Mercurial > repos > iuc > bcftools_call
directory /test-data/ @ 21:1001172b5089 draft
| name | size | permissions |
|---|---|---|
| [up] | drwxr-xr-x | |
 test-cache/
|
drwxr-xr-x | |
 23andme.fa
|
287 | -rw-r--r-- |
|
annotate.hdr
|
259 | -rw-r--r-- |
|
annotate.tab
|
700 | -rw-r--r-- |
|
annotate.vcf
|
2649 | -rw-r--r-- |
|
annotate2.tab
|
82 | -rw-r--r-- |
|
annotate2.vcf
|
1115 | -rw-r--r-- |
|
annotate3.vcf
|
1181 | -rw-r--r-- |
|
annots.bcf
|
1254 | -rw-r--r-- |
|
annots.vcf
|
2646 | -rw-r--r-- |
|
annots2.vcf
|
1154 | -rw-r--r-- |
|
check.vcf
|
2692 | -rw-r--r-- |
|
cnv.vcf
|
16703 | -rw-r--r-- |
|
cnv_baf_only.vcf
|
9148 | -rw-r--r-- |
|
cnv_pairwise_summary.tab
|
198 | -rw-r--r-- |
|
cnv_summary.tab
|
182 | -rw-r--r-- |
|
color_chrs.dat
|
210 | -rw-r--r-- |
|
color_chrs_unrelated.dat
|
213 | -rw-r--r-- |
|
concat.1.a.vcf
|
1774 | -rw-r--r-- |
|
concat.1.b.vcf
|
1136 | -rw-r--r-- |
|
concat.2.a.vcf
|
743 | -rw-r--r-- |
|
concat.2.b.vcf
|
1194 | -rw-r--r-- |
|
consensus.fa
|
1031 | -rw-r--r-- |
|
consensus.tab
|
31 | -rw-r--r-- |
|
consensus.vcf
|
660 | -rw-r--r-- |
|
convert.23andme
|
440 | -rw-r--r-- |
|
convert.gs.gt.gen
|
3236 | -rw-r--r-- |
|
convert.gs.gt.samples
|
204 | -rw-r--r-- |
|
convert.gvcf.vcf
|
9300 | -rw-r--r-- |
|
convert.hls.gt.hap
|
1402 | -rw-r--r-- |
|
convert.hls.gt.legend
|
986 | -rw-r--r-- |
|
convert.hls.gt.samples
|
288 | -rw-r--r-- |
|
convert.hs.gt.hap
|
2893 | -rw-r--r-- |
|
convert.hs.gt.samples
|
204 | -rw-r--r-- |
|
convert.vcf
|
7966 | -rw-r--r-- |
|
csq.fa
|
1840 | -rw-r--r-- |
|
csq.gff3
|
2529 | -rw-r--r-- |
|
csq.vcf
|
3316 | -rw-r--r-- |
|
fasta_indexes.loc
|
324 | -rw-r--r-- |
|
filter.1.vcf
|
2308 | -rw-r--r-- |
|
filter.2.vcf
|
2472 | -rw-r--r-- |
|
filter.3.vcf
|
3676 | -rw-r--r-- |
|
fixploidy.ploidy
|
198 | -rw-r--r-- |
|
fixploidy.samples
|
12 | -rw-r--r-- |
|
fixploidy.vcf
|
1131 | -rw-r--r-- |
|
gvcf.fa
|
472 | -rw-r--r-- |
|
isec.a.vcf
|
1731 | -rw-r--r-- |
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isec.b.vcf
|
1797 | -rw-r--r-- |
|
merge.2.a.vcf
|
1933 | -rw-r--r-- |
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merge.2.b.vcf
|
1934 | -rw-r--r-- |
|
merge.3.a.vcf
|
1667 | -rw-r--r-- |
|
merge.3.b.vcf
|
1672 | -rw-r--r-- |
|
merge.4.a.vcf
|
2269 | -rw-r--r-- |
|
merge.4.b.vcf
|
2228 | -rw-r--r-- |
|
merge.a.vcf
|
2491 | -rw-r--r-- |
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merge.b.vcf
|
3272 | -rw-r--r-- |
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merge.c.vcf
|
3212 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.1.bam
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67789 | -rw-r--r-- |
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mpileup.1.bam.bai
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96 | -rw-r--r-- |
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mpileup.2.bam
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27928 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.2.bam.bai
|
96 | -rw-r--r-- |
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mpileup.3.bam
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27569 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.3.bam.bai
|
96 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.3.cram
|
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mpileup.AD.vcf
|
1001357 | -rw-r--r-- |
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mpileup.X.vcf
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643355 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.ploidy
|
49 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.ref.fa
|
4284 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.samples
|
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|
mpileup.vcf
|
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|
norm.fa
|
1167 | -rw-r--r-- |
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norm.merge.vcf
|
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norm.setref.vcf
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norm.split.vcf
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norm.vcf
|
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plugin1.vcf
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plugin2.vcf
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5940 | -rw-r--r-- |
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plugin_frameshifts.bed
|
18 | -rw-r--r-- |
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query.out
|
536 | -rw-r--r-- |
|
query.vcf
|
2312 | -rw-r--r-- |
|
reheader.hdr
|
1008 | -rw-r--r-- |
|
reheader.samples
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8 | -rw-r--r-- |
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reheader.samples2
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24 | -rw-r--r-- |
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reheader.vcf
|
3917 | -rw-r--r-- |
|
roh.vcf
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298067 | -rw-r--r-- |
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stats.a.vcf
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379 | -rw-r--r-- |
|
stats.b.vcf
|
379 | -rw-r--r-- |
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summary.pdf
|
65152 | -rw-r--r-- |
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view.GL.vcf
|
1959 | -rw-r--r-- |
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view.bcf
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2384 | -rw-r--r-- |
|
view.vcf
|
5506 | -rw-r--r-- |