Mercurial > repos > iuc > homer_gtf_to_annotations
view test-data/motif_test1/homerMotifs.all.motifs @ 4:df55927535ed draft default tip
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/homer commit e6639e130c5bf50f489dd09e38a1cbc712280fff
| author | iuc |
|---|---|
| date | Fri, 07 Apr 2023 15:02:25 +0000 |
| parents | 8ebb6520eef4 |
| children |
line wrap: on
line source
>CTAATGAGCT 1-CTAATGAGCT 10.296193 -2.906976 0 T:1.0(100.00%),B:219.7(5.48%),P:1e-1 Tpos:101.0,Tstd:0.0,Bpos:96.2,Bstd:70.8,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 >ATCAAGATGA 2-ATCAAGATGA 10.296193 -2.906976 0 T:1.0(100.00%),B:219.8(5.48%),P:1e-1 Tpos:113.0,Tstd:0.0,Bpos:94.6,Bstd:75.6,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 >GTTGCTGCCA 3-GTTGCTGCCA 10.296193 -2.906976 0 T:1.0(100.00%),B:219.9(5.49%),P:1e-1 Tpos:140.0,Tstd:0.0,Bpos:103.4,Bstd:83.3,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 >CCTGAGACTG 4-CCTGAGACTG 10.296193 -2.902420 0 T:1.0(100.00%),B:220.0(5.49%),P:1e-1 Tpos:181.0,Tstd:0.0,Bpos:96.7,Bstd:84.1,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 >CGAGGCTAAC 5-CGAGGCTAAC 10.296193 -2.897885 0 T:1.0(100.00%),B:221.5(5.53%),P:1e-1 Tpos:90.0,Tstd:0.0,Bpos:103.4,Bstd:66.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 >ATGAGCTTAATC 1-ATGAGCTTAATC 12.355432 -2.920769 0 T:1.0(100.00%),B:216.0(5.39%),P:1e-1 Tpos:105.0,Tstd:0.0,Bpos:97.7,Bstd:71.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 >TGCCATCTCAAA 2-TGCCATCTCAAA 12.355432 -2.920769 0 T:1.0(100.00%),B:216.2(5.39%),P:1e-1 Tpos:146.0,Tstd:0.0,Bpos:105.7,Bstd:83.1,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 >CGAGGCTAACCC 3-CGAGGCTAACCC 12.355432 -2.916150 0 T:1.0(100.00%),B:217.8(5.43%),P:1e-1 Tpos:91.0,Tstd:0.0,Bpos:101.8,Bstd:65.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 >CTCCTGAGACTG 4-CTCCTGAGACTG 12.355432 -2.911553 0 T:1.0(100.00%),B:218.1(5.44%),P:1e-1 Tpos:180.0,Tstd:0.0,Bpos:95.7,Bstd:83.7,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 >GATGATGCTCGT 5-GATGATGCTCGT 12.355432 -2.906976 0 T:1.0(100.00%),B:219.8(5.48%),P:1e-1 Tpos:119.0,Tstd:0.0,Bpos:93.3,Bstd:77.5,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 >CCCTAATG 1-CCCTAATG 8.236954 -2.897885 0 T:1.0(100.00%),B:221.6(5.53%),P:1e-1 Tpos:98.0,Tstd:0.0,Bpos:97.0,Bstd:70.2,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 >TGCTGCCA 2-TGCTGCCA 8.236954 -2.897885 0 T:1.0(100.00%),B:221.8(5.53%),P:1e-1 Tpos:141.0,Tstd:0.0,Bpos:102.6,Bstd:84.0,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 >GAGACTGA 3-GAGACTGA 8.236954 -2.897885 0 T:1.0(100.00%),B:221.9(5.54%),P:1e-1 Tpos:183.0,Tstd:0.0,Bpos:97.7,Bstd:84.4,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 >CTTAATCA 4-CTTAATCA 8.236954 -2.888876 0 T:1.0(100.00%),B:223.5(5.58%),P:1e-1 Tpos:108.0,Tstd:0.0,Bpos:94.6,Bstd:75.1,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.700 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 >GATGATGC 5-GATGATGC 8.236954 -2.888876 0 T:1.0(100.00%),B:223.5(5.58%),P:1e-1 Tpos:117.0,Tstd:0.0,Bpos:93.3,Bstd:78.0,StrandBias:10.0,Multiplicity:1.00 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.700 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100 0.700 0.100 0.100