Mercurial > repos > iuc > funannotate_annotate
view test-data/funannotate_db/trained_species/fly/augustus/fly_utr_probs.pbl @ 11:9c15ca7e764e draft default tip
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/main/tools/funannotate commit 9e3708d04faea0f1be4ea8918e859d6f2c7eb31d
author | iuc |
---|---|
date | Wed, 26 Jun 2024 09:41:52 +0000 |
parents | a5baa4ff168d |
children |
line wrap: on
line source
# UTR model parameters # begin of content independent part # Length distributions [UTRLENGTH] # maximal individually stored length probability d= 800 # slope of smoothing bandwidth = 0.25 # smoothing minwindowcount = 1 # length 5' sing 5' init 5' int 5' term 3' sing 3' init 3' int 3' term # total number of exons of above types 6188 1995 342 1995 7966 178 69 178 # number of exons exceeding length d=800 81 32 6 27 823 7 7 48 # 1000 P(len=k), k=0,1,..., 800 0 0.681 5.07e-15 4.35e-06 4.62 0.00284 5.75 3.2e-18 0 1 1.82 9.16e-12 0.000391 10.5 0.0358 10.4 1.04e-17 0 2 2.76 6.1e-09 0.013 13 0.178 8.35 3.54e-17 0 3 3.13 1.49e-06 0.158 12.5 0.405 6.03 1.32e-16 0 4 3.51 0.000135 0.708 12.6 0.599 9.23 5.19e-16 2.83e-20 5 3.55 0.00451 1.17 13.8 0.682 15.3 2.13e-15 2.89e-18 6 2.95 0.0564 0.708 15 0.512 20.4 8.93e-15 2.29e-16 7 2.5 0.272 0.158 15.4 0.296 18.5 3.83e-14 1.42e-14 8 2.56 0.548 0.013 15.3 0.27 12.9 1.67e-13 6.84e-13 9 3.12 0.566 0.000391 14.5 0.332 11.6 7.41e-13 2.57e-11 10 3.83 0.407 4.35e-06 13.6 0.267 11.3 3.35e-12 7.5e-10 11 4.27 0.328 1.78e-08 12.2 0.252 7.9 1.54e-11 1.71e-08 12 4.37 0.472 5.42e-11 9.93 0.347 6.71 7.12e-11 3.03e-07 13 4.42 0.528 8.34e-10 8.9 0.549 8.5 3.31e-10 4.18e-06 14 4.28 0.326 3.63e-08 9.1 0.796 6.71 1.53e-09 4.49e-05 15 4.04 0.333 4.68e-06 9.88 0.875 4.29 7.03e-09 0.000376 16 4.33 0.612 0.000396 11.4 0.938 6.01 3.21e-08 0.00245 17 4.51 0.867 0.013 12.8 1.03 9.28 1.46e-07 0.0124 18 4.07 1.1 0.159 12.8 1.03 11 6.62e-07 0.0492 19 3.76 1.22 0.723 11.3 0.904 11.6 2.99e-06 0.152 20 3.96 1.21 1.34 10.7 0.878 12.3 1.32e-05 0.364 21 4.31 1.12 1.51 11 1.11 13.6 5.6e-05 0.68 22 4.45 1.4 1.86 10.3 1.38 12.8 0.000224 0.989 23 4.75 2.06 2.7 8.37 1.36 8.55 0.000833 1.12 24 4.76 2.19 3.68 6.7 1.25 5.92 0.00284 0.994 25 4.68 2.04 3.45 6 1.2 6.15 0.00881 0.7 26 4.47 2.06 3.12 6.21 1.14 7.01 0.0248 0.434 27 4.28 2.35 3.29 6.62 1.1 7.47 0.0629 0.352 28 4.83 3.68 3.35 6.53 0.986 7.33 0.144 0.514 29 5.98 4.63 3.25 5.68 0.939 6.87 0.296 0.878 30 6.15 4.11 3.2 4.95 1.15 6.45 0.549 1.3 31 5.15 3.31 3.23 5.2 1.46 6.14 0.918 1.57 32 4.9 2.94 3.22 5.98 1.72 5.79 1.39 1.59 33 5.97 2.5 3.03 6.3 1.94 5.34 1.9 1.39 34 7.15 2.36 2.73 6.51 2.02 4.96 2.37 1.11 35 7.24 2.86 2.53 7.51 2.19 4.8 2.73 0.859 36 6.12 2.78 2.52 7.26 2.39 4.86 2.94 0.648 37 4.95 2.05 2.64 5.47 2.29 5.02 3.02 0.466 38 4.34 1.81 2.72 4.59 2.15 5.19 3.05 0.311 39 4.11 2.08 2.69 4.74 2.11 5.32 3.09 0.189 40 4.19 2.33 2.7 4.96 2 5.39 3.19 0.107 41 4.29 2.47 2.95 4.98 1.85 5.44 3.36 0.0591 42 4.22 2.58 3.52 4.91 1.87 5.48 3.59 0.0393 43 4.26 2.73 4.35 4.84 2.07 5.58 3.84 0.0391 44 4.69 2.92 5.33 4.86 2.23 5.78 4.08 0.0537 45 4.43 3.1 6.32 4.93 2.3 6.09 4.29 0.0815 46 3.6 3.22 7.22 4.96 2.25 6.51 4.48 0.123 47 3.46 3.29 7.94 4.92 2 6.99 4.64 0.18 48 3.87 3.39 8.42 4.86 2 7.48 4.78 0.254 49 4.21 3.6 8.62 4.87 2.27 7.91 4.91 0.344 50 4.36 4.01 8.54 4.94 2.5 8.23 5.04 0.448 51 4.41 4.55 8.25 4.98 2.62 8.41 5.18 0.562 52 4.46 5.04 7.86 4.89 2.68 8.41 5.31 0.679 53 4.62 5.25 7.47 4.66 2.73 8.23 5.42 0.79 54 4.92 5.08 7.17 4.36 2.8 7.87 5.5 0.887 55 5.31 4.64 6.98 4.12 2.9 7.36 5.54 0.963 56 5.61 4.19 6.89 4 3.07 6.75 5.53 1.01 57 5.7 3.93 6.85 4.03 3.3 6.11 5.46 1.03 58 5.54 3.92 6.83 4.14 3.53 5.48 5.33 1.03 59 5.29 4.03 6.8 4.25 3.69 4.93 5.17 1.01 60 5.13 4.16 6.75 4.3 3.76 4.48 4.97 0.984 61 5.16 4.24 6.66 4.28 3.79 4.14 4.74 0.955 62 5.35 4.23 6.53 4.19 3.8 3.89 4.52 0.934 63 5.63 4.14 6.37 4.05 3.79 3.7 4.29 0.927 64 5.92 4 6.18 3.88 3.77 3.55 4.1 0.937 65 6.16 3.84 5.96 3.72 3.79 3.4 3.93 0.965 66 6.28 3.71 5.74 3.62 3.87 3.24 3.8 1.01 67 6.2 3.64 5.51 3.59 3.99 3.07 3.72 1.06 68 5.92 3.63 5.3 3.64 4.07 2.88 3.68 1.13 69 5.57 3.68 5.09 3.72 4.04 2.7 3.68 1.19 70 5.32 3.74 4.91 3.79 3.89 2.52 3.73 1.25 71 5.27 3.79 4.73 3.8 3.7 2.35 3.8 1.31 72 5.39 3.8 4.57 3.73 3.58 2.2 3.9 1.36 73 5.62 3.78 4.42 3.59 3.56 2.06 4.01 1.4 74 5.85 3.76 4.28 3.42 3.6 1.94 4.12 1.44 75 6.06 3.76 4.15 3.27 3.65 1.83 4.22 1.47 76 6.24 3.81 4.04 3.16 3.68 1.74 4.31 1.5 77 6.38 3.89 3.95 3.1 3.68 1.66 4.38 1.52 78 6.47 3.99 3.9 3.06 3.69 1.6 4.42 1.55 79 6.5 4.1 3.88 3.03 3.7 1.55 4.43 1.58 80 6.47 4.2 3.91 2.99 3.73 1.52 4.42 1.62 81 6.4 4.27 3.98 2.94 3.76 1.52 4.38 1.66 82 6.32 4.32 4.08 2.87 3.8 1.54 4.32 1.7 83 6.24 4.34 4.21 2.79 3.82 1.59 4.24 1.75 84 6.19 4.34 4.35 2.71 3.83 1.66 4.15 1.8 85 6.17 4.33 4.48 2.64 3.83 1.75 4.05 1.86 86 6.18 4.29 4.6 2.59 3.84 1.85 3.95 1.9 87 6.18 4.24 4.69 2.54 3.87 1.95 3.85 1.94 88 6.16 4.16 4.75 2.51 3.93 2.05 3.76 1.98 89 6.07 4.07 4.77 2.5 4.02 2.15 3.68 2 90 5.93 3.96 4.76 2.5 4.12 2.23 3.61 2.01 91 5.74 3.85 4.71 2.51 4.21 2.3 3.56 2.01 92 5.53 3.74 4.65 2.53 4.26 2.35 3.51 1.99 93 5.37 3.65 4.56 2.57 4.23 2.37 3.48 1.96 94 5.27 3.58 4.47 2.62 4.11 2.37 3.45 1.92 95 5.25 3.54 4.37 2.69 3.94 2.35 3.43 1.87 96 5.27 3.54 4.26 2.75 3.76 2.32 3.41 1.81 97 5.31 3.57 4.16 2.81 3.61 2.26 3.39 1.75 98 5.33 3.62 4.06 2.87 3.51 2.19 3.37 1.68 99 5.31 3.7 3.96 2.91 3.45 2.11 3.34 1.61 100 5.25 3.78 3.86 2.93 3.42 2.03 3.3 1.54 101 5.16 3.86 3.76 2.93 3.39 1.94 3.26 1.47 102 5.06 3.94 3.65 2.91 3.36 1.85 3.2 1.4 103 4.97 3.99 3.55 2.88 3.31 1.77 3.14 1.33 104 4.89 4.02 3.45 2.82 3.25 1.68 3.08 1.27 105 4.84 4.02 3.36 2.76 3.2 1.61 3.01 1.21 106 4.81 3.98 3.27 2.69 3.16 1.54 2.94 1.16 107 4.8 3.92 3.19 2.61 3.15 1.47 2.87 1.11 108 4.78 3.83 3.12 2.53 3.16 1.41 2.8 1.07 109 4.74 3.72 3.06 2.46 3.19 1.36 2.74 1.03 110 4.66 3.6 3.01 2.4 3.24 1.31 2.68 0.992 111 4.55 3.49 2.97 2.35 3.3 1.26 2.64 0.963 112 4.4 3.39 2.94 2.31 3.35 1.22 2.6 0.938 113 4.23 3.31 2.92 2.28 3.39 1.19 2.58 0.919 114 4.05 3.25 2.9 2.27 3.41 1.15 2.57 0.905 115 3.88 3.22 2.89 2.26 3.41 1.12 2.57 0.896 116 3.73 3.21 2.88 2.25 3.39 1.08 2.59 0.892 117 3.61 3.22 2.87 2.25 3.35 1.05 2.62 0.892 118 3.53 3.24 2.85 2.24 3.31 1.02 2.66 0.897 119 3.47 3.27 2.84 2.23 3.27 0.996 2.71 0.906 120 3.44 3.3 2.83 2.21 3.24 0.97 2.77 0.919 121 3.41 3.34 2.81 2.19 3.22 0.947 2.84 0.935 122 3.39 3.37 2.79 2.15 3.21 0.926 2.91 0.954 123 3.36 3.41 2.77 2.11 3.2 0.908 2.99 0.976 124 3.33 3.43 2.75 2.07 3.2 0.895 3.08 0.999 125 3.29 3.46 2.73 2.02 3.19 0.885 3.17 1.02 126 3.25 3.49 2.7 1.97 3.18 0.88 3.26 1.05 127 3.21 3.52 2.68 1.92 3.16 0.88 3.35 1.08 128 3.16 3.55 2.66 1.87 3.13 0.884 3.44 1.1 129 3.13 3.58 2.65 1.83 3.11 0.893 3.53 1.13 130 3.09 3.62 2.64 1.8 3.08 0.907 3.62 1.15 131 3.05 3.67 2.63 1.77 3.05 0.925 3.7 1.18 132 3 3.72 2.63 1.74 3.03 0.947 3.78 1.2 133 2.95 3.78 2.63 1.72 3.01 0.972 3.86 1.22 134 2.89 3.83 2.64 1.71 2.98 1 3.93 1.24 135 2.83 3.88 2.66 1.69 2.96 1.03 4 1.26 136 2.76 3.93 2.68 1.68 2.93 1.06 4.07 1.28 137 2.68 3.97 2.7 1.67 2.89 1.09 4.13 1.3 138 2.62 4 2.73 1.66 2.85 1.13 4.18 1.31 139 2.55 4.01 2.76 1.65 2.8 1.16 4.22 1.33 140 2.5 4 2.8 1.64 2.75 1.19 4.27 1.34 141 2.45 3.98 2.83 1.62 2.69 1.22 4.3 1.36 142 2.42 3.94 2.86 1.61 2.63 1.24 4.33 1.37 143 2.39 3.89 2.89 1.6 2.58 1.27 4.35 1.38 144 2.36 3.83 2.92 1.59 2.54 1.29 4.36 1.39 145 2.34 3.76 2.95 1.58 2.51 1.31 4.37 1.4 146 2.32 3.68 2.97 1.58 2.48 1.33 4.38 1.41 147 2.29 3.59 2.99 1.58 2.47 1.35 4.37 1.42 148 2.26 3.51 3 1.59 2.47 1.36 4.36 1.44 149 2.23 3.43 3 1.6 2.47 1.38 4.35 1.45 150 2.2 3.35 3.01 1.62 2.49 1.39 4.33 1.46 151 2.17 3.27 3 1.64 2.5 1.4 4.3 1.48 152 2.14 3.21 3 1.67 2.51 1.41 4.27 1.49 153 2.1 3.15 2.98 1.71 2.53 1.42 4.23 1.5 154 2.07 3.09 2.97 1.74 2.54 1.43 4.19 1.52 155 2.05 3.04 2.95 1.78 2.54 1.44 4.15 1.54 156 2.02 2.99 2.92 1.81 2.54 1.45 4.1 1.56 157 1.99 2.95 2.9 1.84 2.53 1.46 4.05 1.57 158 1.96 2.91 2.87 1.87 2.51 1.47 4 1.59 159 1.94 2.87 2.85 1.9 2.49 1.49 3.94 1.61 160 1.91 2.83 2.82 1.92 2.46 1.5 3.88 1.64 161 1.89 2.8 2.79 1.93 2.42 1.52 3.82 1.66 162 1.87 2.76 2.76 1.94 2.38 1.54 3.76 1.68 163 1.85 2.73 2.73 1.94 2.34 1.55 3.69 1.7 164 1.83 2.69 2.7 1.94 2.29 1.57 3.63 1.73 165 1.82 2.66 2.68 1.93 2.25 1.59 3.56 1.75 166 1.81 2.63 2.65 1.92 2.2 1.62 3.5 1.77 167 1.81 2.6 2.62 1.91 2.17 1.64 3.43 1.79 168 1.8 2.57 2.6 1.9 2.14 1.66 3.37 1.81 169 1.8 2.55 2.58 1.88 2.12 1.69 3.3 1.83 170 1.8 2.53 2.56 1.87 2.1 1.71 3.24 1.85 171 1.8 2.51 2.54 1.85 2.09 1.74 3.17 1.87 172 1.8 2.49 2.52 1.84 2.09 1.76 3.11 1.89 173 1.8 2.48 2.5 1.82 2.09 1.79 3.05 1.91 174 1.8 2.47 2.48 1.81 2.09 1.81 2.99 1.92 175 1.79 2.46 2.47 1.8 2.1 1.84 2.93 1.94 176 1.79 2.45 2.45 1.79 2.1 1.86 2.87 1.95 177 1.78 2.45 2.44 1.78 2.11 1.89 2.81 1.96 178 1.77 2.44 2.42 1.77 2.11 1.91 2.75 1.96 179 1.76 2.44 2.41 1.77 2.1 1.93 2.7 1.97 180 1.74 2.43 2.39 1.76 2.1 1.94 2.65 1.97 181 1.73 2.43 2.38 1.75 2.09 1.96 2.59 1.98 182 1.71 2.43 2.36 1.75 2.07 1.97 2.54 1.98 183 1.68 2.43 2.35 1.75 2.05 1.98 2.49 1.97 184 1.66 2.43 2.34 1.74 2.03 1.99 2.44 1.97 185 1.63 2.42 2.32 1.74 2 1.99 2.4 1.96 186 1.61 2.42 2.31 1.73 1.98 2 2.35 1.95 187 1.58 2.42 2.29 1.73 1.95 2 2.3 1.94 188 1.56 2.42 2.27 1.72 1.92 1.99 2.26 1.93 189 1.53 2.42 2.26 1.71 1.89 1.98 2.22 1.92 190 1.51 2.41 2.24 1.7 1.86 1.97 2.18 1.9 191 1.49 2.41 2.22 1.69 1.83 1.96 2.13 1.88 192 1.47 2.4 2.21 1.68 1.81 1.94 2.09 1.87 193 1.46 2.39 2.19 1.66 1.78 1.92 2.06 1.84 194 1.45 2.38 2.17 1.64 1.77 1.9 2.02 1.82 195 1.44 2.37 2.16 1.62 1.75 1.87 1.98 1.8 196 1.43 2.35 2.14 1.6 1.74 1.84 1.95 1.77 197 1.42 2.33 2.13 1.57 1.73 1.81 1.91 1.75 198 1.42 2.31 2.11 1.55 1.72 1.78 1.88 1.72 199 1.41 2.29 2.1 1.52 1.72 1.75 1.85 1.69 200 1.41 2.27 2.08 1.49 1.71 1.71 1.82 1.66 201 1.41 2.24 2.07 1.46 1.71 1.67 1.79 1.63 202 1.4 2.21 2.06 1.43 1.71 1.63 1.77 1.6 203 1.4 2.19 2.05 1.4 1.7 1.59 1.74 1.57 204 1.39 2.16 2.04 1.38 1.69 1.55 1.72 1.54 205 1.38 2.13 2.03 1.35 1.69 1.51 1.7 1.51 206 1.37 2.1 2.02 1.33 1.68 1.47 1.68 1.48 207 1.36 2.07 2.02 1.3 1.67 1.43 1.66 1.45 208 1.35 2.04 2.02 1.28 1.66 1.39 1.65 1.42 209 1.34 2.01 2.01 1.26 1.65 1.35 1.63 1.39 210 1.33 1.98 2.01 1.24 1.64 1.31 1.62 1.36 211 1.32 1.95 2.01 1.23 1.62 1.27 1.61 1.32 212 1.31 1.92 2.02 1.21 1.61 1.23 1.6 1.29 213 1.3 1.9 2.02 1.2 1.6 1.19 1.6 1.27 214 1.28 1.87 2.03 1.19 1.58 1.16 1.59 1.24 215 1.27 1.84 2.03 1.18 1.57 1.12 1.59 1.21 216 1.26 1.82 2.04 1.17 1.56 1.09 1.59 1.18 217 1.24 1.79 2.05 1.16 1.55 1.06 1.59 1.15 218 1.23 1.77 2.06 1.15 1.54 1.02 1.59 1.13 219 1.22 1.75 2.07 1.14 1.53 0.995 1.59 1.1 220 1.2 1.72 2.08 1.14 1.53 0.966 1.59 1.08 221 1.18 1.7 2.09 1.13 1.52 0.939 1.6 1.06 222 1.17 1.68 2.1 1.12 1.52 0.913 1.6 1.04 223 1.15 1.65 2.11 1.11 1.51 0.888 1.61 1.02 224 1.13 1.63 2.12 1.1 1.51 0.865 1.62 1 225 1.12 1.61 2.13 1.09 1.51 0.843 1.63 0.983 226 1.1 1.59 2.14 1.08 1.5 0.823 1.64 0.967 227 1.08 1.57 2.15 1.07 1.5 0.803 1.65 0.952 228 1.06 1.55 2.16 1.06 1.49 0.785 1.66 0.939 229 1.04 1.53 2.17 1.04 1.49 0.769 1.67 0.927 230 1.03 1.51 2.17 1.03 1.48 0.753 1.68 0.916 231 1.01 1.5 2.17 1.02 1.47 0.739 1.69 0.906 232 0.993 1.48 2.18 1 1.47 0.726 1.7 0.898 233 0.979 1.46 2.18 0.989 1.46 0.714 1.71 0.891 234 0.965 1.45 2.17 0.975 1.45 0.703 1.72 0.885 235 0.952 1.44 2.17 0.961 1.44 0.694 1.73 0.88 236 0.94 1.43 2.16 0.946 1.43 0.685 1.74 0.876 237 0.929 1.42 2.15 0.932 1.42 0.678 1.75 0.874 238 0.918 1.41 2.14 0.918 1.41 0.672 1.75 0.873 239 0.909 1.4 2.13 0.904 1.4 0.666 1.76 0.872 240 0.901 1.39 2.11 0.891 1.39 0.662 1.77 0.873 241 0.893 1.38 2.09 0.878 1.39 0.659 1.77 0.874 242 0.886 1.38 2.07 0.866 1.38 0.656 1.78 0.877 243 0.879 1.37 2.05 0.854 1.37 0.655 1.78 0.88 244 0.873 1.37 2.03 0.843 1.37 0.654 1.78 0.884 245 0.868 1.37 2 0.833 1.36 0.654 1.78 0.889 246 0.863 1.37 1.97 0.824 1.36 0.655 1.78 0.894 247 0.858 1.36 1.94 0.815 1.35 0.657 1.78 0.9 248 0.854 1.36 1.91 0.807 1.35 0.659 1.78 0.906 249 0.851 1.36 1.88 0.799 1.34 0.662 1.78 0.913 250 0.848 1.36 1.85 0.792 1.34 0.666 1.77 0.921 251 0.845 1.36 1.81 0.786 1.33 0.67 1.77 0.929 252 0.843 1.36 1.78 0.78 1.32 0.675 1.76 0.937 253 0.842 1.36 1.74 0.774 1.31 0.68 1.75 0.945 254 0.841 1.36 1.71 0.769 1.3 0.686 1.75 0.954 255 0.841 1.36 1.67 0.764 1.29 0.692 1.74 0.963 256 0.842 1.36 1.63 0.759 1.27 0.698 1.72 0.972 257 0.842 1.36 1.6 0.754 1.26 0.705 1.71 0.981 258 0.843 1.35 1.56 0.749 1.25 0.712 1.7 0.99 259 0.845 1.35 1.53 0.744 1.23 0.719 1.69 0.999 260 0.846 1.35 1.49 0.739 1.22 0.727 1.67 1.01 261 0.848 1.35 1.46 0.734 1.2 0.734 1.66 1.02 262 0.85 1.35 1.43 0.729 1.19 0.741 1.64 1.03 263 0.851 1.34 1.4 0.724 1.18 0.749 1.62 1.03 264 0.853 1.34 1.37 0.719 1.17 0.756 1.6 1.04 265 0.854 1.34 1.34 0.714 1.15 0.764 1.58 1.05 266 0.854 1.34 1.31 0.708 1.14 0.771 1.57 1.06 267 0.854 1.33 1.28 0.703 1.14 0.778 1.55 1.07 268 0.853 1.33 1.26 0.698 1.13 0.785 1.53 1.07 269 0.852 1.32 1.24 0.693 1.12 0.791 1.51 1.08 270 0.85 1.32 1.22 0.688 1.12 0.797 1.48 1.09 271 0.847 1.32 1.2 0.683 1.12 0.803 1.46 1.09 272 0.843 1.31 1.18 0.678 1.11 0.809 1.44 1.1 273 0.839 1.31 1.16 0.673 1.11 0.814 1.42 1.1 274 0.834 1.3 1.14 0.668 1.11 0.819 1.4 1.11 275 0.828 1.3 1.13 0.664 1.11 0.823 1.38 1.11 276 0.822 1.29 1.12 0.66 1.11 0.827 1.36 1.12 277 0.815 1.28 1.1 0.655 1.11 0.83 1.33 1.12 278 0.808 1.28 1.09 0.651 1.11 0.833 1.31 1.13 279 0.801 1.27 1.09 0.647 1.11 0.836 1.29 1.13 280 0.793 1.26 1.08 0.643 1.12 0.838 1.27 1.13 281 0.785 1.26 1.07 0.639 1.12 0.839 1.25 1.13 282 0.777 1.25 1.06 0.636 1.12 0.84 1.23 1.13 283 0.769 1.24 1.06 0.632 1.12 0.84 1.21 1.14 284 0.76 1.24 1.06 0.628 1.12 0.84 1.19 1.14 285 0.753 1.23 1.05 0.624 1.12 0.839 1.17 1.14 286 0.745 1.22 1.05 0.621 1.12 0.838 1.15 1.14 287 0.737 1.21 1.05 0.617 1.12 0.836 1.13 1.14 288 0.73 1.21 1.05 0.613 1.12 0.834 1.11 1.14 289 0.724 1.2 1.05 0.609 1.12 0.831 1.1 1.13 290 0.717 1.2 1.05 0.605 1.13 0.827 1.08 1.13 291 0.712 1.19 1.04 0.602 1.13 0.824 1.06 1.13 292 0.707 1.18 1.04 0.598 1.13 0.82 1.05 1.13 293 0.702 1.18 1.05 0.594 1.13 0.815 1.03 1.13 294 0.698 1.17 1.05 0.59 1.13 0.81 1.02 1.12 295 0.695 1.17 1.05 0.586 1.13 0.805 1 1.12 296 0.692 1.17 1.05 0.582 1.13 0.799 0.987 1.12 297 0.69 1.16 1.05 0.578 1.13 0.793 0.974 1.12 298 0.688 1.16 1.05 0.574 1.13 0.787 0.961 1.11 299 0.688 1.16 1.05 0.571 1.13 0.78 0.949 1.11 300 0.687 1.15 1.05 0.567 1.13 0.773 0.938 1.11 301 0.688 1.15 1.05 0.564 1.13 0.766 0.926 1.1 302 0.689 1.15 1.05 0.56 1.13 0.759 0.916 1.1 303 0.69 1.15 1.05 0.557 1.13 0.752 0.906 1.1 304 0.692 1.15 1.05 0.554 1.13 0.744 0.896 1.09 305 0.694 1.15 1.05 0.552 1.12 0.736 0.887 1.09 306 0.696 1.15 1.05 0.549 1.12 0.729 0.878 1.09 307 0.698 1.15 1.05 0.547 1.11 0.721 0.87 1.08 308 0.701 1.15 1.05 0.545 1.11 0.713 0.861 1.08 309 0.703 1.15 1.05 0.543 1.1 0.705 0.854 1.08 310 0.706 1.14 1.05 0.542 1.1 0.697 0.846 1.07 311 0.708 1.14 1.04 0.541 1.09 0.689 0.839 1.07 312 0.71 1.14 1.04 0.54 1.09 0.682 0.832 1.07 313 0.712 1.14 1.04 0.539 1.08 0.674 0.826 1.07 314 0.713 1.14 1.04 0.538 1.08 0.666 0.82 1.06 315 0.714 1.14 1.04 0.538 1.07 0.659 0.813 1.06 316 0.714 1.14 1.03 0.538 1.07 0.651 0.807 1.06 317 0.714 1.14 1.03 0.538 1.06 0.644 0.801 1.06 318 0.713 1.14 1.03 0.538 1.06 0.637 0.796 1.06 319 0.712 1.14 1.02 0.538 1.05 0.63 0.79 1.06 320 0.71 1.14 1.02 0.539 1.05 0.623 0.785 1.06 321 0.708 1.14 1.02 0.539 1.04 0.616 0.779 1.06 322 0.705 1.13 1.01 0.539 1.04 0.61 0.774 1.06 323 0.702 1.13 1.01 0.54 1.03 0.603 0.768 1.06 324 0.699 1.13 1.01 0.54 1.03 0.597 0.763 1.06 325 0.695 1.13 1 0.541 1.02 0.591 0.757 1.06 326 0.691 1.12 0.999 0.541 1.02 0.586 0.752 1.06 327 0.686 1.12 0.994 0.541 1.01 0.58 0.746 1.06 328 0.681 1.12 0.99 0.541 1.01 0.575 0.74 1.06 329 0.677 1.11 0.986 0.541 1 0.57 0.735 1.06 330 0.672 1.11 0.981 0.541 1 0.565 0.729 1.06 331 0.666 1.1 0.976 0.541 0.994 0.56 0.723 1.06 332 0.661 1.1 0.972 0.541 0.989 0.556 0.717 1.07 333 0.656 1.1 0.967 0.54 0.984 0.551 0.711 1.07 334 0.651 1.09 0.962 0.54 0.979 0.547 0.705 1.07 335 0.646 1.09 0.958 0.539 0.974 0.543 0.699 1.07 336 0.641 1.08 0.953 0.538 0.968 0.54 0.692 1.07 337 0.636 1.08 0.948 0.537 0.963 0.536 0.686 1.08 338 0.631 1.07 0.943 0.536 0.958 0.533 0.679 1.08 339 0.626 1.06 0.938 0.534 0.953 0.529 0.672 1.08 340 0.621 1.06 0.933 0.532 0.948 0.526 0.665 1.09 341 0.617 1.05 0.928 0.53 0.944 0.523 0.658 1.09 342 0.613 1.05 0.923 0.528 0.939 0.521 0.651 1.09 343 0.608 1.04 0.918 0.526 0.935 0.518 0.644 1.09 344 0.604 1.04 0.913 0.524 0.931 0.515 0.636 1.1 345 0.601 1.03 0.908 0.521 0.927 0.513 0.629 1.1 346 0.597 1.02 0.902 0.518 0.923 0.51 0.621 1.1 347 0.594 1.02 0.897 0.515 0.919 0.508 0.614 1.1 348 0.591 1.01 0.892 0.512 0.916 0.506 0.606 1.11 349 0.588 1.01 0.887 0.509 0.913 0.504 0.598 1.11 350 0.585 1 0.881 0.505 0.91 0.502 0.59 1.11 351 0.582 0.996 0.876 0.501 0.907 0.499 0.582 1.11 352 0.58 0.99 0.87 0.497 0.904 0.497 0.574 1.11 353 0.578 0.984 0.865 0.493 0.901 0.495 0.566 1.12 354 0.576 0.979 0.859 0.489 0.898 0.494 0.558 1.12 355 0.574 0.974 0.854 0.485 0.895 0.492 0.55 1.12 356 0.572 0.968 0.848 0.48 0.892 0.49 0.542 1.12 357 0.57 0.963 0.842 0.475 0.889 0.488 0.533 1.12 358 0.568 0.958 0.836 0.47 0.886 0.486 0.525 1.12 359 0.566 0.952 0.831 0.465 0.883 0.484 0.517 1.12 360 0.565 0.947 0.825 0.46 0.88 0.482 0.509 1.12 361 0.563 0.942 0.819 0.455 0.876 0.48 0.5 1.12 362 0.562 0.937 0.813 0.449 0.872 0.478 0.492 1.12 363 0.56 0.932 0.807 0.443 0.869 0.476 0.484 1.12 364 0.558 0.927 0.801 0.438 0.864 0.474 0.476 1.12 365 0.556 0.922 0.794 0.432 0.86 0.472 0.468 1.12 366 0.555 0.917 0.788 0.426 0.855 0.47 0.459 1.12 367 0.553 0.912 0.782 0.42 0.85 0.468 0.451 1.11 368 0.551 0.907 0.776 0.414 0.845 0.465 0.443 1.11 369 0.548 0.902 0.769 0.408 0.84 0.463 0.435 1.11 370 0.546 0.897 0.763 0.401 0.834 0.461 0.428 1.11 371 0.544 0.892 0.757 0.395 0.828 0.459 0.42 1.11 372 0.541 0.887 0.75 0.389 0.822 0.456 0.412 1.1 373 0.539 0.882 0.744 0.382 0.815 0.454 0.404 1.1 374 0.536 0.876 0.737 0.376 0.809 0.451 0.397 1.1 375 0.533 0.871 0.731 0.37 0.802 0.449 0.389 1.09 376 0.53 0.866 0.724 0.364 0.795 0.446 0.382 1.09 377 0.527 0.861 0.718 0.357 0.788 0.444 0.375 1.08 378 0.524 0.856 0.711 0.351 0.781 0.441 0.368 1.08 379 0.521 0.851 0.705 0.345 0.774 0.439 0.361 1.08 380 0.517 0.846 0.698 0.339 0.767 0.436 0.354 1.07 381 0.514 0.841 0.692 0.333 0.76 0.433 0.347 1.07 382 0.51 0.836 0.685 0.327 0.753 0.431 0.34 1.06 383 0.507 0.831 0.679 0.321 0.747 0.428 0.334 1.06 384 0.503 0.826 0.673 0.315 0.74 0.425 0.327 1.05 385 0.499 0.821 0.666 0.31 0.734 0.423 0.321 1.05 386 0.496 0.816 0.66 0.305 0.727 0.42 0.315 1.04 387 0.492 0.811 0.654 0.299 0.721 0.417 0.309 1.03 388 0.488 0.807 0.647 0.295 0.716 0.415 0.303 1.03 389 0.485 0.802 0.641 0.29 0.71 0.412 0.297 1.02 390 0.481 0.797 0.635 0.285 0.705 0.409 0.292 1.02 391 0.478 0.793 0.629 0.281 0.7 0.407 0.287 1.01 392 0.474 0.788 0.623 0.277 0.695 0.404 0.281 1.01 393 0.47 0.784 0.618 0.273 0.691 0.402 0.276 1 394 0.467 0.78 0.612 0.27 0.687 0.399 0.271 0.994 395 0.464 0.776 0.606 0.266 0.683 0.397 0.266 0.988 396 0.46 0.772 0.6 0.264 0.679 0.394 0.262 0.982 397 0.457 0.768 0.595 0.261 0.675 0.392 0.257 0.977 398 0.454 0.764 0.589 0.259 0.672 0.39 0.253 0.971 399 0.451 0.761 0.584 0.257 0.669 0.388 0.249 0.965 400 0.448 0.757 0.579 0.255 0.666 0.386 0.245 0.959 401 0.446 0.754 0.573 0.254 0.663 0.384 0.241 0.954 402 0.443 0.75 0.568 0.253 0.66 0.382 0.237 0.948 403 0.44 0.747 0.563 0.252 0.658 0.38 0.234 0.942 404 0.438 0.744 0.558 0.252 0.655 0.378 0.23 0.937 405 0.435 0.741 0.553 0.252 0.653 0.376 0.227 0.932 406 0.433 0.739 0.548 0.252 0.65 0.375 0.224 0.926 407 0.431 0.736 0.543 0.253 0.648 0.373 0.221 0.921 408 0.429 0.733 0.539 0.254 0.645 0.372 0.219 0.916 409 0.426 0.731 0.534 0.256 0.643 0.371 0.216 0.911 410 0.424 0.729 0.529 0.257 0.64 0.37 0.214 0.907 411 0.422 0.726 0.525 0.259 0.638 0.369 0.212 0.902 412 0.42 0.724 0.52 0.261 0.635 0.368 0.21 0.897 413 0.418 0.722 0.516 0.264 0.633 0.367 0.208 0.893 414 0.416 0.721 0.512 0.267 0.63 0.366 0.206 0.889 415 0.414 0.719 0.507 0.27 0.628 0.366 0.204 0.885 416 0.412 0.717 0.503 0.273 0.625 0.365 0.203 0.881 417 0.41 0.716 0.499 0.277 0.623 0.365 0.202 0.877 418 0.408 0.715 0.495 0.281 0.62 0.365 0.2 0.874 419 0.406 0.713 0.49 0.284 0.617 0.365 0.199 0.87 420 0.404 0.712 0.486 0.289 0.615 0.365 0.199 0.867 421 0.402 0.711 0.482 0.293 0.612 0.365 0.198 0.864 422 0.4 0.71 0.478 0.297 0.61 0.365 0.197 0.861 423 0.397 0.709 0.474 0.301 0.607 0.365 0.197 0.859 424 0.395 0.708 0.47 0.306 0.605 0.366 0.197 0.856 425 0.393 0.708 0.466 0.31 0.602 0.366 0.197 0.854 426 0.391 0.707 0.462 0.315 0.6 0.367 0.197 0.852 427 0.388 0.707 0.459 0.32 0.598 0.368 0.197 0.85 428 0.386 0.706 0.455 0.324 0.596 0.368 0.197 0.848 429 0.384 0.706 0.451 0.329 0.594 0.369 0.197 0.846 430 0.381 0.706 0.447 0.333 0.592 0.37 0.198 0.845 431 0.379 0.706 0.443 0.338 0.59 0.372 0.198 0.844 432 0.377 0.706 0.44 0.342 0.588 0.373 0.199 0.843 433 0.374 0.706 0.436 0.346 0.587 0.374 0.2 0.842 434 0.372 0.706 0.432 0.35 0.585 0.375 0.201 0.841 435 0.37 0.706 0.429 0.354 0.584 0.377 0.202 0.84 436 0.367 0.706 0.425 0.358 0.583 0.378 0.203 0.84 437 0.365 0.706 0.421 0.362 0.582 0.38 0.204 0.84 438 0.363 0.706 0.418 0.365 0.581 0.381 0.206 0.84 439 0.361 0.706 0.414 0.368 0.58 0.383 0.207 0.84 440 0.359 0.706 0.411 0.371 0.579 0.385 0.208 0.84 441 0.356 0.706 0.407 0.374 0.578 0.386 0.21 0.841 442 0.354 0.706 0.404 0.377 0.577 0.388 0.212 0.841 443 0.352 0.706 0.4 0.379 0.577 0.39 0.213 0.842 444 0.35 0.706 0.397 0.381 0.576 0.392 0.215 0.843 445 0.348 0.706 0.394 0.383 0.576 0.394 0.217 0.844 446 0.346 0.705 0.39 0.384 0.575 0.396 0.219 0.845 447 0.344 0.705 0.387 0.385 0.575 0.398 0.221 0.847 448 0.342 0.704 0.384 0.386 0.574 0.399 0.223 0.848 449 0.34 0.704 0.38 0.387 0.574 0.401 0.225 0.85 450 0.338 0.703 0.377 0.387 0.574 0.403 0.227 0.852 451 0.336 0.702 0.374 0.387 0.573 0.405 0.229 0.853 452 0.335 0.701 0.371 0.387 0.573 0.407 0.231 0.855 453 0.333 0.7 0.368 0.387 0.572 0.409 0.233 0.858 454 0.331 0.699 0.365 0.386 0.572 0.411 0.236 0.86 455 0.329 0.697 0.362 0.385 0.571 0.413 0.238 0.862 456 0.327 0.695 0.359 0.384 0.571 0.415 0.24 0.864 457 0.325 0.693 0.356 0.382 0.57 0.417 0.243 0.867 458 0.324 0.691 0.353 0.381 0.57 0.419 0.245 0.87 459 0.322 0.689 0.35 0.379 0.569 0.421 0.247 0.872 460 0.32 0.686 0.347 0.376 0.569 0.422 0.25 0.875 461 0.318 0.683 0.345 0.374 0.568 0.424 0.252 0.878 462 0.317 0.68 0.342 0.371 0.567 0.426 0.254 0.881 463 0.315 0.677 0.339 0.368 0.567 0.428 0.257 0.884 464 0.313 0.674 0.337 0.365 0.566 0.429 0.259 0.887 465 0.311 0.67 0.334 0.362 0.565 0.431 0.261 0.89 466 0.309 0.666 0.331 0.358 0.564 0.432 0.264 0.893 467 0.308 0.662 0.329 0.355 0.563 0.434 0.266 0.896 468 0.306 0.658 0.327 0.351 0.563 0.435 0.268 0.899 469 0.304 0.654 0.324 0.347 0.562 0.437 0.27 0.903 470 0.302 0.649 0.322 0.343 0.561 0.438 0.273 0.906 471 0.3 0.645 0.32 0.339 0.56 0.439 0.275 0.909 472 0.299 0.64 0.317 0.335 0.559 0.44 0.277 0.912 473 0.297 0.635 0.315 0.33 0.558 0.442 0.279 0.916 474 0.295 0.63 0.313 0.326 0.557 0.443 0.281 0.919 475 0.293 0.625 0.311 0.322 0.556 0.444 0.283 0.922 476 0.291 0.619 0.309 0.317 0.555 0.444 0.285 0.926 477 0.29 0.614 0.307 0.312 0.554 0.445 0.287 0.929 478 0.288 0.608 0.305 0.308 0.553 0.446 0.289 0.932 479 0.286 0.603 0.303 0.303 0.552 0.447 0.291 0.935 480 0.284 0.597 0.301 0.298 0.551 0.447 0.293 0.938 481 0.282 0.591 0.299 0.294 0.55 0.448 0.295 0.942 482 0.28 0.586 0.298 0.289 0.548 0.449 0.297 0.945 483 0.279 0.58 0.296 0.285 0.547 0.449 0.298 0.948 484 0.277 0.574 0.294 0.28 0.546 0.449 0.3 0.951 485 0.275 0.568 0.293 0.275 0.545 0.45 0.302 0.954 486 0.273 0.562 0.291 0.271 0.543 0.45 0.303 0.957 487 0.272 0.557 0.289 0.267 0.542 0.45 0.305 0.96 488 0.27 0.551 0.288 0.262 0.541 0.45 0.306 0.962 489 0.268 0.545 0.286 0.258 0.54 0.45 0.307 0.965 490 0.266 0.54 0.285 0.254 0.538 0.45 0.309 0.968 491 0.265 0.534 0.283 0.25 0.537 0.45 0.31 0.97 492 0.263 0.528 0.282 0.246 0.536 0.45 0.311 0.972 493 0.261 0.523 0.28 0.242 0.534 0.449 0.312 0.975 494 0.26 0.517 0.279 0.238 0.533 0.449 0.313 0.977 495 0.258 0.512 0.278 0.234 0.532 0.448 0.314 0.979 496 0.256 0.507 0.276 0.231 0.53 0.448 0.315 0.981 497 0.255 0.501 0.275 0.227 0.529 0.447 0.316 0.983 498 0.253 0.496 0.274 0.224 0.527 0.447 0.317 0.985 499 0.252 0.491 0.272 0.221 0.526 0.446 0.318 0.987 500 0.25 0.486 0.271 0.218 0.525 0.445 0.319 0.988 501 0.249 0.481 0.27 0.215 0.523 0.445 0.319 0.99 502 0.247 0.477 0.269 0.212 0.522 0.444 0.32 0.991 503 0.245 0.472 0.267 0.209 0.521 0.443 0.32 0.992 504 0.244 0.468 0.266 0.207 0.52 0.442 0.321 0.993 505 0.242 0.463 0.265 0.204 0.518 0.441 0.321 0.994 506 0.241 0.459 0.264 0.202 0.517 0.44 0.321 0.995 507 0.24 0.455 0.262 0.199 0.516 0.438 0.322 0.995 508 0.238 0.45 0.261 0.197 0.515 0.437 0.322 0.996 509 0.237 0.446 0.26 0.195 0.514 0.436 0.322 0.996 510 0.235 0.443 0.258 0.193 0.512 0.435 0.322 0.997 511 0.234 0.439 0.257 0.192 0.511 0.433 0.322 0.997 512 0.233 0.435 0.256 0.19 0.51 0.432 0.322 0.997 513 0.231 0.431 0.254 0.188 0.509 0.431 0.322 0.996 514 0.23 0.428 0.253 0.187 0.508 0.429 0.322 0.996 515 0.229 0.424 0.252 0.185 0.508 0.427 0.322 0.996 516 0.227 0.421 0.25 0.184 0.507 0.426 0.321 0.995 517 0.226 0.418 0.249 0.183 0.506 0.424 0.321 0.994 518 0.225 0.415 0.247 0.182 0.505 0.423 0.321 0.993 519 0.224 0.412 0.246 0.181 0.504 0.421 0.32 0.992 520 0.223 0.409 0.244 0.179 0.503 0.419 0.32 0.991 521 0.221 0.406 0.243 0.178 0.503 0.418 0.319 0.99 522 0.22 0.403 0.241 0.178 0.502 0.416 0.319 0.988 523 0.219 0.4 0.24 0.177 0.501 0.414 0.318 0.987 524 0.218 0.397 0.238 0.176 0.501 0.412 0.317 0.985 525 0.217 0.395 0.237 0.175 0.5 0.41 0.317 0.983 526 0.216 0.392 0.235 0.174 0.499 0.408 0.316 0.981 527 0.215 0.39 0.233 0.173 0.499 0.406 0.315 0.979 528 0.214 0.387 0.231 0.173 0.498 0.404 0.314 0.977 529 0.213 0.385 0.23 0.172 0.497 0.402 0.313 0.974 530 0.212 0.382 0.228 0.171 0.497 0.4 0.313 0.972 531 0.211 0.38 0.226 0.171 0.496 0.398 0.312 0.969 532 0.21 0.378 0.224 0.17 0.495 0.396 0.311 0.966 533 0.209 0.376 0.222 0.169 0.495 0.394 0.31 0.963 534 0.208 0.373 0.22 0.169 0.494 0.392 0.309 0.96 535 0.207 0.371 0.219 0.168 0.493 0.39 0.308 0.957 536 0.206 0.369 0.217 0.167 0.492 0.388 0.307 0.954 537 0.205 0.367 0.215 0.167 0.491 0.386 0.306 0.951 538 0.205 0.365 0.212 0.166 0.49 0.384 0.304 0.947 539 0.204 0.363 0.21 0.166 0.49 0.382 0.303 0.944 540 0.203 0.361 0.208 0.165 0.489 0.379 0.302 0.94 541 0.202 0.359 0.206 0.164 0.488 0.377 0.301 0.936 542 0.201 0.357 0.204 0.164 0.487 0.375 0.3 0.933 543 0.2 0.355 0.202 0.163 0.485 0.373 0.299 0.929 544 0.199 0.353 0.2 0.162 0.484 0.371 0.298 0.925 545 0.198 0.351 0.198 0.162 0.483 0.368 0.296 0.921 546 0.197 0.349 0.195 0.161 0.482 0.366 0.295 0.917 547 0.196 0.348 0.193 0.161 0.481 0.364 0.294 0.912 548 0.195 0.346 0.191 0.16 0.479 0.362 0.293 0.908 549 0.193 0.344 0.189 0.159 0.478 0.359 0.291 0.904 550 0.192 0.342 0.186 0.159 0.477 0.357 0.29 0.899 551 0.191 0.34 0.184 0.158 0.475 0.355 0.289 0.895 552 0.19 0.339 0.182 0.158 0.474 0.353 0.288 0.89 553 0.189 0.337 0.179 0.157 0.472 0.35 0.286 0.886 554 0.188 0.335 0.177 0.156 0.471 0.348 0.285 0.881 555 0.187 0.333 0.175 0.156 0.469 0.346 0.284 0.876 556 0.185 0.332 0.172 0.155 0.467 0.344 0.283 0.871 557 0.184 0.33 0.17 0.155 0.466 0.341 0.282 0.867 558 0.183 0.328 0.168 0.154 0.464 0.339 0.28 0.862 559 0.182 0.327 0.165 0.153 0.463 0.337 0.279 0.857 560 0.181 0.325 0.163 0.153 0.461 0.335 0.278 0.852 561 0.179 0.323 0.16 0.152 0.459 0.332 0.277 0.847 562 0.178 0.322 0.158 0.152 0.457 0.33 0.276 0.842 563 0.177 0.32 0.156 0.151 0.456 0.328 0.275 0.837 564 0.176 0.318 0.153 0.151 0.454 0.326 0.273 0.832 565 0.175 0.317 0.151 0.151 0.452 0.323 0.272 0.827 566 0.173 0.315 0.149 0.15 0.451 0.321 0.271 0.822 567 0.172 0.314 0.147 0.15 0.449 0.319 0.27 0.817 568 0.171 0.312 0.144 0.149 0.447 0.317 0.269 0.812 569 0.17 0.31 0.142 0.149 0.446 0.315 0.268 0.807 570 0.169 0.309 0.14 0.149 0.444 0.312 0.267 0.802 571 0.168 0.307 0.138 0.148 0.442 0.31 0.266 0.797 572 0.167 0.306 0.135 0.148 0.441 0.308 0.265 0.792 573 0.166 0.304 0.133 0.148 0.439 0.306 0.264 0.787 574 0.165 0.303 0.131 0.147 0.437 0.304 0.263 0.782 575 0.164 0.301 0.129 0.147 0.436 0.302 0.262 0.777 576 0.163 0.3 0.127 0.147 0.434 0.3 0.261 0.772 577 0.162 0.298 0.125 0.147 0.433 0.297 0.26 0.767 578 0.161 0.297 0.123 0.147 0.431 0.295 0.26 0.762 579 0.161 0.295 0.121 0.146 0.43 0.293 0.259 0.757 580 0.16 0.294 0.119 0.146 0.429 0.291 0.258 0.752 581 0.159 0.292 0.117 0.146 0.427 0.289 0.257 0.747 582 0.159 0.291 0.115 0.146 0.426 0.287 0.256 0.742 583 0.158 0.289 0.113 0.146 0.425 0.285 0.256 0.738 584 0.158 0.288 0.111 0.146 0.423 0.283 0.255 0.733 585 0.157 0.286 0.109 0.146 0.422 0.281 0.254 0.728 586 0.157 0.285 0.107 0.146 0.421 0.279 0.254 0.723 587 0.157 0.284 0.106 0.146 0.42 0.277 0.253 0.718 588 0.156 0.282 0.104 0.145 0.418 0.275 0.253 0.714 589 0.156 0.281 0.102 0.145 0.417 0.273 0.252 0.709 590 0.156 0.28 0.101 0.145 0.416 0.271 0.251 0.705 591 0.156 0.278 0.0989 0.145 0.415 0.269 0.251 0.7 592 0.156 0.277 0.0974 0.145 0.414 0.267 0.25 0.695 593 0.155 0.275 0.0958 0.145 0.413 0.265 0.25 0.691 594 0.155 0.274 0.0943 0.145 0.412 0.263 0.25 0.687 595 0.155 0.273 0.0929 0.145 0.411 0.261 0.249 0.682 596 0.155 0.271 0.0915 0.145 0.409 0.259 0.249 0.678 597 0.155 0.27 0.0901 0.144 0.408 0.257 0.248 0.673 598 0.155 0.269 0.0888 0.144 0.407 0.256 0.248 0.669 599 0.155 0.267 0.0875 0.144 0.406 0.254 0.248 0.665 600 0.155 0.266 0.0862 0.144 0.405 0.252 0.247 0.661 601 0.155 0.265 0.085 0.144 0.404 0.25 0.247 0.657 602 0.155 0.263 0.0839 0.143 0.403 0.248 0.247 0.653 603 0.155 0.262 0.0827 0.143 0.402 0.246 0.247 0.649 604 0.156 0.261 0.0816 0.143 0.401 0.244 0.246 0.645 605 0.156 0.259 0.0806 0.143 0.4 0.243 0.246 0.641 606 0.156 0.258 0.0796 0.142 0.399 0.241 0.246 0.637 607 0.156 0.256 0.0786 0.142 0.398 0.239 0.246 0.633 608 0.156 0.255 0.0776 0.141 0.397 0.237 0.246 0.629 609 0.156 0.254 0.0767 0.141 0.396 0.236 0.245 0.626 610 0.156 0.252 0.0759 0.14 0.395 0.234 0.245 0.622 611 0.156 0.251 0.0751 0.14 0.394 0.232 0.245 0.619 612 0.156 0.25 0.0743 0.139 0.393 0.23 0.245 0.615 613 0.156 0.248 0.0735 0.139 0.392 0.228 0.245 0.612 614 0.155 0.247 0.0728 0.138 0.391 0.227 0.245 0.608 615 0.155 0.246 0.0721 0.138 0.39 0.225 0.245 0.605 616 0.155 0.244 0.0715 0.137 0.388 0.223 0.245 0.601 617 0.155 0.243 0.0709 0.136 0.387 0.222 0.245 0.598 618 0.155 0.241 0.0703 0.135 0.386 0.22 0.245 0.595 619 0.154 0.24 0.0698 0.135 0.385 0.218 0.245 0.592 620 0.154 0.239 0.0693 0.134 0.384 0.216 0.244 0.589 621 0.154 0.237 0.0688 0.133 0.383 0.215 0.244 0.586 622 0.153 0.236 0.0684 0.132 0.382 0.213 0.244 0.583 623 0.153 0.234 0.068 0.131 0.381 0.211 0.244 0.58 624 0.153 0.233 0.0676 0.13 0.379 0.21 0.244 0.577 625 0.152 0.232 0.0673 0.129 0.378 0.208 0.244 0.574 626 0.152 0.23 0.067 0.128 0.377 0.206 0.244 0.571 627 0.151 0.229 0.0667 0.127 0.376 0.204 0.244 0.569 628 0.151 0.227 0.0665 0.126 0.375 0.203 0.244 0.566 629 0.15 0.226 0.0662 0.125 0.374 0.201 0.244 0.563 630 0.15 0.225 0.0661 0.124 0.373 0.199 0.244 0.561 631 0.149 0.223 0.0659 0.123 0.371 0.198 0.244 0.558 632 0.149 0.222 0.0658 0.122 0.37 0.196 0.244 0.556 633 0.148 0.22 0.0657 0.121 0.369 0.194 0.244 0.553 634 0.147 0.219 0.0656 0.119 0.368 0.193 0.244 0.551 635 0.147 0.218 0.0655 0.118 0.367 0.191 0.244 0.549 636 0.146 0.216 0.0655 0.117 0.366 0.189 0.244 0.546 637 0.145 0.215 0.0655 0.116 0.364 0.188 0.244 0.544 638 0.145 0.213 0.0655 0.115 0.363 0.186 0.243 0.542 639 0.144 0.212 0.0656 0.113 0.362 0.184 0.243 0.54 640 0.143 0.211 0.0656 0.112 0.361 0.183 0.243 0.538 641 0.142 0.209 0.0657 0.111 0.36 0.181 0.243 0.536 642 0.142 0.208 0.0658 0.109 0.359 0.18 0.243 0.533 643 0.141 0.207 0.066 0.108 0.357 0.178 0.243 0.531 644 0.14 0.205 0.0661 0.107 0.356 0.176 0.243 0.53 645 0.139 0.204 0.0663 0.106 0.355 0.175 0.242 0.528 646 0.139 0.203 0.0665 0.104 0.354 0.173 0.242 0.526 647 0.138 0.202 0.0667 0.103 0.352 0.171 0.242 0.524 648 0.137 0.2 0.0669 0.102 0.351 0.17 0.242 0.522 649 0.136 0.199 0.0672 0.101 0.35 0.168 0.241 0.52 650 0.136 0.198 0.0675 0.0993 0.349 0.167 0.241 0.519 651 0.135 0.197 0.0677 0.098 0.347 0.165 0.241 0.517 652 0.134 0.195 0.068 0.0968 0.346 0.163 0.24 0.515 653 0.133 0.194 0.0683 0.0956 0.345 0.162 0.24 0.514 654 0.133 0.193 0.0687 0.0943 0.344 0.16 0.239 0.512 655 0.132 0.192 0.069 0.0931 0.342 0.159 0.239 0.51 656 0.131 0.191 0.0694 0.0919 0.341 0.157 0.239 0.509 657 0.13 0.189 0.0697 0.0908 0.339 0.155 0.238 0.507 658 0.13 0.188 0.0701 0.0896 0.338 0.154 0.238 0.506 659 0.129 0.187 0.0705 0.0885 0.337 0.152 0.237 0.504 660 0.128 0.186 0.0709 0.0873 0.335 0.151 0.237 0.503 661 0.127 0.185 0.0713 0.0862 0.334 0.149 0.236 0.501 662 0.127 0.184 0.0718 0.0852 0.332 0.147 0.235 0.5 663 0.126 0.183 0.0722 0.0841 0.331 0.146 0.235 0.499 664 0.125 0.182 0.0726 0.0831 0.329 0.144 0.234 0.497 665 0.124 0.181 0.0731 0.082 0.328 0.143 0.234 0.496 666 0.124 0.18 0.0735 0.0811 0.326 0.141 0.233 0.495 667 0.123 0.179 0.074 0.0801 0.325 0.14 0.232 0.493 668 0.122 0.178 0.0745 0.0791 0.323 0.138 0.231 0.492 669 0.122 0.177 0.075 0.0782 0.321 0.137 0.231 0.491 670 0.121 0.176 0.0754 0.0773 0.32 0.135 0.23 0.489 671 0.12 0.175 0.0759 0.0764 0.318 0.134 0.229 0.488 672 0.119 0.174 0.0764 0.0756 0.317 0.132 0.228 0.487 673 0.119 0.173 0.0769 0.0748 0.315 0.131 0.227 0.486 674 0.118 0.172 0.0774 0.074 0.313 0.129 0.226 0.484 675 0.117 0.171 0.0779 0.0732 0.312 0.128 0.226 0.483 676 0.116 0.17 0.0784 0.0725 0.31 0.126 0.225 0.482 677 0.115 0.169 0.0789 0.0717 0.308 0.125 0.224 0.481 678 0.115 0.168 0.0794 0.071 0.307 0.124 0.223 0.479 679 0.114 0.167 0.0799 0.0704 0.305 0.122 0.222 0.478 680 0.113 0.166 0.0804 0.0697 0.303 0.121 0.221 0.477 681 0.112 0.165 0.0809 0.0691 0.302 0.119 0.219 0.476 682 0.111 0.165 0.0814 0.0685 0.3 0.118 0.218 0.474 683 0.11 0.164 0.0819 0.0679 0.299 0.117 0.217 0.473 684 0.11 0.163 0.0824 0.0674 0.297 0.115 0.216 0.472 685 0.109 0.162 0.0829 0.0668 0.295 0.114 0.215 0.471 686 0.108 0.161 0.0834 0.0663 0.294 0.113 0.214 0.47 687 0.107 0.16 0.0839 0.0659 0.292 0.111 0.212 0.468 688 0.106 0.16 0.0844 0.0654 0.291 0.11 0.211 0.467 689 0.105 0.159 0.0848 0.0649 0.289 0.109 0.21 0.466 690 0.104 0.158 0.0853 0.0645 0.288 0.107 0.209 0.465 691 0.103 0.157 0.0857 0.0641 0.287 0.106 0.207 0.463 692 0.102 0.157 0.0862 0.0637 0.285 0.105 0.206 0.462 693 0.102 0.156 0.0866 0.0634 0.284 0.103 0.205 0.461 694 0.101 0.155 0.0871 0.063 0.283 0.102 0.203 0.459 695 0.0996 0.154 0.0875 0.0627 0.281 0.101 0.202 0.458 696 0.0987 0.154 0.0879 0.0624 0.28 0.0998 0.2 0.457 697 0.0977 0.153 0.0883 0.0621 0.279 0.0986 0.199 0.455 698 0.0967 0.152 0.0887 0.0618 0.278 0.0974 0.198 0.454 699 0.0957 0.151 0.0891 0.0615 0.277 0.0962 0.196 0.453 700 0.0947 0.151 0.0894 0.0613 0.276 0.095 0.195 0.451 701 0.0937 0.15 0.0898 0.061 0.275 0.0939 0.193 0.45 702 0.0927 0.149 0.0901 0.0608 0.274 0.0927 0.192 0.449 703 0.0917 0.149 0.0905 0.0606 0.273 0.0916 0.19 0.447 704 0.0907 0.148 0.0908 0.0604 0.272 0.0905 0.188 0.446 705 0.0897 0.147 0.0911 0.0602 0.271 0.0894 0.187 0.444 706 0.0887 0.147 0.0914 0.06 0.271 0.0883 0.185 0.443 707 0.0876 0.146 0.0917 0.0598 0.27 0.0872 0.184 0.441 708 0.0866 0.145 0.0919 0.0597 0.269 0.0861 0.182 0.44 709 0.0856 0.145 0.0922 0.0595 0.269 0.085 0.18 0.438 710 0.0846 0.144 0.0924 0.0594 0.268 0.084 0.179 0.437 711 0.0836 0.143 0.0926 0.0592 0.268 0.083 0.177 0.435 712 0.0826 0.143 0.0928 0.0591 0.267 0.0819 0.175 0.433 713 0.0816 0.142 0.093 0.059 0.267 0.0809 0.174 0.432 714 0.0806 0.141 0.0931 0.0588 0.266 0.0799 0.172 0.43 715 0.0796 0.141 0.0933 0.0587 0.266 0.0789 0.17 0.429 716 0.0786 0.14 0.0934 0.0586 0.266 0.0779 0.169 0.427 717 0.0776 0.139 0.0935 0.0585 0.265 0.077 0.167 0.425 718 0.0767 0.139 0.0936 0.0584 0.265 0.076 0.165 0.423 719 0.0757 0.138 0.0937 0.0583 0.265 0.0751 0.163 0.422 720 0.0748 0.137 0.0937 0.0582 0.265 0.0742 0.162 0.42 721 0.0738 0.136 0.0938 0.0581 0.264 0.0732 0.16 0.418 722 0.0729 0.136 0.0938 0.0579 0.264 0.0723 0.158 0.416 723 0.072 0.135 0.0938 0.0578 0.264 0.0714 0.156 0.414 724 0.0711 0.134 0.0938 0.0577 0.264 0.0705 0.155 0.413 725 0.0702 0.134 0.0937 0.0576 0.264 0.0697 0.153 0.411 726 0.0693 0.133 0.0937 0.0575 0.263 0.0688 0.151 0.409 727 0.0684 0.132 0.0936 0.0574 0.263 0.0679 0.149 0.407 728 0.0676 0.132 0.0935 0.0573 0.263 0.0671 0.148 0.405 729 0.0667 0.131 0.0934 0.0572 0.263 0.0662 0.146 0.403 730 0.0659 0.13 0.0932 0.0571 0.263 0.0654 0.144 0.401 731 0.0651 0.13 0.0931 0.0569 0.263 0.0646 0.142 0.399 732 0.0643 0.129 0.0929 0.0568 0.262 0.0638 0.14 0.397 733 0.0635 0.128 0.0927 0.0567 0.262 0.063 0.139 0.395 734 0.0628 0.127 0.0925 0.0566 0.262 0.0622 0.137 0.393 735 0.062 0.127 0.0923 0.0564 0.262 0.0614 0.135 0.391 736 0.0613 0.126 0.092 0.0563 0.261 0.0606 0.133 0.388 737 0.0606 0.125 0.0918 0.0561 0.261 0.0598 0.132 0.386 738 0.0599 0.124 0.0915 0.056 0.261 0.0591 0.13 0.384 739 0.0592 0.123 0.0912 0.0558 0.26 0.0583 0.128 0.382 740 0.0585 0.123 0.0908 0.0557 0.26 0.0576 0.126 0.38 741 0.0578 0.122 0.0905 0.0555 0.259 0.0568 0.124 0.377 742 0.0572 0.121 0.0901 0.0553 0.259 0.0561 0.123 0.375 743 0.0565 0.12 0.0897 0.0552 0.258 0.0554 0.121 0.373 744 0.0559 0.119 0.0893 0.055 0.258 0.0547 0.119 0.371 745 0.0553 0.118 0.0889 0.0548 0.257 0.054 0.118 0.368 746 0.0547 0.118 0.0885 0.0546 0.256 0.0533 0.116 0.366 747 0.0541 0.117 0.088 0.0544 0.256 0.0526 0.114 0.363 748 0.0535 0.116 0.0876 0.0542 0.255 0.0519 0.112 0.361 749 0.053 0.115 0.0871 0.0539 0.254 0.0512 0.111 0.359 750 0.0524 0.114 0.0866 0.0537 0.253 0.0505 0.109 0.356 751 0.0519 0.113 0.0861 0.0535 0.252 0.0499 0.107 0.354 752 0.0513 0.112 0.0855 0.0532 0.251 0.0492 0.106 0.351 753 0.0508 0.111 0.085 0.053 0.25 0.0486 0.104 0.349 754 0.0503 0.11 0.0844 0.0527 0.249 0.0479 0.102 0.346 755 0.0497 0.109 0.0838 0.0525 0.248 0.0473 0.101 0.344 756 0.0492 0.108 0.0832 0.0522 0.246 0.0466 0.099 0.341 757 0.0487 0.107 0.0826 0.0519 0.245 0.046 0.0974 0.339 758 0.0482 0.106 0.082 0.0516 0.244 0.0454 0.0958 0.336 759 0.0477 0.105 0.0814 0.0513 0.242 0.0447 0.0942 0.334 760 0.0472 0.104 0.0807 0.051 0.241 0.0441 0.0926 0.331 761 0.0467 0.103 0.0801 0.0507 0.239 0.0435 0.0911 0.329 762 0.0462 0.102 0.0794 0.0504 0.238 0.0429 0.0895 0.326 763 0.0457 0.101 0.0787 0.0501 0.236 0.0423 0.0879 0.323 764 0.0452 0.0997 0.078 0.0497 0.234 0.0417 0.0864 0.321 765 0.0447 0.0986 0.0773 0.0494 0.232 0.0411 0.0849 0.318 766 0.0442 0.0974 0.0766 0.0491 0.23 0.0405 0.0834 0.315 767 0.0437 0.0963 0.0759 0.0487 0.228 0.04 0.0819 0.313 768 0.0432 0.0951 0.0751 0.0483 0.226 0.0394 0.0804 0.31 769 0.0427 0.094 0.0744 0.048 0.224 0.0388 0.079 0.307 770 0.0422 0.0928 0.0737 0.0476 0.222 0.0382 0.0775 0.305 771 0.0417 0.0916 0.0729 0.0472 0.22 0.0377 0.0761 0.302 772 0.0412 0.0904 0.0721 0.0468 0.218 0.0371 0.0747 0.299 773 0.0407 0.0892 0.0713 0.0464 0.215 0.0366 0.0733 0.297 774 0.0402 0.088 0.0706 0.046 0.213 0.036 0.0719 0.294 775 0.0397 0.0868 0.0698 0.0456 0.211 0.0355 0.0705 0.291 776 0.0391 0.0855 0.069 0.0452 0.208 0.0349 0.0691 0.288 777 0.0386 0.0843 0.0682 0.0448 0.206 0.0344 0.0678 0.286 778 0.0381 0.0831 0.0674 0.0443 0.203 0.0339 0.0665 0.283 779 0.0375 0.0818 0.0665 0.0439 0.201 0.0333 0.0652 0.28 780 0.037 0.0805 0.0657 0.0435 0.198 0.0328 0.0639 0.277 781 0.0364 0.0793 0.0649 0.043 0.195 0.0323 0.0626 0.275 782 0.0359 0.078 0.0641 0.0426 0.192 0.0318 0.0613 0.272 783 0.0353 0.0768 0.0633 0.0421 0.19 0.0313 0.0601 0.269 784 0.0348 0.0755 0.0624 0.0416 0.187 0.0308 0.0588 0.266 785 0.0342 0.0742 0.0616 0.0412 0.184 0.0303 0.0576 0.264 786 0.0336 0.0729 0.0607 0.0407 0.181 0.0298 0.0564 0.261 787 0.033 0.0717 0.0599 0.0402 0.178 0.0293 0.0553 0.258 788 0.0324 0.0704 0.0591 0.0397 0.175 0.0288 0.0541 0.255 789 0.0319 0.0691 0.0582 0.0392 0.172 0.0283 0.0529 0.253 790 0.0313 0.0678 0.0574 0.0388 0.169 0.0278 0.0518 0.25 791 0.0307 0.0665 0.0566 0.0383 0.166 0.0273 0.0507 0.247 792 0.0301 0.0653 0.0557 0.0378 0.163 0.0269 0.0496 0.245 793 0.0295 0.064 0.0549 0.0372 0.16 0.0264 0.0485 0.242 794 0.0289 0.0627 0.054 0.0367 0.156 0.0259 0.0474 0.239 795 0.0283 0.0615 0.0532 0.0362 0.153 0.0255 0.0464 0.236 796 0.0277 0.0602 0.0524 0.0357 0.15 0.025 0.0454 0.234 797 0.0271 0.059 0.0515 0.0352 0.147 0.0246 0.0443 0.231 798 0.0264 0.0577 0.0507 0.0347 0.144 0.0241 0.0433 0.228 799 0.0258 0.0565 0.0499 0.0342 0.141 0.0237 0.0424 0.225 800 0.0252 0.0552 0.049 0.0336 0.137 0.0233 0.0414 0.223 # # AATAAA/TGTAA box probabilities [AATAAA] # Size of vector 4096 # Probabilities aaaaaa 0.0183 aacaaa 0.0141 aagaaa 0.0218 aataaa 0.6 aataca 0.0353 aatata 0.0707 aatgaa 0.0117 agtaaa 0.0232 attaaa 0.124 cataaa 0.0156 gataaa 0.0117 tataaa 0.0534 # end of content independent part [1] # (a,c,g,t)= (0.295, 0.205, 0.205, 0.295) # # Probabilities file for the UTR model # # # # The emission probabilities of single and initial 5' UTR exons # [EMISSION-5INITIAL] # size of the emission vector 1024 #k= 4 # patpseudo : pseudocount for sequence patterns 1 aaaaa 0.404 aaaac 0.191 aaaag 0.174 aaaat 0.23 aaaca 0.404 aaacc 0.173 aaacg 0.23 aaact 0.193 aaaga 0.261 aaagc 0.259 aaagg 0.152 aaagt 0.328 aaata 0.338 aaatc 0.219 aaatg 0.119 aaatt 0.324 aacaa 0.492 aacac 0.168 aacag 0.184 aacat 0.156 aacca 0.394 aaccc 0.207 aaccg 0.271 aacct 0.128 aacga 0.286 aacgc 0.284 aacgg 0.231 aacgt 0.199 aacta 0.244 aactc 0.202 aactg 0.292 aactt 0.261 aagaa 0.47 aagac 0.13 aagag 0.238 aagat 0.162 aagca 0.352 aagcc 0.205 aagcg 0.279 aagct 0.164 aagga 0.399 aaggc 0.283 aaggg 0.152 aaggt 0.166 aagta 0.185 aagtc 0.154 aagtg 0.4 aagtt 0.261 aataa 0.41 aatac 0.168 aatag 0.154 aatat 0.267 aatca 0.304 aatcc 0.194 aatcg 0.346 aatct 0.155 aatga 0.231 aatgc 0.297 aatgg 0.17 aatgt 0.302 aatta 0.248 aattc 0.189 aattg 0.245 aattt 0.318 acaaa 0.428 acaac 0.25 acaag 0.145 acaat 0.177 acaca 0.475 acacc 0.152 acacg 0.163 acact 0.21 acaga 0.28 acagc 0.357 acagg 0.12 acagt 0.243 acata 0.344 acatc 0.228 acatg 0.0966 acatt 0.332 accaa 0.39 accac 0.222 accag 0.221 accat 0.167 accca 0.417 acccc 0.22 acccg 0.222 accct 0.141 accga 0.367 accgc 0.291 accgg 0.151 accgt 0.19 accta 0.228 acctc 0.216 acctg 0.306 acctt 0.25 acgaa 0.432 acgac 0.177 acgag 0.215 acgat 0.176 acgca 0.344 acgcc 0.195 acgcg 0.285 acgct 0.175 acgga 0.351 acggc 0.259 acggg 0.146 acggt 0.243 acgta 0.209 acgtc 0.193 acgtg 0.332 acgtt 0.267 actaa 0.381 actac 0.214 actag 0.185 actat 0.221 actca 0.28 actcc 0.211 actcg 0.296 actct 0.212 actga 0.27 actgc 0.309 actgg 0.192 actgt 0.23 actta 0.19 acttc 0.194 acttg 0.236 acttt 0.38 agaaa 0.466 agaac 0.151 agaag 0.223 agaat 0.161 agaca 0.334 agacc 0.197 agacg 0.281 agact 0.187 agaga 0.362 agagc 0.285 agagg 0.16 agagt 0.193 agata 0.357 agatc 0.229 agatg 0.111 agatt 0.302 agcaa 0.371 agcac 0.155 agcag 0.34 agcat 0.134 agcca 0.424 agccc 0.195 agccg 0.266 agcct 0.115 agcga 0.352 agcgc 0.238 agcgg 0.251 agcgt 0.159 agcta 0.219 agctc 0.212 agctg 0.365 agctt 0.204 aggaa 0.397 aggac 0.146 aggag 0.267 aggat 0.191 aggca 0.363 aggcc 0.194 aggcg 0.301 aggct 0.141 aggga 0.329 agggc 0.265 agggg 0.244 agggt 0.163 aggta 0.15 aggtc 0.195 aggtg 0.361 aggtt 0.294 agtaa 0.386 agtac 0.173 agtag 0.23 agtat 0.212 agtca 0.291 agtcc 0.189 agtcg 0.349 agtct 0.172 agtga 0.289 agtgc 0.31 agtgg 0.154 agtgt 0.247 agtta 0.192 agttc 0.211 agttg 0.246 agttt 0.351 ataaa 0.467 ataac 0.162 ataag 0.148 ataat 0.223 ataca 0.438 atacc 0.167 atacg 0.21 atact 0.185 ataga 0.308 atagc 0.284 atagg 0.121 atagt 0.287 atata 0.413 atatc 0.161 atatg 0.104 atatt 0.322 atcaa 0.403 atcac 0.164 atcag 0.257 atcat 0.176 atcca 0.34 atccc 0.215 atccg 0.301 atcct 0.144 atcga 0.324 atcgc 0.28 atcgg 0.218 atcgt 0.178 atcta 0.227 atctc 0.238 atctg 0.305 atctt 0.23 atgaa 0.428 atgac 0.151 atgag 0.213 atgat 0.209 atgca 0.37 atgcc 0.208 atgcg 0.221 atgct 0.201 atgga 0.311 atggc 0.31 atggg 0.161 atggt 0.218 atgta 0.241 atgtc 0.119 atgtg 0.373 atgtt 0.267 attaa 0.405 attac 0.162 attag 0.18 attat 0.253 attca 0.29 attcc 0.218 attcg 0.308 attct 0.185 attga 0.257 attgc 0.26 attgg 0.19 attgt 0.293 attta 0.227 atttc 0.189 atttg 0.218 atttt 0.366 caaaa 0.416 caaac 0.186 caaag 0.165 caaat 0.233 caaca 0.457 caacc 0.151 caacg 0.192 caact 0.201 caaga 0.253 caagc 0.262 caagg 0.143 caagt 0.341 caata 0.264 caatc 0.223 caatg 0.104 caatt 0.409 cacaa 0.296 cacac 0.352 cacag 0.164 cacat 0.189 cacca 0.36 caccc 0.207 caccg 0.232 cacct 0.201 cacga 0.241 cacgc 0.323 cacgg 0.199 cacgt 0.237 cacta 0.175 cactc 0.239 cactg 0.28 cactt 0.305 cagaa 0.375 cagac 0.177 cagag 0.248 cagat 0.2 cagca 0.37 cagcc 0.184 cagcg 0.232 cagct 0.215 cagga 0.362 caggc 0.315 caggg 0.15 caggt 0.174 cagta 0.15 cagtc 0.197 cagtg 0.317 cagtt 0.336 cataa 0.344 catac 0.211 catag 0.139 catat 0.306 catca 0.265 catcc 0.214 catcg 0.312 catct 0.21 catga 0.212 catgc 0.286 catgg 0.161 catgt 0.341 catta 0.171 cattc 0.214 cattg 0.19 cattt 0.425 ccaaa 0.42 ccaac 0.202 ccaag 0.183 ccaat 0.195 ccaca 0.329 ccacc 0.275 ccacg 0.175 ccact 0.221 ccaga 0.244 ccagc 0.356 ccagg 0.127 ccagt 0.273 ccata 0.233 ccatc 0.306 ccatg 0.0964 ccatt 0.364 cccaa 0.335 cccac 0.237 cccag 0.22 cccat 0.207 cccca 0.329 ccccc 0.272 ccccg 0.231 cccct 0.167 cccga 0.291 cccgc 0.332 cccgg 0.154 cccgt 0.223 cccta 0.18 ccctc 0.281 ccctg 0.274 ccctt 0.264 ccgaa 0.378 ccgac 0.159 ccgag 0.215 ccgat 0.248 ccgca 0.299 ccgcc 0.271 ccgcg 0.207 ccgct 0.224 ccgga 0.318 ccggc 0.291 ccggg 0.165 ccggt 0.225 ccgta 0.176 ccgtc 0.22 ccgtg 0.275 ccgtt 0.329 cctaa 0.333 cctac 0.203 cctag 0.193 cctat 0.271 cctca 0.209 cctcc 0.282 cctcg 0.259 cctct 0.25 cctga 0.208 cctgc 0.319 cctgg 0.222 cctgt 0.25 cctta 0.189 ccttc 0.211 ccttg 0.224 ccttt 0.376 cgaaa 0.446 cgaac 0.169 cgaag 0.16 cgaat 0.225 cgaca 0.286 cgacc 0.175 cgacg 0.3 cgact 0.239 cgaga 0.276 cgagc 0.275 cgagg 0.143 cgagt 0.307 cgata 0.276 cgatc 0.252 cgatg 0.106 cgatt 0.366 cgcaa 0.295 cgcac 0.226 cgcag 0.273 cgcat 0.206 cgcca 0.315 cgccc 0.199 cgccg 0.304 cgcct 0.181 cgcga 0.277 cgcgc 0.274 cgcgg 0.166 cgcgt 0.283 cgcta 0.155 cgctc 0.259 cgctg 0.304 cgctt 0.283 cggaa 0.37 cggac 0.176 cggag 0.232 cggat 0.222 cggca 0.321 cggcc 0.179 cggcg 0.293 cggct 0.208 cggga 0.293 cgggc 0.315 cgggg 0.157 cgggt 0.235 cggta 0.153 cggtc 0.247 cggtg 0.263 cggtt 0.337 cgtaa 0.335 cgtac 0.202 cgtag 0.2 cgtat 0.262 cgtca 0.211 cgtcc 0.165 cgtcg 0.426 cgtct 0.198 cgtga 0.207 cgtgc 0.283 cgtgg 0.16 cgtgt 0.349 cgtta 0.147 cgttc 0.228 cgttg 0.23 cgttt 0.395 ctaaa 0.416 ctaac 0.193 ctaag 0.153 ctaat 0.238 ctaca 0.346 ctacc 0.194 ctacg 0.222 ctact 0.238 ctaga 0.277 ctagc 0.287 ctagg 0.118 ctagt 0.318 ctata 0.3 ctatc 0.242 ctatg 0.103 ctatt 0.355 ctcaa 0.359 ctcac 0.197 ctcag 0.257 ctcat 0.188 ctcca 0.327 ctccc 0.204 ctccg 0.27 ctcct 0.199 ctcga 0.286 ctcgc 0.311 ctcgg 0.182 ctcgt 0.221 ctcta 0.186 ctctc 0.316 ctctg 0.253 ctctt 0.246 ctgaa 0.422 ctgac 0.172 ctgag 0.187 ctgat 0.219 ctgca 0.297 ctgcc 0.218 ctgcg 0.248 ctgct 0.237 ctgga 0.268 ctggc 0.361 ctggg 0.148 ctggt 0.222 ctgta 0.151 ctgtc 0.182 ctgtg 0.333 ctgtt 0.333 cttaa 0.409 cttac 0.171 cttag 0.152 cttat 0.268 cttca 0.256 cttcc 0.197 cttcg 0.31 cttct 0.236 cttga 0.23 cttgc 0.258 cttgg 0.228 cttgt 0.283 cttta 0.17 ctttc 0.207 ctttg 0.222 ctttt 0.401 gaaaa 0.456 gaaac 0.158 gaaag 0.172 gaaat 0.214 gaaca 0.302 gaacc 0.177 gaacg 0.282 gaact 0.239 gaaga 0.329 gaagc 0.264 gaagg 0.149 gaagt 0.257 gaata 0.265 gaatc 0.24 gaatg 0.126 gaatt 0.369 gacaa 0.371 gacac 0.206 gacag 0.238 gacat 0.185 gacca 0.381 gaccc 0.191 gaccg 0.268 gacct 0.161 gacga 0.294 gacgc 0.274 gacgg 0.207 gacgt 0.225 gacta 0.184 gactc 0.213 gactg 0.272 gactt 0.331 gagaa 0.358 gagac 0.132 gagag 0.348 gagat 0.162 gagca 0.338 gagcc 0.169 gagcg 0.305 gagct 0.188 gagga 0.404 gaggc 0.272 gaggg 0.177 gaggt 0.147 gagta 0.151 gagtc 0.152 gagtg 0.417 gagtt 0.279 gataa 0.366 gatac 0.201 gatag 0.182 gatat 0.251 gatca 0.224 gatcc 0.222 gatcg 0.356 gatct 0.197 gatga 0.25 gatgc 0.289 gatgg 0.181 gatgt 0.281 gatta 0.187 gattc 0.213 gattg 0.213 gattt 0.387 gcaaa 0.402 gcaac 0.244 gcaag 0.155 gcaat 0.199 gcaca 0.382 gcacc 0.191 gcacg 0.191 gcact 0.235 gcaga 0.23 gcagc 0.403 gcagg 0.13 gcagt 0.238 gcata 0.245 gcatc 0.248 gcatg 0.116 gcatt 0.391 gccaa 0.371 gccac 0.192 gccag 0.267 gccat 0.17 gccca 0.362 gcccc 0.245 gcccg 0.238 gccct 0.155 gccga 0.277 gccgc 0.336 gccgg 0.168 gccgt 0.219 gccta 0.192 gcctc 0.229 gcctg 0.286 gcctt 0.293 gcgaa 0.379 gcgac 0.171 gcgag 0.248 gcgat 0.203 gcgca 0.303 gcgcc 0.18 gcgcg 0.304 gcgct 0.212 gcgga 0.333 gcggc 0.297 gcggg 0.136 gcggt 0.235 gcgta 0.157 gcgtc 0.186 gcgtg 0.362 gcgtt 0.294 gctaa 0.42 gctac 0.17 gctag 0.198 gctat 0.212 gctca 0.217 gctcc 0.24 gctcg 0.285 gctct 0.258 gctga 0.231 gctgc 0.319 gctgg 0.2 gctgt 0.25 gctta 0.206 gcttc 0.192 gcttg 0.231 gcttt 0.371 ggaaa 0.487 ggaac 0.143 ggaag 0.166 ggaat 0.204 ggaca 0.311 ggacc 0.157 ggacg 0.298 ggact 0.234 ggaga 0.277 ggagc 0.308 ggagg 0.183 ggagt 0.232 ggata 0.275 ggatc 0.215 ggatg 0.138 ggatt 0.372 ggcaa 0.362 ggcac 0.161 ggcag 0.301 ggcat 0.176 ggcca 0.482 ggccc 0.192 ggccg 0.21 ggcct 0.116 ggcga 0.314 ggcgc 0.236 ggcgg 0.252 ggcgt 0.198 ggcta 0.207 ggctc 0.203 ggctg 0.316 ggctt 0.273 gggaa 0.445 gggac 0.132 gggag 0.224 gggat 0.199 gggca 0.324 gggcc 0.207 gggcg 0.277 gggct 0.192 gggga 0.29 ggggc 0.317 ggggg 0.199 ggggt 0.194 gggta 0.156 gggtc 0.184 gggtg 0.371 gggtt 0.289 ggtaa 0.36 ggtac 0.179 ggtag 0.203 ggtat 0.259 ggtca 0.363 ggtcc 0.162 ggtcg 0.301 ggtct 0.173 ggtga 0.236 ggtgc 0.256 ggtgg 0.239 ggtgt 0.268 ggtta 0.179 ggttc 0.224 ggttg 0.252 ggttt 0.345 gtaaa 0.457 gtaac 0.184 gtaag 0.118 gtaat 0.241 gtaca 0.37 gtacc 0.174 gtacg 0.228 gtact 0.228 gtaga 0.273 gtagc 0.292 gtagg 0.127 gtagt 0.309 gtata 0.283 gtatc 0.225 gtatg 0.139 gtatt 0.353 gtcaa 0.331 gtcac 0.24 gtcag 0.236 gtcat 0.192 gtcca 0.338 gtccc 0.188 gtccg 0.29 gtcct 0.185 gtcga 0.24 gtcgc 0.323 gtcgg 0.199 gtcgt 0.238 gtcta 0.191 gtctc 0.231 gtctg 0.293 gtctt 0.285 gtgaa 0.454 gtgac 0.159 gtgag 0.195 gtgat 0.193 gtgca 0.295 gtgcc 0.177 gtgcg 0.32 gtgct 0.208 gtgga 0.317 gtggc 0.281 gtggg 0.179 gtggt 0.222 gtgta 0.14 gtgtc 0.124 gtgtg 0.478 gtgtt 0.258 gttaa 0.396 gttac 0.161 gttag 0.187 gttat 0.256 gttca 0.257 gttcc 0.194 gttcg 0.331 gttct 0.219 gttga 0.217 gttgc 0.269 gttgg 0.181 gttgt 0.334 gttta 0.187 gtttc 0.187 gtttg 0.21 gtttt 0.416 taaaa 0.378 taaac 0.181 taaag 0.142 taaat 0.299 taaca 0.346 taacc 0.205 taacg 0.203 taact 0.246 taaga 0.262 taagc 0.287 taagg 0.13 taagt 0.32 taata 0.292 taatc 0.182 taatg 0.118 taatt 0.408 tacaa 0.371 tacac 0.204 tacag 0.161 tacat 0.264 tacca 0.365 taccc 0.187 taccg 0.238 tacct 0.21 tacga 0.293 tacgc 0.267 tacgg 0.201 tacgt 0.239 tacta 0.221 tactc 0.219 tactg 0.213 tactt 0.347 tagaa 0.401 tagac 0.161 tagag 0.2 tagat 0.238 tagca 0.327 tagcc 0.252 tagcg 0.187 tagct 0.234 tagga 0.318 taggc 0.303 taggg 0.172 taggt 0.207 tagta 0.183 tagtc 0.157 tagtg 0.286 tagtt 0.375 tataa 0.296 tatac 0.162 tatag 0.131 tatat 0.41 tatca 0.273 tatcc 0.18 tatcg 0.32 tatct 0.227 tatga 0.21 tatgc 0.238 tatgg 0.139 tatgt 0.413 tatta 0.209 tattc 0.165 tattg 0.187 tattt 0.44 tcaaa 0.395 tcaac 0.191 tcaag 0.176 tcaat 0.238 tcaca 0.397 tcacc 0.192 tcacg 0.151 tcact 0.261 tcaga 0.224 tcagc 0.318 tcagg 0.0949 tcagt 0.363 tcata 0.226 tcatc 0.288 tcatg 0.0818 tcatt 0.405 tccaa 0.343 tccac 0.219 tccag 0.229 tccat 0.208 tccca 0.353 tcccc 0.25 tcccg 0.224 tccct 0.172 tccga 0.279 tccgc 0.296 tccgg 0.163 tccgt 0.261 tccta 0.172 tcctc 0.28 tcctg 0.252 tcctt 0.296 tcgaa 0.373 tcgac 0.149 tcgag 0.223 tcgat 0.254 tcgca 0.299 tcgcc 0.227 tcgcg 0.237 tcgct 0.237 tcgga 0.273 tcggc 0.267 tcggg 0.155 tcggt 0.305 tcgta 0.179 tcgtc 0.236 tcgtg 0.25 tcgtt 0.335 tctaa 0.329 tctac 0.169 tctag 0.222 tctat 0.28 tctca 0.209 tctcc 0.208 tctcg 0.275 tctct 0.307 tctga 0.222 tctgc 0.281 tctgg 0.209 tctgt 0.288 tctta 0.179 tcttc 0.242 tcttg 0.217 tcttt 0.362 tgaaa 0.445 tgaac 0.154 tgaag 0.159 tgaat 0.241 tgaca 0.326 tgacc 0.192 tgacg 0.217 tgact 0.265 tgaga 0.264 tgagc 0.283 tgagg 0.126 tgagt 0.327 tgata 0.271 tgatc 0.174 tgatg 0.144 tgatt 0.411 tgcaa 0.388 tgcac 0.166 tgcag 0.236 tgcat 0.21 tgcca 0.378 tgccc 0.197 tgccg 0.251 tgcct 0.174 tgcga 0.279 tgcgc 0.242 tgcgg 0.188 tgcgt 0.291 tgcta 0.19 tgctc 0.238 tgctg 0.328 tgctt 0.245 tggaa 0.398 tggac 0.157 tggag 0.202 tggat 0.242 tggca 0.313 tggcc 0.253 tggcg 0.22 tggct 0.213 tggga 0.304 tgggc 0.297 tgggg 0.159 tgggt 0.24 tggta 0.175 tggtc 0.216 tggtg 0.308 tggtt 0.302 tgtaa 0.361 tgtac 0.189 tgtag 0.152 tgtat 0.297 tgtca 0.286 tgtcc 0.191 tgtcg 0.289 tgtct 0.234 tgtga 0.195 tgtgc 0.26 tgtgg 0.122 tgtgt 0.424 tgtta 0.162 tgttc 0.149 tgttg 0.257 tgttt 0.433 ttaaa 0.427 ttaac 0.156 ttaag 0.156 ttaat 0.261 ttaca 0.349 ttacc 0.223 ttacg 0.191 ttact 0.237 ttaga 0.222 ttagc 0.288 ttagg 0.143 ttagt 0.346 ttata 0.264 ttatc 0.186 ttatg 0.11 ttatt 0.439 ttcaa 0.386 ttcac 0.175 ttcag 0.228 ttcat 0.211 ttcca 0.345 ttccc 0.219 ttccg 0.253 ttcct 0.183 ttcga 0.269 ttcgc 0.27 ttcgg 0.202 ttcgt 0.259 ttcta 0.204 ttctc 0.228 ttctg 0.251 ttctt 0.316 ttgaa 0.412 ttgac 0.155 ttgag 0.187 ttgat 0.247 ttgca 0.315 ttgcc 0.242 ttgcg 0.215 ttgct 0.229 ttgga 0.303 ttggc 0.323 ttggg 0.148 ttggt 0.226 ttgta 0.156 ttgtc 0.134 ttgtg 0.3 ttgtt 0.409 tttaa 0.358 tttac 0.181 tttag 0.16 tttat 0.3 tttca 0.247 tttcc 0.222 tttcg 0.316 tttct 0.215 tttga 0.206 tttgc 0.245 tttgg 0.197 tttgt 0.352 tttta 0.173 ttttc 0.212 ttttg 0.213 ttttt 0.403 # 5' initial and single exon patterns: # aaaaa 82843 # aaaac 39191 # aaaag 35637 # aaaat 47216 # aaaca 36440 # aaacc 15586 # aaacg 20805 # aaact 17443 # aaaga 21586 # aaagc 21390 # aaagg 12565 # aaagt 27093 # aaata 40299 # aaatc 26101 # aaatg 14177 # aaatt 38609 # aacaa 41540 # aacac 14206 # aacag 15534 # aacat 13163 # aacca 14586 # aaccc 7646 # aaccg 10051 # aacct 4739 # aacga 13823 # aacgc 13728 # aacgg 11162 # aacgt 9614 # aacta 11090 # aactc 9181 # aactg 13228 # aactt 11859 # aagaa 24660 # aagac 6817 # aagag 12475 # aagat 8503 # aagca 17908 # aagcc 10425 # aagcg 14182 # aagct 8310 # aagga 11172 # aaggc 7942 # aaggg 4260 # aaggt 4648 # aagta 11142 # aagtc 9272 # aagtg 24128 # aagtt 15724 # aataa 32498 # aatac 13321 # aatag 12200 # aatat 21151 # aatca 17293 # aatcc 11027 # aatcg 19693 # aatct 8828 # aatga 7139 # aatgc 9151 # aatgg 5241 # aatgt 9308 # aatta 23574 # aattc 17999 # aattg 23369 # aattt 30289 # acaaa 34993 # acaac 20423 # acaag 11807 # acaat 14469 # acaca 22368 # acacc 7145 # acacg 7665 # acact 9909 # acaga 10398 # acagc 13243 # acagg 4451 # acagt 9014 # acata 13226 # acatc 8777 # acatg 3717 # acatt 12774 # accaa 14408 # accac 8216 # accag 8149 # accat 6162 # accca 8147 # acccc 4297 # acccg 4342 # accct 2765 # accga 9120 # accgc 7229 # accgg 3753 # accgt 4717 # accta 3775 # acctc 3567 # acctg 5058 # acctt 4129 # acgaa 13989 # acgac 5742 # acgag 6964 # acgat 5708 # acgca 11424 # acgcc 6487 # acgcg 9476 # acgct 5829 # acgga 8752 # acggc 6457 # acggg 3632 # acggt 6061 # acgta 5306 # acgtc 4907 # acgtg 8440 # acgtt 6795 # actaa 9449 # actac 5301 # actag 4581 # actat 5493 # actca 7160 # actcc 5405 # actcg 7571 # actct 5422 # actga 8629 # actgc 9883 # actgg 6125 # actgt 7343 # actta 6745 # acttc 6877 # acttg 8366 # acttt 13481 # agaaa 29144 # agaac 9425 # agaag 13983 # agaat 10052 # agaca 7566 # agacc 4463 # agacg 6369 # agact 4233 # agaga 14540 # agagc 11454 # agagg 6410 # agagt 7764 # agata 10089 # agatc 6483 # agatg 3137 # agatt 8540 # agcaa 22383 # agcac 9320 # agcag 20469 # agcat 8107 # agcca 14372 # agccc 6602 # agccg 9016 # agcct 3895 # agcga 15362 # agcgc 10385 # agcgg 10969 # agcgt 6959 # agcta 7412 # agctc 7171 # agctg 12344 # agctt 6900 # aggaa 11708 # aggac 4306 # aggag 7883 # aggat 5629 # aggca 8241 # aggcc 4398 # aggcg 6838 # aggct 3203 # aggga 4115 # agggc 3317 # agggg 3051 # agggt 2038 # aggta 1978 # aggtc 2578 # aggtg 4774 # aggtt 3878 # agtaa 10785 # agtac 4833 # agtag 6422 # agtat 5913 # agtca 8005 # agtcc 5197 # agtcg 9587 # agtct 4719 # agtga 17297 # agtgc 18610 # agtgg 9251 # agtgt 14796 # agtta 9708 # agttc 10664 # agttg 12428 # agttt 17739 # ataaa 33136 # ataac 11483 # ataag 10487 # ataat 15852 # ataca 15393 # atacc 5850 # atacg 7385 # atact 6495 # ataga 9121 # atagc 8428 # atagg 3573 # atagt 8520 # atata 24808 # atatc 9665 # atatg 6231 # atatt 19342 # atcaa 15945 # atcac 6508 # atcag 10172 # atcat 6970 # atcca 9815 # atccc 6189 # atccg 8665 # atcct 4160 # atcga 15632 # atcgc 13513 # atcgg 10533 # atcgt 8599 # atcta 6200 # atctc 6489 # atctg 8300 # atctt 6265 # atgaa 7173 # atgac 2532 # atgag 3567 # atgat 3497 # atgca 7786 # atgcc 4380 # atgcg 4663 # atgct 4232 # atgga 3798 # atggc 3788 # atggg 1970 # atggt 2664 # atgta 5905 # atgtc 2912 # atgtg 9137 # atgtt 6538 # attaa 20448 # attac 8194 # attag 9100 # attat 12795 # attca 13291 # attcc 9977 # attcg 14111 # attct 8477 # attga 13172 # attgc 13330 # attgg 9751 # attgt 15028 # attta 20506 # atttc 17018 # atttg 19651 # atttt 32973 # caaaa 43418 # caaac 19417 # caaag 17161 # caaat 24289 # caaca 26215 # caacc 8635 # caacg 11018 # caact 11503 # caaga 10351 # caagc 10723 # caagg 5863 # caagt 13926 # caata 13225 # caatc 11189 # caatg 5237 # caatt 20536 # cacaa 16535 # cacac 19660 # cacag 9159 # cacat 10541 # cacca 9798 # caccc 5624 # caccg 6300 # cacct 5470 # cacga 5689 # cacgc 7610 # cacgg 4699 # cacgt 5576 # cacta 5553 # cactc 7569 # cactg 8869 # cactt 9666 # cagaa 14648 # cagac 6902 # cagag 9690 # cagat 7824 # cagca 21630 # cagcc 10748 # cagcg 13560 # cagct 12574 # cagga 6947 # caggc 6041 # caggg 2876 # caggt 3341 # cagta 6575 # cagtc 8638 # cagtg 13946 # cagtt 14769 # cataa 11634 # catac 7130 # catag 4703 # catat 10359 # catca 8822 # catcc 7120 # catcg 10403 # catct 7004 # catga 2652 # catgc 3581 # catgg 2016 # catgt 4260 # catta 7992 # cattc 10020 # cattg 8868 # cattt 19897 # ccaaa 22858 # ccaac 10998 # ccaag 9988 # ccaat 10600 # ccaca 10689 # ccacc 8914 # ccacg 5687 # ccact 7176 # ccaga 8743 # ccagc 12753 # ccagg 4529 # ccagt 9779 # ccata 6535 # ccatc 8594 # ccatg 2705 # ccatt 10220 # cccaa 10510 # cccac 7440 # cccag 6908 # cccat 6491 # cccca 6998 # ccccc 5771 # ccccg 4915 # cccct 3555 # cccga 5763 # cccgc 6560 # cccgg 3044 # cccgt 4417 # cccta 2476 # ccctc 3861 # ccctg 3758 # ccctt 3628 # ccgaa 12022 # ccgac 5045 # ccgag 6838 # ccgat 7884 # ccgca 9877 # ccgcc 8937 # ccgcg 6819 # ccgct 7381 # ccgga 5357 # ccggc 4888 # ccggg 2783 # ccggt 3792 # ccgta 4179 # ccgtc 5208 # ccgtg 6530 # ccgtt 7796 # cctaa 4282 # cctac 2608 # cctag 2480 # cctat 3484 # cctca 3490 # cctcc 4714 # cctcg 4327 # cctct 4181 # cctga 3879 # cctgc 5946 # cctgg 4126 # cctgt 4659 # cctta 3485 # ccttc 3900 # ccttg 4139 # ccttt 6955 # cgaaa 27117 # cgaac 10240 # cgaag 9721 # cgaat 13685 # cgaca 7318 # cgacc 4466 # cgacg 7675 # cgact 6100 # cgaga 9792 # cgagc 9772 # cgagg 5067 # cgagt 10911 # cgata 9622 # cgatc 8806 # cgatg 3689 # cgatt 12768 # cgcaa 13814 # cgcac 10597 # cgcag 12767 # cgcat 9636 # cgcca 10407 # cgccc 6578 # cgccg 10039 # cgcct 5978 # cgcga 10780 # cgcgc 10662 # cgcgg 6481 # cgcgt 11009 # cgcta 5022 # cgctc 8403 # cgctg 9867 # cgctt 9198 # cggaa 12483 # cggac 5928 # cggag 7851 # cggat 7512 # cggca 9512 # cggcc 5296 # cggcg 8676 # cggct 6154 # cggga 4658 # cgggc 5006 # cgggg 2498 # cgggt 3739 # cggta 4203 # cggtc 6808 # cggtg 7230 # cggtt 9282 # cgtaa 7221 # cgtac 4361 # cgtag 4315 # cgtat 5645 # cgtca 5373 # cgtcc 4184 # cgtcg 10835 # cgtct 5043 # cgtga 7584 # cgtgc 10389 # cgtgg 5877 # cgtgt 12814 # cgtta 5500 # cgttc 8493 # cgttg 8578 # cgttt 14757 # ctaaa 12696 # ctaac 5893 # ctaag 4680 # ctaat 7269 # ctaca 5361 # ctacc 3013 # ctacg 3437 # ctact 3695 # ctaga 4531 # ctagc 4709 # ctagg 1925 # ctagt 5218 # ctata 6009 # ctatc 4853 # ctatg 2067 # ctatt 7125 # ctcaa 8045 # ctcac 4410 # ctcag 5758 # ctcat 4225 # ctcca 7313 # ctccc 4564 # ctccg 6056 # ctcct 4463 # ctcga 7833 # ctcgc 8511 # ctcgg 4990 # ctcgt 6057 # ctcta 4677 # ctctc 7954 # ctctg 6359 # ctctt 6194 # ctgaa 11880 # ctgac 4832 # ctgag 5269 # ctgat 6171 # ctgca 10913 # ctgcc 8008 # ctgcg 9113 # ctgct 8701 # ctgga 6544 # ctggc 8815 # ctggg 3618 # ctggt 5426 # ctgta 4625 # ctgtc 5572 # ctgtg 10192 # ctgtt 10186 # cttaa 8829 # cttac 3684 # cttag 3267 # cttat 5779 # cttca 6061 # cttcc 4662 # cttcg 7347 # cttct 5596 # cttga 5940 # cttgc 6662 # cttgg 5881 # cttgt 7301 # cttta 7169 # ctttc 8711 # ctttg 9376 # ctttt 16888 # gaaaa 46563 # gaaac 16179 # gaaag 17567 # gaaat 21827 # gaaca 10445 # gaacc 6101 # gaacg 9738 # gaact 8257 # gaaga 13121 # gaagc 10530 # gaagg 5951 # gaagt 10231 # gaata 12304 # gaatc 11104 # gaatg 5852 # gaatt 17092 # gacaa 10067 # gacac 5580 # gacag 6455 # gacat 5026 # gacca 5953 # gaccc 2980 # gaccg 4185 # gacct 2525 # gacga 6974 # gacgc 6511 # gacgg 4927 # gacgt 5344 # gacta 3668 # gactc 4247 # gactg 5435 # gactt 6612 # gagaa 13568 # gagac 5016 # gagag 13216 # gagat 6142 # gagca 12234 # gagcc 6134 # gagcg 11066 # gagct 6808 # gagga 7794 # gaggc 5245 # gaggg 3415 # gaggt 2831 # gagta 4975 # gagtc 5001 # gagtg 13738 # gagtt 9193 # gataa 12422 # gatac 6834 # gatag 6180 # gatat 8546 # gatca 5683 # gatcc 5638 # gatcg 9026 # gatct 4997 # gatga 3552 # gatgc 4110 # gatgg 2572 # gatgt 3997 # gatta 7828 # gattc 8910 # gattg 8913 # gattt 16197 # gcaaa 27057 # gcaac 16446 # gcaag 10438 # gcaat 13420 # gcaca 12843 # gcacc 6419 # gcacg 6417 # gcact 7910 # gcaga 12628 # gcagc 22145 # gcagg 7143 # gcagt 13096 # gcata 8335 # gcatc 8455 # gcatg 3969 # gcatt 13322 # gccaa 17661 # gccac 9165 # gccag 12701 # gccat 8101 # gccca 8650 # gcccc 5859 # gcccg 5678 # gccct 3716 # gccga 8883 # gccgc 10755 # gccgg 5376 # gccgt 7010 # gccta 3487 # gcctc 4170 # gcctg 5205 # gcctt 5322 # gcgaa 17495 # gcgac 7881 # gcgag 11445 # gcgat 9369 # gcgca 11366 # gcgcc 6758 # gcgcg 11390 # gcgct 7951 # gcgga 10677 # gcggc 9533 # gcggg 4365 # gcggt 7534 # gcgta 5562 # gcgtc 6585 # gcgtg 12805 # gcgtt 10382 # gctaa 9723 # gctac 3939 # gctag 4587 # gctat 4915 # gctca 6070 # gctcc 6738 # gctcg 7989 # gctct 7228 # gctga 9226 # gctgc 12771 # gctgg 7992 # gctgt 9994 # gctta 6208 # gcttc 5771 # gcttg 6949 # gcttt 11174 # ggaaa 21226 # ggaac 6233 # ggaag 7250 # ggaat 8915 # ggaca 5362 # ggacc 2706 # ggacg 5130 # ggact 4035 # ggaga 7075 # ggagc 7880 # ggagg 4679 # ggagt 5919 # ggata 6536 # ggatc 5113 # ggatg 3289 # ggatt 8842 # ggcaa 12049 # ggcac 5370 # ggcag 10026 # ggcat 5850 # ggcca 10291 # ggccc 4103 # ggccg 4490 # ggcct 2470 # ggcga 8578 # ggcgc 6425 # ggcgg 6865 # ggcgt 5407 # ggcta 4052 # ggctc 3974 # ggctg 6180 # ggctt 5328 # gggaa 7424 # gggac 2192 # gggag 3738 # gggat 3316 # gggca 5305 # gggcc 3388 # gggcg 4545 # gggct 3154 # gggga 2945 # ggggc 3211 # ggggg 2017 # ggggt 1969 # gggta 1823 # gggtc 2160 # gggtg 4350 # gggtt 3381 # ggtaa 4332 # ggtac 2151 # ggtag 2438 # ggtat 3115 # ggtca 6060 # ggtcc 2705 # ggtcg 5020 # ggtct 2893 # ggtga 5541 # ggtgc 6011 # ggtgg 5605 # ggtgt 6290 # ggtta 4211 # ggttc 5282 # ggttg 5928 # ggttt 8125 # gtaaa 14984 # gtaac 6038 # gtaag 3858 # gtaat 7898 # gtaca 6202 # gtacc 2916 # gtacg 3822 # gtact 3831 # gtaga 4799 # gtagc 5139 # gtagg 2226 # gtagt 5430 # gtata 6652 # gtatc 5283 # gtatg 3266 # gtatt 8310 # gtcaa 8844 # gtcac 6411 # gtcag 6295 # gtcat 5133 # gtcca 5710 # gtccc 3175 # gtccg 4898 # gtcct 3120 # gtcga 7893 # gtcgc 10605 # gtcgg 6526 # gtcgt 7809 # gtcta 3529 # gtctc 4258 # gtctg 5410 # gtctt 5265 # gtgaa 19839 # gtgac 6953 # gtgag 8507 # gtgat 8430 # gtgca 15552 # gtgcc 9314 # gtgcg 16886 # gtgct 10934 # gtgga 9199 # gtggc 8150 # gtggg 5205 # gtggt 6450 # gtgta 8818 # gtgtc 7761 # gtgtg 30042 # gtgtt 16199 # gttaa 11407 # gttac 4630 # gttag 5371 # gttat 7372 # gttca 8520 # gttcc 6429 # gttcg 10989 # gttct 7274 # gttga 9112 # gttgc 11307 # gttgg 7604 # gttgt 14049 # gttta 12363 # gtttc 12331 # gtttg 13875 # gtttt 27482 # taaaa 32895 # taaac 15764 # taaag 12396 # taaat 26056 # taaca 11473 # taacc 6805 # taacg 6741 # taact 8173 # taaga 7508 # taagc 8239 # taagg 3739 # taagt 9173 # taata 13796 # taatc 8616 # taatg 5550 # taatt 19258 # tacaa 13589 # tacac 7472 # tacag 5876 # tacat 9673 # tacca 6548 # taccc 3352 # taccg 4276 # tacct 3760 # tacga 5870 # tacgc 5355 # tacgg 4024 # tacgt 4786 # tacta 4551 # tactc 4527 # tactg 4392 # tactt 7160 # tagaa 9878 # tagac 3967 # tagag 4926 # tagat 5875 # tagca 8608 # tagcc 6619 # tagcg 4933 # tagct 6153 # tagga 3717 # taggc 3536 # taggg 2014 # taggt 2421 # tagta 5279 # tagtc 4530 # tagtg 8249 # tagtt 10820 # tataa 14563 # tatac 7975 # tatag 6461 # tatat 20172 # tatca 7704 # tatcc 5064 # tatcg 9034 # tatct 6385 # tatga 3468 # tatgc 3919 # tatgg 2294 # tatgt 6804 # tatta 11329 # tattc 8943 # tattg 10110 # tattt 23827 # tcaaa 19684 # tcaac 9530 # tcaag 8769 # tcaat 11892 # tcaca 10029 # tcacc 4838 # tcacg 3806 # tcact 6591 # tcaga 7330 # tcagc 10398 # tcagg 3099 # tcagt 11848 # tcata 5825 # tcatc 7423 # tcatg 2109 # tcatt 10441 # tccaa 12047 # tccac 7709 # tccag 8060 # tccat 7316 # tccca 7636 # tcccc 5407 # tcccg 4852 # tccct 3723 # tccga 8012 # tccgc 8506 # tccgg 4688 # tccgt 7483 # tccta 3131 # tcctc 5099 # tcctg 4601 # tcctt 5392 # tcgaa 17185 # tcgac 6855 # tcgag 10275 # tcgat 11711 # tcgca 14116 # tcgcc 10739 # tcgcg 11197 # tcgct 11220 # tcgga 8998 # tcggc 8783 # tcggg 5114 # tcggt 10049 # tcgta 6543 # tcgtc 8610 # tcgtg 9118 # tcgtt 12230 # tctaa 7136 # tctac 3671 # tctag 4826 # tctat 6081 # tctca 5623 # tctcc 5584 # tctcg 7400 # tctct 8256 # tctga 6443 # tctgc 8179 # tctgg 6079 # tctgt 8358 # tctta 5202 # tcttc 7034 # tcttg 6295 # tcttt 10518 # tgaaa 25096 # tgaac 8704 # tgaag 8961 # tgaat 13605 # tgaca 6855 # tgacc 4035 # tgacg 4570 # tgact 5583 # tgaga 6689 # tgagc 7192 # tgagg 3199 # tgagt 8289 # tgata 7773 # tgatc 4992 # tgatg 4119 # tgatt 11796 # tgcaa 19271 # tgcac 8235 # tgcag 11711 # tgcat 10400 # tgcca 12694 # tgccc 6626 # tgccg 8413 # tgcct 5843 # tgcga 11451 # tgcgc 9956 # tgcgg 7731 # tgcgt 11974 # tgcta 6659 # tgctc 8343 # tgctg 11513 # tgctt 8613 # tggaa 12227 # tggac 4830 # tggag 6201 # tggat 7432 # tggca 10309 # tggcc 8337 # tggcg 7239 # tggct 7011 # tggga 4979 # tgggc 4867 # tgggg 2599 # tgggt 3934 # tggta 4023 # tggtc 4977 # tggtg 7092 # tggtt 6954 # tgtaa 10435 # tgtac 5460 # tgtag 4403 # tgtat 8579 # tgtca 7037 # tgtcc 4701 # tgtcg 7092 # tgtct 5749 # tgtga 13199 # tgtgc 17643 # tgtgg 8249 # tgtgt 28728 # tgtta 9400 # tgttc 8638 # tgttg 14903 # tgttt 25120 # ttaaa 26793 # ttaac 9776 # ttaag 9760 # ttaat 16382 # ttaca 9707 # ttacc 6190 # ttacg 5314 # ttact 6584 # ttaga 6161 # ttagc 7986 # ttagg 3967 # ttagt 9596 # ttata 11794 # ttatc 8319 # ttatg 4907 # ttatt 19619 # ttcaa 17125 # ttcac 7749 # ttcag 10089 # ttcat 9375 # ttcca 12300 # ttccc 7801 # ttccg 9022 # ttcct 6527 # ttcga 14361 # ttcgc 14428 # ttcgg 10762 # ttcgt 13835 # ttcta 7262 # ttctc 8134 # ttctg 8938 # ttctt 11265 # ttgaa 17625 # ttgac 6643 # ttgag 7990 # ttgat 10567 # ttgca 15354 # ttgcc 11798 # ttgcg 10471 # ttgct 11178 # ttgga 11296 # ttggc 12056 # ttggg 5542 # ttggt 8431 # ttgta 9580 # ttgtc 8235 # ttgtg 18446 # ttgtt 25141 # tttaa 22302 # tttac 11303 # tttag 9994 # tttat 18703 # tttca 16234 # tttcc 14532 # tttcg 20748 # tttct 14089 # tttga 14555 # tttgc 17327 # tttgg 13889 # tttgt 24869 # tttta 22308 # ttttc 27335 # ttttg 27532 # ttttt 52052 # # The emission probabilities of internal and terminal 5' UTR exons # [EMISSION-5] # size of the emission vector 1024 #k= 4 # patpseudo : pseudocount for sequence patterns 1 aaaaa 0.409 aaaac 0.211 aaaag 0.192 aaaat 0.188 aaaca 0.414 aaacc 0.2 aaacg 0.202 aaact 0.184 aaaga 0.274 aaagc 0.283 aaagg 0.188 aaagt 0.254 aaata 0.342 aaatc 0.232 aaatg 0.163 aaatt 0.262 aacaa 0.521 aacac 0.159 aacag 0.183 aacat 0.137 aacca 0.454 aaccc 0.191 aaccg 0.252 aacct 0.104 aacga 0.376 aacgc 0.244 aacgg 0.227 aacgt 0.153 aacta 0.293 aactc 0.185 aactg 0.303 aactt 0.218 aagaa 0.453 aagac 0.149 aagag 0.274 aagat 0.125 aagca 0.382 aagcc 0.216 aagcg 0.246 aagct 0.156 aagga 0.479 aaggc 0.245 aaggg 0.163 aaggt 0.113 aagta 0.212 aagtc 0.187 aagtg 0.371 aagtt 0.23 aataa 0.439 aatac 0.176 aatag 0.153 aatat 0.231 aatca 0.361 aatcc 0.218 aatcg 0.273 aatct 0.148 aatga 0.261 aatgc 0.319 aatgg 0.182 aatgt 0.237 aatta 0.269 aattc 0.18 aattg 0.261 aattt 0.29 acaaa 0.384 acaac 0.303 acaag 0.154 acaat 0.159 acaca 0.489 acacc 0.201 acacg 0.148 acact 0.163 acaga 0.258 acagc 0.408 acagg 0.148 acagt 0.186 acata 0.341 acatc 0.28 acatg 0.124 acatt 0.255 accaa 0.386 accac 0.25 accag 0.226 accat 0.138 accca 0.467 acccc 0.226 acccg 0.178 accct 0.129 accga 0.412 accgc 0.285 accgg 0.172 accgt 0.131 accta 0.253 acctc 0.217 acctg 0.293 acctt 0.236 acgaa 0.381 acgac 0.227 acgag 0.234 acgat 0.158 acgca 0.399 acgcc 0.291 acgcg 0.166 acgct 0.144 acgga 0.409 acggc 0.289 acggg 0.154 acggt 0.148 acgta 0.245 acgtc 0.231 acgtg 0.277 acgtt 0.246 actaa 0.371 actac 0.239 actag 0.192 actat 0.197 actca 0.31 actcc 0.226 actcg 0.284 actct 0.181 actga 0.304 actgc 0.304 actgg 0.226 actgt 0.166 actta 0.205 acttc 0.198 acttg 0.281 acttt 0.316 agaaa 0.403 agaac 0.174 agaag 0.281 agaat 0.142 agaca 0.373 agacc 0.218 agacg 0.258 agact 0.15 agaga 0.36 agagc 0.297 agagg 0.202 agagt 0.141 agata 0.35 agatc 0.243 agatg 0.149 agatt 0.258 agcaa 0.362 agcac 0.138 agcag 0.397 agcat 0.103 agcca 0.483 agccc 0.168 agccg 0.243 agcct 0.105 agcga 0.373 agcgc 0.209 agcgg 0.284 agcgt 0.134 agcta 0.232 agctc 0.191 agctg 0.401 agctt 0.175 aggaa 0.315 aggac 0.181 aggag 0.33 aggat 0.173 aggca 0.351 aggcc 0.206 aggcg 0.293 aggct 0.15 aggga 0.412 agggc 0.235 agggg 0.217 agggt 0.136 aggta 0.164 aggtc 0.223 aggtg 0.374 aggtt 0.239 agtaa 0.384 agtac 0.215 agtag 0.219 agtat 0.183 agtca 0.325 agtcc 0.237 agtcg 0.291 agtct 0.146 agtga 0.295 agtgc 0.296 agtgg 0.213 agtgt 0.196 agtta 0.199 agttc 0.213 agttg 0.281 agttt 0.308 ataaa 0.478 ataac 0.163 ataag 0.154 ataat 0.205 ataca 0.424 atacc 0.213 atacg 0.207 atact 0.156 ataga 0.341 atagc 0.345 atagg 0.137 atagt 0.176 atata 0.453 atatc 0.169 atatg 0.122 atatt 0.256 atcaa 0.422 atcac 0.147 atcag 0.256 atcat 0.174 atcca 0.361 atccc 0.205 atccg 0.267 atcct 0.167 atcga 0.374 atcgc 0.279 atcgg 0.201 atcgt 0.147 atcta 0.235 atctc 0.209 atctg 0.335 atctt 0.221 atgaa 0.361 atgac 0.173 atgag 0.241 atgat 0.225 atgca 0.368 atgcc 0.236 atgcg 0.188 atgct 0.208 atgga 0.399 atggc 0.295 atggg 0.143 atggt 0.163 atgta 0.22 atgtc 0.148 atgtg 0.383 atgtt 0.249 attaa 0.442 attac 0.156 attag 0.179 attat 0.223 attca 0.311 attcc 0.234 attcg 0.285 attct 0.17 attga 0.293 attgc 0.279 attgg 0.214 attgt 0.213 attta 0.252 atttc 0.195 atttg 0.247 atttt 0.306 caaaa 0.391 caaac 0.207 caaag 0.194 caaat 0.208 caaca 0.497 caacc 0.153 caacg 0.17 caact 0.18 caaga 0.28 caagc 0.271 caagg 0.196 caagt 0.253 caata 0.282 caatc 0.255 caatg 0.125 caatt 0.339 cacaa 0.303 cacac 0.334 cacag 0.174 cacat 0.188 cacca 0.448 caccc 0.196 caccg 0.211 cacct 0.146 cacga 0.29 cacgc 0.323 cacgg 0.195 cacgt 0.192 cacta 0.173 cactc 0.227 cactg 0.287 cactt 0.312 cagaa 0.373 cagac 0.177 cagag 0.266 cagat 0.185 cagca 0.495 cagcc 0.179 cagcg 0.182 cagct 0.144 cagga 0.53 caggc 0.244 caggg 0.129 caggt 0.0973 cagta 0.189 cagtc 0.239 cagtg 0.309 cagtt 0.262 cataa 0.38 catac 0.195 catag 0.152 catat 0.272 catca 0.35 catcc 0.24 catcg 0.242 catct 0.168 catga 0.282 catgc 0.25 catgg 0.205 catgt 0.263 catta 0.205 cattc 0.175 cattg 0.221 cattt 0.399 ccaaa 0.394 ccaac 0.238 ccaag 0.202 ccaat 0.166 ccaca 0.353 ccacc 0.273 ccacg 0.171 ccact 0.203 ccaga 0.265 ccagc 0.363 ccagg 0.181 ccagt 0.191 ccata 0.253 ccatc 0.307 ccatg 0.12 ccatt 0.32 cccaa 0.334 cccac 0.236 cccag 0.233 cccat 0.196 cccca 0.321 ccccc 0.309 ccccg 0.218 cccct 0.152 cccga 0.325 cccgc 0.315 cccgg 0.18 cccgt 0.18 cccta 0.188 ccctc 0.285 ccctg 0.266 ccctt 0.261 ccgaa 0.374 ccgac 0.169 ccgag 0.245 ccgat 0.212 ccgca 0.326 ccgcc 0.325 ccgcg 0.144 ccgct 0.205 ccgga 0.386 ccggc 0.291 ccggg 0.144 ccggt 0.179 ccgta 0.186 ccgtc 0.28 ccgtg 0.237 ccgtt 0.297 cctaa 0.372 cctac 0.23 cctag 0.221 cctat 0.177 cctca 0.262 cctcc 0.338 cctcg 0.219 cctct 0.181 cctga 0.225 cctgc 0.31 cctgg 0.245 cctgt 0.219 cctta 0.204 ccttc 0.271 ccttg 0.238 ccttt 0.288 cgaaa 0.445 cgaac 0.161 cgaag 0.194 cgaat 0.201 cgaca 0.325 cgacc 0.179 cgacg 0.289 cgact 0.207 cgaga 0.286 cgagc 0.294 cgagg 0.208 cgagt 0.212 cgata 0.26 cgatc 0.289 cgatg 0.143 cgatt 0.308 cgcaa 0.287 cgcac 0.228 cgcag 0.29 cgcat 0.195 cgcca 0.379 cgccc 0.221 cgccg 0.257 cgcct 0.143 cgcga 0.326 cgcgc 0.26 cgcgg 0.186 cgcgt 0.227 cgcta 0.165 cgctc 0.265 cgctg 0.329 cgctt 0.241 cggaa 0.362 cggac 0.144 cggag 0.285 cggat 0.209 cggca 0.377 cggcc 0.185 cggcg 0.272 cggct 0.167 cggga 0.362 cgggc 0.282 cgggg 0.216 cgggt 0.14 cggta 0.158 cggtc 0.209 cggtg 0.347 cggtt 0.286 cgtaa 0.331 cgtac 0.206 cgtag 0.229 cgtat 0.235 cgtca 0.246 cgtcc 0.228 cgtcg 0.349 cgtct 0.177 cgtga 0.237 cgtgc 0.277 cgtgg 0.225 cgtgt 0.26 cgtta 0.172 cgttc 0.227 cgttg 0.274 cgttt 0.327 ctaaa 0.42 ctaac 0.196 ctaag 0.17 ctaat 0.214 ctaca 0.399 ctacc 0.193 ctacg 0.222 ctact 0.186 ctaga 0.293 ctagc 0.346 ctagg 0.134 ctagt 0.228 ctata 0.317 ctatc 0.232 ctatg 0.17 ctatt 0.281 ctcaa 0.379 ctcac 0.211 ctcag 0.233 ctcat 0.178 ctcca 0.372 ctccc 0.231 ctccg 0.176 ctcct 0.22 ctcga 0.297 ctcgc 0.344 ctcgg 0.182 ctcgt 0.177 ctcta 0.197 ctctc 0.329 ctctg 0.244 ctctt 0.23 ctgaa 0.392 ctgac 0.166 ctgag 0.231 ctgat 0.212 ctgca 0.343 ctgcc 0.238 ctgcg 0.196 ctgct 0.223 ctgga 0.354 ctggc 0.332 ctggg 0.152 ctggt 0.162 ctgta 0.174 ctgtc 0.221 ctgtg 0.341 ctgtt 0.264 cttaa 0.44 cttac 0.16 cttag 0.194 cttat 0.206 cttca 0.265 cttcc 0.236 cttcg 0.276 cttct 0.223 cttga 0.277 cttgc 0.239 cttgg 0.271 cttgt 0.213 cttta 0.208 ctttc 0.204 ctttg 0.249 ctttt 0.339 gaaaa 0.411 gaaac 0.193 gaaag 0.202 gaaat 0.194 gaaca 0.35 gaacc 0.209 gaacg 0.221 gaact 0.22 gaaga 0.303 gaagc 0.284 gaagg 0.213 gaagt 0.2 gaata 0.278 gaatc 0.306 gaatg 0.136 gaatt 0.28 gacaa 0.362 gacac 0.225 gacag 0.247 gacat 0.166 gacca 0.406 gaccc 0.209 gaccg 0.199 gacct 0.186 gacga 0.404 gacgc 0.228 gacgg 0.2 gacgt 0.168 gacta 0.205 gactc 0.214 gactg 0.292 gactt 0.289 gagaa 0.338 gagac 0.144 gagag 0.377 gagat 0.141 gagca 0.399 gagcc 0.188 gagcg 0.248 gagct 0.165 gagga 0.471 gaggc 0.256 gaggg 0.167 gaggt 0.106 gagta 0.177 gagtc 0.201 gagtg 0.363 gagtt 0.26 gataa 0.356 gatac 0.211 gatag 0.189 gatat 0.244 gatca 0.283 gatcc 0.256 gatcg 0.254 gatct 0.207 gatga 0.32 gatgc 0.288 gatgg 0.17 gatgt 0.221 gatta 0.216 gattc 0.225 gattg 0.234 gattt 0.325 gcaaa 0.363 gcaac 0.316 gcaag 0.137 gcaat 0.184 gcaca 0.392 gcacc 0.242 gcacg 0.151 gcact 0.215 gcaga 0.197 gcagc 0.505 gcagg 0.146 gcagt 0.153 gcata 0.229 gcatc 0.304 gcatg 0.137 gcatt 0.331 gccaa 0.349 gccac 0.206 gccag 0.292 gccat 0.153 gccca 0.416 gcccc 0.273 gcccg 0.193 gccct 0.118 gccga 0.281 gccgc 0.34 gccgg 0.211 gccgt 0.168 gccta 0.176 gcctc 0.257 gcctg 0.285 gcctt 0.282 gcgaa 0.365 gcgac 0.2 gcgag 0.271 gcgat 0.164 gcgca 0.342 gcgcc 0.241 gcgcg 0.202 gcgct 0.216 gcgga 0.377 gcggc 0.342 gcggg 0.14 gcggt 0.141 gcgta 0.194 gcgtc 0.204 gcgtg 0.335 gcgtt 0.268 gctaa 0.382 gctac 0.198 gctag 0.207 gctat 0.213 gctca 0.293 gctcc 0.259 gctcg 0.21 gctct 0.238 gctga 0.25 gctgc 0.366 gctgg 0.205 gctgt 0.179 gctta 0.215 gcttc 0.244 gcttg 0.21 gcttt 0.331 ggaaa 0.425 ggaac 0.174 ggaag 0.205 ggaat 0.197 ggaca 0.357 ggacc 0.187 ggacg 0.241 ggact 0.215 ggaga 0.247 ggagc 0.32 ggagg 0.251 ggagt 0.182 ggata 0.292 ggatc 0.295 ggatg 0.126 ggatt 0.286 ggcaa 0.387 ggcac 0.171 ggcag 0.315 ggcat 0.127 ggcca 0.503 ggccc 0.195 ggccg 0.175 ggcct 0.127 ggcga 0.333 ggcgc 0.217 ggcgg 0.289 ggcgt 0.161 ggcta 0.236 ggctc 0.212 ggctg 0.317 ggctt 0.236 gggaa 0.397 gggac 0.145 gggag 0.292 gggat 0.165 gggca 0.346 gggcc 0.185 gggcg 0.29 gggct 0.179 gggga 0.382 ggggc 0.298 ggggg 0.199 ggggt 0.121 gggta 0.203 gggtc 0.225 gggtg 0.333 gggtt 0.24 ggtaa 0.326 ggtac 0.202 ggtag 0.285 ggtat 0.187 ggtca 0.351 ggtcc 0.216 ggtcg 0.271 ggtct 0.161 ggtga 0.225 ggtgc 0.256 ggtgg 0.259 ggtgt 0.259 ggtta 0.233 ggttc 0.229 ggttg 0.226 ggttt 0.312 gtaaa 0.489 gtaac 0.184 gtaag 0.137 gtaat 0.19 gtaca 0.398 gtacc 0.194 gtacg 0.209 gtact 0.199 gtaga 0.29 gtagc 0.337 gtagg 0.152 gtagt 0.221 gtata 0.319 gtatc 0.232 gtatg 0.135 gtatt 0.313 gtcaa 0.362 gtcac 0.202 gtcag 0.235 gtcat 0.201 gtcca 0.404 gtccc 0.185 gtccg 0.225 gtcct 0.187 gtcga 0.278 gtcgc 0.311 gtcgg 0.214 gtcgt 0.197 gtcta 0.196 gtctc 0.218 gtctg 0.341 gtctt 0.244 gtgaa 0.443 gtgac 0.143 gtgag 0.221 gtgat 0.193 gtgca 0.337 gtgcc 0.203 gtgcg 0.265 gtgct 0.195 gtgga 0.378 gtggc 0.276 gtggg 0.171 gtggt 0.176 gtgta 0.162 gtgtc 0.136 gtgtg 0.456 gtgtt 0.246 gttaa 0.409 gttac 0.189 gttag 0.183 gttat 0.219 gttca 0.26 gttcc 0.24 gttcg 0.281 gttct 0.218 gttga 0.235 gttgc 0.301 gttgg 0.221 gttgt 0.243 gttta 0.214 gtttc 0.222 gtttg 0.222 gtttt 0.343 taaaa 0.389 taaac 0.196 taaag 0.156 taaat 0.259 taaca 0.371 taacc 0.234 taacg 0.187 taact 0.208 taaga 0.271 taagc 0.331 taagg 0.169 taagt 0.229 taata 0.274 taatc 0.234 taatg 0.144 taatt 0.348 tacaa 0.354 tacac 0.222 tacag 0.171 tacat 0.254 tacca 0.375 taccc 0.24 taccg 0.23 tacct 0.155 tacga 0.322 tacgc 0.265 tacgg 0.207 tacgt 0.207 tacta 0.235 tactc 0.205 tactg 0.236 tactt 0.324 tagaa 0.362 tagac 0.173 tagag 0.271 tagat 0.194 tagca 0.41 tagcc 0.264 tagcg 0.154 tagct 0.173 tagga 0.427 taggc 0.301 taggg 0.155 taggt 0.117 tagta 0.179 tagtc 0.219 tagtg 0.272 tagtt 0.33 tataa 0.29 tatac 0.169 tatag 0.15 tatat 0.39 tatca 0.307 tatcc 0.235 tatcg 0.24 tatct 0.217 tatga 0.245 tatgc 0.29 tatgg 0.16 tatgt 0.305 tatta 0.219 tattc 0.179 tattg 0.185 tattt 0.417 tcaaa 0.358 tcaac 0.241 tcaag 0.181 tcaat 0.221 tcaca 0.38 tcacc 0.272 tcacg 0.153 tcact 0.194 tcaga 0.231 tcagc 0.375 tcagg 0.143 tcagt 0.251 tcata 0.218 tcatc 0.358 tcatg 0.0968 tcatt 0.327 tccaa 0.305 tccac 0.238 tccag 0.26 tccat 0.197 tccca 0.361 tcccc 0.268 tcccg 0.192 tccct 0.178 tccga 0.267 tccgc 0.329 tccgg 0.198 tccgt 0.207 tccta 0.148 tcctc 0.276 tcctg 0.291 tcctt 0.284 tcgaa 0.375 tcgac 0.183 tcgag 0.234 tcgat 0.208 tcgca 0.305 tcgcc 0.288 tcgcg 0.176 tcgct 0.231 tcgga 0.327 tcggc 0.297 tcggg 0.184 tcggt 0.192 tcgta 0.16 tcgtc 0.269 tcgtg 0.232 tcgtt 0.339 tctaa 0.329 tctac 0.235 tctag 0.168 tctat 0.269 tctca 0.232 tctcc 0.227 tctcg 0.238 tctct 0.304 tctga 0.243 tctgc 0.291 tctgg 0.233 tctgt 0.233 tctta 0.193 tcttc 0.294 tcttg 0.204 tcttt 0.308 tgaaa 0.423 tgaac 0.175 tgaag 0.198 tgaat 0.204 tgaca 0.358 tgacc 0.225 tgacg 0.221 tgact 0.196 tgaga 0.269 tgagc 0.303 tgagg 0.2 tgagt 0.228 tgata 0.254 tgatc 0.21 tgatg 0.194 tgatt 0.342 tgcaa 0.383 tgcac 0.146 tgcag 0.263 tgcat 0.208 tgcca 0.455 tgccc 0.172 tgccg 0.231 tgcct 0.142 tgcga 0.366 tgcgc 0.194 tgcgg 0.203 tgcgt 0.237 tgcta 0.214 tgctc 0.221 tgctg 0.349 tgctt 0.216 tggaa 0.384 tggac 0.175 tggag 0.247 tggat 0.194 tggca 0.315 tggcc 0.28 tggcg 0.218 tggct 0.187 tggga 0.344 tgggc 0.349 tgggg 0.148 tgggt 0.158 tggta 0.154 tggtc 0.233 tggtg 0.334 tggtt 0.279 tgtaa 0.378 tgtac 0.211 tgtag 0.169 tgtat 0.243 tgtca 0.279 tgtcc 0.221 tgtcg 0.276 tgtct 0.223 tgtga 0.219 tgtgc 0.265 tgtgg 0.168 tgtgt 0.348 tgtta 0.183 tgttc 0.181 tgttg 0.31 tgttt 0.326 ttaaa 0.418 ttaac 0.181 ttaag 0.165 ttaat 0.237 ttaca 0.359 ttacc 0.218 ttacg 0.205 ttact 0.218 ttaga 0.221 ttagc 0.367 ttagg 0.16 ttagt 0.252 ttata 0.269 ttatc 0.212 ttatg 0.176 ttatt 0.343 ttcaa 0.399 ttcac 0.187 ttcag 0.213 ttcat 0.202 ttcca 0.361 ttccc 0.221 ttccg 0.246 ttcct 0.172 ttcga 0.304 ttcgc 0.263 ttcgg 0.2 ttcgt 0.233 ttcta 0.179 ttctc 0.254 ttctg 0.287 ttctt 0.28 ttgaa 0.386 ttgac 0.176 ttgag 0.212 ttgat 0.226 ttgca 0.397 ttgcc 0.239 ttgcg 0.168 ttgct 0.197 ttgga 0.37 ttggc 0.314 ttggg 0.153 ttggt 0.163 ttgta 0.205 ttgtc 0.174 ttgtg 0.31 ttgtt 0.312 tttaa 0.4 tttac 0.163 tttag 0.159 tttat 0.278 tttca 0.255 tttcc 0.265 tttcg 0.275 tttct 0.205 tttga 0.255 tttgc 0.245 tttgg 0.228 tttgt 0.272 tttta 0.2 ttttc 0.204 ttttg 0.238 ttttt 0.357 # 5' internal and terminal exon patterns: # aaaaa 20612 # aaaac 10643 # aaaag 9700 # aaaat 9478 # aaaca 10619 # aaacc 5128 # aaacg 5183 # aaact 4733 # aaaga 6498 # aaagc 6712 # aaagg 4447 # aaagt 6026 # aaata 8840 # aaatc 6009 # aaatg 4217 # aaatt 6782 # aacaa 14633 # aacac 4456 # aacag 5145 # aacat 3845 # aacca 5681 # aaccc 2385 # aaccg 3148 # aacct 1295 # aacga 4773 # aacgc 3104 # aacgg 2886 # aacgt 1942 # aacta 3713 # aactc 2340 # aactg 3835 # aactt 2764 # aagaa 7287 # aagac 2404 # aagag 4405 # aagat 2005 # aagca 6241 # aagcc 3532 # aagcg 4008 # aagct 2539 # aagga 5274 # aaggc 2700 # aaggg 1798 # aaggt 1241 # aagta 2907 # aagtc 2565 # aagtg 5077 # aagtt 3150 # aataa 8115 # aatac 3256 # aatag 2835 # aatat 4271 # aatca 5444 # aatcc 3279 # aatcg 4114 # aatct 2234 # aatga 2324 # aatgc 2838 # aatgg 1618 # aatgt 2110 # aatta 4841 # aattc 3242 # aattg 4693 # aattt 5222 # acaaa 10143 # acaac 8009 # acaag 4078 # acaat 4215 # acaca 6995 # acacc 2872 # acacg 2111 # acact 2333 # acaga 3077 # acagc 4863 # acagg 1766 # acagt 2221 # acata 3713 # acatc 3045 # acatg 1351 # acatt 2775 # accaa 5459 # accac 3544 # accag 3204 # accat 1946 # accca 3062 # acccc 1481 # acccg 1168 # accct 847 # accga 3056 # accgc 2111 # accgg 1277 # accgt 974 # accta 1141 # acctc 978 # acctg 1322 # acctt 1064 # acgaa 4190 # acgac 2497 # acgag 2575 # acgat 1741 # acgca 3202 # acgcc 2336 # acgcg 1332 # acgct 1159 # acgga 2653 # acggc 1872 # acggg 995 # acggt 961 # acgta 1298 # acgtc 1224 # acgtg 1467 # acgtt 1302 # actaa 2628 # actac 1695 # actag 1363 # actat 1399 # actca 1886 # actcc 1376 # actcg 1726 # actct 1099 # actga 2620 # actgc 2622 # actgg 1946 # actgt 1433 # actta 1660 # acttc 1605 # acttg 2278 # acttt 2561 # agaaa 7404 # agaac 3190 # agaag 5164 # agaat 2611 # agaca 2777 # agacc 1628 # agacg 1926 # agact 1121 # agaga 5064 # agagc 4170 # agagg 2842 # agagt 1986 # agata 2534 # agatc 1764 # agatg 1082 # agatt 1866 # agcaa 9200 # agcac 3521 # agcag 10101 # agcat 2621 # agcca 5744 # agccc 1998 # agccg 2891 # agcct 1247 # agcga 4633 # agcgc 2597 # agcgg 3528 # agcgt 1661 # agcta 2137 # agctc 1755 # agctg 3690 # agctt 1612 # aggaa 4786 # aggac 2755 # aggag 5024 # aggat 2636 # aggca 2782 # aggcc 1634 # aggcg 2325 # aggct 1185 # aggga 1987 # agggc 1133 # agggg 1045 # agggt 655 # aggta 550 # aggtc 750 # aggtg 1258 # aggtt 805 # agtaa 2646 # agtac 1480 # agtag 1508 # agtat 1258 # agtca 2427 # agtcc 1766 # agtcg 2172 # agtct 1091 # agtga 3571 # agtgc 3588 # agtgg 2583 # agtgt 2370 # agtta 1824 # agttc 1956 # agttg 2578 # agttt 2829 # ataaa 8405 # ataac 2876 # ataag 2715 # ataat 3603 # ataca 3642 # atacc 1826 # atacg 1778 # atact 1335 # ataga 2515 # atagc 2544 # atagg 1011 # atagt 1300 # atata 5885 # atatc 2202 # atatg 1584 # atatt 3329 # atcaa 5495 # atcac 1918 # atcag 3338 # atcat 2267 # atcca 3268 # atccc 1858 # atccg 2420 # atcct 1511 # atcga 3720 # atcgc 2774 # atcgg 1997 # atcgt 1467 # atcta 1598 # atctc 1422 # atctg 2275 # atctt 1498 # atgaa 2140 # atgac 1025 # atgag 1430 # atgat 1335 # atgca 2338 # atgcc 1499 # atgcg 1190 # atgct 1321 # atgga 1560 # atggc 1152 # atggg 558 # atggt 635 # atgta 1203 # atgtc 811 # atgtg 2100 # atgtt 1361 # attaa 4692 # attac 1651 # attag 1899 # attat 2361 # attca 2628 # attcc 1973 # attcg 2407 # attct 1435 # attga 3082 # attgc 2932 # attgg 2252 # attgt 2242 # attta 3948 # atttc 3056 # atttg 3858 # atttt 4788 # caaaa 11557 # caaac 6117 # caaag 5719 # caaat 6142 # caaca 10908 # caacc 3351 # caacg 3722 # caact 3954 # caaga 3619 # caagc 3499 # caagg 2528 # caagt 3259 # caata 3946 # caatc 3566 # caatg 1749 # caatt 4750 # cacaa 5179 # cacac 5718 # cacag 2981 # cacat 3218 # cacca 4495 # caccc 1965 # caccg 2112 # cacct 1462 # cacga 1857 # cacgc 2071 # cacgg 1249 # cacgt 1228 # cacta 1372 # cactc 1796 # cactg 2274 # cactt 2471 # cagaa 4548 # cagac 2160 # cagag 3241 # cagat 2257 # cagca 11077 # cagcc 3996 # cagcg 4073 # cagct 3224 # cagga 4284 # caggc 1970 # caggg 1038 # caggt 785 # cagta 1832 # cagtc 2318 # cagtg 2995 # cagtt 2539 # cataa 3501 # catac 1793 # catag 1400 # catat 2507 # catca 3663 # catcc 2516 # catcg 2534 # catct 1764 # catga 1180 # catgc 1047 # catgg 856 # catgt 1101 # catta 2132 # cattc 1824 # cattg 2303 # cattt 4153 # ccaaa 6893 # ccaac 4153 # ccaag 3530 # ccaat 2908 # ccaca 4061 # ccacc 3132 # ccacg 1963 # ccact 2336 # ccaga 3375 # ccagc 4611 # ccagg 2301 # ccagt 2430 # ccata 2115 # ccatc 2570 # ccatg 1003 # ccatt 2674 # cccaa 3366 # cccac 2377 # cccag 2348 # cccat 1975 # cccca 2224 # ccccc 2137 # ccccg 1509 # cccct 1051 # cccga 1634 # cccgc 1583 # cccgg 904 # cccgt 906 # cccta 702 # ccctc 1062 # ccctg 994 # ccctt 973 # ccgaa 3234 # ccgac 1461 # ccgag 2121 # ccgat 1837 # ccgca 2792 # ccgcc 2780 # ccgcg 1229 # ccgct 1757 # ccgga 2008 # ccggc 1516 # ccggg 751 # ccggt 929 # ccgta 854 # ccgtc 1287 # ccgtg 1091 # ccgtt 1363 # cctaa 1261 # cctac 779 # cctag 748 # cctat 601 # cctca 1195 # cctcc 1540 # cctcg 995 # cctct 823 # cctga 1134 # cctgc 1561 # cctgg 1233 # cctgt 1103 # cctta 957 # ccttc 1274 # ccttg 1119 # ccttt 1353 # cgaaa 6759 # cgaac 2438 # cgaag 2943 # cgaat 3048 # cgaca 2578 # cgacc 1425 # cgacg 2296 # cgact 1644 # cgaga 2873 # cgagc 2949 # cgagg 2089 # cgagt 2130 # cgata 1923 # cgatc 2140 # cgatg 1057 # cgatt 2275 # cgcaa 3191 # cgcac 2535 # cgcag 3230 # cgcat 2164 # cgcca 3533 # cgccc 2061 # cgccg 2396 # cgcct 1330 # cgcga 1797 # cgcgc 1433 # cgcgg 1027 # cgcgt 1253 # cgcta 1063 # cgctc 1714 # cgctg 2126 # cgctt 1555 # cggaa 3494 # cggac 1385 # cggag 2752 # cggat 2012 # cggca 2991 # cggcc 1466 # cggcg 2160 # cggct 1322 # cggga 1437 # cgggc 1118 # cgggg 856 # cgggt 553 # cggta 660 # cggtc 869 # cggtg 1446 # cggtt 1192 # cgtaa 1386 # cgtac 860 # cgtag 956 # cgtat 982 # cgtca 1277 # cgtcc 1182 # cgtcg 1813 # cgtct 920 # cgtga 1387 # cgtgc 1620 # cgtgg 1317 # cgtgt 1517 # cgtta 1054 # cgttc 1391 # cgttg 1683 # cgttt 2006 # ctaaa 3158 # ctaac 1476 # ctaag 1279 # ctaat 1613 # ctaca 1856 # ctacc 898 # ctacg 1031 # ctact 865 # ctaga 1189 # ctagc 1404 # ctagg 542 # ctagt 924 # ctata 1396 # ctatc 1022 # ctatg 748 # ctatt 1238 # ctcaa 2323 # ctcac 1291 # ctcag 1425 # ctcat 1089 # ctcca 2135 # ctccc 1326 # ctccg 1009 # ctcct 1263 # ctcga 1575 # ctcgc 1829 # ctcgg 965 # ctcgt 941 # ctcta 993 # ctctc 1658 # ctctg 1229 # ctctt 1158 # ctgaa 3064 # ctgac 1296 # ctgag 1805 # ctgat 1659 # ctgca 3318 # ctgcc 2304 # ctgcg 1899 # ctgct 2163 # ctgga 2372 # ctggc 2222 # ctggg 1019 # ctggt 1085 # ctgta 1017 # ctgtc 1293 # ctgtg 1993 # ctgtt 1546 # cttaa 2153 # cttac 784 # cttag 948 # cttat 1007 # cttca 1572 # cttcc 1402 # cttcg 1641 # cttct 1325 # cttga 1585 # cttgc 1367 # cttgg 1554 # cttgt 1221 # cttta 1572 # ctttc 1543 # ctttg 1879 # ctttt 2562 # gaaaa 10477 # gaaac 4921 # gaaag 5152 # gaaat 4948 # gaaca 3586 # gaacc 2139 # gaacg 2262 # gaact 2259 # gaaga 4084 # gaagc 3832 # gaagg 2879 # gaagt 2704 # gaata 3069 # gaatc 3376 # gaatg 1496 # gaatt 3093 # gacaa 3451 # gacac 2140 # gacag 2349 # gacat 1582 # gacca 2198 # gaccc 1130 # gaccg 1079 # gacct 1008 # gacga 2799 # gacgc 1583 # gacgg 1389 # gacgt 1161 # gacta 1069 # gactc 1115 # gactg 1521 # gactt 1506 # gagaa 4285 # gagac 1824 # gagag 4790 # gagat 1795 # gagca 5178 # gagcc 2436 # gagcg 3227 # gagct 2146 # gagga 4351 # gaggc 2364 # gaggg 1541 # gaggt 979 # gagta 1388 # gagtc 1579 # gagtg 2852 # gagtt 2045 # gataa 2970 # gatac 1757 # gatag 1575 # gatat 2031 # gatca 2110 # gatcc 1913 # gatcg 1899 # gatct 1546 # gatga 1402 # gatgc 1262 # gatgg 743 # gatgt 967 # gatta 1840 # gattc 1923 # gattg 2001 # gattt 2771 # gcaaa 7634 # gcaac 6629 # gcaag 2884 # gcaat 3861 # gcaca 3768 # gcacc 2319 # gcacg 1451 # gcact 2063 # gcaga 3874 # gcagc 9947 # gcagg 2880 # gcagt 3009 # gcata 1987 # gcatc 2643 # gcatg 1186 # gcatt 2874 # gccaa 5593 # gccac 3307 # gccag 4680 # gccat 2456 # gccca 2755 # gcccc 1806 # gcccg 1278 # gccct 784 # gccga 2310 # gccgc 2791 # gccgg 1736 # gccgt 1382 # gccta 794 # gcctc 1157 # gcctg 1281 # gcctt 1269 # gcgaa 4214 # gcgac 2308 # gcgag 3124 # gcgat 1888 # gcgca 2417 # gcgcc 1708 # gcgcg 1426 # gcgct 1525 # gcgga 3080 # gcggc 2791 # gcggg 1142 # gcggt 1151 # gcgta 1131 # gcgtc 1194 # gcgtg 1956 # gcgtt 1564 # gctaa 2237 # gctac 1161 # gctag 1211 # gctat 1247 # gctca 1783 # gctcc 1572 # gctcg 1278 # gctct 1448 # gctga 2463 # gctgc 3611 # gctgg 2024 # gctgt 1764 # gctta 1268 # gcttc 1434 # gcttg 1233 # gcttt 1950 # ggaaa 6063 # ggaac 2480 # ggaag 2918 # ggaat 2805 # ggaca 2357 # ggacc 1233 # ggacg 1589 # ggact 1422 # ggaga 2918 # ggagc 3781 # ggagg 2960 # ggagt 2145 # ggata 2175 # ggatc 2201 # ggatg 942 # ggatt 2133 # ggcaa 3811 # ggcac 1682 # ggcag 3099 # ggcat 1254 # ggcca 3104 # ggccc 1205 # ggccg 1077 # ggcct 786 # ggcga 2501 # ggcgc 1629 # ggcgg 2171 # ggcgt 1209 # ggcta 1131 # ggctc 1014 # ggctg 1520 # ggctt 1130 # gggaa 2366 # gggac 862 # gggag 1742 # gggat 985 # gggca 1579 # gggcc 842 # gggcg 1322 # gggct 813 # gggga 1190 # ggggc 927 # ggggg 620 # ggggt 375 # gggta 449 # gggtc 497 # gggtg 737 # gggtt 531 # ggtaa 753 # ggtac 465 # ggtag 658 # ggtat 431 # ggtca 1097 # ggtcc 675 # ggtcg 846 # ggtct 502 # ggtga 1095 # ggtgc 1245 # ggtgg 1261 # ggtgt 1261 # ggtta 865 # ggttc 850 # ggttg 842 # ggttt 1162 # gtaaa 3330 # gtaac 1253 # gtaag 933 # gtaat 1293 # gtaca 1578 # gtacc 770 # gtacg 828 # gtact 787 # gtaga 1165 # gtagc 1351 # gtagg 610 # gtagt 887 # gtata 1273 # gtatc 926 # gtatg 539 # gtatt 1249 # gtcaa 2223 # gtcac 1243 # gtcag 1443 # gtcat 1232 # gtcca 1875 # gtccc 857 # gtccg 1045 # gtcct 866 # gtcga 1710 # gtcgc 1916 # gtcgg 1318 # gtcgt 1215 # gtcta 706 # gtctc 784 # gtctg 1227 # gtctt 877 # gtgaa 3722 # gtgac 1201 # gtgag 1860 # gtgat 1625 # gtgca 3139 # gtgcc 1891 # gtgcg 2471 # gtgct 1820 # gtgga 2633 # gtggc 1927 # gtggg 1189 # gtggt 1224 # gtgta 1447 # gtgtc 1218 # gtgtg 4083 # gtgtt 2201 # gttaa 2116 # gttac 976 # gttag 947 # gttat 1135 # gttca 1449 # gttcc 1337 # gttcg 1566 # gttct 1213 # gttga 1760 # gttgc 2255 # gttgg 1659 # gttgt 1824 # gttta 1825 # gtttc 1890 # gtttg 1890 # gtttt 2921 # taaaa 7909 # taaac 3980 # taaag 3172 # taaat 5273 # taaca 2955 # taacc 1867 # taacg 1486 # taact 1659 # taaga 1917 # taagc 2341 # taagg 1197 # taagt 1624 # taata 2636 # taatc 2257 # taatg 1387 # taatt 3350 # tacaa 3172 # tacac 1985 # tacag 1528 # tacat 2274 # tacca 1733 # taccc 1109 # taccg 1061 # tacct 717 # tacga 1503 # tacgc 1237 # tacgg 967 # tacgt 966 # tacta 975 # tactc 854 # tactg 982 # tactt 1346 # tagaa 2207 # tagac 1056 # tagag 1653 # tagat 1182 # tagca 3009 # tagcc 1936 # tagcg 1131 # tagct 1268 # tagga 1306 # taggc 921 # taggg 473 # taggt 356 # tagta 803 # tagtc 982 # tagtg 1219 # tagtt 1482 # tataa 3061 # tatac 1784 # tatag 1585 # tatat 4119 # tatca 1774 # tatcc 1358 # tatcg 1386 # tatct 1254 # tatga 1027 # tatgc 1218 # tatgg 672 # tatgt 1281 # tatta 1837 # tattc 1497 # tattg 1548 # tattt 3498 # tcaaa 4780 # tcaac 3219 # tcaag 2416 # tcaat 2952 # tcaca 2275 # tcacc 1629 # tcacg 917 # tcact 1163 # tcaga 1841 # tcagc 2993 # tcagg 1136 # tcagt 2002 # tcata 1374 # tcatc 2250 # tcatg 608 # tcatt 2058 # tccaa 3004 # tccac 2342 # tccag 2555 # tccat 1939 # tccca 2044 # tcccc 1517 # tcccg 1085 # tccct 1009 # tccga 1675 # tccgc 2067 # tccgg 1241 # tccgt 1298 # tccta 730 # tcctc 1360 # tcctg 1434 # tcctt 1397 # tcgaa 3564 # tcgac 1743 # tcgag 2226 # tcgat 1975 # tcgca 2649 # tcgcc 2501 # tcgcg 1526 # tcgct 2005 # tcgga 1934 # tcggc 1759 # tcggg 1085 # tcggt 1134 # tcgta 892 # tcgtc 1504 # tcgtg 1297 # tcgtt 1895 # tctaa 1437 # tctac 1025 # tctag 732 # tctat 1173 # tctca 1248 # tctcc 1221 # tctcg 1282 # tctct 1635 # tctga 1582 # tctgc 1895 # tctgg 1514 # tctgt 1512 # tctta 1014 # tcttc 1546 # tcttg 1074 # tcttt 1620 # tgaaa 5300 # tgaac 2200 # tgaag 2479 # tgaat 2561 # tgaca 1854 # tgacc 1167 # tgacg 1144 # tgact 1015 # tgaga 1894 # tgagc 2136 # tgagg 1411 # tgagt 1610 # tgata 1706 # tgatc 1409 # tgatg 1304 # tgatt 2295 # tgcaa 4822 # tgcac 1844 # tgcag 3310 # tgcat 2622 # tgcca 3651 # tgccc 1377 # tgccg 1857 # tgcct 1138 # tgcga 2621 # tgcgc 1390 # tgcgg 1453 # tgcgt 1698 # tgcta 1545 # tgctc 1593 # tgctg 2525 # tgctt 1561 # tggaa 3649 # tggac 1659 # tggag 2346 # tggat 1837 # tggca 2479 # tggcc 2199 # tggcg 1712 # tggct 1474 # tggga 1375 # tgggc 1396 # tgggg 591 # tgggt 632 # tggta 651 # tggtc 987 # tggtg 1417 # tggtt 1181 # tgtaa 2047 # tgtac 1144 # tgtag 914 # tgtat 1315 # tgtca 1331 # tgtcc 1056 # tgtcg 1319 # tgtct 1065 # tgtga 2374 # tgtgc 2873 # tgtgg 1821 # tgtgt 3779 # tgtta 1414 # tgttc 1394 # tgttg 2395 # tgttt 2514 # ttaaa 5496 # ttaac 2377 # ttaag 2170 # ttaat 3112 # ttaca 1862 # ttacc 1131 # ttacg 1065 # ttact 1131 # ttaga 1217 # ttagc 2022 # ttagg 880 # ttagt 1390 # ttata 2010 # ttatc 1579 # ttatg 1314 # ttatt 2563 # ttcaa 3251 # ttcac 1521 # ttcag 1738 # ttcat 1645 # ttcca 2643 # ttccc 1615 # ttccg 1798 # ttcct 1255 # ttcga 2526 # ttcgc 2184 # ttcgg 1660 # ttcgt 1939 # ttcta 1079 # ttctc 1535 # ttctg 1730 # ttctt 1693 # ttgaa 3596 # ttgac 1645 # ttgag 1975 # ttgat 2107 # ttgca 3723 # ttgcc 2241 # ttgcg 1575 # ttgct 1848 # ttgga 3001 # ttggc 2549 # ttggg 1238 # ttggt 1318 # ttgta 1716 # ttgtc 1458 # ttgtg 2598 # ttgtt 2618 # tttaa 4207 # tttac 1720 # tttag 1677 # tttat 2921 # tttca 2498 # tttcc 2589 # tttcg 2685 # tttct 2006 # tttga 2916 # tttgc 2795 # tttgg 2606 # tttgt 3109 # tttta 3197 # ttttc 3269 # ttttg 3810 # ttttt 5718 # # The emission probabilities of 3' UTR exons # [EMISSION-3] # size of the emission vector 1024 #k= 4 # patpseudo : pseudocount for sequence patterns 1 aaaaa 0.4 aaaac 0.2 aaaag 0.132 aaaat 0.268 aaaca 0.396 aaacc 0.185 aaacg 0.17 aaact 0.248 aaaga 0.323 aaagc 0.239 aaagg 0.142 aaagt 0.296 aaata 0.348 aaatc 0.154 aaatg 0.211 aaatt 0.288 aacaa 0.449 aacac 0.186 aacag 0.139 aacat 0.225 aacca 0.449 aaccc 0.193 aaccg 0.175 aacct 0.184 aacga 0.413 aacgc 0.199 aacgg 0.149 aacgt 0.238 aacta 0.354 aactc 0.156 aactg 0.206 aactt 0.285 aagaa 0.437 aagac 0.144 aagag 0.179 aagat 0.24 aagca 0.391 aagcc 0.188 aagcg 0.184 aagct 0.236 aagga 0.413 aaggc 0.246 aaggg 0.16 aaggt 0.181 aagta 0.286 aagtc 0.153 aagtg 0.223 aagtt 0.338 aataa 0.414 aatac 0.154 aatag 0.105 aatat 0.326 aatca 0.33 aatcc 0.205 aatcg 0.233 aatct 0.232 aatga 0.279 aatgc 0.214 aatgg 0.155 aatgt 0.352 aatta 0.305 aattc 0.139 aattg 0.211 aattt 0.345 acaaa 0.44 acaac 0.194 acaag 0.131 acaat 0.235 acaca 0.521 acacc 0.156 acacg 0.128 acact 0.195 acaga 0.375 acagc 0.286 acagg 0.117 acagt 0.222 acata 0.399 acatc 0.135 acatg 0.142 acatt 0.324 accaa 0.394 accac 0.225 accag 0.152 accat 0.228 accca 0.444 acccc 0.208 acccg 0.154 accct 0.195 accga 0.419 accgc 0.254 accgg 0.137 accgt 0.19 accta 0.376 acctc 0.155 acctg 0.174 acctt 0.295 acgaa 0.403 acgac 0.15 acgag 0.173 acgat 0.274 acgca 0.402 acgcc 0.209 acgcg 0.165 acgct 0.224 acgga 0.432 acggc 0.246 acggg 0.146 acggt 0.176 acgta 0.36 acgtc 0.128 acgtg 0.174 acgtt 0.339 actaa 0.378 actac 0.181 actag 0.147 actat 0.295 actca 0.337 actcc 0.197 actcg 0.208 actct 0.258 actga 0.311 actgc 0.234 actgg 0.161 actgt 0.294 actta 0.309 acttc 0.149 acttg 0.181 acttt 0.361 agaaa 0.427 agaac 0.179 agaag 0.168 agaat 0.226 agaca 0.388 agacc 0.178 agacg 0.181 agact 0.254 agaga 0.377 agagc 0.251 agagg 0.158 agagt 0.213 agata 0.306 agatc 0.185 agatg 0.215 agatt 0.294 agcaa 0.388 agcac 0.14 agcag 0.25 agcat 0.222 agcca 0.423 agccc 0.194 agccg 0.185 agcct 0.198 agcga 0.393 agcgc 0.198 agcgg 0.193 agcgt 0.215 agcta 0.298 agctc 0.172 agctg 0.25 agctt 0.28 aggaa 0.325 aggac 0.155 aggag 0.261 aggat 0.259 aggca 0.379 aggcc 0.173 aggcg 0.225 aggct 0.223 aggga 0.354 agggc 0.241 agggg 0.219 agggt 0.187 aggta 0.248 aggtc 0.192 aggtg 0.251 aggtt 0.31 agtaa 0.365 agtac 0.165 agtag 0.172 agtat 0.298 agtca 0.329 agtcc 0.207 agtcg 0.22 agtct 0.244 agtga 0.267 agtgc 0.246 agtgg 0.186 agtgt 0.301 agtta 0.27 agttc 0.155 agttg 0.201 agttt 0.374 ataaa 0.48 ataac 0.133 ataag 0.123 ataat 0.263 ataca 0.482 atacc 0.149 atacg 0.148 atact 0.221 ataga 0.336 atagc 0.227 atagg 0.135 atagt 0.302 atata 0.454 atatc 0.104 atatg 0.155 atatt 0.287 atcaa 0.404 atcac 0.16 atcag 0.179 atcat 0.258 atcca 0.374 atccc 0.219 atccg 0.181 atcct 0.226 atcga 0.401 atcgc 0.195 atcgg 0.166 atcgt 0.238 atcta 0.334 atctc 0.171 atctg 0.223 atctt 0.272 atgaa 0.435 atgac 0.123 atgag 0.156 atgat 0.287 atgca 0.409 atgcc 0.185 atgcg 0.173 atgct 0.232 atgga 0.384 atggc 0.239 atggg 0.17 atggt 0.207 atgta 0.399 atgtc 0.105 atgtg 0.195 atgtt 0.301 attaa 0.369 attac 0.147 attag 0.141 attat 0.343 attca 0.337 attcc 0.208 attcg 0.204 attct 0.251 attga 0.277 attgc 0.19 attgg 0.128 attgt 0.405 attta 0.332 atttc 0.143 atttg 0.179 atttt 0.347 caaaa 0.384 caaac 0.191 caaag 0.139 caaat 0.287 caaca 0.414 caacc 0.183 caacg 0.137 caact 0.266 caaga 0.287 caagc 0.263 caagg 0.157 caagt 0.292 caata 0.3 caatc 0.171 caatg 0.176 caatt 0.353 cacaa 0.299 cacac 0.349 cacag 0.127 cacat 0.225 cacca 0.408 caccc 0.238 caccg 0.14 cacct 0.213 cacga 0.324 cacgc 0.276 cacgg 0.159 cacgt 0.24 cacta 0.216 cactc 0.224 cactg 0.203 cactt 0.357 cagaa 0.373 cagac 0.172 cagag 0.191 cagat 0.265 cagca 0.433 cagcc 0.184 cagcg 0.157 cagct 0.225 cagga 0.403 caggc 0.276 caggg 0.155 caggt 0.166 cagta 0.233 cagtc 0.189 cagtg 0.209 cagtt 0.369 cataa 0.295 catac 0.213 catag 0.132 catat 0.36 catca 0.33 catcc 0.248 catcg 0.187 catct 0.235 catga 0.24 catgc 0.232 catgg 0.168 catgt 0.36 catta 0.234 cattc 0.159 cattg 0.166 cattt 0.442 ccaaa 0.392 ccaac 0.207 ccaag 0.164 ccaat 0.237 ccaca 0.387 ccacc 0.235 ccacg 0.136 ccact 0.242 ccaga 0.283 ccagc 0.316 ccagg 0.153 ccagt 0.247 ccata 0.274 ccatc 0.21 ccatg 0.167 ccatt 0.349 cccaa 0.35 cccac 0.241 cccag 0.171 cccat 0.238 cccca 0.345 ccccc 0.28 ccccg 0.157 cccct 0.218 cccga 0.359 cccgc 0.26 cccgg 0.164 cccgt 0.216 cccta 0.258 ccctc 0.231 ccctg 0.194 ccctt 0.317 ccgaa 0.378 ccgac 0.165 ccgag 0.172 ccgat 0.285 ccgca 0.326 ccgcc 0.294 ccgcg 0.139 ccgct 0.24 ccgga 0.358 ccggc 0.292 ccggg 0.171 ccggt 0.179 ccgta 0.287 ccgtc 0.189 ccgtg 0.199 ccgtt 0.325 cctaa 0.364 cctac 0.181 cctag 0.195 cctat 0.26 cctca 0.268 cctcc 0.273 cctcg 0.196 cctct 0.263 cctga 0.222 cctgc 0.273 cctgg 0.216 cctgt 0.288 cctta 0.26 ccttc 0.189 ccttg 0.191 ccttt 0.36 cgaaa 0.416 cgaac 0.175 cgaag 0.143 cgaat 0.267 cgaca 0.314 cgacc 0.184 cgacg 0.216 cgact 0.286 cgaga 0.299 cgagc 0.243 cgagg 0.192 cgagt 0.266 cgata 0.243 cgatc 0.193 cgatg 0.204 cgatt 0.36 cgcaa 0.323 cgcac 0.193 cgcag 0.204 cgcat 0.28 cgcca 0.334 cgccc 0.247 cgccg 0.195 cgcct 0.225 cgcga 0.319 cgcgc 0.215 cgcgg 0.183 cgcgt 0.283 cgcta 0.22 cgctc 0.19 cgctg 0.263 cgctt 0.326 cggaa 0.353 cggac 0.15 cggag 0.217 cggat 0.28 cggca 0.339 cggcc 0.185 cggcg 0.243 cggct 0.232 cggga 0.311 cgggc 0.274 cgggg 0.214 cgggt 0.201 cggta 0.214 cggtc 0.182 cggtg 0.264 cggtt 0.341 cgtaa 0.323 cgtac 0.177 cgtag 0.201 cgtat 0.298 cgtca 0.264 cgtcc 0.22 cgtcg 0.239 cgtct 0.277 cgtga 0.213 cgtgc 0.213 cgtgg 0.199 cgtgt 0.375 cgtta 0.209 cgttc 0.159 cgttg 0.197 cgttt 0.435 ctaaa 0.376 ctaac 0.161 ctaag 0.204 ctaat 0.259 ctaca 0.372 ctacc 0.185 ctacg 0.157 ctact 0.286 ctaga 0.305 ctagc 0.247 ctagg 0.145 ctagt 0.303 ctata 0.34 ctatc 0.146 ctatg 0.186 ctatt 0.328 ctcaa 0.369 ctcac 0.207 ctcag 0.163 ctcat 0.261 ctcca 0.35 ctccc 0.22 ctccg 0.168 ctcct 0.263 ctcga 0.346 ctcgc 0.238 ctcgg 0.164 ctcgt 0.252 ctcta 0.274 ctctc 0.221 ctctg 0.209 ctctt 0.296 ctgaa 0.407 ctgac 0.155 ctgag 0.173 ctgat 0.266 ctgca 0.357 ctgcc 0.212 ctgcg 0.159 ctgct 0.272 ctgga 0.322 ctggc 0.283 ctggg 0.19 ctggt 0.205 ctgta 0.335 ctgtc 0.138 ctgtg 0.215 ctgtt 0.311 cttaa 0.4 cttac 0.151 cttag 0.191 cttat 0.258 cttca 0.314 cttcc 0.208 cttcg 0.198 cttct 0.28 cttga 0.269 cttgc 0.198 cttgg 0.186 cttgt 0.346 cttta 0.281 ctttc 0.158 ctttg 0.201 ctttt 0.36 gaaaa 0.367 gaaac 0.193 gaaag 0.144 gaaat 0.296 gaaca 0.355 gaacc 0.182 gaacg 0.174 gaact 0.288 gaaga 0.328 gaagc 0.248 gaagg 0.178 gaagt 0.245 gaata 0.303 gaatc 0.178 gaatg 0.201 gaatt 0.318 gacaa 0.371 gacac 0.214 gacag 0.175 gacat 0.239 gacca 0.366 gaccc 0.236 gaccg 0.163 gacct 0.234 gacga 0.402 gacgc 0.207 gacgg 0.191 gacgt 0.2 gacta 0.267 gactc 0.184 gactg 0.214 gactt 0.335 gagaa 0.389 gagac 0.13 gagag 0.231 gagat 0.25 gagca 0.383 gagcc 0.18 gagcg 0.194 gagct 0.243 gagga 0.458 gaggc 0.216 gaggg 0.175 gaggt 0.151 gagta 0.271 gagtc 0.166 gagtg 0.23 gagtt 0.333 gataa 0.328 gatac 0.18 gatag 0.141 gatat 0.351 gatca 0.279 gatcc 0.229 gatcg 0.239 gatct 0.254 gatga 0.314 gatgc 0.216 gatgg 0.194 gatgt 0.277 gatta 0.264 gattc 0.163 gattg 0.196 gattt 0.377 gcaaa 0.378 gcaac 0.217 gcaag 0.144 gcaat 0.261 gcaca 0.385 gcacc 0.209 gcacg 0.134 gcact 0.272 gcaga 0.264 gcagc 0.371 gcagg 0.155 gcagt 0.21 gcata 0.316 gcatc 0.174 gcatg 0.139 gcatt 0.37 gccaa 0.349 gccac 0.223 gccag 0.209 gccat 0.219 gccca 0.389 gcccc 0.241 gcccg 0.165 gccct 0.206 gccga 0.291 gccgc 0.308 gccgg 0.191 gccgt 0.211 gccta 0.292 gcctc 0.191 gcctg 0.211 gcctt 0.306 gcgaa 0.378 gcgac 0.164 gcgag 0.197 gcgat 0.26 gcgca 0.355 gcgcc 0.231 gcgcg 0.163 gcgct 0.251 gcgga 0.334 gcggc 0.317 gcggg 0.164 gcggt 0.185 gcgta 0.298 gcgtc 0.152 gcgtg 0.224 gcgtt 0.326 gctaa 0.398 gctac 0.162 gctag 0.172 gctat 0.269 gctca 0.283 gctcc 0.241 gctcg 0.185 gctct 0.291 gctga 0.242 gctgc 0.302 gctgg 0.213 gctgt 0.243 gctta 0.297 gcttc 0.172 gcttg 0.182 gcttt 0.349 ggaaa 0.414 ggaac 0.175 ggaag 0.16 ggaat 0.252 ggaca 0.359 ggacc 0.169 ggacg 0.214 ggact 0.258 ggaga 0.284 ggagc 0.269 ggagg 0.24 ggagt 0.206 ggata 0.257 ggatc 0.213 ggatg 0.232 ggatt 0.299 ggcaa 0.356 ggcac 0.159 ggcag 0.248 ggcat 0.237 ggcca 0.45 ggccc 0.175 ggccg 0.185 ggcct 0.19 ggcga 0.295 ggcgc 0.214 ggcgg 0.289 ggcgt 0.203 ggcta 0.265 ggctc 0.179 ggctg 0.254 ggctt 0.302 gggaa 0.369 gggac 0.15 gggag 0.217 gggat 0.264 gggca 0.357 gggcc 0.178 gggcg 0.236 gggct 0.229 gggga 0.328 ggggc 0.236 ggggg 0.256 ggggt 0.179 gggta 0.215 gggtc 0.226 gggtg 0.24 gggtt 0.32 ggtaa 0.306 ggtac 0.172 ggtag 0.2 ggtat 0.323 ggtca 0.311 ggtcc 0.217 ggtcg 0.226 ggtct 0.247 ggtga 0.219 ggtgc 0.225 ggtgg 0.29 ggtgt 0.266 ggtta 0.248 ggttc 0.178 ggttg 0.184 ggttt 0.39 gtaaa 0.417 gtaac 0.153 gtaag 0.135 gtaat 0.294 gtaca 0.429 gtacc 0.14 gtacg 0.165 gtact 0.265 gtaga 0.281 gtagc 0.253 gtagg 0.143 gtagt 0.322 gtata 0.324 gtatc 0.123 gtatg 0.19 gtatt 0.363 gtcaa 0.356 gtcac 0.176 gtcag 0.207 gtcat 0.261 gtcca 0.357 gtccc 0.202 gtccg 0.161 gtcct 0.28 gtcga 0.315 gtcgc 0.243 gtcgg 0.175 gtcgt 0.267 gtcta 0.327 gtctc 0.166 gtctg 0.215 gtctt 0.292 gtgaa 0.41 gtgac 0.146 gtgag 0.159 gtgat 0.286 gtgca 0.383 gtgcc 0.187 gtgcg 0.191 gtgct 0.239 gtgga 0.324 gtggc 0.277 gtggg 0.192 gtggt 0.207 gtgta 0.353 gtgtc 0.122 gtgtg 0.262 gtgtt 0.262 gttaa 0.389 gttac 0.147 gttag 0.174 gttat 0.291 gttca 0.313 gttcc 0.193 gttcg 0.212 gttct 0.282 gttga 0.281 gttgc 0.206 gttgg 0.164 gttgt 0.348 gttta 0.288 gtttc 0.152 gtttg 0.179 gtttt 0.381 taaaa 0.333 taaac 0.18 taaag 0.136 taaat 0.351 taaca 0.314 taacc 0.187 taacg 0.152 taact 0.347 taaga 0.265 taagc 0.289 taagg 0.114 taagt 0.331 taata 0.297 taatc 0.15 taatg 0.171 taatt 0.383 tacaa 0.338 tacac 0.197 tacag 0.102 tacat 0.363 tacca 0.383 taccc 0.209 taccg 0.136 tacct 0.273 tacga 0.386 tacgc 0.2 tacgg 0.124 tacgt 0.29 tacta 0.281 tactc 0.173 tactg 0.153 tactt 0.393 tagaa 0.342 tagac 0.167 tagag 0.181 tagat 0.31 tagca 0.323 tagcc 0.222 tagcg 0.144 tagct 0.312 tagga 0.317 taggc 0.277 taggg 0.148 taggt 0.257 tagta 0.22 tagtc 0.162 tagtg 0.157 tagtt 0.46 tataa 0.245 tatac 0.174 tatag 0.105 tatat 0.476 tatca 0.29 tatcc 0.204 tatcg 0.179 tatct 0.327 tatga 0.242 tatgc 0.202 tatgg 0.114 tatgt 0.442 tatta 0.274 tattc 0.127 tattg 0.155 tattt 0.445 tcaaa 0.39 tcaac 0.173 tcaag 0.152 tcaat 0.285 tcaca 0.387 tcacc 0.209 tcacg 0.125 tcact 0.279 tcaga 0.279 tcagc 0.296 tcagg 0.131 tcagt 0.295 tcata 0.286 tcatc 0.191 tcatg 0.147 tcatt 0.375 tccaa 0.366 tccac 0.2 tccag 0.167 tccat 0.267 tccca 0.359 tcccc 0.254 tcccg 0.151 tccct 0.236 tccga 0.303 tccgc 0.258 tccgg 0.178 tccgt 0.26 tccta 0.258 tcctc 0.206 tcctg 0.205 tcctt 0.33 tcgaa 0.389 tcgac 0.136 tcgag 0.166 tcgat 0.309 tcgca 0.352 tcgcc 0.246 tcgcg 0.139 tcgct 0.264 tcgga 0.317 tcggc 0.244 tcggg 0.188 tcggt 0.252 tcgta 0.317 tcgtc 0.172 tcgtg 0.155 tcgtt 0.355 tctaa 0.332 tctac 0.172 tctag 0.179 tctat 0.317 tctca 0.296 tctcc 0.197 tctcg 0.172 tctct 0.335 tctga 0.236 tctgc 0.226 tctgg 0.163 tctgt 0.376 tctta 0.282 tcttc 0.184 tcttg 0.181 tcttt 0.353 tgaaa 0.411 tgaac 0.148 tgaag 0.138 tgaat 0.303 tgaca 0.334 tgacc 0.214 tgacg 0.17 tgact 0.281 tgaga 0.335 tgagc 0.238 tgagg 0.159 tgagt 0.269 tgata 0.297 tgatc 0.144 tgatg 0.193 tgatt 0.367 tgcaa 0.373 tgcac 0.147 tgcag 0.171 tgcat 0.308 tgcca 0.383 tgccc 0.199 tgccg 0.165 tgcct 0.253 tgcga 0.33 tgcgc 0.211 tgcgg 0.184 tgcgt 0.275 tgcta 0.259 tgctc 0.181 tgctg 0.242 tgctt 0.318 tggaa 0.356 tggac 0.148 tggag 0.218 tggat 0.278 tggca 0.34 tggcc 0.236 tggcg 0.19 tggct 0.235 tggga 0.298 tgggc 0.254 tgggg 0.198 tgggt 0.25 tggta 0.232 tggtc 0.179 tggtg 0.209 tggtt 0.38 tgtaa 0.346 tgtac 0.181 tgtag 0.123 tgtat 0.349 tgtca 0.286 tgtcc 0.229 tgtcg 0.186 tgtct 0.299 tgtga 0.232 tgtgc 0.214 tgtgg 0.14 tgtgt 0.413 tgtta 0.269 tgttc 0.136 tgttg 0.192 tgttt 0.403 ttaaa 0.387 ttaac 0.149 ttaag 0.178 ttaat 0.285 ttaca 0.362 ttacc 0.193 ttacg 0.161 ttact 0.285 ttaga 0.247 ttagc 0.241 ttagg 0.15 ttagt 0.361 ttata 0.324 ttatc 0.118 ttatg 0.171 ttatt 0.388 ttcaa 0.401 ttcac 0.156 ttcag 0.161 ttcat 0.282 ttcca 0.376 ttccc 0.214 ttccg 0.165 ttcct 0.245 ttcga 0.352 ttcgc 0.209 ttcgg 0.158 ttcgt 0.282 ttcta 0.296 ttctc 0.171 ttctg 0.195 ttctt 0.338 ttgaa 0.407 ttgac 0.125 ttgag 0.154 ttgat 0.313 ttgca 0.374 ttgcc 0.212 ttgcg 0.144 ttgct 0.271 ttgga 0.31 ttggc 0.262 ttggg 0.172 ttggt 0.255 ttgta 0.371 ttgtc 0.104 ttgtg 0.171 ttgtt 0.354 tttaa 0.373 tttac 0.142 tttag 0.153 tttat 0.332 tttca 0.304 tttcc 0.213 tttcg 0.203 tttct 0.28 tttga 0.247 tttgc 0.183 tttgg 0.144 tttgt 0.426 tttta 0.285 ttttc 0.14 ttttg 0.188 ttttt 0.388 # 3' exon patterns: # aaaaa 172084 # aaaac 85844 # aaaag 56934 # aaaat 115212 # aaaca 87739 # aaacc 41046 # aaacg 37700 # aaact 54928 # aaaga 51265 # aaagc 37998 # aaagg 22495 # aaagt 46914 # aaata 119983 # aaatc 53194 # aaatg 72670 # aaatt 99225 # aacaa 87950 # aacac 36497 # aacag 27168 # aacat 44122 # aacca 42903 # aaccc 18437 # aaccg 16747 # aacct 17555 # aacga 34224 # aacgc 16489 # aacgg 12357 # aacgt 19751 # aacta 50983 # aactc 22530 # aactg 29639 # aactt 41056 # aagaa 56325 # aagac 18527 # aagag 23052 # aagat 30958 # aagca 43185 # aagcc 20733 # aagcg 20327 # aagct 26067 # aagga 25344 # aaggc 15092 # aaggg 9845 # aaggt 11076 # aagta 36215 # aagtc 19345 # aagtg 28159 # aagtt 42695 # aataa 107533 # aatac 40119 # aatag 27336 # aatat 84830 # aatca 42723 # aatcc 26539 # aatcg 30128 # aatct 30006 # aatga 43678 # aatgc 33492 # aatgg 24345 # aatgt 55084 # aatta 80903 # aattc 36907 # aattg 56028 # aattt 91516 # acaaa 87859 # acaac 38662 # acaag 26121 # acaat 46970 # acaca 65415 # acacc 19610 # acacg 16027 # acact 24454 # acaga 26256 # acagc 20050 # acagg 8215 # acagt 15522 # acata 56611 # acatc 19134 # acatg 20120 # acatt 45972 # accaa 39881 # accac 22767 # accag 15394 # accat 23113 # accca 23181 # acccc 10840 # acccg 8023 # accct 10173 # accga 16016 # accgc 9693 # accgg 5234 # accgt 7281 # accta 20107 # acctc 8256 # acctg 9273 # acctt 15778 # acgaa 32936 # acgac 12264 # acgag 14136 # acgat 22437 # acgca 18247 # acgcc 9486 # acgcg 7463 # acgct 10140 # acgga 13907 # acggc 7912 # acggg 4686 # acggt 5671 # acgta 18672 # acgtc 6624 # acgtg 9017 # acgtt 17577 # actaa 39330 # actac 18860 # actag 15254 # actat 30662 # actca 21135 # actcc 12344 # actcg 13038 # actct 16177 # actga 21151 # actgc 15877 # actgg 10910 # actgt 20007 # actta 36230 # acttc 17455 # acttg 21243 # acttt 42420 # agaaa 61248 # agaac 25744 # agaag 24053 # agaat 32392 # agaca 21711 # agacc 9975 # agacg 10121 # agact 14202 # agaga 26665 # agagc 17759 # agagg 11145 # agagt 15078 # agata 29683 # agatc 18002 # agatg 20871 # agatt 28581 # agcaa 48032 # agcac 17396 # agcag 30915 # agcat 27542 # agcca 26316 # agccc 12034 # agccg 11513 # agcct 12313 # agcga 21535 # agcgc 10844 # agcgg 10568 # agcgt 11796 # agcta 24126 # agctc 13877 # agctg 20218 # agctt 22654 # aggaa 23745 # aggac 11281 # aggag 19011 # aggat 18923 # aggca 17493 # aggcc 7978 # aggcg 10367 # aggct 10315 # aggga 10391 # agggc 7067 # agggg 6418 # agggt 5497 # aggta 8535 # aggtc 6615 # aggtg 8641 # aggtt 10673 # agtaa 31603 # agtac 14283 # agtag 14924 # agtat 25753 # agtca 18380 # agtcc 11567 # agtcg 12247 # agtct 13588 # agtga 18399 # agtgc 16908 # agtgg 12822 # agtgt 20734 # agtta 34579 # agttc 19935 # agttg 25731 # agttt 47960 # ataaa 116518 # ataac 32304 # ataag 29820 # ataat 63852 # ataca 63376 # atacc 19552 # atacg 19393 # atact 29041 # ataga 28940 # atagc 19551 # atagg 11619 # atagt 26032 # atata 132972 # atatc 30357 # atatg 45496 # atatt 84001 # atcaa 42802 # atcac 16952 # atcag 18950 # atcat 27308 # atcca 27690 # atccc 16209 # atccg 13394 # atcct 16757 # atcga 28892 # atcgc 14079 # atcgg 11954 # atcgt 17123 # atcta 29433 # atctc 15077 # atctg 19672 # atctt 24035 # atgaa 47262 # atgac 13397 # atgag 16931 # atgat 31167 # atgca 35363 # atgcc 16021 # atgcg 14911 # atgct 20080 # atgga 23707 # atggc 14758 # atggg 10480 # atggt 12738 # atgta 59223 # atgtc 15521 # atgtg 28902 # atgtt 44717 # attaa 76604 # attac 30600 # attag 29208 # attat 71083 # attca 36014 # attcc 22236 # attcg 21798 # attct 26896 # attga 38141 # attgc 26187 # attgg 17637 # attgt 55782 # attta 99508 # atttc 42767 # atttg 53629 # atttt 103918 # caaaa 88825 # caaac 44121 # caaag 32102 # caaat 66363 # caaca 46842 # caacc 20720 # caacg 15484 # caact 30053 # caaga 23962 # caagc 21980 # caagg 13090 # caagt 24389 # caata 43449 # caatc 24701 # caatg 25511 # caatt 51173 # cacaa 40600 # cacac 47369 # cacag 17295 # cacat 30568 # cacca 24344 # caccc 14210 # caccg 8320 # cacct 12720 # cacga 12983 # cacgc 11028 # cacgg 6380 # cacgt 9623 # cacta 15588 # cactc 16193 # cactg 14667 # cactt 25737 # cagaa 29158 # cagac 13422 # cagag 14909 # cagat 20760 # cagca 36046 # cagcc 15326 # cagcg 13067 # cagct 18736 # cagga 14632 # caggc 9999 # caggg 5635 # caggt 6003 # cagta 14529 # cagtc 11794 # cagtg 13054 # cagtt 23034 # cataa 38838 # catac 27989 # catag 17379 # catat 47366 # catca 22432 # catcc 16894 # catcg 12739 # catct 15980 # catga 14088 # catgc 13627 # catgg 9881 # catgt 21111 # catta 32639 # cattc 22202 # cattg 23123 # cattt 61716 # ccaaa 47519 # ccaac 25094 # ccaag 19959 # ccaat 28767 # ccaca 28442 # ccacc 17271 # ccacg 9961 # ccact 17740 # ccaga 16239 # ccagc 18146 # ccagg 8795 # ccagt 14165 # ccata 21618 # ccatc 16539 # ccatg 13137 # ccatt 27519 # cccaa 24960 # cccac 17186 # cccag 12194 # cccat 16993 # cccca 15553 # ccccc 12648 # ccccg 7069 # cccct 9852 # cccga 10359 # cccgc 7491 # cccgg 4740 # cccgt 6229 # cccta 10171 # ccctc 9109 # ccctg 7623 # ccctt 12487 # ccgaa 18211 # ccgac 7934 # ccgag 8309 # ccgat 13745 # ccgca 12382 # ccgcc 11154 # ccgcg 5286 # ccgct 9109 # ccgga 8433 # ccggc 6887 # ccggg 4034 # ccggt 4211 # ccgta 8861 # ccgtc 5838 # ccgtg 6136 # ccgtt 10030 # cctaa 20717 # cctac 10302 # cctag 11096 # cctat 14795 # cctca 9905 # cctcc 10080 # cctcg 7244 # cctct 9714 # cctga 8287 # cctgc 10181 # cctgg 8048 # cctgt 10740 # cctta 15476 # ccttc 11211 # ccttg 11368 # ccttt 21397 # cgaaa 42466 # cgaac 17847 # cgaag 14567 # cgaat 27280 # cgaca 12557 # cgacc 7349 # cgacg 8623 # cgact 11416 # cgaga 13834 # cgagc 11265 # cgagg 8900 # cgagt 12294 # cgata 18165 # cgatc 14413 # cgatg 15202 # cgatt 26836 # cgcaa 19018 # cgcac 11381 # cgcag 12015 # cgcat 16470 # cgcca 13319 # cgccc 9837 # cgccg 7762 # cgcct 8970 # cgcga 7901 # cgcgc 5321 # cgcgg 4520 # cgcgt 6989 # cgcta 8796 # cgctc 7593 # cgctg 10520 # cgctt 13035 # cggaa 15926 # cggac 6764 # cggag 9775 # cggat 12619 # cggca 11703 # cggcc 6382 # cggcg 8396 # cggct 8009 # cggga 6533 # cgggc 5772 # cgggg 4501 # cgggt 4224 # cggta 5379 # cggtc 4576 # cggtg 6641 # cggtt 8587 # cgtaa 18388 # cgtac 10086 # cgtag 11446 # cgtat 16929 # cgtca 7396 # cgtcc 6175 # cgtcg 6685 # cgtct 7752 # cgtga 6928 # cgtgc 6915 # cgtgg 6472 # cgtgt 12191 # cgtta 12567 # cgttc 9574 # cgttg 11843 # cgttt 26159 # ctaaa 42651 # ctaac 18201 # ctaag 23124 # ctaat 29389 # ctaca 20134 # ctacc 9999 # ctacg 8485 # ctact 15444 # ctaga 16023 # ctagc 12983 # ctagg 7632 # ctagt 15894 # ctata 30476 # ctatc 13050 # ctatg 16702 # ctatt 29337 # ctcaa 21293 # ctcac 11933 # ctcag 9381 # ctcat 15085 # ctcca 14842 # ctccc 9341 # ctccg 7116 # ctcct 11158 # ctcga 12679 # ctcgc 8740 # ctcgg 6014 # ctcgt 9243 # ctcta 15022 # ctctc 12155 # ctctg 11474 # ctctt 16245 # ctgaa 23356 # ctgac 8887 # ctgag 9939 # ctgat 15268 # ctgca 20320 # ctgcc 12040 # ctgcg 9049 # ctgct 15504 # ctgga 13179 # ctggc 11615 # ctggg 7784 # ctggt 8401 # ctgta 22459 # ctgtc 9290 # ctgtg 14446 # ctgtt 20894 # cttaa 38659 # cttac 14545 # cttag 18408 # cttat 24962 # cttca 17740 # cttcc 11753 # cttcg 11184 # cttct 15789 # cttga 16349 # cttgc 12036 # cttgg 11325 # cttgt 21016 # cttta 33226 # ctttc 18614 # ctttg 23750 # ctttt 42589 # gaaaa 70795 # gaaac 37126 # gaaag 27841 # gaaat 57073 # gaaca 27770 # gaacc 14262 # gaacg 13637 # gaact 22543 # gaaga 23234 # gaagc 17513 # gaagg 12625 # gaagt 17365 # gaata 36947 # gaatc 21733 # gaatg 24447 # gaatt 38760 # gacaa 22880 # gacac 13230 # gacag 10814 # gacat 14773 # gacca 12029 # gaccc 7759 # gaccg 5344 # gacct 7690 # gacga 13654 # gacgc 7035 # gacgg 6475 # gacgt 6795 # gacta 12629 # gactc 8718 # gactg 10096 # gactt 15811 # gagaa 28629 # gagac 9591 # gagag 16985 # gagat 18395 # gagca 21465 # gagcc 10109 # gagcg 10890 # gagct 13617 # gagga 18989 # gaggc 8944 # gaggg 7246 # gaggt 6235 # gagta 14269 # gagtc 8747 # gagtg 12152 # gagtt 17580 # gataa 30543 # gatac 16717 # gatag 13100 # gatat 32709 # gatca 16683 # gatcc 13685 # gatcg 14323 # gatct 15185 # gatga 21829 # gatgc 14969 # gatgg 13444 # gatgt 19216 # gatta 29029 # gattc 17878 # gattg 21610 # gattt 41495 # gcaaa 48225 # gcaac 27760 # gcaag 18325 # gcaat 33389 # gcaca 20797 # gcacc 11255 # gcacg 7241 # gcact 14654 # gcaga 20059 # gcagc 28202 # gcagg 11817 # gcagt 16008 # gcata 28773 # gcatc 15827 # gcatg 12683 # gcatt 33671 # gccaa 26504 # gccac 16966 # gccag 15858 # gccat 16659 # gccca 15064 # gcccc 9326 # gcccg 6382 # gccct 7972 # gccga 10108 # gccgc 10718 # gccgg 6637 # gccgt 7325 # gccta 12168 # gcctc 7983 # gcctg 8783 # gcctt 12771 # gcgaa 21046 # gcgac 9148 # gcgag 10980 # gcgat 14489 # gcgca 12018 # gcgcc 7840 # gcgcg 5515 # gcgct 8521 # gcgga 11523 # gcggc 10956 # gcggg 5658 # gcggt 6374 # gcgta 11600 # gcgtc 5934 # gcgtg 8711 # gcgtt 12723 # gctaa 24526 # gctac 9976 # gctag 10581 # gctat 16600 # gctca 11679 # gctcc 9953 # gctcg 7642 # gctct 12008 # gctga 14002 # gctgc 17478 # gctgg 12323 # gctgt 14078 # gctta 20780 # gcttc 12044 # gcttg 12729 # gcttt 24393 # ggaaa 32482 # ggaac 13717 # ggaag 12544 # ggaat 19780 # ggaca 12268 # ggacc 5776 # ggacg 7338 # ggact 8831 # ggaga 14931 # ggagc 14149 # ggagg 12614 # ggagt 10822 # ggata 15708 # ggatc 13021 # ggatg 14183 # ggatt 18279 # ggcaa 20758 # ggcac 9295 # ggcag 14459 # ggcat 13822 # ggcca 14649 # ggccc 5704 # ggccg 6037 # ggcct 6194 # ggcga 10696 # ggcgc 7765 # ggcgg 10475 # ggcgt 7361 # ggcta 10086 # ggctc 6790 # ggctg 9653 # ggctt 11479 # gggaa 13471 # gggac 5463 # gggag 7941 # gggat 9659 # gggca 10174 # gggcc 5058 # gggcg 6735 # gggct 6525 # gggga 8195 # ggggc 5893 # ggggg 6398 # ggggt 4461 # gggta 5086 # gggtc 5347 # gggtg 5686 # gggtt 7586 # ggtaa 9105 # ggtac 5110 # ggtag 5966 # ggtat 9612 # ggtca 7772 # ggtcc 5422 # ggtcg 5645 # ggtct 6166 # ggtga 6737 # ggtgc 6931 # ggtgg 8954 # ggtgt 8206 # ggtta 11041 # ggttc 7950 # ggttg 8205 # ggttt 17376 # gtaaa 49806 # gtaac 18284 # gtaag 16120 # gtaat 35095 # gtaca 26206 # gtacc 8575 # gtacg 10066 # gtact 16190 # gtaga 15160 # gtagc 13651 # gtagg 7697 # gtagt 17375 # gtata 36601 # gtatc 13910 # gtatg 21451 # gtatt 41005 # gtcaa 17373 # gtcac 8568 # gtcag 10110 # gtcat 12763 # gtcca 12643 # gtccc 7145 # gtccg 5716 # gtcct 9925 # gtcga 10879 # gtcgc 8403 # gtcgg 6053 # gtcgt 9247 # gtcta 14142 # gtctc 7192 # gtctg 9279 # gtctt 12632 # gtgaa 22171 # gtgac 7898 # gtgag 8578 # gtgat 15456 # gtgca 19569 # gtgcc 9576 # gtgcg 9740 # gtgct 12223 # gtgga 13520 # gtggc 11570 # gtggg 8035 # gtggt 8655 # gtgta 28209 # gtgtc 9790 # gtgtg 20993 # gtgtt 20988 # gttaa 38185 # gttac 14429 # gttag 17049 # gttat 28574 # gttca 18122 # gttcc 11176 # gttcg 12252 # gttct 16309 # gttga 20918 # gttgc 15318 # gttgg 12218 # gttgt 25859 # gttta 43562 # gtttc 22996 # gtttg 27044 # gtttt 57517 # taaaa 101843 # taaac 55163 # taaag 41753 # taaat 107418 # taaca 33452 # taacc 19887 # taacg 16205 # taact 36970 # taaga 30349 # taagc 33088 # taagg 13058 # taagt 37815 # taata 59522 # taatc 29993 # taatg 34214 # taatt 76720 # tacaa 49086 # tacac 28622 # tacag 14764 # tacat 52648 # tacca 21760 # taccc 11874 # taccg 7702 # tacct 15498 # tacga 20677 # tacgc 10714 # tacgg 6657 # tacgt 15572 # tacta 24832 # tactc 15318 # tactg 13530 # tactt 34819 # tagaa 29557 # tagac 14467 # tagag 15633 # tagat 26757 # tagca 23181 # tagcc 15906 # tagcg 10306 # tagct 22359 # tagga 13624 # taggc 11907 # taggg 6371 # taggt 11037 # tagta 21523 # tagtc 15866 # tagtg 15368 # tagtt 44892 # tataa 66059 # tatac 46791 # tatag 28260 # tatat 128328 # tatca 23991 # tatcc 16833 # tatcg 14782 # tatct 26996 # tatga 29068 # tatgc 24252 # tatgg 13747 # tatgt 53061 # tatta 64950 # tattc 30092 # tattg 36734 # tattt 105498 # tcaaa 49131 # tcaac 21790 # tcaag 19198 # tcaat 35908 # tcaca 21274 # tcacc 11474 # tcacg 6864 # tcact 15344 # tcaga 15737 # tcagc 16721 # tcagg 7381 # tcagt 16657 # tcata 24742 # tcatc 16574 # tcatg 12759 # tcatt 32478 # tccaa 30301 # tccac 16571 # tccag 13806 # tccat 22071 # tccca 17342 # tcccc 12284 # tcccg 7298 # tccct 11402 # tccga 11645 # tccgc 9920 # tccgg 6850 # tccgt 9991 # tccta 14465 # tcctc 11551 # tcctg 11499 # tcctt 18488 # tcgaa 30235 # tcgac 10592 # tcgag 12942 # tcgat 23994 # tcgca 16238 # tcgcc 11344 # tcgcg 6419 # tcgct 12167 # tcgga 11229 # tcggc 8653 # tcggg 6651 # tcggt 8930 # tcgta 17754 # tcgtc 9611 # tcgtg 8692 # tcgtt 19883 # tctaa 28931 # tctac 14963 # tctag 15544 # tctat 27575 # tctca 15010 # tctcc 10012 # tctcg 8752 # tctct 16989 # tctga 13952 # tctgc 13359 # tctgg 9620 # tctgt 22211 # tctta 24104 # tcttc 15702 # tcttg 15462 # tcttt 30136 # tgaaa 57429 # tgaac 20711 # tgaag 19309 # tgaat 42433 # tgaca 14993 # tgacc 9618 # tgacg 7630 # tgact 12628 # tgaga 17903 # tgagc 12698 # tgagg 8494 # tgagt 14351 # tgata 29231 # tgatc 14140 # tgatg 19007 # tgatt 36137 # tgcaa 39854 # tgcac 15703 # tgcag 18307 # tgcat 32925 # tgcca 21317 # tgccc 11056 # tgccg 9205 # tgcct 14052 # tgcga 15154 # tgcgc 9711 # tgcgg 8441 # tgcgt 12631 # tgcta 18321 # tgctc 12813 # tgctg 17066 # tgctt 22462 # tggaa 25213 # tggac 10492 # tggag 15442 # tggat 19656 # tggca 18766 # tggcc 12999 # tggcg 10461 # tggct 12936 # tggga 11247 # tgggc 9601 # tgggg 7472 # tgggt 9444 # tggta 10778 # tggtc 8322 # tggtg 9749 # tggtt 17692 # tgtaa 60334 # tgtac 31563 # tgtag 21488 # tgtat 60833 # tgtca 15064 # tgtcc 12074 # tgtcg 9810 # tgtct 15724 # tgtga 21852 # tgtgc 20171 # tgtgg 13199 # tgtgt 38847 # tgtta 39827 # tgttc 20120 # tgttg 28412 # tgttt 59615 # ttaaa 98393 # ttaac 37844 # ttaag 45291 # ttaat 72420 # ttaca 35427 # ttacc 18873 # ttacg 15726 # ttact 27887 # ttaga 26242 # ttagc 25589 # ttagg 15905 # ttagt 38327 # ttata 69425 # ttatc 25253 # ttatg 36600 # ttatt 83057 # ttcaa 44750 # ttcac 17442 # ttcag 18028 # ttcat 31444 # ttcca 27485 # ttccc 15594 # ttccg 12037 # ttcct 17921 # ttcga 25221 # ttcgc 14965 # ttcgg 11310 # ttcgt 20239 # ttcta 28351 # ttctc 16356 # ttctg 18660 # ttctt 32422 # ttgaa 47499 # ttgac 14608 # ttgag 17968 # ttgat 36555 # ttgca 31476 # ttgcc 17850 # ttgcg 12080 # ttgct 22771 # ttgga 20302 # ttggc 17146 # ttggg 11267 # ttggt 16683 # ttgta 64460 # ttgtc 18109 # ttgtg 29654 # ttgtt 61476 # tttaa 101164 # tttac 38483 # tttag 41333 # tttat 89923 # tttca 39758 # tttcc 27803 # tttcg 26520 # tttct 36657 # tttga 41172 # tttgc 30519 # tttgg 24062 # tttgt 71057 # tttta 94640 # ttttc 46611 # ttttg 62333 # ttttt 128813 # # The emission probabilities of the tss upwindow # [EMISSION-TSSUPWIN] # size of the emission vector 16 #tssup_k= 1 # patpseudo : pseudocount for sequence patterns 1 aa 0.326 ac 0.195 ag 0.204 at 0.275 ca 0.306 cc 0.2 cg 0.248 ct 0.245 ga 0.245 gc 0.298 gg 0.193 gt 0.264 ta 0.212 tc 0.219 tg 0.221 tt 0.347 # motif around the TSS of TATA-less promoters [TSSMOTIF] # width of motif, n= 13 # order of markov model, k= 0 # markov chain emission probabilities 0 0.268 0.227 0.222 0.283 1 0.257 0.23 0.22 0.293 2 0.279 0.234 0.216 0.27 3 0.271 0.238 0.214 0.278 4 0.285 0.237 0.216 0.261 5 0.263 0.214 0.229 0.295 6 0.249 0.223 0.195 0.332 7 0.162 0.309 0.241 0.288 8 0.406 0.252 0.193 0.15 9 0.275 0.199 0.233 0.293 10 0.275 0.194 0.165 0.365 11 0.294 0.215 0.182 0.308 12 0.283 0.207 0.228 0.282 # motif around the TSS of TATA promoters [TSSMOTIFTATA] # width of motif, n= 13 # order of markov model, k= 0 # markov chain emission probabilities 0 0.293 0.245 0.261 0.201 1 0.32 0.188 0.298 0.193 2 0.3 0.216 0.248 0.237 3 0.301 0.216 0.213 0.271 4 0.314 0.254 0.221 0.211 5 0.293 0.174 0.264 0.269 6 0.235 0.172 0.213 0.38 7 0.15 0.422 0.116 0.312 8 0.501 0.174 0.208 0.118 9 0.256 0.211 0.229 0.304 10 0.264 0.225 0.113 0.398 11 0.329 0.222 0.121 0.329 12 0.312 0.195 0.213 0.28 # tata box motif [TATAMOTIF] # width of motif, n= 12 # order of markov model, k= 0 # markov chain emission probabilities 0 0.21 0.237 0.381 0.173 1 0.19 0.341 0.336 0.133 2 0.0032 0.0032 0.0032 0.99 3 0.99 0.0032 0.0032 0.0032 4 0.0032 0.0032 0.0032 0.99 5 0.99 0.0032 0.0032 0.0032 6 0.637 0.0432 0.0272 0.293 7 0.99 0.0032 0.0032 0.0032 8 0.602 0.0592 0.0576 0.282 9 0.37 0.0976 0.386 0.147 10 0.202 0.315 0.312 0.171 11 0.254 0.283 0.278 0.184 # motif after polyA signal [TTSMOTIF] # width of motif, n= 14 # order of markov model, k= 1 # markov chain emission probabilities 0 0.368 0.167 0.147 0.317 0.414 0.134 0.181 0.27 0.365 0.182 0.115 0.337 0.342 0.126 0.224 0.308 1 0.368 0.17 0.139 0.323 0.41 0.145 0.177 0.268 0.338 0.199 0.106 0.358 0.323 0.136 0.21 0.33 2 0.397 0.173 0.114 0.316 0.425 0.149 0.173 0.252 0.35 0.19 0.106 0.353 0.335 0.13 0.198 0.337 3 0.42 0.159 0.102 0.319 0.437 0.152 0.165 0.246 0.359 0.191 0.102 0.348 0.329 0.124 0.176 0.371 4 0.452 0.148 0.104 0.296 0.446 0.147 0.159 0.248 0.386 0.187 0.1 0.328 0.337 0.114 0.167 0.382 5 0.455 0.141 0.107 0.297 0.435 0.143 0.159 0.263 0.375 0.194 0.0979 0.333 0.324 0.115 0.162 0.399 6 0.453 0.144 0.11 0.292 0.421 0.15 0.156 0.274 0.362 0.2 0.104 0.334 0.323 0.118 0.158 0.4 7 0.453 0.145 0.11 0.292 0.422 0.158 0.145 0.275 0.365 0.194 0.109 0.333 0.325 0.121 0.154 0.401 8 0.454 0.145 0.109 0.292 0.427 0.165 0.132 0.276 0.372 0.197 0.112 0.319 0.329 0.119 0.158 0.394 9 0.454 0.153 0.106 0.288 0.435 0.156 0.131 0.278 0.371 0.197 0.107 0.325 0.331 0.118 0.166 0.385 10 0.451 0.155 0.104 0.29 0.424 0.154 0.145 0.276 0.361 0.194 0.105 0.34 0.336 0.116 0.169 0.379 11 0.457 0.157 0.102 0.284 0.427 0.156 0.147 0.271 0.359 0.199 0.105 0.337 0.343 0.117 0.165 0.376 12 0.461 0.149 0.103 0.287 0.432 0.168 0.145 0.255 0.364 0.21 0.106 0.32 0.348 0.12 0.162 0.37 13 0.467 0.144 0.101 0.287 0.447 0.171 0.135 0.247 0.364 0.225 0.111 0.3 0.347 0.122 0.162 0.369