Mercurial > repos > galaxy-australia > panaroo
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planemo upload for repository https://github.com/usegalaxy-au/tools-au/tree/master/tools/panaroo commit 23afccfad9fc0d2a4b91fd391f4847062fd98042
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Standard</option> - <option value="2">2. Vertebrate Mitochondrial</option> - <option value="3">3. Yeast Mitochondrial</option> - <option value="4">4. Mold, Protozoan, and Coelenterate Mitochondrial Code and the Mycoplasma/Spiroplasma Code</option> - <option value="5">5. Invertebrate Mitochondrial</option> - <option value="6">6. Ciliate, Dasycladacean and Hexamita Nuclear Code</option> - <option value="9">9. Echinoderm Mitochondrial</option> - <option value="10">10. Euplotid Nuclear</option> - <option value="11" selected="True">11. Bacteria and Archaea</option> - <option value="12">12. Alternative Yeast Nuclear</option> - <option value="13">13. Ascidian Mitochondrial</option> - <option value="14">14. Flatworm Mitochondrial</option> - <option value="15">15. Blepharisma Macronuclear</option> - <option value="16">16. Chlorophycean Mitochondrial</option> - <option value="21">21. Trematode Mitochondrial</option> - <option value="22">22. 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$advanced.graph_correction_option.all_seq_in_graph - $advanced.graph_correction_option.no_clean_edges - - #if $advanced.gene_alignment_option.a != 'None' - -a '$advanced.gene_alignment_option.a' - #end if - - #if '$advanced.gene_alignment_option.aligner' == 'mafft' - --aligner mafft - #else - --aligner '$advanced.gene_alignment_option.aligner' - #end if - #if $advanced.gene_alignment_option.core_subset != '' - --core_subset $advanced.gene_alignment_option.core_subset - #end if - #end if - -i $input_directory/*.gff - -o outdir - --clean-mode $mode - > '$log' && - mv outdir/gene_presence_absence.Rtab outdir/gene_presence_absence_rtab.Rtab && - 2>&1 - + panaroo + --clean-mode '$mode' + #if str($gen_code) != 'None': + --codon-table '$gen_code' + #end if + #if str($advanced.adv_options_selector) == "set": + #if $advanced.remove_invalid_genes + $advanced.remove_invalid_genes + #end if + --threshold '$advanced.matching_option.threshold' + --family_threshold '$advanced.matching_option.family_threshold' + --len_dif_percent '$advanced.matching_option.len_dif_percent' + $advanced.matching_option.merge_paralogs + --search_radius '$advanced.refind_option.search_radius' + --refind_prop_match '$advanced.refind_option.refind_prop_match' + --refind-mode '$advanced.refind_option.refind_mode' + --min_trailing_support '$advanced.graph_correction_option.min_trailing_support' + --trailing_recursive '$advanced.graph_correction_option.trailing_recursive' + --edge_support_threshold '$advanced.graph_correction_option.edge_support_threshold' + --remove_by_consensus '$advanced.graph_correction_option.remove_by_consensus' + --high_var_flag '$advanced.graph_correction_option.high_var_flag' + --min_edge_support_sv '$advanced.graph_correction_option.min_edge_support_sv' + $advanced.graph_correction_option.all_seq_in_graph + $advanced.graph_correction_option.no_clean_edges + #if $advanced.gene_alignment_option.alignment != 'None' + --alignment '$advanced.gene_alignment_option.alignment' + --aligner '$advanced.gene_alignment_option.aligner' + #end if + #if $advanced.gene_alignment_option.core_subset + --core_subset $advanced.gene_alignment_option.core_subset + #end if + #if $advanced.gene_alignment_option.core_entropy_filter + --core_entropy_filter $advanced.gene_alignment_option.core_entropy_filter + #end if + #end if + -i $input_directory/*.gff + -o outdir + -t \${GALAXY_SLOTS:-8} + #if $log_out + 2>&1 | tee '$log' + #end if + && mv outdir/gene_presence_absence.Rtab outdir/gene_presence_absence_rtab.Rtab && + mv outdir/combined_protein_cdhit_out.txt outdir/combined_protein_cdhit_out.fa ]]></command> <inputs> - <param name="gff_input_collection" type="data_collection" format="gff" collection_type="list" label="GFF Input Collection" help="A list of gff files (i.e prokka)"/> - <param name="mode" type="select" label="The stringency mode at which to run panaroo" help="--clean-mode"> - <expand macro="clean_mode"/> + <param name="gff_input_collection" type="data_collection" format="gff" collection_type="list" label="GFF Input Collection" help="A collection of input GFF files"/> + <param name="mode" type="select" label="The stringency mode for Panaroo to run" help="Each of these modes can be fine tuned using the additional parameters in the 'Graph correction' section."> + <option value="strict">Strict</option> + <option value="moderate">Moderate</option> + <option value="sensitive">Sensitive</option> </param> - <param name="gen_code" type="select" label="the codon table user for translation" help="default: 11"> + <param name="gen_code" type="select" label="The Codon table used for translation" help="Default: 11.Bacteria and Archaea"> <expand macro="genetic_code"/> </param> - <conditional name="advanced"> - <param name="adv_options_selector" type="select" label="Set advanced options?" help="Provides additional controls"> + <param name="log_out" type="boolean" label="Output log file?" truevalue="yes" falsevalue="no"/> + <conditional name="advanced"> + <param name="adv_options_selector" type="select" label="Set Advanced Options?" help="Fine Tuning of Panaroo algorithmic parameters"> <option value="set">Set</option> <option value="do_not_set" selected="True">Do not set</option> </param> - <when value="set"> - <param name="remove_invalid_gene" argument="--remove-invalid-genes" type="boolean" truevalue="--remove-invalid-genes" falsevalue="" label="removes annotations that do not conform to the expected Prokka format such as those including premature stop codons" help="--remove-invalid-genes"/> - - <section name="matching_option" title="Matching" expanded="false"> - <param name="seq_threshold" argument="--threshold" type="float" value="0.98" label="sequence identity threshold" help="default: 0.98"/> - <param name="peptide_threshold" argument="--family_threshold" type="float" value="0.7" label="protein family sequence identity threshold" help="default: 0.7"/> - <param name="length_diff_cutoff" argument="--len_dif_percent" type="float" value="0.98" label="length difference cutoff" help="default: 0.98"/> - <param name="merge_paralogs" type="boolean" truevalue="--merge_paralogs" falsevalue="" checked="false" label="do not split paralogs" help="--merge_paralogs"/> - </section> - - <section name="refind_option" title="Refind" expanded="false"> - <param argument="--search_radius" type="integer" value="5000" label="Search radius" help="--search_radius (default: 5000)"/> - <param argument="--refind_prop_match" type="float" value="0.75" label="Gene proportion match" help="default: 0.75"/> - <param argument="--refind_mode" type="select" label="The stringency mode at which to re-find genes" help="default: default"> - <expand macro="refind_mode_option"/> - </param> - </section> + <when value="set"> + <param argument="--remove-invalid-genes" type="boolean" truevalue="--remove-invalid-genes" falsevalue="" label="Remove Invalid Genes" help="Removes annotations that do not conform to the expected Prokka format."/> + + <!--Options for Matching--> + <section name="matching_option" title="Matching" expanded="false"> + <param argument="--threshold" type="float" value="0.98" label="Sequence identity threshold" help="default: 0.98"/> + <param argument="--family_threshold" type="float" value="0.7" label="Protein family sequence identity threshold" help="default: 0.7"/> + <param argument="--len_dif_percent" type="float" value="0.98" label="Length difference cutoff" help="default: 0.98"/> + <param argument="--merge-paralogs" type="boolean" truevalue="--merge_paralogs" falsevalue="" label="Merge Paralogs"/> + </section> + + <!--Options for Refind--> + <section name="refind_option" title="Refind" expanded="false"> + <param argument="--search_radius" type="integer" value="5000" label="Refinding Search radius" help="The distance in nucleotides surronding the neighbour of an accessory gene in which to search for it"/> + <param argument="--refind_prop_match" type="float" value="0.2" label="Refinding Proportion Match" help="he proportion of an accessory gene that must be found in order to consider it a match"/> + <param argument="--refind_mode" type="select" label="Refind Mode" help="Set the stringency mode at which to re-find genes"> + <option value="default" selected="True">Default</option> + <option value="strict">Strict</option> + <option value="off">Off</option> + </param> + </section> - <section name="graph_correction_option" title="Graph Correction" expanded="false"> - <param argument="--min_trailing_support" type="integer" value="2" label="Minimum cluster size to keep a gene called at the end of a contig" help="--min_traiiing_support [relexed mode : 2 is used]"/> - <param argument="--trailing_recursive" type="integer" value="1" label="Number of times to perform recursive trimming of low support nodes near the end of contigs" help="--trailing_recursive [relaxed mode: 1 is used]"/> - <param name="edge_support_threshold" type="integer" value="1" label="Edge support threshold" help="--edge_support_threshold [ Minimal edge 1 is used ]"/> - <param name="len_outlier_proportion" type="float" value="0.01" label="Length outlier support proportion" help="--length_outlier_support_proportion [default: 0.01]"/> - <param name="remove_by_consensus" type="boolean" truevalue="True" falsevalue="False" checked="False" label="Remove consensus" help="--remove_by_consensus [default: False]"/> - <param name="high_var_flag" type="integer" value="5" label="Highly variable gene region" help="--high_var_flag [default: 5]"/> - <param name="min_edge_support_sv" type="integer" value="2" label="Minimum edge support structural variants" help="--min_edge_support_sv [relaxed mode: 2 is used]"/> - <param argument="--all_seq_in_graph" type="boolean" truevalue="--all_seq_in_graph" falsevalue="" label="Retains all DNA sequence" help="--all_seq_in_graph [default: off]"/> - <param argument="--no_clean_edges" type="boolean" truevalue="--no_clean_edges" falsevalue="" label="Edge filtering in the final output graph" help="--no_clean_edges [default: off]"/> - </section> - - <section name="gene_alignment_option" title="Gene Alignment" expanded="false"> - <param argument="-a" type="select" label="Output alignments of core genes or all genes." help="-a [optional: core or pan; default: None"> - <expand macro="gene_alignment"/> - </param> - <param argument="--aligner" type="select" label="Specify an aligner" help="--aligner [mafft|prank|clustal][default: mafft]"> - <expand macro="gene_aligner"/> - </param> - <param name="codons" type="boolean" truevalue="true" falsevalue="false" checked="false" label="Generate codon alignments" help="--codons"/> - <param name="core_threshold" type="float" value="0.95" label="Core-genome sample threshold" help="--core_threshold [default: 0.95]"/> - <param argument="--core_subset" type="integer" value="" optional="true" label="Subset of the core genome to these many genes" help="--core_subset [default: all]"/> - <param name="core_entropy" type="float" value="0.1" label="Set the Block Mapping and Gathering with Entropy" help="--core_entropy_filter (threshold can be between 0.0 and 1.0) [default: Tukey outlier method]"/> - </section> - </when> + <!--Graph Correction--> + <section name="graph_correction_option" title="Graph Correction" expanded="false"> + <param argument="--min_trailing_support" type="integer" value="2" label="Minimum trailing support" help="Minimum cluster size to keep a gene called at the end of a contig"/> + <param argument="--trailing_recursive" type="integer" value="1" label="Trailing Recursive" help="Number of times to perform recursive trimming of low support nodes near the end of contigs"/> + <param argument="--edge_support_threshold" type="float" value="1" label="Edge support threshold" help="Minimum support required to keep an edge that has been flagged as a possible mis-assembly."/> + <param argument="--len_outlier_proportion" type="float" value="0.01" label="Length outlier support proportion" help="--length_outlier_support_proportion"/> + <param argument="--remove_by_consensus" type="boolean" truevalue="True" falsevalue="False" label="Remove consensus" help="If a gene is called in the same region with similar sequence a minority of the time, remove it."/> + <param argument="--high_var_flag" type="integer" value="5" label="Highly variable gene region" help="Minimum number of nested cycles to call a highly variable gene region."/> + <param argument="--min_edge_support_sv" type="integer" value="2" label="Minimum edge support structural variants" help="Minimum edge support required to call structural variants in the presence/absence sv file"/> + <param argument="--all_seq_in_graph" type="boolean" truevalue="--all_seq_in_graph" falsevalue="" label="Retains all DNA sequence" help="Retains all DNA sequence for each gene cluster in the graph output."/> + <param argument="--no_clean_edges" type="boolean" truevalue="--no_clean_edges" falsevalue="" label="No Clean Edges" help="Turn off edge filtering in the final output graph."/> + </section> + + <!--Gene Alignment--> + <section name="gene_alignment_option" title="Gene Alignment" expanded="false"> + <param argument="--alignment" type="select" label="Output alignments of core genes or all genes."> + <option value="None" selected="True">None</option> + <option value="core">Core genome alignment</option> + <option value="pan">Pan-genome alignment</option> + </param> + <param argument="--aligner" type="select" label="Specify an aligner" help="--aligner [mafft|prank|clustal][default: mafft]"> + <option value="mafft" selected="True">MAFFT</option> + <option value="prank">PRANK</option> + <option value="clustal">Clustal</option> + </param> + <param argument="--codons" type="boolean" label="Generate codon alignments by aligning sequences at the protein level" truevalue="--codons" falsevalue="" help="Generate codon alignments by aligning sequences at the protein level"/> + <param argument="--core_threshold" type="float" value="0.95" label="Core Threshold" help="Core-genome sample threshold"/> + <param argument="--core_subset" type="integer" optional="true" label="Subset of the core genome to these many genes" help="Randomly subset the core genome to these many genes. Default is all genes."/> + <param argument="--core_entropy_filter" type="float" value="0.1" label="Core Entropy Filter" help="Manually set the Block Mapping and Gathering with Entropy (BMGE) filter. By default this is set using the Tukey outlier method."/> + </section> + </when> <when value="do_not_set"/> - </conditional> + </conditional> </inputs> <outputs> - <collection name="output" type="list" label="${tool.name} on ${on_string}: Pangenome output"> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>clstr)" directory="outdir" format="txt" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>txt)" directory="outdir" format="txt" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>gml)" directory="outdir" format="txt" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>Rtab)" directory="outdir" format="tabular" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>csv)" directory="outdir" format="csv" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>fasta)" directory="outdir" format="fasta" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>fa)" directory="outdir" format="fasta" visible="false" /> - <filter>advanced['adv_options_selector'] != 'set'</filter> - </collection> - <collection name="output_advance" type="list" label="${tool.name} on ${on_string}: Pangenome output (advance)"> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>clstr)" directory="outdir" format="txt" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>txt)" directory="outdir" format="txt" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>gml)" directory="outdir" format="txt" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>Rtab)" directory="outdir" format="tabular" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>csv)" directory="outdir" format="csv" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>fasta)" directory="outdir" format="fasta" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>fa)" directory="outdir" format="fasta" visible="false" /> - <filter>advanced['adv_options_selector'] == 'set' and advanced['gene_alignment_option']['a'] == 'None'</filter> - </collection> - <collection name="output_pangenome" type="list" label="${tool.name} on ${on_string}: Pangenome alignment output"> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>clstr)" directory="outdir" format="txt" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>txt)" directory="outdir" format="txt" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>gml)" directory="outdir" format="txt" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>Rtab)" directory="outdir" format="tabular" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>csv)" directory="outdir" format="csv" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>fasta)" directory="outdir" format="fasta" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>fa)" directory="outdir" format="fasta" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>aln)" directory="outdir" format="aln" visible="false" /> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>embl)" directory="outdir" format="embl" visible="false" /> - <filter>advanced['adv_options_selector'] == 'set' and advanced['gene_alignment_option']['a'] != 'None' </filter> - </collection> - <collection name="output_pangenome_fasta" type="list" label="${tool.name} on ${on_string}: Pangenom alignment fasta"> - <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.(?P<ext>fas)" directory="outdir/aligned_gene_sequences" format="fasta" visible="false" /> - <filter>advanced['adv_options_selector'] == 'set' and advanced['gene_alignment_option']['a'] != 'None'</filter> - </collection> - <data name="log" format="txt" label="${tool.name} on ${on_string}: log"/> + <!--Panaroo default outputs --> + <collection name="output" type="list" label="${tool.name} on ${on_string}: Pangenome default output"> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.fasta$" directory="outdir" format="fasta" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.fa$" directory="outdir" format="fasta" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.txt$" directory="outdir" format="txt" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.clstr$" directory="outdir" format="txt" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.gml$" directory="outdir" format="txt" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.csv$" directory="outdir" format="csv" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.Rtab$" directory="outdir" format="tabular" visible="false"/> + <filter>( advanced['adv_options_selector'] != 'set' ) or ( advanced['adv_options_selector'] == 'set' and advanced['gene_alignment_option']['alignment'] == 'None' )</filter> + </collection> + + <!--Panaroo advance alignment outputs --> + <collection name="output_pangenome" type="list" label="${tool.name} on ${on_string}: Pangenome alignment output"> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.clstr$" directory="outdir" format="txt" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.txt$" directory="outdir" format="txt" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.gml$" directory="outdir" format="txt" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.Rtab$" directory="outdir" format="tabular" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.csv$" directory="outdir" format="csv" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.fasta$" directory="outdir" format="fasta" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.fa$" directory="outdir" format="fasta" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.aln$" directory="outdir" format="fasta" visible="false"/> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.embl$" directory="outdir" format="embl" visible="false"/> + <filter>advanced['adv_options_selector'] == 'set' and advanced['gene_alignment_option']['alignment'] != 'None' </filter> + </collection> + + <!--Pan Genome Aligned FASTA --> + <collection name="output_pangenome_fasta" type="list" label="${tool.name} on ${on_string}: Pangenome Alignment Gene Sequences"> + <discover_datasets pattern="(?P<designation>.+)\.fas$" directory="outdir/aligned_gene_sequences" format="fasta" visible="false"/> + <filter>advanced['adv_options_selector'] == 'set' and advanced['gene_alignment_option']['alignment'] != 'None'</filter> + </collection> + + <!--Panaroo log output --> + <data name="log" format="txt" label="${tool.name} on ${on_string}: Panaroo Log"> + <filter>log_out</filter> + </data> </outputs> <tests> - <!-- run panaroo with default parameters (i.e panaroo -t 2 -i *.gff -o default \-\-clean-mode strict \-\-remove-invalid-genes) --> + <!-- Test 1 : Testing Panaroo with default parameters --> + <test expect_num_outputs="2"> + <param name="mode" value="strict"/> + <param name="gen_code" value="11"/> + <param name="log_out" value="yes"/> + <conditional name="advanced"> + <param name="adv_options_selector" value="do_not_set"/> + </conditional> + <param name="gff_input_collection"> + <collection type="list"> + <element name="10_small.gff" value="10_small.gff"/> + <element name="11_small.gff" value="11_small.gff"/> + </collection> + </param> + <output_collection name="output" count="13" type="list"> + <element name="combined_DNA_CDS" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="18206"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="combined_protein_CDS" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="7048"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="combined_protein_cdhit_out" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="5119"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="pan_genome_reference" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="5055"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="summary_statistics" ftype="txt"> + <assert_contents> + <has_line line="Core genes	(99% <= strains <= 100%)	251"/> + <has_line line="Total genes	(0% <= strains <= 100%)	251"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="gene_data" ftype="csv"> + <assert_contents> + <has_text text="KPLBOJCC_00001"/> + <has_text text="NCFNLLIC_00549"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="gene_presence_absence" ftype="csv"> + <assert_contents> + <has_text text="dcd"/> + <has_text text="trmB"/> + <has_text text="betI_1"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="gene_presence_absence_roary" ftype="csv"> + <assert_contents> + <has_text text="kstR2_1"/> + <has_text text="ybgJ"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="struct_presence_absence" ftype="tabular"> + <assert_contents> + <has_line_matching expression="Gene\s+10_small\s+11_small"/> + </assert_contents> + </element> + </output_collection> + <output name="log"> + <assert_contents> + <has_text text="total seq: 979"/> + </assert_contents> + </output> + </test> + + <!-- Test 2 : Testing Panaroo with Advanced filtering option along with Alignment turned off --> <test expect_num_outputs="2"> <param name="gen_code" value="11"/> <param name="mode" value="strict"/> - <param name="adv_options_selector" value="do_not_set"/> + <param name="log_out" value="yes"/> + <conditional name="advanced"> + <param name="adv_options_selector" value="set"/> + <section name="gene_alignment_option"> + <param name="alignment" value="None"/> + </section> + </conditional> + <param name="gff_input_collection"> + <collection type="list"> + <element name="10_small.gff" value="10_small.gff"/> + <element name="11_small.gff" value="11_small.gff"/> + </collection> + </param> + <output_collection name="output" count="13" type="list"> + <element name="combined_DNA_CDS" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="18206"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="combined_protein_CDS" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="7048"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="combined_protein_cdhit_out" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="5119"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="pan_genome_reference" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="13120"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="summary_statistics" ftype="txt"> + <assert_contents> + <has_line line="Core genes	(99% <= strains <= 100%)	251"/> + <has_line line="Shell genes	(15% <= strains < 95%)	475"/> + <has_line line="Total genes	(0% <= strains <= 100%)	726"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="gene_data" ftype="csv"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="980"/> + <has_n_columns sep="," n="8"/> + <has_text text="KPLBOJCC_00003"/> + <has_text text="NCFNLLIC_00003"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="gene_presence_absence" ftype="csv"> + <assert_contents> + <has_text text="recB"/> + <has_text text="recC"/> + <has_text text="rpoB"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="gene_presence_absence_roary" ftype="csv"> + <assert_contents> + <has_text text="ctpI_2"/> + <has_text text="amiD_1"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="struct_presence_absence" ftype="tabular"> + <assert_contents> + <has_line_matching expression="Gene\s+10_small\s+11_small"/> + </assert_contents> + </element> + </output_collection> + <output name="log"> + <assert_contents> + <has_text text="total seq: 979"/> + </assert_contents> + </output> + </test> + <!-- Test 3 : Testing Panaroo with Advanced Filtering options along with MAFFT core alignment --> + <test expect_num_outputs="3"> + <param name="gen_code" value="11"/> + <param name="mode" value="strict"/> + <param name="log_out" value="yes"/> + <conditional name="advanced"> + <param name="adv_options_selector" value="set"/> + <section name="gene_alignment_option"> + <param name="alignment" value="core"/> + <param name="aligner" value="mafft"/> + </section> + </conditional> <param name="gff_input_collection"> - <collection type="list"> - <element name="gff10.gff" value="10_small.gff"/> - <element name="gff11.gff" value="11_small.gff"/> - </collection> + <collection type="list"> + <element name="10_small.gff" value="10_small.gff"/> + <element name="11_small.gff" value="11_small.gff"/> + </collection> </param> - <output_collection name="output" count="13"/> + <output_collection name="output_pangenome" count="18" type="list"> + <element name="summary_statistics" ftype="txt"> + <assert_contents> + <has_line line="Core genes	(99% <= strains <= 100%)	251"/> + <has_line line="Shell genes	(15% <= strains < 95%)	475"/> + <has_line line="Total genes	(0% <= strains <= 100%)	726"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="alignment_entropy" ftype="csv"> + <assert_contents> + <has_text text="stf0.aln,0.0"/> + <has_text text="bglB.aln,0.0"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="combined_DNA_CDS" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="18206"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="combined_protein_cdhit_out" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="5119"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="combined_protein_CDS" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="7048"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="struct_presence_absence" ftype="tabular"> + <assert_contents> + <has_line_matching expression="Gene\s+10_small\s+11_small"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="gene_data" ftype="csv"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="980"/> + <has_n_columns sep="," n="8"/> + <has_text text="KPLBOJCC_00003"/> + <has_text text="NCFNLLIC_00003"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="pan_genome_reference" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="13120"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="gene_presence_absence" ftype="csv"> + <assert_contents> + <has_text text="recB"/> + <has_text text="recC"/> + <has_text text="rpoB"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="gene_presence_absence_roary" ftype="csv"> + <assert_contents> + <has_text text="ctpI_2"/> + <has_text text="amiD_1"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="core_gene_alignment_filtered" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_size value="569962" delta="1000"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="core_gene_alignment" ftype="fasta"> + <assert_contents> + <has_size value="569962" delta="1000"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="core_alignment_header" ftype="embl"> + <assert_contents> + <has_text text="ID Genome standard; DNA; PRO; 1234 BP."/> + <has_text text="hisB_1.aln"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="core_alignment_filtered_header" ftype="embl"> + <assert_contents> + <has_n_lines n="760" delta="10"/> + </assert_contents> + </element> + </output_collection> + <output_collection name="output_pangenome_fasta" count="251"/> <output name="log"> <assert_contents> - <has_text text="pre-processing gff3 files..."/> - </assert_contents> - </output> - </test> - <test expect_num_outputs="2"> - <param name="gen_code" value="11"/> - <param name="mode" value="strict"/> - <param name="adv_options_selector" value="set"/> - <param name="a" value="None"/> - <param name="gff_input_collection"> - <collection type="list"> - <element name="gff10.gff" value="10_small.gff"/> - <element name="gff11.gff" value="11_small.gff"/> - </collection> - </param> - <output_collection name="output_advance" count="13"/> - <output name="log"> - <assert_contents> - <has_text text="pre-processing gff3 files..."/> - </assert_contents> + <has_text text="total seq: 979"/> + </assert_contents> </output> - </test> - <test expect_num_outputs="3"> - <param name="gen_code" value="11"/> - <param name="mode" value="strict"/> - <param name="adv_options_selector" value="set"/> - <param name="a" value="core"/> - <param name="gff_input_collection"> - <collection type="list"> - <element name="gff10.gff" value="10_small.gff"/> - <element name="gff11.gff" value="11_small.gff"/> - </collection> - </param> - <output_collection name="output_pangenome" count="18"/> - <output_collection name="output_pangenome_fasta" count="251"/> - <output name="log"> - <assert_contents> - <has_text text="pre-processing gff3 files..."/> - </assert_contents> - </output> - </test> + </test> </tests> <help><![CDATA[ -Panaroo_ is A Bacterial Pangenome Analysis Pipeline. +Panaroo_ is a pangenome analysis tool specifically designed to analyze bacterial genomes. Panaroo builds a full graphical representation of the pangenome, where nodes are clusters of orthologous genes (COGs) and two nodes are connected by an edge if they are adjacent on a contig in any sample from the population. Using this graphical representation, Panaroo corrects for errors introduced during annotation by collapsing diverse gene families, filtering contamination, merging fragmented gene segments and refinding missing genes. **INPUTS** -Panaroo now supports multiple input formats. To use non-standard GFF3 files you must profile the input file as a list in a text file (one per line). Separate GFF and FASTA files can be provided per isolate by providing each file delimited by a space or a tab. Genbank file formats are also supported with extensions '.gbk', '.gb' or '.gbff'. These must compliant with Genbank/ENA/DDJB. This can be forced in Prokka by specifying the --compliance parameter. - - a list of gff format in a collection + - A list of gff3 files (from Prokka) in a collection. **OUTPUTS** @@ -269,7 +472,7 @@ - core_gene_alignment_filtered - core_alignment_filtered_header - core_alignment_header - - a collection of fasta files + - a collection of Pangenome Aligned Fasta files .. _Panaroo: https://gthlab.au/panaroo/#/gettingstarted/quickstart @@ -277,5 +480,4 @@ <citations> <citation type="doi">10.1186/s13059-020-02090-4</citation> </citations> -</tool> - +</tool> \ No newline at end of file
--- a/test-data/combined_DNA_CDS.fasta Tue Aug 27 05:51:12 2024 +0000 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,18206 +0,0 @@ ->0_0_0 -TTGTGTCACTTCAGTTTCACGGTTATCAGCGGGGCGCTCTTTGTCAGTGCCCGACGTTAT -GATTCGAACATGTTAGCGAATAGCCGGGAGGAGCTTGTCGAGGTCTTCGACGCGCTGGAT -GCCGACCTGGACCGCTTGGACGAGGTGTCCTTTGAGGTGCTGAGCACCCCGGAACGGCTG -CGGTCTCTGGAACGTCTGGAATGCTTGGCGCGCCGGCTACCGGCGGCCCAGCACACGTTG -ATCAACCAACTCGACACCCAAGCCAGCGAGGAAGAACTGGGCGGCACGCTGTGCTGCGCG -CTGGCCAACCGGCTGCGCATCACCAAGCCCGAAGCCGGCCGACGCAGCGCCGAAGCCAAG -CCTTAG ->0_0_1 -ATGGCTATACCACCGGAGGTGCACTCGGGCCTGTTGAGCGCCGGGTGCGGTCCGGGATCA -TTGCTTGTTGCCGCGCAGCAGTGGCAAGAACTTAGTGATCAGTACGCACTCGCATGCGCC -GAGTTGGGCCAATTGTTGGGCGAGGTTCAGGCCAGCAGCTGGCAGGGAACCGCCGCCACC -CAGTACGTGGCTGCCCATGGCCCCTATCTGGCCTGGCTTGAGCAAACCGCGATCAACAGC -GCCGTCACCGCCGCACAGCACGTAGCGGCTGCCGCTGCCTACTGCAGCGCCCTGGCCGCG -ATGCCCACCCCAGCAGAGCTGGCCGCCAACCACGCCATTCATGGCGTTCTGATCGCCACC -AACTTCTTCGGGATCAACACCGTTCCGATCGCGCTCAACGAAGCCGATTATGTCCGCATG -TGGCTGCAAGCCGCCGACACCATGGCCGCCTACCAGGCCGTCGCCGATGCGGCCACGGTG -GCCGTACCGTCCACCCAACCGGCGCCACCGATCCGCGCGCCCGGCGGCGATGCCGCAGAT -ACCCGGCTAGACGTATTGAGTTCAATTGGTCAGCTCATCCGGGATATCTTGGATTTCATT -GCCAACCCGTACAAGTATTTTCTGGAGTTTTTCGAGCAATTCGGCTTCAGCCCGGCCGTA -ACGGTCGTCCTTGCCCTTGTTGCCCTGCAGCTGTACGACTTTCTTTGGTATCCCTATTAC -GCCTCGTACGGCCTGCTCCTGCTTCCGTTCTTCACTCCCACCTTGAGCGCGTTGACCGCC -CTAAGCGCGCTGATCCATTTGCTGAACCTGCCCCCGGCTGGACTGCTTCCTATCGCCGCA -GCGCTCGGTCCCGGCGACCAATGGGGCGCAAACTTGGCTGTGGCTGTCACGCCGGCCACG -GCGGCCGTGCCCGGCGGAAGCCCGCCCACCAGCAACCCCGCGCCCGCCGCTCCCAGCTCG -AACTCGGTTGGCAGCGCTTCGGCTGCACCCGGCATCAGCTATGCCGTGCCCGGCCTGGCG -CCACCCGGGGTTAGCTCTGGCCCTAAAGCCGGCACCAAATCACCTGACACCGCCGCCGAC -ACCCTTGCAACCGCGGGCGCAGCACGACCGGGCCTCGCCCGAGCCCACCGAAGAAAGCGC -AGCGAAAGCGGCGTCGGGATACGCGGTTACCGCGACGAATTTTTGGACGCGACCGCCACG -GTGGACGCCGCTACGGATGTGCCCGCTCCCGCCAACGCGGCTGGCAGTCAAGGTGCCGGC -ACTCTCGGCTTTGCCGGTACCGCACCGACAACCAGCGGCGCCGCGGCCGGAATGGTTCAA -CTGTCGTCGCACAGCACAAGCACTACAGTCCCGTTGCTGCCCACTACCTGGACAACCGAC -GCCGAACAATGA ->0_0_2 -ATGACGCTTAAGGTCAAAGGCGAGGGACTCGGTGCGCAGGTCACAGGGGTCGATCCCAAG -AATCTGGACGATATAACCACCGACGAGATCCGGGATATCGTTTACACGAACAAGCTCGTT -GTGCTAAAAGACGTCCATCCGTCTCCGCGGGAGTTCATCAAACTCGGCAGGATAATTGGA -CAAATCGTTCCGTATTACGAACCCATGTACCATCACGAAGACCACCCGGAGATCTTTGTC -TCCTCCACTGAGGAAGGTCAGGGGGTCCCAAAAACCGGCGCGTTCTGGCATATCGACTAT -ATGTTTATGCCGGAACCTTTCGCGTTTTCCATGGTGCTGCCGCTGGCGGTGCCTGGACAC -GACCGCGGGACCTATTTCATCGATCTCGCCAGGGTCTGGCAGTCGCTGCCCGCCGCCAAG -CGAGACCCGGCCCGCGGAACCGTCAGCACCCACGACCCTCGACGCCACATCAAGATCCGA -CCCAGCGACGTCTACCGGCCCATCGGAGAGGTATGGGACGAGATCAACCGGACCACGCCC -CCAATAAAGTGGCCTACGGTCATCCGGCACCCAAAGACCGGCCAAGAGATCCTCTACATC -TGCGCGACGGGCACCACCAAGATCGAGGACAAGGACGGCAATCCGGTTGATCCGGAGGTG -CTGCAAGAACTCATGGCCGCGACCGGACAGCTCGATCCTGAGTACCAGTCGCCGTTCATA -CATACTCAGCACTACCAGGTTGGCGACATCATCTTGTGGGACAACCGGGTTCTCATGCAC -CGAGCGAAGCACGGCAGCGCCGCGGGCACTCTGACGACCTACCGCCTGACCATGCTTGAT -GGCCTCAAGACGCCGGGATACGCGGCATGA ->0_0_3 -ATGAGCCACACCGACTTGACGCCCTGCACACGGGTGCTGGCATCCAGCGGCACGGTTCCG -ATCGCAGAGGAACTGCTGGCCAGAGTGCTCGAGCCCTACTCCTGCAAAGGATGTCGCTAC -CTCATCGACGCACAGTACAGCGCCACCGAGGATTCGGTTCTTGCCTATGGCAACTTCACG -ATCGGTGAGTCCGCCTATATTCGAAGCACGGGGCACTTCAACGCGGTCGAACTGATTCTG -TGTTTCAATCAGCTCGCCTACAGCGCCTTCGCTCCGGCCGTCCTCAACGAGGAAATCCGG -GTGCTTCGCGGCTGGTCGATCGACGACTACTGCCAACACCAGCTCTCTAGCATGCTGATC -AGGAAGGCATCATCGCGGTTCAGAAAACCGCTGAACCCGCAAAAGTTCTCTGCCCGCCTC -CTGTGTCGAGATCTGCAGGTCATCGAACGAACCTGGCGCTATCTCAAGGTCCCGTGCGTC -ATCGAGTTCTGGGACGAGAACGGCGGGGCGGCGTCCGGTGAGATCGAACTAGCGGCCCTC -AACATTCCGTAA ->0_0_4 -ATGCCTCAGTTGCCATCTACCGTGCTGGACCGGGTCTTCGAGCAGGCACGGCAGCAGCCG -GAAGCAATCGCCTTGCGTCGCTGCGACGGCACTAGCGCACTGCGGTACCGTGAACTCGTC -GCCGAAGTTGGTGGCCTTGCCGCGGATTTGCGTGCCCAGTCGGTTAGCCGGGGTTCTAGG -GTGCTGGTCATTTCCGACAATGGACCCGAGACGTACCTGTCGGTGCTGGCGTGTGCAAAG -CTCGGGGCGATCGCCGTCATGGCCGACGGCAATCTTCCGATCGCAGCCATCGAACGATTC -TGTCAGATCACCGACCCCGCAGCGGCTCTCGTCGCACCAGGGAGCAAGATGGCATCTTCC -GCCGTTCCCGAGGCGCTGCACTCGATACCAGTGATCGCGGTCGACATAGCCGCTGTTACA 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P-type ATPase B 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sulfoacetate--CoA ligase 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FAD-linked oxidoreductase 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quercetin 23-dioxygenase 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lipase 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4 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reductase 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methyltransferase 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acid-dihydrodiol dehydrogenase 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-10_small,.10665_7_10.1,0_0_181,KPLBOJCC_00182,MSRMAAPVSLDVHGRQVIVTHPGRVVFPAHNDRKGYTKFDLVRYYLAVAEGAMRGVAGRPMILKRFVKGISAEAVFQKRAPANRPDWVDVAELHYASGRSAAEAVIHDAAGLAWVINLGCVDLNPHPVLAGDLDHPDELRVDLDPMPGVAWQRVVEVALVVREVLEDYGLTAWPKTSGSRGFHVYARIAPCWSFPQVRLAAQTVAREVERRLPDAATSRWWKEEREGVFVDFNQNAKDRTVASAYSVRATPDARVSTPLHWEEVPGCDPAVFTMATVPSRLADIGDPWAGMDDAVGRLDRLLMLAEELGPPQKAQSAKPLIEIARAKTRAEAMAALDIWRDRYPGAAALLRPADVLVDGMRGPSSIWYRIRINLQHVPADQRPPQEELIADYSPWPR,ATGAGCCGCATGGCCGCCCCGGTGTCGCTGGACGTGCACGGACGCCAGGTCATCGTCACGCATCCGGGCAGGGTCGTCTTCCCCGCTCACAACGATCGAAAGGGCTACACCAAGTTCGATCTGGTCCGCTATTACCTCGCCGTGGCCGAGGGGGCGATGCGCGGGGTGGCCGGCCGGCCGATGATTCTCAAGCGTTTCGTCAAGGGCATCTCCGCCGAGGCGGTGTTTCAGAAGCGCGCACCGGCAAACCGGCCAGACTGGGTGGACGTGGCCGAGCTGCACTATGCGTCGGGCCGCTCCGCCGCGGAGGCGGTCATTCACGACGCCGCCGGGCTGGCGTGGGTGATCAACCTGGGGTGTGTGGATCTCAATCCGCATCCGGTGCTCGCCGGCGACCTCGATCATCCCGACGAGCTGCGGGTGGACTTGGACCCGATGCCCGGGGTCGCGTGGCAGCGGGTCGTCGAGGTCGCGTTGGTGGTCCGGGAGGTGCTGGAGGATTACGGGTTGACCGCATGGCCGAAGACGTCCGGGTCGCGGGGCTTTCACGTCTATGCCCGGATCGCGCCTTGCTGGTCGTTTCCCCAGGTGCGCCTGGCCGCCCAGACCGTTGCGCGTGAGGTCGAACGGCGCCTACCCGACGCGGCAACCAGTCGTTGGTGGAAGGAAGAACGCGAGGGCGTGTTCGTCGACTTCAACCAGAACGCCAAGGACCGCACGGTCGCGTCGGCCTACTCGGTGCGGGCCACCCCGGATGCCCGGGTGTCCACGCCGCTGCACTGGGAGGAGGTGCCCGGCTGCGACCCGGCGGTGTTCACCATGGCCACCGTGCCCAGCCGGTTGGCCGACATCGGTGACCCCTGGGCCGGGATGGATGACGCGGTTGGCCGGCTCGACCGGCTGTTGATGCTGGCCGAGGAACTGGGTCCGCCGCAGAAGGCGCAATCCGCCAAGCCGCTGATCGAGATCGCCCGCGCCAAGACGCGGGCCGAGGCGATGGCGGCGTTGGACATCTGGCGCGACCGGTATCCCGGCGCCGCGGCTTTGCTGCGGCCCGCCGATGTGCTGGTCGACGGCATGCGCGGGCCGAGTTCGATCTGGTATCGGATCCGGATCAACCTGCAGCACGTCCCGGCCGACCAGCGCCCGCCGCAGGAGGAGCTGATCGCCGACTACAGCCCGTGGCCGCGGTGA,,hypothetical protein 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secretion system protein EccA3 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secretion system protein EccC3 -10_small,.10665_7_10.1,0_0_200,KPLBOJCC_00201,MTLRVVPEGLAAASAAVEALTARLAAAHASAAPVITAVVPPAADPVSLQTAAGFSAQGVEHAVVTAEGVEELGRAGVGVGESGASYLAGDAAAAATYGVVGG,ATGACGTTGCGAGTGGTTCCGGAGGGGCTGGCCGCAGCCAGCGCTGCGGTGGAAGCGCTGACGGCGCGGTTGGCCGCCGCGCATGCGAGCGCAGCGCCGGTGATTACCGCGGTAGTGCCGCCGGCGGCGGATCCGGTGTCGCTGCAGACCGCGGCCGGGTTCAGTGCACAGGGCGTCGAGCACGCGGTCGTCACCGCCGAAGGTGTCGAAGAGCTGGGACGCGCCGGCGTTGGTGTGGGCGAATCCGGCGCCAGCTACCTGGCCGGTGATGCGGCCGCCGCCGCTACGTACGGGGTCGTGGGCGGCTGA,PE5_1,PE family immunomodulator PE5 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family protein PPE4 -10_small,.10665_7_10.1,0_0_202,KPLBOJCC_00203,MSLLDAHIPQLVASQSAFAAKAGLMRHTIGQAEQAAMSAQAFHQGESSAAFQAAHARFVAAAAKVNTLLDVAQANLGEAAGTYVAADAAAASTYTGF,ATGAGCCTTTTGGATGCTCATATCCCACAGTTGGTGGCCTCCCAGTCGGCGTTTGCCGCCAAGGCGGGGCTGATGCGGCACACGATCGGTCAGGCCGAGCAGGCGGCGATGTCGGCTCAGGCGTTTCACCAGGGGGAGTCGTCGGCGGCGTTTCAGGCCGCCCATGCCCGGTTTGTGGCGGCGGCCGCCAAAGTCAACACCTTGTTGGATGTCGCGCAGGCGAATCTGGGTGAGGCCGCCGGTACCTATGTGGCCGCCGATGCTGCGGCCGCGTCGACCTATACCGGGTTCTGA,esxG,ESAT-6-like protein EsxG -10_small,.10665_7_10.1,0_0_203,KPLBOJCC_00204,MSQIMYNYPAMLGHAGDMAGYAGTLQSLGAEIAVEQAALQSAWQGDTGITYQAWQAQWNQAMEDLVRAYHAMSSTHEANTMAMMARDTAEAAKWGG,ATGTCGCAAATCATGTACAACTACCCCGCGATGTTGGGTCACGCCGGGGATATGGCCGGATATGCCGGCACGCTGCAGAGCTTGGGTGCCGAGATCGCCGTGGAGCAGGCCGCGTTGCAGAGTGCGTGGCAGGGCGATACCGGGATCACGTATCAGGCGTGGCAGGCACAGTGGAACCAGGCCATGGAAGATTTGGTGCGGGCCTATCATGCGATGTCCAGCACCCATGAAGCCAACACCATGGCGATGATGGCCCGCGACACGGCCGAAGCCGCCAAATGGGGCGGCTAG,esxH,ESAT-6-like protein EsxH 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secretion-associated protein EspG3 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protein IniB 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protein IniA 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protein IniC -10_small,.10665_7_10.1,0_0_258,KPLBOJCC_00260,MRLSLIARGMAALLAATALVAGCNTTIDGRPVASPGSGPTEPTFPTPRPTTAPPGTTAPTLPTTPVSPTAPAGAIPLPPDSNGYVFIETKSGMTRCQINRDSVGCEAPFTNSPLRDGEHANGIHITAGGSVQWVLGNLGAIPTVSIDYRTYEAQGWTIDATTDGTRFTNNRTGHGMFVSIEKVDTF,GTGCGGCTATCGCTCATTGCACGGGGTATGGCGGCCCTGCTGGCGGCTACCGCGCTAGTTGCCGGCTGCAACACCACCATCGACGGCAGGCCGGTCGCTTCGCCAGGGTCGGGACCTACCGAGCCGACTTTTCCGACGCCTAGGCCAACTACCGCGCCGCCGGGGACCACCGCCCCGACGCTACCGACGACACCGGTCAGCCCGACCGCGCCGGCCGGCGCCATTCCGCTCCCGCCTGACTCCAACGGTTACGTCTTCATCGAAACCAAGTCCGGAATGACGCGTTGCCAGATCAATAGGGACAGCGTTGGCTGCGAGGCACCGTTCACCAACTCCCCCTTGCGAGATGGTGAGCACGCCAACGGCATCCACATCACCGCCGGCGGCTCCGTGCAGTGGGTGTTGGGCAATCTGGGCGCCATCCCCACCGTCAGCATCGACTACCGAACCTATGAAGCGCAGGGCTGGACCATCGACGCCACCACCGATGGCACCCGCTTCACGAACAACCGCACGGGCCATGGCATGTTCGTCAGCATCGAGAAGGTCGACACATTCTGA,,hypothetical protein 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protein DnaK 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GrpE 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protein 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protein ClpB 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sulfhydrylase 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kinase 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III 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dismutase [Cu-Zn] 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histidine kinase senX3 -10_small,.10665_7_10.1,0_0_408,KPLBOJCC_00410,MTSVLIVEDEESLADPLAFLLRKEGFEATVVTDGPAALAEFDRAGADIVLLDLMLPGMSGTDVCKQLRARSSVPVIMVTARDSEIDKVVGLELGADDYVTKPYSARELIARIRAVLRRGGDDDSEMSDGVLESGPVRMDVERHVVSVNGDTITLPLKEFDLLEYLMRNSGRVLTRGQLIDRVWGADYVGDTKTLDVHVKRLRSKIEADPANPVHLVTVRGLGYKLEG,ATGACCAGTGTGTTGATTGTGGAGGACGAGGAGTCGCTGGCCGATCCGCTGGCGTTTCTGCTGCGCAAGGAGGGCTTTGAGGCCACGGTGGTGACCGATGGTCCGGCAGCTCTCGCCGAGTTCGACCGGGCCGGCGCCGACATCGTCCTGCTCGATCTGATGCTGCCTGGGATGTCGGGTACCGATGTATGCAAGCAGTTGCGCGCTCGGTCCAGCGTTCCGGTGATCATGGTGACCGCCCGGGATAGCGAGATCGACAAGGTGGTCGGCCTGGAGCTGGGCGCTGACGACTACGTGACCAAGCCCTATTCGGCACGCGAGTTGATCGCACGCATCCGCGCGGTGCTGCGCCGTGGCGGCGACGACGACTCGGAGATGAGCGATGGCGTGCTGGAGTCCGGGCCGGTTCGCATGGATGTGGAGCGCCATGTCGTCTCGGTGAACGGTGACACCATCACGCTGCCGCTCAAGGAGTTCGACCTGCTGGAATACCTGATGCGCAACAGCGGGCGGGTGTTGACTCGCGGACAACTGATCGACCGGGTCTGGGGTGCGGACTACGTGGGCGACACCAAGACGCTCGACGTCCATGTCAAGCGGCTGCGCTCCAAGATCGAAGCCGACCCGGCTAACCCGGTTCACTTGGTGACGGTGCGCGGGCTGGGCTACAAACTCGAGGGCTAG,regX3,Sensory transduction protein regX3 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1 -10_small,.10665_7_10.1,0_0_415,KPLBOJCC_00417,MTGPHPETESSGNRQISVAELLARQGVTGAPARRRRRRRGDSDAITVAELTGEIPIIRDDHHHAGPDAHASQSPAANGRVQVGEAAPQSPAEPVAEQVAEEPTRTVYWSQPEPRWPKSPPQDRRESGPELSEYPRPLRHTHSDRAPAGPPSGAEHMSPDPVEHYPDLWVDVLDTEVGEAEAETEVREAQPGRGERHAAAAAAGTDVEGDGAAEARVARRALDVVPTLWRGALVVLQSILAVAFGAGLFIAFDQLWRWNSIVALVLSVMVILGLVVSVRAVRKTEDIASTLIAVAVGALITLGPLALLQSG,ATGACGGGACCACACCCCGAAACAGAGAGCTCCGGTAACCGGCAGATCTCGGTGGCCGAGTTGCTGGCCAGGCAAGGGGTCACCGGCGCCCCGGCCCGACGGCGCCGGCGGCGACGCGGCGATAGTGACGCCATCACGGTCGCCGAGCTGACCGGTGAGATTCCGATCATTCGTGACGACCATCACCACGCCGGCCCGGACGCGCACGCGAGCCAGTCTCCGGCGGCTAACGGGCGAGTCCAGGTTGGCGAAGCTGCCCCACAGTCGCCGGCGGAACCAGTCGCCGAGCAGGTTGCCGAAGAGCCAACGAGAACCGTGTACTGGTCGCAACCCGAGCCGCGCTGGCCCAAGTCCCCCCCGCAGGACCGGCGCGAGTCCGGGCCCGAGCTTAGCGAGTACCCGCGGCCACTGCGCCACACGCATAGCGACAGAGCACCCGCGGGGCCGCCGTCCGGTGCCGAACACATGAGTCCGGATCCGGTCGAGCACTACCCCGATCTCTGGGTGGATGTCCTGGACACCGAGGTGGGCGAAGCGGAAGCCGAGACCGAGGTGCGCGAAGCGCAACCTGGGCGCGGCGAGCGCCACGCCGCAGCGGCGGCGGCCGGCACCGACGTCGAGGGTGATGGTGCGGCCGAGGCGCGGGTTGCCCGTCGTGCCCTGGACGTGGTCCCGACGCTGTGGCGCGGCGCGTTGGTCGTGCTGCAGTCGATCCTGGCCGTTGCCTTCGGTGCCGGGTTGTTCATCGCCTTCGACCAGTTGTGGCGCTGGAACAGCATAGTGGCGCTAGTGCTATCGGTGATGGTCATCCTTGGCCTAGTGGTCTCGGTGCGGGCAGTCCGCAAGACCGAAGACATCGCCAGTACGTTGATCGCGGTTGCGGTGGGGGCGCTGATTACCCTGGGACCGCTGGCCTTGTTGCAATCGGGCTAG,,putative 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cation-transporting ATPase I -11_small,.10665_7_11.1,1_0_13,NCFNLLIC_00014,MFRVESNGNPDLVPVETLHSGDPITDVNGGGQRYIVLESKTVGDSCVVLELESRVNHQLQVIEKSFPAGYHVGRAHHRIL,GTGTTTCGCGTGGAGTCAAACGGAAATCCGGATTTGGTGCCCGTCGAAACATTGCACTCCGGTGACCCGATCACCGATGTCAACGGTGGCGGTCAGCGGTACATCGTCCTTGAGTCGAAGACCGTCGGTGACAGCTGCGTGGTGCTCGAGCTGGAGTCGAGAGTGAACCACCAGCTGCAGGTCATCGAGAAGTCCTTCCCGGCGGGTTACCACGTCGGCAGGGCCCACCACCGCATTTTGTGA,,hypothetical protein 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1 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hydrogen peroxide-inducible genes activator 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decarboxylase 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dehydrogenase 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hydroxymycolic acid dehydrogenase -11_small,.10665_7_11.1,1_0_39,NCFNLLIC_00040,MTPQARPARRADVRELSRTMARAFYDDPVMSWLLSNDNARTARLTRLFATIVRHQHLAGGGVEVARGAAGIGGAALWDPPDRWRESRRQQLAMTPGFLRVFGFRTAKARAALDVMMRVHPEEPHWYLAAIGSDPTVRGQGFGQVLMRSRLDRCDAEHCPAYLESTKPENVPYYQRFGFRVTREIALPDAGPPLWAMWREPR,ATGACCCCGCAGGCACGCCCAGCGCGCAGGGCCGATGTCCGCGAGCTGTCCCGCACCATGGCCCGGGCGTTCTATGACGATCCGGTCATGAGCTGGTTACTGTCGAACGACAACGCCCGCACCGCAAGGCTGACCCGGTTGTTCGCGACGATTGTCCGCCACCAGCATCTGGCCGGCGGTGGTGTGGAAGTGGCCCGCGGCGCGGCGGGCATCGGCGGGGCGGCGCTGTGGGATCCCCCGGATCGATGGCGGGAGTCGCGCCGCCAGCAACTGGCGATGACACCGGGGTTCCTGCGGGTGTTCGGCTTTCGGACGGCCAAGGCCCGCGCGGCGCTGGACGTGATGATGCGTGTGCATCCCGAAGAACCCCACTGGTATCTGGCCGCCATCGGCAGCGACCCGACGGTCCGCGGCCAGGGGTTCGGTCAGGTGCTGATGCGGTCACGGCTGGACCGTTGCGATGCCGAACACTGTCCGGCCTACCTCGAATCCACCAAACCCGAGAATGTGCCCTACTATCAACGGTTCGGTTTCCGGGTGACCCGTGAGATCGCTCTGCCCGACGCGGGGCCGCCGCTATGGGCGATGTGGCGGGAGCCTCGGTAG,,hypothetical protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_40,NCFNLLIC_00041,MIALPALEGVEHRHVDVAEGVRIHVADAGPADGPAVMLVHGFPQNWWEWRDLIGPLAADGNRVLCPDLRGAGWSSAPRSRYTKTEMADDLAAVLDGLGVAKVKLVAHDWGGPVAFIMMLRHPEKVTGFFGVNTVAPWVKRDLGMLRNMWRFWYQIPMSLPVIGPRVISDPKGRYFRLLTGWVGGGFRVPDDDVRLYLDCMREPGHAEAGSRWYRTFQTREMLRWLRGEYNDARVDVPVRWLHGTGDPVITPDLLDGYAERASDFEVELVDGVGHWIVEQRPELVLDRVRAFLAAGTEQRD,ATGATCGCTCTGCCCGCCTTGGAAGGTGTCGAACATCGGCACGTGGATGTGGCGGAAGGCGTCAGGATCCACGTTGCGGACGCCGGGCCGGCCGATGGTCCGGCGGTAATGCTGGTGCACGGCTTCCCGCAGAACTGGTGGGAGTGGCGCGACCTCATCGGCCCGCTGGCCGCCGACGGCAACCGGGTGCTGTGTCCCGACCTGCGCGGCGCGGGCTGGAGTTCGGCGCCCCGCTCGCGGTATACCAAGACCGAGATGGCTGACGATCTGGCTGCGGTTTTGGACGGCCTGGGTGTGGCCAAGGTCAAGCTGGTGGCCCACGATTGGGGTGGGCCGGTCGCGTTCATCATGATGTTGCGCCATCCCGAGAAGGTGACCGGGTTTTTCGGCGTGAACACCGTGGCACCCTGGGTGAAGCGCGATCTTGGCATGCTCCGCAATATGTGGCGGTTCTGGTATCAGATCCCCATGTCGCTGCCGGTGATCGGCCCGCGGGTGATCAGCGATCCTAAGGGCCGCTACTTCCGGCTGTTGACCGGGTGGGTCGGGGGCGGATTTCGGGTTCCCGATGACGACGTGCGCCTGTACTTGGACTGCATGCGCGAGCCGGGGCACGCCGAGGCCGGATCGCGGTGGTATCGCACCTTTCAGACCAGGGAAATGCTGCGCTGGCTGCGCGGCGAGTACAACGACGCTCGGGTCGATGTCCCGGTCCGATGGCTGCACGGCACCGGAGATCCGGTGATCACGCCCGACCTGCTGGACGGCTATGCCGAGCGGGCCAGCGATTTCGAGGTGGAGCTGGTCGACGGCGTGGGCCATTGGATCGTCGAGCAGCGACCCGAGCTGGTGCTCGACCGGGTGCGTGCGTTCCTAGCTGCGGGGACCGAGCAGCGCGATTGA,,Soluble epoxide hydrolase -11_small,.10665_7_11.1,1_0_41,NCFNLLIC_00042,MTAVAAGALVVETDSFRLRLLDGLVASIGERGYRATTVSDIVRHARTSKRTFYDRFTSKEQCFLELLLADNETLGNSIRAAVDPNADWHDQIRQAVEAYVTHIESRPAVTLSWIREFPSLGAAAYPVQRRGMEQLTSLLIELSASPGFRRANLPPLNVPLAVILLGGLRELTALTVEDGQPIRNIVEPAVDASIALLGPRS,GTGACAGCAGTCGCCGCCGGCGCGTTGGTCGTCGAGACCGACTCGTTTCGGCTACGGTTGCTCGACGGCCTGGTCGCCTCGATCGGTGAGCGGGGTTATCGCGCCACCACCGTCTCCGACATCGTCCGGCACGCCCGCACATCCAAGCGCACGTTCTACGACCGGTTCACCAGCAAGGAACAGTGCTTTTTGGAACTCCTGCTAGCGGACAACGAGACGTTGGGCAACAGCATCCGGGCGGCCGTCGATCCAAACGCCGACTGGCACGACCAGATTCGTCAGGCGGTCGAGGCCTACGTCACCCATATCGAATCCAGGCCGGCGGTGACGTTGAGTTGGATCCGTGAATTCCCGTCGCTCGGTGCCGCCGCTTACCCCGTCCAGCGCCGCGGCATGGAGCAGCTAACCAGCCTGCTGATCGAGCTCAGCGCCAGCCCTGGGTTCCGGCGGGCTAACCTACCGCCACTGAATGTGCCACTGGCCGTAATCTTGCTGGGCGGTTTGCGTGAACTGACCGCGCTGACCGTCGAGGACGGCCAGCCGATCCGGAACATCGTCGAGCCGGCGGTGGATGCGTCAATCGCGCTGCTCGGTCCCCGCAGCTAG,,hypothetical protein 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-11_small,.10665_7_11.1,1_0_67,NCFNLLIC_00068,MSYVIAAPEMLATAAADVDGIGSAIRAASASAAGPTTGLLAAAADEVSSAAAALFSEYARECQEVLKQAAAFHGEFTRALAAAGAAYAQAEASNTAAMSGTAGSSGALGSVGMLSGNPLTALMMGGTGEPILSDRVLAIIDSAYIRPIFGPNNPVAQYTPEQWWPFIGNLSLDQSIAQGVTLLNNGINAELQNGHDVVVFGYSQSAAVATNEIRALMALPPGQAPDPSRLAFTLIGNINNPNGGVLERYVGLYLPFLDMSFNGATPPDSPYQTYMYTGQYDGYAHNPQYPLNILSDLNAFMGIRWVHNAYPFTAAEVANAVPLPTSPGYTGNTHYYMFLTQDLPLLQPIRAIPFVGTPIAELIQPDLRVLVDLGYGYGYADVPTPASLFAPINPIAVASALATGTVQGPQAALVSIGLLPQSALPNTYPYLPSANPGLMFNFGQSSVTELSVLSGALGSVARLIPPIA,ATGTCCTACGTCATCGCGGCCCCGGAGATGTTGGCAACGGCGGCCGCGGACGTGGACGGGATCGGTTCGGCGATACGAGCGGCCAGCGCGTCCGCTGCGGGTCCAACGACCGGACTGCTGGCCGCGGCCGCCGATGAGGTGTCGTCGGCCGCTGCAGCGCTGTTCAGCGAATACGCGCGCGAATGTCAAGAGGTCCTAAAGCAGGCTGCGGCGTTCCATGGCGAGTTCACCCGGGCGCTGGCTGCCGCCGGGGCCGCCTATGCCCAGGCTGAAGCCAGCAACACCGCTGCTATGTCGGGCACCGCCGGGTCCAGCGGCGCCCTCGGTTCTGTCGGGATGCTGTCAGGCAACCCGCTAACCGCGTTGATGATGGGCGGCACCGGGGAACCGATCCTTAGTGACCGCGTCTTGGCGATCATTGACAGCGCATACATTCGGCCCATTTTCGGGCCCAACAACCCGGTCGCCCAGTACACGCCCGAGCAGTGGTGGCCGTTTATCGGGAACCTGTCACTGGACCAATCCATCGCCCAGGGTGTCACGCTGCTGAACAACGGCATCAACGCGGAACTACAAAATGGGCATGACGTCGTCGTTTTCGGCTACTCGCAAAGCGCCGCGGTAGCGACCAATGAAATACGCGCTCTTATGGCGTTACCACCGGGCCAAGCCCCAGATCCAAGCCGGCTGGCTTTCACGTTGATCGGTAATATCAATAACCCCAACGGCGGCGTCCTCGAGCGTTACGTGGGCCTTTACCTCCCGTTCTTGGATATGTCGTTCAACGGTGCGACTCCACCGGATTCCCCCTACCAGACCTACATGTACACCGGCCAATACGACGGCTACGCCCACAACCCGCAGTACCCGCTCAATATCTTGTCGGACCTCAACGCCTTCATGGGCATCAGATGGGTGCACAACGCGTACCCCTTCACCGCGGCCGAGGTTGCCAATGCCGTGCCGTTGCCCACGTCTCCGGGCTACACCGGCAACACCCATTACTACATGTTTCTGACCCAGGACCTGCCGCTGTTGCAGCCGATTCGCGCCATCCCCTTCGTAGGGACCCCAATAGCCGAGCTGATTCAGCCCGACCTACGGGTGCTAGTCGACTTGGGCTATGGCTACGGCTACGCCGACGTACCCACCCCGGCCAGCCTGTTCGCGCCAATCAACCCGATCGCCGTGGCCTCGGCCCTGGCGACCGGGACCGTGCAAGGCCCCCAAGCCGCCCTAGTAAGCATCGGATTGTTACCGCAGTCCGCGCTACCCAATACGTATCCGTATCTTCCGTCGGCGAATCCGGGCCTGATGTTCAACTTCGGTCAATCCAGTGTGACGGAGTTGTCGGTGCTCAGTGGCGCCCTCGGGTCCGTAGCGAGATTGATTCCACCGATCGCGTGA,PE3_1,PE family protein PE3 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family protein PE3 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quercetin 23-dioxygenase 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dehydratase -11_small,.10665_7_11.1,1_0_99,NCFNLLIC_00100,MTAAHGYTQQKDNYAKRLRRVEGQVRGIARMIEEDKYCIDVLTQISAVTSALRSVALNLLDEHLSHCVTRAVAEGGPGADGKLAEASAAIARLVRS,ATGACAGCAGCACACGGCTACACGCAGCAAAAGGACAACTACGCCAAGCGGTTGCGTCGCGTCGAGGGGCAAGTGCGCGGCATCGCGCGAATGATCGAGGAAGACAAGTACTGCATTGACGTTCTGACCCAGATCAGCGCCGTCACCAGTGCGTTGCGGTCGGTGGCGCTGAACCTGCTGGACGAGCACCTGAGCCACTGCGTCACCCGTGCCGTGGCCGAGGGCGGTCCTGGGGCTGACGGCAAGCTGGCAGAGGCCTCGGCAGCAATCGCGCGCCTGGTTCGTTCCTGA,ricR,Copper-sensing transcriptional repressor RicR 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dehydrogenase 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ligand binding oxidase 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acid-dihydrodiol dehydrogenase 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dehydrogenase -11_small,.10665_7_11.1,1_0_158,NCFNLLIC_00159,MNSTNNLTPSSLREAFGHFPTGVVAIAAEVDGVRQGLAASTFVPVSLEPPLVSFCVQNTSTTWPKLTGVPMLGISVLGEAHDAAVRTLAAKTGDRFAGLETVSNDAGAVFIKGTSVWLESAIEQLVPAGDHTIVVLRVNQVKVDPNVAPIVFHRSVLRRLGV,GTGAACTCAACGAACAACCTGACGCCGTCCTCACTGCGGGAGGCCTTCGGCCATTTCCCGACCGGGGTGGTGGCCATCGCTGCGGAGGTCGACGGAGTGCGGCAAGGCTTGGCAGCCAGTACCTTTGTCCCGGTCTCGCTGGAACCGCCGCTGGTGTCGTTCTGTGTGCAGAACACCTCGACGACATGGCCGAAACTCACCGGCGTGCCGATGCTGGGCATCAGCGTGCTCGGCGAGGCCCATGACGCCGCAGTGCGCACACTGGCCGCAAAAACTGGGGACAGGTTCGCCGGTTTGGAGACGGTATCCAACGACGCCGGCGCCGTCTTCATCAAGGGCACCAGCGTGTGGCTCGAGAGCGCGATCGAGCAGCTGGTCCCGGCGGGAGATCACACCATCGTGGTCTTACGGGTCAACCAGGTCAAGGTGGATCCCAACGTAGCGCCCATTGTGTTCCATCGCAGCGTGCTCCGCCGACTCGGCGTCTAA,hsaB_1,Flavin-dependent monooxygenase reductase subunit HsaB 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acid synthase 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transporter NarK -11_small,.10665_7_11.1,1_0_174,NCFNLLIC_00175,MHTQVHTARLVHTADLDSETRQDIRQMVTGAFAGDFTETDWEHTLGGMHALIWHHGAIIAHAAVIQRRLIYRGNALRCGYVEGVAVRADWRGQRLVSALLDAVEQVMRGAYQLGALSSSARARRLYASRGWLPWHGPTSVLAPTGPVRTPDDDGTVFVLPIDISLDTSAELMCDWRAGDVW,GTGCACACCCAGGTACACACGGCCCGCCTGGTCCACACCGCCGATCTTGACAGCGAGACCCGCCAGGACATCCGTCAGATGGTCACCGGCGCGTTTGCCGGTGACTTCACCGAGACCGACTGGGAGCACACGCTGGGTGGGATGCACGCCCTGATCTGGCATCACGGGGCGATCATCGCGCATGCCGCGGTGATCCAGCGGCGACTGATCTACCGCGGCAACGCGCTGCGCTGCGGGTACGTCGAAGGCGTTGCGGTGCGGGCGGACTGGCGGGGCCAACGCCTGGTGAGCGCGCTGTTGGACGCCGTCGAGCAGGTGATGCGCGGCGCTTACCAGCTCGGAGCGCTCAGTTCCTCGGCGCGGGCCCGCAGACTGTACGCCTCACGCGGCTGGCTGCCCTGGCACGGCCCGACATCGGTACTGGCACCAACCGGTCCAGTCCGTACACCCGATGACGACGGAACGGTGTTCGTCCTGCCCATCGACATCAGCCTGGACACCTCGGCGGAGCTGATGTGCGATTGGCGCGCGGGCGACGTCTGGTAA,aac,Aminoglycoside 2'-N-acetyltransferase -11_small,.10665_7_11.1,1_0_175,NCFNLLIC_00176,MTTLEILRSGPLALVEDLGRAGLAHLGVGRSGAADRRSHTLANRLVANPDDWATVEVTFGGFSARVRGGDVDIAVTGADTDPTVNGIMVGTNSIHHVRDGQVISLGTPRAGLRTYLAVRGGVCVEPVLGSRSYDVMSAIGPSPLRAGDVLPVGEHTDDYPELDQAPVAAIEEHLVELRVVPGPRDDWLVDPDALVHTIWMASNRSDRVGMRLQGRPLQHRWPDRQLPGEGVTRGAIQVPPNGLPVILGPDHPITGSYPVVGVITDEDIDKVAQIRPGQYVRLHWARPRSRLPGQGVTQAW,ATGACAACACTGGAAATCCTGCGCAGCGGACCGCTGGCCCTCGTCGAAGACCTCGGCCGTGCCGGACTGGCCCATCTCGGTGTCGGTCGATCCGGTGCCGCCGACCGCCGCTCCCACACGCTGGCCAACCGGCTAGTCGCCAACCCCGACGATTGGGCCACGGTCGAAGTGACCTTCGGCGGCTTCTCGGCGCGGGTTCGCGGCGGCGACGTCGACATCGCGGTGACGGGCGCCGACACCGATCCGACCGTGAACGGAATCATGGTCGGCACCAACAGCATTCACCACGTCCGGGACGGCCAGGTGATCTCACTGGGCACCCCACGGGCCGGGCTGCGGACCTATCTGGCGGTGCGCGGCGGCGTCTGTGTGGAGCCCGTGCTGGGGTCACGCAGCTACGACGTGATGTCGGCGATCGGCCCGTCGCCGCTACGGGCCGGAGACGTGCTGCCGGTCGGCGAACACACCGACGACTATCCCGAACTCGACCAGGCACCGGTGGCCGCTATCGAGGAGCATCTGGTGGAGCTGCGGGTGGTGCCCGGGCCGCGCGACGACTGGCTGGTGGACCCGGACGCGTTGGTGCATACCATCTGGATGGCGTCCAACCGCAGTGACCGCGTAGGAATGCGGCTACAGGGCCGCCCGCTACAGCACCGCTGGCCGGATCGGCAACTGCCCGGCGAAGGCGTTACCCGCGGCGCAATCCAGGTGCCGCCCAACGGATTACCGGTGATCCTGGGGCCGGATCACCCGATCACCGGAAGCTATCCGGTCGTCGGCGTCATCACCGACGAGGACATCGACAAGGTCGCGCAGATACGGCCCGGCCAATATGTGCGACTGCACTGGGCACGACCCCGGTCTCGGTTGCCTGGCCAGGGTGTAACACAAGCCTGGTAG,ybgK,putative 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protein 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protein 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-11_small,.10665_7_11.1,1_0_181,NCFNLLIC_00182,MSRMAAPVSLDVHGRQVIVTHPGRVVFPAHNDRKGYTKFDLVRYYLAVAEGAMRGVAGRPMILKRFVKGISAEAVFQKRAPANRPDWVDVAELHYASGRSAAEAVIHDAAGLAWVINLGCVDLNPHPVLAGDLDHPDELRVDLDPMPGVAWQRVVEVALVVREVLEDYGLTAWPKTSGSRGFHVYARIAPCWSFPQVRLAAQTVAREVERRLPDAATSRWWKEEREGVFVDFNQNAKDRTVASAYSVRATPDARVSTPLHWEEVPGCDPAVFTMATVPSRLADIGDPWAGMDDAVGRLDRLLMLAEELGPPQKAQSAKPLIEIARAKTRAEAMAALDIWRDRYPGAAALLRPADVLVDGMRGPSSIWYRIRINLQHVPADQRPPQEELIADYSPWPR,ATGAGCCGCATGGCCGCCCCGGTGTCGCTGGACGTGCACGGACGCCAGGTCATCGTCACGCATCCGGGCAGGGTCGTCTTCCCCGCTCACAACGATCGAAAGGGCTACACCAAGTTCGATCTGGTCCGCTATTACCTCGCCGTGGCCGAGGGGGCGATGCGCGGGGTGGCCGGCCGGCCGATGATTCTCAAGCGTTTCGTCAAGGGCATCTCCGCCGAGGCGGTGTTTCAGAAGCGCGCACCGGCAAACCGGCCAGACTGGGTGGACGTGGCCGAGCTGCACTATGCGTCGGGCCGCTCCGCCGCGGAGGCGGTCATTCACGACGCCGCCGGGCTGGCGTGGGTGATCAACCTGGGGTGTGTGGATCTCAATCCGCATCCGGTGCTCGCCGGCGACCTCGATCATCCCGACGAGCTGCGGGTGGACTTGGACCCGATGCCCGGGGTCGCGTGGCAGCGGGTCGTCGAGGTCGCGTTGGTGGTCCGGGAGGTGCTGGAGGATTACGGGTTGACCGCATGGCCGAAGACGTCCGGGTCGCGGGGCTTTCACGTCTATGCCCGGATCGCGCCTTGCTGGTCGTTTCCCCAGGTGCGCCTGGCCGCCCAGACCGTTGCGCGTGAGGTCGAACGGCGCCTACCCGACGCGGCAACCAGTCGTTGGTGGAAGGAAGAACGCGAGGGCGTGTTCGTCGACTTCAACCAGAACGCCAAGGACCGCACGGTCGCGTCGGCCTACTCGGTGCGGGCCACCCCGGATGCCCGGGTGTCCACGCCGCTGCACTGGGAGGAGGTGCCCGGCTGCGACCCGGCGGTGTTCACCATGGCCACCGTGCCCAGCCGGTTGGCCGACATCGGTGACCCCTGGGCCGGGATGGATGACGCGGTTGGCCGGCTCGACCGGCTGTTGATGCTGGCCGAGGAACTGGGTCCGCCGCAGAAGGCGCAATCCGCCAAGCCGCTGATCGAGATCGCCCGCGCCAAGACGCGGGCCGAGGCGATGGCGGCGTTGGACATCTGGCGCGACCGGTATCCCGGCGCCGCGGCTTTGCTGCGGCCCGCCGATGTGCTGGTCGACGGCATGCGCGGGCCGAGTTCGATCTGGTATCGGATCCGGATCAACCTGCAGCACGTCCCGGCCGACCAGCGCCCGCCGCAGGAGGAGCTGATCGCCGACTACAGCCCGTGGCCGCGGTGA,,hypothetical protein 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ligase 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secretion system protein EccA3 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secretion system protein EccC3 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_200,NCFNLLIC_00201,MTLRVVPEGLAAASAAVEALTARLAAAHASAAPVITAVVPPAADPVSLQTAAGFSAQGVEHAVVTAEGVEELGRAGVGVGESGASYLAGDAAAAATYGVVGG,ATGACGTTGCGAGTGGTTCCGGAGGGGCTGGCCGCAGCCAGCGCTGCGGTGGAAGCGCTGACGGCGCGGTTGGCCGCCGCGCATGCGAGCGCAGCGCCGGTGATTACCGCGGTAGTGCCGCCGGCGGCGGATCCGGTGTCGCTGCAGACCGCGGCCGGGTTCAGTGCACAGGGCGTCGAGCACGCGGTCGTCACCGCCGAAGGTGTCGAAGAGCTGGGACGCGCCGGCGTTGGTGTGGGCGAATCCGGCGCCAGCTACCTGGCCGGTGATGCGGCCGCCGCCGCTACGTACGGGGTCGTGGGCGGCTGA,PE5_1,PE family immunomodulator PE5 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_201,NCFNLLIC_00202,MAAPIWMASPPEVHSALLSNGPGPGSLVAAATAWSQLSAEYASTAAELSGLLGAVPGWAWQGPSAEWYVAAHLPYVAWLTQASADAAGAAAQHEAAAAAYTTALAAMPTLAELAANHVIHTVLVATNFFGINTIPITLNEADYVRMWLQAAAVMGLYQAASGAALASAPRTVPAPTVMNPGGGAASTVGAVNPWQWLLALLQQLWNAYTGFYGWMLQLIWQFLQDPIGNSIKIIIAFLTNPIQALITYGPLLFALGYQIFFNLVGWPTWGMILSSPFLLPAGLGLGLAAIAFLPIVLAPAVIPPASTPLAAAAVAAGSVWPAVSMAVTGAGTAGAATPAAGAAPSAGAAPAPAAPATASFAYAVGGSGDWGPSLGPTVGGRGGIKAPAATVPAAAAAAATRGQSRARRRRRSELRDYGDEFLDMDSDSGFGPSTGDHGAQASERGAGTLGFAGTATKERRVRAVGLTALAGDEFGNGPRMPMVPGTWEQGSNEPEAPDGSGRGGGDGLPHDSK,ATGGCCGCGCCCATCTGGATGGCTTCGCCGCCGGAGGTACATTCGGCGTTGCTTAGCAATGGTCCGGGCCCGGGTTCGCTAGTGGCGGCTGCCACGGCCTGGAGCCAGCTGAGTGCCGAGTATGCCTCGACGGCAGCAGAACTCAGTGGGCTACTGGGGGCGGTACCTGGTTGGGCATGGCAGGGGCCCAGCGCGGAGTGGTACGTGGCCGCGCATTTGCCATATGTGGCGTGGCTGACGCAGGCCAGTGCGGATGCCGCAGGAGCAGCGGCCCAGCACGAGGCCGCCGCGGCGGCCTACACCACTGCCTTGGCAGCCATGCCGACATTAGCGGAGTTGGCCGCCAACCACGTGATTCACACCGTGTTGGTGGCGACGAATTTCTTTGGGATCAACACGATTCCCATCACGCTCAATGAGGCCGATTACGTGCGCATGTGGTTGCAGGCGGCCGCCGTCATGGGTCTTTATCAGGCGGCTTCGGGTGCGGCACTGGCTTCGGCGCCGCGCACCGTCCCGGCGCCGACGGTTATGAATCCAGGTGGCGGTGCGGCGAGCACTGTCGGGGCGGTCAACCCCTGGCAGTGGCTCTTAGCGTTGCTTCAACAGCTCTGGAACGCCTACACGGGTTTCTACGGGTGGATGTTGCAGCTCATCTGGCAGTTCCTGCAGGATCCCATTGGTAACTCGATCAAGATCATCATCGCCTTCCTCACGAATCCCATTCAGGCACTGATCACTTACGGGCCGCTGTTGTTCGCGCTGGGCTACCAGATTTTCTTCAACCTGGTCGGCTGGCCGACCTGGGGCATGATCTTGAGCTCGCCGTTCTTGTTGCCGGCCGGGCTCGGGCTGGGCTTGGCAGCAATAGCCTTTCTACCTATTGTGCTTGCGCCCGCGGTGATTCCGCCGGCGAGTACTCCGCTGGCTGCTGCCGCCGTCGCCGCCGGGTCGGTGTGGCCGGCGGTCAGCATGGCCGTAACGGGGGCGGGCACCGCTGGGGCTGCGACGCCCGCGGCGGGCGCGGCTCCGTCTGCGGGCGCAGCGCCGGCCCCGGCAGCTCCCGCGACCGCCAGTTTCGCCTATGCGGTGGGTGGCAGCGGTGATTGGGGGCCGAGCTTGGGGCCGACGGTAGGTGGTCGCGGTGGTATCAAGGCGCCGGCCGCTACGGTTCCGGCGGCGGCCGCGGCGGCGGCAACTCGTGGGCAGTCGCGCGCGCGGCGGCGCCGGCGGTCTGAATTGCGGGACTACGGCGACGAGTTCTTGGACATGGATTCCGATAGCGGTTTCGGCCCCTCGACGGGCGACCACGGCGCGCAGGCCTCCGAACGGGGGGCCGGGACGCTGGGATTCGCCGGGACCGCAACCAAAGAACGCCGGGTCCGGGCGGTCGGGCTGACCGCACTGGCCGGTGATGAGTTCGGCAACGGCCCCCGGATGCCGATGGTGCCGGGGACCTGGGAGCAGGGCAGCAACGAGCCCGAGGCGCCCGACGGATCGGGGAGAGGGGGAGGCGACGGCTTACCGCACGACAGCAAGTAA,PPE4_1,PPE family protein PPE4 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_202,NCFNLLIC_00203,MSLLDAHIPQLVASQSAFAAKAGLMRHTIGQAEQAAMSAQAFHQGESSAAFQAAHARFVAAAAKVNTLLDVAQANLGEAAGTYVAADAAAASTYTGF,ATGAGCCTTTTGGATGCTCATATCCCACAGTTGGTGGCCTCCCAGTCGGCGTTTGCCGCCAAGGCGGGGCTGATGCGGCACACGATCGGTCAGGCCGAGCAGGCGGCGATGTCGGCTCAGGCGTTTCACCAGGGGGAGTCGTCGGCGGCGTTTCAGGCCGCCCATGCCCGGTTTGTGGCGGCGGCCGCCAAAGTCAACACCTTGTTGGATGTCGCGCAGGCGAATCTGGGTGAGGCCGCCGGTACCTATGTGGCCGCCGATGCTGCGGCCGCGTCGACCTATACCGGGTTCTGA,esxG,ESAT-6-like protein EsxG -11_small,.10665_7_11.1,1_0_203,NCFNLLIC_00204,MSQIMYNYPAMLGHAGDMAGYAGTLQSLGAEIAVEQAALQSAWQGDTGITYQAWQAQWNQAMEDLVRAYHAMSSTHEANTMAMMARDTAEAAKWGG,ATGTCGCAAATCATGTACAACTACCCCGCGATGTTGGGTCACGCCGGGGATATGGCCGGATATGCCGGCACGCTGCAGAGCTTGGGTGCCGAGATCGCCGTGGAGCAGGCCGCGTTGCAGAGTGCGTGGCAGGGCGATACCGGGATCACGTATCAGGCGTGGCAGGCACAGTGGAACCAGGCCATGGAAGATTTGGTGCGGGCCTATCATGCGATGTCCAGCACCCATGAAGCCAACACCATGGCGATGATGGCCCGCGACACGGCCGAAGCCGCCAAATGGGGCGGCTAG,esxH,ESAT-6-like protein EsxH 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secretion-associated protein EspG3 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secretion system protein EccD3 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protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_213,NCFNLLIC_00214,MTKEKISVTVDAAVLAAIDADARAAGLNRSEMIEQALRNEHLRVALRDYTAKTVPALDIDAYAQRVYQANRAAGS,ATGACGAAAGAGAAGATCTCCGTGACGGTGGACGCGGCCGTCCTCGCGGCGATCGACGCGGACGCCAGGGCGGCGGGTTTGAATCGGTCGGAAATGATTGAGCAGGCACTGCGCAACGAGCACCTGCGTGTCGCTCTGCGCGATTACACGGCTAAAACCGTACCGGCGTTGGACATCGATGCCTACGCACAGCGGGTGTACCAGGCGAACCGGGCGGCCGGAAGTTGA,,Antitoxin -11_small,.10665_7_11.1,1_0_214,NCFNLLIC_00215,MIAPGDIAPRRDSEHELYVAVLSNALHRAADTGRVITCPFIPGRVPEDLLAMVVAVEQPNGTLLPELVQWLHVAALGAPLGNAGVAALREAASVVTALLC,TTGATCGCTCCCGGCGACATCGCGCCGCGCCGCGACAGTGAACACGAGCTCTACGTCGCCGTCTTGTCCAACGCGCTCCATCGGGCCGCGGACACCGGACGGGTGATCACCTGCCCATTCATTCCGGGCCGGGTCCCCGAGGATCTCTTGGCGATGGTGGTGGCGGTCGAGCAACCCAACGGCACGCTGCTGCCGGAACTCGTGCAGTGGCTTCATGTTGCCGCGCTCGGTGCGCCACTCGGCAACGCGGGCGTGGCCGCCCTACGCGAGGCTGCCTCGGTCGTGACAGCTCTGCTCTGTTAG,,Toxin 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VapC2 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_217,NCFNLLIC_00218,MGVPAKKKQQQGERSRESILDATERLMATKGYAATSISDIRDACGLAPSSIYWHFGSKEGVLAAMMERGAQRFFAAIPTWDEAHGPVEQRSERQLTELVSLQSQHPDFLRLFYLLSMERSQDPAVAAVVRRVRNTAIARFRDSITHLLPSDIPPGKADLVVAELTAFAVALSDGVYFAGHLEPDTTDVERMYRRLRQALEALIPVLLEET,GTGGGCGTTCCCGCCAAGAAAAAACAGCAGCAGGGGGAGAGGTCACGAGAATCGATTCTCGACGCGACCGAACGCCTGATGGCGACCAAGGGCTACGCGGCGACCTCGATCAGCGACATCCGCGACGCGTGCGGGCTAGCACCCAGCTCTATTTACTGGCACTTCGGCTCCAAAGAGGGCGTGCTGGCCGCCATGATGGAGCGCGGCGCGCAGCGCTTCTTTGCCGCGATACCCACCTGGGATGAGGCCCATGGGCCCGTCGAGCAGCGATCCGAGCGCCAGCTGACCGAGCTGGTGAGCCTGCAGTCGCAGCATCCGGACTTCCTGCGCCTGTTCTACCTGCTGTCGATGGAACGAAGTCAGGATCCGGCGGTTGCCGCGGTGGTGCGCCGGGTCCGCAACACCGCGATCGCCCGATTTCGTGACAGCATCACGCACCTGCTGCCATCGGACATCCCGCCGGGCAAAGCCGATCTCGTCGTCGCGGAGCTGACCGCGTTCGCGGTTGCGCTGTCGGACGGCGTCTATTTCGCCGGCCACCTTGAACCGGACACGACCGACGTCGAGCGCATGTACCGGCGGCTGCGGCAAGCGCTCGAGGCCCTGATTCCCGTCCTCCTGGAGGAGACATGA,,hypothetical protein 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phosphodiesterase cytoplasmic 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protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_253,NCFNLLIC_00255,MSRPGTYVIGLTLLVGLVVGNPGCPRSYRPLTLDYRLNPVAVIGDSYTTGTDEGGLGSKSWTARTWQMLAARGVRIAADVAAEGRAGYGVPGDHGNVFEDLTARAVQPDDALVVFFGSRNDQGMDPEDPEMLAEKVRDTFDLARHRAPSASLLVIAPPWPTADVPGPMLRIRDVLGAQARAAGAVFVDPIADHWFVDRPELIGADGVHPNDAGHEYLADKIAPLISMELVG,GTGAGTCGCCCGGGTACATACGTCATTGGTCTCACTCTCCTGGTCGGCCTGGTCGTCGGCAATCCAGGGTGCCCGCGGTCCTACCGCCCACTGACCCTGGATTACCGGCTTAACCCGGTCGCGGTGATTGGCGACTCCTATACCACCGGCACCGATGAGGGCGGTCTGGGCTCGAAATCATGGACCGCTCGCACCTGGCAGATGCTCGCTGCACGTGGCGTGCGGATCGCAGCCGACGTGGCCGCCGAGGGCCGGGCCGGCTACGGGGTGCCCGGCGACCACGGCAACGTGTTTGAGGATCTGACCGCCAGGGCCGTCCAGCCCGACGATGCACTGGTGGTGTTCTTTGGCTCCCGCAACGACCAAGGCATGGATCCTGAGGATCCCGAGATGCTGGCCGAAAAGGTCCGCGACACTTTCGATCTAGCGCGCCACCGCGCACCATCCGCGAGCTTGCTGGTGATCGCACCGCCGTGGCCTACCGCCGACGTACCTGGCCCAATGCTGCGGATTCGCGACGTGCTGGGCGCTCAGGCGCGGGCCGCAGGAGCAGTGTTTGTCGACCCGATCGCCGACCACTGGTTTGTCGACAGGCCCGAGCTGATCGGCGCGGATGGCGTGCATCCCAACGATGCGGGACATGAGTATCTGGCGGACAAGATCGCGCCGCTGATCAGCATGGAGTTGGTTGGATGA,,hypothetical 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protein 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protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_267,NCFNLLIC_00269,MLYLLLVLILATLIYLGWRAARAQMNRPKTRVIGPDDDPEFLRRLGHGDNNRS,GTGCTCTACCTGCTCCTCGTGCTGATTTTGGCGACGCTGATCTACCTTGGCTGGCGCGCTGCACGGGCACAGATGAACCGGCCCAAGACTCGCGTCATCGGGCCCGACGACGATCCAGAGTTCCTGCGGCGGTTGGGGCACGGGGACAATAACCGTTCCTAG,,hypothetical protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_268,NCFNLLIC_00270,MSEAPNDKTTRGVVDILVYATARLLLVVAVSAAIFGVARLIGLTEFPVVVATLFGLIIAMPLGIWVFSPLRRRATAALAVAGERRRAERERLRARLRGESLPEEQ,GTGTCAGAAGCGCCTAACGACAAGACCACTCGGGGTGTTGTCGACATACTGGTCTATGCGACGGCGCGGCTGCTGCTGGTGGTGGCGGTCAGCGCAGCGATTTTCGGGGTCGCGCGACTGATCGGGTTGACCGAATTCCCCGTTGTCGTGGCCACGCTGTTCGGGCTGATCATCGCGATGCCGTTGGGCATTTGGGTGTTCAGCCCGCTGCGGCGGCGCGCCACGGCCGCGCTCGCGGTGGCCGGTGAGCGTCGGCGCGCCGAGCGGGAACGGCTGCGGGCCCGGCTGCGTGGCGAGTCGCTACCCGAAGAACAGTGA,,hypothetical protein 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4-epimerase 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protein 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B12-dependent ribonucleoside-diphosphate reductase 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glyoxylase CFP32 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protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_335,NCFNLLIC_00338,MVNVRRALADTSVFIGIEATRFDPDRFAGYEWGVSVVTLGELRLGVLQASGPEAAARRLSTYQLAQRFEPLGIDEAVSEAWALLVSKLRAAKLRVPINDSWIAATAVAHGIAILTQDNDYAAMPDVEVITI,GTGGTGAACGTACGGCGCGCCCTCGCCGACACATCCGTTTTCATTGGCATCGAGGCGACACGATTCGACCCGGACCGGTTTGCGGGATACGAATGGGGCGTCTCGGTAGTCACACTCGGCGAGCTGCGGCTCGGGGTGTTGCAAGCCTCCGGCCCCGAGGCCGCCGCACGTCGGCTCTCCACCTACCAGCTTGCGCAACGGTTCGAACCACTAGGCATCGACGAGGCGGTCTCCGAAGCATGGGCATTACTGGTGTCCAAGCTGCGCGCCGCCAAACTGCGCGTGCCGATCAACGACAGCTGGATTGCGGCCACAGCCGTGGCGCACGGCATTGCGATCCTGACCCAAGACAACGACTACGCCGCCATGCCCGACGTCGAGGTCATAACGATCTGA,vapC4,Ribonuclease VapC4 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_336,NCFNLLIC_00339,MSATIPARDLRNHTAEVLRRVAAGEEIEVLKDNRPVARIVPLKRRRQWLPAAEVIGELVRLGPDTTNLGEELRETLTQTTDDVRW,ATGTCTGCTACGATACCCGCTCGCGATCTTCGCAACCACACCGCCGAGGTACTGCGGCGAGTTGCCGCCGGCGAGGAAATCGAGGTGCTCAAGGACAATCGCCCCGTAGCGCGCATCGTTCCGCTCAAGCGGCGCCGCCAATGGTTGCCAGCTGCCGAGGTGATCGGCGAACTGGTGCGCTTGGGCCCCGATACCACCAATCTGGGCGAGGAGCTGCGAGAGACGCTGACGCAAACCACGGACGATGTGCGGTGGTGA,vapB4,Antitoxin VapB4 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protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_338,NCFNLLIC_00341,MADEERSEALLRERSLHYVASSRAGDMLVVTWSGQRSELLSQLKIHAATTTWTPIFS,GTGGCCGACGAAGAACGCTCGGAGGCGCTGCTGCGGGAGCGCTCGCTGCACTACGTGGCCAGTAGCCGGGCGGGGGACATGTTGGTGGTGACCTGGAGCGGACAGCGGTCGGAGTTGTTGAGTCAGCTGAAGATTCACGCGGCGACAACGACGTGGACGCCGATCTTTTCGTAA,,hypothetical protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_339,NCFNLLIC_00342,MKPPLAVDTSVAIPLLVRTHTAHAAVVAWWAHREAALCGHALAETYSVLTRLPRDLRLAPMDAARLLTERFAAPLLLSSRTTEHLPRVLAQFEITGGAVYDALVALAAAEHRAELATRDARAKDTYEKIGVHVVVAA,GTGAAACCGCCGCTGGCAGTGGACACCAGCGTCGCGATTCCGTTGCTGGTACGGACCCATACCGCGCATGCGGCGGTTGTCGCCTGGTGGGCACATCGGGAGGCCGCGCTGTGCGGGCACGCCCTGGCCGAAACCTACTCCGTGCTGACCCGCCTGCCGCGTGACCTACGACTGGCACCGATGGACGCCGCGCGGCTTCTTACCGAACGCTTTGCGGCACCGCTGTTGTTGAGTTCCCGCACCACTGAACATCTCCCACGCGTGCTGGCCCAATTCGAGATCACTGGTGGCGCGGTCTATGACGCTCTCGTGGCCCTTGCCGCCGCCGAGCACCGGGCTGAACTCGCCACACGCGATGCTCGAGCCAAGGACACTTACGAAAAGATCGGCGTCCACGTCGTTGTCGCCGCGTGA,,Ribonuclease VapC27 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-11_small,.10665_7_11.1,1_0_341,NCFNLLIC_00344,MPITPLLHESVARFAATGADITTRAEPDLFVSIDPDHLRRILTAVLDNAITHGDGEIAVTAHARDGAVDIGVRDHGPGFADHFLPVAFDRFTRADTARGGRGSGLGLAIVAALTTTHGGHANATNHPDGGAELRITLPTPRPPFHEELPRITSSDTKDPNREHDTSDQ,GTGCCGATCACTCCCCTGCTGCACGAGAGCGTGGCCCGCTTCGCCGCTACTGGAGCGGACATCACCACACGCGCGGAACCGGACCTGTTCGTCTCGATCGATCCGGACCACCTGCGCCGAATCCTCACCGCCGTGCTCGACAACGCCATCACCCACGGGGACGGTGAAATCGCTGTCACCGCGCACGCCCGCGACGGTGCAGTCGACATCGGCGTCCGCGACCACGGCCCCGGATTCGCCGACCACTTTCTTCCCGTCGCCTTCGACCGATTCACCCGCGCCGACACCGCCCGCGGCGGTCGCGGCAGCGGCCTCGGCCTGGCCATCGTCGCCGCCCTCACCACCACCCACGGCGGACATGCCAACGCCACCAACCACCCCGACGGCGGGGCCGAACTCCGCATCACCCTCCCCACACCGCGGCCGCCCTTCCACGAGGAGCTTCCGCGGATCACGTCATCAGATACAAAGGACCCGAATCGGGAGCACGACACTAGCGACCAATAG,,Sensor histidine kinase component HK1 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-11_small,.10665_7_11.1,1_0_343,NCFNLLIC_00346,MRILVVEDEPKMTALLARALTEEGHTVDTVADGRHAVAAVDGGDYDAVVLDVMLPGIDGFEVCARLRRQRVWTPVLMLTARGAVTDRIAGLDGGADDYLTKPFNLDELFARLRALSRRGPIPRPPTLEAGDLRLDPSEHRVWRADTEIRLSHKEFTLLEALIRRPGIVHTRAQLLERCWDAAYEARSNIVDVYIRYLRDKIDRPFGVTSLETIRGAGYRLRKDGGRHALPR,GTGCGCATCCTGGTGGTCGAGGACGAGCCCAAGATGACGGCGCTGCTGGCGCGGGCGCTGACCGAGGAGGGCCACACGGTCGACACCGTTGCCGACGGCCGCCATGCGGTGGCGGCCGTCGACGGCGGTGACTACGACGCGGTGGTGCTGGATGTGATGCTGCCCGGTATCGACGGGTTCGAGGTATGCGCGCGGCTGCGACGGCAGCGGGTGTGGACACCGGTGCTGATGCTTACCGCCCGCGGCGCGGTCACCGACCGCATCGCGGGCCTAGACGGCGGCGCCGACGATTACCTCACCAAACCGTTCAACCTCGACGAACTGTTCGCCCGGTTGCGCGCGCTGTCACGGCGCGGGCCCATCCCACGCCCACCGACGCTGGAGGCCGGCGATCTACGCCTGGACCCGAGCGAACACCGAGTCTGGCGTGCCGACACCGAAATCCGGCTCAGTCACAAGGAATTCACCCTGCTGGAAGCCCTGATCCGCCGTCCCGGCATCGTCCACACCCGCGCCCAGCTGCTGGAACGCTGCTGGGACGCCGCCTACGAGGCCCGCTCCAACATCGTCGACGTCTACATCCGCTACCTGCGCGACAAGATCGACCGGCCCTTCGGCGTCACCTCGCTGGAAACCATTCGCGGTGCCGGATACCGGCTGCGCAAGGACGGAGGACGGCATGCGCTCCCCCGCTGA,tcrA,Transcriptional regulatory protein TcrA -11_small,.10665_7_11.1,1_0_344,NCFNLLIC_00347,MNRIVQFGVSAVAAAAIGIGAGSGIAAAFDGEDEVTGPDADRARAAAVQAVPGGTAGEVETETGEGAAAYGVLVTRPDGTRVEVHLDRDFRVLDTEPADGDGG,ATGAATCGCATCGTGCAGTTCGGAGTTTCCGCCGTGGCCGCGGCGGCGATCGGCATCGGAGCCGGGTCGGGGATCGCGGCGGCGTTCGACGGCGAGGACGAGGTGACCGGCCCCGACGCCGACCGCGCGCGCGCCGCCGCGGTGCAGGCGGTCCCGGGCGGCACCGCCGGAGAAGTCGAGACCGAGACCGGCGAAGGCGCCGCCGCCTACGGCGTGCTGGTCACCCGGCCCGACGGCACCCGTGTCGAGGTCCACCTGGACCGGGATTTCCGGGTTCTGGACACCGAACCGGCCGACGGGGACGGCGGTTAG,,hypothetical protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_345,NCFNLLIC_00348,MAALLAAAALALTACAGSDDKGEPDDGGDRGASLATTSDADWKPVADILGRTGKLNDGSVYKIGFARSDLSVQTKGVTVAPALSLGSWVAFARTPDGQTMLMGDLVVTEDELASVTDAVQAGGLQQTALHKHLLEQSPPIWWTHIAGHGDAADLARAVRSALDATDTPPPASATSGQTSLDLDTAAIDEALGRSGTIAGGVYKFFIARRDPVTMSGMLIPPSMGLATALNFQPTGNGRAAINGDFVMTAAEVQDVVQALRGGGIDIVAIHNHGFDEQPRLFYMHFWAENDAVALARTLRAAVDATAAR,ATGGCCGCGCTGCTGGCGGCGGCCGCGCTGGCACTGACCGCATGCGCGGGCAGCGACGACAAGGGCGAACCCGACGACGGCGGGGACCGGGGCGCATCCTTGGCCACCACCAGCGATGCGGACTGGAAGCCGGTGGCCGACATTCTCGGCCGAACCGGCAAGCTGAACGATGGCAGCGTCTACAAAATCGGGTTTGCGCGCTCGGATCTGAGCGTGCAGACCAAGGGGGTGACCGTCGCCCCCGCGCTGTCACTCGGGTCGTGGGTCGCGTTCGCCCGCACCCCCGACGGGCAGACCATGCTGATGGGAGATCTGGTGGTCACCGAAGACGAGCTGGCCTCGGTGACCGACGCCGTGCAGGCCGGCGGCCTGCAGCAGACCGCGCTGCACAAGCACCTGCTCGAGCAGTCGCCGCCGATCTGGTGGACCCACATCGCCGGCCACGGCGACGCCGCCGACCTGGCCCGTGCGGTCCGGTCGGCGCTGGATGCCACCGACACACCACCGCCCGCCTCGGCAACTTCCGGCCAGACCAGCTTGGACCTGGACACCGCGGCCATCGATGAGGCGCTGGGCCGCTCCGGCACCATCGCGGGCGGGGTGTACAAATTCTTCATCGCCCGCCGCGATCCGGTCACCATGTCCGGCATGCTCATCCCCCCGTCCATGGGTCTGGCTACCGCCCTCAACTTCCAGCCCACCGGCAACGGCCGCGCGGCGATCAACGGCGATTTCGTCATGACCGCCGCCGAGGTCCAAGACGTCGTCCAAGCACTGCGCGGCGGCGGAATCGACATCGTCGCCATACACAACCACGGGTTCGACGAACAACCACGCCTGTTCTACATGCACTTCTGGGCCGAGAACGACGCCGTCGCACTCGCCCGCACGCTACGCGCCGCGGTGGACGCCACCGCGGCCCGGTGA,,hypothetical protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_346,NCFNLLIC_00349,MNLAAWAERNGVARVTAYRWFHAGLLPVPARKVGRLILVDELASEAGAQPKTAVYARVSSADQKSDLDRQVARVTSWATAEQIPVDKVVTEVGSVLNGHRRKFPAVLRDLSVTRIVVEHRDRFCRFGSEYVHAALAAQGRELVVVDSAEVDDDLVWDMTEILTSMCARLYGKRAAQNRAKRAVAAAAVDDHEAA,ATGAATCTCGCGGCGTGGGCCGAGCGCAATGGCGTCGCGCGGGTGACCGCGTATCGCTGGTTCCACGCTGGGCTCTTGCCGGTCCCGGCCCGGAAGGTTGGTCGACTCATTCTGGTCGACGAGCTGGCTAGCGAGGCTGGCGCGCAGCCAAAGACTGCGGTGTACGCGCGGGTGTCGTCGGCTGATCAGAAGTCTGATTTGGATCGGCAGGTGGCGCGGGTGACTTCGTGGGCCACAGCCGAACAGATCCCGGTCGACAAGGTTGTCACCGAGGTCGGGTCGGTGCTCAACGGGCACCGACGTAAGTTCCCTGCGGTGCTGCGCGATCTGTCGGTCACGCGGATTGTGGTTGAGCATCGGGATCGGTTCTGCCGGTTCGGTTCGGAGTATGTCCACGCTGCGCTGGCCGCTCAGGGTCGGGAGTTGGTCGTGGTGGACTCGGCCGAGGTTGACGATGACCTGGTATGGGATATGACCGAGATTCTGACCTCGATGTGCGCAAGGTTGTATGGCAAACGTGCTGCTCAGAACCGGGCCAAGCGGGCCGTCGCGGCTGCCGCTGTCGATGATCATGAGGCGGCCTGA,,putative protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_347,NCFNLLIC_00350,MPRLEIPNGWCVQAFRFTLDPTAEQAHALARHFGARRKAYNWTVAQLKADIQAWRATGAQTAKPSLRVLRKRWNTVKDEVCVNAETGTVWWPECSKEAYADGIAGAVDAYWNWQQRRAGKRDGKRMGFPRFKKKGRDADRVSFTTGAMRVEPDRRHLTLPVIGCVRTHENTRRIERLIAKDRARVLAITVRRNGTRLDASVRVLVQRPQQPNVELPESRIGVDVGVRRLATVATADGACCPVLVPDG,ATGCCGCGTTTGGAGATCCCCAACGGCTGGTGTGTGCAAGCGTTCCGGTTCACACTCGATCCGACCGCCGAGCAGGCACACGCGTTGGCGCGGCATTTCGGCGCCCGCCGCAAGGCCTACAACTGGACCGTCGCGCAGCTGAAAGCCGATATCCAAGCGTGGCGCGCGACCGGCGCCCAGACGGCGAAGCCGTCGCTTCGGGTACTGCGGAAACGCTGGAACACGGTGAAAGACGAGGTGTGTGTCAACGCCGAGACTGGCACCGTGTGGTGGCCGGAATGCTCGAAAGAGGCCTACGCCGACGGGATCGCGGGCGCGGTCGACGCGTACTGGAACTGGCAGCAGAGGCGTGCTGGCAAGCGCGACGGCAAGAGAATGGGCTTCCCTCGATTCAAGAAGAAGGGCCGCGACGCCGATCGCGTGTCGTTCACCACGGGTGCGATGCGCGTTGAGCCCGACCGTAGACACCTCACTTTGCCGGTGATCGGCTGCGTGCGTACGCATGAGAACACCCGCCGCATCGAGCGCCTCATCGCCAAAGACCGGGCGCGGGTGCTGGCGATCACGGTGCGCCGCAACGGCACCCGGCTGGATGCGAGTGTGCGGGTACTGGTGCAGCGCCCCCAGCAACCCAACGTGGAACTGCCTGAGTCGCGAATCGGTGTCGACGTGGGTGTTCGTCGTCTGGCCACGGTCGCCACCGCGGACGGCGCATGCTGCCCGGTCCTGGTGCCAGACGGCTAA,,IS607 family transposase IS1536 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_348,NCFNLLIC_00351,MLPGPGARRLTLGIIPEGGAHIDVPRKTVGAWQTADTMGIFQALPDVWGGWRTECWEDRFEEQLIRCNGALRLPELDLAAGMDSAREWLRDRIFQRFSDSPAGQILKLSELLADVGPGLVVSDDAVTNGGARPNNEEWARFVAACDLVRGAHAESA,ATGCTGCCCGGTCCTGGTGCCAGACGGCTAACGCTGGGCATTATCCCCGAGGGCGGCGCCCATATCGACGTGCCCCGAAAGACCGTGGGCGCCTGGCAAACAGCCGACACCATGGGCATCTTCCAGGCCCTTCCCGACGTCTGGGGCGGGTGGCGGACCGAATGCTGGGAAGACCGCTTCGAAGAGCAGCTGATTCGATGCAACGGGGCGCTGCGGCTTCCCGAGCTGGATTTGGCCGCGGGCATGGACAGCGCCCGGGAGTGGCTCCGTGACAGGATATTTCAGCGCTTCTCGGACAGCCCGGCAGGCCAAATTCTGAAACTCTCCGAGCTGCTGGCCGATGTCGGACCCGGTCTGGTCGTCAGCGACGATGCCGTGACGAATGGCGGGGCTCGCCCAAACAACGAAGAGTGGGCGCGTTTCGTTGCGGCGTGCGATCTGGTGCGTGGGGCTCACGCCGAATCGGCCTGA,,hypothetical protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_349,NCFNLLIC_00352,MALNIKDPSVHQAVKQIAKITGESQARAVATAVNERLARLRSDDLAARLLAIGHKTASRMSPEAKRLDHDALLYDERGLPA,ATGGCGTTGAACATCAAAGATCCGTCGGTTCACCAGGCGGTCAAGCAGATCGCGAAAATCACCGGCGAATCTCAGGCTCGGGCGGTGGCGACCGCGGTGAACGAGCGTCTGGCCAGACTGCGCAGCGACGATCTCGCCGCCCGGCTCTTGGCTATCGGCCACAAGACCGCGAGCAGGATGAGCCCGGAAGCAAAGCGCCTCGACCACGATGCTCTGCTGTATGACGAGCGAGGGCTGCCGGCGTGA,,Antitoxin VapB28 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_350,NCFNLLIC_00353,MIVDTSAIIAILRDEDDAAAYADALANADVRRLSAASYLECGIVLDSQRDPVISRALDELIEEAEFVVEPVTERQARLARAAYADFGRGSGHPAGLNFGDCLSYALAIDRREPLLWKGNDFGHTGVQRALDRR,GTGATCGTCGACACGTCGGCGATCATCGCGATTCTGCGCGACGAGGACGACGCCGCGGCCTACGCCGACGCGCTCGCCAACGCCGATGTCCGCAGACTGTCTGCGGCCAGCTACCTGGAATGCGGGATAGTCCTTGACTCCCAGCGTGATCCGGTCATCAGCAGAGCACTGGATGAACTTATCGAAGAAGCCGAGTTCGTCGTCGAGCCGGTAACCGAGCGCCAGGCCCGCCTGGCCCGAGCGGCCTACGCGGATTTCGGCAGAGGCAGCGGCCACCCCGCGGGCTTGAATTTCGGCGACTGCCTGTCCTATGCACTGGCGATCGATCGACGTGAGCCGCTGCTGTGGAAGGGCAACGACTTTGGGCACACCGGCGTCCAAAGGGCACTGGATCGGCGGTGA,,Ribonuclease VapC28 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_351,NCFNLLIC_00354,MTDEKCVRCGGDQLVEGAVVWNAPLRFKREGAGHFNRGTQVNAVACETCGHIDLYLESRARGSTK,GTGACCGACGAGAAGTGCGTGAGATGCGGGGGCGACCAGCTCGTCGAAGGGGCCGTCGTCTGGAACGCGCCGCTGCGTTTCAAGCGCGAAGGTGCCGGCCACTTCAATCGCGGCACCCAGGTCAACGCCGTTGCCTGCGAGACTTGTGGGCATATCGACCTCTATCTCGAAAGCCGTGCCCGCGGCTCGACGAAGTGA,,putative proteinB -11_small,.10665_7_11.1,1_0_352,NCFNLLIC_00355,MDDELRGLLARYARGELSADDARRAILRYPKWRVAEIDGELETVALDDGTPMLIAESSASDGREYSGLELVRDIAPLVGGLSFDPDEPWGSAFRPGALPELQNWARMVELEDAVAKPGPGQRDLLYEGPWWVAVSPGTGRPAVHRADGLDVITIMTAPDAAATFRRTERHRGLDVVRLGPALWGDLAKRSDFDGVRLNPLRPLAQLWPPHVPAMLVAGCDPRPNAEPLPARTVAEIHLWLDQHGARQEKRELSNRATPVGEVTVARAWWNYDRREIAFTRVAPASDTEGLGSVPSRILCAGKLRQSIQSKLAGLPRLTWRADAWHRQRAALAVGWALELEKLVCGERVPFAALRTPEGAHLWHLEPQAFTARAIRKLRDRAASFR,ATGGACGACGAGCTACGGGGCTTACTGGCCCGATATGCGCGCGGAGAACTCTCCGCCGACGACGCGCGGCGCGCGATACTGCGCTACCCGAAGTGGCGGGTCGCCGAGATAGACGGCGAACTCGAGACCGTGGCGCTCGATGACGGCACACCGATGCTCATCGCCGAGAGTTCGGCGTCGGACGGCCGCGAATATTCCGGCCTGGAACTGGTTCGCGACATCGCTCCGCTCGTCGGTGGCCTGTCATTCGATCCCGACGAACCGTGGGGTTCGGCGTTCCGGCCGGGTGCGCTGCCCGAGCTGCAGAACTGGGCGCGCATGGTCGAGCTCGAGGATGCCGTTGCCAAACCGGGCCCCGGCCAGCGGGATTTGCTGTACGAAGGGCCGTGGTGGGTTGCCGTCTCCCCGGGCACCGGCCGGCCCGCCGTTCACCGCGCCGACGGGTTGGACGTCATCACGATCATGACCGCGCCGGACGCGGCGGCGACATTCCGGCGAACCGAGCGACACCGCGGACTCGACGTCGTGCGGTTGGGTCCCGCACTCTGGGGCGACCTCGCCAAACGCAGCGACTTCGACGGCGTTCGGCTCAATCCGCTGCGTCCACTCGCCCAGCTGTGGCCGCCGCACGTCCCCGCGATGCTGGTCGCCGGATGCGATCCGCGCCCGAACGCCGAGCCACTGCCCGCCCGCACGGTTGCCGAAATCCATCTGTGGCTGGATCAGCATGGGGCGCGTCAAGAAAAGCGCGAACTGTCCAACCGTGCGACCCCGGTCGGCGAGGTCACCGTCGCGCGCGCCTGGTGGAACTACGACCGCCGGGAGATCGCGTTCACCCGCGTCGCTCCGGCGTCCGACACCGAAGGTCTGGGCTCGGTTCCGTCCCGGATCCTCTGCGCCGGCAAACTCCGCCAAAGCATCCAGAGCAAACTCGCCGGCTTGCCCCGGCTGACGTGGCGCGCTGACGCCTGGCACCGGCAGCGTGCCGCCCTGGCCGTAGGCTGGGCACTCGAGCTGGAGAAGCTCGTGTGTGGTGAGCGGGTTCCTTTCGCGGCGTTGCGCACACCTGAAGGCGCGCACCTGTGGCATCTGGAGCCGCAAGCGTTTACCGCACGGGCGATCCGAAAGCTTCGTGATCGCGCGGCGTCGTTCAGGTGA,,hypothetical 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-11_small,.10665_7_11.1,1_0_354,NCFNLLIC_00357,MIAGVAAKRMNREQFFRAASGLDEDRLRKALWNLYWRGTANMRERIEAELASAGRARPARKIKPPADPDIVGWEVDEFVSLARSGAYLGGDRRVSPRERSRWRFTFKRLAAEAQDALRAEDAEPAASALEQLIDLAREADGYDYFRSDDPVAAAGFVVSDVAAAGHPHFREFAAEIGAAIPP,ATGATCGCCGGCGTGGCGGCGAAACGAATGAACCGCGAACAGTTCTTCCGCGCGGCGTCGGGGCTCGATGAGGATCGCCTACGGAAGGCGCTGTGGAACCTCTACTGGCGCGGCACCGCAAACATGCGGGAGCGCATCGAGGCCGAGCTGGCCAGCGCCGGGCGCGCTCGCCCGGCGCGCAAAATAAAGCCGCCGGCCGATCCGGACATCGTGGGTTGGGAGGTCGACGAGTTCGTGTCACTGGCGCGGTCGGGTGCCTACCTGGGCGGGGACCGGCGGGTGTCGCCGCGGGAACGATCGCGCTGGCGTTTCACCTTCAAGCGGCTCGCCGCGGAAGCCCAGGACGCCCTGCGAGCCGAGGACGCCGAGCCCGCGGCATCCGCACTGGAGCAACTGATCGACCTGGCGCGCGAGGCCGACGGGTACGACTACTTCCGCTCCGACGATCCGGTGGCAGCGGCGGGTTTCGTCGTGTCCGATGTGGCGGCGGCGGGCCACCCACACTTCCGTGAGTTCGCCGCCGAGATCGGTGCGGCGATCCCGCCGTGA,,hypothetical protein 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protein 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family membrane protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_368,NCFNLLIC_00371,MSEVASRELRNDTAGVLRRVRAGEDVTITVSGRPVAVLTPVRPRRRRWLSKTEFLSRLRGAQADPGLRNDLAVLAGDTTEDLGPIR,ATGTCTGAGGTGGCCTCGCGTGAGCTGCGTAACGATACGGCCGGCGTGCTGCGCCGCGTGCGGGCAGGGGAGGACGTCACCATCACCGTCAGCGGCCGTCCGGTCGCGGTGCTTACCCCGGTTCGTCCGCGGCGCCGGCGTTGGCTGAGCAAAACGGAGTTCCTGTCGCGGTTGCGCGGCGCTCAAGCCGATCCCGGGCTCCGTAACGACCTCGCGGTCCTTGCCGGCGACACGACCGAGGATCTCGGGCCGATCCGGTGA,vapB5,Putative antitoxin VapB5 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_369,NCFNLLIC_00372,MSTTPAAGVLDTSVFIATESGRQLDEALIPDRVATTVVTLAELRVGVLAAATTDIRAQRLATLESVADMETLPVDDDAARMWARLRIHLAESGRRVRINDLWIAAVAASRALPVITQDDDFAALDGAASVEIIRV,GTGAGCACGACGCCGGCCGCCGGAGTGCTCGACACGTCGGTGTTCATCGCGACCGAAAGCGGCCGGCAACTCGACGAGGCGCTGATCCCCGACCGGGTCGCCACCACCGTCGTCACCCTCGCCGAACTGCGCGTCGGCGTGCTGGCCGCGGCGACGACCGACATCCGGGCTCAACGCCTGGCGACCCTGGAATCCGTTGCCGATATGGAAACGTTGCCCGTCGACGACGATGCCGCCCGAATGTGGGCCCGATTGCGGATCCATCTTGCCGAGTCCGGTCGCCGGGTGCGGATCAACGACCTGTGGATCGCGGCCGTCGCGGCATCGCGAGCGCTGCCGGTCATCACCCAGGACGACGACTTCGCCGCCCTCGACGGTGCGGCCAGTGTGGAGATCATTCGGGTCTGA,vapC5_1,Ribonuclease VapC5 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protein 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protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_376,NCFNLLIC_00379,MSKDRLYFRQLLSGRDFAVGDMFATQMRNFAYLIGDRTTGDCVVVDPAYAAGDLLDALESDDMQLSGVLVTHHHPDHVGGSMMGFQLPGLAELLERASVPVHVNTHEALWVSRVTGIPVGDLITHEHGDKVSVGDIDIELLHTPGHTPGSQCFLLDGRLVAGDTLFLEGCGRTDFPGGDSDEMYRSLRQLAELPGDPTVFPGHWYSAEPSASLSEVKRSNYVYRPASLDQWRMLMGG,GTGTCCAAGGACCGGCTGTACTTCCGTCAACTGCTCTCCGGTCGCGATTTCGCCGTCGGCGACATGTTCGCGACGCAAATGCGCAACTTTGCCTACCTGATCGGAGATCGCACAACCGGGGACTGCGTGGTGGTCGACCCGGCCTACGCTGCCGGGGATCTGCTCGACGCGCTCGAATCCGACGATATGCAGCTATCGGGTGTGCTGGTGACCCACCATCATCCAGACCATGTGGGCGGCTCGATGATGGGTTTTCAGCTGCCGGGACTGGCTGAGCTGCTGGAGCGGGCATCTGTACCCGTGCACGTGAACACCCATGAAGCGCTGTGGGTTTCGCGAGTCACTGGGATTCCTGTCGGCGACCTGATCACCCATGAGCATGGGGACAAGGTCAGCGTCGGCGACATCGACATCGAGCTGCTGCACACACCCGGGCATACCCCAGGCAGTCAGTGCTTTCTACTCGACGGCCGGCTGGTCGCCGGTGACACGCTATTCCTGGAAGGCTGTGGACGCACAGACTTTCCCGGCGGTGATTCCGACGAGATGTACCGCAGCCTGCGACAGCTCGCCGAGCTTCCGGGTGACCCAACCGTCTTTCCCGGGCACTGGTATTCGGCCGAGCCAAGTGCGTCGCTGTCGGAGGTCAAGCGTTCCAATTACGTTTATCGCCCCGCAAGTCTCGATCAATGGCGAATGTTGATGGGCGGCTGA,baeB,putative polyketide biosynthesis zinc-dependent hydrolase BaeB -11_small,.10665_7_11.1,1_0_377,NCFNLLIC_00380,MLKRVEIEVDDDLIQKVIRRYRVKGAREAVNLALRTLLGEADTAEHGHDDEYDEFSDPNAWVPRRSRDTG,ATGCTGAAGAGGGTCGAGATAGAGGTTGATGACGACCTTATCCAAAAGGTCATCCGGCGGTACCGTGTGAAGGGTGCGCGCGAGGCTGTCAACCTTGCGCTGCGAACGTTGCTCGGCGAGGCGGATACCGCGGAGCATGGGCACGATGACGAGTACGACGAGTTCAGCGATCCCAATGCCTGGGTTCCGCGGCGGAGCCGCGACACAGGGTGA,,putative proteinA -11_small,.10665_7_11.1,1_0_378,NCFNLLIC_00383,MASSTDVRPKITLACEVCKHRNYITKKNRRNDPDRLELKKFCPNCGKHQAHRETR,ATGGCTTCCAGTACCGACGTGCGGCCGAAGATCACTTTGGCATGCGAGGTGTGCAAGCACCGTAACTACATCACCAAAAAGAACCGCCGCAACGACCCGGACCGGCTGGAGCTGAAGAAGTTCTGCCCGAATTGCGGCAAACACCAGGCGCACCGCGAGACGCGGTAA,rpmG2_1,50S ribosomal protein L33 2 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_379,NCFNLLIC_00384,MALSADIVGMHYRYPDHYEVEREKIREYAVAVQNDDAWYFEEDGAAELGYKGLLAPLTFICVFGYKAQAAFFKHANIATAEAQIVQVDQVLKFEKPIVAGDKLYCDVYVDSVREAHGTQIIVTKNIVTNEEGDLVQETYTTLAGRAGEDGEGFSDGAA,GTGGCGTTGAGCGCAGACATCGTTGGGATGCATTACCGGTATCCCGACCACTACGAGGTGGAGCGGGAGAAGATTCGCGAGTACGCCGTCGCCGTTCAAAACGACGACGCGTGGTATTTCGAGGAGGACGGCGCCGCCGAACTCGGGTATAAGGGCTTGCTGGCTCCGTTGACGTTTATCTGTGTGTTCGGCTACAAGGCCCAGGCGGCGTTCTTCAAGCATGCGAACATCGCGACCGCGGAGGCGCAGATCGTCCAGGTAGACCAAGTGCTGAAATTCGAGAAACCGATCGTGGCGGGCGACAAGCTGTACTGCGACGTCTATGTGGATTCGGTGCGTGAGGCGCACGGCACCCAGATCATCGTGACCAAGAACATCGTCACCAACGAGGAAGGTGACCTCGTGCAGGAGACCTATACGACCCTGGCGGGCCGTGCCGGCGAGGATGGAGAGGGATTTTCTGATGGCGCTGCGTGA,,hypothetical protein 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-11_small,.10665_7_11.1,1_0_382,NCFNLLIC_00388,MSDEGDVADEAVADGAENADSRGSGGRTALVTKPVVRPQRPTGKRSRSRAAGADADVDVEEPSTAASEATGVAKDDSTTKAVSKAARAKKASKPKARSVNPIAFVYNYLKQVVAEMRKVIWPNRKQMLTYTSVVLAFLAFMVALVAGADLGLTKLVMLVFG,GTGAGCGACGAAGGCGACGTTGCCGACGAGGCCGTAGCCGACGGCGCCGAGAATGCGGACAGCCGCGGGAGCGGTGGCCGGACGGCCCTGGTGACAAAGCCGGTGGTGCGGCCGCAACGTCCCACCGGCAAGCGGTCGCGGTCGCGTGCGGCAGGAGCCGACGCAGACGTCGACGTCGAAGAGCCGTCGACCGCGGCTTCGGAAGCTACCGGGGTCGCCAAGGACGATTCGACCACCAAGGCCGTGTCGAAGGCTGCCAGGGCAAAAAAGGCCAGTAAACCGAAGGCCCGGTCGGTTAACCCGATCGCATTCGTCTACAACTACCTCAAGCAGGTCGTTGCCGAGATGCGGAAGGTAATCTGGCCGAACCGCAAACAAATGCTTACCTACACGTCGGTGGTGCTGGCGTTTCTGGCCTTCATGGTGGCGCTGGTCGCCGGTGCTGACTTGGGCCTGACCAAGCTGGTGATGTTGGTGTTCGGCTGA,secE,Protein translocase subunit SecE -11_small,.10665_7_11.1,1_0_383,NCFNLLIC_00389,MTTFDGDTSAGEAVDLTEANAFQDAAAPAEEVDPAAALKAELRSKPGDWYVVHSYAGYENKVKANLETRVQNLDVGDYIFQVEVPTEEVTEIKNGQRKQVNRKVLPGYILVRMDLTDDSWAAVRNTPGVTGFVGATSRPSALALDDVVKFLLPRGSTRKAAKGAASTAAAAEAGGLERPVVEVDYEVGESVTVMDGPFATLPATISEVNAEQQKLKVLVSIFGRETPVELTFGQVSKI,GTGACTACCTTCGACGGTGACACGTCCGCGGGTGAGGCGGTCGATCTAACAGAGGCCAACGCCTTCCAGGATGCAGCGGCCCCGGCTGAAGAGGTCGATCCGGCCGCCGCGCTCAAAGCGGAGCTGCGCAGCAAGCCCGGCGACTGGTACGTCGTTCACTCCTACGCAGGGTACGAGAACAAGGTCAAGGCCAACCTGGAAACCCGGGTGCAGAACCTTGATGTCGGCGACTACATCTTCCAGGTGGAGGTGCCCACCGAAGAGGTCACCGAGATCAAAAACGGCCAACGCAAGCAGGTCAACCGTAAGGTGCTGCCCGGCTACATTCTGGTGCGGATGGACTTGACCGACGACTCCTGGGCCGCGGTGCGTAACACGCCGGGGGTCACGGGGTTCGTTGGGGCAACATCTCGCCCGTCAGCGCTCGCCCTCGACGACGTGGTGAAGTTTCTGCTTCCGCGGGGGTCGACGAGGAAGGCTGCCAAGGGTGCGGCCAGCACGGCTGCCGCCGCCGAGGCGGGCGGGCTAGAGCGTCCGGTCGTCGAGGTCGACTACGAGGTGGGCGAATCGGTAACCGTCATGGACGGGCCGTTTGCCACATTGCCGGCCACGATCAGCGAGGTCAACGCCGAACAGCAGAAACTCAAGGTGCTGGTCTCCATCTTCGGCCGCGAAACACCGGTGGAGCTGACCTTTGGCCAAGTCTCCAAGATCTAG,nusG,Transcription termination/antitermination protein NusG -11_small,.10665_7_11.1,1_0_384,NCFNLLIC_00390,MAPKKKVAGLIKLQIVAGQATPAPPVGPALGQHGVNIMEFCKAYNAATENQRGNVIPVEITVYEDRSFTFTLKTPPAAKLLLKAAGVAKGSAEPHKTKVAKVTWDQVREIAETKKTDLNANDVDAAAKIIAGTARSMGITVE,ATGGCCCCGAAGAAGAAGGTCGCCGGGTTGATCAAGCTGCAGATCGTGGCGGGCCAGGCCACCCCTGCCCCGCCAGTGGGCCCCGCGCTCGGTCAGCACGGCGTCAACATCATGGAGTTCTGCAAGGCGTACAACGCCGCGACGGAGAACCAGCGCGGCAACGTCATCCCGGTGGAGATCACCGTTTATGAAGACCGTAGCTTCACTTTCACGCTGAAGACGCCGCCCGCCGCCAAGCTGCTGCTTAAGGCCGCTGGTGTGGCGAAGGGTTCGGCGGAGCCGCACAAGACCAAGGTCGCCAAAGTCACCTGGGATCAAGTCCGCGAAATCGCCGAGACCAAGAAGACGGACCTCAACGCCAACGACGTCGACGCTGCGGCCAAGATCATCGCCGGTACCGCTCGGTCGATGGGCATCACCGTCGAATAG,rplK,50S ribosomal protein L11 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_385,NCFNLLIC_00391,MSKTSKAYRAAAAKVDRTNLYTPLQAAKLAKETSSTKQDATVEVAIRLGVDPRKADQMVRGTVNLPHGTGKTARVAVFAVGEKADAAVAAGADVVGSDDLIERIQGGWLEFDAAIATPDQMAKVGRIARVLGPRGLMPNPKTGTVTADVAKAVADIKGGKINFRVDKQANLHFVIGKASFDEKLLAENYGAAIDEVLRLKPSSSKGRYLKKITVSTTTGPGIPVDPSITRNFAGE,ATGAGCAAGACCAGCAAGGCATATCGCGCCGCCGCCGCGAAGGTGGACCGCACCAACCTCTACACCCCGCTGCAGGCGGCCAAGCTTGCCAAAGAGACCTCGTCGACCAAGCAGGACGCGACCGTCGAGGTGGCGATCCGGCTTGGCGTCGACCCGCGTAAGGCAGACCAGATGGTTCGCGGCACGGTCAACCTGCCACACGGCACTGGTAAGACTGCCCGCGTCGCGGTATTCGCGGTTGGTGAAAAGGCCGATGCTGCCGTTGCCGCGGGGGCGGATGTTGTCGGGAGTGACGATCTGATCGAGAGGATTCAGGGCGGCTGGCTGGAATTCGATGCCGCGATCGCGACACCGGATCAGATGGCCAAAGTCGGTCGCATCGCTCGGGTGCTGGGTCCGCGCGGCCTGATGCCCAACCCGAAAACCGGCACCGTCACCGCCGACGTCGCCAAGGCCGTCGCGGACATCAAGGGCGGCAAGATCAACTTCCGGGTTGACAAGCAGGCCAACCTGCACTTCGTCATCGGGAAAGCGTCGTTCGACGAGAAGTTGTTGGCGGAGAACTACGGCGCGGCGATCGACGAGGTGCTGCGGCTCAAGCCGTCCTCGTCGAAGGGCCGCTACCTGAAGAAGATCACCGTGTCGACGACGACGGGCCCGGGCATTCCGGTCGACCCATCCATCACCCGCAACTTCGCGGGGGAGTAG,rplA,50S ribosomal protein L1 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_386,NCFNLLIC_00392,MAEKPISPTKTRTRFEDIQAHYDVSDDFFALFQDPTRTYSCAYFEPPELTLEEAQYAKVDLNLDKLDLKPGMTLLDIGCGWGTTMRRAVERFDVNVIGLTLSKNQHARCEQVLASIDTNRSRQVLLQGWEDFAEPVDRIVSIEAFEHFGHENYDDFFKRCFNIMPADGRMTVQSSVSYHPYEMAARGKKLSFETARFIKFIVTEIFPGGRLPSTEMMVEHGEKAGFTVPEPLSLRPHYIKTLRIWGDTLQSNKDKAIEVTSEEVYNRYMKYLRGCEHYFTDEMLDCSLVTYLKPGAAA,ATGGCCGAGAAACCGATTAGCCCAACCAAGACACGGACACGCTTCGAAGACATCCAAGCGCACTACGACGTCTCCGATGATTTCTTCGCCCTGTTCCAGGACCCGACCCGAACTTACAGCTGTGCCTACTTCGAGCCACCGGAGCTCACGCTCGAAGAAGCCCAATACGCCAAGGTCGACCTCAACCTGGACAAGCTGGACCTCAAGCCGGGCATGACGCTGCTGGACATTGGGTGCGGTTGGGGCACCACCATGAGGCGCGCCGTCGAGCGGTTCGACGTTAACGTCATCGGCCTGACGTTGTCCAAGAACCAGCACGCCCGCTGCGAGCAAGTGCTGGCTTCGATCGACACCAACCGCTCACGTCAAGTGCTGCTGCAAGGCTGGGAGGATTTCGCCGAACCCGTCGACCGGATTGTGTCGATCGAAGCCTTCGAGCACTTCGGGCACGAGAACTACGACGACTTCTTCAAGCGGTGTTTCAACATCATGCCCGCCGACGGCCGGATGACCGTCCAGAGCAGCGTCAGCTACCACCCCTACGAGATGGCGGCCCGCGGTAAGAAGCTGAGCTTCGAGACGGCGCGTTTCATCAAGTTCATCGTCACCGAGATATTTCCCGGCGGCCGCCTGCCGTCCACCGAGATGATGGTCGAACACGGCGAGAAGGCCGGTTTCACCGTCCCGGAGCCGCTCTCGTTGCGCCCGCATTACATCAAGACGCTGCGGATCTGGGGGGACACGCTGCAGTCCAATAAGGACAAGGCCATCGAGGTCACCTCCGAAGAGGTCTACAACCGCTACATGAAGTATTTGCGTGGCTGCGAGCACTACTTCACCGACGAGATGCTCGACTGCAGCCTGGTGACCTACCTCAAGCCGGGTGCCGCGGCCTAA,mmaA4,Hydroxymycolate synthase MmaA4 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mycolic acid synthase MmaA3 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_388,NCFNLLIC_00394,MRSVQAPKGHLGSGKALHLMVNDLTPHFEDVQAHYDLSDDFFRLFLDPTQTYSCAHFEREDMTLEEAQIAKIDLALGKLGLQPGMTLLDIGCGWGATMRRAIAQYDVNVVGLTLSKNQAAHVQKSFDEMDTPRDRRVLLAGWEQFNEPVDRIVSIGAFEHFGHDRHADFFARAHKILPPDGVLLLHTITGLTRQQMVDHGLPLTLWLARFLKFIATEIFPGGQPPTIEMVEEQSAKTGFTLTRRQSLQPHYARTLDLWAEALQEHKSEAIAIQSEEVYERYMKYLTGCAKLFRVGYIDVNQFTLAK,GTGCGTTCCGTGCAAGCACCGAAAGGCCACCTAGGGTCCGGAAAGGCATTACACCTCATGGTCAACGACCTAACGCCGCACTTCGAGGACGTGCAGGCACACTACGACCTGTCCGACGACTTCTTCCGGCTGTTCCTGGATCCGACCCAGACCTACAGCTGCGCGCATTTCGAACGCGAGGACATGACGCTGGAAGAGGCCCAGATCGCCAAGATCGACCTGGCGCTGGGCAAGCTAGGTCTGCAGCCCGGCATGACGCTGCTCGATATCGGTTGCGGCTGGGGCGCCACCATGCGGCGCGCGATCGCGCAGTATGACGTCAACGTCGTCGGCCTGACATTGTCGAAGAACCAGGCCGCCCATGTGCAGAAGTCGTTCGACGAGATGGACACCCCGCGCGACAGGCGAGTGTTGCTGGCGGGATGGGAGCAGTTCAACGAGCCCGTCGACCGCATCGTGTCGATCGGCGCGTTCGAGCACTTCGGCCACGATCGTCACGCCGACTTCTTCGCCCGGGCCCACAAAATCCTGCCGCCCGATGGCGTGTTGCTGCTGCACACGATCACCGGCCTGACCAGGCAGCAGATGGTCGACCACGGCTTGCCGCTCACGTTGTGGCTGGCCCGCTTTCTCAAGTTCATCGCGACCGAAATCTTCCCGGGGGGCCAACCTCCGACGATTGAAATGGTTGAGGAACAGTCGGCGAAGACGGGTTTCACGCTGACTCGCCGCCAGTCGCTGCAGCCGCATTACGCCAGGACCCTCGACCTGTGGGCCGAGGCGCTGCAGGAACACAAAAGCGAGGCCATCGCGATCCAGTCCGAAGAGGTCTACGAGCGGTACATGAAATACCTGACCGGCTGCGCCAAGCTGTTCCGGGTCGGCTACATCGACGTCAACCAGTTCACGCTGGCGAAGTAG,mmaA2,Cyclopropane mycolic acid synthase MmaA2 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_389,NCFNLLIC_00395,MAKLRPYYEESQSAYDISDDFFALFLDPTWVYTCAYFERDDMTLEEAQLAKVDLALDKLNLEPGMTLLDVGCGWGGALVRAVEKYDVNVIGLTLSRNHYERSKDRLAAIGTQRRAEARLQGWEEFEENVDRIVSFEAFDAFKKERYLTFFERSYDILPDDGRMLLHSLFTYDRRWLHEQGIALTMSDLRFLKFLRESIFPGGELPSEPDIVDNAQAAGFTIEHVQLLQQHYARTLDAWAANLQAARERAIAVQSEEVYNNFMHYLTGCAERFRRGLINVAQFTMTK,ATGGCCAAGCTGAGACCATATTACGAAGAGTCACAGTCGGCTTACGACATTTCGGATGACTTCTTCGCGTTGTTCCTCGATCCCACCTGGGTCTACACCTGCGCCTATTTCGAGCGTGACGATATGACGCTGGAAGAGGCGCAACTGGCCAAGGTGGATCTGGCGTTGGACAAGCTGAACCTCGAACCGGGGATGACGCTACTCGACGTGGGTTGCGGGTGGGGCGGGGCGCTCGTTCGGGCCGTGGAGAAGTACGACGTCAATGTCATCGGCCTCACGCTCAGCCGGAATCACTATGAACGCAGCAAAGACCGCCTGGCCGCAATCGGAACGCAACGGCGCGCCGAGGCCCGGCTGCAGGGCTGGGAAGAGTTTGAAGAGAACGTCGACCGGATCGTCAGCTTTGAGGCATTCGACGCGTTCAAAAAGGAGCGGTATCTGACGTTCTTCGAACGCTCCTACGACATCCTGCCCGATGACGGGCGGATGCTACTGCACAGCCTGTTCACCTACGACCGCAGGTGGCTGCACGAACAGGGCATTGCGCTGACGATGAGCGACCTTCGATTCCTCAAATTCCTGCGGGAGTCGATCTTCCCGGGCGGCGAGCTGCCATCGGAGCCCGACATTGTCGACAATGCGCAGGCCGCGGGCTTCACCATCGAGCATGTCCAGCTGCTGCAGCAGCACTACGCACGGACTCTCGATGCATGGGCCGCCAACCTACAGGCTGCCCGCGAACGCGCCATCGCCGTACAGTCCGAAGAGGTCTACAACAACTTCATGCACTATCTGACCGGATGCGCGGAGCGCTTCCGCAGAGGCCTAATCAACGTCGCCCAGTTCACCATGACCAAGTAG,mmaA1,Mycolic acid methyltransferase MmaA1 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_390,NCFNLLIC_00396,MDIRSGTAVSGDVKLYYEDMGDLDHPPVLLIMGLGAQMLLWRTDFCARLVAKGLRVIRYDNRDVGLSTKTERHRPGQPLATRLVRSWLGLPSQAAYTLEDMAADAAALLDHLDVKHAHVVGASMGGMIAQIFAARFAQRTKTLAVIFSSNNHRFLPPPAPRALLALLTGPPPDSPRDVIVDNAVRVSKIIGSPAYPIPEDQVRAEAAESYDRNFHPWGIAQQFSAILGSGSLLRYDRRIVAPTVVIHGRADKLMRPFGGRAVARAINGARLVLIDGMGHDLPRQLWDRVIGELTRNFSEAG,GTGGACATCCGTAGCGGCACCGCGGTCTCCGGTGATGTGAAGCTGTACTACGAGGACATGGGTGACCTCGACCACCCGCCGGTGTTGCTGATCATGGGCCTGGGCGCCCAGATGCTGCTGTGGCGGACCGACTTCTGCGCGCGGCTCGTCGCGAAGGGCCTGCGCGTCATCCGCTACGACAACCGCGATGTCGGCCTGTCCACCAAGACCGAGCGCCACCGCCCGGGACAGCCACTGGCCACGCGGTTGGTCCGGTCCTGGCTCGGTCTGCCCAGCCAGGCTGCCTACACGTTGGAAGACATGGCCGCCGACGCCGCGGCGTTGCTCGATCACCTCGACGTCAAGCACGCGCACGTCGTCGGGGCGTCGATGGGCGGCATGATCGCCCAGATTTTCGCCGCGCGATTCGCGCAGCGGACGAAAACCCTGGCGGTCATCTTCTCCAGCAACAATCACCGGTTTCTGCCACCGCCGGCGCCACGCGCGCTGCTGGCGCTGCTCACGGGTCCGCCGCCGGATTCGCCACGCGACGTCATTGTCGACAACGCCGTCCGGGTCAGCAAGATCATCGGCAGCCCGGCCTACCCGATTCCCGAAGACCAGGTACGAGCCGAGGCCGCCGAAAGCTACGACCGCAACTTCCATCCCTGGGGAATCGCCCAGCAGTTCAGCGCGATACTGGGCAGCGGCAGCCTGCTGCGCTACGACCGGCGCATCGTCGCACCGACCGTCGTCATCCACGGGCGCGCGGACAAGCTGATGCGGCCGTTCGGCGGCCGCGCGGTCGCGCGAGCAATCAACGGCGCGCGCCTGGTGCTCATCGACGGCATGGGCCATGACCTGCCCAGACAGCTGTGGGATCGGGTGATCGGCGAGTTGACGCGCAACTTCTCTGAGGCCGGCTGA,rdmC,Aclacinomycin methylesterase RdmC 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protein 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RNA polymerase subunit beta' -11_small,.10665_7_11.1,1_0_413,NCFNLLIC_00419,MHALGHDAGLAARLALPAAPFNMSGNPAICLPAGDTS,ATGCATGCGTTGGGGCACGACGCCGGCCTGGCCGCCAGATTGGCGCTGCCCGCCGCCCCGTTCAACATGAGTGGCAATCCCGCCATCTGCCTGCCTGCGGGGGACACGTCGTGA,amiD_1,Putative amidase AmiD 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factor Tu 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protein 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-11_small,.10665_7_11.1,1_0_435,NCFNLLIC_00441,MTGTEHLVHTLRSQGRVCTSSGSPMYRELLELVAADVESGGVFASILADQKGAPEGQAVPLRLLGGLHRMVLDGRAPVLRRWYPSTGGTWQAEAAWPDIVRTATDQPESLRAALDRPPQTNEVGRSAALIGGLLIACLQFDLPIRLFEIGSSAGLNLRPDRYRYRYLGGEWGLADSPVRIDNAWLGELPPTATVRIVERHGYDIAPIDVTSPDGELNALSYIWPDQTDRLERLRGAIAVARNIPADLHRQAAHAAVAGMTLTDDALTVLWHSITWQYLPADERAAIRAGIDALAAQADAHCPFVHLTLEPAHQRPGAQIKYLVRMRSWPGGHARVLGECHPHGPPVTWQ,GTGACGGGCACCGAACACCTGGTCCACACCCTGCGGTCACAGGGGCGGGTGTGCACCTCCTCCGGCTCCCCGATGTACCGCGAGCTACTTGAGCTCGTGGCAGCTGACGTCGAAAGCGGCGGCGTCTTCGCGTCCATCTTGGCCGACCAGAAGGGTGCTCCGGAGGGCCAGGCGGTGCCGCTTCGGCTGCTCGGCGGATTGCACCGGATGGTGCTCGACGGCCGCGCACCGGTGTTGCGCCGCTGGTACCCCAGCACCGGCGGCACCTGGCAGGCGGAGGCAGCCTGGCCCGATATCGTCCGCACCGCGACCGACCAGCCGGAGTCGCTGCGTGCGGCTCTCGATCGGCCACCGCAGACCAACGAGGTAGGGCGCTCGGCGGCGTTGATCGGTGGACTTCTCATCGCCTGCCTCCAATTCGACTTGCCAATAAGGCTTTTCGAGATAGGGTCCAGTGCAGGGCTGAACCTGCGACCAGATCGGTACCGCTACCGTTATCTCGGCGGCGAATGGGGCCTGGCCGACTCACCGGTGCGAATCGACAATGCCTGGCTGGGCGAATTGCCGCCGACGGCCACGGTGCGGATCGTCGAACGACACGGATACGACATCGCGCCCATCGACGTCACCAGCCCCGACGGGGAGCTGAACGCGTTGAGCTACATCTGGCCGGACCAGACCGATCGGTTGGAGCGGTTGCGGGGCGCCATCGCCGTCGCCCGCAACATTCCCGCGGACCTCCATCGGCAGGCGGCGCACGCCGCAGTCGCCGGCATGACTCTGACCGACGATGCACTCACCGTGTTGTGGCATTCGATCACCTGGCAGTACCTGCCCGCCGACGAACGCGCAGCGATCCGCGCCGGAATCGACGCATTAGCCGCGCAAGCCGATGCCCACTGCCCGTTCGTGCACCTCACCTTGGAGCCTGCCCACCAGCGGCCCGGCGCCCAAATCAAGTACCTGGTACGTATGCGCAGTTGGCCGGGTGGTCACGCCCGGGTCTTGGGTGAATGCCATCCACACGGCCCACCGGTGACCTGGCAATGA,,hypothetical protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_436,NCFNLLIC_00442,MPHESRVGRRRSTTPHHISDVAIELFAAHGFTDVSVDDIARAAGIARRTLFRYYASKNAIPWGDFSTHLAQLQGLLDNIDSRIQLRDALRAALLAFNTFDESETIRHRKRMRVILQTPELQAYSMTMYAGWREVIAKFVARRSGGKTTDFMPQTVAWTMLGVALSAYEHWLRDESVSLTEALGAAFDVVGAGLDRLNQ,ATGCCGCACGAGTCGCGGGTGGGCCGACGGCGCTCAACCACACCGCACCACATCAGCGATGTTGCCATCGAACTGTTCGCTGCCCACGGTTTCACCGATGTCAGCGTGGACGACATCGCCCGGGCGGCCGGCATCGCCCGCAGAACGTTGTTTCGCTACTACGCCTCCAAGAACGCCATCCCCTGGGGTGACTTCAGCACCCACCTTGCACAGCTACAAGGTCTACTCGACAATATCGATTCACGGATTCAGCTGAGGGACGCGTTGCGCGCAGCGCTGTTGGCCTTCAACACCTTTGACGAATCCGAAACCATCCGACACCGCAAGCGCATGCGGGTCATCTTGCAAACTCCTGAACTGCAGGCCTATTCGATGACCATGTATGCTGGCTGGCGCGAGGTGATCGCCAAATTCGTTGCCCGCAGATCGGGTGGAAAGACGACAGACTTTATGCCCCAAACCGTCGCCTGGACAATGCTGGGGGTCGCTCTGAGCGCCTATGAACATTGGCTGCGCGACGAATCCGTCTCCTTGACCGAAGCGCTCGGGGCCGCGTTTGACGTCGTCGGCGCCGGTCTGGACCGACTCAACCAGTGA,mftR,Putative mycofactocin biosynthesis transcriptional regulator MftR 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mycofactocin radical SAM maturase MftC 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mycofactocin system heme/flavin oxidoreductase MftD 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protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_445,NCFNLLIC_00451,MAGQKIRIRLKAYDHEAIDASARKIVETVVRTGASVVGPVPLPTEKNVYCVIRSPHKYKDSREHFEMRTHKRLIDIIDPTPKTVDALMRIDLPASVDVNIQ,GTGGCGGGACAGAAGATCCGCATCAGGCTGAAGGCCTACGACCATGAGGCCATTGACGCTTCGGCGCGCAAGATCGTCGAAACCGTCGTCCGCACCGGTGCCAGCGTCGTAGGGCCGGTGCCGCTACCGACTGAGAAGAACGTGTATTGCGTCATCCGCTCACCGCATAAGTACAAGGACTCGCGGGAGCACTTCGAGATGCGCACACACAAGCGGTTGATCGACATCATCGATCCCACGCCGAAGACCGTTGACGCGCTCATGCGCATCGACCTTCCGGCCAGCGTCGACGTCAACATCCAGTAG,rpsJ,30S ribosomal protein S10 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ribosomal protein S3 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_453,NCFNLLIC_00459,MLIPRKVKHRKQHHPRQRGIASGGTTVNFGDYGIQALEHAYVTNRQIESARIAINRHIKRGGKVWINIFPDRPLTKKPAETRMGSGKGSPEWWVANVKPGRVLFELSYPNEGVARAALTRAIHKLPIKARIITREEQF,ATGTTGATTCCCCGTAAGGTTAAACATCGCAAGCAGCACCATCCTCGCCAGCGCGGCATCGCCAGCGGCGGCACCACGGTGAACTTCGGCGACTACGGCATTCAGGCCCTTGAGCACGCCTATGTCACCAACCGGCAGATCGAATCGGCGCGTATCGCCATCAACCGGCACATCAAGCGTGGCGGCAAGGTTTGGATCAACATCTTCCCTGACCGCCCGCTGACCAAGAAGCCCGCCGAAACCCGCATGGGTTCGGGCAAGGGCTCGCCGGAGTGGTGGGTAGCCAACGTTAAGCCGGGCCGGGTGCTGTTCGAGCTCAGTTACCCCAATGAAGGTGTCGCCCGGGCCGCGCTCACCCGAGCGATCCACAAGCTGCCGATCAAGGCACGCATTATTACTCGAGAGGAGCAGTTCTGA,rplP,50S ribosomal protein L16 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_454,NCFNLLIC_00460,MAVGVSPGELRELTDEELAERLRESKEELFNLRFQMATGQLNNNRRLRTVRQEIARIYTVLRERELGLATGPDGKES,ATGGCAGTGGGTGTCTCGCCGGGCGAACTGCGTGAGCTCACCGACGAGGAGCTGGCCGAGCGGTTGCGCGAGTCCAAGGAAGAGTTGTTCAACTTGCGTTTCCAGATGGCGACCGGCCAGCTCAACAATAACCGCCGGCTCCGTACGGTGCGTCAGGAAATCGCGCGCATCTACACCGTGCTGCGCGAACGAGAACTGGGTCTGGCGACTGGGCCCGATGGTAAGGAATCGTGA,rpmC,50S ribosomal protein L29 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_455,NCFNLLIC_00461,MAEAKTGAKAAPRVAKAAKAAPKKAAPNDAEAIGAANAANVKGPKHTPRTPKPRGRRKTRIGYVVSDKMQKTIVVELEDRMRHPLYGKIIRTTKKVKAHDEDSVAGIGDRVSLMETRPLSATKRWRLVEILEKAK,ATGGCAGAGGCTAAGACCGGCGCGAAGGCGGCGCCTAGGGTGGCTAAGGCCGCCAAGGCGGCCCCCAAGAAGGCCGCACCCAACGACGCTGAGGCCATAGGTGCGGCCAACGCGGCAAACGTTAAGGGGCCCAAGCACACTCCGCGTACTCCGAAGCCACGCGGCCGCCGCAAGACACGAATCGGCTATGTGGTGAGCGACAAAATGCAGAAGACCATTGTGGTGGAGCTGGAAGACCGCATGCGGCACCCGCTATACGGCAAGATCATCCGGACCACTAAGAAGGTCAAGGCACACGACGAAGACAGCGTTGCCGGCATTGGCGACCGTGTCTCGCTGATGGAGACGCGTCCGCTGTCGGCGACCAAGCGCTGGCGGCTCGTCGAGATCCTCGAGAAGGCTAAGTAA,rpsQ,30S ribosomal protein S17 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-11_small,.10665_7_11.1,1_0_462,NCFNLLIC_00468,MAKKALVNKAAGKPRFAVRAYTRCSKCGRPRAVYRKFGLCRICLREMAHAGELPGVQKSSW,ATGGCGAAGAAGGCACTGGTCAACAAGGCCGCAGGCAAACCGAGGTTTGCCGTGCGCGCCTACACCCGTTGCAGCAAGTGCGGCCGCCCGCGTGCGGTCTACCGCAAGTTCGGGCTGTGCAGGATTTGCCTGCGCGAGATGGCGCACGCGGGTGAGTTGCCCGGCGTGCAGAAGAGCAGCTGGTAA,rpsZ,30S ribosomal protein S14 type Z -11_small,.10665_7_11.1,1_0_463,NCFNLLIC_00469,MTMTDPIADFLTRLRNANSAYHDEVSLPHSKLKANIAQILKNEGYISDFRTEDARVGKSLVIQLKYGPSRERSIAGLRRVSKPGLRVYAKSTNLPRVLGGLGVAIISTSSGLLTDRQAARQGVGGEVLAYVW,ATGACGATGACGGACCCGATCGCAGACTTTTTGACCCGTCTGCGTAACGCCAACTCGGCGTATCACGACGAGGTCAGCTTGCCGCACTCCAAGCTCAAGGCCAACATCGCGCAGATTCTCAAGAACGAGGGGTACATCAGCGACTTCCGAACCGAGGACGCTCGGGTCGGTAAATCGCTGGTTATCCAGCTCAAGTACGGCCCTAGCCGGGAGCGCAGCATCGCCGGGTTGCGGCGGGTGTCCAAGCCCGGCCTGCGGGTGTACGCGAAATCCACCAATCTGCCGCGGGTGCTCGGCGGCCTGGGCGTGGCGATCATCTCGACCTCCTCGGGCCTGCTGACTGACCGGCAGGCAGCTAGACAGGGCGTGGGCGGCGAAGTCCTCGCATATGTCTGGTGA,rpsH,30S ribosomal protein S8 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protein L15 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protein 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protein 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3-oxopropanoate dehydrogenase 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PPE family protein PPE40 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_502,NCFNLLIC_00508,MAEQRYQAVLAVISDGLSISQVAEKVGVSRQTLHTWLARYEAEGLDGLRIGTGTAL,GTGGCAGAACAGCGGTATCAAGCCGTGTTGGCGGTGATCAGCGACGGGTTGTCGATCTCGCAGGTTGCCGAGAAAGTTGGGGTGTCGCGGCAGACGCTGCATACCTGGTTGGCCCGCTATGAGGCCGAGGGCCTCGATGGCTTAAGGATCGGTACCGGAACAGCCTTATAA,,hypothetical protein 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protein 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sensor histidine kinase TcrY -11_small,.10665_7_11.1,1_0_506,NCFNLLIC_00513,MSIFTKIINRELPGRFVYEDDDVVAFLTIEPMTQGHTLVVPRAEIDHWQNVDPALFGRVMSVSQLIGKAVCRAFSTQRAGMIIAGLEVPHLHIHVFPTRSLSDFGFANVDRNPSPGSLDEAQAKIRAALAQLA,GTGTCGATCTTCACCAAGATCATCAACCGTGAACTGCCCGGCCGTTTCGTCTACGAGGACGACGACGTCGTGGCGTTCTTGACGATTGAGCCGATGACGCAAGGCCACACCTTGGTGGTGCCACGAGCCGAAATCGACCACTGGCAAAACGTGGATCCCGCGTTATTTGGCCGCGTCATGTCGGTGAGCCAGCTGATCGGCAAGGCCGTGTGCCGGGCGTTTTCAACCCAACGCGCCGGGATGATCATTGCCGGGCTGGAAGTGCCCCACCTACACATCCACGTGTTTCCCACCCGCAGCCTCAGTGATTTCGGCTTTGCCAACGTCGACCGCAACCCCTCACCGGGATCGCTGGACGAAGCGCAGGCCAAGATCAGGGCGGCCCTGGCACAACTGGCGTGA,,putative HIT-like protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_507,NCFNLLIC_00514,MTQTTQSPALIASQSSWRCVQAHDREGWLALMADDVVIEDPIGKSVTNPDGSGIKGKEAVGAFFDTHIAANRLTVTCEETFPSSSPDEIAHILVLHSEFDGGFTSEVRGVFTYRVNKAGLITNMRGYWNLDMMTFGNQE,ATGACCCAAACGACCCAATCCCCGGCCCTGATCGCGTCGCAGTCGTCGTGGCGGTGCGTCCAAGCCCACGACCGGGAGGGCTGGCTGGCGCTGATGGCCGACGACGTCGTCATCGAGGATCCGATCGGCAAGTCCGTCACCAATCCCGATGGCAGCGGCATCAAAGGTAAGGAGGCCGTCGGCGCCTTCTTCGACACACACATTGCGGCCAATCGGTTGACGGTCACCTGCGAGGAGACGTTCCCGTCCAGCTCACCGGACGAGATCGCCCACATTCTGGTGTTGCACAGCGAGTTTGACGGCGGCTTTACCAGTGAGGTCCGCGGCGTGTTCACCTACCGGGTGAATAAGGCCGGTTTGATCACCAACATGCGTGGGTACTGGAACCTCGACATGATGACCTTCGGTAACCAGGAATGA,,hypothetical protein 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dehydrogenase B -11_small,.10665_7_11.1,1_0_509,NCFNLLIC_00516,MAGYPRDELEDVVHRWLQANRTAERRGDWTLLADFYTDDATYGWNVGPNEDVMCVGIDEIRDIALGQEMDGLQGWRYPYQRVVIDEKQGEVVGFWKQVATDANGAEQEVYGIGGSWFRYAGGGKWNWQRDFFDFGHVSALYLELIKAGKLSPGMQKRIERAVSGNKVPGYYPLGKTPVPLW,GTGGCCGGCTATCCTCGCGACGAACTCGAAGATGTGGTTCACCGCTGGTTACAGGCCAACCGTACGGCGGAGCGGCGCGGCGACTGGACGTTGCTGGCCGACTTCTACACCGACGACGCCACCTACGGCTGGAACGTCGGTCCCAACGAGGACGTGATGTGCGTCGGCATCGACGAGATCCGCGACATTGCGCTGGGCCAGGAAATGGACGGCCTGCAGGGCTGGCGCTACCCCTATCAACGGGTCGTCATCGACGAGAAACAGGGCGAGGTGGTTGGGTTCTGGAAACAGGTTGCCACCGACGCCAATGGCGCCGAGCAGGAGGTGTACGGCATTGGCGGCAGCTGGTTCCGGTATGCCGGCGGCGGGAAATGGAACTGGCAACGCGATTTCTTCGACTTCGGTCATGTTTCCGCGCTCTACCTGGAATTGATCAAGGCCGGCAAGCTATCGCCAGGCATGCAGAAGCGCATCGAACGCGCCGTGTCGGGCAACAAAGTGCCGGGCTATTACCCGCTCGGCAAGACGCCGGTGCCACTGTGGTAA,,hypothetical protein 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14-alpha demethylase 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dehydrogenase 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cytochrome P450 123 -11_small,.10665_7_11.1,1_0_514,NCFNLLIC_00521,MSSDVLVTTPAQRQTEPHAEAVSRNRRQQATFRKVLAAAMATLREKSYADLTVRLVAARAKVAPATAYTYFSSKNHLIAEVYLDLVRQVPCVTDVNVPMPIRVTSSLRHLALVVADEPEIGAACTAALLDGGADPAVRAVRDRIGAEIHRRITSAIGPGADPGTVFALEMAFFGALVQAGSGTFTYHEIADRLGYVVGLILAGANEPSTGGSE,GTGTCCAGCGATGTACTGGTTACCACCCCGGCCCAGCGCCAAACCGAACCCCACGCCGAAGCGGTGTCACGCAACCGCCGCCAGCAGGCAACCTTCCGCAAGGTGCTAGCTGCCGCCATGGCGACCCTGCGGGAGAAGTCATACGCCGACCTGACGGTGCGCCTGGTGGCGGCCCGCGCCAAGGTAGCCCCGGCGACGGCCTACACATACTTCTCGTCGAAGAACCATCTGATCGCCGAGGTCTACCTCGACCTGGTCCGCCAGGTCCCCTGCGTCACCGACGTCAACGTCCCGATGCCTATCCGGGTGACGAGCTCGTTGCGACACCTGGCGCTGGTGGTTGCCGACGAACCCGAAATCGGCGCGGCGTGCACGGCGGCGCTGCTCGACGGCGGCGCCGACCCCGCGGTGCGTGCGGTGCGCGACCGAATCGGCGCCGAGATCCACCGCCGCATCACATCGGCGATCGGACCTGGCGCCGATCCCGGTACCGTGTTCGCACTCGAGATGGCGTTCTTCGGAGCGCTCGTACAGGCCGGCAGCGGCACCTTCACCTACCACGAGATCGCCGATCGACTCGGGTACGTGGTGGGCCTGATCTTGGCCGGAGCTAACGAGCCGAGCACTGGTGGCAGCGAATGA,,putative HTH-type transcriptional regulator 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aldehyde dehydrogenase 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oxidoreductase 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oxidoreductase -11_small,.10665_7_11.1,1_0_518,NCFNLLIC_00525,MDELRRTGLDKMNEVYAWDMPDMPGEFFALTVDHLFGRIWTRPGLSMRDRRMAVIAVLTAQGQSDLLEVQVNAVLHNDELTIDELRELAVFITHYVGFPLGSRLNSAIERVAAKRKQAAENGSLPDTKANVAEVLAKESGKSS,ATGGACGAGCTGCGCCGCACCGGCCTGGACAAAATGAACGAGGTTTACGCCTGGGACATGCCCGACATGCCAGGTGAGTTTTTTGCCCTGACCGTCGATCACCTATTCGGCAGGATCTGGACCCGTCCCGGCCTGTCCATGCGGGACCGGCGGATGGCCGTGATCGCGGTGCTGACCGCTCAAGGCCAGTCGGATCTGCTCGAGGTCCAAGTCAACGCCGTCCTGCATAACGACGAACTCACCATAGACGAGCTGCGTGAACTCGCTGTGTTCATTACCCACTATGTCGGCTTCCCGCTGGGCTCGCGGCTGAACAGTGCGATCGAGCGGGTAGCGGCCAAGCGTAAGCAGGCGGCCGAGAACGGCTCGCTGCCCGACACGAAAGCCAACGTCGCCGAAGTTCTTGCTAAGGAATCTGGTAAATCGAGCTAG,,hypothetical protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_519,NCFNLLIC_00526,MRVLVIGSGAREHALLLALGKDPQVSGLIVAPGNAGTARIAEQHDVDITSAEAVVALAREVGADMVVIGPEVPLVLGVADAVRAAGIVCFGPGKDAARIEGSKAFAKDVMAAAGVRTANSEIVDSPAHLDAALDRFGPPAGDPAWVVKDDRLAAGKGVVVTADRDVARAHGAALLEAGHPVLLESYLDGPEVSLFCVVDRTVVVPLLPAQDFKRVGEDDTGLNTGGMGAYAPLPWLPDNIYREVVSRIVEPVAAELVRRGSSFCGLLYVGLAITARGPAVVEFNCRFGDPETQAVLALLESPLGQLLHAAATGKLADFGELRWRDGVAVTVVLAAENYPGRPRVGDVVVGSEAEGVLHAGTTRRDDGAIVSSGGRVLSVVGTGADLSAARAHAYEILSSIRLPGGHFRSDIGLRAAEGKISV,GTGCGCGTCCTGGTAATCGGTTCGGGTGCCCGCGAACATGCGCTATTGCTGGCGCTCGGCAAAGACCCGCAGGTTTCGGGGCTAATCGTTGCTCCCGGCAATGCAGGCACCGCTCGGATCGCCGAGCAGCACGACGTCGACATCACCTCCGCCGAGGCGGTGGTCGCCCTGGCTCGCGAAGTCGGCGCTGACATGGTGGTGATTGGCCCCGAGGTACCGTTAGTGCTCGGGGTGGCCGACGCCGTGCGCGCGGCCGGCATCGTGTGTTTCGGGCCCGGTAAGGACGCGGCTCGCATCGAAGGCTCCAAAGCATTCGCCAAGGACGTCATGGCGGCGGCCGGTGTGCGCACCGCGAACAGCGAAATCGTAGACAGCCCAGCGCACTTGGACGCGGCCCTGGACCGGTTCGGGCCGCCTGCCGGTGACCCGGCCTGGGTGGTCAAAGACGACCGGCTAGCCGCCGGCAAGGGTGTGGTGGTGACAGCGGACCGCGATGTCGCGCGCGCACACGGAGCTGCCCTGCTCGAGGCCGGGCACCCGGTGTTGCTGGAGTCCTACCTGGACGGCCCGGAGGTATCGCTGTTCTGTGTCGTCGACCGCACCGTCGTGGTGCCGCTGCTGCCGGCACAGGACTTCAAGCGAGTCGGTGAGGACGACACCGGACTTAACACCGGCGGTATGGGCGCCTACGCGCCGCTGCCGTGGTTGCCCGACAACATCTATCGGGAGGTGGTCAGCCGGATCGTCGAACCCGTTGCGGCCGAACTAGTCCGGCGTGGAAGCTCGTTTTGCGGATTGCTGTATGTTGGTCTCGCGATTACCGCCCGCGGGCCGGCGGTGGTCGAGTTCAACTGCCGATTCGGCGATCCGGAGACCCAAGCCGTGCTGGCCTTGCTGGAGTCTCCGCTCGGCCAACTGCTTCATGCCGCCGCTACCGGGAAGCTGGCCGATTTCGGCGAGTTGCGGTGGCGTGACGGTGTGGCCGTAACAGTGGTACTGGCGGCCGAAAACTATCCCGGGCGCCCCCGGGTCGGCGACGTCGTTGTCGGCTCCGAAGCCGAGGGGGTGCTGCACGCCGGAACCACGCGGCGCGACGATGGCGCGATCGTTTCGTCCGGTGGCCGGGTGCTGTCGGTGGTGGGCACCGGTGCCGACTTGTCCGCAGCACGCGCACACGCGTATGAAATCCTCAGTTCAATTCGGTTGCCAGGAGGTCATTTCCGCAGCGATATCGGTTTACGGGCGGCCGAGGGGAAGATCAGCGTCTAG,purD,Phosphoribosylamine--glycine ligase 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hydrolase-like YwrD proenzyme 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protein -11_small,.10665_7_11.1,1_0_522,NCFNLLIC_00529,MVSAAAELLGEGGFEAVRHRAVARRAGLPLASTTYYFSSLDDLIARAVEHIGMIEVAQLRARVSALSRRRRGPETTAVVLVDLLVGEMSSPGLAEQLISRYERHIACTRLPDLRESMRRSLRQRAEAVAEAIERSGRSAQIELVCTLICAVDGSVVSALVEGRDPRAAALATVVDLIDVLAPVDQRPVPF,TTGGTCAGCGCCGCCGCGGAGCTGCTCGGCGAGGGCGGGTTCGAGGCGGTACGCCACCGGGCGGTGGCGCGGCGGGCCGGTTTGCCGTTGGCGTCTACCACCTACTACTTCTCGTCGCTCGACGATTTGATCGCTCGCGCGGTCGAACACATCGGAATGATCGAGGTGGCTCAGCTGCGAGCCCGGGTCAGTGCGCTGTCCCGGCGACGTCGGGGGCCCGAGACCACCGCCGTTGTGCTGGTTGACCTGCTGGTGGGGGAAATGTCCAGTCCGGGGCTTGCCGAGCAGCTGATCTCACGATACGAGCGCCATATCGCCTGTACCCGCCTGCCTGACCTGCGCGAAAGCATGCGCCGCAGCCTGCGTCAGCGCGCTGAGGCCGTGGCCGAGGCCATCGAGCGCTCCGGCCGCTCCGCACAGATCGAACTGGTGTGTACGTTGATCTGTGCGGTCGACGGATCGGTGGTCTCGGCGCTGGTCGAAGGGCGGGACCCGCGTGCCGCTGCGCTGGCGACGGTGGTCGACCTCATCGACGTGCTCGCGCCCGTCGACCAGCGTCCGGTGCCGTTCTGA,,hypothetical protein 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lyase 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-11_small,.10665_7_11.1,1_0_527,NCFNLLIC_00534,MRPALSDYQHVASGKVREIYRVDDEHLLLVASDRISAYDYVLDSTIPDKGRVLTAMSAFFFGLVDAPNHLAGPPDDPRIPDEVLGRALVVRRLEMLPVECVARGYLTGSGLLDYQATGKVCGIALPPGLVEASRFATPLFTPATKAALGDHDENISFDRVVEMVGALRANQLRDRTLQTYVQAADHALTRGIIIADTKFEFGIDRHGNLLLADEIFTPDSSRYWPADDYRAGVVQTSFDKQFVRSWLTGSESGWDRGSDRPPPPLPEHIVEATRARYINAYERISELKFDDWIGPGA,ATGCGCCCCGCATTGTCCGACTACCAGCATGTGGCCAGCGGTAAGGTCCGCGAGATCTACCGTGTCGATGACGAGCACCTGCTGCTGGTTGCCAGCGACCGGATCTCGGCGTACGACTACGTCCTGGACAGCACCATCCCGGACAAGGGCCGCGTCCTGACCGCCATGAGCGCATTCTTCTTCGGGCTCGTCGATGCCCCTAACCATCTGGCCGGGCCGCCGGACGACCCGCGTATCCCCGACGAGGTGCTGGGCCGCGCGCTGGTGGTGCGTCGGCTGGAGATGCTGCCGGTGGAATGTGTGGCCCGTGGCTACCTGACCGGTTCGGGGTTACTGGATTACCAGGCAACCGGGAAGGTATGCGGTATCGCGCTGCCGCCGGGCCTGGTCGAGGCCAGTCGGTTCGCCACACCGCTGTTCACCCCGGCGACTAAAGCCGCGTTGGGGGACCACGACGAGAACATCTCGTTTGACCGGGTGGTGGAGATGGTAGGCGCGTTGCGTGCCAACCAGCTGCGTGATCGTACTCTGCAGACGTATGTGCAGGCCGCCGATCACGCTCTCACCCGCGGAATCATTATCGCCGACACCAAGTTTGAATTTGGCATCGACCGCCACGGCAACCTGCTGCTGGCCGACGAAATCTTCACACCGGACTCGTCGCGGTACTGGCCTGCCGACGACTACCGGGCCGGCGTGGTCCAGACCAGCTTCGACAAACAGTTTGTCCGCAGCTGGCTCACCGGCTCCGAGTCCGGCTGGGATAGAGGCAGCGATCGGCCGCCGCCTCCGCTCCCCGAGCATATCGTCGAGGCCACGCGTGCCCGTTATATTAATGCATACGAACGGATTTCCGAACTAAAATTCGACGACTGGATCGGCCCTGGCGCATGA,purC,Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide 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-11_small,.10665_7_11.1,1_0_530,NCFNLLIC_00537,MLGNAMVEACPAEGDAPVPITPAGRPRSGQRSYPDRLDVGLLRTAGVCVLASVMAHVDVTVVSVAQRTFVADFGSTQAVVAWTMTGYMLALATVIPTAGWAADRFGTRRLFMGSVLAFTLGSLLCAVAPNILLLIIFRVVQGFGGGMLTPVSFAILAREAGPKRLGRVMAVVGIPMLLGPVGGPILGGWLIGAYGWRWIFLVNLPVGLSALVLAAIVFPRDRPAASENFDYMGLLLLSPGLATFLFGVSSSPARGTMADRHVLIPAITGLALIAAFVAHSWYRTEHPLIDMRLFQNRAVAQANMTMTVLSLGLFGSFLLLPSYLQQVLHQSPMQSGVHIIPQGLGAMLAMPIAGAMMDRRGPAKIVLVGIMLIAAGLGTFAFGVARQADYLPILPTGLAIMGMGMGCSMMPLSGAAVQTLAPHQIARGSTLISVNQQVGGSIGTALMSVLLTYQFNHSEIIATAKKVALTPESGAGRGAAVDPSSLPRQTNFAAQLLHDLSHAYAVVFVIATALVVSTLIPAAFLPKQQASHRRAPLLSA,ATGCTCGGCAACGCCATGGTTGAAGCGTGTCCCGCGGAAGGCGATGCCCCGGTGCCCATCACCCCCGCGGGGCGGCCCCGCTCTGGCCAACGCAGCTATCCCGATAGGCTCGATGTGGGGTTGCTTCGGACCGCCGGAGTGTGTGTCCTGGCCTCGGTGATGGCACATGTGGACGTCACCGTGGTCAGCGTCGCGCAACGCACCTTCGTTGCCGATTTCGGGTCCACCCAGGCCGTCGTGGCCTGGACCATGACCGGCTACATGCTCGCGTTGGCCACTGTGATCCCGACAGCCGGTTGGGCGGCCGACCGGTTCGGCACCAGGCGGCTTTTCATGGGTTCGGTATTGGCGTTCACCCTCGGCTCACTGCTGTGCGCAGTAGCACCAAACATCTTGCTGCTCATCATATTTCGTGTTGTCCAGGGTTTCGGTGGGGGCATGCTGACGCCGGTGTCCTTTGCCATCTTGGCCCGTGAGGCGGGCCCGAAGCGGCTGGGGCGCGTGATGGCGGTGGTGGGCATTCCGATGCTGCTCGGCCCGGTCGGTGGGCCGATCCTGGGTGGTTGGCTCATCGGGGCCTACGGCTGGCGTTGGATTTTCTTGGTCAACCTGCCGGTCGGGCTGTCCGCGCTCGTCTTGGCGGCGATCGTGTTCCCAAGAGATCGCCCGGCAGCGTCGGAAAACTTCGACTACATGGGCCTCTTGTTGCTGTCGCCGGGCCTGGCGACCTTCCTGTTCGGGGTGTCATCTAGCCCCGCCCGTGGAACGATGGCCGATCGGCACGTGTTGATACCGGCGATCACCGGCCTGGCGTTGATCGCGGCATTCGTCGCACATTCGTGGTACCGCACAGAACATCCGCTCATAGACATGCGCTTGTTCCAGAACCGAGCGGTCGCGCAGGCCAACATGACGATGACGGTGCTCTCCCTCGGGCTGTTTGGCTCCTTCTTGCTGCTCCCGAGCTACCTCCAGCAAGTGTTGCACCAATCACCGATGCAATCGGGGGTGCATATCATCCCACAGGGCCTCGGTGCCATGCTGGCGATGCCGATCGCCGGAGCGATGATGGACCGACGGGGACCGGCCAAGATCGTGCTGGTTGGGATCATGCTGATCGCTGCGGGGTTGGGCACCTTCGCCTTTGGTGTCGCGCGGCAAGCGGACTACTTACCCATTCTGCCGACCGGGCTGGCAATCATGGGCATGGGCATGGGCTGCTCCATGATGCCACTGTCCGGGGCGGCAGTGCAGACCCTGGCCCCACATCAGATCGCTCGCGGTTCGACGCTGATCAGCGTCAACCAGCAGGTGGGCGGTTCGATAGGGACCGCACTGATGTCGGTGCTGCTCACCTACCAGTTCAATCACAGCGAAATCATCGCTACTGCAAAGAAAGTCGCACTGACCCCAGAGAGTGGCGCCGGGCGGGGGGCGGCGGTTGACCCTTCCTCGCTACCGCGCCAAACCAACTTCGCGGCCCAACTGCTGCATGACCTTTCGCACGCCTACGCGGTGGTATTCGTGATAGCGACCGCGCTAGTGGTCTCGACGCTGATCCCCGCGGCATTCCTGCCGAAACAGCAGGCTAGTCATCGAAGAGCACCGTTGCTATCCGCATGA,mdtD_1,Putative 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protein,KPLBOJCC_00179,NCFNLLIC_00179 -group_3,,hypothetical protein,KPLBOJCC_00131,NCFNLLIC_00131 -msrA,msrA,Peptide methionine sulfoxide reductase MsrA,KPLBOJCC_00044,NCFNLLIC_00044 -eccC3,eccC3,ESX-3 secretion system protein EccC3,KPLBOJCC_00200,NCFNLLIC_00200 -aftD,aftD,Alpha-(1->3)-arabinofuranosyltransferase,KPLBOJCC_00149,NCFNLLIC_00149 -group_2,,putative protein,KPLBOJCC_00004,NCFNLLIC_00004 -group_1,,hypothetical protein,KPLBOJCC_00086,NCFNLLIC_00086 -ctpI_1,ctpI_1,putative cation-transporting ATPase I,KPLBOJCC_00013,NCFNLLIC_00013 -dltA,dltA,D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1,KPLBOJCC_00007,NCFNLLIC_00007 -group_0,,hypothetical protein,KPLBOJCC_00220,NCFNLLIC_00220
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-group_137,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,226,,,,708,708,708.0,KPLBOJCC_00084,NCFNLLIC_00084 -group_136,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,225,,,,717,717,717.0,KPLBOJCC_00223,NCFNLLIC_00223 -bluB,bluB,56-dimethylbenzimidazole synthase,2,2,1.0,1,224,,,,726,726,726.0,KPLBOJCC_00221,NCFNLLIC_00221 -group_135,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,223,,,,735,735,735.0,KPLBOJCC_00189,NCFNLLIC_00189 -group_134,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,222,,,,735,735,735.0,KPLBOJCC_00119,NCFNLLIC_00119 -group_133,,Putative quercetin 23-dioxygenase,2,2,1.0,1,221,,,,735,735,735.0,KPLBOJCC_00090,NCFNLLIC_00090 -group_132,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,220,,,,735,735,735.0,KPLBOJCC_00087,NCFNLLIC_00087 -ugpQ,ugpQ,Glycerophosphodiester phosphodiesterase cytoplasmic,2,2,1.0,1,219,,,,738,738,738.0,KPLBOJCC_00232,NCFNLLIC_00232 -group_131,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,218,,,,741,741,741.0,KPLBOJCC_00246,NCFNLLIC_00246 -group_130,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,217,,,,744,744,744.0,KPLBOJCC_00172,NCFNLLIC_00172 -frdB_1,frdB_1,Fumarate reductase iron-sulfur subunit,2,2,1.0,1,216,,,,747,747,747.0,KPLBOJCC_00161,NCFNLLIC_00161 -group_129,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,215,,,,750,750,750.0,KPLBOJCC_00093,NCFNLLIC_00093 -glpG,glpG,Rhomboid protease GlpG,2,2,1.0,1,214,,,,750,750,750.0,KPLBOJCC_00016,NCFNLLIC_00016 -ldtA,ldtA,LD-transpeptidase 1,2,2,1.0,1,213,,,,756,756,756.0,KPLBOJCC_00023,NCFNLLIC_00023 -group_128,,putative methyltransferase,2,2,1.0,1,212,,,,765,765,765.0,KPLBOJCC_00136,NCFNLLIC_00136 -group_127,,LD-transpeptidase 4,2,2,1.0,1,211,,,,765,765,765.0,KPLBOJCC_00103,NCFNLLIC_00103 -group_126,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,210,,,,768,768,768.0,KPLBOJCC_00107,NCFNLLIC_00107 -group_125,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,209,,,,777,777,777.0,KPLBOJCC_00234,NCFNLLIC_00234 -group_124,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,208,,,,780,780,780.0,KPLBOJCC_00035,NCFNLLIC_00035 -group_123,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,207,,,,786,786,786.0,KPLBOJCC_00248,NCFNLLIC_00248 -tam,tam,putative trans-aconitate 2-methyltransferase,2,2,1.0,1,206,,,,786,786,786.0,KPLBOJCC_00210,NCFNLLIC_00210 -caiD_1,caiD_1,Carnitinyl-CoA dehydratase,2,2,1.0,1,205,,,,789,789,789.0,KPLBOJCC_00134,NCFNLLIC_00134 -group_122,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,204,,,,795,795,795.0,KPLBOJCC_00074,NCFNLLIC_00074 -group_121,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,203,,,,798,798,798.0,KPLBOJCC_00076,NCFNLLIC_00076 -stf0,stf0,Trehalose 2-sulfotransferase,2,2,1.0,1,202,,,,804,804,804.0,KPLBOJCC_00211,NCFNLLIC_00211 -group_120,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,201,,,,822,822,822.0,KPLBOJCC_00163,NCFNLLIC_00163 -group_119,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,200,,,,831,831,831.0,KPLBOJCC_00061,NCFNLLIC_00061 -group_118,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,199,,,,843,843,843.0,KPLBOJCC_00155,NCFNLLIC_00155 -group_117,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,198,,,,843,843,843.0,KPLBOJCC_00051,NCFNLLIC_00051 -group_116,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,197,,,,855,855,855.0,KPLBOJCC_00230,NCFNLLIC_00230 -group_115,,Putative short-chain type dehydrogenase/reductase,2,2,1.0,1,196,,,,861,861,861.0,KPLBOJCC_00055,NCFNLLIC_00055 -rmlA,rmlA,Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase,2,2,1.0,1,195,,,,867,867,867.0,KPLBOJCC_00250,NCFNLLIC_00250 -group_114,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,194,,,,870,870,870.0,KPLBOJCC_00077,NCFNLLIC_00077 -group_113,,Putative dioxygenase,2,2,1.0,1,193,,,,870,870,870.0,KPLBOJCC_00003,NCFNLLIC_00003 -espG3,espG3,ESX-3 secretion-associated protein EspG3,2,2,1.0,1,192,,,,888,888,888.0,KPLBOJCC_00205,NCFNLLIC_00205 -group_112,,Monoacylglycerol lipase,2,2,1.0,1,191,,,,897,897,897.0,KPLBOJCC_00092,NCFNLLIC_00092 -ybgK,ybgK,putative protein YbgK,2,2,1.0,1,190,,,,903,903,903.0,KPLBOJCC_00176,NCFNLLIC_00176 -group_111,,Soluble epoxide hydrolase,2,2,1.0,1,189,,,,903,903,903.0,KPLBOJCC_00041,NCFNLLIC_00041 -dnaK_1,dnaK_1,Chaperone protein DnaK,2,2,1.0,1,188,,,,1863,1863,1863.0,KPLBOJCC_00227,NCFNLLIC_00227 -group_110,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,187,,,,909,909,909.0,KPLBOJCC_00219,NCFNLLIC_00219 -group_109,,Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase,2,2,1.0,1,186,,,,909,909,909.0,KPLBOJCC_00197,NCFNLLIC_00197 -aes_1,aes_1,Acetyl esterase,2,2,1.0,1,185,,,,909,909,909.0,KPLBOJCC_00129,NCFNLLIC_00129 -group_108,,putative protein,2,2,1.0,1,184,,,,921,921,921.0,KPLBOJCC_00190,NCFNLLIC_00190 -group_107,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,183,,,,927,927,927.0,KPLBOJCC_00049,NCFNLLIC_00049 -group_106,,Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase,2,2,1.0,1,182,,,,933,933,933.0,KPLBOJCC_00053,NCFNLLIC_00053 -nrdB,nrdB,R2-like ligand binding oxidase,2,2,1.0,1,181,,,,945,945,945.0,KPLBOJCC_00146,NCFNLLIC_00146 -oxyR,oxyR,putative hydrogen peroxide-inducible genes activator,2,2,1.0,1,180,,,,945,945,945.0,KPLBOJCC_00024,NCFNLLIC_00024 -group_105,,Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase,2,2,1.0,1,179,,,,954,954,954.0,KPLBOJCC_00052,NCFNLLIC_00052 -rmd,rmd,GDP-6-deoxy-D-mannose reductase,2,2,1.0,1,178,,,,957,957,957.0,KPLBOJCC_00018,NCFNLLIC_00018 -group_104,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,177,,,,969,969,969.0,KPLBOJCC_00085,NCFNLLIC_00085 -group_103,,2-haloacrylate reductase,2,2,1.0,1,176,,,,969,969,969.0,KPLBOJCC_00056,NCFNLLIC_00056 -nadR,nadR,Trifunctional NAD biosynthesis/regulator protein NadR,2,2,1.0,1,175,,,,972,972,972.0,KPLBOJCC_00124,NCFNLLIC_00124 -php,php,Phosphotriesterase homology protein,2,2,1.0,1,174,,,,981,981,981.0,KPLBOJCC_00143,NCFNLLIC_00143 -group_102,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,173,,,,993,993,993.0,KPLBOJCC_00178,NCFNLLIC_00178 -eccE3,eccE3,ESX-3 secretion system protein EccE3,2,2,1.0,1,172,,,,996,996,996.0,KPLBOJCC_00208,NCFNLLIC_00208 -sigG,sigG,ECF RNA polymerase sigma factor SigG,2,2,1.0,1,171,,,,999,999,999.0,KPLBOJCC_00091,NCFNLLIC_00091 -mch,mch,Beta-methylmalyl-CoA dehydratase,2,2,1.0,1,170,,,,1014,1014,1014.0,KPLBOJCC_00128,NCFNLLIC_00128 -auaH,auaH,Aurachin B dehydrogenase,2,2,1.0,1,169,,,,1023,1023,1023.0,KPLBOJCC_00046,NCFNLLIC_00046 -fbpC,fbpC,Diacylglycerol acyltransferase/mycolyltransferase Ag85C,2,2,1.0,1,168,,,,1023,1023,1023.0,KPLBOJCC_00036,NCFNLLIC_00036 -group_101,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,167,,,,1041,1041,1041.0,KPLBOJCC_00079,NCFNLLIC_00079 -group_100,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,166,,,,1068,1068,1068.0,KPLBOJCC_00032,NCFNLLIC_00032 -mcd,mcd,(2S)-methylsuccinyl-CoA dehydrogenase,2,2,1.0,1,165,,,,1074,1074,1074.0,KPLBOJCC_00127,NCFNLLIC_00127 -fgd2,fgd2,F420-dependent hydroxymycolic acid dehydrogenase,2,2,1.0,1,164,,,,1083,1083,1083.0,KPLBOJCC_00039,NCFNLLIC_00039 -group_99,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,163,,,,1086,1086,1086.0,KPLBOJCC_00121,NCFNLLIC_00121 -pntAA,pntAA,NAD(P) transhydrogenase subunit alpha part 1,2,2,1.0,1,162,,,,1101,1101,1101.0,KPLBOJCC_00063,NCFNLLIC_00063 -group_98,,Putative transport protein,2,2,1.0,1,161,,,,1104,1104,1104.0,KPLBOJCC_00117,NCFNLLIC_00117 -group_97,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,160,,,,1110,1110,1110.0,KPLBOJCC_00088,NCFNLLIC_00088 -adhB_1,adhB_1,Alcohol dehydrogenase B,2,2,1.0,1,159,,,,1119,1119,1119.0,KPLBOJCC_00071,NCFNLLIC_00071 -group_96,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,158,,,,1134,1134,1134.0,KPLBOJCC_00185,NCFNLLIC_00185 -group_95,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,157,,,,1146,1146,1146.0,KPLBOJCC_00173,NCFNLLIC_00173 -group_94,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,156,,,,366,381,373.5,KPLBOJCC_00047,NCFNLLIC_00047 -hisB_1,hisB_1,Histidine biosynthesis bifunctional protein HisB,2,2,1.0,1,155,,,,573,654,613.5,KPLBOJCC_00020,NCFNLLIC_00020 -gtf1,gtf1,Glycosyltransferase Gtf1,2,2,1.0,1,154,,,,1155,1155,1155.0,KPLBOJCC_00137,NCFNLLIC_00137 -hddA,hddA,D-glycero-alpha-D-manno-heptose 7-phosphate kinase,2,2,1.0,1,153,,,,1161,1161,1161.0,KPLBOJCC_00021,NCFNLLIC_00021 -group_93,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,152,,,,1164,1164,1164.0,KPLBOJCC_00140,NCFNLLIC_00140 -group_92,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,151,,,,1167,1167,1167.0,KPLBOJCC_00247,NCFNLLIC_00247 -nagZ,nagZ,Beta-hexosaminidase,2,2,1.0,1,150,,,,1167,1167,1167.0,KPLBOJCC_00151,NCFNLLIC_00151 -lprN_1,lprN_1,Lipoprotein LprN,2,2,1.0,1,149,,,,1173,1173,1173.0,KPLBOJCC_00082,NCFNLLIC_00082 -group_91,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,148,,,,120,120,120.0,KPLBOJCC_00105,NCFNLLIC_00105 -group_90,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,147,,,,126,126,126.0,KPLBOJCC_00066,NCFNLLIC_00066 -group_89,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,146,,,,1194,1194,1194.0,KPLBOJCC_00182,NCFNLLIC_00182 -mymT,mymT,Metallothionein,2,2,1.0,1,145,,,,147,147,147.0,KPLBOJCC_00096,NCFNLLIC_00096 -group_88,,putative protein,2,2,1.0,1,144,,,,1197,1197,1197.0,KPLBOJCC_00012,NCFNLLIC_00012 -group_87,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,143,,,,1212,1212,1212.0,KPLBOJCC_00209,NCFNLLIC_00209 -group_86,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,142,,,,1212,1212,1212.0,KPLBOJCC_00132,NCFNLLIC_00132 -caiA_1,caiA_1,Crotonobetainyl-CoA dehydrogenase,2,2,1.0,1,141,,,,1212,1212,1212.0,KPLBOJCC_00062,NCFNLLIC_00062 -group_85,,Putative secreted protein.1,2,2,1.0,1,140,,,,174,174,174.0,KPLBOJCC_00150,NCFNLLIC_00150 -group_84,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,139,,,,183,183,183.0,KPLBOJCC_00029,NCFNLLIC_00029 -group_83,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,138,,,,189,189,189.0,KPLBOJCC_00022,NCFNLLIC_00022 -group_82,,Putative antitoxin VapB51,2,2,1.0,1,137,,,,195,195,195.0,KPLBOJCC_00142,NCFNLLIC_00142 -group_81,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,136,,,,1230,1230,1230.0,KPLBOJCC_00226,NCFNLLIC_00226 -sotB,sotB,sugar efflux transporter,2,2,1.0,1,135,,,,1242,1242,1242.0,KPLBOJCC_00101,NCFNLLIC_00101 -group_80,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,134,,,,216,216,216.0,KPLBOJCC_00188,NCFNLLIC_00188 -vapB2,vapB2,Antitoxin VapB2,2,2,1.0,1,133,,,,222,222,222.0,KPLBOJCC_00216,NCFNLLIC_00216 -porA,porA,Porin PorA,2,2,1.0,1,132,,,,1281,1281,1281.0,KPLBOJCC_00139,NCFNLLIC_00139 -group_79,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,131,,,,1284,1284,1284.0,KPLBOJCC_00116,NCFNLLIC_00116 -group_78,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,130,,,,225,225,225.0,KPLBOJCC_00241,NCFNLLIC_00241 -group_77,,putative PE-PGRS family protein PE_PGRS24,2,2,1.0,1,129,,,,225,225,225.0,KPLBOJCC_00060,NCFNLLIC_00060 -group_76,,Antitoxin,2,2,1.0,1,128,,,,228,228,228.0,KPLBOJCC_00214,NCFNLLIC_00214 -group_75,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,127,,,,1311,1311,1311.0,KPLBOJCC_00160,NCFNLLIC_00160 -group_74,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,126,,,,234,234,234.0,KPLBOJCC_00153,NCFNLLIC_00153 -group_73,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,125,,,,1317,1317,1317.0,KPLBOJCC_00125,NCFNLLIC_00125 -fadI,fadI,3-ketoacyl-CoA thiolase FadI,2,2,1.0,1,124,,,,1323,1323,1323.0,KPLBOJCC_00157,NCFNLLIC_00157 -group_72,,Putative cytochrome P450 138,2,2,1.0,1,123,,,,1326,1326,1326.0,KPLBOJCC_00043,NCFNLLIC_00043 -group_71,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,122,,,,243,243,243.0,KPLBOJCC_00014,NCFNLLIC_00014 -group_70,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,121,,,,1329,1329,1329.0,KPLBOJCC_00130,NCFNLLIC_00130 -group_69,,putative protein,2,2,1.0,1,120,,,,249,249,249.0,KPLBOJCC_00006,NCFNLLIC_00006 -rkpK,rkpK,UDP-glucose 6-dehydrogenase,2,2,1.0,1,119,,,,1332,1332,1332.0,KPLBOJCC_00238,NCFNLLIC_00238 -bbsG,bbsG,(R)-benzylsuccinyl-CoA dehydrogenase,2,2,1.0,1,118,,,,1344,1344,1344.0,KPLBOJCC_00038,NCFNLLIC_00038 -group_68,,Putative cytochrome P450 135A1,2,2,1.0,1,117,,,,1350,1350,1350.0,KPLBOJCC_00243,NCFNLLIC_00243 -group_67,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,116,,,,261,261,261.0,KPLBOJCC_00195,NCFNLLIC_00195 -group_66,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,115,,,,258,258,258.0,KPLBOJCC_00181,NCFNLLIC_00181 -group_65,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,114,,,,1359,1359,1359.0,KPLBOJCC_00089,NCFNLLIC_00089 -hcaB_1,hcaB_1,3-phenylpropionate-dihydrodiol/cinnamic acid-dihydrodiol dehydrogenase,2,2,1.0,1,113,,,,1365,1365,1365.0,KPLBOJCC_00156,NCFNLLIC_00156 -group_64,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,112,,,,1365,1365,1365.0,KPLBOJCC_00078,NCFNLLIC_00078 -mak,mak,Maltokinase,2,2,1.0,1,111,,,,1368,1368,1368.0,KPLBOJCC_00034,NCFNLLIC_00034 -gabD1,gabD1,Succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP(+)] 1,2,2,1.0,1,110,,,,1374,1374,1374.0,KPLBOJCC_00147,NCFNLLIC_00147 -group_63,,putative FAD-linked oxidoreductase,2,2,1.0,1,109,,,,1374,1374,1374.0,KPLBOJCC_00070,NCFNLLIC_00070 -group_62,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,108,,,,1398,1398,1398.0,KPLBOJCC_00212,NCFNLLIC_00212 -mycP3,mycP3,Mycosin-3,2,2,1.0,1,107,,,,1386,1386,1386.0,KPLBOJCC_00207,NCFNLLIC_00207 -esxH,esxH,ESAT-6-like protein EsxH,2,2,1.0,1,106,,,,291,291,291.0,KPLBOJCC_00204,NCFNLLIC_00204 -narK_2,narK_2,Nitrate/nitrite transporter NarK,2,2,1.0,1,105,,,,1392,1392,1392.0,KPLBOJCC_00180,NCFNLLIC_00180 -rpmB_1,rpmB_1,50S ribosomal protein L28,2,2,1.0,1,104,,,,285,285,285.0,KPLBOJCC_00011,NCFNLLIC_00011 -group_61,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,103,,,,1392,1392,1392.0,KPLBOJCC_00002,NCFNLLIC_00002 -group_60,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,102,,,,288,288,288.0,KPLBOJCC_00057,NCFNLLIC_00057 -esxG,esxG,ESAT-6-like protein EsxG,2,2,1.0,1,101,,,,294,294,294.0,KPLBOJCC_00203,NCFNLLIC_00203 -ricR,ricR,Copper-sensing transcriptional repressor RicR,2,2,1.0,1,100,,,,291,291,291.0,KPLBOJCC_00100,NCFNLLIC_00100 -narK_1,narK_1,Nitrate/nitrite transporter NarK,2,2,1.0,1,99,,,,1410,1410,1410.0,KPLBOJCC_00174,NCFNLLIC_00174 -PE3_1,PE3_1,PE family protein PE3,2,2,1.0,1,98,,,,1407,1407,1407.0,KPLBOJCC_00068,NCFNLLIC_00068 -group_59,,putative protein,2,2,1.0,1,97,,,,294,294,294.0,KPLBOJCC_00164,NCFNLLIC_00164 -group_58,,Putative diacyglycerol O-acyltransferase,2,2,1.0,1,96,,,,1410,1410,1410.0,KPLBOJCC_00133,NCFNLLIC_00133 -group_57,,Toxin,2,2,1.0,1,95,,,,303,303,303.0,KPLBOJCC_00215,NCFNLLIC_00215 -group_56,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,94,,,,303,303,303.0,KPLBOJCC_00102,NCFNLLIC_00102 -eccD3,eccD3,ESX-3 secretion system protein EccD3,2,2,1.0,1,93,,,,1419,1419,1419.0,KPLBOJCC_00206,NCFNLLIC_00206 -pntB,pntB,NAD(P) transhydrogenase subunit beta,2,2,1.0,1,92,,,,1428,1428,1428.0,KPLBOJCC_00065,NCFNLLIC_00065 -PE5_1,PE5_1,PE family immunomodulator PE5,2,2,1.0,1,91,,,,309,309,309.0,KPLBOJCC_00201,NCFNLLIC_00201 -group_55,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,90,,,,1443,1443,1443.0,KPLBOJCC_00252,NCFNLLIC_00252 -group_54,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,89,,,,1449,1449,1449.0,KPLBOJCC_00148,NCFNLLIC_00148 -geoB,geoB,Geranial dehydrogenase,2,2,1.0,1,88,,,,1464,1464,1464.0,KPLBOJCC_00135,NCFNLLIC_00135 -group_53,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,87,,,,333,333,333.0,KPLBOJCC_00064,NCFNLLIC_00064 -nirD,nirD,Nitrite reductase (NADH) small subunit,2,2,1.0,1,86,,,,357,357,357.0,KPLBOJCC_00167,NCFNLLIC_00167 -group_52,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,85,,,,1473,1473,1473.0,KPLBOJCC_00059,NCFNLLIC_00059 -group_51,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,84,,,,1479,1479,1479.0,KPLBOJCC_00122,NCFNLLIC_00122 -clcB,clcB,Voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB,2,2,1.0,1,83,,,,1479,1479,1479.0,KPLBOJCC_00050,NCFNLLIC_00050 -cobQ_1,cobQ_1,Cobyric acid synthase,2,2,1.0,1,82,,,,1485,1485,1485.0,KPLBOJCC_00169,NCFNLLIC_00169 -group_50,,putative protein,2,2,1.0,1,81,,,,366,366,366.0,KPLBOJCC_00001,NCFNLLIC_00001 -group_49,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,80,,,,1491,1491,1491.0,KPLBOJCC_00015,NCFNLLIC_00015 -group_48,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,79,,,,369,369,369.0,KPLBOJCC_00030,NCFNLLIC_00030 -group_47,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,78,,,,375,375,375.0,KPLBOJCC_00187,NCFNLLIC_00187 -PE3_2,PE3_2,PE family protein PE3,2,2,1.0,1,77,,,,1509,1509,1509.0,KPLBOJCC_00069,NCFNLLIC_00069 -group_46,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,76,,,,1515,1515,1515.0,KPLBOJCC_00010,NCFNLLIC_00010 -group_45,,Long-chain-fatty-acid--CoA ligase FadD13,2,2,1.0,1,75,,,,1518,1518,1518.0,KPLBOJCC_00126,NCFNLLIC_00126 -calB,calB,Coniferyl aldehyde dehydrogenase,2,2,1.0,1,74,,,,1521,1521,1521.0,KPLBOJCC_00054,NCFNLLIC_00054 -group_44,,putative protein,2,2,1.0,1,73,,,,387,387,387.0,KPLBOJCC_00228,NCFNLLIC_00228 -PPE4_1,PPE4_1,PPE family protein PPE4,2,2,1.0,1,72,,,,1542,1542,1542.0,KPLBOJCC_00202,NCFNLLIC_00202 -group_43,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,71,,,,1548,1548,1548.0,KPLBOJCC_00083,NCFNLLIC_00083 -group_42,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,70,,,,1548,1548,1548.0,KPLBOJCC_00080,NCFNLLIC_00080 -group_41,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,69,,,,1593,1593,1593.0,KPLBOJCC_00081,NCFNLLIC_00081 -group_40,,Putative fatty-acid--CoA ligase FadD10,2,2,1.0,1,68,,,,1599,1599,1599.0,KPLBOJCC_00005,NCFNLLIC_00005 -PPE3,PPE3,putative PPE family protein PPE3,2,2,1.0,1,67,,,,1611,1611,1611.0,KPLBOJCC_00196,NCFNLLIC_00196 -eccB3_1,eccB3_1,ESX-3 secretion system ATPase EccB3,2,2,1.0,1,66,,,,1617,1617,1617.0,KPLBOJCC_00199,NCFNLLIC_00199 -group_39,,Heme-binding protein,2,2,1.0,1,65,,,,411,411,411.0,KPLBOJCC_00115,NCFNLLIC_00115 -group_38,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,64,,,,411,411,411.0,KPLBOJCC_00048,NCFNLLIC_00048 -sauT,sauT,putative sulfoacetate--CoA ligase,2,2,1.0,1,63,,,,1629,1629,1629.0,KPLBOJCC_00026,NCFNLLIC_00026 -group_37,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,62,,,,1644,1644,1644.0,KPLBOJCC_00031,NCFNLLIC_00031 -group_36,,Ribonuclease VapC51,2,2,1.0,1,61,,,,414,414,414.0,KPLBOJCC_00141,NCFNLLIC_00141 -group_35,,Long-chain-fatty-acid--CoA ligase FadD13,2,2,1.0,1,60,,,,1665,1665,1665.0,KPLBOJCC_00075,NCFNLLIC_00075 -PPE2,PPE2,putative PPE family protein PPE2,2,2,1.0,1,59,,,,1671,1671,1671.0,KPLBOJCC_00170,NCFNLLIC_00170 -lcfB_1,lcfB_1,Long-chain-fatty-acid--CoA ligase,2,2,1.0,1,58,,,,1683,1683,1683.0,KPLBOJCC_00183,NCFNLLIC_00183 -vapC2,vapC2,Ribonuclease VapC2,2,2,1.0,1,57,,,,426,426,426.0,KPLBOJCC_00217,NCFNLLIC_00217 -group_34,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,56,,,,1707,1707,1707.0,KPLBOJCC_00144,NCFNLLIC_00144 -group_33,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,55,,,,435,435,435.0,KPLBOJCC_00249,NCFNLLIC_00249 -ilvD,ilvD,Dihydroxy-acid dehydratase,2,2,1.0,1,54,,,,1728,1728,1728.0,KPLBOJCC_00099,NCFNLLIC_00099 -group_32,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,53,,,,1731,1731,1731.0,KPLBOJCC_00138,NCFNLLIC_00138 -group_31,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,52,,,,1776,1776,1776.0,KPLBOJCC_00213,NCFNLLIC_00213 -oxc,oxc,Oxalyl-CoA decarboxylase,2,2,1.0,1,51,,,,1749,1749,1749.0,KPLBOJCC_00025,NCFNLLIC_00025 -group_30,,Ribonuclease VapC25,2,2,1.0,1,50,,,,429,429,429.0,KPLBOJCC_00191,NCFNLLIC_00191 -group_29,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,49,,,,1767,1767,1767.0,KPLBOJCC_00058,NCFNLLIC_00058 -pckG,pckG,Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP],2,2,1.0,1,48,,,,1821,1821,1821.0,KPLBOJCC_00123,NCFNLLIC_00123 -group_28,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,47,,,,432,432,432.0,KPLBOJCC_00098,NCFNLLIC_00098 -treS,treS,Trehalose synthase/amylase TreS,2,2,1.0,1,46,,,,1806,1806,1806.0,KPLBOJCC_00033,NCFNLLIC_00033 -group_27,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,45,,,,435,435,435.0,KPLBOJCC_00028,NCFNLLIC_00028 -group_26,,Butyryl-CoA dehydrogenase,2,2,1.0,1,44,,,,1836,1836,1836.0,KPLBOJCC_00158,NCFNLLIC_00158 -group_25,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,43,,,,1848,1848,1848.0,KPLBOJCC_00104,NCFNLLIC_00104 -group_24,,Ribonuclease VapC24,2,2,1.0,1,42,,,,438,438,438.0,KPLBOJCC_00154,NCFNLLIC_00154 -group_23,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,41,,,,441,441,441.0,KPLBOJCC_00073,NCFNLLIC_00073 -group_22,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,40,,,,456,456,456.0,KPLBOJCC_00242,NCFNLLIC_00242 -eccA3,eccA3,ESX-3 secretion system protein EccA3,2,2,1.0,1,39,,,,1896,1896,1896.0,KPLBOJCC_00198,NCFNLLIC_00198 -group_21,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,38,,,,456,456,456.0,KPLBOJCC_00171,NCFNLLIC_00171 -sdhA_1,sdhA_1,Succinate dehydrogenase flavoprotein subunit,2,2,1.0,1,37,,,,1941,1941,1941.0,KPLBOJCC_00162,NCFNLLIC_00162 -group_20,,putative protein,2,2,1.0,1,36,,,,1923,1923,1923.0,KPLBOJCC_00008,NCFNLLIC_00008 -group_19,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,35,,,,456,456,456.0,KPLBOJCC_00072,NCFNLLIC_00072 -group_18,,putative enoyl-CoA hydratase 1,2,2,1.0,1,34,,,,456,456,456.0,KPLBOJCC_00037,NCFNLLIC_00037 -pepO,pepO,Neutral endopeptidase,2,2,1.0,1,33,,,,1992,1992,1992.0,KPLBOJCC_00110,NCFNLLIC_00110 -group_17,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,32,,,,2058,2058,2058.0,KPLBOJCC_00017,NCFNLLIC_00017 -bglB,bglB,Thermostable beta-glucosidase B,2,2,1.0,1,31,,,,2076,2076,2076.0,KPLBOJCC_00095,NCFNLLIC_00095 -group_16,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,30,,,,480,480,480.0,KPLBOJCC_00165,NCFNLLIC_00165 -group_15,,Elongation factor G-like protein,2,2,1.0,1,29,,,,2145,2145,2145.0,KPLBOJCC_00027,NCFNLLIC_00027 -group_14,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,28,,,,483,483,483.0,KPLBOJCC_00222,NCFNLLIC_00222 -group_13,,Acyl-CoA dehydrogenase FadE34,2,2,1.0,1,27,,,,2196,2196,2196.0,KPLBOJCC_00184,NCFNLLIC_00184 -hsaB_1,hsaB_1,Flavin-dependent monooxygenase reductase subunit HsaB,2,2,1.0,1,26,,,,489,489,489.0,KPLBOJCC_00159,NCFNLLIC_00159 -napA,napA,Nitrate reductase,2,2,1.0,1,25,,,,2247,2247,2247.0,KPLBOJCC_00109,NCFNLLIC_00109 -ctpB,ctpB,Cation-transporting P-type ATPase B,2,2,1.0,1,24,,,,2259,2259,2259.0,KPLBOJCC_00009,NCFNLLIC_00009 -baiE,baiE,Bile acid 7-alpha dehydratase,2,2,1.0,1,23,,,,492,492,492.0,KPLBOJCC_00225,NCFNLLIC_00225 -group_12,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,22,,,,504,504,504.0,KPLBOJCC_00113,NCFNLLIC_00113 -group_11,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,21,,,,504,504,504.0,KPLBOJCC_00045,NCFNLLIC_00045 -nasD,nasD,Nitrite reductase [NAD(P)H],2,2,1.0,1,20,,,,2511,2511,2511.0,KPLBOJCC_00166,NCFNLLIC_00166 -group_10,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,19,,,,2514,2514,2514.0,KPLBOJCC_00194,NCFNLLIC_00194 -group_9,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,18,,,,510,510,510.0,KPLBOJCC_00094,NCFNLLIC_00094 -group_8,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,17,,,,2700,2700,2700.0,KPLBOJCC_00193,NCFNLLIC_00193 -cobU,cobU,Bifunctional adenosylcobalamin biosynthesis protein CobU,2,2,1.0,1,16,,,,525,525,525.0,KPLBOJCC_00168,NCFNLLIC_00168 -group_7,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,15,,,,2808,2808,2808.0,KPLBOJCC_00192,NCFNLLIC_00192 -mmpL3_1,mmpL3_1,Trehalose monomycolate exporter MmpL3,2,2,1.0,1,14,,,,2835,2835,2835.0,KPLBOJCC_00118,NCFNLLIC_00118 -group_6,,Heme uptake protein MmpL11,2,2,1.0,1,13,,,,2898,2898,2898.0,KPLBOJCC_00114,NCFNLLIC_00114 -aac,aac,Aminoglycoside 2'-N-acetyltransferase,2,2,1.0,1,12,,,,546,546,546.0,KPLBOJCC_00175,NCFNLLIC_00175 -group_5,,Multidrug efflux ATP-binding/permease protein,2,2,1.0,1,11,,,,3585,3585,3585.0,KPLBOJCC_00106,NCFNLLIC_00106 -group_4,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,10,,,,3630,3630,3630.0,KPLBOJCC_00179,NCFNLLIC_00179 -group_3,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,9,,,,549,549,549.0,KPLBOJCC_00131,NCFNLLIC_00131 -msrA,msrA,Peptide methionine sulfoxide reductase MsrA,2,2,1.0,1,8,,,,549,549,549.0,KPLBOJCC_00044,NCFNLLIC_00044 -eccC3,eccC3,ESX-3 secretion system protein EccC3,2,2,1.0,1,7,,,,3993,3993,3993.0,KPLBOJCC_00200,NCFNLLIC_00200 -aftD,aftD,Alpha-(1->3)-arabinofuranosyltransferase,2,2,1.0,1,6,,,,4203,4203,4203.0,KPLBOJCC_00149,NCFNLLIC_00149 -group_2,,putative protein,2,2,1.0,1,5,,,,552,552,552.0,KPLBOJCC_00004,NCFNLLIC_00004 -group_1,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,4,,,,555,555,555.0,KPLBOJCC_00086,NCFNLLIC_00086 -ctpI_1,ctpI_1,putative cation-transporting ATPase I,2,2,1.0,1,3,,,,4878,4878,4878.0,KPLBOJCC_00013,NCFNLLIC_00013 -dltA,dltA,D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1,2,2,1.0,1,2,,,,7539,7539,7539.0,KPLBOJCC_00007,NCFNLLIC_00007 -group_0,,hypothetical protein,2,2,1.0,1,1,,,,9561,9561,9561.0,KPLBOJCC_00220,NCFNLLIC_00220
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