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-a -s mr.mrrefChr0 4361 37 + 130230 TTATTAATAGGCTAGGGGTGTTGTTCACAGTACCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4578 37 + 636262 TCATTAATAGGCTAGGGATGTTGTTCACAGTACCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 642057 18 - 647215 TTGCTATTCGTCCAGGGG------------------- - -a -s mr.mrrefChr0 4398 23 + 130230 CATCGTACACCAAGGTATAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4616 23 + 636262 CATCGTACACCAAGGTATAACCA - -a -s mr.mrrefChr0 4421 255 + 130230 ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATAGTGAAGATTGCAAGACAAAGAATGTGCTGATCTAAATTTTTTGATTAGTGGATGCAGCTGGTTGCACCATCAACACAGACGGCAGCAGCATTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCACTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGTGGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 4650 255 + 636262 ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATACTGAAGATTGCAAAACAAAGAATGTACTGATCTAAATTCTTTAATTAGTGGATGTGGCTGGTTGCACCATCAACACAGACAGCAGCATCACTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCGCTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGCAGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 642075 254 - 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-a -s mr.mrrefChr0 12009 111 + 130230 TTGCTTTTCACAATTCTTTATCCTAATGGGCTTGGAGCACATGGCAAGAACCTTACAGCAATTTTTCAAGCTTGTTTCTATTCCTTGGTGTCCTTTCACTTCTAAACAGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13214 97 + 636262 TTGCTT--CACAATTC------------AGCTTGGAGCACATCGCAAGAACCTCTCAGCAACTTTTCATGCTTGTTTCTATTCCTTGGTGTCCTTTCACTTCTAAACAGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 235309 105 - 647215 TTGCTTTTCACAATTCTTTATCCTAATGGGCTTGGAGCACATGGCAAGGTCTTTACAGCGATTTTTGAAGCTTGTTTCTATTTCTTGGTATGCTTTCACTTTCAC------ - -a -s mr.mrrefChr0 12120 70 + 130230 TTCTGGAGCAAATCAAGGTACTCCAATAGACCATTGTCAACTACTCTACCAACTGCCAGATGAAGGACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13318 70 + 636262 TTCTGGAGCAAATCAAGGTACTCCAATAGACCATTGTCAACTACTCTATCAACTGCTAGATGAAGGACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 235414 68 - 647215 TTTTAAAAAAAATAAAGGTACTCCAATAAACCATTGTCAACTACTCAACCAACTGCCAGC--AAGAATCC - -a -s mr.mrrefChr0 12190 161 + 130230 AGGCCTAGCTTAGTCTCCAAAAGCGAATCCTTTTTTAGCCACAATTACCCTGTATGATGACTTAGGAGGCTCATACCTCCATCAGAAACTGGCTTCATTCCTCCATCAGAAAACAAGCCTTATAGGTCAACATACACTCATCATTAATTAGCCTTCTCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 13388 140 + 636262 ---------------------AGCGAATCCTTTTTTTAACACAATTACCCTGTATGATGACTTAGGAGGCTCATACCTCCATCACAAACTGGCTTCATTCCTCCATTAGAAAACAAGCCTTATAGGTCAATATACAATCATCATTAATTAGCCTTCTCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 235514 149 - 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-a -s mr.mrrefChr0 25884 79 + 130230 CAATTTAAGTTGCAGTCTCACTTATAAGAATTTTAATGTGTTTCAGCCTTCATAATCAGCGTGATATAATCATAAGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27415 79 + 636262 CAATTTAAGTTGCAGTCTCACTTATAAGAATTTCAATGTCTTTCAGCCTTCATAATCAGTGTGATATAATCATAAGCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 19522 79 + 647215 CAATCTAAGTAGCAGTCACACTTATATGAATTTTGATGTGTCTCATCTTTCATAATCAGCATGATGTAATCATAAGCCC - -a -s mr.mrrefChr0 25963 161 + 130230 TCACAAGCACATGATTCCCCCCTCAGCACAGCCTGGACAAATGAACAGCCTGGAGTAGACACATGATTCTCTTTAGAATGAAATCATAAGGTTATTCCTGCGCACAGTTATATGCCTTGCTTGTAATTATCATGGGCCTAGCCCTTCACAAGAACATTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27498 160 + 636262 TCACAAGCACATGATTCCTCCCTCAGCACAGTCTGGAAGAACGAACAGCCTGGAGTGGACACATGATTCTCCTTAGAATGAAATCATAAGGTAATTCCTGTGCACAGTTATATGTCTTGCTTGTAATTATCATGGGCCTGGCCC-TCACAAGAACATTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 19601 159 + 647215 TCACAAGCACAAGACTCCCCCCTCAGCACAACCTGGACAAATGAACAACCTGGAGTAG-CACATGATTCTCTCTATAATGACATCATAATGGTATT-CTGCGCACAGTTGCATGCCTTGCATGTAATTATCATAGGCCTAGCCCTTCACAAGGACATTAAG - -a -s mr.mrrefChr0 26124 227 + 130230 CATTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAATTAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTAAATGAATAGTCGTATTAGTTTACATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGTCTCCCAATCATCCTACTGCAATGTGTTGGGATTAGATGTTGACAGATCATTTTGAAGAGCCCTCAAGGGCTCTGCATCTCAAATAGAACTACTAAAGTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27659 221 + 636262 CATTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAATTAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTAAATGAATAGTCATATTAGTTTACATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGTCTCCCAATCATCCTGCTGCAA-----TGGGATTAGATGTTGACAGATCATGTTGAAGAG-CCTCAAGGGCTCTGCAGCTCAGATAAAACTACTAAAGTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 19760 221 + 647215 CGTTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAAATAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTACATGAATAGACGTATCAGTTTAGATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGT------ATCACCCTACTGCAATGTGTTGGGATGAGATGTGGACAGATTACTTTGAAGAGCCCTCAAGGGCTTTGCATCCCAAAAAGAACAACTAAAGTAGT - -a -s mr.mrrefChr0 26351 26 + 130230 AACATAGGCCTATTATGAACATGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27881 26 + 636262 AACATAGGCCTATTATGAACATGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 19981 26 + 647215 ACCTTAGGCCTATTATGAACCTGTTA - -a -s mr.mrrefChr0 26377 37 + 130230 GTGTACATAGGATAATAGATAGTGCTCTAGCAGTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27907 37 + 636262 GTGTACATAGGATAATAGATAGTGCTCTAGCAGTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 20008 37 + 647215 GTGTATATGGAATAATAATTAGTTCTATAGTGGCAGT - -a -s mr.mrrefChr0 26414 59 + 130230 AAGACTATCATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGCCTCCCAATCATCCTACTGCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 27945 59 + 636262 AAGACTATCATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGCCTCCCAATCATCCTACTGCAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 20045 59 + 647215 AAGACTATCATTCTTTTAGCCATACTCTTTACTGGACTCCCAATCATCCTACTGCAATG - -a -s mr.mrrefChr0 26473 22 + 130230 TGTTGGGATCAGGTGTGGACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28004 22 + 636262 TGTTGGGATCAGGTGTGGACAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 20113 22 + 647215 TGTTGGGGTCAGATGTGGACAG - -a -s mr.mrrefChr0 26495 6 + 130230 CTTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 28026 6 + 636262 CTTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 20137 6 + 647215 TTTATT - 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-a -s mr.mrrefChr0 38076 329 + 130230 GTACAGGTATGCCTAAATATGATGCCAATCCATTATAGCAAGTGACTACAGTAGAGAATGTATAACAATTGTGAGCAGCCCATCCCTCCTAGATTACACACCTATATTAGGTATAGTTACTTAGATAAATTAACCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTACTTCAGAGGGTGTCTTCTTCTCATAGGTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCATATGGGTTCACATTTGGGGTCCTATCTCTTGATGGTGTGCTAGATGGAGGAAGCTAATTTGATATTTGTAATGGATCACCAGTCACTTAATGTGTCAGAAACAAACATTGCTTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 40289 329 + 636262 GTACAGGTATGCCTAGATAGGATGCCAATCCATTATAGCAAGTGACTACAGTATAGAATGTATAACAATTGTGAGCAGCCCATCCCTCCTAGATTACACACCTATATTAGGTATAGTTACTTAGACTAATTGGCCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTGCTTCAGAGGATGTCTTCCTCTCATAGGTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCGTATGGGTTCACATTTGGGGTCCTGTCTCTTGATGGTGTGCTATACGGAGGAAGCTCATTTGATATTTGTAATGGATCACCACTCACTTAATGTGTTACAAACAAACATTGCTTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 32505 329 + 647215 GTCCAGGTATGCCTAAATCTGATGCCAATCCATTTTAGCAAGTTACTACAGTAGAGAATGTATGGCAATGGTGTGCAGTCCATCCCTCCGAGATTATACACCTATATTATATATAGCTATTTAGATAAATTAACCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTACTTCAGAGGGTTTCTTCTTTTCATAGTTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCATATGGGTTCACATTTGGGATCCTATCTGTTGATGGTACACTAGATGGAGGAAGCTAATTTGGTATCTGTAATGGATCACCAGTCAGTTAATGTGTCAGAAACAAACACTGGTTCCT - 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-a -s mr.mrrefChr0 39663 13 + 130230 TACTGGGCCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41902 13 + 636262 TACTGTTCCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 34246 13 + 647215 TGCTGGGTATGTA - -a -s mr.mrrefChr0 39676 87 + 130230 GTACTAACCACCAACATGTGAGACATGGTGAACATAAAAAGTCCTGTGGTCACAGTAAACTTTTGAAAACATAAGCTAAGGAAAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 41923 86 + 636262 GTACTAACCACCAGCATGTGAGACATGGTGTGCATAAAAAG-CCTGCGGTCACATTAGACTTTTGAAAACATAACCTAAGGAAAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 34259 87 + 647215 GTAACAACCACCAACATGTGCGCCATGGTGAACATCAAAAGTCCTGTGGTCACTGTAAACTCTTGAAAACATAAGCTAAGGAAAGCT - -a -s mr.mrrefChr0 39763 49 + 130230 TTGCTCACACATGACTAGAGATATACCAACCATCCCAATAAGATAATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42009 49 + 636262 TTGCTCACACATGACTAAAGATCTACCAACCATCCCAATAGGAGAATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 34353 49 + 647215 TTGCTCACACATGACTAGAGACATACCAACCATCCCAATAAGATAATTG - -a -s mr.mrrefChr0 39812 268 + 130230 TGATTGTGCTAGTTGATGATAATGCAGTATCAGACAGAAAGAAGGATTAACTTCATTACATCACTTTGTAGTAAGGGTATTCCTGACCATGCTAGAGCGTTTTGGACCACCTCTGGTTAAAGGCTCATTATATAATCCATAACTGCTGTCAGGTCAGGTGTAAGTGGTTTAGACTCTACTGCATAGCTCATAGTTTTCAGCTGGTGCTTAATTGGGTGCCAATCAACTGTATCCAATGAACTGTAGTCTTGCACTTGGTGCTTCACGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42058 264 + 636262 CCAT----CTAGCTGATGATAATGCGGTATCAGACAAAAAGACGGATTAACTTCATTACATTGCTTTGTAGTAAGGGTAATCCTGACCATGCTAGAGCGTTTTGGACCACCTCTGGTTAAAGGCTCATTATATAATCCATAACTGCTGTCATGTCAGGTGTAAGTGGTTTAGACTCTACTGCATAGCTCATAGTTTTCAGCTGGTGCATAATTGGGTGCCAATCAACAGTATCCAATGAATTGTGGTCTTGCACTTGGTGCTTCACGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 34404 245 + 647215 TGATTGTGCTAGTTGATGATATAGTAGTATCAGACAGAAAGAACGATTCACTTCATT-CATCACTTTGGAGTAAGGGTATTCCTGTCCATGC-----ATTTTCAGACCAT--------AAAGGCTCATTATACACTCCGTAACTGCTGTCAGGTCAGGTGTA---------GGCTGTACTGCAAAGCTCATAGTTGTCAGCTGATGCTTAATTGGGCGCCAATCAACTGCATCCAATGAACTGTAGTCTTGCATTTGGTGCTGCACGA - -a -s mr.mrrefChr0 40080 165 + 130230 TCCACGAGAACATTATTCCATTGGGAATACTAGATGATTTACTAACACTTAAGGGGTTGGAGACAATATCACAGTACTGGCAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGTTGGGAGTTTGATGTAGTGGCAAAGGACTGGGAACTCTTTACAGCTAGAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42336 165 + 636262 TCCACGAGAACATTATTCCATTGGGAATACTAGATGATTTACTAACACTTAAGGAGTTGGAGACAATATCACAGTGCTGACAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGTTGGAAGTTTGATTTAGTGGCAAAGGACTGGGAATGCTTTACAGCCAGAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 34649 165 + 647215 TCCACGAGAACGTCATTCCATTGGGAGTACTAGATGAACTGCTAACACTTGAGGGGTTGGAGACAATATCTCAGTACTGGCAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGATGGGAGTTTGATGTAGTGGCAAAGGACTGGGAACTCTCTACAGCTATTAAA - -a -s mr.mrrefChr0 40245 115 + 130230 TAGTGGAAGGGGCCTGGAGAACATTTGGAGAACATTAACAGTAATGACTAGTAACAAATGGAAGAACTTAGCAAGAAGGATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 42502 115 + 636262 TAGTGGAAGGCGCCTGGAGAACATTTGGAGAACATTAACAGTAATGAATAGTAGTGAATGGAACAACTTAGCAAGAAGGATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 34814 114 + 647215 TAGTGGAAGGGGTCTGGAGAACATTTGGATAACATCAACAGTAATGACTAGTAACAAA-GGAAGAACTTAGTGAGAAACATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATGCC - 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-a -s mr.mrrefChr3 777 123 + 181019 ATCGTTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442438 119 + 636262 ----TTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 454537 123 + 647215 ATCGTTGTGATAAGGACCTGTAGTGTACCCACAGCACAGCATTAAAAGTCAGAGGTTAATGGGGTTGATAATTTTTTCTGTGGTGTGGGGCAGTTTTATAATACAGTTAGTGAGCCGCAGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 900 63 + 181019 AATAAAAGGATCACACATTAATGTTGCACCAATGGCACCAACCAGTGATACAGATCCAGCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442559 63 + 636262 AATAAAAGGATCACACATTAATGTTGCACCAATGGCACCAACCAGTGATACAGATCCAGCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 454660 63 + 647215 AATAAAAAGATTGCACATTAATGTTGCACCAACGGCACCGGCCAGGGATACAGATCCAGCATG - -a -s mr.mrrefChr3 963 27 + 181019 GTTCAACTCTCTATTACACATCAAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 442625 27 + 636262 GTTCAACTCTCTATTACACATCAAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 454723 27 + 647215 GTTCATCTCTCTATTACACATCAAACC - 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-a -s mr.mrrefChr3 1656 79 + 181019 GCCGGTCGTGATGCTCGCGTTCATGTCCGCAGGACCCGCCCGGGGCCCTACTCCCTTGACCAACGATATCTCGTCGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443298 79 + 636262 GCCTGTCGTGATGCTCGCGTTCATGTCCGCAGGACCCGCCCGGGGCTCTACTCCCTTGACCAACGATATCTCGTCGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 455475 73 + 647215 GCCGGTCGTGATGGTCGTGTTCATGTCCGCGAAACCCGCCCGAGGCCCCACTCCCTTGACCAACGTTATCACG------ - -a -s mr.mrrefChr3 1735 57 + 181019 GGACGGGCGGAAACTGAATGTTGCATTTTCCGCGCAATGGAGACGTGCTATATCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443378 57 + 636262 GGACGGGCGGAAACTGAACGTTGCATTTTCCGCGCAATGGACACGTGTTATATCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 455548 53 + 647215 ----GGGTCGAAACTGAATGTTGCACTTTCCGCGCAATGGAGATTTGCTACATCAGA - -a -s mr.mrrefChr3 1792 146 + 181019 TGTCATAGGTCAAAATATTCCGGTCGATGGGGCGGCTAAAGCAATTCATGCGTTGGCCTTTTAAATAACCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATCTACTGATTGGTTGACTTGCAACAGTCCCATAGTGATTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443435 146 + 636262 TGACATAGGTCAAAATATTCCGGCCGCTGGGGCGGCTAAAGCAATTCATGCGTTAGCCTTTTAAATAGCCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATGTACTGACTGGTTGACTTGCAACAGTCCCATAGTGATTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 455602 146 + 647215 TGTCAAAGGTCGAAATACTCCGGTCGATGGGGCGGCTAAAACAATTCATGCGTTGACCTTTTGAATAACCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATCTACAGATTGGTCAACTTGCAACAGTCCCATAGTGGTTTGA - -a -s mr.mrrefChr3 1938 30 + 181019 AACAAGCCACAGTTCCATAGTGGTTTAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443589 30 + 636262 AACAAGCATCAGTCCCATAGTGGTTTAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 455748 30 + 647215 AACAAGCCACAGTTCCATAGTGGTTTGACA - -a -s mr.mrrefChr3 1968 417 + 181019 AGCAAGAATGTCCTGTCCTATCTGGTCCGTATCACCTCTGTGATCTATAGACATCTCAGATTCAATACATTAATAGACTTAAATTGGGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGACAGCCTAGCACTGCAGTGAGGAACATGGGCCTAATGTCTTCATACCATAGCATAACCATTTCGTATATAATTTGGCTATGAAGATATAGTTTTAATGTGACCCAGCTAAAGAATTGGAAGTCAAATTACTGGGCTCACCAGTGATCGGTGTTACACGATCGGTTTGTATAGTTGCATGCCTCAGCACTAGGCATGTTTGCAAGCCTAACCAAGGCTACAAGAAAGAAGGCAAAACAGGAGGATTACTGGGCTATAGCAACATAGTACTACATGACCAGGTGGAGCAATGCAAAATTTCTGCATGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 443633 416 + 636262 AACAAAAATGTCCTGTCATATCTGGTCCGTATCACCCCTGTGATCTATAGACATCTCAGATTCTATACATTAATAGACTTAAATTGGGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGGCAGCCCAGCACTGCAGTGAGGAACATGGGTCTAATG-CTTCATACCATAGCATAACCATTTCGTATATAACTTGGCTATGAAGTTATGGTTTTAATGTGACCCAGTTAAAGAATTGGAAGTCAAATTACTGGGCTCACCAGTGATCGGTGTTACACGATCGGTTTGTATAGTTGCATGCCTCAGCACTAGGCATGTTTGCAAGCCTGACAACGGCTACAAGAAAAAAGGCAAAACAGGAGGATTACTGGGCTATAGCAACATAGTACTACATGACCGGTGGGAGCAATACAAAGTTTCTGCACGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 455778 415 + 647215 AGAAAGAATGTGCTGACCTATCTGGTCTGTACCAACTCTGTGATCTACGGACAACTAAGA-GCAATACATTAATGGAC-TAAATTGAGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGACAGCCTAGCACTGCAGTGAGGAACATGTGCCTAATGTTTTCATACCATGTCTTTATCACTTCGTATCTAATCTGGCTATGAAGATATAGTGTTAATATGACCCAGCGAAAGAATTGGAAGTCTGATTACTAGGCTCACCAGTGGACGGTGTTGCATGTTCCGTCCATATAGCTGCATGCCTCAGAACTAGGCATGTCTGCAAGCCCAACCAAGGCTACAAGAAAGAAGGCAATGCAGGAGGATTACTGGGCTATATTAACATAGTACTACATGACCAGGTGAAGTATTGCAAAATTTTTGCATGCCT - -a -s mr.mrrefChr3 2385 489 + 181019 GTGTTAGCTGGTCCAGACAAGCCTTAAGTTTAGATTATGAATACTGGATCTAACCTAACAGAGATACCTGGAGATAGTACTAGGGTCCGTAATTGAAGTTAATTTCAGTAGCTAACAATAATGCCTGCATGATGGCATGAAAACATTGTTGGCTTTATGTTCACATTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCACAGCTTGCATTACCTCCTTTATATTGGCTGGAATCTTACAACAAACAATATGCGGACCTCATTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGACACTAATACTTCGACATCAAGCATAGGCCTCAGGGAATGCTGTTTCCCAGTGTGCACAAAAAAATTCTTAACACTCCTTTAATCATGGGTGCATGGTAGACGAATTTCTTAAATAAACTGTTGTGTTGTCTCAGTATCTGATGTTGGGTGTGGGAATGATAAGTTTAAGCCTCGCACTCTTAGTCCCATTGTCAGCCTGACTTATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444050 446 + 636262 GTGTTAGCTGGTCAAGACAAGCCTTAAGTTTAGATTGTGAATACTGGATCTAGTCCAACTGAGATACCTGGAGACAGTAGTAGGGTCCGTAATTCAAGTTCATTTCAGTAGCCAATAGTAATGCCTGCATGATGGCATGGAAGCATTGTTGGCTTTACACTCACATTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCACAGCTTGCATTACCTCCTTTATATTGGCTGGAGTCTTACAACAAACAATATGCGAACCTCCTTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGACACTGACAC-TCGGCATCAAGCATAGGCCTCAGGGAATGCTGTTTCCCAGTGTGCACAAAAAAATCCTTAACACTCCTTTAATCATGGGTGCATGGTAGACGAATTTCTTAAATAAACCGTTGTGTTATCTCAGTATCTGATGTTGGGTGTGGGAATGGTAAGTTT------------------------------------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 456193 489 + 647215 GTGTTGGCTGGTCCAGACAAGCCTTAACTTTAGATCATGAATACTGGATTTAACCTTACAGAGATACCTTGAGATAGTACTTGTGTCTGTAATTGAAGTTAACTTCAGTAGTTAACAATAATGCCTGCATGATGGCATGAAAACATTCTTGGCTTTATGTTTACACTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCCCAGCTTGCATAACCTCCTTTATATCGGCTGGAATCTTACAACAAACAACATGTGGACCTCATTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGCCACTAATACTTTGACATCAAGCATAAGCCTCAGGGAATGCTGTTTACCTGTGTGCACAAAAAAATTGTTAAGACTCCTTTAATCATGGCTTCATGGTAGACAAATTTCTTGAATAAACTGTTGTGTTGTCTCAGCATCTGATGTTGGGTGTGGGTATGATAAGTTTAAGCCTCGCACTCTTAGTCCCATTGTCAGCCTGACTTATATG - -a -s mr.mrrefChr3 2874 386 + 181019 AGAGTGATAGCCCACCATGATCCTTCAATGCTCCTTATTTGTGATCTGGTGGATTGGTAAATGTGTATATCATATCCTGGGAGAGGGTTGGTTGCAGGCTTTTCTTCAGTGCCAGGGCAATAGAAATTTTAGCAGTTTAGTATCTACGTTAAATTATCTTTAACATCACAAATTATAACAGTGAGGTGTACTGTACATGGTACTCTTATCACAGCAGTAATAAGAAATCTAGGGACAGTGTATGGTAATTCTCAGTACTGTATGCTTGTGGTGAACATGTGCTACTCCTGTCTACCCCTTTTCCAAGTGCTGAATCGAGTTAACCAAGATTCTATATATAGTCCTTATTTTTGCCATCCTATGTACAGGATGTAGCATGCATGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 444496 335 + 636262 -------------------------------------------ACCTGGTGGATTGGTAAATGTGCATATCAACTACTGGGAGATGGTTGGTTGCAGGCTTTTCTTCAGTGCTAGGGCAATAGAAATTTTAGCAGCTTAGTATCTACGATAAGTTATCTTTAACATCACAAATTATAACAGTCAGGTGTACTGT-CATGGTACTC-TATCACAGCAGTAATAAGAAGTCTAGGAACAGTGTATGAGAATTCTCAGTACTGTAAGCTTGTGGTGAACATATGCTACTCCTGTCTACCCCTTTTCCAAGTGCTGAATCAAGTTAGCCAAGATCCTATATGTAGTCCCTATTTTTGCCATCCTATGTACAGGATGTAGCATGC------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 456688 363 + 647215 AGAGTGATAGCCCACCATGATCCTTCAATGCTCCTTATTTGTGATCTGTTGGATTGGTAAATGTGTATATCATATCCTTGGAGAGGGTTG----CAGGCTTTTCTTCAGGGCCAGGGCGAGCAAAATTTTGGTGGTTTAGT-------TTAGATTATCTTTAACATCACAAATTCTGACCGTGAGGTGTACTGTACATGGTACTTTTATCA---CAGTAATAAGAAATCTAGAGACAGTGTATGGTAATTCTCAGTACTGTATGCTAGTGGTGAACATGTGCTACTCCTG--------TTATCCAA-TGCTGAATGGAGTTAACTGAGATTCTATATATAGTCCTTATCGTTGACATCCTATGTACAAGGTGTAGCATGCATGGCA - 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-a -s mr.mrrefChr3 3481 73 + 181019 CTTCTTGAGAATCCAAGTCCTAATTACTGCCCTATATGTGTGGATTTAATGTGTCAGGATTAGGTCACAAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445043 71 + 636262 CTTCTTAAGAATCCAAGTCCTAATTACTGCCCTATATGTGTGGCTTTAATGTGTCAAG--TAGGTCACAAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 457278 73 + 647215 CCTCTTGAGAATCCAGGTCCTAATTACTACCCTATATGTGTGGATCTAATGTGTCAGGATTAGGTGACAAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 3554 85 + 181019 AAGGACCTAACAAAGCCAACTTACTTCGCTAAATAGATCCTGTCTTACCCAAAGCAATATATTCTTGTTCATAATAAGTAATTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445115 85 + 636262 AAGGACCTAACAAAGCCAACTTACTTCACTAAATAGATCCTGTCTTACCCAAAGCAATATATTCTTGTTCATAATAAATAATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 457351 85 + 647215 AAGGACCTAACAAAGCCAACATACTTTGCTAAATGGATCCTGTCTTATCCACAGCAATATATTCTTGTCTATAATAAGTAATCAT - -a -s mr.mrrefChr3 3639 43 + 181019 AGAAGTTCCAGACATAATTGACATGTTTCCAATGTCTTACTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 445200 43 + 636262 AGAAGTTCCAGACATAGTTGACATGTTTCCAATGTCTTACTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 457527 43 + 647215 AGAAGTACCAGACATAATTGACATGTTTCCAATGGCTTACTGG - 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-a -s mr.mrrefChr3 23725 98 + 181019 GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACTTGTTTTAAAGCACTTCACTGTCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468045 98 + 636262 GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGAATACCTTCCTTTGCAAGGTCTTGTTTTAAGGCACTTCACTGGCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 477957 98 + 647215 GGATTGTATTAGCACTGTCTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACATGTTTAAAAGCACTTCACTCTCTGGGCTACTCAAGGGACATGTATTATCA - -a -s mr.mrrefChr3 23823 58 + 181019 ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468168 32 + 636262 ACACAAGCCTCAGACAGCTTAATGCTCCAGGC-------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 478055 58 + 647215 ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA - -a -s mr.mrrefChr3 23881 356 + 181019 ACAGCTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCTGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAAACTTCCAGCTTCACCTAACCCCACCATGACAGGATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATGTGCAACTGTTTACCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCATCAGGGCTCCGATGTGGGGTCAACCATCACTATCAAGGATCAACCAAAATTCCAGGCTGGGTGTCACATTGTCTTTCTTCACACTTCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGACATTCATATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 468200 337 + 636262 ACAGTTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCCGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAA-------------------CCCACCATGACAGAATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATTTGCAGCTGTTTGCCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCAGCAGGGCTCTGATGTGGGGTCAAGCATCACTACCAAGGATCAACCATCATTCCAGGCTGGGTGTTGCATTGTCTTTCTTCACACTCCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGGCATTCATATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 478117 353 + 647215 ACAGCTCCATTCAGATGTGCATTGGCTATGGACCTGCTGCTTCGACAGTTGCATCTGCTGCTTCCCACAGTTGCCATAGGTTGTATATCAACACTTCCAGCTTCACCTAACCCCACCCTGACAGGATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATGCATGACTGTTCACCATGCACAACCTTAAGGGCAAGTAAAAACTAATCTGTCTGCTTCCAGTATAATTTGACAATTCATCAGGGCTCCGATGTGGGGTCAACCATCACTATGACAGATCACCCAAAATTCCATGCCAGGTGTCACCTTGTCTCTCTTCACACTTCAAGCTGTG---CACCCAGGTATAATTTAGACATTCAAATT - 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-a -s mr.mrrefChr3 30017 123 + 181019 GGACTAGAAAATACATGATGCTGAAGCCTGCCATTCAAGGATTAATAATACCCAAGAAGGCACTCCTCTTATCCCCATGTATAAAAACAACCGCATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474298 123 + 636262 GGACTAGAAAATACATGATGCTGAAGCCTGCCATTCAGGGATTAATGATACCCAAAAAGGCACTCCTCTTATCCCTATGTATAAAAACAACCGCATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 484241 123 + 647215 GGACTAGAAAGTACATCATGCTGAAGTCTACTATTCAAGGATGAGTAATACCCATGAGGGCACTCCTCTCATCCCCATGGGTAAAAACAACCACATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAGA - -a -s mr.mrrefChr3 30140 12 + 181019 AAGATGGATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474722 12 + 636262 AAGATGTAACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 484364 12 + 647215 GAGATGGATTTG - -a -s mr.mrrefChr3 30152 367 + 181019 GTATTTGCTTAAATATAGAGGCCTGACAAGTCTTTTTGGACAGAATTGGAGGATTGCAAATAATAACATTTCCCTTGGTTCTCGTAACAAGATTGTAATGTTGGGTTGGAACTAAGGTAGTTAGAATTTAGCATTGCAGCAATCTAGTACTTGTATGTGACACACGGTTGGAATGGCTCACCCAACCCCAAGCTCCTTGAATTGAGTGACTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACATCTTGAAGGTTAGTAAGCACAAAGGTGATGATTGACTCTTCAAGTGTTGATTGATAGGACAGCAAGGGGTTGCACAGTTCCAGCAGGTTTCCATGTCCAACACAAGGTATTGTAATCTTCTCTAAATTGGGAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474735 313 + 636262 GTATTTGCTTAATTATATAGGCCTGACAAGTCTTTTTGGACATAATAAAAGGATTGCAAATAATAACATTTCCC---------------------------------------------------ATTTAGTATTGCAGCAATCTAGTACTTCTATGTGACG---GGTTGGAGTGACTCACCCAACCACATACTCCTTGAATTGAGTTACTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACACCTTGGAAGTTAGTAAGCACAAGGGTGATGATTGAGTCTTCAAGTATTGATTGATACAACAGCAAGGGGTTGCACAGTTCCAGCAGGTTTCCATGTCCAACACAAGGTATTGTAATCTGCTCTAAATTAGGAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 484376 367 + 647215 ATATTTACTTAAACATAGAGGCCTGACAAGCCTTTTTAGAGAGAAATGGACGATTGCAAATAATAACATTTCCCTTGGTTCTCGTAACAAGATTGTAATGTTGGGTTGGAACTAAGGTAGTTAGAACTTAGCAATGCAGCAGTCGAGTACTTGTAGGTGACACACGGTTGGAATGGCTCACCCAATCCCAAGCTCCCTGAATTGAGTGATTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACATCTAGAAGGTTAGCAAGCACAAAGGTGATGATTGACTCTTCAAGTGTCGATGGATAGGACAGCAAGGGGTTGCAAGGTTCCAGCAGGTTTCCATGTTCAACACAAGGTATTGTAATCCTCTCTAGATTGGGAGCA - 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-a -s mr.mrrefChr3 41590 22 + 181019 TACCAATAGTCACTTGGGTGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487476 22 + 636262 TACCAATAGTCACTTGGGTGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 495759 22 + 647215 TACCAATAGTCTCTTGTGTGCC - -a -s mr.mrrefChr3 41612 59 + 181019 ATTTCAGTCCACTATACATGGCCACTTCAAGATTATTCTAATAATGCATAATGCCTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487501 59 + 636262 ATTTCAGTCCACTATACATGGCCACTTCAAGATTATTCTAATAATGCATAATGCCTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 495781 59 + 647215 ATTTCAGTCCACTATGCATGGCTACTCCAAGATTGTTCTAATAACCCATAATGCCTAGA - -a -s mr.mrrefChr3 41671 147 + 181019 CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCACACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTGTCTATGTGAGATATTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487567 147 + 636262 CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCCCACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTATCTATGTGGGATGTTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 495840 147 + 647215 CCCAGGGCATAGATCCCATCAATCATTCTCTTCATGTTCTGTTAGCCTATTAGATCTACGGAGCTTTGGTGTCATATTTCAAATACCACCATTTAGCATGCTCCCTTTGTCTATGTGAGATATTAGGTAAGCCTGATAAATACTACT - -a -s mr.mrrefChr3 41818 64 + 181019 TGGTTGACTTTCAATTTGTCCCAAATCTCAATCTTTGTTTTTATTCATCTTACCAGTTCTTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487718 64 + 636262 TGGTTGTCTTTCGATTTGTCCCAAATCTCAATCTTTGTTTTTATTCATCTTACCAGTTCTTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 495987 64 + 647215 TGGTTGACTTTCAATTTGGCCCAAATCTTAATCTTTGTTTTTATTCATCTTACCAGTTCTTGGT - -a -s mr.mrrefChr3 41882 11 + 181019 AGGACCACCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487786 11 + 636262 AGGAGCACCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496051 11 + 647215 ATGACCACCTA - -a -s mr.mrrefChr3 41893 18 + 181019 TGGTCAAGCCACAATGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487798 18 + 636262 TGGTCAAGCCACAATGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496062 16 + 647215 TGGTAGAGTCACAATG-- - -a -s mr.mrrefChr3 41911 46 + 181019 ATGAATGTCTGAATCTCAGCAGGATACCAATACCTAACGGCAACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487817 46 + 636262 ATGAATGTCTGAATCTCAGCAGGATACCAATACCTAACGGCAACAG - -a -s mr.mrrefChr3 41957 97 + 181019 GGTAAGGCTAGATGACATATGTACTTTCATATGGAGTAATCAAAGAGAGTTTCCAGGAATCACTCACCCCCATCCATCAGAGTGTCTAATCTGCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487864 97 + 636262 GGTAAGGCTAGATGACATATGTACTTTCATATGGAGTAATCAAAGAGAGTTTCCAGGAATCACTCACCCCCATCCATCAGAGTGTCTAATCTGCCCC - -a -s mr.mrrefChr3 42054 56 + 181019 AGGACTCACGGGAGACAGACATATAGCAGTAATTTTCCAGACAAGGCGATGTGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 487962 56 + 636262 AGGACTCACGGGAGACAGACATATAGCAGTAATTTTCCAGACAAGGCGATGTGCTG - -a -s mr.mrrefChr3 42110 50 + 181019 GAGGCTATCCTAGTTGGAAATCAAGTTTTCATTAAAGTACCCACACTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488024 50 + 636262 GAGGCTATCCTAGTTGGAAGTCAAGTTTTCATTAAAGTACCCACACTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496078 36 + 647215 --------------TGGAAATCAAGTTTTCATTAAAGTGCCCACACTTAC - -a -s mr.mrrefChr3 42160 40 + 181019 TTCAGAGGAAGGATACAGTCATGCAAAAGTGGAACCCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488076 40 + 636262 TTCATAAGAAGGATACAGTCATGCAAAAGTGGAACCCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496114 40 + 647215 TTCAGAGGGAGGATACAGTCATGTAAAAGCGGAACCCTAA - -a -s mr.mrrefChr3 42200 17 + 181019 CTATCAGGCAAAGGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488135 17 + 636262 CTGTCAGGCAAAGGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 496154 17 + 647215 CTATCAGGCAAAGGTGG - -a -s mr.mrrefChr3 42217 123 + 181019 CCTAACAGCCTAAAATCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCCAGGGAGAATGGGAAATGGAAAAATCAACAAATGGAGAAATCAACAACATGATGTGCAATTCTCTATATACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488154 123 + 636262 CCTAGCAGCCTAAAACCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCCAGGGAGAATGGGAAATGGAAAAATCAACAAATGGAAAAATCAACAACATGATGTGCAATTCTCTATATACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 496171 101 + 647215 CCTAACAGACCAAAATCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCAAGGGAGAA----------------------ATGGAGAAATTAGCAATATGATGTGCAATTCTCCATATACATG - -a -s mr.mrrefChr3 42340 54 + 181019 AGTCAGATCAAATAAACAGTTGATGTACCCGCTTCATATTAGTGCAAAAGTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488291 54 + 636262 AGTCAGATCAAGTAAACAGTTGGTGTCCCTGCTTCATATTAGTGCAAAAGTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 496272 33 + 647215 AGTCAGATCAAATAAACAGTTGATGTACCCACT--------------------- - -a -s mr.mrrefChr3 42394 26 + 181019 CATTGAATCACTGCAGGCTTAGGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488373 26 + 636262 CATTGAATCACTGCAGGCTTAGGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 42420 27 + 181019 TACAGATTCATAAATTCTCATTCCCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488400 27 + 636262 TACAGATTCATAAATTCTCATTCCCAC - -a -s mr.mrrefChr3 42447 18 + 181019 TAGAGAGACGAGAGACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488430 18 + 636262 TAGAGAGACGAGAGACAA - -a -s mr.mrrefChr3 42465 295 + 181019 TCAAATGACAGGCCCAGGAATGGTGAACTTCAAATAGATATTTTTATGACACCCAGAACATTGTTATAATGTTTATAGAATTACTTCATACACCAGTAAGAGTAAATACTGTAGGAAAAATATTCTTAGATGTGTAGTCCCATTCAATTCTAGTGGCATTTCTGGTCTAGCAGCTCCTGGTATTTGTAAGCAAGCTCTGGCCTCAGGTAACTATAGTATTTATTACGTACCAGTATTAGACAATGAGTTCAAGTTGCGCTAGTAAGTGCCTTGGCATTTTACTTGTTACCACTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488449 295 + 636262 TCAAATGACAGGCCCAGGAATGGTGAACTTCAAATAGATATTCTTATGACACCCAGAACAGTGTTATAATGTTTATAGAATTACTTCATACACCAGTAAGAGTAAATGCTGTCAGAAAAATATTCTTAGATGTGTAGTCCCATGCAATTCTAGGGGCACTTCTGGTCTTGCAGCTCTTGGCATTTGTAAGCAATCTCTGGCCTCAGGTAACTATAGTATTTATTACATACCAGTATTAGACAATGAGTTTAAGTTGCGCTAGTGAGTGCCTTGGCATTTTACTAGTTACCACTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496305 269 + 647215 -------------CCAGGAATAGTAAACTTCAAATAAATATTTTTACGCCACCCAGAACATTGTTATAATATTTATAGAGTTACTTCATATACCAATAGGAGTAAATACTGTAGGAAA------------CGTGTAGTCCCATTCAATTCTAGTGGCATTTCGGATCTAGCAGCTCCTGGTATTTTTAAGCAAGCCCTGGCCTCAGGTCATTACAGTATTTATTAAGT-CCAGTATTAGACAATGAGTTCAAGTTGTACTAGTAAATGCCTTGGCATTTTATATGTTTCCACTGC - -a -s mr.mrrefChr3 42760 23 + 181019 TGGATGGATAACAAGCGCCACCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488744 23 + 636262 TGGGTGGATAACAAGCGCCACCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496578 23 + 647215 TGGATAGATAGCAAGCACCACCC - -a -s mr.mrrefChr3 42783 48 + 181019 TTGTAAATTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAGTGGATGGAGCGCTGGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488767 48 + 636262 TTGTAAGTTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAATGGATGGAGCGCTGGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 496603 48 + 647215 TTGTAAATTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAGTGGATGGAGTGCTGGTGT - -a -s mr.mrrefChr3 42831 14 + 181019 AGTGCTTTGGATGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488817 14 + 636262 AGTGCTTTGGATGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 496651 14 + 647215 AGTGCTTTGGCTGT - -a -s mr.mrrefChr3 42845 115 + 181019 CATGTTAATCCACTCCACCCTCCAAGGGCAATATTGCAGTCACCTGGTTTCACACACATGCTAGTGGTTTACTCCTAAACAGGCCTGTTCTTCAATCATTAGCTCTTGCAGCTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488831 114 + 636262 CATGTTAATCCACTCCACCCTCCAAAG-CAATATTGCAGTCACCTGGTTTCACACACATGCTAGTGGCTGACTCCTAAATGGGCCGGTTCTTCAACCATTAGCTCTTGCAGCTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496670 115 + 647215 CATGTTAATCCACTCGACCCTGCAAGGGCAATATTGCAGTCACCTGATTTTGCACACATGCTAGTGGTTTACTCCTAAACAGGCCTGTTCTTGAATCATTAGCTCTTGCTGCGTA - -a -s mr.mrrefChr3 42960 35 + 181019 AGCCCAGAGTTTAGGCCTCATTTGAGATTGTGCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488958 33 + 636262 AGCCTAGAGTTCAG--CTAATTTGAGATTGTACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496785 35 + 647215 AGGCCAGAGTTTAGGCCTCATTTGATATTGTGCTT - -a -s mr.mrrefChr3 42995 53 + 181019 TCAAACTCACATAAGGTCAAAGCTCATGTACACTGGGAGGCTCCATACTCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 488992 53 + 636262 TCAAACTCATATAAGGTTGAAGCTCATGTACACTGGGAGGCTCCATACTCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496820 53 + 647215 TCAAACTCACATAAGCTCAAAGCTCATGTACACTGGGAGGTTCCGTACTCTAC - -a -s mr.mrrefChr3 43048 21 + 181019 CTGTCTTATTATAGCCTGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489054 21 + 636262 CTGTCTTATTATAGCCTGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496873 21 + 647215 CTGTCTTATCATAGCCTGATT - -a -s mr.mrrefChr3 43069 46 + 181019 AAGCATGATTTATACTGTGACATGACTCTCTATTCAACATAGTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489075 45 + 636262 AAGCAT-ATTTATACTGTGACATGACTCTCTATTCAACATAGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 496898 46 + 647215 AAGCATGATTGTTATTCTGACATGACGCCCTATTAAAGATAGGTAA - -a -s mr.mrrefChr3 43115 93 + 181019 TTGTATTTTTTCCTGGAGTGAAGCCAGGGTATAAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTGTTGCTGTGCAGATTATAAATTGTGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489121 80 + 636262 TTGTGTTTTTTCCTGGAGTGAGGCCAAGGTATAAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTG--------CAGATT-----TTGTGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 496944 93 + 647215 TCGTATTTATTCCTGGACTGAAGCCAGGGTATTAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTGTTGCTGTGCAGATGATAAATTGTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 43208 217 + 181019 TGAGGCAAACTCTCCCCATGGGCACTGAGCCTCTATTGATTGTCATGCCTCCATCTTATCTACTTGCTTTTCAAACTTTGTAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGGGCATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCGCTCATTCAGGGTTTAGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTCTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489202 214 + 636262 TCGGGTGAACTCTCCCCATGGGCACTAAGCTTCTATTGATTATCATGCCTCTATCTTATCTACTTCCTTCTCAAACCTTGCAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGG-CATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCACTCATTCAGGGGTTCGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTC--TT -s simRat_chr6.simRat.chr6 497037 215 + 647215 TGAGACAAACTCTCCCCATGGGCACTGAGCCTCTACTGATTGTCATGCCTCCATCTTATCAACTTGCTTTTCAAACTTTGTAGGTTTGCC-ACATATAGCAGGGAGATATGTTTGAATGGGTATTGTAGAGATAGTCCCTCACCAGTGCCCGTTCATTCAAGGTCTAGCTTATGCACTTCAGACTGCATTAGATTTCTCC-TCTTGTCCCTTCTGTT - -a -s mr.mrrefChr3 43425 118 + 181019 CCAATCACCAACAATCCCATTGCGTTTATCAATCAATCTTGTATCCTGATGACCAGGTAGCACATAATAAATAAAAATGGAGTGACAACAATACACCAGTTGCTATATGTTGTCTCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489417 118 + 636262 CCAGTCACCAGCAGCCCCATTGCGTTTATCACCCAATCTTGTATCCTGATGACCAGGTGGCATCCAATAAATAAAAATTAAGTGACAACAGTATACCAGTTGCTATATGTTATCTCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 497252 118 + 647215 CCAATCACCAACAATCAAATTGCGTTTATCAATCAATCTTGTATTCTGATGACCAAGTAGCACATAATAGATAAAAATGGAGTGACAACAATACACCAGTTGATATATGTTGTCTCCC - -a -s mr.mrrefChr3 43543 368 + 181019 GAATCTAGGTACTTTGGGGAAGGACTCTTGGGAGTTCACAGTCCTGGGACACACTATTAGAATCTGATTCACCCAGATTATACAGGAACAGCCTGAATCATTAGTCAAGGTCTTTGGCAGTAAGGCTATGCAATCTAAAGCAAAAGCGGTAATTGAAAATTTTGTTAAAAAGTTGGAAGAAAATTACAATCCAGAATGTGGAATTGGTGCATTCCATGACTCAGATCTAGTCCAAAGGTTATGTCAGTGTAAAGGGTTTGGATGTGAATTCTGGTACCAACATAAAGGGGACTACATACCAAGTGTTACTGTACAAATTCATGGTCAGATCTAAATTTATACACTAAGTAATCGTGATTTTCAGCTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 489535 323 + 636262 GAATCTAGGTACTTCGGGGAAGGACTCTTGGGCGTTAACAGTCCTGGGACACACTATTAGATTCTGATTCACCCAGATAATACAGGAACAGCCTGAATCATTAGTCAAGGTCTTTGGCAGTAAGGCTATGCAATCAAAGGCAGAAGCGGTAATTGAAAATTTTGTTAAAAAGTTGGAAGAAAATTACAATCCAGAATGTGGAATTGGTTCATTCCATGACTCAGATCTAGTCCAAAGGTTATGTCAGTGTAACAGGTTTGGATGTGAATTCTGGTATGAACACAAAGGGGACCACGTACCAAGTCTTACCGTACAAATTCATG--------------------------------------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 497371 366 + 647215 GAATCTAGGTACTTTGTGGAAGGACTCTTGGGAGTCCGCAAGCCTGGAACGTGCTATTAGAATCTGATTCACCCAGATTATACAGGAACAGCCTGAATCATTAGTCAAGGTCTTTGGCAGTAAGGCTATGCAATCTAAAGCAAAAGCCATCATTGATAATTTTGTTAAAAAGTTGGAGGAAAATTACAATCCAGAATGTGGAATTGGTGCATTCCATGACTCATATCTAGTCCAAAGGTT-TGTCAGCATAAAGAGTTTGGGTGTGAATTCCGTTACCAAAATAAAGGG-ACTACAGACCAGGTGATACTGTAAAAATTCATGGTCAGATCTAAATTTATACACTAAGTAATCGTGATTTTCAGCTGC - 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-a -s mr.mrrefChr3 49123 109 + 181019 GGGTGCTGCCTCTTCTTTTCTGGGACAGGAGGAACTGACCTTACCTGGGTCAGTCTCTGTTGCACAGGTATTGTATTTGGGTACACTCATTCACCCCTTCAGTTGTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495217 109 + 636262 GGGTGCTGCCTCTTCTTTTCTGGGACAGGAGGAACCGACCTTACCTGGATCAGTCTCTGGTTCACAGGTACTGTATTTGGGTACACTCATTCACCCCTTCAGTTGGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 503069 109 + 647215 GGGTGCTGCCTCTTCTTTTCTGGGACAGGATGAACTGACCTTACCTGGGTCAGCCTCTGTTGCACAGGTATGGTATTTGGGTTCACTCATTCACTCCTTCAGTTATTCC - -a -s mr.mrrefChr3 49232 323 + 181019 TAGAGATAAAGTGACTCAATGCTCACTTCTGAGATACAGAGGTTTGATCATAACACAATGAACATCACCTAGGACAGAGTGACCTCATTCTAGGAAATAGCGTGTACTAAGCAACGAAGTACAGGGTTTGGTAAAAATTCTGAGCACTGCCAGGAACTGTTCTAATAAGAGCAAAATTATTTTAGTCCCATGCGTGGCCACTATTGTATGGTATAGATCTGATAGGTGTAGCCCGTGCTGGCACAGGGAAGACGTTGTGCTATGTAATGCCCGGTCTCATTCACCTGGTGCTCCAGCCCAGGTCACCTTATGTATTATTCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 495326 323 + 636262 TAGAGATAAAGTGACTCAATGCTCACTTCTGAGATACAGAGGTTTGATCATAACACAATCAACATCACCTAGGACAGAGTGACCTCATTCTAGGAGACAGTGTGTACTGAGCAACGAAGTACAGGTTTTGGCCAAAATTCTGAGCACTGCCAGGAGCTGTTCTAATAAGAGTGAAATTTTTTTAGTCCCATGCGTGGCCACTATTGTATGGTATAGATCTGATAGGTGTAGCCCGTGCTGGCACAGGGAAGACGTTGTGCTATGTAATGCCCGGTCTCATTCACCTGGTGCTCCAGCCGAGGTTGCCTTATGTATTATTCCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 503179 304 + 647215 CAGAGATGGAGCGACTCAATGCTCACTTCTGAGATACGGAGGTTTGATCACAACATAACGAACATTATCTAGGTC-------------------GAATAGCATGTTCTAAGCAAAGAAATACAGGGTTTGGTAAAAATACTGAGCACTACCAGGAACTGTTCTAATGCAAGCAAAGTTATTTTAGTCCCATGCGTGGCCACTATTGTATGGTATAGATCTGATAGGTGTAGCGCGAGCTGGCACAGGGAAGACATTGTGCTATGTAATGCCCGGTCTCATTCACCTGGTGCTCCAGCCCAGGTCACCTTATGTACGATTACTG - 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-a -s mr.mrrefChr3 75047 125 + 181019 CTGTCAGAATATTGTACTGATCACATTACATCAGGACACAATTTTTATTTTACTGTCAGCAGCAACTAGGGGATAATTGCGTTTAGTTTCCCTACTTAGAAATGAAGTGTCTTGAACAGGTGCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523220 125 + 636262 CTGTCAGAATACTGTACCGATCACATTACATCAGGACACAATTTTTATTTTACTGTCAGCAGCAACCAGGGGATAATTGCGTTTAGTCTCCCTACTTAGAAATGTAGTGTCTTAAACAGGTGCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 534185 124 + 647215 CTGTCAGAATATTGTACTGAGCACACTACATCAGGACACAATTTTTA-TTTACTGGCAGCAGTAACTGGGAGATAATCACATTTAGTTTCCCTGCTTAGAATTGAATTGTCTTGAACTGGCACAT - -a -s mr.mrrefChr3 75172 180 + 181019 GTACCCTCTAGCACCTATATGGTGAAATCCAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAACTAGTTTATTGTTTCTCCGTTGAGATTCACACTTAAGATCCACCTGACCTTAGGTGATCTCCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATGCCTACTAATTCAATGCATCCTTTGATGATACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523346 173 + 636262 GTACCCTCTAG-------ATGGTGAAATCAAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAACTAGTTTATTGTTTCTCCGTTGAGATTCACACTTAAGATCCACCTGACCTGAGGTGATCTCCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATGCCTACTAATCCAATGCATCCTTTGATGATACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 534309 175 + 647215 GTACCCTCTAGCACCTATATGATGAAATCCAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAGCTATTTTATTGCTTCTCTGTTGAGATTCACACTTAAGATCCG-----CCTTAGGTGATCTTCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATACCTACTAATTGAATGCATCCTTTGATGATACAT - -a -s mr.mrrefChr3 75352 121 + 181019 TGCGGAGGGTAAATGCCCATGCCACTCGTTACTAGACTACCCTAAGCTTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTACTTAACTATATTGCTTTGTGACAAAGTTTTGACATTAGACTATTATAGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523529 121 + 636262 TGCAGAGGGTAAATGCCCATGCCTTTTGTTACTAGACTACCCTGAGCCTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTATCTAACTATATTGCTTTGTGACAGAGTTTTGACATTAGACCATTATAGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 534484 119 + 647215 TGCGGAGGGTAAATGCCCATGCCACTCGTTACTAGACTACCCTATGCTTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTACTT-ACTATATCGCTTTGAGACAAAGTTTTAACA-TAGACTATTATATGGA - -a -s mr.mrrefChr3 75473 320 + 181019 TTTTGGTGCCATTTTTTGCTTCAGACTACCATGCTAACTGGACATGAGGACTGGCTGGAATCTAGGCCATTCCAGTAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGAGCTCTTATGTGCAGCAGACCACAAATTCATGAGAAATAGTCTTTCCAGAGCCATTTTGCTACTTATACATGAACCCGGTTCTCTAAATTGATTCCCAATGCAGATGAAATATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAGAGCAAATGTGTAACATTCATAGGTTTATAGTTTTCTGTTCCTACATCCTTAGTGCCAGACCATCCGACTTCCAGCCACTTGGACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 523704 315 + 636262 TTTTGGTGCTGTTTTTTGCTTCAGACTACTGTGCTAACTGGACATGAGGACTGGCTGGAATCTAGGCCATTCCAGTAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGTGCTCTAATGTGCAGCAGACCACAAATTCATGAGAAGTAGTCTTTCTAGAGCCATTTTGCCACTTATACATCAACCCAGTCCTCTAAATCGATTCCCAATGCAGATGAAATATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAAAGCAAATGTGTAGCATTCATAGGTTTATAGTTTTCTGTTCCCACATCCATAGTGCCAGACCATCCGACTTCCAGCC-----GACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 534603 306 + 647215 TTTTGGTGCCATTCTTTGCTTCAGACTACCATGCTAATTGGACATGAGGACTGGCTGCAGTCTAGGCCATTCCAGCAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGAACTTCTA-------------ACAAATTCATGTGAAATAGCCTTTCCAGATCCATTTTGCTACTCATTCATGAACCTGGTTCTCCAGATTGATTCCCAATGCAGAGGAAGTATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAGAGCAAATGTGTAACATTTGTAGGTTTATAA-TTTCTGTTCCTAAATACTTAGTGCCAGTCCATCCAACTACCAGCCACTTGGACCA - 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-a -s mr.mrrefChr3 76419 5 + 181019 CCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 535587 5 + 647215 CCAAG - -a -s mr.mrrefChr3 76424 94 + 181019 CAATCAATTCTGATATCAATAATATGCCAGTTTTGTCCCTTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAGTTAATCCAATATTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524631 92 + 636262 CAATCAATTCTGATATTAATAATAAGCCAGTTTTGTCCCTTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAATAACACC--TATTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 535593 94 + 647215 CAATCTATTCTGATATCTATAATATGCTAGTCTTGTCCATTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAGTTAATCCAATATTGA - -a -s mr.mrrefChr3 76518 233 + 181019 ATGAGGATCATATACTCATCAGCACAAAGAATAAAACTAAACTTAAATGGATACTATGCCTTATCAATAAAAGTTGTTAGGGACCATGTTAGAAAACCAGTGTTAGGCTGGAGTCCTTAAGAAGGCTGGTCACTCAACTGGAGCCTTGGGTGGCCTCCAATCTCAGTTCAAATTTGAGCTACTGGATGGATTAATAGTTTGCTGTAGACAGTGAAGGAGCCATAATACTAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 524723 217 + 636262 -------------ACACATCTGCACAAAGAATAAA---GAACTTAGATGGATACTATGCCTTATCAATAAAAGTTGTTGGGGACCATGTTAGAAAACCAGTGTTAGGCTGGAGTCCTCAAGAAGACTGGTCACTCAACTTGAGCCTTGTGTGGCCTCCAATCTCAGTTCAAATTTGAGCTACTGGATGGATTAATAGTTTGCTGTAGACAGTGAAGGAGCCATAATACTGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 535692 232 + 647215 ATGAGGATCATATACTCATTAGTACAAAGAATAAAACTAAACTTAAATGGATACTATGCCTTATCAATTAAAGTTGTCAGGGACCATGGTAGCAAACCAGTGTTAGGCTGGAGACCTTAAGAAGGCTGGTCACTCAACTGTAGCCTCGGGTGACCTCAAATTCCAGTTCAGGTTTGAGCTATTGGTTGTATTAATAGTTTACTGTAGACATTTAA-GAGCCATAATACTAGGA - 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-a -s mr.mrrefChr3 79516 20 + 181019 CAGCTGGGACTCCTAAAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527654 20 + 636262 CAGCTGGGACTCCTAAAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 538688 20 + 647215 TAGCTGGCCCTCCTTGAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 79536 24 + 181019 GGTTACTGGTCTGGTGGTCAtgaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527675 24 + 636262 GGTTACTGGTCTGGTGGTCATGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 538708 24 + 647215 GGCTACTGGTTTGGGGGTCAtgaa - -a -s mr.mrrefChr3 79560 19 + 181019 ttacaccgttgtcaatagg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527699 19 + 636262 TTACACCGTTGTCAATAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 538733 19 + 647215 ttaaacccttgtcaactgg - -a -s mr.mrrefChr3 79579 17 + 181019 gatccagcaaaggaaga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527718 17 + 636262 GATCCAGCAAAGGAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 538770 17 + 647215 gatccagcaaaggacga - -a -s mr.mrrefChr3 79596 300 + 181019 gtcacatggaatccccagAAAACTTCTGTTCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCTTATGCAGCTGTTGACATGTGCATATCTACCTGTGCATATCTACCAGGTATAACATAGATGGAAATGAAGTTCTTACAAGACACAAGTATACTCATCCCCCTTAAGCAAGGTTAAAAAAACATTATTCCACTTTATGCAATTAAAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGGAGTAAATCTTCTACAACTACAAATATATTAATGCCTACTTTGCATTTTGAATGGTCTGAGGTCACTATTTCAGTGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527735 198 + 636262 GTCACATGGAATCCCCAGAAAACTTCTGTTCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCTTATACAGCTGTTGGCATGTGCATATCTACCTGTGCATATC------------------------------------------------------------------------------------------------------AAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGGAGAAAATCTTCTACAACTACAAATATATTAATGCCTCCTTTGCGTTTTGAATGGTCTGAGGTCACTATTTCAGTGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 538788 279 + 647215 gtcacatggaatccctagGCACCTTCTGTGCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCCTATGCGGCTGCTGACATGTGCATATCTACCTGTGCATATCTACCAGGTATAACATAGATGGAAATGAAGTTCTTACAAGACACAAGTATACTCATCCCCCTTAAGCAAGGTTAAAAAAACATTATTCCACTTTATGCAATTAAAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGAAGTAGGTCTTCTAGAACTACAAATA----AATGTCTACTTTGCATTTTGAATAGTATGAG----------------- - -a -s mr.mrrefChr3 79896 228 + 181019 GAGCTAGGGATAACTAACTAAGCTCCCTTGTCTCTTGGCTTCAGCAGACGTTTATGTCATTTATCTATCATTACATCTGATATCTGCTACTACTTGAGTGAACTGCACTGAGCTAACCAACATGTGGTCCAGATCAAGGGAGAAGCCACATATGCAAAGCACAATTCTGTATTGGTTTGTCAGGCTAGAGATTGTATTCACCCTACTTGATTAACATCCTTAATCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 527935 210 + 636262 GAGCTAGGGATAACTAACTAAGCTCCCTTTTCACTTGGCTTCAGCAGACGTTTATGTCACTTATCTATCATTACATCTGATATC------------------CTGCACTGAGCTAACCAACAGGTGATCCAGATCAAGGGAGAAGCCACATATGCAAAGCACAATCTTGTATTGGCTTGTCAGGCTGGAGATTGTATTCACCCTACTTGATTAACATCCTTAATCTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 539067 197 + 647215 ------------------------CTCTTGTCTCTTG------GCAAACGTTAATGTCATTTATTGATCATTACATCTGATATCTGCTACTACTTGAGTGAATCGCACTTAGCTAACAAACATATGGTCCAGCTCAAGGAAGAAGCCGCATATGCAACACACAATTCTCTATC-GTTGGCCAAGCTAGAGATTGTACTTCTCCAACTTGATCAACATCCTTAATCCAT - -a -s mr.mrrefChr3 80124 21 + 181019 GCGTTTTGTGGATATTGACTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528175 21 + 636262 GCGCCTTGTGGATATTGACTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 539264 21 + 647215 GAGTTGTGTGGATATTGAGTA - -a -s mr.mrrefChr3 80145 626 + 181019 CCACAAAGGAGTGACTGTGAGAACTATGTTAAACTATTCATCCTTGTTCATGTGTTCTAACTGGTTGGTGTCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAGATATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGTAGCATTTATGATTTAGGTTACAATCATGAATATAAAATACAGTAGCTTTTGGTACCAGCTATCAGTAACCGTGAAAACAGATGCTGTACATTCACTAAGTCCGGGCTGGAAGCACATGAATGATAAAGAACTTTCTGAATTACTCCCAAATATAAAATTTCATCAGCAGACTATGGCAAAGTGGCTTCAATTCTTTTTAAGGCATAGGCCTCTACCATGGCTGATGAGTTGTGTTCTGATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGATTTTGACAGTAAACTAGAGCATCACATGGGCTAATGACGAATCACAGCATAGGAATACTGCAACCTTCAGGGTTAATATTAGTCTAGTCAATCGGTACCAATTATGGTATCTCTGACTGTCATTTGCCAGACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTATCTGCATACACTACCACAAGAGGAATACTTGTTTGCACTCCTTTAACAGCTAATGCACAATGTATGACTTGACGACAAGTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 528196 622 + 636262 CCACAAAGGAGTGACTGTGAGAACTATATTAAACTATTCACCCTTGTTCATGTGTTCTAACTGGTCGGTGCCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAGAGATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGTAGCATTTATGATTTAGGTTACAATCATGAATATAAAATACAGTAGCTTCTGGTACCAGCTATTAGTAACCGTGAAAACAGATGCTGTACATTCACTAAGTCCGGGCTGGAAGCACATGAATGATAAAGAACTTTCTGAATTACTCCC--ATATAAAATTTCATCAGTAGACTATGGCACTGTGGCTT-AATTCTTTTTAAGGTATAGGCCTCCACCATGGCTGATGAGCTGTGTTCTTATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGATGTTGACAGTAAACCAATGCATCACATGGGCTAATGACGAATCATAGCATAGGAATACTGCATCCTTCAGGGTTAATATTAGTCTAGTCAATCGGTACCAATTATGGTATCTCTGACTGTCATTTGCCAGACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTTTCTGCATACACTACTACAAGAGGAATACTTGTCTGCACTCCCTT-ACGGCTAATGCACAATGTACAACTTGACCACAAGTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 539286 624 + 647215 CCACAAAGGAGTGACTGTAAGAACTATGACAAACTACTCATACTTGTTCATGTGTTCTAA-TGGTTGATGTCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAACTATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGGGGCACTTATGATTTAGGTCACAATCATGAATTTAAAATTCAGTAGCTTTTAGTACCAGCTATCAGTAACTATGAAAATAGATGACATCCATTCACTATGTCCTGGCTGGAATCACCTGGATGATAAAGAACTTTCCTAATTACTCCCAAATATAAGTTTTCGTCAGCAGACTATGGCAAAGTGGCTTCAATTCTCTTTAAGGCATAGGCCTCTACCATGGCTGATGAGTTGTGTTCTGATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGGTTTTGACAGTAAACTGGAGCATCACATTGACTAACAAAGAATCACGTCATGTGAATACTGCAACGTTCAGGGTTAATATTAGCCTAGTCAATCAGTACCAATTATGGTATCTCCGACTGTCACTTGCCACACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTATCAGCATACACTAACACAAGAGGAATACTTGTTTGCACCCCTTTAACAGCTAGTGCACGATGCATGACTT-ACGAGGAATCTG - 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647215 TCTATTGTTGGAATGAGGGATAGCTGACCTGTTCTGAGTTGCATAATAGGCATAT - -a -s mr.mrrefChr3 98926 64 + 181019 TAATTATCTACCCAATAGCATTTGTGTTACAGGGCATATAAAGTTCAAGTGTCTCCTAGTCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548824 64 + 636262 TAATTATCTACCCAATAGCATTTGTGTTACAGGGCATATAAAGTTCAAGTGTCTCCTAGTCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 23752 64 - 647215 TACTTATCTACCCAATAGCATTTGCGTTACAGGGCATATAAATCTCAAGTAACTTCTAGTCCTT - -a -s mr.mrrefChr3 98990 51 + 181019 GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548888 51 + 636262 GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 23817 51 - 647215 GATCCAGCATGAAGTGGATGCGCTAAAAGAGAGACATCAAGCATTTTGGGA - -a -s mr.mrrefChr3 99041 243 + 181019 CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCAAAGAGCTATTGATGTGCTACTAGGTATGAGAGGCTGGTCTAATGATAACCAGAATGTCCCTGCCAGCGGGTGTACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTGGCTGCTGTTGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATTTGGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 548939 234 + 636262 CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCGAAGAGCTAT-GATGTGCTACTAGGTATGAGAGACTGGTCTAATGATAGCCAGAATGTCCTTGCCAGCGGGTGAACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTG--------TGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATCTAGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 23871 235 - 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647215 GTCGCAGAACCGCTGGGACGACTTAAATGTGAGCAACGTCGTTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAACG - -a -s mr.mrrefChr3 99456 92 + 181019 CTGCTGGGAAAGGGGATCTGTAAAGGATGCTCAGTAAAGGTTATGCCCACATTAGCTTATGTCACTGCAGGAAGAGATATGGACTACACCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549345 92 + 636262 CTGCTGGGAAAGGGGAACTGTAAAGGATGCTCAGTAAAGGTTATGCCGACATTAGCTTACGTCGCTGCAGGAAGAGATATGGACTACACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 24322 92 - 647215 CTGCTGGGAAAGGGGATCTGCAAAGGCTGCTCAGTAAAGGTTATGCCCACGTTAGGTTATGTCACTGCAGGAAGAAATATGGACAACACCCC - -a -s mr.mrrefChr3 99548 90 + 181019 TTTCTTGGTCCTGTGTCATCCTACAAATTTTCCTAGGTCATTTGAAACCATGCACTCATGCAATAAATTAGCTGCTTGACATCACAAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549438 90 + 636262 TTTCTTGGTCCTGTGTCATCCTACAAATTTTCCTGGGTCATTTGAAACCATGCACTCATGCTATAAATTAGCTGCTTGACATCAGAAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 24414 90 - 647215 TTTCTTGGTCATGTCTCATCCTACAAGTTTTCCTAGGTCATTTGAAACCATGCATTCGTGCAATAAATTAGCTGCTTGACATCACAAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 99638 93 + 181019 TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTCTACGTCTAATACCACCAGTGTGTGTGAGCACACAGTTGATAGCTTAGACAGTCAAGTTAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549528 93 + 636262 TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTCTACGTCTAATACCACCAGTGTGTGTGAGCACACAGTTGATAGCTTAGACAGTCAACTTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 24506 93 - 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647215 CTAGAATTAGAGACACAGTGACTGACGCAGGATATGTATTGGTATTCTCCTAAATCTT - -a -s mr.mrrefChr3 100020 23 + 181019 CTGTATGAGCCACCTGCGTGTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549938 23 + 636262 CTGTATGAGCCACCTGCGTGTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 24906 23 - 647215 CTGTATGAGCTACCTGCTTGTGG - -a -s mr.mrrefChr3 100043 60 + 181019 GAGATTATTGAACTGTACTTCACAATCTGGTAAACCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAAATCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 549965 60 + 636262 GAGATTATTGAACTGTACTTCACAATCTGATAAACCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAAATCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 24929 50 - 647215 ---------GAACTGTACTTCACAATCTGGTAATCCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAA-TCT - -a -s mr.mrrefChr3 100103 82 + 181019 GGTATAAAAGGAGAATAGTATAATTGAAGGACAATAGTATGAAACCAAAACCTCTGCATCTTGGTACAAATTGAGGAATTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550025 82 + 636262 GGTATAAAAGGAGAATTGTATATTTGAAGCACCATAGTATGAAATGAAAACCTCTACACCTTGGTACAAATTGAGGAATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 25021 82 - 647215 GATATAAAAGGAGAATATTATAACTGAAGGACAATAGTATGAAACCAAAACCTCTGCATCTTGGTACAAATTGAGGAATTGT - -a -s mr.mrrefChr3 100185 21 + 181019 TGAATCTAGCCTTGGCCATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550109 21 + 636262 TGAATCTAGCCTTGGCCATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 25103 21 - 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647215 GAGTAACTGACTCAAATGACCTATCTACTGACCCATAGACCAATC - -a -s mr.mrrefChr3 100377 6 + 181019 CAGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550346 6 + 636262 CAGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 25317 6 - 647215 TAGTAT - -a -s mr.mrrefChr3 100383 86 + 181019 TTATTTATGATTTCAGTACTAACTGCTGGCAAATAAAACAGAGGTACACCAATGGGGATGGAATTGATCCAATTGATTGCCGTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550360 86 + 636262 TTATTTATGATTTCAGTACTAACTGCTGGCAAATAAAACAGAGGTACACCAATGGGGATGGAATTGATCCAATTGATTGCCGTTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 25323 86 - 647215 TTATTTTTGATTACAGCACTAACGGCTGTCAAATAAAACAGAGATTCGTCAACGGGGGTGGAATTGATTCGATTGATTGCTGTTAG - -a -s mr.mrrefChr3 100469 51 + 181019 CATACATATATGGAACCTATACCATAAGAGATGAGCATTAAACCTCAGCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550446 51 + 636262 CATACATATATGGAACCTATACCATAAGAGATGAGCATTAAACCTCAGCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 25410 51 - 647215 CATGCATATATGGAACCTACACCATAAGAAATGAGCATTAAACCCCAGCAA - -a -s mr.mrrefChr3 100520 282 + 181019 CATACCAGCCTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACAGTAACTTGTAGTTATCATACCCAAGTGAAAGGGCCATTGGCACCCAAGGTCCACAAAAGTAACAGTTTGTAACCACGCTAGAAGGCAGCTTATAGCCATCTACACATTTCTTCTTAAATCCCAGTGGCACTCTTCTTCTCCTTTTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCTCACAACTATAAACATTTCAGATTGAAAAGAGTAAGGGAGAGTGTACTGCAGACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 550498 282 + 636262 CATACCAGCCTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACAGTAACTTGTAGTTATCATACCCAAGTGAAAGGGCCATTGGCACCCAAGGTCCACAAAAGTAACAGTTTGTAACCACGCTAGAAGGCAGCTTATAGCCATCTACACATTTCTTCTTAAATCCCAGTGGCACTCTTCTTCTCCTTTTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCTCACAACTATAAACATTTCAGATTGAAAAGAGTAAGGGAGAGTGTACTGCAGACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 25461 282 - 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-a -s mr.mrrefChr3 101302 91 + 181019 TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551297 91 + 636262 TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26255 91 - 647215 TACCCTACCAAAAATCAAGGAAGTTATTTTTCAAGCATAACATAGCAAACCTTGCAGGTTACAATGCCTTATCGATTCTTTGAACTTACAT - -a -s mr.mrrefChr3 101393 13 + 181019 ATGTGAGAGATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551397 13 + 636262 ATGTGAGAGATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26346 13 - 647215 ATGTAAGAAATTA - -a -s mr.mrrefChr3 101406 7 + 181019 TGCTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551412 7 + 636262 TGCTAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26359 7 - 647215 TGCTAAT - -a -s mr.mrrefChr3 101413 15 + 181019 CATCAGTGATATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551421 15 + 636262 CATCAGTGATATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26366 15 - 647215 CATCAGTGATATTGA - -a -s mr.mrrefChr3 101428 95 + 181019 TACAAGCAATTATTTAATGCTATGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCTCCTCTGTCCTTTGAAGAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551437 92 + 636262 TGCAAGCAATTACTTGATGCTATGATAAAAGTGCAGGTGAACTTAAGTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCCCCTCTGTCCTTT---GAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26381 94 - 647215 TACAAGCAAT-ATTTAATGCTAGGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCATCCAGTTGTGGTCAGTGGTCTCCTCTGTCCGTTGAAGAGGT - -a -s mr.mrrefChr3 101523 1 + 181019 A -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551574 1 + 636262 A -s simRat_chr6.simRat.chr6 26475 1 - 647215 G - -a -s mr.mrrefChr3 101524 15 + 181019 ACCTGTTACCCTCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551575 11 + 636262 GTCTGT----CTCGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 26478 15 - 647215 ACTTATTACCCTTGT - -a -s mr.mrrefChr3 101539 353 + 181019 ATAAGCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTACCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGTCGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTGATTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTTGGGCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTGCCAAGCCAGCCTAGACTAATCTAGGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAAATGCCACCTCACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551586 352 + 636262 ATGACCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTGCCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGCTGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTCCTTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTCAGCCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTACCAACCCAGCCTAGACTAATCTAGACTTAAGACACACAATAACCA-TGTTAAAATGCCGTCTAACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAGAGAAGCACCACTGACAATACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26498 352 - 647215 AGAGGTGGCTTGCTTCTCGCTTGAGTTACCATTAGCCTACCCCCTCAACTCACTGAAGGATTAATATCGGCAGATGCATGTCGTGATGGGCCAGCACAGTCTTTATAAAGATTTGATTCAATTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCGAAGCTTGGGCCGAGAAGAATTTGGAAAAATCTTACATCCTAGCTGAGTGCCCACTACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGTA-GCCTGCCAAGCCAGCCTAAACTAACCTGAGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAGGTGCCACCTCACTGTTCTAGATGGACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT - -a -s mr.mrrefChr3 101892 51 + 181019 TCCCCTACTTGCATTTATGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551938 51 + 636262 TCCCCTACTTGCATTTATAAGTACTAGCACCATAGTTTTTTCAGCTTTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 26863 51 - 647215 TCCACTACTGACATTTGTGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA - -a -s mr.mrrefChr3 101943 169 + 181019 TCAAATCACCGTAAGGGATCCTATCTGGTTAGCACTGGCATCTATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGTTGAGATTGCGACATGCAGCACTTAGGATTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 551992 155 + 636262 TCAAATCACTGTAAGGGTTCCTATCTGGTTAGCACTGGCACCAATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCTATCAGACCCA--------------GCAGTTCTGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGCTGAGATTGCAACATGTAGCACTTAGGATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 26914 169 - 647215 TCAAACCACCGAAAGGGATCCTATCTTGTTAGCACTGGCATCTATTATCAAAGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTGGATAAAGTTGAGAAGATACAACTGTTGAGATTGTGACATGCAACACTTAGGATTAT - -a -s mr.mrrefChr3 102112 113 + 181019 AATCAGAGTATATTCTGCAGCACCCCGATTGGGGACAAATACAGAACAATAGTGTCCTGAGCCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAGACCAAGAAATAACTGAATGGGATATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552151 112 + 636262 AATCAGAGTATATTCT-CAGCACCCCGCTTGGGGACAAATATAGAACAATAGTGTCCTGAATCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAGACCAAGAAATAACTGAATGGGATATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 27083 112 - 647215 ACACAGAGGATATTGTGCAGCTCCCCCATTGGAGACACATACAGCACAACAGCGTCCTGAGCCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAAACCAATAAATA-CTGAATGCGATGTGTT - -a -s mr.mrrefChr3 102225 205 + 181019 GTAAGTAGCCCTATCATATGGCTTTTTCAGGATTTAGCAGTCTTCACAGAGGCTGTTCATTTGCTGAGGACATTATGAGATACTCTAGAATGAATCCATTATGATGGCCAATGAGGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGACATGGATCATAGGCCATTCGGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGAGTGCTTAGAATTCAAAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552263 202 + 636262 GTAAGTAGCCCTATCATACGGTGTTTTCAGGATTTAGTAGTCTTCACAGAGGCTGT--ATTTGCTGAGGACATTATGAGATACTCTAGAATGAATCCATTATGATAGCCAATGAGGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGAGAGGGATCATAGGCCATTCAGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGAGTGCTTA-AATCCAAAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 27196 205 - 647215 GTAAGTAGGCCTATCATATTGCTTTTTCAGAATTTAGCAGTCTTCACAGAGGCTGTTCATTTGTTGAGGACATCAGGAGATACTCTAGAATGAGTCCATTATGATGGCCAATGAAGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGACATGGATCATAGGCCATTCGGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGTGTGCTTAGAATTCAAAGACA - -a -s mr.mrrefChr3 102430 54 + 181019 AGATGAATCTATGCTTAAATGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552465 54 + 636262 AGATGAGTCTATGCTTAACTGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 27499 54 - 647215 AGGTTAATTTATGCTTAAATGCCATTCTGATTTTAATAGACACTTTGTCTGGTT - -a -s mr.mrrefChr3 102484 11 + 181019 AATCTCAAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552519 11 + 636262 AATCTCAAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 27557 11 - 647215 AATCCCAAGAG - -a -s mr.mrrefChr3 102495 38 + 181019 CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552531 38 + 636262 CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 27568 38 - 647215 CGCATGCACCAAAGTCATTAGTAGGACTAGGTCAAAGC - -a -s mr.mrrefChr3 102533 494 + 181019 AAGCGTTCTATATATGATGATGCTGAGCTACAGAGCCTCAATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATGGAAGTAAAAACAGCCTTTCCCACTTATACATGTGCTGGTAGGAATTTCAACTTCAACTGCTGTACTTTTTTTTTAAGGCATGCACATCTTTTGTCTGGGGACAGAGAGGCACTACCCTAACATATGAACTCGCTCACTTGTAAGCTAGGGTGACAAAACAATCTGCCCTCTTAAATGTGATTTTATAATTACGTTACTCTCTGCCTAGAAGTGACATTACAGGCTGCTTGAATAAGAAACTCCCTGTCTGGGTCTGTGCCTAGTCAATTGTGATCCTCCATAGAAATCCAGTTGTGGATATGCTTGGGCACCAAACTCTCATTGTTGTACTGAGAGAACTGACATCAGTTGAAGATAGATTTATTATAGAGGGCTCTAAGTACTCCCTCATATAGTTATTTGTTTATGGGGGCTATGGGCAATAGGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 552569 492 + 636262 AAGCGTTCTATATATGA-GATGCTGAGCTACAGAGCCTCAATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATAGAAGTAAAAACAGCCTTTCCCACTTATACATGTTCTGGTAGGGATTTCAACTTCAACTGCTGTACTTTTTCTTTAAGGCATGCACATCTTTTG-CTGGGGTCAGAGAGGCACTACGCTAACATATGAACTCGTCCACTTGTAAGCTAGGGTGACAAAACAATCTGCCCTCTTAAATGTGATTTTATGATTATGTTACTCCCTGCCTAGAAGTGACGTTACAGGCTGCATGAATAAGAAACTCCCTGTCTGGGTCTGTGCCTAGTCAATTGTGATCCTCCATAGAAATCCGGTTGTGAATATGCTTGGGCACCAAACTCTCCCTCTTGTACTGAGAGAGCTGACATTAGTTGATGATAGATTTATTATAGAGGGCTCTGAGTACTCCCTCATATAGTTATTTGTTTATGGGGGCTATGGGCAATAGGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 27615 488 - 647215 AAGCATTCTATCTATGATGATGCTAAGCTACAGACCCTCTATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATGGTAGTAAAAACAGCCTTTCCCGCTTATACATGTGCTGGTAGGAATTTCAACTTTAACTGCTGTACTTTTCTTTTGAGGCATCCACATCTTTTGTCTGACGACAGAGAGGCACCACCCTAACATATGTACTCACTCACTTGTAAGCTAGCGCGACAAAACAATCTGGACTCTTAAATCTGTTC----AATTACTTTACTCTCTGCCCAGAAGTGACAT--CAGGCTGCTTGAATAAGAAAATCCCTGTGTGGGTCTGTGCCTAGTCCATTGTGATCCTCCATAGAAATCCAGTTGTGGATATTCTTGGGCACCAAACTCTCATTGTTGTACTGAGAGAACTGACATCAGTTAAAGACAGATTTAATATAGAGGGCTCTAGGTACTCCCTAATGTAGTTATTTATTTATAGGGGCTATGGGCAATGGGCCC - -a -s mr.mrrefChr3 103027 319 + 181019 TGGACAAACTCTTGGAATAAGATAAGCAGCCAGACTCTATAATAGCACCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCAAAATTCAAGTTCTGTCATTGTTGAGTTTGTAAGTTTCTCCCCATCACTCTTACTATAATGTTGACCCCATATGGGGACGCATATCTTAAATGCCTACTGTTAGGTTAAAATAAACATCATGAGAGCACCTTATCTAATGCTGGTTTCACATGACCCTTGTCGGCCTTGAGTCATCTCTTTATCCAAGCTAATACCCATGTGATGTGCCTAATGGGAATGCTTTGGTGCAGCTATGCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553062 314 + 636262 TGGACAAACTCTTGGAATAAGATAAGC-GCCAGACTCTTTAATAGCACCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCCAAATTCAAGTT---TCATTGTTGAGTTTGCAAGTTTCTCCCCATCACTCTTATTATAATGTTGACCCCATATGGGGACGCATATCTTAAATGCCTACTGTTAGGTTAAAATAAACATCATGACAGCACCTTATCTAATGCCGGTCTCACATGACCCTTGTCGGCCTTGAGTCATCTCTT-ATCCAGGCTAATCCCCATATGATGTTCCTAATGGGAATGCTTTGGTGCAGCTATGCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 28103 312 - 647215 TGGACAAACTCTTGGAGTAAGATAAGCAGCCAGACCCTATAATAGTAGCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCAAACTTCAAGTTCTGTCATTGTTGAGTTTGT-------TCCCCATCATTCTTACTATTATGTTGACTCCATATGGGGATGCGTATCTTAAATGCCTACTGTTATGTTAAAATAAACACCATGGGAGCACCTTATCTAATGCTGGTTTCACATGACCCTTGTAGGCCTTGAGTCCTCTCTTTATCCAAGCTAACACCCATGTGATGTGCCTAATGGGATTGCTGTGGTGCAACTGTGCTT - -a -s mr.mrrefChr3 103346 57 + 181019 CTGTGTATGAATACAGGATTAATAACTTAATGACATGTCTGATTTAGCCCCTCAGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553376 57 + 636262 CTGTGTATGAATATAAGATTAATAACTTAACGACATGTCTGATTTCGCCCCTCAGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 28416 57 - 647215 CAGTGCATAAATACAGGATTAGTGATTCAATGACATGTCTGATTTAGCCCCTCAGCA - -a -s mr.mrrefChr3 103403 32 + 181019 GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553433 32 + 636262 GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 28481 30 - 647215 GAGACCAATAATCTCATAAACGGAAGGTAA-- - -a -s mr.mrrefChr3 103435 167 + 181019 GGCAGTCCCTCCTGTATATTGTATCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGCATAGTGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553467 167 + 636262 GGCAGTCCCCCCTGTCTATTGTGTCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGTTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGGATAGAGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 28511 167 - 647215 GGCAGTCCTTTCCGTATATTGTATCAGAAGGATCAGGGAAAGATTTACAAGCCAATATAAGTATCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATATAATGTGACCACTGGAGGACCAGCTCAGTGGATGGGTGGCTGGACATCTGAGCAAATTCAACTTGGGCTAACTTATTCC - -a -s mr.mrrefChr3 103602 217 + 181019 TCCAGTTCAATTAGTGGCGGGGATAAGGGGTCCATGCCACTACAGTTTTGGGCAAAGCCATCTTACTCAGCCAGTTATATAAATAAGGGAAGGGAACTTAGTAATCAACCATAATAGGACTGCATATAGTTAATTATGAGCCTTTGATATGCATGGATGTATAATACCCTGATTTCATAGTGTAGTGATTTTATACCCCGGCTTTACATTATACCGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553634 216 + 636262 TCCAGTTCAATTC-TGGCGGGGATAAGGAGTCCATGCCGCTGCAATTTTGGGCAAAGCCATCTTGCTCAACCAGTTATACAAATAAGGGAAGGGAACTTAGTAATCAATCATAATAGGACTGCATACAGTTAATTAGGAGCCTTTGATATGCATGGATGTACAATACCCTGATTTCATAGTGTAGTGATTTTATAACCCGGCTTTATATTATACCGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 28787 215 - 647215 TCCAGTTCAATTAGGGGTGGGGGTAAGGGGTCCATGCCACTAGAGCTTTGGGCAAAGCCATCTTACTCAGCCAGTTATATAGATAAGAGAAGAGAACTTAGTAATCAACCATAATAGGACTACATATGG--AATTATGAGCCTTTGATATGCATGGATGTATTCTACCCTGATTTTATAGTGTAGTGATTTTATACCCTGGCTTTACACTATACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 28678 109 - 647215 TCCAGTTCAATTAGTGGCAGGGCTAAGTGGTCCATGCCACTACAGTTTAGGGCAAAGCCATCATACTCAGCCAGTTATATAAATAAGGGAAGGGAACCTAGTACTCAAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------ - -a -s mr.mrrefChr3 103819 187 + 181019 CGTGCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAATATTTATTATCCAATTATTTGATTTTTGATTGGGTATGACACCCTGTCCCCCCCTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAGGTTTGGTGGCAATGTTACACTATTACCACTATATTTACAATGAGTAACAGATTCCTTTGCACCCTTGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 553850 186 + 636262 CGTGCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAA-ATTTACTATCCAATTATTTACTTTTTGATTGAGTGTGACACCCTGTCCCCCCCTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAGGTTTGGTGGTAATGTTACACTACTACCACTATATTTACAATGAGTAACAGATTTCTTTGCACCCTTGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 29005 175 - 647215 TACTCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAATGTTTATTATCCAATTATTTGATTTTTGATTGGGTATGTAACCCTGTCCCCCTTTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAAGTTTG-TGGCTATGTTACACTTTTACCATTATATTTACAGTGGGTAACAGTTTCCTTA----------- - -a -s mr.mrrefChr3 104006 105 + 181019 CAGAGTATCAGTGCTATAAACACTGGGCTTACAGACATCTGTAGAATAGGATTCTGGAAAAAAGTGAAGGAACACAATGCCAGAGTTAAAACAGCCATATCATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 554037 101 + 636262 CAGAGTATCAGCGCTATAGACACTGGGCTTACAGACACCTGTAGAATAGGATTCTGGAAAAAAGCGAAGGAACACAATGCCAGTGTTAA----GCCATATCATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 29180 104 - 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647215 TATCCTATCATTACCCCAGTGAACATCATGGTACCCTGAAGTATCTCAGATATGAATATCATGTGAAACACAGCATCCC - -a -s mr.mrrefChr3 107989 45 + 181019 ACTCGTTTTATAGGGTAAAATGTGTTGGGCCCTTCTCCAGATGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558090 45 + 636262 ACTCGTTTTATAGGGTAAAATGTGTTGGGCCCTTCTCCAGATGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33249 45 - 647215 ACTTGTTTTATGGCGTGAAATGTGTTGGGTCCTCCTACGGGTGCC - -a -s mr.mrrefChr3 108034 17 + 181019 AATGATTGGTTGATAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558136 17 + 636262 AATGATTGGTTGATAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33294 17 - 647215 AGTGGTTGCTTGACAAC - -a -s mr.mrrefChr3 108051 68 + 181019 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTAGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439433 68 + 636262 ACATGAGGTGGATAGGTTCCTTCTTGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558153 68 + 636262 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTAGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33311 68 - 647215 ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTACAGATGCTGGTGATTATTTGGCAGCACATGAGGCAGGTGGGCT - -a -s mr.mrrefChr3 108119 58 + 181019 CAGCAGCCAAGTAATGACTGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTAATGGGAGCTTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439501 58 + 636262 CAGCAGCCAAGTAATGACCGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTGATGGGAGCTTGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558222 58 + 636262 CAGCAGCCAAGTAATGACTACATGCACATGGCCGTGTTTGCCCTTAATGGGAGCTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 33379 58 - 647215 CACCAGCCAAGTAATGACAGCACGCACATGGCCATGTTTTCCTTTAATGGGAGCTTTG - -a -s mr.mrrefChr3 108177 58 + 181019 CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 439559 58 + 636262 CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558280 58 + 636262 CACATGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33438 58 - 647215 CACAAGGAGCACTTGAAATCTTGACAACATTAAGGAGGTCCAAAAAGAGTTTAAGAAT - -a -s mr.mrrefChr3 108235 33 + 181019 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558338 33 + 636262 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33496 33 - 647215 GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT - -a -s mr.mrrefChr3 108268 21 + 181019 ATAGGCCAAATGTTTGATCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558388 21 + 636262 ATAGGCCAAATGTTTGATCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33529 21 - 647215 ATAAGCCAAATGTTGGATATC - -a -s mr.mrrefChr3 108289 29 + 181019 ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558409 29 + 636262 ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 33553 29 - 647215 ATTTATCAGGCTACAGCGATACAGAGACA - -a -s mr.mrrefChr3 108318 35 + 181019 TGAGTTACAACCCTGGGGCAACACAATATGTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558450 35 + 636262 TGAGTTACAACCCTGGGGCAACACAATATGTGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 33582 35 - 647215 TGAGTTGCAACCTTGGGGCAGCACAATATCTGAAC - -a -s mr.mrrefChr3 108353 84 + 181019 TCTCTTCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGGGAGTGCAATGCAGGACCTTCCCTGGTACATGTTGGTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558492 84 + 636262 TCTCTTCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGGGAGTGCAATGCAGGACCTTCCCTGGTACATGTTAATTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33617 84 - 647215 TGTCTCCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGTGAGTGCAGTGCAGGACCTTCCCTGGTAAATGTAGGTTAT - -a -s mr.mrrefChr3 108437 422 + 181019 ATATAAGATTATTCACATAGTGCACATCAAGGTAAGCAACATTTAATAATGCCTGGTAGCTTCTCCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAATAGATAGTTGAACTGTTCCAATTATAAACTTGTATTCACAATTGCTATCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATTTAATAGCAAGGGAATTTGTTCTTCCAAACAACTGTTCTATGTTGACCTACTCAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTCCCCTTACTGGTGTTATGAATGCTAGTATAGTCTTCAGCTCAAATGCTAGTATAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCGTAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558576 370 + 636262 ATATAAGACTATTCACATAGTGCACATCAAGGCAAGCAACATTTAATAGTGCCTGGTAGCTTC-CCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAAGAGACATTAGAACTGTTCCAATTATAAACTTG--TTCACAATTGCTTTCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATCTAATAGCAAGGGAATATGTTGTTCCAAACAACTGTTCTA--CTGGCCTACTTAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTGCCTT-----------------------------------------------TAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCACAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 33703 413 - 647215 ATATAAGGTTATACTCATAGTGCACATCAATGTAAGCAACATTTAATAATGCCTGGAAGCTTCTCCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTCGTAAAATTGGGAAATAGATAGTTGAACTTTTCCAATTATAAATTTGTATTCACAATTGCTATCTCATTTCTTTCACTTAAGCAGCTACTTTTCCTCTGTTTGATTAAATAGCAAGGGAATTTGTTCTTCCAAACAACTGTTCTATGTTGACCTACTCAACTGTGTAGCACAGTAATTGTTGGCTTG---------GGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTCGCCTTACTGGTGTTATGAATGCTAGTATAGTCTTCAGCTCAAATGCTAGTATAGTCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTCGGACAGGTTTTAATATTTATGATCCCGTAGT - -a -s mr.mrrefChr3 108859 57 + 181019 ATCCTGTCGTCGTGGACAATAGATTATAGGCCCAGACCAAAGCAACTGTCTACTGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 558953 57 + 636262 ATCCTGTCGTCGTGGACAATAGATTATAGGCCCAAACCAAAGCAACTATCTACTGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 34116 57 - 647215 CGCCCGTAGTCGCGGACAATAGATTATAGGCCCAGACCAAAGCAACCGCCTATTGAA - -a -s mr.mrrefChr3 108916 434 + 181019 ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCATATCTCCCAAGGCAGTGGACAGGGGCCACTAAACTCTCTTAGCTTCAGAGCCTCAAATGAGTAGGTCTTGTTGTGGTTGCAGGAGTCATACACTGTGGCCCTAATGACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCAGTGGCACTAATCTAGAGCTAAATTAGGCTTAAAAACCGCTCACTGGCTAGTGAATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACAGGAGACTATTACCTAGCACTCGTGCAATTAAGTGTGACCAAATCTCCTGAATTATAGAAATTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAAACGGTCGGACCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559010 418 + 636262 ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCACGTCTTCCAAGGCAGTGGATGGGGGCCAATAAACTCTCTTAGCTTCAGAGGTTCAAATGAGTAGGTCCTGTTGTGGTTGCAGGACTCATACACTGTGGCCCTAATAACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCCGTGGCACTGATCTAGGGCTAAATAAGGCTTAAAAACC---------------CATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACTGGAGACTATTACCTAGCACTC-TGCAATTAAGTGTGCCCAAATCTCCTGAATCATATAAACTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAATCGGTCGGACCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 34176 433 - 647215 ATGTACCCATCAGATACTCTAATCAATGACAGTTCAACCCATAAATCCCAAGGCAGTGGACAGGGGCCACTAAAATCTCTCAGCAC-AGAGCCTCAAATGAGTAGGTCTTGTTGTGGTTGCAGGCGCCATACACCACGGCTCTAATGAACATGCACCTTGGGGAGTGACTACTATGAATCTTTGACTCAGTGGTACTAATCTAGAGCTAAATTTGGCTTAAAAACCGCTCACTGGCTAGTGAATATCTGCTTTTCTCTCTTTGCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACAGGAGACTATTGCCTAGCACTCGTGCAATTAAGTGGGACCAAGTCTCCTGAATTATAGAAATTCACCTCCTTTCAGTAAACTGTACAGAATAAAAATAAAGGTAGGTTTACACAGAAGGAATCAGGGAATGAAACGGCCGGACCTA - -a -s mr.mrrefChr3 109350 171 + 181019 GCGATGTTCCGGCCCTTCGCAAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCGACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCGCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559429 171 + 636262 GCGATGTTCCGGCTCTTCGTAAACAGCTTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCACGACAAACATGTATCAGGCGGTCTTCGACCACTTCTGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 34609 171 - 647215 GCGATGGTCCGGCCCTTCGCCAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGTCTCTAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCTACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTAATCCCTCTAACCAGATGGCAGTCTTAATTCAATTACTACGCGTGTCTTGCGCG - -a -s mr.mrrefChr3 109521 365 + 181019 GAACACGTTGCGTTTATTCCTGAATCATCGATTCCCCTACTCAAAACATAGCTTCACACCGCTGTAAAGGGCGCAAACTTTGACGACAGTTCGGTAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTGCGGGAGTGCTCCGATACCATTAGCTGTGGACCGACTTTATGGGTCGACAATATTGTTTAACGACTTGGCTTCCCTGCATCTTATTCTGCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTACCAAAGGTGGATGCCAGGGGGACAACTAGGGCTTAATAAATGGAAGCCTGCCCATGATACTCTGTTTCTGTTGTCTGCAGTCATTGAGCAACATATCGCTCAGAGAGACATCTATCCATAGATCTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559600 355 + 636262 GAACACGTT--GTT---TCCTGATTCATCGATTTCCCTACTCAAAACATAGCTTCACACCGCTGTAAAGGGCGCAAACCTTGACGACAGTTCGGTAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTACGGGAGTGCTCCGATACCATTAAGTGTGGGCCGTCTTTATGGGTCGACAATATCGTCTAACGACTTGGCTTCCCTGCATCTTATTCTTCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTACAAAAGGTGTATGCCAGGGGGACTACTAGGGCTTAATAAATGGAAGCCTGCCCATGATAC-----TTCTGTTGTCGGCTGTCATTGAGCAACATATTGCTCAGAGAGACATCTATCCATAGATCTATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 34783 365 - 647215 TAATACGTTGCGTTTATTACTGAATCAACGATTCCCCTACTCAAAACATCGCTTCACAACGCTGTAAAGGGCGCAAACTTTGACTACAGTTCGATAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTGCGGGAGAGCTCCGATACCATGAGCTGCGGACCGACTTTATGGGACGACAATATTGTTTAACTACTTGGCTTCCCTGCTTCTTAATCTGCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTGCCAAAGGTGGATGCCAGGGGGGCAACTAGGGCTGAATAAATGCAAGCCTGCCCATGATACTCTGTTTCTGTTGTCTGCAGTCATTGAGCACCATGTCGCTCAGAGAGACATCTATCCAGAGACCTATG - -a -s mr.mrrefChr3 109886 83 + 181019 CTTTGAGATTGAGCCTTATGTGTGATGCAGCCATGAAAATTGGGTTATTTCAACATTATGTGATACATATTCTATCTTCCGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 559957 83 + 636262 CTTTGTGATTGAGCCTGATGTGTGATGCAACCATGAAAATTGGGTTGTTTTAACAGTATGTGATACCTATTCTATCTTCCGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 35148 83 - 647215 CTTTGAGATTGAGCCTTCTATGTAATACAGCCACAAAAAGTGGATTATTTCAACATTATGCGATACACATTCTATCTTCCAAG - -a -s mr.mrrefChr3 109969 11 + 181019 GTCCAAGCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560040 11 + 636262 GTCCAAGCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 35235 11 - 647215 TTCCAAGTTCC - -a -s mr.mrrefChr3 109980 13 + 181019 AGCATTCACTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560051 13 + 636262 AGCATTCACTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 35247 13 - 647215 AGCCTTCACTTTA - -a -s mr.mrrefChr3 109993 153 + 181019 TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGAATTATAATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCAACTGGGATCATGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560064 151 + 636262 TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAAT-GTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGGATTATGATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAACTACTGCAGCTGGGATGATGG- -s simRat_chr6.simRat.chr6 35273 153 - 647215 TGATTATTGTCAATATATGTAATGGGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTTTATGATTTGGTGAGCTTATCAAAAAAAATAATGTGAATACTATTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCGACTGGGATCACGGG - -a -s mr.mrrefChr3 110146 20 + 181019 TCTGTTTGTCACAGACTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560215 17 + 636262 ---GTTTGCTACAGACTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 35427 20 - 647215 TCTGTTTGTCACACACTTGA - -a -s mr.mrrefChr3 110166 353 + 181019 CATCTAATGCACTTTGCTCATGAACTCACTACAATCTGCAGCTAAGTCAGACTATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATGGCCCGGGTCTTACAATACAAGTTCTACACCACCATTAGAAGCTAGTTGTAGTCTTAAGTCTAAATGAGGGAAACTCTCAGGTGAGGCAATTTAAGTCTGAGGGACACCACTACAATTGTGTATGCAAGGTGTAGCaGTACAAAAAATTTGAGTGCAAGGAGAAGGAGTAACAatgtTAATATGCATTAAGTGGTGGCAGGTGTTGTCAGTACTCTGAAGTGTACTAGCAATAGGCCCGATTCCCTTGCATGTTTAATATATGGCTCCTCAAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560282 322 + 636262 CATCTAATGCACTTTGCTCATGAACTCACTACAATCTGTAGCTAAGTCAGACTATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATGGTCCGGGCCCTACAATACAAGTTCTACACCACCATTAGGAGCTAGTTGTAGTATTATGTCAAAATGA----------CAGGTGAGGCAATTT-----TGAGGGACACCACTACAATTGTGTATGCAAGGTGTAGT-GTACAAAAAATTCGAGTTCAAGGAGAAGGAGCAACA----TAATAT-----------TGGCACGTGTTGTCAGTACTCTGAAGTGTACCAGCAATAAGCCCGATTCCCTTGCATGTTTAATAAATGGCTCCTCAAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 35447 353 - 647215 CATCTAATGCTGTTTGCTCATGAACTCACCACAACCTGCAACTAAGTCAGACCATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATAGCCCGGGTCTTACAATACAAGTTGTACACCACCAATAGAAGCTAGTTGTAGGCTGAAGTCTAAATAAGGGAAACTCTCAGGCGAGGCAATTTAAGTCTGAGGGACACCACTACAATTCTGTATGCAAGGTGTAGCAGTACAAAAAATTTGAGTGCCAGGAGAAGGAGTAACAATGTTAATATGCATTAAGTGGTGGCAGGAGTTGTCAGTACTCTGACATGTACTATCAATAGGCCCTATTCCCTTGCATGTTTAATATATGGCTCCTCAGACA - -a -s mr.mrrefChr3 110519 78 + 181019 AACCAAGGGACGGACCTTATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGTTATGCCATTCTTATCAGCTTGAGTCTGGGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560604 78 + 636262 AGCCAAGAGACGGACCTCATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGCTATGCCATTCTCATCAGCTCGAGCTTGGGTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 35801 76 - 647215 AAGCAGGGGATAGACCTTACT--TATTACATTTGCCTGCTGTTCATTGTGCCATCCTTATCAACTTGAGTCTGGGTAC - -a -s mr.mrrefChr3 110597 168 + 181019 ATCTCAATGCCACCACCAAGGGATCCAACCTAAATTATATCTGGGATGAGTTTCCAGTAAGAAACCTCTCCTTTAGTTGAGCTCTGTCTTTCCATGCTGACTATGGTGAGCATGCTCTAATTAACACACTCACCTTATTGCTAGGTACCCTGCATGTTGCATTGCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560682 168 + 636262 ATCTCAATGCCACCACAAAGAGATCCAACCTAAATTATATCTGGGACGAGTTTCCAGAAAGAAACCTCTCCATTGGTTGAGCTTTGTCTTTCCACACTGACTATGGTGAGCATGCTCTAATTAACACACTCACCTTATTGCTAGGTACCCTGCATGTTGCATTGCATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 35878 168 - 647215 ATCTCAATCCCACCACCAAGGGATCCAACCTAAATTATGGCTGGGATGAGTATCCAGTAAGAAACCTCTTCTTTAGTTGAGCTCTGTCTTTCCATGCTGAGCATGGCGAGCATACCCTAATTAACGCACTCTCCTTATTGCTAGGTACCCTACAAGTTGCATTGGATG - -a -s mr.mrrefChr3 110765 10 + 181019 AAGGTTTAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560851 10 + 636262 AAGGTTTAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36046 10 - 647215 AAGTTTTAAT - -a -s mr.mrrefChr3 110775 45 + 181019 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATATTGATGAGATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560861 45 + 636262 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATAATGATGAGATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 36067 45 - 647215 TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATATTGATGAGATTA - -a -s mr.mrrefChr3 110820 254 + 181019 TGTGCCCAAATATAGGGTATATTCCTTGAAGAACATAGCCTGTCTTATGAAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACACAGAAATGAAGGATAATTAAAGAATCTCTATAAGGACCAACATACAAACGATCGTTAATACATACTCATCTCTATTGTTCAACTTACCCAGCTCTAGTTTGGCACTTCTTAATGGACAATACGGTACCATCTCACCCCAAGCCCCCCACGTAGCTATCACCTGTAGCTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 560906 240 + 636262 TGTGCCCAAATATAGGGTATATTCCTTGAAGAACATAGCCTGTCTTATGGAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACGCAGAAATGAAGGATAATTAAATAGTCTCGATA-----------ACAAACGATTGTTAATACATTC---TCTCTATTGTTCAACTTACTCAGCTCTAGTTTGGCACTTCTTAACGGACAATACGGTACCATCCCACCCCAAGCCCCCCACGTGGCTATCACCTGTAGCTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 36113 254 - 647215 TGTGCCCAAATATGGGGTATGTTCCTTCGAGAACATACGCTGTCTCATGAAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACACAGAAATGAAGGATAATTAAGGAATCTCTATAAGGACCAACATACAAATGATCGTTAATACATACTCATCTATATTGTTTAACTTGCCCACCTCTAGTTTGGCACTTCTTAATTGACAATTTGGTACCATCTCCCCCCAAGCCCCCCACATAGCTATCACCTGTGTCTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 111074 47 + 181019 TGTCTATCTACCTCCTAGTTCACATAACAGGATACCAAAGTGGACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561147 47 + 636262 TGAGTATCTACCTCCTTGTTCACATAACAGGATACCAAAGTGGACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36367 47 - 647215 TATCTATCTATCTCCTATTTCACATCACAGGATACCAAAGTGAAACT - -a -s mr.mrrefChr3 111121 19 + 181019 GGAGTGGACCTGGGATCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561194 19 + 636262 GGAGTGGACCTGGAATCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36417 19 - 647215 GGAGTGGACCTGGGTTCAT - -a -s mr.mrrefChr3 111140 67 + 181019 TCTCCAAATCCATAGCTGACCCTCATGCCAGAGGCTTTCCTCATGCTGGAGTGGCGGCCCCAGAATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561213 60 + 636262 TCTCCAAATCTGTAGCTGACCCTGATGCCAGAGGCTTTCCCCATGCTGGAGTG-------CAGAATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 36439 67 - 647215 TCTTCAAATCCATAGCTGACCCTCATGCCAGAGGCTTTCCTCATGCTGGAGTGGCGGCCCCAGAATA - -a -s mr.mrrefChr3 111207 83 + 181019 TTGTTAACATCATCAGTCATTCTTAGAAACAATTAGAAGAAGAACTTGCCTATAAGTTATATGGCACGCAGCAGTTTATTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561273 83 + 636262 TTGTTAACATCATCAGTCATTCTTAGAAACAATTAGAAGAAGAACTTGCCTCTAAGTTATATGGCACGCAGCAGTTTATTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36507 83 - 647215 TTGTTAATATCATCGCTTGTTTTTAGAAACACTTTGAAGAAGAACTTGCCTATAAGTTATATGGCACGCAGCAATTTATCCTT - -a -s mr.mrrefChr3 111290 27 + 181019 GGCCTATGGAAGAATGAGTACATACAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561356 27 + 636262 GGCCTATGGAAGAATGAGTACATACAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 36641 27 - 647215 GGCCTATGGAAGAATGAATACATACAC - -a -s mr.mrrefChr3 111317 13 + 181019 AATCTTTCATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561383 13 + 636262 AATTTTTCATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 36669 13 - 647215 AATCTTTCATATG - -a -s mr.mrrefChr3 111330 137 + 181019 TATAATTATGTGCAATTCTTGACTGATATTCTAAGTTTTATTGAATGAGTCAGAACTTGGTTAAACTGTGGTGATTGGTATGACTGTGGACTTATCGTCAACAGGGATGAATCTGAAGCCATGGACTATATCAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 561397 135 + 636262 TATAATTATGTGCAATTCTTGACTGATATTCTAAGTTTTATTGAATGAGT-AGAACATGGTTAAACTGTGGTAATTGCTATTACTGTGGGCTTATC-TCAACAGGGATGAATCTGAAGCAATGGACTATATCAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 36682 133 - 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-a -s mr.mrrefChr3 111994 8 + 181019 GAGGTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562065 8 + 636262 GAGGTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 37333 8 - 647215 GGAGTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 112002 33 + 181019 TCAACCTGCTCAGGACACGCAGAATCGGTCTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562073 33 + 636262 TCAACCTGCTCAGGACACGCAGAATCGGTCTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 37347 33 - 647215 TCAACCTAGTCAGGACACACAGAACCAGTCCGA - -a -s mr.mrrefChr3 112035 18 + 181019 GACCCCACAAGAGACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562128 18 + 636262 GACCCCACAAGAGACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 37380 18 - 647215 GACCCCACAAGTGGCACA - -a -s mr.mrrefChr3 112053 52 + 181019 TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCGGCTGGTGCCCTCTAAGTTGGCCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562146 52 + 636262 TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCGGCTGGTGCCCTCTAAGTTGGCCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 37399 52 - 647215 TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCAGCTGGTGCCCTCTGAATTGGCAATT - -a -s mr.mrrefChr3 112105 17 + 181019 AGAGGACATGAGGTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562198 17 + 636262 AGAGGACATGAGGTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 37453 17 - 647215 GGAGGACATGAGGTTGC - -a -s mr.mrrefChr3 112122 23 + 181019 GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562215 23 + 636262 GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 37473 23 - 647215 GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG - -a -s mr.mrrefChr3 112145 59 + 181019 GACACATGGGACTCCTAGCCCCCTTGTCAATGGAACTGGAGCAGTTAGATAGATTCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562238 59 + 636262 GACACATGGGACTCCTAGCCCCCTTGTCAATGGAACTGGAGCAGTTAGATAGATTCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 37521 59 - 647215 AACACATGGAACCCCTGGCCCCCTTTTGAATGGAACCGGAACAGTTTTATGAATTTGCC - -a -s mr.mrrefChr3 112204 24 + 181019 AACAGGGAGCCCACATTCCATGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562298 24 + 636262 AACAGGGAGCCCACATTCCATGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 37580 24 - 647215 AACAAGGAAGCCGCTTTGAATGTG - -a -s mr.mrrefChr3 112228 132 + 181019 CTAGCATCACAGGATCTAAGGAACCATGGAATTATAAATCAGTATGGAATGGGCAGCTTAGCATTAGCAAGTCATATGCTTGTGGCATCATATCCCCAAAACAGTACATAACAGTCTGACCCATGCAACATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562322 132 + 636262 CTAGCATCACAGGATCTAAGGAACCATGGAATTATAAATCAGTATGGAATGGACAGCTTAGCATTAGCAAGTCATATGCTTGTGGCATCATATCCCCAAAACAGTACATAACAGTCTGACCCATGCAACATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 37618 132 - 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647215 GGGGGCTCAGTTTAATGATTGGTGAAAGCCTGTTCTGAACGACTCCCTCTGATGTGCCAACCGCCTTGAGACTTAGGTGTCTCTCTCTAAAGGGCATCCTGTTCTGGTAGATGAAGCAACCCAAAATTATCCTTAAGACTGACAATCTCCAGGGTG - -a -s mr.mrrefChr3 112624 32 + 181019 ACCTACACCTACTATCATGAAACTACATAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562777 32 + 636262 ACCTACACCTACTATAATGAAACTACATAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 38019 32 - 647215 TCCTACGCCTACCATCATGAAACTACATAATT - -a -s mr.mrrefChr3 112656 212 + 181019 TCTCCAAGGAAAACATCAAATCATTCATCATTCTCTTCTCAACGTCCCATAGGGTTGTACTGCTGACAATCTACTTTACCTCATACCCAAAATCTATCTACCAATGCTCAGAACCTGACAGTCACACTTAAACTGGCTCTAATTTCATGCTGAAATTCaTGAAACTGGGAGTATATAACCAGACTAAAAACGTAAacagtgaagcctACGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 562809 194 + 636262 TCTTCAAGGAAAACATCAAATCATTCATCATTCTCTTCTCAACATCCCATAGGATTGTACTGCTGACAATCTACTTTCCCTGATACCCAAGATCTATCTACCAATGCTCAGAACCTGACAGTCCCCCTTGAACTGGCTCTAATTGCATGCTGAAATTC-TGAAACTGGGAGTATGTAACCAGACTAAAGACTTAA----------------- -s simRat_chr6.simRat.chr6 38069 212 - 647215 GCTCCAAGGAAGACATCAAAACATTCATCATTCTCTTCTCAATGTCCCACAGGGTAGTACTACTGATAATCTATTTTACCTCATACCCAAAAACTATCCACCAATGCTGAGAACCTGTCAGTCACACTCAAACTGGCTCTAATTTCATGCTGAAATTCATGAATCTGGGAGTGTATAACCAGACTAAAAACGTAAACAGTGAAGCCTACGGT - -a -s mr.mrrefChr3 112868 72 + 181019 GCATCAGATATCAAAACTCTGATTTTGGTCCCCAGGACAATCATCTTCACTAAATTAGCTTACTGGTCGTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563003 68 + 636262 ----CAGATAACAAAACTCTGACTTTGGTCCCCAGGACAATTATCTTCAATAAATTAGCTTACTGGTCGTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 38282 72 - 647215 GCATTTGATATCAAAGCTCTGATTATGGTCCCCAGGCCAATCATCTTCACTAAATTAGCTTAGTGGTAGTAA - -a -s mr.mrrefChr3 112940 70 + 181019 TCATCTGACTATCAGATCTGACCTCTCTAGTGTAAAGTAAGAGATTGAGTAACACTCGACTTACAGACCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563072 70 + 636262 CCATCTGGCTATCAGATCTAACCCCCCTAGTGTAAAGTAAGAGATTGAGTAACACTCGACTAACAGACCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 38354 70 - 647215 TCATCTGACTATCAGATCTGACCTCTCTAGTGTTCACTGAGAGATAGAGTAACACTAACCCTAATCTTCT - -a -s mr.mrrefChr3 113010 59 + 181019 TAGTCTACAAGGAGTAATGTTCTCAGGGAACTCTTATTATGGGGGGATAAATTGCAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563143 42 + 636262 TGGTCTACAAGGAGTGATGTTCTCAGGGAGCTCTTATT-----------------GATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 38424 58 - 647215 TAGTCTA-AAGGAGCAGTTTTCTCAGGGAACTCTTATTATGGGGGGATAAATTGCAATG - -a -s mr.mrrefChr3 113069 155 + 181019 TGACACATAGCATCTAAGATGTGCAATAGGAGTATAAGAAATTTTCTGGCTCAAGATCATCTTAATCTAACTCCAAGATTAAACGTAACAGGGGGCAGAAATTATGTACCAGTTCATTCTAGGGGGACAGTTGTTTTTGGGTGGCTCACAAGGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563186 155 + 636262 TGACACATAGCATCTAAGATGTGCAATAGGAGTATAAGAAATTTTCTGGCTCATGATCATCTTAATCTAACTCAAAGATTAAACGTAACAGGGGGCAGAAATTATGTGCAGGACCATTCTAGGGGGACAGTTGTTTTTGGGTGGCTCACAAGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 38482 155 - 647215 TGACACGTAGCATCCAAGATGTGCAATAGGAGTATAAGAAATTTTCTGGTTTAAGATCATCTTAATCTAACTTCAAGCCTAAACGTAACAGGGGGCAGAAATTATGTACCAGTTCATTCTAGGGGGACAGTTGTTTTTGTGTGGCTCATAAGGAA - -a -s mr.mrrefChr3 113224 10 + 181019 GTGTACCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563341 10 + 636262 GTGTATGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 38640 10 - 647215 GTGTACCACA - -a -s mr.mrrefChr3 113234 217 + 181019 TCTTGAATTCCTTAGCCACGCCAGGTTGTTCTTAGTAAGATCCCCCTCAGTGGTAATAATTTCAGGGGCTTCCACAAGTTCTCTCAAGTTGTGGCACTGTTTTTAATACTTTACATCAGATGGGTCTGTGGGGAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGTTGATCACAACTCTAGCCAGACCCTTGCAATAGCGTGCAGCTCTGTAAGACAGTTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 563352 217 + 636262 TCTTGAATTCCTTAGCCCCGCCAGGTTGATCTTAGTAAGATCCCCCTCAATGGTAATAATTTCAGGGGCTCCTACAAGTTCTCTCAAGTTGCGGCACTGTTTTTCATATTTTATGTCAGATGGGTCTGTGGGAAGGCAATTAGCAAATACTGGCAAATGTTGATCACAACTCTAGCCAGACCCTTGCAATAGCGTGCAGCTCTGTAAGACAGTTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 38650 211 - 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647215 ATAATACCTCATGTCAAGGGAGCTTATGTCCTCTAGGCCTTCAAAAGAAATCTAAGAGTAGATATTCTTAGGATGAGATTGGAGTACTGCTTGAAGAACCTCTAAGTCTCACAGATGTTAACAGTTCAATATTTCCTATGGCAGGCATAGTGCCAAGGATTAT-----TCAACTACTTCTAAACTCTGTTTAACTTTGAAGTTGAATTATGACAATGGTGGTGCTTTGGGATGATCTACTTGAGCATAGTTTATATAGACTTATGGCAGGCTATA---GCTGACTTATTATCAAGCTGTTTTATGTAACCATTCTCCTTCTACACTTCCAATCAGCCCAGAACCCTTTAGAAAGTCTTGTCTGAACTATAAAGGAGGGGTAATGTCATCTTACATCACAGTCCATACATACTAGCCCAGGAACTGCCTAGAAACCACCCCAGAGGAGTTAGTGGATTGGCAAAGGTGCTACC - -a -s mr.mrrefChr3 114032 690 + 181019 AAGTGACATGAAATCACAGTAGCTGCTGGTAGGGCGCAACTTGAAGCAAATTGCAAATAAAGGAAATACATGATAAACTCATTCAACATGGAGGATAAAGTTGTAGACAATAAGCTGTACTAACTCTTATTATATTAACAAAGATTTCTCATATTATTTATATTAATAATGGCCAGATTCATGTCATGTAATCCCTCCTTTGGTGGCATTGGAAAAGGACATCTAATGCGAGAAGTAGATGCACTGGATGGGTTGTGTTCTCATATCTGTGACCAGTCTGGTGCCCTTTATAAAGTATTGAACCGTCGTAAGGGACCTGATGTGGTGGGGGGGTTGCGGGCACAGATTGATAGAAAACTTTATAAGCAGAACATGCAAGTAACAAATATAAAGCGTTATTGTAGCAGACCCGAGCATTGAATTCCTAGATGTAAGTGTAGACTCCACATTGAGAAAGAGATATTAAACACACCATTGTTGACAGTCCAAGAAGGAGCAGTTGAAGAGCTTACTCTCCCTGAACCAGAGCCTGAACACACTGGTGAATGTCATGTCAGTGGTGTTGTCTTAGGTTTGTATTTAAAACCTGTGATATATGATACTCCAAGATGGTTGTGTGCACAGATTATCTCTCCAAGTTGGTTCAGTACAGGCTCACAGGGAAAGTGATTTCTACGTGAAACCCCCCGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 564152 683 + 636262 AAGTGACATGAAGTCACAGTAGCTGCTGGCAGGGCACGACTTGAAGCAAATTGCAAATAAAGGAAATACATGATAAGCTCATTCAACATGGAGGATAAAGTTGTAGACAATAAGCTGTACTAACTCTTATTATATTAAC----ATTTCTCATATCAATTATATTAATGATGGCCAGATTCATGTCATGTAATCCCTCTTTTGGTGGTATTGGAAAGGGACATCTAATGAGAGAAGTGGATGCACTGGATGGGTTGTGTTCTCATATCTGTGACCAGTCTGGTGCCCTTTATAAAGTATTGAACCGTCGTAAGGGACCTGATGTGGTGGGGGGGTTGCGGGCACAGATTGATAGAAAACTTTACAAGCAGAACATGCAAGTAACAAATATAAAGCATTATTGTAGCAGCCCCGAGTATTGAATTTCTGGATGTAAGTGTAGTCTCCCCATGGAGAAAGAGATATTAAACACACCATTGTTGACAGTCCAAGAAGGTGCAGTTGAAGAGCTTACTCTCCCTGAACCAGAGCCTGAACACACTGGTGAATGTCATGTCAGTGGTGTTGTCTTAGGTCTGTACTTAAAACTTGTGATATATGATACTCCAAGATG---GTGTGCACAGATTATCTCTCCAAGTTGGTCCAGTACAGGCTTACAGGGAAAGTGATTTCTAGGTGAAACCCCCCGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 39435 690 - 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-a -s mr.mrrefChr3 114975 45 + 181019 CTTAGCCTGCAAACAACCCAGGACAGTGATCCAACAGACATTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565091 45 + 636262 CTTAGCCTGCAAACAACCCAGGACAGTGATCCTACAGACATTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 40394 45 - 647215 CTTAGCCTCCAAACAACCCAGGACAGTGATCCAACCCATATTTAA - -a -s mr.mrrefChr3 115020 82 + 181019 GAAGAAGCGTCTAGTGTTATAAACCTAGCAATCTAGGGATCCAACATACTCACAGGCAGATGGGACACTCATGTGAAGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565136 82 + 636262 GAAGAAGCGTCTAGTGTTATAAACCTAGCAATATAGGGATCCAACATACTCATAGGCAGATGGGACACTCATGTGAAGATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 40440 82 - 647215 GAAGAAGTGTCTGGTACTATAAACCTACCAATCTACAGATCCAACATACTCACAGGTAGATTGGACACTCCTGAGAAGATTG - -a -s mr.mrrefChr3 115102 247 + 181019 CTCAGTTTGCTGTACAATACAAGGAATTTGTATGGGGTGACCTGAAGAGAAATCTGGCCAAGTGCTATACTATAGAACTGAATATGATATATTAGGGTATAATGGAGTCACTCCTATTAAAATACCCATGAAATGTTTAGCAGTCTAAAGGAAACGGTAAGGTACCATATAGTAGAATCTTTTGTTGAATAAGTGAAGCACAAATATTACCTCTCCTGATAAAAATCAATCATACTAAACATTAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 565218 247 + 636262 CTTGGTTTGCTATACAATACAAGGGATTTGTATGGGGTGACATGAAGAGAAATCTGGCCAAGCACTATACTATAGAACTGAATATGATATATTAGGGTATAATGGAGGCACTCCCATTAAAATACCCATGAAATGTTTAGCAGTCTAAAGGAGCCTGTAAGGTACCATATAGTAGAATCTTTTGTTGAATAAGTGAAGCACAGATACTACCTCTCCTGATAAAAATCAAGCATACTAAACATTAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 40535 239 - 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647215 ------actcaacaaagaagctatgctgtcacaagggttgaatcctaaatagaccctcaatgccccaactaaaa-----ttatcaacaagcagacaaagagattacagggtctactgacataagctccactgacacgcactaaaacagaagagttggaatcatttctgcacaaaccacaatc--ttgaagatgaCTCAATCCTATATGCACTGAAACCCATATAAAGCAAATGAGAGAGGAATACAGAAT-CAAGGCATGTTTTTTCTCATGTCAGA - -a -s mr.mrrefChr3 116217 276 + 181019 tgctggagatctgtgatcagtgtactagacatcatgcactggacatttgcaatcagaacactagtcaactgaataattgattagaaagcccatctactatgaaccagtatataagatgtgtggaactataagttatgtaacctattaactgaaccatcatgaatcacatgatattattgtgaggacacattgaatacaccaggccagtttacatattaagaatcctgaactgagggaaattaccaatgttgtttgggtgattaaagaataagcaag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566356 275 + 636262 tgctggaggtctgtgatcagtgtactagacatcatgtgctggacatttgcaatcagaacactagtcaactgaataattcattagaaagcccatctactatgaaccagtatataagatgtgtggaactatatgttatgtaa-ttattaacgtaaccatcatgaatcacacaatattactgtgaggacacattgaatacaccaggccagtttacatgttaagaatcctgaactgagggatattaccgatattgtttgggtgattaaagaataagcaag -s simRat_chr6.simRat.chr6 41686 276 - 647215 TACTGGACATCTGTGACCAGGGTGCCTGACACTAAGCACTGGACATTTGCGATCGGAGTGCTAACCAATTGAATAATTGATTAGAAAACCCATCCACTATGAATTAGTATATaagatgtgtggaactgtaagttatgtaacctattaactgaaccatcatgaatcacatgatattattgtgaggacacattggatacaccaggccagtttacatattaagattcctgagatgagggaaattaccaacgttgtgtgggtgtttaaagaatgataaag - -a -s mr.mrrefChr3 116493 82 + 181019 acatccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcctaagatgggcacaagaatgaaggaaacaaaatat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566631 82 + 636262 acatccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcccaagatgggcacaagaatgaaggaaacaaaatat -s simRat_chr6.simRat.chr6 41971 81 - 647215 acaaccaatctcatagtcagataatggataaagacctgtagcatgtcctgagatgggaacaagaaTGAAGGAAACAAAATC- - -a -s mr.mrrefChr3 116575 103 + 181019 ttccacgttctcagatgatatgatgctctaccttggaaaccctAGCATGGCAAGTTGGGCACAGCTAGCCTAGATGTAATTGAGAGGTACGAGAACAAGAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566714 103 + 636262 ttccacgttctcagatgatatgatgctctacctaggaaaccctGGCATGGAAAGTTGAGCACAGCTAGCCTGGATGTAATTGAGAGGTACGAGAACAATAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 42052 78 - 647215 -------------------------CTCTACCTTGGAAACTCTAGCATGGCAAGCAGGGCACTGCTAGCCTAGATATAATTAAGAGGTATGAGAACTAGAGGT - -a -s mr.mrrefChr3 116678 165 + 181019 GGTAatactaaagaaacacccactggtaatactaaagaaacacccacctacagtttaggtaggaagatcatagttgggaaaggctaaagagacagccactccactcaattttatttttctcagtaggcacctccagcctcatcttaggcagggagacccttagcg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 566818 165 + 636262 GGTAatactaaagaaacacccactggtaatactaaagaaacacccacctacagtttaggtaggaagatcatagttgggaaaggctaaagagacagctactccacccaattttatttttctcagtaggcacctccagcctcatcttaggcagggagacccttaggg -s simRat_chr6.simRat.chr6 42130 163 - 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647215 CAAGATTAAATGGAATGGGTGCCTCCAACGAACATAAACAACAAAGATACATACTAGGAGAAAAGGAAAACATCCATCATGCTGATTACATCCCGCTTCTGATTTTGCATCGCTCTTTTGATTTGCTGCTTAGGCTATGATGT - -a -s mr.mrrefChr3 121192 73 + 181019 TAGGGAGTCCTTATTCTGCATGAAATTGTGAGCCATAATGTGGCTTCTTACTGAATCTAGTTATATATACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571222 73 + 636262 TAGGGAGTCCTTATTCTGCATGAAGTTGTGAGCCATAATGTGGCTTCTTACTGAATCTAGTTATACATACACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 46761 73 - 647215 TTGGGAGTCCTTATTCTGCATGAAATTGTGAGCCATAATGTGACTTCATACTAAATCTAGTTATATTTATACA - -a -s mr.mrrefChr3 121265 8 + 181019 CCTTGCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571295 8 + 636262 CCTTGCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 46835 8 - 647215 CCTTGCAG - -a -s mr.mrrefChr3 121273 18 + 181019 TGGATATACACACCTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571321 18 + 636262 TGGATATACACACCTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 46843 9 - 647215 ---------CTACCTTGC - -a -s mr.mrrefChr3 121291 63 + 181019 AGCTATGAAGATAGATAGTTGTGGTAATATGTTAGCCACAATGTGGTCTACTACTCCTAGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571341 60 + 636262 AGCTATGAAGATAG---GTTGTGGTAATATGTTAGTCACAATGTGCTCTACTACTCCTAGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 46852 63 - 647215 AGCTCTCAAGATAGATAGTTGTGGTGATATGTTAACCACTATGTGGTCTACCACTCCTGGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 121354 77 + 181019 CTTTTGATTTCACTTTAATAAATATGCACACCTTTGGTATAGAGGTATGTGCTTTCTGTTGCCCCTTAGGGGAGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571402 77 + 636262 CTTTTGATTTCACTTTAATAAATATGTACACCTTTGGTATAGAGGTTTGTGCTTTCTGTTGCCCCTTAGGGGAGTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 46915 77 - 647215 CTTTTGATTTTACTTTAATAAATATGCACACCTTTGATATAGAGGTATGTGCTTTTTGTTGCCCCGTAGGGGAGTAC - -a -s mr.mrrefChr3 121431 29 + 181019 TCTTTTGGGGAGTACTCCTTTCTGCTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571483 29 + 636262 TCTTTTAGGGAGTACTCCTTTCTGCTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 46992 29 - 647215 TCTTTTGGGGAGTACTCCTCTCTGCTTTC - -a -s mr.mrrefChr3 121460 13 + 181019 GTCATCATACTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571512 13 + 636262 GTCCTCATACTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 47024 13 - 647215 GTCATCATACTCC - -a -s mr.mrrefChr3 121473 182 + 181019 AATCATTGCACTAAGTTAAGCGAAGGTGTGAGAGACTGAACATGGATGTATAGGTCATAGATTAGAGGCACTCCACCACGAAGGATAAGGACAGCTGGTGTGATAGCTGCAGATGTGACCAGAGGATCTCTGCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCAACTGCTGAATAAGATAGCATGCTCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571525 182 + 636262 AATCATTGCACTCAGTTAAGTGAAGGTGTGAGTGACTGAACATGGATGTATAGGACATAGATTTGAGGCATTCCACCGCAAAGGATAAGGACAGCTGGTGTGATAGCTGCATATGTGACCAGAGGATCTCTGCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCAACTGCTGAATCAGATGGCATGCTCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 47038 178 - 647215 AATCATTGCACTAGGCTAAGCAAAGATGTGAGAGACTGAACATGGGTGTATAGGTCATAGATCAGAAGCACTCCACCATGAAGGATAAGGACAGCTGGCATGAGTGCTACAGATGTGACCAGAGGAGCCCTCCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCATCTGCGGAATAAGATAGCATGCT---- - -a -s mr.mrrefChr3 121655 338 + 181019 GTGTTACTATAGTGCAAGCACTTACAGTCCCCATGGGACTCATTATCAAAGGCCACACCCTGTACATTTGAGTACCCATACATTAACATGTGATGTTTTTATGGTAATTAATGTATCCATAGAGATATAGATCTCAATGACTAAGATGCCTCTGATTGTAGTTTGTTTGGTGCATCATTTCAAAGAAATCAGAGTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACATTTTGTGGATGTTGGACTACACAAATTTGGATGCCAATGCATCCAGACGGAGCTGCGGGATTGAGATTAAGTGATGGTGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCAGTTCCATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 571710 338 + 636262 GTGTTACTATAGTGCAAGCACTTACAGTCCCCATGGGACTCATTATCAAAGGCCACACCCTGTACATTTGAGTACCTATACATTAACCTGTGAAGTTTTGATGGTAATTAATGTATTCATAGAGATATAGATCTCAATGACTAATATGACTCTGATTGTAGTTTGTTTGATGCATCATATCAAAGAAATCAGAGTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACATTTTGTGGTTGTTGGACTACTCAAATTTGGATGCCAATGCATCCAGACGGAGCTGCGGGATTGAGATTGAGTGATGGTGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCAGTTCCATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 47216 338 - 647215 GTACTACTATAGGGGAGGCAATTACAGACCCCATGGGACTTATCATCAAGGGCCACCCCCTGTACATTTGTACAGCCATACATTAACATGTGATGTTTTTATGGTAATTAATGTATCCATAGAGATATTGATGTCAACGACTGAGATGCCTCTGATTGTCGTGTGTTTGGTCCATCATTCCAAAGAAGTCAGATTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACTTTTTACGGATGCAGGACTACACGAAAAAGAATTCCAATGCAACCAGACAGTGCTGATGGATTGAGATTAAGTCATGAGGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCCGTTCTTTTA - -a -s mr.mrrefChr3 121993 57 + 181019 ACTAAGCTCCATAATGCTTGGACTGCCCTGGAGGACTGTATATTAGGTGGGGTAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572049 57 + 636262 ACTAAGCTCCATAATGCTTGGACTGCCCTGGAGGACTGTATATTAGGTGGGGTGGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 47554 57 - 647215 CCTGAGCTGCATAATGGTTGGACTGCCTTGGAGGACTGTTTATTAGGTAGAGCAGCT - -a -s mr.mrrefChr3 122050 10 + 181019 AAAGGAGTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572112 10 + 636262 AAAGGAGTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 47611 10 - 647215 AAAGGGGAGA - -a -s mr.mrrefChr3 122060 11 + 181019 GAGAGCACCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572123 11 + 636262 GAGAGCACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 47621 11 - 647215 GAGAACACCCC - -a -s mr.mrrefChr3 122071 57 + 181019 TAACATAAAACTTAAATTGAAGGGAGCTATAATTCTGACAAGGTGTTATTACCAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572135 57 + 636262 TAACATAAAACCTAAATTGGAGAGAGCTATAGTTCTAACAAGGTGTTGTTACCTAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 47632 57 - 647215 TAACATAAGACTTAAATTGAAGGGAGCTTTAATTCTGACAAGATGCCATTGCCAAAA - -a -s mr.mrrefChr3 122128 101 + 181019 TTCATGAGATTAGAATTCTAGATAATTGCATCATGAATTATTGGACAGAGATGAAATCCACATGTCATATGGATTAACTCATAGGTTGCCGGGTATCCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572192 101 + 636262 TTCATGAGATTAGAATTCTAGATAATTGCATCATGAATTATTGGACAGAGATGAAATCCACATGTCATATGGATTAACTCATAGGTTGCCGGGTATCCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 47690 101 - 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647215 ACCCTCGCTTATTAAACCCCTCTATTGATAAAACTGAAGG - -a -s mr.mrrefChr3 122392 118 + 181019 TTAACATGGATTCCACTGAATAAGGGGGTACATCACACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGCATGAGCCAGCTGGGTTTAAGAGGGCCGTATCTATGGGGTCCTATCAAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572473 118 + 636262 TTAACATGGATTCCACTGAATAAGGGGGTACATCACACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGCATGAGCCAGCAGGGTTTAAGAGGGCCATATCTATGAGGTCCTATCAAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 47992 118 - 647215 GTAACACAGATTCCACTGAACAAAGGGGCACATCATACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGTATGAGCCAGCTGGGTTTCAGAGGGCTGTTTTTATGGGGTCCTATTAGGCC - -a -s mr.mrrefChr3 122510 57 + 181019 ACTTTTTGACAAAAACTTTATTCATAGAATAAAATGTGGAGATAATCTCAAACATAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572595 57 + 636262 ACTTTTTGACAAGAACTTTATTCATAGAATAAAATGTGGAGATCATCTCAAACATAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 48110 57 - 647215 ACTTCTTGACAAAACCTTTATTCATAGAATAACATGCAGAGATAATCGCAAGTATAC - -a -s mr.mrrefChr3 122567 45 + 181019 AATAGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATCTTCCATCAATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 572652 45 + 636262 AATAGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATTTTCCATCAATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 48215 45 - 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-a -s mr.mrrefChr3 128654 65 + 181019 TTGTCTAAGCTAGTGGATGTTTCTGCAATTGGAGAAGTCATCGTGGGTTGGTGGCAGCTTAACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578776 65 + 636262 TTGTCTAAGCTAGTGGATGTTTCTGCAATTGGAGAAGTTATCGTGGGTTGGTGGCAGCTTAACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 54545 65 - 647215 GTGTCTAAGCTAGTGGATGTTTCTGCAATTGGAGAAGTCATCATGGGTTGGTGGCAGCTTAACAA - -a -s mr.mrrefChr3 128719 159 + 181019 CTTAAAAATGTTTGGCCATAATTTTATAGGAGTGCTCTCAAAGCTATGCAACACAAATTAAGACACTAACTCAGTTTCCCTGTGATCATGGGTGGCTGTTCCCTCTCTCTTACATGAGGTATATAGAACCAGCATGACACCAACCTCCTATTCACAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 578843 159 + 636262 CTTAAAAATGTCTGGCCATAATTTTATAGGAGTCCTCTCAAAGCTATGCAACACAAATTAAGACACTAACTCAGTTTCCCTGTGATCATGGGTGGCTGTTCCCTCTCTCTTACATGAGGCATATGGAATCAGCACAACACCAACCTCCTATTCACAGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 54610 156 - 647215 CTTAAAAATATTTGGTCATAACTT-ATAGGAGTGCTCTGAAAGATATGCAGCACAAATTAAGAC--TAACTCAGTTTGCCTGTGATCATAGGTGACTGTTCCCTCTCTCTTAGATGAGGTATATAGAACCAGCATGACAATAAGCTCCTATTCACAGAA - -a -s mr.mrrefChr3 128878 102 + 181019 GCAATGAGACCTGGTATTTGATCATTTGTATGCTTGTTAGACAACTTTGGTTTCCAGAGGTGCTACTATAGGCGTTAAGTGTCAATTCACTGTGGGGTGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 579029 102 + 636262 GCAATGAGACCTGGTATTTGATCATTTGTATGCTTGTTAGACAACTTTGGTTTCCAGAGGTGCTACTATAGGCGTTAAGTGTCAATTCACTGTGGGGTGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 54766 32 - 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-a -s mr.mrrefChr3 130676 97 + 181019 ACTCCTCTGTGCAACCTACTTGAGGTTCAATTTATCTTCATGTTCAAAGTATAATTCAAAAAAAGTGAGTTGTGAGGAGCTTGCATGCAAATGTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580855 97 + 636262 ACTCCTTTGTGCAACCTACTTGAGGTTCAATTTATCTTCATGTTCAAAGTATAATTCAACAAAAGCGAGTTGTGAGGAGCCTGCATGCAAATGTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 56418 97 - 647215 CCTCCTCTGTGCAACATACTTTAGGTTCAATTGATCTTCATGTTGAAGGTATAATTCAAAAAAAGTGAGTTGTGAGAAGCTTGCCCACAAATGTTAA - -a -s mr.mrrefChr3 130773 404 + 181019 AAAATACTTTGCCTTACCTAGATTAATCCTTCCCTAATGTCTTTGCTCTTGAAGAATGAGGGTCTGCGGTCCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCAACCCCTCTTTAGAGGCACATCTGTTGCAACGACTTTTCTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACTACCAGCTACAAGGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTGGTTAACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCTGCTGTGCTGTTTTATAAACATTGGTACAGGTCTGTCTATAACAAGTCAACTGAGTCCTTTGTACTCAGATCAGTTCTGGCTTGACATTGTGGTTGTGTTGATTTTCTGTATAGTAATGATACCTGCTCTTAAAATAACCTTCTGCAATCCCCATTCTAAGCAAGCAGGAATAGGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 580952 402 + 636262 AAAATACTTTGCCTTACATAGATTAATCCTTCCCTAATGTCTCTGCTCTTGAAGATTGAGGGTCTGCGGTTCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCAACCCCTCTTTAGAGGCACATCTGTTGCAGCGACTTTTCTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACTACCAGCTACAAGGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTAGTTGACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCTGCTGTGCTGTTTTATAAACATTGGTACAGGTCTATCTATAACAGGTCAACTCAGTCCTTTGTACTCAGATCAGTTCTGGCTTGACATTGTGGTTGTGTTGATTTTCTGTCTAGTAATGACACCTGCT--GAAAATAAACTTCTGCAATCCCCATTTTAAGCAAGCAGGAATGGGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 56518 403 - 647215 AAAATACTTTCCTTTACCTAGATTAATCCTTCCTTAATGCCTTTGCTCTTGTAGAAGGAGGGTCTGCCGTCCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCATCCCCTCTTTAGAGGCCCAACTGTTGCAACGACTATTTTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACAACGAGCTACAAAGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTGATTAACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCGGCTGTCCAGTTTTATGAATGTCGGTACAGGTCCGTCTGTAACAAGTCAACTGAGTCATT-GTACTCAGTTCAGCTTTGGCTTGAAATTGTGGCTCTATTGATTTTCTGTATAGCAATGATGCCTGCTCTTAAAATCACCTTCTGCAATCCCCATGCTAAGCAACCAGGAATAGGC - -a -s mr.mrrefChr3 131177 28 + 181019 AACCACCTGGGCCAATCTAGTCCTAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581354 28 + 636262 ACTCACCTGGGCCAGTCTAGTCCTGGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 56928 28 - 647215 AACCACCTGGGCCAATTTTGTCCTAAGG - -a -s mr.mrrefChr3 131205 51 + 181019 AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCATAGGAACTATTGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581383 51 + 636262 AAACAAACTACCCAACTGCTCTTATACCATGATCATAGGAACTATCATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 56956 51 - 647215 AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCACTGGAACTATTGTGTG - -a -s mr.mrrefChr3 131256 34 + 181019 TCGTATCTCTGCAGATCTAACTGTTCAGAACCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581439 32 + 636262 TCGCATCTCTGCAGATCTAACTGTT--GAACTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57007 34 - 647215 TCGTAGTTCTACAGATTTAACTGTTCAGTACCTG - -a -s mr.mrrefChr3 131290 130 + 181019 CATTACATTCCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCTCCAGGCTTGAATGATCGGGTGGTAGCGAAGGATTGTTTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581471 120 + 636262 CATTACATTCCCTTGCACTCTGTA----------ATCAACCACAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCTGAATAATCCTATATCGTATAGCTCCAGGCTTGAATCATTGGGTGGCAGCGAAGGATTGTTTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57044 130 - 647215 TATTACGTTTCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATTGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCGCCAGCCTTAAATGATCTGGTGGTGACTAAGGATTGTTTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 131420 157 + 181019 CTGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGGCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCTAGTGCCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGCGTAAGCTGGAAACATTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581637 157 + 636262 CCGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGCCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCCAGTGCCACTGAGGGGGTATCTTAACAGTATGCGTAAGCTGAAAACATTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 57174 155 - 647215 CTGAATTT-ACCACAACACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAATTGCCAATGCATGGCAGCCCC-TGCTAACGGTAGGGGGGAATGAATGCACAGGTACCTATTGTCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGTGGAAGCTGGAAACATTGG - -a -s mr.mrrefChr3 131577 51 + 181019 AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTATTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581794 51 + 636262 AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTGTTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57330 51 - 647215 AATCCCAATTCTAACACCACTGGATTAATTGGGTAAGTTTTAATGGGGAAG - -a -s mr.mrrefChr3 131628 58 + 181019 ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581845 58 + 636262 ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 57382 57 - 647215 GGCTTCAAGACGTAATTCTGACTTCAT-GAGAAGAGATTATAGTCAACCTTCCCACTT - -a -s mr.mrrefChr3 131686 104 + 181019 ACATAGAACTATTTCACACCCTCATGTACTTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACCCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 581903 104 + 636262 ACATGGAATTATTTTACACCCTCATGTACCTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACGCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 57443 104 - 647215 ACATAGAACTATTTCACAAAATAATATACTTTGGATTCATGGAGGTATACATGACCCTCTTTAATACTGAGGGCACAAAAGCTTGTGAAAATTAGTACCACCCC - -a -s mr.mrrefChr3 131790 231 + 181019 CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCAAGGCCGTGTATGCGCTCAGTAATACCTAACAGCTACCCTTATCCCAAATAAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582007 230 + 636262 CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTGACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCTAGGCCGTGTATGCGCTCCGCA-TACCTAACAGCTATCCTTATCCCCAATAAGGCAACCAGTCCCCATTGAGAGCACACCGGATACTCTGGAAAGCTCTCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 57548 228 - 647215 CTGAGAAGAGAGGTCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTACAGCCAGGGCACAACCAGGGTAGTGGAGGGAAATGCAAGGCCATGTATG---TCAGTAATGCCTAAAAGTTACCCTTAGCCGAAATGAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAAGCCCCCAAGAGACATCATGCAGGAAGATCAGCCCTTCTAAGGCCATATGAAAAT - -a -s mr.mrrefChr3 132021 679 + 181019 CAATCCTTTGTTGAATATGCACACTAACTGGCTCTTTGATTGTTGTCCCAGCATCTGGTATTATTACACTGAGGAGACTATAGTATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCCAGCTGTTCAGGTGGCCAAGTGTCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCAATGCCAGTTTACGGGTTAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATTAGCCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTGATTGATGGTGTTCCCACACTGGGCACCAGTGAACCCTATTGCATGTTTGCAAGCTGGGTTGAATTCCGTTTGTCACTGCACCCTGATAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCGTCAGGAGTGAACATATTATTCTGAATGACATTTCAGTAAATTTATATCTATTTTGTGAAGAATAAAGACATTTTTCTATCTGATAGTGTTCTGCATTGCACTCTCGACTTCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCAGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAAGAAGGAATATCAGTGTTAAGGTCTATTGAATTTTTCAGTTCAAGGTGGAACAAATTGGTTCCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGTAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAAATCTCTATAAAGAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582238 679 + 636262 CAATGCTTTGTTGAATATGTACACTAACTGGCTCTTTGATTGTTGTGCCAGTGTCTGGTATTAATACACTGAGGAGACTATAGTATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCTAGCTGTTCAGGTGGCCAAGTGCCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCAATGCCAGTTTACGGGTTAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATCAGCCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTCATTGATGGGGTTCCCGCACTGGGCACCAGTGAACCCTATTACATGTTTGCAAGCTGGGTTGAATTCCGTTTGTCGCTGCATCCTGATAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCGTCAGGAGTGAACATATTATTCTGAACGACATTTCAGTGAATTGATATTTATTTTGTGAAGAATAAAGGCATTTCTCTATCTGATAGTGTTCTGCATTGCATTCTCGACTCCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCGGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAGGATGGAATATCAGTGCTAAGGTCTATTGAATTTTTCAGTTCAAGGTGGAATAAATTGGTTCCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGTAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAAATCTCTATAAAATGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 57776 676 - 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647215 AGTAATGCTTGTATTA - -a -s mr.mrrefChr3 132725 205 + 181019 TTCACCTGTACAGTCCCTCAACCAATATCTGGCTAAAGGAGTAAACCTCCCCTCTTTTCAAGCAGCATACCATACTAATGTGATGGCTCTCTTGTCTCTTTAGCAACAAGGGCTGCAAGTGATCCCCTAGATCTTTCATGGCTATGTACAAGGGTTATTTTTACACCTACTTAGTCACCTTCATGGCAGCTTCTAACCTCTAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 582946 205 + 636262 TTCACCCGTACAGTCCCTCAACCAATATCTGGCTAAAGGAGTAAACCTCCCCTCTTTTCAAACAGCATACCGTACTAATGTGATGGCTCTCTTGCCTCTTTAGCAACAAGGGCTGCAAGTGACTCCCTAGATCTTTCATGGCTATGGACAAGGGTTATTTTTACCCCTACTTACTCACCTTCATGGCAGCTTCCAACCTCTAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 58478 195 - 647215 TTCACCTGTACAGCCCCTCACCCAATATCTGGT----------AACCCGCCCTCTTTTCAAGCAGCATACCATACTAATGTGATGGCTTTCTTGTCTCTTTATCAACAAGGGCTACCAGTGATCTCCTAGAGCTTTCGCGGCTATCTACAAGGGGCATTTTAACACCTACTTAGTCACCTTCATGACAGTTTCTAACCTGTACTT - -a -s mr.mrrefChr3 132930 60 + 181019 TTTGTACCTCTTTGCAAAGTTAGTCCCTACCAATTGACAACTCTTAGACTACAGAACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583152 60 + 636262 TTTGTACCTCTTTGCAAAGTTAGTCCCTACAAATTGACGACTCTTAGACTACAGAACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 58673 60 - 647215 TTTGTACCTCTTTGCAAGGTTAGTGCCAACCAATGGGCAACCCTTAGACCACAGAACCTT - -a -s mr.mrrefChr3 132990 33 + 181019 GTCCTTTACACCCATGTCACCTTTAGTTGAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583212 33 + 636262 GTCCTTTACACCCATGTCACCTGTAGTTGAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 58735 33 - 647215 GTCCTTTACACCCATGTAGCATTTAGTTGAATC - -a -s mr.mrrefChr3 133023 74 + 181019 TGGCAATGAAGTCACAAAGGGGGGGCAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGAGGGGTAGCAGCGACTCAGCCCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583246 74 + 636262 TGGCAATGAAGTCACCAAGGGGGGGCAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGAGGGGTAGCAGCGACTCCGCCCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 58768 69 - 647215 -----ATGAAGTCACAAAGGGTGGGTAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGGGGGGGGGTAGGGACTCAGCCCCTG - -a -s mr.mrrefChr3 133097 21 + 181019 AAATTAACTATTACAGCCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583320 21 + 636262 AAATTAACTGTTACAGCTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 58838 21 - 647215 AAACTAACTATTACTGCCTCC - -a -s mr.mrrefChr3 133118 70 + 181019 TTGGGCCTTGACTGTGTGACACAATGGCCCACCCTGTTAGCAGATCTTACCAACTACCCTCTTGATTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583341 70 + 636262 TTGGGCCTTGACTGTGTGACACAATGGCCCACTCTGTTAGCAGATCATACCAACTACCCTCTTGATTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 58860 61 - 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-a -s mr.mrrefChr3 133476 24 + 181019 GGTACTAATACGGTCAAAGTTCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583745 24 + 636262 GGTACCAATACGGTCAAAGTTCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 59185 6 - 647215 TATCCT------------------ - -a -s mr.mrrefChr3 133500 61 + 181019 TCAGGTGCAGTGACTACCCTTCCTGTCTCTCATCTTGTCTCATCCAAGTTTACTACATGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583772 61 + 636262 TCAGGTGCAGTGACTACCCTTCCTGTCTCTCATCTTGTCTCATCCAAGTTTACTACATGTC - -a -s mr.mrrefChr3 133561 5 + 181019 TGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583844 5 + 636262 TGCAC - -a -s mr.mrrefChr3 133566 461 + 181019 TTCCACATTAGAGATTTATGTATGGTGCCTCAATAAACATTTTCACATTGTTACTCCAAACTGCGCTGGTCAGACCACAGTATTCTAGCTCACCAATTCCAGACAATTCCACTAAAGACTTTATAAGCCACCACTAGACCATATCAGCTACTCACCTCCCTTTCAGAGAGACAGTTTGTAAAACCTGACTAGTGAACTGGTTAAGCCAATTCCAGTGTAGTGGTCCTCAAATGCCCAATTCTGATTATCGCTAATATAGGTATAAACTAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATTACCTATAAGTGCACCTACATGGAGTAAATGTAGTTGGAGGTGAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTTTCAATCATCAGTAAATTTTAGGAGATGTGTATTCACCAAACCCTATTACATATGCATGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATTTAGGTACAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 583857 460 + 636262 TTCCACATTTGAGATTTATGTATGGTGCCTCAATAAACATTTTCATGTTGTTACTCCAAACTGAGCTGGTCAGGCCACAGTATTCTAGCTCACCACTTCCAGACATTTCCATTAAAGACTTTATAAGCCACCACTAGACTATATCAGCTACTCACCCCCCTTTCAGAGAGACGGTTTGTAAAACCTGACTAGTGAACTAGTTAAGCCAATTC-AGTGTAGTGGGCCTCAAATACCCAATTCTGATTATCACTAATATAGATATAAACTAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATGACATATGAGTGCACCTATATGGAGCAAATGCAGTTAGAGGTGAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTATCAATCATCAGCAAATTGTGGGAGATGCGTACTCACAAAACCCTCTTACATATGCCTGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATTTAGGCACAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 59191 443 - 647215 -TCCACACCACAGATTTC---------CCTCAGTAAACATTTTCACATTGTTACTTCAAACTGCACTGGTCAGACCATAGCATTCTTGCTCACCAATTTCAGACAATTCCACTAAAGACTTTATCATCCACCACTAGACCATATCAGCTGCTCACCTCCCTTTCAGAGAGCCA-TGTGCAAATCCTGACTAGTGGACTGGTTAAGCCAATTCCAGTGGAGAGGTGCTCAAATGC-------TGGTTATTGCTAATATAGGTATAAACCAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATTACCCATAAGTGCACCTACATGGAGTAAATGTATTTGGAGGTAAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTTTCAATCATCAGTGAACTTCAGGGGAGGTGTATTCACCAACCACTATTACATATGCAGGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATCTAGGTGTGTA - -a -s mr.mrrefChr3 134027 14 + 181019 TTCACCACAAGCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 584317 14 + 636262 TTCACCACAAGCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 59754 14 - 647215 TTCACTACAAGAGT - -a -s mr.mrrefChr3 134041 360 + 181019 TGCTATTTGCATCAGTAACTAGATGACATATGAAATGAGGTAAAAGGAATATCCAATATGTGTTTTCACTGGTGGCAACTTCAAAGAAGCCAAGCATCCTGGTTTTGATGGCATGCTCTGATGTTTTCTGGGCTGGGGACTTGGATGCTCAGATGGTTCTTATGATGTACCCAGTAATTTGACAAAGCCTCCGAACCCTGTTAACTTTTATAATCCCTCACCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCCAATCAGATAAGAGAAAAAATATGGACAGCATTGTCTAACTAAGAAAGAAAAGAATACTGAAACAGTTTCATTGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 584431 360 + 636262 TGCTATATGCATCAGTAACTAGATGACATATGAAATAAGGTAAAAGGAATATCCAATATGTGTTTTCAGTGGTGGCAACTTCAAAGCAGCCAAGCGTCCTGGTTTTGATGGCATGCTCTGATGTTTTCTGGGCTGGGAACTTGGATGCTTGGATGGTTCTTATGGTGTACCTAGTAATTTGACAAAGCCTCCGAACCTTGATAACTTTTATAGTCCCTTGCCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCCAATCAGATGAGAGAAAAAATATTGACAGCATTGTCTAACTAAGAAAGAAAAGAACACTGAACCAGTTTCATTGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 59768 354 - 647215 TGCTGTTTGCATAAGTAACTAGATGACATATGAAATGAGATAAAAG-AATACCCAATGTGTGTTTTCACTGGTAGTAACTACAGAGAAGCCAGGCATCCCGGTCTTGATGGGGTGCTTCAATCTTTTTTGGGCTGGGGACTTGGATGCTCAGATGGTACTTATGATGTACTCAGTAATTTG-----GCTTTCAAACCCTGTTAAGTTTTATAATCCCACACCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCAAGTCAGATAAGAGAAAAAATATGGACAGCATTGTATAACTAAGAAAGAGAAGCATACTGAAACAGTGTCCTAGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA - -a -s mr.mrrefChr3 134401 354 + 181019 GCTGTGATAGGTATCTGTAAAAGAGCCCAGACATTTGTCTATCACCTCTGACAATATTTGAGGTCTGCCATATGCAATACCCGCCCACTGATATTAACTTCTGAATTGATTAAACAATGATTAACTAAAGTGATCGAGCTTACCATTGATTAGCTCAGGTATATCGGGTAGAGGATTGTTTGGTGCAAGTATCTACAGGCTGACCAATTTGGGGTAATTGTAATCAATGGGACAGGTGGCTCCATTAACTAATGCATGGTTCACACATCACATGTAAAAAAAAGAAGAATGCCATTTCACCTAGAGTACTACCTGAGTGATGGGTGATTGATTGTTACAAGTATTAATAGATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 584794 347 + 636262 GCTGTGATGGGTATCTGTAAAAGAGCCCAGACATTTGTCTATCACCTCTGACAATATTCGAGGTCTGCCATATGCAATACCCGCCCACTGATATTAACTTCTGAATTAATTAAAGAATCATTAACTAAAGTGATCGAGCCTAGCATTGATTAGCCCAGGTATATTGGGTAGAGGATTGTTTGGTGCAAGCATCTACAGGCTGACCAATTTGGGGTAATTGTAAACAATGGGAGAGGTGGCTCCGTTAAGTAATGTATGTTTCACACATCACATCTAAAAAAAAGAACAGT-------CACCTAAAGTACTACCTGAGTGATGGGTGATTGGTTGTTACAAGTATTAATAGATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 60122 351 - 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647215 gaacccaaggcagaaccttttcttattgaaaaaaatcaggggagtgcgatcatatcctcgaactttaagtgttactcttgagtaacagtttggaaagcaacactatattagcatcaaaagatcattacaatacaccatgggattagtagtgatggagctaccacacttagg - -a -s mr.mrrefChr3 136048 52 + 181019 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586448 52 + 636262 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat -s simRat_chr6.simRat.chr6 61906 52 - 647215 aaacgcttcatattatgatgagaaattttaacaaggactcattattcaatct - -a -s mr.mrrefChr3 136100 73 + 181019 gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586509 73 + 636262 gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt -s simRat_chr6.simRat.chr6 61958 73 - 647215 gaatcagtttattaccttccaaaaattaaaacttgacatttccccattaccttataccatgattaatacaagc - -a -s mr.mrrefChr3 136173 37 + 181019 tgtaactaatctaaagaattgaggttcggagctacca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586583 37 + 636262 tgtaactaatctaaagaattgaggttcggagctacca -s simRat_chr6.simRat.chr6 62031 37 - 647215 tgttactggtctaatgaattgaggttctcatccccca - -a -s mr.mrrefChr3 136210 44 + 181019 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586628 44 + 636262 aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta -s simRat_chr6.simRat.chr6 62068 44 - 647215 aaaagtgttaagggctgagtagattttctgagaaggacctttta - -a -s mr.mrrefChr3 136254 24 + 181019 caatatgtacttagggaattggtt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586674 24 + 636262 caatatgtacttagggaattggtt -s simRat_chr6.simRat.chr6 62112 24 - 647215 agatattggaacgggggaatggtt - -a -s mr.mrrefChr3 136278 59 + 181019 atacaaaaaaaccacaaggatagagtggccataacatggacatatgtcttgcagaactc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586869 59 + 636262 atacaaaaaaaccacaaggatagagtggccataacatggacatatgtcttgcagaactc -s simRat_chr6.simRat.chr6 62136 59 - 647215 atacaataccaccacaaggatagtgtgggcataacatgcaaatatgtcttgcaaagccc - -a -s mr.mrrefChr3 136337 63 + 181019 aagataaatgatcaacaaacatgagtgggatgtaaacaagggaaagagcacacttacagtaaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 586928 63 + 636262 aagataaatgatcaacaaacatgagtgggatgtaaacaagggaaagagcacacttacagtaaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 62215 63 - 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-a -s mr.mrrefChr3 138438 57 + 181019 AAGGTCTTGGGTAGTCCTCCCTAGGACATATAAGGGGAGATAACACTTTAGAACACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589642 56 + 636262 TAGGTCTTGGGTAGTCCCCCCTAGGACATCTAAGGGG-GATAACAGTTTAGCACACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 64251 57 - 647215 AAGGTCTTGGGTAGTCCTCCCTAGGACATACAAGGAGAGATAGCACTTTAGACCACT - -a -s mr.mrrefChr3 138495 138 + 181019 TTCCCAACTAATAGATGGAGTCTTTATCTGTTATTATAGTTCCACACTAAGCACTCAATTTATAGTGGTAATATGTTATGTGGAGACCACATCACGTCTAAATTGTCTGCGAAACCTCAACCCCTAACCTCACTACAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589700 129 + 636262 TTCCTGACTAATAGATGGAGTCTTTACCTATTATTATAGTTCCACACTAAGCACTCTATTTATAGTGGTAATATGTTATGTGGGGACCACATCCTG--------ATCGGCGAAACCTCAACCTCTAACCTCACTACA- -s simRat_chr6.simRat.chr6 64308 138 - 647215 CTCTCAACTAATAAGTGGAGTCTTTATCTGTTCTTATATCTTCATACTAAGCACTCAATGTATACTGGTAGTATGTTATGTGGAGACCACATCACGTCTAAATTGTCTGCGAAACCTCAATCCCTAACCTCACTACAG - -a -s mr.mrrefChr3 138633 89 + 181019 GAGTTCACAGGTTTTTTTCTGCTTTTCACTCATAAGCATCTCTAATGGCATTGTGATGAAAGGTGAATCTATTGTGACAACTGTTAGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 589829 86 + 636262 GAGTTCACAGGTTTTTTTCTGCTTTTCACTCATAAGCATCTCAAATGGCATTGTGATGAAAGGTAAATCTATTGTGACAATTGTTA--- -s simRat_chr6.simRat.chr6 64447 85 - 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647215 CAGAGACATGGATGTGCATGAGTCTATGATTGATGTTTGCACGAGTATTGTCTACTTAGTAACAATAGATTGGGCAAGTCTTGCCTTATGAGTTACAGTAAAAATTATTCCCTAAGGTAC - -a -s mr.mrrefChr3 140140 49 + 181019 TCTGCAGAAGTCTCAGTCCTCAATATACACCACCAACTTGCCTCTACCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591418 49 + 636262 TCTGCAGAAGTCTCAGTCCTCAATATACACCACCAACTTGCCTCTACCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 65983 49 - 647215 TGTACTGAAGTCTCAGACTTCAACATACACCTCGAATATGCATCTACCA - -a -s mr.mrrefChr3 140189 53 + 181019 AACAGGTAGGATATTTATGCCTTTCCTGCACGGATGAAAATGAATCTTCTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591473 53 + 636262 AACAGGTAGGATATTTATGCCTTTCCTGCACGGATGAAAATGAATCTTCTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 66032 53 - 647215 AACAGGTGGGATGTATATTCATTTCCTGGATGGATGAGAACAAATTCTCTAAA - -a -s mr.mrrefChr3 140242 71 + 181019 GATCATACTGGGGTGCCCCAGATATTCTATTATTCAGCAATTCCCTAGCTCCCATACAACATCAAAGGTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591526 71 + 636262 GATCATACTGGGGTGCCCCAGATATTCTATTATTCAGCAATTCCCTAGCTCCCATACAACATCAAAGGTAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 66086 71 - 647215 GATCAGACGGGGGTGCCCTAGTGATTCTATTATTCAGCAATCCTCTAACTCCCATACAACACCAAAGGTTG - -a -s mr.mrrefChr3 140313 107 + 181019 TCTTGGCTTGGTGTGATCCATCATCTTAATCCCCCAGTCTGATAAACAGGGTGGTTCAATAAACAAGGGCGCAATCCAATGTCCCCCAGACTGATAAGCAACTAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591597 107 + 636262 TCTTGGCTTGGTGTGATCCATCATCTTAATCCCCCAGTCTGATAAACAGGGTGGTTCAATAAACAAGGGCGCAATCCAATGTCCCCCAGACTGATAAGCAACTAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 66185 107 - 647215 TCCTTGTTTGGTGGAATCCATCATCTTAATCCTCCAGTCTGATAAACGGGGGGGTTCAATAAACAAGAGTGCAATCCAATGTCCCCCACACCAATAACCAACTGAAA - -a -s mr.mrrefChr3 140420 18 + 181019 TCCAGTTGTAATACTCTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591704 18 + 636262 TCCAGTTGTAATACTCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 66296 18 - 647215 TCCAGCTGTAATACTCTA - -a -s mr.mrrefChr3 140438 11 + 181019 TGTATCCGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591722 11 + 636262 TGTATCCGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 66319 11 - 647215 TGTATCCGTCA - -a -s mr.mrrefChr3 140449 26 + 181019 CTGATAGCCAATTCAAGGGGTTTCAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591739 26 + 636262 CTGATAGCCAATTCAAGGGGTTTCAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 66330 26 - 647215 CTAATAGCCAATTCAAGGAGTGTCAG - -a -s mr.mrrefChr3 140475 81 + 181019 TCATACTTTATATATGAGAACAAGATTGAAGGGACACAGAGTGCTATTTTGCATCACCCAATATCAGAAATCCATATCTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591765 81 + 636262 TCATACTTTATATATGAGAACAAGATTGAAGGGACACAGAGTGCTATTTTGCATCATCCAGTATCCGAAGTCCATATCTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 66359 81 - 647215 TCATACTTTATATATGCAAACAGGATTGATGTGACACAGAGTGCTATTTTGCATCACCCAATATCAGAAATCCATATCACT - -a -s mr.mrrefChr3 140556 201 + 181019 CTATGGTGGGAGACATTAGATAGGATGACATTCACGCTAGACAAACCATCCTCACTGTTGTCAAAAGTACAATAGTGCTCTGCATTACCAGTACAAGACGTCTGTTTGATTTCTTCTTCTGCCATCTAGGGGACATCTTCTGTTTAGCTCTTCCTATACATATTTTTAGTTGCAATCCATGGCATTGGATCGGGACTCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 591846 201 + 636262 CTATGGTGGGAGACATTAGGTAGGATGACATTCACGCTAGACAAACCATCCTCACTGTTGTCAAAAGTACAATAGTGCTCTGCATTAGCAGTACCAAAAGTCTGTTTGATTTCTGCTTCTGCCATCCAGGGGACATCTTCTGTTTAGCCCTCCCTATACATATTTTTAGTTGCAATCCATGGCATTGGATCGGGACTCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 66442 155 - 647215 CTATGGTGGGAGACGTTAGATAGGATGACATTC----------------------------------------------CTGCATTACCAGTACAAGACGTCCATTTGATTTCTTCTTCTTTCATCTAGGGGGCATAGACTGTTTATCTATTCCTATACATATTTCTAGTTGCAATACATGGCATTGGATAGGGACTCTGT - -a -s mr.mrrefChr3 140757 16 + 181019 GGCTGTCCTTATTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592048 16 + 636262 GGCTGTCCTTATTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 66597 16 - 647215 GGCTGTCCATATTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 140773 250 + 181019 AGCTCCAGTACATGGCATTCGATAGGGTGCTACATTTATTTATATCCCCTAGTGAGGGCTAAAACTAGTCACATTACCTGGTACATTACACAATTAAACCAGATTTAGGGTCTGCTCTGATGGTTTACATAGTCTGATTTATCCCTATGGTGATGCTGGCTCAATTACTCCAACCTTTTGGTTTACAGTAGTTGAGGATAAGTGATAATGGACTTATGTTATTGTCTTACAATTTCTCTATTTATCCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592066 250 + 636262 AGCTCCAGTACATGCCATTCTATAGGGTGCTACATTTATTTATATCCCCCAGTGAGGGCTAACACTAGTCACATTACCTGGTACATGACACAATTAGACCAGATATAGGGTCTGCTCTGATGGTTTACATGGTCTGATTTATCCCTATGGTGATGCTGGCTTAATTAGTCCAACCTTTTGGTTACCAGTAGTTGAGGATAAGTGATAATGGACTTATGTTATTGTCTTACAATTTCTCTATTTATCCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 66613 240 - 647215 AGCTGCAATACATAGCATTCGATTGGGTGCTACATTTATTTATATGCACTAGTGAAGGCTAAAACTAGTCTCATTACCTGGTATGTTACACAATCAAATCA-ATTTAGGGTCTGCTCCGATGGTTTACATAGTCTGATTTAACCCTATGGTGGTGCTCATTCATCTACTCCAACCTTTTGGTTTACAGTAATTGAGGATAAGTGATAATGGACTTGTGTTATTGTCTTACAATTTCTCTAT--------- - -a -s mr.mrrefChr3 141023 53 + 181019 TCTAATTTATGTAGAGGTGGATAACCCAACCTATGAACATCCTACGCCCAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592319 53 + 636262 TCTAATTTATGTAGAGGTGGATAACCTAACCTATGAACATCCAACGCCCAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 66853 27 - 647215 -------------------------CCAACCCATGAACATCCTACGCCCAAG- - -a -s mr.mrrefChr3 141076 61 + 181019 GAAGAGGCAAGATCAGTATGTATGCCATCTCCATGACTAGTCAGACAGTCTTGACACACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592372 60 + 636262 AAAGAGGCAAGATCAGCATGTATGCCATCTCCATG-CTAGTCAGACAGTCTTGACACACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 67225 59 - 647215 gaagAG--AAGCTCAGTATGTATGACATCTCCATGACTTGTCAAACAGTCTTGACACACAA - -a -s mr.mrrefChr3 141137 113 + 181019 CTCGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAATATCATGACAAAGTTACCTTGAAGAAAAGTTACCTTCATAGAGATTCAGCAAAGCCTGCAACCATATTTAGAATGAGCTAAATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592432 113 + 636262 CTTGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAGTATCATGACAGAGTTACCTTGAAGAAAGGTTACCCCCATAGAGATTCAGCAAAACCTGCAACCATATTTAGAATGAGCTAAATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 67298 113 - 647215 CTCGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAATATCATGACAAAGTTACCTTGAAGAAAAGTTACCTTTATAGAGATATGGCAAAGCCTCCAACAATATTAAAGCTTGACTGGAGC - -a -s mr.mrrefChr3 141250 4 + 181019 TCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592551 4 + 636262 TCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67411 4 - 647215 ACAT - -a -s mr.mrrefChr3 141254 98 + 181019 GAGCTAAGTCTTGCTATCTCAACACTAACCCCAGGCTGGCAAGGCAGATATCCATGATGAATACATATAAGAGGTGCACCTGAAGCTAAGTAGAACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592555 98 + 636262 GAGCTAAGTCTTGCTATCTCAACACTAACCCCAGGCTGGCAAGGCAGATATCCATGATGAATACATACAAGAGGTGCACCTGAGGCTAAGTAGAACTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67419 97 - 647215 GAGCTAAGGCTTGCTATCTCAACGCTAACCCCAGGCTGGCAAAGCATACATCCATGATGAA-ACATATAAGAGGTGCACCTGAAGTTAAGTAGAACTG - -a -s mr.mrrefChr3 141352 64 + 181019 TGGCACACTTTGGGTAGCCATGACTTGCACCTGAATGAGGTTACTCAGAGGCCATTAGTGGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592666 64 + 636262 TGGCACACTTTGGGTAGCCATGACTTGCACCTGAATGAGGTTACTCAGAGGCCATTAGTGGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 67516 64 - 647215 TTGCACACTTTGGGTGGCCATGACTATCATCTCAATGAGGTTATTCAGACATCATTGGGGGATG - -a -s mr.mrrefChr3 141416 31 + 181019 CAGTCAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592730 31 + 636262 CAGTCAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67583 31 - 647215 CAGTTAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT - -a -s mr.mrrefChr3 141447 11 + 181019 CAGGTTGTCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592761 11 + 636262 CAGGTTGTCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67648 11 - 647215 CAGGTTGTCTT - -a -s mr.mrrefChr3 141458 46 + 181019 TTGAGTACCATTAAGTATTGAGTATGGGTCTTGTATTTTAGATCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592772 46 + 636262 TTGAGTACCATTAAGTATTGAGTATGGGTCTTGTATTTTAGATCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 67707 46 - 647215 TTGAGTACCATTGAGTATTGAGTATGTGTCTTGTATTTTGGATTTG - -a -s mr.mrrefChr3 141504 50 + 181019 ATAATACTCCCATAAAATATTATGTTATACACAGTCACTTGTGAATTGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592836 50 + 636262 ATAATACTCCCATAAAAGAACATATTATACACAGTCACTTGTGAATTGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 67753 49 - 647215 ATAATACTCCCATAAAATATTATGTTATACACAGTC-CTTGTGAATTGAG - -a -s mr.mrrefChr3 141554 297 + 181019 GATATATGGCCCTCCTCATACTGAAAAATTGAGACTGCACACCTTGCCCCTTTTTAGCAATAGTGACACCCAAGGGTGACTAAGATCATTGGTATGTTGTCCCTGCAAAAAGCTTATGCCTGCGAATCAGCAATCCACATCATAATAGTTTCTTCACTAGGAGATGGTAAGCACAATGGTCCCAGGCAAATGCTAATTGAGGTAGGGTGCAGGTAGACATTTTGATCTCTAATTGAAGGGAGAAGCTCGTTGGAGAATCGAAAAAGAACTGAACCAGTGGACACCTCATAATTTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 592958 293 + 636262 GAAATATGGCCCTCCTCATACTGGAAAGTTGAGACTGCATACCTTGCCCCTTTTCAACAATAGTGACACTCGAAGGTGACTAAGACCATTGGTATGTTGTCCCTGCAAAAAACTTATGCCTGCAAATCAGCAATCCACATTATAATGGTTTCTTCACTAGGAGATGGTATGCACAATGGTCCCAGGTAAATACTAACTAAGGTAGGGTGCAGGTAGACATTTTGATCTCTGAT----GGGAGAAGCTTGTTGGAGAATCAAAAAAGAACTGAACCATTGGACACCTCATAATTTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 67802 292 - 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-a -s mr.mrrefChr3 142263 180 + 181019 CTCTATTTAGAAGTGTGACCTAATTACACCCTACTGATGTCTTAGCTATCAAATATGCCCCTTCTCAAACATGTCACTCAGACTACCTGTTTAATTGGATATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGACTAGGTTAATGTCTCCATTACTGGAGTACATGTTACATGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593663 180 + 636262 CTCTATTTAGAAGTGTGACATTATTACACCCTACTTATGTCTTAGCTACCAAACATTCCCCTTCTCAAACATGTCACACAGACTATCTGTTTAGTAGAAAATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGGCAAGGTTAATGTCTCCATTACTGAAATTCATATTACATGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 68685 180 - 647215 CTCTATTTAGAAGTGTGACCTAATTAGACCCCACTGATGTCTTACCTATCAAATATGCCCCTTATCAAATATGTCACTTAGACTACCTGTTTAATTGGATATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGACTAGGTTAATGTCTCCATTACTGGAGTACATGTTACATGATT - -a -s mr.mrrefChr3 142443 165 + 181019 TACCTTGCATATCCTTGTAACAGGAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAAAAATGCATATTCTACAGAACCATCCATAACATGTTCTCAATGAGATGAATATGATGCTAAATCTAGAAGTGCCTACCATAGCATCATAGATCATTTTAGAGCAACACATAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 593843 160 + 636262 TAGATTGCATATCCTTGTAACAGAAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAAAAATGCATATTCTCCAGAGCCATCCGTATCCTGTTCTCAATAAGATGAA-ATCATGCTTAA--GGGAAGTGCTTACCATAGCATCATAGATCATTTTAGAGCAACA--TAGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 68873 165 - 647215 TACCTTGCAGATCATCTGAACAGGAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAACAATACATAGTCTACTGAACCATCCAGAACATGTTCTCAGTGAGATGAGTAGGAGGCAAAATCTAGAAGTCCCTACTGTCGCATCATAGATCGTTTTACAGCAACACATAGAAG - -a -s mr.mrrefChr3 142608 114 + 181019 TGATGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTATGGCAAATAACGCCTCTTTAGCAGTAAGTTAACTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594004 114 + 636262 TGATGAACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTCTGGCAAATAACGCTTCTTTGGCAGTAAGTTAATTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 69038 110 - 647215 CAAAGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGGTCCTCACCTATGGCAAA----ACCTTGTTACCTTTTAATGAACTGATGGATTTCAACTAGGCCTATT - -a -s mr.mrrefChr3 142722 86 + 181019 GCTTTTTAATGGACTGATGGGCTTCGCCTATGCCTATTTGATGGCATATCTAACATGTACATAGGGTTTTATGTTATCCACTTTAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594118 86 + 636262 GCTTTTTAATGGACTGATGGGCTTCGCTTATGCCTGTTTAATGGCATATCTAATATGTACATCGGGTTTTATGTTATCCACTTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 69175 84 - 647215 GTTTGATTATCCACTTTTGGGCTTCACCTATGCCTATTTGATAGCATATCTCACATGTACATAGGGTTTGA--TTATCCACTTTAG - -a -s mr.mrrefChr3 142808 128 + 181019 AATTTCTTTTTATTGATGAATTACTGTTTATGCCAAAACTATAAGACTGTTTTCCATATTTGGAGTGAGTCCTGGGTGAGTTTCCCCAGCTGTGTTGCTATTATTTCTGCCCCTGTATGGGATACCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594204 128 + 636262 AATTTCTTTTTATTGATGAATTCCTGTTTATGCCATAACTATAAGACTGTTTTCCATATTTGGAGTGAGTCCTGGGTGATTTTCCCCGGTTGTGTTGCTATTATTTCTGCCCCTGTATGGGACATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 69272 124 - 647215 AACTTCTTTTTATTCATGAGTTACTGTTTATGCCAAAACTTTAAGACTATTTTCCATGTTTGGGGTGAGTGCTGGGCAAGTTTCCCCAGCTGTCTTGCTATTATTTTT----CTGTATGGAATACGCA - -a -s mr.mrrefChr3 142936 40 + 181019 TGGTGGGCCATGTACCATGGCACTTAGAAAATCAGTTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594332 40 + 636262 TGATGGGCCATGTACCATGGCACCTAGAAAATCTGTTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 69398 40 - 647215 TGGTGAGCCATGTACCATGGCACTTCGAAAATCAGTTGTG - -a -s mr.mrrefChr3 142976 135 + 181019 GGCTATTTACTTTGGTCAATGGTACTCCTGAATAGAAAAAAAGTCTTGAGACTCCCCAAGTGGTGAGTTGTCCCCATAAAATGGCAAACTGGACCCTTTGATTTGTTTTCTGTACGTAAAGGACTGCAGCTGGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594372 135 + 636262 GGCTATTTACTTTAGTCAATGGTACTCCTGAATAGAAAAAAAGTCTTGAGACTCCCCAAGTGGTGAGTTGTCCCCATAAAATGGCAAACTGGACCCTTTGATTTGTTTTCTGTACGTAAAGGACTGCAGCTGGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 69583 135 - 647215 GGCTATTTACTTTGGTCAATGCCACTCCTGAATAGAAGAAGACTATAGAGACTCCCAAATTGGTGAGTTGTCTCCATAAAATGTCAAACTGGACCCTTTAGTCTGTTTTTTGTACATAAAATATTGCAGCAGGAG - -a -s mr.mrrefChr3 143111 24 + 181019 TCCATTGAGTTGGCTATTAGTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594509 24 + 636262 TCCATTGAGTTGGCTATTAGTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 69718 24 - 647215 TCCGTTGAGTCGGCTATTAGCCCA - -a -s mr.mrrefChr3 143135 31 + 181019 ATGGGAGTGCACAAACTGTGGCACTAAGACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594533 31 + 636262 ATGGGAGTGCACAAACTGTGGCACTAAGACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 69748 31 - 647215 ATGAGAGTGCACAAACTGCAGGAGTAAGACG - -a -s mr.mrrefChr3 143166 36 + 181019 CCAGGAGATACATGGAATCCCTGGCCCCTCTGTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594576 36 + 636262 CCAGGAGATACATGGAATCCCTGGCCCCTCTGTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 69779 36 - 647215 CCTGGAGCTACATGGAATCACTAGCCCCTTCGTAAC - -a -s mr.mrrefChr3 143202 134 + 181019 TGGATGCTATACCACGTGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCCCAGATATAGTGAACTAGTCATTCGTAAAGCCAAACTGCAGGCCCTGTTTATGTGCTTCTTGTGCATCTAGGCTTACGAGAGAGGTTTGTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594621 132 + 636262 TGGATGCTATACCACGTGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCCCAGATATAGTGAACTAGTCATC--TAAAACCAAACTGCAGGCCCTGTTTATGTGCTTCTTGTGCATCTGGGGTTACAAGAGAGGTTTGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 69815 122 - 647215 TGGGTGCCTTACCACATGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCACAGGTATAGTGAACTAGTCATTCGTAAAGCCAAAGTACAGGTCCTGTTTATGAGCTTCCTGTGCACCTAGGCTTACGAG------------ - -a -s mr.mrrefChr3 143336 9 + 181019 GCTCACTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594757 9 + 636262 GCTCACTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 69937 3 - 647215 ------TCT - -a -s mr.mrrefChr3 143345 224 + 181019 CTTAGTCTCAGCTTGGGGTGGCATGATACATCCTATACCATATGTCTCCACTTGCCAGATTGTGTAATGGGTACTAAGCCAAGCAAGTCAGACAAGTTATGAGTCAGCAACCAGTTGCCTAAGTTACTAGGTCTAATCTGGTAAAGTATAGTTCATTTGAGGTATTTCAAATGACTTTGAGCTATGCAGACTGTACCTGAATGCAATGCAACGTGGTGCATTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594767 223 + 636262 CTTAGTCTCAGCTTGAGGTGCCATGATACATCCTATACCATATGTCTCCACTCGCCAGATTGTGTAATGGGTACTTAGCCAAGCAAGTCAGACAAGTTATGAGTCAGCAACGAATTGCCTAAGCTACTAGGTCTAATTTGGTAAAGTATAGTACATTTGAGGGATTTCAAATGACTTTGAGCTATGAATAC-ATACCTGAATGCAATGCAACGAGGCGCACTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 69940 220 - 647215 CTTAATCTCA-CTTGGGGTGGCA--ATGCATTCTATACCACATGTCTCCACTTGTCAGAGTGTGTAATGGGTACTAAGCCAAGCACGTCAGACAGGTTATGAGTCAGCAACCAGTTCCATAAGTTACTAGGTCTAA-CTGGTAAAATATATTTAATTTTAGGTACTTCAAATGACTTTGAGCTATGCAGACTGTACCTGAATGCAATGCAACATGGTGCATTGC - -a -s mr.mrrefChr3 143569 18 + 181019 AAAAGCTCAGGTTTAGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 594990 18 + 636262 AAAAGCTCAGGTTAAGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 70162 18 - 647215 AAAAGCTCAGGTTTAGCC - -a -s mr.mrrefChr3 143587 105 + 181019 AAGTTCCCCCACAGTAACAAGCCTCGAATGCATATAAAAGCCCCTCTATCTTTAAATGAATAGCCAAGGAGTACAACACACCATGAAACACACATATCAATCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595009 102 + 636262 AAGTTCCCCCACAG---CAAGCCTCGAATGCATATGAAAGTCCCTCTATCTTTAAATGAATAGCCATGGAGTATGACGCACCATGAAACACACATATCAATCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 70180 93 - 647215 AAGTTCGCCCAGAGTAACAAGAC-----------TAAAAGCCCCTCTTTC-TTAAATGAATAGCTGAGGAGTACAACACACTGTAAAACACACATATCTACCAGT - -a -s mr.mrrefChr3 143692 22 + 181019 GTGACATTTCCTTAGGCAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595112 22 + 636262 GTGACATTTCCTTAGGCAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 70273 22 - 647215 ATGACATTCCCTTAGGCAAAAA - -a -s mr.mrrefChr3 143714 210 + 181019 GGGCTCAGAGGTAATGCTCAGGAATAGACAGTGTCACTGGGGTCAATTCAATTACTGCTAAGCTATAAGAACAATTGTGGATATGCTTGAAAACTAACAGATTCATTCAACCAATGCATGCATTCCATCTCTCAGATCACAAACAACAAATTGCTAGGAATCCTTACATAAGTAGCAGTTCCTAGGAGTTGGCACACCAGACCATGCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 595135 210 + 636262 GGGCTCAGAGGTAATGCTCAGGAATAGACAGTGTCACTGGGGTCAATTCAATTACTGCTGAGCTATAAGAACAATTGAGGATATGCTTAAAAGTGGACAGATTCATTCAACCAATGCATGCATTCCATCTCTCAGATCACAAACAACAAATTGCTAGGAATCCTTACATAAGTAGCAGTTCCTAGGAGTTGGCACACCAGACCATGCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 70295 172 - 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647215 --------------------------CCCAACATGACCATTGCAGCATGGCAACCTTGTAACCAACACAGTTTACCTTGATTTTTAGCTTCAATACACACTCTGCATGGTCTTATGATTCTAAAGCATCATAGTTACTGACCTCTTGATCCGAACTGAACCTGGTTTCTTGATCACTATTGTATAGTTAATAGTCTTATAGAATAGAGAGTTCAATGGTTGAGGTAATGAAATATTGCATAATGGTAACAAAGACATGAGACTATTTATATCCTATATTACATAA-AATTATTGGTCCAAGTTACTGGCATAGGAAATTTTGCATGTCACCTTAGCTG - -a -s mr.mrrefChr3 144696 292 + 181019 ATGAGAGCAACACTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGAGTATAATAATTGCTACATATGTAATCCTAGCTTTATGAAGTCCACAATTTGAACAATATATAGTGGAAAGAGAAAGAATTGCATACATGCAATACATGACACAAATGATAATCTGACAGTTATATTATCCCTATCTGTAGCAATTACATGGTGCATGATGGCCCCCTCACTTGGTTAGGCAGGACAAAGACTGAATGCCTTTAAGGAGGTTTATCCTCAATTTCTGTTGCCAATGACCAAACAGGAAAACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596271 292 + 636262 ATGAGAGCAACATTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGAGTATAATAATTGCTACATATGTAAACCTAGCTTTATGAAATCCACAATTTGAACAATATATAGTGGAAAGAGAAAGAATTGCATACATGCAATACATGTCACAAGTGATATTCTGAAAGTTATATTATCCATATTTGTAGCAATTACATGATGCATGATGGCCCCCCCACTTGGTTGGGCAGGACAAAGACTGAATGCCTTTAAGGAGGTTTATCCTCAATTTCTGTTGCCAATGAACAAACAGGAAAACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 71202 279 - 647215 ATGAGAGCAACACTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGTGTATAATAATTGCTACATATGTAATCCTAGCTTTATGAAGTCTACAATTCGAACAATATATGGTGGAAAGCAAACGAATTGCATAGATGCAATACATGACACCAATGATAATCTGACAGTTATATTCTCCCTATCTGTAGCAATTACGTGGCGGAAGATGGTCCCCTCACTTGGTTAGGCAGGGCAAAGACTGAATGCCTTTAAGAAGGTTTATGCTC-------------AACAACCAAACAAAAAAACC - -a -s mr.mrrefChr3 144988 40 + 181019 ATACATAATAATTGCAGAATTCCATTATTATGAATCAGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596574 40 + 636262 ATACATAATAATTGCAGAATTTCATTATTATGAATAAGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 71481 40 - 647215 ATACATAATAATTGCAGAATTCCATTATTATGAATCAGTT - -a -s mr.mrrefChr3 145028 28 + 181019 CATTCTGAGGACAATCTAGCCAATCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 596614 28 + 636262 CATTCTGAGGACAATCTAGCCAATCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 71522 28 - 647215 CATTTTGAGGACAATCTAGCCAAGCTGT - -a -s mr.mrrefChr3 145056 85 + 181019 ATATACACATTTAATGCAGATACGGCAGCATCCCTGGCCACCCAATACCAAATTGAAAAGCTCAGGATGGATCCTACTACTCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597072 79 + 636262 ATATACACATTTAATGCAGATACAGCGGCATCCCTGGCCACCCAATACCAAATTGA------CAGGATGGATCCTACTACTCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 71550 73 - 647215 ATATATAC------------TAAGGCAGCATCCCTGGCCACCCAATATCAAATTAAAAAGCTCAGAATGGATCCTACTACTCCTC - -a -s mr.mrrefChr3 145141 75 + 181019 TCTGTAAAAGAGTGCCTCTTAATATGCATTATCACTTAGCTGGACTGTCTGAGCCTGAGGTCTCATTCTCCACGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597154 75 + 636262 TCTGTAAAAGAGTGCCTCTTAACATGCATTATCACTTAGCTGGACTGTTTGAGTCTGAGGTCTCATTCTCCACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 71623 75 - 647215 TCTGTAAAGGGGTGCCTCCTAATATGCATTATCACTCAGCTGGACTGTCTGAGCCTAAGGTCTCACTCCTGAGGT - -a -s mr.mrrefChr3 145216 30 + 181019 CTCACTCTCTCCATACAATTATACTATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597230 30 + 636262 CTGGTATTGTCTTTACAATTACACTATCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 71698 30 - 647215 CTCACTCTCCCCATGCAATTATACTATCAA - -a -s mr.mrrefChr3 145246 149 + 181019 TGTAGTTTAATGAGGATAAGAAAATGGTGCCATATTTACATTTATGAATTAGGAAATGTAGTTGCTACTTTGAACAGACATTGACCAACATGCCTGAAAGAGAACTGAATCTTAATATCTTTAATGCAAGCCTCACTATCTATCATGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 597261 149 + 636262 TGTAGTTTAATGGGGATAAGAAAATGGTGCCAGATTTACATTTATGAATTAGGAAATATAGTTGCTACTTTGAGCAGACATTGACCAACATGCCTGAAAGAGGACTGAATCTTAATATCTTAAATGCAAGCCTCACTATCTATCATGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 71728 138 - 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647215 ttccaatgggttagtgcatgatgggcttcattgaagatga - -a -s mr.mrrefChr3 147622 26 + 181019 agctgcattgagatttaagcttacac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599745 26 + 636262 agctgcattgagatttaagcttacac -s simRat_chr6.simRat.chr6 74148 26 - 647215 acctgcattgagatttaggcttacac - -a -s mr.mrrefChr3 147648 86 + 181019 tacatcttgtatctaatTTTCACTAGTAATAGCTTAATATCTTAAAGATGGCAATAAATGTACATTAGGTCTAGTGTATAGTTTCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599771 85 + 636262 tacatcttgtatctaatTTTCACTAGTAATAGCTTAATAACTCAAAAATGG-AATAAATGTACATTAGGTCTAGCATATAGTTTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 74176 86 - 647215 tacatctcgaatctgatTTTCACTAGTAATAACTTCATATCTTAAAGATGGCAATAAATGTACATTAGGTCTAATGTATAGTTTCG - -a -s mr.mrrefChr3 147734 76 + 181019 TGTGTCTTTCCCATTATCAGAGATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTAACAGTGAATCACATCTCACCTGCTTCCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 599856 75 + 636262 TGTGTCTTTCCCATTATCAAAGATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTAACAGTG-ATCACATCTCACCTGCTTCCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 74273 76 - 647215 TGTGTATTTCCCATTATCAGAAATCATCCCAATGTGGCTAAGAATTGACAGTGAATCATATCTCACCTGCTTTTCC - 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647215 ATGAAAAAAGTTCAAGAGCGCCCC - -a -s mr.mrrefChr3 152519 7 + 181019 TTAATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604775 7 + 636262 TTAATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 79066 7 - 647215 TTGATGC - -a -s mr.mrrefChr3 152526 91 + 181019 TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604783 91 + 636262 TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79073 91 - 647215 TTTTTGGCTCATAGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCTGGCTTTTGGACTGGGGGACGTGTACATAAAATATTGCAGCTGGCACCATTTGA - -a -s mr.mrrefChr3 152617 20 + 181019 GGACATTAGATTACACCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604874 20 + 636262 GGACATTAGATTACACCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 79213 20 - 647215 GGATATTAGATTACACCCTC - -a -s mr.mrrefChr3 152637 8 + 181019 TATACCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604894 8 + 636262 TATACCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 79239 8 - 647215 TGTACCCC - -a -s mr.mrrefChr3 152645 157 + 181019 CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAACAAAGGACTTGGTACTCTCCCGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 604915 157 + 636262 CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAATAAAGGACTTGGTATTCTCCCGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 79247 157 - 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647215 CCAATTGCAGATAACCTCCAGTTCCCTGTCCGTTTATGATTTCAGGTCAAGAAATTTTTGCACCAAGGAAGGAGATAATCTTTGCTTGTTGCAGATCATTTCCATAGCAATTCAGTATTTTTTAACGTAGGAGGATTCTACAAAGCCTAGCAAGCATTCTATTCTTGTTAGATGCCCTTGATTGGCCGATGTACGTCACCTATTGAAACATTTACCCTTTAATCAGTACCACGTCTGTAGTGAACAAAGG - -a -s mr.mrrefChr3 153185 56 + 181019 TTAGCTGGCCTTTGTTTTTACCTCAAGCTGGCAATTGTACTAAGATCTAGTACAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605458 51 + 636262 TCAGCTGGCCCTTGTTTTGGCCTCAAGCTGTCAATTGTTC-----TCTAGTACAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79788 56 - 647215 TTAAGTCACCTTTGTTTTTACCTCAGCCTGGCAATTGTACTAAGATCTAGTACAGA - -a -s mr.mrrefChr3 153241 70 + 181019 AGAACAAAATGGTCCCTCAAGATCCTCTGAGGGCCCAAAACTGATTCCTTAATCTAACTGTGTCAAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605509 48 + 636262 AGAACAAAATGGTCCCTCAA----------------------GGTTCCTTAATCAAACTGTGTCAAGTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 79845 70 - 647215 AGAACGAGATGGTGCCTCAAGATCCTCTGAGGGCCCAAAACTGATTCCTTAATCTAACACTATCAAGTTA - -a -s mr.mrrefChr3 153311 48 + 181019 GAAGTAGACAGGATGGGCTGCACCAGGGTAGGTGAACAACCTATCTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 605562 48 + 636262 GAAGTAGACAGGATGGGCTGCACCAGGATAGGTGAACAACCTATCTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 79915 48 - 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-a -s mr.mrrefChr3 155160 191 + 181019 ACCACTGCCTGCTCATCAGAACCCCACAATTGCCAACATAAAGTTAGAATAATATGTTACTTGTATGTCGACATTAAAACTTTTATCTTAACAATGTTCTAAGAACTACAGCTAACCAGCGGCCTGCCATAATCAAGAATCCATTTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACCCAGTGCAGAATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607297 191 + 636262 ACCACCGCCTGCTCATCATAATCCTACAATTGCCAACATATAGTTAGAATAAGATGTTACTTGTATGTCGACTTTAAAACTCTTATCTTAACAATGTTCTAAGAACTACAGCTAACCAGCGGCCTGCCATAATCAAGAATCCATTTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACCCAGTGCAGAATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 81805 191 - 647215 ATCACTGCCTGCTCATCAGAACCCCACAATTGCTAACATAAAGTTAGAATAATATGTTACTTGTATGTCCACATTAAACCTTTTATCTTGACCATGTTCTAAGAACTACAGCTAATCAGCAGCTTTCCATAATCAACAATCCATGTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACACAGTGCAGAATG - -a -s mr.mrrefChr3 155351 222 + 181019 GGTTCACTAGGATGCAGCCCTAATGCGCACTGGATAGAGGTACATCTACAACATTGCTGAAAATCCAGGGCAAGAACACATCCATAACATTGCATAAATTTAAAAATGGAGAATGTTGGGGAATGTTGAGGGTATATGCTGGGAAGAATGGCACTCATAGAATAAGAATTGCAGGCTGCTGACATCATGGCTACTATATCACTTTCTGTCCACTGCTAAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 607490 173 + 636262 GATTCACTAGGATGCAGCCCTAATGTGCACTGCATTGAGGTACATCTACAACATTGCTGAGAATCCAGGGCAAGAATACTTCCATAACCTTGCATAAATTTAAAAATGGAGAATGTTGGGGAATGTTGAGGGTATATCCTGGGAAGAGTGGCATTCA-------------------------------------------------TGTCCACTGTTAAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 81996 222 - 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647215 CATATTGACAGACAACCATTTTAAATGGAAAAAAAAGTGATAATTATTCCTCTGGGTACTTG - -a -s mr.mrrefChr3 158266 111 + 181019 CTGATGTTTAGTGTTAATGTCTAATTAAATTAAATAACTAAGAGGTTTGAAGTGGTCAACTTTTGATTATCAGTTCCCTTGTCTTAGGTGTGGATCATACTCATATGCAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610326 104 + 636262 CTGATGTTTAATGTTAATGTCTAATTAAATTAACTAACCAAGAGGTCTGAAGTGGTCC-------ATCATCAGTTCCCTTGTCTTAGGTGTGGATCATACTCATATGCAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 84924 111 - 647215 CTGATGTTTAGTTTTAATCTCTAATTAAATTAAATAACTAAGAGGTTTGAAGTGGTCAACTTTTGATTATCAGTTCTCTTGTCTCAGGCGTGGGTCGTACTCATATGCGGA - -a -s mr.mrrefChr3 158377 393 + 181019 CAGACTTTGTATTTGAACCCAGAGTACATACAACATTCATCTGCTACTCCTGCCTGATATATAAGTGTGATTGAGCCTAGGGCTGACTGTCTACTGTAAATGTAACCCACAGAAGTGAGCTCTGCCCCCAGTGTCCAGTCTCATGTGTGCTAACAGTGTTGCTTGGAGCAAGACCCCCCTTCAAGTTTCAGATGCAGTATGTTGTTGATTGTTGGCAGCCAGCCTCCCGGTTTAAGTGAGGAACTATAACTGTAAGTCAATCTATGCACATAGAACTGGTTTATGTCTTCGGTCTTAATGTAGCAAGATGGTGGTTCATGTGTTCAGTCATAATGTAGCAGGATGTGAGTAGAAAGAGCCCCATTTCTAGTTCTTCCAGATTTTCATGGAAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610430 393 + 636262 CATACTTTGTATTTGAACCCAGAGTACATATAACGTTCATCTGCTACCCCTGCCTGATATACAAGTGTGATTGAACCTAGGGCTGACTGTCTAATGTAAATGTAACCAACAGAAGTGAGCTCTGCCCCCAGTGTGCTGTCTCATGTGTGCTAACAGTGTTGCTTGGAACAAGACCCCCATTCAAGTTTCATATGCAGTATGTTGTCGATTGTTAGCAGCCAGCCTCCCGGTTTATGTGAGGAACTATAACTGTAAATCAATCTATGCACATAGAACGGTTTTATGTCTTCGGTATTAATGTAGCAAGATGGTGGTTCATGTGTTCAGTCAAAATGTAGCAGAATGTGAGTAAAAAGAGCCCCATTTCTAGTTTTTCCAGATTTTCATGGAAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 85082 393 - 647215 CGGACTGTGTATTTGAACTCAGAGTACACACAACATTCGTCTGCTACTCCTGCCTGGTATATGAGTGTGGTCAAGCCTTGGGCTGACTGTGTACTGTAAATGTAACCCACAGAAGTGAGCACTACCCCCGGTTCCCAGTGTCTGGTGTGCTGACAATGGTAATTGGAGCAAGATTCCCCTCCAAGTTTCAGATGCAGTATGTTGTTGATTGTTGGCAGACAGCCTCCCAGTTTAAGTAAGGAACTATAACTGTAAGTAAATCTATGTATACAGAACTGGTTTATATCTTCGGTCTTAATGTAGCAGGATGGTTGTTCATGTGATCGGTTATAACGTAGCAGGATGTGAGTAGAGAGAGCCCCACTTCTAGTTCTTCCAGTTTTTCATGGTAGC - -a -s mr.mrrefChr3 158770 97 + 181019 GACAGGCATGCATTTCTAAAATCGATTAAAATTGGATGCAGCTAACTGTTGACAGTGTGGAAACTGCCCCCTGTACATTAGGGAGGGAATGCCTACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610823 87 + 636262 GACAGGCATGCATTTCTAAAATCGATTAAAAGTGGATGCAGCTAACTG--GACAGTGTGGAAACTGCCTG--------TAGGGCGGGAATGCCTACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 85484 92 - 647215 GTCAGGCATGTATTTACAAAAT-CATTAAAATCGGGTGCAGCTAAGTGTTGGCAGTGTGGGAACTGCCCCCTGTACATTAGGGAGGGCATG----CC - -a -s mr.mrrefChr3 158867 25 + 181019 TAGAGTGGAATTGACAATTTAGTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 610913 25 + 636262 TAGATTGGAATTGACAATTTAGTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 85576 9 - 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647215 AGTCTTTTTTATGTGAGATGTGTTTAAGGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 159117 195 + 181019 AGGATGATATGCTCATTTGTCATGGAGTGATTTGACCATTTATGCAAATGCATCCTTTTAATGACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGATTCATAGGGATATGCAATTTGTGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGACTAGCAGTTATCTGTCACATAAGGCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611191 195 + 636262 AGGAGGATATGCTCATTTGTCATGGAGAAATTTGACCATTTATGCAAACGCATCCTTTTAATCACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGGCTCATAGGGATATGCAATTTATGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGATTAGCAGCTATCTGTCACATCAGGCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 85828 181 - 647215 AGGATGATATGCTCCTTGGTCATGGAGTGACTTGACCATTTATGTAAATACAT-CTATTAATGACATTTACTGCTCCCCGTGAGGT-------------AGACAAGATTCATAGGGATACGCAATTTGCAAATTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAGAAGGCTATTAGTTATCTGTCACATAAGGCCCC - -a -s mr.mrrefChr3 159312 49 + 181019 ACAGCTGATCATATGGCTTTAATAACATAACTGGGTAGGACTTGATGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 611386 48 + 636262 ACAGCTGAT-ATATGGCTTTAATAACATAACTGGGTAGGACTTGATGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 86014 49 - 647215 ACGGCTGATCAGATAGCTTTAATCATGTAACTGGATAGGACCAAGTGAT - 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-a -s mr.mrrefChr3 169132 56 + 181019 GCAATCAATTAAAAATTGCCTTTCAAATTGCCCTTATTCAGTCCCAAGGGTGTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622123 30 + 636262 --------------------------ATTGCCCTTAATCAGTCCCAAGGGTGTTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 633944 56 + 647215 GCAATCAATTAAAAATTGCCTTTCAAATTACCCTTATTCAGTTTCATGGGCCTTCA - -a -s mr.mrrefChr3 169188 42 + 181019 CCCAACCTAGTGAGGAATGATTCCTAGAATAATATGACTTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622153 42 + 636262 CCCAACCTAGTGAGGAATGATTCCTAGAATAATATGACTTGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 634025 42 + 647215 ACCAAACTAGTGAGGAATGATTCCTATAATAATATGACTTGC - -a -s mr.mrrefChr3 169230 77 + 181019 ATGCTTGAGCATTGTAAAGTTGAGAAGTGAATAGGCTTTAAGAGACAAAATACTCAAAGAGAGAAGAAACAATGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622195 77 + 636262 ATGCTTGAGCATTGTAAAGTTGAGAAGTGAGTAGGCTTTAGGAGACAAAATACTCAAAGAGAGAAGAAACAATGCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 634072 67 + 647215 AAGCTTGAGCATCGTAAA----------GAATAGGGTTTAAGAGGCAAAATACTCAAAGAGAGAATAAACAATGCCC - -a -s mr.mrrefChr3 169307 51 + 181019 AATGACTGCGACCAACACTATCTGCCCTTTGACTCAAACAGGGAAGATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622272 51 + 636262 AATGACTGCGACCAACACTATCTGCCCTTTGACTCAAACAGGGAAGATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 634140 51 + 647215 AATGCCTGTGACTAACAGTATCTCCCCTTTGACTCAAAGGGTGAAGATCAA - -a -s mr.mrrefChr3 169358 6 + 181019 GAGAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622324 6 + 636262 GAGAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 634191 6 + 647215 GAGAGA - -a -s mr.mrrefChr3 169364 13 + 181019 GCCCAAATAACTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 634206 13 + 647215 GCCCAAATAACTC - -a -s mr.mrrefChr3 169377 333 + 181019 CACCTGATACTATCTCCCCTTTGAGTAATTGCTAGCTGCAGCCCTTGTGTACCACATCTGACTTTACTTTGAATTCATACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGTAAAGGTAGTGTGCTGTCAGATCACTTATGCTCCATTGTCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGATCCCATGGCAATGTATTAAGCCAATACCTACCATGGGTAGGCATAAACTGTATCACCTGTAGGATAGATGGGGTGACAACTATGAACCTCCATATTCAGCCCAAATAAAGATATATTATATCAAGAACACAGACCACCAAAATTAGCACGCACTTGAATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622633 324 + 636262 ---------CTATCTCCCCTTTGAGTAATTGCTGGCTGCAGCCCTTGTGTATCACATCTGACTTTACTTTGAATTCCTACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGTAAAGGTAGTGTGCTGTCAGATCACTTATGCTCCATTGTCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGATCCCATGGCAATGTATTAAACCAATACCTACCATGGGTAGGCATAAACTGTACCACCTGTAGGATAGATGGGGTGACAACTATGAACCTCCATATTAAGCCCAAATAAAGATATATTATATCAAGAACACAGACCACCAAAATTAGCATGCGCCTGAATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 634224 332 + 647215 CACCTGATAATATCTCCCCTTTGACTAATTGCTAGCTGCAACCATAGTGTACCACATCTTACTTTAATTTGAATTCATACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGCAAAGGTGGTGTGCTGTCAGATCACTTGTGCTCCATTATCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGAACCCATGGATATGTAATAAGCCGATACTTACCATGGATAGGCATAGACTGTCTCACTCATGGGATTGGTGAGGTGACAACTGTGAACCTCCAT-TTCAGCCCAAATAATTAACTATTATATCAAGAACACAGAACCCCAAACTTAGCACGCACTTGATGGCT - -a -s mr.mrrefChr3 169710 17 + 181019 TGTTCTCCTTGTGGGCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622957 17 + 636262 TGTTCTCCTTGTGGGCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 634569 17 + 647215 CATGCTACTTGATGCCA - -a -s mr.mrrefChr3 169727 19 + 181019 AAATCATTGTCCTGATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622974 19 + 636262 AAACCATTGTCCTGATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 634721 19 + 647215 AAATCATGACAATGGTTTT - -a -s mr.mrrefChr3 169746 12 + 181019 CATGTGGCCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 622993 12 + 636262 CATGTGGCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 634743 10 + 647215 CATGAGGGGA-- - -a -s mr.mrrefChr3 169758 31 + 181019 AGGCTGAGAGTGCTTCTCACTCCTCATCATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623006 31 + 636262 AGGCTGAGAGTGCTTCTCACTCCTCATCATG - -a -s mr.mrrefChr3 169789 81 + 181019 TAAGCGTTGTATATAAGATAGGCATATTTGTACTGAATCATTACATACTGAACACACAAGCATTGTATCAAGTAGCATGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623065 81 + 636262 TAAGCGTTGTATATAAGATAGGCATATTTGTACTGAATCATTACATACTGAACACACAAGCATTGTGTCAAGTAGCATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 634753 20 + 647215 -------------------------------------------------------ACAGATATTGTATA------CACGGT - -a -s mr.mrrefChr3 169870 321 + 181019 AGGCGACTGTATAGGCTAAAACTGTGTTACAGGTGAAATATCATGCAAATTTAATACTGATATCTTGTACATTGTTTCACATCACTATATGTAGAAAACCAGCCACCAAAGGCTAGTATAATTTGTATGAGGATGAGTAGTGACAATGCAGCAATTCTTCCTCACTCATTCTAGTTCCTAAATATATCTGTGCCTGAGTAACAACTCTGAAAACATACAGGTACTATTTTATATGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATTATATCGATTAATGGCTCTCCCAATGAGCACTATCAATTATCCCTCACATCCCACTATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623146 321 + 636262 AGGCGAATGTATAGGCTAAAACTGTGACACAGGTGAAATATCATACACATTTAATACTGATATCTTTAACATTGTTTCACATCACTACATGTAGAAAACCAGCCACCAAATGATAGTATGATTCGTATGAGGATGAGTAGTGACAATGCAGCAATTGTTCCTCACTCTTTCTAGTTCCTAAATATATCTGTGCCTGAGTAACTACTCTGAAAACATACATGTACTATTTTATATGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATTATATCTATTAATGGCTCTCCCAATGAGCACTATCAATTACCTCTCACAACCCACTATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 634774 320 + 647215 AGTAGACTGCATAGGCTAAAACTGTGTTACAAGTGAAATATCATGCAAATTTGATACTGGTACCTTGTACTTCGTTTTAGATCTCTATATGTA-AAAACCAGCCTTCAAAGGCTACTATAACTTATATGTGGATGAGTAGTGACAACGCAGCAATTCTTCCTCACTCATTCTAGTTCCAAAATATATCTGTCTTTGAGTAACAACTCTGAAGGCATACAGGTACTATTTTATAGGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATGATATAGATTAATGGCTTTCCCAATTAGCACTATCAATTATCCCACACATCCCACTATA - 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-a -s mr.mrrefChr3 170397 239 + 181019 CTACTCTATCACTATTTATCTCTTAGCCAGAGGTCATCAATTTGATGCAGTCAGGATAACTTTGTGAATTCTCTAAATATGTCTGGCCTACTTTGTTGAATTGGGCTTGTACCTCTTGCATGACCAAAATAATTTTGCAGAGACATGTCATGTCATGTGGTACTTCAGAGTGTGTTTGTGCTCAGAAGGCATCAATTCTAAACAGAGTCACATCATGCCATGGTTGTAGTGACTTATAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623675 239 + 636262 CTACTCTATCACTATTTATCTCTTAGCCAGAGGTCATCAATTAGATGCAGTCAGGATAACTTTGTGACTTCTCAAAATATGTCGGGCCTATTTTGTTGAATTGGGCTAGTACCTCTTGCATGACCAAAGTAATTTTGCAGAAACATGTCATGTCATGTAGTACTTCAGACTGTGTTTGCAATCAGAAGGCATCAATTCTAAACGTAGTCACTTCATGCCATGTTTGTAGCGACTTATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 635305 239 + 647215 CTACTCTATCACTATTTATCTCTCAGCCAGAGGTCATCAATTTGATGCAGTTGGGATAACTTTGTGTATTCTCTACATATGTCTGGCCTACTTTGTCAAGTTGGGCTTGTACCTCTTGCATGACCAAAATAATTTTGTAGAGACATGTTATGTCATGTGGTACTTCAGAGTGTGTTTGTGCTCAGAAGGCATCAATTCTAAACAGAGTCACATCATGCAATGGTTGTACTGACTTATAT - -a -s mr.mrrefChr3 170636 206 + 181019 ATGGTCCCTTCACTAGGTTTAATCCTCATGAAATGGTAGTTAGCTTTTATTCATGATTCCGAACCAGACTGGCTTTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCAGTAGAGAAGGTCTACCCAGGAATAGGTCACTTCTGACTCGGTTCGTTGTATCTCAATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCAAAAAAAATGCACTCCTTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 623921 206 + 636262 ATGGTCCCTTCACTAGGTTTAATCCTCATGAAATGGCATTTAGCTTTCCTTCATGATTCCGTACCAAACTGGCTTTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCGATAGAGAAGGTGTACCCAGGAATAGGTCACTTCTGACTCGGCTCGTTGTATCTCAATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCACAAAGAATGCACGCCTTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 635544 200 + 647215 GTGGTCCCTCCAGTAGGTTTAATCCTCATGAAATG-TAGTTAGCTTTTACTCACGATTCCCATACTGGTGGGGTCTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCAGTAGAGAGAGACTACCCAGGTATAGGTCACTTCTGACTTGGTTCTTTGTATCTCGATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCAAAAAAAACGCATTC----- - 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-a -s mr.mrrefChr5 7089 334 + 294542 TTGGGAGGGCCTTGATTCAGATCATTCAAACTGAGGGCTGGGAGAGAGCTCCAGGGATCGGAAGGATTGGTACCCCATGCTGTACATTCAAGATATTTTTATAAAAAGTTAAAACAATAGAAAAAAATATACACAGTAGAGTGGGGGACCTGCCCTCAGATAAGATCTTGTTGGGTAGAGTCAATAGAAGCAGGTGGGCAAGAATTTTTAATAGTTCCTGGGTCACTAATGTGCTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCACAGGACAGTCAAATTCCACCTCTAACTATCATAGTAGTGTAAAAGTGGAGAATGTGCACTTAGTCTAATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 143704 334 + 636262 TTGGGAGGGCCTTGATTCAGATCATTCAAACTAAGGGCTGGGAGAGAGTTCCAAGGATCGGAAGGATTGATACCCCATGCTGTACATTCAAGATATTTTTATAAAAAGTTAAAACAATAGACAAAAATATACACAGTAGAGTGGGGGACCCGCCCTCAGATAAGATCTTGTTGGGTAGAGTCAATAGAAGCAAGTGGGCAAGAATTTTTAATAGTTCCTGGGTCACTACTGTACTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCACAGGACAATCTAATTCCACCTCTAATTATCGTAGTAGTGTAAAAGTGGATAATGTGTGCTTAGTCTAATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 141376 333 + 647215 TTGGGAGGGCCTTGAATCAGATCATTCAAACTGAGGGCTGGGAAAGAGCTCCCGGGTTTGGAGGGATCGGTACCC-ATGCTGTACATTCAAGATATTTTCACAAAAAGTTGAAACAATAGAAATAAAGATACACAGTAGAGTGGGGGACCTGCCCTGAGATGAGACCTTCTTGGGTAGAGTCAATAGAACCCGGTGGGCCAGAATTTATAATAGTTCCTGAGTCACTAATGTGCTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCATAGGATGGTCAAGCTCGAACTCTAACTATCATAGTCATATAAAAGTGGAGAATGTGCATTTAGCCTAATT - 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-a -s mr.mrrefChr5 12004 271 + 294542 TAAATAGAGACCGTGGCAGCCATAGGACCTCAACTTTGCTATCCCTGAGACATAGGAATACGTTGGCCCTATCTTCCAACCTAGGCTTGATGAATTACTCATTATAGAGCCTTTCATACGCATAATTATTTCCATACAATTTGACACAGTCAAATTTCTTGACTATTTGACTTCATGGGCAAAAAGGAGATGTAGATTACTCTCAGCAATTACCTGGGCAAAGAGGCACTGGACCTTGCTGGCATGGATAAAAACTGTCAGACAATTAACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 148825 233 + 636262 TAAACAGAAACCGTGGCAGCCATAGGACCTCAACTTTGCTGTCCGTGAGACATAGGAATGCGTTGGCCCTATCTTCCAACC----------------------------------ATACGAATAATTATTTCCATACAATTTGAGACAGTCAAATTTCTTGACTATTTGACTTCATGGGGAAAAAGG----GTAGATTACTCTAAGCAATTACCTGGGCAAAGAGGCACTGGACCTTGCTGGCCTGGATAAAAACTGTCAAACAAATAACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 146291 268 + 647215 TAAATAGAGACCATGTCAGCCATGTGCCCTCAACTCTGCTATCCCCAAGACATAGGAATACATTGGGCCTATCTTCCAACCTAGGCTTGATGAATTACTCATTATAGAGCCTTTCATACACATAATTATTTCCATGCAATTTGACACAGTCAAATTTGTTGACTATTTGACTTTATGTGCAAAAAGGAGATGTAGATTACCCTCAGCAATTACCGGGGTAAAGACGCACTAGACCTTGCTGGCAC---TAAAGACTGTTAGACAATTAACT - -a -s mr.mrrefChr5 12275 122 + 294542 GGCCAGAGCTGATGTGTGGTAATTTTTATTGCACGGATGAATCATTCTCCACTCGGTTTAGCTGGGGCAAATTCTTTGATATACCCAATAAGCATTTTTGTCATATTTACTATCCTCTTGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149059 122 + 636262 GGCTAAAGCTGATGCGTGGTAATTTTTATTGCATGAATGAATCATTCTCCACTCGGTTTAGCTGGAGCAAACTCTTTAATACACCCAATAAGCATTTTTGTCATGTTTACTATCTTCTTGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 146559 122 + 647215 GGCCAGAGCTGATGTGTGTCAATTTTTATTGCACGGATGAACCATTCTCCACCCAGTTTAGCCTAGGCAAATTCTTTGATATGCCCAATAAGCATTTTTGTCATACTTACTATCCTCTTGCT - -a -s mr.mrrefChr5 12397 90 + 294542 ATGACATTGTAGAAATGTGACAACTGGGGACTGGGGGCCTGCTGAGGGCCAATACACTGACAGCTGCTGGATACACCATATTGAATCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149181 90 + 636262 ATGACATTGTAGAAATGTGACAACTGGGGACTGGGGGCTCGTTGAGGGCCAATGCACTGACAGTTGCTGGAGACACCATATTGAATCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 146684 90 + 647215 ATGACAATGTAGAAATGTGAGAGCTGGGGCCTGGGGGCCTGCTGAGGGGCAATACACTGACAGCTACTGGATACACCATATCAAATCACA - -a -s mr.mrrefChr5 12487 140 + 294542 CAGTACTATTACTATTCTTCTCAGATTAGTGAGCAGAATGTTACTACAGCCAAGGGTCTCCATCATAATTCTATATGGTTCAATCCTTGTAAAATGCATGCCCCATCTGAATTTAAACAAATACATGCTTTAGTATGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149272 135 + 636262 CAGTACCTTTACTATTCTTCTCAGATTATTGAGCAGAATGTTACTACAGCCAAGGGTCTCCATCATAATT-TATATGGTTCAAGCCTTGTAAAATGCAG----CATCTGAATTTAAACAAACACATACTTTAGTATGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 146774 139 + 647215 CAGTACTATTACTATTCT-CTCAGATTAGGGAGCAGAGTGTGGCTACAGGCAAGGGTGTCCATCATAATTCTATATGGTTCAGTCCTTGTAAAATGCGTGCCCCATCTGGATTTAAACAAATACACGATATAGTATGTGT - -a -s mr.mrrefChr5 12627 20 + 294542 TATGCCTGGGTCAAAATTCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 149407 20 + 636262 TATGCCTGGGTCAAAATTCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 146994 20 + 647215 TATGCCTGGGTCAAAATTCA - 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-a -s mr.mrrefChr5 13240 3 + 294542 GAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150123 3 + 636262 GAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 147642 3 + 647215 AAT - -a -s mr.mrrefChr5 13243 21 + 294542 GTCCCCAAATTATTTAGACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150168 21 + 636262 GTCCCTAAATTATTTAGATAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 147645 21 + 647215 GTCTCCAAATTATTTAGACAT - -a -s mr.mrrefChr5 13264 489 + 294542 AACATAAATTCAGTAGATAATTGAGATCTCAAGTCGGAGTTCATAAGGTCAGCCCTTATAGACACCTGACATATTGTGTTTTAGTAGCCACATGCCACATCATTGTGAACCTGTTTTCAAACCCAAGCTATGGATATTTTAGATGCGCCATGCCTGCTAGTCCATTAGCTGCATTGTGTTTGCAGGGACCAACAAGAATGCTACTCATTATAGACATATGGTTTGAGACCCCTGTAAATCTAGTAGAGTGATAAGTAGTAGGCTTCCCTTTTCTAATGTGATTGCTTCTCTACTGTCAGCTCTCTAACTCGATTGCTTCTCTACTGTCAACTCTATCATCTATTGACCAGATGGAGGAAATATCATTTACCATTCCTGAACAGGTTAGTCATCCAGTTGGGGAAGTCACAAATTGGGTTATTATCATATGATGATATAAGCATACAACTCATTAGTCAACTTTGCATTATTGTTCCAAATCACACATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150189 478 + 636262 AACATAAATTCAGTAGATAATTGAGATCTCAGGTCGGAGTTCATAAGGTCAGCCATTATAGACACCTGACATACTGTGTTTTAGCAGTCACATGCCACATCATTGTGAACCTGTTTTCAAGTCCAAGCTATGGATATTTCAGATGCGCCATGCCTGCTAATCCATTAGCTGCATTGTGTTTACAGGGACATACAAGAATGCTACTCATTATAGACATAGGGTTTGAGACCCCTGTAAATCTAATAGAGTGAAAAGTAGTAGGCTTCTCTTTTCTAATGTGATTGCTTCTCTACTGTCAGCTCTCTAACTCGATTGCTTCTCTACTGTCAACCCTATCATCTATTGACCAGACGGAGGAAATATCATTTGCCATTCCTGAACAGGTTAGTCATCCAGTTGGGAAAGTTACAAA-----------TCATCTGATGATATAAGCACACAACTCATTAGTCAACCTTGTATTATTATTCCGAATCACCCATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 147772 489 + 647215 AGCATAAATCCAATATATAATTGAGATCTTAAGTAGGAGTTCATAAGGTCAGCCCTTATAGATACTTGACACATTGTGTTTTAGTAGCCTCATGCCACATCATTGTGAACCTGTCTCCATACCCAAGCTGTGGATATTTTAGATTCACCATGCCTGCTAGTCCATGAGCGGCATTGTCTTTGCAGGGACCAAAAAGAAAGCTACTCACTATAGACATATGGTTTAAGACCCCCGTAAATCTAGTAGAGTAATAAGTAGTAGGCTTCCCCTTTCTAACGTAATTGCTTCTCTACTGTCTACTCTCTAACTTGATTGCTTCTCTACTGTCAACTCTATCATCTATTGACCAGATGGAAAAAATATCATTTACCATTCCTGAACAGATTAGTGATCCAGTTGGGGAAGTCACGAGTTGGGTTATTATCATATGAGAATATAAACATACAACTCACTAGTGAACTTTGCATTATTGTTTCAAATTACACATGC - -a -s mr.mrrefChr5 13753 139 + 294542 ACTGGCTCTTCTCTAGTGATGATTGAGATCAGGGGTTCAAGCTTCTGTGGTTGTCCTGAAGTATACTTGGCAACCACACAGATGAGGAGTGGAATGGTATTCTAGTGGTATTCTTGTGCTGATTCTATAAAGGCCATCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150667 138 + 636262 ACTGGTTCTTCTCTAGTGATGATTAAGATCAGGGGTTCAAGCTTCTGT-GTTGTCCTGACGTATACTTGGCAACCACACAGATGAGGAGTGGTATGGTATTCTAGTGGTATTCTTGTGCTGATTCTATAAAGGCCATCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 148262 139 + 647215 ACTGGCTCTTCTCTAGTGATGACTGAGATCAGGGGTTCCAGCTTCTGTGGTTGTCCTGAAGTATACTTGGCAACCACACAGACGAGGAGTGGAATGGTTTTCTTGTGGTATTCTTGTGCTGATTCTATAAAGGCCGTCC - -a -s mr.mrrefChr5 13892 37 + 294542 TATTCTTGTATTTAATTGTAAGCATTCATGTTAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150805 30 + 636262 TATTCTTGTATTTAATTGTAA-CACTCATGT------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 148402 37 + 647215 TATTCATATATTTAATTTAAAGATTTCACATTAGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 13929 140 + 294542 TGCAACTGAGTGAACTGAATAATGTGGATTATGAACACAGATTAATTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAAGCAAGACAATTGAGGTGAGGACTAGTTGGTCACTGTTAGAAGGTAATAATCTATGAATACATGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150835 139 + 636262 TGCAACTGAGTGAACTGAAAAATGTGGATTATGAACACAGATTAATTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAAGCAAGACAATTATGGTGAGGACTAGTTGGTCACTGTTAGAAGGT-ATAATCTGTGAATACATGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 148440 140 + 647215 TGCAACTGAGCGAACTGAATAATGTGGTTTGTGAACACAGATTAACTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAATCAAGACAATTGAGCTGAAGGCTAGTTGGTCACTGTTAGTAGGTAATAATCTATGAAGACACAC - -a -s mr.mrrefChr5 14069 183 + 294542 AATCTTGTAACTCATTGTTCAAAGCTAATTTGTATTAGTAGGCTTTGTACTCATAACTGCCAGCATTTATGGTAACTAGCCCTTGAATATCTGTCCAATTATGAACTGGGATAGGAATTATAAAAACTATGTAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCCATATATATAGAGACATTTTAATATATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 150974 179 + 636262 AATCTT-TCACTCATTGTTCAAAGCTAATTACTATTGGTAGGCTTTG---TCATAACTGCCAGCATTTATGGTACCTAGCCCTTGGAGATCTGTCCAATTATGAACTGGGGTAGGAGATATAAGAACTATGTAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCCATATATACAAAGACATTTTAATATATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 148581 179 + 647215 AATCTTGTAACTCATTGTGCAAAACTAATTTGTATTAGTATGCTATGTACTTATAACTGCCAGCCCTTATGGTAACTAGCCCTTGAATATC-GTCCAATTATGAACTGGAATAGGAATTATAAAAACTACGCAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCTGTATATATAGAGAC---CTAATCTATG - -a -s mr.mrrefChr5 14252 149 + 294542 TAAGTTGTTGTCCAGCCTCTATTCCCCATGTTCACATGGCATACACTATCAGTTTTACCAGATTTTAGTATTCTAAACCCTCTATATGGGATCTACCTGTGAGTGTAATTTACTAGTGGGCTGAATATTGGATGGGAACTGCCCATAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 151153 149 + 636262 TAAGCTGTTATCCAGCCTCTATTCCCCGTATTCCAATGGCATACACTATCAGTTTTACCAGATCTTAGTATTCTAAACCCCCTATATGGGGTCTACCTGTGAGTGTAATTTATTAGTGGGCTGAATATTGGATGAGAACTGCCCATAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 148764 149 + 647215 TGAGTTGTCGTCCAGCCTCCATTCCCCATGTTCACATGTCATGCTCTATGAGTTTTACCAGATTTCAATATTCTAAGCCCTCCATATGGGATCTACCTGTGAGTGTAATTTACTAGTGGGCTGAATATTGGATGGGAACTGCCTATAGA - 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-a -s mr.mrrefChr5 22497 472 + 294542 ACACCCATGGGGCAGCTATTAAAGACATACCAATAACATGACCATTGTGCTTAATAAGGCGTAAGACCAATGGTATCCAGAGATCCACATATAGCTTGGCTAAACACTAATCATCCCTTAATAGATGGCAAATCAAATACTTAATAGCACAAATATAAAAATCAGCATTTAAAAGATCATGGACAGGCACCACACTCAACAGAGAAGCCTGCTACTAGTGTATACCCTGTTTTTAAATTCTATGACATTTTGCTTGTGGCCTGAGGCCACTATATCCAAAATGATAAACTACTCCACTAAGTCAATGCATGGAGAACATTTAGATTCTGGCCATTTGCCTTTATGTGTTAGGTTATCACCTTATGTAATGCCCTGCAAAGTTTTACTCATCAAGTGCAATTTTCGTAAATGTTCAAGGGTTTAGCACCTAACTGATCTGACACTGGAAGTTCAATTCTGACCTTACAATAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 159580 457 + 636262 ACACCCATGGGGCGGCTATTAAAGACATACCGATTACATGACCATTGTGCTTGATAAGGCGTCGGCCCAATGGTATCCATGGATCCGCATATAGCTTGGCTAATCACTAATCGTCCCTTAATAGATGGCAAATCAAATACTTAATAGCACAAATATGAAAAATAGCATTTAAAAGATCATGGACAGACACCACACTCAACAGAGAAGCCTGCTACTAGTGTGTACCCTATTTTTAAATTCTATGACATTTTGCTTGTGGCCTGAGGCCACTATA-CCAAAATGATAAACTG------------GATGCATGGAGAACATTTAGATTCTGGCCATTTGCCTTTATGTGTTAGGTTATCACCTTATGTAATGCCCTTCAAAGTTTTACTCACCAAGTGCAATTTTCGTAAATGTTCCAGGGTTTAGCGCTT--CTGATCTGGCACTGGAAGTTCAATTCTGACCTTACAATAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 157299 468 + 647215 ACATTGATGGGTCAGCAATTAAGGGCATACCAATACCATGAGCATTGTGCTTAATAGGGCATAAGAAAAATGGTTTCCAGAGATCCACATATAGCTTGGCTGAACACGAATCATCCCTTAATAGATGGCAAATCAAATACTTAATAGCACAAATATAAAGATCAGGATTTAAATGATCATGGACATGCACCACACTCAAAAGAGAAGCCTGCTACTAGTGTATACCCTGTTTTTCAATTCTTTGACATTTTTCCCGTGGCCTGGGGCCACTACATCCAAACTGATAAACTACTCCACTAAGTCAATGCGCGGAGAAAACTTAGGT-CTGGCCATTTGCCTTTATGTGTTAGGTTATCACCTTATGTAAGGGCCTGCAAAGTT--ACTCATCCAG-ACAATTCTGCTAAATGTTCAACAGTTTGGCACCTAACTGATCTGACACTGGAAGTTCAATTGTAGTCTTACAATAGT - 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636262 ATATCTATTACACCAAGAGGTAAAGCCATTCATTACAGTGTGGTCAGTCAGACCGTCTAGTCACTCAGGGCTTAGTGGTACCCAGCGCGTTTTATGTATGACAAAAGGAACTTGGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 159004 117 + 647215 ATATCCGTTACATCAAGCTATAAAGCCATACATTACAGTGTGATCACTCAGACAGTCCAGTCACTCCGGGATTAGTGGTACCTAGTGCATTTTTTGTATGGCAAAAGGAACTTGGAA - -a -s mr.mrrefChr5 24383 82 + 294542 AGGAACCCAAGTGGTCCACAGTAAATTAGATGGCCCCAGATTTCTGTAGCCTGTAACAGCTCATGTGGTCATGTCACCCCAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474440 82 - 636262 AGGAACCCAAGTGGTCCACAGTAAATTAGATGGCCCCAGATTTCTGTAGCCTGTAACAGCTCATGTGGTCATGTCACCCCAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 159155 82 + 647215 AGGAAACTAAGTGGCTGACATTAAATTAGGTGGCCCCAGATTTCTGTGGCCTGTCTCAGCTCATGTGGTCATGTCACACCAT - -a -s mr.mrrefChr5 24465 39 + 294542 GGCCTAGCTCAGCCACATCTAGCTATATCTAGAACATAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474522 39 - 636262 GGCCTAGCTCAGCCACATCTAGCTATATCTAGAACATAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 159246 39 + 647215 GGCATAGCTCAGCCACATCTAGCTGTATTTAGGACATAG - -a -s mr.mrrefChr5 24504 32 + 294542 ATATAAATAAGATAGCATCTCACTCATCAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474561 32 - 636262 ATATAAATAAGATAGCATCTCACTCATCAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 159291 32 + 647215 ATATGTATAAGATAGCATCTCACTCTTAAGGG - -a -s mr.mrrefChr5 24536 107 + 294542 TGAAGCGTGTTGGATCCTTCTACAGGGGCCTGCGATCACTTGACACTGCACGAGGCGGGTAGGATCCTTTCACAGGTGCCTGTGATTGCTTGTTGTTGTAGACGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474593 107 - 636262 TGAAGCGTGTTGGATCCTTCTACAGGGGCCTGCGATCACTTGACACTGCACGAGGCGGGTAGGATCCTTTCACAGGTGCCTGTGATTGCTTGTTGTTGTAGACGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 159324 107 + 647215 TAAAGGGTGTTGGGTCCTTCTACAGGGGCCTGTGATCACTTGACACTGTATGAGGCATGTATGATCCTTCTACAGGTGCGTGTGATTGCTTGTTGTTGTGCACAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 24643 10 + 294542 CTGTAGGAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474702 10 - 636262 CTGTAGGAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 159431 10 + 647215 CTGTATGAAA - -a -s mr.mrrefChr5 24653 107 + 294542 TCTCAACAACGTTAAGGCTATCAACACAAAATGGAGACAGGAAATTTTGTGATTTATGCCGCAAAAGGTTCCAAGATGGGTATCCATCACCCCAGAGACCCTCGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474747 107 - 636262 TCTCAACAACGTTAAGGCTATCAACACAAAATGGAGACAGGAAATTTTGTGATTTACGCCGCAAAAAGTTCCAAGATGGGTATCCATCACCCCAGAGACTCTCAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 159441 96 + 647215 TCTCATCAACGTTAAGGCTAT-----------GGAGACACGAAATTTTATGATTTATGCCGCAAAAGGATCCAAGATGGTTCTTCATTGCCCCAGAGACCCTCGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 24760 59 + 294542 AGTCTACCCGGAACTATTATATATCAAACATTTAGACCCACTACCTCCAAAATTATGAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474854 59 - 636262 AGTCTACCCGGAACTATTATACATCAAACATTTAGACCAATTACCTCCAAAACTATGAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 159539 59 + 647215 AGTCTACCTGGAATTATTATATATCAAACATTTAGACCCACTACCTCCAAAATTATGAA - -a -s mr.mrrefChr5 24819 141 + 294542 ATTTAAATACCATAGGTACGGTAGCAGATATAGCACATGTGACATTCCAAACCTGGTTAGTTAAGGTGGGTCAGTATTGCAAGTTTTGTAAAATTAATTGTCTAAGGAAATTTTTATTGTGATGACACAAGATGTCAGTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 474913 141 - 636262 ATTTAAATACTATAGATACGCTAGCAGATATAGCACATGTGGCATTCCAAACCTGGTTAGTTAAGGTTGGTCAGTATTGCAAATTTTGTAAAATTAACTGTCTAAGAGCATTTTTATTGTGATGACACAAGATGTCAGATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 159599 141 + 647215 AGCTAAATACCCTAGGTATGGTATGAGATATAGCACATGTGACATTCCAAACTTAGTTAGTTTAGGTGGGCCAGTATTGCCAGTTTTGTAAAATTAATTGCCCAAGGAAATTTATATTGTGATGACACAGGATGTCAGTTA - -a -s mr.mrrefChr5 24960 44 + 294542 TGTTTTATAGTGAATAACAGAGAACACTGTGCTAGGGGGAGATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475054 44 - 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-a -s mr.mrrefChr5 25264 26 + 294542 GCAGCACATGGATCAGAAAATTGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475372 26 - 636262 GCAGCACAGGGATCAGAAAATTGCTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 160028 26 + 647215 GCAACACATGGATCAGGAAATTGCTG - -a -s mr.mrrefChr5 25290 69 + 294542 TTGTGTTGACATATTAAGAAAGCATATACTGCATGTTTGCTGGAGATTTTGGATACTCTGTTAGGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 475407 69 - 636262 TTGTGTTGACATATTAAGAAAGCATATACTGCATGTTAGCTGGAGATTTTGGATACTCTGTTAAGGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 160054 69 + 647215 TTGTGTTTACATACTAAGAAAGCATATACTACATGTTTGCTGGATATGTTGGATACTCTGTTAGGGACT - -a -s mr.mrrefChr5 25359 128 + 294542 GCAGTGCAGCTGCTGACTAGGTTATATTGAATCTTCCAGTGTGAAGCATGGTCATGGGTCTATGCAGTCAGAAATGTCATGTCATAGGCAGTTCATCAGATAACTTCACTTTCTAGCATCACAATGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 162497 128 + 636262 GCAGTGCAGCTGCTGACTAGGTTCTATTGAATCTTCCAGTGTGAAGCATGGTCATGGGTCTACGTAGTCAGAAATGTCATGCCATAGGCAGTCCATCCGATAACATCACTTTCTACCATCACAATGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 160130 122 + 647215 --AGTGCAGCTGCTGGCTAGGTTATATAGAATCTTCCAGTGTCATGTATGGTCAAGGGTCTATGCAGTCAGAAATGTAATGTCATAGGCAGTTCATCAGATAACTTCATTTTCTAGCATCACAA---- - 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-a -s mr.mrrefChr5 38007 7 + 294542 ctcatat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182797 7 + 636262 ctcatat -s simRat_chr6.simRat.chr6 173058 7 + 647215 ctcatat - -a -s mr.mrrefChr5 38014 18 + 294542 agcactcgagagcaaatt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182822 18 + 636262 agcactcgagagcaaatt -s simRat_chr6.simRat.chr6 173065 18 + 647215 aacactctagaacaaata - -a -s mr.mrrefChr5 38032 196 + 294542 ctcttcagcaagtctaactacaatgcatatttggtttatggtaccaattcactcagttgggatgctaatgataggttgctacagaatattggtaacactacttcatcttactgcaatggcccaaggacctgaggttctggtgcaagtagagacgagagtgttattttggttgagacaaaacttataacctggtgta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 182843 196 + 636262 ctcttcagcaagtctaactacaatgcatatttggtttatggtaccaattcactcagttgggatgctaatgataggttgctacagaatattggtaacactacttcatcttactgcaatggcccaaggacctgaggttctggtgcaagtagagacgagagtgttattttggttgagacaaaacttataacctggtgta -s simRat_chr6.simRat.chr6 173083 196 + 647215 ctcttcagcaaattcaactacaaggcaagtttggcttatgagaccaatttacttggttgggatgctaatgataggttgctacacaatattggaagcactactttatcctactgctatggcctgaggacctgatgttctggtgcaagcagagactagagtgttcttttggttgagacacaacttacaacctggtgta - -a -s mr.mrrefChr5 38228 31 + 294542 ccaccagcttgatttgtctgacttatgggct -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183039 31 + 636262 ccaccagcttgatttgtctgacttatgggct -s simRat_chr6.simRat.chr6 173282 31 + 647215 ccaccagcttgatttatctgacttgtgagct - -a -s mr.mrrefChr5 38259 57 + 294542 ctctttggtggtcttacacaaacttgacaattgtttttttgcactctgtaaccagag -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183073 57 + 636262 ctctttggtggtcttacacaaacttgacaattgtttttttgcactctgtaaccagag -s simRat_chr6.simRat.chr6 173313 57 + 647215 ctctttggtggttccatgcagacttgacaattgttcttttgcactctctaaacagag - -a -s mr.mrrefChr5 38316 19 + 294542 gggttttttttacagagat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183130 19 + 636262 gggttttttttacagagat -s simRat_chr6.simRat.chr6 173377 19 + 647215 gggttttttttacagagag - -a -s mr.mrrefChr5 38335 76 + 294542 tcatcaaacttattagatctgtacatttaatttgcagaacaatatgttaatgtgtgtaggtttagcatcttcaggt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 183149 76 + 636262 tcatcaaacttattagatctgtacatttaatttgcagaacaatatgttaatgtgtgtaggtttagcatcttcaggt -s simRat_chr6.simRat.chr6 173406 76 + 647215 taatcaaaggtattagatctgtacattttatttgcagaacaatatgtttatgtgcatgggtttaccatcttcaggt - 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-a -s mr.mrrefChr5 78938 100 + 294542 cgtaaaaaaaccactgtcaaattagcctggaatcaaaaaagagaacctatggcaaacttagttctaggtaaaaaaaattgagctggttggatcatgttgc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224763 100 + 636262 cgtaaaaaaaccactgtcaaattagcctggaatcaaaaaagagaacctatggcaaacttagttctaggtaaaaaaaattgagctggttggatcatgttgc -s simRat_chr6.simRat.chr6 215722 100 + 647215 tgcaaaaaagccactgtcaaatcagcctggaaacaaaaaagagaacccatggcaaaattaattctatgtaaaagaaattgagctggtgggaccatgttgc - -a -s mr.mrrefChr5 79038 15 + 294542 AGattacaatcaatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224863 15 + 636262 AGattacaatcaatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 215828 15 + 647215 ACATTACAATCAATG - -a -s mr.mrrefChr5 79053 77 + 294542 ttcatataggtaggggccaaggattcactagttgatagtggtgttggaggaactggttgtctatcttccaagagcta -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224879 77 + 636262 ttcatataggtaggggccaaggattcactagttgatagtggtgttggaggaactggttgtctatcttccaagagcta -s simRat_chr6.simRat.chr6 215843 77 + 647215 TTCGTATAGGTGGgggccaagaattcactatttgatagcagtgttggaggaactggttgtctatctagcaagaggta - -a -s mr.mrrefChr5 79130 23 + 294542 ttcttagtgccttatacaggttt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224956 23 + 636262 ttcttagtgccttatacaggttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 215932 23 + 647215 ttcttaatgctttatacaggttt - -a -s mr.mrrefChr5 79153 112 + 294542 agaaaagggtctaaatgttagtggatgatcccagaaacactgtccaagatattggcatgggacaacatctatttagataccaaagtcaactgctgtgaattgcaaaatcgat -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 224979 112 + 636262 agaaaagggtctaaatgttagtggatgatcccagaaacactgtccaagatattggcatgggacaacatctatttagataccaaagtcaactgctgtgaattgcaaaatcgat -s simRat_chr6.simRat.chr6 215970 112 + 647215 AAAGAGAAGACTAAACCTTCGCGGATGATCtcagaaacaccatctgggatattggcatagaagaacatctgtttagtcaccaaagtcaactgcagctaaactcaaaatcgat - -a -s mr.mrrefChr5 79265 21 + 294542 gagcacaagtgagatatggac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225091 21 + 636262 gagcacaagtgagatatggac -s simRat_chr6.simRat.chr6 216089 21 + 647215 gagcacaactgagacataaac - -a -s mr.mrrefChr5 79286 24 + 294542 aagagcctgcatggattgaaagaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225118 24 + 636262 aagagcctgcatggattgaaagaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 216110 24 + 647215 aaaagcctgagtggattgatagaa - -a -s mr.mrrefChr5 79310 9 + 294542 tggttacaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 225152 9 + 636262 tggttacaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 216134 9 + 647215 TGGTTAAAA - 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-a -s mr.mrrefChr5 86744 19 + 294542 GATAAAGATTGATTCTAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233259 19 + 636262 GATAAAGATTGATTCTAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 223880 19 + 647215 GATAAAGATGGATTCTACG - -a -s mr.mrrefChr5 86763 114 + 294542 ACTGAGACCTTGTCTTGGTTAGGATCCCAGTCATGCCTGTTCTTTAGTAATCAGAGTTTTCCTCCCTTTTCAGTGGCAGGTCTCAATAGGAAATTGATTAGTACATTATATGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233279 110 + 636262 ACTGAGACCTTGTCTTGGTTAGGATCCCAGTCCTGCCTGTTCTTTAGTAATCAGAGTTGTCTACCTTTTTC----GCAGGTCTCAATAGGAAATTGGTTAGTACATTATATGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 223899 114 + 647215 ACTGGGACCTTGTCTTGGTTAGGATCCCAGTCATGCTTGTTCTTCAGTAATCAGAGTTTTCCTCCCTTTTTAGTGGCAGGTCTCTATAGGAAACTGATTAGCACATTATCTGGT - -a -s mr.mrrefChr5 86877 140 + 294542 AACAATTTGAACTAATTGAACTGACATCTCCTCAGCAGAACTCTTGTGAGTTGTGCTAGACAAATCATACTTAGGCTGCTCAAGCTTGTATTTAGTTCAATCATAGCAATACAGGTCATTCTTGACTGCATTAGAGCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233389 140 + 636262 ATCAATTCGAACTAATTGAACTGACATCTCCTCAGCAGAACTCTTGTGAGTGGTGCCAGACAAATCATACTTAGGTTGCTCAAGCTTGTATTTAGTTCAATCATAGGAATACAGGTCATTCTTGACTGCATTAGAGCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 224014 135 + 647215 AACAATTTGAACTAATTGACCTGACATCTCTTCAGCGGAACTCTTGTGAATTGTGTTGGGCAAATCATACTTAGGCCAACCAAATTTGTTTTAAGGCCAATCATAGCAACACAGGTCATTCTTGACTGCATTAGA----- - 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-a -s mr.mrrefChr5 87349 206 + 294542 CTCAAAATGCAATAACTTTTGCTTGCTCTTGTCTTGGTGTGAACAAAATTGGTTGTGGATGTAAAGCCAAGTTTTGCAAACTAAACCTAGGGGCATAGGCATGCTAAGGTCAACAGGGTCTAAGAAAGGGCATTTGCCTTGAGTGAAGCAACCTTCTAGGTTCGTAGACCACATGATTCTGCCTGTTGTCTGCTCTGAATTAAACG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 233838 205 + 636262 CTCAAAATGCAATAACTTTTGCTTGCTCTTGTCTTGGTGTGAACAAAATTGGTTGTGGGTGTAAAGCCAAATTGTGCAAACTAATCCTAGGGGCATAGGC-TGCTAAGGTCAACAAGGGCTAAGAAAGGGCATTTGCTGCGAGTGAAGTGACCTTCTAGGTTCGTAGACCACATGATTCTGCCTGTTGTCTACTCTGAATTAAACG -s simRat_chr6.simRat.chr6 224503 206 + 647215 TTCAAAATGCAATAACTTTTGCTTGCTCTATTCTTGGTGTGAACAAAATTGGCAGTGGATGTAAAGCTAGGTTTTGCAAACTAAACCTAGGGGCATAGGCATGCGATGGTCAACAGGGTCTAAGAATGGGCATTTGTCTTGAATGAAGCAACCTACTAGGTTTGTATACCACAAGGTTCTGCCTATTGTCTGCTATGAATTAAACG - -a -s mr.mrrefChr5 87555 130 + 294542 ATGTTTATGTAGCAACAAGAACATGCCCACTCAGAAAAGCTACATGGGTGTACCACCTGCATCATATGAAAGGAGGGTTCAAGTAGTCTTTAGAATTAGATCCATATTGGTATATCATTCCACCCCTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234048 130 + 636262 ATGTTTATGTAGCAACAAGAACATGCCCACTCAAAAAAGCTACATGGGTGCACCACCTGCATGATATGAAAGAAGGGTTCAAGTAGTCTTTAGAATTAGATCCATATTGGTATATCATGCCACTCCTTTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 224709 129 + 647215 AT-TTTATGTAGCAACAAGAACATGCTCACTCAGAAAAGCTACATGGGTCTACCACCTGCATCCTATAAACAGAGGGTTCAAGAAGTCTTTAGAATTAGATCCATATTGGTATATCATTCTACCCCTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 87685 162 + 294542 TTGAGTAGGTAGGCGAATCTAACTTTTTTATATCTGAGTAAATACAAGATCTATATAGGAAAGGTCTGGGCCTTACCATTTCCAGACTAGAAAATTTCCTGTATATACACAGGGATGTGTCCATGGGATTTACAGCTCTGCCTGGGGGCTTGATTGGGGACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234180 162 + 636262 TTGAGTAGGTAGGTGAATCTGACTTCTTTTTATCTGAGTAAATACAAGATCTATATAGGAAAGGTCTGGGCCTTACCATCTCCAGACTAGAAAATTTCCTGTATATACACAGGGATGTTTCCATAGGATTTACAGCTCTGCCTGGGGGCTTGATTGGGGACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 224838 161 + 647215 TTGAGTAGGTAGGCGAATCTAACTTTTCTATATGTGAGTAAATACAAGATCTATGTAGGAAAGGTCTGGGCCTTACCATTTCCAGACTAGAGAATTTCCAGT-TATACACAGGGGTGTGGCCATGGGATATACAGCTCTGACAGGGGGCTCGACTGGGGACT - -a -s mr.mrrefChr5 87847 111 + 294542 TGTGCATGTCCAGGCATTACAGTCTGGAACCTTTGTGATTGAAAATAGTCCCTCACTACCAACAACGCAATCGGCTGATACCCTAGGGGCCTCGCATTTTACATAAAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 234345 111 + 636262 TGTGCATGTCGAGGCATGACAGTCTGGGACCATTGTGATTGAAAATAGTCCCTCACTACCAACAACGCAGTCGGCTGATACCCTGGGGGCCTCACATTTTACATAAAGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 224999 108 + 647215 ---GCAAGTCCAGGCATTACAGTCTGGAACCTTTGTGATGGACAATAGTCCCTCACCACCAACAATGCAATTGGCTGATACGCTAGGGGCCTCGCATTTTACTTAAAGAGG - 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-a -s mr.mrrefChr5 96262 148 + 294542 CTATCTTCCATTGTGAGACCCAACTGGGTTCTATCTGAAGCTTTACTGCATCAATCAGGCAGTGAACTATAGTCTTGTTTTGTCTTTTAACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAATAGGGGCTTTAAGCGTTTGCATGTATTAATACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243184 148 + 636262 CTATCTTCCATTAGGAGAACCAACTGGGTTCTATCTGAAGCTTTACTTCATCAATCAGGCAGTGAACTATAGTCTGGTTTTGTTCTTTAACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAATAGGGGCTTTAAGCGTTTGCATGTATTAATACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 233263 136 + 647215 CTATCTTCTGTTGTGAGACCCAACTGGGTTCTATTTGAGGCTTTACTGC---------GCAGTGAACTATAGTCTTGCTTTTTCTTTTGACAAGTGATAATCAGAAGGTCTAAAACA---GCTTTAAGTGTTTGCATGTATTGATACA - -a -s mr.mrrefChr5 96410 255 + 294542 TTCCCTAGCACATACATTTAAGAGTCAGGATGAATAATTGAGAGAGAAGTGATGCTTGAACTCAAGAACGCAGAACTGGAATGTATGAATGACTTAACCATGAATTCAGACTGTAATGCACTCCTACGCTAGATATCCTAGACTCTGTATCAATGAGAGCTGCAGCCGAGTAGCTTCTTATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTTGCCCTGTTAAGCCTTACTTTGATATGTTTCCTTGAGACTATCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243333 243 + 636262 TTCCCTGGCACATACATTTAAGAGTCAAGAAGAATAATTGAGAGAGAAGTGATGCTTGAACTCAAGAACGCAGAACTGGAATGTATAAATGACTTAACCATGAAAACAGTC--TAATGCACTCCTACGCCAGATATCCTAGACTCT-TGTCAATGAGAGCTGCAACCTAG--------CATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTCGCCCTGTTAAGCCTTACGTTG-TATGTTTCCCTGGGACTATCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 233399 254 + 647215 TTCCCTAGCACATACCATTAGGAGCCAGGATGAATAACTGAGAGTGAAGTTATGCTTGAATTCAAGAA-ACAGAACTGGAATATATGAATGACTTAACCATAAATTCAAACTGTAATGCACTCCTTCTCTAGATATCCTAGACTCTGCATCAATGAGAGCTACAGTAGAGTAGCTTCTTATCTTCAATGCTCCCACTGACTCCTATACCTTTGCCCTGTTAAGCCTTACTTTGATGTGTTTCCTTGAGACTATCG - -a -s mr.mrrefChr5 96665 319 + 294542 TGATCGCACACCATTATTGCATTACTGGTTGGGTTGGCCTTCTCTCATCACATATAATGTCTAATACGGAGTTGCACAAAGTTTTAGTACCTGCTGTTGGTCATTAGGGAAACATAATGTGATATTTAAAGTAGAAGATGATGGCCTTGTCCTGCCTCATTCTTGAGATCTACATTTTATTAGTAAAAATTGGGTTCACCTATCACCTGTATAGATAATTCATAGTTGTGGTAGATGCACCTTTACCCTAAACATGGAAATTCAACAGATTGAGTGACTTTAGTGACCACATGATGGGTCAGTCCTGCCCTTTAGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 243592 309 + 636262 TGATCGCACACCCTTAT--CATTACT-GTTGGGTTGGCCTTCTCTTATCACAT-TATTGTCTAACACGGAGTTACACAAAGTTTTAGTA------GTTGGTTATTAGGGAAACATAAAGTGATATTTAAAGTAGAAGACGGTGGTCTTGTCCTGCCTCATTCTTGAGATCTACATTTTATTAGTAAAAATCGGGTTCACCTATCACCTGTAGATGAAATTCATAGTTGTGGTAGATGCACCACCACCCTAAACATGGAAATTCAACCGATTGAGTGACTTCAATGACCATACGATGGGTCAGTCCTGCCCTTTAGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 233653 318 + 647215 TGATCGCACACCATTATTGCATTACTGGTTGGGTTGGTCTTCTCTCATCACATATAATGTGTAATACAGAGTTGCACAAAGTTTTAGTACCTGCTGTTGGTCATTAGGGAAACATAATCTGATATTTAAAGTAGAAGATGATGGCCTTGTCCAACCTCATTCCTGAGATCTACATTTTAACACTAAAAATTGGGGGCACCTATCACCTGTATAGATAATTTATAGTT-TGGTAGATGCATCTTTACCCTAAACATGAAAATCCAACAGATTCAGTGACTTTGGTGACCGCATGATGGGTCTGTCCTGCCGTTTAGCACA - 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-a -s mr.mrrefChr5 97277 68 + 294542 CTATCCTATGAATTTATTGGTGTTCATGAAACTTCACTGGGATGGATGAACTCGACTGTGGTTTATAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244195 54 + 636262 --------------TATTGGTGTTCATGAAACTTCACTGGGATGGATGAACTTGACTGCATATTATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 234265 68 + 647215 CTATCCTATGAATTTATCCGTGTCCATGAAACTTCACTGGGGTGGATGAACTCGACTGTGGTTCATAA - -a -s mr.mrrefChr5 97345 380 + 294542 CCCACTGAATCAGATGAAAGGGGTATTGTCAAGTGCACATTGCCAATTCTCAGTGAAGTAGTGTAGTGATTGACCATCAGGCACTACTATCAGTGTGAACATCAGTGTGAACAGCATTCTTTAGTGATTAAGCTTTTGATAGAAGACAGCTTCATTGAGAGCACATGAGGTATCTTTTGCTTTCAATAGCAGATGTCCTACCAACTAGAGTCTTTCAATTTCTTTTGTGCACAAATTAATGAGTGCCACATTGCCACAATGTTCGTAGCCCCTATAAGGAGGTTGTTTGTCTTACAAGCATGGGAACCAGAGTGTACTCACTGCCGGTGCTTTCCAGCATCTAGAAAGAATACAGATCAGGATGTTAGAGAGCACTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 244251 371 + 636262 CCCACTGAAACAGATGATAGGGGTATAGTCAAGTGCGCAATGCGAATTCTCAGT-----TGTGTCGTGATTGACCATTAGGCACTACTATAAGTGTGAACATCAGTGTGAACAG---TCATTAACAATTAAGCTTTTGATAGAAGACAGCTTGATTGAGAGCACATGAGGTATCTTTTGCTTTCAATAGCAGATGGCCTACAAGCTAAAGTATTTGAATTTCTTTTTTGCACAAATTAATGAGTGCCAGATTGCCACAACGTCAGTAGCCCCTACAAAGAGGATGTTTGTTTTACAAGTATGGGAACCAGAGTGTACTCACTGCCGGTGCGTTGCAGCATCTAATAAGAATACAGATCAGGATGTTA-AGATCACTCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 234333 377 + 647215 CCCACTGAATCTGATGAAAGGGGTAATGCCAAGTGCACATTGCCAATTTTCAGTGAAGTAATGTAGTGACTGAC---CATGCACTACTATCAGTGTGAACATCAGTGTCAGCAGCATTCTTTAGTGATTAAGCTTGTGATAGAAGACAGCTTCATTGAAAGCACATGAGGTATCTTTTGCTTTCAATAGCAGATGTCCTACCAACTAGAGTCTTTCAATTTCTTTTGTGCACAAATTAACGAGTGCCACATTGCCACAATGTTCGTAGCCCCTATAAGGAGGTTGTTTGTCTTACAAGCATGGGAACCAGAGTGTACTCACTGCGGGTGCTTTCCAGCATCTAGAAAGAATACAGATCAGGATGTTAGAAAGCACTCAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 234876 189 + 647215 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GATGTCCTACCAACTAGAGTCTTTCAATTTCTTTTGTGCACAAATTAATGAGTGCCACATTGCCACAATGTTCGTAGCCCCTATAAGGAGGTTGTTTGTCTTACAAGCATGGGAACCAGGGTGTACTCACTACCGGTGCTTTCCGGCATCTAGAAAGAATACAGATCAGGATGTTAGAGAGCACTCAGG - 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-a -s mr.mrrefChr5 114199 16 + 294542 CTGGCTAGCACAGCGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375634 16 - 636262 CTGGCTAGCACAGAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 251425 16 + 647215 CTGGCTAGCACAGCAC - -a -s mr.mrrefChr5 114215 83 + 294542 TAAGATGATAAGATGGGTGATACACTGTGGAGGTGATGCCTGGCCAGCACAGCATAGGCCTAATTATCGTTAAAGGCATATTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 375650 16 - 636262 -------------------------------------------------------GGGCCTAATTATCGTC------------ -s simRat_chr6.simRat.chr6 251456 83 + 647215 TAAGATGATAAGATGGGTGATACACTGTGGAGGTGATGCCTGGCCAGCACAGCATAGGCCTAATTGTCATTAAAGGCATATTC - -a -s mr.mrrefChr5 114298 53 + 294542 TTCACCACCAGGACAAATAAACCCATCATTGAGTCAGACAGGGAATGGTCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261769 47 + 636262 TTCACCACCAAGGCAAATAAACCCATCATTGAGTCA------GAATGGTCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 251539 53 + 647215 TGCACCACCAGGACAAATAAACCCATCATTGAGTCAGACAGGGAATGGTCATC - -a -s mr.mrrefChr5 114351 60 + 294542 AAGCCTATCTTTCACTGACTACAACATATTTAACTTGTAGGAACAGTCATATATGCCAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261816 49 + 636262 -----------TCACTGACTACAACATATTTAACTTTTAGGAACAGTCATATATGCCAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 251594 59 + 647215 AAGCCTATCTTTCACTAACTTCAACATATTTAACTTGTAGG-ACAGTCATATATGCCGAA - -a -s mr.mrrefChr5 114411 45 + 294542 CTTGGCTTGTTGTATTCAAGACTAGAGACAGCAACCAATTCAGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261865 45 + 636262 CTTGACTTGTTGTATCCAACACTAGAGACAGCAACCAATTCAGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 251654 45 + 647215 CTCGGCTTGTTGTATTCATGACTAGAGACAGTAACTAATACAGGC - -a -s mr.mrrefChr5 114456 252 + 294542 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCATCAAGCAGTATCCACAACGTTGCTAAGATTGATCATGCAAGGAATATGAAGTTTCATCATGGAGAATGGAGAATGGACACAGGAGAAGTGAGGAAACTTCTTGGACTACTACATTTGACTGTGTAGCGGTGGCTGAGTCTACATCAACGGTATGTACCTCTGTTCAGCAAATATGTTTTGTCTTTTAAGATGTTCCAGTATGGGAATAGATTTGCTAAGATGTCATGCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 261915 251 + 636262 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCACCAAGCAGTATCCACAACATTGCTAAGATTGATTGTG-AAGGAATATGAAGTTTCATCATGGCGAATGCAAAATGGACAAAGGAGAAGTGAGGAAACTTCTTGGACTTCTACATTTGACTGTGTAGCAGTGGCTGAGTCTACATTAACGGTATGTACCTCTGTTCGGAAAATATGTTTTGTATTTTAAGATGTTCCAGTATGGGAATAGATTTGCTAAGATGTCATGCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 251699 252 + 647215 TAGGGAGTTTTAACAGAACAGCATCAAGCTGTATCCACAACGTTGCTAAGATTGATCATGCAAGGGATGTGAAGTTTCATCATGGAGAATGGAGGATGGACACTGGAGAAGTGGGGAAACTTCTTGGACTACTACCTTTGATTGTGTAATGCTGGCTAAGTTTACACCAATGGTATGTACCTCTGTGCAGCAAATATGTTTTGTCTTCAACGATGTTCCAGTAGGGGAATAGATTTGCTAAGACAGCAGGCC - -a -s mr.mrrefChr5 114708 351 + 294542 AAGTCATAGTGGGTATTCAATACTTGCACCTCCAATCCAATTGATTGCCTGCATGTTTCTATTTCTAGGGTTCCCACATAGTTTGTTTTTGGTCTGATAAACAATCTCCAACTTGGTTACACCCAACTAAATGAGCCTGGCACTCCCAAACCTCAAGAAGTTTGAATAACAGACAATGAAGATCATTCTAGAACCACTATGGATAATAGCTAACCAGACTTTCAGATTCACATATTGGGGGTACTCATTTTATTTACAGAGTATTACCAAATATTAGTGGCATCATAATGGCTTCTTAGTTTCAAAGACATGTGCAATCCACAGGAGAAAAGGGTCTAATGTCCTAACACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 262169 350 + 636262 AAGTCATAGTGGGTATTCAATACTTGCACCTCTAATCCAATTGATTGCCTGCATGTTTCTATTTCTAGGGTTCCCACATAGTTTGTTTTTGTTTTGACTAACTATTTCCAACTTGGTTACACCCAACTAAATGAGCCTGGCACTCCCAGACGTCAAGAGGATTGATTAACAGACAATGAAGATCATTCTGGAACCACTATGGATAATAGCTAACCAGACTTTCAGATTCACAAATTGGGGGTACTCATTTGATTTAGAGAGTATTACTAAATATT-ATGGCATCATAATGGCTATTTAGCATCAAAGACATGTGCAATCCACAGGAGAAAAGGGTCTAATGTCCTAACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 251951 332 + 647215 AAGTCATCATGGGTATGCGATCCTTGCAACTCCATTCCAATTGATTGCCCACATGTTTCTATTTGCAGGATTCTCAGATAGTTTGTTTTTGGTCTGATAAATAATCTCCAACTTGGTG-CACCCACCTAAATGAGCCTGGCACTTCCAAACCTCATGAAGTTTGAATAACAGGCAATGGA-ATCATTCTAG------------TAATAGCTAGCCAGAATTCCAGATTCACATAATGGGG--ACTCGTTTTATATACATAGTATCACCAATTATTAGT---ACCACAATGGCTTCTTAGTTTCAAAGACATGTGCAATCCACAGGGGAAAAGGGTCTAATGTCCTAACACA - -a -s mr.mrrefChr5 115059 120 + 294542 CAGATTGTTGTTTGTAGGTCATTTTTGACTCGACATCCCTTCAGAGACTTTTGAAGCTAAGTTCATCAACTTGGAGACTAGTGCACACCTCAGACCTGTCCATCATATAGACAGTTAGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 262520 120 + 636262 CAGATTGTTGTTTGTAGGTCATTTTTAACTCGACATCCCTTCAGAGACTTTTGAAGCTAAGTTCATCAACTTGGAGACCAGTGCACACCTCAGAGCTGTCCATCATGTAGACAGTTAGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 252283 120 + 647215 CAGGGGTTCATTTGTAGGTCATTTTTGACTTGATAATACTTTAGAGACTTTGGGGGCCAAGTTTATCAACTTACAGCCTAGTGCACACCTCAGACCTGTTCATCACATAGACAGTGAGTA - -a -s mr.mrrefChr5 115179 437 + 294542 AAATATTATGTTAAAGCAGGGTAACACAATTGTCGTGGGAACTGACCAAAAGTCAGGGTGATGAGGGTTCAGCCAGTTATCCAAGAGGCTAAATCTTTGCAGTGGATTCTCCCATTTTAGTATTCTTAGGAAGTTGCACCCTAATGTTATACCAAAGGGCTAACACATGCAGGACTCAGGTAAAAGAACCATGGGTACTCTGTTGTGAGCACAAGGGAGAGCAACTAACTGGCTTGGATTTTAGCAGGATATTAAAACCTTAGAGTAATAGCTCATAGCAGAGATCAGTGACTATCATGTTTCAGAATATGAATCCAACAGGCATATCATCCCAGCACAAGGGTCAGGATAAATGAAGGCACCCTGTGCTTTTCATTGCAAACACACCCTTATCTATATACTTATGCTACCACTTCTTTGTATTGACACTTAGTTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 262640 410 + 636262 AGATGTTATGTTAAAGCAGGGTAACACAATTGTCGTGGGAACTGACCAAAATCCAGGGTGATGAGGGTTCAGCGAGTTATCCAAGAGGCTAAATCTTTGCAGTGGATTCTCCCATCTTAGTATTCTTAAGAAATTGCACCCTAGTGTTACACCAGAGGGCCAACACATGCAG--CTCAGGTAAAAGAACCATCGGTACTCCGTTGTGAGCACAAGGGAGAGCAACTAACTGGCTTGG-TTTTAGCAGGATATTAAAACCTTAGAGGAATAGCTCATAGCAGAGATGAGTGACTATCATGTTCCAGAATATGAATCCAACTGGCATATCATCCCAGCACAAGGGTCAGGATAAATGAAGGCACCCTGTACTATTCATTGCAAACACCCC------------------------CTTCTTTGTATTGACACTTAGTTGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 252404 427 + 647215 AAGTATTATGTTAAAGCAGGGTAACACAATTGTCATGGGAAATGACCAAAAGTCAGGGCGATGAGGGTTCTGCCAGTTATCCAAGCGGCTAATTCTTTGCAGCTGTTTCTCATATTTTACTACTCTTAGGAGGATGCACCCTAAAGTTATACTAAAGAACTATCACATGCAGGACTC------AAGAACGATGGGTACTCTGTTGTGAGCACAAGGGGGAGTGAATAACGGGCTGGGATTCTAGCAGGATATT-AAGCCTTGGAGTACTACTTCATAGCAGAGATCAGTGACTATCGTGTTTCAGAATATGAAACCAACAGGCATATCATCCCAGCAGAAGGGATAGGAGAAATGAAGGCATCCTGTGCTTTTC---GCAAACACACCCTTATCTATATACTTATGCTACCACTTCTTCGTATTGACACTAAGTTGT - -a -s mr.mrrefChr5 115616 109 + 294542 GAAAAGTAATTTAGAAATTCACCAGGAGCTATTCACTCTGTCAATAGGATGATTAGGTTCACACAATTTATTTTAATGTAGCTTGATTATGCCGGGAACATCAGGTTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263055 109 + 636262 GAAAAGTAATTTAGAAATTCACCAGGAGCTATTCACTCTGTCAATAGGGTGATTAGGTTCACACAATTTATTTTAATGTAGCTTGATTATGCCGGGAACATCAGGTTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 252831 109 + 647215 AAAAAATCATTTAGGAATTCACCAAGAGCTATTCTCTCTGTCGCTAGGATTATTAGGTTCACACGATTTATTTTAATGTAGATTGATTATGCCGGGAACATTAGGTTTC - -a -s mr.mrrefChr5 115725 117 + 294542 AATGTATGCCCACACTAACTAAGCTTTTAGAGCTAAGCATCCTCACTCACGCAAAATGGCTTGAGGAAATGGTTGAGCAGGGTAGGCCCACCATCAATATTGAGTTGATTTGAACTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263164 117 + 636262 AAAGTATGCCCACACTAACTAAGCTTTTAAAGCTAAGCATCCTCACTCACGCAAAATGGCTTGAGGAAATGGTTGAGCAGGGTAGGCCCACCATCAATATTGAGTTGATTTGAACTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 252941 117 + 647215 AATGTACGCCCACACTAACTAAGGTATTGGACCTAAGCATCCTCATTCAGGCAAAATGGCTTGAAGAGATGGTTGGGCAGGGTAGACCCGCCGTCAATATTGAGTTGATTTCAACTG - -a -s mr.mrrefChr5 115842 18 + 294542 TGTGCTTCATGCCACTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263282 18 + 636262 TGTGCTTCATGCCACTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 253058 18 + 647215 TGTGCTTCATGCCACTCC - -a -s mr.mrrefChr5 115860 32 + 294542 AAGGCCCAAAATACAAGGGATTTTAGTTAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263300 32 + 636262 AAGGCCCAAAATACAAGGGATTTTAGTTAAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 253077 32 + 647215 AAGGCCCAAATTATAAGGGATTTTAGTGAAGG - -a -s mr.mrrefChr5 115892 107 + 294542 CATTTGGTATTCAACAAAGAAAGAATTAAGCTTTTATGTGCAGCTTAATATGACGTGTGGAGTGATTTATAGAGTACATTTCCTTAGAACATCTTCACATAGTATTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263335 107 + 636262 CATTTGGTATTCAACAAAGAAAGAATTAAGCTTTTATGTGCAGCTTAATATGACGTGTGGAGTGATTTATAGAGTACATTTCCTTAGAACATCTTCACATAGTATTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 253109 107 + 647215 CATTTGGTATTCAATAAAGAAGGAAGTAAGCTTTGATGTACAGTTAAATATGGTATATCAAGTGGTTTATAGAGTACATTTTCCTAGAACATCTTGATATAGTATTA - -a -s mr.mrrefChr5 115999 170 + 294542 CAATGAACACGAGGAATAGGTAGAATGCCTAAGAAATGGAGTTTTCACAGGATAAAGGTGATAATAGAATTACTGGAGATTACACCCCAGATAACTTTGGCACTGATTCACTAGTCAACAGTATCAACATGCAAGGCAGCTGATCACCAGTCAGCTCAGGTTTGGGCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263442 170 + 636262 CAATGAACACGAGGAATAGGTAGAATGCCTAAGAAATGGAGTTTTCACAGGATAAAGGTGATAATAGAATTACTGGAGATTACACCCCAGATAACTTTGGCACTGATTCACTAGTCAATAGTACCAACATGTAAGGCAGCTGATCACCTGTCAGCTCAGGTTTGGGGATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 253224 170 + 647215 CAATTAGCATGAGGAATAGGTAGAATGCCCAAAAAATGAAGATTCCACAGGATAAAGGTGATAGTGGAATTATCGGAGATTACACCCCAGATAACTTTGGCACTGATTCACTAGTCAACAGTATCAACATGCAAGGCAACTGATCACCAGTCAGCTCAGGTCTGGGCATT - -a -s mr.mrrefChr5 116169 113 + 294542 TGACTCCATACCCTGAAGTAATTACAACAGGGTATTCCTTATAAGCTTGATACTAGCATTGGGGAAGTAGTAGGCGCTAGGGAGAATGTAGTGGTAATAACTTCATGTAGATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263613 104 + 636262 TGACTCCATTCCCTGAAGTAATTACAACAGGGTATTCC---------TGATGCTAGCATTGGGGGAGTAGGAGGCGCTAGGGAGAATGTAGTGGTAATAAGTTCATGTAGATG -s simRat_chr6.simRat.chr6 253394 97 + 647215 TAACTGTACACCCTGAAGTAATTACAGCAGGGTGATCCTTATAAGCTTGATACTGGCATTGGGTAAGTAGTAGG---------GAATGT-------ATAACTTCATGTAGGTG - -a -s mr.mrrefChr5 116282 30 + 294542 CAATCTTTGAACAAAACAAACCCTGTCAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263717 30 + 636262 CAATCTTTGAACAAGACAAACCCTGTTAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 253493 30 + 647215 CAATCTACGAACCAAACAAACCCTGTCAGG - -a -s mr.mrrefChr5 116312 95 + 294542 TGAGTGCAGGGAAATGGCCCACATCACTCTGAGTCTGCACCTGCACATGTGCTTAAGCCTCCAAGCTAACACCCAAACGAGCCTATTAGCTTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 263766 93 + 636262 TGATTGCAGGGAAATGGCCCACATCACTCTGAGTCTGCACCTGCACATATGCTTAAGCCT--AAGCTAACACCCAAACGAGCCTGTTAGCTTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 253523 95 + 647215 TGAGTGCAGGGGGATGGCCCACATCACTCTGAATCTGCATCTGCACATGTGCTTAAGCCTCCGAGCTAACACCCAGACATAGCTATCAGCTTGAC - 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-a -s mr.mrrefChr5 116755 11 + 294542 aaatctcctaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264211 11 + 636262 aaatctcctaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 253985 11 + 647215 aagtcccctaa - -a -s mr.mrrefChr5 116766 107 + 294542 actgaactgcttacaattgacactgtggagactgaaacactgataccatgcactcagatgatatttggctgttagcagggtccatacaggcaactttccagtgactg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264223 107 + 636262 actgaactgcttacaattgacactgtggagactgaaacactgataccatgcactcagatgatatttggctgttagcagggtccatacaggcaactttccagtgactg -s simRat_chr6.simRat.chr6 253996 107 + 647215 attgaactgctcacaattgacactgtgcggactaaaataccactatcatgcactctaacagtgttatgctcctaacggggtccatacaggcgacttcacagtgactg - -a -s mr.mrrefChr5 116873 70 + 294542 gaggtactggcaaagctgtgacagaaaactgtgggggcacaaaatgctcaattgttgggatttgccgcga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264330 70 + 636262 gaggtactggcaaagctgtgacagaaaactgtgggggcacaaaatgctcaattgttgggatttgccgcga -s simRat_chr6.simRat.chr6 254119 70 + 647215 gaggtactgccaaagctatgacagaacaccgtgggggcacaaaatgcgtactttttggaatcatccgtga - -a -s mr.mrrefChr5 116943 95 + 294542 gtaggctgtagaaaagggaaaaaattattcctaaaacaaaaggttgtaaaaacctctgataaactagcttgctgtcccaACAAACACCTGGATGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 264401 95 + 636262 gtaggctgtagaaaagggaaaaaattattcctaaaacaaaaggttgtaaaaacctctgataaactagcttgctgtcccaACAAACACCTGGATGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 254189 95 + 647215 gtaggctgtaaaaaagggaaaaagttattcctaaaacagaagattatcaaaacctctgataaaccagcttgctgtcccaAAAGACCCATGGATGA - 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-a -s mr.mrrefChr5 118275 9 + 294542 CTTGCATGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266681 9 + 636262 CTTGCATGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 255480 9 + 647215 CTTGCATGG - -a -s mr.mrrefChr5 118284 38 + 294542 ATTGACCTGAAGTGTTTCCCAGTGGTCATTGACTTACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266690 38 + 636262 ATTGACCTGAAGTGTTTCCCAGTGGTCATTGACTTACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 255497 38 + 647215 GTTGACCTGAAGTGTTTCCCCGTGGCTATTGACTTACC - -a -s mr.mrrefChr5 118322 8 + 294542 TATGATTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266729 8 + 636262 TATGATTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 255535 8 + 647215 TACGATTG - -a -s mr.mrrefChr5 118330 69 + 294542 CCCAACATAATTCCAGAATGCTATAGAGTATGAAACCTCCACAACAGTGCGTTGGGGTAGTGAACTTCG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266738 69 + 636262 CCCAACATAATTCCAGAATGCTATAGAGTATGAAACCTCCACAACAGTGCGTTGGGGTAGTGAACTTCG -s simRat_chr6.simRat.chr6 255543 69 + 647215 CCCAACATAACTCCAGAATGCTTTAGAGTATGAAACCTCCCCAATAGTGGGTTAGGGTAGTGTACTTCA - -a -s mr.mrrefChr5 118399 26 + 294542 TATTAGCACCTCTGCCAGAAGATTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 266807 26 + 636262 TATTAGCACCTCTGCCAGAAGATTGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 255613 26 + 647215 TATTAGCATCACTGCCAGAAGATGGG - 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-a -s mr.mrrefChr5 130031 161 + 294542 GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCGGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTACCATGAGAGGAAGTCTAGAACACTGTAAGTGCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278590 161 + 636262 GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCAGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTAGTGTGAGAGGAAGTCTGGCACACTGTAAGTGCTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 267790 86 + 647215 ---------------------------------------------------------------------------AGACCCGGGCTTTTGGCTCTCACCCTAAGAATGGTCTGGGAGAGGAAGTCAACCATGAGAGGAAGTCTAGAACCCTGTAGGTGCTA - -a -s mr.mrrefChr5 130192 291 + 294542 AACACATGGAACTATAATTTCTTATAACAAGCAGGCAGTCCATAATGTGGCCTACAATCCTCCATACTCTCCAATCATTTGGTTGGCACTAAGCAGCAACTGGATTCATTGTACCACAGTAGGGGTTATTGGAAGTGATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTCCAGGTGGATGGTATATATACCAAGCTGGTGAAAATATTTTTCAAGTCATCTGGTGTGGTTGCTCTTATAGCTTCATTCTTAGTATGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGATCTGAGGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 278751 291 + 636262 AACACATGGAACTATAATTTCTTGTAACAAGCAAGTAGTCCATAATGTGGCCTACAATCCTCCATACCCTCCAATCATTTGGTTGGCATTAAGCGGCAACTGGATTCATTGTACCACAGGGGGGGTTATTGGAAGTAATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTGCAGGTGGATGGTGTATATACCAAGCTGGTGCAAATATTTTTCAAGTAATCTGGTGTGGTTGCTCCTATAGCTTCATTTTTAGTACGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGATCTGAGGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 267881 285 + 647215 AACACATGGAACTATAATTTCTCATACTACGCAGGCAGTC-----TGTGGTCTATGATCCACCATACTCTCCAATCATTTGGTTGGCACTAAGCAGCAATTGAATTCATTATACCAGAATAGGGGCTATTCGAAGTGATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTCCAGGTGGATGATATATGTGCTAAGCCGGTGAAAATATTTCTCAAGCCAACTGGTGT-GTTCCTCTTATAGCTTCATTCTCAGTATGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGTTCTGAGGT - 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-a -s mr.mrrefChr5 131387 94 + 294542 TCCATCAATTCAATCTAGAGCACAGAACAAGAATTACAGTTTGCCAAGGCGGCAAAGTTGGTCATAGATTAACCCTTCCACTACCCATGCCCTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280333 83 + 636262 TCCATCAATTCAATCTAGAC---ACAACAACAATTAC--TTTGCCAAGGCGGCAAAGTTG--TATAGATTAACCCTTCCACTACTCCTG----G -s simRat_chr6.simRat.chr6 269003 92 + 647215 TCCATAAATTCGATCTAGAGCACAGAACAAGTATCACAGCTTGCCAAGGCAGCAAGGTTGGTCACAGATTAACCCCTCCACTACCCA--CCCTG - -a -s mr.mrrefChr5 131481 148 + 294542 CTGGGGATTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAACTAGGAACATGAATTGTAAAATTTGACACTATTGGGTTCATGAGCACCCGTCAGATGTGGTCCAAGAGTGCTATAACAATCAATTCAGTGGGGCGAGAGTTAGATCCCAGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 280416 147 + 636262 TAGGGGACTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAA-TAGCAACCTAAATTGTAAAATTTGACACTATTGGGTTCATGAGAACCCGTCAGATGTGGTCCAAGAGTGCTATAACAATCAATTCAGTGGGGCGAGAGTTAGATCCCAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 269101 91 + 647215 CTGGGGATTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAACTTGGAGCATGAATAGGAAAATTTGACACTATTGAGTTCATGAGCAC---------------------------------------------------------TCCCAGT - 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-a -s mr.mrrefChr5 135629 73 + 294542 ATGTGCAGTGGTTCTACCACTTGTGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284577 62 + 636262 ATGTGC------TTTACC-----TGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 272977 73 + 647215 CTTTGCAGTGGTTCTTCCACTTGTGCCACTGTATTAGTCTTGCAAACTCAGTCGCTGCAAGGTGAATCTCTGT - -a -s mr.mrrefChr5 135702 55 + 294542 ACCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284639 55 + 636262 GCCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 273051 55 + 647215 ACCCTTTACAGCCATGAGTACTATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAGCTCTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 135757 68 + 294542 CCTACTTACTCGAACAGAGCTCATTTTGCAACTGTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284694 63 + 636262 CTTACATACTTGAACAGAGCTCATTTTGCAGCTGTACTTGATCGACCTAGGTAGCCAGAGCTA----- -s simRat_chr6.simRat.chr6 273107 68 + 647215 CCTACTTTCTCGAGCAGAGCTCATTTTGCAACTTTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG - -a -s mr.mrrefChr5 135825 348 + 294542 CTTTATGCATGACTTGGGGTTGCTATAAAGGAAAATAGTGACAGATTTATTGATTCCATGTCTTGGATAATTGGAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGACGGAAGGCCATGAACATACCTCTCCAGCATTGTTTCTGAACATTTTGGGTGGCCCAGGGCAGTGTAGAATGTGTGATCATATCTTGAGGAAGTGCTTCCATGTTAGTAGAAGAAGATAGCCAATTATTGCCAAAAACATACGGTTCCAGTTCAGGTCCTCTTTTTAAGCAGATGGGGGGTGCCATAAACCATAAGTTATGTCAGAATGACATTAAGGGCCCTAGGTTGACTTTTATTCTCCTCTAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 284757 337 + 636262 ----------GACTTGGGGTTGTTATAAAGGAAGATAGTGACAGATTTACTGATTCCAGGTCTTGGCTAATTGAAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGACGGAAGGCCATGAACATACCTCTTCAGCAGTGTTTCTGAACATTTTAGGTGGCCTAGGGCAGTA-AGAATGTGTGATCATATCTTGAGGAAGTGCTTCCATGTTAGTGGAAGAAGATAGCCAATTATTGCCAAAAACATACGGTTCCAGCTCAGGTCCTCTTTTTAAACAGATGGGGGGTGCCATAAACCATAAGTTATGTCAGAATGACAGTAAGGGCCCTAGGTTGACCTTTATTCTCCTCTAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 273181 339 + 647215 CTTTATGCATGACTTGGGTTCACTATAAAGGAAAATAGTGACAGATTTATTGAGTCCATGTCTTGGAAAATTGGAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGAAAGAAGGCCATGAACATACCTCTCCAGCATTGTCTCTGAACACTTTGGGTGGCCCAGGGCAGTGTAGATCGTGTGATCATATCTTACAGAAGTGCTCCCATGCTAGTAAAAGAAGATAGCTGATTATTGCCACAAACATACAGTTCCTGTTCAGGCCCTTTTTTTAAGCAGATGGGAGTTGCTATAAACCATAAGTTATGTCAGACTGACATTAAGGGCCCTAGGTTGACTTTTGTTCT--------- - -a -s mr.mrrefChr5 136173 27 + 294542 AACATTGACTTTTATTCTACTCTAAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285095 27 + 636262 AACATTGACTTTTATTCTACTCTAAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 273520 24 + 647215 ---ATTCACTTTTATTCTACTCTACGG - -a -s mr.mrrefChr5 136200 257 + 294542 AACTTCTTCCAAGTGCCACTGCTATCAGCTAGTGCCTTACCTTGTGATTGCCAGAACATCAGTCTACACTCACAGAATGTCTCCTGTAACCAAATTAACAAAATTAACCTTAACAAAACTAACCTTACTGAAGGTCCTTAGTCTCTTTTATGTGTTTAACATGCAGTTAACAACTTGTTAGCTTACAATTGTTGGACACAATAATATTGCCAGTGTAACCCATTCAAGTCATATAATTTGTTGTCTCATCAGCCAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285122 242 + 636262 AGCTTCTTCCAAGGGCCACTGCTATTAGCTAGTGCCTTACCTTGAGATTGCCAGAACATCAGTCTACACTCACAGAATGTCTCCTGTAGCCAAA---------------TTAACAAAACTAACCTTACTGAAGGTCCTTGGTCTCTTTTATGTGTTTAACATGCAGGTAACAACTTGTAAGCTTACAACTGTTGGATACAATGATATTGCCAATGTAACCCATTCAAGTCGTATAATTTGTTGTCTCATCAGCCAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 273549 252 + 647215 AACTTCTTCCTAGTGCCACTGCAATCAGCTAGTGCCTTACTTTGTGACTGCCAGAACATCTGTCT---CTCACACAATGTCTCCTGTAACTAAATTAACAAAATTAACCTTAACAAAATTAACCTTACTGAAGGTCCTTAGTCTGTTTTATGCGTTTAACATGCAATTAACAGCTTGTTA--TTACAATTGTTGGACACAACAATATTGCCAGTGTAACCCATTCAAGTCATATAGTTTGTTGTCTAATCAGCCAAC - 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-a -s mr.mrrefChr5 136686 81 + 294542 CCAACATCCAAGTATCTGGAGTTTGGTAATTATGGAGACTTGCAGGGCCTTTTAGTAGTCTTACATCAAACTATTAGGAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285600 81 + 636262 CCAACATCCAAGTATCTGGAGTTTGGTAATTATGGAGACTTGCAGGGCCTTTTAGTAGTCTTACATCAAACTATTAGGAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 274044 81 + 647215 CCAACATTCAGGCATCTGGAGTATGGTAACTATGGACACTTGCAGGGCCTTTTAAATGTCCTATGTCGAGCTATTGGGAAT - -a -s mr.mrrefChr5 136767 9 + 294542 GTACAGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285682 9 + 636262 GTACAGGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 274125 9 + 647215 GTACAGGTA - -a -s mr.mrrefChr5 136776 43 + 294542 TCCAAAGGATGACAAGAGTAGACCAATACCTTTTAATTGTCCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285691 43 + 636262 TCCAAAGGATGACAAGAGTAGACCAATACCTTTTAATTGTCCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 274145 43 + 647215 TTCAAAGGATGGCAAGAGTAGACCAATACCTTTTAATCGTCCT - -a -s mr.mrrefChr5 136819 147 + 294542 ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAGTGCGCAGACCCAAAGGATGTCAAGAGTAGACCAATGCAATAGATTGCGTAGTTAGCAACAGGCAGCTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGAAGGTTGTGTCATCCTGACCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285734 147 + 636262 ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAGTGCGCAGACCCAAAGGATGTCAAGAGTAGACCAATGCAATAGATTGCGTAGTTAGCAACAGGCAGCTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGAAGGTTGTGTCATCCTGACCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 274190 147 + 647215 ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAATACACAGATCCAAAGGATAGTAAGAATAGACCAATGCAATAGACCACACAGATAGCAACTGGCAACTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGACTGTTACAGCAGCCTGACCTT - -a -s mr.mrrefChr5 136966 133 + 294542 GTCTTCTGAATCAGGCAATATATTAATTTTAATAGAAAGATTTTAAGGTCAGGGGCATCTTATCTTTGCCAAAATGAAGGTTAATGATACATTACAATTTTCAAGTTGCTCAGCTGAGAAGGTTAAGACCCTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 285881 133 + 636262 GTCTTCTGAATCAGGCAATATATTAATTTTAATAGAAAGATTTTAAGGTCAGGGGCATCTTATCTTTGCCAAAATGAAGGTTAATGATACATTACAATTTTCAAGTTGCTCAGCTGAGAAGGTTAAGACCCTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 274341 133 + 647215 GTCTTCTGAATCAGCCAATATATTAATATTCACAGAAAGATTATAAGGTCAGGAGTATCTTACTTTTGCCAAACTGAAGATTTACTGAACATTACAAGTTACAAGGTGCTCAGCTGAGAAGGCTAAGACGCTT - -a -s mr.mrrefChr5 137099 170 + 294542 CAAGTCCAGCACTTTATTTTGTTTAGGCACTGGACTCTTCATAGCCACTAGAGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAACTCCTCCGCTATCAGTATCTTCATCTACAGGTCCAGTCCTTCAATCGTCTTTCCATCAGGACCCTCATTGTGGACACAGGCGCAGATTCCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286031 170 + 636262 CAAGTCCAGCACTTTATTTTGTTTAGGCACTGGACTCTTCATAGCCACTAGAGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAACTCCTCCGCTATCAGTATCTTCATCTACAGGTCCAGTCCTTCAATCGTCTTTCCATCAGGACCCTCATTGTGGACACAGGCGCAGCTGCCCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 274474 170 + 647215 CAAGCCTAGCATTTTGTTTCATTTGGGCAGTGGGCTCTTCATAGCCACCTGTGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAATTCCTGCTCTATCAGTATCTTCACCTACTGGATCAGTCCTTGAATTTTTTCTCCATCAGGGCCCTCATTGTGGACTCAGGCCCAGAGTCCCC - -a -s mr.mrrefChr5 137269 32 + 294542 TAAATTCCAGATGCTTAAGGATCAGGTCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286204 32 + 636262 TAAATTCCGGATGCTTAAGGATCAGGTCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 274644 32 + 647215 TAAATTCCAGATGCTTAAGGATCAGGTCTGTA - -a -s mr.mrrefChr5 137301 97 + 294542 GATATCTGATGCACAATAATTTTCTATCAACCTAATTTCCTATCCACTGTCTCAATGATCTCTTTAGATCTGGATATGTGAAATCTTAGTTACAAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286264 97 + 636262 GATATCTGATGCACAATAATTTTCTATCAACCTAATTTCCTATCCACTGTCTCAATGATCTCTTTAGATCTGGATATGTGGAATCTTAGTTACGAGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 274676 29 + 647215 GAAATCCT--------------------------------------------------------------------TGTGAAATCTTTGTTACAACG - -a -s mr.mrrefChr5 137398 15 + 294542 CAAAGGGATCACTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286362 15 + 636262 CAAAGGGATCACTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 274705 15 + 647215 TAAAAGGATCACTAA - -a -s mr.mrrefChr5 137413 256 + 294542 TAGGTTACTATCCTCCAAGTGACTGTATGGACTTCAAATAACCAATTAGTTAACGGGTCAAGTGTTCAAAATTTTCAGACTCCAACTGCCATGGCAATTCTGCTGACATACCTCCATGCACATTCAAGGAACTCAAGGCGTCTGATGGCCATACAATTAAATCATGGCTTGGAAAATTCTACTTCCTGCAACTTCAAGAAAGGCCTTGAACCCGATTAATAAGTACCCCACAAACCCACCTTTACTTGCCACTATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 286396 254 + 636262 TAGGTTACTATCCTCCAAGTGACTGTATGGACTTCAAATAACCAATTAGCTAACAGGTCAAGTGTTCAGAATTTTCAGATTCCAACTGCCATGGCAATTCTGCTGGCAAACCTCCATGCACATTCAA--AACTCAAGGCATCTGATCGCCATACATTTGAATCATGGCTTGGAAAATTCTACTTCCTGCAACTTCAAGAAAGGCCTTGAACCCGATTAATAAGTATCCCACAAACCCACCTTTACTTGCCACTATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 274720 224 + 647215 TAGGT--------------------------------ATAACCAATTAGTTAACGGGTCAAATGTTCAAAGTTTACAGACTCCCACTGCCATGCAAATTCCGCTGACATACCTCAATGCACACTGAAGGAACTCAAGGCGTATGATGGCCATACAATTAAATCACGGCATGGAAAATTCTTCTTCCTGCAACAGCAAGAAAGGCCTTGAACCCATTTAGGAAATACCCCACAAACTCGCCTTTACTCACCACTATC - 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-a -s mr.mrrefChr5 155880 128 + 294542 TTGCATAACAGCCATGCCCCCATAACCCAGGTCTTTGTTCCTAATCTGTGTGACATCATTGGAGAGAACAACTGGCATCCAGGTCATCTACTCCTCCAAAGTTATGGCATGAACTCTTAAGCTGTAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305373 128 + 636262 TTGCATAACAGCCATGCCCCCATAACCCAAGTCTTTGTTCCTAATCTGTGTAACATCATTGGAGAGAACAACTGGCATCCAGGTCATCTACTCCTCCAAAGCTATGGCATGAACTCTTAAGCTGTAGC -s simRat_chr6.simRat.chr6 297145 118 + 647215 ----------GCAATGCCCCCATAACCCAGGTTTTTGTTTCAAAGCTGTGTGACATCATTGGGGAGAACAACTTCCATCTAGGTCATCTGCTCGTCCAAAGTTGTGGCATGAGCTCTTAAACAGTAGT - -a -s mr.mrrefChr5 156008 12 + 294542 GGAAGTGTTTCT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305503 12 + 636262 GGAAGTGTTTCT -s simRat_chr6.simRat.chr6 297263 12 + 647215 GGAAGTGTTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 156020 252 + 294542 TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTCTGCTCTATTACATTTATCTATGGAGACTAACGTTCCCTTAAAGTTCTGGTGCTTATCCCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCATATAAGGCCAATCTGTCTACTGCCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCATGATATAACTGAGCTGAGGTTTTTGAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305515 252 + 636262 TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTGTGCTCTATTACATTTATCTATAGAGACTAACGTTCCCCAAAAGTTCTGGTGCTTATCTCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGGACAGCTGGGTCATATAAGGACAATCTGTCTACTGGCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCACGATATAACTGAGCAGAGGTTTTTGAAAATAGAGGATTAAGGTTTAACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 297277 252 + 647215 TGAAGCTGTAATTGCTATAATACCCTGGGAAGTTCATGCCTCTTCTGTTCTATTACATTTGTCTATGGAGACTAATGTACTCTTAATGTTCTGGTCCTTATCCCCGAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCACATAAGGCCAATCTGTCTGCTGCCATAACTTTGAAGCATACCTTTTGCCCATCTCCATGATATAACTGAGCTAAGGTTTTTTAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA - -a -s mr.mrrefChr5 156272 72 + 294542 CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAGAAGGTGAGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACAGGGTGTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305769 68 + 636262 CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAG----TGGGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACTGGGTGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 297529 72 + 647215 CCTGAAGCAATGGGTTTGTGTAGAAGGTGAGTGAGCCCGATTCACATTGAGCTCTATCTGGACAGGATGTAC - -a -s mr.mrrefChr5 156344 64 + 294542 ATTTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACTTAGAATGGCTAACCAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 305910 64 + 636262 ATCTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACCTAGAATAGCTGGCCAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 297601 64 + 647215 ATTGAGGGGGTTAGCCTGCTCATCAGCACTTACTAATCCGCCGTACTTAGAATGACTAACCAAT - -a -s mr.mrrefChr5 156408 477 + 294542 CAGTCTGGTGGTTGATGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGGATTGGTATTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATGCCTTTATGTTTCTTTTATCTTAGGCATACTTCCGTCATAAACAGAGTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTCAACCTTATGCTTACACAAGTAAGAACTTAGGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGACAGTCTTGTTAGCACCATTCCTTGTACAGGAACCTCTGATTCGCATTCACAATTCTGCACTACCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACTAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCATACACAAGCTTTTCTCACAGCATGGGTGAGGTGTGGTATAGTGGCTTAATATTTTGGGCACTTTTTCTCTCTGGAAAATCAGTTCAAAGAAGAGCTACATCCAGCACC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 306031 473 + 636262 CAGTCTGGTGGTTGATGATTGAAAATTATAAGGTGTGTGTTCTAGTGGATTGGTGTTACAAGGTACGCAT-GCAAGTGTTATGCCTTTATGTCTCTTTTATCCTAGGCATGCTTCCGTCATAGACAGAGTTTGATGTGATG---TTGGGTGACCTCAACCTTATGCTTACACAAGTAAGAACTTAGGTATAGTGTGATAGTCCCATCCAGTTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGACAGTCTTGTTAGCGCCATTTCTTGTACTGGAATCTCTGATTCGCCTTCACAATTCTGCACTACCTGATGAAAGTAGGTACTCACAAAACTAACACATGATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATATATCATACACAAGCTTTTCTCACAGCATGAGTGAGGTGTGGCATAGTGGCTTAATATTTTGGGCACTTTTTCTCTCTGAAAAGTTAGTTCAAAGAAGAACTACATCCAGCACC -s simRat_chr6.simRat.chr6 297665 457 + 647215 CAGTCTGGTGGTTGGTGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGG-----TAGTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATCC------GTTCCTTTTATCTTAGTCATACTTCTGTCATAAAAAGATTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTTAACCTTATGCTTAGACAAGTGAGAACTTAAGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGATAGTCTTGTTAGCACCACTCCTTATACAGGAACCTCTGCTTCACATTCACAATTCTGCACTGCCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACGAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCACGCAAAAGCT--------TGCATGGGTGAGGTGTAGTATAGTGGCTTAGTATTTTGGGCACTTTTTCTCTGTGGAAAATCAG-TCAAAGAGGAGGTACATCCAGCACC - 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-a -s mr.mrrefChr5 162974 181 + 294542 AATACTTGCAGCTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAACTAGAGAGATGTTGGTGTGGTGCGCCAGAATGAATCAGACACATGTATGAAATCCTCGCTCCATCATAGGCCAGGTGGACCCACCATTAAGAGGTCAAATATACCTTTCTCATGCTTAACAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312768 180 + 636262 AATACTTGCAGCTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAACTAGAGAGACATTGGTGTG-TGCACCAGAATGAATCGGGCACATGTATGAAATCCTCGCTCCATCATAGGCCAGGTGGACCCACCATTAAAAGATCAAATATAACTTTCTCATGCTTAACAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 304528 169 + 647215 AAGCCTTGTAGTTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAGCTAGAGAGATGTTGGTGTGGTGCGCCAGAATGAATCAGACACATGTATGAAATCCTTGCTCCATCATAGG------------AACATTTAGAGGTCAAATATACCTTTCTCATATATAACGT - -a -s mr.mrrefChr5 163155 16 + 294542 GCTTAGATTTTGCACA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312949 16 + 636262 GCTTAGATTTTGCACA -s simRat_chr6.simRat.chr6 304697 16 + 647215 GCTTAGATTTCACACA - -a -s mr.mrrefChr5 163171 102 + 294542 GTGCCTCGTGCAAAGCTTCATTAAATGGCAAACATGGACACGTACAAGCGGTTAGTGCTTCACCCTGCCCTGCTTGATGTGATGTAAAACAGTCACAGGCAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 312975 102 + 636262 GTGCCTCGTGCAAAGCTTCATTAAATGGCAAACATGGACACGTACAAGCGGTTAGTGCTTCACCCTGCCCTGCTTGATGTGATGTAAAACAGTCACAGGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 304713 102 + 647215 GTGCCTCGTGCAAAGCTCCATTAAATGGCAAATGTGGCCATGTATATGCAGCTAGTGCTTCACCCTGCCTTGCTTGATGCAATGTTAAACAGCCACAGGCAC - 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-a -s mr.mrrefChr5 163742 142 + 294542 CGTTGAACCCTCCTTGGGTAGCTGGCTTGATATGTGTATACTAGACATGATGTGAAGCTGATGCAGTTACAGTCTCATTGTGACAAGCTATTATTAGTGTACTTATTTCAGGTATGTTTAGGTGCTATATGTAGGTAGCCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313591 142 + 636262 CGTCTAACCCTCCTTGGGTAGCTGGCTTGATATGTGTATACTGGACACAATGTGAAGCTGATGCAGTTACAGTCACATTGTGACAAGCCATTATTAGCGTACTTGATTCAGGTATGTTTAGGTGCTATGTGTAGGTAGCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 305254 140 + 647215 CATTGAACCCTCCTTGGGCAGCTGGCTGGAT--TTGTAGACTAGACATGATGTGAAGCTGATGCAGTCACAGTCTCATTGTGACAGACTGTTATTAGTGTACTTATTTCTGGTATCTGTAGGTGCTATATGAAGATAGCCAA - -a -s mr.mrrefChr5 163884 256 + 294542 AGCCACAGAAATGAATATGTGTTCATGTTAACAGGTGTAGCTCATATTGATGTGATGCCTTGGGATGCATGCTGCCATGACTTCAAACGCATAGCAGCTTTCTTTGTTTTGAAGATGGTGTATATATAAATATGTATTCACCAGCTCTCTAGGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATAATGAACCTTGCATGACCAATTAATCTTACTACTCAATGAGTGTTGATGTGGCATTGGGATGATGAATGATTTTACTTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313733 248 + 636262 AGGCACAGAAATGAATACATGTACATGTTAACAGGTGTGGCTCATCTTGATGTGATGCCTTGGAATGCACACTGCCATGACTCCAAATGCATGGCAGCTTTCTTTGTTTTGAAGATGGTGTATATATAAGTATGTATTCACCAGCTCTCTAGGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATA-----CCTTGCATGACCAATCAATTTTACTATTCAATGAGTATTGGTGTGGCATTGGGATGA---ATGATTTTACTTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 305413 243 + 647215 ATCCACAGAAATGAATATGTGTTC----------TTGTAGCTCATATTGATGTG---CCCTGGGATGCATGCTGCCATAACTTCAAACACATAGTAGCTTTCTTTGTTTTGAAGGTGGTGTATATATAGATGTGCATTCACTAGCTTTCTAAGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATAATGAACCTTGCATGACCAATTGATCTCACTACTCAGTGAGTGTTGATGTAGCATTGGGATGATGAATAATTTTACTTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 164140 49 + 294542 ACCTAGACCGTGCCTGACTCAATTTCATGGAGATAATGAGACTGAATCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 313981 46 + 636262 ACCTAGACCATGCCTAACTCAATTT---GGAGATAATGAGACTGAATCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 305663 49 + 647215 ATCTAGACTGTGCCTGACTCAATTTCATGGAGATAATAAGACTGAACCA - -a -s mr.mrrefChr5 164189 367 + 294542 AAACTAAAGTGCAGAAGTTCAGATTTGGATAAatgataagacCTTGGTGATAACATTCAGTACCCCAGAATGAAGCTTCATGACTAAAGTGCTTGTTACAGTGGTAGATAAAACTAAGGTTGAAACAAATGAATACCATTTTATAATATATCGAAGACTGTAGATATGACGACAGACCAAGTACCACGAGTGTTGGTGTATGAGATCATATAAACGAGCATGAATGAGCTCAAGAACAAGTTAATTGCCCCTGCAGCATAGTCATCAAATAGGGCTCTTGTATCTAGGGTTTCAAATGAGTCAATACAAACCCTTGAGGAAAAGATTAGTAACCCATGAAATGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314028 357 + 636262 AAACTGAAGTGCAGAAGCTCAGACTTGGATAA----------CTTGGTGGTAACATTCAGTGCCCCAGAATGAAGCTTCATGACTAAAGTGCTTGTTACAGTGATAGATAAATCTAAGGTTGGAACACATGCATACCATTTTATAATATATCGAAGACTGTAGATATGACGACAGACCAAGTACTGCGAGTGTTGTTGTATGAGATCATATAAACGAGCATGAGTGAGCTCAAGAACAAGTTGATAGCCCCTGCAGCATAGTCATCAAATAGGGCCCATGTATCTATGGATTCAAGTGAGTCAATACAAACCCTTGCAGAAAAGATTAGTAACCCATGAAATGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 305712 367 + 647215 AAACTAGAGTGCAGAAGTTCGGGTTTGGATAAATGATAAGACATTGATGACAACATCCAGTACCCCAGAATGAAGCTTCACGACTAAAGCACTTTTTACAGTGGCAGATAAAACTAAGTTTGAATCAAATGAATACCAAGTTACAATATATCGAAGACTGTAGATATGACAACAGACCAAGTACCACAAGTGTTGGTGTATGAAGCCATATAAGAGAGCATTCATGAGCTCAAGAAGAAGTTAATTGCCCCTGCAACATGGTCATCAAATAGGGCTCTTGTATCTAGGCTTTCAAATGAGTCAATACAAACCCTTGAGGAAAAGATTAGTAACTCATTAAGTGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT - 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-a -s mr.mrrefChr5 164825 163 + 294542 TTGCATAACTGACTGGGTTTCACACCTTCTTTCCCATCAGGACACTCTGTGCATGGAATCTGACAACATGGCTTCCCATATATGAAGAGCATCTCACTTGCTGTGAGAATTGGAGCCAGCAGATGTGGAAAATACCCTACTTGATAGTCTTATGTCTGGCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314706 163 + 636262 TTGCATAACTGACTGGGTTTCACACCTTCTTTCCCATCAGGACACTCTGTGCATGGAATCTGACAACATGGCTTCCCATATATGAAGAGCATCTCACTTGCTGTGAGAATTGGAGCCAGCAGATGTGGAAAATACCCTACTTGATAGTCTTATGTCTGGCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 306400 163 + 647215 TCGCATTAATGACAAGGTTTGGCCCCTTCTTTTTCATCAGGACACTCTGTGCATTGAATCTCATAACATGGCTTCCTGTGTATGAAGAGAAGCTCACTTTCTGTGAGAATAGGAGCCAGTAGACGCCAAATATATCCCACTTGATAGCCTTATGTCTGGCAAG - -a -s mr.mrrefChr5 164988 38 + 294542 TGGATTAAATGATTTATTTCGACTGCCTTACCTTAGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314869 38 + 636262 TGGATTAAATGATTTATTTCGACTGCCTTACCTTAGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 306567 38 + 647215 TGGAGTAAATGATTCAATTCAACTCCCTTACCTTAGAC - -a -s mr.mrrefChr5 165026 405 + 294542 TCACTGGTCTACCTAATATTCAGAGATTATGCTGTGCATCAAAACTGGAAGATTGTCCCCCCATTATATGAACAGCATATCACTGGCCAAAAGGGTTTGATCACCCTCATATTCACAAGAGATCACTCCAGTTCAGAGAGCATCAGATTCTATTTACACATTTCAACCCATTGAATAATCACCTGCTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGGAATATGGCATACCAGTAACCATTAGCATTATATTTTTCCAACCTCATGTGCATCACTCAGCATTATTTTTTTCTGACCTTGTGTGCCTCAGCCCTAACTCAGACCAGAAGTTAGACCCCCATTATGTTAGGGTGGCTTCCATATTATTCTTCCAATTTGATGGCACACAATATAGCTCCCAGAGTTATCTTAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 314907 405 + 636262 TCACTGGTCTACCTAATATTCAGAGATTATGCTGTGCATCAAAACTGGAAGATTGTCCCCCCATTATATGAACAGCATATCACTGGCCAAAAGTGTTAAATCACCCTCATAATCACAAGAGAACACTTCAGTTCAGAGAACATCAGATTCTATTGACAAATTTCAACCCATTGAATAATCACCTGCTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGGAATATGGCATAGCAGTAACCATTAGCATTACATTTTTCCAACCTCATGTGCATCACTCAGCATTATTTTTTTCTGGCCTTGTGTGCCTCAGCGCTAACTCAGACCAGAAGTTAGACCCCCATTATGTTAGGGTGGCTTCCATATTATTCTTCCAATTTGATGGCACACAATATAGCTCCCAGAGTTATCTTAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 306606 403 + 647215 TCTCTGACTTACCTAATAATCAGAGATTACGCTGTGCATTAAAACTGAAAGATTTACCCCCCAT-ATATGAACAGCACATGACTGGC-ATAGGGGTTTGATGACCCTCATATTCACAAGAGATCACTCCAGTTAAGAGAGCATCAGATTCTGCTTACACATTTCAACTCCTTGAATAATCACCTGTTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGAAATATGGCATACCAGGAACCATAAGCATCATATGCTTCCAACCTTTTGTGCATCATTAAGCATTGTTTTTTTCTGACCTTGTGTGCATCAGCCCTAACTCTGTCCAGAAGCTAGATCCAGATTATGTTGGGGTTGCTTCCATATTATTCTTCCAATTCAATAGCACTGAATATAGCTCCAAGAGTTATTTTAC - 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-a -s mr.mrrefChr5 173574 183 + 294542 CATAATAGTGATTCTTTAGTTTAATCTCTGCTTTATGGCTGTCATAACTGTGAGTGTAGACAATATGGACGCTAAAGGATCATGGCCCTACTTGCACTTACATTTTATCTGAAGCGTGTGATCTATTGCAGTACTTGGTGATAAACTCAACTAAAAACAATGCTTCTAGTAATAGTCTGTTTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325571 183 + 636262 CATAATAGTGATTCTTTAGTTTAATGTCTGCTTTATGGCTGTCATAACTGTGAGTGTAGACAATATGGACGCTAAAGGATCATGGCCCTGCTTGCACATACATTTTATCTAAAGCGTGTGATCTATTGCAGTACTTGGTGATAAACTCAACTAAAAACAGTGCTTTTATTAATAGGCTGTTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 316953 181 + 647215 CATAATGGTGATTCTTGAGTTTAACCTCTGCTTTATGGCTGCCATAACTGAGAGTGTAGACAATGTGGATACTAAAGGCCCATGGCCCTACTTGCACTTACATTTTATCTGAAGCGTG--ATCTCTTGCAGTACTTGGTGATAAATTGACCTGAAAACAATACTTCTAGTAATACTCTGTTTT - -a -s mr.mrrefChr5 173757 44 + 294542 ACAGGTCCAAGGAGAGTCAATTGAGATGGCTACCAACTTTTTTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325754 35 + 636262 ACAGGTC---------TCAAATGAGATGGCTACCAACTTTTTTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 317135 44 + 647215 ACAGGGCCAAGGAGAGTCCATTAAGATCGCTAGCAACTTTTTTA - -a -s mr.mrrefChr5 173801 63 + 294542 CAAAAGCTTCAAATTTGTTGACAATGTCTAACTCCTAGTATTGATTGCATTAATCTGCTCTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 325791 63 + 636262 CAAAAGCTTCAAATTTGTTGACAATGTCTAACTCCTAGTATTGATAGCATTAATCTGCTCTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 317179 63 + 647215 GAAGAGCTTCAAATTTGTTGACAATGTCTAACTCCTGGTATCCACTGCATTAATCTGCCCTGT - 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-a -s mr.mrrefChr5 189761 18 + 294542 TTCTTTGTTTTACAGTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342187 18 + 636262 TTCTTTGTTTTACAGTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 333815 18 + 647215 TTCATGGTTTTACAGTCC - -a -s mr.mrrefChr5 189779 66 + 294542 AGTTGTTAAAGGTGGTCTATGATTGTCCAACCCCCAAAATAACAATATAAGGTAACCCCCAAAAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342220 66 + 636262 AGTTATTAAAGCTGGTCTATGATTGTCCAACCTCCAAAATAACAATATAAGGTAACCCCCAAAAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 333833 66 + 647215 AGTTGTTAAAAGTGGTCTATGTCTATCCAACCCCCAAAATAACACTAATAGGTAACCCCCAAAAAG - -a -s mr.mrrefChr5 189845 24 + 294542 GTCAGTGACAAAACATTCACCTCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342297 24 + 636262 GTCAGTGACAAAACATTCTCCTCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 333899 24 + 647215 GTCACTGACAAGACATTCACTTCT - -a -s mr.mrrefChr5 189869 38 + 294542 ACTTGGAGTAGTAGTGCTTTACTTCCACTGTGAGTGAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342321 38 + 636262 ACTTGGACTAGTAGTGCTTTACTTCCACTGTGAGTGAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 333924 38 + 647215 GCTTGGAGTAGTCATGCTTTACTTTCACTGTGAATGAC - -a -s mr.mrrefChr5 189907 144 + 294542 TAATGAAGCCCCCCCATGGCATATTAACAACCAGGAAGTGTCATGTACAATATAATCCCTGCAATCTACTGAGGTGTGAGTCTAATGTTGAAGGATCTCTTCATAAAGATAACTTTTACACTGTAAATTGTCTCTATTAAAGGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 342359 144 + 636262 TAATGAAGCCACCCCATGGCATATTGACAACCAGGAAGTGTCATGTACAATATAATCCCTGCAATCTACTGAGGTATGAGTCTAATGTTGAAGGATCTCTTCATGAAAATAACTTTTACACTGTCAATTGTCTCTATTAAAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 333969 132 + 647215 TAATGAAGCCCCCCCATGGCATAATAACAACCGGGAAGTGTCATGCACAAT------------ACCTACTGAGGTGTGAGTCTAATGATGAAGGATCTCTTCATAAAGATAACTTTTACGCTGTAAATTGTCTCTATTAAAGAA - 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-a -s mr.mrrefChr5 191463 97 + 294542 TAATGTGGCGGGGTCCTTGTACTAAGGCTGTTAGGTCTCATACTGTAACAGCTAAAATTGGCCAGATTTTCTATTATAAAGCTAATGCTGTAACTTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 343940 97 + 636262 TAATGTGGCGGGGTCCTTGTACTAAGGCTGTTAGGTCTCGTACTGTAACGGCTAAAATTGGCCAGATTTTCTATTATAAAGCTAATGCTGTAACTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 335448 82 + 647215 ---------------CTTGTACTATGGCCATTAGGTCTCATACTGTAACAGCTAAAATTGGCCAGATTTTTTATTATAAAGCTAATGTTTTAACTTC - -a -s mr.mrrefChr5 191560 128 + 294542 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACTGTGGCCCTTGATAATTATGTGGTAAATGGGATAATACAGGTTAAGATGCATTCCATGGTAGTGATCAGAGCTACAAATACTAAACCAGAATTTTTTGATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344037 121 + 636262 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACTGTGGCCCTTGATAATTCTGTGGTAAATGGGATAATACAGGTTAAGATGCA-------GTAGTGATCTGAGCTACGAATACTAAACCAGAATGTTTTGTTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 335535 128 + 647215 ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACCGTGGCGCTTGATAACTATGTGGTAAATGTGATAATACAGGTTAAGATGCATTCCATGGTAGTGATCAGAGCTACAAATACTAAACCAGAATTTTTTGATT - -a -s mr.mrrefChr5 191688 135 + 294542 ATTTGTTTCCTGCTACCTACCATTAGTGCATATCAGCAGCCCTCAAACTACCCTGACCTTTGTGTATCGCACAGTCAACCCTTTGGCTTCTTTCTATAGCAATTTCAGAAAGTGTTATTCAATGTACTAATCCTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 344159 135 + 636262 ATTTGTTTCCTGCTACCTACCATTAGTGCATATCAGCAGCCCTCAAACTACCGTGACCTTTGTGTATCGCACAGTCAACCCTTTGGCTTCTTTCTATAGCAATTTCAGAAAGTGTTATTCAATGTACTGATCCTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 335663 129 + 647215 ATTTGTTTCCTGGTACCTACTATTAGTGCATATCGG------TCAAACTACCCTGACCTTTATGTACCACACAGTCAACCCTTCGGACTCTTTCTAGAACAATTTCAGAAATAGTTATTCAATGTACTAATCCTC - 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-a -s mr.mrrefChr5 198793 56 + 294542 AATGTTGCAGATGGTCCCTTTAGAGTCATCCAGGGTAACTTGAGTCAGCGTTGTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351639 56 + 636262 CATGTTGCAGATGGTCCCTTTAGACTCATCCAGGGTAACTTGAGTCAGCGTTGTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 342975 33 + 647215 AATGTTGTAGATGGTCCCTTGAGAGTCATCCAA----------------------- - -a -s mr.mrrefChr5 198849 14 + 294542 ATCTCAAACCTTGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351696 14 + 636262 ATCTCAAACCTTGA - -a -s mr.mrrefChr5 198863 408 + 294542 CAAGTGCTCTTTCACAGGTATCAGGTATAGGTGGGATTCAACACCCCAAAGTTATAAACAAAAAAGTTACATTTTACAAAGGTGTGTGCTACAACCATAATTGAGCTTATAGTAAGCCAAGCTTCTCAAAGGTTAACTCATTTGGGAATACAACCCTTATATATCCATGGGGATGACAGAACAGTCCTAAATGTGGACACTCCTAACTAGCCCATTCCTAGTTATTGAGGCCACACTTGTGCTTGTCTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGACTATGAGTGGGGTGCGGCCATTGGCAAGGTTCTGTAGGAGTTGCTGTGAGGTTTGAATGGCCACCCTATTTTATGAAGCTTGAAACTAAGGGGTCAATGTTTTTTTCTGTGTTGATGCTATCCAAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 351713 407 + 636262 CAAGTGCTCTTTCACAGGTATCAGGTATAGGTGGGATTCAAAACCCCAAAGTTATAAACAAACAAATTACATTTTGCAAGGCTGTGTGCTACAACCATAATTGCACTTATAGAGAGCCAAGCTTCTCAAAGATTAACTCATATGGGAATACAACCCTTATATATCTATGGAGCTGACAGAATGGTCCTAAATGTGGACACT-CTAACTAGCTCATTCCTAGTTATTGGGGCCACACTTGTGCTTGCGTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGAGTATGAGTGGGGTGCGGCCACTGGCAGTGTTCTGTAGGAGTTGCTGTGGGGTTTGAATGGCCACCCTATTCTATGAAGCTTGAAACTATGGGGTCAATGTTTTTTTCTGTGTTGATGCTATCCAAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 343008 389 + 647215 -------------ACAGGTATCA-GTATAGCTGGGATTCAACACCCAAAAGTTATAAGCAAAAAAGTTCCATTTTACAAAGGTGTGGGCTACAGCCATAATTGAGCTTATGGTATG-CAAGGTTCTCAAAGGTAAACTCATTTGGGAATACAACCTTTCAATGCCCATGGGGATGACAGAACAGTCCTGAATGTGGACACTCCTAGCTACCCCATTCCTAGTTATTAAGGCCACATTTGCGCTTGTCTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGACTATGAGTGGGGTGAGGGCATTGGCAAGGTTCTATAGGAGTTGCTGTGAG----GAATGGACACCCAATTTTATGAAACTTGAAACTAAGGGGCCAATGTTTTTTTCCTTCTTGATGCTATCCAAG - 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-a -s mr.mrrefChr5 202203 66 + 294542 ctgggttaagaaacaaaaaggagtacagatgaccttttcagaacaagcgtacaatacacaaaaaga -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354714 66 + 636262 ctgggttaagaaacaaaaaggagtacagatgaccttttcagaacaagcgtacaatacacaaaaaga -s simRat_chr6.simRat.chr6 346528 66 + 647215 ctggcttaagaactgagatggattacgaatggcctgttcacaacaagtgcgcaatacacaaaaaca - -a -s mr.mrrefChr5 202269 34 + 294542 gaataacatgattaaaaaatgaactagacatcaa -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354784 34 + 636262 gaataacatgattaaaaaatgaactagacatcaa -s simRat_chr6.simRat.chr6 346594 34 + 647215 gaatggcatgattaaaaattgaagtacaaaccag - -a -s mr.mrrefChr5 202303 93 + 294542 gcacccaattgcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacgagaagaactgtgtttattcatggtcagcctattgcactcgtctagaccaggg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354821 93 + 636262 gcacccaattgcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacgagaagaactgtgtttattcatggtcAGCCTATTGCACTCGTCTAGACCAGGG -s simRat_chr6.simRat.chr6 346628 93 + 647215 gcacccaatggcaagggaggctgttgtgtcaaacaagcacaagagtaagtttgttgagtcatgatcggcctattgcaccagtaagcatcaggg - -a -s mr.mrrefChr5 202396 44 + 294542 aactttaccttttcctGATTGGTCCATCATACAAATGTGCTCCA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 354921 44 + 636262 AACTTTACCTTTTCCTGATTGGTCCATCATACAAATATGCTCCA -s simRat_chr6.simRat.chr6 346721 44 + 647215 aactttaccttttcctGATTAGTCCAGCATACAAATGTGCTTCA - 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-a -s mr.mrrefChr5 205086 254 + 294542 TATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTACAGCTAGTTAACCTTGTTTTGATACTCTTGTCTAGAGTTATTGTTTGATACCTAGTTAAACAAAAAACGGAGTAATGTATATACTCTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGTGGAACAGTTCTCATAGACAAAAATTGTCATTTATTGTTGAAGATAGTAGTACAAGAATCCATTCTCAATTTATCCCCTATGCATCATTTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357611 251 + 636262 TATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTACAGCTAGTTAAGCTTGTTTTGATACTCTTGTCTAGAGTTAGTCTTTGATACCTAGTTAAACAAAAAACGGAGTAGTGTAT-TACTCTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGTGGAGCAGATCTCATAGACAGAA--TGTCATTTCTTGTTGAAGATAGTAGTACAAGAATCCATTCTCAATTTATCCCCTATGCATCATTTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 349539 253 + 647215 GATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTCCAGCTAGTTAGCCTTGTATTGATACTCTTGTCTAGAGTTATTGTTTCATACCTAATTAAATGAAAAACAGAGTCATGTATATACTTTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGCAGAACAGTTCTCATAGACAAAAATGGTCACTTATTA-TGAAAATAGTAATACAAGAATTCATTCTCCATCTATCCCCTATGCATTATTTA - -a -s mr.mrrefChr5 205340 55 + 294542 TCTTTCTTTGTTCTCATGCCAAAGTGCCCTGGGTGTGGTCCGTTTATAGTTTAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 357862 55 + 636262 TCTTTCTTTGTTCTCATGCCAAAGTGCCCTGGGTGTGGTCCGTTTATAGTTTAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 349815 55 + 647215 TCTTCCTCCGTTCTCGTGCCAAAGTGCCCTGGGCTTGGACCATCTATAATCTAAC - 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-a -s mr.mrrefChr5 217677 12 + 294542 AACGTATAGCCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370693 12 + 636262 AACGTATAGCCC - -a -s mr.mrrefChr5 217689 56 + 294542 GGTTATCTTTGATGCTGCATCAGGTGTGGTATATCTAGAGGGGCTGTATTACCTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370707 56 + 636262 GGTTATCTTTGATGCTGCATCAGGTGTGGTATATCTAGAGGGGCTGTATTACCTAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 362832 35 + 647215 ---------------------AGGTGTGGTAGACCTAGAGGTGCAGTATTACGTGA - -a -s mr.mrrefChr5 217745 70 + 294542 AAAGGCATTTGTGGCTATTATCTGTAATGGCGATTATCACCATCTTACGTTGACTCCATCTAGGCTTAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370763 70 + 636262 AAAGGCATTTGTGGCTATTATCTGTAATGGCGATTATCACCATCTTACGTTGACTCCATCTAGGCTTAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 362871 70 + 647215 GAAGCCATCTGTGGGGTATTTCTGAATTGGTGATTATCACTATCTTACACTGTCTCCATCTAGGCTTAGA - -a -s mr.mrrefChr5 217815 26 + 294542 GTCTAGTTAGCTAATGAGTGTCACAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370839 26 + 636262 GTCTAGTTAGCTAATGAGTGTCACAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 362941 26 + 647215 GTCCAGTTGGCTAAAGAGTGTCACAA - -a -s mr.mrrefChr5 217841 28 + 294542 TTTGTTTGATAAATTTCACTGTACCATC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 370865 28 + 636262 TTTGTTTGATAAATTTCACTGTACCATC -s simRat_chr6.simRat.chr6 363212 28 + 647215 ATTGTTTGATAAATTGCACTAAACCATC - 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-a -s mr.mrrefChr5 222895 86 + 294542 ACAAAGGTTGGTCATAGGTTAAAGGCCAATTGGTTATTGCTTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATCAATCATCTCCTCCAAGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173815 78 + 636262 ACAAAGGTTGTTCATAGG-TAAAGGCCAATTGGT------TTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATC-ATCATTTCCTCCCAGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 368558 86 + 647215 ACAAAGGTTGGTCATGGGTTAAAGGCCGACGGGTTATTGCTTCCACCTTCATATCATCACTGGGAATCAATCATCTCCTCCAAGAG - -a -s mr.mrrefChr5 222981 116 + 294542 TCACTTCTGAGCTTTGGAAGTATTTCCATCACTAGGCACAACACTTGGTCATATTACTGGGGGAATGGGAGTGGAACATGGGGTTGAATGAAAGTGGGGCTACCAGGCTTCACATA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 173898 116 + 636262 TCACTTCTGAGCTTTGGAAGTCCTTCCGTCTCAAGGTACAACACTTGATCATATTACTGGGGGAATGGGAGTCGAAGATGGGGATGAATGAAAATGGAGCTACCAGGCTTCACATA -s simRat_chr6.simRat.chr6 368644 115 + 647215 TCACTTCTGAACTTTGGAAGTATGTCCATGAGTAAGCACAACACTTGGTCATATTACTGGGGGAA-GGGAGTGGAACATGGGGTTGAATGAAAGTGGGGCTAATGGGCTTGACATA - -a -s mr.mrrefChr5 223097 42 + 294542 TAAAGATGCTTGAAACCAACAACACCCCTCCCTTCTGCTGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 174014 42 + 636262 TAAAGATGCTTGAAATCAACGACACTCCTCCCTTCTGCTGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 368800 41 + 647215 TAAGGATGCTTG-AACCAACAACACCCCTCCCTTTTGCTGTA - 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-a -s mr.mrrefChr5 233487 38 + 294542 ggcaaaatgttactcttaattggtatattcacagttgg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380120 38 + 636262 ggcaaaatgttactcttaattggtatattcacagttgg -s simRat_chr6.simRat.chr6 379303 38 + 647215 ggcgacattcctgtcttaattggtaggtacacacctgg - -a -s mr.mrrefChr5 233525 49 + 294542 gtggcaacagtcttttgttcctatgacccacacagcatgttatggacca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380160 49 + 636262 gtggcaacagtcttttgttcctatgacccacacagcatgttatggacca -s simRat_chr6.simRat.chr6 379341 49 + 647215 gtggtaacgggcttttgatcctttggcccacacaGCAcattatggacct - -a -s mr.mrrefChr5 233574 43 + 294542 gtgaaaccaggcccctcttagatgaataagtggcagaattttt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 322446 43 + 636262 gtgataccaggctcctctcaaatgagtaagtggcaaaATTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380209 43 + 636262 gtggaaccaggcccctcttagacgattaagtggcagaatcttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 379390 43 + 647215 gagaaaccaggcacctcttacatgaataagtggcagaatcttt -s simRat_chr6.simRat.chr6 194600 43 - 647215 gtgaaaccaggcccctctcagatgaataagtggcaaaattttt - -a -s mr.mrrefChr5 233617 6 + 294542 gtccca -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 380252 6 + 636262 gtccca -s simRat_chr6.simRat.chr6 379433 6 + 647215 gtccca -s simRat_chr6.simRat.chr6 194643 6 - 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-a -s mr.mrrefChr5 235551 46 + 294542 gactttatcaaaaaactcgctctttgatttgttgaccttggggaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 381366 46 + 647215 gactttatcaaaagaccgactcttggactcattgagcttggggaat -s simRat_chr6.simRat.chr6 196699 46 - 647215 gactttatcgaaaaactcgctctttgatttgttgaccttgggtaat - -a -s mr.mrrefChr5 235597 98 + 294542 gttttctgagtctttatacctttaagctcaaaatttattttagttatttgctgctgccaactcacccttgaatgagtgagctcttgctcatgcagctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 381418 98 + 647215 attttctgagtctttatacctttaagctcaaattttaatctagttatttgctgctgccaactcacccttgcatgagtaagctcttgctcaggcagctc -s simRat_chr6.simRat.chr6 196745 98 - 647215 gttttctgggtctttatacccttaagctcaaaatgtattttagtcacttgctgttggcgagtcgcccttgagtgagtgagctcttgcttgtgtagctc - -a -s mr.mrrefChr5 235695 45 + 294542 ctgtgtcgcagccatatcatccaggcgtaattttatagagctctg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381686 45 + 636262 ctgtgtcgcagccatatcatccaggcgtaattttatagagctctg -s simRat_chr6.simRat.chr6 381674 45 + 647215 ctgtgtcacagccctggcctccaggctttactttatagagctctg - -a -s mr.mrrefChr5 235740 21 + 294542 tctgcaaggcaattagagatg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 381731 21 + 636262 tctgcaaggcaattagagatg -s simRat_chr6.simRat.chr6 381720 21 + 647215 tctccaaggcaattagtgatg - 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-a -s mr.mrrefChr5 236013 5 + 294542 gtttc -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 323651 5 + 636262 Gttac -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382010 4 + 636262 tttt- -s simRat_chr6.simRat.chr6 382002 5 + 647215 gtttt - -a -s mr.mrrefChr5 236018 143 + 294542 tgaggttacatcccaggcctcaaaagccttcacacacctgtgttgggtttatgcacattcaatacagttgatttttctgattgtatagaaccttctagcgttatggattgcccttcccggtcccttctcacactagcagattt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382014 143 + 636262 tgaggttacatcccaggcctcaaaagccttcacacacctgtgttgggtttatgcacattcaatacagttgatttttctgattgtatagaaccttctagcgttatggattgcccttcccggtcccttctcacactagcagattt -s simRat_chr6.simRat.chr6 263299 143 - 647215 tgaagttagatcccatgcctcaaaagcctttgcacacctgcgttgggtttgtgcatgttcaatacagttgttttttctgattgtgtagaatcttcaaccattattgttcgcccctctcggtcccctctcgcactagcagattt - -a -s mr.mrrefChr5 236161 21 + 294542 aacctaaagtctgccttgtcg -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382157 21 + 636262 aacctaaagtctgccttgtcg -s simRat_chr6.simRat.chr6 263443 21 - 647215 aacccaaagtctaacttgtca - -a -s mr.mrrefChr5 236182 100 + 294542 tttttcttttctcctttcccaataatctggtgttccttctcctagcccttcacctcgagcttacgagtgtgcctgcatgcaaggtgcatcttatggatgt -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 382178 100 + 636262 tttttcttttctcctttcccaataatctggtgttccttctcctagcccttcacctcgagcttacgagtgtgcctgcatgcaaggtgcatcttatggatgt -s simRat_chr6.simRat.chr6 263488 100 - 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-a -s mr.mrrefChr5 237678 362 + 294542 aACTTGTAGTGGGGCTTCACTATCTCCTCTGAGAGCCGTTGAGGTTGGTAAGAACATCTTCATTTCTTGATATTGAGACATAGCAGCAAAAAAAGCTATGCTTACTTTTAAAGGCACCAGTACGTCCATATCCAGTAGTCTATTAGTGTTAGTCCATGATAGGTCAGACATGTTTACTTGAGGGATTGGGATGAGGGGATCTTCATTTCCATAACTTATAGAAGTGTGACATTTTTATAAGAGAGGGGTGTAGGGCTCACTCACATTCGAGTGAAATCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTCCTAACCTTGTAGGGGCCTTTTTTGCAACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTTTAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 383805 362 + 636262 AACTTGTCGTGGGGCTTCACTATCTCCTCTGAGAGCCGTTGAGGTTGTTGAGAACATCGTCATTTCTTGAGATTGGGACATAGCATCAAAGAAAGCTATGCTTACTTTTAAGGGCACCAATACGTCCATATCCAGTAGTCTATTAATGTTAGTCCATGAGAGGTCAGACATGTTAACTTGAGGGATTGGGATGAGGGGATATTCATTTCCATAACTTATAGAAGTGTGACATATTTACAAGAGGGGGGTGTAGGGCTGACTCACATCCGAGTGAAATCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTCCTTACCTTGTAGGGGCCTTTTTTGCGACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTATAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 383917 362 + 647215 aACTTGCAGTGGGGCTTCACGCTCTCCTCTGAGAGCCGTTCAGGCTGGCAAGAATATCTTCATTTCTTGATATAGAGACATAGTAGCAAAAAAAACTATGCTTACTTTTAAAGGCACTAGTGTGTCCATATCCAGTAGTCTATTAGCTTTAGTCCATGATAGGTCAGACATGTTTACCTCAGGGATTGGGATGAGGGGATCTTCGTTTCCATAATTTTTAGAACTGTAACATTTTTATAAAAGAAGGGTGTAGGGATCACTCACATTCGAGTGAAGTCCAAAAAACTGTCACACCTCAGCCTGTTATCCTTTTAGGGGCCTTATTTACAACTCCCTAACCAAAACTGCACCCAGTTCTTTAA - -a -s mr.mrrefChr5 238040 34 + 294542 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGATGTGACATTACTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384167 33 + 636262 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGATGCAACATTGCC- -s simRat_chr6.simRat.chr6 384280 34 + 647215 TCAGCCCCAATTTTTGGTGGACGTGAACTTATTT - -a -s mr.mrrefChr5 238074 306 + 294542 ATTATGAGCCCTTGTTCTGTTCCACTTAGGAAGATTCCTGAATATGTTACAGATTGTATCCATGTTGTAGCACCTACTTACCATCCAGCCACTAGTGAAGCAGATAAGCGAGTGTCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTTTTGTGGATGCTGTATGCAGACTTTGACTCTTTTGGCTCTTATATAATCTAGGCCCTATCCTTGTTAGAACCTATTGCAAGTGTTTTTGCGAAAAGGATTCCACCATTAGTATTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAATCTGATAGAATCAGTTTTGATCTGAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384200 303 + 636262 ---ATGAGCCCTTGTTTTGTTCCATTTAGGAGGATTGCTAAGTTTATTACAGACTGTATCCATGTTGTAGCACCTACTTACCATCCAGCTACTAGTGAAGCAGATAAGCGAGTGTCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTCTTGTGGATGCTACATGCAGACTTTGACTCTTTTGGCTCTTATATAATCCAGGCCCTATCCTTGTTAGAACCTATCGCAAGTGTTTTTGTGAAAGGGATTCCACCATTAGTGTTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAACCTGATAGAATCAGTTTTGATCTGAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 384318 301 + 647215 ATTGTACGCCCTTGTTCTTTTCCACCTAGGAAGATTCCAGAATATGTTACAGATTGTATCCATATTGTAGCACCTACTTCCCATCTAGCCCCTAATGCAGCAGATAAGCGAGTTCCATTTTCACAAGCCTGGTGAAATACAGTTTTTGTGG-TGCTGTATGT----TTTGACTCTTTTGACTCTTGTATAATCTAGGCCCTATCCTTACTGGAACCTCTTGCAAGTGTTTCTGCGTAAAAGGTTCCACCATTAGTATTTGGGGCATTGTAGCAATTTTAATCTGATAGAATCAGTTTTGATGTGAT - -a -s mr.mrrefChr5 238380 81 + 294542 AGCATTGTAATTTGACAGTTCCTCATTCACTGAGAGGACTGATGAGTGCAAACTATGTATAACCATTACTAAATTATAGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384568 81 + 636262 AGCATTGTAATTTGACAGTTCCTCATACACTGAGAAGACTGATGAGTGCAAACTATGTATAACCATTACTAAATTATAGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 384619 76 + 647215 AGCATTGTAATTTGACAGTTTTTTATTCACTGAGAGGACTG-----TGCAGACTATGTACAACCACTACTAAACTATAGCC - -a -s mr.mrrefChr5 238461 67 + 294542 GCCTTATTGATGGTATTGTATCTGGTTCATATCCTTGTCAGTTAGCTTGGGCTCTCAGTAGTGGTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384650 67 + 636262 GCCTTATTGATGGTATTGTATCTGGTTCATATCATTTTCAGTTAGCTTGGGCACTCAGTAGTGGTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 384695 67 + 647215 GTCTTATTGATGATATTGTATCTAGTGCACATCCTTGTCAGTTAGTTTAGGCTCCCAGTAGTGGCGT - -a -s mr.mrrefChr5 238528 35 + 294542 ATATTTCCTACATCATCAATAGAGGCATTTGTGTG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384719 35 + 636262 ATAGTTCCTACTTCATCAACAGAGGCATTTGTGTG -s simRat_chr6.simRat.chr6 384762 35 + 647215 TTATTCTCCACATCATCAATAGAGGCATTTCTGTG - -a -s mr.mrrefChr5 238563 156 + 294542 ATAGTTATTCTGACAGGCTCCCCCATGTCTTTTGAGAATTGCCCCAGTAGTTTAAGGATTACATAGTCACAATGAGAAAAAGAAGAAAGGTTGGTAAGGCCATGTTGGGAGGTTCCACGAAACCAGCTATGACATTACCTTACCTATATCAACAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384754 156 + 636262 AAAGTTATTCTGACATGCTCCCCCATGTCTTTTGAGAATTGCCCCAGTAGTTTAAGGATTACATAGTCACAATGAGAAAAAGAAGAAAGGTTGGTAAGGCCATATTGGGAGGTTCCGCGAAACCAGCTATGAGTATATCTTACCTATATCAACAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 384801 145 + 647215 ATAGTTATCCTGACAG------CAATGTCTCTTGAGAATTGCCACAGTGGTTTA-GGATTACATAGTTACAATGAGAAAAAGAAGAAAGGTTGGCAAGGCCATGCTGGGAGATTCCACAACAGCAGCTATGACATTACCTTACCT----CAACAAA - -a -s mr.mrrefChr5 238719 57 + 294542 CTGGTGTACCATTGTGAACCAAACACCCTCATTAGGAGTGGTCAAGGAATGCATACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384910 57 + 636262 GTGGTGTACCATTGTGAACCAAACACCCTCATTAGGAGTGGTCAAGGAATGCATACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 384947 57 + 647215 CTGGTGTACCCTCATGAACCAAACTCCCTCATTAGGCATGGTCAAGGAATGCATCCA - -a -s mr.mrrefChr5 238776 290 + 294542 TGCCTAACAAATGCTGGCATCCTTATCACCTGGCATTCTTGTCACCACTTGAATCACAGCATTTATTCTAGCCTATCAGTATGAGTAGCTGGATGGGAATATAAGCCCCCCATAGATTTCGCGTCCTGCTGCTGGCTATATGACCATGAACCAAGTTTTGCCTCCTCAGTCAGATAGCATCTTTGACTGCGCAGTCATTTATCTATCATCTGCTTGGTGCAGAGTGGCACAAACTTAACACACGGCAGAGTCTTGTCCTTATAGAGCTGTTGGAAGGACTAGCTCATAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 384967 286 + 636262 TGCCTAACAAATGCCGGCATCTTTGTCACCTGGCATTCTTGTCACCACGTGAATCACAGCATTTATTCTAGCCTATCAGTATGAGTAGCTGGATGGGAATATAAGTCCCACACAGATTTTGAGTCTTGCTGCTGGCTATAT---CATGAACCAAGTTTTGCCTCCTCAGTCAGATAGCATCTTTGACTGCGCAGTCATTTATCTATTATCTGCTTGGTGCAGAGTGGTGCAAACTTAACACACGGCAGAGTCCTGTCCTTATAGAGCTGATGGAAGGACTAGCTGATAA- -s simRat_chr6.simRat.chr6 385005 267 + 647215 TGTCTAACAAGTGCTTGCATCCTCATCACCTGGCATTCTTTTCACCACTTGAGACGTAGCAT--------------------GAGTAGCTGGATGGGAATATGAGCCCTCCATGGATTTCGCTTCCTGTTATTG-CTATATGACCATGAACCAAGTTTTTCATTCTCAGTCTGATAGCATCTATGGCTTCGCAGTCATTTATCTATCATCTGCTTGGTCCAGAATGGCACAAACTTAACACAG--CAGAGTCTTGTCCTTATAGAGCTGTTGGAAGGACTAGCTCATAAA - -a -s mr.mrrefChr5 239066 68 + 294542 CATAAAAAATCAAGCTATGTTATATGTCAAGGTTAGTGCCCCATTCTACCTAGCAACATGCCTATAAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 385253 63 + 636262 -----AAAATCAAGCTATGTTAGATGTCAAGGCTAGTGCCCCTTTCTACCTAGCAACATGCCTATAAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 385273 68 + 647215 CATAAAAAATTGAGCTATGTTATATGTCAATGTTAATGCCCCATTCTACCTAGTATCTTGCCTATAAA - -a -s mr.mrrefChr5 239134 459 + 294542 CTAACTGTGGTAAGCACAGGGTCACACATTAACATCATGATATCAGCAATTGGGCATGAAAAAGGATGAAAAAGAACCTTACATTTAAACATGGAGTGGAGGGAACTAGTGTATGTGTTAAAATTTCAATTTATGTGTTAGTATCGCTTTTATGCATTTTAGGACTTGACATAGTTGATTGTTAATGATAACACCTGCATTATATCTGAGGTCCCAGGTTGCAAAGCCCTTAAGTATCTGGCTTTCTACCCAGTACTCCAGTATGTGGTGTCTTCAAAGCTAATCACAAGTGTGGGTTCAAGTGACATGGGTGCTAAGCCATGGACACTAGGATAGCACAGGAGGTATCTCTGCGCCACAACAGATTCATGCATCTATGTCACCCCCCAAAAGTTAGATAATGGCCCTGTTTGGTTGGTGAACCTAGCAAAGATGAAGTTACTTACTGTGGAAGTGTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 385316 451 + 636262 CTAATTGCGGTAAGCACAGGGTCAAACATTAACATCATGATATCAGCAATTGGGCATGAAAA-GGATTAAAAAGAACCTTACATTTAAACATGGAGTGGAGGGATCTAGTGTATGTGTTAAAATATCAATTTATGTGTTAGTATCGCTTTTATGCATTTTAGGACTTGACATAGTTGATTGCTAATGATAACACCTGCGTTATACCTGATGTCCCAGGTTGCAAAGCCCTTAAGTATCTGGCTTTCTACCCAGTACTCCAGTATGTGGTGACTTCAAAGCTGATCACAAGTGTGGGTTCAAGTGACATGGGTGCTAAGCCATGGACACTAGGATAGCACAGGAGGTATCGT-------CAACAGATTCATGCATCTATGTCACCCCCCAAAAGTTAGATAATGGCCCTGTTTGGTTGGTGAACCGAGCAAAGATGACGTTACTTACTGTGGAAGTGCAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 385342 410 + 647215 CTAACTGTGGTAAGCACACGGTCACACATTAACATCATGATATCAGCAATTGGGCATGAAAAAGGATGAAAAGGAACCTTACATTTAAACATGGAGTGGAGGGAACTAGTCTGTGTGTTAAAGTTTCAATCTATGTGTTAGTATGGTTTTTGTGTATTTTAGGACTTGTCATAGTTGATTGTTCATGATAACACCAGCATTAAATCTGAGGTCCCAGGTTTCAAGAACCTTAAGTATCTGGCTTTCCACCCAGTACTCCAGTATGTGGGGTCTTCAAAGCTACTCACA-GTGTGGGTTCAAGTGACGCGGGCGTAACGCCATGGACACTGGGATAGTACAGGAGGTACCTCTGCGCCACAACAGATTCATGCATC------------------------------------------------CTCACAAAGATGAAGCTACTTATGGGGGAAGAGTGC - -a -s mr.mrrefChr5 239593 249 + 294542 AAAGAAATACAAAAACTGTCTCCAGGGGTATCGTTAAAAAATAAAAAAAATGGTCATAAGAGACTTACATTTAAGTATGATGCAAATAGTTCACCTCAGGCATGTTAACCCCCCAGATTGGTTTTTAAGATTTAGTTTGGGACTCTTGGTGAATTACCACAGTAAGTGACGGTTGATTAGACTAAGTTCCATACCTCTACTATTACAAGTTGAGACCCCTAGTGCATGTGGATGTATTATTGACCCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 385778 249 + 636262 AAAGAAATACAAAAACTGTCTCCAGGGGTATCGTTAAAAAACAAAGAGAATGGTCATAAGAGACTTACATCTAAGTATGATGCAAATAGTTCACCTCAAGCATGTTAACCCCCCGGATTGGTTTTTAAGATTTAGTTTGAGACTCACAGTGCATTCCCACAGTAAGTGACGCTTGATTAGACTAAGTTCCATACCTCTACTATTACAATTTGAGACCCCTAGTGCATGAGGACTTATTATTGACTCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 385752 249 + 647215 AAGGAAATACAAAAACTGTCTCTAGGGGTATTGTTAGGAAATAAAAAAAATTGTCATAAGAGACTAACATTTAAGTATAGTGCAGGTGGATTGCCTGAGGCATGTCTACCCCCGAGATTGATTTTTAGGATTTAGTTTAGGACTCTTGGTGAATTACCACAGCAAGTGACGGTTGATTAGACTAAGATCTATACCTCTACTATTACAAGTTGAGACCCCAAGTGCATATGGATGCACTATTGACCCATT - -a -s mr.mrrefChr5 239842 94 + 294542 GAAACCTGTGAAGATGCATTTTGGTGATGGTAGTGTAGTACATGTCCAATTCTCTAGTGGGTTTGCAAGATAAGGGGATATGTGCTGGTGCTGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 386027 93 + 636262 GAAGCCTGTGAAGAACCATTTTGGTGATGGTAGTGTAGTACATGTCCAATTCTCAAGTGGGTTTGCAAGATAAGGGGATATGTGCTGGTGTGG- -s simRat_chr6.simRat.chr6 386002 82 + 647215 GAAACCTGTGAAGATGCATTTTGGTGGTGGTAGAGTAGTACATGTCCAACTCTCTAGT------------CAAGGGGATATCTGCTGCTGCTGC - 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-a -s mr.mrrefChr5 248313 32 + 294542 GGATAAGACACGCAACTGCCCTTAGCCAGGTC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394533 32 + 636262 GGATAAGACACACAACTGCCCTAAGCCAGGTC -s simRat_chr6.simRat.chr6 394804 32 + 647215 GAATAAGACATGCAACTGCCCTTAGCCATGTC - -a -s mr.mrrefChr5 248345 138 + 294542 CAAGTTATCAGGCAGTGGGCCCCACAAGGGTCCGTTGATCCACATTTCGATTGGAGCATCTCCTGGGTGTCTGGGAGTGGGCAGGAAGCAGGCTTGAAGGACCCTGTTATACTGGAGGTCTTACTGCTGGGTGTCATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394571 138 + 636262 CAAGTGATCAGGCAGTGGGCCCCAGAAGGGTCAGTTGATCCACATTTCGATTGGAGCATCTCTTGGGTGTCTGGGAGTGGACAGGGAGCAGGCTTGAAGGACTCTGTTATACTGGAGGTCTTACCGCTGGGTGTCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 394836 138 + 647215 CAAGCTATCAGGCAGTGGGCCCCACGAGGGTCCGTTGATCCACATTCCTATTGGAGCATCTCCCGGGTGTCTGGGAGTGGGCAGGAAGCAGGCTTGAAGGACCCTGTTATACTGTAGGTCGTACTATTGGGTGTAATT - -a -s mr.mrrefChr5 248483 3 + 294542 ACT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394709 3 + 636262 ACT -s simRat_chr6.simRat.chr6 394980 3 + 647215 GCT - -a -s mr.mrrefChr5 248486 242 + 294542 GGTGTCCTCTAACCACCATGATTTGTACTTTGTTTTTCATGTAAAGACTGGTTGCTTAACATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTTGACCCCTAAAGGATGACTGGCTAGAGCCCAACCTGAGATTTTCCTGCAGAACTCCTTTAATCAATACCACTCTACACCAGGAGGACTCTCCAGTGAAGCTACAGCCTAACATGCAGAGTACTCTCATGATGAACTTTCTCCATGAGAGGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 394712 240 + 636262 GGTGTCCTCTAACCACCATGATTTGTACTTTGTTT--CATGTAAAGAGCGGTTGCTTAACATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTTGACCCCTAAAGGATGACTGACTAGAGCCCAATCTGAGATTTTCCTGCGGAACTCCTTTAATCAATACCACTCTACACCAGGAGTACTCCCCAGTGAAGCTACAGCCTAACATGCAGAGTACTCTCATGATGGACTTTCTCCATGAAAGGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 394985 232 + 647215 GGTGTCCTTTATACACCATGATTTGAGCTTTTTGGTTCATGTAATGACTG----------ATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTCCGTTGCTAAAGGATGACATGCTAGAGCCCTACCTGAGGTTTTCCTGCAGAACTCCTTTAATCAAGACCACTCTACACCAGATGGACTCTCCAGTGAAGCCACAGCCTAAGATGCAGAGTACTTTCATGATGAACCTTCTCCATGAGAAGG - 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-a -s mr.mrrefChr5 255902 161 + 294542 ATGGAACTCTCCCATGATATTGTTGCTCAAGACTTAGTACATCTTTCTCACCAAAAAGATAAAGTGTAGTTTGTCTATGAGGTCCTGGACTTGATAGCTATTAAATGTGGCTCTGGGGAGTGATCAAGAGCTGGGACATATATTAGCATTTTAACCACATT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 402869 157 + 636262 ATGGCCCTCTCCCATGATATAGTTGCTCAAGACTTAGTACATTTTTCTCAGCAACAAGATAACGTGTAGTTTGTCTATGAGGCCCTGGACTTGACAGCCATTAAATGTGGCTCTGGGGAGTGATCAAG----GAGACATATATTAGCATTCTAACCACATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 402736 157 + 647215 ATGGAACTCTTCCATGATATTGTTGCTCAAGACTCAGTATATCTTTCTCACCAAAAAGATAGAGTGTAGTTTGTCTATGAGGTCCTGGACTTGATAGCTATCAAATGTAGCTCTGAGGAGCGATCAAGAGCTGGGAGATATATTAGCATTT----AGCATT - -a -s mr.mrrefChr5 256063 25 + 294542 GGACACTCTTTCCCCATTTCCAAGA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403026 25 + 636262 GGACACTCCTTCCCCATTTCCAAGA -s simRat_chr6.simRat.chr6 402894 25 + 647215 TGACACTCTTTCCCCATTACCAAGA - -a -s mr.mrrefChr5 256088 11 + 294542 AAGACAAGGTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 403052 11 + 636262 AAGACAATGTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 402919 7 + 647215 ----CAAGGTA - 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-a -s mr.mrrefChr5 260988 606 + 294542 TAAGGTGAAAGGATGATTGAAGTGATTCTATGGCAAGTGATGCTATGGGCAGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTTCCCACACTACTAATGAATCATTGTCAGACATCCAATATAGCAGTTTATGGCATAATAGGTTGTACACACTATTGAGATCTGCTTGGTAAAGGGGCTAATGTGTGAAGTTAGCATAGAACAAGAATATTTATGATGGTATCTGAATTATTAACCTACTTTTGTGGTATTGGTCAATTATTTCACACTACAACTAAGCCTATACAAATATATTTATTATCGGATTACAGGGCAAGAACATTATTCAGAGAGTGGATTGTAGACTGAATTTCATTATAATAAGTCATAGAATAGTACTGGGGGTGAACAATTACAGCCCAAGATCTGAAATTGAGATCGTAATTGTGACTAGAGGTTTAAATTTACATTTTATTGTACACACATCACCTGCCCACTCTCATACCTTGGGCATTTTCAATAGACTACAATAAGTTTGTAAGTGGTTATTAATATGGTAGTCACTGCTAGAACTTGTGTTTCTATCCAAGCAGTTATGCAACTATGCAACTTCTGGTGGCC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 408158 600 + 636262 TAAGGTGAAAGGATGATTGAAGTGATTCTATGGCAAGTGATACTATAGCCAGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTCCCCACACTACTAATGAGTTCACGTCAGACATCCAATATA-TAGTTTATGGCATAATAGGTGGTAC----TGTTGAGATCTGCTTGGTAAAGGTGC-AATGTGTGGAGTTAGCATAGAACAAGAATTATTATGATGGTATCTGAATTATTAAGCTACTCTTATGGTATTGGGCAATTATTTCACACTACAACTAAGCCTATACAAATATATTTATTATGGGATTACAGGCCAGGAACATTATCCAGAGAGTGGATTGTAGACTGAATTTCATTATATTAAGTCATAGAATAGTACTGGGCGCGAACAGTTACAGCCCAAGATCTGAAATTGGGATCGTAATTGTGACTAGAGGTTTAAATTTGCATTTTATTGTACATACATCACCTGCCCACCCTCATATCTTGGGCATTTTCAACAGACTATAATAAGTTTGTGAGTGGTTATCAATATGGTAGTCACTGCTAGAACTCGTGTTTCTATCCAAGCAGTTATGCAACTATGCAACTTTTGGTGGCC -s simRat_chr6.simRat.chr6 414673 605 + 647215 TAAGGTAAAAGGATGATTGAGGTGATGCTATGGCAAGTGATGCTATGGGCGGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTTCCCACACCACTAATGGATCATTGTCAGACATCCAATATAGCAGTTTATGGCATAATAGGTTGTACACACTACTGAGATCTGCTTGGTGAAGGGGCTAATGTGTGAAGTTAGCATAGAACAAGAATATTTATGATGCAATCTGAAGTATTAACCTACTTTGGTGGTATTGCTCAAGTATCTCACACCGCAACTAAGCCTATACAA-TATATTTTTTGTCGGATTACAGGGAAAGAACATTAGTCAGAGACTGGATTGTAAACTGCATTTCATTACAATAAGTCATAGCATAGTACTGGGGGTGAACAATTACAGCCCAAGATCTAAAATTGAGATCCTACTGTTGGCTAAAGGTTTAAATTTACATTTTATTCTAGACACATCACCTGCCCATTCTCATACCTTGGGGATTTACAATAAACTGCAATAAGGTTGTAAGTGGTTATTAATATGGCAGTCACTGCTAGAACTTGTATTTCTATCCAAGCAATTATGCAACTATGCAACCTCTGGTGACC - 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-a -s mr.mrrefChr5 261968 63 + 294542 GTCATTGTGAGGACTCCTCAACAAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATGTTGATGAG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409095 63 + 636262 GTCATTGTGAGGACTCCTCAACAAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATGTTGATGAG -s simRat_chr6.simRat.chr6 415650 59 + 647215 GTCGTTGAGAGGACT----ATCTAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATATTGATGGG - -a -s mr.mrrefChr5 262031 117 + 294542 TGGCTATATGTCATGGGCTTTCCATTGGTCCCCAGTCATCAGATTAAATCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCATTACGTCTGATTATTTCCTTGAATAAAATACTGATTGT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409158 117 + 636262 TGGCTATATGTCATGGACTTTCAATTGGTCCCCATTCATCAGATCAAATCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCATTACGTCTGGTTATTTCCTGGAATAAAATACTGATTGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 415731 115 + 647215 TATCTGCATCTCATGGGCTTTCCATTGGTCTCCAGTCAT--GGTTGAACCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCACTATGTCTGATTATTTTCTTGAATAAAATACTGATTAT - -a -s mr.mrrefChr5 262148 19 + 294542 ATAGTGTGAAGCTTCCATT -s simRat_chr6.simRat.chr6 415849 19 + 647215 ATAGTGTGAAGCTTCCATT - -a -s mr.mrrefChr5 262167 90 + 294542 ATTTATATATGATTTGTTTTCAGATCTGCAGTTGAGCTACCTAAAGTCTTCAGGTTACACCATATAAAAACTCAGCTATGTGTCTCTGTT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409275 86 + 636262 ----ATATACGATTTGTTTTCAGATCTGCAGTTGAGCTACCTAAAGTCTTCAGGTTACACCATATAAAAACTCAGCTATGTGTCTCTGTT -s simRat_chr6.simRat.chr6 415870 82 + 647215 ATTTATATATGATTTGGTTTCAGATCTCCAG--------CCTACAGTCTTCAGGTTACACCATATAAAAACTCAGCTATGTGTTTCTGCT - 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-a -s mr.mrrefChr5 262565 7 + 294542 CCAATTA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409667 7 + 636262 CCAATTA -s simRat_chr6.simRat.chr6 416263 7 + 647215 TCAATTT - -a -s mr.mrrefChr5 262572 5 + 294542 TGAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409714 5 + 636262 TGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 230251 5 - 647215 TGAAC - -a -s mr.mrrefChr5 262577 21 + 294542 CTCCTCATTTACCATTACAAC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409719 21 + 636262 CACCTCATTTACCTTTACAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 230268 21 - 647215 CTATACATTTACCATTACAAC - -a -s mr.mrrefChr5 262598 357 + 294542 CTGGTATAGGAGATGTTTCACTTACTCTATTAGGGTGATGATGAATCAAGACTTAGGTCAGCCTAAACACATGTACAATGTTTTTGCTTCTATTTAGTTCAGTCCAGTCGTTGTGCATGTGTGTGCACTGTACAGTTTCCCTTCCTTCAAATTCATATGATTACAATGCCACTAACAATCTTAAATCTTTCCTATTATAACAAACTGAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTGGATGAGGTCTCACCACCTCACTCCATTGTCCATAACAGATTTGTCAGCATTGTCCAAGAAGCTCCAAAGAGAAATACCACATGACAGATGGCTCTACTGACCCATGGTATTCCAGAGG -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 409740 341 + 636262 CTGGTACAGGAGGTGTTTCACTTACTCTATTAGGGTGATGTTGTATC--------TGTCAGCCTAAACACATGTAGAATGTTTTTGCTTCTATTTAGTTAGGTCCAGTCATCATGCAAGTGTGTGTACTGTACAGTTACTCTCCCTTCTGATTCATATGATGACAATGCCACTAACAATCTTAAATCTTTTCTATTATAACAAACTGAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTGAATGAGGACACACCACCTCTCTCCATTGTCCATAACAGATTTGTCAGCATTGTCCAAGAAGCTTCAAAGAGATATATCTCATGACAGATGGCT--------CCATGGTATTCCAGAGT -s simRat_chr6.simRat.chr6 230292 357 - 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-a -s mr.mrrefChr5 268269 382 + 294542 GATGTCTGGGCAATCAAAAGTGGGCAGATTCCTGCTCAAATACAGTTTATCATCACGCACTGGGCAGGGTATAAGCCAGTTATTTGATTGCTCGTAGGGGACCCAGAGCACAACTTCTGCTTAAACAAGATCCATACTTCCACTTAAGAAAGCCCAATTTGATTTTCCCTTGAATTTTGGCAGATCTTTTGATAGACACCCACATTCGTACGTCATGACAAGTTTGTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAATGAAAGGCTTGCTGGTCACCAACCCAAGACAGATGTTCAAAGCTGTCATTACACAGTGTGCTTTGGCCACTGTACACTATGGACAAATATGCAAACCAGAGAACACCTCATTAATGGTATGACTTAT -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415570 382 + 636262 GATGTCTGGCCAATCAAGAGTGGGCAGATTCCTGCTCAAACACAGTTTATCATCATGCACTGGGCAGGGTATAAGCCAATTATCCGATTGCTCGTAGGGAACCCAGAGCACAACTTCTGCTTAAACAAGATCCATACTTCCACTTAAGAAAGCCCAATTTGATTTTCCCCTGGAGTTTGGCAGATCTTTTGATAGACAACCACATTCGTACATCATGACCAGTTTGTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAATGAAAGGCTTGCTGATCACCAACCCAAGACAGATGTTCAAAGCTGTCATTACACAGTGTGCTTTGGCCAGTGTGCACTATGGACAAATATGCAAACCAGAGAACACCTCATTAATGGTATGACTTAT -s simRat_chr6.simRat.chr6 421895 382 + 647215 GATGTCTGGGCAATCAAAAGTGGGTGGATTCCTGCTCAACTACAGTTTTTCATCACGCACTGGGCAGGGTATAAACCAGTTATTTGGGTGCTTGTAGGAGACCCAGAACACAACTTCTGCTTAAAAAAGATCCATACTCCCACCTAAAAAACCTCCATTTGATTTTACCTTGAATTTTGGCAGAGCTTTTGATAGCCACCCGCACTTGTCTGTCATGGCAAATTTTTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAAAGAAAGGCTTGCTGGTCACCGACCCAAGACAGATGTTCAAGGCTGTCATTACACAGTGTACTTTGACCACTGTACACTACAGACAGAAATGCAAACCAGAGAATACCTAATTAATGATGTGACTTAT - -a -s mr.mrrefChr5 268651 268 + 294542 ATCTGGCTGGAGCATGTCTATTCCCCAGTAGCAATAAAGGGCCCTGCTTAAGGCTGCAAGCTTAATCAGCCTCCAAACAAGGGGTTAATTTTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTAGGACCTGTGGTCTCCCTGGCCTTTAATGAATCACAAAGAGCTTCCAACTCCTGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACATCAGTAAACAGACTGTTATGCAGAGTTTCCCTTCCCCAAGTTCATCCCCACCATTAGGCTTACAACTGAGC -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 415952 268 + 636262 ATCTGGCTGGAGCACGTCTATTCTCCAGTAGCAATGAAGGGCCCTGCTTAAGGCCGCAAGCTTAATCAGCCCCCAAACAAGGGGTTAATTGTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTAGGACCTGTGGTCTCCCTGGCCTTTAATGAATTGCAAAGAGCTTCCAACCCTCGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACATCAGTAAACAGACTGTTATGCAGAGTTTCCTTTCCCCAAGTTCATCCCCACTGTTAGGCTTACAACTGAAC -s simRat_chr6.simRat.chr6 422278 266 + 647215 ATCTGGCTAGAGCATGTCTATTTCCCAGTAGCAATAAATGGCCCTTTTTGAGGCTGCAAGCTTGATCAGACTCCACACATGGGGTTAATTTTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTATAGCCTGTAGTCTCCTTGGCCTTTAAAGATGCACAAAGAGCTGCCAACTCCTGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACACCAG--TACAGACTATTATGCTGAGTTTCCCTACTCCAAGTTCATCCCCACCACTAGGCGTGCGACTGAGT - -a -s mr.mrrefChr5 268919 137 + 294542 TCCCAAGAATACAGAGTGTTTTTAGTCTCTTATTCCAAGTACCATAATTTGCTGAGGGCCTGTACACCTAGTTAGACAAAATTACAGCCAAAACAGTAGTTTTTTTAATCCATTCCCACCCTCCATAGCACAATCAA -s simMouse_chr6.simMouse.chr6 416518 137 + 636262 TCCCAAGAACACAGAGTGTTTTTAGTCTCTTATTCCCAGTACCATCGTTTGCTGAGGGCCTGTGAACATAGTTAGACAAAATAACACCCAAAGCAGTAGTTTTTTTAATCCATTCCCACCCTCCATAGCACCATCAA -s simRat_chr6.simRat.chr6 422544 136 + 647215 TCCCAAGAGTATAGAGTGTCTTTAGTCTCTTATTGCAAGTACCATAATTAGCTGAGGGC-TGTACACCTAGTTAGACAAAACTACAGCAAACACTTTAGTTTTTTTAATGCATACCCACCCTCCATAGCACAACCAA - 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