Mercurial > repos > greg > vsnp_add_zero_coverage
comparison test-data/NC_002945v4.fasta @ 5:6ffab0b0940a draft
Uploaded
author | greg |
---|---|
date | Wed, 16 Jun 2021 17:41:24 +0000 |
parents | 4ebdeb4df6ca |
children |
comparison
equal
deleted
inserted
replaced
4:04aded03ab74 | 5:6ffab0b0940a |
---|---|
1 >NC_002945.4 Mycobacterium bovis AF2122/97 genome assembly, chromosome: Mycobacterium_bovis_AF2122/97 | |
2 TTGACCGATGACCCCGGTTCAGGCTTCACCACAGTGTGGAACGCGGTCGTCTCCGAACTTAACGGCGACC | |
3 CTAAGGTTGACGACGGACCCAGCAGTGATGCTAATCTCAGCGCTCCGCTGACCCCTCAGCAAAGGGCTTG | |
4 GCTCAATCTCGTCCAGCCATTGACCATCGTCGAGGGGTTTGCTCTGTTATCCGTGCCGAGCAGCTTTGTC | |
5 CAAAACGAAATCGAGCGCCATCTGCGGGCCCCGATTACCGACGCTCTCAGCCGCCGACTCGGACATCAGA | |
6 TCCAACTCGGGGTCCGCATCGCTCCGCCGGCGACCGACGAAGCCGACGACACTACCGTGCCGCCTTCCGA | |
7 AAATCCTGCTACCACATCGCCAGACACCACAACCGACAACGACGAGATTGATGACAGCGCTGCGGCACGG | |
8 GGCGATAACCAGCACAGTTGGCCAAGTTACTTCACCGAGCGCCCGCGCAATACCGATTCCGCTACCGCTG | |
9 GCGTAACCAGCCTTAACCGTCGCTACACCTTTGATACGTTCGTTATCGGCGCCTCCAACCGGTTCGCGCA | |
10 CGCCGCCGCCTTGGCGATCGCAGAAGCACCCGCCCGCGCTTACAACCCCCTGTTCATCTGGGGCGAGTCC | |
11 GGTCTCGGCAAGACACACCTGCTACACGCGGCAGGCAACTATGCCCAACGGTTGTTCCCGGGAATGCGGG | |
12 TCAAATATGTCTCCACCGAGGAATTCACCAACGACTTCATTAACTCGCTCCGCGATGACCGCAAGGTCGC | |
13 ATTCAAACGCAGCTACCGCGACGTAGACGTGCTGTTGGTCGACGACATCCAATTCATTGAAGGCAAAGAG | |
14 GGTATTCAAGAGGAGTTCTTCCACACCTTCAACACCTTGCACAATGCCAACAAGCAAATCGTCATCTCAT | |
15 CTGACCGCCCACCCAAGCAGCTCGCCACCCTCGAGGACCGGCTGAGAACCCGCTTTGAGTGGGGGCTGAT | |
16 CACTGACGTACAACCACCCGAGCTGGAGACCCGCATCGCCATCTTGCGCAAGAAAGCACAGATGGAACGG | |
17 CTCGCGATCCCCGACGATGTCCTCGAACTCATCGCCAGCAGTATCGAACGCAATATCCGTGAACTCGAGG | |
18 GCGCGCTGATCCGGGTCACCGCGTTCGCCTCATTGAACAAAACACCAATCGACAAAGCGCTGGCCGAGAT | |
19 TGTGCTTCGCGATCTGATCGCCGACGCCAACACCATGCAAATCAGCGCGGCGACGATCATGGCTGCCACC | |
20 GCCGAATACTTCGACACTACCGTCGAAGAGCTTCGCGGGCCCGGCAAGACCCGAGCACTGGCCCAGTCAC | |
21 GACAGATTGCGATGTACCTGTGTCGTGAGCTCACCGATCTTTCGTTGCCCAAAATCGGCCAAGCGTTCGG | |
22 CCGTGATCACACAACCGTCATGTACGCCCAACGCAAGATCCTGTCCGAGATGGCCGAGCGCCGTGAGGTC | |
23 TTTGATCACGTCAAAGAACTCACCACTCGCATCCGTCAGCGCTCCAAGCGCTAGCACGGCGTGTTCTTCC | |
24 GACAACGTTCTTAAAAAAACTTCTCTCTCCCAGGTCACACCAGTCACAGAGATTGGCTGTGAGTGTCGCT | |
25 GTGCACAAACCGCGCACAGACTCATACAGTCCCGGCGGTTCCGTTCACAACCCACGCCTCATCCCCACCG | |
26 ACCCAACACACACCCCACAGTCATCGCCACCGTCATCCACAACTCCGACCGACGTCGACCTGCACCAAGA | |
27 CCAGACTGTCCCCAAACTGCACACCCTCTAATACTGTTACCGAGATTTCTTCGTCGTTTGTTCTTGGAAA | |
28 GACAGCGCTGGGGATCGTTCGCTGGATACCACCCGCATAACTGGCTCGTCGCGGTGGGTCAGAGGTCAAT | |
29 GATGAACTTTCAAGTTGACGTGAGAAGCTCTACGGTTGTTGTTCGACTGCTGTTGCGGCCGTCGTGGCGG | |
30 GTCACGCGTCATGGGCGTTCGTCGTTGGCAGTCCCCACGCTAGCGGGGCGCTAGCCACGGGATCGAACTC | |
31 ATCGTGAGGTGAAAGGGCGCAATGGACGCGGCTACGACAAGAGTTGGCCTCACCGACTTGACGTTTCGTT | |
32 TGCTACGAGAGTCTTTCGCCGATGCGGTGTCGTGGGTGGCTAAAAATCTGCCAGCCAGGCCCGCGGTGCC | |
33 GGTGCTCTCCGGCGTGTTGTTGACCGGCTCGGACAACGGTCTGACGATTTCCGGATTCGACTACGAGGTT | |
34 TCCGCCGAGGCCCAGGTTGGCGCTGAAATTGTTTCTCCTGGAAGCGTTTTAGTTTCTGGCCGATTGTTGT | |
35 CCGATATTACCCGGGCGTTGCCTAACAAGCCCGTAGGCGTTCATGTCGAAGGTAACCGGGTCGCATTGAC | |
36 CTGCGGTAACGCCAGGTTTTCGCTACCGACGATGCCAGTCGAGGATTATCCGACGCTGCCGACGCTGCCG | |
37 GAAGAGACCGGATTGTTGCCTGCGGAATTATTCGCCGAGGCAATCAGTCAGGTCGCTATCGCCGCCGGCC | |
38 GGGACGACACGCTGCCTATGTTGACCGGCATCCGGGTCGAAATCCTCGGTGAGACGGTGGTTTTGGCCGC | |
39 TACCGACAGGTTTCGCCTGGCTGTTCGAGAACTGAAGTGGTCGGCGTCGTCGCCAGATATCGAAGCGGCT | |
40 GTGCTGGTCCCGGCCAAGACGCTGGCCGAGGCCGCCAAAGCGGGCATCGGCGGCTCTGACGTTCGTTTGT | |
41 CGTTGGGTACTGGGCCGGGGGTGGGCAAGGATGGCCTGCTCGGTATCAGTGGGAACGGCAAGCGCAGCAC | |
42 CACGCGACTTCTTGATGCCGAGTTCCCGAAGTTTCGGCAGTTGCTACCAACCGAACACACCGCGGTGGCC | |
43 ACCATGGACGTGGCCGAGTTGATCGAAGCGATCAAGCTGGTTGCGTTGGTAGCTGATCGGGGCGCGCAGG | |
44 TGCGCATGGAGTTCGCTGATGGCAGCGTGCGGCTTTCTGCGGGTGCCGATGATGTTGGACGAGCCGAGGA | |
45 AGATCTTGTTGTTGACTATGCCGGTGAACCATTGACGATTGCGTTTAACCCAACCTATCTAACGGACGGT | |
46 TTGAGTTCGTTGCGCTCGGAGCGAGTGTCTTTCGGGTTTACGACTGCGGGTAAGCCTGCCTTGCTACGTC | |
47 CGGTGTCCGGGGACGATCGCCCTGTGGCGGGTCTGAATGGCAACGGTCCGTTCCCGGCGGTGTCGACGGA | |
48 CTATGTCTATCTGTTGATGCCGGTTCGGTTGCCGGGCTGAGCACTTGGCGCCCGGGTAGGTGTACGTCCG | |
49 TCATTTGGGGCTGCGTGACTTCCGGTCCTGGGCATGTGTAGATCTGGAATTGCATCCAGGGCGGACGGTT | |
50 TTTGTTGGGCCTAACGGTTATGGTAAGACGAATCTTATTGAGGCACTGTGGTATTCGACGACGTTAGGTT | |
51 CGCACCGCGTTAGCGCCGATTTGCCGTTGATCCGGGTAGGTACCGATCGTGCGGTGATCTCCACGATCGT | |
52 GGTGAACGACGGTAGAGAATGTGCCGTCGACCTCGAGATCGCCACGGGGCGAGTCAACAAAGCGCGATTG | |
53 AATCGATCATCGGTCCGAAGTACACGTGATGTGGTCGGAGTGCTTCGAGCTGTGTTGTTTGCCCCTGAGG | |
54 ATCTGGGGTTGGTTCGTGGGGATCCCGCTGACCGGCGGCGCTATCTGGATGATCTGGCGATCGTGCGTAG | |
55 GCCTGCGATCGCTGCGGTACGAGCCGAATATGAGAGGGTGGTGCGCCAGCGGACGGCGTTATTGAAGTCC | |
56 GTACCTGGAGCACGGTATCGGGGTGACCGGGGTGTGTTTGACACTCTTGAGGTATGGGACAGTCGTTTGG | |
57 CGGAGCACGGGGCTGAACTGGTGGCCGCCCGCATCGATTTGGTCAACCAGTTGGCACCGGAAGTGAAGAA | |
58 GGCATACCAGCTGTTGGCGCCGGAATCGCGATCGGCGTCTATCGGTTATCGGGCCAGCATGGATGTAACC | |
59 GGTCCCAGCGAGCAGTCAGATACCGATCGGCAATTGTTAGCAGCTCGGCTGTTGGCGGCGCTGGCGGCCC | |
60 GTCGGGATGCCGAACTCGAGCGTGGGGTTTGTCTAGTTGGTCCGCACCGTGACGACCTAATACTGCGACT | |
61 AGGCGATCAACCCGCGAAAGGATTTGCTAGCCATGGGGAGGCGTGGTCGTTGGCGGTGGCACTGCGGTTG | |
62 GCGGCCTATCAACTGTTACGCGTTGATGGTGGTGAGCCGGTGTTGTTGCTCGACGACGTGTTCGCCGAAC | |
63 TGGATGTCATGCGCCGTCGAGCGTTGGCGACGGCGGCCGAGTCCGCCGAACAGGTGTTGGTGACTGCCGC | |
64 GGTGCTCGAGGATATTCCCGCCGGCTGGGACGCCAGGCGGGTGCACATCGATGTGCGTGCCGATGACACC | |
65 GGATCGATGTCGGTGGTTCTGCCATGACGGGTTCTGTTGACCGGCCCGACCAGAATCGCGGTGAGCGATT | |
66 AATGAAGTCACCAGGGTTGGATTTGGTCAGGCGCACCCTGGACGAAGCTCGTGCTGCTGCCCGCGCGCGC | |
67 GGACAAGACGCCGGTCGAGGGCGGGTCGCTTCCGTTGCGTCGGGTCGGGTGGCCGGACGGCGACGAAGCT | |
68 GGTCGGGTCCGGGGCCCGACATTCGTGATCCACAACCGCTGGGTAAGGCCGCTCGTGAGCTGGCAAAGAA | |
69 ACGCGGCTGGTCGGTGCGGGTCGCCGAGGGTATGGTGCTCGGCCAGTGGTCTGCGGTGGTCGGCCACCAG | |
70 ATCGCCGAACATGCACGCCCGACTGCGCTAAACGACGGGGTGTTGAGCGTGATTGCGGAGTCGACGGCGT | |
71 GGGCGACGCAGTTGAGGATCATGCAGGCCCAGCTTCTGGCCAAGATCGCCGCAGCGGTTGGCAACGATGT | |
72 GGTGCGATCGCTAAAGATCACCGGGCCGGCGGCACCATCGTGGCGCAAGGGGCCTCGCCATATTGCCGGT | |
73 AGGGGTCCGCGCGACACCTACGGATAACACGTCGATCGGCCCAGAACAAGGCGCTCCGGTCCCGGCCTGA | |
74 GAGCCTCGAGGACGAAGCGGATCCGTATGCCGGACGTCGGGACGCACCAGGAAGAAAGATGTCCGACGCA | |
75 CGGCGCGGTTAGATGGGTAAAAACGAGGCCAGAAGATCGGCCCTGGCGCCCGATCACGGTACAGTGGTGT | |
76 GCGACCCCCTGCGGCGACTCAACCGCATGCACGCAACCCCTGAGGAGAGTATTCGGATCGTGGCTGCCCA | |
77 GAAAAAGAAGGCCCAAGACGAATACGGCGCTGCGTCTATCACCATTCTCGAAGGGCTGGAGGCCGTCCGC | |
78 AAACGTCCCGGCATGTACATTGGCTCGACCGGTGAGCGCGGTTTACACCATCTCATTTGGGAGGTGGTCG | |
79 ACAACGCGGTCGACGAGGCGATGGCCGGTTATGCAACCACAGTGAACGTAGTGCTGCTTGAGGATGGCGG | |
80 TGTCGAGGTCGCCGACGACGGCCGCGGCATTCCGGTCGCCACCCACGCCTCCGGCATACCGACCGTCGAC | |
81 GTGGTGATGACACAACTACATGCCGGCGGCAAGTTCGACTCGGACGCGTATGCGATATCTGGTGGTCTGC | |
82 ACGGCGTCGGCGTGTCGGTGGTTAACGCGCTATCCACCCGGCTCGAAGTCGAGATCAAGCGCGACGGGTA | |
83 CGAGTGGTCTCAGGTTTATGAGAAGTCGGAACCCCTGGGCCTCAAGCAAGGGGCGCCGACCAAGAAGACG | |
84 GGGTCAACGGTACGGTTCTGGGCCGACCCCGCTGTTTTCGAAACCACGGAATACGACTTCGAAACCGTCG | |
85 CCCGCCGGCTGCAAGAGATGGCGTTCCTCAACAAGGGGCTGACCATCAACCTGACCGACGAGAGGGTGAC | |
86 CCAAGACGAGGTCGTCGACGAAGTGGTCAGCGACGTCGCCGAGGCGCCGAAGTCGGCAAGTGAACGCGCA | |
87 GCCGAATCCACTGCACCGCACAAAGTTAAGAGCCGCACCTTTCACTATCCGGGTGGCCTGGTGGACTTCG | |
88 TGAAACACATCAACCGCACCAAGAACGCGATTCATAGCAGCATCGTGGACTTTTCCGGCAAGGGCACCGG | |
89 GCACGAGGTGGAGATCGCGATGCAATGGAACGCCGGGTATTCGGAGTCGGTGCACACCTTCGCCAACACC | |
90 ATCAACACCCACGAGGGCGGCACCCACGAAGAGGGCTTCCGCAGCGCGCTGACGTCGGTGGTGAACAAGT | |
91 ACGCCAAGGACCGCAAGCTACTGAAGGACAAGGACCCCAACCTCACCGGTGACGATATCCGGGAAGGCCT | |
92 GGCCGCTGTGATCTCGGTGAAGGTCAGCGAACCGCAGTTCGAGGGCCAGACCAAGACCAAGTTGGGCAAC | |
93 ACCGAGGTCAAATCGTTTGTGCAGAAGGTCTGTAATGAACAGCTGACCCACTGGTTTGAAGCCAACCCCA | |
94 CCGACTCGAAAGTCGTTGTGAACAAGGCTGTGTCCTCGGCGCAAGCCCGTATCGCGGCACGTAAGGCACG | |
95 AGAGTTGGTGCGGCGTAAGAGCGCCACCGACATCGGTGGATTGCCCGGCAAGCTGGCCGATTGCCGTTCC | |
96 ACGGATCCGCGCAAGTCCGAACTGTATGTCGTAGAAGGTGACTCGGCCGGCGGTTCTGCAAAAAGCGGTC | |
97 GCGATTCGATGTTCCAGGCGATACTTCCGCTGCGCGGCAAGATCATCAATGTGGAGAAAGCGCGCATCGA | |
98 CCGGGTGCTAAAGAACACCGAAGTTCAGGCGATCATCACGGCGCTGGGCACCGGGATCCACGACGAGTTC | |
99 GATATCGGCAAGCTGCGCTACCACAAGATCGTGCTGATGGCCGACGCCGATGTTGACGGCCAACATATTT | |
100 CCACGCTGTTGTTGACGTTGTTGTTCCGGTTCATGCGGCCGCTCATCGAGAACGGGCATGTGTTTTTGGC | |
101 ACAACCGCCGCTGTACAAACTCAAGTGGCAGCGCAGTGACCCGGAATTCGCATACTCCGACCGCGAGCGC |