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homer_annotatepeaks
directory /test-data/ @ 4:
dcd291aeb8a9
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[up]
drwxr-xr-x
demoDB/
drwxr-xr-x
motif_test1/
drwxr-xr-x
CTCF_peaks.bed
5584
-rw-r--r--
CTCF_peaks_first.txt
9035
-rw-r--r--
CTCF_peaks_second.txt
6006
-rw-r--r--
CTCF_peaks_shifted.bed
2009
-rw-r--r--
CTCF_peaks_third.txt
9454
-rw-r--r--
all_fasta.loc
231
-rw-r--r--
annotations_default.txt
7618
-rw-r--r--
annotations_default_simplified.txt
5768
-rw-r--r--
annotations_default_stats.txt
329
-rw-r--r--
annotations_exon_start.txt
7244
-rw-r--r--
annotations_exon_start_stats.txt
300
-rw-r--r--
annotations_small_TSSTTS.txt
11081
-rw-r--r--
annotations_small_TSSTTS_stats.txt
330
-rw-r--r--
chr2_subset.fa.gz
416684
-rw-r--r--
fake_phix_peaks.bed
18
-rw-r--r--
fake_phix_peaks.subset.bed
36
-rw-r--r--
generate_tests.sh
4508
-rw-r--r--
homer_promoters.loc
411
-rw-r--r--
phiX174.fasta
5473
-rw-r--r--
phiX_nothing.txt
339
-rw-r--r--
phiXcpg.txt
390
-rw-r--r--
scanMotif_res1.bed
58
-rw-r--r--
scanMotif_res1.txt
101
-rw-r--r--
small.gtf
115259
-rw-r--r--
small_simplified.gtf
65658
-rw-r--r--