Mercurial > repos > gga > apollo_feat_from_gff3
view test-data/export/cds.fa @ 16:12ebb583b8a3 draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxy-genome-annotation/galaxy-tools/tree/master/tools/apollo commit 1f9a5502a7423c78d862e81537b7646c9f4da5d9"
author | gga |
---|---|
date | Fri, 10 Dec 2021 09:52:37 +0000 |
parents | bb562d95b6cd |
children |
line wrap: on
line source
>df4157db-1481-4120-858c-e6a4c0f78547 (mRNA) 690 residues [Merlin:2-691 + strand] [cds] name=Merlin_1_mRNA-00001 CGTTTAGACAAAGGTACATTATTGTATCGTGGCCAAAAATTAGACCTTCCTACATTCGAG CATAACGCAGAGAATAAGTTGTTCTATTTCAGAAACTACGTTTCAACTTCATTAAAGCCT CTGATCTTTGGTGAATTTGGTCGTATGTTTATGGCACTAGATGACGATACTACAATTTAT ACTGCTGAGACGCCTGATGATTATAATCGTTTCGCAAACCCAGAAGATATAATTGATATT GGCGCTACTCAAAAAGACTCATTTGACGATAACAATAATGATGGAACATCTATTAATATC GGCAAACAAGTTAATTTAGGATTCGTTATTTCCGGTGCTGAAAATGTTCGAGTTATTGTT CCAGGTTCTTTAACTGAATATCCAGAAGAAGCGGAAGTTATTCTGCCTCGTGGTACTCTT TTGAAGATCAATAAAATCACTACTCAAGTAGATAAACGCTCGAATAAGTTCATGGTTGAA GGTTCAATCGTTCCGCCTTCTGAGCAAATTGATGAATCTGTTGAGATTTATGACGGTGAT CTGTTCATGGAAACAGGTGAAGTAGTAAAACTGTCCGGATTCATGCAGTTCGTCAACGAA TCTGCATACGATGAAGAGCAAAACCAGATGGCTGCTGAGATTCTGTCTGGATTCTTGGAC ATTGATGACATGCCACGTAAGTTCCGCTAG >eedd9b31-f1dd-487c-a3ab-6435b2214685 (mRNA) 288 residues [Merlin:752-1039 + strand] [cds] name=mrna-name-00001 ATGAAATCAATTTTTCGTATCAACGGTGTAGAAATTGTAGTTGAAGATGTAGTTCCTATG TCTTATGAATTCAATGAAGTTGTTTTCAAAGAGCTTAAGAAAATTTTAGGCGATAAGAAG CTTCAAAGTACTCCAATTGGACGTTTTGGAATGAAAGAAAACGTTGATACTTATATTGAA AGTGTAGTGACAGGGCAGTTAGAAGGTGAATTTTCTGTAGCAGTTCAAACTGTAGAAAAT GATGAAGTTATTTTAACTTTACCAGCTTTCGTAATTTTCCGCAAATAA >8cd6db6d-b818-4b65-b6f2-de79844a5641 (mRNA) 945 residues [Merlin:1067-2011 - strand] [cds] name=Merlin_3_mRNA-00001 ATGCTAACTTTAGATGAATTTAAAAACCAAGCGGGTAATATAGACTTTCAGCGTACTAAT ATGTTTAGTTGTGTATTTGCAACTACTCCGTCAGCAAAGTCTCAACAATTACTCGATCAA TTTGGCGGTATGCTCTTTAATAACCTTCCGTTGAATAATGACTGGCTTGGATTAACACAA GGTGAGTTCACATCAGGACTCACCTCAATTATCACTGCCGGTACTCAACAGCTGGTAAGA AAGTCTGGTGTATCGAAATATCTTATTGGAGCAATGAGCAATCGTGTTGTTCAGTCTTTA TTAGGTGAATTTGAAGTCGGAACTTATTTGTTAGACTTCTTTAACATGGCTTATCCGCAA TCTGGATTGATGATTTATTCGGTCAAAATTCCAGAGAACAGATTGTCTCATGAAATGGAT TTCAACCATAACTCACCGAATATTAGAATAACTGGACGTGAACTCGATCCGTTAACTATA TCATTCAGAATGGATCCCGAAGCAAGTAACTATCGTGCAATGCAAGATTGGGTGAACTCC GTTCAAGACCCGGTTACTGGATTGCGAGCATTACCAACTGACGTCGAAGCTGACATTCAG GTTAACCTTCATGCTCGAAATGGATTACCTCATACTGTGATAATGTTCACAGGTTGTGTT CCTGTTGCGTGTGGAGCTCCTGAGCTTACATATGAAGGAGATAACCAAATTGCGGTTTTC GATGTTACATTTGCTTACAGAGTAATGCAAACGGGTGCTGTTGGACGTCAAGCTGCTCTT GATTGGATTGAAGATAGAGCTGTTAATTCTATAACTGGAATTAATAGTGAAATGTCTCTT AATGGAAGTTTAAGTAGATTATCTAGACTTGGAGGAGCTGCTGGAGGGTTGTCTCACGTC ATTAATTCGACCCGAAACTCTACTTCGAAAATACTTGGATTGTAA >125a44c4-44da-4854-9d3b-ae2aa0221120 (mRNA) 1056 residues [Merlin:2011-3066 - strand] [cds] name=Merlin_4_mRNA-00001 ATGAGCATTAAAGTCAGAGAATTAGATGATAAGACTGATGCTTTAATTAGCGGAGTTAAA ACCTCCGCTGGTCAAAGTTCACAATCAGCAAAAATAAAATCCACTATAACTGCGCAATAT CCGTCTGAACGTTCAGCTGGTAATGACACATCTGGTTCTTTACGAGTTCATGATCTTTAT AAGAACGGGTTGTTGTTCACTGCGTATGATATGAATTCTCGTACAACCGGTGATATGCGT AGCATGCGTTTAGGTGAAATGAAACGTACTGCAAATAGTGTAGTGAAATCAATCACTGGA ACAAATACTAATAAAGTTGATAAAATTCCAGTAGTGAATATTTTACTTCCACGCTCGAAA TCAGATGTTGAATCAGTTTCTCATAAATTTAATGACGTTGGAGATTCACTTATTTCTCGT GGCGGCGGTACTGCTACAGGGGTATTAAGTAACGTTGCATCTACTGCTGTCTTTGGCGGA TTAGAGTCATTGACTCAAGGATTAATGGCTGACCATAACGAGCAGATCTATAACACTGCT CGATCAATGTATGGCGGCGCAGATAACCGTACGAAGGTATTCACGTGGGATTTAACTCCT CGATCAGTACAAGATCTTATTGCTATTATCGAGATCTATGAATACTTTAACTACTATAGT TATGGCGAAACGGGAACGTCTACTTATGCAAAAGAAGTTAAGTCTCAATTAGATGAATGG TATAAATCAACTTTCCTTGATACATTAACTCCAGATGAAGCTAATAAAAATGACACTGTT TTTGAGAAAATAACTTCATTCTTAAGTAATGTTATTGTTGTAAGTAACCCTACTGTGTGG TTCGTCAGAAACTTTGGAACCACAAGTAAATTCGATGGACGTGCTGAAGTATTCGGTCCA TGTCAAATTCAGAGTATCCGTTTTGATAAAACTCCAAATGGAAACTTTAACGGTTTAGCT ATAGCTCCAAACCTGCCAAGTACATTCACATTAGAAATTACTATGCGTGAAATCTTGACA TTGAACCGAGCTTCAGTATATGCGGAAGGATTCTGA >87414073-7db0-4a60-903f-5e3593e55884 (mRNA) 1662 residues [Merlin:3066-4796 - strand] [cds] name=Merlin_5_mRNA-00001 ATGAAAAGCGAAAACATGTCCACAATGAGACGTCGTAAAGTTATCGCTGATTCAAAGGGT GAAAGAGATGCAGCCTCGACTGCATCTGATCAAGTAGACTCTTTAGAATTAATCGGCCTT AAACTTGATGATGTACAAAGCGCTAATGAACTAGTTGCTGAAGTAATTGAAGAAAAGGGC AATAACTTAATTGATTCAGTTGATAACGTCGCTGAAGGTACTGAATTAGCTGCTGAAGCA TCTGAACGAACTACTGAGTCTATCAAGACTCTTACTGGCGTAGCGTCAACAATCAGCGAC AAATTAAGTAAACTCGCTTCGATGCTCGAGTCGAAGGTTCAGGCTGTGGAGCAAAAAGTA CAAGAATCTGGTGCCTCAGCTTCAACTGGGCTGTCAGTGATAGAAGATAAGCTTCCAGAT CCTGATGAGCCTTTCTTTCCACCTGTCCCTCAGGAACCCGAGAACAACAAGAAAGATCAA AAGAAAGATGATAAGAAACCTACCGATATGTTAGGTGACTTGCTGAAGACTACGAAGGGC GGATTTAAAGCTACGATATCAATCACTGATAAAATATCGTCTATGCTTTTCAAATACACC GTAACAGCATTAGCTGAAGCTGCTAAAATGGCTGCTATGCTATTTGCATTAGTATTAGGC ATAGATTTACTTCGTATTCATTTTAAGTATTGGACTGATAAATTCATGAGTAACTTCGAT GAATTCAGTGCTGAAGCTGGTGAATGGGGTGGACTGCTTCAATCAATTTTTGGAATGTTA GGAGATATTAAAAAGTTCTGGGAAGCTGGAGACTGGAGTGGATTAGCAGTAGCTATTGTC AAAGGATTAGCTGATGTGATTTACAACCTGAGCGAAATAATGTCTTTGGGAATTTCAAAG ATATCTGCTTCTATACTCGATGCACTTGGCTTTGAAAATGCAGCAACTACTATTCGTGGT TCAGCACTAGAAGGATTCCAGGAACGCACTGGTAATTCATTGTCTGAAGATGATCAAAAA GCTTTGGCTAAATATCAGAGTAAGCGTATTGAAGAAGGTCCTGGAATTATTGATAAAGCT GGCGAATTTAAAACTCGTGCATTTGATTGGGTACTAGGAAGAGAGAATAAAATCGATTCT ACACAAGCATCTGACCGTGATCAAGAGACTCAGAATCTTAAAGCAATGGCTCCTGAAAAA CGCGAAGAAACACTGATCAAACAAAACGAAGCTCGTGCAGCTGTTCAGCGTTTAGAAAAA TATATTGGTGATGTTGATCCAGAGAATCCAACTAATATGCAATCTTTAGAGAAGGCATAT AACAGTGCCAAAAAGTCTATTAGTGATTCTGCTATAAGTGATCAACCAGCTACTAAAAAG GAACTCGATAAAAGATTCCAACGAGTAGAATCCAAGTATCAGAAGCTCAAAGAAGATAAC ACTCCGAAGCCTGCGGCTCCAGCTACTTCGGAAGATAATCAACGAGTTCAAAATATTCAA AAAGCTGAAAATGCTAAAGAGCAATCTAAAAAATCAACCGGTGATATGAATGTTGCTAAC ACTCAGGTTAATAACGTAAATAATAGTAAGACTATTCACCAGGTTCAAACAGTCACGGCT ACTCCAGCTCCTGGAGTATTCGGGGCAACAGGAGTTAATTAA >1dcb3fc3-3307-4476-9c8a-04d252f9371f (mRNA) 777 residues [Merlin:5011-6066 - strand] [cds] name=Merlin_42_mRNA-00001 TTTAATGACGCTGGTGAATCAATAAAAGAGATGATCGGTGCAATTTATGAATCAAAACCT CTTATAGCACCTGCGATGAACACAATCAACACATATGTTCCTCGAGTTCCATGGACGAGT AACATAACTGAATACAAGAAATATGTTCGAGATGTTGCATTAGCAGTAGATAATGACCAA TTCGTTTTTGTATGGGAAGATATCTATGGCTTGAACATGATGGATTATGACGCAATGATT AACCAAGAATCAATCAAGGTTATTGTCGGTGAACCACGCACAATAGGTCAATTTGTCGGT GAGCTGGAATATAATCTCGCTTATGACTTCCAGTGGTTAACGAAGGCTAATGCCCATACA CGCGATCCTATTTTTAACGCTACAATCTATTCACACTCATTCTTGGATAATAACCTTCCT AGAATAGTAACAGGTGATGGACAGAATAGCATCTTCGTTTCTCGCTCGGGTGCATATTCT GAAATGACTTATCGAAATGGATATGAAGAAGCTATCAGGCTTCAGACTATGGCACAATAC GACGGTTATGCAACTTGTAAAATGGTTGGAGACTTTGAAATGACTCCTGGAGATAAGATT AATTTCTTTGATCCAAAGAAACAATTCAAAGCTGATTTTTACATTGATGAAGTAATTCAT GAAGTAAGTAATAACCAAAGCATAACTACACTTTATATGTTTACTAACTCTCGTAAGTTG GAAACAGTAGAACCAATAAAGGTTAAAAATGAACTTAAATCTGATACTACCACTTAA