Mercurial > repos > gga > apollo_delete_features
diff test-data/export/cdna.fa @ 10:df0e4eb2dfa5 draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxy-genome-annotation/galaxy-tools/tree/master/tools/apollo commit 08015be1ee8a784e0619f961aaa724857debfd6f"
author | gga |
---|---|
date | Mon, 02 Dec 2019 05:44:41 -0500 |
parents | |
children | 21a8cad7dfa5 |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/export/cdna.fa Mon Dec 02 05:44:41 2019 -0500 @@ -0,0 +1,103 @@ +>ff2fe902-7bab-431c-be82-30ed072915d1 (mRNA) 690 residues [Merlin:2-691 + strand] [cdna] name=Unknown +CGTTTAGACAAAGGTACATTATTGTATCGTGGCCAAAAATTAGACCTTCCTACATTCGAG +CATAACGCAGAGAATAAGTTGTTCTATTTCAGAAACTACGTTTCAACTTCATTAAAGCCT +CTGATCTTTGGTGAATTTGGTCGTATGTTTATGGCACTAGATGACGATACTACAATTTAT +ACTGCTGAGACGCCTGATGATTATAATCGTTTCGCAAACCCAGAAGATATAATTGATATT +GGCGCTACTCAAAAAGACTCATTTGACGATAACAATAATGATGGAACATCTATTAATATC +GGCAAACAAGTTAATTTAGGATTCGTTATTTCCGGTGCTGAAAATGTTCGAGTTATTGTT +CCAGGTTCTTTAACTGAATATCCAGAAGAAGCGGAAGTTATTCTGCCTCGTGGTACTCTT +TTGAAGATCAATAAAATCACTACTCAAGTAGATAAACGCTCGAATAAGTTCATGGTTGAA +GGTTCAATCGTTCCGCCTTCTGAGCAAATTGATGAATCTGTTGAGATTTATGACGGTGAT +CTGTTCATGGAAACAGGTGAAGTAGTAAAACTGTCCGGATTCATGCAGTTCGTCAACGAA +TCTGCATACGATGAAGAGCAAAACCAGATGGCTGCTGAGATTCTGTCTGGATTCTTGGAC +ATTGATGACATGCCACGTAAGTTCCGCTAG +>f2e1909a-1d40-4a49-a67b-5fe2afdc4957 (mRNA) 288 residues [Merlin:752-1039 + strand] [cdna] name=Unknown +ATGAAATCAATTTTTCGTATCAACGGTGTAGAAATTGTAGTTGAAGATGTAGTTCCTATG +TCTTATGAATTCAATGAAGTTGTTTTCAAAGAGCTTAAGAAAATTTTAGGCGATAAGAAG +CTTCAAAGTACTCCAATTGGACGTTTTGGAATGAAAGAAAACGTTGATACTTATATTGAA +AGTGTAGTGACAGGGCAGTTAGAAGGTGAATTTTCTGTAGCAGTTCAAACTGTAGAAAAT +GATGAAGTTATTTTAACTTTACCAGCTTTCGTAATTTTCCGCAAATAA +>12fe0db6-c8e1-4bc9-b594-87c92c6c9669 (mRNA) 945 residues [Merlin:1067-2011 - strand] [cdna] name=Unknown +ATGCTAACTTTAGATGAATTTAAAAACCAAGCGGGTAATATAGACTTTCAGCGTACTAAT +ATGTTTAGTTGTGTATTTGCAACTACTCCGTCAGCAAAGTCTCAACAATTACTCGATCAA +TTTGGCGGTATGCTCTTTAATAACCTTCCGTTGAATAATGACTGGCTTGGATTAACACAA +GGTGAGTTCACATCAGGACTCACCTCAATTATCACTGCCGGTACTCAACAGCTGGTAAGA +AAGTCTGGTGTATCGAAATATCTTATTGGAGCAATGAGCAATCGTGTTGTTCAGTCTTTA +TTAGGTGAATTTGAAGTCGGAACTTATTTGTTAGACTTCTTTAACATGGCTTATCCGCAA +TCTGGATTGATGATTTATTCGGTCAAAATTCCAGAGAACAGATTGTCTCATGAAATGGAT +TTCAACCATAACTCACCGAATATTAGAATAACTGGACGTGAACTCGATCCGTTAACTATA +TCATTCAGAATGGATCCCGAAGCAAGTAACTATCGTGCAATGCAAGATTGGGTGAACTCC +GTTCAAGACCCGGTTACTGGATTGCGAGCATTACCAACTGACGTCGAAGCTGACATTCAG +GTTAACCTTCATGCTCGAAATGGATTACCTCATACTGTGATAATGTTCACAGGTTGTGTT +CCTGTTGCGTGTGGAGCTCCTGAGCTTACATATGAAGGAGATAACCAAATTGCGGTTTTC +GATGTTACATTTGCTTACAGAGTAATGCAAACGGGTGCTGTTGGACGTCAAGCTGCTCTT +GATTGGATTGAAGATAGAGCTGTTAATTCTATAACTGGAATTAATAGTGAAATGTCTCTT +AATGGAAGTTTAAGTAGATTATCTAGACTTGGAGGAGCTGCTGGAGGGTTGTCTCACGTC +ATTAATTCGACCCGAAACTCTACTTCGAAAATACTTGGATTGTAA +>58fc8255-95ed-4417-a373-238f826810ac (mRNA) 1056 residues [Merlin:2011-3066 - strand] [cdna] name=Unknown +ATGAGCATTAAAGTCAGAGAATTAGATGATAAGACTGATGCTTTAATTAGCGGAGTTAAA +ACCTCCGCTGGTCAAAGTTCACAATCAGCAAAAATAAAATCCACTATAACTGCGCAATAT +CCGTCTGAACGTTCAGCTGGTAATGACACATCTGGTTCTTTACGAGTTCATGATCTTTAT +AAGAACGGGTTGTTGTTCACTGCGTATGATATGAATTCTCGTACAACCGGTGATATGCGT +AGCATGCGTTTAGGTGAAATGAAACGTACTGCAAATAGTGTAGTGAAATCAATCACTGGA +ACAAATACTAATAAAGTTGATAAAATTCCAGTAGTGAATATTTTACTTCCACGCTCGAAA +TCAGATGTTGAATCAGTTTCTCATAAATTTAATGACGTTGGAGATTCACTTATTTCTCGT +GGCGGCGGTACTGCTACAGGGGTATTAAGTAACGTTGCATCTACTGCTGTCTTTGGCGGA +TTAGAGTCATTGACTCAAGGATTAATGGCTGACCATAACGAGCAGATCTATAACACTGCT +CGATCAATGTATGGCGGCGCAGATAACCGTACGAAGGTATTCACGTGGGATTTAACTCCT +CGATCAGTACAAGATCTTATTGCTATTATCGAGATCTATGAATACTTTAACTACTATAGT +TATGGCGAAACGGGAACGTCTACTTATGCAAAAGAAGTTAAGTCTCAATTAGATGAATGG +TATAAATCAACTTTCCTTGATACATTAACTCCAGATGAAGCTAATAAAAATGACACTGTT +TTTGAGAAAATAACTTCATTCTTAAGTAATGTTATTGTTGTAAGTAACCCTACTGTGTGG +TTCGTCAGAAACTTTGGAACCACAAGTAAATTCGATGGACGTGCTGAAGTATTCGGTCCA +TGTCAAATTCAGAGTATCCGTTTTGATAAAACTCCAAATGGAAACTTTAACGGTTTAGCT +ATAGCTCCAAACCTGCCAAGTACATTCACATTAGAAATTACTATGCGTGAAATCTTGACA +TTGAACCGAGCTTCAGTATATGCGGAAGGATTCTGA +>c009dd7a-3284-4e7f-9ee1-3b56e2598e07 (mRNA) 1662 residues [Merlin:3066-4796 - strand] [cdna] name=multiexongene +ATGAAAAGCGAAAACATGTCCACAATGAGACGTCGTAAAGTTATCGCTGATTCAAAGGGT +GAAAGAGATGCAGCCTCGACTGCATCTGATCAAGTAGACTCTTTAGAATTAATCGGCCTT +AAACTTGATGATGTACAAAGCGCTAATGAACTAGTTGCTGAAGTAATTGAAGAAAAGGGC +AATAACTTAATTGATTCAGTTGATAACGTCGCTGAAGGTACTGAATTAGCTGCTGAAGCA +TCTGAACGAACTACTGAGTCTATCAAGACTCTTACTGGCGTAGCGTCAACAATCAGCGAC +AAATTAAGTAAACTCGCTTCGATGCTCGAGTCGAAGGTTCAGGCTGTGGAGCAAAAAGTA +CAAGAATCTGGTGCCTCAGCTTCAACTGGGCTGTCAGTGATAGAAGATAAGCTTCCAGAT +CCTGATGAGCCTTTCTTTCCACCTGTCCCTCAGGAACCCGAGAACAACAAGAAAGATCAA +AAGAAAGATGATAAGAAACCTACCGATATGTTAGGTGACTTGCTGAAGACTACGAAGGGC +GGATTTAAAGCTACGATATCAATCACTGATAAAATATCGTCTATGCTTTTCAAATACACC +GTAACAGCATTAGCTGAAGCTGCTAAAATGGCTGCTATGCTATTTGCATTAGTATTAGGC +ATAGATTTACTTCGTATTCATTTTAAGTATTGGACTGATAAATTCATGAGTAACTTCGAT +GAATTCAGTGCTGAAGCTGGTGAATGGGGTGGACTGCTTCAATCAATTTTTGGAATGTTA +GGAGATATTAAAAAGTTCTGGGAAGCTGGAGACTGGAGTGGATTAGCAGTAGCTATTGTC +AAAGGATTAGCTGATGTGATTTACAACCTGAGCGAAATAATGTCTTTGGGAATTTCAAAG +ATATCTGCTTCTATACTCGATGCACTTGGCTTTGAAAATGCAGCAACTACTATTCGTGGT +TCAGCACTAGAAGGATTCCAGGAACGCACTGGTAATTCATTGTCTGAAGATGATCAAAAA +GCTTTGGCTAAATATCAGAGTAAGCGTATTGAAGAAGGTCCTGGAATTATTGATAAAGCT +GGCGAATTTAAAACTCGTGCATTTGATTGGGTACTAGGAAGAGAGAATAAAATCGATTCT +ACACAAGCATCTGACCGTGATCAAGAGACTCAGAATCTTAAAGCAATGGCTCCTGAAAAA +CGCGAAGAAACACTGATCAAACAAAACGAAGCTCGTGCAGCTGTTCAGCGTTTAGAAAAA +TATATTGGTGATGTTGATCCAGAGAATCCAACTAATATGCAATCTTTAGAGAAGGCATAT +AACAGTGCCAAAAAGTCTATTAGTGATTCTGCTATAAGTGATCAACCAGCTACTAAAAAG +GAACTCGATAAAAGATTCCAACGAGTAGAATCCAAGTATCAGAAGCTCAAAGAAGATAAC +ACTCCGAAGCCTGCGGCTCCAGCTACTTCGGAAGATAATCAACGAGTTCAAAATATTCAA +AAAGCTGAAAATGCTAAAGAGCAATCTAAAAAATCAACCGGTGATATGAATGTTGCTAAC +ACTCAGGTTAATAACGTAAATAATAGTAAGACTATTCACCAGGTTCAAACAGTCACGGCT +ACTCCAGCTCCTGGAGTATTCGGGGCAACAGGAGTTAATTAA +>2706ea76-172a-48c1-b940-eb603996f082 (mRNA) 1056 residues [Merlin:5011-6066 - strand] [cdna] name=cds-not-under-exon +CTTTAATGACGCTGGTGAATCAATAAAAGAGATGATCGGTGCAATTTATGAATCAAAACC +TCTTATAGCACCTGCGATGAACACAATCAACACATATGTTCCTCGAGTTCCATGGACGAG +TAACATAACTGAATACAAGAAATATGTTCGAGATGTTGCATTAGCAGTAGATAATGACCA +ATTCGTTTTTGTATGGGAAGATATCTATGGCTTGAACATGATGGATTATGACGCAATGAT +TAACCAAGAATCAATCAAGGTTATTGTCGGTGAACCACGCACAATAGGTCAATTTGTCGG +TGAGCTGGAATATAATCTCGCTTATGACTTCCAGTGGTTAACGAAGGCTAATGCCCATAC +ACGCGATCCTATTTTTAACGCTACAATCTATTCACACTCATTCTTGGATAATAACCTTCC +TAGAATAGTAACAGGTGATGGACAGAATAGCATCTTCGTTTCTCGCTCGGGTGCATATTC +TGAAATGACTTATCGAAATGGATATGAAGAAGCTATCAGGCTTCAGACTATGGCACAATA +CGACGGTTATGCAACTTGTAAAATGGTTGGAGACTTTGAAATGACTCCTGGAGATAAGAT +TAATTTCTTTGATCCAAAGAAACAATTCAAAGCTGATTTTTACATTGATGAAGTAATTCA +TGAAGTAAGTAATAACCAAAGCATAACTACACTTTATATGTTTACTAACTCTCGTAAGTT +GGAAACAGTAGAACCAATAAAGGTTAAAAATGAACTTAAATCTGATACTACCACTTAAGA +AAATACAAGTCAATGGCAAAACCATTTCTATTCCTAAGCTTGGCTTGAAGCATCACACGT +TGATTAAAGATGTTCGTGCAATGGATGAGAACATGGGAATTCTTTTGGACTCAATTCATC +CTGGGCTAAACGCTGCTGAATCAGATTTAGTGTCTATTCATTTGCTAGAGTTCAATGGCA +AGTTAAAATCAAGTGTCGTTAAAGATGGATACACTTACAATATCAATGACATTTATATTT +GCCAACGCCTTGAATTCCAGTTCCAAGGAAAGACAT