Mercurial > repos > iuc > homer_gtf_to_annotations

diff test-data/motif_test1/homerMotifs.all.motifs @ 0:8ebb6520eef4 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/homer commit e49d856e0181edc6120220a1b819cba2466a4289"
author iuc
date Sun, 08 Aug 2021 11:04:17 +0000
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/motif_test1/homerMotifs.all.motifs	Sun Aug 08 11:04:17 2021 +0000
@@ -0,0 +1,165 @@
+>CTAATGAGCT	1-CTAATGAGCT	10.296193	-2.906976	0	T:1.0(100.00%),B:219.7(5.48%),P:1e-1	Tpos:101.0,Tstd:0.0,Bpos:96.2,Bstd:70.8,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+>ATCAAGATGA	2-ATCAAGATGA	10.296193	-2.906976	0	T:1.0(100.00%),B:219.8(5.48%),P:1e-1	Tpos:113.0,Tstd:0.0,Bpos:94.6,Bstd:75.6,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+>GTTGCTGCCA	3-GTTGCTGCCA	10.296193	-2.906976	0	T:1.0(100.00%),B:219.9(5.49%),P:1e-1	Tpos:140.0,Tstd:0.0,Bpos:103.4,Bstd:83.3,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+>CCTGAGACTG	4-CCTGAGACTG	10.296193	-2.902420	0	T:1.0(100.00%),B:220.0(5.49%),P:1e-1	Tpos:181.0,Tstd:0.0,Bpos:96.7,Bstd:84.1,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+>CGAGGCTAAC	5-CGAGGCTAAC	10.296193	-2.897885	0	T:1.0(100.00%),B:221.5(5.53%),P:1e-1	Tpos:90.0,Tstd:0.0,Bpos:103.4,Bstd:66.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+>ATGAGCTTAATC	1-ATGAGCTTAATC	12.355432	-2.920769	0	T:1.0(100.00%),B:216.0(5.39%),P:1e-1	Tpos:105.0,Tstd:0.0,Bpos:97.7,Bstd:71.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.700	0.100	0.100
+>TGCCATCTCAAA	2-TGCCATCTCAAA	12.355432	-2.920769	0	T:1.0(100.00%),B:216.2(5.39%),P:1e-1	Tpos:146.0,Tstd:0.0,Bpos:105.7,Bstd:83.1,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+>CGAGGCTAACCC	3-CGAGGCTAACCC	12.355432	-2.916150	0	T:1.0(100.00%),B:217.8(5.43%),P:1e-1	Tpos:91.0,Tstd:0.0,Bpos:101.8,Bstd:65.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+>CTCCTGAGACTG	4-CTCCTGAGACTG	12.355432	-2.911553	0	T:1.0(100.00%),B:218.1(5.44%),P:1e-1	Tpos:180.0,Tstd:0.0,Bpos:95.7,Bstd:83.7,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+>GATGATGCTCGT	5-GATGATGCTCGT	12.355432	-2.906976	0	T:1.0(100.00%),B:219.8(5.48%),P:1e-1	Tpos:119.0,Tstd:0.0,Bpos:93.3,Bstd:77.5,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+>CCCTAATG	1-CCCTAATG	8.236954	-2.897885	0	T:1.0(100.00%),B:221.6(5.53%),P:1e-1	Tpos:98.0,Tstd:0.0,Bpos:97.0,Bstd:70.2,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+>TGCTGCCA	2-TGCTGCCA	8.236954	-2.897885	0	T:1.0(100.00%),B:221.8(5.53%),P:1e-1	Tpos:141.0,Tstd:0.0,Bpos:102.6,Bstd:84.0,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+>GAGACTGA	3-GAGACTGA	8.236954	-2.897885	0	T:1.0(100.00%),B:221.9(5.54%),P:1e-1	Tpos:183.0,Tstd:0.0,Bpos:97.7,Bstd:84.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+>CTTAATCA	4-CTTAATCA	8.236954	-2.888876	0	T:1.0(100.00%),B:223.5(5.58%),P:1e-1	Tpos:108.0,Tstd:0.0,Bpos:94.6,Bstd:75.1,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.700	0.100	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+>GATGATGC	5-GATGATGC	8.236954	-2.888876	0	T:1.0(100.00%),B:223.5(5.58%),P:1e-1	Tpos:117.0,Tstd:0.0,Bpos:93.3,Bstd:78.0,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.700	0.100	0.100	0.100
+0.100	0.100	0.100	0.700
+0.100	0.100	0.700	0.100
+0.100	0.700	0.100	0.100