Mercurial > repos > iuc > homer_gtf_to_annotations

comparison test-data/motif_test1/homerMotifs.all.motifs @ 0:8ebb6520eef4 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/homer commit e49d856e0181edc6120220a1b819cba2466a4289"
author iuc
date Sun, 08 Aug 2021 11:04:17 +0000
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:8ebb6520eef4
1 >CTAATGAGCT 1-CTAATGAGCT 10.296193 -2.906976 0 T:1.0(100.00%),B:219.7(5.48%),P:1e-1 Tpos:101.0,Tstd:0.0,Bpos:96.2,Bstd:70.8,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
2 0.100 0.700 0.100 0.100
3 0.100 0.100 0.100 0.700
4 0.700 0.100 0.100 0.100
5 0.700 0.100 0.100 0.100
6 0.100 0.100 0.100 0.700
7 0.100 0.100 0.700 0.100
8 0.700 0.100 0.100 0.100
9 0.100 0.100 0.700 0.100
10 0.100 0.700 0.100 0.100
11 0.100 0.100 0.100 0.700
12 >ATCAAGATGA 2-ATCAAGATGA 10.296193 -2.906976 0 T:1.0(100.00%),B:219.8(5.48%),P:1e-1 Tpos:113.0,Tstd:0.0,Bpos:94.6,Bstd:75.6,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
13 0.700 0.100 0.100 0.100
14 0.100 0.100 0.100 0.700
15 0.100 0.700 0.100 0.100
16 0.700 0.100 0.100 0.100
17 0.700 0.100 0.100 0.100
18 0.100 0.100 0.700 0.100
19 0.700 0.100 0.100 0.100
20 0.100 0.100 0.100 0.700
21 0.100 0.100 0.700 0.100
22 0.700 0.100 0.100 0.100
23 >GTTGCTGCCA 3-GTTGCTGCCA 10.296193 -2.906976 0 T:1.0(100.00%),B:219.9(5.49%),P:1e-1 Tpos:140.0,Tstd:0.0,Bpos:103.4,Bstd:83.3,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
24 0.100 0.100 0.700 0.100
25 0.100 0.100 0.100 0.700
26 0.100 0.100 0.100 0.700
27 0.100 0.100 0.700 0.100
28 0.100 0.700 0.100 0.100
29 0.100 0.100 0.100 0.700
30 0.100 0.100 0.700 0.100
31 0.100 0.700 0.100 0.100
32 0.100 0.700 0.100 0.100
33 0.700 0.100 0.100 0.100
34 >CCTGAGACTG 4-CCTGAGACTG 10.296193 -2.902420 0 T:1.0(100.00%),B:220.0(5.49%),P:1e-1 Tpos:181.0,Tstd:0.0,Bpos:96.7,Bstd:84.1,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
35 0.100 0.700 0.100 0.100
36 0.100 0.700 0.100 0.100
37 0.100 0.100 0.100 0.700
38 0.100 0.100 0.700 0.100
39 0.700 0.100 0.100 0.100
40 0.100 0.100 0.700 0.100
41 0.700 0.100 0.100 0.100
42 0.100 0.700 0.100 0.100
43 0.100 0.100 0.100 0.700
44 0.100 0.100 0.700 0.100
45 >CGAGGCTAAC 5-CGAGGCTAAC 10.296193 -2.897885 0 T:1.0(100.00%),B:221.5(5.53%),P:1e-1 Tpos:90.0,Tstd:0.0,Bpos:103.4,Bstd:66.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
46 0.100 0.700 0.100 0.100
47 0.100 0.100 0.700 0.100
48 0.700 0.100 0.100 0.100
49 0.100 0.100 0.700 0.100
50 0.100 0.100 0.700 0.100
51 0.100 0.700 0.100 0.100
52 0.100 0.100 0.100 0.700
53 0.700 0.100 0.100 0.100
54 0.700 0.100 0.100 0.100
55 0.100 0.700 0.100 0.100
56 >ATGAGCTTAATC 1-ATGAGCTTAATC 12.355432 -2.920769 0 T:1.0(100.00%),B:216.0(5.39%),P:1e-1 Tpos:105.0,Tstd:0.0,Bpos:97.7,Bstd:71.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
57 0.700 0.100 0.100 0.100
58 0.100 0.100 0.100 0.700
59 0.100 0.100 0.700 0.100
60 0.700 0.100 0.100 0.100
61 0.100 0.100 0.700 0.100
62 0.100 0.700 0.100 0.100
63 0.100 0.100 0.100 0.700
64 0.100 0.100 0.100 0.700
65 0.700 0.100 0.100 0.100
66 0.700 0.100 0.100 0.100
67 0.100 0.100 0.100 0.700
68 0.100 0.700 0.100 0.100
69 >TGCCATCTCAAA 2-TGCCATCTCAAA 12.355432 -2.920769 0 T:1.0(100.00%),B:216.2(5.39%),P:1e-1 Tpos:146.0,Tstd:0.0,Bpos:105.7,Bstd:83.1,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
70 0.100 0.100 0.100 0.700
71 0.100 0.100 0.700 0.100
72 0.100 0.700 0.100 0.100
73 0.100 0.700 0.100 0.100
74 0.700 0.100 0.100 0.100
75 0.100 0.100 0.100 0.700
76 0.100 0.700 0.100 0.100
77 0.100 0.100 0.100 0.700
78 0.100 0.700 0.100 0.100
79 0.700 0.100 0.100 0.100
80 0.700 0.100 0.100 0.100
81 0.700 0.100 0.100 0.100
82 >CGAGGCTAACCC 3-CGAGGCTAACCC 12.355432 -2.916150 0 T:1.0(100.00%),B:217.8(5.43%),P:1e-1 Tpos:91.0,Tstd:0.0,Bpos:101.8,Bstd:65.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
83 0.100 0.700 0.100 0.100
84 0.100 0.100 0.700 0.100
85 0.700 0.100 0.100 0.100
86 0.100 0.100 0.700 0.100
87 0.100 0.100 0.700 0.100
88 0.100 0.700 0.100 0.100
89 0.100 0.100 0.100 0.700
90 0.700 0.100 0.100 0.100
91 0.700 0.100 0.100 0.100
92 0.100 0.700 0.100 0.100
93 0.100 0.700 0.100 0.100
94 0.100 0.700 0.100 0.100
95 >CTCCTGAGACTG 4-CTCCTGAGACTG 12.355432 -2.911553 0 T:1.0(100.00%),B:218.1(5.44%),P:1e-1 Tpos:180.0,Tstd:0.0,Bpos:95.7,Bstd:83.7,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
96 0.100 0.700 0.100 0.100
97 0.100 0.100 0.100 0.700
98 0.100 0.700 0.100 0.100
99 0.100 0.700 0.100 0.100
100 0.100 0.100 0.100 0.700
101 0.100 0.100 0.700 0.100
102 0.700 0.100 0.100 0.100
103 0.100 0.100 0.700 0.100
104 0.700 0.100 0.100 0.100
105 0.100 0.700 0.100 0.100
106 0.100 0.100 0.100 0.700
107 0.100 0.100 0.700 0.100
108 >GATGATGCTCGT 5-GATGATGCTCGT 12.355432 -2.906976 0 T:1.0(100.00%),B:219.8(5.48%),P:1e-1 Tpos:119.0,Tstd:0.0,Bpos:93.3,Bstd:77.5,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
109 0.100 0.100 0.700 0.100
110 0.700 0.100 0.100 0.100
111 0.100 0.100 0.100 0.700
112 0.100 0.100 0.700 0.100
113 0.700 0.100 0.100 0.100
114 0.100 0.100 0.100 0.700
115 0.100 0.100 0.700 0.100
116 0.100 0.700 0.100 0.100
117 0.100 0.100 0.100 0.700
118 0.100 0.700 0.100 0.100
119 0.100 0.100 0.700 0.100
120 0.100 0.100 0.100 0.700
121 >CCCTAATG 1-CCCTAATG 8.236954 -2.897885 0 T:1.0(100.00%),B:221.6(5.53%),P:1e-1 Tpos:98.0,Tstd:0.0,Bpos:97.0,Bstd:70.2,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
122 0.100 0.700 0.100 0.100
123 0.100 0.700 0.100 0.100
124 0.100 0.700 0.100 0.100
125 0.100 0.100 0.100 0.700
126 0.700 0.100 0.100 0.100
127 0.700 0.100 0.100 0.100
128 0.100 0.100 0.100 0.700
129 0.100 0.100 0.700 0.100
130 >TGCTGCCA 2-TGCTGCCA 8.236954 -2.897885 0 T:1.0(100.00%),B:221.8(5.53%),P:1e-1 Tpos:141.0,Tstd:0.0,Bpos:102.6,Bstd:84.0,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
131 0.100 0.100 0.100 0.700
132 0.100 0.100 0.700 0.100
133 0.100 0.700 0.100 0.100
134 0.100 0.100 0.100 0.700
135 0.100 0.100 0.700 0.100
136 0.100 0.700 0.100 0.100
137 0.100 0.700 0.100 0.100
138 0.700 0.100 0.100 0.100
139 >GAGACTGA 3-GAGACTGA 8.236954 -2.897885 0 T:1.0(100.00%),B:221.9(5.54%),P:1e-1 Tpos:183.0,Tstd:0.0,Bpos:97.7,Bstd:84.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
140 0.100 0.100 0.700 0.100
141 0.700 0.100 0.100 0.100
142 0.100 0.100 0.700 0.100
143 0.700 0.100 0.100 0.100
144 0.100 0.700 0.100 0.100
145 0.100 0.100 0.100 0.700
146 0.100 0.100 0.700 0.100
147 0.700 0.100 0.100 0.100
148 >CTTAATCA 4-CTTAATCA 8.236954 -2.888876 0 T:1.0(100.00%),B:223.5(5.58%),P:1e-1 Tpos:108.0,Tstd:0.0,Bpos:94.6,Bstd:75.1,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
149 0.100 0.700 0.100 0.100
150 0.100 0.100 0.100 0.700
151 0.100 0.100 0.100 0.700
152 0.700 0.100 0.100 0.100
153 0.700 0.100 0.100 0.100
154 0.100 0.100 0.100 0.700
155 0.100 0.700 0.100 0.100
156 0.700 0.100 0.100 0.100
157 >GATGATGC 5-GATGATGC 8.236954 -2.888876 0 T:1.0(100.00%),B:223.5(5.58%),P:1e-1 Tpos:117.0,Tstd:0.0,Bpos:93.3,Bstd:78.0,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
158 0.100 0.100 0.700 0.100
159 0.700 0.100 0.100 0.100
160 0.100 0.100 0.100 0.700
161 0.100 0.100 0.700 0.100
162 0.700 0.100 0.100 0.100
163 0.100 0.100 0.100 0.700
164 0.100 0.100 0.700 0.100
165 0.100 0.700 0.100 0.100