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comparison test-data/art.solid.02_F3.map @ 0:b98d6fffd00b draft

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author iuc
date Thu, 11 Jun 2015 11:51:06 -0400
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2 @CM art_SOLiD -s -r 42 test-data/input.fa test-data/art.solid.02 50 50 20 75 10
3 @SQ chr1 1626
4 ##Header End
5 chr1 1_1_1_F3 1525 + 2 32 03 48 01
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7 chr1 1_1_3_F3 807 - 7 28 13 33 03 35 23 38 12 41 13 43 23 45 10
8 chr1 1_1_4_F3 1418 - 4 5 10 12 13 44 21 48 10
9 chr1 1_1_5_F3 652 + 7 4 23 18 32 28 10 37 32 43 02 44 02 48 10
10 chr1 1_1_6_F3 379 + 1 47 32
11 chr1 1_1_7_F3 1504 - 4 7 03 8 01 10 32 32 32
12 chr1 1_1_8_F3 1431 + 4 24 32 34 13 38 13 47 03
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14 chr1 1_1_10_F3 473 + 4 26 03 28 13 31 23 43 23
15 chr1 1_1_11_F3 962 - 4 11 02 35 03 37 01 47 02
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20 chr1 1_1_16_F3 1099 - 1 44 32
21 chr1 1_1_17_F3 884 - 2 30 30 49 03
22 chr1 1_1_18_F3 149 + 2 8 32 38 32
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25 chr1 1_1_21_F3 1202 - 2 5 03 19 13
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29 chr1 1_1_25_F3 565 + 2 8 01 43 13
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32 chr1 1_1_28_F3 1210 - 4 19 03 27 03 39 32 47 13
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36 chr1 1_1_32_F3 240 + 2 28 03 38 02
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39 chr1 1_1_35_F3 1264 - 5 20 32 32 23 37 03 42 13 47 03
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41 chr1 1_1_37_F3 1379 + 0
42 chr1 1_1_38_F3 954 - 2 45 03 47 03
43 chr1 1_1_39_F3 348 - 5 35 03 42 03 46 13 47 32 48 13
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211 chr1 1_1_207_F3 668 + 3 20 13 27 03 43 21
212 chr1 1_1_208_F3 976 - 5 31 30 33 03 46 12 47 13 48 13
213 chr1 1_1_209_F3 944 - 1 11 10
214 chr1 1_1_210_F3 231 + 2 2 03 34 21
215 chr1 1_1_211_F3 317 - 1 37 03
216 chr1 1_1_212_F3 455 + 2 19 10 39 32
217 chr1 1_1_213_F3 115 - 1 34 32
218 chr1 1_1_214_F3 776 + 4 17 03 18 32 35 03 38 02
219 chr1 1_1_215_F3 350 + 1 43 13
220 chr1 1_1_216_F3 918 + 1 18 13
221 chr1 1_1_217_F3 180 + 3 8 30 17 10 38 30
222 chr1 1_1_218_F3 808 - 0
223 chr1 1_1_219_F3 99 + 1 43 03
224 chr1 1_1_220_F3 1467 + 2 27 03 48 10
225 chr1 1_1_221_F3 1305 + 2 33 30 46 13
226 chr1 1_1_222_F3 956 + 0
227 chr1 1_1_223_F3 693 + 3 7 13 17 30 42 03
228 chr1 1_1_224_F3 309 - 2 43 13 47 30
229 chr1 1_1_225_F3 220 - 4 37 03 38 03 42 03 47 10
230 chr1 1_1_226_F3 279 - 4 37 03 46 32 47 30 48 10
231 chr1 1_1_227_F3 1381 + 1 32 10
232 chr1 1_1_228_F3 1099 + 2 19 03 23 32
233 chr1 1_1_229_F3 354 + 1 30 01
234 chr1 1_1_230_F3 1502 + 1 24 03
235 chr1 1_1_231_F3 1541 - 1 17 03
236 chr1 1_1_232_F3 1301 - 1 43 02
237 chr1 1_1_233_F3 1153 + 1 36 03
238 chr1 1_1_234_F3 855 + 0
239 chr1 1_1_235_F3 961 + 5 1 13 18 02 37 02 44 02 47 32
240 chr1 1_1_236_F3 853 + 2 43 10 47 30
241 chr1 1_1_237_F3 314 + 1 38 30
242 chr1 1_1_238_F3 56 + 2 13 23 44 02
243 chr1 1_1_239_F3 1231 - 6 5 03 17 03 29 02 37 03 38 13 48 32
244 chr1 1_1_240_F3 636 - 1 27 13
245 chr1 1_1_241_F3 103 + 4 19 30 27 03 30 20 44 03
246 chr1 1_1_242_F3 1069 - 2 27 10 48 03
247 chr1 1_1_243_F3 511 + 0
248 chr1 1_1_244_F3 453 - 2 15 32 43 12
249 chr1 1_1_245_F3 960 + 2 6 32 43 03
250 chr1 1_1_246_F3 1332 - 2 18 32 40 01
251 chr1 1_1_247_F3 444 - 0
252 chr1 1_1_248_F3 1396 + 2 17 13 40 32
253 chr1 1_1_249_F3 607 + 2 3 32 38 13
254 chr1 1_1_250_F3 911 + 3 9 20 27 13 44 30
255 chr1 1_1_251_F3 548 - 2 29 13 48 31
256 chr1 1_1_252_F3 1318 + 2 1 32 34 30
257 chr1 1_1_253_F3 475 + 2 18 10 47 21
258 chr1 1_1_254_F3 212 + 3 8 03 24 30 47 01
259 chr1 1_1_255_F3 333 - 2 6 03 48 21
260 chr1 1_1_256_F3 1275 - 3 28 03 32 13 39 13
261 chr1 1_1_257_F3 347 - 3 16 23 37 31 43 03
262 chr1 1_1_258_F3 1508 - 3 34 03 40 32 44 02
263 chr1 1_1_259_F3 1154 + 4 0 10 28 32 40 03 43 01
264 chr1 1_1_260_F3 473 - 2 8 13 39 32
265 chr1 1_1_261_F3 66 - 2 34 01 45 13
266 chr1 1_1_262_F3 40 + 3 34 03 41 31 48 23
267 chr1 1_1_263_F3 1271 + 5 5 30 27 23 37 13 47 02 48 32
268 chr1 1_1_264_F3 506 - 1 8 12
269 chr1 1_1_265_F3 1037 - 0
270 chr1 1_1_266_F3 1356 - 1 7 13
271 chr1 1_1_267_F3 122 + 0
272 chr1 1_1_268_F3 1230 + 2 38 13 43 32
273 chr1 1_1_269_F3 628 + 2 7 03 38 03
274 chr1 1_1_270_F3 509 - 1 47 31
275 chr1 1_1_271_F3 102 + 3 22 03 36 20 43 23
276 chr1 1_1_272_F3 350 - 2 44 13 49 32
277 chr1 1_1_273_F3 1297 + 4 11 10 31 13 43 13 48 10
278 chr1 1_1_274_F3 769 + 2 1 03 37 32
279 chr1 1_1_275_F3 538 - 0
280 chr1 1_1_276_F3 1043 - 3 2 03 7 10 43 12
281 chr1 1_1_277_F3 611 - 0
282 chr1 1_1_278_F3 690 + 1 26 03
283 chr1 1_1_279_F3 1406 - 1 19 30
284 chr1 1_1_280_F3 555 - 5 8 23 19 02 24 21 28 21 38 21
285 chr1 1_1_281_F3 167 - 4 0 30 18 13 20 03 35 03
286 chr1 1_1_282_F3 364 - 2 7 03 48 12
287 chr1 1_1_283_F3 980 + 1 43 23
288 chr1 1_1_284_F3 204 - 0
289 chr1 1_1_285_F3 1144 + 2 13 03 39 03
290 chr1 1_1_286_F3 64 + 1 43 23
291 chr1 1_1_287_F3 1071 - 3 11 03 38 13 48 13
292 chr1 1_1_288_F3 304 - 3 39 03 47 02 48 13
293 chr1 1_1_289_F3 1050 - 6 3 03 10 30 25 03 35 23 47 23 48 02
294 chr1 1_1_290_F3 1142 + 3 1 03 24 03 43 03
295 chr1 1_1_291_F3 251 - 3 2 03 30 13 33 32
296 chr1 1_1_292_F3 828 - 3 16 31 23 03 28 03
297 chr1 1_1_293_F3 1327 - 2 38 03 49 23
298 chr1 1_1_294_F3 906 + 4 2 23 10 02 37 10 47 01
299 chr1 1_1_295_F3 1515 - 3 40 03 44 23 47 20
300 chr1 1_1_296_F3 1241 + 3 8 30 10 32 20 03
301 chr1 1_1_297_F3 1520 - 1 28 32
302 chr1 1_1_298_F3 1028 + 2 27 03 42 32
303 chr1 1_1_299_F3 1403 - 2 31 23 46 13
304 chr1 1_1_300_F3 1225 - 0
305 chr1 1_1_301_F3 584 - 2 43 13 48 20
306 chr1 1_1_302_F3 942 - 1 44 03
307 chr1 1_1_303_F3 876 - 0
308 chr1 1_1_304_F3 331 + 3 25 10 33 23 37 32
309 chr1 1_1_305_F3 912 - 1 24 10
310 chr1 1_1_306_F3 517 - 5 25 32 29 23 33 03 39 30 44 32
311 chr1 1_1_307_F3 1349 - 1 44 03
312 chr1 1_1_308_F3 759 - 2 8 03 29 13
313 chr1 1_1_309_F3 1437 + 2 41 03 47 32
314 chr1 1_1_310_F3 347 + 0
315 chr1 1_1_311_F3 684 - 2 33 32 47 03
316 chr1 1_1_312_F3 371 + 1 43 31
317 chr1 1_1_313_F3 507 + 2 19 21 43 01
318 chr1 1_1_314_F3 573 + 4 12 32 17 23 22 03 41 13
319 chr1 1_1_315_F3 255 - 3 17 03 45 01 48 20
320 chr1 1_1_316_F3 1259 + 3 9 12 31 03 32 12
321 chr1 1_1_317_F3 391 - 1 47 03
322 chr1 1_1_318_F3 532 + 3 7 31 18 02 47 01
323 chr1 1_1_319_F3 1160 + 3 0 10 27 32 30 01
324 chr1 1_1_320_F3 1552 + 1 7 03