Mercurial > repos > iuc > ivar_variants
directory /test-data/zika/ @ 0:12d66d0d05ac draft
name | size | permissions |
---|---|---|
[up] | drwxr-xr-x | |
db/ | drwxr-xr-x | |
Z52.consensus.fa | 10188 | -rw-r--r-- |
Z52.consensus.fa.fai | 68 | -rw-r--r-- |
Z52.consensus.qual.txt | 10140 | -rw-r--r-- |
Z52.masked.sorted.depth | 176862 | -rw-r--r-- |
Z52.merged.bam | 7571164 | -rw-r--r-- |
Z52.sorted.depth | 183059 | -rw-r--r-- |
Z52.trimmed.sorted.depth | 179048 | -rw-r--r-- |
Z52.tsv | 1440 | -rw-r--r-- |
Z52_a.masked.bam | 3366621 | -rw-r--r-- |
Z52_a.masked.sorted.bam | 3366621 | -rw-r--r-- |
Z52_a.sorted.bam | 4021097 | -rw-r--r-- |
Z52_a.sorted.bam.bai | 96 | -rw-r--r-- |
Z52_a.trimmed.bam | 3524783 | -rw-r--r-- |
Z52_a.trimmed.sorted.bam | 3479627 | -rw-r--r-- |
Z52_a.trimmed.sorted.bam.bai | 96 | -rw-r--r-- |
Z52_a.tsv | 1021 | -rw-r--r-- |
Z52_b.masked.bam | 3968214 | -rw-r--r-- |
Z52_b.masked.sorted.bam | 3968214 | -rw-r--r-- |
Z52_b.sorted.bam | 4762174 | -rw-r--r-- |
Z52_b.sorted.bam.bai | 96 | -rw-r--r-- |
Z52_b.trimmed.bam | 4194701 | -rw-r--r-- |
Z52_b.trimmed.sorted.bam | 4132291 | -rw-r--r-- |
Z52_b.trimmed.sorted.bam.bai | 96 | -rw-r--r-- |
Z52_b.tsv | 1455 | -rw-r--r-- |
primer_mismatchers_indices.txt | 81 | -rw-r--r-- |
primers_Z52_consensus.tsv | 336 | -rw-r--r-- |