Mercurial > repos > iuc > cnvkit_segment
directory /test-data/ @ 3:33be231ce128 draft default tip
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|---|---|---|
| [up] | drwxr-xr-x | |
 access-excludes.bed
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capture.antitarget.bed
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capture.bed
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excludes.bed
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excludes_1.bed
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fasta_indexes.loc
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1157 | -rw-r--r-- |
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gene-breaks.txt
|
57 | -rw-r--r-- |
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gene-sex.txt
|
59 | -rw-r--r-- |
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gene_genemetrics.txt
|
31 | -rw-r--r-- |
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gene_segmetrics.cns
|
106 | -rw-r--r-- |
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genome.fasta
|
16909 | -rw-r--r-- |
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genome.fasta.fai
|
19 | -rw-r--r-- |
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multible_capture.antitarget.bed
|
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31 | -rw-r--r-- |
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normal.bam
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normal.targetcoverage.cnn
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ref-tas.cnn
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reference.cnn
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3226 | -rw-r--r-- |
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reference.cnn.2
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2556 | -rw-r--r-- |
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reference.target-tmp.bed
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1081 | -rw-r--r-- |
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sample-diagram.pdf
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6747 | -rw-r--r-- |
 sample-heatmap.png
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11753 | -rw-r--r-- |
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sample-scatter.pdf
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10490 | -rw-r--r-- |
 sample-scatter.png
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12015 | -rw-r--r-- |
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sample.cnr
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2399 | -rw-r--r-- |
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sample.cns
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94 | -rw-r--r-- |
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test.targetcoverage.cnn
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tumor-diagram.pdf
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6757 | -rw-r--r-- |
 tumor-heatmap.png
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8239 | -rw-r--r-- |
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tumor-scatter.pdf
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10661 | -rw-r--r-- |
 tumor-scatter.png
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13642 | -rw-r--r-- |
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tumor.antitargetcoverage.cnn
|
31 | -rw-r--r-- |
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tumor.bam
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52884 | -rw-r--r-- |
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tumor.bam.bai
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tumor.bintest.cns
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tumor.cnr
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tumor.cns
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tumor.targetcoverage.cnn
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2092 | -rw-r--r-- |
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tumor_1.bam
|
52884 | -rw-r--r-- |