTACTGCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 339833 145 + 647215 TTGGACATTCATTGGTGTTTGATCCATTGGAATTACCACAAGTCGAGGTATGGGACAGAGAGTTGGGATCAACTGGGTATTACAGATTACATTGGGGCTGCAACAGTGTGAACACTGTGTCTGGACCTGTACCATTCACTGCACC + +a +s mr.mrrefChr5 195848 30 + 294542 AGGTGTGTTAGGTGTCTCAGAGGTATCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348635 30 + 636262 AGGTGTGTTAGGTGGCTCAGAGGTATCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 339978 16 + 647215 AGGTGTGTTAGGTATC-------------- + +a +s mr.mrrefChr5 195878 32 + 294542 AGAGAGGAGCTCATGAAATTGGGATTAGTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348668 32 + 636262 AGAGAGGAGCTCATGAAATTGGGATTAGTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 339994 5 + 647215 -------------------T--------TGTA + +a +s mr.mrrefChr5 195910 84 + 294542 AAAGTGAAACAGTTAACTGGGGAATAATGGCTACACATGTGAACCATCTTCTTGTCCCATCCCAACATTATCCTCAATATCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348700 84 + 636262 AAAGTGAAACAGTTAACTTTGAAATAATGGCTACACACATGAACCATCTTCTTGTCCCATCCCAACATTATCCTCAATATCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 340005 84 + 647215 AAAGCAAAACAGTTAACTGGGGAATAATAACTACACATGTGAACCATCTTCTTGCCATATCCCATCATTGCCCTAAATATCATC + +a +s mr.mrrefChr5 195994 183 + 294542 AGAGAATTACAAAAGTAAGGCTTCACTAGACTACACCTGAACAAATGTGGAATCATCGGTCAGGCACATTGAAAAACTGATGTTGTGTTCAAGGCAGACCTACTATTATTCTTGTTTCTCTTAAAATATCACCTTTAACCAACCTCTCAAGAAAACCATCAAATGTCAAAAAATTCTGACTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348784 182 + 636262 AGAGAATTACCAAAGTAAGGCTTCACTAGACTACACCTG-ATAAATGTGGAATCATTGTTCATGCACATTGAAAAGCTGATGTTGTGTTCAAGGTTGACCTACTCTTATTCTTGTTCCTCTTAAAATATCACCTTTAACCAACCTCTCAGGAAAACCATCAAATGTCAAAAAATTCTGACTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 340090 182 + 647215 AGAGAATTACAAAAGCAAGGCTTCACTAGACTACACCTGAACAAGTCTGGAATCATCGGTCAGGCACATTGAAAAA-TGATATTGTGCTCAAGGCAGACTTACTATTATTCTTGTTTCTCTTAAAATATCACCTTCAACCATCCTCTCAAGAAAAACATAAACTGTCAAAAAGCCCTGACTTT + +a +s mr.mrrefChr5 196177 279 + 294542 CCCCGTGTGCCAGTAATCACCCTACTCTGTCTCACTGCCACCAAGAATGTATACAACCATGCGGATGTCACACAATAAAACTGCTTCTTATTCTCTTGGGCAATTCTCAATTTTAGTACTTATATTGCCATTCTGTACCGTCTGAATATGATCCATTTGACTAGTAGATGTGTCAACTACATTATTACTCTGGATGCTTCAAAGTGAGTATCTTACAGACTCACATCTATTGAGCTTGTTAAAGGTGCAAAGGTTCCCATGGGAGAGGTGGTAGAATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 348971 277 + 636262 CCCTGTGTGCCAGTAATCACCCTACTCTGTCTCACTGCCACCAAGAATGTATACAACC--GCGGAAGTCACACAATAAAACTGCTTCTTATTCTCTTGGGCAATTCTCAACTTTAGTACTTATATTGCCATACTGAACCGTCTGAATATGATCCATTTGACTAGTCGATGTGTCAACTACATTATTACTCTGGATGCTTCTAAGTGAGTGTCTTACAGACAGACATCTATTGAGCTCGTTAAAGGTGCAAACGTTCCCATGGGAGAGGTGGTAGAATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 340272 276 + 647215 CTCCTCATACCAGTAATCACCTTACTCTGTCTCACTGCCACCAAGAATGTCTACAACCATGCAGATGGCACACAATAAAACTGCTTCTTGTGCTCTTGGGCAATTCTCAATTTTAGTGCTTATATTTCCATTCTGTA---TCTGAATACGATCCATTTGACTAGTAGATGTATCAACTATATTATTACTCTGGTTGCTTCAAAGTGAGTATCTTACAAACTCATGTCTATTGAGCTTGTTATAGCTGTGAAGGTTCCCATGGGAGAGGTGGTAGAATGT + +a +s mr.mrrefChr5 196456 188 + 294542 AGATCTCACTCCTAGCAGTACCGTCAATAGTCTAGGGTGCTGTCCCATATATACATTTTTGACCCATCGGGACTCTGTCTGTTATAACCTGGTGACATCTGGGATGACTCTCAGTCACCAATCCTGGATCCATACATGTTCATCGATCATTAAGGACCACTAGATTGCTAAGCAGATGTAACTCACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349248 188 + 636262 AGATCCCACTCCTAGCAGTATCGTCAATAGTCTAGGGTGCTGTCCCATATATACATTTTTAACCCATCAGGACTCTGTCTGTTCTAACCTGGTGACATCTGGGATGACTCTCAGTCACCAATCCTGGATCCATACATGTTCATCAATCATTAAGGACCACCAGATTGCTAAACAAATGCAACTCACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 340549 174 + 647215 AGATCTCACTCCTAGCATCACTGTCAATAGTCTAGGGTGCTGTCGCATACATACATTTTTGACCCATCGGGACTCTCCCTGCTATAACCTGGTGACAACTAGGA--------------CCATCCTGGATCCACATAGGTTCATGGATCATTAAAAACCACTAGATTGCTAAGCAGATGTAACTCACAC + +a +s mr.mrrefChr5 196644 82 + 294542 CTTCTTCTTGTTGGGGATGAGGAGTCCGTGCCCTATGTTGCTGGATTCCAAATTCTTTTTTCCCTTCTTGTCAACCCTCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349439 82 + 636262 TTTCTTCTTGTTGGGGATGAGGAGTCTGTGCCCTATGTTGCTGGATTCCAAATTCTTTTTTCCCTTCTTGTCAACCCTCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 340723 82 + 647215 CTCATTATTGTTGGGGATGAAGATTCCATGCCCTATGTTGCTGGATTTAAAATTCTTTTTTCCCTTCTTGTCAACCCTCTTG + +a +s mr.mrrefChr5 196726 43 + 294542 GCCCAGCTAATGTAGACATATACTGGTCCCAGTGTCTGGAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349521 43 + 636262 GTCCAGCTAATGTAGACGTATACTGGTCCCAGTGTCTGGAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 340815 43 + 647215 GCCCAGCTAATGTGGAGATACGCTGGTCCCTGTGTCTGGAGAC + +a +s mr.mrrefChr5 196769 25 + 294542 AGGCAACCCTAGCCATTAGGTGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349564 25 + 636262 AGGCAACCCTAGCCATTAGGTGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 340864 25 + 647215 AGGTAACCCTAGTCATTAGGTGCAG + +a +s mr.mrrefChr5 196794 65 + 294542 ACCTTCATTGGAACCTTTTCCTTAAACTTGACTCATATCTTTGTAAAGATTACCTGACACACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349589 65 + 636262 ACCTTCATTGGAACCTTTTCCTTAAACTTGACTCACATCTTTGTAAAGATTACCTGACACACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 340899 65 + 647215 ACCTTCGTTGAAACCTTTTTCTTACATTTGACTCATATCTTAGAAAAGCTTACCTGACACATGGG + +a +s mr.mrrefChr5 196859 147 + 294542 CCTGCAGACTCAGATAAAATACCGACGTAATGTACAATACTACTAGTTCTGAAGCATCCCTGTGGGAGGCATGGGAAGTAGAGTAGGATTATGTAACTTGGTTCCTACCCAGACTGACACCCACACATAGTCCAGGCCCTGAGTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349663 147 + 636262 CCTGCAGACTCAGATGAAATACCGACGTAATGTACAATACTACTAGCTCTGAAGCATCCCTGTGGGAGGCATGGGAAGTGGAGTGGGATTATGTAGCTTGGTTCCTACTCAGACTGACACCCACACAAAGTCCAGGCCCTGAGTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 340964 147 + 647215 CCTCGAGACTCAGATAAGATACCGACGTAATGTACAATACTACTAGTTCTGAAGCATCCCTGTGGGAGGGATGGGAAACAGAGTAGGATTATGTAACTTAGTTCCTACCCAGACTGACACCCTCACATAGTCCAGGCCCCGAGCAAA + +a +s mr.mrrefChr5 197006 46 + 294542 AGATAGTCCATTGCCTAGCCTAGTTCACTTCCATCAAGGATCACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349810 46 + 636262 AGATAGTCAATTGCTTAGCTTAGTTCACTTCCATCAAGGATCACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 341114 46 + 647215 AGATAGTACATTGCCTAGCCTAGTGTACTTCCTTCAAGGATCACTT + +a +s mr.mrrefChr5 197052 177 + 294542 TCAAGGTATAGTTCTTGACTCATCTGTCGATTTCTTAGTGAACACTCTTCTCTTTGGAAGTTTAAAGGAAACCTTGTCATGGGTCCTTTGCTCGGTGGTAACCAGATAGAGGGATCCTAGCCGTATGTACACTATGCTTGGGGTGTACTTGAAGATAAGCTCACTACCATCATAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 349856 176 + 636262 TCAAGGTATAGTTCTTGACTTGTCCATCGATTTCTTAGTGGA-ACTCTCCTCTTTGGAAGTTTAAAGGAAACCTTGTCCTGGGTCCTTTGCTCGGTGGCAACCAGATATAAGGATCCTAGCCGTATGTGCACTATGCTTGAGGTGTACTTGAAGATACGCTCACTACTATCATAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 341162 174 + 647215 TCAAGGCAGAGCTCTTGACTCATCTGTCAATTTCTTAGTGAACCCTCTTCTCTTTGGAGATTTAAAGGAAACCTTGTCATGGGTCCTTTGCTCAGTGGTAACC--ATAGAGGCATCCTAGCCACATGTACACGAG-CTCAGGGTATACTTGAAGATAAGCTCACTACCATCATAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 197229 79 + 294542 ATCTCTTGTCTGAGATGCACTCAAAAGGGGAGCCTATGGAACCATAACAAAGGTATTTTTGGTATGGCAGGTTTGAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350032 79 + 636262 ATCTCTTGTCTGATATGCACTCAAAAGGGGAGCCTACAGAACAATAACAAAGGTATTTTTGGTATGGCAGGGCTGAGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 341337 79 + 647215 ATCTATTGTCTGAGATGCACTCAAAAGGGGAGCCTATGGAACCATAACAGAGGTAGTTTTGGTATGCCAGGTTTGAGCT + +a +s mr.mrrefChr5 197308 131 + 294542 CCATACCTACTTCACACCAAAAGAAGTCAGGCATCCCACAATGAAAAATTGTAACAACTCTGGTCTGCCCATAAGAATCTCAGATTACTGCACAGAAGCTGCCACTGGCTTGATCTCTGGTCCAAGGTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350116 131 + 636262 CCATACCTACTTCACACCAAAAGAATTCAGGCATCCCACAATGAAAAATTGTAACAACTCTGGTCTGCCCATAAGAATCTCAGTGTACTGCACAGAAGCTGCCACTGGTTTGATCTCTGGTCCAAGGTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 341416 131 + 647215 CCCTACCTACTTCACAGCAAAAGAAGTTAGGCTGCCCACAATGAAAAATTGTAACAACTCTGGTCAGCCCATAAGAATCTCAGATTATTGCACAGAAGCTGCTACTGGCTTAATTTCTGGTCCAAGATAGT + +a +s mr.mrrefChr5 197439 23 + 294542 TGGATTTCATAAGATCACTGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350247 23 + 636262 TGGATTTCATAAGATCACTGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 341548 23 + 647215 TGGATTTCCTAAGATCAGTGGTC + +a +s mr.mrrefChr5 197462 22 + 294542 TGTGTATTCAAACGAGATTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350270 22 + 636262 TGTGTATTCAAACGAGATTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 341576 22 + 647215 TATGTCTGCAAACAAGATCGGT + +a +s mr.mrrefChr5 197484 118 + 294542 TTCTTGCAAACATAACAACCCACCATGGCATGTAGATGGTGTACTATTTGTTTCCAATGTCTTGAGAATGGGGGATGCACTTATCTTAAGTGTAGGTTAGCCTGTTGTGTATTACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350302 118 + 636262 TTCTTGCAAACATAACAACCCACCATGGCATGTAGATGGTGTACTATTTGTTTCCAATGTCTTGAGAATGGGGGATGCACTTATCTTAAGTGTAGGTTAGCCTGTTGTGTATTACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 341598 118 + 647215 TTCTAGCACACAAAATAACTCACCATGGTATGTAGATGGTGTTCTATTTGTCTCCAATGTCTTGACCACTGGGGATGCACTTATCTTAAGTGTAGGTCAACCTGCTGTGTATTATCTT + +a +s mr.mrrefChr5 197602 286 + 294542 AAACACTCTGCACTATAACAAGATCTACACGTCAGATCACTTACCTGAATTACCGCACTTACTTTGGCATGACAGTGTAGGAACAAACTGTAGGATTGAGACGGATAGACTGAGTGCAGATATTTGGCACTCTAAAGTATCTTTTGGTAGCCTAATCAACAGACAATGGGCTCTCAGAGGAGTGCTTGTTTGTGCCAGTTAGGCTGTACTCCTTTCCTTTGGTAAGCCTATAGATAAGTTTGGCTTAGGAGCGTCATAAACCTATCCAATATATCGATATATTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350421 286 + 636262 AAACACTCTGCACTATAACAAGATCTACACGTCAGATCACTTACCTGAATTACCGCACTTACTTTGGCATGACAGTGTAGGAACAAACTGTAGGATTGAGACGGATAGACTGAGTGCAGATATTTGGCACTCTAAAGTATCTTTTGGTAGCCTAATCAACAGACAATGGGCTCTCAGAGGAGTGCTTGTTTGTGCCAGTTAGGCTGTACTCCTTTCCTTTGGTAAGCCTATAGATAAGTTTGGCTTAGGAGCGTCATAAACCTATCCAATATATCGATATATTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 341716 286 + 647215 AATCACTCCACACTATTATAAAATGCACACCTCAGATCGCTTGCTTGAATTACCCCACCTATTTTGGCATGACAGTGGAGGAACAAACTGTAGGATTGAGAGGGACAGACTGTGCACAGATATTTCATACTCTAAAGCATCCTTTGGTACCCTAATCAACAGATAATGGGCTTTCAGGTGAGTGCTTGTTTGTGCCAGTTAGACTGTACTCTTTCCCTTTGGTAAGCCTATAGATAGGTTTGGCTTAGTAGCATCATAAACCTATCCAATATATCAATATATGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 197888 95 + 294542 CTCAAATCACAATCAGTTTCTGTATTTCTCCATATCCTGATTCACAAGTTAGGCTAGTCCCTTACTGTGATTGTAATTTCATGACTCCTATACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350712 95 + 636262 CTCAAATCACAATCAGTTTCTGTATTTCTCCATATCCTGATTCACAAGTTAGGCTAGTCCCTTACTGTGATTGTAATTTCATGACTCCTATACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 342002 95 + 647215 CTCAAACCACAATCAGTTTCTATATCTCTCCATATCTTGATCCATTGGTCAGGCTAATCCTTTACTGAGATTGTAATTGCATGACTGCTATAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 197983 11 + 294542 TGCCTCTTGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350807 11 + 636262 TGCCTCTTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 342100 11 + 647215 TGCATCTTGCA + +a +s mr.mrrefChr5 197994 10 + 294542 CCTGAGGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350818 10 + 636262 CCTGAGGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 342154 10 + 647215 CCTTAGTCAC + +a +s mr.mrrefChr5 198004 131 + 294542 TTTTGTTAACAGAGTTCACATATGGATATGTTGTGACAGTGCATTCTCACTTATCTGTTAAAGCAGTTTTGGCTGGATTGGTTTAAACATGGCGCAAACTGCAAATGCAGTGACTCCACCAGTGTCCCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350837 131 + 636262 TTTTGTTAACAGAGTTCACATATGGATATGTTGTGACAGTGCATTCTCACTTATCTGTTAAAGCAGTTTTGGCTGGATTGGTTTAAACATGGCGCAAACTGCAAATGCAGTGACTCCACCAGTGTCCCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 342164 131 + 647215 TTTTGTTAACAGACATTGCATATGGTTATGTTGTAATAGTGCACTCTCACTTACCTGTTAAAACAGTTTTAGCTAGATTGGTCGAAATGTGGCGCACAGTCCAAGCACAATGACTCACCAAGCATTCCCTC + +a +s mr.mrrefChr5 198135 107 + 294542 ACTCGCAGTCTTAATCTGTCACAACATCCACACTGATAAGCCTAAATTTGATGAATCAGAGAACAATGGCCCTCAGGCAAAAGTTTGATCCCAGAATGGATCACAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 350969 107 + 636262 ACTCGCAGTCTTAATCTGTCACAACATCCACACTGATAAGCCTAAATTTGATGAATCAGAGAACAATGGCCCTCAGGCAAAAGTTTGATCCCAGAATGGATCACAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 342295 107 + 647215 ACACACAGTCTAAGACTGTCACAATATCCAACCTGATAAGGCTAAACTTGACGAATCAGACAACAACAGTCCACGGTCAAAAGTTGGATCCCAGAATGGATCCTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 198242 36 + 294542 CAGGGGTTTTCATCACATCTAGGTTGTACTTTACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351076 36 + 636262 CAGGGGTTTTCATCACATCTAGGTTGTACTTTACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 342403 36 + 647215 CAGGGATGTTCATCAAACCTAGGTTGTACTCAACCT + +a +s mr.mrrefChr5 198278 13 + 294542 TTAAATGAGTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351112 13 + 636262 TTAAATGAGTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 342462 13 + 647215 TTCAATGGGTTGG + +a +s mr.mrrefChr5 198291 119 + 294542 AAGGTTTGTCCCTGTGGTGGAATCATAGACTTTATGGAATCAAGGTGTGGTGAAAACAGTCACTATCATCATTTTGGTTGACTGCACATGGATATGATTTGCCTTTGATAAGCGGCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351130 119 + 636262 AAGGTTTGTCCCTGTGGTGGAATCATAGACTTTATGGAATCAAGGTGTGGTGAAAACAGTCACTATCATCATTTTGGTTGACTGCACATGGATATGATTTGCCTTTGATAAGCGGCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 342475 119 + 647215 AAGGTTTGTCCCTGTGGTGGAATCATAGACTTTATGGAACCAGGAAGTGGAGGAAACAGTTATTGTCATCATTTTGGTTAACTGCACTTGGGTATGGTTGATTTTTGATAATTGGCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 198410 33 + 294542 TAAAGGGCCATTAAGTATCCTTATTGTAGAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351251 33 + 636262 TAAAGGGCCATTAAGTATCCTTATTGTAGAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 342594 33 + 647215 TAAAGGACCACTAAGTATCCTTATCGTAGAGAC + +a +s mr.mrrefChr5 198443 8 + 294542 TTCTCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351287 8 + 636262 TTCTCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 342627 8 + 647215 TTCTAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 198451 7 + 294542 TCTGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351295 7 + 636262 TCTGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 342638 7 + 647215 ACTAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 198458 25 + 294542 AGCCTCTGTGTAGAGACTGTTTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351303 25 + 636262 AGCCTCTGTGTAGAGACTGTTTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 342645 25 + 647215 ATCCTTATTGTAGAGACTTCTTCTC + +a +s mr.mrrefChr5 198483 53 + 294542 AGATCTGTGTGAGCCTCTGCGTTAATGTCTGAGGGGGATGCTCAGAGGGTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351328 53 + 636262 AGATCTGTGTGAGCCTCTGCGTTAATGTTTGAGGGGGATGCTTAGAGGGTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 342672 47 + 647215 AGATCTGTGTGAGCCCCTGGGTTAGTGTCTCAGGGGGATGCTCAGAG------ + +a +s mr.mrrefChr5 198536 32 + 294542 TGCTTAGAGGGTTGGGGGTGTTGTATGTGACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351384 32 + 636262 TGCTTAGAGGGTTGGGGGTGTTGTATGTGACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 342719 23 + 647215 ---------GGATGGGGGTCTTGTATGTGACA + +a +s mr.mrrefChr5 198568 3 + 294542 TAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351416 3 + 636262 TAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 342748 3 + 647215 TAT + +a +s mr.mrrefChr5 198571 222 + 294542 CACCTAACTCAATTGCTACAAGAGGATAGAATGCTTAAGTGACCCTATTATGAATAGCTATGGCAACTGTATCTTACTCACATGAGCTCAAATTCCCATTCTCAATTTTATGCCTAACCAACAATGGGTATACTGCAGAATACCATGGAATTTCAGATTGTTGCCCTAAAGGTTGCTTGCAAGGCTAGTCAATCAGATTCAAAGTATAAGAACATACAGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351419 219 + 636262 CACCTAACTCAGTTGCTACAAGAGGATAGAATGCTCAA-TGACCCTATTATGACTAGCTATGGAAACTGTATCTTGCTCACATGTGCTCAAACTCCCATTCTCACTTTTATGCGTAACCAACAATGGGTATAGTGCAGAATACCATGGAATTTCAGAATGTTACCCTAAAACTTG--TGCATGGCTAGTCAATCAGATTCAAAGTATAATAACATACAGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 342753 222 + 647215 CACTTAACTCAATCGCTACAAGAGAATAGAATGCTTAAGTGACCCTACTATGGATAGCTATGGCAACTGTATCTTACTCACATGAGCTCAAATTCCCATTGTCAATTTTATGCCTAACCAAAGATGGGTATACTGCGGAATACCATAGAAGCTCAGATTGTTGTCCCAAAGGTTGCTTGGAAAACTAGTCAATCAGAGTCAATGTATAAGAACATACAGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 198793 56 + 294542 AATGTTGCAGATGGTCCCTTTAGAGTCATCCAGGGTAACTTGAGTCAGCGTTGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351639 56 + 636262 CATGTTGCAGATGGTCCCTTTAGACTCATCCAGGGTAACTTGAGTCAGCGTTGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 342975 33 + 647215 AATGTTGTAGATGGTCCCTTGAGAGTCATCCAA----------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 198849 14 + 294542 ATCTCAAACCTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351696 14 + 636262 ATCTCAAACCTTGA + +a +s mr.mrrefChr5 198863 408 + 294542 CAAGTGCTCTTTCACAGGTATCAGGTATAGGTGGGATTCAACACCCCAAAGTTATAAACAAAAAAGTTACATTTTACAAAGGTGTGTGCTACAACCATAATTGAGCTTATAGTAAGCCAAGCTTCTCAAAGGTTAACTCATTTGGGAATACAACCCTTATATATCCATGGGGATGACAGAACAGTCCTAAATGTGGACACTCCTAACTAGCCCATTCCTAGTTATTGAGGCCACACTTGTGCTTGTCTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGACTATGAGTGGGGTGCGGCCATTGGCAAGGTTCTGTAGGAGTTGCTGTGAGGTTTGAATGGCCACCCTATTTTATGAAGCTTGAAACTAAGGGGTCAATGTTTTTTTCTGTGTTGATGCTATCCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351713 407 + 636262 CAAGTGCTCTTTCACAGGTATCAGGTATAGGTGGGATTCAAAACCCCAAAGTTATAAACAAACAAATTACATTTTGCAAGGCTGTGTGCTACAACCATAATTGCACTTATAGAGAGCCAAGCTTCTCAAAGATTAACTCATATGGGAATACAACCCTTATATATCTATGGAGCTGACAGAATGGTCCTAAATGTGGACACT-CTAACTAGCTCATTCCTAGTTATTGGGGCCACACTTGTGCTTGCGTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGAGTATGAGTGGGGTGCGGCCACTGGCAGTGTTCTGTAGGAGTTGCTGTGGGGTTTGAATGGCCACCCTATTCTATGAAGCTTGAAACTATGGGGTCAATGTTTTTTTCTGTGTTGATGCTATCCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 343008 389 + 647215 -------------ACAGGTATCA-GTATAGCTGGGATTCAACACCCAAAAGTTATAAGCAAAAAAGTTCCATTTTACAAAGGTGTGGGCTACAGCCATAATTGAGCTTATGGTATG-CAAGGTTCTCAAAGGTAAACTCATTTGGGAATACAACCTTTCAATGCCCATGGGGATGACAGAACAGTCCTGAATGTGGACACTCCTAGCTACCCCATTCCTAGTTATTAAGGCCACATTTGCGCTTGTCTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGACTATGAGTGGGGTGAGGGCATTGGCAAGGTTCTATAGGAGTTGCTGTGAG----GAATGGACACCCAATTTTATGAAACTTGAAACTAAGGGGCCAATGTTTTTTTCCTTCTTGATGCTATCCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 199271 46 + 294542 CCTATAGACAGAGAACCAAATGAATTGTGCTACAGTGGCTGGTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352120 46 + 636262 CCTATAGACAGAGAACCAAATGAATAGTGCTACAGTGCCTGGTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 343429 46 + 647215 CCTATAGACAGATAACCAAATGAATTGTGCTACAGTGGCGGGTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 199317 83 + 294542 GAAGCTTCTTGTTGCATATTTCTGGCACTCATTATAAAGTGGTCAGTGTCTCCAGCCAACCATGCTCAACAGGCTTTAATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352167 83 + 636262 GAAGCTTCTTGTTGCATATTTCTGGCACTCATTACAAAGTGGTTAGTGTCTCCAGCCAACCATGCTCAACGGGCTTTAATATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 343475 76 + 647215 GAAGGTTCTTGTTGCATAATTCTGGCACTCATTATAAAGCGGCCAGTGTC-------AACCATTCTCAACAGGCTTTAATGTT + +a +s mr.mrrefChr5 199400 347 + 294542 CAGGGCCCAGATCTAACACATAATGAACCCAATTCTTTGTAGGTAGGAGGTTTGTGGAACAACAAGTTACTGTGTATAAACTGTTTTTACCAGTTTTGATGCCTTAGCTCCCCGACAAGCAAGCTACTGTTCTATCTGTATTATGTTAGTAGCAAAGAGCATAATAATTCAGTGGGCAACATTTGGCTGATCTATCTTTTATTGCTAACTGATTATCTGAAGGGCACCTAGAAGTGCTTTGTGCCATCACCATTAATCTATGTGCACTAGTTGGCTTTCACGTCCCCGTACTGGCATCCAAATAGTGAACAAGGCCTGCTGGACACTCTGTAAATAGGAACTAACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352251 342 + 636262 CAGGACCCAGATCTAACACAT-ATGAACCCAATTTTTTGTAGGTAGG----TTCAGGAACAACAAGTTACTGTGTATAAACTTTTTTTACCAGTAGTCATGCCTTAGGTCCCCGCCAAACAAGCTACTGTTCTATCCGTATTATGTTAGTAGCAGAGAGCATAATAATTCAGTGGGCAACATTTGGCTGATCTATCTTTTATTGCTATCTGATTATCTGAAGGGTACCTAGAAGTTCTTTGTGGTATTACCATTAATCTAAGTGCACTCCCTGGCTTTCACGGCCCTGTACTGGCATCCAAATATTGAACAAGGCCTGCTGGACACTCTGTAAATAGGGGCTAACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 343551 346 + 647215 CAGGGTCCAGAACTAACACATAATGAAACCCGTTCTTTGTAGGGAGGAGGTTTGTGGAAGAACAAGTTAGTGCGTATAAACCGTGTTTACCAGTTTTGATGTCTTAGCTCCCCAACAAGAAAGCTACTGTTCTGTCTGTATTATACTGGTAGCAAAGAACCCAATAATTCAGTCAGCAACATTTGGCTGATCTATCTTTTATTGCTAACTGATTATCTGAAGGGCACCTAGAAGTGCTTTGTGCCCTCACCTTTAATGTATGTGCACTAGTTGGCTTTCACCTCCCCGT-CTGGCATCCAAATAGTGACCAAGGCCTGCTAGACACTCTGTAAAAAAGAACTAACCC + +a +s mr.mrrefChr5 199747 50 + 294542 ATGCCAAAGAGATGCACTCTACAATAACCCCTTGATAACCTTAAGAGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352596 50 + 636262 GTGCCAAAGAGATGAACTCTACAATAACCCCTTGACAGCCTTAAGAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 343897 49 + 647215 ATGCCAAGGAGATGCATTCAACAATAACCCCCT-ATAACCTTAAGAGAGA + +a +s mr.mrrefChr5 199797 151 + 294542 GCATGTGAAAATTACCTCATGTTTAGGCCAAAATAACCCTTAGGTCCATGTAACTCAGGGCAATTGTTGCCAGAGAGATAGGAAGTTGATTTGAACTTCAGTGTTGCAAATACCTCATTCAATAAGTTCCTTCTGTTCCAGGTACCAGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352646 139 + 636262 GCATGTGAAAATTACCTCATGTTTAGGCCAAAATAACCCTTAGGTCCACGTAACTTACGGCAATTGTTGCCAGGGAGATAGGAAGTTCATTTGAACTTC------------ACCTCATTCAATAAGTTCCTTCTGTTCCAGGTACCAGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 343978 151 + 647215 GCATGTGAAAATTACCTCATGTTTAGGCCAACATAACCTCAAGGGCCATGTAACTCAGGACAATTATTGCCGGACAGATAGGAAGCTGATTTGAACTTCAGTGTTGCAAATACCTCATTCAATAAGTTCCTTCCATTCCAGGTGCCAGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 199948 6 + 294542 TTTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352785 6 + 636262 TTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 344137 6 + 647215 TTTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 199954 126 + 294542 GAATGTAGCTCTGTTTGAGACTAAGCTCCAATGTTGCCTCTCCTCATGAGAGCTCTGTAGCGATGTAGTAAGCAGGTTATTTTCGCTCATATTCTAGCTCAAGAACAGGCTCTAAGAGAATCAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352791 123 + 636262 AAATGTAGC---ATTTGAGACTAAGCTCCAATGTTGCCTCTCCTCATGAGAGCTCTGTAGCGATGTAGTAAGCAGGTTATTTTCGCTCATATTCTAGCTCAAGAACAGGCTCTAAGAGAATCAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 344151 126 + 647215 GAGTGTACCTCTGTTTGAGACTAAGCTCCAAAGCTGTCTTTCCTCAGGAGAGCTCTGTAGCGATGTAGTGAACGGACTATTTTCACTCATATTCTAGCTCAATAACTGGATCTATGGGAATCAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 200080 30 + 294542 CCAGGGAGGCAGTAGTGTAAAACAGATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352915 30 + 636262 CCAGGGAGGCAGTAGTGTAAAACAGATAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 344277 30 + 647215 CCAGAAAGGCAGGAGTGTAAAACAGATAGT + +a +s mr.mrrefChr5 200110 72 + 294542 AAAAATCTTGAGGCCCTATGAGAGGTATATTGATTGTCTAGATAAAATGTAGCCTGTCAAGAGCTATGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 245997 72 + 636262 AAAAATCTTGAGGCCCTATGAGAGGTATATTGATTGTCTAGATAAAATGTAGCCTGTCAAGAGCTATGTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 344322 72 + 647215 AAAAATCTTGAGGCCCTATGAGAGGTAAATTGATTGCCTAGATAAAATGAAGCCTGTCAAGAGCTATGTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 200182 37 + 294542 CCTCAAACCTCATAGCTGCAACCCTTTGACTTATTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246069 37 + 636262 CCTCAAACCTCATAGCTGCAACCCTTTGACTTATTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 344396 37 + 647215 ACTTAAACCTCATAGCTACAACCATCTGACTTATTTT + +a +s mr.mrrefChr5 200219 48 + 294542 GGCACCCTTTGAGTTAGCTATCAGTCAGGGAGACATGAGGTTGCTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246106 48 + 636262 GGCACCCTTTGAGTTAGCTATCAGTCAGGGAGACATGAGGTTGCTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 344455 48 + 647215 GGCACCCTTTGATTTGGCTATCAGTCCGGGGGACATGAGGTTGATCCT + +a +s mr.mrrefChr5 200267 23 + 294542 AATGTAGGAGTGGGACAGAATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246165 23 + 636262 AATGTAGGAGTGGGACAGAATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 344503 23 + 647215 GATGTAGGAGTGCGACAGAATTG + +a +s mr.mrrefChr5 200290 77 + 294542 CTGAATTGGAAGCCTTGTGCACATACCTGGCCTCCTTGTTAATCAGACTGGACTAGTTAGACGGATTCTGTTGAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246189 77 + 636262 CTGAATTGGAAGCCTTGTGCACATACCTGGCCTCCTTGTTAATCAGACTGGACTAGTTAGACGGATTCTGTTGAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 344526 77 + 647215 CTGAATTGAAAGCCTTGTGCACAGACCTGGCCCCCTCGTCAAGTGCTCTGGAGTAGTTAGATGGATTACATTGAGCC + +a +s mr.mrrefChr5 200367 50 + 294542 GGGGCTTCATTCATGAGATCCTTTACCCACCTTGTCACCAAACTTGTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 246267 50 + 636262 GGGGCTTCATTCATGAGATCCTTTACCCACCTTGTCACCAAACTTGTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 344603 50 + 647215 GGGCCTTTATTGAAGAGATCCTTCACCAGACTTGTCACCAAACTTGTAGT + +a +s mr.mrrefChr5 200417 123 + 294542 TGACAATAGTGGGAGTCAACTAGAGTTCCTCAGTGGCAAGAATATTTGAAACAGGAGCATGGGTACGTCAGGTTTACTCCTTTTGACATATTATTGCTAGCACTGACAGGTCATTGATCACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 352952 123 + 636262 TGACAATAGTGGGAGTCAACTAGAGTTCCTCAGTGGCAAGAATATTTGAAACAGGAGCATGGGTACGTCAGGTTTACTCCTTTTGACATATTATTGCTAGCACTGACAGGTCATTGATCACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 344713 123 + 647215 TAACAATGACAGGAGTCAACTAGAGTTCCTCTCTGGCAAGAATGTATGAAACATGAGGATGTGTACATTAGGTTTATTCCTTTTGACATATTATTGCTAGCAATGACAGGTCATTGATCACAC + +a +s mr.mrrefChr5 200540 127 + 294542 CCTGAAGTAAACAACTTCATGTATACATCACATGCTGCTTCACGTGTACTGCTGCGTCCTCTCAGTGAGACTCATCTCATGGCCATTGGGTATTTGCCCATAAGCTGGCATATTCCCAAGTATGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353077 127 + 636262 CCTGAAGTAAACAACTTCATGTATACATCACATGCTGCTTCACGTGTACTGCTGCGTCCTCTCAGTGAGACTCATCTTATGGCCATTGGGTATTTGCCCATAAGCTGGTATATTCCCAAGTATGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 344836 127 + 647215 CATGAAGTAAACAACTTCATGTATACATCACACGCTGGTTCACCTTTACTGCTGCATCCTCTCAGGGAGATTCTCCTCATGGCCATTGGGTATCTGCCCATAAGCTGGCATATTCCCAGGTATGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 200667 31 + 294542 CCAGGCTGGTATAGCCCTTGAGAAGTGACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353205 29 + 636262 CCA--CTGGTACAGCCCTTGAGAAGTGACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 344963 31 + 647215 CCAGGCTGGTATAGCCCTTGAGAAGTGACCA + +a +s mr.mrrefChr5 200698 64 + 294542 ATCAAACTGGTTTAGACATTTTAGATGAATCTAACGGGTTCTTAAGATTGCGACATAATAGGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353236 63 + 636262 ATCAAACTGGTTTAGACATTTT-GATGGATCTAACGGGTTCTTAAGATTGCGACATAATAGGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 344994 64 + 647215 ATCAAGCTGGTCTATACATTTTAGATGAATCTTTCAGGTTTTTAAGATTGCAACATAATAGGGC + +a +s mr.mrrefChr5 200762 105 + 294542 CTTATTTAGttctaattagatgaacttcatgtaattcttctagttcaggtacaagggtgcgaccccaggtaactttagagtgtgtatgcaaaatatacctcaagg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353300 90 + 636262 CTTATTTAGttctaattagatgaacttcatgtaattcttctagttcaggtacaa---------------taactttagagtgtgtatgcaaaatatacctcaagg +s simRat_chr6.simRat.chr6 345058 104 + 647215 CTTATTTAGttccaattggatgatcttcatataattcttctagtttaggtactagggtgcgaccccaggtgctgctggagattggttggttaata-acttcagag + +a +s mr.mrrefChr5 200867 60 + 294542 ggtcccaactttaagactctcctgtttcaagtgctaggTATCAAGTGACATTGAATGGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353390 60 + 636262 ggtcccaactttgagattctcctgtttcaagtactaggTATCAGGTGACACTGAATGGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 345164 60 + 647215 GGTCCTAACTCTAAGACTCTACTGTCTCAAGTGCTAGTTATCAAGTGACATTATTTGGGG + +a +s mr.mrrefChr5 200927 86 + 294542 TCTGGGACAAGTCTCAGCTGAATGCAAACAAGTCTCACCTCAGTGTAAACTATTGCTGCAAACTGGACTAATAGTGCACAGTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353450 86 + 636262 TCTGGGACAAGTCTCAGCTGAATGCAAACAAGTCTCACCTCAGTGTAAACTATTGCTGCAAACTGGACTAATAGTGCACAGTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 345232 86 + 647215 TCTGATACAAGTCTCACCTGAGTGCAAACAAGTCTCACCTTAATGTAAATTATTGCCGCAAACTGAACTAATAATGCACAGTGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 201013 130 + 294542 AGAAAGAGGTGGTATAAATAGTGGATTTAGTTAGCTCTCATAGTAGGCAGCATAATCCTCACCAATGTTGTTAAAAGGGCACTGACAGCGCAATTCCTATGCATAATCATTTGAACAAGACATTGTCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353537 130 + 636262 AGAAAGAGGTGGTATAAATAGTGGACTTAGTTAGCTCTCATAGTAGGCAGCATAATCCTCACCAATGTTGTTAAAAGGGCACTGACAGCGCAATTCCTATGCATAATCATTTGAACAAACCATTGTCAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 345318 122 + 647215 AGAAAGAGGTAAGATA-------GATTTAGTTAGCTCTCATAGTAGGCAGCATAATCCTCTCCAATGT-GTTAAAAAGGCATTAACATCCCAATTCCTAGACATAATCATTTGAACAAGACACAGCAGAC + +a +s mr.mrrefChr5 201143 8 + 294542 CTGATTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353667 8 + 636262 CTGATTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 345458 8 + 647215 CTGATTCA + +a +s mr.mrrefChr5 201151 55 + 294542 TACAGCCTCATATGTATGACCCTGACTTCCTTCATTCTCGAAAGGGGTATATGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353677 34 + 636262 TACAGC---------------------TCCTTCATTCTCGAAAGGGGTATATGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 345466 49 + 647215 TACAGCCTCATATGTATGACCCTGACTTCCTTCATTCTCG------GTATATGCC + +a +s mr.mrrefChr5 201206 80 + 294542 TTAAACCAGTATATGCCTTAAACCACTAAACTGGCCAAGGGGTTGCTTAACAGCTAAGACATGTGGTGTGTCATATCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353713 80 + 636262 TTAAACCAGTATATGCCTTAAACCACTAAGCTGGCCAAGGGGTTGCTTAACAACTAAGACATGTGGTGTGTCATATCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 345515 80 + 647215 TTAAACCAGTATATGCCTTAAACCATTAAACTGGCCAAGGAATTGTTTAACAGCTAAGACATGTGGTGTGTCACATCACA + +a +s mr.mrrefChr5 201286 698 + 294542 TGCCAGCTTAGAGTACGTTAGAATCTTGCAATATAGACTCTCGTTACAGACATGACAGATGGATATGGAATCAAGTTACTACTATGACAATTTAGACTGTATTTGCTTTGCTGCAAGGTGTGTCTTCCACCCTCAGGCTGTCTGATCGGACCAGTTGAGACCCCCACAGAAGCGTATATCACAGTCTATAGCACTGAGAGGAGGCCATGGGTGGGGGTAGCTGTCAGACATGTTGCTGATACACAGTCAATGGGAGTCAGACTACAGACTCCATAACCCTGTACTAGGACTCAACACAAGAGCAAGACGCAATTTTTCTTGGACCCATTTCCTTTTCCTATTAAGAATTAGAACAGGAAGGGAAGGGGGGTTGCCAGTAGGGGAGAAAATATAGTGAAAAGAGTAATCATAAGTGATCTGTAGACATAATCACACAGGAGGATGTAGCCTCTAGAGCAAGGCTTGCAACAGCTTTCCGTCATTGGGGCTTCACAAAGGCTACGTGGTGGCACACAGTATGATATCATGATGTAATGTGTTGGGAAGGATTGGTGGACCTACCTTGATCCACAAATTGAGGCTAAGCTGTAAGGTAGTCTTTTATCCCCCTTGCCTCAAACTTTCTTAGGGCCAGGTATGGACCACTGAAATCACTAAAAGAAAATCAGGCCTATATATTTTCTAACTGATAGTTGATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 353793 691 + 636262 TGCCAGCTTAGAGTACGTTAGAATCTTGCAATATAGACTCTCGTTACAGACATGACAGATGGATATGGAATCAAGTTACTACTATGACAATTTAGACTGTATTTGCTTTGGTGCAAGGTGTGTCTTCCACCCTCAGGCTGTCTGATCGGACCCGTTGAGACCCCCACAGAAGCGTATATCACAGTCTATAGCTCTGAGAGGAGGCCATGGGTGGGGGTA-----CAGACATGTTGCTGA--CACAGTCAAAGGGGGTCAGACTACAGACTCTATAATCCTGTACTAGGACTCAACACAAGAGCAAGACGCAATTTTTCTTGGACCCATTTCCTTTTCTTATTAAGAATTAGACCAGGAAGGGGAGGGGGGTTGCCAGTAGGGGAGAAAATATAGTGAAAAGAGTATTTACAAGTGATCTGTAGACATAATCACACAGGAGGATGTAGCCTCTAGAGCAAGGCTTGCAACGGCTTTCCGTCATTGGCGCATCACAAAGGCTATGTGGTGGCACACAGTATGATATCATGATGTAATGTGTTGGGAAGGTTTGGTGGACTCACCTTGATCCACAAATTGAGGCTAAGCTGTAAGGTAGTCTTTTATCCCCCTGGCCTCAAACTTTCTTAGGGCCAGGTATGGACCACTGAAATCACTAAAAGAAAATCAGGCCTATATATTTTCTAACTGATAGTTGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 345597 697 + 647215 TGACTGCTTAGAGTTCATAAGGATCTTACAATATAGACTCTCTTCACAGACATGACAGAATGATATGGAATCAAGTTACTACAATGAGAATTTAGACTGTATCTGCTATGCTGCAAGGTGTGTCTTCCACCCTCAGGCTGTCTGATTGGACCAGTTGAGACCCCCACAGAAGCCTATATCACATTCTACAGCACTGAGAGCAGGCCATGGGTAGGGGTAGCTGTCAGACATGTTGCTGATACACAGCCAATGGGAGTCAAACTTCAGACTCCATAACCCTGTGCTAGGACTCAACACAAGAGCAAGACACAATTTTTCTTGGACCCATTTCTTTTTCCTATTAAGAATTAGAACAGCAAGGGAAAGGGCGTTGCCAGTAGGGAAGAAAATATGGTGAAAAGAGTAATCATAAGTGATCTGTAGACATAACCTCACAGGAGGATATAGCCTCTAAAGCGAGGCTTGCAACAGCTTTCCATCATTGGGACTTCACACAGGCTACATTGTGGCACAGAGTATGATATCATGATTCAATGTGTTGGTAAGGATTGGTTGACCTACCTTGATCCACAA-TTGAGGCTAAGCTGTAAGGCAGTCTTTTACCCCCCTTGCTTCAAACTTTCATAGGGCCAGGTATGGACCACTAATATCACTAAAGGAAAGTGAGGCCAATATACTATATACATGATAGTTGATC + +a +s mr.mrrefChr5 201984 32 + 294542 CATTGCTAAATTGAAGTAGCATAGGATGCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354484 32 + 636262 CATTGCTAAATTGAAGTAGCATAGGATGCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 346298 32 + 647215 CATTGCCAAATTGGAGTAGCATAGGGTGCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 202016 72 + 294542 ACTTCATCCTAAAGGATCACCCTGATCAAAGTCTGCTTAGTCATGGATGTGTAGATCAGTCTGAACAAGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354516 72 + 636262 ACTTCATCCTAAAGGATCACCCTGATCAAAGTCTGCTTAGTCATGGATGTGTAGATCAGTCTGAACAAGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 346331 72 + 647215 ACTTCACCCTAAAGGATCACCCTGATTAAAGTCTGCTTAGTGACAGATGTGTAGATCAGTCTGAACAAGCGC + +a +s mr.mrrefChr5 202088 17 + 294542 AGAGATTCAATTGGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354599 17 + 636262 AGAGATTCAATTGGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 346403 17 + 647215 AGAGATTCAATGGGCCT + +a +s mr.mrrefChr5 202105 8 + 294542 tgtcagga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354616 8 + 636262 TGTCAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 346425 8 + 647215 tttaagga + +a +s mr.mrrefChr5 202113 90 + 294542 cagaagaaaagaagtttgtggatatagggcaccaaaagcttaggccttgggacaaattcttcaatacttatttggctgaaaaggtacagg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354624 90 + 636262 CAGaagaaaagaagtttgtggatatagggcaccaaaagcttaggccttgggacaaattcttcaatacttatttggctgaaaaggtacagg +s simRat_chr6.simRat.chr6 346434 90 + 647215 caaaagaaaagaagtttgtggatatagtgaactaccagcttaggacttggaacaaatttttcaacacttatttggctgaaaagggacagg + +a +s mr.mrrefChr5 202203 66 + 294542 ctgggttaagaaacaaaaaggagtacagatgaccttttcagaacaagcgtacaatacacaaaaaga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354714 66 + 636262 ctgggttaagaaacaaaaaggagtacagatgaccttttcagaacaagcgtacaatacacaaaaaga +s simRat_chr6.simRat.chr6 346528 66 + 647215 ctggcttaagaactgagatggattacgaatggcctgttcacaacaagtgcgcaatacacaaaaaca + +a +s mr.mrrefChr5 202269 34 + 294542 gaataacatgattaaaaaatgaactagacatcaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354784 34 + 636262 gaataacatgattaaaaaatgaactagacatcaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 346594 34 + 647215 gaatggcatgattaaaaattgaagtacaaaccag + +a +s mr.mrrefChr5 202303 93 + 294542 gcacccaattgcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacgagaagaactgtgtttattcatggtcagcctattgcactcgtctagaccaggg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354821 93 + 636262 gcacccaattgcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacgagaagaactgtgtttattcatggtcAGCCTATTGCACTCGTCTAGACCAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 346628 93 + 647215 gcacccaatggcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacaagagtaagtttgttgagtcatgatcggcctattgcaccagtaagcatcaggg + +a +s mr.mrrefChr5 202396 44 + 294542 aactttaccttttcctGATTGGTCCATCATACAAATGTGCTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354921 44 + 636262 AACTTTACCTTTTCCTGATTGGTCCATCATACAAATATGCTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 346721 44 + 647215 aactttaccttttcctGATTAGTCCAGCATACAAATGTGCTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 202440 137 + 294542 GTGTGATAATACAGTGTAGAGAACAAGGTGTTATGGTTCCATGTAACACCTATCTAATAGTCCTATAACAAGATTGAAGGGACAAAAGAATAAATAAAATACAAGAGGATACTGTCATTTCAAATTTAGTTAGGTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354970 137 + 636262 GTGTGATAATACGGTGTAGAGAACAAGGTGTTATGGTTCCATGTAACACCTATCTAATGGTCCTATAACGAGATTGAAGTGACAAAAGAATAAATAAAATACAAAAGGATACTGTCATCTCATATTTAGTTAGGTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 346765 134 + 647215 GTGTGATAA-ACAGTGTGTAGGACAAGCTGCTATGGTTCCATGAATCACCCATCTAATAGTCCTGTAACAAGATTGAAGGGACAAAAGAATAAATGAAAGACAAGAGGGTACTGGCACTTCAAATTTAGT--GGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 202577 77 + 294542 GTTTGATATTTGGTTAGACAATTAATGAGCAGTTAAGCAGTGAATCAACCCCACCCTACCATCCTAGGTAGAGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355118 77 + 636262 ATCTCATATTTAGTTAGACAATCAATGAGCAGTTAAGCAGTGAATCAACCCCACCCTACCATCCTAGGTAGAGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 346899 77 + 647215 GTTTGTGAGATGTTTAGGCAAATAATGAGCAGTTACGTAGCGAATGAACCCTACCCTACCATCCCAAGTAAAGGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 202654 39 + 294542 ATGTGATTGGGTTTGTGGTAGCTGAGTGGCTAGTACCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355198 39 + 636262 ATGTGATTGGGTTTGTGGTAGATGAGTGGCTAGTACCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 346976 39 + 647215 ATGTGATTAGCTTTGTGGTAGCTGAGCGGCTAGTGCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 202693 237 + 294542 TCTTAGACCATAATGAAAAGTAACTAAATAATCAGTCCTAGGAATAATTACTCAAATATTGTTATGTTGCATATATATAACTATCCAATGACAGATCCATATTCCTGCTTGTATATTATAGATACCGTAAGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGTAGTTCCCCTGAATTAGTAATGAAATTGTAGCAACCTGCAGCTGGTCTCATCCACATTGTAAGGACATGTGTTGGGGCTAGTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355237 237 + 636262 TCTTAGACCATAATGAAAAGTGACTAAATAATCAGTCCTAGGAATAATTACTCAGATATTGTTATGTTGCATGTATATAACTATCCAATGACAGATCCAGATTCCTGCTTGTATATTATAGACACCATAGGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGTAGTTCCCCTAAATTAGTAATGAAATTGTAGCAACCTGCAGCTGGTCTCATCCACATTGTAAGGACATGTGTTGGGGCTAGTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 347061 235 + 647215 TCTTGGACCGTAATGAAAAGGAAATACATCCTCAGTCCTGGGAATAATTACTCAAATGTTGTTATGTTGCTTATATATAACTATCCAATGACAGATTCATATTACTACTCGTATATTATAGATACCGTAAGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGCAGTTCCCCTGAATTAGTAATCGAATTGTAACAACCTGCAGCTGGTCTAATCCACATTGTGAGGACATGAGT--AGTCCAGTATG + +a +s mr.mrrefChr5 202930 120 + 294542 AGTAGAGATGGAGTACACTGGATAAGAGTACTAGTCCACGCTAAGCAACAACACCTGTCTTGAGACTCAAATATTAGCAGAGTCAAGGATGGTGTTACAGTGTATGATAGTCCATCATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355474 119 + 636262 AGTAGAGATGGAGTACACTGGATGAGAGTACTGGACCACGCTAGGCAACAACGACTGTCTTGAGACTCAAATATGAGCAGAGTCAAGGATAGTGCTAC-GTATATGATAGTCCATCATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 347296 120 + 647215 AGTAGAGATAGAGCACACTGGATAAGAGTGCTAGTCCACGCTTAGCAACATCACCTGTCTTGAGACTGAAATATTAGCAGAGTCAAGGATGGTGTTACAGAGTATGATAGTCCATCATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 347416 97 + 647215 CAT----------------------GTGTACTAGTCCACGCTAAGCAACAACACCTGTCTTG-GACTCAAATATTAGCAGAGTCAAAGATGGTGTCACAGGGTATGATAGTCCATCATGG + +a +s mr.mrrefChr5 203050 554 + 294542 CATGTCATCTTGACCACAATTTGACCAATGCAGATAACACGATTGTAATGTTGGGTCCCTGTTGCAAGCAGCTCAAGGTTAGGATGATGTTTATATCTGATCACAGTGCAAAGTTGTGCAAATTCTGTGGCCTTTAACTTTTACATGAGTGCTGGTAGTGTATCAAGACACCGGAATTTCTAAAGTGCAGGGAACTCAGTATTGTGGAACATGGGAGTTATGCATGGTGACTTTTGAATAGGATATTAAAAGTTGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAATAATTTCAGATCCTCCTATAAGTTCCTGTGAGGCTGCTTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGACACTCCTTGTTGATCATTTTACTGTCTAGTTCCTATGTATTATTATGCCTTCTGTGAGTTTCCCTTCTGCTCCACTATAACAGTTTGGATGCTGCAGAGGGACTGGATAAACATGAATGAACGTGAATTCTATTATTGCATCAAATCACTGGATAAACACATCATTAGACCCTCTAATGATTATCACACTGTTTATAGCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 355593 544 + 636262 CATGTCATCTTGACCACAATTCGACCAATGCAGATAATAGGATTGTAATGTTGGGTCCATGTTGCAAGCAGCTCAAGGTTAGGATGATGTTTATATCTGATCACAGTGCAAAGTTGTGCAA----TGTGGCCTTTAACTTCTACATGAGTGCTGGTAGTGTACCAAAACACCGGAGTTTCTAAAGTGTAGGGAACTCAGTATTGTGGAAGATAGAAGTTATGCATGGTGACTTTTGAATATAATATTAAAAGTGGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAATAATTTCAGATCCTCTTAT-CGTCCCTCTGAGGCTGCTTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGATGCTCCTAGTTGATCATTTTACTGTCTAGTTCCTATGTATTACCATGCCTTCTGTGAGTTTCCCC-----TCCACTATAACAGTTTGGATGCTGCAGAGGGACTGGACAAACATGAATGAACGTGAATTCTATTATTGCATCAGATCACTGGATAAACACATCATTAGAGCCTCTAATGATTACCACACTGTTTATAGCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 347513 536 + 647215 CATGTCATCTTGACCATAATTTGACCAATCCAGATAACACCAGCAT-ATGTTGGGTGTCGGTTGCAACCAGTTTAATGCTAGGATGGTGTTTATATCTGATGACGATGCAAAGTTGTGCAAATTCTGTGGCCTTTTACTTTTACATGATTGCTGGTAGTGTATCAAGACACGTGAATTTCTAAAGTGCAGGGAACTCAGCATTGTGGAACATGGGAGTGATCTGTGGTGAGTCTTGAATAGGATATTAAAAGTTGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAGTAATTTCAAATCCTCCTAGAAGTTCCTGTGAGGCTGCCTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGACACTTGTTGATGATCATTTTAC----------------ATTATTATGCCTTCTGTGAGTTTCCCTTCTGCTCCACTATAACAGTTTGGATGTTGCAGAGGGACTGGATAGACATGAATGAACATGAATTCTATTATTGCATCAAATCATTTGATAAACAC-TCATTGGACCCTCTAATGATTATCTCACTGTTTCTAGCTCA + +a +s mr.mrrefChr5 203604 27 + 294542 AGTCATTATGAAAAAATCTAGGATGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356137 27 + 636262 AGTCATTATGATAAAATCTAGGATGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 348052 22 + 647215 AGTCATTATGAAAAAATCTATG----- + +a +s mr.mrrefChr5 203631 389 + 294542 AAGGGCAGACTAAGGTGAGTCTTGCCATTGGGTGGTTCCCACTAAGTACTGATTGCAAGGCATCCTCAGAGCTGGTCAAACACACATACTTGCCGCACAGATTGTAGTGACATATTACTAACTTGATTCACTCAGTTGTACAATTGTTAAATTCTACAAAGGAGGTGAATAAAGTCTGTTGTGCCAGATTTACTGGTCATGACGCATACTGAATGAGAATCATGATTCAATTGTGTTAATAAGGTCATGCCCTGTGCTTTTGGGTAAGAAGACAGTAGCAAGCTAAGTTGCTGTACCACCAGATGTGGCAGTCAATTTTTGTCCTCACCATAGGGGATCTTGTGTGATACATAGCACATATAAATTCACAGCTGCACTTTATTTACAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356170 372 + 636262 AAGGACAGACT--GGTAAGTCTTGCCATTG------TCCCACTAAATACTGATTGCAAGGCATCCTCAGAGCTGGTCAAACATACAT--------CACAGACTGTAGCGACATATTATTAACTTGATTCATTCAGTTGTACAATTGTTAAATTCTACAAAGGAGGTGAATAAAGTTTGTTGTGCCAGATTTACTGGTCATGATGCATACTGAACAAGAATCATGATTCAATTATGTTAATAAGGTCATGCCCTGTGCTTTTGG-TAGGAAGACAGTAGCAAGCTAAGTTGCTGTACCACCAGATGCGGCAGTCAATTTTTGTCCTCACCACAGGGGATCCTGTGTGATACACAGCACATATAAATTCACAGCTGCACTCTATTTACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 348074 381 + 647215 -AGGGCAGACTAAGGTGTGTCTTGCCACTGGGTGGTTCACAGTAAGTACTAGTTGTAAGGCATCCACAGAGCTGGTCAAACCCACATACTTGCCGTACAGATTGAAGTGACATATTACTAACTTGATTCACTCAGTTGTACAATTGTTACATTCTACAAA--AGGTGAATAAAGTCCGTTGTCCCACATCCACTGATCACGACGCATACTGAATGAGAATGACGATTCAATTGTGTTAATAAGGTCGTGACCTGCGCTTTTGGGCCAGAAGACTATAGCAAGTTATGTTACTGTACCGCCAGATGTGGCAGTCAATTCTTGTCCTCCCCATAGGGGATCTTGTTTGATGCTTAGCACATATACATTCA-----GCATTTTATTTTAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 204020 341 + 294542 ATACGGTTCCCCAAGGCAGCCTATATCAAACTACAGAAAGTATGTCAGCTTAGACTGGTTAATTGAAACTAAACCAACATATTAAGTCGATCTGGCAGCCCTTCGAAAGGAATCCCTTAGCACGGACTTCAGTCCACCAGCGCTTTTATGGCCCGCTGGTCCGCGACAATAACGGAGATGAAGGTGAAAAAAAAGACGTACGAAGTTCGTGGTTGGATCATGTCCGACCTTGCCCGAAGAACCTAACTGGCCTACTGCACTCATCAATCACAGAACTTTCTTTCAGTATCATGCTGGTCTATCCATAGATATGCCACATCATAGAGACCCTATGGTTATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356543 337 + 636262 ATACGGTTCCCCAAGGCAGCCTATATCAAACTACAGAAAGTATGTCAGCTTAGATTGGTTAATTGAAACTAAACCAACATATTAAGTCGATCTGGCAGCCCATCAGAAAGAATTCCCTAGCACGGACTGCAGTCCACCAGCGGTTTCATGGCCCGCTGGTCCGCGATAATAACGGAGATCAAGGTGAAAAAAAAGACGTACGAAGTTCATTGTTGGATCATGTCCGAC----CCTGAAGAACCTAACTGGCCTACTGCACTCATCAATCACAGAACTTTCTTTCAGTATCATGCTGGTCTATCCATAGATATGCCACATCATAGAGACCCTATGGTTATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 348455 328 + 647215 ATACAGTTCCCCAAAGCTGCCTATATCTAACTACAGAAAGAATGCCAACTTAGACTGGTTAATTGAGACTAAGCCAACATACTAAGACGATCTGGCAGCCCTTCGAAAGAAATCTCTTAGCACGGACTTCAGTCTACCAGCGCTATTATGGCCTCCAGGTCCGCGACAATAACGGAAATGAAGGTG-------------ACGGAGTTCGTGGTTGGATCATGTTCGACCTTGCCCGAAGAACCTAACTGGCATATTGCACTCATCAACCACAGAACTTTCTTTCAATATCATGCTGGTCTATCCATAGATGTGCCACATCATAGAGAGCCTATGATTATCC + +a +s mr.mrrefChr5 204361 254 + 294542 CCACCATTTATTGCTGAGACAAGATTTAGCTATCTTAATATATGGCTCTATTTAGACATACCTATGTCCTACCATATTGCCCGTTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTGTCCTTGACCTCAGAGAACTCCTGGATAAAGTATCAACACTAAAGAGTGAACTGTCATTGCCTATGAGCATGTGCCCTTTTCATTGATCCAGCCCTTTGGCTGCTCTTTACAAGCTAGGTTAGTTGCAATGTGTTGGATCAAATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 356881 252 + 636262 CCACCATTTATTGCTAAGACAAGATTTAGCTATCTTAATATATGGCTCTATTTAGACATACCTGTGTCCTACCATATTGCCCGTTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTGTCCTTGACCTCAGAGAACTCCTGGATAAAGTATCAACACTAAAGAGTGAACTGTCATTGCCTAT--GCATGTGACCTTTTCATTGATCCAGCCCTTAGGCTGCTCTTTGCAAGCTAAGTTAGTTGCAATGTGTTGAATCAAATACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 348783 228 + 647215 CCACCATATATTGCTGAGACAA-------------------------CCCTTTAGACATACCTA-GTGCTACCATATTGCCCATTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTATTGTTGACCTCAGAGAACACCTGGGTAAAGTATCAACTCAAAAGAGTGAACTGTCATCGCCTATGAGTGTGTGCGCATTTCATTGATCCAGCCCATTGGCTGCTCTTCACGAGCTAGGTTATTTGTAATGTGTTAGATTGAATATT + +a +s mr.mrrefChr5 204615 15 + 294542 CGTCAATTGGTAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357133 15 + 636262 CGTCAATTGGTAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 349096 15 + 647215 CATCAATTGGTAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 204630 54 + 294542 CTGAGGCATCTACAGCTAGGTTACTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357148 54 + 636262 CAGAGGCATCTACAGCTAGGTTACTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 349117 54 + 647215 CTGATACATCTGCAGCTAGGTCATTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCGTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 204684 180 + 294542 TTGGTAGTACAGAGCCCGAGGCATCTACAGCCCTATCTTGCCCCAGCTAGTACTTGATCAGCAGAGGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTATATTTCCTCTATTGGACACTAGTGAATTGTGCACTCAAATTCAATATGACCAAACGTACAAGAGGTACATTCTACGCCTCCTCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357206 180 + 636262 TTGGTAGTACAGAGCCCGAGGCATCTACAGCCCTATCTTGCCCCAGCTAGTACTTGGTCAGCAGACGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTAGATTTCCTCTATTGGACACTAGTGAATTGTGCACTCAAATTCAATATGACCAAACGTACAAGATGTCCATTCTATGCCTCCTCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 349171 169 + 647215 TTGGTAGTGTAGAGTCAGAGACATCTACAGCCTTATCTGG-CCCAGCTAGTACTCAATCAGCAGAGGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTATATTTCCTCTTTTGGACACTAGTGGATTGTGCACTGAAATTCAATATGACCAAACGGACAAGAGGTACATTCTACG---------- + +a +s mr.mrrefChr5 204864 222 + 294542 GAGTCTAGACTTGACATGGTTTAATAAAATTATACAGGAAAAGATGAAGTGATGTGACTGAGCCAATTGATAAATCAGTTTCCCTAACTATATGTCTAGCATTTGGTGCTACAAAAGGGTACCGGCCCTCTACAATCCACTTTCAAAAGATTGCATCTCCTGTATGTTATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTAAGTCTGCACAGCTTTATAGGCATGCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357392 209 + 636262 GAGTCTAGACTTGACATGGTTTAATAAAATTATACAGGAAAAGATGAAGTGATGTGACTGAGCCAATTGATAAAGCAGTTTCCCTAACTACATGTCTAGCATTTGGTGCTACAAAAGGGTACCGGC-------------CTTTCAAAAAACTGCATCTCCTGTATGATATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTAAGTCTGCACAGCTTTATAGACATGTGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 349340 199 + 647215 -----------TGACATGGTCTAATAAGATTATACAGG-AAAGATGAAGTGATGTGACT-----------TAAATCAGTTTCCATAACTATATGTCTAGCACTTGGTGCTACAAAATGGTACTGGCCCTCTACAATCCACTTTCAAATGATTGCATCTCCTATATGTTATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTCAGTCTGCACAGCTTTATAGGCATGCAGTT + +a +s mr.mrrefChr5 205086 254 + 294542 TATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTACAGCTAGTTAACCTTGTTTTGATACTCTTGTCTAGAGTTATTGTTTGATACCTAGTTAAACAAAAAACGGAGTAATGTATATACTCTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGTGGAACAGTTCTCATAGACAAAAATTGTCATTTATTGTTGAAGATAGTAGTACAAGAATCCATTCTCAATTTATCCCCTATGCATCATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357611 251 + 636262 TATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTACAGCTAGTTAAGCTTGTTTTGATACTCTTGTCTAGAGTTAGTCTTTGATACCTAGTTAAACAAAAAACGGAGTAGTGTAT-TACTCTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGTGGAGCAGATCTCATAGACAGAA--TGTCATTTCTTGTTGAAGATAGTAGTACAAGAATCCATTCTCAATTTATCCCCTATGCATCATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 349539 253 + 647215 GATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTCCAGCTAGTTAGCCTTGTATTGATACTCTTGTCTAGAGTTATTGTTTCATACCTAATTAAATGAAAAACAGAGTCATGTATATACTTTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGCAGAACAGTTCTCATAGACAAAAATGGTCACTTATTA-TGAAAATAGTAATACAAGAATTCATTCTCCATCTATCCCCTATGCATTATTTA + +a +s mr.mrrefChr5 205340 55 + 294542 TCTTTCTTTGTTCTCATGCCAAAGTGCCCTGGGTGTGGTCCGTTTATAGTTTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357862 55 + 636262 TCTTTCTTTGTTCTCATGCCAAAGTGCCCTGGGTGTGGTCCGTTTATAGTTTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 349815 55 + 647215 TCTTCCTCCGTTCTCGTGCCAAAGTGCCCTGGGCTTGGACCATCTATAATCTAAC + +a +s mr.mrrefChr5 205395 28 + 294542 TTCACAATTCCAACCAATGAGTACCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357917 28 + 636262 TTCACAATTCCAACCAATGAGTACCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 349880 28 + 647215 TTCACAATTCTTACCAATCAGTACCACA + +a +s mr.mrrefChr5 205423 147 + 294542 ACATGAAACTCTCTAATCTTTAAAGGCTAACATTCTATTGCAACCTAGTACGGCTCCAACAGGATTATTTCCATTATTGTAACAGTCCAAGGAAAGGATGGTGAGAAGAATAAGATGACCAGGGGGTCACGGGCTCTGTTTCAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357948 147 + 636262 ACATGAAACTCTCTAATCTTTAAAGGCTAACATTCTATTGCAACCTAGTACGGCTCCAACAGGATTATTTCCATTATTGTAACAGTCCAAGGAAAGGATGGTGAGAAGAATAAGATGACCAGGGGGTCACGGGCTCTGTTTCAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 349908 147 + 647215 GCATGAAACCCTTTAGTCTTTAAAGGCCAACATTATATTGAAACTTATTAAGGCTCGAAAAGGATTCTTTCCATCATTGTTACATTCCAAGGAGAGAGAGATGAGAAGGTTAAGGTGACCAGCGGGTCACAGGCTCAGTTTCAAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 205570 162 + 294542 TAGCCCTCCTAGCAGACTGGTTTATCTCTGAACTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGTGACAGGATTTGCAGAGAGAGTCAGAGGCATCAGTAGGGAATTTTTATTGAAATAGGCAATGTCTTGTTTTATGCACTGATGTAATTATTTAGATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358095 161 + 636262 TAGCCCTCCTAGCAGACTGGTTTATCTCTGAACTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGCGACAAGATTTGCAGAGAGGGTCAGAGGAATCAGTAGGGAATCTTTATTGAAATAGGC-ACGTCTTGTTTTATGCACTGATGTAATTATTTAGATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 350072 162 + 647215 TAGCCCCCTTGGCAGGCTGGTAGATCTCTGAGCTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGTAACAGGATTTGCAGAGAGAGTCAGAGGCATCAGTAGGGAATTTTTATTGAAATAGGCAATGTCTTGTTTTATGCCCTGGTGTATTCATTTAGATCA + +a +s mr.mrrefChr5 205732 73 + 294542 AATTTGAGCTTAAGATCAGAACAGGGTGACCGTATGATGGTGCTTCATGACAACTATCTCTTTATTATCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358274 73 + 636262 AATTTGAGCTTAAGATCAGAACAGGGTGACCGTATGATGGTGCTTCATGACAACTATCTCTTTATTATCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 350234 73 + 647215 AATTTGAGATTAAGATCAGAACAGAGTGACTATATGGTAATGCATCATGACAACTATCTCTTTATTATCACTG + +a +s mr.mrrefChr5 205805 9 + 294542 gcagctcTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358347 9 + 636262 GCAGCTCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 350497 9 + 647215 gcagcccTT + +a +s mr.mrrefChr5 205814 11 + 294542 GAGTGACTTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358357 11 + 636262 GAGTGACTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 350506 11 + 647215 GAGTGGCTTCA + +a +s mr.mrrefChr5 205825 108 + 294542 TTTGGCTCCTGAGGGGATGAGCATGCAATCAGGgatcacttctttgtttcaccattaattccctttcatttcttggattgcaattagttaatgccattttttcacctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358369 108 + 636262 TTTGGCTCCTGAGGGGATGAGCATGCAATCAGGGATCACTTCTTTGTTTCACCATTAATTCCCTTTCATTTCTTGGATTGCAATTAGTTAATGCCATTTTTTCACCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 350517 108 + 647215 TTTGGCTCCTGGGGGGATAAGTATGCAATCAGGgcttccatctttgtttcactgttaattccctttcatttcttggattgcaattagttaatgacctcatctcacctc + +a +s mr.mrrefChr5 205933 57 + 294542 ctccttgtgacacaagtctcactatacagacccctaacttcagttcaatctcaagtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358477 57 + 636262 CTCCTTGTGACACAAGTCTCACTATACAGACCCCTAACTTCAGTTCAATCTCAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 350626 57 + 647215 ctccttgtaacactatactcactacatagacccctgacttcatatcaatctcaagtt + +a +s mr.mrrefChr5 205990 8 + 294542 cttcagtc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358545 8 + 636262 CTTCAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 350683 8 + 647215 ctttggtc + +a +s mr.mrrefChr5 205998 95 + 294542 cattcttcaaggcacttatgttcttaacttcttctgtgcttgtgccttatctgcctgtcagtttagtttcatgtgatggaggaacaagttccggt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358553 95 + 636262 CATTCTTCAAGGCACTTATGTTCTTAACTTCTTCTGTGCTTGTGCCTTATCTGCCTGTCAGTTTAGTTTCATGTGATGGAGGAACAAGTTCCGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 350693 95 + 647215 caatcttcaaggcacttatgtatttaactacttctgtccttgtgcgttatctgactgttagcttagttccaggtgatgggggaaaaaattacagt + +a +s mr.mrrefChr5 206093 14 + 294542 ccttgtcactaggt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358663 14 + 636262 CCTTGTCACTAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 350788 14 + 647215 tctggtcaatcagc + +a +s mr.mrrefChr5 206107 67 + 294542 gaggcaggatcctagctacacgtgaaccccaagggtgcatgtttaattggtaccccattgactcaac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358682 67 + 636262 GAGGCAGGATCCTAGCTACACGTGAACCCCAAGGGTGCATGTTTAATTGGTACCCCATTGACTCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 350802 67 + 647215 aaggtagcatcctacccacacgtgaaccccatgggtgtgtttttaattggcatcccactgttacaac + +a +s mr.mrrefChr5 206174 6 + 294542 ctgtta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358749 6 + 636262 CTGTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 350870 6 + 647215 ttgtca + +a +s mr.mrrefChr5 206180 49 + 294542 ttggtaccatgtcaaggccagcctaccacacacatatttcgttgtctct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358755 49 + 636262 TTGGTACCATGTCAAGGCCAGCCTACCACACACATATTTCGTTGTCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 350877 49 + 647215 ccagtactatgttaaggtcagcctaccacccacatatttcgttgtctct + +a +s mr.mrrefChr5 206229 11 + 294542 ccagctgcctg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358805 11 + 636262 CCAGCTGCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 350926 11 + 647215 ccagctgtctg + +a +s mr.mrrefChr5 206240 51 + 294542 cactctatgagaaggcccttaaagctcatgtattcgTTTAGATACATGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358816 51 + 636262 CACTCTATGAGAAGGCCCTTAAAGCTCATGTATTCGTTTAGATACATGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 350939 51 + 647215 ccctctgtataaaggcccttaaagcccatgtattcaTTTAGATATGTACAT + +a +s mr.mrrefChr5 206291 130 + 294542 CTGCTCATTCAGCCTGAATCCTCATTCTAGTGCCGTTGTCACCATTACTACCGATGTATAtattgtggtcccttgtagtggcttgataacctttatgatgggaggtgctgtgaagtgtgcatgtacagca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358868 130 + 636262 CTGCTCATTCAGCCTGAATCCTCATTCTAGTGCCGTTGTCACCATTACTACCGATGTATATATTGTGGTcccttgtagtggcttgataacctttatgatgggaggtgctgtgaagtgtgcatgtacagca +s simRat_chr6.simRat.chr6 350990 130 + 647215 CTGCTGATTCTGCTTGAATCCTCATCCTAGCTCCATTGTCACCATTGCTACTGCTGTATAcattgtaagcccttgcaatgccttgataacctttatagtaggaggtgctgtggagtgtgcatgtatagca + +a +s mr.mrrefChr5 206421 36 + 294542 aaccatctgtacctcgcactgtctatctcatgtgag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 358998 36 + 636262 aaccatctgtacctcgcactgtctatctcatgtgag +s simRat_chr6.simRat.chr6 351121 36 + 647215 gaccatctgtacctcccactgtctatctcatatgag + +a +s mr.mrrefChr5 206457 99 + 294542 cctactgttacattgcaggagcagtgatgccacactcacactgtgtaacttgtgattatcaaattctttccattcccattaattcattatgactatagc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359052 99 + 636262 cctactgttacattgcaggagcagtgatgccacactcacactgtgtaacttgtgattatcaaattctttccattcccattaattcattatgactatagc +s simRat_chr6.simRat.chr6 351157 99 + 647215 cctattgttacattgcaggcagagtgatgccatactcacactgtatgacttgtgattatcaaattcgttccatttgcattaattcatcatgaatatagc + +a +s mr.mrrefChr5 206556 16 + 294542 cgaaagtcagtaccaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359151 16 + 636262 cgaaagtcagtaccaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 351257 16 + 647215 tgaaggtcaatactaa + +a +s mr.mrrefChr5 206572 11 + 294542 tgtagtcgaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359177 11 + 636262 tgtagtcgaAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 351273 11 + 647215 tgtaatcgagt + +a +s mr.mrrefChr5 206583 60 + 294542 cctgtaagcaaatccagcccTTTTAGGGTAGCTAGGGATTCCAGGCCATTCATTTTCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359189 60 + 636262 CCTGTAAGCAAATCCAGCCCTTTTAGGGTAGCTAGGGATTCCAGGCCATTCATTTTCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 351284 60 + 647215 cctgtaatcaaatccaccccTTTTAGGGTAGCTAGGGATTCCAGGCCCTTCATTTTCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 206643 85 + 294542 AATTACATTTATATTCTTCCAGTTCAGTTAAGAAGAGTGTGCCTGACTGATATGAGTAcatccatgcagagtaggtcatatcaga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359249 85 + 636262 AATTACATTTATATTCTTCCAGTTCAGTTAAGAAGAGTGTGCCTGACTGATATGAGTAcatccatgcagagtaggtcatatcaga +s simRat_chr6.simRat.chr6 351345 85 + 647215 GATTACATATATGTTCTTCCAGTTCAGTTAAGAAGAGTGCAACTGGCTGATGTGAGGCCACCCATGCAATGTGGGTCATAACAGA + +a +s mr.mrrefChr5 206728 39 + 294542 catctgtttgtgtgctataaatttttttggtattgtgtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359334 39 + 636262 catctgtttgtgtgctataaatttttttggtattgtgtg +s simRat_chr6.simRat.chr6 351433 39 + 647215 CAGCTGTTTGGGTGTTATGAATTTATTCGGTATGGTTTG + +a +s mr.mrrefChr5 206767 72 + 294542 cctagtgaagtccttgtggttggggcaaacatgtgtgttAATTGTAGATACTTGTGCAGGGAAGATCAAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359395 72 + 636262 cctagtgaagtccttgtggttggggcaaacatgtgtgttAATTGTAGATACTTGTGCAGGGAAGATCAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 351472 72 + 647215 CCTAGCAAAGTGCTTGTGGTTGTGGCAAACTTGTGTGTTCATTGTAGATACTGGTGCGGGGGAGATCAAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 206839 9 + 294542 CTAAGTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359467 9 + 636262 CTAAGTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 351545 9 + 647215 CTAAGTATT + +a +s mr.mrrefChr5 206848 58 + 294542 TATAACTGGCTGAGTCCCCACTCACAATTATAATTGTAATGTGAGCATGAGCCAAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359476 58 + 636262 TATAACTGGCTGAGTCCCCACTCACAATTATAATTGTAATGTGAGCATGAGCCAAGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 351555 58 + 647215 AATAACTAGCTGCGTCCCCACTCTCAATTGTAATTATAATGTGAGCACAAGCCAAGAC + +a +s mr.mrrefChr5 206906 58 + 294542 TTGACTGACAGAATCCCCAAATCTGCATAGagctaagacctgattgagagatttacca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359538 58 + 636262 TTGACTGACAGAATCCCCAAATCTGCATAGAGCTAAGACCTGATTGAGAGATTTACCa +s simRat_chr6.simRat.chr6 351613 58 + 647215 TTGATTAGCAGAATCACCAAATCAGCAAGGagccaggatttgattgacagacttacta + +a +s mr.mrrefChr5 206964 46 + 294542 caggatgtatggttcatagtaccagtaccaaaggtggagatagatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359596 46 + 636262 caggatgtatggttcatagtaccagtaccaaaggtggagatagatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 351695 46 + 647215 cagagtgtatgattcatattaccagtatagaaggtggtgataactc + +a +s mr.mrrefChr5 207010 105 + 294542 tgtttttcctgtgctgcaggggatgaaagtgtgaggctttcataagtttcattgccccagTGCACAGTTGGTGCCAAATTAACCCTAGAAGCTAAGGCCTACTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359642 105 + 636262 tgtttttcctgtgctgcaggggatgaaagtgtgaggctttcataagtttcattgccccagTGCACAGTTGGTGCCAAATTAACCCTAGAAGCTAAGGCCTACTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 351742 105 + 647215 tgtttttgctgtgctggaggggatgaaggtgataggccttcatatgtttcattactcaagTGCACAGTCAGTGCCAAATTAACCCTCGAGGCTAAGGCCTACTGC + +a +s mr.mrrefChr5 207115 33 + 294542 TGGAACATGTTGATCAGACTAGacaaccctttt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359750 33 + 636262 TGGAACATGTTGATCAGACTAGacaaccctttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 351847 33 + 647215 TGGAACATGGTAACCAGGCTAGacaaccttttt + +a +s mr.mrrefChr5 207148 75 + 294542 gggcccaggcagttgcataggaagtgaaactgatcttacttaggtgctcctctatgtacctcaattatctctgct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359784 75 + 636262 gggcccaggcagttgcataggaagtgaaactgatcttacttaggtgctcctctatgtacctcaattatctctgct +s simRat_chr6.simRat.chr6 351880 75 + 647215 ggtcccaggcatttgcataggaagtgtaaccgatcttacccaggtgctcctctatgtacctcaattatctctact + +a +s mr.mrrefChr5 207223 40 + 294542 ttttcttgttgcagttttgtggacagaagtgcttgattgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359859 40 + 636262 ttttcttgttgcagttttgtggacagaagtgcttgattgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 351956 40 + 647215 tcttctggttgtagttaggtagactgaagtgcttgttcgg + +a +s mr.mrrefChr5 207263 69 + 294542 attggatgtggttgtcctgggagttgcaagatgcagtttcagaccgactccagaataaaccagtaaatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359906 69 + 636262 attggatgtggttgtcctgggagttgcaagatgcagtttcagaccgactccagaataaaccagtaaatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 351996 69 + 647215 attggatatggttgtcctgggggttacaaaatgcagtgccagagctacttcagaacaaaccagtagatg + +a +s mr.mrrefChr5 207332 16 + 294542 aaccccgcctgtgacc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359977 16 + 636262 aaccccgcctgtgacc +s simRat_chr6.simRat.chr6 352065 16 + 647215 aaccctgcctgtgacc + +a +s mr.mrrefChr5 207348 6 + 294542 tcagcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 359993 6 + 636262 tcagcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 352083 6 + 647215 ccagcc + +a +s mr.mrrefChr5 207354 107 + 294542 taaactgaagtcacaattgattttccaatgagtacaaaagggttatctccctttataatggaatggtagggttgcattccagattctggcagttaatcaggttgtga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360008 107 + 636262 taaactgaagtcacaattgattttccaatgagtacaaaagggttatctccctttataatggaatggtagggttgcattccagattctggcagttaatcaggttgtga +s simRat_chr6.simRat.chr6 352089 107 + 647215 taaactgaagtcacaattgattttccaatgagtacaagagggttatctccctttataatagaatcagatggttgcataccagattttgacagttgattgggttgtga + +a +s mr.mrrefChr5 207461 32 + 294542 tttttggctgaggtgcctcgattcttgagctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360115 32 + 636262 tttttggctgaggtgcctcgattcttgagctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 352198 32 + 647215 ttttcggctgaggtgcattgcttctcaagctt + +a +s mr.mrrefChr5 207493 15 + 294542 ccaggtgtacacccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360155 15 + 636262 ccaggtgtacacccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 352230 15 + 647215 cccagtgaacacttc + +a +s mr.mrrefChr5 207508 36 + 294542 tgtgaagtaacctatctcatattgaccctccaaccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360173 36 + 636262 tgtgaagtaacctatctcatattgaccctccaaccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 352245 36 + 647215 tgtgaaattacctatctcatgttgacccttataccc + +a +s mr.mrrefChr5 207544 11 + 294542 tctgtgatgtc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360213 11 + 636262 tctgtgatgtc +s simRat_chr6.simRat.chr6 352281 11 + 647215 tctgtgatgtc + +a +s mr.mrrefChr5 207555 186 + 294542 cccaactagtgcatcctgggagtatttgctgctgATTTCTCGAGGATTTCCATGAGGAGTCTCTTTGCTAGTATTGGTCTCTATTATTTGTGCCCCTACCACTTTACAAGCATTACGATGAGGGTGGCAAAGGGTGTCATGCAATGCAGCTGTATGCTCAGTAGAATCCACACTACTCCTGCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360237 186 + 636262 cccaactagtgcatcctgggagtatttgctgctgATTTCTCGAGGATTTCCATGAGGAGTCTCTTTGCTAGTATTGGTCTCTATTATTTGTGCCCCTACCACTTTACAAGCATTACGATGAGGGTGGCAAAGGGTGTCATGCAATGCAGCTGTATGCTCAGTAGAATCCACACTACTCCTGCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 508881 186 + 647215 CCCAACTAGTGCACCCTGGGAGAATTTGTTGCTGATATCTCCAGCATTTTCATAGGGAGTCTCTTTACTAGTATTGGTCTCTATTATTTGTGCCCCTACCACTTTGCAAGCATTGTAATAAGGGTGGCAAAGGATGTCATGCGACGAAGTTCTGTATTCAGTAGGATCCACCCTATTCTTGCAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 207741 10 + 294542 ccatatgatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360530 10 + 636262 ccatatgatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 509067 10 + 647215 CCATCGGATT + +a +s mr.mrrefChr5 207751 60 + 294542 GTATGGGCTAACTGTGCAGGATGGTGAAGCATTCCCAATGTCTTCAAGCCTCTCATTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360636 60 + 636262 GTATGGGCTAACTGTGCAGGATGGTGAAGCATTCCCAATGTCTTCAAGCCTCTCATTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 352303 60 + 647215 CTATAAGTCAACCATGCATGATGGTGAAGCACTCCCAATGTCTTCAAGCCTCTCGTTACT + +a +s mr.mrrefChr5 207811 44 + 294542 GAACCAGAGGAGTTATATGGCATCTCAAGTATatctaatgtctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360696 44 + 636262 GAACCAGAGGAGTTATATGGCATCTCAAGTATatctaatgtctc +s simRat_chr6.simRat.chr6 352368 44 + 647215 GAACCAGAACAGTTATATGGCATCTCAAGTATATCTAATGTCTC + +a +s mr.mrrefChr5 207855 40 + 294542 ccccttgttgctgaaccagggaagttatatggcatccggt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360740 40 + 636262 ccccttgttgctgaaccagggaagttatatggcatccggt +s simRat_chr6.simRat.chr6 352416 40 + 647215 TCTCTTGTTGCTTAACCAGGGAAGTTACATGGCATCCCGT + +a +s mr.mrrefChr5 207895 20 + 294542 TAAACCAGGGAAGTTATATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360815 20 + 636262 TAAACCAGGGAAGTTATATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 352456 20 + 647215 TAAACTAGAAGAATCATATG + +a +s mr.mrrefChr5 207915 79 + 294542 AAGAATCCAAGTGTTGACTGACCTGTTTATCAaatcagttggccagaattagtattacagttaggagtactttgttttt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360851 79 + 636262 AAGAATCCAAGTGTTGACTGACCTGTTTATCAaatcagttggccagaattagtattacagttaggagtactttgttttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 352476 79 + 647215 AAGAGTCCAAGCATTAACTGCTTTGTTTATCAaatcagttggccagaattagtgttacagcaaggagtactttgctttt + +a +s mr.mrrefChr5 207994 22 + 294542 gcctctaatgcactcctactaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360931 22 + 636262 gcctctaatgcactcctactaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 352555 22 + 647215 gcctctaatgcacccctactaa + +a +s mr.mrrefChr5 208016 148 + 294542 atatgattatgtgtgtgctgaactccctatataactgatgttataagggcccagtccctgctggtgatgattccattaatgcagtgcctttaggtactataattagcctctacattgggctgactctcccccagtcccaccatgaccc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 360969 148 + 636262 atatgattatgtgtgtgctgaactccctatataactgatgttataagggcccagtccctgctggtgatgattccattaatgcagtgcctttaggtactataattagcctctacattgggctgactctcccccagtcccaccatgaccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 353215 148 + 647215 ATATAATTACGTGTGTGCCGAACTCCGTATAAAACTGAGGctataaggacccagctcctgctggtgatggttccatcaatgcggtgcttttaagtactatgattagtctccacattgggctgactctcccccagtcccaccatgactc + +a +s mr.mrrefChr5 208164 89 + 294542 ctatctgatacttcaggtagagatctctcactgttcatttcataatacaccactgatctctccactgaactacggtcttcaatctgaac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361136 89 + 636262 CTATCTGATACTTCAGGTAGAGATCTCTCACTGTTCATTTCATAATACACCACTGATCTCTCCACTGAACTACGGTCTTCAATCTGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 353363 89 + 647215 ccatctggtacttcaggtagagatatctgaccgttgatttcttagtacaaccctagtctttactctgaactactgtgtttaatgggaaa + +a +s mr.mrrefChr5 208253 8 + 294542 tactgtgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361225 8 + 636262 TACTGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 353454 8 + 647215 tactgagt + +a +s mr.mrrefChr5 208261 15 + 294542 aatgggatattgtga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361235 15 + 636262 AATGGGATATTGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 353462 15 + 647215 aatgtagtattttga + +a +s mr.mrrefChr5 208276 19 + 294542 tccctcaatacattgttcg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361250 19 + 636262 TCCCTCAATACATTGTTCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 353501 19 + 647215 tccctccatacactgttca + +a +s mr.mrrefChr5 208295 118 + 294542 ttcagAGCATGATGTGGTAGTTGGTAGAAACTTACTCATAGAGTGACTCAGTTCAAAAGTCACTCAGTTTAAACAACGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361269 118 + 636262 TTCAGAGCATGATGTGGTAGTTGGTAGAAACTTACTCATAGAGTGACTCAGTTCAAAAGTCACTCAGTTTAAACAACGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 353529 118 + 647215 gtgggAGCATAATGTGGTAGTTGGTAGAAATTTACTCATAGAGTGATTCAGCTCAAGACTCACCCAGTTTATACAATGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 208413 119 + 294542 AGAAGCCGTCATTTCCAGCAAGACAGCAATGGGGTAAAACTTGAGGACCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAAGAATACAGCTTGAGGGGGGCCCGAGATTTAAGATCATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361387 119 + 636262 AGAAGCCGTCATTTCCAGCAAGACAGCAATGGGGTAAAACTTGAGGACCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAAGAATACAGCTTGAGGGGGGCCCGAGATTTAAGATCATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 353648 119 + 647215 AGAGGTCTTCATCTCCAACAAAACAGCAATGGGGTAAAACTTGATGTCCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAGGATTACAGCTTGAGGGGGGCCCCAGATTTAAGATCATGG + +a +s mr.mrrefChr5 208532 50 + 294542 CCATGATTCTAATGCATGTCAACACTAGCCCCTTGGCACTTAATTCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361508 50 + 636262 CCATGATTCTAATGCATGTCAACACTAGCCCCTTGGCACTTAATTCAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 353767 50 + 647215 CCATGAATCTAATGCATGTCAATACTAGCCCCTTAGCACTCAATTCAATG + +a +s mr.mrrefChr5 208582 116 + 294542 ATACCTAATCTAAGGGTTCATGATGACTCAAGACAGGTTCTAATCATGAGAGTTGATTGGACCCATGCTAAGCCCATATAGCAGCTCTTAATAATAGCCACAATGGAAATGGAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361562 116 + 636262 ATACCTAATCTAAGGGTTCATGATGACTCAAGACAGGTTCTAATCATGAGAGTTGATTGGACCCATGCTAAGCCCATATAGCAGCTCTTAATAATAGCCACAATGGAAATGGAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 353817 116 + 647215 ATACCTAAACCAAGGTATCTTGATGCCTCAATACAGGTTCTAATGATGATAGGTTATTGGATGCATGCTGAGCCCCTATAGCAGCTCTTATAGATAGCAACAATGGAAACGGAATG + +a +s mr.mrrefChr5 208698 49 + 294542 ATCCTGGGAATTAGTGAAAAGCattgatcttctaacccggtggttaaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361679 49 + 636262 ATCCTGGGAATTAGTGAAAAGCATTGATCTTCTAACCCGGTGGTTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 353933 49 + 647215 ATCCTGGGAACTAGTGAAAAGCattgatcttctaacctagtggatacca + +a +s mr.mrrefChr5 208747 18 + 294542 CTTGTGAGAGACCCACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361728 18 + 636262 CTTGTGAGAGACCCACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 354042 18 + 647215 CTTCTGATTGCCTCAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 208765 72 + 294542 GGAATCCTTGCAGCTCCTTGTTTAGAGGCTCCATGGGAAGCTGTGGCAAGCAATCCCAAGTGACTCCCTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361746 72 + 636262 GGAATCCTTGCAGCTCCTTGTTTAGAGGCTCCATGGGAAGCTGTGGCAAGCAATCCCAAGTGACTCCCTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 354068 72 + 647215 GAGATCCTCACAGCTACTTGTTTAGGGGTTCCACGGGAAGCTGGATCCAGGAATGCCAAGTGACTCCCTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 208837 193 + 294542 TGGTAGATTCAATCCTACTCCACTAGTTCCCCCACAAGTTCTACTAACGATGCCCATATGCCCCCCAGAGTGGTAACCAACCCAAAAGCCAGCTGTATGACTCTATGTGTGCCATATAGATTGAAGGGCCGCAGCTTCCAGATGGTATGCCGACAATCTCCAGAGGTGTTAAAACTTTCTGGATGTGAGGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 361821 193 + 636262 TGGTAGATTCAATCCTACTCCACTAGTTCCCCCACAAGTTCTACTAACGATGCCCATATGCCCCCCAGAGTGGTAACCAACCCAAAAGCCAGCTGTATGACTCTATGTGTGCCATATAGATTGAAGGGCCGCAGCTTCCAGATGGTATGCCGACAATCTCCAGAGGTGTTAAAACTTTCTGGATGTGAGGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 354140 193 + 647215 TGGTAGATTCGGTCCTACTCCACTAGCTCCTCCACTAGTTCAATTAATAATGCCACTATGCCCCCCAGAGTGGTAGCCAACTCAAAAGCCAGCTGCGTCACCTTATGTATGCAATATAGGTTGAAGGGCTGCAGCTTCTAGATGGTATGCCAACAGTCTGCAGGGGTGTTATAACTTTCTGGTTGTGTGGGAT + +a +s mr.mrrefChr5 209030 10 + 294542 AATAATCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362015 10 + 636262 AATAATCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 354333 10 + 647215 AATAATTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 209040 398 + 294542 CAGAATTTGCACACCAACCAGGTACTCAAATAGGATTTGCCCATTGACTAAGTGCTATCAGGCCAGTATGGTTAACATTATAATATTTGAGCCAATGGTGATCACTCTGTTTCTAATCATAAATGCACCAGGTAACCCAGATTACTCGTTTCCTTCTTAGTACATTTCTTGGGGTTTCCTTATAGAAGGCAACTGTTCATGCAGCACCTGACAAGTAGAGGCATTCTCAATTCACCCCTGTGTACCTCTTATGTGACCGGGAATTCAACATGCAAGCTATACAAATAATTTGACCAGAGAAACACTAGTTCATTACACTAGGTTGATTGCTTGTTCAGTATCTTCATTTTCCCAGCGTGGCTCTCCAGGCTCCAGCAGGTACGTATAACAAAGGCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362025 398 + 636262 CAGAATTTGCACACCAACCAGGTACTCAAATAGGATTTGCCCATTGACTAAGTGCTATCAGGCCAGTATGGTTAACATTATAATATTTGAGCCAATGGTGATCACTCTGTTTCTAATTATAAATGCACCAGGTAACCCAGATTACTCGCTTTCTTCTTAGTACATTCCTTGGGGTTTCCTTTTAGAAGGCAACTGTTCATGCAGCACCTGACAGGTAGAGGCATTCTCAATTCACCCCTGTGTACCTCTTATGTGACCGGGAATTCAACATGCAAGCTATACAAATAATTTGACCAGAGGAACACTAGTTCATTACACTAGGTTGATTGCTTGTTCAGTATCTTCATTTTCCCAGCGTGGCTCTCCAGGCTCCAGCAGGTACGTATAACAAAGGCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 354359 392 + 647215 TAGAATTTGCACACCATCCAGGCACTCAAATAGGATGTGCCCATTAACCAAATGCTATCAGACCGGTTTGATTAAAATTATAACATTCGAGCCATTAGTGATGTCTCTGCTGCTAATCATAAATGCACCACGTAACCCAGATTACTCGTTTCCTTCTTAGTACATTTCTTGAGGTTTCCTCATAGAAGGCAACTGTTCATACAGCACCTGACAAGTAGAGGCCATCTCAATTCACCCCCGTGTACGCCTAATGTAACCTGGAA-TCAACATGCAAGCTG---AAATAATACGACCGGGGAAACACTAGTTTATTACACTAGCTTGATTGCT--TTCAATATCTTCATTTTCACAGCATGTTTCACCAGGCTCCAGCAGGTAGGTATAACAAGAGCCAG + +a +s mr.mrrefChr5 209438 7 + 294542 TACTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362423 7 + 636262 TACTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 354752 7 + 647215 TACTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 209445 42 + 294542 GAGCGAAGCCCTCACCACTTGGAGGAACTCCTGTGCCCATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362430 41 + 636262 GAGCGAAGCCCTCACCACTTGGAGGAACTCCTGTGCA-ATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 354762 42 + 647215 GGGAGAAGCCCTCACCACTTGGGGGAACCACTGTGCCCATAT + +a +s mr.mrrefChr5 209487 283 + 294542 CAGTATTATAACTTCCTAACTATGGTAGTGTATAGTAGTGATTTCTAGCCCTATTAGCATGTGACAGACTGTCCTTATCCTCTAGCCTCTGTTATCCATGTCACAGGCCTGTGGGTCTGTACCAAAACTAGTAACAAGTGTGGAACTCTGTTCCTATATTGTTTGTACTGAAGTCTGTCTGATTGTTGCTTCAACTGGAAGTCATCATCAGCAACCTACTGCTTTATCACCTGCGTCACTTTTTAGAGGTCTTAACCTATTAACTTGACACAATCTGGAGATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362471 283 + 636262 CAGTATTATAACCTCCTAACTATGGTAGTGTATGGTAGCGATTTCTTGCCCTATTAGCGTGTGACAGACTGTCCTTATCCTCTAGCCTCTGGTACCCATATCACAGGCCTGTGGGTCTGTACCAAAACTAGTAACAAGTGTGGAACTCTGTTCCTATATTGTTTGTACTGAAGTCTGTCTGATTGTTGCTTCAACTGGAAGTCATCATCAGCAACCTACTGCTTTATCACCTGCGTGACTTTTTAGAGGTCTTAACCTATTAACTTGACACAATCTGGAGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 354808 279 + 647215 CAAAATTACAACTTCCTAAGTATAGTAGCGTATAGTAGTGATTTCTAGCCCAATTAGCATGTGACAGATTGTCCTTATCCTCTTGCCTCTGTTATCCACGTCACAGGCCTGTGGGTCTGTGCCGAAACAAGTAACAACTGTGGAACCGTGTTCCGATATTATTTGTACTG-AGACTGTCTGATTCTTGTATCAAT---GAGTCATCATCAGCAACCTCCTGTTTTATCACCTGCGTCACTTTTTGGTGGTCTTAGCGCACTAGCTTAGCAAAGTCTAGAGATC + +a +s mr.mrrefChr5 209770 83 + 294542 AACCTATCCATCAGGAGGCCATGGGTTGGGGATGGCCCTGTTATACAACTTGTAATCACTTGCATCAATGACCTACTGAATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362754 73 + 636262 ----------TCAGGAGGCCATGGGTTGGGGATGGCCCTGTTATACAACTCATAATCACTTGCATCAATGACCTACTGAATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 355089 83 + 647215 AACCTATCCATCAGGAGGTCATGCGTTGGGGACAGCCCCATTACACAACTTGTAACCACTTGCATCAATGACCTACTGAATGG + +a +s mr.mrrefChr5 209853 11 + 294542 ATGAAAAATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362827 11 + 636262 ATGAAAAATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 355173 11 + 647215 ATCAATGACCT + +a +s mr.mrrefChr5 209864 11 + 294542 TTGATGAAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362838 11 + 636262 TTGATGAAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 355190 11 + 647215 CGGATGAAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 209875 112 + 294542 TAGTCAGTCTTATAATCGCATGTGTCAGAGAATGCAGCAGTACCTCTCATATCCTGGACAACCTCTCTAAAACATGAGGTATCACTACCATTTAAAGTTGAATTACATGGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362849 111 + 636262 TAGTCAGTCTCATAATCGCATGTGTCAGAGAATACAGCAGTACCTCTCATATCCTGGACGATCTCTCTAAAACATGAGGTAT-ACTACCATTTAAAGTTGAATTACATGGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 355203 112 + 647215 TATCTAGTTTTATAATCACATGTGTCGCAGACTGCAGCAGTACCTCTCATATACTAGGCAACCTCTCTAAAACATTGGGTTTCACCACCATTTAAAGTTGAATTGCATAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 209987 323 + 294542 TAGCTTGATGTCCTATTCTGCAGACTTCAAGCCACTGAGCCCAACGTAGCATCACCTAATGGGATCAGTGTTGTCTTTTGGTGACAATTTATAACCATCACTGATAAATGGTTGGCTTGCATAGATGTTAGAACTTGGTCACATGCCTACGATAGCCATATCCTGCCCTGTGCCATCCTTCTGGGTTTGGGTCTGGGTTTGAAGCAAGCCTCATGACGCTGTTAGTCACCATCACTGTTGATGAAAGTTATTAATTAGTGGAAACTCTGTGGTAGGTACATAACAGCAAAAGGTCTAATTTCATCCTAATCCTATCTTTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 362960 323 + 636262 TAGCTTGATGTTGTATTCTGCAGACTTCAAGCCACTGAGCCCAACGTGGCATCACCTAATGGGATCAGTGTTGTCTTTTGGTGACAATTTATAACCATCACTGATAAATGATTGACTTGCATAGATGTTAGAACTTGGTCACATGCCTACGATAGCCATATCCTGCCCTGTGCCATCCTTCTGTGTTTGGGTTTGGGTTTGAAGCAAGCCTCATGACCCTGCTAGTCACCATCACTGTTGATGAAAGTTATTAATTAATGGAAACTCTGTGGTAGGCCCATAACAGCAAAAGGTCTAATTTCATCCTAATACTATCTTATCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 355338 320 + 647215 TAGCTTGATGTCCTATTCTATGGACTTCCAGTCACTCAGCCCAACGTAGGATCACCAAGTGGGATCAGTGTTGTCTTCTGGTAACAATTTACAACCATCACTGATATATGGCTGGC-TGCATAGAAGTTAGCACTTGGTCACATGCCAAGGATAGCCATGTCCTCCAATGTGCCATCCTTCTGGGTTTGGGTCTGGGTTTGAAGCAAGCCTTATGACGCTGTTAGTTACCATCTTTGTTAATGAAAGTTATTAATTAGTTGAAACTCTGTGGTAGTTACATA--AGCAAAAGGTCTAATCTCATCCTAACCCTATCTTTTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 210310 48 + 294542 TGTTCTGCCACTTGGATGTTTTGTAATTTGATAATAGGGGGAAAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363290 48 + 636262 TCTTTTGCCACTTGGATGTTTTGTAATTTGATAATAGGGGGAGAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 355658 47 + 647215 TGTGCTGCCAC-TGGATTTTCTGTAACTTGATAATAGGGGGAATGTGT + +a +s mr.mrrefChr5 210358 32 + 294542 TACTATTACTGGAGCATTATCTTGAGATCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363338 32 + 636262 TACTATTACTGGAGCATTATCCTGAGATCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 355717 32 + 647215 TACTCTTACTGGAGCATAATCTTGAGGTCTGT + +a +s mr.mrrefChr5 210390 37 + 294542 AGCCTGCCACTGGTGTAAGAGGGTTGAGGACCTAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363370 29 + 636262 AGCCTGCCACTGGTGTAAGAGGGTTGAGG-------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 355750 37 + 647215 AGCATGCCACTGGTGTAACAGGATTGAGGACCTAGTC + +a +s mr.mrrefChr5 210427 86 + 294542 TTTCAATCTCTCTTGTTCATATTCTACTTACATGCACTAAGAGTTGTAAATTCCTATATAGAAGCTCTAACTGAGTCAGTCCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363399 65 + 636262 ---------------------TTCTACTTATGCGCACTAAGAGTTGTAAATTCCTATATCGAAGCTCTAACTGAGTCAATCCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 355794 85 + 647215 TTTCAATCTCTCTTGTTCATATACTAGTTACATGCACTAAACAATG-AAATTCCTATATAGAAGCTCTAACTGAGTCAGTCCATAA + +a +s mr.mrrefChr5 210513 88 + 294542 CTATGGTCAATTCTTTGAGAGGTGGTGGGGAACAATGTCATTGTCAGCATCTGTCAGATCCAGGTTGGAGAGCTGATTCACAATGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363464 86 + 636262 CTATGGTCAATTCTTTGAGAGGCGGTGGGGAACAATGTCATTGTCAGCATCTGTC--ACTCAGGTTGGTGAGTGGATCCACAATGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 355880 88 + 647215 CTATGGTCCATTCCTTGGGCGGTGGTTGGGAACAATGTTGTTGTCAGCATCTGTCAGATCCAGGTTGGAAAGCTGATTTGAAATGAGA + +a +s mr.mrrefChr5 210601 213 + 294542 GCTCAATGGCTGCCTGGTTGATTGATACATAAATTAGAATCCGGGTGGGCATGATTTCTGGGTGACACCAGGACACAGCTGAAACTGATTGAGAAGTGCTACAATCTTTGAATTATACATGTAGAATCAGATTCTGGTTGATTCTAGACATAGACTCTATGTTTGGCACCCCGTTGAGACAGAGTAAGTACTGGGTCTTCCTACTGTTCTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363550 213 + 636262 GCTCAACGGCTGCCTGGTTGATTGATACATAAATTAGAATCCGCGTGGGCATGATTTCTGGGTGACACCAGGACACAGCCAAAACTGATTGAGAGGTGCTACAATCTTTGAATTATACATGTAGAATCAGATTCTGGTTGATTCTAGAGATAGACTCTATGTTTGGCACCCCGTTGAGACAGAGTAAGTACTGGGTCATCCTACTGTTCTGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 355971 212 + 647215 GCTCAATGGCTGCCTGGTTGATTGACACAT-AATTAGATTCTGGCTGGGCATGATTCCCGGGCAATACCAGGACACAGCTGAGACTGATCAAGAAGTGCTAAAATCTTTGAATTATACATGTACAATCAGATTGTGGTTGATTCTAGACGTAGACTCTATGGTTGGCATCTAGTAGAGACAGAGTAAGTACCTGGTCTTCCTACTGTTCTAGG + +a +s mr.mrrefChr5 210814 123 + 294542 ATGCCCCTGTACCCTAGGATATATTCTCTCTGCCCATGGTAAAGTGTTGAAACAGTTTCCCGTACAGAGTAGTACACTGTAACTAAGATCACTTACATTTCACCTAAGTAGGTACTCGTATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363763 123 + 636262 ATGCCCCTGTACACTAGGATACATTCTCTCTGCCCTTGGTAAAGTGTTGAAGCAGTTTTCCGTACAGAGTAATACACTGTAACCAAGATCACCTACGTTTCACCTAAGTAGGTACTCGTAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 356187 123 + 647215 ATGCCCCTGTACCCTAAAATATATCCTGTCTGCCCATGGTAAAGTGTTGCAACATTTTCTAGTACAGAGTAGTACACTGTAACTAAGATCACTTACATTCCACCTAAGTATGTATTGGTATCT + +a +s mr.mrrefChr5 210937 123 + 294542 AAGATCACTTACATTTCACCTAAGTACTCAGAAGGGCAGTCCATACTTAAGTTCAATGGACCTTTTAACCTGGCCATGAGTCATCCAAAATTATGTGTATCCATACACCCACACATTTTTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 363888 123 + 636262 AAGATCACTTACATTTCACCTAAGTGCTCAGAAGTACAGTCCATACTTAAGTTCAATGGACCTTTTAACCTGGCCATGAGCCATCCAAAATTATGTGTATCCATACATCCACACACTTGTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 356310 121 + 647215 GAGATCACTTACACTCCACCTAAGTACTTAGA--GGTAGCCCACAAGTAACTTCAATGGATCTTTTAACTTGGCCATGAGTCATCCAAAATTATGTGTATCCATACACCCACACATTTTTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 211060 104 + 294542 GTAGTTTTGAGGCTGCATTGCTGTCATTCATAATGTTTGAGTCCAGCAATAAACTTGTACATCACAATTATGGCATTAAGCCCACCGCCAGCTGTACCCATATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364012 97 + 636262 GTGCTTCTGATGCTGCATTGCT----TCCCTAATGTTTGAGTCCAGCAATAAACTTGTACATCACAATTATGGCATTAAGCCCACCGC---CTGTTCCCAGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 356431 104 + 647215 GTAGTTTTGTGGCTGCATTGCTGTCAGTCACAATGTTTGAGTCCAGCAATAAACTTGTACATCACAATTATGGCATTAAGCCCACCTCCAGCTGTACCCTTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 211164 1 + 294542 C +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364109 1 + 636262 C +s simRat_chr6.simRat.chr6 356539 1 + 647215 C + +a +s mr.mrrefChr5 211165 131 + 294542 ACCCTAAACTAGGCATGCATTACACCTTTTGATGATGAACCCAATAAAACCATTGAAACAACTGAAAAAATAAAATTGGATGCATTGGCATTCCATGCCCAATGACACACACAACCACTGTGTAGGTCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364111 131 + 636262 ACCCTAAACTAGGCATGCATTACGCCTTTTCATGATAAACCCAATAAAATCATTGAAACAAAAGGAAAAATAAAACTGGATGCATTAGCATTCCATGTCCAATGACACACACCACCACTGTGTAGGTCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 356540 131 + 647215 ACCCTAAGCTATGCATGCATAACACCTTTTGATGATGAACCCAATGAAACCATTGAAACAACTGAAAACATAAAATTGGATGCATTGGCAGTTCATACCCAATGACACACACAACCACTGTGAAGGTCGAT + +a +s mr.mrrefChr5 211296 49 + 294542 ATAAAGGCAAAATTATTAACATTAAAGTCTAGGTCAACCATGTTGTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364242 49 + 636262 ATAAAGGCAAAATTATTAACATTAAAGTCTAAGCCAACCATGTTGTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 356703 46 + 647215 ATAAAGGCAAAATTATTAAGATTAAAGTCTGGATCCAC---ATTGCCAG + +a +s mr.mrrefChr5 211345 52 + 294542 CTTAAGATTAAGAGGAGTGAGTAGCCTACAGTACAATTTTATGCATTTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364295 52 + 636262 CTTAAGATTAAGAGGAGTGAGTAGCCTACAGTACAATTTTATGCATTTGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 356749 52 + 647215 CTTAAGATCAAGATGAGTGAGTGGCTCACAGCACAATTTTATGCATTTTGCA + +a +s mr.mrrefChr5 211397 87 + 294542 TCCCAAGCGACCCTAGGTGTCCTCATTGCCTAGTTTATGAGAGTGTTGGCCAAACACAGCTTTGGTGATGGGATTTTCACTAGCGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364348 87 + 636262 TCCCAAGCGACCCTAGGTGTCCTCATTGCCTAGTTTATGAGAGTGTTGGCCAAACACAGCTTTGGTGATGGGATTTTCACTAGCGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 356801 87 + 647215 CCCCAAGCAACCTTAGGTGTCTTCATTGCTTAGTTTATGAGAGTGTTGTCCAAACACAGGTTTAGTGATGGGATTTTCACTGGTGGT + +a +s mr.mrrefChr5 211484 42 + 294542 TAAGAATACATCTGTATTTTAAACAAGAATTTGGGTGCTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364435 42 + 636262 TAAGAATACATCTGTATTTTAAACAAGAATTTGGGTGCTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 356894 42 + 647215 TAAAAAGAAGTCTGTATCTTTAGCGAAAATTTGGGTGCTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 211526 19 + 294542 CTGACTCTGCTAGTGGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364479 19 + 636262 CTGACTCTGCTAGTGGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 356936 19 + 647215 TTGACTCTACCAGTGGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 211545 204 + 294542 AGTCCAGTAGGTTTGGCATTTTTAGGTCACAAGGTGATATTATTAGTACATGCCAAGTATATTACTATCAGAGTCTGAGAGGGGGAATTGGGCTAATTTACCTTGAAGTGGCTTTACTGTGCAAATTGTATGGTCCCATTACAAATCTTTGTTGCATTCTTTATTGAACCTGGCCTGTCCCAGAAAGAAGGGATTTTCATCCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364499 204 + 636262 AGTCCAGTAGGTTTGGCATTTTTAGGTCACAAGGTGATATTATTAGTACATGCCAAGTATATTACTATCAGAGTTTGAGAGGGGGAATTAGGCTAATTTACTTTGAAGTGGCTTTACTGTGCATATTGTATGGTCCCATTACAAATCTTCATTGCATCCTTTATTGAACCTGGCCTGTCCCAAAAAGAAGGGATTTTCATCCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 356955 204 + 647215 AGTCTGGTTGGTTTAGTATTTTTCGGTCAGAAGGTGATATTATTATTACATGCGAAGTATGTTACCATCAGAGCCTGAGAGGTGGAATTGGGTTAATTTACCTTGAAGTGGCTTTTCTTTGCTAGTTGTATGGTCCCATTACAAATCTTTGTTGCATTCTTGTTTGGGCCTGGCCTGTTTCAGAAAGAAGGTATTTTCATCCCT + +a +s mr.mrrefChr5 211749 81 + 294542 ATTCATCACTTTTGGAAGAAGTTAAACAGAAAACAAGTATCATTCCCCAGTGTTGAGCTATTTGTGTCCAATAAACTTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364703 81 + 636262 TTTCATCACTTTTGTAAGAAGTTAAACAGAAAACAAGTATCATCCTCCAGTGTTGAGTTATCTGTGTCCAATAAACTTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 357161 81 + 647215 ATTCATAACTTTTGGAAGAAGTTAAACAGAAAATGAGCGTTAGTCCACAATGTTGAGCTATTTGTGTCCAATAAACTTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 211830 302 + 294542 TCCTAACACTTTTGAAACTAAATGTACTAAATGTAGCAAGGCTGGAATAATTGTGATATTTCCTAAGGTATGTCTGTTCCACCCAGCGTCATGTGGTCTAGATTATGCTATGGAGAGTGCTACATCACACTTTATATGAGAGAATAAGCATAGTCATCCATGGCAGGCCTTGCCTCTTTAGCCATACTGGTACCTACTATGTATGGAAAATTTTTGTGCTAGACCAGTATTTAGCCTTTCCCATCCCAACTTGAAATTGTCCTTCTGTTTGAACAACCTCCATTCTCCCAATGCTCTTCGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 364801 293 + 636262 TCCTAACACTTCTGAAACTAAATGTAGTTAATGTAGCAAGGCTGGAATAATTGTGATATTTCCTAAGGTACGTCTGTTCCACCCAGCGTTATGTGGTCTAGATTGTACTATGGAGAGTGCTACATCACACTTTA----AGAGAATAAGCATAGTCATCCAGGGCAGGCCTTGCCTCTTTAGCCATGCTGGTGCCTACTATGTATGGAAAATTTTTGTGCTAGACCAGTATTTAGCCTTTCCCATCCCAACTTGAAATTGTCCTTCTGTTTGAACAACCTCGATTCTCCCAATGCTCT----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 357242 296 + 647215 TACTAACACCTTTGAAACTGAATGTACTAAATGTAGCCAGGCTGGAATAATTATGATATTTCCTGGGGTATGTCCATCCCACTCGGCGTCAGG----CTAGATCATGCTACGGAGACTGCTACATCACACTCTATATGAGAGAGTAAGCATAGTCATCTATGGCAGG--TTGCCTCTTTAGCCATACTGGTACCTAACATGTATGGATAATTTTTGTGCTGGACCAGTATTTAGCCTTTCCCATCCCGACTTGACATTGTCCTACTGTTTGTACAACCTCCATTCTCTTGATGCTCTTCGTA + +a +s mr.mrrefChr5 212132 332 + 294542 GGGGTCCCCTTAATTTTATTTAATGGAATTGGATGCAAACAATGTTTGATTATTGACAATCAGGCCATGACACATTCCAAATTGTGGATTCTCAAAGTTACAAAAGTAATGGTATGAAGCTTTTTTAGACACTGATATTTTTAGAGGTTGCTGCAATGACGCTTCCACACCTTATTCCCGCAGGTAGATGAAGTTTCAATTCCCTTGGGTTTTGTCCGACTGGTAGAGCACAGTTAACTAGGGGAGTCATCCTACACTGCCAACAGAGGTCACTGTTGGCCGTATATGGTGACTCCCCTGGTTCACTGCACTCTTGACCAATTAAGGAAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365094 332 + 636262 GGGGTCCCCTTAATTGTATTTAATGGAATTGGATGCAAACAATGTTTGATTATTGACAATCAGGCCATGAGACATTCCAAATCGTGGATTCTCAGAGTTACAGAAGTAATGGTGTGAAGCTTTTTTAAACATTGATACTGTTAGAGGTTGCTGCAATGACGCTTCCACGCCTTATGCCCGCAGGTAGAAGAGATTTCAATTCCCTTGGGTCTTGGCCTACTGGAAGAGCACAGTTAACTAGGGGAGTCATCCTACACTGCCAACAGAGCTCACTGTTGGCCGTATATGGTGACTCCCCTGGTTCACTGCACTCTTGACCAATTAAGGAAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 357539 331 + 647215 GGGGCCTCCTTAATTTTATTTAATGGAATTGGACATAAACAATGTTTGATTACTGACAATCAGGC-ATGACACACTCCAAATTGTGGATGTTCAAACTTACAAAAGTAATGGTATGAAGCGCTGCTAGACACTGATATTTTTAGAGGTAGCTGCAACAGGGCTTCCACACCTTATTCCCGTAGGTAGATGAAGCTTCAATTCCCTTGGGTTTTGTCCGACTGGTAGAGCACAGTTAACTAGGGAAGTCATCCTACACTGCCAACAGAGGTCACTGTTGGCCTTATATGGTGACTCCCCTGGCTCACTGCACTCTTGACCAGCTTAGGAAACC + +a +s mr.mrrefChr5 212464 68 + 294542 GATTGGGACTTACACCTACTTGGGGTTATCATAGTGGGTGTGGCTGCCTAAAAATATACATGTCTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365432 68 + 636262 GATTGGGACTTACACCTACTTGGGGTTATCATAGTGGGTGTGGCTGCCTAAAAATATACATGTCTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 357870 68 + 647215 AATTGAGACTTGCACCTGCTTCAGGTAGTAATAGTGGGTGTGGCTGCCTAAGAATATATGTGTCTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 212532 12 + 294542 TAGCTATGTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365500 12 + 636262 TAGCTATGTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 357939 12 + 647215 TAGCCATATATT + +a +s mr.mrrefChr5 212544 212 + 294542 CTGTTGCTTTGAAAACATGTAATTCAAAGCATGTCAGTGGCATTGGTCTCACAAATAATTCCACTGCACAGCAGGAGTATGAGCAATGAGCATCATTGACATCCTCGTTGACTTCCACTTGGTTTAGTCTTATAATTGTTTACAACCAATTTGTGCAGTGTATATTATTTAGGTGGCACCTGCCCACAACACTCTCTGTCAGATGGTAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365512 212 + 636262 CTGTTGCTTTGAAAACATGTAATTCAAAGCATGTCAGTGGCATTGGTCTCACAAATAATTCCACTGCATAGCTGGAGTATGAGCAATGAGCATCATTGACATCCTCGCTGACTTCCACTTGGTTTAGTCTTATAATTATTTACAACCAGTATGTGCAGTGTATATTATTTAGGTGGCACCTGCCCACAACACTCTCTGTCAGATGGTAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 357958 212 + 647215 CTGTTGCTTTGAAAACCTATAATTCAAAGCATGTCAGTGGCATTGGTCTAACAAATAATTCCACTGCACAGCAGGAATATGAGCAATGAGCATCATTGACATCCTCTTTAACTTCCACTTAGTTTAGTCTTATAGTAGTTTACAACTAATTTGTGCAGTGTATATCATGTAGGTGGCACCTGCCCGTGACCCACTTGGTCAGATGGCAAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 212756 24 + 294542 CCGTGCTAAGCAATGTGCTTTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365724 24 + 636262 CCGTGCTAAGCAATGTGCTTTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 358176 24 + 647215 CCATGTTAAGCGATGTGCTTTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 212780 13 + 294542 GAGTGCTTAACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365748 13 + 636262 GAGTGCTTAACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 358201 13 + 647215 GAGTGCTTAACAG + +a +s mr.mrrefChr5 212793 43 + 294542 TGAGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365761 43 + 636262 CAAGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 358215 43 + 647215 TGTGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCG + +a +s mr.mrrefChr5 212836 224 + 294542 AGGAATTGACCTGCCACTCCCGTTTGGCTGGGTGATTTTGTTGGCACCTAAGAAGACCATGCTGCAGGAGACCCAAAGACTGAGGCAGAATACTCTTCATCCGATTGCAGCATATTACCTGGTCATATGGTCCTCCTTTCTGCCTGATGAATGGCTCCTGGACAAGTGTGAGCATATCTCTTAATATCTTATTTACATACACATATAAGGTTTGATCACTTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 365804 221 + 636262 ---AATCGACCTGCCACTCCCGTTTGGCTGGGTGATTTTGTTGGCACCTAAGAAAACCATGCTGCATGAGACCCAAAGACTGGGGCAGCATACTCTTCATCCGATTGTAGCATATTACCTGGTCATATGGTCCTCCTTTCTGCCTGATGAATGGCTCCTGGACAAGTGTGAGCATATCTCTTAAGATCTTATTTACATACACATATAAGGTTTGATCACTTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 358260 223 + 647215 AGGAATTGACCGTGCACTCCCATCTGGCTAGGTGATTTTGTTG-CACCTAAGCAGATCATGCTGCAGGAGACCCAAAAACTGAGGCGGAATACTCATCATCCAATTGCAGCATATTACCTGGTACTATGGTCCTACTTTCTGCCTGATGAATGGTTCCTGGACAAGTGTGAGCATATCTCTTAATATCATATTTGTATACACATATGAGTTTTGATCACTAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 213060 383 + 294542 AGATAGATATGTTAGTTAATGAAACAGTTATACAAAGAGTGGTTAAGGTAGCAGAAACCTCCAACCATGAAAGCAGTGCTTTCAGATGTGTCATGGCTGAGAGGACCACCCAACCTAACTCCCTCTAGAACATACAAATAAGCTCTCCAAAGCAACCGATGACAGGTGTGCTTATGCAACAGCTAATGGGACTGCAACTTCATGGTCACTCAAGCTCTACACCTAATGTAGTGTTCAAATGGTATACACTCCAGCGATTGCTAAGCCACCATTAAGTAGGAGCAATTTAAGATTAATCATTGTTCGTTGATAGCAGCACTAAGAAGAACTTCATGCATGACTTATATCTATAGGAGGTCTCAAAGCACCAAAGCCAAAGGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 366027 383 + 636262 AGATAGATATGTTAGTTAATGAAACAGTTATACAAAGAGTGGTTAAGGTAACAGAAACCTCCAACCATGAAAGCAGTGCTTTCAGATGTGTCAGGGCTGAGAGGACCACCCAACCTAACTCCCTCTAGAACATACAAATAAGCTCTCCAAAGCAACCGATGACAGGTGTGCTTATGCAACAGCTAATGGGACTGCAACTTCATGGTCACTCAAGCTCTACACCTAATGTAGTGTTCAAATGGTATACACTCCAGCGATTGCTAAGCCACCATTAAGTAGGAACAATTTAAGGTTAATCATTGTTCATTGATAGCAGCACTAATAAGAACTTCATGCATGACTTATATCTATAGGAGGTCTCAAAGCATCAAGGCCAGATGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 358483 380 + 647215 AGATAGATACCTCAGTTAGTGAAA--GGTATACAAAGAGTGAGTAAGATGGCAGAAACCTCCAATCATGAAAGCAGCGCTTTCCAGTCTGTCATGGCCAGGAGGACCACCCAACCCTATTCACACTAGAACATACAAATAAGCTCCCTGAAGCAACCAATCACGGGTGTGCTTATGCAACAGCCGATGGGTCTTCGACTTCATGGTCGCTCAAGCCCTACACCTGATGTAGTGTTCAAATCGCCTGCATTCCAGCCATTGCAAAGCCATCATTAAGTATGAGCAATTTAAGATTAATTATTGTTCGTTGATAGCAGCACTAAGAAGAACTTCATGCATGACTGATATCTATAGGAGGTCTCAAAGCACCAAAACCAAAG-CCT + +a +s mr.mrrefChr5 213443 32 + 294542 GACATTGTGCCAACCTTAGTAAGTTTTGAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 366412 32 + 636262 GCTATTGTGCCAACCTTAGTAAGTTTTGAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 358863 32 + 647215 GACATTGTGTGAACCTTAATAGGTTTTGAACG + +a +s mr.mrrefChr5 213475 468 + 294542 AGTCCTCATGGCCTATTTATTGAACCTGGAGATCAGATGATTAGAATTTATTATATAGGGATTCTCAAAAGCCTGACTCAATGAATTAGAAATATGAGGGGGAAGCAAGTTTGCATACTTTATGCAGATACTGGGAGATAGAAGTAACACTATCAGTTAGGAGATTACCCAAAACCCGCACTGGAAAAATACTGCTCGTCATGAGTATTAGAATGGTGTCACTGATAAATGTTATTGAAGGGCCATGTCCTACAATTCATCCTACACTTAAAAATCTTGTCCACTTACATACCAATCCACTTACAGGTGTTGTTGAGTGGTAAAAGTGACCATGTAAGGCTGGCAACAGATCTCATGGGAAGCGCTTCCTTGTTTGGTGGAGTCCATCTCAGTCCTCCAGTTCAATTAATAGAGGACTTGAATGAATAAGGGTGTGATCCAATTGCATACCATTAGTCACCAATGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 366444 468 + 636262 AGTCCTCATGGCCTGTTTATTGAACCTGGAGATCAGATGATTAGAATTTATTATATAGTGATTCCCAAAAGCCTGACTGAATGAATTAGAAATATGAGAGGGAAGCAAGTTTGCATACTTTATGCAGACACTGGGAGATAGAAGTAACACTATGAGTTAGGAGATTACCCAAAACCCGCACTGGAAAAGTGCTGCTCGTCAAGAGTATTAGAATAGTGTCACTGATCAATGTTATTGAAGGGCCATGTCCTACAATTCATCCTACACTTCAAAATCTTGTCCACTTACATACCAATCCACTTACAGGTGTTGTTGAGTGGTGAAAGTGACCACATAAGGCTGGCAACAGATCTCATGGGAAGCGCTTCCTTGTTTGGTGGAGTCCATCTCAGTCCTCCAGTTCAATTAACAGAGGACTTGAATGGATAAGGGTGTGATCCAATTGCATACCATTAGTCACCAATGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 358896 440 + 647215 AGTCCTCATGGCCTAATTGTTGAATCCGCAGATCA---------AATTTATTATATAGGGATTCTCAAGAGCCTGACTCAATGAATTAGAAATATGAGGGGGAAGCAAGTTTGCATACTTTATGCAGATACTGGGAGATAGAAGTAATGCTGTCAGGTAGGAGATAACCCAAAACCACTACAAGAAAAACACTGCTCGTCATGAG---TAGAATG--GTCACTGATAAGTGTTATTGAAGGGCCAGGTCCTACAATCCATCCTACACGTAAACATCTTGTC-------------ATCCACTTAGAGGTGTCGTAGAGTGGTACAAGTGACCATGAAAGGCTGGCAACAGATCTCATGGGATGCGCTTCCTTGTTTGGTGG-GTCGATCTCAGTCCTCCAGTTCAATTAATAGAGGGGTTCAATGAATAAGAGTGTGATGAGGTTGCATAACATTAGTCACCAATGGGT + +a +s mr.mrrefChr5 213943 80 + 294542 GATGGAAAAAGGAACACCTTCAACATTAAGCTTACACCTGCACATAAACGTGGCACTGACACATAAACATGCTAAAGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 366912 80 + 636262 GATAGAAAAAGGAGCACCTTCAGCATTAAGCTTACACCTGCACATAAACGTGGCACTGACACATAAACATGCTAAAGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 359421 80 + 647215 GATGGAAAAAGGAACACCTTCAACATTAAGCTTACATGTACACATAGACATGACACCTAGGCATAAACATGCTACAGTTG + +a +s mr.mrrefChr5 214023 252 + 294542 CAAACAGACTGCTAGACCGTATGTCTCATCCCAGATTGATACATGTACCCAAGCAGAACTTTGAGGGGCCACTGCCCTACAACGTCATTGTATACAATGGAAAAAAAGAATAGTTAGCTGGCCAGAAATCCTAGCTCTGAAAGATGAAGAAAGTGGCCTTCCTGGTATGATGGAAGACACTGTTATACTTTTAAAGCAATTAGTCAATTCAATGCAAATCCCAAATCCCACAAAAGGCTACAATCTTTACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 367005 250 + 636262 CAAACAGACTGCTTGACCGTATGGCTCA-CCCTGATTGATACATGTACCCAAGCAGAACTTTGAGGGGCCACTGCCCTACAACGTCATTGTATACAATGGAAAAAAAGAATAGTTAGCTGGCAAGAAATCCTAGCTCTGAAAGATGAAGAAAGTGGCCTTCCCGGTATGATGGGAGACACTGTTATACTTTTAAAGCAATTAGCCAATGCAATGCAAATCCCAAATCCCAC-AGAGGCTACAATCTTTACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 359501 245 + 647215 CAAACAGACTGCCATACCTTATGTCTCATCCCAAATTGATACATGTATCCAGGCAAAACTTTGAGGGGCCACTGCCCTACAACGTC----TATACAATGGAAAAAAAGAATAGTTCGCTGGCCAGAAATCCTAGCT---AAAAGTGAAGAAAGTGGCCTTCTTGGTATGATGGAGGACACTATTATACTTTTAGAACAATTAGTCAATTCAATGCAAATCCCAAATCCCACAAAAGGCTACAATCTTTACTC + +a +s mr.mrrefChr5 214275 159 + 294542 AGGCCACAAGGAAGACTAATATGACTGTTCTTTGATATGAATCTCTCCAATCTGGAGGAAGGCGCATGCTCTAGAACTGCATTGGCAAACTGGGTATAAAAAAGAGAGGATTTCAAGTGTTACAGGCAGTAGGTAACACCCCTTTATTTACCTTCTCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 367255 158 + 636262 AGGCCACAAGGAAGACTAATATGACTGTTCTTTGATATTAATTTCTGCAATCTGGAGGGAGGCGCATGCTCTAGAACTGCATTGGCAAACTGGGTATAAAAAAGAAAGGTTTTCAGGTGTTACA-GCAGTAGGTAACACCCCTCTATTTACCTTCTCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 359752 153 + 647215 AGGCCACAAGGAAGGCTAATATGGCTGTTCTTTGATATGAAACTCTCCAATCTGGAGGAAGGCATATGCCCTAGAACTGCATTGGCAAACTGG--ACAAAAAAGGGACGATTTCAAGTGTTACAGGCAGTAGGTAACACCCCTTTATTTACCTTC---- + +a +s mr.mrrefChr5 214434 267 + 294542 GATTTTTTCAGCTAATCTGACTATCTGGTGGTAGCCATCTTTTGCAGAGGTTGGCTCATGCCAGGACTCATTAAATAGAGATTGAAGCAGGGTACAGGAAATGACTATTCCACCAATTATAACAGGACTTCCACATCTGGGCAGATTAGGAAAGTGTGATTTGCCTGACTAATGGTCTGTATGAGACAGTCTGAGTTGTGGCTACAGTGTTTCTGGACCCAGCATCGCAGAGCACCCCCAGACCTAGGATTCCTGATATGAGCATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 367415 266 + 636262 GATTTTTTCAGCAAATCTGACTATCTGGTGGTAGCCATCTTTTGCAGAGGTTGGCTCATGCCAGGACTCATTAAATAGAGATTGAAGCAGGGTACAGGAAATGACTATTCCACCAATTATAACAGGACTTCCACATCTGGGCAGATTAGGAAAGTGTGATTTGCCTGACTAATGGTCTGTATGAGACAGTCTGAGTTGTGGCTACTGTGTTCCTGGACCCAGCATCACAGAGCGCCCCCAGACCTAGGATT-CTGATAGGAGCATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 359905 155 + 647215 AATTTTTTCAGCTAATCTGACTACCTGGTGGCAGCAATTTTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTGATTTGCCTGATTAATGGTCAGTATGCGACAGTCTGCGTTGTGGCTACAGTGTTTCTGGACCCAGCATCGCAGAGCACCCCCACACCTATGATTCCTGACATGAGCATGT + +a +s mr.mrrefChr5 214701 387 + 294542 ATGAGAAGAAATGCTATTACATAGAAACACAAAGATGGGACTAATGAGAGACAAAAACAAACTTCAAAGACTATAACTGGGAACCAGGAGGACAAGTTATAGAATAAACACTGAAAATTATGAACTCATTGGCTAGGAGGGACAGGAACAGTAACTTGAGCCTTCATGGAAAACACGCTTTAAGTACAACAGGAGTATAGTAGGAATGGGGACACTTAACTGCTAGCCCAGTTGACCCCTTGATACTAACTATGCTATGGCTAAACCTCAGGTAACCATTATTATCTAGGTCATCAAGGTCATACTCACAAAGAGTCATGCTTATACCAACTACTCTGTAAGGCACCCTGGATATTATGTGCCTAGTCATCCAACCAGACAGTTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 367682 358 + 636262 ATGAGTAGAAATCCTATTACATAGGAACACAAAGATGGGACTAATGAGAGACAAAAACAAACTCC----------ACTAGGAACCAGGAGGAGAAGTCATGGAATAAACACTGAAA---ATGAACTCATTAGCTGGGAGGGACAGGAACAGTAACTTGAGCCTTCATGGAAAACACGCTTCAAGTACAACAGGAGTATAGACAGAATGGGGACGCATAACTGGTGGCCCAG-TGACCCCTTGATACTAACTATGCTATGGCTAAACCTCAGGTGATCATTATTATCTAGGGCATC---------------AAGAGTCATGCTTATACCAACTACTCTGTAAGGCACCCTGGATATTATGTGCCTAGTCATCCAGCCAGACAGTTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 360060 383 + 647215 ATGAGAAGGAATGCTATTACATAGAATCACAAAGATGGGACTAATGAGA---CAAAACAAACTTCAAAGACTATAACTGGGAACCAGGAGGCCAAGTTATACAATAAACACTGAAGATTATGAACTCAATGGCTAGGCGGGACAGGAACGTTAACTTGCGCCTTCATGAAAAACACACTTTAAGTACAACAAGAATATAGTAGGAATGGGGACACTTAACTGCTATCTCAGTTGACCCCTCAATACCAATTATGTTATGGATAAACCT-GGGTAACCATTATTATCTAGGTCATCAAGGTCATACTCACAAAGAGTCATGCTTATATCAACCACTCAGTAAGGCTCCCCCAATATTATTTGACTAGTGATCCAACCAGACAGTGGGA + +a +s mr.mrrefChr5 215088 23 + 294542 GAATACTTTGGTTGTATAAACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368044 23 + 636262 AGATACTTTGATTGTATAAACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 360443 23 + 647215 GAATACTCTGGTTGTATAAATTC + +a +s mr.mrrefChr5 215111 18 + 294542 TTCCTGAATTAGACAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368068 18 + 636262 TTCCTGAACTAGACAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 360466 18 + 647215 TTCCTGCATTAGACGAAT + +a +s mr.mrrefChr5 215129 161 + 294542 GAAGGCTTTGAGCTGAGGGTCATTTAACATCTTATTAGTACTAGGTGCAGTGCCTGAGACCCACTAGTCTTTCTATGTCTGACATCCCATATAATAGAAGAAGTTCTCACTAACTATTGTCAAAAGTTCTTGCTGATTATTGTCAAGGCACCCATCTTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368086 161 + 636262 GAAGGCTTTGAGCTGAGGGTCATTTAACACCTTATTAGTACCAGGTACAGTGCCTGAGACCCACTAGTCTTTCTATGTCCGACATCTCATATAATAGAAGAAGTTCTCACTAATTATTGTCAAAAGTTCTAGCTGATTATTGTCAAGGCACCCATCTTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 360500 161 + 647215 GAGGGTTTTGAGCTGAGGGTCATTTAAGATCCTATTAGTACTGGGTGCAGTGCCTGATACCAACTGGTCCTTCCATGTATGATGTTCCATATAATAGAAGAAGTTCTCGCTAACTATTGTCAAGAGTTCTTGCCAATTAGTGTTAATGCGCCCATCTTGAG + +a +s mr.mrrefChr5 215290 34 + 294542 GACATATCGCCCTTCATGACAGGCCCTGGAATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368247 34 + 636262 GACATATCGCCCTTCAAGACAGGCCCTGGAATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 360665 34 + 647215 GACATATCGCTCTTCATGACAGGCTCTGGAATCC + +a +s mr.mrrefChr5 215324 28 + 294542 TAGACCCATATCTTTGAAGGCAACAGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368282 28 + 636262 TAGTCCCATATCTCTGAAGGCAACAGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 360699 20 + 647215 AAGACCCATATCTTTCAAGG-------- + +a +s mr.mrrefChr5 215352 102 + 294542 TTTTTGTAGTATCAGCACAGACATGTTGAAGTACCATGACCCAGGTCTGGTAGGCATGGTTCAGGTCAAGGTGAGAGAAGAAAGATTACAATGCCTGAACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368311 102 + 636262 TTTTCGTAGCATAAGCACAGACATGCTGAAGTACCATGACCCAGGTCTGGTAGGCATGGTTCAGGTCCCGGTGAGAGAAGAAAGATTACAATGTCTGAACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 360719 101 + 647215 -TTTTGTAGTATCAGCAAAGATATGTTAGAGTAACATGACCCAGTTCTGGTCAGCATGATTCAGGTTAAGGTGAGAGAAGAGAGATTACAATCCCTGAACAC + +a +s mr.mrrefChr5 215454 97 + 294542 CCACTTTAGTGACTTCTATAGGGTATTCTTAATGTGAATCTGACAAGCCTGCACATCAGTGTATTCTGTATTCCTGGTACCATAGTTCTAAAATCGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368413 97 + 636262 CCACTTTAGTGACTTCTATAGGGTATTCTTAATGTGAATCTGACAAGCCTGCACATCAGTGTATTTGGTATTCCTGGTACCATAGTTCTAAAATCGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 360824 97 + 647215 CCAATTTAGTGCCTTCTATATGTTACTCTTAATGTGAATCTGACAAGCCTGCACATCAGTGTATTCTGTATTCCTGGGACCATAGTTCTTAACATGC + +a +s mr.mrrefChr5 215551 121 + 294542 TTTGGATGCACTGCAATTATTCTCAGGCATATCCGTAAATAAAGTATTAAATCAGTGTCTGTACTTTTCTGTATTAAAAGGTGTCTAATTGCTTTTGCCTAGCCTACATGGATGGTATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368525 92 + 636262 TATGGATGCACTGCAATTATTCTCAGGCATATCTGTAAATAAAGTATT-AATCAGTGTATGTACCTTCCTGTATTAAAAGGTATCTATTTGCT---------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 360921 121 + 647215 TTTGGATGCACTGCCATTATTCACAGGCATATCCGTAAATAAAGTATTAAATCAGTGTCTGTTCTTTTCTGGATTAAAAGGTGTCTAATTGCCTTTGCCTAGCCTACATGGATGGTATGTT + +a +s mr.mrrefChr5 215672 99 + 294542 CAGTATCCGCTCAATGCCCACTTATCCCCCTTTTGGAAAGGAAATATTCAATCAACTCTTAGGAGTAATTGTCAGGCTGTATGGTACAGGACCCCAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368617 92 + 636262 --GTATCCGCTCAATGCCCACTTATCCCCCTTTTGGAAAGTAAATATTCAATCAACTCTTAGGAGTAATTGTCA-----GATGGTACTGGACCCCAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 361043 92 + 647215 CAGTAACTGCTCAATGTCCACTTATCCAC-------AAAGGAAATATTCAATCAACTCTTAGGAGTCATTGTCAGGCTGTATGGTACAGGTCCCCAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 215771 29 + 294542 CTCTGATTTCATACACTGAGTCTCTTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368711 29 + 636262 CTCTGATTTCATACACTGAGTCTCTTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 361135 28 + 647215 CTCTGATTTTA-ACACTGAGTCTCTTTAG + +a +s mr.mrrefChr5 215800 59 + 294542 TGCCATCACACACAGTCTTAAAGAATCTGTTGGGATAAACCAGAAAGAAAGAAATCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368740 50 + 636262 --------CACACAGTCTTAAAGAATCTGTTGGGATAAACCAGAAA-AAAGAAATCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 361165 57 + 647215 TGCCATCACACACAGTCTTAAAGAATCTGTT--GATAAACCAGAAAGAAAAAAATCAGC + +a +s mr.mrrefChr5 215859 206 + 294542 GGTTTGCCTCAACATCAGGTAAGCGTGGTCCCAACTGTTATTACAGGGCATTGGCCTGCGTGAATGGGTGATACATTGATGACACGAAACTGTGATCACCCAAATTATGTCACCCTTGGCAGCCTATACAGTAGCTATGGATTTATGGACACCTATATTGCAGCTGTTCATTTATGGAGGAGCCTATCCGGCAGCTATTGTGTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368791 206 + 636262 GGTTTGCCTCAACATCAGGTAAGCGTGGTCCCAACTGTTATTACAGGGCATTGGCCTGCGTGAATGGGTGATACATTGATGACACGAAACTGTGATCACCCAAATTATGTCACCCTTGGCAGCCTATACAGTAGCTATGGATTTATTGACACCTATATTGCAGCTGTTCATTTATGGAGGAGCCTATCCGGCAGCCAGTGTGTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 361222 197 + 647215 GGATTACCTCAACATCAGGTAAGAGTGATCCCTATTCTTATTACAGGGGATTGGCCTGTGTGAATGCGTAATACGTTGGTGACAGGAAGCTGTGATCACCCAAATTTTGTCACCCTTGGTTGCCTAGACAGTAGCTATGGATTTGTGGATGCCTTTATTGCAGCTGT---------GAGGAGCTTATCCGGCAGCTATTGTGTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 216065 199 + 294542 CAATGTAACACCAGTATACATCAGATATTAAGGAGCTGTATCATACTATTGAGGGATCACCATCCTGCTATTAACTACCATTAAAGAGAGGTCCAGTCTTCCTGCAGTGGCTGACAAAATTAAACCTTTCAAAAATTAACTCAGCCTGTAGCCTACAAATTGGTGTGTGTTGGATACTTGTTATGATATCACTAGCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 368997 186 + 636262 CAATGTAACACCAGTATACATCAGATATTAAGGAGCTGTATCATGCTATTGAGGTATCACCAT-CTGCTATTGACTACCATTAATGAGAGGTCTGGTCTTCCTGCAGTGGCTGACAATATTTAACCTTTCAAAA--TAACTCAGCCTGTAGCCTACAAATTGGTGTGTGTTGGATACTTGTTAT----------GCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 361424 199 + 647215 GAATGTAACATTTGTAGACACCAGCTAGCATGGTGCCGTATCATACCATTGAGGGATCACCATCCTGCTATTAACCACCATTGAAGAGATGTCCAGTCTTCCTACAGTGGCTAACAAAATTAAACCTTTCAAAAATTAACTCAGCCTGTAGCCTATGAATTGGTGTGTGTTGGATCCTTGTTATGATATCACTAGCCAC + +a +s mr.mrrefChr5 216264 129 + 294542 CCTGTGATTAAGTGAGAGGCAATTGCATGTGTCCAGTGCCTGTTCTAATCCTATTTGGCTCGGACAAATTAGTATAAATCATTAACTAATGGCTTTGAGCGATTTCGACATTCGTATGAGTAACAGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369183 121 + 636262 CCTGTGATTAAGAAAGAGGCAATTGCTTGTGTCCAGTGCCTGTTCTAATCCTATTTGGCTCGGATAAATTAGTAAAACTCATTAACTAATGGCTTTCAGCGATTTCGACATTCGTG--------AGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 361628 129 + 647215 CCTGCAAATAAGTGAGAGGCAATTGCATGTGTCCGGTGCCTGTTCTAACCCTACTTGGCTCGGACAAATTAGTATAAATCATTAACTAATGGCTTTGAGTGATTTCTACATTCATATGAGTAACAGCAC + +a +s mr.mrrefChr5 216393 36 + 294542 CGGCCTGATCTCTTCCTTCTCCTTGGGCGGCAATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369304 36 + 636262 CGGCCTGATCTCTTCCTTCTCCTTGGGCGGCAATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 361760 36 + 647215 CGGCCTGGTCTCTTCCTGCTCCTTGGGCGGCAATCT + +a +s mr.mrrefChr5 216429 98 + 294542 ACATGCATCTGTCATGAATAACTTGTCAAAAGACCCACTGGGGCACACATTTGTAGTGCCACTCCGAGTAACTTTGAGATGAGTGAATGACTTCTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369343 98 + 636262 ACATGCATCTGTCATGAATAACTTGTCAAAAGACCCACTGGGGCACACATTTGTAGTGCCACTTCGAGTAACTTTGAGATGAGTGAATGACTTCTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 361796 93 + 647215 ACACGCATCGGTCGTGAATAACTTGTCAAAAGACTGACGGGGGCACACACTTGTAGTGACCCTCCGAGTAACT-----ATGACTGAATGACTTCTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 216527 56 + 294542 ATAGGTAGGCCTTGCGGCCAGGTACTTTTCCAAAGCGATCAAACCTGGGTTCAGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369441 56 + 636262 ATAGGTAGGCCTTGCGGCCAGGTACTTTTCCAAAAAGATCAAACCTGGGTTCAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 361925 56 + 647215 ATAGGTCGGCCTTGTGGCCAGGTACTTATCCAAAGCGATCAAACCTGGGTTCAGGA + +a +s mr.mrrefChr5 216583 151 + 294542 CACCTGGTCTGGCGCATTGACCTTCAATCTCATTGGCGATCATGCATCCTCGAGGTGTCTGGGAACGTTAATGGTCTGCAATGAGCGCCACGTATCTTGGGCCTATAGTGGTCCGAAAATGGTGAAAGGTGAGAAGACAAGCATTTATGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369497 151 + 636262 CACCAGGTCTGGCGCATTGACCTTCAATCTCATTGGCGATCATGCATCCTAGAGGTGTCTGGGGACGTTAAGGGTCTACAATGAGCGCCACGTACCTAGGGCATATAGTGGTTCGAAAATGGTGAAAGGTGAAAAGAAAAGCACCTATGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 361986 151 + 647215 CACCTGGTCACGCGCATTGACCTTCAATCTCATTGGCGATCATCCATCCTCGAGGTGTCTGGGAACGTTAATGGTCTGCAATGAGCGCCACGTATCTTGGGCCTATAGTGACCCAAAGATGGTGAAAAATGAGAAGACAAGCATTTATGGC + +a +s mr.mrrefChr5 216734 38 + 294542 TGACCACCTTCCTGGTGTTAGGCAGTAGGTTTACAGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369660 38 + 636262 TGATAACCATCCTGGTGTTAGGCAGTAGGTTTACAGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 362137 12 + 647215 TGACCCCCTTCC-------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 216772 48 + 294542 GTAGTCTAATCTCAAATAGTCATGGTAAACCCGCCTTATATAGTGACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369711 48 + 636262 GTAGTCTAATCCCACATAGTCATGGTAAGCTCGCCTTATATAGTGACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 362149 35 + 647215 ---GTGGAGTATCAAATAATCATGGTAAACCCGCCTTA---------- + +a +s mr.mrrefChr5 216820 20 + 294542 CTCCCCCAATCACCCTCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369760 20 + 636262 CTCCCCCAATCACCCTCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 362184 20 + 647215 CTCCCCCAATCATCTTCCTT + +a +s mr.mrrefChr5 216840 48 + 294542 ATACACACTTCCTTATGTAGCCCTGCTACATTAGCATCTCATGTATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369780 48 + 636262 ATACACACTTCCTTATGTAGCCCTGCTACATTAGCATCTCATGTCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 362205 48 + 647215 ATACACACTTTCCTTTGTAGCCCTACTACATTAGCATCGCATGTATGT + +a +s mr.mrrefChr5 216888 40 + 294542 GAGTCAGACAGGCCCATGGTTACTATATGCTAGAAGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369870 40 + 636262 GAGTCAGACAGGCCCATGGTTACTATATGCTAGAAGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 362253 40 + 647215 GAGACAGACAGGCCCATGGTTACTATATTCTAGAAGCATA + +a +s mr.mrrefChr5 216928 309 + 294542 ATCTATCTGGTATCACCTGTGTATTCTCATGGCTACATAGACAAGAGGTTGCAAACAATGCATATCAATTTCCAAAATTTCCAAAATAGAGACAAATTTGAGGACTTCATAGGATGTAGGAACAATGAAATCTTTCAAAGTGTTTGGCTGTCTGTAGTACTCCCAGTGTTTGTGGCTCTATGTCATTTTAATTTGGGAAGTTGCAGGAGATGAGACCACTAGGACCCAATCCTAATTTGTGTCAAGGTCCATGATTCAGCTAATTCTATAATGCCATTGCCTTAAAGACATCTGTCACTTAATACAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 369910 306 + 636262 ATCTATCTGGTATCACCTGTGTATTCTCATGGTT---TAGACAAGAGGTTGCAAACAATGCATATCAATCTTCATAATTTCCAAAATAGAGACAAATTTGAGGACCTCATAGGATGTAGGAATAATGCAATCTTTCAAAGTGTTTGGCTGTCTGTAGTTCTCCCAGTGTTTGTGGTTCTATGTCATTTTAATTTGGGAAGTTGTAGGAGATGAGACCACTAGGACCTAATCCTAATTGGTGTCAAGATCCATGATTCAACTAATTCTATAATCCCATTGCCTTAAAGACATCTGTTACTTGACACAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 362317 309 + 647215 ATCTATCTGGTATCACCTGTGTATTCTCATGGCGACATAGATGAGGGGTTGCAAACAATGCATATCAGTTTCCAAAATTTCCAAAATAGACACAAATTTGAGGAGTTCATAGGATGTTGTAACAATGAAATCTTTCAAAGTGTTTGACTGTCTGTAGTACTCCCAGTGTTTGTGGCACTACGTTATTTTAATTTGGGAAATTGCAGGAGATGAGACTACTAGGACCCAATCCTAATTTGTGTCGAGGGCCACGGTTCAGCTAATTCAATAATGCCATTGCCTTAAACACATCTGTCACTTAATACAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 217237 62 + 294542 GCTTCTTATCTTAATCAGGGGGTCATTATCTAGTCAAAGCAATCCTGCCCTTGGGGGTGTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370216 62 + 636262 GCTTCTTATCTTAATCAGGGGACCATCATCTAGTCAAAGCAATCCTGCCCTTGGGGGGGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 362630 62 + 647215 CCTTCTTATCTTAATCAGGGGGTCATTATCTAGTTAATGTGATCCCGCCCTTGGGGGTGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 217299 10 + 294542 TGTGTGCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370278 10 + 636262 TGTGTGCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 362702 10 + 647215 TGTGTGCCAA + +a +s mr.mrrefChr5 217309 131 + 294542 CCCAACTGTCCCCAGATGATGTAGTGGCAATTGAGGGTGGGTTAGGCTGATGGGGGTGAGTTCAAACAAGACTTCAGTAAATGCCCTGGCAAAAGCATATAGCCATTCTTTTTCCATAAAAGTGATGGAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370288 131 + 636262 CCCAGCTGTCCCCGGATGATGCAGTGGCACTTGAGAGTGGGTTAGGCTGATGGGGGTGAGTTCAAACAAGACTTCAGTAAATGCCTTTGAAAAGGCACATAGCCATTCTTTTCCCATAAAAGTGATAGAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 362714 118 + 647215 CCCAACGGCCCCAAAATAATGTGGTGGCAATTGATGGTGGGTTAGAACAATGGGGGCTAGTTCAAACAAGACTT----------CCTGGCAAAAGTATGTACCCATTCTTTTTCCATAAAAGTGCTGG--- + +a +s mr.mrrefChr5 217440 133 + 294542 TAGACAACAAGACTTATATACCAATCAAGCCAGCACAGCACAGCTCACTTGAAATTGTCAATCTGACAGACAGTTCAACAGTATACTAAACTCATGTCAAAACTATTCAGCATTGACCAACCCTGCCGGCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370422 133 + 636262 TAGACAACAAGACTTATATACCAATCAAGCCAGCACAGCACAGCTCACTTGAAATTGTCAATCTGACAGACAGTTCAACAGTATACTAAACTCATGTCAAAACTATTCAGCATTGACCAACCCTGCCGGCATT + +a +s mr.mrrefChr5 217573 20 + 294542 GGATCTAGATGAGCTCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370558 20 + 636262 GGATCTAGATGAGCTCAGTT + +a +s mr.mrrefChr5 217593 22 + 294542 CATGTCACGGTCTCTCAGGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370579 22 + 636262 CATGTCACGGTCTCTCAGGTTC + +a +s mr.mrrefChr5 217615 25 + 294542 GAGCGCTCTAGTATGTGGATACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370618 25 + 636262 GAGCGCTCTAGTATGTGGATACAAA + +a +s mr.mrrefChr5 217640 17 + 294542 ATCCTGGGTTTTGCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370645 17 + 636262 ATCCTGGGTTTTGCATC + +a +s mr.mrrefChr5 217657 20 + 294542 GTGTACTTTCAGGTAGCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370668 20 + 636262 GTGTACTTTCAGGTAGCATT + +a +s mr.mrrefChr5 217677 12 + 294542 AACGTATAGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370693 12 + 636262 AACGTATAGCCC + +a +s mr.mrrefChr5 217689 56 + 294542 GGTTATCTTTGATGCTGCATCAGGTGTGGTATATCTAGAGGGGCTGTATTACCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370707 56 + 636262 GGTTATCTTTGATGCTGCATCAGGTGTGGTATATCTAGAGGGGCTGTATTACCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 362832 35 + 647215 ---------------------AGGTGTGGTAGACCTAGAGGTGCAGTATTACGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 217745 70 + 294542 AAAGGCATTTGTGGCTATTATCTGTAATGGCGATTATCACCATCTTACGTTGACTCCATCTAGGCTTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370763 70 + 636262 AAAGGCATTTGTGGCTATTATCTGTAATGGCGATTATCACCATCTTACGTTGACTCCATCTAGGCTTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 362871 70 + 647215 GAAGCCATCTGTGGGGTATTTCTGAATTGGTGATTATCACTATCTTACACTGTCTCCATCTAGGCTTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 217815 26 + 294542 GTCTAGTTAGCTAATGAGTGTCACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370839 26 + 636262 GTCTAGTTAGCTAATGAGTGTCACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 362941 26 + 647215 GTCCAGTTGGCTAAAGAGTGTCACAA + +a +s mr.mrrefChr5 217841 28 + 294542 TTTGTTTGATAAATTTCACTGTACCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370865 28 + 636262 TTTGTTTGATAAATTTCACTGTACCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 363212 28 + 647215 ATTGTTTGATAAATTGCACTAAACCATC + +a +s mr.mrrefChr5 217869 45 + 294542 CTCAGTGACAAGTAAATCTGGAGATTGGCTGCAGCACTTGATAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370977 45 + 636262 CTCAGTGACAAGTAAATCTGGAGATTGGCTGCAGCACTTGATAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 363240 45 + 647215 CTCAGTAACAAGTAAATTTGGAGATTGGCTCTAATGCTGGATAGA + +a +s mr.mrrefChr5 217914 57 + 294542 TGGTAGGAGCTAGTTTAAGAAAAGTAACAACTAGTTTGAGGACCATTTATGCCTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371022 57 + 636262 TGGTAGGAGCTAGTTTAAGAAAAGCAACAACTAGTTTGAGGACCATTTATGCCTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 363286 57 + 647215 TGTTAGGAGTTAGGCTAATAAAAATAGCAACTAGTTTGAGGACCATGTATGCCTATG + +a +s mr.mrrefChr5 217971 68 + 294542 TGCCCCTGGAACTCATTTGTTTTTGCTTGCTTGTGGTATACAGAGTGCGGTGGTATACAGAATGCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371079 68 + 636262 TGCCCCTGGAACTCATTTGTTTTTGCTTGCTTGTGATATACAGAGTGCGGTGGTATACAGAATGCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 363432 68 + 647215 TGCCCCTGGAACTCATTTGTTTTTGCTTGCTGGTGGTTTACAGAGTGCTGTGGTGTACAGAATCCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 218039 153 + 294542 GCATGGCAGCAGGAAGCATCAGCCCTGGGATAGAATGCTGTGTTGGTGTTCACTGCCATCAGGAGGGGAGAAAGAGGCTGCCTGTTGTCAACTTATACTCCACCATCTAATGGCATTTATGAGTGCTAGGAAATGAGGGAACTGCTTGAACTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371165 152 + 636262 GCATGGCAGCAGGAAGCATCAGTCCTGGGATAGAATGCTGTGTTGGTGTTCACTGCCATCACAAGGGGAG-AAGAGGCTGCCTGTTGTCAACTTATACTCCACCATCTAATGGCATTTATGAGTGCTAGGAAATGAGGGAACTGCTAGAACTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 363500 152 + 647215 GCATGACAGCAGGAAGCATCAGCCCTGGGATAGAATGCTGTGTTGGTGTG-GTTGCGATCAGGAGAGAAGAAAGAGGCTGCCTGTTGTCAACTTATACTTTGCCATCTAATGGCATTTGTGAGTGCTGGGAAACAAGGGAACTGCTTGAACTG + +a +s mr.mrrefChr5 218192 323 + 294542 CCTATGAATGGATCCATCCCTGCAATCTGAGACAGGATTTGAATTATTGAACTTATGGTTCTGCATGGTGAATGGAACACATGACTGCACTGGGATTCCAGCAATATATGAGTACACTTCTCCCATAAGATATCTAACTGAGACAGTCATGTAAATAATGTGATAAGTATTAGGATGAATTTTATGTTGGATACAGTTGTTGGTGCTCAAACCCATATTACTGTCATGACAATTCAAATCAATCATAAACACTTACCACTGAGCATCAATTGGGCCTAGACATGGAATGGAGACCATATGATTAAAAAGGTTACTGCAGGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371317 316 + 636262 CCTATGAATGGATCCATCCCTGCAATATGAGACAGGATTGGAATTATTGAACTTATGGTTCTGCATGGTGGATGGAACACATGACT-CACTGGGATTCCAGCAATATATGAGTACACTTCTCCCATAAGATATCTAACTAAGACAATCATGTAAATAATGTGGTAAGTATCAGGATGACTTTTATGTTGGATGCAGTTGTTGATGCTCAAACCCATATTACTGACATAACAATTCACATCAATCATAAACACTTACCA------ATCAATTGGGCCTAGATATGGAATGGAGACGATATGATTAAGAAAATTACTGCAGTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 363731 323 + 647215 CCTATGAATGGATCCATCCCTGCAATCTGAGACAGGATTTGAATTATTGAACTTATGGTTCTGCACAGTGAATGGAACACATGGCTGCACTGGGATTCCAGCAATATGTGAGTACTCTTATGTTATAAGTTATTTAACTGAGACGGTCATGTAAACAATCTGATAAGTATTGGGATGGATTTTATGTTAGATACAGTTGTTGGTGGTCAAACCCATACCACTGTCAGGTCGATCCAAATCAATCCTAAATACTTACCACTGAGCATCAATTGGGTCTAGACATGGAACGGAGACCATATGGTTAAAAAGGTTACTGCAGGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 218515 30 + 294542 GTGAGAGAACCTGGATGCAGCAAACAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371653 30 + 636262 GTGAAAGAACCTGGATGCAGCAAACAAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 364054 30 + 647215 GTAAGAGAACTTGAACGCAGCAAACAGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 218545 75 + 294542 AATGGTGCAGCAATGCTACTCATGCCAATGTGAAGGAACCTGTGATGCTGAGGACAAAGTGAGTTTGTGATTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371683 75 + 636262 AATGGTGCAGCAATGCTACTCATGCAAATGTGAAAGAAGCTGTGATGCTGAGGACAAAGTGAGTTTGTGGTTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 364086 75 + 647215 AATGGAGCAGCAATGGTACTCATGCCAATGTGAAGGAACCTGGGATGCTGAAAACAAAGTGAATTTGTGATTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 218620 9 + 294542 GGTTGACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371759 9 + 636262 GGTTGACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 364161 9 + 647215 GGTTGACAC + +a +s mr.mrrefChr5 218629 22 + 294542 ACAACCTGGTGGAGGTTTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371769 22 + 636262 ACAACCTGGTGGAGGTTTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 364170 22 + 647215 ACAACATGGTATAAGCTTTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 218651 635 + 294542 GAGGTTTACATCCTGGTAGGTGCCTCTAGAGGCCTATTCGAATAATGAATACTTTTGGAATGGCAAACCAACTTTGCTACATTGCCCCTCACCCAATTTGAAGAAAAGTGCCTGGATCCTGGATGTAAGACAAGAAGGGCCCCAGAGGATGGCATATATGAGAGGAAGCAGAAACCACTCAATATAATACTATCCCAGTGTATAGATCAACTAATCTGCCAATGCCTTACTGGATGCTTATGGAGCAATTTTCAGGAGTGGAGTGACTTGGTCAAATAGCATGGGGTGTGGGAAGAACCTGATTCAGTGGCATACAGTGGATGCAGATAAGATCATAGACTACAAGGACAAAAACTGCGATAAGATTGCCCACTACACAATGCAAGGGACAGTGTTATCTGGCCTATCTAATAGGCCGGTGATGCGCAGGTGCTGGGGGACACTGTGATGGAGATCCAGGCTAGGAGAGTATTCCCACAAGAGACATTTAAACTACAGTTAGTACATCAATGTCATGTTAGTGGGCCCCAAGCTTTGTAGGGGGTTCCTAAACCAAGTAGCCATGATTATACAGTATTTATGGTATACAGTAATGGTCCAATGGCATGTTTCTGCAGCTCTTACTACTCCTTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 371794 628 + 636262 GAGGTTTACGTCCTGGTAGGTGCCTCTAGAGGCCTATTCGAATAATGAATACTTTTGGAATGGTAAACCAACTTTACTACATTGCCCTTCACCCAATATGAAGAAAAGTGCCTGGATCCTGGATGTAAGACAAGAAGGGCCCCAGAGGATGGCCTATATGAGAGAAAGCAGAAACCACTCAATATAATACTATCCCAGTGTATAGGTCAACTAATCTGCCAATGCCTTACTGGATGCTTATAGAGCATTTTTCAGGGGTGGAGTGACTTGGTTAAATAGCATGGGATGTGGGAAGAACCTGATTCAGTGGTATACAGTGGATGCAGATAAGATCATAGACTATAAGGAC-AAAACTGCAATAAGATTGCTCACTACACAAGGCAAGGGACAGTGTTATC------ATCTAATAAGCCGGTGATGCGCAGATGCTGGGGGACACTGTGGTGGAACTCCAGGCTAGGAGAGTATTCCCATATGAGACATTCAAACTACAGTTGGTACATCAATGTGATGTTAGTGGGCCCCAAGCTTTGTAAGGGGTTCCTAAACCAAATAGCCATGATTACGCAGTAATTATGGTATACCGTAATGGTCCAATGGCATGTTTCTGCAGCTCTTACTACTCCTTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 364192 622 + 647215 CAGGTTTATATCCTGGTAGGTGCCCCTAGAGGCCTATTTGATTAATGAATACTTGTGGAATGCCAAACCAGTTTTGCTACATTGCCCCTCACCCAATTTGAAGAAAAGTGCCTGGATCCTGGATGTAAGACAGGAAGGGCCCCAGAGGATGACATATATTGGAGGAAGCTGAAACCACTCAATATAATACTATCCTAGTCTATAGATCAACTCATCTGCCAATGCCTTACTGGATGCTTATGGAGTGATTTTCAGGAGTGGCGTGACT----CAAATAGCATGGGGTGTGGGAAGAGCCTAATTCAGTGGCATACATTGGATGCGGATAGGATCATAGACTTCAAGGACAAAAACTGCGATAAAATTGCCCACTACACAATCCAAGGGACAGTGTTGTCTGGCCTATCTAATAGGCCAGTGATGGGCAGGTGCTGGGGGACACTGTGATGGAGATCCAGGCCAGTCAAGTATCCCCACAAGAGACATTTAAACCACAGTTAG---------GTCATGTCAGTGGGCCCCAAGCTTTGTCGGGAGTTCCTAAACCAAGTAGCCATGATTATACAGTATTCGTGGTACACAGCAATAGTCCAATGGCATGTTTCTGCAGTTCTTACCACTTTTGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 219286 49 + 294542 TTGCTACTACAATTGAGCTCAGACTCACAGCTGGCTGGCCCCAGATCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 372436 49 + 636262 TTGCTACTACAATTGAGCTCAGACTCACAGCTGACTGGCCCCAAATCTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 364814 49 + 647215 TAGCTGCTATGATTGAGCTCACACTCACAGCTGGCTGGCCCCAGATCTA + +a +s mr.mrrefChr5 219335 160 + 294542 AGGTATTTGCAAAACTGTTAAGCCCAGTTTACCAGCATACTACACATTGGTGTGGGTAGTTTATGGGACAAAGATGTTGTGTAAGCATATTGTCATGACGACACTGCTCTTCTCTTAGCATTACAGGACCAGGTCAGGCACTGCCAACCCTTGAGTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 372486 156 + 636262 AGGTATTTGCAAAACTGTTAAGCCCAGTTTACCAGCATACTACACAATGGTGTGGGTAATTTATGGGACAAAGATGTTGTGTAAGCATATTGTCATGACGACATTGCTCTTTTCTTAGCACTACAGGACCAGGTCAGCCACTG-TAACCC---AGTATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 364863 151 + 647215 AGGTATTTGCAAAACTGTTCAACCCAGTTTACCAGCATGTTCCACATTGGTGTGGGTAGTTTATGGGACAA---------GTTAGCAAGTTGTCATAACAACACTGTTCCTCTCTTAGCCTTGCCAGTCCAGATCAGGCCCCGCCAACCCTTGAGGATTG + +a +s mr.mrrefChr5 219495 79 + 294542 CGGTTGCAGAGCAATGCAGACCAGCCCTTAAAAAATCAGGTTTGGCATAAAAAACCGGGTTTAGCATAATGATGTGCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 372642 60 + 636262 CGGTTGCAGAGCAATGTAGACCAGCT-------------------GATAAAAAACCGGGTTTAGCATAATGATGTGCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 365015 79 + 647215 AGGTTGCAGAGTAATGCAGACCAGCCCTTAAAAAATCAGGTTTGGCATGAAAAACCAGGTTTGGCATGACCATCTTCTC + +a +s mr.mrrefChr5 219574 190 + 294542 TAAATGCCAGGCTTGGACCCACCAGATCTAGCCAAGGTGAACAGCATCACACTGAAAGACATTGCTTGACTTTTTTTTTCGACTGCATTGTTCTAATTAGATGGAGTTCTCTGTCAAACAACTTAGCTAGTTTGTGCAAGGAAAATTCACACAATCAAACAATTGGCTGAAACCTCCTTCTTTAAAACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 372702 190 + 636262 TAAATGCCAGGCTTGGACCCACCAGATCTAGCCAAGGTGAGCAGCATCACACTGAAAGGCATTGCTCGGCTTGTTTTATCACCTACATTGTTCTAATTAGATGGAGTTCTCTGTCAAACAACTCAGCTAGCTTGTGCAAGGAAAATTCATACAATCAAACAATTGGCTCAAACCTCCTTCTTTAAAAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 365095 190 + 647215 GGAATGCCAGGCTTGCGCCCACCAGATCCAGCCAAGGTGAACAACATCACAGTGAAAGACATTGCTTGACTTTTTTTTTCGACTGCATTGTTTTAATTAGATGGAGTCCTCTGTCAAACAACTTGGCTAGTTTGTACAGGGAAAATTCACACAATCAACGAGTTGGATGAGACATCCTTCGCGAACACTT + +a +s mr.mrrefChr5 219764 51 + 294542 TGACACTCAGGTATTGTAGACTGGCCCTATTGAAAACCTCCCTTGGTAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 372897 51 + 636262 TGACACTCAGGTATTATAGACTCCCTCTATTGAAAATCTCCCTTGGTAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 365285 51 + 647215 TGAGACTCAGGAGTTGGAGACTGGCCCTATCAGATTCCTCCCTTGGTAACG + +a +s mr.mrrefChr5 219815 116 + 294542 CCAATGATAGCCCAGCTCTTTCTACTGTCCAGTTCTGTAACTTAGTAAATTCATCTCTTTCCACGTTCTGCATGCTATTGAGTCAGCCTTGTGAAAAGGAAGGTGTACTGACTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373074 116 + 636262 CCGGGGATAGCCCAGCTCTTTCTACTGTCCAGTTCTGTAACGTGGTAAATTCAGCTCTTTCCACGTTCTGTATGCTATTGAGTCAGCCTTGTGAAAAGGAAGGTGTACTGACTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 365336 116 + 647215 CGAATGGTAGCCCAGCTCTTTCCACTGTCCAGTTCTGTAACTTAGTAAATTCATCCCTTTCCATGTTCCGCGTGCTGTTGACTGGGCCTTGTGAAAAGGAAGGTGTACTTACTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 219931 6 + 294542 GGATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373190 6 + 636262 GGGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373349 6 + 636262 GTATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 365452 6 + 647215 GGATGA + +a +s mr.mrrefChr5 219937 1 + 294542 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373196 1 + 636262 G +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373359 1 + 636262 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 365458 1 + 647215 A + +a +s mr.mrrefChr5 219938 6 + 294542 GGCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373267 6 + 636262 GGCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373360 6 + 636262 GGCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 365459 6 + 647215 GGCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 219944 1 + 294542 T +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373366 1 + 636262 T +s simRat_chr6.simRat.chr6 365465 1 + 647215 T + +a +s mr.mrrefChr5 219945 45 + 294542 AACATTCTGACTCATTATTAGATGTTTGATTTTGATGTCCACTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373273 45 + 636262 AACATTCTGTCTCATTATTTGATGTTTGAGTTTGATGTCCACTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373367 45 + 636262 AAGATTCTGACTCATTATTAGAGGTTTGATGCTCATTGTTACTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 365466 45 + 647215 AAAATTCTGACTCATTATTAGATGTTTGATTTTTGTGTCCCTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 219990 1 + 294542 C +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373412 1 + 636262 C +s simRat_chr6.simRat.chr6 365511 1 + 647215 C + +a +s mr.mrrefChr5 219991 31 + 294542 CAAATTGTACTCCTGTGGGTCATGTTCTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373318 31 + 636262 CAAATTGTACTCCTGTGGGTCATGTTCTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373413 31 + 636262 CAAATTGTACCCCGGTGGGTCATGTCCTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 365512 31 + 647215 AAAATAGTACTCCTGTGGGTCATGTTCCCCA + +a +s mr.mrrefChr5 220022 77 + 294542 GAAGAGCCAGTACATGATCCAACCCAGTTCTGGAGCAGATCCAATCTACCCTTTCTCAGCTATATGAATCATTCTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373445 77 + 636262 GAAGAGCCAGTACATGATCCAACCCAGTTCTGGAGCAGATCCAATCTACCCTTTCTCAGCTATATGAATCATTCTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 365543 77 + 647215 AATTAACCTGTACATGATCCAACCCAGTGCTGGAGCAGATGCAATCTGCCCTTTATCAGGTATATGATTCCTTTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 220099 38 + 294542 TATTAGCAAATTTCCTTTTCTATTAGGCTGTTATTACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373522 38 + 636262 TATTAGCAAATTTCCTTTTCTATTAGGCTGTTATTACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 365627 38 + 647215 TATTAGGTAATTTCCTTTTCCATTAGGCTGTTATTAAC + +a +s mr.mrrefChr5 220137 77 + 294542 TAATACAACATTCTGAGCTGACAGCCTTAACCACTGGCAAACATGCTGGCATGGATGAAATACAGATCCTTACCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373561 77 + 636262 TAATACAACATTCTGAGCTGACAGCCTTAACCACTGGCAAACATGCTGGCATGGATGAAATACAGATCCTTACCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 365665 77 + 647215 TAATACAACATTCTGAGCTGCCAGCCTTAACCACTGGCAAACATGCTGGCATAGAAAAGATAAAGAATCTCACCTTT + +a +s mr.mrrefChr5 220214 231 + 294542 TGCTAGGATCTCAAGCCCATCAGAAAGCCTATAAAGAGGGGTCCAGTATTATCATGGAATGTTGACCGAGTCTTGAACAGATCTTTATTATCTGGGAATGTTCTTTCTAGTGACCTGTTAGGCAGGGCCCTTTGCTCAATACCATTTTCATGGTGAAGATTTATGTTGGTGTGTTAGCTAGTAGTGGCACTACCTGAATATAGTACTCCTGTGGTTGAGCATTCTTTGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373643 231 + 636262 TGCTAGGATCTCAAGCCCATCAGAAAGCCTATAAAGAGGGGTCCAGTATTATCATGGAATGTTGACCGAGTCTTGAACAGATCTTTATTATCTGGGAATGTTCTTTCTAGTGACCTGTTAGGCAGGGCCCTTTGCTCAATACCATTTTCATGGTGAAGATTTATGTTGGTGTGTTAGCTAGTAGTGGCACTACCTGAATATAGTACTCCTGTGGTTGAGCATTCTTTGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 365742 231 + 647215 TGCTAGGATCTCAAGACTATCAGAAAGCCAATAAAGAGAGATCCAATATGAACATGGAGTGCTGACTGTATCTTGAACAGATCTTTATTATCTGGGAATGTTCTCTCTAGTGACCTGTTAGGCAGTGCCATTTGCTCAGTTCCATTTTCATGTTGAAGACCTTCGCCAGTGCGTTAGCTAGTAGGAGCAATACCTGAATATAGGACTCCTGTGGTTGAACATTCTTTACGG + +a +s mr.mrrefChr5 220445 83 + 294542 CACCTGTTTTGCTCTATGAGTTGCAATAAAGCCCGCAGAACTGGTAAGAGCCTGCTAACTGGACTAACCCAGATAATAGCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373876 83 + 636262 CACCTGTTTTGCTCTATGAGTTGCAATAAAGCCCGCAGAACTGGTAAGAGCCTGCTAACTGGACTAACCCAGATAATAGCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 365973 83 + 647215 CGCCTGTTTTGTTCTATGAGCTGCAATAAAGCCCACAGAACTGGTAAAAGCTTGCTAACTGAACCAACCCAGATAATAACCTG + +a +s mr.mrrefChr5 220528 13 + 294542 TTTTAACCCATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373959 13 + 636262 TTTTAACCCATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 366060 13 + 647215 TTCTAGACCATTC + +a +s mr.mrrefChr5 220541 26 + 294542 TAGACCAACCTATTCTAGACCCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 373996 26 + 636262 TAGACCAACCTATTCTAGACCCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 366073 26 + 647215 TAGACCAACCTATTCTAGACCCCAAA + +a +s mr.mrrefChr5 220567 24 + 294542 TATGATGTAGCATGGTCTTGCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374023 24 + 636262 TATGATGTAGCATGGTCTTGCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 366099 24 + 647215 TGTAATGTAGCACGGTCTTGTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 220591 268 + 294542 GAGTGAGTGGCTGGAGCAACAATGTGAACAATCACTCTCTCATAGGATATTGTTAGTTCATGTAGGCAAACTTAGGTATCATTCTCAGGGCTCGAGGGTGTGAAAATTTATTTGGAATCTATATGTAGTAGAAAGCAAAACTACTACGACAGTTGTTGAGTTGCTGTGTAGAGAAAAGATATAGGTGTCAAATTGTTAGCATATCATGGCCCACATGTAATACTAATCATGCAATACTAATCATGCTGATTGATGTTGCATACtatct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374047 230 + 636262 GAGTGAGTGG-------------------------------ATAAGATATTGTTAGTTCATGGGGGCAAACATAGGTATCATTCTCAGGGCTCGAGGGTGTGAAAATTTATT-------TATATGTAGTAAAAAGCAAAACTACTACGACAGTTGTTGCGTTGCTGTGTAGACAAAAGATATAGGTGTCAGATTGTTAGCATATCATGGCCCACATGTAATACTAATCATGCAATACTAATCATGCTGATTGATGTTGCATACTATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 366125 266 + 647215 GAGTCAGTGGCTGGAGCAACAATGTGAACAATCACTCTCTCATCGGATATT--TAGTTCATGTAGGCAAACTTAGGTGCCACTCTAAGGGCTGAAGGGTGTGGAAATTTATTTGGAATCTAGATGTAGTAGAAAGCAAAACTCCTACGACAGTCGTTGAGTTGCTGTGTAGAGAAAAGATATAGGTGTCAAATTCTTAGCATATCATGGCCCACATGTTATACTAATCATGCAATACCAATCATGCTGATTGATGTTGCATTGactct + +a +s mr.mrrefChr5 220859 26 + 294542 actgccgtcagtgttgagagtatcgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171716 26 + 636262 actgccgtcagtgttgagagtatcgt +s simRat_chr6.simRat.chr6 366392 26 + 647215 actactgtcggtgttgagagtaccat + +a +s mr.mrrefChr5 220885 190 + 294542 gggtagggaccttcccaatgggtatccagcaatggaggatgtgacggaagcgaagctagttaactgataccatattgcctggatgaaataactcttttccttctcgatgcagacaagtcccgaggagtgctttgaggatttgctgaaacttagccagggagataatatctgtaaccaaaattgcagtctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171743 190 + 636262 gggtagggaccttcccaatgggtatccagcaatggaggatgtgacggaagcgaagctagttaactgataccatattgcctggatgaaataactcttttccttctcgatgcagacaagtcccgaggagtgctttgaggatttgctgaaacttagccagggagataatatctgtaaccaaaattgcagtctc +s simRat_chr6.simRat.chr6 366418 190 + 647215 gggtggggactttcccgaggggtaactagcaatggagaatgcgatggaaaagaagcaatttaactagtatcatattggctggatgcaataactgctttccttctcagtgtggacaagtcccgggaagtgctttgagaatttgctgaaacttacccaatgagataatatccgtgaccaaatttgcagtctc + +a +s mr.mrrefChr5 221075 6 + 294542 tgacaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171933 6 + 636262 tgacaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 366612 6 + 647215 tgccaa + +a +s mr.mrrefChr5 221081 157 + 294542 agataatatctgtgaccaaattcgcagcctcatggtcgagaatcaaattttgtcttaggaagggctgtctgtacaacatcttgtataggctaagtcccaccttttgcagtgaatttatggtgcatcgaagagcaattggtaacagcaccagccatgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 171939 157 + 636262 agataatatctgtgaccaaattcgcagcctcatggtcgagaatcaaattttgtcttaggaagggctgtctgtacaacatcttgtataggctaagtcccaccttttgcagtgaatttatggtgcatcgaagagcaattggtaacagcaccagccatgc +s simRat_chr6.simRat.chr6 366620 157 + 647215 agataacatctgtgaccaaattcgcagcctcatggtcaagaactgaatcattcactaggaaggtctgtccctacagcatctcatataggttaagtcccacttctttcggtgaatttctggttcatagaagagcaagtggtaacagcaacagccatgc + +a +s mr.mrrefChr5 221238 17 + 294542 tagatgggtctgttgtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172096 17 + 636262 tagatgggtctgttgtg +s simRat_chr6.simRat.chr6 366778 17 + 647215 tatatgaatctgttgtg + +a +s mr.mrrefChr5 221255 25 + 294542 ttaaggtgacacttcagtgtttcat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172113 25 + 636262 ttaaggtgacacttcagtgtttcat +s simRat_chr6.simRat.chr6 366803 25 + 647215 ttaaggtgacatttcagtgtttcat + +a +s mr.mrrefChr5 221280 95 + 294542 gccttacctgaagattgcggcctccatgtacaatgagagtaatcttgtattctaagtgctcgaaacgcaccatgagtgacagcccccttaagtgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172149 95 + 636262 gccttacctgaagattgcggcctccatgtacaatgagagtaatcttgtattctaagtgctcgaaacgcaccatgagtgacagcccccttaagtgc +s simRat_chr6.simRat.chr6 366828 95 + 647215 gtgtttcatgaagattgtggcctccatgcacaatgagagtaatattgtattccaagcgcttgagacacacctgcagtgacagcccccttgagtgc + +a +s mr.mrrefChr5 221375 93 + 294542 attgctctgaaaaccgtgaggtaaccgaagtgaagtataatgtcatgcacaagtgccttaattacctccttggccttctctatgcgtcaggag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172253 93 + 636262 attgctctgaaaaccgtgaggtaaccgaagtgaagtataatgtcatgcacaagtgccttaattacctccttggccttctctatgcgtcaggag +s simRat_chr6.simRat.chr6 366923 93 + 647215 atctctctgtaaaccatgaggtaactggaccaaggtataattttgtgcacaagtgcctggattacctcctgggccttctctgtgtgccggagg + +a +s mr.mrrefChr5 221468 72 + 294542 gcctcagcccaactgataaacatgttgacccaccctaataggtattagaatccttgagacttgggcatatgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172346 72 + 636262 gcctcagcccaactgataaacatgttgacccaccctaataggtattagaatccttgagacttgggcatatgc +s simRat_chr6.simRat.chr6 367019 72 + 647215 gcctcagctcaagcgataagcatgtcgacccacccttataggtattggcatccttgagactttggcatatgt + +a +s mr.mrrefChr5 221540 132 + 294542 taaagcctaactcccaatcctccctcaggttatggtcaagcctctgctctcgcaacaatgcctgacactaaggtaacaggtcatttctttgggaacaatccaggtccaataaatagttacttagccatccga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172418 132 + 636262 taaagcctaactcccaatcctccctcaggttatggtcaagcctctgctctcgcaacaatgcctgacactaaggtaacaggtcatttctttgggaacaatccaggtccaataaatagttacttagccatccga +s simRat_chr6.simRat.chr6 367092 132 + 647215 taaagcctaactgccaatcctctctcaggtaatagtcgggcctctgctctttcaacggttcctgacactaaggtaacaggtcatttctttgcgaacaatccaggtccagtaaatagatacttggtcatctga + +a +s mr.mrrefChr5 221672 14 + 294542 gcctaagtcaaatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172550 14 + 636262 gcctaagtcaaatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 367237 14 + 647215 gcctaagtgaaatg + +a +s mr.mrrefChr5 221686 41 + 294542 tttggttaagagcctttaccaatttccactggttggctgca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172566 41 + 636262 tttggttaagagcctttaccaatttccactggttggctgca +s simRat_chr6.simRat.chr6 367251 41 + 647215 tttggtaaagagcctttaacaatttccactggttggatgca + +a +s mr.mrrefChr5 221727 71 + 294542 agcagcaaaattttcccctcctcagtcgcggaacagttacagggcaagaaactgtgcccataagatttgcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172618 71 + 636262 agcagcaaaattttcccctcctcagtcgcggaacagttacagggcaagaaactgtgcccataagatttgcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 367292 71 + 647215 cacagccaaattttcccctcctcagtcactgaccagcctcaggttaagaaactatccccatgagatttgtc + +a +s mr.mrrefChr5 221798 11 + 294542 caatttcctcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172694 11 + 636262 caatttcctcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 367363 11 + 647215 caatttcctcc + +a +s mr.mrrefChr5 221809 24 + 294542 ccaaatattgtggtttcacctctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172705 24 + 636262 ccaaatattgtggtttcacctctc +s simRat_chr6.simRat.chr6 367375 24 + 647215 ccaaatattgtggttatgtctctt + +a +s mr.mrrefChr5 221833 18 + 294542 tctccccagaccagtgga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172737 18 + 636262 tctccccagaccagtgga +s simRat_chr6.simRat.chr6 367399 18 + 647215 cccccccagaccagtaga + +a +s mr.mrrefChr5 221851 28 + 294542 acaagcctcttgagaggagggtcctgtc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172755 28 + 636262 acaagcctcttgagaggagggtcctgtc +s simRat_chr6.simRat.chr6 367423 28 + 647215 ataagcatctctagatgagggtcctgtc + +a +s mr.mrrefChr5 221879 26 + 294542 aagcagcatgtttggcatcaacatct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172783 26 + 636262 aagcagcatgtttggcatcaacatct +s simRat_chr6.simRat.chr6 367453 26 + 647215 aagaggcttgttaggcttcaacatct + +a +s mr.mrrefChr5 221905 17 + 294542 cttgagagttgccttcg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172809 17 + 636262 cttgagagttgccttcg +s simRat_chr6.simRat.chr6 367480 17 + 647215 cttgacagtttccttca + +a +s mr.mrrefChr5 221922 16 + 294542 atctcatgctctttct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172826 16 + 636262 atctcatgctctttct +s simRat_chr6.simRat.chr6 367499 16 + 647215 atttcacgctctttcc + +a +s mr.mrrefChr5 221938 11 + 294542 tccccaacagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172852 11 + 636262 tccccaacagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 367515 11 + 647215 tatacagcagt + +a +s mr.mrrefChr5 221949 37 + 294542 cactgtcatctgttttggcttctggatggctaacaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172867 37 + 636262 cactgtcatctgttttggcttctggatggctaacaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 367526 37 + 647215 tattgttacccatcaagaagccaaaagaggtcacagt + +a +s mr.mrrefChr5 221986 91 + 294542 aactgccatatagcttcctgaggttttattggtgtaccttaggaggtcagaaactctctctcgtgccagatagccacatgtgcatgtagcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172904 91 + 636262 aactgccatatagcttcctgaggttttattggtgtaccttaggaggtcagaaactctctctcgtgccagatagccacatgtgcatgtagcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 367578 91 + 647215 accagcagtaaggcttcctgatgtcttattggtgtaccttaggaagtcagaaatccttcctcatgccagataggcgcatgtgcatggagca + +a +s mr.mrrefChr5 222077 17 + 294542 agtatgtggagtctctg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 172995 17 + 636262 agtatgtggagtctctg +s simRat_chr6.simRat.chr6 367678 17 + 647215 tgtatttggagtctgcg + +a +s mr.mrrefChr5 222094 35 + 294542 cctcgcatagtttgcgtgcctctgtgagtgtgatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173012 35 + 636262 cctcgcatagtttgcgtgcctctgtgagtgtgatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 367714 35 + 647215 cctcacctagttcaagtgcctgtgtaagtgtggtg + +a +s mr.mrrefChr5 222129 93 + 294542 aaatgaattcagccagctgagtaccagtgcctggcatcagggggttacttccttgaaaaccattctcgctaataacagcatactttgctttgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173047 93 + 636262 aaatgaattcagccagctgagtaccagtgcctggcatcagggggttacttccttgaaaaccattctcgctaataacagcatactttgctttgc +s simRat_chr6.simRat.chr6 367781 93 + 647215 aagtgaattcagccagctgaccactagtccccggcataaaggggtttctttctagaatgccattatcactaacaacagcatactctgtcttgc + +a +s mr.mrrefChr5 222222 18 + 294542 gaagacccttttctacaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173140 18 + 636262 gaagacccttttctacaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 367877 18 + 647215 aaagacccttttctacaa + +a +s mr.mrrefChr5 222240 83 + 294542 acgagcaaatgtcagcatatacattgaggtcagggtcagtcactggaacctccagtagatcagcgcaagctgcatgcattcaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173158 83 + 636262 acgagcaaatgtcagcatatacattgaggtcagggtcagtcactggaacctccagtagatcagcgcaagctgcatgcattcaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 367896 83 + 647215 acgagctactgtcagtatataccttgaggtcagggtcagactgtggaacctccagtagatcagcgtgagctgcaaacatttga + +a +s mr.mrrefChr5 222323 60 + 294542 ACTCTCACCCATCGGTTCAATTACATACCCCATTATTTTAAGTCTATGTCATACCATAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173241 60 + 636262 actctcacTCGTCAGTTCAATTACATACCCCATTATTTTAAGTCTATGTCATACCATAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 368000 60 + 647215 ACTCTCACCGATTGGTTCAATTACATACCCCATTATTTTAATTCTATGTCATGCCATAGA + +a +s mr.mrrefChr5 222383 264 + 294542 CTCTGAATATACTCTATCAATTTACACAGACAACAACATTCGCCTCATCCCCTTCTTTCCAAGATGTCCATGATACATCAGGGTAATAGATCCCCAGAGTGGTTTTTTAGTTGTCATCACTGTTGGTGGTTAGTTTCGTAATTTAGTAGCAGTGCCAGTTTGATAGCATGGAGTTTATCTGTGATCCAGCTGAGCTTAGCAGTTAGGCATAAGGATTTAAGCTGGTCTCGGTGAACTATAACAAGCACAAAAAGTATAAAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173303 264 + 636262 CTCTGAACATACTCTGTCAATTTACACAGACAACAACATTCGCCTCATCCCTTTCTTTCCAAGATGTCCATGATACATCTGGGTAATAGATCCCCAGAGTGGTTTCCTAGTTGCCATCACTGTTTGTGGTTAGTTTCGTAATTTAGTAGCAGTGCCAGTTTGATAGCATGGAGTTTATCTGTAATCCAGCTGAGCTTAGCAGTTAGGCATAAGGATTTAAAATGGTCTCGGTGCACTATAACAAGCCCAAAAAGTATAAAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 368060 248 + 647215 GTCTGAATATCCTCTATCAATTTACACAGA---------------CATCCCCTTCTTTGCGAGGTGTCCATGATGCAACAGGGTAATGGATCCCCAGAGTGGTTTTTTAGTTGTCATCACTGTTGGTGGTTAGTTTAGTATTTTAATAGCAGTGCCAGTTTGATAGCATGGAGTTTATCTGTGATCCAGCTAAGCTTTGCA-TTAGGCCTAGGGATTTAAGCTGGTCTTGGTGATCTATAATAAAGACAGAAAGTAAAAAAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 222647 71 + 294542 CCATTTGACATTGCGGGATCAGTCACAGAGGGTAAACTTCAGTATTTGCCATTTGTGGGGTACATTGTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173567 71 + 636262 CCATTTGACATTGCGGGATCAGTCACAGAGGGTAAACTTCAGTATTTGCCATTTGTGGGGTACATTGTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 368312 69 + 647215 CCACTGG--ATTGCAGGATCAGTCACAGAGGGCAGACTTTGGTGTTTGCCATTTGTGGGGTACATTGTTTG + +a +s mr.mrrefChr5 222718 177 + 294542 CACGTGTTAATTACAAGTCTCATGAATCCTACTAGAGTATACCTTGCATGTCCCTTTACTCTTTGAAAAACCCTAACCTAGCTCATGCTTCATAATATACTTTAGCTGTATACTTTGTGTGGGAAAGATAGAATATAGACTTAGCTTGAATAGGATGCACTGGAAACCTTTCACCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173638 172 + 636262 CACAAGTTAATTACAAGTCTCATGAATCCTACTAGAGTATACCTTGCATGTCCCCTTACTCTTTGAAAAACCCCAACCTAGCTCATACTTC-----CAACTTTAGCTGTATACTTTGTGTGGGAAAGATAGAATATGGACTTAGCTTGAATAGGATGTGCTGGAAACCTTTCACCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 368382 176 + 647215 CATGTGTTAATGACAAATCTCATGAGTCCTACTAGAGTATACCTTGCGTGTCCCTTTTTTCTTTGGAACACCCT-ACCTAGCTCATGCTTCATAATATACTTTGGCTGGATACTTTGTGTGGGCAAGATATAATATAGACTTAGCTTGGATAGAATGCACTGGACGAATTTCACCCT + +a +s mr.mrrefChr5 222895 86 + 294542 ACAAAGGTTGGTCATAGGTTAAAGGCCAATTGGTTATTGCTTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATCAATCATCTCCTCCAAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173815 78 + 636262 ACAAAGGTTGTTCATAGG-TAAAGGCCAATTGGT------TTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATC-ATCATTTCCTCCCAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 368558 86 + 647215 ACAAAGGTTGGTCATGGGTTAAAGGCCGACGGGTTATTGCTTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATCAATCATCTCCTCCAAGAG + +a +s mr.mrrefChr5 222981 116 + 294542 TCACTTCTGAGCTTTGGAAGTATTTCCATCACTAGGCACAACACTTGGTCATATTACTGGGGGAATGGGAGTGGAACATGGGGTTGAATGAAAGTGGGGCTACCAGGCTTCACATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173898 116 + 636262 TCACTTCTGAGCTTTGGAAGTCCTTCCGTCTCAAGGTACAACACTTGATCATATTACTGGGGGAATGGGAGTCGAAGATGGGGATGAATGAAAATGGAGCTACCAGGCTTCACATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 368644 115 + 647215 TCACTTCTGAACTTTGGAAGTATGTCCATGAGTAAGCACAACACTTGGTCATATTACTGGGGGAA-GGGAGTGGAACATGGGGTTGAATGAAAGTGGGGCTAATGGGCTTGACATA + +a +s mr.mrrefChr5 223097 42 + 294542 TAAAGATGCTTGAAACCAACAACACCCCTCCCTTCTGCTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 174014 42 + 636262 TAAAGATGCTTGAAATCAACGACACTCCTCCCTTCTGCTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 368800 41 + 647215 TAAGGATGCTTG-AACCAACAACACCCCTCCCTTTTGCTGTA + +a +s mr.mrrefChr5 223139 271 + 294542 GAAATATTGACGCTTCCACCTAGATTATACCCAAACCTACAACTATACAAACTGACAAACCCTAAAACAGAGACCTGCCTGTACACTGGCTCTCCATTCTGTAACCTAAAAAATGACTGAGATAGTTTGTACTGAGGAATGGCCAATTCTCTTTCTCAATAAAGGGGATAGGCCAGATGCATCTGCTGGAGGCTTGTAATAAGCCTGCATCTACGGCAGCATAACTAGTAAGTGATAACAAAAAATATGGTCACACAGCAGACCAGGAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 174194 271 + 636262 GAAATATTGACGCTTCCACCTAGATTATACCCAAACCTACAACTATACAAACTGACAAACCCTAAAACAGAGACCTGCCTGTACACTGGCTCTCCACTCTGTAACCTACAAAATGACTGAGATAGTTTGTAACGAGGAATGGCCAATTCCCTTTGTCTATAAAGGGGATAGGCCAGATGCATCTCCTGGAGGCATGTAATAAGCCTGCATCTACGGCAGCATAACTTGCAAGTGATAACAAAAAATATGGTCACACAGCAGACCAGGAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 368841 239 + 647215 GCAATAATGACGCTTCCACCTAGCTGAGGCAAACACCTAC----CTGCAAAATGGCAA----------------------------TGGCTCTCCATTCTGCAACCTAAAAAATGACTGTGATAGTTTGCACTGAGAGGTGTCCACTGCTCTTTCTAAATAAAGGGGATAGGCCAGATGCATTTGCTGGAGGCTTGTACTAAGCCTGCGTTTACGGCAACATAACTAGTAAATGATAACAAAAAACATGGTCGTGTGGTAGACCAGCAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 223410 596 + 294542 CCCACACTAATATATATCAGGTAATAACACATCCAGGCTGTATGTATATATGGTCTTTATGGGTGGTCATAAGCTTCTTCAGTGTCCTCTTGATAGAGCTGGATGCAGTCTGCTGGTCTCTTTAGAGTTAGAATGGTTAAATGCACATGCTTTTTCTTAATGTCTGTTTTAGTAATTTGTCTTATGAGTAGGCAGCTTTGTAGAACTTACCTCAGGTCATGGCACTGGCACTACAGCAGGTAAGGCTTACCAGTAAGCTGTCATATGATATCAGTAACAAGATGAGAGGTGTCAGTTGTTCATGGTACAGAGATGTGCAAGGAAAAAGATCATTATGGTTCTCCCAGTAGCCATGAAAGCTGGGAATAATTGAATGGGGCCAGAGTTCATTATGGTTTTCCCAGTAGCCATGACAGTTGGGAATAATTGAATGGGGCCAAAGCAGCTACAACCAATTAGCTCCCACATTTTGTTCACTCAAAAGTGGTAGGTGTAAAACACTGTGATATGCATACCATGGTTGAGCTTAGATTTGAGAGGCAGAGGGAATAACAATTTATGTCATACTAGATTCACCTGCTGTAGAGATGGGGCTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 174465 595 + 636262 CCCACACTAATATATATCAGGTAATAACACATCCAGGCTGTATGTACATATGGTCTTTATGGGAGGTCATAAGCTTCTTCATTGTCTTCTTGATAGAACTGGATGCAGTCTGCCGGTCTCTTTAGTGTTAGAATGGTTAAATGCACATGCTCTTTCTTAATGTCTGTTTTAATAATTTGTCTTATGAGTAGGCAGCTTTGTAGAATTTACCTCAGGTCATAGCACTAGCACTCCAGTAGGTAAGGCTTACCGGTAAGCTATCATATGATAACAGTAACAAGATGAGAAGTGTCAGTTGTTCATGGTTCAGAGCTGTGCAAAGAAAAAGATCATTATGGTTCTCCCAGTAGCCATGAAAGCTGGGAATAATTGAATGGGGCCAGAGTTCATTATGGTTTTCCCAGTAGCCATGACAGTTGGGAATAATTGAATGGGGCCAAAGCAGCTACAACCAATTAGCTCCCACATTTTGTTCACTCAAAAGTGGTAGGTGTAAAACACTGTGATATGCATACCATGGCAGAGCTCAGATTTGAGAGGCAGAAGGAATAACAATTTATGTCATACTAGA-TCACTTGCTGTTGAGATGGGGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 369081 569 + 647215 CCCGCACTAGTATACATCAAGTAATAGCAAATCCAGGCTGTATTTATATATGGTC-TTATCAGTGGTCATAAGCTCCTTCAGTGTCCTCCTGATAGAGCTGGATGCAGTCTGCTGGTCTCTTTAGAGTCAGAACGGTTAAATGCAGATGTCTTTTCTTAATGTCTGTTCTAGTTACTTGTCTTATGAGTAGGCAACTTTGTAGTACTTACCTCAGGTCATGGCACTGGTACTACAGCAGGTAAGGCTTACCAGTAAGTTGTTGTATGATATCCGAAACAAGATGAGAGGTGACAGTCATTCATTGTACAGAGATGTGCAGGGAAAAAGATCATTATGATACTCCCAGTAGCCATGATAGTTGGGAATAATTGAATAGGGCCAAAGTTCATTATGGTTTCCCCAGTAGCCATGGTAGTTGGGAACAATTGAATGGGGCCAAAGCAGCTACAACCAATAAGCTCCTAC--------------------------GTAAAACATTGTGATATGCATACCGTGGTTGAACTTAGATTTGAGAGGGAGAGGGAATAACAATTTATGTCATACTAGATTCACCTGCTGTAGGGAGGGGGCTA + +a +s mr.mrrefChr5 224006 182 + 294542 TGTATGCATGGTTATAGACCTCTTATGTCTCCTTTACAAATTGTTTAAGTGTCTCGCTTAGTGTTGGTATTTATAAGTTTCCATTACAACCACCCGTATAATATTATCCTAATGGAAAAACCAAACTGTTCTAAGCACAGAATGATGTGTTTATGTCTTGCCTTAATGTCAGAACATTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 175065 182 + 636262 TGTATGCATGGTTATAAACCTCTTATGTCTCCTTTACAAATTGTTTAAGTGTCTCGCTTAGTGTTGGTATTTATAAGTTTCCATCACAACCACCCGTATATTGTTATTCAAATGGAAAAACCAAGCTGTTCTAAGACCAGAACAATATGTTTGTTTCTTGCCTTTATGTCAGAACACTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 369650 182 + 647215 TGCATGCATGGGTATAGACCTATTATGTATTCTTTGTGTATTGTTTAAGTGTCTCACTTAGTGTTGGTATTTATAAGTTCCCATTACAACCACCCGTATAATATTATCCTAATGGAAAAACCAAACTGTTCTAAACACAGAATGATGTGTTTAAGTCTTACATTAATGTCAGAACATTTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 224188 715 + 294542 CACCCATGTGAAAAAAGTGTTTCTTAGAGGAATGTAATGATGTGGACATAACATGATAGGTGTGTAACTGTGCATTTCTCTTGTGCTTTATCTAGATACAATCTCTAATTTTTGTAAGGATGAAAGACAAAATCCCCCATGGACTCCAGTACTACTCTTGGTGTAAGAAATATGGCTTTAGTCCCAGTGCCAGTTGAATTAAATCTTGCTAAACATAGATATTGTATATTCTGCTTTACTGGGTCTTTCTCTAGCAACTCACCCAAAGGCTCCGCCCCCTTTCTGATGCTCTTGTAAGTCCATAACTTATGATGCCAATAATGAAGCTGAACTGCCTTTCATGTCATGTTAACTAAGTAACAGGTGATGGGCTGTGGCATCCTTATTACTGCTCTAGACAACTAGCACCTTGGGAGTGCACACCAGGTTGCTGTGAGCATGTGTCAGCACTGTAAAAGTTCCACTGCACTAGGATACATGGTCTAAAAGTTAGGATTTAACAGTAACAAAGGTCTGGCGTTCTACCCCCCTCCCAGTGCTAATGTGAAACATCTCTTTTTCTACTGGAATAGGCTGAGCATAAAGACTTAAAGTTGCTGTTACATGCTATGTGCAAAGAGGTGGCACGCTAAATGTAAGGCCAACGAATTAGCAGAGATGATATGATGAGTTCAGTTCTTCAATTCTGTCCTACACAGGGGAATATAGTTCCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 175249 711 + 636262 CACCCATGTGAAAAAAGTGTTTCTTAGAGGAATGTAATGATGTGGACATAACATGATAGGTGTGTAACTGTGCATTTCTCTTGTGCTTT-TCTAGATACAATCGCTAATTTTTGTAAGGATGAAAGACAAAATCCCCCATGGACTCCAGTACCTCTCTTGGTGTAAGAAATATGGCTTTAGCCCCAGTG-CAGTTGAATTAAATCTTGCTAAAGATAGATATTGTATGTTCTGCTTAACTGGGTCTTTCTCTAGCAACTCACCCAAAGGCTCTGCTCCCTTTCGAGTGCTCTTGTAGGTCCATAACTTATGATGCCAATAACGAAGCTGAACTGCCTTTCATGTCATGTTAACTAAGTAACAGGTGAT-GGCTGTGGCATCCAAATTACTGCTCTAGACAACTAGCACCTTGGGAGTACACACCAGGTTGATGTGAGCATGTGTCAG-ACTGTAAAAGTTCCACTGCTCTAGGATACATGGTCTAAAAGTTAGGATTTAACAGTAACGAGGGTCTGGCGTTCTACCCCCCTCCCAGTGCTAATGTGAAAGATCTCTTTTTCTACTGGAATAGGCTGAACATAAAGACTTAAAGTTGCTGTTACATGCTATGTGCAAAGAGGTGGCACTCTAAATGTAAGGCCAACGGATTAACAGAGATGATATGATGAGTTCAGCTCTTCAATTCTGTCCTACACAGGGGAATATGCTTCCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 369832 702 + 647215 CACCCAAGTGAAAAGAGTGTTTCTGAGAGGAACGTAATGATGTGGACAT---------GGTGTGTAACTGTGCATTCCTCTTGTGCTTTATCTAGATATAATCTCTAATCCTTGCAAGGGTGTCGGACAAAATGCCCCATGGTCTCCAGTACTACTCTTGATTTAAGAAATATGACTTTAGTCCCAGTGCCAGTTGAATTAAATCTTGCTAGACATAGATATTGTATATTCTGATCTACTGGGTTCTTCTCTAGCAACTCGTCCAGAGGCTCCGCCCTCTTTCTGATACTCTTGTAAGTCCATAACTTGCGATACCGATAATGTAGGTGAACTACCTTTCATGTCACGTTTACTAAGTAACAGGTGATGGGCTGTGGGATCCTTATTACTGCCCCATACAACAAGCACCTTGGGAGTGCA---CAGGTTGCTGAG-GCATGTGTCAGCACTATAAAAGGTCCACTGCACTAGCATACATAGTCTAGAAGTTAGGATTTAACGGTAACAAAGGTCTGGCGTTCTACCTCCCTCCTAGTGCTAATGTGAAACATCTTTTTTTCTACTGAGACAGGCTGAGCATAATGACTTAAATTCCCTGTTACGTGCCAAGTGCAAAGAGGTGGCACGCTGAATGTAAGGCCAACAAATTAGCAGAGATGATATGATGAGTGCAGTTCTTCAGTCCTGTCCTGCACAGGGGAATATAGCTCCTAA + +a +s mr.mrrefChr5 224903 14 + 294542 TAACAGTCCAATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 175960 14 + 636262 TAACAGTCCAACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 370536 14 + 647215 TAACAGTCCAATCA + +a +s mr.mrrefChr5 224917 185 + 294542 CCCTGCTGTTAAATCCTTCCACTACATTAATGGCAGTGGTTGTAAGTGAAACAAATGTTTATCAGAATTAAAGACTACCTAAAGTGAATGGCTGTAGTTGGTTAGATGTTAGCTGCcactgtttttgtttaagtggatggtcatataactcttccagttaactttacaaagatgcacccttaagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 175992 184 + 636262 CCCTGCTGTTAAATCCTTCCACTACATTAATGACAGTGGTT-CAAGTGAAACAAATGTTTATCAGAATTAAAGACTACCTAAGGTGAATGGCTGTAGTTGGTTAGATGTTAGCTGCcactgtttttgtttaagtggatggtcatataactcttccagttaactttacaaagatgcacccttaagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 370550 168 + 647215 CCCTGCTGTCAAGTCCTTCCACTACATTAATGGCAGTGGTTGTGAGTGAAACAGATATTT-----------------CCTAGAATGAATGGGTGTAGTTGGTTAGATGTTACCTGCCGCTCTTTCTGTTTAAGTGGATGGTCATATAGCTCTTCAAGCTTACTTTACAAGGATGTACCTTCGGGT + +a +s mr.mrrefChr5 225102 85 + 294542 ccccagactagtgctgaggtcccagcaattcctttgatgtacagtaaatataacttgaggactcccagtctaaaaaccttatata +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176177 85 + 636262 ccccagactagtgctgaggtcccagcaattcctttgatgtacagtaaatataacttgaggactcccagtctaaaaaccttatata +s simRat_chr6.simRat.chr6 370718 85 + 647215 CAAAATGCTAGTGCTGAGGTCCCAACAAATCCTTTGATGTATATAGAATATAACTTGAGGACTCCCAACCTACAAACTTTATATA + +a +s mr.mrrefChr5 225187 75 + 294542 gacgacatCTGGTAGACTCCACCTAAGAAGCAGCCCTAAGTGCATCCCAATTGATATATGTGTGTGTACTACCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176262 75 + 636262 gacgacatCTGGTAGACTCCACCTAAGAAGCAGCCCTAAGTGCATCCCAATTGATATATGTGTGTGTACTACCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 370807 75 + 647215 GACAGAATGCAGTCGCCTCCACCCAAGAACCAGCCTTAAGTGCATACAAATATATATATGTTTGTGTACTACCCG + +a +s mr.mrrefChr5 225262 41 + 294542 TTTTTCAACATTTAAAATAAGACCCAATTTCATTGCAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176337 41 + 636262 TTTTTCAACATTTAAAATAAGACCCAATTTAATTGCAGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 370883 41 + 647215 TTTTTCAACATTTAAGAGAAGACCCAATTTCATTGCTTAGG + +a +s mr.mrrefChr5 225303 278 + 294542 AGTTCAATGGTTCTATGACTGAGACAGCAGAATTGAGGCCTGGGACGAGCATAATTGAGGCCTTGATGGGGATGATTGCAGTATGAAGCATGAGCAATGGTGGATACTGAATCCAGATTATAACTCACAGGGTTACAATGACCATTCTCAGCTGTCTTTGTGTCCCTCTTTACCATCACCTTAAGCAGGTACCTTGGAATCGCCAGGGCTGGTGTCCCAAACTATTATAGAAATAATTATAGAGAAAGTTGGGGACACCAGGGCCTTGAGCCATTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176378 160 + 636262 AGTCCAATGCTTCTATGACTGAGACAACAGAAGTGAGGACTGGGACCCGCATAATTGAGGCCTTGATGGTGATGTTTGAAGTATGAAGCATGAGCAATGGTGGATCCTGAATCCAGATCATAACTCACAGGGTTACAATGACCATCCTCAGCTGTCTTTG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 370926 278 + 647215 AGTTCAATGGTTCTATGTCTGAGACAGCAGAATTGAGGCCTGGTACGAGCATAACTGAGGCCTCCATGGGGATGATTGCAGTACGAAGAATGGGCAATGGTGGATACTGACTTCAGGGTATATCTCACAGGGTTACAATTACCATTCTCAACTCGCTTTGTGTCCCTCTTTACCATCACCTTAAGCAGGTACCTTGGAATCGCCAGGGCTGGTGTCCCAAACTATTATAGAAATAATTATAGAGAAAGTTGGGGACACCAGGGCCTTGAGCCATTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 225581 39 + 294542 TCATTTTGATGGGCGCAATTTGGTACATTGGACTTTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 371206 39 + 647215 TCATTTTGATGGGCGCAATTTGGTACATTGGACTTTATA + +a +s mr.mrrefChr5 225620 9 + 294542 ACATTCGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 371248 9 + 647215 ACATTCGAA + +a +s mr.mrrefChr5 225629 248 + 294542 CTATATAGATGAAATGAAACAGAGTTGCCAAGTTAAATGTCCTAGTGGTTTTCACATGAATCATTATGCTTTTTTGAGCCCAGCTGGAGCCAGAGTTGTGTAAAGGCTTTCCTACTCAAGCTACTGAAAACTCATTCTGGTTCTTGTGCATCTGGTAATGTTATTATTATCTCTAAGTCACATAAATATCAGAACCTGAGCTACACAAGCAAAATCAGAACATCTGACATCTTTTTGTAGCTCATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176538 231 + 636262 ----------GAAATGAAACAGAGTTGCCAAGTTGAATGCCCTAGTGGTCTTCACATGATTCATTATGCTCTTTTGAACCCAGCTGGAGCCAGAGTTGTGTAAAGGCTTTCCTACTCAAACTACTGAAAACTCATTCTGGTTCTTGTGCATCTGGTAGTGTTATTAGTATTTCTAAGTCACACAAATA--AGAACGCGAGCTACACAAGCAAAATCAGAACATCTGACATCTTTTTGTAGCTC----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 371319 245 + 647215 CTATATAGATGAAATGAAACAGAGTTGC---GCTAAATGTCCTAGTGGTTTTCACATGAATCATTATGCATGTTTAAGATCAGCTGGAACAAGAGTTGAGTAAAGGCTTTGCTACTCAAGCTACTGTAATCTCATTCTGGTTCTTGCACATCTGGTAATTTTATCATTATCTCTAAGTCACATAAATATCAGAACCTGAGCTACACAAACAAAATCAGAACATCTGACATCTTTCTGTGGCTCATGTG + +a +s mr.mrrefChr5 225877 239 + 294542 GCACTTATAGAAAAAGGCAAGGATGTGAGCAAAATACCTTCTGAGACATTGATCTATAGCCCATGTACGAGACCTTAATTACTGTACTGTGTCCATATGCCCAGGTGAACTTGCTTCTACAGAAGGTATCCCCTATAATATAGCTGAATGCAGCAGTTGGTGCACAATCTAAAATTAAAAGCTTGAGACTCTATACTCACTTAGAATACACAGCAAATGGTTTGATATTGGCAAGTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 176769 231 + 636262 ------GTAGAGAAAAGCAAGCATGTGAGCAACATGCCTTCTGAGACATTGATCTATAGCCCATGTA-GAAACCTTAATTGCTGTACTGTGTCCATATGCCCAGGTGAACTTGCTTCTACAGAAGGTATCCCCTATAATATAGCTGAATGCGGCAGTTGGTGCACAATCTAAAATTGAAAGCTTGAGACTC-ATACTCACTTAGAATACACAGCAAATGGTTTGATATTGGCAAGTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 371565 220 + 647215 GCACTTATAGAAAGAGGCAAGGATGTGAGCAAAAGACCTTCTGAGACACTGATCTATAGCCCATGTACTAGACTTCAATTACTGTACTGTGGCCATAGGCCCAGGTAAACTTGCTTCTACAGAAGTTATCCCCTATAATATAGCTGAATGAAGCAGTTGGTGCACTATCTAAAATTAAAAGCTTACGACTCTATACTCACTTTGAATACAC-------------------GCAAATGAT + +a +s mr.mrrefChr5 226116 605 + 294542 AGTAATAGTAATAAAACAGATTCACTTCTTAGGATTGATGGAATCCTAACTTTTTAATTGAGGGTACTATCTGGTCTGACTCTTTCAAGTATAAGGGGCTATGGTACAGTTGCATCAGAACCCAGCCAGCTTTATATCTTCCAACAAATTTAATGCAGTCAGTTTGCTTTTGATCTTCAGCAATTCTCAAACCAAGTAATTCTAGAACTTGGCTATGGTATCTCATATTATACACTTGACTTTGTAAAATATGTGCTGAGAGTTAAGGGCTCCCCAAAACATTAATAAAGCCTTAACATTTAGATCTTGTCTGAGCAAAGCTTTGTATGACTTCAAGTATAGTTaggtagtatcactgaggcttgtacttcttcactggattcattcagtctatttcctgtctacttggaaagttgaacagcccatcaGATCCTCATAATTGAACTAAAAGAGTTACATAGCATCCAACGAAATAGAGGATAAGGGAATTGTGATGATTGTTGCTACATGTATTGCCTCTCCCTATGCAATTAAGGTTCAAAGGTTGTTTCATGTATTTTATTAATATAGTACGTCTCTTGCCATCTCAAATTCCAGCATCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177007 595 + 636262 AGTAATAGTAATAAAACAGATTCACTTCTTAGGATTGGTGGAATCCTAACCTTTTGATTGTGGGTACTATCTGATCTGACTCTTTCAAGTATAAGGGGCTATGGTACAGTTGCATCAGAACCCAGCCAGCTTTATCTCTTCCAATAAATTTAATGCAGTCAGTTTGCTTTTGATCTTCAGTAATTCTCAAACCAAGTGATTCTAGAA-----CTATGGTATCTCATATTATGCACTTGACTTTGTAAAATATGTGCTGAGAGTTAAGAGCTCCCCAAAACGTTAATAAAGATTTAACGTTTAGATCTTGTCTGAGTAAAGCTTTGTATGACTTCAATTATAGTTaggcagtatcactgtggcttgtacttcttcactggattcattcagtctatttcctgtctacttggaaagctgaacagcCCATCAGATCATCATAATTGAGCTAAAAGAGTTACATAGCATCAAATGAAATAGAGGATAGGGGAATTATGATGATTGTTGCTACATGTATTGCCTCTCCCTATGCAATTAATGTTCAAAGGTCGTTTCATGTGTTCTATTAATATA-----TCTCTTGCCATCTCAAACTCCAGCATCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 371785 600 + 647215 AGTAATAGCAATAAAACAGATTGACTTCTTAGGATTTATGAAATCCTAACTTTTTAATTGAGGGTACTATCTGGTCTGACTCTTCCAAGTATAAGGTGCTACGGTACGGTTGCATCAGAATCCAGCTAGCTTTATATCTTCCAACATATTTAATGCAGTCAGTTTGCTTTTGTTCTTTAGCAATTTTGAAACCAAGTAATTCTAGAACTTGGCTATGGTATCTCATATTATACACATGACTTTGTAAAATATGTGCTGAGAGTCAAGGGCTCTCCAAAACATCAACAAAGCCTTAACATTTAGACCTTGTCAGAGCAAAGCTTTGTGTGACTTCAAGTATAGTTaggtagtatgactgaggcttgtctgtctacactgaattcattcagtctatttcctgtctactcagaatgtcgaatggcccatgaGATCCTCATAATCAAACTAAAAGAGTTACATAGCATCCAACAAAATAGAGGATCAGGGAATTGTGATGATTGTTGCTACATGTATTGCCTCTCC-----CAATTGAGGTACAAAGGTTGTTTCATGTATTTTATTAATATAGTACGTCTCTTGCCATCTCAAATTCCACCATCTAAG + +a +s mr.mrrefChr5 226721 63 + 294542 GCACCAGTCTTTTTGGAGGCCAAAACATTGCAACATGGCCAAGACACTAGAAGAAAAGACCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177622 63 + 636262 GCACCAGTCCTTTTGGAGGCCAAAACATTGCAACATGGCCAAGACACTAGAAGAAAAGACCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 372385 63 + 647215 GCAAAAGTCTTTTTGGGGGCCAAAACATTGGAAGATGGTCAAGACACTAGAAGAAAAGACCAG + +a +s mr.mrrefChr5 226784 7 + 294542 AATGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177696 7 + 636262 AATGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 372448 7 + 647215 AAAGACT + +a +s mr.mrrefChr5 226791 32 + 294542 GATTTTTAATGTAGTTCCTACCTTGCAGAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177704 32 + 636262 GATTTTTAATGTAGTTCCTACCTTGCAGAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 372455 32 + 647215 GATTTTTAATGTAGTTCCTACCTCGCAGAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 226823 153 + 294542 AGATTTTATTTTCAATGTAGTTCCTCTGTTGCCAAAGAGTAGACAGGGGTGGTTTTTATCTCAAGATTGCACAGATATTATAGACGTGTATGTGTAGATACTGTTAGAGTCTGGTCATGGCTGTGGACCTGGAGAGTAAAACAATAGGTCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177736 137 + 636262 AGATTTTATTTTCAATGTAGTTCCACTG----------------AGGGGTGGTTTTTATCTCAAGATTGCACAGACATTATATACGTGTATATGTAGATACTGTTAGGGTCTGGTAATGGCTGGGGGCCTGGAGAGTAAAACAATAGGTCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 372491 153 + 647215 AGCTTTCATTTTCAAAGTAGTTCCTCTGTTGCCAAAGAGTAGACACAGGTGGTTTTTATCTCAAGATTGCACAGATAATATAGATGTCTATGTGTAGATACTGTTAGAGTCTGGTCATAGCTGTGGACCTGGTGAGTTAAACAACAGGTCTTG + +a +s mr.mrrefChr5 226976 345 + 294542 GGGGGGAAACATAGTGTCTACATCCTAACGCATTCTTATTTTTTAGTCTCCTATAAGTGGACAATGGAGTTAGTTTTAGTGCCATACCCTGTAAGATCTAGAGGGAATCATTTACACTTGGCCTCTCAAATATTACCTCTATCCCATGTGTCACAGCTTCCTAGGGCTGACAGAATGCTTAAAACAGCATCCTATTGTCCTGCCATCCCTCTAGCCTGTACTCTATATGCCACCATTCTGTACTACCTAAGTATCCCCCCGTATCCCCTCAATTTGTAGCAGCTGCACAGCATGCCCAATTCACTTCTTAGCATCACGTTACCCTTCTTAGCATCACATTACCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177873 322 + 636262 GTGGGGAAACATAGTGTCTACATCCTAACGCACTCTTATTTTTTAGTCTCCTATAAGCGGATAATGAAGTCAGTTTTAGCGCCATACCCTGTAAGATCTAGAGGGAATCATTTAC-------------AATGTTACCTCTATCCCATGTGTCACAGCTTCCTAGGGCTAACACAATGCTTAAAACAGCATCCTATTGTCCTGCCATCCCTCTAGCCTGTACTCTATATGCCACCATTCTATACTACCTAAGTATCCCCC----------CGATTTGTAGCAGCTGCAGAGCATACCCGATTCATTTTTTAGCATCACACTACCCTTCTTAGCATCACGTTACCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 372646 345 + 647215 GGAGGAAAACATAGTGTCTACAACATAACACATTCTTATTTTTTAGCCTCCTATAAGTGGTCAATGGAGTTAGTTTTAGTGCCATACCCTGTAAGATCTAGAGGGGATCATTTACACTTGGCCTCTCAAATATTACCTCTATCCCATGTGTCACAGCTTCCTAGGGCTGACAGTGTGCTTAAAACAGCATGCTATTGTCCTGCCATCCCTCTAGCCTGTACTCCATATGCCACCAGTCTGTACTACCTAAGTGTCCCCCCGTATCCCCTCAATTTGTAGCATCTGCACAGCTTGCCTAATTCACTTCTTAGCATCACGTTACCCTTTTTAGCATCACATTACCCT + +a +s mr.mrrefChr5 227321 144 + 294542 TTTAATTACCACTTCGTTTTGCCATCAGTTCCATGCCATCATTTGCAGTAACTATTTGACATTTGTATCAACTTGTTTGTTGTGCTATGCCTGCAGACAGGATAATTCATGAAAAGATAGGTAGAATCCCCCACCCTGGAGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178196 144 + 636262 TTTAATTACCACTTCGTTTTGCTATCAGTTCCATGCCATCATTTGCAGTAACCATTTGACATTTGTGTCAACTTGTTTGTTTTGCTATGCCTGCAGACAGGATGACTCATGAAAAGATAAGTAGAATCCCCCACCCTGGAGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 372991 144 + 647215 TTTCTTTACAACTGCATTTTCTCATCTGTTCCATGCCATCATTTGCAGTTACTATTTGACATTTGTATCAACTTGTTTGTTGTGCTAGGCCTGCACACAGGATAATTGATGAAGAGATAGATAGAATTCCTCACCCTTGAGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 227465 154 + 294542 CAGTCAAGTTGCTATAGTTAAGGAGCTCTTGTCGCTGGATGGAATATTCCAGTAATATTGAGGATATCGCAGCAACAGCAGGGAGGGAATTATATCAATCATGTTATATAGTTTACACTAAATTGCACCAATAAGCAGCAAAGGGGTCTGATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178346 143 + 636262 CACT-AAGTTGCTATAGTTATGGAGATCTTGTCGCTGGATGGAATATTCCAGTAATCTTGAGGATATCGCA-------CAGGGAGGAAATTATATCAATTATGTCATATAG---ACACTAAATTGCACCAATGAGCAGCAAAGGAGTCTGATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 373135 154 + 647215 CAGTCAAGTTGCTATAGGTAAGGAGCTCATGTCACTGGATGGAATATTCCAGCAACATTGAGGATATGGCAGCAACAGAAGGGAGGGAATTATATCAATCATGTTCTATAGTTTACACTAAATCGCACCAATAAGCAGCAAAGGGGCCTTATGG + +a +s mr.mrrefChr5 227619 51 + 294542 AAAGCCTTTAGTTTAAAAACCACTAGTTTACTATGACAAGCAGAGTAAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178495 51 + 636262 AAAGCCTTTAGTTTAAAAACGATTAGTCTATTATGACAAGCAGAGTAAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 373289 51 + 647215 AAAACCTTTAGTTTAAGAACCACTAGTTTACTATAACAAGCAGATTAAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 227670 34 + 294542 CTCAACAAAGTGGTCAGTTACTGTGTGTTTGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178546 34 + 636262 CTCGACAAAGTGGTCAGTTACTGTGTGGTTGGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 373345 34 + 647215 CTCAACAAAGTGGTGAGTTATTGTGTGTACGGGA + +a +s mr.mrrefChr5 227704 78 + 294542 CACCTTGCCCTGGCTAGGTTAATGTGGTCTTGTCCCTTCGAGGGAAACTAATAATTTCGTATTGGCCTGGTGACTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178580 68 + 636262 CACCTTGCCCTGGCTAGGTTCATGTGGTCTCGTCCCTTCGAGGGAGACTAATAATT----------CTGGTGACTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178753 68 + 636262 AACCTTGCCCTAGCTAGGTTAACATGGTCTTTTCCCTTCGAGGAAAACTAATAATT----------CTGGTGACTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 373379 74 + 647215 CACCCTGCCCTGGCTATTTT----CCATCTTGTCCCAGCTAGGGAAACTAATAATTTCGTATTGGCCTGGTGACTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 227782 105 + 294542 TGTGGTAGGTCTAGGTCCTGGGTAGATACATAATTTAGTTCCATACATTAATGTGAGGCAGCCAAAGGTGTGGCCACACCTCTAAGGCTAGCCTGGCGAGACAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178648 105 + 636262 TGTGGTAGGTCTAGGTCCTGGGTAGATACATGATTTAATTCCATACATTAATGTGAGGCAGCCAAAGGTGTGGCCACACCTCTAAGTCTAGCCTGGCTAGACAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178823 99 + 636262 TGTGGTAGGTCTAGGTCCTGGGTAGTTACATAATTTAGTTCCATACATTAATGTGAG------AAAGGTGTGTCCACACCTCTAAGGCTAGCCTGGCGAGACAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 373453 69 + 647215 TGCGGTAGGCCTGGGTTTTGGGTAGATACATAATTTAGTTCCATACATTCGTGTGAGGCAGCCAAAGGT------------------------------------ + +a +s mr.mrrefChr5 227887 60 + 294542 CCGCCAGGCTCTGACTAGAATAGATATGTATGTAGCTTTGACCACTTGATGAGACCATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179004 55 + 636262 CCGCCAGGCTCTGAGTAGAATAGATATGTATGTAGTTTTGA-CAATTGACGAGA----AA +s simRat_chr6.simRat.chr6 373522 60 + 647215 CTGCCAGGCTCTGACTAGAATAGATGTGTATGTAGCTTTGACCACTTGATGAGACCATCC + +a +s mr.mrrefChr5 227947 112 + 294542 CTACCCTAAAGGTATGCTGTCATAGTAGGTTCCCAGACTATGGAGATTAAACACTGTCTCATTGTATGTCACTATTACATTACCCCTTCCTCAATGTATCTTAACAAGTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374277 112 + 636262 CTACCCTAAAGGTGTGCAGTCATAGTAGGTCTGCAGACTATAGAGATTAAATACTGTCTCATTTTGGGTCACTATTACATTCCCTCCTCCTCAATGCATCTTAACAAGTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 373582 112 + 647215 CTACCCTGAAGGCATACTATCATAGTAAGTTCCCAGAATTTGGAGATTAAACACTGTCTCATTGTATGTTGCTATTACATTAACCCTCCCTCAATGTATCTCAACAAGTTGA + +a +s mr.mrrefChr5 228059 73 + 294542 TTGATTTATATGAGCCTCTACAAAGTCTTATGAATATGCAAGCTACAAGATGCCTTTTTTAGGCTCACAGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374390 73 + 636262 TTGATTTAGATGAGGCTCTACAAAGTCTTATGAATATGCAGGTTACAAGACACCTTTTTTAGGCTCACAGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 373694 73 + 647215 TTGATTGATATGAGCCTCCACGAAGTTTTATGAGTTTGCAAGCTACAAGATGCCTTTTTTAGTTTCACAGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 228132 321 + 294542 GAAAAGTGAGGATCTAAGTAAAGGTAAACCGTAAGGAACAAAAAGAACAAAGTCTAGGATAGAGGACACAAGAGTTAACTTTGCTCTTACCAAAGACAATTTTTAGATACTTTCACTCACTCAAGACGCCACTAAGTATACTGAGCTTTAAGTTACTTAGAAATGCATGGATAGTTTTGTATTCCCCTCAATTCCAGGTCTCTCAGGACCTCACTTTGGGCAAAAGACCAGAATCACACAGGTATAATCAGCTGTGTTGTGCATGTCAGCGATGGTGCAACTCTTATTATGCAATCCTGAATGGCTATTACATACCATTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374463 321 + 636262 GAAAAGTGAGGATCTAAGTAGAGGTAAACCATAAGGAACAAAAAGAATAAAATCTAGGATAGAGGACACAAGAGTCAACTTTGTTCTTACCAAGGACAATTTTTAGATACTTTCACTCACTCAAGACGCCCCTAAGAATACTGAGCTTTAAGCTACATAGAAATGCATGGATCGTCTTGTATTCCCATCAATTCCAGCTCTCTTAGGACCCCACTATGGGCAAAAGACCAGAATCACACAGGTATAATCAGCTGTGTTATGCATGTCAGGGATGGTGCAACTGTTAATATGCAATCCTGAATGGCTATTACATACCATTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 373768 321 + 647215 GAAAAGTGAGGATCTAAGTAAAGGGAAACCGTAAAGAACAAAAAGAACAACGACTAGGAGAGAGCACACAAGAGTTGACTTTGCACTTACCAAAGACAATTTTTAGAGCCTTTCGCTCGCTCAAGACACCACTAAGTATACTGGGCTTAAAGTTACTTAGAAATGCATGGATAGCTTTGTATTCCCCTCAATTCCAGGTCTCACATGACCTAACTTTGGGCAAAAGACCAGAATCACACAGGTATAATCAGCTGTGTTGTGCATGTCAGCTATGGTGAACCTCTTATTACACAATCCTGTATAACACTCATGTAACAGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 228453 133 + 294542 ATTTTTTGGCATGCTTCATTGTCTTTCAACAGCTGTGGAATTCGTGTCTATAACATCCCCTGGACCCAGTCTTCTTTTACCTTTACTCCCATGTTTGACTGGCATGTTCAAAGGGAGTGAGAAAATTCCTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374800 133 + 636262 ATTTTTTGGCATGCTTCATTGTCTTTCAACAGCTGTGGAATTCGTGTCTATAACATCCCCTGGACCCAGTCTTCTTTTACCTTTACTCCTACGTTTGACTGGCATGTTCAAAGGGAGTGAGAAAATTCCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 374089 133 + 647215 ATCTTTTGGCATGCTTCAGTGTCTTTCAACAGCTGCAGAATTGGTGTCTATAAAATTCTGTGAACCCAGTCATCTTCTATCTTTACTCCCATGTTTAAGTGGCATGTTCAAAGCGAGTGAGTCAACTCCTATA + +a +s mr.mrrefChr5 228586 41 + 294542 TCTCAAGTGTGGGACCAACCTGTGACATGTTCACTGAAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374935 41 + 636262 TCTCAAGTGTGGGACCAACCTGTGACATATTCACTGAAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 374222 41 + 647215 TCTCAAGTATGGGACCAACCTGTGACATGTTCACTGAAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 228627 258 + 294542 GTTAAGCAACTATGTCTATTCTTTCATCTTGAGACATCTAGTTTCTGCTATGGTGTGAATCAAGTGTTCATTTGGAGACTGGCTTTATTAGCTGTGAAGTTTATACTATTGAATGTGCCTTCAGCCCAGCAGTGTGGGAACTCCAAGATTTTCAACTGGATATCCCTACTAACATCCTCTACCTGCATAGTTCTCTCAGGATTTAGACAAGAGTTACATTATTCAAGTGGAGGTATTGGTCTAGCGTATTCAATTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 374978 250 + 636262 GTTAAGCAACTATGTCTATTCTTCCATCTTGAGACATCCAGTTTCTGCTATGGTGTGAATCAAGTGTTC--------ACTGGCTTTATTAGCTGTCAAGTTTTTATAATTGAATGTGCCTTCAGCCCAGCAAACTGGGAACTCCAAGATTTTCAACTGGGTATACCTACTAACATCCTCTACCTGCATAGTTCTCTCAGGATTTAGACAAGAGTTACATTATTCAAGGGGAGGTATTAGTCAAGCGTATTCAATTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 374263 256 + 647215 GTTAAGCAAGTATGTCTTTTCTTTCATCTTGAGACATCTAGTTTCTGCTATGATGTGAATCAA-TGTTTATTTGGAGACTGGCTTTCATAGCTGTGAAGTTTACACTATCAGATGTGCCTTCAGCTCAGCAGTGTGGGAACTCCAAGATCTTCAACTGGATGTCCCTACTAACATCCTCTACCTGCACAGTTTTCTCAGGGTTTAGACAATAGTTACATTATTCAAGTGG-GGTATTGTTCTAGTGTATTCAATTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 228885 35 + 294542 CTAGTGTATTCAATCGAAGATAAGTGTCTATCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375228 21 + 636262 -------GATCAATC-------AGTGTCTATCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 374520 35 + 647215 CTAGTGTATTCAATTGAAGATAAGGGTCTATCAAC + +a +s mr.mrrefChr5 228920 28 + 294542 ACCATGCTCACTATACATTTCAGTGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375249 28 + 636262 ACCATGCTCACTATACATTTCAGTGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 374556 25 + 647215 ACCATGGTCACAATACATTTTAGTG--- + +a +s mr.mrrefChr5 228948 210 + 294542 AAGTAATGTATAATCTAGTTGGGAACAAACCCGTTTATTGATAGTTTGTGATTCCTTGACCTCAGTGGCACATAAATTAAGAATATGTCTGGCTTCAACGGAGGATGCTGTTACTACTATATATTATTACTGTACATATTACTAATGTAGTCAGAGGGGTAAGCTAACTCCATGATCATTTTTTCAAGTGAGAAAAGACCAATCCTGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375279 208 + 636262 AAGTAATGTATAATCTAGTTAGGAACAAACCTGTTTATTGATAGTTTGTGACTCATAGACCTCAGTGGCAC--AAATTAAGAATATGTCTGGCTTCAACGGAGGATGCTGTTACTACTATATATTATTATTGTACATATTACTACTGTAGTCAAAGGGGTAAGCTAACTCCATGATCATTTTTTCAAGTGAGAAAAGACCAATCCTGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 374581 210 + 647215 AAGTAATGTATAATCTAGTTGGGAAGAAACCCGTTTATTGATAGTTTGTGTTTCCTTGACCTCAGTGGCACATAAATTAAGAATATGTCTGTCTTCAATGCAGGATGCTGTCACTGCTATATATTGTTACTCTACATTTTACCAATGTAATCAGAGGGGTGAGCTAACTCCATTATCATCTTGTCGAGTGAGCAAAAACCAATCCTGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 229158 218 + 294542 TGTCCTATTGTTGGAGGTGTCAATCTGGTTTGTTTGATGGTACAAGGGTCCTATGATCTCTTTAAATGCATCTTGACTTTTCTAGTTTCAGACTTGAGCTTATAGGGGCCATCCAGTCTACATAATGGCTGCCATATTCCTAAGTTGGCCAAGCAAAGTGAGTAAGAGTAGGTAGTACTAAATTGGTTTAAGACTCCTGCTTGTGTACTCGCACCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375580 218 + 636262 TGTCCTATTGTTGGAGGTGTCAATCTGGTTTGTTTAATGGTACAAGGGTGCTATGATCTCTTTAAATGCATCTTGACTTTTCTAGTCTCAGACTTGAGCTTATAGGGGCCATCCAGACTACATAATGGTTGCCCTATTTCTAAGTTGGCCAAGCAAAGTGAGTAAGAGTAGGTAGTACTAAACTTGTTTAAGACTCCTGCTTATATACTCGTACTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 374791 216 + 647215 TGTCCTATTTTTGGAGGTGTCAGTCTGGGTTGTTTGATGGTAC-CGGGTCCTGTGATCTCTTTAAATGCATCTTGCCTTTTCTAGTTTCGGACTGGATC-TATAGGGACCATGAAGTCTGCATAATGGCTTCCATATGCCTAAGTTTGCCAAGCAAAGTGAGTAAGAGTAGGTAGTCCTAAATTGGCTTAAGACTCCTACTTGTGTACTCGCACCTAA + +a +s mr.mrrefChr5 229376 51 + 294542 TGTTATTTAGATTTCAGAACAGTGCCTGGTGCAAAGCTGTAATAAAGGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375798 51 + 636262 TGTTATTTAGATTTCAGAACAGTGCCTGGTGCAAAGCTGTAATAAAGGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 375008 51 + 647215 TGTTGTTTAGATTTCAGCACAGTGCCTGATGCAATGCTATAATAAAAGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 229427 222 + 294542 AACACAGCCATGTACTTTTGGTTATTGCTTGGCCATGAGCCTGCCCACTTTAGGAGATGTTAAGCGATCACAGAAGGAGTCTGCCCACATCATGCAAGAGGTTAGTCATGCACAGCTCCCTACGTACATTCTATATCCCCTGTCCACCTCATGCTAATGCATCTTCATTGTGGTGGCAGAAACAAGGAAAGAGAGAAGGAAAGCCTTCAATGGTAATTTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375862 218 + 636262 AACACAGCCATGTACTTTTGGTTATTGCTTGGCCATGAGCCTGCCCACTTTAGGAGATGTTAAGCGATCACAGAAGGAGTCTGCCCACATCATGCAAGAGGTTAGTCATGCACAGCTCCCTACGTACATTCTATATCCCCTGTCCACCTCATGCTAATGCATCTTCATTGTGGTGGCAGAAGCAGG----GAGAGAAGGAAAGCCTTCAATGGTAATTTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 375059 220 + 647215 AACACAGCCATGTACTCATGGTTATTGCATGGCTATCAGTCTGCCCTCTTGAGAAGATGTTTAGCGATCACAGAAGAAGTCTGCCTGCCTCATGCAAGAGGTTTGTCATGCAGAGCTGCCCACGTACATTTGAGATCCCCTGCCCACCTCATGCTTATGCACCTTTATTGTGGTGGCAGAAACAAGGAAAGAAAGAAGGAAAGCCTTCAATGG--GTTTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 229649 156 + 294542 GAAACTCTTCAGTTCCTTAAAGGAGACTAGAAATAGTTGCATCCCACAGCATACACAGAAAGGTAACTGGTGTAGTTTATACTCAGCCCTCACTTTGCAGCGCTGACTGATTCTCTCACAAACTGATTAAACATCAAACTATATTGAGTCCATCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376080 154 + 636262 GAAACTTTTCAGTTCCTTC-AGGAGACTGGAACTAGTTGCATCCCACAGCATACACAGAAAGGTAACTGGTGTAGTTTGTACTCAGCCCTCACTTTGCAGCCCTGACTTACTCTCTCACAAACTGA-TAAACATTAAACTATATTGTGTCCATCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 375336 156 + 647215 GAAATTCTTCACTTACTTAAAGAAAACTATAAATAGTTGCACTGCACAGCATGCACAGTGAGGTGACTGGGGTAGTTTATGCTCAGCCCTCACATTGCAGCGCCAACTGGTTCTCTCACAAACTGATTAAATATCAAACTATATTGAGTCCATCAC + +a +s mr.mrrefChr5 229805 110 + 294542 AGACAGCAGTAACATAAGAAAAGCTAAAGTTTTCAGTGTAATTTCCATGCAAAAGAATTTGATTGACAAACATTCAGTGGTCCCATGCTGACTGAAAGTGTATACAAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376236 110 + 636262 GGACAGCAGTAACATAAGAAAAGCTAAAGTTTTCAGTGTAATGTACAAGCAAAAAAAATCACTTGACAAACATTCAGTGGTCCCATGCTGACTGAAAGTGTATACAAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 375492 110 + 647215 AGACGGCAGTACCATAAGAAAAGGTAAAGTTTTCAGTGTAATTTCCATGCAAAAGACTTTGATTGACAAGCATTCAGTAGTCCAATGCTGCCTGAAATTGTATACAAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 229915 59 + 294542 GACAAAGCTTGCATAATAGGAGGAGGCCTTCCCACCCCTTGTGTAGTAGACTTGTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376346 51 + 636262 --------TTACATAATAGAAGGAGGCCTTCCCACCCCTTCTGTAGTAGACTTGTTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 375604 59 + 647215 GACAAAGCATGCATAATAGGACGAGGCCTTCCCACCTCTTGTGTAGTAGAATTGTTTGA + +a +s mr.mrrefChr5 229974 232 + 294542 GATCACATGCACAGGTGACTCATGGGAACTACTGTCTGTATCCTTTTGATTGTACAATCCAAAATATACTGAAAATACAAACACTATAAAGGTGCCATGGAGATGGGAAGTCATAACAAAAACTCTTAACAATACCCTACCATTCCTATATTTTGGTTCATAAAAAAATCCATTTTATCCCCTTTATCCACACACCTTGCCAGCATAACTATAGAATCTTGCTCTCTAAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376398 230 + 636262 GATCACATGCACAGGTGACCCATGGGAACTACTGTCTGTGTCCTCTTGATTGTACAATCCAAAACATACTGAAAATACAAACACTATAAAGGTGCCATGGAGATGGGAAGTCGTAACAAAAATTCTTAACAGTGCCCTACCATTCCTATATTTTGGGTCATAAAAAAACCCATCTTAT--CCTTTATCCGCACACCTTGCCAGCATAAATATAGAATCTTTCTCTCTAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 375663 230 + 647215 GATCACATGAGTGGGTGACTCATGAGGACTACTGTCTG-ATCCTTTTGATTGTACAATACAAAGTATACTGAAAATACAAATGCCATAAAGCTGCCATGG-TATGGTCAGTCATAACAATAACTCTAAACAATACCCTACCATTCCTATATTTTGGTTCAAAAAACAATCCATTTTATCCCCTTTATCCACACACCTTGCCAGCATGACTATAGAACCTTGCTCTCTAAGAG + +a +s mr.mrrefChr5 230206 261 + 294542 AAATGCACGCATTGTACAACACTGACCCTATGCATGTGAAACTTGCACCTTATTATCCTTTGACCAGCAATATTTTTGGTAATTGTGTGTACCTAGTGTTAGACAGTGATTTCTCCATAGATACATGGTGACCACCAGGCTTTTCATAATTGGGAGTATGGAACCCTAGTAGCTACGAGCAAACCCATCAGTCATTTGCATGGGAGAGTATATTCTTCTCAGCATGATGATACCTTCCTTTTTCCAGAATAGACCAGCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376628 261 + 636262 AAATGCATGCATTGTACAACACTGACCCTATGCATGTGAAACTAGCAGCTTATTATCCTTTGTCCAGCAATATTTTTGGTAATTGTGTGTACCTAGCATCAGACAGTGATATCTCCATAGACACATGGTGACCACCAGGCTTTTGATAATTGGGAGTATGGAACCCTAGTAGCTACGAGCAAACCCATCTGTCATTTGCATGGGAGAGTATATTCTTCTCAGCATGATGATACCTTCCTTTTTCCAGAATACACCAGCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 375894 259 + 647215 AAATGGACGCAATGCAAAACGCTGACCCTATGCATGTGAAATGTGCACCTTAGTATTCTTTGACCAGCAATATTTTTAGTAATTGTGTGTACCTAATGCTGAACAGTCATTTCTCCATATGTACATGGTGACCACCAGGCTTCTCATAATTGGGAGTATAAGACCCTAGTAGC--CGAGCAAACCCTTCAGTCATTTGAGTGGGTGGGTGTATTCTTCTCAGCATGATGATAGCCTTCTTTTTCCAGAATAGACCAGCTGA + +a +s mr.mrrefChr5 230467 15 + 294542 GCAGACCCACACAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376889 15 + 636262 GCAGACCCACACGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 376166 15 + 647215 GCAGACCCACACAAT + +a +s mr.mrrefChr5 230482 158 + 294542 CAATGTTTATACCCAGCACTGGATTTGGTATTTATAGGGGATAGGGGCTCAGGGCAACAATAGGAGACCATTGACATAAAAAAATTGTTGTGGGGGTATGCATGTGGACAGACTAAAAGAGAGGTGAGTATTTTTGAACATTCCAATTGCAGTCTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 376904 158 + 636262 CAATGTTTATACCTAGTACTGGATTTGGTATTTATGGGGGATAGGGGCTCACAGCAACAATAGGAGACTATTGACATAAAAAAATCGTTGTAGGGGTATGCACGTGGACAGACTAAAAGAGAGGTGAGTATTTTTGAACATTCCAATTGCAGTCTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 376182 158 + 647215 CAATGTTGATGCCCAACACTTCATTTGGTATTTATAGGGGATAGGGGCTCAGGGCAACAACAGGAGACCATTGACATCGAAAAATTGCGGTGGGGGCATGCATGTGGGCAGACTGAAAGAAAGGTGAGTATTTCTGAACACTCCGATTGCAGTCTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 230640 11 + 294542 AGGAAGGTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377062 11 + 636262 AGGAAGGTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 376341 11 + 647215 AGGGAGGTTTG + +a +s mr.mrrefChr5 230651 20 + 294542 TTACAGTATCAAGAGATGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377074 20 + 636262 TTACAGTATCAAGAGATGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 376352 20 + 647215 TTACAGTATTAAGAGATGAA + +a +s mr.mrrefChr5 230671 225 + 294542 ATGAATAAGGTTCCGCTATGGATGATATACAGCATTTAATAACAACTACCTGAGCGTTATGGTGATCAACTTTTGAAATTAAAAATGACAGTAAGGGAAATCTGGCATGCAGCAACATCATAAGCCTTAATTCTATAGTTAATGGGCAGCAAAGTGGGTGTGGACATCCCAGAAGGAGGGGACTCCAAGAGACTATGCCTGCAGATAGTACTAGCAAGTTAGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377094 225 + 636262 ATGAATCAGGTTCCACTATGGATGATATACAGCATTTAATAACAACTATCTGAGCGACATGGTGATCAACTTTTGAAATCAAAAATGACAGTAAGGGAAATCTGGCATGCAGCAACATCATAAGCCTTAATTCTATAGTTAATCGGCAGCAAAGTGGGTGTGGACATCTCAGAAGGAGGGGACTCCAAGAGACTATGCCTGCAGATAGTACTAGCAAGTTAGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 376373 225 + 647215 ATGAGTAAGGTTCCGCTATGGATGATCTACAGTGTTCAATAACGACTACCTGAGGGTTACAGCGAACAACTTTTGAAATTAAAAATGCCAGTATGGCAAATCTGGCATGCAGCAACATCTTAGGCCTTAGATCTATAGTGAATGGGCAGCAAAGTGGGTGTGGACATCCCACAAGGAGGGGTCTGCAAGAGACCATGCCTGCAGATAGAACTAGCAAGTTAGGAG + +a +s mr.mrrefChr5 230896 270 + 294542 GGGGAGGAACCCAAGAGGCTATGCCTGCAGATTGTTTGAGGGTTAAATTCTGAAAAGTGGATTTCCAGATGGTTTGTAGAAGTCAGCATGGATGCCCTGATTCTGATATACCACAAGGGCATACTTAACACCAAGGCAGAGTGCTCCCAAGATACTATCGGACCATTCTAAGGGAGTGACCGATAAGCAATGTTGTGACAAAGATAGAAATGTGTGTTACTTGTGCAAGAGTCAACATTATAAGAAGTATATAGGTAGGGTTGAGTTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377336 270 + 636262 GGGGGAGAACCCAAGAGGCTATGCCTACAGATTGTTTGAGAGTTAAATTCTGAAAAGTGGATTTCCAGATGGTTTGCAGAAGTTAGCATGGATGCCATGATCCTGATGTACCACAAGGGCATACTTAACACCAAGGCAGAGTGCTCCTGAGATACTGTTGGCCCAATCTAAGGAACTGACCGATAAGCAATGTTGTGACAAAGATAGAAATGTGTGTTACTTGTACAAGAGTCAACATTATAAGAAGTATGTAGGTAGGGTTGAGTTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 376598 266 + 647215 GGGGAGGATTCCAAGGTGTTATGCCTGCAGATTATTTAAGGGTTAAATACTGAAAAGTGGATTTCCAGATTGTTTATAGGAGTCAGCATGGATGCACTGATTTTGATATACC----GGGCATACTTAATGTCAAGGCAGAGTGCTCCCAAGGTATTATCAGACCATTCCAAGGGAGTGACCAATAACCAATGTTGTGACGAAGATAGAAACTTGTGTTGCTTTTGCAAGAGTCAACATTATAAGAAGTATATAGGTAGGGTTGAGTCATT + +a +s mr.mrrefChr5 231166 178 + 294542 TACTTATAGTGACTGTAAATGATATCAATATTGAATGCTACTATAACATGAGGGGGTTTCTTTTTCCTCAAGGCTGTATGGATATATGTATGCCCTTCTTCCATACTTAATTATTTATTGAGGTTGGCTAAGGTTTTTGTGATCCTGGCTTAACCAGTGGACCATTGTTTGAGGAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377606 178 + 636262 TACTTATAGTGACTGTAAATGATATCAATATTGAATGCTACTATAACATGACGGGGTTTCTTTTTCCTCAGGGCTGTATGGATATATGTATGCCCTTCTTCCATACTTAACTATTTATTGAGGTTGGCTAAGGTTTTTGTGATCCTGGCTTAACCAGTGGACGATTGTTTGAGGAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 376902 178 + 647215 TACTTATAGTGACTGTAAATGATATCATGATTGAATGCTACTATAACATGAGGAGGTTTCTTTTTCCCCAAGCCTATATGGATATATGTATGCCCTTCTTCCATCCTTAATTATTTATTGAGGTTGGCTAAGGTTTCTGTGATCCAGGGTTAACTAGTGGACCATTGTTTAAGGAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 231344 103 + 294542 CCTGGTATGCCTAGATGTGATTCCATCCAATCCTTTAATGGCATTAGCTTGCCCTCAATTGAAATGAGCATCGGAGTTCTACAGTCAACCTTTCCTACCTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377784 103 + 636262 TCTGTTATGCCTAGATGTGATTCCATCCAATCCTTTAATGGCATTAGCTTGCCCTCAATTGAGATGAGCATCGGAGTTCTACGGTCAACCTTTCCTACCTAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 377090 103 + 647215 CCTGGTGTGCTTAGATGTGATTCCATCCAATCCACTAATGGCACTAGCTTGCCCTCAACTGAAAGATGCATAGTAGCTCTACAGTCAACCTCACCTATCTAAC + +a +s mr.mrrefChr5 231447 273 + 294542 TATTCAGGGAGTATCTTCTGTGTTTTTTTGAAGAGACTATTTTCCGCTGGGATCGACTGTTGTAATGGACACTCAAGTAACTGGTAAACCTGAGCAGTAGTCAGGCATGCATGAAACGGTCTTACTAAGTTGTTGCAGGGCATTCTAGCCATGAAAATGCACCAATTAGTGGGGAGACCATTTTTTTAGGCAGAAACTTGTGTCTGGTTTTTTAGGCTGAAACTCATGTTGGTTTGCTGTACAAGAGTAAATATCTAATATCAGCATAGAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 377887 261 + 636262 TATTCAGGGAGTATCTTCTGTGTTTTTTTGAAGAGACTATTTTCCGCTG------------GTAATGGACACTCAAGTAACTGGTGAACCTGAGCAGTAGTCAGGCATGCATGAAACGGTCTTACTAAGTTGTTGCAGGGCATTCTAGCCATGGAAATGCACCAATTAGTGGGGAGACCATTATTTTAGGCAGAAACTTGTGTATGGTTTTTTAGGCTGAAACTCATGTTGGTTTGCTGTACAAAAGTAAATATCTAATATCAGCACAGAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 377199 262 + 647215 TATCTAGAGAGTATCTTCTGTGTTGTTTTGAAGAGACTATCTACCAATGGGATCGACTGTTGTAATGGACACTCAAGTCGCTGGTAGACCTGAGCAGTAATCAGGCATGCATGAAACAGGCTTACTAAGTTG----------TTCTTGCCATGAAAATGTACCAATTAGTGAGAAGACCATTTTTCTAGGCCGAAA-TTGTGTCTGGTCTTCTAGGTAGAAACTTGTGTTGAGTTGCTGTACAAGGATAAATATCTAATATCAGAATACAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 231720 18 + 294542 CTATAATATGAGATTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378148 18 + 636262 CTATAATATGAGATTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 377467 18 + 647215 CTATTATATGAGACTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 231738 253 + 294542 ATGTCTTTGTACAGGCTGTGTTCTTAATTGATTTATCATAGTGCAGTGTGACTGCACAGAGGAATACCAGGTTACTCCAAGTCAAGGATTTTCCCCAGCAAGTGTTTAGTGTACAAAGGGTACATGCGTAATGTTGTTATCATATTAAGTAGTGCAAGCAGTTGGGGTAATACAAGTAGTATGTCCTACACACATTTAACAGTTGGGCAGGTGAGTATTTAACAGTTGGGCAATCGAGTGGGTGCAACCATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378166 253 + 636262 ACGTCTTTGTACAGGTTGTGTTCTTAATTGATTTATCATAGTGCAGTGTGACTGCACAGAGGAATACCAGGTCGCTCCAAGTCAAGGATTTTCCCCAGTAAGTGTTTAATGTATAAAGGGTACATGCGAAATGTTGATATCATATTAAGTAGTGCAAGCAGTGGGAGTAATACAAGTAGTATGTCCTACACACATTTAACAGTTGGGCAGGTGAGTATTTAACAGTTGGGCAATCGAGTGAGTGCAACCATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 377487 253 + 647215 ATGTCTTTGTACCGGCTGTGTTCTAAGTGGATCTATCATAGTGCAGTGTGGCTGCACAGAGGAACACAAAGCTACTCCAAGTCAAGGATCTTCCCCAGCAAGTGTTTAGTGTACAAAGGGTACATGCGTAATGTTGTTATCATATTAAGTGGTGCAAGCAGTTAGGGTAATACAAGTAAGATGTTCTACACACATTAAACAGTTGGGCACATGAGTATTTAACAGTTGGGCAGGTGGGTGGGGGCAACCATTC + +a +s mr.mrrefChr5 231991 16 + 294542 AACGCCCAAATAAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378419 16 + 636262 AACGCCTAAATAAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 377746 16 + 647215 AACACCCAAATAAGGC + +a +s mr.mrrefChr5 232007 207 + 294542 AGATAATGTGTTCCAGAATAATGGGTTAAAATTAAGGGATGAGGACAGTCCCTGAATAGGCTGCAAGGATTTTGGGGAAGTAGTACCAAAGCTGATGTGTGGTTCATAACATAGAAGCTATGAAACTTGGAATAATGAGCAAGTGATTGTTCTTGTAAGATCCGAAGGCTGGGGAAGAGGAACATCTATGAGGGATTGAACATCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378435 206 + 636262 AGATAATGTGTTCCAGATTAATGGGGTAAAATCAAGGTATGGGAACAGTCCCTGAATAGGCTGCAAGGATTCCGGGGAAGTAGTACCAAAGCGGATGTGTGGTTC-TGAAATAGAAGCTATGAAACTTGGAATAATGAGCAAGTCATTGTTCTTGTAAGATCCGAGGGCTGGGGAAGAGGAACATCTGTGAGGGATTGAACATCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 377764 206 + 647215 AGATAATGTATTCAAGAATAATGGGTTAAAATTAGGGGATCAGGCTAGTCACTGAATAGGCTGCAAGGATTTTGGGGAGGTAGTTCCAAAGCTG-TGTGTGGTTCATAACATAGAAGCTACAGAGCTGGGAATAATGAGCAAATGATTGTTCTTGTAAGATCCGAAGGCTGGGGAATAGGAACATCTATGAAGGACTGAACATCTGG + +a +s mr.mrrefChr5 232214 142 + 294542 GGGTAACGAAAAGTCCTCATACTTTGGCGAGATTAGTCTTTGGGACCACTACAGGACAATACAACAAGTGGAAGTGTATCCAGTAATGTTGGGGGGTTGGCACACCACCTGACAGTGTTAGGAGACAAGTATGTTTAGTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378641 139 + 636262 GGGTTACGATAAG-CCCCATACTTTGG-GAGATTGGCCTTTGGGACCACTACAGGACAATACAACAA-TGGAAGAGGATCCAGTGATGTTGGGGGGTTGGTACACCACCTGACAGTGTTAGGAGACAAGTATGGTTAGTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 377972 142 + 647215 GGGTATCGAAATGTCCTCATACTTTTGCGAGATTAGTCTTTGGTACCACTACAGGACAATACAACAAGTGGAAGTGTATCCAGTAATGATGGGGGGTTGCCACACCACCTGACAGTGTAAGGAGAGAAATATGTTTAGTTTA + +a +s mr.mrrefChr5 232356 85 + 294542 CAATGATATTGATTAATGACCCTAGCTAAAATTCTCAGATGTCTTTATCCAGCAGGTAGATAATATTAGGTGGGTCAATCAGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378780 85 + 636262 CAATGATGTTGATTAATGACCCTAGCTAAAATTCTCAGACGTCTTTATCCACTGTGTAGATAATATTAGGTGGGTCAATTGGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 378218 81 + 647215 CAATGATATTGATCACTGACCCTAGCTAAAGTTCTTATATGTCTTTAACCAGCAGGTAGATAATATTAGGTGGG----TCAATTA + +a +s mr.mrrefChr5 232441 43 + 294542 GAAAGAATGGCGTGTTTTCTCAACTACTAATATAGCAATTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378865 42 + 636262 GAAAGACTGGCGTGTTTTCTCAACTACTAGTAT-GTCATTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 378303 35 + 647215 GAAGGAATGG---AGT-----GACTACTAATATATCAATTTGC + +a +s mr.mrrefChr5 232484 40 + 294542 TCCTTGTTGCCTAGCTCGCTATCTTTAGCTCTCTTATACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378908 40 + 636262 TCCTTGTTGCCTAGCTCGCTATCTTTAGCTCTCTTATACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 378338 40 + 647215 TCCTTGTTTCCTAGCTAGCTACCTTTAACTCTCCCGTACT + +a +s mr.mrrefChr5 232524 111 + 294542 GTCATACGGCCGATCTCATCCACTGCACGGCTCGTTGCTGGTGCACCGAGCGTGAACCCGACTCAAGAAATTGCAGCGAGCGGCCCTCGTCCGAAGCCCTGGCGAGCACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 378948 111 + 636262 GTCATGCGGCCGATCTCAACCACCGCACGGCTCGTGGCCGGTGCAACGAGCATGAACCCGACTCAAGAAATTGCACTGAGTAGCACTCGTCCGAAGCCCTGGCGAGCACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 378388 109 + 647215 GTCATACGGCCGATGTCATCCACTGCACGGCTCGTTGCTAGTGCACC--GCGTGAACACGACTCAAGGTATTGCAGCGAGCGGCCCTCGTCCGAAGGCGTGTCGAGCACAA + +a +s mr.mrrefChr5 232635 104 + 294542 AATCCCAAATTAGCCCCCATGAGCCGCATTGTCCTAGTGGCATAGGATCTCTAGGTCCCCAAACCCCCTCTCGATCACCAACTGGTGCCGAAGACTGCACCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379063 104 + 636262 AATCCCAAATTCGCCCCCATTAGCCGCATTGTCCTAGTGGCATAAGATCTCTAGGTCCCCAAACCCCCTCTCGAGCACCAACTGGTGCCTAAGGCTGCAGCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 378497 104 + 647215 AATCCCAAATTAGCCTCCATGAGCCGCATTGTCCAATTGGCACAGGATCACTAGGTCTCCAAGTCCCCTCTTGATCACCAACTGATGCCGAAAACTGGACCCTC + +a +s mr.mrrefChr5 232739 65 + 294542 GGTACTCTTCACAGGTCGCCCTACTCAAGCGCCCAAGGTCAATCGTTGGCCGCACATACTGGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379222 65 + 636262 GGTACTCTTCACAGGTCGCCCTACTCAAGCGCCCAAGGTCAATCCTGGGCCGCACATACTGGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 378601 65 + 647215 GGTACTCTTCACAGGTCGCCCTACTCACGCGCCCAACGGCAATCGTTGGCCGCACAGACTGGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 232804 35 + 294542 TGTTACCAGAGTAACTGATCGCACAAGTTATTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321930 35 + 636262 TGTTACCAGAGTAACTGATCACACAAGTTATTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379414 35 + 636262 CGTTGCCGAAGTAACTGATTGCACAAGCTATATAG + +a +s mr.mrrefChr5 232839 13 + 294542 AATGTTATTGCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379472 13 + 636262 AATGTTATTGCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 378666 13 + 647215 AACATTACTGCGA + +a +s mr.mrrefChr5 232852 15 + 294542 AAAAAAATAATATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379485 15 + 636262 AAAAAAATAATATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 378679 15 + 647215 AAAAGAATAATATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 193946 15 - 647215 ACGATCATAAGATTT + +a +s mr.mrrefChr5 232867 9 + 294542 CCAAAAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379500 9 + 636262 CCAAAAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 378694 9 + 647215 CCAACAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 193964 9 - 647215 CTTAAAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 232876 40 + 294542 TGTTGTACAACATACTGTTTTGTTTTGATCCCACGGGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379509 40 + 636262 TGTTGTACAACATACCATTTTGTTTTGATTCCATGGGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 378703 40 + 647215 TGCTTTACAACAAACTGCTTTGTCTCAATCCCACGGACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 193976 30 - 647215 TGTTGTTGGAGACACTG----------ATCACACAAGCAT + +a +s mr.mrrefChr5 232916 4 + 294542 TTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321965 4 + 636262 TACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379549 4 + 636262 TTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 378743 4 + 647215 TTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 194006 4 - 647215 TTCA + +a +s mr.mrrefChr5 232920 75 + 294542 TAGGCACCTGCCCCTATAATACAATCTGTTTCGTATGCTCCTTCACACTGTATGAGGTTTACCTGACTAATTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 321969 75 + 636262 TAGGCTCCTCCCACTATAATACAATTTCTTTTGTGTGCTCCTTCACACTGTATGAGGTTTACTTGACTGATTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379553 72 + 636262 TAGGCACCTGCCCCTATAATACAACCTGTTTCGTATGCTCCTTCAAACTGTGTGAGGTTCACCTG---AATTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 378747 75 + 647215 TATGCACCTGCCCCTATAATACAATCTGTTCCGTATGCTCCTTCCCACTGTATGAGGTTTACCTGACTAACTTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194017 71 - 647215 TAGGACTCTGACTCTA--ATACAATCAATTTCTTACGCTCCTTCATACCGA--GAGGTTTACCTGGCCGGTTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 232995 27 + 294542 TCCTTTTACTTGAATGTTCCTGTCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322044 27 + 636262 TCCTTTTACGTGAATGTTCTTGTCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379625 27 + 636262 TCCTCTTACTTGAATGTTCCTGTCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 378822 27 + 647215 TCCTTTTATTTGAATGTTCCAGTCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194095 27 - 647215 TCCTTTTACTCAAATGTCCCTGTGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 233022 6 + 294542 CATACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322075 6 + 636262 CATACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379652 6 + 636262 CATGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 378849 6 + 647215 CAACCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 194122 6 - 647215 CAAACA + +a +s mr.mrrefChr5 233028 1 + 294542 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322081 1 + 636262 A +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379658 1 + 636262 A +s simRat_chr6.simRat.chr6 194128 1 - 647215 A + +a +s mr.mrrefChr5 233029 35 + 294542 TACAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCCTCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322082 35 + 636262 TATGAGATTTACTGGACTGTTTTTATTCCCTCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379659 35 + 636262 TACAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCCTCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 378855 35 + 647215 TACAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCCTCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 194129 35 - 647215 TATAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCATCACC + +a +s mr.mrrefChr5 233064 8 + 294542 ATATTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322117 8 + 636262 ATCTTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379694 8 + 636262 ATATTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 378890 8 + 647215 ATATTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 194237 8 - 647215 ATATTAGG + +a +s mr.mrrefChr5 233072 7 + 294542 TGTATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322125 7 + 636262 TGTATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194245 7 - 647215 TGTACTT + +a +s mr.mrrefChr5 233079 27 + 294542 GAAGGTGGCACTTCTGAGTATGGCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322132 27 + 636262 GACTGTCGCACTTCTGATTATTTCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379702 27 + 636262 GAAGGTGGCACTTCTGAGTATGGCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 378898 27 + 647215 GAGGGTGGCACTTCTGAGTATGGCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194252 27 - 647215 GAAGGTGGCACTTTTGAGTATGGCCGT + +a +s mr.mrrefChr5 233106 6 + 294542 TTTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379729 6 + 636262 TTATGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 378925 6 + 647215 TTTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194279 6 - 647215 TTTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 233112 28 + 294542 ATGCTTCTCCACAATATTAGATTTTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322159 28 + 636262 ATTCTTCTCCACAATATTAGATTTCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379735 28 + 636262 ATGCTTCTCCACGACATTAGATTTTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 378931 28 + 647215 ATGCTTCTCCACAATATTAGATTTGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 194285 15 - 647215 GTGCTTCCCCACTAT------------- + +a +s mr.mrrefChr5 233140 44 + 294542 ATTGTCTGTCTTATGGCTCTTCAGAGTATCACTGCTGGCCCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322203 44 + 636262 ATTGTGTGTCTTATGTCTCCTCAGAGTATCACCGCCGGCTCTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379763 34 + 636262 ACTT----------GGCTCACCAGAGTATCACTACTGGACCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 378959 44 + 647215 ATTTTCCATCTTATGGCTCTTCAGAATATCAGTGCTGGCTCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194300 29 - 647215 -TCGTCTGTGTTATGGCTTTTCAGA--------------CCTTT + +a +s mr.mrrefChr5 233184 14 + 294542 ACTGCTGGCCTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379797 14 + 636262 ACTGCTGGCCTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 379003 14 + 647215 ACTGCAGGCTTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194329 14 - 647215 ACCACTGTTCCTTT + +a +s mr.mrrefChr5 233198 22 + 294542 TCGTATGCTTCTCCACTATATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322247 20 + 636262 CCGTATGCTTCTCCACTGTA-- +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379811 18 + 636262 TCGTACACTTATCCAGTA---- +s simRat_chr6.simRat.chr6 379017 22 + 647215 ACATACGTTTCTCCGGTTTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 194343 22 - 647215 TCGTGTGCTTTTCCCCTATATC + +a +s mr.mrrefChr5 233220 35 + 294542 AGGTTTTTTAATCGTCCTTCTTATGGCTCTTCAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379829 35 + 636262 AGGTTTTTTAATCGTCCTTCTTATGGCTCTTCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 379039 35 + 647215 AAGTTTTTTAATTGCTCTTCTTATGGCTCTTCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 194365 26 - 647215 GGGTCTC---------CTTCTTATGGCTCTTCAGA + +a +s mr.mrrefChr5 233255 37 + 294542 GTATCACCCCCACTCACAGTTCAGATATCAACCGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379864 37 + 636262 GTATCACCTCTCCTCACAGTTCAGATATCAACCGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 379074 37 + 647215 GTATCACCCCCACTTTCAGTCCAGAAATCAACCACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194392 14 - 647215 GTATCGGCCCCACT----------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 233292 11 + 294542 ATCCCTTACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322267 11 + 636262 ACCACTTAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379901 11 + 636262 CTCCATTGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 379111 11 + 647215 CTCCATTACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 194406 11 - 647215 ATCCCTTGCAC + +a +s mr.mrrefChr5 233303 5 + 294542 GCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379912 5 + 636262 GCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 379122 5 + 647215 GCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 194417 5 - 647215 GTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 233308 18 + 294542 ACCCATCCCCCCCTACaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322278 18 + 636262 ACCCATCCCCCCCTAAaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379917 18 + 636262 ACCCATCCCCCCCTAcaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 379127 18 + 647215 GCCCATCCCCCCCTACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 194422 10 - 647215 --------TCCCTTACAA + +a +s mr.mrrefChr5 233326 19 + 294542 tcttattgggacgagctga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322296 19 + 636262 tcttattggaatgagctac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379935 19 + 636262 tcttattgggacaagctga +s simRat_chr6.simRat.chr6 379145 19 + 647215 Tcttattgggacgagctga +s simRat_chr6.simRat.chr6 194433 19 - 647215 TCTCAAGAGGACAGGTAGa + +a +s mr.mrrefChr5 233345 1 + 294542 a +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322315 1 + 636262 a +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379954 1 + 636262 a +s simRat_chr6.simRat.chr6 379164 1 + 647215 a +s simRat_chr6.simRat.chr6 194467 1 - 647215 a + +a +s mr.mrrefChr5 233346 1 + 294542 t +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379955 1 + 636262 t +s simRat_chr6.simRat.chr6 379165 1 + 647215 t +s simRat_chr6.simRat.chr6 194468 1 - 647215 t + +a +s mr.mrrefChr5 233347 21 + 294542 gtacacttttgtaaatgcttc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322316 21 + 636262 aaacacttttgtaaatgcttc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379956 21 + 636262 gtatacttttgtaagtgcttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 379166 21 + 647215 ggatacttttgtaaatgcttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 194469 21 - 647215 gtacacttttgtaaatgcttc + +a +s mr.mrrefChr5 233368 1 + 294542 t +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322337 1 + 636262 t +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379977 1 + 636262 t +s simRat_chr6.simRat.chr6 194490 1 - 647215 t + +a +s mr.mrrefChr5 233369 47 + 294542 ttgaagtgtagacttcttgtgtagtaagagaatgtctattcatgtct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322338 47 + 636262 ttggagtgtagacttcttctccagcaagagaatgcctatccatgact +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 379978 47 + 636262 ttgaaatgtagacttcttgtgtagtaagaggatgtctatttatgtct +s simRat_chr6.simRat.chr6 379187 47 + 647215 ttaaaatgtagacttcttgtgtagtgagagaacgtctatttgtgtct +s simRat_chr6.simRat.chr6 194491 44 - 647215 ttggagcgtaaacttctcttgca---agggaatgtctattcatgtct + +a +s mr.mrrefChr5 233416 6 + 294542 ctagcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380025 6 + 636262 ccagcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 379234 6 + 647215 ctagcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 194535 6 - 647215 ctagcc + +a +s mr.mrrefChr5 233422 18 + 294542 catcttttaatggtgtcg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322385 18 + 636262 cgtctcttaatggtgttg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380031 18 + 636262 catcttttattgttgtcg +s simRat_chr6.simRat.chr6 379240 18 + 647215 catcttattatgttgtca +s simRat_chr6.simRat.chr6 194541 18 - 647215 catctcttaatagtgttg + +a +s mr.mrrefChr5 233440 2 + 294542 tt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322405 2 + 636262 tt +s simRat_chr6.simRat.chr6 194559 2 - 647215 tt + +a +s mr.mrrefChr5 233442 13 + 294542 ggttttcgttttg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322407 13 + 636262 ggtgactgttttg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380049 13 + 636262 gtttttcatgttg +s simRat_chr6.simRat.chr6 379258 13 + 647215 aattataattttg +s simRat_chr6.simRat.chr6 194561 13 - 647215 ggttttcgttttg + +a +s mr.mrrefChr5 233455 2 + 294542 tg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380062 2 + 636262 tg +s simRat_chr6.simRat.chr6 379271 2 + 647215 tg +s simRat_chr6.simRat.chr6 194574 2 - 647215 tg + +a +s mr.mrrefChr5 233457 5 + 294542 atctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380064 5 + 636262 atttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 379273 5 + 647215 atctc +s simRat_chr6.simRat.chr6 194577 5 - 647215 atctc + +a +s mr.mrrefChr5 233462 17 + 294542 tgtaattctgttatgga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322420 17 + 636262 tgtatatctgttaagga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380069 17 + 636262 tgtaattctgttataga +s simRat_chr6.simRat.chr6 379278 17 + 647215 tgtgattctattatgga +s simRat_chr6.simRat.chr6 194582 17 - 647215 tgtaagtatgttatgga + +a +s mr.mrrefChr5 233479 1 + 294542 c +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322445 1 + 636262 t +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380086 1 + 636262 c +s simRat_chr6.simRat.chr6 379295 1 + 647215 c +s simRat_chr6.simRat.chr6 194599 1 - 647215 c + +a +s mr.mrrefChr5 233480 7 + 294542 ctgtgca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380087 7 + 636262 ctgtgca +s simRat_chr6.simRat.chr6 379296 7 + 647215 ccatgaa + +a +s mr.mrrefChr5 233487 38 + 294542 ggcaaaatgttactcttaattggtatattcacagttgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380120 38 + 636262 ggcaaaatgttactcttaattggtatattcacagttgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 379303 38 + 647215 ggcgacattcctgtcttaattggtaggtacacacctgg + +a +s mr.mrrefChr5 233525 49 + 294542 gtggcaacagtcttttgttcctatgacccacacagcatgttatggacca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380160 49 + 636262 gtggcaacagtcttttgttcctatgacccacacagcatgttatggacca +s simRat_chr6.simRat.chr6 379341 49 + 647215 gtggtaacgggcttttgatcctttggcccacacaGCAcattatggacct + +a +s mr.mrrefChr5 233574 43 + 294542 gtgaaaccaggcccctcttagatgaataagtggcagaattttt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322446 43 + 636262 gtgataccaggctcctctcaaatgagtaagtggcaaaATTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380209 43 + 636262 gtggaaccaggcccctcttagacgattaagtggcagaatcttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 379390 43 + 647215 gagaaaccaggcacctcttacatgaataagtggcagaatcttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 194600 43 - 647215 gtgaaaccaggcccctctcagatgaataagtggcaaaattttt + +a +s mr.mrrefChr5 233617 6 + 294542 gtccca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380252 6 + 636262 gtccca +s simRat_chr6.simRat.chr6 379433 6 + 647215 gtccca +s simRat_chr6.simRat.chr6 194643 6 - 647215 gtccca + +a +s mr.mrrefChr5 233623 2 + 294542 ag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380258 2 + 636262 ag +s simRat_chr6.simRat.chr6 194649 2 - 647215 at + +a +s mr.mrrefChr5 233625 14 + 294542 tggcaggtttgcag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380260 14 + 636262 tggcaggtttgcag +s simRat_chr6.simRat.chr6 379439 14 + 647215 tggtatgtttggtt +s simRat_chr6.simRat.chr6 194651 14 - 647215 tggcaggtttgcgg + +a +s mr.mrrefChr5 233639 4 + 294542 gtgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380280 4 + 636262 gtgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 379453 4 + 647215 gtgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 194665 4 - 647215 gtgg + +a +s mr.mrrefChr5 233643 83 + 294542 taatagtctcttgctcctttgccccacacaatgcctttgacttaataatatcccactcccgtttgttgattcgcagcctcgca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380284 77 + 636262 taacaatctcttgctcctttgccccacactatgctttttacttaataatatcccactcccctttgttgattcacagc------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 379457 83 + 647215 taatggtctattgctcctttgccctacacaatgccattgacttaataatatcccactcctgtttgctgattcgcagcccctca +s simRat_chr6.simRat.chr6 194697 82 - 647215 ttat-gtttgttgctgctttgacccacacagtgtctttgacttaatgatatcaaactcacgtttgtcaattcgtggttttgca + +a +s mr.mrrefChr5 233726 16 + 294542 ttcgcatctttttttg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380361 16 + 636262 ttcacatcttttctgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 379540 16 + 647215 ttcgcagctgtttttg +s simRat_chr6.simRat.chr6 194792 16 - 647215 tttgcaactttttttg + +a +s mr.mrrefChr5 233742 25 + 294542 gagtgttaagcatcaagggctcttc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322489 25 + 636262 CAATGTCAAACATCAAGGCCCTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380377 22 + 636262 gagtg---ggcatcaagggttcttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 379556 25 + 647215 gtgtgttgagcattataggttcttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 194808 25 - 647215 gcatgttaagcataaaaggctcttc + +a +s mr.mrrefChr5 233767 4 + 294542 agta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380399 4 + 636262 agta +s simRat_chr6.simRat.chr6 379581 4 + 647215 agta +s simRat_chr6.simRat.chr6 194833 4 - 647215 agtt + +a +s mr.mrrefChr5 233771 10 + 294542 cctatatctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322514 10 + 636262 CATGTAACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380403 10 + 636262 gctatatctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 379585 10 + 647215 gctatatctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 194837 10 - 647215 cctatatctt + +a +s mr.mrrefChr5 233781 3 + 294542 gga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380413 3 + 636262 gga +s simRat_chr6.simRat.chr6 194847 3 - 647215 gga + +a +s mr.mrrefChr5 233784 59 + 294542 tgttggtgatccctaagttgtcctctataatcttaacgctccttggcagctgagagtgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322524 44 + 636262 TG----------ctaatctgtcctctaaaatcttaacgtcccttggcggctgag----- +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380416 1 + 636262 t---------------------------------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 379595 59 + 647215 tgtttgtgatccctcagttgtccgctattatcttaacgctctttagcagctgagagttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 194850 59 - 647215 tagtggtgttccctaagttgtcctctatgatcttaacactccttggcagctgacagtgt + +a +s mr.mrrefChr5 233843 53 + 294542 atggcacctggcatttacttcagtgtagggagtgagaaatggggtaagtgttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 379668 53 + 647215 atggcatgtggggtttacttcattgtagggagtgagaaattggttgagtggtc +s simRat_chr6.simRat.chr6 194909 53 - 647215 agggcacctggcattcacttcagtgtagggagtgagaaagggggcaagtgtcc + +a +s mr.mrrefChr5 233896 68 + 294542 tcctggcagatagaaggccaattcccctagcaccaggtattgaagagggactcctgtggccattgatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380417 58 + 636262 ----------tagaaggtcaatttccctagcaccagttattgaagagggactcctgtggccattgatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 379724 68 + 647215 tccaggcagatgaatggccaattcccctggcatcacgtattgaagaggggcttctggggctattgatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 194962 68 - 647215 tcctggcaggtagaaggccaattcctccagtaccatgtattgaaaaaggaatcctgtgcccattgatt + +a +s mr.mrrefChr5 233964 97 + 294542 tcttcctgatgtatggaagatagagcaattggaaagttgagggatgaacttgattttcagcaagtccatcttattgccatgggctatgggccgaatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322568 97 + 636262 ctttcctgatgtatggaagatggagcaattagaaagttgaaggatgaacttgaatttcagcaagaccatcttattgccatggcatatgggccaaatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380475 90 + 636262 tcttcctgatgtatggaagatagagcaatggggaag--gagggatagccagga-----ggggtagccatcttactgccaagggctatgggccgaatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 379792 97 + 647215 tcttcctgatgtatggaagatagagcaatgggaaagtttagggatgaacttgattttcaacaagtccatcttaccgccatgagctaagggctgaatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 195030 92 - 647215 tcttcctgacgtgtggaagatagagcaattggaaagttgagggatgaacttgatttttgacaagtccatcttattgccatggtcta-----tgattc + +a +s mr.mrrefChr5 234061 34 + 294542 tcgtggtaccagtatggtgttgttttactgagag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322665 34 + 636262 ttgtagtatcagaatggtgttgttccagtgagtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380565 34 + 636262 tcgtggcaccagtatagtgctgttttgctaagag +s simRat_chr6.simRat.chr6 379889 34 + 647215 tcgtggtaccagtatagtgtagttttactgagag +s simRat_chr6.simRat.chr6 195123 34 - 647215 ttgtgggaccagaatggtgttgttttaatgagag + +a +s mr.mrrefChr5 234095 7 + 294542 tcactca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322699 7 + 636262 ttgctta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380599 7 + 636262 tcactca +s simRat_chr6.simRat.chr6 379929 7 + 647215 tcactca +s simRat_chr6.simRat.chr6 195157 7 - 647215 tcgctcg + +a +s mr.mrrefChr5 234102 18 + 294542 atagtagaatttgttatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322706 18 + 636262 atagtagaatttgtgatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380628 18 + 636262 atggcaaagtccattcca +s simRat_chr6.simRat.chr6 379936 18 + 647215 atagtagaatttgttata +s simRat_chr6.simRat.chr6 195164 18 - 647215 atagtggaatttgtggtc + +a +s mr.mrrefChr5 234120 28 + 294542 cgggaggattatgccgccagctcaattc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322724 28 + 636262 tgggaggattatgccaccggcccgatgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380649 28 + 636262 cagaagaatcaagcaggcagcataaccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 379954 28 + 647215 cgggagggttatgctgccagctcaattc +s simRat_chr6.simRat.chr6 195182 28 - 647215 tgggagggttatgccgctggcttgattc + +a +s mr.mrrefChr5 234148 25 + 294542 ttctggcttggaacggactttgcca +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322764 25 + 636262 ttctggcttggaacagacttcgctg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380677 13 + 636262 tcctggatcacaa------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 379982 25 + 647215 ttttggcctggaatggactttgcca +s simRat_chr6.simRat.chr6 195210 25 - 647215 ttctggcttggaacggactttgcca + +a +s mr.mrrefChr5 234173 89 + 294542 ggctcgcttttttggttccaattaaacctaacgattgtttttttacactcagtgaacagggccatagggcttttaatagtagtcctatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322821 89 + 636262 ggctcgctttttcggttccaagtaaacctaactcttgtctctttatactcagggaacagggccatagggcttttaatagtagtcctatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380690 64 + 636262 --------gttcta---ctatttgaacttgacaat--tttttttacactcagtaaacagggccacagggcttttgat------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 380007 89 + 647215 ggctcccttttttggttccaattaaacctgacgattttttttttacactcagtaaacagggccacagttcttttaatagtagttctttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 195235 83 - 647215 ------cttttctggttccaagtaaacttaatgatggtttttttacattcagtgaacagggccatcagacttttgatcgtagtcctgtt + +a +s mr.mrrefChr5 234262 24 + 294542 agacctacaggtgagtttgtgtaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322910 23 + 636262 agacctacagttgagattggata- +s simRat_chr6.simRat.chr6 380111 24 + 647215 agacttataggtgagtttgtgtaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 195318 24 - 647215 agctctacaggtaagtttgtgtaa + +a +s mr.mrrefChr5 234286 43 + 294542 taacatcttcaagttcacgttaagtcgatcgactcacgagcat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322933 42 + 636262 -aacatcttcgagttcacattaagttgatcgactcatgagcat +s simRat_chr6.simRat.chr6 380135 43 + 647215 taacatctctaagttcatgttaagccagtcaacccacaagcat +s simRat_chr6.simRat.chr6 195345 43 - 647215 taacatcttcaagttcacgttcagtcgatcgactcacgagcat + +a +s mr.mrrefChr5 234329 10 + 294542 tcaatattct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322975 10 + 636262 tcaatactct +s simRat_chr6.simRat.chr6 380178 10 + 647215 tcaatattct +s simRat_chr6.simRat.chr6 195402 10 - 647215 ttaatattct + +a +s mr.mrrefChr5 234339 50 + 294542 tgggattaattatcgtttctctgattagctttaatagtgggttttatatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322985 50 + 636262 tgggattaattatcgtttctctgattagctttaatagtgggttttatatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 195412 50 - 647215 ttggattatttattgtttctctgataagcttttatagtggattatgtatt + +a +s mr.mrrefChr5 234389 6 + 294542 taataa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323035 6 + 636262 taataa +s simRat_chr6.simRat.chr6 195463 6 - 647215 taataa + +a +s mr.mrrefChr5 234395 17 + 294542 gcagatcctttatgtct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323041 17 + 636262 gcagatcctttatgtct +s simRat_chr6.simRat.chr6 380188 17 + 647215 gcagatcatttatgtct +s simRat_chr6.simRat.chr6 195469 17 - 647215 gcagatcctttatgtct + +a +s mr.mrrefChr5 234412 2 + 294542 tg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323058 2 + 636262 tg +s simRat_chr6.simRat.chr6 195486 2 - 647215 tg + +a +s mr.mrrefChr5 234414 38 + 294542 aatcaactgtgtctctagaaatttgattcgtttagaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323060 22 + 636262 agtcaactgtgtctctataaat---------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 380205 38 + 647215 aatcaactgggtctttagaaatttcatccgcttagcat +s simRat_chr6.simRat.chr6 195488 38 - 647215 aatcaactgcgttcctagaaatttgattcgtttagaat + +a +s mr.mrrefChr5 234452 43 + 294542 tgattgttgaaggtgattcactcatgctctgactgctttgctg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380754 22 + 636262 ---------------------tcatgctctcagtgccttgttg +s simRat_chr6.simRat.chr6 380243 43 + 647215 tgattgttgaaggtgattcacgcatgctctgactgctttgctg +s simRat_chr6.simRat.chr6 195543 43 - 647215 tgattgtcgaaggtgattcactcatgctctgactggtttgctg + +a +s mr.mrrefChr5 234495 17 + 294542 attcttctacaagaaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380776 17 + 636262 attcttctacaagaaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 380286 17 + 647215 attctactacaagaaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 195589 17 - 647215 atttttatacaaaaaag + +a +s mr.mrrefChr5 234512 14 + 294542 tctcagattttaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323082 14 + 636262 tttcagattttaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380793 14 + 636262 tctcagattttaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 380303 14 + 647215 tctcagattttaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 195606 14 - 647215 tttcacattttaat + +a +s mr.mrrefChr5 234526 1 + 294542 a +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323096 1 + 636262 a +s simRat_chr6.simRat.chr6 195620 1 - 647215 a + +a +s mr.mrrefChr5 234527 32 + 294542 ccttaattttgtaactagagacttcagctaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323097 32 + 636262 cattaattatgtaatcagagacttcagttaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380807 32 + 636262 ccttaattttgtaactagagacttcagctata +s simRat_chr6.simRat.chr6 380317 32 + 647215 ccttaattttgtaactggggactccagctaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 195621 32 - 647215 cattaattttgtagccggaaacttcagctaaa + +a +s mr.mrrefChr5 234559 45 + 294542 ttgcttatcagcttaagcaagtttccagctgctgccattggatta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323129 45 + 636262 ttgtttatcagcttaagcaagtctacagctcctgccattggatta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380839 45 + 636262 tcgcttatcagcttatgtaagtttccagctgccgccatcagatta +s simRat_chr6.simRat.chr6 380349 45 + 647215 ttgcttatcagcttaagtaaggttccagcagccaccattgaatga +s simRat_chr6.simRat.chr6 195679 45 - 647215 ttgcttatcagcttaagcaagtttccagctactgccattgggtta + +a +s mr.mrrefChr5 234604 28 + 294542 ctgaggtatactatcatatcatccgcaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323174 28 + 636262 ctgaggtaaacagacatatcatccctga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380884 27 + 636262 c-gaggtatactatcatatcatctgcaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 380394 28 + 647215 ctgaggtgtactatcgtaccatcagcaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 195725 27 - 647215 cctgggtatact-tcatatcgtccacaa + +a +s mr.mrrefChr5 234632 34 + 294542 atattgaaggttttatttcttcttcatccaattg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323290 34 + 636262 atattgaaagctttacttcttcttcatccaattg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380911 34 + 636262 atattgaaggttttatttcttcttcatccaattg +s simRat_chr6.simRat.chr6 380422 34 + 647215 atattgaaggctctatttcttcttcatccaattt +s simRat_chr6.simRat.chr6 195752 34 - 647215 atattgaaagtttcatctccccttcttccaatag + +a +s mr.mrrefChr5 234666 5 + 294542 gatac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380945 5 + 636262 tatac +s simRat_chr6.simRat.chr6 380456 5 + 647215 gatac +s simRat_chr6.simRat.chr6 195786 5 - 647215 gatac + +a +s mr.mrrefChr5 234671 100 + 294542 actgtttatctttatcctgtcgggttgtctgcaccaatagttccaggactttgttaaacagcagtggtgatatggaacagccctgccgccttttcgtgcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323324 100 + 636262 cctgcttatcttgatcctgttgggttgtctgcaccaatagctccaggattttgttgaagagcagtggtgatatggaacagccctgcctcctttttgtgcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380950 100 + 636262 accgtttatctttatcctgtctggttgtctgtgccaatagttccaggactttgttaaacagcagcgatgatatggaacagccctgctggcttttcgtgtc +s simRat_chr6.simRat.chr6 380461 100 + 647215 attgtttatctttaacctgtctggttgtctgcgccaatagttccaggactttgttaaacagcagtaatgatatagaacaaccctgctggcttttcacacc +s simRat_chr6.simRat.chr6 195791 100 - 647215 cctatttatctttatcctgtcgggctgtccacaccaatagttccaggattctgttgaacagcagcggtgatatggaaccgccctgccaccttgtcatgcc + +a +s mr.mrrefChr5 234771 73 + 294542 ctttaaagggaagacttcaagcctgcatccatttactattagattgcaaatcagtttatcgtaaattgctcta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323424 73 + 636262 ctttaaaagaaagacttcaatcctgcacccatttactattagattgcaagccggtttatcgtaaattgccctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381050 72 + 636262 ctttaaagggaagac-tcaagcctgcatccatttattattagattgcaaatcagtttgtagtaaattactcta +s simRat_chr6.simRat.chr6 380561 73 + 647215 ctttaaagggaaggcttcaagcctgcatacatttactctgagatcgcagatcagttaattgtatattgctcta +s simRat_chr6.simRat.chr6 195903 73 - 647215 ttttaaagggaagacttcaagcctgcatccatttactattagattgcacgtgggtttatcgtaaattgcccta + +a +s mr.mrrefChr5 234844 18 + 294542 acaacattgacgtagttg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323497 18 + 636262 acaacattgacgtagttg +s simRat_chr6.simRat.chr6 195976 18 - 647215 acaacattgatgtagttg + +a +s mr.mrrefChr5 234862 32 + 294542 ccctcgatgcacaactcattgaggatcattag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323515 32 + 636262 ccctcgacacacaactcattgaggatcattag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381122 32 + 636262 cccttgatgcaccatgcattgaggatcgttgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 380634 32 + 647215 ccctcaatgcacaactcattgaggatcattag +s simRat_chr6.simRat.chr6 195994 32 - 647215 cccttgatgcataactcattaagaatccttag + +a +s mr.mrrefChr5 234894 27 + 294542 catgcaatcctgcttagtctgttcgat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323547 27 + 636262 catgtgatcctgctctgcctgtacggc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381155 27 + 636262 catgcaatcctgcttagtctgtttgat +s simRat_chr6.simRat.chr6 380666 27 + 647215 catgcagtcctgtttagtctgtttgat +s simRat_chr6.simRat.chr6 196026 27 - 647215 catgtaatcctgctccacctgttcgat + +a +s mr.mrrefChr5 234921 2 + 294542 tg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323574 2 + 636262 cg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381182 2 + 636262 tg +s simRat_chr6.simRat.chr6 196053 2 - 647215 gg + +a +s mr.mrrefChr5 234923 14 + 294542 gcccgacatctctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323576 14 + 636262 gcccgtcatctctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381184 14 + 636262 gcctgacctctctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 380693 14 + 647215 gtcaaacctctctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 196055 14 - 647215 gcccattatctctt + +a +s mr.mrrefChr5 234937 15 + 294542 tccaatgttaagatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381198 15 + 636262 tccaatgttaagaca +s simRat_chr6.simRat.chr6 380707 15 + 647215 tccaacgttaagatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 196069 15 - 647215 tccaatgtcagaatc + +a +s mr.mrrefChr5 234952 34 + 294542 atgtgattctcctgattggcccggttaaccggtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323590 34 + 636262 atgtgattcttctgattggcccggttaataggtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381213 34 + 636262 ctgtgattctcctgattggccaggttatctgttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 380722 34 + 647215 ctgtgattctcctgattgccccagttagccattt +s simRat_chr6.simRat.chr6 196084 34 - 647215 atgtgcttctcccgattagcccagttaaccagtt + +a +s mr.mrrefChr5 234986 6 + 294542 gtatta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323624 6 + 636262 gtatta +s simRat_chr6.simRat.chr6 196118 6 - 647215 gtatta + +a +s mr.mrrefChr5 234992 4 + 294542 catt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323630 4 + 636262 tgct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381247 4 + 636262 cata +s simRat_chr6.simRat.chr6 380756 4 + 647215 catt +s simRat_chr6.simRat.chr6 196124 4 - 647215 catt + +a +s mr.mrrefChr5 234996 14 + 294542 agcaggttttcata +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323634 14 + 636262 agcaggttttcata +s simRat_chr6.simRat.chr6 196128 14 - 647215 aataggtatttgta + +a +s mr.mrrefChr5 235010 3 + 294542 tct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323648 3 + 636262 tct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381251 3 + 636262 tcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 380760 3 + 647215 tct +s simRat_chr6.simRat.chr6 196142 3 - 647215 tct + +a +s mr.mrrefChr5 235013 20 + 294542 tgggccatcctggcattcct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381254 20 + 636262 tgggccatgctggcattccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 380763 20 + 647215 tgtgccatcctggcagtact +s simRat_chr6.simRat.chr6 196145 20 - 647215 tgagccaccctggcattcct + +a +s mr.mrrefChr5 235033 6 + 294542 agggtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381274 6 + 636262 agggtg +s simRat_chr6.simRat.chr6 196165 6 - 647215 ggggtg + +a +s mr.mrrefChr5 235039 28 + 294542 aattctaagtgatcataatgtattagct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381280 28 + 636262 aagtctaagtcatcataatgtattaact +s simRat_chr6.simRat.chr6 380783 28 + 647215 aattctaagtgatcataatgttttggct +s simRat_chr6.simRat.chr6 196171 28 - 647215 aattctaagtgatcataaggtatcagct + +a +s mr.mrrefChr5 235067 5 + 294542 cactg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381308 5 + 636262 ttctg +s simRat_chr6.simRat.chr6 380811 5 + 647215 cactg +s simRat_chr6.simRat.chr6 196202 5 - 647215 caatg + +a +s mr.mrrefChr5 235072 14 + 294542 atgatttgttggta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381313 14 + 636262 atgatttgttggta +s simRat_chr6.simRat.chr6 380816 14 + 647215 acaatttgatggtg +s simRat_chr6.simRat.chr6 196218 14 - 647215 atgatttgctggta + +a +s mr.mrrefChr5 235086 88 + 294542 atttcgattggcaagtatttggttcaaattaccgtcttggcgaatcaaaagcccaggtctagctgtctgttgtatcatcatggcttta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381329 78 + 636262 atttt-attgac-----ttta--tcaaaagacagactttccgactcatagacccagg--ggagtgttttttgaacctttataccttta +s simRat_chr6.simRat.chr6 380830 88 + 647215 gtttcagctggcaagtatttggttcaaattctcgtcttggcaaattgaaagcccaggtctagctcgctgtcgtatcatcgtggcttta +s simRat_chr6.simRat.chr6 196232 88 - 647215 atttcgattggcaagtattcggttcaggttgccatcttgggcaatcaaaagcacaggtctagctttctgttgtctcatcatggcctta + +a +s mr.mrrefChr5 235174 25 + 294542 ctcgaattggatatcagtactatgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381409 25 + 636262 ctcaaattttattttagtaatttgc +s simRat_chr6.simRat.chr6 380918 25 + 647215 cttgacttggatatcagtacgatgc +s simRat_chr6.simRat.chr6 196320 25 - 647215 ctcgatttggatatcagtacaatgc + +a +s mr.mrrefChr5 235199 4 + 294542 agct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381434 4 + 636262 tgct +s simRat_chr6.simRat.chr6 380993 4 + 647215 agct +s simRat_chr6.simRat.chr6 196345 4 - 647215 agct + +a +s mr.mrrefChr5 235203 35 + 294542 cttgcagaaatgacactagcttctcttcgtgtagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381449 30 + 636262 cttgcatgagta-----agctcttactcatgtagc +s simRat_chr6.simRat.chr6 380997 35 + 647215 cttgcagatatgacactaacttctctttgtgtagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 196349 35 - 647215 ctagcagaaatgacaccagcatctcttcgtatcgt + +a +s mr.mrrefChr5 235238 12 + 294542 ttgaataaaatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381652 12 + 636262 ttgaatgaattg +s simRat_chr6.simRat.chr6 381032 12 + 647215 ttagagaaaatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 196384 12 - 647215 ttgtaaaatatt + +a +s mr.mrrefChr5 235250 2 + 294542 aa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381664 2 + 636262 aa +s simRat_chr6.simRat.chr6 196396 2 - 647215 ac + +a +s mr.mrrefChr5 235252 4 + 294542 tggt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381666 4 + 636262 tggt +s simRat_chr6.simRat.chr6 381044 4 + 647215 cagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 196398 4 - 647215 tggt + +a +s mr.mrrefChr5 235256 29 + 294542 aggccaggtagtttcttcgttggcctgtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381673 13 + 636262 gggccagatgatt---------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 381048 29 + 647215 aggccaggtagtttcttcatcggcccgtt +s simRat_chr6.simRat.chr6 196402 29 - 647215 aagctgggtagtttcttagttggcctgtt + +a +s mr.mrrefChr5 235285 45 + 294542 aataaatgcctttacttcaggaccaattacgggtctgttgaggga +s simRat_chr6.simRat.chr6 381077 45 + 647215 aataagtgcctttacttcagggccaattatgggtctgtttaggga +s simRat_chr6.simRat.chr6 196432 45 - 647215 aataaatgcctttacttcaggaccaattacgggtctattgaggga + +a +s mr.mrrefChr5 235330 36 + 294542 tcaataccttctttattagaacagggcagagcgccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 381122 36 + 647215 tcaataacttctttattagcacagggcagagcgccc +s simRat_chr6.simRat.chr6 196478 36 - 647215 tctataccttctttattgaaacggggtagaggacac + +a +s mr.mrrefChr5 235366 37 + 294542 gaatcaaagaagtcattatctaccaagttaatgtcct +s simRat_chr6.simRat.chr6 381161 37 + 647215 gaatcagagaaatcattatctactaagttaatgtcct +s simRat_chr6.simRat.chr6 196514 37 - 647215 gaatcaaagaagtcaatatctaccaagttaaaattct + +a +s mr.mrrefChr5 235403 64 + 294542 tagcgtgaaggggatggtggtggtgcttaataatcatttggacatctgcggggtcggttgtttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 381214 64 + 647215 tagcgtgcaggggatggtggtgttgcttaataatcatttgaacatctgcagggtaagttgtttt +s simRat_chr6.simRat.chr6 196551 64 - 647215 tagcatgaaggggttggtgatggggcttaatactcatttggacgtctgcggggtcggttgttat + +a +s mr.mrrefChr5 235467 84 + 294542 ccctggttgagttctcaagacatcaatatgattcttcttgcatatctctttaacgatgctcaataaaggccggtcaattgtatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 381281 84 + 647215 ccctggatgatttctcaagacatcagtataattgttcttcaatatttcttttactatgctcaacaaaggctgatcgattgtatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 196615 84 - 647215 ccctggttgagttcttaagacatcaatatgaatctttttgcaattctctttaacgatgctcaataaaggccggtcaattctatt + +a +s mr.mrrefChr5 235551 46 + 294542 gactttatcaaaaaactcgctctttgatttgttgaccttggggaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 381366 46 + 647215 gactttatcaaaagaccgactcttggactcattgagcttggggaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 196699 46 - 647215 gactttatcgaaaaactcgctctttgatttgttgaccttgggtaat + +a +s mr.mrrefChr5 235597 98 + 294542 gttttctgagtctttatacctttaagctcaaaatttattttagttatttgctgctgccaactcacccttgaatgagtgagctcttgctcatgcagctc +s simRat_chr6.simRat.chr6 381418 98 + 647215 attttctgagtctttatacctttaagctcaaattttaatctagttatttgctgctgccaactcacccttgcatgagtaagctcttgctcaggcagctc +s simRat_chr6.simRat.chr6 196745 98 - 647215 gttttctgggtctttatacccttaagctcaaaatgtattttagtcacttgctgttggcgagtcgcccttgagtgagtgagctcttgcttgtgtagctc + +a +s mr.mrrefChr5 235695 45 + 294542 ctgtgtcgcagccatatcatccaggcgtaattttatagagctctg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381686 45 + 636262 ctgtgtcgcagccatatcatccaggcgtaattttatagagctctg +s simRat_chr6.simRat.chr6 381674 45 + 647215 ctgtgtcacagccctggcctccaggctttactttatagagctctg + +a +s mr.mrrefChr5 235740 21 + 294542 tctgcaaggcaattagagatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381731 21 + 636262 tctgcaaggcaattagagatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 381720 21 + 647215 tctccaaggcaattagtgatg + +a +s mr.mrrefChr5 235761 104 + 294542 tcagagttcttacgtttgtgcaccagggctttgctccctgcgatgtagccacttcttaaatatgcacgatgtggagcagcaaagaataagtacccagcataaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381752 104 + 636262 tcagagttcttacgtttgtgcaccagggctttgctccctgcgatgtagccacttcttaaatatgcacgatgtggagcagcaaagaataagtacccagcataaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 381744 104 + 647215 tcagagttcttacattcacgcactagagctttgctcactacgatgtagctaatttttaagtatgcatgatatggagcaccaaagaatgagtacccagattaaat + +a +s mr.mrrefChr5 235865 73 + 294542 ggggtgaaaagtctcattgatctcaatcaactcagcttggtgaaaacctgtattcagctcagggtatgtagtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381862 73 + 636262 ggggtgaaaagtctcattgatctcaatcaactcagcttggtgaaaacctgtattcagctcagggtatgtagtg +s simRat_chr6.simRat.chr6 381848 73 + 647215 ggggtgaaaagtctcattgatcgcaatcaagtcagtttggtgtaaaactgcaatcagctcgtggtatgtattg + +a +s mr.mrrefChr5 235938 75 + 294542 cttcatgttgatctatccacagtcgatagtggcgtgttgacatcacccttgacccactgtatgtgagtgtgggcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381935 75 + 636262 cttcatgttgatctatccacagtcgatagtggcgtgttgacatcacccttgacccactgtatgtgagtgtgggcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 381927 75 + 647215 ctttgtgttgatctattcacagtcgatagtggcgagttgacatcacccttgactcactgtatgtgagtgtgggcc + +a +s mr.mrrefChr5 236013 5 + 294542 gtttc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323651 5 + 636262 Gttac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382010 4 + 636262 tttt- +s simRat_chr6.simRat.chr6 382002 5 + 647215 gtttt + +a +s mr.mrrefChr5 236018 143 + 294542 tgaggttacatcccaggcctcaaaagccttcacacacctgtgttgggtttatgcacattcaatacagttgatttttctgattgtatagaaccttctagcgttatggattgcccttcccggtcccttctcacactagcagattt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382014 143 + 636262 tgaggttacatcccaggcctcaaaagccttcacacacctgtgttgggtttatgcacattcaatacagttgatttttctgattgtatagaaccttctagcgttatggattgcccttcccggtcccttctcacactagcagattt +s simRat_chr6.simRat.chr6 263299 143 - 647215 tgaagttagatcccatgcctcaaaagcctttgcacacctgcgttgggtttgtgcatgttcaatacagttgttttttctgattgtgtagaatcttcaaccattattgttcgcccctctcggtcccctctcgcactagcagattt + +a +s mr.mrrefChr5 236161 21 + 294542 aacctaaagtctgccttgtcg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382157 21 + 636262 aacctaaagtctgccttgtcg +s simRat_chr6.simRat.chr6 263443 21 - 647215 aacccaaagtctaacttgtca + +a +s mr.mrrefChr5 236182 100 + 294542 tttttcttttctcctttcccaataatctggtgttccttctcctagcccttcacctcgagcttacgagtgtgcctgcatgcaaggtgcatcttatggatgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382178 100 + 636262 tttttcttttctcctttcccaataatctggtgttccttctcctagcccttcacctcgagcttacgagtgtgcctgcatgcaaggtgcatcttatggatgt +s simRat_chr6.simRat.chr6 263488 100 - 647215 ttcttcttttctccttttccatgaatctggtggttgttctcccaaaccttcaccttgagtttacagatttgccggcatgtaaggtgcatcttttggatgt + +a +s mr.mrrefChr5 236282 37 + 294542 tgagcaatactgacttctatagctaatctgtgtggct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382278 37 + 636262 tgagcaatactgacttctatagctaatctgtgtggct +s simRat_chr6.simRat.chr6 263617 37 - 647215 tcagcatccctgatttttatagctactctgtgtctct + +a +s mr.mrrefChr5 236319 97 + 294542 caaagattttattcccatgaccttttgctcaacgaatttactcatatgactggggcgaatatggtgacatatgggtgggattagctcatggcacatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382319 97 + 636262 caaagattttattcccatgaccttttgctcaacgaatttactcatatgactggggcgaatatggtgacatatgggtgggattagctcatggcacatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 263654 97 - 647215 caaagagttcaatcctatgacctcttgatcaaagaggttaatcctatgaccagggtgaatttggtcacatacacgtggggttcattcatggcacatg + +a +s mr.mrrefChr5 236416 19 + 294542 gtctgggttctgttggatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382452 19 + 636262 gtctgggttctgttggatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 263751 19 - 647215 gtctgggtttagttgtacc + +a +s mr.mrrefChr5 236435 107 + 294542 ttgtcttgcaataagtggttacaatctagaaacatagactgaatgtaaaaagcctcatgtaggcataaaaagtccctgcctaatgaacaataccaacccctaattac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382477 107 + 636262 ttgtcttgcaataagtggttacaatctagaaacatagactgaatgtaaaaagcctcatgtaggcataaaaagtccctgcctaatgaacaataccaacccctaattac +s simRat_chr6.simRat.chr6 263770 107 - 647215 ttgtcttgccataagtggttacaatccagaaacattgacagaatgtaaagtgccccatgtaggcacagagaatccccgtctaataaatgataccaacccctagttag + +a +s mr.mrrefChr5 236542 50 + 294542 atttggcacattgatgcaatagatgatagggactcctttgtgtgttcaag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382585 50 + 636262 atttggcacattgatgcaatagatgatagggactcctttgtgtgttcaag +s simRat_chr6.simRat.chr6 263877 50 - 647215 atttggcatattgatgcaataaatgatagggattcttatgtatatttaag + +a +s mr.mrrefChr5 236592 67 + 294542 ttatttctccaagagtaggcctgcccagaacaaaatcccacaaaccttactcgtcagtgaaatattt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382645 67 + 636262 ttatttctccaagagtaggcctgcccagaacaaaatcccacaaaccttactcgtcagtgaaatattt +s simRat_chr6.simRat.chr6 263927 67 - 647215 ttatttctccaagagtaggcctgcctggtacaaagtcctacaaggcttgcttatctgtgaaatattt + +a +s mr.mrrefChr5 236659 49 + 294542 gatattcccttcactaacaaagctgagcttacctggttatggaattttg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382712 49 + 636262 gatattcccttcactaacaaagctgagcttacctggttatggaattttg +s simRat_chr6.simRat.chr6 263995 49 - 647215 gatatttccttcactaacaaagctgagccaacctggctgtggaattttg + +a +s mr.mrrefChr5 236708 18 + 294542 ggtctgacatttttttcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382763 18 + 636262 ggtctgacatttttttcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 264044 18 - 647215 ggtctgacatttttttcc + +a +s mr.mrrefChr5 236726 248 + 294542 tcaagatattgaagaagggtccccattttgccttttgatcaatgggatctgttaagtggtctgttactcacagtttccctttccttgtcatctagtcctcttctgttggagcacttagcacaccctgcacctatacctggacattggctcctttgattatcgtacaaaaattctgttgtataatgtcacggagctcttcctccaattttgcaccattccacctttcttgatccggcacccctaagagt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382782 248 + 636262 tcaagatattgaagaagggtccccattttgccttttgatcaatgggatctgttaagtggtctgttactcacagtttccctttccttgtcatctagtcctcttctgttggagcacttagcacaccctgcacctatacctggacattggctcctttgattatcgtacaaaaattctgttgtataatgtcacggagctcttcctccaattttgcaccattccacctttcttgatccggcacccctaagagt +s simRat_chr6.simRat.chr6 264062 248 - 647215 taacgatattgaagatgggtccccattttggctttcaattgacggtatctgttaaatagtctgatactcattgtttccctttagtggtcatctagtcctcttccgttggagcgcttaacatagcctgcacttttgcctggttacagggtcctttaattatcgcagaagaattcttttgtataatgtcctggagctcattctccaatttcatgctgttctgcctttctttatccggcacctctgagagt + +a +s mr.mrrefChr5 236974 47 + 294542 cacaagttgggcctctggtagtcccaaatctcttggggcccatgctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383038 47 + 636262 cacaagttgggcctctggtagtcccaaatctcttggggcccatgctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 264310 47 - 647215 cacaagttgggcctttgatagtcccagctctcttgagacccatgctt + +a +s mr.mrrefChr5 237021 14 + 294542 atcctgtgttaggg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383085 14 + 636262 atcctgtgttaggg +s simRat_chr6.simRat.chr6 264358 14 - 647215 attccgttttaggg + +a +s mr.mrrefChr5 237035 22 + 294542 ctatttccttagaatctctctc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383099 22 + 636262 ctatttccttagaatctctctc +s simRat_chr6.simRat.chr6 264377 22 - 647215 ctttctccttgaaaactctctc + +a +s mr.mrrefChr5 237057 71 + 294542 agttcattttggtttccccgtccctggtaatcagatcctccctctgttcaaaatggtcaaaaaggctactg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383123 71 + 636262 agttcattttggtttccccgtccctggtaatcagatcctccctctgttcaaaatggtcaaaaaggctactg +s simRat_chr6.simRat.chr6 264399 71 - 647215 agctcgttttcatctccccatccccagtaaccagatcctccctgctgtcaaaatggtcagaatagctactg + +a +s mr.mrrefChr5 237128 40 + 294542 aaactcctgcaatcataatgtgtcttaggcaagcttgtct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383194 40 + 636262 aaactcctgcaatcataatgtgtcttaggcaagcttgtct +s simRat_chr6.simRat.chr6 264639 40 - 647215 AAactcctgcaagcataatgtgtcttaagcagccttgtct + +a +s mr.mrrefChr5 237168 40 + 294542 gtttagttagctcttgagataatctttagtcttcttaact +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383237 40 + 636262 gtttagttagctcttgagataatctttagtcttcttaact +s simRat_chr6.simRat.chr6 264679 40 - 647215 gtatagttatctcttgagaggatctttagtgttcttactt + +a +s mr.mrrefChr5 237208 44 + 294542 tttgttgaagctgtggaggtgcctagcattcgctcatatctctt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383297 44 + 636262 tttgttgaagctgtggaggtgcctagcattcgctcatatctctt +s simRat_chr6.simRat.chr6 264719 44 - 647215 tttgtcgaagctgtggaggtatctgtcattcgctcgcatctctt + +a +s mr.mrrefChr5 237252 19 + 294542 caaagcttgacgtagtatg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383343 19 + 636262 caaagcttgacgtagtatg +s simRat_chr6.simRat.chr6 264763 19 - 647215 caaagcttggcgtagttca + +a +s mr.mrrefChr5 237271 73 + 294542 gaatggttagagtctttctccctcaatttgtcagagtcattaccggtcttggtcatgtctactaagggtgcgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383365 73 + 636262 gaatggttagagtctttctccctcaatttgtcagagtcattaccggtcttggtcatgtctactaagggtgcgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 264782 73 - 647215 gagtagctaaagtctttctccctcaatttgtcaaagtcattaccagccttggtcttgtctactaaaggtgggg + +a +s mr.mrrefChr5 237344 65 + 294542 gcaaaggcacagcgccattgatctatgaattgttacagtagtgtgctcagcccatgtgctcattc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383438 65 + 636262 gcaaaggcacagcgccattgatctatgaattgttacagtagtgtgctcagcccatgtgctcattc +s simRat_chr6.simRat.chr6 264871 65 - 647215 ccaaaggtgaagcaccattgttgtttgaattgtcacagttgtgtcctcagcccatTTGCCCATCC + +a +s mr.mrrefChr5 237409 13 + 294542 acaagttacagtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383505 13 + 636262 acaagttacagtg +s simRat_chr6.simRat.chr6 264936 13 - 647215 ACAAGTTACAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 237422 37 + 294542 tgacTGTGCATAGTGGACATGATGTGGCCATGCATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383545 37 + 636262 tgacTGTGCATAGTGGACATGATGTGGCCATGCATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 264949 37 - 647215 TGACTGTGCATAGTGGCCATGGTGGGGCCATACATAG + +a +s mr.mrrefChr5 237459 39 + 294542 CAGTCATGGAGGGGGGGTGGAGCAGGTTGGATAAGGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383583 39 + 636262 CAGTCATGGAGGGGGGGTGGAGCAGGTTGGATAAGGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 264986 39 - 647215 CGGCCGTGGTGGGGGGGTGGAGCAGGTTGGATAAGGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 237498 48 + 294542 CACATTATTAATCCCATCTTAATCCCCATGCATACATATCGTTAGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383622 48 + 636262 CACATTATTAATCCCATCTTAATCCCCATGCATACATATCGTTAGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 265027 48 - 647215 CCCACTCTTAATCCCACCTTAATCTCTATGTATACATATCCTTAGATA + +a +s mr.mrrefChr5 237546 102 + 294542 TGTGGTTCCTGAATTGCGACATGTCACTCTACACTCTCATAGAGAACAACAGTCACGATGTCTGTGATAGTTCCTCGGCCTACGATTGCGGGGCTTACGCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383670 102 + 636262 TGTGGTTCCTGAATTGCGACATGTCACTCTACACTCTCATAGAGAACAACAGTCACGATGTCTGTGATAGTTCCTCGGCCTACGATTGCGGGGCTTACGCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 265076 102 - 647215 TGTGGTGCCTGCATATTGTCAGGTCGCTCTACACTCTCACAAAAAGCAACTGTTACAGTGTCCACGATCATTTCTCAGCCTACAATTCCGGGGCTCACCCGT + +a +s mr.mrrefChr5 237648 30 + 294542 AGATTTTTCAGTGGTCAAATACTCTAGctg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383773 30 + 636262 AGATTTTTCAGTGGTCAAATACTCTAGCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 265178 30 - 647215 AGATTTTTCAGTGGTCAAATACTCTAGctg + +a +s mr.mrrefChr5 237678 362 + 294542 aACTTGTAGTGGGGCTTCACTATCTCCTCTGAGAGCCGTTGAGGTTGGTAAGAACATCTTCATTTCTTGATATTGAGACATAGCAGCAAAAAAAGCTATGCTTACTTTTAAAGGCACCAGTACGTCCATATCCAGTAGTCTATTAGTGTTAGTCCATGATAGGTCAGACATGTTTACTTGAGGGATTGGGATGAGGGGATCTTCATTTCCATAACTTATAGAAGTGTGACATTTTTATAAGAGAGGGGTGTAGGGCTCACTCACATTCGAGTGAAATCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTCCTAACCTTGTAGGGGCCTTTTTTGCAACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383805 362 + 636262 AACTTGTCGTGGGGCTTCACTATCTCCTCTGAGAGCCGTTGAGGTTGTTGAGAACATCGTCATTTCTTGAGATTGGGACATAGCATCAAAGAAAGCTATGCTTACTTTTAAGGGCACCAATACGTCCATATCCAGTAGTCTATTAATGTTAGTCCATGAGAGGTCAGACATGTTAACTTGAGGGATTGGGATGAGGGGATATTCATTTCCATAACTTATAGAAGTGTGACATATTTACAAGAGGGGGGTGTAGGGCTGACTCACATCCGAGTGAAATCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTCCTTACCTTGTAGGGGCCTTTTTTGCGACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 383917 362 + 647215 aACTTGCAGTGGGGCTTCACGCTCTCCTCTGAGAGCCGTTCAGGCTGGCAAGAATATCTTCATTTCTTGATATAGAGACATAGTAGCAAAAAAAACTATGCTTACTTTTAAAGGCACTAGTGTGTCCATATCCAGTAGTCTATTAGCTTTAGTCCATGATAGGTCAGACATGTTTACCTCAGGGATTGGGATGAGGGGATCTTCGTTTCCATAATTTTTAGAACTGTAACATTTTTATAAAAGAAGGGTGTAGGGATCACTCACATTCGAGTGAAGTCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTGTTATCCTTTTAGGGGCCTTATTTACAACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 238040 34 + 294542 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGATGTGACATTACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384167 33 + 636262 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGATGCAACATTGCC- +s simRat_chr6.simRat.chr6 384280 34 + 647215 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGACGTGAACTTATTT + +a +s mr.mrrefChr5 238074 306 + 294542 ATTATGAGCCCTTGTTCTGTTCCACTTAGGAAGATTCCTGAATATGTTACAGATTGTATCCATGTTGTAGCACCTACTTACCATCCAGCCACTAGTGAAGCAGATAAGCGAGTGTCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTTTTGTGGATGCTGTATGCAGACTTTGACTCTTTTGGCTCTTATATAATCTAGGCCCTATCCTTGTTAGAACCTATTGCAAGTGTTTTTGCGAAAAGGATTCCACCATTAGTATTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAATCTGATAGAATCAGTTTTGATCTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384200 303 + 636262 ---ATGAGCCCTTGTTTTGTTCCATTTAGGAGGATTGCTAAGTTTATTACAGACTGTATCCATGTTGTAGCACCTACTTACCATCCAGCTACTAGTGAAGCAGATAAGCGAGTGTCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTCTTGTGGATGCTACATGCAGACTTTGACTCTTTTGGCTCTTATATAATCCAGGCCCTATCCTTGTTAGAACCTATCGCAAGTGTTTTTGTGAAAGGGATTCCACCATTAGTGTTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAACCTGATAGAATCAGTTTTGATCTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 384318 301 + 647215 ATTGTACGCCCTTGTTCTTTTCCACCTAGGAAGATTCCAGAATATGTTACAGATTGTATCCATATTGTAGCACCTACTTCCCATCTAGCCCCTAATGCAGCAGATAAGCGAGTTCCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTTTTGTGG-TGCTGTATGT----TTTGACTCTTTTGACTCTTGTATAATCTAGGCCCTATCCTTACTGGAACCTCTTGCAAGTGTTTCTGCGTAAAAGGTTCCACCATTAGTATTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAATCTGATAGAATCAGTTTTGATGTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 238380 81 + 294542 AGCATTGTAATTTGACAGTTCCTCATTCACTGAGAGGACTGATGAGTGCAAACTATGTATAACCATTACTAAATTATAGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384568 81 + 636262 AGCATTGTAATTTGACAGTTCCTCATACACTGAGAAGACTGATGAGTGCAAACTATGTATAACCATTACTAAATTATAGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 384619 76 + 647215 AGCATTGTAATTTGACAGTTTTTTATTCACTGAGAGGACTG-----TGCAGACTATGTACAACCACTACTAAACTATAGCC + +a +s mr.mrrefChr5 238461 67 + 294542 GCCTTATTGATGGTATTGTATCTGGTTCATATCCTTGTCAGTTAGCTTGGGCTCTCAGTAGTGGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384650 67 + 636262 GCCTTATTGATGGTATTGTATCTGGTTCATATCATTTTCAGTTAGCTTGGGCACTCAGTAGTGGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 384695 67 + 647215 GTCTTATTGATGATATTGTATCTAGTGCACATCCTTGTCAGTTAGTTTAGGCTCCCAGTAGTGGCGT + +a +s mr.mrrefChr5 238528 35 + 294542 ATATTTCCTACATCATCAATAGAGGCATTTGTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384719 35 + 636262 ATAGTTCCTACTTCATCAACAGAGGCATTTGTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 384762 35 + 647215 TTATTCTCCACATCATCAATAGAGGCATTTCTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 238563 156 + 294542 ATAGTTATTCTGACAGGCTCCCCCATGTCTTTTGAGAATTGCCCCAGTAGTTTAAGGATTACATAGTCACAATGAGAAAAAGAAGAAAGGTTGGTAAGGCCATGTTGGGAGGTTCCACGAAACCAGCTATGACATTACCTTACCTATATCAACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384754 156 + 636262 AAAGTTATTCTGACATGCTCCCCCATGTCTTTTGAGAATTGCCCCAGTAGTTTAAGGATTACATAGTCACAATGAGAAAAAGAAGAAAGGTTGGTAAGGCCATATTGGGAGGTTCCGCGAAACCAGCTATGAGTATATCTTACCTATATCAACAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 384801 145 + 647215 ATAGTTATCCTGACAG------CAATGTCTCTTGAGAATTGCCACAGTGGTTTA-GGATTACATAGTTACAATGAGAAAAAGAAGAAAGGTTGGCAAGGCCATGCTGGGAGATTCCACAACAGCAGCTATGACATTACCTTACCT----CAACAAA + +a +s mr.mrrefChr5 238719 57 + 294542 CTGGTGTACCATTGTGAACCAAACACCCTCATTAGGAGTGGTCAAGGAATGCATACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384910 57 + 636262 GTGGTGTACCATTGTGAACCAAACACCCTCATTAGGAGTGGTCAAGGAATGCATACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 384947 57 + 647215 CTGGTGTACCCTCATGAACCAAACTCCCTCATTAGGCATGGTCAAGGAATGCATCCA + +a +s mr.mrrefChr5 238776 290 + 294542 TGCCTAACAAATGCTGGCATCCTTATCACCTGGCATTCTTGTCACCACTTGAATCACAGCATTTATTCTAGCCTATCAGTATGAGTAGCTGGATGGGAATATAAGCCCCCCATAGATTTCGCGTCCTGCTGCTGGCTATATGACCATGAACCAAGTTTTGCCTCCTCAGTCAGATAGCATCTTTGACTGCGCAGTCATTTATCTATCATCTGCTTGGTGCAGAGTGGCACAAACTTAACACACGGCAGAGTCTTGTCCTTATAGAGCTGTTGGAAGGACTAGCTCATAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384967 286 + 636262 TGCCTAACAAATGCCGGCATCTTTGTCACCTGGCATTCTTGTCACCACGTGAATCACAGCATTTATTCTAGCCTATCAGTATGAGTAGCTGGATGGGAATATAAGTCCCACACAGATTTTGAGTCTTGCTGCTGGCTATAT---CATGAACCAAGTTTTGCCTCCTCAGTCAGATAGCATCTTTGACTGCGCAGTCATTTATCTATTATCTGCTTGGTGCAGAGTGGTGCAAACTTAACACACGGCAGAGTCCTGTCCTTATAGAGCTGATGGAAGGACTAGCTGATAA- +s simRat_chr6.simRat.chr6 385005 267 + 647215 TGTCTAACAAGTGCTTGCATCCTCATCACCTGGCATTCTTTTCACCACTTGAGACGTAGCAT--------------------GAGTAGCTGGATGGGAATATGAGCCCTCCATGGATTTCGCTTCCTGTTATTG-CTATATGACCATGAACCAAGTTTTTCATTCTCAGTCTGATAGCATCTATGGCTTCGCAGTCATTTATCTATCATCTGCTTGGTCCAGAATGGCACAAACTTAACACAG--CAGAGTCTTGTCCTTATAGAGCTGTTGGAAGGACTAGCTCATAAA + +a +s mr.mrrefChr5 239066 68 + 294542 CATAAAAAATCAAGCTATGTTATATGTCAAGGTTAGTGCCCCATTCTACCTAGCAACATGCCTATAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 385253 63 + 636262 -----AAAATCAAGCTATGTTAGATGTCAAGGCTAGTGCCCCTTTCTACCTAGCAACATGCCTATAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 385273 68 + 647215 CATAAAAAATTGAGCTATGTTATATGTCAATGTTAATGCCCCATTCTACCTAGTATCTTGCCTATAAA + +a +s mr.mrrefChr5 239134 459 + 294542 CTAACTGTGGTAAGCACAGGGTCACACATTAACATCATGATATCAGCAATTGGGCATGAAAAAGGATGAAAAAGAACCTTACATTTAAACATGGAGTGGAGGGAACTAGTGTATGTGTTAAAATTTCAATTTATGTGTTAGTATCGCTTTTATGCATTTTAGGACTTGACATAGTTGATTGTTAATGATAACACCTGCATTATATCTGAGGTCCCAGGTTGCAAAGCCCTTAAGTATCTGGCTTTCTACCCAGTACTCCAGTATGTGGTGTCTTCAAAGCTAATCACAAGTGTGGGTTCAAGTGACATGGGTGCTAAGCCATGGACACTAGGATAGCACAGGAGGTATCTCTGCGCCACAACAGATTCATGCATCTATGTCACCCCCCAAAAGTTAGATAATGGCCCTGTTTGGTTGGTGAACCTAGCAAAGATGAAGTTACTTACTGTGGAAGTGTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 385316 451 + 636262 CTAATTGCGGTAAGCACAGGGTCAAACATTAACATCATGATATCAGCAATTGGGCATGAAAA-GGATTAAAAAGAACCTTACATTTAAACATGGAGTGGAGGGATCTAGTGTATGTGTTAAAATATCAATTTATGTGTTAGTATCGCTTTTATGCATTTTAGGACTTGACATAGTTGATTGCTAATGATAACACCTGCGTTATACCTGATGTCCCAGGTTGCAAAGCCCTTAAGTATCTGGCTTTCTACCCAGTACTCCAGTATGTGGTGACTTCAAAGCTGATCACAAGTGTGGGTTCAAGTGACATGGGTGCTAAGCCATGGACACTAGGATAGCACAGGAGGTATCGT-------CAACAGATTCATGCATCTATGTCACCCCCCAAAAGTTAGATAATGGCCCTGTTTGGTTGGTGAACCGAGCAAAGATGACGTTACTTACTGTGGAAGTGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 385342 410 + 647215 CTAACTGTGGTAAGCACACGGTCACACATTAACATCATGATATCAGCAATTGGGCATGAAAAAGGATGAAAAGGAACCTTACATTTAAACATGGAGTGGAGGGAACTAGTCTGTGTGTTAAAGTTTCAATCTATGTGTTAGTATGGTTTTTGTGTATTTTAGGACTTGTCATAGTTGATTGTTCATGATAACACCAGCATTAAATCTGAGGTCCCAGGTTTCAAGAACCTTAAGTATCTGGCTTTCCACCCAGTACTCCAGTATGTGGGGTCTTCAAAGCTACTCACA-GTGTGGGTTCAAGTGACGCGGGCGTAACGCCATGGACACTGGGATAGTACAGGAGGTACCTCTGCGCCACAACAGATTCATGCATC------------------------------------------------CTCACAAAGATGAAGCTACTTATGGGGGAAGAGTGC + +a +s mr.mrrefChr5 239593 249 + 294542 AAAGAAATACAAAAACTGTCTCCAGGGGTATCGTTAAAAAATAAAAAAAATGGTCATAAGAGACTTACATTTAAGTATGATGCAAATAGTTCACCTCAGGCATGTTAACCCCCCAGATTGGTTTTTAAGATTTAGTTTGGGACTCTTGGTGAATTACCACAGTAAGTGACGGTTGATTAGACTAAGTTCCATACCTCTACTATTACAAGTTGAGACCCCTAGTGCATGTGGATGTATTATTGACCCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 385778 249 + 636262 AAAGAAATACAAAAACTGTCTCCAGGGGTATCGTTAAAAAACAAAGAGAATGGTCATAAGAGACTTACATCTAAGTATGATGCAAATAGTTCACCTCAAGCATGTTAACCCCCCGGATTGGTTTTTAAGATTTAGTTTGAGACTCACAGTGCATTCCCACAGTAAGTGACGCTTGATTAGACTAAGTTCCATACCTCTACTATTACAATTTGAGACCCCTAGTGCATGAGGACTTATTATTGACTCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 385752 249 + 647215 AAGGAAATACAAAAACTGTCTCTAGGGGTATTGTTAGGAAATAAAAAAAATTGTCATAAGAGACTAACATTTAAGTATAGTGCAGGTGGATTGCCTGAGGCATGTCTACCCCCGAGATTGATTTTTAGGATTTAGTTTAGGACTCTTGGTGAATTACCACAGCAAGTGACGGTTGATTAGACTAAGATCTATACCTCTACTATTACAAGTTGAGACCCCAAGTGCATATGGATGCACTATTGACCCATT + +a +s mr.mrrefChr5 239842 94 + 294542 GAAACCTGTGAAGATGCATTTTGGTGATGGTAGTGTAGTACATGTCCAATTCTCTAGTGGGTTTGCAAGATAAGGGGATATGTGCTGGTGCTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386027 93 + 636262 GAAGCCTGTGAAGAACCATTTTGGTGATGGTAGTGTAGTACATGTCCAATTCTCAAGTGGGTTTGCAAGATAAGGGGATATGTGCTGGTGTGG- +s simRat_chr6.simRat.chr6 386002 82 + 647215 GAAACCTGTGAAGATGCATTTTGGTGGTGGTAGAGTAGTACATGTCCAACTCTCTAGT------------CAAGGGGATATCTGCTGCTGCTGC + +a +s mr.mrrefChr5 239936 268 + 294542 GACTTGGCCAACTATGGATGGATGGTACCCCCACATAATCGATGGAGTAACAGCTTTCTTTATCATCAAGCTCAGGTTGGCCCTCGGCCCCTATCAAAGTTATCATGGCAGTTTTTGTGAATATAAGTGCTGTTATCTTCTTATTGGTGGTTCCATGGTGTGGAATGCCTTACAACCAGAGTTGTCTTTGTCCTGGTTGTTGCCTCAAAATGGCTGCTTCATGGACTCACCAATACAGACAAAGTGTGCAGAACTGTTTGGCGTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386120 257 + 636262 GACTTGGCCAACTATGGAATGATGGTACCT-------ATCGATGGAGCAAGAGCTTTCTTTATCGTCAAGCTCAGGTTGGCCCTCGGCCCCTATCAAAGATATCATGGCAGTTTTTGTGAAACTGA----GGTTATCTTCTTATCGGTGGTTCCAGGATGTGGAATGCCTTCCAACCAGAGATGTCTCTGTCCTGGTTGTTGCCTCAAAATGGCTGCTTCATGGACTCACCAATACAGACAAAGTGTGCAGAACTGTTTGGCGTAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 386089 267 + 647215 GACTTGACCAACTATGGATGGATGCTACCCCCACATAATCGATGGAGTAACAGATTTCTTTATCATCAAGCTCAGGTTGGCCCTTG-CCCCTATCAAAGTTATCATAGCAGTTTTTGTGAATATAAGTGCTGATGTCTTCTGATTGGTGGTTCCATGGTGTACAATGCCTTACAACCAGAGTTGTCATTGTCCTGGTTGTTGATTCAAAATGGCTGCATCATGGACTCACTAATACAAACCAAGGGTGCAGAACTGTTTGGCATAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 240204 273 + 294542 TTGTTCTGGATTTGGGACCATCATTCTGTGCCCTGCATATCAAAACAATTCAAGTCGGCTACCCCATGCATTGAATGTTAAACCGGGCCCTTGCCAAATGAGCACTAGATGTATAAGTTGGGGTCATCCATCTCCTCCCGATAGCTAATGCCAACGCCCATTCAGCAGTCCCAAACCATATATGATTCAAAAATTTGCCCTCACCATTCATTCAAATAATGGTCAGTCTGGTGGTTCAATGTCTCCTGATTCACTGTCCAGGATGGTAGTACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386377 269 + 636262 TTGTTCTGGGTTTGGGACCATC----TGTGCCCTGCATATCAAAGCAATTCAAGTCGGCTACCCAATGCATTGAAAGTTAAACCGGGCCCTTGCCAAATGGGCACTAGATGTATAAGTTCGGGTCACCCATCTCCTCCCGATAGCTAATGCCAACGTCCATTCAGCAGTCCCAAACCCTATATGATTCAAAAATTTGCCCTCACCATTCATTCAAATAATTGTCAGTCTGGTGGTTCAATGTCTCCTGATTCACTGTGCAGGATGGTAGTACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 386357 271 + 647215 TTGTTCTGTACTTGGGACCATCATTCTGTGCCTCGTATATCAAAACAATTCAAGTCACCTACCACACGCATTGAATGGTGAACCGGGCCCTTACCAAATGAACCCTAGATGTATAAGTTGGGGTCATCCATGTCCTCCAAATAGCTAATGCCAATGCCCATCCTGCAGTTCCAAAACATACATGATTCGAAAATTTGTCCTCACAATATCTTCGAATAATGGTCAGTCTGGTGGTTCAATGTCTCCTGATTCAGAGTCCAGGATGGTAGTA-- + +a +s mr.mrrefChr5 240477 26 + 294542 TAATAGGTTATAGACGACATGCCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386647 26 + 636262 TAATAGGTTATAGATGACATGCCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 386628 20 + 647215 ------GTAATACACGACATGCCCTT + +a +s mr.mrrefChr5 240503 68 + 294542 CCACGAACAGATAGTATAGCCCTAAGCCCTAACTAAGACCTACCACATTCTTCCTGAAAATGACATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386673 68 + 636262 CCACGAACAGATAGTATAGCCCTAAGCCCTAACTACGACCTACTACATTCTTCCTGAGAATGACATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 386650 68 + 647215 CCACAAACAGATAGTATAGCCCTAAGCCCTAACTAAGATCTACCACATTGTCCCTAAAAAGGACATGT + +a +s mr.mrrefChr5 240571 493 + 294542 TATGCAGGTGGGAATTTAGCTGAGACAGACCTCCTATCAGTTTGAAGTGATGTCAAGCCTAGTAATGCCTTGCACACCTTTCGATTCTGTACTTTGCTCTTTGAGGAGGTTCTACACCTGAAGAATTCCTTCAACATGCATGGGTTGGTTGGTAGCGCAATAGAAGCAATTGTTCTCACATTAATCAAGAATTGAGGAGGAAAGTGGAACATCACAATATCATCTGCTGGCCTATTGTGACTAATGGTTGTATTTCTCCTAGCCTGCCTCACAAACACTTATCAATGGGTAGAGACCAAGAACCCATACATAGAGACCAAGAATCCATACCAAGGCTTAACAGTACGACATCTGAAGAGGCATGACTAGTAGGGTGGAATACTTATCTTCCAAAAGGCACAAATTTTTCTGTAGAACACAAGATGAATTCAGGTGGTTAAATACCAGGGGCTGCCACTAATACTAATCAGGTGGTAAAACCTGACTGCTGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386741 493 + 636262 TATGCAGGAGAGAATTTAGCTGAGACAGCTCTCCTTTCAGTCTGAAGTGATGTCAAGCCTAGTAATGCCTTGCACACCTTTCGATTCTGTACTTTGCTCTTTGTGGAGGTTCTACACTTGAAGAATTCCTCCAACATGCATGGGTTGGTTGGTAGCGCAATAGATGCAATTGTTCTCACATTAATCAAGAATTGAGGAGGAAAGAGGGACATCACAGTATCATCTGCTGGCCTATTGTGACTAATGGTTGTATTTCTCCTAGCTTGCCTCACAAACACTTATCAATGGGTAGAGACCAAGAACCCATACATAGAGACCAAGAATCCTTACAAAGGCTTAACAGGACGACATCTGAAGAGGCATGACTAGTAGGGTGGAATACTTATCTTCCAAAAGGCACAAATTTTTCTGTAGAACACAAGATGAATTCAGGTGGTTAAATACCAGGGGCTGCCACTAATACTAATCAGGTGGTAAAACCTGACTGCTGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 386720 488 + 647215 TATGCTGGTAGGAA----GCTGAGACAGACCTCCTATCAGTTTGAATTAATGTCAAGCCTAGTAAGGCCTTACATACATTTAGATTGTATACATTGCTCTTCGAGGAGGCACTACACCTGAAGAATTCCTTCAA-ATGCATGGGTTGCTGAGTTACACAATAAAAGTAATTGTTCTCACATTAACCAAGAATTGAGTAGGAAAGTGGAGCATCACCATATCATCTGCTGGCCTATTGTGACTAATGGTTGTGTTTCTACTATCCTGCCTCACAAACACTTATCCATGGGTAGAGACCAAGAATCAACACATTGGGACTGAGAATCCATACCAGGACTGAACAGTACGACAACTGAAGAGGCGTGACTAGTAGGGTGGAATACTTAGCTTTAAAGAGGCACTAACATTTCTGGAGAATACAAGGTGGATTCAAATGGTTAAATACCAGGGGCTACCACTAATACCAGTCAGGTGGTTAAACCTGCCTGCTGAGC + +a +s mr.mrrefChr5 241064 335 + 294542 CATCTCTAACATTCATGCATTATACTATGATTGCGATTAGCAGTTATTACTAGTCCATTCCAAAATGAATTTGGCAATTCCATCTACACTGCCCCCTTATTGTGTTCCAGGCTAATCGGTTCAATTCTCTGCAGAAAATTTCTCAAAAACTTATAAAATTAACCATCCTTACAAAGAATGACCTTTAAAGCCTGGCTTAAACTCCCATTGCCAGAGGCTCAGCTTCAACTATTGGAAGAACACCTAAATAATTGAACAATTGGTATATATACCTATTTGTGCCCACTATATTTAATCAGCAGTGATCAGTTGATTCACTATAGAAGGTGAGAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387234 332 + 636262 CATCTCTAACATTCATGCATTATACTATGATTGCGATTAGCAGTTATTACTAGTCCACTCCAAAATGAATTTAGCAATTCCATCTACACTGCCCCCTTATTGT---CAAGGCAAGTTGGTCCAATTCTCTGCAGAAAATTTCTCAAAAACTTATAAAATTAATCATCCTTACAAAATACAACATTCAAAGCCTGGCTTAAACTCCCGTTGCCAGAGGCTCAGCTTCAACTATTGGAAGAACATCTAAATAATTGAACAATTGCTATATATACCTATTTGTGCCCACTATGTTTAATCAGCATTGATCAGTTGATTTGCTATAGAAGATGAGAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 387209 335 + 647215 CGTTCCTTACATTCATGCATTATATTATGATTACAAGAAGGAGGTATTACTAGTCCATTCCAAAATGAATGTGGCTATTCCATCTACACTGCCCCCTTACTGTGTTACAGGCTTATCGGTTCAATTCTCTGCAGAAAATTTCTCAGAGACTTATTAAATTACCCACCTTTACAAAGAATGATCTTTAGAGCCTGGCCTAAACTCCCATTGCCAGAGGCTCAGCTTTAACTATTGGAAGAACACCTAATTAATTGAACAATTGGTATATATACCTATTTGTGCCCACTATATTTCATCAGCAGTGATCAGTTGCTTCACTATAGAATGTGAGAGCC + +a +s mr.mrrefChr5 241399 9 + 294542 CCAGAAAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387568 9 + 636262 CCAGAAAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 387544 9 + 647215 CCAGAAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 241408 94 + 294542 TCAACAATCAAAAAGCATAAGGACAACTTGCAGATTTGCACATACCTATCAACCCAAAGGCTGCTGCTTTAATATTTTATGTATATAATATGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387579 94 + 636262 TCAGCAGTCAAAAAGCATAAGGACAACCTGCAGATTTTCAAATACCTGTCAACCCAAAGGCTGCTGCTTTAATATTTTATGTATATAATATGAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 387553 94 + 647215 TCAACAACCAAAAAGCATAAGTATAACTTGCAGATTTGCACATACCTATCACCTCAAAGGCTGCTGCTACAATACTTTATGTAGATATTATGAC + +a +s mr.mrrefChr5 241502 128 + 294542 CTTCATAACATATTTTGACATCTCAGGTGTAAGATGGTAGAAAGTGTGACAATGGCACCTATGATATTAATATGATTCATATAAGCAGGTTGAATTGTCCCATTGGTTGTAGAAGTTTTGCTGTCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387703 128 + 636262 CTTCATGACATGTTTCGACATCTCAGGTGTAAGATGGTACAAAGTGTGACAATGGCACCTATGATATTAATACGATTCATATAAGCCGGCTGAATTGTCCCATTGTTTGTAGAAGCTTTGTTGTCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 387647 128 + 647215 CTTCATAACATATTTTGACATCACAGATGTAAGATGGTAGAAAGTGTGACAATGGCACCTATGATATTAATATGATTCATATAAGCAGGTTGAATTGTCTCATGGGTTGTAGAAGTTTTGCTGTCAAT + +a +s mr.mrrefChr5 241630 120 + 294542 CATTTTGTTTGTGCTGCACCATCAGTGCCATTCACCTTAACCAAGTACCCTCCAATAGAACTACAACCATGTAGCCATAATGAACCATGACTACTGGCCTAAATTAGCGAGTCTGATTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387831 118 + 636262 CATTTTGTTTGTGCTGCACCAACAGTGCCATTCACCCTAACTAAGTACCCTCCAATAGAACTACACCCA-GTAGCCATGATGAACCATGACT-CTGGCCTAAATTAGCGAGTCTGATTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 387776 120 + 647215 CGTTTTGATTGTGCTGCACCATCAGTGCCATTCACCTTAACCAAGTACCTTCCAATAGAATTACAAACATGTATTCATAATGATCCATGACCATGGGCCTAAGTTAGTGAGTCTCATCAT + +a +s mr.mrrefChr5 241750 275 + 294542 CCACATAAATAACACATAGTGGTCATGATTCATTATTACAGATTGCAAATTTGGTTCAAATTCTCAATAGTGTAAACATTTTCCTGTGAGATTTAGTAATGCTATGCATGAATTGTTGCTCAGAAGGACCAGTTTAACCCTAACTGTGCTTGTTGACAGCTGGTCCATCCTATTAGTCTCCAATGTATTCCACCATACCCTTAAGGCTGTTTCTGATGGTGTTGATGACTATGGATAATTTGATTGTGTATTTAATACATATAGAGGCTTAAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 387949 242 + 636262 ---------------------------------TATTACAGATTGCAAATTTGGTTCAAATTCTCAATAGTGTAAACATTCTCCTGTGAGATTTAGTAATGCTATGCATGAATTGTTGCTCAGAAGGACCACTTTAACCCTAATTGTGCTTGTTGACAGCTGGTCCATCCTATTAGCCTCCAATGTATTCCACCATACCCTTAAGGCTGTTTCTAATGGGGTTGATGACTATGGATAATTTGATTGTGTATTTAATACATATAGAGACTGAAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 387901 271 + 647215 CCACATAAATAACACATAGTGGTCATGATTCATCATTACAGATTGCAAGTTTGGTTCAAATTCTCCATAGTGTAAACATTTTTCTGTGAGATTTGGTAATGCTATGCATGAATTGTTGC--ATCAGGACCAGGTTAACCCTAACTTTGCTTGTTGATAGCTGGTCCATCCTATTAGTCTCCAATGTATTCCACCATATCCCT--GGCTGTTTCTGACGGTGCTGATGACTATTGATAAGCTGAGTGTGAATTGAATACATATAGAGGCTTAAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 242025 65 + 294542 TTAGGCAAAATTGATTACTTGGTTAGCTCACCATCATAACAGTGGGGGAATAATAGGACCACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 388192 65 + 636262 TTAGGCAAAATTGATTACTTGGTTAGCTCACCATCATAACAGTGGGGAAATCATAGGACCACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 388172 65 + 647215 GTAAGCAAAATTGATTACTTGGCTATCTCAGCATTATAACAGTGGGAGAATAATGTAACCATATT + +a +s mr.mrrefChr5 242090 40 + 294542 GCACGCTGTAACAGTTTTATGCTGATTTCCATCCTACACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 388266 40 + 636262 GCACGCTGTAACAGTTTTATGCTGATTTCCATCCTACACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 388237 40 + 647215 GCACACAGTAACAGTTTTAGGCTGATTTCCATCCTACACA + +a +s mr.mrrefChr5 242130 557 + 294542 TGGCTTATGATGATAGCTCAAGTTATTGAGTGCTCCATAAAATCAAGTTGATGTACTTGGGAGGAATAGTTATGGCCCAACTCAGTAATTGTCACCTAATTGGCATGAATTTGTTGAATTGGTTTGTTCATGGATTGTATTTTTATGGGTGCTGGTGCATAATGTACAGCAACACTTGCCTATACATATACATTGGTCTAATAGCACAAAGTTGTTGTTACTAATAACATCCCTGAATAAGCTGTGCTTCCTGCTGTGTATCAATTTATCAAGGGAATGATAGTTTAACAATGATCCATAGAGATTCAGATTTTTTGCAGGTCCCCTGGAAGGTGTGTTACTATTTCTAATGACAGTCAGTAATCCCAGATGTTGATGGAATTGAAACTCGCATGGATGGCACCCTGTACTATAGTTTATGTACCACCATCCCATTGTAGGTCCACCACCTACATAAAAAACTGATACATTCGTTTGTCTGTTTATCACCATGTTTCAGTCATTCACTCCACTATGTCCAACAGGAGAATATTCTGTTTAACATGAGTGATATTAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 388307 554 + 636262 TGACTTATAAAGACAGCTCAAGTTATTGGGTGTTCCATAAAATCAAGTTGATGTATTTAGGAGGAATAGTTATGGCCCAACTCAGTAATTGTCACCTAATTGGCATGAATTTGTTGAATTGGTTTGTTCATGGATTGTGTGTTTATGTGTGTTGGTGCATAATATACAGCAACACTTGCCTATACATATAAATTGGTCTCATAGCACAAAAGTATTGTTACTGATAATATCCCTGAATAGGCTGTGCTTCCTGCTGTGTATCAATATATCAAGGGAATGATAGTTTTACAATGATCCG--AAGATTCAGATTTTTTGCAGGTCCCTTGAAAGGAGTCTGACTATTTCTAATGACAATCAGTAATCCCAGATGTTGATGGAATTGAAACTCGCATGGATAGCACCCTGTACTATAGTCTATGAGCCACCATCCCATTGTATGTCCACCACTTACGTAAAAAGCTGATACATTCGTTTGTCTGTTTATCACCTTGTTTCAGTCATTTACTCCACTATGTCCTACAG-AGAATATTCTGTGTAACATGAGTGATATTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 388277 555 + 647215 TGGTTTAAGATGGTGGCTCAAGTTATTGAGTGCTCCATAAAATCAAGGTAATGCACTTGGGAGGAACATTTGTGGCCCAACTCAGTAATTGCCACCTAATTGGCATGAATTCGTTGAATGGGTTTGTTCATGGATCGTATTTTCATGGATGCTTGTGCATAATGTACAGCAACATTTTCCTATACATATACATTGGTCTAATAGCAAAAGGTTGTTATTACTAATAACATACCTAAATAAGCTGTGCTTCCTGCTGTGTAACAATTTATTGAGGGAGGAATAGTTTAACAATGATCCATAGAGATTCAGATTTTT-GCAGGTCCCCTGGAGGATGTGTTGCTATTTCTAATGACAGTCAGTAATCCTAGATGTTGATGGAATTGAACCTCACATGGATGGCACCCTGTACTATATTTTATGTACCACCATCCCATAATAGGTCGACCACCTACATAAAAAACTGACACATTCATTTGACTGTTC-TCACCATGTTTCAGTCATTCACTCCACTATGTTCAACAGGAGAGTATTCTGTTTAACACGAGTGATATTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 242687 129 + 294542 TCCATGCTAGCAAAAGGGTGACATTCATGGACTCAGATCAGGGATTTTGATGCCATATCCCCTGTTTGGGTCTCTCCCATCTTGGGTCAAGCCCACATCCACTTGGCCCTTTTAGAGCTCAGTTTATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 388864 129 + 636262 TCCATGCTACTAAAAGGGTGACATTCATGGAGTCAGATCAGGGATTTTGACGCCATATCGCCTGTTTGTGTCTCTCCCATCTTGGGTCAAGCCCACATCCACTTGGCCCTTTTAGAGCTTAGTGTATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 388832 129 + 647215 TCCATGCTAGCAAAATGGTGACATACATGGACTCAGATCAGGGATTTTGATGCCATATCCCATGCTTGGGTCTCTCCCATCTTGGGTCGAACCCGCATCCATTTGGCCCTTTTAGAGCTCAGTTTATCA + +a +s mr.mrrefChr5 242816 9 + 294542 AGGTTCACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 388994 9 + 636262 AGGTTCACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 388961 9 + 647215 AAGTTCACC + +a +s mr.mrrefChr5 242825 116 + 294542 TCCCACTAAAGAAATTCTACTACCTAGTGAGTATGTAAGGCAAGGGCTATAGCTAATGTTCTGTTCCGCCTTCCATGCAATGTTTAACTGAATTCACAACTGGGAACTCAACTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389005 116 + 636262 TCCCACTAAAGAGATTCTACTACCTAGAGAACATGTAAAGCAAGGGCCATAGCTAATGTTCTGTTCTGCCTCCCATGCAATGTTTAACTGAATTCACAATTGGGAATGCAACTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 388970 111 + 647215 TCCCACTAAAGAAATTCTACTACCAAGTGAGTGTGTAAGGCAAGGTCTATAGCTAATATTC-----CGCCTTCCTTGCAATGTTTAACTGACTTCACAACTGGGAACTCAACTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 242941 55 + 294542 CTAATACCTACAACGCCAACATAATCATCAGCTGCTAGGTATGTCTTTGAGTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389121 55 + 636262 CTAATACCTACAACACCAACATAATCATCAGCTGCTAGGTATGTCTTTGAGTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 389083 52 + 647215 CTAATACCTCCAACGCCTACATAGTCATCAACT---AGGTATATCTTTGAGTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 242996 40 + 294542 GTCCTTGATCAGCTCCCTGGTGAATGCTCCCTGGTGAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389176 40 + 636262 GTCCTTGATCAGCTCCCTGGTGAATGCTCCCTGGTGAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 389137 40 + 647215 GTCCTTGATCAGCTCCCTGGTGAATGCTCCCTGGTGAACT + +a +s mr.mrrefChr5 243036 40 + 294542 TGAGTATGTCCGGGAGGACTATTCAGCAGTTCAATCATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389224 40 + 636262 TGAGTATGTCCGGGAGGACTATTTAGCAGTTCAATCATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 389177 40 + 647215 TGCGTACGTCCCGGAGGACTATTCAACAGTTCAAACAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 243076 29 + 294542 CTCAGTATTGCACACCTGTAAGTTCAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389264 29 + 636262 CTCAGTATTGCACACCTGTAAGTTCAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 389218 29 + 647215 CTTAGTATTGCACACCTCTATATTCAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 243105 27 + 294542 ATCCATTTTTTTTCTGCCACTCAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389293 27 + 636262 ATCCATTTTTTTTCTGCCACTCGGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 389340 27 + 647215 ATCCATTTTTTTTCTGCCACTCAGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 243132 271 + 294542 TCTTCTGCCATTTAGATAAGACCAACCTGGCATGCAAAGAGTGACTGGTATGTGATTTGAGATCTAGGACTGTGCTACCTTGTCTGTCTGCTTCCACCTTGCTTGTAGTTGTCATGACGACGTCACCCCTTGATATACTTCAATAATAGATTTAATATTCACTTCAGTCTTTCCCTTCAGCCTAAAAGCTTCTCAGAGTTCAACACTGTTTTCTCTACTGTAAATACCCTGCCACCTATTTGTTTGGCTCTGGCTACCATGTGTTCAAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389320 271 + 636262 TCTTCTGCCATTTAGATAAGACCAACCCAGCATGCAAAGAGTGACTGGTACGTGATTTGAGATCAAGGACTGTGCTACCTTGACTGTCTGCTTCCACCTTGTTTGTAGTTGTCATGACGACGTCACCCCTTGATATACTTCAAGAATAGATTTAATATTCACTTTAGTCTTCCCCTTCAGCCTAAAAGCTTCTTAGAGTTCAACACTGTTTACTCTACTGTAAATACCCTGCCACCTGTTTGTTTGGCTCTGGCTACCATGTGTTCAAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 389381 250 + 647215 TCTTTTGCTGTTTAAATAAGATCAGCCTGGCATGCAAAGAGTCACAGATATGTGAATTGGGATCTAGGACTGTACCACCTCTTCTGTCTGGTTTCACCTTGCTCGTAGTTGTCATTATGATGTCACCCCTTGATATACTTCAATAATAGATTTAATATTGACTTCAGTCTTTCCCTTCTGCCTAAAAGCTTCTCAGAGTTCAACTCTGTTTTCTCTACTTTAGATACCCTGCCACCTATTTGTTTAGCTT--------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 243403 181 + 294542 AGTTGAGTCTGAGAAGTCATTCTAAGATACTATTTATTGAACATGGGTGAATTCTCCAAAAGTCAGTTTAATTCTCTGTCACTCATGTGCTCCTGCTGTGAAATGATGGTGCTGATGGTGATCCATGCTGTGGAACAATGGGGCTCATGGTGTGCTACATCCAGAACTGCCCAATGCTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389594 181 + 636262 AGTTGAGTCTGAGAAGTCATTCTAAGATACTATTTATACAACATGGGCGAATTCTCCAAAAGTAAGTTTAATTCTCTGTCACTCATGTGCTCCTGCTGTGAAATGATGGTGCTGATGGTGATCCATGCTGTGGAACAATGGGGCTCATGGTGTGCTACATCCAGAACCGCCCAATGCTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 389631 181 + 647215 AGTTGAGTCTGAGAAGTCATTCTAAGATATTATTTATTGGATTTGGGTGAATTCTCCAAAGGTCAGTTTAATTCTCTGTCACTCATGTGCTCCTGCTGTGAAATGATGGTGCTGATGGTGATCCACGCTGCAAAACAGTGGTGTTCGTGGTGAACTACATCCAAGACTGCCCAACGCTCTC + +a +s mr.mrrefChr5 243584 325 + 294542 AGTTCTTGGTCGTAGGTGCACTCAATTCTTGTTTGTGACTTCCCTTTTTTGGTGGAGTTACTGCACTTTGTAATTCTAACATATGTTAAGAGCTGGCAGGCTATGACAATATGTACTGGCCATTTGGAAAAGGTCTGTCAACGATCCTCTAGCTACAATGATTTCTGATCCTAATTAACCCAACAATGACATTACTTTTATTAAGATGACATAACAAGAGAGGAGACTGCAATTCCTTGGATGGTTTGATAGAGATCACGAATTGTTCAGCGGTCCAGCTCACCAGCTTCAACCACCATCTGAGTGATGTACACATGAGAGATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 389775 325 + 636262 AGTTCTTGGTCGTAGGTGCACTCAATTCTTGTTTGTGACTTCCCTTTTTTGGTGGAGTTACTGCACTTTGTAATTCTAACATATGGTAAGAGCAGGCAGACTATGACAATATGTACTGGCCATTTGGAAAAGGTCTGTGAACGATCCTCTAGCTACAATGATTTCTGATCCTAATGAACCCAACAATGACATTACTTTTATTAAGATGACATAACAAGAGAGGAGACTGCAGTTCCTTGGATGGTTAGATAAGGATCACGAATTGTTCAGCGGTCCAGCTCACCAGCTTCAACCACCATCTGAGTGATGTACACATGAGAGATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 389813 301 + 647215 AGTTCTTGCCCTTAGGTGCAC-AAATTCTTGTTTGTGACTTCCCTTTTTTGGTGG--------------GTAATTCTAATATGTGTTAAGAGCTGTCAGGCTATGAGAATATGTACTGGACATTTGCAAAAGGTCTGTCAATGATCCTCTAGCCTCAATGATTTC----CCTAATTAATCCAACAATGACATTACATTTATCAAGATGACATAACAATAGA-----CTGCAATTCCTTGGGTGGTTTGATTGATGTCACAAACTGATCAGCAGTCCAGCTCACCTGCCTAAACCACCATCTGAGTGATGTACACATGAGGGACAG + +a +s mr.mrrefChr5 243909 265 + 294542 AGTAAGTCCTTTGGACTATAACTTCATTCTACATGTATGCTGTAGGTGGCATATAATCCTTGGTGCTCTGAGGCATTGTATTTCCTGCCTATGGCTAGATTATTGGTACTTCCAGTATATTTCCATTCTATGGCTAGATTCTTGGTACTTCCAGTACTAGGAGGCTAATATTATTGGTCCATATGGGTAGCTAGATGAGGCACAAGTGGGCAGGCTGATGAGCCACAATGTGTGAAGCTCAAGATTATGCACTGATGCCCTCAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 390100 265 + 636262 AGTAAGTCCTTTGGACTATCACTTCATTCTACATGTATGCTGCAGGTAGCTTATAATCCTTGGTGCTCTGAGGCATTGTATTTCCCGCCTATGGCTAGATTATTGGTACTTCCAGTATATTTCCATTCTATGGCTAGATTCTTGGTACTTCCAGTACTAGGAGGCTAATATTATTGGTCCATATGGGTCGCTAGAAGAGGCACAAGTGGGCAGGCTGATGAGCCACAATGTGTGAAGCTCAAGATTATGCACTGATGTCCTCAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 390118 262 + 647215 AATAAGTCCTTTGGATTATAACTTCACTCAACACGTAT-CTGTAAGTGGCATATAATTCTTGGCACTCTCAGGCATTGTATTTCCTGC--ATGGCTAGATTCATTGTACTTCCAGTATATTTCCTTCCTATGGTTAGATTATTGGTACTTCCAGTACTAGGATACTAATATTATTGGTCCATATGGGTAGCTAAATGAGGCATAGGTGGGCAGGCTGATGGGCCACAGTGTGTTGAGCTCAAGATTGTACACTGATGCCCTCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 244174 249 + 294542 ATTAGGTGTAGAAGTTAAATCACATAATTCAATTACCATACTGCTAGGGCACTGAAGTATGCCCAGAAAACCCATTACATGTGCTTTTTCTAGGGATGGCTCTACATACACAAGAGTATGTTTGGCTTGTTTCAACCCTAGAAATGTAATAATTAATGAATGCCCACATGTACCCAAGACTGAAATCAGTACCAATTCTTTCCTGTAAAGCTGTAATAATCTTTTTGGATAGGAAGGTCTGAAAAGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 390369 247 + 636262 ATTAGGTGTAGAAGTTGAATCACATAGTTCAATTACTATACTGCTAAGGCACTGATGTATGCCCAGAAAACCCAATACATGTGCTTT--CTGGGGCTGGCTCTATATACACAAGAATATGTTTGGCTTGTTTCAACCCTAGAAATGTAACAATTAACGAATGCCCACATGCACCCAAGGCTAAAATCAGTACCAATTCTTTCCTGTAAAGCTGTAATAATCTTTTTGGATAGGAAGGTCTGAAAAGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 390380 248 + 647215 GTCAGGCGTAGAAGTTAAGTCACGTAATTCAATTACCATACTGCCAGAGTACTGAAGCATGCTGGGAAAACCCATT-CATGTGATTATTCTACGGATGGCTCTACATACACAAGAGTATGTTTGGCTTGTTTCAACCCTTCAAACGTAATAATTCATGAAAGCCCAGATATACCCAAGATGGAAATCAGTATCAATTCTTCCCTGTAAAGCTGAAATAATCATCTTGGATAGGAAGGCCTAAAAAGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 244423 25 + 294542 GTGTACCCCAACTCATAAACCTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 390707 25 + 636262 GTGTACCCCAACTCATAAACCTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 390628 24 + 647215 GGGAATGCCAACTGATAAACCTTG- + +a +s mr.mrrefChr5 244448 356 + 294542 ATTCCACTGGACTCATAGGGAACATGTAAAATGCAGGCAAAATATGGGTAAGTTACATGCTAGGTTTCCAACTACTAGCATCTGTGCATCAATACTATGTGTTCCTACTATCTCCCCAGATATGATGGAAAACTCTAAAGCAGAGAACTTGCTGGAGACCAAATACCAATACAACCCTTCTGCAGACCATAGGTGTTCACTTCTATGCAAGGGCAAGCTGGTCCAGAATGATTTTTAGGACTATGGGACATCTGTAATATGTTTATGCGTGAGGGGGACTTAGGCTTCTTTGTAGTAGTCATTAGGATGGAGATGATTCTAGTGTACAATGTATATTGCGCCAACACAGGCTCCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 390733 356 + 636262 ATGCTGCTGGACTCATAGGAAACATGTAAAATACAGGCAAAATATGGGTAAGTTACATGCTAGGTTTCCAACTACTAGCATCTGTGCGTCAATACTATGTGCTCCTACCATTTCCCCACATATGATGGAACACTCTAAAGCAGAAAACTTGCTGGAGACCAAATACCAATACAACCCTTCTGCAGACCATAGGTGTTCACTCCCATGCAAGGGCAAGCTGGTCCAGAATGATTTTTAGGACTATGGGACATCTGTAATATGTTTATGCGTGTGGGGGACTTAGAGTTCTTTGTAGTAGTCATTAGGATGGAGATGATTCTAATGTACAATGTATATTGCGCCAACACAGGCTCCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 390652 354 + 647215 ATTCCACTGGACTCATAGGGAACATGTAAAATGCAGGCAACATGTGGGTAAGTTACAAGCTAGGCTTCCAATTAGTAGCATCTGTGCATCAATACTATGTGTTCCTACTATCTCTCCAGATATGATGGAAAAATCTAAAGCAGAGAACTTGGTGGAGACCAAACACCAATCCAACTCTTCTGCAGACCATAGGTGTTCATTTGTATGCAAGGGTGAGGTGGTCCAGAATAATTTTTATGACTATAGGACATCTATAGTATTTTTATGTATGAGAGGGACTTAGGCTTCTCTGTAGCAGTCATTAGGATGAAGATGATTCTAGTGTCCAATGTATGTTGCATCAACACAGGC--TCC + +a +s mr.mrrefChr5 244804 179 + 294542 AACCAGTGCTCTGCAACTTCTGTGCTTGACATTGACTAGACTTGAACAGTTCACTTGTTGCTGCCCAAGAGCAACTTACTACTACACACTATAACTTGTTAATGAGAGCCAGTCAATCTCTACTTCCAAGCTCAGTATATAAATAAATGTTTCTCATAGGGCCTGCATGAAAAATCACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391089 177 + 636262 AACCAGTGCTCTGCAACTTCTGTGCATGACATTGAATAAACTTGAACAGTTCACTTGTTGCTACCCAAGAGCAACTTACTACTACACACTACAACTTTTTAATGAGAGCCAGTCA-TCTCTACTTCCAAGCTCAGTATATAAATAAATGTTTC-CATAGGGCCAGCATGAAAAATCACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 391007 178 + 647215 AACCAATGCTCTGCAACTTTCGTGTTTACCATTGACTAGGCTTGAACAGTTCACTTGTTACTGCCCAAGAGCAACTTACAACTACACACTATGACTTGTTAACGAGAGCCAGTCAATCTCTCCTACCAAGCCCAGTATATAAA-AAATGTTTCTCATAAGGCCTGCATGAAACACCACA + +a +s mr.mrrefChr5 244983 134 + 294542 CGCAATGCCAGCTTTCCTATGTGTTTCCCCTATTAATTGCCTCTTTTCCTCATTCTTTATTAAATGTATGATTAAGCAACACATATGCATGAGAATAAGACTTTGTTTCCTAATAGCACGTCATTGGCTGTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391266 117 + 636262 CGCGATGATGCCTTTCCTATGTGTTTCCCCTATTAATCGCCTTTTTCCCTCATGCTTTACTAAATATATGATTCAGCAACACATATGCATGAGAGTAAGATTTTGTTTCTTAATAGA----------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 391186 134 + 647215 TGCAATGCCAGCTTTCCTATGTGTTCCCCCTATTAATTGCCTCTTTTGCTCATTCTATATTGAATGTATGATCAAACAACGCATATGCATGAGAATAAGACTTTGTTTCCTAATAGCACGTCATTGGCTGTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 245117 34 + 294542 TGGTGGTATCTAGGCAAAATTAACCTTGGCTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 391322 34 + 647215 TGGTGGTATCTAGGCAAAATTAACCTTGGCTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 245151 10 + 294542 TCTGGGAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391383 9 + 636262 -CTGGGGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 391357 10 + 647215 TCTGGGAACT + +a +s mr.mrrefChr5 245161 108 + 294542 AAGTTGACCCTGGGAATGATCTTGAGCATCATGATCTAGTACGTGTGGCCACACTGTAGGTACTAATTAGCTATTACTGCACTTAATTTATTAAGCCTGGCAAGGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391394 108 + 636262 TAGTTGACCCTGGGAATGATCTTGAGCATCATGATCTAGTACGTGTGGCCACACTGTAGGTACTAATTAGCTATTACTGCACTTAATTTATTAAGCCCGGCAAGGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 391367 108 + 647215 AGGTTGACCCTAGGACTGAACTTGAGTATCATGATCTAGTACGTGTGACCAGACTGTAGGTACTAATTAGCTATCACTGCACTTAATTTATTAAGCTTGGCAGGGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 245269 195 + 294542 TGTCATACACTTTTATGGCATACTAGTTACAGACTAGAACCACTCCTCGTGGCTTACTTGGGGTTAGTTGGGGGTGATTCACTTGACATTATCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACATATTTGCTCCACACGCGACTTGCCTGAAAATGTAAGGAATACAATTAAAACAATATAGCTACCAATGGGCACTTTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391511 191 + 636262 TGTCATACAC----ATGGCATACTGGTTACAGACTGGAACCACTCCTCATGGCTTACTTGGGATTAGGTGGGGGTAATTCACTTGACATTACCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACGTATTTGCTCCACACACGACTTGCCTGAAAATGTAAGGAATACAATTAAAACGATATGGCTACCAATGGGCACTTTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 391475 195 + 647215 TGTCTTACGCTTTTATGGCTTACTAGTTACAGACTAGAACCACTCCTGGTGGGATACTAGGGGTTAGTTGGGGGTGACTCACTTGTCATTATCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACACACTTGTTCCACACGCTACTTGCCAGAATGTGTAAGGAATACAATTAAAACACTATAGCTACCAATGGGCACCTtgc + +a +s mr.mrrefChr5 245464 54 + 294542 TGAGGGTGTCTAGGCCATTTGCATTGGGATCTATTGCTTATATCCTGCTTAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391702 54 + 636262 TGAGGATGTGTAGGCCGTTTGCATTGGGATCTATGGCTTATATCCTGCTTACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 391875 54 + 647215 TGGGGGTGTCTAGGCCATTTGAGTTGGGATCTATTGCTTATATCATGCTTCAAA + +a +s mr.mrrefChr5 245518 284 + 294542 TAATAAGAAAGCATCATGCATGCAGTAAGGGATCATACTACATTACACATAGCAAGATGGAGTATTGACTCCCTTTATTTGATTAGGCCATCTGAAGTCAACACACCAGACAGGCAGTACTTGAACTAGAAGCTTTACAAATTCTGCTTCTTAGTGCACGGTGACGGGTCTGGCAAGCGAGACACTCCTGATCTTGGTTGCTACATGATAGCGCTTACCCACGACTCCGTCTCATACAACGACGAAAAGTAATGGGCGTTCGGTCTAGGAATTTTTCCAGGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 391756 284 + 636262 TAATAAGAAAGCATCATGCATGCAGTAAGGGATCATACTACATTACACATAGCAAGATGGAGTATTGACTCCCTTTATTTGATTAGGCCATCTGAATTCAACACGCCAGACAGGCAGCACTTGAACTAAAAGCTTTACAGATTCTGCTTTTTAGTGCCCGGTGACGGGTCTGGCAAGCGAGACACTCCTGATCTTGGTTGATACAGGATAGCGCTTACCTACGACTCCGTCTCATACAACGACGAAAAGTAATGGGCGTTCGGTCTAGGAATTTTTCTAGCGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 391931 282 + 647215 TAGTAGGAAATCATCATAAATGCAGTAAGTGATCATACTACATTGCACATAGCGAGATGGAGTACTGTCTCCCTTTGTTTGATT-GGCCATCTGAAGTCAACACACCAGACGGGCAGTACTTGAACTAGAAGCTTTAAAAATTCTGCTACTTAGTGCACGGTGAGGGGTCTGGCAAG-GAGACACTTCTGATCTTGGTTGCTACATGACAGAACCTATCCACGATTTCGTCTCATACAACGACGAAAAGTCATGGGCGTTCGGTCTAGGAGTTTTTCCGGGAGC + +a +s mr.mrrefChr5 245802 51 + 294542 GAATACTTCAACCAAAAAGAGCTGAAGGCGCGGAGGTTATAGACAGCAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392040 51 + 636262 GAATACATCAACCAAAAAGAGCTGATGGCGCGGAGGTTATAGACAACAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 392227 51 + 647215 AGATACTTCAATCAAAAGGAGCTGAAGGCGCGGGGGTCATAGACAGCAGAG + +a +s mr.mrrefChr5 245853 129 + 294542 CACAGACATGACCACTGGGTCACAGCTGCTAGGGTTCAACCATTTCAACACATAGTCCCCATCACAGATTATCTGCATCTCAAATCGTCGACACCTAATTTCCGGGTGGCACTCCTTCTTGGAGCACTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392092 129 + 636262 CACAGACATGACCACTGTGTCACAGTTGCTAGGGTTCAACCATTTCAACACATAGTCCCCGTCACAGATTATCTGCATCTCAAATTGACGACACCCAATTTCTGGGTGGCACTCCTTCTTGGAGCACTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 392278 129 + 647215 CACGGACATGACTGCTGGGTCACAACTGCTTGGGTTCAACCATTTCAACACATAGTCCCCATCACAGATTATTTGCATCTCAAATCGTCGACACCTAATTTCCGGGTGGCACTCCCTCCTGGGGCACTC + +a +s mr.mrrefChr5 245982 100 + 294542 GAACCCTCCGAGTCAGCCATGCCGATTTTCTGATGACGCAATACACCCGGTGTCCAAGGCTTCGTGTGCGTGAATTGGCTCACCGTGGGGATTGCCCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392221 100 + 636262 GAACCCTCCGAGTCAGCCATGCCGATTTTCTGATGACGCAATACACCCGGTGTCCAAGGCTTCGTGTGCGTGAATTGGCTCACCGTGGGGATTGCCCCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 392415 100 + 647215 GCGCCCTCCAAGTCTACCGGGCCGATTTTCTGACGACGCGACACATTTGGGGTCCAAGGCTTCGTACGAGTGAGTTGGCTCACCGTGGGGCTCGCCCCCC + +a +s mr.mrrefChr5 246082 8 + 294542 CCCTTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392321 8 + 636262 CCCTTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 392516 8 + 647215 CCCCTAGT + +a +s mr.mrrefChr5 246090 184 + 294542 AAAAGCAAGCTCTGGTAAGGTCTGTAAATTACCCTTGAGTGAACTAGAACAGGTAGAATGAACAGGTAGTATAGAACTGTGCAATGAAAAAAGAATTTTTGAGTGCCAATTGTTGTCCTTCAGTCTTGAAAGACATGCATTAGTAAGGATACTCCTCTTCCTCTGTGTTCTACATCCAGAGGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392348 184 + 636262 AAAAGCAAGCTCTGGTAAGGTCTGTAAATTACCCTTGAGTGAACTAGAACAGGTAGAATGAACAGGTAGTATAGAACTGTGCAATGAAAAAAGAATTTTTGAGTGCCAATTGTTGTCCTTCAGTCTTGAAAGACATGCATTAGTAAGGATACTCCTCTTCCTCTGTGTTCTACATCCAGAGGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 392524 184 + 647215 AAAAGGATTCTGTGGTAAACACTGTATATTATCCTTGGGTAGAATAGAACAGGTAGAATGAACAGGTAGTATAGGACTGTACAATGAAAACAGAATTTCTCAGTGCCAAATGTGGTCCATCAATTTAGGAAGACATGCATTAGATAAGATACTATTGCGCCTCTGTGTCCTATATCCAGATGGG + +a +s mr.mrrefChr5 246274 129 + 294542 ATGAAGTGAGGAGCAAAGCCAAACACATAGTACTTTGATTCTGTGGACCTTGTTGATTCCAAATTAGCATGGCTAATCACATTGTCCCCAATCCCATTGTTCCCATTGAGTGTTTGTATCATACATCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392532 129 + 636262 ATGAAGTGAGGAGCAAAGCCAAACACATAGTACTTTGATTCTGTGGACCTTGTTGATTCCAAATTAGCATGGCTAATCACATTGTCCCCAATCCCATTGTTCCCATTGAGTGTTTGTATCATACATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 392709 129 + 647215 ATGAAGCAAGGAGCCGAGGCAAACACATAGTACTGTGATTCTTTGGGCCTTGTTGCTTCCAGACTAGGATGGCTAATCACATTGTCCCCAACCACATTGTTCCCATTGAGTGTTTGTATAATACACCCC + +a +s mr.mrrefChr5 246403 274 + 294542 ACATTTAGCAGCCTGATTGAAAAGATGACTAACACAACTCCGAGCTTACTAAAACTTAGTAGGAGCTCCAATATTGTTAGTAGACAAGTAGGAGATTGATGTGATTGAGACTGTCAACTAATAAATAGTCATAAAATTGATGGGATGACATCCGCAGGGATTCTAGAAGAAGGATTATTGCATTCTCTCCACATTTATTGAAGTGCAAGAGGCACCATCACTAGGTGATACACTCTTTATACCCTACAATGGCTTCCTAAAATGGTTGTGGTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 392726 274 + 636262 ACATTTAGCAGCCTGATTGAAAAGATGACTAACACAACTCCGAGCTTACTAAAACTTAGTAGGAGCTCCAATATTGTTAGTAGACAAGTAGGAGATTGATGTGATTGAGACTGTCAACTAATAAATAGTCATAAAATTGATGGGATGACATCCGCAGGGATTCTAGAAGAAGGATTATTGCATTCTCTCCACATTTATTGAAGTGCAAGAGGCACCATCACTAGGTGATACACTCTTTATACCCTACAATGGCTTCCTAAAATGGTTGTGGTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 392838 274 + 647215 ACATTTAGCAGCCTGATTGAAAGGATGACTAACACAACTCTAAGCTTACTAAAACTTAGTAGGAGCTCCAATATTGTGAGTAGATATGTAGGAGATTGATGTGATTGAGACTGTTACCTAATAAATAGCCATAAAGTTGATGGGTTGACATCTGCTGGGATTCTAGAAATAGCATGCATGCATCCTCTCCACATGTATTCAACTGCAACTGGCACCATCACTAGGTGGTACACACTTTATACCCTTCAATGGCTTTCTGAAATGGTTGTGGTGA + +a +s mr.mrrefChr5 246677 9 + 294542 TCATAGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393000 9 + 636262 TCATAGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 393113 9 + 647215 TCATATGTG + +a +s mr.mrrefChr5 246686 67 + 294542 CACTATGTTAACCCTGAGCATAGCAGTAAATCCTGTTTTAGATACTATTTCACTAAGGCAAGCTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393009 67 + 636262 CACTATGTTAACCCTGAGCATAGCAGTAAATCCTGTTTTAGATACTATTTCACTAAGGCAAGCTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 393123 67 + 647215 CACTATGTTAACTCTGAGCATAGCAATAAAACCTGTTTTAAGTAATCTTGCACTGAAGCAAGCTGGA + +a +s mr.mrrefChr5 246753 59 + 294542 GACAGACAGAATAGAAAATCATGTGGCGCCATTGCATGCAGTCATACAATGTGCGCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393077 59 + 636262 GACAGACAGAATAGAAAATCATGTGGCGCCATTGCATGCAGTCATACAATGTGCGCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 393190 59 + 647215 GACAGACAGGGTGGAAAATCATGAGGTGCCATTGTATGCAGTCACACAATATGAGCAAC + +a +s mr.mrrefChr5 246812 284 + 294542 CAATGTGATGTTGCCAGTGATAGAATCACTCATAATCTCACTCACTAGCTTAGTAGTGCAATGTTTGCCTGCATAATGGGAAAAAATTATTAGAAATAGCAAAGTATAAGTTAAGTTTTATGTAGTGAAAAGGCACTGGAGTGCTACTCTCTCTTTTTGTGGATTCTCCAGTTTTTTGGGTTATTTGTTGGTTTTGTCACTGTTAGGTGGGCAGAATGCCCAGTTTACAATGTTGTGTGTATCTTAACCTAGTGATTAAGAATGGGTATGCTGGTAGGGCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393151 272 + 636262 CAATGTGATGTTGCCAGTGATAGAATCACTCATAATCTCACTCACTAGCTTAGTAGTGCAATGTTTGCCTGCATAATGGGAAAAAATTATTAGAAATAGCAAAGTATAAGTTAAGTTTTATGTAGTGAAAAGGCACTGGAGTGCTACTCTCTCTTTTTGTGGATTCTCCAGTTTCTTGGGTTATTTGTTGGTTTTGTCACTGCTGGGTGGACAGAATGCCCAGTTTACAATGTTGTGTGTGTCTTAACCTAGTGATGAAGAATGGGTATGCT------------ +s simRat_chr6.simRat.chr6 393249 284 + 647215 CAATATGGTGTTGCCAGTGATAGGATCACTCATTATCTCACTCATTAGCTAAGTAGTGCAATGTTAGCCTGCATAATGGGTGTAAATTAGTAGACATGGCAAAATATAAGTTAAGTTTTATGTAATGAAAAGGTACTAAAGTCCTACTGGCTCTTTTTGTGGACTCTCCTGTTTTTTGGGTTATTTATTGGTTTTGTCACTGTCAAGTGGGCAGAATGCCCAGTTTACAATGTTGTGCATATCTCAAACTCGTGACTAAGAATGGGGATGCTGGTAGGGCATAT + +a +s mr.mrrefChr5 247096 305 + 294542 CAACTAATCTTATCCATGGACCACATTCTGCTAAGCTCATGTCACCTCGTGTGCATGCAGCTCCTTTCTTTACCTATGGGGAATTCTAGCCCAACCAATTTCTACTTACCCCATTCTGTTGTGAATTTGGTCACATGGGATGGGTACATGTGCTTACTTCATACCTTAATTAATAATGCCACCGGTAACACTTAAGAATGCCTCTGGCAAAATTTAGCATCCAGCACAATTCATCTTAAGGCCCAATCATAGGGAGAGAAAGAAACTAGCATGGTCTATCTTAACATTGTGATCTATTCAGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393423 277 + 636262 --------CTTATCCATGGACCACATACTGCTAAGCTCATGTCACCTCGTGTGCATGCAGCTCCCTTCTTTACCTATGGGGAATTCTAGCCCAATCAATTTCTACTTACCCCATTCTGTGGTGAATTTGGTCACATGGGATGGGTACATGTGCTTACTTCA------------------TACC--TAACACTTAAGAATGCCTCTGGCAAAATTTAGCATCTAGCACAATTCATCTTAAGGCCCAATCATAGGAAGAGAAAGAAACTAGCATGGTCTATGTTAACGTTGTGATCTATTCATCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 393534 302 + 647215 CAACTAATCTTATCCATGGAGCACATTCAACTAATCTCATGTCAGCTCATGGGCATGCAGGTAGTTTCTTGACCTATGGGGAATTCTAGCTCAACCAATTCCTACTTACCTCATTCTGTTGTGAATTTGTTCACATGGGATGGGTTCATGTGCTTACTTCATACCTTAATTAATAATGCCACTGGTGACACTTAAGAACGCCTCTGGCAATGCTTAGCATCCAGCACAATTC---TTAAGGCCCAATCATAGGGAGAGAAAGAATCTAGCATGGTCTGTCTTAAGATTGTGATTTATGCAGCACT + +a +s mr.mrrefChr5 247401 228 + 294542 ATCTCTTAGGGGAAATACAACTGGACAGAGACAATATGCATATTGTTATTTTCTTATGACTATTTTTACATATCAGGCTCAACAGGAAAGAATGCCTGGGAGATGGCTGGTGCCCAATAATTGAAGATATTGTGATTAGAGAGTTAAGATTCAGATTAAGCTAGAATCTCGATCACACATAAAAATTAGAGTTACAACATCTGTACACTTCCTGCTGTTTATGTATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393736 228 + 636262 ATCTCTTAGGGGAAGTACAACTGGACAGAGACAATATGCCTATTATTATTTTCTTATGACTATTTTTTAATATTAGGCTCAACAGGAAATAATGCCTGGGAGATGGTAGGTGCCCAATAGTTGAAGATATTGTGATTAGAGAGTTAAGATTCAGATTAAGCTAGAATCTCGATCACACATAGAAATTAGAGTTACAACATCTGTACACTTTCTGCTGTTTAGGTATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 393836 228 + 647215 GTCTCTTAGGGGAAATGCAACTGGATATAGACAATATGCATATCGTTATTTTCTTATGACTATTTTTACATATCAGGCTCAATGGGAAAGAATTCCTGGGAGATGGCTGGTGCTGAATAATCGAAGATATTGTTATTTGTGGGTTAAGATGCAGATTAAGCTAGAATCTTGATCACACATAAAACTTAGAGTTACTACATCTGTACCCTTCCTGCTGTTAATGTGTTC + +a +s mr.mrrefChr5 247629 51 + 294542 CCTGCTCTGGAGTTAACTTATTAGATGTGATTGGGAACACAATTTATTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 393968 51 + 636262 CCTACTCGGGAGTTAACTTATTAGTTGTGATTGGGAACACAATTTATTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 394064 49 + 647215 CCTGCTCTGGAGCTAACTTATTAGATGTGATTGGGCACACAATTTATCA-- + +a +s mr.mrrefChr5 247680 77 + 294542 TTCATACTGTCTAGTATGGATGCCTCTGGATGATTAAACCCAGTATTTAGAATTAACAGCTGGTTGTGCCAAAGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394022 77 + 636262 TTCATACTGTCTAGTATGGATGCCTCTCGATGATTAAACCCAGTATTTAGAATTAACAGCTGGTTGTGCCAAAGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 394113 77 + 647215 TTCATACGGTCTAGCATGGATACATCTGGATGATTAAACGCAGTATTGAGGATTAACAACTGATTGTGATAAAACCT + +a +s mr.mrrefChr5 247757 98 + 294542 GAGTGCTAAACAATGTTGTTGTCAATAAACCTGGGACAGCATACTCAGAATGGTTGTCTGTAAACTTAAAGAGTTCTTGGAATTTTCTCTGAAAGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394099 98 + 636262 GAGTGCTAAACAATGTTGGTGTCAATAAACCTGGGACAGCATACTCAGAATGGTTGTCTGTAAACTTAAAGAGTTCTTGGGGTTTTCTCTGAAAGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 394214 98 + 647215 GAGTGCTACACAATGTTATTGTTAATAAACCTGGGATAACACACTCAGAATGGTTGTCTGTAAACTCTAAGAGTTCTTGGAATTTCCTCTGAAAGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 247855 70 + 294542 CTCAAATGAGCAATATCATTCGGCAGAAGGAGCCCTCTTGTATTCATGGTAAAGCTTCCTTGAGAGCTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394207 70 + 636262 CTCAAATGAGCAGTATCATTCAGCAGAAGGAGCCCTCTTGTATTCATATTGAAGCTTCCTTGAGAGCTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 394312 70 + 647215 CTCAATTGAGCAATATCATTTGGCAGAAGGAGCCCTCTTGTATTCATGGCAATGTTTCCTTGTGAGTCCA + +a +s mr.mrrefChr5 247925 11 + 294542 CCACTATTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 394383 11 + 647215 CCACTATTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 247936 27 + 294542 GTCCACACTATCTGTTGCTATCAATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83810 27 + 636262 GTCCACACTATCTGTTGCTATCAATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 394395 27 + 647215 GTCCACACCGTCTGGTACTATTGATAA + +a +s mr.mrrefChr5 247963 15 + 294542 GTAACCAGGGTATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83837 15 + 636262 GTAACCAGGGTATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 394448 15 + 647215 ATAACCAGGGTAGAT + +a +s mr.mrrefChr5 247978 14 + 294542 CACTGGTTCATCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83852 14 + 636262 CACTGGTTCATCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 394464 14 + 647215 CACTAGTTCATCTA + +a +s mr.mrrefChr5 247992 25 + 294542 CTAGGGCATTTACTTGTTGTAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 83867 25 + 636262 CTAGGGCATTTACTTGTTGTAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 394478 25 + 647215 CTAGGGTATTTATTTGTTGTGAATA + +a +s mr.mrrefChr5 248017 5 + 294542 CCCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394277 5 + 636262 CCCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 394541 5 + 647215 TCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 248022 20 + 294542 AGGATTATGTACAATTGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394282 20 + 636262 AGGATTACGTACAATTGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 394553 13 + 647215 AGGATTATGTACA------- + +a +s mr.mrrefChr5 248042 152 + 294542 CTGCAATCATAAAATTAGTTCTCCTGTTTTCAACTTCCCAACCTTGACAGTCAGGGTAGGGCTTAGAAATTTTATGTCCCAACTGCCCCCAGGGTAAGTGTGCCATCGCTGGCATATGGTTGTGACTCTGTCCAACACTTGCAGTGTCATCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394305 128 + 636262 CTGCAATCATAAAATTAGTTTCCCTGTTTTGAACTTCCCAATCTTG-----CAGGGTAGGGCTTAGAAATTTTATGTCCCAACTGCCCCCAGGTAAAGTGTGCCATCACTAGCATATGGTTGTGACTATGTCC------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 394566 130 + 647215 -------CATAAAATTATTTCTCCTGTTTTCAAGTTCCCAACTTTGACAGTCAGGGTAGGGCTTAGAAATTT---------------CCCAGGGTAAGTGTGCCATCGCTGGCATATGGTTGTGACTCTGTCCAACACTTGCAGTGTCATCA + +a +s mr.mrrefChr5 248194 119 + 294542 GTAATTGGCTTGCTGAAAGAAGGTGTTTAATTACTTGTAAGAGATAAACTTGATTACATGTTCTTGGTTGGCACATAACTGAAACTCTGGCATAATCCAGTGTGATCCAAGGTTCCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394433 94 + 636262 -------------------------TTTATTTACTTGTAAGAGATAGACTTGATACCATGTTCTTGGTTGGCACATAACTGAAACTCTGGCATAATTCAGTGTGATCCAAGGTTCCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 394699 105 + 647215 GTAATTGGCTTGCTGAAAGAAGGTGTTTAATAACTTGTAAGAGATAAACTTGATTACATGTACTTGGTTGGCATATCACTGAAACTCAGGCATAATCCAGTGTGA-------------- + +a +s mr.mrrefChr5 248313 32 + 294542 GGATAAGACACGCAACTGCCCTTAGCCAGGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394533 32 + 636262 GGATAAGACACACAACTGCCCTAAGCCAGGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 394804 32 + 647215 GAATAAGACATGCAACTGCCCTTAGCCATGTC + +a +s mr.mrrefChr5 248345 138 + 294542 CAAGTTATCAGGCAGTGGGCCCCACAAGGGTCCGTTGATCCACATTTCGATTGGAGCATCTCCTGGGTGTCTGGGAGTGGGCAGGAAGCAGGCTTGAAGGACCCTGTTATACTGGAGGTCTTACTGCTGGGTGTCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394571 138 + 636262 CAAGTGATCAGGCAGTGGGCCCCAGAAGGGTCAGTTGATCCACATTTCGATTGGAGCATCTCTTGGGTGTCTGGGAGTGGACAGGGAGCAGGCTTGAAGGACTCTGTTATACTGGAGGTCTTACCGCTGGGTGTCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 394836 138 + 647215 CAAGCTATCAGGCAGTGGGCCCCACGAGGGTCCGTTGATCCACATTCCTATTGGAGCATCTCCCGGGTGTCTGGGAGTGGGCAGGAAGCAGGCTTGAAGGACCCTGTTATACTGTAGGTCGTACTATTGGGTGTAATT + +a +s mr.mrrefChr5 248483 3 + 294542 ACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394709 3 + 636262 ACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 394980 3 + 647215 GCT + +a +s mr.mrrefChr5 248486 242 + 294542 GGTGTCCTCTAACCACCATGATTTGTACTTTGTTTTTCATGTAAAGACTGGTTGCTTAACATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTTGACCCCTAAAGGATGACTGGCTAGAGCCCAACCTGAGATTTTCCTGCAGAACTCCTTTAATCAATACCACTCTACACCAGGAGGACTCTCCAGTGAAGCTACAGCCTAACATGCAGAGTACTCTCATGATGAACTTTCTCCATGAGAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394712 240 + 636262 GGTGTCCTCTAACCACCATGATTTGTACTTTGTTT--CATGTAAAGAGCGGTTGCTTAACATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTTGACCCCTAAAGGATGACTGACTAGAGCCCAATCTGAGATTTTCCTGCGGAACTCCTTTAATCAATACCACTCTACACCAGGAGTACTCCCCAGTGAAGCTACAGCCTAACATGCAGAGTACTCTCATGATGGACTTTCTCCATGAAAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 394985 232 + 647215 GGTGTCCTTTATACACCATGATTTGAGCTTTTTGGTTCATGTAATGACTG----------ATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTCCGTTGCTAAAGGATGACATGCTAGAGCCCTACCTGAGGTTTTCCTGCAGAACTCCTTTAATCAAGACCACTCTACACCAGATGGACTCTCCAGTGAAGCCACAGCCTAAGATGCAGAGTACTTTCATGATGAACCTTCTCCATGAGAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 248728 68 + 294542 ACCGTCCAGAGGGGTACAGACTCATATTCCCCACCCTCTTTTGAGTCCCTATTCTATCTTTCTCTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394954 68 + 636262 ATCCTCCAGAGGGGTACAGACTCATATTCCCCACCCTCTTTTGAGTCCCTACCCTATCTTTCTCCTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 395217 66 + 647215 ACCGTACAGAGGGGTACAGACTCATA--CCCCGCCCTCTTTTGAATCCCTATTCTATCTTTCTCTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 248796 192 + 294542 GTCTCCCTTGTTTATCTTTTAGTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATCATCTCCAACAACATTCAGCATTCATCTCTACCTTTTAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGCCAATAAAAGGCTCACGCATCATGTAGGCACTCGAGAAATTAAATACAGACATAAAGACCGAATCACACAATACTAGCTCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395023 191 + 636262 GTCTCCCTTGTTTATCTTTTACTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATAATCTACAACAACATTCAGCAGCCA-CTCTACCTTTTAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGCCAATAGAAGGCTCACGCATCATGTAGGCACTTGAGAAATTAAATACAGACATGAAGACTGAATCACCCAATACTAGCTCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 395283 192 + 647215 GTCTCCCTTGCTTATCTTTTAGTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATCATCCCCAACCACATTCAGCATTCATCTCTACTTCTAAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGAAAATAAAAAGCTCACATATCATGCAGGCACTCGAGAAATCAAATACAGCCATAAAGACCGAATCACACAATACTAGCTCATA + +a +s mr.mrrefChr5 248988 46 + 294542 TGGAGTGACTCTGCAACATCTTCCTGCATCGGCCATGTCCAAATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395293 46 + 636262 TGGATTGACTCTGCAACACCTTCCTGCATCAGCCATGTCCAAATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 395475 46 + 647215 TGAAGTGTCTCTGCAATATCTTCCTGCATCGGCCATGTCCAGATTT + +a +s mr.mrrefChr5 249034 7 + 294542 ACCTACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395339 7 + 636262 ACCTACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 395526 7 + 647215 ACTCACT + +a +s mr.mrrefChr5 249041 20 + 294542 CACACATATACACATAGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395346 20 + 636262 CACAAATATACACATAGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 395534 20 + 647215 CACACATACACACATTGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 249061 449 + 294542 AAACCCAATTACTTGTTGATGAACAGTAGTTACTGTAGTACCTTGGAAAGGGCCTACTTTAATTATAACTATGAGCTTGTCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCATTCCATGAAAGATGTAGAAGTGAAGAGAAAACATCTTTTTCAGAGCCGCAGATGAGATTATTATTTAAAAGCAAGACTATGCAAGACACTCATGTGATTGACATGGTACTGAATAAGGACAATGCTGTATTTTTGTTCTCTAGCATGTACAATACAGCCCAAGGTACTCCTTATAAAAAACCCCCATCGGTTGTTGAACCACAATTCTTTGTTCCAGTTCTACTTCCACTACTGAGAGTTAGGTTCACCACAACATAGGAGCATTGCAGAGTTCTCAGTTCTTGGCGCAATAGACAATTTGCAATAGATTTAGACTCTTGAATAAAAGAATCCATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395366 449 + 636262 AAACCCAATTACTTGTTGATGGAGAGTAGTCAATGTAGTGCCTTGGAAAGGGCCTACTTTAACTATAACTATGAGCTTGGCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCATTTCATGAAAGATGTAGAAGTGAAGAGAAAACATCTTTTTCAGACCCACAGATGAGATTATTACTTAAAAACAAGTCTACACTAGACAGTCATGTGATTGACATCGTACTGAATAAGGACAATGCTGTATTTTTGCTCTCTAGCATGTACAATACAGCCCAAGGTACTCCTTATAAAAAACCCCCATCGGTTGTTGAACCACAATTCTTTGTTCCAGTTCTACTTCCACTACTGAGAGTTAGGTTCACCACAACATAGGAGCATTGCAGAGTTCTCAGTACTTGGCGCAATAGCCAATTTGCAATAGATTTAGACTCCTGAATAAAAGAATCCATTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 395622 445 + 647215 AAACCCAATTACTTGTTGATGAACAGTAGTTACTGTAGTACCTTGGAAAGGGCCTACTTTAATTATAACTATGACCTTCTCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCACTCCA----AGAGGTAGAAGTGAAGGGAAAACATCCCTTTCAGAGCAGCAGATGAGATTATTTTTCAAAGGCAAGACTATGCAAGACACTCATGTGCTTAACAAGGTACTGAATAAGTATAACGCTGTATTTTAATTCTCTAATGTGTACAATACAGTCCAAGCTACTCCTTATAAAAGGGCCCCATCAGTTCTTCAACCACAATTCTTTACTCGAACTCTAATACAACTACTGAGAGTTAGGTTCATCACAAGCGAGGAGAATTGCAGAGTTCTTGGTTCTTGGTGCAATAAATAATTTACAATAGATTTGGACTCTTGAATAAAAGAATCCTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 249510 48 + 294542 GTGATCACCCCCAACATGTGCCCCCGTCTGATATTTCATTAAATGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395823 48 + 636262 GTGAGCACCCCCAACATGTGCCCCCGTCTGATATTTCATTAAACATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 396067 48 + 647215 GTGATCACCTCCAACATGTGCCCCCGTCAGAAAGTTGATCAACTGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 249558 276 + 294542 GTCCTGACTCTATCAGCAGGGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACCACAGATTAGATGAGGAAAAATGGTTTGAGCTGGTGCTTGCAATCCAACAAAAAGGACCTGCTAAATGCATGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAACATGGACCAACCAGTATCTGATACAGGTGTGGCAGAAGTAGGTCCCTACATTATGAGCAGCTATCAGCAACAGAGAAAGTCATGCATTGGATTTCACTATAGTATCCGGCCTCAAGTAATCCTCAAGTTGTTGCTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 395871 274 + 636262 GTACTGACCCTATCAACAAGGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACAATAGATTGGATGAGGAAAAATGGTTGGAGCTGGTGGTTGCAATTCGAGAAAAAGGACCTGCTAAATGCGTGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAGCATAGACAACCCAATATCTGATACGAGTGTGGCAAAATCAGGTTGCTATATTATGAGCAACTATCAGCAACAGGTGAAGTCATGTACTGGATTTCACTATAGTATCAAGCCTCATATAATCTTCAAGTTGTTGCTG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 396115 272 + 647215 GTCCTGACTCTATCAGCAGAGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACCACAGATTAGATGAGGAAAAATGGTTTGAGCTGGTGCTTGCAATCCAACAAAAAGGACCTGCTAAATGCCTGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAACATGGACCAACCAGTCTCT----CAGGTGTGGCCGAAGTAGGTCCCTACATTATGAGCAGCTATCAGCAACAGAGAAAGTCATGCATTGGATTTCACTATAGTATCCGGCCTCAAGTAATCCTCAATTTGTTGGTTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 396397 263 + 647215 GTCCTGACTCTATCAGCAGGGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACCACAGATTAGATGAGGAAAAATGGTTTGAGCTGGTGCTTGCAATCCAACAAAAAGCACCTGCTAAATGCATGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAACATGGACCAACCAGTATCT----CAGGTGTGGCAGAAGTAGGTCCCTACATTATGAGCAGCTATC---------GAAAGTCATGCATTGGATTTCACTATAGTATCCGGCCTCAAGTAATCCTCAACTTGTTGCTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 249834 8 + 294542 TCCTACCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396145 8 + 636262 TCCTACCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 396660 8 + 647215 TCCTATCT + +a +s mr.mrrefChr5 249842 10 + 294542 TCAAGTATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396153 10 + 636262 TCACATATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 396387 10 + 647215 TCAACTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 396668 10 + 647215 TCGAGTATTT + +a +s mr.mrrefChr5 249852 77 + 294542 CTGAGTCCTATTAGGTTTTGTTTTAGTGAAAAGGAGTGAGGTGTAGTCATTTAGGTTCACTTTATGAGCTTAATGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396163 77 + 636262 CTGAGTCCTATTAGGTTTTGTTTTAGTGAAAAGGAGTGAGGTGCAGTCATTTAGGTTCACTTCGTGAGCTTAACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 396678 77 + 647215 CTGAATCCTATTACGTTTTGTCTGAGTGAAAAGGGGTGAGGTGTAGTCATATATCTTAACTTTATGAGCTTAATGGG + +a +s mr.mrrefChr5 249929 54 + 294542 CTTGGGCCATTTCCTTTATGTTGGTACTATAGGCAACCATTAGTTTGTCAATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396240 54 + 636262 CTTCAGCCATTTCCTTTATGTTGGTATTGTAGGCAACCATTAGTTTGTCAATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 396757 54 + 647215 AGTGGGCCGTTTACTTTATGTTGGTACTATAGACAACCACTAGTTTGTTAATGT + +a +s mr.mrrefChr5 249983 64 + 294542 TTACATCATCTACTCCAGTCTGATCCTTAGTAATTATGTAATTCTTCAACACCTAAGCTTTAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396294 64 + 636262 TTACATCATCTACTCCAGTCTGATCCTTAGTAATTATGTAATTCTTCAACACCTAAGCTTTAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 396815 64 + 647215 TTACATCCTCTACCCCGGTCTGATCCTTCATAATAACTTAATTGTTTAGCACCTCAGCTTTAGA + +a +s mr.mrrefChr5 250047 146 + 294542 TGGGTGAGTGAGATAGTATGAGTAATATGAGCATTTATTTGTTGCTCCCTGCTTATACTGTATGGTTTACCCTTGGGACAGGATCTATCAAAGAGGCACGTGTCAGGGCGCATATGCTGTTTCACTCAAACTCCACTGTAAGCCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396369 146 + 636262 TGGGTGAGTGAGATAGTATGAGTAATATGAGCATTTATTTGTTGCTCCCTGCTTATACTGTATGGTTTACCCTTGGGACAGGATCTATCAAAGAGGCACGTGTCAGGGCGCATATGCTGTTTCACTCAAACTCCACTGTAAGCCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 396879 146 + 647215 TGAGTGAGTGAAATCGTATGAGTAGTATGAACATTTCTTTGTTGCTCCAGGCTTATACTGTATGGGTCACCCTTATGACATGATAAATCAAGGGGGTGCTCATCAGAGCGCATGTGCTCTTTCACTCAAACTTTACTGTAAACCAA + +a +s mr.mrrefChr5 250193 19 + 294542 TGACTATATCTTTTCTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396516 19 + 636262 TGACTATATCTTTTCTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 397025 19 + 647215 TATCAGTATCTTTTCTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 250212 22 + 294542 AGTCAGGACCCATTTACCTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396536 22 + 636262 AGTCAGGACCCATTTACCTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 397044 22 + 647215 AGTCAGGACCCATTTACCTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 250234 126 + 294542 CACTACCCACTGCCAGCAGGACAATGGATAGTAGTCAATTTCCTTCCAGGTTGAGAGCATAAGAATTGCACCTGAATCTTGTCTCAAAATCCATGACATGTTAAATAATCAGGTAATGCACCTTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396558 125 + 636262 CACTACCCACTGCCAGCAGGACAATGGATAGTAGTCAATTTCCTCCCAGGTTGAGAGTATAAGAGTTGCACCCGAATCTTGTCTCAAAATCCATGACATGTTAT-TAATCAGGTAATGCACCCTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 397072 126 + 647215 TACTACCCACTCCTAGCGGGACAATGGATAGTGCTCAATTACCTTCCAGGTTGAGAGCCCAAGAAGTGCACCTGAATCATGTCTCAAAATTCATGACGTGTTAAATAATCAGGTAATGCACCTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 250360 479 + 294542 CAGCATCAAGTACTTAACTCAAGACTAGGCGCTAATAAGGACTCTAAGGGTGTCTAACAACTGTTCCCATTCAATTGAGGCTTGAGCCAGTGTCAATGCATTAAGCTGTTTCGTATACTCAGCACTTGGACCAACTCAATGTCATGTTAAGTAGTACAGGTGCACTTGAGCTTAGGCATTTATTAATGCTATAAAGACTCATATGACGCTACTCCATGGAGGTTGACAGATCACAGCATATACCACTAGTTCTGGGGGGATAGTAGATGTAAATTCTTGACTCTGACTGATTGACTCGACAATTGTGTCCAGCTTGGATTTCTTGTTATGTAAATGTCTGGATAGTGATTAAGGCCTTCAATGGGGTAGTACCATCCTTTTCAGGTAAACAAGGCAGTGGACATGGGGTCCAATAAATATGGTGTGGGTTGGTGGACTTACCTCAGGATGTTGCCAAAATATAATTTTTGTTTGCTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 396792 468 + 636262 CACCATCAAGTACTTAACTCAAG--TAGGCACTAATAGGGACTCTAAGGGTGTCTAACAACTGTTCCCATTCAACCGAGGTTTGTGCCAGTGTCAATGCATTAAGCTGTCTCGTATACTCAGCACGCAGACCAACTCAATGTCATGTTAAGTAGTACAGATGC---------TAGGCATTTATTAATGCTAAAAAGACTCATATGACGCTACTCCATGGAGGCTGACAGATCACAGCATATACCACTAGTTTTGGGGGGATATTAGATGTAAATTCCTGACTCTGATTGATTGGCTCGACAATTGTGTCCTGCTTGGATTTCTTGTTATCTAAATGTCTGGATGGTGATTAAGGCTTTCAATGGGGTAGTAACATCCTTTTCAGGTAAACAAGGCAGTGGACATGGGGTCCAATGAATATGGTGTGGGTTGATGGACTTACCTCAGGATGTTGCCAAAATATGATTTTTGTTTGCTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 397198 472 + 647215 CAGCATCAAGCAATTAACTCAAGACTAGGCGCTAATCAGGGTTCAAAGAGGGTCTAACTACTGTTCCCAATCAATTGAGGCTTGAGCCAGTGTTAATGCATTAAGCTGCTT-----ATCCAGCACTTGGATTAACTCAATGTCATGTTGAGTAGGACAGGTGCACTTGAGCTTAGGCATTCAATAAT--TATAAAGACTCATATGATGCTACTCCATAGAGGTTGACGGATCATGGCATATACCATTGGCTCTGGGGCGATGGTAGATGTAAATCCTTGACTCTGCCTGATTGACTCAACAATTGACTCCAGCTTGGATTTCTCATTATGTAAATATCTGGACAGTTATTAAGGCCTTCACGGGGGTAGTACCATCCTTATCAGGTAAATAAGGCAGAGAAGATGGGGTCTGATAAATATGGTGGGGGTTGGACGAATTACCTCAGGATGCTGACAAAATATAATTTTGGCTTGCTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 250839 21 + 294542 GTCACAGGTCACCCCACTGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397262 21 + 636262 GTCACAGGTCACCCCACTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 397670 21 + 647215 GTCACAGGTCACTTCTCTGGT + +a +s mr.mrrefChr5 250860 204 + 294542 TTTGTGGCAGCAATTGACTTGGTACAGTGGTGCAATGATGATAGAACCTTTGTTGTGGGCTCAACATCACCCCCGCTTACTGTTCAGTTCAACAGGAAATGTTTATTAATTCATTTCCTTACAAAGTCATAATGCCAGTTAAGTCAGGCTCACAGGGTAGGTAGGTTGCATTTTGCTGTTCtaGTTCAGCTATTAGGGTGCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397287 202 + 636262 TTTGTGGCAGCAATTGACTTGGTACAGTGGTGCAATGATGATAGAACCTTTGTTGTGGGCTCAACATCATCCACGCTTACTGTTCGGTTCAACAGGAAATGTTTATTGATTCATTTCCTTACAAGGTCATAAGGCCAGTTAAGTCAGGCTCACAGGGTAGGTAGGTTGCATTTTGCTGTTC--GTTCAGCTATTGGGGTGCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 397691 204 + 647215 TTGGTGGCAACAATTGACTTGATGCAGGTGGGCAATGATGATAGAACCTTTGTTGTGGGCACAACATCACCGCCGCTTACTGTTCAGTTCAACAGGAAACATTTATTAATTCATTTCTTTACAAAGTCCTAATGCAAGTAAAGTCAGGCTCACAGAGTAGGTAGGTTGCATTTTGCTGTTCTAGTAGAGCTATTAGAGTGCAAG + +a +s mr.mrrefChr5 251064 137 + 294542 GCGGCTTGGAGGTCATAGCTTTCAGACTTTTAGCTCATGAGCTCTGGAGGGTTGGCAGGGATAATGGGGGTATAAACATGGGGAGCAGAGGAAATGATGTCAGCAACACAACCAAACAACTGAAGTATAAGGTCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397489 137 + 636262 GCAGCTTGAAGGTCATAGCTTTCAGACTCTTAGCTCATGAGCTCTGTAGGGTTGGCAGGGATAACGGGGGTATAAACATGGAGAGCAGAGGAAATGATGTCTGCAACACAACCGAACAACTGAAGTGTAAGGTCTGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 397907 137 + 647215 GCGGCTTTGAGGTCATAGCTTTCTGACTTTTACCTTATGAGTTCTGGAGGGTTGGCAGGGATAATGGTGGTATTAACATGGGGAGTAGAGGAAATGATGTCAGTAACACAACCAAACAACTGAAGTATAAGGTCTAA + +a +s mr.mrrefChr5 251201 225 + 294542 ATGAATTCTCATATTACAGTTGAGCCCCAACCTGCATCACCGAGTATAAGAGTTTGGTGTCAAATACTATGCAGCTGATCTGCTCCAAACATACTTCCAATCAGTTCACTAGGTTAAGAATAATGGATAAGCTCTACTTGAGTTGTCTGGGAGCTTAAGTTGAACCTGAGCTAACAGTGAACCTGCATAAAATTAGGACTAAAGAGCTGTAGAGAAGGGATACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397738 218 + 636262 CCAAATTCTCATATTACAGTTGAGCCCCAACCAGCATCACCGAGTATAAGAGTTTGGTGTCAAATACTATGCAGCTGATCTGCTCCAAACATACTTCCAGTTAGTTCACTATGTTAAGAATAATGGATAAGCTCTACTTAAGTTGTCTGGGAGCTTAAGTTGAACCTGAGCTGACAGTGAACCTGCATAAAATTAGGACTAAAGAGCTGTAGAGAAGG------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 398044 225 + 647215 ATGAATTCTCATCTTACAGTTGAGCCCCAACATGCATCATTGAGTATAAGAGTTTGGTGGTAAATACTATGCAGCTGATCTGCTCCAAACACACTTCCAATCAGTTCCCTAGGGTAAGAATGATGGATAAGCTCTACTTGAGTTCTCTTGGAGCTCAAGTTGAACCTGAGCTAACTGTGAACCTGCATAAAATTGGGACTAAAGAGCTGTATAGAAAGGATACAG + +a +s mr.mrrefChr5 251426 101 + 294542 AGGGGATACTCAATTTGCAATTATCTCAGAAATCTTAGAAGGGAGTTACAGCAATATATCCATCTTCAATCCTTGAGACACTAGGGGTTGGGACTAGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 397956 97 + 636262 ----GATACTCAATCTGCAATTATCTCAGAAATCTTAGAAGGGAGTTACAGCAATACAACGATCTTCAATTCTTGAGACACCAGGGGTTGGGACTAGATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398277 101 + 647215 AGGGGATACTCAATTTGCAATTATCTCAGACATCTCAGACGGGAGTTACAGCACCATATCCATCTTGAATCCTTGAGACACTAGGGGTTGGGACTACATAT + +a +s mr.mrrefChr5 251527 155 + 294542 ATATTGGAGGCAAAAAGGGGTGCATTCAAGAACAAAAAAATTCTTGCATTAAAATATACTGAATTGCACAGTACTTACCTCTTTTGATATCATTGCTATCAGCCAATATAGCAAATGAATAAAGAGCTAAGATAAGGTTGCAAAAGTGCCGATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398053 155 + 636262 ACATTGGAGGCTAAAAGGGGTGCATTCAAGAACAGAAAAATTCTTGCACTAAAATATACTGAATTGCACAGTACTTACCTCTTTTGATATCATTGCTATCAGCCGAGATGGCAAATGAATGAAGAGCTAAGATAAGGTTGCAAAAGTACCAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 398379 155 + 647215 ATATTGGAAGCAAAAAGGGATGCCCTCAAGAACAAAAAAATTCTTGCATTAAAATATATTGAATTGCAGAGCACTTACCTATCCTGACATCATTGCTATCAACCAATACAGCAAATAAATAAAGAGCTTAGATAAGGTTGCAAACATGCCGATAC + +a +s mr.mrrefChr5 251682 46 + 294542 AAGCCCGCAGTGGGAGGCTGCTGCATTTACAACCATTTCAGGAGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398208 45 + 636262 AAGCCCGCCGTGGGAGGCTGCTGCATTTACAACCATTTCAGG-GCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398538 46 + 647215 AAGTCAACAGTGGGAGGCTGCTGTGTTTACAACCATTTCAGGAGCT + +a +s mr.mrrefChr5 251728 4 + 294542 TGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398253 4 + 636262 TGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398585 4 + 647215 TGGC + +a +s mr.mrrefChr5 251732 189 + 294542 TGGTGGCTAGTAGTGATATATACAATTTTGGTAGGCAGCAGAGTATTCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTGGCAATGACTACCATATGAGAAATGCAGGCAGTGTATTTCCCTTCAATATTCATGAGACAATAGTGCAAGTAATAATTTGTAGCCAGCAGGGCATTCAAGGAACATAGGAAGCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398257 189 + 636262 TGGTGGCTAGTAGTGATATAGACAATTTTGGTAGGGAGCAGAGTATCCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTGGCAATGACTACCATATGAGAAATGCAGGGAGTGTATTTCCCTTCAATATTCATGGAACAATAGTGCAAGTAATAATTTGTAGCCACCAGGGTATTCAAGGAACATAGGAAGTCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398505 183 + 636262 TGGTGGCTAGTAGTGATATATATGATTTTGGTGGGTAGGAGAGTATGCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTG-CAATGACTACCATATGAGAATTGCAGGCTGTGTATTTC-----AATATTCATGAGACAATAGTGCAAGTCATAATTTGTAGCCAGCAGGACATTCAGGGAACATAGGAAGCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398589 181 + 647215 TAATGGCTAGTACTGATCTATACAATTTTGGTAGGCAGCAGAGCATTCAAGACCCTCGAAAGTAGATTACATTGGCAACCACTACCAT--GAGAAACGCAGGCAGTG-ACGCA-----AATGTCCATGAGACAATAGTACAAGTAGTAATTCGTAGCCAGCAGGGCATTCAAGAAACACAGGAAGCCTG + +a +s mr.mrrefChr5 251921 7 + 294542 CATTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398446 7 + 636262 CATTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398688 7 + 636262 CATTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398771 7 + 647215 CATTTTC + +a +s mr.mrrefChr5 251928 52 + 294542 GTATATGTAAACAGCTGATTAAAGGTGGACCACACTAGACAGGATGCCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398453 52 + 636262 GTATATGTAAACAGCTGATTAAAGGTGGACCACACCAGACAGGATGCCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398695 52 + 636262 GTATATGTAAACAGCTGATTAAAGATGGACCACACTAGACAGAATGCCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398779 51 + 647215 GTATAT-TAAACAGCTGATTAAAGGTGGATCACACTAAACAGGATGACATAA + +a +s mr.mrrefChr5 251980 16 + 294542 TGACTTTTCAATATCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398747 16 + 636262 TGACTTTTCAATATCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398830 16 + 647215 TGAATATGCAGTACCC + +a +s mr.mrrefChr5 251996 72 + 294542 GGGGCATGTTTACTCATTGGTATTAGCTTAGTAATCTGGATCAGAGTAATGACATGAATGAGCCACTCACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398767 72 + 636262 GGGGCATGTTTACTCATTGGTATTAGCTGAGTAATCTGAAACGGAGTAATGACATGAATGAGCCACTCACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398846 52 + 647215 --------------------TATTAGCTTAGTAATCTGGATCAGAGTAATGACATGAATGAGCTACTCACAT + +a +s mr.mrrefChr5 252068 37 + 294542 TTGACCACAGCTACAGGTTAGGCATATAGCTGCTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398885 37 + 636262 TTGACCACAGCTACAGGTTAGGCATGTAACTGCTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 398898 37 + 647215 TTGAGCAGAGCTACAGGTTGGGCATATAGCCGCTACT + +a +s mr.mrrefChr5 252105 108 + 294542 GAAGTGATAGACCATTCTGTTTTTACTGCAGAGCCAAGAATAAAACTGAAGGGAGTAGGGTCTTCTTCAGCGTCAACTGGTAATCAAGAGGGCAAAGTGGTGTAGACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 398922 107 + 636262 GAAGTCATTGACCATTCTGTTTTTACT-CAGAGCCAAGAATAAAACTGAAGGGAGTAGGGTCTTCTTCAGCGTCAACTGGTAATCAAGAGGGTAAAGTGGTGTAGACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 398936 108 + 647215 GAAGTGATAGACCATTCTGTTCTTACTGCAGAGCCAACACAAAAACTGAAGGGAGTAAGGTCTTCTTCAGCATCAACGGGTAATCCAGAGCGCAAAGCGGTGTCGACT + +a +s mr.mrrefChr5 252213 140 + 294542 GCTCATTGGAGTGAAGATGTGGTTAATGGACTACACCACCCCCTGACCCACCACTCCCAGATGAGGATTGTTATAGTCTTGTGTGCTAAGAGAATCCCCAGAATTTTACCCATATTGCATAATCCCCAGGTAAATTCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399029 140 + 636262 GCTCATTGGAGTGAAGATGTGGTTAATGGGCTACACCACCCTCTGACCCACCACTCCCAGATGAGAATTGCTATAGTCTTGTGTGCTAAGAGAATCCCCAGAATTTTACCCATATTGCATAATTCCCAGGTAAATTCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 399045 138 + 647215 GCCTATTGGAATAAAGATGTGCTTAATGTACTACACCACCCCCTGACCCACCACTCCCAGATGAGGGTTGTTAAAGTCATG-GTGCTAAGAGA-TTCCCAGAATTTTACCCATATTGCATAATCTCCAGGTAATTTCAAC + +a +s mr.mrrefChr5 252353 82 + 294542 ACCCTTCAGGATTTCATCACCAAAATTAGCACTCCTTACTTCACAATTGTATAGTGTCATAAGGTGAAGTAGAAAAGGAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399169 82 + 636262 ACCCTTCAGGATTTCATCACCAAATTTAGCACTCCTTACTTCTCAATTGTATAGTGTCATAAGGTGAAGTAGAAAAGGAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 399184 82 + 647215 ACCCTGCAGGATTTCATCACCAAAATTAGCTCTACTTACTTCACAATTGTACAGTGTCATAAGGAGAAGTAGAAAAGTAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 252435 38 + 294542 TAGACCTTGGTCAGCATTCTTGTCTCATAAATGTTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399255 38 + 636262 TAGACCTTGGTCAGCATTCTTGTCTCATAAATGTTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 399266 38 + 647215 TAAACCTAGGTCAGCATTCTTCTCTTATAAATGTTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 252473 271 + 294542 TTTTTCACTAAGGGGCAATCTTCCATGGTGCTCTCAGGGATTAGTATGTGAGTCACATTGCCTTCTCATACCTCTTTATACTCTTTGCTAACTTTTCATGCAAAAACCATGTTGATATCTGGACTCTAATTATTCACATTCACAGACTAGAGATCTAATTAGTGAATACCCATGGCTCAATGTAATAGAGGAGAAGACAAACTCCAACCAGACTGTCAAAGAATACTGGTAGGAAAGACAGCTACACCAATTTGATGGCAGGTGTGGCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399333 271 + 636262 TTTTTCATTGAGAAGCAATTTTCCATGGTGCTCTCAGGGATTAGTATTTGAGTCACATTGCCTTCTCATACCTCTTTATACTCTTTGCTAACTTTTCATGCAAAACCCATGTGGTTATCTGGACTCTAATTATTCACATTGACAGACTAGAGATCTAATTAGTGAATTCCCATGGCTCAATGTAATAGAGGAGAAGACAAACTCCATCCAGACTGTCAAAGAAAACTGGTAGGAAAGACAGCTACACCAATTTGATGGCAGATGTGGCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 399304 268 + 647215 TTTTTCACTAAGGGGCAATCTTCCATGGTGCCCTCAGGGACTAGTATGTTGGTCAAATTGCCTTCTCATACCTCTTTATACTCTTTACTAACTTTTTGTGCAAAAACCATGTTGATATT--GTCTCTAATTATTCACATTCCCAGACTAGAGATCTAATTAGTGAATACCTATGGCCCA-TGTAATAGAGGAGAAGACAAACTCCAACCGGACTGTCAAAGAATACTGGTAGGAAAGACAGCTACACCAATTTAATAGCAGGTGTGGCGAA + +a +s mr.mrrefChr5 252744 268 + 294542 ATGAATTCTGCTAGATTATCTGAGAACTTATCAGGTGAGAGTGAGAGATGACAGATTGGGTTATTCGAGAGGCTCATGTGAGAGACAGCTGCTTGCTAACACATGATACTGGCAGTTCACAGTCACTGTAGCCTGAGGTTAGAAATCTAATAGGATCAATCTCCTCATGCAAGTTATTGATACAAACAACAAGAAGGCCTTCCATTGGATAGAAATGATGATGTCAACATACAGATAAATTTAGATTGGTTCCACTTCTAAGCCCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399608 268 + 636262 ATGAATTCTGCTAGATTATCTGAGAACTTATCAGGTGAGAGTGAGAGATGGCAGATTGGGTTATCTGAGAGGCCCATGTGAGAGACAGCGGCTTGCTAACACATGTTACTGGCAGTTCACAGTCACTGTAGCCTGAGGTTAGAAATCTAATAGGATCGTTCTCTTCATGCAAGTTATTGATACCAACAACAAGAAGGCCTTCCATTGGATACAAATGATGATGTCAACATACAGATAAATTTAGACTGGTTCCACTTCTAAGCCCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 399572 268 + 647215 ATGAATTGTGCTAGATTATCTGAGAACTTATCAGGTGAGAGTGAGAGATGACAGATTAGGTTACTCGAAAGGCTCATGTGAGAGACAGCTGTTTGCTGACACAAGATACTGGCAGGTCACAGTCACTGTAGCCTGGGGTTACAGATCTAATAGGATCAATCTCCTCTTGCAATTTGTTGATACAACCAACAAGAAGGCCTTCCATTAGATAGAAATGATGAGATCAAAATACAGATAAATTTAGATTCATTCCACTTCTACGCCCAAA + +a +s mr.mrrefChr5 253012 154 + 294542 TCAGTTGCAAGACTTCACCAGTGGCCCTTGTCTATGTCTCAGTACTGGGGTCCACGGCTATCACACTATGGAGGTTATAGGATCTCAACAAGATACAGAACCTTTCTCAATTTAAAATAGGAGAGCACAAACAACAAACAAAGAGATAACAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 399879 154 + 636262 TCAGTTGCAAGACTTCACCAGTGGCCCTTGCCTATGTCTCACTACCGGGGCCCACGGCTGTCACACTATGGAGGTTATAGGATCGCGACAAGATAGAGAGCCTTTCTCAATTTAAAGTAGGAGAGCACAAACAACAAACAAAGAGATAACAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 399840 145 + 647215 TCAGTTGCAAGACTTGACTGCTAGCACTTGTCTATGTCTCAGTACTGGGGTCCATGGCCATC-CATGACGGAGGTTGTAGGATCTCAACAAGATACGGAACCTTTCTCAATTTAAAATCGGAGAGCGCAAATAATAAACAAAGAG--------A + +a +s mr.mrrefChr5 253166 19 + 294542 CCTCTCAGATTGGGTGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400033 19 + 636262 CCTCTCAGATTGGGTGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 399986 19 + 647215 CCTCTCAGATTGGGTGATG + +a +s mr.mrrefChr5 253185 51 + 294542 CTGAAGGGTATCAAAACTTTTATCTTGTGAATGCTTATAAATTTGTTTTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400052 51 + 636262 CTGAAGGGTATCAAAACTTTTATCTTGTGAATGCTTATAAATTTGTTTTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 400018 51 + 647215 CTGAAGGGTCTCAAGACTTTTATCTTGTGAATGCTTATAAATTTGTTTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 253236 15 + 294542 TAAGATAGAACACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400163 15 + 636262 TAAGATAGAACACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 400069 15 + 647215 TAAGATAAAAGTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 253251 30 + 294542 ATTCCATTTCCATCTTGAGTCATAAATCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400178 30 + 636262 ATTCCATTTCCATCTTGAGTCATAAATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 400085 30 + 647215 ATCCCATTTCCATCTTGAGTCATAAATATC + +a +s mr.mrrefChr5 253281 265 + 294542 GGGCTCTGTTACCTAGACAGAAACTGGGGTCTAGTTCTGGCTTAGGGGGGGTGCACCCAGGCAAAATCTATAGTGGTGCATTATCAGTCAGCGAGAAAATGAACACAGACCAGGGAGTAATTGTGCTGCATAACAGGGACAGGGGATACATCTCTGAATGCATACTTCCGACCTAAAAGGAGGTGGGGGATGCTAGTCCACAGAAGCTGCCAACCCCCAACCCCCTAGGGGAAAAGCCCTGATAATATGATACAGGACACTAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400212 265 + 636262 GGGCTCTGTTACCTAGACAGAAACTGGGGTCTAGTTCTGGCTTAGGGGGGGTGCACCCAGGCAAAATCTATAGTGGTGCATTATCAGTCAGCGAGAAAATGAACACAGATCATGGAGTAATTGTGCTGCATAACAGGGACAGGGGATACATCTCTGAATGCATACTTCCGACCTAAAAGAAGGTGGGGGATGCTAGTTCACAGAAGCTGCCAACCCCCAACCCCCTAGGGGAAAAGCCCTGATAATATGATACAGGACACTATCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 400115 265 + 647215 GGGCTCCACTACCTTGTCAGAAACTGGGATCAAGTTCTGGCTTAGGGTGGATGCACCCAGGCGAAATCTATAGTGGTGCATTACCAGTCAGAGAGAAAATGAACACAGACCAGGGAGCAATTGTGCTACATAACAGGGATAGGGGATACATCTCAGAATGCATACTTCCAAACTAAAAGGAGGTGGGGGATGCTAGTCCACTGAAGCTGCCAACCCCCCATCCCTTAGGGTAACAGCCTTGATCATATGATACAGGACACTAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 253546 89 + 294542 GATGGAGAGATGATTCTTTACAGGCCTACACAAAGTGTCTTTTCTGGGGACAGATCACAGTTCATTCAACAGCCTAAGGATATGTGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400477 88 + 636262 GATAGAGAGAGGATTCTTTA-AGGCCCACACAATGTGTCTTTTCTGGGGACAGAAGACAGTTGATTCAACAGGCTAAGGATATGTGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 400387 89 + 647215 GATGGAGAGATGATTCCTTACAGGCCTACACAAAGTGTCATTTCGGGGAACGCATCACAGTTCATTCAACAGCCTAAGGATATGTGGAT + +a +s mr.mrrefChr5 253635 74 + 294542 TGACAGTGTATTTCAGCTGTATAATGATTGTTATTAGATTAATGAGAATCAAGGTATTAAATTTGATGCAAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400567 74 + 636262 TGACAGTGTAATTCAGCTGTACAATGATTGTTATTAGATTAATGAGGATCAAGGTATTAAATTTGATGCAAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 400476 74 + 647215 TGACAGTGTATTTCAGCCGTATAATGATTGTCATTAGATTAATGGGAGTCTAGGTATTGAACTTGATGCAAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 253709 97 + 294542 ATACATTGACTCATGGTAGTCAttgcttggtgtacatatcctaaagttaatgactgactgccgtcatgacctgaatgttttgaggatggggcccttc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400642 97 + 636262 AGACATTGACTCATGGTAGTCAttgcttggtgtacatattctaaagttaatgactgactgccgtcttgacttgaaggttttcaggatggggcccttc +s simRat_chr6.simRat.chr6 400550 96 + 647215 ATAGTTTGACTCAGGGTAGTCAttgtttggtgtacatatcctaaagtta-tgactgactgtcatcaagacctgaatgttttgaggatggggcccttc + +a +s mr.mrrefChr5 253806 347 + 294542 aaagcttctttcacatacatatgctcacattttttgttaacccctcaagtagttgaagttgcacctttgtaaccaaactagggtagttatatgcaatccactgaaagagaacaatgacatggGTTtGCCAGCCTGCTAAGTGGAATGGGCCAAGGTTATGAATAGGATTCAGAGAAATATGTGCAAAGAACACTAAAAAAGATACAAAGAACAAAGAAACATATGCTGTGCTTCCTAATAAGCACCTTGGCTCCAGTACAGATATTTGTGATAGCTGTGAGGTGGAAATATCATCATATGTCTGAGACTTTAGTAAGTGGTGAGCTTGTTCTGGTAAGGGGAAAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 400754 347 + 636262 gaaacttcttcctcatacctatgctcacactttttgttagcccctcaagtggttgaagttgcacctttgtaaccaaactagggtaattatatgcaatccaCTGAAAGAGAACAATGACGTGTGTTTGCCAGCCTGCTAAGTGGAATGGGCCAAGGTTGTGAATAGGATTAAGAGAAATATGTGCAAAGAACACTAAAAAAGGTACAAAGAACAAAGAAACATATGCTGTGCTTCCTAATAAGCACCTTTGCTCCAGTACAGATGTTTGTGATAGCTGTGAGGTGGAAATATCATGATATGTCTGAGACTTTAGTAAGTAGTGAGCTCGTTCTGGTAAGGGGAAAAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 400646 346 + 647215 aaagcttctttcatgtacatatgctcacattttttgttaacccctcaagtagttgaagttgcacctttgtaaccatactagggtagttatatgcagtccactgaatgagaacaataacatggGTT-GCCTGCCTCTTAAGTGGAGTGGGCCAATGTTATGAATAGGATTCAAAGAATTATGGGCAAAGAATACTAAAAAAGATACAAAGAACGATGAAACATATGCTGTGCCTTCTAATAAGCACTTTGGCTCCAGTACAGGTATTTGTGATAGCTGTGAGGTGGGAATATCATCATATGTCTGAGACTTAAGTAAGTGGTGAGCTTGTTCTGGTAAGGGGAAAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 254153 6 + 294542 GTTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401101 6 + 636262 GTTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 400993 6 + 647215 GTTGGA + +a +s mr.mrrefChr5 254159 180 + 294542 TAGCCAACCAAGATAATCAAGAAACACTAAGGGAGTTTGATTAGATTATTAACAGTGAAAGAGTAACATCACCTGGTGACAACAATGGAACATGGATACCCACTGAGGTACCTAGCATGCATCATACATACTAATAGTACGATATTGCACTTAGTATAAAAGGGTGACATAGGATCAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401113 157 + 636262 TAGCCAACCAAGATAATCAAGAAACACTAAGGGAGTTTGATTACATTATCAACAGTCAAA-----------------GA------TGGAACATGGGTACCCACTGAGGTACCTAGCATGCGTCATACATACTAATAGTATGATACTGCACTTAGTTTAAAAGAGTGACATAGGATCAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 400999 180 + 647215 CAACCAACCAAGGTAATCAACAAACACTAAGAGAGTTTGATCAGAACATTAACAGTGAAAGAGTAACATCACCTGGTGACAACAATGGAACATGCATGCCCACTGAGGTACCTAACATGCATTGTACATACTAACAGTACGATATTGCGGTTAGCATAAAAGGGTGACATAGGATCAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 254339 8 + 294542 TGCAAGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401272 8 + 636262 TTCAAGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 401179 8 + 647215 TGCAAGTG + +a +s mr.mrrefChr5 254347 213 + 294542 AACCATGATTGCCATTAAGGCTCCTATTGCTCTGTCTTAAGTAATAAGGGGTTAACCCTCCTCAACTGGGGTGTTATGTAATTGCACTTCATCCTTTCTACTGTGCTCTAACATATGTTACACTAAAGTGCTATTTGAGTGACCTGGAGTCACCTGACATTATAACTATAAAAAATTACCTGGAAGTAGAATGTCCTTAAGGAAACTCTGTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401308 211 + 636262 AACCATGATTGCCATTAAGGCTCCTATTGCTCTGTCTTAAATAATAAAGGGATACCCCTCCTCACCTGGGGTGTTATGTAATTGCATTTCATCCTTTCTACTGTGCTCTAACATATGTTACACTAAAGTGCTATT--AGTGACCTGGAGTTACCTTACATTATAATTATAAAAAGTTACCTGGAAGCAGAATGTCCTTAAGGAAACTCTGTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 401187 213 + 647215 AACTATGATTGCCATTAAGGCTCCTATTGCGCTGTCTTATGTCATAAGTGGTTAACCCACCTCAACTGGGGTGTTATGTAATTGCACTTCATCCTTTCTACTGTGCTCTAACATATGTTACACTAAAGTACTATTTGAGTGACCTGGAGTCACCTGATATTATTACTTTAAGAAATTACCTGGAAGTAAGATGACCTTAGGGAAACGCTGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 254560 209 + 294542 CATGACAGGACAGCTGCAATCTCAACAAAGGGAGTTGTACAATGCTTAAGTCTTGAACCTTGGGGAAGAGCTAGTTGTGTGTGCACTTCACCAGTAACCAAGCACCTGCTGAGTGGAGTTCTGGATTTCTGTAAGGAAACTGGAATAAATGTGTGCATATTAGTACAATGATTCGTAATTTAGAAGGCATTAGACATGAGAGGATACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401519 209 + 636262 CATGACAGGACAGCTGCAATCTCAAGAAAGGGAGTTATACAATGCTTAAGTATTGAACCTTGGGGAAGAGCTACTTGTGTGTGCACTTCACCAGTAACCAAGCACCTGCTGAGTGGAGTTCTGGATTTCTGTAAGGCAACTGGAATAAATGTGTGCATATTAGTACAATGATTCGTAATTTAGAAGGCAGTAGACATAAGAGGATACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 401401 209 + 647215 CATGACAGAACAGCTCCAATCTCAACAAAGGGAGTTGTAAAATGCCTAACCCTTGAACCTTCAGGAAGAGCAAGTTGTGTTTGCACTTCATCGATAACCAAGCACCTGCTGAGTGGAGTTCTGGGTTTCTGTAGGGAAACTGGAATAAATGTGTACATATTAGTACAATAACTCATAATTTCGAAGGCATTAGACATGAGAGGGTACCC + +a +s mr.mrrefChr5 254769 106 + 294542 ATGAATAAGCAAGAGGTGGGAGCTACATACATCTTAACCCCCCTCTCTGCCTAAGCATAATAGTCCCTGTGGTTGTTCCGGGTAATTAGAGGGAGTAGTATAGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401744 106 + 636262 ATGAATGAGCAAGAGGTGGGAGCCACATGCTTCTTAACCCCCCTCTCTGCCTAAGCATAGTAGTCCCTGTGGTTGTTACAGGTAATTAGAGGCAGTGGTATAGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 401610 106 + 647215 ATGAATAAGCTAGAGGTGGGAGCTACATACATCTTAACCCCCCTCTTTTCCTAAGCATAATACTTCCTGTGGTAGTTCCGGGTTATTAGAGGGAGAAGTAGAGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 254875 293 + 294542 TGATTGTTTTTGAAATGAGGATTGCCCTTAAACATCTCCTTGCAAAGTTTTTGGCAACCTAAATGCACTTCAGAACCTAGACTTCTTCACAGACTGAAAATTTTTGGGTCATGGGTCTGGCTTGCAATGCCCAACTACAAATATGCAGCCAGCAGTATTAAATGCAGACTGGGAAAGATTAGATATTGATTCCCAATCATTGTCCTTCATCTTGCTATTACCCAGGATGGAAATAAACAAATACGACTTATAAATGTAGGGGCTTAATGATACTCAAGTTAGGAACCTCAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 401850 289 + 636262 TGATTGTTTTTGAACTGAAGATTGCCCTTAAACATCTCCTTGCAAAGTTTTTGGCAACCTAAATGCACT----AACCTAGACTTCTTCACAGACTGAAATTTTTTGGGTCATGGGTCTGGCTTGCTATGCCAAACTACAAATATGCAGCCAGCTGTACTAAATGCAGACTGAGAAAGATTAGATATTGTTTTTTAATCATTGTCCTTCATCTTGCTATTACCCAGGATGGAAATAAACAAATACGACTTATAAATGTAGGGGCCTAATGATACTCAAGTTGGGAACCTCAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 401717 290 + 647215 TGATTGTTTTTGAAACGAGGATTGCCCACAAACATCTCCTTGCAAAGTTTA---CAACCTGAGTGCCCTTCAGAACCCAGACTTCTTCACAGACTGAAAATTTTTGGGTCATGGGTCTGGGTTGCAATGCCCAACTACAAATATGCAGCCAGCAGTATTAAATGCAGACTGGGCAAGATTAGATATTGATTCCCAATCATTGTCCTTCATCTTGCTAGTACCCAGGATGGGAATAAATAAATACGACTTACAAATGTAGGAGCTTAATGCTACTCAAGTTAGGAACCTAAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 255168 17 + 294542 ATCCCTGCCAGCATCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402140 17 + 636262 ATCCCTGCCAGCATCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 402007 17 + 647215 ATCCCTGCCAGCATCCC + +a +s mr.mrrefChr5 255185 32 + 294542 TGCCAGTACAATAATAGAGATTAACACTTGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402161 32 + 636262 TGCCAGTACAATAATAGAGATTAACACTTGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 402024 23 + 647215 TGCGAGCACAATAA---------GCACTTGGG + +a +s mr.mrrefChr5 255217 83 + 294542 ATTCCCTGAGGAAGTCTCCAATTTGCATCTGACTTTCTGACTTCATAAGGAGACAGAATTGGAAGGTGAGGGTAGGGGTGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402193 83 + 636262 CTTTCCTGAGGAAGTCTCTAATTTGCATCTGACTTTCTGACTTCAAAAGGAGACAGGATTGAAAGGTGTGGGTTGGGGTGGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 402048 83 + 647215 ATTCCCTGAGGAAGTCTCCAATTTGCATCTGACTTTCTGACTTCGTAAGAAGACAGAATTGGAAGGCGAGGGTAGGTGTGGAA + +a +s mr.mrrefChr5 255300 104 + 294542 AGTTGCACAACCTGAAAAAATCATAGCTCTCATCTTGGGATCTTGTGTCACTATTGAATATCAAACACTTTCTTCTGACTATCCTGCTATGGCAAAATTTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402276 103 + 636262 AGTTGCACAACCCGAAAAATTCACAACCCTCATCTTGG-CTCTTGTCTCACTATTGAATATCAAACACTTTCTTCTGACTAGCCTGCTATGGCAAAATTTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 402148 102 + 647215 AGTTGCACAACTTGAAAAAATTATAGCTCTCATCTTGGGATCTTGTGTCACTATTGACC--CAAACACTTTCTATTGACTGTCCTGCCATGGCAAAATGTAATT + +a +s mr.mrrefChr5 255404 76 + 294542 CCACACATGTAGTCCTACAACCTGGCGATCTTCAAAGGATGCAGTTCTTTGATATGGGAGTTGATAGTTGATGCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402380 71 + 636262 CCACACATGTAG-----CAACCTGGCAATCTTCAAAGGATGCAGTTCTTTGATATGGGGGTTGATAGTTGATGCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 402250 64 + 647215 CCAATGATGTAGTCCTACAACCTGGTGATCTTCAAAGGATTCAGCTCCTTGATATGGAAGTTAA------------ + +a +s mr.mrrefChr5 255480 19 + 294542 GCGTCAGGCCTAAATAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402452 19 + 636262 GCGTCAGGCCTAAACAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 402314 19 + 647215 GCATCAGGCCTAACTAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 255499 403 + 294542 AAGCTATGACACTAAGTTGGGAATTGTGTATAACACCTGGCATTCCTCAGTTGATTTGGGAGCAAATCTGAATGGTGTAAGCTGGCTCTAGTATCGGATCCTCTTACCTATAGTGTAATCTTTGGAAAATCAGATGAACTTTGAGATCTGGAATACATAAATCCTGCCAAATAAGCAGCTGCTAACATAGCTAGTTATGTTGTTATACACCATAAATTAACCCAGTATGTGAAAGATAAGCCAATGAGGGTGGAATGAGGGTGGAATCAACTAATGAGCAGTTATGACTGTCTTGTAAGTAGAGGACATAGAATTTGGCCCAGGTGGTGTGTCCCTAGCTATCTCCCCTGCCAACCATCTCTTGATTTGTTGACCTACCTCCTAAAGTTACAGAACTCTAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402471 397 + 636262 AAGCTATGACACTAAGTTGGGAATTGTGTATAACGCCTGGCATTCCTCAGTTGATTTGGGACCAAGTCCGAATGGTGTAAGCTGGCTCTAGTATCGGATCCTCTTAGCCAT------ATCTTTGGAAAATCAGATGACCTTTGAGGTCTGGAATACATAGATCCTGCCAAATGAGGAGCTGCTAACATAGCTAGTTATGTTGTTATACACCATAAATTAACCTGGTATGTGAAAGATGAGCCAATGAGGGTGGAATGAGGGTGGAATCAACTAATCAGCAGTCACGACTGTCTTGTAAGTAGAGGACATAGAATTTGGCCCAGGGGGTGTGTCCCTAGCTAGCTCCCCTGCCAACCATCTCTTGATTTGTTGACCTACCCCCTAAAGTTACAGAACTCTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 402334 402 + 647215 AAGCTGTGATGTTAAGTTGAGAATTGTGTATAACACCTGGCCTTCCTCAGTTGATCTGGGAGCAAATCTGATTAGTGAAAGCTGGCTCTAGTATTCAATCCTGGTACCTGTAGTGTAATCTTTGGAAAATCGGATGAAATTTGAGATCCAGAATACATAAATCCTGCCTAATAACCAACTACTAACAAAGCAAGTTATGTTGTTATACACCATAAATTAAGCCAGTATGTGAAAGATAAGCCAATGAGGGCAGAATGAGGGTGTGATCATC-AATGAGCAGTTATGACTGTCTTGCAAGTGGAGGATATAGAATTTGGCCCAGGTGGTGTGCCCCTAGCTATCTCCCCTGCCAGCCATCTCTTGATTTGTTGACCTACTTGCTAAAGTTACAGAACTCTCAGT + +a +s mr.mrrefChr5 255902 161 + 294542 ATGGAACTCTCCCATGATATTGTTGCTCAAGACTTAGTACATCTTTCTCACCAAAAAGATAAAGTGTAGTTTGTCTATGAGGTCCTGGACTTGATAGCTATTAAATGTGGCTCTGGGGAGTGATCAAGAGCTGGGACATATATTAGCATTTTAACCACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402869 157 + 636262 ATGGCCCTCTCCCATGATATAGTTGCTCAAGACTTAGTACATTTTTCTCAGCAACAAGATAACGTGTAGTTTGTCTATGAGGCCCTGGACTTGACAGCCATTAAATGTGGCTCTGGGGAGTGATCAAG----GAGACATATATTAGCATTCTAACCACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 402736 157 + 647215 ATGGAACTCTTCCATGATATTGTTGCTCAAGACTCAGTATATCTTTCTCACCAAAAAGATAGAGTGTAGTTTGTCTATGAGGTCCTGGACTTGATAGCTATCAAATGTAGCTCTGAGGAGCGATCAAGAGCTGGGAGATATATTAGCATTT----AGCATT + +a +s mr.mrrefChr5 256063 25 + 294542 GGACACTCTTTCCCCATTTCCAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403026 25 + 636262 GGACACTCCTTCCCCATTTCCAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 402894 25 + 647215 TGACACTCTTTCCCCATTACCAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 256088 11 + 294542 AAGACAAGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403052 11 + 636262 AAGACAATGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 402919 7 + 647215 ----CAAGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 256099 199 + 294542 TGAGGCTGGTCATGATACATGATAAACGTTTGTGAGTGAGTCATTGCTAGACAAGGCAGCATTAATTATCCATGATTCAAGGGTTATAGGAGTTGTCAGTTGAGTGTGTATTTATAGGCCTTTCTAGTAAATTGAAATACTAACTCCCCTGTACAGGCACACCCAGACTAGCCCTATCGAGTGGATGAAATTTAACTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403340 199 + 636262 TGGGGCTGGTCATGATACATGATAAACGTTTGTGAGTGAGTCATTGCTAAACAAGGCAGCATTACTTATCCAAGATTCAAGGGTTATAAGAGTTGTCAGTTGTGTGTGTATTTATAGGCCTTTCTAGTAAATTGAAATGCTAACTCCCCTGTACAGGCACATCCAGACTAGCCCTATCGAGTGGATGAAATTTAACTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 402926 198 + 647215 TGAGGCTGATCATGATACATGTTAAACATTTGTGAGTGAGTCATTACTAGACAAGGCAGCAT-AATTATCCATGATTTAAGGGTTATAGGAGCTGTCAGTTGAGTGTGTATTTATAGTCTTTTCTAATAATTTGGAACACTAACTCCCCTGTACAGACACACCCAGACTAACGCTATCGAACAGGCTAAATTTAACTGC + +a +s mr.mrrefChr5 256298 77 + 294542 AAAGATAGCATAATATTCAGGGAATGTGGGCATGGACTATATATATTCTACCCTACTTTCATCTCGCCGAGCATCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403540 76 + 636262 AAAGATAGCA-AATATTCAGGGGATGTGGGCATGGACCATCTATATTCTACCCTACTTTCATCTCGCCGAGCATCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 403124 66 + 647215 AGAGATAGCATAATACTCGGGGAAAGTGGGGACGGACTATATATATGCTACCCTACTTTCAGC-------GCA---- + +a +s mr.mrrefChr5 256375 425 + 294542 GCTGAGCAGAGATAATTATGTATAAACATAGTAAGACTATTGCCCAACTATTGAGTATCACATGTGGTCTCTCAAGGATGCAGGATCCTGATCAGTCCAACTGAGAGCTGGGAGGAACTTTAGCTTTTATGAGTATGAGAAACTAGTTAGGGTTGTTAATATGGTTTGAAAACCAGACTATTAGTGAGGTTTTTGGTCAGTGGTGACACCTGTAATGCACAGCAGCACAGTGGGATTCAGTTGTGGCTAATATTCTATCATTGTACAGGTGTAATCTTCTTAAGCAAAGTAGGGTTCTTTCAGTAGCCCCAGTGGTGACTCCTAACCTTAAAGCCAGCTTACAAGCATAGTTAGCAGATTAGCTTTGAGCAAGGTAACACCATACATCTTATAACACCCTCATTCAGGATGCTGATAGGATGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403617 403 + 636262 GCTGAGCAGAGATAATTATGTATAAACATGGTAAGACTATTGCCCAACTATTGAGCATCACATGTGGTCTCTCAAGGATGCAGGATCCTGG--------ACTGAGGGCTGGGAAGAACTTTAGCTTTTATGAGTATGAGAAACTAGTTTGGGTT----------TTTGAAAACCAGACTATTAGTGAGCTTTTTGGTCAGTGGTGACACCTGTAATGCACAGCAGCACAGTGGGATTCAGTTCTGGCTAATATTCTACCATTGTACAGGTGTAATCTTCTTAAGCAAAGTAGGGTTCTTTCAGTAGCCCCAGTGGTGACTCCTAACCTTAAAGCCAACTTGCAAGCATAATCAGCAGATTAGCTTTGAGCAAGGTAACACCGTACATCTT----CACCCTCATTCAGGATACTTATAGGATGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 403190 379 + 647215 -----GCAGAGATAGTTATGTAGAAACAGAGTAAGGATATTACCCAACTATTAAGTGTCATAGACGGTCTCTCAAGGATGCAGGATCCTGATCAGTCCAACTGTGAGTTGGGCGGAACCTTAGCTTTAATGAGTATGAGAAACTACTTAGGCTGGTTAATATGGTTTGAAAACTAGACTATCAGTGGGGTTTATGGTCAGTGGTGACACATGTAATGCACGGCAGCACAGTGAGATTCAATCGTGGCTAATATTCTATCATTG--CAGGTGTA---------------------------------------TGGTGACTCCTAACCTTAAAGCCAGCTTACAAGCATAGTTAGCAGATTAGCTTAGTGTAAGGTAACACCATATATATTATAACTCCCTCATTCATGATGCTGATAGGATGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 256800 98 + 294542 ACTATTTATAGCCATCCAGATAGTTCTAACAGTTTTTATGTTCGTCCTTTGGCCTCAATGGTGAATGCAGAGAAAATGGCGATTCCACAGATAACACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404021 98 + 636262 ACTATTTATAGCCATCCAGATATTTCTAACAGTTTTTATGTTCATCCTTTGGCCTGCATGGTGATTGCAGAGAAAATGGTGATTCCACAGATAAGACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 403569 98 + 647215 ACAATTTATAGCCATCCAGATAGTTCTAAGAGTTTTTATGTTGGTTCTTTGGCCTCAATAGTGAATGAAGAGAAGATGGCGATTCCACACATAACATG + +a +s mr.mrrefChr5 256898 132 + 294542 GATAAATTTCGTCCTCAATCAGCGCCCCTGGTACAATATAGTTGGCTGCAGAGTTACCAACAGTGGTTTTGGGAGAGCTGATATGTTGGAACAATCCCTTAACCTATTCTGTAGGGGAATTCAGCAAGAGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404119 132 + 636262 GATAAATTTCGTTCCCAGTCAGCGCCCCTGGTACAATATGGTTGTCTGCAGAGTTACCAACAGTGGTTTTGGGAGGGCTGATATGTTGGAACAATCCCTCAACCTATTCTGTAGGGGGAGTCAGCAAGACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 403682 132 + 647215 GATAAATTTCCTCCTCAATCAGCTCTCCTTGTAGAATATAGTTGGCTGCAGTGTTAGCAACAGTGTTTCTGGAACAGCCATTGTGTTGGAACAATCTCTTAACCTATTCTGCAGAGGACTTCAGCAAGAGCA + +a +s mr.mrrefChr5 257030 106 + 294542 GTACGCAGTATGTGGATATTCAAGTAGTTGGAGTCTAGAAGCAGCATCCTTCACAGTTCTTGGCTTTGGCTGCAATAACAGTCAGTACGATCAAGAACGTTTGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404251 106 + 636262 GTACGCAGTATGTGGATATTCAAGTAGTTGGAGTCTGGAAGCAGCATCCTTCACAGTTCTTGGCCTTGGCTGCAATAATGGTCAGTACGATCAAGAATGTTTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 403817 98 + 647215 GTACGTACTACGTGAATATTCAAGAAGTTAGAGTCTAAAAGAAGCCTCCTTCAC--------GCTTTGGCCGCAATAACAGTCAGTATGACCAAGAACATTTGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 257136 254 + 294542 GCTCTAATTGTACCTCATGCTGATTTATCTCCAGACTACTCACTCTGCCGTACTCGCTTGTAGTTGTGGAGCTGAGCACATCCATAGGTATACCCTACAATAATCCGAGGGTGAAAGCACCATCCCTAGCTCTATGTGTCAGTCATGCTAGTGCTCACTAAACTCACACTGGCAAAACTTATGGAAAGATAGCTTGGTGGGGACACCAAAGCATATCAGTGACACAACACCCAGCAGATCAAATAGCCCAGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404358 254 + 636262 GCTCTAATTGTGCCTCATGCTGATTTGTCTCCAGATTACTCACTCTGCCATACCCATTTGTAGTTGTGGGGCTGACCACATCCATAGGTACACCCTACAATAATCCGAGGCTGAAAGTGCCATCACTAGCTCTATGTGTCAGTCATGCTAGTGCTCACTAAACTAGCACTGGCAAAACTTATGGAAAGATAGCTCGGTGGGGACACCAAAGCATATCAGTGACACAACACCCAGCAAATCAAATAGCCCAGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 403915 254 + 647215 GCTCTAATTGTACCTCATGCTGATTTATCTCCAGTCTACTCACTCTGCCGTACTCGCCTGTAGTTGTGGAGCTGAGTGCACCCATAGGTATAGCCTACAATAGTCCGAGGGTGAAAGCACCATCCCTGGCTCGATGTGTCAGTCATGCTAGTGCTCGCTTAAATCACACTGGCAAAACATATCCAAAGATAGCTTGGTGGGGACACCTATGCATATCAGTGACACAACACCCAGCAGATCAAATAGCCCAGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 257390 121 + 294542 TAAAAAAAATGGCAATATATGCTGTAAGGGTGTTAGTGAGCCGAAGAATAACCTGAGAACATCAGTAAGTGTCAACAGCTAGTGATAATAAAATCACAACCCAGCCAGTTCCAGAAGAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404619 108 + 636262 TAAAAAAAATGGCCACATATGCTGTAACGGTGCTAGTGAGCCGAAGAATAACCTGAGAACTTCACTAAGTGTCACC------------TAAGTTCACAACCCAGCCAGTTC-AGAAGAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 404169 121 + 647215 CAAAAGAAATGGCAGTATATGTTGTAAGGGGGTTAGTGACTCAAAGAATAACCTGAGAACATCAGTAAATGTCAACAGCTAGTGATAATAAAAGTACAACCCAGCCAGTTCCAGAAGAACC + +a +s mr.mrrefChr5 257511 82 + 294542 CCCAAGATACATTGATACACTGGAAGGGAGCATCGTGTTTGGGACTATGCTGATTTAGTTGAGAGCCAGCTGTTAAAGTTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404734 82 + 636262 CCCAACATGCATTGATACACTGGAGGGGAGCATTGTGTTTGGGACCATGCTGATTTAGTTGAGAGCCAGCTGTTAAAGTTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 404290 82 + 647215 CCTATGATACATTGATACCTTCATAGGGAGCATCATATGTGGGACTATGCTGATTTAGTTGAGAGCCAGCTGTTAAAGATAG + +a +s mr.mrrefChr5 257593 19 + 294542 CAAATGTAGACGACTGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404816 19 + 636262 CAAATGTAGACGAGTGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 404374 19 + 647215 CAAATATAGTCAACTGCCC + +a +s mr.mrrefChr5 257612 363 + 294542 TGAATTTGGCCTAGACAATTAATACATTGTTTGATTGGCAATTAACCCAGTGATTATTTGATAATGTGACAATAATCCAGCCCACAGGAGATTACATGCCTTCCCCATGAGAGTGGGTGACTGACAGTCCAGCCTACTAGTGCACTATTGATTGTGTAGGGTACCCTTACCTGGTTGCTATCTGTTCTAATTAAAACCTTCTAATTGATGCTAAGATGGCATGGAACGCAGTGAAAGAATCTGGTTCAAATATGTGTGATACTATTAAGAGTTGAACTCTCTAGCCAGCCACCCTAATTTGTACCTTCTGCTTTTTGATAGTTTTCCATTTATATTCCCCTGCTTTTTCTGTTAATACTGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 404837 361 + 636262 CGAATTTGGCCTAGACAATTAATACATTGTTTGATTGGCAACTAACCCAGTGAGTATTTGATAACGTTATAATAATCCAGCCCACAGGAGATTACATGCCTTCCCCATGAGAGTGGGTGACTGACAGTCCAGCCTACTAGTGCACTATTGAT-GTGTAGGGTACCCTTACCTGGTTGCTATCTGTTCTAATTAAAACCTTCTAATTAATGCTGAGATGGCATG-AACGCACTCAAAGAATCTGGTTCAAATATGTGTGATAATATTAAGGGTTGGACTCTCTAGCCAGCCAACCTAGTTTGTACCTTCTGCTTTTTGATAGTTTTCCATTTATATTCCCCTGCTTTTTCTGTTAATACTGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 404393 312 + 647215 TGAATTTGGCCTAGACAATTAATACATT------TTGGTAATTAACCCAGTGATTCCGTGATAATGTGACAATAATCCAGCCAACGAGAGACTACATCCCTTCTCCATGGGAGTGTGTGACTGACAATACAGCCTACTAGTGCACTATTGATTGTGTGGGGTACCCATACCTGGTTGCCCTCTGTTCTAATTAAAACCTTCTAATTGATGCTAAGATGGCATGGAATGCAGTGAAAGAATCCAGTTCAAACATGTGTGATACCATAAAGAGTTGAACTCTCTAGCCAAGCACCCTAATTGCTACCTTATACTATCTGA--------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 257975 8 + 294542 AGTTGGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405203 8 + 636262 AGTTGGAA + +a +s mr.mrrefChr5 257983 6 + 294542 ACCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405213 6 + 636262 ACCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 257989 34 + 294542 GTAGGGCCTTCAAAGGTCAGGACCACCTATCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405222 34 + 636262 GTAGGGCCTTCAAAGGTCAGGACCACCTATCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 258023 3 + 294542 GCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405258 3 + 636262 GCT + +a +s mr.mrrefChr5 258026 152 + 294542 TCTGCTCCTTGTGTCCCTATATGTCACTTCATCATCAACACTTTCATGAGATCATGTAAAACCCCTTAAATTGGTGGGAATAAGGGCACAATCCTAAAAGTATCAATATTGCCACATTTTTGTCTTTCATATTCAAAGGTCCATTTATCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405262 152 + 636262 TCTGCTCCTTGTGTCCCTATATGTCACTTCATCATCAACACTTTCATGAGATCATGTAAAACCCCTTAAATTGGTGGGAATAAGGGCACAATCCTAAAAGTATCAATATTGCCACATTTTTGTCTTTCATATTCAAAGGTCCATTTATCATT + +a +s mr.mrrefChr5 258178 11 + 294542 AACATATTGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405415 11 + 636262 AACATATTGCC + +a +s mr.mrrefChr5 258189 191 + 294542 CAATGATTCATTCAATTTAACACCCCTATTAAGTAAGGATGAATCCCCTTATTATGGATTATGATCACCCTAATCATGCTGTGTTTATGCCCTGTCTTTCTCATTACTAGGTGCAAACAGGAGTGCTGGGAGTTCTTGATCCCTTTGATAGACAGGTCCCATACATCTTTTCTTAGTGAGATTTACAACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405443 191 + 636262 CAATGATTCATTCAATTTAACACCCCTATTAAGTAAGGATGAATCCCCTTATTATGGATTAAGATCACCCTAAACATACTGTGTTTATGCCCTGTCTTTCTCATTACCAGGTGCAAACGGGAGTGCTGGGGGTTCTTGATCCCTTTAAGAGACAGCTCCCATACATCTTTTCTTAGTGAGATTTACAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 404705 138 + 647215 -----------------------------------------------------ATGGATTATGATCACTCTAATCAAGCTGTGTTTATGCCCTGTGTTTCTCACTACTAGTGGCAAACAATAGTGCTGGGAGCTCTTGATCTCTTTGATAGACAGGTCCCATACATCATTCCTTAGTGAAATTTACAACAT + +a +s mr.mrrefChr5 258380 8 + 294542 CCTGTATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405634 8 + 636262 CCTGTATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 404861 8 + 647215 CCTGTATA + +a +s mr.mrrefChr5 258388 101 + 294542 ACCCCTTAAGTATTGGTTTGTATGCAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTAAATGAAATAGAGGTAATTCCTCGCCTAGTGACTAATACGGTGAGGCTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405642 101 + 636262 ACCCCTTAAGTATTGGTTTGCATACAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTCAATGAAATAGAGGTAATTCCTCGCCTAGTGACTAATACGCTGGGGCTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 404871 76 + 647215 ACCCCTTAAGTAT-GGTCTGTATGCAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTAAATA------------------------AGACTAATACGGTCAGGCTCCA + +a +s mr.mrrefChr5 258489 127 + 294542 TGTAATCCATGCCACTACGCATCTCCTTAGTGATCATCTCTACAATGTAGATTTCATGTAGTTGCAAAATTCTACCAATTATGTGGTGTCTTTATCTTACATTAATTAATTCGAGCAAATATAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405747 120 + 636262 TGTAAACCATGCCACC-------TCTTAGGTGATTGTCTCTACAATGTAGATTTCATGTAGTTGCAAAATTCTACCAATTATGTGGTGTATTTATCTTACATTAATTTATTCGAGCAAATATAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 404947 127 + 647215 TGTAATCCATGCCACTACGCATCTCCTTAGTGATCATCTCTACAACGGAGATTTCATGTAGTTACAAAATTCTACCAATTATGTGGCGTCCGTATCTTACATTAATTAATTCATGCAAATATAAACA + +a +s mr.mrrefChr5 258616 396 + 294542 CATTTCTCTGGTCTACTAATTAGTATTTGAGATTAATAGTCTGTCAGCAATCCTGGCTGGCTGATATCTATGTCTATGCTGGCATAATTATGGTATACAGCTTCATCACTTCAGCAAACCAATAACAACTTTATTTAGGTGAGCAGGGAGGTAGAAGTGACAATCTTTTGGTGTGACTCTAACACGACTGACATGATCTTTTAGAATATGCCCATCAGATTCCATTCCACCTTGCATATGTACTGATGACCAATGCATTACCTGAGAGGAGTCAAGCTCTACTACATTAACTCTTAATAAGGCTCAATAAGTCCAGGGATTTGGACCATATATATAACCACTTCATAGTATCAAGGCTAGTACATCTCCATCACCACTAACTACTGGTATAGAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 405868 383 + 636262 CATTTCTCTTGTCTACTAATTAGTATTCG-------------GTCAGCAATCCTGGCTGGCTGATATCTATGTCTATGCTGGCATAATTATGGTATGCAGCTTCCTCACGTCAGAAAACCAATAACAACTTTATTTAGGTGAGCAGAGAGGTTGAAGTGACAATCTTTTGGTGTGACTCTAACATGACTGACATGATCTACTAGAATATGCCCATCAGATTCCATTTCATCTTGCATATGTACTGATGACCAATGCATTACCTGAGAAGAGTCAAGCTCTACCACATTAACTCTTAATAAGGCTCAATAGGTCCAGGGACTTGGATCATATATATAACCACTTCATAGTATCAAGGCTAGTACATCTCCATCACCACTAACTATTGGTATAGAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 405074 388 + 647215 CATTTCTCTGGTGTGCTAATTGGTATTTGAGATTAATAGTCTGCTAGCAATCCTGGCTGGCTGATATCTATGTCTATGCTGGCATAATTATGGTATACAGCTTTATTACTTCAGCAAACCAAAGACAACTTTATTTAAGTCAGCAGGGAGGTAGAAGTGACGATCTTATAGTGTGACTCTAACACGACTGACATAATCTTTTAGAATGTCCCGATCAGATTCCATCCCACCTTGCATATGTGCTCATAGCCAATGCATTACCTGTGAGGAGTCAAGTTCTACTGCATTAGCTCTCAATAAGGCTCTATAAGTCCAGGGATTTGGACTATATATATAATCGCTTCATGATATC--------TATATCTCCATCACCACTTATTACAGGTATAGAGGA + +a +s mr.mrrefChr5 259012 83 + 294542 TCAGAATGAATCTAAGTACTGACATCGCTGATAGTCAGACACTACTCACTCTTTCACTAATTAAGGCCATTCTTTGTAATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406252 81 + 636262 TCAGTATGAATCTAAGTACTGACATCGCTGATAGTCAGACACTACTCACTCTTTCACTAATTAAGACCG--CTTCGTAATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 405462 83 + 647215 TCAGAATGAATCTAAGTGCTGACACCGCTGATAGTCAGACACTACTCAGTCTTTCACTAATTAAGGCCATTCTTTGTAATCAA + +a +s mr.mrrefChr5 259095 24 + 294542 GCATAGACCTCATACCAGCCATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406333 24 + 636262 GCATACACCTCATACCAGCCATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 405547 24 + 647215 GCATAGACCTCATACCAACCATAC + +a +s mr.mrrefChr5 259119 220 + 294542 CTTTAGTGACTATTATCTATACTTCCTAGAGTCAACATCTGTGATGTCTAAATCATACTGTGCATGCACATTGACTTCACCTCAGTATATACAATCCATTGTGCTGGTGTGCACAGTAGATTAAGTGCTTGTCTTATTTCAGGTAATTGTTAGCATGTTGTTGAAATATAGCATCCTAAACCTGGATCCCCTTTCTCTATAGCATAAACAGTTGGTTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406361 220 + 636262 CTTTAGTGACTATTATCTATACTTCCTAGTGTCAACATCTGTGATGACTAAATCATACTGTGTATCCACATTGACTTCACCTCAGTATATACAACCCATTGTGCTGGTGTGCACAGTAGATTAGGTGTTTGTCTTATTTCAGGTAATTGTTAGCATGTTGTTGGAATATAGCATCCTGAACCTGGATCCCCTTTCTCTATAGCATAAACAGTTGGTTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 405571 212 + 647215 CTTTAGTGAATATTATCTACACTTCTTAGAGTCAAGATCTGTGATCTCTAAATCATACTGTGCATGCACATTGCCTTCACCTCAGTATAAACAATCCATTGTGCTGGTGTTC------GATTCAGTGCTAGTCTTATTTCACTTAATTGTTAACACGTCG--GAAATATACCATCCTAAACCTGGATGCGCTTACTCTATAGGATAAACAGTTAGTTTCG + +a +s mr.mrrefChr5 259339 22 + 294542 ACCAGTTTGCTGCACCTGATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406581 22 + 636262 ACCAGTTTGCTGCACCTGATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 405785 22 + 647215 GCCGGTCTGCTGCACCTAATAG + +a +s mr.mrrefChr5 259361 137 + 294542 ATATCCTGACTTACTTAAACTTTTATTTTAGGGCTTAGCAGCAGCTCAACCACTATGTGATGTAATCTGCTGAGGGCAATGCAAAGAGCCTATTAGACTAGATATGTGTAATGTTGAGGTATACAGGTGGGAAACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406604 137 + 636262 ATATCCTGACTTACTTAAACTTTTATTTTAGGGCTTAGCAGCAGCTCAACCACTATGTGATATAACCTGCTGAGGGCGATGCAAAGAGCCTATTAAACTAGATATGTGTAATGCTGAGGTATACTGGTGGGAAACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 405807 136 + 647215 GTATCCTGACCTATTTAAACCTTAACTGTAGGGTTTAGCAGCAGCTCAGCTAGTAAGTGATGTAATCTGCTAAGGGCAATGCAATGAGTCTTTTAGACTACATATGTGTGCTGTTGAGGTATGCAGGT-GGAAACAC + +a +s mr.mrrefChr5 259498 193 + 294542 ATACATGATAGTATACCGATATCATCCTGGTGAAAACTTCCTGGCATAACCCCTAAGAGTGTTGGTAACACTTGTTTCTGCAACATAGTTTGGTGGCCTAACACACTTGAATGATCTACATATGTTTAGAAGTTCTAAATTGTTATCTCAAAAATGGAACATGTACATCCTGTGGCTGTGCAGTATGCGAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406741 192 + 636262 ATATATGATAGTATACCGATATCATCCTGGTGAAAACTTCCTGGCATAACCCATAGATGTGTTGGTAACTCTTGTTCCTGCAACATAGTTTAGTGGCCAATCACACTTGAATGAGCTACATATGTTCAGAAGTTCTAAATTGTTATCTCGAAAATGGAACATGTACAT-CTGTGGCTGTGCAGTATGCAAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 405944 178 + 647215 ATACATGATAG-ATACCGAAATC--------------TTCCTGGCATAAAGCCTAAGAATCTTGGTAACACTTGCTTCTGCAACATAGTTTGGTGGCCTAACACACTTGAATGATCTACATATGTTTAGATGTTCTAAATTGTTATCTCAAAAATGGAACATGTACATCCTGTCACTGTGCAGTATCTGAGGC + +a +s mr.mrrefChr5 259691 191 + 294542 ACAGTGATTCAGATTGCCATGTATCTCATGTATGAGTACCCTACCCACTAAAACATCTAGTGTCTTATCTGGAGTATAACTCCAGTTGGGCAGGAACTAGTTGAGTCTGGGCTCCAGATACTGCAGCTGATCCATATAACCATTGCACAAGCATCATAGCCAAAGATTACCATGAAATGACAAGATGAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 406933 191 + 636262 ACAGTGATTCAGATTGCCATGTATCTCATGTATGAGTACCCTACCCACTAAAACATCTAGTGTCTTATCTGGGATATAACTCCAGTTGAGCAGGAACTAGTTGAGTCTGGGCTCCAGATACTGCAGCTGATCCATATTACCATTGCACAATCATCATTGCCAAACATTACCATGAAATGACAAGATGAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 413216 190 + 647215 ACAGCGATGCCAATTGGCATGTATCCCATGTATGAGTATCCTACCCACTAAAACATGTAGTGCCTCATCTGGAGTATAACTCCATTTAGGCAGGAACTAGTTGAGTCTGGGCTTCA-CTACTGCAGCTGGTGCATGTAACCATTGTACAAGCATCATAGCCAAAGATTGCCATTACATAACAAGATTGACA + +a +s mr.mrrefChr5 259882 202 + 294542 AGACAAGAACACTGGGGTTGCATGCCATATGGGACAGGGGAAGAGGCATGTAATTTCTACAAATTTCAGGTTATACCATGTCTGATAGTATGATCGGACTAAGGACTAAGATTAGAGATAAAGCCAGAATGGCCATTCAAGGATCCCTGACTATTTGAAAATACCACATTTTCACAGTCACAAAACTATTATGGAGAAAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407124 200 + 636262 AGACAAGAACACTGGGGTTGGATGCCATACAGGACAGGGGAAGAGGCATGTAATTTCTACAAAGTTCAGGTTATACCATGTCTGACAGCATGATCGGACTAAGGACTAAGATTAGAGATAAAGCCAGAACGGCCATTCAAGGATTCCTGACTATTTGAAG-CACCACATTTTCACCGTCACAAA-CTATTATGGAGAAAATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 413589 196 + 647215 GGACAAGGACGCTGGGGTTGCATGCCATATGCAACCGGGGAAGAGGCATGTAATTTCTACAAATTTCAGGTTATACCATGTCTGCTAGTATGATCAGAGTAAGTACTAAGATTTGGAGTGAAGACAGCATGGCCATTCAAGGATCCCCAACTATTTGAAAATACCAC----TCACAGCCACAAAACTATTATGGAGAAAG-- + +a +s mr.mrrefChr5 260084 23 + 294542 GATGGGTTTGTGTTGTCTTGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407325 23 + 636262 GATGGGTTTGTGTTGTCTTGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 413785 23 + 647215 AAGGAGATTGTGTTGTCTTGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 260107 60 + 294542 GGATCCTATGGATGATTGGTTATCAAGATTTAAGCAAAAATAAAATACTAATTATTTAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407348 59 + 636262 GGATCCTATGGATGATTGATTATCAA-ATTTAAGCAGTAATAAAATACTCATTATTTAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 413809 60 + 647215 GGTTCCTATGGATGACTGGTTATCAAGATTTAACCAAAAATAAACTAGTAATTATTTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 260167 70 + 294542 GGGGTAATTCACTTTATGGAAGTATATAGTTACATTACTAGAGTTCTAGTAGAATAACCAGCAGAATCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407407 61 + 636262 GGGGTAATTCACTTTATGGAAG-ATATGGTTACATTACTAGAGTTCTAGTAGAATAACCAAC-------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 413870 69 + 647215 GAGGTAATTCACTTTATGGAAGTATATAGTCAC-TTACTAGCGTTCTAGTGGAATATCCAGCAGAATCAT + +a +s mr.mrrefChr5 260237 196 + 294542 CACCTATTCCCTTTATAACAAAATCAATTTTATCTCCCAAATATGACATGTCTAAATTGTAAACTTCTAAATTATTTCTATTTTTCAAGCAGCCAGCCTGGATAAGAGGATTGCAAACCTCAATTGTTAGTATTCCACAGTCTGTTACCCAAGATGATTGTTGCCTCAAGGGCAATGGGAAGCTCCTACACTCAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407468 150 + 636262 -----------------------TCAATTTTATCTCCCAAATGTGACACGCCTAAATTGTAAACTTCTAAATTATTTCTATTTTTCAAGCAGCCAGCCTGGATAAGAGGATTGCTGACCTCAATTGTTAGTATTCCACAGTCTGTTACCCAAGATGATTGTTGTCTCAAGGGC----------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 413940 196 + 647215 CACCTATTCCCTTTATAACAAAACAAATTTTAGTTCCCAAATATGACATGTCTAAATAGTAAACATCGAAATTATTTTTATGTTTCAAGCAGCCAGCCTAGATAAAAGGATTGCAAATCTCAATTGTTAGTATTACCCAGTCTGTTACCCAAGATGATTGTTGCCTCATGGGCAATGGGAAGCTCCTACACTCAGC + +a +s mr.mrrefChr5 260433 11 + 294542 TACTATGTGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 414137 11 + 647215 TACTATGTGGT + +a +s mr.mrrefChr5 260444 110 + 294542 AGTGATATTTAGCAATACGTTACATGAATTAGATCTACCAATACAGAGATTTCTTGTCTTCATGAGTAGTCATTTCACTTCTTTTTCTAAGCCCCCCACAGTCGCTGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407618 86 + 636262 ----------------------TGTGAATTAGATCTA--AATACAGAGATTTCTTGTCTTCATGAGTAGTCATTTCACTTATTTTTCTAAGCACCCCACAGTCGCTGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 414149 110 + 647215 AGTGATATTTAGCAATACGTTACATGAATTAGATCTACCAATACAGAAATTGTTTGTTTTCGTGAGTAGTCATTTCAGTTCTCTTTCTAAGCCATGCACAATCTCTGTCC + +a +s mr.mrrefChr5 260554 160 + 294542 TATCTTAGGTGCCTCCAAAATATAAAGCAGAACAGAAGCAATAGGTGAGCAGATATGAGGAATGGTTCTAGCCTTCTTTCACATCCCCAGGATTGACAATCCAGGTGGTGGATGCAGGAGAAGGGGTTCAGAGGTTTCCCAACCCCATAGACATGGTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407717 160 + 636262 TACCCTAGGTGCCTCCAAAATTTAAAGCGGAATAGAAGCAATAGGTGAGCAGATATGAGGAATGGCTCTAGCCTTCTTTTACATCCCCAGGGTTGATAATCCAGGTGGTGGATGCAAGACAAGGGGTTCAGAGGTCTCCCAACCCCATAGACACGGTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 414259 160 + 647215 TGTCTTAGGTGCCGCTGAAATATTAAATAGAACAGAAGCAATAGGTGAGTGGATATGAAGAAAGGTTCTAGTCTTCTTTCACATCCCCAGGATTGACAATCCAAGTGGTAGATGCAGTAGAAGGGTTTCAGAGGTTTCCCAACCCCATAGACATGGTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 260714 29 + 294542 GACCACCTCATTTACGCAGCAGGGGTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407877 29 + 636262 GACCACCTCATTTACGCAGCAGGGGTCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 414420 25 + 647215 GACACCCTCAATTGCACAGCAGGGA---- + +a +s mr.mrrefChr5 260743 46 + 294542 ACGTTTATGAGCAAGCAAGTCGAATTTGCCTAGCTATGCTGTGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407909 46 + 636262 ACGTTTATGAGCAAGCAAGTCGAGTTTGCCTAGCTATGCTGTGTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 414445 34 + 647215 -----------CAGGCAAGTGGAATTTGCCTAGCT-TGCTGTGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 260789 39 + 294542 GACATTCTCTGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGATTTCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 407955 39 + 636262 GACATTCTCTGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGATTTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 414480 32 + 647215 GA-------TGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGACTTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 260828 160 + 294542 TGGAGAAGGTGTATTTGATTATGATCACCCTGCACCCCTGGTGTTTCCTCAAGAGCAAAGTAAGAGTGTTCCTGTACCAACAGACAGAACCTGTTGCAACAAATAGATCCTCACGGTTTTTGAGAGGTAAGGAAGCCTGTGGAGAGAGCCAATATACATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 408001 157 + 636262 TGGAGAAGGTGTATTTGATTACGATCACCTTGCACCCCTGGTGTTTCCTTAAGAGCAGAGTAAGAGTGTTCCTGTACCAACAGACAGAACCTGTTGCACCAAATAGATC---ACGGTTCTTGAGAGGTAAGGAAGCCTGTGGAGAGAGCCAATATACATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 414512 156 + 647215 TGGAGAAGATGTATTTGATTATGCTCACTCTGCACCCCTCGTGCTTCCTCAAGAGCAAAGTGAGAGTATTCCAGTGCCAACAGA----ACCTGTTGCAACAAATAGAACCTCACTGTTTTTGAGAGGTATGTCAGCCTGTGGAGAGAGCTAATATACATT + +a +s mr.mrrefChr5 260988 606 + 294542 TAAGGTGAAAGGATGATTGAAGTGATTCTATGGCAAGTGATGCTATGGGCAGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTTCCCACACTACTAATGAATCATTGTCAGACATCCAATATAGCAGTTTATGGCATAATAGGTTGTACACACTATTGAGATCTGCTTGGTAAAGGGGCTAATGTGTGAAGTTAGCATAGAACAAGAATATTTATGATGGTATCTGAATTATTAACCTACTTTTGTGGTATTGGTCAATTATTTCACACTACAACTAAGCCTATACAAATATATTTATTATCGGATTACAGGGCAAGAACATTATTCAGAGAGTGGATTGTAGACTGAATTTCATTATAATAAGTCATAGAATAGTACTGGGGGTGAACAATTACAGCCCAAGATCTGAAATTGAGATCGTAATTGTGACTAGAGGTTTAAATTTACATTTTATTGTACACACATCACCTGCCCACTCTCATACCTTGGGCATTTTCAATAGACTACAATAAGTTTGTAAGTGGTTATTAATATGGTAGTCACTGCTAGAACTTGTGTTTCTATCCAAGCAGTTATGCAACTATGCAACTTCTGGTGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 408158 600 + 636262 TAAGGTGAAAGGATGATTGAAGTGATTCTATGGCAAGTGATACTATAGCCAGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTCCCCACACTACTAATGAGTTCACGTCAGACATCCAATATA-TAGTTTATGGCATAATAGGTGGTAC----TGTTGAGATCTGCTTGGTAAAGGTGC-AATGTGTGGAGTTAGCATAGAACAAGAATTATTATGATGGTATCTGAATTATTAAGCTACTCTTATGGTATTGGGCAATTATTTCACACTACAACTAAGCCTATACAAATATATTTATTATGGGATTACAGGCCAGGAACATTATCCAGAGAGTGGATTGTAGACTGAATTTCATTATATTAAGTCATAGAATAGTACTGGGCGCGAACAGTTACAGCCCAAGATCTGAAATTGGGATCGTAATTGTGACTAGAGGTTTAAATTTGCATTTTATTGTACATACATCACCTGCCCACCCTCATATCTTGGGCATTTTCAACAGACTATAATAAGTTTGTGAGTGGTTATCAATATGGTAGTCACTGCTAGAACTCGTGTTTCTATCCAAGCAGTTATGCAACTATGCAACTTTTGGTGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 414673 605 + 647215 TAAGGTAAAAGGATGATTGAGGTGATGCTATGGCAAGTGATGCTATGGGCGGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTTCCCACACCACTAATGGATCATTGTCAGACATCCAATATAGCAGTTTATGGCATAATAGGTTGTACACACTACTGAGATCTGCTTGGTGAAGGGGCTAATGTGTGAAGTTAGCATAGAACAAGAATATTTATGATGCAATCTGAAGTATTAACCTACTTTGGTGGTATTGCTCAAGTATCTCACACCGCAACTAAGCCTATACAA-TATATTTTTTGTCGGATTACAGGGAAAGAACATTAGTCAGAGACTGGATTGTAAACTGCATTTCATTACAATAAGTCATAGCATAGTACTGGGGGTGAACAATTACAGCCCAAGATCTAAAATTGAGATCCTACTGTTGGCTAAAGGTTTAAATTTACATTTTATTCTAGACACATCACCTGCCCATTCTCATACCTTGGGGATTTACAATAAACTGCAATAAGGTTGTAAGTGGTTATTAATATGGCAGTCACTGCTAGAACTTGTATTTCTATCCAAGCAATTATGCAACTATGCAACCTCTGGTGACC + +a +s mr.mrrefChr5 261594 61 + 294542 TTAAGGCAACATAACGCTGGGGTCACGTACTTATGACACCAGTCCCAGTATCTGAAAGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 408758 61 + 636262 TTAAGGCAATATAATGCTAGGGTCACATACTTATGACACTAGTCCCAGTATCTGAAAGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 415280 61 + 647215 TTATGGCAACATAACACTGGGGTCACGTACTTATGAAACCAGTCCCAGTATCTAAAAGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 261655 313 + 294542 AGAGGCGATATTTTTTGCATGGTTGTCACAATATCAGCTTCTACATTGATACCAGATCAACCCTTGAAATGATCCAATTCTTACCACAGTTCTGGCATACTGCACAGAACTTGTGAGCTTAGTGAGTATTCCAACAATGTTGTAGGTCATAACTTGACATGCTAATGTGAGCTATAGTCATAGAATTGTCCGAAGAGTAAGCCCATTTTTCCATAATTTAATCTCCAGTACTGCGTCCCCTATCTATGGGTCTGGTGCAGTTTGCCCATTGGGATGAGATTAGTCTCTTAAACTGTTTAAGGCCTAGAATGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 408819 275 + 636262 AGAGGCTATATTTTTTGCATTGTTGTCACAATGTCAGCTTCTACATTGATACCAGATCAGCTCTTGAAATGATCCAATTCTTACCACAGTTCTGGCATACTGCACAGAACTTGTGAGCTTAGTGAGTATTCCAACAATGTTGTAGGTCATAATT--------------------------------------AAGAGTAAGCCCATTTTTCTATAATTTAATCTCCAGTACTGTGTCCCCCATCTATGGATCTGGTGCAGTTCGCCCATTGGAATGAGATTAGTCTCTTAAACTGTTTAAGGCTTATAATATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 415343 307 + 647215 AGAGGCGATATTTTTTGCGTG-----CACAAAATCAGCTTAGACCTTGGTACCAGATCAACCCATGAAATGCTCCATTTCTTACCACAGTTCTGGCATACTGCACAAAACTTGTGAGGTTAGTGAGTATTCCAA-AATGTTGTAGGTCATAACTTGACATGCTAATGTGAGCTATAGTCATAGAATTGTCCGAAGAGTGAGCCCATTTTACCATAATTTAATCTCCAGTACTGCGTCCCCTATCCTTTGGTCTGGTGCAGTTTGCCCATTGGGATGAGATTAGTCTCATAAGATGTTTAAGGCCTAGAAGGAT + +a +s mr.mrrefChr5 261968 63 + 294542 GTCATTGTGAGGACTCCTCAACAAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATGTTGATGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409095 63 + 636262 GTCATTGTGAGGACTCCTCAACAAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATGTTGATGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 415650 59 + 647215 GTCGTTGAGAGGACT----ATCTAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATATTGATGGG + +a +s mr.mrrefChr5 262031 117 + 294542 TGGCTATATGTCATGGGCTTTCCATTGGTCCCCAGTCATCAGATTAAATCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCATTACGTCTGATTATTTCCTTGAATAAAATACTGATTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409158 117 + 636262 TGGCTATATGTCATGGACTTTCAATTGGTCCCCATTCATCAGATCAAATCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCATTACGTCTGGTTATTTCCTGGAATAAAATACTGATTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 415731 115 + 647215 TATCTGCATCTCATGGGCTTTCCATTGGTCTCCAGTCAT--GGTTGAACCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCACTATGTCTGATTATTTTCTTGAATAAAATACTGATTAT + +a +s mr.mrrefChr5 262148 19 + 294542 ATAGTGTGAAGCTTCCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 415849 19 + 647215 ATAGTGTGAAGCTTCCATT + +a +s mr.mrrefChr5 262167 90 + 294542 ATTTATATATGATTTGTTTTCAGATCTGCAGTTGAGCTACCTAAAGTCTTCAGGTTACACCATATAAAAACTCAGCTATGTGTCTCTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409275 86 + 636262 ----ATATACGATTTGTTTTCAGATCTGCAGTTGAGCTACCTAAAGTCTTCAGGTTACACCATATAAAAACTCAGCTATGTGTCTCTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 415870 82 + 647215 ATTTATATATGATTTGGTTTCAGATCTCCAG--------CCTACAGTCTTCAGGTTACACCATATAAAAACTCAGCTATGTGTTTCTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 262257 27 + 294542 GACTGCATAATGTGACACTGGAATTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409361 27 + 636262 GCCTGCATAATGTGACACTGGAGTTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 415954 27 + 647215 GACTGCATAATGTGATAGTGGAATTCA + +a +s mr.mrrefChr5 262284 93 + 294542 TATCCAGTCCTGAGCTCTAGACCATAAATAACAGTTCTCATATAATGGTTACAAAGATGAGAGTCACCAGGATACACCTTGATATTGTGTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409389 93 + 636262 TATCCAGTCCTGAGCTCTTGACCAGAAATAACAGTTCTGATATAATGGTTACAAAGATGAGAGTTACCAGGATACACCGTGATATTGTGTGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 415981 93 + 647215 TATCCAGTCCTGAGCTCTAGACCATAAATAACAGTTCCCATATAACGATTACAAAGGTGAGAGTCACCTGGATACACCTTGACATTGTGTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 262377 188 + 294542 AGATAGATGGTGTCCCAAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACGTGACAATCACCTTCTGGTTTTTCCAGGAGTGTATCCTATTGATGATTGGTCCATGGGTCAGTCCTTAGTCATTTGTGTCAGTTGCTAGTCATTAGGACGTTTAGTAGATGATCAAGGGTTTAACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409482 184 + 636262 AGATAGATAGTGTCCCCAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACGTGACAATCACCTTCTGGTTTTTCCAGGAGTGTATCCTATTGATGATTGCTCTATGGGTCAGTCCTTAGTCATTTGTGTCAGTTGCTC----CTAGGACGTTTAGTAGATGATCTAGAGTTTAACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 416075 188 + 647215 AGATAGATGGTGTCCCAAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACATGACAGTCACCTTCCATTTTTTCGAGGAGTGTATCCCATTGATGATTGGTCCATGAGCCAGTCACGAGTCATCAGTGTCAGTTGCTAGTCATTAGGACGTTTTGTAAATGATCAAAGCTTTCACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG + +a +s mr.mrrefChr5 262565 7 + 294542 CCAATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409667 7 + 636262 CCAATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 416263 7 + 647215 TCAATTT + +a +s mr.mrrefChr5 262572 5 + 294542 TGAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409714 5 + 636262 TGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 230251 5 - 647215 TGAAC + +a +s mr.mrrefChr5 262577 21 + 294542 CTCCTCATTTACCATTACAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409719 21 + 636262 CACCTCATTTACCTTTACAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 230268 21 - 647215 CTATACATTTACCATTACAAC + +a +s mr.mrrefChr5 262598 357 + 294542 CTGGTATAGGAGATGTTTCACTTACTCTATTAGGGTGATGATGAATCAAGACTTAGGTCAGCCTAAACACATGTACAATGTTTTTGCTTCTATTTAGTTCAGTCCAGTCGTTGTGCATGTGTGTGCACTGTACAGTTTCCCTTCCTTCAAATTCATATGATTACAATGCCACTAACAATCTTAAATCTTTCCTATTATAACAAACTGAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTGGATGAGGTCTCACCACCTCACTCCATTGTCCATAACAGATTTGTCAGCATTGTCCAAGAAGCTCCAAAGAGAAATACCACATGACAGATGGCTCTACTGACCCATGGTATTCCAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409740 341 + 636262 CTGGTACAGGAGGTGTTTCACTTACTCTATTAGGGTGATGTTGTATC--------TGTCAGCCTAAACACATGTAGAATGTTTTTGCTTCTATTTAGTTAGGTCCAGTCATCATGCAAGTGTGTGTACTGTACAGTTACTCTCCCTTCTGATTCATATGATGACAATGCCACTAACAATCTTAAATCTTTTCTATTATAACAAACTGAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTGAATGAGGACACACCACCTCTCTCCATTGTCCATAACAGATTTGTCAGCATTGTCCAAGAAGCTTCAAAGAGATATATCTCATGACAGATGGCT--------CCATGGTATTCCAGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 230292 357 - 647215 CTGGTATAGGAGATGTTTTGCTTACTCTATTAGGTTCATCATTAACCAAGACTTAGGTGAGCCCTAACACATGCACACTGTTTTTGCTTCTATTTAGTTCAGTCCATTTGTTGAGCATGTGTGTGCACTGTACAGTTTTCCATCCTTCAAATTCATATGAGTACAATGCCACTAACAGCCTTCAATCTTTCCTATTATAACAAACTAAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTAGATGAGGTCTCACCACCTCACTCCAATGCCCATAACAGATTAGTCAGTATTGTCCAGGAAACTCCAAAGAGAAATACTACATGACATATGGCTCTACTGACCCATGGTATTCAAGAAG + +a +s mr.mrrefChr5 262955 4 + 294542 CTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410090 4 + 636262 CTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 230649 4 - 647215 CTTG + +a +s mr.mrrefChr5 262959 14 + 294542 GCAAATGTTTGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410096 14 + 636262 GCACATGGTTGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 230653 14 - 647215 GCAAAAGTTTAGTA + +a +s mr.mrrefChr5 262973 7 + 294542 TACAAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410259 7 + 636262 CACAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 230667 7 - 647215 TACAAAA + +a +s mr.mrrefChr5 262980 7 + 294542 ATTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410267 7 + 636262 ATTCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 230674 7 - 647215 ATACAGG + +a +s mr.mrrefChr5 262987 7 + 294542 AAAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410274 7 + 636262 AAAGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 230684 7 - 647215 ACAGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 262994 125 + 294542 TTCTCTAGTGCACCATGATGTTCACAACTCTTGAGAAATATGTTTATGGCATTGTACATTGAAGTGGGATGCTATTTGCATCTTACTAGACTCTTACCACCCCAATTTGCCTGCTCATTGTCATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410282 119 + 636262 TTCTTTTGTGCACCATGATGTTCACAACTCTTGAGGAATATGTTTATGGCATTGCATATTAAAGTAGGGTGCT------ATCCTACTAGACTATTACCACCCCAACTTGCCTGCTCATCGTCATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 230691 121 - 647215 TTCTCTAGTGCACCATGATGTTCACAACTCTTGAGAAATATGTTTATGGTATTGTACATTGGAGTGGGATGCTATTTGCATCTCACTAG-CTCCTACCACCCCAATTTGCCTGC-CGTTGCCA-- + +a +s mr.mrrefChr5 263119 148 + 294542 TGGTTCTAGTGTTTCTTAGTGTCTAGGATTATGCCTGTCACTTACTTGTCTCTCTTCACAATAAGTTAGTTACTGACTGTGTGGCTATGTTATCACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTAACACAAAAACCTTGCAAGTAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410408 148 + 636262 TGGTTCTAGTGTTTCTTAGTGTCTGGGATTATGCCTGTCACTTACCTGTCTCTCTTCACAATAAGTTAGTTACTGACAGTGTGGCTATGTGATCACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTAACACAAAAACCTTGCAAGTAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 230812 133 - 647215 ---------------TTAGTGTCAAGGATTATGCCTGTCACCTACTTATCTCTCTTCACAATAAGTCTGTTACTGGCTGTGTGGCTATGTTATAACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTCGCACAAAAATTTTGTAAGTGATT + +a +s mr.mrrefChr5 263267 64 + 294542 ATCATGTGCTCCTGGTCACCAGTCATATTGATCTAGCTTAGGGGCCCCCTACAATTTTATTTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410557 64 + 636262 ATCATGTGCTCCTGGTCACCAGTCATATTGATCTAGCTTAGGGGCCCCACACAATTTTATTTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 416976 51 + 647215 -------------GGTCACCAGTTATATTGATCTAGCTTAGGGGCCCCCTGCAAATTTATTTAA + +a +s mr.mrrefChr5 263331 14 + 294542 ACTAGTATAAAAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410622 14 + 636262 ACTAGTATAAAAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 417027 14 + 647215 ACTAGAATAAAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 263345 647 + 294542 TCTTCCTTGTTCACTATTACCCAAGCATGATATTTTCAAATGTTCTGTCACCATTTGCACCCCAACCTCTCCAGGTATTTAAACTTTCTTGAGAATCTTCACCATATCTGAGACACCATATGGACGGGGGGTGGTGCAATATGACCAGTACCAAATATATGTCTGGTGCTTGGGGGTGAAAAGGGTGCTTGGGGGTCAAAAGGACTATGACATAGGACCTTGATAACAATGATTAGTTGACCAATAATTGAAGGAGGTCAAAGTGTGGTGTTAAGGATTGGCCTTTTGTCTTAAGGACATGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGAATAAAAAGTCATCTGGTAAGGATACTGGAGTAAGGGGTCAAAAAGGAGTACTGGATGCTATCCCCCATATGTAAGCTCCCTCTTAAGACTTTGCTGAGTAAAGGACCACCACATTGTTAGCCTCACTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTTACCATGGGATGGTTTCTTGGGACCTGAGTGAGGAGTGCAATGATCCATAGATGGAACACAATGATCTAAGGGTAAGAGATCCTTGTTGTAATGGTATCACCTAATAGGCAGTTTTACCTTCTATGAGCATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 410639 644 + 636262 TCTTCCCTGTTCACTATCACCCAAGCATGATATTTTCAAATGTTCTGTCACCATGTGCACCCCAACCTCTCCAGGTATTTAAACTTTCTTGAGAATCCTCACCATATCTGAGACACCATATAGACGGGGGG-AGTGCAATATTACCAGTACCACATATATGTCTGGTGCTTGGGGGTGAAAAGGGTGCTTGGGGGTCAAGAGGACTATGACATAGGACCTTGATAACAATGATTAGTTGACCAATAATTGAAG-AGGTCAAAGTGTGGAGTTGAGGATTGGCCTTTTGTGCCAAGGACATGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGCATGAAAAGTCATTTGGTAAGGATACTGGAGTAAGGGGTCACAGAGGAGTGCTGGGTGCTATCCCGCATATGTAAGCTCCCTCTTATGACTTTGCTGAGAAAAAAACCAC-ACATTGTTAGCCTCACTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTAACCGTGGGATGGTTTCTTGAGACCTGAGTGAGGAGTGCAATGATCCATAGATGGAACACAATGATCTAAGGGTAATAGATCCTTGTTGTAATGGTATCACCTAATAGGCAGTTTTACCTTCTATGAGCATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 417041 623 + 647215 TCTTCATTGTTCACTAATACTCAACCATAATATTTTCAAATGTTCTGGCACCATTTGCACCCCAACCTCTCCAGGTAT--AGACTTTCTTGAGAATCTTCACTGTATCTGAGCCACCATATGGACGGGGAGTGGTGCAATATGACCAGTACCAAATATGTGTGTAGTGCTTGGGGGT-------------------CAAAAAGACCATGACATATGACCTTGATAACAATGGTTAGTTGACCAATAATTGAGGGAGGTCAAAGTGTGGTCTTAAGGATTCGCCTTTTGTCTTAAAGACTTGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGAATAAAAAGTCATCTGGTAAGGATACTGGAATAAGGGGGCAAAAAGCAGTACTGGATGCTACCCCCCATATGTA---TCCCTCTTAAGACTTAGCTGAGTAAAGGACCACCACATTGTTAGCCTCGCTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTTACCATAGGATGGTTTTTTGGGACCTGAGTGAGGAGTGCAGTGATCCATAGATGGAGCATAAAGATCTAATGGTAAGAGATCCTTGATGTATTGGTATCAGCTAATAGGCAGTGTCACCTTCTATGGGTCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 263992 80 + 294542 ACCAAAAAAGCATAGAACTGTGTATTAACTGTAAGTTGACCATTCAGAATCTATTGCTCTAAACATATGGCAAATTGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411288 80 + 636262 ACCAAAAAAGCATAGAACTGTGTATAAACTGTAAGTTGACCGTTCAGAATCTATCGCTCTAAACATATGGCAAATTGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 417664 64 + 647215 ----AAGAAGCATAGAACTGTGTATTA-CTGTAAGTTTCCCATTCAGAATCTATTGCCCTAAACATATG----------- + +a +s mr.mrrefChr5 264072 12 + 294542 ATTGTGGACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411369 12 + 636262 ATTGTGGACAAA + +a +s mr.mrrefChr5 264084 18 + 294542 GCATGCAAGCTCACTTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411392 18 + 636262 GCATGCAAGCTCACTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 264102 58 + 294542 AATATGAACTACGTCAGATGAGATGCCACCTTAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411421 58 + 636262 AATATGAACTACGTCAGATGAGATGCCACCTTAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 417728 51 + 647215 -------ACTACATCAGATGAGATGCTACCCCAACATGAGTTTTAGAAAAGGAACCTG + +a +s mr.mrrefChr5 264160 253 + 294542 TTGCACCACACGGCCAAAGTGTAAGCTCACTTCTGATACCCACAGAATTCGAATTACAATAAATGAGATGCCACCTCAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTGGTAGTCTGTTGCACCACACAGCTAAACAAAGTGAAGTCATTCCACACTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGCAATGCACCCAACTATACAAAGCCTAATTGCTAGGCAAGTTACTATAACACAGGATCATAGTGAGGTTCTTCGGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411487 244 + 636262 TTGCACCACACGGCCAAAGTGTAAGCTCACTTCTGATACCCACAGAATTCAAATTACAACAAATGAGATGCCACCGCAACATGGG----AGGAATGGAACTTGGTA-----TTACGCCACACAGCTAAACAAACTGAAGTCATTCCACACTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGAAATGCACCCAACTATACAAAGCCTAATTGCTAGGCAAGTTACTATAACACAGGATCATAGTGAGGTTCTTCTGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 417779 252 + 647215 TTGCACCACACAGCCATAATGCAAGCTCACTTCTGATTTCCAGAGAATTTGAATTACAATAAACGAGATGCTACCTCAGCAAGAGTTTTAGGAATTGAAGTTGGTAGTCTGTTGCACCACACAGTGAAACAAAGTGAAGATATTCCAC-CTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGCAATGCACCCAACTATACAAAGCTTAATGGCTAGGCAAGTTACTACAACCCAGGAGAATAATGGGGTTCTTTGGAAG + +a +s mr.mrrefChr5 264413 44 + 294542 CTAGCTGGCAAAGGTAAATACATGACATGGAAGAAATAAGACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411740 44 + 636262 CTAGCTGGCAAAGGTAAATACATGACATGGAAGGAATAAGACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 418031 44 + 647215 CTAGCTGGCACAGGTAGATACATGACATGGAAGAAATAAGACAG + +a +s mr.mrrefChr5 264457 287 + 294542 TACAGTTGAAGTCAGCACTGCCTTTTCACTTCAGTCCCTGTGTCTAAATCATGATTCACACCCGGTGTGTAATGTGTGGAAAGAGGTCAGACAATGACTACCATTTTAAGACAACCAACTATGTTGTTTTACATAGCTGTTGCAAGCGGTTAGCTGCACTTTCTAGGCTTCAGGGTCATAGAAAAGAAACAATGGGAATGTGGGCCACCTTACACTTACATTAATACATGCAATAATAGTGAGAGTTGAATACATTGCTGGCCAACTGATGGGTGGGGAAAACGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 411784 279 + 636262 TACAGCTGAAGTCAGCACTGCCTTTTCACTTCAGGCCCTGTGCCTAAATCATGATTCACACCCGGTGTGGAATTTGTGGAAAGAGGTAGGACAATGCCTACCATTTTAAGACAACCAACTATGTTGTTTTACACAGCTGTTGCAAGCGATTAGCTGCACTTTCTAGGCTCCAGGGTCATAGAAAAGAAACA--------GTGGACCTACTTACACTTACATTAATACATGCAACAATAGTGAGAGTTGAATACATTGCTGGACAACTGATGGGTGGGGAAAGCGCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 418077 285 + 647215 TACAGTTCAAGTCAGCAATGCCTTTTTACTTTGGTTCCTATGTCTAAATTATGATTCAAATCCCGTATGTAATGTATGGAAGGAGGTCAGACAATGACTACCATTTTAAGACAACCAGCTATGTTGTTCTGCATAGCTGTTGCAAGCAGTTAGCTGCACTTTCTAGGCTTCAGGGTCATAGAAATGAAATAATGGGAATGTGGGCCACCTTATACTTACATTAA--CATGCAATAATAGTGAGAGTAGAATACATTGTTGGCCACCTCACGGGTGGGGAAAACACCA + +a +s mr.mrrefChr5 264744 58 + 294542 GGGGAACAGAATAATAGTCTTGGTTATAAGCACTTATAGATCTGTGCACAGCCTGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412063 58 + 636262 GGGGAACAGATTAATAGTCTTGGTTGTTAGCGCTTATAGATCTGTGTACAGCCTGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 418367 58 + 647215 GGGGAATAGAATAACGGTCTTAGTTATAAGCACTTATAGGTCTGTGCACAGCCTGAGG + +a +s mr.mrrefChr5 264802 48 + 294542 TCAAAAAGCATAACTGGAAACCTGTCAATAAATAATCATATAAATCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412122 48 + 636262 TCAAAAAGCAGAACTGCAAACCTGTCAATAAATAATCATATAAATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 418425 48 + 647215 TCAAAAAACATAACTGGAAACCTGTCAGTAAATAATCATATAAATCTG + +a +s mr.mrrefChr5 264850 35 + 294542 TCTAATTGCAATAAACTTACATGGAAGAATCACCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412170 30 + 636262 -----CTGCAATAAACTTACATGGAAGAATCACCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 418474 19 + 647215 TCTAATTGCAAGATACTTA---------------- + +a +s mr.mrrefChr5 264885 147 + 294542 ATATGGGGTCTTATTATATTTTATTTTTTTCAGAGTTTATCCATAAAGTTGTATCATTTGATAATGCCTAGAAAAAAGCACTAAACCACAAAATATAGGAAAGAAACCTGATTTGCCTCAACAACAGAGCTAGCCAAGAAGAAGAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412201 147 + 636262 ATATGGGGTCTTATTATATTTTATTTTTTTCAGAGTTTATCTATAAAGTTGTATCATTTGATAATGCCTAGAAAAAAGCACTAAACCACAAAATATAGGAAAGAAACCTGATTTGCCTCAACAACAGAGCTAGCCAAGAAGAAAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 418493 105 + 647215 ---------------------------------------TCCATAAAGTCATATCATTGGATAATGCCTAGGACAAAGCACTAAACCACAAAATATAGGAAAGAAACCTGACTTACCTGAACAACAGAGCTAACCAAGTAGATG--- + +a +s mr.mrrefChr5 265032 18 + 294542 TGGGTGCACTGAGCAATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412351 16 + 636262 TGGGTGCACTGAG--ATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 418598 18 + 647215 TGGGTGCACTGAGCAATG + +a +s mr.mrrefChr5 265050 119 + 294542 CATGTAAATATTGCTATGGCACAATAACTCAACTATTAGGCCTTAAAGTCTAATAACTCTAATCTTTGTGAGTATAAAATCATGGGGCTGAGGCTCTGAAAGTGCTGAGCAATGTCCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412368 119 + 636262 CATGTAAATCTTGCTATGGCACAATAACTCAACTATTAGGCCTTAAAGTCTAATAACTCCAATCTTTGTGAGTATAAAATCATGGGGCTGGGGCTCTGAAAGTGCTGAGCAATGTCCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 418616 119 + 647215 CCAGTAAGTATTGCTATGGCACAATACTTTAACTATTAGGCCTTAAAGTCTAATAACTCTAATGTTTGTGAGTCTAAAATCATGGGGCTAAGGCTCTGAAAGTGCTGAGCAATGTCCTC + +a +s mr.mrrefChr5 265169 50 + 294542 CAATAGATGTAAGATTTGTATCATTCTTATTGGAAGGTTTATATGTAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412487 48 + 636262 CAATAAATGTAAGATTT-TATCACTCTCATTGGAAGGTT-ATATGTAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 418739 50 + 647215 CACTAGACGTAAGATTTGTATCATTCTTATTGGAAGGTTTATATGTAATC + +a +s mr.mrrefChr5 265219 41 + 294542 CCACGCACAGGCCTAAAATTTTTGTGACTTCTGCAACAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412544 41 + 636262 CCACGCACAGGCCTATAGTTTTTGTGACTACTGCAACAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 418789 41 + 647215 ATATGCACAGGCCTAAGATTTTTGTAACTTCTGCAACACTG + +a +s mr.mrrefChr5 265260 37 + 294542 AGTCTCTTTTCACGTGACACTCTACTCTGTTTTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412585 37 + 636262 AGTCTCTTTTCACGTGACACTCTACTCTGTTTTTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 418832 37 + 647215 GGTCTCTTTCCACATGACACTCTACTTTGTTTTTAGG + +a +s mr.mrrefChr5 265297 42 + 294542 TTATAGTGAGATGCTGGGCCCTTTATTAGCACCCCTAGAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412622 42 + 636262 TTATAGTGAGATGCTGGGCCCTTTATTAGCACCCCTAGAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 418896 42 + 647215 TTATAGTGAGATGCTGGGCTGTTTATAAGCACCCTTAGAGAG + +a +s mr.mrrefChr5 265339 33 + 294542 CCCGGCAGTAGCTATCAATGAGGCAGTAGCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412664 33 + 636262 CCCGGCAGTAGCTATCAATGAGGCAGTAGCTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 418939 33 + 647215 TTTGGCAGCAGCTGCTAATGGGGCAGCAGCTAT + +a +s mr.mrrefChr5 265372 102 + 294542 CAAGGCCACCCCCATAATGTATCTCCTTGCTCTTTTTTGTTTACATTAAGTATAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGACCATTAGTGTGGAGGATGACCATTGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412698 102 + 636262 CAAGGCCACCCCCATAATGTATCTCCTTGCTCTTTTTTGTTTACATTAAGTATAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGACCATTAGTGTGGAGGATGACCATTGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 418972 102 + 647215 CAACACACCCCCAATAATGCGTCTCTTCGAGCTTCTTTGTCTACATTAAGCATAGCTGGCGCCCTTTGAGTCAACCATTGGTGTGGGGGATGACTATAGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 265474 94 + 294542 AGGGGATATGTACATGAAGTATTGCAGCTAGTGACAGTGGGGACTGAGTTCTGACAATATTTAGCGGTGTCTCACGCCAAGTGATTAGATATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412800 94 + 636262 AGGGGATATGTACATGAAGTATTGCAGCTAGTGACAGTGGGGACTGAGTTCTGACAATATTTAGCGGTGTCTCACGCCAAGTGATTAGATATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 419075 94 + 647215 GGGGGACGTGTACATGAAGTATTGCAACTGGCACCAGTGGGCACTGGGTCCTGAAAATATTTAGCGGTGCCGCACACCAAATGATTAGATGTTC + +a +s mr.mrrefChr5 265568 18 + 294542 TGGATTGACTATCAGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412902 18 + 636262 TGGATTGACTATCAGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 419169 18 + 647215 TAGATTGACTATGCGTTT + +a +s mr.mrrefChr5 265586 84 + 294542 CTAGGCCACACCCTAGTTTGTTGAACCGCCCTGTTAATTTAACTGGGGGATGAGGTTTATGGAACTATGGGCCTAATTCCCCGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 412921 84 + 636262 CTAGGCCACACCCTAGTTTGTTGAACCGCCCTGTTAATTTAACTGGGGGATGAGGTTTATGGAACTATGGGCCTAATTCCCCGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 419187 84 + 647215 CTAGACCACACCCTAGCTTGTTGAACCCCCCTGTTAATTAAACTGGGGGATAAAGTTTATGGAACTATGGGTCTAATTCCTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 265670 22 + 294542 GTTGCTGACACTCATTTGAGGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413005 22 + 636262 GTTGCTGACACTCATTTGAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 419272 22 + 647215 GTTGTTGACATTCTTTTGAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 265692 61 + 294542 CCATGATTGGTTGATCTGCCATAAGCATAGGCTAAGATGAATTCCACTGACTGCAGAGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413027 61 + 636262 CCATGATTGGTTGATCTGCCATAAGCATAGGCTAAGATGAATTCCACTGACTGCAGAGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 419295 61 + 647215 CCGTGATTGACTGATCTGCCATGAGCACAGGCCAAGATGAATTCCACTCAATGAAGAGATA + +a +s mr.mrrefChr5 265753 12 + 294542 CAATTTAACCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413093 12 + 636262 CAATTTAACCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 419356 12 + 647215 CAATTTAACCCA + +a +s mr.mrrefChr5 265765 187 + 294542 TACCTAATATATGTGTGGTGCTTGGGGCTCATAATTAAGGAATGTGACATGCAGACCCCGACATCACTGATTCATTGACCAATAATTCAAGTAAGGTGAAAGTGTGGAGTTAAGATTGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACCTCTTGAAACTAGATAGGGAATACACTCCCACATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413105 179 + 636262 TACCTAACATGTGTGTGGTGCTTGGGGCTCATGATTAAGGAATGTGACATGCAGACCCCGACATCACTGATTCATTGACCAATAA-----GGAGGGTGGAAATGTGGAGTTAG---TGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACCTCTTGAAACTAGATAGGGAATACACTCCCACATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 419370 187 + 647215 TACCTAATATATGTGTGGTGCGCGGGGCTCATAACTTAGGTATATGACATGCAGACCCCAACAGCCCTAATCCATGGACCAATAATTCAAGTAAGGTGAATGTGTGGAGTTAAGATTGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACGTCTTGAGACTATATAGGGAACACACTCCCACATAA + +a +s mr.mrrefChr5 265952 132 + 294542 AGAGATACAGGTGCACTTGATGCTACTCCCCATCTATCACCTCCCTCTTTTTACTTTGCTCAGTGAAGGGCCACATCACACATTGTTAGTCTTACTCAACCTATAGCACAGTCTGTGCTACAATGAGGGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413284 132 + 636262 AGAGATCCGGTTGCACCTGAAACTACTCCCCATCTATCACCTCCCGATTTTTACTTTGCTCAGTAAAGGACCACATCACACATTGCTAGTCTTACTCGACCTATAGCACAGCCTATGCCACAATGAGGGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 419614 123 + 647215 AGACAGACAGGGGAACTCAATGCTACTCCC------TCACCTCTTTCTTTTCATTTTGCTCAGTGAAGGGC---ATCACACATTGTTAGGGTTACTCAACCTATAGCACAGTCTGTGCTACAATGAGGACCT + +a +s mr.mrrefChr5 266084 178 + 294542 GATGGGATGCTTTCTTGAGACCTGAGTAAGGAGTGCAACAATCTACAGATGAACCGCAGTGACCTAATGATAAATAATCCATAGACAGAACACCAGGATGTAACAGTATTAGCTAACAGTTAGGTTCACATTCTATGGGACGGGTACATGATAAATTAAGGGGGCATCATGTGTCAAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413416 178 + 636262 GATGGGATGCTTTCTTAAGACCTGGACAAGGAGTACAACAATCTACAGATGAACCGCAGTGACCTAATGATAAATAATCCATAGACAGAACACCAGGATGTAACAGTATCAGCTAACATTTAGGTTCACATTCTATGGGATGGGTATATGATAAATTAAGGGGGCATCATGTATCAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 419740 177 + 647215 GATGGGATGCTTTCTTGAGACCTGAGTGAGGAGTGCAGCAATCTACAGATGAACCACGATGACCTAATGGCAAATGATCCATAGACAGAGCACCAGGATGTAACAGTATTAGCTAATAGTCAAGTTCACATTCTATGGGACGGGT-CATGACAAACTAAGGAGGCATCATGTGTCAAC + +a +s mr.mrrefChr5 266262 121 + 294542 TGTAAGGTGAACACTCAGAATCTATTGCTCTACACAAATGGTATAGATCCCATCATGGACAAATTTAGGAGGCCATATGCGAGCTTACTACTAATACCCTTATAATTAGAATTATAACAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413594 121 + 636262 TGTAAGGTGAATACTCAAAATCTGCTGCTCTACACAAATGGTGGAGACCATATCATTGACAAACTTAAGAGGCCAAATGTGAGCTTACTACTGATACCCTTATAATTAGAATTATAACAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 419920 121 + 647215 TGTAAGGTGAACACTCAGAATCTATTGCTCTACACAAATGGGATAGATCCCATCATGGACAAATTTAGGAGGCCATATGCCAGCTTGCTACCAATACCCTTACAATTAAAATTGTAACAGA + +a +s mr.mrrefChr5 266383 14 + 294542 TGAGATCACACCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413720 14 + 636262 TGCTATGACACCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 420041 14 + 647215 TGAGATCACACCTT + +a +s mr.mrrefChr5 266397 71 + 294542 TTATGAAAGGAACTCAGTAGTCTACTGAGTGAAACAGCTAAACAGGGTGAACTCATCCTGCACTAGCTATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413743 69 + 636262 TTATGAAAGGAACTCAGTAGTCTACTGAGTGAAACAGCTAAACAGGGT-AGCTCATCCTGCAC-AGCTGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 420055 71 + 647215 TTATGAAAGGGTCTAAGTAGTCTATTGAGTGAAATAGCTAAACAAGTTGAACTCATTCTGCACTAGCTATC + +a +s mr.mrrefChr5 266468 255 + 294542 AAATTCCATACTAAGCTGCACACCCAACCGCACAAAGCCTGATTGCTAAGCAAGTTGCTATAACTCAAGCACGTGTGATGAGGTGCTTTGGAAGCCAGGTAGATACATACCATGGAAGAAATGACACATCACATAATCGTTACAGTTCAAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGCCCCTGAGTCTAAACTGTGATTCACACCAGCTGTGTAATTAAAGCAACAAGAGTGAGAGTTGAATGTTGGTCTGGGGGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 413812 201 + 636262 ---------------------------------------------------AAGTTGCTATAACTCAAGCACATGTGACGAGGTGCGTTGGAAGCCAGGTAGATACATACCAGGGAAGAAGCGACACATCACATAATCGCTACAGTTCAAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGC---TGAGTCAAAGCTGTGATTCACACCAGCTATGTAATACATGCAACAAGAGTGAGAGTTGAATGTTGGTCTGGGGGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 420129 253 + 647215 AAATTCCATACTAAGCTGCACACCCAACCGCACAAAGCCTGATTGCTAAGCAAGTTGCTATAACTCAGG-GTGTTTGATGAGGTGCTTTGGAAGCCAGGTAGATACATAACATGGAAGAAATGACACATCACATAAGCATTACAGTCAGAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGCCCCTGAGTCTAAACTGTGCTTCACACCAG-GGTGTAATTAAAGCAACAAGAGTGAGAGTTGAGTTCTTGGATGGCTATTG + +a +s mr.mrrefChr5 266723 6 + 294542 AGCTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414030 6 + 636262 AGCTGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 420382 6 + 647215 GGCCGG + +a +s mr.mrrefChr5 266729 116 + 294542 GGCTCTCAGTCTGAGAGTTATCACACTCTTATTTGCGACCTTTCCCATTAGCTGATCCATAAGACTAACATGAAATTCTGCTAAATGATATGGTGTGCCACATGAGATCCCCCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414049 116 + 636262 GGCTCTCAGTCTGAGAGTTATCACACTCTTATTTGCGACCTTTCCCATTAGCTGATCCATAAGACTAACATGAAATTCTGCTAAATGATATGGTGTGCCACATGAGATCCCCCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 420388 116 + 647215 GGGGCTCAGTCTGAGGGTCATCACACTCTCATTTGTAAACTCTCCCATTAGCTAATCTGTAAGACTGAGATGGAATTCTTCTTAACAATAAGGTGCACAACGTGAGGTCCCTCTCC + +a +s mr.mrrefChr5 266845 104 + 294542 ACCCTTGTAATCACCAGGTTCTGTGTACTTGTCAGGTAATCATGTATGGCTCATAAATTGCTAGGGAAGTTGGACCAGCTGGTAGGAAATATGGTGGTAGCTCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414176 104 + 636262 ACCCTTGTAATCACCAGGTTCTGTGTACTTGTCAGGTAATCACGTATGTATCATAAATTGCTAGGGAAGTTGGACCAGCTGGTAAGAAATATGGTGGTAATCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 420504 101 + 647215 ACCCTTGTAATCACCAGGTTCTGTGTACTTGTCAGGTAATCATGTATGGCTTGTAAATTGCT---GAAGCTGTACCAGATGGTAGGAAATATGGTGGTAGCTCG + +a +s mr.mrrefChr5 266949 378 + 294542 TTAGGAAGGCCACAATCATGAGGATGCTTGCCCCCTAGATACTTTTTGACTTGAGCTTGAATAGCAAAAACAGCATGACATGTGGTGAGTTTGTGATCTAAGCTAGTCACCTGTGCACAAACTGGTGAATTTCAGCCCATGATTTTGTTATCCCTAATATTGATTAAACATATACATTATATAACCCCATAATTTCCACTGGCCAACTGCTAGGAGTGTTTGTGGTGATTTCTATCACTGTCCAATTGATTAAGGGAATACAAAGAGCTTATGAGCTTCTCCCTTTAAATCACTATTATGTCACAATGGCTCAACTCCTAATGTGAAACTGTAGGAATATCTTGTTAAACAAAACTTTTCAAAATCCAGACCCATGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414281 362 + 636262 TTAGGGAGGTCACAATCATGAGGATGCTGGCCCCCTAAATACTTTTTGATTTGGGCTAGAA---CAAAAACACCATGACATGTGGTGAG------GTCTAAGCTAGTCACGTGTGCAAAAACTGCTGAATTTCAGTCTATGATTTTGTTATCCCTAATATTGATTAAACATATACACTATATAACCCCATA-------CTGGCCAACTGCTAGGAGTGTTTGTTGCGATTTCCATCACTGTCCAATTGATTAAGGGAATACAAAGAGCTTATGAGCTTCTCCCTTTAAATCACAATTATGTCACAATTGCTCAACTCCTACTCTGAAACTGTAGGAATATCTTACTAAACAAAACTTTTCAAAATCCAGACCCATGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 420605 339 + 647215 TTAGGAAGACCATAATCATGTGGATGCTTGCCCCCTGGGTATTTTTTGACTTAAGCTTGGATAGCAAATTCAGCATGACATGTTGTGAGTTTGTGATCTAAGCTAGTCACCTGTGCACAAACTGGTGAAGTTCAGCCCATGATTAT------------ATTGATTAAATATACACATTATATAACCCCATAATTTCCACTGACCAACTCCTAAGAGTGTTCATGGTGTTTTCTATAACTGTCCAATCGATTGAGAGAATGCAAAAAGCTTATGAGCTTCTCCATTATATTCACTATTATGACAGAATGGCTCAACTCCTAATGTAAAACC-CAGGATTATCTTGTCACATAA-------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 267327 164 + 294542 GCAGCACAGTTTTAGGTGGTCTCCCAATGCTTAAGGGCAATGCATCCATGGAGGGTGCAGATGATTGCAAGCCAATGTGCCACACTCCAGTGCATTTTGTGATTTGAATCCATATCGTCAACTTGCAGGACATAGTTGCAATGTCCAACCTGCAGTCAACTACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414644 128 + 636262 GCAGCACAGTTTTTGGTGGTCTGCCACTGCTTAAGGGCAATGCAACCATGG---------------------CAATGTG------TCGAGTGCATTTTGTGATTTGAATCCATATCCTGGACTTGCGGGACATAG----AATGTCCAACCTGCAGTCAA----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 420944 164 + 647215 GCAGCACAGTTTTAGGTGGTCCCCAAATGCTTAAGGGCAATGCATCCATGGAGGGTGCAGATGATTGCAAGCCAATGTGCCACACTCCAGTGCATTTTGTGATTTGAATCCATATCGTCAACTTGTAGGACATAGTTGCAATGTCCAACCTGCAGTCAACTACC + +a +s mr.mrrefChr5 267491 95 + 294542 ATTTTGTTATTCTCTTCTCTCTAATAGTGGAATGATAAAGAGCAGCGTAGGATTGCAAAAACTAGGATGGAAAAAATGTACTAATGTAGGAAATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414772 94 + 636262 -TTTTGTTATTCTCTCCTCTCTAATAGTGGAGTGATAAAGAGCAGCGTAGGATTGCAAAAATTAGGATGGAAAAAATGTACTAATGTAGGAAATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 421110 95 + 647215 ATTGTGTTATCTTCTTCTCTCTAATAGTTGAATGATAAAGAGCAGAGTAGGATTGCAAGGTCTAGGATTCAAAAAATGTACTAATGTAGGAAACT + +a +s mr.mrrefChr5 267586 117 + 294542 AATCCTGGTGTCCGTATTATTCCACATGTCCTCTACATGCAGTTGGGTGGCTACATATTGAGCTTTGAGTTGAATACATTTGCAAGAGAGTAGCTATGAATTATCATGGGGCAATTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414872 114 + 636262 AACCCTGGTGTCCGTAATATTCCACATGTCCTCC---TGCAGTTGGGTGGCTACATATTGAGCTTTGAGTTGAATACATTTGCTAGAGAGTAGTTATGAATTATCATGGGGCAATTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 421205 117 + 647215 AATCCTGGTGTCCGTATTATTCCACATGTCCTCTACATGCAGTTGGGTGGCTACATATTGAGCTTTGAGTTGAAAATGTTTGCAAGAGAGTGGCTATGACTTATCACAGGGCAATTG + +a +s mr.mrrefChr5 267703 14 + 294542 CATGCTGAGTTTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 414996 14 + 636262 CATGCTGAGTTTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 421322 14 + 647215 CATGCTGAGTTTTG + +a +s mr.mrrefChr5 267717 12 + 294542 ATTGAATATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415011 12 + 636262 GTTGAATATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 421336 12 + 647215 ATTGAATATGTT + +a +s mr.mrrefChr5 267729 81 + 294542 GAGGGTAGCTATGCATTCTCTTACACATCCAGGGCATTGGGTCAGTATCACAAAATGGTTGTTACTATGGCAGAGGAAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415023 81 + 636262 GAGGGTAGCTATGCATTCTCTCACACAGCCAGGGCATTGAGTCAGTACCACAAAGTGGTTGTTACTATGGCAGAGGAAGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 421353 81 + 647215 GAGGGTAGCTATAAATTCTCTTACACATCCAAGTCATTGGGTCAATATCCGAAAATGGTTGTTATTATAGCATAGGAAGGG + +a +s mr.mrrefChr5 267810 71 + 294542 TGGAATCCACAAGAGTAGTTGTATAAATGAGAGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAACGTGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415109 71 + 636262 TCGAATCCACAGGAGTAGTTGTTTAAATGAGAGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAATGTGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 421434 71 + 647215 TGGAATCCACAAGAGTAGTTGTATAAAAGAGGGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAACATGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 267881 19 + 294542 CCTGTAAAAGCTATATGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415180 19 + 636262 CCTGGAAAAGCTATATGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 421507 19 + 647215 CCTGTAAAAGCTATGCGCA + +a +s mr.mrrefChr5 267900 369 + 294542 GATTGAGAAGACCAAGTGTGTACTATCTAGGAGATTGATGTTACCATTATGGTAGTAGCCTAGGGCCACTGAAAGGGGACTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATTGAGCAGCTAGTTATTTGTACTTCTTTGTAGTGGTACAGAACTATTATGTCAGCAGGGCATGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCTTGAACTGGTGTCATTCAGGAGTTCTGTGCAGCAGATCCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAATGAAGTCTTCTGCGGCTGGGACCTACGCATGGGCACTGGCCAAAGAGCATTGAAACTTTTACATGGAGTGTTAGATGCTTTATCAGGCACATTATTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415199 369 + 636262 GATTGAGAAGACCAAGTGTGTACTATCTGGGAGATTAATGTTACCATTATGGTAGTAGCCTAGGGCCACCGAAAGGGAACTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATTGTGCAGCTAGTTCTTTGTACTTCTTTGCAGTGGTACAGAATTATTATGTCAGCAGGGTGTGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCTTGAACTGGTTTCATGTAGGAGTTCTGTGCAGCAGACTCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAATGAAGTCTTCTGCGGCTAGGACCTATGCATGGGCATTGGCCAAAGAGCGTTGAAACTTTTACATGGAGCGTTAGATGCTTTATCAGGCACATTGCTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 421527 368 + 647215 GACTGAGAAGACCAAGTGTGTACTGTCTAGGAAATTGATGTTACCATTATGATAGTAGCCTAGGGCCACTGAAAGGGGATTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATAGAGCAGCTAGTTATTTG-ACTTCTTTGTAGTGGTACAGAACTATTATGTCAGCAGGGCATGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCACAAACTGGGGTCATTCAGGAGTTCAGTGCAGTAGATCCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAAGGAAGTCTTCTGCGGCTGGGACCTGCGCATGGGCACTGGCCAGAGATCACTGAAACTTTTACATGGAGTGTTAGATGTGTTATCAGGCATATTATTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 268269 382 + 294542 GATGTCTGGGCAATCAAAAGTGGGCAGATTCCTGCTCAAATACAGTTTATCATCACGCACTGGGCAGGGTATAAGCCAGTTATTTGATTGCTCGTAGGGGACCCAGAGCACAACTTCTGCTTAAACAAGATCCATACTTCCACTTAAGAAAGCCCAATTTGATTTTCCCTTGAATTTTGGCAGATCTTTTGATAGACACCCACATTCGTACGTCATGACAAGTTTGTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAATGAAAGGCTTGCTGGTCACCAACCCAAGACAGATGTTCAAAGCTGTCATTACACAGTGTGCTTTGGCCACTGTACACTATGGACAAATATGCAAACCAGAGAACACCTCATTAATGGTATGACTTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415570 382 + 636262 GATGTCTGGCCAATCAAGAGTGGGCAGATTCCTGCTCAAACACAGTTTATCATCATGCACTGGGCAGGGTATAAGCCAATTATCCGATTGCTCGTAGGGAACCCAGAGCACAACTTCTGCTTAAACAAGATCCATACTTCCACTTAAGAAAGCCCAATTTGATTTTCCCCTGGAGTTTGGCAGATCTTTTGATAGACAACCACATTCGTACATCATGACCAGTTTGTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAATGAAAGGCTTGCTGATCACCAACCCAAGACAGATGTTCAAAGCTGTCATTACACAGTGTGCTTTGGCCAGTGTGCACTATGGACAAATATGCAAACCAGAGAACACCTCATTAATGGTATGACTTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 421895 382 + 647215 GATGTCTGGGCAATCAAAAGTGGGTGGATTCCTGCTCAACTACAGTTTTTCATCACGCACTGGGCAGGGTATAAACCAGTTATTTGGGTGCTTGTAGGAGACCCAGAACACAACTTCTGCTTAAAAAAGATCCATACTCCCACCTAAAAAACCTCCATTTGATTTTACCTTGAATTTTGGCAGAGCTTTTGATAGCCACCCGCACTTGTCTGTCATGGCAAATTTTTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAAAGAAAGGCTTGCTGGTCACCGACCCAAGACAGATGTTCAAGGCTGTCATTACACAGTGTACTTTGACCACTGTACACTACAGACAGAAATGCAAACCAGAGAATACCTAATTAATGATGTGACTTAT + +a +s mr.mrrefChr5 268651 268 + 294542 ATCTGGCTGGAGCATGTCTATTCCCCAGTAGCAATAAAGGGCCCTGCTTAAGGCTGCAAGCTTAATCAGCCTCCAAACAAGGGGTTAATTTTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTAGGACCTGTGGTCTCCCTGGCCTTTAATGAATCACAAAGAGCTTCCAACTCCTGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACATCAGTAAACAGACTGTTATGCAGAGTTTCCCTTCCCCAAGTTCATCCCCACCATTAGGCTTACAACTGAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415952 268 + 636262 ATCTGGCTGGAGCACGTCTATTCTCCAGTAGCAATGAAGGGCCCTGCTTAAGGCCGCAAGCTTAATCAGCCCCCAAACAAGGGGTTAATTGTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTAGGACCTGTGGTCTCCCTGGCCTTTAATGAATTGCAAAGAGCTTCCAACCCTCGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACATCAGTAAACAGACTGTTATGCAGAGTTTCCTTTCCCCAAGTTCATCCCCACTGTTAGGCTTACAACTGAAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 422278 266 + 647215 ATCTGGCTAGAGCATGTCTATTTCCCAGTAGCAATAAATGGCCCTTTTTGAGGCTGCAAGCTTGATCAGACTCCACACATGGGGTTAATTTTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTATAGCCTGTAGTCTCCTTGGCCTTTAAAGATGCACAAAGAGCTGCCAACTCCTGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACACCAG--TACAGACTATTATGCTGAGTTTCCCTACTCCAAGTTCATCCCCACCACTAGGCGTGCGACTGAGT + +a +s mr.mrrefChr5 268919 137 + 294542 TCCCAAGAATACAGAGTGTTTTTAGTCTCTTATTCCAAGTACCATAATTTGCTGAGGGCCTGTACACCTAGTTAGACAAAATTACAGCCAAAACAGTAGTTTTTTTAATCCATTCCCACCCTCCATAGCACAATCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 416518 137 + 636262 TCCCAAGAACACAGAGTGTTTTTAGTCTCTTATTCCCAGTACCATCGTTTGCTGAGGGCCTGTGAACATAGTTAGACAAAATAACACCCAAAGCAGTAGTTTTTTTAATCCATTCCCACCCTCCATAGCACCATCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 422544 136 + 647215 TCCCAAGAGTATAGAGTGTCTTTAGTCTCTTATTGCAAGTACCATAATTAGCTGAGGGC-TGTACACCTAGTTAGACAAAACTACAGCAAACACTTTAGTTTTTTTAATGCATACCCACCCTCCATAGCACAACCAA + +a +s mr.mrrefChr5 269056 450 + 294542 TGTTGAATTGAACTTTCCCATTTAATGAGTCATAGGTAACTTATTCCTGTTTTCCTCTTACTTATAAACAAACCCTGCCACCACATATTGACAACTTGACATGCATTCAGGATATGCATTATGATTTGTCATTTTTGGCATGTACTAGTTGCTAGGGGGGCTGATGGCGGAAACCTTTTTTGTCACAGCTTGATAGTCAGTGGTTCACTAAAGTATGTATTTAGATGCCCTCACGTCTATTCCAGATGCAAGTATCAATCCCAGCTACCAGCTCACTTCCAAACAAAAGAGCATATTTGCAATCATGCTGAGGCATTGGACTACAAAAGTCAAGTCACTGATAAACTCTGCGCAATCTTAAGGTATTTAATAAAGAGAGTTGGTCTCCTAAGGTATCACTAGTCTGAATGCTATCATGTTGCTATTGGATTTCTCATCAGCAGGATTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 416655 446 + 636262 TGTTG--TTGAACTTTCTCATTTAATGAACCATAGGTAACTTATTCCTGTTTTCCTCTTACTTATAAACAAACCCTGCCACCACATATTGACAACTTGACATGCATTCAGGATGTGCATTATGATTTGTCATTTTTGGCATGTACTAGATGCTAGGGGGGCTGATGGCGGGAACCTTTTTTGCCACAGCTTGATAGTCAGTGGTTCATTAGAGTATGTATTTAGATGCACTCACGTCTATTCCCGATGCAAGTACCAATCCCAGCTGCCAGCTCACCACCAAACAAAAGAGCATATTTGCAATCATGCTGAGGCATTGGACTACGAAAGTCAAGTCACAGATAAACTCTGCGCATTCTTAAGGTATTCAATAAGGAGAGTTGATCT--TAAGGTATCACTAGTCTGAATGCTATCATGTTGCTATTGGATTTCTCATAAGCAGGATTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 422683 438 + 647215 TGTTGAATTGAACTTTCCCATAAAATGAGTCATTGCTAACTCATTCCCGTTTTCCCCTCACTTATAAACAAACCCTGCCACTATGTATTGACAACTTGACATGCATTCAGGATATGCATTACGATTTGTTCTTTTTGGCATGCACTAGTTGCTAGGGGGGCTGTTGGCGGAAACCCTTTTTGTCATAGCTTCATAGTCAGTAGTTCACCCAAGTATGTATCTAGATGCCCTCATGTCTATTCCAGATGCAAGTATCAATCTGAGCTACTGGCTCCCTTCCAAACCAAACAGGATATTTGCAATCATGCTGAGGCGTTAGACTACAAAAGTAAAGTCACTGATAACCTCTACATAATCTTAAGGTACTTAACAAAGAGAGTTGGCCTCCTAAGGTATCACTAATCTGG------------TGCTATTGGATTTCTCCTCAGCGGGATTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 269506 126 + 294542 CCAGTTGAGCTGGACTGGGGTATCACAAAGTCATTATTTCTCTGTTACCTCCGTATATGTCCAAAGTGACTATCTTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACTCACCATATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417101 126 + 636262 CCAGTTGAGCTGGACTGGGGTATCACAAAGTCATTATTTCTCTGTTACCTCCCTATATGTCCAAAGTCACCATCTTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACCCAGCATATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 423136 126 + 647215 CCGGTTGAGCTGGACCAGGTTATCACAAAGTCTTTATTTATCTCTTACCTCCGTATATGTCCAAGGTGACTATCCTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACTCACCATATTG + +a +s mr.mrrefChr5 269632 47 + 294542 CCTACTCAATAATTGTCTAGTCATTGGTCAGGTTGCTATTTTGAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417228 47 + 636262 TCAACTCCATAATTGTCTAGTCATTGGTCAGGTTGCTATTTTGAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 423262 47 + 647215 CCTGCTCAATAATTGTCTAGTCATTGGTCATGTTGCTATATAGAAAC + +a +s mr.mrrefChr5 269679 88 + 294542 ACACCCAGTAATGGGCCCTCTAATCATGGAAGCAAGGCAGGGCAACTACTAAAAAGAGCGATCCATGTCAACTATGTTGGGGTGCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417277 88 + 636262 ACACCCAGTAATGGGCCCTCTAATCATGGAAGCAAGGCAGGGCAACTATTCAAAAGAGCGATCCATGTCAACTATGTAAGGGGGCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 423309 88 + 647215 ACACGCAATAATGGGCCATCCAATCATGGAAGCAAGGTAGGGCAATTACTAAAAATAGTGTCCCATGTTAACCATGTTGGGGTGCCAG + +a +s mr.mrrefChr5 269767 38 + 294542 CATACTAAAGTTAATATGGGTTCCATTAATATGGGCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417366 38 + 636262 TATACTAAAGTTAGTATGGGTTCCATTAATATGGGCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 423397 38 + 647215 CATACTAAAGTTAATATGGGTTCCATTAATATGGGCCC + +a +s mr.mrrefChr5 269805 33 + 294542 AAAGCATCTGGTGATGGTTGGGATAAAACGACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417404 32 + 636262 -AAGGATCTGGTGATGATTGGGATAAAACGACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 423436 33 + 647215 AAAGCATCTGGTGATGGTTGGAATAAAACAACC + +a +s mr.mrrefChr5 269838 90 + 294542 ATGTGCTACTCTGCCTGTGGTCAACCAAGGGGGAGCCAGTATCAAGGCTTCGCATTCTCTCCTGCAACCCTCATCACTTTCACAGTATGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417437 90 + 636262 ATGCGCTACTCTGCCTGTGGTTGACCAAGGGGAATCCAGTATCAAGGCTTCACATTCTCTCCTGCAACCCTCATCACTTTCACAGTATGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 423469 90 + 647215 ATGTGCTACTCTGCCTGTGGTCAACCAAGGGGGAGCCAGTATCAAGGCTTCGCATTCTCTCCTGGAACCCTCATCACTTTCACAGTATGT + +a +s mr.mrrefChr5 269928 108 + 294542 CTGCCCACTCTCGTGTCTAATGGACCTTCCCATGAATGTTTGCATCAATCCTTGGCCAACAGATATGACCAGTTCTGGTGGGGCATACACGAAAGGGATGGAACTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417528 108 + 636262 CTGCCCACTCTCGTGTCTATCAAACCTTCCCATGAATGTTTGCATCACTTCTTGGCCAACAGATATGACCAGTTCTGGTGGGGCATACATGAAAGGGATGGAACTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 423559 108 + 647215 CTGTCCACCCTCTTATCTAATGGACCTTCCCATGGATGTTTGGATCAATCTTTTGCCAACAGATATGACCAGTTCTGGTGTCTCATACACGAAACGGATGGAACTGAA + +a +s mr.mrrefChr5 270036 90 + 294542 CATGGTGCATATTCCCAAAAGGATGGGAATGTCTCAAAAACCATCATCCAGGTGAATGGAGGGGGGTTGACAGGGTGTCTGTTGCATTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417637 90 + 636262 CATGGTGCATGTTCCCGAAAGGATGGGAATGTCTCAATAACCATCATCCAGGTGAATGGAGGGGGGTTGACAGGGTGTCTGTTGCATTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 423667 90 + 647215 CATGGTGTATATTCCCATAAGGTTGGGAATGTCTCAAAAACCATCATCCAGGTGTATGGATGGGGGGTAACAGGGTGCCTGTTGTGTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 270126 193 + 294542 ATGTAGATCCTGCTGTGACACTACTAATGATAGCTGACATGATTTTAAGTGGAAACGTGAAGTGTCTCTAGGAATGTAAACCAAAAAATCCTCATGGGTGATCAAGGTCAGCAAACCATCATGAGTGGTTGGATGACTGGAAGGCATAAATGTATCATGTTAATTTCTTACCCCACTGATTTCATGTCTTTAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417727 193 + 636262 ATGTAGATCCTGTTGTGACACTACTAATAATAGCTGACATAATTTTAAGTGGAAACGTGAAGTGTCTCTAGGAATGTAAACCAAACATTCCTCATGGGTGATCAAGGTCAGCAAACCATTATGAGTGGTTGGATCACCAGAAGTCATAAATGTATCATGTTGATTTCTTATCCCACTGATTTCACATCATTAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 423759 190 + 647215 ATTTAGGTCCTGCTGGGACCCT---AATGATAGCTGACATGATTTTAAGTGGAAATATGATGTGTCTCTAGGAATGTAAACCAAGAAATCCTCATGGGTTATCAAGGTAAGCAAACCATCATGACAGGTTGAATGACTGGAAGGCCTAACTGTCTCATGCCAATTTCTTACCTAACTGATTTCATGTCTTTAG + +a +s mr.mrrefChr5 270319 31 + 294542 CTGAAGTTCGTCTCCATGTGGTTGCCAGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417920 31 + 636262 CTGAAGTTCGTCTCCATGCAGTTGCCAGAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 423966 31 + 647215 CTGAAGTTCATCTCCATGTGGTTGCAAGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 270350 61 + 294542 TACCAGAAATCTGATGTACACTGATAGGCCTACTAAGCTCCACTGCCTCGTCTTAGTAGAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 417951 61 + 636262 TACGAGAAATCTGATGTACACTGATAGGGCTACTAGGCTCCACTGCCTCGCCTTAGTAGGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 423999 61 + 647215 TACCAGAAATCCAATGTACACTGGTAGGCCTACTGAGCTCCACTGCCTTGTCTTGGTTGAC + +a +s mr.mrrefChr5 270411 54 + 294542 ACCACACTTTGTAAGTTAAGTTGTGGTAGGACATAGAACCCTACTAACATGGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418012 44 + 636262 ACCACACTTTGTAAACTATGTTGTGGT--------GAACCCTACTAACATGG-- +s simRat_chr6.simRat.chr6 424061 54 + 647215 ACCACACTCTGTAAGTTAAGATGTGGTAGGACATAGAACCCTACTAACATGGGA + +a +s mr.mrrefChr5 270465 265 + 294542 ACATCAATGTCACTACCTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCCCTGGATATGAGATCTTCGTTTCATATAAAATAGTCAGAACTTCCTAGTTTGGTTACAGACACAGGCATCCCTATTAACCTAGTAGTTCCTGCTCTGCCACCGGCAGTTTGAGGACCCTTGACTGTTCGTTCTTTCTACACTTGGTGCCATCTTTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATTCATCTTTTTCTCTATCAATTGCACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418056 262 + 636262 ---CTAATGTCACTACTTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCCCTGGGTATGAGATCTTTGTTTCACGTAAAATAGTCAGAGCTCCCTAATTTGGTTCCAGAAACAGGCATCCCTATTAACCTAGTAGTTCCTGCTCTGCCACCAGCAGTTTGAGGACCCTCGACTGTTCGTTCTTTTTACACTTGGTGCCATCATTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATTCATCTTTTTCTCTATCAGTTGCACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 424116 259 + 647215 ACATCAACGCCACTACCTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCTCTGGATATGAGATCTTCGTTTCATATAAAATAGTCAGAACTTCCTAGTTTGGTCACAGACACAGGCATCCCTATGAGCCTAGTAGTGCCTGCTTTTACACCGG------GAGGACCCTTGACTGTTCGTGTTTTCTACAATTGGTGCCATCTTTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATACATCTTTATCTCTATCAATTGCACT + +a +s mr.mrrefChr5 270730 282 + 294542 CCAATACTTGTATAGACCTCTACAGCATTGAGATAATGAGCAGACCATGTATCCTTTCTTGATGCCCATGCTATTGCAGTATTTGCTTGGAACTTTTACAGGGCTAGAATGCACAAAAGTGCCCAAACAATTTATTTATATCCTGAGCCATAACTTAGTTTAGGGAGATCTACAGGATTTCATGTTCACATGTTTCACTAGAGTTCTCATGTTGTGCCCTAACCATTCCTCCCAACTGCATGGATAACTCTACGTTTTAGAAATATCTGGTGTAGGATGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418318 273 + 636262 CAAATACT---------CTCTACAGCATTGAGATAATGAGCAGACCATGTATCCTTTCTTGATGACCATGCTATTGTAGTATTTGCTGGGAAGTTTTACAGGGCTAGAATGCACAAAGGTGCCCAAACAATTTATTTATATCCTGAGCCATAAATTAGTTTAGTGAGATCTACAGGATTTCATGTTCACATGTTTCACTAGAGTTCTCATGTTGTGCCCTAACCATTCCTCCCAACTGCATGGATAACTCTACGTTTTAGAAATATCTGGTGTAGGATGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 424382 282 + 647215 CCAATACCTGTATAGACCTCTACAGCATTGAGATAATGAGCAGACCATGTATCCTTTCCTGATGCTCATGCTATTGCAGTATGTGTTTGGAACTTTCACTAGGCTAGGATGCACAAAAGTGCCCAAACAATTTATTTATATCCTGAATCATAACTTAATTAAGGGAGATCTACAGGGTTTCATGTTCACATGTCCCACTAGAGTTCCCATCTTTTGCTATAATCATTCCTCCCAAATGCATTGATGACTCAACATTGTAGAAATATCTGGTGTATGTTGGTG + +a +s mr.mrrefChr5 271012 180 + 294542 GTGTGGTACTTTCCCTTTCTCTTGGCACTATGAAGGCTTTTCTAATCTGTTGAGAACATCTGAAGGTTAACTGACTATTGGCATGACTGGATCCTCTGAGGTGACAGCAAAACATAAACACTTAAATCACCTCTGGCTGTTCCTTGGATGTGAAAGAAATGATTGCTGAGAGCAATTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418591 175 + 636262 GTGTGGTACTTTCCCTTTCTCTTGGCACTATGAAGGCTTTTCTAATCTGGTGAGAACATCTGAAGGTTAACTGACTATTGGCATGACTGGATCCTCTGAGGTGACAGCAAAACATAAACACTTAAACCACCTCAGGCTGTTCCTTGGAGGTGAAAGAAGTTATTGCTGTGAGCAA----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 424666 178 + 647215 GTGTGGTCCTTTCCCTTTCTCTCGGCA--ACTAGGGCTTTCCTGGTCGGTTGAGAACATCTGAAGGTTAACTGACTATTGGCAGGTTTGGATCCCTTGAGGTGACAGCAAAACATTCACACTTAAATCACCTCTGGCTGTTCCTTGGATGTGAGAGAAATGATTGCAGAGAGCAATTCAG + +a +s mr.mrrefChr5 271192 5 + 294542 GAGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 424850 5 + 647215 GAGCA + +a +s mr.mrrefChr5 271197 243 + 294542 CAGAGACAACTACCTAAAATTTCACATTGGCAGCTATGATGTGGAAGAGTCTCCAGTTACAAAGGAGGATCCCATCCAGGACATCAGGACCCATAAAGGAGAGACAACTGACAAAGCAATTCTATACTCAACCAGAGGGCAAGATACAGTGCAACATGCATCACAGGAAGCATAATCAGAGTCATGATGGTACGCAACCACTAATGATAGCATCACAGGACCACATGCTCTAGTTTAGAGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418766 205 + 636262 ------------------------CATTGGCAGCTATGATGTGGAAGAATCTCCAATTCCAAAGGAGGATCCCATCCAGGACATCAGGACCCATAAAGGAGAGACAACTGACCAAGCAATTCTATACTTAACCAGAGGGCAAGATACAGTGCAACATGCATCACAGGAAGCATATTCAGAGTCATGATGGTGCGCA--------------CATCACAGGACCACATGCTCTAGTTTAGAGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 424857 243 + 647215 CAGAGACAACTACCTAAAATTTCACATTGGCGGCTATAATGTGGAAGAGTCTCCAGTTACAAAGCAAGATACCATCCAGCACATCAGGACCCATAAAGGAGAGACAACTGACAAAGTGATTCTATACTCAACCAGAGGGCAAGATATAGTGCACTATACATCACAGACAACGAGATCAGAGTCATGAGGGTATCCAACCACTAATGATAGCATCACAGGGCCACGGGCTCTAGTTTAGAGAGA + +a +s mr.mrrefChr5 271440 56 + 294542 TTTGCCCTGCTGTGTGAGAGAATCACCATAAGTGTCGTCCGCCCTAATCGACAACG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 418973 56 + 636262 TTTGCCCTGCTGCGTGAGACAATCACCATAAGTGTCGTCCGCCCTAATCGACAACG +s simRat_chr6.simRat.chr6 425100 33 + 647215 TTTGCCCTGCTGTGTGAGAGAATCACCATAAGC----------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 271496 114 + 294542 GGCCACGTGGTACAGACAGTGTGTAAGTAAGAATGATATCGATTTTGCATTAAGTCACTATACATACACCAGCCTAGATAGGAGGAGAAAAATTAAATGAAAATTGACGGTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419034 114 + 636262 GGCCACGTGGTACAGACAGAGTGTAAGTAAGAATGATATCGATTCTGCATTAAGTCACTATACATACACCAGCCTAGATAGGAGGAGAAAAATCAAATGAAAATTGACGGTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 425133 98 + 647215 ---------------ACAGTGTGTAAGTAAGAATGATATCAATTTTGCATTAAGTCACTATACATGCACCAGC-TAGATAGGAGGACAAAAATTGAATGAAAATTGACAGTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 271610 11 + 294542 CGTACAAGGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419148 11 + 636262 CGTACAAGGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 425250 11 + 647215 CGTGCAAGGCT + +a +s mr.mrrefChr5 271621 48 + 294542 TTTTTCTACTTGATAGAAAAGTTGAAAAGTTCTAATTGACTAGTGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419279 48 + 636262 TATCTCTACTTGATAGAAAAGTTGGAAAGTTCTAATTGACCAGTGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 425261 48 + 647215 TTTTTCTACTTGATAGAAAAGTTTAAAAGTTCTAATTGTCTAGTGCAC + +a +s mr.mrrefChr5 271669 216 + 294542 TATAAGTATCCAAACTCAGGTGGCTGCTGAGGCCAAAAATGTGTTCATTATATACGTGTAACTTCTATGCAAAATTACATTTAATATTCCTGATGACAGGTTGTCTGTCCAGATTGTGTTTCCAGATGCTGTACACAGGGATATAGACTTTAATTAATGAAGGCTCGTGCCTACATCTGACACTGAGCTGATGCAACTTAAATCAATCGAGCAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419327 216 + 636262 TATAAGTATCCAAACTCAGGTGGCTGCTGAGGCCAAGAATGTGATCATTATATACGTGTAACTTCTATGCAAAACTACATTTAATATTCCTGATGACAGGTTGTCTGTCCAGATTGTGTTTCCAGACACTGTACACAGGGATATAGACTTTAATTAATGAAAGCTCGTGCCTACATCTGACACTGAGCTGATATAACTTAAATCAATCGAGCAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 425378 216 + 647215 TATAAGTATCAAAACTCAGGTGGCTTTTGAGGCAAAAAATGTATTCATTATATACGTGTAACTTCTATGCAAAATTACATTTAATATTCCTTATGACAAGTTGTCTTTCCAGATTGTGTCTCCAGATGCTGTATACAGGGACTTAAACTTTAATTAATGAAGGCTTGTGCTTACATCTAACACTGAGCTGATGCAACTTAAATCAATTGAGCAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 271885 118 + 294542 CTAACTTGCTAGTAGTGAACTGTAGAGATAGAAAATTTATGTCTCCAAGTCAGTACACTTGATACAGTATGTGGAAGAGGCACAACTAGGCACTAGGCATATGGATTGTGGGTCACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419543 118 + 636262 CTAACCTGCTAGTAGTGAACGGTAGAGATAGAAAATTTATGTCTCCAAGTCAGTACACTTGATACAGTATCTGGAAGAGGCACAACCAGGCACTAGGCATATGGATTGTGGGTCACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 425598 118 + 647215 TTAGCTTGCTAGTAGTGAACTGTAGATATAGAAAATTTATGTCTCCAAGTCAGTACACGTGATACAGCATGTGGAAGCGACACAACTAGGCACTAGGCACATGGATTGTTGTTCACAT + +a +s mr.mrrefChr5 272003 184 + 294542 ACCTTTTGATGCTCTTAGACAGGGGTGCTTAGTGGCTACCTCAAATTTTCAAACCAACCAGGATGTCTTAACCTATCTAGTAAGTTACAGTAGCCTGAACACCAGGCTAACCATCTCTCTGATTTTAGACTAGCCACCTAGATTCCAGCTCATTCACAACTGGAAGAATTGTGATCCATACTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419661 181 + 636262 ACCTTTTGATGCTCTTAGGCAGGGGTGCTTAGTGGCTACCTCGAATTCTCGAATCAACCAGGATGTCTTAACCTATCTGGTAAGTTACAGTAGCCTGAACACCAGGCTGACCATCTCTCTGATT---GACTAGCAACCCAGATTCCAGCTCATTCACAACTGGAAGAATTGTGATCCATACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 425732 184 + 647215 ACCTATAGAAGCTCTTAGACAGGGGTGCTTAGTGGGTACCTCATATCTTCAAACCAACCAGGATGTCTTGACCTATATAGTGAGTTACAGTACCCTGAACACTAACCCAAACAGCTCTCTGATTTTAGACTAGCCACATAGATTCAAGCTTACACACATCTGGAAGAATTGTGAGTGATACATA + +a +s mr.mrrefChr5 272187 7 + 294542 AGGATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419845 7 + 636262 AGGATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 425916 7 + 647215 AGGATTA + +a +s mr.mrrefChr5 272194 94 + 294542 GAAGACCAAAGCTATATTTTGTTTCAGAGTAGCACCTTAGTCGCAAACTCAGTACACTAGATTAGTGATCTGTTCCCAACTAAGGTACTTTACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419853 94 + 636262 GAAGACCAAAGTTATACTCTGTTTCAGAATAGCACCTTAGTTGCAAACTCAGTACACTAGATTAGTGATCTGTTCCTAACTAAGGTACTTTACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 425923 94 + 647215 GAAGACCAAAGCTCTATTTGGCTTTAGAGTAGCACCCTAGTCACAAACTCAGTACGCTAGATTAGTAATATGTTCCCAACTAAAGTACATTATG + +a +s mr.mrrefChr5 272288 57 + 294542 CTGAGAACTTAGACACATCCAGCAGCACAGCCCCCCAGTCTCTGTCAAAGGAGCAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 419947 57 + 636262 CTGGAAACTTAGACACATCCAGCAGCACAGCCCCCCAGTCTCTGTCAAAGGAGCAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 426167 57 + 647215 CTGAGAACTTAGATGCGTCCAGCCGCCCAGCCCACCAGCCTCTGGCAAAGGAGCAAA + +a +s mr.mrrefChr5 272345 70 + 294542 GGAGCTAAGAAATATATTATAGTTTACTCTTGTAATCACCAGATTCTTAGGGACCTCTCAGAATGGGGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420007 70 + 636262 GGAGCTAAGAAATATATTATAGTTTACTCTTGTAATCACCAGATTCTTAGGGACCTCTCAGAATGGGGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 426224 70 + 647215 GGAGCTCATAAATGTAATATAGTTTACTCTTTTAACCACCAGATTCTTGGGGATCTCTCTAAATGAGGTA + +a +s mr.mrrefChr5 272415 203 + 294542 TATTGTCAGTATAGACATCTGCTCTCAGTACTCTGCTTGAGTTATCTTATCACTTGAGCATGAAGACATATGTTCTGGGCTTCTTGAGCGATAATGTAAGGTTAGGAGATGCCCATTCTATATGCATGCATGGGCTATACACCTTTATCCCCTGGTATGCCAAGGTCCCTGTGATAAACTGCGCTTGACCAAACTGGCTCTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420077 196 + 636262 TATTGTCAGTATAGACATCTGCTCTCAGTACTCTGCTTAAGTTATCTTATCACTT-AGCATGAAGAGATATG------GCTTCTTGAGCGATAATGTAAGGTTAGGAGGTGCCCATTCTATATGCATGCATGGGCTATACACCTTTATCCCCTGGTATGCTAAGGTCCCCGTGACAAACTGCGCTTGACCAACCTAGCTCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 426295 203 + 647215 TGTTGGCATTATAGGCGTCTACTCTCAGTACTCTGCTGGAGTTATGTCATCACTTGAGCATGAAGACATATGTTCTGGGCATCTTTAGCAATAATGTAAGGTTAGGAGATGCCCATTCTATATGTATGCATGGGCTATACACCTTAATCCCCTGGTATGCCAAGGTCCCTGTGATAAACTGGGCCTGACCAAACTGACTCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 272618 29 + 294542 TGGAACAGAGGCAACAATCAGAGTAAAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420274 29 + 636262 TGGAACAGAGGCAGCAATCAGAGTAAAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 426498 29 + 647215 TGGAACACAGGCAATTATTAGAGTAAAAT + +a +s mr.mrrefChr5 272647 14 + 294542 ATCAGTAAGATACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420308 14 + 636262 ATCAGTAAGATACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 426527 14 + 647215 ATCCATAAAATACA + +a +s mr.mrrefChr5 272661 203 + 294542 AATTTTCTACACTTTAGGAGAGTTTTGTCATATGAGGAATCAGGCATGCCGGGTGTATATCCATATCACCAATAATCATAAAAGGTTCACCAGCCTTAGGTAGGTAAGTATCAGGTCAATTGTTCTGCCATTCTAATGTCAAAGTTGGCAGCATAAACACTTGCCATGTGCCTTGAGGGACATTGTGTAGCGACCCTGGACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420326 192 + 636262 AATTTTCTACACT------GAGTTTTGTCATATGAGGAACCAGGCATGCCGGGTGAATA-----ATCACCAATAATCATAAAAGGTTCACCAGCCTTAGGTTGATAAGTATCTGGTCAATTGTTCAGCCATTCTAATGTCAAAGTTGGCAGCATACACACTTGCCATGTGCCTTGAGGGTCATTGTGTAGCGACCCTGGACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 426541 197 + 647215 AATTTTCTACACTTTAGGAGAGTTTTGTCATACGAGAAATCAGGCAAGCCAGGTGTATATCCATATCACCAGTAATCATAAAAGGGTCACCAGCCTTAGGTAGGTAAGTATCAGGTCAACTCTTCTGCCATTCT---GTTAAAGTGTGCAGCATAAACACTTGCCATGTGCCTTG--GGACATTGTGAGGAGATCCTGGACG- + +a +s mr.mrrefChr5 272864 41 + 294542 GGATAACACAGAGAATTCCTTGGAAACAATACACTTTCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420519 41 + 636262 GTACAACACAGAGAATTCCTTGGAAACAATACACTTTCCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 426738 41 + 647215 GGATAACACAGAGAATTCCTTGAAAACTATACATTTTCATC + +a +s mr.mrrefChr5 272905 123 + 294542 TGTGTTCCTTGCAAGTAACATGTTACAAGAACTTAGGTCTTGATAATGTACATTTAATTTTAGATGTCAACTTGACCACACTTAAGAAAGTCCTGATGATCATCTGTTATTTTCAATTTTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420560 123 + 636262 TGTGTCCCTTGCAAGTTACATGTTACAAGAACTTAGGTCTTGATAATGTACATTTAATTTTAGATGTCAACTTGACCACACTTAAGAAAGTCCCGATGATCATCTGTTATTTTCAATTTTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 426783 123 + 647215 TGTGTTCCCTTCAAGCAGCATTTTGCAAGAACTTAGGTCTTGGTAATGTACATTTAATTTTAGTTGTCAGCTAGACCACACTTAAGAGAGTCCTGATGATCATCTGTTATCTTCAATTTTTCC + +a +s mr.mrrefChr5 273028 45 + 294542 TCTCATATATCCACATTGTATGATTCTGCTTAAACAAGGTCTCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420683 45 + 636262 TCTCATATATCCACATTGTATGATTCTGCTTAAACAAGGTCTCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 426913 45 + 647215 TCTCATATACACACATTGTATGATTCTGCTCAAACAAGATCTCCT + +a +s mr.mrrefChr5 273073 18 + 294542 GACCCATAATTGTCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420729 18 + 636262 GACCCATAATTGTCTAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 426958 18 + 647215 AACTAGTAACTGTTGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 273091 16 + 294542 TGCAGCCTTAATTGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420747 16 + 636262 TGCAGCCTTAATTGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 426977 16 + 647215 TGCAGCCTTAATTGAG + +a +s mr.mrrefChr5 273107 37 + 294542 CTAGCATTGGCAACTTGAGCTATTTGGTCTGTAGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420766 37 + 636262 CTAGCATTGGCAACTTGAGCTATTTGGTCTGTAGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 426993 37 + 647215 CTAGCATTGGCAACTTGAGCTATTAGGCGTGTGGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 273144 276 + 294542 GTTCAGAACTAAGACATATGAGACACTTCACACAATCTGAATAACTAGTATGTCTAATAGACAACTGGGATGTAGGGAATTGGCTACTAGATTAGTTGGCGTCACCTAATATAATAAGTATATATTATTGGTTATGTGAGCTATATAGTTTATATCTGTAAGTATATGTATTTAGGCTAGAGCCCTTGTCATGACCATACATAGAATCCAGAACAATTGCAGCTTTACAAACTGGTATTATCTGTATATGCCTATAGTATGTAGCTTGACCCTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 420803 254 + 636262 GTTCAGAACTAAGACATATGAGACACTTCACACAATCTGAATAACTAGTATGTCTAATAGACAACTGGGATGCAGGGAAT----------------------CATCTAACATAATAAGTATATATTATTGGTTATGTGAGCTATATAGTTTATATCTGTAAGTATATGTATTTGGGCTAGAGCCCTTGTCATGACCATACATAGGATCCAGAACAATCACAGCTTTTCAAACCGGTATTATCTGTATATGCCTATAGTATGTAGCTTGACCCTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 427031 276 + 647215 GTCCCATACTAAGACAGATGAGGCACTTCGTGCAATTTGAATAACTAGTCTGTATAATAGACAACTGGGATGTAGGGAATTGGCTACTAGATTAGTTGGCGTCACTTAATATATTAAGTAAATATTATCGGTTATGTGAGCTACCTAATTAATACCTGTAAGCATATGTTTTTAGGCTACAGTCCCTGTCATAACCATAGATAGAATCCAGAACAATTGCAGCTTTACAAACTGGTATTACCTGAATATGCCTATAGTATGTAGCTTGACCCTAGT + +a +s mr.mrrefChr5 273420 66 + 294542 ATTCCTCCACACATATCTGTCTGACCTTTTCCTGGCCTCATGATGCTTTGTTGTTCTGATTGTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421063 66 + 636262 ATTCCTCCACACATATCTGTCTGACCTTTTCCTGGCCTCATGATGCTTTGTTGTTATGATTGTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 427307 66 + 647215 ATTCCTTTACACATGACTGTCTGACCTTCTCCTAGACTCATGATGCTTTGTTGTTCTGATTGTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 273486 343 + 294542 GCTACCCTTTGATCTGAAGTAGAACTTCAGTGTGTGAGGTGTGGCCAAGCCAATCACAAGATATGACAGGCTCATGGGCATTTCCTAAGCACCACTGGGTTTTGGTGCTAAGATTACCATATCATGTTGGAATAGTTTATGTGATACTAGTAAGGACTGAAATTGATACAGTTATGGAGGCTGACTGTTCCCCCTGGCTAGGACCTATGAGACATGCCCCAGAAGGCTTTTAGAGAGCACTGCTTTAGCCTGGATAATCATAACTATTGCCCTGTCTTTTTCCAAAGTTAGCATCATGTTTGCCAGGCAGTCCATTGGACAAACAGAATGTTTACCTCCTCCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421130 343 + 636262 GCTACCCTTTGAACTGAAGTAGAACTTCAGTGTGTGAGGTGTGGCCAAGCCAATCACAAGATATGACAGGCTCATGGGCATTTCCTAAGCACCACTGGGTTTTGGTGCTAAGATTACCATATCATGTTTGAATAATTTATGTGATACTAGTAAGGACTGAAATTGATACAGTTATGGAGGCTGACTGTTCCCCCCAGCTAGGACCTCTGAGACATACCCCAGAAGGCTTTTAGAGAGCACTGCTTTAGCATGGATAATCATAACTATTGCCCTATCGTTTTCCAAAGTTAGCATCATGTTTGCCAGGCAGCCCATGGGACAAACAGAATGTCTACCTCCTCCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 427373 342 + 647215 ACCACCCTTTGATCTGAAGTGGAACTTCAGTGTGTAAAGTGTGGCCAAGCCAATCACAAGATATGACAGCCTCATGGGCATTTCCCAAGAACCACTGGGTTTTGGTGCTAAGATTGCCATATCATGGAGGAATAGTTTATG-GCTATTAGTAGGGACTGAAATTGATACACTTATGGAGGCTGACTGTTCCCCCTGGCTAGGACCTATGAGATATGACCCAGAAGGCTTTTAGAGAGCACTGGTTTAGCCTGGATAATCATAACTATTGCAATGTATTTTTCCAAAGTTAACATCAGGTTTGTCGGGCAGTCCATTGGACAAACAGAATGTTAACCTCTTCGC + +a +s mr.mrrefChr5 273829 148 + 294542 CAACCATCTGCATGCTGATAGATAAGCTGTATGAGTCAATCCTATCTTCAGTTTTTGAGCACCAGAAAACTAGGAGGAGTACCAGGCCATTCACATCAACATGCTTGTTACCTAGTGTTGTTTAGATTTTGCATAGCAAATCGTGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421473 148 + 636262 CAACCATCTGCATGATAATAGATGAGCCATATGAGTCAGTCCTATCTTCAGTTTTTGAGTACCAGAATGCTAGGAGGAGTACCAGGCCATTCACATCTACATGCTCGTTACCTAGTGTTGTTTAGATTTTGCATAGCAAATCGTGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 427718 148 + 647215 CAACCATCTGTATGCTGATACATAAGCTGCATGAGTCAATCCTATCGTCAGTGTTTGAGCACCAGAAAACTAGCAGGAGTACCAGACCATTCACATCAACATGCTTGTTACCTAATGTTGTTTAGATTTTGCATAGCAAATCGTGCAA + +a +s mr.mrrefChr5 273977 95 + 294542 AGCACACATATCAGGGGATTTTTTGCATCAAGAGGTATACTAATTAACTTCCTAGTTATCCGAGCACCGAAACCTGGAAATGAGGTTCCTCAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421634 95 + 636262 AGCACACATATCGGGGGATTTCATGCCTCAAGAGGTATACTAATTAACTTCCTAATTATCCAAGCACCGAGACCTGGAAATGAGGTTCCTCAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 427866 95 + 647215 AGCACACATATCAGGGAATTTTTTGCATTGAGAAGTGTACTAATTAAATTCCTAGTTATCAGAGTACCGAAACCTGGAAATGAAGTTCCTCAATA + +a +s mr.mrrefChr5 274072 143 + 294542 TGCCTGTTAACGTCAAATGGATGAATACTTCCATTTGTGATTTCCACAGGCAAGTCGCTAACTTCCAAAATACCAATTATGTTTTGCCTTCATGATCCTCTAAACTGGTTGGATCATCGCTTAAACTGGTTGGGCTGTTAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421731 143 + 636262 TGCCTGTTAATGTCAAATGGATGAATACTTCCATTTGTAATTTCCACAGGTAAGTCGCTAACTTCCAGAATACCAATTAAGTTTCGCCCTCATGATCTTCTAAATTGGTTGGATCATCGCTTAAACTGGTTGGGCTGTTGAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 427961 127 + 647215 -----TTGAGCTTCACA-------ATAC----ATTTGTGATTTCTGCAGGCAAGTCGCTAACTTCCAAAATACCAATTATGTTTTGCCTTCATGATCCTCTAAACTGGTTAGATCATCCTCTAAACTGGTTGGGCTGTTAAAG + +a +s mr.mrrefChr5 274215 54 + 294542 ATAGCCCAGTGTACTGCACCACTTCTGGAGTGTGGGGCTTTCAGACTTGATATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421874 40 + 636262 ATAGCTCAGTGTGCTG--------------TGTGGGGCCTTCAGACTTGATATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 428089 54 + 647215 ATAGCCCAGTGTATTGCACCACTTCTGGAGTGTGGGGCTTTTAGACTTGATGTA + +a +s mr.mrrefChr5 274269 78 + 294542 TGGTCCTAACCTCGGCAACATCATAAAGTATATAATCTAACAACTCAATATTAACTCTACACACTATTGAGTGACCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421915 78 + 636262 GGGTCCTAACCTTGGCAATATCATGGAGTATATAATCTAACAACTCAATATGAAAGCTACACACCATTGAGTGACCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 428143 78 + 647215 TGGTCCTATCCTCGGCAACATCATAAAGTACATAATCTAACAACTCATTATTAACTCTGCACACTATTGAGTGACCAT + +a +s mr.mrrefChr5 274347 77 + 294542 GCCTGCAGCATTGGTAACCAGCTGAGGTATGTGATCAAAATGCTTGAACTTAGTGCCTTGTGGTTTCTAAGAGTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 421993 77 + 636262 GCCTGCAGCATTGGTAACCAGCTGAGGTCTGTGATCAAACTGCTTGAACTTAGTGCCTTGTGGTTTCTAAGAGTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 428224 77 + 647215 GCCTGCAGCATTGGTAACCACCTGAGTTACATGATCAAAATGCTTGAAGTTAGTGCCTTGTGGTTTCTAAGAGCAGC + +a +s mr.mrrefChr5 274424 118 + 294542 ATATGAAATAGTCATTTATCAATCAGTTAAAGGCCATTGTGGCCACAATTGAGGTGGCCATGCAGATGAGCTAAGGGGTATACTTTTACTCCTAAATAATATTGAATGTCTGCCTGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422070 118 + 636262 ATATGAAATAGACATTTATCAATCAGTTAAAGGCCATTGTGGCCATAATTGAGGTGGCCATGCAGATGAGCTAAGGGGAATGCTTTTACTCCTAAATAATAATGAATGTCTGCCTGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 428314 118 + 647215 ATATGAAATAGTCATTTATCAATGAGTTAAAGGCTATTGTGGCCACAATTGAGGTGGCCATGCAGATGAGCCGAGGGGTACACTTGTACTCTGGAATAACATAGAATGTCTGCCTGCT + +a +s mr.mrrefChr5 274542 50 + 294542 AAGTCTGTCAATTAGATGTCGATGTTACACAAACACACGCATACCTACCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422188 50 + 636262 AGGTCTGTCAATTAGATGTCTATGTTACACAAACACACGCATACCTACCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 428433 50 + 647215 AAGTCTACCAATAAGATGTCGATGTCACACAAACACACACATACCTACCC + +a +s mr.mrrefChr5 274592 125 + 294542 CTACATCATACCTACCCTAATCTGCATAGGGACATGAGAAATAGTATGCAATATATGTCCTGTAGCATGCTTATGACCATGCTGTCAATCTTTAATTACACTGCAGAGTAAACCTGCCCCCGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422242 125 + 636262 CTACATCATACCTACCCTAATCTGCATAGGGACATGAGAAATAGTATGCAATATATGTCCTGTAGCATGCTTATGACCACGCTGTCAAACTTTAATTACACTGCAGAGTAAACCTGCCCCTGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 428483 125 + 647215 CCGAATCATACCTACCTTAATCTGCATAGGGACATGAGAAATAGTATGCAATATATGTCCTGTAGTATGCTTATGATCATGCTGTCAATCTTTAATTACACTGCAAAGTAAACCTGCCCCCCCCC + +a +s mr.mrrefChr5 274717 175 + 294542 AGAATTAATATCATACTGGTTACAAGTGGGATGAGAGGTAGGCACCCTTCATTGCAGGATGCACACACCCAGCCAACAAAATGTGCGATTTTTTCATTTTGCCTATCTTGGCTGTGCATCATTGTGAAAGGTGATCTTTCAATCGGGTTGTGGATTTAGGCATGTGCCATGTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422367 175 + 636262 AGAATTAATATCATACTGGTTACAAGTGGGGTGAGAGGTAGGCACCCTTCTTTGCAGGATGCACACACCCAGCCAACAAAATGTGCGATTTTTTCATTTTGCCTATCTTGGCTGTGCATCATCGTGAAAGGTGATCTTTCAATCGGGTTGTGGATTTAGGCATGTGCTAGGTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 428613 141 + 647215 AGAGCTAATATCATACTGGTTACAAGTGGGATCAGAGATAGGCACCCTTCATTACAGGATGCACACACCCAGCCAGCAAAATGTGC---------------------------------CATTGTGAAAGATGATCTTT-AATTGACTTGTGCATTTAGGCATGTGCCATGTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 274892 12 + 294542 TTAGATTAGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422542 12 + 636262 TTAGATTAGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 428782 12 + 647215 TTAGATTAAAGG + +a +s mr.mrrefChr5 274904 114 + 294542 GAGATGTGACTAACACACAAGTCAAATCAGGCTCAAGATTCCAATGAGAGTGGCTTGTATATAAACACAAAGGCAAAACAGAGCACACCTGTCAGTGGGGTACATGTATCAAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422554 114 + 636262 GAGATGTGACTAACACACAAGTCAAATCAGGCTTAAGATTCCAATGAGAGTGGCTTGTATGTAAACACAAAGGCAAAACAGAGCACACCTGTCAGTGGAGTACATGTATCAAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 428798 114 + 647215 GAGATAGGACTAACACACAAGTCAAATCAAGATCAAGCTGCTAATGAGATTGGCCTGTATATAAACACAAAAGCAAAACAGAGCACACCTGTTAGCAGGGTACATGTATCAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 275018 89 + 294542 TTAGCTCGGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATGTCTTTACAATTGTCCCACCTAGCAAATTTTTAGGAAACAACTTGTGGCCATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422674 89 + 636262 TTAGCTCGGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATGTCTCTACAACTGTTCCACCTAGCAAATTTTTAGGAAACAACTTGTGGCCATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 428912 87 + 647215 TTAGCCTCGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATCTCTTTACAATTGTCCCACCTATCAAATTTTTAGAAAACAA--TATGCCCATAA + +a +s mr.mrrefChr5 275107 22 + 294542 TTATTGTAACAGAGTACCGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422765 22 + 636262 CCATTGTAACAGAGTACCGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 428999 21 + 647215 TTGTTGTAACAGAG-ACTGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 275129 87 + 294542 ATAGCTAGGAGCTAGCTAGTATTGGGACACTGGGCCATTTATTATTTACTAGGAACAGGTGAGTAGCTGAGCTTTTCTATATTTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422787 87 + 636262 ATAACTAGGAGCTAGCTAGTATTGGGACACTGGGCCATTTATTATTTAATAGGAACAGTTGAGTAGCTGAGCTTTTCTATATTTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 429024 86 + 647215 ATAGCTTGGAGCCAGCTCGTATTGGGACAC-GGGCCATTTATTTTTTACTTGGAATAGGTGAGTAGCTGAGTTTTACTATATTTGTT + +a +s mr.mrrefChr5 275216 148 + 294542 TGCATTTAGTATTACAACATCTGGTTTGATCTCTACCACAGTTCACCCGGTAAATTTGCAGTGCTGCATAAAATACTAAAGTCTTCAACATTAGCCTGCCAAACTTAATATCCCACACAGTCTCCAGTGGGATCTAGAGACATTGTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 422874 148 + 636262 TGCATTTAGTATCATAACCTCTGGTTTGATCTCTCCCACAGTTCACCCGGGAAAATTGCAGTGCTGCATAAAACACTAAAGTCTGCAACATCAGCCTGCCAAACTTATTATCCCACACAGTCTCCAGTGTGATCTAGAGACACTGTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 429114 139 + 647215 TGCAATTAGTATTACAACATCTAGTTTGATCTCTACCACAGTTTACCCAGTAAGTTTGCAGTGCTGCATAAAATACTAAAGTCTTCGACATTAGC---------TTAATATCCCATACAGTCTCTAGTGGGATCTAGAGACATTGTTG + +a +s mr.mrrefChr5 275364 6 + 294542 TCTTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423028 6 + 636262 TCTTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 429253 6 + 647215 TCTTGT + +a +s mr.mrrefChr5 275370 30 + 294542 CATCAGTACAGATAAACAATAAAATGCTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423038 30 + 636262 CATCAGTACAGATAAACAATAAAATGCTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 429259 30 + 647215 CATCAGTACAGATGAACAATAAAATTCTGC + +a +s mr.mrrefChr5 275400 11 + 294542 TTAAGCAAGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423070 11 + 636262 TTAAGCAAGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 429289 11 + 647215 TTAAGCAAGTC + +a +s mr.mrrefChr5 275411 15 + 294542 TCTGTGACTGGTGGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423082 15 + 636262 TCTGTGACTGGTGGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 429300 15 + 647215 TCTGTGACTGGTGGA + +a +s mr.mrrefChr5 275426 9 + 294542 TCGCCATTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423097 6 + 636262 ---CCATTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 429316 9 + 647215 TCGCCGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 275435 278 + 294542 TCTATTGACTCATGCCAGTGCAACACACATAGTCCCTGTGATTTGCACTAAGTGAGCTGATTGTACATGAAATCTCTCATAATCTCTCTGGTACCAAAATAACTCCTACTACCAAGTGTGATCTGTGCATACACCAGTACCTTATAGATTCCAACAATTGGGATCACCTACAGAGAGACAAAAAACGTACAGACCTGTTTTGTCCCCTCTTCTATGTCGTAGGTTCATAAAGACTAGACACATGAGGACATAGAAGATGAGTACTGTACATTTCCCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423104 273 + 636262 TCTATTGACTCATCCCAGTGCAACACACATAGTCCCTGTAATTTGCACTAAGTGAGTTGATTGTACATGAAACCTCTCATAATCTCTCTGGTAACAAAATAATTCCTACTACTAAGTGTGATCTGTGCATACACTAGTACCTTATAGATGCCAACAATTGTGATCACCCATAGAAAGACAAAAGACTTAC----CTGTTATGTCCCCTCTTCTATATCGTGGGTTCATAAAGACTAG-CACATGAGGACATAGAAGATGAGTACTGTACATTTCCCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 429325 271 + 647215 TTTATTGACTCATGCCAGTGAAGCACATTTAGTCTCTGTGATTTGCACTAGGTGAGCTAATTGTGCATGAACTCTCTTATAATCACTCTGGTACCAAAATAACTCACACTACCAAGTGTGATCTGTGCATACACCAGTACCTTATAGATTCCAACAATCGGGATCACCTACAGAGAGACAAAAAACGTACAGACCTGTTTTGTCCACTCTTCTAGGTCATAGG-------GGACTAGACGGGTGAAGACATAGAAGATGAGTATTGTACATTTCCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 275713 118 + 294542 ACATACCCAGCGAAGGAAGTCTGGTATAGGATTACAATTCCATTCATCCACCACGGGCCATCAGTCAACTCAACTCATCTGGTCTCAAATTAAACATAACTTCGCACCCTCTAAGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423382 118 + 636262 ACATACCCAGCGAAGGAAGTCTGGTATAGGATTACAATCCCATTCATCCACCATGGGCCATCAGTCAACTCAACTGATCTGGTCTCAAATTAAACATAACTTGGCAGCCTCTAAGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 429596 111 + 647215 ACAAACTCAGTGAAGGAAGTTTGGTATAGGATTACAAGTCCGTTCATCCACCACAGGCCA-------ACTCAAATCAACTGATCTCAAATTAAATATATCTTCGCACCCTCTAAGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 275831 9 + 294542 CCTTTGTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423500 9 + 636262 CCTTTGTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 429762 9 + 647215 CCTTCTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 275840 149 + 294542 CAACCATTTGAAAGCTATAAAGCATGAACATTGCCAAAACTTTAAGAGAGACCTTAGACTTAGGATGAGAGGCATCTGAACTGTGCTGTGACTCCACTTGGGGCTGTTTAAGCATTACAATCAAGGATGGTAGATGGTGAAGTAAGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423509 149 + 636262 CAACCATTTGAAAGCTATAAAGCATGAACATTGCCAAAACTTTAAGAGAGACCTTAGACTTAGGATGAGAGGCATCTGAACTGTGCTGTGACTCCACTTGGGGCTGTTTAAGCATTACAATCAAGGATGGTAGATGGTGAAGTAAGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 429779 12 + 647215 CTACCATCTGAG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 275989 17 + 294542 GATGTTATTAATCTAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423668 17 + 636262 GATGTTATTAATCTAAG + +a +s mr.mrrefChr5 276006 87 + 294542 GGGGCAATGGTTGTGTAGATATAGGATGAACATCCTCTACCCAGTATTGTATTGTGGTTATCATGTGGACTCACCATGATGCACAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423686 87 + 636262 GGGGCAATGGTTGTGTAGATATAGGATGAACATCCTCTACCCAGTATTGTGTCGTGGTCATCATGTGGACTCACCATGATGCATAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 429791 60 + 647215 ---------------------------GAACATCCTCTACACAGTATTGTATTATGGTTATCATGTGGACTCACTATGATGCACAGT + +a +s mr.mrrefChr5 276093 215 + 294542 ACATCAAAGCCAGTCATGTGCAACAGTAAAATTGTCTAATCTTACTCCTTGTCTGCAAGAACACTCCTCTAACATCCTGATAGATTTAAATTCCTTACGAGACATCATGTTGTGTTGTATTCTCCTTTAGGAACAATGTATGACTGAACCTGCACACCCTGCAAGTGGCAATGCTACAAGTTGATTGATCACCTTACACCATTAGTGAAATGCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423773 215 + 636262 ACATCAAAGCCAGTCATCTCCAACAGTCAAATTGCCTAATCTTACTCCTTGTCTGCAAGAACATTCCTCTAACATCCTGATAGATTTAAATTCCTTACGAGACATCACGTTGTGTTGTATTCTCCTTTTGGAACAATGTATGACTGAACCTGCACACCCTGCATGTGGCAATGCTACAAGCTGATTGAGTACCTTACATCTTTAGTGAAGTGCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 429861 215 + 647215 AAATCAAAGCCAGTCATGTGCTACAGTAATATTGTCTAATCTTACTCCTTGTCTGCCAGACCACTCCTCTAACATCCTGATAGGTTTAACTTCCTTCCGAGACAGCATATTGTGGTGTATTCCCCTTTAGGAACAATGTATGGCTGAACCTACAAGCTCTGCAAGTGTTAATGCTGCAAGTTGATTGATCATCTTACACCATGAGTGAAATGTGG + +a +s mr.mrrefChr5 276308 13 + 294542 CTTTTTTTAGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 423989 13 + 636262 CTTTTTTTAGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 430076 13 + 647215 CTTTTTTTAGTCC + +a +s mr.mrrefChr5 276321 126 + 294542 CATGCTGAAAACCCTCACTATAAAGTCTTTACTAGACACAGTACATATATAAGATGAACCACATAAACAAAGCACCAACTAATGGACGGTCTCGTATCATGGCCTGCATGCCATCCCCAAAAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424003 120 + 636262 CATGCTGAAAACCATCACTATAAAGTTTTTACTAGACACAGTACATATATAAGATGAACAACATAAACAAAGCACCAACTAA-----GGTCTCGCATCATGACCTGCATAC-ATTCCCAAAAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 430089 126 + 647215 CATACTGACAACCCTCACTATAAAGTCTTTAATAGACACAGTAAATATACAAGCTGGACCACATAAACAAAGGACCGAGTACTGGACGGTCTGGTGTCATGGCCTGCATGCCATCCCCACAAATAG + +a +s mr.mrrefChr5 276447 336 + 294542 TGATGTTGGCTATTGCTTTTTTGTGTCTTCTCTGCCCTCTTCTTATTCTTGTTCCACACTCAAGTTAAACAAGTGTAGCTTGTCAACCAATTCTTTCACAGGTATTGTCAACTTCCAACGGTTAGTCAATGGAACACTGGTCAAAATAGCACTCTAATAGCAGTTCAAAGCATAATACTACATTTTTTAACAAAGTCAAGTACTATGTCTTTGAACATCTAGGGCTTTGAACATTGAACTGGCCTAAGCCCTGACATCTGTGATAGCCCTAGCCATGCAAAATAATCCAAGCTTGTGGTACATGGCAGTGGGATCCTCATCTGTGACACTCTGATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424124 324 + 636262 TGATGTTGGCTATTGCCTTCTTGTGTCTATTCTGCCCTCATCTTATTCTTGGTCCACACTCAA------------TAGCTTGCCAACCAATTCTTTCACAGGTATTGTCAACTTCCAACGGTTAGTCAATGGAACACTGGTCAAAATAGCACTTTAATAGCAGTTCAAAGCACAATACTATATTTTTTAACAAAGTCAAATACTATGTCTTTGAACATCTAGGGCTTTGAACATTGAACTGGCCTAAGCCCTGACATCTGTGATAGCCCTAGCCATGCAAAATAATCCAAGCTTGTGGTGCATGGCAATAGGATCCTCATCTGTGATACTCTGATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 430215 325 + 647215 TGATGTTGGCTATTGCTTTTTGGCGTCTTCTCTGCCCTCTTCTTATTCTTGTTCCACACTCAAGTTAAACAAGTGTAGTGTGTCAACCAATTCTTTCACAGGTGTTGTCAACATCCAACAGTAAGTCCATGGAACACTGAGCAAAAAAGCAGTCCAACAG-----------ATAATACTACATTTTTTAACAAAGTCGGGTCCTATGCCTTTGAACATCTATGGCTTTGAACATTGAACTGGCCAGAGCCCTGGCATCTGTGATAGCCTTTGCCACACAAAATAATCCAAGTTTGGGGTACATGGCAGTGGGATCCTTATCTGTGACACTCTAATC + +a +s mr.mrrefChr5 276783 189 + 294542 AGTGACCCCTTTGGACCTGGGATGAAGGGTGTCGTGTCCTTCTAAAGGTGCTTGCAATCAGATGACAGCATGTGAAGTGGGCACATGAGCCAGGCAGGGTCCTCCTACAGGTGCCTGTAATCACTTGAGAGCGCATAAGTGGGGCCGGCTCAGAGCCACGCACTAACCATGTGCACATGGCCACATTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424448 189 + 636262 AGTGACCCCTTTGGACCTGGGATGAAGGGTGTCGTGTCCTTCTAAAGGTGCTTGCAATCAGATGACAGCATGTGAAGTGGGCACATGAGCCAGGCAGGGTCCTCCTACAGGTGCCTGTAATCACTTGAGAGCGCATAAGTGGGGCCGGCTCAGAGCCACGCACTAACCATGTGCACATGGCCACATTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 430542 189 + 647215 AGTGAACCCTTTCGACTTGGGATGAATGACGTTGTGTCCCTCTAAAGGTGCTTGCAATCACTTGACAGCATGTGACATGGGCACGTGAGGCAGGCAGGGTCCTCCTACAAGAGCTTGTAATCATTCGAGAGTGCATAAGTGGGGCAGGCTCAGAGCTACATGCTAACCACGTGTATGTGGCCACATTTG + +a +s mr.mrrefChr5 276972 16 + 294542 CCTTTCATTGGAGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424637 16 + 636262 CCTTTCATTGGAGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 430740 16 + 647215 TCATACAGTTCAACTA + +a +s mr.mrrefChr5 276988 9 + 294542 TACATGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424653 9 + 636262 TACATGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 430759 9 + 647215 CACTTGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 276997 9 + 294542 GCTGTGCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424663 9 + 636262 GCTGTGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 430768 9 + 647215 GCGGTGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 277006 97 + 294542 TTAAGATTGTTTCTTCTATAGGCTTCTAAGGTGCCTGTTGGAATGATGACTCAACAACACCTCCTAAAAGTTTAGTTGACCTGTAGGGTAAATGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424685 97 + 636262 TTAAGATTGTTTCTTCTATAGGCTTCTAAGGTGCCTGTTGGAATGAAGACTCGACAACACCTCCTAAAAGTTTAGTTGACCTGTATGATAAATGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 430777 93 + 647215 TTGAGTCTTTCACTGCAACAGGCACCTAAGAAGCCTATAGGAAACATGATTTAACA----TTGTTGAGAATTTGCACAGCACCTTGTGTAAAGCTCC + +a +s mr.mrrefChr5 277103 14 + 294542 CTGGGCCACACAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424782 14 + 636262 CTGGGCCACACAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 430879 14 + 647215 CTGGTCCACAAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 277117 27 + 294542 ATGTAGTCTGAAGTATCAGTTAGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424796 27 + 636262 ATGTAGTCTGAAGTATCAGTTAGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 430894 27 + 647215 ACATAGTCTGAAGTATTGGTTAGAGTC + +a +s mr.mrrefChr5 277144 30 + 294542 CAGTTACCTAGGGATGAGTGGCTGTGGGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424823 30 + 636262 CAGTTACCTAGGGATGAGTGGCTGTGGGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 430922 30 + 647215 CAGTTACCTGGGGATGAGTGGCTATTGGGT + +a +s mr.mrrefChr5 277174 92 + 294542 AGGTCCCTGTCTAAACTCAGTGGATCAGTGGTTTGAGCGCTGATGAATGGGTGCAGATAAACCTGATGCATGAAGGGTGCAGCCCTATGTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424853 88 + 636262 ATATCCCTGTCTAAATGCAGTGGATCAGTGGTCTGAGCGCTGATGAATGGGCACAGATAAACCTGATGCATAAAAGGTGCAGCCTTAT---- +s simRat_chr6.simRat.chr6 430989 91 + 647215 AGGTCCCTGTCGAAACTCAGTGTCTCAGTGGCTTGA-GGCTGATGAATAGGTGCAGATAAATCAGATGCATGGAGAGTGGAGCCCTATGTCA + +a +s mr.mrrefChr5 277266 23 + 294542 CAATCCAGCCCTCCATTATGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424941 22 + 636262 -AATCCAGCCCTCCATTATGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 431084 23 + 647215 CAACCCAGCCCTCCATTATTTCT + +a +s mr.mrrefChr5 277289 452 + 294542 CTTGCCAGTTATATAAGTCATCTTTGTTAGTGCTTATGGGTGCCTTCTGTCTTTTGGGCTGACAGTCAAAGCAAGAACCAGGCTAAGTAGTAGGCAGGGAGAGTAGGTGAGTGGAATCTTAACTATGTCTAATCCCTGATAGCCAACAACAGGCTAGTTTAATCAGCAACATATTTTTATTGCTGGGTCCCCTTGGATCTACTACTTAGAGTGGCTCTTGTATCTTAATCTGTAAGTAAACATCTGGCTGCAGACATTCAAGGCATGTTATCAAATCCATGCCATATAATGAACATATCCGATATCTCATGGCCATGTGACAGGTACAGTGTACGACACAGCATTCCCCATGAGGCAAGTTCCCTTCAGTGGTCTTACTAATTCCAGCTATACATGCCCTTTACTGTGACCTTATGCCCCTACTTACCAGCAGTATTGTCAATCCTAGAACT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 424963 414 + 636262 CTTGCGAGCTATATAAGTCGTCTTTGTTACTGCTTCTGGGTGCCTTCTGTCTTTTGGGCTGACAGTCAAAGCAACAACAAGGCTAAGTAGTAGGCAGA---AGTAGGTGAGTGGAATCTTAACTATGTCTAACCCCTGATAGCCAACAACAGGTTAGTTTAATCAGCAACATATTTTTATTGCTGGGTCCCCTTGGATCTACTATTTAGAGTGGCTCTTGTATCTTAATCTGTAGGTAAACATCTGGCTGCAGACATTCAAGGCGTGTTA-----------------------------------CTCATGGCCATGTGACGGGTACAGTGTACGACACAGCATTCCCCATGAGGCAAATTCCCCTCAGTGGTCTTATTAATTCCAGCTATGCATACCCTTTACTGTGACCTTATGCCCCTACTTAACAGCAGTATTGTCAATCCTAGAACT +s simRat_chr6.simRat.chr6 431108 429 + 647215 CTTGGCAGTTATTTGAGTCATCTTTGTTAGTGCCTA-------CCTCTGTCTTTTG-A------GTCAAAGCAAGAACCAGGCTAAGTTGTAAGCAGGGAGAGTAGGTTAGTGGAATTTTAACTATGTCTAATCTCTGATAGCCAACAACAGGCCAGTTTAATCAGCAACCTATTTTTATTGCTATGCCCCCTTGGGTCTACTGCCTAGACCGGCTCTTGTATCTTACTCTGTAAGTC---------CTGCATACATTCAAGGCACGTTATCAAATCCATGCCATATAATGAACATATCCGATATCTCACGGCCATGTGACAGGTACAGTGTACGACACTGCATTCCCCATGAGGTAAGTTCCCTTCAGTGGTCTTACTGATTCCAGCTATACATGCCCTTTACTGTAACCTTATGCACCTACTTACCAGCAGTATTGGCAATCATAGAACT + +a +s mr.mrrefChr5 277741 11 + 294542 CTATTAACGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425377 11 + 636262 CTATTAACGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 431541 11 + 647215 CTATTAACGCT + +a +s mr.mrrefChr5 277752 36 + 294542 GGTGCAGTGCTTGAAATTGTACCTTATTATAATCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425388 33 + 636262 GGT---GTGCTTGAAATTGTTCCTTATCATAATCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 431554 36 + 647215 GGTGCAGTGCTTAAAATTGTACCTTATTATAATCTT + +a +s mr.mrrefChr5 277788 47 + 294542 ATCTGCCTAGTCTAAAGGCTTGTCAGATAAATTAGCTTAGTTCCTGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425421 47 + 636262 ATCTTCCTAGTCTAAAGGGTTGTCAGATAAATGAGCCTAGTTCCTGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 431591 40 + 647215 CTCTGCCTAGTCAAGGGGCTTGTCAGTTAAATTAGCTTAG------- + +a +s mr.mrrefChr5 277835 7 + 294542 GTCTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425528 7 + 636262 GTCTGTG + +a +s mr.mrrefChr5 277842 19 + 294542 TAACTATTGCATCCCCCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425536 19 + 636262 TAACTATTGCATCCCCCTT + +a +s mr.mrrefChr5 277861 16 + 294542 AGTTTAACATGGATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425556 16 + 636262 AGTTTAACATGGATAC + +a +s mr.mrrefChr5 277877 333 + 294542 TGATTGCCCAAGTGTCACTCTTATAGTTCTGACTTTTATATTATCCAGAGGACATGCATGTCAGGAGACATGACATACTCAAAATGGAGTGGCATGTGCTGTTTGACTAGTCTGTCTTTCCTGGCCCATGTAGATTATGGGAGGGAGCATCTAGCAGAAGGGTTTTCAGCCACAAATTAGTTGCTTGCCAGAAACTTGTAGCAGGTGTAGGGAGCGTCCCTGTAATTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTCACCATCTCAAATGTAGGGCTGGTGATGTATTCCAGGATTCTGCAAGATAAGATTGAAAGTGGCTAGTCATAGCTGTTGAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425574 327 + 636262 TGATCACCCAAGTCTCACTCTTATAGTACTGACTTCTATATTATCCAGTGGACATGCATGTCAGGAGACATGACATACTCAAAATGGAGTGACATCTGCTGTT------GTCTGTCTTTCCTGGCCCATGTAGATTATGGGAGGGAGCATCTAGCAGAAAGGTTTTCAGTCACAAATTAGTTGCTTACCAGAAACTTGTAGCAGGTGCAGGGAGCGTCCCTGTAATTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTCACCATCTCAGATGTAGGGCTGGTGATGTATTCCAGGATTCTGCAAGATAAGATTGAAAGTGGCTAGTCATACCTGTTGAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 431631 324 + 647215 --ATTGCCCAAGTGTCACGCCTATAGTTCTGTCTTTTATATTATCCAGAGAACATGCATTTCAGGAGACATGACATGCCCAAAATGGAGTGGCATGT-CTATTTGACTAGTCTGTCT------ACCCATGTAGATTATGGAAGGGAGCATCTAGAAGAAGGGTTTTTGGCCACAAATTAGTTGCTTGTCAAAAACTTGTAAAAGGTGTAGAGAGCATCCCTGTAACTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTTACCATCTCAAATGTAGGGCTGATGGTGTATTCTAGGATTCTGCAAGATGAGATTGAAAGTGGCTAGCCAGAGCTGTTGAGC + +a +s mr.mrrefChr5 278210 69 + 294542 AGCCGCTGTACTTTCCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCCCTATTTTACTATATCTGTGTAGTAGTTGAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425905 69 + 636262 AGATGCTGAACTTTTCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCCCTATTTTACTATATATGTGTAGTAGTTGAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 431955 69 + 647215 AGCCGCTGTTCTTTCCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCGCTATTTTACTGTATCTGTGTAGTAGTTGAT + +a +s mr.mrrefChr5 278279 15 + 294542 CCTGTTAGCCAGCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 425999 15 + 636262 CCTGTTAGCCAGCCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 432024 15 + 647215 TCTGTTAGCCAGCCA + +a +s mr.mrrefChr5 278294 120 + 294542 TGCTGCTATGCGGGACAGAAGACCAAGCCAAACAAGGAAAAGAACTTATGGAGATTTGGGTATACCATAAGAGCAGTGGTCTGGGTTTGCTGTGCACCTGTGACTGGACTGAGGGTCTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426014 120 + 636262 TGCTGCTATGCAGGACAGAAGACCTAGCCAAACAAGGAAAAGAACTTATGGAGATTTGGGTATACCATAAGAGCAGTGGTCTGGGTTTGCTGTGCACCAGTGACTGGACTGAGGGTCTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 432040 118 + 647215 TACTGCTATGCGGGACAG--GACCAAGTCGAACAAGGAAAAGAACTTATGGAGATTTGCATATACCATAAGAGCAGTGGTCTGGTTTTGCTGTGCACCTGTGACTGGACTGAGGGTCTTC + +a +s mr.mrrefChr5 278414 532 + 294542 ACCACTGGCTCCTTATAATGACACAGACCCAGAAAGCAGAGAAGGGAGGAGTTGCTGGAGTACCTGGAAATTGCTGATACATATTTTGCATATGAAACAGTAGAATCATTCTTCAGTTGCATAGGTGCTAGATCAGCTTTTAACATTGAGCTTACTTAGGGATGATTCCTCAAGATGGTGTGAACAGATGTGTGTTATACTTGGGGTCCACAGTGACAATCCTGGTTGCTCTCTGAGGGTACAGTGATTATAACTTCTCAAGAGAAATTCTGATTAAGCCATGATATGGTATAGCAATCATACCTGTTCCTTGGTATCTTGGGTGGAAGGGAATCAAACACAGTTTCAATACTAGTACCTGCTGATCGACATCTCCTGTTGTGATAATAAGCAAGCTCAGGAAATGGCCTAAAAAGTTGGTTTTCAATTGGATACTGTTATGTGCAAATAGTAATAGAATCACGTCATGACAAGAAGAAGCTATTCAAAGCAGCTTAATGGATGATTTGTGCAAATAGTTTGTGTCTTAATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426134 486 + 636262 ACCACTGGCTCCTTATAATGAC-------CAGGAAGCAGAGAAGGGAGGAGTTTCTGGAGTACCTGGAAATTGCTGACACATGCTTTGCATATGAA-CAAAAGATTCATTCTTCAGCTTCATAGGTGCTAGATCAGCTTTTAACATTGAACTTAATTAAGGAGGATTCCTCAAGATGGTGTGAACAGATGTGTGTTATACTTGGGGCCCCC---------------TGCT---TGAGGGTACAGTGATTATAACTTCTCAAGAGAAATTCTGATTAAGCCATGATATGGTATAGCAATCATACCTGTCCCTTGGTATCTTGGGTGAAAGGGAATCAAACACAGTTTCAATACTAGTACCACCTGATAAACATCTCCTGTTGTGATAATAAGCAAGCTCGGGAAATGGCATAATCAGCTGGTTTTCAATTGGATACTGTTATGTGCAGATA--------------------CAAGAAGAAGCTATCCAAAGCAGCTTAATTGATGATTTGTGCAAATAGTTTGTGTCTTAATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 432161 522 + 647215 GCCACTGGCTCCTTATGATGACACAGACCCAGACAGCAGAAAAGAGAGGACTTGCTTGAGTACCTGGAAATTGCCAATATACATTTTGCATATGAAACAGTAGAATCATCCTTCAGTTGCATAGGCGCTAGATCATCTTTTAACATTGAGCTTACTTAGGGATAATTCCTCAAGATGGTGTGAACAGATGTGTGTTATACTTGGGGTCCACAGTGACAATCCTGGTTGCTCTCTTAGTGTACAGTGATTATAACTTCTCAAGAGTAATTCTGACTAAGCCATGATATGGTATAGCAATCATACCAATTCCTTGGTATCTTGGGTGGA-TGGAATCAAACACAGTTTCAATACTAGTACCTGAAGTTCGGCATCTCATGTTGTGATGATCAGC----TCAGGAAATAGCCTAGAAAGTTG-TTTTTAATTGAATACTGTTATGTGCAAATAGTAATAGAATCACGTCATGACAAAAAGAAGCTATTCAAAGC----TTGTGCAAATTTTGTGCAACTAGTTTGTGTCTTAATC + +a +s mr.mrrefChr5 278946 21 + 294542 TCATGTCACCAACAGTTAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426620 21 + 636262 TCGTGCCACCAACAGTTAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 432684 21 + 647215 TCATGTCATCAGCAGTTAGAG + +a +s mr.mrrefChr5 278967 88 + 294542 CCCCAGGATTCAACTATTCAGCCTTTTTCCGAAAAACCACAAAATAGAACCAACAGCTTGTATTAATAAGCAAATAAACTGACTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426641 88 + 636262 CCCCAGGATTCAACTATTCAGCCTTTTTCTGAAAAACCACAAAATAGAACCAACAGCTTATATTAATAAGCAAATAAACTGACTCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 432711 88 + 647215 CCCCAGAATTCAACTATTCAGCCTATTTCCGAAAAACCACCAAATAGAACCAACAGCTTGTATTAATAAGCCAATAAACTGACTCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 279055 203 + 294542 TCCTGCAACTCTTCATGGTACTCAAAAATAGCTGCCCATTTGCAAGCTTGGATTACCTGACTTGTCTCAGCTTAAATTGCAAAGAAGATTTTGTATGTAGGGTAGATGCTTTCCAAAAGATGGTTTAAGTCGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGACAACACTCATAAGATTCACATCCGCCAATGTTTTATAAGGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426737 203 + 636262 TCCTGCAACTCTTCATGGTACTCAAAAATAGCTGTCCATATGCAAGCTTGGATTAACTGACTTGTCTCAGCTTAAATTGCTAAGAAGATTTTGTACATAGGGTAGATGCTTTCCAAAAGATGGTTTAAGTCGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGACAACACTCATAAGATTCACATCCGCCAATGTTTTATATGGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 432799 198 + 647215 TCCTGCAACTCT-----GTACTCAAAAATAGCTGCCCATTTGCAAGCTTGGATAACCTGACTTATCTGAGCTTGAATTGCAAAGAAGATCTTGTATGCAGGGTACATGCTTTCCAATCGATGGTTTAAATTGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGAAAACACTCATGGGATTCATATCCGCCAATGATTTATAAGGTTC + +a +s mr.mrrefChr5 279258 28 + 294542 AGTAGCCTGGTTGCCTTTTTTCATGCTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426941 28 + 636262 AGTAGCCTGCTTGCCTTTATTCATGCTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 432997 28 + 647215 AGTAGCCTGGTTGCCTTTTTTCATGCTT + +a +s mr.mrrefChr5 279286 237 + 294542 CAGTGTGTCGTCACACTCCAGACTCAGGTGTAATATTGCTGCAACAAGAAACTCACTCATGTAGGATTTAGACTTTCATTACCCATAAAGCTGGAGCAAGCAGCCAAGTGAATGTAGTAGGCTATGAGCCACAAATGAGTCTTCATCAATAGCCCAGAAATTCATAGCCCTCAGTTATCCTGAACCATGATTCCATTGGGGAAGGAGTTTATAGTCATCAAAGTGGGTACACTCCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 426969 235 + 636262 CAATGT-TCGTCACACTCCAGACTCAGGTGTGATATTGCTGCTACAAGAAACTCACTCATGTAGGATTTAGACTTTCATGACCCATAAAGCTGGAGCAAGCAGC-AAGTCAATGTAGTAGGCTATGAGCCACAAATGAGTCTTCGTCAATAGCCTAGAAATTCATAGCTCTCAGTTATCCTGAAGCATGATTCCATTGGGGAAGGCGTTTATAGTAATCAAAGTGGGTACACTCCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 433026 237 + 647215 CAGTGTGTTGGCACACTCCAGACTCAGGTGCAATGTTGTTGCAACAAGAAACCCACTCATGTAGGATTTAGACTATCATTACTCTCAAAGTTGGAGCAGGCTGCCAAGTGAATGTATAAGGCCATGAGCCACAAATGAGTCTTCATCAATAGCCCAGACATTCATAGCCCTCAGTTAGCCTGAACCATGATCCCATTGGGGAACGAGTTTATAGCCATCAAAGTGGGTGCATTACTG + +a +s mr.mrrefChr5 279523 35 + 294542 TCCCCTGTGATGTCACATGGCCCAAACAAGTGATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427217 35 + 636262 TCCCCTGTGATGTCACATGGCCCAAACAAGTGATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 433263 35 + 647215 TCCCCTGTGGTGTCACATGGCACAAACTAGTGATT + +a +s mr.mrrefChr5 279558 197 + 294542 AAGATGTCTATGCAAACTGTGTCTATTTTGATCCAATACCTTAGCCCTGACTGAACCCTAAACAAGACACATAGTAGTAGGATGATTTCTGCAGGTGCACAATCCATCCTCATAGGGGTAATCTCAGGAATGCTTACTCCATATCAACCTCTTTGCTGCCCTTCTGTGCATTCGCTGTTGGTATTAATATCAGTCAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427252 188 + 636262 AAGATGTCTATGCGAATCGTGTCTATTTTGATCCAATACCTTAGCCCTAA--GCACCCTAAACAGGACACATAGTAGTAGGGTGATTTCTGCAGGTGCACAATCCATCCCCATAGGGATAATCTCAGGAATGCTTACTCCATATCAACCTTTTTGCTGCCTTTCTGTGCATTCGCTGTTGGTATTAATAC------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 433299 197 + 647215 AAAACGTCCTTGCAAACTGTGGCTATTCTTATTGCATATCTTAGCCCTGACTGAGCCCTGAACAAGAGACATAGTAGTAGGATGTTTTCTGCGGGTGCACAATCCATCCTCATAAGAGTAATCTCAGGAATACTCACTCCATATCAACCTCTTTGCTGCCCCTCTATGCATTCACTGTTGGTAATAATATCAGTCAG + +a +s mr.mrrefChr5 279755 20 + 294542 AGGTGTAGCATAAATTGATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427440 20 + 636262 AGGTGTTTCATAAATTGATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 433502 20 + 647215 AGGTGTAGCATAAATTGATG + +a +s mr.mrrefChr5 279775 603 + 294542 CAGTAGACTATGGGATTAGTATGCTATCTTCTACACCTATAGCAGTCCATTCACATCATCCTGAGGTAAGAATACGACTGGAGCGTATTGCAATTTTCACTGGCCATACTAAGTCTATTAGAGTTGTTTAAGTAGTCATGTTTGCTACCATTTGGATAACTTATTATTAATGTTGTTTAACTGGACTTGGACGCATCCTCTCAATGAGAGAGGTACCCTGTTCCCAATTTGAATGAGTGTTTTGGCACTCACATATAGTGCATCTGATCATAATATAAGCCCCATGATGAGCATTTGCAGGGCAAGATCTGTAAAAGAATGATTCTTCTGACGGAAAATATAGGTTGGGCTAGCTGGTAATGAAAAATCTCATGTCAGTGGATGTGAAGGTATAATAGACTTCATTGTATTATCAACTTTGTTTAGGCTTGGAACTTGGGCAACATACTATACTGTATTTGCTTGCATAAGATTGTTGGTTAACATGGCATTAGTATGACCTTGCTGGCCATGTTTCCAGATATGTATCCTGTTTTCTATTAAGTCTGATCTTCCAATAATAGTGAACCTGACCCAACTGTTCCAGTGATCTGCTGGGCATTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427460 524 + 636262 CAGTAGACTATGGGATTAGTTTGCTGTCTTCTAAACCTAAAGCATTCCATTCACATCATCCTGAGGTATGAACACGACCGGAGCGTATTGCAATTTTCACTGGCCATACTAAGTCTATTAGAGTTGTCTAAGTAGTCATGTTTGCTACCATTTGGATAACCTATTATTAATGTTGTTTGACAGGACTTGGACGCATCCTCTCAATGAGAGAGGTACCCTGTTCCCAATCTGAATGAG--------CACTACTATATAGT--------------------------------------CTTGGCAAGATCTGTAAAAGAATGATTCTTCTGATGGAAAATATAGGTTGGGCTAACTGCTAATGATAAATTTCATGTCAGTGGATGTGAAGATATAATAGACTTCATTGTATTATCAACTTTGTTTAGGCTTGGAACTTGGGCAACATACTATACTGTATCTGCTTGCATAAGATTGTTGGTTAATGTGGCATTAGTATGACCTTGCTGGCCATGTTTCCAGATATGTATCCTGTTTTCTATTAAGTCTGATCTTATAATAATAGTGAACCT--------------------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 433523 588 + 647215 CAGTAGATCATGG-ATTAGTATGCCATCTTCTACACCTATAGCAGTCCATTCACATCATCCTGATGCTAGACTACAACTGGAGCCTGTTTCAGTATTCACTGGCCGTACTAAGTCTATTAGAGTTGTTTATGTAGTGATGTTTGCTACCATTTAGATAACTTATTGTTAAAGTTATCTAATTAGACTTAGACGCATCCTCTCAATGAGAGAGGTACCCTATTTCCAATTTGAATGAGTGTTTTGGCACTCACATATAGTGCATCTGATCATAATATAAGCCCCATGATGAGCATTTGCAGGGCAAGATCTGTAAAAGAAC-ATTCTTTTGACGGAGGATATAGGTTTGGCTGGCTGGTAATGAAAAATCTCATGTCAGTGGAGGTGAGGGTATAACAGACTACATTGTATCATCAGCTTTGTACAGG-TTGGACCTTGGGCAGCACTATATCCTCCATTTGCTTGCATAAGGTTGTTGGTTAACATGGCATGAGTATGACCT------CAATGTTTCGAAATATGTATCCTGTTTTCGATTAAGT------TTCCAACAATAGTGGACCTGACCCAACTGTTCCAGTGATCTGCTGGGCATTT + +a +s mr.mrrefChr5 280378 10 + 294542 TGCTATTCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 434118 10 + 647215 TGCTATTCAA + +a +s mr.mrrefChr5 280388 30 + 294542 TTGCTTTATTCACTACATACTTGGCTGGCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 427984 18 + 636262 ------------CTACATACTTGGCTGGCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 434154 30 + 647215 TTGCTTTATTCACTATATACCTGGCTGTAC + +a +s mr.mrrefChr5 280418 161 + 294542 TCTAGAAGTATTCCACTCCTGAGACGACTGACCTTGGCCCATCTTCAAGTACACACCAAGGGGCAGTCCAGGCAGGTACCCTGGGAAGCTGACCAGGATTCTCCAATTTTTCATCCTAATGCCAAGGACATTGCATATGAGCTTTGTAGGCTCACTATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428002 161 + 636262 TCCAGGAGTATTCCACTCCTGAGACGACTGACGTTGGCTCATCTTCAAGTACACACCAAGGGGCAGTCCAGGCAGGTACCCTGGGAAGCTGACCAGGATTCTCCAATTTTTCATCTTAATGCCAAGGACATTGCATATGAGCTTTGCAGGCTTACTATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 434192 161 + 647215 TCTACAAGTATTCCACTCCTGAGATGATTAACCTTGGCCCAACTTCAAGTACACACCAAGGGGCAGTCGAGGCAGGTACCCCGGGAAGCTGACCAGGATTCTCCAATTTGTCATCCTAATGCCAAGGACATTGCATATGAGCTTTGTAGGCTCACTATGTG + +a +s mr.mrrefChr5 280579 29 + 294542 CAGTGTCCAGAGGTTAACTTGTTATACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428163 29 + 636262 CAGTGTCCAGAGGTTAACTTGTTATACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 434358 20 + 647215 CCATGTGCAGAGGTTGACTT--------- + +a +s mr.mrrefChr5 280608 65 + 294542 GTCCTATCTTTGACAATGGCTAATCTAGTCCATTGTTCTATTTCTGAACAGAAGAAAGCAGATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428193 65 + 636262 GTCCTATCTTTGACAATGGCTAATCTAGTCTATGGTTCTATTTCTGAACAGAAGAAAGCAGATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 434378 39 + 647215 --------------------------AGTCCTATGTTCTATTTCTGCATAGAAGAAAACAAATTC + +a +s mr.mrrefChr5 280673 47 + 294542 TAGTTTACATTGGTTAAAACATTAAGTGCTCTAAGATGACATGTTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428258 47 + 636262 TATTTTACATTGATTAAAACATTAAGTACTATAAGATGACATGTTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 434421 47 + 647215 TAGTTTACATTGGTTTAAACATTAAGTGCTCTAATATGACACGTTTT + +a +s mr.mrrefChr5 280720 170 + 294542 CACCCATGGAGTAATTCCAGAGTGACAAAGACCTGGGTATTGTATTATTTGTAGTCTTTCATGCTATCTGGAGGCTTTTGGTGTAGCCTCAAATTGCATCTTGGCTGGTGATTTTCAATACCTCACATGTATGGCAAACTAAAGAATCCACTAAAAGAGGAGAGTAGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428306 170 + 636262 CATCCATGGAGTAATTCCAGAGTGACAAAGACCTGGGTATTGTACCATTTGTAGTCTTTCATGCTATCTGAAGGCTTTTGGTGTAGCCTCAAATTGCATCTTGGCTGGTGATTTTCAATACCTCACATGTATGGCAAGCTAAGGAATCCACTAAAAGAGGAGAGTAACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 434468 170 + 647215 CACCCATGGAGTAATTCCAGGGTGACAGAGAGCTGGGTATTGTATTATTTGTAGTCTTTCATGCTACATGGTGACTTGTGGTGTAGCCTCACATTGCATCTTAGCTCATGATTTTCAATACCTCACATGTATGGCAAACTTAAGAATCCACTAAAAGAGGAGAGTAGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 280890 192 + 294542 ATCTCTAGCCTGGTGGATGTACATATGTGCAGTCCACCCACTTTCTGAAACACAGAGCTTTAGGTCCAGACTCCACCACTGGGTCTTGAAATGTGGTTCTTGTCAAAAACAGGCAGTAGACTCTAACAAAGTCCGAGTTAGCTGAAGGTTCAAACCGTAAGTGACTAAGCTTGCAATGCTTTTAGCCTTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428479 178 + 636262 ATCTCTAGTCTGGTGGATGTACATATGTGCAGTCCACCCACCTTTTGAAACACAGAGCTGTAGGT--------------TGGGTCTTGAAATGTGGCTCTTGTCACAAGCAGGCTGTATACTCTAACGAAGTCCGAGTTAGCTGAAGGTTCAAACCGTAAGTGACTAAGCTTGCAATGCTTTTAGCCTTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 434638 185 + 647215 ATCTCTAGCCTGATGTGTGTACCTATGGACAGTCCACCGACTTTCTGAAACACAGAGCTTTAGGTCCAGACTCCACCACTGGGTCTGGAAATGTGGTTCTTGTCAAAAACAGACAGTAGACACTAACAA-------GTTATCTGAAGGCTCAAACCCTAAGTGACTGAGCTTGCAATGATTTTAGCCCTTAC + +a +s mr.mrrefChr5 281082 167 + 294542 AAGAACGCTCTATGTCAAGGCTGAAAATCTCCAGGTGTTAGCTTTTAGTGCTTACAAGGACACTTCCATGTCAAGGCTGAAAATCTCCAGGTGTTAGCCATATCAAAAGTAAATATGAAGGGTTAGGTATACCTTGACTGGAGATCTTGTCAATTGCCGAATTGGCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428657 167 + 636262 AAGAACGCTCTATGTCAAGGCTGAAAATCTCCAGCTGTTAGCTTTTAGTGCTTACAAGGACACTTCCATGTCATGGCTGAAAATCTCCAGGTATCCGCCTTATCAAAAGTAAATGCAAAGGGTTAGGTATACCTTGACTGGAGATCTTGCCAATTGCCAAGTTGGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 434829 167 + 647215 AAGGACACTCCATGTCAAGGCTGAAAATCTCCAGGTGTTATCCTTTAGTGCTGACAAGGACACTTCCATGTCAAGACTGAAAATCTCCAGGTGTTAGCCATATCAAAAGTGAATATGAAGGGATAGGTATACCTTGAGGGGAGATCTAGTCAATCACTGAATTCGCA + +a +s mr.mrrefChr5 281249 178 + 294542 ACATTCCCATCGGCACCGCCCAGGAGGAACAATGGCCAGCATTAGGGAATAGTCATAATTCCATGGTTATGGTATGTAGGGAGTACTGCATGAACACACCACTCAAAAACACAATAGTGGATAGACTAAAACTAGTAAGGATGTGCAACAATGTACAACACTGTTATTTCATTATGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 428824 171 + 636262 GCATTCCAATCGGCACTGCCCAGGATGAACGATGGCTGGCATTAGGGAATAGTCATAATTCCATGGTTATGGTATCTCGGGAGTACTGCATGGACACACCACTCAAAAACACAATAGTGGATAGACTAGAACTAG-------ATGCAACAACATACAACACTGATATTTCACTATGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 435001 178 + 647215 ACACTCCCATCGGCACCCTCCAGGAGGAACAATGGCCAGCATTAGGGAATAGTCATAATTCCATGGTAGTGGTTCGTAGGGAGTGCTGCATGAACACACCACTCACAAACACAACAGTGGATAGACTAAAACTAGTAAGGATGTGCAACAATGTACCGTGCTGTTATTTGATTATGTG + +a +s mr.mrrefChr5 281427 303 + 294542 TGATACAAAGGATCACTGGAACTCACTAAGCCACATGTTTGACAATCTTTCCAAAGAGGTAGGTCACCTAATATGGCACTGGCAGGCAAAGACTTGCCTTTACAGTGAAGTCAAAATATTTGTTGTACACTTGATGGTCACTCAAGGAAATTTGTTGGTTGTTTTAACTCTTTTATCTGAAATCTGCATGAAGTGTGAAATTTGAAAGAGAAAAGACAGGACCTTGAACAGCTAGTTATGGTCTTCAACCAAAGAGGCCTGACTCACTGGATATGTGTATGTGTCTACCCATAACGTTATATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429004 286 + 636262 TGATACAGAGGATCACTGGAACTCAATATGCCACATGTTTGACAATCTTTCCAAAGAGGTAGGTCACCCAATATGGCACTGGCAGGCAAAGACTTGCCTTTACAGTGAGGTCAAAATATTTGTTGTACACTTCTTGGTCACCCAAGGAAATTTGTTGGTTGTTCTAACTCTTTTATCTGAAATTTGCATGAAGAATGAAATTTGAAAGAGAAAAGAC---A--------------TTATAGTCTTCAACCAAAGAGGCCTGACCCACTGGATATGTGTATGTGTCTACCCATGACATTATATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 435179 270 + 647215 TGATACAAAGCATCACTGGAACTAACTAAGCCACATGTTTAACAATCTTTCTAAAGAGGTAGGTCACCTAATATGCCACTGGCA---------------------GGAAGTCAAAATATCTGTTGCACACTTGATGGTCACTCAAGT-------TCAGCTGTTTTGACTCTTTTATCTGAAATCTGCATGAAGTGTGAAATTTGAAAGAGAAAATACAGGTCCTTGAACAGCTAGTTATGGGCTTCAACCAAAGAG-CCTGACTCACTG----TGGATATGTGTCTACCTATAACGTTATATT + +a +s mr.mrrefChr5 281730 210 + 294542 GTGTAACCCTTCACAGCACCCATGACAGCTCTTCTATCTAAATTTGGCATGTACACAAATACGCAGTGACCAGGCAATGCAGAATCAATGCAGAAAAATTGTTTCAGTATGTTGCCGGGGTCATTATCTGGTGTCTGGTGGACTGGTTAAGAAGCCTTGCAGGGGCCCATGTATATACACTGAGGATGCACATGGTGTAAGTTATTAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429290 191 + 636262 GTGTAAGCCTTCA------------------TTCAATCTAAATTTGGCATGTACACAAATACGCAGT-ACCAGGCAATGCAGAATCAATACAGAGAAATTGTTTCAGTATGTTGCCAGGGTCATTATCTGGTGTCTGGTGGACTGGTTAAGAAGCCTTGCAGGGGCCCATGTATATACACTGAGAATGCACATGGTGTAAGTTATTAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 435450 208 + 647215 GTGTAGCCCTTCACAGCACCCATGACAGCTCTTCTATCTAAATTTGGCGTGTACACAAATACACAGTGACCAGGCAATGCAGGAGCAATGCAGAATAATTGTTTCAGTATGTTACCGGGGTCATTATGTGGTGCCTGGTCGACTGGTTAAG--GCCTTACAGGGGCCCATGTATATACACTGAGGATGCACATGGTGTAAGTTATTAAGC + +a +s mr.mrrefChr5 281940 173 + 294542 ATTTCCCCAGAATCAGACAAACAAACTGCATCTCACAACACTGTAGGAACTTCAAAGAATGACTTGGACTGTGCGACACCTTGTGAACTTTTTGATGGCACTTGAGACTTCCCCACCAGAGCCAAGTATCAAACTGTTTCCACCAGTACCCAGTACCAAACTTATTTTTGATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429485 173 + 636262 ATTTCCCCAGAATCAGACAAATAAACTGCATCCCGCAACACTGTAGGAACTTCAAAGAATGACTTGGACTGTGCGACACCTTGTGAACTTTTTGATGATACTTGAGACCTCTCCACCAGAGCCAAGTTTCAGACTGTTTGCACCAGTACCCAGTACCAAACTTATTTTTGATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 435658 162 + 647215 AGTTTCCCAGTATCAGACAAACAAACTGCATCTAACAACACTCTAG-AACTTCAAAGAATGACTCAGACTGTG----------TGAACTTTTCGACGGCCCTTGAGACTTCCCCAACAGAGCCAAGTATCAAACTGTTTCCACCAGTACCCAGTACCAAACTTATTTTTGACC + +a +s mr.mrrefChr5 282113 56 + 294542 AAGAAACGACATACAGCAGCAAACAATGTACAGCAGCCAAAAGAAGACATACAAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429658 56 + 636262 AAGAAACGACATACAGCAGCAAACAATGTACAGCAGCCAGAAGAAGACATACAAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 435822 56 + 647215 AAAAGACAACATATAGCAGCAAACAACATACAGCAGCCAAAAGAAGACATACAAGA + +a +s mr.mrrefChr5 282169 74 + 294542 CCATGGCCAAGGTATAAAAAGTTCAGATTCACCTACAGCAAAATTTGGTTTCGGCAATTACTATATGTTTCTTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429716 74 + 636262 CAAGGGCCAAGGTATGAAGAGTTCAGATTCACCTACAGCAAAATTTGCTCTCGGCAATTACTATATCTTCCTTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 435878 74 + 647215 CCATGGCCAAGGTATAACAAGTTCAAATTCACATACAGCAAAATTTAGTTTCCGCAATTAATAAATGTTTGTTA + +a +s mr.mrrefChr5 282243 28 + 294542 TACAGATGGACAACCATTGTTGTTTTGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429792 27 + 636262 TACATATGGTCAAAC-TTGATGCTCAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 435952 28 + 647215 TATAGATGAACAACCATTGTTGTTTTGA + +a +s mr.mrrefChr5 282271 437 + 294542 AATCTCTAGCATTGCGAGGCAATGCCAAAAATTTGAACACCAATGATGATAATCTATAGGTAAGAAACATATGCATACATGGAATAAGAAAAGTATATATAATGTTTGGATTTAAGCAGACACATGAGCCTAAGCACATGTGGCTGCTATTCATCAGTTTAAATACTGATAGGCCACAGGAAGTACTAACTAAATAGCAAAAAATTGCTGTCTAAATGTCTTATCATATTTACTTTACAGACTACCAATTACTAGCATAATTTTCTGCTGGAGCAGCTTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACATGCAACTTATCTTCACCACGAGCAATTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTAATTAAACACTGAAGTGAATGGAAACACATTTAATTTGAATTCAAGATTAGTTTTGTAGCATGCCATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 429820 419 + 636262 AAT---TAGCATTGCCTCACAATACTAAAAATTTGAA-ACCAATGATGGTTGTCTA--------AAACATATGCATACATGGAATAAGAGAAGTATATATAATGTTTGGTTTTAAGCAGACACATGAGCCTAAGCGCATGTGGCTGCTATTCATTAGTTTAAATACTGATAGGCCACAGGAAGTACTAACTAAAGAGCAAAAAATTGCTGTCTGAATGTCTTATCATATTTACTTTACAGAGTACCAATTACTAGCATAATTTTCTGCTGGAGCAG-TTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACACGCAACTTATCTTCACCACGAGCAAGTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTAATTAAACACTGAAGTGAATGGAAACACATTTAATTTGAAT-----ATTAGTTTTGTAGCATGCCATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 435980 429 + 647215 AATCTCTAGAAATGCGAGGCAATGTCAATTGTATGAGCATCAAGGTTGATAATTTGTAGGTAAGGAAGATATGCAGACATGGAATAAGAAAAGTGTATATAATGTTTGGATTTAACCAGACACACGAGCCTAAGGACATGTGGCTGCTATTCATCAGTTTAAATAC----AGGCCTCAAGAA----TCACTAAATAGCAAAAATTTGCTGTCTAAATATCTCATCGTATTTACTTTAGAGACTACCAATTAATAGCGTAATTTTCTGCTGGAGCAGCTTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACATGCAACTTATCTTCACCAGGAGCAATTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTATTTAAACGCTGAAGTGAATTGAAATGCATTTGACTTGACTTCAAGAGTAGTTTTATAGTGTGCCATA + +a +s mr.mrrefChr5 282708 56 + 294542 TTATTCACATACAGTAATCATTGTTTTAGAGTGCACTTTTGTTATTAATGAACAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430239 56 + 636262 TTATTCACATACACTAATCATTGTTTTAGAGTGCACTTCTGTTGTTAATGAACAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 436416 56 + 647215 TTATTCACATACAGTAATCATTGTTTTAGAGTGCACTTTTTCCATTAATGAGCAGA + +a +s mr.mrrefChr5 282764 171 + 294542 CTGTGGAATCCTGTCTCACACTCTTATTTGTGTGAGCTAAGCTTGCAAAGGACTTGATCCAAGGCAGGATGTGCTGCACAGATCTTAGACTTTGTCTAATCTGGCTCTAAAGACAGGAATAGATTAGATGGGATTGCTTAAATATCTGTACAAAAGAAATAATCTACTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430298 171 + 636262 CCGTGCAATCCTGGCTCACACTCCTATTTGTGTGAGCTTAGTTGGCAGAGGACTTGATCCAAGGCAGGATGTGCTGCACATATCTTAGACTTCATCTAATGTGGCTCTAAAGACAGGAACAGATCAGATGGGATTGCTTAAATATCTGTACAAACGAAATAATCTATTACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 436472 171 + 647215 TTGTGGAATCCTGTCTCACACTCTTATTTGTGTGGGCTAGGCTTGGCATGGACTTGATCCAGGGCAGGATGTGCTGCACAGATCTTAGACTTTGTCTAATCTGGCTAAAAAGACAGGAATAGATTAGATGGGATTGCTTAAATATCTGTACAAAAGAGATAATCTACTACA + +a +s mr.mrrefChr5 282935 392 + 294542 CAACCCAGGGTTTTGGATACAACTGTGGCTTTACAAATAGGTTGAAGCCCTTCTCTTCCTATTTTGCCACTGGACTCCCAAGGCAGCATGCCATGATAGTCACCCTAAATGACCACACACCATGAGAGTTGTAAATCCTTTCTTTACTCTATTTGCTATATATAATATATGCCTATCATGACAGCACCTGACAGCAATAATAAGAGGTAGAGACAATGGATAACCTGTGGGCTAGAAAGATCAATCTTGGTGGGCCTCCTGCACAAGCAGGATCCCAAGCACATTCTTAAGTGCCCATAATTTGCCCCTTTTGGAGCCAACTATACTAAAGTGAAAACAGCTTGAGAAAAACCATAGGATGGAGGAGCGTAATGACAGTGTTGCAGGGAAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430480 354 + 636262 CAACCTAGGGTTTTGGATACAACTGTGGCTTTACAAATAGTTTGAAGCCCTTCTCTTCCTATTTTGCCTCTGGACTCCTAATGCAGCATGCTATGATAGTCACCCTAAATGACC--------TGAGAGTTGTAAATCCTTTCTTTACTCTATTTGCTATATATAATAGATGCCTATCATGACAGCACCTCACAGCTATAATAAGGGGTAGAGACAATGGATAACCTGGTGGCTA------------------------------AAGCAGGATCCCAAGCACATTCTTAAGTGCCTATACTTTGCCCCTTTTGGAGCCAACTATACTACAATGAAAACAGCTTGTGAAAAACCATAGAATGGAGGAGCATAATGGCAGTGTTGCAGGGAAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 436643 391 + 647215 CAACTCAGGGTTTTGGCTACAACTGTGGCTTTACATATAGGTTGGAGCCCTTCTCTTCCTACTTTGCCATTGGACTCCCAAGGCAGCATGCCATGATAGTCACCGTAAATGATCACACACCATGAGAGTTGTAAATCCTTTCTTTACTCTATTTGCTATATATAATATGTGCCTAACATGCCAGC-CCTGACAGCAATAATAAGAAGTAGAGACAATAGATAACCTGTGGGCTAGAAAGATCAATCTTGGTGGGCCTCCTGCACAACCAGGATCCGAAGCACATTGTTAAGTGCCCATAATTTGCCCCATTTGGAGCCAACTATACTAAAGTGAAAAGAGCTTGAGAAAAATCATAGGATGGAAGAGCGTAATGACAGTGTTGCAGGGCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 283327 29 + 294542 CAAATGCAGGATGCATAGGTGAGTGGAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430836 29 + 636262 CAAATGCAGGATCCATGGGTGAGTGGCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 437034 29 + 647215 CAAATGCAGAATGCATAGGTGAGTGGAAA + +a +s mr.mrrefChr5 283356 26 + 294542 GGTCCCATCTGCCAAACGGCCATGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177774 26 - 636262 GGTCCCATCTGCCAAACGGCCATGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 437063 24 + 647215 GGTATC--CTGCCAAAAGTTCATGTT + +a +s mr.mrrefChr5 283382 496 + 294542 AATGTACAGGTGTATACCTCTATGGTGTTAGCTCAGCCACCGCATGGGAGAGCCCTAGATGGCAGAAGCAATAATTGTGACAGAGTTGAGTTTCATTGGAAGGATTCTGGCATTTTTAGCACAGGTTAATTCAAACCACCTCCTTACTTGCCCCAATGCCCGGAGCCTGTTGGCACATCCTATATGTAGCCATACCAGGATCGGGTTTGTTTCTATCTATGGGCATAGACATCACTATAAAAGATTGCCTAACATGAGTAAAATGCCAATGGGCCTGGTAAGAGAACAAGACTAGTGCACTCTGAGTATGAAAGAAGTGAATTGTGTGTGGCCCCTGAATGTCTCAGTGTGCACATTTATGCTCTTTCACTAGGTGAAGTTCTCCAGAACACCTGCCCCAAGGTGGTCTCTTGTTTTAAGTTGAGCTAGTTGCAGAAGGTGGCACACAAAGTTCAGATCCTTACTAATGGATATTCTTTGTTCATAGATGTATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 177800 483 - 636262 AATGTACAGGTGTATACCTCTATGGTGTTAGTTCAGCGACCGCATAGGAGAG-------------AAGCAATAATTGTGATAGAGTTGAGTTTCATTGGAAGGATTCTGGCATTTTTAGCATAGGTTAATTCAAACCATCTCCTTACTTGCCTCAATGCCCGGAGCCTGTTGGCACATCCTATATGTAGCCATACCAGGATCGGGTTTGCTTCTATCTATGGGCATAGACATCACTATAAAAGATTGTCTAACATGAGTTAAATGTCAATGGGCACAGTAACAGGACAAGACTAGTGCACTTAGAGTCTGAAAGAAGTGAAGTGTGTGTGGCCCCTGAATGTCTCAGTGTGCACATCTATGCTCTTCCACTAGGTGAAGTTCTCCAGAACGCCTGCCCCAAGGTGGTCTCTTGTTTTAAGTTGAGCTAGTTGGAGAGGGTGGCACACAAAATTCAGACCCTTACTAAAGGATATTCTTCGTTCATTGATGTATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 437088 491 + 647215 AGTGTACAGGTGTATACTTCTATGGTCTTAGCTCAGCCACCGCATGGGAGATCCCTAGATGGCAGCAGCAATAATCGCGACAGAATTGAGTTTAACAGGAGGGATGCTGGCATTTTTAGCACAGGTTAATTCAAACCACCTCCTTACATGCCCCAATGCCAGGAGCCTGTTAGCACATCCCATATGTAGCCCTACCAGGATTGGGTTTGTTTCTATCTATGGTCATAGACGTCACTGTAAAAGATTGCTTAGCATGAGTAAAATGCTAACGGGCCTGGTAGGAGAATAAGACTAGTGCACTCTGAGTATGAAAGAAATGAATTTTGTGTGCCCCCTGAAGGTCT-----TGCACACTTATGCCCTCTCACTAGGTGAAGTTTTCCAGAACACTTGACCCAGGGTGGTCTCTAGTTTTAAGTTGAGCTAGTTGCAGAAGGTGGCACACAAAGTTCAGATTCATACTAATGGAAATTCTTTGCTCATAGAGGTATGGT + +a +s mr.mrrefChr5 283878 214 + 294542 TACATAGATTGACAGACAGCTAGTGACAGATGTAACTAAATATGAATTAGTAGGTATTAATAGTAATCTTTTTCCTAATAAGTGTATAAGGATGTGTCAGTTCCTGATACTTTAGGTAGTGGAATGACTAACAGATCTTATTTATTGATAGGCTATTGAATTTTATTGAGTACACCAGGGCCAAGCCCCATTTGTGTGAGAATTTGTGTGAGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178284 212 - 636262 TACATAGATTGACAGACAGCTAGTGACAGAGGTAACTAGATATGAATTAGTAGGTATCAACAGTCATCTTTTCCCTAATAAGTGTATAAGGATGTGTCAGTTCCTGATACTTTAGGTAATGTAATGACTAACGGATCTTACTTTTTGATAGGCTATTGAATTTTATTCAGTACACAAGGG--AAGTCCCATTTATGTGAGAATTTGTGTGAGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 437579 204 + 647215 TACATAGATTGACAGACAGCTAGTGATAGATGTAACCAAACATGAATTAGTAGGTATTAATAGCAATCTTTTTCCTAATAAGTGTATAC-GATGTATCAGTTCCTGC---------TGGCGGAATGACTAACAGATCTCATCTATTGATAGGCTCTTGAATTTTATTGAGTACAACAGGGCCAAGCCCCATTTGTGTGAGAATTTGTGTGAGAA + +a +s mr.mrrefChr5 284092 35 + 294542 ACATGGTAGACTCAGGGTTTGAACCATTCTCTAAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178496 35 - 636262 ACATGGTAGACTCAGGGTTTGAACCATTCTCTAAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 437845 35 + 647215 ACATGGTAAACTCAGGGTGTGAACCATTCTCAGAA + +a +s mr.mrrefChr5 284127 58 + 294542 CCATTCACAGAGATTCTGTTGAAAATGGAACTAGTTCATGCTCTGTTGTATTAAAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178544 58 - 636262 CCATTCACAGAGATTCTGTTGAAAATGGAACTAGTTCATGCTTTGTGGTATTAAAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 437880 20 + 647215 -------------------------------------ATGCTCTGTTGTATTAAAAC- + +a +s mr.mrrefChr5 284185 15 + 294542 ATGAGGTTTGTTTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178603 15 - 636262 ATGAGGTTTGTTTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 437900 14 + 647215 -TGAAGTTTGTTTCC + +a +s mr.mrrefChr5 284200 184 + 294542 TTAGGTGGTGATTTATATTTTACATTTCTCTATTGACAGGACTGCCTTGTTCTTTGTTATGTTGTCAGTAAGCTTTCCATGTAATTACAGCACAGTTTAAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTTTAAAGTTTGCAGACAGCCATATGGTCCATGATCTATCTGTGTCATCCCGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178618 184 - 636262 TTAGATGGTGATTTATATTTTACATTTCTCTATTGTCAGGACTGTCTTGTTCTTTGGTATGTTGTCAGTAAGCTTTCCATGTAATTACAGCACAGTTTCAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTATAAAGTTTGCAGACAGCCATCTGGTCCATGACCTATCTGTGTCATCCTGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 437915 184 + 647215 TTAGGTGGTGATTTATATTTTACATTCCTCAAATGACAGGACTGCCTTGTTCTTTGTTATGATGCCAGTAGGCTTTCCATGTAATTATAGTACAGTTTAAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTTTAAAGTTTGCAGGCAGCCATATGGTCCATGATCTATCTGTGTCACCCCATAA + +a +s mr.mrrefChr5 284384 132 + 294542 AGACTATAAAGTTCTTACACTTATATAAGGGTTAGAAATAATTATGCTGTGGTGTTAGATCATGGGTAGTCCCCAGTTGAAGTAGCTACATGTTGAGTGGATTGTAAGAAGAGCGTAGTATGGGTGTCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 178802 127 - 636262 AGACTATAAAGTTCTTACACTTATATAAGAGTTAGAAATAATTATGCTGTGGTGTTAGATCATGGGTAGTCCCCAGTTGAAGTAGCTACATGTTGAGTGGATTGTAAGAAGAGCGTAATATGGGTCT----- +s simRat_chr6.simRat.chr6 438101 132 + 647215 TGACTATAAGGATGGTACACTTATACAAGGGTTAGAAATAACTATGCCCTGGTGTTAGATCATGGGTAGGCCCCAATTGGAGTAGTCACGTGTTGATTGGATTGTAAGAAGAGCTTAGTATGGGTGTCAGTT + +a +s mr.mrrefChr5 284516 36 + 294542 GAGCAATGACTACAATGCTGTTCAATTAAATACCAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179160 36 - 636262 GAGCAATGACTACAATGCTGTTCAATTAAATACCAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 438233 36 + 647215 GAGCAATGACTAAAATGTTGTTCCATTAAGTAACCA + +a +s mr.mrrefChr5 284552 218 + 294542 TGCACAATGGAACATCTGGCCCCTGTCACGCATGCAGCAGCTGAAATTCACCGTGTGCACCGAGGAGGCAAATTATTGTTTAAAACTTCTGTAGACTTCTTGTTTAACCTCTCTGACAAGATTCTTAGGAGGGGTTGTGTACTCACCAGTCGTAATAGCTTCAAAAGGCCAAGCAGGCAAAGTTCCTGATCATTTGTCACCTACCACACTCAGTAGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179196 218 - 636262 TGCACAATGGAACATCTGGCCCCTGTCACGCATGCAGCAGCTGAACTTCACCATGTGCACCAAGGAGGCAAATTAGTGTCTACAACTTCTGTAGACTGCTTGTTGAACCTCTCTGACAAGATTCTTTGGAGGGGTTGTGTTTTCACCAGTTGTGATAGCTTCAAAAGGCCAAGCAGGCAAAGTTCCTGATCATTAGGTTCCTACCACACTCAGTAGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 438280 188 + 647215 TGAATAATGGAACATCTGGCCTCTGTGACAAATGCAGCAGCCGAAATTCACTGCATGCACCGAGGAGGCAAACTATTGCTGAAAATTTCTGTAGACTTCTTGTCTAACCTCTCTGACATGATTCTCAGGAGGGGTTGTGTACTCACCAGTCACAATAGCTTCAAAAGGACAAGCTGGCA-----------AGGTTGTCA------------------- + +a +s mr.mrrefChr5 284770 53 + 294542 TGAATGCACTAGTTCGTTGTGTCTGGTTTGGAAATGATCTGGGGTCTTGACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179418 53 - 636262 TGAATGCACTAGTTCGTTGTGTCTGGTTTGGAAATGATCTGGGGTCTTCACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 438468 50 + 647215 ---ACATACTAATTCATTGTTTCTGGTTTAGAAATGACCTGGGGTCTTGACTA + +a +s mr.mrrefChr5 284823 216 + 294542 ATGTCTTGCATGTGTCCAGTTTTGATTGAGTGGCTTTAGTGAGTGGTTTTATTGTTGACTGAGATTCGAATAGACTTTGACCAAGATTCCAAGAGGATTTGAATCTTTGAACAGGGCACCAGCTGATTCATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATATGGATAAGGTCCTTGATAAGGAGCATTTCATATGATAGGGCAGTGAATAGAGAACAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179481 216 - 636262 ATGTCTAGCATGTGTCCAGTTTTGACTGAGTAGCTTTAGTGAGTGGCTTTATTGTTGACTGAGTTTTGAGCAGACTTTGACCAAGATTCCAAGAGGATTTGAACCTTAGAACAGGGCACCAGCTGTTTTATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATGTGGATAAGGTCCTTGATAAGGAGCATTTCATATGATAGGGCAGTGAATAGAGAACAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 438518 216 + 647215 ATGTCTTGCATGTGTCCATTTTTGGTTGAGTGGCTTTCGTGAGTAGTCTTATTGTTGATTGAGATTCGAATAGACCTAGAACAAGATTACAAGAGGATTCAAATCTTTGAACAGGTTACCAGCTGACTCATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATATGGCTAAGGCCCTTGATAAGGAGCATTTCGTATGATAGGACAGAGAATGGAAAACAGG + +a +s mr.mrrefChr5 285039 87 + 294542 CGTAGGCAAAGGGTGAACAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGATAAACTCAAGACAAATACTCACCCTTAGATAAGATATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179697 87 - 636262 CGTAGGCAAAGGGTGAACAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGATAAACTCAAGACAAATACTCACCTTTAAATGAGATATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 438735 86 + 647215 AACAGTCAAAGGGTGAGCAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGAGGGCCACAAGACAAATACTGAGTCTTTGGTAGAATACT- + +a +s mr.mrrefChr5 285126 94 + 294542 AAATGGCATAGCAGCATGAATTTGATTAATAATAAATGATGCACTATTAACACTGTTGTACAAATTATCGTTACCCAAGTTATGGAGCACTGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179784 94 - 636262 AAATGGCATAGCAGCATGAATTCGATTTATAATAAATGATGCACTATTAACACTGTTGTACAAGTTGTCGTTACCCAGGTTATGGAGCACTGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 439032 94 + 647215 AAGTGGCATAGCAGCATGGACTTGATTAATATTATATGATGCACTATTAACACTGTGACACAAATTATTGTTACACAAGTTATGGAACACTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 285220 129 + 294542 CACAAGTTAAATCTTTGTGGGCCCTAGGGTGAGCAAAGTTTTTACAGAGATTTTTGAGACAAGGTACAGCTGTTTGAAATCTTCTGTCATCCTGGGATGATAGGCATTCTGGGATGACACATTAGGTGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 179878 129 - 636262 CACAAGTTAAATCTTTGTGGGCCCTAGGGTGAGCAAAGTTTTTACAGAGATTTTTGGGACAAGGTACAGCTGTTTGAAAACTTCTGTCATCCTGGGATGATAGGCATTCTGGAATGACACATTAGGCGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 439127 128 + 647215 CAAAAGTTAAGTTTACACGAGCCCTAGGGTTGGCAAAGTTTTTACAGAGATTTTTGAGACAAGGTACAGCTGCTTGAAATCTTCTGTCATCCTGCAATCATATGCAGTCTGGGATGACACATTAGGTG- + +a +s mr.mrrefChr5 285349 112 + 294542 CGGAGAAACTAAACCCATGTTAGGTACTATGCTCTTGTTTGCTGGCCATTTCACAAATACTCCACCATATTGTGTCTTTTTATTAGGTTGAGAAAAGACGCTATATGAATAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180008 112 - 636262 CGGAGAAACTAAACCCATGTTAGGTACTATGCTCTTGTTTGCTGGCCATCTCACAAATATTCCACCATGTTGTGTCTTTTTATTAGATTGAGAAAAGACGGTATAGGAATAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 439255 111 + 647215 -GGAGAAATTAGACCCATGTTAGGTTCTATGCTCTTGTTTGCTGGCCATTTCACGAATACTCCACCGTATTGTGTCTTTTTATTAGGTTCAGAAAAGTCACTATGTGAATCC + +a +s mr.mrrefChr5 285461 88 + 294542 AAAAACATAATGTATTCAGCTGACCCCAAACAGTAACTAAGTGTGGTATATGACTCAATACAATCCTTACTTTCTCTGGTGGATGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180120 88 - 636262 AAAAACATAATGTATTCAGCTGACCCCAAACAGTCACCAAGTGTGGTATATGACACAATACAATCCTTGCTTTCTCTGGTGGATGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 439377 87 + 647215 AGAAACATTATG-ATTCAGCTCACCCCAAACAGTAACTAAGTGTGGCATAGGACTCAACACAATCCTTACTTTCTTTGGAGGTTAACG + +a +s mr.mrrefChr5 285549 30 + 294542 TTTCTGGGCTTCTTGTTATGAGTAATGGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180222 29 - 636262 TTTCTGGGCTTCTT-TTATGAGTAATGGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 439464 30 + 647215 TTTCTGGGCTTCTTGTTATGAGTAATGGTT + +a +s mr.mrrefChr5 285579 45 + 294542 TATCTTGCACTATTTCAGCTGGTATATCATGATTGTATCGCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 180257 25 - 636262 TATCTGGTACTATTTCAGCTGGTAT-------------------- +s simRat_chr6.simRat.chr6 439494 45 + 647215 TATCTTGCACGATTTCAGTTAGTATATCATGATTGTATCGCAGTT + +a +s mr.mrrefChr5 285624 390 + 294542 GATAGCTTAGGTATAGCATCCATGATATTAGCACAGACGAGCATGCCCCTCAATATATGGTCAATATGGGGATAGCAATATTGCTGCTGTAATACTGAAATGATGAATCATATTGTTGTTTCAAGATAGCACCTCAAAATGTTTTAAAAGATTCAATGGGCTAGAACTGTGTTTGCATTGGTGTTTACATCTAATAATGCCAGTTGTTGCGTTGTTGCTGGAATGCTTTATGATGTAGATTTTTCAACGGTGGCAGTGGTTTGAATAGTTCAGCCAAATAGGTTGGCCCAAGATTAGTAAGATAGTCTAGCATGTGAGCTTCATTTAGGTCTCATAACACATATAGGAGGGACAGGTGGTAGCTGTAGAGAATGTAGGAAACCACATTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 430999 379 + 636262 GATAGGTTAGGTATAGCATCCATGATGTTAGCACAGACAGGCATA-CTCGCTATATATGGTAAATATGGGGATAGCAATATTGCTGCTGTAATACTGAAATGATGAAGCATATTGTTGTTTCAGGACAGCAC-------TGTTTTAAAAGATTCAATGGGCTAGAACTGTGTTTGCATTGGTGTTCACATCTAATGATGCCAATTGTTGCGTTGTTGTTGG---GCTTTATGATGTAGATTTTTCAACGGTGGCGGTGGTTTGAATAGTTCAGTCAAATAGATTGGCCCAAGATTAGTAAGATAATCTAGCATGAAAGCTTCATTTAGGTCTCATAACACATATAGGAGGGATAGGTGGTAGCTGTAGAGAATGTAGGAAACCACATTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 439539 390 + 647215 GATAGCTAAGGTATAGCAGCCATGATATTAGCACAGACGAGCATGCCCCTCAATATATGGGCGATATGGGCATAGCAATCTTGTTGTTGTAATACTGAAATAATGAATCATATTGTAGTTTCGAGATAACACCTCAAAATGTTTTAAAAGATTCAATGGGCTACGTGGGTGTTTGGATTTTCGTTTACATGTAATACTGCCAGTTGTTGTGTTGTTGCTGGAATGCTTTATGATGTAGATGTCTCAAGGGTGGCAGTGGTTTGAAAAATTCAGCTAAATGGGTGGGCCCAAGGTTAGTAAGGTAGTCTAGCATGTGAGATTTGTTTAACTCTCATAACACACATTGGAGGGACCGGTGGTAGCTGTAGAGAGTGTAGGAAACCACATTAA + +a +s mr.mrrefChr5 286014 144 + 294542 GGTTATTGGTAGTTTGTTAGCAGGATGACCCATTTTGTTTCGTCTTAAAGCCTTACCTCAAAGTCACAGTTCATTATAGTTTTCAAAAATCTGCTTTGCAACACCTGTGACTGCCCTTTGAGCTAGGCCAAACATTGTCTTCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431378 144 + 636262 GGTTATTGGTAGTCTGTTAGCAGGATGACCCATTTTGTTTCGTTTTAAAGCCTTACCTCAAAGTCACAGTTCATTATAGTTTTCAAAAATCTGCTTTGCCACACCTGTGACCGCCCTTTGAGCTAGGCCAAACACTGTCTTCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 439931 144 + 647215 GGTTATTGGTAGTTTGTTAGCAGGATGACCCATCTTGTGTCATCTAAAAGCCTTACCTCAAAGTCACAGTTCATTATAGTGTTCAGAAATCTGGTTTGCAACACCTGTGACTGCCTGTTGAGCTGGGCCAAACATTGTCTTCTT + +a +s mr.mrrefChr5 286158 158 + 294542 GGTAAAAAGATTCGAGCTAGGCCAAACATTGTCATCTGGAGTAAAAAGAGTTTCCCTCACCACCATCTGAGCTATAAGACTATTGCTGGGAAGCTCTACTGGGCTCACATAAGCTTATCCGATCAATGGAATGCCAGGGTATTTTGTAGTAACCCTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431523 156 + 636262 GGTAAAAAGATTCGAGCTAGGCCAAACATTGTCATCTGGAGTAAAAAG-GTTTCCCTCACCACCATCTGAGCTATAAGACTATTGCTGGGGATCTCTAATGGGCTCACATAAGGTCATCTG-TCAATGGAATGCCAAGGTCTTTTGTAGTAACCCTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 440075 158 + 647215 GGTAAATAGATTTGAGCTAGGCCAAACATTGTCTTCTGCAGTAAAAAGAGTTTCCCTCACAACCATCTGGGCCATAAGACAGTATTTGGGAAGCTCTACTGGGCTCACATAAGCCTATCCGATCAATGGAATGCCCGGGTATTTTGTAGTAACCCTTG + +a +s mr.mrrefChr5 286316 37 + 294542 TATGGACCTGTCAGGCCGCCTTACAATACTTAGCCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431681 37 + 636262 TATGGACCTGTCAGGCCGCCTTACAATACTTAGCCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 440233 37 + 647215 TATGGACCTATCAGGCCGCCTTACAGTACTTAGCTCA + +a +s mr.mrrefChr5 286353 51 + 294542 TTTACAGAAGCCTCATAGTCACTTCAAAGAGCATCCTTAAATAAAAGATAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431718 51 + 636262 TTTACAGAAGCCTCATAGTCACTTCAAAGAGCATCCTTACATAAAAGATAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 440282 51 + 647215 CTTACTGAAGCCTGATAGTTACGTCAAGGAGCATCCTTAAATAAAAGATAT + +a +s mr.mrrefChr5 286404 82 + 294542 TGGTTGTCCCACAGGAAATCTACTCAGTGCCTCGTTTTCGATGGAAATAACTAAGATAAGAGTTACATGAAAGGTTGCTACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431769 82 + 636262 TGGTTGTCCCACAGGAAATCTACTCAGTGCCTCTTTTTCGATGGACATAACTAAGATAAGAGTTACATGAAAGGTTGCTGCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 440343 82 + 647215 TGGTTGTCCCACAGGAAGTTTACTCAGTGCCTCGTTTTCGATGGGAATAGCTAAGATAAGAGTGACATGAAAGGTTGCTACA + +a +s mr.mrrefChr5 286486 50 + 294542 TTTGAAATAGTCCATCCAAGTAGTTGTGTGTCCCTTATGACCACATGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431851 50 + 636262 TTTGAAATAGTCCATCCAAGTAGTTGTGTGTCCCTTATGACCACGTGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 440426 50 + 647215 TTTGAAAAAGTCCACCTGATTAGTTGTGTGTCCCCTATGACCACATGTTG + +a +s mr.mrrefChr5 286536 258 + 294542 AATAATATCTCTATCTCTCCTCACTATCATGGCACACATTCTTGATAGGAACCTCTTCATAAGATTTCAGGTGCAATCTAAAGCACCTGTAGCATGGGAAATGTACATTATTTTCATGAATCGGGAATAGGGCACTAATAACCAGTCCCTGGTACTTTCATGTCATCTCATCTCAGTGTACAATGAAGTTAGATGCAAATAAATGTTCCAGGCAATATTAGATTTGATAACAAACGCATTCAGGACACGATTACACTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 431901 255 + 636262 AATAATAGCTCTATCTCTCCTCATCATTATGGCACACATTCTTGATAGGAACCTCTTCCTAGGATTTCA-GTTCAATCTAAAGCACCTGTAGCGTGGGAAATGTACATTATTATCGTGAATCAGGAATAGGGCACTGATAACCAGTCCCTGGTATTTTCATCTCATCTCATCTCATTGCACGATGAAGTTAGACGCAAATAAATGTTCCAGGCAATATTAGATTTGAT-ACGGACGCATTCAGGACGC-ATTACACTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 440477 257 + 647215 AATAATATCTCTATCTCTCCTCACTATCATGACACACACTCTT-ATAGGAACCTCTTCATAAGATTGCAGGTGCAATCTAAAGCACCTGTAGCATGGGAAATGTACATTATTTTCAAGAATCGGGAATAGGGCACTAATAACCAGTCCCTGGTACTCTCAAGTCATCCCGTCTCGGTGTGCAATGAAGTTAGATGCAAATAAATTTTCCAGGCAGTTTTAGATTTGATAACAAACGCATCCAGGACACGATTACATTT + +a +s mr.mrrefChr5 286794 28 + 294542 CTGCTGCTGCTACAGGTTTTCTCTACTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432157 28 + 636262 TTGCTGCTGGTACAGGTTTTCTCTACTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 440734 28 + 647215 CTGCTGCTGCTACAGGTGTTCTCTACTA + +a +s mr.mrrefChr5 286822 19 + 294542 TTGGGGTGTTCATTCCCGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432268 19 + 636262 TTTGGGTGTTCATTCCCGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 440762 19 + 647215 CTGTGGTGGTCATTCCCAT + +a +s mr.mrrefChr5 286841 138 + 294542 AGCGGCAGAACCAGCTAATATGCACTCAGAATCTTCCATTAGTGTTCATGTTGAACCTTCCAATTATTGTCTAAGGTGAGTTATGAGTTGCATTAAAACTAAGTCCTAACACTGCAAGGAATAGATCTCTCAGGAGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432295 131 + 636262 AGTGGCAGGACCAGCCAACATGTACTCAGA-------ACTAGTGTCCTTATTGAACCTTCCAATTATTGTGTGAGCTGGGTTATGAGTTGCATTAAAACTAAGTCCTAACACTGCAAGGAATAGATCTCTCAGGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 440781 138 + 647215 AGCGGCAGAACTAGCTAATGTGCACTCAGAATCTTCCATTAGTGTTCATGATGAACCTTCCGACTATTGTCCAAGGTGAGGTATGAGTTGCATTAAAACTAAGTCCTAACACTACGACGAATAGATGTCTCAAGAGGA + +a +s mr.mrrefChr5 286979 11 + 294542 ATAGTGGCTGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432426 11 + 636262 ATAGTGGCTGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 440920 11 + 647215 ATAGGAGCTGC + +a +s mr.mrrefChr5 286990 23 + 294542 TTGAGACTATGCTCTGCCACTCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432442 23 + 636262 TTGAGACTATGCTCTGCCACTCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 440931 23 + 647215 TTGAGACTGTGCTCTGCCACTCA + +a +s mr.mrrefChr5 287013 25 + 294542 CAGCAACAATACTCATCCATCAGTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432466 25 + 636262 CAGCAACAATACTCATCCATCAGTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 440954 25 + 647215 CATCAACAATACTTAACCCTTGATT + +a +s mr.mrrefChr5 287038 175 + 294542 GACATAGGGCTCATATCTCATGATATAGACTGTTTAGTCTCCACAAGGCTTAGAGCTACAAACCTGCTGATGTAAATTCTGTCGCTAGTACATACATTTAGCCTAGTCACAACCCACAGGGGCATGTAAGAATCAAGAGTGTTTTTTATAAGAGGTTGATAATGAGTTTATCAAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432492 175 + 636262 GACATAGGGCTCATATCTCATGATATAGACTGTTTAGTCTCCACAAGGCTTAGAGCTACAAACCTGCTGATGTAAATTCTGTCGCTAGTACATACATTTAGCCTAGTCACAACCCACAGGGGCATGTAAGAATCAAGAGTGTTTTTTATAAGAGGTTGATAATGAGTTTATCAAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 440979 175 + 647215 GACATAGGGCTCATATCCCAGGAAATAGACTGTCTAGTCTGCACAAGGCTTGGAGCTGCAAACCTATGGATGTAAATTCTGTAGCCAACACATACATCTAGCCTAGTAGCAAACCAGAGGGGTGTGTAAGAATCAAGAGTGTTTTTTATAAGAGGCTGATAATGAGTTGATCAAC + +a +s mr.mrrefChr5 287213 106 + 294542 CACTGTGATAGATAAACAACCCCCATAACTAGAGCAATGAAACACTTTTATAAGAGATTGACAATGGGTTAGTCAATATGCTATGATTGACATGCCAACGATATGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432668 106 + 636262 CACTGTGATAGATAAACAACCCCCATAACTAGAGCAATGAAACACTTTTATAAGAGATTGACAATGGGTTAGTCAATATGCTATGATTGACATGCCAACGATATGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 441154 106 + 647215 CACTGTGATAGATAAGCAACCCCCATAACTAGAGCAAGGAAGTGCCTTTATAAGACCTGGACAATGGATTAGTCAGTACGCTATGATTGATATGCCAGTGATATGC + +a +s mr.mrrefChr5 287319 169 + 294542 GGGGCCTCATAACTAGAGTAAGGACACGCCTTAATAAAAGTCTTATAATGGATTGATCAAAATGCTATGGTAGACTTGCAGGCCCACCTACTAGAGTAATGACACACTGGTTTGACTAGTTGATACCAGACTGTTAGACAACATCAATGAATAGTTTCTAGGCCATGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432774 169 + 636262 GGGGCCTCATAACTAGAGTAAGGACACGCCTTAATAAAAGTCTTATAATGGATTGATCCAAATGCTAAGGTAGACTTGCAGGCCCACCTACTAGAGTAATGACACACTGGTTTGACTAGTTGATACCAGACTGTTAGACAACATCAATGAATAGTTTCTAGGCCATGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 441261 152 + 647215 AGGGCCCCATAGGTAGAGTAATGATACACCTTAATAAAA-----------------TCAAAATGCTGTGGTAGTCTTATAGGCTCACTTACTAGAGTAACGAAACACTGGTTTGACTAGTTGATACCAGACTGTTAGACAACAGCAATGAACAGTTTCTAGGCCATGAG + +a +s mr.mrrefChr5 287488 75 + 294542 TATTCATAATTATTGTGAACTACAGCAAAGAAAAATGCAATGGGGACGTCTGAGAAGAATCGATGCCAAAGACAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 432952 75 + 636262 TATTCATAATTATTGTGAACTACAGCAAAGAAAAATGCAATGGGGACATCTGAGAAGAATCGATGCCAAAGACAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 441413 75 + 647215 TATTCATAATTAGTTTGAACTACAGTAAAGAAAAATGCAATGGGGACGTCTGAGAAGAATCAATGCCAAAGACAG + +a +s mr.mrrefChr5 287563 82 + 294542 AAACAACTCCAACCTGGCATAAATGAAATAAATATTAGCTAGAATCTTTCTCTTGGTAGAAAGGGAGCAAGATGCTCCACAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433028 82 + 636262 AAACAACTCCAACCTGGCATAAATGAAATAAATATTAGCTAGAATCTTTCTCTTGGTAGAAAGGGAGCAAGATGCTCCACAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 441488 82 + 647215 CAACAAATCAAACCTGGCGTAAATGAAATAAATAGTACCTAGAATCTTTTTCTGGGTACAGAGGAAGCAAGATGCTCCACAT + +a +s mr.mrrefChr5 287645 387 + 294542 TCAGCTTTTCTTTTGAGGTCATCTTTATCAGCAAGCAAAATTACATGATACTGCTACAATGACTGTTTTTACTTTCAACATGGTTTATGGAAGTATATTCTTGTGCCTTAGACAAACCGATAAATTCCAAGAGTGACCAGCACACAGGAGTAGCCACCTTGCACATTTTTCCATATAGTGTTGTGTCACAGATATTCAGTTACTGTATAGTTGCTGTAAGAAATCAAAAAGTTAGGTATCAAAAATTGGCATAGGTCCAAACAGGAATAACTGCCAGGGAGATAGATACATCCTTACTGGATAAACCATAATTCTCAGTATTATGTCTTGATCTCTAGAGTTATCCAGCAGCGGTACATAACCCATGACTTCTACTATCTTAGACAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433110 284 + 636262 ----------------------------------------------------------------------------------ATTCCTGGA--TATATTCTTGTGCCTTATACAAACAGATTAATTCCAAGAGTGACCAGCACACGGGAGCAGCCACCTTTCACATTTTTCCATATGGTGTTGTGCCCCAGATATTCAGTTACTGTATAGTTGCTGTAAGAAATTAAAAAGTTAGGTATTAAAAATGGGCATAGGTCCAAACAGGAATAACTGCCAGGGAGATAGATACA-------------------AATTCTCAGTATTATGTCTTGGTCTCTAGAGTTATCCAGCAGTGGTACATAACCCATGACTTGTACTGGCTAAGACAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 441663 387 + 647215 TCAGCTTTTCTTTTGAGGTCATCTTTATCAGCAAGCAAAATTACATGATACTGCTACAATGACTGTTTTTACTTTCAACATGGTTTATGGAAGTATAATCTTGTGCCTTAGACAAACCGATAAACTCCAAGAGTGACCAGCACACAGGAGTGGCCACCTTGTACATTCTTCCATACAGTGTTGTGTTACAGATATTCAGTTACTGTGTAGTTGCTGTAATAAATCAAAAAGTTGGGTAACAAAAATTGGCACAGGTCTAAACAGAAATAACATACAAGGAGATAGAGACATCCTTACTGGATAAACCATAAATCTGAGTATTATGACTAGATCTTGAAGCTTATCCAGTGGCAGCACATAACCCATGACTACTACCATCTTAGACAT + +a +s mr.mrrefChr5 288032 78 + 294542 TTTTATTAGCTGACATGCTGAAGGTTGTCTTGTCCAATGCTCTTCATAACAATTTCAGCTCCGTATTCAACCAATAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433395 78 + 636262 TTTTATTAGCTGACATGCTGAAGGTTGTCTTGTCCAATGCTCTTCATAACAATTTAAGCTCCGTATCCAACCAATAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 442050 72 + 647215 TTCTATTAGCCGACATGCTGAAGGTTGTCTTGTCCAATGCTCTT------GTTTTCAGCTCCGTAGTCAACTTACAGC + +a +s mr.mrrefChr5 288110 262 + 294542 AACCTAGTGCAAATGACTGTGTTGTTCATTGAAAGTGTGTGACTTTGTTGACTCAAGGTATATCCACAGGAGAGGAAGTTAAGGGCTTTAGATAATAGAGAATTGCAGCGGCAAATTTTATTTCATATCAGGACAATGAGAAAACAACACAGTTGTGGGTGTGCAGCCTTATGATCCTATGTCTGGCTATTGATCTTCGGGTGATAGACCTTCTTGTTCAGCGTACTTAGTCTGCAAGTTCAGTTGATGTATGGGTTCAATA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433479 262 + 636262 AACCTAGTGCAAATGATTATGTTGTTCATTTAAATTATGTGACTTTGGTGACTCAAGGTACAGCCACCGGAAAGGAAGTTAAGGGCTTGAGATAACAGACAATTGCATCAGCAAATTTTATTTCATATCAGGACAATGAGAAAACAACACAGTTGTGGGTGAGCAGCCTTATGATCCTATGTCTGGCTATTGATCTTCGGGTGATAGACCTTCTTGTTCAGCGTACTTAGTCTGCAAGTTCAGTTGATGTATGGGTTCAATA +s simRat_chr6.simRat.chr6 442122 260 + 647215 AACCTAGTGCAACTGACTGTGTTGTTCATTGAAAGTGTGTGACTTTGTTGACTCA--GTATGTCTCCAGGAGAGGAAGTTAAGGGTTTTAGATAATAGAGAACCGCAGTGGCAAGTTTTGTTTCATATCAGGACAGTGAGAAAACGACACAGTTGTGGGTGTGCAGCCTTATGGTCCTAGGTCTAACTATTAATCTTCAGGTAACAGACCTTCTTGTTCAGCAGACTTAGACTGCAAGTTTTGTTGAGGTAGGGGTTCAATA + +a +s mr.mrrefChr5 288372 14 + 294542 AACGTGGGTGCAAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433809 14 + 636262 AACGTGGGTGCAAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 442382 14 + 647215 AACATGGGCACAAG + +a +s mr.mrrefChr5 288386 99 + 294542 CCTAGTCCAACAGAAAACTCTAATGGTCCCAGTTGTATTACTTTATGTATATGTCCCCCAGGCCAATAACCAGCTCAGTGCCAGTTCAACTTTATGTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433832 99 + 636262 CCTAGTCCAACAGAAAACTCTAATGGTCCCAGTTGTATTACTTTATGTATATGTCCCCCAGGCCAATAACCAGCTCAGTGCCAGTTCAACTTTATGTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 442396 99 + 647215 CCTAGTCCAACAACCAACTCTAATGGATCCAGTTGTATTACTTCATATATATGTCCCCCAGGCCAATAGGCAACTTAGTGCCAGTTCTACTTTATGTCT + +a +s mr.mrrefChr5 288485 52 + 294542 AAAGATTGAAGAGGCATGCCCACGGTTCTTTAAGGCTGTTGGTAGTATTAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433936 52 + 636262 AAAGATTGAAGAGGCATGCCCACGGTTCTTTAAGGCTGTTGGTAGTATTAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 442495 52 + 647215 AAAGATTGAAGAGGCATGCTCACAGTTCTTTTAGGTTGTTGGTAGTATTAGT + +a +s mr.mrrefChr5 288537 5 + 294542 ACTAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433989 5 + 636262 ACTAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 442547 5 + 647215 ACTGT + +a +s mr.mrrefChr5 288542 113 + 294542 CAGAGGGTAAAGTGGTTCTACCTAATATCTTCCTCTAGGACAGGATTACTTTGCTCAGTACTCTGACATTATACTATTAATTCGGTTAAAACCtgattagggtgtgccacagc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 433994 113 + 636262 CAGAGGGTAAAGTGGTTCTACCTAATATCTTCCTCTAGGACAGGATTATTTAGCTCAGTACTCTGatattatactatcaattcggttaaaacctgagtagggtgtgccacagc +s simRat_chr6.simRat.chr6 442554 113 + 647215 TAGAGGGTAGAGTGGCTCTACCTAATATTTTCTTCTCGAAAAGGATTACATTGCTCAGTGGTCTGACATTATATTATTAGTTCAGTTAGAACCTGATTAGTGTTTGCCACAGC + +a +s mr.mrrefChr5 288655 47 + 294542 ctaagagtttaagtctttcaggacatagttatgaaattagatacagc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434107 47 + 636262 ctaagatttcaagtcttttaggacatagttatagtattagatacagc +s simRat_chr6.simRat.chr6 442669 47 + 647215 CTAACAGTTTCAGCCTATCAGGACACAGTTAAGAAATTAGATACAGC + +a +s mr.mrrefChr5 288702 87 + 294542 gggtcccagtttaaagactttgggcacacaactgctgtgggtttagtaaatgagttcaggattgtaaggtagacatacggcagtgat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434159 87 + 636262 gggtcccagtttaaagactttggacacacaactgctgtgggtttagtaaatgagttcaggattgtaaggtaggcatacggcagtgat +s simRat_chr6.simRat.chr6 442716 86 + 647215 GGGTCTCAG-TTAAAGACTTCAGGCACACGACTGCTGGGGGTTTAGTAAATGGCTTCAGGATTTTAAGGTAGACACACTGCAGTGGT + +a +s mr.mrrefChr5 288789 7 + 294542 tggCTCa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434248 7 + 636262 gggctca +s simRat_chr6.simRat.chr6 442802 7 + 647215 TGGCTCA + +a +s mr.mrrefChr5 288796 53 + 294542 TTGGCATCacatcattatggcggaaatgtaatttTGTCTGAAGATGGCATGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434257 53 + 636262 ttggcatcacatcattatggcggaaatgtaatttTGTCTGAAGATGGCATGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 442809 49 + 647215 TTGGCAACACATCACTATGGTGGAAATG----TTTGTCTGAGGCTGACAAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 288849 265 + 294542 TGGCTCTGCCTCTGGACAGGAGCTGTTTGCAGGCCCCTCAATGAGATGTCAAAAATATGGAACATAGGACAAGGTAGCTTCCAATCAGGATCTTACCAAACAACAAGAGCCACATAAAAGAAACCCGTGGTCCCTGGGGGTGTGCTGATTGTGAGTCCGTGCCCCTCCTTCGCTGAGCTGCACCGGAGGTACCAACCCTAACTTTGTGCTTATCATTAATCCCTGCCCCTCCTACACTGGGCTGTGCCAGGGGTACCAACGTGTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434310 262 + 636262 TGGCTCGGCCTCTGGACAGGAGCTGTTTGCAGGCCCCTGAATGAGATGTCAAAAGAGTGGAATGTAAGACAAGGTAGCTTGCAATCAGGATCT---CAAACAACAAGAGTCACCTAAAAGAAACCCGTGGTCTCTGGGGTTGTGGTGATTGTGAGTCCGTGCCCCTCCTTCGCTGAGCTGCACCGGAGGTACCAACCCTAACTTTGTGCTTATCATTAATCCCTGCCCCTCCTACACTGGGCTGTGCCAGGGGTACCAACGTGTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 442860 265 + 647215 TGGCTCTGCCTCAGGATAGGAACTGTTTGCAGGCCCCTCAATGAGATGTCAAAAATATGGGACATAGAACAAGGTAGCCTCCAATCAGGATCTTACCAAACAACAAGAGCCACATAACGCGAGCCAGTGGTCCCTGGGGGTGTGCTGTCCGTGAGTCCGTGCCCCTCCTATACTGGGCCAGGCCAGGGGTCCCCACCCTAACTTTGTGTTGATCGTTAATCTGTGCCCCTCCTATGCCGGGCTGTGCCAGAGGAATCAACGTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 289114 61 + 294542 CCAGAGGCACTGTCGGAATGCACCAGGGATACCAACATGTCCCAGAATTTAGAGGTCCGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434573 61 + 636262 CCAGAGGCACTGTCGGAATGCACCAGGGATACCAACATGTCCCAGAATTTAGAGGTCCGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 443125 61 + 647215 CCAGAAGCACCATTGGGCTGCGCCAGGGGTACCAACATGGCCCAGAATTTAGTGGTGCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 289175 27 + 294542 CGACACATGGTACCCAAATGCCAAAGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434637 27 + 636262 CGACACATGGTACCCAAATGCCAAAGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 202249 27 - 647215 CTACACATGGTACCCAAAAGCCGAAGT + +a +s mr.mrrefChr5 289202 15 + 294542 GGGATGTCCACGCAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434664 15 + 636262 GGGATGTCCACGCAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 202278 15 - 647215 GGGATATCTACGCGT + +a +s mr.mrrefChr5 289217 47 + 294542 TGCAATACACTGCAGAAAACACACCAGTGTCGGTGCCACCACCAGGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434697 47 + 636262 TGCAATACACTGCAGAAAACACACCAGTGTCGGTGCCACCACCAGGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 202293 47 - 647215 TGCAATACAACGCAGAAAACACACCAGCGTCGGTGCCACTACCTGGG + +a +s mr.mrrefChr5 289264 49 + 294542 TGCCACCACCAGGCACTTTGTGTGgtcgaaaagagggtggtgtaaaatt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434744 49 + 636262 TGCCACCACCAGGCACTTTGTGTGgtcgaaaagagggtggtgtaaaatt +s simRat_chr6.simRat.chr6 202351 49 - 647215 TGCCACTACCTGGGACATGGAGTGCtcaaaaagagggtgaggtacaatt + +a +s mr.mrrefChr5 289313 21 + 294542 gtcattgtttactagatgaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434794 21 + 636262 gtcattgtttactagatgaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 202400 21 - 647215 gtcactgtttactagatgcaa + +a +s mr.mrrefChr5 289334 28 + 294542 atgcacagttatcatagttgacctcatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434826 28 + 636262 atgcacagttatcatagttgacctcatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 202421 28 - 647215 atgtatggtcgtcatagctaaccccatc + +a +s mr.mrrefChr5 289362 103 + 294542 tgaagcattatcagaagactatatattaagagcagtgttaacaagacttcatcccatctcctaagcgttaaggatgccactggaatagacgtagagggaggtg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434860 103 + 636262 tgaagcattatcagaagactatatattaagagcagtgttaacaagacttcatcccatctcctaagcgttaaggatgccactggaatagacgtagagggaggtg +s simRat_chr6.simRat.chr6 202449 103 - 647215 cgaagcattatccaaagagtatatagcaggagcagtgtcaacatgacttcatcccatcacctaggtgttaaagatgccactggaatagatgtagaggcgggtg + +a +s mr.mrrefChr5 289465 19 + 294542 tccgggtgccagctgacga +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434963 19 + 636262 tccgggtgccagctgacga +s simRat_chr6.simRat.chr6 202553 19 - 647215 tccaggcactggctgatga + +a +s mr.mrrefChr5 289484 294 + 294542 ctggggagataaacggagttgccacagaggcggtcgagttgggctcctgatgacagtacgttatgctccttcttgtttcctgtttctccttctctctaatattgcagtacggcacctcatctattgattatgataatcgaagcaaactaatcatggtttgctcaatctcgcaaaaagctgttatgattttaaatgattggaaggtatttatatcgtctagcatcataagtcctcaacaaatgtccaaataaagcttatttccctgcactgaggccagattatcaggtggcaaac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 434984 294 + 636262 ctggggagataaacggagttgccacagaggcggtcgagttgggctcctgatgacagtacgttatgctccttcttgtttcctgtttctccttctctctaatattgcagtacggcacctcatctattgattatgataatcgaagcaaactaatcatggtttgctcaatctcgcaaaaagctgttatgattttaaatgattggaaggtatttatatcgtctagcatcataagtcctcaacaaatgtccaaataaagcttatttccctgcactgaggccagattatcaggtggcaaac +s simRat_chr6.simRat.chr6 202572 294 - 647215 ctggggagataaacggagtcaccgtagaagcagtcaggctggggtcgtaatgacagtacgttgtattacctcctgtttcctgtttttccacctctctaatattgcagtattgcccctcatctattgattgttttaattgaagcaaacaaatcatggtttgctctttattgccaaaagatgttatgattttaaataaccagaaggtaattatattatctagcatcataagtcctcagcaaatgtctgaagaagggttatttcctcacactaatgtcagattgttgggtgggaaat + +a +s mr.mrrefChr5 289778 97 + 294542 ttctagtggtaaatgtttgcttggcactgaggcttctccctcatcctaaccgtcatctgggtgcagatgatcacatcccctgatcccaatgctcatc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435279 97 + 636262 ttctagtggtaaatgtttgcttggcactgaggcttctccctcatcctaaccgtcatctgggtgcagatgatcacatcccctgatcccaatgctcatc +s simRat_chr6.simRat.chr6 202866 97 - 647215 ttctagtggtaaatgtttgcttggcactgaggcttcaccctcctcctaattgtcatcggggggtagatgatcgcatgccctgaccccaatgctcatc + +a +s mr.mrrefChr5 289875 40 + 294542 gtacctcttgcaccaagcgttttaaggttgtatcaattag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435377 40 + 636262 gtacctcttgcaccaagcgttttaaggttgtatcaattag +s simRat_chr6.simRat.chr6 202963 40 - 647215 gtacctcttgtgccgaccgttttaacgtcatatcaattag + +a +s mr.mrrefChr5 289915 44 + 294542 gtatgtattatgcgcttcattatgtccttaataggggggatcat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435417 44 + 636262 gtatgtattatgcgcttcattatgtccttaataggggggatcat +s simRat_chr6.simRat.chr6 203017 44 - 647215 gtatctactatgcacttcattatgaccttaaagggtgggatcat + +a +s mr.mrrefChr5 289959 5 + 294542 tatgc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435462 5 + 636262 tatgc +s simRat_chr6.simRat.chr6 203061 5 - 647215 tatcc + +a +s mr.mrrefChr5 289964 131 + 294542 cgtctcaggacacagtcttctccaacatcagttcatggcacctggttcattttgtttggcaggctgatcagtgatgttgattgcatcgctgattgaatccttccaaaggctgataatgttacccttaatgg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435470 131 + 636262 cgtctcaggacacagtcttctccaacatcagttcatggcacctggttcattttgtttggcaggctgatcagtgatgttgattgcatcgctgattgaatccttccaaaggctgataatgttacccttaatgg +s simRat_chr6.simRat.chr6 203066 131 - 647215 catcccaggacgcagtcttttccaacaccaactcatggtacctggttcattttgcctggtgggctgatcagtgacttggatggggttgtcgatcgaatccttccaaagcctgataatgttaccctaaatga + +a +s mr.mrrefChr5 290095 25 + 294542 gattctcttcagtcatgttcacacc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435605 25 + 636262 gattctcttcagtcatgttcacacc +s simRat_chr6.simRat.chr6 203197 25 - 647215 gatgcacttcagtcatgttcacacc + +a +s mr.mrrefChr5 290120 38 + 294542 atagcgtgtcaaatatagagaacatcattaaatgttct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435630 38 + 636262 atagcgtgtcaaatatagagaacatcattaaatgttct +s simRat_chr6.simRat.chr6 203229 38 - 647215 atggcgtgtcaaacatagagaacatcattaaatgtcct + +a +s mr.mrrefChr5 290158 11 + 294542 gtgactcttgt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435669 11 + 636262 gtgactcttgt +s simRat_chr6.simRat.chr6 203267 11 - 647215 gtgactcttgg + +a +s mr.mrrefChr5 290169 34 + 294542 aatcaaggggtctgatgtattgggagatacatag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435682 34 + 636262 aatcaaggggtctgatgtattgggagatacatag +s simRat_chr6.simRat.chr6 203278 34 - 647215 aggcctgagcgctaatgtattagtcgatatgtag + +a +s mr.mrrefChr5 290203 41 + 294542 tctacacctacaaatgtaaatccatgagaatctgcatagct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435722 41 + 636262 tctacacctacaaatgtaaatccatgagaatctgcatagct +s simRat_chr6.simRat.chr6 203312 41 - 647215 tctacacctacaaacgtaaatccatgagaatctgcatagct + +a +s mr.mrrefChr5 290244 78 + 294542 agcattgtccaggacctgaagtaccagtaggggcctacaattgttcctccctgagaatatgcaaacgtgaaggtagcc +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435766 78 + 636262 agcattgtccaggacctgaagtaccagtaggggcctacaattgttcctccctgagaatatgcaaacgtgaaggtagcc +s simRat_chr6.simRat.chr6 203353 78 - 647215 gacattgtccaggacctgaagtacctgtaggggcctatagtagttcccccccgagaatatgtgaatgtcaaggaaacc + +a +s mr.mrrefChr5 290322 10 + 294542 ttgaaaccag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435844 10 + 636262 ttgaaaccag +s simRat_chr6.simRat.chr6 203432 10 - 647215 ttgaaaccag + +a +s mr.mrrefChr5 290332 15 + 294542 gtcaaccaagcagtt +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435875 15 + 636262 gtcaaccaagcagtt +s simRat_chr6.simRat.chr6 203442 15 - 647215 gacgactaagtggtt + +a +s mr.mrrefChr5 290347 52 + 294542 tttttgtacgtgtaaatccgaagtactggagtgatttcatgcctatatttag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435890 52 + 636262 tttttgtacgtgtaaatccgaagtactggagtgatttcatgcctatatttag +s simRat_chr6.simRat.chr6 203460 52 - 647215 ttattgtacatgtaaatccagagaattgtagcaatttcatgcctatatttag + +a +s mr.mrrefChr5 290399 38 + 294542 cctttaaatgtcaagggttggtagtctggcatactaaa +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435949 38 + 636262 cctttaaatgtcaagggttggtagtctggcatactaaa +s simRat_chr6.simRat.chr6 203512 38 - 647215 cctttaggtgttgagtgttggtagtatggcatactaaa + +a +s mr.mrrefChr5 290437 10 + 294542 tattttttag +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435987 10 + 636262 tattttttag +s simRat_chr6.simRat.chr6 203551 10 - 647215 tgttttttag + +a +s mr.mrrefChr5 290447 33 + 294542 atcagatgaaccgaatgcttgcaatatagcgac +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 435998 33 + 636262 atcagatgaaccgaatgcttgcaatatagcgac +s simRat_chr6.simRat.chr6 203561 33 - 647215 atcagttgagctgaattcttgcaatatagtgac + +a +s mr.mrrefChr5 290480 7 + 294542 ataagct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436031 7 + 636262 ataagct +s simRat_chr6.simRat.chr6 203599 7 - 647215 gtaagct + +a +s mr.mrrefChr5 290487 21 + 294542 gtagcttgccccacggtaaat +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436038 21 + 636262 gtagcttgccccacggtaaat +s simRat_chr6.simRat.chr6 203608 21 - 647215 gtagttctccccccagtaact + +a +s mr.mrrefChr5 290508 74 + 294542 ccagggtcttgcatttcctctttgctagttgaagttctcaagggggtcttctgcctccagaataatgagactct +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436059 74 + 636262 ccagggtcttgcatttcctctttgctagttgaagttctcaagggggtcttctgcctccagaataatgagactct +s simRat_chr6.simRat.chr6 203630 74 - 647215 ccaggggcttgcatttcttctttgctagttggagttctcaagggggtcttctgcctccaggacaatgagattct + +a +s mr.mrrefChr5 290582 4 + 294542 attg +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436136 4 + 636262 attg +s simRat_chr6.simRat.chr6 443187 4 + 647215 ATTG + +a +s mr.mrrefChr5 290586 28 + 294542 GAGTGAGCTCTACACATATACTGGTGTA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436845 28 + 636262 GAGTGAGCTCTACACATATACTGGTGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 443191 28 + 647215 GACTGAGCTCTACACAAATACTGGTGTC + +a +s mr.mrrefChr5 290614 50 + 294542 GGCAGAGCATCACCTTAATGACTGACTTAGCTCTACACAAGTATGTTATG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436873 50 + 636262 GGCAGAGCATCACCTTAATGACTGACTTAGCTCTACACAAGTATGTTATG +s simRat_chr6.simRat.chr6 443222 50 + 647215 GACATAGTGTCACTTTAATAACTTCCTGAGCTCCATGCAAATATGTTATG + +a +s mr.mrrefChr5 290664 2 + 294542 GT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436925 2 + 636262 GT +s simRat_chr6.simRat.chr6 443272 2 + 647215 GT + +a +s mr.mrrefChr5 290666 30 + 294542 GTGAGAAGCATACCACATACTGTGGGCATC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436927 30 + 636262 GTGAGAAGCATACCACATACTGTGGGCATC +s simRat_chr6.simRat.chr6 443275 30 + 647215 ATGACAAATATACCACATACCGTGAACATA + +a +s mr.mrrefChr5 290696 8 + 294542 CATGATAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436957 8 + 636262 CATGATAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 443307 8 + 647215 AACAATAA + +a +s mr.mrrefChr5 290704 11 + 294542 GTTAAGGGTAT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436965 11 + 636262 GTTAAGGGTAT +s simRat_chr6.simRat.chr6 443316 11 + 647215 GTTAAGGGTAT + +a +s mr.mrrefChr5 290715 9 + 294542 GGCAACTTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436979 9 + 636262 GGCAACTTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 443327 9 + 647215 GGCAACTTG + +a +s mr.mrrefChr5 290724 157 + 294542 GGGCAGATAGCAACACCACCGTTCCATTTCATACTATATAAATGAGGGAAACAGGGGGTAACATGACGTCAAAATCTAGAAGTAGTTCTTTGTCTCTTCATCCCTATATTGGTAAGAGGTGCCTTCCATTGGGTTTTAAGCTGAATCTCTGTTATTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 436988 157 + 636262 GGGCAGATAGCAACACCACCGTTCCATTTCATACTATATAAATGAGGGAAACAGGGGGTAACATGACGTCAAAATCTAGAAGTAGTTCTTTGTCTCTTCATCCCTATATTGGTAAGAGGTGCCTTCCATTGGGTTTTAAGCTGAATCTCTGTTATTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 443337 157 + 647215 GGGCATATAGCAACACCACTGTTCCATTGCTCACTATGTGAATGAACACAACAGGGGGTAACACAACATCAAAATTTAGAAGTAGCTCTTTGTCACTTCATCCCTATAATGGTCAGAGGTGCCTTCTGTTGGGTTTTAAGCTGAATGTCTGTCATTA + +a +s mr.mrrefChr5 290881 17 + 294542 AACCTAAGGCTggagta +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437152 17 + 636262 AACCTAAGGCTGGAGTA +s simRat_chr6.simRat.chr6 443494 17 + 647215 GATCCAAGGCTaccgga + +a +s mr.mrrefChr5 290898 60 + 294542 GACCCAGTTATATGGTATTTAGACGCTGGTAGTGCATTGCAGGGGATGAGTTCCTCATCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437169 60 + 636262 GACCCAGTTATATGGTATTTAGACGCTGGTAGTGCATTGCAGGGGATGAGTTCCTCATCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 445709 60 + 647215 GACTCAGTTATAAGGTTTTTGGATGCTGGTAGTGCATTGCAAGGGATGGATTCCTCACCC + +a +s mr.mrrefChr5 290958 28 + 294542 CACACATATGTCCTGAGGGCCTGGTAGC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437229 28 + 636262 CACACATATGTCCTGAGGGCCTGGTAGC +s simRat_chr6.simRat.chr6 445773 28 + 647215 CCCACATATGTCCTGGGGGCCTGATAGT + +a +s mr.mrrefChr5 290986 6 + 294542 AGAGGT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437260 6 + 636262 AGAGGT +s simRat_chr6.simRat.chr6 445801 6 + 647215 AGAGGT + +a +s mr.mrrefChr5 290992 12 + 294542 AGTTTATTCAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437267 12 + 636262 AGTTTATTCAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 445807 12 + 647215 AATTTATTCAGG + +a +s mr.mrrefChr5 291004 146 + 294542 GAGGCTGCTATAATATGGCTCACGCTCTCAGAATCCAGGCGTTTAGTACTAGTAATGCACAAGAAACCATTAGTTCAACTTTCTTCAGTGTTCTTCTACACGAACTGTTTTCAGCAAGTGCTGCATCCATGGTTGGGTATTGGTTT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437287 146 + 636262 GAGGCTGCTATAATATGGCTCACGCTCTCAGAATCCAGGCGTTTAGTACTAGTAATGCACAAGAAACCATTAGTTCAACTTTCTTCAGTGTTCTTCTACACGAACTGTTTTCAGCAAGTGCTGCATCCATGGTTGGGTATTGGTTT +s simRat_chr6.simRat.chr6 445819 146 + 647215 GAGGCTGCCATAATATGACTCAAGCTCTCAGAAACCAGGAGTTTAGTACTAGTGATGCGCAAGAAACTGTTAGTTCAACTTTCTTCAGTGTTCTTCAACACGAATTGTTTTCAGCAACTGCTGCATCCATGGTTAGGTATTGAATT + +a +s mr.mrrefChr5 291150 21 + 294542 CATTTTGCCTTCCCCCAGTTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437440 21 + 636262 CATTTTGCCTTCCCCCAGTTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 445965 21 + 647215 CATTTTGCCTTCCTCCTGATC + +a +s mr.mrrefChr5 291171 42 + 294542 GGGGTTCGATTTTAGAGTATTGTCTATGAGAAATTCAGAACC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437461 42 + 636262 GGGGTTCGATTTTAGAGTATTGTCTATGAGAAATTCAGAACC +s simRat_chr6.simRat.chr6 446000 42 + 647215 AGCGTTTGATTCTTAAGAATTGTCTATGGGAAATTCAGGGCC + +a +s mr.mrrefChr5 291213 234 + 294542 TCTAAGTAAAGTCCAGTGATGGCCACCATGCCACCTATAGTGTTTTGATCAGCCAACATGGGCAACAGGCATTTACTCACAGCCAGTCAATATGGAGAACTTGAGTGTGATCTCAGGAAGGTCTCGAACATCGAGGGATGACCAGTCCATGCCCTACCTTAGATCCTGTGTATACACAAGCTACCCTTCTTGCTAACAACACATTTCTTTGCTCGAAGAGTAGAAAGAAGTCCA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437503 234 + 636262 TCTAAGTAAAGTCCAGTGATGGCCACCATGCCACCTATAGTGTTTTGATCAGCCAACATGGGCAACAGGCATTTACTCACAGCCAGTCAATATGGAGAACTTGAGTGTGATCTCAGGAAGGTCTCGAACATCGAGGGATGACCAGTCCATGCCCTACCTTAGATCCTGTGTATACACAAGCTACCCTTCTTGCTAACAACACATTTCTTTGCTCGAAGAGTAGAAAGAAGTCCA +s simRat_chr6.simRat.chr6 446044 234 + 647215 TCTCAGTAAAGTCCAGTGACAGCCACCACAGCACCTCTAGTGTTTTGACCAGCCCGCATAGGCAATAGGCGTTTGTCCACAGACAGTTAATATGGGGAACTTGAGCATGATCTCAGCAAGGCCTAGGACATTGAGGGATGAACAGTCCATGCCCTGCCTTAGATCCCATGTATAAGCAAGCTACCCTTCTTGCTAACAACACATTTCTTTACTTGAAGAGTAGAAAGAAGTCCA + +a +s mr.mrrefChr5 291447 17 + 294542 TAGATGTCTCTAAGCCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437737 17 + 636262 TAGATGTCTCTAAGCCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 446292 17 + 647215 TAGATGTCTCTAAGCCT + +a +s mr.mrrefChr5 291464 22 + 294542 GCTACTGCATATAATAGGGTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437754 22 + 636262 GCTACTGCATATAATAGGGTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 446311 22 + 647215 GATACTGCTTATACTAGAGTAA + +a +s mr.mrrefChr5 291486 6 + 294542 TATCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437777 6 + 636262 TATCTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 446333 6 + 647215 TATCTG + +a +s mr.mrrefChr5 291492 17 + 294542 TCTTTTGTACTATGGAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437783 17 + 636262 TCTTTTGTACTATGGAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 446340 17 + 647215 TCTTTTGTGCTATGGAG + +a +s mr.mrrefChr5 291509 28 + 294542 TGCCCTCCTGCCATCAAGCAATGTATGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437800 28 + 636262 TGCCCTCCTGCCATCAAGCAATGTATGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 446358 28 + 647215 TGTCATTTTTCCTTCAAGCTATATGTAG + +a +s mr.mrrefChr5 291537 177 + 294542 TGGTCTAAGTAGTCACTTGATAATTGGTTCTGTCAAAGTGATCATGCCATGGTTATATGAATCCCCATGGATATCCCTACAATTCACTCTGTTAGGAACCCTGATAACAATCCCTAGAATTCAGCTTCTATCCACAGACTGGTGACTATTCCCAGAGCTCATCTTTTATCCAGGCAC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 437836 177 + 636262 TGGTCTAAGTAGTCACTTGATAATTGGTTCTGTCAAAGTGATCATGCCATGGTTATATGAATCCCCATGGATATCCCTACAATTCACTCTGTTAGGAACCCTGATAACAATCCCTAGAATTCAGCTTCTATCCACAGACTGGTGACTATTCCCAGAGCTCATCTTTTATCCAGGCAC +s simRat_chr6.simRat.chr6 446386 177 + 647215 CGGTCTAAGCATTCACTTGATAATGGGTTATGTCAGAGAGATTATGCCATGGTTATATGAATCCCCATGGATATCCCTACAATTCACTCTGTGAGGAACCCTGATAGTTGCCCCTAGATTTCATTTTCTATCCACAGACTGGTGACTATCTCCAGAGCTCATCTTTTATCCAGGCAC + +a +s mr.mrrefChr5 291714 96 + 294542 ACCCTTGCTATGGTGAGTGAGAACTTTTTACCATGCCCATGGAGTCAAATTCTGAGGTGGAGCCTCTAACAGATCATGTGCCTATTGCCTCAAACA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438013 96 + 636262 ACCCTTGCTATGGTGAGTGAGAACTTTTTACCATGCCCATGGAGTCAAATTCTGAGGTGGAGCCTCTAACAGATCATGTGCCTATTGCCTCAAACA +s simRat_chr6.simRat.chr6 446570 96 + 647215 GCCGTTGCTGTTGTGGGTGAGAACTTTTTACCATGCCTATGGAGTCGAATTCTGAGGTAGAGCCACTAATAGATTATGTGGCTATTGTCTCAAACA + +a +s mr.mrrefChr5 291810 119 + 294542 CTAAATTTTGGGGTCGAGCAGAGAGGCTTTTTTCAGGAAGTAGAGAAGTAAGGCCCTCACCAGTTATGCTGTTGATTGTTCCAATCACTGACCTACCTCTTGTTATGCTTCTTCTGAGA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438109 107 + 636262 CTAAATTTTGGGGTCGAGCAGAGAGGCTTTTTTCAGGAAGTAAAGAAG------------CAGTTATGCTGTTGATTGTTCCAATCACTGACTTACCTCTTGTAATACCTCTTCTGAGA +s simRat_chr6.simRat.chr6 446667 119 + 647215 CTAAATCTTGTGGTAGTGAAGTGAGGCTCCTTTCAGGATGTAGAGAAATAAGGCCCTCACCAGTTATGCCATGGATTGTTCCAATCAATGACCTACCCCTTGTTATGCTCCTTCTGAGA + +a +s mr.mrrefChr5 291929 7 + 294542 TTTTATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438219 7 + 636262 TTTTATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 446786 7 + 647215 TTCCATT + +a +s mr.mrrefChr5 291936 224 + 294542 ATTTTTCTTCTCCTGAGATACTGGAAAATCCCCTCCTCAACCCTCCAATGGCATCTCTGTGGTAACTGTTTGTCTTGAACATTCTTTCATACCTCTGTTATAAGAAGCATGTTGATTGCAGATATCGGTATTTGAAGGTAAATAGGCACTCACAATGCAGTCTGCAGGGCCTTTGGGTCAGCCCCTATGTAAGTTGGTATGTAGGATTTATTTCTCTTGGGCTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438227 224 + 636262 ATTTTTCTTTTTCTGAGATGCTGAAAAATCCCCTCCTCAACCCTCCAATGGCATCTCTATGCTAACTGTTTGTCTTGAACATTCCTTCATACCTCTGTTATAAGGAGTATGTTGACTGCAGATATCGGTATTTGAAGGTAAATAGGCACCCACATTGTAGTCTGCAGGGCCTTTTGGTCAGCTCCTATGTAAGTTGGTTTGTAGGATTTATTTCTCTTGGCCAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 446793 215 + 647215 -TTTTTTTTCTCCTGAGATAACGGAAAATCC------CAACTCTCCAATGGCATCTGTGTGGTAAGTGTTTGTCTTGAACATTCTTTCATACCTCTGTGATAAGAAGCAGATTGATTGCAGATCTCAGTATTTGAAGGC-AATAGGCACTCACAATGCAAACTGCAGGGCTTTTGGGTTAGTCCCTATTTAAG-TGGTATGTACAATTTATTTCTCTTGGGCTG + +a +s mr.mrrefChr5 292160 23 + 294542 ACTACCCTATACTAATATTTTCC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438460 23 + 636262 ACTACCCTATACTGATATTTTCC +s simRat_chr6.simRat.chr6 447008 23 + 647215 ACTACCCTATACTAATATTGTCC + +a +s mr.mrrefChr5 292183 75 + 294542 ATACTTCTAAAATCATACTCCATCAATTTCAGTGGTTCTGTTGCCTATGTGTACTCAGGTACATAACTGGGTGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438486 75 + 636262 ATACTTCTAAAATCATACTCCATCAATTTCAGTGGTTCTGTTGCCTATGTGTACTCAGGTTTGTAACCAGGTGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 447031 65 + 647215 GTACTTGTAAAA-------CCATCAATTTGAGTGGTTCTGTTGCCC---TACACCTGGATACAAACCTGAGTATA + +a +s mr.mrrefChr5 292258 151 + 294542 GGTTGTCTAGCAGTATCCTTTATGATAGGGGAAGGGAAAATTATGTATTTTGCGGTTTCAGAAATGTTACTACAGGCCTTTGCAGTGAATGAAGCCAGCCCAAAGATTGAAATGAGGTTACAACATTAAAGCAGTCATTATAGCAGTTGAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438561 151 + 636262 GGTTGTTTAGCAGTATCCATTATGATAGGGGAGGGGCAAATTATGTATTTTGCGGTTTCGCAATTGTTACTACAGGCCTTTGCAGTGAATGAAGCCAGCCCAAAGATTGAAATGGGGTTACAACATTAAAGCAGTCATTATAGCAGTTGAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 447099 151 + 647215 AGTTGTCTAGCAGTATCCTTCATGATACAGGAAGGGAAAATTATGTATTTTGCTGTTTTAGAAATGTTACTACAGGCCCTTGCAGTGAATGAAACCATCCCAAAGAGTGAAATGAGGTTACAACATCAAAGCAGTCATTATTGCAGTTAAA + +a +s mr.mrrefChr5 292409 46 + 294542 TTACAGGACAGGAGACATCAACAAACATTAATATCCAAAAAGTAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438739 46 + 636262 TTACAGGACAGGAGACATCAACAAACATTAATATCCAAAAAGTAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 447250 46 + 647215 TTACAGGATGGGAGACATAAACAAACATTTCTATCCTAACAGTAGG + +a +s mr.mrrefChr5 292455 274 + 294542 TTGATATTGTTTGTTTAAGCTAGCAACTTACTAAACTTACTAAATTGGATTGCATAAAATAGGGACACCAGTCAGGTTTTTGGTGTGTTTCTCTCTACAACCATTCTGGGAGATTTTAACTCCAAGGAATCTGGAGGTGGAAAGCAGTCCACACATGTCTGGAAAAGCAAATCTATAAATATTGTGAGGTATGGGCATATCTCGCAACTTTCTAGTTGATGCCAAAACGCTTAAACACACAGGCTATCAGCAGTCTATGGCATCTTGGCTCTAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 438789 274 + 636262 TTGATATTCTTTGTTTAAGCTAGCAACTTACTAAACTCACTAAATTGGATTGCATAAAATAGGGACACCAGTCAGGTTTTTGGTGTGTTTCTCTCTACAACCATTTTGGGAGATTTTAACTCCAAGGAATCTGGGGGTGGAAAGCAGTCCACACCTGTCTGGAAAAGCAAATCTATAAATATTGTGAGGTACGGGCATATCTCGCAACTTTTAAGTTGATGCCTAAACGCTTAAACACACAGGCTATCAGCAGTCTATGGCGTCTTGGCTCTAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 447296 273 + 647215 TTGTGATTGTGTGTTTAAGCTAGCAACTTGCTAAACTTACTAAATTGGATTGCATAAAATAAGGACACCAGTTAGGTTTTTAGTGTGTTTCTCCCC-CAACCATTCTGGGAGATTTTAACTCCAAGGGGTCTGGAGGTGGAAAGCAGTCCACACATACCTGGAAAAGCAAAGCTATACATGTTGTGAGGTATGGGCATATCTGGCAACTTTCTAGTTGACGCTAAAAGGCATAGACATACAGGCTATCCGCTGTCTATGGCATCTTGGCTCTAA + +a +s mr.mrrefChr5 292729 359 + 294542 TAAATCAGTTGAAGTACAATGGCCGTTACATAATGGCAATTACATAGACAGATTCTATGAGACATAATGACTGGAGACTAAGTCTGCATAGAATAACTAGTGCATATAGCCCTTTAATGAAATGATCCACTTGTGGCTAGCCTAGATAACTTGACCACTCTTTCAGTGCCATGCCAATATTGACCAGTTGGAAGGGTACCATTCAGTCCGGATTACCATTCAGTTCAGACGAGTAGCTTACCATCACAACATAGATCATCTTTCTATTAACCCCACTAGTGCAATGGAGAGACACATATTCGCCTTAAGATCCTACGTTGTAGTACTTACTCAGAAACAAACTGAGACAGTATAGTCTC +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439063 359 + 636262 TAAATCAGTTGAGCTATGATGGCCGTTACATAATGGCAATTACATAGACAGATCCCATGACACATAATGACTGGAGACTAAGTCTGCATAGAATAACTAGTGCATATAGCCATTTGATGAAATGATCCACTTGTGGCTAGCCTAGATAACTTTACTACTCTTTCAGTGCCATGCCAATATTGACCAGTTGGAAGGGTACCATTCAGTCCAGATTACCATTCAGTTCAGACGAGTAGCTTACCATCACAACATAGATCATCTTTCTATTAACCCCACTAGTGCAATGGAGAGACACATATTCGCCTTAAGATCCTACGTTGTAGTACTTACTAAGAAACAAACTGAGACAGTGTAGTCTC +s simRat_chr6.simRat.chr6 447577 352 + 647215 TAAATCAGTTGAAGTACAATGGCCATCACATAATGGCAATTACATAGACACAATCTATGAGACATAATGACTGGAGACTAAGTTTGAATATAATAACTAGTGCATACAGTCCTTTAATGAGATGATCCACTTGTGGCTAGCCTGCATAACTTGACCACTCTTTTGGTGCCATGCCAATATTGACCAGTTGGAAGTGTACCATTCAGCCTGGATTACCATTCAGTTCAAAAGAGTAGCTTACCATCACAACATAGATCATCTTTCTATTAA-------AGTGCAGTGGAGGGACGTGTATTCGTCTTAAGATCCTATGTTGTACTACTTACTCAGAAACAATCTGAGACAGTATAGTCTC + +a +s mr.mrrefChr5 293088 838 + 294542 TAGGACATACCGAGCAGCCCATAAGAACCAACATGAATGTACAAACTACACAAGATTCCCACATAACCAGCAGCACAGACAATACAGGTTCCACCTGTTATAGTATCCTGGTTATTAGGAACTAGATGAAATGCCCAGGGGATATATGGTATCTTAGCAAACAACAATACTACAAAGGCTACAAGAAGTGGATTGCCCAATGCTAAAACATCCAGGTTTGTTTCATCTGTTCTCCCTATTTGAATCAAGTCCACAAAAGGAAAAATGGAAAGAGAAGACACTAACTTTAACGAAAAGACTATTACACTACTGTGCCAGTTTATGTGAAGGACACTTTGTATAAGCTATTGGAGATACTACTCTGTTCCACATTTTCATGACAGCACAGGGTCCCAACTCACCTCTTCATTCTCCTCTTTATTTATGAATGCATATATGTGTTTCGCGAAGCTGTTGATTTGTTGTACTTGCAGTACTCATATTGTTACTTTGCCTCATGTTTTAATTGTATGTGTTAGTTTGATACTTAAACTGTTGAATGTTATGATCATAAACTTAACTGTTACCTCTCTCAAGAAGGGATCATATGGTGAAGTTTTCAATTTCAGGCTACATCTAGGTTGGTTCAGCAGCTCCAATTGAGGTGTTTCCCAAGTATCAGGTGGTGCTTTTGACAAAGCTAGTACTTTTGATATGATACAGATGTCCTGCCAGTGGACTAAGCACAATTTAAGTGTAAACAACTCAGTCATAGATAATTTAGACCAGTACAAAAATAAGTCATGTAAGCCATTTTTAATATTCCAACGCACACAAACTTTACAATTGTAATGTCTCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439618 819 + 636262 TAGGATATACAGATCAGCCCATAAGAACCAACATGAATATACAGACTACACATGATTCCCACATGACCAGCGGCATAGACAACACAGGTTCCACCTGTTATAGTATCCTGGATATTAGGAACTAGATGAAATGCCCAGGGGATATATGGTATCTTAGCAAACAACAATACTACAAAGGCTACAAGAAGTGGGTTGCCCAATACTAAAATATCCAGATTTGTTTTATCTGTTCTCCCTATTTGAGTCAAGTCCATGAAAGGAAAAATGGAAAGGGGAGACACTAACTTTAACATAGAGACTATTAC---ACTGTGCTAGTTTATGTGAAGGACGCTTTGTATAAGCTATTGGAGATACTACTCTGTTCCACATTTTCATGACAGCACAGGGTCCCAACTCACCTCTTCATTCTCCTCTTTATTTACTAGCGCATATACATGTTTCGCGAAGCTGTTAATTTGTTGTACTTGTAGTACTCATATTGTTACTTTGCCTCATGTTTTAATTGTATGTGTTAGTTTGATATTTAAACTGTTGAATGTTATGATCATAAACTTAACTGTTACCTCTCACTAGATGGGATCATATGGTCTAGTTTTCAATTTCAGGCTACATTTAGGTTGGTTCAGCAGCTCCAATTGAGGTGTTTCCCGAGTGTCAGGTGGTGCTTTTGACAAAG-----------GATATGATACAGATGTCCTGCCAGTGGGCTAAGCACAATTTAAGTGTAAAC----CAGTCATA-ATATTTTAGACCAGTACAAAAATAAGTCATGTAAGCCATTTTTAATATTCCAACACACACAAACTTTACAACTGTAATGTCTCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 447929 832 + 647215 TAGTCCATATCCAGCAGCCCATAACAACCAAAATGAATGTACAAAGTACACAAGATTCCT-TAAAACCAGCAGCACAGACAGTACAGGTTCCACCTGCTGCAGTGTGCTGGTTATTTGGAACTAGATGAAATGCCCAGGGGATGAATGGTTTCTTAGCGAACAACAATACTACAAAGGTTACCAGAAGTGGATTGCCTAATGCTAAAACATTCATGTTTGTTTCATCTGTTCTCTCTATTTGAATCAAGCCCACAAAAGGAAAAATGGAAAGAGAAGACACTAACTTTAAGGAAAGGACTATTGCACTACTGTGCCAGTTTATGTGAAGGACACTTTGTATCAGTTATTGGAGATACTATTCTGTTCCTCATTGTCATGACACCAAAGGCCCCCAACTCACTTCTTCATTCTCCTCTTCATTTGTGAATGCATATATGTGTTTCAAGAAGCTGTTGCTTTGCTGTACTTGCAGCACTCATATTGTTA-TTTGCCACATGAATTAATTGTATGTTTAAGTTTAATACTTAACCTGTTGAAGGTTCTGATGCTTAACTGATCTGTTACCTCTCTCAAGAAGGGATCATATGGTGACGTCTTCAATTTCAGGCTCCATCTAGG-TGGTTCCGCAGCTCCAATTGA---GTTTCCCAAGTATCTGGCGGTGCTTTTGACACAGCTAGTACTTTTGGTAGGATAGAGTTGTCCTGCCAGTGAACTAACCACATTTTAAGTATCAACAACTCAGTCATAGGTAATTTAGACCAGTGTAAAAATGAGTCATGTAAGCCGTTTTTAATATTCCAACGCACACAGACTATACAATTGTAATATCTCT + +a +s mr.mrrefChr5 293926 271 + 294542 CAAAAAACCAAGTTTTAAGGTTTCGTCAAGTGAACAGGGACACTTATCATACATGCAATCAGATTGTCTGTATTTTAAGAATACCAGTGTTTTTGGTGGATTCATCCAAACCTCAGGTTGACTAGGTATTTGCTGTGGAGTAAGTACATGCATATGACATTAATATCATATTAAGGACTTCTGTAGTATAATGTGTAACCATTGACTTGACTAATATGTAGTGCAAGCTTGTTTACTATCCACATTACCTTCCATCAACTGGGAATTCATT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440437 271 + 636262 CAAAAAACCAAGTTTTAAGGTTTCGTCAAGTTAACAGGGACACTTATCATACATGCAATCAGATTGTCTGTATTTTAAGAATACCAGTGTTTTTGGTGGATTCATCCAAACCTCAGGTTGACTAGGTATTTGCTGTGGAGTAAGTACATGCATATGACATTAATATCATATTAAGGACTTCTGTAGTATAATGTGTAACCATTGACTTGACTAATATGTAGTGCAAGCTTGTTTACTATCCACATTACCTTCCATCAACTGGGAATTCATT +s simRat_chr6.simRat.chr6 448779 271 + 647215 CAAAAAACTAAGTTTTACGGTTTCGTCAGGTGAACAGGGAGACTTATCAGACATGCAGTCAGATTCACTGTATTTTGAAAGTATCAGTGCTTTTGCTGGATTCATCCAATTCTCAGGTTGACAAGGAATTTGCAGTGAAGTCAGTACAGGCACATAACACTAATGTCATATTAGGGACTTCTGTAATAAAATGTGTAACCATTCACTTGACTGACATGTAGTGCAAGCTTGTTTACTATCTACACTACCTTCCATCAACTAGGAATGCGTT + +a +s mr.mrrefChr5 294197 5 + 294542 ATGCT +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440708 5 + 636262 ATGCT +s simRat_chr6.simRat.chr6 449051 5 + 647215 ATGCT + +a +s mr.mrrefChr5 294202 6 + 294542 ATGAGG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440713 6 + 636262 ATGAGG +s simRat_chr6.simRat.chr6 449058 6 + 647215 ATGACG + +a +s mr.mrrefChr5 294208 58 + 294542 TGCTGTTCAAGGTGCTGATGATTTTAGGGAGTGCCTTAACCCTGAAAGTTCCCAATAG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440719 58 + 636262 TGCTGTTCAAGGTGCTGATGATTTTAGGGAGTGCCTTAACCCTGAAAGTTCCCAATAG +s simRat_chr6.simRat.chr6 449136 58 + 647215 TGCTGTTCGAAGTGCTGCTGACTTTAAGAAGTGCCTTAACCCCCAGAGCTCCCAATAG + +a +s mr.mrrefChr5 294266 49 + 294542 GTTGGAGGGAATCAGCATTGTCTTCTTGCCTTAACAGACTATCAAACAA +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440777 49 + 636262 GTTGGAGGGAATCAGCATTGTCTTCTTGCCTTAACAGACTATCAAACAA +s simRat_chr6.simRat.chr6 449197 49 + 647215 GGAGGGGGGAATCAGCATTGTCTTCTTATCTTAACAGACTATCAAACAA + +a +s mr.mrrefChr5 294315 153 + 294542 ACTTAACCTGTGGGCATCCAAATCTTTAAATCTGGGATTGAATGATATTCATTGAAACTTGTCCTTCAAGAGCCCTCATCTCACTCCAACACCGCTAGTGTCGTTTGGGTCAACTCTCACATGTTGAGGATCCAGAGCCACCTGCTCAGAGCG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440826 153 + 636262 ACTTAACCTGTGGGCATCCAAATCTTTAAATCTGGGATTGAATGATATTCATTGAAACTTGTCCTTCAAGAGCCCTCATCTCACTCCAACACCGCTAGTGTCGTTTGGGTCAACTCTCACATGTTGAGGATCCAGAGCCACCTGCTCAGAGCG +s simRat_chr6.simRat.chr6 449310 153 + 647215 GCTTAACCTGTGGGCATGCAACTCTTTAAATCTGGGGCTGAGTGGTTTTCATCAAAACTTGTCTTGCAAGAGCCAGTATCTGACTCCAACAGTGCTAGTATCATTTGGGTGGACTCTCACATGTTGAAAATCCGAAGCCATCCGCTCTGGGCA + +a +s mr.mrrefChr5 294468 74 + 294542 TTTCTGTCAGTGCATTTGCATGTATGATGGTGACAGTAACAAAGAAAATCTGATACATGTGCTGAAGAATGGTG +s simMouse_chr6.simMouse.chr6 440979 74 + 636262 TTTCTGTCAGTGCATTTGCATGTATGATGGTGACAGTAACAAAGAAAATCTGATACATGTGCTGAAGAATGGTG +s simRat_chr6.simRat.chr6 449482 74 + 647215 TTTCTATCAGTGCATTTGCATATATTGTCCTAACAGAAACAAAGAGGATCAGATACAATTGCTGAAGAGTGGTG +