Mercurial > repos > iuc > funannotate_annotate
diff test-data/funannotate_db/trained_species/fly/augustus/fly_utr_probs.pbl @ 0:a5baa4ff168d draft
"planemo upload commit 87560553f1dbbd3e0ab7d7157fa5a7f32f61dca1"
author | iuc |
---|---|
date | Mon, 04 Oct 2021 19:39:38 +0000 |
parents | |
children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/funannotate_db/trained_species/fly/augustus/fly_utr_probs.pbl Mon Oct 04 19:39:38 2021 +0000 @@ -0,0 +1,7137 @@ +# UTR model parameters +# begin of content independent part + +# Length distributions +[UTRLENGTH] +# maximal individually stored length probability d= +800 +# slope of smoothing bandwidth = +0.25 +# smoothing minwindowcount = +1 +# length 5' sing 5' init 5' int 5' term 3' sing 3' init 3' int 3' term +# total number of exons of above types + 6188 1995 342 1995 7966 178 69 178 +# number of exons exceeding length d=800 + 81 32 6 27 823 7 7 48 +# 1000 P(len=k), k=0,1,..., 800 +0 0.681 5.07e-15 4.35e-06 4.62 0.00284 5.75 3.2e-18 0 +1 1.82 9.16e-12 0.000391 10.5 0.0358 10.4 1.04e-17 0 +2 2.76 6.1e-09 0.013 13 0.178 8.35 3.54e-17 0 +3 3.13 1.49e-06 0.158 12.5 0.405 6.03 1.32e-16 0 +4 3.51 0.000135 0.708 12.6 0.599 9.23 5.19e-16 2.83e-20 +5 3.55 0.00451 1.17 13.8 0.682 15.3 2.13e-15 2.89e-18 +6 2.95 0.0564 0.708 15 0.512 20.4 8.93e-15 2.29e-16 +7 2.5 0.272 0.158 15.4 0.296 18.5 3.83e-14 1.42e-14 +8 2.56 0.548 0.013 15.3 0.27 12.9 1.67e-13 6.84e-13 +9 3.12 0.566 0.000391 14.5 0.332 11.6 7.41e-13 2.57e-11 +10 3.83 0.407 4.35e-06 13.6 0.267 11.3 3.35e-12 7.5e-10 +11 4.27 0.328 1.78e-08 12.2 0.252 7.9 1.54e-11 1.71e-08 +12 4.37 0.472 5.42e-11 9.93 0.347 6.71 7.12e-11 3.03e-07 +13 4.42 0.528 8.34e-10 8.9 0.549 8.5 3.31e-10 4.18e-06 +14 4.28 0.326 3.63e-08 9.1 0.796 6.71 1.53e-09 4.49e-05 +15 4.04 0.333 4.68e-06 9.88 0.875 4.29 7.03e-09 0.000376 +16 4.33 0.612 0.000396 11.4 0.938 6.01 3.21e-08 0.00245 +17 4.51 0.867 0.013 12.8 1.03 9.28 1.46e-07 0.0124 +18 4.07 1.1 0.159 12.8 1.03 11 6.62e-07 0.0492 +19 3.76 1.22 0.723 11.3 0.904 11.6 2.99e-06 0.152 +20 3.96 1.21 1.34 10.7 0.878 12.3 1.32e-05 0.364 +21 4.31 1.12 1.51 11 1.11 13.6 5.6e-05 0.68 +22 4.45 1.4 1.86 10.3 1.38 12.8 0.000224 0.989 +23 4.75 2.06 2.7 8.37 1.36 8.55 0.000833 1.12 +24 4.76 2.19 3.68 6.7 1.25 5.92 0.00284 0.994 +25 4.68 2.04 3.45 6 1.2 6.15 0.00881 0.7 +26 4.47 2.06 3.12 6.21 1.14 7.01 0.0248 0.434 +27 4.28 2.35 3.29 6.62 1.1 7.47 0.0629 0.352 +28 4.83 3.68 3.35 6.53 0.986 7.33 0.144 0.514 +29 5.98 4.63 3.25 5.68 0.939 6.87 0.296 0.878 +30 6.15 4.11 3.2 4.95 1.15 6.45 0.549 1.3 +31 5.15 3.31 3.23 5.2 1.46 6.14 0.918 1.57 +32 4.9 2.94 3.22 5.98 1.72 5.79 1.39 1.59 +33 5.97 2.5 3.03 6.3 1.94 5.34 1.9 1.39 +34 7.15 2.36 2.73 6.51 2.02 4.96 2.37 1.11 +35 7.24 2.86 2.53 7.51 2.19 4.8 2.73 0.859 +36 6.12 2.78 2.52 7.26 2.39 4.86 2.94 0.648 +37 4.95 2.05 2.64 5.47 2.29 5.02 3.02 0.466 +38 4.34 1.81 2.72 4.59 2.15 5.19 3.05 0.311 +39 4.11 2.08 2.69 4.74 2.11 5.32 3.09 0.189 +40 4.19 2.33 2.7 4.96 2 5.39 3.19 0.107 +41 4.29 2.47 2.95 4.98 1.85 5.44 3.36 0.0591 +42 4.22 2.58 3.52 4.91 1.87 5.48 3.59 0.0393 +43 4.26 2.73 4.35 4.84 2.07 5.58 3.84 0.0391 +44 4.69 2.92 5.33 4.86 2.23 5.78 4.08 0.0537 +45 4.43 3.1 6.32 4.93 2.3 6.09 4.29 0.0815 +46 3.6 3.22 7.22 4.96 2.25 6.51 4.48 0.123 +47 3.46 3.29 7.94 4.92 2 6.99 4.64 0.18 +48 3.87 3.39 8.42 4.86 2 7.48 4.78 0.254 +49 4.21 3.6 8.62 4.87 2.27 7.91 4.91 0.344 +50 4.36 4.01 8.54 4.94 2.5 8.23 5.04 0.448 +51 4.41 4.55 8.25 4.98 2.62 8.41 5.18 0.562 +52 4.46 5.04 7.86 4.89 2.68 8.41 5.31 0.679 +53 4.62 5.25 7.47 4.66 2.73 8.23 5.42 0.79 +54 4.92 5.08 7.17 4.36 2.8 7.87 5.5 0.887 +55 5.31 4.64 6.98 4.12 2.9 7.36 5.54 0.963 +56 5.61 4.19 6.89 4 3.07 6.75 5.53 1.01 +57 5.7 3.93 6.85 4.03 3.3 6.11 5.46 1.03 +58 5.54 3.92 6.83 4.14 3.53 5.48 5.33 1.03 +59 5.29 4.03 6.8 4.25 3.69 4.93 5.17 1.01 +60 5.13 4.16 6.75 4.3 3.76 4.48 4.97 0.984 +61 5.16 4.24 6.66 4.28 3.79 4.14 4.74 0.955 +62 5.35 4.23 6.53 4.19 3.8 3.89 4.52 0.934 +63 5.63 4.14 6.37 4.05 3.79 3.7 4.29 0.927 +64 5.92 4 6.18 3.88 3.77 3.55 4.1 0.937 +65 6.16 3.84 5.96 3.72 3.79 3.4 3.93 0.965 +66 6.28 3.71 5.74 3.62 3.87 3.24 3.8 1.01 +67 6.2 3.64 5.51 3.59 3.99 3.07 3.72 1.06 +68 5.92 3.63 5.3 3.64 4.07 2.88 3.68 1.13 +69 5.57 3.68 5.09 3.72 4.04 2.7 3.68 1.19 +70 5.32 3.74 4.91 3.79 3.89 2.52 3.73 1.25 +71 5.27 3.79 4.73 3.8 3.7 2.35 3.8 1.31 +72 5.39 3.8 4.57 3.73 3.58 2.2 3.9 1.36 +73 5.62 3.78 4.42 3.59 3.56 2.06 4.01 1.4 +74 5.85 3.76 4.28 3.42 3.6 1.94 4.12 1.44 +75 6.06 3.76 4.15 3.27 3.65 1.83 4.22 1.47 +76 6.24 3.81 4.04 3.16 3.68 1.74 4.31 1.5 +77 6.38 3.89 3.95 3.1 3.68 1.66 4.38 1.52 +78 6.47 3.99 3.9 3.06 3.69 1.6 4.42 1.55 +79 6.5 4.1 3.88 3.03 3.7 1.55 4.43 1.58 +80 6.47 4.2 3.91 2.99 3.73 1.52 4.42 1.62 +81 6.4 4.27 3.98 2.94 3.76 1.52 4.38 1.66 +82 6.32 4.32 4.08 2.87 3.8 1.54 4.32 1.7 +83 6.24 4.34 4.21 2.79 3.82 1.59 4.24 1.75 +84 6.19 4.34 4.35 2.71 3.83 1.66 4.15 1.8 +85 6.17 4.33 4.48 2.64 3.83 1.75 4.05 1.86 +86 6.18 4.29 4.6 2.59 3.84 1.85 3.95 1.9 +87 6.18 4.24 4.69 2.54 3.87 1.95 3.85 1.94 +88 6.16 4.16 4.75 2.51 3.93 2.05 3.76 1.98 +89 6.07 4.07 4.77 2.5 4.02 2.15 3.68 2 +90 5.93 3.96 4.76 2.5 4.12 2.23 3.61 2.01 +91 5.74 3.85 4.71 2.51 4.21 2.3 3.56 2.01 +92 5.53 3.74 4.65 2.53 4.26 2.35 3.51 1.99 +93 5.37 3.65 4.56 2.57 4.23 2.37 3.48 1.96 +94 5.27 3.58 4.47 2.62 4.11 2.37 3.45 1.92 +95 5.25 3.54 4.37 2.69 3.94 2.35 3.43 1.87 +96 5.27 3.54 4.26 2.75 3.76 2.32 3.41 1.81 +97 5.31 3.57 4.16 2.81 3.61 2.26 3.39 1.75 +98 5.33 3.62 4.06 2.87 3.51 2.19 3.37 1.68 +99 5.31 3.7 3.96 2.91 3.45 2.11 3.34 1.61 +100 5.25 3.78 3.86 2.93 3.42 2.03 3.3 1.54 +101 5.16 3.86 3.76 2.93 3.39 1.94 3.26 1.47 +102 5.06 3.94 3.65 2.91 3.36 1.85 3.2 1.4 +103 4.97 3.99 3.55 2.88 3.31 1.77 3.14 1.33 +104 4.89 4.02 3.45 2.82 3.25 1.68 3.08 1.27 +105 4.84 4.02 3.36 2.76 3.2 1.61 3.01 1.21 +106 4.81 3.98 3.27 2.69 3.16 1.54 2.94 1.16 +107 4.8 3.92 3.19 2.61 3.15 1.47 2.87 1.11 +108 4.78 3.83 3.12 2.53 3.16 1.41 2.8 1.07 +109 4.74 3.72 3.06 2.46 3.19 1.36 2.74 1.03 +110 4.66 3.6 3.01 2.4 3.24 1.31 2.68 0.992 +111 4.55 3.49 2.97 2.35 3.3 1.26 2.64 0.963 +112 4.4 3.39 2.94 2.31 3.35 1.22 2.6 0.938 +113 4.23 3.31 2.92 2.28 3.39 1.19 2.58 0.919 +114 4.05 3.25 2.9 2.27 3.41 1.15 2.57 0.905 +115 3.88 3.22 2.89 2.26 3.41 1.12 2.57 0.896 +116 3.73 3.21 2.88 2.25 3.39 1.08 2.59 0.892 +117 3.61 3.22 2.87 2.25 3.35 1.05 2.62 0.892 +118 3.53 3.24 2.85 2.24 3.31 1.02 2.66 0.897 +119 3.47 3.27 2.84 2.23 3.27 0.996 2.71 0.906 +120 3.44 3.3 2.83 2.21 3.24 0.97 2.77 0.919 +121 3.41 3.34 2.81 2.19 3.22 0.947 2.84 0.935 +122 3.39 3.37 2.79 2.15 3.21 0.926 2.91 0.954 +123 3.36 3.41 2.77 2.11 3.2 0.908 2.99 0.976 +124 3.33 3.43 2.75 2.07 3.2 0.895 3.08 0.999 +125 3.29 3.46 2.73 2.02 3.19 0.885 3.17 1.02 +126 3.25 3.49 2.7 1.97 3.18 0.88 3.26 1.05 +127 3.21 3.52 2.68 1.92 3.16 0.88 3.35 1.08 +128 3.16 3.55 2.66 1.87 3.13 0.884 3.44 1.1 +129 3.13 3.58 2.65 1.83 3.11 0.893 3.53 1.13 +130 3.09 3.62 2.64 1.8 3.08 0.907 3.62 1.15 +131 3.05 3.67 2.63 1.77 3.05 0.925 3.7 1.18 +132 3 3.72 2.63 1.74 3.03 0.947 3.78 1.2 +133 2.95 3.78 2.63 1.72 3.01 0.972 3.86 1.22 +134 2.89 3.83 2.64 1.71 2.98 1 3.93 1.24 +135 2.83 3.88 2.66 1.69 2.96 1.03 4 1.26 +136 2.76 3.93 2.68 1.68 2.93 1.06 4.07 1.28 +137 2.68 3.97 2.7 1.67 2.89 1.09 4.13 1.3 +138 2.62 4 2.73 1.66 2.85 1.13 4.18 1.31 +139 2.55 4.01 2.76 1.65 2.8 1.16 4.22 1.33 +140 2.5 4 2.8 1.64 2.75 1.19 4.27 1.34 +141 2.45 3.98 2.83 1.62 2.69 1.22 4.3 1.36 +142 2.42 3.94 2.86 1.61 2.63 1.24 4.33 1.37 +143 2.39 3.89 2.89 1.6 2.58 1.27 4.35 1.38 +144 2.36 3.83 2.92 1.59 2.54 1.29 4.36 1.39 +145 2.34 3.76 2.95 1.58 2.51 1.31 4.37 1.4 +146 2.32 3.68 2.97 1.58 2.48 1.33 4.38 1.41 +147 2.29 3.59 2.99 1.58 2.47 1.35 4.37 1.42 +148 2.26 3.51 3 1.59 2.47 1.36 4.36 1.44 +149 2.23 3.43 3 1.6 2.47 1.38 4.35 1.45 +150 2.2 3.35 3.01 1.62 2.49 1.39 4.33 1.46 +151 2.17 3.27 3 1.64 2.5 1.4 4.3 1.48 +152 2.14 3.21 3 1.67 2.51 1.41 4.27 1.49 +153 2.1 3.15 2.98 1.71 2.53 1.42 4.23 1.5 +154 2.07 3.09 2.97 1.74 2.54 1.43 4.19 1.52 +155 2.05 3.04 2.95 1.78 2.54 1.44 4.15 1.54 +156 2.02 2.99 2.92 1.81 2.54 1.45 4.1 1.56 +157 1.99 2.95 2.9 1.84 2.53 1.46 4.05 1.57 +158 1.96 2.91 2.87 1.87 2.51 1.47 4 1.59 +159 1.94 2.87 2.85 1.9 2.49 1.49 3.94 1.61 +160 1.91 2.83 2.82 1.92 2.46 1.5 3.88 1.64 +161 1.89 2.8 2.79 1.93 2.42 1.52 3.82 1.66 +162 1.87 2.76 2.76 1.94 2.38 1.54 3.76 1.68 +163 1.85 2.73 2.73 1.94 2.34 1.55 3.69 1.7 +164 1.83 2.69 2.7 1.94 2.29 1.57 3.63 1.73 +165 1.82 2.66 2.68 1.93 2.25 1.59 3.56 1.75 +166 1.81 2.63 2.65 1.92 2.2 1.62 3.5 1.77 +167 1.81 2.6 2.62 1.91 2.17 1.64 3.43 1.79 +168 1.8 2.57 2.6 1.9 2.14 1.66 3.37 1.81 +169 1.8 2.55 2.58 1.88 2.12 1.69 3.3 1.83 +170 1.8 2.53 2.56 1.87 2.1 1.71 3.24 1.85 +171 1.8 2.51 2.54 1.85 2.09 1.74 3.17 1.87 +172 1.8 2.49 2.52 1.84 2.09 1.76 3.11 1.89 +173 1.8 2.48 2.5 1.82 2.09 1.79 3.05 1.91 +174 1.8 2.47 2.48 1.81 2.09 1.81 2.99 1.92 +175 1.79 2.46 2.47 1.8 2.1 1.84 2.93 1.94 +176 1.79 2.45 2.45 1.79 2.1 1.86 2.87 1.95 +177 1.78 2.45 2.44 1.78 2.11 1.89 2.81 1.96 +178 1.77 2.44 2.42 1.77 2.11 1.91 2.75 1.96 +179 1.76 2.44 2.41 1.77 2.1 1.93 2.7 1.97 +180 1.74 2.43 2.39 1.76 2.1 1.94 2.65 1.97 +181 1.73 2.43 2.38 1.75 2.09 1.96 2.59 1.98 +182 1.71 2.43 2.36 1.75 2.07 1.97 2.54 1.98 +183 1.68 2.43 2.35 1.75 2.05 1.98 2.49 1.97 +184 1.66 2.43 2.34 1.74 2.03 1.99 2.44 1.97 +185 1.63 2.42 2.32 1.74 2 1.99 2.4 1.96 +186 1.61 2.42 2.31 1.73 1.98 2 2.35 1.95 +187 1.58 2.42 2.29 1.73 1.95 2 2.3 1.94 +188 1.56 2.42 2.27 1.72 1.92 1.99 2.26 1.93 +189 1.53 2.42 2.26 1.71 1.89 1.98 2.22 1.92 +190 1.51 2.41 2.24 1.7 1.86 1.97 2.18 1.9 +191 1.49 2.41 2.22 1.69 1.83 1.96 2.13 1.88 +192 1.47 2.4 2.21 1.68 1.81 1.94 2.09 1.87 +193 1.46 2.39 2.19 1.66 1.78 1.92 2.06 1.84 +194 1.45 2.38 2.17 1.64 1.77 1.9 2.02 1.82 +195 1.44 2.37 2.16 1.62 1.75 1.87 1.98 1.8 +196 1.43 2.35 2.14 1.6 1.74 1.84 1.95 1.77 +197 1.42 2.33 2.13 1.57 1.73 1.81 1.91 1.75 +198 1.42 2.31 2.11 1.55 1.72 1.78 1.88 1.72 +199 1.41 2.29 2.1 1.52 1.72 1.75 1.85 1.69 +200 1.41 2.27 2.08 1.49 1.71 1.71 1.82 1.66 +201 1.41 2.24 2.07 1.46 1.71 1.67 1.79 1.63 +202 1.4 2.21 2.06 1.43 1.71 1.63 1.77 1.6 +203 1.4 2.19 2.05 1.4 1.7 1.59 1.74 1.57 +204 1.39 2.16 2.04 1.38 1.69 1.55 1.72 1.54 +205 1.38 2.13 2.03 1.35 1.69 1.51 1.7 1.51 +206 1.37 2.1 2.02 1.33 1.68 1.47 1.68 1.48 +207 1.36 2.07 2.02 1.3 1.67 1.43 1.66 1.45 +208 1.35 2.04 2.02 1.28 1.66 1.39 1.65 1.42 +209 1.34 2.01 2.01 1.26 1.65 1.35 1.63 1.39 +210 1.33 1.98 2.01 1.24 1.64 1.31 1.62 1.36 +211 1.32 1.95 2.01 1.23 1.62 1.27 1.61 1.32 +212 1.31 1.92 2.02 1.21 1.61 1.23 1.6 1.29 +213 1.3 1.9 2.02 1.2 1.6 1.19 1.6 1.27 +214 1.28 1.87 2.03 1.19 1.58 1.16 1.59 1.24 +215 1.27 1.84 2.03 1.18 1.57 1.12 1.59 1.21 +216 1.26 1.82 2.04 1.17 1.56 1.09 1.59 1.18 +217 1.24 1.79 2.05 1.16 1.55 1.06 1.59 1.15 +218 1.23 1.77 2.06 1.15 1.54 1.02 1.59 1.13 +219 1.22 1.75 2.07 1.14 1.53 0.995 1.59 1.1 +220 1.2 1.72 2.08 1.14 1.53 0.966 1.59 1.08 +221 1.18 1.7 2.09 1.13 1.52 0.939 1.6 1.06 +222 1.17 1.68 2.1 1.12 1.52 0.913 1.6 1.04 +223 1.15 1.65 2.11 1.11 1.51 0.888 1.61 1.02 +224 1.13 1.63 2.12 1.1 1.51 0.865 1.62 1 +225 1.12 1.61 2.13 1.09 1.51 0.843 1.63 0.983 +226 1.1 1.59 2.14 1.08 1.5 0.823 1.64 0.967 +227 1.08 1.57 2.15 1.07 1.5 0.803 1.65 0.952 +228 1.06 1.55 2.16 1.06 1.49 0.785 1.66 0.939 +229 1.04 1.53 2.17 1.04 1.49 0.769 1.67 0.927 +230 1.03 1.51 2.17 1.03 1.48 0.753 1.68 0.916 +231 1.01 1.5 2.17 1.02 1.47 0.739 1.69 0.906 +232 0.993 1.48 2.18 1 1.47 0.726 1.7 0.898 +233 0.979 1.46 2.18 0.989 1.46 0.714 1.71 0.891 +234 0.965 1.45 2.17 0.975 1.45 0.703 1.72 0.885 +235 0.952 1.44 2.17 0.961 1.44 0.694 1.73 0.88 +236 0.94 1.43 2.16 0.946 1.43 0.685 1.74 0.876 +237 0.929 1.42 2.15 0.932 1.42 0.678 1.75 0.874 +238 0.918 1.41 2.14 0.918 1.41 0.672 1.75 0.873 +239 0.909 1.4 2.13 0.904 1.4 0.666 1.76 0.872 +240 0.901 1.39 2.11 0.891 1.39 0.662 1.77 0.873 +241 0.893 1.38 2.09 0.878 1.39 0.659 1.77 0.874 +242 0.886 1.38 2.07 0.866 1.38 0.656 1.78 0.877 +243 0.879 1.37 2.05 0.854 1.37 0.655 1.78 0.88 +244 0.873 1.37 2.03 0.843 1.37 0.654 1.78 0.884 +245 0.868 1.37 2 0.833 1.36 0.654 1.78 0.889 +246 0.863 1.37 1.97 0.824 1.36 0.655 1.78 0.894 +247 0.858 1.36 1.94 0.815 1.35 0.657 1.78 0.9 +248 0.854 1.36 1.91 0.807 1.35 0.659 1.78 0.906 +249 0.851 1.36 1.88 0.799 1.34 0.662 1.78 0.913 +250 0.848 1.36 1.85 0.792 1.34 0.666 1.77 0.921 +251 0.845 1.36 1.81 0.786 1.33 0.67 1.77 0.929 +252 0.843 1.36 1.78 0.78 1.32 0.675 1.76 0.937 +253 0.842 1.36 1.74 0.774 1.31 0.68 1.75 0.945 +254 0.841 1.36 1.71 0.769 1.3 0.686 1.75 0.954 +255 0.841 1.36 1.67 0.764 1.29 0.692 1.74 0.963 +256 0.842 1.36 1.63 0.759 1.27 0.698 1.72 0.972 +257 0.842 1.36 1.6 0.754 1.26 0.705 1.71 0.981 +258 0.843 1.35 1.56 0.749 1.25 0.712 1.7 0.99 +259 0.845 1.35 1.53 0.744 1.23 0.719 1.69 0.999 +260 0.846 1.35 1.49 0.739 1.22 0.727 1.67 1.01 +261 0.848 1.35 1.46 0.734 1.2 0.734 1.66 1.02 +262 0.85 1.35 1.43 0.729 1.19 0.741 1.64 1.03 +263 0.851 1.34 1.4 0.724 1.18 0.749 1.62 1.03 +264 0.853 1.34 1.37 0.719 1.17 0.756 1.6 1.04 +265 0.854 1.34 1.34 0.714 1.15 0.764 1.58 1.05 +266 0.854 1.34 1.31 0.708 1.14 0.771 1.57 1.06 +267 0.854 1.33 1.28 0.703 1.14 0.778 1.55 1.07 +268 0.853 1.33 1.26 0.698 1.13 0.785 1.53 1.07 +269 0.852 1.32 1.24 0.693 1.12 0.791 1.51 1.08 +270 0.85 1.32 1.22 0.688 1.12 0.797 1.48 1.09 +271 0.847 1.32 1.2 0.683 1.12 0.803 1.46 1.09 +272 0.843 1.31 1.18 0.678 1.11 0.809 1.44 1.1 +273 0.839 1.31 1.16 0.673 1.11 0.814 1.42 1.1 +274 0.834 1.3 1.14 0.668 1.11 0.819 1.4 1.11 +275 0.828 1.3 1.13 0.664 1.11 0.823 1.38 1.11 +276 0.822 1.29 1.12 0.66 1.11 0.827 1.36 1.12 +277 0.815 1.28 1.1 0.655 1.11 0.83 1.33 1.12 +278 0.808 1.28 1.09 0.651 1.11 0.833 1.31 1.13 +279 0.801 1.27 1.09 0.647 1.11 0.836 1.29 1.13 +280 0.793 1.26 1.08 0.643 1.12 0.838 1.27 1.13 +281 0.785 1.26 1.07 0.639 1.12 0.839 1.25 1.13 +282 0.777 1.25 1.06 0.636 1.12 0.84 1.23 1.13 +283 0.769 1.24 1.06 0.632 1.12 0.84 1.21 1.14 +284 0.76 1.24 1.06 0.628 1.12 0.84 1.19 1.14 +285 0.753 1.23 1.05 0.624 1.12 0.839 1.17 1.14 +286 0.745 1.22 1.05 0.621 1.12 0.838 1.15 1.14 +287 0.737 1.21 1.05 0.617 1.12 0.836 1.13 1.14 +288 0.73 1.21 1.05 0.613 1.12 0.834 1.11 1.14 +289 0.724 1.2 1.05 0.609 1.12 0.831 1.1 1.13 +290 0.717 1.2 1.05 0.605 1.13 0.827 1.08 1.13 +291 0.712 1.19 1.04 0.602 1.13 0.824 1.06 1.13 +292 0.707 1.18 1.04 0.598 1.13 0.82 1.05 1.13 +293 0.702 1.18 1.05 0.594 1.13 0.815 1.03 1.13 +294 0.698 1.17 1.05 0.59 1.13 0.81 1.02 1.12 +295 0.695 1.17 1.05 0.586 1.13 0.805 1 1.12 +296 0.692 1.17 1.05 0.582 1.13 0.799 0.987 1.12 +297 0.69 1.16 1.05 0.578 1.13 0.793 0.974 1.12 +298 0.688 1.16 1.05 0.574 1.13 0.787 0.961 1.11 +299 0.688 1.16 1.05 0.571 1.13 0.78 0.949 1.11 +300 0.687 1.15 1.05 0.567 1.13 0.773 0.938 1.11 +301 0.688 1.15 1.05 0.564 1.13 0.766 0.926 1.1 +302 0.689 1.15 1.05 0.56 1.13 0.759 0.916 1.1 +303 0.69 1.15 1.05 0.557 1.13 0.752 0.906 1.1 +304 0.692 1.15 1.05 0.554 1.13 0.744 0.896 1.09 +305 0.694 1.15 1.05 0.552 1.12 0.736 0.887 1.09 +306 0.696 1.15 1.05 0.549 1.12 0.729 0.878 1.09 +307 0.698 1.15 1.05 0.547 1.11 0.721 0.87 1.08 +308 0.701 1.15 1.05 0.545 1.11 0.713 0.861 1.08 +309 0.703 1.15 1.05 0.543 1.1 0.705 0.854 1.08 +310 0.706 1.14 1.05 0.542 1.1 0.697 0.846 1.07 +311 0.708 1.14 1.04 0.541 1.09 0.689 0.839 1.07 +312 0.71 1.14 1.04 0.54 1.09 0.682 0.832 1.07 +313 0.712 1.14 1.04 0.539 1.08 0.674 0.826 1.07 +314 0.713 1.14 1.04 0.538 1.08 0.666 0.82 1.06 +315 0.714 1.14 1.04 0.538 1.07 0.659 0.813 1.06 +316 0.714 1.14 1.03 0.538 1.07 0.651 0.807 1.06 +317 0.714 1.14 1.03 0.538 1.06 0.644 0.801 1.06 +318 0.713 1.14 1.03 0.538 1.06 0.637 0.796 1.06 +319 0.712 1.14 1.02 0.538 1.05 0.63 0.79 1.06 +320 0.71 1.14 1.02 0.539 1.05 0.623 0.785 1.06 +321 0.708 1.14 1.02 0.539 1.04 0.616 0.779 1.06 +322 0.705 1.13 1.01 0.539 1.04 0.61 0.774 1.06 +323 0.702 1.13 1.01 0.54 1.03 0.603 0.768 1.06 +324 0.699 1.13 1.01 0.54 1.03 0.597 0.763 1.06 +325 0.695 1.13 1 0.541 1.02 0.591 0.757 1.06 +326 0.691 1.12 0.999 0.541 1.02 0.586 0.752 1.06 +327 0.686 1.12 0.994 0.541 1.01 0.58 0.746 1.06 +328 0.681 1.12 0.99 0.541 1.01 0.575 0.74 1.06 +329 0.677 1.11 0.986 0.541 1 0.57 0.735 1.06 +330 0.672 1.11 0.981 0.541 1 0.565 0.729 1.06 +331 0.666 1.1 0.976 0.541 0.994 0.56 0.723 1.06 +332 0.661 1.1 0.972 0.541 0.989 0.556 0.717 1.07 +333 0.656 1.1 0.967 0.54 0.984 0.551 0.711 1.07 +334 0.651 1.09 0.962 0.54 0.979 0.547 0.705 1.07 +335 0.646 1.09 0.958 0.539 0.974 0.543 0.699 1.07 +336 0.641 1.08 0.953 0.538 0.968 0.54 0.692 1.07 +337 0.636 1.08 0.948 0.537 0.963 0.536 0.686 1.08 +338 0.631 1.07 0.943 0.536 0.958 0.533 0.679 1.08 +339 0.626 1.06 0.938 0.534 0.953 0.529 0.672 1.08 +340 0.621 1.06 0.933 0.532 0.948 0.526 0.665 1.09 +341 0.617 1.05 0.928 0.53 0.944 0.523 0.658 1.09 +342 0.613 1.05 0.923 0.528 0.939 0.521 0.651 1.09 +343 0.608 1.04 0.918 0.526 0.935 0.518 0.644 1.09 +344 0.604 1.04 0.913 0.524 0.931 0.515 0.636 1.1 +345 0.601 1.03 0.908 0.521 0.927 0.513 0.629 1.1 +346 0.597 1.02 0.902 0.518 0.923 0.51 0.621 1.1 +347 0.594 1.02 0.897 0.515 0.919 0.508 0.614 1.1 +348 0.591 1.01 0.892 0.512 0.916 0.506 0.606 1.11 +349 0.588 1.01 0.887 0.509 0.913 0.504 0.598 1.11 +350 0.585 1 0.881 0.505 0.91 0.502 0.59 1.11 +351 0.582 0.996 0.876 0.501 0.907 0.499 0.582 1.11 +352 0.58 0.99 0.87 0.497 0.904 0.497 0.574 1.11 +353 0.578 0.984 0.865 0.493 0.901 0.495 0.566 1.12 +354 0.576 0.979 0.859 0.489 0.898 0.494 0.558 1.12 +355 0.574 0.974 0.854 0.485 0.895 0.492 0.55 1.12 +356 0.572 0.968 0.848 0.48 0.892 0.49 0.542 1.12 +357 0.57 0.963 0.842 0.475 0.889 0.488 0.533 1.12 +358 0.568 0.958 0.836 0.47 0.886 0.486 0.525 1.12 +359 0.566 0.952 0.831 0.465 0.883 0.484 0.517 1.12 +360 0.565 0.947 0.825 0.46 0.88 0.482 0.509 1.12 +361 0.563 0.942 0.819 0.455 0.876 0.48 0.5 1.12 +362 0.562 0.937 0.813 0.449 0.872 0.478 0.492 1.12 +363 0.56 0.932 0.807 0.443 0.869 0.476 0.484 1.12 +364 0.558 0.927 0.801 0.438 0.864 0.474 0.476 1.12 +365 0.556 0.922 0.794 0.432 0.86 0.472 0.468 1.12 +366 0.555 0.917 0.788 0.426 0.855 0.47 0.459 1.12 +367 0.553 0.912 0.782 0.42 0.85 0.468 0.451 1.11 +368 0.551 0.907 0.776 0.414 0.845 0.465 0.443 1.11 +369 0.548 0.902 0.769 0.408 0.84 0.463 0.435 1.11 +370 0.546 0.897 0.763 0.401 0.834 0.461 0.428 1.11 +371 0.544 0.892 0.757 0.395 0.828 0.459 0.42 1.11 +372 0.541 0.887 0.75 0.389 0.822 0.456 0.412 1.1 +373 0.539 0.882 0.744 0.382 0.815 0.454 0.404 1.1 +374 0.536 0.876 0.737 0.376 0.809 0.451 0.397 1.1 +375 0.533 0.871 0.731 0.37 0.802 0.449 0.389 1.09 +376 0.53 0.866 0.724 0.364 0.795 0.446 0.382 1.09 +377 0.527 0.861 0.718 0.357 0.788 0.444 0.375 1.08 +378 0.524 0.856 0.711 0.351 0.781 0.441 0.368 1.08 +379 0.521 0.851 0.705 0.345 0.774 0.439 0.361 1.08 +380 0.517 0.846 0.698 0.339 0.767 0.436 0.354 1.07 +381 0.514 0.841 0.692 0.333 0.76 0.433 0.347 1.07 +382 0.51 0.836 0.685 0.327 0.753 0.431 0.34 1.06 +383 0.507 0.831 0.679 0.321 0.747 0.428 0.334 1.06 +384 0.503 0.826 0.673 0.315 0.74 0.425 0.327 1.05 +385 0.499 0.821 0.666 0.31 0.734 0.423 0.321 1.05 +386 0.496 0.816 0.66 0.305 0.727 0.42 0.315 1.04 +387 0.492 0.811 0.654 0.299 0.721 0.417 0.309 1.03 +388 0.488 0.807 0.647 0.295 0.716 0.415 0.303 1.03 +389 0.485 0.802 0.641 0.29 0.71 0.412 0.297 1.02 +390 0.481 0.797 0.635 0.285 0.705 0.409 0.292 1.02 +391 0.478 0.793 0.629 0.281 0.7 0.407 0.287 1.01 +392 0.474 0.788 0.623 0.277 0.695 0.404 0.281 1.01 +393 0.47 0.784 0.618 0.273 0.691 0.402 0.276 1 +394 0.467 0.78 0.612 0.27 0.687 0.399 0.271 0.994 +395 0.464 0.776 0.606 0.266 0.683 0.397 0.266 0.988 +396 0.46 0.772 0.6 0.264 0.679 0.394 0.262 0.982 +397 0.457 0.768 0.595 0.261 0.675 0.392 0.257 0.977 +398 0.454 0.764 0.589 0.259 0.672 0.39 0.253 0.971 +399 0.451 0.761 0.584 0.257 0.669 0.388 0.249 0.965 +400 0.448 0.757 0.579 0.255 0.666 0.386 0.245 0.959 +401 0.446 0.754 0.573 0.254 0.663 0.384 0.241 0.954 +402 0.443 0.75 0.568 0.253 0.66 0.382 0.237 0.948 +403 0.44 0.747 0.563 0.252 0.658 0.38 0.234 0.942 +404 0.438 0.744 0.558 0.252 0.655 0.378 0.23 0.937 +405 0.435 0.741 0.553 0.252 0.653 0.376 0.227 0.932 +406 0.433 0.739 0.548 0.252 0.65 0.375 0.224 0.926 +407 0.431 0.736 0.543 0.253 0.648 0.373 0.221 0.921 +408 0.429 0.733 0.539 0.254 0.645 0.372 0.219 0.916 +409 0.426 0.731 0.534 0.256 0.643 0.371 0.216 0.911 +410 0.424 0.729 0.529 0.257 0.64 0.37 0.214 0.907 +411 0.422 0.726 0.525 0.259 0.638 0.369 0.212 0.902 +412 0.42 0.724 0.52 0.261 0.635 0.368 0.21 0.897 +413 0.418 0.722 0.516 0.264 0.633 0.367 0.208 0.893 +414 0.416 0.721 0.512 0.267 0.63 0.366 0.206 0.889 +415 0.414 0.719 0.507 0.27 0.628 0.366 0.204 0.885 +416 0.412 0.717 0.503 0.273 0.625 0.365 0.203 0.881 +417 0.41 0.716 0.499 0.277 0.623 0.365 0.202 0.877 +418 0.408 0.715 0.495 0.281 0.62 0.365 0.2 0.874 +419 0.406 0.713 0.49 0.284 0.617 0.365 0.199 0.87 +420 0.404 0.712 0.486 0.289 0.615 0.365 0.199 0.867 +421 0.402 0.711 0.482 0.293 0.612 0.365 0.198 0.864 +422 0.4 0.71 0.478 0.297 0.61 0.365 0.197 0.861 +423 0.397 0.709 0.474 0.301 0.607 0.365 0.197 0.859 +424 0.395 0.708 0.47 0.306 0.605 0.366 0.197 0.856 +425 0.393 0.708 0.466 0.31 0.602 0.366 0.197 0.854 +426 0.391 0.707 0.462 0.315 0.6 0.367 0.197 0.852 +427 0.388 0.707 0.459 0.32 0.598 0.368 0.197 0.85 +428 0.386 0.706 0.455 0.324 0.596 0.368 0.197 0.848 +429 0.384 0.706 0.451 0.329 0.594 0.369 0.197 0.846 +430 0.381 0.706 0.447 0.333 0.592 0.37 0.198 0.845 +431 0.379 0.706 0.443 0.338 0.59 0.372 0.198 0.844 +432 0.377 0.706 0.44 0.342 0.588 0.373 0.199 0.843 +433 0.374 0.706 0.436 0.346 0.587 0.374 0.2 0.842 +434 0.372 0.706 0.432 0.35 0.585 0.375 0.201 0.841 +435 0.37 0.706 0.429 0.354 0.584 0.377 0.202 0.84 +436 0.367 0.706 0.425 0.358 0.583 0.378 0.203 0.84 +437 0.365 0.706 0.421 0.362 0.582 0.38 0.204 0.84 +438 0.363 0.706 0.418 0.365 0.581 0.381 0.206 0.84 +439 0.361 0.706 0.414 0.368 0.58 0.383 0.207 0.84 +440 0.359 0.706 0.411 0.371 0.579 0.385 0.208 0.84 +441 0.356 0.706 0.407 0.374 0.578 0.386 0.21 0.841 +442 0.354 0.706 0.404 0.377 0.577 0.388 0.212 0.841 +443 0.352 0.706 0.4 0.379 0.577 0.39 0.213 0.842 +444 0.35 0.706 0.397 0.381 0.576 0.392 0.215 0.843 +445 0.348 0.706 0.394 0.383 0.576 0.394 0.217 0.844 +446 0.346 0.705 0.39 0.384 0.575 0.396 0.219 0.845 +447 0.344 0.705 0.387 0.385 0.575 0.398 0.221 0.847 +448 0.342 0.704 0.384 0.386 0.574 0.399 0.223 0.848 +449 0.34 0.704 0.38 0.387 0.574 0.401 0.225 0.85 +450 0.338 0.703 0.377 0.387 0.574 0.403 0.227 0.852 +451 0.336 0.702 0.374 0.387 0.573 0.405 0.229 0.853 +452 0.335 0.701 0.371 0.387 0.573 0.407 0.231 0.855 +453 0.333 0.7 0.368 0.387 0.572 0.409 0.233 0.858 +454 0.331 0.699 0.365 0.386 0.572 0.411 0.236 0.86 +455 0.329 0.697 0.362 0.385 0.571 0.413 0.238 0.862 +456 0.327 0.695 0.359 0.384 0.571 0.415 0.24 0.864 +457 0.325 0.693 0.356 0.382 0.57 0.417 0.243 0.867 +458 0.324 0.691 0.353 0.381 0.57 0.419 0.245 0.87 +459 0.322 0.689 0.35 0.379 0.569 0.421 0.247 0.872 +460 0.32 0.686 0.347 0.376 0.569 0.422 0.25 0.875 +461 0.318 0.683 0.345 0.374 0.568 0.424 0.252 0.878 +462 0.317 0.68 0.342 0.371 0.567 0.426 0.254 0.881 +463 0.315 0.677 0.339 0.368 0.567 0.428 0.257 0.884 +464 0.313 0.674 0.337 0.365 0.566 0.429 0.259 0.887 +465 0.311 0.67 0.334 0.362 0.565 0.431 0.261 0.89 +466 0.309 0.666 0.331 0.358 0.564 0.432 0.264 0.893 +467 0.308 0.662 0.329 0.355 0.563 0.434 0.266 0.896 +468 0.306 0.658 0.327 0.351 0.563 0.435 0.268 0.899 +469 0.304 0.654 0.324 0.347 0.562 0.437 0.27 0.903 +470 0.302 0.649 0.322 0.343 0.561 0.438 0.273 0.906 +471 0.3 0.645 0.32 0.339 0.56 0.439 0.275 0.909 +472 0.299 0.64 0.317 0.335 0.559 0.44 0.277 0.912 +473 0.297 0.635 0.315 0.33 0.558 0.442 0.279 0.916 +474 0.295 0.63 0.313 0.326 0.557 0.443 0.281 0.919 +475 0.293 0.625 0.311 0.322 0.556 0.444 0.283 0.922 +476 0.291 0.619 0.309 0.317 0.555 0.444 0.285 0.926 +477 0.29 0.614 0.307 0.312 0.554 0.445 0.287 0.929 +478 0.288 0.608 0.305 0.308 0.553 0.446 0.289 0.932 +479 0.286 0.603 0.303 0.303 0.552 0.447 0.291 0.935 +480 0.284 0.597 0.301 0.298 0.551 0.447 0.293 0.938 +481 0.282 0.591 0.299 0.294 0.55 0.448 0.295 0.942 +482 0.28 0.586 0.298 0.289 0.548 0.449 0.297 0.945 +483 0.279 0.58 0.296 0.285 0.547 0.449 0.298 0.948 +484 0.277 0.574 0.294 0.28 0.546 0.449 0.3 0.951 +485 0.275 0.568 0.293 0.275 0.545 0.45 0.302 0.954 +486 0.273 0.562 0.291 0.271 0.543 0.45 0.303 0.957 +487 0.272 0.557 0.289 0.267 0.542 0.45 0.305 0.96 +488 0.27 0.551 0.288 0.262 0.541 0.45 0.306 0.962 +489 0.268 0.545 0.286 0.258 0.54 0.45 0.307 0.965 +490 0.266 0.54 0.285 0.254 0.538 0.45 0.309 0.968 +491 0.265 0.534 0.283 0.25 0.537 0.45 0.31 0.97 +492 0.263 0.528 0.282 0.246 0.536 0.45 0.311 0.972 +493 0.261 0.523 0.28 0.242 0.534 0.449 0.312 0.975 +494 0.26 0.517 0.279 0.238 0.533 0.449 0.313 0.977 +495 0.258 0.512 0.278 0.234 0.532 0.448 0.314 0.979 +496 0.256 0.507 0.276 0.231 0.53 0.448 0.315 0.981 +497 0.255 0.501 0.275 0.227 0.529 0.447 0.316 0.983 +498 0.253 0.496 0.274 0.224 0.527 0.447 0.317 0.985 +499 0.252 0.491 0.272 0.221 0.526 0.446 0.318 0.987 +500 0.25 0.486 0.271 0.218 0.525 0.445 0.319 0.988 +501 0.249 0.481 0.27 0.215 0.523 0.445 0.319 0.99 +502 0.247 0.477 0.269 0.212 0.522 0.444 0.32 0.991 +503 0.245 0.472 0.267 0.209 0.521 0.443 0.32 0.992 +504 0.244 0.468 0.266 0.207 0.52 0.442 0.321 0.993 +505 0.242 0.463 0.265 0.204 0.518 0.441 0.321 0.994 +506 0.241 0.459 0.264 0.202 0.517 0.44 0.321 0.995 +507 0.24 0.455 0.262 0.199 0.516 0.438 0.322 0.995 +508 0.238 0.45 0.261 0.197 0.515 0.437 0.322 0.996 +509 0.237 0.446 0.26 0.195 0.514 0.436 0.322 0.996 +510 0.235 0.443 0.258 0.193 0.512 0.435 0.322 0.997 +511 0.234 0.439 0.257 0.192 0.511 0.433 0.322 0.997 +512 0.233 0.435 0.256 0.19 0.51 0.432 0.322 0.997 +513 0.231 0.431 0.254 0.188 0.509 0.431 0.322 0.996 +514 0.23 0.428 0.253 0.187 0.508 0.429 0.322 0.996 +515 0.229 0.424 0.252 0.185 0.508 0.427 0.322 0.996 +516 0.227 0.421 0.25 0.184 0.507 0.426 0.321 0.995 +517 0.226 0.418 0.249 0.183 0.506 0.424 0.321 0.994 +518 0.225 0.415 0.247 0.182 0.505 0.423 0.321 0.993 +519 0.224 0.412 0.246 0.181 0.504 0.421 0.32 0.992 +520 0.223 0.409 0.244 0.179 0.503 0.419 0.32 0.991 +521 0.221 0.406 0.243 0.178 0.503 0.418 0.319 0.99 +522 0.22 0.403 0.241 0.178 0.502 0.416 0.319 0.988 +523 0.219 0.4 0.24 0.177 0.501 0.414 0.318 0.987 +524 0.218 0.397 0.238 0.176 0.501 0.412 0.317 0.985 +525 0.217 0.395 0.237 0.175 0.5 0.41 0.317 0.983 +526 0.216 0.392 0.235 0.174 0.499 0.408 0.316 0.981 +527 0.215 0.39 0.233 0.173 0.499 0.406 0.315 0.979 +528 0.214 0.387 0.231 0.173 0.498 0.404 0.314 0.977 +529 0.213 0.385 0.23 0.172 0.497 0.402 0.313 0.974 +530 0.212 0.382 0.228 0.171 0.497 0.4 0.313 0.972 +531 0.211 0.38 0.226 0.171 0.496 0.398 0.312 0.969 +532 0.21 0.378 0.224 0.17 0.495 0.396 0.311 0.966 +533 0.209 0.376 0.222 0.169 0.495 0.394 0.31 0.963 +534 0.208 0.373 0.22 0.169 0.494 0.392 0.309 0.96 +535 0.207 0.371 0.219 0.168 0.493 0.39 0.308 0.957 +536 0.206 0.369 0.217 0.167 0.492 0.388 0.307 0.954 +537 0.205 0.367 0.215 0.167 0.491 0.386 0.306 0.951 +538 0.205 0.365 0.212 0.166 0.49 0.384 0.304 0.947 +539 0.204 0.363 0.21 0.166 0.49 0.382 0.303 0.944 +540 0.203 0.361 0.208 0.165 0.489 0.379 0.302 0.94 +541 0.202 0.359 0.206 0.164 0.488 0.377 0.301 0.936 +542 0.201 0.357 0.204 0.164 0.487 0.375 0.3 0.933 +543 0.2 0.355 0.202 0.163 0.485 0.373 0.299 0.929 +544 0.199 0.353 0.2 0.162 0.484 0.371 0.298 0.925 +545 0.198 0.351 0.198 0.162 0.483 0.368 0.296 0.921 +546 0.197 0.349 0.195 0.161 0.482 0.366 0.295 0.917 +547 0.196 0.348 0.193 0.161 0.481 0.364 0.294 0.912 +548 0.195 0.346 0.191 0.16 0.479 0.362 0.293 0.908 +549 0.193 0.344 0.189 0.159 0.478 0.359 0.291 0.904 +550 0.192 0.342 0.186 0.159 0.477 0.357 0.29 0.899 +551 0.191 0.34 0.184 0.158 0.475 0.355 0.289 0.895 +552 0.19 0.339 0.182 0.158 0.474 0.353 0.288 0.89 +553 0.189 0.337 0.179 0.157 0.472 0.35 0.286 0.886 +554 0.188 0.335 0.177 0.156 0.471 0.348 0.285 0.881 +555 0.187 0.333 0.175 0.156 0.469 0.346 0.284 0.876 +556 0.185 0.332 0.172 0.155 0.467 0.344 0.283 0.871 +557 0.184 0.33 0.17 0.155 0.466 0.341 0.282 0.867 +558 0.183 0.328 0.168 0.154 0.464 0.339 0.28 0.862 +559 0.182 0.327 0.165 0.153 0.463 0.337 0.279 0.857 +560 0.181 0.325 0.163 0.153 0.461 0.335 0.278 0.852 +561 0.179 0.323 0.16 0.152 0.459 0.332 0.277 0.847 +562 0.178 0.322 0.158 0.152 0.457 0.33 0.276 0.842 +563 0.177 0.32 0.156 0.151 0.456 0.328 0.275 0.837 +564 0.176 0.318 0.153 0.151 0.454 0.326 0.273 0.832 +565 0.175 0.317 0.151 0.151 0.452 0.323 0.272 0.827 +566 0.173 0.315 0.149 0.15 0.451 0.321 0.271 0.822 +567 0.172 0.314 0.147 0.15 0.449 0.319 0.27 0.817 +568 0.171 0.312 0.144 0.149 0.447 0.317 0.269 0.812 +569 0.17 0.31 0.142 0.149 0.446 0.315 0.268 0.807 +570 0.169 0.309 0.14 0.149 0.444 0.312 0.267 0.802 +571 0.168 0.307 0.138 0.148 0.442 0.31 0.266 0.797 +572 0.167 0.306 0.135 0.148 0.441 0.308 0.265 0.792 +573 0.166 0.304 0.133 0.148 0.439 0.306 0.264 0.787 +574 0.165 0.303 0.131 0.147 0.437 0.304 0.263 0.782 +575 0.164 0.301 0.129 0.147 0.436 0.302 0.262 0.777 +576 0.163 0.3 0.127 0.147 0.434 0.3 0.261 0.772 +577 0.162 0.298 0.125 0.147 0.433 0.297 0.26 0.767 +578 0.161 0.297 0.123 0.147 0.431 0.295 0.26 0.762 +579 0.161 0.295 0.121 0.146 0.43 0.293 0.259 0.757 +580 0.16 0.294 0.119 0.146 0.429 0.291 0.258 0.752 +581 0.159 0.292 0.117 0.146 0.427 0.289 0.257 0.747 +582 0.159 0.291 0.115 0.146 0.426 0.287 0.256 0.742 +583 0.158 0.289 0.113 0.146 0.425 0.285 0.256 0.738 +584 0.158 0.288 0.111 0.146 0.423 0.283 0.255 0.733 +585 0.157 0.286 0.109 0.146 0.422 0.281 0.254 0.728 +586 0.157 0.285 0.107 0.146 0.421 0.279 0.254 0.723 +587 0.157 0.284 0.106 0.146 0.42 0.277 0.253 0.718 +588 0.156 0.282 0.104 0.145 0.418 0.275 0.253 0.714 +589 0.156 0.281 0.102 0.145 0.417 0.273 0.252 0.709 +590 0.156 0.28 0.101 0.145 0.416 0.271 0.251 0.705 +591 0.156 0.278 0.0989 0.145 0.415 0.269 0.251 0.7 +592 0.156 0.277 0.0974 0.145 0.414 0.267 0.25 0.695 +593 0.155 0.275 0.0958 0.145 0.413 0.265 0.25 0.691 +594 0.155 0.274 0.0943 0.145 0.412 0.263 0.25 0.687 +595 0.155 0.273 0.0929 0.145 0.411 0.261 0.249 0.682 +596 0.155 0.271 0.0915 0.145 0.409 0.259 0.249 0.678 +597 0.155 0.27 0.0901 0.144 0.408 0.257 0.248 0.673 +598 0.155 0.269 0.0888 0.144 0.407 0.256 0.248 0.669 +599 0.155 0.267 0.0875 0.144 0.406 0.254 0.248 0.665 +600 0.155 0.266 0.0862 0.144 0.405 0.252 0.247 0.661 +601 0.155 0.265 0.085 0.144 0.404 0.25 0.247 0.657 +602 0.155 0.263 0.0839 0.143 0.403 0.248 0.247 0.653 +603 0.155 0.262 0.0827 0.143 0.402 0.246 0.247 0.649 +604 0.156 0.261 0.0816 0.143 0.401 0.244 0.246 0.645 +605 0.156 0.259 0.0806 0.143 0.4 0.243 0.246 0.641 +606 0.156 0.258 0.0796 0.142 0.399 0.241 0.246 0.637 +607 0.156 0.256 0.0786 0.142 0.398 0.239 0.246 0.633 +608 0.156 0.255 0.0776 0.141 0.397 0.237 0.246 0.629 +609 0.156 0.254 0.0767 0.141 0.396 0.236 0.245 0.626 +610 0.156 0.252 0.0759 0.14 0.395 0.234 0.245 0.622 +611 0.156 0.251 0.0751 0.14 0.394 0.232 0.245 0.619 +612 0.156 0.25 0.0743 0.139 0.393 0.23 0.245 0.615 +613 0.156 0.248 0.0735 0.139 0.392 0.228 0.245 0.612 +614 0.155 0.247 0.0728 0.138 0.391 0.227 0.245 0.608 +615 0.155 0.246 0.0721 0.138 0.39 0.225 0.245 0.605 +616 0.155 0.244 0.0715 0.137 0.388 0.223 0.245 0.601 +617 0.155 0.243 0.0709 0.136 0.387 0.222 0.245 0.598 +618 0.155 0.241 0.0703 0.135 0.386 0.22 0.245 0.595 +619 0.154 0.24 0.0698 0.135 0.385 0.218 0.245 0.592 +620 0.154 0.239 0.0693 0.134 0.384 0.216 0.244 0.589 +621 0.154 0.237 0.0688 0.133 0.383 0.215 0.244 0.586 +622 0.153 0.236 0.0684 0.132 0.382 0.213 0.244 0.583 +623 0.153 0.234 0.068 0.131 0.381 0.211 0.244 0.58 +624 0.153 0.233 0.0676 0.13 0.379 0.21 0.244 0.577 +625 0.152 0.232 0.0673 0.129 0.378 0.208 0.244 0.574 +626 0.152 0.23 0.067 0.128 0.377 0.206 0.244 0.571 +627 0.151 0.229 0.0667 0.127 0.376 0.204 0.244 0.569 +628 0.151 0.227 0.0665 0.126 0.375 0.203 0.244 0.566 +629 0.15 0.226 0.0662 0.125 0.374 0.201 0.244 0.563 +630 0.15 0.225 0.0661 0.124 0.373 0.199 0.244 0.561 +631 0.149 0.223 0.0659 0.123 0.371 0.198 0.244 0.558 +632 0.149 0.222 0.0658 0.122 0.37 0.196 0.244 0.556 +633 0.148 0.22 0.0657 0.121 0.369 0.194 0.244 0.553 +634 0.147 0.219 0.0656 0.119 0.368 0.193 0.244 0.551 +635 0.147 0.218 0.0655 0.118 0.367 0.191 0.244 0.549 +636 0.146 0.216 0.0655 0.117 0.366 0.189 0.244 0.546 +637 0.145 0.215 0.0655 0.116 0.364 0.188 0.244 0.544 +638 0.145 0.213 0.0655 0.115 0.363 0.186 0.243 0.542 +639 0.144 0.212 0.0656 0.113 0.362 0.184 0.243 0.54 +640 0.143 0.211 0.0656 0.112 0.361 0.183 0.243 0.538 +641 0.142 0.209 0.0657 0.111 0.36 0.181 0.243 0.536 +642 0.142 0.208 0.0658 0.109 0.359 0.18 0.243 0.533 +643 0.141 0.207 0.066 0.108 0.357 0.178 0.243 0.531 +644 0.14 0.205 0.0661 0.107 0.356 0.176 0.243 0.53 +645 0.139 0.204 0.0663 0.106 0.355 0.175 0.242 0.528 +646 0.139 0.203 0.0665 0.104 0.354 0.173 0.242 0.526 +647 0.138 0.202 0.0667 0.103 0.352 0.171 0.242 0.524 +648 0.137 0.2 0.0669 0.102 0.351 0.17 0.242 0.522 +649 0.136 0.199 0.0672 0.101 0.35 0.168 0.241 0.52 +650 0.136 0.198 0.0675 0.0993 0.349 0.167 0.241 0.519 +651 0.135 0.197 0.0677 0.098 0.347 0.165 0.241 0.517 +652 0.134 0.195 0.068 0.0968 0.346 0.163 0.24 0.515 +653 0.133 0.194 0.0683 0.0956 0.345 0.162 0.24 0.514 +654 0.133 0.193 0.0687 0.0943 0.344 0.16 0.239 0.512 +655 0.132 0.192 0.069 0.0931 0.342 0.159 0.239 0.51 +656 0.131 0.191 0.0694 0.0919 0.341 0.157 0.239 0.509 +657 0.13 0.189 0.0697 0.0908 0.339 0.155 0.238 0.507 +658 0.13 0.188 0.0701 0.0896 0.338 0.154 0.238 0.506 +659 0.129 0.187 0.0705 0.0885 0.337 0.152 0.237 0.504 +660 0.128 0.186 0.0709 0.0873 0.335 0.151 0.237 0.503 +661 0.127 0.185 0.0713 0.0862 0.334 0.149 0.236 0.501 +662 0.127 0.184 0.0718 0.0852 0.332 0.147 0.235 0.5 +663 0.126 0.183 0.0722 0.0841 0.331 0.146 0.235 0.499 +664 0.125 0.182 0.0726 0.0831 0.329 0.144 0.234 0.497 +665 0.124 0.181 0.0731 0.082 0.328 0.143 0.234 0.496 +666 0.124 0.18 0.0735 0.0811 0.326 0.141 0.233 0.495 +667 0.123 0.179 0.074 0.0801 0.325 0.14 0.232 0.493 +668 0.122 0.178 0.0745 0.0791 0.323 0.138 0.231 0.492 +669 0.122 0.177 0.075 0.0782 0.321 0.137 0.231 0.491 +670 0.121 0.176 0.0754 0.0773 0.32 0.135 0.23 0.489 +671 0.12 0.175 0.0759 0.0764 0.318 0.134 0.229 0.488 +672 0.119 0.174 0.0764 0.0756 0.317 0.132 0.228 0.487 +673 0.119 0.173 0.0769 0.0748 0.315 0.131 0.227 0.486 +674 0.118 0.172 0.0774 0.074 0.313 0.129 0.226 0.484 +675 0.117 0.171 0.0779 0.0732 0.312 0.128 0.226 0.483 +676 0.116 0.17 0.0784 0.0725 0.31 0.126 0.225 0.482 +677 0.115 0.169 0.0789 0.0717 0.308 0.125 0.224 0.481 +678 0.115 0.168 0.0794 0.071 0.307 0.124 0.223 0.479 +679 0.114 0.167 0.0799 0.0704 0.305 0.122 0.222 0.478 +680 0.113 0.166 0.0804 0.0697 0.303 0.121 0.221 0.477 +681 0.112 0.165 0.0809 0.0691 0.302 0.119 0.219 0.476 +682 0.111 0.165 0.0814 0.0685 0.3 0.118 0.218 0.474 +683 0.11 0.164 0.0819 0.0679 0.299 0.117 0.217 0.473 +684 0.11 0.163 0.0824 0.0674 0.297 0.115 0.216 0.472 +685 0.109 0.162 0.0829 0.0668 0.295 0.114 0.215 0.471 +686 0.108 0.161 0.0834 0.0663 0.294 0.113 0.214 0.47 +687 0.107 0.16 0.0839 0.0659 0.292 0.111 0.212 0.468 +688 0.106 0.16 0.0844 0.0654 0.291 0.11 0.211 0.467 +689 0.105 0.159 0.0848 0.0649 0.289 0.109 0.21 0.466 +690 0.104 0.158 0.0853 0.0645 0.288 0.107 0.209 0.465 +691 0.103 0.157 0.0857 0.0641 0.287 0.106 0.207 0.463 +692 0.102 0.157 0.0862 0.0637 0.285 0.105 0.206 0.462 +693 0.102 0.156 0.0866 0.0634 0.284 0.103 0.205 0.461 +694 0.101 0.155 0.0871 0.063 0.283 0.102 0.203 0.459 +695 0.0996 0.154 0.0875 0.0627 0.281 0.101 0.202 0.458 +696 0.0987 0.154 0.0879 0.0624 0.28 0.0998 0.2 0.457 +697 0.0977 0.153 0.0883 0.0621 0.279 0.0986 0.199 0.455 +698 0.0967 0.152 0.0887 0.0618 0.278 0.0974 0.198 0.454 +699 0.0957 0.151 0.0891 0.0615 0.277 0.0962 0.196 0.453 +700 0.0947 0.151 0.0894 0.0613 0.276 0.095 0.195 0.451 +701 0.0937 0.15 0.0898 0.061 0.275 0.0939 0.193 0.45 +702 0.0927 0.149 0.0901 0.0608 0.274 0.0927 0.192 0.449 +703 0.0917 0.149 0.0905 0.0606 0.273 0.0916 0.19 0.447 +704 0.0907 0.148 0.0908 0.0604 0.272 0.0905 0.188 0.446 +705 0.0897 0.147 0.0911 0.0602 0.271 0.0894 0.187 0.444 +706 0.0887 0.147 0.0914 0.06 0.271 0.0883 0.185 0.443 +707 0.0876 0.146 0.0917 0.0598 0.27 0.0872 0.184 0.441 +708 0.0866 0.145 0.0919 0.0597 0.269 0.0861 0.182 0.44 +709 0.0856 0.145 0.0922 0.0595 0.269 0.085 0.18 0.438 +710 0.0846 0.144 0.0924 0.0594 0.268 0.084 0.179 0.437 +711 0.0836 0.143 0.0926 0.0592 0.268 0.083 0.177 0.435 +712 0.0826 0.143 0.0928 0.0591 0.267 0.0819 0.175 0.433 +713 0.0816 0.142 0.093 0.059 0.267 0.0809 0.174 0.432 +714 0.0806 0.141 0.0931 0.0588 0.266 0.0799 0.172 0.43 +715 0.0796 0.141 0.0933 0.0587 0.266 0.0789 0.17 0.429 +716 0.0786 0.14 0.0934 0.0586 0.266 0.0779 0.169 0.427 +717 0.0776 0.139 0.0935 0.0585 0.265 0.077 0.167 0.425 +718 0.0767 0.139 0.0936 0.0584 0.265 0.076 0.165 0.423 +719 0.0757 0.138 0.0937 0.0583 0.265 0.0751 0.163 0.422 +720 0.0748 0.137 0.0937 0.0582 0.265 0.0742 0.162 0.42 +721 0.0738 0.136 0.0938 0.0581 0.264 0.0732 0.16 0.418 +722 0.0729 0.136 0.0938 0.0579 0.264 0.0723 0.158 0.416 +723 0.072 0.135 0.0938 0.0578 0.264 0.0714 0.156 0.414 +724 0.0711 0.134 0.0938 0.0577 0.264 0.0705 0.155 0.413 +725 0.0702 0.134 0.0937 0.0576 0.264 0.0697 0.153 0.411 +726 0.0693 0.133 0.0937 0.0575 0.263 0.0688 0.151 0.409 +727 0.0684 0.132 0.0936 0.0574 0.263 0.0679 0.149 0.407 +728 0.0676 0.132 0.0935 0.0573 0.263 0.0671 0.148 0.405 +729 0.0667 0.131 0.0934 0.0572 0.263 0.0662 0.146 0.403 +730 0.0659 0.13 0.0932 0.0571 0.263 0.0654 0.144 0.401 +731 0.0651 0.13 0.0931 0.0569 0.263 0.0646 0.142 0.399 +732 0.0643 0.129 0.0929 0.0568 0.262 0.0638 0.14 0.397 +733 0.0635 0.128 0.0927 0.0567 0.262 0.063 0.139 0.395 +734 0.0628 0.127 0.0925 0.0566 0.262 0.0622 0.137 0.393 +735 0.062 0.127 0.0923 0.0564 0.262 0.0614 0.135 0.391 +736 0.0613 0.126 0.092 0.0563 0.261 0.0606 0.133 0.388 +737 0.0606 0.125 0.0918 0.0561 0.261 0.0598 0.132 0.386 +738 0.0599 0.124 0.0915 0.056 0.261 0.0591 0.13 0.384 +739 0.0592 0.123 0.0912 0.0558 0.26 0.0583 0.128 0.382 +740 0.0585 0.123 0.0908 0.0557 0.26 0.0576 0.126 0.38 +741 0.0578 0.122 0.0905 0.0555 0.259 0.0568 0.124 0.377 +742 0.0572 0.121 0.0901 0.0553 0.259 0.0561 0.123 0.375 +743 0.0565 0.12 0.0897 0.0552 0.258 0.0554 0.121 0.373 +744 0.0559 0.119 0.0893 0.055 0.258 0.0547 0.119 0.371 +745 0.0553 0.118 0.0889 0.0548 0.257 0.054 0.118 0.368 +746 0.0547 0.118 0.0885 0.0546 0.256 0.0533 0.116 0.366 +747 0.0541 0.117 0.088 0.0544 0.256 0.0526 0.114 0.363 +748 0.0535 0.116 0.0876 0.0542 0.255 0.0519 0.112 0.361 +749 0.053 0.115 0.0871 0.0539 0.254 0.0512 0.111 0.359 +750 0.0524 0.114 0.0866 0.0537 0.253 0.0505 0.109 0.356 +751 0.0519 0.113 0.0861 0.0535 0.252 0.0499 0.107 0.354 +752 0.0513 0.112 0.0855 0.0532 0.251 0.0492 0.106 0.351 +753 0.0508 0.111 0.085 0.053 0.25 0.0486 0.104 0.349 +754 0.0503 0.11 0.0844 0.0527 0.249 0.0479 0.102 0.346 +755 0.0497 0.109 0.0838 0.0525 0.248 0.0473 0.101 0.344 +756 0.0492 0.108 0.0832 0.0522 0.246 0.0466 0.099 0.341 +757 0.0487 0.107 0.0826 0.0519 0.245 0.046 0.0974 0.339 +758 0.0482 0.106 0.082 0.0516 0.244 0.0454 0.0958 0.336 +759 0.0477 0.105 0.0814 0.0513 0.242 0.0447 0.0942 0.334 +760 0.0472 0.104 0.0807 0.051 0.241 0.0441 0.0926 0.331 +761 0.0467 0.103 0.0801 0.0507 0.239 0.0435 0.0911 0.329 +762 0.0462 0.102 0.0794 0.0504 0.238 0.0429 0.0895 0.326 +763 0.0457 0.101 0.0787 0.0501 0.236 0.0423 0.0879 0.323 +764 0.0452 0.0997 0.078 0.0497 0.234 0.0417 0.0864 0.321 +765 0.0447 0.0986 0.0773 0.0494 0.232 0.0411 0.0849 0.318 +766 0.0442 0.0974 0.0766 0.0491 0.23 0.0405 0.0834 0.315 +767 0.0437 0.0963 0.0759 0.0487 0.228 0.04 0.0819 0.313 +768 0.0432 0.0951 0.0751 0.0483 0.226 0.0394 0.0804 0.31 +769 0.0427 0.094 0.0744 0.048 0.224 0.0388 0.079 0.307 +770 0.0422 0.0928 0.0737 0.0476 0.222 0.0382 0.0775 0.305 +771 0.0417 0.0916 0.0729 0.0472 0.22 0.0377 0.0761 0.302 +772 0.0412 0.0904 0.0721 0.0468 0.218 0.0371 0.0747 0.299 +773 0.0407 0.0892 0.0713 0.0464 0.215 0.0366 0.0733 0.297 +774 0.0402 0.088 0.0706 0.046 0.213 0.036 0.0719 0.294 +775 0.0397 0.0868 0.0698 0.0456 0.211 0.0355 0.0705 0.291 +776 0.0391 0.0855 0.069 0.0452 0.208 0.0349 0.0691 0.288 +777 0.0386 0.0843 0.0682 0.0448 0.206 0.0344 0.0678 0.286 +778 0.0381 0.0831 0.0674 0.0443 0.203 0.0339 0.0665 0.283 +779 0.0375 0.0818 0.0665 0.0439 0.201 0.0333 0.0652 0.28 +780 0.037 0.0805 0.0657 0.0435 0.198 0.0328 0.0639 0.277 +781 0.0364 0.0793 0.0649 0.043 0.195 0.0323 0.0626 0.275 +782 0.0359 0.078 0.0641 0.0426 0.192 0.0318 0.0613 0.272 +783 0.0353 0.0768 0.0633 0.0421 0.19 0.0313 0.0601 0.269 +784 0.0348 0.0755 0.0624 0.0416 0.187 0.0308 0.0588 0.266 +785 0.0342 0.0742 0.0616 0.0412 0.184 0.0303 0.0576 0.264 +786 0.0336 0.0729 0.0607 0.0407 0.181 0.0298 0.0564 0.261 +787 0.033 0.0717 0.0599 0.0402 0.178 0.0293 0.0553 0.258 +788 0.0324 0.0704 0.0591 0.0397 0.175 0.0288 0.0541 0.255 +789 0.0319 0.0691 0.0582 0.0392 0.172 0.0283 0.0529 0.253 +790 0.0313 0.0678 0.0574 0.0388 0.169 0.0278 0.0518 0.25 +791 0.0307 0.0665 0.0566 0.0383 0.166 0.0273 0.0507 0.247 +792 0.0301 0.0653 0.0557 0.0378 0.163 0.0269 0.0496 0.245 +793 0.0295 0.064 0.0549 0.0372 0.16 0.0264 0.0485 0.242 +794 0.0289 0.0627 0.054 0.0367 0.156 0.0259 0.0474 0.239 +795 0.0283 0.0615 0.0532 0.0362 0.153 0.0255 0.0464 0.236 +796 0.0277 0.0602 0.0524 0.0357 0.15 0.025 0.0454 0.234 +797 0.0271 0.059 0.0515 0.0352 0.147 0.0246 0.0443 0.231 +798 0.0264 0.0577 0.0507 0.0347 0.144 0.0241 0.0433 0.228 +799 0.0258 0.0565 0.0499 0.0342 0.141 0.0237 0.0424 0.225 +800 0.0252 0.0552 0.049 0.0336 0.137 0.0233 0.0414 0.223 +# +# AATAAA/TGTAA box probabilities +[AATAAA] +# Size of vector +4096 +# Probabilities +aaaaaa 0.0183 +aacaaa 0.0141 +aagaaa 0.0218 +aataaa 0.6 +aataca 0.0353 +aatata 0.0707 +aatgaa 0.0117 +agtaaa 0.0232 +attaaa 0.124 +cataaa 0.0156 +gataaa 0.0117 +tataaa 0.0534 +# end of content independent part +[1] +# (a,c,g,t)= (0.295, 0.205, 0.205, 0.295) +# +# Probabilities file for the UTR model +# +# + +# +# The emission probabilities of single and initial 5' UTR exons +# +[EMISSION-5INITIAL] +# size of the emission vector +1024 +#k= +4 +# patpseudo : pseudocount for sequence patterns +1 +aaaaa 0.404 +aaaac 0.191 +aaaag 0.174 +aaaat 0.23 +aaaca 0.404 +aaacc 0.173 +aaacg 0.23 +aaact 0.193 +aaaga 0.261 +aaagc 0.259 +aaagg 0.152 +aaagt 0.328 +aaata 0.338 +aaatc 0.219 +aaatg 0.119 +aaatt 0.324 +aacaa 0.492 +aacac 0.168 +aacag 0.184 +aacat 0.156 +aacca 0.394 +aaccc 0.207 +aaccg 0.271 +aacct 0.128 +aacga 0.286 +aacgc 0.284 +aacgg 0.231 +aacgt 0.199 +aacta 0.244 +aactc 0.202 +aactg 0.292 +aactt 0.261 +aagaa 0.47 +aagac 0.13 +aagag 0.238 +aagat 0.162 +aagca 0.352 +aagcc 0.205 +aagcg 0.279 +aagct 0.164 +aagga 0.399 +aaggc 0.283 +aaggg 0.152 +aaggt 0.166 +aagta 0.185 +aagtc 0.154 +aagtg 0.4 +aagtt 0.261 +aataa 0.41 +aatac 0.168 +aatag 0.154 +aatat 0.267 +aatca 0.304 +aatcc 0.194 +aatcg 0.346 +aatct 0.155 +aatga 0.231 +aatgc 0.297 +aatgg 0.17 +aatgt 0.302 +aatta 0.248 +aattc 0.189 +aattg 0.245 +aattt 0.318 +acaaa 0.428 +acaac 0.25 +acaag 0.145 +acaat 0.177 +acaca 0.475 +acacc 0.152 +acacg 0.163 +acact 0.21 +acaga 0.28 +acagc 0.357 +acagg 0.12 +acagt 0.243 +acata 0.344 +acatc 0.228 +acatg 0.0966 +acatt 0.332 +accaa 0.39 +accac 0.222 +accag 0.221 +accat 0.167 +accca 0.417 +acccc 0.22 +acccg 0.222 +accct 0.141 +accga 0.367 +accgc 0.291 +accgg 0.151 +accgt 0.19 +accta 0.228 +acctc 0.216 +acctg 0.306 +acctt 0.25 +acgaa 0.432 +acgac 0.177 +acgag 0.215 +acgat 0.176 +acgca 0.344 +acgcc 0.195 +acgcg 0.285 +acgct 0.175 +acgga 0.351 +acggc 0.259 +acggg 0.146 +acggt 0.243 +acgta 0.209 +acgtc 0.193 +acgtg 0.332 +acgtt 0.267 +actaa 0.381 +actac 0.214 +actag 0.185 +actat 0.221 +actca 0.28 +actcc 0.211 +actcg 0.296 +actct 0.212 +actga 0.27 +actgc 0.309 +actgg 0.192 +actgt 0.23 +actta 0.19 +acttc 0.194 +acttg 0.236 +acttt 0.38 +agaaa 0.466 +agaac 0.151 +agaag 0.223 +agaat 0.161 +agaca 0.334 +agacc 0.197 +agacg 0.281 +agact 0.187 +agaga 0.362 +agagc 0.285 +agagg 0.16 +agagt 0.193 +agata 0.357 +agatc 0.229 +agatg 0.111 +agatt 0.302 +agcaa 0.371 +agcac 0.155 +agcag 0.34 +agcat 0.134 +agcca 0.424 +agccc 0.195 +agccg 0.266 +agcct 0.115 +agcga 0.352 +agcgc 0.238 +agcgg 0.251 +agcgt 0.159 +agcta 0.219 +agctc 0.212 +agctg 0.365 +agctt 0.204 +aggaa 0.397 +aggac 0.146 +aggag 0.267 +aggat 0.191 +aggca 0.363 +aggcc 0.194 +aggcg 0.301 +aggct 0.141 +aggga 0.329 +agggc 0.265 +agggg 0.244 +agggt 0.163 +aggta 0.15 +aggtc 0.195 +aggtg 0.361 +aggtt 0.294 +agtaa 0.386 +agtac 0.173 +agtag 0.23 +agtat 0.212 +agtca 0.291 +agtcc 0.189 +agtcg 0.349 +agtct 0.172 +agtga 0.289 +agtgc 0.31 +agtgg 0.154 +agtgt 0.247 +agtta 0.192 +agttc 0.211 +agttg 0.246 +agttt 0.351 +ataaa 0.467 +ataac 0.162 +ataag 0.148 +ataat 0.223 +ataca 0.438 +atacc 0.167 +atacg 0.21 +atact 0.185 +ataga 0.308 +atagc 0.284 +atagg 0.121 +atagt 0.287 +atata 0.413 +atatc 0.161 +atatg 0.104 +atatt 0.322 +atcaa 0.403 +atcac 0.164 +atcag 0.257 +atcat 0.176 +atcca 0.34 +atccc 0.215 +atccg 0.301 +atcct 0.144 +atcga 0.324 +atcgc 0.28 +atcgg 0.218 +atcgt 0.178 +atcta 0.227 +atctc 0.238 +atctg 0.305 +atctt 0.23 +atgaa 0.428 +atgac 0.151 +atgag 0.213 +atgat 0.209 +atgca 0.37 +atgcc 0.208 +atgcg 0.221 +atgct 0.201 +atgga 0.311 +atggc 0.31 +atggg 0.161 +atggt 0.218 +atgta 0.241 +atgtc 0.119 +atgtg 0.373 +atgtt 0.267 +attaa 0.405 +attac 0.162 +attag 0.18 +attat 0.253 +attca 0.29 +attcc 0.218 +attcg 0.308 +attct 0.185 +attga 0.257 +attgc 0.26 +attgg 0.19 +attgt 0.293 +attta 0.227 +atttc 0.189 +atttg 0.218 +atttt 0.366 +caaaa 0.416 +caaac 0.186 +caaag 0.165 +caaat 0.233 +caaca 0.457 +caacc 0.151 +caacg 0.192 +caact 0.201 +caaga 0.253 +caagc 0.262 +caagg 0.143 +caagt 0.341 +caata 0.264 +caatc 0.223 +caatg 0.104 +caatt 0.409 +cacaa 0.296 +cacac 0.352 +cacag 0.164 +cacat 0.189 +cacca 0.36 +caccc 0.207 +caccg 0.232 +cacct 0.201 +cacga 0.241 +cacgc 0.323 +cacgg 0.199 +cacgt 0.237 +cacta 0.175 +cactc 0.239 +cactg 0.28 +cactt 0.305 +cagaa 0.375 +cagac 0.177 +cagag 0.248 +cagat 0.2 +cagca 0.37 +cagcc 0.184 +cagcg 0.232 +cagct 0.215 +cagga 0.362 +caggc 0.315 +caggg 0.15 +caggt 0.174 +cagta 0.15 +cagtc 0.197 +cagtg 0.317 +cagtt 0.336 +cataa 0.344 +catac 0.211 +catag 0.139 +catat 0.306 +catca 0.265 +catcc 0.214 +catcg 0.312 +catct 0.21 +catga 0.212 +catgc 0.286 +catgg 0.161 +catgt 0.341 +catta 0.171 +cattc 0.214 +cattg 0.19 +cattt 0.425 +ccaaa 0.42 +ccaac 0.202 +ccaag 0.183 +ccaat 0.195 +ccaca 0.329 +ccacc 0.275 +ccacg 0.175 +ccact 0.221 +ccaga 0.244 +ccagc 0.356 +ccagg 0.127 +ccagt 0.273 +ccata 0.233 +ccatc 0.306 +ccatg 0.0964 +ccatt 0.364 +cccaa 0.335 +cccac 0.237 +cccag 0.22 +cccat 0.207 +cccca 0.329 +ccccc 0.272 +ccccg 0.231 +cccct 0.167 +cccga 0.291 +cccgc 0.332 +cccgg 0.154 +cccgt 0.223 +cccta 0.18 +ccctc 0.281 +ccctg 0.274 +ccctt 0.264 +ccgaa 0.378 +ccgac 0.159 +ccgag 0.215 +ccgat 0.248 +ccgca 0.299 +ccgcc 0.271 +ccgcg 0.207 +ccgct 0.224 +ccgga 0.318 +ccggc 0.291 +ccggg 0.165 +ccggt 0.225 +ccgta 0.176 +ccgtc 0.22 +ccgtg 0.275 +ccgtt 0.329 +cctaa 0.333 +cctac 0.203 +cctag 0.193 +cctat 0.271 +cctca 0.209 +cctcc 0.282 +cctcg 0.259 +cctct 0.25 +cctga 0.208 +cctgc 0.319 +cctgg 0.222 +cctgt 0.25 +cctta 0.189 +ccttc 0.211 +ccttg 0.224 +ccttt 0.376 +cgaaa 0.446 +cgaac 0.169 +cgaag 0.16 +cgaat 0.225 +cgaca 0.286 +cgacc 0.175 +cgacg 0.3 +cgact 0.239 +cgaga 0.276 +cgagc 0.275 +cgagg 0.143 +cgagt 0.307 +cgata 0.276 +cgatc 0.252 +cgatg 0.106 +cgatt 0.366 +cgcaa 0.295 +cgcac 0.226 +cgcag 0.273 +cgcat 0.206 +cgcca 0.315 +cgccc 0.199 +cgccg 0.304 +cgcct 0.181 +cgcga 0.277 +cgcgc 0.274 +cgcgg 0.166 +cgcgt 0.283 +cgcta 0.155 +cgctc 0.259 +cgctg 0.304 +cgctt 0.283 +cggaa 0.37 +cggac 0.176 +cggag 0.232 +cggat 0.222 +cggca 0.321 +cggcc 0.179 +cggcg 0.293 +cggct 0.208 +cggga 0.293 +cgggc 0.315 +cgggg 0.157 +cgggt 0.235 +cggta 0.153 +cggtc 0.247 +cggtg 0.263 +cggtt 0.337 +cgtaa 0.335 +cgtac 0.202 +cgtag 0.2 +cgtat 0.262 +cgtca 0.211 +cgtcc 0.165 +cgtcg 0.426 +cgtct 0.198 +cgtga 0.207 +cgtgc 0.283 +cgtgg 0.16 +cgtgt 0.349 +cgtta 0.147 +cgttc 0.228 +cgttg 0.23 +cgttt 0.395 +ctaaa 0.416 +ctaac 0.193 +ctaag 0.153 +ctaat 0.238 +ctaca 0.346 +ctacc 0.194 +ctacg 0.222 +ctact 0.238 +ctaga 0.277 +ctagc 0.287 +ctagg 0.118 +ctagt 0.318 +ctata 0.3 +ctatc 0.242 +ctatg 0.103 +ctatt 0.355 +ctcaa 0.359 +ctcac 0.197 +ctcag 0.257 +ctcat 0.188 +ctcca 0.327 +ctccc 0.204 +ctccg 0.27 +ctcct 0.199 +ctcga 0.286 +ctcgc 0.311 +ctcgg 0.182 +ctcgt 0.221 +ctcta 0.186 +ctctc 0.316 +ctctg 0.253 +ctctt 0.246 +ctgaa 0.422 +ctgac 0.172 +ctgag 0.187 +ctgat 0.219 +ctgca 0.297 +ctgcc 0.218 +ctgcg 0.248 +ctgct 0.237 +ctgga 0.268 +ctggc 0.361 +ctggg 0.148 +ctggt 0.222 +ctgta 0.151 +ctgtc 0.182 +ctgtg 0.333 +ctgtt 0.333 +cttaa 0.409 +cttac 0.171 +cttag 0.152 +cttat 0.268 +cttca 0.256 +cttcc 0.197 +cttcg 0.31 +cttct 0.236 +cttga 0.23 +cttgc 0.258 +cttgg 0.228 +cttgt 0.283 +cttta 0.17 +ctttc 0.207 +ctttg 0.222 +ctttt 0.401 +gaaaa 0.456 +gaaac 0.158 +gaaag 0.172 +gaaat 0.214 +gaaca 0.302 +gaacc 0.177 +gaacg 0.282 +gaact 0.239 +gaaga 0.329 +gaagc 0.264 +gaagg 0.149 +gaagt 0.257 +gaata 0.265 +gaatc 0.24 +gaatg 0.126 +gaatt 0.369 +gacaa 0.371 +gacac 0.206 +gacag 0.238 +gacat 0.185 +gacca 0.381 +gaccc 0.191 +gaccg 0.268 +gacct 0.161 +gacga 0.294 +gacgc 0.274 +gacgg 0.207 +gacgt 0.225 +gacta 0.184 +gactc 0.213 +gactg 0.272 +gactt 0.331 +gagaa 0.358 +gagac 0.132 +gagag 0.348 +gagat 0.162 +gagca 0.338 +gagcc 0.169 +gagcg 0.305 +gagct 0.188 +gagga 0.404 +gaggc 0.272 +gaggg 0.177 +gaggt 0.147 +gagta 0.151 +gagtc 0.152 +gagtg 0.417 +gagtt 0.279 +gataa 0.366 +gatac 0.201 +gatag 0.182 +gatat 0.251 +gatca 0.224 +gatcc 0.222 +gatcg 0.356 +gatct 0.197 +gatga 0.25 +gatgc 0.289 +gatgg 0.181 +gatgt 0.281 +gatta 0.187 +gattc 0.213 +gattg 0.213 +gattt 0.387 +gcaaa 0.402 +gcaac 0.244 +gcaag 0.155 +gcaat 0.199 +gcaca 0.382 +gcacc 0.191 +gcacg 0.191 +gcact 0.235 +gcaga 0.23 +gcagc 0.403 +gcagg 0.13 +gcagt 0.238 +gcata 0.245 +gcatc 0.248 +gcatg 0.116 +gcatt 0.391 +gccaa 0.371 +gccac 0.192 +gccag 0.267 +gccat 0.17 +gccca 0.362 +gcccc 0.245 +gcccg 0.238 +gccct 0.155 +gccga 0.277 +gccgc 0.336 +gccgg 0.168 +gccgt 0.219 +gccta 0.192 +gcctc 0.229 +gcctg 0.286 +gcctt 0.293 +gcgaa 0.379 +gcgac 0.171 +gcgag 0.248 +gcgat 0.203 +gcgca 0.303 +gcgcc 0.18 +gcgcg 0.304 +gcgct 0.212 +gcgga 0.333 +gcggc 0.297 +gcggg 0.136 +gcggt 0.235 +gcgta 0.157 +gcgtc 0.186 +gcgtg 0.362 +gcgtt 0.294 +gctaa 0.42 +gctac 0.17 +gctag 0.198 +gctat 0.212 +gctca 0.217 +gctcc 0.24 +gctcg 0.285 +gctct 0.258 +gctga 0.231 +gctgc 0.319 +gctgg 0.2 +gctgt 0.25 +gctta 0.206 +gcttc 0.192 +gcttg 0.231 +gcttt 0.371 +ggaaa 0.487 +ggaac 0.143 +ggaag 0.166 +ggaat 0.204 +ggaca 0.311 +ggacc 0.157 +ggacg 0.298 +ggact 0.234 +ggaga 0.277 +ggagc 0.308 +ggagg 0.183 +ggagt 0.232 +ggata 0.275 +ggatc 0.215 +ggatg 0.138 +ggatt 0.372 +ggcaa 0.362 +ggcac 0.161 +ggcag 0.301 +ggcat 0.176 +ggcca 0.482 +ggccc 0.192 +ggccg 0.21 +ggcct 0.116 +ggcga 0.314 +ggcgc 0.236 +ggcgg 0.252 +ggcgt 0.198 +ggcta 0.207 +ggctc 0.203 +ggctg 0.316 +ggctt 0.273 +gggaa 0.445 +gggac 0.132 +gggag 0.224 +gggat 0.199 +gggca 0.324 +gggcc 0.207 +gggcg 0.277 +gggct 0.192 +gggga 0.29 +ggggc 0.317 +ggggg 0.199 +ggggt 0.194 +gggta 0.156 +gggtc 0.184 +gggtg 0.371 +gggtt 0.289 +ggtaa 0.36 +ggtac 0.179 +ggtag 0.203 +ggtat 0.259 +ggtca 0.363 +ggtcc 0.162 +ggtcg 0.301 +ggtct 0.173 +ggtga 0.236 +ggtgc 0.256 +ggtgg 0.239 +ggtgt 0.268 +ggtta 0.179 +ggttc 0.224 +ggttg 0.252 +ggttt 0.345 +gtaaa 0.457 +gtaac 0.184 +gtaag 0.118 +gtaat 0.241 +gtaca 0.37 +gtacc 0.174 +gtacg 0.228 +gtact 0.228 +gtaga 0.273 +gtagc 0.292 +gtagg 0.127 +gtagt 0.309 +gtata 0.283 +gtatc 0.225 +gtatg 0.139 +gtatt 0.353 +gtcaa 0.331 +gtcac 0.24 +gtcag 0.236 +gtcat 0.192 +gtcca 0.338 +gtccc 0.188 +gtccg 0.29 +gtcct 0.185 +gtcga 0.24 +gtcgc 0.323 +gtcgg 0.199 +gtcgt 0.238 +gtcta 0.191 +gtctc 0.231 +gtctg 0.293 +gtctt 0.285 +gtgaa 0.454 +gtgac 0.159 +gtgag 0.195 +gtgat 0.193 +gtgca 0.295 +gtgcc 0.177 +gtgcg 0.32 +gtgct 0.208 +gtgga 0.317 +gtggc 0.281 +gtggg 0.179 +gtggt 0.222 +gtgta 0.14 +gtgtc 0.124 +gtgtg 0.478 +gtgtt 0.258 +gttaa 0.396 +gttac 0.161 +gttag 0.187 +gttat 0.256 +gttca 0.257 +gttcc 0.194 +gttcg 0.331 +gttct 0.219 +gttga 0.217 +gttgc 0.269 +gttgg 0.181 +gttgt 0.334 +gttta 0.187 +gtttc 0.187 +gtttg 0.21 +gtttt 0.416 +taaaa 0.378 +taaac 0.181 +taaag 0.142 +taaat 0.299 +taaca 0.346 +taacc 0.205 +taacg 0.203 +taact 0.246 +taaga 0.262 +taagc 0.287 +taagg 0.13 +taagt 0.32 +taata 0.292 +taatc 0.182 +taatg 0.118 +taatt 0.408 +tacaa 0.371 +tacac 0.204 +tacag 0.161 +tacat 0.264 +tacca 0.365 +taccc 0.187 +taccg 0.238 +tacct 0.21 +tacga 0.293 +tacgc 0.267 +tacgg 0.201 +tacgt 0.239 +tacta 0.221 +tactc 0.219 +tactg 0.213 +tactt 0.347 +tagaa 0.401 +tagac 0.161 +tagag 0.2 +tagat 0.238 +tagca 0.327 +tagcc 0.252 +tagcg 0.187 +tagct 0.234 +tagga 0.318 +taggc 0.303 +taggg 0.172 +taggt 0.207 +tagta 0.183 +tagtc 0.157 +tagtg 0.286 +tagtt 0.375 +tataa 0.296 +tatac 0.162 +tatag 0.131 +tatat 0.41 +tatca 0.273 +tatcc 0.18 +tatcg 0.32 +tatct 0.227 +tatga 0.21 +tatgc 0.238 +tatgg 0.139 +tatgt 0.413 +tatta 0.209 +tattc 0.165 +tattg 0.187 +tattt 0.44 +tcaaa 0.395 +tcaac 0.191 +tcaag 0.176 +tcaat 0.238 +tcaca 0.397 +tcacc 0.192 +tcacg 0.151 +tcact 0.261 +tcaga 0.224 +tcagc 0.318 +tcagg 0.0949 +tcagt 0.363 +tcata 0.226 +tcatc 0.288 +tcatg 0.0818 +tcatt 0.405 +tccaa 0.343 +tccac 0.219 +tccag 0.229 +tccat 0.208 +tccca 0.353 +tcccc 0.25 +tcccg 0.224 +tccct 0.172 +tccga 0.279 +tccgc 0.296 +tccgg 0.163 +tccgt 0.261 +tccta 0.172 +tcctc 0.28 +tcctg 0.252 +tcctt 0.296 +tcgaa 0.373 +tcgac 0.149 +tcgag 0.223 +tcgat 0.254 +tcgca 0.299 +tcgcc 0.227 +tcgcg 0.237 +tcgct 0.237 +tcgga 0.273 +tcggc 0.267 +tcggg 0.155 +tcggt 0.305 +tcgta 0.179 +tcgtc 0.236 +tcgtg 0.25 +tcgtt 0.335 +tctaa 0.329 +tctac 0.169 +tctag 0.222 +tctat 0.28 +tctca 0.209 +tctcc 0.208 +tctcg 0.275 +tctct 0.307 +tctga 0.222 +tctgc 0.281 +tctgg 0.209 +tctgt 0.288 +tctta 0.179 +tcttc 0.242 +tcttg 0.217 +tcttt 0.362 +tgaaa 0.445 +tgaac 0.154 +tgaag 0.159 +tgaat 0.241 +tgaca 0.326 +tgacc 0.192 +tgacg 0.217 +tgact 0.265 +tgaga 0.264 +tgagc 0.283 +tgagg 0.126 +tgagt 0.327 +tgata 0.271 +tgatc 0.174 +tgatg 0.144 +tgatt 0.411 +tgcaa 0.388 +tgcac 0.166 +tgcag 0.236 +tgcat 0.21 +tgcca 0.378 +tgccc 0.197 +tgccg 0.251 +tgcct 0.174 +tgcga 0.279 +tgcgc 0.242 +tgcgg 0.188 +tgcgt 0.291 +tgcta 0.19 +tgctc 0.238 +tgctg 0.328 +tgctt 0.245 +tggaa 0.398 +tggac 0.157 +tggag 0.202 +tggat 0.242 +tggca 0.313 +tggcc 0.253 +tggcg 0.22 +tggct 0.213 +tggga 0.304 +tgggc 0.297 +tgggg 0.159 +tgggt 0.24 +tggta 0.175 +tggtc 0.216 +tggtg 0.308 +tggtt 0.302 +tgtaa 0.361 +tgtac 0.189 +tgtag 0.152 +tgtat 0.297 +tgtca 0.286 +tgtcc 0.191 +tgtcg 0.289 +tgtct 0.234 +tgtga 0.195 +tgtgc 0.26 +tgtgg 0.122 +tgtgt 0.424 +tgtta 0.162 +tgttc 0.149 +tgttg 0.257 +tgttt 0.433 +ttaaa 0.427 +ttaac 0.156 +ttaag 0.156 +ttaat 0.261 +ttaca 0.349 +ttacc 0.223 +ttacg 0.191 +ttact 0.237 +ttaga 0.222 +ttagc 0.288 +ttagg 0.143 +ttagt 0.346 +ttata 0.264 +ttatc 0.186 +ttatg 0.11 +ttatt 0.439 +ttcaa 0.386 +ttcac 0.175 +ttcag 0.228 +ttcat 0.211 +ttcca 0.345 +ttccc 0.219 +ttccg 0.253 +ttcct 0.183 +ttcga 0.269 +ttcgc 0.27 +ttcgg 0.202 +ttcgt 0.259 +ttcta 0.204 +ttctc 0.228 +ttctg 0.251 +ttctt 0.316 +ttgaa 0.412 +ttgac 0.155 +ttgag 0.187 +ttgat 0.247 +ttgca 0.315 +ttgcc 0.242 +ttgcg 0.215 +ttgct 0.229 +ttgga 0.303 +ttggc 0.323 +ttggg 0.148 +ttggt 0.226 +ttgta 0.156 +ttgtc 0.134 +ttgtg 0.3 +ttgtt 0.409 +tttaa 0.358 +tttac 0.181 +tttag 0.16 +tttat 0.3 +tttca 0.247 +tttcc 0.222 +tttcg 0.316 +tttct 0.215 +tttga 0.206 +tttgc 0.245 +tttgg 0.197 +tttgt 0.352 +tttta 0.173 +ttttc 0.212 +ttttg 0.213 +ttttt 0.403 + +# 5' initial and single exon patterns: +# aaaaa 82843 +# aaaac 39191 +# aaaag 35637 +# aaaat 47216 +# aaaca 36440 +# aaacc 15586 +# aaacg 20805 +# aaact 17443 +# aaaga 21586 +# aaagc 21390 +# aaagg 12565 +# aaagt 27093 +# aaata 40299 +# aaatc 26101 +# aaatg 14177 +# aaatt 38609 +# aacaa 41540 +# aacac 14206 +# aacag 15534 +# aacat 13163 +# aacca 14586 +# aaccc 7646 +# aaccg 10051 +# aacct 4739 +# aacga 13823 +# aacgc 13728 +# aacgg 11162 +# aacgt 9614 +# aacta 11090 +# aactc 9181 +# aactg 13228 +# aactt 11859 +# aagaa 24660 +# aagac 6817 +# aagag 12475 +# aagat 8503 +# aagca 17908 +# aagcc 10425 +# aagcg 14182 +# aagct 8310 +# aagga 11172 +# aaggc 7942 +# aaggg 4260 +# aaggt 4648 +# aagta 11142 +# aagtc 9272 +# aagtg 24128 +# aagtt 15724 +# aataa 32498 +# aatac 13321 +# aatag 12200 +# aatat 21151 +# aatca 17293 +# aatcc 11027 +# aatcg 19693 +# aatct 8828 +# aatga 7139 +# aatgc 9151 +# aatgg 5241 +# aatgt 9308 +# aatta 23574 +# aattc 17999 +# aattg 23369 +# aattt 30289 +# acaaa 34993 +# acaac 20423 +# acaag 11807 +# acaat 14469 +# acaca 22368 +# acacc 7145 +# acacg 7665 +# acact 9909 +# acaga 10398 +# acagc 13243 +# acagg 4451 +# acagt 9014 +# acata 13226 +# acatc 8777 +# acatg 3717 +# acatt 12774 +# accaa 14408 +# accac 8216 +# accag 8149 +# accat 6162 +# accca 8147 +# acccc 4297 +# acccg 4342 +# accct 2765 +# accga 9120 +# accgc 7229 +# accgg 3753 +# accgt 4717 +# accta 3775 +# acctc 3567 +# acctg 5058 +# acctt 4129 +# acgaa 13989 +# acgac 5742 +# acgag 6964 +# acgat 5708 +# acgca 11424 +# acgcc 6487 +# acgcg 9476 +# acgct 5829 +# acgga 8752 +# acggc 6457 +# acggg 3632 +# acggt 6061 +# acgta 5306 +# acgtc 4907 +# acgtg 8440 +# acgtt 6795 +# actaa 9449 +# actac 5301 +# actag 4581 +# actat 5493 +# actca 7160 +# actcc 5405 +# actcg 7571 +# actct 5422 +# actga 8629 +# actgc 9883 +# actgg 6125 +# actgt 7343 +# actta 6745 +# acttc 6877 +# acttg 8366 +# acttt 13481 +# agaaa 29144 +# agaac 9425 +# agaag 13983 +# agaat 10052 +# agaca 7566 +# agacc 4463 +# agacg 6369 +# agact 4233 +# agaga 14540 +# agagc 11454 +# agagg 6410 +# agagt 7764 +# agata 10089 +# agatc 6483 +# agatg 3137 +# agatt 8540 +# agcaa 22383 +# agcac 9320 +# agcag 20469 +# agcat 8107 +# agcca 14372 +# agccc 6602 +# agccg 9016 +# agcct 3895 +# agcga 15362 +# agcgc 10385 +# agcgg 10969 +# agcgt 6959 +# agcta 7412 +# agctc 7171 +# agctg 12344 +# agctt 6900 +# aggaa 11708 +# aggac 4306 +# aggag 7883 +# aggat 5629 +# aggca 8241 +# aggcc 4398 +# aggcg 6838 +# aggct 3203 +# aggga 4115 +# agggc 3317 +# agggg 3051 +# agggt 2038 +# aggta 1978 +# aggtc 2578 +# aggtg 4774 +# aggtt 3878 +# agtaa 10785 +# agtac 4833 +# agtag 6422 +# agtat 5913 +# agtca 8005 +# agtcc 5197 +# agtcg 9587 +# agtct 4719 +# agtga 17297 +# agtgc 18610 +# agtgg 9251 +# agtgt 14796 +# agtta 9708 +# agttc 10664 +# agttg 12428 +# agttt 17739 +# ataaa 33136 +# ataac 11483 +# ataag 10487 +# ataat 15852 +# ataca 15393 +# atacc 5850 +# atacg 7385 +# atact 6495 +# ataga 9121 +# atagc 8428 +# atagg 3573 +# atagt 8520 +# atata 24808 +# atatc 9665 +# atatg 6231 +# atatt 19342 +# atcaa 15945 +# atcac 6508 +# atcag 10172 +# atcat 6970 +# atcca 9815 +# atccc 6189 +# atccg 8665 +# atcct 4160 +# atcga 15632 +# atcgc 13513 +# atcgg 10533 +# atcgt 8599 +# atcta 6200 +# atctc 6489 +# atctg 8300 +# atctt 6265 +# atgaa 7173 +# atgac 2532 +# atgag 3567 +# atgat 3497 +# atgca 7786 +# atgcc 4380 +# atgcg 4663 +# atgct 4232 +# atgga 3798 +# atggc 3788 +# atggg 1970 +# atggt 2664 +# atgta 5905 +# atgtc 2912 +# atgtg 9137 +# atgtt 6538 +# attaa 20448 +# attac 8194 +# attag 9100 +# attat 12795 +# attca 13291 +# attcc 9977 +# attcg 14111 +# attct 8477 +# attga 13172 +# attgc 13330 +# attgg 9751 +# attgt 15028 +# attta 20506 +# atttc 17018 +# atttg 19651 +# atttt 32973 +# caaaa 43418 +# caaac 19417 +# caaag 17161 +# caaat 24289 +# caaca 26215 +# caacc 8635 +# caacg 11018 +# caact 11503 +# caaga 10351 +# caagc 10723 +# caagg 5863 +# caagt 13926 +# caata 13225 +# caatc 11189 +# caatg 5237 +# caatt 20536 +# cacaa 16535 +# cacac 19660 +# cacag 9159 +# cacat 10541 +# cacca 9798 +# caccc 5624 +# caccg 6300 +# cacct 5470 +# cacga 5689 +# cacgc 7610 +# cacgg 4699 +# cacgt 5576 +# cacta 5553 +# cactc 7569 +# cactg 8869 +# cactt 9666 +# cagaa 14648 +# cagac 6902 +# cagag 9690 +# cagat 7824 +# cagca 21630 +# cagcc 10748 +# cagcg 13560 +# cagct 12574 +# cagga 6947 +# caggc 6041 +# caggg 2876 +# caggt 3341 +# cagta 6575 +# cagtc 8638 +# cagtg 13946 +# cagtt 14769 +# cataa 11634 +# catac 7130 +# catag 4703 +# catat 10359 +# catca 8822 +# catcc 7120 +# catcg 10403 +# catct 7004 +# catga 2652 +# catgc 3581 +# catgg 2016 +# catgt 4260 +# catta 7992 +# cattc 10020 +# cattg 8868 +# cattt 19897 +# ccaaa 22858 +# ccaac 10998 +# ccaag 9988 +# ccaat 10600 +# ccaca 10689 +# ccacc 8914 +# ccacg 5687 +# ccact 7176 +# ccaga 8743 +# ccagc 12753 +# ccagg 4529 +# ccagt 9779 +# ccata 6535 +# ccatc 8594 +# ccatg 2705 +# ccatt 10220 +# cccaa 10510 +# cccac 7440 +# cccag 6908 +# cccat 6491 +# cccca 6998 +# ccccc 5771 +# ccccg 4915 +# cccct 3555 +# cccga 5763 +# cccgc 6560 +# cccgg 3044 +# cccgt 4417 +# cccta 2476 +# ccctc 3861 +# ccctg 3758 +# ccctt 3628 +# ccgaa 12022 +# ccgac 5045 +# ccgag 6838 +# ccgat 7884 +# ccgca 9877 +# ccgcc 8937 +# ccgcg 6819 +# ccgct 7381 +# ccgga 5357 +# ccggc 4888 +# ccggg 2783 +# ccggt 3792 +# ccgta 4179 +# ccgtc 5208 +# ccgtg 6530 +# ccgtt 7796 +# cctaa 4282 +# cctac 2608 +# cctag 2480 +# cctat 3484 +# cctca 3490 +# cctcc 4714 +# cctcg 4327 +# cctct 4181 +# cctga 3879 +# cctgc 5946 +# cctgg 4126 +# cctgt 4659 +# cctta 3485 +# ccttc 3900 +# ccttg 4139 +# ccttt 6955 +# cgaaa 27117 +# cgaac 10240 +# cgaag 9721 +# cgaat 13685 +# cgaca 7318 +# cgacc 4466 +# cgacg 7675 +# cgact 6100 +# cgaga 9792 +# cgagc 9772 +# cgagg 5067 +# cgagt 10911 +# cgata 9622 +# cgatc 8806 +# cgatg 3689 +# cgatt 12768 +# cgcaa 13814 +# cgcac 10597 +# cgcag 12767 +# cgcat 9636 +# cgcca 10407 +# cgccc 6578 +# cgccg 10039 +# cgcct 5978 +# cgcga 10780 +# cgcgc 10662 +# cgcgg 6481 +# cgcgt 11009 +# cgcta 5022 +# cgctc 8403 +# cgctg 9867 +# cgctt 9198 +# cggaa 12483 +# cggac 5928 +# cggag 7851 +# cggat 7512 +# cggca 9512 +# cggcc 5296 +# cggcg 8676 +# cggct 6154 +# cggga 4658 +# cgggc 5006 +# cgggg 2498 +# cgggt 3739 +# cggta 4203 +# cggtc 6808 +# cggtg 7230 +# cggtt 9282 +# cgtaa 7221 +# cgtac 4361 +# cgtag 4315 +# cgtat 5645 +# cgtca 5373 +# cgtcc 4184 +# cgtcg 10835 +# cgtct 5043 +# cgtga 7584 +# cgtgc 10389 +# cgtgg 5877 +# cgtgt 12814 +# cgtta 5500 +# cgttc 8493 +# cgttg 8578 +# cgttt 14757 +# ctaaa 12696 +# ctaac 5893 +# ctaag 4680 +# ctaat 7269 +# ctaca 5361 +# ctacc 3013 +# ctacg 3437 +# ctact 3695 +# ctaga 4531 +# ctagc 4709 +# ctagg 1925 +# ctagt 5218 +# ctata 6009 +# ctatc 4853 +# ctatg 2067 +# ctatt 7125 +# ctcaa 8045 +# ctcac 4410 +# ctcag 5758 +# ctcat 4225 +# ctcca 7313 +# ctccc 4564 +# ctccg 6056 +# ctcct 4463 +# ctcga 7833 +# ctcgc 8511 +# ctcgg 4990 +# ctcgt 6057 +# ctcta 4677 +# ctctc 7954 +# ctctg 6359 +# ctctt 6194 +# ctgaa 11880 +# ctgac 4832 +# ctgag 5269 +# ctgat 6171 +# ctgca 10913 +# ctgcc 8008 +# ctgcg 9113 +# ctgct 8701 +# ctgga 6544 +# ctggc 8815 +# ctggg 3618 +# ctggt 5426 +# ctgta 4625 +# ctgtc 5572 +# ctgtg 10192 +# ctgtt 10186 +# cttaa 8829 +# cttac 3684 +# cttag 3267 +# cttat 5779 +# cttca 6061 +# cttcc 4662 +# cttcg 7347 +# cttct 5596 +# cttga 5940 +# cttgc 6662 +# cttgg 5881 +# cttgt 7301 +# cttta 7169 +# ctttc 8711 +# ctttg 9376 +# ctttt 16888 +# gaaaa 46563 +# gaaac 16179 +# gaaag 17567 +# gaaat 21827 +# gaaca 10445 +# gaacc 6101 +# gaacg 9738 +# gaact 8257 +# gaaga 13121 +# gaagc 10530 +# gaagg 5951 +# gaagt 10231 +# gaata 12304 +# gaatc 11104 +# gaatg 5852 +# gaatt 17092 +# gacaa 10067 +# gacac 5580 +# gacag 6455 +# gacat 5026 +# gacca 5953 +# gaccc 2980 +# gaccg 4185 +# gacct 2525 +# gacga 6974 +# gacgc 6511 +# gacgg 4927 +# gacgt 5344 +# gacta 3668 +# gactc 4247 +# gactg 5435 +# gactt 6612 +# gagaa 13568 +# gagac 5016 +# gagag 13216 +# gagat 6142 +# gagca 12234 +# gagcc 6134 +# gagcg 11066 +# gagct 6808 +# gagga 7794 +# gaggc 5245 +# gaggg 3415 +# gaggt 2831 +# gagta 4975 +# gagtc 5001 +# gagtg 13738 +# gagtt 9193 +# gataa 12422 +# gatac 6834 +# gatag 6180 +# gatat 8546 +# gatca 5683 +# gatcc 5638 +# gatcg 9026 +# gatct 4997 +# gatga 3552 +# gatgc 4110 +# gatgg 2572 +# gatgt 3997 +# gatta 7828 +# gattc 8910 +# gattg 8913 +# gattt 16197 +# gcaaa 27057 +# gcaac 16446 +# gcaag 10438 +# gcaat 13420 +# gcaca 12843 +# gcacc 6419 +# gcacg 6417 +# gcact 7910 +# gcaga 12628 +# gcagc 22145 +# gcagg 7143 +# gcagt 13096 +# gcata 8335 +# gcatc 8455 +# gcatg 3969 +# gcatt 13322 +# gccaa 17661 +# gccac 9165 +# gccag 12701 +# gccat 8101 +# gccca 8650 +# gcccc 5859 +# gcccg 5678 +# gccct 3716 +# gccga 8883 +# gccgc 10755 +# gccgg 5376 +# gccgt 7010 +# gccta 3487 +# gcctc 4170 +# gcctg 5205 +# gcctt 5322 +# gcgaa 17495 +# gcgac 7881 +# gcgag 11445 +# gcgat 9369 +# gcgca 11366 +# gcgcc 6758 +# gcgcg 11390 +# gcgct 7951 +# gcgga 10677 +# gcggc 9533 +# gcggg 4365 +# gcggt 7534 +# gcgta 5562 +# gcgtc 6585 +# gcgtg 12805 +# gcgtt 10382 +# gctaa 9723 +# gctac 3939 +# gctag 4587 +# gctat 4915 +# gctca 6070 +# gctcc 6738 +# gctcg 7989 +# gctct 7228 +# gctga 9226 +# gctgc 12771 +# gctgg 7992 +# gctgt 9994 +# gctta 6208 +# gcttc 5771 +# gcttg 6949 +# gcttt 11174 +# ggaaa 21226 +# ggaac 6233 +# ggaag 7250 +# ggaat 8915 +# ggaca 5362 +# ggacc 2706 +# ggacg 5130 +# ggact 4035 +# ggaga 7075 +# ggagc 7880 +# ggagg 4679 +# ggagt 5919 +# ggata 6536 +# ggatc 5113 +# ggatg 3289 +# ggatt 8842 +# ggcaa 12049 +# ggcac 5370 +# ggcag 10026 +# ggcat 5850 +# ggcca 10291 +# ggccc 4103 +# ggccg 4490 +# ggcct 2470 +# ggcga 8578 +# ggcgc 6425 +# ggcgg 6865 +# ggcgt 5407 +# ggcta 4052 +# ggctc 3974 +# ggctg 6180 +# ggctt 5328 +# gggaa 7424 +# gggac 2192 +# gggag 3738 +# gggat 3316 +# gggca 5305 +# gggcc 3388 +# gggcg 4545 +# gggct 3154 +# gggga 2945 +# ggggc 3211 +# ggggg 2017 +# ggggt 1969 +# gggta 1823 +# gggtc 2160 +# gggtg 4350 +# gggtt 3381 +# ggtaa 4332 +# ggtac 2151 +# ggtag 2438 +# ggtat 3115 +# ggtca 6060 +# ggtcc 2705 +# ggtcg 5020 +# ggtct 2893 +# ggtga 5541 +# ggtgc 6011 +# ggtgg 5605 +# ggtgt 6290 +# ggtta 4211 +# ggttc 5282 +# ggttg 5928 +# ggttt 8125 +# gtaaa 14984 +# gtaac 6038 +# gtaag 3858 +# gtaat 7898 +# gtaca 6202 +# gtacc 2916 +# gtacg 3822 +# gtact 3831 +# gtaga 4799 +# gtagc 5139 +# gtagg 2226 +# gtagt 5430 +# gtata 6652 +# gtatc 5283 +# gtatg 3266 +# gtatt 8310 +# gtcaa 8844 +# gtcac 6411 +# gtcag 6295 +# gtcat 5133 +# gtcca 5710 +# gtccc 3175 +# gtccg 4898 +# gtcct 3120 +# gtcga 7893 +# gtcgc 10605 +# gtcgg 6526 +# gtcgt 7809 +# gtcta 3529 +# gtctc 4258 +# gtctg 5410 +# gtctt 5265 +# gtgaa 19839 +# gtgac 6953 +# gtgag 8507 +# gtgat 8430 +# gtgca 15552 +# gtgcc 9314 +# gtgcg 16886 +# gtgct 10934 +# gtgga 9199 +# gtggc 8150 +# gtggg 5205 +# gtggt 6450 +# gtgta 8818 +# gtgtc 7761 +# gtgtg 30042 +# gtgtt 16199 +# gttaa 11407 +# gttac 4630 +# gttag 5371 +# gttat 7372 +# gttca 8520 +# gttcc 6429 +# gttcg 10989 +# gttct 7274 +# gttga 9112 +# gttgc 11307 +# gttgg 7604 +# gttgt 14049 +# gttta 12363 +# gtttc 12331 +# gtttg 13875 +# gtttt 27482 +# taaaa 32895 +# taaac 15764 +# taaag 12396 +# taaat 26056 +# taaca 11473 +# taacc 6805 +# taacg 6741 +# taact 8173 +# taaga 7508 +# taagc 8239 +# taagg 3739 +# taagt 9173 +# taata 13796 +# taatc 8616 +# taatg 5550 +# taatt 19258 +# tacaa 13589 +# tacac 7472 +# tacag 5876 +# tacat 9673 +# tacca 6548 +# taccc 3352 +# taccg 4276 +# tacct 3760 +# tacga 5870 +# tacgc 5355 +# tacgg 4024 +# tacgt 4786 +# tacta 4551 +# tactc 4527 +# tactg 4392 +# tactt 7160 +# tagaa 9878 +# tagac 3967 +# tagag 4926 +# tagat 5875 +# tagca 8608 +# tagcc 6619 +# tagcg 4933 +# tagct 6153 +# tagga 3717 +# taggc 3536 +# taggg 2014 +# taggt 2421 +# tagta 5279 +# tagtc 4530 +# tagtg 8249 +# tagtt 10820 +# tataa 14563 +# tatac 7975 +# tatag 6461 +# tatat 20172 +# tatca 7704 +# tatcc 5064 +# tatcg 9034 +# tatct 6385 +# tatga 3468 +# tatgc 3919 +# tatgg 2294 +# tatgt 6804 +# tatta 11329 +# tattc 8943 +# tattg 10110 +# tattt 23827 +# tcaaa 19684 +# tcaac 9530 +# tcaag 8769 +# tcaat 11892 +# tcaca 10029 +# tcacc 4838 +# tcacg 3806 +# tcact 6591 +# tcaga 7330 +# tcagc 10398 +# tcagg 3099 +# tcagt 11848 +# tcata 5825 +# tcatc 7423 +# tcatg 2109 +# tcatt 10441 +# tccaa 12047 +# tccac 7709 +# tccag 8060 +# tccat 7316 +# tccca 7636 +# tcccc 5407 +# tcccg 4852 +# tccct 3723 +# tccga 8012 +# tccgc 8506 +# tccgg 4688 +# tccgt 7483 +# tccta 3131 +# tcctc 5099 +# tcctg 4601 +# tcctt 5392 +# tcgaa 17185 +# tcgac 6855 +# tcgag 10275 +# tcgat 11711 +# tcgca 14116 +# tcgcc 10739 +# tcgcg 11197 +# tcgct 11220 +# tcgga 8998 +# tcggc 8783 +# tcggg 5114 +# tcggt 10049 +# tcgta 6543 +# tcgtc 8610 +# tcgtg 9118 +# tcgtt 12230 +# tctaa 7136 +# tctac 3671 +# tctag 4826 +# tctat 6081 +# tctca 5623 +# tctcc 5584 +# tctcg 7400 +# tctct 8256 +# tctga 6443 +# tctgc 8179 +# tctgg 6079 +# tctgt 8358 +# tctta 5202 +# tcttc 7034 +# tcttg 6295 +# tcttt 10518 +# tgaaa 25096 +# tgaac 8704 +# tgaag 8961 +# tgaat 13605 +# tgaca 6855 +# tgacc 4035 +# tgacg 4570 +# tgact 5583 +# tgaga 6689 +# tgagc 7192 +# tgagg 3199 +# tgagt 8289 +# tgata 7773 +# tgatc 4992 +# tgatg 4119 +# tgatt 11796 +# tgcaa 19271 +# tgcac 8235 +# tgcag 11711 +# tgcat 10400 +# tgcca 12694 +# tgccc 6626 +# tgccg 8413 +# tgcct 5843 +# tgcga 11451 +# tgcgc 9956 +# tgcgg 7731 +# tgcgt 11974 +# tgcta 6659 +# tgctc 8343 +# tgctg 11513 +# tgctt 8613 +# tggaa 12227 +# tggac 4830 +# tggag 6201 +# tggat 7432 +# tggca 10309 +# tggcc 8337 +# tggcg 7239 +# tggct 7011 +# tggga 4979 +# tgggc 4867 +# tgggg 2599 +# tgggt 3934 +# tggta 4023 +# tggtc 4977 +# tggtg 7092 +# tggtt 6954 +# tgtaa 10435 +# tgtac 5460 +# tgtag 4403 +# tgtat 8579 +# tgtca 7037 +# tgtcc 4701 +# tgtcg 7092 +# tgtct 5749 +# tgtga 13199 +# tgtgc 17643 +# tgtgg 8249 +# tgtgt 28728 +# tgtta 9400 +# tgttc 8638 +# tgttg 14903 +# tgttt 25120 +# ttaaa 26793 +# ttaac 9776 +# ttaag 9760 +# ttaat 16382 +# ttaca 9707 +# ttacc 6190 +# ttacg 5314 +# ttact 6584 +# ttaga 6161 +# ttagc 7986 +# ttagg 3967 +# ttagt 9596 +# ttata 11794 +# ttatc 8319 +# ttatg 4907 +# ttatt 19619 +# ttcaa 17125 +# ttcac 7749 +# ttcag 10089 +# ttcat 9375 +# ttcca 12300 +# ttccc 7801 +# ttccg 9022 +# ttcct 6527 +# ttcga 14361 +# ttcgc 14428 +# ttcgg 10762 +# ttcgt 13835 +# ttcta 7262 +# ttctc 8134 +# ttctg 8938 +# ttctt 11265 +# ttgaa 17625 +# ttgac 6643 +# ttgag 7990 +# ttgat 10567 +# ttgca 15354 +# ttgcc 11798 +# ttgcg 10471 +# ttgct 11178 +# ttgga 11296 +# ttggc 12056 +# ttggg 5542 +# ttggt 8431 +# ttgta 9580 +# ttgtc 8235 +# ttgtg 18446 +# ttgtt 25141 +# tttaa 22302 +# tttac 11303 +# tttag 9994 +# tttat 18703 +# tttca 16234 +# tttcc 14532 +# tttcg 20748 +# tttct 14089 +# tttga 14555 +# tttgc 17327 +# tttgg 13889 +# tttgt 24869 +# tttta 22308 +# ttttc 27335 +# ttttg 27532 +# ttttt 52052 + +# +# The emission probabilities of internal and terminal 5' UTR exons +# +[EMISSION-5] +# size of the emission vector +1024 +#k= +4 +# patpseudo : pseudocount for sequence patterns +1 +aaaaa 0.409 +aaaac 0.211 +aaaag 0.192 +aaaat 0.188 +aaaca 0.414 +aaacc 0.2 +aaacg 0.202 +aaact 0.184 +aaaga 0.274 +aaagc 0.283 +aaagg 0.188 +aaagt 0.254 +aaata 0.342 +aaatc 0.232 +aaatg 0.163 +aaatt 0.262 +aacaa 0.521 +aacac 0.159 +aacag 0.183 +aacat 0.137 +aacca 0.454 +aaccc 0.191 +aaccg 0.252 +aacct 0.104 +aacga 0.376 +aacgc 0.244 +aacgg 0.227 +aacgt 0.153 +aacta 0.293 +aactc 0.185 +aactg 0.303 +aactt 0.218 +aagaa 0.453 +aagac 0.149 +aagag 0.274 +aagat 0.125 +aagca 0.382 +aagcc 0.216 +aagcg 0.246 +aagct 0.156 +aagga 0.479 +aaggc 0.245 +aaggg 0.163 +aaggt 0.113 +aagta 0.212 +aagtc 0.187 +aagtg 0.371 +aagtt 0.23 +aataa 0.439 +aatac 0.176 +aatag 0.153 +aatat 0.231 +aatca 0.361 +aatcc 0.218 +aatcg 0.273 +aatct 0.148 +aatga 0.261 +aatgc 0.319 +aatgg 0.182 +aatgt 0.237 +aatta 0.269 +aattc 0.18 +aattg 0.261 +aattt 0.29 +acaaa 0.384 +acaac 0.303 +acaag 0.154 +acaat 0.159 +acaca 0.489 +acacc 0.201 +acacg 0.148 +acact 0.163 +acaga 0.258 +acagc 0.408 +acagg 0.148 +acagt 0.186 +acata 0.341 +acatc 0.28 +acatg 0.124 +acatt 0.255 +accaa 0.386 +accac 0.25 +accag 0.226 +accat 0.138 +accca 0.467 +acccc 0.226 +acccg 0.178 +accct 0.129 +accga 0.412 +accgc 0.285 +accgg 0.172 +accgt 0.131 +accta 0.253 +acctc 0.217 +acctg 0.293 +acctt 0.236 +acgaa 0.381 +acgac 0.227 +acgag 0.234 +acgat 0.158 +acgca 0.399 +acgcc 0.291 +acgcg 0.166 +acgct 0.144 +acgga 0.409 +acggc 0.289 +acggg 0.154 +acggt 0.148 +acgta 0.245 +acgtc 0.231 +acgtg 0.277 +acgtt 0.246 +actaa 0.371 +actac 0.239 +actag 0.192 +actat 0.197 +actca 0.31 +actcc 0.226 +actcg 0.284 +actct 0.181 +actga 0.304 +actgc 0.304 +actgg 0.226 +actgt 0.166 +actta 0.205 +acttc 0.198 +acttg 0.281 +acttt 0.316 +agaaa 0.403 +agaac 0.174 +agaag 0.281 +agaat 0.142 +agaca 0.373 +agacc 0.218 +agacg 0.258 +agact 0.15 +agaga 0.36 +agagc 0.297 +agagg 0.202 +agagt 0.141 +agata 0.35 +agatc 0.243 +agatg 0.149 +agatt 0.258 +agcaa 0.362 +agcac 0.138 +agcag 0.397 +agcat 0.103 +agcca 0.483 +agccc 0.168 +agccg 0.243 +agcct 0.105 +agcga 0.373 +agcgc 0.209 +agcgg 0.284 +agcgt 0.134 +agcta 0.232 +agctc 0.191 +agctg 0.401 +agctt 0.175 +aggaa 0.315 +aggac 0.181 +aggag 0.33 +aggat 0.173 +aggca 0.351 +aggcc 0.206 +aggcg 0.293 +aggct 0.15 +aggga 0.412 +agggc 0.235 +agggg 0.217 +agggt 0.136 +aggta 0.164 +aggtc 0.223 +aggtg 0.374 +aggtt 0.239 +agtaa 0.384 +agtac 0.215 +agtag 0.219 +agtat 0.183 +agtca 0.325 +agtcc 0.237 +agtcg 0.291 +agtct 0.146 +agtga 0.295 +agtgc 0.296 +agtgg 0.213 +agtgt 0.196 +agtta 0.199 +agttc 0.213 +agttg 0.281 +agttt 0.308 +ataaa 0.478 +ataac 0.163 +ataag 0.154 +ataat 0.205 +ataca 0.424 +atacc 0.213 +atacg 0.207 +atact 0.156 +ataga 0.341 +atagc 0.345 +atagg 0.137 +atagt 0.176 +atata 0.453 +atatc 0.169 +atatg 0.122 +atatt 0.256 +atcaa 0.422 +atcac 0.147 +atcag 0.256 +atcat 0.174 +atcca 0.361 +atccc 0.205 +atccg 0.267 +atcct 0.167 +atcga 0.374 +atcgc 0.279 +atcgg 0.201 +atcgt 0.147 +atcta 0.235 +atctc 0.209 +atctg 0.335 +atctt 0.221 +atgaa 0.361 +atgac 0.173 +atgag 0.241 +atgat 0.225 +atgca 0.368 +atgcc 0.236 +atgcg 0.188 +atgct 0.208 +atgga 0.399 +atggc 0.295 +atggg 0.143 +atggt 0.163 +atgta 0.22 +atgtc 0.148 +atgtg 0.383 +atgtt 0.249 +attaa 0.442 +attac 0.156 +attag 0.179 +attat 0.223 +attca 0.311 +attcc 0.234 +attcg 0.285 +attct 0.17 +attga 0.293 +attgc 0.279 +attgg 0.214 +attgt 0.213 +attta 0.252 +atttc 0.195 +atttg 0.247 +atttt 0.306 +caaaa 0.391 +caaac 0.207 +caaag 0.194 +caaat 0.208 +caaca 0.497 +caacc 0.153 +caacg 0.17 +caact 0.18 +caaga 0.28 +caagc 0.271 +caagg 0.196 +caagt 0.253 +caata 0.282 +caatc 0.255 +caatg 0.125 +caatt 0.339 +cacaa 0.303 +cacac 0.334 +cacag 0.174 +cacat 0.188 +cacca 0.448 +caccc 0.196 +caccg 0.211 +cacct 0.146 +cacga 0.29 +cacgc 0.323 +cacgg 0.195 +cacgt 0.192 +cacta 0.173 +cactc 0.227 +cactg 0.287 +cactt 0.312 +cagaa 0.373 +cagac 0.177 +cagag 0.266 +cagat 0.185 +cagca 0.495 +cagcc 0.179 +cagcg 0.182 +cagct 0.144 +cagga 0.53 +caggc 0.244 +caggg 0.129 +caggt 0.0973 +cagta 0.189 +cagtc 0.239 +cagtg 0.309 +cagtt 0.262 +cataa 0.38 +catac 0.195 +catag 0.152 +catat 0.272 +catca 0.35 +catcc 0.24 +catcg 0.242 +catct 0.168 +catga 0.282 +catgc 0.25 +catgg 0.205 +catgt 0.263 +catta 0.205 +cattc 0.175 +cattg 0.221 +cattt 0.399 +ccaaa 0.394 +ccaac 0.238 +ccaag 0.202 +ccaat 0.166 +ccaca 0.353 +ccacc 0.273 +ccacg 0.171 +ccact 0.203 +ccaga 0.265 +ccagc 0.363 +ccagg 0.181 +ccagt 0.191 +ccata 0.253 +ccatc 0.307 +ccatg 0.12 +ccatt 0.32 +cccaa 0.334 +cccac 0.236 +cccag 0.233 +cccat 0.196 +cccca 0.321 +ccccc 0.309 +ccccg 0.218 +cccct 0.152 +cccga 0.325 +cccgc 0.315 +cccgg 0.18 +cccgt 0.18 +cccta 0.188 +ccctc 0.285 +ccctg 0.266 +ccctt 0.261 +ccgaa 0.374 +ccgac 0.169 +ccgag 0.245 +ccgat 0.212 +ccgca 0.326 +ccgcc 0.325 +ccgcg 0.144 +ccgct 0.205 +ccgga 0.386 +ccggc 0.291 +ccggg 0.144 +ccggt 0.179 +ccgta 0.186 +ccgtc 0.28 +ccgtg 0.237 +ccgtt 0.297 +cctaa 0.372 +cctac 0.23 +cctag 0.221 +cctat 0.177 +cctca 0.262 +cctcc 0.338 +cctcg 0.219 +cctct 0.181 +cctga 0.225 +cctgc 0.31 +cctgg 0.245 +cctgt 0.219 +cctta 0.204 +ccttc 0.271 +ccttg 0.238 +ccttt 0.288 +cgaaa 0.445 +cgaac 0.161 +cgaag 0.194 +cgaat 0.201 +cgaca 0.325 +cgacc 0.179 +cgacg 0.289 +cgact 0.207 +cgaga 0.286 +cgagc 0.294 +cgagg 0.208 +cgagt 0.212 +cgata 0.26 +cgatc 0.289 +cgatg 0.143 +cgatt 0.308 +cgcaa 0.287 +cgcac 0.228 +cgcag 0.29 +cgcat 0.195 +cgcca 0.379 +cgccc 0.221 +cgccg 0.257 +cgcct 0.143 +cgcga 0.326 +cgcgc 0.26 +cgcgg 0.186 +cgcgt 0.227 +cgcta 0.165 +cgctc 0.265 +cgctg 0.329 +cgctt 0.241 +cggaa 0.362 +cggac 0.144 +cggag 0.285 +cggat 0.209 +cggca 0.377 +cggcc 0.185 +cggcg 0.272 +cggct 0.167 +cggga 0.362 +cgggc 0.282 +cgggg 0.216 +cgggt 0.14 +cggta 0.158 +cggtc 0.209 +cggtg 0.347 +cggtt 0.286 +cgtaa 0.331 +cgtac 0.206 +cgtag 0.229 +cgtat 0.235 +cgtca 0.246 +cgtcc 0.228 +cgtcg 0.349 +cgtct 0.177 +cgtga 0.237 +cgtgc 0.277 +cgtgg 0.225 +cgtgt 0.26 +cgtta 0.172 +cgttc 0.227 +cgttg 0.274 +cgttt 0.327 +ctaaa 0.42 +ctaac 0.196 +ctaag 0.17 +ctaat 0.214 +ctaca 0.399 +ctacc 0.193 +ctacg 0.222 +ctact 0.186 +ctaga 0.293 +ctagc 0.346 +ctagg 0.134 +ctagt 0.228 +ctata 0.317 +ctatc 0.232 +ctatg 0.17 +ctatt 0.281 +ctcaa 0.379 +ctcac 0.211 +ctcag 0.233 +ctcat 0.178 +ctcca 0.372 +ctccc 0.231 +ctccg 0.176 +ctcct 0.22 +ctcga 0.297 +ctcgc 0.344 +ctcgg 0.182 +ctcgt 0.177 +ctcta 0.197 +ctctc 0.329 +ctctg 0.244 +ctctt 0.23 +ctgaa 0.392 +ctgac 0.166 +ctgag 0.231 +ctgat 0.212 +ctgca 0.343 +ctgcc 0.238 +ctgcg 0.196 +ctgct 0.223 +ctgga 0.354 +ctggc 0.332 +ctggg 0.152 +ctggt 0.162 +ctgta 0.174 +ctgtc 0.221 +ctgtg 0.341 +ctgtt 0.264 +cttaa 0.44 +cttac 0.16 +cttag 0.194 +cttat 0.206 +cttca 0.265 +cttcc 0.236 +cttcg 0.276 +cttct 0.223 +cttga 0.277 +cttgc 0.239 +cttgg 0.271 +cttgt 0.213 +cttta 0.208 +ctttc 0.204 +ctttg 0.249 +ctttt 0.339 +gaaaa 0.411 +gaaac 0.193 +gaaag 0.202 +gaaat 0.194 +gaaca 0.35 +gaacc 0.209 +gaacg 0.221 +gaact 0.22 +gaaga 0.303 +gaagc 0.284 +gaagg 0.213 +gaagt 0.2 +gaata 0.278 +gaatc 0.306 +gaatg 0.136 +gaatt 0.28 +gacaa 0.362 +gacac 0.225 +gacag 0.247 +gacat 0.166 +gacca 0.406 +gaccc 0.209 +gaccg 0.199 +gacct 0.186 +gacga 0.404 +gacgc 0.228 +gacgg 0.2 +gacgt 0.168 +gacta 0.205 +gactc 0.214 +gactg 0.292 +gactt 0.289 +gagaa 0.338 +gagac 0.144 +gagag 0.377 +gagat 0.141 +gagca 0.399 +gagcc 0.188 +gagcg 0.248 +gagct 0.165 +gagga 0.471 +gaggc 0.256 +gaggg 0.167 +gaggt 0.106 +gagta 0.177 +gagtc 0.201 +gagtg 0.363 +gagtt 0.26 +gataa 0.356 +gatac 0.211 +gatag 0.189 +gatat 0.244 +gatca 0.283 +gatcc 0.256 +gatcg 0.254 +gatct 0.207 +gatga 0.32 +gatgc 0.288 +gatgg 0.17 +gatgt 0.221 +gatta 0.216 +gattc 0.225 +gattg 0.234 +gattt 0.325 +gcaaa 0.363 +gcaac 0.316 +gcaag 0.137 +gcaat 0.184 +gcaca 0.392 +gcacc 0.242 +gcacg 0.151 +gcact 0.215 +gcaga 0.197 +gcagc 0.505 +gcagg 0.146 +gcagt 0.153 +gcata 0.229 +gcatc 0.304 +gcatg 0.137 +gcatt 0.331 +gccaa 0.349 +gccac 0.206 +gccag 0.292 +gccat 0.153 +gccca 0.416 +gcccc 0.273 +gcccg 0.193 +gccct 0.118 +gccga 0.281 +gccgc 0.34 +gccgg 0.211 +gccgt 0.168 +gccta 0.176 +gcctc 0.257 +gcctg 0.285 +gcctt 0.282 +gcgaa 0.365 +gcgac 0.2 +gcgag 0.271 +gcgat 0.164 +gcgca 0.342 +gcgcc 0.241 +gcgcg 0.202 +gcgct 0.216 +gcgga 0.377 +gcggc 0.342 +gcggg 0.14 +gcggt 0.141 +gcgta 0.194 +gcgtc 0.204 +gcgtg 0.335 +gcgtt 0.268 +gctaa 0.382 +gctac 0.198 +gctag 0.207 +gctat 0.213 +gctca 0.293 +gctcc 0.259 +gctcg 0.21 +gctct 0.238 +gctga 0.25 +gctgc 0.366 +gctgg 0.205 +gctgt 0.179 +gctta 0.215 +gcttc 0.244 +gcttg 0.21 +gcttt 0.331 +ggaaa 0.425 +ggaac 0.174 +ggaag 0.205 +ggaat 0.197 +ggaca 0.357 +ggacc 0.187 +ggacg 0.241 +ggact 0.215 +ggaga 0.247 +ggagc 0.32 +ggagg 0.251 +ggagt 0.182 +ggata 0.292 +ggatc 0.295 +ggatg 0.126 +ggatt 0.286 +ggcaa 0.387 +ggcac 0.171 +ggcag 0.315 +ggcat 0.127 +ggcca 0.503 +ggccc 0.195 +ggccg 0.175 +ggcct 0.127 +ggcga 0.333 +ggcgc 0.217 +ggcgg 0.289 +ggcgt 0.161 +ggcta 0.236 +ggctc 0.212 +ggctg 0.317 +ggctt 0.236 +gggaa 0.397 +gggac 0.145 +gggag 0.292 +gggat 0.165 +gggca 0.346 +gggcc 0.185 +gggcg 0.29 +gggct 0.179 +gggga 0.382 +ggggc 0.298 +ggggg 0.199 +ggggt 0.121 +gggta 0.203 +gggtc 0.225 +gggtg 0.333 +gggtt 0.24 +ggtaa 0.326 +ggtac 0.202 +ggtag 0.285 +ggtat 0.187 +ggtca 0.351 +ggtcc 0.216 +ggtcg 0.271 +ggtct 0.161 +ggtga 0.225 +ggtgc 0.256 +ggtgg 0.259 +ggtgt 0.259 +ggtta 0.233 +ggttc 0.229 +ggttg 0.226 +ggttt 0.312 +gtaaa 0.489 +gtaac 0.184 +gtaag 0.137 +gtaat 0.19 +gtaca 0.398 +gtacc 0.194 +gtacg 0.209 +gtact 0.199 +gtaga 0.29 +gtagc 0.337 +gtagg 0.152 +gtagt 0.221 +gtata 0.319 +gtatc 0.232 +gtatg 0.135 +gtatt 0.313 +gtcaa 0.362 +gtcac 0.202 +gtcag 0.235 +gtcat 0.201 +gtcca 0.404 +gtccc 0.185 +gtccg 0.225 +gtcct 0.187 +gtcga 0.278 +gtcgc 0.311 +gtcgg 0.214 +gtcgt 0.197 +gtcta 0.196 +gtctc 0.218 +gtctg 0.341 +gtctt 0.244 +gtgaa 0.443 +gtgac 0.143 +gtgag 0.221 +gtgat 0.193 +gtgca 0.337 +gtgcc 0.203 +gtgcg 0.265 +gtgct 0.195 +gtgga 0.378 +gtggc 0.276 +gtggg 0.171 +gtggt 0.176 +gtgta 0.162 +gtgtc 0.136 +gtgtg 0.456 +gtgtt 0.246 +gttaa 0.409 +gttac 0.189 +gttag 0.183 +gttat 0.219 +gttca 0.26 +gttcc 0.24 +gttcg 0.281 +gttct 0.218 +gttga 0.235 +gttgc 0.301 +gttgg 0.221 +gttgt 0.243 +gttta 0.214 +gtttc 0.222 +gtttg 0.222 +gtttt 0.343 +taaaa 0.389 +taaac 0.196 +taaag 0.156 +taaat 0.259 +taaca 0.371 +taacc 0.234 +taacg 0.187 +taact 0.208 +taaga 0.271 +taagc 0.331 +taagg 0.169 +taagt 0.229 +taata 0.274 +taatc 0.234 +taatg 0.144 +taatt 0.348 +tacaa 0.354 +tacac 0.222 +tacag 0.171 +tacat 0.254 +tacca 0.375 +taccc 0.24 +taccg 0.23 +tacct 0.155 +tacga 0.322 +tacgc 0.265 +tacgg 0.207 +tacgt 0.207 +tacta 0.235 +tactc 0.205 +tactg 0.236 +tactt 0.324 +tagaa 0.362 +tagac 0.173 +tagag 0.271 +tagat 0.194 +tagca 0.41 +tagcc 0.264 +tagcg 0.154 +tagct 0.173 +tagga 0.427 +taggc 0.301 +taggg 0.155 +taggt 0.117 +tagta 0.179 +tagtc 0.219 +tagtg 0.272 +tagtt 0.33 +tataa 0.29 +tatac 0.169 +tatag 0.15 +tatat 0.39 +tatca 0.307 +tatcc 0.235 +tatcg 0.24 +tatct 0.217 +tatga 0.245 +tatgc 0.29 +tatgg 0.16 +tatgt 0.305 +tatta 0.219 +tattc 0.179 +tattg 0.185 +tattt 0.417 +tcaaa 0.358 +tcaac 0.241 +tcaag 0.181 +tcaat 0.221 +tcaca 0.38 +tcacc 0.272 +tcacg 0.153 +tcact 0.194 +tcaga 0.231 +tcagc 0.375 +tcagg 0.143 +tcagt 0.251 +tcata 0.218 +tcatc 0.358 +tcatg 0.0968 +tcatt 0.327 +tccaa 0.305 +tccac 0.238 +tccag 0.26 +tccat 0.197 +tccca 0.361 +tcccc 0.268 +tcccg 0.192 +tccct 0.178 +tccga 0.267 +tccgc 0.329 +tccgg 0.198 +tccgt 0.207 +tccta 0.148 +tcctc 0.276 +tcctg 0.291 +tcctt 0.284 +tcgaa 0.375 +tcgac 0.183 +tcgag 0.234 +tcgat 0.208 +tcgca 0.305 +tcgcc 0.288 +tcgcg 0.176 +tcgct 0.231 +tcgga 0.327 +tcggc 0.297 +tcggg 0.184 +tcggt 0.192 +tcgta 0.16 +tcgtc 0.269 +tcgtg 0.232 +tcgtt 0.339 +tctaa 0.329 +tctac 0.235 +tctag 0.168 +tctat 0.269 +tctca 0.232 +tctcc 0.227 +tctcg 0.238 +tctct 0.304 +tctga 0.243 +tctgc 0.291 +tctgg 0.233 +tctgt 0.233 +tctta 0.193 +tcttc 0.294 +tcttg 0.204 +tcttt 0.308 +tgaaa 0.423 +tgaac 0.175 +tgaag 0.198 +tgaat 0.204 +tgaca 0.358 +tgacc 0.225 +tgacg 0.221 +tgact 0.196 +tgaga 0.269 +tgagc 0.303 +tgagg 0.2 +tgagt 0.228 +tgata 0.254 +tgatc 0.21 +tgatg 0.194 +tgatt 0.342 +tgcaa 0.383 +tgcac 0.146 +tgcag 0.263 +tgcat 0.208 +tgcca 0.455 +tgccc 0.172 +tgccg 0.231 +tgcct 0.142 +tgcga 0.366 +tgcgc 0.194 +tgcgg 0.203 +tgcgt 0.237 +tgcta 0.214 +tgctc 0.221 +tgctg 0.349 +tgctt 0.216 +tggaa 0.384 +tggac 0.175 +tggag 0.247 +tggat 0.194 +tggca 0.315 +tggcc 0.28 +tggcg 0.218 +tggct 0.187 +tggga 0.344 +tgggc 0.349 +tgggg 0.148 +tgggt 0.158 +tggta 0.154 +tggtc 0.233 +tggtg 0.334 +tggtt 0.279 +tgtaa 0.378 +tgtac 0.211 +tgtag 0.169 +tgtat 0.243 +tgtca 0.279 +tgtcc 0.221 +tgtcg 0.276 +tgtct 0.223 +tgtga 0.219 +tgtgc 0.265 +tgtgg 0.168 +tgtgt 0.348 +tgtta 0.183 +tgttc 0.181 +tgttg 0.31 +tgttt 0.326 +ttaaa 0.418 +ttaac 0.181 +ttaag 0.165 +ttaat 0.237 +ttaca 0.359 +ttacc 0.218 +ttacg 0.205 +ttact 0.218 +ttaga 0.221 +ttagc 0.367 +ttagg 0.16 +ttagt 0.252 +ttata 0.269 +ttatc 0.212 +ttatg 0.176 +ttatt 0.343 +ttcaa 0.399 +ttcac 0.187 +ttcag 0.213 +ttcat 0.202 +ttcca 0.361 +ttccc 0.221 +ttccg 0.246 +ttcct 0.172 +ttcga 0.304 +ttcgc 0.263 +ttcgg 0.2 +ttcgt 0.233 +ttcta 0.179 +ttctc 0.254 +ttctg 0.287 +ttctt 0.28 +ttgaa 0.386 +ttgac 0.176 +ttgag 0.212 +ttgat 0.226 +ttgca 0.397 +ttgcc 0.239 +ttgcg 0.168 +ttgct 0.197 +ttgga 0.37 +ttggc 0.314 +ttggg 0.153 +ttggt 0.163 +ttgta 0.205 +ttgtc 0.174 +ttgtg 0.31 +ttgtt 0.312 +tttaa 0.4 +tttac 0.163 +tttag 0.159 +tttat 0.278 +tttca 0.255 +tttcc 0.265 +tttcg 0.275 +tttct 0.205 +tttga 0.255 +tttgc 0.245 +tttgg 0.228 +tttgt 0.272 +tttta 0.2 +ttttc 0.204 +ttttg 0.238 +ttttt 0.357 + +# 5' internal and terminal exon patterns: +# aaaaa 20612 +# aaaac 10643 +# aaaag 9700 +# aaaat 9478 +# aaaca 10619 +# aaacc 5128 +# aaacg 5183 +# aaact 4733 +# aaaga 6498 +# aaagc 6712 +# aaagg 4447 +# aaagt 6026 +# aaata 8840 +# aaatc 6009 +# aaatg 4217 +# aaatt 6782 +# aacaa 14633 +# aacac 4456 +# aacag 5145 +# aacat 3845 +# aacca 5681 +# aaccc 2385 +# aaccg 3148 +# aacct 1295 +# aacga 4773 +# aacgc 3104 +# aacgg 2886 +# aacgt 1942 +# aacta 3713 +# aactc 2340 +# aactg 3835 +# aactt 2764 +# aagaa 7287 +# aagac 2404 +# aagag 4405 +# aagat 2005 +# aagca 6241 +# aagcc 3532 +# aagcg 4008 +# aagct 2539 +# aagga 5274 +# aaggc 2700 +# aaggg 1798 +# aaggt 1241 +# aagta 2907 +# aagtc 2565 +# aagtg 5077 +# aagtt 3150 +# aataa 8115 +# aatac 3256 +# aatag 2835 +# aatat 4271 +# aatca 5444 +# aatcc 3279 +# aatcg 4114 +# aatct 2234 +# aatga 2324 +# aatgc 2838 +# aatgg 1618 +# aatgt 2110 +# aatta 4841 +# aattc 3242 +# aattg 4693 +# aattt 5222 +# acaaa 10143 +# acaac 8009 +# acaag 4078 +# acaat 4215 +# acaca 6995 +# acacc 2872 +# acacg 2111 +# acact 2333 +# acaga 3077 +# acagc 4863 +# acagg 1766 +# acagt 2221 +# acata 3713 +# acatc 3045 +# acatg 1351 +# acatt 2775 +# accaa 5459 +# accac 3544 +# accag 3204 +# accat 1946 +# accca 3062 +# acccc 1481 +# acccg 1168 +# accct 847 +# accga 3056 +# accgc 2111 +# accgg 1277 +# accgt 974 +# accta 1141 +# acctc 978 +# acctg 1322 +# acctt 1064 +# acgaa 4190 +# acgac 2497 +# acgag 2575 +# acgat 1741 +# acgca 3202 +# acgcc 2336 +# acgcg 1332 +# acgct 1159 +# acgga 2653 +# acggc 1872 +# acggg 995 +# acggt 961 +# acgta 1298 +# acgtc 1224 +# acgtg 1467 +# acgtt 1302 +# actaa 2628 +# actac 1695 +# actag 1363 +# actat 1399 +# actca 1886 +# actcc 1376 +# actcg 1726 +# actct 1099 +# actga 2620 +# actgc 2622 +# actgg 1946 +# actgt 1433 +# actta 1660 +# acttc 1605 +# acttg 2278 +# acttt 2561 +# agaaa 7404 +# agaac 3190 +# agaag 5164 +# agaat 2611 +# agaca 2777 +# agacc 1628 +# agacg 1926 +# agact 1121 +# agaga 5064 +# agagc 4170 +# agagg 2842 +# agagt 1986 +# agata 2534 +# agatc 1764 +# agatg 1082 +# agatt 1866 +# agcaa 9200 +# agcac 3521 +# agcag 10101 +# agcat 2621 +# agcca 5744 +# agccc 1998 +# agccg 2891 +# agcct 1247 +# agcga 4633 +# agcgc 2597 +# agcgg 3528 +# agcgt 1661 +# agcta 2137 +# agctc 1755 +# agctg 3690 +# agctt 1612 +# aggaa 4786 +# aggac 2755 +# aggag 5024 +# aggat 2636 +# aggca 2782 +# aggcc 1634 +# aggcg 2325 +# aggct 1185 +# aggga 1987 +# agggc 1133 +# agggg 1045 +# agggt 655 +# aggta 550 +# aggtc 750 +# aggtg 1258 +# aggtt 805 +# agtaa 2646 +# agtac 1480 +# agtag 1508 +# agtat 1258 +# agtca 2427 +# agtcc 1766 +# agtcg 2172 +# agtct 1091 +# agtga 3571 +# agtgc 3588 +# agtgg 2583 +# agtgt 2370 +# agtta 1824 +# agttc 1956 +# agttg 2578 +# agttt 2829 +# ataaa 8405 +# ataac 2876 +# ataag 2715 +# ataat 3603 +# ataca 3642 +# atacc 1826 +# atacg 1778 +# atact 1335 +# ataga 2515 +# atagc 2544 +# atagg 1011 +# atagt 1300 +# atata 5885 +# atatc 2202 +# atatg 1584 +# atatt 3329 +# atcaa 5495 +# atcac 1918 +# atcag 3338 +# atcat 2267 +# atcca 3268 +# atccc 1858 +# atccg 2420 +# atcct 1511 +# atcga 3720 +# atcgc 2774 +# atcgg 1997 +# atcgt 1467 +# atcta 1598 +# atctc 1422 +# atctg 2275 +# atctt 1498 +# atgaa 2140 +# atgac 1025 +# atgag 1430 +# atgat 1335 +# atgca 2338 +# atgcc 1499 +# atgcg 1190 +# atgct 1321 +# atgga 1560 +# atggc 1152 +# atggg 558 +# atggt 635 +# atgta 1203 +# atgtc 811 +# atgtg 2100 +# atgtt 1361 +# attaa 4692 +# attac 1651 +# attag 1899 +# attat 2361 +# attca 2628 +# attcc 1973 +# attcg 2407 +# attct 1435 +# attga 3082 +# attgc 2932 +# attgg 2252 +# attgt 2242 +# attta 3948 +# atttc 3056 +# atttg 3858 +# atttt 4788 +# caaaa 11557 +# caaac 6117 +# caaag 5719 +# caaat 6142 +# caaca 10908 +# caacc 3351 +# caacg 3722 +# caact 3954 +# caaga 3619 +# caagc 3499 +# caagg 2528 +# caagt 3259 +# caata 3946 +# caatc 3566 +# caatg 1749 +# caatt 4750 +# cacaa 5179 +# cacac 5718 +# cacag 2981 +# cacat 3218 +# cacca 4495 +# caccc 1965 +# caccg 2112 +# cacct 1462 +# cacga 1857 +# cacgc 2071 +# cacgg 1249 +# cacgt 1228 +# cacta 1372 +# cactc 1796 +# cactg 2274 +# cactt 2471 +# cagaa 4548 +# cagac 2160 +# cagag 3241 +# cagat 2257 +# cagca 11077 +# cagcc 3996 +# cagcg 4073 +# cagct 3224 +# cagga 4284 +# caggc 1970 +# caggg 1038 +# caggt 785 +# cagta 1832 +# cagtc 2318 +# cagtg 2995 +# cagtt 2539 +# cataa 3501 +# catac 1793 +# catag 1400 +# catat 2507 +# catca 3663 +# catcc 2516 +# catcg 2534 +# catct 1764 +# catga 1180 +# catgc 1047 +# catgg 856 +# catgt 1101 +# catta 2132 +# cattc 1824 +# cattg 2303 +# cattt 4153 +# ccaaa 6893 +# ccaac 4153 +# ccaag 3530 +# ccaat 2908 +# ccaca 4061 +# ccacc 3132 +# ccacg 1963 +# ccact 2336 +# ccaga 3375 +# ccagc 4611 +# ccagg 2301 +# ccagt 2430 +# ccata 2115 +# ccatc 2570 +# ccatg 1003 +# ccatt 2674 +# cccaa 3366 +# cccac 2377 +# cccag 2348 +# cccat 1975 +# cccca 2224 +# ccccc 2137 +# ccccg 1509 +# cccct 1051 +# cccga 1634 +# cccgc 1583 +# cccgg 904 +# cccgt 906 +# cccta 702 +# ccctc 1062 +# ccctg 994 +# ccctt 973 +# ccgaa 3234 +# ccgac 1461 +# ccgag 2121 +# ccgat 1837 +# ccgca 2792 +# ccgcc 2780 +# ccgcg 1229 +# ccgct 1757 +# ccgga 2008 +# ccggc 1516 +# ccggg 751 +# ccggt 929 +# ccgta 854 +# ccgtc 1287 +# ccgtg 1091 +# ccgtt 1363 +# cctaa 1261 +# cctac 779 +# cctag 748 +# cctat 601 +# cctca 1195 +# cctcc 1540 +# cctcg 995 +# cctct 823 +# cctga 1134 +# cctgc 1561 +# cctgg 1233 +# cctgt 1103 +# cctta 957 +# ccttc 1274 +# ccttg 1119 +# ccttt 1353 +# cgaaa 6759 +# cgaac 2438 +# cgaag 2943 +# cgaat 3048 +# cgaca 2578 +# cgacc 1425 +# cgacg 2296 +# cgact 1644 +# cgaga 2873 +# cgagc 2949 +# cgagg 2089 +# cgagt 2130 +# cgata 1923 +# cgatc 2140 +# cgatg 1057 +# cgatt 2275 +# cgcaa 3191 +# cgcac 2535 +# cgcag 3230 +# cgcat 2164 +# cgcca 3533 +# cgccc 2061 +# cgccg 2396 +# cgcct 1330 +# cgcga 1797 +# cgcgc 1433 +# cgcgg 1027 +# cgcgt 1253 +# cgcta 1063 +# cgctc 1714 +# cgctg 2126 +# cgctt 1555 +# cggaa 3494 +# cggac 1385 +# cggag 2752 +# cggat 2012 +# cggca 2991 +# cggcc 1466 +# cggcg 2160 +# cggct 1322 +# cggga 1437 +# cgggc 1118 +# cgggg 856 +# cgggt 553 +# cggta 660 +# cggtc 869 +# cggtg 1446 +# cggtt 1192 +# cgtaa 1386 +# cgtac 860 +# cgtag 956 +# cgtat 982 +# cgtca 1277 +# cgtcc 1182 +# cgtcg 1813 +# cgtct 920 +# cgtga 1387 +# cgtgc 1620 +# cgtgg 1317 +# cgtgt 1517 +# cgtta 1054 +# cgttc 1391 +# cgttg 1683 +# cgttt 2006 +# ctaaa 3158 +# ctaac 1476 +# ctaag 1279 +# ctaat 1613 +# ctaca 1856 +# ctacc 898 +# ctacg 1031 +# ctact 865 +# ctaga 1189 +# ctagc 1404 +# ctagg 542 +# ctagt 924 +# ctata 1396 +# ctatc 1022 +# ctatg 748 +# ctatt 1238 +# ctcaa 2323 +# ctcac 1291 +# ctcag 1425 +# ctcat 1089 +# ctcca 2135 +# ctccc 1326 +# ctccg 1009 +# ctcct 1263 +# ctcga 1575 +# ctcgc 1829 +# ctcgg 965 +# ctcgt 941 +# ctcta 993 +# ctctc 1658 +# ctctg 1229 +# ctctt 1158 +# ctgaa 3064 +# ctgac 1296 +# ctgag 1805 +# ctgat 1659 +# ctgca 3318 +# ctgcc 2304 +# ctgcg 1899 +# ctgct 2163 +# ctgga 2372 +# ctggc 2222 +# ctggg 1019 +# ctggt 1085 +# ctgta 1017 +# ctgtc 1293 +# ctgtg 1993 +# ctgtt 1546 +# cttaa 2153 +# cttac 784 +# cttag 948 +# cttat 1007 +# cttca 1572 +# cttcc 1402 +# cttcg 1641 +# cttct 1325 +# cttga 1585 +# cttgc 1367 +# cttgg 1554 +# cttgt 1221 +# cttta 1572 +# ctttc 1543 +# ctttg 1879 +# ctttt 2562 +# gaaaa 10477 +# gaaac 4921 +# gaaag 5152 +# gaaat 4948 +# gaaca 3586 +# gaacc 2139 +# gaacg 2262 +# gaact 2259 +# gaaga 4084 +# gaagc 3832 +# gaagg 2879 +# gaagt 2704 +# gaata 3069 +# gaatc 3376 +# gaatg 1496 +# gaatt 3093 +# gacaa 3451 +# gacac 2140 +# gacag 2349 +# gacat 1582 +# gacca 2198 +# gaccc 1130 +# gaccg 1079 +# gacct 1008 +# gacga 2799 +# gacgc 1583 +# gacgg 1389 +# gacgt 1161 +# gacta 1069 +# gactc 1115 +# gactg 1521 +# gactt 1506 +# gagaa 4285 +# gagac 1824 +# gagag 4790 +# gagat 1795 +# gagca 5178 +# gagcc 2436 +# gagcg 3227 +# gagct 2146 +# gagga 4351 +# gaggc 2364 +# gaggg 1541 +# gaggt 979 +# gagta 1388 +# gagtc 1579 +# gagtg 2852 +# gagtt 2045 +# gataa 2970 +# gatac 1757 +# gatag 1575 +# gatat 2031 +# gatca 2110 +# gatcc 1913 +# gatcg 1899 +# gatct 1546 +# gatga 1402 +# gatgc 1262 +# gatgg 743 +# gatgt 967 +# gatta 1840 +# gattc 1923 +# gattg 2001 +# gattt 2771 +# gcaaa 7634 +# gcaac 6629 +# gcaag 2884 +# gcaat 3861 +# gcaca 3768 +# gcacc 2319 +# gcacg 1451 +# gcact 2063 +# gcaga 3874 +# gcagc 9947 +# gcagg 2880 +# gcagt 3009 +# gcata 1987 +# gcatc 2643 +# gcatg 1186 +# gcatt 2874 +# gccaa 5593 +# gccac 3307 +# gccag 4680 +# gccat 2456 +# gccca 2755 +# gcccc 1806 +# gcccg 1278 +# gccct 784 +# gccga 2310 +# gccgc 2791 +# gccgg 1736 +# gccgt 1382 +# gccta 794 +# gcctc 1157 +# gcctg 1281 +# gcctt 1269 +# gcgaa 4214 +# gcgac 2308 +# gcgag 3124 +# gcgat 1888 +# gcgca 2417 +# gcgcc 1708 +# gcgcg 1426 +# gcgct 1525 +# gcgga 3080 +# gcggc 2791 +# gcggg 1142 +# gcggt 1151 +# gcgta 1131 +# gcgtc 1194 +# gcgtg 1956 +# gcgtt 1564 +# gctaa 2237 +# gctac 1161 +# gctag 1211 +# gctat 1247 +# gctca 1783 +# gctcc 1572 +# gctcg 1278 +# gctct 1448 +# gctga 2463 +# gctgc 3611 +# gctgg 2024 +# gctgt 1764 +# gctta 1268 +# gcttc 1434 +# gcttg 1233 +# gcttt 1950 +# ggaaa 6063 +# ggaac 2480 +# ggaag 2918 +# ggaat 2805 +# ggaca 2357 +# ggacc 1233 +# ggacg 1589 +# ggact 1422 +# ggaga 2918 +# ggagc 3781 +# ggagg 2960 +# ggagt 2145 +# ggata 2175 +# ggatc 2201 +# ggatg 942 +# ggatt 2133 +# ggcaa 3811 +# ggcac 1682 +# ggcag 3099 +# ggcat 1254 +# ggcca 3104 +# ggccc 1205 +# ggccg 1077 +# ggcct 786 +# ggcga 2501 +# ggcgc 1629 +# ggcgg 2171 +# ggcgt 1209 +# ggcta 1131 +# ggctc 1014 +# ggctg 1520 +# ggctt 1130 +# gggaa 2366 +# gggac 862 +# gggag 1742 +# gggat 985 +# gggca 1579 +# gggcc 842 +# gggcg 1322 +# gggct 813 +# gggga 1190 +# ggggc 927 +# ggggg 620 +# ggggt 375 +# gggta 449 +# gggtc 497 +# gggtg 737 +# gggtt 531 +# ggtaa 753 +# ggtac 465 +# ggtag 658 +# ggtat 431 +# ggtca 1097 +# ggtcc 675 +# ggtcg 846 +# ggtct 502 +# ggtga 1095 +# ggtgc 1245 +# ggtgg 1261 +# ggtgt 1261 +# ggtta 865 +# ggttc 850 +# ggttg 842 +# ggttt 1162 +# gtaaa 3330 +# gtaac 1253 +# gtaag 933 +# gtaat 1293 +# gtaca 1578 +# gtacc 770 +# gtacg 828 +# gtact 787 +# gtaga 1165 +# gtagc 1351 +# gtagg 610 +# gtagt 887 +# gtata 1273 +# gtatc 926 +# gtatg 539 +# gtatt 1249 +# gtcaa 2223 +# gtcac 1243 +# gtcag 1443 +# gtcat 1232 +# gtcca 1875 +# gtccc 857 +# gtccg 1045 +# gtcct 866 +# gtcga 1710 +# gtcgc 1916 +# gtcgg 1318 +# gtcgt 1215 +# gtcta 706 +# gtctc 784 +# gtctg 1227 +# gtctt 877 +# gtgaa 3722 +# gtgac 1201 +# gtgag 1860 +# gtgat 1625 +# gtgca 3139 +# gtgcc 1891 +# gtgcg 2471 +# gtgct 1820 +# gtgga 2633 +# gtggc 1927 +# gtggg 1189 +# gtggt 1224 +# gtgta 1447 +# gtgtc 1218 +# gtgtg 4083 +# gtgtt 2201 +# gttaa 2116 +# gttac 976 +# gttag 947 +# gttat 1135 +# gttca 1449 +# gttcc 1337 +# gttcg 1566 +# gttct 1213 +# gttga 1760 +# gttgc 2255 +# gttgg 1659 +# gttgt 1824 +# gttta 1825 +# gtttc 1890 +# gtttg 1890 +# gtttt 2921 +# taaaa 7909 +# taaac 3980 +# taaag 3172 +# taaat 5273 +# taaca 2955 +# taacc 1867 +# taacg 1486 +# taact 1659 +# taaga 1917 +# taagc 2341 +# taagg 1197 +# taagt 1624 +# taata 2636 +# taatc 2257 +# taatg 1387 +# taatt 3350 +# tacaa 3172 +# tacac 1985 +# tacag 1528 +# tacat 2274 +# tacca 1733 +# taccc 1109 +# taccg 1061 +# tacct 717 +# tacga 1503 +# tacgc 1237 +# tacgg 967 +# tacgt 966 +# tacta 975 +# tactc 854 +# tactg 982 +# tactt 1346 +# tagaa 2207 +# tagac 1056 +# tagag 1653 +# tagat 1182 +# tagca 3009 +# tagcc 1936 +# tagcg 1131 +# tagct 1268 +# tagga 1306 +# taggc 921 +# taggg 473 +# taggt 356 +# tagta 803 +# tagtc 982 +# tagtg 1219 +# tagtt 1482 +# tataa 3061 +# tatac 1784 +# tatag 1585 +# tatat 4119 +# tatca 1774 +# tatcc 1358 +# tatcg 1386 +# tatct 1254 +# tatga 1027 +# tatgc 1218 +# tatgg 672 +# tatgt 1281 +# tatta 1837 +# tattc 1497 +# tattg 1548 +# tattt 3498 +# tcaaa 4780 +# tcaac 3219 +# tcaag 2416 +# tcaat 2952 +# tcaca 2275 +# tcacc 1629 +# tcacg 917 +# tcact 1163 +# tcaga 1841 +# tcagc 2993 +# tcagg 1136 +# tcagt 2002 +# tcata 1374 +# tcatc 2250 +# tcatg 608 +# tcatt 2058 +# tccaa 3004 +# tccac 2342 +# tccag 2555 +# tccat 1939 +# tccca 2044 +# tcccc 1517 +# tcccg 1085 +# tccct 1009 +# tccga 1675 +# tccgc 2067 +# tccgg 1241 +# tccgt 1298 +# tccta 730 +# tcctc 1360 +# tcctg 1434 +# tcctt 1397 +# tcgaa 3564 +# tcgac 1743 +# tcgag 2226 +# tcgat 1975 +# tcgca 2649 +# tcgcc 2501 +# tcgcg 1526 +# tcgct 2005 +# tcgga 1934 +# tcggc 1759 +# tcggg 1085 +# tcggt 1134 +# tcgta 892 +# tcgtc 1504 +# tcgtg 1297 +# tcgtt 1895 +# tctaa 1437 +# tctac 1025 +# tctag 732 +# tctat 1173 +# tctca 1248 +# tctcc 1221 +# tctcg 1282 +# tctct 1635 +# tctga 1582 +# tctgc 1895 +# tctgg 1514 +# tctgt 1512 +# tctta 1014 +# tcttc 1546 +# tcttg 1074 +# tcttt 1620 +# tgaaa 5300 +# tgaac 2200 +# tgaag 2479 +# tgaat 2561 +# tgaca 1854 +# tgacc 1167 +# tgacg 1144 +# tgact 1015 +# tgaga 1894 +# tgagc 2136 +# tgagg 1411 +# tgagt 1610 +# tgata 1706 +# tgatc 1409 +# tgatg 1304 +# tgatt 2295 +# tgcaa 4822 +# tgcac 1844 +# tgcag 3310 +# tgcat 2622 +# tgcca 3651 +# tgccc 1377 +# tgccg 1857 +# tgcct 1138 +# tgcga 2621 +# tgcgc 1390 +# tgcgg 1453 +# tgcgt 1698 +# tgcta 1545 +# tgctc 1593 +# tgctg 2525 +# tgctt 1561 +# tggaa 3649 +# tggac 1659 +# tggag 2346 +# tggat 1837 +# tggca 2479 +# tggcc 2199 +# tggcg 1712 +# tggct 1474 +# tggga 1375 +# tgggc 1396 +# tgggg 591 +# tgggt 632 +# tggta 651 +# tggtc 987 +# tggtg 1417 +# tggtt 1181 +# tgtaa 2047 +# tgtac 1144 +# tgtag 914 +# tgtat 1315 +# tgtca 1331 +# tgtcc 1056 +# tgtcg 1319 +# tgtct 1065 +# tgtga 2374 +# tgtgc 2873 +# tgtgg 1821 +# tgtgt 3779 +# tgtta 1414 +# tgttc 1394 +# tgttg 2395 +# tgttt 2514 +# ttaaa 5496 +# ttaac 2377 +# ttaag 2170 +# ttaat 3112 +# ttaca 1862 +# ttacc 1131 +# ttacg 1065 +# ttact 1131 +# ttaga 1217 +# ttagc 2022 +# ttagg 880 +# ttagt 1390 +# ttata 2010 +# ttatc 1579 +# ttatg 1314 +# ttatt 2563 +# ttcaa 3251 +# ttcac 1521 +# ttcag 1738 +# ttcat 1645 +# ttcca 2643 +# ttccc 1615 +# ttccg 1798 +# ttcct 1255 +# ttcga 2526 +# ttcgc 2184 +# ttcgg 1660 +# ttcgt 1939 +# ttcta 1079 +# ttctc 1535 +# ttctg 1730 +# ttctt 1693 +# ttgaa 3596 +# ttgac 1645 +# ttgag 1975 +# ttgat 2107 +# ttgca 3723 +# ttgcc 2241 +# ttgcg 1575 +# ttgct 1848 +# ttgga 3001 +# ttggc 2549 +# ttggg 1238 +# ttggt 1318 +# ttgta 1716 +# ttgtc 1458 +# ttgtg 2598 +# ttgtt 2618 +# tttaa 4207 +# tttac 1720 +# tttag 1677 +# tttat 2921 +# tttca 2498 +# tttcc 2589 +# tttcg 2685 +# tttct 2006 +# tttga 2916 +# tttgc 2795 +# tttgg 2606 +# tttgt 3109 +# tttta 3197 +# ttttc 3269 +# ttttg 3810 +# ttttt 5718 + +# +# The emission probabilities of 3' UTR exons +# +[EMISSION-3] +# size of the emission vector +1024 +#k= +4 +# patpseudo : pseudocount for sequence patterns +1 +aaaaa 0.4 +aaaac 0.2 +aaaag 0.132 +aaaat 0.268 +aaaca 0.396 +aaacc 0.185 +aaacg 0.17 +aaact 0.248 +aaaga 0.323 +aaagc 0.239 +aaagg 0.142 +aaagt 0.296 +aaata 0.348 +aaatc 0.154 +aaatg 0.211 +aaatt 0.288 +aacaa 0.449 +aacac 0.186 +aacag 0.139 +aacat 0.225 +aacca 0.449 +aaccc 0.193 +aaccg 0.175 +aacct 0.184 +aacga 0.413 +aacgc 0.199 +aacgg 0.149 +aacgt 0.238 +aacta 0.354 +aactc 0.156 +aactg 0.206 +aactt 0.285 +aagaa 0.437 +aagac 0.144 +aagag 0.179 +aagat 0.24 +aagca 0.391 +aagcc 0.188 +aagcg 0.184 +aagct 0.236 +aagga 0.413 +aaggc 0.246 +aaggg 0.16 +aaggt 0.181 +aagta 0.286 +aagtc 0.153 +aagtg 0.223 +aagtt 0.338 +aataa 0.414 +aatac 0.154 +aatag 0.105 +aatat 0.326 +aatca 0.33 +aatcc 0.205 +aatcg 0.233 +aatct 0.232 +aatga 0.279 +aatgc 0.214 +aatgg 0.155 +aatgt 0.352 +aatta 0.305 +aattc 0.139 +aattg 0.211 +aattt 0.345 +acaaa 0.44 +acaac 0.194 +acaag 0.131 +acaat 0.235 +acaca 0.521 +acacc 0.156 +acacg 0.128 +acact 0.195 +acaga 0.375 +acagc 0.286 +acagg 0.117 +acagt 0.222 +acata 0.399 +acatc 0.135 +acatg 0.142 +acatt 0.324 +accaa 0.394 +accac 0.225 +accag 0.152 +accat 0.228 +accca 0.444 +acccc 0.208 +acccg 0.154 +accct 0.195 +accga 0.419 +accgc 0.254 +accgg 0.137 +accgt 0.19 +accta 0.376 +acctc 0.155 +acctg 0.174 +acctt 0.295 +acgaa 0.403 +acgac 0.15 +acgag 0.173 +acgat 0.274 +acgca 0.402 +acgcc 0.209 +acgcg 0.165 +acgct 0.224 +acgga 0.432 +acggc 0.246 +acggg 0.146 +acggt 0.176 +acgta 0.36 +acgtc 0.128 +acgtg 0.174 +acgtt 0.339 +actaa 0.378 +actac 0.181 +actag 0.147 +actat 0.295 +actca 0.337 +actcc 0.197 +actcg 0.208 +actct 0.258 +actga 0.311 +actgc 0.234 +actgg 0.161 +actgt 0.294 +actta 0.309 +acttc 0.149 +acttg 0.181 +acttt 0.361 +agaaa 0.427 +agaac 0.179 +agaag 0.168 +agaat 0.226 +agaca 0.388 +agacc 0.178 +agacg 0.181 +agact 0.254 +agaga 0.377 +agagc 0.251 +agagg 0.158 +agagt 0.213 +agata 0.306 +agatc 0.185 +agatg 0.215 +agatt 0.294 +agcaa 0.388 +agcac 0.14 +agcag 0.25 +agcat 0.222 +agcca 0.423 +agccc 0.194 +agccg 0.185 +agcct 0.198 +agcga 0.393 +agcgc 0.198 +agcgg 0.193 +agcgt 0.215 +agcta 0.298 +agctc 0.172 +agctg 0.25 +agctt 0.28 +aggaa 0.325 +aggac 0.155 +aggag 0.261 +aggat 0.259 +aggca 0.379 +aggcc 0.173 +aggcg 0.225 +aggct 0.223 +aggga 0.354 +agggc 0.241 +agggg 0.219 +agggt 0.187 +aggta 0.248 +aggtc 0.192 +aggtg 0.251 +aggtt 0.31 +agtaa 0.365 +agtac 0.165 +agtag 0.172 +agtat 0.298 +agtca 0.329 +agtcc 0.207 +agtcg 0.22 +agtct 0.244 +agtga 0.267 +agtgc 0.246 +agtgg 0.186 +agtgt 0.301 +agtta 0.27 +agttc 0.155 +agttg 0.201 +agttt 0.374 +ataaa 0.48 +ataac 0.133 +ataag 0.123 +ataat 0.263 +ataca 0.482 +atacc 0.149 +atacg 0.148 +atact 0.221 +ataga 0.336 +atagc 0.227 +atagg 0.135 +atagt 0.302 +atata 0.454 +atatc 0.104 +atatg 0.155 +atatt 0.287 +atcaa 0.404 +atcac 0.16 +atcag 0.179 +atcat 0.258 +atcca 0.374 +atccc 0.219 +atccg 0.181 +atcct 0.226 +atcga 0.401 +atcgc 0.195 +atcgg 0.166 +atcgt 0.238 +atcta 0.334 +atctc 0.171 +atctg 0.223 +atctt 0.272 +atgaa 0.435 +atgac 0.123 +atgag 0.156 +atgat 0.287 +atgca 0.409 +atgcc 0.185 +atgcg 0.173 +atgct 0.232 +atgga 0.384 +atggc 0.239 +atggg 0.17 +atggt 0.207 +atgta 0.399 +atgtc 0.105 +atgtg 0.195 +atgtt 0.301 +attaa 0.369 +attac 0.147 +attag 0.141 +attat 0.343 +attca 0.337 +attcc 0.208 +attcg 0.204 +attct 0.251 +attga 0.277 +attgc 0.19 +attgg 0.128 +attgt 0.405 +attta 0.332 +atttc 0.143 +atttg 0.179 +atttt 0.347 +caaaa 0.384 +caaac 0.191 +caaag 0.139 +caaat 0.287 +caaca 0.414 +caacc 0.183 +caacg 0.137 +caact 0.266 +caaga 0.287 +caagc 0.263 +caagg 0.157 +caagt 0.292 +caata 0.3 +caatc 0.171 +caatg 0.176 +caatt 0.353 +cacaa 0.299 +cacac 0.349 +cacag 0.127 +cacat 0.225 +cacca 0.408 +caccc 0.238 +caccg 0.14 +cacct 0.213 +cacga 0.324 +cacgc 0.276 +cacgg 0.159 +cacgt 0.24 +cacta 0.216 +cactc 0.224 +cactg 0.203 +cactt 0.357 +cagaa 0.373 +cagac 0.172 +cagag 0.191 +cagat 0.265 +cagca 0.433 +cagcc 0.184 +cagcg 0.157 +cagct 0.225 +cagga 0.403 +caggc 0.276 +caggg 0.155 +caggt 0.166 +cagta 0.233 +cagtc 0.189 +cagtg 0.209 +cagtt 0.369 +cataa 0.295 +catac 0.213 +catag 0.132 +catat 0.36 +catca 0.33 +catcc 0.248 +catcg 0.187 +catct 0.235 +catga 0.24 +catgc 0.232 +catgg 0.168 +catgt 0.36 +catta 0.234 +cattc 0.159 +cattg 0.166 +cattt 0.442 +ccaaa 0.392 +ccaac 0.207 +ccaag 0.164 +ccaat 0.237 +ccaca 0.387 +ccacc 0.235 +ccacg 0.136 +ccact 0.242 +ccaga 0.283 +ccagc 0.316 +ccagg 0.153 +ccagt 0.247 +ccata 0.274 +ccatc 0.21 +ccatg 0.167 +ccatt 0.349 +cccaa 0.35 +cccac 0.241 +cccag 0.171 +cccat 0.238 +cccca 0.345 +ccccc 0.28 +ccccg 0.157 +cccct 0.218 +cccga 0.359 +cccgc 0.26 +cccgg 0.164 +cccgt 0.216 +cccta 0.258 +ccctc 0.231 +ccctg 0.194 +ccctt 0.317 +ccgaa 0.378 +ccgac 0.165 +ccgag 0.172 +ccgat 0.285 +ccgca 0.326 +ccgcc 0.294 +ccgcg 0.139 +ccgct 0.24 +ccgga 0.358 +ccggc 0.292 +ccggg 0.171 +ccggt 0.179 +ccgta 0.287 +ccgtc 0.189 +ccgtg 0.199 +ccgtt 0.325 +cctaa 0.364 +cctac 0.181 +cctag 0.195 +cctat 0.26 +cctca 0.268 +cctcc 0.273 +cctcg 0.196 +cctct 0.263 +cctga 0.222 +cctgc 0.273 +cctgg 0.216 +cctgt 0.288 +cctta 0.26 +ccttc 0.189 +ccttg 0.191 +ccttt 0.36 +cgaaa 0.416 +cgaac 0.175 +cgaag 0.143 +cgaat 0.267 +cgaca 0.314 +cgacc 0.184 +cgacg 0.216 +cgact 0.286 +cgaga 0.299 +cgagc 0.243 +cgagg 0.192 +cgagt 0.266 +cgata 0.243 +cgatc 0.193 +cgatg 0.204 +cgatt 0.36 +cgcaa 0.323 +cgcac 0.193 +cgcag 0.204 +cgcat 0.28 +cgcca 0.334 +cgccc 0.247 +cgccg 0.195 +cgcct 0.225 +cgcga 0.319 +cgcgc 0.215 +cgcgg 0.183 +cgcgt 0.283 +cgcta 0.22 +cgctc 0.19 +cgctg 0.263 +cgctt 0.326 +cggaa 0.353 +cggac 0.15 +cggag 0.217 +cggat 0.28 +cggca 0.339 +cggcc 0.185 +cggcg 0.243 +cggct 0.232 +cggga 0.311 +cgggc 0.274 +cgggg 0.214 +cgggt 0.201 +cggta 0.214 +cggtc 0.182 +cggtg 0.264 +cggtt 0.341 +cgtaa 0.323 +cgtac 0.177 +cgtag 0.201 +cgtat 0.298 +cgtca 0.264 +cgtcc 0.22 +cgtcg 0.239 +cgtct 0.277 +cgtga 0.213 +cgtgc 0.213 +cgtgg 0.199 +cgtgt 0.375 +cgtta 0.209 +cgttc 0.159 +cgttg 0.197 +cgttt 0.435 +ctaaa 0.376 +ctaac 0.161 +ctaag 0.204 +ctaat 0.259 +ctaca 0.372 +ctacc 0.185 +ctacg 0.157 +ctact 0.286 +ctaga 0.305 +ctagc 0.247 +ctagg 0.145 +ctagt 0.303 +ctata 0.34 +ctatc 0.146 +ctatg 0.186 +ctatt 0.328 +ctcaa 0.369 +ctcac 0.207 +ctcag 0.163 +ctcat 0.261 +ctcca 0.35 +ctccc 0.22 +ctccg 0.168 +ctcct 0.263 +ctcga 0.346 +ctcgc 0.238 +ctcgg 0.164 +ctcgt 0.252 +ctcta 0.274 +ctctc 0.221 +ctctg 0.209 +ctctt 0.296 +ctgaa 0.407 +ctgac 0.155 +ctgag 0.173 +ctgat 0.266 +ctgca 0.357 +ctgcc 0.212 +ctgcg 0.159 +ctgct 0.272 +ctgga 0.322 +ctggc 0.283 +ctggg 0.19 +ctggt 0.205 +ctgta 0.335 +ctgtc 0.138 +ctgtg 0.215 +ctgtt 0.311 +cttaa 0.4 +cttac 0.151 +cttag 0.191 +cttat 0.258 +cttca 0.314 +cttcc 0.208 +cttcg 0.198 +cttct 0.28 +cttga 0.269 +cttgc 0.198 +cttgg 0.186 +cttgt 0.346 +cttta 0.281 +ctttc 0.158 +ctttg 0.201 +ctttt 0.36 +gaaaa 0.367 +gaaac 0.193 +gaaag 0.144 +gaaat 0.296 +gaaca 0.355 +gaacc 0.182 +gaacg 0.174 +gaact 0.288 +gaaga 0.328 +gaagc 0.248 +gaagg 0.178 +gaagt 0.245 +gaata 0.303 +gaatc 0.178 +gaatg 0.201 +gaatt 0.318 +gacaa 0.371 +gacac 0.214 +gacag 0.175 +gacat 0.239 +gacca 0.366 +gaccc 0.236 +gaccg 0.163 +gacct 0.234 +gacga 0.402 +gacgc 0.207 +gacgg 0.191 +gacgt 0.2 +gacta 0.267 +gactc 0.184 +gactg 0.214 +gactt 0.335 +gagaa 0.389 +gagac 0.13 +gagag 0.231 +gagat 0.25 +gagca 0.383 +gagcc 0.18 +gagcg 0.194 +gagct 0.243 +gagga 0.458 +gaggc 0.216 +gaggg 0.175 +gaggt 0.151 +gagta 0.271 +gagtc 0.166 +gagtg 0.23 +gagtt 0.333 +gataa 0.328 +gatac 0.18 +gatag 0.141 +gatat 0.351 +gatca 0.279 +gatcc 0.229 +gatcg 0.239 +gatct 0.254 +gatga 0.314 +gatgc 0.216 +gatgg 0.194 +gatgt 0.277 +gatta 0.264 +gattc 0.163 +gattg 0.196 +gattt 0.377 +gcaaa 0.378 +gcaac 0.217 +gcaag 0.144 +gcaat 0.261 +gcaca 0.385 +gcacc 0.209 +gcacg 0.134 +gcact 0.272 +gcaga 0.264 +gcagc 0.371 +gcagg 0.155 +gcagt 0.21 +gcata 0.316 +gcatc 0.174 +gcatg 0.139 +gcatt 0.37 +gccaa 0.349 +gccac 0.223 +gccag 0.209 +gccat 0.219 +gccca 0.389 +gcccc 0.241 +gcccg 0.165 +gccct 0.206 +gccga 0.291 +gccgc 0.308 +gccgg 0.191 +gccgt 0.211 +gccta 0.292 +gcctc 0.191 +gcctg 0.211 +gcctt 0.306 +gcgaa 0.378 +gcgac 0.164 +gcgag 0.197 +gcgat 0.26 +gcgca 0.355 +gcgcc 0.231 +gcgcg 0.163 +gcgct 0.251 +gcgga 0.334 +gcggc 0.317 +gcggg 0.164 +gcggt 0.185 +gcgta 0.298 +gcgtc 0.152 +gcgtg 0.224 +gcgtt 0.326 +gctaa 0.398 +gctac 0.162 +gctag 0.172 +gctat 0.269 +gctca 0.283 +gctcc 0.241 +gctcg 0.185 +gctct 0.291 +gctga 0.242 +gctgc 0.302 +gctgg 0.213 +gctgt 0.243 +gctta 0.297 +gcttc 0.172 +gcttg 0.182 +gcttt 0.349 +ggaaa 0.414 +ggaac 0.175 +ggaag 0.16 +ggaat 0.252 +ggaca 0.359 +ggacc 0.169 +ggacg 0.214 +ggact 0.258 +ggaga 0.284 +ggagc 0.269 +ggagg 0.24 +ggagt 0.206 +ggata 0.257 +ggatc 0.213 +ggatg 0.232 +ggatt 0.299 +ggcaa 0.356 +ggcac 0.159 +ggcag 0.248 +ggcat 0.237 +ggcca 0.45 +ggccc 0.175 +ggccg 0.185 +ggcct 0.19 +ggcga 0.295 +ggcgc 0.214 +ggcgg 0.289 +ggcgt 0.203 +ggcta 0.265 +ggctc 0.179 +ggctg 0.254 +ggctt 0.302 +gggaa 0.369 +gggac 0.15 +gggag 0.217 +gggat 0.264 +gggca 0.357 +gggcc 0.178 +gggcg 0.236 +gggct 0.229 +gggga 0.328 +ggggc 0.236 +ggggg 0.256 +ggggt 0.179 +gggta 0.215 +gggtc 0.226 +gggtg 0.24 +gggtt 0.32 +ggtaa 0.306 +ggtac 0.172 +ggtag 0.2 +ggtat 0.323 +ggtca 0.311 +ggtcc 0.217 +ggtcg 0.226 +ggtct 0.247 +ggtga 0.219 +ggtgc 0.225 +ggtgg 0.29 +ggtgt 0.266 +ggtta 0.248 +ggttc 0.178 +ggttg 0.184 +ggttt 0.39 +gtaaa 0.417 +gtaac 0.153 +gtaag 0.135 +gtaat 0.294 +gtaca 0.429 +gtacc 0.14 +gtacg 0.165 +gtact 0.265 +gtaga 0.281 +gtagc 0.253 +gtagg 0.143 +gtagt 0.322 +gtata 0.324 +gtatc 0.123 +gtatg 0.19 +gtatt 0.363 +gtcaa 0.356 +gtcac 0.176 +gtcag 0.207 +gtcat 0.261 +gtcca 0.357 +gtccc 0.202 +gtccg 0.161 +gtcct 0.28 +gtcga 0.315 +gtcgc 0.243 +gtcgg 0.175 +gtcgt 0.267 +gtcta 0.327 +gtctc 0.166 +gtctg 0.215 +gtctt 0.292 +gtgaa 0.41 +gtgac 0.146 +gtgag 0.159 +gtgat 0.286 +gtgca 0.383 +gtgcc 0.187 +gtgcg 0.191 +gtgct 0.239 +gtgga 0.324 +gtggc 0.277 +gtggg 0.192 +gtggt 0.207 +gtgta 0.353 +gtgtc 0.122 +gtgtg 0.262 +gtgtt 0.262 +gttaa 0.389 +gttac 0.147 +gttag 0.174 +gttat 0.291 +gttca 0.313 +gttcc 0.193 +gttcg 0.212 +gttct 0.282 +gttga 0.281 +gttgc 0.206 +gttgg 0.164 +gttgt 0.348 +gttta 0.288 +gtttc 0.152 +gtttg 0.179 +gtttt 0.381 +taaaa 0.333 +taaac 0.18 +taaag 0.136 +taaat 0.351 +taaca 0.314 +taacc 0.187 +taacg 0.152 +taact 0.347 +taaga 0.265 +taagc 0.289 +taagg 0.114 +taagt 0.331 +taata 0.297 +taatc 0.15 +taatg 0.171 +taatt 0.383 +tacaa 0.338 +tacac 0.197 +tacag 0.102 +tacat 0.363 +tacca 0.383 +taccc 0.209 +taccg 0.136 +tacct 0.273 +tacga 0.386 +tacgc 0.2 +tacgg 0.124 +tacgt 0.29 +tacta 0.281 +tactc 0.173 +tactg 0.153 +tactt 0.393 +tagaa 0.342 +tagac 0.167 +tagag 0.181 +tagat 0.31 +tagca 0.323 +tagcc 0.222 +tagcg 0.144 +tagct 0.312 +tagga 0.317 +taggc 0.277 +taggg 0.148 +taggt 0.257 +tagta 0.22 +tagtc 0.162 +tagtg 0.157 +tagtt 0.46 +tataa 0.245 +tatac 0.174 +tatag 0.105 +tatat 0.476 +tatca 0.29 +tatcc 0.204 +tatcg 0.179 +tatct 0.327 +tatga 0.242 +tatgc 0.202 +tatgg 0.114 +tatgt 0.442 +tatta 0.274 +tattc 0.127 +tattg 0.155 +tattt 0.445 +tcaaa 0.39 +tcaac 0.173 +tcaag 0.152 +tcaat 0.285 +tcaca 0.387 +tcacc 0.209 +tcacg 0.125 +tcact 0.279 +tcaga 0.279 +tcagc 0.296 +tcagg 0.131 +tcagt 0.295 +tcata 0.286 +tcatc 0.191 +tcatg 0.147 +tcatt 0.375 +tccaa 0.366 +tccac 0.2 +tccag 0.167 +tccat 0.267 +tccca 0.359 +tcccc 0.254 +tcccg 0.151 +tccct 0.236 +tccga 0.303 +tccgc 0.258 +tccgg 0.178 +tccgt 0.26 +tccta 0.258 +tcctc 0.206 +tcctg 0.205 +tcctt 0.33 +tcgaa 0.389 +tcgac 0.136 +tcgag 0.166 +tcgat 0.309 +tcgca 0.352 +tcgcc 0.246 +tcgcg 0.139 +tcgct 0.264 +tcgga 0.317 +tcggc 0.244 +tcggg 0.188 +tcggt 0.252 +tcgta 0.317 +tcgtc 0.172 +tcgtg 0.155 +tcgtt 0.355 +tctaa 0.332 +tctac 0.172 +tctag 0.179 +tctat 0.317 +tctca 0.296 +tctcc 0.197 +tctcg 0.172 +tctct 0.335 +tctga 0.236 +tctgc 0.226 +tctgg 0.163 +tctgt 0.376 +tctta 0.282 +tcttc 0.184 +tcttg 0.181 +tcttt 0.353 +tgaaa 0.411 +tgaac 0.148 +tgaag 0.138 +tgaat 0.303 +tgaca 0.334 +tgacc 0.214 +tgacg 0.17 +tgact 0.281 +tgaga 0.335 +tgagc 0.238 +tgagg 0.159 +tgagt 0.269 +tgata 0.297 +tgatc 0.144 +tgatg 0.193 +tgatt 0.367 +tgcaa 0.373 +tgcac 0.147 +tgcag 0.171 +tgcat 0.308 +tgcca 0.383 +tgccc 0.199 +tgccg 0.165 +tgcct 0.253 +tgcga 0.33 +tgcgc 0.211 +tgcgg 0.184 +tgcgt 0.275 +tgcta 0.259 +tgctc 0.181 +tgctg 0.242 +tgctt 0.318 +tggaa 0.356 +tggac 0.148 +tggag 0.218 +tggat 0.278 +tggca 0.34 +tggcc 0.236 +tggcg 0.19 +tggct 0.235 +tggga 0.298 +tgggc 0.254 +tgggg 0.198 +tgggt 0.25 +tggta 0.232 +tggtc 0.179 +tggtg 0.209 +tggtt 0.38 +tgtaa 0.346 +tgtac 0.181 +tgtag 0.123 +tgtat 0.349 +tgtca 0.286 +tgtcc 0.229 +tgtcg 0.186 +tgtct 0.299 +tgtga 0.232 +tgtgc 0.214 +tgtgg 0.14 +tgtgt 0.413 +tgtta 0.269 +tgttc 0.136 +tgttg 0.192 +tgttt 0.403 +ttaaa 0.387 +ttaac 0.149 +ttaag 0.178 +ttaat 0.285 +ttaca 0.362 +ttacc 0.193 +ttacg 0.161 +ttact 0.285 +ttaga 0.247 +ttagc 0.241 +ttagg 0.15 +ttagt 0.361 +ttata 0.324 +ttatc 0.118 +ttatg 0.171 +ttatt 0.388 +ttcaa 0.401 +ttcac 0.156 +ttcag 0.161 +ttcat 0.282 +ttcca 0.376 +ttccc 0.214 +ttccg 0.165 +ttcct 0.245 +ttcga 0.352 +ttcgc 0.209 +ttcgg 0.158 +ttcgt 0.282 +ttcta 0.296 +ttctc 0.171 +ttctg 0.195 +ttctt 0.338 +ttgaa 0.407 +ttgac 0.125 +ttgag 0.154 +ttgat 0.313 +ttgca 0.374 +ttgcc 0.212 +ttgcg 0.144 +ttgct 0.271 +ttgga 0.31 +ttggc 0.262 +ttggg 0.172 +ttggt 0.255 +ttgta 0.371 +ttgtc 0.104 +ttgtg 0.171 +ttgtt 0.354 +tttaa 0.373 +tttac 0.142 +tttag 0.153 +tttat 0.332 +tttca 0.304 +tttcc 0.213 +tttcg 0.203 +tttct 0.28 +tttga 0.247 +tttgc 0.183 +tttgg 0.144 +tttgt 0.426 +tttta 0.285 +ttttc 0.14 +ttttg 0.188 +ttttt 0.388 + +# 3' exon patterns: +# aaaaa 172084 +# aaaac 85844 +# aaaag 56934 +# aaaat 115212 +# aaaca 87739 +# aaacc 41046 +# aaacg 37700 +# aaact 54928 +# aaaga 51265 +# aaagc 37998 +# aaagg 22495 +# aaagt 46914 +# aaata 119983 +# aaatc 53194 +# aaatg 72670 +# aaatt 99225 +# aacaa 87950 +# aacac 36497 +# aacag 27168 +# aacat 44122 +# aacca 42903 +# aaccc 18437 +# aaccg 16747 +# aacct 17555 +# aacga 34224 +# aacgc 16489 +# aacgg 12357 +# aacgt 19751 +# aacta 50983 +# aactc 22530 +# aactg 29639 +# aactt 41056 +# aagaa 56325 +# aagac 18527 +# aagag 23052 +# aagat 30958 +# aagca 43185 +# aagcc 20733 +# aagcg 20327 +# aagct 26067 +# aagga 25344 +# aaggc 15092 +# aaggg 9845 +# aaggt 11076 +# aagta 36215 +# aagtc 19345 +# aagtg 28159 +# aagtt 42695 +# aataa 107533 +# aatac 40119 +# aatag 27336 +# aatat 84830 +# aatca 42723 +# aatcc 26539 +# aatcg 30128 +# aatct 30006 +# aatga 43678 +# aatgc 33492 +# aatgg 24345 +# aatgt 55084 +# aatta 80903 +# aattc 36907 +# aattg 56028 +# aattt 91516 +# acaaa 87859 +# acaac 38662 +# acaag 26121 +# acaat 46970 +# acaca 65415 +# acacc 19610 +# acacg 16027 +# acact 24454 +# acaga 26256 +# acagc 20050 +# acagg 8215 +# acagt 15522 +# acata 56611 +# acatc 19134 +# acatg 20120 +# acatt 45972 +# accaa 39881 +# accac 22767 +# accag 15394 +# accat 23113 +# accca 23181 +# acccc 10840 +# acccg 8023 +# accct 10173 +# accga 16016 +# accgc 9693 +# accgg 5234 +# accgt 7281 +# accta 20107 +# acctc 8256 +# acctg 9273 +# acctt 15778 +# acgaa 32936 +# acgac 12264 +# acgag 14136 +# acgat 22437 +# acgca 18247 +# acgcc 9486 +# acgcg 7463 +# acgct 10140 +# acgga 13907 +# acggc 7912 +# acggg 4686 +# acggt 5671 +# acgta 18672 +# acgtc 6624 +# acgtg 9017 +# acgtt 17577 +# actaa 39330 +# actac 18860 +# actag 15254 +# actat 30662 +# actca 21135 +# actcc 12344 +# actcg 13038 +# actct 16177 +# actga 21151 +# actgc 15877 +# actgg 10910 +# actgt 20007 +# actta 36230 +# acttc 17455 +# acttg 21243 +# acttt 42420 +# agaaa 61248 +# agaac 25744 +# agaag 24053 +# agaat 32392 +# agaca 21711 +# agacc 9975 +# agacg 10121 +# agact 14202 +# agaga 26665 +# agagc 17759 +# agagg 11145 +# agagt 15078 +# agata 29683 +# agatc 18002 +# agatg 20871 +# agatt 28581 +# agcaa 48032 +# agcac 17396 +# agcag 30915 +# agcat 27542 +# agcca 26316 +# agccc 12034 +# agccg 11513 +# agcct 12313 +# agcga 21535 +# agcgc 10844 +# agcgg 10568 +# agcgt 11796 +# agcta 24126 +# agctc 13877 +# agctg 20218 +# agctt 22654 +# aggaa 23745 +# aggac 11281 +# aggag 19011 +# aggat 18923 +# aggca 17493 +# aggcc 7978 +# aggcg 10367 +# aggct 10315 +# aggga 10391 +# agggc 7067 +# agggg 6418 +# agggt 5497 +# aggta 8535 +# aggtc 6615 +# aggtg 8641 +# aggtt 10673 +# agtaa 31603 +# agtac 14283 +# agtag 14924 +# agtat 25753 +# agtca 18380 +# agtcc 11567 +# agtcg 12247 +# agtct 13588 +# agtga 18399 +# agtgc 16908 +# agtgg 12822 +# agtgt 20734 +# agtta 34579 +# agttc 19935 +# agttg 25731 +# agttt 47960 +# ataaa 116518 +# ataac 32304 +# ataag 29820 +# ataat 63852 +# ataca 63376 +# atacc 19552 +# atacg 19393 +# atact 29041 +# ataga 28940 +# atagc 19551 +# atagg 11619 +# atagt 26032 +# atata 132972 +# atatc 30357 +# atatg 45496 +# atatt 84001 +# atcaa 42802 +# atcac 16952 +# atcag 18950 +# atcat 27308 +# atcca 27690 +# atccc 16209 +# atccg 13394 +# atcct 16757 +# atcga 28892 +# atcgc 14079 +# atcgg 11954 +# atcgt 17123 +# atcta 29433 +# atctc 15077 +# atctg 19672 +# atctt 24035 +# atgaa 47262 +# atgac 13397 +# atgag 16931 +# atgat 31167 +# atgca 35363 +# atgcc 16021 +# atgcg 14911 +# atgct 20080 +# atgga 23707 +# atggc 14758 +# atggg 10480 +# atggt 12738 +# atgta 59223 +# atgtc 15521 +# atgtg 28902 +# atgtt 44717 +# attaa 76604 +# attac 30600 +# attag 29208 +# attat 71083 +# attca 36014 +# attcc 22236 +# attcg 21798 +# attct 26896 +# attga 38141 +# attgc 26187 +# attgg 17637 +# attgt 55782 +# attta 99508 +# atttc 42767 +# atttg 53629 +# atttt 103918 +# caaaa 88825 +# caaac 44121 +# caaag 32102 +# caaat 66363 +# caaca 46842 +# caacc 20720 +# caacg 15484 +# caact 30053 +# caaga 23962 +# caagc 21980 +# caagg 13090 +# caagt 24389 +# caata 43449 +# caatc 24701 +# caatg 25511 +# caatt 51173 +# cacaa 40600 +# cacac 47369 +# cacag 17295 +# cacat 30568 +# cacca 24344 +# caccc 14210 +# caccg 8320 +# cacct 12720 +# cacga 12983 +# cacgc 11028 +# cacgg 6380 +# cacgt 9623 +# cacta 15588 +# cactc 16193 +# cactg 14667 +# cactt 25737 +# cagaa 29158 +# cagac 13422 +# cagag 14909 +# cagat 20760 +# cagca 36046 +# cagcc 15326 +# cagcg 13067 +# cagct 18736 +# cagga 14632 +# caggc 9999 +# caggg 5635 +# caggt 6003 +# cagta 14529 +# cagtc 11794 +# cagtg 13054 +# cagtt 23034 +# cataa 38838 +# catac 27989 +# catag 17379 +# catat 47366 +# catca 22432 +# catcc 16894 +# catcg 12739 +# catct 15980 +# catga 14088 +# catgc 13627 +# catgg 9881 +# catgt 21111 +# catta 32639 +# cattc 22202 +# cattg 23123 +# cattt 61716 +# ccaaa 47519 +# ccaac 25094 +# ccaag 19959 +# ccaat 28767 +# ccaca 28442 +# ccacc 17271 +# ccacg 9961 +# ccact 17740 +# ccaga 16239 +# ccagc 18146 +# ccagg 8795 +# ccagt 14165 +# ccata 21618 +# ccatc 16539 +# ccatg 13137 +# ccatt 27519 +# cccaa 24960 +# cccac 17186 +# cccag 12194 +# cccat 16993 +# cccca 15553 +# ccccc 12648 +# ccccg 7069 +# cccct 9852 +# cccga 10359 +# cccgc 7491 +# cccgg 4740 +# cccgt 6229 +# cccta 10171 +# ccctc 9109 +# ccctg 7623 +# ccctt 12487 +# ccgaa 18211 +# ccgac 7934 +# ccgag 8309 +# ccgat 13745 +# ccgca 12382 +# ccgcc 11154 +# ccgcg 5286 +# ccgct 9109 +# ccgga 8433 +# ccggc 6887 +# ccggg 4034 +# ccggt 4211 +# ccgta 8861 +# ccgtc 5838 +# ccgtg 6136 +# ccgtt 10030 +# cctaa 20717 +# cctac 10302 +# cctag 11096 +# cctat 14795 +# cctca 9905 +# cctcc 10080 +# cctcg 7244 +# cctct 9714 +# cctga 8287 +# cctgc 10181 +# cctgg 8048 +# cctgt 10740 +# cctta 15476 +# ccttc 11211 +# ccttg 11368 +# ccttt 21397 +# cgaaa 42466 +# cgaac 17847 +# cgaag 14567 +# cgaat 27280 +# cgaca 12557 +# cgacc 7349 +# cgacg 8623 +# cgact 11416 +# cgaga 13834 +# cgagc 11265 +# cgagg 8900 +# cgagt 12294 +# cgata 18165 +# cgatc 14413 +# cgatg 15202 +# cgatt 26836 +# cgcaa 19018 +# cgcac 11381 +# cgcag 12015 +# cgcat 16470 +# cgcca 13319 +# cgccc 9837 +# cgccg 7762 +# cgcct 8970 +# cgcga 7901 +# cgcgc 5321 +# cgcgg 4520 +# cgcgt 6989 +# cgcta 8796 +# cgctc 7593 +# cgctg 10520 +# cgctt 13035 +# cggaa 15926 +# cggac 6764 +# cggag 9775 +# cggat 12619 +# cggca 11703 +# cggcc 6382 +# cggcg 8396 +# cggct 8009 +# cggga 6533 +# cgggc 5772 +# cgggg 4501 +# cgggt 4224 +# cggta 5379 +# cggtc 4576 +# cggtg 6641 +# cggtt 8587 +# cgtaa 18388 +# cgtac 10086 +# cgtag 11446 +# cgtat 16929 +# cgtca 7396 +# cgtcc 6175 +# cgtcg 6685 +# cgtct 7752 +# cgtga 6928 +# cgtgc 6915 +# cgtgg 6472 +# cgtgt 12191 +# cgtta 12567 +# cgttc 9574 +# cgttg 11843 +# cgttt 26159 +# ctaaa 42651 +# ctaac 18201 +# ctaag 23124 +# ctaat 29389 +# ctaca 20134 +# ctacc 9999 +# ctacg 8485 +# ctact 15444 +# ctaga 16023 +# ctagc 12983 +# ctagg 7632 +# ctagt 15894 +# ctata 30476 +# ctatc 13050 +# ctatg 16702 +# ctatt 29337 +# ctcaa 21293 +# ctcac 11933 +# ctcag 9381 +# ctcat 15085 +# ctcca 14842 +# ctccc 9341 +# ctccg 7116 +# ctcct 11158 +# ctcga 12679 +# ctcgc 8740 +# ctcgg 6014 +# ctcgt 9243 +# ctcta 15022 +# ctctc 12155 +# ctctg 11474 +# ctctt 16245 +# ctgaa 23356 +# ctgac 8887 +# ctgag 9939 +# ctgat 15268 +# ctgca 20320 +# ctgcc 12040 +# ctgcg 9049 +# ctgct 15504 +# ctgga 13179 +# ctggc 11615 +# ctggg 7784 +# ctggt 8401 +# ctgta 22459 +# ctgtc 9290 +# ctgtg 14446 +# ctgtt 20894 +# cttaa 38659 +# cttac 14545 +# cttag 18408 +# cttat 24962 +# cttca 17740 +# cttcc 11753 +# cttcg 11184 +# cttct 15789 +# cttga 16349 +# cttgc 12036 +# cttgg 11325 +# cttgt 21016 +# cttta 33226 +# ctttc 18614 +# ctttg 23750 +# ctttt 42589 +# gaaaa 70795 +# gaaac 37126 +# gaaag 27841 +# gaaat 57073 +# gaaca 27770 +# gaacc 14262 +# gaacg 13637 +# gaact 22543 +# gaaga 23234 +# gaagc 17513 +# gaagg 12625 +# gaagt 17365 +# gaata 36947 +# gaatc 21733 +# gaatg 24447 +# gaatt 38760 +# gacaa 22880 +# gacac 13230 +# gacag 10814 +# gacat 14773 +# gacca 12029 +# gaccc 7759 +# gaccg 5344 +# gacct 7690 +# gacga 13654 +# gacgc 7035 +# gacgg 6475 +# gacgt 6795 +# gacta 12629 +# gactc 8718 +# gactg 10096 +# gactt 15811 +# gagaa 28629 +# gagac 9591 +# gagag 16985 +# gagat 18395 +# gagca 21465 +# gagcc 10109 +# gagcg 10890 +# gagct 13617 +# gagga 18989 +# gaggc 8944 +# gaggg 7246 +# gaggt 6235 +# gagta 14269 +# gagtc 8747 +# gagtg 12152 +# gagtt 17580 +# gataa 30543 +# gatac 16717 +# gatag 13100 +# gatat 32709 +# gatca 16683 +# gatcc 13685 +# gatcg 14323 +# gatct 15185 +# gatga 21829 +# gatgc 14969 +# gatgg 13444 +# gatgt 19216 +# gatta 29029 +# gattc 17878 +# gattg 21610 +# gattt 41495 +# gcaaa 48225 +# gcaac 27760 +# gcaag 18325 +# gcaat 33389 +# gcaca 20797 +# gcacc 11255 +# gcacg 7241 +# gcact 14654 +# gcaga 20059 +# gcagc 28202 +# gcagg 11817 +# gcagt 16008 +# gcata 28773 +# gcatc 15827 +# gcatg 12683 +# gcatt 33671 +# gccaa 26504 +# gccac 16966 +# gccag 15858 +# gccat 16659 +# gccca 15064 +# gcccc 9326 +# gcccg 6382 +# gccct 7972 +# gccga 10108 +# gccgc 10718 +# gccgg 6637 +# gccgt 7325 +# gccta 12168 +# gcctc 7983 +# gcctg 8783 +# gcctt 12771 +# gcgaa 21046 +# gcgac 9148 +# gcgag 10980 +# gcgat 14489 +# gcgca 12018 +# gcgcc 7840 +# gcgcg 5515 +# gcgct 8521 +# gcgga 11523 +# gcggc 10956 +# gcggg 5658 +# gcggt 6374 +# gcgta 11600 +# gcgtc 5934 +# gcgtg 8711 +# gcgtt 12723 +# gctaa 24526 +# gctac 9976 +# gctag 10581 +# gctat 16600 +# gctca 11679 +# gctcc 9953 +# gctcg 7642 +# gctct 12008 +# gctga 14002 +# gctgc 17478 +# gctgg 12323 +# gctgt 14078 +# gctta 20780 +# gcttc 12044 +# gcttg 12729 +# gcttt 24393 +# ggaaa 32482 +# ggaac 13717 +# ggaag 12544 +# ggaat 19780 +# ggaca 12268 +# ggacc 5776 +# ggacg 7338 +# ggact 8831 +# ggaga 14931 +# ggagc 14149 +# ggagg 12614 +# ggagt 10822 +# ggata 15708 +# ggatc 13021 +# ggatg 14183 +# ggatt 18279 +# ggcaa 20758 +# ggcac 9295 +# ggcag 14459 +# ggcat 13822 +# ggcca 14649 +# ggccc 5704 +# ggccg 6037 +# ggcct 6194 +# ggcga 10696 +# ggcgc 7765 +# ggcgg 10475 +# ggcgt 7361 +# ggcta 10086 +# ggctc 6790 +# ggctg 9653 +# ggctt 11479 +# gggaa 13471 +# gggac 5463 +# gggag 7941 +# gggat 9659 +# gggca 10174 +# gggcc 5058 +# gggcg 6735 +# gggct 6525 +# gggga 8195 +# ggggc 5893 +# ggggg 6398 +# ggggt 4461 +# gggta 5086 +# gggtc 5347 +# gggtg 5686 +# gggtt 7586 +# ggtaa 9105 +# ggtac 5110 +# ggtag 5966 +# ggtat 9612 +# ggtca 7772 +# ggtcc 5422 +# ggtcg 5645 +# ggtct 6166 +# ggtga 6737 +# ggtgc 6931 +# ggtgg 8954 +# ggtgt 8206 +# ggtta 11041 +# ggttc 7950 +# ggttg 8205 +# ggttt 17376 +# gtaaa 49806 +# gtaac 18284 +# gtaag 16120 +# gtaat 35095 +# gtaca 26206 +# gtacc 8575 +# gtacg 10066 +# gtact 16190 +# gtaga 15160 +# gtagc 13651 +# gtagg 7697 +# gtagt 17375 +# gtata 36601 +# gtatc 13910 +# gtatg 21451 +# gtatt 41005 +# gtcaa 17373 +# gtcac 8568 +# gtcag 10110 +# gtcat 12763 +# gtcca 12643 +# gtccc 7145 +# gtccg 5716 +# gtcct 9925 +# gtcga 10879 +# gtcgc 8403 +# gtcgg 6053 +# gtcgt 9247 +# gtcta 14142 +# gtctc 7192 +# gtctg 9279 +# gtctt 12632 +# gtgaa 22171 +# gtgac 7898 +# gtgag 8578 +# gtgat 15456 +# gtgca 19569 +# gtgcc 9576 +# gtgcg 9740 +# gtgct 12223 +# gtgga 13520 +# gtggc 11570 +# gtggg 8035 +# gtggt 8655 +# gtgta 28209 +# gtgtc 9790 +# gtgtg 20993 +# gtgtt 20988 +# gttaa 38185 +# gttac 14429 +# gttag 17049 +# gttat 28574 +# gttca 18122 +# gttcc 11176 +# gttcg 12252 +# gttct 16309 +# gttga 20918 +# gttgc 15318 +# gttgg 12218 +# gttgt 25859 +# gttta 43562 +# gtttc 22996 +# gtttg 27044 +# gtttt 57517 +# taaaa 101843 +# taaac 55163 +# taaag 41753 +# taaat 107418 +# taaca 33452 +# taacc 19887 +# taacg 16205 +# taact 36970 +# taaga 30349 +# taagc 33088 +# taagg 13058 +# taagt 37815 +# taata 59522 +# taatc 29993 +# taatg 34214 +# taatt 76720 +# tacaa 49086 +# tacac 28622 +# tacag 14764 +# tacat 52648 +# tacca 21760 +# taccc 11874 +# taccg 7702 +# tacct 15498 +# tacga 20677 +# tacgc 10714 +# tacgg 6657 +# tacgt 15572 +# tacta 24832 +# tactc 15318 +# tactg 13530 +# tactt 34819 +# tagaa 29557 +# tagac 14467 +# tagag 15633 +# tagat 26757 +# tagca 23181 +# tagcc 15906 +# tagcg 10306 +# tagct 22359 +# tagga 13624 +# taggc 11907 +# taggg 6371 +# taggt 11037 +# tagta 21523 +# tagtc 15866 +# tagtg 15368 +# tagtt 44892 +# tataa 66059 +# tatac 46791 +# tatag 28260 +# tatat 128328 +# tatca 23991 +# tatcc 16833 +# tatcg 14782 +# tatct 26996 +# tatga 29068 +# tatgc 24252 +# tatgg 13747 +# tatgt 53061 +# tatta 64950 +# tattc 30092 +# tattg 36734 +# tattt 105498 +# tcaaa 49131 +# tcaac 21790 +# tcaag 19198 +# tcaat 35908 +# tcaca 21274 +# tcacc 11474 +# tcacg 6864 +# tcact 15344 +# tcaga 15737 +# tcagc 16721 +# tcagg 7381 +# tcagt 16657 +# tcata 24742 +# tcatc 16574 +# tcatg 12759 +# tcatt 32478 +# tccaa 30301 +# tccac 16571 +# tccag 13806 +# tccat 22071 +# tccca 17342 +# tcccc 12284 +# tcccg 7298 +# tccct 11402 +# tccga 11645 +# tccgc 9920 +# tccgg 6850 +# tccgt 9991 +# tccta 14465 +# tcctc 11551 +# tcctg 11499 +# tcctt 18488 +# tcgaa 30235 +# tcgac 10592 +# tcgag 12942 +# tcgat 23994 +# tcgca 16238 +# tcgcc 11344 +# tcgcg 6419 +# tcgct 12167 +# tcgga 11229 +# tcggc 8653 +# tcggg 6651 +# tcggt 8930 +# tcgta 17754 +# tcgtc 9611 +# tcgtg 8692 +# tcgtt 19883 +# tctaa 28931 +# tctac 14963 +# tctag 15544 +# tctat 27575 +# tctca 15010 +# tctcc 10012 +# tctcg 8752 +# tctct 16989 +# tctga 13952 +# tctgc 13359 +# tctgg 9620 +# tctgt 22211 +# tctta 24104 +# tcttc 15702 +# tcttg 15462 +# tcttt 30136 +# tgaaa 57429 +# tgaac 20711 +# tgaag 19309 +# tgaat 42433 +# tgaca 14993 +# tgacc 9618 +# tgacg 7630 +# tgact 12628 +# tgaga 17903 +# tgagc 12698 +# tgagg 8494 +# tgagt 14351 +# tgata 29231 +# tgatc 14140 +# tgatg 19007 +# tgatt 36137 +# tgcaa 39854 +# tgcac 15703 +# tgcag 18307 +# tgcat 32925 +# tgcca 21317 +# tgccc 11056 +# tgccg 9205 +# tgcct 14052 +# tgcga 15154 +# tgcgc 9711 +# tgcgg 8441 +# tgcgt 12631 +# tgcta 18321 +# tgctc 12813 +# tgctg 17066 +# tgctt 22462 +# tggaa 25213 +# tggac 10492 +# tggag 15442 +# tggat 19656 +# tggca 18766 +# tggcc 12999 +# tggcg 10461 +# tggct 12936 +# tggga 11247 +# tgggc 9601 +# tgggg 7472 +# tgggt 9444 +# tggta 10778 +# tggtc 8322 +# tggtg 9749 +# tggtt 17692 +# tgtaa 60334 +# tgtac 31563 +# tgtag 21488 +# tgtat 60833 +# tgtca 15064 +# tgtcc 12074 +# tgtcg 9810 +# tgtct 15724 +# tgtga 21852 +# tgtgc 20171 +# tgtgg 13199 +# tgtgt 38847 +# tgtta 39827 +# tgttc 20120 +# tgttg 28412 +# tgttt 59615 +# ttaaa 98393 +# ttaac 37844 +# ttaag 45291 +# ttaat 72420 +# ttaca 35427 +# ttacc 18873 +# ttacg 15726 +# ttact 27887 +# ttaga 26242 +# ttagc 25589 +# ttagg 15905 +# ttagt 38327 +# ttata 69425 +# ttatc 25253 +# ttatg 36600 +# ttatt 83057 +# ttcaa 44750 +# ttcac 17442 +# ttcag 18028 +# ttcat 31444 +# ttcca 27485 +# ttccc 15594 +# ttccg 12037 +# ttcct 17921 +# ttcga 25221 +# ttcgc 14965 +# ttcgg 11310 +# ttcgt 20239 +# ttcta 28351 +# ttctc 16356 +# ttctg 18660 +# ttctt 32422 +# ttgaa 47499 +# ttgac 14608 +# ttgag 17968 +# ttgat 36555 +# ttgca 31476 +# ttgcc 17850 +# ttgcg 12080 +# ttgct 22771 +# ttgga 20302 +# ttggc 17146 +# ttggg 11267 +# ttggt 16683 +# ttgta 64460 +# ttgtc 18109 +# ttgtg 29654 +# ttgtt 61476 +# tttaa 101164 +# tttac 38483 +# tttag 41333 +# tttat 89923 +# tttca 39758 +# tttcc 27803 +# tttcg 26520 +# tttct 36657 +# tttga 41172 +# tttgc 30519 +# tttgg 24062 +# tttgt 71057 +# tttta 94640 +# ttttc 46611 +# ttttg 62333 +# ttttt 128813 + +# +# The emission probabilities of the tss upwindow +# +[EMISSION-TSSUPWIN] +# size of the emission vector +16 +#tssup_k= +1 +# patpseudo : pseudocount for sequence patterns +1 +aa 0.326 +ac 0.195 +ag 0.204 +at 0.275 +ca 0.306 +cc 0.2 +cg 0.248 +ct 0.245 +ga 0.245 +gc 0.298 +gg 0.193 +gt 0.264 +ta 0.212 +tc 0.219 +tg 0.221 +tt 0.347 + +# motif around the TSS of TATA-less promoters +[TSSMOTIF] +# width of motif, n= +13 +# order of markov model, k= +0 +# markov chain emission probabilities + 0 0.268 0.227 0.222 0.283 + 1 0.257 0.23 0.22 0.293 + 2 0.279 0.234 0.216 0.27 + 3 0.271 0.238 0.214 0.278 + 4 0.285 0.237 0.216 0.261 + 5 0.263 0.214 0.229 0.295 + 6 0.249 0.223 0.195 0.332 + 7 0.162 0.309 0.241 0.288 + 8 0.406 0.252 0.193 0.15 + 9 0.275 0.199 0.233 0.293 +10 0.275 0.194 0.165 0.365 +11 0.294 0.215 0.182 0.308 +12 0.283 0.207 0.228 0.282 + +# motif around the TSS of TATA promoters +[TSSMOTIFTATA] +# width of motif, n= +13 +# order of markov model, k= +0 +# markov chain emission probabilities + 0 0.293 0.245 0.261 0.201 + 1 0.32 0.188 0.298 0.193 + 2 0.3 0.216 0.248 0.237 + 3 0.301 0.216 0.213 0.271 + 4 0.314 0.254 0.221 0.211 + 5 0.293 0.174 0.264 0.269 + 6 0.235 0.172 0.213 0.38 + 7 0.15 0.422 0.116 0.312 + 8 0.501 0.174 0.208 0.118 + 9 0.256 0.211 0.229 0.304 +10 0.264 0.225 0.113 0.398 +11 0.329 0.222 0.121 0.329 +12 0.312 0.195 0.213 0.28 + +# tata box motif +[TATAMOTIF] +# width of motif, n= +12 +# order of markov model, k= +0 +# markov chain emission probabilities + 0 0.21 0.237 0.381 0.173 + 1 0.19 0.341 0.336 0.133 + 2 0.0032 0.0032 0.0032 0.99 + 3 0.99 0.0032 0.0032 0.0032 + 4 0.0032 0.0032 0.0032 0.99 + 5 0.99 0.0032 0.0032 0.0032 + 6 0.637 0.0432 0.0272 0.293 + 7 0.99 0.0032 0.0032 0.0032 + 8 0.602 0.0592 0.0576 0.282 + 9 0.37 0.0976 0.386 0.147 +10 0.202 0.315 0.312 0.171 +11 0.254 0.283 0.278 0.184 + +# motif after polyA signal +[TTSMOTIF] +# width of motif, n= +14 +# order of markov model, k= +1 +# markov chain emission probabilities + 0 0.368 0.167 0.147 0.317 0.414 0.134 0.181 0.27 0.365 0.182 0.115 0.337 0.342 0.126 0.224 0.308 + 1 0.368 0.17 0.139 0.323 0.41 0.145 0.177 0.268 0.338 0.199 0.106 0.358 0.323 0.136 0.21 0.33 + 2 0.397 0.173 0.114 0.316 0.425 0.149 0.173 0.252 0.35 0.19 0.106 0.353 0.335 0.13 0.198 0.337 + 3 0.42 0.159 0.102 0.319 0.437 0.152 0.165 0.246 0.359 0.191 0.102 0.348 0.329 0.124 0.176 0.371 + 4 0.452 0.148 0.104 0.296 0.446 0.147 0.159 0.248 0.386 0.187 0.1 0.328 0.337 0.114 0.167 0.382 + 5 0.455 0.141 0.107 0.297 0.435 0.143 0.159 0.263 0.375 0.194 0.0979 0.333 0.324 0.115 0.162 0.399 + 6 0.453 0.144 0.11 0.292 0.421 0.15 0.156 0.274 0.362 0.2 0.104 0.334 0.323 0.118 0.158 0.4 + 7 0.453 0.145 0.11 0.292 0.422 0.158 0.145 0.275 0.365 0.194 0.109 0.333 0.325 0.121 0.154 0.401 + 8 0.454 0.145 0.109 0.292 0.427 0.165 0.132 0.276 0.372 0.197 0.112 0.319 0.329 0.119 0.158 0.394 + 9 0.454 0.153 0.106 0.288 0.435 0.156 0.131 0.278 0.371 0.197 0.107 0.325 0.331 0.118 0.166 0.385 +10 0.451 0.155 0.104 0.29 0.424 0.154 0.145 0.276 0.361 0.194 0.105 0.34 0.336 0.116 0.169 0.379 +11 0.457 0.157 0.102 0.284 0.427 0.156 0.147 0.271 0.359 0.199 0.105 0.337 0.343 0.117 0.165 0.376 +12 0.461 0.149 0.103 0.287 0.432 0.168 0.145 0.255 0.364 0.21 0.106 0.32 0.348 0.12 0.162 0.37 +13 0.467 0.144 0.101 0.287 0.447 0.171 0.135 0.247 0.364 0.225 0.111 0.3 0.347 0.122 0.162 0.369