--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/count/qcheck/matrix.counts.matrix	Fri Nov 18 06:07:54 2016 -0500
@@ -0,0 +1,41 @@
+	wt_37_2	wt_37_3	wt_37_1	wt_GSNO_3	wt_GSNO_1	wt_GSNO_2	wt_ph8_3	wt_ph8_1	wt_ph8_2
+TR24|c0_g1_i1	90.00	67.00	85.00	36.00	35.00	34.00	222.00	196.00	201.00
+TR2779|c0_g1_i1	186.00	137.00	217.00	147.00	186.00	197.00	1088.00	1094.00	1086.00
+TR127|c1_g1_i1	9.00	23.00	16.00	2.00	0.00	1.00	3.00	1.00	1.00
+TR2107|c1_g1_i1	59.00	65.00	47.00	6.00	6.00	7.00	3.00	1.00	2.00
+TR2011|c5_g1_i1	11.00	4.00	4.00	8.00	5.00	7.00	3.00	4.00	8.00
+TR4163|c0_g1_i1	368.00	422.00	425.00	172.00	216.00	210.00	234.00	254.00	212.00
+TR5055|c0_g2_i1	36.00	17.00	27.00	4.00	7.00	3.00	4.00	4.00	11.00
+TR1449|c0_g1_i1	196.00	230.00	207.00	66.00	113.00	91.00	124.00	130.00	107.00
+TR1982|c2_g1_i1	7.00	7.00	6.00	4.00	3.00	8.00	16.00	9.00	11.00
+TR1859|c3_g1_i1	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	1.00	2.00	4.00
+TR1492|c0_g1_i2	1895.00	1906.00	1921.00	1104.00	1263.00	1319.00	899.00	929.00	922.00
+TR1122|c0_g1_i1	2.00	3.00	0.00	3.00	0.00	0.00	1.00	1.00	0.00
+TR2278|c0_g1_i1	497.00	610.00	598.00	333.00	406.00	413.00	323.00	409.00	337.00
+TR4084|c0_g1_i1	95.00	148.00	86.00	77.00	111.00	127.00	175.00	201.00	158.00
+TR4761|c0_g1_i1	2089.00	1746.00	1875.00	155.00	174.00	165.00	394.00	389.00	406.00
+TR3638|c0_g1_i1	647.00	676.00	712.00	117.00	184.00	174.00	324.00	344.00	338.00
+TR2090|c0_g1_i1	0.00	0.00	0.00	22.00	0.00	0.02	10.33	0.00	9.09
+TR3854|c0_g1_i1	1878.00	1734.00	1864.00	1775.00	2173.00	2151.00	2216.00	2142.00	2155.00
+TR131|c0_g1_i1	32.00	28.00	31.00	1001.00	1233.00	1208.00	1486.00	1492.00	1457.00
+TR5075|c0_g1_i1	13.00	22.00	21.00	6.00	8.00	10.00	163.00	121.00	142.00
+TR2182|c3_g2_i6	1.44	2.70	3.84	3.35	0.00	0.00	1.22	2.18	2.63
+TR3788|c0_g1_i1	17.00	30.00	22.00	91.00	132.00	125.00	32.00	22.00	27.00
+TR4859|c0_g1_i1	6.00	12.00	8.00	4.00	1.00	3.00	1.00	1.00	2.00
+TR2487|c0_g1_i1	386.00	383.00	424.00	689.00	866.00	806.00	963.00	989.00	1032.00
+TR2122|c0_g2_i2	145.00	135.00	136.00	155.00	157.00	201.00	369.00	398.00	344.00
+TR4277|c0_g1_i1	4466.00	4701.00	4284.00	118.00	134.00	164.00	172.00	162.00	170.00
+TR4669|c0_g2_i1	0.00	0.00	0.00	209.00	0.00	217.50	0.14	0.06	0.18
+TR3091|c0_g1_i1	22.00	17.00	19.00	250.00	308.00	284.00	333.00	343.00	316.00
+TR2130|c1_g3_i1	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
+TR3807|c0_g1_i1	6.00	4.00	2.00	0.00	0.00	1.00	0.00	1.00	0.00
+TR1894|c2_g1_i1	21.00	14.00	11.00	1.00	2.00	5.00	1.00	3.00	1.00
+TR5212|c0_g1_i1	64.00	89.00	78.00	73.00	98.00	108.00	103.00	105.00	84.00
+TR939|c0_g1_i1	96.00	99.00	99.00	72.00	89.00	88.00	107.00	103.00	108.00
+TR1891|c0_g1_i1	115.00	137.96	124.00	96.53	139.00	110.94	364.77	411.00	384.00
+TR2672|c0_g1_i1	14.00	29.00	22.00	0.00	4.00	2.00	14.00	4.00	7.00
+TR2844|c0_g1_i1	166.00	211.00	178.00	161.00	214.00	223.00	199.00	245.00	213.00
+TR1837|c2_g1_i1	1.00	0.00	0.00	1.00	1.00	4.00	0.00	3.00	2.00
+TR1678|c0_g1_i1	1.00	0.00	1.00	0.00	0.00	2.00	8.00	10.00	6.00
+TR3249|c0_g1_i1	1.00	2.00	1.00	4.00	1.00	0.00	6.00	1.00	7.00
+TR1479|c0_g1_i1	136.00	178.00	141.00	277.00	324.00	354.00	367.00	363.00	302.00